	chr	pos	allele1	allele2	variant_id	logfc.mean	logfc.mean.pval	abs_logfc.mean	abs_logfc.mean.pval	jsd.mean	jsd.mean.pval	logfc_x_jsd.mean	logfc_x_jsd.mean.pval	abs_logfc_x_jsd.mean	abs_logfc_x_jsd.mean.pval	active_allele_quantile.mean	active_allele_quantile.mean.pval	logfc_x_active_allele_quantile.mean	logfc_x_active_allele_quantile.mean.pval	abs_logfc_x_active_allele_quantile.mean	abs_logfc_x_active_allele_quantile.mean.pval	jsd_x_active_allele_quantile.mean	jsd_x_active_allele_quantile.mean.pval	logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean	logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean.pval	abs_logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean	abs_logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean.pval	quantile_change.mean	quantile_change.mean.pval	abs_quantile_change.mean	abs_quantile_change.mean.pval	closest_gene_1	gene_distance_1	closest_gene_2	gene_distance_2	closest_gene_3	gene_distance_3	peak_overlap	sig.chrombpnet.relaxed	sig.chrombpnet	allele	profile_shift	profile_diff	count_shift	count_diff
0	chr1	8319388	G	A	rs11121162	-0.0812503638	0.0050930896739862	0.0812503638	0.0048441967144702	0.0149850734759235	0.0790162398329473	-0.0012264451806184	0.0087091311054541	0.0012264451806184	0.0083248050474314	0.4434817788566271	0.2657389113650963	-0.0362156953986435	0.009684390996151	0.0362156953986435	0.0089739357498615	0.0066520558387354	0.0566151703035914	-0.0005471943319167	0.01060806830605	0.0005471943319167	0.0099734524984277	-0.0390045539891492	0.0113934017439755	0.0390045539891492	0.011109368389936	SLC45A1	1273	ERRFI1	293079	PARK7	365096	False	True	True	ref	20	0.0003357	0	0.0
1	chr1	8320734	C	T	rs12408399	-0.0082077428999999	0.4306135353899131	0.0082077428999999	0.4184469098011768	0.0074370930992688	0.6940144240303662	-6.232196967670479e-05	0.4957326552457262	6.232196967670479e-05	0.4839582913560857	0.222983640909138	0.5981247938650391	-0.0017688489807511	0.4846106595005814	0.0017688489807511	0.4711388011251989	0.0016181590214957	0.6654739023378704	-1.297306793317175e-05	0.5267705373903959	1.297306793317175e-05	0.5136910927928491	-0.007402566416664	0.3003099773692421	0.007402566416664	0.2922354653928831	SLC45A1	2619	ERRFI1	294425	PARK7	366442	False	False	False	ref	20	0.0002213	100	0.07697
2	chr1	8332335	G	A	rs11586622	-0.0540872278	0.022740693441876	0.0540872278	0.0212646183147701	0.0129430849183169	0.137779200244206	-0.000726009576823	0.0245136956943029	0.000726009576823	0.0232023431531487	0.5667382441726574	0.0812334284256675	-0.0307353629702189	0.0158127184329518	0.0307353629702189	0.0145898524734802	0.0073691314925385	0.0436985685962348	-0.0004144570499799	0.0185786651067859	0.0004144570499799	0.0174267348875662	-0.0105872467556717	0.1812141590834232	0.0105872467556717	0.1755641740347968	SLC45A1	14220	ERRFI1	306026	PARK7	378043	False	False	False	ref	85	0.0138	-100	0.03088
3	chr1	8332532	G	A	rs4908751	0.0048743159	0.5815285080825806	0.0048743159	0.5945046458862125	0.0157928249740527	0.0663917357833464	7.597709014462029e-05	0.4049861210543845	7.597709014462029e-05	0.4161343819202975	0.5694976088963578	0.0779435050159207	0.0027791713431972	0.3631224375625156	0.0027791713431972	0.3755406789834016	0.0090085521118445	0.0188705300054514	4.339280884913579e-05	0.2477109511885203	4.339280884913579e-05	0.2580050373030389	0.0008962748576229	0.8110869606318198	0.0008962748576229	0.8248160994061285	SLC45A1	14417	ERRFI1	306223	PARK7	378240	False	False	False	alt	100	0.005867	-90	0.2283
4	chr1	8406670	T	C	rs301796	-0.00443857201	0.5911291478099849	0.00479432883	0.5810142389750241	0.0156135925291259	0.0760673672214254	-7.955387155953226e-05	0.4098246345171178	8.285518742571856e-05	0.4004018149277391	0.2497951223560409	0.5725696987826373	-0.0012225448024537	0.5609091795576744	0.0012829687320203	0.5501264720548191	0.0041050790077609	0.21677163289655	-2.2152859636990003e-05	0.4197186166257033	2.271357546056772e-05	0.409639775016333	-0.0038714094544548	0.4457272496813463	0.0041494206371434	0.4374469458841296	SLC45A1	88555	ERRFI1	380361	RERE	442251	False	False	False	ref	35	0.002686	65	0.04227
5	chr1	8409277	A	G	rs301789	0.0645622068	0.0095961958468581	0.0645622068	0.0102319528667933	0.0132814786895895	0.1228644463977129	0.0008994478581863	0.0149002193934572	0.0008994478581863	0.0157642703491816	0.53079596261372	0.1271923583435708	0.0343259804057831	0.0088016168189748	0.0343259804057831	0.0095546726680918	0.0070630209677502	0.050345079749125	0.0004783394095561	0.0125661207904554	0.0004783394095561	0.0134477507418542	0.0167470616915113	0.0857740998025379	0.0167470616915113	0.0883165226853792	SLC45A1	91162	ERRFI1	382968	RERE	439644	False	True	False	alt	-50	0.001644	-35	0.04773
6	chr1	8413271	G	A	rs1763838	-0.0001333518883199	0.9178229486818456	0.0009389097276799	0.9158448663265052	0.0080358939615382	0.5877653345317497	-2.449441032621792e-06	0.9202974638724738	7.669470463658022e-06	0.918111525832516	0.1573730017946243	0.7289399388336749	-5.177942782034135e-05	0.9033665396698884	0.000144743329054	0.9011434792957626	0.0012902926927569	0.7431180998269205	-6.294267103587103e-07	0.9070364390962842	1.2319375957027463e-06	0.9047437955832416	-0.0002116204524942	0.8541655326530372	0.0007883899210572	0.851454650102279	SLC45A1	95156	ERRFI1	386962	RERE	435650	False	False	False	ref	20	0.002563	0	0.0
7	chr1	8430260	T	G	rs302719	-0.00755216792	0.4661657172171029	0.00755216792	0.4538571717818799	0.0180511571757866	0.0391875431934523	-0.0001378990194267	0.2807409512182009	0.0001378990194267	0.2711646156281656	0.2469320221164119	0.5811098705494461	-0.0018451192467908	0.4847816094128535	0.0018451192467908	0.4715730814256765	0.0044458362732741	0.1911854934462352	-3.363340136606657e-05	0.3267809177033683	3.363340136606657e-05	0.3155767324799017	-0.0071328540752496	0.3008559568426774	0.0071328540752496	0.2923889596347316	SLC45A1	112145	ERRFI1	403951	RERE	418661	False	False	False	ref	95	0.003038	95	0.00766
8	chr1	8435530	A	G	rs172531	0.00687748488	0.4524545438191297	0.0072613401999999	0.4630706339026693	0.0073579365156894	0.7088045614424092	5.134891146630573e-05	0.5057884224246626	5.436728431260909e-05	0.5156458607189005	0.1702507287419993	0.70615547116836	0.0012269356811199	0.5479922838164181	0.001294688438808	0.559297032751807	0.001275243065738	0.7450531135202797	9.27565053472228e-06	0.5791712370348528	9.8084113930284e-06	0.5900387197503225	0.0067116878805796	0.2753541607155256	0.0070602392140997	0.2808141860938083	SLC45A1	117415	ERRFI1	409221	RERE	413391	False	False	False	alt	60	0.01002	90	0.013016
9	chr1	8443182	G	A	rs301818	0.0503013688	0.0293232561087087	0.0503013688	0.0307825675982703	0.0153249813793387	0.1081757848607069	0.0010239179024227	0.0305839673471418	0.0010239179024227	0.0319287536966207	0.316358053506779	0.4704669094600126	0.016165658264042	0.0633281017935618	0.016165658264042	0.067990079139715	0.0049378816611943	0.1688357635709318	0.0003335231295452	0.0446666427067415	0.0003335231295452	0.0472464307752625	0.0409008392203238	0.0136973364410253	0.0409008392203238	0.0141041467158247	SLC45A1	125067	RERE	405739	ERRFI1	416873	False	False	False	alt	5	0.001093	-80	0.01923
10	chr1	28647287	G	T	rs7368197	0.00484978634	0.5656262226807836	0.00484978634	0.5787706162482769	0.0303896541708002	0.0037737319693816	0.0001512732572664	0.2228963312802154	0.0001512732572664	0.2319825263276229	0.162088818348738	0.7094127785953115	0.0007461365776438	0.6294722345273791	0.0007461365776438	0.6436552778124632	0.0048664115498898	0.1425492545472064	2.303291852245888e-05	0.3674437319849659	2.303291852245888e-05	0.379503553650567	0.0044191329785578	0.4090173817653045	0.0044191329785578	0.4194385636362553	TAF12	1004	GMEB1	21492	RAB42	55086	False	True	True	alt	0	0.0	60	0.0177
11	chr1	28688564	C	A	rs61786043	0.00356600456	0.6506733034086207	0.00356600456	0.6641737496874247	0.0107402779795555	0.2401389547379986	3.888871015667733e-05	0.5852444539236754	3.888871015667733e-05	0.5978665505699514	0.3113953464247553	0.4812953808423379	0.0011114727870955	0.5522918766948185	0.0011114727870955	0.5661046763570072	0.0033483123236533	0.357007041425832	1.2135746004961643e-05	0.5063463891047614	1.2135746004961643e-05	0.5195794659232965	0.0026245085529932	0.56598245103237	0.0026245085529932	0.5782245568004418	GMEB1	19785	TAF12	40273	YTHDF2	48058	False	False	False	alt	65	0.002441	100	0.128
12	chr1	28725056	G	A	rs61787564	-0.0596487157999999	0.0160971862539948	0.0596487157999999	0.015087864084514	0.0118210145950394	0.1744853017993174	-0.0007196868537252	0.0233163318805194	0.0007196868537252	0.0219900024378554	0.1833608232450543	0.6798112981622818	-0.0105653499020502	0.1227710555598687	0.0105653499020502	0.1148921261563121	0.0021083539015635	0.5836968137950524	-0.0001241416829442	0.0980534175627171	0.0001241416829442	0.0918075111939623	-0.0561022417244991	0.0027209663412689	0.0561022417244991	0.0026360613476625	YTHDF2	11566	GMEB1	56277	TAF12	76765	False	True	False	ref	85	0.01566	100	0.0773
13	chr1	28727199	T	G	rs61787565	-0.00989647	0.3750766234088229	0.00989647	0.3633182621362782	0.0331890330424108	0.0024976273106905	-0.000337594877549	0.0900001736795431	0.000337594877549	0.0852670263999678	0.1301735495181485	0.7684213835769734	-0.0013095248211171	0.5545516948747357	0.0013095248211171	0.540990957405769	0.0043394512436927	0.1983960124159686	-4.514175467789936e-05	0.2688681669248565	4.514175467789936e-05	0.258367328786069	-0.0093776906399443	0.2209690419864474	0.0093776906399443	0.214366463121122	YTHDF2	9423	GMEB1	58420	TAF12	78908	False	True	True	ref	10	0.0004272	-80	0.0257
14	chr1	28786062	T	G	rs113507743	0.0006734300044	0.7737374765697241	0.0024363627244	0.7759273056066179	0.0261093801273411	0.0084601963158375	1.79356356035822e-05	0.4812217056806824	6.55370872007321e-05	0.4832987255487909	0.3873214452432079	0.3499693883151272	0.0002962113223076	0.632274984031376	0.000940926657806	0.6342711715106641	0.0099877447981679	0.0128406943909343	8.241734214185295e-06	0.4054629515957261	2.507940043303119e-05	0.4073601486065014	0.0002551893691843	0.7613438109507641	0.0012966939491073	0.7635338679473317	OPRD1	26109	YTHDF2	49440	EPB41	101030	False	True	True	alt	90	0.00727	-55	0.021
15	chr1	28790639	A	T	rs61787581	-0.044296521	0.0407317276524984	0.044296521	0.0381208075017098	0.017617076156949	0.0439301226038043	-0.0008011925304534	0.0191576195221924	0.0008011925304534	0.0181493502826297	0.3885372254898909	0.3527345464480315	-0.0171178723841286	0.0597596376388198	0.0171178723841286	0.0552649920909286	0.006796097339441	0.052526599806507	-0.0003076113575537	0.0278072139170018	0.0003076113575537	0.0258599010286365	-0.0265376196848514	0.0368791450985123	0.0265376196848514	0.0359466719593432	OPRD1	21532	YTHDF2	54017	EPB41	96453	False	False	False	ref	-100	0.001776	90	0.04498
16	chr1	28810174	A	G	rs569356	0.00145094862	0.803193266677592	0.0021296177	0.8060574175889155	0.0127368635878394	0.1429098287117962	1.866149823255135e-05	0.7327427756804226	2.6260241162216552e-05	0.7358497060288418	0.3123248166474756	0.4785405826343413	0.0004459988763208	0.7034481065034581	0.0006512828748817	0.7060715770512503	0.0039834613323644	0.2485761307097951	5.759997503674348e-06	0.6420485609992252	8.041397167717852e-06	0.6449582028864138	0.0010829987862944	0.7256548499772738	0.0015809292627516	0.7288416854767508	OPRD1	1997	YTHDF2	73552	EPB41	76918	False	False	False	alt	95	0.003418	100	0.1381
17	chr1	28814643	G	A	rs533123	0.00366092974	0.5273779540092064	0.00581271906	0.5310393251087219	0.0108699701352212	0.2417418397441051	4.153152670760274e-05	0.4651442905296453	6.551433625475726e-05	0.4683821006631912	0.56483158538989	0.0832407854934769	0.0020101821371956	0.361337836985548	0.0032344782331343	0.3649697919963831	0.0061230306500881	0.0772022334070579	2.2822715874920123e-05	0.3210977214349064	3.643248754459919e-05	0.324382987587371	0.000838182968703	0.7676165706381767	0.0012074814054087	0.767874730268401	OPRD1	2472	EPB41	72449	YTHDF2	78021	False	False	False	alt	50	0.001022	-5	0.0007324
18	chr1	28824876	T	C	rs369247	0.0313962018	0.0816826285656796	0.0313962018	0.0872390852232838	0.0091223074860672	0.4071727443831554	0.0002922122986946	0.0954463522639689	0.0002922122986946	0.1009882136211821	0.3082853556572164	0.4736587494520705	0.009730491758973	0.1173068997040646	0.009730491758973	0.1254519132688831	0.0027934759113609	0.4399797123047328	8.973977788491762e-05	0.1232783153264185	8.973977788491762e-05	0.1310580514714252	0.0236371746594881	0.0446092407285406	0.0236371746594881	0.0457177757211777	OPRD1	12705	EPB41	62216	YTHDF2	88254	False	False	False	alt	100	0.01794	5	0.005432
19	chr1	28828321	T	G	rs4654375	-0.00402933148	0.5816638185678771	0.005094846	0.5734369859373905	0.0181693076834968	0.0395130003650232	-7.742775139167604e-05	0.3740701555838621	9.51810130705397e-05	0.3668854999524849	0.1391570451975642	0.7559393677629471	-0.0004723209313925	0.6847130831935428	0.0006707142762323	0.6769185032086638	0.0025090185144993	0.5029970243843117	-9.186562022910158e-06	0.5359075461283876	1.2492128407145716e-05	0.5284126891653164	-0.0040809551966306	0.4035661112880376	0.004931586427245	0.3971557091885779	OPRD1	16150	EPB41	58771	YTHDF2	91699	False	False	False	ref	-70	0.002975	95	0.06683
20	chr1	28833590	A	G	rs2236859	-0.00377080176	0.6880658269973675	0.00377080176	0.6747737388561742	0.0070729969401349	0.7624759200908608	-2.623901473238885e-05	0.7425383564745284	2.623901473238885e-05	0.72919159425048	0.3330325003371404	0.444184413429581	-0.0012786952409209	0.5809835539716464	0.0012786952409209	0.5673329091625436	0.0023644061691192	0.5383023630416234	-8.943041481897462e-06	0.6277187666087111	8.943041481897462e-06	0.6141515104014084	-0.0027635141443375	0.5958343755234687	0.0027635141443375	0.5834456940100257	OPRD1	21419	EPB41	53502	YTHDF2	96968	False	False	False	ref	-5	0.000595	50	0.0222
21	chr1	28835487	C	A	rs2236855	-0.01477866152	0.2544884757287475	0.01477866152	0.244503905103426	0.0110253858112871	0.2197528673533991	-0.000165176489562	0.2146302119508406	0.000165176489562	0.2062988861462865	0.342360397929439	0.4202224293240671	-0.0051910007429083	0.2493002293281019	0.0051910007429083	0.2384686794931144	0.0037512607527525	0.2842572815190696	-5.767322744380128e-05	0.2143982909233038	5.767322744380128e-05	0.2048892577076556	-0.0098652475648087	0.2022744844124075	0.0098652475648087	0.1962728071414719	OPRD1	23316	EPB41	51605	YTHDF2	98865	True	False	False	ref	75	0.00544	75	0.05933
22	chr1	28836056	A	G	rs760588	0.00903138176	0.391530693851016	0.00903138176	0.4039231032515543	0.0056942804208746	0.954419122479126	5.17801603701389e-05	0.5226284629188666	5.17801603701389e-05	0.5351189297671743	0.3932758638575089	0.3446512694392513	0.0034931315003542	0.3188020542120696	0.0034931315003542	0.3310201185341128	0.0022372891501524	0.5584421137384958	1.999912546034565e-05	0.414702570126147	1.999912546034565e-05	0.4272817866313758	0.0052635400782165	0.3794735609748834	0.0052635400782165	0.3894434706741149	OPRD1	23885	EPB41	51036	YTHDF2	99434	True	False	False	alt	-100	0.004753	65	0.0403
23	chr1	28841542	C	T	rs4233254	0.00060686128	0.6842466526306656	0.0036608452799999	0.6873603701401028	0.00566059407975	0.9550505146522584	2.7037591277876127e-06	0.7778253182137473	2.11930570812838e-05	0.7808826661370839	0.3041338603097542	0.4892370478527712	0.0001538408535182	0.5950680540035574	0.0011097943548392	0.5983826676064551	0.0017067496585717	0.6625917693608661	6.777939232844297e-07	0.6796529726194785	6.3809576253994e-06	0.6828926651328425	0.0007676428178715	0.5747532232863996	0.0028299048745318	0.5777209169097905	OPRD1	29371	EPB41	45550	YTHDF2	104920	False	False	False	alt	85	0.0498	-100	0.0706
24	chr1	28917939	G	T	rs150082	0.00674822096	0.4563120426709666	0.00674822096	0.4685943298434715	0.0163659090281485	0.0590942956982481	0.0001135448713976	0.2962443498865086	0.0001135448713976	0.3064146920884605	0.0108237637319888	0.9758888077088786	6.391345210180093e-05	0.9070482006925644	6.391345210180093e-05	0.921461845349457	0.0001749714562135	0.9553816041639936	1.0582957936430028e-06	0.8618709536067073	1.0582957936430028e-06	0.8763817918638791	0.0012946192387887	0.7335303782631788	0.0012946192387887	0.7470843031662249	EPB41	30847	OPRD1	105768	YTHDF2	181317	False	False	False	alt	-75	0.005806	-65	0.05588
25	chr1	28959599	A	T	rs3102739	0.0109141718	0.3181059240162671	0.0109141718	0.3295170370495364	0.0076478540040008	0.6143067793480238	8.535346557350254e-05	0.3720239776696873	8.535346557350254e-05	0.3830832947951529	0.3535617589394081	0.4148507146456464	0.0038918162818324	0.2834174399656234	0.0038918162818324	0.2951091821656387	0.0027149954869685	0.4634280409727594	3.055908994347132e-05	0.3163540455464055	3.055908994347132e-05	0.327792033362028	0.0071681241506654	0.2691911063547264	0.0071681241506654	0.2774337135605779	EPB41	72507	OPRD1	147428	TMEM200B	164304	False	False	False	alt	55	0.003052	95	0.01843
26	chr1	28983862	T	G	rs2985339	0.00345592648	0.3630097944518936	0.00965794248	0.3651871675933554	0.0098624267706794	0.3062428473182991	3.4138661944629715e-05	0.3429952013351141	9.499511836669632e-05	0.3447119806797506	0.4839925725370594	0.1993628565675002	0.0018286908505328	0.2555685466244131	0.0046751794953801	0.2576093948482152	0.0047781302299021	0.1601159573981398	1.809245158602414e-05	0.2403072938169181	4.600543502005236e-05	0.2419450099800597	0.0006078901233415	0.5064455681823151	0.0033174617993962	0.5078436297462228	EPB41	96770	TMEM200B	140041	OPRD1	171691	False	False	False	alt	85	0.001727	90	0.0906
27	chr1	28989957	G	A	rs7513398	0.00116784726	0.6123893518311342	0.00465601422	0.6133669121632852	0.0303309061548044	0.0036948604995501	3.746119158408135e-05	0.2598806939274954	0.0001356839107768	0.261058159285398	0.3329100924283447	0.4462386353429046	0.0005615255343389	0.5105347254917091	0.0015625123187425	0.5120782292646195	0.0100696588095464	0.0127394125682655	1.7282199549224785e-05	0.2478182965267659	4.556929425412218e-05	0.2493642118768751	0.0006369360678015	0.5256628754362955	0.0031265884500876	0.5265024558818225	EPB41	102865	TMEM200B	133946	OPRD1	177786	False	True	True	alt	100	0.03117	-100	0.062
28	chr1	29040724	C	T	rs2486201	-0.00495856204	0.5950267470264677	0.00495856204	0.5818055488065517	0.0066887522820338	0.8297364117416186	-3.22614513666681e-05	0.668658847015461	3.22614513666681e-05	0.6555256532529711	0.0810236620711832	0.8535306212564777	-0.0004185935323065	0.769989641527523	0.0004185935323065	0.7558769629284126	0.0005338121494045	0.8852871894728904	-2.689002800175651e-06	0.8052974388218918	2.689002800175651e-06	0.7910526294239453	-0.0039087542401891	0.4627807759861474	0.0039087542401891	0.4520491912960597	TMEM200B	83179	SRSF4	141176	EPB41	153632	False	False	False	ref	-35	0.002693	10	0.0119
29	chr1	29944296	C	A	rs10914662	-0.01691376534	0.2273553810377452	0.01691376534	0.2178666548331075	0.0081373346243022	0.5670599775212037	-0.000139309243116	0.2618375055973207	0.000139309243116	0.2523905486668149	0.5698544590711523	0.0758335917582358	-0.0094979597764303	0.1448940554969484	0.0094979597764303	0.1370777080106243	0.0046379728422988	0.1767367582897653	-7.828779466676472e-05	0.1726830957489615	7.828779466676472e-05	0.1645170123088372	-0.0030871689540347	0.5385288606159633	0.0030871689540347	0.5268606691850469	ENSG00000289710	632529	PTPRU	707779	MECR	713354	False	False	False	ref	100	0.004227	-25	0.02295
30	chr1	29954792	A	G	rs56335113	0.005512241596	0.563078926253062	0.0055865084839999	0.5721150854552411	0.0131052924788929	0.1273741295860628	7.041484451810644e-05	0.4760786523712986	7.147362341993102e-05	0.4845666545370772	0.404234483760205	0.3310840685686781	0.0022202389200428	0.4628666939334955	0.0022498034568235	0.4725591473204418	0.0052888208986656	0.120322232654534	2.83517759485348e-05	0.3884911069782869	2.877325999253441e-05	0.3972914119290307	0.0029668357555576	0.5550634880639119	0.0030124793825661	0.5630515468666979	ENSG00000289710	622033	PTPRU	718275	MECR	723850	False	False	False	alt	-45	0.001595	-45	0.0368
31	chr1	29958713	G	A	rs1009080	-0.0008071898892	0.7490974792780113	0.0024495685908	0.7437584772823399	0.0082413382178683	0.5413035851243424	-6.754477950652743e-06	0.7531116764004606	2.000075125092022e-05	0.7479501008806057	0.1382441726573927	0.7514634996814875	-9.963867278958744e-05	0.7807323329388085	0.0003591772324162	0.7748968466127583	0.0010832257621713	0.7731103058676282	-8.289283892682998e-07	0.7870339771981775	2.9212346805769888e-06	0.781307792416957	-0.0010373551592858	0.6111117613600068	0.0023776180250831	0.6063503479795203	ENSG00000289710	618112	PTPRU	722196	MECR	727771	False	False	False	ref	-100	0.002853	80	0.02292
32	chr1	29961039	C	G	rs6679167	-0.0311479846	0.102000528449811	0.0311479846	0.0961925196765713	0.0092576729793088	0.3961988689065253	-0.0002988998388019	0.1129771463332239	0.0002988998388019	0.1073763671871551	0.5946244255645807	0.0528201453697058	-0.0185026953509024	0.0541328921967083	0.0185026953509024	0.0499018986433992	0.0055075542509938	0.1089823213165759	-0.000177678968381	0.066973304274028	0.000177678968381	0.0624440807206355	-0.0046307534310521	0.4205277303201301	0.0046307534310521	0.4100875945163861	ENSG00000289710	615786	PTPRU	724522	MECR	730097	False	False	False	ref	85	0.011566	100	0.1306
33	chr1	29961104	T	C	rs1498232	0.01841495	0.0942200696193798	0.030198266	0.0981097734520279	0.0145361460869283	0.1021939159355616	0.0001254432915561	0.0530503547962963	0.0004421603235148	0.0552299012807325	0.5975476924034482	0.0504278879427899	0.0108605223016263	0.0481852653853132	0.0180255617021855	0.0509206962413373	0.0087172205010945	0.0260005186402013	7.232175721914e-05	0.0330012867790623	0.0002649067660088	0.0346824412221646	0.0030270023547962	0.4139174697155642	0.0044046100063278	0.4213580177703617	ENSG00000289710	615721	PTPRU	724587	MECR	730162	False	False	False	alt	20	0.0006714	30	0.02466
34	chr1	29990225	C	T	rs10127492	0.0214534292119999	0.193055379696704	0.0216670711879999	0.2004350933852433	0.012520314488843	0.1487734131459149	0.0003063623199995	0.1383520361178099	0.0003083938884173	0.1438055262991874	0.56576105561261	0.0805208883233198	0.0120922924734938	0.1173371959391916	0.0122164077815601	0.1240643512743895	0.0070897692351454	0.0477011162821979	0.0001734818151113	0.0923605169655608	0.0001746620548037	0.0972228094374416	0.0042676791253021	0.4508078203519357	0.0042884262284878	0.4588155401665965	ENSG00000289710	586600	MATN1	733360	PTPRU	753708	False	False	False	alt	-50	0.00357	0	0.0
35	chr1	29998186	G	T	rs10798981	-0.00037385712	0.7624271546176689	0.0027317997199999	0.7546203589621411	0.0099621905896465	0.3048709110800124	-2.2360996813046325e-06	0.7322844197189412	2.703838244406985e-05	0.7245580754810976	0.1152439340657059	0.795910850643251	-9.70706743722284e-05	0.8106477255033102	0.0003512370212293	0.8011409488054706	0.0011190857070045	0.7716734283627135	-7.117710499890781e-07	0.7949758830392257	3.385248162696609e-06	0.7853512014525993	-0.0001535285635742	0.6316490176545151	0.0023568709218974	0.6249378089647887	ENSG00000289710	578639	MATN1	725399	LAPTM5	759588	False	False	False	ref	100	0.001106	30	0.03087
36	chr1	30001463	C	T	rs143052415	-0.0511109478	0.0267809636434151	0.0511109478	0.025083828337933	0.0097394501426162	0.3346992555670075	-0.0005049088954016	0.0427337122654282	0.0005049088954016	0.0402050934890712	0.4828348841792964	0.1998135682876553	-0.0246498778614669	0.0279628633419357	0.0246498778614669	0.0256665110137091	0.0047087274786742	0.1709930082602312	-0.0002437095665811	0.0393757903014657	0.0002437095665811	0.0366230574932548	-0.0195126505461674	0.0811804094891023	0.0195126505461674	0.0789828430459004	ENSG00000289710	575362	MATN1	722122	LAPTM5	756311	False	False	False	ref	50	0.001545	35	0.01758
37	chr1	30059087	G	A	rs1966008	-0.0484098056	0.0319298266070863	0.0484098056	0.0298474453465761	0.0100354895039953	0.3013807892206587	-0.0004921495696525	0.0439173569480102	0.0004921495696525	0.0413062990759282	0.4256724654820071	0.2938125196976685	-0.0205905510126999	0.0422749674446766	0.0205905510126999	0.0389777345564522	0.0042697570488563	0.2187633464652383	-0.0002090898589847	0.0489747086212106	0.0002090898589847	0.0455906213014743	-0.0245521219099782	0.047323266863125	0.0245521219099782	0.0460775012528849	ENSG00000289710	517738	MATN1	664498	LAPTM5	698687	False	False	False	ref	40	0.001315	-70	0.03574
38	chr1	30059135	C	T	rs1966007	-8.565519999999748e-07	0.8130310343596476	0.00181631594	0.8157998750851114	0.006960101480309	0.7998724631169086	-1.0163528251396634e-06	0.843482401049866	1.2909758750508344e-05	0.84608751265203	0.4286849448645732	0.2892392590669349	-8.37198658839997e-06	0.6463284336895746	0.0007977823042573	0.6495387647450562	0.0029837327912164	0.4254868841043676	-5.086050981283559e-07	0.6863794146459331	5.677068900443981e-06	0.6893783303758513	-6.224130955739988e-06	0.8324821034504648	0.0008361082583843	0.8349190485016342	ENSG00000289710	517690	MATN1	664450	LAPTM5	698639	False	False	False	ref	-5	0.0002708	-75	0.03397
39	chr1	30059448	C	T	rs616924	0.0411498243999999	0.0485445072743715	0.0411498243999999	0.0518037494744573	0.0162801812529048	0.0698340953124977	0.0008190469552713	0.0321441804411392	0.0008190469552713	0.0340315883402721	0.4617496032116515	0.2340457954826452	0.0191561420135847	0.0447391539947482	0.0191561420135847	0.0486122626492105	0.0075719034357648	0.050071215457419	0.000386499553198	0.0298648134356894	0.000386499553198	0.0320392931464571	0.0167283892986441	0.0965073196192616	0.0167283892986441	0.0993853039599572	ENSG00000289710	517377	MATN1	664137	LAPTM5	698326	False	False	False	alt	-10	0.0002584	90	0.05347
40	chr1	35702473	C	A	rs28734113	-0.0464469312	0.0370603999786749	0.0464469312	0.0347396278013095	0.0274943085550193	0.0066872770816039	-0.0013204016521419	0.0084789418228973	0.0013204016521419	0.008127206090183	0.596342285708358	0.0514314312763928	-0.0276910994532733	0.0213866084649733	0.0276910994532733	0.0197084062839745	0.0164022892986736	0.0024409379988195	-0.0007879347871943	0.0062714968778579	0.0007879347871943	0.0059374454516604	-0.006840319920331	0.2903667609537395	0.006840319920331	0.2820762617202358	C1ORF216	16421	PSMB2	60947	CLSPN	67505	False	True	True	ref	85	0.006805	-10	0.00586
41	chr1	35713267	G	T	rs12562583	-0.00155408582	0.7563171433723412	0.00275255118	0.7531515043378012	0.0212940744503236	0.0200317804566105	-2.949781168556564e-05	0.518848355804896	5.695810110394853e-05	0.5152851322775055	0.2415585223913111	0.5907303346307408	-0.0003676309591637	0.6975352760696323	0.0006548042707452	0.6942224815946544	0.0051135358270487	0.132007770206147	-6.8345884100743244e-06	0.5258708921079878	1.3411633983496046e-05	0.5224382023773156	-0.0014564466436373	0.6163701627848437	0.0024232616520917	0.6126759338993278	C1ORF216	5627	CLSPN	56711	PSMB2	71741	False	False	False	ref	-100	0.01991	35	0.0467
42	chr1	35720505	A	G	rs6658453	0.0391718902	0.0499444306678533	0.0391718902	0.0536402707689167	0.0118173801289419	0.1831152977740274	0.0004693455189591	0.0436483366599698	0.0004693455189591	0.046591052255699	0.3190178321351881	0.4656510874458138	0.0124768002054082	0.084315828007935	0.0124768002054082	0.0909713454918452	0.0037736798815401	0.2651061487228442	0.0001496371697473	0.0682087685961963	0.0001496371697473	0.0731334861302606	0.0294629612340376	0.0260405929101391	0.0294629612340376	0.0267060259438243	C1ORF216	1611	CLSPN	49473	PSMB2	78979	False	False	False	alt	50	0.001221	-85	0.0654
43	chr1	35729771	C	T	rs11264194	-0.0101553266	0.3822011465613983	0.0101553266	0.3700942325823488	0.0071251736552784	0.7205741769815623	-7.827585709382725e-05	0.4390121481455469	7.827585709382725e-05	0.4274200631130726	0.2268529756532743	0.6109709324194366	-0.0025465675563066	0.4344227051226477	0.0025465675563066	0.4208485975364188	0.0016543766921156	0.6605193320757494	-1.998461028105508e-05	0.4714372620792437	1.998461028105508e-05	0.45813296637233	-0.0088029958816999	0.2323181250815004	0.0088029958816999	0.2264025991530784	C1ORF216	10877	CLSPN	40207	AGO4	78246	False	False	False	ref	100	0.005302	75	0.02557
44	chr1	35754957	C	A	rs16822339	0.0079499269799999	0.443383867521681	0.0079499269799999	0.4560766519515446	0.0066282697258895	0.8369413702103712	5.496587060107986e-05	0.5302979399953544	5.496587060107986e-05	0.5430347743902934	0.0891523770993474	0.8396308325371067	0.0007070957392992	0.6749411788089971	0.0007070957392992	0.6893155432169046	0.0005905929368699	0.8743394037938853	4.885711757283327e-06	0.7169110641163148	4.885711757283327e-06	0.7312057569079273	0.0061162460191495	0.3124718705208606	0.0061162460191495	0.3208468879888445	CLSPN	15021	C1ORF216	36063	AGO4	53060	False	False	False	alt	-85	0.00454	45	0.01584
45	chr1	35796132	T	G	rs12037102	0.00102998258	0.4297067163383939	0.00804202854	0.4302379264230016	0.0097339353395482	0.3385941016720371	-4.209689476145876e-06	0.4048036381138163	8.353594484286475e-05	0.4044154214846621	0.3200427390325625	0.4659224043428424	0.0002739993044856	0.3889522962677756	0.0026320524547583	0.3891529141325406	0.0031450873368279	0.362873613909882	-2.142880699375242e-06	0.3624008126202309	2.7566282645001466e-05	0.3617545789466579	0.0005829935995186	0.3442170213315135	0.0059523439039823	0.3449321423418703	AGO4	11885	CLSPN	26154	AGO1	73677	False	False	False	alt	100	0.00838	75	0.03098
46	chr1	35810036	T	G	rs515346	-0.00272893908	0.6887994013771295	0.00349189992	0.6807577380224826	0.0307746350674934	0.0038437305093757	-9.618416226844034e-05	0.3267380535417054	0.0001153267403311	0.3197599507083982	0.23529912136018	0.5992350226443692	-0.0006754999814663	0.6438069647799	0.0008659651553916	0.6355907116780811	0.0074761094522414	0.0445494109362806	-2.462907454020892e-05	0.3717262360300414	2.9407818521766552e-05	0.3640549234902556	-0.0025124741957903	0.55157284376396	0.0029979564103361	0.5441522934038112	AGO4	2019	CLSPN	40058	AGO1	59773	False	True	True	ref	100	0.00522	100	0.06238
47	chr1	35890856	A	G	rs2765012	0.000248631704	0.8922482457804914	0.001143277056	0.8889426516479257	0.0164849180179374	0.0627856303200772	-1.5649810978774357e-06	0.8167026683563897	1.582857915979024e-05	0.8130215120183685	0.0260438386290313	0.947668399567644	1.9638703318542903e-06	0.9702454148939108	2.2309321716637854e-05	0.9667887042628486	0.0004249770403846	0.9022349662565388	-5.6603625391928244e-08	0.9514112966340575	3.280636618129928e-07	0.9477416826401966	-4.356891669002001e-05	0.921868362105896	0.0003713731470242	0.9182659425648696	AGO1	21047	AGO3	39863	AGO4	82839	False	False	False	alt	80	0.002533	95	0.08685
48	chr1	35898381	G	C	rs647690	-0.031176542	0.1002699575800408	0.031176542	0.094507528819642	0.0103692578450586	0.2673035420042478	-0.0003255863070559	0.0948662159380231	0.0003255863070559	0.0898672715888761	0.1661780723866429	0.7025055785238019	-0.0052221313264546	0.2586323162313247	0.0052221313264546	0.2472494940130305	0.0017438262785199	0.6382852571665424	-5.523186018500236e-05	0.232022506825971	5.523186018500236e-05	0.2220102868550887	-0.0273301590265458	0.0327949670663827	0.0273301590265458	0.031970250045233	AGO1	28572	AGO3	32338	AGO4	90364	False	False	False	ref	15	0.00238	20	0.003906
49	chr1	35905567	T	C	rs2791962	0.043948744	0.0357729115392732	0.043948744	0.0384706489052169	0.0205885126642881	0.0228724429132428	0.0009277578658665	0.0139912357759889	0.0009277578658665	0.0147300690804845	0.1110654674841025	0.7996058340825062	0.0049683907439798	0.2343762715544586	0.0049683907439798	0.2455266113995946	0.0023436785204067	0.5148569596214927	0.000106937251716	0.1049659548018971	0.000106937251716	0.1117707155063027	0.0371559870953017	0.0110274195057049	0.0371559870953017	0.0113830638859735	AGO3	25152	AGO1	35758	AGO4	97550	False	False	False	alt	-100	0.03015	25	0.0264
50	chr1	35959384	A	G	rs10796876	0.0249728608	0.1296033192635433	0.0249728608	0.1370027001411536	0.0151052509843411	0.077071859459931	0.0003770700027695	0.0629366718696674	0.0003770700027695	0.0668574778335717	0.1479517422379899	0.7431840409752598	0.003821418111441	0.2928036726657529	0.003821418111441	0.3046112130500397	0.002249649276554	0.5565960533199	5.797954521986448e-05	0.1982701637506104	5.797954521986448e-05	0.2079060796261907	0.0242471394931482	0.0481083916305542	0.0242471394931482	0.0494512051109144	AGO3	28665	AGO1	89575	TEKT2	124711	False	False	False	alt	55	0.00598	90	0.04877
51	chr1	35975547	G	T	rs709309	0.00361559664	0.6255648906458381	0.00409177224	0.6342670428001035	0.026268995590484	0.0078546199355512	9.896205490189028e-05	0.3256636779876493	0.0001105410384318	0.3334149411217066	0.0606790526872684	0.8938833910519576	0.0002621005411814	0.8128945739373101	0.0002776258048197	0.8213477848156665	0.0016324508788023	0.6644759630695626	7.211227656702632e-06	0.6440505773463814	7.588749677001053e-06	0.6528587448515151	0.002761439434019	0.5478197173444052	0.0029440139420532	0.5560230943155906	AGO3	44828	AGO1	105738	TEKT2	108548	False	True	True	alt	-20	0.001617	-95	0.02324
52	chr1	36027819	T	C	rs274728	-0.01141595346	0.3301025456584404	0.01141595346	0.318738149666057	0.0070530262456365	0.7546756230400765	-7.683479152059913e-05	0.4084479487282975	7.683479152059913e-05	0.397411221209438	0.2387120198342306	0.5906565074801232	-0.0028262670669908	0.3780225620938567	0.0028262670669908	0.3654153058021329	0.0016628276204293	0.6642064456374878	-1.894291712892737e-05	0.433232853632581	1.894291712892737e-05	0.4207362709451747	-0.0099191900330916	0.2006995040140545	0.0099191900330916	0.1947478778379516	TEKT2	56276	ADPRS	61074	AGO3	97100	False	False	False	ref	-100	0.02065	10	0.006714
53	chr1	36044355	A	T	rs812106	-0.0026435925	0.7252526575807973	0.00322501366	0.7161840178934693	0.0160856976648327	0.0647138779913733	-4.804473849995966e-05	0.5579505993523369	5.647715791668607e-05	0.5493314838915873	0.1807342399817424	0.6840288337585018	-0.0004534799190867	0.7324216474123711	0.0005443429937968	0.7235201966711955	0.0029099638131231	0.4171139850373561	-8.196089237534574e-06	0.6151729910543428	9.513887124576796e-06	0.6062890496346369	-0.0026182844220375	0.5563301471455887	0.0031743067874147	0.5482699901864083	TEKT2	39740	ADPRS	44538	COL8A2	80867	False	False	False	ref	25	0.001282	25	0.05124
54	chr1	36128255	T	C	rs7542594	-0.1207300402	0.0011447222191129	0.1207300402	0.0010791262392996	0.0400988470680533	0.0012867080574144	-0.004886419556401	0.0009840021820258	0.004886419556401	0.0009285082948571	0.5073641842757706	0.1534117570653977	-0.0617262052356504	0.0015163056119596	0.0617262052356504	0.00143127090634	0.0205534574298711	0.0013353205686179	-0.0025219738429129	0.0010005192817507	0.0025219738429129	0.0009485346393718	-0.041500430502391	0.0103171836065039	0.041500430502391	0.0100464798771847	COL8A2	3033	MAP7D1	27325	TRAPPC3	27798	False	True	True	ref	-80	0.002884	-15	0.02594
55	chr1	43337449	C	A	rs839993	-0.0408370482	0.0533747895574663	0.0408370482	0.0500073341827596	0.0092318919402829	0.4007173015998226	-0.0003846154780473	0.0709381282467744	0.0003846154780473	0.0669909341651662	0.4661147937219265	0.2289647668434073	-0.0190294048698817	0.0504896472298253	0.0190294048698817	0.046553153705134	0.0043004781664127	0.2185404376940658	-0.0001790924587572	0.0634018721021127	0.0001790924587572	0.0591387835769628	-0.017174452017137	0.1038097361654855	0.017174452017137	0.1008990564012081	MPL	370	CDC20	21533	ELOVL1	30625	False	False	False	ref	100	0.003458	95	0.0895
56	chr1	43350861	T	C	rs839996	0.0021119234	0.7658331545000209	0.00242185056	0.7760107503641739	0.0220007335179623	0.018127075345082	4.20333985966379e-05	0.5218441897586187	5.006681770080477e-05	0.5314937477101156	0.1754872975860745	0.688180713894031	0.0004167819717291	0.733965942151179	0.0004439651801196	0.744765687048419	0.0038815085270096	0.2285130397627581	8.67343805825593e-06	0.5684477093342782	9.378036223441577e-06	0.5795202192450496	0.0018215956597059	0.630579013641636	0.0021162045249431	0.640338665617672	CDC20	8121	MPL	13042	ELOVL1	17213	False	True	False	alt	70	0.0346	90	0.01715
57	chr1	43376073	T	C	rs11587504	0.000575680952	0.5991517410940931	0.005263688048	0.5983648119543632	0.007553331944789	0.6348446273524959	8.623734184972609e-06	0.6127213954317526	4.559255986606115e-05	0.6117043944511494	0.2325771014222138	0.6028133007655679	5.023072222511746e-06	0.6244252421884805	0.0010966791142428	0.6227206296852807	0.0017212161929416	0.6579595956579412	8.157573290950835e-07	0.634268284514171	9.346282420913565e-06	0.632545085243321	0.0005332005518729	0.4463029644543591	0.0046245293000964	0.4450092116673598	ELOVL1	7999	MED8	13735	SZT2	13810	False	False	False	alt	100	0.02277	-60	0.02365
58	chr1	43376500	A	G	rs685756	0.0012624581252	0.7626478232794781	0.0027249794748	0.7637649319862878	0.0199299757828022	0.027435157547403	2.3882170516927207e-05	0.5868322718401908	4.737849441168634e-05	0.5872953072255357	0.2693202211641199	0.547171286241119	0.0003767953218918	0.7108987610165047	0.0007164022248849	0.7109515656581508	0.00543699088989	0.1150921457485889	7.033189283107486e-06	0.5787217484736505	1.2519522030473765e-05	0.5792270803396138	0.0007821657901015	0.6514026926657285	0.0021182792352617	0.6515824755542966	ELOVL1	8426	MED8	13308	SZT2	13383	False	False	False	alt	-100	0.02936	-100	0.01137
59	chr1	43398186	G	A	rs839761	-0.00582719774	0.5444832748098868	0.00582719774	0.531484938631702	0.0062003556400858	0.9217895493149176	-3.6138344906040704e-05	0.644915164558834	3.6138344906040704e-05	0.6317173420687913	0.3255365719561406	0.4581572343287808	-0.0019051972023836	0.4711159524900911	0.0019051972023836	0.4577360279600497	0.0020162460926916	0.6033601444537655	-1.1801921384307744e-05	0.5460930619467516	1.1801921384307744e-05	0.5328471086993002	-0.0040290874386663	0.4507105455441217	0.0040290874386663	0.4399669457346587	SZT2	8303	MED8	8378	ELOVL1	30112	False	False	False	ref	60	0.001115	-10	0.00873
60	chr1	43410148	T	C	rs3001721	0.0015541553599999	0.7314547501236842	0.0026100623599999	0.7393173123406771	0.0089533563992103	0.436500148149977	1.2542070871133036e-05	0.7250438680929592	2.2645126902632856e-05	0.7326961453672699	0.1305573709270842	0.7721291332778923	0.0002105162660781	0.7662230827764658	0.0003300518733782	0.7745902273249541	0.0011841250113839	0.7634433995805591	1.7570647668443294e-06	0.763886623913344	2.900797071865725e-06	0.7720423763205105	0.0017386072469631	0.5755148245256951	0.0025352960092946	0.5825012290173749	SZT2	20265	MED8	20340	ELOVL1	42074	False	False	False	alt	-25	0.0018215	-95	0.01617
61	chr1	43414425	A	T	rs72671121	-0.000997517293	0.9214919493064878	0.000997517293	0.908417009332927	0.015399300144114	0.0759565249202103	-1.4807437483588783e-05	0.8481554149493885	1.4807437483588783e-05	0.8345324535195687	0.1695992697019678	0.7027816694983748	-0.0001606257656862	0.8915386260985148	0.0001606257656862	0.8774588166272896	0.0026338460777821	0.4585430537905785	-2.411600184109652e-06	0.8339688013608114	2.411600184109652e-06	0.8199507144249538	-0.0008755277544372	0.8456182883713059	0.0008755277544372	0.8319120772875609	SZT2	24542	MED8	24617	HYI	39564	False	False	False	ref	-50	0.005615	-100	0.081
62	chr1	43441225	A	G	rs2027130	0.00585651734	0.4165534871748622	0.00835535854	0.4257210935465607	0.0098551123058852	0.322411931560811	5.0879499556418135e-05	0.3968148435401893	8.061066212418011e-05	0.4046239656915704	0.5041442338613471	0.1651290978350689	0.0029737561639062	0.2802012657151642	0.0042812288099887	0.2890415219136049	0.0049690934594309	0.1472676512206009	2.5678241579818016e-05	0.2686696474472157	4.1234524412164266e-05	0.2764969716531746	0.0016576935445388	0.5989358537293661	0.002387991576676	0.6077803908415214	HYI	12764	SZT2	51342	MED8	51417	False	False	False	alt	100	0.00177	-10	0.00525
63	chr1	43458495	A	T	rs2494994	-0.0351420484	0.0741739999729493	0.0351420484	0.0700398840265932	0.0128041559473565	0.1408247504155787	-0.0004728229711439	0.0522059383371948	0.0004728229711439	0.0495546024375176	0.1893318395419038	0.6732430325653429	-0.0065934573007537	0.2013336035842949	0.0065934573007537	0.1913663918829044	0.0023943625827079	0.5226361866193149	-8.791792979789846e-05	0.1464623765929031	8.791792979789846e-05	0.1388128942488723	-0.0356767186381601	0.0188924006635834	0.0356767186381601	0.018402352450214	HYI	4506	PTPRF	66693	SZT2	68612	False	False	False	ref	85	0.013	-30	0.01062
64	chr1	43461740	T	C	rs2842196	0.0078668763399999	0.4495284309610888	0.0078668763399999	0.4620786046400258	0.0091844517722511	0.3820282676413432	8.271053524014542e-05	0.4297282127585923	8.271053524014542e-05	0.4414205199927787	0.2289173124202533	0.6084776206403354	0.0018918462744321	0.476079525035081	0.0018918462744321	0.4894714725271558	0.0021465554411204	0.5680259577894496	2.007368533670037e-05	0.4538668477842713	2.007368533670037e-05	0.4668115641973007	0.0069295324640296	0.2949400084369661	0.0069295324640296	0.3032653205841426	HYI	7751	PTPRF	63448	SZT2	71857	False	False	False	alt	100	0.004395	55	0.0307
65	chr1	43473130	A	C	rs7413861	0.0078965837999999	0.1914155953884195	0.0194493342	0.1968411688129058	0.016039415938957	0.0657466888041579	1.988630173566e-05	0.0992806844917216	0.0003344589070672	0.1021964845767801	0.3556281704167056	0.4050432466499053	0.0029902323285279	0.1803504886232941	0.0071504640174684	0.1862913933565869	0.0056751410864387	0.106628886046391	8.099593947174492e-06	0.1077896452551594	0.0001213795389826	0.1116033654847992	0.004742787788255	0.1561470610757787	0.012145354204919	0.1596655371127268	HYI	19141	PTPRF	52058	SZT2	83247	False	False	False	alt	-50	0.002605	-50	0.02515
66	chr1	43483103	G	A	rs10789433	0.003264957404	0.6913928779557288	0.003297531836	0.7031629577062242	0.0335538302953144	0.0023769404878955	0.0001048021931976	0.3253434550140412	0.0001061207262288	0.3347459513096167	0.0762103341320967	0.8504914629446599	0.0002361181403212	0.8091262930308093	0.0002376394226787	0.8220065633787371	0.0025292489920398	0.4228341915834548	7.705761373044601e-06	0.6132824150802574	7.767339145702351e-06	0.6249837520463493	0.0021597734416331	0.6161225589470354	0.0021763711241817	0.6262397076300373	HYI	29114	PTPRF	42085	SZT2	93220	False	True	True	alt	-85	0.01883	-50	0.0297
67	chr1	43483424	A	G	rs10732843	-0.00387905012	0.6756612781249678	0.00387905012	0.6622799780130488	0.0214743207761117	0.0193146927342719	-8.557165561853457e-05	0.4112760838278593	8.557165561853457e-05	0.3998118159896012	0.0712766729945331	0.8616983494184116	-0.0002274079393732	0.8418027967814206	0.0002274079393732	0.8275780590973019	0.0014709853644381	0.6744031654084355	-4.922261936836734e-06	0.7131232134868353	4.922261936836734e-06	0.6989595881718863	-0.0025498189815246	0.6028397781020514	0.0025498189815246	0.5905516465442519	HYI	29435	PTPRF	41764	SZT2	93541	False	True	False	ref	95	0.004257	55	0.006104
68	chr1	43580248	A	G	rs2077652	0.0470200451999999	0.0290898700581003	0.0470200451999999	0.0311636474090445	0.0106294972977988	0.2497034290207663	0.0005086231072188	0.0393579394635659	0.0005086231072188	0.0418967230842976	0.4919262647952779	0.1846492717773529	0.0230971018540239	0.0266403757067902	0.0230971018540239	0.0291682656266665	0.0052537321905873	0.1194191498016799	0.0002511655358272	0.0332802285012217	0.0002511655358272	0.0360201382558937	0.0164877229016898	0.0929822707892174	0.0164877229016898	0.0957857835780355	PTPRF	55060	ENSG00000284989	69902	ST3GAL3	125577	False	False	False	alt	-100	0.0215	-95	0.01489
69	chr1	43582229	G	C	rs16830935	0.0096905188	0.3482715119114085	0.0096905188	0.3600966776360609	0.0072626310362051	0.7442625496450488	6.932554387458964e-05	0.4115473661065741	6.932554387458964e-05	0.4232670035785997	0.4705525990933516	0.2143962723378855	0.0046713729574321	0.2507267656415329	0.0046713729574321	0.2622501986548842	0.003396419344562	0.34908428152503	3.3225878815431364e-05	0.2947676254707133	3.3225878815431364e-05	0.3062273778917148	0.0034191226050062	0.4869981327745427	0.0034191226050062	0.4984622634728792	PTPRF	57041	ENSG00000284989	67921	ST3GAL3	123596	False	False	False	alt	100	0.000831	-30	0.04797
70	chr1	43596766	C	T	rs10890265	-0.019535715	0.200503135824165	0.019535715	0.1913722386598723	0.0089471718088492	0.4275133274608301	-0.0001753164454212	0.2138857999692583	0.0001753164454212	0.2054937549754373	0.2444651915476302	0.5735552047716377	-0.0046201025134626	0.2728880596938393	0.0046201025134626	0.2617108178770944	0.0021567386545472	0.5584533792740346	-4.078413426409811e-05	0.2760445195783363	4.078413426409811e-05	0.2655458553542026	-0.0166868950922726	0.1044649252037349	0.0166868950922726	0.1015997241487295	ENSG00000284989	53384	PTPRF	71578	ST3GAL3	109059	False	False	False	ref	100	0.004078	-80	0.05762
71	chr1	43613740	T	C	rs603542	0.0543010314	0.0193416077843828	0.0543010314	0.0207077018985066	0.01982323998741	0.0267507398501436	0.0010979953614276	0.0098639934846201	0.0010979953614276	0.0103718960140148	0.4403572651168581	0.2650856437538507	0.0240911402045152	0.0247849411247966	0.0240911402045152	0.0270804341527502	0.0087802428984823	0.0214696761776373	0.0004901269907787	0.0116626693740408	0.0004901269907787	0.0125393174994823	0.0250583512277097	0.0412982109508746	0.0250583512277097	0.0424592313312671	ENSG00000284989	36410	PTPRF	88552	ST3GAL3	92085	False	False	False	alt	100	0.001649	40	0.01497
72	chr1	43618949	G	T	rs16831024	0.0243203881999999	0.1291005390058129	0.0243203881999999	0.1363651609313482	0.0091678713300794	0.4022318875240719	0.0002362437877746	0.142662694746862	0.0002362437877746	0.1495232206105226	0.4654114669239306	0.2222441613243806	0.0113382899606134	0.0993285277684	0.0113382899606134	0.1065843873432169	0.0042374018714606	0.2215656756305831	0.0001091866030951	0.1092918696706408	0.0001091866030951	0.1164167338272723	0.0099482359775515	0.1943157853842932	0.0099482359775515	0.2001020335432927	ENSG00000284989	31201	ST3GAL3	86876	PTPRF	93761	False	False	False	alt	-100	0.003365	100	0.03787
73	chr1	43621160	C	T	rs1143702	0.0480922311999999	0.0284428805415065	0.0480922311999999	0.0305174417449678	0.0211822075044826	0.0207770046949524	0.0010378954418946	0.0112878392535116	0.0010378954418946	0.0118651901111969	0.5561095032106141	0.0931072257825934	0.0268218608841368	0.0193409139780174	0.0268218608841368	0.0210793893300899	0.0118023458589421	0.0074164375072548	0.0005799168227562	0.0090785870788482	0.0005799168227562	0.0096731270399819	0.0104980342119731	0.1804931669826493	0.0104980342119731	0.1863464532062755	ENSG00000284989	28990	ST3GAL3	84665	PTPRF	95972	False	False	False	alt	-55	0.002151	-15	0.01697
74	chr1	43636916	C	T	rs11210894	-0.00271342608	0.6593344258530592	0.0041400802	0.6498264850991305	0.0068786679191676	0.8134963630861214	-1.7486645737753953e-05	0.7151179435978123	2.8547601219768573e-05	0.705800252986387	0.2532412161951887	0.5695176330180384	-0.0007473448898361	0.6031996427350315	0.001087880697935	0.5931960767407616	0.0017297824116993	0.6545632388156499	-4.820598315313194e-06	0.6494111276840171	7.460797753493635e-06	0.6394602387182694	-0.0018527163144845	0.5257905309164707	0.0032054274421933	0.5180675272566311	ENSG00000284989	13234	ST3GAL3	68909	PTPRF	111728	False	False	False	ref	-100	0.00935	95	0.04886
75	chr1	43640118	C	T	rs12045413	-0.0417227678	0.0490309638658452	0.0417227678	0.045863785595846	0.0094437044957599	0.3626262784634096	-0.0003961187718797	0.0661917362008044	0.0003961187718797	0.062351825671871	0.1478729032458842	0.7360048813775543	-0.0059475492107176	0.2160892066152706	0.0059475492107176	0.2058460155423447	0.0013932353166847	0.7102319496422753	-5.64872614269743e-05	0.2098134077059124	5.64872614269743e-05	0.2003898217971431	-0.0370294297658688	0.0118239522096913	0.0370294297658688	0.0114829126135611	ENSG00000284989	10032	ST3GAL3	65707	PTPRF	114930	False	False	False	ref	100	0.0169	-40	0.02249
76	chr1	43652524	A	T	rs12041746	-0.00123815116	0.8932007823418823	0.00123815116	0.8793868796977091	0.0208294336140205	0.0238879504427894	-2.79811503338962e-05	0.713094312987399	2.79811503338962e-05	0.7000866107267333	0.3394350563802528	0.4320773772002214	-0.0004399029850927	0.7656902553565704	0.0004399029850927	0.7519071298072033	0.0072468317873781	0.0469312672064213	-1.009204908210904e-05	0.60082185369677	1.009204908210904e-05	0.5876040840212711	-0.00088590130603	0.8401532682528279	0.00088590130603	0.8264133268276473	ENSG00000284989	2374	ST3GAL3	53301	PTPRF	127336	False	False	False	ref	90	0.03864	95	0.0779
77	chr1	43706787	C	T	rs34550543	-0.0314473238	0.0879763527864978	0.0314473238	0.0834231929961503	0.0143104656744554	0.0970201217495859	-0.0004873500696476	0.0536146262294368	0.0004873500696476	0.0511011683244544	0.7113808234525255	0.0109746566086751	-0.0224674940479737	0.0355609381717758	0.0224674940479737	0.0329713080516641	0.0102101908425934	0.013476319551176	-0.0003487062591754	0.028140004177718	0.0003487062591754	0.0264503966007177	-0.0044585524746107	0.4251421374441594	0.0044585524746107	0.4147518155939102	ST3GAL3	962	ENSG00000284989	56637	PTPRF	181599	False	False	False	ref	-95	0.004726	15	0.0383
78	chr1	43765809	G	A	rs56352978	0.0735874723999999	0.0066211600074565	0.0735874723999999	0.0070094628456037	0.0416382561517905	0.0014747892095632	0.003198111334656	0.0018986890086336	0.003198111334656	0.0020015566247668	0.5116443116629841	0.1485284800012275	0.0377815564894076	0.0072966562490207	0.0377815564894076	0.0078710902370247	0.0210926024483948	0.0012514083279779	0.0016239814529037	0.0018795477754733	0.0016239814529037	0.0019783718381718	0.0229898650400936	0.0484541506648652	0.0229898650400936	0.0498528047913184	ST3GAL3	59984	ENSG00000284989	115659	ARTN	167512	False	True	True	alt	-40	0.001587	-85	0.03833
79	chr1	43767861	C	T	rs11590088	0.003636158934	0.6356279351823736	0.003636158934	0.6489868937155133	0.0205515883805413	0.023698127691451	7.679523564455088e-05	0.3973649266691653	7.679523564455088e-05	0.4086482933742802	0.0570296372369007	0.8948816023703754	0.0002121196494424	0.8212535749666318	0.0002121196494424	0.8355399170238369	0.0011515956587766	0.7633662787429191	4.3684671387408665e-06	0.7057841929397266	4.3684671387408665e-06	0.7196147448824427	0.0027033475450989	0.5586135195648794	0.0027033475450989	0.5707214534231169	ST3GAL3	62036	ENSG00000284989	117711	ARTN	165460	False	False	False	alt	95	0.02542	-45	0.02054
80	chr1	49392239	C	T	rs3957	-0.026883166	0.1355111945624214	0.026883166	0.1284543016096217	0.0066066101991416	0.8455450014457006	-0.0001820628203049	0.2139355856407629	0.0001820628203049	0.2054756119435994	0.0966317077977986	0.8287662164819867	-0.0026183956433542	0.4095102857812096	0.0026183956433542	0.3968637185980088	0.0006457835280635	0.8657592135103597	-1.7918731046675486e-05	0.4731508761720954	1.7918731046675486e-05	0.4606213738709828	-0.021205614166122	0.0646155487269111	0.021205614166122	0.0628594902050924	BEND5	615270	AGBL4	631715	ELAVL4	631791	False	False	False	ref	-60	0.002975	35	0.02583
81	chr1	49508120	T	C	rs1167295	-0.001349697494	0.767601863850527	0.002453187626	0.7637506737729013	0.0200843584030046	0.0261502528405575	-3.1716227934250046e-05	0.5501823877337997	5.075026473861503e-05	0.5456742433956716	0.0227533480637765	0.9597500934621416	-3.42515939940096e-05	0.9403148874784896	6.23870601865416e-05	0.9375978937670346	0.000462025806976	0.9068889251048315	-8.471637776390814e-07	0.8864382757075135	1.3221619085431566e-06	0.8833013012566092	-0.0005560223653772	0.8198438902648404	0.0009626655878172	0.8166091048801635	AGBL4	515834	ELAVL4	515910	BEND5	731151	False	False	False	ref	75	0.00473	50	0.01003
82	chr1	49509401	C	T	rs1167294	0.0025382644	0.7284082993814824	0.0025382644	0.7419863040096849	0.0227640830382376	0.015171603473751	6.202101554677923e-05	0.4755895254888423	6.202101554677923e-05	0.4878826313541538	0.0590545545078268	0.8941137982205185	0.0001685057725808	0.8513040189840714	0.0001685057725808	0.8654849948978652	0.0013880821860945	0.718689473299829	4.216827991543391e-06	0.7283651644705994	4.216827991543391e-06	0.7422893915867838	0.0019606012510502	0.6499398155615453	0.0019606012510502	0.6631623232104894	AGBL4	514553	ELAVL4	514629	BEND5	732432	False	True	False	alt	-90	0.003399	100	0.02325
83	chr1	49552771	T	C	rs1405913	0.0517045337999999	0.0220632006903496	0.0517045337999999	0.0237835887586166	0.0118769157342812	0.1777574345007949	0.0006415503704974	0.0285684071143408	0.0006415503704974	0.030444292053735	0.3843981784043403	0.3634638179412536	0.0201116902865064	0.0380336989876144	0.0201116902865064	0.041543947603534	0.004627647586424	0.1750631940700687	0.0002529452005613	0.0367454207774427	0.0002529452005613	0.0397484943276926	0.0312181661635493	0.0230352681488644	0.0312181661635493	0.0236449319924265	AGBL4	471183	ELAVL4	471259	BEND5	775802	False	False	False	alt	50	0.002155	-95	0.0268
84	chr1	49561483	C	T	rs1305494	0.005641867726	0.5605643300991572	0.005641867726	0.5740298165466045	0.0083636721611723	0.5203926507504291	4.813203842078327e-05	0.5694568798963464	4.813203842078327e-05	0.5824892924303571	0.0639238996255147	0.885082593130724	0.0003856864079314	0.7891876918037817	0.0003856864079314	0.8036477036383781	0.0005387115368867	0.8873504631036183	3.315721272762706e-06	0.7880642881350717	3.315721272762706e-06	0.8024269054533888	0.0035705764582619	0.4876260680322558	0.0035705764582619	0.4987761284196005	AGBL4	462471	ELAVL4	462547	BEND5	784514	False	False	False	alt	-100	0.08844	50	0.03918
85	chr1	49615927	C	T	rs11205633	-0.0038185677799999	0.6584917868424135	0.0038185677799999	0.6449729599757468	0.0078807080249303	0.62016466172593	-2.949072617023013e-05	0.6841021768014011	2.949072617023013e-05	0.6710169471165908	0.0422867457131297	0.92567832187135	-0.0001547994346213	0.8830544198795298	0.0001547994346213	0.8686723875316451	0.0003416655001347	0.931582950104334	-1.224672872631849e-06	0.8909697007450904	1.224672872631849e-06	0.8765169610672201	-0.002170146993226	0.6426064954962145	0.002170146993226	0.6299885611847917	AGBL4	408027	ELAVL4	408103	DMRTA2	807516	False	False	False	ref	-70	0.00796	35	0.02612
86	chr1	49620517	C	G	rs6684606	-0.0037620469695	0.6461408635209086	0.0037641795505	0.6369985842931275	0.0058154414687597	0.9548349893698124	-2.23863344645151e-05	0.7417276565275083	2.239792735928897e-05	0.7330902876575206	0.1903567464392784	0.6699469775146503	-0.0008504281065276	0.6654295919784502	0.0008506935979176	0.6556733982454949	0.001116729835405	0.7771748352458844	-5.095774583076181e-06	0.7329169545325729	5.097217817240241e-06	0.7237037072921821	-0.0038361393790391	0.4917049140569181	0.0038361393790391	0.4836167100136206	AGBL4	403437	ELAVL4	403513	DMRTA2	802926	False	False	False	ref	-90	0.002487	70	0.03546
87	chr1	49647919	T	C	rs6588355	0.00679846316	0.4648633758647543	0.00679846316	0.4773825423666758	0.0070838304436912	0.7580692683171213	4.799130776516414e-05	0.5349954182908313	4.799130776516414e-05	0.5476384792972113	0.1044595898297699	0.810509460741433	0.0007514147271511	0.6501360302196976	0.0007514147271511	0.6643645513017884	0.0007375037166356	0.8412837298593568	5.2758506532531885e-06	0.6851184725445223	5.2758506532531885e-06	0.6992563210324115	0.0058091888920009	0.3137109316859467	0.0058091888920009	0.3226764547894418	AGBL4	376035	ELAVL4	376111	DMRTA2	775524	False	False	False	alt	-75	0.001867	-85	0.0323
88	chr1	49652929	T	C	rs6660689	0.0692168448	0.0081758335979797	0.0692168448	0.0087423528220296	0.0151653056534082	0.0787228686917472	0.0010671553936677	0.0105961599357877	0.0010671553936677	0.0111888443764242	0.4288384734281476	0.2827572270898861	0.0297644127940658	0.0144105208018196	0.0297644127940658	0.015796256610593	0.0065435205639491	0.0624861796551494	0.0004618455682015	0.0130835016642226	0.0004618455682015	0.0141045253292712	0.0354671728959843	0.016032335655216	0.0354671728959843	0.0165128183628747	AGBL4	371025	ELAVL4	371101	DMRTA2	770514	False	True	True	alt	-55	0.00112	-50	0.01111
89	chr1	49716626	C	T	rs12137221	-0.0338020406	0.0861149181085308	0.0338020406	0.0810777322292082	0.0095779924514276	0.3510152204221878	-0.0003348446974808	0.0933725571150641	0.0003348446974808	0.0885277145685774	0.1467982033008641	0.7446442703949804	-0.0052135862871715	0.2634839114599236	0.0052135862871715	0.2522014683875812	0.0014443515287696	0.7125495302745892	-5.321019665689283e-05	0.2522908128059791	5.321019665689283e-05	0.2420028152067902	-0.0308135976514278	0.0269220095782873	0.0308135976514278	0.0262016266364418	AGBL4	307328	ELAVL4	307404	DMRTA2	706817	True	False	False	ref	-35	0.003937	-85	0.0612
90	chr1	49752696	T	G	rs4926540	0.0072041961399999	0.4547426843485903	0.0072041961399999	0.4675965110697614	0.0100800299090768	0.2912804280019695	7.569669493293302e-05	0.4196790839367303	7.569669493293302e-05	0.4315728780124834	0.0857809728316683	0.8475127220947909	0.000654765507644	0.6780991403117457	0.000654765507644	0.6924048632321064	0.0008979109039295	0.8147950622733232	7.073967599699532e-06	0.6437239463019528	7.073967599699532e-06	0.6577142347572187	0.0056618844593823	0.337743396258898	0.0056618844593823	0.3471593463674596	AGBL4	271258	ELAVL4	271334	DMRTA2	670747	False	False	False	alt	55	0.001302	-80	0.02202
91	chr1	49850920	C	T	rs68007327	-0.0037209633	0.6934715023818605	0.00382882074	0.6835844659272126	0.0078761763445347	0.5954006565636877	-3.1645135681945225e-05	0.7146905148478588	3.253462888879072e-05	0.7053738658812004	0.072865901098559	0.8751110001387208	-0.0004451065688492	0.8121997394841522	0.0004488290319491	0.8027074640225953	0.000603708837106	0.8833303776991526	-3.816694630322572e-06	0.8213804064440633	3.847393536941675e-06	0.8120336863810286	-0.0034191226050062	0.5729946665686496	0.0034813639145633	0.5645853475056246	AGBL4	173034	ELAVL4	173110	DMRTA2	572523	False	False	False	ref	-100	0.01944	75	0.0244
92	chr1	60578378	C	T	rs987335	-0.0176771996	0.2161135392866852	0.0176771996	0.2069033240140923	0.00863349507705	0.4764257592897128	-0.0001560929299043	0.2347611229120552	0.0001560929299043	0.2260212276906814	0.2185126401726158	0.628903640127645	-0.0039127745219777	0.3087047295202557	0.0039127745219777	0.2970223714667863	0.0018839983943444	0.62834426786475	-3.452400046331541e-05	0.3158151346627631	3.452400046331541e-05	0.3047512770398372	-0.016481498770734	0.095806620019425	0.016481498770734	0.093086883327823	NFIA	286882	C1ORF87	504608	CYP2J2	651605	False	False	False	ref	40	0.003237	45	0.02692
93	chr1	60586229	C	T	rs11207639	0.00100640723	0.8264800864387577	0.00170583723	0.834163451171783	0.0219845401016798	0.0176877618147355	2.593423290732208e-05	0.6089176244490734	3.941110723699329e-05	0.6166291950926093	0.1192190790360895	0.7922809326697435	0.0001506458408732	0.8454264606083294	0.0002025667230426	0.853474982175365	0.002534046835005	0.5019631748744103	3.5559943972385247e-06	0.7250304010734462	4.556425031406174e-06	0.7332808083484922	0.0010892229172501	0.7160231805861128	0.001549808607973	0.7236979624899507	NFIA	279031	C1ORF87	512459	CYP2J2	659456	False	True	False	alt	95	0.00386	-80	0.02357
94	chr1	60596802	G	A	rs484743	0.0121359744	0.2892520112555647	0.0121359744	0.300058487010657	0.016290405229295	0.0625697851108824	0.0001977293063321	0.1714694526557928	0.0001977293063321	0.1792763806733662	0.1301569518355999	0.7707509255959294	0.0016258379110784	0.4885102013911942	0.0016258379110784	0.5019611320334693	0.0020317626286364	0.6026002472156866	2.534809938044301e-05	0.3588945855355152	2.534809938044301e-05	0.3706232311071012	0.011118372597226	0.1593260786709893	0.011118372597226	0.1644647721592555	NFIA	268458	C1ORF87	523032	CYP2J2	670029	False	False	False	alt	-100	0.001363	70	0.02007
95	chr1	60597975	G	T	rs10218679	0.000974661996	0.6160728489821071	0.004441896276	0.6198457080983403	0.0143216300343671	0.1013736668324446	2.159948945613944e-05	0.5105122573890957	5.874686911483132e-05	0.5146255341234397	0.4990694924221205	0.175927991864097	0.0003809019791031	0.4536395662365199	0.0021881674366496	0.4572004032490684	0.0071167900087603	0.0458143621989312	9.387303698274304e-06	0.3643642104585099	2.874703271064237e-05	0.3687796885359687	0.0006078901233414	0.7045447433205494	0.0016784406477245	0.7076642905019899	NFIA	267285	C1ORF87	524205	CYP2J2	671202	False	False	False	alt	-100	0.009514	65	0.00907
96	chr1	60620463	T	C	rs2987774	0.00017529173	0.8946633244643817	0.00110448927	0.8945053943012305	0.0139204348934018	0.1027766242143363	2.87250647459858e-06	0.8152459996255234	1.6348169981253157e-05	0.8140652859264337	0.3506592392037261	0.4027374786343129	8.608999413431341e-06	0.7734268045189585	0.0003880952361482	0.7718130759909969	0.0048799529651893	0.1522604788496338	2.2528478157416615e-07	0.6919294011320516	5.6987956416130445e-06	0.6906415428592781	0.0001535285635743	0.8683150949190298	0.0006348613574829	0.8670138319853836	NFIA	244797	C1ORF87	546693	CYP2J2	693690	True	False	False	alt	100	0.00442	-80	0.0477
97	chr1	60646465	A	G	rs494011	-0.0043702165	0.6077571410247357	0.0043702165	0.5946770410976434	0.0406307346879299	0.0010764049821371	-0.0001833087009804	0.1916678746337232	0.0001833087009804	0.1837232371396334	0.173362794219857	0.6935415971815622	-0.000837719301551	0.6396478514038956	0.000837719301551	0.6255267721112253	0.0073567939367703	0.0455525818895368	-3.6178331186983306e-05	0.3141551517336418	3.6178331186983306e-05	0.3027867104356766	-0.0042842768078506	0.4423704697246139	0.0042842768078506	0.4319349436805247	NFIA	218795	C1ORF87	572695	CYP2J2	719692	False	True	True	ref	-95	0.00891	60	0.0693
98	chr1	60653642	T	C	rs554774	0.0341071178	0.0703427987460803	0.0341071178	0.0751845183677811	0.0085713625681375	0.4837481580140637	0.0002985102859197	0.0932837416980029	0.0002985102859197	0.0987194316105397	0.4425875787093226	0.2684596030751409	0.0151125030928387	0.063519758536796	0.0151125030928387	0.0690560225190046	0.0037919323970499	0.289112681456446	0.0001322667221015	0.0806975479536738	0.0001322667221015	0.086490428623345	0.0155354308654653	0.0987902311718822	0.0155354308654653	0.1017442556793627	NFIA	211618	C1ORF87	579872	CYP2J2	726869	False	False	False	alt	-95	0.001038	55	0.011475
99	chr1	60656200	C	A	rs489543	-0.0139645828	0.2809710672630996	0.0139645828	0.2704782513074382	0.0112234483085259	0.2063186273364308	-0.0001624832840272	0.2365257045387908	0.0001624832840272	0.2278423708284538	0.1080094191848462	0.8114244346825845	-0.001555066578813	0.5254073354125552	0.001555066578813	0.512052327575402	0.0012152546290507	0.7574978328126191	-1.822027268472392e-05	0.4689176120120903	1.822027268472392e-05	0.4564090418435371	-0.0124441124907934	0.1546525081000079	0.0124441124907934	0.1500141301052994	NFIA	209060	C1ORF87	582430	CYP2J2	729427	False	False	False	ref	-10	0.0002098	-25	0.0005493
100	chr1	60656438	A	G	rs471660	-0.00524606282	0.5718111590911482	0.00524606282	0.558941767380593	0.0138405600674772	0.1114005649628262	-7.885314937931922e-05	0.4348773003483125	7.885314937931922e-05	0.4231865938360168	0.100239629041795	0.8254234903453255	-0.0005138895010794	0.7374044465446562	0.0005138895010794	0.7234418813598429	0.0013706155277409	0.7279172743257913	-7.79766061179772e-06	0.6485742415810364	7.79766061179772e-06	0.6350089947994498	-0.0046286787207335	0.4306557710495642	0.0046286787207335	0.4201732648354385	NFIA	208822	C1ORF87	582668	CYP2J2	729665	False	False	False	ref	-100	0.003456	-95	0.0347
101	chr1	65843709	A	C	rs4077431	0.001988006222	0.7682786630939171	0.002596270098	0.7717472372601183	0.0106954474136889	0.2481199316788227	2.226071318519281e-05	0.7256791312374488	2.809163207123026e-05	0.7291497311373821	0.1292191827716054	0.775134910036661	0.0002774142188761	0.8038414005837528	0.0003531020377649	0.8066212402137888	0.0013579462341965	0.7295273542749626	3.034261008168564e-06	0.7793693359313963	3.7576202607473774e-06	0.7822470595276835	0.0017095613025031	0.6298044507063152	0.002373468604446	0.6334831739593417	PDE4B	51194	LEPR	423056	LEPROT	423121	False	False	False	alt	-10	0.0004883	50	0.02136
102	chr1	65847114	A	G	rs4133072	0.0035478094719999	0.7028738688485497	0.0035478094719999	0.7169609157721604	0.0080697860510127	0.5799830049893296	2.8391578901023973e-05	0.7172095646304111	2.8391578901023973e-05	0.7308765988283779	0.0263882405419142	0.9516134935073718	9.802790975552948e-05	0.9089571932343438	9.802790975552948e-05	0.9231664178089124	0.0002152303174868	0.9543116027353344	7.914460381555359e-07	0.9117160955427364	7.914460381555359e-07	0.9260469487460922	0.0013672340999387	0.7398278860454924	0.0013672340999387	0.7530738850886074	PDE4B	54599	LEPR	426461	LEPROT	426526	False	False	False	alt	20	0.0007553	-90	0.04065
103	chr1	65858829	G	A	rs12129719	0.000547422336	0.8199150372877648	0.001675733336	0.8282450550112281	0.0073432817412275	0.7073980045030727	4.520380667457257e-06	0.8349423481262014	1.2268874976794193e-05	0.8432824241488341	0.0790900320542743	0.8604525902882282	4.119852466629504e-05	0.8808038405233144	0.0001105716430107	0.8893896845727658	0.0005736408634327	0.8825603393470894	3.3565506715617776e-07	0.8897453775587022	8.120638034650607e-07	0.8984780997539386	0.0005684706272886	0.7399394208543353	0.001302918080063	0.7479104678464905	PDE4B	66314	LEPR	438176	LEPROT	438241	False	False	False	alt	-25	0.001057	50	0.02478
104	chr1	71655902	C	A	rs954299	0.001784364846	0.7967928515591048	0.002124612418	0.804147131895083	0.0078183623405652	0.6324672268507477	1.435696495747318e-05	0.8086849275975817	1.6875069542646906e-05	0.815913175951669	0.2735547049243249	0.5404785325348034	0.0005169652635608	0.7094474091128289	0.0005980113820768	0.7168570273715891	0.002157242742499	0.5796417772008144	4.175976786528819e-06	0.7252252201084584	4.775782982493084e-06	0.7324782198505626	0.0013361134451602	0.7010775358336575	0.001680515358043	0.7082906653760643	ZRANB2	574613	PTGER3	608086	NEGR1	626637	False	False	False	alt	-65	0.00271	70	0.02322
105	chr1	71656412	G	T	rs2422013	0.00208976914	0.7308599060414093	0.0027311047	0.7389893087292322	0.0268770059449245	0.0069990363616399	6.17642742455128e-05	0.4053677675781549	7.512415179518187e-05	0.4128054035001895	0.418386082843183	0.3073389562762916	0.0009055838805189	0.5559797548274593	0.0011499325975089	0.564656401785076	0.0113169953438908	0.0084183612482248	2.6676931425540923e-05	0.3109240214350612	3.1767042138766634e-05	0.3187764840544943	0.0010746999450201	0.7380995775138044	0.0013651593896202	0.7459095595582629	ZRANB2	575123	PTGER3	608596	NEGR1	626127	False	True	True	alt	100	0.02148	100	0.08594
106	chr1	71657276	G	A	rs2901616	-0.0011363217999999	0.7414545806097708	0.00304873292	0.7423029582527442	0.0218051357816713	0.0182883476501386	-1.900386398202801e-05	0.4926821345428886	6.749968078344172e-05	0.4927536588261578	0.230570856544155	0.6070252481935806	-0.0001904316199727	0.7084477308541617	0.0006462516955368	0.7098227384674504	0.0050708877610655	0.1409034149927766	-3.102334650545343e-06	0.528647603655924	1.46096075952597e-05	0.529577807849226	-0.0007116256392701	0.6006901233409992	0.0025249224577018	0.6014388647251481	ZRANB2	575987	PTGER3	609460	NEGR1	625263	False	True	False	ref	100	0.01192	45	0.03754
107	chr1	71661749	C	A	rs2422016	0.002121423418	0.7658634186527226	0.002471720802	0.7740695541559791	0.0180177757255381	0.0418692054904085	3.889596684249888e-05	0.5855914226048757	4.485495385054069e-05	0.593731284281071	0.0255957012002198	0.953677126084226	6.4624815627557e-05	0.9270655167519464	7.404369771561674e-05	0.9349021779084392	0.0004390005628559	0.9105061681199798	1.0856184166320574e-06	0.8853270434667461	1.2458451235983575e-06	0.8932758912316578	0.0008983495679415	0.7955002927484006	0.0010601769727901	0.803264396252377	ZRANB2	580460	PTGER3	613933	NEGR1	620790	False	False	False	alt	-100	0.0047	95	0.04156
108	chr1	71662548	G	A	rs12120761	-0.0260086131999999	0.1397155615925779	0.0260086131999999	0.1325718381236252	0.0100072969165103	0.3026620087103825	-0.0002679665831187	0.1293774921430694	0.0002679665831187	0.1231323484856957	0.1368167719582153	0.7604480023829868	-0.0037208739001049	0.329268756901173	0.0037208739001049	0.3172155822691369	0.0013950216837921	0.7204162747072669	-3.897607558425372e-05	0.3062939676388794	3.897607558425372e-05	0.2953017328447005	-0.0241807487629539	0.0529719167082398	0.0241807487629539	0.0515750753088669	ZRANB2	581259	PTGER3	614732	NEGR1	619991	False	False	False	ref	90	0.00277	-95	0.03485
109	chr1	71664478	C	T	rs2422021	-0.007144426766	0.4932266081183001	0.008319692914	0.4880502175026556	0.0132121950423632	0.1580486763371327	-0.0001586271971511	0.3415410788079601	0.0001677292921842	0.3365876226460401	0.0526997168020414	0.900649401070495	-0.0003376782712685	0.799425693511734	0.0003909749462903	0.7973413001353962	0.0006596370522461	0.8664957464299209	-7.42554509548865e-06	0.7075466332953906	7.830576536173486e-06	0.7043883946867888	-0.0039170530814634	0.4678935836869212	0.0045311673357606	0.4644951342657993	ZRANB2	583189	PTGER3	616662	NEGR1	618061	False	False	False	ref	55	0.0159	100	0.02832
110	chr1	71668902	G	A	rs7531932	-0.0287516592	0.1145827139697406	0.0287516592	0.1081476002225479	0.0083750172086627	0.5183107074914503	-0.0002402433797202	0.1402939327554813	0.0002402433797202	0.1336560969727017	0.2597599560161412	0.5606103082179794	-0.0075788564174948	0.1809301528170859	0.0075788564174948	0.1713189886950884	0.0021803155575408	0.5769346814463023	-6.350418335655372e-05	0.1985182025476713	6.350418335655372e-05	0.1892437826628826	-0.0250293052832497	0.042843421598564	0.0250293052832497	0.0417355134407528	ZRANB2	587613	NEGR1	613637	PTGER3	621086	False	False	False	ref	-75	0.00838	-80	0.08154
111	chr1	71687651	T	C	rs10789321	0.044723751	0.0349989467325951	0.044723751	0.0376188263015228	0.0096034430727244	0.3363490254741259	0.000434530816559	0.0490453252439309	0.000434530816559	0.052171291006434	0.1844790921067645	0.6808099640992303	0.0084322401862297	0.1453597742611133	0.0084322401862297	0.1544071281427736	0.0017662346293283	0.6476084237529433	8.172417353525387e-05	0.1417657501024138	8.172417353525387e-05	0.1499489540793644	0.0427037624871626	0.0075948443142655	0.0427037624871626	0.00781624382065	NEGR1	594888	ZRANB2	606362	PTGER3	639835	False	False	False	alt	-100	0.005863	45	0.02649
112	chr1	71719533	G	T	rs11209830	-0.0722074008	0.0074141554566327	0.0722074008	0.0070469239143242	0.0287581674439816	0.0070736306633848	-0.0022590479237878	0.0041497453566101	0.0022590479237878	0.0039864039044352	0.1308084108756314	0.7705439490787845	-0.0099796270535716	0.1384311906703794	0.0099796270535716	0.1300188642711727	0.0040289637418143	0.2175041202925935	-0.0003298441234101	0.0331698686178177	0.0003298441234101	0.0311900583764851	-0.0604653575244556	0.0017374081478393	0.0604653575244556	0.0016777273926951	NEGR1	563006	ZRANB2	638244	PTGER3	671717	False	True	True	ref	-95	0.012985	-30	0.0177
113	chr1	71756804	G	A	rs12740031	-0.0349655654	0.0775326518588449	0.0349655654	0.0728138770620079	0.0092171267198385	0.3895328021868279	-0.0003227242530287	0.0911806493017824	0.0003227242530287	0.0862790589922201	0.1459620950424796	0.7477033978388442	-0.0053445055367324	0.2527980049548348	0.0053445055367324	0.2417009720380675	0.0013542648891984	0.7311702944818074	-4.964172669862702e-05	0.2512474003937037	4.964172669862702e-05	0.2409832353655799	-0.0331393479185468	0.0208374519246707	0.0331393479185468	0.0202687014572336	NEGR1	525735	ZRANB2	675515	PTGER3	708988	False	False	False	ref	-5	0.000702	100	0.03137
114	chr1	71843759	C	T	rs517762	0.00115437447	0.8414335658124863	0.00127060761	0.8476700144894045	0.0240271958816968	0.0117036171611136	2.959105914235344e-05	0.6226622167239927	3.222585974862438e-05	0.6288652662405566	0.3070073341009761	0.4841834590113266	0.0003247261696125	0.7623856877626592	0.0003604605430572	0.7681878412347841	0.0072442275108113	0.0415674850136928	8.21276237125949e-06	0.5881249032404254	9.021351473051335e-06	0.5951872520978599	0.0010912976275687	0.7647447650814055	0.0011452400958516	0.7699130208251035	NEGR1	438780	ZRANB2	762470	PTGER3	795943	False	True	False	alt	-90	0.002655	100	0.007507
115	chr1	71885236	A	G	rs11209863	0.0015082486	0.7228598372624612	0.0025409417599999	0.7294857650360826	0.006363138061099	0.8818181121872679	7.074897754770925e-06	0.7980234759075383	1.496047036850844e-05	0.8038574535327327	0.1279141899812238	0.7772581537387807	0.0001613099366574	0.7777421216331996	0.000311197509142	0.7840749242999195	0.0008269357830226	0.8338934352982909	7.119533654451452e-07	0.8215710887700534	1.85776028065366e-06	0.827532538522881	0.0016867394889988	0.5778352147270203	0.0026618533387275	0.5830250578941936	NEGR1	397303	ZRANB2	803947	PTGER3	837420	False	False	False	alt	95	0.007233	20	0.01201
116	chr1	72810145	T	C	rs12135442	0.0604349867999999	0.0142103196428897	0.0604349867999999	0.0151173340379297	0.0130943027412058	0.1273737864531388	0.0008252428196231	0.0180074497696863	0.0008252428196231	0.0190597814578435	0.1500098548740131	0.7376474840115355	0.0088883844195252	0.1349770014563565	0.0088883844195252	0.1436683200342022	0.0019401054741926	0.6148606469874311	0.0001199310294677	0.093702528552354	0.0001199310294677	0.0999477147989831	0.0543574103465803	0.0031933308574241	0.0543574103465803	0.0032951167323423	NEGR1	527606	LRRIQ3	1388042	FPGT-TNNI3K	1388091	False	True	False	alt	0	0.0	-100	0.01022
117	chr1	72820726	G	A	rs11210070	0.00212851908	0.5356624406860176	0.00598688668	0.5418406665735926	0.009778412544888	0.3245244649586597	2.404310999264078e-05	0.5110029128870271	5.743326748643056e-05	0.517362170775602	0.0287077666780775	0.9489237572698092	8.45115476515946e-05	0.8597829711082129	0.0001914983102959	0.8680477728044493	0.0002950297976209	0.939943053797326	9.885935138771164e-07	0.8463566112255366	1.914452609727697e-06	0.8546216271152672	0.0010477287108787	0.5762191759668462	0.0026867498625503	0.5826317351902283	NEGR1	538187	LRRIQ3	1377461	FPGT-TNNI3K	1377510	False	False	False	alt	70	0.05292	60	0.01819
118	chr1	72827649	T	C	rs2422320	-0.000594695783	0.871915807618313	0.001357587863	0.8645614980273065	0.0202210775983321	0.0256693510618939	-1.2481598868640645e-05	0.6962291494031577	2.671144931859336e-05	0.6891240380711925	0.0116785443832404	0.9772853121166076	-2.3449377035687054e-06	0.9776880819469372	1.6597872524107483e-05	0.9736355392266391	0.0002341348183682	0.9478634031362662	-5.744698421081978e-08	0.9544324911108488	3.2329995634087135e-07	0.949274673478854	-8.921254369857517e-05	0.9308344937823452	0.00033402836129	0.9245815983089842	NEGR1	545110	LRRIQ3	1370538	FPGT-TNNI3K	1370587	False	False	False	ref	-100	0.002825	40	0.013885
119	chr1	72837963	T	G	rs1525980	0.0462982638	0.0360279122491197	0.0462982638	0.0383809846993826	0.0256475800936709	0.0114037492351935	0.0013872796952626	0.0113102873702837	0.0013872796952626	0.0119343684344968	0.0570586831813607	0.8986737407158903	0.0029838689195607	0.3730307857914018	0.0029838689195607	0.385850833556232	0.0015733331787601	0.6867868795700457	9.430285063140512e-05	0.1673134776097069	9.430285063140512e-05	0.1759434999169073	0.0274235209908816	0.0381970447826082	0.0274235209908816	0.0393734154756625	NEGR1	555424	LRRIQ3	1360224	FPGT-TNNI3K	1360273	False	True	False	alt	60	0.01	60	0.02643
120	chr1	72950162	T	G	rs6682845	0.00967706808	0.3598343030725092	0.00967706808	0.371809656433723	0.0078551285670461	0.5740893449903495	8.460525300492243e-05	0.3824893204840823	8.460525300492243e-05	0.3939206954592231	0.0808825817695203	0.8494993917792812	0.0009737467687058	0.6136084066320825	0.0009737467687058	0.6281539151150637	0.0006873314081742	0.8473391807987279	9.084390989354376e-06	0.6129637350872006	9.084390989354376e-06	0.6274202726116231	0.0078880486312098	0.2392958536473239	0.0078880486312098	0.2455421787202848	NEGR1	667623	LRRIQ3	1248025	FPGT-TNNI3K	1248074	False	False	False	alt	50	0.001766	60	0.0558
121	chr1	73065515	C	T	rs11210117	0.000130717926	0.8769256535875207	0.0012557174059999	0.878186488023779	0.0065981224191703	0.8570364044976682	1.192727895972776e-06	0.9005177341766378	8.277079943639794e-06	0.9019107939428198	0.3510638077158476	0.4152397660913898	4.6598421967042495e-05	0.7599951209330883	0.0004206888898447	0.7609532381047958	0.0023143008714414	0.5492811582041403	4.162326749418518e-07	0.7946127175521229	2.772992757300138e-06	0.7956151080232783	5.3942468282860005e-05	0.8130672028804243	0.0009543667465429	0.8143163287107166	NEGR1	782976	LRRIQ3	1132672	FPGT-TNNI3K	1132721	False	False	False	alt	-100	0.003704	-20	0.01718
122	chr1	73068063	C	A	rs11210120	0.0101589546	0.3311867040105055	0.0101589546	0.3424867157644586	0.0122638490879658	0.154294992418419	0.0001252268136694	0.2592160830959387	0.0001252268136694	0.2686847960896243	0.1819686926212927	0.6860796534746492	0.0018228349515298	0.4454609869950042	0.0018228349515298	0.4589025370492057	0.0022358122650045	0.5589639910805446	2.2520464940679247e-05	0.3730675812722418	2.2520464940679247e-05	0.3850721755572539	0.0098237533584372	0.1830485400025089	0.0098237533584372	0.1890197296021873	NEGR1	785524	LRRIQ3	1130124	FPGT-TNNI3K	1130173	False	False	False	alt	60	0.001457	-100	0.02557
123	chr1	73078997	T	C	rs61773608	-8.045051920000015e-05	0.8029931210955246	0.0017779753847999	0.8063217640092739	0.0073265595057558	0.7187361602936455	-3.7074440354047696e-06	0.825517844776655	1.3939158275760445e-05	0.8283404087369084	0.0421850849075197	0.926412876032816	-1.4119975600413587e-05	0.9251188408738916	6.815409189520302e-05	0.9290356019103152	0.0003264497295205	0.9364198843414404	-2.3957831497667346e-07	0.931488949569674	5.654117955499756e-07	0.9361015923909	-2.2821813504297733e-05	0.7834867648053401	0.0011058205997987	0.786680618623304	NEGR1	796458	LRRIQ3	1119190	FPGT-TNNI3K	1119239	False	False	False	ref	5	0.0005455	-35	0.00209
124	chr1	73091210	A	T	rs4233100	-0.0027386738	0.7539258838702727	0.0027386738	0.7403416299891428	0.027515132134606	0.0061107701273105	-7.583186649506233e-05	0.438462265741019	7.583186649506233e-05	0.4268044296604689	0.0811170240355189	0.8571682724532452	-0.0002404883638396	0.8468357667537413	0.0002404883638396	0.8327485069709756	0.0022551489073205	0.5500709110862885	-6.646068211885745e-06	0.674521194729844	6.646068211885745e-06	0.6608547873253259	-0.0022469112750131	0.6411452477757283	0.0022469112750131	0.6284536335167559	NEGR1	808671	LRRIQ3	1106977	FPGT-TNNI3K	1107026	False	True	True	ref	-35	0.002808	-40	0.01405
125	chr1	73094184	G	A	rs12141350	-0.00048159498	0.7692191405520066	0.00231755098	0.7720592883533629	0.0065051676924083	0.8544543150835049	-3.968601183314865e-06	0.809224045868978	1.541933891285625e-05	0.8121034496400255	0.1611220033402835	0.7141582324361695	5.4661332163799945e-06	0.7699110077438779	0.0003379082153078	0.7736429578701319	0.0010492071813635	0.7786537431665017	-6.695241189351664e-08	0.8019789670480922	2.249027555808964e-06	0.8056692197843709	-0.00023236755568	0.616509514007698	0.0022738825091546	0.6187728273621513	NEGR1	811645	LRRIQ3	1104003	FPGT-TNNI3K	1104052	False	False	False	ref	100	0.02808	-70	0.02881
126	chr1	73095920	T	C	rs11210125	4.1870132000000005e-05	0.8376492146348777	0.001880332508	0.8344863498436367	0.0193953024295749	0.0310900199436251	-5.419892061887167e-06	0.6698835694953093	3.44340655918199e-05	0.6668895172448791	0.0186848411290573	0.9697716696639426	-1.98527585548914e-05	0.9612988542064418	3.968444282905025e-05	0.9615278389481616	0.000403386800617	0.9223007988899068	-5.477771628094054e-07	0.9302791865767924	8.381569911174258e-07	0.9271061128904114	-0.0002489652382286	0.8769548019231574	0.0006514590400314	0.8732116156124425	NEGR1	813381	LRRIQ3	1102267	FPGT-TNNI3K	1102316	False	False	False	alt	-20	0.002312	40	0.01292
127	chr1	73133797	G	A	rs4428835	-0.00420531184	0.4735500441056761	0.00708617736	0.4704096870895067	0.0065539102023122	0.8532593740777847	-3.0740366629680046e-05	0.5612200482260209	4.737410620699618e-05	0.5587782944114179	0.211956555565929	0.6393378985552438	-0.0009355730116837	0.5162794067770138	0.0015085756720768	0.5140353826674029	0.0014104063307217	0.7206053517229966	-6.908042105485471e-06	0.5761890575472639	1.0241337242106415e-05	0.574311608998814	-0.0040436104108963	0.303015973993418	0.0068942623886139	0.3009683095787097	NEGR1	851258	LRRIQ3	1064390	FPGT-TNNI3K	1064439	False	False	False	ref	-90	0.00779	-40	0.00537
128	chr1	73134581	G	T	rs7547148	0.01027959128	0.3341881925958841	0.01027959128	0.345726975673073	0.0293006575290631	0.0044230297335481	0.0003079010070086	0.0919907152966343	0.0003079010070086	0.0971565228373859	0.0219442110395335	0.961655004517049	0.0002438708778531	0.8227587104246243	0.0002438708778531	0.8369308299948631	0.0006477986075743	0.8729531945542351	7.323172455726455e-06	0.6428738597467234	7.323172455726455e-06	0.6565165237230138	0.0036431913194119	0.4792172081604813	0.0036431913194119	0.490617810961551	NEGR1	852042	LRRIQ3	1063606	FPGT-TNNI3K	1063655	False	True	False	alt	10	0.0007935	10	0.006813
129	chr1	73135379	C	T	rs12118367	0.001394834396	0.8340583149592319	0.001503709684	0.8424624735874126	0.0276420788767755	0.005864706424573	3.9027506249997e-05	0.5848727351727475	4.223818528620856e-05	0.5934841857548512	0.0085415823815599	0.9842121293947598	1.4807676856330262e-05	0.9665420443607056	1.5483072057967605e-05	0.9790359181712596	0.0002410751267666	0.95052940877193	4.3025450474512833e-07	0.9377446438133958	4.501715792340183e-07	0.94772788911177	0.0002634882104585	0.9294033211394656	0.0002676376310957	0.9417998795539684	NEGR1	852840	LRRIQ3	1062808	FPGT-TNNI3K	1062857	False	False	False	alt	100	0.004425	100	0.01672
130	chr1	73135616	T	C	rs12137150	-0.00254200555	0.7337860216105772	0.002605085338	0.723739267916044	0.034386470485273	0.0020947252410463	-9.241092227946882e-05	0.3824862470300224	9.417803568696082e-05	0.372933041681509	0.0165727860247512	0.9690546423734532	-4.458891575640541e-05	0.9537060287557696	4.565552489001941e-05	0.9460121899882786	0.0005743352983931	0.8805603140751733	-1.6337125414200316e-06	0.8634523357016017	1.6635924660480044e-06	0.8537720120687192	-0.00075519455596	0.8511239742382828	0.0007759416591457	0.8416316594166978	NEGR1	853077	LRRIQ3	1062571	FPGT-TNNI3K	1062620	False	True	False	ref	-100	0.005623	-100	0.01541
131	chr1	73144531	G	A	rs4391625	-0.0044266950799999	0.6325730500372945	0.0044266950799999	0.6188452587329215	0.0064019203616878	0.8867153474982528	-2.882371322902916e-05	0.7105568351340382	2.882371322902916e-05	0.6968084354742374	0.0051245344868722	0.9894556402763064	-2.4396388219785256e-05	0.9785095042099746	2.4396388219785256e-05	0.9666518433703556	3.295559668597499e-05	0.991855918954064	-1.602552795855652e-07	0.9844395766798372	1.602552795855652e-07	0.9729959033147249	-0.0004813327939086	0.911284593529708	0.0004813327939086	0.8971434618706254	NEGR1	861992	LRRIQ3	1053656	FPGT-TNNI3K	1053705	False	False	False	ref	55	0.02295	55	0.0219
132	chr1	73146005	C	T	rs57852356	-0.0410571554	0.0543259086124848	0.0410571554	0.0511610216667945	0.0085910372103387	0.4844348019259304	-0.0003710531681498	0.0851308791861135	0.0003710531681498	0.0806618921163635	0.0543947551323146	0.9060350158621672	-0.0027896780562606	0.4431660134859429	0.0027896780562606	0.4298595991955737	0.0004891168288969	0.9060970005186628	-2.5939042651798384e-05	0.4527883497302791	2.5939042651798384e-05	0.4402081724158743	-0.0239753524414153	0.0606237309433025	0.0239753524414153	0.0589246744120948	NEGR1	863466	LRRIQ3	1052182	FPGT-TNNI3K	1052231	False	False	False	ref	-95	0.003757	-45	0.00931
133	chr1	73148706	C	T	rs6424521	-0.066806601	0.0108567571822089	0.066806601	0.010258903516803	0.0167409746846392	0.055107055867751	-0.0011597568313343	0.0107891502304098	0.0011597568313343	0.0103449617948417	0.2384319339412234	0.5913608186739824	-0.0164206470923138	0.064951160081148	0.0164206470923138	0.0603324388122051	0.0040987976963382	0.2151525331976397	-0.0002907522095322	0.033401958962802	0.0002907522095322	0.0312701499623431	-0.0634031473355532	0.0018636593483176	0.0634031473355532	0.0018045446490934	NEGR1	866167	LRRIQ3	1049481	FPGT-TNNI3K	1049530	False	True	False	ref	-30	0.003693	-100	0.0484
134	chr1	73152946	A	G	rs4454488	0.0716438058	0.0071274413936474	0.0716438058	0.0075265628729553	0.0133343167563643	0.1195664478352465	0.0009876149689116	0.0123750510863499	0.0009876149689116	0.0130791438386394	0.2420128839510782	0.5873787680807574	0.0173796482364959	0.0500105746471085	0.0173796482364959	0.0543706256686982	0.003247111700974	0.3499156094458065	0.0002414034465269	0.0363094546920935	0.0002414034465269	0.0390968533090795	0.0667475803690909	0.001239345846063	0.0667475803690909	0.0012626774859696	NEGR1	870407	LRRIQ3	1045241	FPGT-TNNI3K	1045290	False	True	True	alt	60	0.01502	95	0.02759
135	chr1	73153069	A	G	rs4369180	-0.000840977992	0.8141663890474824	0.0021480781519999	0.8054722385413958	0.0139820191911724	0.1070479792743564	-1.0583123083462276e-05	0.7200050183384769	2.725437974849869e-05	0.7118646589516308	0.1685100467847176	0.7050811450419445	-0.0002058366890589	0.7913414764994084	0.0003636123646773	0.7818031590665581	0.0023552695620729	0.5295946163553962	-2.588498222864187e-06	0.729307382464052	4.600829705082506e-06	0.7199330828374558	-0.0007987634726501	0.6676650172566707	0.0019564518304131	0.6598496221692101	NEGR1	870530	LRRIQ3	1045118	FPGT-TNNI3K	1045167	False	False	False	ref	-65	0.003204	-85	0.01588
136	chr1	73153162	G	T	rs4633241	-0.000498272492	0.8141435310321523	0.001910929388	0.8214680518627027	0.0142484382708139	0.0953773207357254	-3.5628762134914475e-06	0.7392776079557075	2.4421815794675447e-05	0.7462426992652499	0.1603709582049605	0.7187607335645522	-2.1972592691813765e-05	0.8215609612066429	0.0002591371960621	0.830165534916229	0.0023289892701363	0.525667428378475	1.2151495748831946e-07	0.7669426907665853	3.3868166277116743e-06	0.7754915472447307	-0.0002240687144057	0.6986558974965116	0.0017386072469631	0.705241939542655	NEGR1	870623	LRRIQ3	1045025	FPGT-TNNI3K	1045074	False	False	False	ref	-100	0.002838	-100	0.0162
137	chr1	73153749	G	T	rs10399828	-0.0120401872	0.3064140786120036	0.0120401872	0.2956954890311483	0.0080153321661604	0.5753490862607825	-9.875328335857531e-05	0.342839066125318	9.875328335857531e-05	0.3324817695669014	0.071548460046266	0.8704691572794219	-0.0009105665034944	0.6416804620714488	0.0009105665034944	0.6275196496405364	0.0005778501891244	0.8776229064780537	-7.468461984136503e-06	0.652848085490158	7.468461984136503e-06	0.6388688242309597	-0.0088112947229742	0.2166595375739779	0.0088112947229742	0.2104440294598925	NEGR1	871210	LRRIQ3	1044438	FPGT-TNNI3K	1044487	False	False	False	ref	-90	0.001083	-100	0.0288
138	chr1	73156986	A	C	rs7528640	-0.00794857964	0.4442885996337894	0.00794857964	0.4322039541118926	0.0182817688083424	0.0378996326444201	-0.000147608508872	0.2576544065260105	0.000147608508872	0.2485014266799361	0.1529725412089336	0.7319451617037385	-0.0013457039546114	0.5700427252352478	0.0013457039546114	0.55658235861568	0.0028972734559672	0.4155759411040487	-2.581698999613803e-05	0.4117546664076928	2.581698999613803e-05	0.3996155273085151	-0.0074793306984511	0.276955043031596	0.0074793306984511	0.2690096181621312	NEGR1	874447	LRRIQ3	1041201	FPGT-TNNI3K	1041250	False	False	False	ref	-70	0.002357	-65	0.01616
139	chr1	73159766	T	C	rs11210151	0.000754873374	0.8803053217438653	0.00113153289	0.8828816946183731	0.0202654130277954	0.0258603859382166	1.8163170181293783e-05	0.7265318917709311	2.5575693244543088e-05	0.7297366828170831	0.1068787020612246	0.8143980072409647	8.291016235646706e-05	0.9026266010646132	0.0001142428392626	0.9051957533219276	0.0020855597873874	0.5918735745690074	1.998196706520944e-06	0.8207116330578538	2.575262071936049e-06	0.8234847270172905	0.0006639073019429	0.8134933515894985	0.0009751138497286	0.8164781724025497	NEGR1	877227	LRRIQ3	1038421	FPGT-TNNI3K	1038470	False	False	False	alt	100	0.01636	-5	0.0027
140	chr1	73161111	T	G	rs11210155	0.0125546738	0.2918029242859152	0.0125546738	0.3027452763955688	0.0134194067221365	0.1178088234636404	0.0001699925422911	0.2077979682829891	0.0001699925422911	0.2164220222265341	0.1405595493729187	0.7578325683358337	0.0018857207028792	0.4662717107928955	0.0018857207028792	0.4794092313565763	0.0019036019278141	0.6287296872679394	2.5691198616484908e-05	0.375535638616121	2.5691198616484908e-05	0.3875337472608658	0.0115353893712589	0.1566046783247249	0.0115353893712589	0.1613923219943481	NEGR1	878572	LRRIQ3	1037076	FPGT-TNNI3K	1037125	False	False	False	alt	100	0.01329	5	0.000351
141	chr1	73161541	C	G	rs11210158	-0.0008122753239999	0.8626037355619292	0.001359814644	0.8580950317613616	0.005868336246715	0.941121964679014	-4.59442873691954e-06	0.904003467322569	8.000925728834937e-06	0.9000474671681475	0.2583159576344153	0.5669669810696691	-0.0001992926760252	0.7848747940688873	0.0003583363178215	0.7759903145170786	0.0015269611367349	0.6978597348262593	-1.136302642331981e-06	0.8326371027469353	2.125787204107757e-06	0.8249632955926501	-0.0009294702227201	0.7576499674725178	0.0013361134451601	0.7487279638090277	NEGR1	879002	LRRIQ3	1036646	FPGT-TNNI3K	1036695	False	False	False	ref	-85	0.01588	-100	0.0209
142	chr1	73161542	C	A	rs11210159	0.002431832838	0.7175624942646666	0.002840162922	0.7232642882672696	0.0076013731876178	0.6451921483879843	1.86535962334696e-05	0.7368505242695857	2.1550109877506333e-05	0.7421199837097905	0.2606749032666314	0.5632348131301608	0.0006587670428753	0.6630763448495158	0.0007664402379003	0.6693081536521623	0.0019672409377697	0.6123324260675242	5.017681761269067e-06	0.6817653855257503	5.780178657321303e-06	0.6876154267370197	0.002213715909916	0.5942259138258954	0.002533221298976	0.599723231435321	NEGR1	879003	LRRIQ3	1036645	FPGT-TNNI3K	1036694	False	False	False	alt	-100	0.01648	-100	0.02773
143	chr1	73163039	C	T	rs6666765	-0.0012233010919999	0.8529262146596476	0.001544475292	0.8449847199936592	0.0086421028835433	0.4714286492120204	-9.73244004399914e-06	0.8535255454138893	1.2617827955203398e-05	0.8457954777220349	0.0642973474828576	0.8878746539028882	-7.838414860122697e-05	0.9170732702108016	0.0001025590883827	0.9094346854929768	0.00054989368856	0.8881798587825981	-6.206965907931163e-07	0.9184864016456638	8.378811537418826e-07	0.9108747093979064	-0.0009896368219587	0.7886222605008386	0.0011722113299929	0.7808818590571379	NEGR1	880500	LRRIQ3	1035148	FPGT-TNNI3K	1035197	False	False	False	ref	-85	0.00604	-90	0.09125
144	chr1	73163824	G	T	rs11210163	-0.00443472596	0.6299273289599296	0.00443472596	0.6166132877787864	0.0140036793991532	0.103448599317266	-5.847898901373269e-05	0.5029383165850994	5.847898901373269e-05	0.490586225639565	0.1226382016410958	0.7850675099913781	-0.0004996199395344	0.7392343974216813	0.0004996199395344	0.7250260458341021	0.0017962863711851	0.6346467409539719	-6.773946614938761e-06	0.6580190427386129	6.773946614938761e-06	0.6441340860825738	-0.003875558875092	0.4712536605099705	0.003875558875092	0.4602957533462483	NEGR1	881285	LRRIQ3	1034363	FPGT-TNNI3K	1034412	False	False	False	ref	50	0.01636	-40	0.02116
145	chr1	73170489	C	A	rs4492565	-0.0006442166599999	0.6679594592393386	0.00391489542	0.6651823812814024	0.0090719295068677	0.4144954483502566	-5.3251588766631164e-06	0.6547005865645775	3.7081890836000805e-05	0.6519621509477826	0.1461986120187968	0.7456385181114232	-9.449046379724005e-05	0.7082377355064085	0.0006782375912935	0.7048904516851108	0.0013434237756346	0.7335076680785678	-7.791010817494738e-07	0.700422667714455	6.494673597625844e-06	0.6970969712199115	-0.0006991773773587	0.5002580583424556	0.0036950590773763	0.4979573907982606	NEGR1	887950	LRRIQ3	1027698	FPGT-TNNI3K	1027747	False	False	False	ref	-85	0.00187	-70	0.02179
146	chr1	73172117	C	A	rs4650196	0.01065464386	0.330166912758307	0.01065464386	0.3415593093432916	0.0145246960354883	0.0893143271874311	0.0001567927002043	0.2127888281352208	0.0001567927002043	0.2216607645556872	0.0363323270988287	0.93640761549837	0.0004085754607674	0.7608195748752636	0.0004085754607674	0.7751376499854695	0.000509312448256	0.896444199213409	5.821528121504594e-06	0.6807441650925169	5.821528121504594e-06	0.6948765730863611	0.0049336611375636	0.3859951504661399	0.0049336611375636	0.3959023485068063	NEGR1	889578	LRRIQ3	1026070	FPGT-TNNI3K	1026119	False	False	False	alt	60	0.000909	-90	0.03372
147	chr1	73173151	A	C	rs6695455	0.0096254322999999	0.3807219917966889	0.0096254322999999	0.3930430055787796	0.0084713842917384	0.5048583487936074	7.923640463769439e-05	0.4056457243186004	7.923640463769439e-05	0.4170376983668667	0.0284982209359017	0.947413667829604	0.0003242534806275	0.8003382761255866	0.0003242534806275	0.8146549974961577	0.0002398245827124	0.947974408370596	2.67787429034074e-06	0.8023349864677017	2.67787429034074e-06	0.8168017825223332	0.003977219680702	0.4470972763371879	0.003977219680702	0.4578460299530108	NEGR1	890612	LRRIQ3	1025036	FPGT-TNNI3K	1025085	False	False	False	alt	-100	0.0016575	85	0.00598
148	chr1	73173633	T	C	rs6698500	0.0181119751	0.207226018385425	0.0181119751	0.2167228369954842	0.0106561045491836	0.2550574145579875	0.000195393073041	0.1771368899291092	0.000195393073041	0.1852193661813002	0.1929190136827145	0.6711347577664609	0.0035148064042502	0.3144402613779321	0.0035148064042502	0.3264995666713343	0.0020399365858507	0.6031701007150831	3.786528387912136e-05	0.2821866098840598	3.786528387912136e-05	0.2931210830653545	0.0179483189659643	0.0951999344639775	0.0179483189659643	0.0978986348578272	NEGR1	891094	LRRIQ3	1024554	FPGT-TNNI3K	1024603	False	False	False	alt	100	0.01218	-50	0.03485
149	chr1	73174844	A	G	rs12124553	0.0516755282	0.0239941744017629	0.0516755282	0.0255584235995422	0.0113228194654907	0.2200219952710832	0.0006370434101802	0.0323038153453043	0.0006370434101802	0.0341848234457524	0.0762373053662382	0.8616168349795158	0.0043392507031119	0.2877079263914143	0.0043392507031119	0.3000849778941847	0.0009458843166055	0.7985543239048228	5.7802332176984825e-05	0.2370784402094946	5.7802332176984825e-05	0.2479735336676465	0.0339339619705598	0.0148022860093741	0.0339339619705598	0.0152811123945145	NEGR1	892305	LRRIQ3	1023343	FPGT-TNNI3K	1023392	False	False	False	alt	-25	0.003489	-25	0.01453
150	chr1	73176803	A	G	rs12126688	0.0269262256	0.1186129199811651	0.0269262256	0.125581676441546	0.0087998409362773	0.4626330458169919	0.0002381384506964	0.1370606447682136	0.0002381384506964	0.1440388058765252	0.0623533439143559	0.8853136615019408	0.0016905468538123	0.4915355403956679	0.0016905468538123	0.5051827972441563	0.0005363075065199	0.8856470080521696	1.4534361851477593e-05	0.495878721414061	1.4534361851477593e-05	0.5088216036572243	0.0157760972624197	0.1002844312351055	0.0157760972624197	0.1032365571661914	NEGR1	894264	LRRIQ3	1021384	FPGT-TNNI3K	1021433	False	False	False	alt	-25	0.0009327	80	0.01643
151	chr1	73179104	C	A	rs4503305	0.002529946674	0.733662781351707	0.002529946674	0.7472277421498248	0.0200333881938456	0.0264847327964328	4.897662655765163e-05	0.527928720446651	4.897662655765163e-05	0.5405614435319873	0.172742455834604	0.696778144244616	0.0004104709810698	0.7385441144093995	0.0004104709810698	0.7528319827761127	0.0035360631470067	0.2987652719665575	8.10763241367034e-06	0.5985469007552986	8.10763241367034e-06	0.6123788333441642	0.0023402732393489	0.6003870847941459	0.0023402732393489	0.6129034545989145	NEGR1	896565	LRRIQ3	1019083	FPGT-TNNI3K	1019132	False	False	False	alt	70	0.005917	-5	6.104e-05
152	chr1	73181248	C	T	rs4641264	0.0105155081799999	0.33955785213092	0.0105155081799999	0.3512622597865457	0.0064413903933938	0.8848873594961217	6.903810562486103e-05	0.4391091023212075	6.903810562486103e-05	0.4508355810875681	0.5746532640380086	0.0726613421830413	0.0060558741665432	0.2059894276376159	0.0060558741665432	0.2166078930238048	0.0036969294129662	0.3038334942879934	3.9713482265516046e-05	0.2746402242330221	3.9713482265516046e-05	0.2856461112098515	0.0017614290604673	0.6767941697080049	0.0017614290604673	0.6899380501711054	NEGR1	898709	LRRIQ3	1016939	FPGT-TNNI3K	1016988	False	False	False	alt	-95	0.007256	60	0.05774
153	chr1	73181316	G	A	rs4578169	-0.0528971598	0.0261216064981672	0.0528971598	0.0246954923153314	0.0236412550362712	0.0129535484271724	-0.0013508853770604	0.0100939055065081	0.0013508853770604	0.0095746679121825	0.5647651946596957	0.0839839336718299	-0.0297400653435273	0.0182071625723538	0.0297400653435273	0.0169596470867297	0.0133073782681922	0.0046907063504695	-0.0007563302268201	0.007998625123454	0.0007563302268201	0.0075093979025594	-0.0111806139067832	0.1883015235590809	0.0111806139067832	0.1829183519929824	NEGR1	898777	LRRIQ3	1016871	FPGT-TNNI3K	1016920	False	True	False	ref	-95	0.00832	-5	0.006958
154	chr1	73181365	T	C	rs7514409	0.0223595088	0.1341296601143294	0.0223595088	0.1411664047410417	0.0139183044067092	0.1015931865263097	0.0003301132129214	0.0883913618637312	0.0003301132129214	0.093009243994035	0.5615950372929179	0.0878819647875261	0.0126033836448408	0.0847159749245489	0.0126033836448408	0.0907036246025554	0.0078280887521879	0.0328457410480723	0.0001864575184103	0.0582768740499882	0.0001864575184103	0.0623351234338117	0.0043382192761335	0.4083267649052695	0.0043382192761335	0.4185844662471559	NEGR1	898826	LRRIQ3	1016822	FPGT-TNNI3K	1016871	False	False	False	alt	-100	0.000309	-55	0.03906
155	chr1	73256777	C	G	rs4074990	0.00875923234	0.3761647261742344	0.00875923234	0.3879772979236249	0.0076060553219868	0.6275273134431075	6.687819235810514e-05	0.4266657252637835	6.687819235810514e-05	0.4382976441862926	0.1322627828089502	0.767104081547718	0.0011619455283479	0.544606155141596	0.0011619455283479	0.5584303152416015	0.0010226293602935	0.7842490695940902	9.030706507551173e-06	0.5662430920763883	9.030706507551173e-06	0.5797940448031957	0.0082241517028184	0.2250877092070462	0.0082241517028184	0.2324122206185148	LRRIQ3	941410	FPGT-TNNI3K	941459	FPGT	941462	False	False	False	alt	-95	0.01999	-65	0.0394
156	chr1	73310990	G	A	rs6424546	0.01160457528	0.3172085997102332	0.01160457528	0.3289573135058665	0.0080223103089632	0.588869598182307	9.512988431515484e-05	0.3501589694609653	9.512988431515484e-05	0.3615526466217568	0.2291766512100747	0.6091362986347385	0.0027649077159691	0.3825026050931177	0.0027649077159691	0.395880726269124	0.0018411507454866	0.6346845353487639	2.267454527320754e-05	0.4010305496279106	2.267454527320754e-05	0.4138271869050939	0.0106100685691759	0.1821752632361273	0.0106100685691759	0.1868720004897251	LRRIQ3	887197	FPGT-TNNI3K	887246	FPGT	887249	False	False	False	alt	-10	0.001366	60	0.011566
157	chr1	73317255	C	T	rs11210207	-0.0375282096	0.0668189476464495	0.0375282096	0.0629057135132011	0.0111707367886821	0.2148366438307661	-0.000434644315862	0.0621361803980327	0.000434644315862	0.0587257747569027	0.0674612807186796	0.882238956438357	-0.0028988550913155	0.4049404319594347	0.0028988550913155	0.3922725490722938	0.0007978104355128	0.8411195012930924	-3.531953180909166e-05	0.3551039584726863	3.531953180909166e-05	0.3433615937564338	-0.025890310065457	0.0490683133080574	0.025890310065457	0.0476990634438676	LRRIQ3	880932	FPGT-TNNI3K	880981	FPGT	880984	False	False	False	ref	-40	0.000519	-15	0.00586
158	chr1	73318394	A	G	rs7517355	-0.0030379236599999	0.7343935008024587	0.0030379236599999	0.7208560774897329	0.0107080870406829	0.2392432787749995	-3.3641806439200824e-05	0.6708704672768747	3.3641806439200824e-05	0.6578548897252907	0.1006504216848721	0.8243188713382233	-0.0003474719574339	0.8088799913678872	0.0003474719574339	0.7948035869897208	0.0010946931376965	0.7823754675488249	-3.89965407860161e-06	0.7768228089997257	3.89965407860161e-06	0.762831877805446	-0.0026950487038246	0.592641437921208	0.0026950487038246	0.580458923032178	LRRIQ3	879793	FPGT-TNNI3K	879842	FPGT	879845	False	False	False	ref	-85	0.002554	-65	0.02734
159	chr1	73321175	G	T	rs10732841	0.00377253172	0.6490315008864528	0.00377253172	0.66223776752606	0.0242013129749174	0.0115206762838914	8.834524477175036e-05	0.3570604885759258	8.834524477175036e-05	0.3678499254210164	0.1058537951638502	0.8149924201599286	0.0003829672599755	0.7537640630148758	0.0003829672599755	0.7677957686035853	0.002602189486281	0.4756099720654811	9.082562198609834e-06	0.573945750585711	9.082562198609834e-06	0.5873607414909447	0.003255220489839	0.5026993326337115	0.003255220489839	0.5142112361909461	LRRIQ3	877012	FPGT-TNNI3K	877061	FPGT	877064	False	True	False	alt	-75	0.002167	50	0.01273
160	chr1	73327947	A	G	rs1885247	-0.0202304324799999	0.1709552554996934	0.02256275088	0.1648341460974223	0.0102550497785174	0.2900146493415332	-0.0002513205636488	0.1477263775113911	0.0002657881327495	0.1429401662879685	0.4595130654882312	0.2338186715162966	-0.008793572170403	0.1445191878029323	0.0099229679353836	0.1383000011031058	0.0046917370000576	0.1655354791643077	-0.0001103813021858	0.1282927120192961	0.000117387040063	0.1235134937813409	-0.0103673274619031	0.2328437439348754	0.0109606946130146	0.2290528929769119	LRRIQ3	870240	FPGT-TNNI3K	870289	FPGT	870292	False	False	False	ref	-20	0.001869	-100	0.08594
161	chr1	73344546	G	A	rs2208565	-0.044835688	0.0401253760898141	0.044835688	0.0374923980508404	0.0092475592759362	0.3812311979840623	-0.0004177209423042	0.0594142495586247	0.0004177209423042	0.055982354275408	0.3347628087428292	0.4358347573582127	-0.0148947650354712	0.0751518490808438	0.0148947650354712	0.0697241591232724	0.0031098042976044	0.3886490625541552	-0.0001394831508036	0.0845665974477072	0.0001394831508036	0.0791585450961661	-0.032508635981701	0.0219062193345399	0.032508635981701	0.0213147288237798	LRRIQ3	853641	FPGT-TNNI3K	853690	FPGT	853693	False	False	False	ref	100	0.00272	-50	0.0664
162	chr1	73355410	T	C	rs2340399	0.0449764342	0.0345418263681374	0.0449764342	0.0371842680242306	0.0107829338304479	0.2396800227514844	0.0005052623160564	0.0422543608758948	0.0005052623160564	0.0450307271157616	0.0777082749821055	0.8662015147030977	0.0037512953755907	0.3173239032300373	0.0037512953755907	0.3293877018545115	0.0008557984572235	0.8295538857724454	4.311969563714066e-05	0.2862019188522363	4.311969563714066e-05	0.2972780517690536	0.0307077874251807	0.0268460962737612	0.0307077874251807	0.0275461529820743	LRRIQ3	842777	FPGT-TNNI3K	842826	FPGT	842829	False	False	False	alt	-90	0.00987	-85	0.0547
163	chr1	73358596	G	A	rs10890034	-0.0537832478	0.0230260294113473	0.0537832478	0.0215034674057869	0.0118982214002804	0.1776973074830871	-0.0006558808179047	0.0285340521241445	0.0006558808179047	0.0268306532332041	0.0489382669944708	0.9092523266762046	-0.0027773737142093	0.3974145069624974	0.0027773737142093	0.3848253914238655	0.0005602338818721	0.8827667667618415	-3.234401948214948e-05	0.3416827328084963	3.234401948214948e-05	0.3302547637524802	-0.0268322285500886	0.0399730056751106	0.0268322285500886	0.0388930522643532	LRRIQ3	839591	FPGT-TNNI3K	839640	FPGT	839643	False	False	False	ref	-100	0.02354	75	0.031
164	chr1	73363940	G	C	rs6689032	-0.001484158332	0.5980480895926262	0.004694780068	0.5976245838053926	0.0067703061990501	0.8191581821201502	-9.653312153520784e-06	0.6626390460843129	3.2881015022922934e-05	0.6632523018517461	0.0091183518501229	0.9820363006375032	-7.877380457802982e-06	0.9527487585890564	3.4965435594748214e-05	0.9555392075107884	6.08742904114007e-05	0.9855651013203705	-5.083192586922988e-08	0.959516598127676	2.43379589955016e-07	0.9623362578397264	-0.0001929480596271	0.8565073801662005	0.0006908785360843	0.8587545974583812	LRRIQ3	834247	FPGT-TNNI3K	834296	FPGT	834299	False	False	False	ref	85	0.001114	100	0.01868
165	chr1	73384090	T	A	rs1923228	0.00781540974	0.4171990402973821	0.00781540974	0.4293702214753377	0.0178727006502875	0.0427275760388874	0.0001353321457031	0.2408461205727661	0.0001353321457031	0.2501362017134327	0.0409879770537038	0.9275896826665756	0.0002817816427956	0.7957581713625342	0.0002817816427956	0.8099083577792754	0.0007769319775454	0.8388112043027727	5.208292253078648e-06	0.6866508346330438	5.208292253078648e-06	0.7004219356831817	0.0035685017479434	0.4771199351162813	0.0035685017479434	0.4885457654673578	LRRIQ3	814097	FPGT-TNNI3K	814146	FPGT	814149	False	False	False	alt	15	0.005585	-55	0.02252
166	chr1	73389332	C	A	rs11210227	0.00134575424	0.7223737801144755	0.00293174092	0.7263639696366972	0.0186336379886734	0.0389233516194664	4.043441277690039e-05	0.5073244260008982	6.091374302873909e-05	0.5125765377500034	0.1084347348001534	0.8114921604992409	0.000152227583519	0.7919405992554084	0.0003339809372562	0.7950929947160619	0.0020300260792293	0.5886285072077304	4.6258552986920855e-06	0.6594689684827967	6.960553312758769e-06	0.6639103753921453	0.0014688949055488	0.5680769647454569	0.0028008589300718	0.5718792897612441	LRRIQ3	808855	FPGT-TNNI3K	808904	FPGT	808907	False	False	False	alt	-25	0.001436	50	0.03674
167	chr1	73390408	A	C	rs55994666	-0.00622541446	0.5188304765100595	0.00622541446	0.5060869553447248	0.0331586739165602	0.0025709983073932	-0.0002112824932028	0.168096540528661	0.0002112824932028	0.1607041024785752	0.2024211869417732	0.6520192440094517	-0.001329151925329	0.562484398290213	0.001329151925329	0.5488183237786162	0.006501375907776	0.0669441549238096	-4.395934128063841e-05	0.2769058606442195	4.395934128063841e-05	0.2659251102227758	-0.0058008900507265	0.3445853036549661	0.0058008900507265	0.3352393817686437	LRRIQ3	807779	FPGT-TNNI3K	807828	FPGT	807831	False	True	True	ref	-50	0.01584	90	0.04654
168	chr1	73469042	T	A	rs11210258	0.000120660338	0.9061024690011692	0.000910360058	0.9147089939907797	0.0140592480228607	0.1032596094202002	2.788401637558669e-06	0.8490925736553567	1.2535324315015836e-05	0.8574672397650329	0.2085249846990113	0.6461977579529927	2.12622247537347e-05	0.8511172189333971	0.0002128483093054	0.8596871574604209	0.0029196412762408	0.4323819868264232	5.569323329789299e-07	0.7992853029579876	2.921596703539733e-06	0.8077097820445983	0.0001784250873971	0.833826692596759	0.0008174358655172	0.8421854551080673	LRRIQ3	729145	FPGT-TNNI3K	729194	FPGT	729197	False	False	False	alt	-25	0.00775	100	0.04318
169	chr1	73495142	A	G	rs1546271	-0.0014646207306	0.8271889042597036	0.0018297345894	0.8238650914764384	0.0184276270348664	0.0370352223666078	-2.9087679600331195e-05	0.6608857538676338	3.528959937374625e-05	0.6562276507274233	0.2019398541478645	0.6512763531235608	-0.0003085890961043	0.8006029755210724	0.0003679842923503	0.7969487747535147	0.0037194572857165	0.288312942462867	-6.123613795015716e-06	0.680095508691252	7.131101827159318e-06	0.6754229400052632	-0.0013070675007001	0.7209863544235782	0.001622423469123	0.7170313191885066	LRRIQ3	703045	FPGT-TNNI3K	703094	FPGT	703097	False	False	False	ref	-60	0.00461	30	0.0047
170	chr1	73517390	G	T	rs11210274	-0.00887152998	0.4220575284319903	0.0101401838199999	0.4160479326336401	0.0110077168230879	0.2415927958127053	-0.0001281059745229	0.3417006385782352	0.000137573313499	0.3366127142200438	0.1760972624197346	0.6949608548717037	-0.0020816575155045	0.4963000386142759	0.0022407339471515	0.4909304016112213	0.0020827939316695	0.5736055917805719	-3.01524840652841e-05	0.4294470020795461	3.135483498275906e-05	0.4238392617407631	-0.0084129503418085	0.2728943370000173	0.0095374433344743	0.2706925167876557	LRRIQ3	680797	FPGT-TNNI3K	680846	FPGT	680849	False	False	False	ref	-100	0.002098	15	0.01288
171	chr1	73522466	C	T	rs12042444	-0.001354365392	0.7807397957041036	0.002399752432	0.7817238498081859	0.017815919554064	0.0473741318974633	-1.1144379420983847e-05	0.6788218081935421	3.180078763685935e-05	0.6797471880586103	0.2265044243197543	0.6099869840222737	-0.0004426112182824	0.7410416723818133	0.0006657558875199	0.7402899222987998	0.0041592656663475	0.2188833426310538	-4.140269972270293e-06	0.6552515793154751	8.540622017042895e-06	0.6542210490006999	-0.0009377690639944	0.6695751692000648	0.0020788597392088	0.6696263953339332	LRRIQ3	675721	FPGT-TNNI3K	675770	FPGT	675773	False	False	False	ref	-100	0.0433	-100	0.007294
172	chr1	83724992	A	G	rs5006353	0.0289226398	0.0981574983577049	0.0289226398	0.1044339680476356	0.0090151052307575	0.4148211004433915	0.0002625137198067	0.1098387735719222	0.0002625137198067	0.1159666214478698	0.2179628419381943	0.6297411830982358	0.0063785226807301	0.1859228229063561	0.0063785226807301	0.1961365372239164	0.0019772035598606	0.6087036022310321	5.822471781940083e-05	0.18934731969208	5.822471781940083e-05	0.1989185807233662	0.0271683316216972	0.032046546551349	0.0271683316216972	0.032869501177301	TTLL7	274158	PRKACB	353071	SAMD13	573375	False	False	False	alt	-90	0.00858	-100	0.1388
173	chr1	83753003	G	T	rs17577938	-0.008351123	0.4319714020782881	0.008351123	0.4199066502662165	0.018446443175465	0.0362820153385863	-0.0001501441209754	0.24495572468093	0.0001501441209754	0.2360452016533497	0.2261454994346413	0.6127149278225089	-0.0018464546382218	0.4826580307144344	0.0018464546382218	0.4694381367420876	0.0041450603513458	0.2283131393690384	-3.304902912363452e-05	0.320355251708676	3.304902912363452e-05	0.3093312954756988	-0.0072324401705411	0.2716595649500896	0.0072324401705411	0.2639372068081636	TTLL7	246147	PRKACB	325060	SAMD13	545364	False	False	False	ref	-80	0.0065	-100	0.0562
174	chr1	83801500	C	G	rs761406	-0.00178621618	0.6946278285165848	0.00325129806	0.686979159175689	0.0071232796234748	0.774030140365494	-1.2806932687120949e-05	0.7415413450215901	2.2896305979784786e-05	0.7340109316292399	0.1158850195541447	0.7966946963963093	-0.0002317764280378	0.7686847342693571	0.0003729971970736	0.7606110540816432	0.0008309807000191	0.8309033539606945	-1.6686112623276192e-06	0.7964362113017687	2.6411364610893527e-06	0.788453218358382	-0.001981348354236	0.5428591507009113	0.0029979564103361	0.5362797024405977	TTLL7	197650	PRKACB	276563	SAMD13	496867	False	False	False	ref	-35	0.00607	85	0.0245
175	chr1	96439584	A	G	rs12756558	0.0352119374	0.0666021490537872	0.0352119374	0.0713546438774323	0.0082624958945147	0.5407362102171415	0.0002943306805056	0.0971004629604501	0.0002943306805056	0.1026745465592677	0.4449838691272731	0.2614491488176255	0.0157049074816011	0.0600567372492408	0.0157049074816011	0.0653348235338727	0.0036725726769717	0.302561138730288	0.0001311687395119	0.0813021595379374	0.0001311687395119	0.0872523989571133	0.0158009937862425	0.1056435983658198	0.0158009937862425	0.1088438932528315	PTBP2	282082	RWDD3	1205373	TLCD4-RWDD3	1321660	False	False	False	alt	90	0.002121	-70	0.057
176	chr1	96648359	T	G	rs12071951	0.00223051168	0.6119091659131527	0.00415814472	0.617449145743757	0.0092594975089179	0.3869419617238147	1.859938671824946e-05	0.5879406298266339	3.866874530864255e-05	0.5932811004558293	0.0491768586811066	0.9107763818198586	0.0001598993057123	0.8298746912009142	0.0002171689971291	0.8368584684547059	0.0004566865443206	0.9022969334486072	1.4142318766635738e-06	0.8202814398979793	2.010489545341525e-06	0.8272909204782756	0.001491716719053	0.5578172975898911	0.0027365429101961	0.564136824232009	PTBP2	73307	DPYD	1346641	RWDD3	1414148	False	False	False	alt	80	0.002022	50	0.0116
177	chr1	96650059	G	T	rs7528506	-0.0015457800079999	0.7881929912209814	0.0023618452079999	0.7795354703866602	0.0082120571091107	0.556731537956955	-1.2246590414680307e-05	0.7967140619078941	1.8745170470791188e-05	0.7882277076267126	0.1277212419215966	0.776788500023939	-0.0002471734258075	0.8127327514795216	0.0003110540443174	0.8034895191855976	0.0010591493538145	0.78682740505752	-1.96518722347531e-06	0.8206418722848456	2.473888404020884e-06	0.8114626579866976	-0.0013589352586644	0.6640050035794943	0.0019564518304131	0.6559861153442238	PTBP2	71607	DPYD	1344941	RWDD3	1415848	False	False	False	ref	-75	0.002506	-95	0.03232
178	chr1	96650984	T	G	rs59012322	-0.0054396021999999	0.5668083588271894	0.0054396021999999	0.5536011578065756	0.011214920584867	0.2092873014647902	-6.0664786420362506e-05	0.4893725888183488	6.0664786420362506e-05	0.4774355533008731	0.4096992707393229	0.320906930756323	-0.0022164779801788	0.4365360956886412	0.0022164779801788	0.4233175150973187	0.0045966200734318	0.1795104644413062	-2.473134247096529e-05	0.3818602876018385	2.473134247096529e-05	0.3699473052827395	-0.0025975373188517	0.5946474406468281	0.0025975373188517	0.5823726145944116	PTBP2	70682	DPYD	1344016	RWDD3	1416773	False	False	False	ref	-55	0.004166	35	0.06073
179	chr1	96652079	C	T	rs6659919	-0.00137621924	0.7398337996393977	0.00307634084	0.7315993475729281	0.0095322599737088	0.3419121960726027	-9.723866257143332e-06	0.7111106323056411	2.93725640878543e-05	0.7034598375008332	0.3975850371891825	0.3393901191687513	-0.0005044742725186	0.5863795912266825	0.0011960111720867	0.5780534541653836	0.0038084652540391	0.2740168648380674	-3.5189935023337785e-06	0.5672827563752922	1.1511245399552713e-05	0.559571446904286	-0.0008962748576229	0.7057805132342746	0.0017718026120602	0.6975306112796289	PTBP2	69587	DPYD	1342921	RWDD3	1417868	False	False	False	ref	100	0.00209	10	0.012726
180	chr1	96664630	A	G	rs12042074	-0.00246796154	0.6980377116444031	0.00344942262	0.690303980295738	0.0082499956020277	0.5372511524864663	-2.000125850908154e-05	0.7152031617742356	2.770055822933121e-05	0.7076905579090099	0.0356933163207086	0.9375730410513378	-0.0001619011721522	0.8932894811385148	0.0001726831021892	0.8853561807195375	0.000293745763305	0.9404406142199844	-1.3016837382221114e-06	0.899159970650285	1.3862650969887418e-06	0.8913175322261042	-0.0018506416041659	0.6864790831652006	0.0020498137947488	0.6783449947418714	PTBP2	57036	DPYD	1330370	RWDD3	1430419	False	False	False	ref	-100	0.002861	50	0.02025
181	chr1	96667513	A	G	rs6688086	0.00258996054	0.6812393764836635	0.0036704377	0.6910573967174938	0.0086788621351717	0.4722335452934008	2.3844433375295988e-05	0.6641654888120857	3.3634719902922584e-05	0.6738797854298864	0.0397120302077821	0.9316921598474296	7.908991365440398e-05	0.8776877915981942	0.000151473666594	0.8875784432876862	0.0003577705678072	0.9299906997627048	7.690681366190911e-07	0.8728713797780622	1.4249428904589915e-06	0.8829341624407526	0.0009211713814458	0.6879373559102596	0.0017469060882373	0.6967043589302185	PTBP2	54153	DPYD	1327487	RWDD3	1433302	False	False	False	alt	95	0.00813	15	0.001312
182	chr1	96678583	C	T	rs12027165	-0.0437154774	0.0415122947289089	0.0437154774	0.0389252602926652	0.0112044508084682	0.225607511541492	-0.0005111509468525	0.0450037593878475	0.0005111509468525	0.0425386419248258	0.4246683056878183	0.2862148431614771	-0.018437746562172	0.0522988211097385	0.018437746562172	0.048360853355708	0.0046354985549808	0.1727171131754889	-0.0002095281791846	0.0502924464544881	0.0002095281791846	0.0469415373277029	-0.0213466944677848	0.0508190972295035	0.0213466944677848	0.0494149648484987	PTBP2	43083	DPYD	1316417	RWDD3	1444372	False	False	False	ref	100	0.04367	-60	0.01245
183	chr1	96687003	T	C	rs1496116	0.0285118369999999	0.1062312092904086	0.0285118369999999	0.1127069573003289	0.0089246869585489	0.4354160912113326	0.000262213334682	0.1233368014577476	0.000262213334682	0.1297290643988214	0.2290355709084118	0.6091765460839583	0.0068750118968363	0.1875412559530722	0.0068750118968363	0.1980546307873045	0.002082879578801	0.5900866972984616	6.399360719130668e-05	0.1934478277132928	6.399360719130668e-05	0.2032765664578322	0.0254566956088755	0.0387413862310237	0.0254566956088755	0.0397051927427521	PTBP2	34663	DPYD	1307997	RWDD3	1452792	False	False	False	alt	60	0.002792	100	0.00943
184	chr1	96708350	T	C	rs12031518	0.0301399101999999	0.0904883499328615	0.0301399101999999	0.0964114375096187	0.0069619833510904	0.7202461913616894	0.0002147801571514	0.146602839118336	0.0002147801571514	0.1538887083881913	0.214296828805278	0.6355216024316985	0.0065158214437894	0.1818882954956835	0.0065158214437894	0.1916762523450408	0.0014841588017936	0.7031769203850353	4.611352532128189e-05	0.2327139920409205	4.611352532128189e-05	0.2428572601669118	0.028317721138186	0.0278179195639424	0.028317721138186	0.0285621183261079	PTBP2	13316	DPYD	1286650	RWDD3	1474139	False	False	False	alt	-100	0.003536	-40	0.02542
185	chr1	96713505	T	G	rs2132427	-0.002591315648	0.7419228844118402	0.0027339060479999	0.7320920132186942	0.020718072261898	0.0226893243849702	-5.078792759562636e-05	0.5489560497420048	5.396214717453528e-05	0.5396774123464727	0.1563356466353385	0.7294036217203476	-0.0004402838094177	0.7724801378978011	0.0004582423985426	0.762581490882434	0.0032442349469372	0.3714660305491087	-8.59420405795199e-06	0.6349606174475693	8.993982062988693e-06	0.6250538086538108	-0.0024149628108175	0.6055871396029137	0.0025809396363032	0.5969770605981413	PTBP2	8161	DPYD	1281495	RWDD3	1479294	False	False	False	ref	-100	0.004143	-100	0.04895
186	chr1	96818940	C	A	rs10875035	-0.00574127226	0.5855111337403099	0.00574127226	0.5722885452389876	0.0096362462298734	0.3433828991637412	-5.364324810413115e-05	0.5678623933048225	5.364324810413115e-05	0.5552909593791554	0.0521914127739913	0.9044031655756862	-0.0002861430753784	0.8477915306335284	0.0002861430753784	0.8336419646482305	0.0005007119703282	0.8934681291203179	-2.6513626054697284e-06	0.8379048036502517	2.6513626054697284e-06	0.823702110703779	-0.0033112376684405	0.5370722353002814	0.0033112376684405	0.5254167592846656	PTBP2	97274	DPYD	1176060	RWDD3	1584729	False	False	False	ref	-100	0.01576	-100	0.04102
187	chr1	97332630	A	G	rs12407539	-0.002269629616	0.4708316179448907	0.007849476016	0.4647217293495902	0.010004719385392	0.3359213646276908	-2.2459600834685345e-06	0.4670523350969976	7.941428501718853e-05	0.4620543857340042	0.0935445388437639	0.8336929665235168	-5.477961290289834e-05	0.6947011850326399	0.000769516723855	0.6870239386716663	0.0009881527405549	0.7981931633821632	1.5516721575271097e-06	0.6726269657319658	8.33302038370058e-06	0.6655883915260301	-0.0008610047822072	0.3545259145094057	0.0063672859676967	0.3494501800059848	PTBP2	610964	DPYD	662370	SNX7	1329072	False	False	False	ref	35	0.003325	100	0.02545
188	chr1	97337068	A	G	rs36025579	0.00139340915	0.814383442335607	0.00174401629	0.8225550671606472	0.0193524028167519	0.0312678703877117	2.9852644472623764e-05	0.6116491946361309	3.464935476182642e-05	0.6199656228292487	0.1608958599155592	0.7226016676113859	0.0002239330906794	0.7929991410778797	0.0002839624566015	0.8013191335364579	0.0030542208757341	0.4047624949665758	4.717913981100535e-06	0.6665802672935149	5.539184983116011e-06	0.6751785264815335	0.0014751190365045	0.679074560541443	0.0017365325366445	0.6869371203391513	PTBP2	615402	DPYD	657932	SNX7	1324634	False	False	False	alt	50	0.002714	95	0.015366
189	chr1	97358196	T	C	rs10875073	0.0608639178	0.0132977142861149	0.0608639178	0.0142446500468973	0.013179996085264	0.1325744102888256	0.0008598508772828	0.0175803559725503	0.0008598508772828	0.0185873511975325	0.4105042583429289	0.3196301794043135	0.024786748278889	0.0237792929667393	0.024786748278889	0.0260058009948112	0.0053760877742426	0.1170331986546688	0.0003484221294649	0.0217993643559138	0.0003484221294649	0.0234684550765696	0.034460938391477	0.0185893963672176	0.034460938391477	0.0191305819049291	PTBP2	636530	DPYD	636804	SNX7	1303506	False	True	False	alt	15	0.000969	15	0.015015
190	chr1	97368472	G	A	rs72728414	-0.00407888648	0.6616967045927205	0.00407888648	0.6485946207849896	0.0082951266817906	0.5411758390725459	-3.3621349327185866e-05	0.67329534398896	3.3621349327185866e-05	0.6602743024983957	0.2143238000394194	0.6356343603203535	-0.0008824640466183	0.6476961210816522	0.0008824640466183	0.6339181086435933	0.0018136867822577	0.6444708058765122	-7.4351056702401e-06	0.6571197796749831	7.4351056702401e-06	0.643488542918381	-0.0037386279940663	0.4865638052495474	0.0037386279940663	0.475325608509992	DPYD	626528	PTBP2	646806	SNX7	1293230	False	False	False	ref	0	0.0	-100	0.01248
191	chr1	97384504	T	C	rs74105186	0.0051884043	0.5487606255394979	0.0051884043	0.5621044215147349	0.005895140869366	0.9457283545358386	2.904245352465889e-05	0.667069318466834	2.904245352465889e-05	0.6803667973290561	0.2344920590462556	0.6033478940135087	0.0012030248407739	0.5539539880297462	0.0012030248407739	0.5680167014931834	0.0013903883872823	0.7201635787867972	6.72985101911068e-06	0.634581931027772	6.72985101911068e-06	0.6485601548730747	0.0047075177128393	0.3885248136894509	0.0047075177128393	0.3989439934745256	DPYD	610496	PTBP2	662838	SNX7	1277198	False	False	False	alt	-45	0.001327	-100	0.009766
192	chr1	97385141	C	T	rs1112314	-0.0372870098	0.0667354804780038	0.0372870098	0.0626375664662525	0.0071119796687843	0.6848041859159879	-0.0002766047517118	0.1202492259209375	0.0002766047517118	0.1144719858727537	0.2840444402950238	0.5243257390545188	-0.0107943534315499	0.123149319098466	0.0107943534315499	0.1155059613234666	0.0020408969721804	0.5889697426076553	-8.074963466906582e-05	0.1649086587913719	8.074963466906582e-05	0.1566013522186473	-0.0314111142231765	0.0245589808702235	0.0314111142231765	0.0238872674090485	DPYD	609859	PTBP2	663475	SNX7	1276561	False	False	False	ref	100	0.1396	-50	0.03406
193	chr1	97388977	C	A	rs12047563	0.0083800135	0.4062880175766882	0.0083800135	0.4184978184321447	0.0153372381235346	0.075833730367508	0.000132760081922	0.2644432265152547	0.000132760081922	0.274178170829243	0.1170634550150934	0.7939317399841018	0.0009871286425239	0.588778183792103	0.0009871286425239	0.6025587726013799	0.0017856855623436	0.6445987374058995	1.557959808233385e-05	0.469776739729125	1.557959808233385e-05	0.4826118439600949	0.0077635660120954	0.2597987553459018	0.0077635660120954	0.2676366239880604	DPYD	606023	PTBP2	667311	SNX7	1272725	False	False	False	alt	-90	0.002304	-100	0.003424
194	chr1	97390265	G	A	rs4503384	-0.0264612822	0.1292540233597454	0.0264612822	0.1222942097047175	0.0085491891531142	0.4842894902749786	-0.0002473491500548	0.1533651594300437	0.0002473491500548	0.1465758212499359	0.1036836481706241	0.8184204762022385	-0.0028537086484525	0.3930566651923378	0.0028537086484525	0.3803634965247081	0.0009061773972878	0.8148516536834045	-2.699225661504343e-05	0.3970660237653093	2.699225661504343e-05	0.3847046452114396	-0.0219151650950735	0.0509798866272062	0.0219151650950735	0.0496294156429579	DPYD	604735	PTBP2	668599	SNX7	1271437	False	False	False	ref	-100	0.00376	-50	0.02844
195	chr1	97391983	A	C	rs56682383	0.0021493677859999	0.7799527385277982	0.0021493677859999	0.7939432366503498	0.0172292819034585	0.0478897451804188	3.5780584138960014e-05	0.6125853822563552	3.5780584138960014e-05	0.6257541368588173	0.1383292357804541	0.7559344900136811	0.0003240997678257	0.7789354398720986	0.0003240997678257	0.793486909051805	0.0024051557875371	0.5171992541035656	5.457043220615438e-06	0.6772653892531136	5.457043220615438e-06	0.6915991852952118	0.0018589404454402	0.6543988727197394	0.0018589404454402	0.6673629671584369	DPYD	603017	PTBP2	670317	SNX7	1269719	False	False	False	alt	100	0.003952	100	0.0219
196	chr1	97393508	T	C	rs9727787	-0.00062718408	0.5211879584468493	0.0061117958	0.5230256342832373	0.0078760664787022	0.6175298320213307	-1.4157038803509502e-05	0.5571125190462475	5.272401073725149e-05	0.5587280205400326	0.0392493698067406	0.9260495621100374	-2.262438500458e-05	0.8368595283721472	0.0002094160085449	0.8403499943809697	0.0003002694436667	0.9353606126129148	-4.230298741469278e-07	0.8462977646340337	1.7355499479874174e-06	0.8495695757827162	-4.564362700858002e-05	0.5453795337342642	0.002979284017469	0.5473593562485902	DPYD	601492	PTBP2	671842	SNX7	1268194	False	False	False	ref	-100	0.0229	10	0.005516
197	chr1	97395772	C	A	rs55824522	0.00488827576	0.5854999876318875	0.00488827576	0.5986139344630346	0.0065786629795226	0.8591037463809439	3.208721491840088e-05	0.666967572703669	3.208721491840088e-05	0.6802773002139268	0.0456436270085788	0.918526230650295	0.0002809685602241	0.8207683592621275	0.0002809685602241	0.8349224319077376	0.0003000015374319	0.9369803802532404	1.8441944339103443e-06	0.8491425149398119	1.8441944339103443e-06	0.8631904228372801	0.0031016919262647	0.541038331136104	0.0031016919262647	0.5529858899128208	DPYD	599228	PTBP2	674106	SNX7	1265930	False	False	False	alt	-25	0.00431	-40	0.01752
198	chr1	97397169	G	T	rs12043021	0.00416414182	0.5882859963925762	0.00437534078	0.5984275905242197	0.0201119968712784	0.0262560857263408	9.01337705463838e-05	0.3529060263346359	9.372952958951236e-05	0.3623645210506638	0.0091245759810786	0.983787913962762	2.999986607458604e-05	0.9487000738146852	3.3671786392804536e-05	0.9583046028191344	0.000180578304832	0.9640474001469584	6.793481222925426e-07	0.9094455852357616	7.41864249599708e-07	0.9189871241217572	0.0005746947582443	0.8621191464416565	0.0006286372265271	0.8715726619921749	DPYD	597831	PTBP2	675503	SNX7	1264533	False	False	False	alt	50	0.00612	-100	0.01753
199	chr1	97397272	T	C	rs12040699	0.0296578909	0.1001787063781003	0.0296578909	0.1061532692786526	0.0081611103727528	0.5526182828948252	0.0002490155122596	0.1337806600588773	0.0002490155122596	0.1405132148464465	0.0117988775817176	0.979223702570616	0.000432665693176	0.7661597575822268	0.000432665693176	0.7800433297078322	0.0001000844551234	0.979389250783936	3.749180995604899e-06	0.7702292687321167	3.749180995604899e-06	0.7840455093077309	0.0054834593719851	0.3810781724436928	0.0054834593719851	0.3910438744022928	DPYD	597728	PTBP2	675606	SNX7	1264430	False	False	False	alt	-50	0.01823	-100	0.04608
200	chr1	97401301	C	T	rs12026223	-0.0907058048	0.0043900439825821	0.0907058048	0.0041349594308681	0.0213982320804954	0.0225771525602202	-0.0022508281332645	0.0051734433681331	0.0022508281332645	0.0049309401725014	0.1264411456550378	0.776828089003399	-0.0135216493664345	0.0995810631553377	0.0135216493664345	0.0937907695049435	0.0031111597464829	0.3524274495610693	-0.0003884761120517	0.0426992697965666	0.0003884761120517	0.0401698558144858	-0.0767622070768368	0.0012384262833373	0.0767622070768368	0.0011957791146029	DPYD	593699	PTBP2	679635	SNX7	1260401	False	True	True	ref	100	0.009315	-15	0.01477
201	chr1	97412905	G	A	rs6687374	-0.0140873293999999	0.2687264147010563	0.0140873293999999	0.2585814829391072	0.0059870990861458	0.909239394464469	-8.539101254921878e-05	0.3837437513351242	8.539101254921878e-05	0.3730208079796007	0.0751978754966337	0.8684401852179204	-0.0010367814449697	0.6075896788027744	0.0010367814449697	0.5938887067611507	0.000444651913336	0.908620221715742	-6.188784831990386e-06	0.6812327589064164	6.188784831990386e-06	0.6672882475140937	-0.0102864137594787	0.1828979933493506	0.0102864137594787	0.1773355758054185	DPYD	582095	PTBP2	691239	SNX7	1248797	False	False	False	ref	-25	0.000864	-85	0.04254
202	chr1	97417845	C	T	rs58941846	0.00947934602	0.4534721319063036	0.00971724706	0.4623644482758218	0.0087091636238268	0.4448304732320154	0.0001077128616688	0.4359604331973474	0.00010931430647	0.4442267546319816	0.0429361300428427	0.9235676673393513	0.0004946086924416	0.778469814260248	0.0005006870777907	0.7869463514886387	0.0003922423335764	0.918708073408966	5.6992522926173125e-06	0.7571789862221086	5.740169299488202e-06	0.7655998952436565	0.0049772300542536	0.4495251543007436	0.0051141609352793	0.4556187916738001	DPYD	577155	PTBP2	696179	SNX7	1243857	False	False	False	alt	-90	0.02533	-85	0.01457
203	chr1	97434996	A	T	rs12129397	0.002527454198	0.7102546373125835	0.0031733966019999	0.71738858112346	0.0109220562135081	0.2289507969050215	2.835456992054867e-05	0.6389168380865371	3.5368982157874904e-05	0.6461051998465323	0.0783244639467214	0.8633894571572992	0.0001272588552745	0.8445056615213703	0.0001973713498451	0.85064655584961	0.0008589727026168	0.8275033325384973	1.4264439242842544e-06	0.8157056696724613	2.198764769948884e-06	0.8219853942102238	0.0014564466436373	0.6287767130181161	0.0021203539455803	0.6347965999219433	DPYD	560004	PTBP2	713330	SNX7	1226706	False	False	False	alt	20	0.000702	85	0.03073
204	chr1	97437034	T	G	rs11165872	-0.00376298314	0.6717071695062087	0.00376298314	0.6582064810575141	0.0151397751430055	0.0816155516909274	-5.4591050233632114e-05	0.51679012674356	5.4591050233632114e-05	0.5047561472242954	0.0271206132843701	0.9535045161999522	-8.494677446414563e-05	0.9288198895352884	8.494677446414563e-05	0.9145937194183844	0.0004370171621407	0.9141947551907024	-1.252513408362736e-06	0.8894427498791331	1.252513408362736e-06	0.8750108045127462	-0.001331964024523	0.7621432874047859	0.001331964024523	0.7487644814282325	DPYD	557966	PTBP2	715368	SNX7	1224668	False	False	False	ref	45	0.00525	-85	0.08057
205	chr1	97455400	T	C	rs12354219	0.0147608351999999	0.2520924003927793	0.0147608351999999	0.2624166106994232	0.0222717093989233	0.016764789204791	0.0003212845247542	0.0871240605342963	0.0003212845247542	0.0921857949981318	0.0488428303198165	0.9148148864800916	0.0008344375152219	0.6509313868781532	0.0008344375152219	0.6645388399766531	0.0011554530153317	0.7578375511301492	1.943501267427336e-05	0.4652873749656577	1.943501267427336e-05	0.4779696615525348	0.0086162719530285	0.2538562992667968	0.0086162719530285	0.2612345340800805	DPYD	539600	PTBP2	733734	SNX7	1206302	False	True	False	alt	-90	0.001701	-100	0.01279
206	chr1	97573370	T	C	rs79917705	-0.000511860048	0.7460076289868489	0.002914093392	0.7489296938638517	0.0173862323873741	0.0461448501103671	-1.3386235114446114e-05	0.5884411890902141	5.471348188561306e-05	0.5907425122763712	0.0553926907955476	0.9015604626211932	-7.363296194272935e-05	0.8766532159233149	0.0001987878511923	0.880527332389667	0.0009853498387304	0.8023722931828083	-1.6726457014332942e-06	0.8020782167502821	3.824036564111494e-06	0.805651493116604	-0.0007717922385086	0.6839917524615491	0.002024917270926	0.6862518074443866	DPYD	421630	PTBP2	851704	SNX7	1088332	False	False	False	ref	-85	0.01169	100	0.02264
207	chr1	97580440	G	C	rs10783069	-0.022211969	0.1730252011456423	0.022211969	0.1648271919150404	0.0086516580517858	0.4658013281875681	-0.0001952760323314	0.1884085606702446	0.0001952760323314	0.1804860824537012	0.0796958474672973	0.8570572927813884	-0.0020170739070509	0.4789456646148389	0.0020170739070509	0.4657595539113434	0.000709841280231	0.8515333554656667	-1.82311119993048e-05	0.4796389483476518	1.82311119993048e-05	0.4669043052052744	-0.0173466529735785	0.1060301615092863	0.0173466529735785	0.102942871541072	DPYD	414560	PTBP2	858774	SNX7	1081262	False	False	False	ref	-10	0.001125	-15	0.01129
208	chr1	97590907	A	G	rs7537165	0.037047852	0.0598378228036087	0.037047852	0.0640678749189028	0.0089911003004905	0.4138199829735416	0.0003340163993677	0.077757302892303	0.0003340163993677	0.0825120829903719	0.1755121941098973	0.6975337665243043	0.0065264990106586	0.1850907695562994	0.0065264990106586	0.1951940458709102	0.0015732519539954	0.6871874098222019	5.859595137364692e-05	0.1913879496651495	5.859595137364692e-05	0.2008217519907206	0.0357929024160001	0.0149542048440082	0.0357929024160001	0.0153415367261984	DPYD	404093	PTBP2	869241	SNX7	1070795	False	False	False	alt	-55	0.000941	15	0.02118
209	chr1	97594925	A	C	rs2811202	1.404727999999942e-06	0.8839288594599721	0.001131599792	0.8851439752494693	0.0176376610701799	0.0451135161977496	2.314380127433578e-06	0.7531149110677277	2.118201552691193e-05	0.7544601727672535	0.0880029875828587	0.8470006724807218	1.6731870591897627e-05	0.9027332347213796	0.0001051086412586	0.904183013808863	0.0016190306249048	0.6708322367069848	5.931659041659862e-07	0.8360665091057002	2.0794386422170096e-06	0.8374199805395621	3.112065477855999e-05	0.8108354812194172	0.0009605908774986	0.812148863435949	DPYD	400075	PTBP2	873259	SNX7	1066777	False	False	False	alt	100	0.004177	100	0.0506
210	chr1	97611109	C	T	rs2811197	-0.00319067502	0.6902973480576587	0.00319067502	0.6766928790937595	0.0153989451323077	0.0717957819432024	-4.982287145885501e-05	0.5285652842664322	4.982287145885501e-05	0.5160622091756343	0.0681168891793482	0.8798804006881993	-0.0001915583457656	0.8631744649121816	0.0001915583457656	0.848876313527942	0.0010259134911518	0.7922779113189699	-2.8901217740045787e-06	0.7945086429819298	2.8901217740045787e-06	0.7804714071743849	-0.0020892332908017	0.6530503213334165	0.0020892332908017	0.6403819935051357	DPYD	383891	PTBP2	889443	SNX7	1050593	False	False	False	ref	-40	0.001434	95	0.06366
211	chr1	97639882	A	C	rs6663670	0.00044796044	0.836682981279777	0.00155055984	0.8413480219618337	0.0071505942213266	0.744838363552397	3.607656038008256e-06	0.8552354975483049	1.145988432009119e-05	0.8598508404674869	0.1134140395647257	0.8039460779811043	2.010721074436217e-05	0.8560241546113951	0.0001806502976039	0.860382714259169	0.0008552120420765	0.8309646994366927	2.4262067861382906e-07	0.8687201428051518	1.3978022829529167e-06	0.8730755662081934	0.0002282181350428	0.750571531196677	0.0012946192387887	0.7546067418871548	DPYD	355118	PTBP2	918216	SNX7	1021820	False	False	False	alt	-95	0.003563	-20	0.01424
212	chr1	97665524	A	T	rs72975785	-0.00684630906	0.4806520869575937	0.00684630906	0.4681254379659525	0.0215751352108485	0.0193913336548193	-0.0001486284083292	0.2353098514821312	0.0001486284083292	0.2263912056106723	0.0912748057552464	0.8424879378088134	-0.0005477831053909	0.7241385074235039	0.0005477831053909	0.7103074451678864	0.0020290659643583	0.5691775420927533	-1.2159475317919486e-05	0.5448188084533346	1.2159475317919486e-05	0.5316568802409322	-0.0052054481892965	0.3730283209423166	0.0052054481892965	0.3633504839841627	DPYD	329476	PTBP2	943858	SNX7	996178	False	True	False	ref	-25	0.00641	-25	0.005497
213	chr1	97867312	C	T	rs11590802	-0.0021324286206	0.8216378481275325	0.0021388263394	0.8137472009690302	0.0066321598868905	0.8593287251958371	-1.3875189297394552e-05	0.8582648864688293	1.39191491401777e-05	0.8506649084549487	0.1161609560265147	0.7984376433673714	-0.0002532304353279	0.8527096651921815	0.0002538273407359	0.8445283211319157	0.000772575932142	0.8432700335562437	-1.6553507774514634e-06	0.876960741522772	1.6594522186074057e-06	0.868900904691664	-0.0017614290604673	0.7010801482504289	0.0017655784811045	0.6932909897112576	DPYD	127688	SNX7	794390	PTBP2	1145646	False	False	False	ref	30	0.00335	15	0.00418
214	chr1	97887860	A	G	rs4970723	0.0324828414	0.0814925305072348	0.0324828414	0.0869122821007311	0.0090587922512972	0.4160787131975745	0.0002993856255309	0.0979692755070696	0.0002993856255309	0.1035252631978101	0.1913214867374142	0.6715611242309751	0.0066787261236996	0.1935253242421608	0.0066787261236996	0.2040194801374986	0.0017719429200034	0.6535149992271571	6.23398628248466e-05	0.1989078513534046	6.23398628248466e-05	0.2086391737939771	0.0305086152345978	0.0247818437501191	0.0305086152345978	0.0254372725445645	DPYD	107140	SNX7	773842	PTBP2	1166194	False	False	False	alt	-85	0.001907	55	0.03848
215	chr1	97946313	G	A	rs12044989	0.00065835426	0.8056330083159825	0.0019366715	0.8134896358485397	0.0370724577437623	0.0016123950574563	3.0588866931597615e-05	0.4589732306691561	7.29391787388376e-05	0.464922297022637	0.2406933681884666	0.592335418544842	0.0001750438853293	0.7344485991730753	0.0005214661505443	0.742140880098999	0.0090449317990578	0.0207225102193483	8.219348171913728e-06	0.4630058441250262	1.969622599899715e-05	0.4693964978028047	0.0005186775796429	0.7045648877997019	0.0016307223103973	0.7117189330762549	DPYD	48687	SNX7	715389	PTBP2	1224647	False	True	True	alt	-50	0.03802	-40	0.04575
216	chr1	97958696	G	A	rs56732321	-0.037763002	0.065244032423496	0.037763002	0.0613567367829024	0.0089432315185818	0.4264740849859457	-0.0003467567505492	0.0855169466836772	0.0003467567505492	0.0809806129247379	0.1665494455336673	0.7063912317744623	-0.0070398452217826	0.2122990938454277	0.0070398452217826	0.201778912057126	0.0015213834113694	0.6924801132164004	-6.55769469977666e-05	0.2181757157992154	6.55769469977666e-05	0.2082589840135886	-0.0350875009076857	0.0180448193287445	0.0350875009076857	0.0175683649844682	DPYD	36304	SNX7	703006	PTBP2	1237030	False	False	False	ref	5	0.0005646	-100	0.04578
217	chr1	97977953	C	T	rs11165939	-0.00329990258	0.6263384848359007	0.0046075610199999	0.6198979583059689	0.006810715781748	0.7967597376924234	-2.584846263175071e-05	0.6766220605691097	3.5115842215370685e-05	0.6708203873774894	0.1705349640556436	0.702955781412409	-0.0004269714773109	0.6891549322394072	0.0007030297818452	0.6830123238989585	0.0011395425211324	0.7703401764414946	-3.2096548699786505e-06	0.724650585818001	5.176423666133379e-06	0.7188319392310352	-0.002848577267399	0.4557013074984193	0.0041431965061877	0.4509898113396743	DPYD	17047	SNX7	683749	PLPPR5	1249976	False	False	False	ref	-100	0.01607	-100	0.03226
218	chr1	97980638	G	C	rs12077962	0.0013697273	0.8555526198853936	0.001511424	0.8651632241366897	0.0084036948519599	0.523166195105381	1.2180774483160367e-05	0.8493223949250558	1.3372299562863873e-05	0.8588646380504193	0.1081297523833234	0.8096165824623163	0.0001427746940578	0.8847537877251298	0.0001602312032547	0.8941553946913593	0.0009480658487328	0.8094664931754343	1.3643411798635291e-06	0.8830529826238047	1.5111326595112308e-06	0.8924301342471413	0.0009190966711272	0.7881356739048667	0.0011058205997986	0.7975635719148528	DPYD	14362	SNX7	681064	PLPPR5	1247291	False	False	False	alt	100	0.02553	100	0.04672
219	chr1	98031620	A	C	rs1198572	-0.00966558184	0.3717533607490334	0.00966558184	0.3602899622074201	0.0285610841075065	0.0049510158685422	-0.0002752804822772	0.1148862145398237	0.0002752804822772	0.1090379290655929	0.1191257170717538	0.7927981684097344	-0.0011971584506075	0.5880613349774051	0.0011971584506075	0.5743349958673698	0.0034776771429672	0.320009826392918	-3.500147780632208e-05	0.3283699680496967	3.500147780632208e-05	0.3170804656454679	-0.0082531976472784	0.2351783741125509	0.0082531976472784	0.2283771396964229	DPYD	36620	SNX7	630082	PLPPR5	1196309	False	True	True	ref	90	0.002579	-95	0.007515
220	chr1	98036428	T	C	rs1702294	0.003027177764	0.7317171622669556	0.003144791484	0.7425699817891812	0.0186139746040945	0.035952490802359	4.90459419600431e-05	0.5986357338991012	5.169414223148311e-05	0.609065448186401	0.121256444568927	0.7902682082614575	0.0004810056543165	0.7840783154754964	0.0004996288339112	0.7950850141410868	0.0022795118899999	0.5487406427384484	7.638862603673781e-06	0.6908170191470371	8.058183643759885e-06	0.7017452307005223	0.0025456695608875	0.619102443099864	0.0026411062355418	0.6285975870525462	DPYD	41428	SNX7	625274	PLPPR5	1191501	False	False	False	alt	-100	0.04776	-100	0.02808
221	chr1	98060611	T	C	rs1702291	0.0444963908	0.0378862295289674	0.0444963908	0.0404590624306929	0.0132746301593235	0.1204547347794801	0.0006123692175496	0.0296269125516948	0.0006123692175496	0.0315263780248392	0.2363800454361559	0.5975963527490699	0.0112487080710626	0.1089890522933234	0.0112487080710626	0.1167378660327168	0.0032023219218231	0.3784733721549431	0.0001576311211655	0.0750907103946181	0.0001576311211655	0.0802555753615675	0.0405626614383966	0.0095338181403196	0.0405626614383966	0.0097520009640653	DPYD	65611	SNX7	601091	PLPPR5	1167318	False	False	False	alt	50	0.001892	30	0.01367
222	chr1	98070109	A	G	rs11808051	0.051613841	0.0220341228246323	0.051613841	0.0236530314978263	0.0104712640155872	0.2713598068623171	0.000566422793963	0.0343098372161569	0.000566422793963	0.0365607738809098	0.172786024751294	0.7011866057466819	0.0093396380810316	0.1364089518499683	0.0093396380810316	0.1453835512053773	0.0018515995100396	0.6351067112696005	0.0001033975354465	0.1249617790551881	0.0001033975354465	0.1327379760313519	0.0454174835838545	0.0050014745580032	0.0454174835838545	0.0051735302234323	DPYD	75109	SNX7	591593	PLPPR5	1157820	False	False	False	alt	100	0.0173	95	0.0673
223	chr1	98101149	A	G	rs12027634	-0.0233285346	0.159871149303809	0.0233285346	0.152503030232078	0.0160164112878212	0.0681935511615547	-0.0004381035884936	0.0813742464156153	0.0004381035884936	0.0778432810378755	0.0883079699996887	0.8420415395601873	-0.0022847947577144	0.4510211654875075	0.0022847947577144	0.4375543210768691	0.0014977785932141	0.6898183727767513	-4.446488960459649e-05	0.3086429758726882	4.446488960459649e-05	0.2971635634169534	-0.0200686729115446	0.0810124151336137	0.0200686729115446	0.0787924218369989	DPYD	106149	SNX7	560553	PLPPR5	1126780	False	False	False	ref	-65	0.00353	-75	0.06186
224	chr1	98112221	A	G	rs4950095	0.00505104518	0.5752722848241059	0.00505104518	0.5884164132570079	0.0057450990271574	0.96426920220522	2.878677665472144e-05	0.6892711660722896	2.878677665472144e-05	0.7024275790420025	0.2338426747165426	0.6028210401880388	0.0011200933558516	0.5734485754939013	0.0011200933558516	0.5872109761526558	0.0013464688068243	0.7270260539170128	6.389551545280497e-06	0.6546595593628454	6.389551545280497e-06	0.6685215581651773	0.0045996327762735	0.4170069147132362	0.0045996327762735	0.4277510168000189	DPYD	117221	SNX7	549481	PLPPR5	1115708	False	False	False	alt	100	0.1405	30	0.00934
225	chr1	98129502	G	A	rs12567725	-0.000880715232	0.895333778764662	0.001162560352	0.8866448907267944	0.0118337770149972	0.1771395949834808	-1.0881519856362018e-05	0.8515360481490376	1.3560018708955957e-05	0.842747074039967	0.1378167823317669	0.7610243636136079	-0.0001438026075314	0.8818401216094319	0.0001638769717591	0.8727622714699227	0.0016728176797753	0.6657091463503811	-1.7442840080615789e-06	0.8518555172082386	1.935059567163956e-06	0.8425926344300787	-0.0008672289131629	0.7928490761555894	0.0011452400958515	0.7843119276596835	DPYD	134502	SNX7	532200	PLPPR5	1098427	False	False	False	ref	100	0.004047	-100	0.04636
226	chr1	98176374	A	G	rs2046585	-0.00552226556	0.5490393797002527	0.00552226556	0.5361521447411681	0.0303985263416604	0.0037038198936342	-0.0001655728808844	0.2064780790055415	0.0001655728808844	0.1981753350128301	0.067662527619581	0.8783775470207017	-0.0003595528243867	0.7833584296009434	0.0003595528243867	0.7692541495132749	0.0020448187940171	0.5941266890055104	-1.0663452537048924e-05	0.5597804438378065	1.0663452537048924e-05	0.5464718098260706	-0.003890081847322	0.4612958139897758	0.003890081847322	0.4505431275253613	DPYD	181374	SNX7	485328	PLPPR5	1051555	False	True	True	ref	-85	0.004303	5	0.007294
227	chr1	114966435	T	C	rs77509205	0.00448764712	0.5902829188994394	0.00448764712	0.6034490346733753	0.0065181735054212	0.870255431451619	2.9197004114626827e-05	0.666831764289472	2.9197004114626827e-05	0.6800214453474345	0.3175613854915508	0.47260205504723	0.0014508446138471	0.5062520972838245	0.0014508446138471	0.5197854132176473	0.0020802079554075	0.5946448488624839	9.478126035635068e-06	0.5675543672201148	9.478126035635068e-06	0.5810824265528541	0.0033921513708647	0.4914820011143819	0.0033921513708647	0.5029401079179723	TSHB	63392	SYCP1	111571	TSPAN2	123068	False	False	False	alt	-40	0.003239	-20	0.01933
228	chr1	115059573	C	T	rs6537851	-0.0420431982	0.0490084161000089	0.0420431982	0.0458832055377978	0.0134016794303834	0.1169266025484717	-0.0005767355145457	0.0353281197682822	0.0005767355145457	0.0332485256692192	0.2661355408251122	0.5507798659752335	-0.0111634256767086	0.1164871427003792	0.0111634256767086	0.108998928033608	0.0035829685316572	0.3060582679629218	-0.0001535623545098	0.0770032745870361	0.0001535623545098	0.0720397128065304	-0.0368717517816574	0.0143403063600276	0.0368717517816574	0.0139711004430286	TSHB	29746	TSPAN2	29930	SYCP1	204709	False	False	False	ref	-90	0.001397	-95	0.03375
229	chr1	115221028	C	T	rs11102896	-0.0451888167999999	0.0386771860008573	0.0451888167999999	0.0362060657197002	0.0104019619529447	0.2716148677657713	-0.0004794864337428	0.0480810184838138	0.0004794864337428	0.0453028698410227	0.4727144472453034	0.2166260243555827	-0.02163629506229	0.0382231578151383	0.02163629506229	0.0352221186137537	0.0049290090087443	0.1496498952218611	-0.000230118104184	0.0444663750829422	0.000230118104184	0.041373587434306	-0.0167636593740598	0.0979282040342676	0.0167636593740598	0.0951957495060657	NGF	117742	TSPAN2	131525	TSHB	191201	False	False	False	ref	0	0.0	-10	0.007294
230	chr1	115255892	G	T	rs2223926	-0.019503713	0.1860437358821133	0.019503713	0.1781697687476607	0.0102570785012397	0.2856312715913354	-0.0002175814120325	0.1712353538459199	0.0002175814120325	0.1643628531800031	0.337690225002334	0.4378072554503896	-0.0067985280116821	0.2009532042696782	0.0067985280116821	0.191469734789835	0.0035105797486742	0.3182851344319505	-7.639755990993841e-05	0.1804691215967208	7.639755990993841e-05	0.1722996899338293	-0.014108030166288	0.1293600427830429	0.014108030166288	0.1256639299052937	NGF	82878	TSPAN2	166389	TSHB	226065	False	False	False	ref	100	0.00595	-75	0.01306
231	chr1	115256641	T	A	rs12745199	-0.0031885737799999	0.7027680435578397	0.0031885737799999	0.6891408782565324	0.0235370291363558	0.0129418410354553	-8.137635523839556e-05	0.4275669632938853	8.137635523839556e-05	0.4159294802087609	0.2910507370408406	0.5132808705700218	-0.0009142505659035	0.6285975774233964	0.0009142505659035	0.6146615237843339	0.0068160427038007	0.0535136763997085	-2.317301747093179e-05	0.4157599852197841	2.317301747093179e-05	0.4032964646508728	-0.0027884106681604	0.5794794905692011	0.0027884106681604	0.5671919784613264	NGF	82129	TSPAN2	167138	TSHB	226814	False	True	False	ref	-95	0.00476	-95	0.03082
232	chr1	150027806	T	A	rs6687454	0.00691942128	0.4642891295117527	0.00691942128	0.4769069548054853	0.0176440417510115	0.0443550253298616	0.000118863619673	0.2787700998970787	0.000118863619673	0.2883332444736672	0.0544383240490046	0.9042361252184288	0.0003700898473108	0.7619449188270371	0.0003700898473108	0.7761906249338909	0.0009893014120486	0.8033388887905208	6.580969622849481e-06	0.6466757753641404	6.580969622849481e-06	0.6605061164618264	0.0043859376134606	0.4069430583874326	0.0043859376134606	0.4174151873974608	OTUD7B	17080	VPS45	39474	MTMR11	90927	False	False	False	alt	55	0.002533	25	0.006714
233	chr1	150036614	A	G	rs77391665	-0.0112952804	0.3378873381167079	0.0112952804	0.3264804699281073	0.0071454566932023	0.7438942828055495	-8.027361175675419e-05	0.41003075220719	8.027361175675419e-05	0.398996407124188	0.0980964532827103	0.8238437442602096	-0.0010745521058115	0.5969001753507146	0.0010745521058115	0.5830872024309265	0.0007174961244247	0.8501015429722242	-7.86276958028937e-06	0.6355366256990863	7.86276958028937e-06	0.6219146020461349	-0.0091868172906357	0.2209965602820446	0.0091868172906357	0.2141979056407244	OTUD7B	25888	VPS45	30666	MTMR11	99735	False	False	False	ref	100	0.01434	85	0.02945
234	chr1	150041153	A	C	rs12063059	0.002468614954	0.7353677719305248	0.002656244126	0.7450256932465043	0.0187182092778879	0.0364848760278982	4.580870879211888e-05	0.5430786932999069	4.908281097875248e-05	0.5521815651949251	0.0870320231537671	0.8407920265185818	0.0001862815886589	0.83138883095622	0.0002040812417875	0.8409033028656138	0.0016762976952213	0.65467798552139	3.6822662539879968e-06	0.7312737677329071	3.99286765542125e-06	0.74086651242077	0.001966825382006	0.6308939040254774	0.0021328022074917	0.6398205385869563	VPS45	26127	OTUD7B	30427	MTMR11	104274	False	False	False	alt	-55	0.00241	-30	0.02222
235	chr1	150043194	T	G	rs72692865	0.0436956458	0.0400601685796583	0.0436956458	0.0427021996312774	0.011475707112277	0.1960428777166075	0.0005247203033197	0.0406352591180859	0.0005247203033197	0.0431774366787262	0.1437151837674664	0.7463394691181541	0.0072633800795859	0.1930894689543491	0.0072633800795859	0.2038186575483062	0.0017078688876388	0.6505276479674978	8.952758966201549e-05	0.1596649243990291	8.952758966201549e-05	0.168324934873739	0.0401746906088236	0.0122444100987466	0.0401746906088236	0.0126107465238661	VPS45	24086	OTUD7B	32468	PLEKHO1	105990	False	False	False	alt	-100	0.01996	85	0.0294
236	chr1	150045258	A	C	rs72692866	-0.00040069217	0.7940452919946435	0.0019241459099999	0.7984613123740734	0.0247206845220099	0.0104167245269986	-1.2722209997596965e-05	0.5448298695052136	5.046694665855394e-05	0.5476765336942653	0.1097480264318094	0.8038351090373493	-3.628252522481342e-05	0.8234241181195422	0.0002389279600307	0.8283630138165597	0.0027885262149804	0.4342863410497416	-1.223051208300308e-06	0.6709769815100586	6.2997473566958455e-06	0.6755427235026108	-0.0002406663969543	0.659696394116967	0.0019834230645545	0.6630610812335372	VPS45	22022	OTUD7B	34532	PLEKHO1	103926	False	True	False	ref	-100	0.07513	-60	0.0401
237	chr1	150047081	C	A	rs72692870	0.0047505194	0.5753103713622265	0.0047505194	0.5887277698452039	0.0252528214171657	0.0094925920704733	0.0001238280657855	0.3113837770113759	0.0001238280657855	0.3217965060299617	0.1759914521934874	0.6906275937058062	0.000678089277681	0.6620154529299628	0.000678089277681	0.6760680354378473	0.0044919207720437	0.1992643911147428	1.735596823235175e-05	0.4516336698461742	1.735596823235175e-05	0.4643419338703931	0.0044751501571592	0.4204623214782137	0.0044751501571592	0.4308430145132414	VPS45	20199	OTUD7B	36355	PLEKHO1	102103	False	True	True	alt	-95	0.0206	25	0.0292
238	chr1	150053395	T	C	rs12074281	0.001075253226	0.8623778756565447	0.001447876694	0.8661405149079865	0.0233705078442039	0.0131926803962914	2.2457613124549563e-05	0.663676495120082	3.171486075018053e-05	0.6681417979081257	0.1226547993236444	0.7855345518150013	0.0001522217568023	0.8555389308288681	0.0001889101259751	0.8594930142400042	0.0028480947123333	0.4468074922652401	3.212725917625064e-06	0.7377489331473037	4.1285340815347546e-06	0.7421393977622709	0.0009605908774987	0.7353962062213588	0.0013962800443987	0.7395260950173516	VPS45	13885	OTUD7B	42669	PLEKHO1	95789	False	True	False	alt	-100	0.003716	-100	0.01794
239	chr1	150086719	G	A	rs56212907	-0.0317241004	0.0968963176781728	0.0317241004	0.0912952666148969	0.0078516286686163	0.6128963835981937	-0.0002504413471993	0.1363297125386263	0.0002504413471993	0.1297670575421418	0.1670287036172574	0.7132456098244857	-0.0054260758550592	0.2444908201614045	0.0054260758550592	0.233652745893671	0.001316419275024	0.7395836464638369	-4.295980536604737e-05	0.2738829091872213	4.295980536604737e-05	0.2634620953437601	-0.0299629664208134	0.0270012027438607	0.0299629664208134	0.0263584000764488	VPS45	19439	PLEKHO1	62465	OTUD7B	75993	False	False	False	ref	-100	0.009224	-100	0.00978
240	chr1	150090550	C	A	rs72694905	0.00558109384	0.5231355663614103	0.00558109384	0.5359263293919815	0.0305994512010041	0.0034971728626225	0.0001683434126545	0.1895819480724315	0.0001683434126545	0.1977908112530364	0.0801937779437545	0.8571183306959946	0.000480963511056	0.7211628632259763	0.000480963511056	0.7352397970618273	0.0024210810813033	0.5262861080746678	1.4261516313521091e-05	0.4812779134573182	1.4261516313521091e-05	0.4942725259659667	0.0046349028516892	0.3918416140125869	0.0046349028516892	0.4020017634856344	VPS45	23270	PLEKHO1	58634	OTUD7B	79824	False	True	True	alt	20	0.001236	-95	0.00923
241	chr1	150109454	A	G	rs72694928	0.0117121196	0.2986080540434602	0.0117121196	0.3096534236415639	0.0073313946171079	0.7293728496843638	8.707659220878344e-05	0.362770659932046	8.707659220878344e-05	0.3733991514328124	0.3540244193404496	0.4102406351511188	0.0042154027529226	0.2687376916745108	0.0042154027529226	0.2802799205087508	0.0026057994871779	0.4950092441130748	3.1514438989574343e-05	0.311045858847955	3.1514438989574343e-05	0.3223190022562122	0.0073901181547525	0.2549387818916222	0.0073901181547525	0.2627529683713027	PLEKHO1	39730	VPS45	42174	OTUD7B	98728	False	False	False	alt	90	0.001696	85	0.03763
242	chr1	150134673	T	G	rs56369603	-0.00412099464	0.6379091532420083	0.00412099464	0.6245719532256075	0.0243255835372373	0.0108267427608377	-9.907336991008232e-05	0.3473472868904776	9.907336991008232e-05	0.3367364511128906	0.0601354785838027	0.8942031562815878	-0.0002615278839503	0.8322546158301449	0.0002615278839503	0.8180738828310749	0.0014703754653646	0.7072313915627998	-6.33669887377563e-06	0.6787509703425999	6.33669887377563e-06	0.6650928485281603	-0.0028796979221775	0.5669059178170105	0.0028796979221775	0.5548571169876864	PLEKHO1	14511	VPS45	67393	ANP32E	101483	False	True	False	ref	60	0.007355	10	0.006012
243	chr1	150140312	C	T	rs72694944	-0.00891533746	0.4039210777920498	0.00891533746	0.3922430909607509	0.0067410608145281	0.8050821559210879	-6.125023248578739e-05	0.493302004834022	6.125023248578739e-05	0.481396736153951	0.0553947655058662	0.900609080664676	-0.0005232664601782	0.7415972757668882	0.0005232664601782	0.7271816806984778	0.0003864257424268	0.9199824203063106	-3.679298559622091e-06	0.7769910483853122	3.679298559622091e-06	0.7625359720403201	-0.0057739188165852	0.3403614446791672	0.0057739188165852	0.3312626553308036	PLEKHO1	8872	VPS45	73032	ANP32E	95844	False	False	False	ref	95	0.01056	15	0.009026
244	chr1	150174687	T	A	rs72694960	0.00183117006	0.7964452430968987	0.00183117006	0.810272481942227	0.0152239365004078	0.0800925485704701	2.8676365826708764e-05	0.6568086567673614	2.8676365826708764e-05	0.670045193516865	0.2108009419184845	0.633842572022439	0.0004009620031745	0.7321293686921876	0.0004009620031745	0.7464376335820284	0.0032598974575963	0.3323022978686633	6.420154963641584e-06	0.6301579064439676	6.420154963641584e-06	0.6440956123198859	0.0017033371715473	0.6792073578451319	0.0017033371715473	0.6921949390084224	PLEKHO1	25503	ANP32E	61469	CA14	82565	False	False	False	alt	100	0.00827	100	0.0737
245	chr1	151471857	G	A	rs11204824	0.00277413512	0.7139612303463699	0.00277413512	0.7275490831518031	0.0124326557059355	0.155787315935354	3.4429326437314387e-05	0.6126654677034538	3.4429326437314387e-05	0.6255634137038071	0.1415699332980632	0.7474882276155078	0.0003926061594064	0.7365637536475371	0.0003926061594064	0.7506573427959439	0.0017925142406539	0.6243621511174491	4.925588783893347e-06	0.6752855372519089	4.925588783893347e-06	0.68940142948123	0.0028423531364432	0.5407533516051339	0.0028423531364432	0.5528276664315983	POGZ	12363	CGN	38654	TUFT1	68449	False	False	False	alt	-65	0.00232	-100	0.0651
246	chr1	151473276	C	T	rs10888415	0.0074074751799999	0.4653655941250868	0.0076531531	0.4764231751989962	0.0093677360578685	0.3695232798351001	7.192892359209459e-05	0.4512170313601548	7.419374915882345e-05	0.4612623903755414	0.598512432701584	0.0498300407610246	0.0044187071639193	0.2938071133491547	0.0045669793999134	0.3047257489757966	0.0056048367621783	0.099607855899001	4.288991798025238e-05	0.284973458362014	4.4256791979429945e-05	0.2952760195045371	0.0010726252347015	0.7816218694499735	0.0011016711791615	0.7919864363049735	POGZ	13782	CGN	37235	TUFT1	67030	False	False	False	alt	100	0.04272	95	0.2805
247	chr1	151611057	C	A	rs58479084	0.001352524264	0.8522908742255975	0.001352524264	0.8661028932292922	0.0353578995910815	0.0019364089812145	5.1902691512708754e-05	0.5339563533610954	5.1902691512708754e-05	0.5462993078520653	0.2381497733378976	0.5966556215394313	0.0003459780679513	0.7798127300190553	0.0003459780679513	0.7939416618986967	0.0085497776294057	0.0248791638909618	1.3383129675483676e-05	0.5317272670225115	1.3383129675483676e-05	0.5450787588277876	0.0012904698181515	0.7490971170809673	0.0012904698181515	0.7624978494200856	SNX27	950	TUFT1	70751	RIIAD1	99377	False	True	True	alt	-45	0.01294	-15	0.0786
248	chr1	151637173	T	G	rs144529710	-0.0003669984999999	0.7202370721914181	0.00302697914	0.7241356178240542	0.0293247230346382	0.0048974620404509	-2.6494932839053287e-05	0.3725267301197628	9.458025856655614e-05	0.3745072821602593	0.2787124347762943	0.5281202272298944	-8.805114434185999e-05	0.6323337661893179	0.0008239164921595	0.6367563818719287	0.008194907750951	0.0280176749686546	-6.685057274188091e-06	0.3733437616540018	2.565800372615845e-05	0.3762968024317962	-0.0003734478573429	0.5989234979021494	0.0025062500648346	0.6021506992801846	SNX27	25166	RIIAD1	73261	CELF3	79630	False	True	True	ref	100	0.00653	-25	0.01376
249	chr1	151657482	A	G	rs6690942	0.00860308394	0.3896349793110729	0.00860308394	0.401839598643225	0.0098756192568175	0.3164821075375097	8.274981583463275e-05	0.3699159435159395	8.274981583463275e-05	0.3808982423389426	0.2034253467359619	0.6536331833731831	0.0017338788516492	0.4671137064637938	0.0017338788516492	0.4808491110510932	0.00201826601716	0.6000651026548649	1.674582058537086e-05	0.4429090732753692	1.674582058537086e-05	0.4558159201991935	0.0079295428375812	0.2319229195168499	0.0079295428375812	0.2386451048884898	SNX27	45475	RIIAD1	52952	CELF3	59321	True	False	False	alt	85	0.00653	60	0.02687
250	chr1	151707487	C	T	rs2280473	-0.0289573532	0.1093192993491096	0.0289573532	0.1030962389382953	0.0106209984036592	0.2595930860883924	-0.0003179674095383	0.0998377034804327	0.0003179674095383	0.0946439949942956	0.5187418956628181	0.139582096931583	-0.0151005890675519	0.0741181504640258	0.0151005890675519	0.0687658043365401	0.0055595444268088	0.1057074392511623	-0.0001677677097939	0.0718559289779718	0.0001677677097939	0.0671102633259315	-0.0083009159846056	0.2514695365606939	0.0083009159846056	0.2440560035204313	RIIAD1	2947	CELF3	9316	OAZ3	55413	False	False	False	ref	-100	0.00567	-90	0.11505
251	chr1	153898374	T	C	rs11800001	-0.00448791476	0.6202558294874979	0.00448791476	0.6070745754559276	0.0185190352544372	0.0375371437828309	-7.745677993949782e-05	0.4114063118670605	7.745677993949782e-05	0.4000775430958012	0.2200105810226247	0.6246492508676416	-0.0009607935946919	0.6178446117366541	0.0009607935946919	0.6038296070468758	0.0041119133430359	0.2265650572032257	-1.6732590244441924e-05	0.4604757606310641	1.6732590244441924e-05	0.4477075826801637	-0.0042054378157449	0.4484843743608286	0.0042054378157449	0.437835339515067	GATAD2B	24986	DENND4B	48344	CRTC2	60241	False	False	False	ref	-45	0.001404	35	0.00589
252	chr1	153902212	C	T	rs11264559	-0.045858578	0.0373726808673219	0.045858578	0.0349730639246846	0.0101607635776448	0.291123344085314	-0.0004671632564931	0.0479577183572791	0.0004671632564931	0.0452013385495057	0.2124358136495191	0.6324307134535664	-0.0099030734631654	0.1327813246493842	0.0099030734631654	0.1249375626869766	0.0021919446507926	0.5497192759105645	-0.000101952334267	0.1229359959099556	0.000101952334267	0.1161104461399277	-0.0435772155312813	0.007744701582711	0.0435772155312813	0.0075420461178952	GATAD2B	21148	DENND4B	44506	CRTC2	56403	False	False	False	ref	100	0.00986	85	0.0238
253	chr1	153907268	C	T	rs6671132	-0.0388344096	0.060991201745037	0.0388344096	0.0571763268746842	0.0102650152977625	0.2905734327233928	-0.0004130856404225	0.0667806165378013	0.0004130856404225	0.0630171975201046	0.2734883141941306	0.5304203102723123	-0.0112255820696802	0.1211221148945959	0.0112255820696802	0.1135121633028416	0.0028484619036478	0.4431349563439002	-0.0001207231623074	0.115116930331404	0.0001207231623074	0.1084433768163019	-0.0317409931638294	0.0217680835471492	0.0317409931638294	0.0212249322921219	GATAD2B	16092	DENND4B	39450	CRTC2	51347	False	False	False	ref	45	0.001141	-65	0.02078
254	chr1	153910068	A	C	rs10908525	-0.0001086917999999	0.5653992015300516	0.0053285418	0.5675320131422401	0.0084949637878005	0.4932784399072228	5.77597760354051e-08	0.571410212900618	4.5926292918610144e-05	0.5735200897991244	0.0636023195261361	0.8757610053192755	-3.790411814848001e-05	0.7931383356027369	0.0003171013123977	0.7963838416320932	0.0005419368350974	0.8744445404116981	-3.299577572517705e-07	0.7901115109108334	2.7687326951756145e-06	0.7933407882714744	0.0001327814603885	0.5081861105945233	0.0033983755018204	0.5107591417440044	GATAD2B	13292	DENND4B	36650	CRTC2	48547	False	False	False	ref	-45	0.002594	-55	0.005707
255	chr1	153923736	A	G	rs4845357	0.10988287	0.001293895605668	0.10988287	0.0013371673727687	0.0230969538050172	0.014185924182758	0.0025538979962315	0.0024340366927609	0.0025538979962315	0.0025262074478329	0.6885652340791917	0.0131887006908067	0.0757678878983898	0.0005332159207041	0.0757678878983898	0.0005680159922705	0.0159075122340155	0.0028130077696965	0.0017615432787038	0.0014774465936944	0.0017615432787038	0.0015400119467738	0.0124876814074834	0.1396088624635826	0.0124876814074834	0.1440755329592254	GATAD2B	376	DENND4B	22982	CRTC2	34879	False	True	True	alt	100	0.02197	-45	0.0678
256	chr1	153926854	A	C	rs10796968	0.0213014268	0.1540740017819359	0.0213014268	0.1621792796755227	0.0101057943824308	0.3001113842799332	0.0002147126518633	0.1440791083647396	0.0002147126518633	0.1512466103686194	0.1798815340408094	0.6858206214902609	0.0038413151480343	0.2807975085383329	0.0038413151480343	0.2925759538327398	0.0017681446081114	0.6455772229327091	3.763877126229817e-05	0.2608654469183926	3.763877126229817e-05	0.271444199245391	0.0202782186537204	0.0627658584939779	0.0202782186537204	0.0645246864678015	GATAD2B	3494	DENND4B	19864	CRTC2	31761	False	False	False	alt	-100	0.008606	-85	0.02112
257	chr1	153928826	A	G	rs3748848	-0.058776423	0.0174260333249084	0.058776423	0.016381559853724	0.0227293764319112	0.0153147206632482	-0.0013394886468486	0.0080291191256889	0.0013394886468486	0.0076674224664019	0.4895361985082832	0.1879985733699135	-0.0290855979843983	0.0186389085121434	0.0290855979843983	0.0172486856263914	0.0111812831887463	0.0095305564894785	-0.0006659882332208	0.008364204247328	0.0006659882332208	0.0078632875422728	-0.0207491778960362	0.0673042964904643	0.0207491778960362	0.0655367950430099	GATAD2B	5466	DENND4B	17892	CRTC2	29789	False	True	False	ref	-50	0.00232	-15	0.01257
258	chr1	153931738	T	C	rs11586593	0.0490752645999999	0.0256614527444592	0.0490752645999999	0.0276305632806659	0.0137138387703735	0.1083726781223587	0.0006640231443973	0.0221760069089276	0.0006640231443973	0.023605338343088	0.4293281050633305	0.2833480764476149	0.0210123672852004	0.0335919347287436	0.0210123672852004	0.0367124380243697	0.0059539029814113	0.0816829751067702	0.0002875242142137	0.0256060910483195	0.0002875242142137	0.027679628112759	0.0247388458386497	0.0460497216969377	0.0247388458386497	0.0473195218912156	GATAD2B	8378	DENND4B	14980	CRTC2	26877	False	False	False	alt	-100	0.002289	20	0.02911
259	chr1	153947280	T	G	rs946682	0.0190118216	0.1926938496424505	0.0190118216	0.2018398377738173	0.0095386004004184	0.3603445637872956	0.0001960258948411	0.1886548966475792	0.0001960258948411	0.1967430693923411	0.57433168393863	0.0728998143879715	0.0108776939160826	0.1079920575957163	0.0108776939160826	0.1158550213460679	0.0054645352354953	0.1114325856286701	0.0001119967279711	0.1097247102782954	0.0001119967279711	0.1168700493939171	0.0034772144939262	0.496619187474405	0.0034772144939262	0.5081870658487799	DENND4B	562	CRTC2	11335	CREB3L4	20255	False	False	False	alt	75	0.01111	-85	0.06226
260	chr1	163732741	G	C	rs10737494	0.0206205117	0.1792671387520969	0.0206205117	0.1881269203018751	0.0093888627712141	0.3664906591354442	0.0001942470634638	0.1807225724160257	0.0001942470634638	0.18880193327045	0.0103942986960445	0.979898290967254	0.000220213780235	0.8279310665239519	0.000220213780235	0.842063708583721	9.777894133992376e-05	0.977797888947064	2.07840810190196e-06	0.8172098649053428	2.07840810190196e-06	0.8314278813366538	0.0034606168113776	0.4902872397065934	0.0034606168113776	0.5018274765668912	RGS5	410950	NUF2	466164	RGS4	663965	False	False	False	alt	45	0.002155	-100	0.02882
261	chr1	163739753	C	T	rs3963479	-0.0012969270306	0.8076083763539468	0.0022719019346	0.8064627315298266	0.0156695432870348	0.0683492675666632	-1.8703378565136023e-05	0.6744782488698012	3.63721581068669e-05	0.6713208936303899	0.114347659208083	0.7980901668303021	-0.0001110673838098	0.8511801448548182	0.0002541438990867	0.8487454972418846	0.0018130145600992	0.6401917865623105	-1.5457917005794688e-06	0.7791151153621113	4.138598856784711e-06	0.7761593089338058	-0.0007842405004201	0.6908908657856975	0.0018547910248031	0.6893799948507083	RGS5	417962	NUF2	473176	RGS4	670977	False	False	False	ref	100	0.00615	100	0.05658
262	chr1	163745482	A	G	rs1932355	0.0125727036599999	0.2901668179004253	0.0125727036599999	0.3012668706604289	0.009892711119283	0.3218457787131375	0.0001211532094736	0.2815969287091555	0.0001211532094736	0.2914193904659595	0.3171713399516592	0.460633356475494	0.0037968087666722	0.2880265527145298	0.0037968087666722	0.2997389253967457	0.0031548842961224	0.3779469440824387	3.679769965353701e-05	0.2742305797609912	3.679769965353701e-05	0.2849778708904283	0.0100955404101702	0.2094291274603717	0.0100955404101702	0.2159000655065278	RGS5	423691	NUF2	478905	RGS4	676706	False	False	False	alt	-100	0.0006976	100	0.013855
263	chr1	163752441	T	G	rs6683086	0.00296166892	0.7113906740182625	0.00315886352	0.7211880050573976	0.0214389137230806	0.019780546038104	6.003332865644338e-05	0.4631018085760181	6.451435200880105e-05	0.4722077390995032	0.1318706625587402	0.7711086394406099	0.0003846705861396	0.7595934379569704	0.0004110998474234	0.7693751255298079	0.0028450548575047	0.4430450412721964	7.906376221810994e-06	0.6085124757642215	8.506951141804573e-06	0.6182446093961338	0.0027116463863732	0.5422845717949228	0.0029149679975932	0.5510490922969397	RGS5	430650	NUF2	485864	RGS4	683665	False	True	False	alt	85	0.003874	-100	0.03079
264	chr1	163764480	T	A	rs1934230	-0.00438824144	0.6335785655172476	0.00438824144	0.6204800759516488	0.0195306740949832	0.0298088592839253	-8.606960795184247e-05	0.394027903418026	8.606960795184247e-05	0.3834385795338757	0.1571738296040415	0.7270420627737687	-0.0007087374972516	0.6815458020414424	0.0007087374972516	0.6678783484813151	0.0030692643372442	0.3994296682742752	-1.388050594653222e-05	0.5180259325342597	1.388050594653222e-05	0.5052021445388639	-0.0041203746926834	0.4547549111958537	0.0041203746926834	0.443797655383574	RGS5	442689	NUF2	497903	RGS4	695704	False	False	False	ref	80	0.01434	80	0.1083
265	chr1	163775601	A	G	rs10799961	0.0306513898	0.0896286054059919	0.0306513898	0.0954672677035591	0.0083147339548741	0.537925499057326	0.0002553777732973	0.1169814101331467	0.0002553777732973	0.1234428124854334	0.3915911990788285	0.3513506199829218	0.0120140386779707	0.0904350078665355	0.0120140386779707	0.097556229706332	0.0032651572746217	0.3767099012894269	0.0001004148073478	0.109949533351355	0.0001004148073478	0.1173378487210403	0.017130883100447	0.0899804489895548	0.017130883100447	0.092646501456818	RGS5	453810	NUF2	509024	RGS4	706825	False	False	False	alt	100	0.002941	-15	0.01605
266	chr1	163777858	A	G	rs3856207	-0.0055036474	0.5724759819683701	0.0055036474	0.5595962336925193	0.0281634428502707	0.0053121697267319	-0.0001594902109208	0.2626135480868276	0.0001594902109208	0.2530673879953595	0.1565742383219742	0.7289140654326196	-0.0009122980410215	0.6550413729140994	0.0009122980410215	0.6414792467321118	0.0045310650364179	0.1972277697127129	-2.73410741831102e-05	0.4073299267433959	2.73410741831102e-05	0.3952912898126132	-0.0051556551416508	0.4027120256320754	0.0051556551416508	0.3924665968531296	RGS5	456067	NUF2	511281	RGS4	709082	False	True	True	ref	35	0.001022	50	0.03348
267	chr1	173645232	G	T	rs969029	0.003287748506	0.6990412555499155	0.003287748506	0.7123658084561222	0.012966017355299	0.132545923902604	4.342122564468226e-05	0.5849811450578397	4.342122564468226e-05	0.5976588745357482	0.0223550036826107	0.9561330898712443	7.966429304857709e-05	0.9116301410880434	7.966429304857709e-05	0.9259107456927618	0.0002933254876775	0.9340034689704932	1.06609768498831e-06	0.8833509830002813	1.06609768498831e-06	0.8976043926380133	0.0011805101712673	0.7663181679119614	0.0011805101712673	0.7798039273913736	TEX50	9893	ENSG00000285777	24605	ANKRD45	24619	False	False	False	alt	-100	0.08295	70	0.04492
268	chr1	173725120	T	G	rs61826814	-0.0045965524199999	0.6232497822407133	0.0045965524199999	0.609667809759796	0.0152724233055382	0.0741745060684518	-7.330842946159881e-05	0.4542197372891322	7.330842946159881e-05	0.4424292796992461	0.13920683824521	0.7563886603219708	-0.0005848260971477	0.7203008656619685	0.0005848260971477	0.7060990699210739	0.0020598248333411	0.5936573080781536	-8.890463822325414e-06	0.6165698784561905	8.890463822325414e-06	0.6027480381400712	-0.0040519092521706	0.4622397045326376	0.0040519092521706	0.4511502899185831	KLHL20	10178	ANKRD45	55269	ENSG00000285777	55283	False	False	False	ref	60	0.002808	100	0.07886
269	chr1	173805138	C	A	rs61827870	0.0045170453399999	0.6026281144636703	0.0045170453399999	0.61566867472174	0.0073008570133552	0.7360043594127804	3.385873890820094e-05	0.6466566484037205	3.385873890820094e-05	0.6596266087314824	0.1517712839344806	0.7379895895041451	0.0007415499182585	0.6594692849307217	0.0007415499182585	0.6730908933745888	0.0011233760485097	0.775179059448824	5.619361443789317e-06	0.6880575406585844	5.619361443789317e-06	0.7017039255408049	0.0045664374111764	0.4144802797193356	0.0045664374111764	0.4252719351345898	DARS2	19516	CENPL	19745	ZBTB37	62945	False	False	False	alt	100	0.001865	20	0.02103
270	chr1	173835419	A	C	rs28804123	-0.040060622	0.0577709805239088	0.040060622	0.0542418448211731	0.0149413950414682	0.0839360422484438	-0.0006540197340175	0.0352745967455231	0.0006540197340175	0.0334077792035175	0.2842913308229339	0.5253442984298421	-0.0114030255425659	0.1188140348341869	0.0114030255425659	0.1109865094389029	0.0043062775821418	0.2008522499505308	-0.0001883168149763	0.07082260456066	0.0001883168149763	0.0663326404071099	-0.0338717206610026	0.0188085202984971	0.0338717206610026	0.0183005127414796	CENPL	10536	DARS2	10765	ZBTB37	32664	False	False	False	ref	85	0.04477	85	0.04974
271	chr1	173855675	C	T	rs9425757	0.00608351726	0.5490995736609343	0.00622806958	0.5584286679449741	0.0243186680010241	0.011239801623064	0.0001678687842315	0.262022208083173	0.0001711211448551	0.2693151829739043	0.3295594352638512	0.4485152462044921	0.0019901682250568	0.4833622162801073	0.0020429738563985	0.4926471289275347	0.0080061627873254	0.0299357419395371	5.5234225259439045e-05	0.2659019936607967	5.642232761898307e-05	0.2741215318450131	0.0045581385699021	0.4449442434081475	0.0046784717683792	0.4519635833745394	ZBTB37	12408	CENPL	30792	DARS2	31021	False	True	False	alt	95	0.02124	30	0.01588
272	chr1	173878871	A	G	rs9425765	0.0470561778	0.0309030241016478	0.0470561778	0.0330922924450588	0.0152574669152579	0.0763654901331567	0.0007323639683831	0.0215364117799627	0.0007323639683831	0.0229003251424479	0.2288343240075104	0.610031331088177	0.0109296000002098	0.1023884758911263	0.0109296000002098	0.1099017797955929	0.0035166496589061	0.3038120778986084	0.0001704681958502	0.0599426238041532	0.0001704681958502	0.0643518593616495	0.0445253581468687	0.0071320234450655	0.0445253581468687	0.007254792766299	ZBTB37	10788	SERPINC1	38456	CENPL	53988	False	False	False	alt	100	0.05536	100	0.04898
273	chr1	173884136	C	T	rs60265316	-0.0015857110772	0.8346388616740779	0.0017236980748	0.8322334833223887	0.0159023229980407	0.0684604378768485	-3.3142161352631535e-05	0.7381038513292715	3.480467941790347e-05	0.7330880677983289	0.1381923048994283	0.7590468766186057	-0.0002496910553013	0.8683415525156687	0.0002682683958527	0.8647748050045119	0.0022225449438992	0.5561327380872876	-5.211959980009307e-06	0.7918550579145114	5.434317979051751e-06	0.7873509249070044	-0.0017137107231402	0.7379936044898576	0.0018381933422545	0.7334990047925534	ZBTB37	16053	SERPINC1	33191	CENPL	59253	False	False	False	ref	70	0.003235	-30	0.01315
274	chr1	173886160	A	T	rs1322775	0.0208491981	0.1510274948799042	0.0208491981	0.159109640449772	0.0121676716183186	0.1650163362855231	0.0002687019713889	0.1133187149742838	0.0002687019713889	0.1190685173194322	0.4371539123849832	0.2735923866120951	0.0090122745758016	0.1295214436295839	0.0090122745758016	0.1377177648876117	0.0053009763358981	0.119431575990721	0.0001159905282774	0.0999635433062641	0.0001159905282774	0.106196657888859	0.0092262367866885	0.1950747964342346	0.0092262367866885	0.2008892210320149	ZBTB37	18077	SERPINC1	31167	CENPL	61277	False	False	False	alt	95	0.006824	35	0.0768
275	chr1	173887899	C	T	rs7349095	0.00659194824	0.4860523108055129	0.00659194824	0.498760325825209	0.0269219046633667	0.0067526923521851	0.000174300392434	0.215327571355016	0.000174300392434	0.224065378239955	0.171182273675038	0.7052023604474765	0.0011791304384709	0.5717457980039677	0.0011791304384709	0.585215447672259	0.0044689146207663	0.1951182720666295	2.9831548777249672e-05	0.3406424739105474	2.9831548777249672e-05	0.3522999109184656	0.0065166651106338	0.3180714977419094	0.0065166651106338	0.32714492202882	ZBTB37	19816	SERPINC1	29428	CENPL	63016	False	True	True	alt	-20	0.000721	80	0.02847
276	chr1	173896268	A	G	rs1322779	-0.0012069205479999	0.8058992987170535	0.002011238548	0.7984021921957362	0.0268886641518868	0.0067363556701568	-3.3877100232445744e-05	0.5138380896071865	5.226846787381069e-05	0.5067765062023842	0.1369993464662496	0.7593448667238232	-0.0002068518868125	0.8108552604698149	0.0002705805671091	0.8026570173552968	0.0037493004598865	0.2787669887968992	-5.65035335991094e-06	0.6341852620319861	7.107560032643493e-06	0.6258363754347751	-0.0013672340999387	0.6731224983926576	0.0018776128383073	0.6659090468312446	SERPINC1	21059	ZBTB37	28185	CENPL	71385	False	True	True	ref	60	0.001175	80	0.01797
277	chr1	173896523	T	C	rs9425434	-0.000443908666	0.8775003602394505	0.001196259266	0.8731404007422244	0.0181626052518962	0.0401943191075714	-1.151230742167918e-05	0.7351154869001423	2.2812632363390568e-05	0.7302809110496924	0.1499102687787217	0.7394748259116907	-5.246011135836895e-05	0.8621883649430704	0.0001699865048904	0.8580293237660412	0.0027499819092077	0.4460488797969865	-1.5106202710413563e-06	0.7699473163881032	3.2754845549274214e-06	0.765195430251735	-0.0004917063455015	0.7648939114219143	0.0012469009014615	0.7609070512393603	SERPINC1	20804	ZBTB37	28440	CENPL	71640	False	False	False	ref	-90	0.002495	-90	0.01709
278	chr1	173900220	T	C	rs73039035	-0.0015171903	0.7843829667509716	0.00242269046	0.7767386630474439	0.0203761369658696	0.024110829381047	-3.311011093022996e-05	0.5933572139153168	5.0686449155224e-05	0.5861810446417034	0.1059575306797787	0.8154318415123606	-0.0001446139114255	0.8432109480360122	0.00025746444925	0.8357314457262847	0.0021772847861243	0.574983675260144	-3.201548370362268e-06	0.7274949608309182	5.392049593767889e-06	0.7202223063204142	-0.0015269867944688	0.6650555762606157	0.002170146993226	0.6577577752635071	SERPINC1	17107	ZBTB37	32137	CENPL	75337	False	False	False	ref	-15	0.002144	90	0.03049
279	chr1	173912733	C	T	rs941989	0.0132579010599999	0.2674952072694035	0.0132579010599999	0.2782079962645742	0.0193811185717254	0.0303275455536056	0.0002564829158549	0.1145820312665619	0.0002564829158549	0.1208458474749014	0.3012251164431166	0.4911880781735429	0.0040537316834779	0.2785964886524191	0.0040537316834779	0.2902772582010882	0.0057626625764976	0.0887519409704298	7.748135208555427e-05	0.1460117220160961	7.748135208555427e-05	0.1544324930279519	0.0098050809655701	0.1923485656652175	0.0098050809655701	0.1986102246059308	SERPINC1	4594	ZBTB37	44650	CENPL	87850	False	False	False	alt	60	0.001404	-5	0.00589
280	chr1	173916398	G	T	rs2227593	-0.0208087967999999	0.179253937758308	0.0208087967999999	0.1708254263090665	0.0086696545244725	0.4653172527089462	-0.0001847422612448	0.200207614980672	0.0001847422612448	0.192066722562345	0.4413593502007282	0.2625075521107944	-0.0092928950168656	0.1440024206665138	0.0092928950168656	0.1356185687059844	0.0038093056457249	0.277685459692132	-8.207439909471309e-05	0.1599836410459283	8.207439909471309e-05	0.1517853609170496	-0.0091245759810786	0.2211872919491885	0.0091245759810786	0.2145719683941384	SERPINC1	929	ZBTB37	48315	CENPL	91515	False	False	False	ref	-100	0.00451	-50	0.02518
281	chr1	173981144	T	C	rs1884994	-0.0008928517686	0.9276357703993404	0.0008928517686	0.9215435976817772	0.0209558908903739	0.0216489036743937	-1.7987716153791416e-05	0.8287139248398404	1.7987716153791416e-05	0.8187674048370208	0.0654280646064792	0.8844625467236138	-6.624257504134507e-05	0.9547232136123676	6.624257504134507e-05	0.9470543292662889	0.0013876162788553	0.7199076701012761	-1.3780405082438286e-06	0.9117491678760504	1.3780405082438286e-06	0.9011554421660924	-0.0005290511312357	0.906250707330835	0.0005290511312357	0.8976617744918617	ENSG00000293562	41154	RC3H1	41213	SERPINC1	63817	False	False	False	ref	45	0.004433	100	0.01791
282	chr1	174046493	T	C	rs6696163	0.021128649	0.1650942285728208	0.021128649	0.1735470139747787	0.0067132205756247	0.7717403947350461	0.0001485205435929	0.2302536858742084	0.0001485205435929	0.2394133412583633	0.0627184929304245	0.8839963237663114	0.0013236428220235	0.5165703060235751	0.0013236428220235	0.5303589535912415	0.0004290581698929	0.9042463938264974	9.38163791740268e-06	0.560515618856358	9.38163791740268e-06	0.5739955790543064	0.0149171671905309	0.117026442156061	0.0149171671905309	0.1205206992608092	RC3H1	24136	ENSG00000293562	24195	RABGAP1L	112918	False	False	False	alt	80	0.0008383	-100	0.02708
283	chr1	174052172	G	C	rs12092774	0.00803201998	0.3375384950753498	0.01057943458	0.346227253067393	0.0087683037207424	0.4373226483436206	7.754948380566521e-05	0.3422780692120285	9.67119162847512e-05	0.3504476394466244	0.4504320584238425	0.2501253282517893	0.0032986418725916	0.2562390351982826	0.0045369254728488	0.2646656665697554	0.0039272750229766	0.2569703678203046	3.1781142801322273e-05	0.2598371192511566	4.109589112378922e-05	0.2680690671371022	0.0036411166090934	0.4004031557408921	0.0045705868318135	0.4073240002402688	RC3H1	29815	ENSG00000293562	29874	RABGAP1L	107239	False	False	False	alt	95	0.002413	5	0.002014
284	chr1	174055925	G	T	rs77574979	-0.00324284796	0.6113898878301822	0.0050273916	0.605221624375951	0.0068321005883981	0.8187955594167995	-2.0640122493991857e-05	0.6817275134546052	3.390079832190331e-05	0.6764742058662974	0.590087034097864	0.057066582136139	-0.0018947982378527	0.3931940894335597	0.0029437871017714	0.387112675199687	0.0040269356915946	0.2512372753554661	-1.2023546143558422e-05	0.4562436873899883	1.981680487828512e-05	0.4506245330140606	-0.0005871430201558	0.8458130425954125	0.00082780941711	0.8406788485455157	RC3H1	33568	ENSG00000293562	33627	RABGAP1L	103486	False	False	False	ref	-5	8.01e-05	-40	0.1084
285	chr1	174061643	T	A	rs61228022	-0.0121315089	0.3159361806452992	0.0121315089	0.3051169399931637	0.0131756863268579	0.1256633483375606	-0.0001611210689723	0.2352253759452928	0.0001611210689723	0.2265307891281615	0.2403240697517608	0.5825594350348468	-0.0029466856496557	0.3812624918115643	0.0029466856496557	0.368898359663818	0.0031132524395605	0.382746160427902	-3.866574435097861e-05	0.3005168528952794	3.866574435097861e-05	0.2896611588317576	-0.0103465803587173	0.1879258829556342	0.0103465803587173	0.1824772264167989	RC3H1	39286	ENSG00000293562	39345	RABGAP1L	97768	False	False	False	ref	-60	0.00529	100	0.02957
286	chr1	174062848	G	T	rs55988379	-0.0667270036	0.0109388276612554	0.0667270036	0.0103533454791572	0.0150111867028774	0.0799105970842077	-0.0010479603066978	0.012981208036253	0.0010479603066978	0.0123418845970747	0.2531603024927644	0.5695122019323237	-0.0168178938488512	0.062308222603919	0.0168178938488512	0.057729155686756	0.0038565497911874	0.2598966403828546	-0.0002688623092316	0.0391430916853334	0.0002688623092316	0.036498494748608	-0.0607765640722413	0.0022000013130451	0.0607765640722413	0.002162787714081	RC3H1	40491	ENSG00000293562	40550	RABGAP1L	96563	False	True	False	ref	-85	0.00992	100	0.04465
287	chr1	174063084	C	A	rs61826842	-0.0223139542	0.1673823447961414	0.0223139542	0.1592333028778232	0.018698915779074	0.0362184341533036	-0.0004149078253664	0.0596776198781647	0.0004149078253664	0.0562290476075249	0.2886088029958817	0.513636795068184	-0.0064874942638513	0.2042014699060064	0.0064874942638513	0.1940409842366838	0.0052182780411184	0.1237300289601845	-0.00011646002583	0.1049729137727005	0.00011646002583	0.0984388190623242	-0.0181765371010072	0.0886482210735299	0.0181765371010072	0.0862278813257092	RC3H1	40727	ENSG00000293562	40786	RABGAP1L	96327	False	False	False	ref	-100	0.00603	20	0.0152
288	chr1	174106636	C	T	rs13376011	0.0017358360739999	0.8088196818866431	0.001921504006	0.8170867712178358	0.0333444025141639	0.0025572779958421	5.826282517547167e-05	0.4755603893851637	6.47632895651933e-05	0.4837184124327013	0.0966545296113029	0.8225090881611945	0.0001465604048011	0.8558301801766306	0.0001634093666947	0.864246697697207	0.0031937773237488	0.3470703666995979	4.854967492933044e-06	0.6791159101198951	5.444870525965387e-06	0.6877395895912904	0.0013278146038859	0.7220019176848563	0.0014979408500088	0.7300088491022187	RABGAP1L	52775	RC3H1	84279	ENSG00000293562	84338	False	True	True	alt	65	0.001038	-100	0.0536
289	chr1	174133461	G	A	rs6425273	-0.0652468076	0.0108145704526337	0.0652468076	0.0101818396879864	0.0133166568902055	0.1196769900076655	-0.0008805909864173	0.0157331763651944	0.0008805909864173	0.0149494100549179	0.2048465233041836	0.6480288794504668	-0.0130884122366505	0.0918540937381527	0.0130884122366505	0.085428800834812	0.0027093809966252	0.4651229533734369	-0.0001759646184046	0.0634525917045426	0.0001759646184046	0.0591910564655902	-0.0614529196360957	0.0016412262699183	0.0614529196360957	0.0015868110573569	RABGAP1L	25950	RC3H1	111104	ENSG00000293562	111163	False	True	False	ref	100	0.01024	-15	0.0123
290	chr1	177285924	C	T	rs11587684	-0.021776783	0.1714603908526444	0.021776783	0.1630609036136418	0.0089951740148579	0.4116491173768725	-0.0001966295197812	0.1798543287179253	0.0001966295197812	0.1719844895146135	0.088185562090893	0.839427016327892	-0.0019025440349222	0.4698348121337741	0.0019025440349222	0.4564057034521074	0.0008082088033205	0.8268799681850839	-1.75621195272615e-05	0.4586779715682528	1.75621195272615e-05	0.4458742629723413	-0.0170914636043941	0.0867306333827598	0.0170914636043941	0.0842621832587564	BRINP2	114965	ASTN1	120951	SEC16B	698379	False	False	False	ref	-10	0.00177	95	0.03943
291	chr1	177289737	G	A	rs72720790	0.002370387034	0.7425641058717678	0.002370387034	0.7563643777918353	0.0084206497413911	0.5173974732776789	2.1083615781397388e-05	0.7349613245706106	2.1083615781397388e-05	0.7485969685385935	0.204742787788255	0.6517372859188584	0.0004948023086018	0.7195078009381498	0.0004948023086018	0.7336041559272984	0.001721010551671	0.6604650007726677	4.380702777450372e-06	0.718974473979488	4.380702777450372e-06	0.7330868949588124	0.0025954626085332	0.579874980207315	0.0025954626085332	0.5921880321550876	BRINP2	118778	ASTN1	124764	SEC16B	694566	False	False	False	alt	-70	0.001472	70	0.0608
292	chr1	177291972	G	A	rs11587000	0.00626920116	0.4813592604392122	0.00626920116	0.4938568886127517	0.0080101680064155	0.5910173715710152	5.075920797050995e-05	0.5126286023113358	5.075920797050995e-05	0.5247023139009137	0.0798825713959687	0.8577599433309964	0.0005090808705959	0.7087392325881002	0.0005090808705959	0.7228668380001744	0.0006734745585401	0.8621483019759641	4.3301192209785375e-06	0.7182924098014496	4.3301192209785375e-06	0.7324340054920337	0.0050581437566779	0.3634568605506242	0.0050581437566779	0.3731079375986904	BRINP2	121013	ASTN1	126999	SEC16B	692331	False	False	False	alt	-50	0.001816	70	0.0306
293	chr1	177591300	C	T	rs1415339	-0.0646335148	0.0119770045277832	0.0646335148	0.0112643742025413	0.0146138639573513	0.0874517950904568	-0.0009608032388373	0.0132830579214656	0.0009608032388373	0.0125941208782999	0.5399475098289401	0.1148242937993642	-0.03494263722388	0.0105905011312478	0.03494263722388	0.0098087498559118	0.0079074246822986	0.031116335554776	-0.000520515923668	0.0115178144283203	0.000520515923668	0.0107954283061707	-0.0165375159493355	0.1013754105868473	0.0165375159493355	0.0984720166352535	SEC16B	393003	BRINP2	420341	ASTN1	426327	False	True	False	ref	-45	0.004242	-80	0.01831
294	chr1	177605857	A	G	rs34929437	-0.00338214314	0.6510279195987421	0.00393737994	0.6426666341485646	0.0228948091339433	0.0146064723881251	-8.689364563446838e-05	0.3847260013592723	9.805076356576796e-05	0.3767457665832519	0.0861357482961441	0.8485580222415667	-0.0003167650630222	0.7922212198785153	0.0003592664601282	0.7838753301778314	0.0020151584497473	0.5984275427918608	-8.395919557702799e-06	0.6258139494251851	9.249957184805356e-06	0.6172310047627662	-0.0031639332358219	0.5307083658393911	0.0034543926804219	0.5231470909095447	SEC16B	378446	BRINP2	434898	ASTN1	440884	False	True	False	ref	95	0.00222	-85	0.03047
295	chr1	177711567	T	A	rs12143554	0.00284745286	0.7079587439662043	0.0031008388999999	0.7177764056625187	0.0069052367472693	0.7946327988934155	2.0714413094679217e-05	0.7471072360654337	2.2282989838336046e-05	0.7566144648671314	0.4995943941327191	0.1740413056441128	0.0014224653133327	0.5132083319970718	0.001545516533432	0.523829500022891	0.0034522921662218	0.3368802799312051	1.0345405729113175e-05	0.5583873142914871	1.1107149644273609e-05	0.568493756452111	0.0008610047822072	0.804682131315681	0.0009688897187729	0.8141884367529593	SEC16B	272736	RASAL2	382538	BRINP2	540608	False	False	False	alt	-50	0.004196	100	0.04773
296	chr1	177759570	G	A	rs12138989	-0.0511677663999999	0.0274085686353156	0.0511677663999999	0.0256560024760675	0.0154170508428296	0.0727304936981097	-0.0008083945156962	0.0197446962922108	0.0008083945156962	0.0186000231629818	0.5687112936856191	0.079772772618252	-0.0291607422512852	0.0181678858198202	0.0291607422512852	0.0166841618459938	0.0087742265401622	0.0211759902278335	-0.0004611464092721	0.0149741710006926	0.0004611464092721	0.013959157765246	-0.0101536322990901	0.1850214443348518	0.0101536322990901	0.1792783735509214	SEC16B	224733	RASAL2	334535	BRINP2	588611	False	False	False	ref	-95	0.01142	5	0.01904
297	chr1	177759699	C	T	rs55902020	-0.0572883423999999	0.0185180440784678	0.0572883423999999	0.0173459391692027	0.0113000905044559	0.2001173183162493	-0.0006426931567994	0.0270425963797164	0.0006426931567994	0.0254999800844468	0.5793047645722466	0.0681789026025945	-0.0332474377526871	0.012321301818198	0.0332474377526871	0.0113806940397663	0.0065427234666687	0.0594172923724695	-0.0003727572409705	0.0195881889314412	0.0003727572409705	0.0182831847898946	-0.0101391093268602	0.1893595395614281	0.0101391093268602	0.1834346642315454	SEC16B	224604	RASAL2	334406	BRINP2	588740	False	True	False	ref	-40	0.00283	-40	0.04468
298	chr1	177799814	T	G	rs10913422	-0.0121741389999999	0.3145158669229663	0.0121741389999999	0.3036321873889481	0.026323436339522	0.00730214703902	-0.0003115153540524	0.0986131579464185	0.0003115153540524	0.0933733938931347	0.3181277814085208	0.4633969052775935	-0.0038794421409167	0.3157920234725355	0.0038794421409167	0.3039097325676468	0.0083966779241337	0.025566542529862	-9.92952761218852e-05	0.1301967782018453	9.92952761218852e-05	0.1227300237559461	-0.0085270594093299	0.2343422245545239	0.0085270594093299	0.2274946633953469	SEC16B	184489	RASAL2	294291	BRINP2	628855	False	True	True	ref	15	0.00135	55	0.0371
299	chr1	177803759	G	T	rs12065872	0.00539770704	0.5251617046944922	0.00539770704	0.5379950450785598	0.0120586467733539	0.1696918884432666	6.514432588061625e-05	0.445713950128962	6.514432588061625e-05	0.4571525283766761	0.3935103061235074	0.3458580302001428	0.0021137910607447	0.425587638629898	0.0021137910607447	0.4386648833404654	0.0047218543045513	0.1666021570374146	2.5404513698659225e-05	0.3630439946916291	2.5404513698659225e-05	0.3750493303752804	0.003197128600919	0.5141639697696244	0.003197128600919	0.5257754695138162	SEC16B	180544	RASAL2	290346	BRINP2	632800	False	False	False	alt	-45	0.001543	-70	0.02875
300	chr1	179110055	T	C	rs3818433	0.0499827312	0.0254334478508457	0.0499827312	0.0272771668460241	0.00967876496924	0.3469775185615364	0.000500015632219	0.0418632803219502	0.000500015632219	0.0445812511137879	0.4513511550949698	0.2538195298695364	0.0226807089889004	0.0293773130186633	0.0226807089889004	0.0322268842222804	0.0043772874692792	0.209128108292285	0.000227300491287	0.0403778343407497	0.000227300491287	0.0436044603636216	0.021757487110862	0.0585638724990412	0.021757487110862	0.0602681649873566	TOR3A	27984	FAM20B	84250	ABL2	119629	False	False	False	alt	-70	0.011505	-100	0.06934
301	chr1	179260586	G	A	rs432798	-0.0330733608	0.0898070380917159	0.0330733608	0.0845871902116584	0.0084593122384443	0.5102415375480623	-0.0002865269989917	0.1179053854865122	0.0002865269989917	0.1120545523440193	0.3570410481436529	0.3994326715737235	-0.0117933738176795	0.1115186082603666	0.0117933738176795	0.1041773079718093	0.0030141074400934	0.4188558765769804	-0.000102198641024	0.1297806826573841	0.000102198641024	0.1223568307386348	-0.0213010508407763	0.0624925051469139	0.0213010508407763	0.0608978933396682	ABL2	30902	SOAT1	33129	AXDND1	105135	False	False	False	ref	-95	0.02277	70	0.03616
302	chr1	179264910	A	C	rs3122378	0.00119987214	0.6376180915239693	0.00390214754	0.643321001289503	0.0153599853863266	0.0752231063150166	1.747850611676611e-05	0.4741992187432818	5.87351821107566e-05	0.4791511258646312	0.3699332980632578	0.3843729293931876	0.0004000866377305	0.5120338946811879	0.0014403391886121	0.5179509163224445	0.0057230743457145	0.0951774642627347	5.618024855030693e-06	0.3896874720105291	2.181414094887035e-05	0.3950643059790357	0.0007074762186329	0.5860934710594509	0.0024917270926046	0.5906715341354685	SOAT1	28805	ABL2	35226	AXDND1	100811	False	False	False	alt	30	0.000675	-5	0.001221
303	chr1	179300414	A	T	rs12049237	0.0063332111599999	0.5105088977473943	0.0063332111599999	0.5233568401447043	0.0132765590672383	0.1223613890067619	9.091271874860512e-05	0.4011948017542903	9.091271874860512e-05	0.4125707764895701	0.2157989190759239	0.6289413105580646	0.0015518257562949	0.5238211926904447	0.0015518257562949	0.5371658414018249	0.0029463111936507	0.4203977898398008	2.24284305840641e-05	0.4325012634290917	2.24284305840641e-05	0.4449994761479112	0.0059357462214337	0.352386813553101	0.0059357462214337	0.3618352299494334	SOAT1	6699	AXDND1	65307	ABL2	70730	False	False	False	alt	-100	0.01055	-100	0.05084
304	chr1	179319605	T	C	rs78993991	-0.0023883526	0.7328495608328419	0.00290001488	0.724628016970472	0.0222928933886307	0.0163641152414023	-5.5409831387695726e-05	0.4625814281220298	6.625190299404972e-05	0.4550764591686171	0.2109648440336517	0.637754748971879	-0.0005068740341304	0.6946659861750016	0.0006060812857933	0.6861922263831423	0.0046898800612885	0.1698096183969953	-1.170032817464817e-05	0.5061571146888899	1.3802519695248618e-05	0.4979243496233637	-0.0023713938941274	0.5715367767153026	0.0027987842197532	0.5640948510543392	SOAT1	25890	AXDND1	46116	ABL2	89921	False	True	False	ref	10	0.0004425	-15	0.02249
305	chr1	179343424	A	G	rs13306728	0.0426724544	0.0392811618592983	0.0426724544	0.0422833751217252	0.0116104353108645	0.1865199989987793	0.0004901577342965	0.0377921533209831	0.0004901577342965	0.0403778515410229	0.2118673430222305	0.6383671611729814	0.0090738923524854	0.1276936871102298	0.0090738923524854	0.1362562717999964	0.0024518957186058	0.522389582156508	0.0001039322920479	0.1034911658523726	0.0001039322920479	0.1105109220660688	0.0409049886409609	0.0080652512958212	0.0409049886409609	0.0083370527739908	AXDND1	22297	SOAT1	49709	ABL2	113740	False	False	False	alt	-100	0.1228	90	0.05798
306	chr1	179355418	T	G	rs12141199	-0.0134465714	0.2776810883878867	0.0134465714	0.2672240608630281	0.0252920816749771	0.0089639776855303	-0.0003382831728379	0.085010462889653	0.0003382831728379	0.080335496157555	0.2929013786450066	0.5084961750484828	-0.0038768565727699	0.3036517332716296	0.0038768565727699	0.2922320348150438	0.0074770496554503	0.0388791903473939	-9.834755423904e-05	0.1266840413210817	9.834755423904e-05	0.119266525306304	-0.0104648388468759	0.1760202656948242	0.0104648388468759	0.1706172502339945	AXDND1	10303	SOAT1	61703	ABL2	125734	False	True	True	ref	-15	0.003906	55	0.04105
307	chr1	179358456	A	T	rs12047160	0.0146657411999999	0.2509978567577594	0.0146657411999999	0.2615520761154801	0.0079489163836685	0.6112793225685851	0.0001244765781496	0.2910800040851918	0.0001244765781496	0.3012070874691138	0.1798773846201723	0.6881615178580379	0.0026709989490829	0.3702985294927616	0.0026709989490829	0.3830006311841269	0.0014159388773753	0.7154831332880318	2.2354820383876185e-05	0.3953950767867085	2.2354820383876185e-05	0.4076317362084529	0.0142428863369951	0.1269974353803098	0.0142428863369951	0.1311095895462845	AXDND1	7265	SOAT1	64741	ABL2	128772	False	False	False	alt	-45	0.0004578	-5	0.004997
308	chr1	179359110	T	C	rs12144580	-0.001244676164	0.732530216427104	0.002787291884	0.724602994370264	0.0470263823446859	0.0007165868342396	-5.868293746484362e-05	0.2993310967440993	0.0001272683641708	0.2942351098378727	0.1113061338810567	0.7993594711298635	-0.0001017985378644	0.7928020338954452	0.0003432268009153	0.784738335217913	0.0051297193066577	0.1295447328854059	-4.846373186143159e-06	0.4976293151594343	1.5580388401168788e-05	0.4913820889457877	-0.0010684758140644	0.5965155334307686	0.0025415201402503	0.5901582070422006	AXDND1	6611	SOAT1	65395	ABL2	129426	False	True	True	ref	-40	0.005432	40	0.005913
309	chr1	179365117	G	A	rs6425537	-0.0408831452	0.0516345652913141	0.0408831452	0.0483763226354346	0.0102084867740972	0.2865094891666438	-0.0004202660306639	0.0593684161123541	0.0004202660306639	0.0560473439774404	0.6445440305397359	0.022167777160261	-0.0263231499135644	0.0235745139705247	0.0263231499135644	0.0217029528900277	0.0065718961897586	0.0585948327013251	-0.0002702964936155	0.0331325242038572	0.0002702964936155	0.0308488613798645	-0.0037033579186505	0.4779548144032139	0.0037033579186505	0.4668427493980416	AXDND1	604	SOAT1	71402	ABL2	135433	False	False	False	ref	50	0.004925	-20	0.03595
310	chr1	179365577	G	A	rs56147147	-0.005760459912	0.5511238986729146	0.005760459912	0.5376099476723128	0.0095108667946589	0.3532661314369822	-5.505108913079677e-05	0.5316670546417508	5.505108913079677e-05	0.5190720636611892	0.7048330376871128	0.011456050951438	-0.0040887778090225	0.3213408668571602	0.0040887778090225	0.3085345662629791	0.0067095282158999	0.055781315226377	-3.913248337660848e-05	0.3071157505045084	3.913248337660848e-05	0.2953240235239656	-0.0008900507266672	0.8340163152261969	0.0008900507266672	0.820200348231492	AXDND1	144	SOAT1	71862	ABL2	135893	True	False	False	ref	85	0.03043	90	0.3813
311	chr1	179365705	C	T	rs55986478	0.02686848392	0.1146678599388966	0.02686848392	0.1215732299733575	0.0138949229662158	0.1016052954027139	0.0003573541083866	0.0724771250663432	0.0003573541083866	0.0768976918986375	0.7240386311061318	0.0099699744601178	0.0194424905721067	0.041544271397154	0.0194424905721067	0.0451463329483853	0.0100512942039633	0.0127932894277158	0.0002583617184829	0.0331616615016365	0.0002583617184829	0.0357361478093194	0.0039709955497463	0.4443330483745352	0.0039709955497463	0.4554598381994116	AXDND1	16	SOAT1	71990	ABL2	136021	True	False	False	alt	-40	0.001602	90	0.10315
312	chr1	179365923	C	T	rs55906130	-0.004733298506	0.3947138381470958	0.008779130694	0.3915641733773324	0.0094665416103379	0.3756761176152923	-5.235209356894237e-05	0.3877859844046081	8.47136663469398e-05	0.3844815395209333	0.7219867426010643	0.0101387479337982	-0.0033796802959239	0.2164256819923188	0.0063119247922198	0.2129398504462151	0.0068230393964361	0.0535479005057713	-3.729710523163683e-05	0.2138976344387868	6.075152963727378e-05	0.2106710431408022	-0.0007531198456415	0.7482926043686959	0.0013423375761158	0.7454070565278749	AXDND1	202	SOAT1	72208	ABL2	136239	True	False	False	ref	-80	0.03079	-80	0.1982
313	chr1	179366027	G	C	rs11577489	0.0506842326	0.0253207891839683	0.0506842326	0.0270029480064705	0.0162964485537139	0.0611675778857207	0.0008418384956177	0.0157880373492774	0.0008418384956177	0.0166947239036289	0.7185883670992438	0.0103870431793808	0.0365069126016143	0.0081906063131408	0.0365069126016143	0.0089070806701045	0.0117291103720825	0.0072723701660904	0.0006072598464987	0.0082181583803862	0.0006072598464987	0.0088101385953261	0.0075083766429111	0.2546095840792503	0.0075083766429111	0.262400498094447	AXDND1	306	SOAT1	72312	ABL2	136343	True	False	False	alt	25	0.001541	-5	0.03613
314	chr1	179401787	G	A	rs12135111	0.0053796853199999	0.5694082819343006	0.0053796853199999	0.5823898054107517	0.0067846582962034	0.8322513289256598	3.709157001239697e-05	0.640263703100511	3.709157001239697e-05	0.6532325693112885	0.3323063517256402	0.4475815875828848	0.0017658808787954	0.4874251994296012	0.0017658808787954	0.5006239993588116	0.0022526800124576	0.559059423700409	1.2162589949453475e-05	0.5443571526705354	1.2162589949453475e-05	0.5575020645994473	0.0037718233591634	0.4802758011196367	0.0037718233591634	0.4915476141803325	AXDND1	36066	SOAT1	108072	ABL2	172103	False	False	False	alt	100	0.004826	-20	0.04483
315	chr1	179410866	A	G	rs6674331	-0.0031935380199999	0.7107015361633688	0.0031935380199999	0.6973571674423329	0.018801313938693	0.0342971869308736	-6.154101827570454e-05	0.4923306333164656	6.154101827570454e-05	0.480410586181443	0.0662496498926337	0.876953146045426	-0.0002192114159969	0.8454012797735897	0.0002192114159969	0.8311471616286188	0.0012493052400877	0.740719988851824	-4.228669220880146e-06	0.7392762604587672	4.228669220880146e-06	0.725372249650056	-0.0025892384775775	0.596632035810213	0.0025892384775775	0.5842724443003564	AXDND1	45145	SOAT1	117151	NPHS2	165086	False	False	False	ref	85	0.01706	-100	0.02158
316	chr1	179418596	G	A	rs202196017	-0.00937898276	0.3809203891026169	0.00937898276	0.3693064742804195	0.0159334596376266	0.0631377024219797	-0.0001503778971749	0.246508386220475	0.0001503778971749	0.2375232999839023	0.6205168103403562	0.0342791637584093	-0.0057858862793796	0.2361928593566481	0.0057858862793796	0.2256703213285266	0.0098878038905388	0.0133863016040399	-9.280098728305412e-05	0.1495804398975621	9.280098728305412e-05	0.1419847919369785	-0.0010684758140644	0.8062377255763531	0.0010684758140644	0.7928668681498428	AXDND1	52875	SOAT1	124881	NPHS2	157356	False	False	False	ref	35	0.01611	100	0.0718
317	chr1	179431748	G	A	rs12120123	-0.00551688382	0.5759769688947005	0.00551688382	0.5627471614313786	0.0079168715900028	0.6025096416827572	-4.274186020199369e-05	0.6141955799972016	4.274186020199369e-05	0.6012992993977606	0.1345677859728835	0.7617612625934572	-0.0007621037713898	0.6791064063250732	0.0007621037713898	0.6648823879160605	0.0010470423617765	0.786830188160244	-5.808362056280255e-06	0.7018610764534081	5.808362056280255e-06	0.6877734654465304	-0.0049295117169264	0.391246412670826	0.0049295117169264	0.3815408248284913	AXDND1	66027	SOAT1	138033	NPHS2	144204	False	False	False	ref	-65	0.03934	-90	0.01198
318	chr1	179432368	G	A	rs12097041	-0.00884759548	0.4270759384415237	0.00884759548	0.414801943426297	0.0078052764025121	0.6032352093103754	-6.670792292591452e-05	0.4757874044257081	6.670792292591452e-05	0.4639541263672538	0.1352275438541893	0.761575994814885	-0.001261523749405	0.587669983502335	0.001261523749405	0.5736848467696268	0.0010558743295554	0.77874342580876	-9.484659454131672e-06	0.6119460398646	9.484659454131672e-06	0.5981594155338705	-0.0079025716034398	0.2511645127584147	0.0079025716034398	0.2443282705823764	AXDND1	66647	SOAT1	138653	NPHS2	143584	False	False	False	ref	0	0.0	-15	0.0087
319	chr1	179438855	A	G	rs12118625	0.0406269876	0.0500313953352126	0.0406269876	0.0531922034578784	0.0104682777221913	0.2839480909943511	0.0004731176600456	0.0575487555884158	0.0004731176600456	0.0607951028433727	0.4240500420128839	0.29839754604183	0.0175533655170048	0.0521982152280513	0.0175533655170048	0.0567300184582231	0.0044799635190003	0.2020618294896219	0.0002060317043973	0.0555099740750114	0.0002060317043973	0.0596484447349556	0.0200209545742175	0.0733285342238751	0.0200209545742175	0.0754407496679927	AXDND1	73134	NPHS2	137097	SOAT1	145140	False	False	False	alt	85	0.01192	70	0.1265
320	chr1	179441828	T	C	rs10913758	0.0069711567999999	0.4557302142415971	0.0073079282799999	0.4665080148459177	0.0063658492904674	0.8967281504561273	4.439724811196851e-05	0.5549100977574781	4.669670180436915e-05	0.5654698903780373	0.4659301445035736	0.228167318729791	0.0031687472511324	0.3380043065535097	0.003338636950752	0.3489865903703134	0.0029751386718963	0.4319373000247209	2.0217919319953137e-05	0.4120969265137526	2.1377915098555023e-05	0.4227223510560728	0.0026390315252232	0.5515115773269071	0.0027469164617889	0.5611291238593004	AXDND1	76107	NPHS2	134124	SOAT1	148113	False	False	False	alt	-85	0.003445	70	0.01181
321	chr1	179460507	C	T	rs36144856	-0.0220736876	0.1685982630951293	0.0220736876	0.1605188851935584	0.0079368904969218	0.5776729890883591	-0.0001828299758368	0.2066163098522115	0.0001828299758368	0.1985009269240659	0.0436187097376528	0.9184955515429736	-0.0012175077348345	0.6229003914233956	0.0012175077348345	0.6086462888008762	0.0003789244328538	0.91526871089568	-1.114848115705403e-05	0.6251689065645447	1.114848115705403e-05	0.6111601238008807	-0.0114316538553304	0.1542410659388128	0.0114316538553304	0.1501489902913783	AXDND1	94786	NPHS2	115445	TDRD5	131107	False	False	False	ref	70	0.001396	90	0.015305
322	chr1	179467153	A	G	rs12131475	0.000338385876	0.8355137898818843	0.00153029656	0.8385650112078179	0.0176326723729451	0.0456877347568629	3.5126923886331253e-07	0.7006943382610671	2.632608690073924e-05	0.7011760968091157	0.1142688202159773	0.800566040231936	5.148554939592497e-05	0.8730082167912081	0.0001611772491213	0.8743567178240813	0.0020276908782848	0.5957880372067967	3.350981471937435e-07	0.8008538770720601	2.7257297091113256e-06	0.8017486779166718	0.0001099596468842	0.7336541880771879	0.001433624830133	0.735013937067381	AXDND1	101432	NPHS2	108799	TDRD5	124461	False	False	False	alt	65	0.00185	20	0.002785
323	chr1	179469373	C	T	rs1928006	0.00550856354	0.5291759680531797	0.00550856354	0.5419232935000736	0.0107811378834435	0.2356806263592014	5.869816984350651e-05	0.4662526271543889	5.869816984350651e-05	0.4780875040121408	0.0369962344007717	0.9329732165798198	0.0002041811662744	0.8275687902074824	0.0002041811662744	0.8418363918482064	0.000399963702085	0.9148752892254448	2.179544704472632e-06	0.8024856603845153	2.179544704472632e-06	0.8168743395371659	0.0029419392317347	0.533857470562565	0.0029419392317347	0.5458613432312768	AXDND1	103652	NPHS2	106579	TDRD5	122241	False	False	False	alt	-95	0.0009155	95	0.01279
324	chr1	179474904	G	A	rs36100834	0.0078337656	0.4235661708601139	0.0078337656	0.4358451409629783	0.0081191755796087	0.5599181086855344	6.345796581232026e-05	0.464758675874436	6.345796581232026e-05	0.476537011658223	0.2726688036182947	0.5369252287221917	0.0020109583265723	0.4293374211766869	0.0020109583265723	0.4425323627553768	0.0022251623156132	0.5516804206685592	1.6216024619489243e-05	0.4517894125307612	1.6216024619489243e-05	0.4644742479343495	0.0067884521623667	0.304625033982335	0.0067884521623667	0.3132992283449412	NPHS2	101048	AXDND1	109183	TDRD5	116710	False	False	False	alt	-75	0.01334	-40	0.05963
325	chr1	179475676	A	G	rs61826032	0.0018134944159999	0.792264459609086	0.0019300416239999	0.8028910088417938	0.0076197502999397	0.6548452822796156	1.394760522247541e-05	0.8110881445248428	1.488925605750118e-05	0.8215257601715944	0.1173933339557463	0.787845862324274	0.0002621388898735	0.8043478107692292	0.0002659702377559	0.8153443598673322	0.0009140130644919	0.8086678225278172	2.0816797746574623e-06	0.8177761181408982	2.11263540175107e-06	0.8287127090180062	0.0017718026120602	0.6624838109456699	0.0018340439216173	0.6725315579857165	NPHS2	100276	AXDND1	109955	TDRD5	115938	False	False	False	alt	-10	1.62e-05	-50	0.014694
326	chr1	179484912	C	A	rs35954891	-0.000916293714	0.6608191565804669	0.003968714314	0.6578568176187749	0.010515425467791	0.2625034119552279	-1.2909205837423056e-05	0.6101477241763591	4.32479940674559e-05	0.6073089488934389	0.1310324795900371	0.7539267116706359	0.0001689193726258	0.7430900390712656	0.0005326449717117	0.7416729135019121	0.0013427211581631	0.7056580335270128	1.345423819372278e-06	0.7120706429094054	5.448035864828333e-06	0.7105471516041598	-0.0008672289131629	0.5577182726638824	0.0029045944460004	0.5551681226780371	NPHS2	91040	TDRD5	106702	AXDND1	119191	False	False	False	ref	-50	0.00778	-80	0.03226
327	chr1	179515686	C	A	rs10913808	-0.0028006318	0.7465479288809216	0.0028006318	0.7329769731435359	0.0150736756484039	0.0822136865999456	-3.8140531905560745e-05	0.616347118623131	3.8140531905560745e-05	0.6035774682165044	0.1258892727102977	0.7820806882161412	-0.0003372232071699	0.7984300052479789	0.0003372232071699	0.7845042537133101	0.0019118022983033	0.6210289997507458	-4.5127899253823295e-06	0.728252119448428	4.5127899253823295e-06	0.7142754082271704	-0.0026846751522318	0.5833269752610734	0.0026846751522318	0.5711652889081361	NPHS2	60266	TDRD5	75928	AXDND1	149965	False	False	False	ref	90	0.00647	-45	0.01807
328	chr1	179542905	G	A	rs12135209	-0.0464042534	0.0347888465541949	0.0464042534	0.0325568305233263	0.0102746412062397	0.287461378548926	-0.000496874664572	0.0483598845710139	0.000496874664572	0.0455297319189756	0.3727009616282326	0.3830879162509081	-0.0174419132111279	0.0577153208935209	0.0174419132111279	0.0533524903503999	0.0038673834393476	0.2660887835866598	-0.000188682607629	0.0613904841359743	0.000188682607629	0.0572028671383583	-0.0290044502536332	0.0271220396962777	0.0290044502536332	0.0264532272637247	NPHS2	33047	TDRD5	48709	AXDND1	177184	False	False	False	ref	-60	0.001995	-70	0.03186
329	chr1	200895854	C	T	rs296534	-0.0017698395914	0.6991864520218001	0.0032975669114	0.6942031317692122	0.00743913511596	0.7076868828586172	-1.3704109452520518e-05	0.7371223804810204	2.3319684959925576e-05	0.7324225481797906	0.5329889314204503	0.1238254031988414	-0.0010098102707656	0.5021486811904968	0.0018010829651892	0.4959955530196138	0.0039607016100866	0.2631177555084711	-7.743857110666541e-06	0.540403702504816	1.2724158457249262e-05	0.5343254613688979	-0.0002489652382285	0.8523267054417082	0.0007302980321372	0.8480591313483636	INAVA	4805	GPR25	22872	KIF21B	127860	False	False	False	ref	90	0.001919	-50	0.0589
330	chr1	200951234	G	A	rs11579874	0.0059322942	0.5060508982367798	0.0059322942	0.5187140627754379	0.0065141909816741	0.8771363350477789	4.009133303704e-05	0.5920637911823048	4.009133303704e-05	0.604788818948207	0.1285179306839282	0.772013102467043	0.0007436208516732	0.6372685130333543	0.0007436208516732	0.6510134077637414	0.0008298080677586	0.8266287036347512	4.974369041221976e-06	0.6872274239857349	4.974369041221976e-06	0.7009882212589098	0.0056473614871522	0.3405201411904482	0.0056473614871522	0.3501847071968477	INAVA	60185	KIF21B	72480	GPR25	78252	False	False	False	alt	-60	0.00468	-95	0.06024
331	chr1	200965304	C	T	rs4915471	0.0254213921999999	0.1211340325602391	0.0254213921999999	0.1280230368719533	0.014814259064636	0.087711188096627	0.0004019767272209	0.0623972417127123	0.0004019767272209	0.0658181025286186	0.4096722995051814	0.3118311159811117	0.0105631148926242	0.1122696259672368	0.0105631148926242	0.1199187494231866	0.0060844135162455	0.0753760332965428	0.0001663214051448	0.0658643242190548	0.0001663214051448	0.0702910715398444	0.0138528407971036	0.1467352088462299	0.0138528407971036	0.1509422598282137	KIF21B	58410	INAVA	74255	GPR25	92322	False	False	False	alt	5	1.526e-05	80	0.03503
332	chr1	200971955	T	C	rs148277892	0.038025825	0.0558797319638978	0.038025825	0.0593961502913468	0.0084793831575104	0.5099728941371447	0.0003281097418757	0.0831122903041073	0.0003281097418757	0.087654148813201	0.6537370719613274	0.0195439942384325	0.0248624925513633	0.0241725254963866	0.0248624925513633	0.0264910172459085	0.0055433111258429	0.1039673128137015	0.0002145331438879	0.0431268672243244	0.0002145331438879	0.0463603042559566	0.0035809500098548	0.4664565443597948	0.0035809500098548	0.4775414537871464	KIF21B	51759	INAVA	80906	GPR25	98973	False	False	False	alt	100	0.1221	100	0.2998
333	chr1	200975712	T	G	rs296563	0.0393764558	0.0517243758943446	0.0393764558	0.0554192332741586	0.0150885414835593	0.0771979752296058	0.0006249706112023	0.0297326286102415	0.0006249706112023	0.0316998767218534	0.5063164555648918	0.1643455124204734	0.019926975689473	0.0388165133872276	0.019926975689473	0.0424238443783642	0.0076816093835601	0.0368329211746116	0.0003182920712253	0.0254294225372217	0.0003182920712253	0.0273917407787053	0.0128341580306849	0.1471564211611662	0.0128341580306849	0.1517597332347932	KIF21B	48002	INAVA	84663	GPR25	102730	False	False	False	alt	5	0.0001526	5	0.005127
334	chr1	200991179	G	A	rs2297909	-0.0171240353999999	0.2313276835361592	0.0171240353999999	0.2214813142838528	0.0082488394625174	0.5429441170093188	-0.0001425502208616	0.2626361958123235	0.0001425502208616	0.2534046998403146	0.5566924968101329	0.0937375072627916	-0.0095300501927999	0.1426862322832883	0.0095300501927999	0.1341000910930583	0.0045902157453488	0.1806690852521404	-7.929262161911546e-05	0.1644193055330204	7.929262161911546e-05	0.1561359122264556	-0.0036411166090934	0.498421113450849	0.0036411166090934	0.4870810200990405	KIF21B	32535	INAVA	100130	GPR25	118197	True	False	False	ref	60	0.001218	-75	0.04575
335	chr1	200992755	T	G	rs59682551	0.00533158765	0.5731874830370801	0.00561350167	0.5834984113058913	0.0110369171972144	0.2218932086919399	5.4778238469006e-05	0.538492817710168	5.840724563627457e-05	0.5481566797348197	0.4256703907716884	0.2796210281763141	0.0021321435489493	0.459056206897927	0.002249273605948	0.469402002014416	0.0046830915663584	0.1622389768391937	2.166615374480531e-05	0.4247165922737598	2.317393904406609e-05	0.4342274689907745	0.0029377898110976	0.575615103091022	0.0031162148984947	0.584386526777524	KIF21B	30959	INAVA	101706	CACNA1S	119696	False	False	False	alt	100	0.003546	-95	0.07776
336	chr1	200993159	G	A	rs12140420	-0.0552720302	0.020887259229787	0.0552720302	0.0195776340510599	0.0119182776561386	0.1834911806753436	-0.0006913828458017	0.0285420570554099	0.0006913828458017	0.0270157687126659	0.4123134057407235	0.3093018660464201	-0.0227082457210889	0.0340040892752166	0.0227082457210889	0.0313885907956103	0.0049540422036754	0.1457409217567935	-0.00028661629282	0.0348795515795297	0.00028661629282	0.0325252592947694	-0.0310584134690193	0.0264016920670252	0.0310584134690193	0.0257086638784759	KIF21B	30555	INAVA	102110	CACNA1S	119292	False	True	False	ref	75	0.001103	-70	0.08124
337	chr1	200993667	T	G	rs10920084	0.0464638544	0.031656104524049	0.0464638544	0.0339667624666077	0.015766203334098	0.0668753388166156	0.0007578443434602	0.0199663493103371	0.0007578443434602	0.0211963637141743	0.4642641521177605	0.2306705903525322	0.0214095664484036	0.0329332290765422	0.0214095664484036	0.0359930149742133	0.0073182159076826	0.04109748520108	0.0003493259438192	0.0204886906398887	0.0003493259438192	0.0220154031569251	0.0201516613242875	0.0749686136984917	0.0201516613242875	0.0771418745706906	KIF21B	30047	INAVA	102618	CACNA1S	118784	False	False	False	alt	35	0.006683	100	0.09607
338	chr1	200997848	C	T	rs55757739	-0.00376468816	0.5790979963573065	0.00511187112	0.5694923073204645	0.0068519315953329	0.8070712656196504	-2.448593963098506e-05	0.646195176678558	3.505362597966077e-05	0.6370136953170472	0.4418178611811325	0.2696234716160144	-0.0016543110132053	0.4249811954519105	0.0022695495851099	0.4154178092467552	0.0030406420643602	0.4139220711223335	-1.0792445932088587e-05	0.480491777711895	1.561855225906397e-05	0.4711702214017991	-0.001622423469123	0.6289413365024429	0.0022697330885174	0.6199096264315104	KIF21B	25866	INAVA	106799	CACNA1S	114603	False	False	False	ref	-5	5.34e-05	-65	0.06232
339	chr1	201015352	G	A	rs12122721	-0.0392977442	0.0561637675674473	0.0392977442	0.052604847296423	0.0082438177785384	0.5430713268983588	-0.0003247421354892	0.0894520163661412	0.0003247421354892	0.0846323400320365	0.4216330044917478	0.2998409070993511	-0.0166404579367949	0.0625062465962686	0.0166404579367949	0.0577985070317698	0.0034622017156205	0.3389138218923981	-0.0001369694299155	0.0857264292932795	0.0001369694299155	0.0801999267719284	-0.0193632714032303	0.0746665973349958	0.0193632714032303	0.0726636359286461	KIF21B	8362	CACNA1S	97099	ASCL5	111832	False	False	False	ref	100	0.007275	100	0.0774
340	chr1	201038700	G	A	rs6701496	0.0238135514	0.1299543445790314	0.0238135514	0.1367631270208112	0.0108053020803389	0.244576384371027	0.0002554074599603	0.1188549289596574	0.0002554074599603	0.124841001769201	0.4325273083745681	0.2824320040507695	0.0101804213258916	0.1144049163223752	0.0101804213258916	0.1219219343099562	0.0046750181299506	0.1719577652404902	0.0001092040786283	0.1048485172338913	0.0001092040786283	0.1114707256496195	0.0114171308831004	0.1603712003494231	0.0114171308831004	0.1652388026169289	KIF21B	14986	CACNA1S	73751	ASCL5	88484	False	False	False	alt	-80	0.002228	-35	0.01758
341	chr1	207053793	A	T	rs4844565	0.0508393491999999	0.0244071133529329	0.0508393491999999	0.0261078480676852	0.017597993849535	0.0455703316582024	0.0009321745513083	0.0144232239956375	0.0009321745513083	0.0151750123282743	0.6609902592350543	0.0174736793247373	0.0336506180011844	0.0104825764617896	0.0336506180011844	0.0113174017727545	0.0116448329600839	0.0082800077218836	0.0006175484533074	0.0087497710106978	0.0006175484533074	0.009271909141497	0.0044979719706635	0.4024806678680059	0.0044979719706635	0.4129212541682278	YOD1	813	PFKFB2	19426	C1ORF116	21037	False	False	False	alt	60	0.002121	45	0.08636
342	chr1	207065830	C	G	rs2075864	0.00749554524	0.4386433977318763	0.00749554524	0.4511901890126208	0.0071872971914178	0.7454840305147454	5.414823366692256e-05	0.5115037904794357	5.414823366692256e-05	0.5234941110645832	0.1037562630317741	0.7963991850109068	0.0008541874701602	0.6285131415611162	0.0008541874701602	0.6432066941140413	0.0007262364571802	0.8336239033475825	5.94472826292416e-06	0.6662636670500881	5.94472826292416e-06	0.6805487726278154	0.0057344993205323	0.3459629177171608	0.0057344993205323	0.3550317648441693	YOD1	12850	C4BPB	23031	PFKFB2	31463	False	False	False	alt	95	0.01412	-55	0.04886
343	chr1	207065831	C	A	rs2075865	-0.0311921412	0.0946709119515575	0.0311921412	0.0891730184707617	0.0120754768913821	0.1693948547037081	-0.0003900061196836	0.0721810157676491	0.0003900061196836	0.0681927890459723	0.0976503905642174	0.8067355593164436	-0.0029454985715282	0.3777948011764219	0.0029454985715282	0.3652056835639193	0.0011346658390222	0.7389196803455913	-3.523233258514515e-05	0.3165302007090704	3.523233258514515e-05	0.3051735263329554	-0.0210375626303177	0.059796676613346	0.0210375626303177	0.0581083295005844	YOD1	12851	C4BPB	23030	PFKFB2	31464	False	False	False	ref	95	0.01285	-60	0.04575
344	chr1	208129244	C	T	rs895239	-0.0307359769999999	0.0972666572338898	0.0307359769999999	0.0916872916919168	0.008607687535292	0.4833829886843976	-0.000268032783528	0.1194053543994063	0.000268032783528	0.1134861439037363	0.2256205977240427	0.6014215976798643	-0.0069566705364481	0.1884863397420408	0.0069566705364481	0.1790855022103558	0.0019311239449261	0.5963612865138082	-6.035549868008061e-05	0.2002861912548126	6.035549868008061e-05	0.1912490273442201	-0.0262139648751542	0.0382462999034641	0.0262139648751542	0.0372168791989149	PLXNA2	115140	CD34	217842	CD46	377206	False	False	False	ref	-25	0.0005875	-90	0.02475
345	chr1	208129256	C	T	rs895240	0.01361280508	0.2853454345177313	0.01361280508	0.296523555753736	0.0089926614882269	0.4470628647299773	0.0001339541573318	0.2888738092398282	0.0001339541573318	0.2989045019127191	0.2369298436705774	0.5859388121346606	0.0027645372505039	0.3578639752156164	0.0027645372505039	0.3702832395433095	0.0020338942849607	0.588819599407234	2.547688019775857e-05	0.3578594353537793	2.547688019775857e-05	0.3695553819603802	0.0124109171256962	0.1715953201086376	0.0124109171256962	0.1768584649643934	PLXNA2	115128	CD34	217854	CD46	377218	False	False	False	alt	10	0.000551	-100	0.0312
346	chr1	208151856	A	G	rs600396	0.0151845562	0.2271364219293539	0.0151845562	0.2371491519671262	0.0091818752830378	0.3957176638420722	0.0001405027303679	0.230463550985099	0.0001405027303679	0.2395449109598798	0.3461176983163725	0.4251584867332959	0.0052692672154976	0.2184093538176154	0.0052692672154976	0.2289611386468756	0.0031760243431229	0.3858474008770704	4.8726548770321245e-05	0.216536419349332	4.8726548770321245e-05	0.2264864773225378	0.0106557121961845	0.1770215108930228	0.0106557121961845	0.182686198920644	PLXNA2	92528	CD34	240454	CD46	399818	False	False	False	alt	-55	0.0009727	55	0.02808
347	chr1	230096333	A	G	rs7529009	0.0202344672	0.1729012604471958	0.0202344672	0.1813660095463944	0.0073913475031849	0.7052725898387466	0.000150438803556	0.2322114183093285	0.000150438803556	0.2410922243457704	0.3512733534580233	0.4135396073095466	0.0072966152317468	0.1693437374377868	0.0072966152317468	0.1792042935612529	0.0025730735840073	0.5000371951363604	5.398557002568145e-05	0.2119988861189508	5.398557002568145e-05	0.2219540884881843	0.0130893473998692	0.1355873409062075	0.0130893473998692	0.139814971907349	GALNT2	38342	PGBD5	329999	URB2	470085	False	False	False	alt	-100	0.001591	-100	0.05444
348	chr1	230098337	C	T	rs7530960	0.0063459356999999	0.4899877879824453	0.0063459356999999	0.5025501809275023	0.0215081329902387	0.0194624855680333	0.0001382752104079	0.2492227517540359	0.0001382752104079	0.2585905403648396	0.3350117739810579	0.4444492220755743	0.0021444571009946	0.4223259504896881	0.0021444571009946	0.4352858291620408	0.0071900848727033	0.0438474856349537	4.667153705635919e-05	0.2385720887030036	4.667153705635919e-05	0.2488432822817217	0.004354816958682	0.4154235750530966	0.004354816958682	0.4260370212594938	GALNT2	40346	PGBD5	327995	URB2	472089	False	True	False	alt	45	0.004948	100	0.0778
349	chr1	230103512	T	C	rs3811489	0.0512434215999999	0.0224779483964243	0.0512434215999999	0.0241549058604954	0.012263943673813	0.1545159632008544	0.0006287108561826	0.0239166964846363	0.0006287108561826	0.0255303231060502	0.3937945414371518	0.3491606088404459	0.0202469891926952	0.0367492373109295	0.0202469891926952	0.0402049234484348	0.0048310321639143	0.1554626044420292	0.0002484678905412	0.0319054891404856	0.0002484678905412	0.0344667912724981	0.0297305988651334	0.0257868090975213	0.0297305988651334	0.0264220993345934	GALNT2	45521	PGBD5	322820	URB2	477264	False	False	False	alt	95	0.03995	95	0.0856
350	chr1	230107008	G	A	rs4412597	-0.0361085418	0.0697585001040261	0.0361085418	0.0653923309278434	0.0097131774428755	0.3281592465154246	-0.0003520231049437	0.079722069722245	0.0003520231049437	0.0752801646950353	0.3936493117148518	0.3425494392964118	-0.0141360603508336	0.0819991800213081	0.0141360603508336	0.0760645916906158	0.0038118025447205	0.2795638259055483	-0.000137434093712	0.085719844412417	0.000137434093712	0.0801829723716409	-0.0201952302409775	0.0678063969009105	0.0201952302409775	0.0660655460321116	GALNT2	49017	PGBD5	319324	URB2	480760	False	False	False	ref	-85	0.001944	100	0.02847
351	chr1	230107215	C	T	rs2078219	-0.018763243	0.2061935353315407	0.018763243	0.19941761116572	0.0135682049616502	0.121427095066383	-0.0003152736350503	0.1619095837701429	0.0003152736350503	0.1567651070303963	0.3567236174649114	0.4039876621933765	-0.0071739230627289	0.2118189029831353	0.0071739230627289	0.2029319741622111	0.004909870458497	0.1528578905242942	-0.0001220684065606	0.1578932154069337	0.0001220684065606	0.1515822108234221	-0.0119669291175219	0.1781816436628234	0.0119669291175219	0.1733538967194265	GALNT2	49224	PGBD5	319117	URB2	480967	False	False	False	ref	80	0.001108	-85	0.09753
352	chr1	230111139	G	A	rs880329	-0.0393430006	0.0557847881826647	0.0393430006	0.0525986238148508	0.0216529976216457	0.0215027226633798	-0.0009689964554535	0.0219577421179556	0.0009689964554535	0.0208997330010813	0.0625815620493988	0.884249670691356	-0.0027470076520564	0.4320118419246196	0.0027470076520564	0.4185340263511231	0.0015154830226844	0.6240182615547397	-7.610112831896472e-05	0.2259175013696046	7.610112831896472e-05	0.2170321873673232	-0.0231952613616323	0.0561972319600546	0.0231952613616323	0.0544132183104449	GALNT2	53148	PGBD5	315193	URB2	484891	False	False	False	ref	55	0.0012455	-100	0.04626
353	chr1	230117287	C	T	rs12083455	0.0191082862	0.183121222298474	0.0191082862	0.1921768914438756	0.0158645724631842	0.0661315306836539	0.0003171147219025	0.0916984992120989	0.0003171147219025	0.0968848448028443	0.3025674540192326	0.4928344024476176	0.005837193264007	0.2071222146193211	0.005837193264007	0.2177467818400401	0.0047850214901573	0.1632178294495943	9.626393235347334e-05	0.1232840299005611	9.626393235347334e-05	0.1308520039530624	0.0151287876430253	0.1130448493010833	0.0151287876430253	0.1166661874373838	GALNT2	59296	PGBD5	309045	URB2	491039	False	False	False	alt	95	0.0008583	10	0.005005
354	chr1	230117500	C	T	rs7512794	-0.0024552874519999	0.6816387419421326	0.003804904308	0.6784713132992242	0.007305172039108	0.7061011461402893	-2.021772095234777e-05	0.7189600516350723	2.864760733434625e-05	0.7159455721223272	0.2903806056079419	0.5135168959240443	-0.000837359976549	0.6123909239988073	0.0012026417131815	0.6092787129513744	0.0021322361851887	0.5797351833078085	-6.827603572630934e-06	0.6447133466613459	9.1092565253644e-06	0.6413982163913364	-0.0012095561157273	0.5860913373736107	0.0025913131878961	0.5836740071937842	GALNT2	59509	PGBD5	308832	URB2	491252	False	False	False	ref	10	0.0003395	-10	0.004303
355	chr1	230117553	T	A	rs7520068	0.017990996	0.1933565597330512	0.017990996	0.2025491082446101	0.0094104138899285	0.3725988427186132	0.0001732431684509	0.194937242643755	0.0001732431684509	0.2032212244729411	0.3012915071733109	0.4968341938485123	0.0054369641634466	0.2150907594967625	0.0054369641634466	0.2256619929435222	0.0028480843713743	0.450966167363178	5.251965848502781e-05	0.2113871363792081	5.251965848502781e-05	0.2212027702295025	0.0143072023568708	0.1173266585382838	0.0143072023568708	0.1209331629321837	GALNT2	59562	PGBD5	308779	URB2	491305	False	False	False	alt	-60	0.00434	-60	0.05798
356	chr1	230228204	A	G	rs7531956	0.0368782490999999	0.0625227591183555	0.0368782490999999	0.0665843219948077	0.0127085212966993	0.1396812591659401	0.0004779711641668	0.0469728055552519	0.0004779711641668	0.0498727335262647	0.1262191516509507	0.7806933272826405	0.0056364857027295	0.2543380382768271	0.0056364857027295	0.2661039618460378	0.0016815217251709	0.6583309994614166	7.633891681915006e-05	0.1982306011495859	7.633891681915006e-05	0.2077675755468554	0.0315563439454765	0.0271011732523159	0.0315563439454765	0.0278485145362549	GALNT2	170213	PGBD5	198128	COG2	414278	False	False	False	alt	85	0.00251	-35	0.0704
357	chr1	239002470	T	G	rs9428451	-0.0078708268	0.4353094372069212	0.0078708268	0.423334509399468	0.0247759028449059	0.0099692943790482	-0.0001968532980399	0.1816258580178323	0.0001968532980399	0.1737771545813369	0.0471394931482691	0.9151773267239524	-0.000376917803204	0.7816695849294764	0.000376917803204	0.7675707313422145	0.0011856205659151	0.7615192467387628	-9.571777994812872e-06	0.5950687012946423	9.571777994812872e-06	0.5817010673928865	-0.0046846958993349	0.4083710188248005	0.0046846958993349	0.3981671325325048	CHRM3	384096	FMN2	1011879	ZP4	1111548	False	True	False	ref	-50	0.006443	95	0.00882
358	chr1	243264850	T	G	rs12741781	0.01078245208	0.3365629526409755	0.01078245208	0.3481617374111403	0.0095002953849832	0.3608683809970368	0.0001014711796059	0.3349380500010026	0.0001014711796059	0.345476275059043	0.223346715214888	0.6221464452157716	0.0024833105323173	0.3951275688887962	0.0024833105323173	0.4078267283313599	0.0021179228653947	0.5861361714638854	2.3370413839970347e-05	0.3827084988101266	2.3370413839970347e-05	0.3947241531975294	0.010091390989533	0.1946005607994433	0.010091390989533	0.2008772183087532	SDCCAG8	8815	CEP170	9057	AKT3	586229	False	False	False	alt	-100	0.01648	0	0.0
359	chr1	243270352	A	G	rs2275154	0.00571280404	0.5152379230007798	0.00571280404	0.5280033877645446	0.0060910178248661	0.9312191834794168	3.4774319627136244e-05	0.6232831485409746	3.4774319627136244e-05	0.6361461943040083	0.3229265863753773	0.4606999410999363	0.0018642287621982	0.4430570147373796	0.0018642287621982	0.4564545447971422	0.0019582329020022	0.6144329005509899	1.1314234151104736e-05	0.5241499633692266	1.1314234151104736e-05	0.5373598094620711	0.0041452712165063	0.4304008954151185	0.0041452712165063	0.4412998030082604	SDCCAG8	14317	CEP170	14559	AKT3	580727	False	False	False	alt	100	0.0008593	-10	0.000641
360	chr1	243490976	A	G	rs884328	0.0435668218	0.0382977762837009	0.0435668218	0.0412001905329015	0.0114929897343457	0.2024308184730039	0.0005071651848792	0.0387864317901848	0.0005071651848792	0.0413565714777393	0.472183321403749	0.2181121995710108	0.0204898077859135	0.0359641440344269	0.0204898077859135	0.0393175274223405	0.0054069541101537	0.1145510917594443	0.0002376484362772	0.0358609528890553	0.0002376484362772	0.038781948822554	0.0174462390688699	0.092240786053015	0.0174462390688699	0.094959300270136	SDCCAG8	234941	CEP170	235183	AKT3	360103	False	False	False	alt	75	0.0005507	55	0.00267
361	chr1	243554380	A	G	rs1352162	-0.00262508732	0.6757793051342087	0.00366546952	0.6661218705233098	0.0076705384245775	0.6552124932217608	-2.1009527482784023e-05	0.6979715874469328	2.9123169923004987e-05	0.6882523308252566	0.3156339796055976	0.4650328587141225	-0.000789571656333	0.5737116642909937	0.0012117618447262	0.5640389184748451	0.002450321109672	0.5237448663171178	-6.453306608095072e-06	0.597316645089229	9.74584676534778e-06	0.5877459381841208	-0.0019937966161474	0.5857739804813823	0.0026411062355418	0.5770614526182456	AKT3	296699	SDCCAG8	298345	CEP170	298587	False	False	False	ref	5	0.002167	50	0.0379
362	chr1	243629710	T	C	rs145071536	0.0473216618	0.0284968921511918	0.0473216618	0.0306262088815424	0.0124661782679598	0.1479042762253724	0.000600630072335	0.0277687871527616	0.000600630072335	0.029613176575817	0.1988651334557411	0.6436241704961874	0.009472772520546	0.122827462957175	0.009472772520546	0.130999660233959	0.0025745879195673	0.4371238048142452	0.0001253872256334	0.0921022199398022	0.0001253872256334	0.0980563535129935	0.0396601624498179	0.0084600673945851	0.0396601624498179	0.0087464054128023	AKT3	221369	SDCCAG8	373675	CEP170	373917	False	False	False	alt	-35	0.001831	95	0.0364
363	chr1	243746765	C	T	rs11586029	0.01141264032	0.3087380961102978	0.01141264032	0.3199671879993257	0.0199585829250665	0.0269713473782266	0.0002248562364796	0.1425851412378599	0.0002248562364796	0.1498483255494317	0.1811491820454568	0.6870043043170905	0.002101628941644	0.425788076864391	0.002101628941644	0.4386944610185407	0.0036938331576122	0.2981596076631696	4.250740181031384e-05	0.256388185229547	4.250740181031384e-05	0.2668685415310133	0.0106847581406445	0.1697675250232537	0.0106847581406445	0.1752406367962853	AKT3	104314	ZBTB18	301783	SDCCAG8	490730	False	False	False	alt	-35	0.001242	85	0.03552
364	chr1	243847139	T	G	rs61833239	0.00841888914	0.40549279749159	0.00841888914	0.4175990300406835	0.017126101938142	0.0509469991662468	0.0001442176698802	0.2457113919640258	0.0001442176698802	0.2550205502705189	0.1371549497401425	0.7595871867363782	0.0011924346452438	0.5586174182375623	0.0011924346452438	0.5721602180846329	0.002446831333551	0.4974478920058138	2.147859791143932e-05	0.4137003497004659	2.147859791143932e-05	0.4261988415604503	0.0077552671708212	0.2511238341122623	0.0077552671708212	0.2588172751464007	AKT3	3940	ZBTB18	201409	SPMIP3	505497	False	False	False	alt	20	0.00765	-35	0.01935
365	chr10	3778595	T	C	rs1043003	0.0906381764	0.0033057290844383	0.0906381764	0.0034598474717786	0.0205092954718731	0.0265875312402099	0.0020185330246687	0.004612227186138	0.0020185330246687	0.0048035904882072	0.4095229203622444	0.3209627802064808	0.0381269355896079	0.007627042912197	0.0381269355896079	0.0081731402154345	0.0086060134784382	0.0284077394439809	0.0008661234328939	0.0062094255381855	0.0008661234328939	0.0065853297060171	0.0507225178684426	0.0039406362806047	0.0507225178684426	0.0040756916255946	KLF6	6686	PITRM1	605754	PFKP	712261	False	True	True	alt	-95	0.002468	-70	0.0187
366	chr10	18421239	T	C	rs11014167	0.000924511176	0.8551723741113468	0.001653553472	0.8565769247897927	0.0229691974883196	0.0142041121552205	2.283295069368563e-05	0.6792299553308142	3.992538197322458e-05	0.681235136076076	0.1209618357036898	0.787036651668575	0.0001508432780449	0.8820972558725796	0.0002017440537785	0.8833811679943064	0.0027539482987014	0.4587042690483268	3.69118927062863e-06	0.7756715802398173	4.876823901099753e-06	0.7778489675207021	0.0009294702227201	0.7634499532096074	0.0013817570721687	0.7651568891484364	NSUN6	238046	ARL5B	238193	CACNB2	280814	False	True	False	alt	-45	0.00952	95	0.01918
367	chr10	21030071	G	A	rs640729	-0.0414935819999999	0.0487468807956048	0.0414935819999999	0.0455905076470533	0.0095587524659218	0.3507618993440537	-0.0003954486831977	0.0645183031647094	0.0003954486831977	0.0608032908997425	0.5575825475368001	0.0918387452785082	-0.0231232495124604	0.0322067463257757	0.0231232495124604	0.0296964346575879	0.0053228730441155	0.1171307423826478	-0.0002200864611188	0.0449620878965302	0.0002200864611188	0.0418412477231702	-0.0088009211713813	0.2235943855036805	0.0088009211713813	0.2168218956154326	NEBL	262940	MLLT10	494576	SKIDA1	496297	False	False	False	ref	95	0.005497	100	0.0588
368	chr10	21038664	A	G	rs663759	-0.0002059243979999	0.8230543999877351	0.001913755882	0.8265316530771656	0.0090789021023338	0.4198017037160867	-2.140405480769312e-06	0.8048361958335565	1.8278547465476148e-05	0.8081916442080455	0.1287648212118382	0.7748781158741791	3.0391913724524365e-05	0.8363837827520689	0.0002493689684622	0.8404550587243588	0.0011810948859655	0.7625429580231603	2.7610003263554973e-07	0.8283566024882294	2.3760159753156987e-06	0.8324265502427799	-0.0002572640795029	0.7141494687490726	0.0016431705723088	0.7171074579428578	NEBL	254347	MLLT10	485983	SKIDA1	487704	False	False	False	ref	-55	0.001823	90	0.04105
369	chr10	21110940	G	A	rs602572	-0.001681201528	0.8506584341559816	0.001681201528	0.837033048799118	0.0092158318045137	0.3982135350361644	-1.6320551029478966e-05	0.8261626470580716	1.6320551029478966e-05	0.8128015471154498	0.0416622579072396	0.923061500318098	-5.868646783423933e-05	0.9540847808506572	5.868646783423933e-05	0.9399398420926884	0.0003726961357794	0.9208227159442424	-5.682994925775555e-07	0.9490206522971528	5.682994925775555e-07	0.9347915608980342	-0.00079876347265	0.8559319750772536	0.00079876347265	0.8422088561917476	NEBL	182071	MLLT10	413707	SKIDA1	415428	False	False	False	ref	100	0.002687	45	0.002802
370	chr10	60375448	G	A	rs10994321	0.079572243	0.0053444373760124	0.079572243	0.005612067115143	0.0280681786026612	0.0073472779311508	0.0023385703043626	0.0032866564812851	0.0023385703043626	0.003425881455301	0.3860952914449319	0.3597626518472213	0.0311069887318298	0.0132271914573706	0.0311069887318298	0.014421887620745	0.011074622302486	0.0119871572403595	0.0009311155946511	0.0048809884797094	0.0009311155946511	0.0051606998127215	0.0505503169120011	0.0045907398871369	0.0505503169120011	0.0046552714502059	ANK3	358042	CDK1	402884	CCDC6	468892	False	True	True	alt	-20	0.0005417	90	0.02667
371	chr10	60420054	C	T	rs10994336	0.0370275138999999	0.0797117126938414	0.0370275138999999	0.083507835876985	0.0208328130543991	0.0263078976409999	0.0011681173502377	0.0429930446088766	0.0011681173502377	0.0451860013979106	0.3596012406767704	0.3899094215221191	0.0157530846504316	0.0866977109906175	0.0157530846504316	0.0909938684907102	0.0080617016076176	0.045997549422029	0.0005235437567352	0.0483077657095853	0.0005235437567352	0.0513418669242778	0.0198695007209618	0.0811208474703711	0.0198695007209618	0.0835376219970437	ANK3	313436	CDK1	358278	CCDC6	513498	False	False	False	alt	50	0.00235	-65	0.02844
372	chr10	60421123	A	G	rs10994337	0.00606972304	0.5035392052255407	0.00606972304	0.5161905041018316	0.0064736792044243	0.8818528059731076	3.876332081738298e-05	0.5969867554118962	3.876332081738298e-05	0.609771661093878	0.1881409558190437	0.6792354940037159	0.001162054826379	0.5574686170840538	0.001162054826379	0.5710778605400184	0.0012257807726373	0.7568907129433883	7.487567368474898e-06	0.6187058278321974	7.487567368474898e-06	0.6323492984607415	0.0059170738285666	0.3221287360494574	0.0059170738285666	0.3314286911312082	ANK3	312367	CDK1	357209	CCDC6	514567	False	False	False	alt	100	0.013084	-60	0.02011
373	chr10	60447629	T	C	rs61847646	0.0170772378	0.1998417353489508	0.0170772378	0.2093154217422529	0.0067034970666935	0.8332856281954246	0.0001145979941634	0.2772716084577691	0.0001145979941634	0.2871022933038128	0.3768420834241019	0.3762475004714775	0.006417299567982	0.1819258279208247	0.006417299567982	0.1918468979064411	0.0025347323772737	0.5088499905355266	4.318605521212635e-05	0.2385030843676499	4.318605521212635e-05	0.2487024880108297	0.0105519766802559	0.1729276315048308	0.0105519766802559	0.178559406498015	ANK3	285861	CDK1	330703	CCDC6	541073	False	False	False	alt	-100	0.010086	-100	0.05814
374	chr10	60514979	T	G	rs9633553	-0.00357656404	0.6848110872739113	0.00357656404	0.6712685741018194	0.0298261902160061	0.0040704739066689	-0.0001115221452752	0.3416652910599007	0.0001115221452752	0.3309316087659475	0.080293364039046	0.8534966694998285	-0.0002957246903982	0.8142874498378774	0.0002957246903982	0.8002889673579142	0.0024280704941626	0.5093678395782846	-9.265708903825312e-06	0.604166668290132	9.265708903825312e-06	0.5904738218454072	-0.0029460886523718	0.5623064611624499	0.0029460886523718	0.5501440073519792	ANK3	218511	CDK1	263353	RHOBTB1	486461	False	True	True	ref	-5	0.0007706	-80	0.00821
375	chr10	60525580	G	A	rs10821789	-0.0314582146	0.0939253690459769	0.0314582146	0.0884373847747513	0.0081916813070072	0.5300464258527908	-0.0002587358500554	0.1243810814357351	0.0002587358500554	0.1182637967442571	0.2206371435388333	0.6187469604751576	-0.0070640690609873	0.1914479773539439	0.0070640690609873	0.1816955018643756	0.0017483364581028	0.6561450231719924	-5.613378242333475e-05	0.2150342442535535	5.613378242333475e-05	0.2056514155763043	-0.0290148238052261	0.0284133979699612	0.0290148238052261	0.0276984232088362	ANK3	207910	CDK1	252752	RHOBTB1	475860	False	False	False	ref	-35	0.004	-35	0.00946
376	chr10	62910533	A	G	rs7915640	0.0490023976	0.0277614233730835	0.0490023976	0.0298087469585749	0.0141615863292167	0.0967747380149821	0.0007479760378014	0.0233323583366756	0.0007479760378014	0.0248380623361859	0.3471986223923484	0.4242122560865404	0.0173384158248413	0.0515326805413955	0.0173384158248413	0.0559867708337879	0.0049996925019403	0.1499513666977627	0.000270251799453	0.0364340483451937	0.000270251799453	0.039190336781741	0.0338820942125955	0.0171946874350499	0.0338820942125955	0.0175760338986945	EGR2	91366	ADO	105812	NRBF2	222715	False	False	False	alt	100	0.00891	-100	0.02623
377	chr10	62915331	C	T	rs10740096	-0.00808272084	0.4435270349748076	0.00808272084	0.4312190288277744	0.0085812229077669	0.4828462353810798	-7.253227539200663e-05	0.4494768601944811	7.253227539200663e-05	0.4379394676022463	0.3752321082168902	0.3781846641389017	-0.0030518360257086	0.3703975281280738	0.0030518360257086	0.3579459238648234	0.0032428962386219	0.3775941944446937	-2.750779750273213e-05	0.3746754762708702	2.750779750273213e-05	0.3627690488994386	-0.0045726615421321	0.409842533306575	0.0045726615421321	0.3997712846018	EGR2	96164	ADO	110610	NRBF2	217917	False	False	False	ref	-100	0.00604	-100	0.0341
378	chr10	62957155	G	A	rs10822098	-0.127127082	0.0008695979949085	0.127127082	0.000822454044691	0.0355785388330291	0.001932897165877	-0.0044959754127052	0.0010684243402025	0.0044959754127052	0.0010206423183989	0.3474807829956742	0.4221050285673831	-0.0444725413907414	0.0049668086615481	0.0444725413907414	0.0046154383348859	0.0123357391623133	0.0059461560898831	-0.0015686720817078	0.0019298805893163	0.0015686720817078	0.0018459966299219	-0.1000217844583449	0.0002264135232769	0.1000217844583449	0.0002267300416486	EGR2	137988	ADO	152434	NRBF2	176093	False	True	True	ref	5	0.000311	100	0.06635
379	chr10	62960604	C	T	rs10761684	0.0072532528	0.3456842910600363	0.01037996	0.3532298188898272	0.0058884777896826	0.9183317619814334	4.164964743353896e-05	0.4702803703246062	6.321146460628872e-05	0.4771444285327046	0.2398178404340293	0.5937124663846518	0.0019330568280457	0.3864917160107351	0.0026006676576922	0.3943883752091047	0.0014135861897729	0.7197537678897575	1.1182487851833443e-05	0.477939758990145	1.5786341448517106e-05	0.4855193179572989	0.0070664633450554	0.2125413018011324	0.0092781045446529	0.2163129515115318	EGR2	141437	ADO	155883	NRBF2	172644	False	False	False	alt	50	0.007217	-50	0.02594
380	chr10	62988546	A	G	rs73300318	0.001755316432	0.8252727347475327	0.001755316432	0.8391967075932955	0.016237507054999	0.0633860742898325	2.4897986076342035e-05	0.7263497875102496	2.4897986076342035e-05	0.7398688669041144	0.3110758410356954	0.4820147541634166	0.0005905802737595	0.7157805705618229	0.0005905802737595	0.7297691621197547	0.0049825320178941	0.1416926824393058	8.232214552585096e-06	0.6233964498769555	8.232214552585096e-06	0.6371536378593373	0.0011659871990373	0.7723454679517728	0.0011659871990373	0.7858604982086137	NRBF2	144702	EGR2	169379	ADO	183825	False	False	False	alt	95	0.0331	100	0.0768
381	chr10	62998737	T	C	rs10995385	0.001013759432	0.7669169921987794	0.002780557328	0.7661316161967936	0.0067842418113552	0.8056808148618771	7.707315522153505e-06	0.8026252369447642	1.9672570332500778e-05	0.8016088860172764	0.2354775464475772	0.5965606318875103	0.0001099308393006	0.7252606803471737	0.0006028531753069	0.7239321252827661	0.0015971691922677	0.6778203923503368	8.923945115724209e-07	0.7597401352976514	4.239204166885915e-06	0.7583290983353659	0.0006265625162086	0.6329444584713093	0.002257284826606	0.6323212831425555	NRBF2	134511	EGR2	179570	ADO	194016	False	False	False	alt	100	0.00548	-90	0.05603
382	chr10	63090314	C	T	rs113899647	-0.0407840687999999	0.0540749560886855	0.0407840687999999	0.0508489156054574	0.0108178429952643	0.2395017996778073	-0.0004596626489512	0.0548521403412958	0.0004596626489512	0.0518476574171184	0.0660732995155551	0.8777206432780661	-0.0026132011182881	0.3947739068600904	0.0026132011182881	0.3821577026858451	0.0007075442444982	0.8513569808651973	-2.934558124175809e-05	0.3513766165440222	2.934558124175809e-05	0.3398449453741804	-0.0259131318789613	0.0420769700526231	0.0259131318789613	0.0410037497843567	NRBF2	42934	EGR2	271147	ADO	285593	False	False	False	ref	35	0.000977	50	0.03062
383	chr10	63115969	G	T	rs59113396	-0.0130169089	0.2954017398707809	0.0130169089	0.2846874571729302	0.0085067123318088	0.5024134555248714	-0.0001134407222111	0.3202757039632292	0.0001134407222111	0.3103835304206494	0.3161132376891876	0.4739384799907959	-0.0042210503960954	0.2968042470794459	0.0042210503960954	0.2853020677307038	0.0026988225152528	0.4809690600401403	-3.685724055285188e-05	0.3089516363995839	3.685724055285188e-05	0.2979651817304418	-0.0095561157273415	0.2045190625952548	0.0095561157273415	0.1982632652057236	NRBF2	17279	EGR2	296802	ADO	311248	False	False	False	ref	-40	0.00243	-70	0.04303
384	chr10	63154433	T	C	rs16918239	-0.00990492396	0.4104018231419337	0.00990492396	0.3984003272976208	0.0071895775817887	0.7278989252965669	-7.997157003113839e-05	0.4737374955303101	7.997157003113839e-05	0.4620584086626633	0.4254172761128227	0.2886736756643075	-0.0044292075289919	0.3242101848244572	0.0044292075289919	0.3120589411835293	0.0030637095292815	0.4096151962930906	-3.6058971123421065e-05	0.3731943260169863	3.6058971123421065e-05	0.3612274510723067	-0.0043631157999564	0.459979246493875	0.0043631157999564	0.44943279521362	NRBF2	21185	EGR2	335266	ADO	349712	False	False	False	ref	-25	0.002117	-65	0.04645
385	chr10	63171485	C	T	rs74557321	-0.0319689398	0.09027849875047	0.0319689398	0.0853140524591166	0.0101446853162676	0.297137935143644	-0.0003440473666002	0.0928758871075559	0.0003440473666002	0.0881951129174101	0.2778929242004584	0.5317671893817808	-0.0092961688902961	0.1487086411705349	0.0092961688902961	0.1403804638510914	0.0028798807020916	0.4415127407215451	-0.0001016189162204	0.1382325489252903	0.0001016189162204	0.1308364326517965	-0.0270811937883172	0.0380825626500021	0.0270811937883172	0.0370212186803458	NRBF2	38237	REEP3	349917	JMJD1C	350365	False	False	False	ref	95	0.001383	85	0.05228
386	chr10	63174840	A	C	rs112637649	-0.003276236172	0.6835330856373469	0.003326315348	0.6744651475672284	0.0251453299039474	0.0095602366147675	-8.501966135403067e-05	0.4016233868743805	8.606186154964004e-05	0.3927895416719749	0.1013309266693637	0.8168266388959917	-0.0004185063114501	0.7761801406526144	0.0004222451451808	0.767102767898052	0.0025001719859048	0.4825732552390996	-1.0521988428522903e-05	0.6000634907234043	1.0599797480564944e-05	0.5905494749656516	-0.0033755536883162	0.5311582732345077	0.0034128984740505	0.5230414043614974	NRBF2	41592	REEP3	346562	JMJD1C	347010	False	True	True	ref	-75	0.00946	-85	0.04126
387	chr10	63178899	T	C	rs76032436	-0.001625296	0.7012974385325791	0.00299522308	0.6970182036134741	0.0411961539264772	0.001072804419656	-8.081765205457999e-05	0.2765738399154027	0.0001256021978914	0.27196914781523	0.0734737912219006	0.8709207555202623	-0.0001163644676756	0.8424379487497465	0.0002050872839186	0.8390793924866894	0.0030030324490634	0.4062244664253905	-5.563076444304842e-06	0.6040101252907822	8.466208481261629e-06	0.5994947547626411	-0.0015435844770173	0.6127053484491654	0.0023236755568003	0.6087761200681865	NRBF2	45651	REEP3	342503	JMJD1C	342951	False	True	True	ref	-95	0.006165	-75	0.04062
388	chr10	63254190	A	C	rs76460998	-0.00273946506	0.6483258274024634	0.0040522621	0.6403132234196445	0.0186803297087014	0.0364688771850017	-6.151407067338573e-05	0.432109736916989	7.818498610131826e-05	0.4249730207908837	0.3015155758877166	0.4966532325091536	-0.0009275305648465	0.5658408062306021	0.0012715441573461	0.5576618282189805	0.0057303283857473	0.0983425793825036	-2.055998735572681e-05	0.400925790646985	2.492853884096009e-05	0.393258957817083	-0.0023008537432961	0.5371830511546325	0.0031265884500876	0.5304237863079071	NRBF2	120942	REEP3	267212	JMJD1C	267660	False	False	False	ref	-35	0.002426	-30	0.02328
389	chr10	63293746	G	C	rs58429288	-0.00026782976	0.7667367866328885	0.00265708196	0.7607926842667958	0.0090536493698198	0.4049500098704885	-9.105248276647744e-07	0.7509269934181648	2.436104946433393e-05	0.7453880530797732	0.0674675048496353	0.8803297907573132	-3.3451705120328786e-05	0.8692675125186222	0.0001882094375477	0.8623117360278297	0.0006134443197137	0.8743717732440619	-2.0547657904496682e-07	0.8649246054674504	1.724424657669872e-06	0.8581050977323526	-0.0004854822145457	0.6781064341363262	0.0018962852311745	0.6721673160567577	NRBF2	160498	REEP3	227656	JMJD1C	228104	False	False	False	ref	100	0.00265	5	0.0007935
390	chr10	63297322	C	T	rs112188494	-0.0013454404	0.4714552022163193	0.0077200336	0.4669631062839251	0.0089935756371922	0.4230655094347013	-1.2706517849808934e-05	0.4679095440976866	6.905187368092894e-05	0.4634421852252247	0.5266320190043465	0.1319616242132793	-0.0007377919112238	0.3141152473401772	0.0041152371286485	0.3098915523228401	0.0047166640177958	0.1680267822380906	-6.8084669946798825e-06	0.3158469750520101	3.666187884620649e-05	0.3116603312524508	-0.0005020798970943	0.6774381551176881	0.0018962852311745	0.6716532653397922	NRBF2	164074	REEP3	224080	JMJD1C	224528	False	False	False	ref	95	0.0008497	-90	0.0603
391	chr10	63333623	C	T	rs78005057	-0.1420299454	0.0011467279845805	0.1420299454	0.0010516412436995	0.0746355249829119	0.0002200564874787	-0.0129653870999564	0.0005067182522953	0.0129653870999564	0.0004444534895791	0.2685090094295583	0.5403885569972694	-0.043757495722734	0.0079030287576248	0.043757495722734	0.0074660122993724	0.0223472127969306	0.0024652819178036	-0.0041111591974446	0.0015072286784964	0.0041111591974446	0.0014017170268513	-0.1334495171111733	0.0001644960312415	0.1334495171111733	0.000151743860506	REEP3	187779	JMJD1C	188227	NRBF2	200375	False	True	True	ref	-95	0.00741	-95	0.00525
392	chr10	64556791	C	T	rs10822313	-0.00502179198	0.5934410815708456	0.0052692563399999	0.584881051187602	0.0078726833175002	0.6098976174648748	-4.204212472685558e-05	0.6115131781995444	4.358965465998843e-05	0.6033182690467856	0.2437743130115456	0.5869981671707183	-0.0012846565186274	0.5787201406077928	0.0013435582661895	0.5699140746199369	0.0019200798148569	0.6216205558933776	-1.076051547926904e-05	0.5935024402002377	1.1128860320146363e-05	0.5850436750100775	-0.0041245241133206	0.4396920539294732	0.004369339930912	0.4325402009986298	JMJD1C	1034941	REEP3	1035389	NRBF2	1423543	False	False	False	ref	0	0.0	0	0.0
393	chr10	64567391	G	A	rs3999058	-0.0615244076	0.0139301214441721	0.0615244076	0.0131038436238149	0.0147499927145759	0.0837330852884892	-0.0009159617515636	0.0140337565658162	0.0009159617515636	0.0133380427575977	0.5245780557889604	0.1375346951341795	-0.0323132027467115	0.0131003902261512	0.0323132027467115	0.0121083012519864	0.0077604031544615	0.0336694192946278	-0.0004824194972482	0.0126896347560719	0.0004824194972482	0.011898973125372	-0.0174441643585513	0.089957206381186	0.0174441643585513	0.0874031357361248	JMJD1C	1045541	REEP3	1045989	NRBF2	1434143	False	True	False	ref	40	0.005363	-30	0.03394
394	chr10	64567820	G	A	rs2394090	-0.0460581791999999	0.0373717922225274	0.0460581791999999	0.0351551057412626	0.0176057014841613	0.0435540315536744	-0.0008429503132125	0.0191739254268999	0.0008429503132125	0.0181941071199961	0.4311268789095321	0.2818135464529736	-0.019903193400133	0.0463461373040971	0.019903193400133	0.0427920775739716	0.0075663785580797	0.0368857209927077	-0.0003637984521066	0.0229060788165915	0.0003637984521066	0.0213646791606587	-0.0222367451944521	0.0630517304778191	0.0222367451944521	0.0613390867274048	JMJD1C	1045970	REEP3	1046418	NRBF2	1434572	False	False	False	ref	-90	0.003141	20	0.026
395	chr10	64573330	C	T	rs10822315	-0.0307604979999999	0.1010889571227186	0.0307604979999999	0.0954542421975264	0.0087872257497309	0.4487835148987108	-0.0002807233159082	0.1198047663010505	0.0002807233159082	0.1141156844151303	0.0214628782456248	0.9613897374010296	-0.0007376836566543	0.6906781413393615	0.0007376836566543	0.6769400254867738	0.0001959015309368	0.9589168529561534	-6.935563252440424e-06	0.6817429697645875	6.935563252440424e-06	0.6681672559200454	-0.0093424205645286	0.2407118174204404	0.0093424205645286	0.2338559014739377	JMJD1C	1051480	REEP3	1051928	NRBF2	1440082	False	False	False	ref	80	0.003325	75	0.02094
396	chr10	64577039	C	T	rs56023698	-0.0704174912	0.0078094592503701	0.0704174912	0.0073853710254663	0.0144963585081728	0.0884292577532592	-0.0010574346415265	0.0119054570336164	0.0010574346415265	0.0113414415824402	0.4889449060674903	0.1880454707645377	-0.0344132290310024	0.0101533923959846	0.0344132290310024	0.0094012923473818	0.0071573948655985	0.0476349279273451	-0.0005230749906786	0.0121268739207441	0.0005230749906786	0.0114054913751766	-0.0258093963630327	0.042865116891262	0.0258093963630327	0.0417331886250144	JMJD1C	1055189	REEP3	1055637	NRBF2	1443791	False	True	True	ref	-15	0.0001822	70	0.009155
397	chr10	90992214	A	G	rs76523509	0.00299608431	0.7250474267944266	0.00309082013	0.7348614050492946	0.0215869550640606	0.0184728626554384	6.762488885212535e-05	0.4668346359203252	6.952437671192186e-05	0.4762597084939804	0.118339401861015	0.7918083589691751	0.0003651286702498	0.7814619582462923	0.0003738466181744	0.7914061888606	0.0025561533703154	0.499516015478352	8.20839516079941e-06	0.6302789086152631	8.383193206466428e-06	0.6404987994762776	0.0025996120291703	0.5731174136974835	0.0026743016006389	0.582129975726395	ANKRD1	71127	RPP30	120261	HTR7	134175	False	True	False	alt	-95	0.004562	30	0.02072
398	chr10	91029521	G	A	rs60020658	0.001131198428	0.8192878123876172	0.001920072684	0.8238389124317496	0.0092206989373862	0.3896479079138342	1.0600824000623092e-05	0.8038713063517007	1.794503308085091e-05	0.8082737053277507	0.0296227139285676	0.9430121993706968	4.166778471296138e-05	0.93749437969004	6.146623466003657e-05	0.9424441790888816	0.0002677405142901	0.9392836304424974	3.745409822499651e-07	0.9346157703461256	5.578558110991157e-07	0.9390199823117992	0.0005103787383686	0.8330748459828006	0.0008257347067915	0.8375287794338165	ANKRD1	108434	PCGF5	133492	RPP30	157568	False	False	False	alt	40	0.001644	-100	0.05133
399	chr10	102490997	A	C	rs4919647	-0.00463871762	0.610902838838998	0.00463871762	0.5978025118569916	0.0262112367703008	0.007751789711243	-0.0001286415848898	0.3110801896348505	0.0001286415848898	0.3010686374037177	0.2707082023672444	0.5426932047459372	-0.0012431624625641	0.5722113059345418	0.0012431624625641	0.5586420200769	0.0069980202732252	0.0489427205746463	-3.3551605790264866e-05	0.3378010560049374	3.3551605790264866e-05	0.3263784222226772	-0.0040685069347191	0.4776022894970965	0.0040685069347191	0.4666063738014712	ACTR1A	11715	SUFU	12976	MFSD13A	29601	False	True	True	ref	100	0.004753	100	0.05664
400	chr10	102514400	C	A	rs4919652	0.00652629716	0.5055135862760151	0.0066273286	0.5146905838058944	0.0114734555127888	0.2063844065726723	7.746410740735526e-05	0.448071626997383	7.872982600691944e-05	0.4568725544323331	0.3490824593616116	0.4179182339529	0.0022545170484845	0.4434957310710667	0.0022885557755928	0.4530010656946497	0.003960745848398	0.2562016880455661	2.633901306971884e-05	0.3927287371960613	2.6765449118605707e-05	0.4017689036449495	0.0045934086453178	0.4350322697223698	0.004655649954875	0.4424162322572197	SUFU	10427	ACTR1A	11688	MFSD13A	53004	False	False	False	alt	85	0.002407	-90	0.04242
401	chr10	102520907	G	A	rs2145307	-0.016388951	0.2527547789446098	0.016388951	0.2427602164174069	0.0146619105564703	0.0877112823555527	-0.0002351571398232	0.1550439576722977	0.0002351571398232	0.1481102122543804	0.219601863089866	0.621760257150274	-0.0036740017985862	0.3387728442521811	0.0036740017985862	0.3267105146554426	0.0031728441572464	0.3765710484283471	-5.181857026252816e-05	0.2446519847015513	5.181857026252816e-05	0.2346820583459892	-0.0147283685515409	0.1323453055987409	0.0147283685515409	0.1285817133882942	SUFU	16934	ACTR1A	18195	MFSD13A	59511	False	False	False	ref	-20	0.000534	-30	0.00914
402	chr10	102575065	A	C	rs10883740	-0.00536594662	0.5535748888050674	0.00536594662	0.5406084079835848	0.0292492150088807	0.0048573073092547	-0.0001618267166882	0.2348518357926255	0.0001618267166882	0.2261227184661196	0.1126899656635442	0.7965135110316235	-0.0006876209491292	0.6861477917544209	0.0006876209491292	0.6718460642574955	0.0033003097444418	0.3431596095269079	-2.050296090082833e-05	0.4411496891497606	2.050296090082833e-05	0.428627686121188	-0.0054253674830651	0.3795667825498234	0.0054253674830651	0.3704991476731241	TRIM8	67439	SUFU	71092	ACTR1A	72353	False	True	True	ref	30	0.006454	50	0.04495
403	chr10	102624580	A	G	rs74558061	0.002340001574	0.7194996407955427	0.002806985774	0.7270382838568387	0.0169574739625818	0.0508791866608895	4.1900716144481934e-05	0.5649482972597919	4.9490113789709455e-05	0.5724498074077555	0.4658492308011493	0.2262278928574103	0.001108286077705	0.5632629586531194	0.0013254359760707	0.5707616995207795	0.0079208397449513	0.0302425630304464	1.9974627070535724e-05	0.4299159679201336	2.350373358455526e-05	0.4370761827651513	0.0008776024647558	0.7887351944854748	0.0010684758140644	0.7961348607540036	TRIM8	17924	ARL3	89817	SFXN2	89959	False	False	False	alt	20	6.104e-05	100	0.06088
404	chr10	102660261	A	G	rs10883761	5.41273200000001e-05	0.8003773530224405	0.002339862	0.7989186277634535	0.0228414268113627	0.0146301014485404	-2.081353973642384e-06	0.5441809878936149	5.436385374629958e-05	0.5434277822593082	0.4252720463905227	0.283936671466996	0.0001342996786756	0.625623924390409	0.0010194591647858	0.6249963808860417	0.0096532223368163	0.0146150464008252	1.700150636767548e-06	0.4162218939078239	2.350944916950721e-05	0.4161567993145861	-0.0002302928453614	0.803306036546819	0.001056027552153	0.8015088163031231	TRIM8	17757	ARL3	54136	SFXN2	54278	False	True	False	alt	-80	0.004463	100	0.05344
405	chr10	102667859	T	G	rs884825	0.0101277552	0.3476632532790597	0.01096709028	0.3581537371200572	0.0069519799960256	0.7884840805731579	7.330939641355769e-05	0.4191431216762342	7.877307801385286e-05	0.4291589879920477	0.4578242512889138	0.2401718943662659	0.0048793072554596	0.2537007822330104	0.0052304124314639	0.2638524269034738	0.0031878413000454	0.3815553455770923	3.534354533638434e-05	0.3070178668579472	3.762907693455344e-05	0.3170171200526163	0.0034938121764748	0.4494033716975822	0.0039087542401891	0.4579434748210341	TRIM8	25355	ARL3	46538	SFXN2	46680	False	False	False	alt	-100	0.001797	55	0.02621
406	chr10	102712218	T	A	rs4919669	0.00763905914	0.4235523411995239	0.00763905914	0.4356520924441655	0.0190416749158842	0.032997888115936	0.0001519553077586	0.2367836731532489	0.0001519553077586	0.2459812559287224	0.3285054824220168	0.4420243490992222	0.0026143376060659	0.3753091838409423	0.0026143376060659	0.3879455177136916	0.0064051715986673	0.0717601336380342	5.318356652595181e-05	0.2230140582733247	5.318356652595181e-05	0.2331247488943691	0.0051017126733679	0.3654272707563424	0.0051017126733679	0.3753928567833897	ARL3	2179	SFXN2	2321	WBP1L	31731	False	False	False	alt	95	0.00775	95	0.0707
407	chr10	102744807	C	T	rs999867	-0.0490777542	0.0291832635683842	0.0490777542	0.0273387295072215	0.0103552279776317	0.2723365968789431	-0.0005129763243411	0.0415249783850016	0.0005129763243411	0.0391699298557152	0.5299660784862913	0.1303409018727741	-0.0260324253044325	0.0236260602284626	0.0260324253044325	0.0217561914459153	0.0054850270278873	0.1051455883910011	-0.0002719479678258	0.0327616242406251	0.0002719479678258	0.0305385297292398	-0.0133258643761864	0.1312937742894785	0.0133258643761864	0.1274377786751141	WBP1L	858	SFXN2	30268	ARL3	30410	False	False	False	ref	-95	0.01039	-90	0.05334
408	chr10	102768371	G	T	rs10786709	0.0010627689119999	0.8288349605636501	0.00190900772	0.8317699619911163	0.0352582793361784	0.0019529764155314	4.641352907509934e-05	0.5034039696071737	7.178906453433729e-05	0.5074686550460248	0.4734613429599892	0.2142620468496637	0.0005308119902285	0.6601577187244404	0.0009010123983513	0.6635098069252237	0.0167750016355692	0.0022766714846873	2.2982508861580542e-05	0.3693525915425334	3.4110205754875374e-05	0.3735434716128868	0.0004087179327586	0.8564915321361726	0.0007406715837301	0.8590279286743723	WBP1L	24422	SFXN2	53832	ARL3	53974	False	True	True	alt	80	0.013	80	0.098
409	chr10	102895758	A	G	rs4363528	-0.002220188086	0.7841967173197211	0.002470815566	0.7759289364319913	0.0209052253784541	0.0214057074146499	-4.724905505501919e-05	0.5955576137207841	5.317054296399067e-05	0.5873868048484849	0.2715609083081775	0.5439992588710391	-0.0006366679179533	0.7250998806245303	0.0006955763846714	0.7165673419769328	0.0056570143195362	0.0971116296711761	-1.3560442690699108e-05	0.5674816435404182	1.4952252492060902e-05	0.5590605987188499	-0.0018693139970331	0.6822344738120945	0.0020643367669788	0.6743911023371885	CNNM2	22537	AS3MT	26287	BORCS7-ASMT	41485	False	False	False	ref	45	0.000519	-10	0.006927
410	chr10	102900095	T	C	rs11191453	0.00625408628	0.4793037122180733	0.00625408628	0.4919009809781275	0.0068174155828237	0.8161120133645884	4.311909570469579e-05	0.5549202759327864	4.311909570469579e-05	0.5672500859009036	0.2010477287108786	0.6537638916711948	0.0011987546813789	0.5339405706627707	0.0011987546813789	0.5477669065534465	0.0013588633828214	0.7225925112886843	8.179618660660257e-06	0.5822559365339696	8.179618660660257e-06	0.5958447071971568	0.0061494413842466	0.3162827512091638	0.0061494413842466	0.3252360858197999	CNNM2	18200	AS3MT	30624	BORCS7-ASMT	45822	False	False	False	alt	100	0.007523	95	0.1085
411	chr10	102903553	G	A	rs10883799	0.0334589222	0.0787554446745373	0.0334589222	0.0833297584763831	0.0147765931965224	0.1007945474487232	0.0005936456558744	0.0477817703121592	0.0005936456558744	0.0499307269483763	0.3826844676811999	0.3671859290819214	0.0131264510731478	0.0890992324047576	0.0131264510731478	0.0957014800463003	0.0057550836300688	0.1031103951020462	0.0002347662940363	0.0532936587328952	0.0002347662940363	0.0566384259938175	0.0199130696376517	0.0846210403253457	0.0199130696376517	0.0870135528308821	CNNM2	14742	AS3MT	34082	BORCS7-ASMT	49280	False	False	False	alt	45	0.007545	-80	0.04437
412	chr10	102932876	C	A	rs112699822	0.0018973945	0.7201613761021034	0.00302461458	0.7240791335848366	0.0066782844099916	0.8316341227310882	1.2568861105505014e-05	0.7684855422844441	1.997795599001748e-05	0.7718298557777293	0.0469009014616333	0.9133232457046376	6.311764923310196e-05	0.8832736566457703	0.000127726980406	0.8858450121988644	0.0003153485405562	0.932356990347458	4.332678292409004e-07	0.900019786955714	8.564801212028812e-07	0.9025951535460802	0.0008983495679415	0.6886581056422658	0.0017406819572816	0.6918721389221388	CNNM2	14581	AS3MT	63405	BORCS7-ASMT	78603	False	False	False	alt	-70	0.00531	90	0.005524
413	chr10	102947259	A	T	rs11191472	0.0111316953999999	0.3105724867860757	0.0111316953999999	0.3217006905147771	0.0169732433113908	0.0503187102619014	0.0001887514813208	0.1736739813340115	0.0001887514813208	0.1817760149405625	0.2168176018423427	0.6307091403986766	0.0023921469836115	0.3907673639362411	0.0023921469836115	0.4037450717776397	0.0036711049604697	0.3023960466395551	4.046899505173809e-05	0.2533972388218063	4.046899505173809e-05	0.2639358362004166	0.010076868017303	0.1749291607063305	0.010076868017303	0.1805468864109329	CNNM2	28964	AS3MT	77788	BORCS7-ASMT	92986	False	False	False	alt	100	0.02374	100	0.0398
414	chr10	102986892	A	G	rs3902934	0.0366404846	0.0598992677535507	0.0366404846	0.0642304289499767	0.0099533832533821	0.3260913403023012	0.0003765927371624	0.0668051327102056	0.0003765927371624	0.0709831001899633	0.2915320698347493	0.5040248282318367	0.0106492528035375	0.1056507464814984	0.0106492528035375	0.1133778342854979	0.002856739627223	0.4387074562613057	0.0001079846667061	0.103890844643459	0.0001079846667061	0.1108273167928103	0.0296019668253819	0.0243563608812736	0.0296019668253819	0.0249745011034725	CNNM2	68597	AS3MT	117421	BORCS7-ASMT	132619	False	False	False	alt	-55	0.01416	-65	0.07947
415	chr10	102988702	A	C	rs1890184	0.0193054252	0.1911838677953115	0.0193054252	0.2002028381120692	0.0127741575585952	0.1384998968002661	0.0002584012774632	0.1275656472607677	0.0002584012774632	0.1340211766384827	0.2935943318914097	0.5071759922201867	0.0057108492756281	0.2176954689105734	0.0057108492756281	0.2286117264738487	0.0037741734866551	0.2845216144949493	7.686882278800053e-05	0.1610144128172864	7.686882278800053e-05	0.1697994390032565	0.0151868795319453	0.113215796506501	0.0151868795319453	0.1165142920324321	CNNM2	70407	AS3MT	119231	BORCS7-ASMT	134429	False	False	False	alt	-100	0.001928	100	0.0719
416	chr10	103009952	T	C	rs11191511	0.00131733356	0.7865025584226498	0.00224172356	0.7941689197115855	0.0182363907903754	0.0380403843592289	2.5250769613325967e-05	0.6112706585465253	4.1978573776890086e-05	0.6183311887587772	0.0379257046234919	0.9298389607713824	7.317081439762259e-05	0.9088139228428	9.38163777395784e-05	0.9165365792062544	0.0006850423330105	0.8582364778022237	1.3934257674647105e-06	0.8518990572869521	1.767028837664127e-06	0.8597573021213057	0.0008755277544372	0.7713729462278504	0.0011991825641344	0.7790884672902936	CNNM2	91657	AS3MT	140481	BORCS7-ASMT	155679	False	False	False	alt	-55	0.0014	75	0.00952
417	chr10	103013607	C	T	rs11191514	-0.0773542967999999	0.0056090010322799	0.0773542967999999	0.0053004118519788	0.0158718171004579	0.0667069276177124	-0.0012705534144428	0.0085363075250022	0.0012705534144428	0.0081559123170831	0.4192055934190188	0.305908233030457	-0.0325913999210849	0.012533492078638	0.0325913999210849	0.0115902357978922	0.0066880304863107	0.0601502637704718	-0.0005379200724411	0.0112882222368496	0.0005379200724411	0.0106424859779348	-0.0407825807321652	0.0087343129214927	0.0407825807321652	0.0084762199285791	CNNM2	95312	AS3MT	144136	BORCS7-ASMT	159334	False	True	True	ref	-60	0.0006447	-65	0.02246
418	chr10	103069712	C	T	rs1926032	-0.0460371318	0.0369988260000603	0.0460371318	0.0346148429911929	0.0119416974218991	0.1755709454968876	-0.0005603455863142	0.0365410380814618	0.0005603455863142	0.0343523815162317	0.5751428956731917	0.0708971988190591	-0.0264640272988553	0.0232788651416801	0.0264640272988553	0.0214010996241641	0.0068690345755204	0.0522234675507017	-0.0003221691355473	0.0258117977571309	0.0003221691355473	0.0239646579163027	-0.0081868069170841	0.2374935098563536	0.0081868069170841	0.2304284000053383	CNNM2	151417	RPEL1	176176	AS3MT	200241	False	False	False	ref	100	0.04065	100	0.03564
419	chr10	103114004	G	C	rs9633712	-0.00184611344	0.5267571677187326	0.00589497336	0.5255514827880161	0.0061201691176406	0.9163326687837372	-1.538880947234786e-05	0.6191500318004354	3.802575027054692e-05	0.6189782490830577	0.158736086473926	0.717592898707303	-0.00047583020718	0.6050154347291544	0.0009869313143199	0.6044454834901001	0.0009784819257764	0.7926089563661896	-3.632616856821938e-06	0.6634712802239453	6.452160567348088e-06	0.663678086718024	-0.0026908992831876	0.351818760315067	0.0059647921658938	0.3519642852617196	RPEL1	131884	INA	163135	NT5C2	163601	False	False	False	ref	-80	0.002563	90	0.04706
420	chr10	103153896	G	A	rs11191582	-0.0181707281	0.2144365490071462	0.0181707281	0.2050760873707515	0.007962522928791	0.6076253674713104	-0.000147476435405	0.2523550051979262	0.000147476435405	0.2431267141641425	0.4055145800267637	0.3201734658989023	-0.0074595847473438	0.1827673692627023	0.0074595847473438	0.1729896611998288	0.0032927168405822	0.3671374710548223	-6.187393238701736e-05	0.2076483025504995	6.187393238701736e-05	0.198105420435213	-0.0093818400605815	0.2083972040830189	0.0093818400605815	0.2021142212292829	RPEL1	91992	INA	123243	NT5C2	123709	False	False	False	ref	-90	0.0047	-45	0.05887
421	chr10	103197872	T	A	rs12414028	-0.002738530914	0.7517548912787148	0.0027737518859999	0.7421140542817002	0.0179218625902976	0.043612285856469	-5.352044818188348e-05	0.563481701467227	5.414512320054021e-05	0.553949650784473	0.2779344184068299	0.5293338548832228	-0.0006988838996642	0.6993812924680035	0.0007090235528628	0.6893456958553656	0.0047895072452447	0.1584526057562273	-1.3072312173782351e-05	0.5594453652058794	1.325214786832028e-05	0.5495146426924856	-0.002373468604446	0.6361843960634922	0.0023942157076317	0.6268602988618457	RPEL1	48016	INA	79267	NT5C2	79733	False	False	False	ref	90	0.002075	-100	0.02942
422	chr10	104732662	T	C	rs1490183	-0.001042262271	0.8617514458176502	0.001486906831	0.8593809723761735	0.0139663867304105	0.1072366440844505	-1.6117897344243736e-05	0.7765151092391434	2.267869321339481e-05	0.7738472035624314	0.2145499434641438	0.6282968467625948	-0.0001373021855333	0.8632048808592113	0.0002177311009363	0.8597847064151544	0.0029324018775604	0.4163992624231344	-2.105867523666969e-06	0.8056499098967969	3.2926080248172647e-06	0.8019750208578085	-0.0008755277544372	0.7557625517784352	0.0014439983817259	0.7514356284205166	SORCS3	91371	CFAP58	378828	ITPRIP	394197	False	False	False	ref	-50	0.00315	-40	0.02878
423	chr10	104752646	C	T	rs2491368	0.00050104134	0.6743206820482883	0.00341471762	0.675358811063913	0.0054015849915874	0.9797336731843967	4.265786484571545e-06	0.7855415956624726	1.803662386030759e-05	0.7869965394904929	0.1842425751304473	0.6845035225391909	0.0001245022681922	0.682355221103947	0.0006262691754213	0.683379670976566	0.001003241570586	0.7974582560746333	9.437146917539116e-07	0.7611100414561305	3.3345678825339573e-06	0.7622336054757618	0.0003029077065114	0.4995100598217711	0.0034979615971119	0.5006075420919238	SORCS3	111355	CFAP58	398812	ITPRIP	414181	False	False	False	alt	50	0.00156	-80	0.034
424	chr10	104828192	A	G	rs12250380	0.00689099342	0.4546873895510773	0.00689099342	0.4673193600680366	0.007403720745828	0.6919190040745913	4.9862855733167376e-05	0.510626438582011	4.9862855733167376e-05	0.5229323361222136	0.2198529030384132	0.623050182344143	0.0015812700080971	0.4853369907849421	0.0015812700080971	0.4991084594971252	0.0016151129541712	0.6750850184157341	1.1325753818720551e-05	0.5221256031182279	1.1325753818720551e-05	0.535512290067018	0.0060104357929023	0.3046572649646963	0.0060104357929023	0.3134905036621191	SORCS3	186901	CFAP58	474358	ITPRIP	489727	False	False	False	alt	-5	0.0005913	-90	0.04825
425	chr10	104851081	A	G	rs1021363	-0.005484406274	0.5372963287916479	0.005590544206	0.5281729693378282	0.0273746146994836	0.0063226360828415	-0.0001650895389941	0.2384245626424875	0.0001674055207358	0.2310036793359772	0.193555949750516	0.6672852232486076	-0.0010395667751498	0.6041742029081282	0.0010646437734192	0.5948498995460116	0.0053849234503297	0.1219461631671411	-3.2488300814216525e-05	0.3570531227988948	3.303549321402311e-05	0.3478888186056885	-0.0056473614871523	0.3632521380798776	0.0057220510586208	0.3563399903875071	SORCS3	209790	CFAP58	497247	ITPRIP	512616	True	True	True	ref	100	0.001633	100	0.075
426	chr10	104872279	T	C	rs2451497	-0.0019534344326	0.6062751847230038	0.0048138231514	0.6039901666817034	0.0086019291299954	0.4784737134118189	-1.7218561325075854e-05	0.6318259710281328	3.938273046351568e-05	0.629721452491347	0.1665722673471716	0.713116663698646	-0.000325493948743	0.6830036552195202	0.0008335990326716	0.6809402118587513	0.0014275491187228	0.7122069393441809	-2.8946999153497096e-06	0.6941488205641149	6.831039471367277e-06	0.6921909916852692	-0.0017738773223788	0.4497193997404165	0.0045581385699021	0.4476978405377507	SORCS3	230988	CFAP58	518445	ITPRIP	533814	False	False	False	ref	-80	0.00167	90	0.09314
427	chr10	104877022	T	A	rs2932558	-0.00712714478	0.4695686878248915	0.00712714478	0.4573065405885735	0.0224050020096947	0.0160634009654819	-0.0001620805582421	0.223803386493028	0.0001620805582421	0.2150906960788794	0.1819998132760713	0.6800845509387636	-0.0012317086984049	0.5639921607909173	0.0012317086984049	0.550146789636518	0.003957877478734	0.232412753923131	-2.6955846928007064e-05	0.355509277923064	2.6955846928007064e-05	0.3439306123975981	-0.0063548377057852	0.309136786005345	0.0063548377057852	0.3004090331540329	SORCS3	235731	CFAP58	523188	ITPRIP	538557	False	True	False	ref	-45	0.003487	-50	0.02475
428	chr10	104880365	G	A	rs2932559	0.0193845043	0.1708002850368812	0.0193845043	0.1792985129038408	0.0108382054648085	0.2345266499410084	0.0002166516535559	0.148769688976007	0.0002166516535559	0.1558601865477692	0.3922488822498158	0.3511501543923782	0.0076580256654892	0.1563562806313324	0.0076580256654892	0.1653995348187302	0.0042723378552973	0.2202845563608818	8.604300466252029e-05	0.1371344851797782	8.604300466252029e-05	0.1446831421173286	0.0111723150655089	0.1646805662652588	0.0111723150655089	0.1697346689049029	SORCS3	239074	CFAP58	526531	ITPRIP	541900	False	False	False	alt	-35	0.0008736	-45	0.04077
429	chr10	121903955	C	T	rs7073961	0.0056212402199999	0.5295892906979366	0.0056212402199999	0.5425020336193119	0.0209734276130067	0.0214289097597814	0.00011582686827	0.2844480751378603	0.00011582686827	0.2942467176244647	0.1760329463998589	0.6921119541855948	0.0009956039159672	0.5829639305306773	0.0009956039159672	0.5970450271298605	0.0036770062099454	0.2865890626993884	2.0451413226544496e-05	0.3957981669218606	2.0451413226544496e-05	0.4081239278042121	0.0052158217408893	0.3532181566563918	0.0052158217408893	0.3629695923032934	ATE1	24846	NSMCE4A	71262	TACC2	85209	False	False	False	alt	-30	0.00293	10	0.000702
430	chr10	121921015	C	T	rs6585767	-0.0090242699	0.394084564771871	0.0090242699	0.382306288531421	0.0214769019660968	0.0203771792540362	-0.0001872774796153	0.1870536733261564	0.0001872774796153	0.1790529412497664	0.2961586738451643	0.5055315644065252	-0.0026933933788983	0.388483161724629	0.0026933933788983	0.3757563271667336	0.0063838903458242	0.0688543347166216	-5.602212038470991e-05	0.2137312895836509	5.602212038470991e-05	0.204395760588168	-0.0068901129679768	0.2814588466231515	0.0068901129679768	0.2733670374036472	ATE1	7786	NSMCE4A	54202	TACC2	68149	False	False	False	ref	-50	0.006348	-50	0.04565
431	chr10	121940050	T	C	rs12415401	0.0308264074	0.086582517183737	0.0308264074	0.0921835618077595	0.0109932163333674	0.2265575250137449	0.0003473493151303	0.0720613657674291	0.0003473493151303	0.0763751577047598	0.1404931586427244	0.7532542451006513	0.0041647153395325	0.2628464542813185	0.0041647153395325	0.2740810477129031	0.0015270817722875	0.6903208761767702	4.6428279512135656e-05	0.2241634930456741	4.6428279512135656e-05	0.2342521559457175	0.0292554902021804	0.0291668597910261	0.0292554902021804	0.0300016192939508	ATE1	11249	NSMCE4A	35167	TACC2	49114	False	False	False	alt	-25	0.005318	95	0.04602
432	chr10	121956355	A	G	rs7095093	0.040575625	0.0462176557062498	0.040575625	0.0495451807541835	0.0099571896052281	0.3010287731101446	0.0004063197071444	0.0548629841980953	0.0004063197071444	0.0584270196460079	0.2727600908723119	0.5359183362386799	0.0110575434339288	0.0992589512784556	0.0110575434339288	0.1066323092216113	0.0027565297323241	0.445005986965679	0.000112252646958	0.0966061757454825	0.000112252646958	0.1030407449207729	0.0348509839313685	0.0164668062513084	0.0348509839313685	0.0169459928661506	NSMCE4A	18862	ATE1	27554	TACC2	32809	False	False	False	alt	70	0.00312	100	0.02414
433	chr10	121957884	G	A	rs7923863	0.00302788198	0.6955048791699414	0.00302788198	0.7094278091379189	0.013271196265552	0.1260932031345806	3.9378483450503536e-05	0.5830166740236852	3.9378483450503536e-05	0.5958720696609467	0.1997323623689041	0.653082116753119	0.0006112683420763	0.6684515248438351	0.0006112683420763	0.6829205552472202	0.0026707040237892	0.4606147972940914	8.027911486537395e-06	0.5908134459068948	8.027911486537395e-06	0.6047497650444839	0.0026971234141432	0.5537764712156722	0.0026971234141432	0.5658069348076523	NSMCE4A	17333	ATE1	29083	TACC2	31280	False	False	False	alt	-25	0.002045	-85	0.04996
434	chr10	121965676	C	A	rs72839625	-0.0007031537699999	0.7050269575618626	0.00359627141	0.7009199844538837	0.0063514492315885	0.8798649294392111	-4.164007483056057e-06	0.7629925309360572	2.3514897987268765e-05	0.7589822316253549	0.1848504652537888	0.6822456335847165	-0.0001547736390537	0.7083096887908804	0.00071853592143	0.7041563960131174	0.0011757356287081	0.7614210713590028	-9.297883303295076e-07	0.751512905762036	4.693391514298756e-06	0.747402101476317	-0.00034855133352	0.5485279179931207	0.0030290770651147	0.5455495070783488	NSMCE4A	9541	TACC2	23488	ATE1	36875	False	False	False	ref	35	0.00144	5	0.002869
435	chr10	122144041	T	C	rs7902292	0.00269440652	0.5492862946678532	0.00651586336	0.5507997545563897	0.0089054569951119	0.4494838297316473	4.4185151054767474e-05	0.5246456020663592	7.332208312259079e-05	0.5264334274712263	0.3815910953433127	0.3663743150989679	0.000977634367992	0.440361536313198	0.0025148178034088	0.4414131010494651	0.0033873389854403	0.3487211735597833	1.6560995823112756e-05	0.4287067489687565	2.8212803855996182e-05	0.4303183325842739	0.001879687548626	0.5057862263204914	0.0038797082957291	0.5061191028138764	BTBD16	127256	TACC2	154877	NSMCE4A	168824	False	False	False	alt	100	0.002308	20	0.0198
436	chr10	122152783	T	C	rs4752661	0.0261165176	0.1180778080415894	0.0261165176	0.1251561145976908	0.0092410318876924	0.3879779009575556	0.0002586423720368	0.1274043660821451	0.0002586423720368	0.1338965715430009	0.4223591531032479	0.3007107104824159	0.01104776953074	0.1019400805839903	0.01104776953074	0.1095403234215205	0.0039165526164876	0.2558467155832915	0.0001097800583051	0.1084889979935536	0.0001097800583051	0.1154145571841326	0.0126308364194648	0.136596772660747	0.0126308364194648	0.1409783353954117	BTBD16	118514	TACC2	163619	NSMCE4A	177566	False	False	False	alt	100	0.00963	-100	0.0324
437	chr11	17018871	C	A	rs10832723	-0.0056647092199999	0.5374193139314505	0.0056647092199999	0.5246120775989512	0.0094030833815268	0.3654302138271239	-5.339666980341711e-05	0.5164174136756233	5.339666980341711e-05	0.5045107943107693	0.0248280583823483	0.953758445972421	-0.0001432866587018	0.886099036365743	0.0001432866587018	0.8717011513559237	0.0002347298585723	0.9489540026309524	-1.368638569728922e-06	0.8770321784861725	1.368638569728922e-06	0.8626293362006527	-0.0023859168663574	0.6190043846763886	0.0023859168663574	0.6065862208510606	PLEKHA7	4456	RPS13	58844	PIK3C2A	189115	False	False	False	ref	-50	0.004826	-60	0.01958
438	chr11	17021494	G	A	rs4456241	-0.0575008466	0.0174970061872534	0.0575008466	0.0164668165677058	0.0196751338661901	0.0287797339067946	-0.0012031728687586	0.0111735846018886	0.0012031728687586	0.0106849272641695	0.4117615327959833	0.3178826696535935	-0.0236327799221645	0.031418755200613	0.0236327799221645	0.0289366837634875	0.0080419011112815	0.0322180093046808	-0.0004906303724368	0.0146993241672197	0.0004906303724368	0.0138427660943181	-0.0310480399174264	0.0235106688166087	0.0310480399174264	0.0229053394309575	PLEKHA7	7079	RPS13	56221	PIK3C2A	186492	False	True	False	ref	-95	0.005554	100	0.085
439	chr11	17026200	G	T	rs77545208	0.00457196824	0.5966687969822847	0.00457196824	0.6098345582324421	0.0164284363471336	0.0584473758898692	7.950419749853527e-05	0.4159017658754592	7.950419749853527e-05	0.4271132444720168	0.2361144825153787	0.597261616578415	0.0010434179200334	0.5817665997509647	0.0010434179200334	0.5954405849759453	0.0038255656764393	0.2756120651258369	1.7814489868085843e-05	0.4452308731217141	1.7814489868085843e-05	0.4578346452390722	0.0041494206371435	0.4429931472260352	0.0041494206371435	0.4539798757869295	PLEKHA7	11785	RPS13	51515	PIK3C2A	181786	False	False	False	alt	90	0.007774	15	0.01007
440	chr11	17027833	T	A	rs34902253	-0.00847664068	0.4226544689857858	0.00847664068	0.4105984034508892	0.0360196549416772	0.0018320906878303	-0.0003008866264639	0.1050348184735783	0.0003008866264639	0.0996998176884264	0.2417742922644425	0.5829664340559809	-0.0019826121547207	0.4575799120017085	0.0019826121547207	0.4442761455196156	0.0086012937574897	0.0224802685061741	-6.971530682573963e-05	0.1770416683169109	6.971530682573963e-05	0.168264738186666	-0.0072614861150011	0.2796548133151648	0.0072614861150011	0.2716551593556108	PLEKHA7	13418	RPS13	49882	PIK3C2A	180153	False	True	True	ref	-45	0.0007324	90	0.055
441	chr11	17034171	A	G	rs7950225	0.0646734556	0.0107956017056569	0.0646734556	0.0115118687907781	0.0115239060761495	0.2018511520803263	0.0007704934321606	0.0188418087899257	0.0007704934321606	0.019976816311464	0.594970902187782	0.0530037725695095	0.0384512257718555	0.006679975222139	0.0384512257718555	0.0072556545591262	0.0068481547304911	0.0526698797630774	0.0004574600014684	0.0129908198229271	0.0004574600014684	0.0139666134309655	0.0098050809655701	0.19166649939517	0.0098050809655701	0.1980179193229994	PLEKHA7	19756	RPS13	43544	PIK3C2A	173815	False	True	False	alt	95	0.00401	95	0.03052
442	chr11	17080007	C	G	rs12577418	-0.0505967564	0.0275310680261347	0.0505967564	0.0258297940456645	0.0167210376763026	0.0564404973268031	-0.0009646192837228	0.0200682541349669	0.0009646192837228	0.0191224036482681	0.4576686480150209	0.243783351293076	-0.0231210418034004	0.0328581407675541	0.0231210418034004	0.0302699187020223	0.0076358726496002	0.0416999947196072	-0.0004399484308765	0.0211729258805421	0.0004399484308765	0.0198575105409111	-0.0213591427296963	0.057871671254748	0.0213591427296963	0.0562989884107345	RPS13	2292	PLEKHA7	65592	PIK3C2A	127979	False	False	False	ref	90	0.003645	100	0.10693
443	chr11	17084183	T	G	rs11024151	-0.0018538826599999	0.7450617801238856	0.00296993326	0.73761520429924	0.0242556319756879	0.0112018664412619	-4.727720556250085e-05	0.4862392348976485	6.878029216823923e-05	0.4792802627686042	0.1598273841014947	0.7123740579422032	-0.000200326458068	0.7693743428640606	0.0004275794077966	0.762324402300554	0.0037887532608877	0.2492636215248748	-5.406847571942765e-06	0.5950593656226735	9.785358624796416e-06	0.5879260209470615	-0.0016659923858131	0.6087500713313267	0.0025249224577017	0.6020063201351756	RPS13	6468	PLEKHA7	69768	PIK3C2A	123803	False	True	False	ref	-70	0.001793	45	0.0271
444	chr11	17086101	G	C	rs1987694	0.023673204	0.1369164172982303	0.023673204	0.144579080226079	0.0118006545444781	0.1747248551061175	0.0002815629224644	0.1016729568877131	0.0002815629224644	0.107449435792194	0.5608834116536479	0.0878920014365274	0.0133021527225341	0.0786778320914034	0.0133021527225341	0.0850302806653169	0.0066232870969483	0.0566499800769519	0.0001583412248784	0.0637705184711551	0.0001583412248784	0.0686026579465595	0.0047739084430336	0.3824323863851228	0.0047739084430336	0.3926985443956619	RPS13	8386	PLEKHA7	71686	PIK3C2A	121885	False	False	False	alt	50	0.0003967	-5	0.000977
445	chr11	17171928	T	A	rs214934	-0.0081484401	0.4273449965764817	0.0081484401	0.4154016880990879	0.020439531208826	0.0239679735141402	-0.0001671482682625	0.215849979859973	0.0001671482682625	0.207415768510694	0.1755246423718088	0.6952342319224335	-0.0013984944840673	0.5332234836160421	0.0013984944840673	0.5196518919299096	0.0035926121721699	0.3059054063970331	-2.874012138519266e-05	0.3446705986670015	2.874012138519266e-05	0.3332875679470901	-0.0077365947779541	0.2563487001263065	0.0077365947779541	0.2487328118561451	PIK3C2A	36058	NUCB2	36226	RPS13	94213	False	False	False	ref	95	0.014305	100	0.036
446	chr11	17184972	A	T	rs664382	-0.00594702432	0.5332934688519633	0.00594702432	0.5206111584778965	0.0268290176301218	0.00698884731533	-0.0001601179746367	0.2311172438093965	0.0001601179746367	0.2224096540194166	0.046500482370149	0.918117345318086	-0.0002880265372045	0.8273720884386562	0.0002880265372045	0.8132633313220213	0.0013325121702428	0.7291218772944816	-8.20364571651853e-06	0.6435524987395452	8.20364571651853e-06	0.6301800154401095	-0.0034460938391476	0.5153678847449045	0.0034460938391476	0.5037733428178283	PIK3C2A	23014	NUCB2	23182	RPS13	107257	False	True	False	ref	100	0.004333	95	0.01189
447	chr11	17185193	A	T	rs665311	0.0033634586459999	0.6756072526755419	0.0035451353139999	0.6859626528662494	0.0107533307019111	0.2472772318504829	3.9183719154348574e-05	0.6052158193693822	4.113364466802067e-05	0.615378652445333	0.0351455927966057	0.9388436524571068	0.0001115264988323	0.8943821173038142	0.0001194513776317	0.9038666108689452	0.0003895557554553	0.923825460358866	1.3467198205160235e-06	0.874177216772945	1.431777101037514e-06	0.8837773277908617	0.0014958661396902	0.7144791500836422	0.0015705557111587	0.724140394337339	PIK3C2A	22793	NUCB2	22961	RPS13	107478	False	False	False	alt	-100	0.0694	-100	0.02254
448	chr11	17188885	T	C	rs615358	0.00395769145	0.603791327434136	0.0045918991299999	0.6138316420761503	0.0070751996066389	0.7826054991973869	2.9384250647610708e-05	0.6569036651853941	3.341459599278063e-05	0.6664576858295753	0.1587900289422089	0.7159986266693649	0.0006561342034405	0.6685108082289274	0.0007612992943572	0.6786437219224547	0.0011049664859393	0.765716601462871	4.734747032068804e-06	0.7012494576501745	5.403063823140716e-06	0.7109674416296453	0.0034938121764748	0.4434178746264766	0.004078880486312	0.4511448893279376	PIK3C2A	19101	NUCB2	19269	RPS13	111170	False	False	False	alt	-100	0.002832	50	0.02953
449	chr11	17188934	G	A	rs615424	-0.0003371424999999	0.6659162383318232	0.00398336242	0.6620467019459476	0.0078251494335266	0.6208012855200059	-5.640493068264271e-07	0.6886335459712858	3.144215428434766e-05	0.6849039038002576	0.161366819157875	0.7123709701200697	-0.0001981458054089	0.7114051381037527	0.0006312262588016	0.7059358757295289	0.0012600713301361	0.7355327000944092	-1.2837503372764142e-06	0.7259396402786671	4.9776322087310914e-06	0.7206207357699381	-0.0004481374288115	0.5056591670597287	0.0035062604383862	0.502311096450522	PIK3C2A	19052	NUCB2	19220	RPS13	111219	False	False	False	ref	80	0.002602	-10	0.00797
450	chr11	19291073	A	G	rs2553965	0.038423335	0.0534570865716308	0.038423335	0.0572767761648506	0.0085360015042866	0.478044759349114	0.0003345281417311	0.0791999807781171	0.0003345281417311	0.0840007468646772	0.2398074668824365	0.5942951445702015	0.0093364547196481	0.1263166608015254	0.0093364547196481	0.1346379646484795	0.0020585678458811	0.5946130195173036	8.1884672709332e-05	0.1412927689919351	8.1884672709332e-05	0.1494842624288794	0.0348613574829614	0.0149517662365366	0.0348613574829614	0.015298089451491	E2F8	49453	NAV2	59652	CSRP3	80502	False	False	False	alt	75	0.003536	-40	0.001068
451	chr11	19300107	C	T	rs712017	-0.0223399422	0.1651731855430193	0.0223399422	0.1571165867461261	0.0083281846693651	0.528300553044186	-0.0001861268373156	0.1900220600050308	0.0001861268373156	0.182045643665826	0.1751076255977758	0.6989263298382485	-0.003902731638732	0.3060132959470045	0.003902731638732	0.2942637951670682	0.0014629547829112	0.709736903092382	-3.267148599677941e-05	0.3213737100974155	3.267148599677941e-05	0.3102209367652477	-0.0220790672102407	0.0599198603192266	0.0220790672102407	0.0583243658825086	NAV2	50618	E2F8	58487	CSRP3	89536	False	False	False	ref	90	0.0179	-90	0.04404
452	chr11	19300979	T	C	rs813212	-0.004605266558	0.605259899717309	0.0047649819299999	0.5956097318969763	0.0092809670387297	0.3796453024475897	-4.116691414380284e-05	0.6050700537841144	4.292014870792522e-05	0.5957262908591252	0.0518034419444184	0.9057128390805116	-0.0002690210354666	0.8471198878119098	0.0002774210908275	0.8375563812955513	0.0004828268982263	0.8979752370316041	-2.4174378685858542e-06	0.8424455108941783	2.509647323456761e-06	0.8324037480468893	-0.0029875828587433	0.5428110280962887	0.0030996172159461	0.5338073861314078	NAV2	49746	E2F8	59359	CSRP3	90408	False	False	False	ref	-100	0.01588	100	0.01611
453	chr11	19302550	T	C	rs1087110	0.0346285968	0.0708161741752327	0.0346285968	0.0756487535210164	0.0093702522555607	0.3680312963828553	0.0003302020416647	0.0829860683709841	0.0003302020416647	0.087892933887402	0.1207771864853369	0.7910626326313567	0.004387281446957	0.2691714676422527	0.004387281446957	0.2806509372574822	0.0011497087817159	0.7715688252543731	4.235208485991463e-05	0.2642076578839595	4.235208485991463e-05	0.2747861390199739	0.0309131837467193	0.0243439771364939	0.0309131837467193	0.0250179587952218	NAV2	48175	E2F8	60930	CSRP3	91979	False	False	False	alt	-100	0.001595	90	0.006058
454	chr11	19307579	C	A	rs1698887	-0.0231364954	0.1639745119479397	0.0231364954	0.1559729903922282	0.012753045539099	0.1392683592876545	-0.0003034300700108	0.1080439416936396	0.0003034300700108	0.1025592281198321	0.4846772269421882	0.1937959452097202	-0.0113810694309755	0.1155741734931666	0.0113810694309755	0.1080505249246166	0.0062376434548256	0.0753410513885164	-0.000150851562644	0.0838703522472825	0.000150851562644	0.0784755217224688	-0.0081411632900755	0.2531034859601233	0.0081411632900755	0.2457076597397371	NAV2	43146	E2F8	65959	CSRP3	97008	False	False	False	ref	85	0.000519	95	0.02295
455	chr11	19311710	T	C	rs11025099	0.0529606693999999	0.0199129815691282	0.0529606693999999	0.0213801566404943	0.0102800168227124	0.277876824561617	0.0005539621088079	0.0319252946152801	0.0005539621088079	0.0341449045779008	0.5463687382649198	0.1059959329140074	0.0289650834720592	0.0149188323780308	0.0289650834720592	0.0163718332027997	0.0056156122270555	0.0997297461957958	0.0003029388648073	0.024113752243158	0.0003029388648073	0.0261032614721721	0.0125353997448106	0.1419765549393115	0.0125353997448106	0.1464918362808433	NAV2	39015	E2F8	70090	CSRP3	101139	True	False	False	alt	-90	0.03128	-90	0.1675
456	chr11	19314074	C	T	rs10833094	0.0184875448	0.1872796156088323	0.0184875448	0.196349090723397	0.0122047240944592	0.1631439190782772	0.0002307548691743	0.1354464805349238	0.0002307548691743	0.1423006095501595	0.4983184472867975	0.1766286888576468	0.0091887719923962	0.1257706005863765	0.0091887719923962	0.1342653179143485	0.0060518184406713	0.07878228403794	0.0001141253648307	0.0956581976582666	0.0001141253648307	0.1020972807463859	0.0060560794199109	0.3149405295092546	0.0060560794199109	0.3239876826918435	NAV2	36651	E2F8	72454	CSRP3	103503	False	False	False	alt	-95	0.01863	-85	0.1059
457	chr11	19321010	G	A	rs57208920	-0.0353178934	0.0790498468158932	0.0353178934	0.0744816768508014	0.0077567354935985	0.6346992537284208	-0.0002828612361767	0.1245486123382372	0.0002828612361767	0.1186233610289489	0.3038807456508884	0.4935659351285552	-0.0108087752598045	0.1275951375328915	0.0108087752598045	0.1195178074020606	0.0023626316073966	0.5440796476140941	-8.673738095832135e-05	0.1582868000340299	8.673738095832135e-05	0.1499501461339152	-0.0285583875351403	0.0354846604524078	0.0285583875351403	0.0344687672419401	NAV2	29715	E2F8	79390	CSRP3	110439	False	False	False	ref	90	0.01174	100	0.02328
458	chr11	19321717	C	A	rs10766541	0.0088859948	0.3720714407146518	0.0088859948	0.3839743962660696	0.0338863003885275	0.0022860802410262	0.0003089725675403	0.0855559816678023	0.0003089725675403	0.0904459535776805	0.1869355491239535	0.6739056261339489	0.0016440839669078	0.4687391309264048	0.0016440839669078	0.4823241579584178	0.00623677605637	0.069817667934478	5.653305075257262e-05	0.192438834237148	5.653305075257262e-05	0.202038686720038	0.0085540306434713	0.2264384732005021	0.0085540306434713	0.2335862040678156	NAV2	29008	E2F8	80097	CSRP3	111146	False	True	True	alt	100	0.003548	-100	0.05734
459	chr11	19323784	G	A	rs7940014	0.00185740998	0.6555587992497893	0.00373224138	0.6577155295378768	0.0100495264616983	0.3016913406419225	2.262464596393833e-05	0.6080991707695119	3.917721229807171e-05	0.6104224394508603	0.152520254359485	0.7361676781543511	0.0003666285084613	0.7098277320755076	0.0005644535141884	0.7115959526822996	0.0015815296039879	0.68588735339515	4.345087682274054e-06	0.677743553826789	6.091575787117961e-06	0.6798605598974475	0.0018257450803431	0.4992722438771778	0.0035477546447576	0.5015025633416674	NAV2	26941	E2F8	82164	CSRP3	113213	False	False	False	alt	55	0.0004272	55	0.01483
460	chr11	19332728	G	A	rs4757792	0.001922763726	0.7507993377128578	0.002808303074	0.7537701347780772	0.0057232842462888	0.9635511616755468	1.1016228939799528e-05	0.8264547379568035	1.6103686834634467e-05	0.8290629685161925	0.0401000010373551	0.92598131367113	7.815855366198959e-05	0.9007503324314594	0.0001134682948243	0.902910228566306	0.0002294382666554	0.9490219508547376	4.481877183402511e-07	0.9252716998011808	6.507965811328433e-07	0.9274230918236228	0.0009149472504901	0.7294737252138914	0.0015083144016016	0.7323147841727236	NAV2	17997	E2F8	91108	CSRP3	122157	False	False	False	alt	100	0.004227	5	0.001625
461	chr11	24360352	A	G	rs17234749	-0.0027599167	0.7654744695505656	0.00279692618	0.757481412544671	0.0087188301402922	0.4710043357884745	-2.2594772765880868e-05	0.7706039827853802	2.2958663624933658e-05	0.7626914532522188	0.1032355107418126	0.8110568667635194	-0.0002385582286526	0.8514501545092967	0.000243788751124	0.843606238623316	0.0009401342592198	0.8021031294287112	-2.080906502712732e-06	0.8531310671326744	2.1323349310546773e-06	0.8453498567787389	-0.0018091473977945	0.6942496602029117	0.0018464921835288	0.6862702883291938	LUZP2	136619	CCDC179	1499878	SVIP	1530053	False	False	False	ref	-95	0.005104	-30	0.01417
462	chr11	24366037	C	T	rs1025883	0.0037579775199999	0.6524115192904912	0.0037579775199999	0.6655642740417482	0.0231845945086758	0.0143607029023083	8.837137213898514e-05	0.3763069504777441	8.837137213898514e-05	0.387233440317456	0.221278229027272	0.6247372856918697	0.0008880628623994	0.6200549345523648	0.0008880628623994	0.6337560958001778	0.0052582452670298	0.1350745264079657	2.122125630183337e-05	0.4158933960430825	2.122125630183337e-05	0.4281336201089347	0.0033610307160862	0.4981015440437166	0.0033610307160862	0.5097048395024724	LUZP2	130934	CCDC179	1505563	SVIP	1535738	False	True	False	alt	95	0.00107	-90	0.0245
463	chr11	24367332	A	T	rs11027838	-0.0116664555	0.3300826829403281	0.0116664555	0.3189202641899645	0.0192836887195359	0.0306010077626194	-0.0002289538327064	0.1577847921324939	0.0002289538327064	0.1506037995662728	0.2279650203840288	0.6106999425683697	-0.0027935848969098	0.3982427665592641	0.0027935848969098	0.3858052195363449	0.0045310379144921	0.1962095394090539	-5.6109369456754254e-05	0.2383564519223789	5.6109369456754254e-05	0.2283145286702149	-0.0104855859500616	0.186563699219717	0.0104855859500616	0.18101463810886	LUZP2	129639	CCDC179	1506858	SVIP	1537033	False	False	False	ref	-90	0.004494	75	0.02771
464	chr11	24373675	T	C	rs72875837	0.00643106936	0.4860999964952695	0.00643106936	0.4988714512429727	0.008695703493442	0.4657319097109512	5.425750165677256e-05	0.4969974878959678	5.425750165677256e-05	0.5091147285522852	0.0110270853432089	0.9799097018470628	8.141140678456461e-05	0.9151145902225616	8.141140678456461e-05	0.9292376239304916	9.539828279956537e-05	0.9796489311946458	6.700362223071143e-07	0.915567199072052	6.700362223071143e-07	0.9297845274629348	0.0013091422110187	0.7441683205330775	0.0013091422110187	0.7575617238293831	LUZP2	123296	CCDC179	1513201	SVIP	1543376	False	False	False	alt	-100	0.015335	-80	0.02737
465	chr11	24374405	G	T	rs1470279	0.005095468792	0.530953574276964	0.005368986008	0.5414300967219969	0.0126623477182025	0.1385974632548619	6.181938244333712e-05	0.4367829386088789	6.583603881570857e-05	0.4461957881840778	0.0040332368593034	0.9923281312050516	2.0488965700962133e-05	0.9584286519607016	2.1862240660380745e-05	0.9705742518036016	5.201764536687246e-05	0.9888990341745318	2.506095749042681e-07	0.9499885766308908	2.70776399085305e-07	0.9609992271390804	0.0003692984367057	0.9058938115670416	0.0003983443811657	0.9154084339391118	LUZP2	122566	CCDC179	1513931	SVIP	1544106	False	False	False	alt	-5	0.0001719	90	0.00932
466	chr11	24375679	T	C	rs35846200	0.0182708336	0.1840341461524156	0.0182708336	0.1931214576555588	0.0071804013390254	0.7417415676544171	0.0001304290692174	0.2435349004952896	0.0001304290692174	0.2528227228809684	0.3535015923401695	0.4122847455422281	0.0064441267163682	0.1802265749565954	0.0064441267163682	0.1900063804949796	0.0025500450338207	0.5051729522818306	4.619970861210762e-05	0.2235372470654942	4.619970861210762e-05	0.2334880573175443	0.0119959750619819	0.1466537272005501	0.0119959750619819	0.151396984095666	LUZP2	121292	CCDC179	1515205	SVIP	1545380	False	False	False	alt	80	0.003586	-15	0.01538
467	chr11	24384375	A	C	rs11027859	0.0164773714999999	0.220410537694996	0.0164773714999999	0.2302230949349111	0.0078420404811316	0.617373499703454	0.0001339921277703	0.2652365131545255	0.0001339921277703	0.2746680295449299	0.1004097552879178	0.824937081193	0.0017272665450715	0.4815326507343201	0.0017272665450715	0.4948380752533605	0.0008170298747252	0.8369708146048986	1.4544788331274417e-05	0.503430468838445	1.4544788331274417e-05	0.516350981758448	0.0137657029637236	0.1287061226135498	0.0137657029637236	0.1326878975425981	LUZP2	112596	CCDC179	1523901	SVIP	1554076	False	False	False	alt	-95	0.001675	-85	0.0468
468	chr11	24533602	G	A	rs11027983	0.0050835508199999	0.5721844181026752	0.0050835508199999	0.5851240519196065	0.0194893408067329	0.0294989856850423	0.0001069591911693	0.3429543517635098	0.0001069591911693	0.3540443357756406	0.1243166422888203	0.7833611462915098	0.0006858412605536	0.6754793607732009	0.0006858412605536	0.6892666770710794	0.0024436500906403	0.5130708824953484	1.4711219821613154e-05	0.5184410640802086	1.4711219821613154e-05	0.5316490130534273	0.0048631209867321	0.4067502616498076	0.0048631209867321	0.4170569273514836	LUZP2	36631	ANO3	1655241	CCDC179	1673128	False	False	False	alt	-100	0.01743	-45	0.00647
469	chr11	24544101	C	T	rs1396844	-0.0840447219999999	0.0065874660934661	0.0840447219999999	0.0062797041838788	0.0270188724885186	0.0082502920465857	-0.0025924357226767	0.0047979437725908	0.0025924357226767	0.0045745058393127	0.2856461166609612	0.5101816184970603	-0.0261910789405694	0.0274536290777059	0.0261910789405694	0.0255813198257582	0.00827033673293	0.0347621695232935	-0.0008376682792189	0.0105541872064459	0.0008376682792189	0.0099913154874084	-0.0736708887021649	0.0015699488413847	0.0736708887021649	0.0015583499739162	LUZP2	47130	ANO3	1644742	CCDC179	1683627	False	True	True	ref	-100	0.007557	10	0.02454
470	chr11	24547843	A	G	rs11028002	0.0228113988	0.1609260645410012	0.0228113988	0.1691094597306322	0.0107566380278357	0.2473802487651182	0.000249042671561	0.1377092000885507	0.000249042671561	0.1445108500278782	0.0887000902498988	0.8452224247028627	0.002052529978043	0.4480045387130132	0.002052529978043	0.4609542451398742	0.0009638241294796	0.8079495797223776	2.2890093691516625e-05	0.4073632701799272	2.2890093691516625e-05	0.419449940812375	0.0176827560451871	0.097862065034987	0.0176827560451871	0.1008024440998976	LUZP2	50872	ANO3	1641000	CCDC179	1687369	False	False	False	alt	-85	0.003532	-25	0.0087
471	chr11	24551870	C	T	rs11028007	0.00547227678	0.5351341101163589	0.00547227678	0.5477474528037355	0.0216422023673103	0.0192086162875341	0.0001235546764837	0.2823408436610896	0.0001235546764837	0.2921904950699521	0.0146640525316652	0.9744005724343456	9.59685756503394e-05	0.9029500932388086	9.59685756503394e-05	0.9169972575442786	0.0003628727637235	0.9281218077544436	2.4843075781546587e-06	0.8197953966287145	2.4843075781546587e-06	0.833869211366225	0.0015850786833888	0.7139826454329852	0.0015850786833888	0.7274426806427474	LUZP2	54899	ANO3	1636973	CCDC179	1691396	False	True	False	alt	-95	0.01438	60	0.01637
472	chr11	24551903	T	C	rs10834383	0.0039603304	0.6253823408963058	0.00436769468	0.6357776411361609	0.0064349071738442	0.872590179997541	2.718461412725568e-05	0.6909721534012327	2.9784259619375007e-05	0.7010204967155007	0.0140872830631022	0.975294932222492	6.497995267978378e-05	0.9265630378125848	6.754079610338674e-05	0.9373680063868676	9.361421520070284e-05	0.9813623599973572	4.4958279799487653e-07	0.9366647589317008	4.659251373160762e-07	0.9482955286282856	0.0010352804489672	0.7885833397110146	0.0010892229172501	0.7982952287286076	LUZP2	54932	ANO3	1636940	CCDC179	1691429	False	False	False	alt	-85	0.0006104	30	0.003937
473	chr11	24558404	A	G	rs1509611	-0.0027470345719999	0.7427117479815697	0.002819331548	0.734154611522662	0.0061366289033845	0.9287922641919808	-1.785821326525872e-05	0.8054148902151274	1.826452772705037e-05	0.7972058340441738	0.2127200489631635	0.6332638859864711	-0.0006266828741429	0.7150090220817805	0.000639733213767	0.7060580600983786	0.0012986522560124	0.7367609522839463	-4.0638722461225255e-06	0.7671758346148988	4.137216139208932e-06	0.7584771949599479	-0.0026473303664975	0.6053572361103009	0.0027344681998775	0.59714524141405	LUZP2	61433	ANO3	1630439	CCDC179	1697930	False	False	False	ref	90	0.02203	-65	0.02937
474	chr11	24559498	A	G	rs11028012	0.0382968977999999	0.0530889210683501	0.0382968977999999	0.0569919203545323	0.0084332080800465	0.5047322437530876	0.0003246415967784	0.0795390128916727	0.0003246415967784	0.0843298357087431	0.1139493148269172	0.7983218793641196	0.0044449673743154	0.2580396641417352	0.0044449673743154	0.2695028331947212	0.0009610996674146	0.8024491943681453	3.765126477467108e-05	0.2723610101466829	3.765126477467108e-05	0.2831353987425442	0.0335625888235354	0.0170326449742399	0.0335625888235354	0.0174956243577379	LUZP2	62527	ANO3	1629345	CCDC179	1699024	False	False	False	alt	-100	0.00842	-100	0.01104
475	chr11	24562187	A	G	rs1509615	-0.0028474959	0.7507352746725043	0.0028474959	0.7368105386344048	0.0316116248490831	0.0030773629682567	-8.901913827804212e-05	0.381518958162848	8.901913827804212e-05	0.3705705595369486	0.2062801481343167	0.6474328923363507	-0.0005853969602679	0.7201104128922071	0.0005853969602679	0.7056204061080739	0.0064392223172949	0.0631047791722315	-1.813929838461279e-05	0.4601951938430044	1.813929838461279e-05	0.4474536453429464	-0.0027074969657361	0.5793540267674602	0.0027074969657361	0.5673170770058703	LUZP2	65216	ANO3	1626656	CCDC179	1701713	False	True	True	ref	-75	0.001846	-85	0.04117
476	chr11	24562296	C	T	rs6484058	-0.00270643528	0.7836485359115262	0.00270643528	0.7699364138888554	0.0061573154814269	0.9246457187055724	-1.7461201821557426e-05	0.8363082222911793	1.7461201821557426e-05	0.8226228585994452	0.2225956700795651	0.6220526055084662	-0.0006029283066232	0.7447578481091353	0.0006029283066232	0.7306432127789488	0.0013657270620586	0.7265994837644953	-3.871458507584085e-06	0.7918681955966876	3.871458507584085e-06	0.7778142247946718	-0.0023610203425346	0.63652578750033	0.0023610203425346	0.6239360294355204	LUZP2	65325	ANO3	1626547	CCDC179	1701822	False	False	False	ref	5	0.0006714	-100	0.03784
477	chr11	24562993	A	G	rs11028020	0.005624926332	0.534690767057881	0.006245370468	0.5414117361137397	0.0073642178154243	0.7166325817521866	4.167219084446761e-05	0.5848105064384435	4.642058609529276e-05	0.5908475712099314	0.255288955279619	0.5691438162261795	0.0013779319926429	0.5440336428832118	0.0015444302060017	0.5506870597718524	0.001883066684274	0.630544106189515	1.0098204214972254e-05	0.5784457573292842	1.1391969446702195e-05	0.5844472879819536	0.0042739032562578	0.4006871672925086	0.0048257762009978	0.4052776182824113	LUZP2	66022	ANO3	1625850	CCDC179	1702519	False	False	False	alt	-85	0.00518	95	0.06824
478	chr11	24563411	T	C	rs34167424	0.0036422064	0.6763769160189814	0.0036422064	0.6900534600585815	0.0174582029568153	0.0462415215220658	6.136338046560556e-05	0.5012798408559147	6.136338046560556e-05	0.5134838290550721	0.1857176941669518	0.6759585209268115	0.0006024680473363	0.7002601892040526	0.0006024680473363	0.714327622978699	0.0033721923044132	0.3256357187502026	1.0525909608816164e-05	0.5736296405042927	1.0525909608816164e-05	0.587172312690734	0.0033070882478033	0.5165803313335479	0.0033070882478033	0.5281346523575751	LUZP2	66440	ANO3	1625432	CCDC179	1702937	False	False	False	alt	-20	9.155e-05	75	0.02405
479	chr11	24569034	G	A	rs1876822	-0.0004690629499999	0.806905597396995	0.00179907569	0.8102899995558519	0.0297248565751089	0.0040070365302469	-6.999485331378769e-06	0.5303827394276507	5.054798332141066e-05	0.533205733967751	0.0593512380833825	0.8948330422126771	-2.4554119384403648e-05	0.9133452491693062	8.029113064610421e-05	0.91691402153277	0.0018306007686814	0.5972252444938457	-4.237104589769024e-07	0.8108694701376232	2.257944811892748e-06	0.8143670039091312	-0.0001244826191143	0.7784703988028231	0.0011161941513915	0.7815849714076855	LUZP2	72063	ANO3	1619809	CCDC179	1708560	False	True	True	ref	0	0.0	0	0.0
480	chr11	24572012	T	G	rs1509588	-0.00563949536	0.5421893907351979	0.00563949536	0.5293994369788039	0.0168616008391987	0.053078645654756	-9.568929505944123e-05	0.3538097843536578	9.568929505944123e-05	0.343355754426031	0.042338613471094	0.9294168253514424	-0.0002489717472583	0.8515195252242713	0.0002489717472583	0.8374236573722547	0.0007777414230522	0.8491950950737265	-4.611270425069436e-06	0.7596988096198783	4.611270425069436e-06	0.7458204656488888	-0.0030332264857518	0.5607099201643351	0.0030332264857518	0.5485799613060967	LUZP2	75041	ANO3	1616831	CCDC179	1711538	False	False	False	ref	100	0.007202	100	0.02072
481	chr11	24572793	T	G	rs10834390	0.0505589367999999	0.0249009470311529	0.0505589367999999	0.0266268306226559	0.0171641004653676	0.048345695561597	0.0008850044873399	0.0147844451776195	0.0008850044873399	0.0156668272480527	0.2634446415419247	0.5484760246485492	0.0141295149510652	0.0790215370367292	0.0141295149510652	0.0852004280558235	0.004544564291114	0.1932595069768298	0.0002488985311505	0.0394786465919421	0.0002488985311505	0.0425408820541245	0.0413240801253124	0.007540678254662	0.0413240801253124	0.0077387500927085	LUZP2	75822	ANO3	1616050	CCDC179	1712319	False	False	False	alt	-10	0.0004883	70	0.0094
482	chr11	24573550	A	G	rs10767214	-0.00331058976	0.7044907482804729	0.00331058976	0.6909007060684197	0.0089847069864925	0.4206653658879003	-2.9952843883365795e-05	0.6827110216761314	2.9952843883365795e-05	0.669509290670249	0.1252606354837705	0.7777904454470248	-0.0004100637213493	0.7692383101289193	0.0004100637213493	0.755115990199541	0.0010943030752008	0.7724097797362021	-3.5813572385949854e-06	0.7626058708490205	3.5813572385949854e-06	0.7485752832199404	-0.0028299048745318	0.5626180059931489	0.0028299048745318	0.5506316697303563	LUZP2	76579	ANO3	1615293	CCDC179	1713076	False	False	False	ref	-40	0.004063	5	0.002838
483	chr11	24578643	C	A	rs7118822	-0.00383896086	0.6492644127984833	0.00383896086	0.6357609333066487	0.00683236695977	0.7666386913517294	-2.730468569469341e-05	0.692651875118162	2.730468569469341e-05	0.6793718779225801	0.1287440741086525	0.7760055269444547	-0.000476439354827	0.7401077858763184	0.000476439354827	0.7261606738473003	0.000864366599137	0.8208263284074125	-3.3446084840873155e-06	0.7686473088383452	3.3446084840873155e-06	0.754583026266519	-0.0038714094544548	0.4708264959751408	0.0038714094544548	0.4599340133411793	LUZP2	81672	ANO3	1610200	CCDC179	1718169	False	False	False	ref	50	0.001785	45	0.05365
484	chr11	24580180	C	T	rs1396842	-0.0229585574	0.1632252010441243	0.0229585574	0.1551476848720879	0.0081228293554103	0.5492312361302705	-0.0001897817624994	0.1940724636506397	0.0001897817624994	0.1860302199909067	0.0480959346051307	0.9146836833774382	-0.0011331189219137	0.5953393502895852	0.0011331189219137	0.5816744881538018	0.0003831236699068	0.9217196193288436	-9.150424536249109e-06	0.6152347337848997	9.150424536249109e-06	0.6017527050985738	-0.0126806294671106	0.1505980838212952	0.0126806294671106	0.1461631311050172	LUZP2	83209	ANO3	1608663	CCDC179	1719706	False	False	False	ref	90	0.003548	100	0.0204
485	chr11	27999359	A	G	rs7113337	0.00371274386	0.6465662881190812	0.00371274386	0.6604032239980541	0.010203787534908	0.2911987376370863	3.7236337569565854e-05	0.6016865524785255	3.7236337569565854e-05	0.6148287728940558	0.2185790309028101	0.6276563404415536	0.0007649615869757	0.633910402925084	0.0007649615869757	0.648197449583894	0.00225840063673	0.5562816976134365	7.736523370807113e-06	0.6032025735648749	7.736523370807113e-06	0.6169898249778089	0.0034170478946876	0.4793813145924612	0.0034170478946876	0.4906035265222003	KIF18A	108797	METTL15	108890	BDNF	277301	False	False	False	alt	25	0.000906	35	0.01877
486	chr11	28011926	G	A	rs11606190	-0.00429096954	0.6378016793625595	0.00429096954	0.6245266082027456	0.0068427556854468	0.7966754490828614	-2.9731492860380743e-05	0.7011617265436269	2.9731492860380743e-05	0.687892672374876	0.1259183186547578	0.7819301463247373	-0.000561529363863	0.7257915053997277	0.000561529363863	0.7118301463315038	0.0008595867816269	0.8262101362887201	-3.881645499212274e-06	0.7645489213810435	3.881645499212274e-06	0.7505213831804562	-0.0042178860776563	0.4449672985716851	0.0042178860776563	0.4342834325553083	KIF18A	96230	METTL15	96323	BDNF	289868	False	False	False	ref	20	0.01692	-60	0.007233
487	chr11	28023872	T	C	rs12273233	-0.0033395427	0.6963823379783616	0.0033395427	0.6827336384935812	0.020963344493503	0.02154286647581	-6.99540781624895e-05	0.4760078580617474	6.99540781624895e-05	0.4639193482813636	0.0681459351238083	0.8804912111593693	-0.0002604515128346	0.8465316697328777	0.0002604515128346	0.8324634862732928	0.0015109037812897	0.6791728161835014	-5.866622056212145e-06	0.7240654000100131	5.866622056212145e-06	0.7102905734631312	-0.0025000259338789	0.6204216682743106	0.0025000259338789	0.607705481999432	KIF18A	84284	METTL15	84377	BDNF	301814	False	False	False	ref	80	0.01332	15	0.00876
488	chr11	28023971	C	T	rs12292666	0.00528054674	0.5450743018272509	0.00528054674	0.5582889125573521	0.0193034557757241	0.031650231183834	0.0001081829359629	0.3257490852644618	0.0001081829359629	0.3365041202611844	0.0778286081805827	0.8627410587294142	0.0004469982330504	0.7414908043049537	0.0004469982330504	0.7553567147347674	0.0016201068382491	0.6482594051240276	9.768728537331132e-06	0.5934290459045056	9.768728537331132e-06	0.6069280272956615	0.0041328229545949	0.4457263310074937	0.0041328229545949	0.456789621926232	KIF18A	84185	METTL15	84278	BDNF	301913	False	False	False	alt	100	0.01718	-45	0.07385
489	chr11	28040712	G	T	rs12278238	-0.00374798882	0.6950775820699749	0.00374798882	0.6816921738300725	0.0081920289212401	0.5532121250378679	-3.203844854433086e-05	0.7061964377181095	3.203844854433086e-05	0.692975919350627	0.0663388624363322	0.8833989060534042	-0.0002746213857291	0.8490251951665158	0.0002746213857291	0.8349937297403938	0.0005593483272039	0.887996882545734	-2.410338422957887e-06	0.8521573609127779	2.410338422957887e-06	0.8382306598103888	-0.0027012728347803	0.6040378904472434	0.0027012728347803	0.5916274607650813	KIF18A	67444	METTL15	67537	BDNF	318654	False	False	False	ref	90	0.00757	-100	0.001617
490	chr11	28115278	G	A	rs113123159	0.0051759520199999	0.5496525007535907	0.0051759520199999	0.5627343076774278	0.0171509051967616	0.0501470228955509	8.839449400962891e-05	0.3441600003958243	8.839449400962891e-05	0.3549456538163321	0.0788804863120986	0.857280158930827	0.000401028567598	0.7393051218364055	0.000401028567598	0.7535871639259711	0.0013436376437692	0.7258557871743999	6.818061927792677e-06	0.6210952435613469	6.818061927792677e-06	0.6350093973144385	0.0040332368593035	0.4278431154653552	0.0040332368593035	0.4385259585126766	METTL15	7029	KIF18A	7122	BDNF	393220	False	False	False	alt	25	0.001343	30	0.04565
491	chr11	28144957	C	T	rs17244352	-0.00101835631	0.8240058811694986	0.00155070659	0.814606106709447	0.0055579191793651	0.9361031706268996	-5.911145213454775e-06	0.8858469419271311	8.43044760833797e-06	0.8768117725990494	0.1244805444039875	0.7816933542291304	-0.0001213925153149	0.8493681004457289	0.0001902011581968	0.8404216172127393	0.0006941444823636	0.8540785430170982	-7.109090921721017e-07	0.8885458947303664	1.0365401447789193e-06	0.8795883259859969	-0.0010954470482058	0.6989529550592962	0.0017012624612287	0.6910084178791618	METTL15	36708	KIF18A	36801	BDNF	422899	False	False	False	ref	-55	0.001276	100	0.05295
492	chr11	28146351	T	G	rs12284362	0.0377373518	0.0574892308766554	0.0377373518	0.0616141862430519	0.0095739033266874	0.3437167792148731	0.0003615421539171	0.0685366982229255	0.0003615421539171	0.0728458040495727	0.1799790454257823	0.6893953250852329	0.0071714390761252	0.1776438379907458	0.0071714390761252	0.1876663952710362	0.0017307943759296	0.6619279704045468	6.898341424901096e-05	0.1755473093517054	6.898341424901096e-05	0.1846354347514928	0.0351767134513843	0.0156062735047443	0.0351767134513843	0.0160420876741801	METTL15	38102	KIF18A	38195	BDNF	424293	False	False	False	alt	35	0.00496	-85	0.0209
493	chr11	28198959	G	T	rs11030238	-0.00451787276	0.6279914622052157	0.00451787276	0.6146755575103593	0.0075886739015736	0.6701789568239118	-3.48054426393295e-05	0.6604313295354179	3.48054426393295e-05	0.6471696937094512	0.0714592475025674	0.8754070642972028	-0.0003353477630956	0.81669523333781	0.0003353477630956	0.8023877165838459	0.000537434488849	0.8924120301497567	-2.5512016021592108e-06	0.832751471355142	2.5512016021592108e-06	0.8183823866317711	-0.0030456747476633	0.5524259968842615	0.0030456747476633	0.5405059645871424	METTL15	90710	KIF18A	90803	BDNF	476901	False	False	False	ref	95	0.007156	95	0.03093
494	chr11	28211322	T	C	rs11030247	-0.00477475002	0.5391736186415895	0.00614066942	0.5310684736768387	0.0216309294850418	0.019422660968743	-0.0001129335007615	0.2973036712451419	0.0001355777628228	0.2906270238672506	0.1023205634913225	0.821618514325208	-0.0005682712476546	0.7013981186451148	0.0007015206189422	0.693218304080293	0.0022735738935091	0.5405708007345841	-1.380840494037708e-05	0.5223172100610016	1.601741790134444e-05	0.5142600484401999	-0.0044419547920621	0.3959321387822235	0.0053589767528708	0.3897732264618363	METTL15	103073	KIF18A	103166	BDNF	489264	False	True	False	ref	100	0.01913	-100	0.0005646
495	chr11	28236730	T	C	rs6484357	0.0251267680999999	0.1328305325729332	0.0251267680999999	0.1402476367346094	0.007661375795198	0.6484751915265352	0.0001948667136107	0.1764254270402574	0.0001948667136107	0.184475970042617	0.2602682600441913	0.5622779912679725	0.0068319641149785	0.1850655241724544	0.0068319641149785	0.1952312546244797	0.0020035769422396	0.6090347539524888	5.3155049970261566e-05	0.2193331668097546	5.3155049970261566e-05	0.2293120023797827	0.0219151650950735	0.0599177988923955	0.0219151650950735	0.0616060767089499	METTL15	128481	KIF18A	128574	BDNF	514672	False	False	False	alt	60	0.00969	70	0.05032
496	chr11	28364633	G	A	rs11030297	-0.00270086016	0.7700159203809924	0.00283595392	0.7619511053681073	0.0072634536724634	0.7258653936925918	-1.896692301165673e-05	0.8068512931556345	1.9924078756986976e-05	0.799055060255512	0.1289826657952883	0.7765218143735748	-0.0003629071323005	0.809149961621863	0.0003739053362551	0.8010663139697951	0.0009567058010095	0.806798487907732	-2.615688620147754e-06	0.8312238469516857	2.693612232315429e-06	0.8232087670872426	-0.0022738825091546	0.6149007721069122	0.0024938018029232	0.6075326531962802	METTL15	256384	KIF18A	256477	BDNF	642575	False	False	False	ref	-20	0.000759	-60	0.01024
497	chr11	28378431	G	A	rs7124325	-0.04953149	0.0279758786087154	0.04953149	0.0264290061448637	0.0112795990675008	0.2151473078941674	-0.000610464674911	0.0387033419602841	0.000610464674911	0.0368590547914587	0.5688108797809106	0.079363234728866	-0.0283104742453902	0.0186446727694736	0.0283104742453902	0.0172559883510769	0.006434860561906	0.0674780798560258	-0.0003498755736799	0.0269909887587867	0.0003498755736799	0.0253126144597995	-0.0093922136121743	0.2001777008478891	0.0093922136121743	0.1941956640693617	METTL15	270182	KIF18A	270275	BDNF	656373	False	False	False	ref	-100	0.006275	-60	0.02295
498	chr11	28381745	A	G	rs11030309	0.0016058226419999	0.8281993402040263	0.001746108738	0.8357487091057324	0.0150276189180556	0.0843352826094243	2.2371917602463342e-05	0.7248916262478277	2.454784992747053e-05	0.7326439194215721	0.1177107646344878	0.7962066291684498	0.000184974091766	0.8515716288322674	0.0001999313061362	0.8592986776923309	0.001754685973009	0.6536315266093232	2.528470252520366e-06	0.7962436387190164	2.760466771534296e-06	0.8039607393946507	0.0013298893142044	0.7202519871241987	0.0015290615047873	0.7278160797559526	METTL15	273496	KIF18A	273589	BDNF	659687	False	False	False	alt	55	0.003998	50	0.01228
499	chr11	28392721	T	C	rs10835321	0.0301348836	0.0955643548331026	0.0301348836	0.1015905870847562	0.0090547720472737	0.4153233284366234	0.0002796028323388	0.1099774105254416	0.0002796028323388	0.1159660733875264	0.0992603657714291	0.8227204922264699	0.0029082274595145	0.3496398165760993	0.0029082274595145	0.3620716716809498	0.0008816251326168	0.8199407607262937	2.63215862784026e-05	0.3499952989653681	2.63215862784026e-05	0.3616387100368912	0.0237761802508324	0.0489245694196329	0.0237761802508324	0.050259805422524	METTL15	284472	KIF18A	284565	BDNF	670663	False	False	False	alt	-20	0.000986	5	0.002197
500	chr11	28395099	A	G	rs4923535	-0.0089581967	0.3991130771111256	0.0089581967	0.387315911903099	0.0229467361667644	0.0143475836463935	-0.0002074943896732	0.169635507273368	0.0002074943896732	0.1621443721462616	0.1931327088455273	0.6697143547233865	-0.0017262413207986	0.4925889391601845	0.0017262413207986	0.479242827678721	0.0043643001309118	0.201326360574367	-3.93961571478931e-05	0.2826586388827495	3.93961571478931e-05	0.2720458839965486	-0.0086370190562142	0.2348102874455226	0.0086370190562142	0.2277859908743482	METTL15	286850	KIF18A	286943	BDNF	673041	False	True	False	ref	65	0.002602	-10	0.002472
501	chr11	28399518	G	A	rs11030323	0.001566574604	0.8006035443750676	0.001698328356	0.8094186040993948	0.0184574226567205	0.0394785965450812	3.515852405262835e-05	0.6049884036581562	3.723336588435336e-05	0.6138175628177609	0.0769157356404111	0.8652273473543591	0.0001400993921592	0.8691289019792945	0.0001482725830497	0.8775984878561187	0.001461863526404	0.6996156356072913	3.151049061484516e-06	0.7738240737630098	3.279759464639274e-06	0.78270319072295	0.0014834178777787	0.7082106168341394	0.0015622568698844	0.716582259788959	METTL15	291269	KIF18A	291362	BDNF	677460	False	False	False	alt	95	0.004414	-55	0.0253
502	chr11	28400294	C	T	rs7931626	-0.0544388852	0.0213397986030108	0.0544388852	0.0199775011081901	0.0132795139972964	0.1205881116939001	-0.0007272628965256	0.0212799272658982	0.0007272628965256	0.0200877204924892	0.1052251579373229	0.8119727095947324	-0.0060024286136131	0.229322461791172	0.0060024286136131	0.2184917781916397	0.001432364574	0.7061273913957229	-8.231206015995205e-05	0.1632503694011163	8.231206015995205e-05	0.1548076317109901	-0.0440253529600929	0.0073171022521732	0.0440253529600929	0.0070966583520263	METTL15	292045	KIF18A	292138	BDNF	678236	False	True	False	ref	55	0.000779	-95	0.04535
503	chr11	28409823	A	G	rs11030324	0.00409344745	0.6546702864316198	0.0041742505499999	0.6633596324187753	0.0170286210621569	0.050610470966403	6.431558181116379e-05	0.4934095528585805	6.607870668886778e-05	0.5015722337203723	0.0683617049969397	0.878165225772065	0.0002880577377621	0.8248247053827026	0.0002938472896938	0.8329102556038501	0.0011723232262096	0.7606537579603939	4.5349901450216094e-06	0.7462208094795252	4.661318255586049e-06	0.7543536756483535	0.0028319795848504	0.5660910146729409	0.0029191174182304	0.574177365412686	METTL15	301574	KIF18A	301667	BDNF	687765	False	False	False	alt	-80	0.003925	-65	0.0267
504	chr11	28428661	G	A	rs11030331	0.0302051534	0.0960971752759073	0.0302051534	0.1015646239855741	0.0154152069196893	0.0908338159026007	0.0006501926460717	0.0633317371670889	0.0006501926460717	0.0662164970405435	0.0396663865807736	0.9277545275426894	0.0017290621624262	0.5447184797515817	0.0017290621624262	0.5588576638098218	0.0008103312805875	0.8297044215175042	4.338754718377875e-05	0.3861030736488834	4.338754718377875e-05	0.3988916141686203	0.0153134368613781	0.1158087889823779	0.0153134368613781	0.1189001250284646	METTL15	320412	KIF18A	320505	BDNF	706603	True	False	False	alt	-95	0.00346	100	0.01364
505	chr11	28434247	C	T	rs4543974	-0.0275768833999999	0.1194349430381466	0.0275768833999999	0.1128149127078109	0.0082518598402947	0.5340283557487662	-0.0002298949634354	0.1474620867413593	0.0002298949634354	0.1406006739210659	0.0405481384661666	0.9258939356865404	-0.0011255651230906	0.5976657002142332	0.0011255651230906	0.5838369758357006	0.0003505177044546	0.9252863929043466	-9.808754907457016e-06	0.60360321180448	9.808754907457016e-06	0.5900528598148403	-0.0127636178798534	0.1378893187940909	0.0127636178798534	0.1337614470935279	METTL15	325998	KIF18A	326091	BDNF	712189	False	False	False	ref	-90	0.003487	-30	0.02637
506	chr11	28441017	C	T	rs10767724	-0.0660355193999999	0.0104763364384265	0.0660355193999999	0.009888363112672	0.0204259903532554	0.0247958274956845	-0.0013887347810505	0.007765003858178	0.0013887347810505	0.0074375942244607	0.2249753628149669	0.6170378284762277	-0.0152693381843167	0.0744373370383013	0.0152693381843167	0.0691077429130082	0.0046847682591902	0.1669040176669204	-0.000323799332785	0.0290057198254794	0.000323799332785	0.0270345225252441	-0.0625587402358945	0.0016282677184901	0.0625587402358945	0.0015810322527968	METTL15	332768	KIF18A	332861	BDNF	718959	False	True	True	ref	80	0.00824	95	0.05176
507	chr11	28447818	T	A	rs10835338	0.0149910898999999	0.2318439843071183	0.0149910898999999	0.241959976044092	0.011692101803071	0.1860584458899088	0.0001736049947387	0.1841767740995166	0.0001736049947387	0.1924137166797248	0.0500212657807653	0.9047514280465464	0.0009730013047413	0.6445046461162562	0.0009730013047413	0.6591916569769946	0.000571495335953	0.8706662214587579	1.1016742345867868e-05	0.5872231477194114	1.1016742345867868e-05	0.6013995990234164	0.0080249795122355	0.2314794120859155	0.0080249795122355	0.237798326439553	METTL15	339569	KIF18A	339662	BDNF	725760	False	False	False	alt	-80	0.01041	-35	0.01865
508	chr11	28451163	C	T	rs10767725	-0.0524565479999999	0.024844937254111	0.0524565479999999	0.0232671018499715	0.0099391173476437	0.3179182500367103	-0.000538139128098	0.0398858509608639	0.000538139128098	0.0375785752683295	0.2895444973495575	0.5160548068474645	-0.015299889459839	0.0751740925360316	0.015299889459839	0.0696291083778621	0.0028904547370912	0.442807949344535	-0.0001577076290047	0.0769338692935937	0.0001577076290047	0.0718827110729572	-0.0442390481229058	0.0067944915532222	0.0442390481229058	0.0066263138736266	METTL15	342914	KIF18A	343007	BDNF	729105	False	False	False	ref	5	0.001221	65	0.01892
509	chr11	28451754	G	T	rs11030341	-0.0579459383999999	0.0165180664031332	0.0579459383999999	0.0154994136924351	0.0129677835137435	0.127921180228232	-0.0007560451610133	0.0195572036674374	0.0007560451610133	0.0184951289375348	0.3685826616458676	0.3885802856858985	-0.02137863200859	0.038290468551181	0.02137863200859	0.0352636264550348	0.0048033254217158	0.156006367235001	-0.0002804283495952	0.0309576715959091	0.0002804283495952	0.028758460225949	-0.0382721812466934	0.0117568986022424	0.0382721812466934	0.0114186224131882	METTL15	343505	KIF18A	343598	BDNF	729696	False	True	False	ref	-100	0.03336	-45	0.0485
510	chr11	28452419	C	A	rs7130732	0.00083596955	0.8432225642246993	0.00165563595	0.8505660398874401	0.0180868626184943	0.0414361609741012	1.9396519557887942e-05	0.6958773188210752	3.010392475265829e-05	0.7033731566396376	0.1768690546582433	0.6933815247994257	0.0001089012799355	0.8065304187244096	0.0003132503156515	0.8136367265547232	0.0031151120741647	0.3967055697554224	2.826680336926956e-06	0.7035954764228893	5.496117458120284e-06	0.7107848912517997	0.0009045736988972	0.7291481428479274	0.0014979408500087	0.7363396858233371	METTL15	344170	KIF18A	344263	BDNF	730361	False	False	False	alt	95	0.00782	-100	0.04562
511	chr11	28453859	G	T	rs7105555	-0.0118607634	0.3165360293035714	0.0118607634	0.3056641052936029	0.0104678097969451	0.2617845762497873	-0.0001266496559998	0.2855562958235907	0.0001266496559998	0.2759895149767531	0.1595078787124347	0.7275899757662224	-0.0019713340120424	0.4816130396156681	0.0019713340120424	0.468526466612903	0.001708415119482	0.6657717417587349	-2.1568545147049343e-05	0.4416309265542309	2.1568545147049343e-05	0.4293146859561359	-0.0109482463511031	0.1751174216625106	0.0109482463511031	0.1699259660980591	METTL15	345610	KIF18A	345703	BDNF	731801	False	False	False	ref	-60	0.000681	-80	0.02414
512	chr11	28460852	G	A	rs11603115	-0.0186389144799999	0.2201652313932465	0.0186389144799999	0.2109916822261187	0.0104777173205209	0.2657414002621638	-0.0002175819579796	0.1829384917388728	0.0002175819579796	0.1758307914122473	0.0964346103175343	0.8244831053519683	-0.0020455974317726	0.4817189217257235	0.0020455974317726	0.4682835403695082	0.0010628586768353	0.7700912068424592	-2.511738160901869e-05	0.43071049593451	2.511738160901869e-05	0.4176194471209042	-0.0163196713658855	0.1146765772753511	0.0163196713658855	0.1114751102281685	METTL15	352603	KIF18A	352696	BDNF	738794	False	False	False	ref	-100	0.001439	-5	0.003448
513	chr11	28479446	G	A	rs1811450	-0.01000564994	0.3732678868650406	0.01000564994	0.3616454691352084	0.0088238213901269	0.4609114783206977	-9.00212401834511e-05	0.3874952993233546	9.00212401834511e-05	0.376683350234186	0.0805298810153632	0.858039961132622	-0.0008418764323868	0.657174197023884	0.0008418764323868	0.6436090097543765	0.0007247743492842	0.8542579907531352	-7.709791852440543e-06	0.6525344585068295	7.709791852440543e-06	0.6390199817150695	-0.0077262212263612	0.2671611444289374	0.0077262212263612	0.2592711896745424	METTL15	371197	KIF18A	371290	BDNF	757388	False	False	False	ref	-50	0.00378	-40	0.015076
514	chr11	28488553	G	A	rs2582905	-0.0285048128	0.1199228814273664	0.0285048128	0.1134564399464336	0.0068550369561681	0.8069046466554176	-0.000199901195228	0.1880391674565693	0.000199901195228	0.1802534520339829	0.1358707040529466	0.7605168235220916	-0.0039936667474749	0.3135669511984291	0.0039936667474749	0.3015184953491781	0.0009604809370454	0.8026756752112655	-2.9091954484743728e-05	0.3683764826956064	2.9091954484743728e-05	0.3565107523491257	-0.0263114762601271	0.0409585814363146	0.0263114762601271	0.0399250759681154	METTL15	380304	KIF18A	380397	BDNF	766495	False	False	False	ref	-100	0.01165	-100	0.01043
515	chr11	28580626	C	A	rs2582895	0.0042169333799999	0.6054025131154113	0.0042169333799999	0.6186264773347931	0.0249215107062959	0.0096325107217959	0.0001045956589863	0.3018015366310507	0.0001045956589863	0.312227195115951	0.1364018298945009	0.7602785315476676	0.0005951509591753	0.6771391543675975	0.0005951509591753	0.6913068555096198	0.0034387157659675	0.3266021222031297	1.4890732254604005e-05	0.4652643353251989	1.4890732254604005e-05	0.4782604772734584	0.0042220354982935	0.416100702078764	0.0042220354982935	0.4267569116489254	METTL15	472377	KIF18A	472470	BDNF	858568	False	True	True	alt	65	0.002975	-40	0.009766
516	chr11	28580674	A	G	rs2585817	-0.0003699697399999	0.7826556403735637	0.0021327722199999	0.7812692292771449	0.0075342711926198	0.6645220662909977	-1.780612995380397e-06	0.7947518088045636	1.6288872283030268e-05	0.793523524117847	0.1256174856585648	0.7780254812813808	-5.698036376112e-05	0.8047235942598938	0.0002650677503281	0.8032333216917882	0.0009480863945517	0.8014262118293523	-2.9478594506055445e-07	0.8161224180086607	2.029780108437888e-06	0.814801359720021	-0.00013070675007	0.6302554889792896	0.0021597734416331	0.6289072698933672	METTL15	472425	KIF18A	472518	BDNF	858616	False	False	False	ref	15	0.0002747	-85	0.006897
517	chr11	28594152	A	G	rs2582896	0.0008359927879999	0.8387127431729212	0.0017167685879999	0.8471105919816412	0.0083211267274562	0.5334317690067504	7.397519857509479e-06	0.8433138760045634	1.3531148559842392e-05	0.8517825038212925	0.1976472784987396	0.659456754717092	0.0002290429163063	0.7855233386312355	0.0003846878455116	0.7943502289792678	0.0016368859589871	0.6708074217594423	1.960125668225293e-06	0.7918480869027802	3.044020365724657e-06	0.8007597641383775	0.00050830402805	0.7440743198230992	0.0013298893142044	0.7517838617522421	METTL15	485903	KIF18A	485996	BDNF	872094	False	False	False	alt	50	0.0006256	80	0.02814
518	chr11	28594704	T	C	rs10742196	0.0100172476	0.34222433973628	0.0105962252	0.3524484311379278	0.0077384186078277	0.6212812281895386	8.295916895790121e-05	0.3859979170347857	8.729556674390644e-05	0.3953461606323412	0.1061836741045031	0.8098831390009383	0.0011791140156903	0.5659846695048041	0.0012272044890015	0.5774668162634734	0.0008319116390031	0.826629363196818	9.823655137836371e-06	0.5833485601448553	1.0183840794041768e-05	0.5946357088858825	0.0083797549767113	0.2108557616473504	0.0089025819769914	0.2157748548454182	METTL15	486455	KIF18A	486548	BDNF	872646	False	False	False	alt	100	0.00657	-70	0.009766
519	chr11	28609701	C	A	rs11030386	0.00468549716	0.6032227533827502	0.00468549716	0.6163701069214935	0.0066104497490458	0.8519089859920154	3.1136643303910285e-05	0.6712203937064987	3.1136643303910285e-05	0.6843258660022075	0.3128849884334899	0.4761031186581347	0.0014934406091311	0.5251973307054608	0.0014934406091311	0.5388941148082521	0.0020685756475866	0.5980880706822845	9.929966058209836e-06	0.5823844124359431	9.929966058209836e-06	0.5958197983536094	0.0032469216485648	0.5104305443472986	0.0032469216485648	0.5221153944986209	METTL15	501452	KIF18A	501545	BDNF	887643	False	False	False	alt	-25	0.001282	90	0.0385
520	chr11	28619515	G	A	rs12226518	-0.0023662923539999	0.7651303310668448	0.002660720314	0.7573113397140263	0.0074475564550774	0.693518128377593	-1.6623131954813114e-05	0.8021288385666743	1.8879578059299185e-05	0.794648565356622	0.1042106245915413	0.8184095143555539	-0.0002707374654114	0.8364575585933917	0.0002887423501111	0.828519158412764	0.0007779334904381	0.8439877708293477	-1.8882566046649784e-06	0.8570133910621116	2.0262429923447825e-06	0.849269991669036	-0.001995871326466	0.6469893293189598	0.0022738825091546	0.6392330706097397	METTL15	511266	KIF18A	511359	BDNF	897457	False	False	False	ref	15	0.0001345	-100	0.02391
521	chr11	28620721	G	A	rs10767732	-0.0234974527	0.1569965073799192	0.0234974527	0.1491064397482689	0.0071422184645011	0.7478734352617987	-0.0001716036905319	0.2155844667849887	0.0001716036905319	0.2070909501735373	0.0843431985808981	0.8511389588041826	-0.0021031862922983	0.46466976544943	0.0021031862922983	0.4514677185639691	0.0006243326530507	0.8715163408667022	-1.5866956214207787e-05	0.5071649884330407	1.5866956214207787e-05	0.4941600992651183	-0.0174462390688699	0.0849981502231331	0.0174462390688699	0.0826842342862928	METTL15	512472	KIF18A	512565	BDNF	898663	False	False	False	ref	35	0.000839	-80	0.02905
522	chr11	28621752	T	C	rs10835368	0.01122129856	0.3378325867812276	0.01122129856	0.3498899393682078	0.012075143166968	0.1623511206485151	0.0001408239282168	0.2667211397989907	0.0001408239282168	0.276629454433075	0.4497723005425367	0.2557474552982874	0.0051068104228348	0.2498118309746384	0.0051068104228348	0.2617267900880811	0.0054410444237398	0.1085661832119924	6.417404243103897e-05	0.2018729358093491	6.417404243103897e-05	0.211690992538909	0.004369339930912	0.4157986601887873	0.004369339930912	0.42635989038325	METTL15	513503	KIF18A	513596	BDNF	899694	False	False	False	alt	100	0.01088	75	0.0754
523	chr11	28622395	T	C	rs10835373	0.01331659688	0.2624812799029429	0.01331659688	0.2728546865443836	0.0088592736665607	0.4149108913699688	0.000124036988227	0.2680404111472015	0.000124036988227	0.2778583426365725	0.4516976317181713	0.2497843506776353	0.0058925024087991	0.1992964376644854	0.0058925024087991	0.2095754962959363	0.0039699468101527	0.2536562778979015	5.458495021528375e-05	0.2034201907164699	5.458495021528375e-05	0.2131275643754945	0.0056950798244794	0.3257178347185929	0.0056950798244794	0.3347591730779088	METTL15	514146	KIF18A	514239	BDNF	900337	False	False	False	alt	-60	0.00822	75	0.04532
524	chr11	28622565	G	T	rs11030388	-0.0039759927	0.6567307838473205	0.0039759927	0.6432978846955631	0.0124718394013341	0.1568652998541872	-4.810959820928297e-05	0.5570735519882872	4.810959820928297e-05	0.5447476640760781	0.4079668876233155	0.3195135943538535	-0.0016156332708424	0.5140179183057999	0.0016156332708424	0.5006201364961094	0.0051703500768538	0.129804675069586	-1.9769368353211228e-05	0.4378955544012282	1.9769368353211228e-05	0.4255967389202754	-0.0021037562630317	0.6634067763020748	0.0021037562630317	0.6506596868596358	METTL15	514316	KIF18A	514409	BDNF	900507	False	False	False	ref	75	0.003538	65	0.03072
525	chr11	28624925	C	T	rs4576808	-0.0037968602	0.6799658305874273	0.0037968602	0.6666835125460246	0.0144613541310042	0.0948780050999467	-5.311314148386227e-05	0.5236941869921177	5.311314148386227e-05	0.5115464807641464	0.2189275822363302	0.6250591708164402	-0.0008166124678103	0.6507347678138715	0.0008166124678103	0.6367472218578424	0.0032370204515348	0.3506350712278258	-1.1627225951421777e-05	0.5440155219684016	1.1627225951421777e-05	0.5308225148052295	-0.0034253467359619	0.5101854020820719	0.0034253467359619	0.4985537525681685	METTL15	516676	KIF18A	516769	BDNF	902867	False	False	False	ref	100	0.005833	75	0.0405
526	chr11	28632479	C	T	rs4290216	0.0059801750399999	0.5068906516345258	0.0059801750399999	0.5194957300542478	0.0289720630110282	0.0046934980104355	0.0001751908045192	0.1917666473349926	0.0001751908045192	0.2000776247840286	0.1653710100727185	0.714860344728062	0.0009942649862722	0.5868398713105021	0.0009942649862722	0.6005576048671349	0.0047577412860954	0.1636208388344229	2.894951992674356e-05	0.3271564424637238	2.894951992674356e-05	0.3385879806412195	0.0055851201775951	0.3338991993938931	0.0055851201775951	0.3434032975383674	METTL15	524230	KIF18A	524323	BDNF	910421	False	True	True	alt	-80	0.002666	55	0.02374
527	chr11	28633321	G	A	rs7935241	-0.0073226898599999	0.4650839503462155	0.0073226898599999	0.4525625439229547	0.0076807193441332	0.6284270992302646	-5.5548179975876186e-05	0.5118590719840874	5.5548179975876186e-05	0.499572033606278	0.2131142439236921	0.6350030554611769	-0.0016600862766479	0.5129094820623438	0.0016600862766479	0.4993257466821291	0.0016537602631154	0.6619685747457411	-1.2754904333689171e-05	0.538080058353104	1.2754904333689171e-05	0.5248730839592899	-0.0066411477297481	0.2952428194116034	0.0066411477297481	0.2869456062690347	METTL15	525072	KIF18A	525165	BDNF	911263	False	False	False	ref	60	0.0005198	-10	0.00989
528	chr11	28634462	T	G	rs7928893	-0.00789024562	0.4413344445218835	0.00789024562	0.4291151264565117	0.0217211293527408	0.0182971320928398	-0.00017174895199	0.2160144010653966	0.00017174895199	0.2074338823489686	0.3279971783939667	0.4554591499534829	-0.0026384550501446	0.3983084566418329	0.0026384550501446	0.3856994073186489	0.0071169213335938	0.0448548505754093	-5.742418925709302e-05	0.2175743568790406	5.742418925709302e-05	0.2077481237392477	-0.005755246423718	0.3542970784073379	0.005755246423718	0.3447773222227625	METTL15	526213	KIF18A	526306	BDNF	912404	False	True	False	ref	-55	0.006485	-55	0.05664
529	chr11	38894025	G	A	rs7122369	-0.030382023	0.0997515880153427	0.030382023	0.0940019434102705	0.0076575996493228	0.6366603706890503	-0.0002315657588789	0.1423154643198516	0.0002315657588789	0.1355528652510106	0.0962976794365086	0.8304817160817565	-0.0029184776564503	0.3694569167747723	0.0029184776564503	0.357072687032299	0.0007389211376336	0.8464067819685666	-2.2293293122744256e-05	0.3998769656460015	2.2293293122744256e-05	0.3877360097857624	-0.0252969429143455	0.0404253791654948	0.0252969429143455	0.0394149769168891	RAG2	2295746	IFTAP	2299655	RAG1	2383652	False	False	False	ref	100	0.002579	50	0.02826
530	chr11	38895917	T	C	rs11034985	0.0487649962	0.0270761817299172	0.0487649962	0.0290862116436286	0.0108292493380011	0.2355789191268078	0.000540378827254	0.0342559257692099	0.000540378827254	0.0365008374149041	0.2680919926555254	0.548147705271561	0.0134980212349121	0.079510330780531	0.0134980212349121	0.0859803657209878	0.0029295360370071	0.4294345426276131	0.0001503588638303	0.0720067367238188	0.0001503588638303	0.0773321838487041	0.042643595887924	0.0073803118512444	0.042643595887924	0.0075815048136648	RAG2	2297638	IFTAP	2301547	RAG1	2385544	False	False	False	alt	0	0.0	25	0.02557
531	chr11	38901131	A	G	rs10837065	-0.001384721012	0.8338846297921275	0.001586180708	0.8245552280838053	0.0334781421796007	0.0024233706059003	-4.681914097941911e-05	0.5204888862930656	5.351049658109505e-05	0.5113591980650486	0.3447089700100623	0.4252886987330952	-0.0004735559875022	0.7181254630500408	0.00053835813495	0.7084131998144512	0.0114486239412313	0.007701255526469	-1.5928287545206386e-05	0.4541578504308885	1.808064964955153e-05	0.4449005203464113	-0.0009107978298529	0.795127220824845	0.0010809240759758	0.786392365416177	RAG2	2302852	IFTAP	2306761	RAG1	2390758	False	True	True	ref	95	0.0137	100	0.0415
532	chr11	38901349	G	A	rs10837066	-0.0447057586	0.0413235592354305	0.0447057586	0.0386861218427295	0.0135170814808923	0.1186259186086519	-0.0006552397097233	0.0338840348319719	0.0006552397097233	0.0320604106620283	0.2670753845994252	0.5483638359144747	-0.0122200052885845	0.1072437635564109	0.0122200052885845	0.1001130542499689	0.0037598569696717	0.2679988379514541	-0.0001859442686013	0.0726621028313196	0.0001859442686013	0.0680474726417004	-0.0378157449766076	0.0125319067442694	0.0378157449766076	0.0122038718163209	RAG2	2303070	IFTAP	2306979	RAG1	2390976	False	False	False	ref	-90	0.06006	-10	0.004017
533	chr11	38910929	A	C	rs12365929	-0.0063038271999999	0.5304092240218196	0.0063038271999999	0.5175907284969855	0.0071865708244015	0.7111547570259259	-4.906350496338942e-05	0.5838532453512828	4.906350496338942e-05	0.5712565964323809	0.201056027552153	0.6542320385811685	-0.001307036036939	0.5721861656241087	0.001307036036939	0.5585190150584359	0.0014563544399117	0.7125103942224356	-1.0157282247573266e-05	0.6085893900856549	1.0157282247573266e-05	0.5950306053602327	-0.0056722580109751	0.3529692023948892	0.0056722580109751	0.3437353870732338	RAG2	2312650	IFTAP	2316559	RAG1	2400556	False	False	False	ref	50	0.003115	45	0.073
534	chr11	38939996	A	C	rs67617610	0.00523257944	0.5643112577510558	0.00523257944	0.5775188739177586	0.025280958995392	0.0088800329988334	0.0001323544703668	0.2733405321729072	0.0001323544703668	0.283399526535519	0.3591012354899947	0.4026230884330288	0.0018331041970091	0.4669027947488116	0.0018331041970091	0.4802337773559193	0.0090918088637672	0.018230988739062	4.650463421517011e-05	0.2444213966052299	4.650463421517011e-05	0.2550501273034949	0.0031722320770961	0.516701365376702	0.0031722320770961	0.5284846331262123	RAG2	2341717	IFTAP	2345626	RAG1	2429623	False	True	True	alt	-100	0.0797	65	0.0278
535	chr11	38944032	G	A	rs10837072	-0.0419791826	0.0479575830840172	0.0419791826	0.0448071451143764	0.0113283848302279	0.2009139647089129	-0.000487197340538	0.0468404082964762	0.000487197340538	0.0440201883588162	0.192514445170593	0.671749304507491	-0.0081340044576757	0.1651124204308701	0.0081340044576757	0.1559920358109081	0.0021777463102166	0.5772219071789535	-9.41013427310158e-05	0.1376596242269369	9.41013427310158e-05	0.1299887538110639	-0.0404319546883265	0.008727833869988	0.0404319546883265	0.0084819429979612	RAG2	2345753	IFTAP	2349662	RAG1	2433659	False	False	False	ref	75	0.02026	55	0.0263
536	chr11	38948510	G	A	rs12277025	0.00477798278	0.5676359553843284	0.00477798278	0.5808147742684341	0.0275682132585981	0.0066882232483403	0.0001341732473799	0.2563861632953428	0.0001341732473799	0.2658407431480741	0.0640006639073019	0.8845757701830176	0.0002881931249097	0.7845646393211322	0.0002881931249097	0.7987146462813883	0.0017932547015794	0.6297196541778748	8.01680904780991e-06	0.5987570170678218	8.01680904780991e-06	0.6121931133849529	0.0032863411446176	0.4978339402922832	0.0032863411446176	0.5093238205878553	RAG2	2350231	IFTAP	2354140	RAG1	2438137	False	True	True	alt	-100	0.01099	40	0.01109
537	chr11	38953272	A	T	rs10837077	-0.00630327848	0.515599032487779	0.00630327848	0.5030147273276908	0.0236691105679172	0.0133657692340942	-0.0001504328986421	0.2492084614726517	0.0001504328986421	0.2403012107909364	0.1899604767684311	0.6724291577097202	-0.0012093265465941	0.5748429734987002	0.0012093265465941	0.5612320696996702	0.004665775788024	0.175124908935707	-2.989666843952473e-05	0.3541873446225619	2.989666843952473e-05	0.342841677409944	-0.0057656199753108	0.341716892022708	0.0057656199753108	0.3323969957100606	RAG2	2354993	IFTAP	2358902	RAG1	2442899	False	True	False	ref	-30	0.001801	-100	0.06323
538	chr11	38961066	G	A	rs10501212	0.006218603	0.5034132003430764	0.006218603	0.5159927656451299	0.0263533049924201	0.0072220542604011	0.0001663783049668	0.2298761125346234	0.0001663783049668	0.2389447061207857	0.0638471353437276	0.8874934151110426	0.0005157771056852	0.7374777769458196	0.0005157771056852	0.7512568703209657	0.0017222691325978	0.6368241490464014	1.4124627882314134e-05	0.5405955076630532	1.4124627882314134e-05	0.553679971701556	0.0048029543874936	0.416767438831386	0.0048029543874936	0.427374113266028	RAG2	2362787	IFTAP	2366696	RAG1	2450693	False	True	True	alt	-50	0.001489	-95	0.02254
539	chr11	38963520	T	C	rs10837082	-0.001996168178	0.8239795236552837	0.001996168178	0.8105244118052884	0.0178831765463219	0.0428240261114563	-3.517547904459586e-05	0.6607083987445466	3.517547904459586e-05	0.6479384184691793	0.0610566499652485	0.8908253804613752	-0.0001097825876772	0.9222411719051048	0.0001097825876772	0.9080923918983894	0.0011079900291762	0.7736880420154665	-2.002823796409358e-06	0.8607957445969514	2.002823796409358e-06	0.8467217997378061	-0.0013693088102572	0.7676393358916211	0.0013693088102572	0.7543556210976068	RAG2	2365241	IFTAP	2369150	RAG1	2453147	False	False	False	ref	100	0.01877	100	0.01878
540	chr11	38964832	G	A	rs11035025	0.00260752848	0.7309567827681432	0.00260752848	0.7445879302897577	0.0258059163276359	0.008052224491416	6.590835160364086e-05	0.4274099123624502	6.590835160364086e-05	0.4388739845144859	0.0158404132822954	0.971671610928963	3.93598942740603e-05	0.9355472498344416	3.93598942740603e-05	0.949573741426862	0.00042984690807	0.9125878276979208	1.0246631292199576e-06	0.8734733413800828	1.0246631292199576e-06	0.8879034984932282	0.0007987634726501	0.8242944271623657	0.0007987634726501	0.8380262345784352	RAG2	2366553	IFTAP	2370462	RAG1	2454459	False	True	False	alt	100	0.05872	-40	0.01576
541	chr11	38965745	C	A	rs7119965	0.0067945949199999	0.4746285453626246	0.0067945949199999	0.487489474094467	0.0092341236964017	0.3799855208939744	6.361143142072537e-05	0.4611668416554866	6.361143142072537e-05	0.4730642450997787	0.1628606105872467	0.7108427566082051	0.0009696590140372	0.5937027918033799	0.0009696590140372	0.6076866981119384	0.0014684434631103	0.7054376219929298	8.952021029803384e-06	0.5814619616684754	8.952021029803384e-06	0.5951644860455261	0.0061743379080695	0.3071991406875886	0.0061743379080695	0.3157180908475666	RAG2	2367466	IFTAP	2371375	RAG1	2455372	False	False	False	alt	-100	0.005478	5	0.003448
542	chr11	38975206	G	A	rs10768438	-0.0129545509999999	0.2888169813116631	0.0129545509999999	0.2781908313851576	0.0082136627339789	0.5479857848921195	-0.0001063693528524	0.3174267318418713	0.0001063693528524	0.3072314195078621	0.1741802300853743	0.6959483992263636	-0.0022215951201447	0.4351646611232269	0.0022215951201447	0.42218547106946	0.001438159199817	0.7123565878218147	-1.8328197353586792e-05	0.4517866118803181	1.8328197353586792e-05	0.4391170219467883	-0.0118196246849033	0.1578163967279342	0.0118196246849033	0.1530607098119539	RAG2	2376927	IFTAP	2380836	RAG1	2464833	False	False	False	ref	5	0.0002747	5	0.001587
543	chr11	38989193	C	T	rs10837090	-0.002656960166	0.5228060708605998	0.007263699458	0.5193675849925132	0.0195399555712498	0.0293126355534175	-3.491740122739124e-05	0.3220494573248282	0.0001443922410721	0.3196906228103126	0.2455149949688274	0.5847208684857305	-0.0007620154448997	0.5278929628784975	0.0020184443155909	0.5238080516908415	0.0048780147169008	0.156813884823269	-1.022579545963231e-05	0.3702543715010944	4.0174040369117295e-05	0.3668411736580894	-0.0017863255842902	0.394407048975496	0.0062718492930424	0.3927517263210944	RAG2	2390914	IFTAP	2394823	LRRC4C	2470580	False	False	False	ref	90	0.010925	-20	0.003052
544	chr11	46373500	T	G	rs200720298	-0.0002839004292	0.959964261770223	0.0004700244171999	0.9558009639169598	0.0263257532494072	0.007584565154193	-7.943064168909203e-06	0.8739619518043731	1.1808845747814058e-05	0.8663522796985019	0.4323986763348167	0.2747300784823735	-0.0001098224794988	0.8650887773720403	0.0001950986573202	0.8574115314836761	0.0113101498936404	0.0082643944057685	-3.1062601004498007e-06	0.7320898425864506	4.877440040028954e-06	0.7243837972444577	-0.0001742756667599	0.961153333263348	0.0002033216112199	0.9564076869130346	MDK	7257	CHRM4	18276	DGKZ	40594	False	True	True	ref	-100	0.03925	-100	0.03064
545	chr11	46375773	A	C	rs3740974	0.0077268227399999	0.3838471700877718	0.0088523140599999	0.3912602092590498	0.0155709661112017	0.0693005857875414	0.0001088272551167	0.2793621663782722	0.0001274865937507	0.2853233249007371	0.628444278467619	0.0296867914425179	0.0048572163387857	0.2411509850005407	0.005569523376626	0.2475577787910211	0.0097905147070997	0.0141007732214039	6.835888169183449e-05	0.1704069624076603	8.017893195503845e-05	0.1753141969940791	0.0008153611551987	0.804862266493924	0.0009273955124015	0.8090404465745249	MDK	4984	CHRM4	16003	DGKZ	42867	False	False	False	alt	-35	0.010025	-40	0.0977
546	chr11	46420976	C	T	rs12283172	-0.0030283957599999	0.5317604343307014	0.0060559093199999	0.5262421859677359	0.0076011096634813	0.6582344192261069	-2.0319423491047195e-05	0.5804778381937661	4.541160897118864e-05	0.5754585876270849	0.2906544673699934	0.5134900228301712	-0.001014899778667	0.4874183470849382	0.0018315751111951	0.481555973859556	0.0022066018349069	0.5674876628430039	-6.951595791546746e-06	0.5218118709583288	1.3719909730696672e-05	0.5164506373101843	-0.0019315553065903	0.4113756110342239	0.0045747362524507	0.4078958343777369	CHRM4	29200	MDK	40219	DGKZ	88070	False	False	False	ref	15	0.000828	20	0.007263
547	chr11	46438488	C	T	rs2864076	-0.0346612398	0.0771140122665384	0.0346612398	0.0724290366958694	0.0082899960441249	0.5398768773955541	-0.0002913991451008	0.106663561771698	0.0002913991451008	0.1012076338562597	0.4391643066836792	0.2744446479365475	-0.0151966023213215	0.0733693146863666	0.0151966023213215	0.0679465111911412	0.0036290719455741	0.3148480640861365	-0.0001273845116251	0.0948829323419343	0.0001273845116251	0.0889172034576345	-0.0163881368063983	0.1009140754015793	0.0163881368063983	0.0980679387869087	CHRM4	46712	MDK	57731	DGKZ	105582	False	False	False	ref	-45	0.00637	95	0.00787
548	chr11	46452336	T	G	rs115292163	-0.0047338676	0.5745177467655672	0.00493388316	0.5653501273787098	0.0242546361956799	0.0109333812690147	-0.000114815932743	0.3088612532196725	0.0001196164757946	0.3010304535251451	0.0876793327731615	0.8425496443713439	-0.0004344039732129	0.752707597787367	0.0004488305565454	0.7437275682455745	0.0021259622368589	0.573448821683602	-1.0542618971595128e-05	0.568709798239284	1.0888869200720224e-05	0.5594849540428668	-0.0041494206371435	0.4414389169643832	0.0042739032562578	0.4338904559588157	CHRM4	60560	MDK	71579	DGKZ	119430	False	True	False	ref	-100	0.00564	100	0.03558
549	chr11	46478324	C	T	rs7130141	-0.020617495	0.1837638958871428	0.020617495	0.1751616303588644	0.005538600927445	0.8852353565424987	-0.000121048780062	0.3043657364043861	0.000121048780062	0.2944323586259302	0.2435377960352285	0.5886412427586828	-0.0050306079019898	0.2548660012131644	0.0050306079019898	0.2439331517511188	0.0013579516687286	0.7245304625731362	-2.9795840227677523e-05	0.3556847865094046	2.9795840227677523e-05	0.3440129205151461	-0.0181350428946357	0.0820971550616792	0.0181350428946357	0.0798328934206823	CHRM4	86548	MDK	97567	AMBRA1	115801	False	False	False	ref	30	0.001697	65	0.02097
550	chr11	46494352	A	G	rs3802888	0.044759001	0.0361937638049008	0.044759001	0.0388103176662149	0.0113953193537415	0.1980132649491714	0.0005278970977411	0.0377844834109581	0.0005278970977411	0.0403263055353	0.4250479776761169	0.2944422290266602	0.0193816545867699	0.0423849134339023	0.0193816545867699	0.0463063123916147	0.0048722478033591	0.1557921973811178	0.0002292179082798	0.0407463515289396	0.0002292179082798	0.0439756074678607	0.0217906824759592	0.057249558890555	0.0217906824759592	0.0588584754597564	AMBRA1	99773	CHRM4	102576	MDK	113595	False	False	False	alt	-60	0.007744	-100	0.0625
551	chr11	46498752	T	C	rs17197116	0.0044837568	0.505598700040955	0.00597629332	0.5149884007928227	0.0063542657926409	0.8952389855840003	2.902118247052428e-05	0.595536513343315	3.75867001682436e-05	0.6043155310649841	0.3211464849220428	0.4632240210592763	0.0014203252505056	0.4445819978744166	0.001937949721632	0.4540723668643618	0.0020426022966253	0.5966611938248527	9.243847727909908e-06	0.5126289752999362	1.221444273066048e-05	0.5218419683242341	0.0035477546447577	0.4068975826972383	0.0046390522723264	0.4131998736289006	AMBRA1	95373	CHRM4	106976	MDK	117995	False	False	False	alt	-35	0.002365	-35	0.01665
552	chr11	46526544	A	G	rs7932866	-0.00159811818	0.8288226517593951	0.0017301857399999	0.8193233156437767	0.0383149084632056	0.0013776095189835	-6.082922261484588e-05	0.4626304316412755	6.593026105155715e-05	0.4536401718227278	0.2375252855320075	0.5960887047408779	-0.0003935820023189	0.7578189810471517	0.0004244455795978	0.7480690931704794	0.0091361483060496	0.0183891774129772	-1.5019206795410572e-05	0.4814714590969379	1.6211295861710342e-05	0.4716876957387625	-0.0014294754094959	0.7180025081316185	0.0015996016556188	0.7092487577848797	AMBRA1	67581	ATG13	90984	HARBI1	91365	False	True	True	ref	100	0.002014	-90	0.01376
553	chr11	46564231	A	G	rs11038919	-0.0039913617	0.679075801024123	0.0039913617	0.6656423251706703	0.0213678623576366	0.0198414856680552	-8.50723649861288e-05	0.4152345530655608	8.50723649861288e-05	0.4040654567788543	0.0612267762113714	0.8903081786578503	-0.0002421424273551	0.8523660945984638	0.0002421424273551	0.8383141456555759	0.0013419975413555	0.7240399015922143	-5.319390811131961e-06	0.7280686464034423	5.319390811131961e-06	0.7141523810140249	-0.0024668305687818	0.6197653267981486	0.0024668305687818	0.6071525205875911	AMBRA1	29894	ATG13	53297	HARBI1	53678	False	True	False	ref	-55	6.104e-05	-85	0.03778
554	chr11	46589689	G	A	rs61882757	-0.0222707179	0.1718931632132327	0.0222707179	0.1637736441975812	0.0095646696309139	0.3506482991347314	-0.0002117847937813	0.1720822949132093	0.0002117847937813	0.164638491231657	0.3454579404350667	0.4211205144599444	-0.00798397249062	0.1781739163244282	0.00798397249062	0.1687292466334423	0.0032983339837683	0.3662515881837686	-7.560851408681058e-05	0.1749590760050449	7.560851408681058e-05	0.166265316118741	-0.0150001556032738	0.1298424830899232	0.0150001556032738	0.1260613452973262	AMBRA1	4436	ATG13	27839	HARBI1	28220	False	False	False	ref	-20	0.0006256	-100	0.07874
555	chr11	46613413	T	A	rs55657382	0.00175853282	0.6552626953931744	0.0039178777	0.658408388908508	0.0066297331798496	0.8460396980076711	1.1476950285125051e-05	0.7195632657774743	2.5509852040133746e-05	0.7224764114754971	0.0654301393167978	0.8775048946135395	0.0001334908622928	0.8233634102225952	0.0002334004206105	0.8258530367912342	0.0004452764001266	0.9023662939270114	8.919925023485805e-07	0.8489174166454373	1.5586977660534537e-06	0.8513854838087253	0.0012531250324173	0.5832892742341907	0.0025560431124803	0.5864833410298853	ATG13	4115	HARBI1	4496	AMBRA1	19288	False	False	False	alt	20	0.00135	85	0.0224
556	chr11	46634411	T	A	rs7128092	-0.0037366354599999	0.681390500452678	0.0037366354599999	0.668175247125774	0.0224836989747913	0.017119249871822	-8.909286371638346e-05	0.4164326998319029	8.909286371638346e-05	0.4049525489907951	0.2609695121318686	0.5617226505414474	-0.0009970000285024	0.6243646758474873	0.0009970000285024	0.6107270263627984	0.0058984872169493	0.0889148334989005	-2.3799614293773e-05	0.4203281727560144	2.3799614293773e-05	0.4081009302538229	-0.0032323986763347	0.5468408942407411	0.0032323986763347	0.5347650192455327	HARBI1	16502	ATG13	16883	AMBRA1	40286	False	True	False	ref	-10	0.001221	-30	0.04895
557	chr11	46645114	A	G	rs61884274	-0.0363390656	0.0725777070777803	0.0363390656	0.0686922120149241	0.0214186309128438	0.024568792029625	-0.0008855016851506	0.0249280209463359	0.0008855016851506	0.0237881571160308	0.2410730401767652	0.5931347934777735	-0.0092290335746101	0.1576062267276406	0.0092290335746101	0.1486183134217173	0.0053448106231516	0.1269763709851902	-0.0002298644526783	0.0616047692355808	0.0002298644526783	0.057914575780475	-0.0340937146650898	0.0218143305518623	0.0340937146650898	0.0212549246207146	HARBI1	27205	ATG13	27586	AMBRA1	50989	False	False	False	ref	-50	0.00417	95	0.04785
558	chr11	46664710	G	A	rs10838610	-0.0721814318	0.0071982151025095	0.0721814318	0.0068325097530553	0.0250840329754681	0.0101609135688043	-0.0018553657730292	0.0047658040785581	0.0018553657730292	0.004596387001536	0.4800298758285874	0.2069751722906066	-0.0347852359187593	0.0101823060321839	0.0347852359187593	0.0093993754357483	0.0121390059645069	0.0076662448594257	-0.0009005408972201	0.005067874493739	0.0009005408972201	0.0048184355009678	-0.0275708254235002	0.0319926046511646	0.0275708254235002	0.0311840646575227	ARHGAP1	35909	ZNF408	36321	HARBI1	46801	False	True	True	ref	-5	0.0003505	-75	0.03613
559	chr11	46760922	C	A	rs10466477	0.00496154282	0.5826594172076865	0.00496154282	0.5963395187892374	0.0079437045529997	0.579066986425422	3.972723549191724e-05	0.6079751692567164	3.972723549191724e-05	0.6213601689218726	0.0675421944211039	0.874979560158473	0.000341521929771	0.7840356087089287	0.000341521929771	0.798765321499303	0.0005463329079942	0.8795767661823358	2.792401459610152e-06	0.7901813239436122	2.792401459610152e-06	0.8049324727347873	0.0033527318748119	0.4937725952113226	0.0033527318748119	0.5050235840813616	F2	41725	ZNF408	59891	ARHGAP1	60303	False	False	False	alt	-5	9.346e-05	-80	0.0709
560	chr11	46775133	A	C	rs7111811	0.00047593572	0.7352872518928902	0.00274092808	0.7316011167498772	0.0281718435152409	0.0052661300730392	1.721313216138407e-05	0.4097304652458748	8.235090557570219e-05	0.4078148706341645	0.209989730183923	0.6397423960072259	0.0002435745675919	0.7060213122195561	0.0006131334541308	0.7024354828960462	0.0059831244106588	0.0895257260848239	8.178953044302343e-06	0.4696667460690805	1.8811457508301304e-05	0.4674429154355646	0.0003153559684229	0.5897254744979273	0.0026141350014003	0.5867947091630071	F2	55936	CKAP5	71175	ZNF408	74102	False	True	True	alt	-40	0.000964	-70	0.02454
561	chr11	46777081	A	G	rs6485690	0.0466246608	0.0326864296591136	0.0466246608	0.0350171216006395	0.0104084597865226	0.2700582491893806	0.0004948137066034	0.043239156048035	0.0004948137066034	0.0461002945632494	0.1026608159835682	0.8207697877598108	0.0054711095592875	0.2476907036545228	0.0054711095592875	0.2592101808832134	0.0010484552436088	0.7935308171263947	5.595104764421291e-05	0.2318421586497025	5.595104764421291e-05	0.24210984304715	0.0375647050280604	0.0147933117976513	0.0375647050280604	0.0151762780628195	F2	57884	CKAP5	69227	ZNF408	76050	False	False	False	alt	100	0.000696	-100	0.010765
562	chr11	46799349	A	G	rs7118097	0.051180585	0.0253310269603994	0.051180585	0.0270515482537299	0.0118805861518861	0.1799247690313782	0.0006513224491716	0.0306555538758921	0.0006513224491716	0.0325488902837291	0.2674675048496353	0.5454663197498735	0.0144721485033114	0.0745370352167382	0.0144721485033114	0.0803877450528614	0.0031818759484901	0.3853407818265562	0.0001831546746071	0.0643224176242377	0.0001831546746071	0.0689306981640746	0.0441664332617557	0.0070446124167395	0.0441664332617557	0.0072632173946158	CKAP5	46959	F2	80152	ZNF408	98318	False	False	False	alt	-85	0.03026	-65	0.02235
563	chr11	46820494	C	T	rs6485696	0.00010929914	0.8567590815426083	0.00152631142	0.8594511999655935	0.0209085482508471	0.0224610045622612	7.089007766030017e-06	0.6786503760525255	3.114872798381457e-05	0.6814757284397565	0.167088870216496	0.7096129554841112	8.097180981206164e-05	0.8184436047646328	0.0002824808109415	0.8213678560029531	0.0035714623670291	0.2990835131002634	2.5429839934351224e-06	0.6906208346314393	5.979929255725259e-06	0.6941589014572915	0.0002572640795028	0.7404244037397189	0.0014232512785401	0.7430136324235409	CKAP5	25814	LRP4	98148	F2	101297	False	False	False	alt	25	0.0011635	-55	0.01651
564	chr11	46843154	T	C	rs11824327	-0.005118978	0.5942265307923283	0.005118978	0.5809880819109845	0.0065965211683891	0.8173374568217926	-3.489103387170431e-05	0.6656963597613078	3.489103387170431e-05	0.6524715750423413	0.3448853203871409	0.4222634429375559	-0.0017455342293319	0.4944061691033077	0.0017455342293319	0.4809851497107973	0.0022693149503973	0.5495148654221788	-1.1850490181615675e-05	0.5535671897398887	1.1850490181615675e-05	0.5402937867653335	-0.0033485824541748	0.5225757268030018	0.0033485824541748	0.510821954598684	CKAP5	3154	LRP4	75488	CSTPP1	93536	False	False	False	ref	-100	0.08826	-100	0.06805
565	chr11	46855531	T	C	rs7938960	-0.00158566976	0.862835809340861	0.00158566976	0.8487279144393675	0.0196422433515169	0.0285632414955774	-3.320689000725384e-05	0.6766316108199801	3.320689000725384e-05	0.6634084015124283	0.1011027085343208	0.8162162762155389	-0.0001740751079622	0.881893108425835	0.0001740751079622	0.8674156254028798	0.0019895418188303	0.5727804606782715	-3.602401979282985e-06	0.7846163597294961	3.602401979282985e-06	0.770071576613928	-0.0013153663419744	0.7658761977818919	0.0013153663419744	0.7524109106795139	CKAP5	9223	LRP4	63111	CSTPP1	81159	False	False	False	ref	-55	0.01253	-50	0.03027
566	chr11	46861767	A	C	rs11039012	-0.003003210608	0.7031843392241558	0.003373748632	0.69486224740758	0.0199678210553118	0.0273603952107765	-6.51991042717126e-05	0.4767940553115711	7.123657497037434e-05	0.4685999928236539	0.1788545524331165	0.689736330332642	-0.00052835268209	0.7160649748980088	0.0005927900668537	0.7077312935568839	0.0035941176718134	0.3044067369602357	-1.1562344884779512e-05	0.5534985239314516	1.2612274435836736e-05	0.544943396840799	-0.0029523127833276	0.5456772756641606	0.0032054274421933	0.5377976726726481	CKAP5	15459	LRP4	56875	CSTPP1	74923	False	False	False	ref	-100	0.01576	100	0.0652
567	chr11	46868168	T	C	rs12273360	0.0371398644	0.0586016761587406	0.0371398644	0.0625484174457775	0.0083145309887456	0.5288495617192229	0.0003152050245103	0.0890109638555862	0.0003152050245103	0.0941756268484726	0.3049077272585815	0.4802004276862158	0.0115298036230199	0.0988866680028223	0.0115298036230199	0.106103558388784	0.0025450022475799	0.493211867614353	9.832720991690078e-05	0.1195874707231811	9.832720991690078e-05	0.1270163705013702	0.0284608761501674	0.0322298740591422	0.0284608761501674	0.0331610135867935	CKAP5	21860	LRP4	50474	CSTPP1	68522	False	False	False	alt	100	0.002815	-55	0.049
568	chr11	46884180	G	A	rs61898529	0.001224338064	0.8561617127545212	0.001315358456	0.8656405262387905	0.011509362499147	0.1934123292146734	1.4816523357535998e-05	0.7991607460381424	1.5922627192343004e-05	0.8085847613694497	0.3227606095498915	0.463239918346048	0.0004183612303226	0.74729284590938	0.0004475635937706	0.7572873544783524	0.0037400062591256	0.2944915196815154	5.083497289413007e-06	0.698738367875165	5.438372126319107e-06	0.7088179670044249	0.0008506312306144	0.8107122779010204	0.0009211713814458	0.8202747978171337	LRP4	34462	CKAP5	37872	CSTPP1	52510	False	False	False	alt	30	0.01068	15	0.02957
569	chr11	46906904	G	A	rs7128102	-0.0365352412	0.0688144976415643	0.0365352412	0.0645272098831862	0.0138874740508427	0.1016701560540917	-0.0005053570064593	0.0414312239771865	0.0005053570064593	0.0389688422563916	0.5498521768898018	0.1022306944473862	-0.0201117493255968	0.044221317794136	0.0201117493255968	0.0407305296554557	0.0076323119308435	0.0342898229156606	-0.0002780522835325	0.031136964230944	0.0002780522835325	0.0289329910600767	-0.0079731117542712	0.2439926900919656	0.0079731117542712	0.2366910869634336	LRP4	11738	CSTPP1	29786	CKAP5	60596	False	False	False	ref	-55	0.01851	-100	0.1938
570	chr11	46912818	C	T	rs7120113	-0.0449756716	0.0389673657755375	0.0449756716	0.0364051522783906	0.011123300572174	0.2274080293464672	-0.0005183543037062	0.0434094004966331	0.0005183543037062	0.0408299247947115	0.5914812394319443	0.0552490513662492	-0.0266720694545279	0.0224176419325062	0.0266720694545279	0.0206234190726343	0.0065779522192314	0.0615535757758115	-0.0003070122201193	0.0286483488838992	0.0003070122201193	0.0266179961499196	-0.0065830558408281	0.2977993124732634	0.0065830558408281	0.289295564891716	LRP4	5824	CSTPP1	23872	CKAP5	66510	False	False	False	ref	90	0.001469	-65	0.0907
571	chr11	47098515	T	C	rs118012321	-0.002684920466	0.7538303947636911	0.002684920466	0.740199592023199	0.0348014739525855	0.0022380736995744	-9.922981218589176e-05	0.3727484984019926	9.922981218589176e-05	0.36211726717291	0.3287337005570597	0.4524453315431906	-0.0008842040117092	0.6350339541338523	0.0008842040117092	0.6213259432556133	0.0114273214975778	0.0080827825844372	-3.256644524121468e-05	0.3403381869628527	3.256644524121468e-05	0.328810025030596	-0.001908733493086	0.6927714790102191	0.001908733493086	0.67970901078168	ARFGAP2	78610	PACSIN3	87928	DDB2	115951	False	True	True	ref	-100	0.1992	-55	0.02051
572	chr11	47130722	G	A	rs10838660	-0.01145462704	0.3520944598874189	0.01145462704	0.3404029657479275	0.0074993987605884	0.6954506526351251	-8.970524085663194e-05	0.4090576135587906	8.970524085663194e-05	0.397660157074347	0.3132148673741428	0.4706181331506314	-0.0035786268853663	0.3400060964857272	0.0035786268853663	0.3277247544574247	0.0023315528607363	0.5468688882921023	-2.773311000621813e-05	0.3794734855032484	2.773311000621813e-05	0.3674884558817211	-0.0087884729094699	0.2621749102066535	0.0087884729094699	0.2550487812577488	ARFGAP2	46403	PACSIN3	55721	DDB2	83744	False	False	False	ref	100	0.00603	20	0.01762
573	chr11	47143555	G	A	rs7121418	-0.00582701136	0.557698959674694	0.00582701136	0.5445390269286139	0.0078500348505027	0.6116936885827573	-4.646334109544322e-05	0.5887329707047781	4.646334109544322e-05	0.57588109826892	0.1151173767362731	0.7907886902013055	-0.0006820101241391	0.705709456568359	0.0006820101241391	0.6913270193767097	0.000912844544692	0.8051692141070221	-5.495214142585258e-06	0.7181931209376199	5.495214142585258e-06	0.703925964726425	-0.004815402649405	0.3970783416839484	0.004815402649405	0.3871171193635442	ARFGAP2	33570	PACSIN3	42888	DDB2	70911	False	False	False	ref	-100	0.001602	-100	0.0802
574	chr11	57653412	G	A	rs1631684	0.0181763146	0.1990672718590181	0.0181763146	0.2086903308075745	0.0109857275314893	0.226361866931546	0.0002012771382151	0.1704478695496141	0.0002012771382151	0.1783656250794889	0.2434880029875828	0.5863506585820745	0.0045854600642202	0.2611813699064544	0.0045854600642202	0.2726840339835224	0.0026778101550119	0.4796830760056363	5.085592235299914e-05	0.2269482137311778	5.085592235299914e-05	0.2371411151197134	0.015541654996421	0.1003135535509743	0.015541654996421	0.1034803217918076	YPEL4	3468	CLP1	5223	ZDHHC5	14336	False	False	False	alt	100	0.05316	-55	0.01791
575	chr11	57666650	C	A	rs499188	0.0072113032	0.4663867029761124	0.0072113032	0.4795154979224214	0.0063637568568831	0.8755248962901263	4.432252704056086e-05	0.5618650866654454	4.432252704056086e-05	0.5748152369361927	0.5809085156485025	0.0655851135343518	0.0041926797847547	0.2827949472561548	0.0041926797847547	0.2951307309485914	0.0037028599739453	0.3039499488413261	2.579602707498844e-05	0.3578267915246647	2.579602707498844e-05	0.3700649498723176	0.001259349163373	0.7489911239891424	0.001259349163373	0.7625256898990307	ZDHHC5	1098	YPEL4	16706	CLP1	18461	False	False	False	alt	-100	0.00715	90	0.1143
576	chr11	57741206	G	C	rs12146541	-0.036131333	0.0723710922148569	0.036131333	0.0679123660657119	0.0172946871337858	0.0501004321907126	-0.0006603209677926	0.0297286778069691	0.0006603209677926	0.0280170362355534	0.7349038890444921	0.0092782533037208	-0.0266483642384682	0.0230449876943412	0.0266483642384682	0.0212564894617031	0.0127828306576248	0.0062684547748553	-0.0004895050544141	0.0145134216770333	0.0004895050544141	0.0135917091173924	-0.0058735049118766	0.3413641223894169	0.0058735049118766	0.3320888803669873	SELENOH	286	ENSG00000254732	574	BTBD18	11469	True	False	False	ref	95	0.01694	95	0.2034
577	chr11	57779528	T	C	rs35808061	-0.0547358181999999	0.0218003664705356	0.0547358181999999	0.0204440098877385	0.0237584622212532	0.0159552299019901	-0.0014392222669169	0.0089387182621694	0.0014392222669169	0.0085668161596076	0.3774209276029833	0.3738147272688089	-0.0209886111102887	0.041305250759316	0.0209886111102887	0.0381839983820826	0.009150773102551	0.0253287391353513	-0.0005607427284041	0.0140341702561395	0.0005607427284041	0.0132093726092449	-0.0338094793514455	0.0178218421825072	0.0338094793514455	0.017390698447936	CTNND1	26284	BTBD18	26853	ENSG00000254732	37748	False	True	False	ref	60	0.005775	-95	0.03363
578	chr11	57788298	T	C	rs11570181	0.0573359456	0.0151358515640945	0.0573359456	0.0162968699655331	0.0098509212191527	0.3158078655470943	0.0005695001688331	0.0297194420367728	0.0005695001688331	0.0318136312457456	0.4543802321600846	0.2464908790279392	0.026131296121395	0.0201536521655301	0.026131296121395	0.0219900492034123	0.0045026132891867	0.1904505099466066	0.0002610724177355	0.0305676862858061	0.0002610724177355	0.0331054052898384	0.025527235759707	0.0416289583290454	0.025527235759707	0.0428295860060269	CTNND1	35054	BTBD18	35623	ENSG00000254732	46518	False	True	False	alt	-15	0.000803	85	0.0692
579	chr11	57807627	A	G	rs1268667	-0.002082256258	0.8066341903952631	0.002082256258	0.7948342549255258	0.040045852585188	0.0011393160804555	-9.119328288291958e-05	0.4332122589631758	9.119328288291958e-05	0.4214897803630055	0.221278229027272	0.6237409319415311	-0.0004301996644243	0.7845976373349546	0.0004301996644243	0.7704994626223474	0.0087970813392337	0.0204570631308851	-1.8873624292020315e-05	0.5023382156681274	1.8873624292020315e-05	0.4893808466051302	-0.0020332161122003	0.6765914737766155	0.0020332161122003	0.663775185008099	CTNND1	54383	BTBD18	54952	ENSG00000254732	65847	False	True	True	ref	-90	0.010376	35	0.02203
580	chr11	63872198	G	A	rs4980505	0.000763846	0.474580914139854	0.0071244519999999	0.4730680082885282	0.0096455590902931	0.3440483465512069	5.705602040241323e-07	0.4493782184906739	6.953325360156985e-05	0.4470018742233989	0.5162563927011691	0.1493490114782186	0.0004494609175435	0.3201398169376893	0.0037370797343353	0.318938874237793	0.0049825185964787	0.1418876749309512	7.496361264244991e-07	0.304898020576682	3.648837905107515e-05	0.3030960101509837	9.751138497287992e-05	0.6767829365771868	0.0018776128383074	0.6750190657081367	MARK2	33269	RCOR2	44966	SPINDOC	58741	False	False	False	alt	-10	0.001221	-10	0.02637
581	chr11	64048350	C	T	rs2014328	-0.0296921724	0.1044831402613898	0.0296921724	0.0984946646486622	0.0098192639077085	0.3234458771706137	-0.0002953138843318	0.1071102886364368	0.0002953138843318	0.1015905363920323	0.5403417047894687	0.1143343885097829	-0.0160226749505644	0.0675509215301368	0.0160226749505644	0.0625439935735387	0.005296056647315	0.1195050918334102	-0.0001590366500563	0.0732373773604459	0.0001590366500563	0.068402859306174	-0.0074150146785754	0.2764688715001062	0.0074150146785754	0.2684832509904681	FLRT1	12418	OTUB1	62496	COX8A	73729	True	False	False	ref	-100	0.005024	-25	0.02454
582	chr11	64053900	G	A	rs478294	-0.1048883582	0.0017188298546904	0.1048883582	0.0016595888537871	0.0231440398350685	0.0146649779968554	-0.0024544741580475	0.0028387928883952	0.0024544741580475	0.0027564609978168	0.5858421767860663	0.0612273875816981	-0.0613762281895286	0.0013251464150053	0.0613762281895286	0.0012694047908231	0.0135647531887195	0.0048591752129829	-0.0014370106496566	0.0022489564134461	0.0014370106496566	0.0021593704040259	-0.018894386871233	0.0834973493877984	0.018894386871233	0.0812099108027798	FLRT1	17968	OTUB1	68046	COX8A	79279	False	True	True	ref	-35	0.001804	-45	0.04456
583	chr11	64056059	G	A	rs540741	-0.0105461222999999	0.3616403209951189	0.0105461222999999	0.3500111355157288	0.0091240499023899	0.4120890632345355	-9.857343990423152e-05	0.364511333005785	9.857343990423152e-05	0.3538483560513245	0.5841160178010145	0.0619088586109761	-0.0060817849142083	0.220367713680157	0.0060817849142083	0.2099573021194851	0.005300728851086	0.1201769248015259	-5.6471955618331925e-05	0.2228711683593408	5.6471955618331925e-05	0.2131290989925104	-0.0019294805962716	0.6916998310223776	0.0019294805962716	0.6786237263990906	FLRT1	20127	OTUB1	70205	COX8A	81438	False	False	False	ref	65	0.00183	5	0.003845
584	chr11	64056147	C	T	rs562664	-0.0746837079999999	0.0062631354101148	0.0746837079999999	0.0059272790933606	0.0229166741867403	0.0146952441493581	-0.0017330438651395	0.0049342179114447	0.0017330438651395	0.0047395636314025	0.5901347524351912	0.056523315147362	-0.0442054602111797	0.0043596140186291	0.0442054602111797	0.0040723363626493	0.0136273476684073	0.0050369837042743	-0.0010340328989147	0.0037936712460868	0.0010340328989147	0.0036107614190796	-0.0123756470502806	0.1557220104302249	0.0123756470502806	0.1508519468935936	FLRT1	20215	OTUB1	70293	COX8A	81526	False	True	True	ref	100	0.01263	75	0.11694
585	chr11	66349440	A	G	rs4930355	0.0503199742	0.0245584751709523	0.0503199742	0.0262880250472737	0.0093230460767423	0.3616343157556353	0.0004723872903513	0.0424639076989148	0.0004723872903513	0.0451080257898486	0.3312046805464786	0.4466699311225948	0.016883509971978	0.0523508509577637	0.016883509971978	0.056791963628647	0.0031123092337967	0.3742165892575172	0.0001599484619536	0.0621306116107165	0.0001599484619536	0.0665710828881814	0.0375875268415647	0.0126204211930869	0.0375875268415647	0.0129972493244326	B4GAT1	1811	BRMS1	4315	RIN1	12600	False	False	False	alt	100	0.01371	-75	0.01959
586	chr11	67004840	G	T	rs11227649	-0.002828397694	0.7666862592144087	0.002828397694	0.7529393180562929	0.0192736012731242	0.0307223509814437	-5.543413376102306e-05	0.54172955743055	5.543413376102306e-05	0.529135573293022	0.3447421653751594	0.4260217513329902	-0.0009931650766042	0.6350577372745275	0.0009931650766042	0.6210729107231283	0.0066214158434072	0.0571236981573804	-1.938251921075353e-05	0.4623246838297822	1.938251921075353e-05	0.4496593411563461	-0.0018776128383074	0.6939261085515637	0.0018776128383074	0.6808751112897219	SYT12	1939	C11ORF86	29562	PC	46454	False	False	False	ref	-85	0.01114	75	0.0348
587	chr11	67005606	C	T	rs1253435	-0.0610469466	0.0134195660099146	0.0610469466	0.0126116305154165	0.0129282154841082	0.133719096285443	-0.0008185321582758	0.0184579055921535	0.0008185321582758	0.0174804379976484	0.4344235936057427	0.2824068229449062	-0.0265870683253417	0.0225523442566095	0.0265870683253417	0.0207625370403917	0.0056238708587842	0.1028353750428596	-0.0003566472422858	0.0224501002141933	0.0003566472422858	0.0209122903374861	-0.0294837083372233	0.0260310040127003	0.0294837083372233	0.025417919130479	SYT12	1173	C11ORF86	30328	PC	47220	False	True	False	ref	-100	0.001633	-50	0.05753
588	chr11	79499415	A	C	rs112437913	-0.0031866672599999	0.3333409510925038	0.01199200726	0.3311981613516462	0.0137121398605486	0.1134754025044155	-9.443547622094664e-05	0.216043768559673	0.0002014722549929	0.2140231056638872	0.6202408738679861	0.0341241609554445	-0.0019410813421107	0.19477443048577	0.0073927758579692	0.1920057964238557	0.0084777879455127	0.0279460504449909	-5.745180530608783e-05	0.1351776111940829	0.0001237220270327	0.1329935849461103	-0.0004398385875371	0.7454712573722806	0.0014108030166287	0.7397574456367635	TENM4	58385	NARS2	924221	GAB2	1081067	False	False	False	ref	40	0.003166	0	0.0
589	chr11	79591215	T	C	rs1893846	0.0564909904	0.0161770364851646	0.0564909904	0.0172905069692953	0.0125714180337054	0.1482119793650615	0.0007284918792883	0.0198651339572068	0.0007284918792883	0.0211139546261288	0.3359453936244151	0.4348716246394754	0.01893163265996	0.0420596142164614	0.01893163265996	0.0458859507572239	0.0042889915956862	0.211709038937505	0.0002478215276747	0.0347802389602725	0.0002478215276747	0.0376369127262578	0.0419942115582111	0.0085587622142155	0.0419942115582111	0.0087976716232339	TENM4	150185	NARS2	1016021	GAB2	1172867	False	True	False	alt	100	0.006668	70	0.05542
590	chr11	79634979	A	G	rs2457246	-0.0052515820199999	0.5846927750643994	0.0052515820199999	0.5715510593340377	0.0248454218457134	0.0098197390628706	-0.0001305798712362	0.2898350729001551	0.0001305798712362	0.2798715281860132	0.2365729934957831	0.597278130696084	-0.0012831317921705	0.5698874404722031	0.0012831317921705	0.5560694789979461	0.0058817964069782	0.0849784167781195	-3.1827855501655044e-05	0.33970669256971	3.1827855501655044e-05	0.3282636171675942	-0.0045353167563978	0.4254443304790829	0.0045353167563978	0.4146849754839006	TENM4	193949	NARS2	1059785	GAB2	1216631	False	True	True	ref	-90	0.001358	100	0.0374
591	chr11	79637393	C	T	rs591699	-0.0343351142	0.0810685742158369	0.0343351142	0.0763318379710741	0.0087919433581318	0.4514336879613808	-0.0003123193392399	0.1046821911672747	0.0003123193392399	0.0993733243262019	0.3506073714457618	0.419117137139964	-0.0123941947190342	0.1033738917006178	0.0123941947190342	0.0966324987750087	0.0031085401253495	0.4023642270786575	-0.0001138369498104	0.1180839144577539	0.0001138369498104	0.1113442008605695	-0.0228778306828908	0.0558981427368008	0.0228778306828908	0.0544112514340058	TENM4	196363	NARS2	1062199	GAB2	1219045	False	False	False	ref	-100	0.00598	-100	0.073
592	chr11	79643238	T	C	rs12789884	0.079020454	0.0054219915704905	0.079020454	0.0057529448135579	0.0186671490932083	0.0350246756954042	0.0015241821115444	0.0061571572184675	0.0015241821115444	0.0064299836892064	0.5109866284919968	0.1501242278436435	0.0401964311379352	0.0060855054804507	0.0401964311379352	0.0066005225248548	0.0094668329493618	0.0167281435839272	0.0007714723031902	0.0058392605524186	0.0007714723031902	0.0062172317740689	0.0261807695100571	0.0358731318850849	0.0261807695100571	0.0369316388066168	TENM4	202208	NARS2	1068044	GAB2	1224890	False	True	True	alt	-55	0.001984	20	0.01953
593	chr11	104509903	A	G	rs71464734	-0.0131012634199999	0.3064913508443145	0.0131012634199999	0.2952440997337927	0.0124648061253062	0.1576558311479442	-0.0001794090826669	0.2195800358722442	0.0001794090826669	0.2110038504984815	0.1570680193777943	0.7279005500948484	-0.0022527563916901	0.4519357079306061	0.0022527563916901	0.4386072968413989	0.0020671863473771	0.5734223673181237	-3.3065094876232145e-05	0.37018516083177	3.3065094876232145e-05	0.3580383304819166	-0.0128196350584549	0.1621288123411128	0.0128196350584549	0.1574528404634064	PDGFD	345524	CASP12	388767	CASP4	459463	False	False	False	ref	85	0.006256	-30	0.02509
594	chr11	104552280	C	T	rs722354	0.00403252776	0.617863044845965	0.00403252776	0.6311238155107202	0.0183022078537129	0.0379922521255356	7.499803453179599e-05	0.3990288455264348	7.499803453179599e-05	0.4099862990981681	0.0805589269598231	0.8566754372628521	0.0003124189058262	0.7790912681356369	0.0003124189058262	0.7932600150343542	0.001468454450141	0.7067796872706898	5.823367903710179e-06	0.6631547959771215	5.823367903710179e-06	0.676961838234494	0.0031369620016804	0.5115285071264847	0.0031369620016804	0.5230939090509683	CASP12	346390	PDGFD	387901	CASP4	417086	False	False	False	alt	-80	0.001205	90	0.02016
595	chr11	104566928	G	A	rs34793132	-0.0584128431999999	0.0174101229575795	0.0584128431999999	0.0163030662011408	0.0109454452547848	0.2241725216651763	-0.0006535910944435	0.0275898519487573	0.0006535910944435	0.0259656551149442	0.3478002883847343	0.4220432138779801	-0.0206536122288916	0.0430507611223829	0.0206536122288916	0.0396625542948706	0.0038179929817426	0.2841351007450016	-0.0002316025001844	0.0444736836603489	0.0002316025001844	0.0414475660213981	-0.0412473158435252	0.0092687813919349	0.0412473158435252	0.0090304624293302	CASP12	331742	CASP4	402438	PDGFD	402549	False	True	False	ref	65	0.009995	70	0.04596
596	chr11	104574276	T	C	rs59832858	0.0185646622	0.1875239868138211	0.0185646622	0.1967686494739746	0.0082201868273176	0.5421359344792533	0.0001554530365767	0.2162798412233413	0.0001554530365767	0.22510668733167	0.0319733607195094	0.9411979421261	0.0006307418149229	0.6872234937019263	0.0006307418149229	0.7015982209543576	0.0002732693040581	0.9408017832331166	5.524312802003336e-06	0.6894813528861822	5.524312802003336e-06	0.7036582798585916	0.0079461405201298	0.2289699690961311	0.0079461405201298	0.2357393937042489	CASP12	324394	CASP4	395090	PDGFD	409897	False	False	False	alt	-40	0.015045	-60	0.0181
597	chr11	104592078	G	C	rs7927714	-0.1662701172	0.0002712411771604	0.1662701172	0.0002492529852154	0.0540321292951727	0.0005434327429811	-0.0096677667572723	0.0003352043641862	0.0096677667572723	0.0003150538749402	0.2869511094513428	0.5134873324413035	-0.0482923208427026	0.0036866751982941	0.0482923208427026	0.0034689251419555	0.0154888896433727	0.0036928968144982	-0.0028063832766494	0.000984021837161	0.0028063832766494	0.0009327648529197	-0.1471695764478884	3.711386675788527e-05	0.1471695764478884	3.021707141986197e-05	CASP12	306592	CASP4	377288	PDGFD	427699	False	True	True	ref	-100	0.004772	65	0.02124
598	chr11	104594377	T	G	rs11226433	0.0025543156799999	0.7405195122213034	0.0025543156799999	0.7546114029683825	0.0121942545295397	0.1610581314209109	3.051441679854081e-05	0.6558494023910229	3.051441679854081e-05	0.6693775966567413	0.1001939854147864	0.8253781410895408	0.000221216187905	0.8176261421329859	0.000221216187905	0.8321042360566717	0.0012377056046045	0.7547175165117315	2.676108426601702e-06	0.7755554445972702	2.676108426601702e-06	0.7900536229871752	0.0021722217035445	0.614500611660658	0.0021722217035445	0.6269552690391335	CASP12	304293	CASP4	374989	CASP5	428791	False	False	False	alt	-20	0.007736	100	0.0315
599	chr11	104610096	G	C	rs10895711	0.0131794605	0.2665580263739218	0.0131794605	0.2771431903017364	0.0079118395615325	0.5984844024844123	0.0001078966064103	0.3110709608924991	0.0001078966064103	0.3210996297087926	0.324856066971649	0.4603286212107798	0.0043290889228105	0.2645033297667101	0.0043290889228105	0.2758091223187213	0.002591630568403	0.5005474932581205	3.562003465595161e-05	0.2920191324149062	3.562003465595161e-05	0.3029750756341536	0.0094980238384215	0.1905200398915545	0.0094980238384215	0.1966187256479512	CASP12	288574	CASP4	359270	CASP5	413072	False	False	False	alt	-75	0.0174	-60	0.0879
600	chr11	104628386	C	T	rs12418899	-0.0491959334	0.0301310983332882	0.0491959334	0.028251187492352	0.0115302103453062	0.1941451109662981	-0.0005745383224544	0.0348790019484046	0.0005745383224544	0.0327711165803087	0.1351984979097293	0.7656620356216369	-0.006928750307444	0.2011355449311129	0.006928750307444	0.1910523495160756	0.0015443612592238	0.6972861487055203	-7.970698175548026e-05	0.1680996307346966	7.970698175548026e-05	0.1595824276226241	-0.0438386290314214	0.0068579831258707	0.0438386290314214	0.0066916034981231	CASP12	270284	CASP4	340980	CASP5	394782	False	False	False	ref	-100	0.02455	20	0.0141
601	chr11	104633688	G	A	rs16894	-0.001265873634	0.7678579139453177	0.002800004874	0.7644281928290527	0.0209877713853987	0.0220058240286922	-1.6963492375631193e-05	0.5454407670445438	5.8447177083998606e-05	0.5425250999698377	0.132084357721553	0.771512585240681	-0.0001468991116814	0.8112622776937166	0.0003487665682982	0.8079238300523626	0.0028060662719973	0.4492964698455005	-1.8393405106452565e-06	0.6752574618317994	7.40125033332957e-06	0.6722145888744644	-0.0008319588377472	0.6082815691093171	0.0024875776719675	0.6053894217719734	CASP12	264982	CASP4	335678	CASP5	389480	False	False	False	ref	-85	0.01987	-80	0.008255
602	chr11	104653880	G	A	rs10895715	-0.0417152063999999	0.0505415137513945	0.0417152063999999	0.0473165002053362	0.0087421044403347	0.4674484549789984	-0.0003752533502557	0.0760724715225297	0.0003752533502557	0.0718778829718021	0.2224151702818493	0.6201257010588304	-0.0099064114011221	0.1432483208932739	0.0099064114011221	0.1346595456567172	0.0020089766130421	0.6054174002544309	-9.155874306247268e-05	0.1556243269027612	9.155874306247268e-05	0.1474949932170142	-0.0383323478459319	0.0115629859398904	0.0383323478459319	0.0112722858225261	CASP12	244790	CASP4	315486	CASP5	369288	False	False	False	ref	100	0.02295	85	0.01863
603	chr11	104703675	C	T	rs1147010	-0.00332262526	0.7120954048867718	0.00332262526	0.6986686151649477	0.0070257642346089	0.7856847090961696	-2.347654207590319e-05	0.7568986635264555	2.347654207590319e-05	0.7435058974252665	0.017130883100447	0.966304646910684	-5.738057857704994e-05	0.9479086461640857	5.738057857704994e-05	0.9337731465018152	0.0001194141794291	0.9725934616333636	-4.018191972054918e-07	0.9571254729283803	4.018191972054918e-07	0.942941140139522	-0.0010000103735515	0.8173277951556952	0.0010000103735515	0.8036181274744565	CASP12	194995	CASP4	265691	CASP5	319493	False	False	False	ref	0	0.0	85	0.02661
604	chr11	104796270	C	A	rs72972953	0.00027813422	0.9191597476141458	0.0007822864759999	0.9220996004238758	0.0132102441465591	0.1220932597917821	3.91926881496478e-06	0.8725481278638874	1.0318559622244407e-05	0.8757539848771996	0.0453614664052531	0.915165061182508	1.0346799476954174e-05	0.9575272157311944	2.955194998599128e-05	0.9601845189595836	0.0005838703128919	0.8721723425423386	1.486807918718276e-07	0.9414514969822496	3.851678140320004e-07	0.9442197572282915	0.0002717870517328	0.8932158698540015	0.0004875569248643	0.8963906229905125	CASP12	102400	CASP4	173096	CASP5	226898	False	False	False	alt	55	0.001432	100	0.00432
605	chr11	104804375	A	G	rs6591097	-0.0047076021	0.5961263354954658	0.0047076021	0.5831332011545917	0.0207069701780486	0.0228302088805012	-9.817794186920918e-05	0.3466329025689266	9.817794186920918e-05	0.3360990322933859	0.1136733783545472	0.7970125951690606	-0.00062088131954	0.7142094180280663	0.00062088131954	0.7005285490501583	0.0023719446714928	0.4998870449507285	-1.2973284809716592e-05	0.5466083238244784	1.2973284809716592e-05	0.5334528009088515	-0.004224110208612	0.4508758300288597	0.004224110208612	0.4400170498546151	CASP12	94295	CASP4	164991	CASP5	218793	False	False	False	ref	95	0.0393	0	0.0
606	chr11	104807143	A	T	rs1144403	0.00714831514	0.4468670872516343	0.00714831514	0.4593896164306633	0.007803564411966	0.6159891224714434	5.682608670867769e-05	0.4830381156869412	5.682608670867769e-05	0.4952339252184182	0.0614363219535471	0.8877083578697307	0.000425612545344	0.7311998130566386	0.000425612545344	0.7452024820209746	0.0004750702051028	0.8982675217684283	3.3383393560160715e-06	0.7450148292190835	3.3383393560160715e-06	0.7592060023717219	0.0048900922208736	0.3677924280574094	0.0048900922208736	0.3776905191349255	CASP12	91527	CASP4	162223	CASP5	216025	False	False	False	alt	5	0.00058	0	0.0
607	chr11	104812625	G	C	rs1529338	-0.00510824186	0.5518749017662744	0.00582613226	0.5438252697600867	0.0079876616678219	0.5854247274583159	-4.1044279233949055e-05	0.5783321435413016	4.6358026208085777e-05	0.5707185130741218	0.2480046473511135	0.5809472270951089	-0.0012297088794327	0.543218831313138	0.0014186783600125	0.53541531173749	0.0019802676371093	0.6096826612767746	-9.899559932838347e-06	0.5615325565421514	1.129829155317382e-05	0.5540683792699002	-0.0042116619467006	0.3954427690857634	0.0049544082407493	0.3891960697256653	CASP12	86045	CASP4	156741	CASP5	210543	False	False	False	ref	95	0.001561	10	0.01459
608	chr11	104813115	G	A	rs4755059	0.0015249985199999	0.7901292379974608	0.00222012372	0.7989320523248252	0.0203355850786186	0.0245401199524644	3.305405976659525e-05	0.565257510751349	4.5302155347556766e-05	0.5737242279238416	0.0849427898629653	0.8423009952289997	0.000108172530421	0.8473353298251314	0.0001726525513455	0.8561684335859916	0.0017111095449464	0.6446835771961952	2.363439220460394e-06	0.7433517488946355	3.499576220688175e-06	0.7523389777489806	0.0012697227149658	0.6789258261797972	0.0017718026120602	0.6873414546630002	CASP12	85555	CASP4	156251	CASP5	210053	False	False	False	alt	-100	0.01091	-100	0.02286
609	chr11	104820457	T	C	rs2555136	0.00443830118	0.5977572988625852	0.00443830118	0.6107406929138095	0.0074340894812309	0.6748171874681068	3.3691667610210454e-05	0.6400287338558153	3.3691667610210454e-05	0.6530752278811279	0.0798638990031016	0.8570805981945153	0.0003473743877767	0.7658945730540294	0.0003473743877767	0.7798845075486204	0.0005821805780668	0.8799165461411733	2.551794570604551e-06	0.7886571941805071	2.551794570604551e-06	0.8027992835042992	0.0032884158549362	0.4978907355302649	0.0032884158549362	0.5095657233398262	CASP12	78213	CASP4	148909	CASP5	202711	False	False	False	alt	-55	0.00874	100	0.05594
610	chr11	104821521	G	A	rs7131576	0.0011319707	0.8337323923615445	0.00158201838	0.8427177536781452	0.0252228626243673	0.0090790351951574	3.1138861534167126e-05	0.6098336247002168	4.204055896366828e-05	0.6184285140639463	0.1471840994201184	0.7378258532386981	8.669227978715071e-05	0.8376225223413262	0.0001944574042807	0.8460773049689673	0.0036563081381755	0.2802626882834745	2.4157425614333104e-06	0.6922279265820117	5.026183351951624e-06	0.7003782319070729	0.0009896368219587	0.7387539428956511	0.001404578885673	0.747452145883082	CASP12	77149	CASP4	147845	CASP5	201647	False	True	True	alt	-65	0.00815	40	0.02069
611	chr11	104825330	C	T	rs1030395	-0.004527103472	0.5993703849759373	0.004761846448	0.588810755764797	0.0070285079979463	0.7655543893975133	-3.431463472648486e-05	0.64650592252568	3.575990890486674e-05	0.6363770652101939	0.0883390906544673	0.843252841104334	-0.0004308835936035	0.761302668778102	0.0004510463736308	0.7504542890410376	0.0006310789781353	0.8691697237155575	-3.3361339587259537e-06	0.7833350354430227	3.460272904119599e-06	0.7725328606616318	-0.0038257658274463	0.4615310446638135	0.0040581333831263	0.452976312907746	CASP12	73340	CASP4	144036	CASP5	197838	False	False	False	ref	100	0.01036	-5	0.000351
612	chr11	104829767	T	A	rs10895736	0.00776641712	0.4128396360165668	0.00776641712	0.4249075153839695	0.0276350732060619	0.0057085511463961	0.0002108274498115	0.1443357893784955	0.0002108274498115	0.1515353162525088	0.0449091795558044	0.9174285657554028	0.0003490411453062	0.7611080027018368	0.0003490411453062	0.7751241940030292	0.0012316364865291	0.7477145848681885	9.40223313871512e-06	0.5586738826609278	9.40223313871512e-06	0.5720723013003712	0.0045124949428935	0.3964088124528809	0.0045124949428935	0.4066559153386203	CASP12	68903	CASP4	139599	CASP5	193401	False	True	False	alt	-60	0.03534	65	0.02277
613	chr11	104829957	T	C	rs10895737	0.0018507041952	0.7893988154987085	0.0024146109248	0.7901793622101458	0.0206478830602375	0.0243516879019312	2.569337479350711e-05	0.6421562317164838	3.927469325896227e-05	0.6425001522684436	0.0506187823525139	0.9085512891546308	8.374349119026262e-05	0.9198774119951804	0.0001079858403823	0.9183113473602844	0.0010770834751163	0.7768082635762142	1.1692234191107634e-06	0.8681058017375081	1.754591256125919e-06	0.8664694040465967	0.0008091370242429	0.7706850759726636	0.0012655732943287	0.7702196016416729	CASP12	68713	CASP4	139409	CASP5	193211	False	False	False	alt	-100	0.04907	-90	0.03047
614	chr11	104832911	G	A	rs7947634	-0.00264319264	0.7160830814670066	0.0032923027199999	0.7064838202839497	0.0040188519396969	0.999961999501176	-1.0088874121254142e-05	0.8586144594269837	1.305101623409078e-05	0.8494758707025113	0.0821481550638491	0.8560734243441567	-0.0001765569782163	0.8403084314727272	0.0002357316527922	0.8310557115688625	0.0003339865802687	0.9318002591789696	-6.748640548217175e-07	0.9072362099275676	9.449011391027616e-07	0.8979899893801715	-0.001850641604166	0.617458245855224	0.0023983651282689	0.6087270688825285	CASP12	65759	CASP4	136455	CASP5	190257	False	False	False	ref	100	0.005306	-5	0.00238
615	chr11	112393282	T	G	rs12576701	0.0368693125999999	0.0596761089966632	0.0368693125999999	0.0639376198747659	0.0102535784525523	0.2863468848056701	0.0003866809098303	0.0638482751224172	0.0003866809098303	0.0679015047464311	0.4008195105758358	0.337111950260993	0.0149543275874921	0.0659588973160135	0.0149543275874921	0.0716732980989595	0.004137727336838	0.2356100043227169	0.0001577893229451	0.0666375433059524	0.0001577893229451	0.0716700145953606	0.0200126557329432	0.0680537900921373	0.0200126557329432	0.0699322969334093	PLET1	132422	PTS	166914	BCO2	217771	False	False	False	alt	-25	0.000754	-45	0.0351
616	chr11	112393897	G	A	rs6589285	-0.00363873326	0.6990715524263067	0.00363873326	0.685616850536024	0.0068524084570758	0.8060264512683893	-2.5279137183706784e-05	0.752122378519829	2.5279137183706784e-05	0.738599631642823	0.16555773400139	0.7148272250885912	-0.0006237199662091	0.7230297772393232	0.0006237199662091	0.7091509690862934	0.0011259434782935	0.7738057088880888	-4.310639942552332e-06	0.7614289994699525	4.310639942552332e-06	0.7475028422132838	-0.0034668409423333	0.521665714416691	0.0034668409423333	0.5100698441793574	PLET1	133037	PTS	167529	BCO2	218386	False	False	False	ref	100	0.01015	-100	0.0293
617	chr11	112398241	T	G	rs4936065	-0.0260173284	0.1371248151009895	0.0260173284	0.1301799597748108	0.0130797618811459	0.1245086861246099	-0.0003572439048784	0.0899831771076126	0.0003572439048784	0.0852675581940389	0.3664809800931544	0.3906794539774614	-0.0094755724959617	0.1434028390180153	0.0094755724959617	0.1350304561574847	0.0047930319118588	0.1611976914356229	-0.0001303867875537	0.1017644335882587	0.0001303867875537	0.0955510316523581	-0.0174358655172771	0.1025772981130862	0.0174358655172771	0.099523940133822	PLET1	137381	PTS	171873	BCO2	222730	False	False	False	ref	25	0.00058	50	0.03394
618	chr11	112400682	C	T	rs12419862	0.0059389421799999	0.5087220913832566	0.0059389421799999	0.5216084470946576	0.00728238257258	0.7365925260562501	4.3432623288976645e-05	0.5624422716227006	4.3432623288976645e-05	0.5752453763236782	0.3825931804271828	0.3622574574844336	0.0022864790902836	0.3996296905622481	0.0022864790902836	0.4127710414119807	0.0027800407691008	0.4576680216626049	1.6689310005436383e-05	0.4410771658221308	1.6689310005436383e-05	0.4539540005254214	0.0033900766605462	0.4883798994228676	0.0033900766605462	0.4997876920905814	PLET1	139822	PTS	174314	BCO2	225171	False	False	False	alt	-80	0.001228	85	0.00738
619	chr11	112400714	A	C	rs11214193	-0.0506080193999999	0.0285189286120167	0.0506080193999999	0.0269834977126925	0.0158158107406047	0.0754473439175581	-0.0009012158986207	0.0231333064009545	0.0009012158986207	0.0221744818782174	0.3818836294982312	0.3633967552921807	-0.0191150223332204	0.0504940264461431	0.0191150223332204	0.0469687494601122	0.0060312875636607	0.0828883380016125	-0.0003429216073729	0.0309711936683894	0.0003429216073729	0.0292819807952098	-0.0337493127522069	0.0227680443949386	0.0337493127522069	0.0221468740265556	PLET1	139854	PTS	174346	BCO2	225203	False	False	False	ref	-90	0.000839	-45	0.03793
620	chr11	112477663	G	A	rs11214222	-0.0640703996	0.0133758699661536	0.0640703996	0.0126222264024379	0.0219267930794866	0.0243259174935977	-0.0016138111931065	0.0085670283364802	0.0016138111931065	0.0082122455424521	0.306673305739686	0.483717705891682	-0.019099633859452	0.0500250951608188	0.019099633859452	0.0461926671120788	0.0066243827091704	0.067534273003238	-0.0004772864687159	0.0191069965094852	0.0004772864687159	0.0179041682084399	-0.0536935030446373	0.0043122315411116	0.0536935030446373	0.0041840862405503	PLET1	216803	PTS	251295	BCO2	302152	False	True	False	ref	-5	0.0004578	-25	0.006958
621	chr11	113094734	A	G	rs12279124	-0.01110543434	0.355496307601467	0.01110543434	0.3440917197561826	0.0071860082586663	0.7248566817710849	-8.345702053736763e-05	0.421749568483389	8.345702053736763e-05	0.4106179085435631	0.3444413323789665	0.4253467871087583	-0.0038590210777993	0.3255054009382131	0.0038590210777993	0.3135977759531859	0.0024609158540031	0.5229736981968031	-2.8839519821667623e-05	0.3728837474505301	2.8839519821667623e-05	0.3611218006729926	-0.0068735152854282	0.2977527506123067	0.0068735152854282	0.2894805019978834	NCAM1	133458	TTC12	219846	ANKK1	293046	False	False	False	ref	40	0.00885	20	0.02533
622	chr11	113099611	T	C	rs7946458	-0.00410599796	0.4818388745680257	0.0070370387199999	0.4787389334315142	0.009672347406576	0.3519075867721631	-4.7281451936909205e-05	0.4635692095487904	7.230368181988129e-05	0.4603927375206693	0.2684778887747798	0.5489952690677822	-0.0012124701354782	0.4772904767768365	0.0019453848525968	0.4744844831055289	0.0025991109082696	0.4995112704767168	-1.3585528507112392e-05	0.455962568414054	1.9843111128250827e-05	0.4530300871446543	-0.0026618533387275	0.3523068557761754	0.005856907229328	0.3500583555515857	NCAM1	138335	TTC12	214969	ANKK1	288169	False	False	False	ref	95	0.006065	-80	0.03326
623	chr11	113102292	A	G	rs7118324	0.0441623208	0.0380917174238116	0.0441623208	0.0402095516629564	0.0283347985002795	0.0068554808022682	0.0014294123546615	0.0107437154379067	0.0014294123546615	0.0113077972733902	0.0419298955383354	0.9216554914002976	0.0020339852620163	0.4430088897198484	0.0020339852620163	0.4565247255011895	0.0012245645859974	0.7342038253927088	6.767323676528655e-05	0.1981179409839486	6.767323676528655e-05	0.2075184903325765	0.0209172294318405	0.0654758160424992	0.0209172294318405	0.0673787745125794	NCAM1	141016	TTC12	212288	ANKK1	285488	False	True	False	alt	-10	0.001053	80	0.02777
624	chr11	113104464	A	T	rs12286447	0.0093426098	0.3584351162827978	0.0093426098	0.3702148728207882	0.0174815254918856	0.0451400616445017	0.0001638833558692	0.1974117263166228	0.0001638833558692	0.2059156859904896	0.428187014388116	0.2845186231860781	0.0039529422567406	0.2757589262962884	0.0039529422567406	0.2872052211309457	0.0074777638557947	0.0370688726717177	6.926105457184899e-05	0.1578767565933262	6.926105457184899e-05	0.1666512277145126	0.0045021213913007	0.4052030530208358	0.0045021213913007	0.4156917160274759	NCAM1	143188	TTC12	210116	ANKK1	283316	False	False	False	alt	-100	0.00682	100	0.07007
625	chr11	113346642	A	G	rs3781884	-0.02673172154	0.148398626723604	0.02673172154	0.1415787682763336	0.0183495276072645	0.0431565772084856	-0.0006660562214716	0.0765978904209082	0.0006660562214716	0.0735029967481382	0.3488521665162502	0.4188506223395314	-0.0100818179588305	0.1648083046221275	0.0100818179588305	0.1566258297892274	0.0066823699275871	0.0744949355464845	-0.0002611462634271	0.0889079540863751	0.0002611462634271	0.0846124930832628	-0.0163300449174783	0.1228941733093371	0.0163300449174783	0.1197037710271837	TTC12	32062	ANKK1	41138	DRD2	129049	False	False	False	ref	65	0.002167	-80	0.02277
626	chr11	113467056	C	T	rs12421616	-0.0502579798	0.0283943271591021	0.0502579798	0.0265488588689851	0.01384164883811	0.1041558150433074	-0.0007119074953305	0.023209128541043	0.0007119074953305	0.0218356476633426	0.2142719322814552	0.6354066622380998	-0.0106623556551821	0.1219268308092684	0.0106623556551821	0.1140691926026532	0.0029682432876907	0.4269509261336355	-0.0001510463852391	0.0790111132777199	0.0001510463852391	0.0737418778820205	-0.0483448998433593	0.0048737613443528	0.0483448998433593	0.0047382175583634	DRD2	8635	ANKK1	79276	TTC12	152476	False	False	False	ref	40	0.0004768	-10	0.005707
627	chr11	113484722	T	C	rs7121986	0.01068222654	0.3264885369835101	0.01068222654	0.3379330607545673	0.008866357335086	0.4300788235780477	9.57796313756228e-05	0.3337966282907578	9.57796313756228e-05	0.3443307430785082	0.2871087874355543	0.5055240236051793	0.0029783727740676	0.3389050251161555	0.0029783727740676	0.3513362096713538	0.0025413135511224	0.481810299440358	2.6659909543346628e-05	0.3388699123956183	2.6659909543346628e-05	0.3505256908463737	0.008603823691117	0.2356488265567372	0.008603823691117	0.2426897812793814	DRD2	9031	ANKK1	96942	TTC12	170142	False	False	False	alt	65	0.001129	-95	0.02031
628	chr11	113493925	G	T	rs4245150	0.0069499401399999	0.4550845347832305	0.0069499401399999	0.4677466468055242	0.0257769226320555	0.0090580463657885	0.0001994252555406	0.1786151902936097	0.0001994252555406	0.1865433623955653	0.1504994865091961	0.7379435771988634	0.0011743704997588	0.5580614380328925	0.0011743704997588	0.5718274821841202	0.0041131233816391	0.2154312059444741	3.43763077945582e-05	0.3184750025884613	3.43763077945582e-05	0.3303092733993314	0.0070457162418696	0.2954109363961821	0.0070457162418696	0.3038544014900634	DRD2	18234	ANKK1	106145	TTC12	179345	False	True	True	alt	85	0.03143	-85	0.04752
629	chr11	113493969	T	C	rs17602038	-0.0127030077999999	0.3109937564939297	0.0127030077999999	0.2999079040972862	0.0083774185460752	0.5324090378556726	-0.0001107043631272	0.3354244780609271	0.0001107043631272	0.3250160749799865	0.1393292461540057	0.7568378383821918	-0.0019015260035967	0.4793004837599356	0.0019015260035967	0.466203736889235	0.0011887800280265	0.7602793002770749	-1.685706634327961e-05	0.4881345245800776	1.685706634327961e-05	0.4753794964499565	-0.0125582215583148	0.1677185710661859	0.0125582215583148	0.1628332744139518	DRD2	18278	ANKK1	106189	TTC12	179389	False	False	False	ref	70	0.03653	60	0.01499
630	chr11	113530172	G	A	rs2514222	-0.00093013888	0.6904689370698476	0.00360312732	0.6861897072995888	0.0071260710510514	0.7599730218940994	-6.794392092377652e-06	0.7357525566655535	2.5420408145716216e-05	0.7316290657232946	0.2031618585255033	0.6439812497689252	-0.0003366878949681	0.6649958424576252	0.0007826691918495	0.6597091075090814	0.0014131799599141	0.7107874042004625	-2.30600828807938e-06	0.7024671376544992	5.400831521846828e-06	0.6974696910039622	-0.0003298789406529	0.5317311901974326	0.0031141401881761	0.5288275979469879	DRD2	54481	ANKK1	142392	TMPRSS5	176201	False	False	False	ref	45	0.003653	85	0.014755
631	chr11	113569572	G	A	rs115990434	-0.00376878468	0.6596350952938452	0.0042820277599999	0.6498374117577487	0.0073339090519166	0.7185983497387177	-2.920735468637535e-05	0.696608246162557	3.238777382504529e-05	0.6871818685090869	0.1880870133507608	0.6785824842564645	-0.0007546439077726	0.6721094054069956	0.0008537796452909	0.6623262714037407	0.0013924061950208	0.7232634531724798	-5.87234593443971e-06	0.6991812029794343	6.4866614808876415e-06	0.6896438194709467	-0.0032448469382462	0.4723843347732932	0.0038133175655348	0.4649501789388347	DRD2	93881	TMPRSS5	136801	ANKK1	181792	False	False	False	ref	70	0.001595	70	0.010086
632	chr11	113580177	A	G	rs59472562	0.0598298116	0.0156170078460272	0.0598298116	0.0165118237303041	0.0143765238286463	0.1011626176181331	0.0009255187146512	0.0168302144347854	0.0009255187146512	0.0176644065962332	0.3093372337887322	0.4798431109339449	0.0187922620023395	0.043893801382349	0.0187922620023395	0.0476444048774005	0.0044928303142779	0.17915812957246	0.0002924515607626	0.0305175717562678	0.0002924515607626	0.0326431062456444	0.0492204275977966	0.0060065752941124	0.0492204275977966	0.0061973371145681	DRD2	104486	TMPRSS5	126196	ANKK1	192397	False	True	False	alt	15	0.0002766	100	0.1164
633	chr11	113590958	C	A	rs11607834	-0.0020505117999999	0.6544546146831437	0.00379247208	0.6452813544309861	0.008663501765703	0.4801807107975333	-1.4940749654707174e-05	0.6506466029341806	3.2741505376100306e-05	0.641943200592464	0.3336217180676147	0.4379822319226931	-0.000706019867285	0.5558682136549109	0.0012859685490738	0.5462335471705942	0.0029031660186696	0.4268094909223862	-5.206897669835656e-06	0.5538557985142116	1.1133281285043196e-05	0.5447817756951638	-0.0013112169213372	0.5960358835235045	0.0026514797871346	0.5879917334536928	DRD2	115267	TMPRSS5	115415	ZW10	182777	False	False	False	ref	-100	0.002129	90	0.02908
634	chr11	113590995	C	G	rs11607852	0.01000257314	0.3439277652543125	0.01000257314	0.3553749737683509	0.0062095357792542	0.8847289414574704	6.372813355943197e-05	0.4559573450257451	6.372813355943197e-05	0.467413356761876	0.3409329972302616	0.427358609955852	0.0033565560685728	0.3130313325280189	0.0033565560685728	0.3249901087993631	0.0020931081893278	0.5878169880072817	2.107606902000827e-05	0.3933098859823327	2.107606902000827e-05	0.4054896110995618	0.0073797446031597	0.2724339525337783	0.0073797446031597	0.2805066512205069	DRD2	115304	TMPRSS5	115378	ZW10	182740	False	False	False	alt	-60	0.001749	100	0.05603
635	chr11	113633414	T	C	rs11605737	0.0064653157199999	0.5054069541247072	0.0064653157199999	0.5184752587842425	0.0114902131395318	0.2044225110840204	7.078026734424622e-05	0.4320544252802155	7.078026734424622e-05	0.4437118889365487	0.3084700048755692	0.4792283726144957	0.0021077663437673	0.4459008499134952	0.0021077663437673	0.4593521642212598	0.0035727340877533	0.30751470505049	2.312050285264295e-05	0.3920355630573478	2.312050285264295e-05	0.404583887343252	0.0043236963039035	0.4105126836987213	0.0043236963039035	0.4209369918230443	TMPRSS5	72959	ZW10	140321	CLDN25	146383	False	False	False	alt	-100	0.001736	70	0.0407
636	chr11	113633965	T	A	rs11606258	0.0128373151	0.2698880468977054	0.0128373151	0.2803764503570107	0.0125568604884914	0.1525017679961058	0.0001656511390166	0.1997930004735445	0.0001656511390166	0.2082942702052929	0.2256019253311756	0.6097863430380488	0.0030772692097812	0.3430151678230371	0.0030772692097812	0.3555054018845942	0.0028341200015264	0.4389180583048005	3.925782903989973e-05	0.2727491166086312	3.925782903989973e-05	0.2836427123404421	0.0117490845340719	0.1479113750095051	0.0117490845340719	0.1525333639648932	TMPRSS5	72408	ZW10	139770	CLDN25	145832	False	False	False	alt	-55	0.006325	95	0.02425
637	chr11	113648213	A	G	rs17532254	-0.00470703708	0.6005679143548994	0.00470703708	0.5874560310362448	0.0242293888377099	0.0110507523519555	-0.0001154323796493	0.3090059134364265	0.0001154323796493	0.2987280570431608	0.4154462183217668	0.3094071914207923	-0.0019422060055007	0.4607520732554547	0.0019422060055007	0.4473311615148326	0.0100343537822144	0.0127049974816218	-4.7412342011218174e-05	0.2463579439859652	4.7412342011218174e-05	0.2362462451531625	-0.0023423479496674	0.6302982440839243	0.0023423479496674	0.617610881860752	TMPRSS5	58160	ZW10	125522	CLDN25	131584	False	True	False	ref	-60	0.004707	100	0.02963
638	chr11	113649400	A	G	rs11602504	0.0614983268	0.0120776887346995	0.0614983268	0.0129629974696409	0.0329571200501171	0.0029758280281632	0.0020642136633359	0.00350180054612	0.0020642136633359	0.0036355409395215	0.5873940601043579	0.059181479017413	0.036049888035589	0.0077732228824061	0.036049888035589	0.0085164058783167	0.0192898609629152	0.0015047215960249	0.0012050728344958	0.0026858071100352	0.0012050728344958	0.0028266007812086	0.0104005228270002	0.1798830636014034	0.0104005228270002	0.1855846517476032	TMPRSS5	56973	ZW10	124335	CLDN25	130397	False	True	True	alt	100	0.01076	5	0.01428
639	chr11	113650237	C	T	rs61904990	-0.0051897996199999	0.5681900082490006	0.0051897996199999	0.555184789305589	0.0078977763291418	0.5893509443533598	-4.373593346813842e-05	0.5851092808169189	4.373593346813842e-05	0.5726003453109484	0.3675577547484931	0.386926449230836	-0.0019120434410291	0.4677454828677928	0.0019120434410291	0.4544511611736949	0.0029072173803557	0.4336902556461151	-1.615559549864191e-05	0.4836910672495547	1.615559549864191e-05	0.4708181377533532	-0.0033444330335376	0.5220030134276177	0.0033444330335376	0.5104271897667644	TMPRSS5	56136	ZW10	123498	CLDN25	129560	False	False	False	ref	60	0.0006466	100	0.02591
640	chr11	113651868	T	C	rs17610915	0.0361414448	0.0633741453932371	0.0361414448	0.0678672205047521	0.0088241147804068	0.4605066177999535	0.0003259245276852	0.0832766240714801	0.0003259245276852	0.0882421465495128	0.3109015653689354	0.4766013107989028	0.0110461484583139	0.1013576190127443	0.0110461484583139	0.1088848996259677	0.002688671443009	0.479595002859572	9.730758659055506e-05	0.114348531778149	9.730758659055506e-05	0.1217940654000494	0.0285957323208746	0.0326412708021175	0.0285957323208746	0.0335797982950269	TMPRSS5	54505	ZW10	121867	CLDN25	127929	False	False	False	alt	20	0.00139	-95	0.02963
641	chr11	113652332	T	G	rs61904994	0.0076153270799999	0.4184136910676885	0.0076153270799999	0.4307016295715286	0.0082903285824142	0.5111888639896887	6.399961360781748e-05	0.4319355508592911	6.399961360781748e-05	0.4438041276620238	0.2069212336227553	0.6332031331995776	0.0016442857980489	0.4752963230453727	0.0016442857980489	0.489111887367193	0.0017465194468385	0.6298166775152289	1.4022564891382291e-05	0.477138937900037	1.4022564891382291e-05	0.4905027210356069	0.0069565036981711	0.2692614737432945	0.0069565036981711	0.2771867257108202	TMPRSS5	54041	ZW10	121403	CLDN25	127465	False	False	False	alt	10	3.24e-05	55	0.02191
642	chr11	113653484	C	T	rs11600745	0.00110426612	0.6711926387431779	0.0036578528	0.6719413499043083	0.0068076384466997	0.8255675826056605	9.109356911701544e-06	0.7264645857358532	2.5517051872560324e-05	0.7273314420788589	0.0843846927872695	0.8475543296281137	9.087529576571892e-05	0.792318119597817	0.0003614286728794	0.7924987409606141	0.0005768497967822	0.8785408110118168	8.141747858896346e-07	0.8199009072195513	2.546535469774815e-06	0.8200886559752436	0.0004419132978557	0.5509612552524941	0.0029606116246018	0.551411370267009	TMPRSS5	52889	ZW10	120251	CLDN25	126313	False	False	False	alt	55	0.0031	-85	0.0199
643	chr11	113654447	C	T	rs73004093	-0.0611950284	0.013464830665356	0.0611950284	0.0127248769556415	0.0125171466327899	0.1478277763356673	-0.0007797932320892	0.0193780533903209	0.0007797932320892	0.0184117322117359	0.2288488469797404	0.6051253437465484	-0.0138661112277126	0.0840856307198727	0.0138661112277126	0.0780658136428616	0.0029147641324014	0.4003909874591374	-0.0001799744075137	0.0620885219245217	0.0001799744075137	0.0579690017054842	-0.0562993392047634	0.0024065302997736	0.0562993392047634	0.0023371401374445	TMPRSS5	51926	ZW10	119288	CLDN25	125350	False	True	False	ref	100	0.00416	-45	0.0058
644	chr11	113655426	C	T	rs11601890	0.0106547551	0.3409648033772779	0.0106547551	0.3522178571072814	0.0092934040732543	0.4051940592252525	0.0001129024950126	0.3365805270313116	0.0001129024950126	0.3470913469100279	0.0612060291081857	0.8872923078442055	0.0006167863683063	0.6802586141386204	0.0006167863683063	0.6943126016211895	0.000546303961117	0.8868865999239023	6.248505983223334e-06	0.6672851550379287	6.248505983223334e-06	0.6811343521938519	0.0068009004242782	0.2792952821361765	0.0068009004242782	0.2876926769736849	TMPRSS5	50947	ZW10	118309	CLDN25	124371	False	False	False	alt	90	0.00472	-40	0.006714
645	chr11	113656345	T	A	rs11601548	0.0065223629059999	0.4661469620454914	0.006662167334	0.4769680162762721	0.0067313977033593	0.8221114528301142	4.1535668326455126e-05	0.5605788442889962	4.269444349461168e-05	0.5707393373090395	0.5059533812591417	0.162124919791057	0.0032813734774889	0.3296682491266574	0.0033538042349967	0.3408350447741439	0.0034158669924253	0.3470714518308743	2.0925364432812128e-05	0.3968975540836643	2.15257099573844e-05	0.4076518330418834	0.0020498137947488	0.6331851546157535	0.002083009159846	0.6432455106651159	TMPRSS5	50028	ZW10	117390	CLDN25	123452	False	False	False	alt	10	0.0004997	20	0.03583
646	chr11	113656479	G	A	rs11607747	-0.100623922	0.0036458613019798	0.100623922	0.0034092632861897	0.0242121425806163	0.0147066405299474	-0.0028934420941513	0.0046324796989411	0.0028934420941513	0.0044061675633169	0.5572402203342357	0.0915193271133999	-0.0568077454351495	0.0030788132166245	0.0568077454351495	0.0028356101942428	0.0136571745969908	0.0064071466704938	-0.0016425934798836	0.0038532109388173	0.0016425934798836	0.0036112437786231	-0.0220271994522764	0.0678121373071099	0.0220271994522764	0.0659366097655758	TMPRSS5	49894	ZW10	117256	CLDN25	123318	False	True	True	ref	60	0.0065	60	0.07605
647	chr11	113663015	G	A	rs11603480	0.0337925538	0.0757775491979421	0.0337925538	0.0801287072299038	0.020930350728609	0.023198137762064	0.0007678737461925	0.0277546057302416	0.0007678737461925	0.0291385149308169	0.2038382140893577	0.6515339751502534	0.0071163548135499	0.1844453271644017	0.0071163548135499	0.1949290957591847	0.0042859054309239	0.2157927505394059	0.0001610900581354	0.0786689931019328	0.0001610900581354	0.0838063384487809	0.0338032552204898	0.0231726449473626	0.0338032552204898	0.0237776919649713	TMPRSS5	43358	ZW10	110720	CLDN25	116782	False	False	False	alt	-95	0.0101	100	0.04462
648	chr11	123401386	T	C	rs6590000	0.0180722864	0.1922359158043451	0.0180722864	0.2014693381084114	0.0082546035871451	0.5276059396417853	0.000152443432523	0.2209045409414303	0.000152443432523	0.2297181217499416	0.3791076670919823	0.3684480802566564	0.0068942051164849	0.1723522984171025	0.0068942051164849	0.1821767587575602	0.0031297063962812	0.3879073792537769	5.815551423827149e-05	0.1922703603774474	5.815551423827149e-05	0.2017462574912398	0.0108465855454931	0.1652074315721831	0.0108465855454931	0.1706632561058525	GRAMD1B	42957	CLMP	206095	SCN3B	253858	False	False	False	alt	85	0.00851	-75	0.007202
649	chr11	123504651	T	C	rs11219174	-0.0097520563199999	0.3659821481592332	0.01120032632	0.3575517783712448	0.00784195193987	0.6229388135080927	-7.834234394657378e-05	0.4084866679268552	8.888392967214063e-05	0.4005916374261618	0.3888048631209867	0.347395746771092	-0.0038726130475558	0.3017175791278497	0.0043392793362732	0.2932091130020516	0.003057145924133	0.4065270876753585	-3.102334225270123e-05	0.3314615372987465	3.4420086366307775e-05	0.3234478010416144	-0.0059315968007966	0.3411085379582779	0.0066411477297481	0.3351103869173529	GRAMD1B	146222	SCN3B	150593	ZNF202	237024	False	False	False	ref	100	0.007492	-65	0.05685
650	chr11	123528661	G	A	rs11601260	-0.1047496709999999	0.0027776825701774	0.1047496709999999	0.0026457621921754	0.0235983071070677	0.0149351072015013	-0.0028575991640332	0.0039108364491422	0.0028575991640332	0.0037380488879527	0.2010581022624715	0.6520986044810323	-0.0226847954003517	0.0372444872586549	0.0226847954003517	0.0348676826104635	0.0050502083136947	0.1431889608436053	-0.0006548713241702	0.0148863723087174	0.0006548713241702	0.014060583573454	-0.102783223892364	0.0003691580281495	0.102783223892364	0.0003601339308751	SCN3B	126583	GRAMD1B	170232	ZNF202	213014	False	True	True	ref	-95	0.001939	-95	0.01901
651	chr11	123533712	C	T	rs111454416	0.006527085764	0.510086684705493	0.006527085764	0.5234442543410844	0.0075041585193973	0.6765059747365278	4.7952902694000486e-05	0.563429659531942	4.7952902694000486e-05	0.5764364038461626	0.0644550254670691	0.8771073778314734	0.0004791223782615	0.7587738369502758	0.0004791223782615	0.7731002036198	0.0004864926306763	0.8893167882716171	3.593846019129108e-06	0.7753679448891749	3.593846019129108e-06	0.7896470384758918	0.0043465181174077	0.4333406775182345	0.0043465181174077	0.4438668270537166	SCN3B	121532	GRAMD1B	175283	ZNF202	207963	False	False	False	alt	-20	0.000725	85	0.02875
652	chr11	124565509	G	A	rs2212756	0.01046398824	0.3352130934514699	0.01046398824	0.3467804173174355	0.027950746674236	0.0056674961622416	0.0002956840746707	0.0996443085999361	0.0002956840746707	0.105297304172106	0.2968412535399745	0.500620058096215	0.0032275853974358	0.3343001281314928	0.0032275853974358	0.346311961147361	0.0084079988028136	0.0267351969532221	9.225956328299048e-05	0.1317655128323147	9.225956328299048e-05	0.1397600493172498	0.0079316175478998	0.2351605550815462	0.0079316175478998	0.242692109231275	OR8A1	1152	OR8B12	20176	PANX3	45920	False	True	True	alt	30	0.0019455	-50	0.0151
653	chr11	124569987	G	A	rs1942660	-0.0675195446	0.0095334197015499	0.0675195446	0.0090021516911761	0.0205200561597979	0.0239866859866577	-0.0013987948610859	0.007051373816465	0.0013987948610859	0.0068056889492354	0.2485253996410751	0.5771512445049803	-0.0166332151772438	0.0630852726236882	0.0166332151772438	0.0583390601771806	0.0051612633030919	0.1221279244265022	-0.0003497686664902	0.0234371602418037	0.0003497686664902	0.0218262599962915	-0.0616375688544486	0.0016357778032895	0.0616375688544486	0.0015972581702961	OR8A1	3326	OR8B12	24654	PANX3	41442	False	True	True	ref	-95	0.00502	70	0.02856
654	chr11	124770773	T	C	rs6590093	0.0019530931148	0.7951286547629061	0.0019530931148	0.808984007495893	0.0225501419952349	0.0157041483560093	4.297978720801986e-05	0.563490062249058	4.297978720801986e-05	0.5762917468305664	0.2185354619861201	0.6242474171056953	0.0004031129455122	0.7459766583820858	0.0004031129455122	0.7602911350872248	0.0049933786935638	0.1401421352515827	8.92341493615425e-06	0.5833786949321705	8.92341493615425e-06	0.5973812178515382	0.0017033371715473	0.6800945471577147	0.0017033371715473	0.6932712928056209	ESAM	8483	VSIG2	18518	MSANTD2	29933	False	True	False	alt	75	0.002243	-100	0.0691
655	chr11	124782170	A	G	rs11601322	0.0455102098	0.034521726964026	0.0455102098	0.0369237301648239	0.0096857799951238	0.3339594729263301	0.0004630132292379	0.0502102609873418	0.0004630132292379	0.0531999996274399	0.1044388427265842	0.799376484489066	0.0044359019790489	0.2668553890001942	0.0044359019790489	0.2789157218582317	0.0009622192184728	0.7856967775741854	4.434839064255382e-05	0.2521629783404617	4.434839064255382e-05	0.2632301244235157	0.0319775101401466	0.0191173792502948	0.0319775101401466	0.0197159585589126	MSANTD2	18536	ESAM	19880	VSIG2	29915	False	False	False	alt	100	0.001923	70	0.01416
656	chr11	126836666	T	G	rs7938753	-0.01199893174	0.3162902048823445	0.01199893174	0.3054061588844964	0.0269569106899199	0.0068263571828089	-0.0003176137019377	0.0954013934351035	0.0003176137019377	0.0903145844783564	0.1873733130011722	0.6792994840423698	-0.0022770056954697	0.4342399229805416	0.0022770056954697	0.4213283545434673	0.0050349062922708	0.1375000544939821	-6.010410733578919e-05	0.206277873207299	6.010410733578919e-05	0.1969299499279095	-0.0113735619664103	0.1680596117249428	0.0113735619664103	0.1629628128710439	KIRREL3	166794	ST3GAL4	481025	DCPS	532605	False	True	True	ref	-30	0.0003743	-95	0.02724
657	chr11	130848319	T	G	rs35274053	-0.00256564108	0.764990988734336	0.00256564108	0.7514363694766444	0.0287566125493283	0.005098961209358	-7.838840411826137e-05	0.435490802943014	7.838840411826137e-05	0.4242945722160482	0.3489953215282316	0.4225454303763584	-0.0009090422924971	0.6369452883480128	0.0009090422924971	0.6232170415996748	0.010075619651633	0.0127658060569565	-2.789475368761061e-05	0.38002172459852	2.789475368761061e-05	0.3682440513674109	-0.0017137107231402	0.7094292514802577	0.0017137107231402	0.6964260278017489	SNX19	68160	ADAMTS15	399673	ADAMTS8	419710	False	True	True	ref	-75	0.01437	-80	0.009705
658	chr11	130875082	G	A	rs10791102	-0.00789127192	0.4380836390076635	0.00789127192	0.4258602893255776	0.0084873946417767	0.5046191855105079	-6.665872250145616e-05	0.4538586443335015	6.665872250145616e-05	0.4425163295811952	0.3084637807446135	0.4814452451325989	-0.0024394426084257	0.4136361874377123	0.0024394426084257	0.4007987597820167	0.0026432283782423	0.4885598226530644	-2.0778102299728072e-05	0.4216233867352463	2.0778102299728072e-05	0.4094556961178917	-0.005856907229328	0.3327813274123719	0.005856907229328	0.3238807453647673	SNX19	41397	ADAMTS15	426436	ADAMTS8	446473	False	False	False	ref	-20	0.001148	-5	0.007996
659	chr11	130926783	C	T	rs10894286	-0.036857494	0.063730835303095	0.036857494	0.0597419445288639	0.0117424545087041	0.1833073278101786	-0.0004424190091386	0.055207588553471	0.0004424190091386	0.0520363141611759	0.4528905901513501	0.2456776643814519	-0.016670177688082	0.0629092074437351	0.016670177688082	0.0582168777915299	0.0052933645439876	0.1196700407687182	-0.0001988463129535	0.0537701032958497	0.0001988463129535	0.0501011700684565	-0.0156785858774467	0.1033288812415336	0.0156785858774467	0.1002933965329342	SNX19	10304	NTM	443696	ADAMTS15	478137	False	False	False	ref	55	0.005676	55	0.02002
660	chr11	130944198	A	G	rs11222406	-0.0018149002599999	0.76612835877947	0.00270206118	0.7576881309831834	0.0072416426759897	0.7443469412227409	-1.4901377609477188e-05	0.7917121024203239	2.0388829765465443e-05	0.7830768733660813	0.1826222263716428	0.6881151782543075	-0.0003468510497613	0.7413498561996665	0.0005200424897814	0.7328604450453152	0.0013359046928999	0.7351472632221757	-2.910285097956888e-06	0.7653797785597781	3.9815447803554906e-06	0.7568382366344097	-0.0017157854334588	0.5910571609641528	0.0026577039180903	0.5836116247386653	SNX19	27719	NTM	426281	ADAMTS15	495552	False	False	False	ref	-100	0.00406	-90	0.0185
661	chr11	131006455	G	A	rs10894307	0.006269226296	0.4999225716602132	0.006269226296	0.5128408686471629	0.0205850003789347	0.0239341483474982	0.0001392923552707	0.2774884128956979	0.0001392923552707	0.2874560471410798	0.086509196153487	0.8364649624684198	0.0004993614708369	0.712937023610605	0.0004993614708369	0.7270316758749282	0.0018230790340202	0.596619122536384	1.1146041376480868e-05	0.5443943104154919	1.1146041376480868e-05	0.5577248961098694	0.0049419599788379	0.3977367800614447	0.0049419599788379	0.4079151397124851	SNX19	89976	NTM	364024	ADAMTS15	557809	False	False	False	alt	10	0.001846	-45	0.02257
662	chr11	131022000	G	A	rs10894308	-0.00362390736	0.6920613630430276	0.00362390736	0.678820665136389	0.0166787120063615	0.0576558104222178	-5.5964568355426994e-05	0.5062844797323026	5.5964568355426994e-05	0.4943198923500652	0.0373862799406632	0.9349724109599392	-0.0001279626717639	0.9048597567982128	0.0001279626717639	0.8906727717551121	0.0006499840615892	0.8679671112937799	-2.056413147288536e-06	0.8441979652370054	2.056413147288536e-06	0.8299454483236539	-0.0017884002946088	0.7014563468119029	0.0017884002946088	0.688349949406507	SNX19	105521	NTM	348479	ADAMTS15	573354	False	False	False	ref	80	0.005096	70	0.01813
663	chr11	131287818	G	A	rs74349870	-0.0198632479	0.1995948873062456	0.0198632479	0.1905513709953026	0.0068655748631525	0.8166496996757912	-0.0001379242259438	0.2735102070296615	0.0001379242259438	0.2640750737348732	0.1155966348198632	0.7969490650507599	-0.0023737048399089	0.4285855094012209	0.0023737048399089	0.4157996584110593	0.0007979907839945	0.8370642139317648	-1.6547169859433996e-05	0.4841968978617634	1.6547169859433996e-05	0.4716594035949032	-0.0179068247595928	0.0921504304404404	0.0179068247595928	0.0895245042901476	NTM	82661	SNX19	371339	ADAMTS15	839172	False	False	False	ref	-20	0.001148	-95	0.02623
664	chr11	131509057	A	T	rs540409	-0.0055297312199999	0.5539465819358226	0.0055297312199999	0.54122930253313	0.0229826993452088	0.0146097966147481	-0.0001289426988729	0.2823844839501012	0.0001289426988729	0.27274676634915	0.216234608242824	0.632038178571583	-0.0011947535430703	0.5695526223519505	0.0011947535430703	0.5560013837693261	0.0049879471375877	0.1452793614957962	-2.797173037289957e-05	0.3546527345002558	2.797173037289957e-05	0.3432004648704525	-0.0051390574591022	0.3808220970006841	0.0051390574591022	0.3709175752757302	NTM	138578	SNX19	592578	ADAMTS15	1060411	False	True	False	ref	-75	0.0058	95	0.083
665	chr11	131511160	C	T	rs407056	-0.0043777853	0.644720381985754	0.0043777853	0.6315478907613854	0.0060626808032375	0.9402875984135972	-2.7018326544742253e-05	0.7336569627772734	2.7018326544742253e-05	0.7203312609324979	0.4636313654705961	0.2312479176154212	-0.0020220099276654	0.4725208826926857	0.0020220099276654	0.4594218339419565	0.0028071586328729	0.4593761138536033	-1.247336379553951e-05	0.5538648511363213	1.247336379553951e-05	0.5407614778829778	-0.0017220095644145	0.7132310647602682	0.0017220095644145	0.700199283647184	NTM	140681	SNX19	594681	ADAMTS15	1062514	False	False	False	ref	-80	0.0019455	-45	0.02808
666	chr11	131511952	T	C	rs408376	0.0569141758	0.0154251630551791	0.0569141758	0.0165886829475595	0.0134488525929838	0.1144960110730496	0.0007778888095385	0.0170249497312899	0.0007778888095385	0.0181712840643467	0.5834998288363986	0.062692387778246	0.0331519687355153	0.010085527048501	0.0331519687355153	0.0110224809355834	0.0078520094483395	0.031410667875332	0.0004535329406923	0.0125046363794754	0.0004535329406923	0.013432439163767	0.0098652475648086	0.1887715658165861	0.0098652475648086	0.1948017360149505	NTM	141473	SNX19	595473	ADAMTS15	1063306	False	True	False	alt	-50	0.003113	50	0.03345
667	chr11	131521018	A	G	rs12279734	-0.007513218136	0.4526352833165639	0.007513218136	0.4400423483724314	0.0060328252589923	0.9371061818727974	-4.460069701574247e-05	0.5640885572805127	4.460069701574247e-05	0.5516705113293546	0.3153041006649446	0.4712137299789611	-0.0025278673277136	0.4187164671515276	0.0025278673277136	0.4055362117809792	0.0018985251865398	0.6260275379164822	-1.4975956373527454e-05	0.5017571172923707	1.4975956373527454e-05	0.4887048764259869	-0.0057448728721252	0.3633756353461799	0.0057448728721252	0.3540500844314505	NTM	150539	SNX19	604539	ADAMTS15	1072372	False	False	False	ref	-80	0.01081	-100	0.03253
668	chr11	131525093	T	G	rs401560	0.0578413836	0.0155670655165249	0.0578413836	0.0167138087050565	0.0258452715380098	0.008213393243713	0.0015012698750124	0.0056597731431016	0.0015012698750124	0.0058901179179739	0.5212979387752984	0.1414115645973333	0.030149063694096	0.0138346541244486	0.030149063694096	0.0151346779015969	0.0134717290893393	0.0044963492318378	0.0007824303257381	0.0051424070880128	0.0007824303257381	0.0054341828153969	0.0162802518698326	0.0941977605226734	0.0162802518698326	0.0970558173075615	NTM	154614	SNX19	608614	ADAMTS15	1076447	False	True	True	alt	100	0.004105	100	0.11
669	chr11	131525401	C	T	rs390812	-0.0546751676	0.020752236706734	0.0546751676	0.0194388065952233	0.0127749332396604	0.1431341475939746	-0.0007442237789177	0.0254218276942833	0.0007442237789177	0.024049504951321	0.4742995259286921	0.2152704131915864	-0.0260734111230466	0.0240830436396148	0.0260734111230466	0.0221561488889878	0.0060895072682449	0.0818948238650396	-0.0003562085804353	0.0250924302885557	0.0003562085804353	0.0234054128730225	-0.0206163964356476	0.0624641667171199	0.0206163964356476	0.0608028420398885	NTM	154922	SNX19	608922	ADAMTS15	1076755	False	True	False	ref	30	0.00566	35	0.02197
670	chr11	131525893	G	A	rs378523	0.008667778	0.4016691926773961	0.008667778	0.4137871772570481	0.0197681737284369	0.0285482026283262	0.0001736567452238	0.2092279470936227	0.0001736567452238	0.2179292618762336	0.33936659093974	0.434073111631084	0.0030160016278354	0.3528230321541054	0.0030160016278354	0.3652541451172562	0.0067473716761505	0.0554801177416804	6.114831803172012e-05	0.1992086029573432	6.114831803172012e-05	0.209004797950202	0.0059253726698409	0.3330151981729444	0.0059253726698409	0.3424232564268569	NTM	155414	SNX19	609414	ADAMTS15	1077247	False	False	False	alt	70	0.001684	75	0.007202
671	chr11	131525976	C	G	rs451456	0.00512442844	0.5565456411598191	0.00512442844	0.5693706345282871	0.0060927568621568	0.9124450134464038	3.232179127327678e-05	0.6489103883741181	3.232179127327678e-05	0.6618468172997907	0.3036110333094741	0.4914609352666969	0.0015684679697062	0.4903540424842874	0.0015684679697062	0.5037901588660862	0.001843619136984	0.6360905464641289	9.840207261613466e-06	0.5647710102742101	9.840207261613466e-06	0.5781805282261857	0.0039253519227377	0.4513901200344101	0.0039253519227377	0.4625014735953945	NTM	155497	SNX19	609497	ADAMTS15	1077330	False	False	False	alt	95	0.001456	40	0.02724
672	chr11	131526164	T	A	rs405479	0.0078579458	0.4297179804541206	0.0078579458	0.4423835311176886	0.0055937533659705	0.976564013644545	4.372312822893879e-05	0.5621977859649857	4.372312822893879e-05	0.5749862218382593	0.2278841066816045	0.611057211375873	0.001772088220594	0.4708523787945142	0.001772088220594	0.484539708278891	0.0012743588236896	0.7401553351500569	9.839385073964914e-06	0.5628669139210931	9.839385073964914e-06	0.5764370633356218	0.0071141816823825	0.2812334939525688	0.0071141816823825	0.2894306551261776	NTM	155685	SNX19	609685	ADAMTS15	1077518	False	False	False	alt	65	0.0003076	35	0.02614
673	chr11	131526874	T	A	rs426913	0.00992023692	0.3575124054057552	0.00992023692	0.3690795305886218	0.019578604389509	0.0294716928656754	0.0001996035106273	0.1781151521402851	0.0001996035106273	0.1860993683633722	0.1998485461467442	0.6526689997397066	0.0018659642681619	0.4516536697211045	0.0018659642681619	0.4648595620158601	0.0037771378452692	0.2775324181165077	3.633700469538721e-05	0.2816331937641446	3.633700469538721e-05	0.2924776353025739	0.0090602599612028	0.219183082785846	0.0090602599612028	0.2258977910892033	NTM	156395	SNX19	610395	ADAMTS15	1078228	False	False	False	alt	-85	0.002235	100	0.04102
674	chr11	132507166	C	T	rs7119976	0.00105525506	0.7514238502783351	0.00244606798	0.7604589404853251	0.0266088424440724	0.0070196646710963	3.2832358097049e-05	0.4443374207048066	6.311969082422175e-05	0.4518465209040494	0.1520098756211163	0.7316655174567421	0.0001711759960505	0.7598812725093198	0.0003529502049192	0.7693271427866257	0.0041718766027311	0.21958858815103	5.368140780328259e-06	0.5653052544224165	9.326585422177752e-06	0.5744839007672233	0.0011182688617101	0.6129647292119402	0.0022386124337389	0.62090111807645	OPCML	1025335	NTM	1136687	SPATA19	1338372	False	True	True	alt	80	0.007797	-30	0.00731
675	chr11	132511185	A	G	rs7106636	0.00037732175	0.9076061551974328	0.0010388574219999	0.9098919448290768	0.0197970220828381	0.0290967295666409	5.944759270285924e-06	0.8260302574834173	1.6858559798325096e-05	0.8286817825044525	0.0417971140779468	0.927830891943809	1.5554693599102588e-05	0.9635784460911164	3.309756661227564e-05	0.9658893637985316	0.0009078561051324	0.8110838282778622	2.7349340601520415e-07	0.9385793954775168	5.62369390590691e-07	0.9409345034627454	0.0001639021151671	0.9001077554684664	0.0004834075042271	0.9023200971031772	OPCML	1021316	NTM	1140706	SPATA19	1334353	False	False	False	alt	100	0.007504	90	0.01158
676	chr11	132511627	G	A	rs2155540	0.00817895008	0.4115050246579119	0.00817895008	0.423778652553875	0.0284146174306152	0.005221697894749	0.0002467020950171	0.1295861192234403	0.0002467020950171	0.1361155687112206	0.0540399796678388	0.9058063569878412	0.0006040131749036	0.7184660306997509	0.0006040131749036	0.7327263045906183	0.0016724130605101	0.6133379513622295	1.9615898431380616e-05	0.4991579093711104	1.9615898431380616e-05	0.5127047069601105	0.0056120914117365	0.3849350616714863	0.0056120914117365	0.3945325067326781	OPCML	1020874	NTM	1141148	SPATA19	1333911	False	True	True	alt	-95	0.01001	-55	0.0327
677	chr11	132513517	T	C	rs4937706	-0.00437073846	0.6290600938565086	0.00437073846	0.6157103503049113	0.0149037970785577	0.0845758666991119	-7.01588514084384e-05	0.4695775718876441	7.01588514084384e-05	0.457879795260567	0.0342804385937613	0.940760390054986	-0.00018304219295	0.8841425564497353	0.00018304219295	0.8699250459551903	0.0005323885473187	0.8943978842090635	-3.0442130442732112e-06	0.8204717614963812	3.0442130442732112e-06	0.8062598806815866	-0.0022510606956503	0.6543147125654317	0.0022510606956503	0.6413788657794752	OPCML	1018984	NTM	1143038	SPATA19	1332021	False	False	False	ref	-80	0.002602	-90	0.03004
678	chr11	132514734	T	G	rs4310627	0.017765572	0.2117479668682344	0.017765572	0.2215697167922685	0.01038270803876	0.2678761194779927	0.0001896650215249	0.1818158497779524	0.0001896650215249	0.1899781786885169	0.2602392140997313	0.5620875445724958	0.0046893796120072	0.2554128780908613	0.0046893796120072	0.2672090820967153	0.0027214765518966	0.4592386994508666	5.049722263305062e-05	0.2286035862187079	5.049722263305062e-05	0.2391634742702924	0.0156619881948982	0.1161272044386441	0.0156619881948982	0.1195023643099278	OPCML	1017767	NTM	1144255	SPATA19	1330804	False	False	False	alt	-100	0.00177	-100	0.067
679	chr11	132515145	C	T	rs1939971	-0.001141367502	0.8728703291004327	0.0014544973419999	0.8658164347219205	0.0194745488356613	0.030089375778472	-2.1676164632916248e-05	0.7252410202937625	2.8506696551391013e-05	0.7184375178439694	0.2316538553304493	0.6082929661830853	-0.0002692863224018	0.8173684399478695	0.0003386628409582	0.8104944564218891	0.0044482313866054	0.1967275452934487	-5.0611089199873325e-06	0.6984953828881544	6.574470061853785e-06	0.6918421448617522	-0.0008734530441187	0.7820748952461073	0.0012469009014616	0.7752213559244479	OPCML	1017356	NTM	1144666	SPATA19	1330393	False	False	False	ref	65	0.000942	60	0.03204
680	chr11	132515155	T	C	rs1939970	0.004307499164	0.6370937185398464	0.004307499164	0.6511878741640931	0.0135934418940254	0.1126002866506292	5.915048259625329e-05	0.5218793764608303	5.915048259625329e-05	0.5348180164804798	0.2328986815215925	0.6062354780973358	0.0010590885594	0.6246502051966482	0.0010590885594	0.6393697089368412	0.0031496610775333	0.3853357276366716	1.4547124298909647e-05	0.5325321821725092	1.4547124298909647e-05	0.5464703572038863	0.0035996224027219	0.4831635819173403	0.0035996224027219	0.4942334685787401	OPCML	1017346	NTM	1144676	SPATA19	1330383	False	False	False	alt	55	0.0005608	50	0.03
681	chr11	132520056	G	A	rs644487	-0.00908532818	0.4231806247288654	0.00908532818	0.4107954700146841	0.0092484397629015	0.3858541722752708	-8.777921520084048e-05	0.410306328901197	8.777921520084048e-05	0.398998242538266	0.1375470699903525	0.7626182064566732	-0.0013000773619578	0.5781894801889286	0.0013000773619578	0.5643247000562702	0.0012895632505933	0.7447535267643172	-1.2572151368466295e-05	0.5633695460884341	1.2572151368466295e-05	0.5499512417089709	-0.0087158580483199	0.2459031105933168	0.0087158580483199	0.2394012123820376	OPCML	1012445	NTM	1149577	SPATA19	1325482	False	False	False	ref	-85	0.001932	-100	0.05084
682	chr11	132520069	C	G	rs644475	-0.00416016862	0.6279585200548371	0.00416016862	0.6144845352011916	0.008101457453048	0.560784218912625	-3.3510031430527644e-05	0.6530382115743557	3.3510031430527644e-05	0.64005795985663	0.1333665286984304	0.7696698806978756	-0.0005509781618466	0.7212566290980654	0.0005509781618466	0.7070664277182279	0.0010796699638066	0.7830716663233065	-4.461759219698827e-06	0.7342368664890444	4.461759219698827e-06	0.7201092315535619	-0.0045000466809821	0.4396754093460301	0.0045000466809821	0.4292651675092802	OPCML	1012432	NTM	1149590	SPATA19	1325469	False	False	False	ref	-100	0.001654	-40	0.05402
683	chr11	132520341	T	C	rs654125	3.331847999999988e-06	0.7987400000504403	0.001923081368	0.8035976802186763	0.0095420600963542	0.357863996337231	-1.1452022759291235e-06	0.7701334316116931	1.924711860223661e-05	0.7747140413363983	0.0511374599321569	0.9099213810077638	-2.0968166208531177e-05	0.9018575797936252	9.973783429566882e-05	0.906791199802444	0.0004935078448203	0.9002050930595176	-2.675436683264053e-07	0.8928498000326053	1.0072684592634591e-06	0.8977577610854616	5.8091888920000064e-05	0.7551043465648202	0.001273872135603	0.7596877837777003	OPCML	1012160	NTM	1149862	SPATA19	1325197	False	False	False	alt	100	0.01529	65	0.01107
684	chr11	132520659	T	C	rs10894572	0.0325971128	0.0862569587287678	0.0325971128	0.0915891102072979	0.0095419248830087	0.3493048666567902	0.0003325754608374	0.0968859233890998	0.0003325754608374	0.1021168607462157	0.0294297658689404	0.9492662789905848	0.0011781660292361	0.5933516017258367	0.0011781660292361	0.6069205097713868	0.000301061148854	0.9405697759103318	1.2506099870325751e-05	0.5676180252232113	1.2506099870325751e-05	0.580689384185172	0.0131640369713378	0.1633272917977506	0.0131640369713378	0.1679811998289971	OPCML	1011842	NTM	1150180	SPATA19	1324879	False	False	False	alt	-75	0.005608	25	0.01044
685	chr11	132521327	T	G	rs639254	-0.001540846502	0.8398736262805516	0.001576411418	0.8314406624328895	0.0075253435944578	0.6872567282880483	-1.1392109577409204e-05	0.8550403694959748	1.1643869295674932e-05	0.8468931440661378	0.0463801491716718	0.9189348856140036	-4.354478727449758e-05	0.9535319619031832	4.5758025270126254e-05	0.9457092411016326	0.0003531610807625	0.9294044080215528	-3.287390811535037e-07	0.9578356055100808	3.444063240696763e-07	0.9500408401077296	-0.0006473096193943	0.8669327298798856	0.0006763555638543	0.8587877134583706	OPCML	1011174	NTM	1150848	SPATA19	1324211	False	False	False	ref	-30	0.001425	10	0.009155
686	chr11	132521983	T	A	rs2508976	-0.00667552758	0.5076988552800659	0.00667552758	0.4946596155045082	0.0058464342898235	0.9520158499089998	-3.846658952898502e-05	0.6343584971357787	3.846658952898502e-05	0.6214252796301721	0.0315293727113351	0.942173875322943	-0.0002301827583153	0.8585707762690187	0.0002301827583153	0.8442159440324518	0.0001797575730761	0.9606668297741342	-1.2982598235222534e-06	0.8971025638765243	1.2982598235222534e-06	0.8828089550417525	-0.0032448469382461	0.5387869940054898	0.0032448469382461	0.5269858529270081	OPCML	1010518	NTM	1151504	SPATA19	1323555	False	False	False	ref	-100	0.09564	-95	0.0332
687	chr11	132524230	T	C	rs2509229	-0.01242689122	0.3165960958261362	0.01242689122	0.3054607666905675	0.010215007027909	0.2828993750959208	-0.000126374612394	0.2936949563993677	0.000126374612394	0.2839397527299704	0.2323800039419495	0.6005468783400739	-0.0031026834375676	0.3725361733534191	0.0031026834375676	0.3600725480233541	0.002317426104133	0.5504620841989746	-3.1074405397263374e-05	0.3531173446856142	3.1074405397263374e-05	0.3416429621574157	-0.011074803680536	0.1859195330694592	0.011074803680536	0.180460123050523	OPCML	1008271	NTM	1153751	SPATA19	1321308	False	False	False	ref	40	0.001158	-30	0.00958
688	chr11	132527297	C	A	rs2509228	0.00344646538	0.6181105935600896	0.00402781866	0.6268791905311071	0.0205422725169736	0.023863667658918	7.57600510359103e-05	0.3833112967211585	8.656420636532813e-05	0.3914983373346015	0.1053081463500658	0.8172511899312349	0.0003832088660099	0.7460932447270205	0.0004303025900096	0.7545561667242902	0.0021619212571112	0.5655450900771154	8.430802442305543e-06	0.5900665810721257	9.3060153487405e-06	0.598840315315115	0.0033216112200333	0.4767393851193978	0.0037241050218362	0.4844536532296151	OPCML	1005204	NTM	1156818	SPATA19	1318241	False	False	False	alt	75	0.002357	-95	0.05148
689	chr11	132528266	C	G	rs2512706	0.000167181588	0.6806581864947384	0.003534662252	0.6828013769448039	0.0075174592868436	0.680473047896948	-6.382788760307293e-07	0.7029054615902115	2.734998084271929e-05	0.7047877340364829	0.1233373790184545	0.7839218071513749	3.418815958448844e-05	0.7482997857070678	0.0004671994390715	0.750798838559597	0.0009329359882169	0.8079834554335613	1.181965240320302e-08	0.7629127073377787	3.6181502676070673e-06	0.7653703683773625	0.0006265625162086	0.502043414643465	0.0033527318748119	0.5043343084034786	OPCML	1004235	NTM	1157787	SPATA19	1317272	False	False	False	alt	65	0.004093	25	0.00831
690	chr11	132537875	C	T	rs55945016	-0.00398049622	0.6732922748158708	0.00398049622	0.6596526716215996	0.0060257718087765	0.9415711227364252	-2.4577246655602883e-05	0.7560287865509394	2.4577246655602883e-05	0.7424799184254987	0.012693077729022	0.9795119267192004	-5.359715888532395e-05	0.961713716475041	5.359715888532395e-05	0.9481117500291872	7.924983046757938e-05	0.9854595784450132	-3.3761800889847374e-07	0.9723282898339932	3.3761800889847374e-07	0.9598482856870664	-0.0008838265957115	0.8459560038095775	0.0008838265957115	0.832108944468659	OPCML	994626	NTM	1167396	SPATA19	1307663	False	False	False	ref	-100	0.007694	-85	0.0056
691	chr11	132542227	A	G	rs73035374	-0.00629567288	0.5465092510007474	0.00629567288	0.5337230503136908	0.0075010719702932	0.6872808429598881	-4.818196034082109e-05	0.5936404121679403	4.818196034082109e-05	0.58129254066181	0.151653025446322	0.7207597011056399	-0.000787289527579	0.6803265031168045	0.000787289527579	0.6663134641138797	0.0010980212698926	0.7616427557470646	-5.844105134906774e-06	0.7065077691167126	5.844105134906774e-06	0.692622847222223	-0.0051950746377036	0.4101939835933231	0.0051950746377036	0.4001447940381545	OPCML	990274	NTM	1171748	SPATA19	1303311	False	False	False	ref	60	0.00454	75	0.005836
692	chr11	132659602	C	T	rs6590647	0.00284872086	0.6416431610690805	0.00378541026	0.6498282399200349	0.0180654611015983	0.0400571187764962	5.445127616821687e-05	0.4294016825293575	6.92717566506842e-05	0.4369826107967503	0.1740453739146671	0.7021809703812886	0.0005619241556041	0.6647040855678492	0.0006885728741921	0.673092175445086	0.0031744869275224	0.3860449137394312	1.0710463898752964e-05	0.5178992391437185	1.271432433930192e-05	0.5262722275738424	0.0030353011960704	0.4707901865208281	0.0036992084980134	0.4781187008555664	OPCML	872899	SPATA19	1185936	NTM	1289123	False	False	False	alt	-30	0.0007935	15	0.00592
693	chr11	132692230	A	C	rs3862599	0.0618707617999999	0.0135458768800562	0.0618707617999999	0.0144215360060883	0.0165889796974546	0.0585465816749741	0.0011282536924195	0.0124099535559892	0.0011282536924195	0.0131121777473627	0.3596551831450533	0.3945049325292002	0.023681362093354	0.0292722784186305	0.023681362093354	0.0317167253869931	0.0062403165004057	0.0804863647558082	0.0004460626693108	0.0191333433141072	0.0004460626693108	0.0204481607549962	0.0391497837114492	0.0103948376430036	0.0391497837114492	0.0106759958422051	OPCML	840271	SPATA19	1153308	IGSF9B	1264738	False	True	False	alt	95	0.002213	-90	0.04248
694	chr11	132692599	G	A	rs3018396	-0.00365340414	0.6791734170440356	0.0039001121	0.6709599584822707	0.018235592756195	0.0397133885230293	-6.285242326636688e-05	0.4787402953421236	6.768950156557467e-05	0.4708896944828384	0.306887000902499	0.4810911020687961	-0.0011382496375046	0.597862055547722	0.0011905988447287	0.5892479445129364	0.0056775143408146	0.1080913313880788	-2.006567473071193e-05	0.4441403783727067	2.1092059201612e-05	0.4359466893688165	-0.002431560493366	0.5889052318214021	0.0026473303664975	0.5813692606182769	OPCML	839902	SPATA19	1152939	IGSF9B	1264369	False	False	False	ref	-70	0.00496	-65	0.0318
695	chr11	132698231	C	T	rs1940148	-0.00233610514	0.6834328445527446	0.00353131546	0.6756746098218841	0.0072788387001403	0.7377344703319395	-1.7186768459687388e-05	0.7205681795418564	2.563693185027249e-05	0.7129647114647533	0.0500793576696853	0.910102631500178	-0.0001081777653122	0.8720521211037026	0.0001613552570527	0.8641878998620885	0.0003631573833481	0.9237466475369392	-7.855197297578869e-07	0.8855976255666279	1.1614857748643665e-06	0.8776851434951141	-0.0015539580286102	0.6380838599358108	0.0021763711241817	0.6307596330575632	OPCML	834270	SPATA19	1147307	IGSF9B	1258737	False	False	False	ref	-100	0.0385	100	0.01913
696	chr11	132702875	A	G	rs1939515	0.0454236466	0.0345738659984552	0.0454236466	0.0370907362680545	0.0115657548296282	0.1953035135576881	0.0005443155602987	0.0361241929940453	0.0005443155602987	0.0385761234347755	0.1379703108953412	0.7607347861886038	0.0064166498335388	0.1931406437566971	0.0064166498335388	0.2033586287194223	0.0015986874628328	0.6853033330873247	7.674082227816556e-05	0.158979744365374	7.674082227816556e-05	0.1678297447801449	0.041485907530161	0.0081565620255345	0.041485907530161	0.0083637433575234	OPCML	829626	SPATA19	1142663	IGSF9B	1254093	False	False	False	alt	100	0.010376	-95	0.02722
697	chr11	133863969	T	C	rs7946883	0.021060889	0.1623539575061146	0.021060889	0.1708484131787799	0.0128544263444133	0.1392494348685574	0.0002725836927352	0.1096402285292621	0.0002725836927352	0.1156550300245979	0.5370491395138954	0.1193624873538224	0.0113734911045886	0.0987894742000787	0.0113734911045886	0.1062313704929506	0.0069131026151808	0.0511185292211888	0.0001474148271292	0.071713741661355	0.0001474148271292	0.0770901932169761	0.0052116723202522	0.3564239934443464	0.0052116723202522	0.3661699266082696	SPATA19	18431	IGSF9B	92999	JAM3	205103	False	False	False	alt	-55	0.00479	100	0.0642
698	chr11	133951249	G	A	rs118031494	0.00304714288	0.4737819091774578	0.00667092984	0.4770797173556065	0.0080202108076412	0.584330166958108	2.821538431582078e-05	0.5118119746607489	5.221607181750708e-05	0.5152644945505052	0.6667206091349496	0.0167165320405613	0.0020774131858572	0.2677203733056725	0.0044669167239043	0.2711401512951896	0.0053552890120676	0.119079516012335	1.9233176037873908e-05	0.2951775840289093	3.507133547327911e-05	0.2984734093510323	0.0002925341549186	0.8499810345977908	0.00071162563927	0.8524550437473032	IGSF9B	5719	SPATA19	105711	JAM3	117823	False	False	False	alt	95	0.001362	-85	0.04016
699	chr11	133952238	G	A	rs73034295	-0.0705032256	0.0081785854833825	0.0705032256	0.0077284219825295	0.0129042576579085	0.136524016867728	-0.0009420681242625	0.0154228052080402	0.0009420681242625	0.0146558061720828	0.5445533667361694	0.1074131952552054	-0.0384883046870076	0.007424724590883	0.0384883046870076	0.0068503417286729	0.0070505367221951	0.0487090986921227	-0.0005153058549487	0.0127340311721979	0.0005153058549487	0.0119660549076487	-0.017896451208	0.0903682216481018	0.017896451208	0.0877526960525816	IGSF9B	4730	SPATA19	106700	JAM3	116834	False	True	True	ref	-80	0.00178	-80	0.1256
700	chr11	133970261	C	T	rs73036081	0.00966168154	0.3609461191930247	0.00966168154	0.3727425199716089	0.0092571612124803	0.3982833302281185	9.1834723532675e-05	0.364369329003432	9.1834723532675e-05	0.3750092576833845	0.45258560773452	0.2515793447782757	0.0043331421893282	0.2660672980853859	0.0043331421893282	0.2774727348283919	0.0041700785086063	0.2337553029592116	4.097113196610287e-05	0.2636613563663829	4.097113196610287e-05	0.2743423151707671	0.0043485928277263	0.4285150556385045	0.0043485928277263	0.4393394157438308	IGSF9B	13293	JAM3	98811	SPATA19	124723	False	False	False	alt	-85	0.0006695	60	0.0441
701	chr11	133972812	G	A	rs11223655	-0.0358418736	0.0710612998635135	0.0358418736	0.0669172179594913	0.0094107926318447	0.3707845591135902	-0.0003457898581407	0.086948027157789	0.0003457898581407	0.0823388446581475	0.5395616137096859	0.1161660295605396	-0.0193017342769831	0.0488643856643932	0.0193017342769831	0.0451450998848445	0.0050717987968813	0.1376038213072384	-0.0001859805715267	0.0616966727079062	0.0001859805715267	0.0575391809437687	-0.0092220873660514	0.2279626569174192	0.0092220873660514	0.2212851777183117	IGSF9B	15844	JAM3	96260	SPATA19	127274	False	False	False	ref	-100	0.002728	-10	0.009705
702	chr11	133983113	C	T	rs4936216	-0.0700248938	0.0097504855680629	0.0700248938	0.009245606319541	0.0157505456871465	0.067315934813424	-0.0011560725060882	0.0118846437103895	0.0011560725060882	0.0113244668698278	0.6065540098963682	0.0423465049826232	-0.0426896952928372	0.0059846075578926	0.0426896952928372	0.0056003644920848	0.0095780877287957	0.0163390661279856	-0.0007067186311403	0.0083999450445494	0.0007067186311403	0.0079332994665101	-0.0087449039927799	0.2278750607018214	0.0087449039927799	0.2210379233943625	IGSF9B	26145	JAM3	85959	SPATA19	137575	False	True	True	ref	100	0.006897	60	0.0674
703	chr11	134100320	T	C	rs470536	0.0162988037	0.2141119141982974	0.0162988037	0.2239094976718496	0.0077293440613782	0.6494179503768697	0.0001256821814697	0.2596603644217776	0.0001256821814697	0.2692455756358721	0.2577495617174452	0.5659156409622151	0.0042129515068998	0.2623391931210234	0.0042129515068998	0.2737660622107757	0.0019853213297886	0.6101165730053537	3.2381596954190825e-05	0.2941707774545201	3.2381596954190825e-05	0.3052657649148431	0.0144316849759851	0.1162268738469676	0.0144316849759851	0.119903845222935	JAM3	31248	VPS26B	124352	NCAPD3	125184	False	False	False	alt	-95	0.015015	-50	0.016
704	chr11	134111740	G	A	rs626717	-0.00186673858	0.6973576008317095	0.00331569482	0.691737233915715	0.0244394987896072	0.0106466798976658	-3.613262054049334e-05	0.3991143155697801	7.820420063989334e-05	0.3949907028154512	0.1530140354153051	0.7347539075917616	-0.0003048639533569	0.7245823301862776	0.0005227657821601	0.7185463227566675	0.0037317045851201	0.283683095356176	-5.995248020586283e-06	0.5267277637627444	1.232219847340702e-05	0.521517450923258	-0.001419101857903	0.5176438988760043	0.0032365480969719	0.5123973396286622	JAM3	42668	VPS26B	112932	NCAPD3	113764	False	True	False	ref	40	0.00177	-55	0.01996
705	chr11	134128003	A	G	rs470713	0.00802892922	0.4345297431255453	0.00802892922	0.4472204580271001	0.0081621846527263	0.5554059081422059	6.480366260132183e-05	0.4725009019893292	6.480366260132183e-05	0.4844913315682511	0.1846326206703388	0.6791862787053186	0.0014398802666673	0.5226111817822762	0.0014398802666673	0.5364091080993525	0.0015110077724989	0.6937400807837056	1.1669153049482469e-05	0.5406361219548039	1.1669153049482469e-05	0.5540716651380324	0.0072988309007354	0.276749687803043	0.0072988309007354	0.2846534330383754	JAM3	58931	VPS26B	96669	NCAPD3	97501	False	False	False	alt	-30	0.00322	75	0.01474
706	chr11	134171989	C	T	rs10736610	0.00414259756	0.4992077443269906	0.0062310771599999	0.5070083421450841	0.008690414573553	0.468340416639275	3.728957315662515e-05	0.5037626563562959	5.46579357063392e-05	0.5110289700441656	0.4624985736366559	0.2264178224296651	0.0018554373279516	0.3553235507465399	0.0028891587504647	0.3627595150796907	0.0040055588831998	0.2496276881402018	1.6649539010816855e-05	0.3606208056303763	2.524624697144981e-05	0.3675747278140013	0.002010394298696	0.5793483270713093	0.0026411062355418	0.5866771782073308	VPS26B	52683	NCAPD3	53515	THYN1	81381	False	False	False	alt	100	0.001742	35	0.02017
707	chr11	134177781	G	A	rs11223722	-0.0002306699279999	0.7703893925699598	0.002157804832	0.770295556302349	0.0058513903979584	0.9547387817986864	-8.234768233320427e-07	0.8337985480125534	1.2654431722812926e-05	0.8344845251936083	0.2658596043527422	0.5488448515397104	-3.0089330394679984e-05	0.715743925580055	0.0005178010047913	0.7158873068456738	0.0015460820681764	0.6935105708684579	-5.6536269816460544e-08	0.7704146313067101	3.0351769312546232e-06	0.7710589814366372	-0.0007427462940487	0.6383321471478965	0.0021162045249431	0.6385186874598708	VPS26B	46891	NCAPD3	47723	THYN1	75589	False	False	False	ref	100	0.02109	65	0.02411
708	chr11	134178248	G	T	rs10894782	-0.0312254184	0.097788250721682	0.0312254184	0.0923200167347249	0.0115706149133519	0.2000313475155077	-0.0003899126873228	0.0790581344745231	0.0003899126873228	0.0749600887603114	0.3004927437006607	0.4959863015671298	-0.0098182142494384	0.1409672083067193	0.0098182142494384	0.1325800851460951	0.0035558544837813	0.3188112397393559	-0.0001256802941154	0.1132125357728342	0.0001256802941154	0.1067567610864575	-0.0237699561198767	0.0486578657281964	0.0237699561198767	0.0474239634068226	VPS26B	46424	NCAPD3	47256	THYN1	75122	False	False	False	ref	-100	0.04523	-100	0.03235
709	chr11	134225779	C	T	rs523621	-0.0589202163999999	0.0160325680656129	0.0589202163999999	0.015015296373772	0.0120761692094257	0.1659987832138779	-0.0007245566612963	0.0232674376011492	0.0007245566612963	0.0219414054587583	0.6276766356497474	0.0294292759330612	-0.0370227298150016	0.0083774763569177	0.0370227298150016	0.007744996254496	0.0075947802113829	0.0372343275641601	-0.000456153200496	0.01470978929459	0.000456153200496	0.013790544592933	-0.0057490222927623	0.3362977528719355	0.0057490222927623	0.3270514224508915	NCAPD3	275	VPS26B	1107	THYN1	27591	False	True	False	ref	100	0.01483	-80	0.12146
710	chr11	134229207	T	G	rs543528	-0.00350108664	0.6639098490513902	0.00394098816	0.6551572835452832	0.0274622478270693	0.0062730382068323	-0.0001026748210752	0.3565460613258881	0.0001117848974496	0.3489132315126005	0.3713046815838338	0.3797005819867678	-0.0013221206120432	0.5511626435920814	0.0014936429106759	0.542043182084748	0.0101343413950782	0.0127761139859	-3.887746690663385e-05	0.3084220920857395	4.242958301452745e-05	0.3002274565240578	-0.0022054170686417	0.6258094579572525	0.002417037521136	0.6180027015300869	NCAPD3	3703	VPS26B	4535	THYN1	24163	False	True	True	ref	-100	0.0754	-65	0.0559
711	chr11	134578234	G	T	rs7936986	-0.0342029488	0.0782042691188303	0.0342029488	0.0734778989170377	0.0146079458973546	0.0847553822804379	-0.0005079716431275	0.0427383158689435	0.0005079716431275	0.040196304202312	0.5607381819313478	0.088603726769695	-0.0192141491510278	0.0478427758315731	0.0192141491510278	0.0440979064591782	0.0082066118754291	0.0270031066247131	-0.0002859429592703	0.030867953768429	0.0002859429592703	0.0286609229750026	-0.0071079575514268	0.2755212804512537	0.0071079575514268	0.2674325814539784	B3GAT1	165992	GLB1L2	246245	GLB1L3	303988	False	False	False	ref	-90	0.005486	-90	0.01312
712	chr11	134598569	G	A	rs10894852	-0.0368142464	0.0642128179250806	0.0368142464	0.0607152579791047	0.0167564550113495	0.0582971955057042	-0.0006965897349185	0.0357755232726414	0.0006965897349185	0.034200119921704	0.4148528511706552	0.3095488858928929	-0.0154246839808631	0.073462735147008	0.0154246839808631	0.068690259500895	0.006981992230688	0.0520331229214637	-0.0002926923906769	0.0389765512217723	0.0002926923906769	0.0368336732152475	-0.0199338167408375	0.0794704428927059	0.0199338167408375	0.0773422135355819	B3GAT1	186327	GLB1L2	266580	GLB1L3	324323	False	False	False	ref	-90	0.0014	-100	0.01416
713	chr11	134629212	T	C	rs7122771	0.0206866932	0.1586276471153941	0.0206866932	0.1671004432603351	0.008947844317576	0.4239164289007475	0.0001852187865414	0.1697988165785884	0.0001852187865414	0.1777197728797956	0.2459444600047718	0.5815715477354617	0.0053065202345916	0.2241748328346489	0.0053065202345916	0.2350933709298987	0.002202852140125	0.5642832035647248	4.749846776469439e-05	0.2291515651235157	4.749846776469439e-05	0.2392240397977352	0.0181246693430429	0.0767563308849292	0.0181246693430429	0.0789952770302984	B3GAT1	216970	GLB1L2	297223	GLB1L3	354966	False	False	False	alt	-70	0.00644	-20	0.001068
714	chr11	134634166	T	G	rs4343039	0.010814421	0.3226613649024697	0.010814421	0.3339538866683298	0.0124432917134431	0.1542839478873307	0.000140660929118	0.2483624164954952	0.000140660929118	0.257737362532034	0.1563999626552142	0.7285923627809718	0.0017255797880976	0.4677300498490887	0.0017255797880976	0.4811113063283705	0.0019644296632406	0.6156107643157364	2.2559580857396736e-05	0.3900169170798092	2.2559580857396736e-05	0.4021794981621057	0.0104938847913359	0.1745950697241949	0.0104938847913359	0.1801279093505787	B3GAT1	221924	GLB1L2	302177	GLB1L3	359920	False	False	False	alt	95	0.005913	-45	0.01752
715	chr11	134634720	G	A	rs2187466	-0.0281242938	0.1194142146985525	0.0281242938	0.1129183312106217	0.0083930579842528	0.5193024875880395	-0.0002411611244956	0.1457654235472519	0.0002411611244956	0.1390046757028153	0.3102376580669924	0.479078051044958	-0.0085865481825868	0.1551549541269823	0.0085865481825868	0.1463083922241928	0.0025956696098312	0.4959667015349988	-7.329904656323302e-05	0.1722772366369458	7.329904656323302e-05	0.1638073663540051	-0.0222491934563635	0.0620697746286453	0.0222491934563635	0.060338820798446	B3GAT1	222478	GLB1L2	302731	GLB1L3	360474	False	False	False	ref	-30	0.001125	10	0.01138
716	chr11	134636158	T	C	rs3019649	0.0517663444	0.0215087261156956	0.0517663444	0.0230582936135191	0.0100553545280549	0.2981590560290947	0.0005256280934098	0.0349346563816123	0.0005256280934098	0.0372511286273295	0.5630016908889097	0.0861413099053701	0.0291668158168963	0.0144710742762933	0.0291668158168963	0.0158968404328052	0.0056624985502927	0.0953926061854055	0.0002962291966379	0.0245489991385494	0.0002962291966379	0.0265331974545644	0.0105768732040788	0.1654847912502341	0.0105768732040788	0.1709666027829692	B3GAT1	223916	GLB1L2	304169	GLB1L3	361912	False	False	False	alt	-20	0.001255	95	0.03015
717	chr11	134637729	C	T	rs3019651	-0.0540150318	0.0220052617662876	0.0540150318	0.0206642270000412	0.0124663597176326	0.1468567900237913	-0.0006733037396846	0.0244423181006173	0.0006733037396846	0.0230066452967465	0.3991057998526955	0.3376774083831615	-0.0215155781862105	0.0382321364622901	0.0215155781862105	0.035226988266902	0.0049525452752855	0.1449487378949251	-0.000266910542584	0.0331597696991774	0.000266910542584	0.0308909946348898	-0.0320273031877923	0.0234840363272657	0.0320273031877923	0.0228414691538211	B3GAT1	225487	GLB1L2	305740	GLB1L3	363483	False	False	False	ref	85	0.001373	95	0.03745
718	chr11	134639072	T	C	rs3019652	-0.0066470147999999	0.4656894177338985	0.0076013479999999	0.4563263562140915	0.0068493398326782	0.8218500415610321	-4.851421112636748e-05	0.5447248772672137	5.422271366132906e-05	0.5356321494214001	0.3876451000529051	0.3538504748669724	-0.0026154963227526	0.3778067176330794	0.0029539614385968	0.3686759880989739	0.0026495606186491	0.4878243436178208	-1.896743757074112e-05	0.4352797620623517	2.099202281714204e-05	0.4262616256328416	-0.0037137314702434	0.4427719431555846	0.0043610410896378	0.4351473851848588	B3GAT1	226830	GLB1L2	307083	GLB1L3	364826	False	False	False	ref	100	0.004734	-5	0.01068
719	chr11	134649712	C	A	rs2226892	-0.00407204272	0.6589531590798381	0.00407204272	0.6455403178325284	0.0118896262248139	0.1792210448800863	-4.69338450292158e-05	0.5722204615044816	4.69338450292158e-05	0.5596313719526435	0.036529424579093	0.9320619274454836	-0.0001518493981353	0.8936616202871894	0.0001518493981353	0.879439349477884	0.0004180358088073	0.9084803199798864	-1.6665787092937424e-06	0.8664924486293664	1.6665787092937424e-06	0.8521906619242784	-0.0019440035685016	0.6797291896352575	0.0019440035685016	0.6669066157809445	B3GAT1	237470	GLB1L2	317723	GLB1L3	375466	False	False	False	ref	0	0.0	55	0.03952
720	chr11	134654769	A	C	rs3018003	0.0131112289599999	0.282646082851954	0.0131112289599999	0.2938500978379916	0.0115272887341998	0.1933747383837668	0.0001432257634451	0.2320214582421844	0.0001432257634451	0.2414089111581103	0.5371445761885496	0.1194329298053549	0.007002281326936	0.1780652882156237	0.007002281326936	0.1882211019576089	0.006191615318297	0.0719278608192854	7.653910754439346e-05	0.149156603171482	7.653910754439346e-05	0.1577873248017074	0.0032075021525119	0.5048937192766431	0.0032075021525119	0.516661050567801	B3GAT1	242527	GLB1L2	322780	GLB1L3	380523	False	False	False	alt	30	0.004395	30	0.0188
721	chr11	134657527	C	T	rs11223928	-0.00834758762	0.4312287502410026	0.00834758762	0.4188210422256687	0.0073242989853349	0.7006746083461414	-6.124203175931222e-05	0.4917692162056487	6.124203175931222e-05	0.4795123508738348	0.5530285583875352	0.0957640336140593	-0.0046357637791188	0.2736799693626479	0.0046357637791188	0.2622755387899855	0.0040252901225123	0.2524999172245111	-3.384071612441251e-05	0.3174650113018419	3.384071612441251e-05	0.3060376193058974	-0.0017199348540959	0.7098607361699214	0.0017199348540959	0.6968001223141357	B3GAT1	245285	GLB1L2	325538	GLB1L3	383281	False	False	False	ref	-95	0.002197	-85	0.07886
722	chr11	134661373	A	C	rs999785	0.00231062998	0.4824462974976621	0.00648630518	0.4898364467604303	0.0086865940146439	0.4788504073326189	1.6526996343543413e-05	0.4923784746410269	5.906515484330342e-05	0.4993433036951776	0.2132636230666292	0.6325158023931237	0.0005359964543076	0.5141671824787367	0.0014361150497429	0.523149224682457	0.0018643079175854	0.6329553382006674	3.902906161134846e-06	0.5157366379978424	1.3072533788237667e-05	0.5243440069774019	0.0020518885050674	0.323431234173786	0.0062179068247595	0.3286239851425827	B3GAT1	249131	GLB1L2	329384	GLB1L3	387127	False	False	False	alt	100	0.004242	5	0.005005
723	chr11	134665000	T	C	rs11223931	-0.00209078032	0.5155640886223616	0.00621933012	0.5146292285124003	0.006965948317968	0.7890945819041572	-1.7409657412746673e-05	0.5873998975120246	4.476745096172967e-05	0.5865040394244047	0.6037137314702434	0.0455914811513769	-0.0012024987617632	0.3097944956902506	0.0037595389877427	0.3091651308647934	0.0042052926757208	0.2278578028787707	-1.0098088489129018e-05	0.3645453978590698	2.706400451062425e-05	0.363989922250884	-0.0003900455398914	0.8408880024155668	0.0008215852861543	0.840159373778632	B3GAT1	252758	GLB1L2	333011	GLB1L3	390754	False	False	False	ref	-85	0.00318	20	0.0423
724	chr11	134716809	T	C	rs10894859	0.011373226	0.2978787778714989	0.011373226	0.3089571974240813	0.0085640691188559	0.4825054698332656	9.765190059327074e-05	0.3124650981255313	9.765190059327074e-05	0.3230683317664787	0.3113268809842425	0.4784757597729874	0.0035642859612338	0.2967781756221136	0.0035642859612338	0.3088372170311156	0.002662770005061	0.4765801852131819	3.0585846811884665e-05	0.3032994255789865	3.0585846811884665e-05	0.31458746778701	0.0086722891316299	0.2186878088675268	0.0086722891316299	0.2254055702303144	B3GAT1	304567	GLB1L2	384820	GLB1L3	442563	False	False	False	alt	-5	0.0001545	10	0.000946
725	chr11	134716814	A	G	rs12277680	0.0411964354	0.0435217324911069	0.0411964354	0.0467416602993873	0.0112867894143612	0.2131548649454765	0.0004758158210314	0.0440458849462726	0.0004758158210314	0.0469973463148766	0.3322814552018174	0.4457330800921288	0.0138510861639099	0.0737285061427297	0.0138510861639099	0.0798706799553457	0.0037703653784446	0.2850164645141781	0.0001607744698192	0.0653293160927846	0.0001607744698192	0.0702953450494958	0.0298384838016991	0.0258519097865031	0.0298384838016991	0.0264866035967106	B3GAT1	304572	GLB1L2	384825	GLB1L3	442568	False	False	False	alt	-5	0.0003777	-15	0.003418
726	chr11	134725880	T	C	rs7951888	-0.0104552578799999	0.3576086328356379	0.0104552578799999	0.3463394043265413	0.0175243182249901	0.0452245498941407	-0.0001870569104117	0.1989890740981393	0.0001870569104117	0.1910003672522437	0.5527422483635722	0.0984554306660186	-0.0057640602333143	0.2286643415745513	0.0057640602333143	0.2181538431120704	0.0096513412026566	0.0147134934325005	-0.0001027010416553	0.1269971006761003	0.0001027010416553	0.1197648617529231	-0.002329899687756	0.6318949755413793	0.002329899687756	0.6194167208996797	B3GAT1	313638	GLB1L2	393891	GLB1L3	451634	False	False	False	ref	100	0.001104	100	0.08936
727	chr11	134901806	T	C	rs10894902	0.00517122066	0.3996830948133165	0.00815425146	0.4080050904281146	0.0076084545866402	0.6570284386831252	3.545839729105824e-05	0.4488291362321006	6.192623893707388e-05	0.4563866440378589	0.3455513023994024	0.4186584359624384	0.0020132232448414	0.3485711872242647	0.0028481711047604	0.3576649455258505	0.0026023447469069	0.4948573808925033	1.4015505733190042e-05	0.3832100426750194	2.14238326172116e-05	0.3918442452482772	0.0032344733866533	0.3454573798306345	0.0054087698005165	0.3515103017899299	B3GAT1	489564	GLB1L2	569817	GLB1L3	627560	False	False	False	alt	-100	0.0017805	80	0.0392
728	chr11	134903531	A	C	rs906627	-0.002713891628	0.7210365094666493	0.002890318852	0.7124556801156046	0.0074980271124757	0.6835256603512132	-2.0176649749618307e-05	0.7490393358173149	2.15661345555114e-05	0.7407215165877535	0.2653969439517007	0.5491917117777051	-0.0007189161348368	0.6570153046900589	0.0007735524056279	0.647802627636828	0.0019927650403468	0.5984098803071506	-5.345361873466846e-06	0.682158991805718	5.77565980093836e-06	0.6733854198794559	-0.0024398593346403	0.6006196622591323	0.002518698326746	0.5924902756353511	B3GAT1	491289	GLB1L2	571542	GLB1L3	629285	False	False	False	ref	85	0.00656	-70	0.04587
729	chr11	134905423	C	A	rs1154905	-0.0033355508	0.5665911165170211	0.0052833565599999	0.5597174359153351	0.0075633600057387	0.6582523501408689	-2.472675566709212e-05	0.6172138749434521	3.7660441110836594e-05	0.6112385347965854	0.4678596250998453	0.222216802817562	-0.0014795033012403	0.4322971946434403	0.0024003194075579	0.4258131879385494	0.0035493495378477	0.3236727275280703	-1.1065149864375272e-05	0.4713516649213876	1.7187459261886133e-05	0.4650072001794423	-0.001085073496613	0.671161745828123	0.0018651645763959	0.6661258355386065	B3GAT1	493181	GLB1L2	573434	GLB1L3	631177	False	False	False	ref	35	0.002544	50	0.04443
730	chr11	134915107	C	T	rs12226882	-0.0361725622	0.0698998952050929	0.0361725622	0.0657087470616709	0.0117010493111633	0.1897744458301193	-0.0004534189247088	0.0630045924366773	0.0004534189247088	0.0594444887868318	0.4848307555057625	0.1981297514429345	-0.0176133824023335	0.0575456103802119	0.0176133824023335	0.0532342144037397	0.0056727197315874	0.1006138810287007	-0.0002207607735157	0.0527375682840806	0.0002207607735157	0.0490646374288328	-0.0129441176775692	0.144227067909399	0.0129441176775692	0.1400475104471014	B3GAT1	502865	GLB1L2	583118	GLB1L3	640861	False	False	False	ref	70	0.0006695	100	0.0917
731	chr11	134937731	T	A	rs7118700	-0.00229222916	0.658824133733099	0.00416119612	0.6500808704574708	0.0056900505387614	0.9656301357050708	-1.2825361157569185e-05	0.7605659284842378	2.366527513727231e-05	0.7519003245884841	0.5282191723980538	0.1261162946143787	-0.0012693389585018	0.4430696330913635	0.0021817300150561	0.4344894541970312	0.0030024338845057	0.422413963651319	-7.109746616935222e-06	0.5410854051716909	1.2401568647089364e-05	0.5324274575093881	-0.0004190914843514	0.7987895488431406	0.0011120447307544	0.7904648291746073	B3GAT1	525489	GLB1L2	605742	GLB1L3	663485	False	False	False	ref	-100	0.003094	70	0.09564
732	chr11	134940387	T	C	rs1319913	0.0628014052	0.0142821567924434	0.0628014052	0.0153272158263933	0.0148571900206619	0.0960335304388226	0.001081108399298	0.0158344471322755	0.001081108399298	0.0167583364892444	0.5860143777425076	0.0600980195618121	0.0370832960525429	0.0090703239610919	0.0370832960525429	0.0098604047336254	0.0087814453370534	0.0245797194737	0.0006429627762761	0.011391326305579	0.0006429627762761	0.0121440428050661	0.0102926378904345	0.1942086740739579	0.0102926378904345	0.2004560014034651	B3GAT1	528145	GLB1L2	608398	GLB1L3	666141	False	True	False	alt	-100	0.06647	-100	0.2169
733	chr11	134951476	C	T	rs11224103	-0.0048398319828	0.6234512759141383	0.0048398319828	0.611410775149081	0.0095926602380461	0.3398057126103164	-4.80542989135423e-05	0.5871353073885246	4.80542989135423e-05	0.575581616578792	0.4623844645691345	0.2351892963917028	-0.0022725580626642	0.481859965447544	0.0022725580626642	0.4683533827610402	0.0044355389190001	0.1956681149299196	-2.2546578684190574e-05	0.4553405646505185	2.2546578684190574e-05	0.4426272060831535	-0.0017655784811045	0.7040730969931313	0.0017655784811045	0.6934943436512173	B3GAT1	539234	GLB1L2	619487	GLB1L3	677230	False	False	False	ref	-5	0.0004692	100	0.01813
734	chr12	1754562	A	T	rs11061971	-0.0175923866	0.2163093204713781	0.0175923866	0.2070088424252533	0.0068935295927201	0.7867653064708182	-0.0001237878601937	0.2855150929210878	0.0001237878601937	0.2758459738931164	0.1902509362130311	0.6679209882619506	-0.0032984988081794	0.3380425293403112	0.0032984988081794	0.3258753989229491	0.0012734040400468	0.7370019743279206	-2.238632168466641e-05	0.3937759320470981	2.238632168466641e-05	0.3817308820499966	-0.0167263145883255	0.0993087520992248	0.0167263145883255	0.0964400790079269	LRTM2	65706	ADIPOR2	65987	FBXL14	159981	False	False	False	ref	70	0.00435	95	0.06573
735	chr12	1769369	C	T	rs7294668	-0.0272521412	0.1227099237119223	0.0272521412	0.1159846592057824	0.0094063311596181	0.3787120294415511	-0.0002671965311477	0.1299206135492137	0.0002671965311477	0.1237288644601079	0.147433064658347	0.7416651045298699	-0.0040243033800216	0.3016032143564319	0.0040243033800216	0.2899294501577946	0.0013952353176075	0.719778169591933	-3.969581252237727e-05	0.2926495984297046	3.969581252237727e-05	0.281834244930588	-0.0252347016047883	0.0378755324319578	0.0252347016047883	0.0369449265269833	LRTM2	50899	ADIPOR2	80794	CACNA2D4	149297	False	False	False	ref	85	0.01116	-100	0.03336
736	chr12	1777378	C	T	rs7306506	0.00367628137	0.6485314005624472	0.00403046791	0.6573119330394667	0.0411149267344566	0.0010471652021702	0.0001721576579026	0.2353585000105064	0.000185338091685	0.2419914627985237	0.2277305781180302	0.6141285407642771	0.0008743585569506	0.6286316404333825	0.000943010466969	0.6376252008532752	0.0093894018015594	0.0165109061327632	4.08128010711402e-05	0.3045664742385058	4.336756206683468e-05	0.3131141131999718	0.0035270075415719	0.5021348594281089	0.0038299152480834	0.5096908690894136	LRTM2	42890	ADIPOR2	88803	CACNA2D4	141288	False	True	True	alt	75	0.00879	10	0.002228
737	chr12	1789481	G	C	rs4766416	-0.0172569539999999	0.2328708202392113	0.0172569539999999	0.2230263188472164	0.0076640577544441	0.6619720453957686	-0.0001371339602315	0.2817193927763344	0.0001371339602315	0.2720812119217261	0.3450471477919895	0.4199482605650876	-0.0062339741163378	0.2239857781835125	0.0062339741163378	0.2135141556827842	0.0027032951768747	0.4760341960405167	-5.058659676032363e-05	0.2571397159393019	5.058659676032363e-05	0.2468788541421783	-0.010827913152626	0.177165361856894	0.010827913152626	0.171693936934839	LRTM2	30787	ADIPOR2	100906	CACNA2D4	129185	False	False	False	ref	-90	0.004227	-50	0.04282
738	chr12	1790548	A	C	rs7294540	0.0114723539	0.3018291261962453	0.0114723539	0.3129082491215288	0.0075189803732412	0.675036347050615	8.83648199397448e-05	0.3497021465504041	8.83648199397448e-05	0.3606819121535973	0.5210821689021671	0.1418965648965441	0.0059405018786149	0.1985782138433609	0.0059405018786149	0.2087772274562975	0.0039206196147385	0.2654466598601138	4.5778018259063296e-05	0.2327821197645657	4.5778018259063296e-05	0.2431744745192692	0.0029772093071504	0.5231928590421389	0.0029772093071504	0.5349836424327947	LRTM2	29720	ADIPOR2	101973	CACNA2D4	128118	False	False	False	alt	-100	0.0009284	80	0.04517
739	chr12	1792998	C	T	rs2286379	-0.0356483158	0.0682549865631312	0.0356483158	0.0642125458805327	0.0114836454796247	0.2185353925286937	-0.0004396091551311	0.063011754576457	0.0004396091551311	0.0599062202379195	0.5116878805796741	0.154602932128027	-0.0181876221105886	0.0528531728757634	0.0181876221105886	0.0489510898599339	0.0058418373108581	0.0946312574487182	-0.0002226599230478	0.0502608220571774	0.0002226599230478	0.0471884537794755	-0.0110955507837217	0.1811158575258383	0.0110955507837217	0.1756291016227823	LRTM2	27270	ADIPOR2	104423	CACNA2D4	125668	False	False	False	ref	15	0.0007076	-60	0.05508
740	chr12	2189882	C	T	rs2283288	-0.0437427544	0.0436455846255929	0.0437427544	0.0408245420318465	0.0096195106897826	0.3445732818007592	-0.0004371495053394	0.0604275234763244	0.0004371495053394	0.0569535686354036	0.5243249411300946	0.1375314024165725	-0.0230585044883217	0.0333104720744731	0.0230585044883217	0.0307112728291717	0.0050634069962492	0.1405326135201317	-0.0002311834396004	0.04615644446831	0.0002311834396004	0.0429373139942479	-0.0119607049865662	0.1575484907008645	0.0119607049865662	0.1527881102056345	DCP1B	185347	CACNA1C	219109	CACNA2D4	271216	False	False	False	ref	-45	0.001017	-95	0.02118
741	chr12	2191041	A	G	rs2238048	0.0497230937999999	0.0252148838534669	0.0497230937999999	0.0269512856007959	0.0160504852883418	0.0619985120911501	0.0007974395709845	0.0162926193704944	0.0007974395709845	0.0172526733227383	0.5804230334339568	0.0664922925928058	0.0288401706635056	0.015629130838619	0.0288401706635056	0.0170423942633537	0.0093262604106553	0.0165214231765412	0.0004629914765329	0.0119501137045663	0.0004629914765329	0.0128339695202338	0.0086204213736656	0.2209795172951984	0.0086204213736656	0.2280648544443988	DCP1B	186506	CACNA1C	220268	CACNA2D4	272375	False	False	False	alt	40	0.002686	-50	0.0753
742	chr12	2191441	G	C	rs11614764	-0.0610034015999999	0.0150442110073594	0.0610034015999999	0.0141972504024885	0.020210455056013	0.0264292211665359	-0.0013141085179782	0.010072722916494	0.0013141085179782	0.0096557804512329	0.437236900797726	0.2614987315350865	-0.0273092969588974	0.0217845352540297	0.0273092969588974	0.020260709006392	0.0090250232314361	0.0229419702126551	-0.0005988373123491	0.0121562045730688	0.0005988373123491	0.0114321833608413	-0.0275874231060487	0.0339068187682642	0.0275874231060487	0.0330148480186879	DCP1B	186906	CACNA1C	220668	CACNA2D4	272775	False	True	False	ref	100	0.002438	-70	0.1168
743	chr12	2195191	C	T	rs2239018	-0.0464768219999999	0.035344606005766	0.0464768219999999	0.0330613644464081	0.009025538786316	0.411918087760338	-0.0004192847332197	0.0572824408538226	0.0004192847332197	0.0539886427003223	0.4247201734457826	0.2937176093514335	-0.0196901127838094	0.0459062903829697	0.0196901127838094	0.0423335608226441	0.0038382195412485	0.2751011826294318	-0.0001778320299216	0.0605024794424852	0.0001778320299216	0.0563665314693685	-0.023633025238851	0.0498107272115254	0.023633025238851	0.0485386915764794	DCP1B	190656	CACNA1C	224418	CACNA2D4	276525	False	False	False	ref	95	0.003878	35	0.00952
744	chr12	2207930	T	C	rs2238053	-0.00885304378	0.4213250179305899	0.00885304378	0.4092637381585695	0.0076906791927769	0.6538018516715758	-6.838682026777786e-05	0.4733977952564806	6.838682026777786e-05	0.4617157696431938	0.2682144005643211	0.5467971079049015	-0.0023323144540584	0.4321256768249104	0.0023323144540584	0.4194670611559721	0.0020449639245339	0.5953443736615307	-1.78972523931907e-05	0.4653232843733509	1.78972523931907e-05	0.4528639734464068	-0.0073901181547526	0.2859951908521573	0.0073901181547526	0.2778551454454024	DCP1B	203395	CACNA1C	237157	CACNA2D4	289264	False	False	False	ref	-40	0.001114	55	0.005524
745	chr12	2214876	T	C	rs7957545	0.0062057730039999	0.5070329857093592	0.0063872776359999	0.517424004610758	0.0075856689608593	0.6473799470800035	4.93771960867225e-05	0.5495162179190665	5.072138894680146e-05	0.5595952760270326	0.3415637091671075	0.4265171728052357	0.002233660524854	0.4393830905968508	0.0022940227374677	0.4503429785748197	0.0026182060770913	0.4791685843110642	1.7996142191325583e-05	0.4700050984679907	1.8443174618023697e-05	0.4804103615217225	0.003686760236102	0.4582235817800428	0.0038402887996762	0.4665448663839771	DCP1B	210341	CACNA1C	244103	CACNA2D4	296210	False	False	False	alt	-100	0.003792	90	0.03632
746	chr12	2222406	A	G	rs10848642	0.0558956116	0.0172192383169992	0.0558956116	0.0184528301946377	0.0115268987208438	0.1963727021772708	0.0006403561448559	0.0235915290029913	0.0006403561448559	0.0251521717480409	0.2370605504206475	0.5987780246280294	0.0132114948345154	0.0780738417976513	0.0132114948345154	0.0844660224458922	0.0027423284069228	0.459732910502691	0.0001519765356154	0.0662790100411174	0.0001519765356154	0.0713040919533675	0.0536208881834873	0.0031015713708903	0.0536208881834873	0.0031754164569832	DCP1B	217871	CACNA1C	251633	CACNA2D4	303740	False	True	False	alt	40	0.003483	20	0.01019
747	chr12	2222938	A	G	rs11062162	0.0219032067999999	0.1573175588988345	0.0219032067999999	0.1657808462197272	0.0074827608664569	0.6782790519804653	0.0001649577793789	0.2087341794222295	0.0001649577793789	0.2174013317628767	0.2964387597381716	0.5020031008556674	0.0063992740487373	0.1859915358267746	0.0063992740487373	0.1961141571534274	0.0022443465362721	0.5587455260968991	4.884123747140696e-05	0.2241698661762163	4.884123747140696e-05	0.2341273355055149	0.0178777788151328	0.0877106000563029	0.0178777788151328	0.0902982114119687	DCP1B	218403	CACNA1C	252165	CACNA2D4	304272	False	False	False	alt	-45	0.003721	-60	0.04074
748	chr12	2223690	C	A	rs1108222	0.021292449	0.1786769301911492	0.021292449	0.1864908027622813	0.0093344849096758	0.4006085654994269	0.0002509549018771	0.1790530623184476	0.0002509549018771	0.1860461638602561	0.2934822975342067	0.5080665424323195	0.0062859934924985	0.22088107803775	0.0062859934924985	0.2323833726685833	0.0027600666373567	0.4432947230923781	7.367607632237559e-05	0.2077066060058452	7.367607632237559e-05	0.2178652328413661	0.0184607724146515	0.1044119840302853	0.0184607724146515	0.1073444356266498	DCP1B	219155	CACNA1C	252917	CACNA2D4	305024	False	False	False	alt	60	0.002258	-40	0.02002
749	chr12	2225094	G	A	rs11062166	-0.0004729221319999	0.6361687160021715	0.004869700812	0.6337846128169972	0.0118140246192408	0.183434879153436	-9.16263188473424e-06	0.5567700837764178	6.134779029475067e-05	0.5549721651335494	0.2874075457214285	0.5157048936311803	-6.029961451701508e-05	0.5886563826224692	0.0014856281639365	0.5872799757775369	0.0034527543978651	0.3417873607449621	-1.620313966747227e-06	0.5230056719375197	1.88181817103901e-05	0.5215270573916483	-0.0009564414568615	0.5450843585072999	0.0034170478946876	0.5429303328397342	DCP1B	220559	CACNA1C	254321	CACNA2D4	306428	False	False	False	ref	-50	0.00687	-95	0.0716
750	chr12	2239678	G	C	rs11062170	0.0060462537399999	0.5224556341040691	0.0070140624999999	0.5296248497007341	0.009873099423798	0.3177335540257173	6.235492131880957e-05	0.4861297421686388	7.218140647942566e-05	0.4928066771390231	0.6087677258062844	0.0417932976841422	0.0037498521927769	0.3424893049308453	0.0043307688978971	0.3502832208503897	0.0060069520640141	0.0793734970247601	3.8614026838077394e-05	0.3197476666991584	4.451366447347272e-05	0.3263045993506046	0.0006224130955715	0.8478126525779212	0.0007261486115	0.851983733468101	DCP1B	235143	CACNA1C	268905	CACNA2D4	321012	False	False	False	alt	-100	0.00821	-100	0.09045
751	chr12	2259230	A	G	rs2370414	0.0536069535999999	0.0209758470592216	0.0536069535999999	0.0225146961476455	0.0157027659797354	0.0670247738357342	0.0008614916605354	0.0158761794954481	0.0008614916605354	0.0168601858491011	0.476334816751211	0.2098026493900385	0.0255822541883697	0.0220288798253765	0.0255822541883697	0.0240500833918639	0.0074504706830464	0.0388808082744456	0.0004094099582429	0.0158499027681738	0.0004094099582429	0.0171358599821577	0.0203051898878618	0.0603083284986281	0.0203051898878618	0.0620684143216029	DCP1B	254695	CACNA1C	288457	CACNA2D4	340564	False	False	False	alt	100	0.03476	-85	0.02136
752	chr12	2274839	T	G	rs2238057	0.00145393978	0.6096849808859517	0.0043529093	0.6137070600349019	0.0098180653356454	0.3200267604523917	1.660868990316058e-05	0.5746395157495185	4.348601554027837e-05	0.5783857678365372	0.5320573864874116	0.1260645597059966	0.0007263860795783	0.4101167834526867	0.0022905794812714	0.4138887129871805	0.0052175634221111	0.1239114394957273	8.36016113548293e-06	0.3865461097353201	2.285546117231692e-05	0.3903065315994564	0.00049378105582	0.7774174869485568	0.0011576883577629	0.7805094300888894	DCP1B	270304	CACNA1C	304066	CACNA2D4	356173	False	False	False	alt	-60	0.0010195	-100	0.02524
753	chr12	3606194	A	G	rs6489486	0.00476156298	0.560091119163222	0.00509017778	0.5693155275629483	0.0071608415948911	0.7444515471169588	3.681984687306271e-05	0.6158811949925352	3.8903786699494526e-05	0.6245896125766995	0.4376850382265376	0.2771966220755286	0.0020655649279314	0.4293846089670053	0.0022128363352973	0.4389397312045994	0.0031405975080781	0.3973665002698403	1.6033165288198036e-05	0.475167981109245	1.6967099959527694e-05	0.4841192403744043	0.0023900662869946	0.59653310842442	0.0024938018029232	0.6046229842980154	CRACR2A	158625	PRMT8	224844	PARP11	267254	False	False	False	alt	-70	0.0064	90	0.0989
754	chr12	15549073	C	T	rs7132826	-0.00437736912	0.6575303873069411	0.00437736912	0.644187646191811	0.0150592094472653	0.0766693238206415	-6.702158401160949e-05	0.4916761425506594	6.702158401160949e-05	0.4797861135672052	0.0455627133061545	0.9209181530952548	-0.0002252246305265	0.8694154679641679	0.0002252246305265	0.8551954555908645	0.0006738959061529	0.8654610636740258	-3.4309856636333414e-06	0.8061200251459313	3.4309856636333414e-06	0.7918714462954031	-0.0024128881004989	0.6262518979072471	0.0024128881004989	0.6136217761222014	RERG	200398	PTPRO	226815	EPS8	333256	False	False	False	ref	-30	0.0004807	-40	0.005257
755	chr12	15554198	G	A	rs11056556	0.0043303028399999	0.615150174966705	0.0043303028399999	0.6282085152223233	0.0217950263512092	0.0179463790525636	9.50936129555076e-05	0.3516380845187642	9.50936129555076e-05	0.3626094739990834	0.1181858732974407	0.7861627943473628	0.0004939976358342	0.7165383154585763	0.0004939976358342	0.7307484741284964	0.0025227050866737	0.484647246477273	1.0535620615069237e-05	0.5469466543386823	1.0535620615069237e-05	0.5602973353954931	0.0035415305138019	0.4790771022942553	0.0035415305138019	0.4906507659140816	RERG	205523	PTPRO	231940	EPS8	328131	False	True	False	alt	-100	0.01561	25	0.02417
756	chr12	15554746	T	A	rs10846207	0.019659211	0.1736552566641362	0.019659211	0.1823839694460179	0.0140021957463143	0.0994527920064963	0.0002771339772219	0.1038099356947117	0.0002771339772219	0.1097660682231632	0.2399589207356922	0.591261607150977	0.0046604195493117	0.2416223549493595	0.0046604195493117	0.2526913516663495	0.0033295656838132	0.3548160251592709	6.514991671275418e-05	0.1677143839289135	6.514991671275418e-05	0.1766987480530039	0.0177698938785671	0.0821753053042699	0.0177698938785671	0.0845902579620578	RERG	206071	PTPRO	232488	EPS8	327583	False	False	False	alt	100	0.01486	-100	0.03424
757	chr12	23364933	T	G	rs11046902	-0.0010287602	0.819365939307062	0.00195046984	0.8100959922466958	0.0238702286876055	0.0122225278823678	-1.9202002364121184e-05	0.5586819053057055	4.6525108879530194e-05	0.5507556563251551	0.2759987136796025	0.5301064640173719	-0.0002229353553204	0.7225219765090801	0.0005212033094363	0.7130460560160967	0.006668541096417	0.0577660239787616	-3.860917784853215e-06	0.524318159103932	1.2702755436158556e-05	0.5159407300681665	-0.0009004242782601	0.7148628268814463	0.0016473199929459	0.7059861906361924	ETNK1	739857	C2CD5	820387	ST8SIA1	927892	False	True	False	ref	-75	0.02527	-75	0.0834
758	chr12	23406204	A	G	rs2418108	-0.0083719784199999	0.4148441359643217	0.0083719784199999	0.402958083325176	0.0262092678627673	0.0078510161918674	-0.0002280783365757	0.1578478647637248	0.0002280783365757	0.1506890119529484	0.0591354682102511	0.8977562066985202	-0.0005732927088741	0.7343729145197401	0.0005732927088741	0.7207790755047359	0.001680215591781	0.6517480203602795	-1.6562248849498945e-05	0.5139945231028	1.6562248849498945e-05	0.5013019920033461	-0.0059067002769737	0.3570982557075359	0.0059067002769737	0.3476751192446989	ETNK1	781128	C2CD5	861658	ST8SIA1	969163	False	True	True	ref	-10	0.001968	-100	0.02904
759	chr12	23486608	C	G	rs77777611	0.002254403086	0.6856760853156438	0.003513689514	0.6899711261779343	0.0071471549845052	0.7442235595477363	1.4398672816427324e-05	0.7413015493654918	2.392676675124534e-05	0.7447234564764106	0.1580597309100716	0.7246112602140587	0.0003359742941932	0.7247596127240097	0.0005702767954878	0.7283833456833861	0.0011247362320569	0.7672289858634839	2.1082572385893417e-06	0.7590529654672546	3.882350387830037e-06	0.7621784268832891	0.0020560379257046	0.5306465870224119	0.0033299100613076	0.5338311212123876	ETNK1	861532	C2CD5	942062	ST8SIA1	1049567	False	False	False	alt	-80	0.00867	40	0.00829
760	chr12	23545302	C	T	rs11612157	-0.0545112412	0.0214121582371873	0.0545112412	0.0200372915562882	0.01007370421748	0.3021699542215427	-0.000545859709183	0.0364482081350471	0.000545859709183	0.0343039101143291	0.2599860994408655	0.5640146657901377	-0.0143276937096164	0.0823038519948214	0.0143276937096164	0.0763879171455897	0.002593081948856	0.4983039971741496	-0.0001422044865394	0.0833402390170415	0.0001422044865394	0.0778599929700294	-0.0499341279473853	0.0041424161780477	0.0499341279473853	0.004048917126214	ETNK1	920226	C2CD5	1000756	SOX5	1017242	False	False	False	ref	-100	0.003246	-10	0.002502
761	chr12	23608548	T	C	rs17468457	-0.0068193004	0.4866647239158291	0.0068193004	0.4741603912110673	0.014044955424001	0.1016694827040762	-9.228898201513548e-05	0.3602196861654546	9.228898201513548e-05	0.3499529375889752	0.0381082791315262	0.9364187877687334	-0.0002820827536447	0.843425132157339	0.0002820827536447	0.8294173689504588	0.0005457510673236	0.8950810064385771	-3.796915646297229e-06	0.7852398552680279	3.796915646297229e-06	0.771256350044226	-0.0034232720256433	0.5298507326837864	0.0034232720256433	0.5182898192443725	SOX5	953996	ETNK1	983472	C2CD5	1064002	False	False	False	ref	-95	0.00566	5	0.001251
762	chr12	23614364	T	C	rs17383970	0.04532359	0.0325702106805983	0.04532359	0.0350082536216651	0.0110580372646512	0.2235878001654604	0.0005272480215954	0.039209890659804	0.0005272480215954	0.0417223982184604	0.3018350812767768	0.491614026272512	0.013662781659731	0.0754677781191233	0.013662781659731	0.0818053007156179	0.0032910685221372	0.3634429612549755	0.0001561849453859	0.0681724620197782	0.0001561849453859	0.0733147763804786	0.0357659311818587	0.0117167036524898	0.0357659311818587	0.0120974927019557	SOX5	948180	ETNK1	989288	C2CD5	1069818	False	False	False	alt	15	0.001434	-25	0.01636
763	chr12	23616961	A	G	rs73091330	0.00418712708	0.6427445490443245	0.00433054404	0.6527525770197081	0.0255910002666033	0.0088080945187134	0.000100105248102	0.3725258966712574	0.0001041410591199	0.3814617659008757	0.2182076577557858	0.6251276687091148	0.0010168749257498	0.6348178104445058	0.0010466580574084	0.6453216749258511	0.0054070421444403	0.1114121323295103	2.342493259875114e-05	0.4291369760892843	2.4263041923207308e-05	0.4390391623990453	0.003356881295449	0.5056921031570533	0.0034523179701033	0.5144614363212257	SOX5	945583	ETNK1	991885	C2CD5	1072415	False	True	True	alt	55	0.0418	65	0.03052
764	chr12	23625917	G	A	rs73091349	9.861846000000004e-05	0.6942237812419895	0.0034453590199999	0.6906347266769417	0.0138092377220133	0.1082206998758179	3.0826848558533166e-06	0.5536051814647355	4.795919328293186e-05	0.5503941381063777	0.1816989802798783	0.6862038876292943	-5.757534954759988e-06	0.6917073784967632	0.0006187784486706	0.6871351714479949	0.0024990010547416	0.5035591361801763	1.01603488311724e-07	0.6022959686508637	8.549051309667126e-06	0.5978953780252257	0.0001224079087957	0.5190089815482644	0.0032801170136619	0.5161936620168457	SOX5	936627	ETNK1	1000841	C2CD5	1081371	False	False	False	alt	-95	0.00595	100	0.0575
765	chr12	23627810	T	C	rs76571125	-5.659330800000004e-05	0.8997950008626876	0.001119641588	0.901621788435048	0.0132825889044389	0.1427452909657079	2.599975415292188e-06	0.8412764679401581	1.5160297691246502e-05	0.8424741444480961	0.1347047168539092	0.7642336780657015	2.7712801287521195e-06	0.8854734589824468	0.0001710017175151	0.885066842929854	0.0020494954495589	0.5402878075613331	8.445749554423363e-07	0.8409275749014508	2.6580099483176207e-06	0.8391714853063255	-0.0001659768254857	0.8103081757163912	0.0010166080561001	0.8117502167859394	SOX5	934734	ETNK1	1002734	C2CD5	1083264	False	False	False	ref	95	0.00943	100	0.04358
766	chr12	23641960	C	A	rs73091376	-0.005821989904	0.557878878422164	0.005821989904	0.5448940847988148	0.0069509986451255	0.7751659493389654	-4.075937446914715e-05	0.6243487561435244	4.075937446914715e-05	0.6124896116589362	0.1527256506810236	0.7331676856423739	-0.001138236425262	0.6336835634387346	0.001138236425262	0.6200962974420037	0.0010638310931945	0.7862140812576112	-7.904115559726448e-06	0.6788212619521664	7.904115559726448e-06	0.665360792598795	-0.0053983962489237	0.4050278079736413	0.0053983962489237	0.3950047283759013	SOX5	920584	ETNK1	1016884	C2CD5	1097414	False	False	False	ref	-70	0.00612	-20	0.0103
767	chr12	23646344	T	C	rs73073805	-0.00484686624	0.5780412502970916	0.00516205872	0.569087717030014	0.0277721878532033	0.0058933473730531	-0.0001437787930313	0.2771625508348661	0.0001508720535795	0.2696630990207037	0.0500461623045881	0.9030239181457628	-0.0002321420735976	0.8364482818016751	0.0002470811751234	0.8282251738896212	0.0013787883967921	0.7034289668815855	-6.775532111160025e-06	0.66022102085548	7.111729659318876e-06	0.6512834010749484	-0.0027531405927447	0.5651973097739078	0.0029191174182304	0.557256103610944	SOX5	916200	ETNK1	1021268	C2CD5	1101798	False	True	True	ref	5	0.000572	-100	0.0091
768	chr12	29778123	C	A	rs10843507	-0.0054182602799999	0.5848489119312349	0.0054182602799999	0.571701693477765	0.0080781714534552	0.5785827679919124	-4.4694232146576514e-05	0.604107346203817	4.4694232146576514e-05	0.5913992739370697	0.1522505420180707	0.7383048704768898	-0.0008514697489148	0.6687625126920629	0.0008514697489148	0.6546968419144561	0.0012510755926751	0.7531047198355699	-7.111556349717389e-06	0.6788487046009248	7.111556349717389e-06	0.6649382291519143	-0.0049378105582007	0.4084310103013743	0.0049378105582007	0.3982406954074998	TMTC1	6636	OVCH1	280437	ERGIC2	396934	False	False	False	ref	35	0.00491	100	0.03537
769	chr12	29791226	T	C	rs7316162	0.016716247	0.2189554468667863	0.016716247	0.228569923453344	0.0077710212403119	0.6204553427202721	0.0001345943469331	0.2602569482571386	0.0001345943469331	0.2696030809592923	0.0002551893691842	0.9995383810716176	5.636989756086016e-06	0.9746391167805232	5.636989756086016e-06	0.9888523446883664	2.065560294629093e-06	0.999503898115839	4.716758476266126e-08	0.974503618851008	4.716758476266126e-08	0.9887040368376192	4.564362700857062e-05	0.9734327775269984	4.564362700857062e-05	0.9869284096566494	TMTC1	6467	OVCH1	293540	ERGIC2	410037	False	False	False	alt	100	0.001175	75	0.02347
770	chr12	29791874	C	G	rs302350	0.00029185106	0.8500039395235061	0.0014657568999999	0.8514139046550746	0.0064700318112834	0.8602183023177128	1.6454472197099369e-06	0.8796049655065714	9.65955833827214e-06	0.8809146953364815	0.0001265573294328	0.9998851752093582	6.25191494975689e-09	0.9861124008240388	1.998047161665763e-07	0.999449512372737	8.560691540795386e-07	0.9999041836776118	8.386284914279049e-12	0.986095107056242	1.3469485008077323e-09	0.9995349257983948	2.0747103185717724e-06	0.987893117129369	2.0747103185717724e-06	0.9992324233226132	TMTC1	7115	OVCH1	294188	ERGIC2	410685	False	False	False	alt	-15	0.0003815	20	0.00415
771	chr12	29806764	C	A	rs369003	0.0077045201999999	0.4151228204490005	0.0077045201999999	0.4272407255405444	0.0295267400612777	0.0041821733602699	0.0002231389666835	0.1341065041394567	0.0002231389666835	0.1410655368207663	0.0886233259681116	0.8436434376963633	0.0006679599111777	0.6604574878742782	0.0006679599111777	0.6741808087612023	0.0027070465222244	0.4480023463256178	1.995475870486261e-05	0.4074064039785577	1.995475870486261e-05	0.4196361914085711	0.0060872000746895	0.312214195608636	0.0060872000746895	0.3211829470424454	TMTC1	22005	OVCH1	309078	ERGIC2	425575	False	True	True	alt	0	0.0	-35	0.0376
772	chr12	29809890	C	T	rs625430	-0.0442031832	0.0410004117386852	0.0442031832	0.0383319074455437	0.0117521935945423	0.1810142070463137	-0.0005216361641745	0.0389376972583502	0.0005216361641745	0.0366141463323858	0.5938982769530805	0.0531873260108753	-0.0262156622396235	0.0234483923262144	0.0262156622396235	0.0215616703331561	0.0069674607661244	0.0479662408655249	-0.0003087842616131	0.0261375239008705	0.0003087842616131	0.0243035489385846	-0.0064440502494839	0.3041929665150615	0.0064440502494839	0.2955933131587015	TMTC1	25131	OVCH1	312204	ERGIC2	428701	False	False	False	ref	5	0.001144	5	0.02515
773	chr12	29866765	A	G	rs58304678	-0.002444720654	0.7572214218949058	0.0026388220259999	0.7492702361197614	0.0070398821439892	0.7871009632437491	-1.7070766165724374e-05	0.7939053451407412	1.8393944756702983e-05	0.7863254048279198	0.0962458116785443	0.8235209433070036	-0.0001713880891651	0.8586055487477532	0.0001961624467398	0.8512152230096571	0.0006721785596902	0.8543937643962589	-1.1947324069779751e-06	0.8760062990418377	1.3636178661985148e-06	0.868633734792599	-0.0016535441239016	0.6771091047620318	0.0019564518304131	0.6696535831147906	TMTC1	82006	OVCH1	369079	ERGIC2	485576	False	False	False	ref	-95	0.002296	-5	0.004364
774	chr12	29870745	T	G	rs10431276	-0.00489929094	0.6285308476569814	0.00489929094	0.615372399189362	0.0134371105058101	0.1135915848099415	-6.687900518739574e-05	0.5171569365289604	6.687900518739574e-05	0.5050954036843636	0.1279224888224981	0.7702736637465065	-0.0005592660824159	0.7474313363428882	0.0005592660824159	0.7336129753496162	0.0017102432677653	0.6504215279206461	-7.611048886370109e-06	0.6743657521807069	7.611048886370109e-06	0.6608309307207219	-0.0044481789230178	0.4724854049284356	0.0044481789230178	0.4617162688613438	TMTC1	85986	OVCH1	373059	ERGIC2	489556	False	False	False	ref	45	0.003963	60	0.02144
775	chr12	29877776	A	C	rs12229602	0.00808710052	0.399580879334791	0.00808710052	0.4118575569323025	0.007023948712627	0.7629535124396006	5.676016940007672e-05	0.4699359130803926	5.676016940007672e-05	0.4818492094459912	0.0286911689955289	0.946275361435885	0.0002436448719497	0.8122215400753325	0.0002436448719497	0.8268348373735693	0.0002092163982063	0.9535494104910972	1.7885907634543817e-06	0.8296477822087616	1.7885907634543817e-06	0.8442684812642514	0.0034751397836076	0.4755630394824932	0.0034751397836076	0.4867454632841725	TMTC1	93017	OVCH1	380090	ERGIC2	496587	False	False	False	alt	-100	0.003857	60	0.02951
776	chr12	29889855	G	A	rs10843539	-0.00600784725	0.5636313511180313	0.00600784725	0.5503761034084038	0.0099094475339933	0.3224384212034887	-5.547749176778617e-05	0.5439042957138391	5.547749176778617e-05	0.5314397158622203	0.5484475980041287	0.102198281776289	-0.0032082167611119	0.3875476519298082	0.0032082167611119	0.3745835911906296	0.0054603148665555	0.111877981218303	-2.976230074776505e-05	0.3736397707682057	2.976230074776505e-05	0.3617238891553307	-0.0013859064928059	0.7588904170831176	0.0013859064928059	0.7455415769843333	TMTC1	105096	OVCH1	392169	ERGIC2	508666	False	False	False	ref	-15	0.002869	-55	0.0945
777	chr12	29896727	G	T	rs2351015	0.01107335434	0.3244810513599638	0.01107335434	0.3360301379791217	0.015526541174953	0.0732704808312657	0.0001775538051585	0.1976889117863765	0.0001775538051585	0.206028876090892	0.1753503667050487	0.6955812697371446	0.0019584871498048	0.4445312500605891	0.0019584871498048	0.457771069723504	0.0026593748239659	0.4793700187123207	3.051596705430562e-05	0.3221648223007999	3.051596705430562e-05	0.3337010206226473	0.0103756263031773	0.1873820074832017	0.0103756263031773	0.1933527716241796	TMTC1	111968	OVCH1	399041	ERGIC2	515538	False	False	False	alt	-85	0.00224	70	0.05338
778	chr12	29902763	A	G	rs4622345	-0.0039013644599999	0.6250348078244259	0.00418259074	0.6143748323836928	0.0203709616869493	0.0244505752227676	-7.661732207707644e-05	0.3964355018303825	8.289421837063478e-05	0.3870747291470341	0.2441207896347472	0.5861275944323371	-0.0009048544764082	0.6107747118118728	0.0009828430685773	0.5996180744675415	0.0050108923116754	0.1411989761679864	-1.786384407902277e-05	0.4309979900921176	1.960452882280326e-05	0.420618350004355	-0.0037033579186505	0.4651812979855406	0.0039730702600649	0.4564939167600108	TMTC1	118004	OVCH1	405077	ERGIC2	521574	False	False	False	ref	15	0.002014	-100	0.00769
779	chr12	29926235	T	G	rs7970635	-0.0037128772399999	0.6676344363004173	0.0037128772399999	0.6543871077656208	0.014167551733038	0.104055131946335	-5.368720975819871e-05	0.5153594221403327	5.368720975819871e-05	0.5034005166995613	0.0035892488511291	0.9924872439892723	-1.2828882808364503e-05	0.9879609927926724	1.2828882808364503e-05	0.977347530106392	5.074858535630325e-05	0.9881443065197848	-1.8747015917680488e-07	0.9780760589187378	1.8747015917680488e-07	0.9659690949812568	-0.0002551893691842	0.9531678542120596	0.0002551893691842	0.9407024072065368	TMTC1	141476	OVCH1	428549	ERGIC2	545046	False	False	False	ref	-55	0.002617	35	0.01941
780	chr12	39049882	C	T	rs114974785	-0.049605782	0.0300291230481728	0.049605782	0.0282284591235449	0.0125998246294137	0.1444646929478341	-0.0006610123250652	0.0313975777343406	0.0006610123250652	0.0297602086204076	0.1949626033465077	0.6610964447894038	-0.0103117639186629	0.1329620429801833	0.0103117639186629	0.1251786933497965	0.0025245406827932	0.4776603871032016	-0.0001404914541523	0.09580235299793	0.0001404914541523	0.0904413423934501	-0.0470731024180748	0.0065643076202568	0.0470731024180748	0.0063331652923895	CPNE8	142452	KIF21A	393508	ABCD2	569921	False	False	False	ref	100	0.006386	-100	0.02126
781	chr12	50070687	A	G	rs706790	-0.019462312	0.1230049583151473	0.0265139559999999	0.1197202691669076	0.0137783094236153	0.1060658138787048	-0.0002765062480933	0.080725644581023	0.0003805400023312	0.0785955047174382	0.552879179244598	0.0951339650964139	-0.0104050074592781	0.0795798776901356	0.0144147570522889	0.0765103151701803	0.0075899480405965	0.0356127441387034	-0.0001470131027023	0.0559422444073351	0.0002061694242259	0.0538722083867847	-0.0053029595742694	0.3329342614662757	0.0065809811305096	0.3282649600205738	ASIC1	13138	SMARCD1	14514	GPD1	33296	False	False	False	ref	-20	0.002808	-20	0.008545
782	chr12	50187707	C	T	rs7315690	0.0066087981399999	0.4685726153718466	0.0066087981399999	0.4813447326072962	0.0085896104039028	0.4802452874621803	5.65009403547817e-05	0.4869698375466439	5.65009403547817e-05	0.498773886436878	0.3510223135094762	0.4153358006642114	0.0022782381367958	0.4037533881594766	0.0022782381367958	0.4168361782557559	0.0030166232536902	0.4231736901745958	1.94990951536539e-05	0.4139644431689556	1.94990951536539e-05	0.4265125629119016	0.0047220406850692	0.403053129875903	0.0047220406850692	0.4132991378949478	CERS5	20174	COX14	75624	GPD1	83724	False	False	False	alt	-100	0.001785	75	0.012085
783	chr12	50189367	A	G	rs7138420	-0.0590580394	0.0193719147501435	0.0590580394	0.0185762007172586	0.0239469891223253	0.0200992502760627	-0.001820017991965	0.01303054983195	0.001820017991965	0.0125319952886905	0.3081587983277835	0.475150223695554	-0.0195918661263947	0.0504990850596133	0.0195918661263947	0.0474096464834676	0.0076925633088164	0.04888117312409	-0.0006028653496033	0.0219166690957597	0.0006028653496033	0.0208384958602557	-0.046127034512806	0.0085618780381983	0.046127034512806	0.0083105699176107	CERS5	21834	COX14	77284	GPD1	85384	False	True	False	ref	-20	0.00653	55	0.03043
784	chr12	50231275	A	C	rs12425229	0.0146956323	0.235380107186698	0.0146956323	0.245422535945239	0.007695796786497	0.6462372688355985	0.000114675908522	0.2844366688954401	0.000114675908522	0.2941501984705832	0.425498189815247	0.293371906206718	0.0061852414027662	0.1898368070540633	0.0061852414027662	0.1999564292305372	0.0032702643749934	0.3735651564480629	4.81762360706341e-05	0.2216680496048729	4.81762360706341e-05	0.2316403330873742	0.0070415668212325	0.2606867890979547	0.0070415668212325	0.2684205477903039	LIMA1	52245	CERS5	63742	COX14	119192	False	False	False	alt	-70	0.01785	-15	0.083
785	chr12	50259146	T	C	rs10783344	0.0267759894	0.1153038139712262	0.0267759894	0.1222501628840491	0.0080521315815433	0.5597751180892658	0.0002285232092094	0.1489222401981484	0.0002285232092094	0.1560618907638943	0.1878235251403022	0.677199324637879	0.0052425714006463	0.2306399657237768	0.0052425714006463	0.2416819423338903	0.0015619322564674	0.6790411186126776	4.6134011535450494e-05	0.2523286893089927	4.6134011535450494e-05	0.2630384366486375	0.0249546157117812	0.0388839391527049	0.0249546157117812	0.039862368559781	LIMA1	24374	CERS5	91613	LARP4	133238	False	False	False	alt	-95	0.00662	15	0.012886
786	chr12	50260192	T	C	rs1972611	0.0274096184	0.1083438107548185	0.0274096184	0.1150756084883598	0.0103129770614943	0.2748763294685792	0.0002847510518176	0.0974610888964897	0.0002847510518176	0.1030515713808856	0.225541758731937	0.6130343378550228	0.0061213164379947	0.1921096325793105	0.0061213164379947	0.2023891783991397	0.0022881036469037	0.5429978292901488	6.252174239130442e-05	0.1738406130218896	6.252174239130442e-05	0.1830084158898311	0.0256890631645556	0.039194802109936	0.0256890631645556	0.0402110164241853	LIMA1	23328	CERS5	92659	LARP4	132192	False	False	False	alt	85	0.00534	-85	0.0589
787	chr12	50280266	C	T	rs67138019	-0.054930304	0.0205248969843686	0.054930304	0.0192541615535837	0.0150922242652538	0.0767266043002074	-0.0008402341532783	0.016334581580218	0.0008402341532783	0.0155176405763821	0.4606997997904541	0.2349271242884797	-0.0253045946741132	0.0261902993698337	0.0253045946741132	0.0240462248521865	0.0069325608213707	0.0492033100666851	-0.0003857967169434	0.0184912196450991	0.0003857967169434	0.0172242356641632	-0.0225645494247865	0.0512677151586497	0.0225645494247865	0.0500098397005962	LIMA1	3254	LARP4	112118	CERS5	112733	False	True	False	ref	-45	0.01489	-45	0.05847
788	chr12	50284576	G	A	rs12832940	-0.0230170292	0.1547693322878542	0.0230170292	0.1472067710021671	0.0116304245294324	0.1976934486479631	-0.000282737317397	0.1192746973079736	0.000282737317397	0.1136070920406887	0.536358260977811	0.1195175829284996	-0.0124147098979963	0.1009732634195008	0.0124147098979963	0.094409082986075	0.0062613660471314	0.0753489355990524	-0.000152997786423	0.0836360206432107	0.000152997786423	0.0785931510669742	-0.0057303498998951	0.3468450255359903	0.0057303498998951	0.3376607493334365	LIMA1	1056	LARP4	107808	FAM186A	112046	False	False	False	ref	-45	0.01746	-45	0.0734
789	chr12	50289962	T	C	rs7311973	-0.0070149502199999	0.4836619807953088	0.0070149502199999	0.4713272651141188	0.0230122528164408	0.0141755371013418	-0.000165266177176	0.2333272162079305	0.000165266177176	0.2245884642140211	0.1516986690733306	0.7327099863327664	-0.0010581837986398	0.6008339008131119	0.0010581837986398	0.5871863267754168	0.0035500962340929	0.3074129689135773	-2.5525602873325592e-05	0.3898128977897798	2.5525602873325592e-05	0.3778843012095561	-0.006695090198031	0.3116241688125895	0.006695090198031	0.303024640683588	LIMA1	6442	LARP4	102422	FAM186A	106660	False	True	False	ref	100	0.00874	100	0.0553
790	chr12	50358938	G	A	rs11169393	0.0018685836199999	0.7932495215167961	0.0021090310599999	0.803468941486746	0.0306824352488651	0.0035903604128744	5.215414460600702e-05	0.4713435882557169	6.152441350876461e-05	0.4808231904964582	0.0530337451633315	0.8974119353679235	0.0001161442918144	0.8822977090486336	0.0001190651100246	0.893375963612681	0.0015262350290186	0.6758673390139303	3.254893128434937e-06	0.7545919401034366	3.368717803847848e-06	0.7655232662667526	0.0013257398935673	0.7341586491309163	0.0013672340999387	0.7444150834002732	LARP4	33446	FAM186A	37684	LIMA1	75418	False	True	True	alt	-75	0.00589	100	0.0365
791	chr12	50465394	G	A	rs12578525	0.0032924976	0.6929320654299299	0.0032924976	0.706382736584458	0.0230864192254254	0.0146805699636266	7.807486795824984e-05	0.4089124137258122	7.807486795824984e-05	0.4201379228986151	0.0106100685691759	0.9765418578588744	2.8511762099704217e-05	0.945509721565258	2.8511762099704217e-05	0.95970025462336	0.0002283451257972	0.9424419580837128	6.157874493829019e-07	0.9046147581615164	6.157874493829019e-07	0.918911253568757	0.00055187294474	0.8671553103728539	0.00055187294474	0.8812388938582922	DIP2B	39592	FAM186A	68772	LARP4	73010	False	True	False	alt	-100	0.01181	80	0.03967
792	chr12	53250416	T	C	rs140587031	0.004505488012	0.6205755253122799	0.004505488012	0.6343553881697386	0.0253568678409388	0.0090822966814763	0.0001048288323138	0.3400200718589798	0.0001048288323138	0.350783458819535	0.1292876482121183	0.764745008325496	0.0005727262470368	0.7058311766503372	0.0005727262470368	0.720333364736035	0.0032374786194043	0.3303367205210682	1.3235724476332034e-05	0.5114045181283181	1.3235724476332034e-05	0.5249987690254349	0.0036597890019605	0.4700493289613142	0.0036597890019605	0.4811926900602018	MFSD5	836	ENSG00000283536	8515	RARG	17436	False	True	True	alt	-60	0.00474	-55	0.02313
793	chr12	53336380	G	A	rs61928076	-0.0328049476	0.0839828517522959	0.0328049476	0.0792966761322504	0.0152924575783622	0.0769683285593583	-0.0005145893920619	0.0457418715875552	0.0005145893920619	0.0433291909536183	0.5014471104472038	0.1656741273058468	-0.0164056917551373	0.0648843931478229	0.0164056917551373	0.0602342425274999	0.0076154212220075	0.0355061581718341	-0.0002557265783524	0.0391561154131124	0.0002557265783524	0.0365739717275053	-0.0112407805060218	0.1896895839003861	0.0112407805060218	0.1841469736573071	SP7	8935	AAAS	11516	MYG1	36684	False	False	False	ref	55	0.001912	-45	0.02795
794	chr12	53471071	A	G	rs11170562	0.030075207	0.0913170046251826	0.030075207	0.0972495444438304	0.0075963084400005	0.6514121946934345	0.0002328793935447	0.1330250699833147	0.0002328793935447	0.1400157518249723	0.350306538449569	0.4185722327862386	0.0104791061293221	0.1077016438212411	0.0104791061293221	0.115691523598097	0.002652540660584	0.4862199389974114	8.089472483015723e-05	0.1384313187678771	8.089472483015723e-05	0.146745915470304	0.0201039429869604	0.0647932631072088	0.0201039429869604	0.0665927654812697	PCBP2	18968	MAP3K12	28992	PRR13	29392	False	False	False	alt	95	0.007053	95	0.04803
795	chr12	53555002	A	G	rs7307025	0.0560470714	0.0170984554153098	0.0560470714	0.0182943375821863	0.0113506155256658	0.2062056426367575	0.000678399413347	0.0271378668569486	0.000678399413347	0.0288884540728991	0.2930113382918909	0.5105700123295701	0.0164420467976808	0.0564333806548284	0.0164420467976808	0.0614141137780565	0.0033068817848814	0.3598489646435244	0.0001976473908545	0.0520508649351357	0.0001976473908545	0.0561517925451119	0.0461581551675846	0.0050267319538397	0.0461581551675846	0.0051787301605049	NPFF	47518	TARBP2	54080	MAP3K12	54939	False	True	False	alt	-75	0.00897	-85	0.0903
796	chr12	53684303	A	C	rs55844955	0.109528789	0.001694423250252	0.109528789	0.0017642463771195	0.0567019458097216	0.0004081738653725	0.006612804767382	0.0006379394099285	0.006612804767382	0.0006633785739215	0.3528708804033236	0.4119894657059637	0.039259479072245	0.0070861874947823	0.039259479072245	0.007690690210687	0.0203104231557403	0.0015449994963813	0.0023970286347786	0.0011943849677624	0.0023970286347786	0.0012507995956254	0.0820008506312305	0.0006149701979647	0.0820008506312305	0.0006086353742937	ATP5MC2	6895	CALCOCO1	43442	ATF7	57893	False	True	True	alt	-35	0.004578	-100	0.0332
797	chr12	71867788	C	T	rs7973727	-0.00678915254	0.5026314116623095	0.00678915254	0.49007479727738	0.007677949523808	0.6353079725528182	-5.464612244547296e-05	0.5440996106059871	5.464612244547296e-05	0.5319568982354896	0.1909501135903899	0.6710191972319706	-0.0012378862963194	0.5708187299485923	0.0012378862963194	0.5571638825991326	0.0014511199765947	0.7112793226615133	-9.803257861305953e-06	0.596543126218895	9.803257861305953e-06	0.5831775271022968	-0.0063818089399267	0.3259222983218028	0.0063818089399267	0.3170013756691884	TBC1D15	28080	TPH2	71058	RAB21	112924	False	False	False	ref	-50	0.007835	-95	0.01636
798	chr12	71878892	A	G	rs61924145	0.00817648414	0.3986342347327308	0.00817648414	0.4104027546931075	0.0150542016532569	0.0777227528679672	0.0001215341814792	0.2657457950507391	0.0001215341814792	0.2752959860150138	0.247552360501665	0.5815791600937505	0.0020620229301344	0.4233373368667207	0.0020620229301344	0.4363837367655995	0.0036725124344828	0.2982021774068258	3.018991953768483e-05	0.3107713249524233	3.018991953768483e-05	0.3220853064668493	0.007373520472204	0.2533390531457072	0.007373520472204	0.2612005351120897	TBC1D15	39184	TPH2	59954	RAB21	124028	False	False	False	alt	-100	0.004883	-95	0.02011
799	chr12	71890721	G	C	rs12302711	0.00293946306	0.598308734388733	0.00448776546	0.6074736738147547	0.0061744167031733	0.920814233862716	1.877488112926656e-05	0.6872498189905533	2.8345317670292592e-05	0.6964367990001389	0.1155862612682703	0.7981983654848371	0.0003855850545619	0.7124419977604798	0.0005664524170304	0.7219656827456563	0.0007408087281378	0.8537362748201465	2.595950432230957e-06	0.7615209922920693	3.713935949596222e-06	0.7709844617370704	0.0026079108704446	0.4562416268724855	0.0038651853234991	0.4638052870745287	TPH2	48125	TBC1D15	51013	RAB21	135857	False	False	False	alt	-30	0.0007095	-75	0.0401
800	chr12	71912128	T	A	rs17110384	-0.009529511	0.3812029936473452	0.009529511	0.369582670033727	0.0188355611745351	0.0335605617526577	-0.0001826069691152	0.2013060752522297	0.0001826069691152	0.1931250908999982	0.1526094669031835	0.7304989959626571	-0.0015961498429459	0.5237908873772297	0.0015961498429459	0.5105328777958231	0.0029324472925144	0.408555664498555	-3.1377697957399024e-05	0.359620717102894	3.1377697957399024e-05	0.3480053366356358	-0.0088818348738056	0.229312111126959	0.0088818348738056	0.2223929968176007	TPH2	26718	TBC1D15	72420	RAB21	157264	False	False	False	ref	35	0.002468	-100	0.0476
801	chr12	71912352	C	G	rs17110387	-0.0196292504	0.1958729272213832	0.0196292504	0.187184681156826	0.0086071179718823	0.4770124631240202	-0.0001727162624257	0.2191426416127624	0.0001727162624257	0.2107538389860707	0.2079004968931213	0.6357797206324722	-0.0040653171329336	0.3094079126273685	0.0040653171329336	0.2976343947143294	0.0018516604534734	0.6274160257427482	-3.691655558502944e-05	0.3173663415011772	3.691655558502944e-05	0.3062687807972443	-0.0172574404298799	0.0913975970081499	0.0172574404298799	0.0887576643775844	TPH2	26494	TBC1D15	72644	RAB21	157488	False	False	False	ref	20	0.001259	60	0.01787
802	chr12	71918488	G	A	rs11178985	-0.00835545064	0.4718688156597064	0.00835545064	0.4596681707109226	0.0075097013636997	0.6753500469493617	-6.342129147753548e-05	0.5282776105703038	6.342129147753548e-05	0.5161649336738982	0.1093911762570151	0.809559255632448	-0.0010864917960419	0.6412259947810047	0.0010864917960419	0.62777746510566	0.000816930901592	0.8347397945369	-8.280041071121976e-06	0.6733008600337289	8.280041071121976e-06	0.6597251842313091	-0.0075540202699197	0.310992426080485	0.0075540202699197	0.3033711335310836	TPH2	20358	TBC1D15	78780	RAB21	163624	False	False	False	ref	100	0.001467	-95	0.02774
803	chr12	71927834	A	G	rs10506643	0.0153597472	0.2338950250116868	0.0153597472	0.2438876387742631	0.0117652636308167	0.1790875106187938	0.0001835034287264	0.1861447717323973	0.0001835034287264	0.1943056459674808	0.216854946628077	0.630804252014558	0.0033485750993861	0.3209785435751908	0.0033485750993861	0.3330100430263024	0.0025619875819441	0.5050210614602698	4.015238416754545e-05	0.2666125387455605	4.015238416754545e-05	0.2771511844595417	0.0140001452297222	0.1197683793161657	0.0140001452297222	0.1235063812357826	TPH2	11012	TBC1D15	88126	TRHDE	159433	False	False	False	alt	100	0.002405	100	0.02498
804	chr12	74908804	G	A	rs7955462	-0.0005778680939999	0.7568111494399843	0.002947058626	0.758462103719588	0.0065804385871695	0.8600788903398245	-3.187753024611654e-06	0.792779490999316	2.098254486549281e-05	0.7950263865821402	0.0272679177169887	0.947324580024506	-1.9160972071478825e-05	0.9278228241959934	9.118780767625475e-05	0.9308760392115436	0.0001802494805192	0.9589714605176882	-1.0914729556353205e-07	0.9366482189784078	6.510076871712661e-07	0.9397863693131534	-0.0002053963215385	0.7668738508003674	0.0012717974252844	0.7691548772083975	KCNC2	301035	ATXN7L3B	370968	GLIPR1L1	425867	False	False	False	ref	65	0.001909	-50	0.01599
805	chr12	74910078	G	T	rs6582256	0.0101472308	0.3311895356121481	0.0101472308	0.342642236781547	0.0367469131495324	0.0016141170594517	0.0003601931183327	0.066211380917212	0.0003601931183327	0.0702005371703242	0.0372348260874075	0.9295059711591572	0.0003755383716758	0.7642867522491457	0.0003755383716758	0.7790688922025215	0.0013685201424461	0.6798565955328559	1.3573741061770276e-05	0.5071422773304104	1.3573741061770276e-05	0.5208165541041802	0.0043942364547349	0.4033189160177819	0.0043942364547349	0.4134783402738925	KCNC2	299761	ATXN7L3B	372242	GLIPR1L1	424593	False	True	False	alt	-15	0.001434	-100	0.055
806	chr12	74916655	T	C	rs6582260	0.00323091597	0.6969228784819401	0.0033549631899999	0.7075881030952208	0.0189096378174641	0.0341286066846108	5.3910702006692615e-05	0.504812918149233	5.653520927623661e-05	0.5151780495282882	0.0239878007033267	0.9539455303676878	7.208422118484649e-05	0.9139983376056664	7.528194460448462e-05	0.9245594241825392	0.0004609223563627	0.8996124198917798	1.225157148366127e-06	0.8628890392372465	1.2928124203587497e-06	0.8734384757871618	0.0010809240759758	0.7734713650771937	0.0011265677029844	0.7837636979701431	KCNC2	293184	ATXN7L3B	378819	GLIPR1L1	418016	False	False	False	alt	20	0.0003357	-100	0.0207
807	chr12	74943371	T	C	rs12316904	-0.00017854448	0.7247338323136286	0.00340778808	0.7198143059543194	0.0081492169512694	0.5487051154383014	-3.416934937193769e-06	0.7472947855362161	2.6045245783014105e-05	0.7417629638396438	0.0523407919169285	0.9070511009375328	-1.532892070720112e-05	0.8825018983515038	0.0001890198146493	0.8759269204101661	0.0004229143842049	0.9125033082097362	-2.2782889312216505e-07	0.8908419612407116	1.4449347939673858e-06	0.8839831942637847	-0.0003153559684228	0.6752159613008193	0.0019709748026431	0.6698840631790088	KCNC2	266468	GLIPR1L1	391300	ATXN7L3B	405535	False	False	False	ref	-100	0.0458	-100	0.0353
808	chr12	74945510	A	G	rs1526821	-0.00294413242	0.7184690316432888	0.00294413242	0.7047711422880619	0.0241755723019106	0.0113578210053606	-6.98762303833105e-05	0.435487883602179	6.98762303833105e-05	0.4239100235496895	0.0929304245894666	0.833067733938969	-0.0002610532904357	0.8266850185560218	0.0002610532904357	0.8125456591905262	0.0024036818112439	0.4707356305591026	-6.33317979399416e-06	0.66982168044577	6.33317979399416e-06	0.6561186622196248	-0.0024481581759146	0.6083451267236116	0.0024481581759146	0.5960428781559284	KCNC2	264329	GLIPR1L1	389161	ATXN7L3B	407674	False	True	False	ref	-100	0.003815	-80	0.01448
809	chr12	74946622	C	T	rs12315638	-0.00232584913	0.7942082539483658	0.00232584913	0.7805802476875332	0.0119077099565697	0.1753695835666285	-2.573029882714572e-05	0.7346025493850177	2.573029882714572e-05	0.7213147416563319	0.0828348841792964	0.8517169700122266	-0.0002013004853561	0.8653625398997763	0.0002013004853561	0.8512883942420807	0.0009776331355121	0.8002659093645352	-2.2063164762938938e-06	0.8369814511901926	2.2063164762938938e-06	0.8228630261233576	-0.0018983599414931	0.6898906661983589	0.0018983599414931	0.6768427390083935	KCNC2	263217	GLIPR1L1	388049	ATXN7L3B	408786	False	False	False	ref	60	0.004654	100	0.03333
810	chr12	74951873	G	C	rs11180302	-0.0311677712	0.0963292121221314	0.0311677712	0.0907043400318206	0.0094313207931724	0.3671532969009446	-0.0002943324563539	0.1032451273135209	0.0002943324563539	0.0978507554655725	0.0383344225562505	0.928729738372101	-0.0013298134960895	0.5685083207841239	0.0013298134960895	0.5548761692054418	0.0003554854530302	0.9231913179262612	-1.236919789349071e-05	0.5569891981209829	1.236919789349071e-05	0.5438971169459558	-0.0150022303135924	0.1420393778703991	0.0150022303135924	0.1382075214828998	KCNC2	257966	GLIPR1L1	382798	ATXN7L3B	414037	False	False	False	ref	100	0.01654	-45	0.01471
811	chr12	74954419	C	G	rs1526803	-0.00443045234	0.6486341540274154	0.004566921632	0.6387763920528962	0.0061689281118026	0.8843984577933295	-2.627649775402079e-05	0.7469546578791973	2.7273540537790185e-05	0.7376917226294202	0.0027987842197532	0.9952745176418536	-2.2524277146958588e-05	0.9781781947050048	2.2712561423334595e-05	0.9790311109058472	1.6829639307785128e-05	0.9966468904032206	-1.3234544472768834e-07	0.9829265646883324	1.3372104707046506e-07	0.9848184907959175	-0.0004004190914843	0.926233023797026	0.0004004190914843	0.922349987290786	KCNC2	255420	GLIPR1L1	380252	ATXN7L3B	416583	False	False	False	ref	95	0.02539	90	0.0365
812	chr12	74959499	A	G	rs952408	0.00039289206	0.7782104335871884	0.00239932246	0.7760864796395411	0.0234807424498618	0.0128599202476637	1.0985822813455422e-05	0.5140869066057153	5.73014942624475e-05	0.5125996279756757	0.1444475565099223	0.7465992047112273	-8.64764383966001e-06	0.7919047728288926	0.0003222937539171	0.7885221779658673	0.0033855093045874	0.3286169954606492	4.682721818281382e-09	0.6240961439531397	7.642382060978809e-06	0.6210533752780812	0.0001908733493085	0.6269630426936915	0.0023070778742517	0.6251182714039276	KCNC2	250340	GLIPR1L1	375172	ATXN7L3B	421663	False	True	False	alt	30	0.00406	-100	0.0432
813	chr12	74973452	G	T	rs12300503	-0.0380798591999999	0.0664773632221406	0.0380798591999999	0.0626681093896288	0.0139933895736673	0.102225351517837	-0.0005513570663207	0.0419109853829163	0.0005513570663207	0.039574750327534	0.3155675888754032	0.4650507396425736	-0.0130944121135045	0.1038013817144128	0.0130944121135045	0.0971571888713497	0.0045054544353376	0.1911953529438667	-0.0001923313030472	0.0683407280852698	0.0001923313030472	0.0641060891836464	-0.02697538356207	0.0384469884989887	0.02697538356207	0.0374795497607028	KCNC2	236387	GLIPR1L1	361219	CAPS2	417476	False	False	False	ref	-50	0.005157	-10	0.002258
814	chr12	87265073	G	A	rs17014518	-0.0449504008	0.042230366185388	0.0449504008	0.0396747294039197	0.0102772082937336	0.3013385791751932	-0.0005085342853069	0.054600352543545	0.0005085342853069	0.0517545849368228	0.0937437110343467	0.8344517874793315	-0.0047029531188217	0.294410574629028	0.0047029531188217	0.2826662263024952	0.0010160624652023	0.797332531667287	-5.49475014622615e-05	0.2655910234390493	5.49475014622615e-05	0.2549896441641615	-0.0359443562692558	0.0187107189496533	0.0359443562692558	0.0182691371681569	MGAT4C	426169	RLIG1	768774	C12ORF50	768964	False	False	False	ref	10	0.002182	25	0.009766
815	chr12	87287207	T	G	rs66619626	0.0014317344	0.6306377954604636	0.0042133948	0.6354207434003845	0.0120772059530991	0.1676352730384094	1.621336440252709e-05	0.5277961868766529	4.9907498934674176e-05	0.5319489655375724	0.13959895849542	0.7576172628546883	0.0001986094610971	0.6951463980224866	0.0006214021179375	0.6997353582127359	0.0016854582359883	0.6609258535198171	2.2013998395551904e-06	0.6340561976550819	7.344276941580058e-06	0.6382614094136826	0.0013568605483459	0.4444716585178623	0.0039087542401891	0.4479288127559694	MGAT4C	448303	RLIG1	746640	C12ORF50	746830	False	False	False	alt	90	0.002298	-15	0.011566
816	chr12	87294412	T	C	rs11104403	-0.00918640732	0.3963771747579379	0.00918640732	0.3845006766691228	0.0216835796046405	0.0190588606991823	-0.0002061324702708	0.1832224535086455	0.0002061324702708	0.1755314201022231	0.0211164016224234	0.9620336456080132	-0.0002078835356132	0.8773730455030585	0.0002078835356132	0.8631443586783394	0.0004420184291281	0.9105704813565182	-4.473581426922627e-06	0.7673357939825041	4.473581426922627e-06	0.7532214805149171	-0.0027489911721075	0.5880205009049109	0.0027489911721075	0.5757574897851401	MGAT4C	455508	RLIG1	739435	C12ORF50	739625	False	True	False	ref	-100	0.001173	90	0.0096
817	chr12	87295117	C	A	rs12815820	-0.0121835616	0.3199118608595575	0.0121835616	0.3089101683022525	0.0101613257963333	0.2936795178748853	-0.0001290661245254	0.2976169429121684	0.0001290661245254	0.2880019541171274	0.1187916887104637	0.7937844128003789	-0.0015161275614863	0.5404876997830986	0.0015161275614863	0.5269698840847254	0.0012114719677845	0.761352746476545	-1.6101514535386924e-05	0.5072063544393055	1.6101514535386924e-05	0.4945616998383176	-0.0108030166288031	0.1888427206950526	0.0108030166288031	0.1832899864987204	MGAT4C	456213	RLIG1	738730	C12ORF50	738920	False	False	False	ref	-100	0.0003967	-95	0.010254
818	chr12	87302883	T	A	rs725421	0.00324566392	0.6092978098198274	0.00427741528	0.6175018770939033	0.0141875802331808	0.0981448968964313	5.05721624915061e-05	0.4577663679021715	6.20356838694954e-05	0.4656294899735191	0.111833110301974	0.806502230294343	0.0003980747402091	0.723116953677354	0.0004989498185849	0.7312879351370247	0.0015905035782392	0.6871501338603468	6.126843353250371e-06	0.6334511666115806	7.247640135245507e-06	0.6418757616848625	0.0031784562080519	0.4531876056493166	0.0039129036608263	0.460322908319986	MGAT4C	463979	RLIG1	730964	C12ORF50	731154	False	False	False	alt	-50	0.00066	10	0.01306
819	chr12	87311437	G	A	rs7972062	-0.0197326464	0.2038143539213384	0.0197326464	0.1949142967301901	0.0109230923063227	0.2350896357101265	-0.0002251839371618	0.167906706311225	0.0002251839371618	0.1605301485500152	0.3071982074502847	0.4888177730877518	-0.006247868850745	0.2216526555470025	0.006247868850745	0.2111360219704768	0.0033796548282235	0.352881682490746	-7.18132820205283e-05	0.1904831910582879	7.18132820205283e-05	0.181252658556284	-0.0152906150478738	0.1249994243675752	0.0152906150478738	0.1213398442688659	MGAT4C	472533	RLIG1	722410	C12ORF50	722600	False	False	False	ref	-10	0.0008316	10	0.006104
820	chr12	87318399	T	A	rs10858579	0.0259434988	0.1198192376247356	0.0259434988	0.126651898800391	0.0092761956820016	0.3982873608384311	0.0002506909294151	0.1272882614114046	0.0002506909294151	0.1338830188541265	0.2124088424153777	0.6376230535139665	0.0057912477622076	0.2131628834549981	0.0057912477622076	0.2239238530036539	0.0020171229914998	0.6040889456685787	5.747952573439135e-05	0.2116993024934819	5.747952573439135e-05	0.2216767358591632	0.0250106328903826	0.0439896227484733	0.0250106328903826	0.0451666651124516	MGAT4C	479495	RLIG1	715448	C12ORF50	715638	False	False	False	alt	50	0.0027	70	0.03217
821	chr12	89434954	C	T	rs1845141	1.2226348000000074e-05	0.8744992921866891	0.0012452511879999	0.8785849916139687	0.0232794109821882	0.0137348983913571	-2.2592807695401924e-06	0.6751403324750789	3.221885833840732e-05	0.6786588780713183	0.0702994844344857	0.874438282900556	1.1144373363199124e-05	0.9118320640892604	8.855685690395243e-05	0.9165126047564992	0.001642596468294	0.6771724144255578	1.0365902830269593e-07	0.8238945043479912	2.2771712380952413e-06	0.82849478339402	0.00010166080561	0.8182475917746147	0.0009190966711272	0.8225082670826862	DUSP6	82453	GALNT4	89842	POC1B	91093	False	True	False	alt	100	0.005615	15	0.00919
822	chr12	89457189	A	C	rs7308051	0.0260157878	0.1205000590389541	0.0260157878	0.127687517006293	0.01043333348006	0.2636684510955526	0.000273847420638	0.106141804295281	0.000273847420638	0.11210060700455	0.0984781999813276	0.8248355937720485	0.0025904276903996	0.387687097169189	0.0025904276903996	0.400667899531117	0.0010727010382462	0.780574449003561	2.8404462067238687e-05	0.3535470300050065	2.8404462067238687e-05	0.3653428083707865	0.0199275926098818	0.0702878827669552	0.0199275926098818	0.0722718619239665	GALNT4	67607	POC1B	68858	POC1B-GALNT4	69073	False	False	False	alt	-60	0.01703	-50	0.01419
823	chr12	89463361	G	A	rs6538188	0.002843516334	0.6725791363931082	0.003194054626	0.6824567184935761	0.0076974808285255	0.6573466658960585	2.311432670975837e-05	0.6997718801142156	2.5405021785558625e-05	0.7092774870278206	0.1614622558325293	0.7218069291697073	0.0004874940467921	0.7071040598392306	0.0005451189216645	0.7166697647079492	0.0012563191769235	0.7504577197151804	4.011166865010745e-06	0.7249340450492623	4.387733477384385e-06	0.7344119143423122	0.0030311517754333	0.5110641086532453	0.0033257606406705	0.5192381453149902	GALNT4	61435	POC1B	62686	POC1B-GALNT4	62901	False	False	False	alt	-20	0.001923	-20	0.01001
824	chr12	89488768	T	C	rs9634199	0.0215995443999999	0.1523093543074287	0.0215995443999999	0.1604630898043406	0.009153132877974	0.4037434120039083	0.0002075310666718	0.1592845360808658	0.0002075310666718	0.1667396834926623	0.1474102428448427	0.7410486128492717	0.0032159828556984	0.3288890482610619	0.0032159828556984	0.3411050643597566	0.0013371406502271	0.730264093180449	3.0231381518704164e-05	0.323194582703926	3.0231381518704164e-05	0.3347729055105296	0.0197263457089803	0.0627041186019204	0.0197263457089803	0.0645316155405374	GALNT4	36028	POC1B	37279	POC1B-GALNT4	37494	False	False	False	alt	-40	0.0047	95	0.01947
825	chr12	89499935	A	G	rs10858884	0.0904917492	0.0034254836406928	0.0904917492	0.003637638985339	0.020071183117928	0.0267738411791573	0.0018781567121649	0.0045253025642328	0.0018781567121649	0.0047501500216022	0.5963983028869595	0.051026186352202	0.0541951106509123	0.0023272001590198	0.0541951106509123	0.0025072744975506	0.0119928468197328	0.0067882918632621	0.0011271843504314	0.0033836836266431	0.0011271843504314	0.0035779555243868	0.0133279390865049	0.129881494470688	0.0133279390865049	0.1340387437159344	GALNT4	24861	POC1B	26112	POC1B-GALNT4	26327	False	True	True	alt	95	0.00923	45	0.11743
826	chr12	89503226	T	C	rs10777173	0.0474013992	0.0294878966325868	0.0474013992	0.0315912012999292	0.0123348624127878	0.1543245201841266	0.0005937326382912	0.0281650097483388	0.0005937326382912	0.0300139748502296	0.5666697787321445	0.0810242724805669	0.0268999527202429	0.0186544211027672	0.0268999527202429	0.0204382069496262	0.0069959402304235	0.0485792575577966	0.0003372523524291	0.0201435449878436	0.0003372523524291	0.0218026467384297	0.0093714665089886	0.1979354301110556	0.0093714665089886	0.2044603521739146	GALNT4	21570	POC1B	22821	POC1B-GALNT4	23036	False	False	False	alt	-65	0.02228	70	0.042
827	chr12	89545558	G	A	rs11105326	-0.1431227832	0.0005217821768656	0.1431227832	0.0004927013162291	0.0482804986498151	0.000790288140887	-0.0071128628108147	0.0005471407399952	0.0071128628108147	0.0005154751225882	0.422344630131018	0.3005708325085403	-0.0609062935883655	0.001469428377049	0.0609062935883655	0.0013903631247835	0.0206260650876025	0.0014774006334746	-0.0030617268213499	0.0007595810249331	0.0030617268213499	0.0007196841127693	-0.0824655857425906	0.0004986596519103	0.0824655857425906	0.0004939073679488	POC1B-GALNT4	19296	POC1B	19511	GALNT4	20762	False	True	True	ref	-25	0.000839	-100	0.02136
828	chr12	89576410	T	C	rs77966649	0.0266821684	0.1208745926934149	0.0266821684	0.1278063908815544	0.008034107102563	0.5957799314182416	0.000223139248407	0.1551170958924796	0.000223139248407	0.1623524676961172	0.0517702465793213	0.9057644198984274	0.0013774625804095	0.5243751026913503	0.0013774625804095	0.5379484021110778	0.0004154152238079	0.9127294514386788	1.1521040982658084e-05	0.5412713146600794	1.1521040982658084e-05	0.5543693331705131	0.0151702818493967	0.1088471688288803	0.0151702818493967	0.1122615170375896	POC1B-GALNT4	50148	POC1B	50363	GALNT4	51614	False	False	False	alt	-15	0.001009	-80	0.02336
829	chr12	91853010	C	G	rs4240748	-0.0029183689	0.6297641150839088	0.00433768038	0.6208341285816913	0.0076703471247509	0.6323064300362986	-2.3734957579230248e-05	0.6682280489414937	3.36771944302673e-05	0.6594120665175905	0.0885009180593159	0.8448291527373301	-0.0002809050890009	0.77983778509499	0.0004005319087291	0.7704339775119917	0.0007233013053	0.8515756936902591	-2.4271947236485044e-06	0.7944400174824772	3.2651772173950785e-06	0.7849736288746181	-0.0025726407950289	0.5029270642160699	0.0036224442162262	0.4951698415753417	BTG1	292836	DCN	669793	LUM	741516	False	False	False	ref	-75	0.004364	-90	0.036
830	chr12	91948482	T	C	rs63482062	-0.0015846317459999	0.7880356540300166	0.0022940828259999	0.7843070150551583	0.0198200532952849	0.0284090852399304	-4.031956216342384e-05	0.5973658588713542	5.13775486625959e-05	0.5928223468713396	0.31339329246154	0.4786354927429261	-0.0005476358743687	0.6878505039845625	0.0007652083211444	0.6837267884436824	0.0062358185320835	0.0756322217410975	-1.3924590424984166e-05	0.5279738768066058	1.7295844068703356e-05	0.5231561241923569	-0.0011327918339401	0.7145225426806149	0.0016639176754944	0.7114014542518048	BTG1	197364	PLEKHG7	754362	DCN	765265	False	False	False	ref	-25	0.00569	100	0.0364
831	chr12	94783625	G	T	rs10777617	-0.028983612	0.1143763171721165	0.028983612	0.1081699060976595	0.0090589424093599	0.4181427826519734	-0.0002666542919347	0.1281252134362919	0.0002666542919347	0.121981497346296	0.2088590130603014	0.6423742069295842	-0.0061901602733963	0.2196617814380306	0.0061901602733963	0.2092052959267515	0.0019118194484041	0.6240883823798841	-5.772513051773228e-05	0.2223435029506521	5.772513051773228e-05	0.2126731402221761	-0.0280500835070902	0.0365437126128516	0.0280500835070902	0.0355824219937226	TMCC3	133068	NDUFA12	220123	NR2C1	290003	False	False	False	ref	-65	0.01175	-60	0.02454
832	chr12	94797338	C	T	rs7311279	-0.0239943902	0.1480504968675368	0.0239943902	0.1405275651933089	0.0087616263433401	0.4556738099534248	-0.0002117878750793	0.1622915236164101	0.0002117878750793	0.1551305821006964	0.0768078507038454	0.8596605633489343	-0.0018617381840278	0.4706232805448909	0.0018617381840278	0.4572446243106937	0.0006723199212749	0.8567940951748114	-1.641166726352235e-05	0.4685156100277314	1.641166726352235e-05	0.4558229654784896	-0.0180935486882643	0.0811086355674377	0.0180935486882643	0.0788679940734194	TMCC3	146781	NDUFA12	206410	NR2C1	276290	False	False	False	ref	-100	0.004272	-90	0.02087
833	chr12	94797413	A	C	rs7311211	0.01103020812	0.3214746053175943	0.01103020812	0.3328246707887173	0.0078795308378248	0.6068133709781923	8.615393049891372e-05	0.3641859762828364	8.615393049891372e-05	0.3751596211091462	0.0771833732715069	0.8590920223244308	0.0008955092463138	0.6144043833063649	0.0008955092463138	0.6285187847549694	0.000606422870926	0.868437357763305	6.980203280869987e-06	0.6302722806029154	6.980203280869987e-06	0.644171082336097	0.0085395076712413	0.2182359252268271	0.0085395076712413	0.2250032434837747	TMCC3	146856	NDUFA12	206335	NR2C1	276215	False	False	False	alt	-90	0.00824	60	0.03918
834	chr12	94801919	G	A	rs11835590	0.02103624392	0.1757277306017092	0.02103624392	0.1842487319998641	0.0095259332893702	0.3621928019466329	0.0002187910426925	0.1750024725295349	0.0002187910426925	0.1825788266849499	0.2389879563066007	0.5949317061339019	0.0053225040035375	0.242162228679202	0.0053225040035375	0.2534235696517212	0.0023290505293715	0.5457992268266949	5.648450510314016e-05	0.2339496640952793	5.648450510314016e-05	0.2440699552191184	0.0187470824386144	0.0842690275331963	0.0187470824386144	0.0868504386386601	TMCC3	151362	NDUFA12	201829	NR2C1	271709	False	False	False	alt	100	0.0174	-85	0.06104
835	chr12	99042804	T	G	rs1319893	-0.00284265378	0.7215154740367342	0.0029928095	0.7127870032829989	0.0122486100745992	0.1604025208993221	-3.773591809309115e-05	0.6235555345282184	3.926609179136254e-05	0.6149402148216753	0.3219016794780028	0.4638725893891787	-0.0009520941091491	0.6193997578385411	0.0009925150771412	0.6103045903884209	0.0039540226575134	0.2609385072691861	-1.2557389184778614e-05	0.545455977239455	1.2969302248919764e-05	0.5364069089393403	-0.0021514746003588	0.6373710083481253	0.0022801066401103	0.6292803240329873	APAF1	397654	IKBIP	397691	SLC25A3	449212	False	False	False	ref	-5	0.002464	-35	0.02711
836	chr12	99044685	C	T	rs7311721	-0.0365510781999999	0.0686957700515889	0.0365510781999999	0.0643381926042944	0.0104556157605405	0.2570317372971135	-0.0003894181507623	0.0685697334376438	0.0003894181507623	0.0647155023486612	0.3673419848753617	0.388676565596606	-0.0134631397851895	0.0897831467507008	0.0134631397851895	0.0834416935732693	0.0038396325431149	0.2780336557308294	-0.000143363534001	0.0838238912921607	0.000143363534001	0.0783802630930386	-0.0229711926472265	0.0487970680077405	0.0229711926472265	0.0475369273388448	APAF1	399535	IKBIP	399572	SLC25A3	451093	False	False	False	ref	90	0.001335	100	0.05533
837	chr12	99046453	G	A	rs7955942	0.00582885348	0.5213062245813517	0.00582885348	0.5338790691651852	0.0065982340517304	0.8561506105440345	3.936495788722057e-05	0.6020290284779415	3.936495788722057e-05	0.6147221402772702	0.1326445295075675	0.7635521253845375	0.0007769830167527	0.6361502513465408	0.0007769830167527	0.6501716447471726	0.0008760963635674	0.8147804680815997	5.255913080768377e-06	0.6826042361551484	5.255913080768377e-06	0.696639020117703	0.0052324194234379	0.3547016713630718	0.0052324194234379	0.3645423075705389	APAF1	401303	IKBIP	401340	SLC25A3	452861	False	False	False	alt	-95	0.01724	-55	0.02022
838	chr12	99050654	A	G	rs1814453	0.0251623608	0.1266291494461882	0.0251623608	0.1339473063377381	0.0085638614682001	0.4971004471756978	0.0002241403819197	0.1481824193464236	0.0002241403819197	0.1553811854051253	0.2719364308758389	0.542454905775336	0.0068505606152705	0.174052989829909	0.0068505606152705	0.1837577142963764	0.0023253477242817	0.5498543308224835	6.089407644927267e-05	0.1894530449702801	6.089407644927267e-05	0.1986649544935007	0.0214774012178549	0.0602424056246154	0.0214774012178549	0.0619949847688339	APAF1	405504	IKBIP	405541	SLC25A3	457062	False	False	False	alt	90	0.03598	90	0.01955
839	chr12	99053361	C	A	rs3794799	0.0104968164	0.3229669934519368	0.0104968164	0.3342114765369367	0.0188285207475031	0.033634161778886	0.0001986910588262	0.1605819112656941	0.0001986910588262	0.168189667538858	0.2986089067313976	0.4931443626275502	0.0030188224294475	0.3337988721744291	0.0030188224294475	0.3460671463856994	0.0055895777903508	0.1064166589063257	5.669039180844003e-05	0.1917283897353335	5.669039180844003e-05	0.2010414387277855	0.0080063071193684	0.2255456856461558	0.0080063071193684	0.2323386488132423	APAF1	408211	IKBIP	408248	SLC25A3	459769	False	False	False	alt	30	0.002136	-45	0.007217
840	chr12	99068591	A	G	rs6419378	0.0041270842999999	0.6188372515792756	0.00430710942	0.629548157815191	0.0200022100242273	0.0272621183593131	7.131795150751794e-05	0.420051048013644	7.56342089880817e-05	0.4296557181471703	0.017188974989367	0.9675493581342156	6.835652193440458e-05	0.9163172869173352	7.153127170222977e-05	0.9268952458366508	0.0003423107581959	0.9263662063864208	1.178035025540015e-06	0.8635511884622622	1.2541523889665898e-06	0.8742734640628698	0.0011742860403115	0.7539649529593926	0.0012531250324173	0.7641215757339461	APAF1	423441	IKBIP	423478	SLC25A3	474999	False	False	False	alt	15	0.0003128	100	0.03647
841	chr12	99073457	T	C	rs2372634	0.0028018685599999	0.7492330855304034	0.0028018685599999	0.76312132344673	0.0169288261558108	0.0527641852722061	4.531169563360825e-05	0.5895064104165708	4.531169563360825e-05	0.6027581129187171	0.2657330470233093	0.5534262632444961	0.0007593381670438	0.6759363870083744	0.0007593381670438	0.6902873477105509	0.0045145874989637	0.1921492618016456	1.2234058432601458e-05	0.5531603745132376	1.2234058432601458e-05	0.5669159225514285	0.002170146993226	0.6278502546161092	0.002170146993226	0.6404425288363976	APAF1	428307	IKBIP	428344	SLC25A3	479865	False	False	False	alt	60	0.000555	-30	0.01511
842	chr12	99074034	C	T	rs7975384	-0.00667545972	0.5184057052736666	0.00667545972	0.505482711522015	0.0127103074114764	0.1393637362346521	-8.079561838789505e-05	0.4109537183613684	8.079561838789505e-05	0.3999714661471873	0.3829251340781543	0.3652187349036898	-0.0025361226690047	0.4192759254141586	0.0025361226690047	0.4063227923664543	0.0048892385568599	0.1547533375895682	-3.088777733165384e-05	0.3427656803735417	3.088777733165384e-05	0.3312943274625535	-0.0036473407400491	0.4872653493088981	0.0036473407400491	0.476287490279721	APAF1	428884	IKBIP	428921	SLC25A3	480442	False	False	False	ref	-30	0.000578	-10	0.00638
843	chr12	99075330	A	G	rs2372636	0.0324910602	0.0816199763392544	0.0324910602	0.0870219740642316	0.0099246158353094	0.3143956461359103	0.0003295578447872	0.0826859700618621	0.0003295578447872	0.0876601802791477	0.0372410502183632	0.93281933707291	0.0012210177973603	0.5497932690098623	0.0012210177973603	0.5635184921651922	0.0003802507175158	0.9221121716684828	1.2827848531423466e-05	0.5225086763118089	1.2827848531423466e-05	0.5357435395376103	0.0145955870911523	0.1189180214301622	0.0145955870911523	0.1225516004425872	APAF1	430180	IKBIP	430217	SLC25A3	481738	False	False	False	alt	-30	0.00041	-50	0.008575
844	chr12	99077062	G	A	rs2372638	-0.00316541548	0.734370880202233	0.00316541548	0.7209052130188557	0.022811572988516	0.0146890765996061	-7.391670996992737e-05	0.4491199674729377	7.391670996992737e-05	0.4377113932924756	0.2983225967074346	0.5031232031582702	-0.0009549653409034	0.6305887784109578	0.0009549653409034	0.6169483700703984	0.0068093215308641	0.0518734266632328	-2.230714114993999e-05	0.4207189242400006	2.230714114993999e-05	0.4086536419507753	-0.0024357099140032	0.6217100252941147	0.0024357099140032	0.6092659138828872	APAF1	431912	IKBIP	431949	SLC25A3	483470	False	True	False	ref	45	0.0008545	45	0.02914
845	chr12	99080758	T	G	rs7137868	-0.00706474912	0.4757923090439162	0.00706474912	0.4633845679822297	0.0268927554173688	0.0066414845863762	-0.0001951411175862	0.186182549031945	0.0001951411175862	0.1783464046532119	0.4576893951182065	0.238635618928217	-0.0032757679462539	0.3456160244657219	0.0032757679462539	0.333497025414257	0.0123260537565648	0.0059833034758182	-9.076356357976676e-05	0.1435283069700324	9.076356357976676e-05	0.1357567820457205	-0.0027697382752932	0.5775325502481384	0.0027697382752932	0.5653110519542002	APAF1	435608	IKBIP	435645	SLC25A3	487166	False	True	True	ref	95	0.003235	100	0.01224
846	chr12	99087094	A	C	rs6538897	-0.01017072148	0.3584187532677474	0.01017072148	0.3469791208552131	0.0212705281550442	0.0211705646477042	-0.000229181162823	0.1575210340601347	0.000229181162823	0.1504691604952459	0.2748078299567423	0.535898191892019	-0.0028507476152374	0.3744059605497838	0.0028507476152374	0.3620827233609351	0.0059457957034366	0.0848835847398935	-6.463340321636063e-05	0.2005619377443857	6.463340321636063e-05	0.1911840583048209	-0.0085727030363385	0.2431703599869809	0.0085727030363385	0.2359550641887528	APAF1	441944	IKBIP	441981	SLC25A3	493502	False	False	False	ref	-70	0.0006094	-15	0.014496
847	chr12	99087253	T	A	rs7299393	0.0024052095432	0.7684334765023753	0.0024214105368	0.7802064647934986	0.0077954310667083	0.6341397474956136	1.942862339589575e-05	0.7819970693891775	1.9561067290367137e-05	0.7937819166865244	0.302986545503584	0.4904115035806236	0.0007651050496291	0.6822374737974453	0.0007701670723266	0.6909546446584955	0.0023908435969151	0.5316786052890735	6.2548252145203095e-06	0.7009628270452052	6.296207491322746e-06	0.7093323706141021	0.0017344578263259	0.6941065762272368	0.0017510555088745	0.7029578088344778	APAF1	442103	IKBIP	442140	SLC25A3	493661	False	False	False	alt	-90	0.003998	-30	0.01932
848	chr12	99098767	C	T	rs10860390	-0.0299824188	0.1053801202607897	0.0299824188	0.0994373331480619	0.0139712593369291	0.0992303539593352	-0.0004243042909457	0.0609180324846883	0.0004243042909457	0.0573834564043835	0.4181516405771844	0.3074278572996844	-0.0126203568325011	0.0992236496220248	0.0126203568325011	0.0923619336675498	0.0058841075860435	0.0867422590683762	-0.0001797629829571	0.0641821733686819	0.0001797629829571	0.0597694392041316	-0.0153694540399796	0.115373943505471	0.0153694540399796	0.1120122486205202	APAF1	453617	IKBIP	453654	SLC25A3	505175	False	False	False	ref	-50	0.03925	70	0.0838
849	chr12	99099957	G	C	rs10745841	-0.006578739924	0.4535979118350821	0.008805808724	0.447405584467364	0.0082760080607837	0.5327415972707714	-7.110135725959963e-05	0.4639537197818827	8.536192408346434e-05	0.4575397967570623	0.1877986286164794	0.6801784660861175	-0.0013661863295901	0.548342085872609	0.0016940817288736	0.5410926107793947	0.0016000888021816	0.686520882739835	-1.4575419438066604e-05	0.5492352599852398	1.667502861379573e-05	0.5415564572619336	-0.0057593958443551	0.2812167005145215	0.0085685536157013	0.2783892864628807	APAF1	454807	IKBIP	454844	SLC25A3	506365	False	False	False	ref	-85	0.02728	-100	0.0174
850	chr12	103913338	A	C	rs80096598	0.0457628978	0.0339792636242547	0.0457628978	0.0363289709978075	0.0157979648324501	0.0662375346657239	0.0007534251394791	0.0205086233806385	0.0007534251394791	0.0217416136935098	0.4007593439765972	0.3235091006757339	0.0186823215313927	0.0444874127553288	0.0186823215313927	0.048343030741912	0.0064064473090333	0.0702821912158147	0.0003111198003362	0.0267003810938937	0.0003111198003362	0.0287701205713441	0.0253031670453012	0.043657209436377	0.0253031670453012	0.044838293915212	HSP90B1	16770	UQCC6	52370	TDG	52485	False	False	False	alt	90	0.004944	95	0.05054
851	chr12	103948094	G	A	rs117856328	-0.0458554722	0.0363315144752549	0.0458554722	0.0339065001159767	0.0098874572221985	0.3220268647031898	-0.0004707279542687	0.0514175424259882	0.0004707279542687	0.0484490851086972	0.2992271704063319	0.4994759459914725	-0.0136584592531584	0.0881034769601212	0.0136584592531584	0.0817833234497241	0.0029083122375672	0.4341478352881757	-0.0001372680807265	0.0891046938826591	0.0001372680807265	0.0833986795202388	-0.0367825392379588	0.0117777233051928	0.0367825392379588	0.011380200947592	UQCC6	17614	TDG	17729	HSP90B1	17986	False	False	False	ref	85	0.019	85	0.01509
852	chr12	103962513	T	C	rs77165492	0.00652416384	0.4707747038454632	0.00652416384	0.4835370708651716	0.0065993574729575	0.8691385849966431	4.215128168568695e-05	0.5591038216831703	4.215128168568695e-05	0.5718329749213568	0.1354744343820993	0.7594755830341806	0.0008440121381683	0.6059485543035792	0.0008440121381683	0.619883491035079	0.0009103965927507	0.8136744944957855	5.565226274274464e-06	0.6570158399814582	5.565226274274464e-06	0.6708363003218751	0.0058963267253809	0.3205990435947665	0.0058963267253809	0.3297030827195831	UQCC6	3195	TDG	3310	HSP90B1	32405	False	False	False	alt	-100	0.0485	55	0.02701
853	chr12	103964469	C	A	rs76093694	-0.00681929192	0.4821777398223533	0.00681929192	0.4697313470954528	0.0080068144018901	0.5652239017150649	-5.565613497067096e-05	0.50681535252431	5.565613497067096e-05	0.4949444505468549	0.2719468044274318	0.5430996314989124	-0.0018868589954137	0.46808227636912	0.0018868589954137	0.4547663800167818	0.002196671103209	0.5619541522396119	-1.5522868068619748e-05	0.4831326502033345	1.5522868068619748e-05	0.4702043833146694	-0.0056722580109751	0.3519097513505478	0.0056722580109751	0.3427023596202058	UQCC6	1239	TDG	1354	HSP90B1	34361	False	False	False	ref	95	0.003914	75	0.04132
854	chr12	104158934	G	T	rs12582033	0.00717280188	0.4482777123637884	0.00717280188	0.4605476480059148	0.0225507958854963	0.0154966125205157	0.0001626647472398	0.2058557124761593	0.0001626647472398	0.2144193938828688	0.0121204576810962	0.9752456862032768	8.769390945477858e-05	0.8997425489011476	8.769390945477858e-05	0.9141193425867766	0.0002667424630459	0.9378736208310182	1.9191905943454062e-06	0.8212931218676524	1.9191905943454062e-06	0.8358630963573893	0.0015290615047873	0.7027441543958247	0.0015290615047873	0.7159154475700525	NFYB	20693	TXNRD1	56846	HCFC2	94402	False	True	False	alt	90	0.00923	80	0.02469
855	chr12	104165950	G	A	rs77743764	-0.124733736	0.0008896721869106	0.124733736	0.0008352216455621	0.0373870980156916	0.0023104747630645	-0.0048285872329685	0.0010551111752034	0.0048285872329685	0.0010005859981992	0.3810018776128382	0.3637107015126115	-0.0478161543427782	0.0034795109580797	0.0478161543427782	0.0032559950896171	0.0145063730085689	0.0050026558106093	-0.0018784047712177	0.0017232283337997	0.0018784047712177	0.0016297313653284	-0.0836772165686365	0.0004742763222613	0.0836772165686365	0.0004697201589355	NFYB	27709	TXNRD1	49830	HCFC2	101418	False	True	True	ref	-80	0.002274	20	0.01599
856	chr12	104172873	G	A	rs61939221	0.00413896818	0.6408485266102654	0.00413896818	0.6542427414842785	0.0087624063727579	0.4571589624066438	3.908681569290963e-05	0.62715192955195	3.908681569290963e-05	0.6402063853363554	0.5801616199338168	0.0661438598569734	0.0023983100753655	0.4098748647199448	0.0023983100753655	0.4228816168936762	0.0050865271741472	0.1385183720868172	2.269006533815346e-05	0.4106682859288065	2.269006533815346e-05	0.4230299959621762	0.00069710266704	0.8487342387729607	0.00069710266704	0.8625430059893606	NFYB	34632	TXNRD1	42907	HCFC2	108341	False	False	False	alt	75	0.01032	-30	0.04077
857	chr12	104238026	A	G	rs4609668	-0.000548351986	0.952371770744234	0.000630691402	0.9436981043951452	0.030509408716123	0.0036896939962074	-1.6405627808003812e-05	0.8148342522050646	1.9008683060585587e-05	0.8056131137862639	0.3586676210334131	0.4035755197157948	-0.0002081460253905	0.8611528861662769	0.0002392422897531	0.8522795008526162	0.0109989963332187	0.0093732732451078	-6.255976133473526e-06	0.6920981746453477	7.239044728847877e-06	0.6830533613294412	-0.0003174306787414	0.9284668613641064	0.0003838214089357	0.9196514635998568	TXNRD1	22246	EID3	65714	NFYB	99785	False	True	True	ref	-35	0.00116	75	0.03424
858	chr12	104242823	G	A	rs4445711	-0.0413375246999999	0.0531704951861966	0.0413375246999999	0.0498462768953586	0.0106863081339726	0.2471305284053492	-0.0004346341664392	0.0623143049813341	0.0004346341664392	0.0587247996427584	0.2092822539652901	0.6452413525654253	-0.009048611653837	0.1590047402687671	0.009048611653837	0.1499474980806703	0.002199364463231	0.5717098312518483	-9.462665778722272e-05	0.1450924257346209	9.462665778722272e-05	0.1372665035058909	-0.0379900206433676	0.0118957892535113	0.0379900206433676	0.0115115632294253	TXNRD1	27043	EID3	60917	NFYB	104582	False	False	False	ref	-75	0.0006037	-40	0.0293
859	chr12	108148814	C	A	rs1981936	0.00292729752	0.6573307967450105	0.00399195728	0.6646254961901797	0.007711754755439	0.6482348440678084	2.2720800034959223e-05	0.6895709180668174	3.0200533345227983e-05	0.6968039879907243	0.2991960497515534	0.4920916834930995	0.0009357718265688	0.568454917066715	0.0012887035677105	0.5756805000022778	0.0022859021389243	0.5484239231894534	7.197672840005832e-06	0.5960890085626191	9.677183599069188e-06	0.6031724985090983	0.001724084274733	0.5889354029371635	0.0025290718783389	0.5952642055239271	WSCD2	19525	CMKLR1	190503	FICD	366464	False	False	False	alt	-80	0.002443	-35	0.013016
860	chr12	108166550	G	A	rs7976025	-0.0362247956	0.0682210762125659	0.0362247956	0.0640406853375001	0.0105275880280094	0.2525677369127175	-0.0003825925668731	0.0664805160151739	0.0003825925668731	0.0627864128707851	0.2364775568211288	0.5964919545889522	-0.0086380157960751	0.1522577121300567	0.0086380157960751	0.1436837415153657	0.0025172279502622	0.4909916540097742	-9.227028397241153e-05	0.1332296809102435	9.227028397241153e-05	0.1260453882905014	-0.0339505596531083	0.0181062251131307	0.0339505596531083	0.0176404397144829	WSCD2	37261	CMKLR1	172767	FICD	348728	False	False	False	ref	-90	0.002369	-65	0.02203
861	chr12	108166873	A	G	rs10778611	0.0551411376	0.0185428126506516	0.0551411376	0.0198761932153867	0.011006905611185	0.2247062227870279	0.0006283138785912	0.0277651012974845	0.0006283138785912	0.029578059404176	0.3077293332918391	0.4851480901919122	0.0171176930768742	0.0521236508397915	0.0171176930768742	0.0566071354154526	0.0033871257804446	0.3481690938722412	0.0001950247936368	0.0501108131090319	0.0001950247936368	0.0539382262952114	0.0442867664602329	0.0067182629657096	0.0442867664602329	0.0068934407188159	WSCD2	37584	CMKLR1	172444	FICD	348405	False	True	False	alt	15	0.0003815	-65	0.0211
862	chr12	108174245	A	G	rs4964233	0.0255448871999999	0.128130374632813	0.0255448871999999	0.1353583130204739	0.0072492431775207	0.7320625313750003	0.000187904091326	0.1825620632704751	0.000187904091326	0.1907157905752217	0.4311891202190894	0.2859792399578482	0.0110527967732121	0.1040543583773339	0.0110527967732121	0.1118338410071591	0.0031228276393378	0.3990006164721777	8.131781725185291e-05	0.1429063957509466	8.131781725185291e-05	0.1512164645104688	0.0122615379827591	0.1555436133094438	0.0122615379827591	0.1605511494360312	WSCD2	44956	CMKLR1	165072	FICD	341033	False	False	False	alt	100	0.002722	-15	0.02245
863	chr12	108181786	A	G	rs2374969	0.0508132754	0.0238663720007075	0.0508132754	0.0256084113231316	0.0095806087677969	0.3510881943941384	0.0004968491599118	0.0399839934174634	0.0004968491599118	0.0426668072229991	0.3472484154399942	0.4242069328393197	0.0177122170062468	0.0489041117810815	0.0177122170062468	0.053346454922906	0.0033283902991464	0.3543064477946382	0.0001732301875785	0.0575958708959484	0.0001732301875785	0.06210956889011	0.0360978848328302	0.0142903274581127	0.0360978848328302	0.0146736795729864	WSCD2	52497	CMKLR1	157531	FICD	333492	False	False	False	alt	-100	0.003723	45	0.01018
864	chr12	108182784	G	A	rs10778612	-0.0084433347999999	0.4240321304612209	0.0084433347999999	0.4118166019427761	0.0065346965325477	0.8496216500618181	-5.672056950756449e-05	0.51906331612888	5.672056950756449e-05	0.5071599913143409	0.2727165219556219	0.5381302957626308	-0.0023706726584092	0.4349874891961662	0.0023706726584092	0.4218479702146729	0.001848176273238	0.6381566996379704	-1.6688397090367315e-05	0.4999168908207479	1.6688397090367315e-05	0.4869366625868359	-0.0071266299442939	0.2935513532938683	0.0071266299442939	0.2855389710903053	WSCD2	53495	CMKLR1	156533	FICD	332494	False	False	False	ref	-55	0.001053	-45	0.0299
865	chr12	108183046	A	G	rs10778613	0.0516276607999999	0.0234287655904841	0.0516276607999999	0.0251856088747934	0.0109634832446214	0.2315715865281981	0.000596887831525	0.0327732482583898	0.000596887831525	0.0348567618598267	0.2415564476809924	0.5912211548136311	0.0129220583290255	0.086413916416135	0.0129220583290255	0.093081335603837	0.002750961058405	0.4529160954364066	0.0001557833667179	0.0786690700454503	0.0001557833667179	0.08414911251693	0.0471249701760391	0.0053257252996045	0.0471249701760391	0.0054848189359016	WSCD2	53757	CMKLR1	156271	FICD	332232	False	False	False	alt	-95	0.012115	-70	0.02832
866	chr12	108187169	G	A	rs2162290	-0.061014217	0.0142265304794837	0.061014217	0.0133411349487477	0.0143129799841352	0.0936024846773698	-0.000889503225181	0.0160963642798112	0.000889503225181	0.0152768648924825	0.2223238830278321	0.618922695714491	-0.0137453125056308	0.0852059851082115	0.0137453125056308	0.079351086886159	0.003286278108199	0.3350467610224621	-0.0002064344628216	0.0534816855319901	0.0002064344628216	0.049963695675687	-0.0569632465067064	0.0024472913529697	0.0569632465067064	0.0023825942095131	WSCD2	57880	CMKLR1	152148	FICD	328109	False	True	False	ref	100	0.002834	-60	0.02702
867	chr12	108192050	A	G	rs1365309	-0.0043867638588	0.6445648769305291	0.0046036344212	0.6394336300522627	0.0076219686341512	0.6539688343843253	-3.550386173748494e-05	0.6839250549636474	3.702378392551175e-05	0.6796417441177544	0.3359142729696366	0.4364876413061152	-0.0013406368910286	0.6038587020019711	0.001412156195939	0.5988090719900505	0.0025365509915269	0.5023758933196592	-1.076539550357519e-05	0.6350805228096634	1.1267483601529328e-05	0.6306509645305406	-0.0034066743430948	0.550899751965045	0.0035685017479434	0.5464263553966231	WSCD2	62761	CMKLR1	147267	FICD	323228	False	False	False	ref	-100	0.00258	5	0.005737
868	chr12	108206460	A	G	rs1106752	0.060972236	0.0125140456931578	0.060972236	0.0134176169545398	0.0141755538239201	0.0952836240461214	0.000881869186906	0.0141464687503011	0.000881869186906	0.0149831401407994	0.3878878411601779	0.3552748995866573	0.0237106660513065	0.0261081004887414	0.0237106660513065	0.0285537302294225	0.0055007832686508	0.1090170179043615	0.000342902887435	0.0203104719842328	0.000342902887435	0.0219043616283455	0.0364941545036773	0.0125894206656424	0.0364941545036773	0.0129131311364787	WSCD2	77171	CMKLR1	132857	FICD	308818	False	True	False	alt	-55	0.001495	-55	0.05957
869	chr12	108208133	G	A	rs7973976	0.00579154976	0.5114759109653331	0.00579154976	0.5244100210784061	0.0085598971107747	0.4960480366595829	4.895510391369211e-05	0.5198072630141061	4.895510391369211e-05	0.5322715965533398	0.0716729426653803	0.8622391665757604	0.0004455703511382	0.7271366262714747	0.0004455703511382	0.741826099046099	0.0006077816287372	0.8626098520598033	3.763195470265294e-06	0.7280596598370117	3.763195470265294e-06	0.7426755570769534	0.004151495347462	0.4184495616419028	0.004151495347462	0.4289739980236652	WSCD2	78844	CMKLR1	131184	FICD	307145	False	False	False	alt	70	0.001352	-95	0.01523
870	chr12	108209193	C	A	rs7313402	-0.000877244932	0.7271986629241058	0.003200783596	0.7235008201242017	0.0160290574975651	0.0648486042312507	-1.122703688757724e-05	0.5682906583490543	5.049375909479518e-05	0.565297980067571	0.1227668336808472	0.7674036229910074	-0.0001131383081431	0.7886032320800914	0.000436117168096	0.7847591334179799	0.0019270345923676	0.5631845531080818	-1.2070118446249011e-06	0.6946445183514748	6.743032027856886e-06	0.691302508674797	-0.0002406663969543	0.6005756205386873	0.0025311465886575	0.5980476967051008	WSCD2	79904	CMKLR1	130124	FICD	306085	False	False	False	ref	70	0.0001831	-40	0.01944
871	chr12	108215857	G	A	rs10861879	-0.0372510324	0.0668177559374545	0.0372510324	0.0625342644759616	0.0080174561866537	0.5885811304208207	-0.0002997114860639	0.1034582918854529	0.0002997114860639	0.0980223799177893	0.2943101069513169	0.5019576991938339	-0.0108911204849602	0.117987407312368	0.0108911204849602	0.1103036592748099	0.0023682221460993	0.531011468476376	-8.79060706439077e-05	0.142931085346414	8.79060706439077e-05	0.1350353763103765	-0.0302741729685992	0.0276008446116727	0.0302741729685992	0.0268691752041558	WSCD2	86568	CMKLR1	123460	FICD	299421	False	False	False	ref	100	0.001221	-60	0.01779
872	chr12	108216899	T	C	rs4964661	0.00129526286	0.258804723015497	0.01472162606	0.2595687688758272	0.008401014752576	0.522465922028871	8.965597371118597e-06	0.2862751331762367	0.0001252932844147	0.2870514501369554	0.3920476353489143	0.346022904115783	0.0005038632437613	0.2163495107732053	0.0059016081243953	0.2173244170777167	0.0032892769690328	0.3724251184497898	3.690942175162837e-06	0.2339649611682102	5.015475015607248e-05	0.2349687372484222	0.0006327866471643	0.2535024973970066	0.0081847322067655	0.254868158637542	WSCD2	87610	CMKLR1	122418	FICD	298379	False	False	False	alt	-10	3.05e-05	0	0.0
873	chr12	108224853	C	T	rs3764002	-0.0073104083599999	0.4571537620140048	0.0073104083599999	0.4447693129766354	0.0077617911383993	0.6375299510345892	-5.827464135133458e-05	0.4997661920226024	5.827464135133458e-05	0.4879406269361265	0.3335179825516862	0.4447619301597136	-0.0024558949721372	0.4136829561629982	0.0024558949721372	0.4009557130680751	0.0025925409097614	0.4922336859418484	-1.9584456307084265e-05	0.440344105881723	1.9584456307084265e-05	0.4280556771143117	-0.0054523387172065	0.3777379397170444	0.0054523387172065	0.3679670239696005	WSCD2	95564	CMKLR1	114464	FICD	290425	False	False	False	ref	100	0.0005465	30	0.02264
874	chr12	108234290	T	C	rs4964665	0.0086964168199999	0.3941593473274696	0.0086964168199999	0.4068187579761132	0.0078791229644543	0.6057969266491605	7.133841768484403e-05	0.4188852413852004	7.133841768484403e-05	0.4311884621335896	0.3356715318623637	0.4434559114804917	0.0028446684635014	0.3626778148016695	0.0028446684635014	0.375540078238379	0.0026328912453367	0.491548767819475	2.331297946681586e-05	0.3821978123780949	2.331297946681586e-05	0.3947771316954093	0.0064025560431124	0.3097059822207624	0.0064025560431124	0.317569566901487	WSCD2	105001	CMKLR1	105027	FICD	280988	False	False	False	alt	-15	0.02179	25	0.02881
875	chr12	108413407	C	T	rs2559882	-0.00816851354	0.4387781138581773	0.00816851354	0.4260969053772865	0.0081729289876135	0.5210410618379455	-6.661472952657412e-05	0.4706806155194628	6.661472952657412e-05	0.4586625474186642	0.029819811408832	0.9408975570555804	-0.0002420642533402	0.8285771377149564	0.0002420642533402	0.8141796386428342	0.0002503031901674	0.94138461299724	-1.987155741266646e-06	0.8318108834153516	1.987155741266646e-06	0.8174974294113144	-0.0037655992282077	0.4859715551997217	0.0037655992282077	0.4750682682603215	CMKLR1	74090	FICD	101871	SART3	147993	False	False	False	ref	-70	0.001312	-35	0.02158
876	chr12	108418329	C	T	rs2559875	-0.0589460254	0.0173541148852621	0.0589460254	0.0164443313873551	0.0159222172092	0.0662725005567942	-0.0009978057266926	0.0162559086101749	0.0009978057266926	0.0155338169334144	0.2045311673357606	0.6485412630126524	-0.012143118197101	0.105649538147631	0.012143118197101	0.09898585920998	0.003384234513026	0.3242804322206235	-0.0002157574608265	0.0585307546152897	0.0002157574608265	0.0548640119600952	-0.0567682237367607	0.0033099144386339	0.0567682237367607	0.0032429909068744	CMKLR1	79012	FICD	96949	SART3	143071	False	True	False	ref	-70	0.0009103	-95	0.04773
877	chr12	108460099	A	G	rs75306978	0.0003153858939999	0.8491908098188881	0.001676173454	0.8475273079716406	0.0104019978296961	0.2832491447080982	-2.568105834033391e-07	0.8188505665602661	1.6174738922744852e-05	0.8167136175270165	0.0956669674996628	0.8260968021810478	2.352416504909464e-05	0.8759424186375815	0.000163676259725	0.8737291900475581	0.0009800369075983	0.790333790976194	-6.780017755269734e-08	0.8595378961723542	1.564475113758198e-06	0.856986539270262	-3.527007541570006e-05	0.7476263174286123	0.0013506364173901	0.7456747638514042	FICD	55179	SART3	101301	ISCU	102484	False	False	False	alt	-45	0.001312	-15	0.03778
878	chr12	108461238	A	G	rs79715421	0.0193098482	0.1764275402996536	0.0193098482	0.1853195420043348	0.0080830390006028	0.5771378306597359	0.000157460910348	0.2081332717899244	0.000157460910348	0.2168695769262513	0.313955538957873	0.4729899327809644	0.0059715027166126	0.1940678742469698	0.0059715027166126	0.2041857418693977	0.0025281324116399	0.504044424814089	4.850629424400229e-05	0.2164575227823273	4.850629424400229e-05	0.2261767936012829	0.0150146785755038	0.1141527285621154	0.0150146785755038	0.1176396860946686	FICD	54040	SART3	100162	ISCU	101345	False	False	False	alt	-100	0.002054	-30	0.007935
879	chr12	110117013	A	G	rs67917264	0.0135538374399999	0.2822439690902588	0.0135538374399999	0.293244020779513	0.0090091432173128	0.4204532073977012	0.0001279098455694	0.2787543473789091	0.0001279098455694	0.2888337409391429	0.2614529196360958	0.5566733086211961	0.0035714012759749	0.3264827685909607	0.0035714012759749	0.3390534083676371	0.0023644306537454	0.5252097214282446	3.39036867263481e-05	0.3189700850889927	3.39036867263481e-05	0.3309788470848728	0.0113341424703575	0.1727787164309116	0.0113341424703575	0.177132403734828	IFT81	7323	C12ORF76	43377	ANKRD13A	117826	False	False	False	alt	100	0.007126	20	0.01697
880	chr12	110451052	C	T	rs3759384	-0.0581850304	0.0163740254006452	0.0581850304	0.0153987716827797	0.011795514548164	0.1975043998451917	-0.0007421486844862	0.0267243351269243	0.0007421486844862	0.0253380612882503	0.5567028703617256	0.0916789991759154	-0.0323662861190277	0.0128540209980247	0.0323662861190277	0.0118664803617308	0.0065328197114778	0.0684111343536789	-0.0004100278122601	0.0201763055459921	0.0004100278122601	0.0188886723106486	-0.0121951472525648	0.1458158635430833	0.0121951472525648	0.1414386149519214	ARPC3	630	FAM216A	17364	GPN3	18216	False	True	False	ref	-90	0.10284	-100	0.0773
881	chr12	110456752	G	A	rs11065647	-0.0120739664	0.3386627660594466	0.0120739664	0.3270573725591624	0.0059239316780851	0.9433734768447024	-7.386371685680194e-05	0.4565057146098237	7.386371685680194e-05	0.4448156993697965	0.1422940071992447	0.7500732736323473	-0.0018512303303394	0.4939715266223598	0.0018512303303394	0.4808262500901313	0.000858539193018	0.8224130072353742	-1.1544079893460969e-05	0.5738883744555338	1.1544079893460969e-05	0.5607875544346097	-0.011767756926939	0.1899435718573695	0.011767756926939	0.1845122605828617	ARPC3	6330	FAM216A	11664	GPN3	12516	False	False	False	ref	-90	0.003693	-85	0.0222
882	chr12	110497463	T	C	rs184629901	0.0180441714	0.1888778640777405	0.0180441714	0.1981428903943941	0.0083024505976374	0.5366896518768905	0.0001505688141703	0.22150933600032	0.0001505688141703	0.2304376919845107	0.1356632330210894	0.7586435980798438	0.0023850535689096	0.3865215384772926	0.0023850535689096	0.3995621886106879	0.0011076233746318	0.7717418840188438	1.9633106785704763e-05	0.4027695521640776	1.9633106785704763e-05	0.4151463848067254	0.0165167688461498	0.0852676105313758	0.0165167688461498	0.0878919454289784	RAD9B	4193	VPS29	4648	GPN3	28195	False	False	False	alt	-100	0.02225	100	0.02374
883	chr12	110512571	T	C	rs4766497	-0.1505283451999999	0.000453146103153	0.1505283451999999	0.0004146344050394	0.045799945261395	0.0010608037066586	-0.0072158706723522	0.000553544223324	0.0072158706723522	0.000509159666904	0.402950238073009	0.318942734868633	-0.0609340254443263	0.0017562977426517	0.0609340254443263	0.0016384622531444	0.0184192817223848	0.0021850892926896	-0.0029322566314928	0.0008843215745866	0.0029322566314928	0.0008384138061138	-0.0962354381269514	0.0002848150188985	0.0962354381269514	0.0002773415147705	VPS29	10460	RAD9B	10915	GPN3	43303	False	True	True	ref	50	0.0017395	85	0.05078
884	chr12	110540227	C	T	rs12311093	0.00565111106	0.5114551714389207	0.00655055314	0.5178559324425304	0.0062991112378037	0.8744572015678065	3.683599760852687e-05	0.5996084324438484	4.205800182349934e-05	0.6047646822007471	0.4375584808971047	0.2753417479445811	0.0025204336274899	0.3935072835842453	0.0029091527261942	0.3999433417777904	0.0027573779343736	0.4698345601983072	1.6348867119635938e-05	0.4665471190770612	1.8615286719001203e-05	0.4723696376081708	0.0023195261361632	0.5659569727399549	0.0028008589300718	0.5705461805943317	VPS29	38116	RAD9B	38571	PPTC7	43091	False	False	False	alt	-15	0.010315	10	0.01032
885	chr12	120682650	T	C	rs12228118	0.0009576951312	0.8094719580470232	0.0016647704112	0.8192338002608607	0.0295425775545482	0.0044101588481341	2.308244664574277e-05	0.5417349689885004	4.626799144191839e-05	0.5504840826939843	0.3034658035871741	0.4939972226336363	0.0002810314366227	0.7159851395359461	0.0005109286396659	0.7261144152838338	0.0090199332130041	0.0194050774131938	6.685280726013852e-06	0.4993113206742208	1.4223787666402574e-05	0.5086026852748033	0.0006991773773586	0.7422487123250016	0.0013132916316559	0.7515789356843877	MLEC	4500	UNC119B	27809	CABP1	42023	False	True	True	alt	-40	0.002563	-20	0.01067
886	chr12	120939764	G	T	rs78197988	-0.03259042088	0.0842842591610114	0.03259042088	0.079660165662061	0.0110350636622853	0.2317008494068099	-0.0004034797566503	0.0803649856019122	0.0004034797566503	0.0762485692261125	0.3556302451270242	0.4103894903517824	-0.0115341841891304	0.1162975871413882	0.0115341841891304	0.1090058004247913	0.0039342781870354	0.2554263585664743	-0.0001433438439987	0.1004063067387934	0.0001433438439987	0.094657124871867	-0.0211122522017862	0.055808317955661	0.0211122522017862	0.0544710560926778	SPPL3	35406	HNF1A	38780	C12ORF43	76738	False	False	False	ref	-50	0.0343	-80	0.0543
887	chr12	120968567	G	T	rs2243616	0.004034427254	0.6195354173776557	0.0043115234259999	0.6283446642914777	0.0316622796956776	0.0034003948831451	0.0001464456447913	0.2689844374542316	0.0001533285916584	0.2765315247816245	0.2181682382597329	0.6277562936979679	0.0008807906328754	0.6178826812683472	0.0009327495787092	0.6269604871358622	0.0068162188374176	0.0534529452644034	3.1312697448590825e-05	0.342285022167268	3.260333477439097e-05	0.3511149682788736	0.0039855185219763	0.4502916429389859	0.0042012883951078	0.4578535127524054	HNF1A	9977	C12ORF43	47935	SPPL3	64209	False	True	True	alt	100	0.04382	-85	0.03119
888	chr12	121005313	A	G	rs1169314	-0.003373713146	0.6888249759289984	0.003459904414	0.6787207293860571	0.0216645820455929	0.0185037212747147	-7.140913847384686e-05	0.4607011642176122	7.341604749675317e-05	0.4511054925617117	0.5343852114648492	0.1208400424008624	-0.0017887984662203	0.4974371481759516	0.0018335763670943	0.4865261904964936	0.0115875835806085	0.0076605765880673	-3.787983353443633e-05	0.3135095615274112	3.892245856971856e-05	0.3036172948457027	-0.0009045736988972	0.8287470939758611	0.0009336196433572	0.8191910486881122	C12ORF43	11189	HNF1A	26769	OASL	33933	False	True	False	ref	-95	0.0619	100	0.1454
889	chr12	121012362	C	T	rs2264750	-0.1031666792	0.0028576103657311	0.1031666792	0.002675211201866	0.0387015847633883	0.0018451470902771	-0.0043973061138023	0.0016484838729745	0.0043973061138023	0.001552020411369	0.427533480637766	0.2842311316765432	-0.0453660912698372	0.0057183230303252	0.0453660912698372	0.0053664835931701	0.0167921150528651	0.0029175384899053	-0.0019560955397793	0.0022686884564265	0.0019560955397793	0.0021191407031275	-0.0538885258145831	0.0042369056032867	0.0538885258145831	0.0041116235757315	C12ORF43	4140	OASL	26884	HNF1A	33818	False	True	True	ref	-15	0.000494	20	0.011475
890	chr12	121252752	T	C	rs2686345	0.0600150738	0.0132801594027296	0.0600150738	0.0141879334900135	0.0124937948322136	0.1507104925200277	0.0007615697347757	0.0177435872967434	0.0007615697347757	0.0188250702073889	0.5662631355097044	0.0813660861227416	0.0340186629433269	0.0095767017457723	0.0340186629433269	0.0104255257916867	0.0070652755467223	0.0459897568637046	0.0004311730239679	0.0134520022456538	0.0004311730239679	0.0144346190460261	0.0117802051888504	0.1470128361958712	0.0117802051888504	0.1518417783788402	P2RX4	42686	CAMKK2	45556	P2RX7	119932	False	True	False	alt	70	0.02556	100	0.12134
891	chr12	121389941	C	A	rs76170072	-0.045495452	0.038469145108252	0.045495452	0.0359957680459816	0.0111412269828502	0.2119701228333151	-0.0005092804253203	0.0410820696157507	0.0005092804253203	0.0387473798452386	0.1718337327150696	0.7009198361468529	-0.0077221140654537	0.1697660026195903	0.0077221140654537	0.1605315027447901	0.0019257651633475	0.6093467271356473	-8.701603455553273e-05	0.141075824866156	8.701603455553273e-05	0.1333766341639335	-0.0438324049004657	0.0072658053272756	0.0438324049004657	0.0070902891334319	ANAPC5	9955	RNF34	10143	CAMKK2	91633	False	False	False	ref	100	0.01633	50	0.02954
892	chr12	121395414	A	G	rs61697335	0.0405967296	0.0445912314249915	0.0405967296	0.0478760618611146	0.0109524880144986	0.2289819396997822	0.0004526699903985	0.0451112451572427	0.0004526699903985	0.0480709338475221	0.1341300220956648	0.7542105396721328	0.0054771312259422	0.2174112536861801	0.0054771312259422	0.2284031963324042	0.0014620118058166	0.6888029940104387	6.063949820338733e-05	0.1849165973839095	6.063949820338733e-05	0.194458801471538	0.0358302472017344	0.0139154994593807	0.0358302472017344	0.0143290867017043	ANAPC5	4482	RNF34	4670	CAMKK2	97106	False	False	False	alt	10	0.002197	-100	0.01813
893	chr12	121398384	A	T	rs11830307	0.000835363078	0.8774062791611964	0.0012181003019999	0.8813426775282253	0.017803652600779	0.0452579661429825	1.3894078904237652e-05	0.751657246867489	2.1930743638873805e-05	0.7561635569836429	0.4206910860071161	0.2997626667168362	0.0003574090494086	0.7491098057669068	0.0005206770903711	0.7537772179242505	0.007603966777982	0.0383362324585271	5.918833149896992e-06	0.6249423198181849	9.43142763365193e-06	0.6300011312095325	0.0004149420637143	0.8827195978151263	0.0005560223653771	0.8868185754396463	ANAPC5	1512	RNF34	1700	CAMKK2	100076	False	False	False	alt	-100	0.01984	-100	0.1233
894	chr12	121403345	A	G	rs59199848	0.0193837636999999	0.17654133634544	0.0193837636999999	0.185517805187907	0.0083560158201888	0.5237098478370776	0.000160487557608	0.2017041908596657	0.000160487557608	0.2104957317042345	0.2232865486156495	0.6198919507774953	0.0041668162796216	0.2660831119252287	0.0041668162796216	0.27758751315395	0.001867999393006	0.627353314403739	3.455945145405138e-05	0.2800135001186883	3.455945145405138e-05	0.2910555950734682	0.0181806865216443	0.075200897378452	0.0181806865216443	0.0773290024312621	RNF34	3261	ANAPC5	3449	CAMKK2	105037	False	False	False	alt	-10	0.0007935	100	0.0408
895	chr12	121420405	A	T	rs3751135	0.0181097688	0.194419959540308	0.0181097688	0.2035011859941181	0.0065206893739655	0.8715868641460395	0.0001197173155269	0.2783918783220614	0.0001197173155269	0.2881853531771379	0.3373209265656282	0.439550418760359	0.0061698261768214	0.1945668276569367	0.0061698261768214	0.2048998044386849	0.0021936651717775	0.5730362897394601	4.063724429973532e-05	0.2570477380321665	4.063724429973532e-05	0.2678184252691508	0.0124337389392005	0.1410091935471221	0.0124337389392005	0.1454474077053255	RNF34	20321	ANAPC5	20509	CAMKK2	122097	False	False	False	alt	-60	0.001202	45	0.0698
896	chr12	121426090	T	C	rs79741351	0.052885956	0.0205385202867236	0.052885956	0.0221482448059247	0.0098217109314091	0.3306148698916097	0.0005272818698994	0.0362329447038792	0.0005272818698994	0.0387337051921739	0.3635079202066412	0.3982672407561592	0.0193190137553846	0.0412688452516944	0.0193190137553846	0.0451288796180893	0.0035793892412316	0.3176170123395572	0.0001931783331763	0.0500511332235058	0.0001931783331763	0.0540798845728626	0.0350854261973671	0.0151618961189713	0.0350854261973671	0.0155478662609206	RNF34	26006	ANAPC5	26194	CAMKK2	127782	False	False	False	alt	-30	0.001127	55	0.03784
897	chr12	121429454	A	C	rs13754	-0.0016367336999999	0.7781004231471721	0.00230828586	0.774300569466336	0.0081638616261852	0.5674171943128885	-1.4970968159032976e-05	0.7843852821298707	2.0278488730152337e-05	0.7809965154566154	0.3697279017417193	0.3881310328272069	-0.0006196282667522	0.6495810754918514	0.0008649823162386	0.6454759884050486	0.0030304806019736	0.4195880640046315	-5.715753621119828e-06	0.6607789362625325	7.649844180039658e-06	0.6570788221023305	-0.001099596468843	0.7387887171441233	0.0014937914293716	0.735328225122541	RNF34	29370	ANAPC5	29558	CAMKK2	131146	False	False	False	ref	15	0.0011215	-100	0.02112
898	chr12	121457323	G	A	rs111782135	-0.0454857688	0.0384101117685087	0.0454857688	0.0359406593406035	0.011446910930578	0.2007171186837542	-0.0005334665597635	0.038874418290736	0.0005334665597635	0.0366543033898846	0.4881544414361144	0.1889405997670352	-0.0223591653128125	0.035461649534533	0.0223591653128125	0.03266858843789	0.0056155599078621	0.1028522336340531	-0.0002637904310025	0.0356979989592372	0.0002637904310025	0.0332454960442964	-0.0155976721750225	0.1120134946637708	0.0155976721750225	0.1087748392824896	RNF34	57239	ANAPC5	57427	KDM2B	124956	False	False	False	ref	45	0.001404	-100	0.0402
899	chr12	121461233	G	A	rs74543852	0.00505088512	0.5541375544295097	0.00505088512	0.5673547390614415	0.0069766155878987	0.7699532479355928	3.5344202264426906e-05	0.6147797869399556	3.5344202264426906e-05	0.6278746812016462	0.3928111287461487	0.3483555200289018	0.0019399160839208	0.4350994817683813	0.0019399160839208	0.4486120266186472	0.0027159688762592	0.4741494058012783	1.3463454010262714e-05	0.4850684973238838	1.3463454010262714e-05	0.4982397850868122	0.0027904853784789	0.5465917156981435	0.0027904853784789	0.5586135072517382	RNF34	61149	ANAPC5	61337	KDM2B	121046	False	False	False	alt	95	0.00286	0	0.0
900	chr12	122065538	G	A	rs34974633	-0.00467470464	0.5250483179159338	0.0063110331999999	0.5183411037586312	0.0082879145908546	0.5243318844816695	-3.761965959584482e-05	0.5462183724849012	5.070851322770576e-05	0.5397506684276681	0.401564331580203	0.3268570724780822	-0.0018063216925143	0.4104262688899957	0.0025413871128085	0.404235266605692	0.0033367445778457	0.3422534740509315	-1.4544156903576474e-05	0.426293117729668	2.042388301768664e-05	0.4203136352831912	-0.0024087386798617	0.5318070496931669	0.0032012780215561	0.5252861387094192	MLXIP	13219	BCL7A	46115	LRRC43	102201	False	False	False	ref	45	0.02055	-30	0.00651
901	chr12	122067480	G	A	rs61952902	0.00205525272	0.7801706432824529	0.00205525272	0.7937700082967376	0.0264706372851857	0.0074732165493018	5.785060639690997e-05	0.5029258661885234	5.785060639690997e-05	0.5153663546545335	0.3834438116577972	0.3646056322926748	0.0007746266889536	0.6424440191949956	0.0007746266889536	0.6562561950792394	0.0101201081339467	0.0122068843276638	2.175319981964872e-05	0.4144353075306745	2.175319981964872e-05	0.4267728597022563	0.0012800962665587	0.7492584042697131	0.0012800962665587	0.7626675299303884	MLXIP	11277	BCL7A	48057	LRRC43	100259	False	True	True	alt	70	0.00467	65	0.02295
902	chr12	122087073	G	A	rs36167334	-0.0261870422	0.1263426720467843	0.0261870422	0.1195110023020549	0.0091984301530652	0.3882250708957297	-0.0002419341696009	0.1353559359030167	0.0002419341696009	0.1289120964054745	0.5454496415937925	0.1068921765450003	-0.0142598079476578	0.0801052736041479	0.0142598079476578	0.074428400668852	0.0050072852478608	0.1397922824267458	-0.00013145594917	0.0899173247255751	0.00013145594917	0.0843301312214574	-0.0062075332731666	0.3220212515816779	0.0062075332731666	0.313213279736753	MLXIP	8316	BCL7A	67650	LRRC43	80666	False	False	False	ref	10	0.0006256	-90	0.02902
903	chr12	122092107	C	T	rs146055085	0.003865052188	0.6504699601074945	0.003865052188	0.6637999615920662	0.0352669735223643	0.0021282880219154	0.0001537920386955	0.2807014379973017	0.0001537920386955	0.2906296051714685	0.2599819500202284	0.5634569130186932	0.0010699186528347	0.6053387930236834	0.0010699186528347	0.6189580328516058	0.0092698035310541	0.0184579781437161	4.281127938449704e-05	0.3135529235005224	4.281127938449704e-05	0.32508865327998	0.0033050135374848	0.5238099090357314	0.0033050135374848	0.5355759712725681	MLXIP	13350	BCL7A	72684	LRRC43	75632	False	True	True	alt	35	0.001648	-80	0.02216
904	chr12	122097852	T	C	rs373281699	0.0363730668	0.057863977020634	0.0363730668	0.0618865993873133	0.0183182627088517	0.0381156949348991	0.0007037977173214	0.0237626816056917	0.0007037977173214	0.0250171588163205	0.4777414703472027	0.2047730881540514	0.017656928343065	0.0477866265208158	0.017656928343065	0.0519237047485218	0.0088549597379822	0.0224267430578133	0.0003460119107874	0.0222392976841093	0.0003460119107874	0.0238413338625746	0.0130976462411435	0.1315597019219183	0.0130976462411435	0.1358064473857209	MLXIP	19095	LRRC43	69887	IL31	76369	False	False	False	alt	-100	0.02118	15	0.0076
905	chr12	122103844	T	G	rs374837345	-0.0007823148799999	0.8693320493850967	0.0014189185599999	0.8625888695703444	0.0263723173383284	0.0075892587449378	-2.334000375184761e-05	0.6360015439576326	3.6552723389264456e-05	0.6286093775038987	0.135132107179535	0.763831526951306	-0.0001502832935922	0.8560147782255697	0.0002050489482676	0.8480375155083894	0.0036152464500568	0.3013057868196107	-4.279827246205435e-06	0.7104386518784711	5.416489285781549e-06	0.7022398339687178	-0.0008506312306143	0.7643363176426151	0.0012780215562401	0.7570012205938423	MLXIP	25087	LRRC43	63895	IL31	70377	False	True	True	ref	-60	0.03363	100	0.01349
906	chr12	122114047	A	G	rs28421373	0.0395010214	0.0499181792582169	0.0395010214	0.0535282371251615	0.0090460524359193	0.4107904296514738	0.0003636299049356	0.0680784458055236	0.0003636299049356	0.0722607379975591	0.3792487473936451	0.3608669459525363	0.0149059872342018	0.0654797212957244	0.0149059872342018	0.0710154460346796	0.0034250291895955	0.3332224048921746	0.0001374153235733	0.0764630823583788	0.0001374153235733	0.0820207847752651	0.0239006628699467	0.0482687435298737	0.0239006628699467	0.0495946150678675	MLXIP	35290	LRRC43	53692	IL31	60174	False	False	False	alt	-85	0.002434	-100	0.04114
907	chr12	122118352	C	A	rs28430881	-0.0279080946	0.1171674480463887	0.0279080946	0.11075157905546	0.0079619315851646	0.5910063093399005	-0.0002257965177677	0.1547280154856901	0.0002257965177677	0.1476693163967887	0.2781833836450585	0.5345280226408445	-0.0078627480483477	0.1718958140090931	0.0078627480483477	0.1624410542948189	0.0022167757664937	0.565363737815051	-6.357047989850371e-05	0.1971776885623932	6.357047989850371e-05	0.1878013743177811	-0.0229566696749965	0.0482645135152908	0.0229566696749965	0.0470664077005739	MLXIP	39595	LRRC43	49387	IL31	55869	False	False	False	ref	35	0.001518	-20	0.0869
908	chr12	122119686	T	C	rs28498376	0.0282121908	0.1044093036046922	0.0282121908	0.110820912298587	0.0104332792115135	0.2580507893713893	0.0002939998065341	0.0949197109028823	0.0002939998065341	0.100488837157415	0.3674560939428831	0.3896606806630556	0.0103239528316055	0.1097303942470596	0.0103239528316055	0.1176275438903164	0.003833069696439	0.2750952386811478	0.000107562748096	0.1009489390691134	0.000107562748096	0.1078382221566925	0.0181267440533615	0.0846950114060027	0.0181267440533615	0.087176683174275	MLXIP	40929	LRRC43	48053	IL31	54535	False	False	False	alt	-100	0.0009613	-100	0.02985
909	chr12	122122115	G	A	rs28478366	-0.002053155756	0.6345488805409831	0.004042931636	0.6283864701896416	0.0076191625803103	0.6161070800713854	-1.0543949382049005e-05	0.6800372320941254	2.827910000568778e-05	0.6752629489775015	0.5127376840008714	0.1521318735393835	-0.0010914043928611	0.4887301568654931	0.0021457282239743	0.4811417771717229	0.003922378951473	0.2580942499499478	-5.6084946274094005e-06	0.5255216460401243	1.5005830270982931e-05	0.5188136361659653	-0.0005560223653772	0.8023642691767394	0.0009834126910029	0.7979183299750863	MLXIP	43358	LRRC43	45624	IL31	52106	False	False	False	ref	-95	0.00934	-30	0.0448
910	chr12	122122290	C	T	rs11059094	-0.0492654228	0.0280826868081118	0.0492654228	0.0263228858820599	0.0096337278714428	0.349000751698193	-0.0004918752454751	0.0476347773103758	0.0004918752454751	0.0449404758906037	0.511862156246434	0.1540859954769955	-0.0252975080248579	0.025006159326184	0.0252975080248579	0.0230181515059862	0.0049450807587329	0.1440509588779641	-0.0002534356241799	0.0387690217085647	0.0002534356241799	0.0361125374688872	-0.0148735982738409	0.1170456645458237	0.0148735982738409	0.1135387846408667	MLXIP	43533	LRRC43	45449	IL31	51931	False	False	False	ref	45	0.001476	-90	0.08496
911	chr12	122123955	T	C	rs11609875	0.0030616717119999	0.5735740103653505	0.004654218488	0.5796626517666847	0.0060943541658491	0.932333473830478	1.847091020029793e-05	0.6655559205896917	2.817565490302897e-05	0.6706222358874778	0.631438085457318	0.0282508255425058	0.0019350329013585	0.357769471246	0.0029502258158372	0.3641519531696437	0.0038499602479669	0.2763950676787996	1.1687788527404588e-05	0.4351447145425421	1.787334124591011e-05	0.4410410913392687	0.0003070571271486	0.8862627242544329	0.0005103787383686	0.8900926631312143	LRRC43	43784	MLXIP	45198	IL31	50266	False	False	False	alt	-95	0.00873	100	0.08746
912	chr12	122124584	C	T	rs11057905	-0.0313456238	0.0944164374384074	0.0313456238	0.0889034701462093	0.0083180864994822	0.5236602298557749	-0.000260670202748	0.1220911361595322	0.000260670202748	0.1159759143390457	0.5829935995186671	0.062592401292844	-0.0183093362805365	0.0529769699593248	0.0183093362805365	0.0488604589193001	0.0048486334569204	0.1528318076060003	-0.0001522299068852	0.0743053125407616	0.0001522299068852	0.0694010250620075	-0.0051847010861108	0.3773222651629817	0.0051847010861108	0.3674347543744551	LRRC43	43155	MLXIP	45827	IL31	49637	False	False	False	ref	-100	0.02359	-100	0.1711
913	chr12	122125237	C	T	rs114490539	-0.04566961	0.0374447900400469	0.04566961	0.0350356932356029	0.0098607762391737	0.3151071675319469	-0.000452867254828	0.0500898922356272	0.000452867254828	0.0471141723052058	0.4292471913609062	0.2803114842265778	-0.0195918904135473	0.0463718441906552	0.0195918904135473	0.0427401469629904	0.0042321882661383	0.2179941394798643	-0.000194244894417	0.0534184986842312	0.000194244894417	0.0497538331401717	-0.0218632973371092	0.0571656485892315	0.0218632973371092	0.055662675898988	LRRC43	42502	MLXIP	46480	IL31	48984	False	False	False	ref	-10	0.0003357	-15	0.01391
914	chr12	122125472	C	A	rs4758691	-0.0020256356399999	0.7232549392242281	0.0032793334	0.7137177561199503	0.0071494914484932	0.7593825819263589	-1.393418614340696e-05	0.7613465273594092	2.298380380045708e-05	0.7520539507781185	0.4473801595452235	0.2551864466440999	-0.0008971885314823	0.5436906486346561	0.0014613323570696	0.534003322980667	0.0031992263649871	0.3799801288652002	-6.181323468974898e-06	0.5849799414442931	1.0253505905800178e-05	0.5754165549696804	-0.00081328644488	0.7600344099992654	0.0013485617070716	0.7507115889357311	LRRC43	42267	MLXIP	46715	IL31	48749	False	False	False	ref	-95	0.02374	-100	0.03165
915	chr12	122126362	G	A	rs4758690	-0.076878228	0.0060482651115565	0.076878228	0.0057484681286164	0.0198116496408251	0.028164659754983	-0.0015595287741877	0.0063099554283755	0.0015595287741877	0.0060660422723803	0.4839344806481395	0.1987842145340228	-0.0370855006823094	0.0086244382920215	0.0370855006823094	0.007996229183624	0.0095597950651548	0.0163426730039076	-0.0007506155139849	0.0066664347580637	0.0007506155139849	0.0062950842230429	-0.0302181557899977	0.0286391833160947	0.0302181557899977	0.0278587960999092	LRRC43	41377	MLXIP	47605	IL31	47859	False	True	True	ref	-100	0.002195	-100	0.03442
916	chr12	122126552	C	T	rs7485421	-0.01100260834	0.3521654349703244	0.01100260834	0.3406404516774131	0.0093549867966066	0.3794538974450117	-0.0001045714636899	0.3432845923944643	0.0001045714636899	0.3327061396333884	0.494310106951317	0.1822978227842576	-0.0055278250668445	0.246434514205798	0.0055278250668445	0.2354070172298431	0.0046144574709717	0.1799684276651667	-5.247042727288304e-05	0.2431976146164367	5.247042727288304e-05	0.2330208282158362	-0.0031701573667776	0.5312376201548844	0.0031701573667776	0.5197803646644592	LRRC43	41187	IL31	47669	MLXIP	47795	False	False	False	ref	65	0.005585	-70	0.09314
917	chr12	122128731	C	T	rs6489242	-0.00731476496	0.4987123007286289	0.00731476496	0.4860433383516015	0.0079491275233822	0.5991893690558437	-6.190522495090945e-05	0.5279394702620562	6.190522495090945e-05	0.5158536459408342	0.5037251423769955	0.1689369431110373	-0.0037049325374664	0.3439347176159226	0.0037049325374664	0.3317022842973651	0.0039994954103905	0.2565823032347272	-3.130297254825855e-05	0.3686985224538734	3.130297254825855e-05	0.3569029574480509	-0.0022323883027831	0.6527448894008839	0.0022323883027831	0.640151130847239	LRRC43	39008	IL31	45490	MLXIP	49974	False	False	False	ref	-100	0.004436	95	0.05396
918	chr12	122130362	A	T	rs7488268	-0.00387448254	0.5379082782880501	0.00649551442	0.5321726280671001	0.0064624980043368	0.8177598361341093	-3.011264647071613e-05	0.6045976638154822	4.7334458358188127e-05	0.5992524156445942	0.6113362171806761	0.0398655298684185	-0.0023909727737668	0.3422624013891471	0.0039842462268618	0.3362088001029127	0.0039550118666229	0.2569056739360116	-1.864450941175568e-05	0.4039864196852421	2.9108844898595863e-05	0.3982496309258826	-0.0004273903256257	0.857363855832445	0.0007593439765972	0.8531859573370856	LRRC43	37377	IL31	43859	MLXIP	51605	False	False	False	ref	40	0.001236	-10	0.01257
919	chr12	122138453	T	C	rs4758686	0.00349247832	0.5273947958676367	0.00543215592	0.5368930635688802	0.0061989165125803	0.9025658091027032	2.1314284876485604e-05	0.6201399954781961	3.313427376295029e-05	0.6290709417407961	0.5529580182367038	0.0961088217724193	0.001925153144368	0.3509821313938602	0.0029612817354475	0.3601555030623487	0.0034332360247714	0.342680463778427	1.18035037862785e-05	0.4251021395234554	1.8117454218540377e-05	0.4342761671058159	0.0008153611551986	0.7436706025457801	0.001317441052293	0.7525989121583204	LRRC43	29286	IL31	35768	MLXIP	59696	False	False	False	alt	-80	0.002872	-55	0.02972
920	chr12	122141834	G	A	rs11057509	-0.0498309822	0.028567715944488	0.0498309822	0.0267246843883026	0.0108456801434484	0.2336975859047066	-0.0005467722186455	0.0361168099121483	0.0005467722186455	0.0339912732940071	0.5399827799043558	0.1136970822650955	-0.0268678920036236	0.0220353790933802	0.0268678920036236	0.0202402366997454	0.0058522433133333	0.0863647095661072	-0.0002945232119208	0.0286002708382703	0.0002945232119208	0.0265782983578372	-0.0131536634197449	0.1477800811316197	0.0131536634197449	0.1433034462672784	LRRC43	25905	IL31	32387	B3GNT4	61848	False	False	False	ref	-25	0.001513	40	0.04547
921	chr12	122143672	T	C	rs1047796	0.073330286	0.0066479404193933	0.073330286	0.0070175202428021	0.0169951297862256	0.0502425961086027	0.0012815351491362	0.0078286162797768	0.0012815351491362	0.0081903414513725	0.5463542152926897	0.1072809488188974	0.0400691576265957	0.0058319350356703	0.0400691576265957	0.0062764389895265	0.0093086877756335	0.0183421698538888	0.0007021536365428	0.0065870574381265	0.0007021536365428	0.0069736621199748	0.0180333820890257	0.0863258264828375	0.0180333820890257	0.088806467066024	LRRC43	24067	IL31	30549	B3GNT4	60010	False	True	True	alt	-80	0.00592	-90	0.07263
922	chr12	122239744	C	T	rs11057249	-0.022873391	0.1674075107011338	0.022873391	0.1593416594519766	0.012524715950592	0.1493376512207776	-0.0002979546276602	0.1136804359288183	0.0002979546276602	0.1079500833150778	0.3551738088569383	0.4037201435506204	-0.0081180265906845	0.1683290824571218	0.0081180265906845	0.1590602476700219	0.0044863109727653	0.2013693431634702	-0.0001068445796599	0.1252204608183106	0.0001068445796599	0.118031055671407	-0.0148715235635223	0.1213020844571379	0.0148715235635223	0.1178100862806566	ENSG00000284934	12210	DIABLO	13682	ENSG00000256861	26679	False	False	False	ref	-60	0.009094	-55	0.01709
923	chr12	122853214	G	A	rs12298151	-0.011450129906	0.3553330806757443	0.011450129906	0.3450112537722585	0.0104887380585891	0.2641614393779322	-0.0001180132546366	0.3285980055132723	0.0001180132546366	0.3193000177005523	0.5488998848535773	0.1018835124729813	-0.0063679091525244	0.2412984443839011	0.0063679091525244	0.2304626224968667	0.0057262783798196	0.0938060576241551	-6.538921087466717e-05	0.2289024802708236	6.538921087466717e-05	0.2189485514964321	-0.0025083247751532	0.6144463236287244	0.0025083247751532	0.6038884704628753	HIP1R	18760	VPS37B	42913	CCDC62	78687	False	False	False	ref	100	0.004856	100	0.03122
924	chr12	122963381	T	C	rs4275659	-0.0092060592	0.3746255491372927	0.0108849172	0.3671283208442666	0.0113373935329664	0.2009169970285978	-0.0001073431742552	0.3234515798976116	0.0001259673546001	0.3170255616549254	0.3646510855921742	0.3788455095684148	-0.0032323351703711	0.333615771964989	0.0039436454054159	0.3267678816688024	0.0040885465220208	0.2333814601345461	-3.714503151316629e-05	0.2893405132251006	4.503585400955925e-05	0.2831831539923305	-0.0057884417888152	0.3344004287427695	0.006564383447961	0.3290468155989619	OGFOD2	11200	ARL6IP4	16680	ABCB9	18268	False	False	False	ref	-100	0.004257	-10	0.01219
925	chr12	122966471	G	C	rs61955196	-0.0207017276	0.1942276806821042	0.0207017276	0.1855011250132698	0.0116444356367537	0.1932977352222986	-0.0002609893696413	0.1458607897505164	0.0002609893696413	0.1394595986523964	0.7993381674083757	0.0062124653926419	-0.0165006825003313	0.0686446428186056	0.0165006825003313	0.0636754506455743	0.009306786850466	0.016977612746551	-0.0002081501761247	0.0593447456788225	0.0002081501761247	0.0554905445053146	-0.0041390470855506	0.4645719973756445	0.0041390470855506	0.4535620410799677	OGFOD2	8110	ARL6IP4	13590	ABCB9	15178	True	False	False	ref	60	0.03516	60	0.004395
926	chr12	122985100	G	T	rs3741530	0.00632723038	0.4934054850448586	0.00632723038	0.506350548145997	0.0101137509261223	0.2871765734036988	6.517953342520645e-05	0.4605886927532032	6.517953342520645e-05	0.4726938504142136	0.6432597848525401	0.0227652300453665	0.0040485886397227	0.2954930711007619	0.0040485886397227	0.3078328553457681	0.0065010576698679	0.0606069132939727	4.168704433394854e-05	0.2723939788042921	4.168704433394854e-05	0.283719192020866	0.00056639591697	0.8671892799208739	0.00056639591697	0.8810858858775255	ABCB9	3451	ARL6IP4	5039	OGFOD2	10519	False	False	False	alt	-15	0.001938	100	0.09894
927	chr12	123017425	T	C	rs12425850	0.0059921907828	0.4971401547875506	0.0060062247372	0.5096709353470276	0.009611612152355	0.3453834201595881	5.978881091609445e-05	0.469739138378508	5.991400443444124e-05	0.4815429591097373	0.1044367680162657	0.8088439785005632	0.0005166051474499	0.7027510571330662	0.000518438315359	0.7157134471915587	0.0009793085579329	0.7902406268203962	5.01856955791305e-06	0.6823905967647853	5.034922806214618e-06	0.6949873685484433	0.0051826263757922	0.3831402395227167	0.0051950746377036	0.3907221112504785	ABCB9	35776	ARL6IP4	37364	OGFOD2	42844	False	False	False	alt	-100	0.005676	-95	0.02551
928	chr12	123102141	T	C	rs1790094	-0.0009931982	0.7129811980513553	0.003329696	0.7067059232034842	0.0063529642653168	0.8838971139874301	-6.923326955188982e-06	0.7800262870274501	2.118517110908143e-05	0.7733666397186642	0.3474143922654799	0.421468741190085	-0.000286326999933	0.5785679346025618	0.0012014001605013	0.5726720978159021	0.0021999473954534	0.5726862257754526	-2.024927681959787e-06	0.6441671680635443	7.61048006513861e-06	0.6378836465873111	-0.0010166080561001	0.6632383430823473	0.0020041701677402	0.6567590160089662	PITPNM2	48949	ABCB9	120492	ARL6IP4	122080	False	False	False	ref	-100	0.001656	65	0.03854
929	chr12	123147820	C	G	rs58991895	-0.0049052281999999	0.548557008885	0.0055963908	0.5382776266144713	0.0078822720813185	0.6080473328474076	-3.962900166561008e-05	0.5737831535554506	4.493334935913491e-05	0.5639214495801861	0.3126194255127127	0.4785387240326962	-0.0014598333590069	0.4950913488371428	0.0016966378760211	0.4843792326550762	0.0024579377617284	0.5249619423425476	-1.1776326285053318e-05	0.5131819927241812	1.3593689490291318e-05	0.5030056441053719	-0.0039357254743306	0.433509991526629	0.0044378053714249	0.4252688897869143	PITPNM2	3270	MTRFR	85566	MPHOSPH9	96194	False	False	False	ref	75	0.02269	65	0.08923
930	chr12	123148383	G	A	rs1727302	-0.058515841	0.0164758810203038	0.058515841	0.01547994348707	0.0120518096447299	0.16855917072199	-0.0007143112311036	0.0229686080600858	0.0007143112311036	0.0216958001287577	0.456515109077895	0.2445271260695954	-0.026795427725896	0.0224997631452703	0.026795427725896	0.0206613149058905	0.0055159087637616	0.1060627290443402	-0.0003276788467601	0.0248945745813086	0.0003276788467601	0.0231714384155672	-0.0248840755609497	0.0431769523190808	0.0248840755609497	0.0421193214297909	PITPNM2	2707	MTRFR	85003	MPHOSPH9	95631	False	True	False	ref	75	0.002312	-55	0.02826
931	chr12	123186245	A	C	rs11613128	-0.002893764448	0.7339989144219934	0.002893764448	0.7208314142708935	0.0336824934602964	0.0024219297124107	-0.0001023869216921	0.3586609310632815	0.0001023869216921	0.3481369083017418	0.1005902550856336	0.8196126855853099	-0.0003031045332231	0.8121063281240664	0.0003031045332231	0.7979175608036586	0.0034897108727448	0.3126911934151698	-1.0893596797097767e-05	0.5783748847479195	1.0893596797097767e-05	0.565113458245358	-0.0026390315252232	0.5926847528582403	0.0026390315252232	0.5805844859588237	PITPNM2	35155	MTRFR	47141	MPHOSPH9	57769	False	True	True	ref	-100	0.01373	-65	0.01294
932	chr12	123193263	A	G	rs4460848	-0.00550005826	0.549409201324547	0.00550005826	0.5366736663177093	0.020800068599706	0.0229596595163724	-0.0001205360508175	0.3034994113541542	0.0001205360508175	0.2934861905969391	0.1611987676220707	0.7194202176651856	-0.0008887987031848	0.630234083375074	0.0008887987031848	0.6166529548905055	0.0033929902636906	0.3368684244285896	-1.972844643619722e-05	0.4406625665448277	1.972844643619722e-05	0.4282362209832954	-0.0053859479870123	0.3693366088443477	0.0053859479870123	0.3597421365026587	MTRFR	40123	PITPNM2	42173	MPHOSPH9	50751	False	False	False	ref	-100	0.11816	-100	0.01874
933	chr12	123204258	C	T	rs74917517	-0.053860826	0.0210450389222637	0.053860826	0.0197923147560703	0.0115267671790188	0.1952928822465512	-0.000650600862933	0.0297652246304325	0.000650600862933	0.0281877195992927	0.3414454506789489	0.4329989501715399	-0.0184956818710377	0.0519171144830211	0.0184956818710377	0.0480399262752585	0.0039198009799364	0.2536918170853048	-0.0002220733221868	0.0478527773987097	0.0002220733221868	0.0445993955319733	-0.0378364920797932	0.0107067447130932	0.0378364920797932	0.0103630192536763	MTRFR	29128	MPHOSPH9	39756	PITPNM2	53168	False	True	False	ref	-15	0.0001984	10	0.00644
934	chr12	123207195	T	G	rs74240770	-0.0116575612999999	0.3195705642974985	0.0116575612999999	0.3086091562426734	0.0352548610788535	0.0019167970543038	-0.0004042913437924	0.0608267855447014	0.0004042913437924	0.0573454717408559	0.0946877042292969	0.8300073319331164	-0.0011121794520605	0.5857786547008337	0.0011121794520605	0.5718684136025202	0.0033127822270441	0.3461244767444718	-3.815957607675593e-05	0.2821260312649671	3.815957607675593e-05	0.2715930269842354	-0.0099129659021358	0.1965493332885409	0.0099129659021358	0.1904776665169006	MTRFR	26191	MPHOSPH9	36819	PITPNM2	56105	False	True	True	ref	-55	0.01349	100	0.04578
935	chr12	123213351	T	C	rs1790134	-0.0053628395	0.5608909787750589	0.0053628395	0.5480323903054605	0.0308705475090094	0.0035456868913144	-0.0001717288787886	0.2268134476861959	0.0001717288787886	0.2180675181481642	0.1118663056670711	0.7921933532206126	-0.0005469120377372	0.712705207629932	0.0005469120377372	0.6987865947235079	0.0033921990338789	0.3129764485966133	-1.711407425594573e-05	0.456967669601476	1.711407425594573e-05	0.4443918446273941	-0.0046639487961492	0.4166246162673013	0.0046639487961492	0.4061897372386797	MTRFR	20035	MPHOSPH9	30663	CDK2AP1	58983	False	True	True	ref	-70	0.0004425	-85	0.00989
936	chr12	123213971	T	G	rs1790133	0.00180860883	0.750522511754771	0.0029692656299999	0.7568527778824731	0.006151619300931	0.8690813304339927	1.5035706188822384e-05	0.7837012357680369	2.171660877383456e-05	0.7897167446931823	0.0505606904635939	0.8986920363913427	0.0001455219557178	0.881835655587097	0.0001782840147602	0.8873667777998495	0.0003075960039963	0.9269332054478366	1.1619164114524555e-06	0.8957622502192105	1.337171281477614e-06	0.9012498576096792	0.0011991825641344	0.6990305956908814	0.0016929636199545	0.7047196945436446	MTRFR	19415	MPHOSPH9	30043	CDK2AP1	58363	False	False	False	alt	-25	0.0008926	100	0.0544
937	chr12	123234332	C	G	rs1727331	-0.0724755018	0.0080317422277485	0.0724755018	0.0076042860421083	0.0161536711222894	0.0639669252615098	-0.0012373309003667	0.0100317623421699	0.0012373309003667	0.0095443560233524	0.5779665764167679	0.068517957738149	-0.0420082161337064	0.0059746587541821	0.0420082161337064	0.0055539939014548	0.0093713037327906	0.0183345133217789	-0.0007199220282825	0.0077889922968828	0.0007199220282825	0.007339228167296	-0.0128320833203663	0.1418710750524721	0.0128320833203663	0.137693643417974	MTRFR	946	MPHOSPH9	9682	CDK2AP1	38002	False	True	True	ref	-40	0.002434	95	0.08105
938	chr12	123257159	C	A	rs11554169	0.00869962804	0.3784319055358296	0.00869962804	0.3901534286259943	0.0298592937346581	0.0040811690355424	0.0002646224997775	0.1115062278498743	0.0002646224997775	0.1175685844860465	0.2900693990601562	0.5146238569668518	0.0025380052383986	0.3727332059711286	0.0025380052383986	0.3853438471663595	0.0087024205312654	0.0219953310759386	7.756309988073285e-05	0.1462865106643216	7.756309988073285e-05	0.1547185706995031	0.0071121069720639	0.2676458620002579	0.0071121069720639	0.2757777966519241	MPHOSPH9	13145	CDK2AP1	15175	MTRFR	23773	False	True	True	alt	100	0.0162	-100	0.03488
939	chr12	123260408	G	A	rs1980251	-0.0894057626	0.0042345892309669	0.0894057626	0.0039966747290339	0.0192348002374816	0.0331933650198597	-0.0018611929301166	0.0056477743167836	0.0018611929301166	0.005398699534009	0.5275946845921637	0.1271469604499893	-0.047412036385627	0.0045554246367929	0.047412036385627	0.0042438871611379	0.0101799888415261	0.0132376757746267	-0.0009934816133609	0.0052224350823803	0.0009934816133609	0.0049166318415951	-0.0249691386840111	0.0423084448807671	0.0249691386840111	0.0410625849636133	CDK2AP1	11926	MPHOSPH9	16394	MTRFR	27022	False	True	True	ref	50	0.002274	45	0.03345
940	chr12	123260602	G	T	rs78197735	0.00546834554	0.5336157519659417	0.00588861774	0.5443426146704395	0.0078238407113955	0.6215791629538702	4.42565219849625e-05	0.5606807037289196	4.772905256321505e-05	0.5711480859670599	0.5121318685878483	0.1496956496912666	0.0027211117512916	0.3693434995486468	0.0029549189316872	0.3800023542629648	0.0040117958672243	0.2571388188557765	2.198695981753786e-05	0.395111117778035	2.391880913528085e-05	0.4054064640635891	0.0017137107231402	0.6730824062783655	0.0017966991358831	0.6830012297879956	CDK2AP1	11732	MPHOSPH9	16588	MTRFR	27216	False	False	False	alt	-80	0.02728	-95	0.266
941	chr12	123268090	G	A	rs76514049	-0.0572035164	0.0190808589115437	0.0572035164	0.017820077077369	0.013221738408953	0.1193679093873232	-0.000762369837728	0.0208729357334804	0.000762369837728	0.019690703809185	0.588842207906721	0.058148263060537	-0.033670426241034	0.0120563943877652	0.033670426241034	0.0111017521097637	0.0077698184709466	0.0324886164608784	-0.0004477250498984	0.0149251542144919	0.0004477250498984	0.013945247350029	-0.00936939179867	0.2134147123035904	0.00936939179867	0.2069005940659669	CDK2AP1	4244	MPHOSPH9	24076	MTRFR	34704	False	True	False	ref	100	0.00776	35	0.0894
942	chr12	123290717	T	C	rs74240779	0.000571818876	0.7221599814196195	0.003299556716	0.7269645371167681	0.0108137649695665	0.2586548737405177	-2.771295942993136e-06	0.675514196877857	3.417445936779154e-05	0.679274727368728	0.4994844344858348	0.1731255957096708	0.0002574438451261	0.5317625432726775	0.0016320855331708	0.5363859821986603	0.0054082956822177	0.1182439348075769	-1.6826236408350114e-06	0.497172975751173	1.6998108356991967e-05	0.5006792735184219	7.054015083144031e-05	0.8040447570691948	0.0010166080561001	0.8085976945273149	CDK2AP1	18383	MPHOSPH9	46703	MTRFR	57331	False	False	False	alt	95	0.02475	-90	0.1418
943	chr12	123298270	C	T	rs67382382	0.0015645415799999	0.7672531109082031	0.00227130514	0.7711235864001439	0.0351387884832114	0.0019929707505578	6.344274148575236e-05	0.3950238751337018	8.506985520286852e-05	0.3999478039175084	0.3918775091027915	0.3465875488653104	0.0006085437902027	0.6164646434344785	0.0009062849591139	0.6210389620915006	0.0138538554817773	0.0042016392845974	2.514414652745652e-05	0.3226165135011266	3.425039119318059e-05	0.3275572373000033	0.0009709644290915	0.7516372594971064	0.0013070675007001	0.7553614495342271	CDK2AP1	25936	MPHOSPH9	54256	MTRFR	64884	False	True	True	alt	90	0.007553	-25	0.0155
944	chr12	123302958	C	G	rs58537268	0.0494734835999999	0.0258823085960298	0.0494734835999999	0.0279650555130207	0.0117591791496118	0.1776967880250269	0.0005989695136037	0.029749587852386	0.0005989695136037	0.0317784313007718	0.2323675556800381	0.6050985417385547	0.0116225216008554	0.0965776192501194	0.0116225216008554	0.1039193323282523	0.0027355261185137	0.4534805488608099	0.0001406330195782	0.0770062440627672	0.0001406330195782	0.0824913860283612	0.0456457017188974	0.0054378338789592	0.0456457017188974	0.0056328106318324	CDK2AP1	30624	MPHOSPH9	58944	SBNO1	61889	False	False	False	alt	-55	0.02307	-30	0.03433
945	chr12	123307918	G	A	rs117741953	0.00434583224	0.5878375276494373	0.00434583224	0.6009661574701125	0.0265243710869367	0.0071111072105147	0.0001188369702055	0.2880581095732054	0.0001188369702055	0.2982373683270004	0.0822539652900963	0.8485703488040999	0.0003706868119203	0.7487634558558756	0.0003706868119203	0.763155581707108	0.0021784205846599	0.5581470219139842	1.0108333240797638e-05	0.5553444255529167	1.0108333240797638e-05	0.568730714089568	0.003846512930632	0.463870869079788	0.003846512930632	0.4748437620667206	CDK2AP1	35584	SBNO1	56929	MPHOSPH9	63904	False	True	True	alt	-30	0.01297	100	0.0632
946	chr12	123317393	A	G	rs57416942	0.0535866432	0.0198589813262919	0.0535866432	0.0212723147802581	0.0116376399011843	0.1824303779888382	0.0006363450593534	0.0256285519227325	0.0006363450593534	0.027355525589224	0.3154016120499175	0.4765923391452313	0.0171289589189386	0.0529498310409431	0.0171289589189386	0.057690945906964	0.0036854693522061	0.3046134256776899	0.0002038450329403	0.0463298275067102	0.0002038450329403	0.0499795975715022	0.0420813493915911	0.0074589946183787	0.0420813493915911	0.0077050038151617	CDK2AP1	45059	SBNO1	47454	KMT5A	66740	False	False	False	alt	90	0.002087	-15	0.01581
947	chr12	123318143	A	G	rs75225286	0.042362116	0.0411012747066116	0.042362116	0.0442122320798581	0.0136929486444955	0.1069574139674417	0.0005998866760565	0.029660779398228	0.0005998866760565	0.0316635461452688	0.0914988744696521	0.836104351411339	0.0040108391955451	0.2818489918269853	0.0040108391955451	0.2935003827622165	0.001295686099169	0.7341615698658193	5.85097609779038e-05	0.2005201391173298	5.85097609779038e-05	0.2104437089857734	0.0324899635888338	0.0177812100797617	0.0324899635888338	0.018245706891644	CDK2AP1	45809	SBNO1	46704	KMT5A	65990	False	False	False	alt	20	0.010925	90	0.02287
948	chr12	123328240	A	G	rs10846519	0.00312639498	0.6774585952654224	0.00312639498	0.6912115739935866	0.0145052030622578	0.0887240596278271	4.59670588872294e-05	0.529226947217304	4.59670588872294e-05	0.5415842174021097	0.3216776107635971	0.4629076705866125	0.0010133936608358	0.5680297357793828	0.0010133936608358	0.5821005585516853	0.0046924929066639	0.1708952771940639	1.4984010339024048e-05	0.4568675679177971	1.4984010339024048e-05	0.4699347831970012	0.0024357099140032	0.583083292740424	0.0024357099140032	0.5953259952642487	SBNO1	36607	KMT5A	55893	CDK2AP1	55906	False	False	False	alt	90	0.002123	-45	0.03032
949	chr12	123336687	T	A	rs7486223	-0.001174588212	0.6818638783810097	0.003695841572	0.6750949188090162	0.0060484424129717	0.8986420939990705	-9.143203219276426e-06	0.7575852907597393	2.4014893899186992e-05	0.7516100973691657	0.3618045830350937	0.4022336903267623	-0.0004328572861094	0.5805988994816557	0.0013618075599853	0.5725835387857225	0.0021922485186772	0.5726991917052349	-3.3861372075827058e-06	0.6512460631628049	8.865579002301151e-06	0.6426361986013795	-0.0008381829687029	0.6330696951264397	0.0023900662869946	0.6257113281401914	SBNO1	28160	KMT5A	47446	CDK2AP1	64353	False	False	False	ref	-40	0.000736	50	0.04346
950	chr12	123338532	G	A	rs7952835	0.00153436676	0.76613066955657	0.00249362664	0.767937777265235	0.0267656969570671	0.0071991934683368	4.763695744999314e-05	0.4668402353061919	7.141330240766461e-05	0.4694230929489448	0.3429931845766035	0.4306946006766344	0.0005379653249928	0.6394512905807468	0.0008706306423435	0.6412026527901756	0.00918924933076	0.0177834933807718	1.6730041661512528e-05	0.400696329749479	2.496537248628844e-05	0.403079169511992	0.001143165385533	0.7100504192403108	0.0016784406477245	0.7122313920781742	SBNO1	26315	KMT5A	45601	CDK2AP1	66198	False	True	True	alt	90	0.02817	-25	0.0238
951	chr12	123342207	A	G	rs7962723	0.0417072498	0.0419809517689294	0.0417072498	0.0451881893186467	0.0104091267444575	0.2703612849415142	0.0004364963961686	0.047383962663872	0.0004364963961686	0.0504907723298013	0.4171225842591727	0.3076329845809116	0.0174841151140341	0.0491574237880637	0.0174841151140341	0.0535414351552233	0.0043588576652405	0.2095054585153264	0.0001837069087152	0.0508976262979899	0.0001837069087152	0.0548415291259678	0.0211060280708305	0.0601491712583237	0.0211060280708305	0.0618018846473192	SBNO1	22640	KMT5A	41926	CDK2AP1	69873	False	False	False	alt	-15	0.0005493	-100	0.02748
952	chr12	123342383	A	G	rs10773011	0.1245792419999999	0.0008363691982491	0.1245792419999999	0.0008967490431943	0.0295348827161632	0.0044455945565123	0.0036602662798363	0.0013732437071914	0.0036602662798363	0.0014274696708363	0.4459091899293561	0.2582011914047107	0.0561334963137878	0.0019578996115428	0.0561334963137878	0.0021050461769306	0.0131352269625735	0.0048669014839511	0.001645606040693	0.001677797369361	0.001645606040693	0.001751571538091	0.0605047770205084	0.0017094706307756	0.0605047770205084	0.001765085743459	SBNO1	22464	KMT5A	41750	CDK2AP1	70049	False	True	True	alt	-10	0.003296	-75	0.04626
953	chr12	123352828	A	C	rs9300256	0.0253330697999999	0.1195754748663952	0.0253330697999999	0.1266919956415985	0.0144281348227735	0.0901665205446739	0.0003716491768447	0.065843333839451	0.0003716491768447	0.0698802937424595	0.4344194441851056	0.2792188077319488	0.0110827578299918	0.1013514985210212	0.0110827578299918	0.108757932247307	0.0062874107970944	0.0689064013727696	0.0001630921064695	0.0619530216302324	0.0001630921064695	0.066564685728217	0.0113050965258975	0.1562955598668775	0.0113050965258975	0.1613267567429986	SBNO1	12019	KMT5A	31305	CDK2AP1	80494	False	False	False	alt	100	0.00593	90	0.05652
954	chr12	123358692	A	G	rs10773016	0.0150777674599999	0.2306528713215773	0.0150777674599999	0.2408720831288114	0.0075930183790163	0.6588383568099452	0.0001147317105553	0.2789555419492895	0.0001147317105553	0.2890450436757841	0.1831077085861886	0.6815139462260078	0.0026501064832585	0.3617132678722217	0.0026501064832585	0.3745742436376135	0.0013959680799355	0.7111268084598734	2.0252815798534688e-05	0.3913434466769305	2.0252815798534688e-05	0.4037451837083385	0.0141515990829779	0.1102004341897863	0.0141515990829779	0.1135540953771959	SBNO1	6155	KMT5A	25441	RILPL2	77992	False	False	False	alt	5	0.0002441	5	0.00119
955	chr12	123939053	G	C	rs4930723	-0.000392308802	0.7942984486875576	0.00219756981	0.7919826257206682	0.0077690928384237	0.6383193816628591	-1.6785688863884835e-06	0.8038888684140569	1.7650938113923236e-05	0.8016514829812291	0.5048849054450772	0.1665820683514321	-0.0002314591533868	0.6072059761195375	0.0010929680655703	0.6045750862901802	0.0039114188571022	0.267841807321757	-1.1329212244637955e-06	0.6276186197220723	8.751028552255986e-06	0.625198921305007	-0.0001286320397514	0.8596658197856858	0.0007261486115001	0.8577043147242854	ZNF664	32793	CCDC92	33778	RFLNA	34189	False	False	False	ref	100	0.00241	-85	0.06946
956	chr12	123943784	T	C	rs4930726	0.01001855452	0.3467235393160929	0.01001855452	0.3582937059790238	0.0101299183080482	0.3022828898371467	0.0001010271551954	0.3206659576563595	0.0001010271551954	0.3310397182250386	0.4955860537972385	0.1777963966653269	0.0049578007801104	0.2367316483034982	0.0049578007801104	0.2479216785082851	0.0050006095754188	0.1416336314146873	4.9888504392826565e-05	0.2179952652942814	4.9888504392826565e-05	0.2279681447805158	0.0034128984740505	0.4948663121524421	0.0034128984740505	0.506451385638337	ZNF664	28062	CCDC92	29047	RFLNA	29458	False	False	False	alt	100	0.004753	-85	0.04614
957	chr12	123962181	A	G	rs7312404	0.02501528966	0.1384865132200271	0.02501528966	0.1459397286578191	0.0177727409240286	0.0448149891147363	0.0004929947413825	0.0516510487552464	0.0004929947413825	0.0545928901191781	0.449417525078061	0.2527496476945228	0.0116232738046902	0.1061084688552979	0.0116232738046902	0.113645598054766	0.0080893105181188	0.0308516876055795	0.0002306394223909	0.0487764246864471	0.0002306394223909	0.0521751887484818	0.0104565400056016	0.1965414963488446	0.0104565400056016	0.2023979406810869	ZNF664	9665	CCDC92	10650	RFLNA	11061	False	False	False	alt	100	0.00227	-100	0.05914
958	chr12	123962799	T	C	rs7134121	-0.01260046424	0.3125368751560412	0.01260046424	0.3015700897301847	0.024524675000603	0.0113018272756179	-0.000336163407059	0.1006739820344502	0.000336163407059	0.0957624964590413	0.4387804852747434	0.2748113415671501	-0.0055382604625227	0.240415794678634	0.0055382604625227	0.2297277652363286	0.0107474389435855	0.0102353805429624	-0.0001476149635964	0.0906835761231945	0.0001476149635964	0.0851241353552745	-0.0057137522173466	0.3642084714979973	0.0057137522173466	0.3547523100816186	ZNF664	9047	CCDC92	10032	RFLNA	10443	False	True	False	ref	-30	0.000824	-75	0.0638
959	chr12	123982657	C	A	rs35099862	-0.0458236274	0.0374524755049814	0.0458236274	0.0351000541368196	0.0118511831360744	0.1805832606974044	-0.0005587083304703	0.0371766423654403	0.0005587083304703	0.0350055222321558	0.42633637278395	0.2887760660053494	-0.0191349890162102	0.0489111717931909	0.0191349890162102	0.0450868975493451	0.0049940675456714	0.142860697130378	-0.0002301868177533	0.0430211863778709	0.0002301868177533	0.0400062888445815	-0.0251911326880983	0.0460079862972133	0.0251911326880983	0.04475952057798	RFLNA	9415	CCDC92	9826	ZNF664	10811	False	False	False	ref	-100	0.003237	-80	0.02234
960	chr12	123984025	G	C	rs7978610	-0.014663915	0.2577511168498751	0.014663915	0.2475842916670479	0.0078636659654212	0.6071153641536187	-0.0001151478985492	0.3003661367643323	0.0001151478985492	0.2905794906108616	0.5292855735017998	0.1304492408610426	-0.0077773288774421	0.1694668759931284	0.0077773288774421	0.1603328532214696	0.0041588136859505	0.2318505677127091	-6.102294825583188e-05	0.1966817295718984	6.102294825583188e-05	0.1875129991004661	-0.0037324038631105	0.4828584810474199	0.0037324038631105	0.4716562810425464	RFLNA	10783	CCDC92	11194	ZNF664	12179	False	False	False	ref	-55	0.004868	85	0.01599
961	chr12	123985512	C	T	rs11837287	0.003170523846	0.6742740436125493	0.003283561914	0.6830969189848551	0.0317118900755681	0.0030662547316114	0.0001029599295095	0.3167972383053412	0.0001059839884928	0.325100495621481	0.265332627931825	0.5506703395736526	0.0008182034740117	0.6191266292077601	0.0008494393584373	0.6285803936845984	0.0085232620468406	0.0246787492882695	2.707585493215615e-05	0.3431972113971692	2.7911495169070844e-05	0.3524467382173486	0.0029045944460004	0.5401133537983561	0.0029709851761947	0.5482778464080917	RFLNA	12270	CCDC92	12681	ZNF664	13666	False	True	True	alt	80	0.001968	100	0.05917
962	chr12	123990609	A	G	rs7307277	0.01285579618	0.318360537220011	0.01285579618	0.3302125353017915	0.0105789666026214	0.264700286912931	0.0001439840561058	0.2759505768634118	0.0001439840561058	0.2860120795096408	0.2954636458884427	0.5044360514372932	0.0038154268748725	0.3180939313981545	0.0038154268748725	0.3310237989867098	0.0030793180703751	0.401144268900177	4.181905307515532e-05	0.2848723787753603	4.181905307515532e-05	0.296516852704038	0.0108528096764488	0.2178920531416977	0.0108528096764488	0.2240151026487506	RFLNA	17367	CCDC92	17778	ZNF664	18763	False	False	False	alt	-10	0.000371	45	0.0396
963	chr12	123992326	C	T	rs12833624	-0.0454571583999999	0.0382858432097065	0.0454571583999999	0.0357638364070745	0.019942080585267	0.0263957333017052	-0.0009164869370554	0.0138806187400923	0.0009164869370554	0.0131884503451009	0.497725080135686	0.178832084762216	-0.0225718942868161	0.0342759412632127	0.0225718942868161	0.0315634501625655	0.0099192042624878	0.0133957164533473	-0.0004546660496244	0.0138310852866482	0.0004546660496244	0.0129513878873214	-0.0157034824012697	0.1108697153151904	0.0157034824012697	0.1076339421862678	RFLNA	19084	CCDC92	19495	ZNF664	20480	False	False	False	ref	85	0.003254	65	0.0365
964	chr12	123995826	G	C	rs34114498	-0.0134889512	0.2849863848126501	0.0134889512	0.2743844131252053	0.0079753084022443	0.5873498241417557	-0.0001084878636648	0.3278470290959485	0.0001084878636648	0.3177219600975924	0.3266942603139037	0.4570991450672248	-0.0044004635107289	0.2811219381463852	0.0044004635107289	0.2699374329747332	0.0026120242343499	0.4895929458651377	-3.548978013504984e-05	0.3061984934139603	3.548978013504984e-05	0.2953057634799128	-0.0095810122511644	0.2087999074096627	0.0095810122511644	0.2023318455111696	RFLNA	22584	CCDC92	22995	ZNF664	23980	False	False	False	ref	-95	0.01513	95	0.09973
965	chr12	124008063	T	G	rs12303671	-0.01261517248	0.3315807583524841	0.01261517248	0.3202903282863555	0.0111855087245704	0.2199440634891547	-0.0001418477607305	0.2847229320692586	0.0001418477607305	0.2749142534548029	0.4478075498708492	0.2570941814797408	-0.0057914472287975	0.2450557937079644	0.0057914472287975	0.2339623525800385	0.0049891240532484	0.1454486807684339	-6.463002061584235e-05	0.2112545544837368	6.463002061584235e-05	0.201537260929395	-0.0054378157449765	0.3882372141476368	0.0054378157449765	0.3781973208252458	RFLNA	34821	CCDC92	35232	ZNF664	36217	False	False	False	ref	-100	0.003345	100	0.0596
966	chr13	32188974	G	A	rs7992065	-0.0256915522	0.1359306556045098	0.0256915522	0.1288350177183615	0.0074819431103758	0.6600707228225168	-0.0001985892372911	0.1842292523506245	0.0001985892372911	0.1765287967224628	0.1397524870589943	0.7595972765708402	-0.0036816178533811	0.3283508052092971	0.0036816178533811	0.3166779801902833	0.0010556529812769	0.7880938557165609	-2.8579513919240065e-05	0.3654694723026123	2.8579513919240065e-05	0.353793210218215	-0.0236060540047095	0.0460511903935975	0.0236060540047095	0.0449349362248906	BRCA2	126113	ZAR1L	126389	N4BP2L1	239337	False	False	False	ref	-80	0.01039	-75	0.01546
967	chr13	32201923	G	T	rs9567419	0.0003595471	0.7920732810414673	0.00221719458	0.7987073300712196	0.0192044730405071	0.0325536153387127	1.4203383229064796e-05	0.6005554879486396	3.994735681467189e-05	0.6066390570835627	0.2182138818867414	0.6267769926476672	0.0001273881010931	0.7379144062452555	0.0004565072974947	0.7450067272539113	0.0042984636375295	0.2174420685543764	3.958857413083677e-06	0.6005579071953866	8.519914321024458e-06	0.6074650008362223	0.0005539476550586	0.6483775048958274	0.0019979460367845	0.6544360123219837	BRCA2	113164	ZAR1L	113440	N4BP2L1	226388	False	False	False	alt	-85	0.010956	-50	0.00896
968	chr13	32202016	T	C	rs9567420	0.0237275242	0.1419411340432299	0.0237275242	0.1498861410565701	0.0076997038472474	0.6354116773006099	0.0001875905333101	0.1839391502671595	0.0001875905333101	0.1921680768542391	0.2429962966420813	0.585809004576085	0.0057796011017483	0.2103226333191065	0.0057796011017483	0.2209224691111121	0.001866007672333	0.6364232710094513	4.554119456834959e-05	0.2442486310300472	4.554119456834959e-05	0.2545972303115217	0.0207180572412576	0.0621317634145617	0.0207180572412576	0.0637754487044129	BRCA2	113071	ZAR1L	113347	N4BP2L1	226295	False	False	False	alt	100	0.00907	-95	0.0439
969	chr13	32202479	T	A	rs61750791	0.00921198064	0.3356058397749057	0.01070989696	0.3450053868518403	0.0113017036352301	0.2143551830457251	8.465364426489549e-05	0.3023201890289521	0.0001077455809132	0.3099772667833738	0.2044274318198321	0.6479640813928451	0.0015604239119802	0.4415220130748004	0.0019629853292434	0.4516343450093545	0.0024275099864254	0.5063243085508325	1.4432029709315354e-05	0.395847911561733	2.063793228869612e-05	0.4047230746281966	0.0082531976472784	0.1955685989100563	0.0094191848463158	0.1998334213439481	BRCA2	112608	ZAR1L	112884	N4BP2L1	225832	False	False	False	alt	100	0.01839	-95	0.03976
970	chr13	37576532	A	G	rs4512969	0.01639940274	0.2311526183044225	0.01639940274	0.2411632016662647	0.0068941062628589	0.7930473793442536	0.0001126859676489	0.3062647044880545	0.0001126859676489	0.3164383028561567	0.0312036431913193	0.9451382960774648	0.0005969211108692	0.7056795431917878	0.0005969211108692	0.7193207801831774	0.000212167864437	0.956091623039596	4.033039513746876e-06	0.743127275657498	4.033039513746876e-06	0.7568541547460462	0.0073652216309297	0.2977008827671765	0.0073652216309297	0.3061448153063067	POSTN	22312	TRPC4	293270	CSNK1A1L	470868	False	False	False	alt	50	0.00285	-90	0.0764
971	chr13	37612750	C	T	rs17258158	-0.0515513952	0.0277195707542177	0.0515513952	0.0260207883054637	0.0096292744807861	0.3565707483908605	-0.0005309782119764	0.047280676057231	0.0005309782119764	0.0445805585581594	0.2035270075415719	0.652308753848583	-0.0113476754550011	0.1222123061783034	0.0113476754550011	0.1146703424671271	0.0020507258465399	0.5957921552712716	-0.0001216200955304	0.1231734717059438	0.0001216200955304	0.1164281669865674	-0.0488262326372679	0.0049866266459826	0.0488262326372679	0.0048532477051363	POSTN	13906	TRPC4	257052	CSNK1A1L	507086	False	False	False	ref	20	0.000537	-75	0.01967
972	chr13	37636007	G	T	rs73184532	0.00556167408	0.5211406177626073	0.00556167408	0.5339859096029923	0.0304263261607315	0.0036466503996542	0.0001653400203809	0.1941166667761063	0.0001653400203809	0.2025176554476685	0.2339982779904355	0.5944739007580085	0.0012986000170235	0.5279687710317841	0.0012986000170235	0.5415756892348939	0.0072712439563027	0.0490343058478489	3.9109255829154005e-05	0.2671653766878858	3.9109255829154005e-05	0.2780678272397	0.0050145748399879	0.3690620416451409	0.0050145748399879	0.3788263820630633	POSTN	37163	TRPC4	233795	CSNK1A1L	530343	False	True	True	alt	-10	0.001381	90	0.0395
973	chr13	37638916	A	G	rs73184537	-0.01235646592	0.3095201943021068	0.01235646592	0.2987788917208564	0.0172348284427869	0.0482161481482022	-0.0002167899835251	0.1700787848955288	0.0002167899835251	0.1626369191746527	0.1943381155406176	0.6627265898893121	-0.0024420822849582	0.4244027475558977	0.0024420822849582	0.4117771225981402	0.0034138460323135	0.3432478929798622	-4.351890255028269e-05	0.2824409976542734	4.351890255028269e-05	0.2718184429538542	-0.0112490793472961	0.1680969243903593	0.0112490793472961	0.1630297831522314	POSTN	40072	TRPC4	230886	CSNK1A1L	533252	False	False	False	ref	-100	0.003674	-100	0.08014
974	chr13	37737646	C	T	rs1924300	0.00773196874	0.4183862460047476	0.00773196874	0.4303866254627599	0.0307756620934555	0.0036232728393162	0.0002428690458529	0.1289691131902834	0.0002428690458529	0.1357007780178386	0.0261869936410128	0.95023697871001	0.0002124860018628	0.8272834166678681	0.0002124860018628	0.8415424678224173	0.0008108325950849	0.8321449771732627	6.701984395640575e-06	0.6412222008240639	6.701984395640575e-06	0.6548433456260675	0.0031182896088133	0.5178491883009901	0.0031182896088133	0.5295386234492906	TRPC4	132156	POSTN	138802	UFM1	612204	False	True	False	alt	65	0.009155	-100	0.001404
975	chr13	37740503	G	A	rs12858218	-0.0004921534679999	0.7934539155988298	0.002052472012	0.7949482282776944	0.0065549005854837	0.8672398402832974	-2.2523321946754102e-06	0.8365530369768613	1.2897040415277868e-05	0.838290314127269	0.0487847384308965	0.9118049107495192	-4.070985886966218e-05	0.9003145469051296	0.0001002544498575	0.9019333703239708	0.0003255691962663	0.931598425743284	-2.108719647117288e-07	0.9169759142453636	6.30401346096969e-07	0.9187237996202664	-0.0003609995954315	0.7565420021237014	0.0012614238736915	0.7575521315068978	TRPC4	129299	POSTN	141659	UFM1	609347	False	False	False	ref	-40	0.0015335	90	0.01729
976	chr13	37743884	G	T	rs2025402	0.00522753916	0.5659654380988827	0.00522753916	0.579006378952188	0.0228177716565369	0.0147909445327892	0.0001240482674087	0.2956414198271061	0.0001240482674087	0.3058078191394638	0.0541644622869531	0.9033967586820624	0.0002983759053212	0.797456300556395	0.0002983759053212	0.8116403427863547	0.0012477376680183	0.751099833576047	7.181553753300551e-06	0.6476457478164774	7.181553753300551e-06	0.6612774418567181	0.0034875880455191	0.5002561956315261	0.0034875880455191	0.5119709820208672	TRPC4	125918	POSTN	145040	UFM1	605966	False	True	False	alt	-50	0.01158	0	0.0
977	chr13	37748922	G	T	rs11620255	-0.0229947662	0.160061215112327	0.0229947662	0.1521541390638658	0.0117046811945876	0.1895793178667782	-0.0002765378898183	0.121595565273966	0.0002765378898183	0.1156687672630958	0.1732569839936098	0.6986157895577289	-0.0044919126970489	0.3060259115864449	0.0044919126970489	0.2940069999031498	0.0020787588836261	0.58231108247766	-5.550337115444016e-05	0.2526124238938529	5.550337115444016e-05	0.2422675541234105	-0.0211018786501934	0.0628317595099785	0.0211018786501934	0.0611149455520602	TRPC4	120880	POSTN	150078	UFM1	600928	False	False	False	ref	-100	0.02965	-90	0.02623
978	chr13	37778264	C	T	rs7330208	-0.0606796696	0.0156371930729238	0.0606796696	0.0147657656031367	0.0152942501973194	0.0782039688179826	-0.0010126073146231	0.0174922312999406	0.0010126073146231	0.0165827111957523	0.0681355615722154	0.8774755505053322	-0.0039997083264881	0.3055946594634052	0.0039997083264881	0.2939605032930625	0.0009755922753463	0.79749945833249	-6.201368296074477e-05	0.2085748228300905	6.201368296074477e-05	0.1991171049148489	-0.0348613574829613	0.0165974521569861	0.0348613574829613	0.0161862795166037	TRPC4	91538	POSTN	179420	UFM1	571586	False	True	False	ref	65	0.008675	-5	0.002228
979	chr13	37779028	G	A	rs9566253	-0.0046285536	0.6063379354495994	0.0046285536	0.5926450350955225	0.0056419734127622	0.9732663096413522	-2.649973029067262e-05	0.7101105950060832	2.649973029067262e-05	0.6966564970314492	0.0980072407390117	0.8274412183774315	-0.0004890212296629	0.747250604824391	0.0004890212296629	0.7326232732570523	0.0005566710748587	0.8847945278623082	-2.790697336607863e-06	0.8043729754186804	2.790697336607863e-06	0.7898328021281192	-0.0044668513158849	0.4433830272605114	0.0044668513158849	0.4336758148211088	TRPC4	90774	POSTN	180184	UFM1	570822	False	False	False	ref	100	0.00685	80	0.03069
980	chr13	37779963	C	T	rs1333376	0.00497227912	0.5665543219292372	0.00497227912	0.5794248079199305	0.007212357625259	0.7399426421575885	3.699355515315209e-05	0.6201378086178309	3.699355515315209e-05	0.6329121745022779	0.1599746885341134	0.7241785259294884	0.0008619235493953	0.6245517990154311	0.0008619235493953	0.6383890374638139	0.0011875373553984	0.7645587820503532	6.614590310318727e-06	0.6579734590004571	6.614590310318727e-06	0.6717184236368815	0.0047510866295292	0.3894017800678881	0.0047510866295292	0.399709501173406	TRPC4	89839	POSTN	181119	UFM1	569887	False	False	False	alt	100	0.002316	35	0.010895
981	chr13	38036983	A	C	rs78587501	0.0211018778	0.168707533141198	0.0211018778	0.1772172554830754	0.0109250063354903	0.224897996197075	0.0002312174389253	0.1389689022323461	0.0002312174389253	0.1458873673071605	0.0028174566126204	0.9949043581529624	6.370557604407349e-05	0.9248197325211952	6.370557604407349e-05	0.9389282855271937	3.149692882300556e-05	0.9934077704211348	7.137504124045919e-07	0.911828133414564	7.137504124045919e-07	0.926027801576092	0.0009543667465429	0.8091977749022703	0.0009543667465429	0.8230230755940582	TRPC4	167181	UFM1	312867	POSTN	438139	False	False	False	alt	75	0.00444	-15	0.01199
982	chr13	38290033	G	T	rs2652578	-0.00594097154	0.5328223105240063	0.00594097154	0.5202090340013987	0.006777764326399	0.7982971581470643	-4.016990711311507e-05	0.6110377862837506	4.016990711311507e-05	0.5983224497810193	0.256834614466955	0.567728136659915	-0.0015525448752425	0.5209749274205849	0.0015525448752425	0.5074340856266912	0.0017518363821946	0.6547142741016452	-1.0555222719784452e-05	0.5763701632374201	1.0555222719784452e-05	0.5630241535510764	-0.0052925860226765	0.3724404513682725	0.0052925860226765	0.3627239047570396	UFM1	59817	FREM2	397045	TRPC4	420231	False	False	False	ref	90	0.00349	15	0.004036
983	chr13	38291192	A	G	rs9548286	-0.00875576086	0.4237533686749012	0.00875576086	0.4115002064562706	0.0078706088108946	0.6233547282748397	-7.162775545442175e-05	0.4666435057603376	7.162775545442175e-05	0.4550395363261779	0.2705048807560244	0.5452975545854608	-0.0025048048580952	0.4314222161263642	0.0025048048580952	0.4185723656111484	0.0021603493668241	0.5819265599041107	-2.074799712857992e-05	0.4570765754331172	2.074799712857992e-05	0.4445345888210413	-0.0069440554362596	0.29715522924785	0.0069440554362596	0.2889443585126421	UFM1	58658	FREM2	395886	TRPC4	421390	False	False	False	ref	85	0.002209	-100	0.03445
984	chr13	38293102	A	C	rs665175	-0.001474946456	0.8042788078929296	0.001885038944	0.8001404930508965	0.0304907749824452	0.0038902986400604	-5.493386123929112e-05	0.4765807188640455	6.427693851374792e-05	0.4708235835225742	0.0596624446311683	0.8906120834106407	-8.823783056155721e-05	0.8966391602813888	0.0001104717173295	0.8930539961760728	0.0018110420951583	0.6342206930807892	-3.2564799418470084e-06	0.7508833656150352	3.763344322661454e-06	0.7462796752034093	-0.001172211329993	0.7392438347114518	0.0014170271475844	0.7350586014625369	UFM1	56748	FREM2	393976	TRPC4	423300	False	True	True	ref	-90	0.000885	70	0.05164
985	chr13	38293934	C	A	rs651360	-0.0074452940799999	0.4805230402896206	0.0074452940799999	0.4681962905040286	0.0077974164646131	0.6267121551132991	-6.335689511255563e-05	0.5178314434681562	6.335689511255563e-05	0.5059400900614114	0.0821336320916191	0.8524491941139773	-0.0006345842618107	0.7117639001092799	0.0006345842618107	0.697975733101052	0.0006444000343402	0.8672110411658142	-5.4057410138387085e-06	0.7257510933911564	5.4057410138387085e-06	0.7120224403698422	-0.0059979875309909	0.3563810911293592	0.0059979875309909	0.3470344240805182	UFM1	55916	FREM2	393144	TRPC4	424132	False	False	False	ref	45	0.002365	-100	0.0261
986	chr13	39982666	C	A	rs7322623	0.0065707992	0.5092377853587656	0.0065707992	0.5224948979643839	0.0096980734514147	0.3338924572525137	6.420516110350745e-05	0.4879813528013311	6.420516110350745e-05	0.5002756082608748	0.4404983454185209	0.2713375186640185	0.0028646672320468	0.3863802266304683	0.0028646672320468	0.3994627374342605	0.0042648993150671	0.2208030006258661	2.798447855661107e-05	0.3690110740624107	2.798447855661107e-05	0.3813978416407098	0.003313312378759	0.525554298746856	0.003313312378759	0.5373215758501673	COG6	327038	LHFPL6	379138	FOXO1	683975	False	False	False	alt	70	0.00112	25	0.00232
987	chr13	39990357	G	A	rs276423	-0.0405843718	0.0527945406395176	0.0405843718	0.0493832917497107	0.0097450602150629	0.3271974334605779	-0.0004010253637288	0.0648864198742909	0.0004010253637288	0.0612014723355972	0.4007033267979958	0.3375060870599226	-0.0163224112216142	0.0654980918832486	0.0163224112216142	0.0605659986466907	0.0039208058190325	0.2687613562680618	-0.0001619831169944	0.0713181955278571	0.0001619831169944	0.0665629924900749	-0.0225852965279722	0.0536377681197002	0.0225852965279722	0.0522543728335141	COG6	334729	LHFPL6	386829	FOXO1	676284	False	False	False	ref	-95	0.000925	95	0.03598
988	chr13	40062244	C	T	rs277293	-0.1211235107999999	0.001487011418969	0.1211235107999999	0.0014031000379295	0.0337202993000874	0.0030729533846663	-0.0044175291303966	0.0016178633655207	0.0044175291303966	0.0015429831332502	0.4056328385149223	0.3241053594996946	-0.0496942041081302	0.0039961327261831	0.0496942041081302	0.0037588262235908	0.0138202095572518	0.0052635682417788	-0.0018275518439282	0.0023474532351486	0.0018275518439282	0.0022261258460241	-0.0758306621437981	0.0012011599745781	0.0758306621437981	0.0011759032056415	COG6	406616	LHFPL6	458716	FOXO1	604397	False	True	True	ref	-100	0.00177	-100	0.1188
989	chr13	43665632	T	C	rs9567243	-0.0063353402	0.5351686197367663	0.0063353402	0.5223145805725776	0.0141861242519994	0.0958041494563091	-9.050060287226508e-05	0.396181297190773	9.050060287226508e-05	0.3849579252507861	0.3804313322752309	0.3708162446845274	-0.0024653344619329	0.4285360390447523	0.0024653344619329	0.4156236855548922	0.0054035010852241	0.1130495365334706	-3.5295409556064986e-05	0.3262563927028435	3.5295409556064986e-05	0.3150522945773396	-0.003473065073289	0.514985783984344	0.003473065073289	0.503395890114204	ENOX1	121340	LACC1	213653	CCDC122	214108	False	False	False	ref	95	0.002857	45	0.05618
990	chr13	43720364	G	A	rs12864863	-0.0372844688	0.0647744182663614	0.0372844688	0.0607377626573729	0.0094046643921536	0.3689689944606732	-0.0003564520745959	0.079201201340467	0.0003564520745959	0.0748411760531437	0.1898505171215468	0.6739410145033333	-0.0071452010550355	0.1871513619976082	0.0071452010550355	0.1774525385700463	0.0017648660415927	0.6527918352747571	-6.749092117315603e-05	0.1858477213477229	6.749092117315603e-05	0.1768780077452684	-0.0360397929439101	0.0148639162887399	0.0360397929439101	0.0144578264951791	ENOX1	66608	LACC1	158921	CCDC122	159376	False	False	False	ref	95	0.0002823	30	0.00928
991	chr13	43743746	T	G	rs11147926	0.040521241	0.0476002629113208	0.040521241	0.051080287434755	0.0090938844530677	0.4099599319118137	0.000380003190685	0.0676703481440729	0.000380003190685	0.0718520693543378	0.2889490554881274	0.5153226529001949	0.0122374516784055	0.0918668481476043	0.0122374516784055	0.0986796091042574	0.0026729738232138	0.4775734625255867	0.0001172637618697	0.1028571853368875	0.0001172637618697	0.1095610720733462	0.0331912156765111	0.0189778405248493	0.0331912156765111	0.0194848606613163	ENOX1	43226	LACC1	135539	CCDC122	135994	False	False	False	alt	-55	0.001316	70	0.01816
992	chr13	43775613	T	C	rs11619519	-0.0368442453999999	0.0686515657733342	0.0368442453999999	0.0644347378352296	0.015857464226838	0.0763761989103912	-0.0006915626885922	0.0424385591685171	0.0006915626885922	0.0402276178314867	0.2066411477297482	0.6483004155368605	-0.00808219102223	0.1728134036234243	0.00808219102223	0.1637723135768965	0.0035278485078714	0.2967159228657997	-0.0001640980355633	0.103510495517039	0.0001640980355633	0.0979103625117925	-0.034794966752767	0.0164902283109465	0.034794966752767	0.0160226639227346	ENOX1	11359	LACC1	103672	CCDC122	104127	False	False	False	ref	-60	0.00169	90	0.05145
993	chr13	43777097	G	A	rs11147928	-0.0045251236934	0.6480437199429736	0.0049023990694	0.6405936974305585	0.0077108748298501	0.6568227953152828	-4.251040851658774e-05	0.664707835529571	4.5097047463907904e-05	0.6583188493471064	0.3468438469278727	0.4224659216166541	-0.0016757680415068	0.5666328688798827	0.0018247542239383	0.5567194311256536	0.0027048690134771	0.4729868534749376	-1.5911436869637092e-05	0.5817249521043352	1.6932901526392702e-05	0.5722191269935941	-0.0027593647237004	0.6021698504288012	0.0030041805412918	0.5942018513358464	ENOX1	9875	LACC1	102188	CCDC122	102643	False	False	False	ref	95	0.02176	65	0.02771
994	chr13	43777105	A	G	rs10870772	0.00210642448	0.5544263514026021	0.00515601568	0.561495526014998	0.0091641320347372	0.4021560763178369	2.402120980314026e-05	0.5334246714075309	4.7882146944229815e-05	0.540392874965625	0.3487588045519144	0.4194972597215927	0.0007295288295791	0.4718134460492137	0.001699397464199	0.4789419631286742	0.0031873828652407	0.384315820797903	8.115323389572626e-06	0.45757177391268	1.5703873176100735e-05	0.4647841831909776	0.0018568657351216	0.4714792750726466	0.0036784613948276	0.476917835676547	ENOX1	9867	LACC1	102180	CCDC122	102635	False	False	False	alt	100	0.02185	55	0.04437
995	chr13	43836417	G	A	rs12872943	0.00772916046	0.4211368846412474	0.00772916046	0.4332719070981817	0.0301216204116879	0.0040869985134411	0.0002409294448111	0.132242066931655	0.0002409294448111	0.138973405961174	0.3653066940528428	0.3901522387718937	0.0028398193372538	0.3508308551383813	0.0028398193372538	0.3631614113280099	0.0110829790433342	0.009175005553314	8.933039195549244e-05	0.1309616846421114	8.933039195549244e-05	0.138891935015058	0.0046494258239192	0.3933378058692011	0.0046494258239192	0.4038327155769394	LACC1	42868	CCDC122	43323	ENSG00000281883	47384	False	True	True	alt	-5	0.000679	40	0.0908
996	chr13	43843305	G	T	rs2875541	-6.805641800000004e-05	0.9008334470770044	0.001007332674	0.9002256252809052	0.0080837156217556	0.5706911540137349	-2.957225613476339e-07	0.901772658294427	7.997903076586413e-06	0.9013585581121994	0.0182221807280157	0.970072865494907	-8.443504674626901e-06	0.974282382008004	1.7090423382272614e-05	0.9768921307203444	0.0001484610445181	0.971844711212812	-6.66813277804984e-08	0.9746309130340394	1.3749177516046356e-07	0.9778174975888774	-0.0001099596468843	0.9362419180745808	0.0002925341549185	0.9359199341022902	LACC1	35980	CCDC122	36435	ENSG00000281883	40496	False	False	False	ref	-100	0.00431	-85	0.01199
997	chr13	43877708	T	A	rs4942255	0.01649965534	0.2230691884411784	0.01649965534	0.2327002278478802	0.0098828447515957	0.3232934676478297	0.0001765851956242	0.214694047153558	0.0001765851956242	0.2230856309562653	0.2760319090446996	0.5341955509300502	0.0046756899680087	0.2603915805928962	0.0046756899680087	0.271866041595263	0.0028145817690923	0.4454410059065961	5.168417289536495e-05	0.2455559338093585	5.168417289536495e-05	0.2559720879002567	0.0135976514279193	0.1262839699221321	0.0135976514279193	0.1300922828439987	LACC1	1577	CCDC122	2032	ENSG00000281883	6093	False	False	False	alt	100	0.005836	-75	0.00867
998	chr13	43890691	C	T	rs1445557	-0.001329263558	0.8856685866227515	0.001408026238	0.8781658494803906	0.0142763870250078	0.1066423523955751	-1.8256678043518463e-05	0.8120727087900637	1.934402704770247e-05	0.8043286774857406	0.126561478853515	0.7784635469417348	-0.0001609471729344	0.8908610131225144	0.0001698007126588	0.8833416080681332	0.0018613004835987	0.6188278904255108	-2.3070194085560985e-06	0.8455814695998249	2.429245923450837e-06	0.8377850934380477	-0.001114119441073	0.7856045037521567	0.0012261537982758	0.7781389078481984	ENSG00000281883	6890	CCDC122	10951	LACC1	11406	False	False	False	ref	5	0.000656	-80	0.01834
999	chr13	43901378	G	T	rs1373903	-0.00151403496032	0.5241550000481399	0.00642187391968	0.5198967559298597	0.008072653046897	0.556485086386556	-6.72245729802654e-06	0.5804396209060853	4.983262402175806e-05	0.5762927256785165	0.3456218425502339	0.4233306084935584	-0.0003128421813501	0.4784490521923702	0.0023048783417865	0.4738036833572978	0.0028154150822321	0.4501543068530871	-6.156958101257457e-07	0.5154970400715929	1.8113595757977098e-05	0.5109753172400364	-0.0009336196433572	0.4660820315991509	0.0040415357005777	0.4627872100341765	ENSG00000281883	17577	CCDC122	21638	LACC1	22093	False	False	False	ref	65	0.002335	100	0.04745
1000	chr13	43904669	C	T	rs7994883	0.00583716656	0.5092416492004953	0.00583716656	0.5219347689107325	0.0133632740880243	0.1239373019816355	8.021603384823981e-05	0.3901987316016068	8.021603384823981e-05	0.4013165611800152	0.1130177698938785	0.801126385367468	0.0006161671831652	0.6691726802475577	0.0006161671831652	0.6830666035594736	0.0014870310135961	0.7067077112110257	8.336909251030907e-06	0.589656457557722	8.336909251030907e-06	0.603246635405105	0.0051639539829251	0.3569225398105112	0.0051639539829251	0.3667329520111273	ENSG00000281883	20868	CCDC122	24929	LACC1	25384	False	False	False	alt	100	0.001568	-100	0.04282
1001	chr13	49584803	A	G	rs1359541	-0.0006224746999999	0.6681751875384366	0.00367173186	0.6708758633360248	0.0107867019243769	0.243479567488101	-1.209930556095041e-05	0.6012585118004106	4.209191907580222e-05	0.6034273963849236	0.6268343032604072	0.0296186005052307	-0.0004338810345356	0.4167852405911521	0.0023173784049609	0.4191721626346528	0.0067801339754715	0.0537935399967128	-8.125219859005194e-06	0.3718223033006784	2.6659664176138733e-05	0.3734493934876144	-4.149420637179985e-06	0.922955236200157	0.0003278042303342	0.9274978619978776	RCBTB1	755	ARL11	43705	PHF11	89192	False	False	False	ref	-100	0.01697	95	0.1212
1002	chr13	49602185	A	G	rs9316462	0.0019513811199999	0.8022137838639274	0.0019513811199999	0.8160747026487034	0.0072391731655517	0.7454434430539564	1.402459816996624e-05	0.8251805930833359	1.402459816996624e-05	0.8389663629608807	0.3758358489195946	0.3759197291674465	0.0007353430507568	0.6411479551514869	0.0007353430507568	0.6553158937781441	0.0027157831828316	0.4734519171448932	5.277368823713119e-06	0.6733553948974673	5.277368823713119e-06	0.6874544236948261	0.001186734302223	0.759165285350652	0.001186734302223	0.7727011476196183	RCBTB1	16627	ARL11	26323	EBPL	89301	False	False	False	alt	-100	0.002686	20	0.01019
1003	chr13	53619055	C	T	rs4619272	-0.00306938548	0.6940826197598275	0.00365740404	0.683802629944439	0.016615840625119	0.0573583782229579	-4.32967279603389e-05	0.5126947498455704	5.511170391906861e-05	0.5035530797831377	0.0654778576541249	0.8848528295857999	-0.0001348491037523	0.8558628555394078	0.0002060159447942	0.8456900010318111	0.0011404794428149	0.7671001609816237	-1.801186422172893e-06	0.7785797628733501	3.231132007816929e-06	0.7685825305704836	-0.0017842508739717	0.6155458798830207	0.0023610203425346	0.6063774411448695	OLFM4	590241	PCDH8	770414	CNMD	879235	False	False	False	ref	100	0.001801	100	0.05002
1004	chr13	53668007	G	A	rs7989647	-0.0009651793399999	0.6011028843586864	0.0048530317399999	0.5968050886445762	0.0094919074172612	0.3739529825745124	-4.468155164865289e-07	0.5836501053246426	4.627840194676583e-05	0.5801585623669212	0.0972914656791045	0.8264300308662391	-4.233759861191999e-05	0.7431576938135015	0.0005040963365518	0.7384689073703217	0.0009430171372016	0.8079273552030899	5.874984279564915e-07	0.7280396766119885	4.962739178269817e-06	0.7237508733707377	-0.0006410854884386	0.4580082114846405	0.0041722424506477	0.4547971969484955	OLFM4	639193	PCDH8	819366	CNMD	928187	False	False	False	ref	80	0.005783	60	0.02304
1005	chr13	53716198	C	T	rs2806731	-0.0119430616	0.3214227345340281	0.0119430616	0.3104879171790556	0.0101562060379723	0.2924309455685285	-0.0001187749031168	0.3050752444157523	0.0001187749031168	0.2952138029696068	0.0764198798742725	0.8659874067855189	-0.0009194688313321	0.6419298916214016	0.0009194688313321	0.6281123283375819	0.0007932143449463	0.8385830661061376	-9.34044203266244e-06	0.6103302772919609	9.34044203266244e-06	0.5968760097051257	-0.0088071453023371	0.2279785405486266	0.0088071453023371	0.2210692093817668	OLFM4	687384	PCDH8	867557	CNMD	976378	False	False	False	ref	-100	0.01274	85	0.04132
1006	chr13	53724171	G	A	rs2806738	-0.0606007223999999	0.0158392114484257	0.0606007223999999	0.014931425621129	0.0131541276149344	0.1254142467806715	-0.0008186567729745	0.0193919419893221	0.0008186567729745	0.0183428055166873	0.3093164866855464	0.4780687021980245	-0.0191124063767384	0.0499301207408062	0.0191124063767384	0.0462261983953873	0.0040734270542116	0.2470682022758317	-0.0002579956541729	0.0391324080314555	0.0002579956541729	0.0364869548600244	-0.0481374288115021	0.0052501690535645	0.0481374288115021	0.0051271180034244	OLFM4	695357	PCDH8	875530	CNMD	984351	False	True	False	ref	-70	0.001457	-5	0.00537
1007	chr13	55165620	G	A	rs3120869	-0.0073688931399999	0.4789767887728494	0.0073688931399999	0.4663691120064429	0.0084687628063367	0.4929507501172487	-6.228847619771263e-05	0.505914394510121	6.228847619771263e-05	0.4938950208619633	0.0798597495824645	0.8479880143587762	-0.0006835934149331	0.7285159208843931	0.0006835934149331	0.7139222126661029	0.000643069536564	0.8575712238138365	-5.498504133871823e-06	0.7358225192291434	5.498504133871823e-06	0.7214771645104135	-0.0048527474351393	0.404963159271103	0.0048527474351393	0.3952491648721655	PRR20A	1975299	PRR20B	1981869	PRR20D	1995013	False	False	False	ref	95	0.002037	55	0.01033
1008	chr13	55250174	A	G	rs9527348	-0.0005382155839999	0.8965121758945098	0.001124465916	0.8924159892547404	0.0088281241048697	0.4585537422507256	-5.680589919487243e-06	0.8845878935185414	1.0444007827443351e-05	0.8805582849036284	0.0792124399630701	0.8629433508073389	-5.740036668566858e-05	0.9222596177062358	9.035859073141702e-05	0.9184082729973704	0.0007209602849784	0.8580143299340955	-6.060702045914409e-07	0.9180245575988184	8.774365537972191e-07	0.9141576554708488	-0.0006120395439786	0.819989752610437	0.0009647402981358	0.8156135523636616	PRR20A	1890745	PRR20B	1897315	PRR20D	1910459	False	False	False	ref	-100	0.001255	100	0.03778
1009	chr13	55251042	T	G	rs3124390	0.0648177581999999	0.0118360712698376	0.0648177581999999	0.0126048652172859	0.0285816106694187	0.0049384036852675	0.0018790569169458	0.0043218807518805	0.0018790569169458	0.0045035398626853	0.4414423386134711	0.2616954924859881	0.0292139613553509	0.0163330417092491	0.0292139613553509	0.0177806356033368	0.0126616263190256	0.0054829516610588	0.00084953089035	0.0051558618507409	0.00084953089035	0.005492321130242	0.0292368178093133	0.0280600360104306	0.0292368178093133	0.0288374099581536	PRR20A	1889877	PRR20B	1896447	PRR20D	1909591	False	True	True	alt	30	0.003296	40	0.05322
1010	chr13	55261356	C	T	rs9537039	0.000425686822	0.9089059039390402	0.000864822382	0.9180477044557668	0.0109649630156143	0.2296547309526627	4.921363174836806e-06	0.8786440822072982	9.928172198655333e-06	0.8878459926076662	0.1214929615452442	0.7850423836279947	4.659489830051277e-05	0.8979049949223672	9.895916637695278e-05	0.90716767256702	0.001329832649154	0.7312490756978357	5.475676894062695e-07	0.8780963113932332	1.1445995022756352e-06	0.8874047969620068	0.0004024938018029	0.8345632767881787	0.0007883899210572	0.8435098193377769	PRR20A	1879563	PRR20B	1886133	PRR20D	1899277	False	False	False	alt	-30	0.000763	-80	0.01351
1011	chr13	55268998	A	G	rs3098275	0.0091481304	0.3632803811660751	0.0091481304	0.3749120647055513	0.0069384107788773	0.7911836955172159	6.334382291008348e-05	0.4476714850814884	6.334382291008348e-05	0.4592373518632434	0.0818618450398862	0.8552219034556623	0.0007484565799472	0.638619880202564	0.0007484565799472	0.6523497413912297	0.0005862348025584	0.8812758009665831	5.360293458366867e-06	0.6779850037898125	5.360293458366867e-06	0.6917815323612458	0.0072801585078682	0.2581530679866911	0.0072801585078682	0.2660778655390773	PRR20A	1871921	PRR20B	1878491	PRR20D	1891635	False	False	False	alt	-10	0.001724	-25	0.00439
1012	chr13	55286759	T	C	rs3098269	0.0430153766	0.0400172053932732	0.0430153766	0.0429626454247939	0.0094153378001585	0.3645065951899642	0.0004089546756082	0.0552325509561018	0.0004089546756082	0.0588122720744293	0.0890984346310646	0.8393995090117559	0.0042271263077536	0.2940096623660421	0.0042271263077536	0.306403985761942	0.0008292542284295	0.8304181984780901	3.9560159767467526e-05	0.2918062502722914	3.9560159767467526e-05	0.3031059413701322	0.0319360159337751	0.0252974256448076	0.0319360159337751	0.0259468119469565	PRR20A	1854160	PRR20B	1860730	PRR20D	1873874	False	False	False	alt	-100	0.003658	90	0.003601
1013	chr13	55292856	T	C	rs3098265	-0.002855007186	0.7279889823444389	0.002855007186	0.7140719457879535	0.0282251649263961	0.0052860285351566	-8.343248865831537e-05	0.4130290711825589	8.343248865831537e-05	0.4014329912645237	0.1995041442338612	0.6579340485430231	-0.0005750301093194	0.7278296996513508	0.0005750301093194	0.7135453262340895	0.0056672312357591	0.1059287856441267	-1.6743362885789765e-05	0.5008152689513018	1.6743362885789765e-05	0.4875302770930419	-0.0027427670411518	0.5820973964875723	0.0027427670411518	0.57020900957801	PRR20A	1848063	PRR20B	1854633	PRR20D	1867777	False	True	True	ref	100	0.003601	-95	0.03433
1014	chr13	55328403	G	A	rs3098271	0.0001339369999999	0.7185331058344959	0.0030741810799999	0.7183818525570981	0.026424623594781	0.0070821075032902	2.695749695617949e-06	0.4509783612268288	7.596949154997803e-05	0.451501189062011	0.0982126370605504	0.8315719398819373	-8.90214339638145e-05	0.82042221360631	0.0003124150230124	0.8188723757618619	0.0025805514776482	0.465422326937239	-2.2936142049749267e-06	0.6608043609304606	7.703548812725346e-06	0.6594749903614587	1.0373551592879987e-05	0.6108917078466193	0.0025207730370646	0.6103729689662402	PRR20A	1812516	PRR20B	1819086	PRR20D	1832230	False	True	True	alt	-100	0.002563	10	0.009
1015	chr13	55333351	T	C	rs1657205	0.00050079978	0.6824537664923073	0.00375210766	0.6859179101655688	0.0077335568175178	0.6242336664302955	4.228392309306797e-06	0.7013505570477088	2.9445084345117428e-05	0.7048672697583305	0.13056359505804	0.7683441606238514	0.0001760564564645	0.7402116165630697	0.0005572317280692	0.7443327652498447	0.0010273681248513	0.7849439445098861	1.4932775449337429e-06	0.7513941080676124	4.463337618215313e-06	0.7552974095651062	0.0001722009564414	0.5160253259134204	0.0032718181723876	0.5183858698281683	PRR20A	1807568	PRR20B	1814138	PRR20D	1827282	False	False	False	alt	-70	0.009285	-20	0.01698
1016	chr13	55363211	C	T	rs3124426	0.00062884034	0.8358542528990676	0.0016544582199999	0.8431849801669362	0.0265775427707283	0.0069575338576472	1.882150490261985e-05	0.5664593674429946	4.358139401841882e-05	0.5730864886123692	0.1365449849064824	0.7615475137837733	0.0001053729748282	0.8232732467859928	0.0002323742973194	0.830950297933902	0.0036350835527804	0.298751299769666	3.0802645308316253e-06	0.6576400988737919	6.146258953753982e-06	0.6649755010785119	0.0008319588377472	0.7118267879159977	0.0015456591873358	0.718830807964982	PRR20A	1777708	PRR20B	1784278	PRR20D	1797422	False	True	True	alt	70	0.007042	-95	0.0751
1017	chr13	55372303	A	G	rs9537096	-0.0036050748	0.689681613829649	0.0036050748	0.6763025363315631	0.0181503905588578	0.0399062625878958	-6.417351975182694e-05	0.465926257548979	6.417351975182694e-05	0.4540962684302194	0.2867789084949014	0.5120400861945578	-0.0009893702622495	0.6079757043710933	0.0009893702622495	0.5941005841484777	0.0052918420587711	0.1236083730094741	-1.786879794195559e-05	0.4454618556904739	1.786879794195559e-05	0.4330653539611175	-0.0028651749499475	0.5673076250396866	0.0028651749499475	0.5552484176510405	PRR20A	1768616	PRR20B	1775186	PRR20D	1788330	False	False	False	ref	-20	0.00535	-75	0.0957
1018	chr13	55377716	A	C	rs4885824	-0.0087058926	0.3386528355649931	0.0120524462	0.3314989010181989	0.0096298990092986	0.3440718896700132	-0.0001025247091306	0.3059386487702474	0.0001269689853349	0.2994551237889413	0.3600929470222719	0.3939464434749838	-0.0034392242487569	0.2949745890457498	0.0044977736905638	0.2871118714633652	0.003504645027026	0.3089042902961223	-4.018249653624127e-05	0.2730516981530186	4.791447373539552e-05	0.265828614329256	-0.0053527526219151	0.2988978264666741	0.007402566416664	0.2942865423997867	PRR20A	1763203	PRR20B	1769773	PRR20D	1782917	False	False	False	ref	-100	0.05402	-85	0.05984
1019	chr13	55403301	C	G	rs3124395	0.001714828252	0.7558957363965502	0.002623615748	0.7612768697314494	0.0079684413386312	0.5849909086717323	1.3504623576878528e-05	0.7632826826096242	2.1247695795650105e-05	0.7683048206242592	0.1124555233975455	0.8068488131481416	0.0001655951855494	0.8277899222250514	0.000258391948336	0.8324984997882274	0.0009046776086669	0.8208446205930167	1.3210662683535973e-06	0.8331049612156828	2.107973393887757e-06	0.8376903620921672	0.0012821709768773	0.6481552066808018	0.0020000207471031	0.6529233171676653	PRR20A	1737618	PRR20B	1744188	PRR20D	1757332	False	False	False	alt	30	0.002226	25	0.01944
1020	chr13	55405727	C	T	rs3105072	0.0045957327599999	0.6076406538559636	0.0045957327599999	0.6211482262421744	0.0217406747009458	0.0184275265286935	0.0001030498863796	0.3532439299899249	0.0001030498863796	0.3641773259400722	0.0340916399547712	0.9392992047946952	0.0001780922921682	0.8599837057115043	0.0001780922921682	0.8742258470546466	0.0007786113512733	0.8443597587333671	4.164369329341238e-06	0.7529687079894323	4.164369329341238e-06	0.7672203574602406	0.0022801066401102	0.6182710382933897	0.0022801066401102	0.6307991488667681	PRR20A	1735192	PRR20B	1741762	PRR20D	1754906	False	True	False	alt	45	0.003391	90	0.013466
1021	chr13	55406060	C	T	rs4242982	0.00592206734	0.5073525588461287	0.00592206734	0.5200720882058367	0.0228032588084259	0.0145531808823132	0.0001342809307966	0.2503090898301696	0.0001342809307966	0.2599966382206338	0.0181910600732372	0.9651159266789398	0.0001033207475666	0.8841137773162377	0.0001033207475666	0.8984287858294815	0.000416550571686	0.9095494697208544	2.350877088321695e-06	0.7892432664544565	2.350877088321695e-06	0.8035274285425041	0.0018610151557588	0.6585549019641755	0.0018610151557588	0.6715269474839215	PRR20A	1734859	PRR20B	1741429	PRR20D	1754573	False	True	False	alt	100	0.002901	-80	0.02231
1022	chr13	55421579	T	A	rs3105090	-0.00579884284	0.5322125898152368	0.00579884284	0.5194417926727978	0.0205961271262421	0.0234008287230942	-0.0001194836584197	0.2833670884152365	0.0001194836584197	0.2737451163644164	0.1521073870060892	0.733065976157267	-0.0008143902856565	0.641736710163954	0.0008143902856565	0.6279853672220249	0.0031410703055605	0.3713015417677998	-1.6608557597894108e-05	0.4630267798980295	1.6608557597894108e-05	0.4503396579619324	-0.0053299308084108	0.3643259864600823	0.0053299308084108	0.3549552316286564	PRR20A	1719340	PRR20B	1725910	PRR20D	1739054	False	False	False	ref	95	0.002892	-100	0.03038
1023	chr13	55503184	T	C	rs73191591	0.00027089892	0.8239503917251095	0.00169860288	0.8260310708224277	0.0056283740652855	0.9728136086244672	1.837135878245814e-06	0.8796513496332365	9.567064368034869e-06	0.8821309083038181	0.0084668928100913	0.9836013883972224	-2.385453965542843e-07	0.9737415054709704	1.331603953664663e-05	0.976653276177262	4.691616155484684e-05	0.9892418525365116	-7.89772436710769e-10	0.9805122355894	7.375450007303413e-08	0.9833936842103992	-3.527007541573761e-05	0.9358678531687824	0.0002634882104585	0.9384914072906778	PRR20A	1637735	PRR20B	1644305	PRR20D	1657449	False	False	False	alt	95	0.002256	65	0.01259
1024	chr13	55551859	T	C	rs73193533	0.0073914887628	0.4092996220074503	0.0095739440372	0.416100979160742	0.0086500686007845	0.4644158942238685	8.201022536243939e-05	0.3790762807995587	0.0001030111444073	0.3847648230187241	0.2721459766180146	0.5373457119490289	0.0018508440133259	0.4342260802861121	0.002613134131942	0.4403993600767072	0.0023948526283358	0.5141585846099795	2.051952533637973e-05	0.4151081700072259	2.794980951565692e-05	0.4211876342175407	0.0074378364920798	0.2937170552949908	0.0089274785008142	0.2952214837377668	PRR20A	1589060	PRR20B	1595630	PRR20D	1608774	False	False	False	alt	-85	0.006447	-50	0.0282
1025	chr13	55587333	G	A	rs112311254	-0.0160780424	0.2462201342368053	0.0160780424	0.2360474208160768	0.0107371207927177	0.2532558512282617	-0.0001534130262003	0.242381435275839	0.0001534130262003	0.233331713249068	0.2577682341103123	0.5612525213713785	-0.004472910911228	0.2992657135193866	0.004472910911228	0.2872846096987336	0.0026675459632809	0.4832208779142057	-4.244743856056032e-05	0.288990864780633	4.244743856056032e-05	0.278133843318287	-0.0136993122335293	0.1305787675220539	0.0136993122335293	0.1270959055051629	PRR20A	1553586	PRR20B	1560156	PRR20D	1573300	False	False	False	ref	-60	0.002262	100	0.03778
1026	chr13	55587944	G	A	rs611686	-0.017500573	0.2296338088234303	0.017500573	0.2200179470565775	0.0106434876002309	0.2513981301327551	-0.0001995938700187	0.2025517428732673	0.0001995938700187	0.1944758861938595	0.2360460170748659	0.5882781012220849	-0.0046866780896446	0.3031633500360218	0.0046866780896446	0.2911679581272654	0.0025311824795257	0.4711369738578023	-5.399467863324455e-05	0.268454401225769	5.399467863324455e-05	0.2578369139210915	-0.0138030477494579	0.1334519672414514	0.0138030477494579	0.1295172564292392	PRR20A	1552975	PRR20B	1559545	PRR20D	1572689	False	False	False	ref	30	0.002216	-95	0.03827
1027	chr13	55607494	C	A	rs73193578	0.0073117390199999	0.4389509193399487	0.0073117390199999	0.4513159752028624	0.0240116059845917	0.0114841815412883	0.0001731796274041	0.1931990426229579	0.0001731796274041	0.2015581431095787	0.0517992925237813	0.9074068994083976	0.000417162249413	0.7485584452590328	0.000417162249413	0.7624292692691957	0.001258657773437	0.7457949564147807	9.946465089932478e-06	0.5706119952573113	9.946465089932478e-06	0.5840024765719417	0.0047988049668564	0.39239311633321	0.0047988049668564	0.4027407373041756	PRR20A	1533425	PRR20B	1539995	PRR20D	1553139	False	True	False	alt	-70	0.00727	10	0.004868
1028	chr13	56115935	T	C	rs517462	0.0310244284	0.0871930454638266	0.0310244284	0.092833001828696	0.0083398591399497	0.5308480799320816	0.0002630213035597	0.1132926168632589	0.0002630213035597	0.1194355084936751	0.5701864127221238	0.0769676618319808	0.0176719089914324	0.0489297739767135	0.0176719089914324	0.0532801843912875	0.0047554128470172	0.1650395090627987	0.0001497930617776	0.0684792970047674	0.0001497930617776	0.0736096050509305	0.0059793151381238	0.3212669683649576	0.0059793151381238	0.3303596967820392	PRR20A	1024984	PRR20B	1031554	PRR20D	1044698	False	False	False	alt	100	0.006096	-95	0.06244
1029	chr13	56148317	C	T	rs3121501	0.0036663165999999	0.6656882841007332	0.0036663165999999	0.6791896239525597	0.0233270991114458	0.0132486978464589	8.112889383667677e-05	0.4006233496878921	8.112889383667677e-05	0.412026637366606	0.0073423998174254	0.9886888406715444	1.6739398455442727e-05	0.964062764654035	1.6739398455442727e-05	0.9780834464058008	0.0001840779728229	0.9673039026886862	3.884832104856045e-07	0.939133133360401	3.884832104856045e-07	0.9532120951976468	0.0002842353136443	0.9247704862207404	0.0002842353136443	0.9387474058546094	PRR20A	992602	PRR20B	999172	PRR20D	1012316	False	False	False	alt	-75	0.01413	5	0.00486
1030	chr13	56229052	T	G	rs2137410	-0.00192692064	0.7728112410577613	0.002434620908	0.7686993008594759	0.0185335815331495	0.0358188207669763	-3.45570143837348e-05	0.6167331497364473	4.429907720153263e-05	0.6114631735312889	0.0886668948848016	0.843658816133592	-0.0001611935003525	0.87709303095799	0.0001992942896485	0.872917204120252	0.0016266890370218	0.6755264266619058	-2.844716545079069e-06	0.7988889717693041	3.5830463861713443e-06	0.794186584242738	-0.0016037510762559	0.6886668617609861	0.001923256465316	0.6838534705263543	PRR20A	911867	PRR20B	918437	PRR20D	931581	False	False	False	ref	-80	0.005615	-75	0.0688
1031	chr13	56237999	C	A	rs9569448	0.00173191948	0.8135838539906597	0.00173191948	0.8275652539027408	0.0202756208366574	0.0253555250531885	3.4551202188347264e-05	0.6134843604982909	3.4551202188347264e-05	0.6264157388859323	0.4110706542598989	0.31573614233002	0.0007008159479293	0.6427196802782756	0.0007008159479293	0.6567833503195556	0.0084218326211023	0.0251356928407158	1.413378428160703e-05	0.469767001655537	1.413378428160703e-05	0.4827203533648666	0.0008776024647558	0.8087419512924175	0.0008776024647558	0.8225930623079116	PRR20A	902920	PRR20B	909490	PRR20D	922634	False	False	False	alt	100	0.0111	100	0.0928
1032	chr13	56355578	C	T	rs9597389	-0.0153539356999999	0.2506784819410195	0.0153539356999999	0.2409111451401481	0.0104328265781679	0.2607729784206694	-0.0001610989088944	0.226609804874776	0.0001610989088944	0.2180380559941197	0.0524092573574414	0.9072236401011357	-0.0007779199243054	0.6735514528684018	0.0007779199243054	0.6600670778229536	0.0005620396058901	0.8854261719576751	-8.396888098932642e-06	0.6375599299342519	8.396888098932642e-06	0.6241411434390055	-0.0087137833380014	0.2424045331886796	0.0087137833380014	0.2355756323864082	PRR20A	785341	PRR20B	791911	PRR20D	805055	False	False	False	ref	45	0.004326	100	0.01415
1033	chr13	56365881	T	C	rs2784002	0.00973573544	0.3691939303876302	0.00973573544	0.3813843798828562	0.0087026768516764	0.459066858321506	8.893937466571348e-05	0.3893168969100254	8.893937466571348e-05	0.4007502648785879	0.0383116007427462	0.929990380500495	0.0004055028672413	0.7546084119997092	0.0004055028672413	0.7687884402499813	0.0003284010847965	0.932603675387124	3.684261158644601e-06	0.7571057406065249	3.684261158644601e-06	0.7713193556175121	0.0052095976099336	0.3710687456982606	0.0052095976099336	0.381085604859622	PRR20A	775038	PRR20B	781608	PRR20D	794752	False	False	False	alt	-95	0.001377	30	0.0244
1034	chr13	56370450	C	A	rs9591754	-0.019720504	0.1874612781109964	0.019720504	0.1790901579617544	0.0118539969700644	0.1773481336302654	-0.0002428699678755	0.1458120903440102	0.0002428699678755	0.1393409890411714	0.145814790609861	0.7442992284315696	-0.0029495408708244	0.3731096265398587	0.0029495408708244	0.3605577163265431	0.0017752569257405	0.6422293136474966	-3.701018096602687e-05	0.3100795119697197	3.701018096602687e-05	0.2989742776538123	-0.0196516561375117	0.0779451335684979	0.0196516561375117	0.0757513794599916	PRR20A	770469	PRR20B	777039	PRR20D	790183	False	False	False	ref	30	0.004303	40	0.02063
1035	chr13	56391810	A	T	rs9316851	0.0097196049	0.2683299229336464	0.0139962137	0.2751256593094037	0.0098773065314177	0.3196633721530172	0.0001119840422814	0.2407044072139693	0.0001489875805804	0.2465033713336663	0.3716781294411768	0.3820822184616025	0.0039741663985711	0.2334036230358029	0.0053478859147861	0.2408617934605529	0.0037034930281636	0.2875334418465973	4.5448337905904486e-05	0.213809762654696	5.733450439549937e-05	0.2204652551998804	0.0059232979595224	0.2373407583126263	0.008371456135437	0.2416765538135055	PRR20A	749109	PRR20B	755679	PRR20D	768823	False	False	False	alt	-85	0.004578	10	0.004333
1036	chr13	56405802	C	G	rs59918226	0.00756407614	0.4284790771986736	0.00756407614	0.4410458929755741	0.0067247305386954	0.7962940422536766	5.373981247784871e-05	0.4947327870294269	5.373981247784871e-05	0.5071010569871499	0.1235801201257273	0.7876148087469109	0.0008344745218088	0.6316424133750903	0.0008344745218088	0.6459620376397556	0.0008144123184092	0.8381401485598298	5.984047760086817e-06	0.6675960395292698	5.984047760086817e-06	0.6816925853312781	0.0064357514082095	0.2909753560626321	0.0064357514082095	0.2989469389204493	PRR20A	735117	PRR20B	741687	PRR20D	754831	False	False	False	alt	-15	0.0017	-15	0.005005
1037	chr13	56417466	G	A	rs9316853	-0.006485608952	0.4952855477469621	0.0074482523519999	0.4848349474264333	0.0074748441103284	0.6810854906720336	-5.327866106423217e-05	0.5395063094337854	6.107118695373415e-05	0.5297411413121377	0.1301569518355999	0.7676808042309684	-0.0009118468938661	0.6408930319208122	0.0010094603485229	0.6295653794027369	0.0009721517616185	0.7995895223095959	-7.417247050624648e-06	0.6616039224238498	8.207420606054496e-06	0.6506767166836808	-0.0057033786657537	0.325517602887717	0.0066286994678367	0.3196687974916432	PRR20A	723453	PRR20B	730023	PRR20D	743167	False	False	False	ref	100	0.003223	75	0.04944
1038	chr13	56420701	G	C	rs12872193	0.0309612752	0.0896913086950232	0.0309612752	0.0952260899689703	0.0084184533859678	0.5176901018004948	0.0002816834822963	0.1184058762680453	0.0002816834822963	0.1244936405518629	0.206695090198031	0.6460728375867982	0.0068716772632734	0.1864197921526004	0.0068716772632734	0.1965295247497981	0.0017935759642018	0.6448380639567214	6.413119871121949e-05	0.2036583249550036	6.413119871121949e-05	0.2132143742439088	0.0292637890434547	0.029682248742094	0.0292637890434547	0.0304662577578938	PRR20A	720218	PRR20B	726788	PRR20D	739932	True	False	False	alt	-100	0.003883	-65	0.03198
1039	chr13	56424533	C	T	rs9597405	-0.0610828432	0.0161726594469082	0.0610828432	0.0152744265403103	0.0137634610466081	0.1099912629262914	-0.000901079931307	0.0193707867942243	0.000901079931307	0.0184114627163807	0.1750101142128029	0.6995528843138917	-0.0114642880416752	0.1214169480141691	0.0114642880416752	0.1138155648255351	0.0024927324581414	0.4896670554118031	-0.0001729797389014	0.0777346872775667	0.0001729797389014	0.0732025045601461	-0.0590130603014553	0.0027611404673025	0.0590130603014553	0.0026813986807497	PRR20A	716386	PRR20B	722956	PRR20D	736100	False	True	False	ref	95	0.003897	-65	0.0329
1040	chr13	56429773	C	G	rs4885970	-0.00567104752	0.580048654093868	0.00567104752	0.5667824415838773	0.0070502741747256	0.7742614288670326	-4.21071463015774e-05	0.6349914888744886	4.21071463015774e-05	0.6219014992417571	0.1802612060291081	0.6906582193451833	-0.0009815468210955	0.6432114913503723	0.0009815468210955	0.6291177945059524	0.0012757833613309	0.7464575432518797	-7.283698947707044e-06	0.6803325112622046	7.283698947707044e-06	0.6664518193879705	-0.0051037873836864	0.3954443909406767	0.0051037873836864	0.3857161386919848	PRR20A	711146	PRR20B	717716	PRR20D	730860	False	False	False	ref	-95	0.001644	10	0.008545
1041	chr13	56437181	C	A	rs71428219	0.00942923336	0.3697754852339397	0.00942923336	0.3816121420066224	0.0284804996068707	0.0051248410217187	0.0002663593676955	0.115064818971194	0.0002663593676955	0.121124321029064	0.0036514901606862	0.9935646436667092	3.4891592230109525e-05	0.9465774272464932	3.4891592230109525e-05	0.9606385211880966	0.0001103426708377	0.9791105252669716	1.0451879018327814e-06	0.8889601332696949	1.0451879018327814e-06	0.90316195940552	0.0006846544051286	0.8508084377426682	0.0006846544051286	0.8646489984010801	PRR20A	703738	PRR20B	710308	PRR20D	723452	False	False	False	alt	60	0.007294	-45	0.0192
1042	chr13	56439331	C	T	rs9597412	0.00083362754	0.8352637565777009	0.0015784833	0.8443815646594602	0.0197281063677638	0.0296739471983803	2.1196678951989995e-05	0.6402149707004968	3.314775552669605e-05	0.6489534035930319	0.0140084440709965	0.9713872517638498	1.6026288952503884e-05	0.9579853994509144	2.12959664338543e-05	0.9671258471298394	0.0003036985946181	0.9301069291545724	3.972753122306672e-07	0.924148876073142	4.818263368673287e-07	0.933678301015205	0.0003444019128828	0.8931348809395594	0.0004439880081743	0.9023742305209042	PRR20A	701588	PRR20B	708158	PRR20D	721302	False	False	False	alt	95	0.003456	-15	0.00811
1043	chr13	56461901	G	T	rs12853934	0.00664613192	0.4637051114952228	0.00664613192	0.4760920428672431	0.0267116602592499	0.0068600192779907	0.0001759624877689	0.184441060977109	0.0001759624877689	0.192664766331074	0.0724530337451632	0.8707497589810208	0.000492543258137	0.7124297907727148	0.000492543258137	0.7264291258157107	0.0019901537986344	0.5904310840700178	1.336847240088076e-05	0.4992493514998492	1.336847240088076e-05	0.5121813243792169	0.0051432068797393	0.3635421831606866	0.0051432068797393	0.37340860688191	PRR20A	679018	PRR20B	685588	PRR20D	698732	False	True	True	alt	-100	0.00855	45	0.01534
1044	chr13	56497855	T	C	rs13378557	-0.00499717908	0.6059006586902311	0.00499717908	0.5924379223806455	0.006593170781216	0.8652812223914046	-3.340034290089326e-05	0.6789697402956189	3.340034290089326e-05	0.6655299165455384	0.0585566240313695	0.8778226265594707	-0.0003058308879174	0.8155923331727267	0.0003058308879174	0.8008512965097319	0.0003652398541908	0.9084284144399044	-1.977784718226026e-06	0.8468655257615109	1.977784718226026e-06	0.8322251104768597	-0.0029045944460004	0.5545988721798777	0.0029045944460004	0.5427421275240508	PRR20A	643064	PRR20B	649634	PRR20D	662778	False	False	False	ref	-55	0.00393	-10	0.003967
1045	chr13	56500393	A	T	rs12874445	7.726873000000015e-05	0.7948842828449659	0.00212972523	0.7924705022277184	0.0184901758703705	0.0373430927188239	-1.5426365189269013e-07	0.6117279675718086	3.712732162307863e-05	0.6097335679313999	0.2137719270946793	0.6306391643608	-4.187902426324e-05	0.7554091671379324	0.0003981351496768	0.7525202192601336	0.0040906508539993	0.2395585275292525	-1.0391324313141367e-06	0.629533548236952	7.080187341300168e-06	0.6266802138017565	-0.0002282181350428	0.6569887591231723	0.0019502276994574	0.6548420800537998	PRR20A	640526	PRR20B	647096	PRR20D	660240	False	False	False	alt	-100	0.00489	80	0.007538
1046	chr13	56514323	A	C	rs1341548	-0.0016858128971999	0.7792645474948208	0.0022059308228	0.7806129023034022	0.0284616630051037	0.0051960311662119	-5.667517166947525e-05	0.5154831958455036	6.916315527404475e-05	0.5134604810138468	0.0244483863940496	0.9531487094891408	-4.149297706816424e-05	0.9397043424766384	5.5457033356180015e-05	0.943513218195008	0.000706392556203	0.8498080384026971	-1.4033198514932905e-06	0.8594535317518212	1.741738958242076e-06	0.862235421268583	-0.0006182636749343	0.8308059594126033	0.0008464818099772	0.8333904504765913	PRR20A	626596	PRR20B	633166	PRR20D	646310	False	True	False	ref	-75	0.00644	40	0.01788
1047	chr13	57898128	A	C	rs34927497	-0.0045397647	0.6173883794204268	0.0045397647	0.604263053841213	0.0222241549464469	0.0166716821292253	-0.0001030316185877	0.3580554362892653	0.0001030316185877	0.3474168399319555	0.0902416000165976	0.8409617467278367	-0.0004449894416782	0.7671069814934456	0.0004449894416782	0.7532625976581797	0.0020763236695239	0.571578407727622	-1.0428911221416104e-05	0.5960696129991735	1.0428911221416104e-05	0.582841775567565	-0.0039564725775163	0.4776189825741058	0.0039564725775163	0.4663375531907627	PCDH17	266383	PRR20E	730930	PRR20D	737495	False	True	False	ref	-65	0.0598	40	0.0325
1048	chr13	57972643	A	G	rs9563564	0.0012102287	0.745362632302823	0.00263244538	0.7468952677623693	0.0171210062256155	0.0497163333027671	1.5555154001759213e-05	0.5898531274366384	4.123401794258048e-05	0.5906498176648101	0.2125146526416249	0.6276346327498296	0.0002797528692371	0.7209908180409754	0.0005445841023566	0.7214964864520929	0.003648257606384	0.2610774500964369	3.843714699496736e-06	0.6067729618592954	8.590844606967977e-06	0.6079087032031537	0.0010601769727901	0.621455765551124	0.0023464973703046	0.621788972851003	PCDH17	340898	PRR20E	805445	PRR20D	812010	False	False	False	alt	35	0.001072	30	0.02448
1049	chr13	57978174	A	G	rs9569791	0.0061942068799999	0.4951786677010859	0.0061942068799999	0.507794291438747	0.010599023406599	0.2518677369161957	6.380867156344367e-05	0.4440033272905938	6.380867156344367e-05	0.4554132775628354	0.0610027074969657	0.8899780571284974	0.0003680674923256	0.7559828533463757	0.0003680674923256	0.7701464503316822	0.0006548193916087	0.8638789327918235	3.868528116132869e-06	0.7271052201610084	3.868528116132869e-06	0.7412155086939658	0.004195064264152	0.4244629096227511	0.004195064264152	0.4350712753807172	PCDH17	346429	PRR20E	810976	PRR20D	817541	False	False	False	alt	-100	0.00342	65	0.02968
1050	chr13	57983580	G	A	rs9569794	-0.0587914346	0.0203481925545815	0.0587914346	0.0192376188543611	0.0136608991074406	0.1234055870818351	-0.0009345828333797	0.0236732318070744	0.0009345828333797	0.0225019657756974	0.1543542982811024	0.723896335771027	-0.0117230823339249	0.1350892716704619	0.0117230823339249	0.1277063458079328	0.0024677427459744	0.458460174003433	-0.0002074844148331	0.0936250310914735	0.0002074844148331	0.0889803858895321	-0.0540171578543345	0.005595397353804	0.0540171578543345	0.0053677180554651	PCDH17	351835	PRR20E	816382	PRR20D	822947	False	True	False	ref	100	0.03436	-30	0.007263
1051	chr13	58011963	G	T	rs9316967	-0.00096076192	0.7771642961513312	0.0023233183999999	0.7698797026935248	0.0099790589993716	0.3029049587643017	-1.1195996014484389e-05	0.7318800493362518	2.3141050858456434e-05	0.7246795404900298	0.0863037998319484	0.8428426136438921	-9.475822037500916e-05	0.8417214414544155	0.000206081937241	0.8339347421441431	0.0008649525461715	0.8153773857427825	-1.0900157807551648e-06	0.8213214412934453	2.065951754687714e-06	0.8135165079590428	-0.0011390159648958	0.6436356261737416	0.0020767850288902	0.6370233129968933	PCDH17	380218	PRR20E	844765	PRR20D	851330	False	False	False	ref	-35	0.000641	30	0.0137
1052	chr13	58042891	A	G	rs9634882	0.0140400855999999	0.2396714762368655	0.0153384318	0.2477113501881559	0.0152914983686569	0.0757310759118399	0.000232763034395	0.1357634789656443	0.0002474306094343	0.1411672596249443	0.2741169514206578	0.5296566324245011	0.0042869349107141	0.2670345733853639	0.004508033168577	0.2761530598731082	0.0042895319769549	0.2077499288803627	7.052300048076396e-05	0.173453612135771	7.302077443945683e-05	0.1808304088152292	0.0115457629228518	0.1559198535844796	0.0125997157646863	0.1588551285192731	PCDH17	411146	PRR20E	875693	PRR20D	882258	False	False	False	alt	-25	0.00476	45	0.01257
1053	chr13	58052335	A	G	rs11148423	0.093574668	0.0027411207916658	0.093574668	0.0028719655308198	0.0282178595563726	0.0054547371825423	0.002679551165851	0.0023813354890156	0.002679551165851	0.0024745992735471	0.3793815288540337	0.3688606642082978	0.0352376512365167	0.0088074205554106	0.0352376512365167	0.0095569184711242	0.0106936319308723	0.0104783415006071	0.0010087011642588	0.0036541500731107	0.0010087011642588	0.0038566467151019	0.0642911233519019	0.0018967787917967	0.0642911233519019	0.0019393828098814	PCDH17	420590	PRR20E	885137	PRR20D	891702	False	True	True	alt	95	0.002398	100	0.04456
1054	chr13	58057801	T	C	rs7998206	-0.00667612618	0.4847624262960599	0.00667612618	0.4721559554470788	0.011415170744149	0.1963435004778531	-7.526862373727542e-05	0.4175023224730662	7.526862373727542e-05	0.406296860971073	0.1456280666811896	0.744721197242711	-0.0010103525591837	0.6051473698194144	0.0010103525591837	0.5910558056133487	0.0016712684973651	0.6685208691111448	-1.1479632941877265e-05	0.5523529471930171	1.1479632941877265e-05	0.5390666834515266	-0.0064067054637495	0.3128629339911918	0.0064067054637495	0.3042671403022379	PCDH17	426056	PRR20E	890603	PRR20D	897168	False	False	False	ref	-45	0.003067	-60	0.01123
1055	chr13	58082465	T	C	rs9563574	0.0333596046999999	0.0800280057779444	0.0333596046999999	0.0849860344621376	0.006929181568362	0.7629738516272889	0.0002445163301049	0.1429769871642478	0.0002445163301049	0.1497557188670443	0.1009554041017022	0.822544661171626	0.0038182296328254	0.3177147204575188	0.0038182296328254	0.3298820721023444	0.0007330631750666	0.8491289494631897	2.886654027729219e-05	0.3677088575314638	2.886654027729219e-05	0.3797093682167374	0.0279546468324359	0.0358499748454399	0.0279546468324359	0.0367898693969071	PCDH17	450720	PRR20E	915267	PRR20D	921832	False	False	False	alt	100	0.00365	25	0.004288
1056	chr13	58092895	A	C	rs9569815	-0.01066422606	0.3514191872318526	0.01066422606	0.3399265240562131	0.0283344326621897	0.0052941071561402	-0.0003121788377146	0.1020354664954789	0.0003121788377146	0.0968380887810781	0.0833929812549922	0.8554257619801473	-0.0009686462195832	0.632555570681601	0.0009686462195832	0.6190645565823603	0.0024352703070501	0.5079518575175425	-2.928971140358053e-05	0.3817181678061426	2.928971140358053e-05	0.3697935713066361	-0.0087573522546914	0.2490236712129193	0.0087573522546914	0.2418800350142836	PCDH17	461150	PRR20E	925697	PRR20D	932262	False	True	True	ref	45	0.004585	-50	0.02554
1057	chr13	58103245	T	C	rs34723208	-0.0072128611	0.4653470129527872	0.0072128611	0.4532403305239277	0.0240412275222325	0.0116276184564649	-0.0001750432401515	0.207519888572292	0.0001750432401515	0.1991951823833274	0.106513553045156	0.8150189012193866	-0.0007965569192554	0.6628257461493186	0.0007965569192554	0.6489448574026279	0.0026517684513521	0.4716220569717184	-1.995835468064152e-05	0.4460179305813377	1.995835468064152e-05	0.4337286325190504	-0.0064710214836253	0.3098149001906503	0.0064710214836253	0.3012047586849121	PCDH17	471500	PRR20E	936047	PRR20D	942612	False	True	False	ref	-100	0.00749	-100	0.0204
1058	chr13	58108334	A	C	rs7989885	-0.0015964059999999	0.8432239053582591	0.0015964059999999	0.8290325995034079	0.0206512178009407	0.0239164824945338	-3.287909001039435e-05	0.6513605573993498	3.287909001039435e-05	0.6383749401764212	0.0068299463687382	0.987039570380736	-1.0831053605130756e-05	0.9904482655628798	1.0831053605130756e-05	0.9804513549159678	0.0001448565143254	0.9695587541979293	-2.2495643065909883e-07	0.9751727053910216	2.2495643065909883e-07	0.9612920785918364	-0.0002531146588657	0.9559496992489944	0.0002531146588657	0.9417387215304782	PCDH17	476589	PRR20E	941136	PRR20D	947701	False	False	False	ref	70	0.005615	-90	0.02365
1059	chr13	58166221	A	C	rs4886061	-0.0074742561399999	0.4833280580750492	0.0074742561399999	0.4706439938758264	0.0215173435639398	0.0197608816255982	-0.00017475747171	0.2464960923160214	0.00017475747171	0.2376085467891973	0.11345138435046	0.8037944120901049	-0.0009691733099174	0.6516308332815421	0.0009691733099174	0.6380312598572655	0.0024880265675599	0.5062745682406232	-2.321351846579132e-05	0.4608271591308245	2.321351846579132e-05	0.4481877834210112	-0.0070249691386839	0.3352580653214096	0.0070249691386839	0.3265844405615051	PCDH17	534476	PRR20E	999023	PRR20D	1005588	False	True	False	ref	-75	0.013985	-35	0.01462
1060	chr13	58166222	A	C	rs66514580	-0.00597988212	0.5306484085185654	0.00597988212	0.5179260486910128	0.0205752804062442	0.0237247367180826	-0.0001259309162805	0.303015568987821	0.0001259309162805	0.2930386570510163	0.1132605110011514	0.8041402695781075	-0.0007041024497387	0.6905681902192968	0.0007041024497387	0.6769381390824021	0.0023924238576478	0.5259129321815422	-1.5408668381848825e-05	0.515713803226655	1.5408668381848825e-05	0.5028872282926691	-0.0055042064751708	0.3768495021219809	0.0055042064751708	0.367113822096884	PCDH17	534477	PRR20E	999024	PRR20D	1005589	False	False	False	ref	-75	0.01582	-35	0.01758
1061	chr13	58246923	T	G	rs4884299	-0.00217998018	0.7406855327309193	0.00276841106	0.7310516709670585	0.0208352843023644	0.0225026832557426	-5.151638934548482e-05	0.474313358654487	5.986027496441478e-05	0.465349230555273	0.0247097998941897	0.9571653788210944	-5.361640491258462e-05	0.9416276360038596	6.263218738674916e-05	0.932354548461664	0.0005280242532879	0.8921883850107656	-1.2365027095529985e-06	0.8791592700430022	1.3643455197394062e-06	0.869448884281607	-0.0008091370242429	0.8267258834174768	0.0009211713814458	0.8174051669568991	PCDH17	615178	PRR20E	1079725	PRR20D	1086290	False	False	False	ref	5	0.000764	95	0.04398
1062	chr13	58277448	C	T	rs56313517	-0.0286163596	0.1124360339897617	0.0286163596	0.1061829323342518	0.0105083091185016	0.2608011469875484	-0.0003054313887899	0.1007151694339523	0.0003054313887899	0.0954233817281373	0.2576831709872508	0.56091698367047	-0.0073068582814864	0.1789733448060512	0.0073068582814864	0.1696206011102569	0.0027097191576827	0.4556098149218242	-7.811905335370432e-05	0.1594865393888684	7.811905335370432e-05	0.1512670980120128	-0.0249131215054097	0.0445391749887447	0.0249131215054097	0.0433583108387616	PCDH17	645703	PRR20E	1110250	PRR20D	1116815	False	False	False	ref	-50	0.0007887	90	0.04462
1063	chr13	65885897	C	T	rs9571511	0.0095170865199999	0.3576912558384468	0.0095170865199999	0.369472573512	0.009535988410795	0.3599182141545671	9.091503979885772e-05	0.3518322113279729	9.091503979885772e-05	0.362388343824376	0.0458116785443832	0.9183716237434262	0.0004468778719265	0.7366219330065775	0.0004468778719265	0.7506625445859222	0.0004609874767346	0.9067693393180808	4.546794208909533e-06	0.7193605044554854	4.546794208909533e-06	0.73337816016977	0.0052988101536322	0.3653922860884394	0.0052988101536322	0.3751289012064407	PCDH9	1344548	ENSG00000285566	2052844	ENSG00000237378	2139155	False	False	False	alt	15	0.0002937	-5	0.004616
1064	chr13	79285321	A	C	rs9545047	0.0132955654	0.2579339453933053	0.0132955654	0.2684232907829452	0.0083767043324082	0.5197875649979627	0.0001108919128462	0.2871538993821633	0.0001108919128462	0.2968919564014963	0.3289639934024211	0.4531802284490731	0.004339562208023	0.2568644153664762	0.004339562208023	0.2680708151714785	0.0027694176341017	0.4670865483983154	3.637891567240903e-05	0.2727701788084796	3.637891567240903e-05	0.2835306285667497	0.0094088112947229	0.1879248984726865	0.0094088112947229	0.1939628815784014	RBM26	121156	NDFIP2	195835	OBI1	626166	False	False	False	alt	-85	0.00851	-85	0.0814
1065	chr13	79364440	T	C	rs9545087	-0.0125714829	0.323975184938394	0.0125714829	0.3128236116342917	0.0210581759196295	0.0210196379935752	-0.0002771510760413	0.1345155300501125	0.0002771510760413	0.1282560938478764	0.1437359308706521	0.7529183018556866	-0.0019970246894312	0.4871896997759495	0.0019970246894312	0.4741634815240242	0.0030757461597919	0.4021417920849699	-4.451679328405253e-05	0.2998834140235292	4.451679328405253e-05	0.2889581802456937	-0.0120914117366362	0.1714701922616358	0.0120914117366362	0.1665438624397999	RBM26	42037	NDFIP2	116716	OBI1	705285	False	False	False	ref	45	0.0006857	-30	0.007362
1066	chr13	79370157	A	G	rs9530904	-0.00517266788	0.5888291022363897	0.00517266788	0.5759352590519771	0.0228067356544918	0.0147859502485536	-0.0001231954719611	0.3233968307685981	0.0001231954719611	0.3133801014648504	0.040400834033548	0.9269582241305574	-0.0002117297043022	0.8642013102636555	0.0002117297043022	0.8500439914300595	0.0009302080965156	0.8133764445777721	-5.092804044505914e-06	0.7339908189782701	5.092804044505914e-06	0.7202156018312886	-0.0027116463863732	0.5947006238842274	0.0027116463863732	0.5823660637312106	RBM26	36320	NDFIP2	110999	OBI1	711002	False	True	False	ref	55	0.0253	55	0.02975
1067	chr13	79411175	T	A	rs9545108	0.00631147948	0.487036428899097	0.00631147948	0.4997753032559034	0.0176720460307235	0.0440907733509977	0.0001142765349633	0.2966853502253869	0.0001142765349633	0.3068539643930437	0.185474953059679	0.677712549399789	0.0011483471537318	0.5480743588954403	0.0011483471537318	0.5618674143470006	0.0032178521152928	0.3771663756545615	2.0414081582901386e-05	0.3969007183374463	2.0414081582901386e-05	0.4090796058997364	0.0059855392690795	0.3158681880769305	0.0059855392690795	0.3250390187578846	RBM26	4698	NDFIP2	69981	OBI1	752020	False	False	False	alt	90	0.00437	-95	0.0646
1068	chr13	79415246	C	T	rs9574422	-0.000216616474	0.9223137439391972	0.000790343714	0.9177289149122188	0.0069362650101949	0.7850415228380074	-1.9337986385106566e-06	0.9350389633288688	5.489005351440124e-06	0.9304183525128292	0.1840122822850859	0.6854286032550968	-2.726646802392e-05	0.8753581748042988	0.000141616799483	0.870879909056143	0.0012715273759445	0.7448842956205938	-2.693128540244705e-07	0.8925307565989864	9.795469735558386e-07	0.8878892539203034	-0.0002344422659986	0.8309448431445438	0.0008527059409329	0.8264446993858167	RBM26	8769	NDFIP2	65910	OBI1	756091	False	False	False	ref	-60	0.001274	-30	0.01091
1069	chr13	88392660	A	G	rs1840492	-0.0049779473099999	0.5695252676875978	0.0049779473099999	0.5574064546072475	0.0218760186121237	0.0180744514613434	-0.0001112353167285	0.3184216659627737	0.0001112353167285	0.3082093585730516	0.1639207875600369	0.7149416573722096	-0.0008891802855342	0.647865769030504	0.0008891802855342	0.6342226417081289	0.0036616757748318	0.3000360174366774	-1.9950145287348115e-05	0.4554137058354255	1.9950145287348115e-05	0.4430209113742917	-0.005105862094005	0.3907142807099067	0.005105862094005	0.3810239895663859	SLITRK5	721288	SLITRK6	2585977	GPC5	3005962	False	True	False	ref	85	0.00201	-85	0.0209
1070	chr13	88392920	C	A	rs2347140	-0.0600833823999999	0.0184217476830997	0.0600833823999999	0.0174124507368987	0.0142512949763401	0.1043797679635342	-0.0009811911144162	0.0210769827300364	0.0009811911144162	0.0200710686315137	0.1198248944491125	0.7896190380896453	-0.0091770634669198	0.182713628792299	0.0091770634669198	0.1735773954856171	0.0019774846988117	0.5776663841374381	-0.0001633501014722	0.1205397431316215	0.0001633501014722	0.1146264996280462	-0.0509320636106183	0.0070721345395357	0.0509320636106183	0.0068463400012832	SLITRK5	721548	SLITRK6	2586237	GPC5	3005702	False	True	False	ref	70	0.001436	100	0.01486
1071	chr13	88408293	G	A	rs396977	-0.1031852806	0.0024297340683877	0.1031852806	0.0023064251859737	0.0287759888529596	0.0073346177295545	-0.0032393781040784	0.0026301960191152	0.0032393781040784	0.0025265303557056	0.2162574300563283	0.6330208393154515	-0.0227061793870488	0.0355989194014413	0.0227061793870488	0.0328147674789299	0.0063233312008786	0.0778057418285465	-0.0007251230105496	0.0095176839603011	0.0007251230105496	0.0090349589369955	-0.0995777964501706	0.0002844312612948	0.0995777964501706	0.000286535639238	SLITRK5	736921	SLITRK6	2601610	GPC5	2990329	False	True	True	ref	10	0.000641	30	0.013916
1072	chr13	88414156	G	A	rs430275	0.0025622378599999	0.7255060038583202	0.0025622378599999	0.7392030029902865	0.0147541070731371	0.0923592923063074	4.138185564738316e-05	0.5683463724334088	4.138185564738316e-05	0.5808709565767048	0.0118175499745847	0.9777138643623586	3.570112449719405e-05	0.940800117274998	3.570112449719405e-05	0.9548872862626367	0.000194328344035	0.9600057306926728	6.295839807265764e-07	0.9127187070111256	6.295839807265764e-07	0.9269183247113264	0.0006659820122615	0.8495621840621298	0.0006659820122615	0.8632874800961917	SLITRK5	742784	SLITRK6	2607473	GPC5	2984466	False	False	False	alt	95	0.00482	40	0.02267
1073	chr13	88435587	T	C	rs338708	0.0436588318	0.0379415541528639	0.0436588318	0.0408281885239672	0.0127001966177199	0.1399909550538333	0.0005597541727146	0.0316346892563321	0.0005597541727146	0.0337779679932609	0.4399215759499579	0.2657925655705165	0.0195468965758996	0.0408545129021198	0.0195468965758996	0.0445911536146003	0.0056324444749211	0.1037271773966448	0.0002524039215129	0.0336602433754475	0.0002524039215129	0.0363932294794078	0.0195541447525388	0.0688151332376534	0.0195541447525388	0.0707735333355444	SLITRK5	764215	SLITRK6	2628904	GPC5	2963035	False	False	False	alt	100	0.01984	-75	0.02942
1074	chr13	88450905	T	C	rs447791	0.001466789376	0.8254747651988242	0.0018700575759999	0.8328244784832345	0.0113112904612573	0.2075254160230494	1.6258454952549245e-05	0.7675738917777719	2.151848685708336e-05	0.7748132204187833	0.0476726937001421	0.9140683133779604	5.958979827440738e-05	0.916967082080106	8.030561697078982e-05	0.9241682786575952	0.0005451435742678	0.8873678986249613	6.645049053092918e-07	0.899128068687776	9.34711836825728e-07	0.9061627075538546	0.0006659820122615	0.8029361628951562	0.0009937862425958	0.8100003469439445	SLITRK5	779533	SLITRK6	2644222	GPC5	2947717	False	False	False	alt	80	0.00573	10	0.00528
1075	chr13	88461603	A	G	rs338704	-0.00433469468	0.6341811209373182	0.00433469468	0.6211252522543641	0.0277790719157834	0.0059942552291389	-0.0001231159319348	0.299778055765778	0.0001231159319348	0.2900618125521143	0.1249162335708876	0.7828303845010585	-0.0005768031104183	0.7246735593975241	0.0005768031104183	0.7108630215700289	0.0035331161783634	0.308118351684216	-1.6606128886026987e-05	0.4894515806834361	1.6606128886026987e-05	0.4768013178527812	-0.0039958920735691	0.4647164995521287	0.0039958920735691	0.4537515399658917	SLITRK5	790231	SLITRK6	2654920	GPC5	2937019	False	True	True	ref	-85	0.003098	10	0.00406
1076	chr13	92670299	T	C	rs9516115	0.0117144257	0.2996895582900737	0.0117144257	0.3108658557942076	0.0061745923158198	0.8946736682487572	7.097715451330353e-05	0.411763957784758	7.097715451330353e-05	0.4229601328212368	0.2358551437255573	0.6014167299036224	0.0027243648879415	0.3606306735599012	0.0027243648879415	0.3731113938505747	0.0014633300580354	0.7079684276385648	1.6569705750943926e-05	0.4413192910119002	1.6569705750943926e-05	0.4539107145725207	0.0110208612122531	0.1685203614838032	0.0110208612122531	0.1739530544581359	GPC6	556509	GPC5	1271677	DCT	1809383	False	False	False	alt	-100	0.004913	-100	0.04932
1077	chr13	92709036	C	T	rs9523786	-0.00787381098	0.4390742735202829	0.00787381098	0.4267151347702207	0.0069699709136641	0.7905143088566345	-5.543731376236493e-05	0.5094374414715966	5.543731376236493e-05	0.4973753376805636	0.0771335802238611	0.8584868313925679	-0.0005848976769686	0.7029309947574178	0.0005848976769686	0.6888572159358208	0.0005363191304774	0.8832067000688227	-4.102223872220342e-06	0.7357770625197483	4.102223872220342e-06	0.7216471336237451	-0.0062116826938038	0.3204306499716206	0.0062116826938038	0.3116902616174141	GPC6	517772	GPC5	1310414	DCT	1770646	False	False	False	ref	-55	0.1815	85	0.04163
1078	chr13	92754331	G	A	rs138907830	-0.0325711586	0.0895732310908706	0.0325711586	0.084211534123895	0.0081227639559747	0.5697965526873349	-0.000264897353249	0.1230113111185742	0.000264897353249	0.1168921671570582	0.3264867892820465	0.4588189753786936	-0.0107612519554196	0.1213297489117431	0.0107612519554196	0.1135817854120764	0.0026540087371956	0.4889073358208575	-8.748961378941223e-05	0.1445644160791981	8.748961378941223e-05	0.1366358193732808	-0.0241454786875382	0.0475760108433203	0.0241454786875382	0.0463507027415707	GPC6	472477	GPC5	1355709	DCT	1725351	False	False	False	ref	-100	0.007088	-100	0.099
1079	chr13	95836047	T	G	rs11839843	-0.00435218037	0.5977695843954651	0.00443101183	0.5885536289323416	0.0185314442996274	0.0367340199987215	-8.471568908656064e-05	0.3958618918485025	8.593916892608847e-05	0.3871551648823688	0.1400802912893287	0.7542552852866495	-0.0006197632798017	0.6963215509264272	0.0006322586867576	0.6870102469298403	0.0025926299078394	0.4877260120781735	-1.2087471918743353e-05	0.5454493925837482	1.2281403100062505e-05	0.5360506012718814	-0.0045664374111764	0.4262092837555799	0.0046286787207335	0.41863478241612	DNAJC3	158907	DZIP1	191341	UGGT2	217435	False	False	False	ref	-100	0.01097	-60	0.02399
1080	chr13	95849839	T	C	rs8000849	-0.0067816812	0.4856280187260988	0.0067816812	0.4730774510124365	0.0309703693025417	0.0033540111416814	-0.0002063746757334	0.1639194458282594	0.0002063746757334	0.1565248859369996	0.1919190033091629	0.6617507340122755	-0.0012307798717466	0.5559717439940837	0.0012307798717466	0.5421714217065733	0.0061196928047093	0.0786928264604829	-3.855751819696839e-05	0.2788181022238922	3.855751819696839e-05	0.2682738162345573	-0.0060789012334152	0.3177675915049567	0.0060789012334152	0.3089419947471434	DNAJC3	172699	UGGT2	203643	DZIP1	205133	False	True	True	ref	-100	0.006435	100	0.06146
1081	chr13	95862624	A	C	rs4773928	0.029535829	0.0975183962004633	0.029535829	0.1036092309727418	0.0080698687468772	0.5794066184812605	0.000241040844493	0.1297508827025474	0.000241040844493	0.1364490281228904	0.0759945642589652	0.8593538599592682	0.0021696588065633	0.408772302328775	0.0021696588065633	0.4218480058876692	0.0006029961924178	0.8697035772292975	1.7399449158906476e-05	0.4297752388121084	1.7399449158906476e-05	0.442313707438648	0.0206475170904262	0.063006223372725	0.0206475170904262	0.0647340315706299	DNAJC3	185484	UGGT2	190858	DZIP1	217918	False	False	False	alt	50	0.001386	55	0.02295
1082	chr13	95870573	T	C	rs6492824	0.0559557722	0.016305668858459	0.0559557722	0.0174514375265462	0.011027652898666	0.2290006699616147	0.0006574143754166	0.0278530223223823	0.0006574143754166	0.029557279728372	0.3019201443998381	0.4940283181228392	0.0174016272143215	0.0506024019987794	0.0174016272143215	0.055017586801394	0.0034434690000386	0.3185963704718453	0.0002109561614578	0.0505745053788337	0.0002109561614578	0.0544679412188121	0.0439236921544829	0.0055331698305591	0.0439236921544829	0.0057337109727908	UGGT2	182909	DNAJC3	193433	HS6ST3	219535	False	True	False	alt	100	0.0007114	-35	0.00763
1083	chr13	95873066	C	A	rs9561967	-0.002736245692	0.7161993553841288	0.003096127548	0.7077040238315331	0.006595189713289	0.8625363033107365	-1.8547868214574843e-05	0.7735664425613273	2.087106454581769e-05	0.7653776834509407	0.0596043527422483	0.8935794584190454	-0.0001707964244863	0.8651882789430403	0.0001887459048903	0.8569878414905912	0.0003984866717284	0.9179431682746136	-1.1762832903325371e-06	0.8879778170883591	1.2921551143204996e-06	0.879892826273948	-0.0020083195883774	0.6453883461773844	0.0021618481519517	0.6375736215281725	UGGT2	180416	DNAJC3	195926	HS6ST3	217042	False	False	False	ref	100	0.0019455	0	0.0
1084	chr13	95873890	T	C	rs11616658	-0.0183127336	0.2193402399641245	0.0183127336	0.2099809793771195	0.0160294756669549	0.0634621395885233	-0.0003086829380638	0.1102234490271199	0.0003086829380638	0.1048537224437799	0.1615307212730422	0.7214064304135569	-0.002889446684296	0.3862961174900689	0.002889446684296	0.3736691502111898	0.0025973936880626	0.4915071618286135	-4.90643039551985e-05	0.2620057872136813	4.90643039551985e-05	0.2515806846528112	-0.0178155375055757	0.0996918030953778	0.0178155375055757	0.0968823175079515	UGGT2	179592	DNAJC3	196750	HS6ST3	216218	False	False	False	ref	-100	0.01154	-60	0.04065
1085	chr13	95876601	A	C	rs9556505	-0.00139853664	0.6160833178650763	0.00490399576	0.6165580305491671	0.0077813507203748	0.6296713322475337	-5.791577492900398e-06	0.6523172065918641	3.534067235615901e-05	0.6539433830198735	0.227392400336103	0.611682490600844	-0.0002960901007118	0.6096230334408023	0.0011383326021122	0.6113834685365691	0.0017725295924254	0.6454642397479978	-1.123086552314439e-06	0.6358572852097268	8.224797552824679e-06	0.6384417253219531	-0.0014232512785402	0.4743371374583945	0.0045934086453178	0.4761760684274538	UGGT2	176881	DNAJC3	199461	HS6ST3	213507	False	False	False	ref	40	0.001417	-100	0.04697
1086	chr13	95893035	A	G	rs1537030	0.0013183448079999	0.7475502961666087	0.002810245072	0.7496399001609193	0.0073214299968623	0.7244008190640264	7.908291621914796e-06	0.7842843352426844	1.953222247814197e-05	0.7854871046413385	0.0636043942364547	0.8898770304705452	2.894559703840222e-05	0.8833700339314314	0.0001493940615241	0.8834554265069386	0.0004731410323022	0.905026078913748	1.1563852224692789e-07	0.8959752809792236	1.0616354667655605e-06	0.8959101374284961	0.0004709592423158	0.6990306172988455	0.0016742912270873	0.69997790515621	UGGT2	160447	HS6ST3	197073	DNAJC3	215895	False	False	False	alt	75	0.03506	-35	0.02515
1087	chr13	95906598	G	A	rs35836619	0.00286553974	0.7190643329606542	0.00286553974	0.7325925122191947	0.0224440783619509	0.0159737057043553	6.739541926384815e-05	0.4644836210589765	6.739541926384815e-05	0.476563872217971	0.4053071089949066	0.327436287893437	0.0011729922208902	0.5608859720523864	0.0011729922208902	0.5746244155275141	0.0091371295849328	0.0180872189703837	2.7725881496352576e-05	0.3570045625161725	2.7725881496352576e-05	0.368974639747188	0.0014709696158673	0.7214710203483604	0.0014709696158673	0.7347615276983022	UGGT2	146884	HS6ST3	183510	DNAJC3	229458	False	True	False	alt	100	0.0108	100	0.1414
1088	chr13	95928601	G	A	rs9556506	-0.044780657	0.0396621529555212	0.044780657	0.0372015598256569	0.016330455962861	0.0586589115283277	-0.0007389167244037	0.0226015681843845	0.0007389167244037	0.0213096255245368	0.644344858349153	0.0232467594944566	-0.0289065400623349	0.0182351340335461	0.0289065400623349	0.016802865119097	0.0105297625097897	0.0107713723072973	-0.0004773544915705	0.0136128012437851	0.0004773544915705	0.0127480409142668	-0.004267679125302	0.4338496395858895	0.004267679125302	0.4233617674297728	UGGT2	124881	HS6ST3	161507	DNAJC3	251461	False	False	False	ref	-100	0.01843	-100	0.07495
1089	chr13	95931789	G	A	rs9556508	-0.0590287068	0.0166704933312867	0.0590287068	0.0155975336620567	0.0172055054239599	0.0469384789166686	-0.0010081793472147	0.0122264460984265	0.0010081793472147	0.0116671790677808	0.6252969429143456	0.0314590291408835	-0.0368628886014311	0.0089545641086017	0.0368628886014311	0.0082629839496802	0.0107428470565222	0.0109731932102054	-0.0006284616575327	0.0082234976784602	0.0006284616575327	0.0077907525021422	-0.0066121017852881	0.3021320711676331	0.0066121017852881	0.2936776055982179	UGGT2	121693	HS6ST3	158319	DNAJC3	254649	False	True	False	ref	-100	0.00864	-55	0.04883
1090	chr13	95937483	C	A	rs1411557	0.00841808928	0.4151400988396062	0.00841808928	0.4271835255393155	0.0270848011841028	0.0063882621582372	0.0002274283188922	0.1568742157572066	0.0002274283188922	0.1642687851181205	0.0845797155572152	0.8525103383982239	0.0007812303348231	0.6562436312250881	0.0007812303348231	0.6699321023269557	0.002306410623359	0.5500008471802704	2.131380165402921e-05	0.4245184111654122	2.131380165402921e-05	0.4368102624073171	0.006811273975871	0.2980329511244469	0.006811273975871	0.3067642987839485	UGGT2	115999	HS6ST3	152625	DNAJC3	260343	False	True	True	alt	-100	0.0066	-100	0.04163
1091	chr13	95968179	T	A	rs11619333	0.00827558986	0.3949697135316826	0.00827558986	0.4068978936478788	0.0211788049226367	0.0206263910662552	0.0001765921399657	0.1922497497096909	0.0001765921399657	0.2006621327842451	0.1106048817933795	0.805983416533687	0.0009765994877669	0.5905728719996592	0.0009765994877669	0.6041068787185389	0.0023603273959818	0.5356145194590973	2.1029063372252e-05	0.4078859454670053	2.1029063372252e-05	0.4201814773168067	0.0075415720080083	0.256306534238505	0.0075415720080083	0.2640820519769123	UGGT2	85303	HS6ST3	121929	DNAJC3	291039	False	False	False	alt	85	0.00232	-5	0.004547
1092	chr13	95971316	C	A	rs7324957	-0.0030621064619999	0.7085041587658656	0.0031691400979999	0.7046651879989638	0.0084585553032664	0.4962177412214379	-2.513678385832893e-05	0.7227983455670173	2.604952163470408e-05	0.7193834429123682	0.1804977230054253	0.6876536254113024	-0.0006586549303108	0.7285676938396767	0.0006765500358217	0.7248946368853425	0.0015246413950203	0.6909186456179685	-5.415392541421804e-06	0.7353173834913979	5.567929923155556e-06	0.7318830106672083	-0.002979284017469	0.5783712740611031	0.0031079160572204	0.5744647610061931	UGGT2	82166	HS6ST3	118792	DNAJC3	294176	False	False	False	ref	95	0.003363	-100	0.06866
1093	chr13	95979670	G	A	rs9562005	-0.002978570274	0.7657383390668995	0.002978570274	0.7519813084673588	0.0102816452404724	0.2820478165454474	-3.0000725780063657e-05	0.7241580273859001	3.0000725780063657e-05	0.7106030599552677	0.1976431290781024	0.6607964154642816	-0.0006193668351827	0.7426447034018792	0.0006193668351827	0.7285650441387612	0.0020558297471827	0.5917571486586033	-6.333369039623937e-06	0.715013633674588	6.333369039623937e-06	0.7012173683283567	-0.002533221298976	0.6118046765595626	0.002533221298976	0.5995163017727433	UGGT2	73812	HS6ST3	110438	DNAJC3	302530	False	False	False	ref	-90	0.004898	-5	0.002167
1094	chr13	95985541	T	C	rs117227967	0.00920564032	0.3759323872169777	0.00920564032	0.3878179603815465	0.0075342682303399	0.6083784910115502	7.49311081117844e-05	0.4209394441119808	7.49311081117844e-05	0.4323757557164011	0.0477390844303363	0.9147089208799544	0.0004367372761106	0.7380903086784453	0.0004367372761106	0.7521277253302241	0.0003550712293037	0.9269764616983726	3.4414325769384733e-06	0.7554951201739084	3.4414325769384733e-06	0.769550951286439	0.005222045871845	0.3643180910270412	0.005222045871845	0.3740107369491418	UGGT2	67941	HS6ST3	104567	DNAJC3	308401	False	False	False	alt	10	0.001568	-65	0.0289
1095	chr13	96003118	T	C	rs2026819	0.0019294350279999	0.776199217694834	0.002503553572	0.778593696484048	0.0076825191127447	0.6510087825155196	1.67046520033902e-05	0.7877306611227011	2.076242666782588e-05	0.7900383970009556	0.1520326974346206	0.7359086494474141	0.0004661865831044	0.7694031497945072	0.0005272734438591	0.7719913733580835	0.0012004700528987	0.7598279897361475	4.034903340791617e-06	0.7801740381817563	4.465481825810324e-06	0.7826596200687563	0.0016493947032645	0.6501124305826194	0.0021929688067303	0.6527773411103486	UGGT2	50364	HS6ST3	86990	DNAJC3	325978	False	False	False	alt	75	0.01466	-95	0.02994
1096	chr13	96029297	A	T	rs3782990	0.00605913346	0.4967945712761332	0.00605913346	0.5094357307985002	0.023681691123014	0.0127982288888435	0.0001436968426501	0.2310693354809556	0.0001436968426501	0.2401818911652055	0.1162397950186204	0.7881487895103941	0.0006866510857032	0.647848162761235	0.0006866510857032	0.6620351030494492	0.0026719897318533	0.4516988950092382	1.5785494359164447e-05	0.4441633825227477	1.5785494359164447e-05	0.4569285545542086	0.0053174825464994	0.3433999595920017	0.0053174825464994	0.3528431251853756	UGGT2	24185	HS6ST3	60811	DNAJC3	352157	False	True	False	alt	-85	0.01216	-90	0.0851
1097	chr13	96053485	T	C	rs2277419	-0.00308680186	0.4394147445477529	0.00833169606	0.4367836900784713	0.0221063513397266	0.0204893017352842	-1.919643336886184e-05	0.2190781972037444	0.0001811557039295	0.2179972693704278	0.8708575815101817	0.0037278839342518	-0.0026699529637838	0.19570599874239	0.007258366650392	0.1937213157859245	0.0192673910727391	0.0016718145666969	-1.618475166722133e-05	0.0835798694508241	0.0001580087834616	0.0831675428202735	-0.0005186775796429	0.7157695712865879	0.0016141246278487	0.7133217489462202	UGGT2	3	HS6ST3	36623	DNAJC3	376345	True	False	False	ref	-45	0.005005	-50	0.04858
1098	chr13	96068177	C	A	rs1854173	-0.0284274238	0.108093217213434	0.0284274238	0.1021437666004232	0.0140280151088871	0.098650340571498	-0.0004064758689198	0.0632353416429831	0.0004064758689198	0.0598550320311243	0.2959947717299971	0.5051969341473798	-0.0085132906984263	0.1531840886788908	0.0085132906984263	0.1445091721626771	0.0041810817016831	0.2185895565684823	-0.0001222748430915	0.0996749475081298	0.0001222748430915	0.0937017667819398	-0.0231309453417566	0.0501733538955906	0.0231309453417566	0.0487979300424214	UGGT2	14695	HS6ST3	21931	DNAJC3	391037	False	False	False	ref	60	0.003893	35	0.06726
1099	chr13	96089608	T	G	rs11618108	0.014321634938	0.2427495939664364	0.014414925862	0.2520071610879034	0.0082111496853116	0.5211771345909287	0.0001332665203792	0.2521112830952809	0.0001338240405798	0.2603061170495297	0.6146080353530639	0.0372003247759647	0.0087703548246882	0.1487166248028575	0.0088281725724499	0.1567242419158027	0.0050415634897074	0.1358455643799349	8.157938750108734e-05	0.1627636203279493	8.192491480807872e-05	0.1702526239268529	0.0015830039730702	0.6921888988556202	0.0015996016556187	0.7021205714630255	HS6ST3	500	UGGT2	36126	DNAJC3	412468	False	False	False	alt	-100	0.02652	100	0.10474
1100	chr13	96103960	T	G	rs200086486	-0.00304362462	0.7094150052540025	0.0032664711	0.7008317484879905	0.0282112970591592	0.0056750973295536	-9.559305976164997e-05	0.3905581545723811	0.0001010297474641	0.3822570395357889	0.272372120042739	0.5385699639120616	-0.0009647692626065	0.6310413694077271	0.0010107815255525	0.6219822001521523	0.0079165565486128	0.0358980049066184	-3.063545548351626e-05	0.3811602370622159	3.175799650604593e-05	0.3724455678846839	-0.0024336352036846	0.59854366577863	0.0026203591323561	0.5904658134823108	HS6ST3	13852	UGGT2	50478	DNAJC3	426820	False	True	True	ref	40	0.01196	-95	0.0382
1101	chr13	96117228	A	C	rs493423	0.001573384202	0.7911137672839215	0.002389150426	0.7931418535819935	0.0151763703301917	0.0800615571368519	2.009961199967787e-05	0.6938229206557854	3.2363758466443245e-05	0.6962611848238195	0.0352908225189057	0.9322410128727096	4.630241656549421e-05	0.9337458919400288	7.051086645016113e-05	0.9361428026959918	0.0005387196399331	0.8803462478609763	6.18652365255934e-07	0.9062289831153372	9.82567900288078e-07	0.907432233863113	0.00052282700028	0.8310995682088604	0.0008838265957115	0.8323236685581262	HS6ST3	27120	UGGT2	63746	DNAJC3	440088	False	False	False	alt	95	0.01712	-90	0.011406
1102	chr13	96136335	T	C	rs504340	0.0807264056	0.0050139025851098	0.0807264056	0.0053516820945121	0.0163392146118961	0.0619817499819325	0.0013927465352923	0.0075518222196977	0.0013927465352923	0.0079736526224502	0.4027240946482847	0.326098465692675	0.0333523823173769	0.0115282044464145	0.0333523823173769	0.0125008713293089	0.0067197767528267	0.0614669626791487	0.0005880485885165	0.0103736057454219	0.0005880485885165	0.0110993672330704	0.0452037884210416	0.0060098390590513	0.0452037884210416	0.0061664019704722	HS6ST3	46227	UGGT2	82853	DNAJC3	459195	False	True	True	alt	-40	0.002808	100	0.01355
1103	chr13	96140622	T	G	rs1117183	-0.00377394846	0.6685748471349667	0.00377394846	0.6549483388521434	0.0186086258693658	0.03588132013993	-6.752068437054735e-05	0.4411887369515764	6.752068437054735e-05	0.4297255728004684	0.2756729841595867	0.5285307353092682	-0.0009548351435061	0.6111471406212646	0.0009548351435061	0.5972151609043944	0.0052348001571387	0.1236902798470818	-1.7572788993355764e-05	0.4469468398003658	1.7572788993355764e-05	0.4344016285661997	-0.0030477494579818	0.537055574965198	0.0030477494579818	0.5255751684207799	HS6ST3	50514	UGGT2	87140	DNAJC3	463482	False	False	False	ref	-40	0.003807	100	0.03394
1104	chr13	96141355	C	T	rs640357	0.002614108646	0.6900186904627686	0.003611039354	0.694675361325668	0.0310334902681717	0.0033587656487297	8.56940341928283e-05	0.3622169907438541	0.0001141221514126	0.3668203102094844	0.4726522059357462	0.2066932091787225	0.0014042047327287	0.5214971746067821	0.0017870417593669	0.5270094753069244	0.014774353205505	0.0034028152360537	4.579852272648054e-05	0.2627342108989159	5.669193327533327e-05	0.2678181830579441	0.0007655681075529	0.7728778737742696	0.001230303218913	0.7759000726470179	HS6ST3	51247	UGGT2	87873	DNAJC3	464215	False	True	True	alt	-100	0.014465	-100	0.10876
1105	chr13	96178713	A	G	rs16951630	0.0177621608	0.1987033414790927	0.0177621608	0.2080614071110259	0.0072374195900663	0.7425932860262895	0.000127364811632	0.2590786511269661	0.000127364811632	0.2683741173137788	0.2485585950061722	0.5800094096722784	0.0044878662923147	0.2568964822033849	0.0044878662923147	0.2681373859930419	0.0017907993119537	0.648287453813574	3.204758790994875e-05	0.3032094638796799	3.204758790994875e-05	0.3143601476913975	0.0160354360522411	0.0961881112614207	0.0160354360522411	0.0991360421163274	HS6ST3	88605	UGGT2	125231	DNAJC3	501573	False	False	False	alt	75	0.004387	-50	0.03198
1106	chr13	96207822	G	A	rs9590371	-0.00588111272	0.560265930077549	0.00588111272	0.5471539431541288	0.0058519001045705	0.9409474270191084	-3.558410377210283e-05	0.6619292000251065	3.558410377210283e-05	0.6486936606437456	0.0091971908422286	0.9808020710184796	-7.141909279626675e-05	0.9476882771652786	7.141909279626675e-05	0.9334727309034686	5.531183436774819e-05	0.9856685306045528	-4.370380932998712e-07	0.9599441846624216	4.370380932998712e-07	0.9463851758421766	-0.0011784354609487	0.789769493590739	0.0011784354609487	0.776132962483251	HS6ST3	117714	UGGT2	154340	DNAJC3	530682	False	False	False	ref	50	0.00255	-60	0.02478
1107	chr13	96221190	T	C	rs1927808	-0.00750330228	0.4473879025106015	0.00750330228	0.4352149021602007	0.0092152761009148	0.3925853103798689	-7.009579665236533e-05	0.4367025306202017	7.009579665236533e-05	0.4255075998013241	0.2256786896129627	0.6143323608344405	-0.0016349070076253	0.5006464539343739	0.0016349070076253	0.487117122457984	0.0020970425521153	0.5904814402431668	-1.5374440702205105e-05	0.4869166582055441	1.5374440702205105e-05	0.4741200258517056	-0.0072656355356382	0.2785074255073156	0.0072656355356382	0.2707723290000204	HS6ST3	131082	UGGT2	167708	DNAJC3	544050	False	False	False	ref	-90	0.02072	-5	0.002686
1108	chr13	96229983	C	T	rs9516643	-0.0518403184	0.025888811984465	0.0518403184	0.0242281211886335	0.0110949581782477	0.2160303667929847	-0.0005786765421157	0.0334312405418189	0.0005786765421157	0.0314591309233813	0.2189587028911088	0.624105080541096	-0.0114046514722606	0.1133778523903271	0.0114046514722606	0.1061074839048644	0.0024053242854113	0.5238155620660588	-0.000126071303445	0.0976074514192675	0.000126071303445	0.0915927373568239	-0.0484465606489693	0.0051195724751581	0.0484465606489693	0.0049894960317548	HS6ST3	139875	UGGT2	176501	DNAJC3	552843	False	False	False	ref	100	0.002037	-70	0.03482
1109	chr13	96232625	A	G	rs9584347	-0.0153974562	0.2471669320215928	0.0153974562	0.2371859031058106	0.0065957010061308	0.8505451274603625	-0.00010200445615	0.3328618636793631	0.00010200445615	0.322872711644878	0.1670992437680888	0.7107813964782879	-0.0026056120792676	0.3988086075883785	0.0026056120792676	0.3860080470884253	0.0010996233723351	0.7731332527861942	-1.7229206674242042e-05	0.4627371715919179	1.7229206674242042e-05	0.4499582958613141	-0.0145561675950995	0.1164242977461087	0.0145561675950995	0.1129813404450182	HS6ST3	142517	UGGT2	179143	DNAJC3	555485	False	False	False	ref	100	0.002285	-40	0.03613
1110	chr13	96234119	A	G	rs9525161	0.002905484266	0.7007430986855461	0.003136916134	0.7111050673319032	0.0125923951717517	0.1405121528059488	3.7771433573940105e-05	0.5973987381453023	4.0754258798020045e-05	0.607540685862784	0.0823245054409278	0.8494773774876768	0.0002540694497126	0.8094491478990484	0.0002662965734235	0.820071739746313	0.0010337210443138	0.7835557363379623	3.2871536737321707e-06	0.7580624339184556	3.4447437822005067e-06	0.7687355409034416	0.0023319743980746	0.5911353908432614	0.0024855029616489	0.6008932907319358	HS6ST3	144011	UGGT2	180637	DNAJC3	556979	False	False	False	alt	90	0.0054	-90	0.05737
1111	chr13	96243278	G	A	rs8002865	0.0051280852	0.5539811704843234	0.0051280852	0.5670816587344032	0.02289946182124	0.0145927426790687	0.0001113804091607	0.2988294330870606	0.0001113804091607	0.3090000452992394	0.1507837218228404	0.7406041357735336	0.0007919770935214	0.6385410432103795	0.0007919770935214	0.6523427407738054	0.0034724443544872	0.336574727413635	1.7146169159118596e-05	0.444893622981293	1.7146169159118596e-05	0.457485940498771	0.0050685173082707	0.3753895122969119	0.0050685173082707	0.3851860669573782	HS6ST3	153170	UGGT2	189796	DNAJC3	566138	False	True	False	alt	60	0.002283	60	0.01773
1112	chr13	96250122	G	A	rs1927804	0.00335503692	0.6580844336424098	0.00335503692	0.6717715716162432	0.0212341664873903	0.0217147651978281	7.512260677193064e-05	0.4006832140211183	7.512260677193064e-05	0.4123469733277599	0.1212460710173341	0.7885122233091127	0.0003865460027753	0.7429319918172074	0.0003865460027753	0.7569819206275584	0.0024536715451516	0.5152957402022722	8.489489440567198e-06	0.5819155965515885	8.489489440567198e-06	0.5957641219380756	0.0033361341922633	0.4935415531183442	0.0033361341922633	0.5050108068650564	HS6ST3	160014	UGGT2	196640	DNAJC3	572982	False	False	False	alt	100	0.002647	100	0.0214
1113	chr13	96251041	C	T	rs9516649	-0.002964936934	0.7149263293103701	0.003241693826	0.7043323420523325	0.0090208369330115	0.4200561814788623	-2.680381990952242e-05	0.7044981849237167	2.901898904359944e-05	0.6941919549128738	0.2517453500554985	0.5698583710563851	-0.0007816473048746	0.6591416678804851	0.0008698285924106	0.6481841000178896	0.0021852768316809	0.5770526194993797	-6.778651288999528e-06	0.6589316067436446	7.48445653545619e-06	0.6481659115410113	-0.0024730546997375	0.5797423908177264	0.0027137210966918	0.5704121784422018	HS6ST3	160933	UGGT2	197559	DNAJC3	573901	False	False	False	ref	75	0.0003738	80	0.08435
1114	chr13	96266681	C	T	rs2104657	0.00241168498	0.7474167414430457	0.00241168498	0.7612374419360161	0.0153517216342216	0.0761743960830624	3.834312126425848e-05	0.5954451336124853	3.834312126425848e-05	0.6081802063466631	0.1560514113216941	0.7259194443948503	0.0003700483092871	0.7495493271719952	0.0003700483092871	0.7637892573527048	0.0023382036570589	0.5365011053116671	5.688122262191685e-06	0.6582159305869111	5.688122262191685e-06	0.6723046155405751	0.0022780319297917	0.6045395282764111	0.0022780319297917	0.6170475949623759	HS6ST3	176573	UGGT2	213199	DNAJC3	589541	False	False	False	alt	-100	0.0174	-20	0.01041
1115	chr13	96279985	C	T	rs1927784	-0.0410467933999999	0.052879449904023	0.0410467933999999	0.0495669070424908	0.0101146567337376	0.2906218000305556	-0.0004216845505648	0.0605047240817385	0.0004216845505648	0.0570075140885374	0.1945601095447048	0.6692503349300751	-0.0082452627155078	0.1677886215483249	0.0082452627155078	0.1585241420006573	0.0019846582498717	0.6137678036703542	-8.514595357163651e-05	0.1564247038211038	8.514595357163651e-05	0.1481201978846887	-0.0395979211402607	0.0103313298469392	0.0395979211402607	0.0100683049240925	HS6ST3	189877	UGGT2	226503	DNAJC3	602845	False	False	False	ref	25	0.001129	90	0.04196
1116	chr13	96289458	G	T	rs61966895	-0.00113345502	0.8261080813075536	0.00169717442	0.8227319957022637	0.0059496459412049	0.926383432109416	-7.182306323620029e-06	0.8691678417832127	1.0625141334100386e-05	0.8661115666637056	0.2104482411643273	0.6413494308971819	-0.0002661282572173	0.7844871336723869	0.0003551761180556	0.780570235336113	0.0012435624651936	0.7493753978249725	-1.6801396431190186e-06	0.8254149473752151	2.220359470217616e-06	0.821794017982662	-0.0012904698181516	0.6984849813921095	0.0017095613025031	0.6949881506787299	HS6ST3	199350	UGGT2	235976	DNAJC3	612318	False	False	False	ref	-95	0.02278	100	0.03632
1117	chr13	96297443	A	G	rs11619328	0.086292694	0.0041368854112085	0.086292694	0.0043659559269715	0.0158818371335385	0.0688153874608381	0.001511223004005	0.0075186527490759	0.001511223004005	0.0079142120125476	0.3481239431944314	0.4123899960380248	0.0318914631876763	0.0142938897373549	0.0318914631876763	0.0155266937410474	0.0057975380041619	0.1057113876792377	0.0005849687374136	0.0130019681285855	0.0005849687374136	0.0139339641813018	0.0596333986867083	0.0018664165247286	0.0596333986867083	0.001923593252183	HS6ST3	207335	UGGT2	243961	DNAJC3	620303	False	True	True	alt	70	0.00314	70	0.02698
1118	chr13	96299179	G	T	rs2038823	-0.0883954186	0.0033609946754517	0.0883954186	0.0032267244929507	0.0202948945072612	0.0254000611288035	-0.0018579940087594	0.0046902134978938	0.0018579940087594	0.0045094142805958	0.3577734208861087	0.4023383027785812	-0.0324483718380243	0.0135920615782116	0.0324483718380243	0.0125561457175669	0.0074133081452838	0.0450254665452451	-0.0006917867250612	0.0081680361756775	0.0006917867250612	0.007746980105061	-0.0616271953028557	0.0016745652276381	0.0616271953028557	0.0016225267210781	HS6ST3	209071	UGGT2	245697	DNAJC3	622039	False	True	True	ref	-90	0.005753	-100	0.0337
1119	chr13	96306638	C	T	rs11618312	0.009558948594	0.426887213366353	0.010114375794	0.4371173224790081	0.0094743320438981	0.3689723110475718	0.0001074972895998	0.4032729971286712	0.0001110100223435	0.4127021260702486	0.161090882685505	0.7189415964363586	0.0014194452685936	0.5558871462645614	0.0015062575945963	0.5660244220236348	0.0015067607301174	0.6992794007724286	1.5800747356923053e-05	0.5314410896095275	1.6349781519610822e-05	0.5412101305391178	0.0086971856554528	0.276818146625806	0.0092200126557329	0.2816762348065738	HS6ST3	216530	UGGT2	253156	DNAJC3	629498	False	False	False	alt	-65	0.001167	-70	0.04932
1120	chr13	96310731	G	A	rs117420459	-0.0556826762	0.0207746224780067	0.0556826762	0.0194672605219648	0.0145206646238053	0.0936361746393492	-0.0008528469019441	0.0199777272487164	0.0008528469019441	0.0189167709190922	0.1930144503573688	0.6694424683086528	-0.011302043250995	0.121674406915476	0.011302043250995	0.1139646861106756	0.0030825161798091	0.3682191772896392	-0.0001901674075209	0.0779814203161899	0.0001901674075209	0.0732055088222342	-0.0518449361507899	0.0038059118712153	0.0518449361507899	0.0037095985744702	HS6ST3	220623	UGGT2	257249	DNAJC3	633591	False	True	False	ref	100	0.00387	35	0.010254
1121	chr13	96315469	G	A	rs115587611	0.00433657882	0.5998365211106543	0.00433657882	0.613090178172229	0.0199350341380635	0.0270453710623513	8.782154530683637e-05	0.3573029823561672	8.782154530683637e-05	0.368218717321552	0.1084824531374806	0.8091976878226929	0.0005149953566207	0.7158731844665288	0.0005149953566207	0.7298720117108346	0.0022833518857132	0.5126151134433368	1.102208787222485e-05	0.5616114180767583	1.102208787222485e-05	0.5750863835200696	0.0039896679426134	0.4424899299768045	0.0039896679426134	0.4534100305700429	HS6ST3	225361	UGGT2	261987	DNAJC3	638329	False	False	False	alt	95	0.02045	100	0.03723
1122	chr13	96316993	T	C	rs115470719	-0.00150742444	0.8245194667744579	0.0018833936	0.8145443185691545	0.0247088978324	0.0101412218331417	-3.572331449740281e-05	0.5648476464944028	4.6655388922443e-05	0.5553748913120297	0.0572184358758907	0.90120882390956	-6.617826998620238e-05	0.9171883700806543	9.76133610382754e-05	0.907130539180764	0.0014215217110966	0.7190553680719692	-1.4848877280042736e-06	0.8194626955463357	2.398927498809198e-06	0.8094591277814298	-0.00088590130603	0.7829247440273639	0.0011888090125415	0.7732123843886416	HS6ST3	226885	UGGT2	263511	DNAJC3	639853	False	True	False	ref	-95	0.001831	-95	0.008545
1123	chr13	96320974	C	A	rs61966906	0.003561012166	0.5811524396883968	0.0044061955539999	0.5873080437567681	0.0091066007141842	0.4038301544247531	3.347855573752433e-05	0.5712890489829764	4.100911329714241e-05	0.5768162938379184	0.0688949055488126	0.8743144103551559	0.0003068769326704	0.7667168407267357	0.0003642457975342	0.7738073602030703	0.0006338539685919	0.8664679856925965	2.8917290019325005e-06	0.7586265657516907	3.403471365110747e-06	0.7654952423446081	0.0033631054264048	0.4667457386643809	0.0038942312679591	0.4716370100224288	HS6ST3	230866	UGGT2	267492	DNAJC3	643834	False	False	False	alt	30	0.01457	-95	0.03665
1124	chr13	96325548	C	T	rs61966910	-0.0417399922	0.0519077221226267	0.0417399922	0.0488119183844599	0.0096284747879249	0.3517803781216663	-0.0004152906116973	0.0681320101238889	0.0004152906116973	0.0643862140774362	0.1133766947789914	0.8047754809165508	-0.0054678711101936	0.2724135856675914	0.0054678711101936	0.2609298523939065	0.0011249964021292	0.7792092604024321	-5.54245902406141e-05	0.2623857494614361	5.54245902406141e-05	0.251893752053881	-0.0357887529953629	0.018133564583641	0.0357887529953629	0.017678093579248	HS6ST3	235440	UGGT2	272066	DNAJC3	648408	False	False	False	ref	-30	0.00952	-20	0.006042
1125	chr13	96331923	G	A	rs11616787	-0.066015908	0.0105668033433732	0.066015908	0.0099716468634051	0.0130057830752073	0.1267179341690554	-0.0008629987493703	0.0157930074957522	0.0008629987493703	0.0149550958340401	0.6316434817788565	0.0274550799042688	-0.0417072159765473	0.0056666003811926	0.0417072159765473	0.0052704771264123	0.0082112482469373	0.0271893706244643	-0.0005450114517448	0.0103727138060155	0.0005450114517448	0.0097614614786392	-0.0065042168487224	0.302295962650489	0.0065042168487224	0.2937681970930769	HS6ST3	241815	UGGT2	278441	DNAJC3	654783	False	True	True	ref	-70	0.00795	-30	0.03027
1126	chr13	96336988	A	C	rs11620555	0.026135444	0.1188532023227956	0.026135444	0.125854460617095	0.009019669953605	0.4264461458595921	0.0002484858924295	0.1315696399872629	0.0002484858924295	0.1383184376569939	0.2810319609124575	0.5246769756861025	0.0074617559151952	0.164136929332369	0.0074617559151952	0.1737415246088815	0.0025259595195856	0.5065571622724662	7.108366727670368e-05	0.1707411287396148	7.108366727670368e-05	0.1797045937318758	0.0215583149202792	0.0570376798487589	0.0215583149202792	0.0585587377787078	HS6ST3	246880	UGGT2	283506	OXGR1	657742	False	False	False	alt	50	0.010956	50	0.08545
1127	chr13	96338199	A	G	rs11842501	0.0055182375	0.5445543665204682	0.0055182375	0.5575973120347832	0.0073703148898006	0.7027247740779654	4.0627905823257706e-05	0.5959783859663518	4.0627905823257706e-05	0.6090556993317372	0.274019440035685	0.5386620468698322	0.0015140996278225	0.5043625278559536	0.0015140996278225	0.5178980714692873	0.0019707116462853	0.6152788088442046	1.0952827695751011e-05	0.5458932726834685	1.0952827695751011e-05	0.5592122807698083	0.0043983858753721	0.4082490384780471	0.0043983858753721	0.4188149579818833	HS6ST3	248091	UGGT2	284717	OXGR1	656531	False	False	False	alt	-30	0.003052	75	0.01877
1128	chr13	96338407	C	T	rs61966935	0.001101549516	0.81111483991459	0.002015130516	0.8141526738182653	0.0072267034500454	0.7408862026594969	9.875186279033464e-06	0.8271302054886125	1.5735072743814527e-05	0.8301532954716722	0.3442442348987022	0.4269082164812066	0.0003738510666243	0.6861419805470483	0.0007319549722634	0.6891139179591168	0.0024925849294874	0.5167616644323111	3.3957938357113543e-06	0.7117414975592741	5.70152923836126e-06	0.7147255622823809	0.0007821657901015	0.7554789936780527	0.0013589352586644	0.7585529552705493	HS6ST3	248299	UGGT2	284925	OXGR1	656323	False	False	False	alt	95	0.003292	100	0.03085
1129	chr13	96342898	G	T	rs11618566	0.00318763298	0.7140509316844528	0.00318763298	0.7279303669622514	0.0103100578189372	0.2746796764301712	3.3930615011017565e-05	0.6646735483938332	3.3930615011017565e-05	0.6781083474893184	0.2005809188892001	0.6579248097673994	0.0006849946004543	0.6943388165407667	0.0006849946004543	0.7087288633155399	0.002092612172325	0.593094950457101	7.343449477707104e-06	0.6618772744538508	7.343449477707104e-06	0.6759324044236236	0.0028153819023018	0.5550187932929935	0.0028153819023018	0.5673062513675585	HS6ST3	252790	UGGT2	289416	OXGR1	651832	False	False	False	alt	-100	0.02737	60	0.0289
1130	chr13	101365510	G	A	rs7993037	0.00305082014	0.6893716642303536	0.00305082014	0.7028795796128435	0.0137633736732927	0.1099574433402947	4.207998418099396e-05	0.5568370004475953	4.207998418099396e-05	0.5693230291778563	0.292695982323468	0.5076997604820427	0.0009208151035591	0.5911106748258798	0.0009208151035591	0.6049567028683956	0.0040467850173963	0.2440589033092881	1.2712213461978956e-05	0.4953605090378987	1.2712213461978956e-05	0.5085112364796551	0.0023381985290303	0.5980244116904414	0.0023381985290303	0.6104300000960831	NALCN	50998	ITGBL1	87084	TMTC4	690417	False	False	False	alt	-55	0.002502	-90	0.04694
1131	chr13	101365522	T	C	rs114779898	0.0114583704	0.3229811193924605	0.0114583704	0.3343247548974919	0.0176297777579195	0.0443815552955183	0.0002083196604848	0.1743706375318434	0.0002083196604848	0.1820644647835656	0.2967375180240458	0.5014236605318771	0.0035092774757871	0.3201128927910031	0.0035092774757871	0.3321724459206134	0.0051874316094365	0.1327527870530992	6.34413787861371e-05	0.1968417463359483	6.34413787861371e-05	0.2063349207353072	0.0087573522546913	0.2299264411154793	0.0087573522546913	0.236903809610324	NALCN	50986	ITGBL1	87072	TMTC4	690429	False	False	False	alt	-70	0.000763	-100	0.0305
1132	chr13	101369769	C	T	rs17486808	-0.0020546594711999	0.7657762763679088	0.0023023376088	0.758877865759019	0.0070756314568154	0.7539144752600908	-1.497909287793931e-05	0.7932406768842098	1.6716247074754452e-05	0.7868471921544239	0.0578823431778337	0.8960116482577404	-0.0001071088390444	0.8952480187664202	0.0001176183511883	0.8892903498342748	0.0004078582493028	0.9125730562189228	-7.882879267386268e-07	0.9048867037327936	8.615286791841482e-07	0.8989435532351597	-0.0014460730920445	0.7143871388688369	0.001549808607973	0.7079478946840904	NALCN	46739	ITGBL1	82825	TMTC4	694676	False	False	False	ref	-75	0.001406	-100	0.03815
1133	chr13	101370676	A	G	rs61973699	0.032468571	0.0828113967017489	0.032468571	0.0881946310457297	0.0088599310836828	0.4498831390071707	0.0003005584629012	0.1015769212087272	0.0003005584629012	0.1071985810153651	0.0337659104347555	0.9356560981533518	0.0011411405045805	0.5750304253224715	0.0011411405045805	0.5891242608936161	0.0003012255440826	0.9332805756570128	1.0532473812783676e-05	0.5692833137696697	1.0532473812783676e-05	0.5827460879496984	0.0131453645784707	0.1483752073565115	0.0131453645784707	0.1526349519623845	NALCN	45832	ITGBL1	81918	TMTC4	695583	False	False	False	alt	90	0.002132	-10	0.00264
1134	chr13	101373078	T	C	rs56313970	0.000567841716	0.7584276252036173	0.002764077756	0.7625186280625936	0.0182380558027259	0.0396160472332387	2.8105632731594822e-06	0.5566357829967564	5.03215444452117e-05	0.559833905220319	0.1255324225355034	0.7773550901721156	-8.844619092481743e-05	0.8055534752850658	0.0003278792955314	0.8088294786032281	0.0024732155102392	0.4706949714753658	-2.712864956913824e-06	0.6896803090376021	6.588466759444351e-06	0.6920066803108188	-9.543667465430008e-05	0.6362410041901825	0.0022157906202346	0.639132931557717	NALCN	43430	ITGBL1	79516	TMTC4	697985	False	False	False	alt	0	0.0	15	0.01198
1135	chr13	101373348	T	G	rs55865304	0.0031662980599999	0.6106721599434879	0.00430873934	0.6187989309300697	0.0232601008847114	0.0134496230045057	7.67633953729061e-05	0.3269621754838931	0.0001022918222699	0.3337713516409109	0.1995352648886398	0.6481113821882697	0.0009025678414467	0.6061622872985802	0.0009737341396137	0.6152122965640794	0.0047455490201253	0.1591363394322229	2.216133112664985e-05	0.4001816771366804	2.375157794992437e-05	0.4090268767041123	0.0032448469382462	0.4506916896206905	0.0039419496052863	0.457916490512389	NALCN	43160	ITGBL1	79246	TMTC4	698255	False	True	False	alt	-45	0.00856	85	0.04245
1136	chr13	101373659	C	T	rs61973707	-0.0574875676	0.0197414156235175	0.0574875676	0.0185829173563014	0.0112278824620146	0.2264283467347358	-0.0007021058473273	0.0290813694836964	0.0007021058473273	0.0275575365294177	0.2362410398448116	0.5861166488604027	-0.0152688162995998	0.0818984327674411	0.0152688162995998	0.0766106263068348	0.002869393326827	0.3994074571775454	-0.000201076113369	0.0736385666621566	0.000201076113369	0.0695244354137614	-0.0498117200385895	0.0047345545536735	0.0498117200385895	0.0046124188856477	NALCN	42849	ITGBL1	78935	TMTC4	698566	False	True	False	ref	75	0.003643	5	0.003052
1137	chr13	101374409	G	A	rs12429854	0.01226200816	0.3112799812876872	0.01226200816	0.3228602424072119	0.0072742332638463	0.6962074161976396	8.987355346899137e-05	0.3802487514009693	8.987355346899137e-05	0.3916093648756301	0.1609332047012935	0.7213174952200878	0.0020284917522731	0.4572550976069441	0.0020284917522731	0.4706055785662311	0.0011404804709709	0.7715776608396464	1.4518599423333576e-05	0.5045080169031091	1.4518599423333576e-05	0.517794875033219	0.0108382867042188	0.1673139587514863	0.0108382867042188	0.1722871704082505	NALCN	42099	ITGBL1	78185	TMTC4	699316	False	False	False	alt	-100	0.0074	-30	0.01419
1138	chr13	101383441	G	A	rs9585685	-0.001716390877	0.8258206615128121	0.001988275763	0.8228041998084934	0.0092512819707159	0.3793747603347777	-1.4150745125949374e-05	0.8251296435438467	1.6927990289758537e-05	0.8222627041414604	0.0254691438707869	0.955301948468649	-5.5014555979287246e-05	0.9544973279386652	5.753236371434469e-05	0.9524234982234994	0.0002652396887113	0.9466853018953112	-5.49804422668177e-07	0.9511863857655474	5.753530266948006e-07	0.9490942802046374	-0.0006846544051286	0.8624273758574356	0.0007468957146857	0.8597709698565189	NALCN	33067	ITGBL1	69153	TMTC4	708348	False	False	False	ref	100	0.01027	-45	0.02422
1139	chr13	111020256	C	T	rs9559929	-0.0794744896	0.0056507047109143	0.0794744896	0.0053851767562166	0.0181187143573479	0.0406620035933926	-0.0014662888727599	0.0070842620626961	0.0014662888727599	0.0067860351458247	0.5680307887011276	0.080304353667114	-0.0451314222754036	0.0046760125703764	0.0451314222754036	0.0043582515313483	0.0102806750639816	0.0123531318076879	-0.000831858831274	0.0057302078907534	0.000831858831274	0.0054160259532044	-0.0165956078382555	0.1038807581191154	0.0165956078382555	0.1010032577454153	ARHGEF7	94304	ANKRD10	105187	TEX29	295929	False	True	True	ref	-70	0.00754	-100	0.07227
1140	chr13	111020704	C	T	rs9559931	-0.0216072212	0.1316158487124319	0.0256421043999999	0.1274994858396184	0.0267708808592568	0.0075146515860704	-0.0006912194959642	0.0346223617820512	0.0007617193520074	0.0337906304853669	0.4838265957115736	0.1959361105385748	-0.0107437544304795	0.1042508235265405	0.0126973027199798	0.100093670921658	0.0130131848551052	0.0056286842314013	-0.0003436180829884	0.030828277190428	0.0003777516298209	0.0299160975104939	-0.0076951005715826	0.2631350470628091	0.0088320418261599	0.2587988864434932	ARHGEF7	93856	ANKRD10	105635	TEX29	295481	True	True	True	ref	100	0.00438	-20	0.005173
1141	chr13	111020707	C	G	rs9559932	-0.0386053373999999	0.0581651197490505	0.0386053373999999	0.0550090928050217	0.0209873945239197	0.023506654154288	-0.0008957429905186	0.0215759609985496	0.0008957429905186	0.0206271900824886	0.4819780288177263	0.1988261243113126	-0.0188317008482069	0.0515349765657527	0.0188317008482069	0.0478329715511305	0.0101510653166894	0.0136796141045616	-0.0004376058838509	0.0204524475390222	0.0004376058838509	0.0192821324156633	-0.0141827197377565	0.1401139111972676	0.0141827197377565	0.1360224359731707	ARHGEF7	93853	ANKRD10	105638	TEX29	295478	True	False	False	ref	100	0.004807	65	0.0102
1142	chr13	111022866	T	C	rs9559934	0.00238081182	0.7329943081345245	0.0027916181799999	0.740625460741787	0.0331041126394716	0.0024914172179663	7.5650443996867e-05	0.3765605089255946	9.231595141866283e-05	0.3834789826610721	0.0930030394506166	0.8346078064764649	0.0002538868736321	0.8094700714932123	0.000279519921088	0.8170926326853335	0.0030358726351402	0.3951477196664394	8.157141274146312e-06	0.5970731778623951	9.197017488029256e-06	0.6049222126164134	0.0019585265407317	0.6142537394633264	0.0023319743980746	0.6219328866654378	ARHGEF7	91694	ANKRD10	107797	TEX29	293319	False	True	True	alt	100	0.01079	100	0.0758
1143	chr13	111033938	G	A	rs34061305	-0.00920623598	0.2897905473880247	0.01331250278	0.282273208812842	0.0162493817622228	0.0583932930859538	-0.0001886416074829	0.1592754258905581	0.000233104068969	0.1540308600766216	0.4023838421560389	0.3298979855000956	-0.0037804389883463	0.2438406657871401	0.0053377270081027	0.2359361572740364	0.0065237168782838	0.0613387381352001	-7.630702096474436e-05	0.1459690732903009	9.316926154267608e-05	0.1397093072769367	-0.0040228633077106	0.2991433829751441	0.0066452971503852	0.2937116259676342	ARHGEF7	80622	ANKRD10	118869	TEX29	282247	False	False	False	ref	5	0.000412	-95	0.02655
1144	chr13	111034262	T	G	rs9522088	0.0413451506	0.043794857943649	0.0413451506	0.0469726589325036	0.0111063651655969	0.2162746247624042	0.0004608402648467	0.0444641556400081	0.0004608402648467	0.0472632084513508	0.3199887965642797	0.4614988116084397	0.0132647293094893	0.0770515132164951	0.0132647293094893	0.0831236577068049	0.0035810305081547	0.3097282195130933	0.0001490534922286	0.0684041187029101	0.0001490534922286	0.0733650430679037	0.0312741833421508	0.0211145765253228	0.0312741833421508	0.0216628719469227	ARHGEF7	80298	ANKRD10	119193	TEX29	281923	False	False	False	alt	100	0.00127	-90	0.04868
1145	chr13	111038211	T	C	rs9515358	0.01101871588	0.2790348343550446	0.01341955892	0.2879286620669882	0.0117777079631893	0.1908409529332234	0.0001042522743025	0.2415876138310109	0.0001466804233892	0.2485490474711019	0.4920320750215251	0.1863485881849382	0.0051900866525373	0.1957425131533625	0.0064423484975876	0.2040744631402197	0.005865155830216	0.0958796712937105	4.9124488338405845e-05	0.1699728202618762	7.125469471223622e-05	0.1763842630307433	0.0037718233591634	0.4019790946979082	0.0045477650183092	0.4094988960962926	ARHGEF7	76349	ANKRD10	123142	TEX29	277974	False	False	False	alt	80	0.003223	-90	0.05157
1146	chr13	111054544	C	T	rs9559947	0.00720900496	0.4745238144513938	0.00720900496	0.4874123474553274	0.0216979080969296	0.0185359828249212	0.000157810880155	0.2485147198494225	0.000157810880155	0.25803100296947	0.1218643346922685	0.789590532976574	0.0009589337650433	0.628661238203522	0.0009589337650433	0.6423740699579962	0.0026893203937445	0.4689581668493122	2.1574619313213587e-05	0.4434571576682182	2.1574619313213587e-05	0.4561809325518541	0.0064046307534309	0.3321605141174272	0.0064046307534309	0.3411409604504303	ARHGEF7	60016	ANKRD10	139475	TEX29	261641	False	True	False	alt	-25	0.0009613	5	0.01486
1147	chr13	111059584	G	A	rs1888848	-0.0733206429999999	0.0069579314427095	0.0733206429999999	0.0066786501435177	0.019185877162268	0.0355915014234695	-0.0015793648807074	0.0081096391612308	0.0015793648807074	0.0077215053173577	0.4931358209110053	0.18654221244909	-0.0362533525895509	0.0087061076726946	0.0362533525895509	0.0080833668968739	0.009496683373604	0.0220338687112686	-0.0007835272145453	0.0080584266862023	0.0007835272145453	0.0076081410523683	-0.025411051981867	0.0367010882794567	0.025411051981867	0.035766219702825	ARHGEF7	54976	ANKRD10	144515	TEX29	256601	False	True	True	ref	-10	0.003738	85	0.0697
1148	chr13	111059590	C	G	rs1888847	-0.0188038826	0.1406810833955869	0.0233407221999999	0.136676329621461	0.0185497002691395	0.0365902465299374	-0.0003789654749355	0.0769176364775993	0.0004386250617854	0.0742860169992474	0.4934822975342068	0.1861011388217264	-0.0092002924827463	0.1131372939364535	0.0114468514417848	0.1089245340336317	0.0091583051830207	0.0185745597093753	-0.0001856199655486	0.0605153690146731	0.0002151622883764	0.0578497340354868	-0.0066349235987924	0.2565852318048983	0.0082200022821813	0.2523951456851374	ARHGEF7	54970	ANKRD10	144521	TEX29	256595	False	False	False	ref	-20	0.006668	80	0.07007
1149	chr13	111059715	G	A	rs1810895	-0.0001991385799999	0.6153305726492468	0.00473396782	0.6171032960611322	0.00776797023327	0.6105330151303845	-5.979625901000715e-06	0.635967990343824	3.816726740174607e-05	0.6375502628862717	0.4778763265179099	0.2113400483859952	-8.943851141997995e-05	0.435810050770898	0.0022698490258115	0.4378597202885924	0.0037113260943406	0.2904157125480253	-2.824599519404487e-06	0.4612281778054308	1.8296736796008667e-05	0.4630376501610836	3.7344785734300025e-05	0.7049692268060417	0.001651469413583	0.7075785894492974	ARHGEF7	54845	ANKRD10	144646	TEX29	256470	False	False	False	ref	-25	0.0029	-45	0.07715
1150	chr13	111060764	A	G	rs75592562	0.0084675552599999	0.4116450066856997	0.0084675552599999	0.4237819762322558	0.007088365939874	0.7263800192160179	6.456329606448017e-05	0.4828485839968962	6.456329606448017e-05	0.4948256026483904	0.1860662455004719	0.6807940710154279	0.0015962323883847	0.495419550771501	0.0015962323883847	0.508690080785886	0.0013414995821896	0.7342575428317691	1.2446406995253216e-05	0.5382364946941636	1.2446406995253216e-05	0.5514858694649268	0.0077718648533697	0.2492697767472883	0.0077718648533697	0.2568112121362584	ARHGEF7	53796	ANKRD10	145695	TEX29	255421	False	False	False	alt	-10	0.00029	-60	0.004456
1151	chr13	111060796	C	A	rs74241867	0.0239623566399999	0.1529054502144213	0.0239623566399999	0.1608124224680033	0.0082582405431445	0.5385965922669431	0.0002183460581537	0.1751167291341731	0.0002183460581537	0.1830685782502885	0.2145333457815952	0.633859306421382	0.0056417989431435	0.2368774712907287	0.0056417989431435	0.2483402508751686	0.0018203378830439	0.6392165130791945	5.175739568096243e-05	0.2492809754986824	5.175739568096243e-05	0.2601533387887911	0.0234815713855952	0.0652627500173374	0.0234815713855952	0.0669365602704151	ARHGEF7	53764	ANKRD10	145727	TEX29	255389	False	False	False	alt	-40	0.02797	-90	0.03226
1152	chr14	20679686	A	G	rs2319380	0.0291713082	0.097125346686918	0.0291713082	0.1033099083393526	0.0114896370558898	0.1952032989126162	0.000339089486914	0.0755581658909347	0.000339089486914	0.080224946101159	0.1009927488874365	0.8233076103585775	0.0029249214530579	0.3494370063774117	0.0029249214530579	0.3617657123342547	0.0011901205806109	0.7616537275712134	3.470582436582847e-05	0.2964410290593432	3.470582436582847e-05	0.307516204946251	0.0233716117387109	0.0471430027614969	0.0233716117387109	0.0483943442527655	ANG	4492	RNASE4	4875	ENSG00000259171	4902	False	False	False	alt	-40	0.04956	95	0.03023
1153	chr14	20680160	C	A	rs10146921	0.01728064474	0.1838737536148393	0.02093177966	0.1893211240010682	0.0163591422691633	0.0686167006633139	0.0003949858878179	0.0882348486717462	0.0004280081787276	0.0907727276935006	0.3215821740889428	0.4602323096994244	0.0061020800954855	0.2000657016839717	0.0071712362772928	0.2061864365651382	0.0054632384326711	0.1203839134227935	0.0001413614051851	0.1121235889439061	0.0001510839573971	0.1158853101385867	0.0128217097687735	0.1316961034084386	0.0153487069367939	0.1323865466754289	ANG	4018	RNASE4	4401	ENSG00000259171	4428	False	False	False	alt	-15	0.0003586	-95	0.0696
1154	chr14	20681949	G	A	rs12587456	-0.0649769899999999	0.0113631247379264	0.0649769899999999	0.0107225372382446	0.0144320217560291	0.0967512325289221	-0.0010044724774408	0.0148937808075835	0.0010044724774408	0.0141133089001296	0.6584632620670339	0.0181569941017787	-0.0428823200984146	0.0051275674181351	0.0428823200984146	0.0047993834231905	0.0095408422092993	0.0191711174988038	-0.0006653931763368	0.0090400272309496	0.0006653931763368	0.0085178208059967	-0.0061369931223352	0.3197383960855553	0.0061369931223352	0.3108297758043157	ANG	2229	RNASE4	2612	ENSG00000259171	2639	False	True	False	ref	-35	0.003998	95	0.07117
1155	chr14	28990775	G	A	rs60652177	-0.00295243808	0.7274091335272574	0.00295243808	0.7136165939759831	0.0067996743876227	0.8239977008407067	-1.977429460161776e-05	0.7779266224575933	1.977429460161776e-05	0.7642079475775928	0.0817228394485419	0.857816105366253	-0.0002245215889917	0.8468810732146045	0.0002245215889917	0.8325997392199709	0.0005638410351688	0.8863666803664515	-1.5309573172006662e-06	0.8702869071985666	1.5309573172006662e-06	0.8559115456000047	-0.0023236755568003	0.620912646697622	0.0023236755568003	0.608511902685593	FOXG1	226445	PRKD1	1201123	G2E3	1568384	False	False	False	ref	100	0.001011	60	0.02158
1156	chr14	29000167	T	C	rs10148671	0.032221158	0.0820779981741456	0.032221158	0.0873805915877228	0.0083235962963405	0.5227556891587791	0.0002798872250491	0.1100220188473608	0.0002798872250491	0.1158663394272129	0.1046670608616271	0.815144924768757	0.0035073400975617	0.3142778355232251	0.0035073400975617	0.3262617842895816	0.0008702451952652	0.8228321979853164	3.016825471669209e-05	0.3304595078039842	3.016825471669209e-05	0.3418859928006244	0.0276164690505087	0.0354578054887881	0.0276164690505087	0.036483312131572	FOXG1	235837	PRKD1	1191731	G2E3	1558992	False	False	False	alt	-80	0.00099	40	0.05304
1157	chr14	29001268	C	T	rs1886456	0.0003934401459999	0.7333204796239884	0.003038925534	0.7295616421414133	0.0083447915015344	0.5266754901059949	4.8633496170835365e-06	0.7334625661506005	2.5830090780635428e-05	0.7299398209019223	0.1960144814780235	0.6620289399877088	0.0001733734341762	0.7287036029328615	0.0005660849595988	0.7247904795542222	0.0016464601933144	0.6680752404075526	1.7523414120909498e-06	0.7314649779632075	4.923386309680504e-06	0.7274610436557739	0.0004502121391301	0.580632765765659	0.0027116463863732	0.5779510305993161	FOXG1	236938	PRKD1	1190630	G2E3	1557891	False	False	False	alt	-30	0.001646	70	0.0487
1158	chr14	29071661	A	G	rs12882564	0.0361847812	0.0589975728668681	0.0361847812	0.0631320520322809	0.0100750961964565	0.3078090090201856	0.0003811615146353	0.0665675519066013	0.0003811615146353	0.0707063769599623	0.1686366041141505	0.7099994711735012	0.00620187743097	0.1922599576827608	0.00620187743097	0.2026299601388146	0.0017262629002171	0.6503956280317877	6.661270448903475e-05	0.1773645525369694	6.661270448903475e-05	0.1865282672214296	0.0347410242844842	0.0137586365672867	0.0347410242844842	0.0141672825261485	FOXG1	307331	PRKD1	1120237	G2E3	1487498	False	False	False	alt	-45	0.005062	50	0.03296
1159	chr14	29256150	A	C	rs1956235	0.0120877013	0.2905313336543441	0.0120877013	0.3013740385957362	0.0070722524942012	0.7800765557918756	8.491050601746095e-05	0.3665315423347933	8.491050601746095e-05	0.3772661448743986	0.2101162875133559	0.6375895130468318	0.0025714518028978	0.3816227664883747	0.0025714518028978	0.3946908506273607	0.0014777585284485	0.6986174531001755	1.7974410474916113e-05	0.4309808717398151	1.7974410474916113e-05	0.4437986143139449	0.0108092407597588	0.1566917646835229	0.0108092407597588	0.1616165862032079	FOXG1	491820	PRKD1	935748	G2E3	1303009	False	False	False	alt	0	0.0	5	0.001099
1160	chr14	29262456	A	T	rs4636809	-0.0091925425	0.3953405102963232	0.0091925425	0.3836750175117145	0.0229753933835977	0.014244346191956	-0.0002145287653109	0.1715302388441466	0.0002145287653109	0.1640818732508601	0.207722071805724	0.6444263935146264	-0.0020582839601894	0.4623300188723768	0.0020582839601894	0.449333697033118	0.0048397822093842	0.1569628173800182	-4.843439240088124e-05	0.2607315598968817	4.843439240088124e-05	0.2504083249218595	-0.0085519559331527	0.2433926851444785	0.0085519559331527	0.2363431551895889	FOXG1	498126	PRKD1	929442	G2E3	1296703	False	True	False	ref	-85	0.00841	75	0.01785
1161	chr14	29531826	A	T	rs1191547	0.0114907143	0.3053742680964075	0.0114907143	0.3165107418686695	0.0114386692071093	0.1996184459863483	0.000129474003714	0.2594513110207971	0.000129474003714	0.268775209943864	0.3126941150841813	0.475066946854851	0.0036597329792253	0.3024211590041709	0.0036597329792253	0.3142548437497963	0.0036034688943202	0.3182138674957327	4.1612048545650593e-05	0.2561562576654707	4.1612048545650593e-05	0.2667242670427724	0.0082594217782341	0.2271685219859088	0.0082594217782341	0.2345128002295401	PRKD1	660072	FOXG1	767496	G2E3	1027333	False	False	False	alt	40	0.002428	40	0.0311
1162	chr14	29601703	G	T	rs3783301	-0.01161998448	0.3413183745488969	0.01161998448	0.3297908364703849	0.0074120762763231	0.6982900731545464	-8.728903865184679e-05	0.4023350422525492	8.728903865184679e-05	0.3912589851538513	0.3069907364184276	0.4872785319362554	-0.0036588463947457	0.3356230595716082	0.0036588463947457	0.3232226675085496	0.0022853986103471	0.5571920482356623	-2.754131644059141e-05	0.3784187923889332	2.754131644059141e-05	0.3664040061089699	-0.008734530441187	0.2373406104054748	0.008734530441187	0.2310041588287644	PRKD1	590195	FOXG1	837373	G2E3	957456	False	False	False	ref	15	0.001045	-95	0.0671
1163	chr14	29614498	T	G	rs10149921	-0.00536668058	0.5826700558684215	0.00536668058	0.5698023886277432	0.019867909490123	0.0279370052019997	-0.0001187309538875	0.3538179807865773	0.0001187309538875	0.3431949553332462	0.0994844344858349	0.8190081928210161	-0.0005858446462424	0.730257058071542	0.0005858446462424	0.7164162595384114	0.0019818720166687	0.5868027986106715	-1.3138828120785093e-05	0.5745155251441398	1.3138828120785093e-05	0.5613802028257179	-0.0046162304588221	0.4473711569404405	0.0046162304588221	0.4366828367430777	PRKD1	577400	FOXG1	850168	G2E3	944661	False	False	False	ref	85	0.012024	-90	0.02762
1164	chr14	29678684	C	A	rs7158984	0.0014571744599999	0.807825472016695	0.0018465025	0.8158728051477473	0.0253661863603673	0.0089840915337072	3.906732677293152e-05	0.5277504875143619	4.7382302664844645e-05	0.5356387941990418	0.1522214960736107	0.7371606888873513	0.0002292361884174	0.7918881621671968	0.0002847887065214	0.8002016558312686	0.003856361682573	0.2686636494340079	6.103000022026675e-06	0.6154502134176949	7.289448983045616e-06	0.6240085641328995	0.0016120499175302	0.6603457413918382	0.0018817622589445	0.6682107103977145	PRKD1	513214	G2E3	880475	FOXG1	914354	False	True	True	alt	-45	0.00344	-85	0.03726
1165	chr14	29695765	C	T	rs10150918	0.00087450464	0.6691702253755729	0.00400439456	0.6690421965551958	0.0120226108639188	0.1649525539288215	1.162432889575825e-05	0.562186354760874	5.143105094694068e-05	0.5620739941307996	0.1518833182916835	0.7376330532090886	1.8903137350500004e-05	0.7229041986618844	0.0005540000488097	0.7216402521331904	0.0018300859433704	0.6406736687795003	1.9691478023613908e-07	0.6596081827024562	7.100110028452476e-06	0.6583220207469889	0.0002593387898215	0.5022109095413471	0.0033797031089533	0.501550000900132	PRKD1	496133	G2E3	863394	SCFD1	926527	False	False	False	alt	80	0.01675	-80	0.04245
1166	chr14	29700781	T	G	rs959388	0.0327827247999999	0.0732354644144015	0.0327827247999999	0.0782476519999399	0.0122562671060071	0.1557223507634567	0.0004010221651832	0.0552116560134768	0.0004010221651832	0.05877441601607	0.5418105996950175	0.107276592112829	0.0176054236308652	0.0480940919700368	0.0176054236308652	0.0523458334405984	0.0066175465003265	0.056627221295458	0.000214480601762	0.0399677343735434	0.000214480601762	0.0431152019809551	0.0077946866668741	0.2369667811772469	0.0077946866668741	0.243988355740974	PRKD1	491117	G2E3	858378	SCFD1	921511	False	False	False	alt	95	0.1288	85	0.4343
1167	chr14	29705233	T	C	rs7140901	-0.00615669352	0.5180110524247475	0.00615669352	0.5054217636661645	0.0173317177678984	0.048597127253889	-0.0001030523993495	0.3307216514621899	0.0001030523993495	0.3206508987916669	0.174806792601583	0.6980850034630692	-0.0010632342375256	0.6000812390997792	0.0010632342375256	0.5865354763841837	0.003162655732911	0.3756715801728215	-1.856558110361711e-05	0.4522399745514661	1.856558110361711e-05	0.4397952763033706	-0.0059544186143009	0.3336313917845152	0.0059544186143009	0.3244765077500451	PRKD1	486665	G2E3	853926	SCFD1	917059	False	False	False	ref	-60	0.002205	100	0.02412
1168	chr14	32737301	T	C	rs17440692	-0.0043100757	0.6118022142762646	0.0043100757	0.5985543087316272	0.0228608372912088	0.0145207184931963	-9.29206576514234e-05	0.3664817079072641	9.29206576514234e-05	0.3554601977228255	0.169375200987562	0.7070878067082638	-0.0007356922578318	0.6742723432789623	0.0007356922578318	0.6602043768331479	0.0038328925619037	0.2745016879821423	-1.5760816905769075e-05	0.488039333939747	1.5760816905769075e-05	0.4749989500725491	-0.0043568916690006	0.4419588263221407	0.0043568916690006	0.4316155978472979	NPAS3	197096	AKAP6	408002	ARHGAP5	661186	False	True	False	ref	85	0.006653	85	0.02109
1169	chr14	32741769	T	G	rs73266980	0.000613840494	0.8409392080185345	0.001718785666	0.8484468868793247	0.0194400820882325	0.029535775465346	9.828353305119364e-06	0.6698971403750411	3.481809977578662e-05	0.6750381796406862	0.124609176443739	0.7837953541778423	9.343791931123372e-06	0.8486350967160547	0.0002526823079681	0.8532856512265675	0.0025198904846556	0.4863840849720933	-2.3425050853042179e-07	0.7453713709532713	5.278143386213652e-06	0.7498346399358687	0.0003547754644757	0.739566606058203	0.0014543719333187	0.7439570968547303	NPAS3	192628	AKAP6	412470	ARHGAP5	665654	False	False	False	alt	-60	0.005264	70	0.0437
1170	chr14	32833853	A	T	rs12882859	-0.0087409114	0.4052129006560054	0.0087409114	0.3934977155753057	0.0194562627859837	0.0303561420811493	-0.0001697006960365	0.2157777397524864	0.0001697006960365	0.2072159420408336	0.0614695173186443	0.8897959689643063	-0.0005441007402474	0.7351285841295774	0.0005441007402474	0.7213079307087307	0.0012919355604807	0.7223930311767836	-1.1456926541516884e-05	0.579099736687469	1.1456926541516884e-05	0.5659032874270071	-0.0055560742331351	0.3674326619450132	0.0055560742331351	0.3578665015459648	NPAS3	100544	AKAP6	504554	ARHGAP5	757738	False	False	False	ref	-70	0.002533	-100	0.0182
1171	chr14	32836003	C	G	rs12894833	0.0396383874	0.0456336260428668	0.0396383874	0.0485988419867349	0.0150824561876449	0.0856673163734252	0.0007185331456959	0.0342049404744237	0.0007185331456959	0.0361376246557397	0.4457660349173746	0.2618703488822373	0.0175026326557241	0.0481259902301196	0.0175026326557241	0.0523043127643236	0.0066751835447334	0.0687358647892661	0.0003139586886051	0.0329047006219294	0.0003139586886051	0.0352476487666464	0.0174773597236485	0.0700782520129751	0.0174773597236485	0.072093980679418	NPAS3	98394	AKAP6	506704	ARHGAP5	759888	False	False	False	alt	-55	0.002934	-80	0.02905
1172	chr14	32836293	T	G	rs12896446	-0.0133076391999999	0.2890565007082897	0.0133076391999999	0.2783544884455414	0.007938170466652	0.5966624961792764	-0.0001079253062353	0.3229407076011104	0.0001079253062353	0.3126862610840213	0.3822031348872913	0.3647924712572341	-0.0050846555410408	0.2509986249147386	0.0050846555410408	0.2400823305566234	0.0030190995495865	0.4178490874059888	-4.098245759621505e-05	0.2740250673947297	4.098245759621505e-05	0.2635340893592099	-0.0083527837425699	0.2575032202302583	0.0083527837425699	0.2501439534439068	NPAS3	98104	AKAP6	506994	ARHGAP5	760178	False	False	False	ref	-100	0.002764	-50	0.005646
1173	chr14	32839824	T	G	rs7140259	-0.0096205559399999	0.3724029649928833	0.0096205559399999	0.3608862339618738	0.0210189848792035	0.0216054195092128	-0.000203513733409	0.1759888505556177	0.000203513733409	0.1683671193144777	0.0876648098009315	0.8444253370100817	-0.0008540091896031	0.6446932475105579	0.0008540091896031	0.6310120664153569	0.0018995437933522	0.6185310716265973	-1.859045148094088e-05	0.4549580839019504	1.859045148094088e-05	0.442573449648428	-0.0079855600161826	0.2531845612669367	0.0079855600161826	0.2457001031459032	NPAS3	94573	AKAP6	510525	ARHGAP5	763709	False	False	False	ref	100	0.001452	-100	0.02838
1174	chr14	32840087	C	A	rs7161135	0.0009147721799999	0.856581284987633	0.00151319002	0.8579517501459863	0.0301316280869212	0.0038355824273919	2.7798373943370664e-05	0.5711104351981022	4.461839800053575e-05	0.5736094143181513	0.0988910673347233	0.8252313102952765	0.000130866450831	0.870000078672309	0.0001657864346523	0.8715929274868055	0.0030546994634607	0.3767404737594166	3.969422570195634e-06	0.7131680154845443	4.97967031642814e-06	0.7153406856034589	0.0008796771750744	0.7532085212900557	0.0013278146038858	0.7551449012014227	NPAS3	94310	AKAP6	510788	ARHGAP5	763972	False	True	True	alt	40	0.02667	60	0.01662
1175	chr14	32870195	T	C	rs12434588	-0.00348532058	0.6921132922139119	0.00348532058	0.678691510984389	0.0088000700565889	0.4523001087981948	-3.0653218465540295e-05	0.6868553399658996	3.0653218465540295e-05	0.6737782768716033	0.0128590545545078	0.9752320031505468	-3.835990390322192e-05	0.9676173607855229	3.835990390322192e-05	0.9535219312555778	0.0001153005403515	0.9742851493860542	-3.446607708128285e-07	0.9662868561105368	3.446607708128285e-07	0.9521195246736792	-0.0006618325916243	0.8788184878314143	0.0006618325916243	0.8649910744458558	NPAS3	64202	AKAP6	540896	ARHGAP5	794080	False	False	False	ref	95	0.002842	100	0.03864
1176	chr14	33186914	A	G	rs12887688	-0.0286155452	0.0636640997283271	0.0391850052	0.0621546087803336	0.0193764787198452	0.035503909833162	-0.0008508597312847	0.0362803062053502	0.0009696899270146	0.0355222252069041	0.2090457369889728	0.6278086699275712	-0.0062300015350039	0.1625467237916454	0.0092694106485251	0.158662166192995	0.0042081544524106	0.1987714735265292	-0.0002017422852476	0.0840717695990138	0.0002359137170657	0.0821585161283632	-0.0287824562495461	0.0228650889216949	0.0355875060944615	0.0227014108297924	NPAS3	252517	AKAP6	857615	ARHGAP5	1110799	True	False	False	ref	-50	0.00412	-65	0.00659
1177	chr14	35006989	A	G	rs10133628	-0.01127334982	0.3421470662995073	0.01127334982	0.3307519140437342	0.0095813154844137	0.3491807895024154	-0.0001130978507195	0.3328986256993224	0.0001130978507195	0.3225970081629152	0.0225832218176536	0.9519486541238482	-0.0001799902478566	0.860482962643755	0.0001799902478566	0.8461019028155891	0.0001861173583286	0.954368875197866	-1.6251686023732323e-06	0.8570431596347805	1.6251686023732323e-06	0.8426312526892258	-0.0028796979221775	0.5589738982701367	0.0028796979221775	0.547010440781167	SRP54	25031	FAM177A1	38129	PRORP	114858	False	False	False	ref	85	0.005203	-55	0.010056
1178	chr14	35007770	T	C	rs72474105	-0.00284422942	0.7324174695273857	0.00284422942	0.7187222913722962	0.0173320138373775	0.0511872178126182	-5.2139678623312e-05	0.521129412884266	5.2139678623312e-05	0.5090112129524335	0.1548045104202325	0.7175290686315826	-0.0004681597709555	0.7417062596112568	0.0004681597709555	0.7275628228666238	0.0029105107290713	0.366921928538663	-9.04193116698665e-06	0.6045775154799571	9.04193116698665e-06	0.590897675273612	-0.0026120602910818	0.5901319033450264	0.0026120602910818	0.5778430732159021	SRP54	25812	FAM177A1	37348	PRORP	114077	False	False	False	ref	-95	0.0582	95	0.02808
1179	chr14	51182363	G	A	rs61985092	-0.032259916	0.0912945989707229	0.032259916	0.0860637123695271	0.0103410617734925	0.276662931123794	-0.0003398526173124	0.0893948263475464	0.0003398526173124	0.0845876790530202	0.2276953080426145	0.6129501432231104	-0.0073722482847632	0.183847946525691	0.0073722482847632	0.1741871124869259	0.0023933885965346	0.5341084664918189	-7.867204661866383e-05	0.1672417100216557	7.867204661866383e-05	0.1587862711249348	-0.0297119264722662	0.0274457549121988	0.0297119264722662	0.0267377563960592	TMX1	57800	TRIM9	86302	PYGL	237880	False	False	False	ref	35	0.0001545	40	0.04025
1180	chr14	51241212	T	C	rs75682793	0.0505756126	0.023458621623269	0.0505756126	0.0252023409192095	0.0112500372440043	0.2070492016935441	0.0005775272182298	0.028796896271187	0.0005775272182298	0.0307663997392488	0.5012043693399308	0.1682430064404088	0.0255045328839374	0.0216235117050392	0.0255045328839374	0.0236598351434419	0.0056434745586896	0.0992266972336154	0.0002913333184375	0.0254827797347262	0.0002913333184375	0.0275859871258126	0.0160873038102054	0.0929699616316952	0.0160873038102054	0.0957385335424897	TMX1	1049	TRIM9	145151	FRMD6	247889	False	False	False	alt	85	0.00679	-75	0.04895
1181	chr14	59450826	T	G	rs112261101	0.0254311212	0.1225926455624793	0.0254311212	0.1296166083569208	0.0091841603667201	0.3986080040307805	0.0002453684686156	0.1297780070762931	0.0002453684686156	0.1363256796719005	0.08731833317773	0.8456791630112153	0.0023360163898011	0.4012025831075416	0.0023360163898011	0.4141177244363659	0.0008310013504957	0.8308819356923428	2.337176393654718e-05	0.3890736420807991	2.337176393654718e-05	0.4012300142128447	0.0209027064596105	0.0621966569944657	0.0209027064596105	0.064035861734156	GPR135	14554	L3HYPDH	33582	JKAMP	33618	False	False	False	alt	-100	0.02534	20	0.01011
1182	chr14	59452013	C	T	rs113869004	0.00317598458	0.6939207989061091	0.00317598458	0.7073449531549677	0.0098887306765959	0.3234557238626618	3.210192975530701e-05	0.6439723371656798	3.210192975530701e-05	0.656992880817628	0.0581043371819209	0.8970852650064093	0.0001893097125245	0.8392374159643673	0.0001893097125245	0.8533576565126312	0.0006073223826621	0.8743223148524992	2.020623476007787e-06	0.8184757506257778	2.020623476007787e-06	0.8325888296189297	0.0021805205448188	0.6199469861859306	0.0021805205448188	0.6326423761547628	GPR135	13367	L3HYPDH	32395	JKAMP	32431	False	False	False	alt	-45	0.01191	-95	0.03882
1183	chr14	59453473	T	C	rs111476301	-0.0037328221043	0.6778965387316713	0.0037378439757	0.6675008276027731	0.0064370529400548	0.8656795748197137	-2.426557759010292e-05	0.7383052697944898	2.4297651580526867e-05	0.7284528612074351	0.1652776481083828	0.7165569696773189	-0.0005444731821641	0.7391084195281551	0.0005454768896331	0.7286893123154907	0.0010656314857176	0.7860077784209022	-3.5443781568248075e-06	0.7784573353109628	3.550788696078307e-06	0.7682690086505313	-0.0036618637122791	0.5219046912139312	0.0036618637122791	0.5124726263691892	GPR135	11907	L3HYPDH	30935	JKAMP	30971	False	False	False	ref	0	0.0	55	0.0193
1184	chr14	59473086	G	A	rs1046701	-0.0241278799	0.1487952513410288	0.0241278799	0.1413832142580118	0.0096102295852496	0.3431385619711692	-0.0002394721121998	0.1464250297473707	0.0002394721121998	0.1398895460197466	0.0720505399433603	0.8728289867846075	-0.0017433069256898	0.4994808293095926	0.0017433069256898	0.4860791676259151	0.0007052658392544	0.8563139656273343	-1.752161210411996e-05	0.4739111603102814	1.752161210411996e-05	0.4612546611118177	-0.0169815039575099	0.0956130087201106	0.0169815039575099	0.0929528265690576	GPR135	7706	L3HYPDH	11322	JKAMP	11358	False	False	False	ref	-75	0.00843	10	0.006042
1185	chr14	59480112	T	C	rs1253099	-0.00540515782	0.4608701360787698	0.0077895069799999	0.4568730874962596	0.0073015180579264	0.7103306327340713	-4.2182266969931456e-05	0.5181831529533474	5.9003995308997415e-05	0.5146369898434181	0.2747559621987779	0.538024439317577	-0.0014761606320663	0.457841219963871	0.0021428703196423	0.4544546228454285	0.0019967932167711	0.6052536621340836	-1.1453260859121276e-05	0.4972625656473433	1.615674257742146e-05	0.4941594818294475	-0.0038133175655348	0.3316974687632406	0.0059959128206723	0.3293131539803068	L3HYPDH	4296	JKAMP	4332	GPR135	14732	False	False	False	ref	5	0.001957	50	0.01666
1186	chr14	59481143	C	T	rs1253102	-0.000829994046	0.7474279718669364	0.002857680166	0.7394662109345005	0.0079929029070403	0.5901036556888569	-5.549676631085494e-06	0.7596859725852538	2.279876143429733e-05	0.7517939386555654	0.2573304702330937	0.5651373446180956	-0.0002977219701433	0.6766091569327572	0.0007381593170392	0.6677070263252038	0.002048276960637	0.5944839905229885	-2.099615206619857e-06	0.6907387490364393	5.846319909930604e-06	0.6819484033075218	-0.0005933671511114	0.6261347648702807	0.002315376715526	0.6189193894164294	L3HYPDH	3265	JKAMP	3301	GPR135	15763	False	False	False	ref	100	0.002884	-70	0.0601
1187	chr14	59530395	A	G	rs111758996	0.009737267868	0.3782158754752694	0.009737267868	0.3905796093353242	0.01142593055478	0.1922185439985139	0.0001175465552634	0.3149052562462513	0.0001175465552634	0.3255128593451496	0.138557453915497	0.7569070679930097	0.001446531148339	0.5253253396560501	0.001446531148339	0.5393761467645976	0.001593997496312	0.6799222756368393	1.7510098083730977e-05	0.4626430013147489	1.7510098083730977e-05	0.4757926320310084	0.0093444952748471	0.2338986247682464	0.0093444952748471	0.2401212560988843	JKAMP	45951	L3HYPDH	45987	CCDC175	46417	False	False	False	alt	-55	0.01018	100	0.03137
1188	chr14	70892347	G	T	rs2526886	0.0066473119	0.4661861433908104	0.0066473119	0.4785759881188689	0.0232439763547335	0.013736202648582	0.0001557774856672	0.2157809958194899	0.0001557774856672	0.2247726520100809	0.1108870423967053	0.8017528677897865	0.0007192776277117	0.6414154362089518	0.0007192776277117	0.6552705266331522	0.0025417833870932	0.4975585190336323	1.6619926697725356e-05	0.4368415403891882	1.6619926697725356e-05	0.4494645382319016	0.005987613979398	0.3107273795250187	0.005987613979398	0.3197337218615687	PCNX1	15059	MAP3K9	82813	TTC9	250430	False	True	False	alt	-65	0.02621	50	0.01685
1189	chr14	70917131	T	C	rs2810073	-0.002283761048	0.7397187492599778	0.002588090088	0.7300090787142804	0.0155535446703002	0.0724983409473724	-4.1805841248069785e-05	0.5914668420076736	4.585181989293912e-05	0.5823174793775279	0.1957509932675649	0.6668273159660979	-0.0004436998468398	0.7445298091980722	0.000495679408279	0.7349931002900901	0.0030515299236881	0.414914394781946	-8.12970796314543e-06	0.6345213870078418	8.820763247824457e-06	0.624901305181314	-0.0023547962115789	0.5969205041518438	0.0026701521800018	0.588300626237304	PCNX1	9725	MAP3K9	107597	TTC9	275214	False	False	False	ref	95	0.002022	-45	0.04077
1190	chr14	70921681	T	A	rs2189806	0.00186256755	0.7799489348071832	0.00213181761	0.7896883085113151	0.0177811085271652	0.0449666493802826	3.853719465696897e-05	0.5827744825150761	4.1998214996629095e-05	0.5924226681047551	0.0238404962707081	0.9576890451972152	5.465013159617325e-05	0.927887268806688	5.799344761835091e-05	0.9379374392835236	0.0004708019275116	0.903326651058684	1.1769858588313117e-06	0.8767889933963492	1.2199618372810173e-06	0.8864138055950928	0.0008547806512515	0.8104208369612304	0.0009128725401715	0.8201035944496473	PCNX1	14275	MAP3K9	112147	TTC9	279764	False	False	False	alt	-100	0.005836	-55	0.01884
1191	chr14	70936594	T	C	rs2332477	0.0392773544	0.0508905669491696	0.0392773544	0.0544576193728577	0.0084046413630599	0.5105087045420501	0.0003306130144576	0.0794065941890817	0.0003306130144576	0.0841816036152027	0.0903494849531633	0.8379000210813143	0.0034952288068868	0.3093306560227991	0.0034952288068868	0.3212781873930602	0.0007735345897534	0.8372116042853612	2.984719430572632e-05	0.3221108151808918	2.984719430572632e-05	0.3335411404397351	0.029446363551489	0.0267374347157247	0.029446363551489	0.0274355093322797	PCNX1	29188	MAP3K9	127060	TTC9	294677	False	False	False	alt	15	0.0008125	85	0.0413
1192	chr14	70940939	A	G	rs2097866	0.0760420393999999	0.0057028708282601	0.0760420393999999	0.0059908426451103	0.0232943743433341	0.0158388663895722	0.0019211346769499	0.0053414265223093	0.0019211346769499	0.0055335380179566	0.2674218612226268	0.5467031968929841	0.0207089647665789	0.0350096254932507	0.0207089647665789	0.0380434461570403	0.0064269392515275	0.0614281612334205	0.0005318012764795	0.0128176953414425	0.0005318012764795	0.0135399957416021	0.0667890745754623	0.0011523401093506	0.0667890745754623	0.0011883820024705	PCNX1	33533	MAP3K9	131405	TTC9	299022	False	True	True	alt	-15	0.000724	100	0.0443
1193	chr14	70945161	T	C	rs2526860	-0.00448951412	0.609123051534314	0.00499182876	0.5995520364717122	0.0063395317422416	0.9004687825168394	-3.0758275458058685e-05	0.6884033602948114	3.347618904519789e-05	0.679219985205056	0.205944045062708	0.6415071264132987	-0.0010806664059334	0.6123290057582141	0.0011422579077059	0.6023525831795357	0.00132608092218	0.7352478116221746	-7.372751674486487e-06	0.6712528450269093	7.706009681312134e-06	0.6615657433565423	-0.0040249380180292	0.4373850558857501	0.0045021213913006	0.4296885352439654	PCNX1	37755	MAP3K9	135627	TTC9	303244	False	False	False	ref	-50	0.001873	-55	0.02441
1194	chr14	70991112	T	C	rs7157250	0.0324635301999999	0.0801238936685897	0.0324635301999999	0.085503799615281	0.0086570606022942	0.4744391117932305	0.000280806760712	0.1031070723910601	0.000280806760712	0.1089441523993132	0.3413354910320646	0.4295910551076402	0.0111679474819727	0.1021948925075356	0.0111679474819727	0.1097537169879412	0.0029288001408886	0.4360070725585687	9.575663758943831e-05	0.1174480019539119	9.575663758943831e-05	0.1250650144455191	0.0224006473096193	0.0536129759963566	0.0224006473096193	0.0549776500306824	PCNX1	83706	MAP3K9	181578	SIPA1L1	329338	False	False	False	alt	-20	0.01109	80	0.03668
1195	chr14	71005509	A	G	rs67981189	-0.00159462148	0.6512994387051887	0.00400757696	0.6448647233651341	0.0177796672113203	0.0431970998178658	-3.4759842567623484e-05	0.4374628621660538	6.8061359702869e-05	0.4315601076841132	0.1030570856544154	0.8171923607257539	-0.0001835595876852	0.7588614408432837	0.0004198013916371	0.7516786225871691	0.00180842946058	0.6432034145045594	-3.8080608311977846e-06	0.6405105674665187	7.068465178986114e-06	0.633503772092321	-0.0018319692112988	0.4871379465433482	0.0035415305138019	0.4812986586139499	PCNX1	98103	MAP3K9	195975	SIPA1L1	314941	False	False	False	ref	-95	0.005672	-85	0.01694
1196	chr14	71010328	A	G	rs7146932	0.0449941086	0.036874566522585	0.0449941086	0.0394816791150996	0.0119841698540517	0.177201694256175	0.0005757547817215	0.0371192888783937	0.0005757547817215	0.0394439773648585	0.1306009398437742	0.7720311491764541	0.0065887297623167	0.2095704600317333	0.0065887297623167	0.2204382390567632	0.0015694225112616	0.6889990886752209	8.300995936097878e-05	0.1711722311187867	8.300995936097878e-05	0.1800058588542408	0.0390979159534849	0.0122144427003125	0.0390979159534849	0.0125226292841729	PCNX1	102922	MAP3K9	200794	SIPA1L1	310122	False	False	False	alt	-70	0.02219	-75	0.03952
1197	chr14	71028571	C	T	rs34488204	0.0007100394239999	0.791615503231486	0.001905861296	0.7950589582436504	0.0172683808874177	0.0468593104677833	1.5510537626839504e-05	0.6346046940371727	3.237365790834888e-05	0.636835919612178	0.0759821159970538	0.8637351083772519	4.537684874822564e-05	0.8725512227770559	0.0001297718192092	0.8746336485582284	0.0013164674966573	0.7340428592548442	9.88616604109497e-07	0.8062589033795137	2.1985930122673508e-06	0.8075401049524662	0.0007219991908629	0.7045074352282185	0.0015684810008402	0.7056819705857925	PCNX1	121165	MAP3K9	219037	SIPA1L1	291879	False	False	False	alt	-45	0.001007	55	0.01051
1198	chr14	71028982	C	T	rs3814869	-0.00384109571	0.6864036548315651	0.004119227818	0.6766449498543962	0.0176996372288047	0.0441772523630024	-6.564434758979929e-05	0.5096745011686057	7.01822106467514e-05	0.5008024511717774	0.0995674228985777	0.8236856191917912	-0.0003521530916707	0.8205769940236115	0.0003769169156453	0.8113392746641116	0.0017701523200877	0.6477840231869731	-5.987889078619273e-06	0.7227842717533765	6.391923131024587e-06	0.7134482435834086	-0.0029585369142833	0.5535460806134852	0.0031743067874147	0.5450485042676205	PCNX1	121576	MAP3K9	219448	SIPA1L1	291468	False	False	False	ref	100	0.00659	100	0.012146
1199	chr14	71060982	A	G	rs4048474	0.0044209529399999	0.6045584204451866	0.0044209529399999	0.6177064651955345	0.0074162462014988	0.7017005271079372	3.286776958297322e-05	0.6426191766665122	3.286776958297322e-05	0.655699319971946	0.0784530959864728	0.8600496999397167	0.0003615893537504	0.7657120685621189	0.0003615893537504	0.7801582412156376	0.0005813327463865	0.8788257434675036	2.6849296996102853e-06	0.7845834427253197	2.6849296996102853e-06	0.7990232103873267	0.0033382089025819	0.4939732408482968	0.0033382089025819	0.5055115106610734	PCNX1	153576	MAP3K9	251448	SIPA1L1	259468	False	False	False	alt	-55	0.001919	0	0.0
1200	chr14	71117756	T	C	rs221923	-0.00537008828	0.5773364460939707	0.00537008828	0.5644354551332614	0.0163275704555993	0.0589322783109498	-9.204654325055872e-05	0.3955875258142485	9.204654325055872e-05	0.3847392681328803	0.1742798161806657	0.7010560343239707	-0.0009785648297233	0.6280284444179559	0.0009785648297233	0.6143965805230912	0.0028586801655939	0.4505389110556238	-1.6858530340698485e-05	0.4937786123687795	1.6858530340698485e-05	0.4811097431869436	-0.0052199711615265	0.3892403986838019	0.0052199711615265	0.3792216682149981	SIPA1L1	202694	PCNX1	210350	MAP3K9	308222	False	False	False	ref	-90	0.00662	-25	0.0155
1201	chr14	71253368	G	C	rs75982415	0.00077983559	0.8601416040870654	0.00149773099	0.8626494093477457	0.006421351051038	0.8793464613468039	5.828755422418098e-06	0.8865293600449723	1.0143663208063748e-05	0.8890639114677736	0.1324515814479402	0.7655514206010128	9.657573370339878e-05	0.8681477668760963	0.0001757085745436	0.8705604400186103	0.0008637812964553	0.8280965848642206	7.057905735623837e-07	0.8903972195793799	1.1859879106875002e-06	0.8927934148656426	0.0005269764209172	0.7514918493119732	0.0013153663419744	0.7540281270309651	SIPA1L1	67082	PCNX1	345962	MAP3K9	443834	False	False	False	alt	-85	0.01617	-100	0.0953
1202	chr14	71255117	C	T	rs142859468	-0.01255992414	0.3233918842581255	0.01255992414	0.3123270521100075	0.0085440308442023	0.4827558821125735	-0.0001147944829158	0.3366953622775243	0.0001147944829158	0.3261585427338149	0.6145955870911524	0.0378417968609928	-0.0076841689358332	0.1853566451656594	0.0076841689358332	0.1757834502026765	0.0052476582119077	0.1217754494195229	-7.021874899371958e-05	0.1996055852784772	7.021874899371958e-05	0.1903679080797877	-0.0014937914293716	0.7464934627174424	0.0014937914293716	0.7332185038430042	SIPA1L1	65333	PCNX1	347711	MAP3K9	445583	False	False	False	ref	30	0.002632	40	0.0475
1203	chr14	71271317	G	A	rs57923981	-0.0362525115999999	0.0714991503214199	0.0362525115999999	0.0670562081917384	0.0116874534862726	0.186949801444279	-0.0004407468754127	0.0595245837205491	0.0004407468754127	0.0561654841399967	0.3926119565555658	0.3485025018236722	-0.0144858992805085	0.0823561818985181	0.0144858992805085	0.0763894002332601	0.0046989537696739	0.166185680451365	-0.0001793929214878	0.067696114680877	0.0001793929214878	0.0632979576288077	-0.0204213736657018	0.0691736534862008	0.0204213736657018	0.0673448138703174	SIPA1L1	49133	PCNX1	363911	MAP3K9	461783	False	False	False	ref	-100	0.003242	95	0.08124
1204	chr14	71299193	A	G	rs723966	0.00148818606	0.7318101293772825	0.00261201674	0.7412930723995124	0.0070463162882269	0.7801909657378407	1.021227019124795e-05	0.7659304870342656	1.84457696925882e-05	0.7754587114779407	0.0765983049616697	0.8616197419546763	0.0001296895279664	0.8344947671106792	0.0001887262248581	0.8448372221384486	0.0005335812109725	0.886058450202325	8.889297549272523e-07	0.8521374645031602	1.321449194701389e-06	0.8625858942601435	0.0012282285085944	0.6394988499412214	0.0020207678502888	0.6484226038079587	SIPA1L1	21257	PCNX1	391787	MAP3K9	489659	False	False	False	alt	25	0.001102	-100	0.05475
1205	chr14	71301356	C	T	rs61991204	-0.0212610922	0.164573099737373	0.0212610922	0.1566070952144148	0.007594204012058	0.6586805452821508	-0.0001623859379017	0.2083338226579931	0.0001623859379017	0.2002242456568639	0.2840070955092894	0.5203195179094757	-0.0060663256963785	0.211317722794207	0.0060663256963785	0.2013073921109138	0.0021613099210749	0.5670137930488368	-4.65567602070039e-05	0.2436139585571102	4.65567602070039e-05	0.2335611144743861	-0.0176765319142314	0.0862535910309827	0.0176765319142314	0.0838307757524373	SIPA1L1	19094	PCNX1	393950	MAP3K9	491822	False	False	False	ref	-100	0.003246	100	0.02917
1206	chr14	71305380	G	T	rs78053899	-0.0278996664	0.1218025500320143	0.0278996664	0.1152451189245254	0.0092534740370027	0.4132409782951601	-0.0002743652044028	0.1283157337954187	0.0002743652044028	0.1223159758048638	0.3387649249473542	0.4378343684058157	-0.0094975468631401	0.1424881732635552	0.0094975468631401	0.1339369540886954	0.0031309375942105	0.4001442979221081	-9.316242425616484e-05	0.1451032503445206	9.316242425616484e-05	0.1373521071945934	-0.0202222014751189	0.0767492882984421	0.0202222014751189	0.0746333786665374	SIPA1L1	15070	PCNX1	397974	MAP3K9	495846	False	False	False	ref	-15	0.0005856	-5	0.005783
1207	chr14	71307335	T	G	rs1990241	-0.00223321544	0.6882123424077795	0.00335709324	0.6795147499959012	0.0078201213452786	0.6221642221337298	-1.7952426506762132e-05	0.7122397817722339	2.6816311884378938e-05	0.7038715488405732	0.2306683679291278	0.6064794794315027	-0.0005262828368257	0.6574612692493664	0.0007511190217685	0.6487555617327662	0.0017972650832024	0.6457782872255006	-4.226618302697628e-06	0.6785605089411698	5.999873518076836e-06	0.6700757793002411	-0.0022489859853317	0.515994137220479	0.0033402836129004	0.5088182613285376	SIPA1L1	13115	PCNX1	399929	MAP3K9	497801	False	False	False	ref	-95	0.02533	0	0.0
1208	chr14	71314024	C	T	rs34873919	-0.0463835812	0.0352838305407869	0.0463835812	0.0329707177726727	0.0104985930114457	0.2689662756951522	-0.0005007285347044	0.0465492579100801	0.0005007285347044	0.0437923133134777	0.1301445035736884	0.7684431311624988	-0.0062384177364713	0.21577524134078	0.0062384177364713	0.2054600509681873	0.0014537541535252	0.6829576242936058	-7.222117369169174e-05	0.1908669768561298	7.222117369169174e-05	0.1820739972534995	-0.0395502028029336	0.0090033079404469	0.0395502028029336	0.0087052863952613	SIPA1L1	6426	PCNX1	406618	MAP3K9	504490	False	False	False	ref	-10	0.000519	-5	0.00177
1209	chr14	71315393	C	A	rs80173099	0.010255844	0.329681631363682	0.010255844	0.3410880193683882	0.0248807344165852	0.009649219162092	0.0002537988231204	0.1151168315163795	0.0002537988231204	0.121484270598636	0.2468594072552619	0.5821653738265653	0.0025309079343537	0.3738626631272764	0.0025309079343537	0.3866164006972767	0.0061334011519764	0.0737001495345855	6.252985735899283e-05	0.1739378176667753	6.252985735899283e-05	0.1830094483236899	0.00912250127076	0.2017923912388561	0.00912250127076	0.2084503550638475	SIPA1L1	5057	PCNX1	407987	MAP3K9	505859	False	True	True	alt	100	0.00823	95	0.07965
1210	chr14	71318485	T	G	rs35054229	-0.00493489044	0.579056114557003	0.00493489044	0.5656719645871432	0.0243897206928212	0.0108965513881993	-0.0001213742208925	0.297977297819149	0.0001213742208925	0.2879769078837063	0.1066650068984117	0.8080626961237728	-0.0006490201318566	0.7255805865825948	0.0006490201318566	0.7113905162226414	0.0024688527780138	0.4479045789005935	-1.5450213857321882e-05	0.5391343549741493	1.5450213857321882e-05	0.5254358129131844	-0.0040996275894977	0.4763915301720332	0.0040996275894977	0.4654671307810922	SIPA1L1	1965	PCNX1	411079	MAP3K9	508951	False	True	False	ref	100	0.00992	-100	0.04852
1211	chr14	71332956	A	T	rs116311114	0.001209070576	0.844209561423998	0.001540886096	0.8535011359096345	0.0188127136256414	0.0343037498728195	2.2780748525836463e-05	0.686258610854812	2.9462453639810297e-05	0.6955964307645137	0.1163933235821947	0.797963366757913	0.0001461878107904	0.8575454333734391	0.0001877615598096	0.8669333011033569	0.0021694165224898	0.577543053227929	2.712028422433711e-06	0.7687827987801288	3.549190990163417e-06	0.7779917342254452	0.0010892229172501	0.7456858708268072	0.001346486996753	0.754879963823703	SIPA1L1	12506	PCNX1	425550	MAP3K9	523422	False	False	False	alt	40	0.000519	0	0.0
1212	chr14	71350087	C	A	rs113102830	-0.002348063826	0.8078134153670581	0.002348063826	0.7935734093909251	0.029042192562586	0.0049415514355391	-5.990583215253574e-05	0.5209866488737502	5.990583215253574e-05	0.5085210956527109	0.5044263944646727	0.1652809251446954	-0.0011897333244628	0.6190285452766555	0.0011897333244628	0.6047286679522164	0.0146981769815414	0.0036213621828617	-3.046153868541411e-05	0.3733938980533464	3.046153868541411e-05	0.3611177989737569	-0.0006722061432172	0.8781515206823712	0.0006722061432172	0.864250195910525	SIPA1L1	29637	PCNX1	442681	MAP3K9	540553	False	True	True	ref	-95	0.00653	25	0.01233
1213	chr14	71357783	A	G	rs111590846	0.0205435802	0.1675506044487414	0.0205435802	0.1762242507508354	0.0089031157192861	0.4240081385825253	0.0001871980111321	0.1883719519700377	0.0001871980111321	0.1967435037039285	0.3187999875517381	0.4697413868603833	0.0065630574953673	0.1855698561004136	0.0065630574953673	0.1957273559374307	0.0028339316243484	0.4547917557590129	5.976852425582037e-05	0.1956903826187853	5.976852425582037e-05	0.2051888170369657	0.0146765007935766	0.1074480824384794	0.0146765007935766	0.1108082104520784	SIPA1L1	37333	PCNX1	450377	MAP3K9	548249	False	False	False	alt	20	0.0002422	-80	0.0598
1214	chr14	71360805	C	G	rs77942366	-0.000594713574	0.7642172411997681	0.002534234002	0.7621300373170651	0.0075149066641809	0.686938420555226	-5.829664519557374e-06	0.7938718438202104	1.853186306374601e-05	0.7915290946445561	0.1925165198809116	0.6669225502344901	-0.000205925863545	0.7384090663734082	0.000527054348983	0.7358630977694055	0.0014542773066943	0.71193909261533	-1.8195180488602504e-06	0.7631213181892302	3.907981684593963e-06	0.7606544264522557	-0.0004398385875372	0.608311326889783	0.002489652382286	0.6067353715694938	SIPA1L1	40355	PCNX1	453399	MAP3K9	551271	False	False	False	ref	100	0.006824	-10	0.004616
1215	chr14	71372567	T	C	rs76088535	0.0425750556	0.044388138373536	0.0425750556	0.0470757537235121	0.0102921735635001	0.2913320100932932	0.000471600519858	0.0540498151109572	0.000471600519858	0.0570429459746425	0.2266143839666386	0.6136766160680875	0.0106307688520758	0.1214113171049831	0.0106307688520758	0.129603427862813	0.0024091889641442	0.5175966698905831	0.0001213025814663	0.1135636407322673	0.0001213025814663	0.1204428374626013	0.0396477141879064	0.0126263578110571	0.0396477141879064	0.0129219175220946	SIPA1L1	52117	PCNX1	465161	RGS6	559863	False	False	False	alt	-100	0.0094	-100	0.01602
1216	chr14	71376191	A	G	rs113124653	-0.000265483848	0.8822241913921322	0.001273343528	0.8796400231832653	0.0149917810440505	0.0823061190483358	-6.53596861391349e-06	0.782778744362512	1.9673750224982323e-05	0.7798664295675803	0.1298332970259027	0.7729236642266575	-7.085836578937033e-05	0.8672796190671996	0.0001783969141168	0.8645535121738674	0.0020451110785577	0.572230269725202	-1.5199635044344686e-06	0.8021685063369622	2.894587377273304e-06	0.7991416146063287	-0.00040664322244	0.7747021468091276	0.001215780246683	0.7720048606950088	SIPA1L1	55741	PCNX1	468785	RGS6	556239	False	False	False	ref	100	0.007195	80	0.01343
1217	chr14	71377271	G	A	rs116767752	0.00087387368	0.5685155116694124	0.00479956448	0.5737424643322339	0.0146756674658584	0.0883729970460342	-6.781836798910997e-06	0.4648267195142822	6.968767320860624e-05	0.4684292140138679	0.6080021576987312	0.0428823816972827	0.000615103285187	0.3768905315338942	0.0029397606101295	0.3820219757955239	0.0088847955405892	0.0206197446144652	-2.959765787788118e-06	0.2906144594469191	4.233541431038498e-05	0.2941361366844535	-4.979304764572289e-05	0.8700681887686679	0.0006058154130228	0.8746780848053918	SIPA1L1	56821	PCNX1	469865	RGS6	555159	False	False	False	alt	-15	0.004272	-10	0.01538
1218	chr14	71935714	C	T	rs71427137	0.0075695476	0.4696763333869941	0.0075695476	0.4826925326339601	0.0131767132090466	0.1218191790248191	0.0001028297233455	0.3572364414354261	0.0001028297233455	0.368281835698483	0.1771159451861533	0.6950366532229704	0.0014156995381912	0.5487975225549028	0.0014156995381912	0.5627149765418934	0.0023254487223654	0.5485253594921767	1.9073548372836582e-05	0.4593896083804551	1.9073548372836582e-05	0.4722966156661775	0.0068174981068268	0.2838054656699063	0.0068174981068268	0.291420232716285	RGS6	3284	SIPA1L1	615264	DPF3	958387	False	False	False	alt	-100	0.0108	-45	0.0307
1219	chr14	71938968	C	T	rs2332687	0.0122930571999999	0.3038699046878292	0.0122930571999999	0.3154311086523342	0.0107978113884906	0.2462657180977758	0.0001431574553155	0.2673176867661774	0.0001431574553155	0.2769801451703486	0.3263000653533749	0.4469541485418959	0.0045145888521218	0.2852073423669274	0.0045145888521218	0.2977200658172156	0.003550444425924	0.3030800234440647	5.3190663960676055e-05	0.2523024219196961	5.3190663960676055e-05	0.2635158741871344	0.0071950953848068	0.2585368447153805	0.0071950953848068	0.2657045288589867	RGS6	6538	SIPA1L1	618518	DPF3	955133	False	False	False	alt	100	0.003468	100	0.0454
1220	chr14	71949502	T	C	rs2190864	0.00045862404	0.8383783615495275	0.00182729856	0.8367105905661765	0.0202674278931782	0.0253873032362475	7.663547740511096e-06	0.6419822569971823	3.686969745926993e-05	0.6409410082142459	0.0757373001794624	0.8679281066807539	4.7593477457004526e-05	0.8882381669443681	0.0001449626253237	0.8863486994062219	0.0015685301798558	0.6927271426582338	8.393170472729507e-07	0.8003222198268755	2.9731221887363007e-06	0.7984766011638506	0.0001473044326186	0.7608278284061616	0.0013049927903816	0.7592399282850576	RGS6	17072	SIPA1L1	629052	DPF3	944599	False	False	False	alt	-60	0.002228	-15	0.0002136
1221	chr14	71973898	G	C	rs2877774	-0.0115330072	0.3194654171650933	0.0115330072	0.308470694225637	0.0063652447342215	0.8715148491633058	-7.344655273506871e-05	0.4250085117192004	7.344655273506871e-05	0.4137590399177703	0.1643357296237512	0.7141000278976978	-0.001874675966059	0.4710531166902108	0.001874675966059	0.4576710615485763	0.0010582406578735	0.7796356932594498	-1.207586454913798e-05	0.5382801996970218	1.207586454913798e-05	0.5250401810327168	-0.0108756314899531	0.1685751889142309	0.0108756314899531	0.1634120211358386	RGS6	41468	SIPA1L1	653448	DPF3	920203	False	False	False	ref	-100	0.01032	0	0.0
1222	chr14	71981278	C	T	rs145192742	-0.0435446506	0.0438711577287596	0.0435446506	0.0410473923964459	0.0090773104364741	0.4018213845413244	-0.0004088472185222	0.0672279183451221	0.0004088472185222	0.0634000668268916	0.5274515295801824	0.1332230190696799	-0.0230174607198161	0.0330056894610339	0.0230174607198161	0.03046969026081	0.0047990748551085	0.1582012291181437	-0.0002166370296344	0.050032641390184	0.0002166370296344	0.046646563444512	-0.0116225272046389	0.1636544149292588	0.0116225272046389	0.1587308872100096	RGS6	48848	SIPA1L1	660828	DPF3	912823	False	False	False	ref	-85	0.007664	0	0.0
1223	chr14	84174900	T	C	rs1779550	0.091122808	0.0028407515402705	0.091122808	0.0029529083790962	0.0183393353068736	0.0392210909144843	0.0017328802290937	0.0049888200809754	0.0017328802290937	0.0051661610137284	0.4585441757694582	0.2409111288292729	0.0419761797478519	0.0049680321962059	0.0419761797478519	0.0053325924448056	0.008402638758715	0.0270559151591378	0.0007972605704299	0.0055928590683398	0.0007972605704299	0.0059076998433331	0.0415543729706739	0.009022130468728	0.0415543729706739	0.0092754308789224	FLRT2	1355245	SEL1L	2641047	STON2	2738435	False	True	True	alt	15	0.003387	50	0.02563
1224	chr14	84176590	C	T	rs2841157	-0.00559724366	0.5567307540793354	0.00559724366	0.5436084697585383	0.0062822079804789	0.8877868003163482	-3.53822961509387e-05	0.651366117741037	3.53822961509387e-05	0.6381861644357728	0.2101017645411259	0.6391348002432024	-0.0012236926953587	0.5790308670949983	0.0012236926953587	0.5652571339568613	0.0013171430792316	0.7365338051734818	-7.73552769835168e-06	0.6447513835238862	7.73552769835168e-06	0.6309747012201398	-0.0050560690463593	0.380474499973964	0.0050560690463593	0.3705660519850799	FLRT2	1353555	SEL1L	2642737	STON2	2740125	False	False	False	ref	-75	0.01167	-35	0.0441
1225	chr14	84185848	C	T	rs995791	0.00798845668	0.4149279978805211	0.00798845668	0.427063874625136	0.0130097643505198	0.1282818189167573	0.0001091898807311	0.3127679133924752	0.0001091898807311	0.3231720317831694	0.0547993236444361	0.904811852806799	0.0004493746112412	0.7417380136888664	0.0004493746112412	0.755791556148975	0.0007189525355721	0.8574025829577019	6.142656657168646e-06	0.6745900890188642	6.142656657168646e-06	0.6883979693028108	0.0050062759987136	0.3817284135771039	0.0050062759987136	0.3918968040924363	FLRT2	1344297	SEL1L	2651995	STON2	2749383	False	False	False	alt	-95	0.01149	95	0.0152
1226	chr14	84185979	G	A	rs1157827	-0.0033748111399999	0.6799284336067515	0.0033748111399999	0.6663303461012291	0.0087049678222974	0.4611452102127522	-2.9619265185553264e-05	0.6702852376085673	2.9619265185553264e-05	0.6571455334448124	0.0201599601655618	0.9667730660600522	-4.345749728499886e-05	0.9602337226224048	4.345749728499886e-05	0.9468418766001888	0.0001731498984555	0.9669339728109106	-3.71087027551965e-07	0.9590046482585832	3.71087027551965e-07	0.9454422052510636	-0.0007240739011815	0.8649085392341934	0.0007240739011815	0.8511479459439419	FLRT2	1344166	SEL1L	2652126	STON2	2749514	False	False	False	ref	-90	0.00511	0	0.0
1227	chr14	84209066	A	G	rs67517866	-0.000393787318	0.9197587877120444	0.00080622679	0.9160687447509122	0.0225034075089179	0.0157516774810792	-8.911244589250315e-06	0.7865458465355055	1.7586818637517923e-05	0.7824020887913437	0.1072998682558947	0.8119929226276156	-4.8208441449627365e-05	0.9170865367309488	8.282332682212697e-05	0.9133701097451898	0.0023968640634569	0.5246518548270354	-1.029256224670676e-06	0.8414961788130321	1.7682394905849836e-06	0.8373317097130938	-0.0004377638772186	0.8625777580014244	0.0006701314328986	0.8587221945686596	FLRT2	1321079	SEL1L	2675213	STON2	2772601	False	True	False	ref	100	0.002441	-25	0.006775
1228	chr14	84209125	C	T	rs28637508	0.0034767127	0.6697238998700014	0.0034767127	0.6832150372295672	0.0185969933490494	0.0355000294525242	6.26706329746572e-05	0.4619786327172379	6.26706329746572e-05	0.4736900985131398	0.0947333478563055	0.8331806461830866	0.0003788208573538	0.7668988385864276	0.0003788208573538	0.7808409426161117	0.001746909374332	0.6521743610252689	6.690199648399379e-06	0.6519015793270377	6.690199648399379e-06	0.6655154365078022	0.0030850942437161	0.5297115396616132	0.0030850942437161	0.541731216684372	FLRT2	1321020	SEL1L	2675272	STON2	2772660	False	False	False	alt	40	0.001877	-85	0.01962
1229	chr14	84211361	C	A	rs7145105	0.00556340414	0.5200814437655272	0.00556340414	0.5329016663757422	0.0371581187111259	0.0015956267655441	0.000204334671602	0.1551185385327317	0.000204334671602	0.1626442518222802	0.1026608159835682	0.8207968322958883	0.0005577238115365	0.6922248228731933	0.0005577238115365	0.7061620750706972	0.0041429923721074	0.2427478607629554	2.2221352007488306e-05	0.3962100535692847	2.2221352007488306e-05	0.4084479199577626	0.0048423738835464	0.3750151385476975	0.0048423738835464	0.3849617906438871	FLRT2	1318784	SEL1L	2677508	STON2	2774896	False	True	True	alt	70	0.002716	-80	0.03464
1230	chr14	84218958	A	C	rs12717596	0.001329913208	0.7535343636942098	0.002636765312	0.7510234756832328	0.0065459964443429	0.868176074152995	9.402275426719925e-06	0.8012740067799837	1.79909215113124e-05	0.7997999913880742	0.1185759188373323	0.7912192713556139	0.0001789370778088	0.8006002005973423	0.0003438798931205	0.796846083249229	0.0007861606117478	0.8362569084809744	1.2621479127589406e-06	0.8303672924471059	2.3450252049867565e-06	0.8274419418790717	0.0011680619093559	0.594325506203324	0.0026577039180904	0.5926515272754252	FLRT2	1311187	SEL1L	2685105	STON2	2782493	False	False	False	alt	-100	0.00553	60	0.02046
1231	chr14	84221664	C	T	rs7148526	-0.00319822154	0.731137728746625	0.00319822154	0.7174185300153152	0.0066700671580519	0.8537051568689157	-2.0657355317412827e-05	0.7864319579975999	2.0657355317412827e-05	0.7728730527712686	0.2575503895268622	0.5623798993672368	-0.0007616793517962	0.6809784825500249	0.0007616793517962	0.6669208309555528	0.0017243210833644	0.6611141874144986	-4.940855099741897e-06	0.727100309394084	4.940855099741897e-06	0.7130243042017814	-0.0027054222554175	0.5858372417613237	0.0027054222554175	0.5736040300732397	FLRT2	1308481	SEL1L	2687811	STON2	2785199	False	False	False	ref	100	0.01933	90	0.1012
1232	chr14	84225088	T	C	rs3001377	-0.00844964256	0.4112678629687612	0.00844964256	0.3994955600986939	0.0249729600010649	0.0095753445024872	-0.0002076604998448	0.1683899889955609	0.0002076604998448	0.1608807173938145	0.1132895569456114	0.8008702525207214	-0.0010023395774155	0.615670178823234	0.0010023395774155	0.6017774711697247	0.0027572915299855	0.4667916230949033	-2.387986771515109e-05	0.3928185351855484	2.387986771515109e-05	0.3809426913906515	-0.0078029855081483	0.2597291557923841	0.0078029855081483	0.2521791379711289	FLRT2	1305057	SEL1L	2691235	STON2	2788623	False	True	True	ref	-35	0.0332	90	0.07086
1233	chr14	84225401	G	A	rs77782646	-0.0902853082	0.0036730800282698	0.0902853082	0.0034436168097586	0.0398723864456015	0.0019416487934035	-0.0040739944939264	0.0017862776048893	0.0040739944939264	0.0016937272005567	0.1174265293208435	0.7930319271236217	-0.0112791941752785	0.1182572729352236	0.0112791941752785	0.1110296197781729	0.0049713932143493	0.1398688533812671	-0.0005320091240629	0.0194332321400251	0.0005320091240629	0.0183272870674959	-0.070753845994253	0.0010504082476862	0.070753845994253	0.0010406594441249	FLRT2	1304744	SEL1L	2691548	STON2	2788936	True	True	True	ref	-100	0.002262	-70	0.04977
1234	chr14	84225694	T	G	rs8004742	-0.00728348794	0.4664922583463598	0.00728348794	0.4540508989993491	0.0189682058246325	0.0329083028745	-0.0001431305343849	0.267880816410385	0.0001431305343849	0.258377277388937	0.0992043485928276	0.8231160036415868	-0.0007367953465943	0.6731565450660686	0.0007367953465943	0.6594506860387571	0.0018751352212383	0.6241778501943611	-1.4294897309582076e-05	0.5130224125466332	1.4294897309582076e-05	0.5001694388708062	-0.006593429392421	0.3224470943197173	0.006593429392421	0.3137535076457241	FLRT2	1304451	SEL1L	2691841	STON2	2789229	False	False	False	ref	90	0.02419	40	0.02565
1235	chr14	84225890	A	G	rs146120508	-0.0059119754	0.5255777883870608	0.0059119754	0.5129237284943501	0.0246981727498886	0.010378820253615	-0.0001478003872588	0.2452862003816194	0.0001478003872588	0.2361286770072567	0.1015591448044066	0.8202458025918622	-0.0006456915208202	0.7004459633687984	0.0006456915208202	0.6866431893305569	0.0025116645907707	0.4882342536794006	-1.600807741755169e-05	0.4896357768704985	1.600807741755169e-05	0.47690800089323	-0.0052324194234379	0.3788489875657622	0.0052324194234379	0.3688954539014943	FLRT2	1304255	SEL1L	2692037	STON2	2789425	False	True	False	ref	-75	0.00589	20	0.006798
1236	chr14	84226209	G	T	rs8004689	0.00503934688	0.5551122791357267	0.00503934688	0.5682079523625309	0.0203997879425995	0.0242294667330222	0.0001025809889422	0.3019252371536449	0.0001025809889422	0.3120806708358709	0.1478832767974771	0.7395494649412325	0.0006905387545749	0.657989203584793	0.0006905387545749	0.6715926442483638	0.0030202282893583	0.3591035092242969	1.4027393684026984e-05	0.4872983692797091	1.4027393684026984e-05	0.500221998363183	0.0043278457245406	0.4092388660357015	0.0043278457245406	0.4197369024353485	FLRT2	1303936	SEL1L	2692356	STON2	2789744	False	False	False	alt	100	0.02031	100	0.0908
1237	chr14	84226409	A	G	rs184858889	-0.00927657446	0.4002656835217293	0.00950471594	0.3910218068396059	0.0216858121530534	0.0186737824729965	-0.0002113101870024	0.1946651455082848	0.0002154661714431	0.188160155236962	0.1722714965922883	0.6955340518575641	-0.0020105710299219	0.4965450108273108	0.002023135508007	0.4869915438948899	0.0038575500666732	0.2413101555081269	-4.6050457042897135e-05	0.3107290735252974	4.627934034454597e-05	0.3015416756529868	-0.0083901285283042	0.2684777248866813	0.0085644041950642	0.2633400279168584	FLRT2	1303736	SEL1L	2692556	STON2	2789944	False	True	False	ref	-50	0.003052	-40	0.0083
1238	chr14	84227306	T	G	rs4144366	0.0042622898599999	0.6094839729325394	0.0042622898599999	0.6229429335729486	0.0087307797827405	0.4639906837887925	3.779505271372976e-05	0.6117427525220006	3.779505271372976e-05	0.6247137632074294	0.1371362773472753	0.7602131014602294	0.0005990721711185	0.6857771625563632	0.0005990721711185	0.699683116710917	0.0012205815615629	0.7556381200020957	5.415805434998348e-06	0.6863516213646778	5.415805434998348e-06	0.7001516320906268	0.0042158113673377	0.4272234438675994	0.0042158113673377	0.437966014257983	FLRT2	1302839	SEL1L	2693453	STON2	2790841	False	False	False	alt	-55	0.01175	-75	0.02911
1239	chr14	84228495	A	G	rs186989036	0.0010315581939999	0.7676337013368524	0.002731540246	0.7667503441459397	0.0141011496192163	0.1045212566196181	8.61592233124941e-06	0.6527281484509833	3.74810158847625e-05	0.6519774136980114	0.1590493677320303	0.7226997217147797	8.601471376960169e-05	0.7894643152059542	0.0003829538823813	0.7876556486648393	0.0022691085745907	0.5441539556744198	4.397838512891732e-07	0.7163517241690823	5.449251558878278e-06	0.7145075246902456	0.0006846544051287	0.6155142396006278	0.0024440087552775	0.6147428609502589	FLRT2	1301650	SEL1L	2694642	STON2	2792030	False	False	False	alt	-100	0.002316	65	0.01129
1240	chr14	84453509	A	G	rs67378160	0.00866611814	0.4613112716393154	0.00866611814	0.4748253274407883	0.0071732209737202	0.738869175366689	6.930870582095506e-05	0.5067749166093807	6.930870582095506e-05	0.5194971535779799	0.2914262596085021	0.5122189253723497	0.0026833590004807	0.436366856224062	0.0026833590004807	0.4499253211808992	0.0021179783178498	0.5884781281176524	2.147807679283208e-05	0.4730699480783791	2.147807679283208e-05	0.4862819951954438	0.0063257917613252	0.3461038110214057	0.0063257917613252	0.3543849079313731	FLRT2	1076636	SEL1L	2919656	STON2	3017044	False	False	False	alt	80	0.01108	75	0.05774
1241	chr14	93274787	A	C	rs7146851	0.0035106273699999	0.5922417096371296	0.00500601227	0.5965706787416519	0.0143385107773802	0.0946300807883423	5.691261157577295e-05	0.4812023916465623	7.477129156621763e-05	0.4856014371955691	0.112482494631687	0.7990929344138152	0.0001399058124667	0.7729164244626145	0.0004154864633802	0.7739702133191764	0.0015361790551623	0.6872974027487526	2.654474556255472e-06	0.6935572797979944	5.89024739336146e-06	0.6949748401311086	0.0023340491083932	0.5091448982072562	0.0036203695059077	0.5120845472729453	BTBD7	58305	UNC79	58433	UBR7	67545	False	False	False	alt	30	0.000946	15	0.007996
1242	chr14	93353198	C	T	rs17129021	0.0013967779	0.7920481024528141	0.00204655006	0.800938765345514	0.0237872097659008	0.012194014493573	3.7000667525050777e-05	0.5259028663446366	4.8933450246990855e-05	0.5343275919460707	0.0183300656645815	0.9653441372363084	2.354085079658097e-05	0.9449365738212578	3.729809920647527e-05	0.95362415389805	0.0004239859437297	0.9115701333199696	6.165722480289414e-07	0.8953785733616637	8.692181212794904e-07	0.904278563492717	0.0003962696708472	0.8595282691105879	0.0006410854884386	0.8682700226259806	COX8C	6015	UNC79	19978	BTBD7	20106	False	True	False	alt	35	0.00119	-15	4.58e-05
1243	chr14	93557014	G	T	rs12591010	0.00999947488	0.3729115591476253	0.00999947488	0.3850109205189657	0.0056466921202283	0.9698881712671704	5.812605432513765e-05	0.5100676837862134	5.812605432513765e-05	0.5224867738550608	0.309391176257015	0.4856447479032814	0.0031786082590782	0.3561148035276347	0.0031786082590782	0.368601340760746	0.0017498634562962	0.6568553466778344	1.846032044684825e-05	0.457681376764435	1.846032044684825e-05	0.4704505050703564	0.0070187450077282	0.2785499146133742	0.0070187450077282	0.2864622002443032	COX8C	209831	UNC79	223794	BTBD7	223922	False	False	False	alt	-65	0.01294	-75	0.05383
1244	chr14	93565719	G	A	rs942065	0.018054747908	0.2002887770455422	0.018132317292	0.2090094546868976	0.0077637064355848	0.6315896907510721	0.0001419944504001	0.2420215607594997	0.0001426215419625	0.2506136870934222	0.4928017925497152	0.1866837605351731	0.0087204726468891	0.1514802549364435	0.0087607270695689	0.1601175221942287	0.0038190506379077	0.2838917604640139	6.842133201898431e-05	0.1827119696256172	6.874675948709563e-05	0.1912737609348956	0.0066473718607039	0.3056559113888975	0.006680567225801	0.3125409932420052	COX8C	218536	PRIMA1	222766	UNC79	232499	False	False	False	alt	-100	0.00619	45	0.01129
1245	chr14	99157759	T	C	rs947191	0.082752536	0.0038683780348611	0.082752536	0.0040465033851993	0.0168035311677609	0.051483865056659	0.001414019313566	0.0063512050274089	0.001414019313566	0.0066145019615932	0.5120882996711584	0.1552697730809394	0.0424054366172377	0.0044968990909458	0.0424054366172377	0.004865874412362	0.0086069822580957	0.023987041781772	0.0007248756913823	0.005958867379417	0.0007248756913823	0.0063277106764205	0.0264857519268871	0.0346171214107712	0.0264857519268871	0.0354827893443926	BCL11B	114438	SETD3	323130	CCNK	323411	False	True	True	alt	-50	0.0013485	15	0.0166
1246	chr14	99220196	A	G	rs2614457	-0.0006629376	0.7166145100499862	0.0030710012	0.7164308974142441	0.0271152641715017	0.0068497295906021	-2.742584060881961e-05	0.3933606990403414	8.624276353317765e-05	0.3928678210053483	0.4372514237699561	0.2750609656828426	-0.0003969348926805	0.539068894616933	0.0013577429584429	0.5390536428907976	0.0119645497780598	0.0070727248616242	-1.4981673057801596e-05	0.295251790059561	3.851742207452201e-05	0.2947173266888654	-0.0002780111826886	0.7554052501861492	0.0013195157626115	0.7551628106484789	BCL11B	52001	SETD3	260693	CCNK	260974	False	True	True	ref	100	0.00406	-80	0.02283
1247	chr14	99220277	A	G	rs2693695	-0.003289081266	0.6614711965604967	0.0034719042539999	0.6522221615152033	0.0070384808972203	0.7687288488266638	-2.2022262831472746e-05	0.722740648964092	2.329696781504092e-05	0.7142584387191239	0.4250625006483469	0.2956015682318276	-0.0013490272786334	0.5280563357249899	0.0014239266886322	0.518226699857697	0.003017862742916	0.4212015199421613	-9.144513908776144e-06	0.5783992452135421	9.66673845380314e-06	0.5693605237595484	-0.0018879863899002	0.6625658217536206	0.0019709748026431	0.6544912059979691	BCL11B	51920	SETD3	260612	CCNK	260893	False	False	False	ref	40	0.004025	-75	0.03705
1248	chr14	99246457	C	T	rs12895055	-0.0325017286	0.0877283960171845	0.0325017286	0.082625388119564	0.0152238290919345	0.0748501299688228	-0.0004861820296389	0.0451490931495977	0.0004861820296389	0.0425311863526303	0.8534881067230987	0.0042697340496278	-0.0276482286272724	0.0209182627059909	0.0276482286272724	0.0193188299823975	0.0130266721199362	0.0052956819312923	-0.0004145556060919	0.0164625238719906	0.0004145556060919	0.0153553226944371	-0.0064710214836253	0.3081370687522655	0.0064710214836253	0.2994528484036935	BCL11B	25740	SETD3	234432	CCNK	234713	True	False	False	ref	-100	0.003242	30	0.01404
1249	chr14	102833379	T	C	rs7147531	0.0006656568759999	0.7914980063589289	0.0023235540199999	0.7960136724001586	0.0209077116441842	0.0223353221563374	4.672861032195335e-06	0.5868890105670146	4.8018353072314576e-05	0.5904368843802899	0.2900922208736605	0.5142106216980973	0.0001716703762857	0.7007073967685459	0.0006626266454359	0.7054115787863547	0.0060755054415031	0.0784445679388441	9.69626575917672e-07	0.5349952605960767	1.3735316774258476e-05	0.5389522338092833	0.0004356891669	0.679766343377982	0.0018962852311745	0.6837560940468097	TRAF3	55929	AMN	89285	CDC42BPB	224170	False	False	False	alt	-95	0.006317	-15	0.00598
1250	chr14	102839878	G	A	rs2403102	0.0006607237999999	0.7607977135654863	0.00246151124	0.7644658402947303	0.0081591686147538	0.5431146034118908	5.201776410521264e-06	0.7631265037673651	1.935061080077365e-05	0.7670120581414599	0.2257264079502899	0.6172874282788774	0.0001807902727812	0.7150858446040065	0.0005205964660565	0.7192910647206294	0.0018349698922229	0.6341306803030787	1.375793747260158e-06	0.7237463383079086	4.054476895198132e-06	0.7278537966553369	0.0009647402981358	0.6105823304754824	0.0022718077988359	0.6143299633892263	TRAF3	62428	AMN	82786	CDC42BPB	217671	False	False	False	alt	-100	0.0035	100	0.11084
1251	chr14	102875712	T	C	rs1131877	0.0264306408	0.1142090564172398	0.0264306408	0.1209947689256651	0.0081428934828319	0.5459416087806527	0.0002165293307687	0.1453054512769084	0.0002165293307687	0.1525164901297531	0.2731584352534777	0.5419333250147965	0.0072994971400668	0.1661005821378139	0.0072994971400668	0.1758325518737077	0.00223346425136	0.5575848589866336	5.998153763656873e-05	0.187295621754336	5.998153763656873e-05	0.1968061161778619	0.0215790620234649	0.0538841871132749	0.0215790620234649	0.055421760798803	AMN	46952	TRAF3	98262	CDC42BPB	181837	False	False	False	alt	-95	0.0047	100	0.02979
1252	chr14	103303151	C	G	rs8007609	0.00080782364	0.7354669679160937	0.00262623764	0.7443343978671983	0.0063039957897023	0.9046113377852272	4.8066301701448425e-06	0.7991458241704801	1.6582898754190053e-05	0.8083075470989411	0.146769157356404	0.7413891029399888	0.0001680587783002	0.7551111509110502	0.0003785933172091	0.7652322889489959	0.0009188258493157	0.8073739005415321	1.0052696118292875e-06	0.7985530950485914	2.3687166773230026e-06	0.8086754405525362	0.0007427462940486	0.5816282806768409	0.0025850890569403	0.5889351849630972	EIF5	30394	ENSG00000291313	31087	MARK3	82227	False	False	False	alt	-50	0.005142	-80	0.0724
1253	chr14	103303723	A	C	rs58026845	0.0044496834319999	0.582638600479617	0.005323018312	0.5920807926377906	0.006072391429361	0.9324472609955824	2.6858496722405388e-05	0.685291093906358	3.1972056603066816e-05	0.6943598030494876	0.049925829106111	0.900881933665503	0.0001960468775739	0.8386553012427971	0.0002385000908267	0.8478210982551957	0.000295204896152	0.9289542615671592	1.131521766649682e-06	0.8716064241644281	1.380094278820757e-06	0.880697572063958	0.0020560379257045	0.5787942560560947	0.0026286579736303	0.5868071143030136	EIF5	29822	ENSG00000291313	30515	MARK3	81655	False	False	False	alt	60	0.03394	55	0.02814
1254	chr14	103304973	C	T	rs8008665	-0.0368379837	0.0710485068631463	0.0368379837	0.0668182463895514	0.008513753294856	0.4911160702169346	-0.0003178443057966	0.1013626926607863	0.0003178443057966	0.0961731137275759	0.0546789904459589	0.8982416554494297	-0.0019866526232747	0.4679259217257219	0.0019866526232747	0.4546935293523024	0.0004657775967934	0.8977626381918726	-1.715664905358781e-05	0.4723436081370821	1.715664905358781e-05	0.4596329765453818	-0.0205251091816304	0.0683843300598065	0.0205251091816304	0.0665674562738807	EIF5	28572	ENSG00000291313	29265	MARK3	80405	False	False	False	ref	40	0.001625	-35	0.004753
1255	chr14	103309178	C	G	rs17101455	0.00030384838	0.4311109013280831	0.0076553153	0.4304993992924282	0.0074033341697031	0.70487580008517	2.094509154185687e-06	0.4849910106406717	5.686348115702005e-05	0.4846031178184506	0.4372659467421861	0.2615033990604472	0.0001043887094749	0.3267501232260737	0.0032519681535225	0.3262187723938775	0.0032279787315407	0.3694641386162243	6.264154471653343e-07	0.3647028607548075	2.408926350959812e-05	0.3641261863844851	0.0006493843297129	0.4716672816629544	0.0038527370615877	0.4724044656642244	EIF5	24367	ENSG00000291313	25060	MARK3	76200	False	False	False	alt	-100	0.006508	-100	0.05298
1256	chr14	103312029	C	T	rs7145682	-0.031348343	0.0919812621793618	0.031348343	0.0868049902173741	0.0084152854839939	0.502190303142389	-0.0002752329510477	0.1248876652646134	0.0002752329510477	0.1188745419917212	0.5700557059720537	0.0778459129782378	-0.0179467295073984	0.0545842317013894	0.0179467295073984	0.0505200856939975	0.0048007601916019	0.1581089773014856	-0.0001576919105058	0.0779835068794677	0.0001576919105058	0.0729966826625832	-0.0058527578086909	0.3343811601116996	0.0058527578086909	0.3253712538458373	EIF5	21516	ENSG00000291313	22209	MARK3	73349	False	False	False	ref	-100	0.00232	-100	0.1537
1257	chr14	103315762	C	G	rs7150297	-0.0076324804	0.4619594617819554	0.0076324804	0.4495295818179097	0.0073980889114264	0.6658268819047746	-5.748630940344874e-05	0.5145530255225226	5.748630940344874e-05	0.5022204130792944	0.5604580960383407	0.0882954406970974	-0.0042437161986724	0.2946212395330842	0.0042437161986724	0.2831635681689203	0.0041438628402598	0.2274331421910515	-3.1964678841999914e-05	0.3337277459098094	3.1964678841999914e-05	0.3224837150512688	-0.0018112221081131	0.6986469277306707	0.0018112221081131	0.6856999368834125	EIF5	17783	ENSG00000291313	18476	MARK3	69616	False	False	False	ref	-60	0.00207	5	0.00528
1258	chr14	103315839	C	A	rs72708820	-0.0217887594	0.1593771076228424	0.0217887594	0.151375334879781	0.0095380843716763	0.3524405957782998	-0.0002140050339821	0.1659723155933301	0.0002140050339821	0.1587263967979754	0.5564393821512671	0.0929321101364462	-0.012223636293611	0.1005577829664459	0.012223636293611	0.0941034096006413	0.0053122295904767	0.1188339294345349	-0.0001202051587152	0.1078558497635026	0.0001202051587152	0.1016265755301411	-0.0043444434070892	0.4276175055461445	0.0043444434070892	0.4170457158575676	EIF5	17706	ENSG00000291313	18399	MARK3	69539	False	False	False	ref	60	0.001299	90	0.04843
1259	chr14	103320219	G	A	rs11850831	-0.0383751402	0.0627375520087046	0.0383751402	0.0588692382827215	0.0080700178207013	0.5657157365200811	-0.0003233655249527	0.098373507898246	0.0003233655249527	0.0933524068171274	0.2131370657371964	0.6267845194653495	-0.007778929396384	0.1718710495893535	0.007778929396384	0.1626418743618957	0.0016809366587991	0.6547686873077145	-6.420241337073022e-05	0.1948157779692175	6.420241337073022e-05	0.1856872222955418	-0.0348074150146785	0.0183013002262017	0.0348074150146785	0.0178465628185744	EIF5	13326	ENSG00000291313	14019	MARK3	65159	False	False	False	ref	-100	0.002518	-80	0.04175
1260	chr14	103330758	A	G	rs8007383	-0.00215667876	0.7066719558089676	0.0035727941199999	0.7026462103387218	0.0072259551836732	0.6940522868054729	-1.3151964235932705e-05	0.7640100682120243	2.3614430181883728e-05	0.7603519581928004	0.3023101899397296	0.496536012534649	-0.0006413456370851	0.6215017572085823	0.0010699453875273	0.6177829643836213	0.002237033370365	0.5613729303376591	-3.875044876989157e-06	0.6682622954399625	7.172654087060575e-06	0.6646745030270527	-0.0013257398935673	0.598417704972638	0.0025124741957903	0.5949405256671341	EIF5	2787	ENSG00000291313	3480	MARK3	54620	False	False	False	ref	-100	0.00714	65	0.03528
1261	chr14	103345983	G	T	rs12432904	-0.0019787512	0.5741674170920461	0.0049586906	0.5689328457525672	0.0091006608324968	0.4037028858185923	-1.9382177513174904e-05	0.5619511625033227	4.537426474316646e-05	0.5571665751601519	0.3830994097449143	0.3663395359174442	-0.0006842220990363	0.4600432992539019	0.0018840610899809	0.4547786162310969	0.0034843440808526	0.3390612452267064	-6.771471816004403e-06	0.4521119018576565	1.7237598719898425e-05	0.446944149041578	-0.0011327918339401	0.5430128401541401	0.0030041805412918	0.5391231490933271	ENSG00000291313	11745	EIF5	12438	MARK3	39395	False	False	False	ref	40	0.003357	-10	0.00955
1262	chr14	103568955	G	A	rs12894729	-0.0849973094	0.0046017073535594	0.0849973094	0.0043790695401562	0.0163427290188347	0.061455453664928	-0.0014946504945717	0.007836896637678	0.0014946504945717	0.0074814612896117	0.4418344588636811	0.265868251444586	-0.03794010449579	0.0088417541831648	0.03794010449579	0.0082160893853802	0.0072768549745305	0.0458052675284559	-0.0006723422705979	0.0095351680024914	0.0006723422705979	0.0089719695115365	-0.0407556094980238	0.0099346561978424	0.0407556094980238	0.0097262099294848	ENSG00000256500	5992	COA8	5994	BAG5	6298	False	True	True	ref	55	0.00859	55	0.10925
1263	chr14	103573728	T	C	rs10431750	-0.0032099263	0.7342596910424648	0.0032099263	0.7207734641995249	0.0239170710898142	0.0122150078616043	-7.88027024066429e-05	0.4418735641542116	7.88027024066429e-05	0.4302139024288907	0.2808473116941047	0.5257098259196017	-0.0008772788789019	0.6600624952583448	0.0008772788789019	0.6459934754592309	0.0066510834368503	0.0557503766669072	-2.141672548038441e-05	0.4410772280424972	2.141672548038441e-05	0.4285823992009879	-0.0024543823068703	0.6185478080928053	0.0024543823068703	0.6060720070249521	ENSG00000256500	10765	COA8	10767	BAG5	11071	False	True	False	ref	-100	0.001692	-95	0.0443
1264	chr14	103580255	A	T	rs71417868	-0.0004282836356	0.8640524449016563	0.0014408654356	0.8645930802727885	0.020257650439318	0.0269641861128896	-2.9762229582100007e-06	0.7064951129429027	2.785858745721744e-05	0.7068066430817836	0.1444496312202408	0.7369092512963882	-1.946542027956706e-05	0.8618754384524988	0.0001867927945921	0.8615617818074588	0.0030180959004227	0.3367713475070384	2.372077469033597e-07	0.7582350926446747	3.763413293963844e-06	0.7573811975755389	-0.0002717870517329	0.76629526341238	0.0012966939491073	0.7637340821927757	ENSG00000256500	17292	COA8	17294	BAG5	17598	False	False	False	ref	100	0.001343	-60	0.04962
1265	chr14	103593729	A	T	rs67899457	-0.009488545	0.2759173962770845	0.0129824713999999	0.268849913315064	0.0070804888259565	0.721858668345172	-6.014123860137188e-05	0.3475448791332103	9.064773913121888e-05	0.3407663527235452	0.4073755951825226	0.3180440067583505	-0.0038104095002447	0.2324974871183917	0.0053443460445683	0.2259378535971923	0.0029001468007835	0.4186494366692203	-2.407475534591981e-05	0.2800716545467274	3.746800751061224e-05	0.2735754652190887	-0.004902540482785	0.2956713592714433	0.0065540098963681	0.2901352590946089	ENSG00000256500	30766	COA8	30768	BAG5	31072	False	False	False	ref	-70	0.01585	65	0.01099
1266	chr14	103723520	G	A	rs56168984	-0.028928067	0.1109263029458667	0.028928067	0.1046664724460037	0.0077069539421672	0.6475731050131672	-0.0002226608930243	0.1527698191993657	0.0002226608930243	0.1455890574937997	0.5690764427016878	0.078084491827583	-0.0164927119979799	0.0641477619834177	0.0164927119979799	0.0592598389447141	0.0043828370916258	0.2029611852050694	-0.000126836335369	0.0940786872090715	0.000126836335369	0.0880205337832626	-0.0055560742331351	0.3539429702671138	0.0055560742331351	0.3444721058529552	ZFYVE21	7789	XRCC3	8016	PPP1R13B	124055	False	False	False	ref	-35	0.00203	-100	0.0979
1267	chr14	103767290	G	C	rs12878682	0.0381586068	0.0576369305381908	0.0381586068	0.0616311497850798	0.0094360112342223	0.3572154556252631	0.0003757544918478	0.0721706102020774	0.0003757544918478	0.0764242490698301	0.2464091951161318	0.5794736528986271	0.0090948218563514	0.1342358046087477	0.0090948218563514	0.1431789903293167	0.002291787582453	0.5497895505232863	8.881228663133568e-05	0.134706889074517	8.881228663133568e-05	0.1427790118833575	0.0335044969346154	0.0176429874576256	0.0335044969346154	0.0181232604425487	ZFYVE21	51559	XRCC3	51786	PPP1R13B	80285	False	False	False	alt	-10	0.001907	95	0.05768
1268	chr14	103772310	T	C	rs12888002	0.0025356135372	0.6658668522973626	0.0032968885827999	0.6739641160309742	0.00814473631544	0.5725185036193334	2.280575003195219e-05	0.6722180669049467	2.7995010819927225e-05	0.6800757128428416	0.0268778721770972	0.9476439578799792	2.6390863022101333e-05	0.912414167022234	7.057375040091678e-05	0.9199452688571722	0.0002060917564886	0.952933311301584	2.631606549265229e-07	0.9151649971355296	5.641108963618368e-07	0.9228107897424512	0.0006784302741729	0.7729745770137499	0.001114119441073	0.7784299123445542	ZFYVE21	56579	XRCC3	56806	PPP1R13B	75265	False	False	False	alt	-20	0.001575	70	0.005127
1269	chr14	103787716	A	G	rs66509671	0.0027221648659999	0.6219238095037611	0.003886204134	0.6244048311391815	0.009233893979015	0.375747334127425	2.295433781698229e-05	0.6268238794325154	3.400361478582242e-05	0.6284242860489047	0.2938930901772839	0.5000111539249705	0.0009085340281539	0.5626863284653636	0.0012676602163275	0.5656925095518697	0.0026915301829589	0.4603044290732059	7.74601152032637e-06	0.5617687849966035	1.1121485078516287e-05	0.5640335642204759	0.002286330771066	0.5427248758335973	0.0031286631604061	0.5438073676542478	PPP1R13B	59859	ZFYVE21	71985	XRCC3	72212	False	False	False	alt	45	0.002014	100	0.0337
1270	chr14	103788746	G	A	rs11160762	-0.03106261508	0.1003214279086026	0.03106261508	0.0955497083282554	0.027582326293841	0.0110988127907118	-0.0011445702285245	0.0327239204778219	0.0011445702285245	0.0315479744936181	0.2776045394661769	0.5344715979385696	-0.009618871510033	0.1650225946810308	0.009618871510033	0.156347944173137	0.0081792261393201	0.0456082005483533	-0.0003657757349714	0.0521022374700128	0.0003657757349714	0.0499017930234572	-0.0254421726366455	0.0501439846338863	0.0254421726366455	0.048735688888092	PPP1R13B	58829	ZFYVE21	73015	XRCC3	73242	False	True	False	ref	-80	0.0008545	-15	0.007507
1271	chr14	103797800	G	C	rs12883337	0.0223028467999999	0.1613589214451725	0.0223028467999999	0.1696507186386038	0.0068867409123828	0.7733008161710206	0.0001581242886743	0.2312182315723975	0.0001581242886743	0.2403419206741924	0.2745256693534165	0.5350076004880825	0.006360676677364	0.2009702399337915	0.006360676677364	0.2115226611870889	0.0018996359962832	0.6248646144215482	4.521016872968528e-05	0.2551666797800415	4.521016872968528e-05	0.2658017482934787	0.0182284048589715	0.0852509237398249	0.0182284048589715	0.08773761123789	PPP1R13B	49775	ZFYVE21	82069	XRCC3	82296	False	False	False	alt	-35	0.006508	-85	0.04968
1272	chr14	103805167	G	A	rs66676135	0.00697173066	0.4480149249115699	0.00697173066	0.4604129740640014	0.008440946547461	0.5159282033592191	5.742717784114261e-05	0.4756288510680861	5.742717784114261e-05	0.4874300796592035	0.1250780609757362	0.7765104126296155	0.0009320506567289	0.5996365432423446	0.0009320506567289	0.6137385776449369	0.0010178791062783	0.7890288512142369	7.355964571759328e-06	0.6152266668651236	7.355964571759328e-06	0.6287911535210787	0.006477245614581	0.2992062566054018	0.006477245614581	0.3079435756579518	PPP1R13B	42408	ZFYVE21	89436	XRCC3	89663	False	False	False	alt	-65	0.01059	-65	0.02283
1273	chr14	103855689	A	G	rs3861678	0.0911399178	0.0027989851598668	0.0911399178	0.0029154209438674	0.0195473166942269	0.0287206270296092	0.0017855996039892	0.0042035899141591	0.0017855996039892	0.0043916211843889	0.5998734426705672	0.0486495666662031	0.0546903578513957	0.0018819677228098	0.0546903578513957	0.0020132480315893	0.0117239254452171	0.0072317595904364	0.0010712741057661	0.0031246497869186	0.0010712741057661	0.0032936743303938	0.0132947437214077	0.1270495840819305	0.0132947437214077	0.1311444814326087	PPP1R13B	8114	ATP5MJ	72580	TDRD9	72768	True	True	True	alt	30	0.0002289	-100	0.08997
1274	chr14	103857440	G	T	rs6576007	-0.0490116254	0.0312091049179748	0.0490116254	0.0292884105790602	0.0168418225116328	0.0530810183704705	-0.0008706660925881	0.0180535801067204	0.0008706660925881	0.0170833232975216	0.5206091349495326	0.1422023812007904	-0.0254906024564851	0.0260182830324989	0.0254906024564851	0.0240318562738542	0.0087624498119385	0.0214004911058524	-0.0004516337362184	0.0160738305157278	0.0004516337362184	0.0150333785611906	-0.0141930932893493	0.1328739228875816	0.0141930932893493	0.1288955260282129	PPP1R13B	9865	ATP5MJ	70829	TDRD9	71017	False	False	False	ref	70	0.000996	-60	0.01161
1275	chr15	34365388	A	G	rs4984237	0.0599000506	0.0137814322581847	0.0599000506	0.0148262935633736	0.0130810789897815	0.1311897527571049	0.0008151749112587	0.01865910240477	0.0008151749112587	0.0197931977456087	0.5726200479258085	0.0750603127108531	0.0343033525261408	0.0093795800832198	0.0343033525261408	0.010294844685901	0.0074808035636107	0.0390631702617432	0.0004661131335251	0.0134506702151732	0.0004661131335251	0.0144706526784104	0.0113984584902333	0.1543540222984135	0.0113984584902333	0.159215228517462	LPCAT4	1808	NUTM1	22072	NOP10	22208	False	True	False	alt	-100	0.01004	-100	0.1246
1276	chr15	34367316	G	C	rs117799466	0.0696432615999999	0.0095603196026779	0.0696432615999999	0.0102353763261438	0.0367513577975468	0.0016030954301238	0.0026946347399112	0.0027620630648099	0.0026946347399112	0.0028769951962628	0.8382950030601977	0.0047994077119436	0.0585241441358065	0.0019591942622654	0.0585241441358065	0.0021263389591061	0.0308550606082559	0.0003906738255687	0.0022684637073996	0.0012224689163812	0.0022684637073996	0.0012930181710916	0.0140478635670494	0.1288650286895566	0.0140478635670494	0.1329215268030671	LPCAT4	120	NUTM1	24000	NOP10	24136	True	True	True	alt	-5	0.0008545	-5	0.001709
1277	chr15	40319660	T	C	rs11070264	0.00773161432	0.4278404028309094	0.00773161432	0.4401838562468755	0.007129420770091	0.753737742401253	5.490647545383877e-05	0.4976332491397245	5.490647545383877e-05	0.5100736002291187	0.1210116287513355	0.7872216138474563	0.0009507074499598	0.6030602660028433	0.0009507074499598	0.6170707732223835	0.0008884149459474	0.8186191859865045	6.930798086598193e-06	0.6385969322028034	6.930798086598193e-06	0.6524744824730218	0.0066432224400667	0.2757421216079989	0.0066432224400667	0.2837716895744328	INAFM2	4033	PLCB2	11725	CCDC9B	21279	False	False	False	alt	-90	0.01544	85	0.02826
1278	chr15	40324785	T	C	rs2289334	0.0702974272	0.0072952972233744	0.0702974272	0.0077047287147848	0.0193606537780698	0.0294336614138431	0.0013732826217265	0.006640037559151	0.0013732826217265	0.0068887194624704	0.6786501934667372	0.0144103387967352	0.0476932995774523	0.0030016477101722	0.0476932995774523	0.0032136709485306	0.0131589448874953	0.0053836208151108	0.0009332024512649	0.0039544506902941	0.0009332024512649	0.0041498880145898	0.0075104513532297	0.2460393984141693	0.0075104513532297	0.2536995862409274	INAFM2	1092	CCDC9B	16154	PLCB2	16850	True	True	True	alt	100	0.03235	-95	0.0999
1279	chr15	40327542	T	G	rs1077476	0.0673309132	0.008738603924622	0.0673309132	0.0092970880684822	0.0152879156558792	0.075419968603874	0.0010744921318231	0.0106899388295411	0.0010744921318231	0.0112393248980575	0.5117584207305056	0.1559029489589951	0.0346919440268254	0.0091042561389651	0.0346919440268254	0.0098942413659074	0.0078728899043148	0.0337731733890228	0.0005565665134691	0.0098632611671035	0.0005565665134691	0.010522503208533	0.0207180572412576	0.0662849050844921	0.0207180572412576	0.0680963604863318	INAFM2	3849	CCDC9B	13397	PLCB2	19607	False	True	True	alt	-25	0.001722	-30	0.09106
1280	chr15	43458039	C	A	rs2467742	0.0003990526099999	0.8685676667807871	0.001248259938	0.8718480906151954	0.0236382198581818	0.0124251517668943	1.2142554220833126e-05	0.6802082768248532	2.891977730179509e-05	0.6840622871822846	0.0331123766844053	0.9320621197033924	1.990531407521028e-05	0.9479422208638648	3.442353608318494e-05	0.9513492259356436	0.0008062407255341	0.8144575640021913	5.21724578731143e-07	0.8963865623278474	8.261601933843073e-07	0.8999406445690755	0.0003755225676614	0.8732068161759259	0.00056639591697	0.876625158838531	TP53BP1	52689	MAP1A	52920	ZSCAN29	86996	False	True	False	alt	100	0.001564	60	0.03918
1281	chr15	43471801	C	T	rs518288	-0.000551060458	0.9021461969773192	0.001058719942	0.9041415783665332	0.026807974507901	0.0068301920809318	-1.0494240757135302e-05	0.7278444320859315	2.5268894990581804e-05	0.7292752280604072	0.0254089772715484	0.9510256410878988	1.491535648382421e-06	0.9698813548545612	1.6097999238146465e-05	0.972519887989381	0.0007401980993456	0.839405123103544	9.815158318459693e-08	0.932374411320105	4.216607973689173e-07	0.9353138244317843	6.63907301943037e-05	0.9389231556419756	0.0002448158175914	0.9417119394679044	TP53BP1	38927	MAP1A	39158	ZSCAN29	100758	False	True	False	ref	-100	0.01611	50	0.0335
1282	chr15	43531615	A	G	rs572837	-0.00576647456	0.5311235923618709	0.00576647456	0.5183260516719824	0.0064823919012471	0.846238856478221	-3.817101338811746e-05	0.6191294536862028	3.817101338811746e-05	0.6064857479576167	0.4139026338447494	0.307238007213389	-0.0022914963557268	0.4228972514540573	0.0022914963557268	0.4099154893721212	0.0026762589544751	0.4687292202283352	-1.507221379981862e-05	0.48973364813899	1.507221379981862e-05	0.4768935139469042	-0.0034045996327762	0.5342383599633765	0.0034045996327762	0.5225027685947269	MAP1A	20656	TP53BP1	20887	PPIP5K1	58593	False	False	False	ref	50	0.003063	-100	0.0552
1283	chr15	43536810	C	T	rs2255663	-0.0125733768	0.3130189959625797	0.0125733768	0.3020667759087083	0.0057294876299005	0.9615300899581491	-7.417478163964434e-05	0.4402569208754716	7.417478163964434e-05	0.4290953553565195	0.0693554912395356	0.8706102279778789	-0.0008895099025905	0.6368098304382545	0.0008895099025905	0.623029936610989	0.0003948173913205	0.912388998408212	-5.19356661675198e-06	0.7106850373632093	5.19356661675198e-06	0.6968506863891353	-0.0090976047469371	0.2316972471126953	0.0090976047469371	0.2247994672838905	MAP1A	25851	TP53BP1	26082	PPIP5K1	53398	False	False	False	ref	-50	0.002289	-85	0.0299
1284	chr15	43632949	T	G	rs7169112	-0.0107692684	0.3398614617586137	0.0107692684	0.3286458121259868	0.0243669081429793	0.0109421054833927	-0.000262892622057	0.1213999398343118	0.000262892622057	0.1153695722520829	0.3261548356310749	0.4584724648083332	-0.0035436139449764	0.3242256921864845	0.0035436139449764	0.3124268805498445	0.007932999443919	0.0305338949214702	-8.632017583882463e-05	0.1445199619271686	8.632017583882463e-05	0.1366754238670728	-0.0078838992105726	0.2556909339148492	0.0078838992105726	0.2481136174305776	ENSG00000284772	666	STRC	14149	CATSPER2	35169	False	True	False	ref	-100	0.006424	90	0.001404
1285	chr15	43743165	A	C	rs8033846	-3.8705967999999937e-05	0.6670950581052136	0.003979311952	0.6708486451444783	0.0351999528999101	0.0021343154404047	-3.417272156155233e-05	0.30414602241958	0.0001518456811314	0.3060547777627261	0.2435274224836357	0.5874263042169416	-5.8190066200819976e-05	0.6413627715318508	0.000979254615747	0.6458513502060987	0.0086087389051945	0.0234664213899114	-1.0335211630081605e-05	0.3566711402803665	3.785544279928357e-05	0.3591286593810537	-0.0003008329961929	0.5273778614860605	0.003429496156599	0.5304658726609262	PDIA3	3230	SERF2	33923	ELL3	34150	False	True	True	ref	-75	0.01138	-50	0.02164
1286	chr15	43746265	C	A	rs7174732	-0.005090900248	0.5973300195144666	0.005212788672	0.5858253988994812	0.0162096756681965	0.0592239125279323	-8.160276629605787e-05	0.4403191008623302	8.35160866861631e-05	0.4297087742147638	0.9042977624249214	0.002667480227835	-0.0046517101397498	0.3218694833870679	0.0047621695099256	0.3105288518249085	0.0146434238377564	0.0033971733272133	-7.45340468660217e-05	0.2181922308866417	7.626796183691967e-05	0.2100222529823522	-0.0008153611551986	0.8401342936985703	0.0008402576790215	0.8297754550009292	PDIA3	130	SERF2	30823	ELL3	31050	True	False	False	ref	80	0.01453	90	0.01367
1287	chr15	43746701	C	T	rs2411284	-0.0143730941	0.2767301862820624	0.0143730941	0.266218881949116	0.0122861575464477	0.1705668294071139	-0.0001946856441692	0.2063924494189535	0.0001946856441692	0.198205568251279	0.9031649705909812	0.0027025929095318	-0.0129543367366328	0.0970829643293677	0.0129543367366328	0.0904650234470106	0.0110838459406019	0.0097342115647818	-0.0001753729748049	0.0739971358866376	0.0001753729748049	0.0693722238868032	-0.0025228477473832	0.6120995992752415	0.0025228477473832	0.5996548145998518	PDIA3	306	SERF2	30387	ELL3	30614	True	False	False	ref	-100	0.01522	-65	0.0904
1288	chr15	43768685	C	T	rs12441861	-0.0165482947	0.2383578728101129	0.0165482947	0.2287078419022211	0.0075726201382622	0.6790718494305921	-0.0001260165566885	0.2972597974257521	0.0001260165566885	0.2876490178198604	0.39145841761844	0.3491955803870353	-0.0064303256630476	0.2121055084723188	0.0064303256630476	0.2018404946620977	0.0029931804115136	0.4222351126806983	-4.953569613743044e-05	0.2502091418700067	4.953569613743044e-05	0.2401889792104855	-0.0092843286756086	0.2100703885652778	0.0092843286756086	0.2040041344826924	SERF2	8403	ELL3	8630	PDIA3	22290	False	False	False	ref	100	0.01017	-75	0.0412
1289	chr15	43977577	A	C	rs2957583	-0.00719221134	0.4681510752934623	0.00719221134	0.4557822710790871	0.0397050739316418	0.0012190455139013	-0.0002933833160753	0.1076622246605983	0.0002933833160753	0.1023167358336499	0.4263197751014014	0.29330110750075	-0.0030860769118899	0.358121156912375	0.0030860769118899	0.3458840095477809	0.0169918699352745	0.0022326781038805	-0.0001263409674139	0.0990651760691197	0.0001263409674139	0.0930854528248985	-0.0033900766605462	0.5183102407315182	0.0033900766605462	0.5067221297511687	WDR76	150596	MFAP1	152887	SERINC4	177357	False	True	True	ref	75	0.0083	80	0.05127
1290	chr15	43988411	T	G	rs4924727	-0.0100898397199999	0.3806705002568598	0.0100898397199999	0.3686895853185474	0.0166375028960256	0.0555536350766781	-0.000170038813504	0.2335227606742052	0.000170038813504	0.2246044224655249	0.2443241112459672	0.5827951117805975	-0.0026960570448807	0.4147892851201814	0.0026960570448807	0.4017228964539172	0.004127054256091	0.2350272218460018	-4.6311346259937285e-05	0.2852947699861921	4.6311346259937285e-05	0.2744288317399618	-0.0090955300366185	0.2464856141268917	0.0090955300366185	0.2394955079814441	WDR76	161430	MFAP1	163721	SERINC4	188191	False	False	False	ref	100	0.003021	-40	0.03165
1291	chr15	44054563	C	T	rs12437804	-0.0232637994	0.1645684636325186	0.0232637994	0.1567108443746891	0.0077204559169984	0.6471071331272692	-0.0001888051791904	0.206052308807654	0.0001888051791904	0.1978684502926911	0.100210583097335	0.8191605105592942	-0.0021503883153187	0.4364926639572424	0.0021503883153187	0.423481033395441	0.0007497680577659	0.8426139610010236	-1.6893184223171568e-05	0.4659736736993507	1.6893184223171568e-05	0.453438541247406	-0.0185479102480315	0.087259012117991	0.0185479102480315	0.0848816852798247	FRMD5	140708	WDR76	227582	MFAP1	229873	False	False	False	ref	-65	0.0004768	-100	0.05786
1292	chr15	44056202	T	C	rs4419034	0.0105072784	0.3306397947166175	0.0105072784	0.3420343243575404	0.0076838917197376	0.6215509090745004	8.3886584431144e-05	0.3775340515625015	8.3886584431144e-05	0.3887141725649159	0.0802539445429931	0.8509280409569342	0.0009581959742184	0.6162200046236505	0.0009581959742184	0.6303578002168694	0.0006382291107772	0.8589064115975691	8.070837210352301e-06	0.6309259651325915	8.070837210352301e-06	0.6451622044302013	0.0077926119565555	0.2348775167936858	0.0077926119565555	0.2417047871925234	FRMD5	139069	WDR76	229221	MFAP1	231512	False	False	False	alt	20	0.0014305	45	0.003487
1293	chr15	44097699	G	A	rs2706488	-0.0270871426	0.1291684095001826	0.0270871426	0.1222971439183464	0.0069865077255782	0.7926614503587417	-0.0001905000848423	0.1924544360119584	0.0001905000848423	0.184435465693577	0.1264266226828078	0.7752499075590756	-0.0032832020265352	0.3407873694603243	0.0032832020265352	0.3288107982001896	0.0008858043304961	0.8157677157431464	-2.32013058848307e-05	0.3931879047567272	2.32013058848307e-05	0.3813762616644732	-0.0238093756159296	0.0518035062415334	0.0238093756159296	0.0503914408746041	FRMD5	97572	GOLM2	191021	WDR76	270718	False	False	False	ref	75	0.003094	-100	0.01428
1294	chr15	44117884	T	C	rs2957581	-0.00579204158	0.5506221450235351	0.00579204158	0.5378554370371798	0.0256768517287169	0.008276390664649	-0.0001397209267686	0.2632614417336481	0.0001397209267686	0.2539490091129857	0.2920963910414008	0.5104503857715295	-0.0017407914489878	0.5035660617755161	0.0017407914489878	0.4904593313880495	0.0074941295094707	0.0379891004153382	-4.185067172418899e-05	0.280175291543738	4.185067172418899e-05	0.2696083703843026	-0.0045394661770349	0.4263844574720571	0.0045394661770349	0.4160889426562499	FRMD5	77387	GOLM2	170836	WDR76	290903	False	True	True	ref	40	0.003601	50	0.01261
1295	chr15	44125178	G	A	rs2615285	-0.00972131854	0.3760480239429559	0.00972131854	0.3643183997568717	0.0087324704711794	0.4533172868110729	-8.416267439096225e-05	0.3919545619311151	8.416267439096225e-05	0.3811036023520623	0.1206132843701697	0.7886903180817166	-0.0011828942818252	0.5743241114322052	0.0011828942818252	0.5606838229097182	0.0010572062747812	0.7853309148994686	-1.027953057889399e-05	0.5747052009590992	1.027953057889399e-05	0.5613911852613126	-0.0091888920009543	0.2195360080610263	0.0091888920009543	0.2129073026351111	FRMD5	70093	GOLM2	163542	WDR76	298197	False	False	False	ref	-85	0.01915	-85	0.03387
1296	chr15	44127261	C	T	rs2555385	0.0060441385799999	0.4972791705555525	0.0060441385799999	0.5100375384224685	0.0242567410634682	0.0113198140163331	0.0001446383475693	0.2268204983180175	0.0001446383475693	0.2359690164449885	0.2164690505088226	0.6295460171971365	0.0013161988675086	0.5219755041558659	0.0013161988675086	0.5357319035112447	0.0051884190871571	0.1252808798334501	3.0973244295302415e-05	0.3034682445934321	3.0973244295302415e-05	0.3148420671274298	0.0056722580109751	0.3281167253025179	0.0056722580109751	0.33746141585614	FRMD5	68010	GOLM2	161459	WDR76	300280	False	True	False	alt	-80	0.0006943	-40	0.0322
1297	chr15	44128046	G	A	rs2114422	0.00425252624	0.5104879792608704	0.00617311884	0.5182155428608605	0.0082383141434249	0.551912068547468	3.574560203681591e-05	0.5330344830260475	5.264523106897376e-05	0.5403113359639119	0.167205053994336	0.7089285724075974	0.0006487265310842	0.5949111538833339	0.000979773187363	0.6026794765272063	0.0013520468854684	0.7253985772429566	5.250042537675432e-06	0.6072663532235463	8.162979767297469e-06	0.6147814741080011	0.0045809603834064	0.3291654034278141	0.0060000622413095	0.3349583907188001	FRMD5	67225	GOLM2	160674	CTDSPL2	299577	False	False	False	alt	-45	0.00317	-25	0.02936
1298	chr15	44133240	A	C	rs8042697	0.0016991093499999	0.8152673043391213	0.00211159233	0.8189174089535785	0.0265646918848897	0.0073319378439222	4.053228438168211e-05	0.5701326649047033	5.206939617626463e-05	0.574635816450094	0.0620940051245344	0.881275562751562	6.722492067214486e-05	0.9123687074638948	0.0001033867562008	0.9144802552553238	0.0016589187239802	0.6488700698885881	1.5351978502434067e-06	0.8178173833471222	2.54765027949175e-06	0.8204979950286536	0.0008049876036058	0.7820126907538465	0.0011452400958515	0.7850313221025003	FRMD5	62031	GOLM2	155480	CTDSPL2	294383	False	True	True	alt	65	0.002747	35	0.01034
1299	chr15	44141094	T	G	rs2706472	-0.00781885248	0.4379615031594356	0.00781885248	0.4256825683964969	0.0220597488422932	0.017343852447808	-0.000174744933938	0.1983248535751496	0.000174744933938	0.1901392349457668	0.0436124856066971	0.9228981547639784	-0.0003253386247605	0.8003278424046056	0.0003253386247605	0.7861597908585555	0.0009737714651407	0.8024639832332379	-7.367437378936381e-06	0.6421370358556897	7.367437378936381e-06	0.6285399960505674	-0.0043029492007178	0.4396945237700402	0.0043029492007178	0.4289550604707521	FRMD5	54177	GOLM2	147626	CTDSPL2	286529	False	True	False	ref	-80	0.0876	-85	0.05286
1300	chr15	58667074	T	C	rs1427281	0.0117581135999999	0.2965317767307917	0.0117581135999999	0.3075618794106668	0.006091502986538	0.9168566366075602	7.192456048825962e-05	0.4135348028143208	7.192456048825962e-05	0.4248514563156779	0.3136298094378572	0.4589645144108761	0.0037888696720165	0.2960706596263126	0.0037888696720165	0.3080412878174023	0.0018819750093472	0.6298414803722782	2.2824095337495823e-05	0.3814621410087231	2.2824095337495823e-05	0.3935552676973386	0.0082345252544113	0.2185830925719054	0.0082345252544113	0.2253894625624233	ADAM10	82717	MINDY2	104119	ALDH1A2	169208	False	False	False	alt	-95	0.006454	100	0.04633
1301	chr15	58685871	C	A	rs74017282	0.0054886564	0.5264516700254686	0.0054886564	0.5395041236167263	0.0173029394098037	0.046411357889618	9.597934450801604e-05	0.3233582028194194	9.597934450801604e-05	0.3337697592547505	0.2436394568408385	0.5870925370141752	0.001296440020095	0.5197322837771667	0.001296440020095	0.5335858072469147	0.0041772348594647	0.2330980714208612	2.241570367929028e-05	0.3691265259556306	2.241570367929028e-05	0.3812255449335978	0.004800879677175	0.3725009950073905	0.004800879677175	0.3824547116420257	ADAM10	63920	MINDY2	85322	RNF111	179305	False	False	False	alt	25	0.0006714	100	0.0291
1302	chr15	58693802	A	T	rs12912003	0.0102471226	0.3419230719770725	0.0102471226	0.3535740705050209	0.008315688317859	0.5470608066060314	8.979639482642126e-05	0.3711866786383207	8.979639482642126e-05	0.3822425843675506	0.1196132739966182	0.7909190088060526	0.0013474439281556	0.5365173580020954	0.0013474439281556	0.550096835560182	0.0010460855105602	0.7891438955484683	1.2499460016599937e-05	0.5426353398569972	1.2499460016599937e-05	0.5559592075545379	0.0096494776916772	0.2018021496329962	0.0096494776916772	0.2081529112857133	ADAM10	55989	MINDY2	77391	RNF111	171374	False	False	False	alt	-95	0.003845	-35	0.01758
1303	chr15	58756822	A	G	rs640704	0.058323413	0.0151458933483167	0.058323413	0.0161789925691183	0.0117584988538469	0.1842529956014545	0.0007138615376992	0.022646778716397	0.0007138615376992	0.0240445429845708	0.2559922820776149	0.5655525153668097	0.0151058174581478	0.0648356642873278	0.0151058174581478	0.0702211536324877	0.0029648875363291	0.4171412464204834	0.0001815597949049	0.055286491650457	0.0001815597949049	0.0594192589347489	0.0521893380636728	0.0033922910637863	0.0521893380636728	0.0035146546492436	ADAM10	7031	MINDY2	14371	RNF111	108354	False	True	False	alt	-90	0.004066	-90	0.03072
1304	chr15	58757147	C	A	rs12437952	-0.00301349497	0.710226348155655	0.00338419519	0.7031285904270774	0.0146384334312671	0.0866089530553609	-4.154593366228516e-05	0.5840476701766186	4.725554876589251e-05	0.5771815712352473	0.1300386933474413	0.766269779467198	-0.0004243414879989	0.7642911161295555	0.0004862148839716	0.7576217647791197	0.0018970413273684	0.605634509382387	-5.8607352125472924e-06	0.6844474536343469	6.809298274752237e-06	0.6776446563496998	-0.0025581178227989	0.5516573054038638	0.0029274162595047	0.5459007346697115	ADAM10	7356	MINDY2	14046	RNF111	108029	False	False	False	ref	-75	0.001371	-55	0.0451
1305	chr15	58774477	C	T	rs8025383	0.00962812256	0.3977358124371467	0.00962812256	0.4100047317666815	0.009891159102204	0.3311550369514657	0.000101372417389	0.3777351045446648	0.000101372417389	0.3889557313907976	0.1451882280936523	0.7435036838213995	0.0014204116130186	0.5457925225994018	0.0014204116130186	0.5593894595717905	0.0013855548769196	0.7208077467685643	1.4477166669464068e-05	0.5195954785045973	1.4477166669464068e-05	0.5325900913493778	0.0086930362348156	0.2634598266434692	0.0086930362348156	0.2706666666822081	MINDY2	3284	ADAM10	24686	RNF111	90699	False	False	False	alt	-95	0.010254	65	0.0802
1306	chr15	58794504	T	G	rs474875	-0.004622306154	0.6024255940812971	0.004622306154	0.5893627287339392	0.0210951043634015	0.0211139001321953	-0.0001003304410124	0.3582655972972888	0.0001003304410124	0.3476261257377043	0.3718399568460254	0.3786043824032832	-0.0017796919957963	0.4933413724489565	0.0017796919957963	0.4800802367707499	0.0078614784216723	0.0317414125917494	-3.863077833615346e-05	0.3047421758807423	3.863077833615346e-05	0.2934096470276045	-0.0028568761086732	0.5701471429155822	0.0028568761086732	0.557954715706	MINDY2	23311	ADAM10	44713	RNF111	70672	False	False	False	ref	-90	0.01155	-95	0.02902
1307	chr15	58849507	A	G	rs793571	-0.00261859567	0.7064114699521821	0.00346454271	0.6992945867222731	0.0192332898738076	0.0315367377698304	-6.238904818619378e-05	0.5187152365894512	7.536777403090063e-05	0.5116378930124728	0.1752217346652973	0.686066625165113	-0.0003544132510777	0.7338333653057769	0.0005812241803289	0.7278422798267822	0.0033002259983461	0.3312651457894942	-8.999207068481891e-06	0.5967496697012453	1.2478995740379868e-05	0.5908814108062894	-0.0025830143466218	0.5640208987466421	0.0034626915216961	0.5580096320750307	RNF111	15669	MINDY2	78314	SLTM	84172	False	False	False	ref	-100	0.02232	-100	0.07336
1308	chr15	58882340	G	T	rs7179456	-0.0157676203999999	0.2460308832901659	0.0157676203999999	0.2361937059489963	0.0070955125283874	0.7616950329200424	-0.0001112190028541	0.3130298730727994	0.0001112190028541	0.3032112510930147	0.167970622101889	0.7062394631401104	-0.0026247093227526	0.3942237281110683	0.0026247093227526	0.3814159446291833	0.0011917521454531	0.7528172847221941	-1.849840072682888e-05	0.4414229173828714	1.849840072682888e-05	0.4288969172983045	-0.0149441384246724	0.1155245321346384	0.0149441384246724	0.1121236829288716	RNF111	17164	SLTM	51339	MINDY2	111147	False	False	False	ref	-35	0.013245	-85	0.01729
1309	chr15	58889786	G	A	rs2270664	0.00378937726	0.6116746855793539	0.00411396538	0.62057654109638	0.0108502293661826	0.230654841098979	3.962377087084094e-05	0.5583940340827616	4.341793136185692e-05	0.5667820423208421	0.4247346964180126	0.2964456687225431	0.0016725782063019	0.4630719888477638	0.0017952091430232	0.4726951659747234	0.0045959661226405	0.1816970533155052	1.7486470061436134e-05	0.4248657680927524	1.891992191345537e-05	0.4336044946072502	0.0017386072469631	0.6607860647837319	0.0018962852311745	0.6689644362801848	RNF111	24610	SLTM	43893	MINDY2	118593	False	False	False	alt	40	0.001415	90	0.0343
1310	chr15	58891447	T	C	rs11071400	-0.001587618356	0.8425679044422036	0.001587618356	0.8308389558127897	0.0221988055172343	0.0167480328722126	-3.711593539480818e-05	0.6305515782330262	3.711593539480818e-05	0.6177650106704159	0.025095696013444	0.9516135805723728	-4.1168450695123816e-05	0.9563879783820728	4.1168450695123816e-05	0.9471985679421158	0.0005505912728557	0.8823406472734042	-9.484263614921096e-07	0.9062905451408624	9.484263614921096e-07	0.8951479290794959	-0.0007054015083143	0.8626357808071504	0.0007054015083143	0.8538674260693664	RNF111	26271	SLTM	42232	MINDY2	120254	False	True	False	ref	-80	0.00378	50	0.01575
1311	chr15	58905741	T	C	rs11857223	0.0323781818	0.0844467621519199	0.0323781818	0.0896923809551909	0.0114184209888247	0.2039035155075699	0.0003775352252101	0.0691766044082465	0.0003775352252101	0.0732836826750692	0.1348063776595192	0.7623484949701996	0.0048605002485122	0.264475862364705	0.0048605002485122	0.2762460447127174	0.0016132094262062	0.669239686308019	5.9333140378138864e-05	0.2203066481842381	5.9333140378138864e-05	0.2306338396331131	0.0297803919127791	0.0308780408508275	0.0297803919127791	0.0317273549526424	SLTM	27938	RNF111	40565	MINDY2	134548	False	False	False	alt	-70	0.0875	95	0.02911
1312	chr15	58910399	G	T	rs4774315	-0.01308109532	0.3134154662849501	0.01308109532	0.3025831955698187	0.0081871761166869	0.549398259451644	-0.0001049743790937	0.3472425932983886	0.0001049743790937	0.3367687136459648	0.0802394215707631	0.855837608067779	-0.0009713949426383	0.6208263300937509	0.0009713949426383	0.6071732941970037	0.0006669178147884	0.8595521525470405	-7.882588793831191e-06	0.6313707217355682	7.882588793831191e-06	0.6178736122431162	-0.0095685639892529	0.216594036041052	0.0095685639892529	0.2099163468522402	SLTM	23280	RNF111	45223	MINDY2	139206	False	False	False	ref	5	0.000473	-95	0.04608
1313	chr15	58946062	A	G	rs4775106	0.00693170496	0.4720042591532854	0.00693170496	0.4852442412178918	0.0067035545020098	0.8307277702729624	4.672472138617913e-05	0.5481404089398287	4.672472138617913e-05	0.5610613450695876	0.2041058517204534	0.6510142026623015	0.0012851487159686	0.545702049734273	0.0012851487159686	0.559693444964844	0.0013742569874285	0.7298989714349372	8.61865184418305e-06	0.5967944206592702	8.61865184418305e-06	0.6105039757134592	0.0063423894438738	0.3114981396299443	0.0063423894438738	0.3201361485390142	SLTM	12383	RNF111	80886	CCNB2	159065	False	False	False	alt	-45	0.003344	60	0.04593
1314	chr15	59067727	C	T	rs8042896	-0.001008977072	0.7916203498090129	0.002364016792	0.7887364185478093	0.0160972152173462	0.0631530399398832	-1.1359568426208447e-05	0.6430004270824249	3.643960362742108e-05	0.6406743540084434	0.3776864905237606	0.3730606003790183	-0.0003573120694277	0.6464543532596801	0.0008734459090872	0.643560467471913	0.0060723999908038	0.0775980281294324	-3.895452628961689e-06	0.5233092461569437	1.3446109608515052e-05	0.5211915962118872	-0.0004958557661386	0.758483560742216	0.0013381881554787	0.7554613147458655	CCNB2	37400	SLTM	134048	LDHAL6B	139117	False	False	False	ref	95	0.006138	-65	0.03061
1315	chr15	59072894	C	A	rs78352043	0.00714448702	0.4702900828547997	0.00714448702	0.4832742393949494	0.0349910233195191	0.0022308994476693	0.0002997022607799	0.1336739604384146	0.0002997022607799	0.1394694793061619	0.220512660919719	0.6196424088028798	0.0015677189742288	0.5058547887835952	0.0015677189742288	0.5195031441780117	0.0077313589045522	0.0361231377230234	6.46102281108945e-05	0.2188508376037342	6.46102281108945e-05	0.2290968218485125	0.0068029751345968	0.3366648839537668	0.0068029751345968	0.3453243008052764	CCNB2	32233	LDHAL6B	133950	SLTM	139215	False	True	True	alt	35	0.002075	100	0.00986
1316	chr15	61539481	T	C	rs11633501	0.0051996118	0.5578965496115936	0.00604593956	0.5685295688373738	0.0090927471915568	0.3942363133316149	4.918681242477292e-05	0.5516798595970809	5.55437573367601e-05	0.5616591505466328	0.2623263726802144	0.5598158458588283	0.0015148820982734	0.5340246026600923	0.0017070285841913	0.5448596227147386	0.0024058310893269	0.5246346145166229	1.431204741830921e-05	0.5249571152253445	1.575529990374735e-05	0.5356573970118784	0.0036992084980134	0.4236046342812943	0.0045415408873535	0.4309701654949077	RORA	310179	VPS13C	520992	C2CD4A	527497	False	False	False	alt	100	0.009766	60	0.0692
1317	chr15	61546114	C	T	rs4635285	-0.0426545931999999	0.0457056799597955	0.0426545931999999	0.042757575428387	0.0116558971277388	0.1971396414280183	-0.000531325298199	0.0473025289858863	0.000531325298199	0.0446104733648892	0.3564518304131785	0.4062158643887997	-0.0151038631963007	0.074132729321232	0.0151038631963007	0.0686928504697395	0.0041268630796627	0.228677023943451	-0.0001864604777753	0.0639206252631962	0.0001864604777753	0.0597964390456568	-0.0286019564518303	0.03085136243972	0.0286019564518303	0.0300900746823063	RORA	316812	VPS13C	514359	C2CD4A	520864	False	False	False	ref	-100	0.003593	-5	0.000679
1318	chr15	61559059	G	T	rs55835773	0.0365426032	0.0595290467241678	0.0365426032	0.0632223587286694	0.0159628798872064	0.0636928652435273	0.0006328411148055	0.0346166741418711	0.0006328411148055	0.0365716226104782	0.2708243861450844	0.540700455749522	0.0103295358466048	0.1141111384275092	0.0103295358466048	0.1215369300278234	0.0044811493131256	0.1909793362859394	0.000185997820014	0.0657276892204814	0.000185997820014	0.070095914270932	0.0313737694374422	0.0243497625181159	0.0313737694374422	0.0250662405759805	RORA	329757	VPS13C	501414	C2CD4A	507919	False	False	False	alt	80	0.000786	80	0.0511
1319	chr15	61559075	C	T	rs55835940	-0.0023331037079999	0.6500807525552335	0.004047903308	0.6412124090738354	0.0122736548496424	0.1559278948799213	-3.110244448921691e-05	0.5498961064774369	5.3565447972359016e-05	0.5418378173707766	0.2358592931461944	0.597333063616581	-0.000642271798164	0.6388819724710589	0.0009628928330925	0.6291360435652122	0.002925221132478	0.4261439853962903	-8.824650176849607e-06	0.5655848693258426	1.3024622943996082e-05	0.5563401579932074	-0.0018838369692631	0.4992557769564856	0.0036514901606862	0.4921814475853646	RORA	329773	VPS13C	501398	C2CD4A	507903	False	False	False	ref	-90	0.0006943	55	0.04416
1320	chr15	61598711	C	T	rs7169676	-0.00045519266	0.6219847916378703	0.00466310934	0.6203816128389718	0.0082500259312625	0.5250909300451171	-2.058379569124188e-06	0.6293062221144626	3.933510731984717e-05	0.627730130395922	0.4963682195873401	0.1807663965294941	-0.0002076973546835	0.4552090874873838	0.0023430832738885	0.453409524483527	0.0040943098730488	0.2384546560142469	-8.249461937087813e-07	0.4669442992038244	1.9741895434292743e-05	0.4653162864580857	-0.0003527007541571	0.7497039332656269	0.0013817570721687	0.7473036326826857	RORA	369409	VPS13C	461762	C2CD4A	468267	False	False	False	ref	-95	0.02611	95	0.11084
1321	chr15	70282669	G	T	rs28620094	0.0073481919199999	0.4794862278240514	0.0073481919199999	0.4923729767570249	0.0079324417119824	0.6083546770044499	6.023653478430886e-05	0.5135981550023301	6.023653478430886e-05	0.5258727594692698	0.019805184701086	0.9608723032536948	0.0001096380441077	0.9003926388084279	0.0001096380441077	0.9146134918221472	0.0001560955933865	0.9632485313523308	8.759172902062957e-07	0.9036602388935872	8.759172902062957e-07	0.9179538337807556	0.0013485617070716	0.7403226108317462	0.0013485617070716	0.7537029131034446	TLE3	184493	UACA	480889	LRRC49	570571	False	False	False	alt	-95	0.003527	-100	0.01627
1322	chr15	70283799	G	A	rs1971791	-0.029686594	0.1080521034870915	0.029686594	0.1020074142755987	0.0088985910012772	0.4469745129033785	-0.0002680978935735	0.1232386732768862	0.0002680978935735	0.1171819876323632	0.0177097272793285	0.9631726701925062	-0.0004715773746041	0.7485215328925819	0.0004715773746041	0.734249747374544	0.0001456873940056	0.9639310693435472	-3.916499719839479e-06	0.7500285390082777	3.916499719839479e-06	0.7357802343298807	-0.0068195728171453	0.2944119698135545	0.0068195728171453	0.2866257397321565	TLE3	185623	UACA	479759	LRRC49	569441	False	False	False	ref	80	0.0026	80	0.04303
1323	chr15	70301656	T	C	rs2415092	0.042929402	0.0387843881108001	0.042929402	0.041603151721698	0.0142830987929828	0.0961619376071149	0.0006285662262645	0.0261617394563105	0.0006285662262645	0.0278590099447336	0.4024855029616489	0.3214958420674341	0.0170543886626222	0.0511140165808334	0.0170543886626222	0.0556248458625506	0.0056809838773382	0.0976005357328065	0.0002459927288261	0.0336356039084854	0.0002459927288261	0.0363928307606954	0.0255645805454412	0.0434654271182451	0.0255645805454412	0.0447044593063794	TLE3	203480	UACA	461902	LRRC49	551584	False	False	False	alt	-35	0.006348	-35	0.04895
1324	chr15	78447129	T	C	rs2915695	-0.000466605324	0.8569212733625778	0.001329492396	0.8551677761671702	0.0061093485114403	0.9301114448676452	-2.5087153221391668e-06	0.898701101210363	7.734889194191747e-06	0.8969936161412474	0.258452888515441	0.564292301937993	-0.0001437868709469	0.770407015148245	0.0003549630171643	0.7687483521479163	0.0015675673849965	0.6878906488817996	-7.679323106067883e-07	0.8185176618131952	2.047684983028527e-06	0.816739992584163	-0.0003651490160686	0.7781781091903691	0.0011452400958515	0.7761146122096899	IREB2	9697	HYKK	60436	PSMA4	93277	False	False	False	ref	100	0.00926	-50	0.0492
1325	chr15	78571130	T	C	rs667282	0.065389298	0.0101684007843452	0.065389298	0.0107473123943077	0.020527590154254	0.025945506517121	0.0014834538767929	0.0082990451550029	0.0014834538767929	0.008697828671898	0.2205002126578076	0.623230119545959	0.0145984727103927	0.0676751743551314	0.0145984727103927	0.0730194114354908	0.004556257185594	0.1734411996243096	0.0003325945713903	0.0281029998268082	0.0003325945713903	0.0300522142126375	0.0608968972707185	0.0017273314587403	0.0608968972707185	0.0017730007283421	CHRNA5	5609	PSMA4	30724	CHRNA3	50165	False	True	False	alt	80	0.001987	90	0.02182
1326	chr15	78602417	C	G	rs3743078	0.0608039564	0.0124978872189405	0.0608039564	0.0133068797395588	0.0130066212866118	0.1329070519868142	0.0008329750001237	0.0177246958927196	0.0008329750001237	0.0187065536616441	0.495428375813027	0.1820511645842122	0.0303317044045027	0.0132093680764079	0.0303317044045027	0.014473052799821	0.0064865293120689	0.0659789848071265	0.0004184008173004	0.0164181819778209	0.0004184008173004	0.0175965466325807	0.0209317524040705	0.0629679873770232	0.0209317524040705	0.0647947644349155	CHRNA3	18878	CHRNA5	36896	PSMA4	62011	False	True	False	alt	100	0.00515	100	0.0824
1327	chr15	78617916	C	T	rs3825845	-0.02723275	0.1264758631248013	0.02723275	0.1196383735798594	0.0078265457048237	0.6218781568621512	-0.0002157046884094	0.1669454991547579	0.0002157046884094	0.1595301202061255	0.4726750277492504	0.2137087155073306	-0.0127277382985233	0.0978259329203978	0.0127277382985233	0.0910250651827425	0.0036851347673684	0.3036392593567594	-0.0001005137021715	0.1258955048759448	0.0001005137021715	0.1186380877455957	-0.0106723098787331	0.1876420127796986	0.0106723098787331	0.1820185625549493	CHRNA3	3379	CHRNA5	52395	PSMA4	77510	False	False	False	ref	55	0.00642	0	0.0
1328	chr15	82569019	T	C	rs698500	0.042466811	0.0410199426952334	0.042466811	0.0441455439600664	0.0088294324077653	0.4405502259343751	0.0003831608034363	0.0632181143524266	0.0003831608034363	0.0671815096168425	0.2915984605649436	0.5100945107008358	0.0124283123218614	0.0870190493106315	0.0124283123218614	0.0938669990242225	0.0025799508823474	0.4913012239636986	0.0001123040545799	0.0997002122559711	0.0001123040545799	0.1064091187389001	0.0348489092210499	0.016106918013279	0.0348489092210499	0.0165643811854054	ENSG00000260836	4175	RPS17	28560	CPEB1	79842	False	False	False	alt	-25	0.000692	100	0.06094
1329	chr15	82577391	T	A	rs2678445	0.000223012314	0.9414535222753074	0.000494204614	0.94689791660796	0.019016820260342	0.0362775589077603	6.031297194646284e-06	0.8659112101146614	1.0030514123739296e-05	0.8699334683432234	0.1089430388282036	0.7965681324047864	4.176366712458368e-05	0.9234310987162376	5.872034555546706e-05	0.9268353206225584	0.002102648070726	0.5317556273263255	9.64782444702094e-07	0.8660294915479607	1.208119286410356e-06	0.8701430145369691	0.0002634882104585	0.9003279544573873	0.0004377638772186	0.9034809080831498	ENSG00000260836	4197	RPS17	36932	CPEB1	71470	False	False	False	alt	80	0.003235	95	0.07385
1330	chr15	82580618	C	T	rs783532	-0.00278406014	0.7375230681811775	0.00318601558	0.7298484422117294	0.0062788254643922	0.9001639797393176	-1.765021033690984e-05	0.7988818736494117	2.020200526053698e-05	0.7915094258761345	0.0985321424496104	0.8213428105057402	-0.0002330930614623	0.8223503423928343	0.0002836382294436	0.8152071666858702	0.0006079772984968	0.8697976867248948	-1.453087826842876e-06	0.8572004752661531	1.7739714258865192e-06	0.8500883196865242	-0.0020166184296517	0.600756131230734	0.0025394454299318	0.5938953369695956	ENSG00000260836	7424	RPS17	40159	CPEB1	68243	False	False	False	ref	15	0.0004425	100	0.0166
1331	chr15	82590236	A	C	rs71412256	-0.00623390012	0.5225296841694824	0.00623390012	0.5099279955279244	0.0374880029143305	0.0015196817424476	-0.0002420998335696	0.1567406719545521	0.0002420998335696	0.1497162218909419	0.0905631801159762	0.835490727351286	-0.0005273998828081	0.7291758262118101	0.0005273998828081	0.715508231832545	0.0033663860910711	0.3430695685037215	-2.038558657702473e-05	0.4315595832123193	2.038558657702473e-05	0.4194286664815634	-0.0052552412369422	0.3796400739940824	0.0052552412369422	0.3697669214922675	ENSG00000260836	17042	RPS17	49777	CPEB1	58625	False	True	True	ref	-80	0.00659	-80	0.03029
1332	chr15	82593431	T	G	rs2567635	0.0304782354	0.1039838736635944	0.0304782354	0.1088146185313743	0.0183545878960835	0.0596524904543616	0.0008577438924281	0.058152342951725	0.0008577438924281	0.0606812666593068	0.1448251537879023	0.744522327605585	0.0056257321437118	0.271648578244418	0.0056257321437118	0.2831805863161425	0.0031046234955648	0.3424819881089818	0.0001787050093749	0.1545838999747427	0.0001787050093749	0.160755848426195	0.0272699924273073	0.0438223763279572	0.0272699924273073	0.0449515958410558	ENSG00000260836	20237	RPS17	52972	CPEB1	55430	False	False	False	alt	15	0.0008707	100	0.01624
1333	chr15	82613877	T	C	rs1269134	0.04314562	0.0389978328450666	0.04314562	0.0418272129070506	0.0127087848297405	0.1433094434603671	0.0005536271411306	0.0313733346818031	0.0005536271411306	0.0333361343879981	0.4759509953422752	0.2053883311339653	0.0206279012003466	0.0352794214130681	0.0206279012003466	0.0385636780844516	0.0060807953103	0.0755355533682324	0.0002659791739385	0.0295446330787721	0.0002659791739385	0.0317732719066207	0.0163321196277969	0.0992793411169868	0.0163321196277969	0.1022382353692748	CPEB1	34984	ENSG00000260836	40683	RPS17	73418	False	False	False	alt	-80	0.005722	20	0.01758
1334	chr15	82630613	A	C	rs28374463	-0.00124497352	0.8066072472138002	0.0022458696	0.7993056724088204	0.025579534513414	0.009124269321258	-3.977974017048226e-05	0.5225957823288915	5.7755452847159245e-05	0.5157287287348813	0.0669239307461695	0.8730111478214698	-2.791775830167573e-05	0.8919038691042598	0.0001369791862707	0.8846724650355763	0.0016023912315391	0.6637118645588974	-1.2456911397502915e-06	0.7792721274598476	3.2043928478158843e-06	0.7722116431718588	-0.0007531198456415	0.747389958371422	0.001404578885673	0.7405042727462805	CPEB1	18248	ENSG00000260836	57419	AP3B2	79499	False	True	True	ref	-100	0.0185	95	0.02835
1335	chr15	82697544	A	C	rs10906984	-0.01086306322	0.341917224445204	0.01086306322	0.3305782765987727	0.0082751034366152	0.5504140005368956	-8.889687504453691e-05	0.37429381003279	8.889687504453691e-05	0.363716405816435	0.2620276143943402	0.5546263153940808	-0.0028334655377388	0.3751151556353205	0.0028334655377388	0.3625754865096829	0.002128618474841	0.5792381871937886	-2.279514968602432e-05	0.3929248659301745	2.279514968602432e-05	0.3809647809357683	-0.0091266506913971	0.2200733161194171	0.0091266506913971	0.2133439158446261	AP3B2	12568	CPEB1	48683	FSD2	108526	False	False	False	ref	-100	0.04953	100	0.02411
1336	chr15	82699762	T	G	rs9652567	0.0418037492	0.0405154831243355	0.0418037492	0.0432004664086673	0.0205210982074718	0.0232572869739618	0.0008975444684534	0.0156961924185636	0.0008975444684534	0.016548953088473	0.5480596271745558	0.1042810572737489	0.0229931452295083	0.0272456153547545	0.0229931452295083	0.0297021237612457	0.0112842267346219	0.0089433032674612	0.0004955711158699	0.0122429653265966	0.0004955711158699	0.0130861972903053	0.0096660753742258	0.1858287342508632	0.0096660753742258	0.1917779177029836	AP3B2	10350	CPEB1	50901	FSD2	106308	False	False	False	alt	100	0.02184	100	0.122
1337	chr15	82706505	A	G	rs4779054	0.0502838849999999	0.0239076274481905	0.0502838849999999	0.0256891922123976	0.0098762619359558	0.3163687506196956	0.0004963936272019	0.0379716311276579	0.0004963936272019	0.0405833790330128	0.4931814645380138	0.1843194695896783	0.0249477679850523	0.0226062329141572	0.0249477679850523	0.0247668705576255	0.004857564678838	0.1546887319238618	0.0002457044138744	0.0328723196887027	0.0002457044138744	0.0355778973560632	0.0172719634021099	0.0847542161929333	0.0172719634021099	0.0872950015984525	AP3B2	3607	CPEB1	57644	FSD2	99565	False	False	False	alt	-100	0.00283	55	0.005463
1338	chr15	84549423	A	C	rs34921234	0.0259285522	0.1212865630731259	0.0259285522	0.1284534075280853	0.011197577073649	0.2114244427417752	0.0002939078810925	0.0983098455376662	0.0002939078810925	0.1040314714401009	0.0130603014554092	0.973871370205198	0.0003468481436834	0.7707829105980628	0.0003468481436834	0.7848535112613939	0.0001480723393648	0.966270191711767	3.990597826170554e-06	0.733829103832182	3.990597826170554e-06	0.747976576560199	0.0050892644114565	0.3653018328242696	0.0050892644114565	0.3750543397372519	ZSCAN2	51564	WDR73	104920	NMB	109140	False	False	False	alt	100	0.004898	-15	0.01184
1339	chr15	84562751	G	C	rs12902973	-0.0003687211619999	0.7886203858894693	0.002481131162	0.7824136778626353	0.0089344126602362	0.4286118194802899	-3.7251193892616574e-06	0.7831781316772426	2.138854265776042e-05	0.7769286505114317	0.2712662994429403	0.539443550866791	-9.647342333919988e-06	0.7033349609877249	0.0007772227173372	0.6977690052865742	0.0024119749649791	0.5282780499478854	-2.537178717216024e-07	0.7017563550095736	6.671983520213543e-06	0.696113192217501	-0.0006410854884386	0.724773574644386	0.0015705557111587	0.7182650393028531	ZSCAN2	38236	WDR73	91592	NMB	95812	False	False	False	ref	-60	0.001703	-60	0.08496
1340	chr15	84582816	G	C	rs34973912	0.00922676284	0.3677952970260521	0.00922676284	0.3795652538707999	0.0069571094635875	0.8049462568477862	6.4496312777018e-05	0.4470870238096719	6.4496312777018e-05	0.4586320954721158	0.4514030228529341	0.2477575505634975	0.0042454588541389	0.2682124907788132	0.0042454588541389	0.2797553193758167	0.0031384602906992	0.3974579523677798	2.9657509800267564e-05	0.3225417394596493	2.9657509800267564e-05	0.3341541446948361	0.0036888349464205	0.4628039650836184	0.0036888349464205	0.473946780486611	ZSCAN2	18171	WDR73	71527	NMB	75747	False	False	False	alt	-100	0.01069	-90	0.1256
1341	chr15	84634492	T	G	rs36126054	0.0258193155999999	0.121699928550486	0.0258193155999999	0.1287239371811824	0.0078684419411258	0.6068750187088829	0.0002068616636535	0.156855091322565	0.0002068616636535	0.1643626909049385	0.6356372991421073	0.0256746771495198	0.0164388861329141	0.0555195278321144	0.0164388861329141	0.0604165891552176	0.0050090001222985	0.1420586824586495	0.0001318856666564	0.0804408143428939	0.0001318856666564	0.0862376602802021	0.0024792788306932	0.5842716165793542	0.0024792788306932	0.5967227413046223	WDR73	19851	NMB	24071	ZSCAN2	33505	False	False	False	alt	70	0.02066	-100	0.1316
1342	chr15	84759142	G	A	rs12899981	-0.00090363642	0.802055561371704	0.00220380418	0.7950186146565352	0.0077961387144238	0.6164486626498623	-5.157176310641186e-06	0.8124854903658555	1.768611522059656e-05	0.8056851183875123	0.2360128217097687	0.596704040145708	-0.0001672426820557	0.7293270744116311	0.0005070296749471	0.7223169287867017	0.001853389159457	0.6258748693595234	-8.44983946347619e-07	0.7428942614668395	4.119307932680523e-06	0.7362712962568152	-0.0010871482069315	0.6701704568117026	0.0019626759613688	0.6634885611432906	ZNF592	10549	SEC11A	42682	ALPK3	58215	False	False	False	ref	-100	0.004738	25	0.01852
1343	chr15	89243824	T	G	rs7178152	-0.00628174784	0.4064336897395421	0.01042646464	0.4024415643234068	0.0169323479477975	0.0521674308257436	-0.0001000579919617	0.257123941284562	0.0001798259711733	0.2547689444018688	0.8519030280397099	0.0043393047619746	-0.0054191911974789	0.1801407942183427	0.0088999386494683	0.177572688559042	0.0144009396861102	0.0035498145370222	-8.63534509416698e-05	0.1115748462938642	0.0001533423125502	0.1106078562345219	-0.0013070675007002	0.6722842432365254	0.0020954574217574	0.6685824383912616	FANCI	122	RLBP1	22210	POLGARF	89985	True	False	False	ref	85	0.0366	75	0.2263
1344	chr15	89248285	A	G	rs2108600	0.0589384892	0.0147090357894913	0.0589384892	0.0157138745257497	0.012279722636274	0.1538225635116132	0.0007433784467334	0.0202134991154415	0.0007433784467334	0.0214595316347901	0.1030550109440969	0.8191012599167398	0.0063697308963132	0.1967684849668433	0.0063697308963132	0.2072713013635096	0.0012824986940356	0.7452042978864195	8.089550237648011e-05	0.1517533798610548	8.089550237648011e-05	0.1603159183251244	0.0471955103268705	0.0052343987748011	0.0471955103268705	0.0053835733030347	FANCI	4339	RLBP1	26671	POLGARF	85524	False	True	False	alt	-45	0.00967	-90	0.05264
1345	chr15	89251793	G	A	rs6496569	-0.00277533792	0.7186761767400073	0.003274697	0.7095174182854589	0.0190923316618292	0.0328066247172634	-5.27160763499855e-05	0.4970343262769303	6.18758673988419e-05	0.4887741023569089	0.1394744758763057	0.7566587497934643	-0.0004698633542497	0.7501604653133476	0.0005167590474105	0.7408520028735937	0.0027597775222585	0.4374266021557324	-9.225226777059353e-06	0.6098451592065958	1.008543889923175e-05	0.6006110062248424	-0.0026369568149047	0.5465583698016049	0.0031016919262647	0.5384755591770009	FANCI	7847	RLBP1	30179	POLGARF	82016	False	False	False	ref	60	0.003338	95	0.05548
1346	chr15	90862916	A	C	rs7168951	0.00449018726	0.5712990678531477	0.0057510959399999	0.5808327887026344	0.0080509068926047	0.5693853441590067	3.53014050360417e-05	0.5991817668056157	4.528482587666799e-05	0.6082386831153795	0.4255064886565213	0.2950859169043865	0.0019735889353718	0.4381072626199465	0.0024985457242168	0.4474932305108245	0.0034269391879416	0.3388563587933365	1.5523108830182886e-05	0.4636287624030124	1.967952758989715e-05	0.4724552600519692	0.0017904750049274	0.5878631617298367	0.0025539684021618	0.5957501981668885	FURIN	5673	FES	20780	MAN2A2	39303	False	False	False	alt	75	0.0152	-95	0.10144
1347	chr15	90866779	G	T	rs3759929	-0.0019651139599999	0.6335011942182767	0.00457218276	0.6254888937192059	0.0149448691590074	0.08213259018703	-2.407766008456669e-05	0.4745977006435569	7.372133941836668e-05	0.4680404995001632	0.476751833525244	0.2128845673077335	-0.0009463721814847	0.4528579056078621	0.0022094884786421	0.4449622472984494	0.0071528491802103	0.0457247155433812	-1.1692249314829175e-05	0.336259324463992	3.574444947547143e-05	0.3298428309745548	-0.0006473096193943	0.7186238034891089	0.0016680670961316	0.7102458328172188	FURIN	1810	FES	16917	MAN2A2	35440	False	False	False	ref	-15	0.001323	-55	0.04126
1348	chr15	90976869	A	G	rs8037254	0.0262648116	0.1158621387323964	0.0262648116	0.1228748615980606	0.0088960451670264	0.4358625849749677	0.0002396803800423	0.129850940315049	0.0002396803800423	0.1366095019184502	0.333049098019689	0.4459341410175403	0.008708822740667	0.1333085981579369	0.008708822740667	0.1419883132525433	0.0029582765155567	0.4308471985161267	7.937041959849486e-05	0.1427390197234115	7.937041959849486e-05	0.1509766118783501	0.0188134731688087	0.073426499237225	0.0188134731688087	0.0755649216114763	PRC1	18760	RCCD1	21987	HDDC3	41673	False	False	False	alt	30	0.003174	100	0.01541
1349	chr15	90977078	C	T	rs12595052	0.0042044862508	0.5937271021812756	0.0049022976508	0.6047048644032887	0.0089639613870642	0.4408100028640841	3.226842882234816e-05	0.6143677120531577	3.904062413925661e-05	0.6243987748219154	0.3621738814717994	0.3991687717795305	0.0015331045359838	0.5158854460072709	0.0017830741802013	0.5272475141829003	0.0032600997772048	0.3786878190568309	1.1768360523598168e-05	0.5284612812607666	1.4194292832890616e-05	0.5390556395193474	0.0028444278467618	0.5506734281427623	0.0033465077438562	0.559234454660651	PRC1	18551	RCCD1	22196	HDDC3	41882	False	False	False	alt	-25	0.002502	35	0.0233
1350	chr15	91033716	T	G	rs11632664	-0.00293402667	0.6188931783122026	0.00435059319	0.6124192827569811	0.00709407587499	0.771209041601921	-2.1386380444473063e-05	0.681497057817788	3.000756297028861e-05	0.6748467063652083	0.5560929055280657	0.0938769152547222	-0.0016460438114361	0.4360785949365708	0.0024599461222801	0.4302263935008565	0.0039357270382956	0.2673293117195929	-1.20100697579254e-05	0.4898074644930426	1.6963455545717244e-05	0.483752043964706	-0.0006348613574829	0.8254192758784961	0.0009211713814458	0.8184009858333722	VPS33B	11113	ENSG00000284946	11150	PRC1	38087	False	False	False	ref	-45	0.0006714	55	0.07043
1351	chr15	97674744	G	T	rs111548674	-0.0166024992	0.2429264780063756	0.0166024992	0.2329723859825589	0.0111492978708133	0.2228654284638801	-0.0001908703489119	0.1962791771658316	0.0001908703489119	0.1882103533060393	0.1974584798597495	0.6630961052539495	-0.0034075825028744	0.3483090587837092	0.0034075825028744	0.3360542034874964	0.0021909460597808	0.5684273088082119	-3.9176131316816246e-05	0.3009708401598263	3.9176131316816246e-05	0.2900528777119186	-0.016176516353904	0.1140963816785649	0.016176516353904	0.1106891049222087	ARRDC4	285960	IGF1R	973796	PGPEP1L	1333048	False	False	False	ref	-50	0.001575	0	0.0
1352	chr15	97709295	A	G	rs11073569	0.0826068694	0.0043355045611903	0.0826068694	0.0045715702127183	0.0181890723557415	0.0385894945554107	0.0015415424145332	0.0057426822343943	0.0015415424145332	0.0059684502477993	0.3145323084264359	0.4759504021514275	0.0265230884929845	0.0204922188985	0.0265230884929845	0.0223165414200045	0.005730655434931	0.0967138228992228	0.0004960909923159	0.0117795715655494	0.0004960909923159	0.0126247674399038	0.0680608720007468	0.0011496988706952	0.0680608720007468	0.0012022668959249	ARRDC4	251409	IGF1R	939245	PGPEP1L	1298497	False	True	True	alt	-90	0.01813	-45	0.007812
1353	chr15	97717715	C	T	rs12908536	-0.0806831978	0.0051297873808319	0.0806831978	0.0048876664354775	0.0255626317063086	0.010389608847103	-0.0022554476769171	0.0040245723748957	0.0022554476769171	0.0038570678901853	0.2785900268674985	0.5309824332575922	-0.0236356586325697	0.0322488285536692	0.0236356586325697	0.0298146306434594	0.0074302216200481	0.0486259025584007	-0.000678973793971	0.0103875039501856	0.000678973793971	0.0097991940143153	-0.0687268540130084	0.0010506405414622	0.0687268540130084	0.001021114192787	ARRDC4	242989	IGF1R	930825	PGPEP1L	1290077	False	True	True	ref	-100	0.005302	-100	0.011475
1354	chr15	97728980	G	A	rs59251433	-0.00189335748	0.5585257549727375	0.0051184280799999	0.5504964751800878	0.0081573369077135	0.5172114591601257	-1.745524378123261e-05	0.619325951838607	3.6172032138681885e-05	0.6109137506193354	0.5013973173995581	0.1728539021535369	-0.000933456895587	0.4018940354697414	0.0025205493415487	0.39366388636804	0.0041157991172805	0.2325755623463919	-8.669465294514103e-06	0.4422609436794244	1.788020112049815e-05	0.433544799768904	-0.0005829935995186	0.7010237031887279	0.0017074865921845	0.6926952404878826	ARRDC4	231724	IGF1R	919560	PGPEP1L	1278812	False	False	False	ref	95	0.0058	-20	0.01184
1355	chr15	97745844	G	T	rs189443571	0.00332039402	0.6257681918590776	0.00407561666	0.634146307214198	0.0208075703324018	0.0228568068320899	7.389250012352315e-05	0.3720961280895366	8.675856827499223e-05	0.3796446502256289	0.3254784800672206	0.4251800056256457	0.0013162413676899	0.5183534813637197	0.0014475057539104	0.5276007747609242	0.0069719886193081	0.0558154430906859	2.9097732403583883e-05	0.3308909580663642	3.133396900228164e-05	0.3392863355447825	0.0021929688067302	0.5589839682362043	0.0027282440689218	0.5663847265841067	ARRDC4	214860	IGF1R	902696	PGPEP1L	1261948	False	False	False	alt	-80	0.003391	-80	0.1609
1356	chr15	97760080	T	C	rs73470164	0.056034176	0.016493615151483	0.056034176	0.0176870916028915	0.0109871118705506	0.2203641668684054	0.000626226569673	0.0259703833405143	0.000626226569673	0.0277587201901302	0.3352690380605607	0.4346729826010176	0.0187880624647362	0.0434795783676453	0.0187880624647362	0.0473880729007524	0.0036320387822575	0.3118134718040419	0.0002069705753797	0.0437578917621226	0.0002069705753797	0.0472255788394105	0.0401788400294608	0.007887964727257	0.0401788400294608	0.0081243869352588	ARRDC4	200624	IGF1R	888460	PGPEP1L	1247712	False	True	False	alt	-100	0.0521	-20	0.01062
1357	chr16	4392526	C	T	rs4786488	-0.076728776	0.0068967588880318	0.076728776	0.0064247775041212	0.0199012457059014	0.0345242449194235	-0.0018164239655596	0.0079507897933677	0.0018164239655596	0.0075683941451728	0.630458822186952	0.0285963535736342	-0.0485116876376348	0.003845807614341	0.0485116876376348	0.0035697328312348	0.0125925404303608	0.0092082222308299	-0.0011536694532116	0.0053771391131112	0.0011536694532116	0.0050340921879045	-0.0080996690837041	0.2572071416023373	0.0080996690837041	0.2495800556565423	VASN	20677	CORO7-PAM16	27968	CORO7	33179	False	True	True	ref	-60	0.000767	100	0.1377
1358	chr16	4447450	T	C	rs6500602	0.0322151994	0.0769042325114071	0.0322151994	0.0817581911280274	0.0170564178999176	0.0499512017735497	0.0005724670083031	0.0340931110936209	0.0005724670083031	0.0360144408528905	0.4926607122480523	0.1859961032985919	0.0159296689466378	0.057774289619436	0.0159296689466378	0.062560331395457	0.0084330217748087	0.0255636576309448	0.0002839425644679	0.029314424425191	0.0002839425644679	0.0314573642347326	0.011060280708306	0.1669147870199587	0.011060280708306	0.1724476099007902	DNAJA3	21644	CORO7	21745	CORO7-PAM16	26956	False	False	False	alt	-40	0.002422	-100	0.0774
1359	chr16	4452513	C	T	rs6500606	-0.0062216745379999	0.5340391334440707	0.0062216745379999	0.5208079628911566	0.0098801897597921	0.31471163028819	-6.555230913253211e-05	0.5075939652871458	6.555230913253211e-05	0.495353750358083	0.3024388219794811	0.4965228699733213	-0.0019618316467332	0.5036754024100282	0.0019618316467332	0.4898660822223951	0.0029971164629061	0.4243589236279476	-2.0758790314457005e-05	0.4761873142020133	2.0758790314457005e-05	0.4630756847911539	-0.0046909200302907	0.4386898886180929	0.0046909200302907	0.428309896414884	HMOX2	22178	DNAJA3	26707	CORO7	26808	False	False	False	ref	100	0.003735	-80	0.05286
1360	chr16	4479000	C	A	rs11076833	0.00693205664	0.4616302429231589	0.00693205664	0.4743195174995014	0.026269484194035	0.0073403530355727	0.0001860358696761	0.1862711368837412	0.0001860358696761	0.1944740952326592	0.2591230199483396	0.5642468319297116	0.0018321999917299	0.4610461390662407	0.0018321999917299	0.4745420634025493	0.0068319198855381	0.0520699007031433	4.928596886032809e-05	0.2350217795341709	4.928596886032809e-05	0.245322266615136	0.0060415564476808	0.3214092161665234	0.0060415564476808	0.3303427792290228	HMOX2	4309	NMRAL1	16763	DNAJA3	53194	False	True	True	alt	-100	0.02289	-100	0.03046
1361	chr16	4486164	A	C	rs4786501	0.0089101134	0.3771968292302388	0.0089101134	0.3891219903482727	0.007017267970512	0.7468926765033161	6.126827590010521e-05	0.4527724356212736	6.126827590010521e-05	0.4645051846894379	0.3175676096225064	0.4700313600155124	0.0027913341159163	0.3518620959113376	0.0027913341159163	0.3643294242752557	0.0022412737163716	0.5521780168203468	1.9307407791605635e-05	0.402977515178588	1.9307407791605635e-05	0.4153138033656756	0.0068237222377825	0.2910183986570103	0.0068237222377825	0.299553278743047	NMRAL1	9599	HMOX2	11473	CDIP1	52664	False	False	False	alt	95	0.00317	30	0.01631
1362	chr16	4487103	T	C	rs4786502	-0.00403965898	0.637333168818829	0.00403965898	0.6240511022972385	0.0246903522723396	0.010470861249317	-0.0001052410674417	0.3384309094316068	0.0001052410674417	0.3279287977710078	0.3333333333333333	0.4417929015216409	-0.0013453546669239	0.5397789385624968	0.0013453546669239	0.5260438741793877	0.0082070231121503	0.0272802701075787	-3.492157150649592e-05	0.3102435906818958	3.492157150649592e-05	0.2991274234918707	-0.0028713990809033	0.5699593295598688	0.0028713990809033	0.557790814164687	NMRAL1	8660	HMOX2	12412	CDIP1	51725	False	True	False	ref	35	0.00721	-100	0.0421
1363	chr16	4508614	G	A	rs2270366	-0.00829607564	0.4403542824255297	0.00829607564	0.4280111283694594	0.0083579315158332	0.522035702482997	-7.009643805065025e-05	0.45842148037867	7.009643805065025e-05	0.4465926498502133	0.1521696283156464	0.7222774433398265	-0.001400096291264	0.5696093097281371	0.001400096291264	0.5555670773458209	0.0012638189182358	0.7254299882863708	-1.1756245513660568e-05	0.5731230098037006	1.1756245513660568e-05	0.5594234095356996	-0.0067469579559953	0.3083934869925816	0.0067469579559953	0.2999235348285353	NMRAL1	12851	CDIP1	30214	HMOX2	33923	False	False	False	ref	25	0.0063	-75	0.0626
1364	chr16	4510300	G	A	rs1051308	-0.0788826075999999	0.0050499147526769	0.0788826075999999	0.0048430593539019	0.0155577056478963	0.0715007679815303	-0.0012710333637548	0.0088525269113165	0.0012710333637548	0.0085141688296303	0.4937499351653026	0.1838207542641445	-0.0390313459878995	0.0068946367090671	0.0390313459878995	0.0064110266112243	0.0076754131460036	0.0376744695643106	-0.0006275469160934	0.0090310970385899	0.0006275469160934	0.0085256432409472	-0.0281413707611074	0.0338329995820777	0.0281413707611074	0.0329191499181654	NMRAL1	14537	CDIP1	28528	HMOX2	35609	False	True	True	ref	-100	0.001938	-15	0.002686
1365	chr16	4519330	G	A	rs11076836	-0.0665657208	0.00987770713131	0.0665657208	0.009288401193464	0.0152728722526257	0.0775004992435948	-0.0011286299331049	0.0134124086869425	0.0011286299331049	0.012702727093161	0.5016379837965124	0.1721388966476568	-0.0336452041849449	0.0110141448134405	0.0336452041849449	0.0101926828237844	0.0077325374225047	0.0418677360148502	-0.0005743690794579	0.0127377398310873	0.0005743690794579	0.0119603891779359	-0.0216952458013049	0.0549408812994601	0.0216952458013049	0.0535837204986679	CDIP1	19498	NMRAL1	23567	C16ORF96	37011	False	True	True	ref	40	0.000389	80	0.07556
1366	chr16	4519439	C	T	rs11076837	-0.0012006671	0.5208376313537376	0.0058270913	0.5170831530016237	0.0089172551337338	0.4556249546670276	-7.791349996167098e-06	0.5289315938872918	4.99828416832825e-05	0.5254358158953614	0.5069762134461976	0.1637355831473383	-0.0005958267102492	0.3537595787095597	0.0029456523380637	0.3501128082623037	0.004512072192045	0.1972559398021949	-4.04915139854709e-06	0.3608015270644178	2.5198969091137888e-05	0.3574232720563138	-0.0002551893691843	0.6809954833688654	0.001811222108113	0.6773562399073821	CDIP1	19389	NMRAL1	23676	C16ORF96	36902	False	False	False	ref	-70	0.003334	-30	0.02649
1367	chr16	4534405	C	T	rs4786519	-0.0443281892	0.0419068721333767	0.0443281892	0.0392532065358243	0.0126799402328043	0.1439457881165352	-0.0005844080511835	0.036712174492814	0.0005844080511835	0.0345681492175327	0.4677413666116868	0.2275574194633123	-0.0207743075056684	0.042394052381062	0.0207743075056684	0.0390655157077841	0.0059485188817564	0.0864052634344231	-0.000274629493795	0.0360553941047222	0.000274629493795	0.033511406983992	-0.0174649114617371	0.0931538906276103	0.0174649114617371	0.0906512151966485	CDIP1	4423	C16ORF96	21936	NMRAL1	38642	False	False	False	ref	90	0.003082	-30	0.0249
1368	chr16	5738914	A	G	rs12596497	0.00179206882	0.672371073327086	0.00367497642	0.6802890056231801	0.0086951071264056	0.4636645215702379	1.6066021232155518e-05	0.6686550760829706	3.0934240547055106e-05	0.6763733100459735	0.2000767642817871	0.6592912082397953	0.0003465937918075	0.6566901744633242	0.0007586110545585	0.6649224333768596	0.0017153050091585	0.6624139384488461	3.0508891403655327e-06	0.658683321687412	6.304348390238372e-06	0.666910679580707	0.0015850786833888	0.4967706443216939	0.0033527318748119	0.5032568885172768	RBFOX1	499111	EEF2KMT	641119	C16ORF89	672804	False	False	False	alt	75	0.002125	100	0.0191
1369	chr16	5739574	T	G	rs929468	0.00482358244	0.5736993712060252	0.00482358244	0.5867862721093278	0.0138373537832748	0.1113278050550596	6.692202092715443e-05	0.4478698703026529	6.692202092715443e-05	0.459444853221305	0.4378634633139348	0.2746091570885187	0.0021783048953757	0.4240153892126611	0.0021783048953757	0.4368902113159191	0.0060704292155187	0.0799298326551614	3.026596570346088e-05	0.3318986552620085	3.026596570346088e-05	0.3434736855013197	0.002141101048766	0.6292633725498439	0.002141101048766	0.6419397781990259	RBFOX1	499771	EEF2KMT	641779	C16ORF89	673464	False	False	False	alt	55	0.001701	95	0.06186
1370	chr16	5740082	G	T	rs57105172	-0.0229126451999999	0.1656172020517881	0.0229126451999999	0.157793202026301	0.0158404445731036	0.0653660308212226	-0.0003956659214514	0.0878331599924873	0.0003956659214514	0.0834173629291457	0.4535378997707445	0.2508745392845808	-0.0104652151577793	0.1342243229407302	0.0104652151577793	0.1261691064727448	0.0071877328164515	0.0451110895092147	-0.0001807420934742	0.0770482385198086	0.0001807420934742	0.0722367566419496	-0.0090249898857871	0.2289519509372883	0.0090249898857871	0.2228152858351715	RBFOX1	500279	EEF2KMT	642287	C16ORF89	673972	False	False	False	ref	-65	0.01941	0	0.0
1371	chr16	5740711	G	A	rs66926752	-0.0045959220199999	0.6404168083479522	0.0045959220199999	0.6272420768964065	0.0064374467246589	0.8692924341536004	-3.0713323168626254e-05	0.7099078804096324	3.0713323168626254e-05	0.6966841768261539	0.3120613284370169	0.4751812114123438	-0.0014302389355774	0.5627508617501734	0.0014302389355774	0.5490876323838845	0.0020177969749533	0.5993943188519901	-9.612053099883774e-06	0.6210992939960005	9.612053099883774e-06	0.6074498288723584	-0.0033299100613076	0.5289504961794673	0.0033299100613076	0.5173123956205516	RBFOX1	500908	EEF2KMT	642916	C16ORF89	674601	False	False	False	ref	10	0.000392	75	0.08777
1372	chr16	5743578	C	T	rs11076959	0.00249746756	0.7383512915585256	0.00249746756	0.7522694761751579	0.0240351826865506	0.011517551557221	6.073810010814674e-05	0.4533784517152072	6.073810010814674e-05	0.4651029508528033	0.3554455959086712	0.4069216174239137	0.0008582005392197	0.6049317644743142	0.0008582005392197	0.6188570649639508	0.0085818804216213	0.0234647651628887	2.1025187123199825e-05	0.3878889174908824	2.1025187123199825e-05	0.4001649063738624	0.0017282336953702	0.6728977303139384	0.0017282336953702	0.6859976596942565	RBFOX1	503775	EEF2KMT	645783	C16ORF89	677468	False	True	False	alt	10	0.002502	95	0.02037
1373	chr16	5747060	T	C	rs9929010	-0.0049498383599999	0.6078923088265304	0.0049498383599999	0.5949172805013216	0.006565172730443	0.8661045402755368	-3.300364827384446e-05	0.6827095737243065	3.300364827384446e-05	0.6696372733497209	0.166308779136713	0.7141779625078497	-0.000866968918941	0.6573476653133933	0.000866968918941	0.643687958581964	0.0010934157020868	0.7818117340292586	-5.767416348624555e-06	0.7083017940689454	5.767416348624555e-06	0.6945358207025512	-0.0045353167563978	0.4260468399996305	0.0045353167563978	0.4153986519597794	RBFOX1	507257	EEF2KMT	649265	C16ORF89	680950	False	False	False	ref	0	0.0	-70	0.0386
1374	chr16	5755393	C	A	rs6500717	0.002664684914	0.6331656526095039	0.004595662526	0.6378098027032229	0.0086662871139675	0.4711327144594046	2.2916623655039208e-05	0.6249030196209604	4.062970764752946e-05	0.6292006352803526	0.4051100115146422	0.3301297150556303	0.0010820788709343	0.493204468419174	0.001855528229674	0.4979277397464659	0.0035118316235615	0.3311661651830467	9.310709000473371e-06	0.4929990727293403	1.6405301678229072e-05	0.4974806828875839	0.0010145333457815	0.6247469669284544	0.0022510606956503	0.6282842486450703	RBFOX1	515590	EEF2KMT	657598	C16ORF89	689283	False	False	False	alt	0	0.0	-95	0.03333
1375	chr16	5758519	A	G	rs7189389	-0.0150224715999999	0.2583102810794864	0.0150224715999999	0.2481473211725656	0.0068801348385312	0.8059983879362764	-0.0001071848231526	0.3381590215687028	0.0001071848231526	0.3278188728837522	0.2752621915165095	0.5361723591862811	-0.0042386873873499	0.2958011886644116	0.0042386873873499	0.2842104826737627	0.0019259799026083	0.6213935033541599	-3.076976488935779e-05	0.3516539981480882	3.076976488935779e-05	0.3402238376409271	-0.012475233145572	0.1483032015280636	0.012475233145572	0.1438056931101659	RBFOX1	518716	EEF2KMT	660724	C16ORF89	692409	False	False	False	ref	20	0.000842	-85	0.02579
1376	chr16	5760685	T	C	rs3900820	-0.0009222497	0.7858169067078237	0.00248301466	0.783325463914724	0.0228432794722481	0.0152737540709699	-2.8721162102064344e-05	0.5365672902377863	5.554988882706702e-05	0.5334470318978586	0.1654456996441871	0.7140556949755792	-0.0002326293714223	0.7686018576858055	0.0004579689936028	0.7657612409874942	0.0038414597686305	0.2615263073661505	-6.67160230533522e-06	0.6007969757769174	1.0491236250350864e-05	0.5975093802608031	-0.0006867291154472	0.6507567552546557	0.0021016815527131	0.6483937571834407	RBFOX1	520882	EEF2KMT	662890	C16ORF89	694575	False	True	False	ref	85	0.00502	80	0.07776
1377	chr16	5770236	A	C	rs9927114	-0.00556813758	0.5517901566699045	0.00556813758	0.5390092903126859	0.0094058861338016	0.3768294083940877	-5.579706451768676e-05	0.5255924354204499	5.579706451768676e-05	0.513389186688106	0.2919760578429236	0.5095667243024866	-0.00165791042156	0.5093144193335026	0.00165791042156	0.4960041157339712	0.0027455252449201	0.4627056101534704	-1.653290594576915e-05	0.4878485923857762	1.653290594576915e-05	0.4751597797678005	-0.0044647766055664	0.440671996699212	0.0044647766055664	0.4298827170545615	RBFOX1	530433	EEF2KMT	672441	C16ORF89	704126	False	False	False	ref	100	0.001552	100	0.0906
1378	chr16	5770244	A	G	rs9927115	0.00205207442	0.7556489085465323	0.00246298406	0.765412800582919	0.0108734678408515	0.2306109043246835	2.111187267493553e-05	0.6972477246190913	2.6073584504909543e-05	0.7068145405772487	0.2956752663409371	0.5039089305422312	0.0006068621895963	0.644697650563558	0.0007230391398044	0.6549929078222179	0.0032152218138972	0.3752292366836554	6.261320348205321e-06	0.602269196645249	7.664150833230493e-06	0.6122330374614233	0.0016742912270873	0.6448544214206163	0.0019937966161474	0.6541125289373254	RBFOX1	530441	EEF2KMT	672449	C16ORF89	704134	False	False	False	alt	100	0.002771	90	0.0891
1379	chr16	5770398	A	C	rs9927274	0.00207003559	0.5039544109103499	0.00761607355	0.505997427271717	0.0091281336802201	0.3951076454518318	2.0026699917581352e-05	0.486066654508773	7.31862425455437e-05	0.4875142001715766	0.3406923308333073	0.4329478249891817	0.0006164147641416	0.4663500681138293	0.0025133484039001	0.4679107123825764	0.0031083770010755	0.3935181439872905	5.934998371502453e-06	0.4504612128346709	2.4173722877985803e-05	0.4515494506473618	0.0007572692662786	0.4217563831801603	0.0047199659747507	0.4209543063760443	RBFOX1	530595	EEF2KMT	672603	C16ORF89	704288	False	False	False	alt	-60	0.003029	100	0.0556
1380	chr16	5770514	T	C	rs9929578	0.0042555647939999	0.6275738677362458	0.004555133114	0.6378536699339136	0.0090869722290306	0.4135120850429785	3.612972048688974e-05	0.6319712691152922	3.8631844874432415e-05	0.6416667047963005	0.3682050643678876	0.3883041011047636	0.0015316181111652	0.5311247352918574	0.0016407845465852	0.5415558680847847	0.0033580011320015	0.3491445465560433	1.30359735270478e-05	0.5314108468746377	1.3947778915174094e-05	0.5414671153744622	0.0025124741957903	0.5813487843700449	0.0026826004419132	0.590169999432998	RBFOX1	530711	EEF2KMT	672719	C16ORF89	704404	False	False	False	alt	-100	0.001484	20	0.00845
1381	chr16	5773676	A	G	rs11648113	0.0336335304	0.076051051715617	0.0336335304	0.0811436096709097	0.0106613185761563	0.250774714837958	0.0003707316038369	0.0705640543650573	0.0003707316038369	0.074934735862843	0.0352099088164814	0.9328983572086	0.0011730554164122	0.5559669046190048	0.0011730554164122	0.5697167992747663	0.0003660508115636	0.9199334833364184	1.2548894602193144e-05	0.5142894919562138	1.2548894602193144e-05	0.5273935301590599	0.0137698523843607	0.1210109191442423	0.0137698523843607	0.124838480538021	RBFOX1	533873	EEF2KMT	675881	C16ORF89	707566	False	False	False	alt	-35	0.001251	-80	0.01717
1382	chr16	5779439	C	T	rs7198618	-0.0071707575359999	0.4761599777392507	0.007359563584	0.4655038111348887	0.0074033686144897	0.6982083697183908	-5.394690793176288e-05	0.5388204790594926	5.543231093429206e-05	0.5290861516974792	0.2001224079087957	0.6553165750069337	-0.0016131441994188	0.5268851211972488	0.0016392443601171	0.5159925133173607	0.0014873176376759	0.7012817152545987	-1.223973271827582e-05	0.5655506347776239	1.2445071782080465e-05	0.5552035585982059	-0.0072822332181869	0.3215819228670939	0.0074191640992126	0.3150004149081065	RBFOX1	539636	EEF2KMT	681644	C16ORF89	713329	False	False	False	ref	-65	0.006004	-35	0.01484
1383	chr16	5785840	C	T	rs11861310	0.00121946048	0.5613481650306505	0.00522390192	0.562571582856715	0.0158114621141827	0.070824185218965	1.335117680385285e-05	0.3941000068518905	8.350527574986388e-05	0.3945470224514524	0.2206350688285147	0.6156035616017991	0.0001846718921501	0.5773828305429554	0.0011486397058135	0.5778852478987417	0.0034514116858777	0.305933589294078	1.0695165652599533e-06	0.4479341332208018	1.814636231813541e-05	0.4475654110132739	0.0009211713814458	0.4177161818924642	0.0046473511136007	0.418862408723117	RBFOX1	546037	EEF2KMT	688045	C16ORF89	719730	False	False	False	alt	-100	0.004333	100	0.06113
1384	chr16	5793138	C	T	rs56142463	0.0144699525599999	0.2051704831327447	0.01693569984	0.2123906522176296	0.0092174471100517	0.3857223407493896	0.0001488706849651	0.2040208192061431	0.0001650737163629	0.2106112528605484	0.3662486125374745	0.3847906949201334	0.0053935028940241	0.1931718105471737	0.0063383747821574	0.2004582941817268	0.0033801179725595	0.3325220186673544	5.5865966154259e-05	0.1894914793451513	6.207495151548004e-05	0.1963351763782967	0.0096681500845443	0.1831649885806464	0.0107967924978474	0.1868438969064396	RBFOX1	553335	EEF2KMT	695343	C16ORF89	727028	False	False	False	alt	90	0.005585	70	0.1055
1385	chr16	7304888	A	G	rs12051021	0.0037736483	0.5785980046945317	0.0060556629799999	0.5796766244418315	0.0060346085974591	0.9189457627939424	2.98423061552627e-05	0.6572675186131743	4.277830411479016e-05	0.6577820462640305	0.5917758482971814	0.0543252958419281	0.0022479526049785	0.3810315306193784	0.0035847390985833	0.3827275485968842	0.0035749649957187	0.3247671356247932	1.777436374519246e-05	0.460924184785902	2.535773770565069e-05	0.4621804724378898	0.0006701314328987	0.8086496298526281	0.0010518781315157	0.8078083434090381	TMEM114	1285623	METTL22	1316796	ABAT	1369709	False	False	False	alt	-40	0.00847	-95	0.08405
1386	chr16	7305257	C	T	rs17143361	0.00299527232	0.6949441172290822	0.00352401716	0.7026088170022405	0.0073214641878335	0.7172565080756002	2.116269447517104e-05	0.735481549031646	2.529763624583309e-05	0.7428740137242124	0.4739800205396321	0.2100609773556375	0.0014490018085413	0.5026801745282801	0.0016837746322125	0.5104908386769595	0.0034935715657922	0.3351334841886818	1.0349129831611408e-05	0.5457282161109238	1.2185123074379983e-05	0.553136861601524	0.001012458635463	0.7627979488493201	0.0012531250324173	0.7701560833734123	TMEM114	1285254	METTL22	1316427	ABAT	1369340	False	False	False	alt	-85	0.001379	10	0.03522
1387	chr16	7307170	T	C	rs4331351	0.0007981727599999	0.8115022386827705	0.00197754428	0.8139869447635213	0.0187722837451759	0.0345061402332862	1.264253700901718e-05	0.6282659325806036	3.590802746736734e-05	0.630749495622813	0.1707569580597308	0.7052082840795898	0.000100414066568	0.793399265721654	0.0003097174002958	0.7957275281931174	0.0033519106183842	0.343816654531664	1.6766942645411477e-06	0.674278982149285	5.869589480403769e-06	0.6766126044773334	0.0006348613574829	0.6635826158161079	0.0018838369692631	0.666142426475321	TMEM114	1283341	METTL22	1314514	ABAT	1367427	False	False	False	alt	5	0.000702	100	0.015465
1388	chr16	7310131	T	C	rs4479249	0.057555367	0.0159983395772927	0.057555367	0.0170035040199352	0.0160170145661396	0.062660644591624	0.0009630541143349	0.0131356142376382	0.0009630541143349	0.0138055231175024	0.5247959003724105	0.1359508298327097	0.0305731121473346	0.0134022686531412	0.0305731121473346	0.0145340801148434	0.008443635309031	0.0245569140136545	0.000513628988714	0.0113622703529552	0.000513628988714	0.0121376878299605	0.015512609051961	0.1048721211362572	0.015512609051961	0.1080896619388994	TMEM114	1280380	METTL22	1311553	ABAT	1364466	False	True	False	alt	-100	0.010605	-25	0.02783
1389	chr16	7365551	A	G	rs4787008	-0.00307884972	0.6657211555431599	0.003955086	0.6613686652171736	0.006349646946972	0.9011674211435382	-2.0438541960834693e-05	0.7342504950624352	2.5845624870571072e-05	0.7306272859497288	0.3148559632361331	0.4735040655680582	-0.0010821482151639	0.5740301905476404	0.0013417870451106	0.5689778299390214	0.0020073424361715	0.6063105853559998	-7.180334347621254e-06	0.6342253430027249	8.786212335302742e-06	0.6299082360195822	-0.001966825382006	0.5928487614157294	0.0026763763109575	0.5887854911015297	TMEM114	1224960	METTL22	1256133	ABAT	1309046	False	False	False	ref	-100	0.002525	-65	0.01547
1390	chr16	7490196	C	T	rs8055816	-0.0150928317	0.2560976879174849	0.0150928317	0.2459237225038989	0.0106414687210043	0.2496393822876014	-0.000169673430139	0.2194766890950364	0.000169673430139	0.2108776549540275	0.192441830309443	0.6697800064567427	-0.003063381605698	0.3745916768442718	0.003063381605698	0.3618496205145992	0.0021085071980021	0.5623211093099376	-3.5321170362529215e-05	0.3278430765523837	3.5321170362529215e-05	0.3161024719106088	-0.0137470305708565	0.1192996632671026	0.0137470305708565	0.1159048393975598	TMEM114	1100315	METTL22	1131488	ABAT	1184401	False	False	False	ref	85	0.001053	45	0.04132
1391	chr16	9786924	A	G	rs2077923	0.00778076014	0.4183835996086126	0.00778076014	0.4307314795339639	0.0059464226519232	0.9439314387338744	4.569228255745641e-05	0.5446196967753846	4.569228255745641e-05	0.5573210471395901	0.2393323582194836	0.5959373050371986	0.0018003597534412	0.4573610490424716	0.0018003597534412	0.4707084571981425	0.0014377940850721	0.7170927496911133	1.0613527163939756e-05	0.5436447593665119	1.0613527163939756e-05	0.5569296199557459	0.0071183311030196	0.2652123263832032	0.0071183311030196	0.2732009830608829	GRIN2A	396413	ATF7IP2	539511	HAPSTR1	695279	False	False	False	alt	65	0.003643	65	0.05304
1392	chr16	9789680	C	T	rs2267787	-0.0217760578	0.1727044333296679	0.0217760578	0.1643783799918553	0.0076304774133118	0.6723967130238943	-0.0001673529979484	0.2176786369081021	0.0001673529979484	0.2091207780080478	0.289716698305999	0.5129988661744579	-0.0063719246811564	0.2077706862410543	0.0063719246811564	0.1976145351493943	0.0022306302021101	0.5663295575563029	-4.940985703890466e-05	0.2415966395041394	4.940985703890466e-05	0.2316116817201865	-0.0176433365491342	0.0918354331486626	0.0176433365491342	0.0892823272821372	GRIN2A	393657	ATF7IP2	536755	HAPSTR1	698035	False	False	False	ref	10	0.0001783	60	0.05856
1393	chr16	9791950	T	G	rs7195942	-0.0210220077199999	0.1816578759620228	0.02206493068	0.1750055171009002	0.01319703721113	0.1304646320850891	-0.000326698277338	0.1147977863212643	0.000336762364565	0.1108443956632074	0.1456674861772424	0.742608310363131	-0.0030122403616006	0.3719338075771652	0.003177660044782	0.3622517234450492	0.0019184425964163	0.6049291746556249	-4.719561548470908e-05	0.2807981128357616	4.879189650112385e-05	0.2722534827877179	-0.0208487639913277	0.0773779133443102	0.0215998091266506	0.0759793805596565	GRIN2A	391387	ATF7IP2	534485	HAPSTR1	700305	False	False	False	ref	-100	0.00165	-100	0.05084
1394	chr16	9792446	C	A	rs7195835	0.003454502334	0.67232206318483	0.003454502334	0.6856845070538726	0.0086997905977837	0.4636284783193329	2.964613512227068e-05	0.6782466862267411	2.964613512227068e-05	0.6913289477344374	0.0491374391850537	0.906878347067978	0.0001813354494109	0.8574996677142379	0.0001813354494109	0.8715517582174793	0.0004273421619823	0.90538614703457	1.554454565444029e-06	0.857024946837571	1.554454565444029e-06	0.871020594470842	0.0021618481519517	0.6416739159736173	0.0021618481519517	0.6546162910141304	GRIN2A	390891	ATF7IP2	533989	HAPSTR1	700801	False	False	False	alt	-90	0.00328	-85	0.01486
1395	chr16	9792974	C	G	rs7196962	-0.0094649866	0.3764166754461626	0.0094649866	0.3647252688021702	0.0098306781485207	0.3133929728939746	-9.366741639856004e-05	0.3512395022618411	9.366741639856004e-05	0.340853904157961	0.1550596997894168	0.7252920599528865	-0.0014104106261979	0.5256546131799205	0.0014104106261979	0.511897520090507	0.0015004417790911	0.6946992087951854	-1.371954557832082e-05	0.4993991168494825	1.371954557832082e-05	0.4864832994198912	-0.0087075592070456	0.2223811614987857	0.0087075592070456	0.2156147899716368	GRIN2A	390363	ATF7IP2	533461	HAPSTR1	701329	False	False	False	ref	-50	0.0005836	-55	0.02338
1396	chr16	9793050	C	G	rs7197004	-0.0348378124	0.0771128803958777	0.0348378124	0.0723760976856801	0.0197092264541945	0.0278747862167752	-0.0007066936382923	0.0247576876946992	0.0007066936382923	0.0233238604323836	0.1651344930964013	0.7103248014901068	-0.0056658720567964	0.226469659765925	0.0056658720567964	0.2161432175263618	0.0032450341569029	0.3602850679972357	-0.0001145558380798	0.109947397698067	0.0001145558380798	0.1035983843960122	-0.0330501353748482	0.0192437089532731	0.0330501353748482	0.0187775060686648	GRIN2A	390287	ATF7IP2	533385	HAPSTR1	701405	False	False	False	ref	-95	0.001671	-90	0.03247
1397	chr16	9793254	C	A	rs9972744	-0.00525250358	0.5990993959181585	0.00525250358	0.5860000867541946	0.0139115535893815	0.105642577658621	-6.871750064937885e-05	0.4673645760922466	6.871750064937885e-05	0.4558044032882892	0.1608149462131349	0.7186220015200737	-0.0008093997778174	0.666558823135138	0.0008093997778174	0.6524697081954988	0.0022534407024309	0.5406687754300219	-1.05654779726469e-05	0.5780062704282329	1.05654779726469e-05	0.5646482282247886	-0.0049191381653336	0.4047826731334825	0.0049191381653336	0.3947949172998616	GRIN2A	390083	ATF7IP2	533181	HAPSTR1	701609	False	False	False	ref	25	0.00727	-100	0.02454
1398	chr16	9798943	T	A	rs11648283	-0.00135974376	0.85007287066575	0.001367861284	0.840346085326308	0.0141421567068169	0.1020541087335036	-2.1362027259671628e-05	0.7292018614595777	2.145150562530912e-05	0.719384924494409	0.3328478511187875	0.4454907524982699	-0.00044067159204	0.7478237422937618	0.0004432954152079	0.7373577966406295	0.0047171578583425	0.1650480835505569	-6.918376885505598e-06	0.6495631705713032	6.947298932361878e-06	0.638759597155163	-0.0010228321870558	0.7997427151515003	0.001026981607693	0.7900537988119871	GRIN2A	384394	ATF7IP2	527492	HAPSTR1	707298	False	False	False	ref	-85	0.004944	-85	0.03262
1399	chr16	9805369	C	G	rs9930307	0.000821831398	0.8716482347698673	0.001411230042	0.869266294466643	0.0069984594059302	0.7807752457360678	6.3953100011444265e-06	0.8890236209445236	1.035010602546172e-05	0.8865434751468062	0.188004024938018	0.6710580657427689	0.0001485137361994	0.8407555907886356	0.0002456621127381	0.8383381111538255	0.0013162263908627	0.7239369591858703	1.155435031846751e-06	0.85801519305623	1.799893710694749e-06	0.8556382802338339	0.0007468957146858	0.7638384443970148	0.0013402628657973	0.7621677250190311	GRIN2A	377968	ATF7IP2	521066	HAPSTR1	713724	False	False	False	alt	-15	0.000267	-25	0.02104
1400	chr16	9805444	A	G	rs9940856	0.0225940211999999	0.1514477445503566	0.0225940211999999	0.1594854387178467	0.0113581742307568	0.2104987704050445	0.0002652527985487	0.1163072975815038	0.0002652527985487	0.1224667274576634	0.1998402473054699	0.6539461759419727	0.0044348383752876	0.2581210197770321	0.0044348383752876	0.2696419616630194	0.002273013934314	0.5357614871166937	5.1765509634684446e-05	0.2146952174606631	5.1765509634684446e-05	0.2248122310071534	0.0217284411664021	0.0615808814861178	0.0217284411664021	0.0633123472765454	GRIN2A	377893	ATF7IP2	520991	HAPSTR1	713799	False	False	False	alt	-90	0.002342	-100	0.04846
1401	chr16	9812125	T	A	rs7184107	-0.00479905486	0.6196261208887539	0.00479905486	0.6066030554621835	0.0218658090724212	0.0180378022716954	-0.0001080791331584	0.3496440062774284	0.0001080791331584	0.3389475033444326	0.3110965881388811	0.4767471365759969	-0.0014865606362079	0.539454604403206	0.0014865606362079	0.5259476256013471	0.0068678538611781	0.0536613743009594	-3.385342563248442e-05	0.3354304674019798	3.385342563248442e-05	0.3240423613856938	-0.0034232720256433	0.517659083295866	0.0034232720256433	0.5061512344601861	GRIN2A	371212	ATF7IP2	514310	HAPSTR1	720480	False	True	False	ref	-95	0.0009613	-35	0.04053
1402	chr16	9813803	G	T	rs10468229	-0.00981489912	0.3741796862213272	0.00981489912	0.3626032239026835	0.0101809002223591	0.2897820481606206	-0.0001032644122261	0.3452284912447286	0.0001032644122261	0.3345744425017545	0.3598917001213705	0.3936238442740934	-0.0034965446134941	0.3339731652340645	0.0034965446134941	0.3219109128293055	0.0037227723737394	0.2917656946770827	-3.7301158757667325e-05	0.3043753735516418	3.7301158757667325e-05	0.2932434411282859	-0.0064087801740681	0.3100518482712982	0.0064087801740681	0.3014950481021622	GRIN2A	369534	ATF7IP2	512632	HAPSTR1	722158	False	False	False	ref	-90	0.01923	-25	0.01233
1403	chr16	9814951	G	T	rs11649466	0.05401397042	0.0227485458449118	0.05401397042	0.0238605237649116	0.0222464636253319	0.0224938417649312	0.001425397656669	0.0134813312020793	0.001425397656669	0.0139047116778201	0.2982852519217004	0.5007002175578967	0.0168928905623335	0.0620132189543313	0.0168928905623335	0.0667584514287662	0.0068512829373163	0.0549795400051993	0.0004455669440929	0.0227955980315668	0.0004455669440929	0.0239709220652329	0.0464818099772818	0.0088333368795951	0.0464818099772818	0.0091057119903121	GRIN2A	368386	ATF7IP2	511484	HAPSTR1	723306	False	False	False	alt	-45	0.0065	95	0.0382
1404	chr16	9818786	C	T	rs11645219	0.0016456202399999	0.6981909446011361	0.0033730289999999	0.7013184198227551	0.0062818713462872	0.8726952506175093	1.1998556798652048e-05	0.7602591563668853	2.195667546580903e-05	0.7632212119816387	0.1361632382078652	0.7609669918675953	0.0002940973982063	0.7409394682969843	0.0004749007846187	0.7437798839817985	0.0008773337658652	0.8195833288981276	2.191366144412636e-06	0.7818117903483057	3.217434492907641e-06	0.7846284845125999	0.0013278146038859	0.5409650826279597	0.0029917322793804	0.5439048105085965	GRIN2A	364551	ATF7IP2	507649	HAPSTR1	727141	False	False	False	alt	-100	0.004242	-15	0.03119
1405	chr16	9820157	A	G	rs1420042	-0.0019101772199999	0.8100458831554797	0.002140656716	0.801842871664187	0.0235398109566695	0.0136224018655196	-5.148712686437274e-05	0.5521943045540263	5.6253302493771776e-05	0.5442315185929656	0.2055996431498251	0.6502827733794879	-0.0004028529345934	0.7666792236089284	0.0004512278311516	0.7583662098648501	0.0048876031445285	0.1604999834714492	-1.0927069166218748e-05	0.5822243776106327	1.1927432567391275e-05	0.573837280345451	-0.0017635037707859	0.6758036991434978	0.0019875724851916	0.6679437423867606	GRIN2A	363180	ATF7IP2	506278	HAPSTR1	728512	False	True	False	ref	-100	0.0815	50	0.01631
1406	chr16	9820544	C	G	rs7196708	-0.0002341821679999	0.7736994698505026	0.002695488992	0.7735141363702933	0.0065680509397551	0.8540082745116534	-1.813087941686885e-06	0.820898201814716	1.7625637916150023e-05	0.820839901115577	0.3613460720546894	0.4025708978529283	-5.818971254669999e-05	0.6454323000425568	0.0009919733597824	0.645138466893886	0.0023716293062001	0.5383322396700435	-4.850386261465243e-07	0.6970182403039714	6.4829826903178975e-06	0.696655855008967	2.904594445999999e-05	0.7327170174448999	0.0014979408500087	0.7327943544822768	GRIN2A	362793	ATF7IP2	505891	HAPSTR1	728899	False	False	False	ref	90	0.002693	90	0.05667
1407	chr16	9821156	A	G	rs6497523	0.0558468752	0.0175083082159681	0.0558468752	0.0188175192384463	0.0105270144910305	0.2603162961460246	0.0006019350462095	0.0285511871675671	0.0006019350462095	0.0304290686998023	0.4236745194452224	0.2996771132892514	0.0239737009572084	0.0259184209981003	0.0239737009572084	0.028380360590018	0.0044737065584004	0.1985236978123095	0.000258892563866	0.0326097149439516	0.000258892563866	0.0352064942401302	0.0283716636064689	0.0312976816999885	0.0283716636064689	0.032140123712569	GRIN2A	362181	ATF7IP2	505279	HAPSTR1	729511	False	True	False	alt	30	0.001648	-95	0.03076
1408	chr16	9846107	C	T	rs35440248	-0.00314676386	0.7163648439656511	0.0035461069799999	0.7059054511966922	0.0087434865740214	0.4553873465381057	-2.5531645525016765e-05	0.7201494245720816	2.948293733380321e-05	0.7099485591060505	0.0670235168414609	0.8756919959470347	-0.0002110911742389	0.856498741811788	0.00023165092961	0.8459304545095007	0.0005894667820929	0.8710114871058552	-1.742840422419167e-06	0.8555841443422227	1.946268479214436e-06	0.8450681322288717	-0.0019294805962717	0.644635740915772	0.0022074917789602	0.6351550122679795	GRIN2A	337230	ATF7IP2	480328	EMP2	734525	False	False	False	ref	30	0.007393	90	0.06433
1409	chr16	9849250	G	A	rs8047364	0.0064773127799999	0.4727815913074837	0.0064773127799999	0.4854605544406374	0.0328138959084465	0.0025957520903172	0.0002072728726637	0.1464084720311556	0.0002072728726637	0.1535895368625077	0.0922685919978422	0.8270226822161312	0.0006210207402356	0.6881669052346922	0.0006210207402356	0.7025197867996938	0.0030464929724418	0.3063033791219122	1.9702971815207858e-05	0.4438726618420483	1.9702971815207858e-05	0.457209706239263	0.0045207937841678	0.420832185205679	0.0045207937841678	0.4312602596662714	GRIN2A	334087	ATF7IP2	477185	EMP2	731382	False	True	True	alt	70	0.006287	5	0.002304
1410	chr16	9854777	G	A	rs9933832	-0.0561673077999999	0.020521181586006	0.0561673077999999	0.0192648557054181	0.0127082514794164	0.1518951201897226	-0.0007918775814758	0.0268532294447476	0.0007918775814758	0.0253516594636956	0.2099274888743658	0.6440904855089026	-0.0122450290157504	0.1070430415094678	0.0122450290157504	0.0999041191692226	0.0027636733353702	0.4405872126182191	-0.0001777248623815	0.0810462135699723	0.0001777248623815	0.0760222951655665	-0.0533905953381258	0.0031126069363861	0.0533905953381258	0.0030292857688507	GRIN2A	328560	ATF7IP2	471658	EMP2	725855	False	True	False	ref	-95	0.002052	95	0.02557
1411	chr16	9861707	C	T	rs727605	-0.0346204036	0.0773175074112527	0.0346204036	0.0725572210327766	0.0085688555882654	0.4756108592937185	-0.0002997361792952	0.0994559251405842	0.0002997361792952	0.0942643561045431	0.3077127356092905	0.4851100096349339	-0.0108971562634508	0.1200146245216178	0.0108971562634508	0.1123496990189485	0.0026497131960759	0.4802302498253602	-9.4818766657139e-05	0.13378933975729	9.4818766657139e-05	0.1262489255339953	-0.0271849293042458	0.0353531489288764	0.0271849293042458	0.0344512482809056	GRIN2A	321630	ATF7IP2	464728	EMP2	718925	False	False	False	ref	30	0.000497	75	0.06757
1412	chr16	9864252	T	C	rs9939815	-0.00585769428	0.5123756017591198	0.00715340052	0.5033945223375063	0.0227606850060297	0.0147790350011494	-0.0001362833422636	0.2658207437654475	0.0001648619372553	0.2593846629523411	0.1959460160375107	0.6650272337991895	-0.0011664080570698	0.5643505342979577	0.0014105517562391	0.5559254915397028	0.0044910929205167	0.1957545342042876	-2.7562049529480165e-05	0.3664011020388238	3.29469767530964e-05	0.3585423367793303	-0.0060726771024595	0.356163307201584	0.0069523542775339	0.3505989665110318	GRIN2A	319085	ATF7IP2	462183	EMP2	716380	False	True	False	ref	-100	0.00283	-40	0.00864
1413	chr16	9864255	T	G	rs9939817	-0.0118664192	0.324347442313583	0.0118664192	0.3133006016743429	0.0269186603800567	0.0067726607868236	-0.000317699177064	0.0965438236947133	0.000317699177064	0.0915838298223721	0.1956348094897249	0.6656005544870809	-0.0023119742244897	0.4236942156073874	0.0023119742244897	0.4108736372058536	0.0053182267297237	0.1227966373780843	-6.256262117219632e-05	0.2017701720868841	6.256262117219632e-05	0.1924759956626861	-0.0116474237284618	0.1769478668318921	0.0116474237284618	0.1718192792503423	GRIN2A	319082	ATF7IP2	462180	EMP2	716377	False	True	True	ref	-40	0.001511	-40	0.008545
1414	chr16	9864332	A	G	rs7196023	-0.0077636447	0.4445793977393166	0.0077636447	0.4324459923898964	0.0134205994079344	0.1231600563405941	-0.0001045390582303	0.340497104559714	0.0001045390582303	0.3302406199369076	0.2047054430025207	0.6509116803640629	-0.0015872641570395	0.5099289558860014	0.0015872641570395	0.4963917791484108	0.0027827703444252	0.4597179684600299	-2.167166472912928e-05	0.4168405178085721	2.167166472912928e-05	0.4047160662638276	-0.0074544341746283	0.2752852193345039	0.0074544341746283	0.2672379071687401	GRIN2A	319005	ATF7IP2	462103	EMP2	716300	False	False	False	ref	-70	0.003067	-100	0.02884
1415	chr16	9865264	G	A	rs16966529	-0.0189371110999999	0.2022224521136361	0.0189371110999999	0.1931854259329444	0.0106257795166446	0.2513331014207606	-0.000206655186467	0.1739180184920669	0.000206655186467	0.1664615676555687	0.3734686044461042	0.3776680630518159	-0.0072631200591275	0.187893409757202	0.0072631200591275	0.1783934427230732	0.0039949700311408	0.2489975777850197	-7.962510550758854e-05	0.1645548605573079	7.962510550758854e-05	0.1563455032676979	-0.0114752227720204	0.175979519542971	0.0114752227720204	0.1708673630628125	GRIN2A	318073	ATF7IP2	461171	EMP2	715368	False	False	False	ref	45	0.01352	40	0.1041
1416	chr16	10036400	T	C	rs76655943	0.0421297466	0.0422518392574364	0.0421297466	0.0453335665140245	0.0109726646580887	0.2353861658233396	0.0004759185280084	0.0442097586471389	0.0004759185280084	0.0471422733148083	0.2406705463749623	0.5915372109303294	0.0100962639832994	0.1126918375765441	0.0100962639832994	0.1205792117906579	0.0026290116786223	0.4859073085687334	0.0001136035958917	0.0982865044351369	0.0001136035958917	0.1049438401026305	0.0392514445170592	0.0105735688220435	0.0392514445170592	0.0108680254122265	GRIN2A	146937	ATF7IP2	290035	EMP2	544232	False	False	False	alt	95	0.01624	85	0.04053
1417	chr16	10038863	A	C	rs28610230	0.00324793066	0.6815806206800678	0.0036410449	0.691491496616803	0.0220257468219608	0.0174039821225288	6.83274006949067e-05	0.444173137502333	7.736201462740777e-05	0.4534459529534972	0.5698835050156121	0.0776935925782263	0.0018449512227683	0.468554350176683	0.002068522992576	0.4788493185121249	0.0125683388788796	0.0057510286994567	3.889172035621251e-05	0.2816648252998923	4.402988231054232e-05	0.2906091547406133	0.0006161889646157	0.8569363234681024	0.0006742808535357	0.8663425958716691	GRIN2A	144474	ATF7IP2	287572	EMP2	541769	False	True	False	alt	-100	0.01239	30	0.04987
1418	chr16	13643666	A	G	rs55761603	0.0075158059199999	0.4299720260694694	0.0075158059199999	0.4422524853281656	0.009998837374558	0.3032324169724681	7.64868934931531e-05	0.3978585498661099	7.64868934931531e-05	0.4091335090716846	0.0674820278218653	0.8732940471572784	0.0005934643427747	0.7097335570218098	0.0005934643427747	0.72407449657595	0.0006938407433147	0.8461125458766982	6.239933559889802e-06	0.6808090927093913	6.239933559889802e-06	0.6950741630217289	0.0049938277368022	0.3650449842775815	0.0049938277368022	0.3747356913368847	ERCC4	276473	MRTFB	427654	SHISA9	742067	False	False	False	alt	85	0.002243	95	0.01062
1419	chr16	24118368	T	C	rs9926924	0.007634123	0.3631237791455838	0.0096119034	0.3719084471350562	0.0097424442727083	0.3445557648972004	5.608310160079416e-05	0.3611372827467192	8.394594404203264e-05	0.3680913961730756	0.4850880195852654	0.1994524783641504	0.0037151518994872	0.2521589277029373	0.004680437773036	0.2603254306592474	0.0047224157275862	0.1678203094159291	2.722331564757295e-05	0.2518932049439176	4.082220022124932e-05	0.2585354087985171	0.0025228477473832	0.5128002970648169	0.0031286631604061	0.5207567979378187	CACNG3	137968	PRKCB	282384	CHP2	363341	False	False	False	alt	-30	0.001584	100	0.1017
1420	chr16	24120003	T	G	rs2283541	0.001494203798	0.7732557641861215	0.002151996162	0.7790819374247009	0.0088393154047155	0.4453959338872628	1.2374384500049191e-05	0.7692804856779328	1.8460688921386155e-05	0.7743948118092684	0.4320356020290666	0.2802664284960067	0.0005940292646337	0.6321136074818933	0.0009066004886591	0.6378594813281787	0.0038239608734438	0.2837869723379951	4.896838199569589e-06	0.6307977397017095	7.789179868427659e-06	0.6362803909595944	0.0009356943536758	0.7692872368873251	0.0011846595919044	0.7742708346863354	CACNG3	136333	PRKCB	284019	CHP2	364976	False	False	False	alt	100	0.001658	75	0.074
1421	chr16	24469698	A	G	rs11640574	-0.00292341598	0.6788219859028892	0.00355459098	0.6704167801071295	0.0312831151805634	0.0033304394858808	-0.0001012376513832	0.3178429552020527	0.0001177217642077	0.310501565815223	0.1344930964014149	0.7605195367002675	-0.0003247475746613	0.7505622858480766	0.000428008614581	0.7422488842185782	0.0040894774209149	0.2295834078779689	-1.1150835856134666e-05	0.5040746840379713	1.3847657849679797e-05	0.4961366320618303	-0.0029585369142833	0.5165041803221653	0.0033983755018205	0.5090275991679388	RBBP6	67996	TNRC6A	140512	CACNG3	213362	False	True	True	ref	-100	0.00998	-35	0.02393
1422	chr16	29959513	G	A	rs4788197	-0.0494978606	0.0368044322704332	0.0494978606	0.0348855895831718	0.0177378479532629	0.046715152515911	-0.0010650226632781	0.0235642089611278	0.0010650226632781	0.0224242145410739	0.4297430471270448	0.2862689974958315	-0.021826165258607	0.0426704059272748	0.021826165258607	0.0397413788909967	0.0077288606088113	0.0394238192688989	-0.0004756486726465	0.0261578876128951	0.0004756486726465	0.0245715966195761	-0.0241973464455024	0.0521111785863238	0.0241973464455024	0.0507020980457242	TAOK2	14356	TMEM219	18627	KCTD13	33277	False	False	False	ref	-15	0.00608	-35	0.11084
1423	chr16	29959944	G	T	rs4788200	0.01207849654	0.2920902002466133	0.0145381641399999	0.2999239304749461	0.0123777986448732	0.1640466080647221	0.0001877981210738	0.2070129686094572	0.0002100036203887	0.2128949926216733	0.3584394028983703	0.3979469357707587	0.0043724110282732	0.2593179373723924	0.0052000314291178	0.2677002795659643	0.0044526577944117	0.1988830885191281	6.780442226694114e-05	0.1983109914499633	7.527605138939208e-05	0.2052971271587035	0.0082200022821813	0.257072941735338	0.0094772767352357	0.2609502232464525	TAOK2	13925	TMEM219	19058	KCTD13	33708	False	False	False	alt	-100	0.01787	-20	0.04004
1424	chr16	29971245	C	T	rs12934406	-8.607633999999998e-05	0.8487754995552805	0.00168353634	0.8443046965689064	0.0104104573172262	0.2737183242602082	1.5387294800238389e-06	0.8096175966665553	1.7978316766401747e-05	0.8055421790067722	0.4456394775879418	0.2577127856115744	-6.640877556475999e-05	0.6642890136597444	0.0007478437248373	0.6592942520213655	0.0046021896749556	0.1826157629662075	3.69486189489879e-07	0.6295323084120664	7.934210307673529e-06	0.6251673011822881	2.697123414146002e-05	0.8717566733546448	0.0006576831709872	0.867272670150734	TAOK2	2624	INO80E	24471	HIRIP3	24829	False	False	False	ref	-95	0.007294	50	0.05103
1425	chr16	29971798	G	T	rs9932196	0.002106999608	0.7103277461921114	0.0028201637519999	0.7153062082184772	0.0275362733749471	0.0063752595000542	6.816371268797406e-05	0.4019342648337158	8.265509728940556e-05	0.4080466031960784	0.379530907996971	0.3699646225796648	0.0008235075681421	0.5781156638216711	0.001082866878084	0.5838555857543701	0.0105566774895449	0.0116588701888095	2.6570049140394256e-05	0.3303264571557396	3.190398377264098e-05	0.3371204622287193	0.001331964024523	0.693691564706447	0.001680515358043	0.6981360418178172	TAOK2	2071	INO80E	23918	HIRIP3	24276	False	True	True	alt	-100	0.008194	-100	0.12256
1426	chr16	29981787	C	G	rs11642046	-0.0297263284	0.1061864534750013	0.0297263284	0.1001088837551573	0.0089050783808948	0.4309602010410156	-0.0002706080617446	0.1196318092491397	0.0002706080617446	0.11371472526303	0.4665297357856409	0.2293081936676172	-0.0139046650480178	0.0853759637292281	0.0139046650480178	0.0792367151501892	0.004157105665184	0.2301181378971392	-0.0001266698103943	0.0967485736142595	0.0001266698103943	0.0906570905689538	-0.0118507453396819	0.1611783334478944	0.0118507453396819	0.1563023788730901	TAOK2	7918	INO80E	13929	HIRIP3	14287	False	False	False	ref	100	0.001694	0	0.0
1427	chr16	29983415	T	A	rs3814884	-0.00888510956	0.4463517877916674	0.00953964816	0.4369414471071342	0.006196790146099	0.912980201988962	-5.533758558585022e-05	0.541234792484009	5.916693756083512e-05	0.5328623860557384	0.5847902986545505	0.0619685376079144	-0.0053520418229134	0.2832099465278383	0.0057196532433837	0.2743895015938662	0.0036295527862465	0.3111059959369037	-3.337113087226924e-05	0.3667397326094114	3.552182688859366e-05	0.3582482480012026	-0.0013112169213373	0.748506380947777	0.0014025041753545	0.7408388724421628	TAOK2	9546	INO80E	12301	HIRIP3	12659	False	False	False	ref	-75	0.015495	95	0.1578
1428	chr16	29983601	C	T	rs3814883	-0.055800812	0.0195595241220912	0.055800812	0.0183611892502206	0.0175236604102661	0.0434287407453032	-0.0009792522322988	0.0128280322262237	0.0009792522322988	0.0122006919494855	0.5755495388956317	0.0713924843086874	-0.0321232005478924	0.0133072515676346	0.0321232005478924	0.012305634182187	0.0101302954622357	0.0132312914367384	-0.0005661665836607	0.0098954436578876	0.0005661665836607	0.0093242223363769	-0.0104586147159202	0.1861020397027885	0.0104586147159202	0.1803035506167901	TAOK2	9732	INO80E	12115	HIRIP3	12473	False	True	False	ref	-50	0.00222	-75	0.05713
1429	chr16	29984559	G	A	rs4787489	-0.0349935182	0.0787745583995713	0.0349935182	0.073966731850859	0.0093839796523094	0.3751243116150563	-0.0003345596826831	0.0922322867780303	0.0003345596826831	0.0873141996994015	0.3891368167719582	0.356856092443204	-0.0137239324963522	0.0895577208613187	0.0137239324963522	0.0831437854029885	0.0036605455324535	0.3113435693815399	-0.0001314918930744	0.0967464300157606	0.0001314918930744	0.0905958798640833	-0.0197076733161131	0.0757756833713207	0.0197076733161131	0.0737320679057736	TAOK2	10690	INO80E	11157	HIRIP3	11515	False	False	False	ref	-100	0.004528	-70	0.03687
1430	chr16	29991755	G	A	rs9924686	0.00216254022	0.6340646525253203	0.00428254378	0.6377642547568483	0.0079604244897048	0.5823764435303763	1.638218541991454e-05	0.6540523996513425	3.4627672076257364e-05	0.6574481418521296	0.5643274307824769	0.0837050147639816	0.0011959328518774	0.4056064069902743	0.0024022188771241	0.4093210481434737	0.0044807551075489	0.1946766964646575	8.969557785458011e-06	0.4317896350597212	1.9348182220730785e-05	0.4351487713687616	0.0005041546074129	0.8360970466849651	0.00082780941711	0.8397414504576228	INO80E	3961	HIRIP3	4319	TAOK2	17886	False	False	False	alt	80	0.00609	-100	0.04852
1431	chr16	57107341	G	A	rs72777107	-0.0150260639	0.2474463167562214	0.0150260639	0.2375456742014292	0.0110657353437582	0.2230066325550022	-0.0001731293488124	0.2035900896848016	0.0001731293488124	0.1953573566934741	0.4155146837622796	0.302705374889014	-0.0062837276646569	0.20748503816733	0.0062837276646569	0.1974323538604833	0.0045915680661119	0.1751208366019053	-7.246123197026949e-05	0.1752229234087517	7.246123197026949e-05	0.1665080525647857	-0.0072096183570368	0.2739530097559237	0.0072096183570368	0.2660402583967121	CPNE2	14757	PSME3IP1	78775	RSPRY1	78797	False	False	False	ref	10	0.000328	80	0.0473
1432	chr16	58504758	C	T	rs9928398	-0.0246133724	0.1424875165745601	0.0246133724	0.134957918219565	0.0068664483164772	0.7862024164153483	-0.0001683472881572	0.2147137070477326	0.0001683472881572	0.2062664970129425	0.4413012583118082	0.2632444333774739	-0.0108559863384659	0.1169418945023137	0.0108559863384659	0.1094406472448839	0.003006263126008	0.4237142473642623	-7.374933574584976e-05	0.167140219902046	7.374933574584976e-05	0.1586564258532471	-0.0113299930497204	0.1767176977015227	0.0113299930497204	0.1713183863762988	SETD6	10722	NDRG4	41911	CNOT1	125127	False	False	False	ref	0	0.0	95	0.04205
1433	chr16	58505278	G	A	rs8056038	-0.05650552	0.0203554124334015	0.05650552	0.019111480161744	0.0210581909213604	0.0207832574583049	-0.0012095570633359	0.009543769891007	0.0012095570633359	0.0091326521581798	0.4166184296517599	0.3067184755954911	-0.0238375821606157	0.0312051292358458	0.0238375821606157	0.0288243803890764	0.0087756831511323	0.0209463775237441	-0.0005102104259346	0.0127849203430169	0.0005102104259346	0.0119556783827022	-0.0289276859718461	0.0287080608951709	0.0289276859718461	0.0280065052057146	SETD6	10202	NDRG4	42431	CNOT1	124607	False	True	False	ref	55	0.02576	55	0.0419
1434	chr16	58505281	G	A	rs8056039	-0.0946262336	0.0027242308411649	0.0946262336	0.0026007208198932	0.0224971193154399	0.0158497267174822	-0.0021322045164345	0.0035453151360652	0.0021322045164345	0.0033930911733796	0.4161391715681698	0.3075597848442745	-0.0396496879115134	0.007085620680497	0.0396496879115134	0.0065958387410698	0.0093616488370624	0.0173672154908147	-0.0008929074431507	0.0047389530627616	0.0008929074431507	0.0045048514869717	-0.0517785454205956	0.0034256984806155	0.0517785454205956	0.0033242438765251	SETD6	10199	NDRG4	42434	CNOT1	124604	False	True	True	ref	55	0.02344	50	0.0471
1435	chr16	58519260	A	C	rs37035	0.0137291552	0.259410239048746	0.0137291552	0.2699363208228696	0.0080714177882419	0.5741315134352311	0.0001124052301187	0.2951639670281898	0.0001124052301187	0.3049264534679015	0.27863152107387	0.5317187697813377	0.0039840647758936	0.2867025678815302	0.0039840647758936	0.2984514471256114	0.0022612809895777	0.5590524791030297	3.274010829058357e-05	0.3092314714458983	3.274010829058357e-05	0.320505383690037	0.0110416083154389	0.160924600124145	0.0110416083154389	0.1661441280508226	SETD6	3780	NDRG4	56413	CNOT1	110625	False	False	False	alt	-60	0.005806	-90	0.02396
1436	chr16	58530960	C	T	rs37059	-0.0571252861999999	0.0196654153665084	0.0571252861999999	0.0186887460078073	0.0139903351026859	0.1093717078183151	-0.0008946097247417	0.0223414110215944	0.0008946097247417	0.0213613091625242	0.2867934314671314	0.5195605399828461	-0.0169260429804048	0.0653344940422967	0.0169260429804048	0.0607163217756837	0.0041045391928681	0.230165054909077	-0.0002681001185392	0.0440584829104188	0.0002681001185392	0.0413818796183825	-0.0496249961099181	0.0056179378147472	0.0496249961099181	0.0054517563671847	SETD6	15480	NDRG4	68113	CNOT1	98925	False	True	False	ref	-100	0.05206	45	0.02295
1437	chr16	58559618	C	T	rs7201946	-0.0034672719728	0.6917301502245995	0.0034841260272	0.6810995991796475	0.0060061793336566	0.9439448922740292	-2.0615406813972955e-05	0.7719750853216577	2.072271084923659e-05	0.7617395452395902	0.2268820215977343	0.608623662522171	-0.0006549848981629	0.6925468210627514	0.0006604974899489	0.6811702803485195	0.0013648627290049	0.7278488583077614	-3.852382898274834e-06	0.7505256704297227	3.887479696289984e-06	0.739530793811612	-0.0031058413469018	0.5330933940321783	0.0031141401881761	0.5236515564044901	SETD6	44138	CNOT1	70267	NDRG4	96771	False	False	False	ref	-95	0.02979	90	0.02554
1438	chr16	58572603	A	C	rs7206744	0.003292875668	0.7095814268604479	0.003292875668	0.723599553815993	0.0071180557657092	0.7421218921829494	2.2795857410105058e-05	0.7547248276219469	2.2795857410105058e-05	0.7685865279831964	0.0452950756750588	0.9082659368044804	0.0001246977609459	0.8798031205855934	0.0001246977609459	0.8941701689382218	0.0003259189194169	0.9214733601737308	8.720871282006476e-07	0.8924691537396366	8.720871282006476e-07	0.9068420901563627	0.0015269867944687	0.7075042399898703	0.0015269867944687	0.7206280646486222	SETD6	57123	CNOT1	57282	NDRG4	109756	False	False	False	alt	-80	0.004353	-100	0.04047
1439	chr16	58576353	C	T	rs9936144	-0.0805703536	0.0046447050239259	0.0805703536	0.0044461611286884	0.0228122466805457	0.0160230608410641	-0.001868793636445	0.0048445623837636	0.001868793636445	0.0046413358642499	0.2142283633647651	0.6318201692951615	-0.0172431521270487	0.058540187056844	0.0172431521270487	0.0541512641260234	0.0048520064619267	0.1382225518676314	-0.0003959991909605	0.0191035971589617	0.0003959991909605	0.0178926791018528	-0.0766086785132625	0.0006454146716693	0.0766086785132625	0.0006356728852305	CNOT1	53532	SETD6	60873	SLC38A7	108417	False	True	True	ref	-100	0.00827	-30	0.03055
1440	chr16	58581678	T	C	rs116630925	0.00180109299	0.8279529805896757	0.00180109299	0.8418923401875161	0.0186086079398573	0.0359173853443419	3.329717584428021e-05	0.6644598310997422	3.329717584428021e-05	0.6779163475287373	0.0569404246932021	0.8958755003355405	9.22041037533101e-05	0.9013729691725058	9.22041037533101e-05	0.915548607884258	0.0010685496045545	0.7833049709470528	1.7366966034336486e-06	0.8410551267615212	1.7366966034336486e-06	0.8554052200426315	0.0010643263934272	0.7839007016742832	0.0010643263934272	0.7975305106150303	CNOT1	48207	SETD6	66198	SLC38A7	103092	False	False	False	alt	30	0.004578	-100	0.04703
1441	chr16	58587091	A	G	rs12443835	-0.0030582803719999	0.7030662210228397	0.0034257247079999	0.6947666857841981	0.0170866768444505	0.0501897989063543	-5.1709466541168913e-05	0.5375484028286344	5.730057141880059e-05	0.5293085305579751	0.4637309515658877	0.2285008941377067	-0.0015150343841889	0.5294007603428162	0.0016660921646459	0.5203834875154579	0.0079239066545967	0.0305171679441719	-2.5615059370148864e-05	0.3944966762412138	2.791358410900034e-05	0.3861740384486706	-0.0009813379806844	0.7965555426427303	0.0011348665442587	0.7887897755235113	CNOT1	42794	SETD6	71611	SLC38A7	97679	False	False	False	ref	10	0.0002842	90	0.03558
1442	chr16	58622367	G	A	rs9925537	-0.0213712379	0.1670391264658816	0.0213712379	0.1589309583214441	0.0111892172566396	0.2167208248610652	-0.0002665186888496	0.1438571312562425	0.0002665186888496	0.1374507324987698	0.4012717974252844	0.3340025677003957	-0.0084848771872573	0.1592995678217324	0.0084848771872573	0.1504515536950606	0.0044856084263354	0.1913073051260036	-0.0001055973607077	0.1343263233802488	0.0001055973607077	0.127202215138215	-0.0112470046369775	0.1583991933188819	0.0112470046369775	0.1538313169406403	CNOT1	7518	SLC38A7	62403	SETD6	106887	False	False	False	ref	15	0.001419	95	0.05313
1443	chr16	58625904	G	A	rs154433	0.0156354547	0.2518545614847613	0.0167721749	0.2594064851954011	0.0152150646553282	0.1103458345140154	0.0004349077224398	0.1566179544272552	0.0004437888788243	0.1602307934638753	0.2328177678191682	0.6014661937445943	0.00393037773581	0.3318299022796462	0.0041271361350881	0.3418158006007311	0.0036693180660336	0.2893452723407044	0.0001106394618788	0.210271232560929	0.000112176728608	0.2167512827717075	0.0149856326310438	0.1430377876542465	0.0157947696552868	0.1456394218819706	CNOT1	3981	SLC38A7	58866	GOT2	108438	False	False	False	alt	-95	0.01532	35	0.02461
1444	chr16	63663230	T	C	rs7193419	0.00359305174	0.6288280588742817	0.0043979757	0.6392536929974237	0.0065237762092956	0.8689389215952493	2.3305268925503795e-05	0.6987488178906855	2.8812988986473765e-05	0.7088601745335613	0.0073382503967882	0.9843606051562994	3.862215935218886e-05	0.9431552552298856	3.978279823560616e-05	0.9557644177667806	4.742200222231765e-05	0.9880304611397877	2.510840689773092e-07	0.9509014416405204	2.5902578090870706e-07	0.9638060531216498	0.0006991773773586	0.8446544023150879	0.0007157750599072	0.855153550226415	CDH11	1462882	CDH8	1626195	CDH5	2703461	False	False	False	alt	-75	0.00612	0	0.0
1445	chr16	63665521	T	G	rs6498914	0.00323513204	0.7085723228380606	0.00323513204	0.7227047024770398	0.0129808235788212	0.130379791586852	3.999484062861148e-05	0.6112664366327064	3.999484062861148e-05	0.6247200954797705	0.135074015290615	0.7578030731893055	0.0005009774123707	0.7453615818519822	0.0005009774123707	0.7602362708569009	0.0017125899743352	0.6495996028214087	5.985021008866739e-06	0.6869732012525939	5.985021008866739e-06	0.7015092481288775	0.0026888245728689	0.5617285330543348	0.0026888245728689	0.5740876036606243	CDH11	1460591	CDH8	1628486	CDH5	2701170	False	False	False	alt	-40	0.00254	-80	0.01576
1446	chr16	63667853	T	C	rs4353494	0.0151557547	0.2622461161869523	0.0151557547	0.2727690215561061	0.0185324392843905	0.0366378778148445	0.0002810276586885	0.1203909231650444	0.0002810276586885	0.1266045980759537	0.0314318613263622	0.9444315527411832	0.000529994360035	0.7325294570163187	0.000529994360035	0.7461246160989402	0.0006284567314569	0.8711939432420831	1.0765829053675082e-05	0.5979091343895033	1.0765829053675082e-05	0.6112578845624624	0.0064647973526695	0.3370070163081782	0.0064647973526695	0.346084351890947	CDH11	1458259	CDH8	1630818	CDH5	2698838	False	False	False	alt	-100	0.005314	-100	0.0476
1447	chr16	63674238	C	T	rs10775297	-0.00754532994	0.4825314450978493	0.00780200854	0.473539539823636	0.0066694488752054	0.8185225070000848	-5.280693167232315e-05	0.5581005389683823	5.4116342058987846e-05	0.5497470737484715	0.1939916389174161	0.6647764334804898	-0.0013010355224316	0.5723960355285802	0.0013559397513925	0.5638054133619326	0.001291092802592	0.736964467068113	-9.1585689079604e-06	0.6221865364947667	9.43865523845165e-06	0.6138651583061732	-0.0066245500471996	0.3124676076308695	0.0069108600711625	0.3067746900330139	CDH11	1451874	CDH8	1637203	CDH5	2692453	False	False	False	ref	-85	0.02545	-35	0.02014
1448	chr16	63675908	G	A	rs12933055	-0.086015071	0.004090659013034	0.086015071	0.0038945479412605	0.0216689324078921	0.0182303885631267	-0.0018421829376483	0.004319591601808	0.0018421829376483	0.0041468842529172	0.2980549590763389	0.498327203262367	-0.0261595582958696	0.0247349764809485	0.0261595582958696	0.0228585247732486	0.0063595792577756	0.0654290380203815	-0.0005529386744832	0.0105005705592724	0.0005529386744832	0.0098292561962087	-0.0733638315750162	0.0008780308654043	0.0733638315750162	0.0008479868444205	CDH11	1450204	CDH8	1638873	CDH5	2690783	False	True	True	ref	10	0.00708	5	0.003906
1449	chr16	64258586	T	C	rs2926123	-0.0016982366252	0.7897505703207998	0.0023115446652	0.783478379597141	0.0094847073136267	0.3609270038019936	-1.6711296893689405e-05	0.7649867242541281	2.3027605695313385e-05	0.7587823797292034	0.1243207917094575	0.7850117252930124	-0.0002189630497479	0.833039031951386	0.0003047443585208	0.8242461945583749	0.0011969722441444	0.7631372065089791	-2.2064375384519537e-06	0.820007948360422	3.089878150619052e-06	0.8110382813503664	-0.0016265728897602	0.6596966539556657	0.0021535493106774	0.6508205150265323	CDH11	867526	CDH5	2108105	BEAN1	2168710	False	False	False	ref	-100	0.0152	100	0.04175
1450	chr16	64263093	C	A	rs2917686	-0.0002084227	0.8602467717766978	0.00150415898	0.8628675713665204	0.0068646462972803	0.8177055177893611	-1.0814884184645055e-06	0.8831317061810418	1.051814018095654e-05	0.885966866714818	0.3886119150613595	0.3456696672591213	-9.87722455818602e-05	0.7096604703982453	0.0006311877462431	0.7121818234472209	0.002689886721095	0.4819829189784244	-5.414804452313109e-07	0.7461044040245737	4.444114421757429e-06	0.7489796867400251	-1.2448261911419998e-05	0.8500893656995846	0.0007468957146857	0.8529984347508217	CDH11	863019	CDH5	2103598	BEAN1	2164203	False	False	False	ref	60	0.0008125	-15	0.01596
1451	chr16	64263270	G	A	rs2917688	-0.0068073123399999	0.4866924286188806	0.0068073123399999	0.4741095733999407	0.0074419547104962	0.6963840254286341	-5.208628845582381e-05	0.5353883668283512	5.208628845582381e-05	0.5231075734773186	0.3631137252461124	0.3877072298591137	-0.0025650875429597	0.4070146632398368	0.0025650875429597	0.3943724125811788	0.0027361020248831	0.4706145890766309	-1.979079154669584e-05	0.4423467624021551	1.979079154669584e-05	0.4299213073282747	-0.0041846907125592	0.4500578402820803	0.0041846907125592	0.4392365347118338	CDH11	862842	CDH5	2103421	BEAN1	2164026	False	False	False	ref	10	0.0008273	35	0.01588
1452	chr16	64265570	G	A	rs2917696	-0.00656503778	0.4903120748400594	0.00656503778	0.4779618697991323	0.0057144064768435	0.969013258969083	-3.715232865137459e-05	0.6249890758018676	3.715232865137459e-05	0.6121538459810897	0.0450896793535202	0.9173891611066294	-0.0002943963587892	0.8076188625293685	0.0002943963587892	0.7933828266868914	0.0002578796622336	0.9440720425128388	-1.667935583442558e-06	0.8562001826947975	1.667935583442558e-06	0.8418023715315817	-0.004006265625162	0.4578044592110216	0.004006265625162	0.4469259155767932	CDH11	860542	CDH5	2101121	BEAN1	2161726	False	False	False	ref	10	0.005463	80	0.02455
1453	chr16	64313247	G	A	rs12921977	0.0023204028	0.6823750338991286	0.00377482916	0.6814456085088105	0.0114286354287672	0.2155198249861242	2.5908983729521795e-05	0.6294581949205118	4.116180480354135e-05	0.6280695847018889	0.1878504963744437	0.6784934080464474	0.000595135287226	0.7002718217171143	0.0007886140852714	0.6985333800918786	0.0021909094328193	0.563004268731067	6.690650370337885e-06	0.6600201267328529	8.701576890465765e-06	0.6581806006081045	0.0018630898660774	0.5352498458979795	0.003444019128829	0.5339926496789915	CDH11	812865	CDH5	2053444	BEAN1	2114049	False	False	False	alt	-55	0.001417	55	0.01288
1454	chr16	64337259	G	A	rs8058130	0.0014808662399999	0.7202065590299066	0.0028747478399999	0.7292158123345028	0.014697097663428	0.0921386580614292	2.9102284289296087e-05	0.5645123525101912	4.435081778116388e-05	0.5731418149523326	0.1914501187771656	0.6699339299805042	0.0002076225641951	0.7097068451237231	0.0005232590544416	0.719041872370799	0.0026929420444106	0.459784180130123	4.31305553618227e-06	0.6131261205600355	7.765998384074699e-06	0.6224657453239504	0.0014564466436373	0.5543043212612951	0.0027967095094346	0.5620084787325437	CDH11	788853	CDH5	2029432	BEAN1	2090037	False	False	False	alt	15	0.0008698	-20	0.009705
1455	chr16	64340633	G	T	rs934655	0.00014230724	0.7176788104924522	0.00321307052	0.7195058426448336	0.0129775956993221	0.1348019468182856	-7.661655810520317e-07	0.6109117174440636	4.218871809387956e-05	0.6127545569547918	0.0798078818245002	0.8587988507225027	4.864436008658291e-05	0.8251320783402111	0.0002713420484586	0.828305202816043	0.0010221558601272	0.7895104380055253	4.493108351739889e-07	0.7731097937954379	3.5499476948402263e-06	0.7762891194182391	2.9045944459999903e-05	0.5946148323304475	0.0025975373188518	0.596497193976789	CDH11	785479	CDH5	2026058	BEAN1	2086663	False	False	False	alt	100	0.005554	-65	0.03012
1456	chr16	65343295	C	T	rs4785823	-0.0426743952	0.0447791520657453	0.0426743952	0.0419416741608171	0.0119065447134485	0.1802759207108182	-0.0005310239674625	0.043756827154087	0.0005310239674625	0.0412946649047667	0.0885756076307845	0.8312880124225244	-0.0040070657460567	0.3226460927862806	0.0040070657460567	0.3101328110396578	0.0011772980797721	0.729684721785336	-5.587659269727373e-05	0.253491688125829	5.587659269727373e-05	0.2429386652260215	-0.0294442888411705	0.0220944306097266	0.0294442888411705	0.0213963239743871	CDH11	217183	CDH5	1023396	BEAN1	1084001	False	False	False	ref	55	0.00342	100	0.02141
1457	chr16	66718992	A	G	rs7196496	0.00616317268	0.4976745093001688	0.00631749616	0.5089958059962666	0.0214530947643202	0.0194927004452662	0.0001279849460484	0.2623822599034685	0.0001317358123713	0.2710890678215505	0.1869583709374578	0.6742137977645876	0.0012320530052504	0.555384055426226	0.0012551889603359	0.567385037038943	0.00394052265961	0.253223649439955	2.537756977749808e-05	0.3719413280804741	2.5939894283955208e-05	0.382953405973879	0.0057386487411694	0.3317570657827396	0.0058838784634694	0.3384639300515269	CMTM4	22249	DYNC1LI2	32617	TERB1	82628	False	True	False	alt	60	0.0731	40	0.0239
1458	chr16	66724067	G	A	rs11862377	-0.0687113561999999	0.0101897327539042	0.0687113561999999	0.0096873171869196	0.0218152036974432	0.0270168519787792	-0.0018338923517534	0.0103978426606103	0.0018338923517534	0.0098666539956228	0.4381518480482162	0.2770287423503627	-0.0300449607021057	0.016182578364562	0.0300449607021057	0.0150049793444945	0.0095475288543246	0.0247931326667915	-0.0008020813331557	0.0111778308561211	0.0008020813331557	0.0105461916926716	-0.0327741989024781	0.0162858275691679	0.0327741989024781	0.0157637211865975	CMTM4	27324	DYNC1LI2	27542	TERB1	77553	False	True	True	ref	-100	0.02307	-70	0.01672
1459	chr16	66749462	C	T	rs13329803	-7.859366000000007e-05	0.7665134252487401	0.00248292774	0.7658090292541335	0.0078578365207448	0.610206326454606	-1.5499987433687365e-06	0.7813310871934693	1.913854725485225e-05	0.7805137083051654	0.3043558543138413	0.4930047391989307	-3.877313405013998e-05	0.6603081401088453	0.0007517093841022	0.6597743487666495	0.0023871197324365	0.5369167771384569	-5.734810580907452e-07	0.6784426452537295	5.786884140740362e-06	0.6777894514419576	0.0001244826191142	0.6697472133134024	0.0019253311756345	0.6692415508119662	DYNC1LI2	2147	TERB1	52158	CMTM4	52719	False	False	False	ref	100	0.01076	-85	0.00839
1460	chr16	66751701	C	A	rs9929143	-0.00368494977	0.5485042131865094	0.00561226737	0.539120216489823	0.0285927071750104	0.0048331305074445	-0.0001040823825682	0.2404194159560554	0.0001629192663304	0.2344347759518385	0.8021431757590847	0.0060939641420763	-0.0029890457484546	0.2962574119243396	0.0044955880264896	0.2881729868180667	0.0229393141091975	0.0008955019757818	-8.463959454011451e-05	0.1105208842256864	0.0001306311058849	0.1070471807134286	-0.0008319588377472	0.7849840862703291	0.0011929584331787	0.7753539779894966	DYNC1LI2	92	TERB1	49919	CMTM4	54958	True	True	True	ref	55	0.013794	55	0.1334
1461	chr16	66772160	A	C	rs75228693	-0.0090180345199999	0.3966805098755472	0.0090180345199999	0.3849061790049696	0.0368922656076795	0.0016493125144622	-0.0003311736041564	0.0952648706245232	0.0003311736041564	0.0904305128506844	0.0532993080841086	0.8998386339235214	-0.0004978371133114	0.7355492289713328	0.0004978371133114	0.7216604506834605	0.0020782004129364	0.5464645194384726	-1.9303430485648035e-05	0.4457693396533225	1.9303430485648035e-05	0.4331820253344046	-0.0059253726698409	0.3460668486691481	0.0059253726698409	0.3368742244000077	DYNC1LI2	20551	TERB1	29460	CA7	72255	False	True	True	ref	-40	0.000992	-90	0.01336
1462	chr16	66857678	C	T	rs16957058	-0.0282261544	0.1164280103097189	0.0282261544	0.1099877677035143	0.0102285237546005	0.2837196356677368	-0.0002949996818692	0.109941382291188	0.0002949996818692	0.1043384355547379	0.2654156163445678	0.5517269128327996	-0.0072788009575561	0.1819066914494989	0.0072788009575561	0.1723329152090679	0.0026951221331512	0.4762451515242749	-7.55138373384166e-05	0.1662512392346862	7.55138373384166e-05	0.1577779494671249	-0.0244836564694654	0.0461048182187868	0.0244836564694654	0.0449710307161637	CA7	13263	NAE1	15578	PDP2	20912	False	False	False	ref	25	0.000656	-25	0.02348
1463	chr16	66860753	T	C	rs3026093	0.007128998134	0.4726410387961471	0.007128998134	0.4851036813977176	0.0057994122431686	0.9361548766811146	4.2646099446269495e-05	0.5958749242110927	4.2646099446269495e-05	0.6084577857540857	0.1339827176630462	0.7604634572149824	0.0009916982101927	0.6153512861167413	0.0009916982101927	0.6292734198584701	0.0007610279416104	0.8384369588000915	5.793788879504145e-06	0.688265964400652	5.793788879504145e-06	0.7019351571228729	0.0059419703523895	0.3382016820498277	0.0059419703523895	0.3476398536908796	NAE1	12503	CA7	16338	PDP2	17837	False	False	False	alt	60	0.02504	55	0.01239
1464	chr16	66871267	A	G	rs9932517	-0.00147380486	0.7565352821916863	0.00259867106	0.7539620638680671	0.0270468306365532	0.0071843115807858	-5.457612102323593e-05	0.5057355464186418	8.058558469594634e-05	0.50260311383622	0.1478272596188757	0.7324509379635815	-6.094672508808842e-05	0.808695176676395	0.0002849592974664	0.8081343788145943	0.0037644779008726	0.2688084289764705	-3.0611161576165988e-06	0.6370155704244918	8.239842594399701e-06	0.6364121415663693	-0.0011037458894801	0.6570103077424962	0.0022821813504288	0.6548108331092617	NAE1	1989	PDP2	7323	CA7	26852	False	True	True	ref	-95	0.03345	-50	0.05524
1465	chr16	66886549	G	A	rs11861556	0.01334114372	0.28204482981777	0.01334114372	0.29279710062443	0.00889495298229	0.4253231412068187	0.000126521947828	0.2912231826358786	0.000126521947828	0.3012038426268566	0.3048392618180686	0.4917904026700623	0.0042345399958819	0.2854474583277684	0.0042345399958819	0.2969852627870341	0.0027038802136295	0.4736816956491322	4.007612517411992e-05	0.289291356323849	4.007612517411992e-05	0.3004403696500878	0.0098133798068443	0.1912771434451763	0.0098133798068443	0.1971182425728019	PDP2	7959	NAE1	13293	CDH16	32368	False	False	False	alt	-10	0.004433	40	0.0436
1466	chr16	66902190	C	T	rs28442574	-0.0387393345999999	0.0587415493445733	0.0387393345999999	0.0549839356347923	0.0100207090217694	0.3107134100670282	-0.0004019745904171	0.0682873952598313	0.0004019745904171	0.0644533865396874	0.3997904542578242	0.3264484794799978	-0.0156932172831278	0.0690788656232217	0.0156932172831278	0.0640491351417273	0.0041304915518785	0.2225564293104947	-0.000167951886297	0.0725495544559005	0.000167951886297	0.067870554855469	-0.0216641251465263	0.0640053103841182	0.0216641251465263	0.0623032193536281	CDH16	16727	RRAD	23345	PDP2	23600	False	False	False	ref	-90	0.0003462	-55	0.10114
1467	chr16	66920342	C	T	rs73586830	-0.00837205706	0.429691264728575	0.00837205706	0.4173844278883035	0.0074693475660526	0.6871083067407844	-6.548192775915821e-05	0.482410657001881	6.548192775915821e-05	0.4704868336206612	0.2971649083496716	0.47618633213192	-0.0025807482061381	0.4140575752174982	0.0025807482061381	0.4009015373114358	0.0021979362075149	0.5452053637087975	-1.993398689922968e-05	0.4496188028428513	1.993398689922968e-05	0.4368378247041413	-0.0060228840548138	0.3508829393651907	0.0060228840548138	0.3418583913941838	CDH16	1425	RRAD	5193	CIAO2B	14081	False	False	False	ref	20	0.001912	95	0.00957
1468	chr16	66920898	A	G	rs59454517	0.00226032094	0.7765590937190365	0.00226032094	0.7903295407420325	0.0065897719500783	0.8396893349970722	1.5489120835035724e-05	0.8141553090536787	1.5489120835035724e-05	0.8279536608979092	0.3758254753680017	0.3605172148392385	0.0008778907261128	0.6138743334950704	0.0008778907261128	0.6280831000236043	0.0025012729483891	0.4981183725531238	6.064959761922445e-06	0.6604369785663504	6.064959761922445e-06	0.674488531193408	0.0012987686594259	0.7445051798390059	0.0012987686594259	0.7578063871838802	CDH16	1981	RRAD	4637	CIAO2B	13525	False	False	False	alt	70	0.0083	70	0.08966
1469	chr16	66930288	G	A	rs17767961	-0.004005361802	0.629092126494034	0.004005361802	0.6157921129509006	0.0072132143456394	0.7510292058082523	-2.832744584211836e-05	0.6885430947628567	2.832744584211836e-05	0.6754990370947682	0.3441446488034108	0.420362728622509	-0.0013209244672289	0.5533129529040387	0.0013209244672289	0.5393741002181276	0.0024663051561505	0.5143376521321897	-9.235255554046204e-06	0.5981968565776598	9.235255554046204e-06	0.5847767196530727	-0.0031763814977333	0.548048818877744	0.0031763814977333	0.5367824640281268	CIAO2B	4135	CES2	4157	RRAD	4753	False	False	False	ref	-40	0.00138	5	0.001311
1470	chr16	67045166	T	G	rs150710353	-0.00339242278	0.6785634557803571	0.00339242278	0.6649099427531829	0.0288079139064534	0.0048986965441875	-9.677908860150996e-05	0.3509786075132269	9.677908860150996e-05	0.3400791883548119	0.1558501644207926	0.7269004788731023	-0.0005746372383109	0.7117665422509603	0.0005746372383109	0.6975372481022122	0.0045258116290989	0.1846201421628567	-1.647135208984284e-05	0.4786906866713552	1.647135208984284e-05	0.4656957734700035	-0.0034419444185105	0.5079730510131062	0.0034419444185105	0.4965905231578437	CBFB	16181	CES4A	56576	PHAF1	64776	False	True	True	ref	100	0.01517	-80	0.03595
1471	chr16	67087027	A	G	rs77801206	-0.00345842336	0.636764301588327	0.00418332192	0.6263877660984613	0.0065564961359976	0.8433534322024455	-2.3053868127939128e-05	0.7097543567132023	2.779666212252166e-05	0.6996810436118406	0.0670027697382752	0.8740865253231745	-0.0002771367541752	0.8056466332707074	0.0002990192924183	0.794669553540778	0.0004332848904118	0.9037288045717372	-1.8084471753307512e-06	0.8396058049937888	1.951618064284321e-06	0.828847764849605	-0.0029481633626904	0.516787258853626	0.0032884158549362	0.5080980006551942	PHAF1	22915	CBFB	58042	B3GNT9	63971	False	False	False	ref	100	0.00226	-10	0.001343
1472	chr16	67096883	G	A	rs148571332	-0.0642173718	0.0125771466147265	0.0642173718	0.0119026809153586	0.0184963393146162	0.0363484565420137	-0.0012066121129706	0.0092584145711419	0.0012066121129706	0.0088240089957134	0.3469558812850756	0.4099233664803822	-0.0229458286591654	0.0336473040063962	0.0229458286591654	0.0311973627303006	0.006475540085672	0.064030841658313	-0.0004348411571897	0.016892769281934	0.0004348411571897	0.015880622532794	-0.0434983765391756	0.0069766724327479	0.0434983765391756	0.0067871900337619	PHAF1	13059	B3GNT9	54115	TRADD	63026	False	True	False	ref	-70	0.003113	-60	0.05154
1473	chr16	67140459	A	G	rs8047207	0.0665823206	0.0110144167815551	0.0665823206	0.011621568499264	0.0161203881822908	0.063027433261476	0.0011565594754642	0.0119197398016015	0.0011565594754642	0.0125223863013009	0.312482494631687	0.4769073748401208	0.0209387773982275	0.0369236348209796	0.0209387773982275	0.0402416719362672	0.0051373765217191	0.1320426305953258	0.0003672898636183	0.0223529727610828	0.0003672898636183	0.0239835898851191	0.0550814842477618	0.0041185073997699	0.0550814842477618	0.0042363493349471	B3GNT9	10539	TRADD	19450	FBXL8	19474	False	True	False	alt	-50	0.001381	-20	0.00952
1474	chr16	67146210	G	C	rs76171566	0.00206596535	0.7409158347338343	0.0027473499499999	0.7482867481785437	0.0085253405013469	0.4910407296648237	1.778645148723641e-05	0.7379385250668585	2.35211322141253e-05	0.7451409363442947	0.3313353872965486	0.4385288342860423	0.0007153874290232	0.6198614615240685	0.0009542067289393	0.626931516229705	0.0028143008477001	0.4405742478796514	6.058351525907446e-06	0.6219244571619023	8.068306584771074e-06	0.6289709786663997	0.0012614238736916	0.6784273324136751	0.0018381933422545	0.6855869593789937	B3GNT9	4788	TRADD	13699	FBXL8	13723	False	False	False	alt	-100	0.005703	65	0.0411
1475	chr16	68182836	G	T	rs78587942	0.0034731777799999	0.671132055096033	0.0034731777799999	0.6846738987860639	0.0176400058881085	0.0453341816601989	6.159747794569524e-05	0.460635110397577	6.159747794569524e-05	0.4722004036123364	0.0780153321092541	0.8555799202276715	0.0002686533822831	0.7915159632419836	0.0002686533822831	0.8059492796287444	0.0014249284550215	0.6957745228558573	4.936576893255964e-06	0.683816534445654	4.936576893255964e-06	0.6978980839549628	0.0027697382752932	0.5500019398033141	0.0027697382752932	0.5619143718173895	ESRP2	55266	PLA2G15	62469	SLC7A6	81681	False	False	False	alt	35	0.003448	100	0.072
1476	chr16	68255156	C	T	rs2290699	-0.0212878909999999	0.1723027882876191	0.0212878909999999	0.1639596746706311	0.0080339926231844	0.5928007995097948	-0.0001745892861798	0.2060793776644393	0.0001745892861798	0.1977839268260491	0.4437639394599529	0.2624159788571877	-0.0094866933182548	0.1396558459006023	0.0094866933182548	0.1312026579398178	0.0035558671297472	0.3241267136615559	-7.755327794653919e-05	0.1637512785098556	7.755327794653919e-05	0.1552881979097841	-0.0095540410170229	0.2155940517407253	0.0095540410170229	0.2091360553352362	SLC7A6	9361	PLA2G15	9851	ESRP2	17054	False	False	False	ref	100	0.003447	-35	0.00589
1477	chr16	68265599	G	A	rs116580887	-0.00806325054	0.3702814651356957	0.0100197070599999	0.3612381379994107	0.0063214444886774	0.8921646859673835	-5.405235187651122e-05	0.4727562998926583	6.544607128252324e-05	0.4640007789049541	0.5754810734551189	0.0707713858778569	-0.0047163270216305	0.226727837879794	0.0057928560682773	0.2186569602902431	0.0036438368423973	0.3077675753914984	-3.1628009914096924e-05	0.295653090048646	3.789733904046853e-05	0.2872501173067641	-0.0012904698181516	0.6974136617893459	0.0017593543501488	0.6886041617381577	SLC7A6	1082	PLA2G15	20294	ESRP2	27497	False	False	False	ref	95	0.007835	-20	0.031
1478	chr16	68286641	T	G	rs78805615	0.0242871356	0.1252288007854921	0.0242871356	0.1324398713234121	0.0080389483566236	0.5545576022022993	0.0002018915308399	0.1581188956786664	0.0002018915308399	0.1656615934089324	0.3614477328602993	0.4024693233226307	0.0088175826411955	0.1327018019928296	0.0088175826411955	0.1412491990903082	0.002907071381744	0.4356737381341447	7.336011821881596e-05	0.1564415907184641	7.336011821881596e-05	0.1650965350018262	0.0151433106152553	0.0986978629911317	0.0151433106152553	0.1017150774355092	SLC7A6	22124	SLC7A6OS	24305	PRMT7	24311	False	False	False	alt	-100	0.0008316	-100	0.02365
1479	chr16	68338869	C	T	rs12925938	-0.0655039219999999	0.0106102035047649	0.0655039219999999	0.0100099721714362	0.0136360016400341	0.1117069321416945	-0.0009240368696407	0.0148641884522632	0.0009240368696407	0.0141075547112815	0.5346632226475379	0.1223222540074283	-0.0351091937370826	0.0100081668667144	0.0351091937370826	0.0092116291532705	0.0073251456651943	0.0433060163458758	-0.0004973991363941	0.0129675002232651	0.0004973991363941	0.0121827189888585	-0.0173902218902685	0.0952009665479401	0.0173902218902685	0.092544250536043	PRMT7	27917	SLC7A6OS	27923	SLC7A6	74352	False	True	False	ref	100	0.00365	50	0.04108
1480	chr16	68361619	C	T	rs71395853	-0.0148666273999999	0.2818920266074907	0.0148666273999999	0.2712048487795603	0.0118096371301941	0.1874215986972104	-0.0001957535746053	0.2128677112024793	0.0001957535746053	0.2046030852057632	0.6157864708140126	0.0375737712785921	-0.0091742810095204	0.1563349489100829	0.0091742810095204	0.1473576080031787	0.0072900258825102	0.042669609435507	-0.0001209245419215	0.122673880666586	0.0001209245419215	0.1157699052176927	-0.0018568657351216	0.6975326986046789	0.0018568657351216	0.6844849200844737	PRMT7	50667	SLC7A6OS	50673	SMPD3	86889	False	False	False	ref	-100	0.002853	-10	0.001038
1481	chr16	68381072	C	G	rs11862968	0.00874177018	0.3876106344860037	0.00874177018	0.3998717973916889	0.0073355728885647	0.6816463503442379	6.435833655560623e-05	0.4470145688380363	6.435833655560623e-05	0.4589808151364383	0.5610535378997706	0.0875186476156949	0.0049569470895105	0.2451855385383874	0.0049569470895105	0.2567562080079061	0.0041093087585633	0.2330476833232836	3.64270831918731e-05	0.2865751948692789	3.64270831918731e-05	0.2979677648437772	0.001520762663513	0.7068158230570265	0.001520762663513	0.7200626075789062	SMPD3	67436	PRMT7	70120	SLC7A6OS	70126	False	False	False	alt	50	0.001545	-100	0.05194
1482	chr16	69246420	T	C	rs34669336	-0.010239527	0.3553271546380873	0.010239527	0.3439527241241568	0.0071819961740829	0.7597351844707062	-7.469885227118578e-05	0.4278555193609423	7.469885227118578e-05	0.4167183681289574	0.1300179462442556	0.77380050908576	-0.0013808727669262	0.5516159214115373	0.0013808727669262	0.5381370228153527	0.0009540058095792	0.8082189696982638	-1.0318361277576005e-05	0.5923966652835349	1.0318361277576005e-05	0.5790546629414332	-0.0094503055010943	0.2129213058354291	0.0094503055010943	0.2063771317468412	ENSG00000260914	53263	SNTB2	59272	VPS4A	64917	False	False	False	ref	95	0.003891	85	0.02345
1483	chr16	69251934	C	A	rs11641316	0.00187887288	0.7109079586596687	0.00287296276	0.7190023830532097	0.0367234405698161	0.0016116768568162	7.324040998415425e-05	0.3004559540937673	0.0001049093362201	0.3069604850238192	0.3357379225925579	0.4410879181189563	0.0006955262794209	0.5877109476380162	0.0009620152589428	0.5962965367511112	0.0124210065850306	0.0061151144833623	2.684533347523772e-05	0.2812743012980011	3.533492768047646e-05	0.2883828125357522	0.0014315501198144	0.6309603276166922	0.0020871585804831	0.6381890445009599	ENSG00000260914	47749	VPS4A	59403	SNTB2	64786	False	True	True	alt	65	0.003326	95	0.03345
1484	chr16	69255754	C	G	rs13339524	-0.0114277151999999	0.3333758705917746	0.0114277151999999	0.3223798402445021	0.0079168789960916	0.5933020458301103	-9.448321897922204e-05	0.3754236377391736	9.448321897922204e-05	0.3647165925029068	0.4088548636396642	0.3225572062085495	-0.0046037163857848	0.2731887097877096	0.0046037163857848	0.2620842728302862	0.0032284458873485	0.3811385219789085	-3.793391175220652e-05	0.2999265937220683	3.793391175220652e-05	0.2891091730798476	-0.0061349184120166	0.3335835364600973	0.0061349184120166	0.3245734976265937	ENSG00000260914	43929	VPS4A	55583	SNTB2	68606	False	False	False	ref	100	0.02031	100	0.0912
1485	chr16	69328549	C	G	rs2242413	0.00620962288	0.5125263283311817	0.00649556328	0.5226268551926175	0.0064562049874072	0.8436385979268267	4.148729313033577e-05	0.6057926640744239	4.332622417486543e-05	0.6153514016258128	0.4631624809385989	0.2307912257226472	0.0028500810808258	0.379413101393396	0.0029854800143595	0.3893440769273268	0.002969521785532	0.4270017209150237	1.8855616625033974e-05	0.4546236230494836	1.9726390029214987e-05	0.4643920094811808	0.0024087386798618	0.6021072998087147	0.0025083247751532	0.6110875030272519	PDF	2039	ENSG00000272617	6322	NIP7	9448	False	False	False	alt	30	0.000215	-70	0.05023
1486	chr16	69362682	C	T	rs9939870	-0.0055871487498	0.597595430828316	0.0055907947702	0.5872967823900663	0.0183625885094167	0.0390092888168332	-9.497348886633652e-05	0.4379951986899953	9.50425683687786e-05	0.4284957290900956	0.322627828089503	0.4617153478039127	-0.0019771672590296	0.5474105996222971	0.0019781533589686	0.5364995293450686	0.0059045088494219	0.0868989176215156	-3.3689756445554174e-05	0.4127678216770911	3.3708439635085914e-05	0.4022934822757922	-0.0033485824541748	0.5409729610076727	0.0033485824541748	0.5315963078851752	ENSG00000260371	6376	TMED6	10896	ENSG00000259900	10952	False	False	False	ref	100	0.00594	95	0.01482
1487	chr16	69366304	T	G	rs35124791	0.0745325504	0.0086297728571622	0.0745325504	0.0091263889477724	0.0323144903915169	0.0053090065546197	0.0030081842996159	0.0044889054344899	0.0030081842996159	0.004663659224286	0.4811688917934833	0.2022247929480134	0.0370687429357007	0.009975388702281	0.0370687429357007	0.0106086965580285	0.0160041823293152	0.004794163698205	0.0015223398440038	0.0044407025198954	0.0015223398440038	0.0046635036526754	0.0268757974667786	0.0396101452098864	0.0268757974667786	0.0407179555461401	ENSG00000260371	9998	TMED6	14518	ENSG00000259900	14574	False	True	True	alt	-100	0.002632	-100	0.083
1488	chr16	69373083	A	G	rs3785074	0.0221859043999999	0.1529516651732706	0.0221859043999999	0.1612144319325848	0.00875027698222	0.4623288751418828	0.0002042077741687	0.1721859107912786	0.0002042077741687	0.180100043035328	0.3544829303208539	0.4130145434787591	0.0077160887618075	0.1591829583778337	0.0077160887618075	0.1688366014426899	0.0031123819050663	0.3998931604174208	7.108150375630735e-05	0.1705050233264985	7.108150375630735e-05	0.179691260953049	0.0149939314723181	0.1107483783865375	0.0149939314723181	0.1139806731302666	ENSG00000260371	16777	TMED6	21297	ENSG00000259900	21353	False	False	False	alt	5	6.2e-05	-30	0.009094
1489	chr16	82418914	C	A	rs11150463	-0.0302494528	0.1003819811396954	0.0302494528	0.0946229138783815	0.0130221482538915	0.1263513297417652	-0.0003938767860296	0.0642835773210183	0.0003938767860296	0.0606800167971459	0.2873058849158186	0.5170738876343274	-0.008737383050933	0.1486691298116177	0.008737383050933	0.1401352794935663	0.0037478948438106	0.2884598705190374	-0.0001139619467953	0.1058889271344116	0.0001139619467953	0.0995139023779788	-0.0251558626126826	0.0432381472040286	0.0251558626126826	0.0421305338369731	CDH13	208052	MPHOSPH6	248690	HSD17B2	383909	False	False	False	ref	-30	0.0006604	80	0.03406
1490	chr16	82619943	C	T	rs9940266	0.0025579249	0.7393043120230725	0.0025579249	0.753002364062375	0.0077980718610539	0.6321354911314486	2.059101497639557e-05	0.7554741096133774	2.059101497639557e-05	0.7691821046334176	0.1599663896928391	0.7250458456237556	0.0004214775976647	0.7420108483036261	0.0004214775976647	0.7560593414438636	0.0012746894398742	0.7485610842343177	3.4621441422951746e-06	0.7562472672666759	3.4621441422951746e-06	0.7702467353080578	0.0024792788306932	0.5858528697875308	0.0024792788306932	0.5982211155971894	CDH13	7023	MPHOSPH6	449719	HSD17B2	584938	False	False	False	alt	70	0.001106	100	0.02164
1491	chr16	82623390	C	T	rs4782721	-0.0399377158	0.0571977715399682	0.0399377158	0.0537946009460505	0.0113677394362038	0.2084086276297964	-0.0004825552059137	0.0529101556970384	0.0004825552059137	0.0499633377000327	0.355252647849044	0.4080105936678274	-0.0147625025275637	0.0821690093609864	0.0147625025275637	0.0764129538928585	0.0041221947103155	0.2339085802818012	-0.000180957775186	0.070473184326144	0.000180957775186	0.0659443264131466	-0.0261890683513313	0.0400869564435359	0.0261890683513313	0.0390978763046647	CDH13	3576	MPHOSPH6	453166	HSD17B2	588385	False	False	False	ref	-85	0.002693	100	0.07263
1492	chr16	82628858	C	T	rs7202931	-0.0397567236	0.0555089963410482	0.0397567236	0.0519583593231321	0.008767015387574	0.4516383021897011	-0.0003545737094032	0.0817864966077104	0.0003545737094032	0.0772460468438725	0.5027355055550369	0.1697608476537299	-0.0199208343720851	0.0451637815457819	0.0199208343720851	0.0415955127693855	0.0044041794389332	0.2041041726151948	-0.0001775824611445	0.0635281916834095	0.0001775824611445	0.0591680238775061	-0.0130623761657277	0.141318299005344	0.0130623761657277	0.137119064556274	CDH13	1892	MPHOSPH6	458634	HSD17B2	593853	False	False	False	ref	-15	0.000969	55	0.05597
1493	chr16	82637526	G	A	rs12930379	0.0412019931999999	0.0433500041686357	0.0412019931999999	0.0464932360397058	0.0118051914609243	0.195765378821304	0.0005371735806407	0.0443189388655863	0.0005371735806407	0.0468188072155144	0.4752455938339609	0.213333556330446	0.0194036341200831	0.0398818897329667	0.0194036341200831	0.0436057753370363	0.0055457329897484	0.1119621352703566	0.0002499875499193	0.0383484917132231	0.0002499875499193	0.0413631900517723	0.0153881264328467	0.1005801675923757	0.0153881264328467	0.1035796253670425	CDH13	10560	MPHOSPH6	467302	HSD17B2	602521	False	False	False	alt	40	0.0047	90	0.01495
1494	chr16	89327154	T	C	rs3114896	0.0441587617999999	0.0371640559399122	0.0441587617999999	0.040009209579517	0.0103190118861323	0.2755968322148077	0.0004667001690405	0.0461612476864161	0.0004667001690405	0.0492422505752675	0.3088745733876907	0.4840159232244325	0.0135486785836824	0.0768757879065575	0.0135486785836824	0.0832125600767099	0.0031899783662747	0.3911222560618081	0.0001432847669983	0.0745295330152245	0.0001432847669983	0.0800730650020834	0.0353509891181443	0.0153637779660073	0.0353509891181443	0.0157028460768502	ENSG00000288715	91138	ZNF778	109450	SLC22A31	125503	False	False	False	alt	100	0.001572	-95	0.06866
1495	chr16	89356224	T	C	rs3114881	0.037932507	0.0572557276765073	0.037932507	0.0612576865358163	0.0077865539096734	0.6366025828296562	0.0003040570219844	0.0963716607694665	0.0003040570219844	0.101785843753757	0.5060322202512475	0.16537089928322	0.0192735025280119	0.0424143710395164	0.0192735025280119	0.0462242759620352	0.0039500599648216	0.2657134905803356	0.0001548580979467	0.0690497390381749	0.0001548580979467	0.0741939436768524	0.0120851876056805	0.1586588157914116	0.0120851876056805	0.1636283892514869	ENSG00000288715	62068	ANKRD11	134337	SPG7	134496	False	False	False	alt	-40	0.001158	-90	0.03845
1496	chr16	89463115	C	T	rs369449674	-0.0194025306	0.1929815404683064	0.0194025306	0.1841502881314237	0.0127683849373532	0.1360501933439322	-0.0002464371353542	0.1363459688677402	0.0002464371353542	0.1298244903935786	0.6391041400844406	0.0247654716324844	-0.0124049636410939	0.0997222512728559	0.0124049636410939	0.0930354051376249	0.0081649119060878	0.0267510394433365	-0.0001576775506561	0.0737602569045504	0.0001576775506561	0.0688864457044594	-0.0019149576240416	0.6821181182448786	0.0019149576240416	0.6692058331477133	ANKRD11	27446	SPG7	27605	ENSG00000288715	44823	False	False	False	ref	-100	0.073	-95	0.03412
1497	chr16	89498995	A	G	rs4785573	0.0564844998	0.0163131672651419	0.0564844998	0.0174288401623978	0.0137971267225798	0.1050103369492639	0.000787433529916	0.0168471305160458	0.000787433529916	0.0179056458168547	0.469121048973537	0.2240873271244472	0.0265396379837659	0.0192621268757259	0.0265396379837659	0.0211098330300483	0.0064616771823601	0.0625969484641749	0.0003695112635532	0.0173510472130911	0.0003695112635532	0.0187621579677685	0.022319733607195	0.0502828531228028	0.022319733607195	0.0516065507143272	SPG7	8275	ANKRD11	8434	RPL13	61683	False	True	False	alt	-100	0.01025	0	0.0
1498	chr16	89526790	C	T	rs34607811	-0.0488501968	0.0304191524781054	0.0488501968	0.0284869165752964	0.0145779423688567	0.0879879656003318	-0.0007266736097399	0.0228846967735401	0.0007266736097399	0.0215801434016745	0.590475004927437	0.0542940716448906	-0.0290821670211173	0.0181436268463359	0.0290821670211173	0.0167561769506803	0.0086342176202469	0.0222811626199139	-0.0004339627650084	0.0163239500307001	0.0004339627650084	0.0152772431019191	-0.0070892851585596	0.2757063560709183	0.0070892851585596	0.2680140014796199	RPL13	33888	SPG7	36070	ANKRD11	36229	False	False	False	ref	100	0.01569	100	0.2053
1499	chr16	89649256	C	T	rs72805595	-0.0626068749999999	0.0130321176529208	0.0626068749999999	0.0122405181395886	0.0122440420309306	0.1652295103098711	-0.0007868285058717	0.0196437070306141	0.0007868285058717	0.0185542156667972	0.5664000663907303	0.0803686142254308	-0.0355023427297155	0.0098177338321993	0.0355023427297155	0.0091081936037092	0.006955403629121	0.0502344794054786	-0.0004476791464718	0.0151967134195134	0.0004476791464718	0.0142202266743686	-0.012693077729022	0.1524652743226693	0.012693077729022	0.1478842915730019	CHMP1A	8482	SPATA33	8485	CDK10	31482	False	True	False	ref	-100	0.01752	70	0.1343
1500	chr16	89650989	A	G	rs467357	0.04133162	0.0436495344701826	0.04133162	0.0468761166476448	0.0091474626243444	0.3899074788090446	0.0003832982737986	0.0609662834575862	0.0003832982737986	0.0648477610042779	0.4081287150281641	0.3197324599756576	0.0168510670427845	0.0521747100710417	0.0168510670427845	0.0568117102857458	0.003736851412372	0.2852923806586789	0.000156346524182	0.0634718995558743	0.000156346524182	0.0683060424695693	0.0230023133020051	0.0544050186856946	0.0230023133020051	0.0559445658876012	CHMP1A	6749	SPATA33	6752	CDK10	29749	False	False	False	alt	100	0.01257	-95	0.03638
1501	chr16	89738447	C	T	rs1230	-0.0284760236	0.1112050066463346	0.0284760236	0.1049509495691029	0.0106047480818121	0.2551491004385077	-0.0003109790747028	0.097520123812883	0.0003109790747028	0.0924345243857469	0.5959252689343251	0.0515373826583715	-0.0170166535292349	0.061008709138961	0.0170166535292349	0.0565269940272067	0.0063273540357544	0.0677599600546114	-0.0001861520770986	0.0601065018494015	0.0001861520770986	0.0561207530638826	-0.003875558875092	0.469130470760196	0.003875558875092	0.4581358499620421	VPS9D1	17549	ZNF276	18046	SPATA2L	36742	False	False	False	ref	25	0.0005608	-90	0.0473
1502	chr16	89746354	C	A	rs12102297	-0.0293651918	0.1092740562215942	0.0293651918	0.1032698280350368	0.0110126490331723	0.2472959698792448	-0.0003558771191473	0.093795975896255	0.0003558771191473	0.0892070315544468	0.5445637402877623	0.1085023019706074	-0.0161268539380363	0.0688561977523675	0.0161268539380363	0.0637409936811095	0.0060315526272757	0.0860263579386596	-0.000196809357054	0.0643902291088738	0.000196809357054	0.0601483900145736	-0.0064751709042624	0.3141698919147457	0.0064751709042624	0.3053838143599961	VPS9D1	25456	ZNF276	25953	SPATA2L	44649	False	False	False	ref	95	0.00426	-90	0.1041
1503	chr16	89763487	C	T	rs12447465	0.0075095076	0.4263304758142766	0.0075095076	0.4384361079028159	0.0292338550410685	0.004561169667484	0.000221582626453	0.1417755658330888	0.000221582626453	0.148843252686092	0.0711272938515959	0.8536815434065388	0.0004878671170027	0.7061952746027409	0.0004878671170027	0.720667510024198	0.0020464308051702	0.473836761721881	1.410863379078288e-05	0.4822405041062842	1.410863379078288e-05	0.4959264879399583	0.0044336559507878	0.4105231307375364	0.0044336559507878	0.4206715984953196	VPS9D1	42589	ZNF276	43086	FANCA	53490	False	True	True	alt	-100	0.0594	100	0.052
1504	chr16	89769113	A	G	rs4785595	0.0012352889554	0.7293450446628972	0.0029784610114	0.7320260972104534	0.0071045430827555	0.7607555801918038	1.0376650118674302e-05	0.7681806098185247	2.119819688489622e-05	0.7706331645667744	0.4657579435471322	0.2258459843180575	0.0005783062156291	0.5567699884234832	0.001399645764965	0.5589835894186235	0.0033102245986849	0.3616909044059311	4.853784137317498e-06	0.5991538432349743	9.964939309389984e-06	0.601380653813267	0.0004253156153071	0.7943413730411174	0.0010726252347015	0.7965423778327942	FANCA	47864	VPS9D1	48215	ZNF276	48712	False	False	False	alt	60	0.0003319	100	0.0917
1505	chr16	89770373	G	A	rs886952	0.005437649726	0.5219366066520602	0.005649468034	0.5327122077935169	0.010002005533236	0.3084502709841355	5.3616628127896704e-05	0.4876858543463126	5.562750728456315e-05	0.4975907785882383	0.5362254795174224	0.1192535920791528	0.0029375912254714	0.3510504392728209	0.0030462217449474	0.3622481423855231	0.0053973386938108	0.1128170493516483	2.9174052394184144e-05	0.326609113537934	3.0205327031340925e-05	0.336722623429746	0.0012676480046473	0.7427985473455664	0.0013298893142044	0.7529975924759653	FANCA	46604	SPIRE2	47807	VPS9D1	49475	False	False	False	alt	100	0.004852	80	0.05502
1506	chr16	89773589	G	A	rs4785721	-0.01406866746	0.2855893685334662	0.01406866746	0.2749534127361138	0.0142034123287394	0.0980668450085026	-0.0001960835201732	0.1886508965842837	0.0001960835201732	0.18073094463044	0.3973692673160509	0.3418193835350363	-0.0056434245373879	0.2375935468926476	0.0056434245373879	0.2267881788971547	0.0056248938574067	0.0977436363062575	-7.837532400203594e-05	0.1642055326389674	7.837532400203594e-05	0.1557280324168151	-0.0077739395636883	0.2708761662528534	0.0077739395636883	0.2630740560531781	FANCA	43388	SPIRE2	44591	VPS9D1	52691	False	False	False	ref	90	0.01965	15	0.01437
1507	chr16	89775966	T	G	rs1558184	-0.001419589264	0.7936252228049745	0.002115011944	0.7843107632787024	0.0193391422969479	0.0317599346453131	-3.012741030466977e-05	0.5960902684833448	4.0958349767376096e-05	0.5868911649069044	0.4429133082293385	0.2627467258366758	-0.0006590956865435	0.6241199538434092	0.0009382920262684	0.614138729463783	0.0086476100448834	0.0234254256964353	-1.3954649396678856e-05	0.4564616621245054	1.8303024577807912e-05	0.4470009505556159	-0.0006037407027043	0.8191493104547748	0.0009564414568615	0.8102425271132971	FANCA	41011	SPIRE2	42214	VPS9D1	55068	False	False	False	ref	85	0.05743	-100	0.073
1508	chr16	89783907	G	A	rs17232672	0.0283162858	0.0787749436556029	0.0336306614	0.0808480725238632	0.0281645924102536	0.008619355440972	0.0011702904980294	0.0250486323458712	0.0012519684776992	0.02557703010805	0.5310677496654529	0.1256520818203802	0.0154624108618024	0.0548895772526704	0.0183157749534043	0.0570716637250648	0.0151197423151848	0.0046497281617679	0.000641403217896	0.019227021119225	0.0006852572918153	0.0196900762724158	0.0070726874760111	0.2788956474531399	0.0083880538179856	0.2834086075258955	FANCA	33070	SPIRE2	34273	VPS9D1	63009	False	True	True	alt	90	0.001724	-100	0.129
1509	chr16	89791140	A	G	rs8045232	0.0529342966	0.0204733974953383	0.0529342966	0.0219970319180072	0.0124178853248221	0.154148071529511	0.0006940889819034	0.0245843518851104	0.0006940889819034	0.0262064601341624	0.4837954750567951	0.2012036064405918	0.0258020530636162	0.0209526952948069	0.0258020530636162	0.0228908299719482	0.0060591036638477	0.0831945046670712	0.0003410106513207	0.0228389610692786	0.0003410106513207	0.0246571492132917	0.0196475067168746	0.0694910383672409	0.0196475067168746	0.0715610786937167	FANCA	25837	SPIRE2	27040	VPS9D1	70242	False	False	False	alt	-15	0.003723	20	0.02798
1510	chr16	89801389	A	G	rs9938865	0.0041886111	0.5984647548736605	0.00426112354	0.6093696667005111	0.0076167639669146	0.6648125313630362	3.134271595061835e-05	0.6410101906727423	3.191737863391837e-05	0.6514738564242872	0.4128279338997292	0.307492185798502	0.0017022336966506	0.4741414762873204	0.0017335339700965	0.4859927984194379	0.0031159784818584	0.3996267692358948	1.2564435290936978e-05	0.5074905468187553	1.281249065369797e-05	0.5188146749984918	0.0021058309733503	0.628700382642693	0.002155624020996	0.6386667660741914	FANCA	15588	SPIRE2	16791	TCF25	72182	False	False	False	alt	10	0.00058	-90	0.0277
1511	chr16	89806819	T	C	rs9940552	0.01122139944	0.3163035900431594	0.01122139944	0.3279480384066589	0.0087158682599404	0.4688927908023939	9.4834557126898e-05	0.3342705186789654	9.4834557126898e-05	0.3453631864438802	0.4845112501167025	0.1988942028940848	0.0054566527169848	0.227606682182583	0.0054566527169848	0.2388624300292011	0.0042178266962559	0.2283056136970238	4.6099986793488014e-05	0.2417830255813138	4.6099986793488014e-05	0.2526264961137324	0.0037863463313934	0.4510769038405692	0.0037863463313934	0.4617861430135764	FANCA	10158	SPIRE2	11361	TCF25	66752	False	False	False	alt	60	0.01544	65	0.1173
1512	chr16	89806969	G	A	rs9927381	-0.0208755802	0.1762543473947872	0.0208755802	0.1678193077470914	0.0167031794994393	0.0555175758530726	-0.0003518901492619	0.0803449269328594	0.0003518901492619	0.0759454120862206	0.4994325667278706	0.1751119856522376	-0.0104161077416262	0.1230658950584232	0.0104161077416262	0.1152769327141109	0.0083467364142424	0.0257895087851853	-0.0001757440589035	0.0634330986531557	0.0001757440589035	0.0591568054816912	-0.0067490326663138	0.2963913975679947	0.0067490326663138	0.2880667259986526	FANCA	10008	SPIRE2	11211	TCF25	66602	False	False	False	ref	100	0.0162	-85	0.10156
1513	chr17	1342148	T	G	rs75329315	-0.00587542532	0.5317657214854088	0.00587542532	0.5207197087819971	0.0100284884957499	0.3095337750672637	-6.11349954994622e-05	0.5143645890635211	6.11349954994622e-05	0.5039201364375361	0.5440305397358894	0.1089975127578514	-0.0032210086372585	0.3984507409714429	0.0032210086372585	0.3853138940578254	0.0054763306149011	0.1115385308126015	-3.3698903719532166e-05	0.3805290130844079	3.3698903719532166e-05	0.3683030944763149	-0.001230303218913	0.7766633784947801	0.001230303218913	0.767308734318864	YWHAE	58074	TRARG1	62485	BHLHA9	71703	False	False	False	ref	-100	0.01541	-95	0.02576
1514	chr17	2008591	G	A	rs7225625	0.00026625724	0.8135053671095699	0.00194382404	0.8173230877415671	0.0218231959750047	0.0180693981100753	8.618281701075286e-06	0.6092336692490579	4.308803748632814e-05	0.6124987483847332	0.5170738285666865	0.1464940214581654	0.0001269347698622	0.6195686807438802	0.0009962785400877	0.6230250233233839	0.0113017874983965	0.0083618578702504	4.162486165613405e-06	0.4312504575492276	2.2116743594676423e-05	0.4342647559850394	0.0001348561707071	0.8797607738295476	0.0005871430201557	0.8833904640092404	RTN4RL1	16743	DPH1	21547	OVCA2	33432	False	True	False	alt	-60	0.00833	-35	0.07996
1515	chr17	2008698	T	C	rs9906314	0.0649340556	0.0095453749025306	0.0649340556	0.0101518217140208	0.0138929126347287	0.1015340147609474	0.0009068813962212	0.0128821080150869	0.0009068813962212	0.0135663424946886	0.5229805288436602	0.1382454382358346	0.0340570008900404	0.0091798478567041	0.0340570008900404	0.0100205344475793	0.0072517091311734	0.0420374024236838	0.0004746097035319	0.0113875165497289	0.0004746097035319	0.0121897267354591	0.0188881627402772	0.0739399432726746	0.0188881627402772	0.0761369837334041	RTN4RL1	16636	DPH1	21440	OVCA2	33325	False	True	False	alt	100	0.004776	-80	0.02263
1516	chr17	2008993	C	T	rs59539549	-0.0031493879	0.644583919890875	0.0042863977799999	0.6373666673017783	0.0074726392082122	0.6734749732868561	-2.6525480389457534e-05	0.6650430418440765	3.4929493014608024e-05	0.6582439176172237	0.4358634425668315	0.274669766002767	-0.0015167828141255	0.4953457170560608	0.0019763174666132	0.4873173387046969	0.0032673409722724	0.359803500297889	-1.278739374574908e-05	0.5165940562070912	1.6183655139237576e-05	0.508991456285686	-0.0013049927903816	0.6747448651176291	0.0019398541478645	0.6689562057319162	RTN4RL1	16341	DPH1	21145	OVCA2	33030	False	False	False	ref	35	0.002625	65	0.04395
1517	chr17	2011265	G	A	rs73292184	-0.00238318152	0.7954614018474355	0.00238318152	0.7815168672164899	0.0176994109296323	0.0433839980463732	-4.301193950089083e-05	0.6086441934121537	4.301193950089083e-05	0.5956472524813193	0.5327088455274432	0.125634749452542	-0.0012705168400478	0.5724318019977489	0.0012705168400478	0.5584695423828298	0.0093942153385631	0.0163771890073369	-2.2854122558066684e-05	0.4171350650515907	2.2854122558066684e-05	0.4049332020451858	-0.00053734997251	0.9032718324904526	0.00053734997251	0.8892697165523544	RTN4RL1	14069	DPH1	18873	OVCA2	30758	False	False	False	ref	-100	0.005783	100	0.081
1518	chr17	2011464	C	T	rs12449566	0.00560717374	0.5248412816063246	0.00608462306	0.5336375522721493	0.0065298480811553	0.8529807065387601	3.732907749389343e-05	0.6061886070623218	4.006013085929625e-05	0.6144341729554715	0.5776263239245221	0.0694479519325309	0.0032330060475086	0.331425815983518	0.0035091222099927	0.3398466465519866	0.0037780131478225	0.2867773951277348	2.155430369566529e-05	0.3988116579657147	2.3133713171571074e-05	0.4069993434807274	0.0009377690639944	0.8019700969294964	0.000983412691003	0.8099353934965339	RTN4RL1	13870	DPH1	18674	OVCA2	30559	False	False	False	alt	-90	0.01996	10	0.01404
1519	chr17	2011483	A	G	rs12450430	-0.00283276016	0.3569294013384903	0.00999736584	0.3533900200527863	0.0070043440768384	0.7541710843176677	-1.3920568796732286e-05	0.4434459438697667	6.956176640193002e-05	0.4404940747918059	0.5811574808867311	0.0658780402458532	-0.001733798037361	0.2218663336647381	0.0057917524518398	0.2187347030416538	0.0040735530977157	0.2485981433558016	-8.803696337548797e-06	0.2780725698315343	4.030885826081716e-05	0.2749550701471581	-0.0003900455398915	0.7044182208327038	0.0016722165167687	0.7011538452229734	RTN4RL1	13851	DPH1	18655	OVCA2	30540	False	False	False	ref	-100	0.01738	35	0.02689
1520	chr17	2011813	C	T	rs11078769	0.02102554272	0.1633972754766527	0.02102554272	0.1717033606253525	0.0093428662723872	0.3849450445357869	0.0001944760400382	0.170848067737759	0.0001944760400382	0.1786239248045653	0.615018827996141	0.0370391135251546	0.0130092149661058	0.0843243659221437	0.0130092149661058	0.0906174799803968	0.0057478644627329	0.0946153024183628	0.0001205120598002	0.0964826585657573	0.0001205120598002	0.1026524903059255	0.0023713938941274	0.592832167476305	0.0023713938941274	0.605205845845039	RTN4RL1	13521	DPH1	18325	OVCA2	30210	False	False	False	alt	30	0.0009155	60	0.0842
1521	chr17	2014316	A	G	rs4239070	0.0457911023999999	0.0327187019626281	0.0457911023999999	0.035214515397969	0.0102583992498116	0.2817893554616025	0.0004815349492925	0.0439725451184151	0.0004815349492925	0.0469248133695294	0.3053247440326144	0.473766894913906	0.013860582417803	0.0732454114778844	0.013860582417803	0.0791837916417756	0.0032159507378396	0.3462209328144943	0.0001498950990792	0.0727040720778079	0.0001498950990792	0.077977171889642	0.036587516468013	0.0146795441455286	0.036587516468013	0.0150756122824875	RTN4RL1	11018	DPH1	15822	OVCA2	27707	False	False	False	alt	-90	0.00338	-100	0.06223
1522	chr17	2016777	G	A	rs4467122	0.0026852115	0.3002273233128394	0.0134069569	0.3009409243140442	0.0134463222909879	0.129039819402827	-1.3981816145489844e-05	0.2190408406665462	0.0001760710925873	0.2191985918791644	0.5469600307057128	0.1053373131542183	0.0014151020325092	0.1919164987213264	0.0074792483266778	0.1933293927050768	0.0073685005832302	0.0434805896068441	-8.953705622417261e-06	0.1478522351906169	9.851130843499e-05	0.1485465796176131	0.0008029128932872	0.5676798753525047	0.002790485378479	0.569588300475126	RTN4RL1	8557	DPH1	13361	OVCA2	25246	False	False	False	alt	-80	0.006416	-90	0.1564
1523	chr17	2023847	C	T	rs4530175	-0.00433254422	0.4205386683935324	0.0086131221799999	0.4180687557089739	0.0133078513015439	0.1261346513561886	-6.67016676447947e-05	0.3165001212532521	0.0001162828970805	0.3140761181485471	0.7686573512173362	0.00748622129522	-0.0032425695073218	0.2052904644081972	0.0065721358778733	0.2033730963586812	0.0102106912537582	0.0123176396171099	-5.014620659201999e-05	0.1465740664994813	8.862601624596146e-05	0.1451124743286623	-0.0007240739011815	0.720222389702944	0.0015539580286101	0.7190582288769509	RTN4RL1	1487	DPH1	6291	OVCA2	18176	False	False	False	ref	100	0.01958	45	0.05093
1524	chr17	2028408	T	G	rs7207749	0.070742869	0.0081723515984389	0.070742869	0.0086614343145833	0.022066205944509	0.0171895489228929	0.0015794299395174	0.0057297320789506	0.0015794299395174	0.0060059241645291	0.5673668813991847	0.0807353465338689	0.0400071520179051	0.0061989081160753	0.0400071520179051	0.0067164998338024	0.0125487937480977	0.0062298698640113	0.0008958781858026	0.0045521069845537	0.0008958781858026	0.0048319150734104	0.0152014025041752	0.1163205144469861	0.0152014025041752	0.1198143213390969	DPH1	1730	RTN4RL1	3074	OVCA2	13615	False	True	True	alt	-20	3.8e-06	65	0.05432
1525	chr17	2028568	A	G	rs7222716	0.0289602848	0.0960096451677675	0.0289602848	0.1021979742864833	0.0106092270548731	0.2508538344453709	0.0003062383418514	0.0857539359823582	0.0003062383418514	0.0907849033501677	0.5542858328405897	0.0955526511985168	0.0161106742460089	0.0562945412836711	0.0161106742460089	0.0612323430670987	0.0058773519840407	0.0842161199686963	0.0001702712098589	0.0556728903982412	0.0001702712098589	0.059975471378392	0.0062386539279452	0.3018296440590842	0.0062386539279452	0.3107799808707356	DPH1	1570	RTN4RL1	3234	OVCA2	13455	False	False	False	alt	35	0.000902	-95	0.1007
1526	chr17	2028599	A	G	rs7222728	0.052808842	0.0205046875363122	0.052808842	0.0220193814090016	0.0104753123974516	0.2672283839201181	0.0005602740966505	0.03089869852427	0.0005602740966505	0.0329712585253979	0.557850185167896	0.0913523961756176	0.029391253837219	0.0145176975692887	0.029391253837219	0.0158847061760935	0.0058204401745447	0.0902397400907235	0.0003106200822596	0.0230703396707618	0.0003106200822596	0.0249032255743746	0.0116432743078247	0.1630085116305124	0.0116432743078247	0.1683585122568247	DPH1	1539	RTN4RL1	3265	OVCA2	13424	False	False	False	alt	-90	0.0008106	-60	0.05118
1527	chr17	2061791	C	T	rs7214308	-0.01910911308	0.1894401942434143	0.02032079932	0.1817177977628398	0.0166422726908125	0.0555537606443906	-0.0003397811537865	0.0819145313605829	0.000355236607699	0.0781207299507347	0.6031971286009191	0.0459082645078268	-0.0116458229116346	0.1053037068664246	0.0123495635058989	0.0993888912370495	0.010060866621767	0.012989826609576	-0.0002070051487986	0.0522692337622555	0.0002159815899821	0.049562285698602	-0.0021971182273675	0.6089073661893462	0.0024128881004989	0.5997793406096883	HIC1	7636	OVCA2	19768	DPH1	31653	False	False	False	ref	-100	0.01704	-85	0.1443
1528	chr17	2061802	C	T	rs12939002	0.00671138296	0.4792249237691465	0.00671138296	0.4919303308120691	0.0073740519251171	0.6744451600269254	5.116499707456024e-05	0.5437090330526505	5.116499707456024e-05	0.5562587588401791	0.6029045944460005	0.0461752252269992	0.0040544966171413	0.2836504922282034	0.0040544966171413	0.2955229374606914	0.0044435142081736	0.1999207450049577	3.090489186984326e-05	0.3307608455028271	3.090489186984326e-05	0.3423466640943594	0.0008589300718886	0.8188724922540236	0.0008589300718886	0.8326123783528524	HIC1	7647	OVCA2	19779	DPH1	31664	False	False	False	alt	-100	0.01709	-95	0.1345
1529	chr17	2099914	G	A	rs6503245	0.00828763406	0.4263397923490369	0.00828763406	0.4386092863238323	0.0090037954162582	0.4352592030689249	8.101391011094061e-05	0.4269005176607819	8.101391011094061e-05	0.4384060603620637	0.3505036359298333	0.4189123111766633	0.0030298729269836	0.3625609990839732	0.0030298729269836	0.3751094804159754	0.0031832982499193	0.3887593327099928	2.985945135574629e-05	0.3602522285386403	2.985945135574629e-05	0.3720390130336155	0.0049502588201121	0.3826013797271114	0.0049502588201121	0.3928696381100398	HIC1	45759	OVCA2	57891	DPH1	69776	False	False	False	alt	70	0.01468	-100	0.157
1530	chr17	2107303	T	C	rs8082647	0.0252805336	0.1243207348854222	0.0252805336	0.1317078763953392	0.0080823841032709	0.5733613732266736	0.0002061716071341	0.1558351601224962	0.0002061716071341	0.1633054768268862	0.4245790931441197	0.2983115226240671	0.01074117925014	0.103892644671427	0.01074117925014	0.1115952631436169	0.0034318975062802	0.3476229058693368	8.760684173363322e-05	0.1273932503911853	8.760684173363322e-05	0.1352154945571492	0.0126806294671106	0.1377744043544251	0.0126806294671106	0.1422214041318652	HIC1	53148	OVCA2	65280	DPH1	77165	False	False	False	alt	75	0.004227	45	0.004135
1531	chr17	2115743	A	G	rs2760742	-0.0114167302	0.3483734925143273	0.0114167302	0.3370753917983053	0.0076370959046769	0.6601482725962762	-8.888753495360391e-05	0.4006362561639563	8.888753495360391e-05	0.3895693275757453	0.0841564746522266	0.8474005423228834	-0.0008638476550678	0.641130658230957	0.0008638476550678	0.627266625087973	0.0006400029053911	0.8652034362779008	-6.6531953652832784e-06	0.6662081075143915	6.6531953652832784e-06	0.6524905425022145	-0.0083029906949241	0.2448791526642873	0.0083029906949241	0.237469424301417	HIC1	61588	OVCA2	73720	DPH1	85605	False	False	False	ref	-95	0.002075	-25	0.02158
1532	chr17	2124812	A	G	rs2760751	0.0515550137999999	0.0234005755738718	0.0515550137999999	0.0250820596116687	0.0110777002543061	0.2247114927207934	0.0006015502039481	0.0304782687458339	0.0006015502039481	0.0323619760122434	0.5152335605141133	0.1497454209446405	0.0269165676158516	0.0196962302083654	0.0269165676158516	0.0214469950358417	0.0057462959418091	0.0958584696991851	0.0003158514992371	0.0254844671620293	0.0003158514992371	0.027419185304726	0.0150727704644238	0.1136945756966287	0.0150727704644238	0.1172289687435506	HIC1	70657	OVCA2	82789	DPH1	94674	False	False	False	alt	80	0.00461	-20	0.010254
1533	chr17	2126940	G	A	rs8067895	-0.0550418924	0.022073689737932	0.0550418924	0.0207615390443184	0.0220996118448823	0.0187496906380638	-0.0013128694709872	0.0106168559315901	0.0013128694709872	0.0101642972812314	0.2355480865984086	0.5966525106095181	-0.0140262612069567	0.091745452615233	0.0140262612069567	0.0856634570666082	0.0054167579309811	0.1182988922718819	-0.0003415260381482	0.0313974165961375	0.0003415260381482	0.0295252964789691	-0.0504092366103382	0.0047421381064313	0.0504092366103382	0.0045870788284595	HIC1	72785	OVCA2	84917	DPH1	96802	False	True	False	ref	100	0.06052	90	0.02682
1534	chr17	2133359	A	G	rs2760736	0.00506812442	0.5413445268018361	0.00506812442	0.5545408357537253	0.0070088480657882	0.760439293054375	3.400413120630155e-05	0.6208180196730727	3.400413120630155e-05	0.6338220014003523	0.2344775360740256	0.6012280699534462	0.0012213105712779	0.5351790387596588	0.0012213105712779	0.5492558952747403	0.001619094303838	0.6783428650848768	8.061686711117549e-06	0.5910224134671338	8.061686711117549e-06	0.6046489971415099	0.0046390522723264	0.3953133754793972	0.0046390522723264	0.4053148969323669	HIC1	79204	OVCA2	91336	DPH1	103221	False	False	False	alt	-90	0.01747	-65	0.0483
1535	chr17	2149410	C	T	rs6503302	0.00311151968	0.6987601481958423	0.00311151968	0.7122060247820307	0.0131025199223797	0.1271434627154909	3.9373245366335e-05	0.5830328697941476	3.9373245366335e-05	0.5957788782178831	0.3245303374516333	0.4551015956667633	0.0010109602248199	0.5792583080378714	0.0010109602248199	0.5932407089034207	0.0042733704949128	0.2062677122273011	1.2858465504456875e-05	0.4936787454577409	1.2858465504456875e-05	0.5068652391186597	0.0021639228622703	0.6247718124675518	0.0021639228622703	0.6373269662022303	HIC1	95255	OVCA2	107387	DPH1	119272	False	False	False	alt	-100	0.009094	75	0.02008
1536	chr17	2178125	G	A	rs9910413	-0.0099892363799999	0.3776306032222438	0.01055450722	0.3679074109771086	0.0083454239147636	0.5327653251644505	-9.229737415645788e-05	0.3929387164770301	9.586463724100404e-05	0.3840678508641163	0.3031400740671583	0.4932455668517245	-0.0029501020990248	0.374204297300594	0.0031355996453148	0.3642263716119608	0.0025092643320004	0.5112666656370373	-2.717266204197869e-05	0.3823994669781323	2.834328414818864e-05	0.3729684509544276	-0.0081494621313498	0.2653244214237863	0.0086017489807985	0.2599045812702248	HIC1	123970	SRR	125259	SMG6	125660	False	False	False	ref	-95	0.0003603	-5	0.009094
1537	chr17	2182304	G	A	rs7214741	-0.0381748428	0.0600233920203705	0.0381748428	0.0561982784432605	0.0081597526576388	0.5509896223930733	-0.0003183797632834	0.0946081009371806	0.0003183797632834	0.0895655293415207	0.4505337192294526	0.255718249145567	-0.0171794770750824	0.0594078212291774	0.0171794770750824	0.0548623172692772	0.0036707161084161	0.3015048237263003	-0.0001430158048933	0.083007395928801	0.0001430158048933	0.0776414292615039	-0.0164400045643626	0.0959236851676857	0.0164400045643626	0.0931499876967207	SRR	121080	SMG6	121481	HIC1	128149	False	False	False	ref	-50	0.003223	-95	0.008804
1538	chr17	2182359	T	C	rs7223390	0.0332520432	0.0739017413371643	0.0332520432	0.0789943364705227	0.0085855480595162	0.4892846108812292	0.0002922436206165	0.098882591916109	0.0002922436206165	0.1044741871960827	0.4487577671967551	0.2582329245226866	0.0149849773662146	0.0649852518506439	0.0149849773662146	0.0705658055127681	0.0038614605526581	0.2766451835003689	0.0001320183929268	0.0834315695222277	0.0001320183929268	0.0893612499041618	0.0140603118289608	0.1181265497662802	0.0140603118289608	0.1217737814571897	SRR	121025	SMG6	121426	HIC1	128204	False	False	False	alt	-100	0.007637	-50	0.02551
1539	chr17	2185741	A	G	rs57130712	0.117098454	0.0010647612587558	0.117098454	0.0011297141608785	0.0376599386267723	0.001857308644674	0.0044086764182841	0.0010077553515945	0.0044086764182841	0.0010704563518678	0.3832342659156215	0.3626137827380392	0.0448032505758554	0.0040384436463603	0.0448032505758554	0.0043648633609867	0.0145318191248972	0.0041613273835508	0.0016997530157854	0.0016049414938949	0.0016997530157854	0.0016831121449114	0.0801211630826045	0.000663842187584	0.0801211630826045	0.0006756217251623	SRR	117643	SMG6	118044	HIC1	131586	False	True	True	alt	-60	0.005493	-65	0.0825
1540	chr17	2186554	G	A	rs2270478	-0.00056193662	0.6257134248527954	0.0041001684999999	0.6210634076210154	0.0066774635163416	0.8466524491485976	-1.2976255974279637e-06	0.6911478214117296	2.8371837942068505e-05	0.6867740979990351	0.2941088600504154	0.4877388744969778	-0.0005294177028207	0.5672219373214128	0.0012025163388172	0.5606510924344632	0.0019214368547793	0.6087699431327349	-2.9514518502937096e-06	0.6189666452635485	8.071989101603508e-06	0.6128391443429582	0.0003381777819272	0.5277043985504277	0.0033174617993962	0.5251570043714537	SRR	116830	SMG6	117231	HIC1	132399	False	False	False	ref	100	0.001153	90	0.04477
1541	chr17	2187213	T	G	rs11867782	0.0086408355	0.3845685328821212	0.0086408355	0.3965767136460096	0.0069812473211824	0.7797346679587895	6.040238548841788e-05	0.460308929614653	6.040238548841788e-05	0.4720451424648267	0.3757113663004803	0.3768719140275125	0.0032282693284452	0.3216749142514601	0.0032282693284452	0.3338214276774397	0.0026267653672201	0.4883891751752314	2.259362421729767e-05	0.3732337227270261	2.259362421729767e-05	0.3853301551118449	0.0051722528241993	0.3582458996287077	0.0051722528241993	0.3678836639409578	SRR	116171	SMG6	116572	HIC1	133058	False	False	False	alt	65	0.003822	65	0.03937
1542	chr17	2192418	C	A	rs2126202	-0.00270098482	0.7132636019628071	0.00316845062	0.7038157774791843	0.0069365424698154	0.7136179133393272	-1.6633087334571183e-05	0.7667303916171527	2.0987829332168807e-05	0.75779012867114	0.5674125250261932	0.0799214913940481	-0.0015499418605917	0.4861947339705851	0.001811895159056	0.4765255998964882	0.0039345189715574	0.25277950924552	-9.562232893232834e-06	0.5407175208099565	1.200249480433384e-05	0.5317646059302438	-0.00047925808359	0.8875321323621047	0.0005829935995186	0.8787071498967299	SRR	110966	SMG6	111367	HIC1	138263	False	False	False	ref	95	0.012955	95	0.1312
1543	chr17	2229030	T	C	rs143499	0.0016859070599999	0.6728330993482742	0.00354272642	0.6815369229709194	0.008499053583251	0.5083648515494654	1.1245052507723357e-05	0.6721322558603344	3.0262463039701697e-05	0.6806254649322984	0.195605763545265	0.6658399336202685	0.0003722802204773	0.6584428522556902	0.0006926234053271	0.6680950876159052	0.0016425532813711	0.6759713928474748	2.55939055294663e-06	0.6637299415766008	5.840322456361932e-06	0.6732468107298969	0.0014813431674602	0.4898324229381522	0.0034481685494662	0.4970768070765601	SRR	74354	SMG6	74755	TSR1	107627	False	False	False	alt	-90	0.001492	25	0.01391
1544	chr17	2232686	A	T	rs7212249	-0.01027217688	0.3207310494906604	0.0135030431199999	0.3161318171593608	0.0062624664253094	0.8410233584460106	-7.732950136064325e-05	0.4234598263282113	9.580970777361836e-05	0.4193086671785379	0.4919532360294193	0.1845591347558029	-0.0052601195718164	0.2188165770047613	0.0068275253392869	0.2148682075441213	0.0031080427763892	0.3956715313433772	-4.0113550093187046e-05	0.2949167008090445	4.905902205569133e-05	0.2910952045510459	-0.0028029336403904	0.4688593895556363	0.0040519092521706	0.4656316814712248	SRR	70698	SMG6	71099	TSR1	103971	False	False	False	ref	-95	0.00613	85	0.00824
1545	chr17	2234722	A	T	rs2169356	0.0074890408199999	0.4397838531758483	0.0074890408199999	0.4521516715713452	0.0218179275073086	0.0179568603014843	0.0001653354154686	0.2094287282387098	0.0001653354154686	0.2179157387339123	0.2661604373489351	0.5459071957092563	0.0019963060589159	0.4374356608108763	0.0019963060589159	0.4506325612725856	0.0057549544703537	0.0885235624942855	4.379378343931358e-05	0.2461475867710241	4.379378343931358e-05	0.2565712082249447	0.0061224701501052	0.3110704657622961	0.0061224701501052	0.3200870112594675	SRR	68662	SMG6	69063	TSR1	101935	False	True	False	alt	70	0.002048	-65	0.0657
1546	chr17	2242035	A	G	rs216218	0.0224156619999999	0.1463717698741331	0.0224156619999999	0.1544007567454519	0.0068566715597201	0.77180281343957	0.0001524819421361	0.2184769295624372	0.0001524819421361	0.2272971577178876	0.3529476446851108	0.412485590852376	0.0078554552984491	0.1508574777847038	0.0078554552984491	0.1601257920894102	0.0023996595261197	0.5351870413690529	5.285452015617768e-05	0.2036618401017427	5.285452015617768e-05	0.2134843217114349	0.0151287876430252	0.1052457053738527	0.0151287876430252	0.1085547928598627	SRR	61349	SMG6	61750	TSR1	94622	False	False	False	alt	-100	0.00991	75	0.03638
1547	chr17	2252991	T	C	rs216224	0.00383251372	0.642206928096691	0.00383251372	0.6555197702445963	0.0112198266057915	0.2131218663706824	4.366048687960661e-05	0.5677115549038204	4.366048687960661e-05	0.5802501611159333	0.3224556271330615	0.4635487380577487	0.00122815945851	0.5385067189084243	0.00122815945851	0.5521123787714621	0.0035847974167821	0.3198223584902777	1.3821744119471302e-05	0.4868314073482696	1.3821744119471302e-05	0.4997844822284882	0.0028713990809032	0.5474773591977928	0.0028713990809032	0.5595961405464621	SRR	50393	SMG6	50794	TSR1	83666	False	False	False	alt	50	0.03537	100	0.00806
1548	chr17	2253616	C	G	rs12950555	0.031899394	0.0843652381529258	0.031899394	0.0896906447537924	0.0090235468647652	0.4192604495345314	0.0002998838214986	0.1002542443902155	0.0002998838214986	0.1057928389780728	0.379462442556458	0.3728466338065435	0.0122476889813324	0.092195908968948	0.0122476889813324	0.0991720023639567	0.0034360865765271	0.3466752817941617	0.0001154712296261	0.102014182562966	0.0001154712296261	0.1087855244678175	0.0194026908992831	0.081051703779327	0.0194026908992831	0.0834521318052185	SRR	49768	SMG6	50169	TSR1	83041	False	False	False	alt	-100	0.003382	-100	0.05103
1549	chr17	2261017	G	A	rs9891227	0.0061335953	0.5141282282667143	0.0061335953	0.5272267186033931	0.0333281297375595	0.0026937741929932	0.0002323378657081	0.1783000373093533	0.0002323378657081	0.1859697526676575	0.2777705162916628	0.5319604899454865	0.0017377481465247	0.4946243644322578	0.0017377481465247	0.5078886514668969	0.0094004869984837	0.0180148573009409	6.62454147188375e-05	0.2200721965386925	6.62454147188375e-05	0.2302453424679794	0.0051950746377036	0.3973207586538287	0.0051950746377036	0.4072474925039555	SRR	42367	SMG6	42768	TSR1	75640	False	True	True	alt	15	0.02737	100	0.0371
1550	chr17	2265215	G	C	rs216176	-0.01088093306	0.3555097483398989	0.01088093306	0.3437060976494556	0.0074111950532253	0.6998590169372411	-8.137130385827107e-05	0.4083434880747748	8.137130385827107e-05	0.3969911009239242	0.3545887405471011	0.4108789113226291	-0.0039026293650481	0.3193977795208483	0.0039026293650481	0.306980534544643	0.0026246632996753	0.4878642168194403	-2.913359773536816e-05	0.3557084177488528	2.913359773536816e-05	0.3436207923598673	-0.0066141764956067	0.3020092548584775	0.0066141764956067	0.2941198173686464	SRR	38169	SMG6	38570	TSR1	71442	False	False	False	ref	70	0.01084	45	0.0362
1551	chr17	2267564	A	G	rs1122645	0.004769178488	0.5958698272680164	0.004769178488	0.6090743439740802	0.0072078793195244	0.7373573075862448	3.3778024193969095e-05	0.65264787178588	3.3778024193969095e-05	0.6656689709268779	0.301988609840351	0.4959149302781405	0.0014326082961654	0.530637036255853	0.0014326082961654	0.5444460820410031	0.0021769791703102	0.5724636183659924	1.0132669998485476e-05	0.5742912321231473	1.0132669998485476e-05	0.5878625105449903	0.0036743119741905	0.4901034707119661	0.0036743119741905	0.5013848706516372	SRR	35820	SMG6	36221	TSR1	69093	False	False	False	alt	95	0.08405	10	0.007263
1552	chr17	2273238	A	G	rs11869805	0.0234800282	0.1436125303120361	0.0234800282	0.1516136168981484	0.0074456428080986	0.6704601058617891	0.0001789586011064	0.1930539148042543	0.0001789586011064	0.2014549642814119	0.2521416197263456	0.5667415799377101	0.0057601798665403	0.2041328978745363	0.0057601798665403	0.214696559154308	0.0018651534591231	0.6218649044569519	4.388102695771871e-05	0.2429409403672896	4.388102695771871e-05	0.2533061364393255	0.0204462701895247	0.0671859531081376	0.0204462701895247	0.0690287261486697	SRR	30146	SMG6	30547	TSR1	63419	False	False	False	alt	-100	0.001966	30	0.01968
1553	chr17	2273670	A	G	rs6502155	0.0329668504	0.0744380055687948	0.0329668504	0.0795463485333989	0.0101593131252081	0.2852997630655263	0.0003333527121051	0.0749161797089915	0.0003333527121051	0.0795839391299717	0.2342949615659913	0.5973416084648482	0.007674559214307	0.1511264196623488	0.007674559214307	0.1603524854488713	0.0023436133761006	0.5394505329681754	7.651343281661351e-05	0.1414303776371779	7.651343281661351e-05	0.1497870349286368	0.0299007251112563	0.0257519052185746	0.0299007251112563	0.0264676867051984	SRR	29714	SMG6	30115	TSR1	62987	False	False	False	alt	15	0.00441	10	0.00894
1554	chr17	2282806	C	T	rs749240	0.0840774733999999	0.004133323881451	0.0840774733999999	0.004329402037268	0.0302103015091252	0.0058417257295417	0.0028111667753778	0.0030731673272682	0.0028111667753778	0.0032487386304357	0.3979958298322597	0.3402667773713821	0.0336668806196252	0.0098671220616313	0.0336668806196252	0.0106121904541882	0.0120818081462751	0.0090965169742611	0.0011212143833905	0.0043227553530795	0.0011212143833905	0.0045657803687494	0.0488034108237636	0.0039668268201325	0.0488034108237636	0.0041033353538335	SRR	20578	SMG6	20979	TSR1	53851	False	True	True	alt	90	0.003242	-80	0.02892
1555	chr17	2287024	C	T	rs410378	-0.00944815552	0.4074373844111841	0.01043538528	0.3990599946933461	0.0088040907549386	0.4466806630924148	-8.736274967921983e-05	0.4226240402303333	9.521777095658024e-05	0.4151888208426234	0.320302077822384	0.4601173934342928	-0.0030774518726826	0.3772711950770299	0.0034074604027518	0.3693532602208269	0.0028282320942693	0.4535374483289174	-2.854354260813448e-05	0.3851166218032744	3.1169298120553294e-05	0.3776666402378343	-0.006593429392421	0.3091383836786242	0.007373520472204	0.3043429532274375	SRR	16360	SMG6	16761	TSR1	49633	False	False	False	ref	20	0.004944	15	0.0398
1556	chr17	2294093	T	C	rs216202	0.00623232146	0.5144542513256419	0.00623232146	0.5273642172519959	0.0084790396800531	0.5177110547164788	5.388812974644686e-05	0.5284001734579574	5.388812974644686e-05	0.5409232681119384	0.2196682538200603	0.6239993997351693	0.0014203738001314	0.5317966953001978	0.0014203738001314	0.5453447179552445	0.0018733154187529	0.6267468731499717	1.2377518793499053e-05	0.5399174084575347	1.2377518793499053e-05	0.5531016286072881	0.0054544134275251	0.3436775878491693	0.0054544134275251	0.3532938027720091	SRR	9291	SMG6	9692	TSR1	42564	False	False	False	alt	-50	0.002972	-75	0.0544
1557	chr17	2295506	C	T	rs216201	-0.0645374666	0.0124838204944423	0.0645374666	0.0117652923218535	0.0129713557115729	0.1350915148764833	-0.000878237559713	0.0176695103348401	0.000878237559713	0.0166767221730701	0.3425699436716148	0.4320779961188628	-0.0221513019876102	0.037098171520961	0.0221513019876102	0.0341127994991154	0.0044353152471423	0.2017180761351292	-0.0002999956833736	0.0310114627258106	0.0002999956833736	0.028926172699467	-0.0485523708752165	0.0056950017034957	0.0485523708752165	0.0055639238877654	SRR	7878	SMG6	8279	TSR1	41151	False	True	False	ref	-90	0.01528	-65	0.06104
1558	chr17	2296455	C	A	rs394752	0.00538443571	0.4819133112550428	0.00702776529	0.489975379484606	0.0088501924965908	0.4393105296490068	4.6809514767992594e-05	0.4824731848486237	6.048096179625652e-05	0.4897487745779096	0.3634104088216682	0.3972946941627326	0.0019613303985583	0.4094625676097094	0.002561949128671	0.4178724326176125	0.0032226966613388	0.3757647645346393	1.7152583738511353e-05	0.4085072319121514	2.2147459590960192e-05	0.4162136297357784	0.0033236859303519	0.4437865911955922	0.0043568916690006	0.4494360115532005	SRR	6929	SMG6	7330	TSR1	40202	False	False	False	alt	100	0.003975	85	0.00908
1559	chr17	2298650	A	G	rs216197	0.0710925334	0.0074995767069661	0.0710925334	0.0079213486740615	0.0180873775123416	0.0396235181877643	0.001306881386793	0.0075107050700933	0.001306881386793	0.0078596741337558	0.4518926544881171	0.2511476419987531	0.0322940644444516	0.0115916185559647	0.0322940644444516	0.0125774814941402	0.0081436992126847	0.0277504492162512	0.0005913638699813	0.0085313914216648	0.0005913638699813	0.0091251657315627	0.0324401705411881	0.0195911929301791	0.0324401705411881	0.0201382870845302	SRR	4734	SMG6	5135	TSR1	38007	False	True	True	alt	-35	0.001831	100	0.0704
1560	chr17	2299649	T	C	rs216196	0.0238246081999999	0.1352854390025099	0.0238246081999999	0.1430971338957199	0.0085481866360416	0.4843754047132237	0.0002000622834123	0.1577621910999862	0.0002000622834123	0.1654027630879056	0.6213031255510949	0.0328719909268445	0.0148235261517758	0.06606436346601	0.0148235261517758	0.0716983889109558	0.0053079666677672	0.1177895806072468	0.0001243987027276	0.0844827665199808	0.0001243987027276	0.0905533709753459	0.0024647558584632	0.5833063027322328	0.0024647558584632	0.5957824451189997	SRR	3735	SMG6	4136	TSR1	37008	False	False	False	alt	55	0.002655	-70	0.00903
1561	chr17	2302629	T	C	rs2224770	0.0053742609759999	0.5447608804230738	0.005551086224	0.554103782532045	0.0094381007973534	0.3685231863354359	5.703289712729123e-05	0.5121960174876439	5.816994359015029e-05	0.5207943578970703	0.5638212014647455	0.084559596466278	0.0030527002622225	0.3660346005166026	0.0031517234273662	0.3758897753034493	0.0053389495720406	0.1207003332458054	3.2429589479687825e-05	0.3463392620026677	3.3066342104206574e-05	0.3556201170348715	0.0009585161671801	0.8006865213440482	0.0010041597941887	0.8089213173087171	SRR	755	SMG6	1156	TSR1	34028	False	False	False	alt	20	0.000862	100	0.09766
1562	chr17	2312964	T	C	rs391300	0.0451081656	0.0348411420284573	0.0451081656	0.0374208918268528	0.0108385034588892	0.2426368390288839	0.0005044217213278	0.0402257650748871	0.0005044217213278	0.0428488283489238	0.3142148777476944	0.4749253166383282	0.014150613024864	0.0723133418315025	0.014150613024864	0.0783485405247114	0.003393341918908	0.3530191366143657	0.0001580312973257	0.0663399690719248	0.0001580312973257	0.0714282098518309	0.0352742248363571	0.0146632226943109	0.0352742248363571	0.0150886453389127	SMG6	9179	SRR	9580	TSR1	23693	False	False	False	alt	65	0.00679	70	0.0381
1563	chr17	4273906	T	C	rs28756069	0.0026965977954	0.6880591049817238	0.0034422512046	0.6962629113268136	0.005662102448835	0.9706843355645802	1.5676540782695212e-05	0.7726989327224827	1.9752086099915944e-05	0.7809223495289921	0.3947655058662434	0.3394879080144238	0.0010441552163982	0.5558556735453817	0.0013376933164046	0.5636292676767685	0.0022338942084177	0.5587382384448938	6.069891947185477e-06	0.6339293955919855	7.674276813241023e-06	0.6408061446958287	0.0012842456871958	0.6933269373984584	0.0016867394889988	0.699464969332281	ANKFY1	9911	UBE2G1	92769	CYB5D2	130737	False	False	False	alt	55	0.003914	45	0.09753
1564	chr17	4281346	C	A	rs9913489	0.00463001664	0.5932406439185783	0.00463001664	0.6068866838612013	0.0221279542617203	0.0170286484059808	0.000102610125926	0.3158451413343217	0.000102610125926	0.3263279367720156	0.158939408085146	0.7246004604615512	0.0007107380523712	0.6522397341718505	0.0007107380523712	0.666392471918329	0.0035803534025574	0.3061253733156543	1.6004488172602766e-05	0.4571939696597639	1.6004488172602766e-05	0.47008811214836	0.004122449403002	0.422748162785009	0.004122449403002	0.4334728367168841	ANKFY1	17351	UBE2G1	85329	CYB5D2	138177	False	True	False	alt	-60	0.002563	100	0.0701
1565	chr17	4282032	T	C	rs11868068	0.0541228586	0.0195670542479732	0.0541228586	0.0210521437114054	0.0111610993202336	0.2135688525704623	0.000625765513656	0.0279161664442014	0.000625765513656	0.0297815022215183	0.1329744084482203	0.7687833357749215	0.0073081222661431	0.1694836021934074	0.0073081222661431	0.1792327972140698	0.0014947240409565	0.706240118295549	8.507052009272832e-05	0.1427918346844219	8.507052009272832e-05	0.1511801128033105	0.0481726988869178	0.0043992517510974	0.0481726988869178	0.0045456868637896	ANKFY1	18037	UBE2G1	84643	CYB5D2	138863	False	False	False	alt	95	0.009125	30	0.03308
1566	chr17	4302040	C	A	rs1866175	0.002574164848	0.7115348452658873	0.003181755328	0.7212685438117953	0.0204092938441713	0.024806074582232	5.867005033830036e-05	0.5065278611001787	7.174852296445269e-05	0.5159467197151207	0.2746418531312565	0.5352739886326113	0.0006608281803953	0.6609465752111281	0.0008172465323023	0.6705291877220694	0.0054826771146161	0.1067312064078589	1.4878598941154262e-05	0.4915084765788509	1.8245526556204444e-05	0.5010059113296894	0.0024813535410118	0.5839985316652005	0.0030207782238404	0.5926823208159806	ANKFY1	38045	UBE2G1	64635	SPNS3	131901	False	False	False	alt	55	0.004738	-85	0.06354
1567	chr17	4309599	A	G	rs9303185	-0.003652841432	0.6532972107580116	0.004165191032	0.6445293849463632	0.0073693627336182	0.701537926825096	-2.981972136918692e-05	0.6780191249730185	3.29469176148399e-05	0.6696252326991259	0.1196609923339453	0.789047348180045	-0.0006157003946753	0.7307082503495276	0.0006505660407139	0.721957327715153	0.0009139582620123	0.8095067011930627	-4.991891490505512e-06	0.7426438051053055	5.204698753770521e-06	0.7340856303462429	-0.003672237263872	0.5023388945795371	0.003962696708472	0.4947985881238164	ANKFY1	45604	UBE2G1	57076	SPNS3	124342	False	False	False	ref	90	0.003479	-90	0.01352
1568	chr17	4321545	C	T	rs4456561	-0.0310554683999999	0.098241997490661	0.0310554683999999	0.0925202000991367	0.0075514518215385	0.6695059884215937	-0.0002334740363823	0.1433668221582114	0.0002334740363823	0.1364874781270516	0.2016161993381673	0.652765786690612	-0.006216726164458	0.2086147281844792	0.006216726164458	0.1984895510709866	0.0015260214388595	0.688711729978976	-4.685625493199855e-05	0.2420919255925057	4.685625493199855e-05	0.2321372523002457	-0.0293343291942862	0.0278099295602732	0.0293343291942862	0.027162882592678	UBE2G1	45130	ANKFY1	57550	SPNS3	112396	False	False	False	ref	20	0.00035	-95	0.02321
1569	chr17	4322762	T	G	rs34499321	0.0118923764	0.2898313437042367	0.0118923764	0.300706081163386	0.008619539018143	0.4762204083160795	0.0001019716175748	0.3088867585783127	0.0001019716175748	0.3189235479832494	0.1430035581281963	0.7527008350219774	0.0017320678196659	0.4662081311264379	0.0017320678196659	0.4796044445401468	0.0012316147901956	0.7520147953855081	1.4854479305326716e-05	0.4689448197928315	1.4854479305326716e-05	0.4818890630296244	0.0111266714385003	0.1573559480468797	0.0111266714385003	0.1625425960608039	UBE2G1	43913	ANKFY1	58767	SPNS3	111179	False	False	False	alt	-100	0.007965	90	0.0205
1570	chr17	4323051	T	C	rs35513053	0.0725939072	0.0072427866592221	0.0725939072	0.007651186505821	0.0167755741357546	0.053520751916394	0.0012843108356563	0.0085601636917821	0.0012843108356563	0.0089778826673257	0.2697932551167543	0.5468353927324606	0.0206435436127159	0.0382470456365307	0.0206435436127159	0.041648686291256	0.0046666050055124	0.1833527445821809	0.0003753098153937	0.022390440159102	0.0003753098153937	0.0240102829711637	0.0641707901534247	0.0014021042058735	0.0641707901534247	0.001444291879605	UBE2G1	43624	ANKFY1	59056	SPNS3	110890	False	True	True	alt	60	0.02304	100	0.0382
1571	chr17	4366050	A	C	rs76655185	0.0386121154	0.0510924769433674	0.0386121154	0.0548086587888257	0.0223659308725368	0.0161877488569144	0.0008911956742726	0.0157928578583882	0.0008911956742726	0.0166453462403696	0.9759541074077532	0.0003889148589137	0.0376449973469695	0.0069540210110892	0.0376449973469695	0.0075206536220257	0.0218174253099483	0.001109544158863	0.0008684994097134	0.0050060900137202	0.0008684994097134	0.0052928689019581	0.0029813587277875	0.5306258614469116	0.0029813587277875	0.5425573405037427	UBE2G1	625	SPNS3	67891	ANKFY1	102055	False	True	False	alt	-65	0.00224	-100	0.0488
1572	chr17	4382134	A	G	rs9891529	0.0263031362	0.1134070907650717	0.0263031362	0.1203080111789216	0.0089350269382674	0.4454963216626221	0.0002373189457158	0.1280111470355757	0.0002373189457158	0.1347325082368348	0.4443656054523386	0.2647575025365533	0.0116276958159827	0.0934494903293764	0.0116276958159827	0.1006833045488123	0.0039670919056691	0.2651746879818784	0.0001047721243315	0.1048409632377381	0.0001047721243315	0.1119511271338149	0.0117864293198061	0.1555296568212867	0.0117864293198061	0.1604777364890014	UBE2G1	15459	SPNS3	51807	SPNS2	116748	False	False	False	alt	65	0.02866	-10	0.007385
1573	chr17	5313674	C	T	rs16954519	-0.0442272546	0.0423094404406128	0.0442272546	0.0395163734849988	0.0093057050690451	0.383809312162118	-0.0004202213619021	0.0613364099702608	0.0004202213619021	0.0577829073001517	0.2774074419859126	0.5339411452823262	-0.0124848419129551	0.1024567635700099	0.0124848419129551	0.0954721847187023	0.0026188044553815	0.4951727312935957	-0.0001202521366431	0.1086592444896568	0.0001202521366431	0.1020901062270207	-0.0377369059845018	0.0117952941206065	0.0377369059845018	0.01144348335779	RABEP1	31408	SCIMP	78814	RPAIN	105968	False	False	False	ref	-80	0.02399	80	0.05374
1574	chr17	12960072	C	T	rs10445248	-0.0371391166	0.0660687186130328	0.0371391166	0.0618934403853885	0.0078640548902377	0.610228289003853	-0.0002936971859248	0.1073407123444703	0.0002936971859248	0.1017743844147855	0.4476768431207792	0.2514170289428703	-0.0164533240097003	0.0651151339108925	0.0164533240097003	0.0601294989525664	0.0035065849117286	0.3375181098821618	-0.0001296006793212	0.0934601266516092	0.0001296006793212	0.0874563323348217	-0.0162740277388769	0.0980537574435498	0.0162740277388769	0.0952872975447169	ELAC2	57993	ARHGAP44	170573	MYOCD	294181	False	False	False	ref	100	0.02936	-100	0.11633
1575	chr17	12963798	C	T	rs9646399	-0.0062693601599999	0.5043030607770471	0.0062693601599999	0.4914701493928547	0.0089850494285443	0.4172609901946087	-5.843818209345688e-05	0.4994247239923217	5.843818209345688e-05	0.4873064847460361	0.3340760796273819	0.4379191966928808	-0.002011785895439	0.4610672996686304	0.002011785895439	0.4477072306390871	0.0029907692409235	0.4175731798116948	-1.869236858616104e-05	0.4514058519326319	1.869236858616104e-05	0.438787058395897	-0.004815402649405	0.4179882043675089	0.004815402649405	0.4077186650249336	ELAC2	54267	ARHGAP44	174299	MYOCD	297907	False	False	False	ref	100	0.01218	-80	0.03412
1576	chr17	13018133	T	C	rs2051975	0.0638918506	0.0111261084391405	0.0638918506	0.0118991823459688	0.011637465184366	0.1862178405067687	0.0007559756926182	0.0183960055434107	0.0007559756926182	0.0195415831339442	0.9264784904407722	0.001773911791061	0.0595043047480276	0.0015350579503107	0.0595043047480276	0.001634656722276	0.0107921962137686	0.0096837838436999	0.0007047277459531	0.0063714043636973	0.0007047277459531	0.0067722360839104	0.00902084046515	0.2003337471019873	0.00902084046515	0.2068141220478162	ELAC2	68	ARHGAP44	228634	MYOCD	352242	True	True	False	alt	-10	0.002625	25	0.06396
1577	chr17	17831426	G	A	rs1889018	-0.00277146812	0.4233623646872358	0.00829953004	0.4190277032636719	0.0095482581052708	0.3495867868935846	-2.86547773955832e-05	0.4065019162949431	8.148325796921235e-05	0.4020933987021079	0.4638056411373562	0.2240319627227417	-0.001329287778512	0.3098848664339326	0.0039157531785081	0.3054521134992839	0.0044173464877169	0.2004757814320485	-1.3560228508757952e-05	0.2975470881494808	3.830258824133696e-05	0.293129551274881	-0.0008589300718887	0.527545530604101	0.0032531457795205	0.5241163745568094	SREBF1	5576	TOM1L2	140996	DRC3	141388	False	False	False	ref	70	0.00298	25	0.03442
1578	chr17	17928159	C	A	rs56886154	0.00803535626	0.4119373808575727	0.00803535626	0.4242783820583094	0.0368437023901074	0.0016311273026755	0.0003209513062985	0.0989361436375449	0.0003209513062985	0.1040982891065797	0.2900590255085633	0.5122513776786388	0.0024181645256726	0.4021097015159653	0.0024181645256726	0.4151496645842912	0.0108677966302384	0.0102773092522488	9.90254321879464e-05	0.1361632525465129	9.90254321879464e-05	0.1439724619984497	0.0065623087376424	0.3039804486708523	0.0065623087376424	0.312743344646782	TOM1L2	44263	DRC3	44655	SREBF1	91157	False	True	True	alt	95	0.00264	100	0.1215
1579	chr17	19250104	T	C	rs4273100	-0.00429554466	0.6337242694939601	0.00497021642	0.6248294193104336	0.0304030752510726	0.0041236240540451	-0.0001665610763977	0.2891044597607028	0.0001840866167833	0.2826178888890881	0.4097054948702787	0.323074802730877	-0.0017597971621093	0.5112359165009409	0.0020266452140174	0.5025316393650402	0.012451717587768	0.006061448166933	-6.787261473959163e-05	0.2455480217917829	7.480436510860467e-05	0.2385680731290951	-0.0024772041203746	0.6269320223596198	0.0027344681998775	0.6191745155886879	EPN2	34488	GRAPL	122568	MAPK7	127618	False	True	True	ref	80	0.00812	-50	0.05637
1580	chr17	19269192	A	G	rs28760541	0.0047359877339999	0.5808683850526346	0.0047359877339999	0.5943705753268779	0.0082802350921544	0.5151739705182561	3.9090575988407706e-05	0.5956814133942069	3.9090575988407706e-05	0.608950566530363	0.2489050716293737	0.5790616448713454	0.0011144638598936	0.5767509623316233	0.0011144638598936	0.590991408638363	0.0020943212995559	0.5849542073806734	9.241788968479216e-06	0.5859824320535099	9.241788968479216e-06	0.5998703239304177	0.0043942364547349	0.4149226601490361	0.0043942364547349	0.4257761870694705	EPN2	53576	MAPK7	108530	B9D1	109001	False	False	False	alt	70	0.004833	95	0.08044
1581	chr17	19299719	A	G	rs16960499	-0.0088653839599999	0.3948391055908689	0.0088653839599999	0.383188883073985	0.0103095100019289	0.2794841273624132	-9.182933429867094e-05	0.3619931214754229	9.182933429867094e-05	0.3515249242723833	0.4595545596946026	0.2390533739322244	-0.0040419432920905	0.292423063705945	0.0040419432920905	0.2811002108750123	0.0047350725459037	0.1684438752548681	-4.1853628461341846e-05	0.267288382330532	4.1853628461341846e-05	0.2569979702953426	-0.0038050187242605	0.4757714824596433	0.0038050187242605	0.4648316534361389	MAPK7	78003	B9D1	78474	EPN2	84103	False	False	False	ref	75	0.002483	-90	0.01363
1582	chr17	19372886	G	A	rs2048230	-0.0569994228	0.0170818677919568	0.0569994228	0.0160423973941947	0.012622262188131	0.1446122933271601	-0.0007383219238476	0.0214039491128209	0.0007383219238476	0.020279919274658	0.5788918972188508	0.067948833490831	-0.0330446774905721	0.0116334637852301	0.0330446774905721	0.0107660905422117	0.0073023565547524	0.0416433436658341	-0.0004277967762004	0.0158932257715593	0.0004277967762004	0.0148770362730736	-0.0100167014180644	0.1924538211482503	0.0100167014180644	0.1865554472071343	MAPK7	4836	B9D1	5307	MFAP4	14304	False	True	False	ref	100	0.02428	100	0.1338
1583	chr17	19488817	A	G	rs2428582	-0.0207552903999999	0.1657051530604723	0.0207552903999999	0.1578928990763251	0.0093956786913065	0.3707245451311291	-0.0001978796644671	0.1714075988741422	0.0001978796644671	0.164059956003581	0.489876451000529	0.186602449265272	-0.0103192908576324	0.1243357996927276	0.0103192908576324	0.117208936473359	0.0046078088901083	0.1761677234785412	-9.847612405074304e-05	0.1297344309231718	9.847612405074304e-05	0.1227893332740298	-0.0064793203248995	0.3019390143109649	0.0064793203248995	0.2936029080126982	SLC47A1	6569	RNF112	77691	MFAP4	101627	False	False	False	ref	-45	0.002281	-100	0.07275
1584	chr17	20014143	C	A	rs9915039	-0.00328252206	0.7096009583252986	0.00369403298	0.6998594801340219	0.0117245129844488	0.186312396731357	-3.3190873960509545e-05	0.6506288694070234	3.875342419566618e-05	0.6414699010726251	0.2211267751740163	0.623666591313733	-0.0007099979846457	0.6883006960175501	0.000796249692704	0.6787203338096388	0.0026196072235634	0.4857780006501656	-7.307638598343533e-06	0.6414985204268148	8.473535832768579e-06	0.6323572006595908	-0.0027863359578418	0.5462673073875651	0.0031182896088133	0.5381682217828921	SPECC1	5277	AKAP10	35800	ULK2	146207	False	False	False	ref	75	0.00588	-70	0.02141
1585	chr17	20016845	T	C	rs28767032	0.0467615632	0.0299184996563987	0.0467615632	0.0320894175232991	0.013201084227473	0.1223642313606122	0.000634652806922	0.0260120348971254	0.000634652806922	0.0276748057016338	0.674295376508055	0.0150912601976216	0.0316024689036267	0.0115211505369381	0.0316024689036267	0.0125480894664375	0.0089151487180656	0.0200860674255835	0.0004295920011542	0.013992646789561	0.0004295920011542	0.0150027162632137	0.0047801325739893	0.37603615799429	0.0047801325739893	0.385896406490837	SPECC1	7979	AKAP10	38502	ULK2	148909	False	False	False	alt	-70	0.002808	60	0.12256
1586	chr17	20037695	G	T	rs8082671	-0.0034698390999999	0.70224114482445	0.0034698390999999	0.6887331998585385	0.0088640381953504	0.4498728075874675	-3.0100393997666296e-05	0.6963618136382492	3.0100393997666296e-05	0.6830179611561272	0.0689633709893255	0.8756309270468499	-0.0002439829776581	0.8416813338143588	0.0002439829776581	0.8274729529106556	0.000608468147954	0.8727173285032306	-2.1046282911803905e-06	0.8401475839179711	2.1046282911803905e-06	0.8258575672100421	-0.0025435948505689	0.6036357952840343	0.0025435948505689	0.5914796563225969	SPECC1	28829	AKAP10	59352	ULK2	169759	False	False	False	ref	100	0.005634	100	0.02261
1587	chr17	20038566	C	A	rs8065337	0.00651824242	0.4735498644338794	0.00651824242	0.4865989739027569	0.0220311370249598	0.0171635401819529	0.0001477211832066	0.2359822265862756	0.0001477211832066	0.2449946077866088	0.2012178549570015	0.6568610220166912	0.0013026541733634	0.5291217742162562	0.0013026541733634	0.5433234781160803	0.0044136255113246	0.2015954227537452	2.9499851539569072e-05	0.33463163544105	2.9499851539569072e-05	0.3468235606659732	0.0069896990632682	0.2985813733773316	0.0069896990632682	0.3062245328929648	SPECC1	29700	AKAP10	60223	ULK2	170630	False	True	False	alt	-45	0.0378	-100	0.0357
1588	chr17	20039537	G	A	rs28807825	0.0025575440399999	0.7207242049095942	0.0027387389999999	0.7293205684320916	0.0094520082566099	0.3592291690181785	2.473087961855287e-05	0.6895103206815743	2.6447834708160927e-05	0.6980720501860332	0.1329121671386632	0.7689873063945781	0.0003513504326357	0.7602543360676014	0.0003725677561336	0.7689670979545722	0.0012499960390723	0.7469172768369637	3.381069302728612e-06	0.7452627343780186	3.582118992574936e-06	0.7540040467598672	0.0027157958070104	0.550348616031329	0.0028527266880361	0.5586319672937098	SPECC1	30671	AKAP10	61194	ULK2	171601	False	False	False	alt	80	0.002388	15	0.008514
1589	chr17	20043976	A	C	rs9914328	-7.754877399999997e-05	0.8256831629293159	0.0019335380659999	0.8257659269134822	0.0153368301098953	0.0746777311043301	-6.608421029165256e-07	0.7035238089498299	2.9054148912286022e-05	0.7032729562210024	0.1916326932852	0.6661376773938301	1.8737938348992e-05	0.7848423951326574	0.0003555178925359	0.7846768364229354	0.0029391042418596	0.4077860661778886	3.081861592868677e-07	0.6986498293232454	5.37839633700636e-06	0.6981460589941105	5.394246828283999e-05	0.6907908439690026	0.0017718026120602	0.6909579239983473	SPECC1	35110	AKAP10	65633	ULK2	176040	False	False	False	ref	-85	0.005386	-65	0.015335
1590	chr17	20044376	G	A	rs7221669	0.0383358129999999	0.0579258073431528	0.0383358129999999	0.0611144281640414	0.0158197291196571	0.0854783423141758	0.0007975894940513	0.0421235243531776	0.0007975894940513	0.0438557259370637	0.2755298291476052	0.526046313267638	0.0121889460286229	0.1087310634293195	0.0121889460286229	0.1158062066769791	0.0047181426837951	0.1711639998502372	0.0002561680522582	0.0642446634958069	0.0002561680522582	0.0677109960282214	0.0312700339215136	0.0295134587796389	0.0312700339215136	0.0304644687731856	SPECC1	35510	AKAP10	66033	ULK2	176440	False	False	False	alt	100	0.00834	-75	0.02524
1591	chr17	20044649	T	C	rs3909257	0.0344095472	0.0677662570143564	0.0344095472	0.0723834943289712	0.0080399651037943	0.5596744324139424	0.0002833789016066	0.1003489467033326	0.0002833789016066	0.1059462770504393	0.2574093092251994	0.5598091498982941	0.0087842722517599	0.1325340335109847	0.0087842722517599	0.1409710203830418	0.0020307892412016	0.6009209999696894	7.103929201506432e-05	0.1574008615914597	7.103929201506432e-05	0.1660355919381909	0.0295542484880547	0.0236810569766217	0.0295542484880547	0.0243440864789653	SPECC1	35783	AKAP10	66306	ULK2	176713	False	False	False	alt	-75	0.00536	90	0.03314
1592	chr17	20078963	G	A	rs4925077	-0.0327783152	0.0908593898642098	0.0327783152	0.0854701233484493	0.0091922236357212	0.3958617474767178	-0.0003036789660046	0.1043131381759528	0.0003036789660046	0.0988364241771468	0.2057490222927623	0.6496548383239431	-0.0068353289893589	0.1981604975488076	0.0068353289893589	0.1882921878913668	0.0018979539805084	0.6292258308041264	-6.356669595642643e-05	0.1991356928000571	6.356669595642643e-05	0.1899316888343645	-0.0311600742746293	0.0239763247927415	0.0311600742746293	0.0234099146107082	SPECC1	70097	AKAP10	100620	ULK2	211027	False	False	False	ref	-100	0.01794	100	0.0557
1593	chr17	20111810	G	T	rs35602968	-0.0814603658	0.0046613408661713	0.0814603658	0.0044319295077802	0.0287705610340024	0.0055501146010202	-0.0023718155426389	0.0030250245531042	0.0023718155426389	0.0029129143758604	0.533466114793722	0.1235986340525689	-0.0437089143755107	0.0047670827104257	0.0437089143755107	0.004472303677884	0.0153807753378673	0.0030451516474452	-0.0012745570373893	0.0027260883891628	0.0012745570373893	0.0026057541471884	-0.021568688471872	0.0607187968593934	0.021568688471872	0.0591195799007848	SPECC1	102944	AKAP10	133467	ULK2	243874	False	True	True	ref	-100	0.02707	-90	0.11255
1594	chr17	20142345	A	G	rs7212500	-0.00031418938	0.4472400148708009	0.00800688794	0.449262338118884	0.0101056779695432	0.2980604370783052	-1.2304058530297612e-05	0.4185455823498168	7.917179590014514e-05	0.4201695532052554	0.2902810195126505	0.5104776952117224	-0.0003506794208453	0.4322428448628859	0.002318443689461	0.434225856527472	0.0029677740881456	0.421771244843481	-6.238003755860401e-06	0.403519271332757	2.332001488212892e-05	0.4049980709178293	-0.0002551893691843	0.3321695233846091	0.0060436311579995	0.3335923204102289	SPECC1	133479	AKAP10	164002	ULK2	274409	False	False	False	ref	-90	0.02917	35	0.03806
1595	chr17	20235578	C	T	rs2703777	-0.0129568430999999	0.3070642795261354	0.0129568430999999	0.2965405735863273	0.0058445227635513	0.9321708940893944	-7.598010121158199e-05	0.4415190585853205	7.598010121158199e-05	0.4302037738568721	0.3788151329370636	0.3732404012618069	-0.0048917069389608	0.268640500762297	0.0048917069389608	0.2573931613359049	0.0022264366102479	0.5663319740282403	-2.878765690654191e-05	0.3633953208252665	2.878765690654191e-05	0.351785992369409	-0.0079502899407669	0.2689976112494274	0.0079502899407669	0.261885519090746	SPECC1	226712	LGALS9B	231961	AKAP10	257235	False	False	False	ref	-85	0.01677	-75	0.0499
1596	chr17	20268211	C	T	rs2158472	0.0009419106399999	0.5727989014440231	0.00508786024	0.5783290006981044	0.0076116519713811	0.5937606181329576	-1.1388458627452185e-07	0.5872026529740363	4.234900436892548e-05	0.5920116008627374	0.4331621697320512	0.2810117840762978	0.0003568235460196	0.4265151238254238	0.0022695282555528	0.4322447804136958	0.0033285708227696	0.3339013353476857	-5.792030337270689e-07	0.4446782373845838	1.9010751846559307e-05	0.4496462780653633	0.0007468957146858	0.6381103942287877	0.0020622620566602	0.6443215508524613	LGALS9B	199328	SPECC1	259345	AKAP10	289868	False	False	False	alt	95	0.01355	100	0.0997
1597	chr17	38855676	C	A	rs72625942	0.00468311864	0.5721011417251903	0.00468311864	0.585261516776075	0.0247619214434299	0.0103404999124707	0.0001188396351363	0.2816607488706146	0.0001188396351363	0.291894793415305	0.5257627153808649	0.1349048876431755	0.0024811316868706	0.3798768377837183	0.0024811316868706	0.3927717318429693	0.0130665445327354	0.0051885202580277	6.315212277843536e-05	0.179674619258206	6.315212277843536e-05	0.188962168820487	0.0011535389371258	0.7638409932326798	0.0011535389371258	0.7775221060222867	RPL23	12968	LASP1	14184	SPMAP1	14238	False	True	False	alt	100	0.0247	30	0.03772
1598	chr17	38859453	C	T	rs117001874	-0.0013259847	0.8408578870970697	0.0017472571399999	0.8314390216813481	0.0089448321792338	0.4201301434948519	-1.100236180748522e-05	0.8262296910161968	1.5331379378769752e-05	0.8170860226568525	0.1069139721366403	0.8079563903612681	-0.0001456562117735	0.8554270649167142	0.0001958423426249	0.8458791872955091	0.0009559274074638	0.7992245094830016	-1.1869791011584355e-06	0.8505539227980199	1.7026943864687762e-06	0.8410336124458344	-0.0011203435720287	0.7314061184638571	0.0014937914293716	0.7223703120066497	RPL23	9191	LASP1	10407	SPMAP1	18015	False	False	False	ref	80	0.006546	55	0.01733
1599	chr17	38861770	G	A	rs72625945	-0.00420297212	0.4843716104609997	0.0074551499199999	0.4815450806571023	0.0090807510155205	0.4168123212716115	-3.95480686563734e-05	0.4889906356125658	6.730120025476643e-05	0.4858754081524797	0.526993018599778	0.1324644679835576	-0.0021015095963097	0.3443665026794393	0.0037949166972831	0.3416349563439799	0.0047987720135618	0.1613612835882308	-1.9781581807995105e-05	0.3484352906028788	3.422861851793049e-05	0.3458932277863079	-0.0011971078538159	0.6470042840103686	0.0021058309733503	0.6443516645368178	RPL23	6874	LASP1	8090	SPMAP1	20332	False	False	False	ref	85	0.01685	-50	0.02667
1600	chr17	38871150	G	T	rs76297940	-0.01008184178	0.3017317388311769	0.01253596802	0.2932492809687133	0.0102522620410403	0.2729021967357867	-0.000103284453366	0.2721668789597531	0.0001287545338088	0.2649843229999583	0.6708140125934917	0.0156415197795745	-0.0067621776992611	0.1569654767492326	0.0084050336978225	0.1500232279413249	0.0068804403235558	0.0494313922317435	-6.931616662875117e-05	0.1424623109253024	8.636650149875048e-05	0.1364378658505532	-0.0009771885600472	0.7748405773379912	0.0012261537982758	0.7656983600599261	LASP1	1290	RPL23	2506	SPMAP1	29712	False	False	False	ref	100	0.013916	-100	0.1533
1601	chr17	45627990	G	A	rs383241	0.00247802928	0.7070100097830146	0.0030841736	0.7168576495908188	0.0215388298355482	0.0193277012675717	5.931024008942828e-05	0.438022964042382	7.12842592225186e-05	0.4469022086887649	0.2742995259286921	0.5394989216314048	0.0006871748341255	0.6260321943178171	0.0008655679740707	0.6362833761162432	0.0059959393285575	0.0855317839546114	1.667924373623619e-05	0.4275450487566429	2.0203293745312067e-05	0.4371496001498906	0.0020020954574217	0.5803906727203253	0.0025290718783389	0.5891309536630398	LINC02210-CRHR1	7645	PLEKHM1	137232	CRHR1	156288	False	True	False	alt	-20	0.0006866	-50	0.009125
1602	chr17	45632761	T	A	rs81632	-0.001687447056	0.8601993214236546	0.001687447056	0.8463131609411277	0.016703608798371	0.0560661828698177	-2.6582935449244884e-05	0.7278756054515122	2.6582935449244884e-05	0.7145369029689128	0.3129264826398613	0.4794321587490696	-0.0005455309968025	0.7405719361529748	0.0005455309968025	0.7263609867242644	0.0051879848375159	0.1262177398406791	-8.550576654784012e-06	0.6248951494905809	8.550576654784012e-06	0.6113111648860999	-0.0011659871990372	0.7925980572672741	0.0011659871990372	0.778966221963835	LINC02210-CRHR1	12416	PLEKHM1	142003	CRHR1	151517	False	False	False	ref	-55	0.003784	-60	0.0092
1603	chr17	45634173	G	C	rs2942169	0.002346232146	0.6187069367022511	0.004083185346	0.624902126974066	0.0090899181082561	0.4129731186698194	2.0126436184232152e-05	0.6112727022923972	3.573198271849785e-05	0.617407201716301	0.1421404786356704	0.7505516237295736	0.000426519183034	0.6822317114026114	0.0006429558758559	0.6891693333425214	0.0012742267888658	0.7400575495452453	3.5633767177133514e-06	0.6776104193268286	5.507938642314226e-06	0.6844964909558136	0.0018776128383074	0.4429299591481122	0.0040477598315334	0.4481687112403855	LINC02210-CRHR1	13828	PLEKHM1	143415	CRHR1	150105	False	False	False	alt	-45	0.0008373	-100	0.0346
1604	chr17	45636559	A	G	rs241041	0.0450623095999999	0.0342767661562012	0.0450623095999999	0.0368651092947935	0.0092891682078153	0.3866897092031876	0.0004302380189997	0.0519780349607912	0.0004302380189997	0.0553514696088863	0.5048952789966701	0.1664576451050333	0.0229747183956827	0.027993138580443	0.0229747183956827	0.0306608403979374	0.0047100323007321	0.1701751064512614	0.0002199397630902	0.0411456971866959	0.0002199397630902	0.0444478591292176	0.0140001452297222	0.1231511619036156	0.0140001452297222	0.1270086251608121	LINC02210-CRHR1	16214	PLEKHM1	145801	CRHR1	147719	False	False	False	alt	-65	0.002592	100	0.1054
1605	chr17	45638558	A	G	rs117368197	-0.00122860146	0.8212361663808864	0.00200276062	0.8120849866576362	0.02806199477568	0.0055494254859564	-3.608511798504654e-05	0.5044914449400507	5.741459835705942e-05	0.4965177762387104	0.136837519061401	0.7557973266804816	-0.000197884198986	0.815931086818406	0.0002700327247844	0.8063944442824498	0.0038205533252366	0.266271502053018	-5.72083648151434e-06	0.6270139243095183	7.708658467864443e-06	0.6174443316872263	-0.0013547858380273	0.6747306018325354	0.0019066587827674	0.6659101485112524	LINC02210-CRHR1	18213	CRHR1	145720	PLEKHM1	147800	False	True	True	ref	90	0.00403	100	0.03076
1606	chr17	45639519	A	G	rs413778	-0.00077772728	0.800973022376678	0.00196703368	0.7929091645706697	0.0077912276679941	0.6225680983881203	-8.275243344679112e-06	0.8090944258159041	1.5621407389500605e-05	0.8006914568147057	0.2753887488459423	0.5344481385137367	-0.000260133028203	0.7118135135379601	0.000585530135324	0.7035844243292664	0.0021629415967254	0.5660655477379543	-2.6850355465521915e-06	0.7238424904282629	4.694963830892971e-06	0.7154008305717732	-0.0005103787383686	0.7197241673295481	0.0015601821595659	0.7126128426418871	LINC02210-CRHR1	19174	CRHR1	144759	PLEKHM1	148761	False	False	False	ref	95	0.003067	20	0.007355
1607	chr17	45645823	G	A	rs413917	-0.0524951838	0.0258405812303318	0.0524951838	0.0242145222642003	0.0102147986516585	0.2905180432221375	-0.0005422093044522	0.0394996910935997	0.0005422093044522	0.0371729278854563	0.2529362337783586	0.573135891207925	-0.0135825724075573	0.0910302551363967	0.0135825724075573	0.0848207190364891	0.002559029043824	0.505369849107056	-0.0001392441607769	0.0901355838141229	0.0001392441607769	0.084422533382049	-0.0483594228155893	0.0052825291520651	0.0483594228155893	0.0051550878981599	LINC02210-CRHR1	25478	CRHR1	138455	PLEKHM1	155065	False	False	False	ref	100	0.01126	-85	0.03223
1608	chr17	45646239	T	C	rs393675	0.0009267263368	0.8227169656638728	0.0019183342912	0.8282474432530582	0.012384323245245	0.1478542460084662	1.1796292857872896e-05	0.7658907224037269	2.400160907337454e-05	0.7707574657881485	0.4166578491478127	0.3096165944995122	0.0003571300960664	0.7012754931626723	0.0008054325758266	0.7065306602875971	0.0051586614431816	0.1287032899027978	4.554929938073387e-06	0.6466214460490828	1.00728863597683e-05	0.6516253094938723	0.0005705453376072	0.822924503105661	0.00094399319495	0.828860088421503	LINC02210-CRHR1	25894	CRHR1	138039	PLEKHM1	155481	False	False	False	alt	50	0.004757	100	0.07385
1609	chr17	45648396	G	A	rs434598	-0.00039280084	0.5002223156020418	0.00636559104	0.4966935491678385	0.0091488177793903	0.4104885145693104	5.330462626483497e-06	0.4922527437709078	6.047076167546949e-05	0.4892616454300901	0.5007500077801638	0.1734614538866065	-0.0001229372947474	0.3411762585981339	0.0032045005131157	0.3375739478838807	0.0045975109769452	0.1858435705986699	3.396295022663784e-06	0.336857275163597	3.054382556286103e-05	0.3338825075002953	-9.336196433572e-05	0.6712573070123099	0.0019149576240416	0.6673237074042564	LINC02210-CRHR1	28051	CRHR1	135882	PLEKHM1	157638	False	False	False	ref	100	0.003752	-50	0.02719
1610	chr17	45648626	G	A	rs434971	-0.0438824482	0.0410429891149701	0.0438824482	0.0383746660978788	0.0103251080111661	0.2665054673696423	-0.00045249185009	0.0516715852314176	0.00045249185009	0.0486164723665264	0.5192128549051339	0.1451238064962924	-0.0226953571459712	0.0332827646534872	0.0226953571459712	0.0307178447634643	0.0053584335087638	0.1128195637876365	-0.000233913720065	0.0413580981309782	0.000233913720065	0.0384949761306627	-0.0127490949076235	0.1449214672845345	0.0127490949076235	0.1406708940874015	LINC02210-CRHR1	28281	CRHR1	135652	PLEKHM1	157868	False	False	False	ref	100	0.01289	100	0.12213
1611	chr17	45650771	G	A	rs422112	-0.0369750697999999	0.0640209909037113	0.0369750697999999	0.0601402817079558	0.0109250470331606	0.2305237305009052	-0.000424245423552	0.0654747140162657	0.000424245423552	0.0618466788517177	0.4430689115032313	0.2640130839521264	-0.0163566500251068	0.0659009868922813	0.0163566500251068	0.0611499032480995	0.0048505353885547	0.1547845691248078	-0.0001882620519165	0.0635497890681094	0.0001882620519165	0.059444048637156	-0.0168715443106255	0.1002768812416694	0.0168715443106255	0.0976377727402648	LINC02210-CRHR1	30426	CRHR1	133507	PLEKHM1	160013	False	False	False	ref	40	0.001442	40	0.02344
1612	chr17	45656779	T	C	rs241032	0.0037298259439999	0.6441133134868533	0.003828930856	0.6544484824318332	0.0077842069742018	0.639819842001949	2.857581609666829e-05	0.675948293389137	2.9286491331459253e-05	0.6856829291047101	0.3898359941493169	0.3486221883951244	0.0015171110138212	0.5164884062430056	0.0015548226740198	0.5275982028621977	0.0030025525031963	0.4240202814644737	1.1529422935103856e-05	0.5447819772958643	1.1799850937081074e-05	0.5552559995388622	0.0020000207471031	0.6390534289610601	0.002053963215386	0.6482169983091073	LINC02210-CRHR1	36434	CRHR1	127499	PLEKHM1	166021	False	False	False	alt	70	0.007103	55	0.07385
1613	chr17	45656938	T	C	rs241031	0.09659365	0.002178887384475	0.09659365	0.0022791971203975	0.0206036775133013	0.0228999038904466	0.0020104699257043	0.0035671901693692	0.0020104699257043	0.0036918334584323	0.4313716947271236	0.2835987237806746	0.0415863681184432	0.0048488679020132	0.0415863681184432	0.005214052342332	0.0089625702282034	0.021022083577196	0.0008719745450896	0.0043824483929223	0.0008719745450896	0.0045870720897803	0.0526519984647143	0.0038280790357243	0.0526519984647143	0.0039376469843467	LINC02210-CRHR1	36593	CRHR1	127340	PLEKHM1	166180	False	True	True	alt	100	0.002632	5	0.00293
1614	chr17	45660364	T	C	rs241022	-0.00018417328	0.3586337254191448	0.0099157066	0.3568990291884997	0.0071911735754534	0.7027454656867312	1.144839901340213e-05	0.4305257007828114	7.147706796710768e-05	0.429797279276791	0.5094783140903951	0.1610490359935555	-0.0001071318223614	0.2429375551417819	0.0050477182742092	0.2413420310913851	0.0036642136896031	0.3067139441873424	5.756570309669807e-06	0.2921427169144922	3.637666272337283e-05	0.2912699549286587	-0.0003381777819271	0.5409707186908275	0.0029481633626904	0.5391084633160217	LINC02210-CRHR1	40019	CRHR1	123914	PLEKHM1	169606	False	False	False	ref	15	0.000269	20	0.03015
1615	chr17	45661310	C	A	rs241020	0.00020909061	0.4782142660407432	0.00677240901	0.482390954440703	0.0086077064061005	0.4836881438445629	-6.3295080302638624e-06	0.4827263156945762	6.347238603861735e-05	0.486422895172984	0.4844780547516053	0.1987663247100675	0.0001319642658427	0.3606954846914375	0.0033300522101676	0.3650233568575091	0.0041682884143114	0.2321767897072313	-2.8626685272715965e-06	0.3635708460863444	3.118818764159997e-05	0.3673923939361902	-6.224130955715992e-05	0.614333772918114	0.002344422659986	0.6179259561046391	LINC02210-CRHR1	40965	CRHR1	122968	PLEKHM1	170552	False	False	False	alt	-85	0.003754	70	0.1428
1616	chr17	45669052	T	A	rs79675109	-0.00933037744	0.3895268373228179	0.00933037744	0.3777473125654637	0.0203054382285346	0.0255612894047277	-0.0001966091964376	0.1865644675399377	0.0001966091964376	0.1787118606513971	0.4221433832301164	0.2971003501545642	-0.0038576469581573	0.3061484717845946	0.0038576469581573	0.2945545382417089	0.0084770480384124	0.0238750028639928	-8.029706931698117e-05	0.1590541631414769	8.029706931698117e-05	0.1507559133108656	-0.0046328281413707	0.4292465648439155	0.0046328281413707	0.4187126859379387	LINC02210-CRHR1	48707	CRHR1	115226	SPPL2C	175830	False	False	False	ref	-100	0.001018	100	0.03174
1617	chr17	45671046	A	G	rs62053950	0.035382254	0.0638304451197076	0.035382254	0.0681830265913935	0.0100221095543688	0.3094340931267361	0.0003579444122945	0.069167991299971	0.0003579444122945	0.0733783889176697	0.6335127957758898	0.0266580346698763	0.0224009264033107	0.0292984424586588	0.0224009264033107	0.0320725112890662	0.0063402688831148	0.0672919296383091	0.0002263472909885	0.0377669081551223	0.0002263472909885	0.0407519271361319	0.0033257606406705	0.4896293009995961	0.0033257606406705	0.5010348048260646	LINC02210-CRHR1	50701	CRHR1	113232	SPPL2C	173836	False	False	False	alt	65	0.00659	-20	0.0371
1618	chr17	45672088	G	A	rs62053953	0.00928508414	0.4073947281548435	0.00928508414	0.4197060009874929	0.0068227522190534	0.8145671381830966	6.556111262488176e-05	0.4782323349559894	6.556111262488176e-05	0.4903247631888957	0.5781035072977936	0.0687396270781461	0.0053486454361654	0.2519965095310228	0.0053486454361654	0.2636271175536779	0.0039267171919798	0.2690785946111136	3.7629268763724006e-05	0.3080581702529316	3.7629268763724006e-05	0.3197767262124993	0.0017323831160073	0.6882830636689989	0.0017323831160073	0.7014040677186628	LINC02210-CRHR1	51743	CRHR1	112190	SPPL2C	172794	False	False	False	alt	-30	0.002031	65	0.0738
1619	chr17	45672213	T	C	rs17687534	0.0417073438	0.0426844738656748	0.0417073438	0.0457714253870707	0.0095795750146706	0.3507826955285203	0.0004091552472972	0.0592119337298279	0.0004091552472972	0.0630372484022498	0.5894978163673897	0.0579142545975047	0.0245568501886736	0.0233989852385743	0.0245568501886736	0.0255946070120865	0.0056348377881705	0.098482415443075	0.0002405224581051	0.0360851604979689	0.0002405224581051	0.0390957498382612	0.0069648025394453	0.2764994646961726	0.0069648025394453	0.2847847440662898	LINC02210-CRHR1	51868	CRHR1	112065	SPPL2C	172669	False	False	False	alt	100	0.01823	100	0.07605
1620	chr17	45672576	A	G	rs1631850	0.0369641228	0.0587451871878735	0.0369641228	0.0622482678480543	0.01482114608608	0.0860259043469015	0.0005819010079227	0.0362838807033685	0.0005819010079227	0.0382869728213281	0.5714208653616739	0.0754129275935276	0.0209770469346929	0.035413323100137	0.0209770469346929	0.038529008164571	0.008433186980289	0.0246539463351606	0.0003284609034671	0.0249936325961533	0.0003284609034671	0.0267765985093124	0.0074544341746282	0.2820142996964692	0.0074544341746282	0.2900314401468445	LINC02210-CRHR1	52231	CRHR1	111702	SPPL2C	172306	False	False	False	alt	-95	0.012665	-35	0.08496
1621	chr17	45672614	T	C	rs62053955	0.0642289906	0.0105869330277834	0.0642289906	0.0112595051223792	0.0139517655255354	0.1068025823897834	0.0009571288608706	0.014708349656817	0.0009571288608706	0.0155514360203785	0.5708835153891638	0.0758532477425155	0.0366209587535392	0.0075758775532105	0.0366209587535392	0.0082614196487771	0.0079349714033213	0.0342855233517716	0.0005438848532539	0.0110238984508509	0.0005438848532539	0.0117628732677235	0.0127698420108092	0.1400956988027338	0.0127698420108092	0.1443473669786818	LINC02210-CRHR1	52269	CRHR1	111664	SPPL2C	172268	False	True	False	alt	-75	0.04678	-75	0.1993
1622	chr17	45675200	C	T	rs62055662	0.0153375818	0.2255229016682532	0.0153375818	0.2354976309081896	0.007168931157785	0.762425248445291	0.0001102011531529	0.289751850451559	0.0001102011531529	0.2997776009465148	0.3606240728638263	0.3972102950049102	0.0054967990902905	0.208771637769065	0.0054967990902905	0.2190953468776427	0.0025871564431966	0.4964260639161612	3.951484016291861e-05	0.2538272294538309	3.951484016291861e-05	0.2641519182721646	0.010251143684063	0.1844576239296948	0.010251143684063	0.1906245385710633	LINC02210-CRHR1	54855	CRHR1	109078	SPPL2C	169682	False	False	False	alt	100	0.00929	100	0.007202
1623	chr17	45679467	C	A	rs757500	0.0114393988	0.2979480552662299	0.0114393988	0.3088204935822025	0.0074963609629685	0.6893859710793201	8.586952063156927e-05	0.3579381726382555	8.586952063156927e-05	0.3685549603304578	0.4340086515420284	0.2743087260156518	0.0050026624056658	0.2291649066185903	0.0050026624056658	0.240025867210183	0.0032471392152473	0.3768788078937501	3.746703262747015e-05	0.2675022241781606	3.746703262747015e-05	0.2782772637313627	0.005236568844075	0.3563276783106956	0.005236568844075	0.3661707646853721	LINC02210-CRHR1	59122	CRHR1	104811	SPPL2C	165415	False	False	False	alt	5	0.0004559	100	0.05374
1624	chr17	45679544	T	C	rs62055693	0.0025132346199999	0.6326419222274354	0.00438385022	0.6358510409661737	0.0069650663938252	0.7647452770984566	2.3108248225333744e-05	0.6762185376776315	3.426100312166364e-05	0.6793611107108323	0.422780319297918	0.2919166547881794	0.0010993921137332	0.4793496524976554	0.0018557357561114	0.4823089791456557	0.0029548148393983	0.4266111138427111	1.0088337774089737e-05	0.524712913379298	1.4590886241777933e-05	0.5278719779024925	0.0011348665442587	0.6521619434451456	0.0021141298146246	0.6547712915728334	LINC02210-CRHR1	59199	CRHR1	104734	SPPL2C	165338	False	False	False	alt	-70	0.002169	75	0.04633
1625	chr17	45682353	A	G	rs17687849	0.00985775568	0.346293896182119	0.00985775568	0.3577280762803985	0.0069582266756361	0.8016050621492015	6.891194842048653e-05	0.4269720421627407	6.891194842048653e-05	0.4382224580193355	0.3628585358769282	0.3936867292942013	0.0035000982594576	0.301622279742576	0.0035000982594576	0.3134319768449033	0.0025233760701116	0.5054587745675758	2.446804531602769e-05	0.3555677079592895	2.446804531602769e-05	0.3673519005150486	0.0064212284359795	0.3053977168359711	0.0064212284359795	0.3141650762839952	LINC02210-CRHR1	62008	CRHR1	101925	SPPL2C	162529	False	False	False	alt	100	0.003773	30	0.03009
1626	chr17	45683319	T	C	rs62055706	-0.003973369066	0.6721991776163032	0.003973369066	0.6587698178330604	0.0203296047019346	0.0250637567144703	-9.000064690175708e-05	0.4309602676058665	9.000064690175708e-05	0.419237362801141	0.0795381694830858	0.8547906946749817	-0.0002994320988768	0.8258063801499458	0.0002994320988768	0.8115876544925273	0.0016136095411385	0.6752767476292922	-6.896904108366975e-06	0.6919630332875559	6.896904108366975e-06	0.6780582671986871	-0.0029689104658761	0.5691961411356616	0.0029689104658761	0.5571243091093265	LINC02210-CRHR1	62974	CRHR1	100959	SPPL2C	161563	False	False	False	ref	-30	0.0008144	-85	0.00949
1627	chr17	45684573	G	C	rs2158474	-0.00354739534	0.6640600510884456	0.00354739534	0.6507578508078224	0.0062105548999227	0.8972394475494723	-2.238356521502772e-05	0.7377481825229595	2.238356521502772e-05	0.7242898891993425	0.1924252326268944	0.6694831490804275	-0.0006984627713726	0.6730132417638	0.0006984627713726	0.6590066791563443	0.0012021006256461	0.7523801269477185	-4.438791877685256e-06	0.7250957973612594	4.438791877685256e-06	0.7111338150843062	-0.0036597890019605	0.4900014358312891	0.0036597890019605	0.4789487762561591	LINC02210-CRHR1	64228	CRHR1	99705	SPPL2C	160309	False	False	False	ref	100	0.007797	100	0.03348
1628	chr17	45684608	C	A	rs62055708	0.00668256758	0.4684806524422433	0.00668256758	0.4808102580034708	0.0093449195199975	0.3813541224983147	6.10378438409549e-05	0.4618855956866651	6.10378438409549e-05	0.4736223342008183	0.2135374848286807	0.6360325704655363	0.0014461198978627	0.5052793262373028	0.0014461198978627	0.5188661532571419	0.0019968383821187	0.602884488489994	1.3249903085482104e-05	0.4949919233346713	1.3249903085482104e-05	0.5079747313913305	0.0063465388645109	0.3028385407983587	0.0063465388645109	0.311682759451661	LINC02210-CRHR1	64263	CRHR1	99670	SPPL2C	160274	False	False	False	alt	100	0.01465	85	0.06287
1629	chr17	45687430	G	T	rs62055714	0.00325747724	0.700653288086593	0.00325747724	0.7142737239391677	0.0099572871842186	0.3061104642639207	3.313070582240307e-05	0.6519424769585118	3.313070582240307e-05	0.665373289642636	0.3274660525524123	0.4554597345525958	0.001061300704758	0.578441587532884	0.001061300704758	0.5921736472425543	0.0032478917402984	0.3769709621540722	1.0737953295964826e-05	0.5483257826299689	1.0737953295964826e-05	0.5617194448584242	0.0021245033662174	0.6273522810576992	0.0021245033662174	0.6399971784127243	LINC02210-CRHR1	67085	CRHR1	96848	SPPL2C	157452	False	False	False	alt	10	0.000391	75	0.09357
1630	chr17	45691267	G	A	rs56323832	0.0016214926	0.521847934668752	0.0061779873999999	0.5287435564307233	0.0086941502417772	0.4669974347167639	1.7742002626282886e-05	0.5280368166069194	5.6239841256397925e-05	0.5353468636005252	0.5158601230303219	0.1499610136774889	0.0009507144416935	0.3538723326623408	0.0031920227291061	0.3609564436256145	0.0044932999032863	0.1928260634973211	1.024218303449302e-05	0.3601548209227579	2.917900304468809e-05	0.367395566156137	0.0001224079087956	0.6953620570727574	0.0017614290604673	0.7029079009125978	LINC02210-CRHR1	70922	CRHR1	93011	SPPL2C	153615	False	False	False	alt	-45	0.002834	-40	0.05353
1631	chr17	45693629	G	A	rs62056864	-0.01174935384	0.3246112981180364	0.01174935384	0.3134673500362325	0.0071074389452114	0.7734994193915331	-8.196572504746993e-05	0.3971121795940907	8.196572504746993e-05	0.3859461212748349	0.1154534798078817	0.791925687414234	-0.0014601304186507	0.5386445680410507	0.0014601304186507	0.5248606372766351	0.00080320208109	0.8286157969639294	-9.993777491444651e-06	0.5839337422896852	9.993777491444651e-06	0.5703478818977664	-0.0105312295770702	0.1862987091174183	0.0105312295770702	0.1808080133057556	LINC02210-CRHR1	73284	CRHR1	90649	SPPL2C	151253	False	False	False	ref	-100	0.013916	-100	0.06165
1632	chr17	45694652	G	T	rs56200760	0.0113584214	0.3251950032191075	0.0113584214	0.3367825178218476	0.0156547654803659	0.0693569499231022	0.000183541814921	0.1980904818000167	0.000183541814921	0.2064733075127964	0.368624155852239	0.3796776276440705	0.0042238866011409	0.2780945713710224	0.0042238866011409	0.2899229000676076	0.0058155341926057	0.091608304743423	6.908272386546605e-05	0.1777648670804974	6.908272386546605e-05	0.1870707214037848	0.0069648025394453	0.2897762646431455	0.0069648025394453	0.2983718702447615	LINC02210-CRHR1	74307	CRHR1	89626	SPPL2C	150230	False	False	False	alt	-100	0.009026	100	0.1041
1633	chr17	45694743	C	A	rs17688391	0.0263526228	0.1153745848790855	0.0263526228	0.1223504820378286	0.0163194821375444	0.0599068216036644	0.0004304584856041	0.0505917033933754	0.0004304584856041	0.0537898370503932	0.4081556862623056	0.3168920072229315	0.010814450994512	0.1028653579625824	0.010814450994512	0.1105371197127188	0.0066837371297577	0.0578083021641529	0.0001772444066555	0.0542457541143833	0.0001772444066555	0.0584530049647279	0.0138362431145551	0.1239654009167099	0.0138362431145551	0.1278615464590775	LINC02210-CRHR1	74398	CRHR1	89535	SPPL2C	150139	False	False	False	alt	80	0.005096	45	0.05347
1634	chr17	45694885	C	T	rs17688410	-0.0404898412	0.0544873336434217	0.0404898412	0.051246399885492	0.0099509176348543	0.3274709441137767	-0.00043306916878	0.0660470851474311	0.00043306916878	0.0625192457305945	0.4351870870029772	0.2746242579795007	-0.0178932504174525	0.0573436362846804	0.0178932504174525	0.0529563353237064	0.0043617032671553	0.2114708184955561	-0.0001929635493614	0.0638961388589537	0.0001929635493614	0.0596641670579199	-0.0187553812798887	0.0854657458064208	0.0187553812798887	0.0831066621479967	LINC02210-CRHR1	74540	CRHR1	89393	SPPL2C	149997	False	False	False	ref	-60	0.001677	-95	0.0456
1635	chr17	45696577	A	G	rs17688558	-0.0033382699599999	0.7079131519153368	0.0033382699599999	0.6943844426335137	0.0084995405644478	0.4984548315314056	-2.780349132598889e-05	0.7121845321841501	2.780349132598889e-05	0.6989774386679546	0.12254483967676	0.7809451515473697	-0.000398643907354	0.7813009108847295	0.000398643907354	0.7672656006713273	0.0010363948378045	0.7819844190246252	-3.2990948713989835e-06	0.7830125774994455	3.2990948713989835e-06	0.768999264801472	-0.002964761045239	0.5688514050119815	0.002964761045239	0.5567074153710824	LINC02210-CRHR1	76232	CRHR1	87701	SPPL2C	148305	False	False	False	ref	95	0.00317	-100	0.02094
1636	chr17	45697131	A	T	rs56162163	0.0183976288	0.1841593279803983	0.0183976288	0.1932762887731373	0.0152972109055646	0.073432136630759	0.000279021170022	0.1019388882396621	0.000279021170022	0.1075799049959958	0.2190479154348073	0.6270125492799131	0.0039697088741574	0.2748004715883614	0.0039697088741574	0.2861976812551136	0.0033761275940045	0.3418989322716494	6.07559323684346e-05	0.1790736738011341	6.07559323684346e-05	0.1881950325521092	0.0180769510057157	0.0799628509919567	0.0180769510057157	0.0823383512074645	LINC02210-CRHR1	76786	CRHR1	87147	SPPL2C	147751	False	False	False	alt	-80	0.003113	5	0.001404
1637	chr17	45697479	C	T	rs56391096	0.00150447234	0.7810475803555019	0.00206433478	0.7854578740173885	0.0184862435666807	0.0368028548874215	3.054621094640028e-05	0.5967000333695957	4.081500148730962e-05	0.6017919713317134	0.2393074616956606	0.5949278202113397	0.000325645425096	0.7259354572803338	0.0004687587302879	0.730587902050873	0.0043945945522865	0.2030169817717779	6.531087274505812e-06	0.5877721791853064	9.15963582520837e-06	0.592995659917305	0.0016867394889988	0.64567750647557	0.0021182792352617	0.6503236743341253	LINC02210-CRHR1	77134	CRHR1	86799	SPPL2C	147403	False	False	False	alt	100	0.003288	-100	0.0058
1638	chr17	45697649	T	C	rs62056872	0.003089065312	0.6648483513755024	0.003799917008	0.6701619035948198	0.0070531845428922	0.7534731947047656	2.207454404781448e-05	0.710074266933392	2.668094580247803e-05	0.7145994126237859	0.2355584601500015	0.6004112010667655	0.0006971913764871	0.6546214831596032	0.0008797779820627	0.6594644151355756	0.001634171070815	0.6729452567694295	4.869361940119251e-06	0.6913108924837693	6.051526546339596e-06	0.6956589910064837	0.0029253415491861	0.5219342471581631	0.0035850994304919	0.5266073394890526	LINC02210-CRHR1	77304	CRHR1	86629	SPPL2C	147233	False	False	False	alt	60	0.002443	90	0.0909
1639	chr17	45698036	T	C	rs12150608	0.0080129045	0.4009358271561891	0.0080129045	0.4129308309546765	0.009103441473099	0.416868345305882	7.444467200803455e-05	0.4048232724701258	7.444467200803455e-05	0.4158909186962293	0.2160582578657455	0.6255532691189483	0.0017134990552584	0.4606285171993793	0.0017134990552584	0.4742921953504938	0.0019166162517572	0.6178810439707555	1.5577429283170043e-05	0.4572068167585585	1.5577429283170043e-05	0.4700374962842565	0.0073382503967882	0.2594461954872503	0.0073382503967882	0.2673822111505164	LINC02210-CRHR1	77691	CRHR1	86242	SPPL2C	146846	False	False	False	alt	-100	0.002647	60	0.03687
1640	chr17	45698180	A	G	rs12150547	0.0476947922	0.0295881690669583	0.0476947922	0.0317061232259253	0.0113599925033544	0.2114907414324075	0.0005542667532104	0.0339149602925292	0.0005542667532104	0.0361570957009144	0.263452940383199	0.5517090735036921	0.0119998982248198	0.0899570887314058	0.0119998982248198	0.0970603954065281	0.0029859146562454	0.3943812493334562	0.0001386035988158	0.0764458180173915	0.0001386035988158	0.0821101561926116	0.0412182698990653	0.0094333868101056	0.0412182698990653	0.0096591543945614	LINC02210-CRHR1	77835	CRHR1	86098	SPPL2C	146702	False	False	False	alt	-85	0.001749	-40	0.01197
1641	chr17	45700212	C	T	rs62056874	-0.01090951646	0.3637490913023098	0.01090951646	0.3519921375065111	0.0078025297075978	0.6188764395295127	-8.525694198306715e-05	0.413808672513572	8.525694198306715e-05	0.4027076921588857	0.3698752061743379	0.3808225751452692	-0.0039139569374908	0.3164416149571937	0.0039139569374908	0.3047360584031445	0.0028612571885879	0.4430624314258716	-3.030331497547736e-05	0.3500757022459039	3.030331497547736e-05	0.3386964535319142	-0.0073237274245582	0.3088968732601967	0.0073237274245582	0.3004770743257283	LINC02210-CRHR1	79867	CRHR1	84066	SPPL2C	144670	False	False	False	ref	100	0.001096	100	0.06934
1642	chr17	45703582	T	C	rs17762308	0.00783372368	0.4426152327203955	0.00783372368	0.4551047993483003	0.0075846998455132	0.6613759185941407	6.304365785226237e-05	0.4851699323070625	6.304365785226237e-05	0.4974588050957584	0.2805195074637703	0.5262789587095249	0.0021326937021562	0.4309248271413584	0.0021326937021562	0.4441304340169166	0.002107348388465	0.5881725824258912	1.7071598047089247e-05	0.4620152755100993	1.7071598047089247e-05	0.4749406984667622	0.0062365792176266	0.3131302296592561	0.0062365792176266	0.3216062249195848	CRHR1	80696	LINC02210-CRHR1	83237	SPPL2C	141300	False	False	False	alt	-95	0.004517	40	0.01071
1643	chr17	45706437	A	G	rs62056909	0.0342099431999999	0.0741837493599194	0.0342099431999999	0.0791872181657514	0.0095491450976848	0.3618053783909261	0.0003436807779358	0.084682935146645	0.0003436807779358	0.0895775317353276	0.2902602724094648	0.503424757518111	0.0095586296654314	0.1238175991464267	0.0095586296654314	0.132240467274687	0.0027273874840343	0.4521442747755806	9.453655335439389e-05	0.1264192075947782	9.453655335439389e-05	0.1341947258725334	0.027232647641573	0.0370773280425571	0.027232647641573	0.038153952837666	CRHR1	77841	LINC02210-CRHR1	86092	SPPL2C	138445	False	False	False	alt	75	0.00342	45	0.02716
1644	chr17	45706856	T	C	rs62056910	-0.00482086206	0.5912991266874089	0.00482086206	0.5778925008459499	0.0088992289189711	0.4463564529756245	-4.533694702690231e-05	0.5733072197491478	4.533694702690231e-05	0.5607957395817914	0.3840890465668731	0.3561687448231442	-0.001862151054111	0.47313626773233	0.001862151054111	0.4596679340883735	0.0033939906026848	0.3419320790097152	-1.741878836432661e-05	0.4628616245035785	1.741878836432661e-05	0.4499865336792691	-0.0027635141443375	0.5819551342343076	0.0027635141443375	0.5697992702014458	CRHR1	77422	LINC02210-CRHR1	86511	SPPL2C	138026	False	False	False	ref	85	0.004433	60	0.04376
1645	chr17	45707582	G	T	rs62056912	0.004993480816	0.5612614537008916	0.005103697824	0.5713638299450999	0.0088221259530128	0.4458267693281042	4.467753719920938e-05	0.5678838219724764	4.565282920958537e-05	0.577315473983	0.4478780900216806	0.2568829922096572	0.0022105682903948	0.4266951233850923	0.0022603916973818	0.4373462192837551	0.0039391755139956	0.2640557191731776	1.970739092321832e-05	0.4318941540695697	2.0148269977317995e-05	0.4419334605223287	0.002213715909916	0.6214766496478646	0.0022925549020217	0.6307454234053215	CRHR1	76696	LINC02210-CRHR1	87237	SPPL2C	137300	False	False	False	alt	55	0.012634	60	0.014496
1646	chr17	45707983	T	C	rs61667602	0.0250482278	0.122272000777129	0.0250482278	0.1296086584014879	0.0158587549356771	0.0648188507815006	0.0004236960700582	0.0581325850354248	0.0004236960700582	0.0617230690186092	0.4367451944522246	0.2747262507064492	0.0108961667033556	0.1028962090163377	0.0108961667033556	0.1105110712971911	0.0069196182309929	0.0510609651632929	0.0001843355498438	0.0555252363005693	0.0001843355498438	0.0597802139165679	0.011350740152906	0.1589272826225846	0.011350740152906	0.1639458242498157	CRHR1	76295	LINC02210-CRHR1	87638	SPPL2C	136899	False	False	False	alt	-100	0.006516	30	0.07214
1647	chr17	45708572	C	T	rs62056916	0.0098605332	0.2745064862030419	0.0132360176	0.2817416424825956	0.0089442969670091	0.4246556427654061	9.495906730366848e-05	0.2759355948863506	0.0001206866894922	0.2827467063583713	0.4675650162346082	0.2170691707886028	0.0047446841204892	0.1948986319951179	0.0062832416782609	0.2019224489129575	0.0041890955642807	0.2223411381601054	4.563938556887484e-05	0.1967069877922521	5.736612538301383e-05	0.2034749356161542	0.0040996275894978	0.3749248683904	0.0051992240583408	0.3812972019325754	CRHR1	75706	LINC02210-CRHR1	88227	SPPL2C	136310	False	False	False	alt	100	0.03842	65	0.1824
1648	chr17	45708647	G	T	rs62056917	-0.00412934926	0.5526803854215624	0.00554111202	0.5428766893928428	0.009210558626132	0.392453769012637	-3.945098953854434e-05	0.539081089790504	5.218714055226345e-05	0.5299163078388045	0.4643886347368748	0.2217788758699214	-0.0020707053536977	0.4000460944141932	0.0026313010646717	0.3901657499911032	0.00426918286854	0.2173407969447052	-1.963870885891241e-05	0.3916071229731426	2.46960966394304e-05	0.3822195715752952	-0.0012655732943287	0.6617816756561058	0.0020456643741117	0.6529354350514532	CRHR1	75631	LINC02210-CRHR1	88302	SPPL2C	136235	False	False	False	ref	30	0.009186	-10	0.001953
1649	chr17	45709764	T	C	rs17762535	0.0428734866	0.0388557298190275	0.0428734866	0.0418307024184975	0.009488882513355	0.3569415516174989	0.0004097866432402	0.0545241793353761	0.0004097866432402	0.0581227444442419	0.4155395802861025	0.3082857728151104	0.017740288273693	0.0475201042672628	0.017740288273693	0.0519075394389412	0.0039714377771936	0.2512096732615704	0.0001709639550529	0.0569122198893663	0.0001709639550529	0.061321719399271	0.0230147615639166	0.0533690528008287	0.0230147615639166	0.0548177959400176	CRHR1	74514	LINC02210-CRHR1	89419	SPPL2C	135118	False	False	False	alt	-85	0.0007844	80	0.02661
1650	chr17	45709860	G	A	rs62056920	-0.016006679	0.2398914505987371	0.016006679	0.229964189233409	0.0079711277353866	0.5985010526816222	-0.0001282381037372	0.2768260526109075	0.0001282381037372	0.2670703227558521	0.4096370294297659	0.3168107352507787	-0.0064745047046401	0.2114822721447079	0.0064745047046401	0.2013503781202224	0.0032614593700678	0.3731229662425082	-5.181789165453366e-05	0.2370281374070495	5.181789165453366e-05	0.2270422086192413	-0.0087863981991514	0.2494468312559109	0.0087863981991514	0.2426312634750806	CRHR1	74418	LINC02210-CRHR1	89515	SPPL2C	135022	False	False	False	ref	35	0.0008054	-15	0.01227
1651	chr17	45714886	C	A	rs55973918	0.00081009216	0.7875719945623516	0.0022248902	0.7908282707202313	0.0228085790725298	0.0150123890825671	2.4774258848477697e-05	0.5353677084301908	5.322087429200996e-05	0.5393723394742888	0.3225987821450429	0.4595478698726745	0.0001917984239669	0.67098080874628	0.0006847208452278	0.6741881160335155	0.0072877348436086	0.0412276858771022	6.2811500547406655e-06	0.4719204244090741	1.619414724314775e-05	0.4755986463382181	0.0008174358655172	0.6980560556326151	0.0017137107231402	0.7015909260903934	CRHR1	69392	LINC02210-CRHR1	94541	SPPL2C	129996	False	True	False	alt	20	0.00238	90	0.0495
1652	chr17	45716299	A	G	rs7502937	0.0023214063599999	0.4652520672246215	0.0071823473599999	0.4704798893558712	0.0070399025922964	0.7877335473903084	1.2987723741107354e-05	0.5371065549936156	4.9891353499543664e-05	0.5418667904990695	0.4738659114721107	0.213286997320841	0.0012153428913589	0.3244642484948163	0.003423696818509	0.3300881923179384	0.0033307177644801	0.3621681696614658	6.98618509670847e-06	0.3781150281296362	2.3743814212993475e-05	0.383282707653963	0.0004419132978557	0.5951446933010661	0.0024502328862332	0.5994034668463197	CRHR1	67979	LINC02210-CRHR1	95954	SPPL2C	128583	False	False	False	alt	100	0.00987	100	0.1399
1653	chr17	45716920	C	T	rs75310534	-0.0518018764	0.0253716110389761	0.0518018764	0.0237223577125194	0.0095786584683802	0.3430207916007331	-0.0004972932846261	0.0428200021818037	0.0004972932846261	0.0402907950023884	0.4816357016151619	0.2032729430161035	-0.0249129136178722	0.0270138023703258	0.0249129136178722	0.0248362442921348	0.004610030895961	0.1757034825983586	-0.0002389914342739	0.0393162070961556	0.0002389914342739	0.0365742464425094	-0.0192242658118859	0.0760107515796164	0.0192242658118859	0.0738658718440171	CRHR1	67358	LINC02210-CRHR1	96575	SPPL2C	127962	False	False	False	ref	-100	0.00132	90	0.03003
1654	chr17	45718207	C	T	rs111415173	0.00046532554	0.860513622803411	0.00136883818	0.868798277071963	0.0094283631387687	0.369047169164966	6.557485768251723e-06	0.8537725893787315	1.2073539149028985e-05	0.862297241406963	0.012533325034492	0.9764283862593172	5.042821202476768e-06	0.9646933424805252	1.8417571188294427e-05	0.9734008559785368	0.0001186034253801	0.9747719008120032	7.95233423240487e-08	0.9644357618998473	1.6117780112931793e-07	0.9731715458648168	6.43160198757e-05	0.9170523100506194	0.0003381777819271	0.9254501029260624	CRHR1	66071	LINC02210-CRHR1	97862	SPPL2C	126675	False	False	False	alt	100	0.042	50	0.02802
1655	chr17	45718268	C	T	rs113991678	-0.020056284	0.1963976024935501	0.020056284	0.187666397286444	0.0120210185430356	0.1699623764367105	-0.0002614598232403	0.146064402883413	0.0002614598232403	0.1395722109575928	0.018647496343323	0.9651157999624972	-0.0004118309591085	0.7868942180761853	0.0004118309591085	0.7729772163389699	0.0002402442767454	0.9490971797535422	-5.701102727293564e-06	0.7270518709559379	5.701102727293564e-06	0.7131658817294693	-0.0055415512609051	0.3670561920930779	0.0055415512609051	0.3574588040517715	CRHR1	66010	LINC02210-CRHR1	97923	SPPL2C	126614	False	False	False	ref	100	0.00717	-15	0.005222
1656	chr17	45721536	C	T	rs55838058	0.00856416426	0.3926545944565489	0.00856416426	0.4049683851655081	0.0061740110770936	0.9233238530010603	5.181951057257935e-05	0.5063735439448904	5.181951057257935e-05	0.5186253748116634	0.4218342513926492	0.3024208345646088	0.0036099334179269	0.3095854920969276	0.0036099334179269	0.3219121881853074	0.0026075694672004	0.4970883900264231	2.1850796843910902e-05	0.3901181983485665	2.1850796843910902e-05	0.4024894037066412	0.0042137366570192	0.4228805324141783	0.0042137366570192	0.4335180634105201	CRHR1	62742	LINC02210-CRHR1	101191	SPPL2C	123346	False	False	False	alt	60	0.002821	-50	0.01999
1657	chr17	45722301	C	A	rs62054378	0.00818293536	0.3938272418077042	0.00818293536	0.4057807801770459	0.0156726685886533	0.0674343383868057	0.0001282556376159	0.2498949693763982	0.0001282556376159	0.2592687857372364	0.4651127086380563	0.2295504378672221	0.003813151134049	0.2813001062924843	0.003813151134049	0.2929045922004993	0.0073075098798335	0.0407624889641573	5.992589136698231e-05	0.180653551188115	5.992589136698231e-05	0.189827770629629	0.0032199504144233	0.5006507309247936	0.0032199504144233	0.5123237655107846	CRHR1	61977	LINC02210-CRHR1	101956	SPPL2C	122581	False	False	False	alt	75	0.004425	70	0.0824
1658	chr17	45722438	C	A	rs77819001	-0.0100795259	0.3877192663040174	0.0100795259	0.3757427295418769	0.0085269456077952	0.4983588925539106	-9.424466606865971e-05	0.3984469897003079	9.424466606865971e-05	0.387082487582425	0.4308011493895164	0.2859162514920215	-0.0044138790226379	0.2983581976455944	0.0044138790226379	0.2864178493515126	0.0036934363111308	0.2980737554458367	-4.143133355502226e-05	0.3063708524279334	4.143133355502226e-05	0.2951483791724965	-0.0042987997800806	0.4393478309650775	0.0042987997800806	0.4284855447086093	CRHR1	61840	LINC02210-CRHR1	102093	SPPL2C	122444	False	False	False	ref	-60	0.001984	35	0.01929
1659	chr17	45722444	G	C	rs76667867	-0.0085991098599999	0.3284829527316712	0.0129702409399999	0.3253812501128699	0.0088553206705132	0.4612916872620415	-0.0001015687002606	0.3281943877731565	0.000137019960691	0.3251756778868836	0.4307264598180478	0.2860759824411797	-0.0038988505219361	0.2553133419224116	0.00575700141917	0.2522442965239331	0.0038554544986691	0.2741988583379429	-4.66303294793804e-05	0.2577769385969941	6.170473334172574e-05	0.2552291488109383	-0.003919127791782	0.3622161952156412	0.0062054585628481	0.3604877311627743	CRHR1	61834	LINC02210-CRHR1	102099	SPPL2C	122438	False	False	False	ref	-60	0.001312	20	0.01355
1660	chr17	45723819	A	G	rs62054381	0.00444893082	0.5119428903616914	0.0059867231	0.5191965580696384	0.0152238589937727	0.0765813961285333	5.712111093977429e-05	0.4017109042927372	8.384614220809526e-05	0.4078235432244884	0.2351850122926586	0.6009153225689006	0.0007912234126773	0.5583065222206851	0.0011848363564252	0.5647557856017175	0.0036173452373847	0.2903863499921627	9.89017636664513e-06	0.4590579682948685	1.675283197361671e-05	0.4645264041858624	0.0051950746377037	0.3406851912352987	0.0066971649083496	0.343658810132196	CRHR1	60459	LINC02210-CRHR1	103474	SPPL2C	121063	False	False	False	alt	-15	0.001899	90	0.01342
1661	chr17	45725541	T	C	rs62054383	0.0429934582	0.0391064711019227	0.0429934582	0.0420987397824227	0.0102261744419171	0.2786095186385905	0.000443705207762	0.0467491082873504	0.000443705207762	0.0499208375276813	0.3177232128963992	0.4644087690069799	0.0138289358635198	0.0744506073415776	0.0138289358635198	0.0806696770175473	0.0032410885495388	0.3711625852237838	0.0001421183204511	0.0730948569613754	0.0001421183204511	0.0786119652937524	0.0329132044938225	0.0177319032995791	0.0329132044938225	0.0182121478082379	CRHR1	58737	LINC02210-CRHR1	105196	SPPL2C	119341	False	False	False	alt	-40	0.00375	15	0.01422
1662	chr17	45727253	C	T	rs56380663	-0.051860789	0.0255729317484968	0.051860789	0.0239743825144279	0.0111691423358196	0.2234886361091256	-0.0005968221102407	0.0341243517508987	0.0005968221102407	0.0320962937717732	0.3423790703223062	0.4309258726896983	-0.017700039934695	0.0576444852993008	0.017700039934695	0.0531687880890754	0.0038425017525183	0.2755321793065898	-0.0002045878388957	0.0542547726261093	0.0002045878388957	0.0505513121376454	-0.0379174057822176	0.0134503253815422	0.0379174057822176	0.0131338175440488	CRHR1	57025	LINC02210-CRHR1	106908	SPPL2C	117629	False	False	False	ref	5	1.144e-05	65	0.03455
1663	chr17	45728224	C	T	rs62054388	-0.0390586592	0.0631827606777466	0.0390586592	0.0600769369924057	0.017291579732604	0.0599722371141295	-0.000887064506808	0.0406592859718907	0.000887064506808	0.0389598628348419	0.3839790869199888	0.3599515155291549	-0.0149605976338612	0.0814479069654067	0.0149605976338612	0.0760573729040803	0.0067012409181604	0.071637950966987	-0.0003426941556766	0.0468638011681495	0.0003426941556766	0.0442348809577481	-0.0245790931441197	0.0544228099918475	0.0245790931441197	0.0527937154261688	CRHR1	56054	LINC02210-CRHR1	107879	SPPL2C	116658	False	False	False	ref	-60	0.004997	-100	0.0509
1664	chr17	45728649	G	A	rs4401083	-0.035788804	0.0741392107539047	0.035788804	0.0695481566959606	0.008711834771676	0.4614215882896201	-0.0003184225939802	0.0988482208725395	0.0003184225939802	0.0936354060488267	0.3893857820101868	0.3375161562125192	-0.0134670337756528	0.088886210233677	0.0134670337756528	0.0825874091869772	0.0033753145162551	0.3444216096688401	-0.0001196837053375	0.1043820867589642	0.0001196837053375	0.0979035193259241	-0.0223861243373893	0.0651430368250508	0.0223861243373893	0.0633360280824723	CRHR1	55629	LINC02210-CRHR1	108304	SPPL2C	116233	False	False	False	ref	90	0.02701	85	0.02478
1665	chr17	45728898	C	T	rs1880752	-0.0488989584	0.0294073368700995	0.0488989584	0.0276646655792052	0.0114139629467602	0.2062716338746576	-0.0005806443722351	0.0377444420168036	0.0005806443722351	0.0357007790417006	0.4075519455596012	0.3047580563452198	-0.0205268503826174	0.041298432452597	0.0205268503826174	0.038252311134889	0.0047603390158194	0.154663425381786	-0.0002486506306541	0.0431765240535293	0.0002486506306541	0.0404118679214112	-0.0248820008506312	0.0424735946696405	0.0248820008506312	0.0414641300866353	CRHR1	55380	LINC02210-CRHR1	108553	SPPL2C	115984	False	False	False	ref	-90	0.003448	-90	0.07056
1666	chr17	45729697	C	T	rs2864087	-0.0758711682	0.0062402397026556	0.0758711682	0.005941753562358	0.0289653749831872	0.0051331563645902	-0.0022170382543659	0.0033818394454755	0.0022170382543659	0.0032759983049687	0.4707662942561644	0.2212216142305766	-0.0358026103613549	0.0097702927566717	0.0358026103613549	0.0090136914906421	0.0137196360443376	0.0047774458517236	-0.001052298621487	0.0037834471576176	0.001052298621487	0.0036130070024343	-0.030730609238685	0.0244821097183346	0.030730609238685	0.0238624516380535	CRHR1	54581	LINC02210-CRHR1	109352	SPPL2C	115185	False	True	True	ref	-55	0.002869	-75	0.04102
1667	chr17	45729747	C	T	rs4609899	-0.179209118	0.0004008054182693	0.179209118	0.0003675977387153	0.054866634789102	0.0008262167735034	-0.0113338750808576	0.0005171627449126	0.0113338750808576	0.0004645803025574	0.4713555119866388	0.2206387258625792	-0.0850537496917908	0.0007616316321176	0.0850537496917908	0.0007117077423384	0.0261457645779795	0.0011727348048732	-0.0053929801228437	0.0006286681649453	0.0053929801228437	0.0005775786381949	-0.091019616386062	0.0008219219740439	0.091019616386062	0.0008033456876422	CRHR1	54531	LINC02210-CRHR1	109402	SPPL2C	115135	False	True	True	ref	65	0.00453	-100	0.04187
1668	chr17	45731898	T	G	rs62054393	-0.0061209028799999	0.4678054971481893	0.0073362275199999	0.4587357876237071	0.0101330728806127	0.2856005563422217	-6.201014874508419e-05	0.4344443001403124	7.476727418124307e-05	0.4264547599690541	0.4078859739208912	0.3220895194709385	-0.0024528137029814	0.3679364164737047	0.0029545437505673	0.3592691907590893	0.0041235810911774	0.2352132849781667	-2.47775879895305e-05	0.3411724605963082	3.0044191595198764e-05	0.3333422718989189	-0.0031452608429547	0.4864327866560253	0.0038216164068091	0.4787486061092976	CRHR1	52380	LINC02210-CRHR1	111553	SPPL2C	112984	False	False	False	ref	-40	0.005234	-75	0.06128
1669	chr17	45733416	G	C	rs113790915	0.01759224704	0.2219934621575791	0.01759224704	0.2321607143988514	0.016809624990122	0.051412045768342	0.0003111741960104	0.1128732520818047	0.0003111741960104	0.1186875666464193	0.4148258799365139	0.3126502281809259	0.007333225491363	0.1819084195796707	0.007333225491363	0.1921187067591511	0.0070268364135093	0.0488026026796105	0.0001312442630102	0.1006573703132641	0.0001312442630102	0.107232727851763	0.0087822487785142	0.24069789932684	0.0087822487785142	0.2475901403680302	CRHR1	50862	SPPL2C	111466	LINC02210-CRHR1	113071	False	False	False	alt	100	0.0331	100	0.0335
1670	chr17	45733507	A	T	rs75022332	0.0194801451	0.1782422497064447	0.0194801451	0.1870716359824423	0.0074687528452023	0.6441964692601158	0.0001527368642213	0.2288737738120631	0.0001527368642213	0.2379006418224881	0.4144109378727995	0.3127142165997865	0.0081993344696484	0.1473402075380408	0.0081993344696484	0.1564990441321926	0.0031142923706038	0.3898687042072313	6.465784087341276e-05	0.1830822707692579	6.465784087341276e-05	0.1925247615927982	0.0096681500845443	0.1901990541588096	0.0096681500845443	0.1963456109526848	CRHR1	50771	SPPL2C	111375	LINC02210-CRHR1	113162	False	False	False	alt	30	0.003296	15	0.01862
1671	chr17	45733530	C	T	rs77804065	-0.0478995306	0.0343919725763663	0.0478995306	0.0321538629429742	0.0107873995854231	0.2431777133534439	-0.0005460222769566	0.0429106609228999	0.0005460222769566	0.0403924587693419	0.4035664270376248	0.3303290657245503	-0.0191981378178996	0.0503043769741062	0.0191981378178996	0.0463990123200853	0.0043418614946369	0.2140627360845159	-0.0002185505118059	0.0516218460056314	0.0002185505118059	0.0480509808242797	-0.0280293364039045	0.0379581385335144	0.0280293364039045	0.0369027196075689	CRHR1	50748	SPPL2C	111352	LINC02210-CRHR1	113185	False	False	False	ref	-5	0.0004272	-5	0.003235
1672	chr17	45735233	A	G	rs62054398	0.01632978366	0.2267406131827008	0.01632978366	0.2368625103525939	0.0066708589178556	0.8034931054798452	0.0001170482918473	0.3088413351358371	0.0001170482918473	0.3192794706338776	0.4646583470782892	0.2293763235344645	0.0075884578763014	0.1640669305906924	0.0075884578763014	0.1737939013446829	0.0030963156463382	0.4042169992249445	5.445089460854104e-05	0.2209599865105221	5.445089460854104e-05	0.2310615902027263	0.0064129295947052	0.3071762165739304	0.0064129295947052	0.3162017443141276	CRHR1	49045	SPPL2C	109649	LINC02210-CRHR1	114888	False	False	False	alt	90	0.008316	-30	0.02045
1673	chr17	45735258	G	A	rs62054399	-0.0301349071999999	0.1048708806199268	0.0301349071999999	0.0989809722364771	0.0067929728731516	0.8135080021958198	-0.000211201593371	0.1724270819953148	0.000211201593371	0.1649433843026416	0.4518221143372855	0.2500426507603241	-0.0135344956301085	0.0892072261218829	0.0135344956301085	0.0829064751932012	0.003064786631766	0.4126552627317533	-9.481736103936556e-05	0.1356366108288336	9.481736103936556e-05	0.1280032036356466	-0.0136225479517421	0.1463042176966379	0.0136225479517421	0.1419649857930327	CRHR1	49020	SPPL2C	109624	LINC02210-CRHR1	114913	False	False	False	ref	50	0.003696	95	0.01936
1674	chr17	45737970	A	G	rs56298110	0.0121711872599999	0.2936494601929709	0.0121711872599999	0.3047771185075217	0.0085003217838967	0.5024007617398099	0.0001044962946056	0.3226550082074797	0.0001044962946056	0.333033219346429	0.2069170842021182	0.644278078624618	0.0026049865738615	0.3854084481062246	0.0026049865738615	0.3982582305755694	0.0018160105873844	0.6433229873330552	2.308496788725772e-05	0.3974260668115073	2.308496788725772e-05	0.4096803585770759	0.0111598668035975	0.1582871919646575	0.0111598668035975	0.1633812070745546	CRHR1	46308	SPPL2C	106912	LINC02210-CRHR1	117625	False	False	False	alt	-100	0.002869	80	0.01694
1675	chr17	45739239	A	C	rs62054419	-0.0199314212	0.1976365841266406	0.0199314212	0.1887841749561002	0.015257057082821	0.0742492215972601	-0.0003066029798819	0.1067702463898491	0.0003066029798819	0.1013359705106862	0.1719001234452639	0.7013743485857485	-0.0035006655419469	0.3418418272716668	0.0035006655419469	0.3298656475216268	0.0026537172334696	0.4646374300194115	-5.446380355827495e-05	0.2344742357131941	5.446380355827495e-05	0.2244286388175596	-0.0188300708513573	0.0804844632786059	0.0188300708513573	0.0782582840500288	CRHR1	45039	SPPL2C	105643	LINC02210-CRHR1	118894	False	False	False	ref	10	6.104e-05	35	0.03156
1676	chr17	45740856	C	A	rs17563827	0.0199295564999999	0.1799832065098868	0.0199295564999999	0.1887976410241122	0.0132563718515106	0.1188983621159796	0.0002660079661304	0.1196004303267641	0.0002660079661304	0.1259160305059095	0.6318073838940238	0.0280713805269202	0.0124902533341055	0.0885772194974341	0.0124902533341055	0.0955214333965447	0.008376344336473	0.024555390254618	0.000166694678157	0.0621743472060896	0.000166694678157	0.0670068062441999	0.0021307274971731	0.634896299921519	0.0021307274971731	0.6475911780533932	CRHR1	43422	SPPL2C	104026	LINC02210-CRHR1	120511	False	False	False	alt	-100	0.1164	-100	0.3408
1677	chr17	45742018	G	A	rs62054424	-0.0539280074	0.0232803367742617	0.0539280074	0.0218762097592923	0.0200629114893942	0.025801887389536	-0.0010881772542679	0.0114496012415237	0.0010881772542679	0.0108407998331077	0.3088807975186464	0.4833024784677004	-0.0164534152682217	0.0643185652708443	0.0164534152682217	0.0595799454264771	0.006148522308515	0.0741120361071112	-0.0003292305128035	0.0247671921193483	0.0003292305128035	0.0231021232886057	-0.0456415522982603	0.0077214150289725	0.0456415522982603	0.0075872655909808	CRHR1	42260	SPPL2C	102864	LINC02210-CRHR1	121673	False	False	False	ref	-85	0.001809	-55	0.0359
1678	chr17	45743375	A	T	rs62054426	0.0437771746	0.0375297062071537	0.0437771746	0.0402450683867976	0.0168142207550702	0.0514266923853519	0.000754363242919	0.0193927229371278	0.000754363242919	0.020578026359072	0.4428303198165956	0.267101689713264	0.0194072710984407	0.0402523616681795	0.0194072710984407	0.043965954555911	0.0074325628353468	0.0393088715514123	0.0003338808936402	0.0214849054460763	0.0003338808936402	0.0231640471222995	0.0201412877726947	0.0685015696285363	0.0201412877726947	0.070476372963454	CRHR1	40903	SPPL2C	101507	LINC02210-CRHR1	123030	False	False	False	alt	95	0.00432	100	0.0716
1679	chr17	45744319	C	A	rs74464991	0.00620945712	0.4961946954840669	0.00620945712	0.5093262531820155	0.0158323643692082	0.0665945921843652	9.837470929699966e-05	0.3437767182360199	9.837470929699966e-05	0.3549467360488827	0.2119212854905133	0.6244859452000685	0.00134658683248	0.5366024454794717	0.00134658683248	0.5508920406931453	0.0032694755851034	0.340745260437171	2.1273722673605112e-05	0.4161408714115679	2.1273722673605112e-05	0.4290848084077666	0.0055726719156836	0.3643557667553152	0.0055726719156836	0.3736265617027837	CRHR1	39959	SPPL2C	100563	LINC02210-CRHR1	123974	False	False	False	alt	90	0.02144	-50	0.07184
1680	chr17	45745032	T	C	rs2004260	0.0143226752999999	0.2565223788461479	0.0143226752999999	0.2668800972490643	0.0080903774510016	0.567414012907115	0.0001157380646968	0.2940339802653448	0.0001157380646968	0.3041492505980275	0.1471654270272513	0.7307927572586472	0.0020770779202552	0.4367304445016444	0.0020770779202552	0.4501262688462717	0.0011659432431406	0.747635372739285	1.6416417999634505e-05	0.4541551585811574	1.6416417999634505e-05	0.4672075516189828	0.0121432794946005	0.1491435026540541	0.0121432794946005	0.1539128595960267	CRHR1	39246	SPPL2C	99850	LINC02210-CRHR1	124687	False	False	False	alt	-80	0.005035	95	0.04773
1681	chr17	45748112	G	A	rs75715199	0.01045093116	0.3305676148952141	0.01096872796	0.3407899549768949	0.0113355849123996	0.2081770051731931	0.0001162636642922	0.2839185070772838	0.0001229937474956	0.2926349323644061	0.3810869407358996	0.3561264973610087	0.0043307845953579	0.2815069814274357	0.0044588654377856	0.2921126339179627	0.0042537373396386	0.2162571206981118	4.815520937853019e-05	0.2451213763534758	4.981994484244247e-05	0.2544727420742592	0.0053527526219151	0.3417506399214298	0.0058008900507266	0.3484906199293687	CRHR1	36166	SPPL2C	96770	LINC02210-CRHR1	127767	False	False	False	alt	0	0.0	-25	0.0185
1682	chr17	45748359	G	T	rs62054439	0.0019690804724	0.799722897755137	0.0019690804724	0.8137616442767159	0.0087503887916235	0.457870835873117	1.82641165605904e-05	0.7864900972764433	1.82641165605904e-05	0.8005039994840103	0.4105727237834417	0.3111740380071936	0.0008518887719389	0.6587056067145803	0.0008518887719389	0.6732450995847123	0.0035987349881669	0.303685371295907	7.898773124547763e-06	0.6510238532512894	7.898773124547763e-06	0.6651608178602144	0.0009751138497286	0.8033038433868032	0.0009751138497286	0.8170461237473237	CRHR1	35919	SPPL2C	96523	LINC02210-CRHR1	128014	False	False	False	alt	-100	0.005104	-100	0.10126
1683	chr17	45748985	A	G	rs12150363	0.0285571939999999	0.0977008148760714	0.0285571939999999	0.1038897458671449	0.0092845704671539	0.3809607994547989	0.0002651884109637	0.1073748803185326	0.0002651884109637	0.1133357713250321	0.4866357534829199	0.1936945377184292	0.0139758921778907	0.0712045945255325	0.0139758921778907	0.0770303675589866	0.0045203863101229	0.1858734431709803	0.0001297445274594	0.0806795850649794	0.0001297445274594	0.0863802857724476	0.0097864085727029	0.1873533152501625	0.0097864085727029	0.1935695964882449	CRHR1	35293	SPPL2C	95897	LINC02210-CRHR1	128640	False	False	False	alt	-100	0.002377	55	0.03084
1684	chr17	45750025	G	C	rs62054440	0.0065509620399999	0.4727755475551687	0.006998187	0.4828862833927853	0.0073345933270504	0.7057949211618255	4.946233604983132e-05	0.5302584115171521	5.261903052411135e-05	0.5397718586107003	0.4988848432037677	0.1751136086995938	0.0032884933301303	0.3281829180035382	0.0035178701570196	0.3381426071515453	0.0036670474474906	0.3001775654119685	2.48880262314136e-05	0.3713598725214947	2.650706053879597e-05	0.3807484750923419	0.0020124690090145	0.6374279553985595	0.0021328022074917	0.6464343160344754	CRHR1	34253	SPPL2C	94857	LINC02210-CRHR1	129680	False	False	False	alt	-100	0.00857	-95	0.0814
1685	chr17	45750855	T	A	rs12150604	0.0176430861999999	0.1997723447019656	0.0176430861999999	0.2092839996332756	0.0069191161273959	0.7911224265524304	0.0001229904518501	0.2776351347103067	0.0001229904518501	0.2872549212396006	0.5272959263062895	0.1324657010026546	0.0094025344728305	0.1256853071481956	0.0094025344728305	0.1342287062231112	0.0036421113761257	0.3154496128719287	6.538993005153797e-05	0.1769848030145431	6.538993005153797e-05	0.1861015473962997	0.0044585524746106	0.4036120277978555	0.0044585524746106	0.4141085668297468	CRHR1	33423	SPPL2C	94027	LINC02210-CRHR1	130510	False	False	False	alt	90	0.00502	-15	0.006958
1686	chr17	45751332	C	T	rs17426064	-0.0471770056	0.033727933050579	0.0471770056	0.0316669805184039	0.0107876518845505	0.2482032457803875	-0.0005258947904424	0.0410663464382355	0.0005258947904424	0.0388394811970613	0.5744457930061515	0.0726776226286236	-0.0271013357193673	0.0218640885942396	0.0271013357193673	0.0202238042908048	0.0061933363558042	0.0735120347228222	-0.0003019879414339	0.0292977888446746	0.0003019879414339	0.0273344167567065	-0.0086971856554528	0.2354323763607768	0.0086971856554528	0.2283395816861177	CRHR1	32946	SPPL2C	93550	LINC02210-CRHR1	130987	False	False	False	ref	50	0.002125	15	0.0047
1687	chr17	45751987	A	G	rs62054442	0.0284835866	0.1005665766771915	0.0284835866	0.106965583876577	0.0079100575635445	0.6047539627132208	0.0002293535315489	0.139804791920536	0.0002293535315489	0.1468541523814457	0.5370242429900726	0.1197692640445807	0.0153634941408942	0.0623779595176714	0.0153634941408942	0.0677395506574754	0.0042547502219818	0.2217311043053575	0.0001238810517146	0.0894139259731974	0.0001238810517146	0.0957032889798222	0.0067801533210925	0.2723622346056201	0.0067801533210925	0.2806220606688694	CRHR1	32291	SPPL2C	92895	LINC02210-CRHR1	131642	False	False	False	alt	-100	0.00757	-100	0.02838
1688	chr17	45754971	A	G	rs35631660	0.0509904214	0.0238622983514116	0.0509904214	0.0256497138734964	0.0118764501815513	0.1704682681359378	0.000608158450613	0.0265955952012427	0.000608158450613	0.028360635103613	0.3129347814811357	0.4768413482903564	0.0158578461239645	0.0588834719842874	0.0158578461239645	0.0639592860494004	0.0037126111267301	0.2976849609787941	0.0001888515184534	0.0487141503427619	0.0001888515184534	0.0525799602298742	0.0410709654664467	0.0094030459123098	0.0410709654664467	0.0097080956565545	CRHR1	29307	SPPL2C	89911	LINC02210-CRHR1	134626	False	False	False	alt	-70	0.01373	-15	0.01114
1689	chr17	45755574	A	G	rs62055876	0.0461080418	0.0314180400300108	0.0461080418	0.033795801443904	0.0096986318719644	0.3330260834934856	0.0004503769045627	0.0454660622588485	0.0004503769045627	0.0485594656445438	0.4186827664187388	0.3002052309763113	0.0193003881732078	0.0400517566155876	0.0193003881732078	0.0437382872228279	0.0040449928129249	0.2463847900683095	0.000187903368717	0.0489772604250375	0.000187903368717	0.0528471521992962	0.0239753524414153	0.0485864655769776	0.0239753524414153	0.0498940314623004	CRHR1	28704	SPPL2C	89308	LINC02210-CRHR1	135229	False	False	False	alt	-25	0.001072	5	0.00589
1690	chr17	45756615	A	G	rs34579278	0.0543347567999999	0.01887989970627	0.0543347567999999	0.0202345129539574	0.0101989735601487	0.2950871342172014	0.0005676477034764	0.0307927605617436	0.0005676477034764	0.0328140716825932	0.521212875652237	0.1409817857236611	0.028231757174026	0.0163248287157478	0.028231757174026	0.0178987686763545	0.005309310603778	0.1219856080030546	0.0002944906677457	0.0254043481744931	0.0002944906677457	0.0274600369662845	0.0163549414413012	0.1041830023513171	0.0163549414413012	0.1073055916986298	CRHR1	27663	SPPL2C	88267	LINC02210-CRHR1	136270	False	False	False	alt	-40	0.001251	100	0.0829
1691	chr17	45756708	C	G	rs34211253	0.006491135388	0.472929541975051	0.006491135388	0.4855847247841096	0.0081998531410352	0.5459759485495017	5.566647516681919e-05	0.4890506955966497	5.566647516681919e-05	0.50100732420692	0.4933557402047739	0.1829747658605593	0.003130453112176	0.3418956012508952	0.003130453112176	0.3541975511727516	0.0040212701166901	0.2546088433519978	2.6838131847861923e-05	0.354678579458376	2.6838131847861923e-05	0.3664787558538439	0.0024564570171889	0.5929137867355975	0.0024564570171889	0.6053814929741292	CRHR1	27570	SPPL2C	88174	LINC02210-CRHR1	136363	False	False	False	alt	-5	0.0002213	50	0.06824
1692	chr17	45757985	T	C	rs11079717	0.0522290416	0.0215035752917673	0.0522290416	0.0231199036739639	0.010080422078008	0.2953307206504245	0.0005351975226345	0.0340157370753669	0.0005351975226345	0.0362641383438599	0.5381923048994284	0.1187130184733278	0.0281159443404671	0.0166864042690463	0.0281159443404671	0.0182520013945565	0.0054278107878706	0.1114415400048512	0.0002882183493809	0.0263119013974639	0.0002882183493809	0.0283750408316281	0.0133777321341507	0.1331672849689036	0.0133777321341507	0.1373637711390829	CRHR1	26293	SPPL2C	86897	MAPT	136543	False	False	False	alt	75	0.00317	95	0.03955
1693	chr17	45759725	T	C	rs56168907	0.003806586956	0.5918568659489679	0.0053383374039999	0.5972527462288044	0.0180991241365298	0.0408723089722923	5.550179793850441e-05	0.4082131321700962	8.98319956310722e-05	0.4131137867069425	0.4256040000414941	0.2885030106417433	0.0016612111657637	0.4705361172311001	0.0022634633920693	0.4766440418428468	0.0076800404159646	0.0341278414448536	2.4414719636842728e-05	0.3300794080380373	3.789584327282598e-05	0.3353279742476721	0.0016556188342202	0.590560684703118	0.002634882104586	0.5951831704395981	CRHR1	24553	SPPL2C	85157	MAPT	134803	False	False	False	alt	-90	0.003212	90	0.1091
1694	chr17	45759871	A	G	rs55801356	-0.00865369374	0.4079113351785728	0.00865369374	0.3961177602386931	0.0073265612929195	0.7198825827584342	-6.50083527240404e-05	0.4739790811571378	6.50083527240404e-05	0.4623445303741547	0.4374111764644861	0.2644986694187858	-0.0037535367565368	0.3115310555939603	0.0037535367565368	0.2999641176133184	0.0032031971837661	0.3863067906638678	-2.822756583641618e-05	0.3556956718265036	2.822756583641618e-05	0.3441766508378064	-0.0040104150457991	0.4665495804798586	0.0040104150457991	0.4555227209396713	CRHR1	24407	SPPL2C	85011	MAPT	134657	False	False	False	ref	100	0.002083	35	0.07697
1695	chr17	45763315	C	T	rs62055890	-0.0402383582	0.0530932489936198	0.0402383582	0.0497651366260438	0.0087839695084598	0.4507850687623493	-0.0003551792454539	0.0775427837228925	0.0003551792454539	0.0734203912209494	0.5159223643398791	0.1500341515386139	-0.0208052833914592	0.0408482432959157	0.0208052833914592	0.0376893602421715	0.004537830493282	0.1814977967432908	-0.0001838521124021	0.0588228750276465	0.0001838521124021	0.054891266945684	-0.011637050176869	0.161421974915767	0.011637050176869	0.1564057405629841	CRHR1	20963	SPPL2C	81567	MAPT	131213	False	False	False	ref	100	0.005917	-35	0.02539
1696	chr17	45764205	T	A	rs56369036	-0.0103117611399999	0.3688174071787363	0.0103117611399999	0.3574395958621132	0.0082434682373313	0.5465461256937846	-8.833477303886084e-05	0.3995327076197235	8.833477303886084e-05	0.3885875481335317	0.241514953474621	0.5921884289076311	-0.0025479933177632	0.4163243152433598	0.0025479933177632	0.4034897748884928	0.0019860428393969	0.6100429477460393	-2.1865798523883137e-05	0.4313387022996376	2.1865798523883137e-05	0.418973314123127	-0.0090395128580171	0.2233121076744517	0.0090395128580171	0.2167990895346362	CRHR1	20073	SPPL2C	80677	MAPT	130323	False	False	False	ref	-90	0.04193	50	0.02515
1697	chr17	45765096	T	C	rs55707339	0.0964276521999999	0.0024021316651235	0.0964276521999999	0.0025318937549854	0.0196378618086237	0.0287874752569974	0.00193260154237	0.0040266541233435	0.00193260154237	0.0041965632504418	0.3582070353426902	0.4010179690423087	0.0345353450656856	0.0094862774880289	0.0345353450656856	0.0102751681538244	0.007022569282111	0.047774994344414	0.0006919625703282	0.0065682574335172	0.0006919625703282	0.0070035328743741	0.0719426550067946	0.0012121679986779	0.0719426550067946	0.0012364621138943	CRHR1	19182	SPPL2C	79786	MAPT	129432	False	True	True	alt	-60	0.00412	40	0.02438
1698	chr17	45766577	G	A	rs62055894	0.00191830438	0.7245339026600226	0.00269143694	0.7337626962644624	0.0072682898817741	0.6951554380859405	1.604043914031409e-05	0.7522019127006451	1.98257682488755e-05	0.7613591497724114	0.3494123383022645	0.4193424026621287	0.000650038155713	0.5930845626704822	0.0009330685558611	0.60267697872941	0.0025201229800634	0.5074853270412227	5.437340607307064e-06	0.6263958252800965	6.823083864406537e-06	0.6359113963010957	0.0013547858380273	0.6580336292511494	0.0018817622589445	0.666261557599229	CRHR1	17701	SPPL2C	78305	MAPT	127951	False	False	False	alt	100	0.00402	100	0.0257
1699	chr17	45766678	A	G	rs62055895	0.0501604368	0.0247990466016786	0.0501604368	0.0265412804685745	0.0098016337038729	0.3470658362539544	0.0005254214923679	0.0421952182023652	0.0005254214923679	0.044817362897008	0.3804645276403281	0.3691912070517699	0.0193272585537331	0.0419397416024757	0.0193272585537331	0.0457392172565435	0.0037687402025847	0.2795340956297251	0.0002041507150314	0.0511267450001869	0.0002041507150314	0.0550977518077808	0.0300127594684591	0.0252167461303602	0.0300127594684591	0.0258896858137315	CRHR1	17600	SPPL2C	78204	MAPT	127850	False	False	False	alt	0	0.0	40	0.1074
1700	chr17	45767194	T	G	rs55657917	-0.0067805718904	0.5301909547944061	0.0067805718904	0.5192993028787003	0.0100156077049576	0.317145128701729	-7.037139977438237e-05	0.5050849555306517	7.037139977438237e-05	0.4949826587446657	0.437595825682839	0.2741210107294678	-0.0029408408628517	0.4313644434420841	0.0029408408628517	0.4182874012044397	0.0043614689934878	0.2086398936138163	-3.0421824946990868e-05	0.4080426290749648	3.0421824946990868e-05	0.3955801970903013	-0.003182605628689	0.5625576985927422	0.003182605628689	0.5526057588509831	CRHR1	17084	SPPL2C	77688	MAPT	127334	False	False	False	ref	-45	0.00879	100	0.04886
1701	chr17	45767493	A	G	rs56109643	0.0110724408	0.3185993401227475	0.0110724408	0.3298144336084984	0.0098382178214776	0.3189909537734175	0.0001129311078604	0.2983020051491822	0.0001129311078604	0.3084529951013109	0.4637413251174804	0.2304694602681795	0.0050303407979663	0.2335297496286172	0.0050303407979663	0.2444782485300239	0.0045428361087273	0.1851405509677627	5.117915583383772e-05	0.2189909713932604	5.117915583383772e-05	0.2289852840466814	0.004902540482785	0.3879625010191359	0.004902540482785	0.3980493897117584	CRHR1	16785	SPPL2C	77389	MAPT	127035	False	False	False	alt	5	0.0001488	0	0.0
1702	chr17	45771384	T	C	rs62055935	0.021450061	0.150141911629177	0.021450061	0.1582316310815285	0.0084136760464761	0.5230445185663611	0.0001846095461658	0.1732306374986635	0.0001846095461658	0.1811018519332337	0.5916077967613772	0.0560217957793419	0.0126622358614647	0.0827045150142299	0.0126622358614647	0.0891275140613463	0.0049612847659842	0.1465420483447456	0.000108643571751	0.1017391883761011	0.000108643571751	0.1083121755780924	0.003240697517609	0.5037225027018357	0.003240697517609	0.5154453509560215	CRHR1	12894	SPPL2C	73498	MAPT	123144	False	False	False	alt	-100	0.01394	-90	0.02881
1703	chr17	45775255	T	C	rs62055948	0.0646837993999999	0.0114173050805057	0.0646837993999999	0.012142515214834	0.0129282618221264	0.1456914385697383	0.0008863503576854	0.0170413225399858	0.0008863503576854	0.0180660772059728	0.5164472660504777	0.138346124600433	0.0336908574697606	0.0106557231547641	0.0336908574697606	0.0116181451379405	0.006746542513648	0.059019714984908	0.0004669251784797	0.0147275463692936	0.0004669251784797	0.0158642541307228	0.0194068403199203	0.077929280057118	0.0194068403199203	0.0801791301094654	CRHR1	9023	SPPL2C	69627	MAPT	119273	False	True	False	alt	-95	0.00383	35	0.05017
1704	chr17	45775743	G	A	rs55787105	0.00241996082	0.581280745938256	0.0048633011	0.584469269605787	0.010741873106676	0.2448429065032603	2.876368369387273e-05	0.520856979964418	5.24316543317884e-05	0.5244345454589634	0.4306932644529507	0.2601474300497275	0.0009236383278887	0.4343924666267973	0.0020830582369971	0.437690326713956	0.0045263783234274	0.1876384665017506	1.0719516621035633e-05	0.3947133786979321	2.1843528192698368e-05	0.3980355513516718	0.0012717974252844	0.6306925323871675	0.0022344630131017	0.63441651474171	CRHR1	8535	SPPL2C	69139	MAPT	118785	False	False	False	alt	60	0.001308	-100	0.04886
1705	chr17	45775767	T	C	rs62055950	0.00186100536	0.4407798719062703	0.0073697921599999	0.4442128583785755	0.0111747233710153	0.2112213626989693	2.434890670786353e-05	0.3796094344676994	8.357983391992939e-05	0.3826927217855447	0.4231828130997209	0.2708967451687992	0.0009350895656674	0.3371543917603977	0.0030812659715344	0.3407952013378504	0.0046884082012204	0.1635745540999093	1.1949463599783524e-05	0.290130736956384	3.468502077661309e-05	0.2937166781249453	0.000852705940933	0.4747515604857505	0.0038112428552162	0.4774861644381427	CRHR1	8511	SPPL2C	69115	MAPT	118761	False	False	False	alt	0	0.0	85	0.04904
1706	chr17	45780960	C	T	rs62057067	0.0026031202792	0.7390198282017931	0.0026031202792	0.752687456560758	0.0248187982813167	0.0099674772970425	6.76708627816995e-05	0.4630001836215116	6.76708627816995e-05	0.4746739293553913	0.30450315874646	0.4904130648330409	0.0007607254796648	0.6502745551919744	0.0007607254796648	0.6639463613209298	0.0075197947395275	0.0360407716842234	1.969070915284048e-05	0.4386342137363914	1.969070915284048e-05	0.4510695620961005	0.0020622620566602	0.6469458607961996	0.0020622620566602	0.6598123548493522	CRHR1	3318	SPPL2C	63922	MAPT	113568	False	True	True	alt	-70	0.0226	90	0.1168
1707	chr17	45815893	G	A	rs117365970	-0.0674254698	0.0105657130706501	0.0674254698	0.0099556027149241	0.0179371356721899	0.0433502805805887	-0.0012766024934394	0.0094257568441621	0.0012766024934394	0.0089881440459615	0.5097293540389423	0.1571893177054988	-0.0342466969878625	0.0113367087334063	0.0342466969878625	0.01050775943702	0.0090907659223043	0.0194434413771296	-0.0006444884205187	0.0090319281283258	0.0006444884205187	0.0084743528587044	-0.0217969066069149	0.065139173066996	0.0217969066069149	0.0633972750763757	SPPL2C	28989	CRHR1	31615	MAPT	78635	False	True	True	ref	85	0.001348	35	0.05737
1708	chr17	45815894	T	C	rs117646503	0.0257785674	0.0766951744897221	0.0305708262	0.0801747971931225	0.0185825612109707	0.0369852355537019	0.0004172770313237	0.0397702980508701	0.0005293972546811	0.0413050823011435	0.516949345947572	0.1458590859380115	0.0137313898714816	0.0575905572259424	0.0161099955731719	0.0609315695142133	0.0095949752735738	0.0161936867807173	0.0002230332907325	0.03154386550629	0.0002786834149764	0.032973868178038	0.006332015892281	0.2325061969036941	0.0078880486312098	0.2373615149861127	SPPL2C	28988	CRHR1	31616	MAPT	78634	False	False	False	alt	100	0.001757	35	0.0646
1709	chr17	45816793	C	T	rs28364023	-0.057290176	0.016986813016092	0.057290176	0.015896064931894	0.0106640421299164	0.25261985106569	-0.0006351667164226	0.0312344706992199	0.0006351667164226	0.0294097780285856	0.4985383665805661	0.1752755782876986	-0.028680852411187	0.0180462553096184	0.028680852411187	0.0166140812016659	0.0053261769529709	0.1190812347497731	-0.0003182905027271	0.0280827945520837	0.0003182905027271	0.0261223282952787	-0.0190188694903473	0.0801391551767074	0.0190188694903473	0.0778896563084548	SPPL2C	28089	CRHR1	32515	MAPT	77735	False	True	False	ref	95	0.001823	-10	0.00538
1710	chr17	45817243	A	G	rs56099546	0.0622516781999999	0.0122706235191477	0.0622516781999999	0.0130804501966583	0.0132153021227194	0.1245097165929755	0.0008737384477552	0.0168996177741454	0.0008737384477552	0.0178505686644076	0.4852747435139369	0.195015579161001	0.0301451104055122	0.0140565969238429	0.0301451104055122	0.0153931607679471	0.0064298041649768	0.0680819309651004	0.0004251283805476	0.0164399543400377	0.0004251283805476	0.0176502874545822	0.0243239037749353	0.0502890746586932	0.0243239037749353	0.0517002888779685	SPPL2C	27639	CRHR1	32965	MAPT	77285	False	True	False	alt	-100	0.002232	-15	0.00757
1711	chr17	45818287	A	G	rs4277389	0.0328956175999999	0.0721579138183385	0.0328956175999999	0.0770082346102253	0.0100104938714733	0.3007853870199205	0.0003251828575727	0.0786498029642644	0.0003251828575727	0.0833356779278496	0.4991192854697662	0.1661143458738645	0.0166469699138048	0.0527568195248345	0.0166469699138048	0.0572728875785758	0.0049854345998733	0.1406321372667625	0.0001642715330487	0.0591802156655576	0.0001642715330487	0.0636273068220239	0.0102034253467359	0.1799117712268751	0.0102034253467359	0.1858464321306223	SPPL2C	26595	CRHR1	34009	MAPT	76241	False	False	False	alt	-80	0.014366	-80	0.07684
1712	chr17	45818431	T	C	rs4309444	0.004308478254	0.5936441457618103	0.004441745786	0.6030921747340997	0.0063756784394442	0.8958190108034503	2.8698257006383483e-05	0.6750494078595456	2.9536826799405365e-05	0.68379090943936	0.4711812363198788	0.2072995513384549	0.0020048489507619	0.4474801160334959	0.0020741764364547	0.45774382920009	0.0029900367603388	0.4201305914106304	1.3259875922695918e-05	0.5164578716580892	1.3696110717459988e-05	0.5258868106850884	0.0017842508739716	0.6836550080674155	0.0018049979771573	0.6925364467261322	SPPL2C	26451	CRHR1	34153	MAPT	76097	False	False	False	alt	-45	0.002193	-70	0.05225
1713	chr17	45822245	C	T	rs78917479	0.00441958482	0.608458210486012	0.00441958482	0.6215458466508594	0.0219404554833818	0.0175610194130474	9.155682233285002e-05	0.3507680539610576	9.155682233285002e-05	0.3615465486031403	0.3966991358831523	0.3414245606608485	0.0017535226565489	0.4700503540753686	0.0017535226565489	0.4835955621448932	0.0086962343495408	0.021552530082843	3.6328669456967416e-05	0.2799638756025752	3.6328669456967416e-05	0.2910316196912929	0.0024211869417732	0.5948800398215932	0.0024211869417732	0.6071925207945377	SPPL2C	22637	CRHR1	37967	MAPT	72283	False	True	False	alt	-15	0.000801	95	0.124
1714	chr17	45824850	C	T	rs4335809	-0.0640860948	0.0116306699099777	0.0640860948	0.0109460168531773	0.0141394500232252	0.0982698126412957	-0.000926052808314	0.0148712633280821	0.000926052808314	0.0141147224178579	0.561522422431768	0.086490976812819	-0.0359856206480509	0.0091719960628344	0.0359856206480509	0.008445748985784	0.0079699596609592	0.031909721542686	-0.0005216993797988	0.0118105215074531	0.0005216993797988	0.0111007408082466	-0.0139648751543065	0.1356081630351145	0.0139648751543065	0.1316278646357966	SPPL2C	20032	CRHR1	40572	MAPT	69678	False	True	False	ref	100	0.01167	95	0.1256
1715	chr17	45825156	G	A	rs4523962	-0.0563945972	0.0182363101370024	0.0563945972	0.0170917167016947	0.0097620288048906	0.3241759890494389	-0.0005537830163647	0.035011230579031	0.0005537830163647	0.0329385470695369	0.5747072065062915	0.0719992319815142	-0.032505826688855	0.0123998994957929	0.032505826688855	0.0114294612876399	0.0056327818230913	0.0979383302533991	-0.0003206130322287	0.0249239148508995	0.0003206130322287	0.0231736786560223	-0.0107718959740245	0.1811533430600044	0.0107718959740245	0.175413737930082	SPPL2C	19726	CRHR1	40878	MAPT	69372	False	True	False	ref	-100	0.005512	-100	0.0773
1716	chr17	45825372	C	A	rs3885074	-0.0231151642	0.156906344226113	0.0231151642	0.149293141011364	0.0127289716644753	0.1380242679509201	-0.000301351166242	0.1041161924665625	0.000301351166242	0.0988677703658607	0.5746947582443801	0.0718158026282467	-0.0132043220973292	0.0919948930702198	0.0132043220973292	0.0856953628867011	0.0072971435815367	0.0404113247249681	-0.0001718879718179	0.0666462692742026	0.0001718879718179	0.0623050155883326	-0.0044751501571592	0.4304805011729568	0.0044751501571592	0.419890891859741	SPPL2C	19510	CRHR1	41094	MAPT	69156	False	False	False	ref	-100	0.002964	-100	0.036
1717	chr17	45825932	G	A	rs62057147	-0.0306550284	0.0913160174176494	0.0306550284	0.0861047597491727	0.0083824081362023	0.5271086075136571	-0.0002593350494583	0.1263735899786825	0.0002593350494583	0.1202330987203422	0.5517567609622507	0.0988892896948374	-0.0171116507443591	0.0585749266136921	0.0171116507443591	0.0543986109803435	0.0046305231585511	0.1778395432849513	-0.0001449507488447	0.08356654218264	0.0001449507488447	0.0783968667727402	-0.0063652112573781	0.3057917024803728	0.0063652112573781	0.2972377348131367	SPPL2C	18950	CRHR1	41654	MAPT	68596	False	False	False	ref	-40	0.00154	-5	0.00357
1718	chr17	45825970	G	A	rs17763050	-0.037508041	0.0656742257908789	0.037508041	0.0615714995333399	0.0099069473481485	0.3156505520274411	-0.0003783496886142	0.0712808368604525	0.0003783496886142	0.0672756065388417	0.550350107366259	0.1008434980197286	-0.0206215640759518	0.0423879554212889	0.0206215640759518	0.0390061221580263	0.0054480635912916	0.1092723846408067	-0.000207828364086	0.0501261768723338	0.000207828364086	0.0466753628651216	-0.0087220821792757	0.2364842465613611	0.0087220821792757	0.2294067071913305	SPPL2C	18912	CRHR1	41692	MAPT	68558	False	False	False	ref	-80	0.0008383	-40	0.05096
1719	chr17	45826182	C	T	rs62057150	0.0407608492	0.0424171725855387	0.0407608492	0.0453830299870578	0.0178480843497213	0.042887532168074	0.0007917469570506	0.0225639569868972	0.0007917469570506	0.0236774433087982	0.5520513698274879	0.0989279810524213	0.022677144641685	0.0284207404577839	0.022677144641685	0.0308635440295486	0.0099381116881243	0.0175289419801189	0.0004434409182148	0.016994553891007	0.0004434409182148	0.0180702409270239	0.0088818348738057	0.2142077299851942	0.0088818348738057	0.2209394864991057	SPPL2C	18700	CRHR1	41904	MAPT	68346	False	False	False	alt	100	0.003056	-100	0.04416
1720	chr17	45826476	C	T	rs62057151	-0.0423830751999999	0.0469481359814587	0.0423830751999999	0.0438526692678104	0.0103798540661879	0.271516828297052	-0.0004472278179731	0.053830733269075	0.0004472278179731	0.0506593478394376	0.5356238135250365	0.1201074206271219	-0.0226949828913528	0.0335907380278095	0.0226949828913528	0.0309340293633569	0.0055434616012742	0.1041174875899599	-0.0002386981422799	0.0408393744250533	0.0002386981422799	0.0379429707699719	-0.010987665847156	0.1824366941027943	0.010987665847156	0.1767748488339169	SPPL2C	18406	CRHR1	42198	MAPT	68052	False	False	False	ref	-95	0.001889	100	0.0776
1721	chr17	45827162	T	C	rs62057153	0.0331930232	0.072771016061222	0.0331930232	0.0779028818366447	0.0067308758966341	0.8266978718480598	0.0002244350768595	0.135005863166605	0.0002244350768595	0.142006017127375	0.5530700525939066	0.0980173906311621	0.0184551908671575	0.0438625774251502	0.0184551908671575	0.0478143056312221	0.0037243376118102	0.2924492299058907	0.0001248468148688	0.0840048232221366	0.0001248468148688	0.0900387591692878	0.0072884573491426	0.2545739560499475	0.0072884573491426	0.2626660611643779	SPPL2C	17720	CRHR1	42884	MAPT	67366	False	False	False	alt	-80	0.01695	35	0.03857
1722	chr17	45827307	C	T	rs62057155	0.00545916862	0.5393397489470874	0.00545916862	0.5521974595026233	0.0084437145607437	0.5243783709115968	4.500211520970223e-05	0.5565743432853365	4.500211520970223e-05	0.5690257185824882	0.5444869760059752	0.1094948124416721	0.0029905971005461	0.3468780722558918	0.0029905971005461	0.3593435263728319	0.0045834315482064	0.1848774785236077	2.4583770603034585e-05	0.3636432065597071	2.4583770603034585e-05	0.3755514210285049	0.0013049927903815	0.7453661509784922	0.0013049927903815	0.7588685994842816	SPPL2C	17575	CRHR1	43029	MAPT	67221	False	False	False	alt	45	0.001505	-100	0.10974
1723	chr17	45834077	T	C	rs1876829	-0.0027725494999999	0.5117386853934266	0.0061968275	0.5084815450664671	0.00715832716393	0.765965308898673	-1.8487253545729856e-05	0.5757530628446728	4.32110865180471e-05	0.5727587013921316	0.5425097770723762	0.1067435828534329	-0.0015730829608297	0.3305410871090118	0.0034218370764179	0.3276410270288409	0.0038672661084325	0.2734858035212086	-1.04927191684391e-05	0.3793146478525769	2.3781082339605733e-05	0.376400536255662	-0.0005166028693243	0.748403015386036	0.0013796823618501	0.7451703587924926	SPPL2C	10805	CRHR1	49799	MAPT	60451	False	False	False	ref	100	0.002808	30	0.02658
1724	chr17	45835216	C	T	rs878887	-0.0456007154	0.0372750036037494	0.0456007154	0.0349013061010898	0.0107333838712456	0.2507685264291003	-0.000493225774049	0.0463299263245587	0.000493225774049	0.0436869825076799	0.4802083009159846	0.1938597440746824	-0.0221055745706266	0.0354592175980442	0.0221055745706266	0.0326384305465466	0.0051567241228908	0.1306477188954433	-0.0002389739697988	0.041788167736151	0.0002389739697988	0.0389391279524009	-0.0169690556955984	0.1005867537870221	0.0169690556955984	0.0977663153087132	SPPL2C	9666	CRHR1	50938	MAPT	59312	False	False	False	ref	25	0.000881	-90	0.02368
1725	chr17	45836191	T	G	rs75104593	-0.0598732962	0.0146863284618696	0.0598732962	0.0138171353597136	0.0222035777869268	0.0166599754805529	-0.0013478018834547	0.0073999507239988	0.0013478018834547	0.0071137557967646	0.4880092117138144	0.1885007572013586	-0.0292511297141051	0.0171578795569792	0.0292511297141051	0.015802356823915	0.010856747192337	0.0104795512450409	-0.0006599747046678	0.0076921037451334	0.0006599747046678	0.0073012755454355	-0.022276164690505	0.0616113479111859	0.022276164690505	0.0599958582096995	SPPL2C	8691	CRHR1	51913	MAPT	58337	False	True	False	ref	-95	0.001469	80	0.0606
1726	chr17	45836192	T	G	rs74998289	-0.0646069326	0.0109085078288966	0.0646069326	0.01029682956959	0.0215485813557436	0.0189079794547496	-0.0014137289423714	0.0068103611798786	0.0014137289423714	0.0065410572351069	0.4880216599757259	0.188493667426119	-0.0314863878510211	0.0137431766635018	0.0314863878510211	0.0126459981348037	0.0105340666849878	0.011723943677513	-0.0006907210845944	0.0070750035242076	0.0006907210845944	0.0067328767088981	-0.0244151910289525	0.0508522731436805	0.0244151910289525	0.0495550936469684	SPPL2C	8690	CRHR1	51914	MAPT	58336	False	True	False	ref	-100	0.002485	80	0.0645
1727	chr17	45837443	C	T	rs62054804	-0.0668925204	0.0096645221495904	0.0668925204	0.009148104421336	0.0116684666982577	0.1815797047828784	-0.0007882641146614	0.0181836952291737	0.0007882641146614	0.0172598436414651	0.5570576458262015	0.0927161279304551	-0.0373377254587732	0.0079345419096954	0.0373377254587732	0.0073714466689553	0.0065116661797469	0.060184608910322	-0.0004408331968724	0.0145752559570233	0.0004408331968724	0.0136565406107974	-0.0146847996348508	0.1188995297642522	0.0146847996348508	0.1154111300667281	SPPL2C	7439	CRHR1	53165	MAPT	57085	False	True	True	ref	-85	0.001947	-70	0.0484
1728	chr17	45841158	A	G	rs74922289	-0.00826935348	0.4779456784051106	0.00826935348	0.4650723400930527	0.0206751819144155	0.022964302077796	-0.0001822444328099	0.2421742505520627	0.0001822444328099	0.2332616721446428	0.2956254732932913	0.500467688513435	-0.0024041180350249	0.4509945535850452	0.0024041180350249	0.4379031099247282	0.0060203687389415	0.0789326225821655	-5.205518592650981e-05	0.269823259939035	5.205518592650981e-05	0.259186914747959	-0.0064606479320324	0.3682409622176078	0.0064606479320324	0.3591423937184608	SPPL2C	3724	MAPT	53370	CRHR1	56880	False	False	False	ref	-100	0.009384	95	0.10754
1729	chr17	45841247	T	C	rs56971664	0.0845197464	0.0041123260610853	0.0845197464	0.0043473834815102	0.0168803452547649	0.0550006744687446	0.0015515472683115	0.0072869764172958	0.0015515472683115	0.0076220820085884	0.362810817539601	0.3946357892760501	0.0314044430202553	0.0131108281896731	0.0314044430202553	0.0142033114938951	0.0062546430024068	0.0788186872386997	0.0005860320227764	0.0114539946489699	0.0005860320227764	0.0122174590739794	0.0588948018132967	0.00241674686065	0.0588948018132967	0.0024887903149627	SPPL2C	3635	MAPT	53281	CRHR1	56969	False	True	True	alt	-80	0.001324	95	0.03009
1730	chr17	45843844	G	T	rs17763596	0.0118349014	0.293969139788552	0.0118349014	0.3047977956828224	0.0130714672731474	0.1313563959614216	0.0001572787569066	0.2094050983157714	0.0001572787569066	0.2181483829192096	0.2363489247813773	0.5896541847044104	0.0029122876137615	0.3521126918262223	0.0029122876137615	0.3648240712335406	0.0030837360813487	0.3706153370731863	3.875914416325609e-05	0.2726631811678314	3.875914416325609e-05	0.2834983034966798	0.0098527993028972	0.1867778511378356	0.0098527993028972	0.1928425940974907	SPPL2C	1038	MAPT	50684	CRHR1	59566	False	False	False	alt	50	0.001564	-20	0.01424
1731	chr17	45845900	G	A	rs62054815	-0.0668214232	0.0099202028815535	0.0668214232	0.0093962411591752	0.0142658839041969	0.0962252186994288	-0.0009834187211875	0.0134288111639947	0.0009834187211875	0.012756532899967	0.5266776626313552	0.1300122468540505	-0.0351362015576718	0.0099318503530047	0.0351362015576718	0.0091926390278253	0.0075008900953238	0.0386333873482017	-0.0005164248759804	0.011996601505037	0.0005164248759804	0.0112938183824826	-0.0194213632921502	0.0825366504610438	0.0194213632921502	0.0802625960347096	SPPL2C	1018	MAPT	48628	CRHR1	61622	False	True	True	ref	80	0.002373	10	0.00421
1732	chr17	45846568	T	C	rs11079725	0.0339173208	0.0696473322214965	0.0339173208	0.0745049085168533	0.0102297605006778	0.2878540397377596	0.0003518345844351	0.0716089610070667	0.0003518345844351	0.0761215760985657	0.4898245832425648	0.1840381818426591	0.0166991767853364	0.0529855589635233	0.0166991767853364	0.057591804063391	0.0050069678191438	0.1424594534475714	0.0001730793612184	0.0564630471104237	0.0001730793612184	0.060793594490365	0.0116142283633647	0.1602076536712547	0.0116142283633647	0.1654783881108461	SPPL2C	1686	MAPT	47960	CRHR1	62290	False	False	False	alt	100	0.00326	25	0.0421
1733	chr17	45847410	C	T	rs55943825	0.0134578497	0.2872766227411827	0.0134578497	0.2984062763455611	0.007838897968687	0.628882629518678	0.0001043519508004	0.3389969030400283	0.0001043519508004	0.3496877990377162	0.4807415014678575	0.2050164995052704	0.0064404369427864	0.2009524184748373	0.0064404369427864	0.2116286920770602	0.0037602573863192	0.2951246753808473	4.981612147646902e-05	0.2364134394555838	4.981612147646902e-05	0.2468145930627223	0.0050000518677579	0.3827798393592558	0.0050000518677579	0.392970448289883	SPPL2C	2528	MAPT	47118	CRHR1	63132	False	False	False	alt	50	0.000977	-50	0.03262
1734	chr17	45848600	G	A	rs62054817	-0.0227819626	0.0819224834499948	0.0323714654	0.0793286222151204	0.0121433003196331	0.1621822183533796	-0.0002470306039662	0.0696008518329289	0.000372328609913	0.0675993713883204	0.5747694478158486	0.0726823230830233	-0.0130861810931614	0.0484989060599786	0.0187167897775567	0.0464076618838747	0.0069732271822069	0.0483291197366954	-0.0001416161859781	0.0457446457716178	0.0002151866351799	0.0439236197389511	-0.0044295065301506	0.335099825531139	0.0059398956420708	0.329569712284354	SPPL2C	3718	MAPT	45928	CRHR1	64322	False	False	False	ref	-35	0.001379	-95	0.09686
1735	chr17	45852626	C	T	rs62054824	0.0073011875399999	0.4359630995682322	0.0073011875399999	0.448799953521852	0.0078780022407464	0.6133418915466148	5.660350977699475e-05	0.4751368039945264	5.660350977699475e-05	0.4871925541239273	0.5666843017043746	0.0808844167893235	0.00418022946159	0.280797906051566	0.00418022946159	0.2928432964983511	0.004468810096707	0.1946439426245105	3.2422515130306896e-05	0.3079387682857455	3.2422515130306896e-05	0.3196780961160777	0.001302918080063	0.7374458206962943	0.001302918080063	0.7510081288711836	SPPL2C	7744	MAPT	41902	CRHR1	68348	False	False	False	alt	95	0.006073	90	0.0871
1736	chr17	45852667	G	A	rs62054825	-0.14270828	0.0005343690427701	0.14270828	0.0005045340237069	0.0357565392861174	0.0024168254844502	-0.0052697223682061	0.0009049463053184	0.0052697223682061	0.000853018164691	0.5694810112138093	0.0777200919532941	-0.0815804908079697	0.000508706986064	0.0815804908079697	0.0004818070162752	0.0204368348948884	0.0013921519191228	-0.0030213507338436	0.0007779678193211	0.0030213507338436	0.0007325385965221	-0.0295542484880547	0.0279736750684532	0.0295542484880547	0.0272318687253271	SPPL2C	7785	MAPT	41861	CRHR1	68389	False	True	True	ref	95	0.1338	100	0.3213
1737	chr17	45853878	G	C	rs56026128	0.0338469232	0.0684691916501692	0.0338469232	0.0732404078242117	0.0093460136631019	0.3729985797302433	0.0003250001739969	0.0837511438812382	0.0003250001739969	0.0887492517441734	0.4536125893422131	0.2493721129682625	0.0154602712070225	0.0605362282900789	0.0154602712070225	0.0655855532947575	0.0042506381415721	0.2187043842925056	0.0001488822724783	0.0707047513780636	0.0001488822724783	0.0758481878292509	0.0138756626106079	0.1162614949442946	0.0138756626106079	0.1199225064294402	SPPL2C	8996	MAPT	40650	CRHR1	69600	False	False	False	alt	80	0.003382	100	0.05115
1738	chr17	45853879	G	A	rs56329743	-0.00419748938	0.6436514841529535	0.00419748938	0.6304224055692099	0.0074056943793018	0.7041846049873014	-3.085239629366819e-05	0.6887232923870317	3.085239629366819e-05	0.6755667093955595	0.4396912831045965	0.2724241590968962	-0.0018566409905464	0.4772499484946674	0.0018566409905464	0.4637191586468841	0.0032487506325648	0.3828753820107722	-1.3627481293434272e-05	0.5183175370811779	1.3627481293434272e-05	0.5053475312663338	-0.0018900611002188	0.6836320141984598	0.0018900611002188	0.6707588621557931	SPPL2C	8997	MAPT	40649	CRHR1	69601	False	False	False	ref	80	0.003445	100	0.04166
1739	chr17	45859967	T	G	rs62054844	0.0061122537479999	0.5191491570958683	0.006273527212	0.5282686307988094	0.0071105120567023	0.7641145718949942	4.30866794653207e-05	0.5844523077480777	4.431233285534762e-05	0.5928393363542621	0.3130530399692942	0.473130497742845	0.001893213177458	0.4804030125531141	0.0019456292696827	0.4898154297490176	0.0022144778292531	0.5589672467514365	1.327375888486626e-05	0.527669620253682	1.3672113083176756e-05	0.5366008416041219	0.0047075177128393	0.4152662015702504	0.004815402649405	0.422833504252709	SPPL2C	15085	MAPT	34561	CRHR1	75689	False	False	False	alt	-90	0.00193	100	0.0971
1740	chr17	45860094	G	A	rs76627340	-0.0313839322	0.0908464547381133	0.0313839322	0.0857047914195855	0.0083949498549687	0.5072151169289676	-0.0002904043606603	0.1233159303690475	0.0002904043606603	0.1174782075105971	0.2957416570711314	0.5004418866315945	-0.0095089520087599	0.1400071873461062	0.0095089520087599	0.131848285151078	0.002572052753511	0.4498901018486437	-9.213449280831096e-05	0.1564447784471608	9.213449280831096e-05	0.1488023547020978	-0.0241683005010424	0.0433138248240887	0.0241683005010424	0.04223933060322	SPPL2C	15212	MAPT	34434	CRHR1	75816	False	False	False	ref	100	0.0003567	95	0.03014
1741	chr17	45861268	A	G	rs62054846	0.0043941513599999	0.3911505666914078	0.01004974144	0.3918813641489269	0.0094856454399742	0.3696602573434763	5.571515602960361e-05	0.3702264424801552	0.0001067487319692	0.3707786179689312	0.4608367306714799	0.2372374225203826	0.0018990561202808	0.290421540129305	0.0045630540379871	0.2907188681677303	0.0043645895475558	0.2073679258860138	2.429001630816673e-05	0.2760423901269596	4.833788337164499e-05	0.276255704893241	0.0022904801917032	0.4757345558255799	0.0043070986213549	0.4751096262289176	SPPL2C	16386	MAPT	33260	CRHR1	76990	False	False	False	alt	-30	0.000922	-30	0.07465
1742	chr17	45862243	A	T	rs56227067	0.0372451079999999	0.0567796150654593	0.0372451079999999	0.0608457517109999	0.0132730632841973	0.1247938421248785	0.0005175651669168	0.0405421321230151	0.0005175651669168	0.0432013400802439	0.614161972634571	0.0369825457009907	0.0228897117070613	0.0278967908298541	0.0228897117070613	0.0305396042960073	0.0081445305997112	0.0297434365625134	0.0003177533944437	0.0243770744168464	0.0003177533944437	0.0263110214460819	0.0041929895538335	0.4180402051648356	0.0041929895538335	0.4286676283702831	SPPL2C	17361	MAPT	32285	CRHR1	77965	False	False	False	alt	-95	0.005554	-65	0.05542
1743	chr17	45862272	G	A	rs55719714	-0.0807579952	0.0046892098758944	0.0807579952	0.0044783129642826	0.0166590076750732	0.0533582723571433	-0.0013495905862962	0.0070712437272922	0.0013495905862962	0.0067905582435431	0.6082718700401457	0.0410963400988128	-0.0490827149090367	0.0030755076948041	0.0490827149090367	0.0028897985554963	0.0101159588120037	0.0122897667025818	-0.0008188615028433	0.0051362404334848	0.0008188615028433	0.0048880545376625	-0.0103071608626645	0.1787619961369667	0.0103071608626645	0.1734432112346747	SPPL2C	17390	MAPT	32256	CRHR1	77994	False	True	True	ref	-90	0.01172	-90	0.0901
1744	chr17	45863319	G	A	rs62054859	-0.0065910938999999	0.4896587988196249	0.0065910938999999	0.4766501398186602	0.0073126980428608	0.7328168518373981	-4.677845535864686e-05	0.5519269607956198	4.677845535864686e-05	0.5394266259050342	0.2015103891119202	0.6550368203522188	-0.0013762383544392	0.546683337845786	0.0013762383544392	0.5325505192771481	0.0014705161354687	0.7054411154348542	-9.792846705881366e-06	0.5859678167200001	9.792846705881366e-06	0.5721680765693551	-0.006332015892281	0.3212437533442503	0.006332015892281	0.3128472693050705	SPPL2C	18437	MAPT	31209	CRHR1	79041	False	False	False	ref	95	0.00335	25	0.03323
1745	chr17	45866289	A	C	rs62055469	0.00375147578	0.6141977493415868	0.00396081662	0.623733059328935	0.0129226494435756	0.1351699513421491	5.269737555125364e-05	0.4985932607278814	5.486106101304886e-05	0.5076050950176678	0.368895942903972	0.3867158278343778	0.0014316102364372	0.50587548482171	0.0015067934803697	0.5158334951362552	0.0047844492874335	0.1641259206185556	2.009485022538548e-05	0.417327311253207	2.0871922128338955e-05	0.4267002399687944	0.0023091525845703	0.5953403136418376	0.0024294857830474	0.6035213768304052	SPPL2C	21407	MAPT	28239	CRHR1	82011	False	False	False	alt	75	0.001955	-75	0.01437
1746	chr17	45866591	G	C	rs56327054	0.0413527501999999	0.0460196132761241	0.0413527501999999	0.0491894541217679	0.0088005097685035	0.4601265523033419	0.0003798482955006	0.0697493350594659	0.0003798482955006	0.0739014851952432	0.3625763752736024	0.3997779555628884	0.0150126040598762	0.0667957469727596	0.0150126040598762	0.0724227560060902	0.0032037975294886	0.3892717495995779	0.000138430024167	0.0818334895166885	0.000138430024167	0.0877083974857061	0.0280334858245417	0.034959584738042	0.0280334858245417	0.0359064763002836	SPPL2C	21709	MAPT	27937	CRHR1	82313	False	False	False	alt	60	0.011826	-35	0.012054
1747	chr17	45867740	T	C	rs62055475	0.049607467	0.0244917757483857	0.049607467	0.0262339916925634	0.0148682311481472	0.0845914167211033	0.0008020772352216	0.0220647927228527	0.0008020772352216	0.0232529898834536	0.5926949449683088	0.0520812397989914	0.0292395052129477	0.0147141096051841	0.0292395052129477	0.0161213475737996	0.0087907818426601	0.0243434552030011	0.0004719247399839	0.0146998280879448	0.0004719247399839	0.0157460346008519	0.0073569227896554	0.251167381791347	0.0073569227896554	0.2581926367494768	SPPL2C	22858	MAPT	26788	CRHR1	83462	False	False	False	alt	-35	0.00659	-35	0.105
1748	chr17	45870562	A	G	rs56289364	-0.01176308838	0.3475818228631309	0.01176308838	0.3359430788387943	0.0096127858043012	0.3563188518458797	-0.0001356189562815	0.3194802372550562	0.0001356189562815	0.3091565242584334	0.5060861627195303	0.1642550761132384	-0.0060927248312832	0.2400895877943613	0.0060927248312832	0.2291269759353577	0.0049208367643189	0.1542342513380984	-7.073304062284526e-05	0.225592583802016	7.073304062284526e-05	0.2159366730776637	-0.0031784562080518	0.5379828436315179	0.0031784562080518	0.5263269854441435	MAPT	23966	SPPL2C	25680	CRHR1	86284	False	False	False	ref	-100	0.003063	60	0.05273
1749	chr17	45873854	T	G	rs34416056	0.0200179894	0.1653930348779529	0.0200179894	0.1739729284223107	0.0100638349157732	0.2947084388463332	0.0001995665404015	0.1529784279891677	0.0001995665404015	0.1603417653245079	0.2911814437909106	0.5049149054396616	0.0058719683053369	0.1981957416551546	0.0058719683053369	0.2084940203431953	0.0029068364304804	0.4257772814005546	5.8209443394120896e-05	0.1830187015289044	5.8209443394120896e-05	0.1924993853244117	0.0158072179171982	0.0993325132011581	0.0158072179171982	0.1023422117511198	MAPT	20674	SPPL2C	28972	CRHR1	89576	False	False	False	alt	-100	0.003199	40	0.01953
1750	chr17	45876163	A	G	rs62055497	0.0375001941999999	0.05691775421906	0.0375001941999999	0.0610403904011205	0.0082945037502581	0.5224616164233774	0.0003158972732648	0.0845917573287719	0.0003158972732648	0.0896454981389729	0.1573543294017572	0.7208210233517892	0.0057853519107704	0.2045920069173182	0.0057853519107704	0.2151555095496653	0.0012838928605396	0.7322152975526905	4.79360355798167e-05	0.2224522782618136	4.79360355798167e-05	0.2326860842968455	0.0342762891731241	0.0166298603146094	0.0342762891731241	0.0170964458855793	MAPT	18365	SPPL2C	31281	CRHR1	91885	False	False	False	alt	-10	0.001236	-90	0.03717
1751	chr17	45877999	C	A	rs55905252	-0.00697302854	0.488716715022012	0.00697302854	0.4762941084158567	0.008107220538431	0.5694730149858912	-5.923889015714511e-05	0.5205547384333249	5.923889015714511e-05	0.508416064483895	0.4388240541914334	0.2751720601491246	-0.0030650562141674	0.3656391356165313	0.0030650562141674	0.3534320033539134	0.0035502490028008	0.3247633466557157	-2.592864863208139e-05	0.387832594094756	2.592864863208139e-05	0.3759539218863516	-0.0032240998350604	0.5421082090605955	0.0032240998350604	0.5301158180424917	MAPT	16529	SPPL2C	33117	CRHR1	93721	False	False	False	ref	100	0.0068	100	0.10394
1752	chr17	45879368	C	A	rs55768605	0.00275320638	0.7319387903347485	0.00275320638	0.7453951756039833	0.0231194794869282	0.0139965302664197	6.484623084619788e-05	0.4536217514425547	6.484623084619788e-05	0.465417027298095	0.0382618076951005	0.9281802977867868	0.0001036174087745	0.8862285103782754	0.0001036174087745	0.9004989230719856	0.0008819033493873	0.8155194826940183	2.431502372964288e-06	0.7906168588925495	2.431502372964288e-06	0.8048415838069497	0.0014854925880973	0.7153045944380911	0.0014854925880973	0.7286480389118785	MAPT	15160	SPPL2C	34486	CRHR1	95090	False	True	False	alt	45	0.002167	45	0.003967
1753	chr17	45881747	A	G	rs55975673	0.039888807	0.0471602524591795	0.039888807	0.050757699544743	0.0087059521243442	0.454327850610303	0.0003504229588424	0.068931587248028	0.0003504229588424	0.0731835967876443	0.3646593844334484	0.3925330588900321	0.0145922702003689	0.066656119696468	0.0145922702003689	0.0724032138252958	0.0031873956395919	0.3707572122156257	0.0001287061413699	0.0807722843169172	0.0001287061413699	0.0866513562835959	0.0263944646728699	0.0370880080669698	0.0263944646728699	0.0380592037746045	MAPT	12781	SPPL2C	36865	CRHR1	97469	False	False	False	alt	100	0.002476	55	0.04657
1754	chr17	45883234	T	C	rs56194412	0.0153742589999999	0.2358758903422128	0.0153742589999999	0.2460674827601995	0.0072620399597466	0.7172592197868897	0.0001158693499233	0.2938147632574864	0.0001158693499233	0.3040282259637445	0.1993091214639156	0.6459640941684023	0.0031376175149416	0.3409648663508374	0.0031376175149416	0.3539553034777929	0.0014591333197366	0.6945135408709654	2.4035841781419542e-05	0.3791064774759849	2.4035841781419542e-05	0.3916563073696668	0.0131578128403821	0.127224629665526	0.0131578128403821	0.131132094962402	MAPT	11294	SPPL2C	38352	CRHR1	98956	False	False	False	alt	50	0.000868	70	0.04996
1755	chr17	45885616	G	A	rs77426526	-0.0579091697999999	0.0178691706202144	0.0579091697999999	0.0167687198410853	0.0120267738458926	0.1795176059585816	-0.0007643875993313	0.0275206560759288	0.0007643875993313	0.0260175009231751	0.2661064948806522	0.5484250469685245	-0.0155708112243443	0.0710162196139401	0.0155708112243443	0.0658778556617852	0.0032665277411022	0.3510602843463827	-0.0002097741418585	0.0608274756392106	0.0002097741418585	0.0569509428248575	-0.0501415989792424	0.0038930670559458	0.0501415989792424	0.0037613579294773	MAPT	8912	SPPL2C	40734	CRHR1	101338	False	True	False	ref	-80	0.00346	-90	0.03674
1756	chr17	45885754	C	T	rs74863825	0.0108033254	0.3191410167540225	0.0108033254	0.3303199760903896	0.012576066119107	0.1476194508340817	0.0001339878071902	0.2465367573312718	0.0001339878071902	0.2558387190069467	0.261892758223633	0.5535988523982239	0.0028337132930975	0.3537914640524035	0.0028337132930975	0.3663829094547673	0.0033192087685512	0.3565892556613072	3.542092103464045e-05	0.2828957290767867	3.542092103464045e-05	0.29395727853939	0.0088631624809385	0.2049213759316562	0.0088631624809385	0.211501702348603	MAPT	8774	SPPL2C	40872	CRHR1	101476	False	False	False	alt	100	0.01163	-70	0.11554
1757	chr17	45888589	A	G	rs62055552	0.0488195378	0.0269548403846053	0.0488195378	0.0290075480561962	0.0154980141693563	0.0706730460777016	0.0007910714640693	0.0194703671810837	0.0007910714640693	0.0206798822215036	0.1819085260220541	0.6779143829352178	0.0092011075536855	0.1318628241788808	0.0092011075536855	0.1404249637560846	0.00305417699193	0.3549397101500128	0.0001609124560793	0.0751233518568941	0.0001609124560793	0.0801402784245647	0.0428178715546841	0.0071356177369777	0.0428178715546841	0.0073655566010974	MAPT	5939	SPPL2C	43707	CRHR1	104311	False	False	False	alt	25	0.0004292	75	0.01462
1758	chr17	45889589	A	G	rs62055558	-0.001950468294	0.6053252685686202	0.004576761814	0.6041422697228658	0.0077086427267592	0.6211698178161345	-1.6304116494290158e-05	0.6428115533803161	3.601648462394515e-05	0.6416240276317828	0.1416819676552661	0.7469239001700114	-0.0002760063629881	0.6785112443936698	0.0007126867801812	0.6781740441365866	0.0011318051031947	0.7598783643536666	-2.257801801214576e-06	0.6971499379804543	5.7052431250065896e-06	0.6968077647380828	-0.0017552049295117	0.4273306047021964	0.0045021213913006	0.4261961888214767	MAPT	4939	SPPL2C	44707	CRHR1	105311	False	False	False	ref	-95	0.010284	100	0.08093
1759	chr17	45890853	A	G	rs17691466	-0.0001318012199999	0.7358898690663251	0.0026534898999999	0.7364295552582801	0.0074670919649192	0.6700161106019948	2.8182052989023346e-07	0.7581944627440571	2.024005598493944e-05	0.7590251498990612	0.1710453427940123	0.7064762665978401	-7.994060244800004e-06	0.7360397834821023	0.0004485384287643	0.7366790333957809	0.0012804597146207	0.744936981875113	1.5156883033970798e-07	0.7560680406914596	3.4314008381377984e-06	0.7568423850659809	-0.0002717870517329	0.5545905604034527	0.0028734737912218	0.5550226809509331	MAPT	3675	SPPL2C	45971	CRHR1	106575	False	False	False	ref	85	0.0003986	-40	0.02391
1760	chr17	45891628	T	C	rs55960528	0.0003153734999999	0.794539595088057	0.00221325446	0.7989179282074774	0.0217615848403245	0.0185701211805885	-1.0201787510735272e-08	0.5643904099280167	4.675682426929144e-05	0.5676968417613292	0.2886005041546074	0.5173722791612592	8.765156261445999e-05	0.6992655149434774	0.0006071744055549	0.7040395806602547	0.0062722989824023	0.069543511645421	7.948237447350816e-08	0.5226279465482877	1.2821125817442578e-05	0.5261893281791746	0.0001037355159285	0.6822319151539245	0.0017966991358831	0.6858512974944523	MAPT	2900	SPPL2C	46746	CRHR1	107350	False	True	False	alt	-50	0.00906	100	0.0725
1761	chr17	45891802	T	A	rs17691556	-0.0179135635999999	0.2125095864876264	0.0179135635999999	0.2033629769493641	0.0076265253995476	0.6121650308065151	-0.0001388473844517	0.257526161732425	0.0001388473844517	0.2483077313067517	0.3183435512816522	0.4686046067407546	-0.005780612129036	0.2244292992920034	0.005780612129036	0.2140615375891718	0.0024673938142258	0.5053663249891661	-4.552285773817748e-05	0.2555457947808243	4.552285773817748e-05	0.2451789977935324	-0.0130789738482763	0.1400862032995329	0.0130789738482763	0.1358696145834484	MAPT	2726	SPPL2C	46920	STH	107449	False	False	False	ref	-100	0.01013	100	0.02695
1762	chr17	45892742	C	A	rs78729125	-0.0012801989979999	0.8180744371526623	0.001733731802	0.8204551006222278	0.0185825782190753	0.035490296094628	-2.2848040083627995e-05	0.6726261987561009	3.099688499365697e-05	0.6735298664565961	0.1744125976410543	0.6916755782825293	-0.0001795899175509	0.8111358931289939	0.0002790783572588	0.8143066406227366	0.0031744329923032	0.3718648301907383	-3.052966727944896e-06	0.7149913121843376	4.823002476627498e-06	0.7174620719002895	-0.0013547858380273	0.6992728790362627	0.0017489807985559	0.7001321686195513	MAPT	1786	SPPL2C	47860	STH	106509	False	False	False	ref	-100	0.007767	-70	0.05386
1763	chr17	45894419	A	G	rs11575895	-0.0756724226	0.0059018041419361	0.0756724226	0.0056126809138997	0.02368660550611	0.0123954646005496	-0.0018207149853086	0.0044772737296804	0.0018207149853086	0.004311527058289	0.966972686438656	0.0006436842492931	-0.0732570160018834	0.0006606451115306	0.0732570160018834	0.0006288717845963	0.022897875543935	0.00089512869801	-0.0017622520219689	0.0016268167980502	0.0017622520219689	0.0015485111177757	-0.006941980725941	0.282367346447489	0.006941980725941	0.2742420821169717	MAPT	109	SPPL2C	49537	STH	104832	True	True	True	ref	-20	0.003662	-15	0.00928
1764	chr17	45896533	T	C	rs62056781	0.0486537278	0.0266940881262	0.0486537278	0.0286327468149104	0.0099431336674677	0.3232066027187771	0.0004928712814854	0.039756425010943	0.0004928712814854	0.0422972118419394	0.825352960092947	0.0052588702828093	0.040087191417516	0.0054808656332508	0.040087191417516	0.0058922177179727	0.0081914688132224	0.0271423865168034	0.0004053370376257	0.0149652284726825	0.0004053370376257	0.0160709793390742	0.0096930466083672	0.1851915536479711	0.0096930466083672	0.1911609653431037	MAPT	2005	SPPL2C	51651	STH	102718	False	False	False	alt	100	0.003906	60	0.12146
1765	chr17	45896864	C	T	rs62056782	0.0733129635999999	0.0074664251711397	0.0733129635999999	0.0079392436547769	0.0287075086287388	0.0068559475670916	0.0022797621778187	0.0037670617830107	0.0022797621778187	0.0039513858633741	0.8106640110374588	0.005794006399317	0.0594116935169115	0.0017084978954973	0.0594116935169115	0.0018072977767046	0.0233424486348516	0.0009372494281089	0.0018560763260302	0.0017428529700169	0.0018560763260302	0.0018220241907925	0.0149835579207252	0.1140167332090954	0.0149835579207252	0.11758702428959	MAPT	2336	SPPL2C	51982	STH	102387	False	True	True	alt	-85	0.010056	-75	0.1677
1766	chr17	45897110	G	T	rs80346216	0.03211044044	0.0863911848996261	0.03211044044	0.0910941066182079	0.0159063670794548	0.0707586840259825	0.0006294324568131	0.0524179226456097	0.0006294324568131	0.0547235373441126	0.7999937758690443	0.0061990454419348	0.0259443408909913	0.0259543077129339	0.0259443408909913	0.0278000548672634	0.0127945062110199	0.0075762610627042	0.0005111867730267	0.023159194220496	0.0005111867730267	0.024481409189673	0.0068403199203311	0.3223500044857365	0.0068403199203311	0.331174482825352	MAPT	2582	SPPL2C	52228	STH	102141	False	False	False	alt	65	0.000847	30	0.10864
1767	chr17	45897183	G	C	rs62056783	-0.0335200178	0.0786061568760664	0.0335200178	0.0739174529361389	0.0136208738400095	0.110052206060768	-0.000463819776683	0.0529810669851166	0.000463819776683	0.0498955193362273	0.7869728939096878	0.0067027174121378	-0.0264857846494732	0.0225553972254633	0.0264857846494732	0.0208266190157769	0.0107639041516432	0.0107827684943665	-0.0003683308401405	0.0216358524236712	0.0003683308401405	0.0202118187678979	-0.006564383447961	0.2989650553098337	0.006564383447961	0.290640923359183	MAPT	2655	SPPL2C	52301	STH	102068	False	False	False	ref	-25	0.0007915	55	0.04233
1768	chr17	45902138	G	A	rs62056801	-0.0159978577	0.2404831313619538	0.0159978577	0.2306401548701997	0.0093118913951011	0.3740630279547537	-0.0001485982177777	0.2349279133754475	0.0001485982177777	0.226052460450529	0.3575825475368001	0.4063923337309596	-0.0058052530888166	0.2259247881931214	0.0058052530888166	0.2153295626316561	0.0033169934072187	0.3595913227601519	-5.368770748005765e-05	0.2206635155232127	5.368770748005765e-05	0.2108527733332985	-0.0103216838348945	0.1891882061358014	0.0103216838348945	0.1834114165754356	MAPT	7610	SPPL2C	57256	STH	97113	False	False	False	ref	-85	0.003334	95	0.01111
1769	chr17	45903164	A	C	rs1984937	0.0301492212	0.0911664131802536	0.0301492212	0.0966414735511518	0.0133693359397402	0.123782599829377	0.000437063091846	0.0610016679586657	0.000437063091846	0.0645021694866827	0.4586333883131567	0.2426927387736351	0.0138685125484613	0.0770767499068495	0.0138685125484613	0.0830569368760127	0.00614809309135	0.0783791278834429	0.0002015364452238	0.0548835423123273	0.0002015364452238	0.058815540928414	0.0124959802487577	0.1518065249191509	0.0124959802487577	0.1563933731185749	MAPT	8636	SPPL2C	58282	STH	96087	False	False	False	alt	100	0.00435	95	0.02771
1770	chr17	45908231	C	T	rs74509629	-0.0650089822	0.0126484079642368	0.0650089822	0.0119387387923912	0.0132632075885054	0.1266738474187354	-0.000924179430555	0.0173518171751625	0.000924179430555	0.0164399309728245	0.5091650328322908	0.158503495364999	-0.0331660934692234	0.0130283362942384	0.0331660934692234	0.0121471539122323	0.0067603661206349	0.0556204554668798	-0.0004726614084081	0.0160092273863178	0.0004726614084081	0.0149867836953612	-0.0206392182491519	0.071083161217564	0.0206392182491519	0.069131947273339	MAPT	13703	SPPL2C	63349	STH	91020	False	True	False	ref	100	0.005615	-75	0.02179
1771	chr17	45911721	A	G	rs62056838	0.0365144002	0.0584320655847948	0.0365144002	0.0625362601411074	0.0100248093465061	0.3036829735329027	0.0003704998731916	0.0640269148641822	0.0003704998731916	0.0680800590183482	0.1987925185945912	0.6529341195838	0.0074408861787252	0.1620381829337483	0.0074408861787252	0.171761215723349	0.0020015938012739	0.5905365023075427	7.565012092538832e-05	0.1505116320392888	7.565012092538832e-05	0.1591283493525831	0.0342928868556727	0.0158508371468674	0.0342928868556727	0.0162948954727387	MAPT	17193	SPPL2C	66839	STH	87530	False	False	False	alt	-30	0.00241	-30	0.01744
1772	chr17	45914415	G	T	rs17564020	-0.00188738292	0.7432781140864836	0.00261985752	0.7376102659157234	0.0068686709706004	0.8157866475387703	-1.2930845114749864e-05	0.7847126911566382	1.8075921808595952e-05	0.7796125645000588	0.4354650981856657	0.2718076889617433	-0.0008448244113148	0.5793413409225131	0.0011726122666875	0.5727815740448694	0.0029939566010327	0.4175195940662466	-5.795029869741171e-06	0.6217964404265881	8.09920375901863e-06	0.6159016212712463	-0.0006991773773586	0.7958150953482036	0.0010684758140643	0.7913249557533732	MAPT	19887	SPPL2C	69533	STH	84836	False	False	False	ref	100	0.01236	100	0.133
1773	chr17	45914522	G	A	rs55682376	-0.00692101444	0.4714859035773804	0.00692101444	0.4590112935572074	0.0057004238742392	0.9617866292943316	-3.969851729647976e-05	0.5981224332525888	3.969851729647976e-05	0.5855587688664764	0.4415917177564082	0.2631457388392721	-0.003118758547051	0.3514948457939782	0.003118758547051	0.3392277535992765	0.0025126103396401	0.5079774224769107	-1.788108887859633e-05	0.4460553623392419	1.788108887859633e-05	0.4332707658543966	-0.0030062552516104	0.5473300770885509	0.0030062552516104	0.5354917238762971	MAPT	19994	SPPL2C	69640	STH	84729	False	False	False	ref	90	0.02078	35	0.011475
1774	chr17	45915090	G	A	rs62056848	-0.0703030569999999	0.0090813388039729	0.0703030569999999	0.0086456048255937	0.01319247164973	0.1258935854950308	-0.0009800984125466	0.0154540414744825	0.0009800984125466	0.0146824790648067	0.3465305656697683	0.4153413695776823	-0.0244796438756234	0.0292415982722726	0.0244796438756234	0.0270446451372575	0.0046058503092786	0.1787367316861754	-0.0003453196042874	0.0269445353695	0.0003453196042874	0.0252601963148001	-0.0509548854241226	0.0045238604480032	0.0509548854241226	0.0044076427131576	MAPT	20562	SPPL2C	70208	STH	84161	False	True	True	ref	-100	0.011475	25	0.01062
1775	chr17	45915097	G	C	rs62056849	0.0348463902	0.0670605496500659	0.0348463902	0.0715612972078247	0.009674502200843	0.3310348381722484	0.0003421614107054	0.0748300370311299	0.0003421614107054	0.0793530575236405	0.3675121111214846	0.3822056840967822	0.012775394356976	0.0820298723142083	0.012775394356976	0.0884203380558013	0.0035388431315066	0.3161762909060539	0.0001246667445501	0.0849085481729854	0.0001246667445501	0.0907071832836263	0.0226516872581665	0.0544046255299434	0.0226516872581665	0.0559843248965335	MAPT	20569	SPPL2C	70215	STH	84154	False	False	False	alt	-95	0.01056	15	0.003174
1776	chr17	45920535	G	C	rs17649700	0.00024498746	0.5651840224246749	0.00490668138	0.5696441352329752	0.0066530090925697	0.8437518041883476	1.2654249992793548e-06	0.6346061937894127	3.388528034854653e-05	0.6390878977002649	0.4179441695453272	0.30164301196579	0.000160863514003	0.4356697945820195	0.0020854161687295	0.4408163089000324	0.0027940931051986	0.4523592470842739	9.795370378739069e-07	0.4917247970290778	1.4454411602590542e-05	0.4968797959976432	-0.0002282181350429	0.6122653407542391	0.0023942157076317	0.6155846583888765	MAPT	26007	SPPL2C	75653	STH	78716	False	False	False	alt	95	0.002731	-20	0.02731
1777	chr17	45922868	A	T	rs8079501	0.0078021756	0.4385691514898321	0.0078021756	0.451013151339416	0.0164808252157036	0.0587592796641896	0.0001382277349325	0.2723173547818862	0.0001382277349325	0.2820357621584031	0.3967302565379308	0.3402314177405456	0.0030046361743743	0.3479773105284545	0.0030046361743743	0.3602117083148469	0.0064475744359801	0.0627120473169876	5.228215829346709e-05	0.2255502771991714	5.228215829346709e-05	0.2356572042046524	0.004858971566095	0.4120791199800129	0.004858971566095	0.422473200097998	MAPT	28340	STH	76383	SPPL2C	77986	False	False	False	alt	60	0.0012665	20	0.0192
1778	chr17	45924591	T	G	rs55685451	0.00470519093	0.5706278964815528	0.00470519093	0.5844277785219305	0.009794418432931	0.3358773026526314	4.536486464412504e-05	0.5448738790906452	4.536486464412504e-05	0.5580105426461651	0.4801543584477016	0.2060082183433775	0.002234279557422	0.4314609277616255	0.002234279557422	0.4451578142741458	0.0046834704185263	0.1756744972103844	2.1511732637339184e-05	0.4145321866275925	2.1511732637339184e-05	0.4273215945157559	0.0017033371715473	0.6808626232359039	0.0017033371715473	0.6935687210484489	MAPT	30063	STH	74660	SPPL2C	79709	False	False	False	alt	-40	0.00157	-95	0.064
1779	chr17	45928047	A	G	rs17564780	0.0168531738	0.2078108026117696	0.0168531738	0.2174328778331091	0.0090619858768736	0.4148236277259252	0.0001546388365146	0.2157228771319155	0.0001546388365146	0.2245991006087391	0.3265137605161879	0.4552987707485282	0.0054578378918964	0.2112609434200184	0.0054578378918964	0.2217021819488781	0.0029461032866485	0.4313250065122758	4.983829358957986e-05	0.2129566598348664	4.983829358957986e-05	0.2227343260081438	0.0123901700225105	0.1469579303070569	0.0123901700225105	0.1518141707661794	MAPT	33519	STH	71204	SPPL2C	83165	False	False	False	alt	-75	0.01068	-70	0.01022
1780	chr17	45933086	C	A	rs62061714	0.001161612312	0.7263904282847414	0.003098252912	0.733158784029002	0.0219965517463771	0.0176745273118547	3.21839389317334e-05	0.4808785356366604	6.851897219134884e-05	0.4868812240512026	0.2166101308104855	0.6276630194685493	0.0001930704629744	0.6949813013260568	0.0006464178168227	0.7016470256638341	0.0047324171161441	0.1627509418632791	5.579728674571711e-06	0.5145603341181657	1.4085380813457816e-05	0.5207446814401917	0.0015394350563802	0.5694498475109979	0.0028506519777175	0.5760091846194326	MAPT	38558	STH	66165	SPPL2C	88204	False	True	False	alt	55	0.0047	55	0.04297
1781	chr17	45934730	A	G	rs62061716	0.0090066433399999	0.3844589715055194	0.0090066433399999	0.3966444953230488	0.0082207938953553	0.5255525668223088	8.24525389893812e-05	0.3996554807070907	8.24525389893812e-05	0.4112142437749271	0.5071442649820019	0.163856537641549	0.0046234581412346	0.262193150000046	0.0046234581412346	0.2738445512416206	0.004193842092432	0.2268800922530908	4.266846010664854e-05	0.2743603024025908	4.266846010664854e-05	0.2855553045884541	0.0026680774696832	0.5611205508536439	0.0026680774696832	0.5731169118496846	MAPT	40202	STH	64521	SPPL2C	89848	False	False	False	alt	-60	0.002316	30	0.05292
1782	chr17	45935549	T	C	rs77924424	0.0567546708	0.0158658697681287	0.0567546708	0.0170162300585753	0.0108857748436119	0.225845118370121	0.0006186699365432	0.0251813355533688	0.0006186699365432	0.0268119588369382	0.5332980632579176	0.1250940410461999	0.0303175213106338	0.0132368226739655	0.0303175213106338	0.0144595883151395	0.0058089321778166	0.0870749024263477	0.0003306552305148	0.0202694269710688	0.0003306552305148	0.0218575963263251	0.0148735982738409	0.1097986800726203	0.0148735982738409	0.1131399740192966	MAPT	41021	STH	63702	SPPL2C	90667	False	True	False	alt	-40	0.00157	25	0.0313
1783	chr17	45935823	C	T	rs62061720	0.0232997322	0.1460234480932499	0.0232997322	0.1539080512331755	0.0082709451971846	0.5330445943772868	0.0002035505124659	0.1734528188266268	0.0002035505124659	0.1811566073375925	0.4740152906150478	0.214272842962508	0.0109500050352655	0.103747035848807	0.0109500050352655	0.1115385829034513	0.0038846641651326	0.2755713133523125	9.477672680285186e-05	0.125725573758007	9.477672680285186e-05	0.133438232374302	0.0090893059056628	0.2207624981677504	0.0090893059056628	0.2275979086936868	MAPT	41295	STH	63428	SPPL2C	90941	False	False	False	alt	-100	0.00623	-90	0.09204
1784	chr17	45936771	G	T	rs12150460	0.0452825102	0.0357432371081802	0.0452825102	0.0380603112098584	0.0194803013180709	0.0311104409755453	0.0009351854998163	0.015970009258701	0.0009351854998163	0.0167882995195052	0.3290926254421725	0.4455435861621949	0.0142370981663456	0.0704220069888897	0.0142370981663456	0.0762159351728259	0.0063527322024207	0.0681264602381565	0.0002931761510357	0.0289739395213148	0.0002931761510357	0.0312290039964104	0.0362036950590773	0.017806406206565	0.0362036950590773	0.0182607421856366	MAPT	42243	STH	62480	SPPL2C	91889	False	False	False	alt	-75	0.00367	-70	0.04745
1785	chr17	45940575	G	T	rs62061732	0.00773838974	0.4498998749690066	0.00773838974	0.4625669011365083	0.0071697789003682	0.7207231700049441	6.064902536870606e-05	0.5025620993460179	6.064902536870606e-05	0.5149963577299326	0.3646344879096256	0.3883147473247793	0.0028918868082719	0.372261180335424	0.0028918868082719	0.3851388041027494	0.0026267825549276	0.4800939009636718	2.276945814917121e-05	0.4132604149119597	2.276945814917121e-05	0.4259883142278137	0.0045519144389464	0.4141301575949211	0.0045519144389464	0.4247674657510542	MAPT	46047	STH	58676	SPPL2C	95693	False	False	False	alt	100	0.00856	100	0.04477
1786	chr17	45941033	A	G	rs62061733	0.00215093148	0.5432221298946256	0.00525865248	0.5476921848811049	0.0066752211318304	0.817694302872228	1.7833896485878124e-05	0.6223256606616836	3.581720420040368e-05	0.6278971104421103	0.4637620722206662	0.2324007304996974	0.0010534858144518	0.3904056073380432	0.0024498470504394	0.3949801750794303	0.0031018817052856	0.4062433200690241	8.672584051600463e-06	0.4547278048596523	1.6752844120138102e-05	0.4598423570866694	0.0007448210043672	0.630446016701397	0.002126578076536	0.6361846854069009	MAPT	46505	STH	58218	SPPL2C	96151	False	False	False	alt	75	0.01085	-25	0.008545
1787	chr17	45942314	T	C	rs62062770	0.0002959219999999	0.6739284516645405	0.0038565172	0.669309610684444	0.0075650539793609	0.6427767373917326	9.116668635342252e-07	0.703730277475984	2.861334895564503e-05	0.6981633661901454	0.4323364350252595	0.2829003650812082	0.0001971125641091	0.5212426553263849	0.0017278903271724	0.516595070494491	0.003278382835563	0.3594522155080555	8.790247386748171e-07	0.5486930322758333	1.2808289776447765e-05	0.5435705685014324	2.904594446002012e-05	0.7130291284589404	0.0016680670961316	0.707115273623459	MAPT	47786	STH	56937	SPPL2C	97432	True	False	False	alt	-100	0.002739	100	0.0752
1788	chr17	45942948	C	T	rs62062772	0.00168578938	0.566437542912884	0.00563118218	0.5722373018398672	0.0063532607442013	0.8897051152316766	1.0219400971152731e-05	0.6549751997726128	3.533820953692264e-05	0.6609076053152422	0.4158175914687911	0.3078609158743796	0.0005914366050925	0.4380140662071147	0.0023956948823726	0.4436745302769375	0.0026371353469663	0.4857790796707035	3.546396249363117e-06	0.5110104294652181	1.503341952567719e-05	0.5166508207316027	0.0013444122864344	0.5890326927232421	0.0026016867394889	0.5954158248077389	MAPT	48420	STH	56303	SPPL2C	98066	False	False	False	alt	100	0.003609	25	0.010605
1789	chr17	45944953	G	A	rs75839508	-0.0373854146	0.064396378703094	0.0373854146	0.0603102850252127	0.0097199275217203	0.3270810398952665	-0.0003629653221108	0.0732433248594198	0.0003629653221108	0.0691183173451181	0.5077023620576977	0.1616167806280061	-0.0190080366650846	0.0491462274595674	0.0190080366650846	0.0453308248268238	0.0049303942137467	0.1471290580349662	-0.0001843681690076	0.05737557207274	0.0001843681690076	0.0534396868947	-0.0113963837799146	0.1625438772869397	0.0113963837799146	0.1575217993344564	MAPT	50425	STH	54298	SPPL2C	100071	False	False	False	ref	-90	0.00293	-90	0.09314
1790	chr17	45947196	G	T	rs62062785	-0.0376600136	0.0604073987253342	0.0376600136	0.0570077208382421	0.0156132943131159	0.0719434324057302	-0.0006418417152534	0.0352060228172837	0.0006418417152534	0.0335473195513094	0.2627122687994688	0.551792836224221	-0.0104515922455963	0.1247235098706126	0.0104515922455963	0.11752749820519	0.0043329291642903	0.1703461432999529	-0.0001840954867506	0.0689386723528792	0.0001840954867506	0.0650693146242787	-0.0328924573906368	0.0205250937987784	0.0328924573906368	0.0202367337888578	STH	52055	MAPT	52668	SPPL2C	102314	False	False	False	ref	100	0.015526	-85	0.05548
1791	chr17	45947294	G	C	rs62062786	-0.00884679692	0.4271422949146251	0.00884679692	0.4150052077310549	0.0078707437821377	0.6088343453055983	-6.753137152921325e-05	0.4721589948837686	6.753137152921325e-05	0.4602761390443331	0.2423863318084212	0.5821561920990734	-0.0021277769897601	0.4641358865622113	0.0021277769897601	0.4508956678813262	0.0019003640798774	0.6107363785259136	-1.607668671029199e-05	0.4910171205813946	1.607668671029199e-05	0.4779942087525577	-0.0071411529165239	0.2866760456071675	0.0071411529165239	0.2790180374657071	STH	51957	MAPT	52766	SPPL2C	102412	False	False	False	ref	0	0.0	-10	0.004677
1792	chr17	45949182	T	C	rs242561	0.0470496448	0.0308804802941678	0.0470496448	0.0330726396178757	0.0152662873863362	0.0735300538030254	0.0007112459249244	0.0202020854433332	0.0007112459249244	0.021486247573529	0.6122636126930778	0.038963538939083	0.0288409490481106	0.0160588175584553	0.0288409490481106	0.0175481342392899	0.0093420477378897	0.0163636151533273	0.0004357923602118	0.0132318195784277	0.0004357923602118	0.0142494089249688	0.0055996431498251	0.3272672388123506	0.0055996431498251	0.3365065103868267	STH	50069	MAPT	54654	SPPL2C	104300	True	False	False	alt	5	0.001099	65	0.02344
1793	chr17	45949724	C	T	rs62062795	0.0774840972	0.0052112826789312	0.0774840972	0.0054473548587776	0.0276058485060022	0.0083753285266494	0.0023034059911709	0.0036338242206395	0.0023034059911709	0.0037731402431064	0.5737507650494299	0.0737668141349879	0.0444672035790805	0.0039185762003097	0.0444672035790805	0.0042168132437283	0.0158315349108058	0.0038529990566122	0.0013213390792726	0.0028989874175512	0.0013213390792726	0.0030290892002203	0.0149420637143538	0.1119192422027	0.0149420637143538	0.1153192576610375	STH	49527	MAPT	55196	SPPL2C	104842	False	True	True	alt	100	0.007084	85	0.02826
1794	chr17	45950017	A	G	rs62062798	0.0494349152	0.025043419211323	0.0494349152	0.0266977367687296	0.0170493890417642	0.0534470611592534	0.0009654645921723	0.0178829082177916	0.0009654645921723	0.0189620600513753	0.4596043527422483	0.2375983408152204	0.0228174566134752	0.0272547240606495	0.0228174566134752	0.0297324671225121	0.0078616369850519	0.040275539592132	0.0004489401214585	0.0181196400129943	0.0004489401214585	0.0194341057448816	0.020381954169649	0.0603651043855576	0.020381954169649	0.0620176457608663	STH	49234	MAPT	55489	SPPL2C	105135	False	False	False	alt	75	0.00054	-45	0.04865
1795	chr17	45950645	T	G	rs62062801	-0.00138466708	0.7892422277420001	0.0021274978	0.7802737534558939	0.0190084767140784	0.0335211967047307	-2.761571795360741e-05	0.6027458716106093	3.8811023096038494e-05	0.5944289569561416	0.2797767611697216	0.5216075770886268	-0.0004524880697236	0.6855285301150446	0.0006470516291175	0.6760375460464699	0.0052082594563528	0.125141388902136	-8.826242868716137e-06	0.5394026275385995	1.1758537389834016e-05	0.5303722724610954	-0.0009502173259058	0.6969717782664844	0.0017012624612288	0.6893652830150911	STH	48606	MAPT	56117	SPPL2C	105763	False	False	False	ref	80	0.001373	-70	0.02612
1796	chr17	45950679	G	T	rs62062802	0.0039767116	0.6214237004639044	0.0039767116	0.6347023159227614	0.0330321491576788	0.0026048672214669	0.000131211975034	0.2459863574648429	0.000131211975034	0.2553665252654619	0.2859448749468355	0.5121296738070954	0.0011439362833843	0.5455865002570686	0.0011439362833843	0.5596237194110304	0.0093575362691183	0.0170650413299629	3.737956616584759e-05	0.2633686881009902	3.737956616584759e-05	0.2740881003114408	0.0032054274421933	0.5062497562824898	0.0032054274421933	0.5180075280092444	STH	48572	MAPT	56151	SPPL2C	105797	False	True	True	alt	90	0.001831	-100	0.084
1797	chr17	45955636	T	C	rs62063262	0.0403181586	0.0460454113557583	0.0403181586	0.0492679060363798	0.0151746861794843	0.0784378789696085	0.000671765692066	0.0306341190329236	0.000671765692066	0.0324929062859365	0.502235500368261	0.1685114200123248	0.0202714649215313	0.0363485672628723	0.0202714649215313	0.0396462993739675	0.0076074647112852	0.0403188498899211	0.0003366587277719	0.0254792757988756	0.0003366587277719	0.0273864132818885	0.0130125831180821	0.1340708080139609	0.0130125831180821	0.1382669616043704	STH	43615	MAPT	61108	SPPL2C	110754	False	False	False	alt	100	0.00342	-80	0.10626
1798	chr17	45957467	G	A	rs62063269	-0.00173769849	0.7169510401455197	0.00334501911	0.7172228042619795	0.0080867604633781	0.5847677119759283	-1.4846002468851282e-05	0.7345656115917001	2.6692862882455563e-05	0.7352089463588279	0.3692299712652621	0.3893126370569652	-0.0006210370540336	0.5991234832574421	0.0012278694008726	0.5993761876725151	0.0029860104734681	0.4282035733768493	-5.3154225569294095e-06	0.6181243064355991	9.784333572666232e-06	0.6186725033526935	-0.0009709644290915	0.6804250577314951	0.0019170323343602	0.6810907145265364	STH	41784	MAPT	62939	SPPL2C	112585	False	False	False	ref	100	0.01823	100	0.08813
1799	chr17	45957493	A	G	rs17571809	-0.0008506531639999	0.8130685895339751	0.002170034116	0.8103855201272903	0.0095428276536489	0.3527159648531445	-5.634893628980881e-06	0.7839336165575879	2.0826537351470185e-05	0.7816526599115392	0.3714685836990009	0.3857778654003153	-0.0003252194219218	0.672898456388949	0.0008088688433974	0.6695500391865072	0.003545174870524	0.329651448626778	-2.186417595197757e-06	0.6523870918023066	7.757558792136947e-06	0.6495916125781627	-0.0003568501747943	0.776019857607319	0.0012199296673201	0.7735345873230186	STH	41758	MAPT	62965	SPPL2C	112611	False	False	False	ref	100	0.02141	100	0.11487
1800	chr17	45958150	G	A	rs77555455	0.00387387138	0.6340802778895702	0.00387387138	0.6475371112189461	0.0193423133867824	0.0310582077035286	7.299301556810767e-05	0.4153289467268293	7.299301556810767e-05	0.426546666483372	0.2570441602091308	0.567424158850475	0.0009863640116864	0.5846203815693137	0.0009863640116864	0.5984726059334624	0.0049761551908722	0.1394375756701173	1.86071033902796e-05	0.4204263249420302	1.86071033902796e-05	0.4328564894266765	0.0035373810931648	0.4822446628964337	0.0035373810931648	0.4936693173186226	STH	41101	MAPT	63622	SPPL2C	113268	False	False	False	alt	-100	0.001907	30	0.01581
1801	chr17	45963457	C	T	rs55711941	-0.0363168052	0.0684702644173885	0.0363168052	0.0642848548277391	0.0094586041503176	0.3573196037108472	-0.0003441416953085	0.0820444828912248	0.0003441416953085	0.0775386011520159	0.4176122158943557	0.3059970070816507	-0.0151540892322826	0.0729918551207575	0.0151540892322826	0.0676341350063462	0.0039402666470981	0.261343996250023	-0.000143250496362	0.0810919875908109	0.000143250496362	0.0758687271944164	-0.0183445886368115	0.082358857129591	0.0183445886368115	0.0800857526651014	STH	35794	MAPT	68929	SPPL2C	118575	False	False	False	ref	50	0.00916	-85	0.0473
1802	chr17	45963735	T	C	rs55709241	0.0561284013999999	0.0171317996415995	0.0561284013999999	0.0184128134356804	0.0148704963286664	0.0844702160804941	0.0008485464300032	0.015923255825036	0.0008485464300032	0.0168559897013826	0.4546872892872333	0.2440634354695028	0.0255778803974693	0.021445891476063	0.0255778803974693	0.0234550546195291	0.0067902318605466	0.0536738820352672	0.0003883732369369	0.0171090863949755	0.0003883732369369	0.0183830078851242	0.0249981846284712	0.044082625875897	0.0249981846284712	0.0453090220108492	STH	35516	MAPT	69207	SPPL2C	118853	False	True	False	alt	-45	0.001801	-10	0.00961
1803	chr17	45964196	G	T	rs112058117	0.0010859192279999	0.842680190851135	0.0016987435079999	0.8503179708004038	0.0273552091315171	0.0067015679834933	3.7642168165871375e-05	0.5841783171579994	5.085706382843753e-05	0.5915880336372852	0.3690681438604135	0.3827580247528208	0.000358869052188	0.7202653746075728	0.0005982035695155	0.727691489744284	0.0099216418724249	0.0132075765789468	1.2496265242754949e-05	0.4949993388894587	1.7657256455363904e-05	0.5022607100647043	0.00088590130603	0.7895835674199851	0.0011182688617101	0.7972105001439185	STH	35055	MAPT	69668	SPPL2C	119314	False	True	True	alt	15	0.001175	-100	0.1178
1804	chr17	45966012	T	C	rs62063291	0.01064808058	0.3457102950609137	0.01064808058	0.3572974638016275	0.0068118476563741	0.8333638806210031	7.406354170456297e-05	0.431880113640841	7.406354170456297e-05	0.4435490392239989	0.2146412307181609	0.630553619496228	0.0021693533228359	0.4243185896044795	0.0021693533228359	0.4373860161024078	0.0014539805248123	0.7062091929691854	1.5055332221436924e-05	0.4817766408300261	1.5055332221436924e-05	0.4946989155111788	0.0093735412193072	0.2048762968822284	0.0093735412193072	0.2107514321562301	STH	33239	MAPT	71484	SPPL2C	121130	False	False	False	alt	100	0.00698	-5	0.001099
1805	chr17	45967142	A	C	rs17650991	0.0111169902	0.314355627524247	0.0111169902	0.3254178679466526	0.0075764924892542	0.6764325051266026	8.667137958343826e-05	0.370703329645226	8.667137958343826e-05	0.3814430781472422	0.2809074782933433	0.5241332237890964	0.0032106372671158	0.3313498198766231	0.0032106372671158	0.343638963658737	0.0021361087630905	0.5794983219553205	2.5257752346862807e-05	0.3671418364586568	2.5257752346862807e-05	0.3791336088522922	0.0088839095841242	0.218852554520947	0.0088839095841242	0.2258044708041049	STH	32109	MAPT	72614	SPPL2C	122260	False	False	False	alt	35	0.0028	-50	0.03613
1806	chr17	45971767	T	C	rs62063303	0.0114827923	0.3287916403272851	0.0122806551	0.3390469376072615	0.0104102684739871	0.2610517097246995	0.0001213358583157	0.2900123642947073	0.000128751203087	0.2990444202947676	0.5927385138849989	0.0541253655721667	0.0068730406710354	0.1892444044297042	0.0073256918257401	0.1985208683523427	0.0061889226834633	0.0719815085834066	7.274366569484956e-05	0.1725073084936418	7.695060980777865e-05	0.1806505620319341	0.0015415097666988	0.688641254424182	0.001695038330273	0.6987897369521258	STH	27484	MAPT	77239	SPPL2C	126885	False	False	False	alt	-70	0.002625	85	0.0991
1807	chr17	45971963	C	T	rs75242405	-0.0545836658	0.0213303246253463	0.0545836658	0.0199720412568986	0.011398413122263	0.1978693664695514	-0.0006281900166884	0.0286625162388245	0.0006281900166884	0.0270166560197954	0.5888505067479952	0.0579626503231806	-0.0321971704363099	0.0131872418398564	0.0321971704363099	0.012162814230126	0.0067172649696624	0.0542105889179586	-0.0003708405546655	0.0199163662630085	0.0003708405546655	0.0185758999131418	-0.0086556914490813	0.2241026876933277	0.0086556914490813	0.2172140750683231	STH	27288	MAPT	77435	SPPL2C	127081	False	True	False	ref	-100	0.03632	-100	0.1824
1808	chr17	45973484	A	G	rs62063776	0.0387006023999999	0.0514269881478798	0.0387006023999999	0.0552382217398545	0.0093899730909743	0.3746590550108278	0.0003649054792588	0.0662841885096393	0.0003649054792588	0.0705125765841818	0.5639456840838598	0.0852773340277227	0.0218240345292264	0.030897520447806	0.0218240345292264	0.0337815571810725	0.0052973101015007	0.1211280928219026	0.0002058231622364	0.0430178807584436	0.0002058231622364	0.0464989560232387	0.0079461405201298	0.2333023221742308	0.0079461405201298	0.2408417468616323	STH	25767	MAPT	78956	SPPL2C	128602	False	False	False	alt	85	0.000931	80	0.0734
1809	chr17	45977022	T	C	rs17572467	0.050619021	0.022903278911357	0.050619021	0.0245382623133014	0.0123927211402095	0.1487334621282857	0.0006296338694388	0.0248117947068578	0.0006296338694388	0.0264507415157032	0.5281424081162667	0.1312646107762976	0.0267542971407906	0.0183335926805916	0.0267542971407906	0.0201157725034236	0.0065348464265989	0.0594247003018594	0.0003323296676566	0.0203160175824017	0.0003323296676566	0.0219157883016308	0.0134627952572121	0.1226410773585812	0.0134627952572121	0.1265672610612461	STH	22229	MAPT	82494	SPPL2C	132140	False	False	False	alt	80	0.00551	90	0.1093
1810	chr17	45977230	T	G	rs17572495	-0.00536909864	0.3321452533222654	0.01121409176	0.3266599381790042	0.0112621039088045	0.2026075458800443	-5.341831194761444e-05	0.2899827831557077	0.0001227521668001	0.2850183584751196	0.5137522173466529	0.1526889548288011	-0.0028553943655727	0.2346798734392865	0.0058491721126066	0.2294815733982095	0.0057783557845357	0.0896636103682453	-2.847325757688324e-05	0.2034742991235798	6.398357734582271e-05	0.1988656201871896	-0.0013195157626116	0.5316006248259987	0.003124513739769	0.5270444287990176	STH	22021	MAPT	82702	SPPL2C	132348	False	False	False	ref	-95	0.00709	-55	0.0689
1811	chr17	45982882	G	A	rs56234850	-0.0571155262	0.0176752544632416	0.0571155262	0.0166001599849243	0.0129428180984666	0.1332515829139805	-0.0007561248968357	0.0204179466467801	0.0007561248968357	0.0192919891918265	0.6645172667766264	0.0171324515773083	-0.0378718487870998	0.0077197453135426	0.0378718487870998	0.0071728262949802	0.0085802573719075	0.0230492269451292	-0.0005002139911524	0.0121569278373593	0.0005002139911524	0.0114202642407883	-0.0054606375584808	0.3553504420686589	0.0054606375584808	0.3458118579530085	STH	16369	MAPT	88354	SPPL2C	138000	False	True	False	ref	100	0.013115	100	0.1631
1812	chr17	45988044	G	A	rs10445371	-0.0166831824	0.2322856908708611	0.0166831824	0.2224871068948126	0.0069645898358951	0.8011586037173987	-0.0001150202888308	0.3062934341923952	0.0001150202888308	0.2964974578127151	0.5150364630338489	0.1494202618833292	-0.0086084122034815	0.1563296355951024	0.0086084122034815	0.1473880459829266	0.0035837502768292	0.3188695339195084	-5.929976443040165e-05	0.2059226696449173	5.929976443040165e-05	0.1964240243709586	-0.0048237014906793	0.4005645096420032	0.0048237014906793	0.3903484729128038	STH	11207	MAPT	93516	SPPL2C	143162	False	False	False	ref	15	0.0004845	95	0.074
1813	chr17	45988535	C	T	rs919464	-0.0518101324	0.0269259369977333	0.0518101324	0.0251785402319771	0.0159823448331768	0.0632369673820967	-0.0008500643567358	0.0181623400599638	0.0008500643567358	0.0172044663185152	0.467502774925051	0.2170452176551002	-0.0241037207232789	0.0300841371447921	0.0241037207232789	0.0276742974828504	0.0074191533712159	0.0389961639473745	-0.0003921629624867	0.0193860412450352	0.0003921629624867	0.0180502044590565	-0.0213010508407762	0.0659947649454217	0.0213010508407762	0.0640910538652212	STH	10716	MAPT	94007	SPPL2C	143653	False	False	False	ref	100	0.01326	-70	0.05438
1814	chr17	45990034	T	C	rs10445337	-0.0265126926	0.123776076735096	0.0265126926	0.1179294119209618	0.0108413411308895	0.2544177762117804	-0.0003269109730572	0.111327261796802	0.0003269109730572	0.106584067281548	0.4288924158964304	0.2914468997248451	-0.011344974849029	0.1145012090636578	0.011344974849029	0.1076998010535053	0.0046386251956907	0.1753865123316266	-0.0001395009804077	0.1019583681904527	0.0001395009804077	0.0964951017545154	-0.0133839562651064	0.1437030401401095	0.0133839562651064	0.1398241497826185	STH	9217	MAPT	95506	SPPL2C	145152	False	False	False	ref	-90	0.004032	95	0.003418
1815	chr17	45990923	G	A	rs62063796	-0.0354372548	0.0735475131385416	0.0354372548	0.0689915580793957	0.0116569376130637	0.1858924900510839	-0.000419342939106	0.0600582555898432	0.000419342939106	0.0566233029643264	0.4878328613367358	0.1924935586540231	-0.0174161982146554	0.0589691187920092	0.0174161982146554	0.0544918247210829	0.0056870438982693	0.0954807587004563	-0.0002062458911131	0.0512196833360884	0.0002062458911131	0.0477129359584231	-0.0121121588398219	0.1517410915944832	0.0121121588398219	0.1470803422848534	STH	8328	MAPT	96395	SPPL2C	146041	False	False	False	ref	100	0.001942	-75	0.00853
1816	chr17	45991114	T	C	rs77290642	0.0619492472	0.0123668730180892	0.0619492472	0.0131828560843243	0.0215779191040107	0.0193665670283409	0.0013956604096916	0.0074450647094434	0.0013956604096916	0.0077711486538436	0.524057303498999	0.1378715078667186	0.0325789237305833	0.0112423450321265	0.0325789237305833	0.012257029682709	0.0113269351068207	0.0094398880585727	0.0007349537432628	0.0066662837120469	0.0007349537432628	0.0070703612019139	0.01786740526354	0.0842916238769145	0.01786740526354	0.0868645273181484	STH	8137	MAPT	96586	SPPL2C	146232	False	True	False	alt	-55	0.002659	-100	0.04907
1817	chr17	45991558	G	A	rs1052551	-0.1049655918	0.0017795307241175	0.1049655918	0.0017167788777686	0.0245028663805185	0.0105603221397141	-0.0026335210358539	0.00261235465371	0.0026335210358539	0.0025094554513833	0.5059264100250003	0.1660413219301738	-0.0529759970848805	0.0023594740470072	0.0529759970848805	0.0022428994164955	0.0123444964529841	0.0064914372273542	-0.0013234409912897	0.0025700528400628	0.0013234409912897	0.0024568102995106	-0.03551696594363	0.014825340298452	0.03551696594363	0.0144688176630525	STH	7693	MAPT	97030	SPPL2C	146676	False	True	True	ref	100	0.007454	-70	0.09
1818	chr17	45992402	A	G	rs74759276	-0.0579571094	0.02380213037649	0.0579571094	0.0225859384424888	0.0280602542503526	0.010318482133423	-0.0021409845766261	0.008833367637223	0.0021409845766261	0.008390077317214	0.4611043683025757	0.2361210351620193	-0.0274750048029465	0.0255493756724468	0.0274750048029465	0.0239387686498941	0.0131988544377553	0.0077745419387883	-0.0010349291472268	0.0098492645706154	0.0010349291472268	0.0093174894917557	-0.0239919501239638	0.0546458180582785	0.0239919501239638	0.0530986941805765	STH	6849	MAPT	97874	SPPL2C	147520	False	True	False	ref	-30	0.001017	80	0.05414
1819	chr17	45992474	G	A	rs17651887	0.00837161896	0.4004953172438042	0.00837161896	0.4127300798634369	0.0078271760786173	0.6250871112890043	6.629265711831028e-05	0.4476096583991995	6.629265711831028e-05	0.4592977316700254	0.4675650162346082	0.2251932124373481	0.0039187038444945	0.2843522160711235	0.0039187038444945	0.2961157585501068	0.0036719106201073	0.3102619262903458	3.112418743169857e-05	0.3158486841315453	3.112418743169857e-05	0.3273299860610957	0.0030270023547961	0.5260721880996465	0.0030270023547961	0.5380032384663196	STH	6777	MAPT	97946	SPPL2C	147592	False	False	False	alt	100	0.005505	10	0.02328
1820	chr17	45993590	T	A	rs55913645	-0.0102149726	0.3572813896535757	0.0102149726	0.3459494857963592	0.0242753845168889	0.0117912046253119	-0.0002526285222264	0.136005241979048	0.0002526285222264	0.1294685350604367	0.4843556468428096	0.1981669570792544	-0.0049288940812661	0.2550621773622543	0.0049288940812661	0.2441614425740624	0.0117099548036931	0.0072942977328628	-0.0001214025593605	0.1037202976374647	0.0001214025593605	0.0972798769233142	-0.003385927239909	0.5177589299947755	0.003385927239909	0.5062115731938233	STH	5661	MAPT	99062	SPPL2C	148708	False	True	False	ref	-85	0.004482	100	0.0838
1821	chr17	45995696	T	G	rs62063849	0.0035483631199999	0.4797045845477757	0.00704825016	0.4830462086868501	0.0083314677090422	0.5331583527635598	1.7006081288418894e-05	0.5090037570166331	5.42373333750951e-05	0.5111801348187787	0.5341237979647092	0.1227562414035818	0.0019192706159051	0.3354843775264751	0.0038330752713601	0.3391951591707906	0.0044498607826024	0.1960926472425768	9.1419216901275e-06	0.3588493783637593	2.950335678171994e-05	0.3610737092124182	0.0008112117345615	0.7017404455116194	0.0015996016556187	0.7046791283420861	STH	3555	MAPT	101168	SPPL2C	150814	False	False	False	alt	-90	0.002277	85	0.02429
1822	chr17	45997069	C	G	rs62063851	-0.0586952893999999	0.0162499929194985	0.0586952893999999	0.0153409676674294	0.0230912949792309	0.0189359027512782	-0.001545817105587	0.0091357656879278	0.001545817105587	0.0087378559208207	0.5803566427037625	0.0664515130623227	-0.0340716045718852	0.0109212673374282	0.0340716045718852	0.0100735524216259	0.0133874477603035	0.0069480308314975	-0.0008963470375836	0.0068122905984758	0.0008963470375836	0.0064572140579447	-0.0103279079658502	0.1882175403235521	0.0103279079658502	0.1829137593237716	STH	2182	MAPT	102541	SPPL2C	152187	False	True	False	ref	100	0.00264	-95	0.04694
1823	chr17	45997733	T	C	rs2004673	-0.00251805068	0.75913429565016	0.00251805068	0.7452567263001841	0.0077014208278617	0.6489968203736363	-1.9356796695028023e-05	0.774347067319964	1.9356796695028023e-05	0.760908377058689	0.4734447452774405	0.2128796915654514	-0.0012214040022684	0.5778956153207356	0.0012214040022684	0.5638813909571915	0.0036415269928994	0.3061016823368641	-9.38300035844098e-06	0.5989003784695595	9.38300035844098e-06	0.5851106074047743	-0.0009626655878172	0.8227290261665529	0.0009626655878172	0.8090756660169104	STH	1518	MAPT	103205	SPPL2C	152851	False	False	False	ref	-80	0.004646	100	0.0594
1824	chr17	45998471	T	C	rs1078269	0.004322744804	0.5207764727501163	0.006016091604	0.530266119830995	0.0085466103664394	0.4923302774879626	3.587100020080304e-05	0.5517920768204174	4.974327158426238e-05	0.56058721958475	0.5226879946887416	0.1392437845629096	0.002308709029779	0.3670366568734811	0.0031520887630601	0.3763846362368678	0.0044676997041711	0.1924968288144729	1.9109587892789926e-05	0.388821197839472	2.601874144897464e-05	0.3975297848500407	0.0011493895164887	0.7002968224051126	0.0016971130405916	0.7090872996930243	STH	780	MAPT	103943	SPPL2C	153589	False	False	False	alt	-100	0.00595	-10	0.007065
1825	chr17	46001466	G	A	rs62064660	0.0035977037399999	0.648739727857858	0.00383550154	0.6578487385253832	0.0208677099109961	0.0229514814071089	8.871006133081617e-05	0.4154981880943906	9.214035621865696e-05	0.4242841438507611	0.244649840765983	0.581206788726624	0.0007894450014175	0.63632672370355	0.0008544108518917	0.6456492375428796	0.0049984431652731	0.1415704606957436	1.9228785848648463e-05	0.451658315920495	2.016593505316486e-05	0.460979942697666	0.0035041857280676	0.5218874145357191	0.0036494154503677	0.5295567417812185	STH	2215	MAPT	106938	SPPL2C	156584	False	False	False	alt	-85	0.01385	-35	0.026
1826	chr17	46004161	T	C	rs62064665	0.0101796229399999	0.3479827410068336	0.0101796229399999	0.3595425722088145	0.0078810905517976	0.6077421806491636	8.56306169885505e-05	0.3902327877331301	8.56306169885505e-05	0.4013390021063208	0.3473500762456042	0.4141014907272731	0.003602220246329	0.3085057496523229	0.003602220246329	0.3204128852840649	0.0027525472474456	0.466195811771788	3.020892476409893e-05	0.3349239903813701	3.020892476409893e-05	0.3465378074055004	0.006361061836741	0.3071894145506728	0.006361061836741	0.3160809989663607	STH	4910	MAPT	109633	SPPL2C	159279	False	False	False	alt	-5	0.0001678	30	0.01001
1827	chr17	46005237	A	C	rs17573593	-0.0038650589599999	0.4587765021390614	0.0081783901599999	0.4511859879274819	0.0123208933710758	0.1525349816803579	-5.759163695949579e-05	0.3566910658913482	0.0001105886295034	0.3498811768011677	0.3636241039844811	0.3973054361968917	-0.0012867212157928	0.3935302654560274	0.0029399433175306	0.3859409403684566	0.0044675696521097	0.1958314673436547	-1.9166125435949475e-05	0.318085166695227	3.947891789762215e-05	0.3111710452196935	-0.0022095664892789	0.4034859787984028	0.0048071038081307	0.3981704577850027	STH	5986	MAPT	110709	SPPL2C	160355	False	False	False	ref	-15	0.001303	-85	0.0727
1828	chr17	46005957	C	T	rs17652337	-0.0417121788	0.0507380629902504	0.0417121788	0.0474859193855008	0.0091112062384153	0.4221366797310126	-0.0003880357913034	0.0720744502397736	0.0003880357913034	0.0681112220667983	0.2212678554756792	0.6262081874087225	-0.0095048913959342	0.146224324733905	0.0095048913959342	0.1374449778055141	0.0020223297910758	0.605847564275322	-8.851649768346552e-05	0.1529114959757933	8.851649768346552e-05	0.1446426621599747	-0.0393800765568106	0.0104920175904507	0.0393800765568106	0.0101972522198669	STH	6706	MAPT	111429	SPPL2C	161075	False	False	False	ref	-100	0.002851	100	0.04016
1829	chr17	46007167	T	C	rs74829364	-0.0024920646479999	0.7197668713511381	0.0027686840319999	0.7098217587386292	0.02639053572189	0.0081581439220341	-7.675888013038586e-05	0.4073926415815936	8.201954156976576e-05	0.3979502193915299	0.2274899117210759	0.6056145256898894	-0.0006812280353236	0.6677789623198331	0.00072910032812	0.6570670092769839	0.0063101584384798	0.0728088704179854	-2.108576196419857e-05	0.4274748967735575	2.1996182350231365e-05	0.4170585536284955	-0.0022074917789603	0.6049093648613216	0.002460606437826	0.5959262895644738	STH	7916	MAPT	112639	SPPL2C	162285	False	True	True	ref	-100	0.1449	100	0.10284
1830	chr17	46009155	G	A	rs62064672	0.0118569122799999	0.3220302587621081	0.0118569122799999	0.3338606276868114	0.0101590254793064	0.3008662770962603	0.0001321503666369	0.2962289642568357	0.0001321503666369	0.3065422925051678	0.5069139721366405	0.1637331594637499	0.0059802217664617	0.2252131447236658	0.0059802217664617	0.2366337353382421	0.0051576328671579	0.1327540973756824	6.681981950830598e-05	0.2058419812370171	6.681981950830598e-05	0.2160805328546089	0.0037469268353405	0.4845022388593097	0.0037469268353405	0.4959615526606034	STH	9904	MAPT	114627	SPPL2C	164273	False	False	False	alt	0	0.0	100	0.05908
1831	chr17	46011406	C	A	rs62064674	-0.001756354868	0.8143800364807148	0.002027060868	0.8061815367491865	0.0165313485173583	0.05529265984396	-2.9650676472013465e-05	0.7077328601897379	3.420058430128309e-05	0.6995550668962344	0.5513418188985363	0.1006257719664719	-0.0009678463491886	0.6299629257706981	0.0011198588906037	0.6213364181227723	0.0091166691498722	0.0181280841721316	-1.6342462052747544e-05	0.510705786961345	1.889742227654679e-05	0.502434273629056	-0.0003879708295729	0.9173818844961842	0.0004419132978557	0.9096522499986288	STH	12155	MAPT	116878	SPPL2C	166524	False	False	False	ref	-80	0.002228	45	0.06775
1832	chr17	46011742	T	C	rs76723223	0.0576118712	0.0162620706480453	0.0576118712	0.0174392301964192	0.0122947870997018	0.1572368210170326	0.0007175196361052	0.0205628036161215	0.0007175196361052	0.0218205925356476	0.5717694166951939	0.0761657298065704	0.0329530744290589	0.0108693041892668	0.0329530744290589	0.0118711426406563	0.0070305992251991	0.0465498285986138	0.0004104877713768	0.0150043580782421	0.0004104877713768	0.0161674116928607	0.0112449299266589	0.1585502761933985	0.0112449299266589	0.1638313309509395	STH	12491	MAPT	117214	SPPL2C	166860	False	True	False	alt	75	0.003605	55	0.0547
1833	chr17	46012197	C	T	rs733966	-0.0728117552	0.0070578729298258	0.0728117552	0.0066930404671329	0.0163392663659467	0.0585742201510084	-0.00119523896649	0.0087445527639961	0.00119523896649	0.0083725558441127	0.5761989232253446	0.0712498403880751	-0.0418989805190866	0.0054484370642199	0.0418989805190866	0.0050937831817377	0.0094126569698963	0.015837650108592	-0.0006875738710592	0.0068928016475817	0.0006875738710592	0.0065439980834873	-0.0138694384796522	0.135180375551668	0.0138694384796522	0.1312055409967776	STH	12946	MAPT	117669	SPPL2C	167315	False	True	True	ref	100	0.002268	80	0.1121
1834	chr17	46012361	G	A	rs733969	-0.042070914	0.0473458049811124	0.042070914	0.0444757159320391	0.0095660357526647	0.3492816370157333	-0.0004105659160974	0.0645462116505493	0.0004105659160974	0.0610601616204554	0.5744478677164702	0.0730903954693485	-0.0242359643781738	0.0291456362549538	0.0242359643781738	0.0268750014708076	0.0054965480274523	0.1064176132969382	-0.000236502578378	0.0427798186681609	0.000236502578378	0.0398521203510094	-0.0076515316548926	0.2597443864149526	0.0076515316548926	0.252099743746623	STH	13110	MAPT	117833	SPPL2C	167479	False	False	False	ref	65	0.001087	-35	0.0376
1835	chr17	46012870	T	C	rs4306559	0.0528543386	0.0200549029815124	0.0528543386	0.0215241401854615	0.0159480002264689	0.0645706822560894	0.0008555497183913	0.0144741579229652	0.0008555497183913	0.0152659248512321	0.5513895372358635	0.0989952989717532	0.0291732492883451	0.0145119708697752	0.0291732492883451	0.0158949651589061	0.0087944761589748	0.0215105500701935	0.0004724324226445	0.0115786493523422	0.0004724324226445	0.0123871806250037	0.0121059347088662	0.1472840522873562	0.0121059347088662	0.1521908400328598	STH	13619	MAPT	118342	SPPL2C	167988	False	False	False	alt	-100	0.0004687	-45	0.0686
1836	chr17	46013829	T	C	rs62062270	0.00444271924	0.6043540977060688	0.00444271924	0.6174514650974613	0.0074483864175421	0.6763806213888766	3.2408753197955806e-05	0.6516628993586865	3.2408753197955806e-05	0.6647797682164419	0.4628927685971845	0.2289733315236324	0.0021137229894105	0.4375278930846071	0.0021137229894105	0.4506504348296403	0.0034632714058222	0.3288080025449153	1.547217806502254e-05	0.4786648164391232	1.547217806502254e-05	0.4915708229957801	0.0018319692112988	0.6728193314099171	0.0018319692112988	0.6857899827335129	STH	14578	MAPT	119301	SPPL2C	168947	False	False	False	alt	95	0.001078	-50	0.01633
1837	chr17	46016130	A	G	rs62062275	0.0248735215999999	0.1237381504792028	0.0248735215999999	0.1310929029984036	0.0085141067108196	0.482812558137732	0.0002166316168015	0.1448944682965602	0.0002166316168015	0.1521180643548194	0.1724250251558626	0.694935130182426	0.004337727977399	0.2581110392195175	0.004337727977399	0.2694957066737656	0.0014813833142057	0.6876504574884365	3.83026114387618e-05	0.2682469326813809	3.83026114387618e-05	0.2792565886706734	0.0231620659965352	0.0453318195444491	0.0231620659965352	0.0465055885579001	STH	16879	MAPT	121602	SPPL2C	171248	False	False	False	alt	75	0.003437	-90	0.03802
1838	chr17	46024197	T	C	rs9468	0.027402452	0.1085719364018507	0.027402452	0.1152956275498523	0.0094690477629966	0.3587083303117824	0.0002622860139742	0.1112254420274983	0.0002622860139742	0.1174097580860292	0.597224037593751	0.0506220501369049	0.0164336491308726	0.0550140985301059	0.0164336491308726	0.0599906869117018	0.005663713637197	0.0962933363171274	0.0001574918262558	0.0629518326241909	0.0001574918262558	0.0678192504497846	0.0039274266330563	0.4399522886889783	0.0039274266330563	0.450799184140181	STH	24946	MAPT	129669	SPPL2C	179315	False	False	False	alt	100	0.02455	-75	0.06122
1839	chr17	46025272	A	G	rs1052590	0.0507643854	0.0226970676271236	0.0507643854	0.0241977025489648	0.018647971287426	0.0355761626872226	0.0010085244966877	0.0138088922737382	0.0010085244966877	0.0145027615109718	0.5373790184545483	0.1154832706699564	0.027676372243076	0.0173154287998049	0.027676372243076	0.0187876968389007	0.0101333780670792	0.0145642481606242	0.0005549468219493	0.0111192473198749	0.0005549468219493	0.0118696070649927	0.0122988827684933	0.1419782014593825	0.0122988827684933	0.1465139371257612	STH	26021	MAPT	130744	SPPL2C	180390	False	False	False	alt	-85	0.001785	35	0.01926
1840	chr17	46026250	C	T	rs17652748	-0.002590512826	0.6987725407231421	0.0031149070939999	0.6937306181984371	0.0062793879126327	0.912705940085994	-1.7689851249184917e-05	0.7632048075412595	2.0550156657231056e-05	0.7590223502080208	0.4632745152958019	0.224853024351573	-0.0011855250964499	0.548916216467109	0.001424340275768	0.5431084916245374	0.0029034595035155	0.437852622991229	-8.051624463917804e-06	0.610832878080413	9.358063756275312e-06	0.6056505905041285	-0.0010829987862944	0.7743584254686746	0.0012489756117801	0.7708733741025977	STH	26999	MAPT	131722	SPPL2C	181368	False	False	False	ref	-45	0.02304	100	0.09656
1841	chr17	46026459	T	C	rs75010486	0.0456112943999999	0.03285598330151	0.0456112943999999	0.0351541327617069	0.0080462024716959	0.5769175406027296	0.0003673854628341	0.0648861069280801	0.0003673854628341	0.0687747666617501	0.515156796232326	0.1475067567606171	0.0236824666229492	0.0258823722335948	0.0236824666229492	0.0282953136531518	0.0041475027692107	0.2302912619673272	0.0001909006953297	0.0482386167091648	0.0001909006953297	0.0519455548197245	0.0130603014554092	0.1311900929097549	0.0130603014554092	0.1354632417847097	STH	27208	MAPT	131931	SPPL2C	181577	False	False	False	alt	40	0.00616	70	0.03638
1842	chr17	46028854	A	G	rs79772576	0.0422518548	0.041672139353714	0.0422518548	0.0447966928508624	0.0091989380050636	0.3967786610055424	0.000396773135954	0.0594271268825111	0.000396773135954	0.0632650392330345	0.3286029938069896	0.4480404390948479	0.0139273870848506	0.0747119235529681	0.0139273870848506	0.0808501375623976	0.0030283807997395	0.4194740525415498	0.0001311329600517	0.0839956244384822	0.0001311329600517	0.0901179232148747	0.0310106951316922	0.0214272440870745	0.0310106951316922	0.0220154449248216	STH	29603	MAPT	134326	SPPL2C	183972	False	False	False	alt	-45	0.00343	-95	0.0417
1843	chr17	46031540	A	G	rs34579536	-0.0380628142	0.0625511794565875	0.0380628142	0.0591235481536808	0.0129781991076934	0.1318891114792686	-0.0004890850709308	0.0493915685404033	0.0004890850709308	0.0467742786567051	0.5718731522111226	0.075731054659894	-0.0218346015228876	0.0384249990611463	0.0218346015228876	0.0356288943998961	0.0074466671665121	0.0394444400143988	-0.0002813672910687	0.0337117731473004	0.0002813672910687	0.0314740739553989	-0.0072075436467182	0.2805815846875796	0.0072075436467182	0.27253373789241	STH	32289	MAPT	137012	SPPL2C	186658	False	False	False	ref	-100	0.0467	80	0.0443
1844	chr17	46033743	A	G	rs62062321	-0.000613248614	0.8406917462931344	0.001617241334	0.8392711599438921	0.0081429843272965	0.547059790810507	-4.369369366733542e-06	0.8450644563910865	1.334006916274396e-05	0.8440356758370761	0.416796854739157	0.3089210484478334	-0.0002325989103077	0.6886751477932832	0.0006538857828565	0.6868602957965873	0.0034042543474729	0.3475023110448648	-1.6220165663168198e-06	0.7011419247771414	5.419609982578688e-06	0.6993062657617131	-0.0004294650359443	0.8140914275074096	0.0009688897187729	0.8141053502411357	STH	34492	MAPT	139215	SPPL2C	188861	False	False	False	ref	20	0.003632	-40	0.05145
1845	chr17	46035019	A	G	rs62062322	-0.00268179284	0.7757820656632385	0.00268179284	0.7621010499042186	0.0219555145539693	0.0175840504955543	-5.983835591013525e-05	0.5363179006046972	5.983835591013525e-05	0.5238833918995478	0.2382389858815962	0.5972574732960055	-0.0006833352244641	0.7116251546074794	0.0006833352244641	0.6974956547931264	0.0051968975478923	0.1292329336552615	-1.516448601139356e-05	0.5296849944499512	1.516448601139356e-05	0.5166733790936401	-0.0022614342472431	0.6492313808053226	0.0022614342472431	0.6364885373652528	STH	35768	MAPT	140491	SPPL2C	190137	False	True	False	ref	50	0.001104	85	0.05933
1846	chr17	46038074	T	C	rs8077487	-0.0013529631999999	0.4785759507819324	0.00735889752	0.4767848604148779	0.007036250077887	0.7867114668254397	-1.3955697706298063e-05	0.5464650486756842	5.368243484705648e-05	0.5446537071640434	0.2077345200676355	0.6436301223773353	-0.000187869215665	0.5240166849317901	0.0015934371863475	0.5224250855787473	0.0014595081556807	0.7083302135346408	-2.2708505182103005e-06	0.5690266124718601	1.1587112383103352e-05	0.5673300506944914	-0.0020269919812445	0.3076453807205922	0.006491768586811	0.3061487320348027	STH	38823	MAPT	143546	KANSL1	187315	False	False	False	ref	-85	0.002186	30	0.02362
1847	chr17	46039584	T	G	rs7221390	-0.0137555132	0.2795695261758756	0.0137555132	0.269048529287815	0.0230095475459219	0.0152924745766099	-0.000323855709078	0.0950712758749285	0.000323855709078	0.0900974771629431	0.4806107947177874	0.2048284797465085	-0.0066007934517798	0.2010470855461544	0.0066007934517798	0.190956252292307	0.0110292223098644	0.0094851289607557	-0.0001550749634867	0.0774058542288448	0.0001550749634867	0.0723088903948891	-0.0052261952924822	0.3821775241868003	0.0052261952924822	0.372243769660283	STH	40333	MAPT	145056	KANSL1	185805	False	True	False	ref	100	0.0008583	100	0.0674
1848	chr17	46041482	G	A	rs62062137	0.00932319806	0.3826381391381916	0.00986788334	0.3931686334970378	0.0105957289865647	0.2789208646019415	8.946719340685238e-05	0.3530961129251622	9.662370379896492e-05	0.3624193248002721	0.3304660836730671	0.4513812252125928	0.0030748462605438	0.3506710915810979	0.0032703078044794	0.3618376202233188	0.0035204979128781	0.3193386205160275	2.9385044434965907e-05	0.3239534650131875	3.1953174436255856e-05	0.3339963163204562	0.0070374174005954	0.2983126741059298	0.0074150146785754	0.3047874413814931	STH	42231	MAPT	146954	KANSL1	183907	False	False	False	alt	-100	0.002953	100	0.01001
1849	chr17	46041954	C	T	rs55893711	-0.00970689088	0.3737017863722142	0.00970689088	0.3621227702807166	0.0083608464655966	0.5185438453575433	-8.236773252298057e-05	0.3946548075161398	8.236773252298057e-05	0.3838630754339796	0.2887727051110488	0.5122268637540807	-0.0027973308119616	0.3804632026505016	0.0027973308119616	0.3677725444328104	0.0024031359537066	0.5301858043316174	-2.3627499304718023e-05	0.3914536521967934	2.3627499304718023e-05	0.3793859286226789	-0.0075872156350169	0.2560956248064489	0.0075872156350169	0.2487289348455506	STH	42703	MAPT	147426	KANSL1	183435	False	False	False	ref	-5	0.0004272	15	0.00453
1850	chr17	46045882	T	C	rs62063670	0.0416157152	0.0426000955812213	0.0416157152	0.0458023721700732	0.0094996332575803	0.3618184681946584	0.0004011545254857	0.0558924239567545	0.0004011545254857	0.0594839584824876	0.2817996037303291	0.5263251114804328	0.0119332362407884	0.0923698152326945	0.0119332362407884	0.0995683390927856	0.0027004659341057	0.4726970270961346	0.0001160543453561	0.0954993364654155	0.0001160543453561	0.1020123602936785	0.036035643523273	0.0143535160781684	0.036035643523273	0.0147433973763756	STH	46631	MAPT	151354	KANSL1	179507	False	False	False	alt	-20	0.0006905	85	0.0622
1851	chr17	46047169	T	C	rs79065019	0.0092827284	0.3754170811559708	0.0092827284	0.3875990145644617	0.0115858310235475	0.1944393504677094	0.0001238180349309	0.300484941159099	0.0001238180349309	0.3102198214507927	0.1989398230272097	0.6585428220812187	0.0020522338132834	0.4593635518891922	0.0020522338132834	0.4733508381896575	0.0023649011024151	0.5223609541327084	2.762718940836768e-05	0.3865317193550037	2.762718940836768e-05	0.3993821690810801	0.0100063278664716	0.2141957331222054	0.0100063278664716	0.2198197277852193	STH	47918	MAPT	152641	KANSL1	178220	False	False	False	alt	90	0.005047	-80	0.0471
1852	chr17	46056168	C	T	rs111259120	-0.001127848566	0.7549030092469315	0.002724106474	0.750023016757221	0.023181072294289	0.0137273010129012	-2.233651485387412e-05	0.4949294683545733	6.227939037378816e-05	0.4900940002132598	0.1896637931928754	0.6747409020822986	-0.0001292943066847	0.7524262588870664	0.0004744794810127	0.7472541606404555	0.0044528327228156	0.1946682712997229	-2.460316893429921e-06	0.5763537774425863	1.1098947806569589e-05	0.5714197369843249	-0.0009149472504901	0.6001419152229742	0.0025207730370646	0.5959334332918443	STH	56917	MAPT	161640	KANSL1	169221	False	True	False	ref	95	0.0464	-95	0.06805
1853	chr17	46059211	A	C	rs111372048	0.0277895752	0.1029224615397885	0.0277895752	0.1094317505907701	0.0107636143916401	0.2356601963320048	0.0002976719394651	0.0904901775902067	0.0002976719394651	0.0958254324333856	0.2438738991068371	0.5870968073767515	0.0067824965293317	0.1719505731439743	0.0067824965293317	0.181648439734897	0.0026096639351897	0.4977159795895947	7.224977834564516e-05	0.151397665880561	7.224977834564516e-05	0.1599545215395803	0.0254235002437784	0.0370162286486555	0.0254235002437784	0.0379598533689896	STH	59960	MAPT	164683	KANSL1	166178	False	False	False	alt	-95	0.02696	-45	0.03284
1854	chr17	46059268	G	A	rs62060785	-0.00605272182	0.5265068801710586	0.00605272182	0.5136290498570868	0.0065045920553519	0.8832212286061734	-4.0643129742327386e-05	0.613766885465792	4.0643129742327386e-05	0.6009292217699468	0.2226454631272107	0.6210140573658003	-0.0013653094700382	0.5477282784217371	0.0013653094700382	0.5338829744497551	0.0014507643135765	0.7112322013641139	-9.15379845611349e-06	0.6080148438109575	9.15379845611349e-06	0.594378668138406	-0.0057303498998951	0.358449345276831	0.0057303498998951	0.349246522097148	STH	60017	MAPT	164740	KANSL1	166121	False	False	False	ref	-100	0.02612	-100	0.0729
1855	chr17	46063981	A	G	rs2838	0.0309557552	0.0928130129664803	0.0309557552	0.0987159093668875	0.008056864310848	0.5877067747216572	0.0002531764591931	0.1327685355714423	0.0002531764591931	0.1395763176106955	0.3271984149213166	0.45117226054758	0.010730359840212	0.1165807255324286	0.010730359840212	0.1247772074084917	0.0026790288767889	0.4820201642226265	8.874237107053015e-05	0.1444551226049712	8.874237107053015e-05	0.1528302837089077	0.0210645338644591	0.0593225674855056	0.0210645338644591	0.0609584098099737	STH	64730	KANSL1	161408	MAPT	169453	False	False	False	alt	-5	0.0004883	-40	0.02954
1856	chr17	46064755	G	A	rs76307183	-3.19298400000001e-05	0.7211042785939952	0.0029157515599999	0.7225123252820445	0.007010777400168	0.7788047835992684	4.740775698414436e-07	0.7602036517021232	2.017873059226082e-05	0.7618969320394947	0.2089834956794157	0.6446287325773488	-6.728347595136e-05	0.6930530277197637	0.0006326767031241	0.6945058250046651	0.0014478536436407	0.710277579345145	-3.323960718203397e-07	0.7261656485336204	4.34435380983495e-06	0.7277849214465749	0.0002510399485471	0.5562699431569677	0.0028859220531332	0.5578866568942443	STH	65504	KANSL1	160634	MAPT	170227	False	False	False	ref	100	0.01817	0	0.0
1857	chr17	46068970	A	C	rs62060802	0.032547419	0.0764023661951083	0.032547419	0.0815986991546103	0.0116629218490508	0.1817398521433935	0.000382390227543	0.0603343229927791	0.000382390227543	0.0641888609412214	0.0672787062106452	0.869447717952734	0.0021987066393284	0.4109401719574695	0.0021987066393284	0.4242821225723258	0.0007907737887057	0.8224393237937736	2.607256912584786e-05	0.3470827570447711	2.607256912584786e-05	0.359247365216846	0.0211039533605119	0.0533361820037033	0.0211039533605119	0.0549328169580671	STH	69719	KANSL1	156419	MAPT	174442	False	False	False	alt	30	0.000677	-75	0.0388
1858	chr17	46075892	A	G	rs62060840	0.0509636724	0.0232211932257489	0.0509636724	0.0250074678876785	0.009607716015666	0.3400301154327919	0.000494934023629	0.038879890387911	0.000494934023629	0.0415488124476365	0.1749292005103787	0.6990200316791637	0.0088399462745493	0.1331766467610601	0.0088399462745493	0.1419343061113054	0.0016842130622843	0.6675392045000271	8.604178948337418e-05	0.1316409190014554	8.604178948337418e-05	0.1396690922251103	0.0485793421093579	0.0041382224462106	0.0485793421093579	0.0042790221062793	STH	76641	KANSL1	149497	MAPT	181364	False	False	False	alt	95	0.00974	10	0.00483
1859	chr17	46082483	T	C	rs17576165	0.0670459342	0.0110321331083691	0.0670459342	0.0117719290176222	0.0135796453702907	0.1216903446132779	0.0010228440568534	0.0155948685782704	0.0010228440568534	0.0165379539564335	0.2955072148051328	0.5039395312809055	0.0208695545619915	0.0380656311283568	0.0208695545619915	0.0411989057400307	0.0041616241799237	0.2393161614662831	0.0003301495982765	0.0309159833399407	0.0003301495982765	0.0330614810809864	0.0566354422763721	0.0031230644899021	0.0566354422763721	0.0032173102835006	STH	83232	KANSL1	142906	MAPT	187955	False	True	False	alt	-85	0.001642	-75	0.01929
1860	chr17	46103631	C	T	rs62061812	0.0007449149399999	0.6733461646936559	0.00364598834	0.6755904388090838	0.0111384319305496	0.2196185162763365	4.067390852261693e-06	0.6036269631699682	3.923458413552877e-05	0.6053847555915143	0.1143206879739415	0.7987480287061071	9.640412779586004e-05	0.7522773134699228	0.000425381087274	0.7551142278290134	0.0012733277536938	0.7417636783334685	5.068236256953829e-07	0.715422274785138	4.556895030892445e-06	0.7180336119972487	0.0001452297223	0.4987255106137241	0.0033651801367233	0.5004368418723648	STH	104380	KANSL1	121758	LRRC37A	189103	False	False	False	alt	-100	0.00768	-5	0.004456
1861	chr17	46106250	C	A	rs17576989	0.00547792664	0.5258713994993555	0.00547792664	0.5385913422611649	0.0186816329370689	0.0352422027717931	0.0001046046753434	0.323974210630459	0.0001046046753434	0.3344099292981768	0.2595877550596998	0.5601185815544462	0.0013722347164646	0.5155290249108387	0.0013722347164646	0.5290518557375601	0.004864581125813	0.1498449151212379	2.6408793928330368e-05	0.3508053078485859	2.6408793928330368e-05	0.3625292955726834	0.0050207989709436	0.3780094991560516	0.0050207989709436	0.3881280182553001	STH	106999	KANSL1	119139	LRRC37A	186484	False	False	False	alt	-45	0.005436	-25	0.03053
1862	chr17	46107062	T	C	rs111295615	0.01113988374	0.3144503476238307	0.01113988374	0.3259781801205652	0.007312193288382	0.6779794867017288	8.272670747850717e-05	0.3762933858063986	8.272670747850717e-05	0.3875779610913469	0.2811045757736076	0.5300422546718465	0.0031768520331285	0.3340170130487216	0.0031768520331285	0.3467757812526184	0.0020649346629121	0.5951666079922887	2.369207995287544e-05	0.3765167392397968	2.369207995287544e-05	0.3889603415788047	0.0089108808182657	0.2055154155489721	0.0089108808182657	0.2113346603110013	STH	107811	KANSL1	118327	LRRC37A	185672	False	False	False	alt	-95	0.00393	95	0.0593
1863	chr17	46114469	A	G	rs17577313	0.0417692998	0.0446980112709329	0.0417692998	0.0477794261067067	0.0102216445104688	0.2857274657098704	0.0004457747286604	0.0537327051181035	0.0004457747286604	0.057013174752016	0.2561126152760921	0.5669914391810599	0.0109953150357705	0.1097192753968106	0.0109953150357705	0.1175668405644258	0.0026346105908774	0.487986809253359	0.0001174922997793	0.1030527849696633	0.0001174922997793	0.109682517809821	0.0374464465399018	0.0137988296396245	0.0374464465399018	0.0142131719227031	KANSL1	110920	STH	115218	LRRC37A	178265	False	False	False	alt	-100	0.009155	-65	0.0609
1864	chr17	46115029	G	T	rs4548919	-0.0040676266006	0.6769740616101005	0.0040791837194	0.6683347956443287	0.0112254763995007	0.2141650312904353	-4.791005253118432e-05	0.6074536428295276	4.8039973696899854e-05	0.5989632495764464	0.1770225832218176	0.695668495044908	-0.0007573159566924	0.7076895241769184	0.0007591026530281	0.69882103037141	0.0020162715165471	0.6021493739839889	-9.135724822282874e-06	0.6596052450573741	9.155810249856383e-06	0.6507771019849925	-0.0037261797321548	0.5067284676445474	0.0037303291527919	0.499013134610307	KANSL1	110360	STH	115778	LRRC37A	177705	False	False	False	ref	80	0.0159	-65	0.01624
1865	chr17	46118769	G	A	rs77560794	-0.0414145086	0.0506761364707389	0.0414145086	0.0475988842396962	0.0105374568161351	0.2686331040363675	-0.0004731027970627	0.0585981048984706	0.0004731027970627	0.0554231037198124	0.3886119150613595	0.3561641801391228	-0.0160715213368796	0.0695676348677853	0.0160715213368796	0.0644553598689	0.0040807115685992	0.2421655101526403	-0.0001832110307135	0.0683793114665967	0.0001832110307135	0.063937549736863	-0.0237907032230624	0.0490517780093248	0.0237907032230624	0.0478849813323444	KANSL1	106620	STH	119518	LRRC37A	173965	False	False	False	ref	90	0.00187	15	0.00896
1866	chr17	46121440	T	C	rs3087534	0.0497652958	0.0259066870801861	0.0497652958	0.0278505076836122	0.0101678657321108	0.2886283329934462	0.0005166036161767	0.0376865671011389	0.0005166036161767	0.0402311462437627	0.2951462152097013	0.5043115623306963	0.0150892102732627	0.0668601440450579	0.0150892102732627	0.0724214281959541	0.0030331582392655	0.41888159925531	0.0001583233729183	0.0684450780879742	0.0001583233729183	0.0735518540142193	0.0406228280376352	0.0085838869483608	0.0406228280376352	0.0088248655586007	KANSL1	103949	STH	122189	LRRC37A	171294	False	False	False	alt	-25	0.001096	-70	0.02808
1867	chr17	46124314	A	C	rs55672516	-0.00418601754	0.6345546475249756	0.00418601754	0.6211502741029077	0.0078886340257693	0.6151072676197871	-3.289432073571522e-05	0.6588052739159685	3.289432073571522e-05	0.6456343930051519	0.1742279484227014	0.6956430595378997	-0.0007752969288705	0.6591821400890235	0.0007752969288705	0.6446804615249695	0.0013663293362044	0.7210174371824966	-6.060445151710377e-06	0.6756252934705756	6.060445151710377e-06	0.6614053495814537	-0.0038734841647734	0.4674886468240278	0.0038734841647734	0.4568670636165446	KANSL1	101075	STH	125063	LRRC37A	168420	False	False	False	ref	-100	0.001251	-10	0.006104
1868	chr17	46143984	G	A	rs2532307	-0.01158144048	0.341542165754714	0.01158144048	0.3305438732843311	0.0091607547812437	0.3980464952017047	-0.0001044084696991	0.3455705247335685	0.0001044084696991	0.3352962975310397	0.3105862094005124	0.4806189680365639	-0.003767007249599	0.3312230975026756	0.003767007249599	0.3190414922591263	0.00285224007035	0.4315540377663998	-3.385119594594622e-05	0.3280862867071325	3.385119594594622e-05	0.3167352900629528	-0.0086017489807985	0.2508071296076456	0.0086017489807985	0.243902046539451	KANSL1	81405	STH	144733	LRRC37A	148750	False	False	False	ref	-90	0.11346	-100	0.0483
1869	chr17	46169258	C	A	rs2532276	-0.0420627574	0.0495033467166072	0.0420627574	0.0464243515084591	0.010348173113024	0.2825281323903364	-0.0004767212779897	0.0606748177710265	0.0004767212779897	0.0574533783839607	0.2772808846564798	0.5335450458878015	-0.012228995705106	0.109302277171914	0.012228995705106	0.1023440447441633	0.0029483518095346	0.4181974279443369	-0.0001419837213683	0.1031173600289935	0.0001419837213683	0.0972040187701112	-0.0358945632216101	0.0162172220755711	0.0358945632216101	0.0157636902848038	KANSL1	56131	LRRC37A	123476	STH	170007	False	False	False	ref	95	0.0392	-100	0.03528
1870	chr17	46189165	G	A	rs2696566	-0.0382900676	0.0635470763039318	0.0382900676	0.0596593936942149	0.0078926015003842	0.6044144850660979	-0.000314515906554	0.1024635661264104	0.000314515906554	0.0972870112724207	0.4125934916337306	0.3151352205203899	-0.0160787154854828	0.0704183039514922	0.0160787154854828	0.0652843788480839	0.0032821213709158	0.3682519258112981	-0.0001329336447408	0.0977604955113747	0.0001329336447408	0.0918247514077179	-0.0192201163912488	0.0821498158497686	0.0192201163912488	0.0799496359248417	KANSL1	36224	LRRC37A	103569	ARL17B	172601	False	False	False	ref	-45	0.00879	90	0.08527
1871	chr17	46708970	T	A	rs199437	0.0015445287	0.529395871363326	0.0060422129	0.5285545930938162	0.0099679964949726	0.3210257367676835	2.897211399991684e-05	0.4892337352425137	6.550992863864317e-05	0.4892322860198826	0.0887581821388188	0.8387473361783953	0.0002022405506272	0.7215775023770181	0.0005361107479449	0.7187625899782438	0.0009016535297844	0.8101924877250967	3.2270968467243468e-06	0.6860915224459818	5.961000340857884e-06	0.6839646480015719	0.0016784406477245	0.3991301215679043	0.0049979771574393	0.3985614446396152	NSF	118300	WNT3	124184	WNT9B	124232	False	False	False	alt	-90	0.02113	-90	0.01791
1872	chr17	46709947	G	C	rs538628	-0.0332476334	0.0882221844771223	0.0332476334	0.0831522893501855	0.0083574879965851	0.526788978709225	-0.0002885799300174	0.1188970839513709	0.0002885799300174	0.1130723469381729	0.0626375792280002	0.8863293166521182	-0.0021465542035051	0.4462272791137944	0.0021465542035051	0.4332726471324373	0.0005289985806222	0.8897853768440727	-1.8861300717282924e-05	0.4579003872360633	1.8861300717282924e-05	0.4454773804519183	-0.0217554124005435	0.0655925437291995	0.0217554124005435	0.0637477357014999	NSF	119277	WNT3	123207	WNT9B	123255	False	False	False	ref	100	0.01068	-40	0.0456
1873	chr17	46711919	A	G	rs199436	0.00574903472	0.5251803892397778	0.00574903472	0.5381517600652173	0.0062810938621024	0.8540003352889891	3.920524580257016e-05	0.6117207237816724	3.920524580257016e-05	0.6245745815557291	0.1500762456042074	0.7373405377070311	0.0008629067785731	0.6160886358419607	0.0008629067785731	0.6301302543981939	0.0009402842485904	0.8056584886597825	5.84610155775524e-06	0.6702641493315538	5.84610155775524e-06	0.68424073333403	0.0054253674830651	0.3502198197994515	0.0054253674830651	0.3596517011875409	WNT3	121235	NSF	121249	WNT9B	121283	False	False	False	alt	-100	0.00512	-95	0.03265
1874	chr17	46714277	G	A	rs199438	0.000484673556	0.7956335778416431	0.002135308964	0.7985488072468024	0.0204936507820298	0.0245844277669294	1.5018357609499653e-05	0.5626096646686005	4.499942135432717e-05	0.5657673922060341	0.0300936731708834	0.9478876139119066	1.3884279446956563e-05	0.9360147856419072	5.758927311770317e-05	0.938691266804417	0.0006116582519743	0.8786426297966058	4.768789009985002e-07	0.8790292608613046	1.2600430680508124e-06	0.8820705265108981	0.0003257295200157	0.8232494756780621	0.00088590130603	0.8260209782891078	WNT3	118877	WNT9B	118925	NSF	123607	False	False	False	alt	-90	0.002262	55	0.00461
1875	chr17	46723580	C	T	rs199453	-0.0133698081	0.2845759668836647	0.0133698081	0.2741566301355707	0.0078873099303162	0.6063101694609782	-0.0001087287685012	0.325238862485545	0.0001087287685012	0.3152319287023892	0.2187138870735173	0.6287657052398002	-0.002953288466812	0.3706335927790964	0.002953288466812	0.3582065665234381	0.0017325423118804	0.6591774507984991	-2.414422792112784e-05	0.3949121667783128	2.414422792112784e-05	0.3828318936789353	-0.012591416923412	0.1447944187196829	0.012591416923412	0.140531366571282	WNT3	109574	WNT9B	109622	NSF	132910	False	False	False	ref	-100	0.0078	-100	0.06506
1876	chr17	46724418	G	A	rs199451	-0.071701914	0.0073956903273407	0.071701914	0.0070312845393501	0.0179048026719196	0.0401496745670329	-0.0013036973878424	0.0081080265116339	0.0013036973878424	0.0077954775456579	0.1751532692247844	0.6964378157219255	-0.0127079871572773	0.097388007328366	0.0127079871572773	0.0907142502964047	0.0031811828081199	0.3459447227011452	-0.0002336118378572	0.0440425432053137	0.0002336118378572	0.0410750582188089	-0.0669716490834966	0.001142660752901	0.0669716490834966	0.0011021318017665	WNT3	108736	WNT9B	108784	NSF	133748	False	True	True	ref	-60	0.0004368	-10	0.00482
1877	chr17	46742756	G	A	rs199442	-0.0369838663999999	0.0666090194820578	0.0369838663999999	0.062421499683631	0.009139928338962	0.3988125822876248	-0.0003376142743139	0.0837140003014368	0.0003376142743139	0.0791195412012154	0.3538293965705038	0.4102986341760902	-0.0129627488074563	0.0938092501714573	0.0129627488074563	0.0872405310496182	0.0032339566817297	0.3733424567197319	-0.0001183552205981	0.1023007549548512	0.0001183552205981	0.0958818267785059	-0.0257575286050684	0.0447902254361468	0.0257575286050684	0.0436298811882923	WNT3	90398	WNT9B	90446	NSF	152086	False	False	False	ref	45	0.013115	-85	0.05032
1878	chr17	46746847	T	G	rs199534	-0.0067027076	0.494916393143571	0.0067027076	0.4821870270496533	0.0220266464035801	0.0175548535192627	-0.0001518699774566	0.2490390705691654	0.0001518699774566	0.2396853446496495	0.0901399392109876	0.8391428321384309	-0.0005759489754624	0.7124444800586915	0.0005759489754624	0.6985258931588454	0.0019807651122181	0.6031734103517352	-1.3107138922910664e-05	0.5242052446203967	1.3107138922910664e-05	0.5111760644208756	-0.0055228788680379	0.3680378717978543	0.0055228788680379	0.358350157139844	WNT3	86307	WNT9B	86355	NSF	156177	False	True	False	ref	-100	0.008896	95	0.04944
1879	chr17	46765770	C	T	rs199528	0.0078572324	0.4114035887430819	0.0078572324	0.4239298395963309	0.0080063150411985	0.5905522874798376	6.143300131947307e-05	0.4489568914246193	6.143300131947307e-05	0.4606083511693117	0.5387690743679914	0.1154823435382269	0.0042610457050056	0.2655192326005973	0.0042610457050056	0.2771474137940643	0.0043056475328098	0.2159633025915672	3.3255493938190946e-05	0.2914307706690053	3.3255493938190946e-05	0.3025899710613124	0.0020311414018817	0.6376993743370899	0.0020311414018817	0.6505311072753047	WNT3	67384	WNT9B	67432	GOSR2	157306	False	False	False	alt	80	0.001488	-60	0.0238
1880	chr17	46771151	C	A	rs199523	-0.0701100448	0.0090861381781759	0.0701100448	0.0085595768208691	0.0256174350707647	0.0087098074499205	-0.0018347635695575	0.0046222179564814	0.0018347635695575	0.0044606251480735	0.8505731387255056	0.0043921674000309	-0.0593921553945962	0.0016935758220176	0.0593921553945962	0.0015746197476128	0.0217534484656137	0.0010219890114971	-0.0015512738291032	0.0020673061169701	0.0015512738291032	0.0019677382423288	-0.0136889386819364	0.1349608078476988	0.0136889386819364	0.1308287935571347	WNT3	62003	WNT9B	62051	GOSR2	151925	True	True	True	ref	-5	0.0005417	100	0.0773
1881	chr17	46777214	A	C	rs199518	0.0012368835259999	0.5913392492152533	0.004700252874	0.5951945716537295	0.0356556844368173	0.0020351389600615	1.16957900946255e-05	0.2298805448284122	0.000160747653878	0.2315308671515972	0.4809074782933432	0.2032395274368502	0.0006493037484343	0.4389954715669378	0.0022802845374323	0.4422679628944794	0.0171000480725658	0.0021877084074422	7.731458502916667e-06	0.1782640352841972	7.782033654325817e-05	0.1797740543357022	0.0001390055913443	0.7109578663984195	0.0016037510762559	0.7124231021071459	WNT3	55940	WNT9B	55988	GOSR2	145862	False	True	True	alt	5	0.0001068	90	0.03021
1882	chr17	46777221	A	G	rs199517	0.0096013118	0.3646414922444946	0.0096013118	0.3764945460410464	0.0203847594362743	0.0243290837687612	0.0001933855655752	0.1740308189810668	0.0001933855655752	0.181972787158709	0.4830631023143393	0.2002225422011024	0.0046052641060811	0.2527123529828559	0.0046052641060811	0.263949464732611	0.0098305232220046	0.0135735357873	9.264950963985572e-05	0.1224934560298134	9.264950963985572e-05	0.1301590142222862	0.0035124845693419	0.4870336355449784	0.0035124845693419	0.4985739244329625	WNT3	55933	WNT9B	55981	GOSR2	145855	False	False	False	alt	95	0.001053	80	0.02907
1883	chr17	46779275	G	C	rs199515	0.0382958732	0.0553926439040534	0.0382958732	0.0587201448432684	0.0142214908913784	0.1012278309369703	0.0005842880081909	0.0366614690506073	0.0005842880081909	0.0386368280738034	0.6117802051888506	0.0396173090868197	0.0233731881080746	0.0286600034836022	0.0233731881080746	0.0311033799441515	0.0086932008075584	0.0223465796265783	0.0003565456218101	0.0228260445155193	0.0003565456218101	0.0245154889258145	0.0045124949428935	0.4039916838804361	0.0045124949428935	0.414352730017956	WNT3	53879	WNT9B	53927	GOSR2	143801	False	False	False	alt	-90	0.013084	70	0.1019
1884	chr17	46783637	C	T	rs199504	-0.0164640367999999	0.229929895527642	0.0164640367999999	0.2204389356070243	0.0075304500400967	0.6620199261557921	-0.0001285722510292	0.281519413864174	0.0001285722510292	0.2719884887413109	0.4200168051535803	0.2907614339848675	-0.0068391104398105	0.1919182885331533	0.0068391104398105	0.182295180059345	0.0031320623013608	0.3895430897750205	-5.29424907582198e-05	0.2280096006577106	5.29424907582198e-05	0.2183376495774661	-0.0087428292824613	0.2463191021920388	0.0087428292824613	0.2392622543808528	WNT3	49517	WNT9B	49565	GOSR2	139439	False	False	False	ref	-70	0.001261	95	0.03732
1885	chr17	46784796	G	A	rs199503	0.0104294656	0.3230019870583037	0.0104294656	0.3342339350026355	0.0174037781384398	0.0475881413848475	0.0001861590571782	0.172358605710519	0.0001861590571782	0.1802717253969593	0.4774281890890984	0.2093981196420583	0.0049643853964765	0.2283670752480649	0.0049643853964765	0.2390633309880811	0.0082946781578186	0.0264122835326202	8.846270609708768e-05	0.1263021788040273	8.846270609708768e-05	0.1338018164249232	0.0040083403354805	0.4415418192251991	0.0040083403354805	0.4525396319090335	WNT3	48358	WNT9B	48406	GOSR2	138280	False	False	False	alt	95	0.012955	-50	0.07117
1886	chr17	46788237	T	C	rs199498	-0.00104226773958	0.7608569965317056	0.00257878470042	0.7638513436880627	0.0226671729048112	0.0156146986893904	-3.205551167777395e-05	0.545134357010553	6.213138104589798e-05	0.5463358291665363	0.3473749727694271	0.417415726860473	-0.00025849909691	0.6627786534267293	0.0008555392846764	0.6665639435865501	0.0077981566639321	0.0323405316315878	-8.665808296426369e-06	0.4800336865019916	2.02934075767336e-05	0.4825003000627096	-0.0011473148061702	0.7071998954915922	0.0018527163144845	0.7085978678061429	WNT3	44917	WNT9B	44965	GOSR2	134839	False	True	False	ref	70	0.002802	95	0.01892
1887	chr17	46881571	A	G	rs4968282	0.0359920706	0.0623753296331599	0.0359920706	0.0668637777003857	0.0077723242935356	0.6385708244236702	0.0002802667996329	0.0997297884125034	0.0002802667996329	0.1054418126025834	0.3263996514486664	0.4511174651225976	0.0117066169433449	0.0921819255688239	0.0117066169433449	0.0993064929192663	0.0025250405303394	0.5054110673103003	9.076397463070452e-05	0.1197091793793828	9.076397463070452e-05	0.1274259383914332	0.0269110675421943	0.0366777410866493	0.0269110675421943	0.0376643314985078	GOSR2	41505	ENSG00000262633	41563	WNT9B	48369	False	False	False	alt	-65	0.001641	60	0.04562
1888	chr17	46885958	G	A	rs34316808	0.0163672932	0.2125917621913662	0.0163672932	0.2224162546671347	0.0112383518341497	0.2071812443580206	0.0001859077530985	0.1817660194103353	0.0001859077530985	0.1899639064495785	0.1893131671490367	0.6671846985195439	0.0033135665650692	0.3315960044387248	0.0033135665650692	0.3443203945484485	0.002106318101528	0.5749906747017947	3.726655937307677e-05	0.2871769094872848	3.726655937307677e-05	0.2984009846049819	0.0143486965632423	0.1092749383456679	0.0143486965632423	0.1127913924250021	GOSR2	37118	ENSG00000262633	37176	WNT9B	52756	False	False	False	alt	-30	0.001337	-60	0.03464
1889	chr17	57657987	A	G	rs4530197	-0.0092038719999999	0.4100078543679599	0.0092038719999999	0.3980245879043321	0.0077620248660885	0.6414107125393943	-7.107449603863338e-05	0.4570333280603396	7.107449603863338e-05	0.4455497576311146	0.2685629518978413	0.539863280059294	-0.002500135505983	0.4246909550132939	0.002500135505983	0.4118383011558831	0.0020461766179705	0.5904052292768764	-1.898479920742443e-05	0.4550335677655464	1.898479920742443e-05	0.4424095924959914	-0.0075270490357783	0.2807579754209364	0.0075270490357783	0.2725644334839771	CCDC182	87312	MRPS23	192069	CUEDC1	297425	False	False	False	ref	-65	0.002668	50	0.02109
1890	chr17	57668632	G	T	rs12603880	0.01098988546	0.3356884991740909	0.01098988546	0.3474196217302903	0.0121092692126487	0.1693173197158684	0.0001447407124181	0.2605267655802944	0.0001447407124181	0.2700721747672147	0.1985912716936897	0.6519604654174131	0.0020003302556344	0.4322259867131778	0.0020003302556344	0.4453720697046061	0.0023718554485738	0.5181907776383604	2.607536518842765e-05	0.3601361158149381	2.607536518842765e-05	0.3722224504408611	0.0107594477121131	0.2004661544661716	0.0107594477121131	0.2064506258930305	CCDC182	76667	MRPS23	181424	CUEDC1	286780	False	False	False	alt	95	0.001595	90	0.03412
1891	chr17	63480868	A	G	rs4305	0.0340257448	0.0720602410821089	0.0340257448	0.0770072937111384	0.0089211591010151	0.4346107075622354	0.0003090327333145	0.0898688054075729	0.0003090327333145	0.0952276974180381	0.4603118289608813	0.2330955820480973	0.0155354607438517	0.0605844265424908	0.0155354607438517	0.0658837937020501	0.004090401612966	0.2411217433629259	0.0001405501149671	0.0738754761417557	0.0001405501149671	0.0794830114101582	0.0147345926824967	0.1185898571797623	0.0147345926824967	0.1222306226144716	ACE	3806	ENSG00000264813	3956	CYB561	34514	False	False	False	alt	-100	0.004967	25	0.02301
1892	chr17	80556797	A	G	rs72855201	-0.0031561384879999	0.7204244537996234	0.0031561384879999	0.7067195224287764	0.0322269352012591	0.0028249236373633	-0.0001046920662849	0.3608870181582413	0.0001046920662849	0.3502173081519736	0.227736802248986	0.6072859891648498	-0.0006684118172304	0.691563117431036	0.0006684118172304	0.6773731963925458	0.0072658906595521	0.0413563594288966	-2.1994500772657272e-05	0.4197563117807313	2.1994500772657272e-05	0.4074113651720665	-0.0029502380730089	0.5695397337538748	0.0029502380730089	0.5575193761542598	ENSG00000289764	11721	RPTOR	11977	NPTX1	78954	False	True	True	ref	25	0.009155	-25	0.0323
1893	chr17	80581712	G	T	rs114177791	-0.0048084377	0.5081754026045231	0.0068127473	0.5002546173475655	0.0090321541075356	0.4239233312843031	-4.740454813740151e-05	0.5008342967884746	6.267970381792801e-05	0.4934437152426182	0.3380304774945798	0.4193867408109357	-0.0016390537742182	0.4377169732504845	0.0024374176408995	0.430225192144009	0.0030266494861367	0.3954515135330314	-1.61717251239345e-05	0.432649819254403	2.2256180645473693e-05	0.4254906655072193	-0.0036224442162262	0.4473271477008584	0.0043900870340978	0.4404555903453835	ENSG00000289764	36636	RPTOR	36892	NPTX1	103869	False	False	False	ref	100	0.002768	-90	0.05023
1894	chr18	4999143	G	A	rs11665120	-0.00110592588	0.6633269532359253	0.0041892780399999	0.6590019023731293	0.0083772338333703	0.5157363013349877	-6.5979285094499565e-06	0.6724346321343536	3.4203290945708875e-05	0.6685765906897545	0.2745733876907437	0.5358735613606808	-0.0005264449447323	0.6003756668746146	0.0012261495632087	0.5952012464339055	0.0022788634737932	0.5566113839213492	-3.623350394850788e-06	0.6107231495204599	9.876223902770465e-06	0.6060585775610855	-0.0001348561707071	0.542945779175834	0.0030850942437161	0.5403201957412728	AKAIN1	198360	ZBTB14	297910	DLGAP1	543836	False	False	False	ref	-55	0.00519	70	0.0415
1895	chr18	29784902	T	C	rs113895388	-0.001889929798	0.8285262292974416	0.001889929798	0.8148510853236823	0.0065231923283487	0.8669184627483394	-1.2793198088646912e-05	0.8643623505543628	1.2793198088646912e-05	0.8509592480327155	0.0001576779842114	0.9998965965246184	-4.168055075002992e-07	0.9868263788723582	4.168055075002992e-07	0.9990812865117789	1.0756081507301172e-06	0.9999199982372432	-2.8927457669137353e-09	0.9866619453885516	2.8927457669137353e-09	0.9992395710432508	0.0	0.9891710431879768	0.0	1.0	DSC3	1257913	DSC2	1317698	DSC1	1377954	False	False	False	ref	100	0.02863	100	0.06213
1896	chr18	29821318	T	G	rs188275234	-0.0022801354999999	0.6236661949805005	0.0045221883	0.6220444890030941	0.0175078541101343	0.0464934160187194	-4.833102388480601e-05	0.4394832781059059	8.319309478620926e-05	0.4373332358155298	0.3341528439091691	0.4436759285105214	-0.0009617983032428	0.5257366777947771	0.001613171630051	0.5240994120951242	0.0058969794696763	0.0888188243476563	-1.985205348362332e-05	0.380727472274564	2.995425049630645e-05	0.3787105237535642	-0.0013672340999388	0.5611399393604386	0.0029855081484247	0.559542852051687	DSC3	1221497	DSC2	1281282	DSC1	1341538	False	False	False	ref	-65	0.00289	-100	0.06445
1897	chr18	29901722	G	T	rs11083369	0.0094549338999999	0.3518944787924277	0.0094549338999999	0.3634795100070861	0.031768447113671	0.0029076769376936	0.0002960269607814	0.0899322891446109	0.0002960269607814	0.0951248463196137	0.090772725858152	0.8363581035240549	0.0008922998250776	0.6031578526552075	0.0008922998250776	0.6170865578478245	0.002940228173452	0.3849156147893228	2.8357054552946263e-05	0.33340143824304	2.8357054552946263e-05	0.3449777851249568	0.007867301528024	0.2517154324505814	0.007867301528024	0.2592624014943505	DSC3	1141093	DSC2	1200878	DSC1	1261134	False	True	True	alt	-95	0.06775	-100	0.1425
1898	chr18	53185406	A	C	rs7505145	-0.0292774074	0.1102589084165399	0.0292774074	0.1045262740837222	0.0210760574505643	0.0249981136789999	-0.0007468300250998	0.0393426339812552	0.0007468300250998	0.0373433590422095	0.1546655048288882	0.7332898885249222	-0.0051180053361055	0.2800127371743235	0.0051180053361055	0.2686267786489454	0.0035015424499828	0.3063601047067764	-0.0001417206695331	0.1340758420994861	0.0001417206695331	0.1276262282910795	-0.0267450907167086	0.0374235597771062	0.0267450907167086	0.0363342724767023	DCC	845208	MBD2	1039263	POLI	1084112	False	False	False	ref	25	0.01831	25	0.01012
1899	chr18	53198529	G	A	rs62099231	-0.00240927512	0.7148397426360555	0.00335261968	0.7053010253908276	0.0061061342795014	0.9071262037820976	-1.473829429298327e-05	0.7853457927199717	2.0692123061429324e-05	0.7757102094145876	0.0334277326528283	0.9415724220859176	-3.405366554372994e-05	0.9153834391816122	0.0001082107109029	0.9056591708367814	0.0002083967303374	0.958075936181248	-2.112383693338406e-07	0.934359733639944	6.792734569103115e-07	0.9245363028644016	-0.0006265625162086	0.7471242979887083	0.0014356995404515	0.7382239939901348	DCC	858331	MBD2	1026140	POLI	1070989	False	False	False	ref	100	0.004963	-20	0.01996
1900	chr18	53256222	A	G	rs4100041	0.00192719368	0.7695935356806097	0.00236192312	0.7768756412880251	0.0100668243185941	0.2968044764084155	1.926363159330556e-05	0.7305613910314928	2.381096619970796e-05	0.7378556464104115	0.2038672600338177	0.6503811587316638	0.0003675859104413	0.741176696665586	0.000449720866183	0.7482527680592742	0.0020388631646242	0.5980734355083959	3.655204134229411e-06	0.7170974416027341	4.514347955082393e-06	0.7242117845733574	0.0017054118818659	0.6260445557748879	0.002228238882146	0.6331479815117113	DCC	916024	MBD2	968447	POLI	1013296	False	False	False	alt	-100	0.01787	-10	0.01079
1901	chr18	53318766	T	G	rs77916462	-0.002792835954	0.7458655582159351	0.002792835954	0.7336970906617719	0.0305443913260408	0.003890165961141	-8.902984800179066e-05	0.4056459430513211	8.902984800179066e-05	0.3946450011064454	0.1933754499528003	0.6682439684953689	-0.0005045081673963	0.7510571729897798	0.0005045081673963	0.7372128138653908	0.0058079397827324	0.0917162245315875	-1.6180426343441255e-05	0.5069195493013452	1.6180426343441255e-05	0.4940260273265445	-0.0027510658824261	0.5840440117536522	0.0027510658824261	0.5720722112659101	MBD2	905903	POLI	950752	DCC	978568	False	True	True	ref	95	0.003357	95	0.0558
1902	chr18	53318768	T	G	rs75048819	-0.00230072638	0.7972154761751331	0.00230072638	0.7834289104955141	0.0306224058099502	0.0035033448269422	-7.026073993579546e-05	0.4551609227336406	7.026073993579546e-05	0.4440015646057412	0.193309059222606	0.6683464611363819	-0.000445545954086	0.7643255981249775	0.000445545954086	0.7501509423811338	0.005865470736498	0.0873007324029198	-1.3504656979336987e-05	0.5261586145847142	1.3504656979336987e-05	0.513154412411805	-0.0021950435170489	0.6453934274009998	0.0021950435170489	0.6328746417202007	MBD2	905901	POLI	950750	DCC	978570	False	True	True	ref	100	0.003754	100	0.04935
1903	chr18	53425189	G	A	rs138740375	-0.0013170026399999	0.7299075772823327	0.00295132828	0.7269573650588693	0.0090838398466586	0.4190279868554643	-9.663074533310966e-06	0.716141474917338	2.6198333983174594e-05	0.7135713890055171	0.2025166236164275	0.6514248717050785	-0.00020713108667	0.6995442192997104	0.0005744802516783	0.6971751257185368	0.0018474230828509	0.6307785265742616	-1.4189625146902593e-06	0.6929419889774725	5.116795928248333e-06	0.690680062167694	-0.0011307171236216	0.5645292804641059	0.0028195313229389	0.5617246406186318	MBD2	799480	POLI	844329	C18ORF54	932718	False	False	False	ref	100	0.0283	-100	0.06616
1904	chr18	55083457	T	G	rs11874716	-0.00838090162	0.4251255688556676	0.00838090162	0.4130381020991802	0.0234933861818793	0.0131030004083202	-0.0001956935185118	0.1840402370111936	0.0001956935185118	0.1761406707996556	0.2056784821419309	0.6481172639907697	-0.0017024210313595	0.4977669867040717	0.0017024210313595	0.4844002250453394	0.0049299989224912	0.1473117580952502	-4.054277941151919e-05	0.2806439495464667	4.054277941151919e-05	0.2699145938451929	-0.0076038133175654	0.2540979770271993	0.0076038133175654	0.2468747878545665	CCDC68	123996	RAB27B	365596	DYNAP	495699	False	True	False	ref	-65	0.001694	-65	0.01434
1905	chr18	55085469	C	T	rs4801131	-0.00296952293	0.7537939732235989	0.00304512155	0.7431796044454279	0.0064251017603233	0.8498021477077092	-1.8702245227774747e-05	0.8132240181035321	1.918687711853176e-05	0.8028293422654483	0.1127999253104285	0.8015069035280329	-0.0004487714841105	0.8006185492764379	0.0004544383025136	0.7897040983128089	0.0007291726647304	0.8481430336762122	-2.8180471211225607e-06	0.8363750391329531	2.854374780565192e-06	0.8255945231687465	-0.0025954626085332	0.6107515105683144	0.0026452556561789	0.601266301444	CCDC68	126008	RAB27B	367608	DYNAP	497711	False	False	False	ref	30	0.0013275	-100	0.01784
1906	chr18	55086009	C	T	rs4589643	0.00947513804	0.345855957702339	0.01068492736	0.3544595311040664	0.0131272723854017	0.1254075676497908	0.0001422225315576	0.2500681923476894	0.000155430664861	0.2571797079406793	0.1492691832902831	0.7404897511042055	0.0014665584034532	0.4962978877540593	0.0016790518204637	0.505325934650618	0.0019935841197633	0.604708320435033	2.282335281470297e-05	0.4053824719055425	2.5143295066107933e-05	0.4139543643883817	0.0096308052988101	0.1995371752160596	0.0104938847913359	0.2031742535142792	CCDC68	126548	RAB27B	368148	DYNAP	498251	False	False	False	alt	-50	0.008644	-95	0.03735
1907	chr18	55157406	C	T	rs4608411	-0.003739845008	0.6417182730946732	0.003953545472	0.6309452977080205	0.0079496541411869	0.5975991142139436	-2.890405695950644e-05	0.6621985270890737	3.0754442810801865e-05	0.6520596395999346	0.1951534766958163	0.6663578858816205	-0.0007424806248029	0.6562466583059872	0.0007804926564646	0.6448001796264805	0.0015457084741705	0.6907248273580289	-5.723275045075923e-06	0.6698958782931406	6.0524129634377606e-06	0.6588094143391799	-0.0035809500098548	0.4654960940059773	0.0038880071370034	0.4570905765471734	CCDC68	197945	RAB27B	439545	TCF4	507381	False	False	False	ref	70	0.001446	-95	0.05142
1908	chr18	55205375	T	G	rs78468782	0.001144618802	0.82748326352706	0.001604167402	0.8372447230087715	0.007765465405721	0.5915342098621612	9.352803873234422e-06	0.8344934063562601	1.2271858791676432e-05	0.8444200351091505	0.2195769665660432	0.614800188062101	0.0003121386292703	0.7611268957286849	0.0003679667357132	0.7716223892718448	0.0017564539702925	0.6253916601312149	2.5321948649860248e-06	0.7698624211906462	2.886815267167317e-06	0.7805183672418463	0.0009315449330387	0.7302720465413496	0.0014170271475844	0.7395725052238831	CCDC68	245914	TCF4	459412	RAB27B	487514	False	False	False	alt	-100	0.002691	90	0.04834
1909	chr18	55207250	G	T	rs79694868	-0.011509348	0.3419822792813353	0.011509348	0.3305692720079288	0.00970390937617	0.3291929266077071	-0.0001146209485881	0.322193563177268	0.0001146209485881	0.311970995293864	0.2850589736408054	0.5229806639178599	-0.0033326949374406	0.3615009991040562	0.0033326949374406	0.348913508575649	0.0027693216831521	0.4648062780886615	-3.324733356818722e-05	0.3405894543586476	3.324733356818722e-05	0.3289811863261958	-0.0086930362348156	0.2219216419431681	0.0086930362348156	0.2157968582454546	CCDC68	247789	TCF4	457537	RAB27B	489389	False	False	False	ref	-5	0.0001411	35	0.03455
1910	chr18	55210035	C	T	rs9953026	-0.0588275772	0.0164896570137994	0.0588275772	0.015423242114724	0.0139749228590807	0.0991217260065287	-0.0008375693616941	0.0176779172421282	0.0008375693616941	0.0167476972868052	0.1470782891938712	0.7448382211574879	-0.0088564488565837	0.1506112136311849	0.0088564488565837	0.1420868228753981	0.0020976649804401	0.5834653105158821	-0.0001289888654877	0.0989333007692454	0.0001289888654877	0.0929384078830776	-0.0542246288861917	0.0029485843157668	0.0542246288861917	0.0028853229852686	CCDC68	250574	TCF4	454752	RAB27B	492174	False	True	False	ref	65	0.00859	100	0.04724
1911	chr18	55212207	T	C	rs74776973	-0.00140128972	0.8004623048976822	0.00230390512	0.7930506099997446	0.0118236508905751	0.18007696942565	-1.8587065800011185e-05	0.7235228521117475	2.867563183479875e-05	0.716188989342938	0.0675421944211039	0.8752074360562325	-8.837228662525229e-05	0.8892257942728983	0.0001463968262922	0.8816598727329161	0.0007954350236617	0.8326691503833278	-1.169143964587849e-06	0.8583122400296083	1.817686415418029e-06	0.8507050853883268	-0.0010456540005601	0.7203907910000192	0.0016348717310345	0.7132379198791594	CCDC68	252746	TCF4	452580	RAB27B	494346	False	False	False	ref	-100	0.002403	-60	0.0227
1912	chr18	55213644	C	A	rs79467351	0.0065411443399999	0.4711575741624764	0.0065411443399999	0.4836454940132315	0.021070009181403	0.0218375382220138	0.0001407010711425	0.2387712769565389	0.0001407010711425	0.2481443756745145	0.2164856481913712	0.6296983798858902	0.0013859363172503	0.5065652357226967	0.0013859363172503	0.5202185074712542	0.0044763134363058	0.1917483303649904	2.920617156233636e-05	0.3154315372039786	2.920617156233636e-05	0.3269423957473943	0.0063548377057853	0.2951174545425618	0.0063548377057853	0.3039188256600529	CCDC68	254183	TCF4	451143	RAB27B	495783	False	False	False	alt	40	0.001625	45	0.042
1913	chr18	55219838	T	C	rs76339649	0.004498981	0.6024159541693788	0.004498981	0.6153850959186087	0.0086709923155101	0.4672859905253093	3.734284469974212e-05	0.6145521836161846	3.734284469974212e-05	0.6273469944503692	0.2580524694239566	0.5647105024735412	0.0012360966726025	0.5543634282913542	0.0012360966726025	0.5679431888965464	0.002218620224946	0.5708736230926793	1.0246652745259287e-05	0.5656758464981713	1.0246652745259287e-05	0.5789634601389436	0.0036514901606862	0.4728177915220147	0.0036514901606862	0.4843046726759312	CCDC68	260377	TCF4	444949	RAB27B	501977	False	False	False	alt	-10	0.0003662	-45	0.00997
1914	chr18	55220120	A	T	rs187698281	0.0036493492199999	0.6456602997500482	0.0036493492199999	0.6590353908620312	0.0116910503641672	0.1822719097439498	4.321646685313296e-05	0.557619281695527	4.321646685313296e-05	0.5700672000767387	0.262459154140603	0.5574388604665746	0.0009777874638512	0.5924002803005006	0.0009777874638512	0.6059166687468922	0.0030737749689101	0.4100567045709681	1.161446487968562e-05	0.5319348387018555	1.161446487968562e-05	0.5450513869112193	0.0032884158549362	0.5009480912804393	0.0032884158549362	0.5123947034540686	CCDC68	260659	TCF4	444667	RAB27B	502259	False	False	False	alt	70	0.007507	100	0.0484
1915	chr18	55221949	T	A	rs116959829	0.016715539	0.2121785418254181	0.016715539	0.2218041126241985	0.0085139327585802	0.479037995223699	0.0001453512390951	0.2334174300386647	0.0001453512390951	0.2424372432936368	0.1591717756408261	0.7257575253416908	0.0026545682132479	0.3687894798807515	0.0026545682132479	0.3812990991981812	0.0013513394913235	0.7267716014106043	2.2979291277908072e-05	0.3768716275773174	2.2979291277908072e-05	0.3888761766304277	0.015827965020384	0.0994360125271394	0.015827965020384	0.1025016266684745	CCDC68	262488	TCF4	442838	RAB27B	504088	False	False	False	alt	90	0.005585	10	0.00839
1916	chr18	55236277	G	T	rs73487018	-0.0256119328	0.1393867090178342	0.0256119328	0.1321872620732734	0.0074076650083881	0.6945978867109502	-0.0001972236433516	0.190949372534871	0.0001972236433516	0.1830572627648635	0.2092324609176443	0.6351038684742899	-0.0056204007392283	0.2419408421600148	0.0056204007392283	0.2310487575860086	0.0015646598776081	0.6856821583959348	-4.40650036265869e-05	0.2831661378603756	4.40650036265869e-05	0.2724146273551039	-0.0232429796989594	0.0537512566958791	0.0232429796989594	0.0523750611123422	CCDC68	276816	TCF4	428510	RAB27B	518416	False	False	False	ref	65	0.010284	100	0.05847
1917	chr18	55236451	A	G	rs73487023	0.0022621073	0.6998462195592675	0.0031159173399999	0.7067748429054396	0.0185629329943518	0.0369040144393197	3.532831872988815e-05	0.5064688355034456	5.439751182349719e-05	0.5129598875663404	0.2104337181920973	0.6338056394992065	0.0003867611745405	0.6828920239628085	0.000598309340696	0.6897968781640283	0.0039158206247179	0.2639614055637777	5.815480966715761e-06	0.5483235166432365	1.0462156915497632e-05	0.5551330783266603	0.0020643367669789	0.5422811058280805	0.0028319795848504	0.5481738526074729	CCDC68	276990	TCF4	428336	RAB27B	518590	False	False	False	alt	65	0.01016	-35	0.01495
1918	chr18	55242449	A	C	rs150458109	-0.00772436012	0.4463506128566706	0.00772436012	0.4343466806896008	0.0194153318459979	0.0306022645634461	-0.0001532276189134	0.2478978751583812	0.0001532276189134	0.2387557178420934	0.2279359744395688	0.6097357547593035	-0.0018052578788477	0.4856975715358762	0.0018052578788477	0.4724311760403107	0.0045444889663603	0.1875016383890403	-3.688168710403901e-05	0.3112602465666437	3.688168710403901e-05	0.3002471647825041	-0.0070975839998339	0.2872784340582813	0.0070975839998339	0.2790216690879141	CCDC68	282988	TCF4	422338	RAB27B	524588	False	False	False	ref	100	0.0279	85	0.0333
1919	chr18	55247745	T	C	rs142300078	0.00059404654	0.6859527037874847	0.00366696922	0.6883484158274372	0.0186885442678921	0.0369543480438401	-2.4305053777213224e-07	0.4812660667196075	7.040154920940233e-05	0.4828391358443711	0.2562848162325334	0.5694119513659173	0.0002030571982954	0.6332324293545472	0.0009739619712596	0.635992253696678	0.0047863900866063	0.1562436249186324	8.420308170122603e-07	0.477430326396987	1.866292881869336e-05	0.4794863832887054	4.1494206371420034e-05	0.5540605891113509	0.0029834334381061	0.5557085730851016	CCDC68	288284	TCF4	417042	RAB27B	529884	False	False	False	alt	80	0.008026	15	0.01355
1920	chr18	55272905	G	T	rs146016468	-0.0161614658	0.2347524088141172	0.0161614658	0.2250838763216557	0.0113209251729572	0.2000231217306096	-0.0001821286720594	0.1898043988667599	0.0001821286720594	0.181918637311177	0.3523833234784593	0.4124699235772131	-0.0056850037034295	0.2285274077188725	0.0056850037034295	0.2179859744758792	0.0040372418734154	0.2533181708242868	-6.478440416350481e-05	0.1907171371062911	6.478440416350481e-05	0.1815545859095831	-0.0110333094741646	0.1788735526715468	0.0110333094741646	0.1736699968282209	CCDC68	313444	TCF4	391882	RAB27B	555044	False	False	False	ref	-75	0.00812	-75	0.06335
1921	chr18	55273297	A	G	rs1261115	-0.0018997195231999	0.8241632007288069	0.0018997195231999	0.8155191974407597	0.0186538905437808	0.037653362969112	-3.337696065623231e-05	0.6618402834069159	3.337696065623231e-05	0.6526015671443979	0.281853546198612	0.5261252157079649	-0.0005681938134419	0.7453117115880369	0.0005681938134419	0.7340386185664999	0.0051912868281775	0.1312893469032383	-9.751834877254646e-06	0.6164520544852673	9.751834877254646e-06	0.6043231039314438	-0.0015456591873359	0.7329068571107827	0.0015456591873359	0.7240827209522613	CCDC68	313836	TCF4	391490	RAB27B	555436	False	False	False	ref	-90	0.001542	-30	0.00851
1922	chr18	55278031	G	A	rs56666482	-0.0259545192	0.130695736739264	0.0259545192	0.1237280548012798	0.0079577168231112	0.6043735772793324	-0.0002069856664949	0.168132779461956	0.0002069856664949	0.160619859153491	0.1953547235967177	0.666774413245252	-0.0050894205516167	0.2471977648433619	0.0050894205516167	0.2365288412291754	0.0015609631462505	0.6929786367639482	-4.07426661769857e-05	0.2742149379582391	4.07426661769857e-05	0.2637330089553756	-0.0251164431166297	0.0405919379976581	0.0251164431166297	0.0395548910848688	CCDC68	318570	TCF4	386756	RAB27B	560170	False	False	False	ref	45	0.002144	10	0.0006714
1923	chr18	55282426	T	C	rs1261117	-0.0074242039999999	0.454931258532804	0.0074242039999999	0.4426248589123491	0.0218599100444031	0.0177087404759254	-0.0001638313578305	0.2174589801908669	0.0001638313578305	0.2087952958379436	0.0589860890673139	0.8963667682878883	-0.0004384921361247	0.7643279457599322	0.0004384921361247	0.7503390542005515	0.0013283300906079	0.7239993467674392	-9.984087125190635e-06	0.5977142145580246	9.984087125190635e-06	0.5843088229277317	-0.004917063455015	0.399600022215726	0.004917063455015	0.3894528746598859	CCDC68	322965	TCF4	382361	RAB27B	564565	False	True	False	ref	-80	0.003319	-65	0.0063
1924	chr18	55286318	T	C	rs1788031	0.00346949844	0.6700245650182646	0.00346949844	0.6834400947719328	0.0138593998441941	0.1058636876629133	4.93880041029955e-05	0.5326574069012195	4.93880041029955e-05	0.5448924911611882	0.3021317648523324	0.4952920552164065	0.0010815838130668	0.5690580495817766	0.0010815838130668	0.5826904570570115	0.0042505564866068	0.227477002393964	1.5615077922602482e-05	0.4704025749040432	1.5615077922602482e-05	0.4832785177342348	0.002649405076816	0.5675819841506237	0.002649405076816	0.5800198414500816	CCDC68	326857	TCF4	378469	RAB27B	568457	False	False	False	alt	-100	0.002289	100	0.06476
1925	chr18	55341866	A	G	rs79926379	0.000768582995	0.7742247046923251	0.002594346595	0.7824571557553772	0.0080458410836721	0.5945020862097979	6.150213300523562e-06	0.7754973872785162	2.1997742918116246e-05	0.7836079195944357	0.179447919584228	0.690632089971951	1.210889943448082e-05	0.7773253167161042	0.0004568309032539	0.785252605395926	0.0014790093032019	0.7077271833577891	1.49034552119047e-07	0.780547958536859	4.00919744748823e-06	0.7885609930520475	0.0006701314328986	0.6435520481837704	0.0021680722829074	0.6509759538824884	TCF4	322921	CCDC68	382405	RAB27B	624005	False	False	False	alt	75	0.002613	-60	0.03708
1926	chr18	55364663	T	C	rs77355441	0.094925724	0.0025676719988582	0.094925724	0.0027030607505605	0.0352107003085987	0.0026149540018122	0.0035046393652096	0.0016636802237493	0.0035046393652096	0.0017636093429831	0.0635234805340304	0.8847277480587283	0.0070524413327173	0.2064010622432148	0.0070524413327173	0.2173530265842882	0.0025262144631819	0.3982217389622844	0.000288445233114	0.0504974679342381	0.000288445233114	0.0532616449762946	0.0483884687600493	0.0085060778145789	0.0483884687600493	0.0086015767554068	TCF4	300124	CCDC68	405202	RAB27B	646802	False	True	True	alt	-60	0.0134	-55	0.01785
1927	chr18	55396445	G	T	rs78322266	0.00866054816	0.3904718841484894	0.00866054816	0.4024437943289219	0.0182780313040662	0.0381633706136534	0.0001590046319636	0.2178814126413522	0.0001590046319636	0.226530745240318	0.2904511457587734	0.514996382553236	0.0025462995683265	0.3826844397535778	0.0025462995683265	0.3954376861331531	0.0053420309474408	0.1191523107680223	4.692974695607509e-05	0.2359755949074344	4.692974695607509e-05	0.2461104026055048	0.0069399060156225	0.2737250438448336	0.0069399060156225	0.2819336595823203	TCF4	268342	CCDC68	436984	RAB27B	678584	False	False	False	alt	100	0.001713	-40	0.01524
1928	chr18	55398661	A	G	rs17594721	0.00061885384	0.8211502936326897	0.0017565735999999	0.8292523307978803	0.0085515636202796	0.484566689865523	4.912118060708409e-06	0.8176615058910942	1.4819667809783495e-05	0.8256675802212079	0.3462131349910268	0.4229849875956487	0.0002158089698017	0.6968336553075752	0.000644594506256	0.7044135166077536	0.0029482901134906	0.4281868058095776	1.7069541304779089e-06	0.6994033531254444	5.440926370165531e-06	0.706933099882428	0.0004626604010414	0.7820643424997059	0.0011058205997987	0.7900715189975454	TCF4	266126	CCDC68	439200	RAB27B	680800	False	False	False	alt	0	0.0	-20	0.02452
1929	chr18	55414923	G	T	rs1371833	0.005404361194	0.5432004586338544	0.005404361194	0.5565318887153996	0.0097535778328085	0.3242200275582709	5.2409253146245854e-05	0.5064479259892953	5.2409253146245854e-05	0.5188420526185555	0.3974792269629353	0.3225021726928936	0.001984305471854	0.4410499490319943	0.001984305471854	0.4546501527923584	0.0038789708199092	0.272346944234971	1.93120433486733e-05	0.4147850668293895	1.93120433486733e-05	0.4273586447846401	0.0032635193311133	0.5023851845423496	0.0032635193311133	0.5139300390566341	TCF4	249864	CCDC68	455462	RAB27B	697062	False	False	False	alt	-100	0.009575	-60	0.00415
1930	chr18	55428385	A	G	rs73477275	0.0005797475999999	0.7505841000193001	0.00256017304	0.7534839352453716	0.0063987029324247	0.8939668024709613	3.01203157693162e-06	0.8035101848190129	1.6300204328332313e-05	0.8063055429106476	0.0471249701760391	0.9146799651449548	1.7183769676710717e-05	0.8883687315153217	0.0001252483343427	0.8914452563486647	0.0003061009600058	0.93516222345939	7.739824187745898e-08	0.907547308783791	8.064739982625915e-07	0.9106646894331776	0.0002344422659986	0.7118503825244303	0.0015913028143444	0.714648348053623	TCF4	236402	CCDC68	468924	RAB27B	710524	False	False	False	alt	-65	0.001993	-100	0.03632
1931	chr18	55486362	T	C	rs140282719	0.0280907567999999	0.1050401659333778	0.0280907567999999	0.1115943691712938	0.0094105121249465	0.3645895452282738	0.0002632172967198	0.111102875725946	0.0002632172967198	0.1172096421320399	0.344007717922385	0.4302677002337906	0.0097347938643694	0.1196427647379598	0.0097347938643694	0.1279432885771479	0.0032325847464448	0.3800985926927686	9.106767329137544e-05	0.1224292134097682	9.106767329137544e-05	0.1300971389914617	0.0193197024865403	0.0715298322277883	0.0193197024865403	0.0735389918962872	TCF4	178425	CCDC68	526901	RAB27B	768501	False	False	False	alt	10	0.000885	30	0.02081
1932	chr18	55536474	C	T	rs78431385	-0.00796475704	0.4313346655374732	0.00796475704	0.4192107587994843	0.0067512253341262	0.8247170907894776	-5.3559076655059457e-05	0.5192406550646848	5.3559076655059457e-05	0.5070119025380577	0.2263342980736314	0.6112505338682535	-0.0017008524061064	0.4913589555289964	0.0017008524061064	0.4779335038253129	0.0015329726790086	0.6976597623500946	-1.1470964424050966e-05	0.5501426756216946	1.1470964424050966e-05	0.5367846947629588	-0.0070830610276039	0.274792443645143	0.0070830610276039	0.2668728294790887	TCF4	128313	CCDC68	577013	RAB27B	818613	False	False	False	ref	-100	0.01332	-45	0.0341
1933	chr18	55715473	G	T	rs184174206	-0.000618732374	0.8089567641988666	0.002044906214	0.8007131775610764	0.0192185516446049	0.0315179496276484	-5.56994413746666e-06	0.6065228410226207	4.081422054671998e-05	0.5996451653348606	0.1392317347690328	0.7585064290485256	-0.0001017158432848	0.81161302204202	0.0003005981442146	0.8028430275741584	0.0026872621938918	0.4780936539801945	-1.0655161026425124e-06	0.690922137015204	5.980388744159463e-06	0.6829674674466947	-0.0007634933972343	0.662356452001864	0.0020166184296517	0.6547138498926255	TCF4	50686	CCDC68	756012	WDR7	935871	False	False	False	ref	-95	0.0094	-95	0.05307
1934	chr18	55737463	A	G	rs813043	6.321166000000001e-05	0.7925509623653678	0.0020431574999999	0.7929808476506636	0.0087332003787189	0.4806541951053286	-1.2823573203019062e-06	0.7869390337619836	1.749448169635129e-05	0.7871352433514204	0.2651396798721978	0.5536672621987175	-3.593507643008e-05	0.701748242051532	0.0005387779412053	0.7024931798143026	0.002353082207484	0.5355602250604183	-8.164421285617428e-07	0.7018520215426008	4.691385562866849e-06	0.7020996820591661	7.676428178715997e-05	0.6631797239422617	0.0018942105208559	0.6633863315270416	TCF4	72676	CCDC68	778002	WDR7	913881	False	False	False	alt	100	0.003092	25	0.001205
1935	chr18	55737755	C	T	rs17527878	4.2684885999999936e-05	0.912939710533305	0.001036215942	0.9101869596495504	0.0186796803652769	0.0360788883408553	4.293623956191952e-07	0.8232877981416178	1.7153440745593176e-05	0.8206904970628328	0.2359070114835215	0.6016290861289462	1.7932790712297298e-05	0.8457968642162533	0.0002588170234353	0.8430288493571882	0.0043790827638252	0.2078422389846717	2.306662960480556e-07	0.760166582512472	4.270607150257597e-06	0.7575567234704862	-3.319536509713998e-05	0.8433758185690766	0.0008091370242429	0.8406570826772677	TCF4	72968	CCDC68	778294	WDR7	913589	False	False	False	alt	-70	0.001816	-25	0.01154
1936	chr18	55747832	T	C	rs77882218	-0.0055458606799999	0.5696846076763902	0.0055458606799999	0.5568874238359866	0.0202265465489641	0.0251970925819779	-0.0001105472903931	0.3234478912293484	0.0001105472903931	0.3135213992616688	0.272604487598419	0.540010871696237	-0.0014886882484142	0.5326884175523549	0.0014886882484142	0.5191497685373129	0.0055665254604413	0.1031635189388304	-3.006001674352568e-05	0.346038893357753	3.006001674352568e-05	0.3346875579034201	-0.0045913339349992	0.4201044744075455	0.0045913339349992	0.4097581568776316	TCF4	83045	CCDC68	788371	WDR7	903512	False	False	False	ref	-45	0.0007	30	0.00986
1937	chr18	55786122	A	G	rs72932579	0.0361968614	0.0615188240434301	0.0361968614	0.0659612645626609	0.0077493129125799	0.6346628912592495	0.0002843431214497	0.1004582463900045	0.0002843431214497	0.1061991983238888	0.1314660940466187	0.7663311204667815	0.0046584136998205	0.2463109931477048	0.0046584136998205	0.2575112629041737	0.0010224989641465	0.7871457445461577	3.682183922868056e-05	0.2771123335663204	3.682183922868056e-05	0.2880674381914229	0.0308115229411093	0.0211737687109558	0.0308115229411093	0.0217359576927796	TCF4	121335	CCDC68	826661	WDR7	865222	False	False	False	alt	100	0.03152	-100	0.03036
1938	chr18	55822147	C	A	rs75882620	0.0022605571	0.6541309340641095	0.0034972678199999	0.659057866478076	0.0226968566950279	0.0154058511847182	5.60312292465767e-05	0.3900966434665742	8.142510143980006e-05	0.3954796819930222	0.3497899355802446	0.4192470559088618	0.0007725114247131	0.5446570489789155	0.0012099195396244	0.550138391046988	0.0080158730732323	0.0304918125266456	1.937907237802101e-05	0.3388645139840501	2.846507018004912e-05	0.3443059232754484	0.0016493947032645	0.593050159312455	0.0024502328862332	0.5973930309196821	TCF4	157360	WDR7	829197	TXNL1	829453	False	True	False	alt	90	0.006546	-100	0.03075
1939	chr18	55889643	G	A	rs148652326	-0.00581715614	0.5387939006511674	0.00581715614	0.5259522728925401	0.0087900903655572	0.4522973570502204	-4.8697057072800606e-05	0.5421772206895381	4.8697057072800606e-05	0.529872374193024	0.2006784302741729	0.6573953654323653	-0.0011317975396054	0.5843614378793786	0.0011317975396054	0.5704830543052762	0.0017601001149419	0.6477121424113892	-9.404433770406708e-06	0.5844398183991819	9.404433770406708e-06	0.570998916442278	-0.0052863618917208	0.3647984164609443	0.0052863618917208	0.3553986666747453	TCF4	224856	WDR7	761701	TXNL1	761957	False	False	False	ref	100	0.00506	-100	0.05627
1940	chr18	55898056	T	C	rs17602354	0.00258451672	0.6496677049244088	0.00355025028	0.6588096770644425	0.0077909842290329	0.6368062947774638	1.992325831656691e-05	0.6773993551951567	2.7321446991067778e-05	0.6862487732710937	0.0866170810900527	0.8467757322297774	0.0001741970196369	0.7939244068170102	0.0002752093885621	0.8028265723771	0.0006728907160207	0.8611147998819099	1.347647321263128e-06	0.8064904959006555	2.1214721161779324e-06	0.8153224783449147	0.0019979460367845	0.5299405145368764	0.0029730598865133	0.5374294285005907	TCF4	233269	WDR7	753288	TXNL1	753544	False	False	False	alt	-100	0.010475	-25	0.01559
1941	chr18	55924568	C	T	rs61576172	-0.001196726348	0.7880321794538079	0.002378023652	0.7866015360820615	0.0177760974902237	0.0426230587055472	-2.0220454650469483e-05	0.6097983593084834	4.35539180856626e-05	0.6082479935594045	0.1928505482422016	0.6683125097127324	-0.0003546300737673	0.7515312287141538	0.0004950089132658	0.7497117018492643	0.0034000794069173	0.3458785621643231	-6.296112059965294e-06	0.6293724205330465	9.052720896717905e-06	0.627432517300901	-0.0012531250324173	0.6452501300337977	0.002199192937686	0.6432373424629981	TCF4	259781	WDR7	726776	TXNL1	727032	False	False	False	ref	-25	0.002708	-25	0.01653
1942	chr18	55953317	C	G	rs118115105	-0.0168007388	0.2287286657833145	0.0168007388	0.2189226244176649	0.0079111343211977	0.6022023407794649	-0.0001337716217804	0.267818199569875	0.0001337716217804	0.2582700283468436	0.5932841626987833	0.0535298476176305	-0.0099282076961433	0.132169629098527	0.0099282076961433	0.1240043723421834	0.00469168076836	0.1695188638025218	-7.90211498749793e-05	0.1585836686201553	7.90211498749793e-05	0.1502227043972449	-0.0024709799894189	0.6119003750654601	0.0024709799894189	0.5993451579297863	TCF4	288530	WDR7	698027	TXNL1	698283	False	False	False	ref	100	0.01483	90	0.1376
1943	chr18	55957436	C	T	rs56062547	-0.0142569412	0.271387080095218	0.0142569412	0.261038594201386	0.0059539986934507	0.93806960907974	-8.576745087931259e-05	0.3879835176803178	8.576745087931259e-05	0.3771398190841524	0.3617734623803151	0.3988027190604305	-0.0051878867284003	0.2473072617078559	0.0051878867284003	0.2364506392081562	0.0021729558354403	0.5736391767547073	-3.1507126747099864e-05	0.3313079583149634	3.1507126747099864e-05	0.3200724459443477	-0.0092262367866885	0.2244545354319813	0.0092262367866885	0.2176047480389831	TCF4	292649	WDR7	693908	TXNL1	694164	False	False	False	ref	100	0.008705	-85	0.02335
1944	chr18	55973548	G	A	rs1424401	-0.00355105758	0.5933007391495364	0.0048189645	0.5837315798097298	0.0068910740193857	0.8038211224902814	-2.597188255457508e-05	0.6541708311223193	3.464876623906128e-05	0.6446982481396519	0.1904438842726584	0.6717542007828609	-0.0006508751599719	0.6203242312271575	0.0009351312682053	0.6103849562253088	0.0013063956394475	0.7376650806621461	-4.729872957153874e-06	0.6630861881426235	6.675171250591726e-06	0.6531897969429347	-0.0033734789779976	0.4138948759350936	0.0046349028516892	0.4067573621844308	TCF4	308761	WDR7	677796	TXNL1	678052	False	False	False	ref	85	0.01688	90	0.0157
1945	chr18	55983078	A	G	rs2902193	-0.0167188504	0.237850201080129	0.0167188504	0.2280548381299627	0.0112138851938791	0.2184965340864101	-0.0001879071991029	0.2000831195803523	0.0001879071991029	0.1918953560387265	0.1575078579653315	0.7269141559793114	-0.0027796971228972	0.3961889289167847	0.0027796971228972	0.3834829426921381	0.0017527766957402	0.650980535259528	-3.082674574689761e-05	0.3467138982707883	3.082674574689761e-05	0.3352291988339747	-0.0158362638616582	0.108625289728075	0.0158362638616582	0.1055035645056249	TCF4	318291	WDR7	668266	TXNL1	668522	True	False	False	ref	-100	0.006092	100	0.074
1946	chr18	55983715	G	A	rs10164243	-0.00604203912	0.5398944149088227	0.00604203912	0.5269349948456747	0.0095051943122298	0.3662726469228398	-5.6822846428175406e-05	0.5179882762359647	5.6822846428175406e-05	0.5056948415290464	0.3550410273965497	0.411814863952878	-0.0021428428402325	0.4529582979927745	0.0021428428402325	0.4398468950892052	0.0033860056568313	0.3561329403526454	-2.0272241663370178e-05	0.4368280524859558	2.0272241663370178e-05	0.4243293009884125	-0.0037344785734291	0.4787858118294114	0.0037344785734291	0.4676550375914058	TCF4	318928	WDR7	667629	TXNL1	667885	False	False	False	ref	-20	0.0006065	100	0.06165
1947	chr18	55998167	G	T	rs1862920	0.00231061932	0.4501693382146589	0.007848777	0.4512501210310472	0.0097217865911407	0.3468229941039088	3.637327142796717e-05	0.4269196341128061	8.377102115266786e-05	0.4285723484144039	0.4989014408863162	0.173390682724145	0.0012758688597229	0.3161104360889226	0.0039950035889914	0.3169971361804646	0.0048829969263323	0.1590057576411353	1.9619207687699286e-05	0.2973924765955357	4.293174781654951e-05	0.2987114857611013	0.0006493843297129	0.602351278808414	0.0024875776719675	0.603333710136936	TCF4	333380	WDR7	653177	TXNL1	653433	False	False	False	alt	60	0.002771	60	0.06616
1948	chr18	56112798	T	A	rs1789562	0.00649035966	0.4744027452573279	0.00649035966	0.4868531224189212	0.022708387054843	0.0154467735174621	0.0001490446251048	0.2291527260183896	0.0001490446251048	0.2382534500114745	0.1271735183974937	0.7770099389136419	0.0008077801604076	0.6223667746140711	0.0008077801604076	0.6361127995924923	0.0029023025620506	0.428960352524851	1.86563843085945e-05	0.4180625145029434	1.86563843085945e-05	0.4304427609393877	0.006060228840548	0.3126167059988226	0.006060228840548	0.3217343873227625	TCF4	448011	WDR7	538546	TXNL1	538802	False	True	False	alt	-100	0.00235	35	0.015594
1949	chr18	56221791	A	C	rs75104423	0.01107586016	0.3367346530051773	0.01107586016	0.3484014067267235	0.0086261408293464	0.4781277823364782	0.0001033208097761	0.346304020153562	0.0001033208097761	0.3573618290523738	0.2939159119907882	0.5020969280635325	0.0034197341736591	0.3384910354621805	0.0034197341736591	0.3511182055707838	0.0025725709543603	0.4920025264743491	3.211454178555547e-05	0.3421965623928094	3.211454178555547e-05	0.3541947611673124	0.0078278820319712	0.2401580332465004	0.0078278820319712	0.2472191618357688	WDR7	429553	TXNL1	429809	TCF4	557004	False	False	False	alt	-100	0.0092	-90	0.04703
1950	chr18	56333783	C	T	rs62091470	-0.0049586024399999	0.5999946210025601	0.0049586024399999	0.5871406959669059	0.0072130637059091	0.7525619063038547	-3.7261895724283504e-05	0.6506999385448345	3.7261895724283504e-05	0.6378391277237779	0.0835610327907965	0.8526698098829564	-0.0004451977624881	0.7767215507854337	0.0004451977624881	0.7627142484597444	0.0006160392537055	0.8743784062963129	-3.4368810067989774e-06	0.7989488261778385	3.4368810067989774e-06	0.7848109406579047	-0.0039398748949677	0.4792884864919399	0.0039398748949677	0.4682284830499314	WDR7	317561	TXNL1	317817	TCF4	668996	False	False	False	ref	-95	0.00457	90	0.0268
1951	chr18	56339270	C	T	rs62091471	-0.0174683389	0.2191744419180503	0.0174683389	0.2096773966189775	0.0078484458829866	0.6287707082145984	-0.0001387614080546	0.2613430238747448	0.0001387614080546	0.2520316083987447	0.153126069772508	0.7341055952133752	-0.0027010032527677	0.3891499067819242	0.0027010032527677	0.3765189332563602	0.001190679724111	0.7612040604731889	-2.1205798649464776e-05	0.4178992962512024	2.1205798649464776e-05	0.4056081573941417	-0.0167740329256527	0.096384501178301	0.0167740329256527	0.0936968041219806	WDR7	312074	TXNL1	312330	TCF4	674483	False	False	False	ref	30	0.000454	-90	0.04977
1952	chr18	69858790	T	C	rs1808094	0.0228053696	0.1383308180738859	0.0228053696	0.1458753469548638	0.0092715059467232	0.3905475174104477	0.0002071540430461	0.1489988823994108	0.0002071540430461	0.1561320601669959	0.3729831222315584	0.3805509226023097	0.0085989574747558	0.136601079269865	0.0085989574747558	0.1453292656843915	0.0034499619023249	0.3442942534741052	7.78416222667012e-05	0.1417425545286391	7.78416222667012e-05	0.1500049956161287	0.0137802259359536	0.1212789508820182	0.0137802259359536	0.1251058036731133	CD226	103013	RTTN	346936	SOCS6	430256	False	False	False	alt	50	0.004578	-90	0.0797
1953	chr18	69860524	T	G	rs1790947	-0.0130501909	0.293380032048491	0.0130501909	0.2826639955885087	0.0273049327091186	0.0062343725364563	-0.0003517913371964	0.0807942711747807	0.0003517913371964	0.0763035192271625	0.0597869272502826	0.8933348992430984	-0.0007950915734819	0.663073250614274	0.0007950915734819	0.6494357216868296	0.001679509404125	0.6584943133995934	-2.218374362947581e-05	0.4199593012524035	2.218374362947581e-05	0.4078167072693688	-0.0086411684768513	0.236054250193642	0.0086411684768513	0.2289928865093489	CD226	101279	RTTN	345202	SOCS6	428522	False	True	True	ref	100	0.001301	0	0.0
1954	chr18	69866096	T	C	rs56249713	0.0136060047	0.2615346736026886	0.0136060047	0.2720579047936617	0.0092549306549499	0.3901610155636101	0.0001279166382112	0.2666799839613814	0.0001279166382112	0.2761706721488088	0.3887094264463324	0.3510599775413735	0.0051131321405124	0.2287545567134585	0.0051131321405124	0.2396786589615376	0.0036001616889976	0.3186121772935258	4.81566669602309e-05	0.2265984538564468	4.81566669602309e-05	0.2366926636772036	0.0075643938215126	0.246757073564348	0.0075643938215126	0.2539496094138891	CD226	95707	RTTN	339630	SOCS6	422950	False	False	False	alt	-100	0.004562	-60	0.0252
1955	chr18	74871632	C	T	rs2554138	0.000918468196	0.8243100075889347	0.001669247084	0.8299568328040565	0.0184311408737402	0.0384088008984629	2.013727565603885e-05	0.6486906747955653	3.0594066123826506e-05	0.653691113556545	0.3378250811730411	0.4008305528509501	0.0004417194070439	0.6899637144622853	0.0005980373034648	0.6949171087504428	0.0065469263635288	0.0679087156963626	9.28356876026022e-06	0.5397499649557886	1.1463566056097232e-05	0.5455689578780039	0.0004979304764572	0.780105266369282	0.0011120447307544	0.783248577867495	ZNF407	273761	CNDP1	337131	PTGR3	337507	False	False	False	alt	65	0.05658	-90	0.02621
1956	chr18	74903496	T	C	rs2554132	-0.00089705695	0.8601381862694786	0.00144499049	0.8580281630708471	0.0155422347742372	0.0708634588059985	-1.4456280044750724e-05	0.7553850920846414	2.308519097394867e-05	0.7532110880270843	0.1957841886326621	0.659628872310488	-0.0002424570132099	0.8175774845991878	0.0003294936359631	0.8155546996160141	0.0030640124142328	0.387987257436108	-3.939080948865431e-06	0.7405580632913736	5.314871759822706e-06	0.7382908510530584	-0.0006639073019429	0.7579627209001696	0.0013444122864344	0.755651242078954	ZNF407	305625	PTGR3	305643	TSHZ1	307260	False	False	False	ref	-30	0.0004883	65	0.0293
1957	chr18	74934989	G	A	rs17055966	-0.038006155	0.0611710192789369	0.038006155	0.05770413748481	0.030010029130654	0.0058741506727969	-0.0012983178111842	0.0131822084653311	0.0012983178111842	0.012610443250644	0.1403126588450087	0.7533916579567134	-0.0060189492584228	0.2381216002831815	0.0060189492584228	0.226965407213823	0.0047645902265622	0.1564488534023444	-0.0002241093801515	0.0651265841837921	0.0002241093801515	0.0615535892509878	-0.0375086878494589	0.0163539569586297	0.0375086878494589	0.0158600255072063	PTGR3	274150	TSHZ1	275767	ZNF407	337118	False	True	True	ref	-80	0.01839	-90	0.07074
1958	chr18	74937840	T	C	rs2930551	0.024612612	0.1399417360337753	0.024612612	0.1474991751407691	0.0153773910392858	0.0734715421725507	0.0003910770570502	0.0713544696710686	0.0003910770570502	0.0756132253171265	0.076824448386394	0.8669328220274457	0.002032778211529	0.4567103464066893	0.002032778211529	0.4697706204491677	0.0012309130341219	0.757415167498395	3.3421640129460144e-05	0.3366802464632093	3.3421640129460144e-05	0.3483286690936503	0.0181039222398572	0.0899466821859954	0.0181039222398572	0.0926255981011527	PTGR3	271299	TSHZ1	272916	ZNF407	339969	False	False	False	alt	40	0.002716	-80	0.02353
1959	chr18	74938238	T	C	rs4891202	-0.00579184676	0.5482889398679509	0.00579184676	0.5355744524068361	0.0056912348457824	0.9437712291197824	-3.3853149057954364e-05	0.6700712767151976	3.3853149057954364e-05	0.6569085820290638	0.1207045716241869	0.7891628096548902	-0.0007190074238266	0.6831503456559104	0.0007190074238266	0.6693668352790847	0.0006905249684731	0.8573367438643376	-4.229865975203737e-06	0.7531794613376143	4.229865975203737e-06	0.7392834482424209	-0.0053817985663751	0.3780698363051458	0.0053817985663751	0.368306534363276	PTGR3	270901	TSHZ1	272518	ZNF407	340367	False	False	False	ref	55	0.001696	-40	0.0638
1960	chr18	74943689	G	C	rs7243542	-0.041756681	0.0500523382278957	0.041756681	0.0470161793428942	0.0102384210807039	0.2919503839991694	-0.0004446763572265	0.0609053013010345	0.0004446763572265	0.0574134847598809	0.3525845703793607	0.4084077311399959	-0.0153831636358061	0.0751184794775551	0.0153831636358061	0.06988325192332	0.0037200491979274	0.2930819180691409	-0.0001683408698151	0.078182127658237	0.0001683408698151	0.0731456391798504	-0.0275334806377659	0.0350198178820114	0.0275334806377659	0.0340940579611244	PTGR3	265450	TSHZ1	267067	ZNF407	345818	False	False	False	ref	70	0.001933	95	0.03326
1961	chr18	74966476	G	T	rs61019476	0.001759585166	0.7755842800762457	0.002186259846	0.7855450847994073	0.0071649214837573	0.7541410323055041	1.316682336589541e-05	0.7960100353065904	1.6254847385052295e-05	0.8059053504496484	0.0493947032645566	0.9148869818600768	5.506035409754936e-05	0.9046611744652432	9.242575887541468e-05	0.9146959291268736	0.0003585480742183	0.9292329184889596	4.2537513167584746e-07	0.9124691960300214	6.958042727428958e-07	0.922521889928444	0.0007821657901015	0.7691435223486639	0.0011805101712672	0.7786470806095575	PTGR3	242663	TSHZ1	244280	ZNF407	368605	False	False	False	alt	90	0.004402	50	0.02878
1962	chr18	74973700	A	G	rs4891041	0.102153508	0.0020924335099143	0.102153508	0.0022712829158917	0.0244930388171572	0.0140699098859742	0.0027399845423471	0.0029168461896969	0.0027399845423471	0.0030926309847506	0.232436021120551	0.6023069707840342	0.0256709075360875	0.0238839852283561	0.0256709075360875	0.0256815102878349	0.0061074442241514	0.0977788463941119	0.000733433217961	0.0104770599633604	0.000733433217961	0.0111119073397271	0.0978059938381103	0.0002775770566399	0.0978059938381103	0.0002819413303093	PTGR3	235439	TSHZ1	237056	ZNF407	375829	False	True	True	alt	40	0.002832	40	0.0313
1963	chr18	74977743	G	A	rs4334389	-0.0364119403999999	0.070321616696441	0.0364119403999999	0.0659119552714456	0.0093860625328931	0.3638752112112577	-0.0003419257851108	0.0823879535660472	0.0003419257851108	0.0778658076351886	0.2523262689446985	0.5741337138475354	-0.0093860576393152	0.1445875007895949	0.0093860576393152	0.1359755940482661	0.0023506729610467	0.543021852681865	-8.758411257279257e-05	0.1458486246547596	8.758411257279257e-05	0.1379441537120197	-0.0327285552754696	0.0202038212623526	0.0327285552754696	0.0196777482397448	PTGR3	231396	TSHZ1	233013	ZNF407	379872	False	False	False	ref	100	0.010376	45	0.02753
1964	chr18	74983478	T	C	rs9963429	0.0096818372	0.3601756940464612	0.0096818372	0.3717671229074969	0.010079076653401	0.299768293065758	0.0001035181059474	0.3343586325942759	0.0001035181059474	0.3446957657753672	0.3551260905196111	0.4114702248939698	0.0034655130656758	0.3142499076655509	0.0034655130656758	0.3263222936657528	0.0035963050611056	0.3212581541946319	3.724816455765502e-05	0.2898257311362188	3.724816455765502e-05	0.3009055212577885	0.0063465388645109	0.3086943368309217	0.0063465388645109	0.3175827560124505	PTGR3	225661	TSHZ1	227278	ZNF407	385607	False	False	False	alt	45	0.00278	25	0.02086
1965	chr18	74984205	A	G	rs4891211	-0.0272865266	0.087601527424539	0.0322167181999999	0.0839367632004592	0.0148800232686083	0.0874278264555464	-0.0004735260729892	0.0484662318189057	0.0005190845730258	0.0467477004729699	0.3076463448790962	0.4836531543128514	-0.0084599171128953	0.1325305888641962	0.0098931652403007	0.1266284883136132	0.0044891347607109	0.1872540600043151	-0.0001420326398478	0.0786980887952826	0.000155276878948	0.0752175354865633	-0.0235624850880195	0.0407825439672979	0.0266164586769571	0.0401897582657629	PTGR3	224934	TSHZ1	226551	ZNF407	386334	False	False	False	ref	80	0.01678	-25	0.00952
1966	chr18	74984423	G	A	rs4891042	0.00041281232	0.743514584779493	0.00283899552	0.7464806730003454	0.0151851299140131	0.0798807620324445	1.459667073828232e-05	0.5881742986973538	4.428338557129145e-05	0.5913444173886028	0.2675504932623782	0.5456884958678302	0.0001963938792118	0.6562649539165086	0.0007723363528536	0.6592587099775062	0.0041136204122663	0.2337663492762407	5.267151077895761e-06	0.5421996137856767	1.23239547888917e-05	0.5456209448806258	0.0004813327939086	0.6206136558079512	0.002315376715526	0.6232741926182999	PTGR3	224716	TSHZ1	226333	ZNF407	386552	False	False	False	alt	-90	0.004272	-90	0.1182
1967	chr18	74984773	A	G	rs9964094	0.0230604828	0.1473673191152139	0.0230604828	0.1552521200421313	0.0108938924459765	0.2348555107812631	0.0002520751323507	0.1228471041504136	0.0002520751323507	0.1292914407137375	0.197068434319858	0.6579290221223513	0.0049280974915195	0.2510560347954642	0.0049280974915195	0.2625518684172637	0.0021759757017198	0.5659569379576077	5.412984876818685e-05	0.2186512639917204	5.412984876818685e-05	0.2287180568201376	0.021626780360792	0.0625882528815463	0.021626780360792	0.0643187292132009	PTGR3	224366	TSHZ1	225983	ZNF407	386902	False	False	False	alt	85	0.00685	-5	0.001167
1968	chr18	74984839	A	G	rs9964170	0.0689913008	0.0085848541244983	0.0689913008	0.009090051270561	0.0199647406644785	0.0281030614634936	0.0014689797088903	0.0070553714121273	0.0014689797088903	0.0073496727075522	0.2285459392732289	0.6085047179131381	0.0162739862113058	0.0594530915574437	0.0162739862113058	0.0644050242355896	0.0045871873038213	0.1899006170052394	0.0003478092763165	0.024548512757739	0.0003478092763165	0.0263635554761275	0.0638637330262761	0.0014208793471298	0.0638637330262761	0.0014708365493197	PTGR3	224300	TSHZ1	225917	ZNF407	386968	False	True	True	alt	20	0.001259	-70	0.02338
1969	chr18	74986065	T	G	rs2920353	-0.005753379	0.5444148392070531	0.005753379	0.5314763425974042	0.0117704551777642	0.1925590807173617	-6.462965226637402e-05	0.4631579164033592	6.462965226637402e-05	0.451543148920078	0.3163393811139119	0.4732200415798506	-0.0018197537765192	0.4812567827193422	0.0018197537765192	0.4680141396147046	0.0037503123353669	0.2908890967062189	-2.0545978650294515e-05	0.4204721173413308	2.0545978650294515e-05	0.4082099014232734	-0.004209587236382	0.4399516963395163	0.004209587236382	0.4292603690504487	PTGR3	223074	TSHZ1	224691	ZNF407	388194	False	False	False	ref	-40	0.00095	90	0.02563
1970	chr18	74986330	T	C	rs9947731	0.0756842708	0.0053125761870302	0.0756842708	0.0055950834151973	0.0192032730923975	0.0314098304449638	0.0014667882291121	0.0059368093014398	0.0014667882291121	0.0061778976614627	0.3239950621894417	0.4580225654439512	0.024690475880464	0.0235027968373323	0.024690475880464	0.0257002048840598	0.0061325660928144	0.0768550063568155	0.0004708140989222	0.0116592953620935	0.0004708140989222	0.0124765766741904	0.0594964678056825	0.001817492042255	0.0594964678056825	0.0018817829947928	PTGR3	222809	TSHZ1	224426	ZNF407	388459	False	True	True	alt	-45	0.0008926	-100	0.013794
1971	chr18	74994128	A	G	rs7241108	0.0162161865999999	0.2219150326794118	0.0162161865999999	0.2318137630548832	0.0060670074095619	0.8944323538115777	0.0001004434033897	0.3260271418508311	0.0001004434033897	0.3365656372323009	0.3917115322773058	0.3445758881596309	0.0064871707043979	0.1874638015491737	0.0064871707043979	0.1976937640185516	0.002392536844495	0.5292813062571663	4.053248612806567e-05	0.2616078394341217	4.053248612806567e-05	0.2722941182435726	0.0087552775443728	0.2146261554960491	0.0087552775443728	0.2216175421422969	PTGR3	215011	TSHZ1	216628	ZNF407	396257	False	False	False	alt	100	0.004627	-100	0.04022
1972	chr18	74997815	C	T	rs9961644	0.002501917828	0.6895179558719685	0.003419830948	0.6965652081493963	0.0065030135319265	0.8595339491610631	1.6881971549583073e-05	0.7562544782305327	2.248708334537192e-05	0.7634196314003686	0.2557308685774748	0.564785978668698	0.0006464043414384	0.650370963341151	0.0008828836841299	0.6571215588879307	0.0016248547506092	0.6756592071953329	4.1888901962490135e-06	0.7064841879223406	5.632919194977384e-06	0.7131701991305984	0.0020747103185717	0.5600861547511964	0.002979284017469	0.5666293856949013	PTGR3	211324	TSHZ1	212941	ZNF407	399944	False	False	False	alt	100	0.001745	-100	0.03976
1973	chr18	75010176	C	T	rs7234127	-0.0376111484	0.0641706729807227	0.0376111484	0.060147943857788	0.0092074305495343	0.3939205927525077	-0.000343173650795	0.0810157279248425	0.000343173650795	0.0765123105321486	0.2706210645338645	0.5468706745754313	-0.0102597866459979	0.1281772920293077	0.0102597866459979	0.120225252878706	0.0024941095346384	0.5187669097383008	-9.3755949096106e-05	0.1333409917694757	9.3755949096106e-05	0.1258109460266835	-0.0334235832321911	0.0200345616499686	0.0334235832321911	0.01948023564952	PTGR3	198963	TSHZ1	200580	ZNF407	412305	False	False	False	ref	-55	0.000885	5	0.0007324
1974	chr18	75017058	T	C	rs9950694	-0.000371509456	0.7571993096698224	0.0025829988159999	0.7605553638197794	0.0173486884621829	0.0470619614647816	-1.187919187952939e-05	0.600318590273306	4.882938052483039e-05	0.6031062467260897	0.046660235064679	0.9160372236816258	-2.903731644389765e-06	0.8993998166126839	0.0001174622276943	0.904968420883439	0.0008280436890165	0.8339788512725241	-2.757207417143844e-07	0.8381102208524485	2.202190737365916e-06	0.8428519834484985	-0.0001265573294328	0.7178343807513144	0.0016120499175302	0.7213920270550959	PTGR3	192081	TSHZ1	193698	SMIM21	410645	False	False	False	ref	100	0.004677	-25	0.002167
1975	chr18	75019182	T	C	rs894577	-0.003767856394	0.6745472439130992	0.003767856394	0.6609456466620673	0.0209599594217507	0.0214140107867451	-8.101566907582516e-05	0.4120779645764127	8.101566907582516e-05	0.4007993675751582	0.1472691625431799	0.7410332436239786	-0.00054511856349	0.7279594760872613	0.00054511856349	0.7135892982889966	0.0030548493835771	0.3980995103577437	-1.1621132120066663e-05	0.557488236980821	1.1621132120066663e-05	0.5439009310877002	-0.0036743119741905	0.4879725005453845	0.0036743119741905	0.476915608674068	PTGR3	189957	TSHZ1	191574	SMIM21	408521	False	False	False	ref	75	0.002659	80	0.0719
1976	chr18	75024241	T	C	rs9319675	-0.001743123944	0.8062507698253206	0.002046352864	0.796747383957034	0.0158435654968019	0.0647034298437189	-2.831796070339264e-05	0.6571055614060793	3.300814595455356e-05	0.6474052196274732	0.2095602651479786	0.6425946650846904	-0.0003854975957214	0.7651556089935768	0.0004443478938344	0.7550253960778261	0.0033207016684428	0.3518935749051206	-6.292198842564285e-06	0.6598197241665251	7.202464258844223e-06	0.649635398906475	-0.0016161993381674	0.6819626425073637	0.0018610151557588	0.6727157386803547	PTGR3	184898	TSHZ1	186515	SMIM21	403462	False	False	False	ref	50	0.002174	60	0.007095
1977	chr18	75026772	G	A	rs4891221	-0.0442832722	0.0444464997301837	0.0442832722	0.041871610014303	0.0090168120592506	0.4273486180554094	-0.0004209459790527	0.0681918568151843	0.0004209459790527	0.0646300415900951	0.2342576167802569	0.6046380442100892	-0.0105240160690223	0.1315334811821478	0.0105240160690223	0.1233555132266841	0.0021292619088902	0.5877045282972638	-0.0001007242826172	0.1392258665209759	0.0001007242826172	0.1315910203085218	-0.0421124700463697	0.0100974545580231	0.0421124700463697	0.009865341850459	PTGR3	182367	TSHZ1	183984	SMIM21	400931	False	False	False	ref	-100	0.004223	-70	0.02454
1978	chr18	79736856	C	A	rs115000070	-0.01469413672	0.2864716245347831	0.01469413672	0.2759161514624823	0.0071353860448858	0.7074014336108053	-0.0001143625676682	0.3374276647464532	0.0001143625676682	0.3270519889853375	0.6148528511706554	0.0373511158010456	-0.0091362938730724	0.1590898594265628	0.0091362938730724	0.1503397680876221	0.0043933535630954	0.1990751014917725	-7.1262306008809e-05	0.1989416005391905	7.1262306008809e-05	0.189985783857062	-0.0016327970207159	0.7225343653433168	0.0016327970207159	0.709341405614244	CTDP1	57052	KCNG2	61083	SLC66A2	214801	False	False	False	ref	45	0.001732	100	0.07355
1979	chr18	79787535	A	G	rs12457876	0.01864225762	0.2255834463547887	0.01911116958	0.2335923959472809	0.0166782500559062	0.0580564929282571	0.0002512382474623	0.1533130119005077	0.0002603138787729	0.1587558225059758	0.6840817850807581	0.0136676187282918	0.0127493800281416	0.1059861862490082	0.0130668279730484	0.1114543498277046	0.0114095355522575	0.0096373409419816	0.0001717477698454	0.076553823339479	0.0001778918665161	0.0804239583770011	0.0020477390844303	0.6485056053073383	0.0021016815527132	0.6565532688096832	KCNG2	10404	CTDP1	107731	SLC66A2	164122	False	False	False	alt	-50	0.00664	85	0.0646
1980	chr18	79818986	G	A	rs11664298	0.0057689263859999	0.4799251517244824	0.007246151506	0.4898906181867092	0.0100051215864695	0.3101099715022683	5.348579136782724e-05	0.448681443590866	7.18575300326708e-05	0.4574074039604464	0.6029668357555575	0.0457270626442825	0.0035287903303907	0.2935710732692631	0.0044052199257677	0.3030290278433533	0.0060353031317773	0.0800947551329177	3.280866254294756e-05	0.2778496753989978	4.3708514714219016e-05	0.2862402648613361	0.0008174358655172	0.797442432675561	0.0010000103735515	0.8075024362815162	KCNG2	21047	SLC66A2	132671	CTDP1	139182	False	False	False	alt	-100	0.007088	-100	0.077
1981	chr18	79871198	A	G	rs59183289	0.152985294	0.0003267688033066	0.152985294	0.0003485949034684	0.0432251377252468	0.0012625178583918	0.0067242572816359	0.0004957917747245	0.0067242572816359	0.0005298735256646	0.6444485938650816	0.0223782967689261	0.0986268916906751	0.0001796052242478	0.0986268916906751	0.0001990889268416	0.0279082796437237	0.0005260727636262	0.0043439780931007	0.0003499967845155	0.0043439780931007	0.0003678355164184	0.014543719333188	0.1090393370732067	0.014543719333188	0.1124661658261392	KCNG2	73259	SLC66A2	80459	HSBP1L1	93385	False	True	True	alt	25	0.00292	-45	0.0492
1982	chr18	79871679	A	C	rs72980085	-0.0001061202399999	0.219071758859796	0.0167691254399999	0.2180964074521904	0.0179661485643533	0.041137729699289	-4.947125257322003e-05	0.1113892886492589	0.0002806649226336	0.1107638655356033	0.647658170727912	0.0213663928604956	-0.0001821344264911	0.1137423839330466	0.0108393865242534	0.1137456085606394	0.011650484255589	0.0083791911107417	-3.386485195454e-05	0.0604887277393438	0.000181697956544	0.0602170205327276	5.601717860146005e-05	0.7132647570733635	0.0015830039730702	0.710885287369918	KCNG2	73740	SLC66A2	79978	HSBP1L1	92904	False	False	False	ref	15	0.0009155	20	0.0454
1983	chr18	79876077	C	T	rs56197868	-0.0315944912	0.0965678816539918	0.0315944912	0.0911248811756977	0.0111083678681164	0.2109969054733447	-0.0003522716900757	0.0832268123605789	0.0003522716900757	0.0786925470476367	0.6301745868733077	0.0285654005922566	-0.0199241547308058	0.0466136340201947	0.0199241547308058	0.0430290057645821	0.0070053088082695	0.0465522110698836	-0.0002222638361457	0.0467866526804539	0.0002222638361457	0.0435531124177587	-0.0033402836129004	0.5218204376605377	0.0033402836129004	0.5102247669686718	SLC66A2	75580	KCNG2	78138	HSBP1L1	88506	False	False	False	ref	-35	0.00628	90	0.05676
1984	chr18	79881226	A	G	rs4239346	0.0684675696	0.0093466532223034	0.0684675696	0.0099828341951181	0.0132686969926064	0.1260866835476914	0.0009462940326708	0.0140493362645712	0.0009462940326708	0.014938292282475	0.6124503366217492	0.0383368836187504	0.0418692979700898	0.0053645221590972	0.0418692979700898	0.0057963266977181	0.0081202419955892	0.0286249364745002	0.000577884691909	0.0094469172362636	0.000577884691909	0.0101588330101048	0.0083922032386227	0.2209698946786723	0.0083922032386227	0.2279044839373821	SLC66A2	70431	KCNG2	83287	HSBP1L1	83357	False	True	True	alt	85	0.013275	35	0.09985
1985	chr18	79881902	C	G	rs11662267	0.0412774472	0.0408204725085958	0.0412774472	0.0434794095992641	0.0104184121534915	0.273406562708555	0.0004609819418116	0.0510457837085627	0.0004609819418116	0.0540931821610583	0.5746159192522744	0.0725172791358183	0.0236966273655284	0.0248097421768725	0.0236966273655284	0.0271082255824547	0.0059857592285786	0.0821402056640457	0.0002646773931075	0.0333283396108381	0.0002646773931075	0.0358625779446984	0.0074793306984511	0.244608715049316	0.0074793306984511	0.2518256906557128	SLC66A2	69755	HSBP1L1	82681	KCNG2	83963	False	False	False	alt	85	0.0083	0	0.0
1986	chr18	79956624	G	A	rs12953577	-0.008628617728	0.4351561828462336	0.008681173232	0.425940542196151	0.008516246132772	0.4619653533229956	-9.331921496300788e-05	0.4204725716348421	9.358493685266096e-05	0.4121462989552715	0.3422836336476519	0.4310129776569059	-0.0028103749140494	0.4085756743541833	0.002829524615929	0.3984912940797701	0.0028557012586301	0.4436259675058515	-2.9917016413333456e-05	0.3986308281251131	3.0013837763908297e-05	0.3891161992959369	-0.0065830558408281	0.3469618305147154	0.0066204006265624	0.3410965072982981	SLC66A2	4967	HSBP1L1	7959	TXNL4A	77325	False	False	False	ref	-65	0.003204	5	0.001465
1987	chr19	2129707	A	G	rs56862829	0.0877035081999999	0.0035362356234823	0.0877035081999999	0.0036992038202596	0.0205025667637866	0.0246506667742321	0.0018447423147374	0.004368135234926	0.0018447423147374	0.004570687664313	0.6221724291745765	0.0331920363995957	0.0544055474485358	0.0020836831108397	0.0544055474485358	0.0021965321639796	0.0127205205375196	0.0055892588510835	0.0011412986201029	0.0030419771668978	0.0011412986201029	0.003208823131731	0.010309235572983	0.1793620207476428	0.010309235572983	0.1851809763770041	MOB3A	33034	IZUMO4	33277	DOT1L	34227	False	True	True	alt	-100	0.001616	90	0.0573
1988	chr19	2131294	C	T	rs72486339	-0.0418900396	0.0454077987294012	0.0418900396	0.0426688240093388	0.0115430712680645	0.196040671370737	-0.0005101426072984	0.0456917923081068	0.0005101426072984	0.043260333190978	0.615668212325854	0.0377812546547944	-0.0260656237871044	0.0235368343234045	0.0260656237871044	0.0217075657157056	0.0071656583515509	0.0449363868495027	-0.0003196804316015	0.0281175328883302	0.0003196804316015	0.026354215197753	-0.0049834541852093	0.382532417500689	0.0049834541852093	0.3726101223264276	DOT1L	32640	AP3D1	33174	MOB3A	34621	False	False	False	ref	-95	0.00889	100	0.0374
1989	chr19	2141944	A	G	rs117443676	-0.00327891984	0.6970297380066187	0.00327891984	0.6835849725775184	0.0148288237866939	0.0931516657374575	-4.8361605627399217e-05	0.5380533287913576	4.8361605627399217e-05	0.5260010957150048	0.193410720028216	0.6642827933707359	-0.0006527122362814	0.6837025010166763	0.0006527122362814	0.6697231873665721	0.002933180625132	0.391237395615696	-9.796564712102667e-06	0.5750216548995009	9.796564712102667e-06	0.5614744087902481	-0.003037375906389	0.5455299195694048	0.003037375906389	0.5336053768317351	DOT1L	21990	AP3D1	22524	MOB3A	45271	True	False	False	ref	-35	0.002167	100	0.06226
1990	chr19	2144047	T	C	rs149339216	-0.01188450416	0.3395765301371334	0.01188450416	0.3279632392744134	0.0082628811093769	0.5524117023993889	-0.0001045740302858	0.3654820784296061	0.0001045740302858	0.3543735088127354	0.5461571178124255	0.1060690917830654	-0.0065707638755021	0.2134277344711773	0.0065707638755021	0.2029440061874551	0.0045309748183896	0.1926500375089649	-5.808129944942672e-05	0.2305334578211731	5.808129944942672e-05	0.2204688279954406	-0.0026639280490461	0.5949026252829958	0.0026639280490461	0.5824272010176818	DOT1L	19887	AP3D1	20421	MOB3A	47374	False	False	False	ref	-30	0.001892	95	0.01314
1991	chr19	2149216	G	A	rs75138150	-0.0550338282	0.0203459715507914	0.0550338282	0.019153473258344	0.0176034873364643	0.0434722401292491	-0.0010133128137527	0.0139670444367417	0.0010133128137527	0.0133218236794809	0.5819935891451156	0.0640819720087667	-0.0320861025932874	0.0135390064026587	0.0320861025932874	0.0125562389851945	0.010256758956021	0.0134018571175771	-0.0005919229192415	0.0105561311185673	0.0005919229192415	0.0099489120447366	-0.0091785184493614	0.2097853590668067	0.0091785184493614	0.2035085954354516	DOT1L	14718	AP3D1	15252	MOB3A	52543	False	True	False	ref	45	0.003372	-65	0.04626
1992	chr19	2165384	G	A	rs141958336	0.0172089612	0.200540091745355	0.0172089612	0.2099117857581475	0.0117891284641073	0.1770732214124386	0.0002018367752676	0.1570215610705228	0.0002018367752676	0.1646637128352058	0.8041182999823651	0.0060313389581707	0.0138299355831532	0.0723634515772293	0.0138299355831532	0.0784356604555094	0.0094581693526345	0.0156437274787652	0.0001618517963078	0.0594360022180349	0.0001618517963078	0.0640500391753712	0.0034170478946876	0.4843770940448898	0.0034170478946876	0.4958134295393176	AP3D1	916	DOT1L	1450	MOB3A	68711	True	False	False	alt	-80	0.006653	-100	0.1344
1993	chr19	2191797	A	C	rs111785160	0.0728367276	0.0087059505812618	0.0728367276	0.009315661724499	0.0269113930495766	0.0079086460940643	0.0022618815659302	0.0043272584066357	0.0022618815659302	0.0045295622466448	0.6134192263405222	0.0387370282373562	0.0446214784227229	0.0048662926167631	0.0446214784227229	0.0053394497674733	0.0164814894650182	0.0026742097640829	0.0013831061580842	0.0030868817125023	0.0013831061580842	0.0032894378492175	0.00916607018745	0.2195939541448593	0.00916607018745	0.2263686278689535	AP3D1	27329	DOT1L	27863	SF3A2	45028	False	True	True	alt	-95	0.002441	55	0.0187
1994	chr19	2196157	C	T	rs77188636	-0.0401147868	0.0531659071845972	0.0401147868	0.0498037408582359	0.0116672721592205	0.1854647895254368	-0.0004728469787602	0.049042626361606	0.0004728469787602	0.0461310494127641	0.6057573211340366	0.0442065453320857	-0.0242602261495551	0.0285265319273288	0.0242602261495551	0.0262395763488348	0.0070658445148266	0.0472575425310528	-0.0002859799426871	0.0308158265456196	0.0002859799426871	0.0286124135595253	-0.005178476955155	0.3787489973109078	0.005178476955155	0.3688604730814077	AP3D1	31689	DOT1L	32223	SF3A2	40668	False	False	False	ref	-70	0.001805	-60	0.073
1995	chr19	2279747	C	T	rs62119705	-0.0482299554	0.0307507535924832	0.0482299554	0.0287347252479105	0.0093123336909501	0.379361806738287	-0.0004588092478553	0.0516224821336615	0.0004588092478553	0.0485807379972876	0.3673046400896274	0.3857535685896623	-0.0177138798004982	0.0558150097922958	0.0177138798004982	0.0515556940277982	0.0034119440348237	0.3348966809835405	-0.0001681266006576	0.0671954818680815	0.0001681266006576	0.062790657260857	-0.0307887011276049	0.0236828554113347	0.0307887011276049	0.0230939881701971	PEAK3	2428	JSRP1	9988	ENSG00000273734	10221	False	False	False	ref	100	0.00319	-25	0.0188
1996	chr19	4957122	G	A	rs4807003	0.0189964587999999	0.15253971948266	0.0235589859999999	0.1579656412955376	0.0095022445374412	0.3702547942634032	0.0002156756921718	0.1516161153134137	0.0002541164761964	0.1562922770067605	0.5069492422120562	0.1605415312523467	0.009335697982744	0.1056043116951036	0.011726600686977	0.1107046202186353	0.0047933329475758	0.1609695928722894	0.000105653771624	0.1075370219665298	0.0001257979084489	0.1119545549946748	0.007431612361124	0.2771574348436343	0.0085353582506042	0.2820281560556772	KDM4B	11992	UHRF1	54041	ARRDC5	54174	False	False	False	alt	85	0.04898	-95	0.0768
1997	chr19	4966030	C	T	rs35502362	0.02361292938	0.159745503644879	0.02361292938	0.1677449102449507	0.0121935736023268	0.162065933114935	0.0003122538624889	0.1129309627875414	0.0003122538624889	0.118528724890149	0.3428458801439848	0.429587292937391	0.0081929105362609	0.1668281132011508	0.0081929105362609	0.176828543861306	0.0041847228919856	0.2282429826517611	0.0001083807323266	0.1269602024009161	0.0001083807323266	0.1345014720711741	0.0169483085924127	0.1192254546623534	0.0169483085924127	0.1224753437841393	KDM4B	3084	UHRF1	62949	ARRDC5	63082	False	False	False	alt	-100	0.004932	15	0.0054
1998	chr19	5020463	G	A	rs34009962	-0.0358219672	0.0703287920977154	0.0358219672	0.0659850765776965	0.010299991946858	0.2866764845770325	-0.0003741267845542	0.0729989204332973	0.0003741267845542	0.0689363606999028	0.4321165157314909	0.2486320422242589	-0.0158146082019821	0.0684393725885163	0.0158146082019821	0.0634777367110409	0.0045624802768234	0.17031419228582	-0.0001690064291505	0.0694835909094312	0.0001690064291505	0.0650558502614968	-0.0159794188736397	0.1086000397297861	0.0159794188736397	0.1054781612743025	KDM4B	51349	UHRF1	117382	ARRDC5	117515	False	False	False	ref	90	0.004677	85	0.0908
1999	chr19	11270403	A	G	rs113848170	0.0586021714	0.0145951685002868	0.0586021714	0.0156555593625697	0.0139631740556849	0.1028724940235927	0.0008322772674934	0.0154441927721308	0.0008322772674934	0.0163665924078479	0.3884189670017323	0.3489389825076199	0.0225771855070014	0.0291100089710373	0.0225771855070014	0.0317781517658967	0.005391591162105	0.1136244609268968	0.0003185124295305	0.0221352924879773	0.0003185124295305	0.0238579057864161	0.0362348157138559	0.0145625835736173	0.0362348157138559	0.0148732963725633	DOCK6	7879	TSPAN16	25737	ANGPTL8	32900	False	True	False	alt	-90	0.01361	-90	0.05185
2000	chr19	19370570	G	T	rs34538000	0.0089206438799999	0.3919190189528458	0.0089206438799999	0.4038062621502208	0.0276411819048911	0.0062209046684122	0.0002583377086245	0.1309009094104404	0.0002583377086245	0.1373860484590971	0.185620182781979	0.6742939860467273	0.0015469035598834	0.4908914989030828	0.0015469035598834	0.5045059152037954	0.0049472359306538	0.1402433094323409	4.3329276692441845e-05	0.2490575892686411	4.3329276692441845e-05	0.2596376197050226	0.0081847322067655	0.2423276973614656	0.0081847322067655	0.2494441230232068	GATAD2A	15257	MAU2	49740	SUGP1	50061	False	True	True	alt	80	0.01367	100	0.03345
2001	chr19	19381164	T	C	rs2965180	0.0524016403999999	0.0215370384069252	0.0524016403999999	0.0231146855204392	0.013202049412631	0.1285506581935135	0.0007216490951059	0.022954074272385	0.0007216490951059	0.0243929232471256	0.2227014803058122	0.6197811175994986	0.0115310788110469	0.0956892541707506	0.0115310788110469	0.1030397743084894	0.0029080282603655	0.409611591816426	0.0001574892989942	0.0660181619333191	0.0001574892989942	0.07085198018347	0.0499714727331196	0.0042722799345132	0.0499714727331196	0.0043958744106495	GATAD2A	4663	MAU2	60334	SUGP1	60655	False	False	False	alt	100	0.010345	-5	0.002747
2002	chr19	19417515	T	G	rs2916073	0.030761443	0.0845891572203387	0.030761443	0.0897943350121971	0.0128268574773727	0.1349342295698428	0.000404461857133	0.0594830409592753	0.000404461857133	0.0628700256058675	0.3898297700183611	0.3460515949148291	0.0120846368342413	0.0874851362961206	0.0120846368342413	0.0939246465768849	0.0050494163075772	0.1317097350743197	0.0001604940377032	0.0641672892308278	0.0001604940377032	0.0686927186983368	0.0180167844064771	0.0830228528053002	0.0180167844064771	0.0854631134287931	GATAD2A	31688	MAU2	96685	SUGP1	97006	False	False	False	alt	70	0.00306	100	0.02985
2003	chr19	19417997	A	G	rs1469713	0.0446046626	0.0338881788828026	0.0446046626	0.0363249397656111	0.0114023584533033	0.1955558266501488	0.0005154286201835	0.0361862622732016	0.0005154286201835	0.0385523037162868	0.4321144410211723	0.2790823018489212	0.0194860521172944	0.0387745427089958	0.0194860521172944	0.0422745245104669	0.004953336233145	0.1401658992000855	0.000226410562053	0.0380767645892874	0.000226410562053	0.0411427813106222	0.0208051950746376	0.0618222153852881	0.0208051950746376	0.0636183642984909	GATAD2A	32170	MAU2	97167	SUGP1	97488	False	False	False	alt	50	0.001595	-55	0.02252
2004	chr19	19468237	T	G	rs10405625	-0.00948044526	0.4172723446967618	0.00948044526	0.4049322523365472	0.009354408697068	0.3698501108901263	-8.493901770149299e-05	0.4175682405324101	8.493901770149299e-05	0.4062874927751098	0.2093341217232543	0.6413123047984834	-0.0019600474640601	0.4839429430548104	0.0019600474640601	0.4707570780174662	0.0019492312358748	0.6096224130591683	-1.757642156903843e-05	0.4757058590148156	1.757642156903843e-05	0.4630707627444093	-0.0087905476197885	0.2612617459329892	0.0087905476197885	0.2538135547317275	TSSK6	47311	NDUFA13	47500	ENSG00000258674	47991	False	False	False	ref	-65	0.006588	60	0.0223
2005	chr19	19505217	T	C	rs3752151	0.050730064	0.0232140183099592	0.050730064	0.0249546549749873	0.0117074193851671	0.1816024742924001	0.0005908028070647	0.0269939610831417	0.0005908028070647	0.0288263905927823	0.5695868214400565	0.0787981905070883	0.0289004640617035	0.0151482986533911	0.0289004640617035	0.0165828003185032	0.0066674357195935	0.0559898396417747	0.0003365284574608	0.0194758697345655	0.0003365284574608	0.0210116150004218	0.0100167014180644	0.1799256180333698	0.0100167014180644	0.1859607383790582	TSSK6	10331	NDUFA13	10520	ENSG00000258674	11011	False	False	False	alt	-100	0.00818	70	0.10693
2006	chr19	19508508	T	C	rs10282	0.0633446393999999	0.0113985610952623	0.0633446393999999	0.0122049411331501	0.0180093736411287	0.039541957376672	0.0011792381807188	0.009474812857653	0.0011792381807188	0.0099751386561549	0.567277668855486	0.0809761552090215	0.035899298925172	0.0080943610879153	0.035899298925172	0.0088583637161119	0.0102226681980888	0.0129663109187892	0.0006682838045163	0.0073375278700313	0.0006682838045163	0.0077953638647791	0.0127013765702963	0.1290645751815082	0.0127013765702963	0.1332846712814037	TSSK6	7040	NDUFA13	7229	ENSG00000258674	7720	False	True	False	alt	-80	0.001472	-100	0.0637
2007	chr19	19520635	A	T	rs7253807	-0.00709143368	0.4752057771549676	0.00709143368	0.4629997953516859	0.0230843391603579	0.0141389064184926	-0.0001669424308156	0.2218091931199441	0.0001669424308156	0.2132004643360554	0.2468407348623948	0.5731715368102024	-0.0017136665822875	0.4917544502462332	0.0017136665822875	0.4782614557296983	0.0055804383224244	0.0996491996340094	-3.950388555895786e-05	0.2811813709312443	3.950388555895786e-05	0.270733663739969	-0.0062199815350781	0.3297580746290435	0.0062199815350781	0.3208221498628763	ENSG00000258674	4407	NDUFA13	4898	TSSK6	5087	False	True	False	ref	-75	0.00457	100	0.0796
2008	chr19	19546823	A	C	rs7245983	0.00705611624	0.4613677420507315	0.00705611624	0.4741063807511368	0.009215657521333	0.3913249641316441	6.613928308076015e-05	0.4506522961049809	6.613928308076015e-05	0.4623491118102295	0.6011950331434973	0.0477883857614567	0.0042107467892799	0.2777397167781056	0.0042107467892799	0.2894295080937886	0.0055525057094807	0.1018530058744399	3.956725248556695e-05	0.2726389088081208	3.956725248556695e-05	0.2834715263847086	0.0010103839251443	0.7968938721250318	0.0010103839251443	0.8105002608536644	CILP2	8574	YJEFN3	17961	ENSG00000258674	30595	False	False	False	alt	35	0.003126	-80	0.07587
2009	chr19	30496516	A	G	rs2053079	-0.01193475884	0.335074571087691	0.01193475884	0.3236731035719979	0.007142252294273	0.7628354225973564	-8.787029186066655e-05	0.4066885380725621	8.787029186066655e-05	0.395295843357372	0.4236662206039481	0.2985218344583842	-0.0051204552395124	0.2627744065586473	0.0051204552395124	0.2516529800377416	0.0030419793001972	0.4187095878244734	-3.791872909487006e-05	0.3113069119718248	3.791872909487006e-05	0.3001956286855388	-0.0056701833006565	0.3604234854217191	0.0056701833006565	0.3509471660182404	ZNF536	271624	URI1	572871	CCNE1	684524	False	False	False	ref	15	0.0008926	45	0.05084
2010	chr19	30500744	T	C	rs2075419	0.0355880332	0.0619868856357857	0.0355880332	0.0664484511263995	0.0134484664302421	0.1138918259115743	0.0004908488452338	0.0402557299377069	0.0004908488452338	0.0429092843842463	0.1278851440367638	0.7625426892612679	0.0048012882234927	0.2524815490028048	0.0048012882234927	0.2644396852322054	0.001788325174855	0.6007652457863382	6.838362779241708e-05	0.17712671356303	6.838362779241708e-05	0.1867732998972133	0.0293364039046047	0.0218007157046272	0.0293364039046047	0.0224494930747539	ZNF536	275852	URI1	577099	CCNE1	688752	False	False	False	alt	85	0.001585	100	0.04782
2011	chr19	30524769	C	T	rs10411290	0.005922495276	0.515902976908657	0.005922495276	0.5287446915087614	0.0219473395906462	0.0177238909010555	0.0001384824148513	0.2817517477824765	0.0001384824148513	0.2916888094887013	0.4225168310874593	0.3017792922083619	0.0024923004681201	0.4042895609499982	0.0024923004681201	0.4169596972673164	0.0092244405977351	0.017186312686022	5.778717242639184e-05	0.2251964352371512	5.778717242639184e-05	0.235561133984221	0.0031473355532733	0.5359222069178231	0.0031473355532733	0.5479564247731769	ZNF536	299877	URI1	601124	CCNE1	712777	False	True	False	alt	60	0.004852	-85	0.05182
2012	chr19	30532140	C	T	rs3786795	0.0023723121999999	0.7484596273477652	0.00271816976	0.7577284902301538	0.0141428260503227	0.0970492038533244	3.670131625028448e-05	0.62284914894334	4.07424481996131e-05	0.6319290814202803	0.2044315812404692	0.6432053742556053	0.0003924340065243	0.7329954438116397	0.0004746980128286	0.7423944098457957	0.0028471503325686	0.4217764074484404	6.027774203014369e-06	0.6457442017582503	6.988978307477654e-06	0.6551020550333931	0.0020435896637931	0.6120973191048437	0.002417037521136	0.620769239746192	ZNF536	307248	URI1	608495	CCNE1	720148	False	False	False	alt	100	0.002625	0	0.0
2013	chr19	30544460	C	G	rs4303654	0.010534008	0.3296606527957151	0.010534008	0.3410404493610811	0.0071615386316176	0.7201806549918696	7.841650390946181e-05	0.392896780178379	7.841650390946181e-05	0.4040886025902848	0.5422940071992448	0.1106797940991501	0.0056518030271466	0.2096118938869608	0.0056518030271466	0.2201941540269161	0.0038779868476145	0.269096258487742	4.201292330764933e-05	0.2539711295602641	4.201292330764933e-05	0.2646555352440916	0.0024834282513303	0.5779486027891841	0.0024834282513303	0.590150140411968	ZNF536	319568	URI1	620815	CCNE1	732468	False	False	False	alt	90	0.00618	-20	0.01543
2014	chr19	33437829	A	G	rs142436687	0.0369571506	0.056851121735411	0.0369571506	0.0607812137684222	0.0117439525516911	0.1799215283003698	0.000438176682681	0.0494270309800509	0.000438176682681	0.0525574964399537	0.541474496623409	0.112834042317629	0.0200507498364808	0.036887905527747	0.0200507498364808	0.0402581482823759	0.0063715505114102	0.0656615224273249	0.0002381393659616	0.0351233833935631	0.0002381393659616	0.0380051303138765	0.0088237429848856	0.2058037074635272	0.0088237429848856	0.2125008293176732	CEBPG	64143	PEPD	83994	CEBPA	135295	False	False	False	alt	65	0.000805	-5	0.001465
2015	chr19	33449354	G	A	rs79051716	-0.0157302498	0.2394955731647682	0.0157302498	0.2296926182590561	0.0083392380257631	0.5352445607794799	-0.000132859111648	0.2732719729351638	0.000132859111648	0.2640039560965955	0.5189182460398967	0.1440542122228338	-0.0081547647984951	0.1618655178395263	0.0081547647984951	0.1527406116339718	0.0042991197175533	0.2198339533065126	-6.845428710432457e-05	0.183020071787908	6.845428710432457e-05	0.1742944746069855	-0.0044232823991949	0.4273543301313827	0.0044232823991949	0.4169525021283151	PEPD	72469	CEBPG	75668	CEBPA	146820	False	False	False	ref	95	0.003002	50	0.01166
2016	chr19	33450805	G	A	rs116925323	-0.1211970572	0.0011517950172073	0.1211970572	0.001109347568291	0.042669201394544	0.0009945885850183	-0.0052914800769504	0.000882764648708	0.0052914800769504	0.000841996046456	0.5459786927250283	0.1074705934346744	-0.0662402524861086	0.0012147345576943	0.0662402524861086	0.0011435635307544	0.023262267691781	0.0008789042765905	-0.0028880715515323	0.0008232196987065	0.0028880715515323	0.0007749796103416	-0.0305397358893763	0.0256717378381352	0.0305397358893763	0.0250469182736964	PEPD	71018	CEBPG	77119	CEBPA	148271	False	True	True	ref	25	0.001221	75	0.02966
2017	chr19	33451314	G	A	rs1345756	-0.0027287112879999	0.7649383817144937	0.002745152596	0.7593062195301191	0.0289561703798761	0.0052013813517513	-7.886965023900171e-05	0.4950264193983964	7.931198456791698e-05	0.4866748350426647	0.4440461000632786	0.26182074537514	-0.0012169124671543	0.6406827648521561	0.0012244354670374	0.6319164407498905	0.0130085708953521	0.0056865763308928	-3.57094481153838e-05	0.4048428134640216	3.591184570160485e-05	0.3958345771279601	-0.0013236651832487	0.7768409987123484	0.0013236651832487	0.7712660586353506	PEPD	70509	CEBPG	77628	CEBPA	148780	False	True	True	ref	-60	0.007446	-100	0.07355
2018	chr19	33451622	C	T	rs77157349	-0.026358921	0.1244408693102471	0.026358921	0.1176579385918213	0.0069431050961808	0.7497742981341349	-0.0001878544614814	0.1851159372704686	0.0001878544614814	0.1771845314404213	0.2758223633025238	0.535046626411301	-0.0072638077078423	0.1804345887313065	0.0072638077078423	0.1710433674663272	0.0019100762388439	0.6234181029078014	-5.14926876141114e-05	0.2295318274437756	5.14926876141114e-05	0.2197275950242195	-0.0221122625753378	0.0515896682184974	0.0221122625753378	0.0502968299452832	PEPD	70201	CEBPG	77936	CEBPA	149088	False	False	False	ref	60	0.002457	-15	0.01198
2019	chr19	33453441	C	T	rs190662727	0.00342496512	0.6791020438035065	0.00342496512	0.6925910223731664	0.0284737126668531	0.0053341864929437	0.0001078461633792	0.3485664317251312	0.0001078461633792	0.3593154249087948	0.2169524580130498	0.6303823951242532	0.0007988843004346	0.6463760554366538	0.0007988843004346	0.6603259587860713	0.0062462953454468	0.0765158791169317	2.550915935673031e-05	0.3989667348686866	2.550915935673031e-05	0.4114061889833789	0.0032510710692019	0.5213131334307352	0.0032510710692019	0.5332676565812164	PEPD	68382	CEBPG	79755	CEBPA	150907	False	True	True	alt	-5	0.001343	100	0.0427
2020	chr19	33457934	C	T	rs35208092	-0.0418637474	0.0477898718388895	0.0418637474	0.0449190960057345	0.0130841952490908	0.1279187913947923	-0.0005640777062335	0.0382022800472381	0.0005640777062335	0.0360976160679052	0.2400668056722579	0.5483674103860573	-0.0100494578608285	0.1368695243618849	0.0100494578608285	0.1292269170787671	0.0031015216312877	0.3042629022889132	-0.0001356973744078	0.1021036814006204	0.0001356973744078	0.0965264317412013	-0.0283737383167874	0.0293703670138442	0.0283737383167874	0.0285875622566639	PEPD	63889	CEBPG	84248	CEBPA	155400	False	False	False	ref	-100	0.003738	0	0.0
2021	chr19	33461291	C	T	rs7254613	-0.01383110668	0.297774394535975	0.01383110668	0.2872043077434825	0.0170192744251054	0.0501953969925452	-0.0002325493253628	0.1642817786092757	0.0002325493253628	0.1572491250787718	0.4802767663564974	0.2053930335151639	-0.0065793406962563	0.2132467329512714	0.0065793406962563	0.2029816466194485	0.0081585065555234	0.0270593709581467	-0.0001104752861203	0.1217514942713391	0.0001104752861203	0.1147342387863422	-0.0051867757964293	0.4041503045722773	0.0051867757964293	0.3940027329458114	PEPD	60532	CEBPG	87605	CEBPA	158757	False	False	False	ref	-100	0.00409	95	0.0779
2022	chr19	33461673	T	C	rs148767361	0.0168518966	0.204069889483774	0.0168518966	0.2137295523331664	0.008833371140232	0.4287582884781843	0.0001526831577642	0.2170882966027888	0.0001526831577642	0.2260832423802111	0.5700391082895051	0.078080427382082	0.0096367839509618	0.1195072271603995	0.0096367839509618	0.1277555474143125	0.0050439433479457	0.1343557769994891	8.750034373169995e-05	0.1302615504401115	8.750034373169995e-05	0.1382309292708548	0.003168082656459	0.5072138611205118	0.003168082656459	0.5190141543754361	PEPD	60150	CEBPG	87987	CEBPA	159139	False	False	False	alt	35	0.000492	80	0.1388
2023	chr19	33462837	A	G	rs6510386	0.0433716542	0.0384113961506799	0.0433716542	0.0412541508920187	0.0114007830953762	0.2075833259115903	0.0005017309948236	0.0380776255348295	0.0005017309948236	0.0405473791786509	0.589869189514414	0.0562579849138201	0.0256799024577722	0.0212656597525299	0.0256799024577722	0.0233169384059699	0.0067375046822854	0.0556340392712454	0.0002977286500588	0.0250391585146237	0.0002977286500588	0.0270479231848566	0.0068506934719239	0.2725520638942516	0.0068506934719239	0.2807979216777285	PEPD	58986	CEBPG	89151	CHST8	159117	False	False	False	alt	10	0.0004578	-50	0.0589
2024	chr19	33463547	T	C	rs76144939	-0.0048331919	0.591188531080269	0.0052024237	0.5804392631703013	0.0108615878299701	0.2338424504001028	-5.130716298957948e-05	0.5268433492988263	5.566678623422016e-05	0.5169110607221136	0.4848763991327711	0.1975301849752804	-0.0023395987031309	0.4250612614417982	0.0025295750305101	0.4143003362433267	0.0052722948218842	0.1228056275882612	-2.4817127487120026e-05	0.3809297527065135	2.7060231184367225e-05	0.3709620080731298	-0.0016763659374059	0.6955736463126239	0.0017842508739717	0.6855951283313555	PEPD	58276	CEBPG	89861	CHST8	158407	False	False	False	ref	75	0.001509	-85	0.04065
2025	chr19	33471266	G	A	rs10423840	-0.0502063738	0.0275253774537467	0.0502063738	0.0259011433810464	0.0110971844023842	0.22433036110314	-0.0005746213864647	0.035864994574592	0.0005746213864647	0.0339053183213809	0.4453448687227045	0.2579154020649297	-0.022512510223714	0.0344050932014858	0.022512510223714	0.0317009133839227	0.0049743061205078	0.1438900635196247	-0.0002590553260821	0.0376997153841239	0.0002590553260821	0.0351605323179167	-0.0220043776387721	0.0575665704720784	0.0220043776387721	0.0560449954994078	PEPD	50557	CEBPG	97580	CHST8	150688	False	False	False	ref	-10	0.00893	35	0.05322
2026	chr19	33479231	G	T	rs10404501	0.00469462566	0.5688634517769692	0.00469462566	0.5819791557419941	0.0171502260469415	0.050074086082819	7.736656763235169e-05	0.378271297411424	7.736656763235169e-05	0.3895084150275331	0.1442151889542422	0.751660374026212	0.0006753729708184	0.6608606519733262	0.0006753729708184	0.674770181488114	0.0024373834081732	0.5274543709094658	1.0880262197990335e-05	0.5328508723349582	1.0880262197990335e-05	0.5462712829096348	0.0046722476374235	0.3888801479501718	0.0046722476374235	0.3988658477596546	PEPD	42592	CEBPG	105545	CHST8	142723	False	False	False	alt	70	0.02487	90	0.0456
2027	chr19	33479609	G	C	rs12461525	-0.0263111423999999	0.1335901203680583	0.0263111423999999	0.1268425382451595	0.0088979482886025	0.4286100274308581	-0.0002616076517562	0.1511465622307695	0.0002616076517562	0.1446405818374041	0.1786906503179493	0.6944115959364444	-0.0052944328497312	0.270503357007264	0.0052944328497312	0.2593259874064731	0.0016870703846732	0.6575366498251145	-5.580810887157862e-05	0.2697488854981158	5.580810887157862e-05	0.2593894225185773	-0.0244608346559611	0.0450495488911719	0.0244608346559611	0.0438911376644915	PEPD	42214	CEBPG	105923	CHST8	142345	False	False	False	ref	-80	0.02226	-100	0.03714
2028	chr19	36169545	A	G	rs1476503	-0.00293084614	0.7308925847192821	0.00293084614	0.7171237688823666	0.0082277852787719	0.5507025052255079	-2.480916743549221e-05	0.7443274809227874	2.480916743549221e-05	0.7308334198658414	0.3130385169970642	0.4759102852900009	-0.00097008613603	0.6267011834146062	0.00097008613603	0.6127169240176057	0.0025829752438902	0.4983491807568784	-8.26538626490316e-06	0.6401152424013755	8.26538626490316e-06	0.6264292193965059	-0.0022012676480046	0.649818318607319	0.0022012676480046	0.6370598524350068	COX7A1	17096	CAPNS1	29591	ZNF146	45058	True	False	False	ref	-35	0.001919	15	0.02246
2029	chr19	36169552	A	G	rs1476504	-0.0020596106999999	0.7677119244960524	0.0027312591	0.7584167804785794	0.0167995612682576	0.0533548578438818	-3.929443589761044e-05	0.6061471447882	5.1123271032567766e-05	0.5974189560072507	0.3142252512992873	0.4738849320617381	-0.0007301092602506	0.6688822367280407	0.0009128496908575	0.6594083750668029	0.0053220225104179	0.1237863652131778	-1.4099459240217094e-05	0.5345772276605297	1.7317819263865272e-05	0.5253011118064408	-0.0013713835205759	0.69672916126425	0.0018859116795816	0.6878287737516864	COX7A1	17103	CAPNS1	29598	ZNF146	45051	True	False	False	ref	20	0.0005875	10	0.0114
2030	chr19	36190511	A	G	rs7249719	-0.0449488418	0.0415673410430342	0.0449488418	0.0392763113276249	0.0161280417902455	0.0705943653180492	-0.0008323610488	0.0284849450086899	0.0008323610488	0.0272050722057306	0.454654093922136	0.2394111272641828	-0.0210941287234654	0.0430549978316529	0.0210941287234654	0.0401003706612629	0.0075127992223956	0.0412792478051344	-0.0003920751660399	0.0275355667301633	0.0003920751660399	0.0260137060328054	-0.0184006058154129	0.0882617773968365	0.0184006058154129	0.0858716149986908	ZNF146	24092	COX7A1	38062	CAPNS1	50557	False	False	False	ref	0	0.0	-10	0.01074
2031	chr19	36194408	C	T	rs2287897	-0.061348596	0.0147803984728958	0.061348596	0.0139427988929664	0.0124894523552157	0.1654009839855672	-0.0008461820400793	0.0223534211835176	0.0008461820400793	0.0211104828765581	0.5148331414226288	0.1526535005164143	-0.0316592206646048	0.0145480651925461	0.0316592206646048	0.0134800832050012	0.0064300674820222	0.0700103202629549	-0.0004361016503315	0.0195396759630671	0.0004361016503315	0.0182579359111735	-0.0185043413313415	0.0858570237698631	0.0185043413313415	0.0835505212443281	ZNF146	20195	COX7A1	41959	ZNF565	51849	False	True	False	ref	55	0.00351	-85	0.01404
2032	chr19	36225931	T	C	rs2432051	-0.0063689944799999	0.5058324066261978	0.0063689944799999	0.4933354953468039	0.0209349904102921	0.0225523571529344	-0.0001387167698667	0.2699053240380074	0.0001387167698667	0.260249248252301	0.0804863120986731	0.8552359955107337	-0.0004874346688034	0.7417514708693252	0.0004874346688034	0.7277361272832813	0.0016021966608433	0.680323060557788	-1.013630259219408e-05	0.5757035308488659	1.013630259219408e-05	0.5623712316292064	-0.0048568968557764	0.3989607063000623	0.0048568968557764	0.3887912255784985	ZNF146	11328	ZNF565	20326	COX7A1	73482	True	False	False	ref	-65	0.0696	95	0.04156
2033	chr19	36243589	G	A	rs2972537	0.01144960568	0.3359623031317293	0.01144960568	0.3473858356342632	0.0067268100791368	0.8403825282087147	7.882755634955422e-05	0.4178658211956799	7.882755634955422e-05	0.4292513972599415	0.2752621915165095	0.5275600407980311	0.0030247337508232	0.3531663241604311	0.0030247337508232	0.3657424592099313	0.0018370000345948	0.6265889976705229	2.069205765746538e-05	0.4117211730367098	2.069205765746538e-05	0.4241454298203887	0.0094254089772715	0.230681785556937	0.0094254089772715	0.2372695448244748	ZNF565	2668	ZNF146	28986	COX7A1	91140	False	False	False	alt	25	0.001057	90	0.02924
2034	chr19	38046684	C	T	rs149760493	-0.0467414692	0.0348676438623318	0.0467414692	0.0327014848039102	0.0107618706000726	0.240935020330004	-0.0005110146711648	0.0416119200202408	0.0005110146711648	0.0393319420422761	0.5931700536312617	0.0542191215462421	-0.0277943900753327	0.0206884504337105	0.0277943900753327	0.0191025901174342	0.006389699190831	0.0651179333534134	-0.0003041580566482	0.0280693225553321	0.0003041580566482	0.0262104939156466	-0.0069959231942239	0.285704350010743	0.0069959231942239	0.2774538026471357	SIPA1L3	139475	WDR87	140007	DPF1	183030	False	False	False	ref	-90	0.010506	-30	0.06116
2035	chr19	38049395	C	T	rs140163185	-0.016713353	0.2518385404388568	0.016713353	0.2416996795080492	0.0076670494680274	0.6530040615219732	-0.0001336590718148	0.2987313671371195	0.0001336590718148	0.2886948982123044	0.5065301507277047	0.1643634940391872	-0.0084808967215487	0.1678047517004394	0.0084808967215487	0.1584143317613107	0.0038836014772529	0.2738357345394667	-6.775804794147758e-05	0.2001264566739453	6.775804794147758e-05	0.1906460493954891	-0.005178476955155	0.3973341704022877	0.005178476955155	0.3872183681179018	SIPA1L3	142186	WDR87	142718	DPF1	180319	False	False	False	ref	-20	0.001068	-35	0.0398
2036	chr19	38050594	G	A	rs150020955	-0.004381254928	0.5728955875641447	0.005357955872	0.5654632999971254	0.0091662797302284	0.3862893221787037	-4.291152797193901e-05	0.5516892625798997	5.075366602633472e-05	0.5447866349099819	0.207780163694644	0.6405630760203216	-0.0009419542252077	0.5986484145087433	0.0011244241739935	0.5910150912754346	0.0019173980648217	0.6109268953798769	-9.207138669022755e-06	0.5797431633635693	1.0681215739073627e-05	0.5725551970942331	-0.0035933982717662	0.4171353877997133	0.0045187190738492	0.4126250471902078	SIPA1L3	143385	WDR87	143917	DPF1	179120	False	False	False	ref	80	0.004845	10	0.006123
2037	chr19	38055616	A	G	rs148362166	0.0096786763	0.3935646562059091	0.0096786763	0.4054662359816406	0.007205394425013	0.7486580443579612	7.412527460349436e-05	0.4582925397029753	7.412527460349436e-05	0.4699401521613859	0.571221693171091	0.0765334592826276	0.0054767499210914	0.2396637442171511	0.0054767499210914	0.2508017895661318	0.0041118354022877	0.2411234768468252	4.188957723032974e-05	0.2879841691696862	4.188957723032974e-05	0.2990317521504069	0.0019543771200945	0.6647739799439184	0.0019543771200945	0.6776197366876165	SIPA1L3	148407	WDR87	148939	DPF1	174098	False	False	False	alt	-95	0.005283	-10	0.01634
2038	chr19	38095543	T	C	rs12983497	-0.00761154	0.463871653396011	0.00761154	0.4511199282147586	0.0094306667174337	0.3786955203224791	-7.676658763161998e-05	0.4449824434668334	7.676658763161998e-05	0.4332762324856044	0.5023413105945082	0.1681979646734886	-0.0038986550142907	0.3198018191383858	0.0038986550142907	0.3074853621325683	0.0047510613466686	0.1671992786607383	-3.9451792824532925e-05	0.3054380091198848	3.9451792824532925e-05	0.2941538105128642	-0.0021452504694031	0.6509781491844513	0.0021452504694031	0.6380917300473978	DPF1	134171	SPINT2	148493	PPP1R14A	160989	False	False	False	ref	-35	0.005806	-100	0.01855
2039	chr19	38100867	G	T	rs3810356	-0.0692168039999999	0.0091684941792257	0.0692168039999999	0.0086192249071486	0.0242241001508207	0.0117166738198573	-0.0016885616319219	0.005060670695696	0.0016885616319219	0.0048842356621549	0.5162626168321248	0.148474748756377	-0.0356808431307972	0.0098146549979217	0.0356808431307972	0.009062544808778	0.0125228627510174	0.006152462085817	-0.0008715840193376	0.0048267999167131	0.0008715840193376	0.0046079950443281	-0.0213114243923691	0.0673163753189071	0.0213114243923691	0.0654426754961569	DPF1	128847	SPINT2	143169	PPP1R14A	155665	False	True	True	ref	60	0.00196	60	0.03522
2040	chr19	38124082	C	T	rs569675332	-0.0181095784	0.2084154327854973	0.0181095784	0.1992957741933553	0.0151972084000296	0.0750401368419581	-0.0002768479651659	0.1142440618491229	0.0002768479651659	0.1085299389890539	0.6543947551323146	0.020067916834444	-0.0118014277750836	0.1055672982707241	0.0118014277750836	0.0986784974831914	0.009925669505269	0.0130853193175667	-0.000180073253619	0.0603685217566673	0.000180073253619	0.0563401376583891	-0.0017323831160074	0.7021944459225916	0.0017323831160074	0.6890551523431996	DPF1	105632	SPINT2	119954	PPP1R14A	132450	False	False	False	ref	-65	0.00879	-35	0.0471
2041	chr19	38124126	G	A	rs182522360	-0.016142704	0.2346285363250727	0.016142704	0.2249393637463136	0.0159916718180307	0.0663119555815598	-0.0002638359629404	0.1241021373764387	0.0002638359629404	0.1180712970827947	0.6573989356736065	0.0192585982424181	-0.0105885572411209	0.121087981337041	0.0105885572411209	0.1134550278542299	0.010510952723468	0.0111291083879772	-0.0001729869632711	0.0664902046296584	0.0001729869632711	0.062090262736753	-0.0015664062905216	0.7292661640080074	0.0015664062905216	0.7161240247819649	DPF1	105588	SPINT2	119910	PPP1R14A	132406	False	False	False	ref	-90	0.02899	-75	0.0739
2042	chr19	38131300	G	A	rs855616	0.00487912298	0.5976617312588938	0.00487912298	0.6109346020565015	0.0085354263194169	0.4926495287800301	4.39216985026218e-05	0.6005186101496427	4.39216985026218e-05	0.6131455656098638	0.4605338229649686	0.2364012707084227	0.00227572438599	0.4556219119816055	0.00227572438599	0.4690734029376735	0.0039306172442221	0.2654304985213286	2.05104255832184e-05	0.4602527413615734	2.05104255832184e-05	0.4732203558986496	0.0020435896637931	0.652681499930144	0.0020435896637931	0.6654654622675802	DPF1	98414	SPINT2	112736	PPP1R14A	125232	False	False	False	alt	-65	0.003956	-15	0.01477
2043	chr19	38135855	T	C	rs8110434	0.00423990778	0.5328639242609993	0.0052941262999999	0.5428383600927343	0.0075583244974537	0.6745418498169049	2.937996414264678e-05	0.5828203359825069	3.849358900274817e-05	0.5920130777865901	0.4657641676780879	0.2287340040813113	0.0020159404798704	0.3808497844665239	0.0024917872788122	0.3908482027223606	0.0035028607143069	0.3360434324826901	1.3934568144117324e-05	0.418872323772164	1.8048221241273227e-05	0.4282989688955123	0.0015788545524331	0.636526307704699	0.0020311414018817	0.6454824853056924	DPF1	93859	SPINT2	108181	PPP1R14A	120677	False	False	False	alt	100	0.01464	-40	0.01309
2044	chr19	38138144	A	T	rs4803805	-0.00437866968	0.6433659849307456	0.00437866968	0.6301770521168574	0.0201411947573256	0.0260161676424296	-8.940821192874016e-05	0.3935361182447295	8.940821192874016e-05	0.3827512721171456	0.1833172543283643	0.6751668105587922	-0.0007580224962618	0.6734702150314104	0.0007580224962618	0.6593194959601901	0.0035637393107196	0.2964014358456838	-1.4793201012287458e-05	0.5005895143119761	1.4793201012287458e-05	0.4877444432591016	-0.0038859324266848	0.4780106168194514	0.0038859324266848	0.4668262185674715	DPF1	91570	SPINT2	105892	PPP1R14A	118388	False	False	False	ref	-100	0.01268	30	0.01422
2045	chr19	38139285	G	T	rs61185863	-0.002241800466	0.6038452533329306	0.005374711546	0.598340232378873	0.0113167422464958	0.2011738443443631	-2.412605840694151e-05	0.5318696065487375	6.100308005726863e-05	0.5269735425294605	0.4099731325013745	0.3176696980060694	-0.0009026549145187	0.4889088761221297	0.0021151139029764	0.4834563471099515	0.0046379246101151	0.174320205523918	-9.636428558621837e-06	0.4353993144990847	2.399127702201313e-05	0.4302721841250038	-0.0008755277544372	0.5798576028665691	0.0027635141443375	0.5756265742569069	DPF1	90429	SPINT2	104751	PPP1R14A	117247	False	False	False	ref	-15	7.25e-05	-50	0.03473
2046	chr19	38180561	A	G	rs10401165	-0.0013472919119999	0.8888487440635168	0.0013472919119999	0.8749902257072629	0.0252968652463375	0.0093375128887955	-3.371336569579294e-05	0.6839240715044543	3.371336569579294e-05	0.6707431750815225	0.2530254463220572	0.5688416815991327	-0.0003097771660078	0.8159104022725425	0.0003097771660078	0.8018303143258312	0.0064718489606463	0.0678132045251072	-7.744787001200478e-06	0.6462443530267249	7.744787001200478e-06	0.6326037864845506	-0.0011203435720287	0.8040666983857343	0.0011203435720287	0.7905036721268225	DPF1	49153	SPINT2	63475	PPP1R14A	75971	False	True	True	ref	80	0.0006104	100	0.02954
2047	chr19	49661592	G	T	rs66675705	0.009449564434	0.3960569475651572	0.009569276766	0.405473669569461	0.0293587292310256	0.0049512516601666	0.0002968411768623	0.1302555604794802	0.0002999309521773	0.1356035451037236	0.5319515762611646	0.1267553579013767	0.0050515054096152	0.2696081323441318	0.0051142693486747	0.279025073744791	0.0156293534958261	0.002877250331758	0.0001587075508357	0.0902395533870216	0.0001603274881192	0.095205427293955	0.0023796927354017	0.6112483119783628	0.0024128881004988	0.6193707270519386	BCL2L12	3551	IRF3	4283	PRMT1	14195	False	True	True	alt	85	0.001003	-55	0.04187
2048	chr19	49665614	G	A	rs2304206	-0.0307753604	0.0937959202822981	0.0307753604	0.0886138402485051	0.0101769010429547	0.2918746904236465	-0.0003228842036532	0.0941814663071416	0.0003228842036532	0.0893515862119698	0.7930414215915103	0.0064769268280445	-0.0243114918963775	0.0291921974504643	0.0243114918963775	0.0269409855925862	0.0080609831781138	0.0289768499446771	-0.0002548933924893	0.0391000901408839	0.0002548933924893	0.036461838742052	-0.0060623035508666	0.3241552865091108	0.0060623035508666	0.3152650029009604	IRF3	261	BCL2L12	471	PRMT1	10173	True	False	False	ref	100	0.01018	90	0.04608
2049	chr19	49665670	A	C	rs2304205	0.0318658816	0.0761337259129864	0.0318658816	0.081215173504371	0.0248856193049821	0.0099768406339782	0.0008181934604786	0.01751138446903	0.0008181934604786	0.0183853554818429	0.8116287513355948	0.0057582578091078	0.0258258624467751	0.0204850408665759	0.0258258624467751	0.0223613327765434	0.0201465277555195	0.0013195152472875	0.0006617753366339	0.0073910763302691	0.0006617753366339	0.0078317368811029	0.0063569124161038	0.2930062001184462	0.0063569124161038	0.3016918862905069	IRF3	205	BCL2L12	527	PRMT1	10117	True	True	True	alt	95	0.02277	50	0.1012
2050	chr19	50466719	C	T	rs2278999	0.0497767797999999	0.0248124938922952	0.0497767797999999	0.0266027071843512	0.0169728668922857	0.050642082057421	0.0008521443580182	0.0146631906881503	0.0008521443580182	0.0155397502263842	0.6263031774188529	0.0306119352070353	0.0312133302592738	0.0123147506051714	0.0312133302592738	0.0134370455692911	0.010628831271666	0.0105428756356527	0.0005342796731576	0.0096444608398633	0.0005342796731576	0.0102816706857908	0.0053320055187294	0.3450844105370155	0.0053320055187294	0.3546039104581113	EMC10	9682	GARIN5A	10129	MYBPC2	33826	False	False	False	alt	-75	0.005894	-70	0.0525
2051	chr19	56675761	T	C	rs2052241	0.0615960049999999	0.0115054585692054	0.0615960049999999	0.0122705460365608	0.0125666220552309	0.1515847991208118	0.0007997007091088	0.0172842271852378	0.0007997007091088	0.0182868222963651	0.3198767622070768	0.4584193959731	0.0194874331270926	0.0392956922086956	0.0194874331270926	0.0428697983772809	0.0040026049861866	0.2396327152366269	0.0002524116422561	0.0342903627988655	0.0002524116422561	0.0370323343910107	0.046500482370149	0.0054277924165646	0.046500482370149	0.0055852570608493	ZNF835	3978	SMIM17	32601	ENSG00000293626	80458	False	True	False	alt	100	0.01271	-100	0.01743
2052	chr19	56678350	C	T	rs758749	-0.0193647877999999	0.1924688481338904	0.0193647877999999	0.1835828180641846	0.0090516755025027	0.4279070462975057	-0.0001793454180467	0.2014515423018988	0.0001793454180467	0.1931746181317219	0.3960953951804479	0.3443092661541128	-0.0077231601551915	0.1726960066916864	0.0077231601551915	0.1634104479611683	0.0035952021674976	0.3190370090219847	-7.164644513080832e-05	0.1780505834693884	7.164644513080832e-05	0.1692833456822265	-0.0105063330532473	0.180037403078677	0.0105063330532473	0.1746544517691198	ZNF835	6567	SMIM17	35190	ENSG00000293626	83047	False	False	False	ref	-75	0.001755	35	0.0443
2053	chr2	2312029	A	G	rs17247190	0.004968721842	0.5907034875362331	0.005011203118	0.6021029021593227	0.0081299333439846	0.5227629757499007	4.489964439722005e-05	0.5851482385106351	4.515560672110279e-05	0.5968615805784365	0.2127615431695348	0.6353000789049416	0.0012428318699683	0.5887657001653095	0.0012490322614815	0.6007314904670985	0.0017820376278202	0.6377050527737671	1.1286804948445504e-05	0.5844313546906343	1.1324164152348346e-05	0.5960927045791216	0.0041826160022406	0.424195123580833	0.0042365584705235	0.4328214447784456	MYT1L	19635	PXDN	567177	TPO	937962	False	False	False	alt	-70	0.002256	100	0.08234
2054	chr2	2322151	T	C	rs10206268	0.0049300103	0.5779474914533721	0.0049300103	0.5909566997576695	0.0194923827474606	0.0296745187533088	9.506934791325956e-05	0.3464305559073087	9.506934791325956e-05	0.3573008887455423	0.3049886409610058	0.4878495903503868	0.0015752920705911	0.4985639402730576	0.0015752920705911	0.5120426556058617	0.0059522454958193	0.0817432469202007	3.046485343529573e-05	0.3265843735906575	3.046485343529573e-05	0.3383003306237117	0.0034813639145633	0.4859705899267666	0.0034813639145633	0.4975988984087823	MYT1L	9513	PXDN	577299	TPO	948084	False	False	False	alt	95	0.00842	95	0.015564
2055	chr2	17824042	G	A	rs35983183	-0.006688423	0.387237860603786	0.009030813	0.3790570978470736	0.0089407062536227	0.4195611925931742	-6.167092826382437e-05	0.3786964883138645	8.227178580699734e-05	0.3710695080832798	0.3125468106515627	0.4764216442954995	-0.0021517062864676	0.3662059677794768	0.0028786080108243	0.3578582985697623	0.0028054738955057	0.4449996643409973	-1.9965504282813755e-05	0.3590119656646513	2.635846119527156e-05	0.3511277808668015	-0.004815402649405	0.2965301621532712	0.006607952364651	0.291371262721929	MSGN1	7581	SMC6	23800	KCNS3	53806	False	False	False	ref	65	0.0017395	-90	0.010284
2056	chr2	17826046	T	C	rs35925486	0.0113032014	0.3155136149573492	0.0113032014	0.3267996634997728	0.0094807980523115	0.3515058473622581	0.0001084072415356	0.3082545131042388	0.0001084072415356	0.3185031609059943	0.0953599103725141	0.8234584349910428	0.0010729355814623	0.5701033626881281	0.0010729355814623	0.584286594357446	0.0008996810836984	0.8056828664487206	1.0288411748945573e-05	0.5496344558568964	1.0288411748945573e-05	0.5632187287667413	0.0091930414215914	0.2056674786994523	0.0091930414215914	0.2121281943409894	MSGN1	9585	SMC6	25804	KCNS3	51802	False	False	False	alt	95	0.001289	95	0.0029
2057	chr2	17872369	A	T	rs6531063	0.00451747566	0.6001771184198116	0.00451747566	0.6135590984970094	0.0161714388099568	0.0620575417355436	7.276777597991116e-05	0.4232184498481433	7.276777597991116e-05	0.4351828533028589	0.2633761761014118	0.5464515703187334	0.0013488507322619	0.5406720669223924	0.0013488507322619	0.5545896701948007	0.00416402965312	0.2131176582826354	2.163133388406875e-05	0.4112196886915688	2.163133388406875e-05	0.4241654270267934	0.0033589560057676	0.4910633754944706	0.0033589560057676	0.5025043858461803	KCNS3	5479	MSGN1	55908	SMC6	72127	False	False	False	alt	-25	0.0002975	-85	0.02065
2058	chr2	17894785	A	G	rs2061607	0.082970114	0.00374959972286	0.082970114	0.0039391732465816	0.0222404807725694	0.0164066056143979	0.001858474539138	0.0039131590799824	0.001858474539138	0.0040690210598981	0.3450243259784852	0.4240398012101031	0.0287351963197729	0.0155842734583661	0.0287351963197729	0.017003558523757	0.0076291719367873	0.0349485458110146	0.0006394725266517	0.0069040509357493	0.0006394725266517	0.0073004299266052	0.0603429496156598	0.0016460310384402	0.0603429496156598	0.0017037699752298	KCNS3	16937	MSGN1	78324	SMC6	94543	False	True	True	alt	100	0.02557	-30	0.007263
2059	chr2	22333905	A	C	rs4552217	0.0061536198599999	0.5100379416956133	0.0061536198599999	0.5231048519321253	0.0057326300035322	0.9677474376663172	3.527024498044109e-05	0.6344104623341047	3.527024498044109e-05	0.6473398740445051	0.2458199773856574	0.5843597795650277	0.0014128378518156	0.5175862879614619	0.0014128378518156	0.5312450013312336	0.0014207410302355	0.7176444731584819	8.126008247444697e-06	0.6062726326511364	8.126008247444697e-06	0.6199354726206725	0.0057593958443551	0.3612671820548117	0.0057593958443551	0.3708256280785005	KLHL29	1051275	TDRD15	1209936	APOB	1289832	False	False	False	alt	-55	0.001934	35	0.01342
2060	chr2	22333932	T	G	rs4277554	0.0019927804	0.4740641931532641	0.0069077999999999	0.4767627783701124	0.0076353979108547	0.6406142266581486	1.1047729180251705e-05	0.5173955561729217	5.248733204532946e-05	0.5195739758004896	0.2467971659457047	0.5827217421431057	0.0002937211208562	0.4835965824322628	0.0017295466958212	0.4857638015231965	0.0019018737605514	0.6225464077719897	1.1992260762110612e-06	0.5115936535462087	1.3275083905484183e-05	0.5133449754051282	0.0019315553065903	0.3222039504826713	0.0059772404278052	0.3244986144199052	KLHL29	1051248	TDRD15	1209963	APOB	1289859	False	False	False	alt	85	0.00303	-100	0.003616
2061	chr2	22345778	C	A	rs7608960	-0.0005799636	0.930705742622682	0.00080748616	0.9216350337143938	0.019392866667156	0.0297533481243613	-1.1397659042714835e-05	0.8300154830931659	1.5542978310945588e-05	0.8207232394842044	0.0862104378676126	0.846734278139132	-5.68957412856711e-05	0.9324376881581398	7.369104634768589e-05	0.9231898731440767	0.0016621617169056	0.6691867501766012	-1.098359201779264e-06	0.8751063373501747	1.4043591801268612e-06	0.8656884797316509	-0.0005684706272886	0.8653070290280702	0.0007054015083143	0.8560115580934374	KLHL29	1039402	TDRD15	1221809	APOB	1301705	False	False	False	ref	-60	0.001175	-15	0.006012
2062	chr2	22415696	T	C	rs11895519	-0.0073782338199999	0.4700579451539574	0.0073782338199999	0.4575596273269642	0.0088735212364338	0.4394438681206501	-6.775472290394695e-05	0.4653446610976038	6.775472290394695e-05	0.4535706080177797	0.0696646230770028	0.8766114862350188	-0.0005273147740251	0.7430198479665746	0.0005273147740251	0.7285957222098745	0.0006236561675328	0.8722473637540192	-4.866319159288086e-06	0.7345547857458075	4.866319159288086e-06	0.720275610274124	-0.0052220458718451	0.3698938512460967	0.0052220458718451	0.3603840203913576	KLHL29	969484	TDRD15	1291727	APOB	1371623	False	False	False	ref	95	0.001312	0	0.0
2063	chr2	22417579	A	C	rs140227113	-0.00692474692	0.4682723609661985	0.00692474692	0.455912792972748	0.0285526597378655	0.0048923916375663	-0.0001978368496394	0.1796849311284308	0.0001978368496394	0.1719736635264195	0.1367918754343924	0.759878732293113	-0.0009222546664846	0.6186465723453969	0.0009222546664846	0.6049265851350364	0.0039741851961391	0.2464830155107168	-2.6870605992165792e-05	0.3624209703979376	2.6870605992165792e-05	0.350641245610005	-0.0067988257139596	0.3051684265937188	0.0067988257139596	0.2967744504604627	KLHL29	967601	TDRD15	1293610	APOB	1373506	False	True	True	ref	85	0.002167	100	0.004135
2064	chr2	22509148	T	C	rs1463977	0.00326864016	0.6016014865647613	0.00438218968	0.6086031662064275	0.0070630070750392	0.769999803235811	2.4949051240780395e-05	0.6448527820326887	3.182131147766932e-05	0.6510254436235625	0.2534549113580016	0.5610644648753736	0.0008613429360874	0.5854120934572895	0.0011081598509371	0.5927815845477126	0.0018378412923585	0.6340804511974939	6.570256360273042e-06	0.6176766648160984	8.179762124501597e-06	0.6245217241183849	0.0027344681998775	0.4775254825886995	0.0037759727798005	0.4816467097494367	KLHL29	876032	TDRD15	1385179	ATAD2B	1417975	False	False	False	alt	-35	0.001289	55	0.03247
2065	chr2	26765143	T	A	rs34995758	-0.01104751166	0.3453668703625943	0.01104751166	0.3340355876778548	0.0053577098937618	0.9666587420308258	-6.09175821456276e-05	0.5066667046977316	6.09175821456276e-05	0.4944516553820499	0.5725266859614726	0.0749826787143707	-0.0063442423134449	0.2133673168230975	0.0063442423134449	0.2030655748304877	0.0030572851112243	0.4149947456204511	-3.485960143976028e-05	0.321632623671001	3.485960143976028e-05	0.310455683993337	-0.0018734634176702	0.6925788346969489	0.0018734634176702	0.6795997377128798	CENPA	853	SLC35F6	858	KCNK3	72420	False	False	False	ref	100	0.003372	-100	0.07153
2066	chr2	26769202	C	T	rs3769126	-0.048269432	0.0303327845307586	0.048269432	0.0284988554693471	0.0148488201606157	0.0837505000569052	-0.0007614745112238	0.0230756908316783	0.0007614745112238	0.0219149505328426	0.4705235531488915	0.2076357507735752	-0.0230790020175119	0.031587861440588	0.0230790020175119	0.0290740827496983	0.0071293955297604	0.0496624388962829	-0.0003717697816074	0.0232194185995901	0.0003717697816074	0.0218154160544459	-0.0183528874780858	0.0873525759097392	0.0183528874780858	0.0849204452201926	CENPA	4912	SLC35F6	4917	KCNK3	76479	False	False	False	ref	30	0.000553	20	0.01855
2067	chr2	26774622	A	C	rs4665905	0.0265567505999999	0.1074410064285622	0.0265567505999999	0.1138987987112511	0.0092106112721124	0.3821673899667337	0.0002517535812894	0.1131157629215278	0.0002517535812894	0.1190169110497195	0.4046535752445564	0.3146640117842091	0.0109766643726852	0.1010845966178023	0.0109766643726852	0.1082549798640316	0.0037623620434802	0.265588759681527	0.0001048124207065	0.1056994445871685	0.0001048124207065	0.1122201677247181	0.0141350014004294	0.1256916024453262	0.0141350014004294	0.1296330070809732	CENPA	10332	SLC35F6	10337	DPYSL5	73126	False	False	False	alt	-60	0.002012	-85	0.0499
2068	chr2	26808217	C	T	rs34736994	-0.061156154	0.0155106836003933	0.061156154	0.0146244318790549	0.0140488694573425	0.1057298972022316	-0.0008931432418472	0.0180091186724402	0.0008931432418472	0.0171089085013267	0.3198331932903868	0.4583556171494217	-0.0202244291136996	0.0444716362856692	0.0202244291136996	0.0410997117380186	0.0045605667716725	0.1734476891634175	-0.0002981328243709	0.0324818618068703	0.0002981328243709	0.0304577632499168	-0.0472162574300562	0.0059775647814799	0.0472162574300562	0.0058529689420808	DPYSL5	39531	CENPA	43927	SLC35F6	43932	False	True	False	ref	-85	0.001329	50	0.01282
2069	chr2	26810572	G	A	rs2082610	0.010181407	0.3372141619147228	0.010181407	0.3488900699596933	0.00848087690062	0.5088566197735959	8.514188865404837e-05	0.3639422787248664	8.514188865404837e-05	0.3748549765998681	0.2950590773763212	0.5040426031192625	0.0030301935055623	0.3383927053288171	0.0030301935055623	0.3508901190729614	0.0024855641970603	0.5162627270623661	2.513289369196353e-05	0.3519940994470879	2.513289369196353e-05	0.3639657037154837	0.0079876347265012	0.2410284348425677	0.0079876347265012	0.248447147106925	DPYSL5	37176	CENPA	46282	SLC35F6	46287	False	False	False	alt	5	3.24e-05	10	0.004578
2070	chr2	26813614	T	C	rs11891133	0.0139091751	0.2593798793528998	0.0139091751	0.2697040213536015	0.0096345339616475	0.3376107799506472	0.000140202375225	0.2533678020566341	0.000140202375225	0.2626934048167816	0.5184929304245894	0.1472200201908655	0.0072386567610755	0.1690282623435511	0.0072386567610755	0.1787651659069354	0.0050031846165736	0.1420732257198439	7.304894448132904e-05	0.1658357558849769	7.304894448132904e-05	0.1746814806789218	0.0039460990259234	0.4459296572929365	0.0039460990259234	0.4569750644734258	DPYSL5	34134	CENPA	49324	SLC35F6	49329	False	False	False	alt	-35	0.003262	-85	0.0828
2071	chr2	26814228	C	G	rs2082611	-0.0448364698	0.0402658378981281	0.0448364698	0.0376603481304018	0.0115851210566797	0.1884576227938173	-0.0005287950750256	0.0389593675430173	0.0005287950750256	0.0366727365182539	0.6587474973806782	0.0181505641760891	-0.029500179705654	0.0173148204512353	0.029500179705654	0.0159767392970488	0.007623959693592	0.0351341930361637	-0.0003475951058174	0.0223543267617771	0.0003475951058174	0.020839888232084	-0.0040332368593034	0.4543401588041113	0.0040332368593034	0.443541443327532	DPYSL5	33520	CENPA	49938	SLC35F6	49943	False	False	False	ref	-20	0.00267	-100	0.0616
2072	chr2	26815782	G	T	rs35610357	-0.01068941964	0.3464991024191992	0.01068941964	0.3349844827707662	0.0165529529231408	0.0546990145825171	-0.0001756244345336	0.2102622414516848	0.0001756244345336	0.202033985491584	0.6381373250759863	0.024669645895992	-0.0068515033097981	0.2023270783636499	0.0068515033097981	0.1926103169773129	0.0105604358859142	0.0104378532605126	-0.0001125602694531	0.1199364271282596	0.0001125602694531	0.1135372281122842	-0.0010560275521529	0.8022948705092158	0.0010560275521529	0.7886082361700767	DPYSL5	31966	CENPA	51492	SLC35F6	51497	False	False	False	ref	-80	0.135	-90	0.00818
2073	chr2	26816924	G	A	rs12475388	0.00761723386	0.4704456973472297	0.0078370007399999	0.4799063415967994	0.0126884948868795	0.1388622022547186	0.0001006660908332	0.3840685305465749	0.0001033921437339	0.3925871944774977	0.5193497857861595	0.1452360007255307	0.0039682256679585	0.3247812576734873	0.0040791703420927	0.3341097014943691	0.0065900448415647	0.0577720930584454	5.241643072569994e-05	0.2578574539839111	5.379262098087448e-05	0.2663668212783475	0.0022240894615089	0.6352906477254185	0.0022946296123403	0.6435541298160076	DPYSL5	30824	CENPA	52634	SLC35F6	52639	False	False	False	alt	70	0.00611	95	0.07874
2074	chr2	26843235	G	T	rs2196150	-0.000441837396	0.7632657563219085	0.002446008924	0.7660602693195769	0.0175400640573927	0.0463384463047515	-1.3211294972609496e-06	0.5743719469744777	4.50105024838073e-05	0.5768136909466348	0.3538335459911409	0.4152555587568316	-0.0001769473101647	0.6384333950001632	0.0008789456853791	0.6406614887192573	0.0061998027585263	0.0740493738479862	-7.864043022225212e-07	0.4934584002308974	1.614545329704553e-05	0.4956451859092295	-0.00030498241683	0.7122458552380475	0.0016203487588044	0.7145079903607345	DPYSL5	4513	CENPA	78945	SLC35F6	78950	False	False	False	ref	80	0.0673	100	0.02411
2075	chr2	26870976	A	C	rs1368889	0.0017993075859999	0.7900708953875052	0.002292695866	0.7975078004016837	0.0238373212977768	0.0123289203400355	4.045946410291525e-05	0.5391106218688069	5.171076038393495e-05	0.5461645786279526	0.1484268509009429	0.7398882015229272	0.0002884302243893	0.7817691116780376	0.0003767650475571	0.7891991640687186	0.00356234697407	0.3072080608018088	6.458459717719434e-06	0.6214103926776863	8.472859478236855e-06	0.6286313498831594	0.0014170271475844	0.6477333570388748	0.0020186931399702	0.6546649634838062	DPYSL5	23228	MAPRE3	99662	CENPA	106686	False	True	False	alt	-80	0.0028	5	0.000641
2076	chr2	27712485	C	A	rs4665386	-0.0047992845839999	0.5609776366851215	0.0054747808639999	0.5506709258222963	0.0057931740383371	0.9629381375156012	-2.761887732567593e-05	0.6678430146904896	3.1673322920351205e-05	0.6580386255816097	0.2390937665328478	0.5773656987098631	-0.0015028123457619	0.5361694223193747	0.00165358832166	0.5250150874223211	0.0013866327271587	0.7073515818401607	-8.686792103672289e-06	0.6124099095665267	9.591775618653024e-06	0.6019121233891819	-0.0033776283986348	0.4522767396093747	0.003991742652932	0.4445420113596999	SUPT7L	48645	SLC4A1AP	49058	MRPL33	59233	False	False	False	ref	70	0.001133	-100	0.0286
2077	chr2	27796239	C	T	rs4666013	-0.0375540448	0.068049063518653	0.0375540448	0.0640976647111526	0.0120012436647833	0.1725783327613711	-0.0004563565781735	0.05586314293207	0.0004563565781735	0.052779633370295	0.3951825226402763	0.3436938758412513	-0.0149407461321839	0.0804209143093221	0.0149407461321839	0.0747577174573786	0.0047883715766115	0.157537705115749	-0.0001833545846974	0.0649365576370907	0.0001833545846974	0.0607407584095919	-0.0225064575358664	0.0656553681944358	0.0225064575358664	0.0638080461987186	MRPL33	24521	BABAM2	93703	RBKS	94442	False	False	False	ref	100	0.01111	-55	0.03653
2078	chr2	27796500	G	A	rs4666015	-0.008484067	0.4228629378771769	0.008484067	0.41069616438676	0.0072148309410401	0.7435413766513849	-6.100046360920734e-05	0.4877903808622126	6.100046360920734e-05	0.47574486058258	0.4178736293944958	0.3084404127525587	-0.0035769131604618	0.3296424670000603	0.0035769131604618	0.3177229652669522	0.0030189091710176	0.4156361827362481	-2.575395601425532e-05	0.3746489019330473	2.575395601425532e-05	0.3628122401191374	-0.004224110208612	0.4444133294657518	0.004224110208612	0.4336252676275204	MRPL33	24782	BABAM2	93442	RBKS	94181	False	False	False	ref	-100	0.0017395	75	0.0475
2079	chr2	27799808	G	A	rs7570730	-0.0015002134199999	0.7406879327130557	0.0029337299	0.7319875369371228	0.0086260272278	0.4800828100085348	-1.2878362422913332e-05	0.7350390386519187	2.5872886937490942e-05	0.7265874217532974	0.4163985103579913	0.3107347294691885	-0.0006584102801232	0.5680426051439301	0.001218602806178	0.5591294660476634	0.0035913521042112	0.3190940084476872	-5.667105307647471e-06	0.5706005203700968	1.0745132392872975e-05	0.562077355098682	-0.0006701314328986	0.749366453441938	0.001433624830133	0.7410141955143665	MRPL33	28090	BABAM2	90134	RBKS	90873	False	False	False	ref	-80	0.00535	45	0.02448
2080	chr2	27802713	G	C	rs11891769	-0.00627337558	0.5513843260160237	0.00627337558	0.5381262192299043	0.0072601865730898	0.7440667578131408	-4.736956924496623e-05	0.6106966776044662	4.736956924496623e-05	0.5977507575374398	0.2996296642081349	0.5004971087232232	-0.0018499396517988	0.5072832614577428	0.0018499396517988	0.4940353022715844	0.0021734752941442	0.5763999361928627	-1.3954159522603644e-05	0.5514887776314766	1.3954159522603644e-05	0.5382683891539124	-0.0053029595742694	0.429278169240528	0.0053029595742694	0.4192693870961694	MRPL33	30995	BABAM2	87229	RBKS	87968	False	False	False	ref	-100	0.02063	-95	0.02118
2081	chr2	27807570	A	G	rs12986980	0.004159181768	0.6433415366073257	0.004159181768	0.6573652430954353	0.0094396032495506	0.366549835627009	3.9029430002580914e-05	0.6164679411174783	3.9029430002580914e-05	0.6299902421201131	0.3137003495886886	0.4754820641399936	0.0013484178284239	0.5553539385173973	0.0013484178284239	0.5696672502341799	0.0029652249310745	0.4250380911077097	1.2622377988661432e-05	0.5372123943591557	1.2622377988661432e-05	0.5510713445036663	0.0028236807435761	0.5475734236272448	0.0028236807435761	0.5596263920558844	MRPL33	35852	BABAM2	82372	RBKS	83111	False	False	False	alt	100	0.01407	-85	0.00508
2082	chr2	27811517	C	T	rs4233716	-0.0208434602	0.1795850980370257	0.0208434602	0.1709918753230918	0.0073405384935411	0.7277101565302766	-0.0001532305745289	0.2354519444159688	0.0001532305745289	0.2266221991339168	0.2347327254432099	0.6001143992161581	-0.0049460160921696	0.2551940464361045	0.0049460160921696	0.2441674409415962	0.0017090837082879	0.6613963138760522	-3.605487021262294e-05	0.2985750041395231	3.605487021262294e-05	0.2877427974441471	-0.0188155478791273	0.0807602430226671	0.0188155478791273	0.0785275434167156	MRPL33	39799	BABAM2	78425	RBKS	79164	False	False	False	ref	100	0.0183	35	0.01367
2083	chr2	27815932	C	T	rs12617171	-0.0113443269	0.3506200362885404	0.0113443269	0.3388321364872032	0.0065580034092275	0.8405609994664844	-7.929865196405335e-05	0.4387056484661615	7.929865196405335e-05	0.4270218177240636	0.3168352368800505	0.4726439129021941	-0.0035414785342505	0.3451555864463754	0.0035414785342505	0.3327831869624607	0.0020767973726966	0.5953323302663485	-2.46345316420036e-05	0.4086556503241986	2.46345316420036e-05	0.3963076849035398	-0.0079917841471384	0.2512994088844658	0.0079917841471384	0.2445787024168186	MRPL33	44214	BABAM2	74010	RBKS	74749	False	False	False	ref	75	0.003862	-90	0.0785
2084	chr2	27835359	C	T	rs12464988	-0.0225021452	0.1689178442175693	0.0225021452	0.1608546423107791	0.0073454557313027	0.720335825243159	-0.0001681422932013	0.2228310785181191	0.0001681422932013	0.2143515263898479	0.2153051380201039	0.6342099732417824	-0.0048746769306533	0.2622072896547138	0.0048746769306533	0.2512584677986412	0.0015824367270816	0.6870973179864263	-3.641830679013004e-05	0.3047584984123346	3.641830679013004e-05	0.2939017735917911	-0.0209442006659819	0.0668848525909722	0.0209442006659819	0.0650604315292085	BABAM2	54583	RBKS	55322	MRPL33	63641	False	False	False	ref	5	0.000473	-40	0.02036
2085	chr2	27856477	C	A	rs4233719	-0.00978678628	0.3914729179413762	0.00978678628	0.379637214541389	0.0094065515774434	0.3724414253347845	-9.067038627852532e-05	0.3888599452465024	9.067038627852532e-05	0.3779493524255635	0.1903090281019512	0.6738095257539852	-0.0019130074164375	0.4886222966059868	0.0019130074164375	0.4754055856740599	0.0018213849299166	0.6374325012211621	-1.8078870594997184e-05	0.4749519517457689	1.8078870594997184e-05	0.4622889360569032	-0.0087449039927799	0.2295410885567329	0.0087449039927799	0.222936350298413	BABAM2	33465	RBKS	34204	MRPL33	84759	False	False	False	ref	75	0.00237	45	0.006977
2086	chr2	27873925	A	G	rs12466717	-0.001223782752	0.7261298359688557	0.003052642224	0.7229179810552614	0.0063092476148627	0.8987196424133688	-6.23365390415288e-06	0.7938953597221842	1.890015391517881e-05	0.7910964431041205	0.1279390865050467	0.7761328043029142	-0.0002527478771267	0.7689630866172085	0.0004489586823881	0.7656911645059825	0.0007992177323089	0.8370473283034097	-1.392716753816379e-06	0.8137780764027481	2.7516990036772534e-06	0.8108439238039009	-0.0013983547547173	0.5666616098794353	0.0029004450253632	0.5632078149430374	BABAM2	16017	RBKS	16756	MRPL33	102207	False	False	False	ref	-100	0.010315	-100	0.03583
2087	chr2	27880131	G	A	rs6547814	-0.0033664214	0.7226106372198415	0.0033664214	0.7090712374032058	0.0092206251095564	0.4017360379965538	-3.016211334129632e-05	0.7102539655117964	3.016211334129632e-05	0.6969701615769921	0.1430263799417006	0.751276885320627	-0.0004538595558155	0.7717868266076897	0.0004538595558155	0.7576386850054369	0.0013582491214422	0.7279272465880523	-4.127581882877239e-06	0.7636758304920953	4.127581882877239e-06	0.7494549068260129	-0.0029979564103361	0.5596025775531853	0.0029979564103361	0.5476310064536161	BABAM2	9811	RBKS	10550	MRPL33	108413	False	False	False	ref	15	0.0008316	95	0.0395
2088	chr2	27901304	G	A	rs10177845	-0.00314883476	0.7349502796919687	0.00314883476	0.721141091996825	0.0085461520283934	0.4970431847942483	-2.636941322512737e-05	0.735688843623376	2.636941322512737e-05	0.7220606577739476	0.1626489901347524	0.7141165828365539	-0.0005309207965543	0.7406041740946258	0.0005309207965543	0.7260246537921844	0.0013764234186104	0.7185817583174711	-4.39592294256391e-06	0.7437900664449694	4.39592294256391e-06	0.729370376113675	-0.0028195313229389	0.5694556302048841	0.0028195313229389	0.5574283412233515	RBKS	10623	BABAM2	11362	MRPL33	129586	False	False	False	ref	75	0.0023	-80	0.01572
2089	chr2	27913484	A	G	rs1458396	-0.00318337296	0.7069180203353387	0.00318337296	0.6931533227678085	0.0177387564375085	0.0451495232731845	-5.618697129265516e-05	0.5000576114900263	5.618697129265516e-05	0.488241779590699	0.0298094378572391	0.9462384434222983	-0.0001029183677532	0.9169030985366796	0.0001029183677532	0.9029830604934516	0.0005563980652791	0.8857138318913124	-1.8423225614698792e-06	0.8530434376840711	1.8423225614698792e-06	0.838753984637368	-0.0015622568698844	0.727681893943987	0.0015622568698844	0.7146782519164505	RBKS	22803	BABAM2	23542	MRPL33	141766	False	False	False	ref	15	0.0008316	-60	0.01897
2090	chr2	27933773	T	G	rs13012050	-0.00290673018	0.7532568444410446	0.00290673018	0.73964394714115	0.0326247761529553	0.0029001922214773	-0.0001013047791277	0.381179923442497	0.0001013047791277	0.3702272319212916	0.0145042998371351	0.9700154777018246	-3.7688911640424665e-05	0.969135683954139	3.7688911640424665e-05	0.9550687680746724	0.0004679317905525	0.8971322561742245	-1.326720765759431e-06	0.8938692901328807	1.326720765759431e-06	0.8796252807488133	-0.0006286372265272	0.8866040436117879	0.0006286372265272	0.8727589914260966	RBKS	43092	BABAM2	43831	MRPL33	162055	True	True	False	ref	0	0.0	-50	0.0386
2091	chr2	27936777	A	G	rs10184052	0.0521511362	0.0228597669432176	0.0521511362	0.0245868930371891	0.013421289404611	0.1219066382035998	0.0007288471301386	0.0227969103698091	0.0007288471301386	0.0242307669580593	0.1212253239141484	0.7868605663126443	0.0063982515694386	0.1886266206997101	0.0063982515694386	0.1986976129587744	0.0015808695271418	0.6770208388914902	8.652103110073179e-05	0.1324775269314145	8.652103110073179e-05	0.1400782393511463	0.0461353333540803	0.0071918393697143	0.0461353333540803	0.0073231329333729	RBKS	46096	BABAM2	46835	MRPL33	165059	False	False	False	alt	90	0.04004	-40	0.0263
2092	chr2	28019441	G	A	rs4616436	0.000995907792	0.8709765075795627	0.001303357072	0.8796932093966964	0.0056726861718143	0.951161115630487	6.855688928478236e-06	0.902642533240682	8.211183637242274e-06	0.9113688745722192	0.0796066349235987	0.8599165812208891	9.796590020589732e-05	0.8994975848398772	0.0001233339182141	0.9082704229057252	0.0004594484485929	0.9068761925386551	6.709513922557775e-07	0.9203990954194836	7.82794927079885e-07	0.9292695661921244	0.0007946140520129	0.7969036486014317	0.0010560275521529	0.8054561980589204	RBKS	128760	BABAM2	129499	MRPL33	247723	False	False	False	alt	-50	0.001091	-70	0.02766
2093	chr2	36985060	G	A	rs6712162	-0.039606634	0.0590209100268472	0.039606634	0.0555097361154243	0.0089970121979912	0.4156512242063522	-0.0003632358340948	0.0829307496984439	0.0003632358340948	0.078526852699887	0.1247938256620918	0.7799667411519531	-0.0052065290038302	0.2654354924017094	0.0052065290038302	0.2542026999610902	0.0010988715277419	0.7789309805689947	-4.70768533912738e-05	0.2718662915123404	4.70768533912738e-05	0.2612512069964639	-0.0350563802529071	0.0194629002996257	0.0350563802529071	0.0189363148079224	STRN	18524	HEATR5B	99312	GPATCH11	99459	False	False	False	ref	80	0.001129	-40	0.013794
2094	chr2	37005187	C	T	rs1123648	0.0038233821919999	0.4587832496050198	0.008198684872	0.4646636677384662	0.0105915801674023	0.2661423577644646	2.793137671188914e-05	0.4213505809967882	8.512219376907715e-05	0.4259405276931948	0.2542495254100146	0.571957976717838	0.000720781304797	0.4876452401870803	0.0019674973578111	0.4931822234391748	0.0027567031124864	0.4611169901820869	4.348490246897897e-06	0.4509688525588437	2.0708687289044235e-05	0.455519547393083	0.003080944823079	0.3123634030481334	0.0065664581582796	0.3148174808440746	STRN	38651	HEATR5B	79185	GPATCH11	79332	False	False	False	alt	100	0.0010195	90	0.04785
2095	chr2	37011373	C	G	rs6753260	-0.0136684539599999	0.2910620365131928	0.0136684539599999	0.2805900289701787	0.0065027658552187	0.8404455960837965	-9.444870412138228e-05	0.3806544788508534	9.444870412138228e-05	0.3699501246287611	0.2159026545918526	0.6309051283894801	-0.0031666657835595	0.365089339795656	0.0031666657835595	0.3526705523952233	0.0014270328062289	0.7149934589241675	-2.2175141964180883e-05	0.4296218085527648	2.2175141964180883e-05	0.4172629188429678	-0.0129337441259763	0.1539255977244182	0.0129337441259763	0.1496721148935414	STRN	44837	HEATR5B	72999	GPATCH11	73146	False	False	False	ref	75	0.002724	-75	0.04443
2096	chr2	37020872	T	C	rs17020136	-0.00517099502	0.5768494557492067	0.00517099502	0.5640849348082939	0.0198371097614347	0.028101492632845	-0.0001029665724945	0.3330979898030206	0.0001029665724945	0.3228671240322959	0.1958796253073164	0.6635426353344072	-0.0010400221416911	0.6033747478478563	0.0010400221416911	0.589787011667371	0.0038335242132641	0.2721611467241548	-2.048490286343019e-05	0.4273632255744978	2.048490286343019e-05	0.4150369187822786	-0.004917063455015	0.3917385114300723	0.004917063455015	0.3817092945691768	STRN	54336	HEATR5B	63500	GPATCH11	63647	False	False	False	ref	-40	0.002289	-70	0.04428
2097	chr2	37179000	C	T	rs28463756	-0.00590094028	0.5562547078273429	0.00590094028	0.5431807080262205	0.0087047724777532	0.4624076710650716	-5.326653393784829e-05	0.5538253002429679	5.326653393784829e-05	0.5413245284126181	0.1879148123943194	0.672713625867575	-0.0010752024545891	0.6152287858467266	0.0010752024545891	0.6012072385605497	0.0016158990242169	0.6764243203205994	-9.559449976535087e-06	0.6138558505977502	9.559449976535087e-06	0.6002989282615069	-0.0053361549393665	0.3776391616968753	0.0053361549393665	0.3678246530053911	CEBPZOS	17489	SULT6B1	17598	EIF2AK2	21478	False	False	False	ref	-75	0.01593	80	0.01056
2098	chr2	37180035	A	G	rs4374352	0.0206428676	0.1665389722488137	0.0206428676	0.1750984792165468	0.0064108754440653	0.8673812606439801	0.0001355925354953	0.2534200828003533	0.0001355925354953	0.2630745994902799	0.2896627558377161	0.5038377559470768	0.0058235639727971	0.2041761541579305	0.0058235639727971	0.2148187894603158	0.0018587935857603	0.6276976267643068	3.832500743918717e-05	0.2674182899827496	3.832500743918717e-05	0.2785358820975368	0.0171620037552256	0.0937322105169657	0.0171620037552256	0.0966622695284952	CEBPZOS	16454	SULT6B1	16563	EIF2AK2	22513	False	False	False	alt	-30	0.003712	40	0.01456
2099	chr2	37181405	C	T	rs6750763	-0.0334680802	0.0850999963709557	0.0334680802	0.0801405972294632	0.0096462396590506	0.3380256028841812	-0.0003283523698516	0.0920899756530475	0.0003283523698516	0.0871838525701563	0.2624259587755059	0.5523623490319336	-0.0089845053299451	0.1534653554177734	0.0089845053299451	0.1444202236351568	0.0025510211635654	0.4880930963939985	-8.868835164091557e-05	0.1487210101296217	8.868835164091557e-05	0.1405971876810251	-0.0286372265272461	0.0331185269338691	0.0286372265272461	0.0322852773675113	CEBPZOS	15084	SULT6B1	15193	EIF2AK2	23883	False	False	False	ref	35	0.00708	-90	0.0668
2100	chr2	37183173	T	G	rs11124565	-0.0033469317	0.6789196794285038	0.00358263738	0.6689469051797088	0.0233430501104307	0.0134450947104007	-8.356684877147359e-05	0.3784249368898493	8.74305800507471e-05	0.369505108839135	0.07871865890725	0.8578323375864203	-0.0002973405099656	0.8078082665276612	0.0003088129429231	0.7977099466825908	0.0018833381749058	0.6135363687162437	-7.374850576358681e-06	0.6394353929912493	7.562908825535035e-06	0.6290267199782887	-0.0029108185769561	0.542823908136897	0.0030187035135218	0.5337945918830527	CEBPZOS	13316	SULT6B1	13425	EIF2AK2	25651	False	True	False	ref	-15	0.00903	0	0.0
2101	chr2	37183820	T	G	rs4670673	-0.0050690633	0.5857821251477412	0.0050690633	0.5728956317318517	0.025754333124261	0.0087453598705109	-0.0001313506331981	0.2774547146835883	0.0001313506331981	0.2679406931055301	0.1387545513957613	0.7551264026897286	-0.0007160386263985	0.6761900847073018	0.0007160386263985	0.6622763089230922	0.0035493539332945	0.3061079607529902	-1.845766942128879e-05	0.4505402870432125	1.845766942128879e-05	0.4381415014405145	-0.0048091785184493	0.4006268834528284	0.0048091785184493	0.3903742833088711	CEBPZOS	12669	SULT6B1	12778	EIF2AK2	26298	False	True	True	ref	85	0.01294	-5	0.006287
2102	chr2	37198486	A	G	rs2287093	0.0754376918	0.0058714887780896	0.0754376918	0.0061950833950875	0.0147240193890087	0.0835108089163268	0.0011356065700863	0.0093255519648588	0.0011356065700863	0.0097423092968916	0.4780775734188114	0.2063524594697327	0.0364626884153457	0.0081045747696293	0.0364626884153457	0.0087988258739528	0.0070262544680329	0.0490452496047738	0.0005477312285087	0.0097130606248915	0.0005477312285087	0.0103623814899486	0.0282347327254431	0.0293675177553125	0.0282347327254431	0.0301280258539474	SULT6B1	1888	CEBPZOS	1997	CEBPZ	33110	False	True	True	alt	-85	0.01309	40	0.02165
2103	chr2	37227075	C	G	rs10182759	0.006313059	0.4793402247966075	0.006313059	0.4918110389885349	0.0076450926722962	0.5906422391234025	4.826929436470559e-05	0.5210947369173653	4.826929436470559e-05	0.5333680880247009	0.2602392140997313	0.5629857433378161	0.0016437048122317	0.4689713132544785	0.0016437048122317	0.4825547587419911	0.0019904297755715	0.5980189465307285	1.2579179235693003e-05	0.4976240932728655	1.2579179235693003e-05	0.5107845410404185	0.0055415512609051	0.3345987023652797	0.0055415512609051	0.3438514732343261	CEBPZ	4521	NDUFAF7	4557	SULT6B1	30477	False	False	False	alt	-70	0.02277	-20	0.0129
2104	chr2	37281990	C	A	rs2041836	0.0031100889	0.5209517793254657	0.0057117131799999	0.5285874097848847	0.0092274813528419	0.3898741972446548	3.026271082240181e-05	0.5144596821851597	5.1725853168708e-05	0.521453379816816	0.4485606697164908	0.2443934971315473	0.001519661647268	0.3908099203761572	0.0024531254861465	0.3986025139130083	0.0041766566020193	0.2334069066647232	1.4667088948583749e-05	0.3838671046426093	2.2368073061220167e-05	0.3911095331319624	0.001404578885673	0.5600652905384698	0.0027863359578418	0.5665086300602287	PRKD3	42843	NDUFAF7	50358	CEBPZ	50394	False	False	False	alt	-40	0.00638	-30	0.01282
2105	chr2	37292625	C	T	rs11682607	-0.0347573512	0.0763000236920706	0.0347573512	0.0717733646712062	0.0102207456707316	0.2890922273625306	-0.0003613118146896	0.0782662691978021	0.0003613118146896	0.074074599782349	0.364675982115997	0.3898302443645109	-0.0126228995598403	0.0964010964388331	0.0126228995598403	0.0898218941855987	0.0037101899703242	0.2966088208181486	-0.0001307479810525	0.0926866171005083	0.0001307479810525	0.0869712168452122	-0.0226475378375293	0.0495392502998502	0.0226475378375293	0.0482324698164966	PRKD3	32208	QPCT	50203	NDUFAF7	60993	False	False	False	ref	75	0.0118	-60	0.043
2106	chr2	37292826	A	G	rs11693917	-0.00108922208	0.7475806357723375	0.00246237252	0.7419683676414035	0.0291079929649701	0.0048863704983413	-2.5491870324806127e-05	0.4164071103705125	7.523693161193486e-05	0.4113906466322009	0.3127356092905528	0.4736975496902067	-0.0003537260407663	0.6367713368742847	0.0008195764658894	0.6306972068797406	0.0093557997046176	0.0196825475321555	-8.15810916470282e-06	0.3787354922948416	2.5300560214604373e-05	0.3736121539042534	-0.0008029128932872	0.6743622581004582	0.0018568657351216	0.6694290479410279	PRKD3	32007	QPCT	50002	NDUFAF7	61194	False	True	True	ref	-100	0.00885	-65	0.0753
2107	chr2	37299694	A	C	rs74177070	-0.0061427359799999	0.5262467396677868	0.0061427359799999	0.5136550891608771	0.0234085806891939	0.0135190434154993	-0.0001503561061058	0.2616375292961824	0.0001503561061058	0.2523508183306042	0.067328499258291	0.8834841932457471	-0.0004301231776453	0.7876502681529886	0.0004301231776453	0.7736459872435567	0.0015715864891124	0.6693543855037225	-1.0505462095277638e-05	0.6183520652404585	1.0505462095277638e-05	0.6049076416529175	-0.0039979667838877	0.4796490855744431	0.0039979667838877	0.4684919321618851	PRKD3	25139	QPCT	43134	NDUFAF7	68062	False	True	False	ref	55	0.006218	-55	0.0333
2108	chr2	50826690	C	T	rs67986063	0.00676087908	0.487167218167338	0.00676087908	0.5000309233613274	0.0225882556166064	0.0153172401139066	0.0001490163506759	0.2341596090801813	0.0001490163506759	0.243204761241607	0.1175136671542235	0.7957002063730926	0.000872805436862	0.6375651793337455	0.000872805436862	0.6517949253954063	0.0026590560936386	0.4821887170023201	1.9195012392855424e-05	0.4407499694596811	1.9195012392855424e-05	0.4534731922530238	0.0060228840548137	0.3125260765214168	0.0060228840548137	0.3213036077331595	NRXN1	398885	FSHR	1672163	LHCGR	2070960	False	True	False	alt	100	0.00282	-15	0.002945
2109	chr2	50834102	T	C	rs17504263	0.0213332032	0.1643504456255654	0.0213332032	0.1727960996628421	0.0098855942736206	0.309047213422963	0.0002068607232772	0.1545002056308267	0.0002068607232772	0.1619541333843931	0.1489683502940901	0.740550535724041	0.0033460253272585	0.3305696775141932	0.0033460253272585	0.3428449945768473	0.0014286927737261	0.7161951955910896	3.149432935767183e-05	0.3166154449039893	3.149432935767183e-05	0.3279476759526434	0.0196143113517774	0.0739142978226614	0.0196143113517774	0.0760326790242832	NRXN1	391473	FSHR	1679575	LHCGR	2078372	False	False	False	alt	-5	0.0017395	5	0.002228
2110	chr2	50841977	A	G	rs17041068	-0.006682217	0.4938746145569822	0.006682217	0.4812015712213808	0.0239384621937063	0.0116020281931534	-0.000160355743292	0.2222410815082745	0.000160355743292	0.2134492242913229	0.0243073060923868	0.957235140312988	-0.0001783239475403	0.8899610175154452	0.0001783239475403	0.875690545068324	0.000564459476101	0.8858279477757847	-4.1818330388253295e-06	0.7738760474461486	4.1818330388253295e-06	0.7595656240559675	-0.0022967043226589	0.6355944998182392	0.0022967043226589	0.6231058503133012	NRXN1	383598	FSHR	1687450	LHCGR	2086247	False	True	False	ref	-100	0.00481	70	0.01437
2111	chr2	50865054	G	A	rs67206190	-0.0494220848	0.0294963946791681	0.0494220848	0.0275286310884725	0.0104543105683499	0.2615173018295956	-0.0005227379489906	0.0406408300566858	0.0005227379489906	0.0382021975185231	0.2933266942603139	0.5109860856135138	-0.0146329509722194	0.0803104769398542	0.0146329509722194	0.0744788069563983	0.0030870833606262	0.4060229185238673	-0.0001554950921935	0.0768967157628738	0.0001554950921935	0.0717325360451801	-0.0414651604269753	0.0084183351874348	0.0414651604269753	0.0081503335852326	NRXN1	360521	FSHR	1710527	LHCGR	2109324	False	False	False	ref	10	0.000309	95	0.03616
2112	chr2	50865455	T	C	rs66848903	-0.00037839605	0.8335631158320519	0.00177720383	0.8370103973327129	0.0080604848815726	0.5714639503124916	-3.173820386822555e-06	0.8443417863329529	1.4079349722322868e-05	0.8478909116022655	0.2586728078092096	0.5654037404135069	-9.89732625236542e-05	0.7547542997002624	0.0004746871586497	0.7581717383024696	0.0020863873917367	0.5928781015628853	-8.199058830181709e-07	0.7676387622154929	3.768384694216838e-06	0.7712077263644799	-0.0005166028693243	0.7247621753144435	0.0015830039730702	0.7274068995714145	NRXN1	360120	FSHR	1710928	LHCGR	2109725	False	False	False	ref	100	0.11395	-75	0.03079
2113	chr2	54640404	C	A	rs2941582	0.00113449152	0.8811545070669711	0.00113449152	0.8948965405767488	0.0091202591803579	0.4056425080273188	1.0596397416418037e-05	0.8707269834111444	1.0596397416418037e-05	0.8844447663750409	0.1681760184234275	0.7077639054952841	0.0001862020370343	0.8521262586354638	0.0001862020370343	0.8661987186838179	0.001530482672874	0.6936863542202355	1.7379531898192562e-06	0.8469224195860416	1.7379531898192562e-06	0.8610349493614612	0.0009730391394101	0.8035099107821877	0.0009730391394101	0.8170370565314923	EML6	83096	SPTBN1	184076	C2ORF73	310369	False	False	False	alt	-65	0.005615	40	0.03073
2114	chr2	54699238	A	G	rs354216	0.01145315236	0.3076298170579145	0.01222042964	0.3175698430405024	0.0191640287145118	0.031088062657557	0.000229674414017	0.1525381284799608	0.0002428640713046	0.1580857125346617	0.6278778825506489	0.0300517137527429	0.0072618847309642	0.1778552170921886	0.0077374025910806	0.1857662366951194	0.0120586255324551	0.0070680825961625	0.0001458222693925	0.0902008697751348	0.0001539965211517	0.0944600394007492	0.0012220043776387	0.7417148389272193	0.0013091422110187	0.7512799376122735	EML6	24262	SPTBN1	242910	C2ORF73	369203	False	False	False	alt	-100	0.01312	-100	0.0879
2115	chr2	54719299	C	A	rs73934803	-0.0017470194799999	0.8377873706656496	0.0017470194799999	0.823786205606586	0.0091122399906394	0.4105708314604895	-1.6353257356064865e-05	0.8174238835106107	1.6353257356064865e-05	0.8036139566132311	0.1331445346943432	0.7675574419483928	-0.0002237240665281	0.8427042082016284	0.0002237240665281	0.8283368658631713	0.0011995147844969	0.7555285666529677	-2.0685976914638528e-06	0.8342856970142035	2.0685976914638528e-06	0.8198866829124307	-0.0017552049295116	0.7016259825588376	0.0017552049295116	0.6886363476270774	EML6	4201	SPTBN1	262971	C2ORF73	389264	False	False	False	ref	-90	0.004166	85	0.03937
2116	chr2	54745089	C	T	rs148661029	-0.0467248302	0.0344254099751977	0.0467248302	0.0322203718245685	0.0104357124970152	0.2657087905705438	-0.0004942099303127	0.0456009836192711	0.0004942099303127	0.0429521904120691	0.2834344754613637	0.5150603540443959	-0.0135393813762865	0.0864896210833487	0.0135393813762865	0.0805527804806738	0.0029875615470976	0.3996918046479625	-0.0001445253338325	0.0838072843391535	0.0001445253338325	0.0787064028276384	-0.0385398188777891	0.0117538277063689	0.0385398188777891	0.0114542606509932	EML6	21589	SPTBN1	288761	RTN4	367532	False	False	False	ref	-55	0.00838	-65	0.04413
2117	chr2	57722969	G	A	rs10180540	-0.01181401816	0.3457859072597682	0.01181401816	0.334259762500899	0.0074889594685459	0.6824036192053488	-9.524045047272363e-05	0.3972395150507611	9.524045047272363e-05	0.3859892231771206	0.1171609664000663	0.7952478270929827	-0.0013187286954404	0.5752451419262753	0.0013187286954404	0.5614348341402673	0.0008730683259836	0.8237341907444463	-1.0479045342669854e-05	0.6024712360831777	1.0479045342669854e-05	0.5888418758526793	-0.0098216786481187	0.1986673406623173	0.0098216786481187	0.1931318424205531	VRK2	184661	FANCL	518441	CCDC85A	1538978	False	False	False	ref	-80	0.005135	-70	0.007477
2118	chr2	57734094	C	T	rs41335055	-0.0030071078	0.7329513435024362	0.0030071078	0.7195267585726254	0.0101328538930465	0.2949427726773603	-3.141883209217247e-05	0.6918142965696946	3.141883209217247e-05	0.6787719024761206	0.1483812072739343	0.7417402013738378	-0.0004214687555962	0.7729874785341901	0.0004214687555962	0.7589738125350384	0.0015208322623076	0.6957200562011661	-4.445113557376336e-06	0.7462656214665266	4.445113557376336e-06	0.7323512368991231	-0.0029211921285489	0.5835056496539286	0.0029211921285489	0.571103289067387	VRK2	173536	FANCL	507316	CCDC85A	1550103	False	False	False	ref	35	0.00148	-100	0.0477
2119	chr2	57837206	A	G	rs77011057	-0.00637866018	0.5071223785930628	0.00637866018	0.4942679655442646	0.007200580933901	0.744499867577654	-4.6133817446427145e-05	0.5692686899087056	4.6133817446427145e-05	0.5566968370457901	0.2063257917613253	0.6479352213451408	-0.0012972699783132	0.5606643236895265	0.0012972699783132	0.5469439118737931	0.001516004703125	0.7006993938605097	-9.605990433875028e-06	0.5987924960682294	9.605990433875028e-06	0.5853552982940328	-0.0061224701501052	0.3248588969743887	0.0061224701501052	0.3160032138420412	VRK2	70424	FANCL	404204	CCDC85A	1653215	False	False	False	ref	-100	0.04138	-70	0.02834
2120	chr2	57844611	C	T	rs79017955	0.001513284928	0.712203191122896	0.002897098528	0.7209296290430044	0.0332236401762536	0.0024621551140821	6.70890356255602e-05	0.3477766415660838	9.919113682371404e-05	0.3555147726398451	0.1232502411850745	0.7850531106828392	0.0002038677890805	0.7590232918372688	0.0003958380251599	0.7682286797521638	0.004125468476136	0.2339774525193367	9.240462216765948e-06	0.5155162790445837	1.3693842431528662e-05	0.524430327128211	0.0017178601437774	0.546429284724918	0.0029377898110975	0.5542236481467302	VRK2	63019	FANCL	396799	CCDC85A	1660620	False	True	True	alt	90	0.001858	-60	0.04385
2121	chr2	57874972	T	A	rs59159185	0.0007461601953999	0.8906208407347632	0.0010645191153999	0.8977942755621563	0.0129968027027712	0.1329685189987212	8.447731307250158e-06	0.8378246397596456	1.30350322330962e-05	0.8447898327195495	0.0685774748700712	0.8802287140634266	4.4711077195303e-05	0.9260873138263376	6.53550832166787e-05	0.9332682309656825	0.0008860737343547	0.8230291073118728	4.980107129129355e-07	0.904774841142966	7.954745671797186e-07	0.9117547511009492	0.0004149420637143	0.8489358085561826	0.0007095509289515	0.856073370386083	VRK2	32658	FANCL	366438	CCDC85A	1690981	False	False	False	alt	100	0.0037	25	0.009476
2122	chr2	57883101	G	A	rs17828225	-0.0395119218	0.0566669363755407	0.0395119218	0.0530417551419556	0.0087671560001918	0.4470723261527469	-0.0003482590418291	0.0809698350849643	0.0003482590418291	0.0765076312656526	0.2412431664228881	0.5918239612510598	-0.0097787953151489	0.1377754284590846	0.0097787953151489	0.1293531044024307	0.0021353811002184	0.5756910371843508	-8.69401218286757e-05	0.1493359798734388	8.69401218286757e-05	0.1412641704216853	-0.0359464309795744	0.0145107211873805	0.0359464309795744	0.0141135082472845	VRK2	24529	FANCL	358309	CCDC85A	1699110	False	False	False	ref	-20	0.0007286	50	0.02832
2123	chr2	57892439	C	T	rs2678915	0.00526357288	0.5444537774150484	0.00526357288	0.557370490427607	0.0069974202262911	0.7763478569940172	3.738036312236216e-05	0.6042770195459066	3.738036312236216e-05	0.6173902139965147	0.2023693191838089	0.6522176895946841	0.0010073727685076	0.575849319355447	0.0010073727685076	0.5895767108070892	0.001399439561989	0.7213323365621868	7.0424008429050615e-06	0.6194960272689407	7.0424008429050615e-06	0.6332135539404491	0.004917063455015	0.3647343128451492	0.004917063455015	0.3745895983440497	VRK2	15191	FANCL	348971	CCDC85A	1708448	False	False	False	alt	100	0.00415	-90	0.01242
2124	chr2	57892828	G	A	rs77843640	-0.0017738097948	0.8217215934736585	0.0021911386188	0.8195668335970856	0.0078340255499534	0.6052394200008117	-1.670233656803024e-05	0.8135938968483355	1.9635139590851845e-05	0.8116983618294421	0.2374256994367161	0.5952088454892314	-0.0002955807759195	0.8118208052203946	0.00041979193834	0.8075001124704636	0.0018332642822476	0.6422054787312761	-2.836979846683699e-06	0.8120070726822077	3.709473618376037e-06	0.8077933591502727	-0.0013361134451602	0.7167323708602342	0.001680515358043	0.712380477698068	VRK2	14802	FANCL	348582	CCDC85A	1708837	False	False	False	ref	-65	0.003105	65	0.01546
2125	chr2	57921981	G	A	rs2717007	-0.023967335	0.155710257973972	0.023967335	0.1480070691667552	0.0085013594308531	0.4955492630994668	-0.0002153538858042	0.1785332553101409	0.0002153538858042	0.1709661175468229	0.1412213819645431	0.7559805265467147	-0.0036093103086744	0.3449696469205166	0.0036093103086744	0.3329296353399404	0.0012519765240111	0.7526355894524646	-3.327021858140763e-05	0.3528179901393144	3.327021858140763e-05	0.3413292674424638	-0.0213321714955549	0.0623096354279339	0.0213321714955549	0.0606177972475982	VRK2	14351	FANCL	319429	CCDC85A	1737990	False	False	False	ref	95	0.002243	-80	0.02258
2126	chr2	57932338	T	G	rs2717019	-0.00519196504	0.563153763570151	0.00558725216	0.5547306096914678	0.0168903300762287	0.0550017959773448	-9.795492802646068e-05	0.3907534386953019	0.0001037417895654	0.3827691466287364	0.1342669529766905	0.7677881650651175	-0.0008729869061897	0.6625882461653073	0.0009018546458762	0.6542068684524337	0.0024275069743713	0.4952043030519322	-1.692037085756268e-05	0.5189688719338261	1.734298421698152e-05	0.5105377802911312	-0.0047033682922021	0.413438743306081	0.0051390574591022	0.4065767258679426	VRK2	24708	FANCL	309072	CCDC85A	1748347	False	False	False	ref	-20	0.001274	-95	0.04132
2127	chr2	57935056	A	G	rs2678888	0.01885566608	0.1970706854918856	0.01885566608	0.2064471151126993	0.0101353372249755	0.2930328081389268	0.0001968002066822	0.1818197798663708	0.0001968002066822	0.1898125569484338	0.1614622558325293	0.7215580765696938	0.0031219240229622	0.3432632396970239	0.0031219240229622	0.3554202571322227	0.0016268206779905	0.678626132086673	3.2275727445719024e-05	0.3177647238251173	3.2275727445719024e-05	0.3290894512553088	0.0178840029460886	0.0897105762630162	0.0178840029460886	0.0923527208297952	VRK2	27426	FANCL	306354	CCDC85A	1751065	False	False	False	alt	-90	0.001785	95	0.04065
2128	chr2	57939046	G	A	rs970941	-0.001296724272	0.7020508685789225	0.003362472768	0.6988569349614908	0.0065344506377959	0.8688846030511362	-8.59200641033201e-06	0.7602195438568108	2.1884898197777984e-05	0.7571582320073784	0.0306476208259421	0.9419712681281048	-3.733995616896497e-05	0.900723844214589	0.0001253562348354	0.8976368642235231	0.0002005837697988	0.9540940600685162	-2.528301016294963e-07	0.9167022034723404	8.183449271297339e-07	0.9136243537674426	-0.0004294650359443	0.7095054023140667	0.0016950383302731	0.7065582073600394	VRK2	31416	FANCL	302364	CCDC85A	1755055	False	False	False	ref	-70	0.002281	-75	0.03424
2129	chr2	57939508	T	G	rs2678891	-0.00810462854	0.4353330481951509	0.00810462854	0.4232449966679658	0.0211144975851706	0.0206286082050118	-0.0001721615180993	0.2138063647289312	0.0001721615180993	0.2053300515939612	0.0175126297990642	0.9687216623735674	-0.0001497315783503	0.8961119831236163	0.0001497315783503	0.8819221685510887	0.0003785835008184	0.9221843362338368	-3.269590713321243e-06	0.8009548448388069	3.269590713321243e-06	0.7868922369984284	-0.0024792788306931	0.6251541639608141	0.0024792788306931	0.6124355884106018	VRK2	31878	FANCL	301902	CCDC85A	1755517	False	False	False	ref	-35	0.001984	-35	0.02261
2130	chr2	57943026	C	A	rs1568254	0.00320614902	0.6980289731277848	0.00320614902	0.7116020855127857	0.0188433836781964	0.0358567916450082	6.316636289715022e-05	0.5018110334472208	6.316636289715022e-05	0.5142370424290118	0.0634653886451103	0.88690313905263	0.0002144971199456	0.8430656000612792	0.0002144971199456	0.8571038931218254	0.0012055528182976	0.7575121275685734	4.221582534372166e-06	0.7467957968329589	4.221582534372166e-06	0.7604498576013671	0.0023402732393489	0.615630124773296	0.0023402732393489	0.6284129895944545	VRK2	35396	FANCL	298384	CCDC85A	1759035	False	False	False	alt	-85	0.002419	-85	0.02364
2131	chr2	57944085	A	C	rs1518393	-0.00453208768	0.6156233193735363	0.00453208768	0.6027035621511433	0.0218959245010829	0.0179392294247632	-0.0001040676077488	0.3591432901226377	0.0001040676077488	0.3485564593925647	0.2866523511654685	0.5190700825077346	-0.001315467912471	0.5591618358202689	0.001315467912471	0.545760037141432	0.0062996266699425	0.0693375887036873	-3.0341890803958728e-05	0.357108019151624	3.0341890803958728e-05	0.3455087128635808	-0.0037573003869334	0.4934336585802131	0.0037573003869334	0.4820981974158156	VRK2	36455	FANCL	297325	CCDC85A	1760094	False	True	False	ref	5	0.000943	-100	0.0542
2132	chr2	57946820	G	C	rs59913344	-0.002075330014	0.6931917811442111	0.003076608106	0.6884188261553333	0.0065206230092697	0.8613479343946083	-1.3525664081626835e-05	0.7510209547324528	2.0325478248939348e-05	0.7468392494296311	0.0338613471094098	0.9387655450289836	-9.938497317246824e-05	0.8931798659328086	0.0001209382630352	0.8896435011374293	0.0002258249121891	0.952164471411076	-6.530591568190514e-07	0.9103617030845702	8.059151955806711e-07	0.906980505217058	-0.0014232512785402	0.6941306282341049	0.0017303084056887	0.6898037184537184	VRK2	39190	FANCL	294590	CCDC85A	1762829	False	False	False	ref	35	0.010666	35	0.015434
2133	chr2	57983104	T	C	rs6732310	-0.00405601154	0.61898175735877	0.0046560565	0.6107971486287431	0.0094149707208536	0.3889394167160211	-3.360025428711156e-05	0.6215553295890195	3.904403275110337e-05	0.6140465118019302	0.2061369931223352	0.6401624819207898	-0.000926487587927	0.6252220521084237	0.0010589158924845	0.6169704699115647	0.0018166404577923	0.6374312459174503	-7.08993135038796e-06	0.629957642488318	8.291358614378516e-06	0.6224009782100625	-0.0031722320770962	0.4662461697164528	0.0039813691013391	0.4597423833270134	VRK2	75474	FANCL	258306	CCDC85A	1799113	False	False	False	ref	-45	0.001024	-95	0.02977
2134	chr2	58011459	T	C	rs17049298	0.00146353694	0.8480124799562437	0.00146353694	0.8621897233020321	0.0067950961142361	0.8332708372459731	9.80545575305361e-06	0.8721027342721497	9.80545575305361e-06	0.8861950816560338	0.1844998392099502	0.6830333045226876	0.0002822146129205	0.8033838263647344	0.0002822146129205	0.8179710146242145	0.0012608306253569	0.7480037274940448	1.895579375829088e-06	0.8279166335947439	1.895579375829088e-06	0.8425137809173008	0.0012323779292315	0.749906533632619	0.0012323779292315	0.7633667969488622	VRK2	103829	FANCL	229951	CCDC85A	1827468	False	False	False	alt	100	0.04214	-100	0.01996
2135	chr2	58053663	A	C	rs3771204	0.0237183418	0.1454224969394426	0.0237183418	0.1532968558343243	0.0090257486294017	0.4180197331715827	0.0002153658438539	0.1558246030134542	0.0002153658438539	0.1632388089919677	0.1058537951638502	0.8124778812822768	0.0026618379131895	0.3886351209474855	0.0026618379131895	0.4014225362986164	0.000977068239724	0.801952360117582	2.471003838371276e-05	0.3862507435926342	2.471003838371276e-05	0.3983475025938441	0.019384018506416	0.0793992414604944	0.019384018506416	0.0816515921168375	VRK2	146033	FANCL	187747	CCDC85A	1869672	False	False	False	alt	-70	0.005463	-100	0.05804
2136	chr2	58084549	T	C	rs12620940	0.0304164756	0.0916378211523144	0.0304164756	0.0973198192820385	0.0085638053530659	0.5017661716412606	0.0002725815011819	0.1135154939850293	0.0002725815011819	0.1195354159507	0.0478780900216806	0.9161526566444288	0.001744247395574	0.4959614177072103	0.001744247395574	0.5093793072673012	0.0004425331501352	0.9123339901416618	1.6857855967263592e-05	0.4975335081643123	1.6857855967263592e-05	0.5105736668775838	0.0177159514102842	0.1024045766945469	0.0177159514102842	0.1053528227389921	FANCL	156861	VRK2	176919	CCDC85A	1900558	False	False	False	alt	55	0.001373	100	0.0153
2137	chr2	58095091	A	C	rs2118899	0.005989235912	0.4844475764067064	0.005989235912	0.4971748720229108	0.0159187536445499	0.0642310440577996	9.66546315646198e-05	0.3274859574412961	9.66546315646198e-05	0.338447525820221	0.1816222159980912	0.6819831708466049	0.0012211015247819	0.541500685247088	0.0012211015247819	0.5555974231855796	0.0029177969032776	0.4118392085971251	1.98562547193206e-05	0.4158396022653498	1.98562547193206e-05	0.4285493062437656	0.0060726771024595	0.3270909378918318	0.0060726771024595	0.3359554928804143	FANCL	146319	VRK2	187461	CCDC85A	1911100	False	False	False	alt	95	0.08826	95	0.0645
2138	chr2	58136314	A	C	rs17049366	-0.0104370304	0.347417375726633	0.0104370304	0.336119602722487	0.0303625478292775	0.0037930856569455	-0.0003130920853481	0.0937906047758244	0.0003130920853481	0.0888579784694054	0.0987935559497504	0.8234194841385908	-0.0009575305228964	0.6132988565891285	0.0009575305228964	0.5994775469155641	0.0032039823393488	0.3351746041182168	-3.0778546948348275e-05	0.3396772118910194	3.0778546948348275e-05	0.328138241972957	-0.0083776802663927	0.2341035387692594	0.0083776802663927	0.2271320355274015	FANCL	105096	VRK2	228684	CCDC85A	1952323	False	True	True	ref	-45	0.0017395	-75	0.02332
2139	chr2	58155355	G	A	rs848293	-0.00306598392	0.6318045075331584	0.00472765184	0.6275145663124349	0.0083842672029606	0.5219860123801953	-3.083578349071226e-05	0.6407230378867359	4.346296055208276e-05	0.6367232418116185	0.3420512660919718	0.4321974981199663	-0.0009699121341156	0.5493403850501168	0.0015567399629183	0.5457520363563878	0.0028482703244548	0.4523178290485466	-9.78040746391165e-06	0.5574260794466548	1.4216196172500623e-05	0.5540524195815216	-0.0024523075965518	0.5536534726273062	0.0034481685494662	0.5502852014447223	FANCL	86055	VRK2	247725	CCDC85A	1971364	False	False	False	ref	100	0.002647	-5	0.00296
2140	chr2	58211263	T	C	rs113506287	0.0539950162	0.019498035834464	0.0539950162	0.020857749645241	0.0102651803611258	0.2838440422584876	0.0005593240568695	0.0320321744247573	0.0005593240568695	0.0340174604200338	0.3921617444164358	0.3478273045955647	0.0212525629979105	0.0329576238922372	0.0212525629979105	0.0359886750809386	0.00403931597506	0.234615582757739	0.0002208935720908	0.0395821075026082	0.0002208935720908	0.0425466999648966	0.0329858193549725	0.0201065538159587	0.0329858193549725	0.0206938754363556	FANCL	30147	VRK2	303633	CCDC85A	2027272	False	False	False	alt	-80	0.001991	-80	0.1166
2141	chr2	58225396	G	A	rs79064653	0.0089953448	0.366165920867681	0.0089953448	0.3778004029957328	0.0277513243604674	0.0056938714738031	0.0002515063006935	0.1160841622824007	0.0002515063006935	0.1222607669698764	0.0470046369775619	0.9189318734900916	0.0004467583220611	0.7379876446882628	0.0004467583220611	0.7519699601841415	0.0013297563578692	0.728751245769757	1.2751855119618588e-05	0.5239782800170326	1.2751855119618588e-05	0.5370801003214678	0.0052801377607651	0.3629925185913357	0.0052801377607651	0.3728511659028408	FANCL	16014	VRK2	317766	CCDC85A	2041405	False	True	False	alt	-100	0.05267	-35	0.01729
2142	chr2	58226795	A	G	rs79588315	-0.0023978776	0.7063907602127042	0.00319072304	0.6984717780574898	0.0238295506231229	0.0123293808087986	-5.711531133559473e-05	0.4124709662233236	7.659182411767082e-05	0.4054186139304452	0.1928090540358301	0.669873192251308	-0.0005217832117974	0.6878602591687148	0.000631647725712	0.6795639455235643	0.0045633832823053	0.1850052270967897	-1.2381061290911376e-05	0.4847232234381669	1.5079919761880704e-05	0.4767541061979756	-0.0025705660847103	0.534325565935999	0.0031182896088133	0.5269427020191735	FANCL	14615	VRK2	319165	CCDC85A	2042804	False	True	False	ref	-45	0.00415	-65	0.015
2143	chr2	58235134	G	A	rs80099621	-0.0348036308	0.0799846024217437	0.0348036308	0.0752260408084132	0.0094953597069811	0.3719377690492687	-0.0003463879946924	0.0926426609792725	0.0003463879946924	0.087774469515656	0.1745682009149472	0.695103294701321	-0.0063283785177438	0.2192360264722963	0.0063283785177438	0.2089897659987839	0.0016849752589111	0.658828446072767	-6.475668535683616e-05	0.2149751994034462	6.475668535683616e-05	0.2057076138260668	-0.0320273031877923	0.0218308046482774	0.0320273031877923	0.0213192663797958	FANCL	6276	VRK2	327504	CCDC85A	2051143	False	False	False	ref	-100	0.005386	-55	0.03662
2144	chr2	58275544	T	C	rs112144830	0.00690581136	0.4945668113417806	0.00726963492	0.503623762039343	0.0085383598171402	0.4948520662490369	6.381662172287913e-05	0.5055791353361678	6.647467770254229e-05	0.5136007367518026	0.5208518760568056	0.1414145873244523	0.0036851829413593	0.332721046282356	0.0038685496542539	0.3417278629604284	0.0044506077268271	0.2009455829901579	3.39622663646145e-05	0.3443391830546929	3.5301923931310575e-05	0.3526795128760362	0.0018568657351217	0.6737118516556895	0.0019357047272274	0.6816437558496293	FANCL	34134	VRK2	367914	CCDC85A	2091553	False	False	False	alt	-20	0.001282	-20	0.03296
2145	chr2	58316524	G	A	rs184071680	-0.0539202415999999	0.0214564916475418	0.0539202415999999	0.0200035393262788	0.0111924724868951	0.2140770330123929	-0.0006240592675359	0.0311138500053783	0.0006240592675359	0.02921343092263	0.5379537132127927	0.1171630398919937	-0.0292468375239075	0.0173624636992136	0.0292468375239075	0.0159562909145756	0.0060683157698247	0.0808014829326343	-0.0003408516869861	0.0247952003963372	0.0003408516869861	0.0231041586310434	-0.0130706750070021	0.1393807689125651	0.0130706750070021	0.135157300374649	FANCL	75114	VRK2	408894	CCDC85A	2132533	False	False	False	ref	100	0.002785	-95	0.02516
2146	chr2	60075401	G	A	rs10199158	-0.00323709844	0.7212616649827114	0.00323709844	0.7078110037523921	0.0061317777704403	0.9189140267470096	-1.944189959272869e-05	0.7999293063158761	1.944189959272869e-05	0.786326520054244	0.2250583512277097	0.6187660742979207	-0.0007839140864614	0.6792549320574635	0.0007839140864614	0.665281882594096	0.0013914130863705	0.7239450036489158	-4.7896555610900905e-06	0.7413318548466841	4.7896555610900905e-06	0.7274245826773126	-0.0029834334381061	0.5609327792737293	0.0029834334381061	0.5489656307019362	BCL11A	479066	PAPOLG	680853	REL	806091	False	False	False	ref	100	0.002302	-60	0.0315
2147	chr2	60076419	C	A	rs11691553	-0.0008525234579999	0.8390230217519781	0.0018772710979999	0.8346296664254936	0.0309511231740377	0.0037863932748606	-1.9029318287815985e-05	0.5561527398131412	5.1507253556033706e-05	0.5519920207822945	0.3508833079181319	0.4187612903548305	-0.0003069514771493	0.7069641629839751	0.0006768204145822	0.7023730815053627	0.0107919613224693	0.0098369058222804	-6.7697615903210295e-06	0.4645583459164238	1.847319253635465e-05	0.4606441773553125	-0.00034855133352	0.8060190270133492	0.0010166080561001	0.802183698333137	BCL11A	478048	PAPOLG	679835	REL	805073	False	True	True	ref	65	0.001221	85	0.05728
2148	chr2	60096992	A	G	rs13415334	-0.01227329088	0.317211009843241	0.01227329088	0.3064662395283385	0.0072404386658988	0.7313144040433226	-9.436777859009244e-05	0.3848610113151295	9.436777859009244e-05	0.3741372585979282	0.4029170427079119	0.3308440466752225	-0.0048520311313035	0.2641541750876684	0.0048520311313035	0.2532045337661524	0.0028890755088206	0.4463087359411386	-3.698604863098237e-05	0.3100370642783772	3.698604863098237e-05	0.2990203685202002	-0.0066909407773938	0.3218241296710467	0.0066909407773938	0.3134019494511795	BCL11A	457475	PAPOLG	659262	REL	784500	False	False	False	ref	15	0.002106	75	0.04706
2149	chr2	60105895	C	T	rs974135	-0.00289405058	0.6863579833788349	0.00351189418	0.6782759447039521	0.0142539389959644	0.0979759433247573	-4.155347104368997e-05	0.5424278432308649	4.9373081936800535e-05	0.5346243414828772	0.3758856419672403	0.3763713851680588	-0.0010486246751173	0.5504717752972941	0.0013091920153128	0.5421169890140536	0.0053342522942199	0.117972545359472	-1.5042049137354734e-05	0.4454441443087291	1.8339866343543703e-05	0.4376692178221568	-0.0019087334930859	0.6439591746515063	0.0021618481519517	0.6361442006772294	BCL11A	448572	PAPOLG	650359	REL	775597	False	False	False	ref	80	0.005894	80	0.08887
2150	chr2	60455312	A	G	rs12621957	-0.00023292491	0.8630039613716085	0.0015104444899999	0.8652580704168323	0.0117318458264918	0.1912934553699254	9.881185548173693e-08	0.8174699708191348	1.7583287097608525e-05	0.8197596293281167	0.1839334432929801	0.6844467703690487	-2.3067789815044497e-05	0.8295779528131773	0.0002963015751528	0.8319651845270002	0.0021257027852092	0.5802182449774897	3.218179750457491e-07	0.796663094541185	3.439544094751053e-06	0.7990842681522395	-8.506312306146005e-05	0.7697236414137806	0.0012925445284701	0.7716088350597797	BCL11A	99155	PAPOLG	300942	REL	426180	False	False	False	ref	-80	0.005524	-100	0.06616
2151	chr2	60456238	A	G	rs17028290	0.0040801825	0.5397692305959122	0.00534581382	0.5496552053113889	0.0244992120896442	0.0106928092493162	9.11060824135265e-05	0.2561387852330007	0.0001241310477065	0.2633173727220134	0.3882052718389194	0.3532405368698149	0.0014716830353894	0.4311682777091008	0.0020053806239289	0.4409139631804432	0.009571310777735	0.0159353741749563	3.296605321624949e-05	0.2231324289771061	4.689218148690772e-05	0.2305504289051432	0.0025809396363032	0.4976160117529422	0.0032489963588833	0.505854493481567	BCL11A	98229	PAPOLG	300016	REL	425254	False	True	False	alt	-40	0.002052	65	0.0748
2152	chr2	60474200	T	C	rs58469620	0.0611957387999999	0.0122039685105452	0.0611957387999999	0.0129907700902723	0.0146698673515119	0.0899179563722792	0.0009704475249925	0.0152060254029784	0.0009704475249925	0.016011112401014	0.3800371373147024	0.3661150866616074	0.0230546316784635	0.0274483973807696	0.0230546316784635	0.0299755780224664	0.0055227847952029	0.1121026966138105	0.000361139720944	0.0214488464768861	0.000361139720944	0.0230982367203473	0.0380086930362347	0.0096505374796459	0.0380086930362347	0.0100426480981116	BCL11A	80267	PAPOLG	282054	REL	407292	False	True	False	alt	70	0.004242	85	0.01917
2153	chr2	60491212	C	T	rs7599488	-0.0627075554	0.0129734195601375	0.0627075554	0.0122323265231829	0.0175353925801849	0.044542105204458	-0.0011263071256403	0.0110454997092079	0.0011263071256403	0.010520593363649	0.2891482276787103	0.5162072502218812	-0.0182341331479183	0.0541880009154913	0.0182341331479183	0.050039313961782	0.0050402598146268	0.138568856637781	-0.0003255781002503	0.0261446231155062	0.0003255781002503	0.0244028687420951	-0.0543740080291288	0.0029707136540624	0.0543740080291288	0.0028706290753182	BCL11A	63255	PAPOLG	265042	REL	390280	False	True	False	ref	35	0.001702	55	0.06775
2154	chr2	60492835	C	A	rs766432	0.002910371391	0.7190614240563455	0.002926400397	0.7317055817408357	0.0188599267907976	0.0345715975261054	6.191155486742872e-05	0.5300238789380226	6.217205020452156e-05	0.5415646012545001	0.3047500492743701	0.4905699283112836	0.000843207013191	0.6578773136815316	0.0008488681044454	0.6673759254364142	0.0057045801953209	0.0950527118511018	1.794834067280937e-05	0.5022443462970254	1.804034187870013e-05	0.5119375321254357	0.0025456695608875	0.60856771981767	0.0025664166640732	0.6172139750654729	BCL11A	61632	PAPOLG	263419	REL	388657	False	False	False	alt	-80	0.001471	-10	0.00727
2155	chr2	60558802	A	G	rs12328348	0.0200679516	0.1707845555608576	0.0200679516	0.1794492129721226	0.0087782750888183	0.4533246397099448	0.0001837583319361	0.1867448769912026	0.0001837583319361	0.1949573756878698	0.3160945652963204	0.4657771888799671	0.0061117369107764	0.1965960280182515	0.0061117369107764	0.2068758974716988	0.002767543410435	0.456331571855559	5.63441812755893e-05	0.2050116761992711	5.63441812755893e-05	0.2146793034754402	0.015367379329661	0.1038820744076977	0.015367379329661	0.1067168282405097	BCL11A	4335	PAPOLG	197452	REL	322690	False	False	False	alt	0	0.0	-95	0.02234
2156	chr2	60584584	G	A	rs356998	-0.0139166702	0.2908951414106594	0.0139166702	0.2801483657941457	0.0068856223634376	0.7864606452989634	-9.556788618330384e-05	0.3656460353780418	9.556788618330384e-05	0.3549389810960806	0.4389921057272378	0.268419821604845	-0.00619630011943	0.2236487687149597	0.00619630011943	0.212881604525567	0.003032551064328	0.4019953175476575	-4.270407814575749e-05	0.2760502252489709	4.270407814575749e-05	0.265206193501407	-0.0060892747850081	0.3379018793498674	0.0060892747850081	0.3288963083388878	BCL11A	30117	PAPOLG	171670	REL	296908	False	False	False	ref	40	0.001248	70	0.04224
2157	chr2	60712744	C	T	rs55710238	-0.01814138612	0.2156485818225376	0.01814138612	0.2063379499131336	0.0079624979886903	0.5954081622960747	-0.000145907107623	0.2541020314333866	0.000145907107623	0.2448616983647424	0.3950538906005248	0.3460021947558038	-0.0071998318778042	0.1912512781597957	0.0071998318778042	0.1812608469432506	0.0031416181439095	0.3976561263070833	-5.775276748485666e-05	0.2178823868486518	5.775276748485666e-05	0.207968396410627	-0.0096764489258186	0.1965799164919421	0.0096764489258186	0.1908185738882103	PAPOLG	43510	BCL11A	158277	REL	168748	False	False	False	ref	-95	0.02948	0	0.0
2158	chr2	72913722	C	T	rs34419497	0.00078011704	0.5783796208493085	0.00533488636	0.5814487834228583	0.0083143827989442	0.5255648636789988	8.22084937447397e-06	0.5849103202866037	4.566028206078077e-05	0.5876864183277435	0.3257834624840506	0.4545244191535906	9.470895248046008e-05	0.5014113880921167	0.0017719368230813	0.5038708387983141	0.0027049299458649	0.4725990152185438	1.3270814797874946e-06	0.5060511978072242	1.5117259518534749e-05	0.5085920974635401	0.001302918080063	0.5023560045030511	0.0036473407400491	0.5051399234868764	EMX1	2539	SPR	26339	EXOC6B	87681	False	False	False	alt	-100	0.00915	85	0.04947
2159	chr2	73140117	T	C	rs1430346	-0.00236538802	0.6613880272094472	0.0037781114999999	0.6522802499268731	0.0214848663571488	0.0193759094625373	-5.669503516456082e-05	0.398117585844851	8.526419101349239e-05	0.3905953972451704	0.1519517837321963	0.7383833487498798	-0.0003512624282525	0.706858447379333	0.000601158806843	0.6977683606877418	0.0032916457055949	0.3648590889623198	-8.705622286147354e-06	0.5270408561034771	1.375921460075623e-05	0.518411412916303	-0.0026784510212761	0.4713235821562827	0.0039398748949677	0.4639793643306125	RAB11FIP5	16604	NOTO	62458	SFXN5	64498	False	True	False	ref	100	0.003483	55	0.0167
2160	chr2	73155786	C	T	rs60796597	-0.0612807726	0.0144506021689668	0.0612807726	0.013588814050246	0.0183125448108284	0.0391914304541906	-0.0011868861900472	0.0106531058359143	0.0011868861900472	0.0101853234543232	0.3134202636956815	0.4775167189586826	-0.0191013178854351	0.0499580669980226	0.0191013178854351	0.0460100996810945	0.0057304461626922	0.0992258942463086	-0.0003697389282518	0.023418588774403	0.0003697389282518	0.0218362230340921	-0.0490233301175323	0.0047870139580748	0.0490233301175323	0.0046700837841361	RAB11FIP5	935	NOTO	46789	SMYD5	58437	False	True	False	ref	95	0.009186	-80	0.0771
2161	chr2	73344289	G	A	rs7604588	-0.0022626127859999	0.803481802566963	0.0022626127859999	0.7897745570157229	0.0070561347578223	0.7523354088664036	-1.843075389419987e-05	0.8200428476338948	1.843075389419987e-05	0.8063350386829942	0.4363655224639259	0.2789222192767697	-0.0009832269410605	0.6447191663784093	0.0009832269410605	0.6307312354504298	0.0030802105191462	0.4099910017699261	-8.041402303523641e-06	0.6756432885754305	8.041402303523641e-06	0.661912588696642	-0.0010767746553387	0.81585469541178	0.0010767746553387	0.8022574826898575	ALMS1	41470	EGR4	50588	FBXO41	59811	False	False	False	ref	5	8.01e-05	-100	0.01068
2162	chr2	73347970	G	A	rs6546822	0.00387804728	0.6573248712194465	0.00387804728	0.6707696406692544	0.0180793491616783	0.041205847774732	7.140737612466602e-05	0.4376872369157364	7.140737612466602e-05	0.4494527769746916	0.0740215147460035	0.8646220296370188	0.0002974890493677	0.7967150872272374	0.0002974890493677	0.8110501481136424	0.0012997224998789	0.7340055581810284	5.341112890424036e-06	0.6916279331531958	5.341112890424036e-06	0.7057034827390971	0.0027697382752932	0.5534609243213086	0.0027697382752932	0.5656077262784347	ALMS1	37789	EGR4	54269	FBXO41	63492	False	False	False	alt	75	0.00772	-95	0.0318
2163	chr2	73364113	T	C	rs1522926	0.001728696408	0.6804483240962003	0.003661057368	0.6890726713895783	0.0071128202651037	0.7630180077359408	1.2498020679001329e-05	0.7258051789114102	2.593138153299001e-05	0.734814011140114	0.1029388271662568	0.8180464596923923	5.41789794847076e-05	0.7696865757865083	0.000400544245934	0.7788688629421108	0.0007257425996496	0.8515481737888788	4.0210558841790025e-07	0.7970616467041797	2.809962954117446e-06	0.8065138320682252	0.0009336196433572	0.5305392206960706	0.0031328125810433	0.5374224586402125	ALMS1	21646	EGR4	70412	FBXO41	79635	False	False	False	alt	100	0.002012	60	0.010376
2164	chr2	73379365	C	T	rs6546827	0.0178453291799999	0.2303871844454261	0.0178453291799999	0.2396886929701726	0.0225764403669112	0.0201171227609286	0.0005393448395259	0.0837558310814931	0.0005393448395259	0.08691355896171	0.1216402659778628	0.7770229553428393	0.0023006367455139	0.4582617739737624	0.0023006367455139	0.4725746452026693	0.0028271119561016	0.3618310615423488	7.384262338962698e-05	0.2393476647675896	7.384262338962698e-05	0.2487920812444068	0.0154669654249525	0.1301310457086613	0.0154669654249525	0.1337653109806596	ALMS1	6394	EGR4	85664	FBXO41	94887	False	False	False	alt	-85	0.00386	90	0.03918
2165	chr2	73395535	C	T	rs56672945	-0.00317664272	0.7094822701218989	0.00355075568	0.7016453670405514	0.028528564391088	0.0051663959869024	-7.456670931515505e-05	0.4099463667439035	8.578684212402494e-05	0.4029234331166312	0.0365626199441902	0.9328333852925056	-8.348380059206762e-05	0.919507875438519	9.438907345945887e-05	0.9121097823713118	0.0011304842385667	0.7592224934194127	-2.1238534993367245e-06	0.8170235522996838	2.4509167800027524e-06	0.8097646489393698	-0.001070550524383	0.7608303572980366	0.0013361134451601	0.7534891626668268	ALMS1	9776	EGR4	101834	FBXO41	111057	False	True	False	ref	-10	0.001648	95	0.01459
2166	chr2	73410391	A	G	rs10179134	-0.00227188982	0.7060273005444816	0.00310073222	0.6964891768966526	0.0226472382161757	0.0151695613035427	-5.263004247464381e-05	0.42872866465463	7.18002500447954e-05	0.4206366801597825	0.0218674467577464	0.9582726944255676	-4.310853112906191e-05	0.941167925175856	5.7235110648763816e-05	0.9318958366171238	0.0004792536128902	0.8955205185718417	-9.702718680301127e-07	0.8745012443093764	1.2970040025725773e-06	0.8648717711807831	-0.0007800910797829	0.8085367779812012	0.0010000103735515	0.7993356807609115	ALMS1	24632	EGR4	116690	FBXO41	125913	False	True	False	ref	-95	0.00894	45	0.02097
2167	chr2	73426010	A	G	rs6753344	-0.001151513856	0.8649316607205702	0.001491094944	0.8634777266166945	0.0069748664975116	0.7694265965835911	-9.185796515358144e-06	0.8800989948029874	1.1359887690198802e-05	0.8787004638037218	0.1714270894926295	0.7052956963083826	-0.0002452413422223	0.8348685186187995	0.0002949382806101	0.833317837349167	0.0011937223602124	0.7629305012794128	-1.906138765305173e-06	0.853545348811881	2.224970067988704e-06	0.8521689659374253	-0.0010332057386487	0.7566062564170943	0.001390055913443	0.754826682775649	ALMS1	40251	EGR4	132309	FBXO41	141532	False	False	False	ref	5	0.000745	-85	0.03326
2168	chr2	73450771	G	C	rs6546837	0.01224721038	0.2871131118232818	0.01224721038	0.2982185461664451	0.0084724231881696	0.5067876262478951	0.000104411171043	0.311786026121385	0.000104411171043	0.3222543620718625	0.382252927934937	0.3659334904949872	0.0046513042053825	0.2459384134352986	0.0046513042053825	0.2573370401196091	0.0032522949436687	0.376787278318855	3.9843929166452056e-05	0.2593160549897809	3.9843929166452056e-05	0.2701151692003812	0.0074233135198497	0.2650061143716941	0.0074233135198497	0.2727495349003758	ALMS1	65012	EGR4	157070	FBXO41	166293	False	False	False	alt	100	0.002457	50	0.03815
2169	chr2	73473004	A	C	rs62151652	-0.0070544137199999	0.4854557063718154	0.0070544137199999	0.4727657418859445	0.0094547851652339	0.3720991110271293	-6.634946424738919e-05	0.4805343220910885	6.634946424738919e-05	0.4686123477189153	0.3498853722548989	0.4205285873320613	-0.0023934353791928	0.4241630008874344	0.0023934353791928	0.4111529216078152	0.0033271159378872	0.3661323759607242	-2.2561564857873227e-05	0.4141045358783817	2.2561564857873227e-05	0.4017896025571102	-0.0047427877882549	0.4160885870180942	0.0047427877882549	0.4057182262378381	ALMS1	87245	NAT8	169418	EGR4	179303	False	False	False	ref	75	0.001071	-35	0.0382
2170	chr2	73485902	A	G	rs10195357	0.0501824598	0.0255949204584141	0.0501824598	0.027501030479918	0.0122565480152536	0.160108969710133	0.000642237165819	0.0281178167882558	0.000642237165819	0.0298972081428859	0.6324546935134182	0.0271597933092848	0.0317483444595717	0.0122724148630729	0.0317483444595717	0.0134074507677341	0.0077545072160386	0.0347573400994076	0.0004064091723374	0.0167608068285298	0.0004064091723374	0.0180386202243485	0.0049295117169264	0.3710871746447983	0.0049295117169264	0.3811095149142561	ALMS1	100143	NAT8	156520	EGR4	192201	False	False	False	alt	-55	0.00932	-55	0.105
2171	chr2	73492748	A	C	rs13421462	-0.00543307592	0.5573065636837488	0.00543307592	0.5445268297500944	0.0289134196908193	0.0047004329607166	-0.0001585516194701	0.2290253378640213	0.0001585516194701	0.2202268556958986	0.0562308737642506	0.8962367231990916	-0.0003001006371882	0.8066022246910178	0.0003001006371882	0.7923398367535122	0.0016396535706035	0.6671928085984602	-8.825170998174646e-06	0.600087759997379	8.825170998174646e-06	0.5866150491041858	-0.0036245189265448	0.489924730380971	0.0036245189265448	0.4786359611555497	ALMS1	106989	NAT8	149674	EGR4	199047	False	True	True	ref	100	0.0726	-15	0.01138
2172	chr2	73493131	C	A	rs13398956	0.00493778376	0.5455336914909267	0.00493778376	0.5588360869818736	0.0166899074503109	0.0560263709501131	8.210940955550447e-05	0.3638347499310019	8.210940955550447e-05	0.3750263358182615	0.0275583771615887	0.9489508740998857	0.0001474383666287	0.85038907092525	0.0001474383666287	0.8648117544060541	0.0004866614275973	0.8982520784518783	2.551109009143712e-06	0.7776270630113228	2.551109009143712e-06	0.7919518629840757	0.0024938018029232	0.5823460222920801	0.0024938018029232	0.5944775810694191	ALMS1	107372	NAT8	149291	EGR4	199430	False	False	False	alt	-100	0.07336	-100	0.01984
2173	chr2	73494123	A	C	rs73947808	0.0455493028	0.0339995801349805	0.0455493028	0.0365569926021273	0.0106375435317113	0.2466976329015313	0.0005165438959901	0.0433198453134007	0.0005165438959901	0.0460223195639621	0.1000819510575835	0.821337235169249	0.0050566363986734	0.2512471176453491	0.0050566363986734	0.2628485268423942	0.0011191372001697	0.7687764240403008	6.056000957813241e-05	0.2206240438290559	6.056000957813241e-05	0.2307654450417985	0.0367348209006317	0.0141372380840512	0.0367348209006317	0.0146572024935128	ALMS1	108364	NAT8	148299	EGR4	200422	False	False	False	alt	95	0.002525	-40	0.01794
2174	chr2	73506740	C	T	rs11693586	-0.00815283552	0.4181091081310537	0.00841611528	0.4074759160193713	0.0130500317800377	0.1281291218859853	-0.0001044426506307	0.3148805568945945	0.0001083509933169	0.3059178413580963	0.1947987012313405	0.6600578904020257	-0.0012546019634671	0.5464599976906984	0.0013406767694066	0.5350078844821182	0.0026043923633339	0.476081698957614	-1.603401000123298e-05	0.4585653145543818	1.7311775622238955e-05	0.4478312056349949	-0.0083527837425699	0.2406844946573082	0.0086017489807985	0.2356057918891755	ALMS1	120981	NAT8	135682	NAT8B	194600	False	False	False	ref	65	0.001648	40	0.010315
2175	chr2	73506748	C	T	rs11693588	-0.00080630578	0.7755517622664926	0.00225032126	0.7663164238200636	0.0104609935728131	0.2644731679831019	-9.01394798329302e-06	0.7277200019296648	2.438848325828945e-05	0.7189221735875357	0.1953941430927706	0.658776547997811	-6.248981618202712e-06	0.753061181916939	0.0004806968684674	0.7442409130506356	0.0020610264633299	0.589911219449819	-1.3651409295697564e-07	0.7221032543790614	5.187994458572407e-06	0.7133214082237004	-0.001085073496613	0.6396509580040551	0.0022012676480046	0.6314937013667614	ALMS1	120989	NAT8	135674	NAT8B	194592	False	False	False	ref	60	0.001827	-55	0.002502
2176	chr2	73519516	T	C	rs6711033	0.00231876343	0.5849784815608968	0.0050157588699999	0.5930582195909544	0.0171981882028758	0.0492782266787378	3.8554856605994617e-05	0.4117798911981454	8.321256711779462e-05	0.4188382717300473	0.1142667455056587	0.8013225082129691	0.0002061595164445	0.7067303876701705	0.0006188264808103	0.7151477180849961	0.0019553383730972	0.6198632863454901	3.434807811608872e-06	0.5862629535555512	1.0267879005802368e-05	0.5943989512971575	0.0021390263384474	0.4133195583604537	0.0047324142366621	0.4195414566638569	NAT8	122906	ALMS1	133757	NAT8B	181824	False	False	False	alt	-20	0.0002136	-5	0.002903
2177	chr2	73519796	C	T	rs11884776	0.00484059638	0.5935839968509218	0.00484059638	0.6065930229849047	0.0065925246018874	0.8258906194954894	3.27346212677013e-05	0.6652137529712386	3.27346212677013e-05	0.6783814059879374	0.1005757321134036	0.8244916650586804	0.0005329687774556	0.7231301060610035	0.0005329687774556	0.7369433788489983	0.0006769695587641	0.8626573715727961	3.652427362926189e-06	0.7612890782049183	3.652427362926189e-06	0.7751217972207868	0.0041556447680992	0.4414916802414489	0.0041556447680992	0.452478662866811	NAT8	122626	ALMS1	134037	NAT8B	181544	False	False	False	alt	-35	0.000632	80	0.05225
2178	chr2	73521927	T	G	rs6719753	-0.0027358408739999	0.6514604880218918	0.003638818806	0.6458238768299784	0.0217819096221748	0.0181434728216115	-5.936116870814839e-05	0.3970880965428777	7.98716079911476e-05	0.3914178344707108	0.4618284422037573	0.231878325414743	-0.0012414868329396	0.4946451397704831	0.0016883291259435	0.4880142922388221	0.0100935263634337	0.012373307566769	-2.6880216312406315e-05	0.3027039184184364	3.708397587107536e-05	0.2968775921132016	-0.0011888090125416	0.7223309087037082	0.001520762663513	0.7176179659859352	NAT8	120495	ALMS1	136168	NAT8B	179413	False	True	False	ref	-65	0.01396	100	0.0165
2179	chr2	73526060	C	T	rs13409668	-0.001508115098	0.8647725053519485	0.00153466861	0.8551327183301908	0.0062606120189107	0.8935627667915333	-8.801656267547447e-06	0.9089006146073312	9.011228522741524e-06	0.8993878974267383	0.0478843141526363	0.9194789886337804	-9.705333651635027e-05	0.9371576528067588	9.880136899097618e-05	0.9278403365318428	0.0003079730265422	0.9408472912212136	-5.703775261112488e-07	0.955379114820648	5.841737846975579e-07	0.9461453256157674	-0.0010746999450201	0.8100964016137655	0.0011161941513915	0.8004458172157317	NAT8	116362	ALMS1	140301	NAT8B	175280	False	False	False	ref	-100	0.003826	100	0.02638
2180	chr2	73529690	G	T	rs7566385	-0.0151645542999999	0.2618048356325855	0.0151645542999999	0.2514921090251695	0.008245490466664	0.5400873456724875	-0.0001267967936384	0.2913866417867228	0.0001267967936384	0.2815994732022464	0.3892778970736211	0.3445287303437737	-0.0056911665812786	0.2300655828308011	0.0056911665812786	0.2193687236217308	0.0031821789474372	0.3881296397420372	-4.724459636981736e-05	0.2485824107337617	4.724459636981736e-05	0.2384193071446731	-0.0089585991555928	0.2324620039177309	0.0089585991555928	0.2258710655291338	NAT8	112732	ALMS1	143931	NAT8B	171650	False	False	False	ref	-40	0.0006866	45	0.002808
2181	chr2	73555073	A	G	rs13431267	-0.000840961706	0.8750129882101055	0.001359613242	0.8696281930042172	0.0196687799205805	0.028905441980899	-1.5891177724447132e-05	0.721636813587262	2.600384006835757e-05	0.7158489841759313	0.1084015394350563	0.8068229944184335	-5.467863714204769e-05	0.8919334866107657	0.0001234157095887	0.8866390767940375	0.0021709828052932	0.5463877853673188	-9.029754506432808e-07	0.8125604212099763	2.3255564007476256e-06	0.8071707849407197	-0.0005850683098372	0.7912369869645178	0.0011078953101172	0.78596044035809	NAT8	87349	NAT8B	146267	ALMS1	169314	False	False	False	ref	40	0.002205	-25	0.00697
2182	chr2	73560899	G	A	rs7604682	-0.01145181354	0.3170094994709887	0.01145181354	0.3060923926411998	0.0124185258608273	0.1494991122533784	-0.0001436039746765	0.2369754843482145	0.0001436039746765	0.2282822211815723	0.2426083258125084	0.5889724770184424	-0.0027462507961562	0.3797233960688463	0.0027462507961562	0.3671376782552031	0.0030220532756221	0.4195623173172229	-3.4500330093087675e-05	0.3053098644138607	3.4500330093087675e-05	0.2943739570164873	-0.0108943038828203	0.1686139355837169	0.0108943038828203	0.1636638588962294	NAT8	81523	NAT8B	140441	ALMS1	175140	False	False	False	ref	-80	0.001647	80	0.06024
2183	chr2	73560999	A	G	rs7580750	0.0438048241999999	0.0367176944023578	0.0438048241999999	0.0393626131311768	0.0174385119494019	0.0464812411409824	0.0008106578580802	0.0185735714192138	0.0008106578580802	0.0195361501463737	0.2896212616313448	0.5122789338542725	0.0130919037234882	0.083175808728212	0.0130919037234882	0.0897453196176379	0.0050982774326601	0.1345323434704593	0.0002429964459615	0.0386384124241037	0.0002429964459615	0.0416483543419289	0.0355190406539486	0.0132502435257974	0.0355190406539486	0.0136445476298058	NAT8	81423	NAT8B	140341	ALMS1	175240	False	False	False	alt	-100	0.00514	-20	0.01453
2184	chr2	73562931	A	G	rs6735946	-0.00093324111	0.9239919930645492	0.00093324111	0.9098050010936548	0.0204184547920644	0.0243180812372867	-1.942246712626091e-05	0.7971598194691584	1.942246712626091e-05	0.7834296222164553	0.0868452992250956	0.8453085443388166	-7.65340917099713e-05	0.9341945658363812	7.65340917099713e-05	0.9199095879811768	0.0017612360773859	0.6529985540714498	-1.5790876416776626e-06	0.8692404151627032	1.5790876416776626e-06	0.8548555969011605	-0.0007717922385086	0.8561509989390302	0.0007717922385086	0.8423573184482258	NAT8	79491	NAT8B	138409	TPRKB	174469	False	False	False	ref	70	0.014984	-15	0.002277
2185	chr2	73570496	T	A	rs10197755	-0.00113444038	0.8005489492435046	0.00204310102	0.7959239963485609	0.0064299085236548	0.8854122010430332	-6.936826564663105e-06	0.8475882556839772	1.2927988016898246e-05	0.8432733193092891	0.1335366549445533	0.7662545464744693	-0.0001601725049346	0.8093485072805475	0.0002751883201065	0.8049592412607423	0.0008579784786085	0.8214880046901584	-9.832714751620577e-07	0.8432821200769558	1.7413561728906818e-06	0.8389888438497084	-0.001172211329993	0.6564586121905741	0.0020062448780588	0.6520145390668489	NAT8	71926	NAT8B	130844	TPRKB	166904	False	False	False	ref	-95	0.00608	-90	0.03047
2186	chr2	73570869	T	G	rs7583255	-0.0057465905199999	0.455638467639947	0.00810617748	0.4476839569691984	0.0080640995616913	0.5838387994151528	-4.820282005446864e-05	0.4837017776604824	6.536328761914801e-05	0.4760959485307264	0.1243477629435989	0.7800496122969041	-0.0007014416824536	0.6126428658570017	0.0009987184545959	0.6045158078682245	0.0009936487729245	0.7961615140484292	-5.855998472851619e-06	0.6265430184804259	8.017990594896771e-06	0.6185934977063533	-0.0058174877332752	0.2847807108446936	0.0076598304961669	0.2803067212104607	NAT8	71553	NAT8B	130471	TPRKB	166531	False	False	False	ref	85	0.00299	-55	0.02419
2187	chr2	73583782	T	G	rs7558944	-0.0092567001999999	0.3817338265875269	0.0092567001999999	0.3701526913067987	0.0144279859743204	0.0939155497864859	-0.0001355911571244	0.2590008252659325	0.0001355911571244	0.2496870714120973	0.0443033641427815	0.9219704835147274	-0.0004176677790798	0.7723961720885621	0.0004176677790798	0.7582729011528073	0.0006829958110527	0.8617737327362978	-6.573059037813971e-06	0.6837584657741321	6.573059037813971e-06	0.669984223252664	-0.0052656147885351	0.3789332217090317	0.0052656147885351	0.3691443921209962	NAT8	58640	NAT8B	117558	TPRKB	153618	False	False	False	ref	-100	0.00798	85	0.02116
2188	chr2	73588201	G	A	rs11903916	-0.00648870094	0.5158817005738746	0.00648870094	0.5028795298830803	0.0075309094564475	0.6832179869913372	-4.991234044186047e-05	0.5612161958272871	4.991234044186047e-05	0.5486853280473476	0.0941358312845568	0.8324772854407894	-0.0006509545287522	0.7100610773085464	0.0006509545287522	0.6956522176214256	0.0007108625272113	0.852754502131215	-5.008951243681215e-06	0.7310265360227804	5.008951243681215e-06	0.7167775555030129	-0.005421218062428	0.3576765084850998	0.005421218062428	0.3485364210225444	NAT8	54221	NAT8B	113139	TPRKB	149199	False	False	False	ref	-45	0.003576	-100	0.04123
2189	chr2	73590111	G	A	rs7603647	-0.0293212304	0.1157541037514577	0.0293212304	0.1097042972713079	0.009371651827654	0.3749557123909114	-0.0002851758997316	0.1247335509296034	0.0002851758997316	0.1188837794347002	0.0808950300314318	0.8572852013650732	-0.0026106095535829	0.4266165841334832	0.0026106095535829	0.4138513615702045	0.00078506961428	0.8418279937732288	-2.5932564789772908e-05	0.4130586191251676	2.5932564789772908e-05	0.4008872695937948	-0.0214898494797663	0.0733693014938076	0.0214898494797663	0.0713339794417304	NAT8	52311	NAT8B	111229	TPRKB	147289	False	False	False	ref	70	0.0188	-60	0.01566
2190	chr2	73610624	T	C	rs6546856	0.0277596886	0.1066829297118148	0.0277596886	0.113135129536679	0.0088596658873141	0.4513574172038712	0.0002530078916709	0.1220654744743123	0.0002530078916709	0.1284793641950109	0.3506862104378676	0.4115738731306843	0.0096170801323683	0.1191077441804684	0.0096170801323683	0.1273620266512022	0.0030711746094313	0.4106426209634846	8.66183583929332e-05	0.130278607320278	8.66183583929332e-05	0.138268619607417	0.0195126505461674	0.0776846081212459	0.0195126505461674	0.0798476491768643	NAT8	31798	NAT8B	90716	TPRKB	126776	False	False	False	alt	-95	0.01599	-100	0.02582
2191	chr2	79206501	C	T	rs13407231	-0.00467786744	0.619903395989894	0.00467786744	0.6064529888473335	0.0056864286674264	0.9644796075445567	-2.726159233687622e-05	0.723961275206467	2.726159233687622e-05	0.7103808164182408	0.1112604902540482	0.8052811087835322	-0.0005244452207774	0.7430182707175811	0.0005244452207774	0.7287593477166864	0.0006307783072738	0.8687667929129558	-3.053936247464545e-06	0.8000367429290473	3.053936247464545e-06	0.7857461743390609	-0.004209587236382	0.4435519791834624	0.004209587236382	0.4330820655629067	CTNNA2	21269	REG3A	46748	REG1A	86138	False	False	False	ref	-100	0.03647	-100	0.05426
2192	chr2	79206616	C	G	rs17016552	0.01153387528	0.3133901971680424	0.01153387528	0.3246766177543634	0.0073007455576233	0.727368768950902	8.661493261819149e-05	0.3783911482430896	8.661493261819149e-05	0.3892469882006003	0.0970964429091587	0.8285016705720643	0.0011439531352266	0.5636766020080782	0.0011439531352266	0.5772878805766744	0.0007113444961573	0.8531750326922948	8.605554033955184e-06	0.5980233318800147	8.605554033955184e-06	0.6114129523354426	0.0098362016203487	0.1989544112447862	0.0098362016203487	0.2053794267871886	CTNNA2	21384	REG3A	46863	REG1A	86253	False	False	False	alt	35	0.001717	-75	0.013855
2193	chr2	79211546	G	A	rs13406464	0.035920506	0.0611053869961112	0.035920506	0.0653698309385551	0.0110761478763477	0.2197838562946197	0.0004089780637738	0.0581472318818535	0.0004089780637738	0.0619158719771092	0.4907208581001877	0.1852008473245068	0.0174933670389283	0.0488967036518099	0.0174933670389283	0.0533018639408355	0.0054375224046372	0.1122566836497953	0.0001992782139967	0.0471369739816	0.0001992782139967	0.0508899306049224	0.0125789686615005	0.1310484806863454	0.0125789686615005	0.1348908953932959	CTNNA2	26314	REG3A	51793	REG1A	91183	False	False	False	alt	-75	0.00405	-100	0.1234
2194	chr2	104359740	G	A	rs4535062	-0.02013907708	0.2106394723700497	0.02013907708	0.2014736087912235	0.0167810755632444	0.0556763343284876	-0.0003467013375975	0.1008905386014518	0.0003467013375975	0.0960143943224873	0.2739240033610307	0.53913806253247	-0.0058526548361248	0.2503706195157912	0.0058526548361248	0.2393687612479451	0.0047032564197536	0.1752057756047104	-0.0001031085071489	0.1484130239018856	0.0001031085071489	0.1405842541826129	-0.0162823265801512	0.1145185569611827	0.0162823265801512	0.111277941393987	POU3F3	493548	MRPS9	678330	GPR45	882004	False	False	False	ref	100	0.00409	60	0.05457
2195	chr2	104365522	A	G	rs17029753	0.0046161178519999	0.5712113279414163	0.004897412428	0.5804392164897406	0.0223411650594883	0.0163882475949213	9.489562970341244e-05	0.3308827653587232	0.0001012521486394	0.3388254671307095	0.1495969875206174	0.7422175801672519	0.0007726202190787	0.6544591712258125	0.0008035629433071	0.6635798378832056	0.0033115458369744	0.3567815804700489	1.5663735044736312e-05	0.4755289308970903	1.6362959381065053e-05	0.4844808889260429	0.0046660235064678	0.3949320078222778	0.0048568968557764	0.4020826051794511	POU3F3	487766	MRPS9	672548	GPR45	876222	False	True	False	alt	-90	0.03366	-10	0.001923
2196	chr2	104365851	T	G	rs60641243	0.0230558512	0.1471928807260737	0.0230558512	0.1549800556001781	0.0101643883794127	0.2945186205407877	0.0002368279119645	0.1339731458258989	0.0002368279119645	0.1406085380421688	0.1633377939605182	0.7200711335799311	0.004022320244632	0.2950531559547332	0.004022320244632	0.3068770592087684	0.0016887118643311	0.6617953506137815	4.189101241303399e-05	0.2716174781865104	4.189101241303399e-05	0.2827331773432389	0.0218176537101007	0.0595642536372121	0.0218176537101007	0.0613347123284219	POU3F3	487437	MRPS9	672219	GPR45	875893	False	False	False	alt	-95	0.0012	20	0.02315
2197	chr2	104367098	C	G	rs7598321	0.00624041864	0.5248923510993926	0.00624041864	0.5378929249517347	0.0067560908380635	0.8204924782836718	4.4304303840945705e-05	0.5918339019066517	4.4304303840945705e-05	0.6047506789765437	0.2273529808400502	0.6145912412799578	0.0014549527507169	0.5375317379896659	0.0014549527507169	0.5512054710243967	0.0015394929847112	0.6971580996963669	1.0252912429827746e-05	0.5874730422465645	1.0252912429827746e-05	0.6009460426045715	0.0054046203798794	0.3612971188001792	0.0054046203798794	0.3709120758808978	POU3F3	486190	MRPS9	670972	GPR45	874646	False	False	False	alt	0	0.0	-45	0.003418
2198	chr2	104367929	C	T	rs62152284	0.00360808406	0.6558783662130314	0.00360808406	0.6691939425412163	0.0205114686493427	0.0236130408289083	7.398719281072204e-05	0.4059553265927495	7.398719281072204e-05	0.4173514898237594	0.503084056888557	0.1672430970314272	0.001792029322638	0.4540970710210941	0.001792029322638	0.4675314843581923	0.0103629540137295	0.0113358365687126	3.693552219043792e-05	0.2750725154832431	3.693552219043792e-05	0.2860318458313528	0.0012178549570015	0.7539626145605748	0.0012178549570015	0.7676056771309301	POU3F3	485359	MRPS9	670141	GPR45	873815	False	False	False	alt	35	0.002563	50	0.0549
2199	chr2	104389309	T	C	rs112338729	0.00525224752	0.5442909229206019	0.00525224752	0.5574668950170194	0.005431516074826	0.974855461833646	2.7976666420126173e-05	0.6739229938536782	2.7976666420126173e-05	0.687110832267807	0.2909200302907706	0.5037283150708198	0.0014752183939373	0.497836264135447	0.0014752183939373	0.51171916716654	0.0015851691996185	0.6786132578250877	7.840037492268761e-06	0.5950855476363308	7.840037492268761e-06	0.6088839228666239	0.0041452712165063	0.4413152018098489	0.0041452712165063	0.4522711053321803	POU3F3	463979	MRPS9	648761	GPR45	852435	False	False	False	alt	-100	0.003489	80	0.03143
2200	chr2	134086836	T	C	rs6729836	0.070066594	0.0078471317087895	0.070066594	0.0082763386337163	0.0140926134791502	0.0970991289406978	0.0010141251894118	0.0116910947852574	0.0010141251894118	0.0122934753343099	0.4267679125302129	0.2905411283226777	0.0299213894693677	0.0140974289164246	0.0299213894693677	0.0154235727333904	0.0060032593767853	0.080079408145548	0.0004323725996318	0.0144025020183278	0.0004323725996318	0.0154560831188937	0.0372389755080446	0.0136989825937162	0.0372389755080446	0.0141018570741906	MGAT5	33148	NCKAP5	518373	TMEM163	632164	False	True	True	alt	90	0.002405	60	0.03577
2201	chr2	140300603	T	C	rs10203500	0.0607399008	0.0133777806852161	0.0607399008	0.0142524387623465	0.0130092024386962	0.1284220222884441	0.0008146353987611	0.0172934981491737	0.0008146353987611	0.0183410863614568	0.1465554621935912	0.7482485492013732	0.0096258185517611	0.1346163944635243	0.0096258185517611	0.1435577387317369	0.0019964308499131	0.6068114740127286	0.0001332768162821	0.0957663282029217	0.0001332768162821	0.1022371241904116	0.0541229680805817	0.002986357369916	0.0541229680805817	0.0031011569723156	NXPH2	1520213	SPOPL	1798832	LRP1B	1830413	False	True	False	alt	-100	0.00593	-85	0.0311
2202	chr2	140302839	G	A	rs12692042	0.0119865219	0.300266188974778	0.0119865219	0.3114846379461699	0.0066609711846796	0.8173342011112019	8.265806936361569e-05	0.3841371614263006	8.265806936361569e-05	0.3952773905092536	0.0524528262741314	0.9084866965967876	0.0007211843530098	0.6724618494748957	0.0007211843530098	0.6865901006192662	0.0003310960133996	0.9346389934843584	4.594942202549837e-06	0.7232970530836155	4.594942202549837e-06	0.7373669743278484	0.0074731065674954	0.2891718403746979	0.0074731065674954	0.2969849977665888	NXPH2	1522449	SPOPL	1801068	LRP1B	1828177	False	False	False	alt	-75	0.0004768	-35	0.02557
2203	chr2	140315675	C	A	rs17477145	0.00890199026	0.3766501687826905	0.00890199026	0.3884640870113565	0.0208076805226776	0.0226757690862225	0.0001851830072124	0.1785398906171292	0.0001851830072124	0.1866933396190147	0.0167595099534227	0.9684260096901378	0.0001579914470756	0.8562306712020489	0.0001579914470756	0.8703566529661528	0.0003614839693393	0.9224382680828312	3.4299581970203267e-06	0.7514534244610476	3.4299581970203267e-06	0.7654254391758972	0.0027199452276475	0.562179313464078	0.0027199452276475	0.5745462709810325	NXPH2	1535285	SPOPL	1813904	LRP1B	1815341	False	False	False	alt	30	0.000778	-75	0.01199
2204	chr2	140315711	A	C	rs13386580	-0.00505880212	0.5811039880429687	0.00505880212	0.5680492006581317	0.0186966494702604	0.0353478310593012	-9.22965320287892e-05	0.3684323632047849	9.22965320287892e-05	0.3577436063505161	0.0147117708689923	0.9720038953125678	-8.106533974825306e-05	0.9322180375413216	8.106533974825306e-05	0.9180225018202132	0.000274325026738	0.9423378267848828	-1.4813186138171875e-06	0.8760902060702214	1.4813186138171875e-06	0.8618557907590391	-0.0014751190365044	0.7437996427948775	0.0014751190365044	0.7304428363093437	NXPH2	1535321	SPOPL	1813940	LRP1B	1815305	False	False	False	ref	0	0.0	-50	0.011826
2205	chr2	140329524	G	A	rs10208226	0.00060489618	0.7927231592300468	0.002047487408	0.791907091689038	0.014057380717203	0.1017279693322288	9.597653859748404e-06	0.6861645521872717	2.890052764618452e-05	0.6860490981560275	0.0908972084772663	0.8398050356217762	2.179064535062e-05	0.8709613449899205	0.00015009287666	0.8693341384827526	0.001293030564148	0.7376366081765978	3.75918989045964e-07	0.8186064765115704	2.1226195393587443e-06	0.8168855101559849	0.00024689052791	0.7048725819030728	0.0016452452826273	0.7041104818111683	NXPH2	1549134	LRP1B	1801492	SPOPL	1827753	False	False	False	alt	-80	0.001701	-95	0.0293
2206	chr2	140345146	A	G	rs1401123	0.0402538126	0.0458451787863798	0.0402538126	0.0490996339969974	0.0169850459362241	0.0503894652596861	0.0007033612045541	0.0230076658054811	0.0007033612045541	0.0244298718427601	0.0100436726522059	0.98108729314224	0.0003887420574655	0.7485440323467123	0.0003887420574655	0.7626900492229624	0.0001685772800178	0.9634302753882816	6.77153145132704e-06	0.6362585530634758	6.77153145132704e-06	0.6501188668212136	0.0052407182647122	0.350659938211333	0.0052407182647122	0.3604343055020406	NXPH2	1564756	LRP1B	1785870	SPOPL	1843375	False	False	False	alt	35	0.001507	-55	0.001892
2207	chr2	140355793	C	T	rs10202846	-0.000460126992	0.7873358286437423	0.002215839868	0.7902455167930895	0.0159480642596384	0.0679879002449806	-5.464077488913493e-07	0.6432344850967924	3.586008244363352e-05	0.6464931893525193	0.0945279515347669	0.8325351860505023	-3.4062891561089347e-06	0.8463222803271991	0.0002358631751562	0.8500291990339005	0.0016249558929924	0.653795808255302	7.745880306685418e-07	0.7669707078233681	4.028736217145205e-06	0.7708444295297605	-9.75113849728808e-05	0.6572803531617394	0.0020809344495274	0.660223223499055	NXPH2	1575403	LRP1B	1775223	SPOPL	1854022	False	False	False	ref	-95	0.002552	-95	0.02444
2208	chr2	144469483	C	T	rs9287360	-0.00536466178	0.5923591615392865	0.00536466178	0.5788504824827151	0.0072136996315302	0.7528499352158404	-3.852840560986809e-05	0.641373540783147	3.852840560986809e-05	0.628124971022855	0.2540399796678388	0.5708783405984797	-0.0013898683886017	0.5668492641871782	0.0013898683886017	0.5531853506842066	0.0018414961702613	0.6394180083550476	-1.0023712178712273e-05	0.60522686769	1.0023712178712273e-05	0.5918865365568905	-0.0048071038081307	0.4507911527959532	0.0048071038081307	0.4401457437442609	ZEB2	51574	GTDC1	136915	ARHGAP15	1378120	False	False	False	ref	-95	0.012726	-30	0.01474
2209	chr2	145662536	C	A	rs67082009	0.0080811202	0.4007375989605548	0.0080811202	0.4126766479884275	0.0269504241749549	0.0065515886064192	0.0002181832665548	0.1411933133591544	0.0002181832665548	0.1482732607040855	0.1142480731127915	0.7979207109207967	0.0009687564048489	0.5951305729425006	0.0009687564048489	0.6088449242397743	0.0031426014785248	0.3654675319747533	2.6759364324949785e-05	0.3548778534798866	2.6759364324949785e-05	0.3667752591157759	0.0071245552339754	0.2681645149975494	0.0071245552339754	0.2763271043338082	ZEB2	1141479	GTDC1	1329968	ACVR2A	2181982	False	True	True	alt	-100	0.002699	-100	0.03427
2210	chr2	145677776	G	A	rs72857431	-0.024758441	0.1464778959066184	0.024758441	0.1388733680890281	0.0067465110460599	0.8278673893259292	-0.0001691273838193	0.2185305609482164	0.0001691273838193	0.2099748667561338	0.2979989418977375	0.4921697966460962	-0.0074340957370288	0.1820521768845288	0.0074340957370288	0.1723637654838182	0.0020401555066485	0.593928538014699	-5.155149864768321e-05	0.2374817673119494	5.155149864768321e-05	0.2275873846411713	-0.0192367140737974	0.0745134479453125	0.0192367140737974	0.0724873597467828	ZEB2	1156719	GTDC1	1345208	ACVR2A	2166742	False	False	False	ref	-65	0.005814	10	0.01569
2211	chr2	145680858	A	G	rs72857434	0.0239910174	0.1381717056854699	0.0239910174	0.1458214388969897	0.0062917636017892	0.8847328869348529	0.0001573034742766	0.2239047456968135	0.0001573034742766	0.2328013452331367	0.2369588896150375	0.599497980939501	0.0057613532113489	0.210064796810978	0.0057613532113489	0.220613326388233	0.0015019677726617	0.7013159889645002	3.811814464191183e-05	0.2804432779070477	3.811814464191183e-05	0.2913729822017645	0.0223550036826107	0.0570640995813949	0.0223550036826107	0.05861540861001	ZEB2	1159801	GTDC1	1348290	ACVR2A	2163660	False	False	False	alt	-95	0.00421	100	0.02673
2212	chr2	145883473	G	T	rs6721450	0.003302201588	0.5803574811516654	0.0051853204119999	0.5858281333944391	0.0079703920851701	0.6001198066984491	2.6868774274768464e-05	0.6045337766191071	4.447089600365446e-05	0.6090148410031174	0.267905268726854	0.5486288851050197	0.0009936107639767	0.5491499423282129	0.0015464309586497	0.5548062709917473	0.0021921611632045	0.572260885804731	8.35355861244545e-06	0.5649121419752544	1.3563855013934242e-05	0.5700203601761544	0.0025850890569404	0.4636840782827568	0.004195064264152	0.4677610606074268	ZEB2	1362416	GTDC1	1550905	ACVR2A	1961045	False	False	False	alt	-100	0.007412	35	0.007416
2213	chr2	146811485	T	C	rs34624969	0.0011019096199999	0.710752423088176	0.0033293327799999	0.7153645744853978	0.0123317084994528	0.1610794077871238	6.040486862085649e-06	0.6232778131240466	4.05620021573055e-05	0.6270985652650889	0.1971825433873794	0.6618478874782711	0.0001350971787613	0.6925107110458629	0.0006934140500936	0.6969906584332983	0.0025045030845473	0.4953050406685547	-3.727380698219571e-08	0.6294908710045518	8.748333919396699e-06	0.633363551615539	0.0009024989885787	0.569548196417552	0.0028112324816646	0.5735382375223818	ACVR2A	1033033	MBD5	1209527	ORC4	1210119	False	False	False	alt	15	0.00149	-10	0.01343
2214	chr2	146823071	C	T	rs4556924	-0.0437646424	0.0439571996490862	0.0437646424	0.0411790954905821	0.0088826893845501	0.4477766610495655	-0.0003974365295475	0.0674797922495077	0.0003974365295475	0.0636929802439577	0.127457753711138	0.778031411749799	-0.0059780285210425	0.2349829262574867	0.0059780285210425	0.2242042691013157	0.0011476347845945	0.7698857704209818	-5.4880158719641e-05	0.2400834511716681	5.4880158719641e-05	0.2298404842445482	-0.0397742715173393	0.011173112773462	0.0397742715173393	0.0109057794485441	ACVR2A	1021447	MBD5	1197941	ORC4	1198533	False	False	False	ref	-10	9.5e-07	5	0.004333
2215	chr2	146834002	A	C	rs7559983	-0.000423165094	0.8870267264792654	0.001129736666	0.8906540539014419	0.0177240173410367	0.0460540713627493	-1.0003982528465443e-05	0.7658314105836704	2.0461773998174685e-05	0.7680838287627789	0.1378022593595368	0.7611482238988793	-7.4866753585791e-05	0.8750060141977732	0.0001593254736627	0.8785275254089276	0.0024913761491389	0.4927115075047463	-1.7423310355829455e-06	0.797022327514995	2.9647145401279663e-06	0.7998798373454956	-0.0004730339526343	0.8054735781003585	0.0009958609529144	0.8084464652189216	ACVR2A	1010516	MBD5	1187010	ORC4	1187602	False	False	False	ref	-70	0.001749	-100	0.03113
2216	chr2	146853682	G	A	rs3934919	-0.00478297702	0.615668488709609	0.00478297702	0.6025590566252034	0.0072204073945506	0.7361614093630797	-3.5867716435311366e-05	0.6592891100574725	3.5867716435311366e-05	0.6463677860616468	0.109362130312555	0.8038682434878358	-0.000519652391182	0.7366912227473851	0.000519652391182	0.7227147906622868	0.0007836943320518	0.834832366561805	-3.863719481455552e-06	0.7624464675909227	3.863719481455552e-06	0.7483275619477386	-0.0040996275894977	0.4484670258081913	0.0040996275894977	0.4377279836343474	ACVR2A	990836	MBD5	1167330	ORC4	1167922	False	False	False	ref	30	0.001596	65	0.0185
2217	chr2	146859620	C	T	rs13022139	-0.0004532264799999	0.7317144860649475	0.00322956048	0.7245078937775425	0.0073926611795253	0.7073874824490164	-2.925354948405476e-07	0.7520751274154466	2.5769378828337064e-05	0.7450528815696081	0.0106826834303259	0.9789397049622718	-1.7378601588851456e-05	0.9711291124403882	3.091481056656671e-05	0.963046132046816	7.710606548326572e-05	0.9819183036008636	-1.0968453098361269e-07	0.9734056225677518	2.338986448929205e-07	0.9664753938057382	-0.0002863100239628	0.9004171063748068	0.0005311258415543	0.8915551834309331	ACVR2A	984898	MBD5	1161392	ORC4	1161984	False	False	False	ref	-100	0.001442	-20	0.003017
2218	chr2	147051395	T	C	rs2254296	0.00270247464	0.7323998135296211	0.00270247464	0.7460735068615002	0.0070265848316694	0.7813204826634363	1.8555622140103904e-05	0.7737084837100612	1.8555622140103904e-05	0.7872418346945037	0.2093756159296257	0.6418422923577366	0.000570646441091	0.6871437137367717	0.000570646441091	0.7013242380972279	0.0014764352283725	0.7038452118301851	3.927361994074354e-06	0.7220187957579155	3.927361994074354e-06	0.7361887555480299	0.0023796927354017	0.5934327170569068	0.0023796927354017	0.6060186471439316	ACVR2A	793123	MBD5	969617	ORC4	970209	False	False	False	alt	-70	0.003944	-65	0.017
2219	chr2	147059580	T	C	rs1451083	-0.0035816564999999	0.6810608132378175	0.0035816564999999	0.6675317164610209	0.0226435954122621	0.0153205665040989	-8.00646788819029e-05	0.3877044828560588	8.00646788819029e-05	0.376609090069269	0.0977479019491903	0.8268986372043956	-0.0003408035691628	0.7907979840217466	0.0003408035691628	0.7764415596499499	0.002236296928829	0.5502281600555325	-7.684856395074842e-06	0.6244636335070896	7.684856395074842e-06	0.6107589649064307	-0.0031722320770961	0.5260486177545629	0.0031722320770961	0.5146618650051865	ACVR2A	784938	MBD5	961432	ORC4	962024	False	True	False	ref	75	0.00403	-60	0.00885
2220	chr2	147060558	C	T	rs6743215	-0.0542000453999999	0.0218491570220083	0.0542000453999999	0.0204576678221112	0.0113030030925074	0.2038198503309846	-0.0006165845585477	0.029423202326153	0.0006165845585477	0.027638757386942	0.2304816440004564	0.6089814561444462	-0.0127107720624737	0.0982711476875449	0.0127107720624737	0.0914596065663039	0.0026148901100053	0.4974755341731453	-0.000145090571375	0.0835829101656251	0.000145090571375	0.0780825986021417	-0.051243270158404	0.003647347911354	0.051243270158404	0.0035484012036822	ACVR2A	783960	MBD5	960454	ORC4	961046	False	False	False	ref	45	0.002472	-60	0.018
2221	chr2	147065200	G	A	rs61064806	-0.0239028086	0.1521335323642362	0.0239028086	0.1444346512313238	0.0080470720138784	0.5598574869971001	-0.0001943749224325	0.185442207274869	0.0001943749224325	0.1776783758784434	0.1571593066318115	0.7230409130287597	-0.0038129322385045	0.3168226988132273	0.0038129322385045	0.304991157160995	0.0012972135713214	0.7320090264784825	-3.183785429133072e-05	0.3364910912059153	3.183785429133072e-05	0.3250677596173051	-0.0211910911938919	0.0586083944873391	0.0211910911938919	0.0570617557487703	ACVR2A	779318	MBD5	955812	ORC4	956404	False	False	False	ref	-100	0.001411	-100	0.04333
2222	chr2	152147871	C	A	rs4664536	0.00544193426	0.5311153743698029	0.00544193426	0.5441224668885773	0.0240003021666483	0.011548463689431	0.0001290396495311	0.253550725496809	0.0001290396495311	0.2631185463309604	0.0921254369858608	0.8381416889116918	0.000511538498512	0.7102781187072554	0.000511538498512	0.7242614705116766	0.0022610350398485	0.5465329872811462	1.2334020155721008e-05	0.5175074915413053	1.2334020155721008e-05	0.5306986120348153	0.0046349028516893	0.4021608540100674	0.0046349028516893	0.412565515698941	STAM2	27892	CACNB4	48704	ENSG00000283228	173922	False	True	False	alt	30	0.00473	60	0.03952
2223	chr2	152160749	T	C	rs191529620	0.0193748308	0.1695171140894494	0.0193748308	0.1781585549353971	0.0099153935908869	0.3089682103296013	0.0001919271200577	0.1620558554166042	0.0001919271200577	0.1698260793299151	0.6510918163051485	0.0211629082252138	0.0126371725014863	0.0822285460751079	0.0126371725014863	0.0886846285239921	0.0064555394294938	0.0616514806582714	0.0001251731806362	0.0830876262380412	0.0001251731806362	0.089042326280737	0.0018423427628917	0.6602168312819776	0.0018423427628917	0.6731739934868043	STAM2	15014	CACNB4	61582	FMNL2	174426	False	False	False	alt	15	0.002747	-75	0.010315
2224	chr2	152161260	G	A	rs3963509	-0.0480709398	0.0324194240375628	0.0480709398	0.0303959665304634	0.0097455066863573	0.3298463698601654	-0.0004766811063241	0.0480800750386645	0.0004766811063241	0.0454108439360656	0.5405222045871845	0.1135462511595176	-0.0258564481587087	0.0248551502266435	0.0258564481587087	0.0229035019409648	0.005264004453084	0.1188107730639538	-0.000256200897036	0.0367387614079739	0.000256200897036	0.0342393312990089	-0.012881876368012	0.1563745009479197	0.012881876368012	0.1517455847915774	STAM2	14503	CACNB4	62093	FMNL2	173915	False	False	False	ref	60	0.014565	-95	0.0795
2225	chr2	152202955	A	C	rs62177360	-0.0086484082	0.4026063090081387	0.0086484082	0.3907557657149603	0.0320876695570477	0.0028671772466663	-0.0002755631095232	0.1118227541525226	0.0002755631095232	0.1061170206696202	0.5045488023734686	0.1662112992352366	-0.0043675244086708	0.2774917564884585	0.0043675244086708	0.2662826126697983	0.0162237256687893	0.0024756494300216	-0.0001394263755798	0.083254506017114	0.0001394263755798	0.0779635987181338	-0.0026660027593646	0.5840256068627457	0.0026660027593646	0.571741291076098	STAM2	27192	CACNB4	103788	FMNL2	132220	False	True	True	ref	-95	0.04376	-100	0.3516
2226	chr2	152278659	C	T	rs6732917	-0.00173082678	0.8316638452495901	0.00173082678	0.8178507504881459	0.0105719037409649	0.2630058517902588	-1.8007464599405977e-05	0.7893856022773418	1.8007464599405977e-05	0.7756141735760483	0.4170603429496157	0.3106621784684491	-0.000717537621936	0.6659336958612176	0.000717537621936	0.6520942232517487	0.0044176133898199	0.2004695043790812	-7.480124027700728e-06	0.6304026875067715	7.480124027700728e-06	0.6168330326143545	-0.0009170219608086	0.8280812020461964	0.0009170219608086	0.814403409017269	FMNL2	56516	STAM2	102896	CACNB4	179492	False	False	False	ref	100	0.001701	80	0.06183
2227	chr2	155028649	G	T	rs72865150	-0.00295090965	0.7220052380385333	0.00323007315	0.7125891119184313	0.0206629010731962	0.0238530431642651	-5.979699121345973e-05	0.4803189763298559	6.45843748730541e-05	0.4715331438479455	0.1278975922986752	0.7769116473314245	-0.0003513423040253	0.7810760055423387	0.0003927799798557	0.7718071603774741	0.0026894918608242	0.4688440087925848	-7.349308145373108e-06	0.6363241678485281	8.059924155758445e-06	0.6267972940019327	-0.0025290718783389	0.5574640611199261	0.0029232668388675	0.5493438842169482	KCNJ3	330793	GALNT13	1156726	NR4A2	1313699	False	False	False	ref	0	0.0	-55	0.010895
2228	chr2	155059850	G	A	rs34849522	0.0038507696588	0.6299339376745424	0.0038607103412	0.6426594267437524	0.0210269044871123	0.0214286785256325	8.46661065852379e-05	0.3868418029493397	8.485027846982683e-05	0.396998918680016	0.0281641925746117	0.9493848684654632	0.000113448611764	0.8873108333915175	0.0001136951721211	0.9008238451028392	0.0006148413808624	0.8743559834048633	2.601863843935075e-06	0.8009028492288821	2.606431888998324e-06	0.8139394974709574	0.0017759520326973	0.6799290495105308	0.0017801014533345	0.6915645210300505	KCNJ3	361994	GALNT13	1187927	NR4A2	1282498	False	False	False	alt	5	0.001877	-100	0.01797
2229	chr2	155061910	T	C	rs62177111	0.00445406774	0.6035580912152029	0.00445406774	0.6166812697158904	0.0064297151989811	0.8235388012211509	2.8845560883474576e-05	0.6849227699887721	2.8845560883474576e-05	0.6980854160132194	0.0271538086494672	0.9453898653754444	0.0001134244121075	0.879152296240882	0.0001134244121075	0.8934192144622981	0.000173977987735	0.9586231889163104	7.406006186374025e-07	0.8984694589468903	7.406006186374025e-07	0.9127685952295146	0.0016286476000787	0.689071207115896	0.0016286476000787	0.7023066250753335	KCNJ3	364054	GALNT13	1189987	NR4A2	1280438	False	False	False	alt	-45	0.00082	-45	0.009415
2230	chr2	155062957	T	C	rs13019836	0.0711309224	0.0084999750004028	0.0711309224	0.0089665111415094	0.0181297098404576	0.0433464937289759	0.0013920930453307	0.0089135837919107	0.0013920930453307	0.0093170598023368	0.176414693098476	0.6874580799948435	0.0122237908680994	0.0882339372382118	0.0122237908680994	0.094885960359218	0.003166205875521	0.3373731149072125	0.0002383379564043	0.040222705854615	0.0002383379564043	0.042950906125274	0.0660484029917322	0.0018546743338923	0.0660484029917322	0.0018482977312276	KCNJ3	365101	GALNT13	1191034	NR4A2	1279391	False	True	True	alt	95	0.01279	-40	0.013245
2231	chr2	155076158	G	T	rs17643843	0.00627147686	0.486253392269168	0.00627147686	0.4988105506873412	0.0185539185429203	0.0367847124548513	0.0001181928397143	0.2834439971267178	0.0001181928397143	0.2932875941933157	0.2322638201641095	0.6063293660614285	0.001463822609616	0.4983438213997014	0.001463822609616	0.5119004963168283	0.0043228881438488	0.210613905011952	2.7623517010025056e-05	0.3337031238525768	2.7623517010025056e-05	0.3451597284703718	0.0057531717133995	0.3282124076202587	0.0057531717133995	0.3375912344981944	KCNJ3	378302	GALNT13	1204235	NR4A2	1266190	False	False	False	alt	75	0.00116	60	0.01073
2232	chr2	155085458	G	A	rs12986694	-0.00472233616	0.6262204910298047	0.00472233616	0.6130435367821582	0.0090602333286153	0.419188004217282	-4.222079879953952e-05	0.6142778241464656	4.222079879953952e-05	0.6016109505181342	0.1556862623056255	0.7318530387393143	-0.0008101735099205	0.686653042817412	0.0008101735099205	0.6725584524182915	0.001431732678108	0.7196458947457294	-7.34956102938622e-06	0.6801212392346341	7.34956102938622e-06	0.6661886112371135	-0.0040373862799406	0.4630466876940882	0.0040373862799406	0.4522173880974193	KCNJ3	387602	GALNT13	1213535	NR4A2	1256890	False	False	False	ref	-95	0.002195	100	0.02626
2233	chr2	155096418	C	T	rs36078004	-0.000648295892	0.8129969498783167	0.0020382342519999	0.811407739973088	0.0079869616597903	0.5773785189736876	-3.390139918650961e-06	0.8288858012009414	1.474059013600222e-05	0.8275458330080888	0.1184763327420408	0.7932610066699911	-0.0001326482929329	0.8331640411906962	0.0002553419708849	0.8314092698657686	0.0009325031309945	0.8117505383102603	-7.819318296166188e-07	0.8455295954392659	1.7948147940733709e-06	0.8440461145048445	-0.0004253156153072	0.6796332709764444	0.0017987738462016	0.6782192937064075	KCNJ3	398562	GALNT13	1224495	NR4A2	1245930	False	False	False	ref	95	0.01356	100	0.012726
2234	chr2	155115610	G	A	rs67625651	0.0182380420999999	0.1849309318660903	0.0182380420999999	0.1940612387800408	0.015232629940071	0.0735631228009659	0.0002770927411801	0.1018493451929537	0.0002770927411801	0.1076312834981049	0.3815018827996141	0.3679886171680711	0.0068791272412443	0.1703869273485559	0.0068791272412443	0.1800264734804716	0.0058150308816471	0.0871306681792218	0.0001046333150204	0.1034063626445034	0.0001046333150204	0.1102260113392906	0.0113175447878089	0.1652749279895706	0.0113175447878089	0.1704782306990834	KCNJ3	417754	NR4A2	1226738	GALNT13	1243687	False	False	False	alt	50	0.003674	-45	0.04193
2235	chr2	155135427	A	C	rs12995353	0.0030832603199999	0.6713245137970119	0.0030832603199999	0.6850180389120457	0.0066681133877475	0.835893756187335	1.9738574956389576e-05	0.74082653356016	1.9738574956389576e-05	0.754607597610295	0.0380979055799333	0.934991693980354	0.0001278910528352	0.8801861269507371	0.0001278910528352	0.8944892779836183	0.0002640417195846	0.948909918294629	8.426819244684783e-07	0.8998137404887269	8.426819244684783e-07	0.9140198205685076	0.0017427566676002	0.6843596496405129	0.0017427566676002	0.6976950039320082	KCNJ3	437571	NR4A2	1206921	GALNT13	1263504	False	False	False	alt	-100	0.003172	-55	0.01381
2236	chr2	155138982	T	C	rs62174916	-0.00250527439	0.7659716398541861	0.00254964421	0.7574722700020158	0.0077138529474938	0.5689606734947573	-1.739581951630732e-05	0.7994169961417072	1.7772422634525465e-05	0.7911519995916992	0.1025653793089139	0.817587757926061	-0.0003067981349631	0.8172320063076347	0.0003084831930063	0.8085828750729736	0.0007765686286322	0.8337146441838782	-2.137214498015796e-06	0.8367228250051204	2.151516970197008e-06	0.8280958762078362	-0.0024543823068703	0.6181509154082955	0.0024709799894189	0.6098084527588904	KCNJ3	441126	NR4A2	1203366	GALNT13	1267059	False	False	False	ref	100	0.002546	50	0.0181
2237	chr2	155156657	T	C	rs67338739	-0.0038444633419999	0.6482353421299033	0.003912014178	0.6379825007487296	0.0257958383031186	0.0083920241924906	-0.0001054911920755	0.3347011397934198	0.0001067278176012	0.3257490349748947	0.1053371922945258	0.8133516173186148	-0.0004246525907156	0.7609152441388981	0.0004303075791949	0.7508758290155635	0.0028516815199618	0.4145951266621208	-1.2086047376746702e-05	0.5523987495023832	1.2189570940194036e-05	0.5418191003564597	-0.0033693295573605	0.5100673964109459	0.0034025249224576	0.5010912085066596	KCNJ3	458801	NR4A2	1185691	GPD2	1278634	False	True	True	ref	-5	4.58e-05	5	0.00271
2238	chr2	155157754	C	G	rs35204416	0.01107725402	0.3257881692748151	0.01107725402	0.337266002513289	0.010607929395267	0.2512102297575861	0.0001206512177586	0.2903208224881244	0.0001206512177586	0.3003286214278705	0.3087583896098507	0.4862558617059367	0.0034414261649537	0.3172078615706364	0.0034414261649537	0.3294056902318349	0.0032894479672831	0.3679021333606751	3.75948465436012e-05	0.2826373709145077	3.75948465436012e-05	0.2936450495228379	0.0084772663616841	0.2330179716331123	0.0084772663616841	0.240438445746895	KCNJ3	459898	NR4A2	1184594	GPD2	1277537	False	False	False	alt	-25	0.000763	90	0.02875
2239	chr2	155198803	G	A	rs72871781	0.0004390301679999	0.7828196633522282	0.002132964792	0.7860708487446428	0.0207460312725246	0.0236386860187842	1.7538428845316463e-05	0.5580785998202655	4.270902561090808e-05	0.5620340561690482	0.0125084285106691	0.9773995026670834	1.0259160741919888e-05	0.958692840214628	2.6692188121907464e-05	0.9661278188194392	0.0002791852660366	0.9422906115875502	3.276985538457048e-07	0.9267730117883926	5.616022571722345e-07	0.9329581903662956	0.0001286320397514	0.9021743204134868	0.0004481374288114	0.9053872126694416	KCNJ3	500947	NR4A2	1143545	GPD2	1236488	False	False	False	alt	5	0.0003815	100	0.04504
2240	chr2	155205181	C	A	rs62176163	0.0143821894	0.2350401246389458	0.0143821894	0.245038041487506	0.0107599379538646	0.2384017015401421	0.0001532139853924	0.2103406142354692	0.0001532139853924	0.2190503357387377	0.3073787072480004	0.4819532433969725	0.0045121392868465	0.2509954500957576	0.0045121392868465	0.2622302407505942	0.0032705593804548	0.3744530973179782	4.751495458553023e-05	0.2231249494494573	4.751495458553023e-05	0.2331820341112118	0.0106142179898131	0.1646643837232056	0.0106142179898131	0.1700564654046421	KCNJ3	507325	NR4A2	1137167	GPD2	1230110	False	False	False	alt	-95	0.00612	-100	0.0376
2241	chr2	155257913	T	G	rs11892879	0.0021276195999999	0.72449863519153	0.0030086021599999	0.7313395205546702	0.009895632134542	0.3188200533064381	2.014660322386277e-05	0.6830957500713893	2.972107156402501e-05	0.6896712121098219	0.1158933183954189	0.7972724871786977	0.0002614011564777	0.7779048918326562	0.0003482665705163	0.7851107849240446	0.0011563139064523	0.7678177348067106	2.5295636694291125e-06	0.757784566271914	3.473612067993849e-06	0.7647882997480867	0.0016493947032645	0.5643720915675793	0.0027033475450989	0.5707055072690167	KCNJ3	560057	NR4A2	1084435	GPD2	1177378	False	False	False	alt	10	0.0005646	-85	0.04446
2242	chr2	155938680	A	G	rs12612835	0.01943246102	0.2162334999084989	0.01943246102	0.2260092952579615	0.0120003768123337	0.1692935067280775	0.0002368773522543	0.1637416003207465	0.0002368773522543	0.1713596780888668	0.2882809987655473	0.505364816690326	0.0063085381608584	0.2323294642330339	0.0063085381608584	0.2438794536016467	0.0035121945449406	0.3249688542408171	7.838442712789874e-05	0.1898721758739733	7.838442712789874e-05	0.1995855257793131	0.0139213062376165	0.1457753077462375	0.0139213062376165	0.1498596064144682	NR4A2	403668	GPD2	496611	KCNJ3	1240824	False	False	False	alt	70	0.00299	-80	0.02692
2243	chr2	155979281	G	T	rs1881046	0.00117711584	0.7795998016275177	0.0021697241999999	0.7872065678314161	0.0237733366998057	0.012620594969684	3.121164499698613e-05	0.5136464641995793	4.984517800929175e-05	0.5209677911068988	0.0151619830081224	0.970878860370958	8.775216523099926e-06	0.9479260036134166	3.463066695591813e-05	0.9554210407741373	0.0003438800407987	0.925053661300986	2.786426058658796e-07	0.9012574174017164	7.640086510935211e-07	0.9088107807871072	0.0001680515358042	0.8683387184334355	0.0005912924407929	0.8754669254867511	NR4A2	363067	GPD2	456010	GALNT5	1278425	False	True	False	alt	100	0.00428	-100	0.01526
2244	chr2	155981422	T	C	rs2103263	0.0407549324	0.0450005925135554	0.0407549324	0.0483303540364029	0.0129208191329336	0.1340088011520084	0.0005505145187791	0.0353580529846298	0.0005505145187791	0.0377062363898965	0.2847851118787539	0.5216106462421806	0.0114866724763267	0.0955117409037083	0.0114866724763267	0.1029108910175044	0.0036190686511805	0.3117865362413863	0.000152280505005	0.0686426746214609	0.000152280505005	0.073843073126175	0.0336580254981897	0.0154202747890016	0.0336580254981897	0.0158549783418051	NR4A2	360926	GPD2	453869	GALNT5	1276284	False	False	False	alt	60	0.003983	65	0.02051
2245	chr2	155988494	A	T	rs35377330	0.0014773805	0.8356308761381112	0.0014773805	0.8495642255219589	0.0150119896592256	0.0812294158892129	2.2971046185842623e-05	0.7180354253162382	2.2971046185842623e-05	0.7314156481871732	0.2951130198446041	0.5008154741969211	0.0004622280019573	0.7259685524649176	0.0004622280019573	0.7399441537554213	0.0045074688713188	0.1796325589919623	7.201557295506637e-06	0.6267879147992996	7.201557295506637e-06	0.6403704577680043	0.0011203435720287	0.7736048712053807	0.0011203435720287	0.787263090709507	NR4A2	353854	GPD2	446797	GALNT5	1269212	False	False	False	alt	-90	0.001648	45	0.03772
2246	chr2	155999745	G	A	rs13026547	-0.0097762793	0.3807146761607984	0.0097762793	0.3690304000725644	0.0081721545841719	0.5507001011854966	-7.981367986760579e-05	0.4098442707402421	7.981367986760579e-05	0.3988043890329845	0.0716563449828317	0.8707223755163895	-0.000791712119987	0.6749101136745611	0.000791712119987	0.6607591597490752	0.0005828978141116	0.8761285962613313	-6.44371968354662e-06	0.6829074110644384	6.44371968354662e-06	0.6691005095090422	-0.0075706179524683	0.2851900360693329	0.0075706179524683	0.277254207227681	NR4A2	342603	GPD2	435546	GALNT5	1257961	False	False	False	ref	-85	0.0003357	45	0.02426
2247	chr2	161949898	G	A	rs7604885	-0.0422078541999999	0.0489544849334491	0.0422078541999999	0.0459254161159974	0.0101445782099784	0.2929895049270111	-0.0004516747217844	0.0599021295355945	0.0004516747217844	0.056729288947451	0.1514372555731905	0.7313771701484896	-0.0068801607358228	0.2151629423553948	0.0068801607358228	0.2044612967359382	0.0015639308759892	0.6797584291126613	-7.398581075393133e-05	0.1948813750567778	7.398581075393133e-05	0.1857444663707195	-0.0384153362586748	0.0142243075518005	0.0384153362586748	0.013816136106804	DPP4	124496	GCG	202506	FAP	295253	False	False	False	ref	-80	0.02878	-100	0.02841
2248	chr2	161966199	G	A	rs13021985	-0.0498109772	0.0297032881731776	0.0498109772	0.0276826691241693	0.0115241086739591	0.1895618885505738	-0.0005894564471604	0.03546482492549	0.0005894564471604	0.0334076639251075	0.0803410823763731	0.8569941211391663	-0.0039325952515956	0.3102480653256044	0.0039325952515956	0.298462667567063	0.000869332832964	0.821241698374456	-4.40022260921117e-05	0.2673867630207027	4.40022260921117e-05	0.2569218843689998	-0.0341601053952841	0.0195242392256938	0.0341601053952841	0.0189998001609669	DPP4	108195	GCG	186205	FAP	278952	False	False	False	ref	100	0.02744	-85	0.03015
2249	chr2	161975246	G	T	rs4295021	0.00417512134	0.5716944102461572	0.00485919202	0.5804127395916963	0.0216583370195877	0.019340678800238	9.795629802679032e-05	0.3217101385714543	0.0001086607685685	0.3293397127875176	0.2539071982074502	0.5727520764951456	0.0011393454177438	0.5418307102083539	0.0012835197765178	0.5509840548981187	0.0055504832037007	0.1067581334793476	2.6491638730994143e-05	0.3437863236510461	2.8747707030420773e-05	0.3522777894259439	0.003773898069482	0.4287912490191678	0.0043216215935849	0.4360052652248173	DPP4	99148	GCG	177158	FAP	269905	False	True	False	alt	90	0.01144	-60	0.01917
2250	chr2	161986568	T	C	rs2909455	0.0238529848	0.1411805412984595	0.0238529848	0.148954300996366	0.0084276277746963	0.5148114026614472	0.0002025946084303	0.1649263308969434	0.0002025946084303	0.1726257316275244	0.1685536157014076	0.7109772056433273	0.0042055395925219	0.2751328314370069	0.0042055395925219	0.2866891997720101	0.001419763311748	0.7185796630473708	3.5687423283733895e-05	0.2914556324683883	3.5687423283733895e-05	0.3024229133475432	0.0232989968775609	0.0534005400306223	0.0232989968775609	0.0549140902904465	DPP4	87826	GCG	165836	FAP	258583	False	False	False	alt	-50	0.0003357	-60	0.04437
2251	chr2	168583520	C	T	rs975341	-8.550133199999987e-05	0.7101152216418175	0.003428946668	0.7150057578135667	0.0081859244173644	0.5109340782917698	-7.11419502810096e-06	0.6965649049259678	3.1872055530697034e-05	0.7008136811384069	0.2751958007863152	0.5389330979123291	-6.862058599522e-05	0.6336084915834207	0.0009833550803169	0.6387748766352468	0.0022868438694342	0.5381872724217114	-2.406504712279638e-06	0.631301766658645	9.263204100821292e-06	0.6357525699664451	0.0005000051867757	0.5958195532647456	0.0024668305687817	0.601153516056027	CERS6	127270	NOSTRIN	203020	G6PC2	317772	False	False	False	ref	-100	0.003454	-100	0.03177
2252	chr2	168629017	T	A	rs6722396	-0.01177477018	0.3318825145870411	0.01177477018	0.3207884482365069	0.0162731702982737	0.0589135304635232	-0.0001957605043744	0.1909370075754411	0.0001957605043744	0.1831727864718577	0.0882892976068216	0.8441380133528076	-0.0011862011346749	0.6020992397911603	0.0011862011346749	0.5882091370704041	0.0014667186875974	0.7038318535581204	-2.006510872300513e-05	0.4666240789837959	2.006510872300513e-05	0.4538398778144288	-0.0096619259535886	0.227289223983724	0.0096619259535886	0.2208663074442563	NOSTRIN	157523	CERS6	172767	G6PC2	272275	False	False	False	ref	100	0.00669	-65	0.03546
2253	chr2	168633437	T	C	rs10189241	0.0487655314	0.0270292588941697	0.0487655314	0.0290001608801986	0.0103886654270184	0.2727248309636108	0.0005272063469338	0.0386133133946857	0.0005272063469338	0.0409928036899269	0.3963858546250479	0.3415789799262105	0.0195468903807742	0.0400192974253242	0.0195468903807742	0.043703676865756	0.0041471365775717	0.2255385844477366	0.0002132351173111	0.0448572156811735	0.0002132351173111	0.0482449186212643	0.0277036068838887	0.0300333774965198	0.0277036068838887	0.0308350766685896	NOSTRIN	153103	CERS6	177187	G6PC2	267855	False	False	False	alt	100	0.01391	100	0.03186
2254	chr2	168635396	G	T	rs7564698	0.0147498671999999	0.2310742062111342	0.0147498671999999	0.2411307796768129	0.0124802693198628	0.1464252601957109	0.0001832832118472	0.1731724002410228	0.0001832832118472	0.1811728337679816	0.2190230189109845	0.6239931038915701	0.0032454103417657	0.3154163392025269	0.0032454103417657	0.3276728549546606	0.0027002263675006	0.4725265186220957	3.984572540024387e-05	0.2504512614581557	3.984572540024387e-05	0.2607938456644543	0.0136723409993879	0.121809981764995	0.0136723409993879	0.1257201409280317	NOSTRIN	151144	CERS6	179146	G6PC2	265896	False	False	False	alt	35	0.0001595	55	0.05334
2255	chr2	168635458	A	G	rs4668081	0.0416200863999999	0.0413451313236225	0.0416200863999999	0.044397889534108	0.0089721300631957	0.4131469509461675	0.0003747353398705	0.0616870048114746	0.0003747353398705	0.0656312549500624	0.2590794510316497	0.5613461735477585	0.0108945228949861	0.1017639804808328	0.0108945228949861	0.1092173763238963	0.0023320513909496	0.5345765831342629	9.834038320345952e-05	0.1107311703142469	9.834038320345952e-05	0.1180095564645206	0.0366539071982074	0.011988158316081	0.0366539071982074	0.0123712276789605	NOSTRIN	151082	CERS6	179208	G6PC2	265834	False	False	False	alt	-25	0.002958	-15	0.01318
2256	chr2	168637414	G	A	rs4277491	-0.0578271498	0.016455378166089	0.0578271498	0.0154852873345574	0.0150152936784047	0.0793244817997834	-0.0008805787607415	0.0162437089007439	0.0008805787607415	0.0154428087209832	0.0813161962261019	0.8531454091502909	-0.0047266326918657	0.2631711326165836	0.0047266326918657	0.2520931948195025	0.0011952886053347	0.7525732985661763	-7.024003875543502e-05	0.1769259326659216	7.024003875543502e-05	0.1681028264796039	-0.0406000062241309	0.008953941195285	0.0406000062241309	0.008680194384102	NOSTRIN	149126	CERS6	181164	G6PC2	263878	False	True	False	ref	-100	0.004723	-50	0.02359
2257	chr2	168638121	C	T	rs75696288	0.00448080434	0.6170887735717207	0.00448080434	0.6304099780572878	0.0122119505246693	0.1584295364841924	5.610061615731036e-05	0.511671795618211	5.610061615731036e-05	0.5239637977031606	0.0492971918795837	0.9130435475002436	0.0002139788353692	0.8374998699964088	0.0002139788353692	0.8517141937155099	0.0006215595075646	0.8757618369653901	2.7892582398299745e-06	0.7968862505048266	2.7892582398299745e-06	0.8109800844452267	0.0025664166640732	0.5862346367655986	0.0025664166640732	0.5987240456454745	NOSTRIN	148419	CERS6	181871	G6PC2	263171	False	False	False	alt	-100	0.01239	0	0.0
2258	chr2	172047370	G	A	rs1008151	-0.0300421516	0.108082688484213	0.0300421516	0.1020780800050928	0.0078506514096723	0.6130322934235621	-0.0002470226044529	0.1502385583958395	0.0002470226044529	0.1433921863528599	0.229863380325522	0.6102735506747267	-0.0071346876782677	0.1959181595326525	0.0071346876782677	0.185998440539744	0.0018351859421376	0.6429040276133903	-5.950012554320253e-05	0.2251065794850882	5.950012554320253e-05	0.2154119117936153	-0.0269878318239815	0.0343744553309305	0.0269878318239815	0.0335164420042339	DLX1	37371	METAP1D	47426	SLC25A12	47511	False	False	False	ref	-25	0.0005417	-50	0.01965
2259	chr2	172107630	G	T	rs1001780	0.0070457497199999	0.4562327629101608	0.0070457497199999	0.4690455618046841	0.0199523064451404	0.027260413481639	0.0001339171759975	0.2512618176179152	0.0001339171759975	0.2605565696439435	0.6095000985487402	0.0410943568583683	0.004289953130204	0.2691125716118068	0.004289953130204	0.2807908800195626	0.0121717648363744	0.0063624921672905	8.158001659063692e-05	0.1396347010985808	8.158001659063692e-05	0.1478309834001762	0.0008444070996586	0.8174035472844964	0.0008444070996586	0.8312009787972705	DLX2	4730	DLX1	22889	METAP1D	107686	False	False	False	alt	-30	0.006958	100	0.04578
2260	chr2	172110061	C	T	rs62184960	-0.0664211134	0.0101029492576022	0.0664211134	0.0095513374465651	0.012620026040509	0.1500946702035555	-0.0008736475630887	0.0164871368699167	0.0008736475630887	0.0157037042930331	0.6256040000414942	0.0304008682319206	-0.0416030171325543	0.0055545019523118	0.0416030171325543	0.0052094381842387	0.0079028714125816	0.0329507625771278	-0.0005477283608606	0.0108906072707992	0.0005477283608606	0.0102816201452608	-0.0068133486861896	0.2847185003334746	0.0068133486861896	0.2765836225290188	DLX2	7161	DLX1	25320	METAP1D	110117	False	True	True	ref	90	0.001547	45	0.07263
2261	chr2	184751506	A	G	rs145078188	0.0007881022	0.4853172722846489	0.0072171734	0.4877966829671418	0.0128380282438222	0.1326270083933325	1.3764344851032091e-05	0.3856093203610792	9.784597691094082e-05	0.3877581533544912	0.0585794458448738	0.8978966410159122	0.0001566536807556	0.753872821046096	0.0005196343619115	0.7574333452734523	0.0007709424940835	0.8467485877855782	2.512756895090984e-06	0.6873574066147549	7.235350058519953e-06	0.6911567989128303	0.0009875621116401	0.4224568958090135	0.0048797186692807	0.4245556426329235	ZNF804A	152976	FSIP2	987299	NUP35	1633992	False	False	False	alt	85	0.003883	70	0.04562
2262	chr2	184787402	A	G	rs11675794	0.0044485401599999	0.6014413069434894	0.0044485401599999	0.6146368837375713	0.0064640630921146	0.8809344413607905	2.8812447595263013e-05	0.6777257877829453	2.8812447595263013e-05	0.6909099601830122	0.0775588958391684	0.8662058515174206	0.0003534883155077	0.77149675598395	0.0003534883155077	0.7854867127516643	0.0005171536639808	0.8976440132985465	2.3620037871647584e-06	0.8057668243441665	2.3620037871647584e-06	0.8198698760464048	0.0034875880455191	0.4864559548070358	0.0034875880455191	0.4980866561707305	ZNF804A	188872	FSIP2	951403	NUP35	1669888	False	False	False	alt	10	0.000787	-95	0.02339
2263	chr2	184937190	A	G	rs728534	-0.0034892458	0.7117523554829046	0.0034892458	0.6982955130180813	0.0222304952356215	0.0167462811809332	-7.979644560642945e-05	0.4420621491800771	7.979644560642945e-05	0.4305821789455371	0.187659623025135	0.6779250106811927	-0.0007500645045509	0.6999653758001712	0.0007500645045509	0.6859452552110086	0.0042321255795455	0.2263044334240712	-1.730047374050755e-05	0.5118020341154557	1.730047374050755e-05	0.4989554088540726	-0.0031016919262647	0.5507414372122305	0.0031016919262647	0.5388086692783178	ZNF804A	338660	FSIP2	801615	ZC3H15	1549064	False	True	False	ref	-50	0.002777	-15	0.01836
2264	chr2	192886081	C	T	rs1445542	0.00322977542	0.692151681092326	0.00322977542	0.7056663022687237	0.0265797035271022	0.0069788343269567	8.477499910829841e-05	0.3772058517095468	8.477499910829841e-05	0.3882131063387174	0.1154597039388375	0.795266949410862	0.0004199477236462	0.7505629310748314	0.0004199477236462	0.7643859230797391	0.0030835107519264	0.3750707140018193	1.1170896865486354e-05	0.5560909293738937	1.1170896865486354e-05	0.5692392890286393	0.0029149679975932	0.5434527962225806	0.0029149679975932	0.5556494617590193	TMEFF2	691148	CAVIN2	1038993	NABP1	1208012	False	True	True	alt	-75	0.004963	-65	0.0495
2265	chr2	192982358	T	G	rs11680198	0.00083993158	0.8795426171742808	0.001256018964	0.8806698505216012	0.0160654954351298	0.0644593122949205	1.4760726781888804e-05	0.7746361517407454	2.109171616922004e-05	0.7765336409536848	0.0137740018049979	0.9740906282034548	1.348004413198817e-05	0.9711051320772834	1.895115244331765e-05	0.9760533935674628	0.0002309616764954	0.9526665083596378	2.530328399870816e-07	0.9562396898663678	3.356029579807091e-07	0.9598311632017336	0.00017427566676	0.9343110798182042	0.0002946088652371	0.9368714889082118	TMEFF2	787425	CAVIN2	1135270	NABP1	1304289	False	False	False	alt	100	0.01056	100	0.00931
2266	chr2	192986694	G	A	rs968109	0.0101252664	0.337538712486381	0.0101252664	0.3489800946023134	0.0225172306494984	0.01540691577806	0.0002273927648563	0.1375580211892113	0.0002273927648563	0.1446131899380234	0.1083807923318706	0.8128679338068256	0.0011479634269196	0.5689493962979357	0.0011479634269196	0.5825345302895261	0.0024390919933407	0.516288298124996	2.5782323008188872e-05	0.3668611047389137	2.5782323008188872e-05	0.3786277124853541	0.0086598408697185	0.2193250481854738	0.0086598408697185	0.2264753497105459	TMEFF2	791761	CAVIN2	1139606	NABP1	1308625	False	True	False	alt	100	0.03705	100	0.01316
2267	chr2	193005369	G	A	rs4471907	0.0039327764	0.3668017381352326	0.0104168403999999	0.3711688974732465	0.0110973042016069	0.2219941560979179	5.652605146992287e-05	0.307090862837483	0.0001231603677292	0.3111452860726777	0.0804323696303903	0.8565292448597748	0.0004841256738282	0.6272033746239865	0.0009183741805939	0.6317050873982667	0.0009161165804854	0.8132630612670656	6.606375317311735e-06	0.5756098555503031	1.1155727215430824e-05	0.5802009428765791	0.0048361497525907	0.2509373595233033	0.0089689727071857	0.2523053991797818	TMEFF2	810436	CAVIN2	1158281	NABP1	1327300	False	False	False	alt	-100	0.01036	5	0.002258
2268	chr2	193015267	G	A	rs10175759	0.0087179756599999	0.3812993072945141	0.0087179756599999	0.393021439169526	0.0188094080848782	0.033800860789189	0.0001654071739549	0.2041374233072651	0.0001654071739549	0.2128533252989802	0.1061504787394059	0.8163172334506067	0.0009762524435018	0.605027165475473	0.0009762524435018	0.618646746946954	0.0020280658518151	0.5905505172074836	1.880844134513752e-05	0.4429421976796385	1.880844134513752e-05	0.4553848619338639	0.0073278768451954	0.2642862504545906	0.0073278768451954	0.2722478975930407	TMEFF2	820334	CAVIN2	1168179	NABP1	1337198	False	False	False	alt	-40	0.003426	0	0.0
2269	chr2	193017382	G	A	rs6712343	0.0025632813	0.7452746241209331	0.0025632813	0.7587361957651839	0.0238204969252194	0.0121577847447291	6.457684366582626e-05	0.4907431758740201	6.457684366582626e-05	0.5030602059404129	0.0295625473293291	0.946480410440067	8.712909951391803e-05	0.9078430622417086	8.712909951391803e-05	0.9220408332710832	0.0007288557758296	0.8493395758700069	2.2869215851022584e-06	0.8220090419182159	2.2869215851022584e-06	0.8359226988641514	0.0012344526395501	0.7601081110832208	0.0012344526395501	0.7738209664025801	TMEFF2	822449	CAVIN2	1170294	NABP1	1339313	False	True	False	alt	70	0.001616	-70	0.02597
2270	chr2	193030136	A	G	rs6714301	6.458891999999994e-05	0.773449500754746	0.00253526072	0.7720808553061975	0.010445330101191	0.2884246767296206	-2.4976425540794496e-06	0.7238406570706141	2.7027938206274105e-05	0.7222163496705333	0.0031660079461404	0.9938265199631788	-7.495425717395854e-07	0.9836331240850562	8.433399753320778e-06	0.9867334855719064	3.5163319861491286e-05	0.9925339718202584	-1.6401519891618967e-08	0.981065048875236	9.553061488556101e-08	0.9840707196123452	1.4522972229996396e-05	0.960714270328707	0.0001639021151671	0.9624119371470866	TMEFF2	835203	CAVIN2	1183048	NABP1	1352067	False	False	False	alt	-5	0.00029	0	0.0
2271	chr2	193031520	T	C	rs7557329	-0.00045211292	0.8374645384819118	0.00167514892	0.8355239750238737	0.0231585238990063	0.0138753967338225	-1.17379766427515e-05	0.5989855099274142	3.853220279167789e-05	0.5970668405988804	0.0889718773016317	0.8447254441721981	-5.796398120738507e-05	0.881504518405318	0.0001476541622041	0.8792038715124106	0.0020746319958171	0.5560955190229727	-1.661862750175166e-06	0.7705682769312759	3.404613152994521e-06	0.7683048771933969	-0.0003527007541572	0.7534080602801195	0.001331964024523	0.7512082728281577	TMEFF2	836587	CAVIN2	1184432	NABP1	1353451	False	True	False	ref	-90	0.01355	-20	0.00644
2272	chr2	193105038	G	T	rs1902746	0.00269750542	0.7275877940776896	0.00269750542	0.7412376417938144	0.0212402156963813	0.0201327516622465	5.717708551493916e-05	0.4755758291023265	5.717708551493916e-05	0.4873579356713711	0.0473407400491706	0.9124942431515528	0.0001511764272393	0.8604280692171943	0.0001511764272393	0.8747593577984192	0.0010344016114466	0.779037532553871	3.2671894697817115e-06	0.7592873122754704	3.2671894697817115e-06	0.7733755009258866	0.0016556188342202	0.6910354125862809	0.0016556188342202	0.704499664645984	TMEFF2	910105	CAVIN2	1257950	NABP1	1426969	False	False	False	alt	5	0.0008698	100	0.03873
2273	chr2	193108463	A	G	rs1037708	0.00075309827	0.8548711868865762	0.00135693559	0.8614518356110644	0.0227278705993729	0.0151717270340935	1.5068685441378797e-05	0.6528002164802746	3.054604019778179e-05	0.6583706678700059	0.1315490824593615	0.7713426980829607	0.0001264735263722	0.8437824025142459	0.0001891316955254	0.850692318686933	0.003004495629846	0.4034607438477313	2.7104696453870827e-06	0.7201359003540866	4.3165026916666e-06	0.7264856599648607	0.0006556084606686	0.7363154692182681	0.0013734582308944	0.7427479552509821	TMEFF2	913530	CAVIN2	1261375	NABP1	1430394	False	True	False	alt	-50	0.000885	100	0.03053
2274	chr2	193124314	C	A	rs12617537	0.00686028842	0.4550950324444763	0.00686028842	0.4677020499944233	0.0396078741943762	0.0011957849094409	0.0002750270769878	0.1000543491578531	0.0002750270769878	0.1055634053693905	0.0301600639010777	0.9458893333960818	0.0001951359812653	0.8308792655853058	0.0001951359812653	0.845155296209207	0.0012207529762196	0.752400771957661	8.016154291297855e-06	0.5987860054006229	8.016154291297855e-06	0.6122722504609219	0.0029128932872747	0.5358184027630869	0.0029128932872747	0.547897459724417	TMEFF2	929381	CAVIN2	1277226	NABP1	1446245	False	True	False	alt	30	0.013664	35	0.01466
2275	chr2	197126458	G	A	rs62279220	-0.01407702624	0.2620263171368876	0.01407702624	0.2519099152067399	0.0130158778575537	0.1361184685162773	-0.0001801096201732	0.191544573793988	0.0001801096201732	0.1838893109525562	0.276679218664094	0.5322185367754214	-0.00388864109053	0.3061002079933014	0.00388864109053	0.2944394674811358	0.003669248388531	0.2919128676756951	-5.0952015574304266e-05	0.2338509708570667	5.0952015574304266e-05	0.2242335011613419	-0.0119503314349733	0.1510029879913891	0.0119503314349733	0.1466800056308648	ANKRD44	184715	PGAP1	198662	SF3B1	308621	False	False	False	ref	-65	0.003521	45	0.06903
2276	chr2	197135526	C	A	rs10191006	-0.0020384842599999	0.7543748208889122	0.0028182081399999	0.7451406089802614	0.0089692338176913	0.4196827939614761	-1.8613023427295e-05	0.7324838260336389	2.5388160342031727e-05	0.7233984506363601	0.1558667621033412	0.7280354567574361	-0.0003384102107809	0.7591491427652405	0.0004606922442331	0.7494152874440302	0.0013825093936841	0.7192910460649173	-3.022900791485721e-06	0.7510283227082789	4.085427579906657e-06	0.7412942118819197	-0.0018568657351217	0.5994282161606574	0.0025166236164274	0.5909858431407595	ANKRD44	175647	PGAP1	207730	SF3B1	299553	False	False	False	ref	60	0.001234	100	0.06232
2277	chr2	197140324	T	C	rs2697260	0.00224549608	0.7705106992729811	0.00224549608	0.7843720226465005	0.0216780333707281	0.0193466150071401	4.729357908716469e-05	0.5318974625462087	4.729357908716469e-05	0.5441466166264525	0.0183591116090415	0.965720944024298	4.4859969152787846e-05	0.9339595258783642	4.4859969152787846e-05	0.9480353815136828	0.0003998699637131	0.9157132994494962	9.333695152645188e-07	0.8839321284186428	9.333695152645188e-07	0.8983394046418026	0.0007323727424558	0.8376596405491659	0.0007323727424558	0.8514607991506893	ANKRD44	170849	PGAP1	212528	SF3B1	294755	False	True	False	alt	100	0.01656	5	0.006226
2278	chr2	197166561	C	A	rs7595352	-0.00645237822	0.5175538206675961	0.00645237822	0.5049235800995404	0.012310351684601	0.1648581582520175	-7.37441535908917e-05	0.4346822632958696	7.37441535908917e-05	0.4234717927464782	0.1974232097843338	0.6624498564398282	-0.0012809655838787	0.5675176064766829	0.0012809655838787	0.5537897958510586	0.0024387268459633	0.519334916048854	-1.466326406738427e-05	0.501700072234113	1.466326406738427e-05	0.4888937729276741	-0.0060208093444952	0.3448941833518118	0.0060208093444952	0.3357085293908525	ANKRD44	144612	PGAP1	238765	SF3B1	268518	False	False	False	ref	70	0.002537	-75	0.03323
2279	chr2	197368952	T	G	rs788007	-0.0037908508799999	0.6526102521544072	0.0037908508799999	0.639119702267546	0.0201697911214779	0.0261746012791255	-8.364599749420233e-05	0.4234631036959084	8.364599749420233e-05	0.4119510964768926	0.4459693565285946	0.2612071894969706	-0.0017290944639867	0.4981907951795257	0.0017290944639867	0.4846355807082411	0.0090422245896375	0.0193401861444919	-3.838328818474075e-05	0.3172668186189432	3.838328818474075e-05	0.305607715285293	-0.001564331580203	0.7288946187616739	0.001564331580203	0.7156117480190517	ANKRD44	57779	SF3B1	66127	COQ10B	84542	False	False	False	ref	40	0.001537	100	0.04175
2280	chr2	197381241	C	T	rs55775495	-0.0276893728	0.1188816808497076	0.0276893728	0.1123173142474924	0.01429385576159	0.092861172483242	-0.0003995836394877	0.0667024736048804	0.0003995836394877	0.0628801865530656	0.3620348758804551	0.3993505434474563	-0.0099994539881151	0.1307217530881668	0.0099994539881151	0.1225764502791156	0.0051526650071086	0.1307748661554739	-0.000143753974072	0.0832759407912786	0.000143753974072	0.0778374699806722	-0.0175126297990642	0.0887800825256247	0.0175126297990642	0.0863701370198714	SF3B1	53838	ANKRD44	70068	COQ10B	72253	False	False	False	ref	-55	0.001114	100	0.05624
2281	chr2	197418581	T	C	rs788023	-0.0017213663599999	0.7401514018631639	0.00279910336	0.7315739378017834	0.0095991204137271	0.3449093138832234	-1.7672008683738874e-05	0.7041238408038524	2.747154187382905e-05	0.695732448927407	0.114696210541603	0.7937290257884618	-0.0001747299587061	0.788861184343262	0.0003204942830357	0.7803234907644632	0.0010998122112491	0.7717260147037884	-1.7937932835826024e-06	0.7729691050240874	3.1191837309149995e-06	0.7644287064565037	-0.0015311362151059	0.5914372634379622	0.0025601925331175	0.5841238756041384	SF3B1	16498	COQ10B	34913	HSPE1	81560	False	False	False	ref	45	0.00731	-100	0.03308
2282	chr2	197500319	C	G	rs1116734	-0.00285197918	0.4354737166852936	0.00774277538	0.4314057497097462	0.0095864398297931	0.3490578798188141	-2.8137326444275933e-05	0.418898975521471	7.330278576291998e-05	0.4153879888352225	0.9729789728109212	0.0004698244298065	-0.002796418659695	0.1709758075612281	0.0075385351084152	0.1678919485816789	0.0093305940840891	0.0165044539795138	-2.7582951076418106e-05	0.1675663289085347	7.139533733834476e-05	0.1645789856390939	-0.0001784250873971	0.8754694322070813	0.00060996483366	0.8721426643056874	HSPE1-MOB4	95	HSPE1	178	MOB4	15253	True	False	False	ref	-100	0.01938	-100	0.1318
2283	chr2	197545160	A	G	rs11680291	0.003102259108	0.6832223014420437	0.003130877732	0.6953601164623144	0.0065548264714507	0.8672979482072202	2.0608119979299848e-05	0.7403025856442819	2.078682069674773e-05	0.7525771484919521	0.0966649031628958	0.8218620362334974	0.000365220508606	0.7617607966052682	0.0003671611920031	0.7744137368381533	0.0006362749288439	0.8616815266227917	2.4207958603320822e-06	0.7932508843675518	2.432913896722054e-06	0.8062348651640489	0.0028299048745318	0.5500102130891873	0.0028548013983547	0.5592717647869941	HSPD1	28423	MOB4	29588	HSPE1-MOB4	44746	False	False	False	alt	95	0.00836	-75	0.03986
2284	chr2	197613596	G	A	rs1455653	-0.0196168374	0.1987467173951441	0.0196168374	0.1899496955382254	0.0081096252935428	0.5637847822341682	-0.000164254385	0.231349486521818	0.000164254385	0.2227729973804245	0.0870133507608999	0.849822285059929	-0.0018501043794565	0.4980396613172922	0.0018501043794565	0.4849356462454264	0.0007196480872046	0.8579684829385404	-1.5841976318392224e-05	0.5150643826705442	1.5841976318392224e-05	0.5022866412720808	-0.0154711148455896	0.1173033531960629	0.0154711148455896	0.1138005267124944	RFTN2	62449	MARS2	91774	HSPD1	96859	False	False	False	ref	65	0.003601	-30	0.01883
2285	chr2	197624529	C	T	rs34139878	-0.0659664802	0.0115568831844973	0.0659664802	0.0108831308880702	0.0152083816874139	0.0777485019666338	-0.0010278564933884	0.0128665646805686	0.0010278564933884	0.0122161606543856	0.2594757207024968	0.5535914838513959	-0.0175443122610241	0.0577747899610002	0.0175443122610241	0.0535756453367982	0.0040389611495286	0.2196166148129915	-0.0002785483986049	0.0350338351956321	0.0002785483986049	0.0328103522791688	-0.0592122324920382	0.0025636661379874	0.0592122324920382	0.002498385246212	RFTN2	51516	MARS2	80841	HSPD1	107792	False	True	False	ref	35	0.004456	35	0.03918
2286	chr2	199144171	A	G	rs1376584	-7.4829804e-05	0.8877987807198271	0.001306629724	0.8810323582538426	0.0209850307440296	0.0223022338539092	-6.417017844828819e-06	0.7354156474081202	2.615660836356285e-05	0.7291502911003642	0.3365864791128539	0.4410811465452321	-2.4358763046427428e-05	0.7829653462481084	0.0004181299280831	0.7767995102354366	0.0069954723804762	0.0484953217544024	-2.0140648640965693e-06	0.6396573723880032	8.324246727241496e-06	0.6335359400346207	-0.0001950227699457	0.8272379760821383	0.0009253208020829	0.8207757881004711	SATB2	327095	FTCDNL1	707021	C2ORF69	767123	False	False	False	ref	100	0.002682	100	0.06573
2287	chr2	199146723	G	T	rs6733580	-0.0086355454	0.4041114213261291	0.0086355454	0.3921119997944872	0.0075456762356661	0.6765958434824231	-6.50935570664674e-05	0.4543993945636901	6.50935570664674e-05	0.4428741322849684	0.2562827415222149	0.5674486747216734	-0.0022161594020115	0.4327313374937317	0.0022161594020115	0.4197128669081638	0.0019283826210442	0.6236860898046245	-1.664720754363867e-05	0.4660065156119783	1.664720754363867e-05	0.4533544114255942	-0.0076432328136183	0.2631426819847377	0.0076432328136183	0.2556229337952592	SATB2	324543	FTCDNL1	704469	C2ORF69	764571	False	False	False	ref	65	0.003716	-20	0.003174
2288	chr2	199149294	G	T	rs2345458	-0.0224733001999999	0.1590797128864853	0.0224733001999999	0.1511165089307482	0.0089788621858889	0.4230569457162362	-0.0002070901188855	0.1689512872953224	0.0002070901188855	0.1615729875705901	0.1104409796782123	0.8067130867376483	-0.0025347698889753	0.4108578462012546	0.0025347698889753	0.3980188955151363	0.0010338488036763	0.7900432762859138	-2.430882479140875e-05	0.4026949530484037	2.430882479140875e-05	0.3905535081443125	-0.018850817954543	0.0712922668027304	0.018850817954543	0.0693861171515213	SATB2	321972	FTCDNL1	701898	C2ORF69	762000	False	False	False	ref	-95	0.002983	100	0.04962
2289	chr2	199150705	G	T	rs921465	0.000510001728	0.8894596697108883	0.001048868528	0.8978848955833153	0.0081309889504529	0.5549819781506343	4.64400603296387e-06	0.8939446896706879	8.448875523086269e-06	0.9023711331012148	0.1083724934905963	0.8031573018377761	5.15945561875617e-05	0.9140883337332664	8.098098826809117e-05	0.9226867591002618	0.0009085336465998	0.8079990060875106	4.978844541885583e-07	0.9147757131092789	7.053782965476435e-07	0.9235503952335526	0.0004398385875372	0.8381066298067423	0.0007759416591458	0.846514749609967	SATB2	320561	FTCDNL1	700487	C2ORF69	760589	False	False	False	alt	-90	0.002714	-45	0.02637
2290	chr2	199150838	C	A	rs1868915	0.0566591158	0.0190877007550238	0.0566591158	0.0202077636789612	0.0213147059033504	0.0243972617841618	0.0014143252492602	0.0107802191662945	0.0014143252492602	0.0113877792779327	0.193439765972676	0.6628668228744903	0.0105769478661399	0.1088339697762865	0.0105769478661399	0.1164091814401493	0.0041396836382383	0.2063077302577716	0.0002671501776543	0.0433793970559915	0.0002671501776543	0.0461944172427668	0.0520026141350013	0.0046922265535358	0.0520026141350013	0.0047240959137098	SATB2	320428	FTCDNL1	700354	C2ORF69	760456	False	False	False	alt	70	0.0116	40	0.01569
2291	chr2	199154272	G	A	rs1376593	-0.0246871236	0.1397119232095351	0.0246871236	0.1324163521134346	0.0072909629551589	0.7126904097258205	-0.0001818280142523	0.1901772009510663	0.0001818280142523	0.1822756617916562	0.3824749219390241	0.3675666365298125	-0.0094896361452424	0.1382185240247543	0.0094896361452424	0.1299383469243418	0.0027932408500769	0.455653006664268	-7.003572100479024e-05	0.1753761222436965	7.003572100479024e-05	0.166689547699949	-0.0145665411466923	0.1174127722510453	0.0145665411466923	0.1139574895074556	SATB2	316994	FTCDNL1	696920	C2ORF69	757022	False	False	False	ref	90	0.00294	-75	0.0139
2292	chr2	199158357	A	C	rs6731445	0.0129131542	0.2715790158014163	0.0129131542	0.2822616003586432	0.009892965549908	0.3141878496569368	0.0001306100024241	0.2571972153740167	0.0001306100024241	0.2667510708093086	0.1498252056556602	0.7423265228894445	0.0019563346533948	0.4478402810497731	0.0019563346533948	0.4611702907270565	0.0014976782574953	0.704890113991157	1.993821499987181e-05	0.4199039123391649	1.993821499987181e-05	0.4324787286443088	0.0119358084627433	0.1362184810750305	0.0119358084627433	0.1405119161894467	SATB2	312909	FTCDNL1	692835	C2ORF69	752937	False	False	False	alt	95	0.005943	15	0.01105
2293	chr2	199161140	A	T	rs6743084	-0.0034932502	0.6513359275470452	0.00418647412	0.6439229012947677	0.0120181083132534	0.1678275942253886	-4.4965081751069815e-05	0.5553505395714501	5.308325272629595e-05	0.5486015604990114	0.1567339910165042	0.7297787682249561	-0.0005696077359283	0.6951054303485219	0.0006710467176746	0.6878838608565715	0.001894745553567	0.6286705780052937	-7.38241949755237e-06	0.6328545824944567	8.570345926006398e-06	0.625552033896203	-0.0031867550493262	0.4677846320854986	0.0040415357005777	0.4612831021804479	SATB2	310126	FTCDNL1	690052	C2ORF69	750154	False	False	False	ref	100	0.005783	-75	0.01549
2294	chr2	199163975	T	C	rs60642146	0.000338647732	0.8894603742516795	0.001148564332	0.8911119818139634	0.0073013425205712	0.733900000925987	2.976958072911325e-06	0.9034139205476888	8.304563686541705e-06	0.9050973772803264	0.0740111411944106	0.8640932358207194	1.863089381381184e-05	0.9279574902087064	7.246327334548985e-05	0.9295701607714936	0.000526454393532	0.8861364072685177	1.6011869575793033e-07	0.9361722483466738	5.131259272356588e-07	0.9378886152722684	0.0001929480596271	0.8424188932911684	0.0007946140520129	0.8439930915320969	SATB2	307291	FTCDNL1	687217	C2ORF69	747319	False	False	False	alt	100	0.002464	80	0.01978
2295	chr2	199163981	G	A	rs896350	0.0013305843499999	0.7728631403134879	0.00253213567	0.7822125698103269	0.0066496696115561	0.8380359995897219	9.34856704964487e-06	0.8084268408018076	1.783872688916791e-05	0.8178196353759989	0.0749717320719094	0.8620834079727682	0.0001680649689548	0.8547600018361918	0.0002146941193333	0.865165549188625	0.0005094456505364	0.8890843655420472	1.211995488256255e-06	0.8717596316269065	1.5414769969820269e-06	0.8821599656041633	0.0009460679052687	0.6940338649115975	0.0017137107231402	0.7030300433495464	SATB2	307285	FTCDNL1	687211	C2ORF69	747313	False	False	False	alt	100	0.002563	75	0.02747
2296	chr2	199167672	C	T	rs2122844	-0.020954691	0.1730633042732809	0.020954691	0.1647796640151655	0.008227472017183	0.5361937474538291	-0.0001717714297063	0.2010937887160084	0.0001717714297063	0.1928430285563598	0.1473417774043299	0.7433769489666261	-0.0031033012393538	0.3511540741150957	0.0031033012393538	0.3389236453292613	0.0012235818782688	0.7524099000562304	-2.568559074864909e-05	0.367661650229773	2.568559074864909e-05	0.355868742255705	-0.0202346497370304	0.0654258633296182	0.0202346497370304	0.063684004648209	SATB2	303594	FTCDNL1	683520	C2ORF69	743622	False	False	False	ref	45	0.002075	-85	0.01163
2297	chr2	199923081	A	G	rs281760	-0.00227374612	0.542395413956399	0.00533036772	0.538009238244408	0.0090474085594703	0.4091142168301625	-2.172878589243585e-05	0.5316222362862971	4.828998309027944e-05	0.5266100756193094	0.2919387130571894	0.5114819263211405	-0.000654650747971	0.4981866216007491	0.0015338824723864	0.49342861246571	0.002647826501226	0.4899589142655017	-6.271187503844045e-06	0.4888912035335655	1.391146838952756e-05	0.4839548605226937	-0.0016929636199545	0.4182261603009017	0.0044730754468407	0.4134628915559669	C2ORF69	11787	MAIP1	32237	TYW5	32655	False	False	False	ref	65	0.002644	-75	0.0521
2298	chr2	199949997	A	T	rs176008	-0.0151750298999999	0.2488844052382052	0.0151750298999999	0.2389345294226698	0.0167405503578944	0.0542248571063887	-0.0002591734937332	0.128071383516333	0.0002591734937332	0.1219435117301889	0.0983454185209389	0.828927539436247	-0.0015408228527752	0.5221959393390682	0.0015408228527752	0.5088638639363572	0.0017218027394899	0.658231326583174	-2.743969083949388e-05	0.3775687929256486	2.743969083949388e-05	0.3657537371297042	-0.0129233705743834	0.1483512512585381	0.0129233705743834	0.14392716301963	MAIP1	5321	TYW5	5739	C2ORF69	38703	False	False	False	ref	100	0.005688	-100	0.03134
2299	chr2	199955782	T	G	rs281766	0.01090304758	0.3233692811425377	0.01090304758	0.3350711852850348	0.0095763978909812	0.3491225005440152	0.000101577460666	0.3161908447391217	0.000101577460666	0.3268385002242772	0.7409661925953588	0.0089118416599884	0.0081333045640453	0.1519836257336483	0.0081333045640453	0.161017495933284	0.0070930500157574	0.0456064587720952	7.577036460950143e-05	0.1551918115591661	7.577036460950143e-05	0.1637681972490124	0.0018962852311745	0.6518464951457085	0.0018962852311745	0.6647128323963573	TYW5	46	MAIP1	464	C2ORF69	44488	True	False	False	alt	-100	0.02151	80	0.1777
2300	chr2	199965270	G	A	rs10178177	-0.001792829	0.7129747192343785	0.00324418692	0.7036140623484736	0.0095422179667532	0.3524580752206724	-1.4377541308919326e-05	0.6928952333387327	2.9911303286796165e-05	0.6840512750616714	0.030081224908972	0.9474415798954892	-3.5502641442740474e-06	0.9215568258389832	0.0001024965628446	0.912030845979652	0.0002992833263357	0.9393707503665176	5.979553268421033e-08	0.9140494890212718	9.992183960765298e-07	0.9044293131740472	-0.0003153559684228	0.7504299754552392	0.0014315501198144	0.7422131727195268	TYW5	9534	MAIP1	9952	C2ORF69	53976	False	False	False	ref	40	0.000281	60	0.01361
2301	chr2	199983267	G	A	rs281793	-0.030763293	0.0990915441424314	0.030763293	0.0933257917485491	0.0080449867419386	0.5771656569140471	-0.0002469208733518	0.1324866863172542	0.0002469208733518	0.1259371154089645	0.4064170790153424	0.327787096961874	-0.0125070426021792	0.0986126739234178	0.0125070426021792	0.0917727258091928	0.0032724601956981	0.3740914638499174	-0.0001004978392677	0.1226087835824796	0.0001004978392677	0.1153485878323331	-0.0166205043620783	0.0955400106963322	0.0166205043620783	0.0927869722647305	TYW5	27531	MAIP1	27949	C2ORF69	71973	False	False	False	ref	95	0.00758	25	0.009155
2302	chr2	200017887	C	T	rs2202922	0.00657181154	0.4624778041494187	0.00657181154	0.475376528090822	0.0077875202308647	0.5977179650851628	5.301481877214657e-05	0.4936250852320666	5.301481877214657e-05	0.5059944907293108	0.2053963215386051	0.6431357399117263	0.0013604341102329	0.518521139076218	0.0013604341102329	0.5325268280086389	0.0016339631510397	0.6616169208706106	1.122045670243458e-05	0.5304808084660925	1.122045670243458e-05	0.5440744495236673	0.0064938432971296	0.3118455551516623	0.0064938432971296	0.3204098442361486	TYW5	62151	MAIP1	62569	C2ORF69	106593	False	False	False	alt	-35	0.001595	100	0.02673
2303	chr2	200019892	A	C	rs3106089	-0.00071943632	0.7423494443508398	0.00264499748	0.7398460194667429	0.0301371196566272	0.0037564439635231	-2.7912747138691508e-05	0.389203578958512	8.067654777297108e-05	0.3866218470520936	0.0140167429122708	0.975524977461328	-1.750264820692437e-05	0.9575980489816986	3.6994410595620016e-05	0.9555057920380976	0.0004323622962592	0.9151402773109436	-6.262697098471e-07	0.8895460618775245	1.1638925824786551e-06	0.8872354083958008	-0.0002946088652371	0.8619005879018568	0.00069710266704	0.8596268148236468	TYW5	64156	MAIP1	64574	C2ORF69	108598	False	True	False	ref	-20	0.001343	65	0.01386
2304	chr2	200043420	G	A	rs1509830	0.00193406958	0.7763996410662882	0.00193406958	0.7904145767504511	0.0154800417109465	0.0713126159703731	2.944388030056504e-05	0.6518642855322594	2.944388030056504e-05	0.6651345654501678	0.2173860724696314	0.6285608937401193	0.0004440213387033	0.7316821389885717	0.0004440213387033	0.7461110498515192	0.003413358056489	0.3393671754695655	6.883995846355208e-06	0.6396176388069232	6.883995846355208e-06	0.6537559181651976	0.0019232564653159	0.6482831776628583	0.0019232564653159	0.6610834689415303	TYW5	87684	MAIP1	88102	C2ORF69	132126	False	False	False	alt	25	0.0009537	-95	0.0828
2305	chr2	200046051	C	A	rs2079196	0.0074274447599999	0.4418158610260787	0.0074274447599999	0.4542821842914133	0.0138774174556988	0.1047236136294118	9.902988829624176e-05	0.324545256391323	9.902988829624176e-05	0.3348839839178016	0.1580950009854873	0.7136883188849039	0.0012915461536148	0.5562410041846105	0.0012915461536148	0.5704513090424816	0.0020941695210953	0.5694739047870957	1.6219583020378254e-05	0.4673090834857538	1.6219583020378254e-05	0.4805339594519949	0.0059959128206723	0.3048323210849945	0.0059959128206723	0.3134073644222214	TYW5	90315	MAIP1	90733	C2ORF69	134757	False	False	False	alt	100	0.02385	95	0.04086
2306	chr2	200048521	A	C	rs3115414	0.0105423338	0.3311638848640789	0.0105423338	0.342517466518561	0.0098094639623698	0.3193798940690627	0.0001069935966083	0.3100088215568726	0.0001069935966083	0.3201097065231508	0.1369848234940196	0.7641694139790305	0.0013944363156554	0.5215893458440801	0.0013944363156554	0.5351619719643388	0.0013327026594077	0.7366524767306015	1.4006558739121572e-05	0.4948589843918786	1.4006558739121572e-05	0.5079917571336883	0.0096536271123144	0.1811059507236905	0.0096536271123144	0.1867668343116679	TYW5	92785	MAIP1	93203	C2ORF69	137227	False	False	False	alt	-100	0.001394	90	0.014404
2307	chr2	200064808	C	T	rs76568708	0.0717725905999999	0.0087866328854016	0.0717725905999999	0.0092474255841915	0.0251109287311802	0.0105687443687232	0.001972536516466	0.0053628126018811	0.001972536516466	0.0056157105921199	0.2142262886544466	0.6280907825279496	0.0158167997395631	0.0605002641621069	0.0158167997395631	0.0651567338772789	0.0055812588611045	0.0957868080943935	0.0004449846295074	0.0188162846754113	0.0004449846295074	0.0200027160087267	0.068544279504974	0.0018139458197271	0.068544279504974	0.0018180241989449	TYW5	109072	MAIP1	109490	C2ORF69	153514	False	True	True	alt	-70	0.003864	-10	0.002441
2308	chr2	200104182	G	A	rs10931887	-0.0075415612999999	0.465673771515364	0.0075415612999999	0.4533140740147764	0.0075411774433415	0.6738321195874208	-5.696780611428809e-05	0.5162028544404336	5.696780611428809e-05	0.5040657033212926	0.0513636033568812	0.9134125110751083	-0.0004034565267262	0.7961542573621844	0.0004034565267262	0.7822257391727238	0.0003892717887803	0.9251797679526363	-3.0937686442380447e-06	0.814105445912312	3.0937686442380447e-06	0.8001729230036447	-0.0043216215935849	0.4460157905801013	0.0043216215935849	0.4352074366519229	TYW5	148446	MAIP1	148864	C2ORF69	192888	False	False	False	ref	30	0.001549	-55	0.01228
2309	chr2	200114365	G	A	rs112403441	-0.0242707161999999	0.1494210408943747	0.0242707161999999	0.1416991884121336	0.0075236046457067	0.6440502647170695	-0.0001838938312165	0.1975424116892032	0.0001838938312165	0.1893081620032909	0.1404101702299816	0.7556233506783501	-0.0036062362898535	0.336592201132907	0.0036062362898535	0.3244756413781224	0.0010917125011557	0.7760843770860024	-2.8224614762684755e-05	0.3737461391839404	2.8224614762684755e-05	0.3618121305761078	-0.0222201475119036	0.0561236597835307	0.0222201475119036	0.0547115554299212	TYW5	158629	MAIP1	159047	SPATS2L	191517	False	False	False	ref	-95	0.015205	-20	0.00241
2310	chr2	200141009	G	A	rs74266489	0.0062522577199999	0.4945045795676508	0.0062522577199999	0.5070181691215351	0.0280266766498955	0.0053871359375423	0.0001748699383026	0.1924528661631724	0.0001748699383026	0.2008191667253799	0.028419381943796	0.9536858808450748	0.0002067795403844	0.8542852431980192	0.0002067795403844	0.8683392712362904	0.0008725059225374	0.8151399800210519	6.41205865429474e-06	0.7063532632290676	6.41205865429474e-06	0.7201532101378422	0.0025021006441975	0.6101560603208631	0.0025021006441975	0.6229145117914022	SPATS2L	164873	TYW5	185273	MAIP1	185691	False	True	False	alt	100	0.00145	75	0.01294
2311	chr2	200144413	C	T	rs11684942	-0.0285682746	0.113571565145802	0.0285682746	0.1073587980796625	0.0073281645398621	0.6805609740954034	-0.0002200267979563	0.1661983079188793	0.0002200267979563	0.1590776801302346	0.2679509123538626	0.5458533690647124	-0.007629815319783	0.1743325306306397	0.007629815319783	0.1650292143918004	0.0019440172644033	0.6146960197772237	-5.821653777128806e-05	0.215062349165584	5.821653777128806e-05	0.205614861910353	-0.024732621707694	0.0470521892960803	0.024732621707694	0.0457309183806574	SPATS2L	161469	TYW5	188677	MAIP1	189095	False	False	False	ref	5	0.0001245	-5	0.003584
2312	chr2	200154353	G	A	rs72932296	0.0373957229	0.0545620343709218	0.0402301359	0.0567858946664504	0.0148902788753689	0.0956450922619223	0.0007222754025179	0.0366984393043328	0.00074329635662	0.038223873831061	0.3470388696978184	0.4214301363763715	0.0129850036473587	0.0815322000544666	0.0140957287174338	0.0861575331472569	0.005198109531905	0.1408275902134111	0.0002584601320697	0.0516923463779842	0.000266697640365	0.0542418385962735	0.0291310075830662	0.0337319280335153	0.0303301901472006	0.034169417035115	SPATS2L	151529	TYW5	198617	MAIP1	199035	False	False	False	alt	-45	0.03038	-15	0.01001
2313	chr2	200159789	T	C	rs1569178	-0.00015306538	0.5857433792296691	0.00460858622	0.590003313852061	0.0133772745780947	0.1198351121692193	-9.846070534374049e-06	0.4759019174961758	6.437656656999451e-05	0.4789550832673328	0.3379412649508811	0.4294630213403486	0.0001100334002015	0.5001738282160945	0.0015806979375396	0.50540047154282	0.0044588851339161	0.1964532778950364	-1.0436031979602526e-06	0.4117755037634077	2.169747393312573e-05	0.4158324155202877	-0.0007572692662787	0.5434928131156009	0.0031224390294504	0.5458009420120145	SPATS2L	146093	TYW5	204053	MAIP1	204471	False	False	False	ref	90	0.003994	85	0.04056
2314	chr2	200176258	C	T	rs11679676	-0.0530337472	0.0247004533431208	0.0530337472	0.0231623663602619	0.0116410886442808	0.1920271934808828	-0.0006582185456223	0.0310794283855457	0.0006582185456223	0.0294091511453975	0.3572215479413687	0.4068882848646343	-0.0190442563953917	0.0511105521862036	0.0190442563953917	0.0472567463333318	0.0041696161839756	0.2336759739245127	-0.0002373645347896	0.0468815052995011	0.0002373645347896	0.0437259206833496	-0.0369256942499403	0.0155728811439614	0.0369256942499403	0.0151640345460189	SPATS2L	129624	TYW5	220522	MAIP1	220940	False	False	False	ref	-35	0.0006104	-80	0.00961
2315	chr2	200184663	A	G	rs55906940	-0.00418409	0.6480534994357334	0.00418409	0.6348470517315663	0.0224816778323469	0.0158483117204961	-9.933740891687492e-05	0.3800068706246616	9.933740891687492e-05	0.3690650092000135	0.3077210344505648	0.4880557043098417	-0.0013239857939298	0.5623815733536569	0.0013239857939298	0.5488737709894752	0.006967612779622	0.0496235897611557	-3.1678648356086054e-05	0.3570764779402418	3.1678648356086054e-05	0.3454980879365891	-0.0032137262834676	0.5461850968716697	0.0032137262834676	0.534087927843139	SPATS2L	121219	TYW5	228927	MAIP1	229345	False	True	False	ref	-65	0.01271	100	0.0638
2316	chr2	200206248	C	T	rs149828043	0.0030541030199999	0.6884770804967891	0.0030541030199999	0.7019946405102114	0.0188003436416333	0.0350898932360657	5.720267703334043e-05	0.4704590523211274	5.720267703334043e-05	0.4824435960019709	0.0532972333737901	0.90714665549207	0.0001385738338071	0.8660353776603329	0.0001385738338071	0.8803126184545688	0.0009848665408171	0.8024917511597255	2.557283024190738e-06	0.784625699395824	2.557283024190738e-06	0.7989871817305407	0.0016161993381673	0.6928767636041213	0.0016161993381673	0.7060327685102978	SPATS2L	99634	TYW5	250512	MAIP1	250930	False	False	False	alt	70	0.002197	-90	0.02692
2317	chr2	200252130	A	G	rs77089299	-0.00591185382	0.5262898214708494	0.00591185382	0.5136033738406537	0.0259066607092854	0.008133574499282	-0.0001505648866605	0.2264256872368547	0.0001505648866605	0.2176541190035277	0.2171122107075798	0.6301624488627772	-0.0012336478105429	0.5573761805317765	0.0012336478105429	0.5435880699576265	0.0056491116438571	0.1032108297607348	-3.143524114361232e-05	0.3178957591279117	3.143524114361232e-05	0.3068074803200118	-0.0057531717133994	0.3384150837578167	0.0057531717133994	0.3294640661132108	SPATS2L	53752	SGO2	257879	KCTD18	267654	False	True	True	ref	-50	0.004883	100	0.02122
2318	chr2	200278008	G	A	rs66621598	0.00092283974	0.7861375338067091	0.0023432320199999	0.7831460611427046	0.0070723919151664	0.7681388788960698	7.748407395081035e-06	0.8156121160041776	1.726755211865997e-05	0.8123210323854523	0.2915860123030321	0.5060006068551551	0.0002064359514764	0.6941450768519796	0.0006450185242083	0.6905428425745204	0.0020280675117609	0.5993535090772264	1.7105137512579308e-06	0.7291440904706742	4.6459688613152586e-06	0.7253304127042397	0.0007261486115001	0.6973876195854593	0.0017925497152459	0.6949174059856178	SPATS2L	27874	SGO2	232001	KCTD18	241776	False	False	False	alt	-100	0.002712	50	0.11334
2319	chr2	200278601	T	C	rs4673871	-7.228154599999904e-06	0.8394015112269565	0.0017418497545999	0.8354572025114462	0.0238791276138992	0.0122339996036588	-4.4010252366760055e-06	0.6562047942684922	3.7755880384905074e-05	0.6492886433867757	0.3093994750982894	0.4827915223863269	-1.2890470105440392e-05	0.7739408387606358	0.0005126070384222	0.7662794555226212	0.0074369279593573	0.0394698130166554	-1.527548160834298e-06	0.619216676694352	1.1136544958741636e-05	0.6118446484349669	-1.6597682548573268e-05	0.7558254204156883	0.0013942053340802	0.7520136665931131	SPATS2L	27281	SGO2	231408	KCTD18	241183	False	True	False	ref	-85	0.0006294	100	0.05615
2320	chr2	200278686	T	C	rs11688415	0.0064696931	0.4679120255687927	0.0064696931	0.4804255801589137	0.0069263022488789	0.7707070274935506	4.675374233915127e-05	0.5366319422119865	4.675374233915127e-05	0.5489030143531816	0.2975425056276517	0.5014105319632868	0.0019467569922562	0.4300208249227875	0.0019467569922562	0.4433846381219692	0.0020761430567392	0.5879957665516303	1.4170339977241409e-05	0.4783018775212371	1.4170339977241409e-05	0.4912875928804763	0.005134908038465	0.3655325504787098	0.005134908038465	0.3753117929394369	SPATS2L	27196	SGO2	231323	KCTD18	241098	False	False	False	alt	-85	0.00724	95	0.03006
2321	chr2	200279387	C	T	rs55826210	-0.0036720490899999	0.6686395307888816	0.003984628862	0.6579310504454865	0.0077024331867284	0.6476850258639602	-2.8396762966881985e-05	0.6986818663196908	3.085523917661124e-05	0.688398543924949	0.0929864417680681	0.8327989969214209	-0.000354660439584	0.796174965809261	0.0003808895268072	0.7854191462268357	0.0007182041884954	0.8480500447648822	-2.75158392812686e-06	0.8093709021592047	2.957878745090728e-06	0.7986935572242062	-0.0030104046722476	0.5435419999398463	0.0032012780215562	0.5345193970162688	SPATS2L	26495	SGO2	230622	KCTD18	240397	False	False	False	ref	65	0.003925	100	0.02249
2322	chr2	200285346	A	C	rs1436162	0.001700110473	0.7239526221369771	0.002702053087	0.7306071389655777	0.0258457418934282	0.0087693930799533	3.490372497521892e-05	0.4501626563528235	6.7307784601895e-05	0.4560179075308308	0.2519880911627713	0.574733190618496	0.0004154377881853	0.674381864413695	0.0007040802898974	0.6807804003053565	0.0065412307492978	0.0633294460521573	8.230961512908571e-06	0.4670375734784127	1.7577191022581533e-05	0.4733491498188402	0.0016224234691231	0.5902590718557705	0.0025311465886575	0.5955209887245729	SPATS2L	20536	SGO2	224663	KCTD18	234438	False	True	True	alt	100	0.002739	95	0.03067
2323	chr2	200308897	A	G	rs3769481	-0.0291769999	0.1174911631882993	0.0291769999	0.1122014339098435	0.0113083486926703	0.2555554608641329	-0.0004509453824128	0.1055783080325983	0.0004509453824128	0.1017370565558324	0.3164078465544248	0.4596653244836052	-0.0103611969957723	0.1545430712290149	0.0103611969957723	0.1464595736042045	0.0038505683776139	0.2670329159283746	-0.0001687793670034	0.1273466246043793	0.0001687793670034	0.121657754636939	-0.0205043620784447	0.0838621501704925	0.0205043620784447	0.0815260079242947	SPATS2L	3015	SGO2	201112	KCTD18	210887	False	False	False	ref	-20	0.000519	100	0.04233
2324	chr2	200311348	C	T	rs17592552	-0.0227594154	0.1646045285949415	0.0227594154	0.1564481694148219	0.0073763095072589	0.7147165526993013	-0.0001695816996083	0.2176194539935536	0.0001695816996083	0.2091240112283371	0.3573730017946244	0.4054636370844784	-0.0082896443398158	0.1647308137951334	0.0082896443398158	0.1553503066770937	0.0026557055597862	0.4876582997612476	-6.215933616980986e-05	0.2031837144739778	6.215933616980986e-05	0.1936938645454236	-0.0145540928847809	0.1192901754253706	0.0145540928847809	0.1157242482307174	SPATS2L	5466	SGO2	198661	KCTD18	208436	False	False	False	ref	-60	0.00236	25	0.03047
2325	chr2	200317342	C	T	rs67067836	-0.0242289542	0.1526097852385374	0.0242289542	0.1449362978213984	0.0067987859408278	0.8341416210872425	-0.0001668318839797	0.2236592704651687	0.0001668318839797	0.214959695705581	0.1938049149887446	0.6692465742385157	-0.0047337851616742	0.2688542368807411	0.0047337851616742	0.2577011864494317	0.0013177932275433	0.736463799419274	-3.2569345112386124e-05	0.3274286374493608	3.2569345112386124e-05	0.3162719004267118	-0.0231516924449423	0.0562181429122206	0.0231516924449423	0.0546766956339416	SPATS2L	11460	SGO2	192667	KCTD18	202442	False	False	False	ref	60	0.001678	-50	0.04364
2326	chr2	200322935	A	G	rs3769474	-0.0021321838614	0.7921613771472972	0.0021321838614	0.7824529708795112	0.0086071097434163	0.4805475231517207	-1.861024045504082e-05	0.7801205281892312	1.861024045504082e-05	0.7705726861859649	0.1886907540534652	0.6763266070991433	-0.0003860464023926	0.7784386276630699	0.0003860464023926	0.7645549144150802	0.0016264825637865	0.6758267031771867	-3.378531294599626e-06	0.7741788778369536	3.378531294599626e-06	0.7605694509485222	-0.0020996068423945	0.6523267528288913	0.0020996068423945	0.6412176340794485	SPATS2L	17053	SGO2	187074	KCTD18	196849	False	False	False	ref	-55	0.005722	-50	0.00641
2327	chr2	200362466	A	G	rs295127	-0.0031446356	0.7181515481113627	0.00345865928	0.7080981851490354	0.0139032689038304	0.1042629976496068	-3.964110389782904e-05	0.6083375152823912	4.431083240244873e-05	0.5986415271896358	0.2979470741397732	0.4985078053209311	-0.0009040829061252	0.6428695931530931	0.00099151855765	0.6325835074295502	0.0041618523932912	0.2285708388933417	-1.165312193975774e-05	0.5556186797567847	1.295334479261407e-05	0.5457238451531151	-0.0022676583781989	0.610874172557363	0.0025000259338789	0.601725363643594	SPATS2L	56584	SGO2	147543	KCTD18	157318	False	False	False	ref	-100	0.00632	-65	0.01032
2328	chr2	200364340	G	A	rs78412932	-0.0449568674	0.0420908667642029	0.0449568674	0.0394524628658188	0.0106888883636145	0.2532806468364103	-0.0005216435650382	0.0515064846514419	0.0005216435650382	0.0486784569440077	0.3724623699415968	0.3824561965389065	-0.0173666007989377	0.0622851190309539	0.0173666007989377	0.0578169954990877	0.0040641261526786	0.2489583410014627	-0.0002055513098774	0.0638840070600748	0.0002055513098774	0.0597431824259314	-0.0274670899075716	0.0359349535767392	0.0274670899075716	0.0349602185790194	SPATS2L	58458	SGO2	145669	KCTD18	155444	False	False	False	ref	20	0.000601	80	0.0232
2329	chr2	200365261	T	C	rs295130	0.0144131816	0.2514462391472965	0.0144131816	0.2619483769493763	0.0128857259343052	0.1365867106646522	0.0001882446708095	0.1776599076558904	0.0001882446708095	0.185773477263893	0.1859044180956233	0.6815335771451644	0.0026973521186836	0.3664098082085532	0.0026973521186836	0.3788159559009257	0.0023805787453327	0.5343705933905534	3.496513510884833e-05	0.2892139494876687	3.496513510884833e-05	0.3002313267207838	0.0144005643212066	0.1240317479191736	0.0144005643212066	0.1278695971031299	SPATS2L	59379	SGO2	144748	KCTD18	154523	False	False	False	alt	-40	0.002655	-100	0.01596
2330	chr2	200367999	G	T	rs296789	0.0032533116	0.6432566794569778	0.00357263412	0.6524927338121131	0.0185134939940467	0.0373265319609064	6.514677078631225e-05	0.4253341834910834	6.986027004719974e-05	0.4339303693450309	0.135766968537018	0.7633624900685807	0.0004526398709369	0.7127059940240665	0.0004857848328252	0.7216988488599778	0.002532056950181	0.4988012496804329	8.955979608580475e-06	0.5649021009004148	9.445230260604256e-06	0.5742796323113332	0.0034315708669176	0.4703708747351797	0.0036805361051462	0.4780288179828688	SPATS2L	62117	SGO2	142010	KCTD18	151785	False	False	False	alt	100	0.00408	95	0.02747
2331	chr2	200369849	T	G	rs3769459	-0.00578242162	0.5439836283304161	0.00578242162	0.5311474552393898	0.0180770470199241	0.0401909394332947	-0.0001029654045668	0.3335529978031	0.0001029654045668	0.3233906148254116	0.1236859303519745	0.7835009408851282	-0.0007192967745653	0.6754637280047305	0.0007192967745653	0.6616976802685788	0.0022358244215927	0.5608500186532174	-1.2801244628514892e-05	0.5253023919424156	1.2801244628514892e-05	0.5122556192043723	-0.0053672755941451	0.3648670569787445	0.0053672755941451	0.355101499501562	SPATS2L	63967	SGO2	140160	KCTD18	149935	False	False	False	ref	-65	0.006332	90	0.03333
2332	chr2	211421177	G	A	rs3791705	0.000272716678	0.8721283327344169	0.0013191184139999	0.8742648038228699	0.0235443186088396	0.0130910503123572	1.055626588392575e-05	0.672946588973138	3.0024574466613723e-05	0.6754065594305364	0.0923785516447265	0.8358949908684536	4.577389150943626e-05	0.8881956460840369	0.0001284739010247	0.8905083912815537	0.0022917102340636	0.5074651254445274	1.541816530305819e-06	0.7812294912167238	3.109485235324856e-06	0.7834781188693809	0.0002531146588657	0.7800962897981032	0.0011452400958516	0.7823549052146208	CPS1	943494	LANCL1	943525	MYL1	1106003	False	True	False	alt	-40	0.007904	85	0.02869
2333	chr2	211436236	A	G	rs6738323	0.00015862068	0.7794865499140204	0.0024411233199999	0.7776696665493381	0.0165497545786904	0.0615380843048541	-1.7691681318173168e-06	0.6178103613321841	3.833711985350653e-05	0.6158390317603664	0.1111878753928982	0.80038947553367	0.0001217989648271	0.813301041499033	0.000319904344535	0.8118451100647589	0.0017741274463571	0.6342679121959323	1.4252830120156508e-06	0.7268543646204325	4.892929394240026e-06	0.7253893469212257	-4.771833732714009e-05	0.6504854479391425	0.0020311414018817	0.6489352222644409	CPS1	958553	LANCL1	958584	ERBB4	1102605	False	False	False	alt	0	0.0	25	0.022
2334	chr2	212537917	G	C	rs1384292	-0.0510056678	0.0267836586574088	0.0510056678	0.0253097019497239	0.0205503985743779	0.0247244895759644	-0.0011099501197121	0.012822973624479	0.0011099501197121	0.0122255368297457	0.8019170323343603	0.0061375958191988	-0.0406786008571142	0.0069133557771592	0.0406786008571142	0.0064559901622637	0.0164559404931383	0.0025318981387226	-0.000884538610893	0.0058304634096533	0.000884538610893	0.0055179238143116	-0.0100063278664715	0.2001330264120487	0.0100063278664715	0.1939605634980171	ERBB4	924	IKZF2	614510	SPAG16	746473	True	False	False	ref	-95	0.01474	-5	0.01013
2335	chr2	212539248	G	A	rs6735626	-0.0405042468	0.0520893852094648	0.0405042468	0.0489137577966523	0.0131452759981601	0.126136402136778	-0.0005443263398947	0.0376642098913653	0.0005443263398947	0.0355302557204846	0.8327700494818411	0.0049616045418247	-0.0335912289816518	0.0119449794116713	0.0335912289816518	0.0110814702342579	0.0109586446141877	0.0093374079148322	-0.0004520471543301	0.014719259724108	0.0004520471543301	0.0137867660045554	-0.0078154337700598	0.2537165204648547	0.0078154337700598	0.2462261079334639	ERBB4	407	IKZF2	613179	SPAG16	745142	False	False	False	ref	-5	0.0008545	-30	0.08203
2336	chr2	212540110	T	C	rs10182996	0.0548461264	0.0182939804126915	0.0548461264	0.0196055271307573	0.0105952880599774	0.2558095432137485	0.0005934299899361	0.0290904102355859	0.0005934299899361	0.0310565539842495	0.5406425377856617	0.112650349337902	0.0298568662932705	0.0143864705586299	0.0298568662932705	0.0156469629669346	0.0057358932038282	0.0953777051181239	0.0003232949453905	0.0225070966114383	0.0003232949453905	0.0243611409492383	0.0131329163165592	0.1284828702440031	0.0131329163165592	0.1326774240409114	ERBB4	1269	IKZF2	612317	SPAG16	744280	False	True	False	alt	-100	0.00502	80	0.03958
2337	chr2	212544613	A	G	rs10207878	-0.0661238438	0.0123989584032477	0.0661238438	0.0118646600327645	0.0235952820692293	0.0172622939682024	-0.0017810451257258	0.0082823112202392	0.0017810451257258	0.008017560084001	0.2722185914791646	0.5378068801332669	-0.0199130197790394	0.0509386733697211	0.0199130197790394	0.0473315454607313	0.0069104827221105	0.0636872132251584	-0.0005583682949399	0.01846952572962	0.0005583682949399	0.0175540314491199	-0.0584798597495824	0.0032501533465063	0.0584798597495824	0.00319093178648	ERBB4	5772	IKZF2	607814	SPAG16	739777	False	True	False	ref	-100	0.02689	5	0.004852
2338	chr2	224444261	T	C	rs1523921	0.00421640184	0.4862025044838275	0.00623373744	0.4955838127916344	0.0096690914757247	0.3365648406932365	3.7318388248029e-05	0.4586540343807692	5.938634512295432e-05	0.4670206934224542	0.4769759022396497	0.2117081863874366	0.0019369714389147	0.344551614269142	0.0029636468632131	0.353438466561545	0.0046402003323587	0.1747785686520561	1.7181565696083442e-05	0.3264378946409967	2.8412532451794967e-05	0.3345994147346952	0.0016535441239017	0.5956618130805416	0.0023547962115789	0.6040856472097201	FAM124B	42154	CUL3	141136	CCDC195	272104	False	False	False	alt	80	0.00464	65	0.0707
2339	chr2	224470254	T	C	rs12470077	-0.003620565886	0.686954429261611	0.003781863074	0.6787471746226516	0.0209788465369361	0.021324625349082	-7.79966451849632e-05	0.4309079914064598	8.09744620908439e-05	0.4227516332081012	0.2157760972624197	0.6280441333516472	-0.0007831218245733	0.6706056853963575	0.0008134440027278	0.662161188331417	0.0046022591291412	0.1794444313180198	-1.7152879467236837e-05	0.4861353495781276	1.7712677784318656e-05	0.4776581113688469	-0.0031639332358219	0.5169097162647948	0.0033797031089533	0.509429493317614	FAM124B	68147	CUL3	115143	CCDC195	246111	False	False	False	ref	-100	0.004486	85	0.05945
2340	chr2	224488932	T	C	rs147137183	0.00463123408	0.6050547687942783	0.00463123408	0.6185486252276902	0.0061506757031627	0.9257398021637476	2.7858315668711585e-05	0.6962560391532653	2.7858315668711585e-05	0.7097580570981291	0.2622807290532059	0.5567951703508625	0.0012113101351532	0.5595263035990249	0.0012113101351532	0.573230779239287	0.001628289586621	0.6798321734787751	7.336350487258125e-06	0.629541571156933	7.336350487258125e-06	0.6433009349016718	0.0037407027043848	0.4529880043354803	0.0037407027043848	0.4641167602331518	FAM124B	86825	CUL3	96465	CCDC195	227433	False	False	False	alt	-10	0.001017	10	0.001938
2341	chr2	224567753	C	A	rs72974238	-0.00297495234	0.75828231885166	0.00297495234	0.7446942457929474	0.0195003971707101	0.0304831560943048	-5.474417323211409e-05	0.5413401345321934	5.474417323211409e-05	0.528931572707462	0.2199338167408375	0.6246305354878342	-0.0006513663355498	0.7200579705401597	0.0006513663355498	0.705839910774277	0.0042741320849593	0.2091478959469705	-1.1973896202102505e-05	0.5682495323068945	1.1973896202102505e-05	0.5548268311609532	-0.0026597786284089	0.5937313681234212	0.0026597786284089	0.5815108549767312	CUL3	17644	CCDC195	148612	FAM124B	165646	False	False	False	ref	-100	0.02708	-45	0.0289
2342	chr2	224577415	A	G	rs80236857	-0.003325022034	0.6919210307123258	0.003325022034	0.6782470675130611	0.0238426598928804	0.0119540633397429	-7.992371979607389e-05	0.4158311037095983	7.992371979607389e-05	0.4044975811829839	0.1952198674260106	0.6651380422581222	-0.000648262525595	0.6883971422830417	0.000648262525595	0.6744329142585477	0.0046524435931079	0.1743543581587593	-1.556111972816048e-05	0.4866768383119336	1.556111972816048e-05	0.4737738649287132	-0.0033506571644933	0.5229011582222367	0.0033506571644933	0.5111644199122577	CUL3	7982	CCDC195	138950	FAM124B	175308	False	True	False	ref	35	0.0178	10	0.010506
2343	chr2	227390758	G	A	rs73090183	-0.0558629551999999	0.0200990236592052	0.0558629551999999	0.0189211660019835	0.0126109279727412	0.1575865607110705	-0.000770365623479	0.0254039181553478	0.000770365623479	0.0241829691307047	0.5440720339422608	0.1099325330848276	-0.030592320825139	0.0158591103866147	0.030592320825139	0.0146588292872534	0.0068823588115276	0.0567241824395503	-0.0004219336817721	0.0199831516723502	0.0004219336817721	0.0187473829241998	-0.0132636230666293	0.143478275687961	0.0132636230666293	0.1391976672394355	SCYGR1	2809	TM4SF20	8763	MFF	65606	False	True	False	ref	40	0.0010605	-10	0.0448
2344	chr2	227399077	A	C	rs34376789	-0.00065809188	0.7668274067050556	0.0025323334	0.768767785027628	0.0194285158890198	0.0298928529920006	-1.290542058886312e-05	0.5617114243774401	5.036651092795757e-05	0.563149476030526	0.3069554663430118	0.4873452611342782	-0.0001195873792246	0.6618913082977627	0.0007454511115127	0.6643499231880756	0.0059656388585704	0.0833430034072542	-2.2483029513841887e-06	0.4979089765288023	1.480142020327447e-05	0.5001687862471456	-0.0006037407027043	0.6619034262858753	0.002039440243156	0.6633451986989257	SCYGR1	11128	TM4SF20	17082	AGFG1	73076	False	False	False	ref	20	0.002625	-25	0.001587
2345	chr2	227401845	C	T	rs11884034	-0.0221966872	0.1734013902885325	0.0221966872	0.1651546183392936	0.0080244919847519	0.5781610022324829	-0.0001834879131499	0.2071107895878101	0.0001834879131499	0.1987684109066099	0.4021141298146246	0.3299379607544512	-0.0090106975809285	0.1536785588145442	0.0090106975809285	0.1447931904848736	0.0032386803039328	0.3703767508222145	-7.464526060821735e-05	0.1774431244540912	7.464526060821735e-05	0.1685223772312616	-0.0122200437763876	0.1703212621187539	0.0122200437763876	0.16521733662413	SCYGR1	13896	TM4SF20	19850	AGFG1	70308	False	False	False	ref	100	0.0154	-100	0.07214
2346	chr2	227402151	C	T	rs55828602	-0.0428549906	0.044357402843293	0.0428549906	0.0415449742675827	0.0118689380131737	0.182413615740029	-0.0005345767953134	0.0435288116710931	0.0005345767953134	0.0409727329514565	0.4175976929221257	0.3036859266628918	-0.018132692567347	0.0536901085358282	0.018132692567347	0.0496141612107096	0.0050035713363745	0.1458076914800289	-0.0002285574868997	0.0480655272320051	0.0002285574868997	0.0447608168213411	-0.0221454579404349	0.0581313574619096	0.0221454579404349	0.0565150980273704	SCYGR1	14202	TM4SF20	20156	AGFG1	70002	False	False	False	ref	-45	0.003296	-95	0.0997
2347	chr2	227403944	T	G	rs56161331	-0.0141868859	0.2638604893843184	0.0141868859	0.253733834904624	0.0193843111462422	0.0304009125452121	-0.0002724062004282	0.1166000036084817	0.0002724062004282	0.1106638223138991	0.5513874625255448	0.0982071985092303	-0.007786959896099	0.1689988619688587	0.007786959896099	0.1598442503435765	0.0107109493380528	0.0100734708140686	-0.000149810793727	0.07725588532343	0.000149810793727	0.0722140963053437	-0.0028299048745318	0.5691784191504239	0.0028299048745318	0.5572388184292236	SCYGR1	15995	TM4SF20	21949	AGFG1	68209	False	False	False	ref	-80	0.002253	45	0.0843
2348	chr2	228111817	C	T	rs12620112	-0.0358385141	0.0778396705539812	0.0358385141	0.0737108182266266	0.0163419474316626	0.0686092964253054	-0.0007158404177958	0.0405949078496936	0.0007158404177958	0.0387551154211349	0.0886274753887488	0.8453311290207236	-0.0033679446223079	0.3689926429178712	0.0033679446223079	0.3566683845790593	0.0015130250564926	0.6993033946964465	-6.805943962411254e-05	0.2357884842639317	6.805943962411254e-05	0.2256447173717519	-0.0271247627050072	0.0413505151451753	0.0271247627050072	0.040309878660293	SPHKAP	69870	DAW1	240762	CCL20	306077	False	False	False	ref	35	0.01042	55	0.003815
2349	chr2	228111818	A	G	rs12613751	0.0694501444	0.0085315542070375	0.0694501444	0.0089792744827408	0.0137132705777472	0.115523396747002	0.0010348932488362	0.0139068114841129	0.0010348932488362	0.0145881918305789	0.1523584269546364	0.7390837946607492	0.0115541576285684	0.1084413562822135	0.0115541576285684	0.1162804971541496	0.0022286147699526	0.5606447966190488	0.0001777655234013	0.071264217107948	0.0001777655234013	0.076280465785473	0.0637952675857633	0.0015902820444277	0.0637952675857633	0.0016346573853524	SPHKAP	69869	DAW1	240763	CCL20	306078	False	True	True	alt	35	0.00906	50	0.00867
2350	chr2	228114794	C	T	rs10933235	-0.00339835604	0.6235873412092919	0.00462219308	0.6138557086301304	0.0069677118377274	0.7489343249150194	-2.113068210974572e-05	0.6961526331868434	3.126457942186461e-05	0.6871899936108535	0.2295210531229577	0.611446069209884	-0.0008117303264456	0.6107595455015787	0.0010877566815699	0.600815203099426	0.0016116441548176	0.683345913268353	-5.129297492927186e-06	0.6614586380158227	7.414914515511329e-06	0.6520954286912547	-0.0028838473428147	0.4513477895364377	0.004078880486312	0.4439408699447533	SPHKAP	66893	DAW1	243739	CCL20	309054	False	False	False	ref	10	0.00039	100	0.03522
2351	chr2	228115397	T	G	rs10175063	0.00646784848	0.314778393878724	0.01200656912	0.3181007927338748	0.0110385826996103	0.2145461854188213	7.659820392362388e-05	0.2709547563636532	0.0001343369489392	0.2735594008742575	0.254232927727466	0.5714081559668984	0.001532825911345	0.3579637380485806	0.0029641960632079	0.3604096474614091	0.002805170651951	0.4520994442865158	1.817724360585966e-05	0.3137050672265125	3.312528175487179e-05	0.3161505724337083	0.0053361549393665	0.1835657483581454	0.0109959646884303	0.1845934152346049	SPHKAP	66290	DAW1	244342	CCL20	309657	False	False	False	alt	60	0.01779	80	0.012054
2352	chr2	228119268	G	A	rs67681818	0.00578866726	0.523563134789239	0.00578866726	0.5364397890091583	0.010033747165355	0.3059578150755702	6.069253714447536e-05	0.4912211856218584	6.069253714447536e-05	0.5033137658159614	0.2955570078527785	0.5056976850682733	0.0018018124968133	0.4684008582334494	0.0018018124968133	0.4816626367958553	0.0030070490682379	0.420604731397065	1.91666410280523e-05	0.4414915831984867	1.91666410280523e-05	0.4540730564845666	0.0045290926254421	0.4075758744812494	0.0045290926254421	0.4181697118600991	SPHKAP	62419	DAW1	248213	CCL20	313528	False	False	False	alt	100	0.004055	-85	0.03662
2353	chr2	228119928	C	A	rs67890737	-0.0068054222	0.4933187894041154	0.0068054222	0.4805564886708389	0.0083379650244359	0.4728503725870159	-5.9477559345125935e-05	0.4970984098819978	5.9477559345125935e-05	0.484753693761134	0.2126453593916949	0.638752580588315	-0.0014084575265545	0.5437472310190631	0.0014084575265545	0.5300558193181375	0.0017346296122619	0.6519452385999379	-1.2083596131116992e-05	0.5458448704995226	1.2083596131116992e-05	0.5325190544337135	-0.0060789012334152	0.3207452072305207	0.0060789012334152	0.3121152916280864	SPHKAP	61759	DAW1	248873	CCL20	314188	False	False	False	ref	-100	0.014565	75	0.0343
2354	chr2	228122334	A	G	rs10191681	0.0365761118	0.061691917897113	0.0365761118	0.0660547938246137	0.0100879524191922	0.3061934088893501	0.0003812256085319	0.0670428313571217	0.0003812256085319	0.0712576513421431	0.2857125073911555	0.5226795173088525	0.0106663341489087	0.1087334467955541	0.0106663341489087	0.1166567564833689	0.0029095059122386	0.436937224046182	0.0001123634748285	0.1043667643765362	0.0001123634748285	0.1112995092400184	0.0307243851077293	0.024343376720597	0.0307243851077293	0.0250255500032429	SPHKAP	59353	DAW1	251279	CCL20	316594	False	False	False	alt	35	0.000702	70	0.03857
2355	chr2	228125369	T	C	rs12618505	-0.0059605054	0.5236608292213222	0.0059605054	0.511045578031913	0.0300644132233921	0.0038735352154023	-0.0001784419904959	0.1975765283783128	0.0001784419904959	0.1893536146544687	0.070594093299723	0.8682883827446102	-0.0004226319113417	0.7545867525400252	0.0004226319113417	0.7405832659840986	0.0021222395803361	0.5588934557702138	-1.260977369434414e-05	0.5192564265404449	1.260977369434414e-05	0.5060303393385603	-0.0046494258239192	0.409445516964233	0.0046494258239192	0.3992168188950193	SPHKAP	56318	DAW1	254314	CCL20	319629	False	True	True	ref	50	0.003433	-90	0.02654
2356	chr2	228125644	T	C	rs4450589	-0.0011740073319999	0.7062336358739687	0.003536334532	0.6985081256194098	0.0251076277659038	0.0094128330361517	-3.686645200890162e-05	0.4169931301107362	9.41073707141416e-05	0.4105099055369162	0.0353177937530471	0.9298549575534985	-4.328976885360683e-05	0.9212369708025602	9.401661731420682e-05	0.9123217014069416	0.00086755716331	0.8096882790378606	-1.214313731323581e-06	0.8256642699103275	2.4434623917857887e-06	0.8163945718891205	-0.0006161889646158	0.7663816173924606	0.0013132916316558	0.7580143515241631	SPHKAP	56043	DAW1	254589	CCL20	319904	False	True	False	ref	100	0.00531	100	0.01214
2357	chr2	228127142	G	A	rs10933236	-0.002736512052	0.7615649691506322	0.002736512052	0.7477662721847571	0.0061212286146358	0.8986820641608314	-1.8810388718571967e-05	0.8163386690328289	1.8810388718571967e-05	0.8024269936504381	0.1057438355169659	0.8177164914413919	-0.0002955047729151	0.8415943705609618	0.0002955047729151	0.8273425610148144	0.0006781629881146	0.867468191520552	-2.1145969559313e-06	0.8708513828996295	2.1145969559313e-06	0.8565841800884042	-0.0024294857830475	0.6331281937496022	0.0024294857830475	0.6206992340707902	SPHKAP	54545	DAW1	256087	CCL20	321402	False	False	False	ref	90	0.01062	-100	0.007538
2358	chr2	228129701	A	C	rs66499548	-0.0074383398	0.4522920168038061	0.0074383398	0.440147669667952	0.0216766514732903	0.0190406634557662	-0.0001615055505901	0.2164268853545148	0.0001615055505901	0.2078505783901194	0.0645670598242719	0.8836791899467208	-0.0004739172228507	0.7431655127042418	0.0004739172228507	0.7289589097106959	0.0015112316026198	0.6837329380216656	-1.1073056573975245e-05	0.5654887707813696	1.1073056573975245e-05	0.5520910970590601	-0.0051743275345179	0.3739977932611597	0.0051743275345179	0.3643219832283747	SPHKAP	51986	DAW1	258646	CCL20	323961	False	True	False	ref	90	0.00293	90	0.01285
2359	chr2	228129788	T	C	rs13388454	-0.001345692026	0.8338962699141289	0.0017221424259999	0.8248265333408897	0.0147187930450097	0.089605865492152	-2.050590780397064e-05	0.7331980656894375	2.4274312418806816e-05	0.7241331533484804	0.0609051961119928	0.8904068204600537	-7.86017667520175e-05	0.910161726293997	9.541334172204144e-05	0.9010788459660248	0.000948005685114	0.8061720704438915	-1.2063994493404812e-06	0.8703037273159944	1.3746893887264682e-06	0.8609928264620823	-0.0010477287108787	0.7612990661527768	0.0012842456871958	0.7525791307734214	SPHKAP	51899	DAW1	258733	CCL20	324048	False	False	False	ref	-45	0.00119	100	0.04102
2360	chr2	228130469	A	G	rs4973071	-0.00698614858	0.4765920024955223	0.00698614858	0.4643353034110675	0.0157522813093945	0.0690836390943722	-0.0001147791531102	0.3223063874915427	0.0001147791531102	0.3121676885090594	0.0220251247419578	0.959949500339282	-0.0001681299519564	0.8799618382568898	0.0001681299519564	0.865609604082704	0.0003718965151342	0.9236877239050152	-2.9779057133577005e-06	0.8080154716656239	2.9779057133577005e-06	0.793897525505794	-0.0027448417514704	0.5889140649639235	0.0027448417514704	0.5765987980761942	SPHKAP	51218	DAW1	259414	CCL20	324729	False	False	False	ref	65	0.004684	80	0.02097
2361	chr2	228131708	A	G	rs4246653	0.0235342367	0.1463442894427676	0.0235342367	0.1543004591661086	0.0076450661187106	0.6624517881491404	0.0001802886781072	0.1916564101439681	0.0001802886781072	0.1999680517750972	0.3113538522183839	0.4750055844378822	0.0075357355483659	0.1667165793371524	0.0075357355483659	0.1765669042335564	0.0023935991641451	0.5305890440873895	5.807907081917423e-05	0.2002782093851965	5.807907081917423e-05	0.2100779188086675	0.0171703025964999	0.0885568921937458	0.0171703025964999	0.0912086879530805	SPHKAP	49979	DAW1	260653	CCL20	325968	False	False	False	alt	100	0.00354	100	0.0444
2362	chr2	228134826	T	C	rs6436754	-0.0001066804119999	0.5769999642211051	0.004590712108	0.5807843235221809	0.005812034208322	0.9353000394071498	2.3887451044919443e-06	0.6864056903858643	2.644409622686576e-05	0.6906673969806499	0.3381051670660484	0.4344127256564155	8.682574510620002e-05	0.5149244821668317	0.0014715716087419	0.519205332976421	0.0019760788488422	0.6089358056201467	1.524980593170967e-06	0.6004426545945283	8.518831520409628e-06	0.6052205612589346	-0.0004253156153072	0.4948623977928454	0.0036909096567391	0.4967543271561296	SPHKAP	46861	DAW1	263771	CCL20	329086	False	False	False	ref	-85	0.007145	55	0.05103
2363	chr2	228138147	C	T	rs4246655	-0.0583504708	0.0171671595712718	0.0583504708	0.0161060580757117	0.011060232142488	0.2190591551921114	-0.0006627399338029	0.0275734902718597	0.0006627399338029	0.0259606917227374	0.2464755858463262	0.582240020752033	-0.014387351118096	0.0818042778394249	0.014387351118096	0.0759430998397244	0.0027063323537258	0.4788054034238178	-0.0001622779138781	0.0724905787503272	0.0001622779138781	0.0676821214880939	-0.0538325086359816	0.0030846042816931	0.0538325086359816	0.0029780599781144	SPHKAP	43540	DAW1	267092	CCL20	332407	False	True	False	ref	-20	0.0004807	70	0.02798
2364	chr2	228139166	G	T	rs4321353	0.0074110984	0.4495924100124189	0.0074110984	0.4620852136127026	0.0204280201263483	0.0245818563878263	0.0001506027157109	0.2369900331925046	0.0001506027157109	0.2462448499427002	0.1267087832861336	0.776802441155344	0.0010028700236073	0.6002908164247497	0.0010028700236073	0.6139887719700067	0.0027077669539103	0.4374453198494438	2.1469179503846327e-05	0.4224800906932984	2.1469179503846327e-05	0.4350104996801047	0.0067780786107738	0.2975784673918147	0.0067780786107738	0.3063335583087386	SPHKAP	42521	DAW1	268111	CCL20	333426	True	False	False	alt	70	0.001648	0	0.0
2365	chr2	229594594	A	C	rs55784527	-0.00167342664	0.7385764322530668	0.00299892136	0.7313182933796228	0.02884668341699	0.0050924945302215	-5.623715816114831e-05	0.3906614313482864	8.652144668027122e-05	0.3845304272229983	0.1598813265697776	0.7215575693736747	-0.0002560271412265	0.7466502034969604	0.0004558984158396	0.7392032790987381	0.0046376455086276	0.1801525974311039	-8.60057401003198e-06	0.5181693303749793	1.3167140239079694e-05	0.5108624500599063	-0.0017323831160074	0.5800301175371789	0.0026908992831875	0.5734984051317665	DNER	119961	PID1	323307	FBXO36	327709	False	True	True	ref	-65	0.00795	95	0.0377
2366	chr2	229732201	A	T	rs62193248	-0.01146127814	0.3210746220563638	0.01146127814	0.3099754826818931	0.0145407515040269	0.0893149567894381	-0.0001643822205385	0.2062402934307839	0.0001643822205385	0.1979824838861886	0.4529528314609072	0.2444134793509424	-0.0052589340245185	0.2433067195793256	0.0052589340245185	0.2325790626116863	0.0066023481150116	0.0585673150503829	-7.546223610398683e-05	0.164346221769911	7.546223610398683e-05	0.1561519962045254	-0.0044378053714249	0.4178190731319173	0.0044378053714249	0.4076282859700551	DNER	17646	FBXO36	190102	TRIP12	191038	False	False	False	ref	-35	0.001282	-5	0.006836
2367	chr2	229738161	G	C	rs11886634	0.0234958602	0.1495016384932905	0.0234958602	0.1573926777493327	0.0077250389407179	0.6201574125031235	0.0001886979306845	0.1900657379095983	0.0001886979306845	0.1983977074819872	0.1360242326165208	0.7639798521330049	0.0036824390493949	0.3275451338040823	0.0036824390493949	0.3398386917997654	0.0010788767786781	0.7863837287301152	2.9813790194990903e-05	0.3588354991340707	2.9813790194990903e-05	0.3707542751190045	0.0212803037375905	0.0699104605439636	0.0212803037375905	0.0719171397335919	DNER	23606	FBXO36	184142	TRIP12	185078	False	False	False	alt	-75	0.01337	55	0.0318
2368	chr2	229750034	A	G	rs11885896	-0.000987505844	0.8550484028702157	0.001278014604	0.848106875445395	0.0062753656567043	0.8868267508933909	-6.332127929847225e-06	0.8854864282816822	8.222678817508431e-06	0.8796535711564661	0.1761346072054689	0.6853876729891941	-0.0002442504837853	0.8141195709479109	0.0002760410298673	0.8032279982808791	0.0011323175251005	0.7595906698411437	-1.6030254180482375e-06	0.8412918384781047	1.8099095279864948e-06	0.8321996308523933	-0.0009460679052687	0.7584015229625888	0.0012780215562401	0.7513229836245503	DNER	35479	FBXO36	172269	TRIP12	173205	False	False	False	ref	100	0.07465	0	0.0
2369	chr2	229753804	A	G	rs62190392	0.017575961	0.2065186819492405	0.017575961	0.2158545001468727	0.0095113022677552	0.3677020763893461	0.0001652269914113	0.2101615197231562	0.0001652269914113	0.2186351392175226	0.3869210261517235	0.3585126958158177	0.0067511436371719	0.179478552248069	0.0067511436371719	0.1894917047751756	0.0036711271530689	0.3059584753218867	6.339554342729906e-05	0.178971046877567	6.339554342729906e-05	0.1883453753705969	0.010207574767373	0.1911905833948588	0.010207574767373	0.197218384327144	DNER	39249	FBXO36	168499	TRIP12	169435	False	False	False	alt	-50	0.0163	-80	0.1472
2370	chr2	229786402	T	G	rs370430952	-0.00161869376	0.7246233278259264	0.00280525404	0.7160333508319792	0.0274332550401187	0.0062813554901514	-5.16679947710427e-05	0.4010229197451255	7.927572865401441e-05	0.3940004751681142	0.3106878702061225	0.4797305749511495	-0.0004958634371802	0.622334241747573	0.0008757266807849	0.6140592155025996	0.0087036095973132	0.0240291830938191	-1.642707681351242e-05	0.3765119142014148	2.5265366374217304e-05	0.3691547936086788	-0.0013423375761159	0.617098318033853	0.0023257502671189	0.6097875730165655	DNER	71847	FBXO36	135901	TRIP12	136837	False	True	True	ref	100	0.1079	50	0.04227
2371	chr2	229800587	T	C	rs7592697	-0.0001921357479999	0.8015979876900388	0.002089054132	0.796904036728093	0.0248213241272127	0.010090727862643	-6.56919420039488e-06	0.5410496705212521	4.9860246018877166e-05	0.5369519911535815	0.3150074170893889	0.4724622254831259	-2.172965564741996e-05	0.6898491846877902	0.0006444031996145	0.6848176561550112	0.0079151114169461	0.0331913187217178	-1.2151285678390223e-06	0.4824272467114771	1.550899254005356e-05	0.4777117803442751	-0.0001120343572028	0.7179458002145936	0.0015892281040259	0.7136375563975212	DNER	86032	FBXO36	121716	TRIP12	122652	False	True	False	ref	-15	0.002441	-100	0.014496
2372	chr2	229803073	C	G	rs13035379	-0.0018768340459999	0.7185717330101448	0.003126001246	0.7099411072055642	0.0068206332635413	0.82492473338485	-1.3028776709314268e-05	0.766551271149169	2.104847037334001e-05	0.7580319562514062	0.1377379433396611	0.7593758006902847	-0.0003273085109715	0.7578254345726732	0.000450386451099	0.7485854603961682	0.0009430680775944	0.8072108236011839	-2.2528659683456007e-06	0.7897516266029794	3.0430302897692304e-06	0.7806745545780766	-0.0018174462390688	0.5501827675699094	0.002921192128549	0.5428744494092964	DNER	88518	FBXO36	119230	TRIP12	120166	False	False	False	ref	100	0.003342	45	0.02911
2373	chr2	229893844	A	G	rs6749080	0.0063862021199999	0.5042308748512824	0.0063862021199999	0.5172328966192119	0.0068124075248589	0.7792421832051001	4.868514323409834e-05	0.5707566973111305	4.868514323409834e-05	0.5835074246488859	0.187557962219525	0.670489229011706	0.0014238497113036	0.5390261284251231	0.0014238497113036	0.5527274823115632	0.0013434462693225	0.7237604648059103	1.1448978248705983e-05	0.5809175110462985	1.1448978248705983e-05	0.5945283254581264	0.005711677507028	0.3504168312792367	0.005711677507028	0.3598649899150695	FBXO36	28459	TRIP12	29395	SLC16A14	175149	False	False	False	alt	30	0.002626	5	0.006622
2374	chr2	232727777	G	A	rs6704763	-0.0035292995092	0.677480827294226	0.0039330422692	0.6717674235503258	0.008849608049176	0.4490682531635703	-3.253216262121402e-05	0.676769526068567	3.54195260151261e-05	0.6712368208249775	0.3112833120675525	0.481868112987795	-0.0011685077624664	0.610809320025869	0.0012764388740341	0.602495119364943	0.0027870029074645	0.4643928044320614	-1.0816207489062205e-05	0.6104756479366569	1.158807602152742e-05	0.6024816438291482	-0.0023381985290303	0.5899347437632252	0.0027240946482847	0.583777979788232	GIGYF2	30477	KCNJ13	48788	EFHD1	121719	False	False	False	ref	60	0.001381	60	0.03287
2375	chr2	232730453	C	A	rs6716488	0.004473106894	0.5580225036625398	0.004830528706	0.5671773319220942	0.0213693247729423	0.0202983716333435	0.0001053492471295	0.3164892389567267	0.0001113670613365	0.3250184402493452	0.4035270075415719	0.3295520386018635	0.0018239117407282	0.442303691365442	0.0019609273290361	0.4520187507730069	0.0086393394891284	0.022567920870682	4.283660370496148e-05	0.2553365435254618	4.51434980317138e-05	0.2638885037985234	0.0024668305687818	0.5845702621304305	0.0025954626085332	0.5928688285770227	GIGYF2	33153	KCNJ13	46112	EFHD1	124395	False	False	False	alt	95	0.0166	95	0.10175
2376	chr2	232769842	T	C	rs2293782	-0.00506607832	0.5902775089186904	0.00506607832	0.577297806130465	0.0063229250252964	0.8824024093640428	-3.129527206495233e-05	0.6814975382384831	3.129527206495233e-05	0.668407991548625	0.1968402161848151	0.66308644666702	-0.0009847956364873	0.6158545965808672	0.0009847956364873	0.6019991040137906	0.0012506387681545	0.7460543510497682	-6.118920853637459e-06	0.6771819331732936	6.118920853637459e-06	0.6633587553487464	-0.0047905061255821	0.4056412152081716	0.0047905061255821	0.3952280256512219	KCNJ13	6723	GIGYF2	72542	SNORC	87429	False	False	False	ref	-100	0.00299	-30	0.003326
2377	chr2	232776161	T	G	rs56054779	-0.00713732822	0.4685214236430321	0.00713732822	0.455889708075521	0.0294463285724164	0.0044112483705522	-0.0002029938325083	0.1663544541267051	0.0002029938325083	0.158965412582091	0.3042044004605856	0.4863093397251696	-0.0020458424047458	0.4493230820183934	0.0020458424047458	0.4361399778043618	0.0091143002435553	0.0198338443442394	-5.896931228191228e-05	0.202235739197182	5.896931228191228e-05	0.1929774125751573	-0.005697154534798	0.3455616007887711	0.005697154534798	0.3364572066118405	KCNJ13	404	GIGYF2	78861	SNORC	81110	False	True	True	ref	-50	0.00438	-50	0.03458
2378	chr2	232825372	C	T	rs12993791	-0.0035213179299999	0.6880633739916479	0.0035811647899999	0.6779853266260399	0.0088361491265483	0.4501880435457904	-2.8433978187013964e-05	0.6967363365803274	2.90972357765582e-05	0.6870712963856619	0.0614093507194057	0.8808221527155214	-0.0002417234708319	0.8429779916798824	0.0002436560974202	0.8327744815855507	0.0005139188963264	0.8826312096093568	-1.8795096498738493e-06	0.847486633067705	1.9009281384084944e-06	0.8373301248487571	-0.0023859168663575	0.6058571789904705	0.0024274110727289	0.5965908253826923	SNORC	31899	KCNJ13	48807	GIGYF2	128072	False	False	False	ref	-50	0.001103	-5	0.006905
2379	chr2	232847538	G	A	rs12328151	-0.0210793053	0.1744813371025131	0.0210793053	0.1659701140896514	0.0097767401391816	0.3256412260802883	-0.0002068878405876	0.1691608369214286	0.0002068878405876	0.1616374436672876	0.0936233778358696	0.833277752589814	-0.0020497064447947	0.4587385118372048	0.0020497064447947	0.4453849509999714	0.0009183327458504	0.8125532917853225	-2.0071577250031885e-05	0.4351785342670499	2.0071577250031885e-05	0.4226689189609082	-0.0173798483386756	0.0850446686253834	0.0173798483386756	0.0826639900883679	SNORC	9733	KCNJ13	70973	GIGYF2	150238	False	False	False	ref	25	0.001348	-75	0.03403
2380	chr2	232871534	C	T	rs2675968	-0.0565846784	0.0182257842453442	0.0565846784	0.0171964805544433	0.0127087073975521	0.1404991736511279	-0.0007327965222972	0.0222630723706987	0.0007327965222972	0.0211500547704513	0.6012614238736915	0.0477736749244506	-0.0340731288523703	0.0110984868469431	0.0340731288523703	0.0102830747044815	0.0076375648721378	0.034344377721728	-0.0004409937108703	0.0154698277802426	0.0004409937108703	0.0144983564360189	-0.0080623242979698	0.2531402946170771	0.0080623242979698	0.2455946578186449	SNORC	14263	KCNJ13	94969	NGEF	141722	False	True	False	ref	-5	0.0002117	-10	0.03192
2381	chr2	232904078	G	A	rs938575	-0.0528656794	0.0229749575464445	0.0528656794	0.0215203416478303	0.0116249844803917	0.1831246421617864	-0.0006243597009213	0.0295367248176733	0.0006243597009213	0.0277799496447628	0.3529683917882965	0.4069446299855735	-0.0187080398652923	0.050046995132806	0.0187080398652923	0.0462464365076524	0.0041277622446333	0.2221471207496945	-0.0002225542095331	0.0461125962421026	0.0002225542095331	0.0429267952060683	-0.0355501613087271	0.0147522207086169	0.0355501613087271	0.0144247532419707	SNORC	46807	NGEF	109178	KCNJ13	127513	False	False	False	ref	-95	0.013916	-80	0.03455
2382	chr2	233107579	C	T	rs79340715	0.0004084093199999	0.7219131530151761	0.00331780552	0.7184464803071766	0.0075642357194401	0.652028487106367	4.538015571202179e-06	0.7577951369734067	2.3945450577726075e-05	0.754327931869195	0.5395346424755443	0.1128674368613349	0.0001399850047921	0.5042627422693416	0.0017800077291767	0.5007983373693957	0.0040797196988477	0.2370187894086318	1.8673756817902475e-06	0.5437053623598882	1.2805916969730422e-05	0.5399926081892275	0.0002448158175914	0.8528281204755304	0.00078424050042	0.8487738055094909	INPP5D	47611	NEU2	74906	NGEF	94323	False	False	False	alt	100	0.00474	55	0.0807
2383	chr2	235876563	G	T	rs4663623	-7.751879400000002e-05	0.5492337344286936	0.005322526566	0.5490131775919087	0.011418059118452	0.2029544991740531	7.026646464505016e-06	0.5044815883907448	5.814334805112667e-05	0.5048101331210851	0.4792622330107158	0.2039499386734261	-0.0001693258400842	0.4226794944104131	0.0024725737894148	0.4214854733788997	0.0054579294009544	0.1099358298724774	1.8044810236230515e-06	0.3800640698928152	2.683475693911677e-05	0.3794766699727996	0.0002883847342814	0.6446264962952071	0.0021680722829074	0.6457656208374045	GBX2	291823	AGAP1	382519	ASB18	387846	False	False	False	ref	-10	0.0002918	35	0.02484
2384	chr2	235877371	C	T	rs4663624	-0.049501974	0.0283156406092804	0.049501974	0.0264416387207108	0.010132436198863	0.2913219615739494	-0.0005111885951991	0.0416205002192561	0.0005111885951991	0.0390849128134371	0.4958370937457856	0.1806841616546918	-0.0245540233839296	0.0274164801644075	0.0245540233839296	0.0252665937510287	0.0050257691223232	0.1384536053046969	-0.0002536525224308	0.0366601629165277	0.0002536525224308	0.0340868656851956	-0.0164130333302212	0.0978453044178624	0.0164130333302212	0.0950762633436473	GBX2	291015	AGAP1	383327	ASB18	387038	False	False	False	ref	10	0.0009727	80	0.0873
2385	chr2	235884746	G	A	rs35772117	-0.0244775524	0.139381017072595	0.0244775524	0.1321210835229198	0.0100146811595422	0.3007759502142307	-0.0002444938012339	0.1343746011108696	0.0002444938012339	0.1278431136228275	0.0660795236465108	0.8780646522932186	-0.0016968657364035	0.5046556436296764	0.0016968657364035	0.4911275578982065	0.0006657749620864	0.8577166436493441	-1.7054294047986297e-05	0.4735228800429669	1.7054294047986297e-05	0.4605638486175234	-0.0164586769572297	0.0900000308173616	0.0164586769572297	0.0875196278752133	GBX2	283640	ASB18	379663	AGAP1	390702	False	False	False	ref	-100	0.002892	80	0.02565
2386	chr2	235886699	A	C	rs13025591	-0.0148305474	0.2618277526772636	0.0148305474	0.2515652580363949	0.02381821044392	0.0120889693146712	-0.0003610285726155	0.075017576078704	0.0003610285726155	0.0710374217299555	0.4135810537453707	0.3165640360793306	-0.0060435882299018	0.2166833663219439	0.0060435882299018	0.2062206550242201	0.0097961404438966	0.0139988841155132	-0.0001466267441824	0.0800959065306011	0.0001466267441824	0.0750661843257176	-0.0081619103932612	0.2526817762582169	0.0081619103932612	0.2452267657568505	GBX2	281687	ASB18	377710	AGAP1	392655	False	True	False	ref	-80	0.00408	25	0.01822
2387	chr2	235889289	A	C	rs10192764	-0.0149384646	0.2553085015242071	0.0149384646	0.2452697326459611	0.0113979184487703	0.1978678476112915	-0.0001688620992923	0.2109543828563102	0.0001688620992923	0.2025684796487159	0.4105270801564331	0.3199411327871997	-0.0061202915908379	0.212576819922333	0.0061202915908379	0.2023898939665573	0.0046802958140526	0.1686682807544338	-6.918217786859651e-05	0.1765146884443503	6.918217786859651e-05	0.1678115786138463	-0.0080270542225541	0.2513301824115744	0.0080270542225541	0.2437984912170457	GBX2	279097	ASB18	375120	AGAP1	395245	False	False	False	ref	-95	0.001818	-15	0.01976
2388	chr2	235904913	T	C	rs6747286	0.000513559536	0.857431937082861	0.0015390501839999	0.8551550310726354	0.0206721567110673	0.0230389107880204	1.2650703237347992e-05	0.6754140022822425	3.28005567717914e-05	0.6740808945343838	0.4667621033413209	0.2247722805161397	0.000248140874827	0.680513165757049	0.0007214826020346	0.6787414256925346	0.0096233767318847	0.0147532131400573	6.204648207599283e-06	0.5056184801342273	1.538918642080981e-05	0.5046891893081835	8.921254369858e-05	0.8879341742756383	0.0005580970756957	0.8851828698490135	GBX2	263473	ASB18	359496	AGAP1	410869	False	False	False	alt	90	0.002686	80	0.01438
2389	chr2	235913925	C	G	rs1962550	0.0299861321999999	0.0985181735697664	0.0299861321999999	0.1045547251934839	0.0090678887456394	0.4119175603021756	0.0002764051678694	0.1108020704645289	0.0002764051678694	0.116705913042034	0.3169099264515191	0.4619662530705152	0.0098581028332929	0.1256540886182031	0.0098581028332929	0.1342828323322609	0.00293006293862	0.4161300262984712	9.257021283032162e-05	0.1326296486612132	9.257021283032162e-05	0.1406804447595324	0.0215915102853763	0.0595436882259423	0.0215915102853763	0.0612752533824423	GBX2	254461	ASB18	350484	AGAP1	419881	False	False	False	alt	60	0.01544	45	0.08606
2390	chr2	235917218	A	G	rs13031349	0.0652563434	0.0104940329500178	0.0652563434	0.0111996852030454	0.0148051377767166	0.0849537631423751	0.0010087266515724	0.0123772172262901	0.0010087266515724	0.0130286987392509	0.5189867114804094	0.1423769235829368	0.0341704990048982	0.0100312004045053	0.0341704990048982	0.0108608711342329	0.0076779105577163	0.0360689234369908	0.000528046342617	0.0109740401668221	0.000528046342617	0.0117108507465426	0.0186516457639601	0.0776430926600162	0.0186516457639601	0.0799039334806255	GBX2	251168	ASB18	347191	AGAP1	423174	False	True	False	alt	-90	0.00612	15	0.010864
2391	chr2	236009895	T	C	rs3738994	0.00242069871	0.6949050784737509	0.00328111543	0.7021881751349439	0.0071927367291186	0.7425759911200666	1.6570626560069038e-05	0.7450643779265116	2.2671099571102364e-05	0.7521359361855173	0.4883411653647859	0.192978551131662	0.0011743198526873	0.5078240878168129	0.0015925188402172	0.5148645622407545	0.0035261923475681	0.3326024109424573	8.077847188526526e-06	0.5588897447839309	1.1042935648561957e-05	0.5655849212804851	0.00084233238934	0.7747483127156698	0.0011493895164886	0.782098078270673	GBX2	158491	ASB18	254514	IQCA1	497640	False	False	False	alt	100	0.03897	-40	0.03003
2392	chr2	236010027	C	T	rs3738993	-0.0060819515	0.5481716745784244	0.0060819515	0.5351658597447037	0.0075647024279551	0.6624930923873198	-4.8925487516723975e-05	0.5821201288871075	4.8925487516723975e-05	0.5694588391603872	0.4697745827238871	0.2226389516294883	-0.0028367511609273	0.4012754460034389	0.0028367511609273	0.3883936960386632	0.003554454045219	0.3271725018036509	-2.283768708838985e-05	0.4317614193003973	2.283768708838985e-05	0.4191432606550269	-0.002184669965456	0.6483504830009076	0.002184669965456	0.6358322116822043	GBX2	158359	ASB18	254382	IQCA1	497508	False	False	False	ref	65	0.06573	-85	0.05554
2393	chr2	236011530	C	T	rs12053257	-0.067691923	0.0095518507287913	0.067691923	0.0090734728824707	0.013166551547244	0.1274227369229612	-0.0009367435197587	0.0160674271172793	0.0009367435197587	0.0153348107998071	0.4883266423925559	0.193322876958723	-0.0333749563685355	0.0121903966554256	0.0333749563685355	0.0112599851611184	0.0064448940439263	0.0680917948311836	-0.0004615436653291	0.0159004550176685	0.0004615436653291	0.0149375709370879	-0.024025145489061	0.0482057618248699	0.024025145489061	0.0469559031491575	GBX2	156856	ASB18	252879	IQCA1	496005	False	True	True	ref	100	0.03152	100	0.03873
2394	chr2	236014543	C	T	rs2123511	-0.0478225046	0.0338839672106909	0.0478225046	0.0317931907524568	0.0112497074741975	0.212560152278473	-0.0005560134650641	0.0403287976379307	0.0005560134650641	0.0382535403792486	0.6086639902903557	0.0413786436678642	-0.029073525606446	0.0190019796681215	0.029073525606446	0.0175547062776193	0.0068499069212409	0.0522548423015792	-0.0003381053276608	0.0261071741493353	0.0003381053276608	0.0244329432523726	-0.0061245448604238	0.3273881525048041	0.0061245448604238	0.3185335165500165	GBX2	153843	ASB18	249866	IQCA1	492992	False	False	False	ref	100	0.01396	55	0.06204
2395	chr2	236027733	T	C	rs11692136	0.0514472134	0.0234723715030187	0.0514472134	0.0251284617661614	0.010312119078709	0.2837334141435675	0.0005493700108757	0.0344672991354798	0.0005493700108757	0.0366643617095667	0.4591935600991711	0.2387772559631907	0.0234994700247503	0.0267877520574225	0.0234994700247503	0.0293091688557092	0.0047111970732933	0.1711676404203703	0.0002497466226604	0.0340526771698741	0.0002497466226604	0.0367361987619037	0.0228923536551208	0.0584721583459433	0.0228923536551208	0.0601114416719236	GBX2	140653	ASB18	236676	IQCA1	479802	False	False	False	alt	5	0.0003967	5	0.002777
2396	chr2	236035028	C	T	rs876739	-0.0605360116	0.0145541067400273	0.0605360116	0.0136772158452938	0.018202195187062	0.0385827011541408	-0.0011323298626268	0.0109625899549009	0.0011323298626268	0.010471705862869	0.4509984543408126	0.2388759245995004	-0.0275736012198887	0.0203798765437898	0.0275736012198887	0.0187371215362627	0.0084085744051274	0.028428964047664	-0.0005282295832929	0.0127208718377925	0.0005282295832929	0.0119656758030241	-0.0276890839116587	0.0363400443637186	0.0276890839116587	0.0354069541042223	GBX2	133358	ASB18	229381	IQCA1	472507	False	True	False	ref	45	0.0002251	90	0.0534
2397	chr2	236041990	A	G	rs3754659	0.0058168394	0.5132840236444342	0.0058168394	0.5264135830870541	0.0067979009752838	0.8277399414936749	3.9762612430980376e-05	0.5915652446359374	3.9762612430980376e-05	0.6044229860737652	0.5155530659031734	0.1508850064503647	0.0029944611119246	0.3503447961871856	0.0029944611119246	0.3631560680798048	0.0035062998434911	0.3320165147228811	2.048084037159885e-05	0.4098221863944734	2.048084037159885e-05	0.422547370391276	0.0016701418064502	0.6912441040601648	0.0016701418064502	0.70452162825453	GBX2	126396	ASB18	222419	IQCA1	465545	False	False	False	alt	-20	0.0002041	-40	0.05298
2398	chr20	38769266	A	G	rs2247983	0.01754965	0.194179807007033	0.01754965	0.2033336244859296	0.0096113175767245	0.3415245943792782	0.0001684942727353	0.1904509435666248	0.0001684942727353	0.1987642098879486	0.464915611157792	0.230902399599782	0.0081621304538483	0.1423969778196412	0.0081621304538483	0.1513748516218897	0.004476003113377	0.1925429739322829	7.848383258358019e-05	0.1398794545149781	7.848383258358019e-05	0.1481816764364428	0.0071743482816211	0.264819775653748	0.0071743482816211	0.2728732536317003	ACTR5	20805	PPP1R16B	36432	SLC32A1	44779	False	False	False	alt	-100	0.0004168	80	0.01181
2399	chr20	38817104	C	T	rs6129108	0.01041685886	0.351725989450585	0.01041685886	0.363468673762408	0.0065917335648673	0.8359222430012533	7.369957446884016e-05	0.4443810422846832	7.369957446884016e-05	0.4560811566982044	0.3796242699613066	0.3669806630911371	0.003947274734658	0.2927293866568299	0.003947274734658	0.3045404123812721	0.0024867307958068	0.5180004741701111	2.781936224613561e-05	0.3583628749456262	2.781936224613561e-05	0.3702867296675704	0.0059772404278052	0.3352150616843929	0.0059772404278052	0.3445341054323051	PPP1R16B	11406	ACTR5	68643	SLC32A1	92617	False	False	False	alt	-100	0.001015	-80	0.03583
2400	chr20	38828463	G	A	rs6129111	0.0022643141112	0.5985307155779662	0.0042374007112	0.6072447037553704	0.0128732959229683	0.1357304697922381	2.3800265317472164e-05	0.4915688802887625	5.653337156631827e-05	0.4987264785089684	0.5094637911181651	0.1561151218838014	0.0010195178061224	0.4355558812927489	0.0021022500732333	0.4441130499925392	0.0065779705522593	0.0615548651999724	1.0269997719530807e-05	0.3562679293091539	2.8232306327065225e-05	0.3634292586075718	0.0009128725401715	0.722794383991285	0.001506239691283	0.7315766386700533	PPP1R16B	22765	ACTR5	80002	FAM83D	97850	False	False	False	alt	100	0.01116	100	0.0996
2401	chr20	38829366	G	T	rs1006945	-0.0184782426	0.2013075319098288	0.0184782426	0.1922957628771078	0.0099183296068904	0.3094702668670974	-0.0001841442470179	0.188037889684435	0.0001841442470179	0.1800260138839187	0.4583242564756896	0.2367090382687876	-0.0084658249118218	0.1537476228905863	0.0084658249118218	0.1449351744163175	0.0045266733723896	0.1849783995672494	-8.399158034698204e-05	0.1455468281161901	8.399158034698204e-05	0.1375710933465795	-0.0077594165914583	0.2662230151886809	0.0077594165914583	0.2583829578868061	PPP1R16B	23668	ACTR5	80905	FAM83D	96947	False	False	False	ref	40	0.002724	-10	0.004364
2402	chr20	38853973	A	G	rs4812319	-0.0243555778	0.1465750849938742	0.0243555778	0.139254533347548	0.0108303825844823	0.2442366687338742	-0.0002837275927452	0.1234578615056403	0.0002837275927452	0.1175345498366707	0.4808784323488832	0.2022055843997049	-0.011811625411052	0.110106934498754	0.011811625411052	0.1031565691213085	0.0052113907471506	0.1299029060627882	-0.000137713915459	0.0984584669906118	0.000137713915459	0.092695063732687	-0.0085602547744271	0.2373819878139276	0.0085602547744271	0.2305592926621432	PPP1R16B	48275	FAM83D	72340	ACTR5	105512	False	False	False	ref	-70	0.002014	60	0.0421
2403	chr20	38855668	G	A	rs6028167	-0.0230025422	0.1456303442925056	0.0230025422	0.1389823595205365	0.0138392981122826	0.1115176391291295	-0.0003627438775377	0.0893660141542864	0.0003627438775377	0.085689932366632	0.3763918712849718	0.3776791499886419	-0.0086395376904097	0.1575873406668869	0.0086395376904097	0.1493410451053085	0.0052202521264729	0.1218807659095213	-0.0001362998891928	0.1001999946510141	0.0001362998891928	0.0950652185437951	-0.0145686158570109	0.1250112426212105	0.0145686158570109	0.1215722371014808	PPP1R16B	49970	FAM83D	70645	DHX35	106632	False	False	False	ref	-90	0.01157	-80	0.1621
2404	chr20	38856737	T	A	rs4812324	-0.0038815691	0.5830265194224723	0.00510883842	0.5760023475471648	0.0063731812769089	0.8766645173844793	-2.5585594931091844e-05	0.6639124089999453	3.28613377650331e-05	0.6570588213436895	0.3105405657735039	0.4746330299620337	-0.0011616353298931	0.50968535927239	0.0016066905788821	0.5029428649737797	0.0019599838549665	0.6090191076870793	-7.574704006601946e-06	0.5737928921725997	1.0213169322517243e-05	0.5671144937379747	-0.0027946347991161	0.4909435790065392	0.0036079212439962	0.4846028350623164	PPP1R16B	51039	FAM83D	69576	DHX35	105563	False	False	False	ref	-100	0.002134	100	0.02211
2405	chr20	43178221	T	C	rs2425614	-0.0073415512	0.4758875337392699	0.0073415512	0.4630726018700393	0.0081817189121981	0.5652808638352341	-6.825969141029281e-05	0.4933323905364441	6.825969141029281e-05	0.4813841808379598	0.3252876067179119	0.4571468952342258	-0.0023921490426064	0.4328571978306763	0.0023921490426064	0.4199249966370997	0.0026802985539234	0.4725117338594912	-2.251637026158765e-05	0.4415087009940411	2.251637026158765e-05	0.4290121552956482	-0.0053423790703222	0.3982626970996675	0.0053423790703222	0.3884297486602083	PTPRT	11749	SRSF6	279673	ENSG00000288000	279834	False	False	False	ref	-100	0.001741	-15	0.011536
2406	chr20	43185524	A	G	rs926288	0.0377565603999999	0.0561163985839853	0.0377565603999999	0.060296363708727	0.0082712346478617	0.5386100650620159	0.0003146737108625	0.0857429950915206	0.0003146737108625	0.0909036896680631	0.2748783701075737	0.5401264240428925	0.0104902530380264	0.1087045699292107	0.0104902530380264	0.1165844846545686	0.0022833546831474	0.5558426198726741	8.780078415799458e-05	0.1291168412568463	8.780078415799458e-05	0.1369784779455624	0.0325729520015767	0.0191512151446968	0.0325729520015767	0.0196634346840931	PTPRT	4446	SRSF6	272370	ENSG00000288000	272531	False	False	False	alt	100	0.001972	-10	0.02208
2407	chr20	43261438	T	C	rs3950190	0.0835696139999999	0.0037570759937894	0.0835696139999999	0.0038922958466802	0.0203080468766788	0.0251045497643188	0.00177547745721	0.0048226703824104	0.00177547745721	0.0050191833613967	0.3870870029772092	0.3584026021253007	0.0325135429246992	0.0103900887414907	0.0325135429246992	0.0112885346755392	0.0079885130202724	0.0345255467815863	0.0007024673951595	0.0070491997262693	0.0007024673951595	0.007481048275405	0.05274536042905	0.0030592584029304	0.05274536042905	0.0031626670926319	PTPRT	71468	SRSF6	196456	ENSG00000288000	196617	False	True	True	alt	-20	0.001343	-10	9.155e-05
2408	chr20	43263195	T	C	rs1569440	0.01083870054	0.3509836370922828	0.01083870054	0.3628463365611082	0.007353504693598	0.7249120275175229	8.041088126665883e-05	0.4163731600927073	8.041088126665883e-05	0.4278003547179745	0.3973920891295552	0.3349976942161262	0.0042908557209942	0.2929785938217538	0.0042908557209942	0.304978037312415	0.0029123251077095	0.4385408617982554	3.171391927290091e-05	0.3390930386198317	3.171391927290091e-05	0.3506921889360277	0.0057054533760723	0.3438064216271563	0.0057054533760723	0.3532339832397234	PTPRT	73225	SRSF6	194699	ENSG00000288000	194860	False	False	False	alt	-55	0.002047	-15	0.012146
2409	chr20	44995017	C	T	rs6017460	0.0036915298604	0.6737049618566834	0.0036943847795999	0.6870459033947464	0.0195801425575692	0.0291266411106551	8.010048623358957e-05	0.4696802483376431	8.01470999078513e-05	0.4815664014398431	0.076824448386394	0.8626001679040942	0.0003135565449761	0.8214388922825911	0.000313799985628	0.834746461894853	0.0015314341670199	0.6924066385919506	6.902022857134152e-06	0.7038515803327565	6.905997632831317e-06	0.7164926623311428	0.0027510658824261	0.585884483127173	0.0027510658824261	0.5978311721135438	STK4	28522	TOMM34	34620	PABPC1L	84956	True	False	False	alt	-80	0.039	75	0.01825
2410	chr20	46052214	G	A	rs12624433	-0.0358943752	0.0708611034842896	0.0358943752	0.0665853797640549	0.0144669461898107	0.0897789374211886	-0.0005276838569969	0.0402445013323934	0.0005276838569969	0.0379719527927516	0.5386798618242927	0.1164035477705438	-0.0193726063908139	0.0475186402778997	0.0193726063908139	0.0438260317077986	0.0078090944596788	0.0324046852208168	-0.0002853687264369	0.0312335409255378	0.0002853687264369	0.0291423759607478	-0.0087635763856471	0.2189705455312647	0.0087635763856471	0.2123921240928622	SLC12A5	30523	NCOA5	37748	MMP9	43305	False	False	False	ref	70	0.00447	-60	0.04428
2411	chr20	46093017	T	C	rs4578918	0.057906847	0.0142217101985409	0.057906847	0.0152162300007101	0.0107394368793644	0.2348182707284137	0.0006283862865285	0.0250793655399757	0.0006283862865285	0.0267457415560896	0.5694042469320221	0.0783989717019546	0.0329847087409645	0.0099831640626045	0.0329847087409645	0.0108752095604113	0.0061105629796054	0.0741795988260408	0.0003576804744387	0.0181962385889712	0.0003576804744387	0.0196386052592412	0.0112532287679332	0.1559788539393234	0.0112532287679332	0.1610153348509969	NCOA5	3055	CD40	25255	SLC12A5	71326	False	True	False	alt	-100	0.02213	85	0.02425
2412	chr20	46107215	A	G	rs6065926	0.0071299091799999	0.4583790717940468	0.0071299091799999	0.4711369739769467	0.0120792860666925	0.1683019038531009	8.069458461249258e-05	0.3832647639507536	8.069458461249258e-05	0.3945438348016197	0.218981524704613	0.6292579046939303	0.0015260077206663	0.5023208056074913	0.0015260077206663	0.5160388969257392	0.0026580813495636	0.4773873091570531	1.723693397888391e-05	0.4412264692797414	1.723693397888391e-05	0.4539517627623951	0.006840319920331	0.2911070680650702	0.006840319920331	0.2989909241651914	CD40	11057	NCOA5	17253	SLC12A5	85524	False	False	False	alt	100	0.001179	-40	0.02403
2413	chr20	46111557	C	T	rs6074022	-0.0135062248	0.2754722220563452	0.0135062248	0.2650333780361688	0.0084875585289163	0.5037550489071136	-0.0001132576293094	0.303654826823228	0.0001132576293094	0.2939281167537683	0.1236755568003817	0.7728031302383933	-0.00166796317873	0.4997820609270771	0.00166796317873	0.4859478011578289	0.0010044977310368	0.7831468280413051	-1.3318304077572096e-05	0.5105891974920284	1.3318304077572096e-05	0.4974891703507694	-0.0116287513355947	0.1536573770018636	0.0116287513355947	0.1490368297897171	CD40	6715	NCOA5	21595	SLC12A5	89866	False	False	False	ref	100	0.003057	-70	0.010925
2414	chr20	46119308	T	G	rs4810485	0.0603309275999999	0.0128963979303457	0.0603309275999999	0.0138146258241384	0.0144582456447092	0.0879980100198839	0.000882202846241	0.0139052528085556	0.000882202846241	0.0147001300448167	0.5470305708565443	0.1057456801149236	0.0330492517994668	0.010427536274486	0.0330492517994668	0.0113621898096751	0.0079161925587584	0.0304084082704346	0.00048371588868	0.0114193639862015	0.00048371588868	0.012222602824292	0.0145312710712766	0.1195768204018593	0.0145312710712766	0.1233244620003709	CD40	1036	NCOA5	29346	SLC12A5	97617	False	True	False	alt	15	0.0006905	90	0.1702
2415	chr20	49483086	C	T	rs74361372	0.003116232528	0.7146269816940056	0.0033302186079999	0.7228478461604906	0.0141269491342241	0.0957084799156168	4.86662531179312e-05	0.5874086519268514	5.1223404345254274e-05	0.5954174878190408	0.7701718897498937	0.0074167230834654	0.0023944486617483	0.4345915198839385	0.0025583206326106	0.4433207455548152	0.0108757560504851	0.0095578235559399	3.7340399775657685e-05	0.3339592394212536	3.929868331651051e-05	0.3420977820844366	0.00059544186143	0.8646449706874685	0.0006576831709871	0.8721852426682436	KCNB1	1211	PTGIS	85051	ZNFX1	204660	False	False	False	alt	100	0.00851	-100	0.0668
2416	chr20	49486664	T	C	rs6012677	0.000801903922	0.8131794990354005	0.001613889042	0.8232326515574129	0.0059733842289142	0.9008907464756042	4.8064592011398665e-06	0.8690860197490348	9.35344302992297e-06	0.879047366414219	0.2226786584923079	0.6181251820813645	0.0002322296821668	0.7640980067740675	0.0003435334464686	0.7748982841027617	0.0013536845748636	0.7205425687137188	1.4095377543675195e-06	0.8109651682908123	2.032820613251325e-06	0.8216230998313659	0.0008361082583843	0.6898489057834315	0.0016493947032645	0.6987294731135841	KCNB1	2367	PTGIS	81473	ZNFX1	208238	False	False	False	alt	-85	0.001524	-100	0.01396
2417	chr20	49488780	T	C	rs11696755	-0.0100898679999999	0.3756975706211779	0.0100898679999999	0.3639433393545133	0.011541800176648	0.1914083143961226	-0.0001214504484771	0.3038584332853566	0.0001214504484771	0.2937950935702119	0.3035757632340584	0.4909085545639513	-0.0032549595004619	0.3641890151198253	0.0032549595004619	0.3515155743212783	0.0035212400411961	0.3197926464539351	-3.945010622687715e-05	0.3066427076926041	3.945010622687715e-05	0.2952412095417339	-0.0070311932696396	0.2790794495007394	0.0070311932696396	0.2715155376800588	KCNB1	4483	PTGIS	79357	ZNFX1	210354	False	False	False	ref	90	0.0008163	60	0.01831
2418	chr20	49493651	C	T	rs6095541	-0.0068459856399999	0.4902965372875644	0.0068459856399999	0.4774621878219232	0.0061023626142445	0.9202224229604726	-4.149074582819004e-05	0.5977786551486255	4.149074582819004e-05	0.5850264687350837	0.0442100021784457	0.9180740272883386	-0.0003263210312406	0.8091675139749698	0.0003263210312406	0.7949783835453061	0.0002671306344022	0.9409137046332452	-1.952452684925727e-06	0.8484398746572851	1.952452684925727e-06	0.8341456484200531	-0.0037842716210748	0.4777088561292805	0.0037842716210748	0.466579105807715	KCNB1	9354	PTGIS	74486	ZNFX1	215225	False	False	False	ref	-90	0.001373	95	0.02771
2419	chr20	49506550	T	G	rs5596	-0.0102942972	0.3538561877528707	0.0102942972	0.3425936692098851	0.026359379392637	0.0072660968850765	-0.0002704276218409	0.1181020882686452	0.0002704276218409	0.1122298999605336	0.3949626033465076	0.3426360218310992	-0.0040391040774112	0.2957442894015823	0.0040391040774112	0.2841738203778342	0.0103859918166471	0.0112503702247124	-0.0001058949305846	0.1164231031838024	0.0001058949305846	0.1097371086952696	-0.0056328385149222	0.3507429646999293	0.0056328385149222	0.3415290158759574	KCNB1	22253	PTGIS	61587	B4GALT5	207328	False	True	True	ref	-50	0.00955	-5	0.00535
2420	chr20	49510639	T	C	rs729824	0.0054831523	0.5510566535600139	0.0054831523	0.5640906309973951	0.0079528636642552	0.5996856906154677	4.478334945840843e-05	0.575782400798904	4.478334945840843e-05	0.5885440545360928	0.3811803027002354	0.366326285719538	0.0020745958713901	0.4357083971689246	0.0020745958713901	0.4488616408646342	0.0030285227635998	0.4123957785678205	1.693187266968667e-05	0.4569366197529997	1.693187266968667e-05	0.4697422472322336	0.0030477494579818	0.5372140693322366	0.0030477494579818	0.5493082466496986	KCNB1	26342	PTGIS	57498	B4GALT5	203239	False	False	False	alt	65	0.01178	100	0.0647
2421	chr20	49513791	C	T	rs495146	-0.003351513655	0.6707277773148448	0.004221296375	0.6660316953786154	0.011437729510271	0.1989027897469328	-4.146171959209374e-05	0.6205105002593517	4.980614190451655e-05	0.615610325388761	0.5491301776989388	0.1018814672477813	-0.0018738671920078	0.497905122521426	0.0023684574925633	0.4908378575516993	0.0062654449443261	0.0700976176216094	-2.3251671510900147e-05	0.4549757234067216	2.79966154779306e-05	0.4480251601049899	-0.0006701314328986	0.8500290355177533	0.0008153611551986	0.845848915639586	KCNB1	29494	PTGIS	54346	B4GALT5	200087	False	False	False	ref	20	0.003265	10	0.01709
2422	chr20	49514764	G	C	rs6012680	-0.0301486113999999	0.1027127973576422	0.0301486113999999	0.0967849263264901	0.0100202806380088	0.3063159811388795	-0.0003049849866522	0.0994815144919347	0.0003049849866522	0.0942866269743622	0.497797694996836	0.1757005532553955	-0.0149596271965037	0.0758781694362415	0.0149596271965037	0.0703019611323426	0.0050084890962207	0.1457122579617646	-0.0001518301534597	0.0768671293013116	0.0001518301534597	0.071752745455456	-0.0103548791999916	0.1959432060222587	0.0103548791999916	0.1899636251185758	KCNB1	30467	PTGIS	53373	B4GALT5	199114	False	False	False	ref	100	0.005768	55	0.1255
2423	chr21	14982650	C	T	rs1810404	-0.0462057545999999	0.0366156163120635	0.0462057545999999	0.0343274742013554	0.0117614199738044	0.1847334426814343	-0.0005702635061595	0.0382838557637499	0.0005702635061595	0.0361237075968217	0.1057355366756916	0.8138953627415056	-0.0054705253211046	0.2616060860307022	0.0054705253211046	0.2502298397363904	0.001340354171662	0.720853057824039	-7.182570565330061e-05	0.2101760381284422	7.182570565330061e-05	0.2005645981664318	-0.0371871077500803	0.0125030150736334	0.0371871077500803	0.0121776494267402	NRIP1	83286	SAMSN1	323829	HSPA13	599166	False	False	False	ref	-30	0.002258	5	0.000946
2424	chr21	14991212	G	A	rs34570637	-0.0330292012	0.0894320000804592	0.0330292012	0.0842395072621793	0.0082908746442605	0.5283010241878611	-0.0002774872415798	0.1222032123002916	0.0002774872415798	0.1162204429019975	0.1480285065197771	0.7407169650628875	-0.0048422109796457	0.26816609868476	0.0048422109796457	0.2569993535827387	0.0012460978487515	0.745652671145344	-4.136650704961237e-05	0.2840634043463334	4.136650704961237e-05	0.2733423085512136	-0.0293986452141619	0.0268776260247672	0.0293986452141619	0.0262045675522371	NRIP1	74724	SAMSN1	332391	HSPA13	607728	False	False	False	ref	40	0.003368	-100	0.0188
2425	chr21	15022260	T	C	rs73172392	0.001336709328	0.8076845592643132	0.0021465511799999	0.8115553330148624	0.0091412717113776	0.4150473071242664	1.3741307349668185e-05	0.783997006997714	2.229851141665847e-05	0.7876802381935548	0.1348644695484392	0.7652259141217019	0.0002872613698981	0.8236024092458198	0.000373625099671	0.8275091705006055	0.0012457039091744	0.7518982300035684	3.005984130457704e-06	0.8093486045774847	3.917681142485766e-06	0.8132230236576314	0.001099596468843	0.7013745951678406	0.0018340439216173	0.7052088823873918	NRIP1	43676	SAMSN1	363439	HSPA13	638776	False	False	False	alt	-90	0.002893	80	0.01913
2426	chr21	20758576	C	T	rs2826495	-0.00138881571	0.8530177845695222	0.0015788596379999	0.843570383473552	0.0136404773020701	0.10999624066621	-1.870439066778947e-05	0.7671343409029739	2.128552398259512e-05	0.7577688649181511	0.1715308250085581	0.7062218353944739	-0.0002564434114924	0.8238899183682596	0.0002902869585182	0.814454773917283	0.0023583671203317	0.5405758122523563	-3.4492201162705454e-06	0.7639578171936474	3.908875461401393e-06	0.7542142864386719	-0.0014253259888588	0.7291095662798444	0.0015622568698845	0.7196989095169763	NCAM2	239834	TMPRSS15	2272697	CHODL	2857312	False	False	False	ref	-60	0.01773	-100	0.04605
2427	chr21	33900088	T	G	rs3746862	-0.0255583954	0.1396519778178434	0.0255583954	0.1323228482507568	0.0217502561814915	0.0186628821110197	-0.0005748394525836	0.0365531530008806	0.0005748394525836	0.0343809563112127	0.4391643066836792	0.2695666540170725	-0.0113824318114935	0.1144947885213393	0.0113824318114935	0.1069529858083204	0.0096656135771535	0.0157295042511792	-0.0002589127996136	0.039324346076958	0.0002589127996136	0.0365878268004057	-0.0111494932520046	0.1651391192932861	0.0111494932520046	0.1601057146322524	ATP5PO	15726	ENSG00000249209	31519	MRPS6	173137	False	True	False	ref	30	0.002523	90	0.04773
2428	chr22	19990499	C	T	rs4819527	-0.0541659422	0.0218221601932456	0.0541659422	0.020377984458135	0.0104197086173971	0.2660618176560977	-0.0005768385928049	0.0353457205028459	0.0005768385928049	0.0332369201477625	0.5196630670442639	0.1377863666452505	-0.0280428996576651	0.0196410916618462	0.0280428996576651	0.0180982980231744	0.0054216686935856	0.111286076297777	-0.0002986828949883	0.0294563827378935	0.0002986828949883	0.0273713516878781	-0.0166018319692112	0.106615097610826	0.0166018319692112	0.103475867147351	ARVCF	26324	TANGO2	26516	TXNRD2	48679	False	False	False	ref	100	0.003391	100	0.05908
2429	chr22	20080563	G	C	rs61174903	-0.0500030051999999	0.0296772014743816	0.0500030051999999	0.0278423335100359	0.0178422697319881	0.0424071993455877	-0.0009454764369965	0.0180726568321532	0.0009454764369965	0.0171494523170333	0.9394039357254744	0.001493577079393	-0.0469600600217327	0.004397015302088	0.0469600600217327	0.0041233880219784	0.0167450511034303	0.0026274947653412	-0.0008869573231976	0.0061344614784782	0.0008869573231976	0.0057979137297223	-0.0068610670235167	0.2950179653562257	0.0068610670235167	0.2868296032631223	DGCR8	341	RANBP1	35376	TRMT2A	36829	True	False	False	ref	-35	0.007584	-15	0.04797
2430	chr22	21676839	C	T	rs138647105	-0.00812228924	0.4282429160527746	0.00812228924	0.4162116282348772	0.0064689880746987	0.8690101210642078	-5.259638308618671e-05	0.5230064238515725	5.259638308618671e-05	0.5109050740592345	0.5976514279193768	0.0505706744293817	-0.0048146738361556	0.2629002114001613	0.0048146738361556	0.2517436699185671	0.0038680030497296	0.2728673204409732	-3.120606729473185e-05	0.3285872280718688	3.120606729473185e-05	0.3174048078888737	-0.0012697227149658	0.7762371235487276	0.0012697227149658	0.7628044535282278	PPIL2	10838	SDF2L1	34536	CCDC116	44122	False	False	False	ref	100	0.0837	100	0.2125
2431	chr22	21713850	C	T	rs7349039	-0.0305511142	0.0973276855786933	0.0305511142	0.0917849903399055	0.0089218047228467	0.4346514976146001	-0.0002746069251189	0.1135393771479356	0.0002746069251189	0.1078211373352526	0.5135405968941587	0.1537340686640899	-0.0157093436987544	0.0688347250671965	0.0157093436987544	0.0637758524875905	0.0045794272060529	0.1796376861631781	-0.0001411334736358	0.0825884664790622	0.0001411334736358	0.0773123182229228	-0.0090851564850257	0.2128143714338	0.0090851564850257	0.2063350678080512	YPEL1	21944	PPIL2	47849	SDF2L1	71547	False	False	False	ref	95	0.003777	100	0.08826
2432	chr22	38825665	A	G	rs75974641	0.0253277011999999	0.127384231811603	0.0253277011999999	0.1347081486814387	0.0065543625238105	0.8536599257025306	0.0001728014946396	0.2047002195010191	0.0001728014946396	0.2132451449239655	0.3445824126806294	0.4186226198637621	0.0084176566776053	0.1416710347413543	0.0084176566776053	0.1507808853281201	0.0022221264203817	0.5608331910292701	5.628956477803219e-05	0.198900419171833	5.628956477803219e-05	0.208643313438399	0.01817238768037	0.0899798921602366	0.01817238768037	0.0928208086550517	NPTXR	18363	DNAL4	31467	SUN2	31522	False	False	False	alt	75	0.01352	-30	0.003906
2433	chr22	38828900	C	T	rs8136346	-0.12502903	0.000937717114439	0.12502903	0.0008772777180489	0.0262565266910311	0.0091210000343795	-0.0033855007588646	0.0019007382666158	0.0033855007588646	0.0018280302641287	0.5034160105395284	0.1682378863320988	-0.0626726204739108	0.0013753381842471	0.0626726204739108	0.0012935139803661	0.0131404370916153	0.0053724526174428	-0.0016876998163225	0.0019238852121779	0.0016876998163225	0.0018295425203858	-0.0463801491716718	0.0069367486734879	0.0463801491716718	0.0067672481380841	NPTXR	15128	DNAL4	34702	SUN2	34757	False	True	True	ref	-50	0.00103	-50	0.01624
2434	chr22	38851745	C	T	rs6001259	0.0059411144	0.3788798278561556	0.0092834204	0.387221931254959	0.0078272344966425	0.6323499088985455	4.2801239445713486e-05	0.4251106771890303	7.420993368266648e-05	0.4328562744768183	0.4697247896762414	0.219074083435442	0.0028508097066495	0.2700440063319066	0.0043399194978489	0.2782398964278238	0.0036563592240106	0.3120528777480737	2.0502256904652785e-05	0.30123315026474	3.4495887635084576e-05	0.3091377502228941	0.0020809344495274	0.490419648460394	0.0035664270376248	0.4981418892485537	NPTXR	7717	CBX6	20504	DNAL4	57547	False	False	False	alt	-60	0.003323	-55	0.01723
2435	chr22	38861668	G	A	rs1053197	-0.0770300718	0.0057789610727542	0.0770300718	0.0054788350024417	0.0300266854189347	0.0051618334431334	-0.0023649531783618	0.003127316378782	0.0023649531783618	0.0029801593711406	0.5938609321673461	0.053676735489243	-0.0456818306932469	0.0039123381134555	0.0456818306932469	0.003692708027987	0.0178728106102613	0.0020472922143095	-0.0014064526198434	0.0024016910342563	0.0014064526198434	0.0022739281585196	-0.0119586302762476	0.1526433971651929	0.0119586302762476	0.1480863928301429	CBX6	10581	NPTXR	17640	DNAL4	67470	False	True	True	ref	-85	0.00383	-80	0.0672
2436	chr22	39604216	G	T	rs5750857	0.00138749334	0.5807812480123296	0.00452630494	0.5848467900298927	0.0129309112088865	0.1368028145472821	2.129433740814879e-05	0.466442039762994	5.921723744036185e-05	0.4706449609290342	0.319333188103611	0.4681417296634276	0.0004901885080906	0.505845055736514	0.0014915253526982	0.510391469846995	0.0041251491472277	0.2376624476005115	7.411171284029693e-06	0.4209042773433685	1.950925264058576e-05	0.4250809609571088	0.0007717922385086	0.4956241740523053	0.0034108237637319	0.5003653570575931	CACNA1I	33462	RPS19BP1	71455	ATF4	84520	False	False	False	alt	-95	0.007835	-90	0.0601
2437	chr22	39650072	A	G	rs136828	0.0452496768	0.0333826202523619	0.0452496768	0.035772707185458	0.0097107064529378	0.3400706489630218	0.000442774339387	0.0472059979192452	0.000442774339387	0.0501770742133108	0.6088714613222128	0.0417928624528672	0.0276031006898939	0.0174471587974131	0.0276031006898939	0.0191061242252692	0.0059191258744648	0.0842816057522843	0.0002703875387773	0.0286772552276784	0.0002703875387773	0.0309049810662797	0.0058631313602837	0.3166899139099871	0.0058631313602837	0.3258194888802127	CACNA1I	79318	RPS19BP1	117311	ATF4	130376	False	False	False	alt	100	0.0064	-10	0.01526
2438	chr22	41062993	A	C	rs35060074	-0.0024431719108	0.7753260161566543	0.0024798374492	0.7667997487513131	0.0305273224646839	0.0038447923630748	-8.371790270498314e-05	0.4447103985480216	8.464703394447434e-05	0.4360321750660681	0.3246112511540575	0.4588658796051026	-0.0008246050304987	0.6664574680322054	0.0008351259430851	0.6572941859215652	0.0100041796436468	0.0133737334575317	-2.841169820825929e-05	0.4043167764139798	2.867830573754452e-05	0.3949865202407135	-0.0017759520326974	0.7040894011704972	0.0017966991358831	0.6957129197302792	EP300	29518	RBX1	111645	L3MBTL2	142290	False	True	True	ref	100	0.006622	50	0.03516
2439	chr22	41381909	T	C	rs2234059	0.035825311	0.0646604037085807	0.035825311	0.0691882569857312	0.012180799130505	0.1645347905076927	0.0004493128501711	0.0495954763820749	0.0004493128501711	0.0528709399161753	0.9931659042106246	5.100427052954514e-05	0.0355846481290026	0.0085429225351136	0.0355846481290026	0.0092922115297267	0.0120977896083896	0.0064874733824012	0.0004463084549776	0.0136465701795719	0.0004463084549776	0.0146501959572056	0.00092947022272	0.8036089500341969	0.00092947022272	0.8173831477728225	TEF	14575	TOB2	64892	ACO2	65922	True	False	False	alt	55	0.0005493	-90	0.02075
2440	chr22	41394496	T	C	rs2273071	0.0738418676	0.0069007770486157	0.0738418676	0.0072560720883039	0.026830934046526	0.0093555367818096	0.0021605675697114	0.0040840652926245	0.0021605675697114	0.0042557687734042	0.4662517246029523	0.2286239790387952	0.0345866573452074	0.0097613963583155	0.0345866573452074	0.0106225791856796	0.0125682111631086	0.0071477826337884	0.0010176465696443	0.004503221035882	0.0010176465696443	0.004752771870084	0.0310106951316921	0.0249803738120374	0.0310106951316921	0.0255991110175956	TEF	27162	TOB2	52305	ACO2	53335	True	True	True	alt	40	0.000518	100	0.014435
2441	chr22	41935405	G	C	rs10154646	-0.041973212	0.0484130072503501	0.041973212	0.0452419476712537	0.009595490933926	0.3378238388575796	-0.0004048756369144	0.0617943972958221	0.0004048756369144	0.0582406152253602	0.5651842861440471	0.0825704057502237	-0.0236531226044324	0.0307068808250185	0.0236531226044324	0.0283131346395407	0.0054352367424036	0.1083958552410282	-0.0002286413195759	0.0424903360733964	0.0002286413195759	0.0395869974756108	-0.0089295532111328	0.2326093970964961	0.0089295532111328	0.2255840228228796	TNFRSF13C	8599	CENPM	11747	SMIM45	11790	False	False	False	ref	-5	0.000113	0	0.0
2442	chr22	43750399	G	C	rs76365544	0.0019507429348	0.7595485072103029	0.0025626231452	0.7657879647829824	0.0065128531794356	0.8614747677949214	1.3087509204973716e-05	0.8080212398314739	1.727587471290883e-05	0.8142184765934903	0.2802975134596832	0.5298004338834739	0.0005980329487219	0.6898453364316628	0.0007565021611225	0.6934553527694459	0.0018283040987312	0.637873108381226	4.027202199558265e-06	0.7362480090850503	5.111640198738601e-06	0.7393596996895784	0.0015726304214773	0.6534578620001499	0.0021535493106774	0.657124282865796	EFCAB6	61938	SULT4A1	112114	PNPLA5	141614	False	False	False	alt	-40	0.003267	-95	0.03014
2443	chr22	49834093	G	A	rs138891	-0.0718596728	0.0081315767452669	0.0718596728	0.0076829282786386	0.0156805140261636	0.067363307452593	-0.0011638940349142	0.0107191575931416	0.0011638940349142	0.0102130957463847	0.4721148559632361	0.2119918964135831	-0.0344032597683525	0.0115991713048725	0.0344032597683525	0.0107548420025227	0.0074938950883657	0.0401440999966813	-0.0005646449403797	0.0117247213431032	0.0005646449403797	0.0110012200627253	-0.0277347275386673	0.0306788342556584	0.0277347275386673	0.029897158374305	BRD1	6220	ZBED4	19752	CRELD2	84075	False	True	True	ref	-100	0.002926	70	0.01901
2444	chr22	49842658	G	A	rs2319458	0.002047558448	0.6445425925491284	0.004215580448	0.6530203095494932	0.0251032718354665	0.0093129809120944	4.899172701641127e-05	0.3420730763611699	0.0001089093183944	0.3485244613381003	0.2324256475689582	0.6021541782672712	0.0003603527665162	0.6255856800796249	0.0009549681803239	0.6345594964356647	0.0058397026376284	0.0896382754197659	8.370841374452903e-06	0.3984308270240386	2.480421929792674e-05	0.4059150591816565	0.0016099752072116	0.4751542599374522	0.0037510762559777	0.4820431184555124	ZBED4	11187	BRD1	14785	CRELD2	75510	False	True	True	alt	-40	0.002172	-95	0.0842
2445	chr22	49865504	A	T	rs13056783	-0.00480172252	0.5895317215470425	0.00480172252	0.5764780866119803	0.0213798627538411	0.0202070821639681	-0.0001069332314295	0.3344590761244969	0.0001069332314295	0.3242721629206334	0.5065654208031204	0.1622752763123099	-0.0024343309575944	0.4120486190628374	0.0024343309575944	0.3990840665041149	0.0108493661160679	0.0096606773719519	-5.430570826356575e-05	0.2289577178467696	5.430570826356575e-05	0.2189703164151845	-0.0014979408500087	0.7396573383755994	0.0014979408500087	0.7263879084963769	ZBED4	11659	BRD1	37631	CRELD2	52664	False	False	False	ref	-70	0.004272	-100	0.1142
2446	chr22	49867412	G	C	rs2295409	0.009129884306	0.4054190803262884	0.009384096254	0.4157628823275385	0.0077796855098311	0.6190681888831716	7.797600620546954e-05	0.4350819265829666	7.997543983453966e-05	0.4447030377503023	0.4781418894386871	0.2087693358750043	0.0044382711604886	0.3033509138812992	0.0045554445695006	0.3135620597065405	0.0037224847757665	0.2957875404558184	3.798630931800926e-05	0.3306201793165757	3.890790429763013e-05	0.3403176601955068	0.0033568812954491	0.5114402772063206	0.0034606168113776	0.5191872328958426	ZBED4	13567	BRD1	39539	CRELD2	50756	False	False	False	alt	-100	0.008934	15	0.013855
2447	chr22	49867475	G	T	rs8139758	-0.0037268197799999	0.4854816956335028	0.0066141215	0.4769976391568188	0.0075335743693936	0.653823351263654	-3.0688346174547214e-05	0.5186802914294772	5.159163535058217e-05	0.510610093008708	0.4583595265511052	0.2413163357025811	-0.001626259688612	0.3695518368066189	0.00297773457495	0.3610502767801654	0.0034432930425922	0.3388093554826797	-1.3405881793305012e-05	0.394331604110243	2.3190197130611927e-05	0.3860022828022052	-0.0016991877509102	0.5602420815375384	0.0028278301642132	0.5525542916283801	ZBED4	13630	BRD1	39602	CRELD2	50693	False	False	False	ref	-50	0.000372	-50	0.00897
2448	chr22	49869993	G	T	rs5769761	-0.0145656245999999	0.2843577425403134	0.0145656245999999	0.2739767594179694	0.0085722641324923	0.482115635619782	-0.0001319020047397	0.2990612450543736	0.0001319020047397	0.28925084082198	0.2546250479776761	0.5703632481144181	-0.0037636416031054	0.3275161795072702	0.0037636416031054	0.3155151870639979	0.002167900207617	0.5764678216833325	-3.364350164417229e-05	0.3344700971326217	3.364350164417229e-05	0.3230359050790282	-0.0129212958640649	0.1644957002393604	0.0129212958640649	0.1599120376973701	ZBED4	16148	BRD1	42120	CRELD2	48175	False	False	False	ref	-70	0.02896	-100	0.01166
2449	chr22	49870394	G	A	rs5769762	0.0139031488799999	0.2591641400724112	0.0139031488799999	0.2697745718004048	0.0194805311346862	0.0293120651945545	0.0002779445372139	0.110501743295762	0.0002779445372139	0.1165756632126352	0.1587817301009346	0.7267260759236073	0.0022800602036647	0.4119332048751932	0.0022800602036647	0.4248043980799141	0.0031182929737954	0.4007990667259826	4.590887368462656e-05	0.2459635279697213	4.590887368462656e-05	0.2563671422325838	0.0133383126380978	0.1298723040838132	0.0133383126380978	0.1340267918164587	ZBED4	16549	BRD1	42521	CRELD2	47774	False	False	False	alt	0	0.0	100	0.0449
2450	chr22	49874174	T	C	rs4824106	-0.00713780478	0.4783504906888439	0.00779406122	0.4697604534270688	0.0069858141076887	0.7565239085087105	-5.468292800183367e-05	0.5433417409250492	5.9121693531469394e-05	0.5353477660752074	0.4286807954439361	0.2896642012490328	-0.0030623219907698	0.365020131903751	0.0033498524373018	0.3569487945769258	0.0030023839750272	0.4194193499998369	-2.355194069361136e-05	0.4160956017681074	2.549672954940545e-05	0.4082359909375754	-0.0031224390294504	0.525645686188908	0.0033880019502276	0.518091828768861	ZBED4	20329	CRELD2	43994	ALG12	44264	False	False	False	ref	100	0.03183	40	0.0361
2451	chr22	49879526	A	G	rs8184990	0.0562274206	0.0164582768828652	0.0562274206	0.017745254614768	0.0106287610207048	0.2470389596996589	0.0006093381710806	0.0271597744144732	0.0006093381710806	0.029033125249184	0.678729032458843	0.0145478898366661	0.0382032773066529	0.0065130911631119	0.0382032773066529	0.0070343629511814	0.0072151768386073	0.0425044800694277	0.0004140508635524	0.0147739245316079	0.0004140508635524	0.0159296000221847	0.0060830506540523	0.3094019652531293	0.0060830506540523	0.3184902461623413	ZBED4	25681	CRELD2	38642	ALG12	38912	False	True	False	alt	90	0.01955	100	0.1637
2452	chr22	49884920	A	G	rs910799	0.0878495228	0.0031686105227651	0.0878495228	0.0032959256145419	0.022863366776762	0.0144135859864881	0.0020334039894505	0.0035885600358688	0.0020334039894505	0.0037199591592181	0.6444153984999844	0.0221258247503047	0.0566126307672204	0.0016011404190884	0.0566126307672204	0.0016943162749833	0.0147409474625741	0.0036488411978345	0.0013111040430007	0.0023743666294663	0.0013111040430007	0.0024821316460284	0.0083527837425699	0.2163141266172861	0.0083527837425699	0.2231945428147171	ZBED4	31075	CRELD2	33248	ALG12	33518	False	True	True	alt	70	0.002478	-45	0.08026
2453	chr22	49884994	C	T	rs910800	-0.0799779328	0.0056049789427174	0.0799779328	0.0053182760411177	0.0192753734857993	0.0366340577525768	-0.0017118342541005	0.0072090702250153	0.0017118342541005	0.0068574131717203	0.6367182232180832	0.0249806410077257	-0.0510207407957499	0.0030089468141575	0.0510207407957499	0.0028297897794278	0.0122985988920349	0.0083164854378397	-0.0010945024670462	0.0048419087378686	0.0010945024670462	0.0045606716371769	-0.007591365055654	0.2611606234763383	0.007591365055654	0.2534425426378812	ZBED4	31149	CRELD2	33174	ALG12	33444	False	True	True	ref	-5	0.0002804	65	0.0323
2454	chr22	49893179	G	A	rs768618	-0.044449147	0.041666702344494	0.044449147	0.0390232832864877	0.0087686334544913	0.4534689597822487	-0.0003938289059937	0.0661942400355272	0.0003938289059937	0.0624266078321824	0.2337327150696584	0.6052222472400526	-0.0105445435119547	0.1266439133387406	0.0105445435119547	0.1186013814805926	0.0020635607570817	0.5974518268936392	-9.389923311695071e-05	0.1382408066076183	9.389923311695071e-05	0.1305182436662227	-0.0421830101972011	0.0090832234329251	0.0421830101972011	0.0088518667467057	CRELD2	24989	ALG12	25259	ZBED4	39334	False	False	False	ref	35	0.001192	-30	0.03113
2455	chr22	49893618	C	T	rs768619	0.00532955888	0.5341618811340608	0.00532955888	0.547127483907654	0.019973907420646	0.0268347136085636	0.0001057676275557	0.3194023228817242	0.0001057676275557	0.3296838013668072	0.2412556146847995	0.5937716081003109	0.0012971830897986	0.5381113300688645	0.0012971830897986	0.5517514483745556	0.0047626208498161	0.1622831617488743	2.544099545712013e-05	0.3633558926934	2.544099545712013e-05	0.375266469621393	0.0050519196257222	0.3767249788035638	0.0050519196257222	0.3868632676992227	CRELD2	24550	ALG12	24820	ZBED4	39773	False	False	False	alt	-95	0.002571	-90	0.01852
2456	chr22	49898221	A	G	rs8138687	0.0027738043799999	0.6100733333892329	0.00447446746	0.6124708084244358	0.0066869992389666	0.8310554828684278	1.9213422557318912e-05	0.6799903165487193	2.9892501195470744e-05	0.682020465640168	0.0449029554248487	0.9137898954348442	8.011433891159711e-05	0.8473509656673849	0.0001945591352467	0.8479374181822673	0.0002956056014989	0.9332714373070646	5.551560462691613e-07	0.871219961816376	1.2810796321735078e-06	0.8718488131421801	0.0009771885600472	0.5904281420866948	0.0025373707196132	0.5917702768201065	CRELD2	19947	ALG12	20217	ZBED4	44376	False	False	False	alt	75	0.0179	85	0.05927
2457	chr22	49915587	T	A	rs3883952	0.000866137034	0.861152518939309	0.001439192474	0.8698999089257625	0.0162581732626159	0.0626552341826586	1.2298833856118274e-05	0.7594983071145769	2.141094591819355e-05	0.7678251872014974	0.4717289598439818	0.2207549558509798	0.0004015105601206	0.6845599555675242	0.0006790529897076	0.6933267026584594	0.0076658103238473	0.0350358700503864	5.690394593716823e-06	0.5750917653527214	1.0103576140767832e-05	0.5831143653551493	0.0003236548096971	0.886903869857306	0.0005103787383686	0.8956329476078159	CRELD2	2581	ALG12	2851	PIM3	45182	False	False	False	alt	75	0.002838	90	0.0489
2458	chr22	49919710	G	C	rs8137331	-0.026321022	0.1321384307535806	0.026321022	0.1250659067897227	0.0109687359523634	0.2342731165165206	-0.0003102249195894	0.1084020479203613	0.0003102249195894	0.1029982420964671	0.5786450066909408	0.0683908906800808	-0.0152724285383978	0.0744921048509382	0.0152724285383978	0.069044484879919	0.0063708316453225	0.0686141881800518	-0.0001807361431082	0.0672553442820867	0.0001807361431082	0.0628164796089304	-0.0044979719706635	0.4234996949723021	0.0044979719706635	0.4129936355479094	ALG12	1272	CRELD2	1542	PIM3	41059	False	False	False	ref	80	0.00723	-55	0.03326
2459	chr22	49920698	A	G	rs7284417	0.0271724878	0.1072897336853851	0.0271724878	0.1135557147438478	0.0085924800443378	0.4901714361205441	0.0002534556962001	0.1280817564489025	0.0002534556962001	0.1345795269213737	0.523509579974896	0.1383218046406555	0.0143125950227406	0.07255905767771	0.0143125950227406	0.0780791187654657	0.0045060881427582	0.1906373167801037	0.0001336265600513	0.0896010901951958	0.0001336265600513	0.0954461479424956	0.0072614861150011	0.2747386788961817	0.0072614861150011	0.282758683971622	ALG12	2260	CRELD2	2530	PIM3	40071	False	False	False	alt	-100	0.001623	100	0.0968
2460	chr22	50660705	G	A	rs6010043	0.00196697196	0.7769918442335252	0.00208978064	0.786907947191922	0.0261136791861448	0.0076745293086977	5.084699485666613e-05	0.4901768259317366	5.350230926673403e-05	0.4997625142811493	0.1328685982219732	0.7617876207164446	0.0002710747145627	0.7870850001618898	0.0002821900342654	0.797293382120469	0.0036030532357085	0.279953693502987	7.25984003872734e-06	0.6067713748395662	7.50017052169752e-06	0.6176115213840138	0.0019896471955102	0.6332269959782335	0.0020601873463417	0.6427679447375544	SHANK3	13704	ARSA	32532	CHKB	59250	False	True	True	alt	100	0.007538	45	0.03156
2461	chr3	2325211	G	A	rs4685508	-0.02027177464	0.1828476352743623	0.02098286296	0.1759480770009256	0.0091686602450019	0.3924907057952146	-0.0002023807607347	0.1799285216310051	0.0002069830763431	0.1736893866792868	0.3421944211039533	0.4303728021200638	-0.0071248570327653	0.196230805028337	0.00733891601081	0.1880199341019219	0.0031892917021677	0.377971175813929	-7.168024966101875e-05	0.1910447833125386	7.30656851597331e-05	0.1835187518466475	-0.0147781615991866	0.1303301277797337	0.0151142646707952	0.1280097913743659	CNTN4	226397	IL5RA	801402	TRNT1	801723	False	False	False	ref	55	0.005817	-85	0.0383
2462	chr3	2326193	G	A	rs12638682	0.01327267626	0.2844944733377761	0.01327267626	0.2952212243370223	0.006731051322831	0.8092572516074633	9.698256418977284e-05	0.3647977256007447	9.698256418977284e-05	0.3757806858243798	0.3057811803027002	0.4905942950556505	0.0041245776520806	0.2912646852992405	0.0041245776520806	0.3031851713602731	0.0020636840567779	0.5983633761371858	3.0337602839954308e-05	0.3494732114810991	3.0337602839954308e-05	0.3613503133995881	0.0099669083704187	0.188209807934045	0.0099669083704187	0.1936739981491045	CNTN4	227379	IL5RA	800420	TRNT1	800741	False	False	False	alt	-95	0.001636	70	0.03107
2463	chr3	2331105	A	C	rs56251018	-0.006887269354	0.5606482212858852	0.006887269354	0.547148652844284	0.0088017665663372	0.4557944925675424	-6.780133109282702e-05	0.5549187388582171	6.780133109282702e-05	0.5424536087533806	0.1009865247564808	0.8243140169591202	-0.0009240852341021	0.7050459226353019	0.0009240852341021	0.6911506526836402	0.0009139867641727	0.8206872834094379	-8.971673439946972e-06	0.6974994688065194	8.971673439946972e-06	0.6838629882528274	-0.0063984066224752	0.4095695038509275	0.0063984066224752	0.4003849956280131	CNTN4	232291	IL5RA	795508	TRNT1	795829	False	False	False	ref	50	0.001862	70	0.015114
2464	chr3	2343483	G	A	rs1720179	0.12804724	0.0007534772804876	0.12804724	0.0008054645544092	0.037645110484595	0.0020485946755914	0.0049338806340903	0.0008952173200949	0.0049338806340903	0.0009534784173822	0.5411342441311632	0.1048656134115377	0.0702038277900087	0.0008714446584723	0.0702038277900087	0.0009259278410654	0.0205870526555639	0.0015203870546237	0.0027289139124574	0.0008246924917628	0.0027289139124574	0.0008851702870631	0.0324297969895953	0.0183603765150882	0.0324297969895953	0.0188564112381016	CNTN4	244669	IL5RA	783130	TRNT1	783451	False	True	True	alt	-100	0.013885	-100	0.1079
2465	chr3	2348928	C	A	rs1685495	-0.001604169402	0.8202046722700748	0.001970365358	0.8182252182197352	0.0085356533224037	0.478333554978372	-1.494961250214732e-05	0.8081484915734812	1.771376212877989e-05	0.8061967549134929	0.0348115644353156	0.9367153298537478	-6.048232064747045e-05	0.9338764338134078	7.123818631267256e-05	0.9328488039921058	0.000302664067424	0.93559365980257	-5.58361660098131e-07	0.931551460955686	6.419365443420778e-07	0.9304045872134744	-0.00076971752819	0.8127194812053987	0.0009979356632329	0.8111761748694978	CNTN4	250114	IL5RA	777685	TRNT1	778006	False	False	False	ref	80	0.00993	85	0.01285
2466	chr3	2351034	T	G	rs4685517	-0.0047189334	0.6076829091839803	0.0047189334	0.5948455506732769	0.013521523939319	0.1127797094523592	-6.557951384041776e-05	0.4786626930881777	6.557951384041776e-05	0.4669171876210541	0.1711760495440823	0.7044464827647097	-0.000923409410676	0.648602473571929	0.000923409410676	0.6350035354871792	0.0023883994193619	0.5210501737344345	-1.3156847839230692e-05	0.5571694982877707	1.3156847839230692e-05	0.5441079235970441	-0.0043299204348592	0.4455068206490485	0.0043299204348592	0.4347126388928256	CNTN4	252220	IL5RA	775579	TRNT1	775900	False	False	False	ref	95	0.00238	-45	0.007614
2467	chr3	2394813	A	G	rs6787394	0.0011389177	0.8650028317455388	0.00145104742	0.8722127984334022	0.0178678896289858	0.0431280506185735	1.9662921831731763e-05	0.742375226183644	2.476614370190545e-05	0.7496578352375701	0.0355148912333114	0.9330996891285066	3.9058131447972025e-05	0.9419481604535423	5.047170659474049e-05	0.9491612114892176	0.0006207545873871	0.8695160868938384	6.286074215278644e-07	0.9106057750004568	8.15215758672049e-07	0.91777228930286	0.0004149420637143	0.8477429531634105	0.0007178497702257	0.8548115221376553	CNTN4	295999	IL5RA	731800	TRNT1	732121	False	False	False	alt	60	0.00461	35	0.04736
2468	chr3	2507826	T	G	rs67888396	0.00400584194	0.5805876162668403	0.0048842752599999	0.5909441685356601	0.0197013438408099	0.0294047243968157	6.398650162359738e-05	0.357198433317176	8.773962598406194e-05	0.365091330071116	0.1784520586313135	0.691139915561092	0.0006947837446047	0.6207476910175836	0.0008824095721478	0.6315630615829916	0.0035236701129071	0.3228628901126172	1.0670506251672147e-05	0.4621008439086403	1.574396998658605e-05	0.471718381476894	0.0036411166090934	0.3950826004855749	0.0045664374111764	0.4028323747982346	CNTN4	409012	IL5RA	618787	TRNT1	619108	False	False	False	alt	-90	0.005554	-30	0.02946
2469	chr3	2507907	T	C	rs67733815	-0.0026311089579999	0.7089723352017153	0.002817920658	0.6998142306236887	0.01998557536128	0.0273999682970273	-5.9810802058953526e-05	0.4810799502970899	6.261535638556201e-05	0.4720013986737286	0.1628938059523438	0.7161995763415115	-0.0003774416818722	0.7550222418627802	0.0004158353730646	0.7461989919031778	0.0032344251473293	0.3617567646897567	-8.681548446653724e-06	0.5952389037571925	9.257942707162312e-06	0.5858975550298178	-0.0028506519777175	0.5522547390143051	0.003008329961929	0.5444256620940521	CNTN4	409093	IL5RA	618706	TRNT1	619027	False	False	False	ref	-45	0.07214	-100	0.048
2470	chr3	3558477	A	G	rs1072848	0.0183074608	0.1835326607077903	0.0183074608	0.1925057677288963	0.0098090449458652	0.3280542681182042	0.0001803712606294	0.1747034841518851	0.0001803712606294	0.1827569170264527	0.1122895465720598	0.7988132449214033	0.0020761188574069	0.4152441518016604	0.0020761188574069	0.4284686715990666	0.0010885298071133	0.7716780543576681	2.025174117678133e-05	0.3895911498231116	2.025174117678133e-05	0.4019806400917897	0.0169939522194213	0.0853491871889588	0.0169939522194213	0.0879107866353794	LRRN1	240955	CRBN	378750	TRNT1	431543	False	False	False	alt	-100	0.002375	100	0.00357
2471	chr3	3562021	G	A	rs7642870	-0.001846826542	0.8203838790717177	0.002046429482	0.8108946187061392	0.006740688879884	0.7845328083957914	-1.2136837940990112e-05	0.8599285853885111	1.3363771729962213e-05	0.8504706535495672	0.0748161287980165	0.8738475090274046	-0.000143434484586	0.89803359108291	0.0001720459165155	0.8888143069790224	0.0004683656501613	0.9110255045746926	-8.630314412439043e-07	0.9218024392338826	1.0389022604019502e-06	0.9125702419567115	-0.0013008433697444	0.7556667523468474	0.0014834178777787	0.7463631471954554	LRRN1	237411	CRBN	382294	TRNT1	435087	False	False	False	ref	100	0.00787	-80	0.05176
2472	chr3	16730989	G	T	rs56345807	0.00499776094	0.5591591444191658	0.00499776094	0.5722774120357766	0.0133730602350934	0.1239704084039696	6.873851934764657e-05	0.4277946549885887	6.873851934764657e-05	0.4392992252985578	0.2313530223342565	0.5999572568449146	0.0011169941963228	0.5585973023987945	0.0011169941963228	0.5725662348419683	0.0029813472925984	0.3966521060525592	1.4705132525171308e-05	0.465623261833036	1.4705132525171308e-05	0.4787703178245659	0.004224110208612	0.4204021432448783	0.004224110208612	0.4310970915033374	DAZL	60683	PLCL2	71663	RFTN1	216963	False	False	False	alt	100	0.001351	50	0.04822
2473	chr3	16745264	C	T	rs138823185	-0.0488265254	0.0293627946135587	0.0488265254	0.0274804294322932	0.0134293542464722	0.1138434129017257	-0.0006702120084004	0.0262071039523842	0.0006702120084004	0.0247114362669069	0.5554725671428127	0.0918817486927699	-0.0273235557612274	0.0206820247990981	0.0273235557612274	0.0190210003366604	0.0074482400627194	0.0385526473191669	-0.0003742208108989	0.0202922292036887	0.0003742208108989	0.0189446844227354	-0.0102096494776916	0.1799999722536877	0.0102096494776916	0.1746044356373724	PLCL2	57388	DAZL	74958	RFTN1	231238	False	False	False	ref	-35	0.0009403	25	0.04614
2474	chr3	16748700	A	G	rs9874028	0.0687672397999999	0.0076309445835286	0.0687672397999999	0.008082931693436	0.0141874178196103	0.0945898088807299	0.0009765295190296	0.0112251451991884	0.0009765295190296	0.0117983795625143	0.4823597755163435	0.203879583210046	0.0331993520226004	0.0098756136430216	0.0331993520226004	0.0107937095278245	0.0068721080856204	0.0524446041199893	0.0004732978816688	0.0114515682368184	0.0004732978816688	0.0122477266292582	0.0260127179742527	0.0360120540784368	0.0260127179742527	0.0369600436984879	PLCL2	53952	DAZL	78394	RFTN1	234674	False	True	True	alt	100	0.001383	55	0.01563
2475	chr3	17411731	T	C	rs6787756	0.0377999656	0.0571783801786145	0.0377999656	0.0610536918060892	0.0104699229392913	0.2655803954442953	0.0004270223559315	0.0603542977852619	0.0004270223559315	0.06399250179109	0.103320573864874	0.8206768816692509	0.0042396028397566	0.2857259841149083	0.0042396028397566	0.2975851537027945	0.0011281845294279	0.7736194963630855	5.0135118883729535e-05	0.2545053327271032	5.0135118883729535e-05	0.2650579772164412	0.0316725277233165	0.0241802482734822	0.0316725277233165	0.0249529147115413	PLCL2	609079	DAZL	741425	RFTN1	897705	False	False	False	alt	0	0.0	-60	0.01381
2476	chr3	17613896	T	C	rs9681617	0.00564564594	0.5163554378291539	0.00564564594	0.5294581664254293	0.0078044589617828	0.6097349687950707	4.239050246393271e-05	0.5554269560724473	4.239050246393271e-05	0.568012558561891	0.2138486913764665	0.636734403181716	0.0011799330391869	0.5479267541386088	0.0011799330391869	0.5620085824673382	0.0016799874094582	0.6667458522056184	8.94006010171012e-06	0.5722435474361603	8.94006010171012e-06	0.5858987228434841	0.005392172117968	0.3529602060737885	0.005392172117968	0.3624023699426552	PLCL2	811244	TBC1D5	830921	SATB1	831725	False	False	False	alt	-40	0.004128	-85	0.01044
2477	chr3	17648935	C	T	rs55701200	-0.0100826130599999	0.3725449660834669	0.0100826130599999	0.3609390775817033	0.0090509612273154	0.4205687470145277	-9.428917620156157e-05	0.3773727966892169	9.428917620156157e-05	0.3667066441052004	0.1273394952229794	0.7772576562161323	-0.0013206241704944	0.5688278339517646	0.0013206241704944	0.5552533044441004	0.0011539063921699	0.7678264989091867	-1.2319724654749886e-05	0.559680455887385	1.2319724654749886e-05	0.5464147834207165	-0.0091349495326714	0.2178669575707402	0.0091349495326714	0.2115808607911729	TBC1D5	795882	SATB1	796686	PLCL2	846283	False	False	False	ref	20	0.0006104	-95	0.0457
2478	chr3	17655683	T	C	rs11128837	0.0486232092	0.02784478205118	0.0486232092	0.0299876007036649	0.0195781817457415	0.0290925209222687	0.0010039699264884	0.0134064839535288	0.0010039699264884	0.0140924095598	0.2797082957292088	0.5294567793701144	0.0140479104804877	0.0757753427300682	0.0140479104804877	0.0819460986829841	0.0054212252654821	0.116665110339144	0.0002874547092013	0.0321201540675075	0.0002874547092013	0.0347064739441658	0.0405481384661666	0.0084629133982143	0.0405481384661666	0.0087324516446464	TBC1D5	789134	SATB1	789938	PLCL2	853031	False	False	False	alt	-90	0.03394	85	0.04385
2479	chr3	17672024	T	A	rs13083917	0.00100362386	0.5709945878631	0.00497256666	0.5784019207827744	0.0058077570360627	0.9443753175274888	6.614449853836717e-06	0.6921225317816777	2.7997672868304585e-05	0.700541776976713	0.1198082967665639	0.786824538489407	-0.0002188069679546	0.6735614337564179	0.0007634754204218	0.6811265896684532	0.0006813863649959	0.863172982739552	-1.0722582541178052e-06	0.747736657681056	4.219922522437704e-06	0.7562719832598255	0.0007385968734115	0.4302472427194551	0.0044523283436549	0.4359623298431266	TBC1D5	772793	SATB1	773597	PLCL2	869372	False	False	False	alt	65	0.0112	-55	0.00776
2480	chr3	17678612	C	A	rs4909009	-0.0100895252	0.3610672098203844	0.0100895252	0.3496865508150135	0.0085188407258949	0.4958859562602443	-8.703024187763913e-05	0.3825203957903785	8.703024187763913e-05	0.3718860317863801	0.0608180582786127	0.89212155589293	-0.0006238178817435	0.704569892084572	0.0006238178817435	0.6906993896205371	0.0005244912353309	0.8932813199318039	-5.432972931412231e-06	0.707967181544884	5.432972931412231e-06	0.6940056742185637	-0.0068382452100125	0.2941656259664747	0.0068382452100125	0.2857471767888861	TBC1D5	766205	SATB1	767009	PLCL2	875960	False	False	False	ref	75	0.000977	45	0.01056
2481	chr3	17693826	A	G	rs6797952	-0.01823629968	0.087636103154383	0.03436396208	0.0850279430980379	0.0204615776943711	0.0259909749680051	-0.0002659113717796	0.0343184790241006	0.0007928395666918	0.0333681090569754	0.6107221029263789	0.0402926543579055	-0.0109624773414615	0.0463925010026345	0.0208215333784969	0.044435340174356	0.0124738140857466	0.0072573609507194	-0.0001584821429548	0.0220819162836782	0.0004806004069012	0.0213424292447541	-0.0026203591323561	0.4334325489302232	0.0044544030539735	0.4267859367021605	TBC1D5	750991	SATB1	751795	PLCL2	891174	False	False	False	ref	-100	0.02106	-100	0.0719
2482	chr3	17699917	C	G	rs35642812	0.004167411322	0.6509058707986428	0.004167411322	0.6644352759856976	0.0081881356486015	0.5626218479165839	3.559900215559289e-05	0.6641023357868396	3.559900215559289e-05	0.6772222488896815	0.123353976701003	0.7845015849325883	0.000578336403115	0.7429521861057466	0.000578336403115	0.7570261060224311	0.0010228558094491	0.7944546338010465	4.948611167977668e-06	0.748725345138089	4.948611167977668e-06	0.7627253099042883	0.003657714291642	0.4975170748660862	0.003657714291642	0.5087307809789471	TBC1D5	744900	SATB1	745704	PLCL2	897265	False	False	False	alt	25	0.002213	100	0.009445
2483	chr3	17712309	C	A	rs6810235	0.00370683152	0.5641444547328383	0.00511378112	0.5734275897881892	0.0081405508856746	0.5524465686846736	2.702082403945072e-05	0.5931414829262803	3.964539430001674e-05	0.6018945113297381	0.1251008827892405	0.7817157376441068	0.0004539728953484	0.6777886167645769	0.0006376955606838	0.6874884943246211	0.0010209138305337	0.7922882562832749	3.3264856197704e-06	0.6926033770216768	4.975030629988401e-06	0.7020833872598079	0.0035498293550762	0.3995377742694169	0.0046950694509278	0.4070334613834483	TBC1D5	732508	SATB1	733312	PLCL2	909657	False	False	False	alt	-50	0.0006485	-25	0.01303
2484	chr3	17716436	G	C	rs13071934	-0.0111859618	0.3283839254600686	0.0111859618	0.3174062027996566	0.0084625302317307	0.5000271427679136	-9.535517371879105e-05	0.3534609339548735	9.535517371879105e-05	0.3431878207313253	0.2767310864220583	0.5332651666188776	-0.0031942439992847	0.3534707179980599	0.0031942439992847	0.3414157583370911	0.0023503305798277	0.5449012812683812	-2.7326938092361192e-05	0.3660798574892815	2.7326938092361192e-05	0.3544709521470467	-0.0090810070643885	0.2135543147873762	0.0090810070643885	0.2069945332491153	TBC1D5	728381	SATB1	729185	PLCL2	913784	False	False	False	ref	-85	0.004776	-30	0.006958
2485	chr3	17735631	A	G	rs9880456	0.0274885188	0.1071698784929336	0.0274885188	0.1138115124273899	0.0081357185330129	0.5717081117296584	0.0002259262905069	0.139741976025775	0.0002259262905069	0.1469194638733891	0.4346103175344142	0.2792978817251461	0.0120164879153321	0.0901193239513189	0.0120164879153321	0.0973041653421959	0.0035634248006737	0.3278405777163755	9.946796049249296e-05	0.1133277481913225	9.946796049249296e-05	0.1207629726617673	0.0126183881575534	0.133105400304486	0.0126183881575534	0.1374923777738437	TBC1D5	709186	SATB1	709990	PLCL2	932979	False	False	False	alt	80	0.001333	80	0.04932
2486	chr3	17757432	A	G	rs4566568	0.0114434583999999	0.3249216140726933	0.0114434583999999	0.3365246953705484	0.0072222812342138	0.7295672472765575	8.554179924988611e-05	0.3878389819543116	8.554179924988611e-05	0.3990995914625035	0.0907519787549663	0.8345978749920413	0.0009740336510118	0.6029297128292993	0.0009740336510118	0.6168369512366123	0.0006500525979417	0.8604063892076096	7.202279908446187e-06	0.6339640676682045	7.202279908446187e-06	0.6476574192355508	0.0084233238934013	0.2296955702425162	0.0084233238934013	0.237071131989734	TBC1D5	687385	SATB1	688189	PLCL2	954780	False	False	False	alt	-35	0.001146	80	0.03613
2487	chr3	17762972	A	G	rs7609916	0.0147235538	0.2475002621306607	0.0147235538	0.2578322807234766	0.006658391633628	0.8439708069005606	0.0001010235828626	0.3345434545609344	0.0001010235828626	0.3450779855577965	0.1774686459403105	0.6894656989191171	0.0026692348922214	0.3778070576864015	0.0026692348922214	0.3904616020709128	0.0011931156049759	0.7620741031650795	1.847719488387606e-05	0.4428180075841165	1.847719488387606e-05	0.4552073321466682	0.013589352586645	0.1295269679847256	0.013589352586645	0.1336656488782453	TBC1D5	681845	SATB1	682649	PLCL2	960320	False	False	False	alt	15	0.001027	25	0.05347
2488	chr3	17780701	A	C	rs11709790	0.002280868046	0.7582105187784209	0.0025925503659999	0.7681409103141411	0.0127476172311321	0.138226163176732	2.8317256127706223e-05	0.6664612323839049	3.2162104810852375e-05	0.6762960155954137	0.377252876067179	0.3714265168837736	0.0008249792744313	0.622845846251938	0.0009630973631334	0.6333388685294381	0.0047655111087089	0.162822456182439	1.0167338067302752e-05	0.5478601419055197	1.1871134227497746e-05	0.5581872345942607	0.0013402628657973	0.7218509533766537	0.0014564466436373	0.7313086103236752	TBC1D5	664116	SATB1	664920	PLCL2	978049	False	False	False	alt	100	0.002077	-100	0.02827
2489	chr3	17782174	A	G	rs4616675	0.074350477	0.0058241454472946	0.074350477	0.0061118504608881	0.0129520847035629	0.1297614881283229	0.0009669167769161	0.0116260390005766	0.0009669167769161	0.0122198902158545	0.5588522702517661	0.0907811387179472	0.0416051292835186	0.0048496503678776	0.0416051292835186	0.0052185566704274	0.0072270105559559	0.0425887573477127	0.000540155416405	0.0092573109180668	0.000540155416405	0.0098682571116329	0.0158736086473925	0.0981695982792289	0.0158736086473925	0.1011107749894893	TBC1D5	662643	SATB1	663447	PLCL2	979522	False	True	True	alt	-100	0.012375	95	0.0602
2490	chr3	17803260	C	T	rs17200916	-0.034281276	0.0798987933720102	0.034281276	0.075321036091247	0.0080743148941704	0.5760308048089778	-0.0002942797265811	0.1142541377203185	0.0002942797265811	0.108718969045727	0.3182273675038122	0.4701498411916869	-0.011052343400587	0.119919894883535	0.011052343400587	0.1123540198049387	0.0025812693550751	0.5015566875356311	-9.56233207765672e-05	0.1432477349621904	9.56233207765672e-05	0.1356623858474216	-0.0275749748441373	0.0378414011658805	0.0275749748441373	0.0367685698922784	TBC1D5	641557	SATB1	642361	PLCL2	1000608	False	False	False	ref	90	0.001165	-100	0.03117
2491	chr3	17811044	G	T	rs11128871	-0.0237834384	0.1591575767902287	0.0237834384	0.1514628012952846	0.0153615830202133	0.073500763655029	-0.0004179178459688	0.085855380252348	0.0004179178459688	0.0815498957159598	0.3298001016608055	0.4463707385672284	-0.008444602042736	0.174540027853672	0.008444602042736	0.1652435453981988	0.0053175638732612	0.1202726816843776	-0.0001532790346471	0.1043424109167362	0.0001532790346471	0.0984956057541357	-0.0152968391788296	0.1149193082299005	0.0152968391788296	0.1116027513075322	TBC1D5	633773	SATB1	634577	PLCL2	1008392	False	False	False	ref	95	0.02118	95	0.0575
2492	chr3	17811429	G	A	rs12495352	-0.0097872129	0.3788258341467891	0.0097872129	0.3671190218197616	0.0063938620377517	0.887531474517963	-6.334457118346005e-05	0.4863342518140582	6.334457118346005e-05	0.474615790044542	0.2906005249017105	0.5125076126050051	-0.0029036672935296	0.3812125770151829	0.0029036672935296	0.3689725225063912	0.00186205913452	0.6345936142576181	-1.8841862620631374e-05	0.4561035875695815	1.8841862620631374e-05	0.443704825921128	-0.0076660546271226	0.2697064881828341	0.0076660546271226	0.2618115845259528	TBC1D5	633388	SATB1	634192	PLCL2	1008777	False	False	False	ref	-85	0.00876	-60	0.0633
2493	chr3	17815368	G	A	rs6771673	0.0068636369	0.4649022798453724	0.0068636369	0.4772395219451376	0.0091464799613686	0.4126686229576982	6.015587889623491e-05	0.466206645466117	6.015587889623491e-05	0.4779724030215878	0.3668544279504974	0.3920643753295978	0.002513262178745	0.3819188170765751	0.002513262178745	0.3945670034880851	0.0033462333859527	0.348068287807978	2.1961206004114017e-05	0.3814716557451488	2.1961206004114017e-05	0.3933990542436244	0.0042573055737092	0.426563244200076	0.0042573055737092	0.4374957618464337	TBC1D5	629449	SATB1	630253	PLCL2	1012716	False	False	False	alt	-40	0.002228	30	0.013214
2494	chr3	17815640	T	A	rs4908979	-0.00291557964	0.710476409636924	0.003142139504	0.700198799187972	0.0068316773978418	0.7530272356631631	-1.933843359149829e-05	0.756597271146337	2.1163803725231853e-05	0.7465487744720107	0.4175167792197014	0.3091612345361458	-0.001209050012461	0.5657451344374966	0.0013033835611575	0.55461864151421	0.0028575846879686	0.4354823119561407	-8.047906629095391e-06	0.6109950582639515	8.807942588262995e-06	0.6003211996168343	-0.0014647454849116	0.7241347079693147	0.001593377524663	0.7142725452275885	TBC1D5	629177	SATB1	629981	PLCL2	1012988	False	False	False	ref	100	0.04648	100	0.06415
2495	chr3	17816952	T	C	rs2033373	0.0071855698599999	0.5002543660867393	0.0071855698599999	0.513595311284635	0.0093859474972616	0.3736992267138312	7.383067306999029e-05	0.4973461842473657	7.383067306999029e-05	0.5097304881540756	0.5800060166599239	0.0669010191465757	0.0040898582828843	0.3298944841884123	0.0040898582828843	0.3426496273155719	0.0054270151487991	0.1123627865163846	4.193337273192649e-05	0.3271442712532011	4.193337273192649e-05	0.3391520435082709	0.0014211765682216	0.7412880611537247	0.0014211765682216	0.7546571026084522	TBC1D5	627865	SATB1	628669	PLCL2	1014300	False	False	False	alt	75	0.002884	45	0.02844
2496	chr3	18869767	C	T	rs7638304	0.0214876195	0.161895399436564	0.0214876195	0.1696743756669687	0.01331785159043	0.1469741191997879	0.0003828966176983	0.1198375717138309	0.0003828966176983	0.1247401731821245	0.1914729405906699	0.670234341331871	0.0040945418360045	0.2886862568360195	0.0040945418360045	0.3004881481163057	0.0025858626108299	0.4645327616909662	7.408874897385562e-05	0.2137975128965711	7.408874897385562e-05	0.2231809585826988	0.020367431197419	0.0688031484957791	0.020367431197419	0.0708654859008605	KCNH8	278744	SATB1	424146	TBC1D5	424950	False	False	False	alt	25	0.001656	-25	0.00824
2497	chr3	24451001	A	G	rs6781559	-0.000929001576	0.8166996342311185	0.0015508432239999	0.817132925411346	0.0160991374969344	0.0623638753518887	-1.751554171151079e-05	0.6940002327701531	2.5455800200343388e-05	0.6934027303707777	0.1646075166754841	0.7121562225500369	-0.0001866757332681	0.7995529774047363	0.0002906365168701	0.8000853125287924	0.0026525634674414	0.4702156739274417	-3.461210288382933e-06	0.7157479635253251	4.775073238493509e-06	0.715377170794636	-0.0010954470482058	0.6874607796595287	0.0017344578263259	0.6877207116906453	THRB	44755	RARB	236887	NKIRAS1	504410	False	False	False	ref	65	0.006134	75	0.03897
2498	chr3	24458364	G	C	rs58274299	0.0342302458	0.0758870713754521	0.0342302458	0.0805702326896975	0.0133196743107376	0.1222336157057888	0.0004800594483562	0.0516092799224605	0.0004800594483562	0.0547114292182997	0.3067562941524289	0.490051897348095	0.0108623310090671	0.1137241762429993	0.0108623310090671	0.1217514832891408	0.0041228912742625	0.2379597255622411	0.0001530778353082	0.0791225334145313	0.0001530778353082	0.0846629799641867	0.0268944698596457	0.0388631704606272	0.0268944698596457	0.0399636497991643	THRB	37392	RARB	229524	NKIRAS1	511773	False	False	False	alt	100	0.002441	95	0.02258
2499	chr3	24461494	G	A	rs78158283	-0.00366566854	0.6788211455680403	0.00366566854	0.6653755580604955	0.0085133990200549	0.5007848607089196	-2.9863451571473454e-05	0.6811147702017295	2.9863451571473454e-05	0.6679726137703527	0.0883951078330687	0.8451777941168863	-0.0002998914587479	0.8099224512324152	0.0002998914587479	0.7957304314289168	0.0007695754555829	0.8446282787499106	-2.5104203185513947e-06	0.810717632024248	2.5104203185513947e-06	0.7965041184381908	-0.003051898878619	0.5410026093910266	0.003051898878619	0.5292324539343071	THRB	34262	RARB	226394	NKIRAS1	514903	False	False	False	ref	-95	0.001278	100	0.02847
2500	chr3	24472985	G	A	rs77704657	0.00694212862	0.4627865787187547	0.00694212862	0.4752635527296889	0.0065003439807639	0.8780190994447958	4.592403393387931e-05	0.557158734964531	4.592403393387931e-05	0.5696232828462469	0.1030923557298311	0.8177975980855993	0.0007154796336168	0.6556113077817801	0.0007154796336168	0.6694940809382676	0.0006774490521672	0.8596851126884665	4.756835124037444e-06	0.7037120126682167	4.756835124037444e-06	0.7175779265172141	0.0061079471778752	0.309017562964648	0.0061079471778752	0.3181736171208505	THRB	22771	RARB	214903	NKIRAS1	526394	False	False	False	alt	-65	0.00238	-65	0.02136
2501	chr3	24515284	G	C	rs2362188	-0.0020653530279999	0.8203071224087998	0.0020653530279999	0.8066647157723886	0.0068904361098322	0.7778428068152331	-1.444901320758356e-05	0.847121858330206	1.444901320758356e-05	0.8334939282030439	0.1559476758057655	0.7313525791577854	-0.0002907756210979	0.8312295720995728	0.0002907756210979	0.8173452670253276	0.0010828551997026	0.7849049361868058	-2.048150651070737e-06	0.8525205931528677	2.048150651070737e-06	0.8384056871140841	-0.0018195209493873	0.7010552447239331	0.0018195209493873	0.6880127368870002	THRB	19528	RARB	172604	NKIRAS1	568693	False	False	False	ref	50	0.01354	-20	0.01242
2502	chr3	24583168	C	A	rs79369190	0.0020679404493999	0.6362742288468102	0.0040868383506	0.6399466201924929	0.0109304700650655	0.2425900411377102	2.7438730932336267e-05	0.5771171913183948	5.229894079574245e-05	0.580188950847185	0.5015446218321766	0.1723913133283499	0.0010310734461694	0.488347852153544	0.0020377476795677	0.4906882219101985	0.0054799600388619	0.1132630412549393	1.3779612085428444e-05	0.4366886610907795	2.617874511853253e-05	0.4387389143489111	0.0006971026670401	0.7461871708576948	0.0014274006991773	0.7484398181497514	THRB	87412	RARB	104720	NKIRAS1	636577	False	False	False	alt	5	0.0006104	100	0.03284
2503	chr3	29687101	T	C	rs1440502	-0.003877922232	0.676301224628182	0.003944441288	0.6662263553321287	0.0123285141824388	0.1549000609210724	-5.402513966185612e-05	0.5657741655084744	5.469964067376591e-05	0.5559535291625719	0.108509424371622	0.8113440032072946	-0.0004694344391963	0.7781899132020651	0.000475672390592	0.7682246631776803	0.0013689966997942	0.7290404761738569	-6.541861099178976e-06	0.7148765737834032	6.605113717439172e-06	0.7048175234932155	-0.0035560534860319	0.5105205426833417	0.0036058465336776	0.5017377835407038	TGFBR2	919378	RBMS3	1112309	GADL1	1207560	False	False	False	ref	-65	0.00201	-100	0.04825
2504	chr3	29700840	A	G	rs7634119	0.0393480476	0.0511019935993984	0.0393480476	0.0547764588627418	0.0081364319935241	0.5681761369610032	0.0003285422453857	0.0834109601467553	0.0003285422453857	0.088332766406405	0.3724042780526769	0.3759637643881305	0.0147195017916445	0.0679018779852377	0.0147195017916445	0.0736241357402611	0.0030254513577656	0.4188685909676337	0.0001226060329506	0.0907385343239503	0.0001226060329506	0.0970088265991513	0.0243799209535368	0.0459234084402189	0.0243799209535368	0.0472421850239315	TGFBR2	905639	RBMS3	1126048	GADL1	1193821	False	False	False	alt	-100	0.015	-50	0.00873
2505	chr3	29702478	C	A	rs140030786	-0.0200151591	0.1908514499821866	0.0200151591	0.181990330719958	0.0096252937002548	0.349204855505322	-0.0001992039327445	0.1860369250013193	0.0001992039327445	0.1782070456668942	0.60017427566676	0.0486502310660424	-0.0120127077251643	0.1057913849670605	0.0120127077251643	0.0986525513446303	0.0057713312552829	0.0917511974457937	-0.0001194128936964	0.1075580253191531	0.0001194128936964	0.1010479947243338	-0.0027655888546561	0.5832475399430792	0.0027655888546561	0.5709978075315791	TGFBR2	904001	RBMS3	1127686	GADL1	1192183	False	False	False	ref	-5	0.001007	-85	0.04272
2506	chr3	29714011	T	C	rs7632532	0.001788609872	0.7649852664950143	0.002653883792	0.7747745910908092	0.0069612689153919	0.772732702662842	1.4204637785824363e-05	0.7871655876663933	1.9919538453166173e-05	0.7971474812064786	0.0815257419682776	0.8525945728320776	0.0001632222042734	0.8421598377311933	0.0002273823926501	0.8525317715324103	0.000569685989525	0.8782030567762632	1.2969072413821342e-06	0.8557167035234674	1.720667964731539e-06	0.8661460111731046	0.0012365273498687	0.6541723782434609	0.0019751242232802	0.6631082947059199	TGFBR2	892468	RBMS3	1139219	GADL1	1180650	False	False	False	alt	50	0.000885	90	0.0331
2507	chr3	29750230	T	G	rs7634890	0.00264131828	0.6380087358777535	0.00439222216	0.6441564640888671	0.0235606044044551	0.0125681979627404	5.753675879586798e-05	0.3513511127510994	0.0001020497921634	0.3565257623122544	0.112366310853847	0.8039191282037378	0.0002273218849367	0.7481423607216297	0.0004770595918108	0.7532843963034944	0.0027127331545939	0.461639994981963	4.714335602053788e-06	0.5657745569570252	1.1276897103692774e-05	0.5711616641015386	0.0020166184296517	0.4728094222990492	0.0037012832083319	0.4775075680515243	TGFBR2	856249	GADL1	1144431	RBMS3	1175438	False	True	False	alt	-65	0.005695	5	0.003052
2508	chr3	29752250	T	G	rs1595901	0.0485236278	0.0287291975486188	0.0485236278	0.0307956445941166	0.0130935421066719	0.1331895560705336	0.0006863794689677	0.0280013096786484	0.0006863794689677	0.029626909725583	0.4129088476021535	0.3175268855463461	0.0201559941852461	0.0388634016611535	0.0201559941852461	0.0423685839003129	0.0054246961201276	0.1174207360263328	0.000285565748689	0.0320731270953919	0.000285565748689	0.0345244937766207	0.026108154648907	0.0410678967493371	0.026108154648907	0.0423361019803466	TGFBR2	854229	GADL1	1142411	RBMS3	1177458	False	False	False	alt	75	0.005043	100	0.05212
2509	chr3	29758222	A	G	rs6780082	0.0384120132	0.0530855364589426	0.0384120132	0.056828776026516	0.0092585400296873	0.3825325165541537	0.0003642658783655	0.0683771566565399	0.0003642658783655	0.0724925815705985	0.1350138486913764	0.7618420011262742	0.0054747227095641	0.2220096785091437	0.0054747227095641	0.2327813456921059	0.0013083019105956	0.73030924582566	5.4338666493119165e-05	0.216665962244641	5.4338666493119165e-05	0.2265664377505296	0.0346621852923785	0.0162368481510094	0.0346621852923785	0.016677433451703	TGFBR2	848257	GADL1	1136439	RBMS3	1183430	False	False	False	alt	-100	0.002054	35	0.06476
2510	chr3	29758779	G	A	rs17551079	-0.001504943354	0.876563064690371	0.001504943354	0.8642104766183912	0.0087652623899746	0.4523167322856186	-1.335033499353648e-05	0.8714122860860937	1.335033499353648e-05	0.8593989588654596	0.29631012769842	0.5035306907854865	-0.0004587776628328	0.7829907082997885	0.0004587776628328	0.7690730031541927	0.0026189543673607	0.4924465431783725	-4.069999901800714e-06	0.7816898666422913	4.069999901800714e-06	0.7677648178477744	-0.0011431653855329	0.8049223783623203	0.0011431653855329	0.7913024839633273	TGFBR2	847700	GADL1	1135882	RBMS3	1183987	False	False	False	ref	-80	0.001175	-10	0.003357
2511	chr3	29760935	C	T	rs2028408	0.001359248622	0.847215927495614	0.001359248622	0.8612845831654103	0.0317385542765583	0.0030140069812896	4.072253963527824e-05	0.5657900181067613	4.072253963527824e-05	0.5784417103461262	0.2766149026442183	0.5328312241798717	0.0003493965652104	0.7607654781859632	0.0003493965652104	0.7749699717332644	0.0089281060556148	0.0219481103885309	1.051197126243048e-05	0.5418538170880778	1.051197126243048e-05	0.5556299130216504	0.001143165385533	0.7622107434770496	0.001143165385533	0.7758496375393918	TGFBR2	845544	GADL1	1133726	RBMS3	1186143	False	True	True	alt	35	0.002136	-100	0.0583
2512	chr3	29760939	T	G	rs2028409	-0.0098985784	0.3632076773895545	0.0098985784	0.3518168839631084	0.033002369429965	0.0025285665056193	-0.0003275348481928	0.0891833656751476	0.0003275348481928	0.0844719071030263	0.275496633782508	0.5345677632552769	-0.0027933376031383	0.3811647504835688	0.0027933376031383	0.3686600239711343	0.0091966732819925	0.0193560937890535	-9.311943522220612e-05	0.1394710317770529	9.311943522220612e-05	0.1317339785172603	-0.0084482204172241	0.2346269595060127	0.0084482204172241	0.2276357847463121	TGFBR2	845540	GADL1	1133722	RBMS3	1186147	False	True	True	ref	35	0.001984	-100	0.05396
2513	chr3	29764026	T	C	rs12715161	0.0027508813	0.5635575347632252	0.0051070315	0.5720384309043824	0.0092263971403401	0.3960317864996195	2.067906429145566e-05	0.5481510696388784	4.641012591959749e-05	0.5558389379255383	0.2383717673419848	0.5897166530657186	0.0005765311862268	0.551272424093704	0.0012038749020734	0.5601113983652588	0.0022353633643422	0.5586195209181525	4.31779266100347e-06	0.5425458529222396	1.1168892348858287e-05	0.5508680208432332	0.0026390315252232	0.3988573886216358	0.0044938225500263	0.4057052330602452	TGFBR2	842453	GADL1	1130635	RBMS3	1189234	False	False	False	alt	-70	0.002432	50	0.02446
2514	chr3	29764085	A	T	rs7340606	0.0129985345399999	0.2785737196578726	0.0129985345399999	0.2894416022791325	0.0237317150355052	0.0130188693045841	0.0003279497849167	0.0864294524971531	0.0003279497849167	0.0913248562743826	0.25242585503999	0.5652293208703936	0.0035603883257971	0.3165751021120542	0.0035603883257971	0.3287545654380481	0.0063291395709494	0.0780363007265604	9.367788976719302e-05	0.1410377981954387	9.367788976719302e-05	0.149233624424717	0.0109980393987489	0.1698709941887435	0.0109980393987489	0.1754712427620043	TGFBR2	842394	GADL1	1130576	RBMS3	1189293	False	True	False	alt	10	0.001507	80	0.003082
2515	chr3	29963152	T	C	rs7612854	-0.0002169288	0.8480724568034154	0.00162127184	0.8517384654342324	0.0128504107906745	0.135280870286517	-4.081487208132924e-06	0.7747726150260205	2.0907186424292024e-05	0.7778616195343201	0.0914905756283778	0.838621127662844	-5.900430659531612e-05	0.8758721452659828	0.0001611309567762	0.8795680124289031	0.0011892284383108	0.7608095188176152	-8.965277186205835e-07	0.837808392799051	2.123083150046775e-06	0.841317704167788	-0.0003444019128828	0.7643176671682413	0.0012821709768773	0.7674284144866991	TGFBR2	643327	GADL1	931509	RBMS3	1388360	False	False	False	ref	-95	0.001862	40	0.01607
2516	chr3	29970451	T	C	rs1449281	-0.002095771234	0.8302698960205055	0.002095771234	0.816472105321272	0.0309457713530211	0.0035422736145293	-6.522865506428184e-05	0.5119672782603298	6.522865506428184e-05	0.4998713249741358	0.2253425865413541	0.6139058811252432	-0.0004670689415665	0.7748481327381083	0.0004670689415665	0.7606600518439333	0.0071468957570525	0.050177580589335	-1.4785122591796223e-05	0.538519330638122	1.4785122591796223e-05	0.5254391868029666	-0.0017406819572816	0.7127861777694282	0.0017406819572816	0.6998181855454294	TGFBR2	636028	GADL1	924210	RBMS3	1395659	False	True	True	ref	100	0.001657	35	0.006653
2517	chr3	29990864	A	G	rs3773124	0.0399427936	0.0476939571501402	0.0399427936	0.0511405938734127	0.0091885906397244	0.3964421804448166	0.0003880123502735	0.0677196967391895	0.0003880123502735	0.0718475929070193	0.1509704457515119	0.7354228033603265	0.0060718345056346	0.1946405582628043	0.0060718345056346	0.2047733768836242	0.0014201621197406	0.7044605204284042	6.050670482143829e-05	0.1943176885052759	6.050670482143829e-05	0.2038025782357264	0.0368655276507017	0.0110552132900424	0.0368655276507017	0.0113820836483159	TGFBR2	615615	GADL1	903797	RBMS3	1416072	False	False	False	alt	95	0.003963	80	0.04623
2518	chr3	30001813	A	G	rs4680866	-0.00108996198	0.8130658336931729	0.0019107670999999	0.8054344790336769	0.0183238247770193	0.0398772876301083	-2.363242979297019e-05	0.6172538413453662	3.596136986120399e-05	0.6097158420944625	0.089415865309806	0.8433966429973887	-0.0001278860821317	0.8696684487323934	0.0001598245882531	0.8616625538334722	0.0016820999052847	0.6594567582693708	-2.6505247552251524e-06	0.7764094196489365	3.130258509682615e-06	0.7681848975594043	-0.0012344526395501	0.7142406671097201	0.0015913028143444	0.7065835622507465	TGFBR2	604666	GADL1	892848	RBMS3	1427021	False	False	False	ref	-35	0.002014	85	0.03162
2519	chr3	30056807	C	T	rs62237196	0.00603713425808	0.534691682047129	0.00603713425808	0.548145820494921	0.0143862009157456	0.0967069435779958	8.92130831322231e-05	0.4027877339353374	8.92130831322231e-05	0.4147477413009076	0.0898204338219275	0.8407727374679184	0.0005600323997966	0.7272758148610309	0.0005600323997966	0.74165172581422	0.0012720715003839	0.7442918635637853	8.24497722985183e-06	0.6378628416476297	8.24497722985183e-06	0.6518538986491783	0.0047676843120778	0.4034597261599255	0.0047676843120778	0.413424965214111	TGFBR2	549672	GADL1	837854	STT3B	1475832	False	False	False	alt	75	0.0009212	-95	0.0307
2520	chr3	30058734	T	C	rs56077410	-0.000551600854	0.8755895950929831	0.001262485522	0.8712723429661527	0.0158671147693168	0.0671752355419463	-1.1570805533889564e-05	0.7559624634951172	2.0941944283908453e-05	0.7509913970313231	0.0246994263425968	0.952237637872318	-6.925980975571688e-06	0.9617730326174206	2.6674368235529955e-05	0.9587537854203724	0.0003828084255496	0.91641408944668	-1.873208704414176e-07	0.9372559000906144	4.393733693372405e-07	0.9332908936702746	-0.0001867239286714	0.9001454129099595	0.00046473511136	0.8962713652666442	TGFBR2	547745	GADL1	835927	STT3B	1473905	False	False	False	ref	90	0.003967	100	0.01468
2521	chr3	31981188	G	C	rs76150980	0.0320881243999999	0.0776818688578742	0.0320881243999999	0.0827694174951087	0.0141294996370836	0.0999505341213764	0.0004552225199947	0.0452125306368925	0.0004552225199947	0.0479543212683071	0.8382389858815962	0.0047825910265356	0.0268224649251791	0.0191305230837492	0.0268224649251791	0.0209024693387156	0.011865402907609	0.0069864419940872	0.0003813446828591	0.0168091558738715	0.0003813446828591	0.0180914435576419	0.0063818089399267	0.291881196178536	0.0063818089399267	0.3005256119103742	ZNF860	563	OSBPL10	96392	GPD1L	124502	False	False	False	alt	-85	0.01306	100	0.09174
2522	chr3	31996113	G	A	rs62244405	-0.049790564	0.0294233821264256	0.049790564	0.0275049148270823	0.0112434567479776	0.2156729663690087	-0.0005744857050742	0.0354029693595105	0.0005744857050742	0.0332967727619831	0.4151308623533438	0.3130710732958833	-0.0207642518823039	0.042154795485464	0.0207642518823039	0.0387906583074587	0.0046491381621055	0.1793739554477003	-0.0002385325996984	0.0423086191167007	0.0002385325996984	0.0393662838997687	-0.0265542173674	0.0389706033712092	0.0265542173674	0.0379472214582144	ZNF860	14362	OSBPL10	81467	GPD1L	109577	False	False	False	ref	15	0.0006657	-60	0.04596
2523	chr3	31996388	T	C	rs17028710	0.0449227344	0.0353215923304508	0.0449227344	0.0380076042964682	0.0095754078487359	0.3484860929100841	0.0004424929077844	0.0511031213747237	0.0004424929077844	0.0544785609617345	0.4372120042739033	0.2776265379603504	0.0198309412759896	0.0389897524188676	0.0198309412759896	0.0425142762555124	0.0042057593958605	0.2294317288889495	0.0001965271174039	0.0496841799860126	0.0001965271174039	0.0535985789998503	0.021234660110582	0.0597238659689723	0.021234660110582	0.0614056894804857	ZNF860	14637	OSBPL10	81192	GPD1L	109302	False	False	False	alt	-55	0.002743	-100	0.03625
2524	chr3	31999737	T	C	rs17028714	0.041094581	0.0434076326325477	0.041094581	0.0466392660872504	0.0104163864652679	0.2711189131566314	0.0004447669692812	0.0493637532566948	0.0004447669692812	0.0525472904888364	0.3882633637278395	0.355553909099116	0.0161525841788562	0.0580563738038836	0.0161525841788562	0.0631292035704044	0.0040589466718804	0.2386095429395091	0.0001749829043432	0.0579158473835497	0.0001749829043432	0.0622652293458282	0.0236786688658595	0.0445582405352125	0.0236786688658595	0.0457455654563411	ZNF860	17986	OSBPL10	77843	GPD1L	105953	False	False	False	alt	-15	0.0009613	50	0.10345
2525	chr3	32000088	G	C	rs17028716	-0.0087079839	0.4360266771614354	0.0087079839	0.4232280950078065	0.0076420328438585	0.6543435624299947	-6.628122357745313e-05	0.4904607276085101	6.628122357745313e-05	0.478218249427028	0.4338406000062241	0.2773718177387318	-0.0037632936663817	0.3463800876931875	0.0037632936663817	0.333572435434703	0.0033418153280564	0.3629949536122975	-2.88395715244664e-05	0.3841640568024764	2.88395715244664e-05	0.3719424090230847	-0.0039647714187906	0.4705591551701892	0.0039647714187906	0.4596144089414883	ZNF860	18337	OSBPL10	77492	GPD1L	105602	False	False	False	ref	-100	0.00418	-100	0.0803
2526	chr3	32010168	C	G	rs1376606	-0.0019448466799999	0.7424714175126186	0.003176411692	0.738463094542974	0.0075934962668454	0.6714731757966744	-1.4260096646241842e-05	0.7621100842336452	2.4182613631916367e-05	0.7584321800397109	0.4687807964812912	0.2244108621819469	-0.0008558788603755	0.5844110628151961	0.0014524926428573	0.5798748151946257	0.0035603664248045	0.3234195402233645	-6.256864486197948e-06	0.60831234925786	1.1063691170011424e-05	0.6040888500117377	-0.0006348613574829	0.791518067079543	0.0011244929926658	0.788468762454687	ZNF860	28417	OSBPL10	67412	GPD1L	95522	False	False	False	ref	70	0.00564	-25	0.007095
2527	chr3	36818214	T	C	rs1553656	0.061975577	0.0118140530050157	0.061975577	0.0126442732436785	0.0148469646631197	0.0816771593726755	0.0009250384667153	0.0125629935340126	0.0009250384667153	0.0132830903940925	0.3567319163061856	0.3954348489105562	0.0221695236975706	0.0301005988680467	0.0221695236975706	0.0329054034956196	0.0053904325238652	0.1131882426413259	0.0003364502216699	0.02131263766585	0.0003364502216699	0.0230063180212106	0.0429631012769841	0.0079792230589881	0.0429631012769841	0.0081924376029105	DCLK3	53661	TRANK1	126843	EPM2AIP1	174917	False	True	False	alt	-95	0.00899	-95	0.117
2528	chr3	36821489	C	T	rs4624519	-0.01956313	0.1906620002745362	0.01956313	0.1819782810203775	0.0073090510509861	0.7167749267907085	-0.0001449275115904	0.2464781612928938	0.0001449275115904	0.2374626489420246	0.3585991555929003	0.4056397847681413	-0.0070309970323496	0.1864564022001655	0.0070309970323496	0.1770246177914259	0.0026310475399497	0.4917396275479182	-5.2311307487584495e-05	0.2275893064183867	5.2311307487584495e-05	0.2179350989170603	-0.0130851979792321	0.146392698029813	0.0130851979792321	0.1420652568499203	DCLK3	56936	TRANK1	123568	EPM2AIP1	171642	False	False	False	ref	25	0.001066	30	0.02771
2529	chr3	36823035	G	T	rs142802540	0.00334020776	0.6757666265603514	0.00334020776	0.689131155709427	0.0314562435704508	0.0032703310961832	0.0001090815619172	0.3249020456090368	0.0001090815619172	0.3352736093845218	0.271417753296196	0.5374500623291713	0.0008766612698933	0.6162997014029789	0.0008766612698933	0.6302635677778567	0.0084814267842009	0.0242762134619278	2.8674372780478385e-05	0.3447346239538145	2.8674372780478385e-05	0.3566634276020254	0.0028299048745318	0.5533923583418024	0.0028299048745318	0.565447992239468	DCLK3	58482	TRANK1	122022	EPM2AIP1	170096	False	True	True	alt	85	0.00177	65	0.04858
2530	chr3	36827948	T	C	rs4789	0.0572325997999999	0.0155793653272039	0.0572325997999999	0.0167116202770663	0.0169134803487539	0.0519041539877416	0.0010121322741837	0.0125340127059697	0.0010121322741837	0.0132179993389808	0.4222325957738151	0.3028394526479092	0.024331940396473	0.0243027892189106	0.024331940396473	0.0265811120164423	0.0071921634673373	0.046398392591645	0.0004337144802674	0.0155080796822879	0.0004337144802674	0.0166871682802992	0.0297700183611863	0.0257332127937568	0.0297700183611863	0.0264032151615008	DCLK3	63395	TRANK1	117109	EPM2AIP1	165183	False	True	False	alt	-10	0.000473	60	0.0356
2531	chr3	36830403	C	A	rs12637912	-0.0029952342	0.5824045641245259	0.0049520334	0.5736748070626654	0.007901155567283	0.5964061396535769	-2.3572520615433377e-05	0.6064155663267146	3.899514524731517e-05	0.5977473372604486	0.293820475316134	0.5046319770139576	-0.0009216437583486	0.517747729292807	0.0014727807674514	0.5080165735496349	0.0023218903936156	0.5407850538149713	-7.245051727808626e-06	0.5378823442925065	1.158886941658364e-05	0.5284541077246445	-0.0022614342472432	0.4666381661751304	0.0038382140893577	0.4594154913386751	DCLK3	65850	TRANK1	114654	EPM2AIP1	162728	False	False	False	ref	0	0.0	50	0.03558
2532	chr3	36830702	C	A	rs3732385	-0.0579169041999999	0.0190978658518778	0.0579169041999999	0.017974744904305	0.0234600000211376	0.0146498262357368	-0.0014558052538604	0.0086543253325752	0.0014558052538604	0.0082754231305578	0.4082594217782341	0.3207573200577276	-0.0238736876133465	0.0313885906480285	0.0238736876133465	0.0290980343946149	0.0096663489752519	0.017340213075841	-0.000604901715745	0.0115947816511219	0.000604901715745	0.0109634355335097	-0.0331787674145996	0.0235191935194962	0.0331787674145996	0.022969763536371	DCLK3	66149	TRANK1	114355	EPM2AIP1	162429	False	True	False	ref	15	0.001029	90	0.04272
2533	chr3	36837072	A	G	rs4678909	0.00761794078	0.4411746454048941	0.00761794078	0.4537399843936098	0.0074585739962943	0.7041059110395458	5.430814087171797e-05	0.5003312417949211	5.430814087171797e-05	0.5127646989943374	0.2225541758731937	0.6050491669662856	0.0018979138954219	0.4722932716664102	0.0018979138954219	0.486302189268434	0.0016134280478608	0.6681055000782344	1.3319373286720804e-05	0.5135208260891048	1.3319373286720804e-05	0.5272130515120094	0.0058818037531509	0.3146060229881973	0.0058818037531509	0.3228884977613591	DCLK3	72519	TRANK1	107985	EPM2AIP1	156059	False	False	False	alt	60	0.01074	60	0.09766
2534	chr3	36844469	C	T	rs9863798	-0.0335972972	0.0824737184947742	0.0335972972	0.0775663458006163	0.0119085129594042	0.1710235268061064	-0.0003809427921304	0.066896265920091	0.0003809427921304	0.0631170590760466	0.1698461602298779	0.7017566559257183	-0.0054374883971457	0.2329582812224466	0.0054374883971457	0.2225290910514339	0.0020835715256077	0.5638244884675903	-6.384603141141119e-05	0.1866978428481162	6.384603141141119e-05	0.1776763301821148	-0.0315604933661137	0.0235689740950533	0.0315604933661137	0.0230026785342859	DCLK3	79916	TRANK1	100588	EPM2AIP1	148662	False	False	False	ref	-100	0.00795	100	0.04282
2535	chr3	36844815	G	A	rs35979223	-0.00610557912	0.5295666547100041	0.00610557912	0.5168490634390179	0.0108418789228079	0.2340875213469464	-6.550081878167886e-05	0.4739135905945741	6.550081878167886e-05	0.4624334702617711	0.2275687507131816	0.6127960530187113	-0.0014033466924218	0.5429036752540682	0.0014033466924218	0.5292091912161018	0.0024579313618056	0.5148201665254847	-1.4963186406803464e-05	0.4978354158168958	1.4963186406803464e-05	0.4849992397548118	-0.0057013039554351	0.3595568999579911	0.0057013039554351	0.3501821184662124	DCLK3	80262	TRANK1	100242	EPM2AIP1	148316	False	False	False	ref	100	0.014114	85	0.002472
2536	chr3	36846482	C	G	rs4678910	0.00108628516	0.7395318045198122	0.00261148048	0.7449910424585029	0.0083555135406959	0.5129079030958049	9.423327799058304e-06	0.7526349028435377	2.080314513890408e-05	0.7584626403137431	0.3274598284214566	0.4490885918469439	0.0003439284440604	0.6217242156611795	0.0008495739080945	0.6268787478345514	0.0027779760507605	0.4378616906923679	3.0607724850157667e-06	0.6339058636404433	6.833504384352182e-06	0.6393227381977125	0.0006597578813058	0.6690477298278961	0.0018381933422545	0.6747936388860459	DCLK3	81929	TRANK1	98575	EPM2AIP1	146649	False	False	False	alt	100	0.014984	-75	0.04102
2537	chr3	36846573	G	T	rs4678911	0.00723575056	0.4589025985515885	0.00723575056	0.4719044691959959	0.0071639119725528	0.7499012090153531	5.298052976020724e-05	0.521543122524289	5.298052976020724e-05	0.533998526659259	0.3451280614944138	0.419609646064868	0.0024985880050966	0.3968346411584965	0.0024985880050966	0.4099278985858183	0.0024886994448968	0.511887642350066	1.85038969465988e-05	0.44126835011299	1.85038969465988e-05	0.4539785978430457	0.0047075177128392	0.3959041455810979	0.0047075177128392	0.4062805146520605	DCLK3	82020	TRANK1	98484	EPM2AIP1	146558	False	False	False	alt	45	0.001846	35	0.01144
2538	chr3	36846681	T	G	rs9819304	-0.009368795	0.3949678027788451	0.009368795	0.3828848168049716	0.0245014853783064	0.0106019899720064	-0.0002452836910283	0.1542206211414236	0.0002452836910283	0.1473618164179221	0.3517069679146049	0.4091423239078344	-0.0035271605099861	0.3440007307539625	0.0035271605099861	0.3317682218840024	0.0087612080748854	0.0227433153700787	-9.292203276553217e-05	0.1572319740470074	9.292203276553217e-05	0.1489220225303491	-0.0057905164991337	0.3624012575531397	0.0057905164991337	0.3529636262412939	DCLK3	82128	TRANK1	98376	EPM2AIP1	146450	False	True	False	ref	-65	0.00618	55	0.02077
2539	chr3	36853088	C	T	rs9883001	-0.036439332	0.0718874502109639	0.036439332	0.0675373423388727	0.0102673050046291	0.2781154109909508	-0.0003968492638762	0.0772241064015353	0.0003968492638762	0.073014451301294	0.1603502111017749	0.7242741514229258	-0.0061276830608232	0.2257351809666261	0.0061276830608232	0.2153903032147962	0.0016792987975066	0.6686827739161674	-6.803411088200711e-05	0.2047241673935687	6.803411088200711e-05	0.1955280209831467	-0.0340252492245769	0.0169792734864562	0.0340252492245769	0.0165532372084086	DCLK3	88535	TRANK1	91969	EPM2AIP1	140043	False	False	False	ref	90	0.00553	-100	0.05414
2540	chr3	36854744	C	T	rs11706780	0.0018976917599999	0.4819021997951668	0.0072629957599999	0.488359209309936	0.0100071988825157	0.311866036045606	2.139686316271889e-05	0.4515732854121724	7.379228589807888e-05	0.4582169281281502	0.2945217274038113	0.5006488227035922	0.0005389955663432	0.4526249578473268	0.0021003485929701	0.4600000219172171	0.0029940495946567	0.4107693801205067	6.295251159702494e-06	0.4256034491813324	2.1542803457916733e-05	0.4327840562285442	0.0015228373738316	0.3509007615806566	0.005726200479258	0.3563648607669917	DCLK3	90191	TRANK1	90313	EPM2AIP1	138387	False	False	False	alt	100	0.001373	15	0.01198
2541	chr3	36881851	A	G	rs11129739	0.0424285633999999	0.0412000108024411	0.0424285633999999	0.0442636730840195	0.0101993998031504	0.3030951777649094	0.0004456319028415	0.0499187343733413	0.0004456319028415	0.0531665168736155	0.1863961244411248	0.6796266985086163	0.008141077741158	0.1512312631046632	0.008141077741158	0.160591746964843	0.0019715977602273	0.6091420838158633	8.885795579560514e-05	0.1402638145139933	8.885795579560514e-05	0.148257033346971	0.0406788452162366	0.0092698508225301	0.0406788452162366	0.0095256131516205	TRANK1	63206	EPM2AIP1	111280	MLH1	111376	False	False	False	alt	-100	0.01158	40	0.01355
2542	chr3	36979390	C	T	rs6807351	-0.00425460618	0.6475162313189995	0.00425460618	0.6340255500383983	0.0266798508372488	0.0075395034698909	-0.0001165830445082	0.3231771531611837	0.0001165830445082	0.3132455661865982	0.0504050871897011	0.9069728642641331	-0.0002082821387227	0.8554912992247062	0.0002082821387227	0.8410795904474191	0.00135498773935	0.7250654023333554	-5.726848008383683e-06	0.7002049060713053	5.726848008383683e-06	0.6861390204141034	-0.0026660027593646	0.5866362540290053	0.0026660027593646	0.5745517157145487	EPM2AIP1	13741	MLH1	13837	TRANK1	34333	False	True	True	ref	-75	0.05466	-100	0.04712
2543	chr3	37835756	G	A	rs6778309	0.0002061674847999	0.9126655711105824	0.0009341950352	0.9140722014802364	0.0202632319006285	0.0250413406392165	4.867871413134625e-06	0.7968702712061553	1.8784578152403456e-05	0.7968596476953782	0.0492390999906637	0.9067168994237228	1.5752420442766558e-05	0.9493864465864694	4.689339963044018e-05	0.9502599977166452	0.0010150450942824	0.7829127944006865	3.383713616317173e-07	0.9098206910033974	9.407072890821432e-07	0.9080339431366736	0.0001970974802643	0.8851540111688359	0.0005705453376071	0.8838658939770584	CTDSPL	26125	VILL	152304	PLCD1	193886	False	False	False	alt	100	0.04147	100	0.0534
2544	chr3	37839605	G	A	rs113888150	-0.0510687156	0.0275616406150049	0.0510687156	0.0258383781913005	0.0097233849921505	0.3479774109577968	-0.0005232665414568	0.0443834466717137	0.0005232665414568	0.041866520773792	0.5367835765931182	0.1199459596378842	-0.0273482881424584	0.021866236809296	0.0273482881424584	0.0202037334757003	0.0052079003807333	0.1313555716765053	-0.0002796845093598	0.0345733504666816	0.0002796845093598	0.0322046543798236	-0.0134752435191235	0.1475562785435823	0.0134752435191235	0.1432317860863491	CTDSPL	22276	VILL	148455	PLCD1	190037	True	False	False	ref	100	0.00527	-100	0.03403
2545	chr3	37845490	G	A	rs72862271	-0.0002211943	0.8020860293451747	0.00220355474	0.8040804140826996	0.0066130440394186	0.859668078620455	-3.609297139706827e-07	0.8444124581027914	1.4031094225677525e-05	0.8467731073422607	0.1058973640805402	0.8120377176101483	-3.9698090779127845e-05	0.8349648613981763	0.0002470496982601	0.8372025593900119	0.0006987704849974	0.8544754884707738	-1.2189301750181437e-07	0.8622338588244507	1.5646083334919276e-06	0.8646822232317122	8.506312306143993e-05	0.6776325937440875	0.0018402680525731	0.679715838951618	CTDSPL	16391	VILL	142570	PLCD1	184152	False	False	False	ref	100	0.003819	40	0.02032
2546	chr3	37903926	G	A	rs1812423	0.00877267722	0.3482477972015863	0.01053460922	0.3568250881710432	0.0091161284306942	0.3996562821030253	8.069016960954736e-05	0.3534262307364224	9.61245128365706e-05	0.3608956862525911	0.3303727217087313	0.4474220323853908	0.0027238794379368	0.3241682744614279	0.0033948644371154	0.3324713416522034	0.0030063763751283	0.4157735849050168	2.5072918794205943e-05	0.3233236231079084	3.0950678669383584e-05	0.3309272914403997	0.0075249743254597	0.2608004532958551	0.0083009159846056	0.2658524817181936	CTDSPL	42045	VILL	84134	PLCD1	125716	False	False	False	alt	95	0.003918	100	0.023
2547	chr3	37928204	C	G	rs9878581	-0.00859390548	0.4094714886740994	0.00859390548	0.397520488421593	0.0070718624824245	0.7446796462810604	-6.205249770844956e-05	0.4796770258425072	6.205249770844956e-05	0.467788410962968	0.1599622402722019	0.7253175570993193	-0.0013884214453523	0.5585962564939021	0.0013884214453523	0.545089217463581	0.0011384942100092	0.776842806211941	-1.004156801914354e-05	0.6009255504461309	1.004156801914354e-05	0.5875508232104576	-0.0075809915040612	0.2594436730864478	0.0075809915040612	0.2517152868703181	VILL	59856	CTDSPL	66323	PLCD1	101438	False	False	False	ref	80	0.0015	70	0.01395
2548	chr3	37929755	G	A	rs34054543	-0.002949819858	0.762644600089199	0.002949819858	0.7496175690599368	0.0062384560903006	0.9074151672617592	-1.7844904072402886e-05	0.8237109948122937	1.7844904072402886e-05	0.8117717966253846	0.0349256735028371	0.9357776488367318	-9.0695083441424e-05	0.934169537024472	9.0695083441424e-05	0.9210758258342726	0.0002177879006394	0.95223816106419	-5.47542796781076e-07	0.9494814327973008	5.47542796781076e-07	0.9373372766100402	-0.0012800962665587	0.7768254840243833	0.0012800962665587	0.7633435702804259	VILL	58305	CTDSPL	67874	PLCD1	99887	False	False	False	ref	70	0.00587	-90	0.05197
2549	chr3	44578516	G	A	rs7627777	-0.0510585965999999	0.0259819994001158	0.0510585965999999	0.0243065986551381	0.0115717137028179	0.1860292956642571	-0.0005930053155501	0.0306498479921667	0.0005930053155501	0.0288064078342696	0.6008174358655173	0.0470968430936286	-0.0306606287404267	0.0151062992744304	0.0306606287404267	0.0139036641822096	0.0069519112779387	0.0483713496413027	-0.0003560489105013	0.0206299697744825	0.0003560489105013	0.0192028063075339	-0.0069191589124368	0.2790176209670831	0.0069191589124368	0.2710523507313112	ZNF660	292	ZNF197	6373	ZKSCAN7	23322	False	False	False	ref	-85	4.77e-06	0	0.0
2550	chr3	44581242	C	T	rs140503691	-0.01054335708	0.3549218862899836	0.01054335708	0.3433101401780798	0.0215352630379076	0.0186924576583179	-0.0002267628433985	0.1479582125967842	0.0002267628433985	0.1412810870156215	0.6576956192491623	0.0184932531948068	-0.0069257132036114	0.195354876149218	0.0069257132036114	0.1854922146440055	0.0141795537933858	0.0038723602981006	-0.0001491472371888	0.080533449512264	0.0001491472371888	0.0756145044381671	-0.0009087231195343	0.8323757211830669	0.0009087231195343	0.8185788964791854	ZNF660	3018	ZNF197	3647	ZKSCAN7	26048	False	True	False	ref	-75	0.02673	-30	0.01074
2551	chr3	44625794	C	G	rs10212378	0.0464210998	0.033957106187079	0.0464210998	0.0362701505420897	0.0166698158517582	0.0591676520004135	0.0008380144835493	0.0224132558572872	0.0008380144835493	0.0236779477190997	0.6142802311227294	0.0373049015162076	0.0285113052904573	0.0178160619190974	0.0285113052904573	0.0194121646816242	0.0102347068987431	0.014873035233903	0.0005139576120524	0.0141932599353151	0.0005139576120524	0.015194668511566	0.0054398904552951	0.3428709199931328	0.0054398904552951	0.3521114408483358	ZNF35	22939	ZNF197	40905	ZNF660	47570	False	False	False	alt	-100	0.01595	50	0.0354
2552	chr3	44693574	C	T	rs9756189	0.0031409121526	0.6905004243880537	0.0031611376674	0.7026818148281909	0.0069770291350961	0.7679713623537516	2.3442995769049824e-05	0.7291513310285127	2.3547805632299496e-05	0.7415975580722276	0.1524538636292907	0.7339864380571725	0.000496212554556	0.7382212027849191	0.0004981946336147	0.7483863758848965	0.0010822169146741	0.7793494840021785	3.694267226753423e-06	0.7619701253260242	3.704538482452337e-06	0.7730901916613045	0.0032075021525119	0.5377345121628054	0.0032075021525119	0.5493038570984057	ZNF502	19070	ZNF501	36023	ZNF35	44841	False	False	False	alt	80	0.003048	-100	0.03168
2553	chr3	44843511	T	A	rs3804582	0.0002367060572	0.9323218760479052	0.0007029679428	0.9342111423230972	0.0199133654642209	0.0293031725793222	8.336013254971217e-06	0.8328856159107844	1.4617031676552492e-05	0.8341375142503971	0.262600234442266	0.5550886124170546	7.74663218527386e-05	0.8727933969181686	0.0001841087947173	0.8711998328388962	0.0054021936467137	0.121478813920345	2.584364094579784e-06	0.7752729252991427	4.045357050690436e-06	0.7730985419601539	0.00026141350014	0.8857763134527632	0.0005477235241029	0.8879578530175258	TMEM42	18394	TGM4	31098	KIF15	81789	False	False	False	alt	15	0.0005493	100	0.02342
2554	chr3	45265828	A	G	rs17635268	-0.000382886556	0.8494972126627723	0.001554492684	0.8451135369158442	0.0098059720027034	0.3206247536651416	-2.938058569815029e-06	0.8218185082925833	1.4942333381363877e-05	0.8176917130475518	0.2432639342731771	0.5836440940874917	-0.0001145935320865	0.7761296252530067	0.0003637464457674	0.7711498629837183	0.0023757851680466	0.5338780145959364	-9.041478451481358e-07	0.7589446669315426	3.460592146375988e-06	0.7541376589669967	-0.0001991721905828	0.7515110546560003	0.0013278146038858	0.7476543144885948	TMEM158	39541	CDCP1	119406	LARS2	122734	False	False	False	ref	80	0.004356	-90	0.04822
2555	chr3	45273808	C	T	rs2215709	-0.0540616172	0.022883368323409	0.0540616172	0.0214963308587647	0.0119793513420713	0.1801107001048623	-0.0006950202091716	0.0303538649673681	0.0006950202091716	0.0286743658140481	0.3080571375221734	0.4829251346463633	-0.0167725684866567	0.0630420734862899	0.0167725684866567	0.0583412388247533	0.0037333348111725	0.2830417306899884	-0.000217215198889	0.0542785829459224	0.000217215198889	0.0506982873080039	-0.0434299110986627	0.0080525320051125	0.0434299110986627	0.0078068845326167	TMEM158	47521	LARS2	114754	CDCP1	127386	False	False	False	ref	95	0.002384	-50	0.01227
2556	chr3	45287158	C	T	rs17635696	-0.0363967286	0.0701964604735691	0.0363967286	0.0657497491715558	0.0094838368454734	0.3569116133989483	-0.0003436401174549	0.0811144603900866	0.0003436401174549	0.0766133418522904	0.1636220292741625	0.7151071058474024	-0.0060079320717434	0.2178562440131291	0.0060079320717434	0.2075032756510474	0.001541534693748	0.6895451421977197	-5.633060923334989e-05	0.2126785432105474	5.633060923334989e-05	0.2032456013753716	-0.0344567889708399	0.0162772922340177	0.0344567889708399	0.0158532814635689	TMEM158	60871	LARS2	101404	CDCP1	140736	False	False	False	ref	-95	0.000656	-100	0.0421
2557	chr3	49931139	T	C	rs6771546	-0.016997727	0.2355106779583375	0.016997727	0.2261201154988993	0.0081018211336254	0.5200843561447097	-0.0001516126522974	0.2637516527794917	0.0001516126522974	0.2545735709833389	0.3778088984325563	0.3733752887578419	-0.0063588182125903	0.2128898807174769	0.0063588182125903	0.2026632874813667	0.0030472260815987	0.4098296579857629	-5.66085906574069e-05	0.2337609602818507	5.66085906574069e-05	0.2237534532095259	-0.0105374537080259	0.2016195657798283	0.0105374537080259	0.1958652686869486	MON1A	966	RBM6	8869	MST1R	27266	False	False	False	ref	-35	0.005848	-100	0.05316
2558	chr3	49938221	C	T	rs7609971	-0.00692263716	0.4852744229951781	0.00692263716	0.4726047162602631	0.0093913499867281	0.364473474963755	-6.451054890236542e-05	0.4786470571840217	6.451054890236542e-05	0.466862092163031	0.5468957146858371	0.1049074873842768	-0.0037601875090565	0.3287149272922184	0.0037601875090565	0.3167098984035554	0.0051398911360408	0.130014860138178	-3.5046287856504125e-05	0.3230179642946594	3.5046287856504125e-05	0.3117359363630335	-0.0015954522349815	0.7276760741442884	0.0015954522349815	0.7144072586487762	RBM6	1787	MON1A	8048	MST1R	34348	False	False	False	ref	0	0.0	80	0.03085
2559	chr3	49963320	G	A	rs58621288	-0.0443562984	0.0408506141333448	0.0443562984	0.0383166274041479	0.0092941123790501	0.3794365392969716	-0.0004251285665213	0.0593816246888592	0.0004251285665213	0.0563080903344157	0.2898225085322461	0.5114555390655019	-0.0132233367058111	0.0923474362782788	0.0132233367058111	0.0861318388120546	0.0027409901707464	0.4431752033767056	-0.0001281318667454	0.0975391287873078	0.0001281318667454	0.0918569115970313	-0.0371124181786117	0.014537244985773	0.0371124181786117	0.0140964479462203	RBM6	23312	MON1A	33147	MST1R	59447	False	False	False	ref	-85	0.109	40	0.0326
2560	chr3	49976681	G	A	rs2624821	0.02066756796	0.1853628897259383	0.02066756796	0.1928510702646811	0.0132021165779017	0.1342886504987049	0.0003568685246303	0.1408369991294294	0.0003568685246303	0.1458551179604623	0.163881368063984	0.7148079458963671	0.0040244359027596	0.3405989701251915	0.0040244359027596	0.3539349806187378	0.0022731169955964	0.526053815076739	7.24414840172309e-05	0.2529624727222847	7.24414840172309e-05	0.2631528442566838	0.0212699301859977	0.0849049823158485	0.0212699301859977	0.0870808976342428	RBM6	36673	MON1A	46508	MST1R	72808	False	False	False	alt	-5	0.0007553	100	0.0329
2561	chr3	49984226	G	A	rs62262138	0.00544062508	0.5283202951422052	0.00544062508	0.5416239355562878	0.0067976654828821	0.8190033112349635	3.614123593448709e-05	0.600968602932898	3.614123593448709e-05	0.6139660754740534	0.2468511084139876	0.5773271038394862	0.001477781069339	0.5080985618900964	0.001477781069339	0.5222502708785925	0.0016667954852986	0.6613128598577238	9.775370866078228e-06	0.5592921665418326	9.775370866078228e-06	0.5729847491993362	0.0044253571095135	0.418421294159538	0.0044253571095135	0.4289322905020305	RBM6	44218	MON1A	54053	MST1R	80353	False	False	False	alt	-100	0.01284	-100	0.055
2562	chr3	49984656	G	A	rs199956414	-0.0377047226	0.0633437314201993	0.0377047226	0.0595644664106461	0.0124321869722054	0.1542706908394559	-0.000469745943296	0.0483407101824535	0.000469745943296	0.0456025307389591	0.2740609342420564	0.5308824314745437	-0.0105942856657717	0.1205568874094187	0.0105942856657717	0.1134114707843308	0.0034493350042946	0.3184467202772074	-0.0001330005308641	0.0916302279009111	0.0001330005308641	0.0861971575389532	-0.0316725277233166	0.0229535479190755	0.0316725277233166	0.0223482349652591	RBM6	44648	MON1A	54483	MST1R	80783	False	False	False	ref	35	0.008194	25	0.01727
2563	chr3	49984859	G	A	rs4688690	0.0078748031	0.4286978263762924	0.0078748031	0.4410798314925563	0.0066643106026592	0.8480274881244569	5.25670394492133e-05	0.5221999825992452	5.25670394492133e-05	0.5342128394024264	0.2959532775236257	0.4993551155902453	0.0023932279632772	0.4071674690838669	0.0023932279632772	0.4202157836056454	0.00196071134071	0.6107176025302337	1.586351071378209e-05	0.4744874236222103	1.586351071378209e-05	0.4872955493737329	0.0063652112573781	0.3269324272855846	0.0063652112573781	0.3356063998099821	RBM6	44851	MON1A	54686	MST1R	80986	False	False	False	alt	-75	0.006332	-100	0.05945
2564	chr3	49986605	A	C	rs111439884	0.00123587528	0.7677269383757667	0.00255801964	0.770732547590281	0.0318496173790456	0.0029758282901104	3.953259383052986e-05	0.3988029639304962	7.978463347431079e-05	0.4019195769497657	0.1545099015549953	0.7300407169705002	0.0001538155849878	0.7662636199959144	0.0003814308050463	0.7686712885923729	0.0049097790846986	0.1503141788166833	4.935397479177994e-06	0.5295825315582197	1.1889946598348164e-05	0.5321195426784524	0.001085073496613	0.6053531418989894	0.0023672444734903	0.6084150310191844	RBM6	46597	MON1A	56432	MST1R	82732	False	True	True	alt	-55	0.006287	45	0.0631
2565	chr3	49988596	A	C	rs34080578	0.009946334	0.3446650262185128	0.009946334	0.3562298284699488	0.0093898514851321	0.3706277629789095	9.249271814985044e-05	0.3429611911491532	9.249271814985044e-05	0.3536084457373105	0.094532100955404	0.8292704428016058	0.0009610241187717	0.5911298874912392	0.0009610241187717	0.6050484714044981	0.000873040986396	0.817300672555721	8.7895941227761e-06	0.5771044612078386	8.7895941227761e-06	0.5905568445968122	0.0084751916513656	0.2227869397060428	0.0084751916513656	0.229919823843713	RBM6	48588	MON1A	58423	MST1R	84723	False	False	False	alt	90	0.005436	-95	0.05707
2566	chr3	49990341	C	T	rs2353579	-0.0255546332	0.1448745185135327	0.0255546332	0.1376260607128062	0.0067258950098711	0.8206917394707975	-0.0001793946540464	0.2197277404072745	0.0001793946540464	0.2111176307036678	0.1186070394921108	0.7943852251386344	-0.0032853215877912	0.3654939963543003	0.0032853215877912	0.3532601755538567	0.0008163833033716	0.8357037249567524	-2.342575937969785e-05	0.424066312704035	2.342575937969785e-05	0.4119490613590169	-0.0234504507308166	0.0582098370253492	0.0234504507308166	0.056649353602294	RBM6	50333	MON1A	60168	MST1R	86468	False	False	False	ref	90	0.01481	60	0.0255
2567	chr3	49997890	T	C	rs4688757	0.00064274576	0.7307740414529748	0.00286970008	0.7329206640341349	0.020804043585639	0.0225417074235059	8.465761448878469e-06	0.4750602035221075	6.095980684369223e-05	0.4769003221217827	0.0855465305656697	0.85174193947622	8.72148808757e-05	0.8292677096020614	0.0002411422695373	0.8323981486502744	0.0017617601425109	0.6556329097304213	1.357382763986453e-06	0.705871767285641	5.085675513777134e-06	0.7087759045115107	0.0003713731470243	0.589435455859404	0.0024834282513303	0.5918376815938418	RBM6	57882	MON1A	67717	RBM5	91030	False	False	False	alt	55	0.003849	70	0.02744
2568	chr3	50003880	C	T	rs6765484	-0.0162053594	0.2269659417180709	0.0162053594	0.2173519897039494	0.0079208934904812	0.6110006200727058	-0.0001280112960469	0.2698158236571525	0.0001280112960469	0.2603876067949408	0.4104980342119731	0.3190150107235974	-0.0066529557931562	0.1943743357801641	0.0066529557931562	0.1847283491994413	0.0032714077814461	0.3753808717566097	-5.287856787879726e-05	0.2212040276455026	5.287856787879726e-05	0.2116239662213357	-0.0086038236911171	0.2282786611294107	0.0086038236911171	0.2214470525156473	RBM6	63872	MON1A	73707	RBM5	85040	False	False	False	ref	-55	0.000635	85	0.082
2569	chr3	50011866	T	G	rs7634917	-0.00207735496	0.6419725569940962	0.00404772896	0.6348261936796323	0.0158515410838203	0.0665939745844286	-3.93204814237925e-05	0.4718074073239356	6.45760191621141e-05	0.4652627707598425	0.1154825257523417	0.794081092568819	-0.0002639956532117	0.7426469832716811	0.0004501406987968	0.7350602061020906	0.0018244999190051	0.6382058852369008	-4.775405514063812e-06	0.638683926199449	7.161345017408191e-06	0.6309616541563986	-0.0024357099140032	0.4775412367240872	0.0037469268353405	0.4712208100582468	RBM6	71858	RBM5	77054	MON1A	81693	False	False	False	ref	-90	0.00598	-55	0.02197
2570	chr3	50019045	T	A	rs75729494	-0.00645683424	0.505911813908643	0.00645683424	0.4935210065298329	0.0282529697525984	0.005487803105946	-0.0001845866135459	0.1998221852973309	0.0001845866135459	0.1916629122704742	0.0965528688056929	0.8291848404642509	-0.0006204990317868	0.7043730045963349	0.0006204990317868	0.6904487166418909	0.0027225888226708	0.4724302512554978	-1.7716475334697958e-05	0.4604938809468642	1.7716475334697958e-05	0.4481198945058619	-0.005624539673648	0.3541405510874495	0.005624539673648	0.3446056382633075	RBM5	69875	RBM6	79037	MON1A	88872	False	True	True	ref	-45	0.001984	-45	0.01337
2571	chr3	50022325	T	C	rs6446193	-0.00577303596	0.5468957530276704	0.00577303596	0.5342904800701669	0.0245278329130437	0.0104176324978595	-0.0001400280851856	0.2693738324157601	0.0001400280851856	0.2599146299438254	0.1547484932416311	0.7313698908009979	-0.0009334371860589	0.6313304287397724	0.0009334371860589	0.6177701153368119	0.003757021165533	0.2873277924802415	-2.250567766312155e-05	0.4139861716812165	2.250567766312155e-05	0.4019183337507364	-0.0055996431498251	0.3639002302257271	0.0055996431498251	0.3541564672212369	RBM5	66595	RBM6	82317	MON1A	92152	False	True	False	ref	-85	0.00145	-20	0.00891
2572	chr3	50031924	G	A	rs11130240	-0.00452016676	0.6322672089539356	0.00452016676	0.6192905207259574	0.0068169900870141	0.7681802041250555	-3.212253579129844e-05	0.6914361157057654	3.212253579129844e-05	0.6785376261902273	0.1846015000155602	0.6837499440256332	-0.0009141532205637	0.6500104835668806	0.0009141532205637	0.6362629664656921	0.0012915228214734	0.7453202854482955	-6.583660542979385e-06	0.693526006513744	6.583660542979385e-06	0.6800331158931066	-0.004282202097532	0.4611632438043502	0.004282202097532	0.4502399431990835	RBM5	56996	RBM6	91916	MON1A	101751	False	False	False	ref	-25	0.001526	50	0.02551
2573	chr3	50032019	G	T	rs9866695	-0.00335138014	0.6291281269279333	0.00423991486	0.6206709684722167	0.007881707767759	0.6111509697861368	-2.769972165915997e-05	0.647743447743403	3.390572583922441e-05	0.6396726015623401	0.2097615120488801	0.6423515669536785	-0.0007574490698766	0.6363472114162492	0.0008979201251924	0.6275884079030372	0.0016651832376392	0.6716604951915968	-6.23431342327831e-06	0.6498738053048869	7.215438784580626e-06	0.6413878428470589	-0.003371404267679	0.4639534334691619	0.0040104150457991	0.4570414627047769	RBM5	56901	RBM6	92011	MON1A	101846	False	False	False	ref	-100	0.01289	60	0.06836
2574	chr3	50056838	T	A	rs12486470	-0.0071198336	0.4774674970066793	0.0071198336	0.4649624097148173	0.0164845171521306	0.0563157970037094	-0.0001168940705878	0.3071600030911809	0.0001168940705878	0.2973597573329393	0.1572443697548729	0.7277145711363449	-0.0011199644027459	0.5886704941667129	0.0011199644027459	0.5748714004047255	0.0025899180496381	0.4996946188525414	-1.8330342653969952e-05	0.450367036020164	1.8330342653969952e-05	0.4379492430671598	-0.0068382452100125	0.2944385777147533	0.0068382452100125	0.2858596305459036	RBM5	32082	SEMA3F	98208	RBM6	116830	False	False	False	ref	75	0.00442	90	0.01978
2575	chr3	50079987	G	C	rs62263590	0.0149555524599999	0.2500389423135856	0.0149555524599999	0.2606636675353138	0.0083787852379782	0.5190784394662794	0.0001289098978024	0.2769924826546909	0.0001289098978024	0.2870436371333923	0.1779541281548563	0.6916953082507383	0.0025901558089566	0.3808570454563996	0.0025901558089566	0.3936718861235725	0.0014840201660796	0.7004628528093805	2.2276477590509087e-05	0.39268216795194	2.2276477590509087e-05	0.4049464340217746	0.0143175759084637	0.1197517510005869	0.0143175759084637	0.1234996518050378	RBM5	8933	SEMA3F	75059	GNAT1	111624	False	False	False	alt	-90	0.05603	-90	0.006744
2576	chr3	50108661	T	A	rs3733133	-0.0031763172319999	0.6743009348108994	0.003586956528	0.6708309377211013	0.0091772769683121	0.4140683843495059	-3.053474422833417e-05	0.6643292710736287	3.370572804663847e-05	0.6611490719553526	0.1660577391881658	0.7038457421039316	-0.0004762826111392	0.7310827663069092	0.0005649561533167	0.7286074049499724	0.0014294505747952	0.7075820562621485	-4.3250140056152966e-06	0.7259674709852407	5.009821897633608e-06	0.7236658473129128	-0.0030747206921233	0.5267293550027653	0.0035560534860319	0.5230640200271768	RBM5	19741	SEMA3F	46385	GNAT1	82950	False	False	False	ref	-70	0.004913	15	0.005707
2577	chr3	50136764	G	T	rs2624847	-0.002029843526	0.5217333458699781	0.006636819074	0.5193693841730687	0.0069524787676641	0.7935980907256319	-1.1910406858182967e-05	0.5856662112913459	4.676392891202071e-05	0.5840522281472811	0.4200935694353675	0.2960000363299984	-0.0011643737876517	0.4033883795708473	0.0029452944286381	0.4004023394956965	0.0029141534836383	0.4338955428770538	-7.170141800736496e-06	0.4560090482711704	2.0631069638967125e-05	0.4536962065427119	0.0	0.5722572232556727	0.0027427670411518	0.5722798749099095	SEMA3F	18282	RBM5	47844	GNAT1	54847	False	False	False	ref	95	0.001825	10	0.01567
2578	chr3	50151221	C	T	rs12054052	-0.0159068362999999	0.2523979029799736	0.0159068362999999	0.2422589445167636	0.0124312608089582	0.1499089751424848	-0.0001983514509391	0.1813025486852174	0.0001983514509391	0.1734673746836469	0.6207823732611335	0.0341049769727452	-0.0099350370146442	0.1396685761083278	0.0099350370146442	0.1312644606696572	0.0077152263730913	0.033755853760784	-0.0001237247843671	0.1051571621370478	0.0001237247843671	0.0989872933635802	-0.001753130219193	0.700250537044794	0.001753130219193	0.6871784525738773	SEMA3F	3825	GNAT1	40390	SLC38A3	54026	False	False	False	ref	-70	0.01895	-70	0.09033
2579	chr3	50171616	G	A	rs2624835	-0.00865742452	0.4172283620201941	0.00865742452	0.404862175036023	0.0118872989040418	0.1776346763047924	-0.0001063083771278	0.3439316485487456	0.0001063083771278	0.3332546159706672	0.6089150302389029	0.0418119999753587	-0.0052686051350376	0.2482079519801383	0.0052686051350376	0.2372089162221829	0.0072099602250079	0.0430271120329093	-6.434757556712609e-05	0.2007078227259473	6.434757556712609e-05	0.1914305531711178	-0.0011929584331787	0.7888133609371643	0.0011929584331787	0.7753031078651889	SEMA3F	16570	GNAT1	19995	SLC38A3	33631	False	False	False	ref	100	0.001617	100	0.04443
2580	chr3	50191334	G	T	rs3755831	0.000958009232	0.7906468791552251	0.001963218288	0.7962447535626048	0.0085068568178971	0.4977534075374015	7.2930351497000675e-06	0.7861974659370311	1.6722139314159262e-05	0.791583655999943	0.4977810973142875	0.1756126971412931	0.0004923903441119	0.5927803391286941	0.0009773967497405	0.5992444391000364	0.0042081021707702	0.2256196857444576	3.754714322496125e-06	0.5962082056753446	8.276128520812787e-06	0.6022379725642646	0.0002095457421757	0.8635837880729293	0.0006286372265272	0.8684318042889567	GNAT1	277	SLC38A3	13913	GNAI2	34959	False	False	False	alt	70	0.0104	75	0.1494
2581	chr3	50202031	C	T	rs4688683	-0.046107641	0.0373538635843495	0.046107641	0.0352616942614127	0.0136057582918928	0.1288365401759294	-0.0007197778938248	0.0324981073308856	0.0007197778938248	0.0309383390455568	0.4884635732735816	0.1848696206169467	-0.0225928833469633	0.0354142236770313	0.0225928833469633	0.032846336329982	0.0066013079521678	0.0631142588662169	-0.0003496511185268	0.0295922763253176	0.0003496511185268	0.0278136703985214	-0.0170250728741999	0.1090938741232346	0.0170250728741999	0.105959596762137	SLC38A3	3216	GNAT1	10420	GNAI2	24262	False	False	False	ref	50	0.001706	25	0.02753
2582	chr3	50206077	G	T	rs2236939	0.0174679637	0.2008286609469337	0.0174679637	0.2102194082800754	0.0157274611964557	0.0669337685146511	0.0002737452700579	0.1059843216385688	0.0002737452700579	0.1116618748192781	0.7762777622174504	0.0071555116383145	0.0135319507786438	0.0776254081598445	0.0135319507786438	0.0834478254991354	0.0121937767196373	0.0061507866548147	0.000211824581133	0.0440214209676586	0.000211824581133	0.0471848805087508	0.0032614446207947	0.500334786586871	0.0032614446207947	0.512010601307561	SLC38A3	830	GNAT1	14466	GNAI2	20216	False	False	False	alt	15	0.001709	5	0.0105
2583	chr3	50206647	G	A	rs2236940	-0.060532366	0.014071792877885	0.060532366	0.0132186478113174	0.0135392071676372	0.1141268763277387	-0.0008449719935095	0.0180103727634762	0.0008449719935095	0.0170854992449378	0.6076058880278842	0.0428236332656071	-0.0368022374780113	0.0082663866768649	0.0368022374780113	0.0076655073563984	0.0082338355601436	0.0291438020856563	-0.000514218235948	0.0122602219743234	0.000514218235948	0.0115246810306478	-0.0078673015280241	0.2469924460287227	0.0078673015280241	0.2396457970856723	SLC38A3	1400	GNAT1	15036	GNAI2	19646	False	True	False	ref	100	0.00918	-85	0.0406
2584	chr3	50235333	T	G	rs4688743	0.00781577506	0.3836270774285727	0.00890369586	0.393503206731863	0.0125465692588176	0.156870537453861	8.737725604098492e-05	0.3132391865973171	0.0001067244292109	0.3213463433361339	0.640328219172398	0.0237716351334848	0.0050142928913014	0.2137202290748435	0.0057013603954884	0.2226576462379998	0.0080196608531394	0.0310651158996876	5.608741990267296e-05	0.1715520114397008	6.830596887711904e-05	0.1787247293642609	0.0007697175281901	0.822747104711058	0.0008361082583844	0.8329186807438143	GNAI2	9040	SLC38A3	30086	SEMA3B	32226	False	False	False	alt	-75	0.00749	15	0.03638
2585	chr3	50278688	T	C	rs6776145	0.0466464751999999	0.0293209724779947	0.0466464751999999	0.0314795625550874	0.0135362352259888	0.1136146571863183	0.0006637751461821	0.0249563347410888	0.0006637751461821	0.0264422455001666	0.3246154005746947	0.4278714448544806	0.0155001265717516	0.0600678784503444	0.0155001265717516	0.064884917479361	0.0045025857081589	0.1800831246246948	0.0002282083141779	0.044835394650602	0.0002282083141779	0.0480982542500274	0.0318820734654923	0.0225222159247449	0.0318820734654923	0.023111280575122	LSMEM2	400	SEMA3B	11129	IFRD2	14230	False	False	False	alt	-100	0.002377	100	0.01155
2586	chr3	50303565	T	C	rs28365992	0.0491735581999999	0.0277150097279709	0.0491735581999999	0.0295947509332671	0.0122192031461074	0.1641166552149548	0.0006239321872892	0.0280951831573331	0.0006239321872892	0.0298153677211477	0.6224774115914065	0.032917346175664	0.0304188218207459	0.013974148505485	0.0304188218207459	0.0151986515870244	0.0075804401428073	0.0360401417285755	0.0003842564452537	0.0173772663719645	0.0003842564452537	0.0186830537874841	0.0059025508563366	0.3327183140308288	0.0059025508563366	0.3418504022366241	NAA80	4149	HYAL3	4160	HYAL1	8816	True	False	False	alt	95	0.008606	85	0.12476
2587	chr3	50314167	C	T	rs12492683	0.00608540672	0.4870976537601796	0.00608540672	0.4997293893661163	0.0078460117317146	0.6260325078730116	4.722316010762453e-05	0.5235478951237769	4.722316010762453e-05	0.5358501355343575	0.2142947540949595	0.6290208082153792	0.0013257525902844	0.515831921115008	0.0013257525902844	0.5297868821205016	0.0016775379124834	0.6604264191339324	1.029719669639534e-05	0.5379481740047344	1.029719669639534e-05	0.5514846998803216	0.0055498501021794	0.335541993186861	0.0055498501021794	0.3448885139658648	HYAL1	1786	HYAL2	8615	TUSC2	14084	False	False	False	alt	-80	0.01334	-45	0.02863
2588	chr3	50314953	T	C	rs12054403	0.01025454416	0.3443698751855116	0.01025454416	0.356311571072357	0.0104893162743097	0.2599861446351148	0.0001122978980384	0.2973820498194215	0.0001122978980384	0.3081235883311832	0.3766034917374661	0.3547455632775511	0.0041880732024165	0.2844025184558702	0.0041880732024165	0.2968280992224565	0.0040277730724312	0.2251035491880019	4.661121448110501e-05	0.2492892749549819	4.661121448110501e-05	0.260343126402989	0.0053631261735079	0.3457085160186068	0.0053631261735079	0.3554569898168973	HYAL1	2572	HYAL2	7829	TUSC2	13298	False	False	False	alt	25	0.000759	25	0.0423
2589	chr3	50334001	C	A	rs2236947	0.0327183322	0.0784388524314931	0.0327183322	0.0837955046704656	0.0182715439193669	0.0386672658399189	0.0006025414022586	0.0270407934892321	0.0006025414022586	0.0288022341412398	0.572200956441457	0.0745966453624687	0.0187309595964439	0.0434781284295806	0.0187309595964439	0.0474941411269204	0.0104654474170171	0.0107944601439824	0.0003453560218033	0.0193787078065543	0.0003453560218033	0.020931142808804	0.005856907229328	0.3164654425061975	0.005856907229328	0.3256247855395179	TUSC2	5750	RASSF1	6979	HYAL2	11219	False	False	False	alt	-100	0.00596	-45	0.11
2590	chr3	50354037	T	C	rs58181992	-0.001111993092	0.841586131105886	0.001745114268	0.8393845128020668	0.0127841893561315	0.1471748424794463	-1.5277700574776776e-05	0.7574820488809502	2.336331034189172e-05	0.7549390968607103	0.2632848888473946	0.5348000394820492	-0.0002475404219722	0.7586547650612919	0.0004402955795421	0.7569842118696792	0.0033035717425557	0.3326081779737111	-3.1383966185759715e-06	0.6945700021175868	5.72463665518271e-06	0.692895114782353	-0.0009336196433573	0.7433088990582412	0.001477193746823	0.7406626632382454	ENSG00000272104	3144	CYB561D2	3191	NPRL2	3211	False	False	False	ref	85	0.002197	100	0.05914
2591	chr3	50418039	G	A	rs6446206	0.0049448118	0.4992920906199297	0.00646628248	0.5076528629330045	0.0079266422388934	0.6003144547653262	3.975843143863465e-05	0.5316777752635276	5.205499709344876e-05	0.5394160611348828	0.449247398831938	0.2457602215836178	0.0020537070519565	0.3723766683053689	0.0028152552178204	0.3801331752881507	0.0035475586724794	0.3189189215968996	1.646055220464887e-05	0.3971069352090035	2.2615404323555044e-05	0.4044383520081854	0.0027531405927446	0.5398339579200737	0.0031016919262647	0.5476204060364833	TMEM115	58518	ENSG00000272104	67146	CYB561D2	67193	False	False	False	alt	45	0.002953	45	0.04224
2592	chr3	50454725	G	A	rs2157328	0.0018620607639999	0.7627075328581389	0.002575507324	0.7705029982606072	0.0209060325708447	0.0228296542429256	4.093541053885545e-05	0.5513181574908338	5.255682883694456e-05	0.5590105134829187	0.646714177532962	0.0214153199076357	0.0012090899248261	0.5138041628592819	0.0016695415593107	0.5217013281840728	0.0135265327160592	0.0045779976879967	2.658813560379568e-05	0.335574357431159	3.408848871342975e-05	0.3428680939479545	0.0001473044326186	0.9427225231773224	0.00021784458345	0.9504346822480704	CACNA2D2	49519	TMEM115	95204	ENSG00000272104	103832	False	False	False	alt	-100	0.00824	-100	0.0831
2593	chr3	50462430	A	G	rs9311454	-0.00772884122	0.4540837499387656	0.00772884122	0.4417965731066728	0.0187688506278785	0.0343381000287487	-0.0001519687213234	0.2495404349418696	0.0001519687213234	0.2405196778926141	0.4182304795692901	0.3068176341662589	-0.0032221636686737	0.3528534831799908	0.0032221636686737	0.3407160403792344	0.0078402245824347	0.0333413479581716	-6.325542616966503e-05	0.2052200994664527	6.325542616966503e-05	0.1958358425399113	-0.0038091681448977	0.4757660638711358	0.0038091681448977	0.4647047824157823	CACNA2D2	41814	TMEM115	102909	HEMK1	106723	False	False	False	ref	85	0.001343	100	0.11804
2594	chr3	50483208	C	A	rs80049775	0.002332969572	0.7160498442899184	0.002994589548	0.7218823053253485	0.0108500055639251	0.2383903820880495	2.614772412174762e-05	0.6644217620186301	3.411989213801383e-05	0.6702538990885055	0.3577671967551531	0.3993585593945944	0.0008798110798936	0.5954092227389741	0.0010824399258621	0.6021398040069345	0.0038238357189105	0.2823234136683337	9.803275345717083e-06	0.5546164532390133	1.2200721468160128e-05	0.5610256444506472	0.0013983547547173	0.6815207369952745	0.0018672392867145	0.6868463673677194	CACNA2D2	21036	HEMK1	85945	C3ORF18	87819	False	False	False	alt	100	0.000703	75	0.01862
2595	chr3	50556413	G	A	rs17051014	0.0185392276	0.194890933885299	0.0185392276	0.2039906535707464	0.0094112742743743	0.3710749202295753	0.0001783057218238	0.1969379561089176	0.0001783057218238	0.2052807978455218	0.4530212969014201	0.2490280530678113	0.0083645168373326	0.1442371813915164	0.0083645168373326	0.153204435138154	0.0042741388422387	0.2202998341515641	8.065027544564742e-05	0.1459836101681638	8.065027544564742e-05	0.1542890635925065	0.0081432380003941	0.2470791078011116	0.0081432380003941	0.2545984311263973	HEMK1	12740	C3ORF18	14614	CACNA2D2	52169	False	False	False	alt	100	0.006363	30	0.02393
2596	chr3	52646807	C	T	rs2028216	0.00462461138	0.5658118454847924	0.00462461138	0.5788655955909895	0.0181399786519819	0.0394983734648355	8.491450014157451e-05	0.3584648408316025	8.491450014157451e-05	0.3695055943090131	0.0281994626500274	0.952580454395622	0.0001393179859201	0.8752432932565414	0.0001393179859201	0.8894039555010408	0.0005118700609508	0.8993344712929628	2.5493996273358445e-06	0.803903583542077	2.5493996273358445e-06	0.8181704731658971	0.0020290666915631	0.6476910883266804	0.0020290666915631	0.6607083040150737	GNL3	34350	PBRM1	39110	SPCS1	58149	False	False	False	alt	0	0.0	75	0.02266
2597	chr3	52664401	T	C	rs12488461	0.0042455198999999	0.6285438676303778	0.0042455198999999	0.6421136255567651	0.0246730421684015	0.0101986543579275	9.933249127955892e-05	0.3463389124096616	9.933249127955892e-05	0.3569279284243969	0.3013164036971337	0.4934275315464622	0.0011949613339041	0.5653047395916144	0.0011949613339041	0.579344014187671	0.007497974093315	0.038542368957821	2.8107305189796395e-05	0.3487901757096962	2.8107305189796395e-05	0.3607405363713445	0.0031162148984947	0.5228783579012587	0.0031162148984947	0.5346392791396826	GNL3	16756	PBRM1	21516	SPCS1	40555	False	True	False	alt	-60	0.01929	-60	0.0187
2598	chr3	52715318	C	T	rs35526119	-0.0478366702	0.0325929797287937	0.0478366702	0.0304608142333215	0.0116764908517348	0.1798933631586464	-0.000563612168828	0.0344352966822081	0.000563612168828	0.0323411754732431	0.5993402421186942	0.049264062289513	-0.0286251765693048	0.0185536202870853	0.0286251765693048	0.0170803633692895	0.0069860109124955	0.0474679535041031	-0.0003367332041968	0.0230717025702106	0.0003367332041968	0.0214639818044195	-0.0069067106505253	0.2915743371162705	0.0069067106505253	0.2832095759688395	GLT8D1	9286	SPCS1	10362	PBRM1	29401	False	False	False	ref	-100	0.01205	-100	0.05884
2599	chr3	52781889	T	C	rs2710323	0.0283235658	0.1017408484530972	0.0283235658	0.1078442056138384	0.0111153195928316	0.2276527050749508	0.0003334511114898	0.0844832519623285	0.0003334511114898	0.0891625390214631	0.2659903111028122	0.5424670433841497	0.0075549767798413	0.1603544890216806	0.0075549767798413	0.1697713219399323	0.0029956986819558	0.3928809550283254	8.994567001975659e-05	0.1327509564043605	8.994567001975659e-05	0.1403762264126322	0.0248259836720297	0.0475108149290218	0.0248259836720297	0.0488647741698787	ITIH1	4293	NEK4	10943	ITIH3	12880	False	False	False	alt	-100	0.00551	35	0.03314
2600	chr3	52820897	G	A	rs2535646	0.00828537234	0.3380589095933202	0.0104792548599999	0.3449844442904258	0.0088912354193266	0.446985167222503	6.452095576365545e-05	0.3558850775160496	8.81665883334778e-05	0.3619824230403597	0.5330407991784146	0.1246836532543954	0.0044380730306722	0.2177011969883369	0.0056042793303384	0.2241404265070464	0.0047306362746158	0.1662929450271394	3.453014380749591e-05	0.2287469163191989	4.709949774037288e-05	0.2342600185260588	0.0020062448780588	0.5823579986404669	0.0025456695608875	0.5894320154990615	ITIH4	9791	MUSTN1	14122	ENSG00000243696	14832	False	False	False	alt	-50	0.0019455	-60	0.11444
2601	chr3	52894317	G	A	rs62253582	-0.013078148	0.3007700954914327	0.013078148	0.2896541242635844	0.0091271551589832	0.3844546127230558	-0.0001210909307234	0.2934068846293646	0.0001210909307234	0.2833292152022071	0.4265874127324972	0.2948390293422174	-0.0056209602277343	0.2400686063958992	0.0056209602277343	0.2290585572008649	0.0038933786366216	0.2528289282795345	-5.199303473179605e-05	0.2354991082882054	5.199303473179605e-05	0.2253777223571679	-0.0059834645587609	0.3377925232635267	0.0059834645587609	0.3286919149875759	STIMATE	3231	STIMATE-MUSTN1	3245	ENSG00000243696	58588	False	False	False	ref	100	0.002335	-100	0.1396
2602	chr3	52894318	G	A	rs62253583	-0.019173716	0.1981375342044651	0.019173716	0.1891881535123327	0.009381626292643	0.3554823882074384	-0.0001798610978917	0.1981251150414399	0.0001798610978917	0.1899258996440971	0.4266869988277886	0.2946567110252229	-0.008209700975338	0.1616188262438829	0.008209700975338	0.1525594847902462	0.0040042010479968	0.245708890262918	-7.701913572476769e-05	0.1615063476564739	7.701913572476769e-05	0.1531347657203858	-0.0091287254017157	0.215923734719246	0.0091287254017157	0.2093053436857082	STIMATE	3230	STIMATE-MUSTN1	3244	ENSG00000243696	58589	False	False	False	ref	100	0.002762	-100	0.1287
2603	chr3	52957291	A	T	rs2465101	-0.001483499348	0.6947896445675156	0.003180621452	0.6938141393949107	0.0125331682286969	0.1523419874504131	-1.982205287185056e-05	0.5932469625715903	4.179635967659575e-05	0.5921527800981629	0.3161962261019305	0.4728802950208544	-0.0004397415455985	0.6172628534735961	0.0009974488239671	0.6161501322528637	0.0040011044701722	0.258679385158063	-5.786041592701768e-06	0.5367966459201637	1.313316595971032e-05	0.5357613238793142	-0.0015601821595659	0.6160967985654956	0.002373468604446	0.6154622381952002	STIMATE-MUSTN1	59729	STIMATE	59743	SFMBT1	89459	False	False	False	ref	65	0.006325	-90	0.09705
2604	chr3	52975579	T	C	rs6801235	-0.00197667346	0.7170603036330371	0.0032184957399999	0.7091917524176592	0.0089926679228728	0.4207303580197353	-1.594223656550606e-05	0.7089244351834622	2.953643133312525e-05	0.7017344122519904	0.1688357763047334	0.710207783246073	-0.0003043573028842	0.7475872645235299	0.000516371024785	0.7400220448100402	0.0015018498594321	0.6984693207994623	-2.406740357102604e-06	0.7410003722982794	4.727648846666568e-06	0.7338342618727935	-0.0023236755568003	0.5588780417465228	0.003269743462069	0.5522031950955663	SFMBT1	71171	STIMATE-MUSTN1	78017	STIMATE	78031	False	False	False	ref	-80	0.002192	5	0.001389
2605	chr3	52980641	C	T	rs2581816	-0.00467350234	0.6247517908571559	0.00467350234	0.611554751556902	0.0074948637685667	0.6781321076517609	-3.576151741228107e-05	0.6608094319321915	3.576151741228107e-05	0.6480089414550864	0.1840371788089088	0.6844723240212314	-0.000802789744768	0.660598388244836	0.000802789744768	0.646884064509444	0.0013943043554294	0.7217871690465041	-6.256411277869145e-06	0.6849319571891022	6.256411277869145e-06	0.6711766251765152	-0.0044689260262035	0.4299635750376319	0.0044689260262035	0.4192554107790706	SFMBT1	66109	STIMATE-MUSTN1	83079	STIMATE	83093	False	False	False	ref	-50	0.005066	-45	0.0594
2606	chr3	52992088	T	C	rs6771610	4.807904799999981e-05	0.6986190582391147	0.003144033008	0.6979810658144402	0.0058574811467375	0.9337172243472373	2.2956608273228087e-06	0.7897918598432404	1.813472517946246e-05	0.7899481890526736	0.2669488272699924	0.5485995207010707	-7.037208167713998e-05	0.6313107379532018	0.0008369541762123	0.6299858589192504	0.001557221552434	0.6896577350438965	1.0721843618891097e-07	0.7057255213893104	4.79302921585791e-06	0.705318013859343	0.0001680515358042	0.568113321661121	0.0026950487038247	0.5683973488101477	SFMBT1	54662	STIMATE-MUSTN1	94526	STIMATE	94540	False	False	False	alt	25	0.001804	65	0.01808
2607	chr3	53235301	T	C	rs2035450	0.0513774302	0.0219540751449675	0.0513774302	0.0236064645352534	0.0112153890829075	0.2085305440925419	0.0005784387486937	0.028553651299135	0.0005784387486937	0.0305680501547474	0.5106982437577153	0.1549871916618372	0.0261803777521004	0.0196346593936046	0.0261803777521004	0.0214885534965199	0.0057205076734057	0.0928433185925302	0.0002944087975291	0.0245499467668035	0.0002944087975291	0.0265582612532547	0.0161599186713554	0.1033613745729494	0.0161599186713554	0.106435944679061	TKT	20751	PRKCD	79291	CACNA1D	93663	False	False	False	alt	-5	0.0001698	-40	0.042
2608	chr3	53236328	T	C	rs3773744	0.01127253754	0.3234417756043924	0.01127253754	0.3346499994894779	0.0097760296273776	0.3351264472235833	0.0001202364915192	0.3036548619209136	0.0001202364915192	0.3134917148740765	0.5106608989719811	0.1512614794301229	0.0056022812951807	0.2149280624442771	0.0056022812951807	0.2255020036345468	0.0049385203019266	0.1489811888299173	5.888199221251756e-05	0.2039537576829263	5.888199221251756e-05	0.2134593580341905	0.0038153922758534	0.4847928182554332	0.0038153922758534	0.4959002119027106	TKT	19724	PRKCD	80318	CACNA1D	92636	False	False	False	alt	100	0.002584	-65	0.03088
2609	chr3	53259970	G	A	rs12490667	-0.0072838138799999	0.4629171009823116	0.0072838138799999	0.4506820070216286	0.0067042635017227	0.8280169801643495	-4.900584546765824e-05	0.5551168692453546	4.900584546765824e-05	0.5427272862781354	0.4274401186734302	0.2903039814381566	-0.0031266849882811	0.3529994507502926	0.0031266849882811	0.3408049912817745	0.0028577387602105	0.448227977577442	-2.1006306690664986e-05	0.4182086950560599	2.1006306690664986e-05	0.4058888910133855	-0.0033921513708648	0.5137975198968558	0.0033921513708648	0.5022895122327459	TKT	3918	CACNA1D	68994	DCP1A	87616	False	False	False	ref	100	0.011635	100	0.02438
2610	chr3	53421542	G	T	rs2358740	0.0001644597799999	0.6858334006450404	0.0031807429	0.6859923474808878	0.0093618093967361	0.3831020277526641	1.9171985521504245e-06	0.6563843192513097	3.080992379710324e-05	0.656776501924733	0.2670006950279567	0.543083768645366	-9.01532225380103e-07	0.6286342519994385	0.0008522690472143	0.6284511138590928	0.0024575879711854	0.5082430759942815	-5.9355286348649895e-08	0.610729913634247	8.1596318384102e-06	0.6105089593724407	-4.149420637144015e-05	0.5778217354400588	0.0026265832633118	0.5786694642232912	DCP1A	73956	CACNA1D	92578	TKT	165490	True	False	False	alt	-70	0.002033	90	0.01706
2611	chr3	53441047	T	C	rs9799015	0.0183532526	0.1885810703141347	0.0183532526	0.1976423255936373	0.0074544339024204	0.702635729633815	0.0001378041118279	0.2434657722056999	0.0001378041118279	0.2525915372159044	0.0342928868556727	0.9322758299326676	0.0006094199263098	0.6735373727197469	0.0006094199263098	0.6878741283899563	0.0002442403691572	0.9436348855031864	4.3697866826351085e-06	0.7034680528870542	4.3697866826351085e-06	0.7178947483433737	0.0079440658098112	0.2315460568914509	0.0079440658098112	0.2384192711573379	DCP1A	93461	CACNA1D	112083	TKT	184995	False	False	False	alt	100	0.003391	-40	0.012726
2612	chr3	53474106	C	A	rs11715213	0.0062944134799999	0.4967895815003591	0.0062944134799999	0.5093050537243026	0.0354087473947559	0.0019286134050501	0.000223259829427	0.1513111311941143	0.000223259829427	0.1585655637047181	0.3546157117812425	0.4054930707513159	0.0021801979393386	0.4155917830462311	0.0021801979393386	0.4284868053250795	0.0125390432053276	0.0057752933326539	7.743238767173128e-05	0.1498639196763835	7.743238767173128e-05	0.158420894859379	0.004224110208612	0.4342984776110534	0.004224110208612	0.4452200472767534	DCP1A	126520	CACNA1D	145142	TKT	218054	False	True	True	alt	50	0.00119	25	0.01403
2613	chr3	53485740	G	A	rs998411	0.0050018174599999	0.5744664284755617	0.0050018174599999	0.5879330946980543	0.0136679605599393	0.1147585367450293	7.081755455917328e-05	0.4693006706200232	7.081755455917328e-05	0.4816005594523648	0.258815962821191	0.5591894782401993	0.0014138480520966	0.5514589750335763	0.0014138480520966	0.5653595853974358	0.0036187793965869	0.3096226019651337	2.080014313130897e-05	0.4584159458757005	2.080014313130897e-05	0.4716593927709183	0.0041784665816034	0.4531480459416914	0.0041784665816034	0.4643727804608195	DCP1A	138154	CACNA1D	156776	TKT	229688	False	False	False	alt	90	0.00501	-70	0.02176
2614	chr3	60291445	A	C	rs10049216	0.01471308144	0.2454931500106632	0.01471308144	0.2558340266524987	0.0083210731826164	0.5232027444111087	0.0001277612581175	0.2744579499387358	0.0001277612581175	0.2842423677165576	0.4205686780983205	0.3053535280868303	0.0061983358487354	0.1976598822526339	0.0061983358487354	0.2080435020523262	0.0035044868946928	0.3322951285956261	5.375507665901849e-05	0.2156941593790951	5.375507665901849e-05	0.2256749985998701	0.0069668772497639	0.2701505698332411	0.0069668772497639	0.2781759392272011	FHIT	960014	CFAP20DC	1241361	PTPRG	1270125	False	False	False	alt	85	0.03168	45	0.02942
2615	chr3	60307186	C	G	rs4679526	9.561731200000008e-05	0.8054793799377891	0.002104680792	0.8074669179451978	0.0066492186877549	0.828355561970645	5.139805706993994e-07	0.8390556490177475	1.4489042353556356e-05	0.8410473567511808	0.1282772642869739	0.7724366922613158	8.920455991361151e-05	0.8372829045805972	0.0002391619795388	0.8399833962806118	0.0008607261731193	0.8177661823000346	6.060202767976967e-07	0.8592282847802222	1.6453288162053084e-06	0.861912863619556	0.0003361030716086	0.6932185138184013	0.0017884002946088	0.6954726431303434	FHIT	944273	PTPRG	1254384	CFAP20DC	1257102	False	False	False	alt	-80	0.001026	70	0.02611
2616	chr3	60324743	G	T	rs1882900	0.0056500401	0.522153321982134	0.0056500401	0.534940784250906	0.0216698969173363	0.0192174329168271	0.0001240678527754	0.2834511507400833	0.0001240678527754	0.2932843149830422	0.2776543325138227	0.5321789074979217	0.0015668874359686	0.4863521924104764	0.0015668874359686	0.4998282905027291	0.0060906534256566	0.0803048963256724	3.476986249673294e-05	0.2934411760903543	3.476986249673294e-05	0.3044834818284004	0.004728264816025	0.3957753726284054	0.004728264816025	0.4062661179079889	FHIT	926716	PTPRG	1236827	CFAP20DC	1274659	False	True	False	alt	-100	0.03464	-100	0.133
2617	chr3	60346500	T	C	rs6787076	0.0525193704	0.0219722541140819	0.0525193704	0.0235606392534057	0.0124806569116847	0.1511115244887625	0.000670190357721	0.024684221429394	0.000670190357721	0.0262735442832107	0.3248954864677019	0.4540657932576413	0.0171129753205713	0.0508582442208958	0.0171129753205713	0.0552903521215751	0.0040109368203862	0.2447582576918554	0.0002164454263606	0.0421819970909162	0.0002164454263606	0.0453505356251001	0.0395709499061193	0.0095133418084939	0.0395709499061193	0.0097549666325001	FHIT	904959	PTPRG	1215070	CFAP20DC	1296416	False	False	False	alt	-10	0.0024	80	0.02173
2618	chr3	60384629	G	A	rs9847855	0.002939811052	0.7332759193394429	0.0032394138	0.7437765215095311	0.007820359073483	0.6194333655818508	2.2165430321913823e-05	0.7550332706922512	2.5039144341604724e-05	0.7650948666427739	0.2467494476083776	0.5807437401883915	0.0006524318204439	0.7128315982942609	0.0007288468531682	0.7233683466806289	0.0019535111185929	0.619033013941933	4.927322880756578e-06	0.728961721374171	5.660276610589253e-06	0.7392488450515068	0.0022220147511903	0.6112973505587814	0.002446083465596	0.6198438635867851	FHIT	866830	PTPRG	1176941	CFAP20DC	1334545	False	False	False	alt	100	0.04504	-50	0.0428
2619	chr3	60384904	C	T	rs9848065	-0.031202075	0.1007649537161893	0.031202075	0.0950407940961341	0.0099424398289059	0.3072716867223946	-0.0003078866346455	0.1018114207813371	0.0003078866346455	0.0965213401830573	0.2231682901274909	0.6193751027774566	-0.0069918345609075	0.1964214652635073	0.0069918345609075	0.1864260380273599	0.0022125235740744	0.5697771756415838	-6.880980348479329e-05	0.1855309911827795	6.880980348479329e-05	0.1765742609547254	-0.0284712497017603	0.029730611016365	0.0284712497017603	0.0290069039946854	FHIT	866555	PTPRG	1176666	CFAP20DC	1334820	False	False	False	ref	55	0.007446	40	0.02353
2620	chr3	60391307	C	A	rs2687176	-0.002351899686	0.7593893317777767	0.002689987314	0.7497499211750691	0.018957861277366	0.0337174082601567	-4.669179240489154e-05	0.5360837215877456	5.159926595557346e-05	0.5263702786070944	0.0051369827487836	0.9888904519038862	-1.1995046977708473e-05	0.9851025849256082	1.3450522294819104e-05	0.9772516664850271	9.628826872745604e-05	0.977000859510888	-2.348657073233681e-07	0.9672471047934016	2.559924983018326e-07	0.9580114527763176	-0.00024689052791	0.9462158549775588	0.00027593647237	0.9369001688313492	FHIT	860152	PTPRG	1170263	CFAP20DC	1341223	False	False	False	ref	15	0.002441	-80	0.01776
2621	chr3	60394062	T	C	rs68056303	0.065258238	0.0100548204542759	0.065258238	0.0107095664811266	0.0126123616975931	0.1427685031014544	0.000847723290373	0.0156895144850258	0.000847723290373	0.0166606078615891	0.2997022790692849	0.4997948544167688	0.0196108811960426	0.0398883689112011	0.0196108811960426	0.0436019273349757	0.0037585981856092	0.2937891484009588	0.0002526294504177	0.0334213725022625	0.0002526294504177	0.0361129588142382	0.0551209037438147	0.0027961984267148	0.0551209037438147	0.0028607025293859	FHIT	857397	PTPRG	1167508	CFAP20DC	1343978	False	True	False	alt	-95	0.001877	-90	0.01733
2622	chr3	60397868	C	T	rs9862806	-0.0353007988	0.0721265441531241	0.0353007988	0.0679667829369864	0.0144279237449902	0.0928120786253892	-0.0005223639496775	0.0412879455229585	0.0005223639496775	0.0391333010820709	0.4516229421467027	0.2517817485727765	-0.0159806713341691	0.0673838819373988	0.0159806713341691	0.0625071032974381	0.0065218421950187	0.0600706853701458	-0.0002366342046627	0.0416233994612818	0.0002366342046627	0.0389547240386897	-0.0155229826035539	0.1146642118037872	0.0155229826035539	0.1112172164276472	FHIT	853591	PTPRG	1163702	CFAP20DC	1347784	False	False	False	ref	100	0.00333	100	0.0487
2623	chr3	60397871	C	T	rs9862809	-0.093903022	0.0028510018842429	0.093903022	0.0027312880602213	0.0227600499849109	0.0148517286828097	-0.0021676406862081	0.0035307934389819	0.0021676406862081	0.0034010858767895	0.4518179649166485	0.2514084197912101	-0.0425294634632703	0.0054941205648466	0.0425294634632703	0.0051226233762767	0.0103202724709075	0.0119076087154284	-0.0009843869390952	0.0041751624315804	0.0009843869390952	0.0039569553796881	-0.0440149794085	0.0077810811108358	0.0440149794085	0.0076045207543245	FHIT	853588	PTPRG	1163699	CFAP20DC	1347787	False	True	True	ref	100	0.003305	100	0.05566
2624	chr3	60437276	T	C	rs2687189	0.00680602136	0.4625873870960401	0.00680602136	0.4750415013197752	0.0080896588988019	0.5711539074984676	5.5858742365242175e-05	0.4950635115631027	5.5858742365242175e-05	0.5069244689104351	0.0854593927322897	0.8508176168030094	0.000617851431572	0.690013000854982	0.000617851431572	0.703882365171041	0.0006924075376171	0.8596530436319353	5.083451726152898e-06	0.7017142088852741	5.083451726152898e-06	0.7154909249409238	0.0057573211340366	0.3448816131777278	0.0057573211340366	0.3542928100873156	FHIT	814183	PTPRG	1124294	CFAP20DC	1387192	False	False	False	alt	-30	0.003384	-90	0.01819
2625	chr3	60442238	C	A	rs77635360	0.013087385	0.2698121176979725	0.013087385	0.2802870592124972	0.0207107773976244	0.0226639559053756	0.0002678138873233	0.1092234376221746	0.0002678138873233	0.1152677999328889	0.0441664332617557	0.9190026244402832	0.0005494132870075	0.7022984133289202	0.0005494132870075	0.7165194215329993	0.0008694766170871	0.8173381778723559	1.0646998946017647e-05	0.5432674352243497	1.0646998946017647e-05	0.5566714719542604	0.0064087801740681	0.2916134964787321	0.0064087801740681	0.3002410905848647	FHIT	809221	PTPRG	1119332	CFAP20DC	1392154	False	False	False	alt	80	0.002287	50	0.01808
2626	chr3	60449492	A	C	rs12629110	-0.0157589787999999	0.2573822566490424	0.0157589787999999	0.2472190709081601	0.014645431758795	0.0857370370917929	-0.0002365617435351	0.1559733233318778	0.0002365617435351	0.1489866707860765	0.1431882073465492	0.7529299061940714	-0.0024961830696774	0.4266575869017667	0.0024961830696774	0.4141084304751401	0.0021338666716731	0.5806504067080429	-3.800738549967259e-05	0.3208986437082533	3.800738549967259e-05	0.3096396680036505	-0.0153570057780681	0.1260848813198443	0.0153570057780681	0.1225244236106158	FHIT	801967	PTPRG	1112078	CFAP20DC	1399408	False	False	False	ref	85	0.003983	-80	0.02515
2627	chr3	60486253	A	G	rs9818182	-0.0023981675308	0.7518242877768061	0.0024441194628	0.7442194356932846	0.0325559554971679	0.0026770972133118	-8.717654419142918e-05	0.4177700616072914	8.858587938476776e-05	0.408011010214186	0.1443811657797279	0.7509334336133419	-0.0003926553569852	0.7882156931167992	0.0004000210897292	0.7781971335030107	0.0047840525555609	0.1680103243219389	-1.4443195369456106e-05	0.5565069187758422	1.4669100694277606e-05	0.5459496495723086	-0.0026929739935061	0.6005459049925991	0.0027095716760546	0.591318605234516	FHIT	765206	PTPRG	1075317	CFAP20DC	1436169	False	True	True	ref	-90	0.00537	100	0.0216
2628	chr3	60487965	A	G	rs9828307	0.026172966	0.123263720258915	0.026172966	0.1303512341476474	0.0087899967872153	0.4607548891013236	0.0002248656407374	0.141861321471478	0.0002248656407374	0.1490647743951606	0.211942032593699	0.6407346186226679	0.0058058835844786	0.2145619091939725	0.0058058835844786	0.2253708624342976	0.0018431602988811	0.6404074559372108	4.968381271447618e-05	0.2270524506956664	4.968381271447618e-05	0.237203967105326	0.0244048174773596	0.0460813004671154	0.0244048174773596	0.0472627936066274	FHIT	763494	PTPRG	1073605	CFAP20DC	1437881	False	False	False	alt	100	0.002619	100	0.04468
2629	chr3	61848270	C	T	rs606506	-0.048311327	0.0306526393337073	0.048311327	0.0286578542761312	0.014631597284028	0.085049482353467	-0.0007141598522494	0.0220660227686693	0.0007141598522494	0.0208424248188147	0.3733856160333613	0.3728133735111216	-0.0181631445926285	0.053272557749004	0.0181631445926285	0.0492049217787198	0.0054895174595805	0.1027789152965592	-0.0002695892149195	0.0331835052429986	0.0002695892149195	0.0308880486727279	-0.0300293571510077	0.0261589586470824	0.0300293571510077	0.0255535825689314	PTPRG	286700	CEP15	470746	FEZF2	526054	True	False	False	ref	85	0.004684	-65	0.01044
2630	chr3	61851594	G	T	rs640732	0.00961838112	0.3694220457910986	0.00961838112	0.3813704818975479	0.0179207735851071	0.0421613416793707	0.0001837314710597	0.2028375779616112	0.0001837314710597	0.2112505894112654	0.215871533937074	0.6342787082795653	0.00220320153328	0.4265939158482763	0.00220320153328	0.4394290116856928	0.0039351878047367	0.2681576118331236	4.273791892129965e-05	0.2766981196736656	4.273791892129965e-05	0.2876783086130502	0.0090021680722828	0.2256758243652924	0.0090021680722828	0.232707752145192	PTPRG	290024	CEP15	467422	FEZF2	522730	False	False	False	alt	100	0.002407	-55	0.03098
2631	chr3	61852543	C	T	rs626136	-0.0533229306	0.0227054041706293	0.0533229306	0.0212933207916806	0.0149280725737165	0.0803172910162485	-0.000802623349213	0.0186540857630498	0.000802623349213	0.017665247501474	0.1721739852073154	0.7057302036859204	-0.0093777304628142	0.1440028161848103	0.0093777304628142	0.1355200401438471	0.0025682432820051	0.4904590955885345	-0.0001413089103169	0.0852642185788665	0.0001413089103169	0.0798915071647926	-0.0511893276901212	0.0036848637496862	0.0511893276901212	0.0035921214082654	PTPRG	290973	CEP15	466473	FEZF2	521781	False	False	False	ref	15	0.0003529	10	0.001526
2632	chr3	61853094	C	T	rs623843	-0.0480616248	0.0328196932683323	0.0480616248	0.0306081987535056	0.009877782426315	0.3125229429279028	-0.0004817186534653	0.0476223730624988	0.0004817186534653	0.0447779965875464	0.2656459091899293	0.5536959636006392	-0.013017354895577	0.0962552036862903	0.013017354895577	0.0896511819432099	0.0026492231908791	0.4800559403543969	-0.000131433098183	0.0963940315975185	0.000131433098183	0.090416052236156	-0.0424008547806512	0.0080609287572442	0.0424008547806512	0.0078557681234301	PTPRG	291524	CEP15	465922	FEZF2	521230	False	False	False	ref	-15	0.00066	100	0.03177
2633	chr3	61864460	T	G	rs623808	0.0553671188	0.0175750955636387	0.0553671188	0.0188745517126466	0.0130784964691314	0.1239178270755166	0.0007390930588993	0.0192871937167386	0.0007390930588993	0.0205266927809343	0.2525482629487857	0.5738279374657159	0.0143266589939377	0.0709188375093054	0.0143266589939377	0.0769181999398329	0.0033366718166379	0.3595379885537043	0.0001926580847275	0.0513237136730179	0.0001926580847275	0.0554295722497008	0.0502038402887996	0.003648135539491	0.0502038402887996	0.003772330565083	PTPRG	302890	CEP15	454556	FEZF2	509864	False	True	False	alt	95	0.006866	85	0.0465
2634	chr3	62068373	A	C	rs9863323	0.0388192256	0.0528888141245022	0.0388192256	0.0567327392752571	0.0098375077359154	0.319870968529992	0.0003828944704547	0.0630837564721165	0.0003828944704547	0.0670966120361037	0.3042044004605856	0.4943841236267587	0.0119461447126445	0.0929399958264804	0.0119461447126445	0.100191520295719	0.0029777991634281	0.4259436588255613	0.000117374286496	0.09387437508955	0.000117374286496	0.1005060264586822	0.031050114627745	0.0219776144680227	0.031050114627745	0.02254411806874	CEP15	250643	FEZF2	305951	PTPRG	506803	False	False	False	alt	100	0.000269	-35	0.02905
2635	chr3	62069778	G	A	rs6787306	0.00600913914	0.5218415533604315	0.00600913914	0.5349752062514017	0.0099841195086912	0.3077117851227978	6.0131626775868e-05	0.4820726034005376	6.0131626775868e-05	0.4943061486092231	0.275002852726688	0.5374805958167725	0.0015959009214052	0.4968192651285101	0.0015959009214052	0.5102671145416442	0.0027439107007048	0.4686732826007131	1.596318482858041e-05	0.4682956015332807	1.596318482858041e-05	0.4812474878578004	0.004902540482785	0.372992959536886	0.004902540482785	0.3828502115939673	CEP15	249238	FEZF2	304546	PTPRG	508208	False	False	False	alt	100	0.01996	-80	0.046
2636	chr3	62070952	A	G	rs6766287	-0.0001598556399999	0.8555103696530875	0.00151239148	0.8527959326829051	0.0329525760998278	0.0025597951236197	-9.046890355492336e-06	0.538325056414421	5.2112851650910525e-05	0.5357922770022817	0.3584580752912375	0.4060680938112017	-3.853045225939999e-05	0.7175040126189463	0.0005525618158745	0.7147773816514388	0.0118573224942388	0.0069527272489666	-2.6341016150280024e-06	0.448654063980538	1.9086540052439715e-05	0.4460838259075008	-0.0002634882104585	0.8172191934746221	0.0009439931949501	0.8146733624710064	CEP15	248064	FEZF2	303372	PTPRG	509382	False	True	True	ref	-100	0.002197	100	0.0372
2637	chr3	62079095	A	G	rs11130874	0.039509392	0.049909031466446	0.039509392	0.0535993063661199	0.0102228234888464	0.2806819646906267	0.0004066314021922	0.0545913743169872	0.0004066314021922	0.058193644127054	0.1959480907478293	0.6627442999762166	0.0079935386871293	0.1577580503259736	0.0079935386871293	0.167363943160633	0.002007845307848	0.6057983114714744	8.23442329761631e-05	0.146384615652128	8.23442329761631e-05	0.1549567376385695	0.0364132408012531	0.0125876100197801	0.0364132408012531	0.012969215877561	CEP15	239921	FEZF2	295229	PTPRG	517525	False	False	False	alt	-40	0.0007954	-95	0.012634
2638	chr3	62079251	C	T	rs11715438	0.0043390142459999	0.5725190765464601	0.0055932698459999	0.5825699927325282	0.0113254049814881	0.2030454478371641	4.908921922371953e-05	0.5001430159244157	6.545622994268838e-05	0.5091137900174656	0.1431363395885849	0.753542190133579	0.0006527087995361	0.6567366246047468	0.0009363634683893	0.666960345719768	0.0016959033786305	0.6657780716163125	7.484527066807083e-06	0.603144884138344	1.1185988707324514e-05	0.6127957940934781	0.0035041857280677	0.4132202727990713	0.0047324142366621	0.4206187359862227	CEP15	239765	FEZF2	295073	PTPRG	517681	False	False	False	alt	100	0.004116	100	0.06555
2639	chr3	62080406	T	C	rs1859404	0.051509062	0.022933379438106	0.051509062	0.024621694693424	0.0108054304361719	0.237593179799441	0.0005784041449184	0.032412217171854	0.0005784041449184	0.0344933528343519	0.3439454766128279	0.4236857770702623	0.0181284720320662	0.0466504808186701	0.0181284720320662	0.0505530456989	0.0037586313361429	0.2785274447431851	0.0002053469064176	0.047526532642307	0.0002053469064176	0.0510450840935585	0.0359505804002115	0.0142424122323536	0.0359505804002115	0.0146276760214598	CEP15	238610	FEZF2	293918	PTPRG	518836	False	False	False	alt	-100	0.01608	25	0.047
2640	chr3	62084622	A	C	rs7646226	0.0228463529	0.1591881417074759	0.0228463529	0.1673229168348694	0.0127128368667661	0.1437455079155034	0.000305328922013	0.1052062664984034	0.000305328922013	0.1107056637982925	0.1622527204639052	0.7193843526426642	0.0036734953860821	0.3097088823341694	0.0036734953860821	0.3215379539375017	0.0020328292244781	0.6012087252308136	4.792306423158904e-05	0.2430073256884111	4.792306423158904e-05	0.2534336364116256	0.0212035394558034	0.0665750918301921	0.0212035394558034	0.0684162122766419	CEP15	234394	FEZF2	289702	PTPRG	523052	False	False	False	alt	-70	0.001743	-70	0.01923
2641	chr3	62093006	A	G	rs35831310	0.0056402834799999	0.5383315211268648	0.0056402834799999	0.5513550932769892	0.0119441048525626	0.1746161156979732	6.984155462482465e-05	0.4598122758956661	6.984155462482465e-05	0.4717017034631919	0.3327980580711417	0.4454476012318241	0.0018561060170201	0.4735099762576297	0.0018561060170201	0.4870066445367164	0.0039800129934947	0.2571735076846917	2.317633620836471e-05	0.4087882380640749	2.317633620836471e-05	0.4212278982079034	0.0039378001846491	0.4592968444685889	0.0039378001846491	0.4706007432189005	CEP15	226010	FEZF2	281318	PTPRG	531436	False	False	False	alt	-100	0.005943	95	0.013275
2642	chr3	62119521	A	G	rs113467722	0.0309699248	0.0842060795153315	0.0309699248	0.0897424721839365	0.0068315107730709	0.8160282635247766	0.0002151592409376	0.1480111054887267	0.0002151592409376	0.1553942306457773	0.3962696708472079	0.3358564731796822	0.0122931714842703	0.08609860042453	0.0122931714842703	0.092785047246632	0.002690906137637	0.4740972647741747	8.501159304756923e-05	0.1319244535263288	8.501159304756923e-05	0.1399417667884975	0.0172491415886056	0.0870460416468731	0.0172491415886056	0.089639738047392	CEP15	199495	FEZF2	254803	PTPRG	557951	False	False	False	alt	60	0.002808	0	0.0
2643	chr3	62122990	G	A	rs2366683	-0.064213618	0.0121626678885397	0.064213618	0.0114665616124968	0.0136989577411129	0.1069823885457464	-0.0009272014337179	0.0165702897810792	0.0009272014337179	0.0156977924915168	0.3257461176983163	0.4547192475180931	-0.0208666580341533	0.0422746309647221	0.0208666580341533	0.0389857952488924	0.0044928617287292	0.1940181222505644	-0.0003050518333924	0.0324308955958621	0.0003050518333924	0.0302067489340338	-0.0491996804946108	0.0045492042476225	0.0491996804946108	0.0044149914838062	CEP15	196026	FEZF2	251334	PTPRG	561420	False	True	False	ref	-100	0.002449	-100	0.06256
2644	chr3	62440565	G	T	rs13081552	0.0790471879999999	0.0058355177475342	0.0790471879999999	0.0062845123858529	0.0281290139797955	0.0082522318021454	0.0025476631488563	0.0035530215578676	0.0025476631488563	0.0037757537707489	0.3117293747860454	0.4759726943679677	0.0254476638143101	0.0232263779941783	0.0254476638143101	0.025172418000315	0.0090880798297976	0.027674897233052	0.0008524736464443	0.0079388484648036	0.0008524736464443	0.0085010799575495	0.0650919615348706	0.001851927910729	0.0650919615348706	0.0018538304366447	FEZF2	66241	CEP15	121549	CADPS	434851	False	True	True	alt	45	0.001881	55	0.03558
2645	chr3	62479364	C	A	rs1452082	-0.0301064549999999	0.1021465941883883	0.0301064549999999	0.0962844269872486	0.0150417515567911	0.0777704702029218	-0.000460154824025	0.0521772996282716	0.000460154824025	0.0491230973344155	0.4432784572454071	0.2657708847003872	-0.0134685741430511	0.0896554707935506	0.0134685741430511	0.0833296283565259	0.0067204589821993	0.0571180411263477	-0.0002073260584432	0.0521584530527818	0.0002073260584432	0.0485592523246937	-0.0136163238207864	0.1316642392095977	0.0136163238207864	0.1276857556385833	FEZF2	105040	CEP15	160348	CADPS	396052	False	False	False	ref	0	0.0	-100	0.0728
2646	chr3	62574848	T	C	rs6786550	-0.0031967984599999	0.5589073968891114	0.00540230018	0.5558102961190767	0.0081978920563802	0.5487582749464534	-2.598126577909844e-05	0.5831167085324044	4.419720204217374e-05	0.5808396476178068	0.0744364568097179	0.8701492705192243	-0.0002797725986553	0.7712473930324357	0.0004152845990446	0.7699684545719858	0.0006172383235324	0.8748944282959241	-2.28313948552605e-06	0.7776505502181031	3.4325281122231263e-06	0.7764806840583719	-0.0024543823068703	0.4639948495002811	0.0042261849189306	0.4617624168137509	FEZF2	200524	CEP15	255832	CADPS	300568	False	False	False	ref	30	0.004875	45	0.03464
2647	chr3	63811581	A	C	rs72886387	0.0002981380259999	0.8015244390759843	0.0021991632939999	0.8046258550459967	0.0305080621616662	0.0037465259395566	5.5239795384824616e-06	0.4952360619051368	6.5974828271238e-05	0.4976387740135762	0.3532132076058881	0.407234132363734	0.0001498344097763	0.6857113362033375	0.0007394966854774	0.6887218431984938	0.0109110973868828	0.0098225059235995	3.584856074268316e-06	0.4340819658195177	2.2333962155709395e-05	0.4370456651755726	0.0001078849365657	0.7312348640752945	0.0015103891119202	0.7341392394443101	C3ORF49	7719	ATXN7	51575	THOC7	52287	False	True	True	alt	-100	0.000412	-45	0.03436
2648	chr3	63871194	G	A	rs3774702	0.0032788576799999	0.6717865876432921	0.0032788576799999	0.6852705509366298	0.0211108831625315	0.0211631895273576	7.166977727601014e-05	0.409610614794698	7.166977727601014e-05	0.421128638105626	0.230803224099835	0.6011262012182425	0.0007456713892402	0.6397862388085518	0.0007456713892402	0.6537010629585033	0.0048911646789897	0.1616985568901452	1.643301369710778e-05	0.4521913453617588	1.643301369710778e-05	0.4649352483683446	0.0029004450253632	0.5326801883529256	0.0029004450253632	0.5446564020432593	THOC7	7326	ATXN7	8038	C3ORF49	51894	False	False	False	alt	60	0.00637	-100	0.03955
2649	chr3	63966089	C	T	rs3774720	-0.0369321984	0.067406532756094	0.0369321984	0.0631702729071417	0.0099629401752075	0.3078670177106116	-0.0003755497504736	0.0743276738038728	0.0003755497504736	0.0702094278039171	0.4418033382089025	0.2633981692195154	-0.0164759887695736	0.065337444186025	0.0164759887695736	0.0603796402074159	0.0044003733384835	0.2049546352429571	-0.0001677023373773	0.0701831974589138	0.0001677023373773	0.0654774651513006	-0.016666147989087	0.0924316879634357	0.016666147989087	0.0898049677714012	PSMD6	57921	THOC7	102221	ATXN7	102933	False	False	False	ref	-85	0.00337	-30	0.02515
2650	chr3	64027666	G	A	rs35838	-0.0042482536	0.6520891505494794	0.0042482536	0.6386121166815295	0.0068627073828362	0.7972872709033244	-2.9944242004964184e-05	0.7005694884909054	2.9944242004964184e-05	0.6872920123250243	0.3841512878764302	0.3649174809906813	-0.0016437114537198	0.5224214698983398	0.0016437114537198	0.5088246504192664	0.0026358792181769	0.4902506554807234	-1.154482125641568e-05	0.5686982885858648	1.154482125641568e-05	0.5552538596490957	-0.0024772041203746	0.6112207585929601	0.0024772041203746	0.5988628432870066	PSMD6	3656	THOC7	163798	ATXN7	164510	False	False	False	ref	-65	0.00202	65	0.04596
2651	chr3	64057955	G	A	rs704375	-0.043884914	0.0420403737168868	0.043884914	0.0393928656945313	0.0099299663854156	0.3067444676709463	-0.0004485572397661	0.0554162975958113	0.0004485572397661	0.0523120732742865	0.3115965933256569	0.4776418012737407	-0.0138223667362463	0.0856387488216686	0.0138223667362463	0.079681422876337	0.0031418431300959	0.3645348683257615	-0.0001433326485847	0.0852909748736189	0.0001433326485847	0.080078914062068	-0.0340854158238155	0.0183884655954095	0.0340854158238155	0.0178856098130317	PSMD6	33945	THOC7	194087	ATXN7	194799	False	False	False	ref	85	0.002623	70	0.03223
2652	chr3	64083760	G	T	rs26936	-0.04619143	0.0375346621165834	0.04619143	0.0353940504652355	0.0120676478606594	0.1702647854983431	-0.0005948823976587	0.0385309240135527	0.0005948823976587	0.036512805625537	0.3829375823400657	0.36702960651416	-0.0178128946446908	0.0582200384742159	0.0178128946446908	0.0540013535375653	0.0046257686803823	0.1772073529542847	-0.0002295492655662	0.0491129980091135	0.0002295492655662	0.0459394187156943	-0.0290729156941461	0.0335889367060842	0.0290729156941461	0.0326383368901279	PSMD6	59750	THOC7	219892	ATXN7	220604	False	False	False	ref	-100	0.003944	-100	0.03812
2653	chr3	71482316	T	C	rs35483362	-0.002812993492	0.7610905190871218	0.002812993492	0.7473637929041212	0.0196345628343876	0.0286804753264249	-5.882267401566908e-05	0.523916157886939	5.882267401566908e-05	0.5114395278435608	0.1791470865880351	0.6906486102737704	-0.0005034021109533	0.7490552133532818	0.0005034021109533	0.7346351826677334	0.0035239662627853	0.3189730066812785	-1.0590810387570446e-05	0.5935309600843942	1.0590810387570446e-05	0.5799271020891595	-0.0026514797871346	0.5919755226315218	0.0026514797871346	0.579771465755005	FOXP1	101662	GPR27	271540	ENSG00000285708	271913	False	False	False	ref	-20	0.000641	100	0.04166
2654	chr3	71482962	T	C	rs6805189	0.0275289557999999	0.1129989864381089	0.0275289557999999	0.1197037126023555	0.0093990297182225	0.3861452312771143	0.0002792736299936	0.1206856122395086	0.0002792736299936	0.1269187129402199	0.2851336632122739	0.5225595803437053	0.0078307358213267	0.1545250104592629	0.0078307358213267	0.1639362683438914	0.0026924872278418	0.4723144623967388	7.996233988829354e-05	0.1564644464954509	7.996233988829354e-05	0.1648018838900557	0.0229587443853151	0.0540251104983995	0.0229587443853151	0.0555659769513721	FOXP1	101016	GPR27	270894	ENSG00000285708	271267	False	False	False	alt	-100	0.009834	100	0.0337
2655	chr3	71522194	C	T	rs6803008	0.0017045619599999	0.5168865549824508	0.00627303676	0.5195916226423373	0.0092313936967966	0.3980144167705159	1.3450243832227607e-05	0.4985158329704303	6.186767595670425e-05	0.5012199656897094	0.4522017863255843	0.2522366135161146	0.0007158939893527	0.3732544362008806	0.00283310123872	0.3759689745850482	0.0041819588512808	0.2351166839182588	5.515166656779167e-06	0.364384187608291	2.8014149355774733e-05	0.3670317282696204	0.0006493843297129	0.6001536670687626	0.0024792788306932	0.6029329910968015	FOXP1	61784	GPR27	231662	ENSG00000285708	232035	False	False	False	alt	80	0.0001678	40	0.02853
2656	chr3	71523984	T	G	rs17008723	0.00402625838	0.5348645621060877	0.00597263146	0.5438466195382896	0.0084685238444348	0.4995185364442865	3.72253482517324e-05	0.5419283283248588	5.223291319230113e-05	0.5507502434049574	0.3020508511499081	0.4921175138741033	0.0012527171327608	0.4758336452506386	0.0019519044064538	0.4848296525883038	0.0025643760301972	0.4969887506723702	1.1734409590127025e-05	0.4827380475211202	1.712551288297192e-05	0.4916859871121878	0.0029398645214161	0.4321638645864507	0.0042137366570192	0.4397681374493448	FOXP1	59994	GPR27	229872	ENSG00000285708	230245	False	False	False	alt	100	0.01271	15	0.008545
2657	chr3	80616803	C	T	rs1437046	-0.0486669052	0.0311417605539936	0.0486669052	0.0291985699514855	0.0119406763241344	0.1785046955669929	-0.0006122446141623	0.0339578620358784	0.0006122446141623	0.0320590332195755	0.3020114316538553	0.4941973910615453	-0.0151495148712333	0.0792042644423543	0.0151495148712333	0.0734475156939188	0.0036193107590969	0.3075305490405715	-0.0001890421327127	0.0643934382293646	0.0001890421327127	0.0601934918573421	-0.0383489455284805	0.0106059525341186	0.0383489455284805	0.0102888195606478	ROBO1	848805	GBE1	1144842	CADM2	4342187	False	False	False	ref	-60	0.01081	55	0.02802
2658	chr3	80652442	T	C	rs678585	-0.00596488878	0.5356769296924719	0.00596488878	0.5227459634707227	0.0223101397171192	0.0162613405843663	-0.0001330133720164	0.2853898896664526	0.0001330133720164	0.2757206010699169	0.1613253249515036	0.7210442512695004	-0.0009984133564758	0.6217965171292563	0.0009984133564758	0.6078978056847	0.0035999611598835	0.3027018722892963	-2.221983670212262e-05	0.421127714118658	2.221983670212262e-05	0.408958217375483	-0.0058361601261423	0.3559668483969281	0.0058361601261423	0.3465195153516915	ROBO1	884444	GBE1	1109203	CADM2	4306548	False	True	False	ref	50	0.002028	90	0.03044
2659	chr3	80655819	C	T	rs500298	0.0047616916	0.5669982749173804	0.0047616916	0.5801006885526448	0.0217932718606537	0.0184380283584867	0.0001039316620259	0.3141483212255934	0.0001039316620259	0.3245587362573123	0.2734074004917063	0.5417764403199726	0.0013141549627558	0.5211609601376587	0.0013141549627558	0.534827804481583	0.0060082547516202	0.0828044185806826	2.888042852409494e-05	0.3250855345066942	2.888042852409494e-05	0.3365889763455707	0.0040705816450377	0.433502637736138	0.0040705816450377	0.4444054065428099	ROBO1	887821	GBE1	1105826	CADM2	4303171	False	True	False	alt	95	0.003769	60	0.003815
2660	chr3	80664787	A	C	rs658551	-0.001475593748	0.7283570318984782	0.003238678148	0.7206111662750367	0.0255158807570768	0.008592902788197	-4.189603639188701e-05	0.4195480843747206	8.5169568040487e-05	0.4135313037649925	0.019054139565763	0.9670812701237876	6.56461303275203e-07	0.9475023998896744	5.329740560892479e-05	0.9477697575705932	0.0004825372677401	0.9006849538103947	-1.599032616829108e-08	0.8925990195781776	1.3402459549962384e-06	0.8886789007274306	7.468957146859303e-05	0.8560070498154736	0.0007261486115	0.8553302007994462	ROBO1	896789	GBE1	1096858	CADM2	4294203	False	True	False	ref	5	0.0002823	0	0.0
2661	chr3	80677674	C	A	rs627529	0.01763210254	0.215557479979403	0.01763210254	0.2252758725584754	0.0149118145784831	0.0854712439204239	0.0002817684774009	0.1181754347700387	0.0002817684774009	0.1241380036063927	0.3045135322980528	0.49178597916977	0.0054134092134802	0.2277403217643399	0.0054134092134802	0.2388650194107415	0.004490197614116	0.1960444260976197	8.500133880788447e-05	0.1477446017332516	8.500133880788447e-05	0.1560989427892505	0.0143217253291008	0.1379979403506967	0.0143217253291008	0.1422359222014368	ROBO1	909676	GBE1	1083971	CADM2	4281316	False	False	False	alt	95	0.008156	75	0.05823
2662	chr3	80686336	C	T	rs7617921	-0.001129688124	0.731340906082094	0.002908742516	0.732718638590767	0.0111576635544654	0.2135152017824228	-1.5803318337863425e-05	0.6632409504608268	3.4852014530876256e-05	0.6642873580813926	0.0779634643512899	0.8632138294922582	-8.395420304064192e-05	0.8478076302984824	0.0002209252299516	0.8500535728046142	0.000885529353993	0.8230679699853406	-1.1634132585629027e-06	0.8162584858961568	2.656527588950997e-06	0.8182959644011343	-0.0004875569248643	0.6329230286078479	0.0022303135924646	0.6342694328935952	ROBO1	918338	GBE1	1075309	CADM2	4272654	False	False	False	ref	-5	9.155e-05	-65	0.004517
2663	chr3	80695967	A	T	rs613707	-0.00396163956	0.6699346757253399	0.00396163956	0.6564124543417158	0.0065768546263107	0.8405596959083577	-2.675324357426716e-05	0.736344466453111	2.675324357426716e-05	0.7228881357247571	0.0242927831201567	0.9606289149517776	-0.0001033270345408	0.9331892755281948	0.0001033270345408	0.9191588857055824	0.0001707091408786	0.9696964387064076	-7.357682721007909e-07	0.94681040004365	7.357682721007909e-07	0.9326928112772204	-0.0013257398935673	0.779115852678454	0.0013257398935673	0.7655404398100775	ROBO1	927969	GBE1	1065678	CADM2	4263023	False	False	False	ref	20	0.005116	80	0.009705
2664	chr3	80732296	C	G	rs9832758	-0.0066819253999999	0.4973739044599031	0.0066819253999999	0.4847065464162644	0.0056663176767896	0.9511511127298063	-3.9988916407445775e-05	0.62404861092632	3.9988916407445775e-05	0.6113881001361318	0.0514880859759955	0.9087113098580069	-0.000450452346295	0.7786651519643687	0.000450452346295	0.7647532986432771	0.0003098893888804	0.9379631803863312	-2.818645404375919e-06	0.8293705990229824	2.818645404375919e-06	0.8153929824517381	-0.0047863567049449	0.4395232229066826	0.0047863567049449	0.4290585686279233	ROBO1	964298	GBE1	1029349	CADM2	4226694	False	False	False	ref	100	0.013275	-35	0.01166
2665	chr3	80772172	C	T	rs7633748	0.0036794349999999	0.6573587260708461	0.0036794349999999	0.6706797626552571	0.010469741406842	0.2654097339756085	3.916645867558693e-05	0.5982826658839866	3.916645867558693e-05	0.6111332929006377	0.0342368696770713	0.9368004256391554	0.0001188583156277	0.8756932453662026	0.0001188583156277	0.8900267702006595	0.0003660691791543	0.922238261799651	1.2795175320291363e-06	0.8581412134349558	1.2795175320291363e-06	0.8725374049918913	0.0016037510762559	0.6953291474009323	0.0016037510762559	0.7086053211676691	GBE1	989473	ROBO1	1004174	CADM2	4186818	False	False	False	alt	-15	0.001013	-75	0.03168
2666	chr3	80789484	C	T	rs9865863	0.003459697444	0.6551778912452058	0.003876286564	0.6642436101257282	0.0070589578187871	0.7439075712518951	2.275215482032953e-05	0.7287258669208657	2.5747168116458013e-05	0.7368752207829067	0.1633896617184825	0.7161798972706372	0.0007206680410371	0.69744805189828	0.0007589738934235	0.7063447034910071	0.0011572347706106	0.7701273417413768	4.8613786090823566e-06	0.7439719926369754	5.136773559827519e-06	0.7523727759738733	0.0035830247201734	0.5133951070929449	0.0038859324266848	0.5210091782660303	GBE1	972161	ROBO1	1021486	CADM2	4169506	False	False	False	alt	-65	0.00337	-85	0.0358
2667	chr3	80793900	C	G	rs9812564	0.0020577320456	0.7994840323759589	0.0020628227544	0.8126965150824894	0.0060746805480262	0.925977053339444	1.2636661408733484e-05	0.8463494509260474	1.2664486005494215e-05	0.8598823893786972	0.006390107781201	0.987829982041945	1.6790290397326988e-05	0.9651930860958045	1.6816166675587126e-05	0.9792426585866756	3.842389869506308e-05	0.9910289451145244	1.0148621984338128e-07	0.9697356119753384	1.0162765338950477e-07	0.9838357731796784	0.0003257295200157	0.917905668755933	0.0003257295200157	0.9312140246486758	GBE1	967745	ROBO1	1025902	CADM2	4165090	False	False	False	alt	100	0.004368	30	0.01311
2668	chr3	80815717	A	C	rs78929026	-0.00432788382	0.6280275439301211	0.00432788382	0.614953023483739	0.012153083516477	0.1619469673638073	-5.41587014425662e-05	0.528057934283617	5.41587014425662e-05	0.515841739525627	0.0279152273363831	0.944992813589273	-0.0001302926593954	0.8986964835942234	0.0001302926593954	0.8844807150407306	0.0003366620112418	0.9241919547047076	-1.6005571295348678e-06	0.866717179778722	1.6005571295348678e-06	0.8524706454458126	-0.0019128829137231	0.6824111345798014	0.0019128829137231	0.669465959573635	GBE1	945928	ROBO1	1047719	CADM2	4143273	False	False	False	ref	-90	0.01469	-100	0.03107
2669	chr3	80864077	T	G	rs9831201	-0.005593110372	0.5224827343625749	0.005864710228	0.513340795436251	0.0159547355429231	0.0654845752840066	-9.283151172263445e-05	0.3648795913948078	9.63591649722873e-05	0.3569140398433328	0.0033797031089533	0.9940541451647088	-1.7394982186034987e-05	0.9833220623401407	1.847125004224116e-05	0.9757514493388844	5.723913272274658e-05	0.988887898686826	-3.127926493362475e-07	0.966642128644402	3.267716692572778e-07	0.9589385528409444	-0.00033402836129	0.9326276167260468	0.0003547754644757	0.9248759352196568	GBE1	897568	ROBO1	1096079	CADM2	4094913	False	False	False	ref	-80	0.00362	100	0.01802
2670	chr3	80930843	T	C	rs9839468	-0.00464001858	0.5946472738053858	0.00464001858	0.5815385284016256	0.0342838277108991	0.0021272916231426	-0.0001631337140181	0.2281800884348917	0.0001631337140181	0.2192901316256593	0.0282264338841688	0.9492902596688612	-0.0001309172774274	0.901859986488904	0.0001309172774274	0.8875634172712913	0.0009477707709065	0.8109194001514276	-4.503866474713705e-06	0.7383269736177491	4.503866474713705e-06	0.7245732270921935	-0.0018900611002188	0.6847077676102118	0.0018900611002188	0.6717081214412233	GBE1	830802	ROBO1	1162845	CADM2	4028147	False	True	False	ref	10	0.0003815	55	0.03046
2671	chr3	80956286	G	A	rs2679046	-0.0383920174	0.0594505583934872	0.0383920174	0.0558069837285859	0.0133144809871075	0.1231682991922781	-0.0005205153713093	0.0431852970607591	0.0005205153713093	0.0407739144893797	0.3182958329443252	0.4706159170796798	-0.0121044403366126	0.1012298721261979	0.0121044403366126	0.0943994939781428	0.0042349480464293	0.2234751460591006	-0.0001639756966714	0.0700459602189827	0.0001639756966714	0.0654443306182763	-0.0300210583097334	0.0252187325405901	0.0300210583097334	0.0246092661971084	GBE1	805359	ROBO1	1188288	CADM2	4002704	False	False	False	ref	100	0.010864	100	0.0689
2672	chr3	80957854	T	A	rs2679042	0.0028016798799999	0.6423476199951063	0.00403477052	0.651907901782489	0.0074990588832806	0.6702006146918255	2.199714630160761e-05	0.6746223929942242	2.997293943758515e-05	0.6838754266854072	0.0049938277368022	0.990506385603365	1.0347985289745508e-05	0.967193093077496	1.8176401307523244e-05	0.976442399983218	3.821277008550669e-05	0.9913921706129044	8.9279926057476e-08	0.9688099681139304	1.399151546305759e-07	0.9780703654482944	0.0002074710318571	0.9194350165399992	0.0003319536509714	0.9287054038409114	GBE1	803791	ROBO1	1189856	CADM2	4001136	False	False	False	alt	40	0.002384	-90	0.0255
2673	chr3	80987800	C	A	rs2372667	0.0120240064	0.3020209095819039	0.0120240064	0.3132143738573725	0.0210574980970045	0.0212624144537676	0.0002561924508878	0.1230624970576796	0.0002561924508878	0.1295040879431854	0.1790412763617879	0.6910546414615761	0.0021773904925003	0.4164730132501287	0.0021773904925003	0.4293711252741621	0.0038234561450533	0.2715788540819542	4.697176204275338e-05	0.2376618930113005	4.697176204275338e-05	0.2479676903644858	0.0117345615618418	0.1642271939550953	0.0117345615618418	0.1696793845856766	GBE1	773845	ROBO1	1219802	CADM2	3971190	False	False	False	alt	20	0.00037	90	0.0562
2674	chr3	80999051	G	T	rs2250739	0.003533517657	0.6902906008483618	0.003533517657	0.7041113993820217	0.0208178458564828	0.0227910647114249	7.411978117185934e-05	0.4608610846329462	7.411978117185934e-05	0.472881505538921	0.2585649228726439	0.5598953975954847	0.0008414826730638	0.662096944921978	0.0008414826730638	0.6760391953200969	0.0054824854666492	0.115529698767877	1.8303147247156312e-05	0.4883548380513751	1.8303147247156312e-05	0.5013817275397559	0.0030187035135218	0.5386477815217048	0.0030187035135218	0.5507317234890508	GBE1	762594	ROBO1	1231053	CADM2	3959939	False	False	False	alt	-95	0.01306	0	0.0
2675	chr3	81004094	G	C	rs2639255	0.00035818288	0.7989942813351778	0.00197918512	0.8030458124326473	0.0072450577657631	0.6705433802939442	1.9923934913402853e-06	0.8233388537266487	1.44096175766373e-05	0.8270156174898897	0.1666345086567287	0.7120056241399565	3.222275027366e-05	0.7746571604855474	0.0003405726662267	0.7784387332658828	0.0012016386298571	0.755627902417326	8.919941015862315e-08	0.7976060989200858	2.479206075775637e-06	0.8011976466156338	0.0004854822145458	0.6441323850873336	0.0020290666915631	0.6477369435279474	GBE1	757551	ROBO1	1236096	CADM2	3954896	False	False	False	alt	-45	0.00272	0	0.0
2676	chr3	81005089	T	G	rs2639254	-0.006619736142	0.493963404016258	0.006619736142	0.4812008779954997	0.0251229315344348	0.009434909065909	-0.0001748748078963	0.229127269573953	0.0001748748078963	0.220302813594755	0.1911264639674685	0.6700871979690276	-0.0011894382891755	0.5811643408320334	0.0011894382891755	0.5673995315499601	0.0048202637993725	0.157684028789375	-3.18299676496812e-05	0.352248800508076	3.18299676496812e-05	0.3405299699985558	-0.006709613170261	0.3291471093329127	0.006709613170261	0.3202112439667408	GBE1	756556	ROBO1	1237091	CADM2	3953901	False	True	True	ref	10	0.0005226	10	0.010025
2677	chr3	81006191	A	G	rs2639213	-0.0014328458	0.2241012844039882	0.015957099	0.2236527956762528	0.0179873283406982	0.0448351729615417	-0.0001066472952414	0.0987933364402717	0.0002982958751815	0.0984909729432619	0.1170032884158549	0.7939403642238065	0.000212659015147	0.4600747709224397	0.0018593033576957	0.4602970169525882	0.0019799438815316	0.5960955036243146	-6.32944284729539e-06	0.3106972277320071	3.254593212581131e-05	0.3096035755682226	-0.0024502328862332	0.1112879950481625	0.0144918515752237	0.1118404147769026	GBE1	755454	ROBO1	1238193	CADM2	3952799	False	False	False	ref	75	0.00172	-15	0.01254
2678	chr3	107845612	T	C	rs7644809	0.0443070304	0.0365102893105563	0.0443070304	0.0391821359885848	0.0110866427928211	0.2188250349649719	0.0005039067775772	0.0405378760402918	0.0005039067775772	0.0432838393309343	0.5095384806896337	0.1551767945304536	0.0227336481554877	0.0290082094871192	0.0227336481554877	0.0318096215597812	0.0056877247119111	0.1002814649327509	0.000260409932739	0.0328190908490214	0.000260409932739	0.035478606706451	0.0130934968205064	0.1235537886086869	0.0130934968205064	0.127461430954101	CD47	246250	BBX	322675	IFT57	376823	False	False	False	alt	-100	0.007248	-35	0.01636
2679	chr3	108046402	T	C	rs3206652	0.00216050989	0.7724567738238101	0.00249631771	0.780063260225235	0.0065952722437192	0.8333764175918155	1.519235384097594e-05	0.8073167589930147	1.718363147100337e-05	0.8148183180484839	0.0965902135914272	0.8253799238125858	0.0002088344478726	0.8244066605104012	0.0002486475949221	0.8320882316253388	0.0006410423853972	0.8617171087896413	1.496201777351454e-06	0.8465630783791056	1.7322863013982138e-06	0.8543170897062222	0.0015124638222388	0.6597465369816702	0.0019149576240417	0.6670029677805177	CD47	45460	IFT57	176033	HHLA2	250128	False	False	False	alt	0	0.0	-45	0.03055
2680	chr3	108061891	T	C	rs3804638	-0.00698482634	0.4754177029185327	0.00698482634	0.4631256117935705	0.0244481722824458	0.010492114698206	-0.0001697243466516	0.2148866632497534	0.0001697243466516	0.2064027868529611	0.2001846492183528	0.6468684509323089	-0.0014796251194428	0.533245351754728	0.0014796251194428	0.5197972030726665	0.0050077507478815	0.1533970365547207	-3.685009963519219e-05	0.3137482454172792	3.685009963519219e-05	0.3026396126465125	-0.0064378261185281	0.3141958032859287	0.0064378261185281	0.3055216458385986	CD47	29971	IFT57	160544	HHLA2	234639	False	True	False	ref	-100	0.012596	-80	0.0314
2681	chr3	108097467	G	A	rs7628325	-0.0075139464	0.4469249021067341	0.0075139464	0.4348795864779893	0.0064628954591273	0.8868924574620913	-4.8535860322563815e-05	0.5474691719167656	4.8535860322563815e-05	0.5352221772366026	0.3590763389661718	0.4041094567814636	-0.0027188157416873	0.3847099786592836	0.0027188157416873	0.3722739369313049	0.0023419711076274	0.5478975911542914	-1.771896668496672e-05	0.4555159415792369	1.771896668496672e-05	0.4432012604110268	-0.0049855288955279	0.3907592368609338	0.0049855288955279	0.3809287613009254	CD47	5605	IFT57	124968	HHLA2	199063	False	False	False	ref	95	0.002174	100	0.012085
2682	chr3	108097886	C	T	rs34910554	0.0042228043799999	0.5731045663166824	0.00509186766	0.5832442975035212	0.0125622610663826	0.1456320438093307	5.114266750478787e-05	0.4678472764600991	6.381849259129904e-05	0.477031309546056	0.3697507235552236	0.384415054828057	0.0016455021398418	0.4591182150531116	0.0019507232176292	0.4697630832883196	0.0046936516452771	0.1742624173200253	2.016895820503849e-05	0.3816848983305284	2.462079623374129e-05	0.3912218950213256	0.0023630950528532	0.5402485391590183	0.0029274162595047	0.5492517370272516	CD47	6024	IFT57	124549	HHLA2	198644	False	False	False	alt	70	0.001196	-90	0.06003
2683	chr3	108098452	G	A	rs17231503	-0.0345838708	0.0801783199759654	0.0345838708	0.0754116081455301	0.0110490883025614	0.223445884891657	-0.0004002185778964	0.0752688430414353	0.0004002185778964	0.0711693716138482	0.4106308156723617	0.3197060619982818	-0.0143953329505794	0.0840692361574986	0.0143953329505794	0.0781242461875623	0.0045864826966197	0.1826466901647214	-0.000168108252352	0.0762111905134895	0.000168108252352	0.0713201986055081	-0.0183653357399972	0.0881176365155031	0.0183653357399972	0.0857108587185139	CD47	6590	IFT57	123983	HHLA2	198078	False	False	False	ref	-95	0.004677	40	0.02509
2684	chr3	108100194	G	A	rs326361	0.005868887	0.5403898059603798	0.005868887	0.553427578790992	0.0089372374447339	0.4369419449891168	5.4750413360474094e-05	0.5271858369793199	5.4750413360474094e-05	0.539898315004559	0.4425357109513584	0.2693187887741513	0.0026161806407433	0.3944413397952394	0.0026161806407433	0.407450101550412	0.0039689154858093	0.2623608624688937	2.4452407408012585e-05	0.3919073380131967	2.4452407408012585e-05	0.4043049026871791	0.0023859168663575	0.5973687418152815	0.0023859168663575	0.6097872219405567	CD47	8332	IFT57	122241	HHLA2	196336	False	False	False	alt	-60	0.001907	45	0.0415
2685	chr3	108149425	A	G	rs60140727	0.0281937135999999	0.1037159659469971	0.0281937135999999	0.1102489319022982	0.0074652586202905	0.697339556272352	0.0002121293789766	0.1492662664257764	0.0002121293789766	0.1566312261933039	0.1911990788286185	0.6617030351865254	0.0053158855220957	0.2170223382947801	0.0053158855220957	0.2275159585624646	0.0014099730574569	0.7104666839323268	3.958225985991255e-05	0.2556736950541318	3.958225985991255e-05	0.2661125201217119	0.0253571095135841	0.0406556949356127	0.0253571095135841	0.0417733656384982	CD47	57563	IFT57	73010	HHLA2	147105	False	False	False	alt	75	0.01404	-95	0.0354
2686	chr3	108149814	G	A	rs10514750	-0.00155092982	0.6760741111404804	0.00362549554	0.6718041511228943	0.0149925869913916	0.0848619784007208	-2.0543810830977125e-05	0.5243629942976414	5.368794993222093e-05	0.5201390868534274	0.2650504673284992	0.5536426752038175	-0.0004230001272725	0.613899985990005	0.0009587958532113	0.6094073240685928	0.0040495374487514	0.2454151233437743	-5.454450978065358e-06	0.499493014364012	1.439990852105148e-05	0.4953087273061289	-0.0014066535959916	0.540290245677876	0.003153559684229	0.536766969149412	CD47	57952	IFT57	72621	HHLA2	146716	False	False	False	ref	-95	0.00971	15	0.00728
2687	chr3	108157520	A	G	rs11926978	0.0316304004	0.0827524157673452	0.0316304004	0.0882237180195842	0.0098612274764523	0.3190995738297281	0.0003158405898957	0.0853100971547503	0.0003158405898957	0.0903815204504916	0.1259432151785806	0.779998161333334	0.0041121386911157	0.276640633356299	0.0041121386911157	0.2883833759064643	0.0012515834884725	0.7479294568527443	4.142349042303156e-05	0.2583975418674779	4.142349042303156e-05	0.2690552647721755	0.0292824614363218	0.0261987000301197	0.0292824614363218	0.0268901544321772	IFT57	64915	CD47	65658	HHLA2	139010	False	False	False	alt	60	0.02539	70	0.0417
2688	chr3	108157585	G	A	rs11919348	-0.0225612015999999	0.1662604103822688	0.0225612015999999	0.1581834487212034	0.0077779888035346	0.6305318624866041	-0.0001747959704927	0.2052304022083507	0.0001747959704927	0.1969259534536643	0.1048766066038029	0.8152797323207792	-0.0023765109254824	0.4158132744845099	0.0023765109254824	0.4030691468628175	0.0008145380986996	0.8319280332656598	-1.8388727330550064e-05	0.444604004192134	1.8388727330550064e-05	0.432176921257595	-0.0200811211734561	0.074129356927778	0.0200811211734561	0.0720997466624637	IFT57	64850	CD47	65723	HHLA2	138945	False	False	False	ref	-10	0.0008545	-10	0.001862
2689	chr3	108160883	G	C	rs62264146	-0.0043432952999999	0.5844228807156864	0.0054222913	0.5805266484772543	0.0063362940391182	0.8909162420413349	-3.159849103304907e-05	0.6594935509398266	3.776276364404912e-05	0.6566690225389098	0.2269318146453801	0.6101374112513687	-0.0012278415639101	0.5697066382868725	0.0014226493625347	0.5663121665890547	0.001474479842273	0.7037166151970828	-8.97457222833397e-06	0.6268294691666304	1.009948327927514e-05	0.6238072270030065	-0.0038008693036235	0.436084758577545	0.004858971566095	0.433178844042756	IFT57	61552	CD47	69021	HHLA2	135647	False	False	False	ref	95	0.01114	100	0.0296
2690	chr3	108162072	T	C	rs2035	0.0255004888	0.1252635001831387	0.0255004888	0.1326566860004091	0.0080991743967081	0.560045840929934	0.000209823824908	0.1564012360738339	0.000209823824908	0.1639544669494621	0.097826740941296	0.8297406244838729	0.0025942825789484	0.3859514490929288	0.0025942825789484	0.398455595813966	0.0007850881124436	0.8403943128098558	2.1013948852703403e-05	0.4077507882773656	2.1013948852703403e-05	0.4199380438819987	0.0208280168881419	0.0637230810827948	0.0208280168881419	0.0654892783433707	IFT57	60363	CD47	70210	HHLA2	134458	False	False	False	alt	-55	0.00479	30	0.0482
2691	chr3	108163444	G	T	rs28494587	0.00689527298	0.4603105939368921	0.00689527298	0.4729033464583335	0.0225959089397016	0.0154359324912095	0.0001598205732538	0.2158751659740778	0.0001598205732538	0.2247481694925766	0.1600348551333519	0.7234542052134162	0.001162584897358	0.5567162554037918	0.001162584897358	0.5704631478799219	0.0036717241299264	0.2952195776416279	2.7352780693329283e-05	0.3532673604618573	2.7352780693329283e-05	0.3653002984672685	0.0068506934719239	0.2905687056739465	0.0068506934719239	0.2991622442994602	IFT57	58991	CD47	71582	HHLA2	133086	False	True	False	alt	-100	0.003382	-65	0.03613
2692	chr3	108167028	A	G	rs2305551	0.0185718174	0.1991708706803188	0.0185718174	0.2083838518297805	0.0187627027944959	0.0344628115814363	0.0003390758462525	0.0781030490746048	0.0003390758462525	0.082806650060774	0.1665079513272958	0.7119682588370229	0.0032972375941975	0.3386326275270135	0.0032972375941975	0.3508578790604427	0.003110196815608	0.383725358074235	5.99055787854344e-05	0.2022443522233148	5.99055787854344e-05	0.2121148834071065	0.0173508023942156	0.0934150525719787	0.0173508023942156	0.0963090501871445	IFT57	55407	CD47	75166	HHLA2	129502	False	False	False	alt	85	0.001892	-95	0.02002
2693	chr3	108168909	A	G	rs9826261	-0.0375764296	0.061449467580751	0.0375764296	0.057799503625868	0.0159554205572322	0.0646761763719474	-0.0006523510777484	0.0353996147194347	0.0006523510777484	0.0336594296339378	0.0493283125343623	0.9064270327443474	-0.0017589410747153	0.4849752231482189	0.0017589410747153	0.4714108247705827	0.0007868424216694	0.8301002293668773	-3.0047031590103023e-05	0.3470859709208329	3.0047031590103023e-05	0.3353791931853686	-0.0188487432442244	0.0749069280038866	0.0188487432442244	0.0729197930423639	IFT57	53526	CD47	77047	HHLA2	127621	False	False	False	ref	75	0.0007553	-45	0.02756
2694	chr3	108169059	A	C	rs9830118	0.01213643982	0.312460232167368	0.01213643982	0.3236680474514996	0.0116636219436625	0.1859950356085571	0.000139561306464	0.2594321453621844	0.000139561306464	0.2690092962415965	0.0656791045550264	0.8779036067104674	0.0008733241010913	0.6406230416991177	0.0008733241010913	0.6549169614255774	0.000734813010796	0.8434814824616358	9.704905619906585e-06	0.5889589731898279	9.704905619906585e-06	0.6027475730870644	0.0079876347265012	0.2378979122764945	0.0079876347265012	0.2446893305501702	IFT57	53376	CD47	77197	HHLA2	127471	False	False	False	alt	-95	0.002232	-20	0.03915
2695	chr3	108171371	C	T	rs11928715	-0.0450159683999999	0.0398318885950792	0.0450159683999999	0.0372256320241422	0.0102312795557008	0.2873578664332225	-0.000469077272083	0.0510673605329956	0.000469077272083	0.0480300096779598	0.2020601873463417	0.653378909317388	-0.0091499548981868	0.1467134274743857	0.0091499548981868	0.1381372399278934	0.0020804454809686	0.5882959906315811	-9.581156504775194e-05	0.1362847435059044	9.581156504775194e-05	0.1287662061488391	-0.0419029243041939	0.0075949592809182	0.0419029243041939	0.00738114063624	IFT57	51064	CD47	79509	HHLA2	125159	False	False	False	ref	50	0.001419	10	0.001556
2696	chr3	108171457	T	C	rs11917405	-0.00615953332	0.5351847955653328	0.00615953332	0.5224889802705498	0.0196039001110043	0.0286015472264108	-0.0001238952492181	0.3128625317047077	0.0001238952492181	0.3028043418399009	0.2084751916513657	0.6443199193913347	-0.0013125293704642	0.5658799849653973	0.0013125293704642	0.5523780666165338	0.0041076299553019	0.240869058716878	-2.6526300491795912e-05	0.3899703063426063	2.6526300491795912e-05	0.3780666906509569	-0.0059046255666552	0.3635209528340132	0.0059046255666552	0.3540116686919485	IFT57	50978	CD47	79595	HHLA2	125073	False	False	False	ref	-75	0.001913	-80	0.02032
2697	chr3	108171613	A	G	rs11921090	0.01501428468	0.245624538969957	0.01501428468	0.2560184014855355	0.0098651952018154	0.3153285016959591	0.0001541987094922	0.2331557441743618	0.0001541987094922	0.2424070748072638	0.2275749748441373	0.6139079300001511	0.0034271887811782	0.3227006372386949	0.0034271887811782	0.3347795551194063	0.0022446249028067	0.5648102026891273	3.507729675248162e-05	0.3021463671641809	3.507729675248162e-05	0.31333128550597	0.0132470253840806	0.1300346946533759	0.0132470253840806	0.1341822139835677	IFT57	50822	CD47	79751	HHLA2	124917	False	False	False	alt	100	0.0247	-65	0.04102
2698	chr3	108172218	C	T	rs17829242	-0.0301123992	0.1065624379766144	0.0301123992	0.1006298025055223	0.0082107270045619	0.5422122573517816	-0.0002586375020307	0.137671147045386	0.0002586375020307	0.1313249984708411	0.096843328250293	0.830354791953399	-0.0031591722458864	0.3709932015286105	0.0031591722458864	0.3587405829112322	0.0008262461023754	0.8326961282452932	-2.7975485551878874e-05	0.3855403507386833	2.7975485551878874e-05	0.3737622469500819	-0.0249048226641354	0.048369423477291	0.0249048226641354	0.0470010097877475	IFT57	50217	CD47	80356	HHLA2	124312	False	False	False	ref	-100	0.00946	-15	0.004326
2699	chr3	108174732	T	C	rs28377152	0.00196256102	0.7966841034729281	0.00196256102	0.8106874905896745	0.0063099658719576	0.8925662945667989	1.3315742203095695e-05	0.8354839003330466	1.3315742203095695e-05	0.8495039152555175	0.0420460793161754	0.9252941211254216	0.0001007767562129	0.9018710126102872	0.0001007767562129	0.9159501994799252	0.0002759180635665	0.944444956164002	7.190275591887482e-07	0.9164394565584228	7.190275591887482e-07	0.9305306789490266	0.001215780246683	0.7658396678226882	0.001215780246683	0.7794829837035961	IFT57	47703	CD47	82870	HHLA2	121798	False	False	False	alt	100	0.00912	-25	0.01299
2700	chr3	108175645	C	A	rs11917750	-0.00541296204	0.5788369618653995	0.00541296204	0.5655815295006758	0.0072043241999539	0.7427940698010902	-3.99006689382916e-05	0.6269522925079806	3.99006689382916e-05	0.6140901356300021	0.2288343240075104	0.608433718054201	-0.001311575343022	0.582915990275709	0.001311575343022	0.5693132587438564	0.0016670233718734	0.6727675193709841	-9.70785270032478e-06	0.6180275203757413	9.70785270032478e-06	0.6045624039794836	-0.0047925808359007	0.4325881737595634	0.0047925808359007	0.4220950592516672	IFT57	46790	CD47	83783	HHLA2	120885	False	False	False	ref	90	0.05542	50	0.05014
2701	chr3	108175745	T	C	rs723271	-0.00115751106	0.8400010121818131	0.00158868238	0.8306890708707243	0.0142273569357193	0.1002651563669441	-1.796795664330679e-05	0.7217649980889836	2.408461051859197e-05	0.7123679962503905	0.2602703347545098	0.5574187667528749	-0.000276299797059	0.7582339303583444	0.0004151303574526	0.7488591110946532	0.003762407711701	0.2893091318098302	-4.371327754450489e-06	0.6683192370535863	6.34079652108683e-06	0.6590586270737578	-0.0011078953101172	0.7304579077896332	0.0014854925880973	0.7215128953541325	IFT57	46690	CD47	83883	HHLA2	120785	False	False	False	ref	50	0.00351	60	0.024
2702	chr3	108176360	C	T	rs7610003	0.00392385632	0.653285177371085	0.00392385632	0.6666888706926016	0.0098918847278755	0.3239151286084994	3.9196048479998745e-05	0.6142010255639673	3.9196048479998745e-05	0.6271022001976905	0.2826294878577579	0.5251534002210385	0.0011433256192462	0.5732255306076288	0.0011433256192462	0.5869039798520295	0.0028308807301225	0.452125920646459	1.1633077835153275e-05	0.5476710124337182	1.1633077835153275e-05	0.5608328241003053	0.0029377898110975	0.5374069828404238	0.0029377898110975	0.5493879576775906	IFT57	46075	CD47	84498	HHLA2	120170	False	False	False	alt	-90	0.007996	-90	0.05606
2703	chr3	108176479	A	G	rs7632036	-0.0008280457199999	0.7440870283386937	0.0027793286799999	0.7503756863098983	0.0105425586952227	0.2626658467149775	-4.895074075469285e-06	0.717980575704532	2.6488396037301045e-05	0.72487255246204	0.2353260925943214	0.6010450145257326	-0.0002528167359778	0.7031969561957172	0.0006798339441275	0.7100589810360274	0.0024844555487913	0.5140465395545829	-1.6906922375319844e-06	0.6801535497068871	6.423190952341093e-06	0.6874859175707907	-0.0004792580835901	0.612858235242322	0.0024626811481446	0.6188131503532648	IFT57	45956	CD47	84617	HHLA2	120051	False	False	False	ref	-100	0.0032	95	0.03014
2704	chr3	108178447	G	A	rs11915212	0.00234809322	0.7160767974756442	0.0028243721	0.7245869886251044	0.0205533857684203	0.0235498176924672	4.945550907709503e-05	0.4882058203597992	5.877909711113852e-05	0.4964565663975285	0.0459652071079575	0.9164081391171788	0.0001093561796747	0.8775128599064089	0.0001206950942117	0.8859138528817359	0.000939270469886	0.8096588782872913	2.2797165892962675e-06	0.7892426658006539	2.501686055142696e-06	0.7978519588533063	0.0014813431674602	0.6949678104450998	0.0016307223103973	0.7031425271057691	IFT57	43988	CD47	86585	HHLA2	118083	False	False	False	alt	-70	0.001167	95	0.02884
2705	chr3	108178698	C	A	rs11915231	0.00933646738	0.3668930599363699	0.00933646738	0.3784326218698441	0.0179711614283622	0.0406404656079063	0.0001732958977031	0.2009164660323913	0.0001732958977031	0.209241179825767	0.0716916150582474	0.8703639662738719	0.0007144244066223	0.6563662873552755	0.0007144244066223	0.6701672405759677	0.0013075338266375	0.7366825073061093	1.35228071379446e-05	0.510429831073426	1.35228071379446e-05	0.5235129879244	0.0070643886347368	0.2756047771681305	0.0070643886347368	0.2838001124197308	IFT57	43737	CD47	86836	HHLA2	117832	False	False	False	alt	0	0.0	0	0.0
2706	chr3	108179746	C	T	rs9818755	-0.084600856	0.0041978923321934	0.084600856	0.0040159979995967	0.0521107175938055	0.0005406868444655	-0.0046394407102868	0.0011541176802274	0.0046394407102868	0.0011167395835911	0.305443002520773	0.4765496336075043	-0.0270079015289336	0.0240532222427657	0.0270079015289336	0.022212911278904	0.0167089469927836	0.0037446611266116	-0.0015467161869048	0.0028321250373877	0.0015467161869048	0.0027209047753811	-0.0663637589601551	0.0012689010442757	0.0663637589601551	0.001229781285783	IFT57	42689	CD47	87884	HHLA2	116784	False	True	True	ref	45	0.001221	40	0.012695
2707	chr3	108181114	A	T	rs7647452	-0.0172256792	0.2240532423555049	0.0172256792	0.2145895778147135	0.0131564341806722	0.1271937447248653	-0.0002300341762954	0.1553028162908832	0.0002300341762954	0.1481174107368793	0.1752922748161288	0.6986326413784316	-0.0030524625500125	0.3637971314463777	0.0030524625500125	0.3517070490374092	0.002345860500261	0.5384500724258897	-4.129275129142141e-05	0.2856392089749934	4.129275129142141e-05	0.2749620164652253	-0.0163155219452483	0.101865709519952	0.0163155219452483	0.098938233074179	IFT57	41321	CD47	89252	HHLA2	115416	False	False	False	ref	-95	0.006844	30	0.015045
2708	chr3	108182218	G	A	rs17829536	0.011172253	0.3190307485583065	0.011172253	0.3304580099060201	0.0107383070388501	0.2542102163944537	0.0001207572031856	0.2875110657393259	0.0001207572031856	0.297404882438085	0.187916887104638	0.6787834330049027	0.0020833533462447	0.4282185254941066	0.0020833533462447	0.4412764068181817	0.0020244887022397	0.6057575737975605	2.2595303915818326e-05	0.389527297573914	2.2595303915818326e-05	0.4015202224815568	0.0106660857477774	0.1717378634508537	0.0106660857477774	0.1772029437055992	IFT57	40217	CD47	90356	HHLA2	114312	False	False	False	alt	-20	0.001001	5	0.0006714
2709	chr3	108184228	A	C	rs10514752	0.00555685944	0.5362506306414683	0.00555685944	0.5494292745641762	0.0073991771619283	0.704460714299754	4.1163248178494864e-05	0.5822096153799602	4.1163248178494864e-05	0.595214480431408	0.1218809323748171	0.7824970592764349	0.0005908075108387	0.6764081394502889	0.0005908075108387	0.6904272204437125	0.0009100227607667	0.8099703991390625	4.445332693742449e-06	0.7000737982077795	4.445332693742449e-06	0.7140160284944908	0.0046328281413707	0.3870064025712861	0.0046328281413707	0.3971247430311817	IFT57	38207	CD47	92366	HHLA2	112302	False	False	False	alt	100	0.03003	-10	0.004333
2710	chr3	108185223	A	G	rs72933710	0.0299870947999999	0.0957013835987533	0.0299870947999999	0.1017873732734662	0.0076068603312277	0.6576552906115745	0.0002273170662884	0.1400484853884161	0.0002273170662884	0.1470943267490085	0.2519196257222585	0.5743076802498762	0.0078069378726148	0.1588716725707021	0.0078069378726148	0.1684034382098496	0.0019182371092328	0.6246268039487258	5.926389703788573e-05	0.1943686270977119	5.926389703788573e-05	0.2038443628211502	0.0264463324308343	0.0353148900333932	0.0264463324308343	0.0362133734635394	IFT57	37212	CD47	93361	HHLA2	111307	False	False	False	alt	-100	0.007717	-15	0.002594
2711	chr3	108186492	A	G	rs13433942	0.0630722818	0.0134216407287464	0.0630722818	0.0141924447859247	0.0124420259154999	0.1597430607220501	0.0008886121518291	0.0222098538634703	0.0008886121518291	0.0233740608119945	0.2562785921015778	0.5685996254384165	0.0172371245911923	0.0553633490815133	0.0172371245911923	0.0598774746292868	0.0033479966621655	0.3222813339469899	0.0002509098303482	0.0478999399559091	0.0002509098303482	0.0511213977320889	0.0563698793555949	0.0029137746431098	0.0563698793555949	0.0029453325733972	IFT57	35943	CD47	94630	HHLA2	110038	False	True	False	alt	-35	0.0238	95	0.03833
2712	chr3	108189077	C	T	rs9816413	-0.002994167428	0.7101592311610638	0.003273055884	0.6999394030482333	0.0163960823374361	0.0569278012127277	-4.856200502207783e-05	0.5444874483249099	5.34727050275689e-05	0.5343408776089671	0.1690805921223249	0.7069954123408607	-0.0004226277555191	0.7535105644396699	0.0004896571505251	0.7425566293438784	0.0027859256812249	0.4554522696836086	-6.789838722439237e-06	0.6472067234463149	7.970100015888575e-06	0.6365271157215228	-0.0028983703150447	0.5320751237737288	0.0031763814977333	0.5232208219807358	IFT57	33358	CD47	97215	HHLA2	107453	False	False	False	ref	100	0.005157	-80	0.03708
2713	chr3	108189334	C	T	rs17239988	-0.0463001386	0.0367599895573931	0.0463001386	0.034401744582004	0.0103404710638153	0.2815426508004918	-0.0004872858519783	0.0463778484855484	0.0004872858519783	0.0436927835292278	0.1862156246434091	0.6790221064720999	-0.0089075074872919	0.1523250972850508	0.0089075074872919	0.1435865750221069	0.0019781421198927	0.6094404424174134	-9.640404794058342e-05	0.1379359189301936	9.640404794058342e-05	0.1303997696304625	-0.0450087656510959	0.0066764156626689	0.0450087656510959	0.0065262512274082	IFT57	33101	CD47	97472	HHLA2	107196	False	False	False	ref	-100	0.012245	85	0.02873
2714	chr3	108190452	A	G	rs9859939	0.024839702	0.1248672976488637	0.024839702	0.1320880466590569	0.0085133455318271	0.4780792208431232	0.0002196544721573	0.1477244076023427	0.0002196544721573	0.1549026890540062	0.3389122293799728	0.4368583797704902	0.0085176396658561	0.1392118159322103	0.0085176396658561	0.1480346790149049	0.002932696567584	0.4225107780288055	7.652393064448837e-05	0.1554896704645626	7.652393064448837e-05	0.163964577436393	0.0169815039575099	0.08391380585941	0.0169815039575099	0.0863838594741445	IFT57	31983	CD47	98590	HHLA2	106078	False	False	False	alt	55	0.001181	-30	0.00989
2715	chr3	108193588	T	C	rs13323116	0.00187188572	0.8097056607786484	0.00187188572	0.8237989209102211	0.0142035092960369	0.0971228328271793	2.541709524277669e-05	0.7157270188518926	2.541709524277669e-05	0.7294261832795084	0.0312368385564165	0.9385504312608376	5.456822549712841e-05	0.9223773121278342	5.456822549712841e-05	0.9367128041409284	0.000443508003917	0.901223940052573	7.485914070268991e-07	0.8972497468136218	7.485914070268991e-07	0.9116803729460468	0.0007987634726501	0.8248575983985831	0.0007987634726501	0.838109102674415	IFT57	28847	CD47	101726	HHLA2	102942	False	False	False	alt	35	0.000839	-100	0.03833
2716	chr3	108195394	T	C	rs9868740	0.0077271140199999	0.4402523700508254	0.0077271140199999	0.4526888968165836	0.0068622373299851	0.8167010058521894	5.387331399120661e-05	0.5169410026054921	5.387331399120661e-05	0.5292044778278677	0.0964491332897643	0.8343733285970376	0.0008504538299941	0.6538391307194745	0.0008504538299941	0.6675035069801394	0.0006767771173512	0.8681388249996658	6.039735591169112e-06	0.6936578627841707	6.039735591169112e-06	0.7073107579107438	0.006201309142211	0.3263413932157765	0.006201309142211	0.3355081283267652	IFT57	27041	HHLA2	101136	CD47	103532	False	False	False	alt	-100	0.003304	-5	0.007706
2717	chr3	108196350	A	C	rs9863548	0.0033224803819999	0.6786372008997761	0.003706198022	0.689103779967916	0.0083841190111841	0.5125866705045815	2.9072386238362e-05	0.6721289770746437	3.2301712471816355e-05	0.6819594220185119	0.1234618616375688	0.784762177747765	0.000501379334791	0.7499988906055601	0.0005475612663419	0.760412544292516	0.0010483904663298	0.7857999266142367	4.388827680704515e-06	0.7442578434747492	4.777489834466871e-06	0.7543683337530236	0.0028610255293104	0.5232084343274609	0.0032635193311133	0.531729771985988	IFT57	26085	HHLA2	100180	CD47	104488	False	False	False	alt	-90	0.03247	-15	0.001495
2718	chr3	108197419	C	T	rs13318120	-0.0103726802	0.374277917472662	0.0103726802	0.3625247022799696	0.0109220706376558	0.2285237445016969	-0.00011180937565	0.3331971124341728	0.00011180937565	0.3228784916051694	0.1078475917799976	0.8090284073943869	-0.0010720311546337	0.611691427467411	0.0010720311546337	0.597933339121601	0.0011873381596706	0.7571218841185356	-1.1623441934194662e-05	0.5641576129314368	1.1623441934194662e-05	0.5509605559588097	-0.0084855652029585	0.239591610407816	0.0084855652029585	0.232627332409185	IFT57	25016	HHLA2	99111	CD47	105557	False	False	False	ref	-90	0.003717	-10	0.0001221
2719	chr3	108199003	A	G	rs9875102	-0.0053906587199999	0.573971511473368	0.0053906587199999	0.5610116855621008	0.0207127929722222	0.0231073127494259	-0.0001109242113362	0.3303951982358991	0.0001109242113362	0.3198878174882897	0.0324111245967281	0.9431613286877348	-0.0001761294865735	0.8805005541250494	0.0001761294865735	0.8662906604357815	0.00069084885461	0.8611075325549497	-3.776868665740682e-06	0.7754548490062257	3.776868665740682e-06	0.7614783442690438	-0.002533221298976	0.6172545623757923	0.002533221298976	0.6046595796065736	IFT57	23432	HHLA2	97527	CD47	107141	False	False	False	ref	100	0.05188	100	0.0668
2720	chr3	108200293	T	C	rs72933753	0.028069081	0.107324017129068	0.028069081	0.1139277707634012	0.008765733489474	0.4555341007425483	0.0002498927940481	0.1261696213110699	0.0002498927940481	0.1328123092007878	0.0414672351372939	0.9265086594604272	0.001249062859981	0.5548911535491394	0.001249062859981	0.5685297902333775	0.0003710915540538	0.924381605800478	1.1292592552084072e-05	0.5540215722771589	1.1292592552084072e-05	0.5673237217611823	0.0140976566146951	0.1218645659069708	0.0140976566146951	0.1256871711301077	IFT57	22142	HHLA2	96237	CD47	108431	False	False	False	alt	-100	0.001982	60	0.018
2721	chr3	108200444	G	A	rs921582	-0.0005143441719999	0.6896610451244739	0.003198335172	0.6862620303453631	0.006440435809446	0.8721960619927273	-2.6898903233014747e-06	0.760985338102809	2.0087848027958585e-05	0.7577620049685987	0.0308135976514278	0.945621288667456	1.07497585618957e-05	0.9111787687484928	9.992000979123503e-05	0.9079882381285936	0.0002030455052788	0.958119799860479	8.131260420564778e-08	0.9285435698096342	6.402190193675398e-07	0.925355429938665	1.8672392867159943e-05	0.7346514463162355	0.0014834178777787	0.7322345951792916	IFT57	21991	HHLA2	96086	CD47	108582	False	False	False	ref	80	0.002443	-90	0.0384
2722	chr3	108202233	G	A	rs1377275	-0.0372298246	0.0658270736422447	0.0372298246	0.061628696918317	0.0078127350728651	0.6087416856314772	-0.0002921427614394	0.1067316996743618	0.0002921427614394	0.1012720525453119	0.3112148466270397	0.4831508342445427	-0.0116852012171582	0.108948348665457	0.0116852012171582	0.1016931805091779	0.0024358261953271	0.5234543419295948	-9.177852268627125e-05	0.1377037618214905	9.177852268627125e-05	0.1299723740546008	-0.0293322544839676	0.0279002540422943	0.0293322544839676	0.0272161785640722	IFT57	20202	HHLA2	94297	CD47	110371	False	False	False	ref	-85	0.0009613	-65	0.01973
2723	chr3	108208573	T	C	rs59142860	0.1232900248	0.000910223922624	0.1232900248	0.0009663303116992	0.0253885711341425	0.0095621956486831	0.0031951999098262	0.0018674333785079	0.0031951999098262	0.0019266579961029	0.3109845537816782	0.47913819719438	0.0383001030432185	0.0071351119025245	0.0383001030432185	0.0076845887996133	0.0078286255702562	0.0315267954524753	0.0009839460741967	0.0038575993829903	0.0009839460741967	0.0040700952323604	0.1069201962675961	0.0001831799917716	0.1069201962675961	0.0001862020464659	IFT57	13862	HHLA2	87957	CD47	116711	False	True	True	alt	30	0.001704	0	0.0
2724	chr3	108210293	C	T	rs72933787	0.002804628148	0.7398969142635645	0.002804628148	0.7534558824077968	0.0210780916670699	0.0212141962309378	6.414120106422185e-05	0.4946611527879611	6.414120106422185e-05	0.5069327554953125	0.1678399153518189	0.7100184269632381	0.0004827962541933	0.7334445801717345	0.0004827962541933	0.7474671327012383	0.0036070415956492	0.3098920302342668	1.1344058899518868e-05	0.5678980858784659	1.1344058899518868e-05	0.5812272277733803	0.0026058361601261	0.5830782837631309	0.0026058361601261	0.59558586741818	IFT57	12142	HHLA2	86237	CD47	118431	False	False	False	alt	30	0.001465	25	0.0017395
2725	chr3	108210974	C	A	rs1289771	0.0035109400399999	0.6601484016732192	0.0035109400399999	0.6735985002873587	0.016742255649485	0.0556924260400555	5.943979056411742e-05	0.4764085693114265	5.943979056411742e-05	0.4884876807391572	0.0582599404558138	0.8933602096083234	0.0001809723519041	0.8415506660502029	0.0001809723519041	0.8558330639169524	0.0009249182124981	0.807527081879024	2.963297368786236e-06	0.7646910779210507	2.963297368786236e-06	0.7787825063091093	0.0022469112750131	0.6140615319896635	0.0022469112750131	0.6267863362336352	IFT57	11461	HHLA2	85556	CD47	119112	False	False	False	alt	-15	0.0001774	80	0.02495
2726	chr3	108211666	C	T	rs1289769	0.001576086908	0.8315920896945235	0.001624622452	0.8420563685939401	0.0171598583955432	0.0520518595359057	2.3143550992204328e-05	0.7094786959000127	2.4327804340232324e-05	0.719845083927761	0.0359713275033972	0.9321852436419216	6.143299012996718e-05	0.91917101583283	6.259604272475019e-05	0.93180599483703	0.0005970465830188	0.8724982360173369	9.10551757897938e-07	0.8846746110728293	9.389299074009896e-07	0.8955584325215187	0.0007780163694643	0.8278280889720981	0.0007946140520129	0.8383570181150486	IFT57	10769	HHLA2	84864	CD47	119804	False	False	False	alt	100	0.001595	-95	0.03134
2727	chr3	108216039	T	C	rs62267923	0.01709882896	0.2108681765978198	0.01709882896	0.2205373900318265	0.0074276745002476	0.6935170231392717	0.0001266278602889	0.2696571229426548	0.0001266278602889	0.2793743892193122	0.1151754686251931	0.7984116418293711	0.0019681633659775	0.4486869368800683	0.0019681633659775	0.4618575648584652	0.0008442758834435	0.8262089243363853	1.442656040310245e-05	0.4875844923474236	1.442656040310245e-05	0.5004905930989707	0.0147262938412223	0.107279189232013	0.0147262938412223	0.1105337027594167	IFT57	6396	HHLA2	80491	CD47	124177	False	False	False	alt	-70	0.004272	40	0.0168
2728	chr3	108218724	G	A	rs1289759	0.00804622746	0.4045663478965403	0.00804622746	0.4164920061866075	0.0223258736557436	0.0166030955381887	0.0001829205034504	0.1815216419056786	0.0001829205034504	0.1896100598502153	0.1371881451052396	0.7615458775411386	0.0011210268681477	0.558666132586342	0.0011210268681477	0.572305830766872	0.003163997181309	0.3804348648463207	2.630425994216453e-05	0.3542854501727416	2.630425994216453e-05	0.3659844009535426	0.0075830662143797	0.247529941874378	0.0075830662143797	0.2551969500912865	IFT57	3711	HHLA2	77806	CD47	126862	False	True	False	alt	15	0.000328	-70	0.01703
2729	chr3	117798492	A	G	rs9842435	0.0094270017604	0.3784666812518868	0.0094286183996	0.3908516532079179	0.0075032903993673	0.6788230959705673	7.43724908391814e-05	0.4267849454294548	7.438346483099486e-05	0.438661460588194	0.3503978257035861	0.4156193695770298	0.0034106680908114	0.3484136127199823	0.0034112744541928	0.3612826686582744	0.0026460275929095	0.4878357379583123	2.714961023822596e-05	0.3799360627251837	2.715372632472061e-05	0.3922512269524427	0.0059191485388852	0.3280546224337008	0.0059191485388852	0.3371178323286791	LINC03051	199100	IGSF11	1347576	TEX55	1347660	False	False	False	alt	-80	0.002304	65	0.00922
2730	chr3	117801450	G	T	rs6799997	0.007064654342	0.4541130070503721	0.00710121901	0.4660831584543836	0.0169596885063636	0.0512440837588142	0.0001260541067714	0.3078265368179567	0.0001266626276088	0.3173455593856732	0.4360812871502816	0.2716035727451577	0.0031971157919212	0.3742256438100529	0.003213651992848	0.3859843925987605	0.00745852745855	0.0387928351018692	5.769862215142837e-05	0.2527176377069263	5.797382287373507e-05	0.2630021867214327	0.0032759675930248	0.5129831789360999	0.003284266434299	0.5235128128182543	LINC03051	196142	IGSF11	1344618	TEX55	1344702	False	False	False	alt	65	0.06097	30	0.01355
2731	chr3	117879459	A	C	rs55979908	0.0044280243479999	0.5927181008263898	0.0044280243479999	0.6062257108366323	0.0081926676431181	0.5532515086464187	3.4804384926525374e-05	0.6226136957335939	3.4804384926525374e-05	0.6356570236599148	0.1370014211765681	0.7638206620570657	0.0005879066935165	0.6939411279365328	0.0005879066935165	0.7082061773482698	0.0011271940714044	0.7753136175016726	4.596592392196632e-06	0.7093176151301243	4.596592392196632e-06	0.7235258387166424	0.0043465181174078	0.4196292147740079	0.0043465181174078	0.4303075227738005	LINC03051	118133	IGSF11	1266609	TEX55	1266693	False	False	False	alt	-70	0.000698	80	0.02057
2732	chr3	117886764	C	T	rs62263082	0.00344711728	0.66862490970335	0.00344711728	0.682072548036847	0.018721883899098	0.0348693726834318	6.289230343343618e-05	0.4581521738486565	6.289230343343618e-05	0.4700686378079037	0.1352296185645079	0.7523599547139634	0.0004679557864859	0.7169602833517362	0.0004679557864859	0.7311237486599071	0.0025959948734179	0.4308922315328596	8.62387272288813e-06	0.5789447392514362	8.62387272288813e-06	0.5925831766252562	0.0032448469382462	0.5173802140819326	0.0032448469382462	0.5292695954893745	LINC03051	110828	IGSF11	1259304	TEX55	1259388	False	False	False	alt	-100	0.01426	100	0.06104
2733	chr3	117897584	C	T	rs55704727	-0.0027382426975999	0.7355546712675487	0.0029223723375999	0.7285361826740034	0.0211012812063266	0.0212534905769236	-5.296275513703829e-05	0.52476976591906	5.685352818113412e-05	0.5168526045396918	0.1795329827072894	0.6903697165521604	-0.0005008243083364	0.7531047267852652	0.0005307265851206	0.7439366128021675	0.0037697827275709	0.2733460121050849	-9.625275647316543e-06	0.6114850401608048	1.025712921431745e-05	0.6002531900716405	-0.0026722268903204	0.5691543433757262	0.0028465025570804	0.5609074208672268	LINC03051	100008	IGSF11	1248484	TEX55	1248568	False	False	False	ref	-45	0.003677	-50	0.03018
2734	chr3	117905670	C	T	rs6769144	-0.000117017942	0.854886821442569	0.001685654862	0.8509252854614703	0.0164248285059419	0.0620129700137519	4.524968723356708e-06	0.7133779425521766	3.129674087081828e-05	0.710361142037723	0.0299422193176277	0.9472907013545628	2.366992955547099e-05	0.9527029667341628	5.9433890221279314e-05	0.9495507736848784	0.000538630605836	0.8914883639291223	7.157674069703127e-07	0.913154709155224	1.2396777536406185e-06	0.9094354194965923	0.0002219940040871	0.8560607419442331	0.0007780163694643	0.8524713085303963	LINC03051	91922	IGSF11	1240398	TEX55	1240482	False	False	False	ref	-60	0.001984	-90	0.00867
2735	chr3	117911328	T	G	rs62263119	0.00692775002	0.4862124268521798	0.00692775002	0.4993731681673412	0.012756879428896	0.1416371883678017	9.48079046366581e-05	0.3847094351511238	9.48079046366581e-05	0.396439651932612	0.0789302793597443	0.8517204890291502	0.0006705566566527	0.6829917222209472	0.0006705566566527	0.6976947820313686	0.0009971980966288	0.7850778919958447	9.154029135385648e-06	0.6098088626948249	9.154029135385648e-06	0.6240600562695013	0.0059751657174866	0.3558419214353219	0.0059751657174866	0.3643269191816848	LINC03051	86264	IGSF11	1234740	TEX55	1234824	False	False	False	alt	-90	0.0074	-90	0.0241
2736	chr3	117911406	A	G	rs62263120	0.00575561782	0.5204121490625215	0.00575561782	0.533512316672074	0.008025432356552	0.5525145837447081	4.918503636046214e-05	0.5427665591391424	4.918503636046214e-05	0.5554955236786564	0.0601977198933598	0.8853076535415138	0.0003038245846017	0.7786697823621764	0.0003038245846017	0.7928302729080694	0.0004711904076832	0.8947030858228343	2.554682344463777e-06	0.784233824707957	2.554682344463777e-06	0.7983848682783204	0.0036867602361019	0.4677645716666113	0.0036867602361019	0.4789277647205275	LINC03051	86186	IGSF11	1234662	TEX55	1234746	False	False	False	alt	100	0.003223	-75	0.009605
2737	chr3	117918458	G	A	rs62264763	-0.0461217766	0.0370462608139404	0.0461217766	0.0346257514051068	0.0102745204581766	0.2786141028153595	-0.0004989761194157	0.0506815498902521	0.0004989761194157	0.0477827521045979	0.121488812124607	0.7849715920878912	-0.0057062694055823	0.2372750732390185	0.0057062694055823	0.2265286415615642	0.0012539620276499	0.7459681296909458	-6.245447819447985e-05	0.2152169440932857	6.245447819447985e-05	0.2055694456916536	-0.0391124389257149	0.0103134213331604	0.0391124389257149	0.0099732747148398	LINC03051	79134	IGSF11	1227610	TEX55	1227694	False	False	False	ref	-30	0.00178	0	0.0
2738	chr3	117920728	G	A	rs62264764	-0.00612109344	0.5373070611476818	0.00612109344	0.5241526571727181	0.0097055718933647	0.3356055004168048	-5.859118232353371e-05	0.5091592263908739	5.859118232353371e-05	0.4968777389780644	0.3894729198435668	0.3546983522895042	-0.0023501872717987	0.4415871865667878	0.0023501872717987	0.4282207722123313	0.0037600793873996	0.2914754647128748	-2.238592990254908e-05	0.42027439398825	2.238592990254908e-05	0.4078657931508966	-0.0034232720256433	0.5075006704898554	0.0034232720256433	0.4963207415829673	LINC03051	76864	IGSF11	1225340	TEX55	1225424	False	False	False	ref	-100	0.00609	-100	0.1522
2739	chr3	117921320	G	C	rs7649429	-0.01810087508	0.2227716328647864	0.01810087508	0.2133841648857568	0.0065253691379524	0.8634405349048632	-0.0001190392593344	0.3084935999606563	0.0001190392593344	0.2986688875813857	0.1489724997147273	0.7409951598427413	-0.0028691255015313	0.3936670229900345	0.0028691255015313	0.3810995394040495	0.0009864043970477	0.7974182802708495	-1.913160528717194e-05	0.4607496183894022	1.913160528717194e-05	0.448068893744224	-0.0169151132273155	0.1000405245279461	0.0169151132273155	0.0972852720420746	LINC03051	76272	IGSF11	1224748	TEX55	1224832	False	False	False	ref	-65	0.02898	95	0.02927
2740	chr3	117931269	T	C	rs7631320	-0.00463979012	0.6184776472792737	0.00463979012	0.6050600269819988	0.0215665450927864	0.01901440307537	-9.962186145371784e-05	0.341769967140421	9.962186145371784e-05	0.3315815166925885	0.13056359505804	0.7706213761326732	-0.0006028855377123	0.7082482328284466	0.0006028855377123	0.6939507582829816	0.0028377928720498	0.4392230287093851	-1.2965838914317747e-05	0.526387920164409	1.2965838914317747e-05	0.5131964466237862	-0.0042075125260635	0.4382734967651387	0.0042075125260635	0.4277825863789055	LINC03051	66323	IGSF11	1214799	TEX55	1214883	False	True	False	ref	45	0.001564	25	0.03387
2741	chr3	117934780	G	T	rs62264778	-0.0075852907399999	0.4616953786807092	0.0075852907399999	0.4492585810162101	0.0085793844828389	0.4771308839416166	-6.467012991106676e-05	0.4730273150938661	6.467012991106676e-05	0.4609724636321957	0.0674343094845382	0.8825267831096458	-0.0004558557585818	0.7586900170379927	0.0004558557585818	0.7445788077054654	0.0005851995298026	0.8812059460769577	-3.905871960317826e-06	0.7575779227190618	3.905871960317826e-06	0.7434994549570841	-0.004989678316165	0.383159855414724	0.004989678316165	0.3731656209239566	LINC03051	62812	IGSF11	1211288	TEX55	1211372	False	False	False	ref	-80	0.0152	60	0.02374
2742	chr3	117936022	T	C	rs62264780	0.000607814466	0.8409304929683408	0.001488858374	0.8464360511707445	0.0083985069076551	0.5219447340724522	3.840062455182479e-06	0.8397243790827689	1.2262812897730009e-05	0.8450017596158729	0.2521333208850714	0.5761682693909939	0.0001176333982107	0.7567710393265394	0.0003833923181021	0.7624032893076723	0.0021355054656478	0.5839213407717999	6.437324021245569e-07	0.760465317492493	3.186223700619358e-06	0.7660492992813858	0.0007033267979958	0.734482826559415	0.0013672340999387	0.7401705970521922	LINC03051	61570	IGSF11	1210046	TEX55	1210130	False	False	False	alt	100	0.001743	-80	0.005554
2743	chr3	117938350	C	T	rs73168397	-0.00150669754	0.6107766526905757	0.00465281794	0.6032095026276291	0.0082528158104221	0.5460287713455083	-7.31618312313893e-06	0.6265324233681951	3.9116818576358006e-05	0.6192556065101759	0.1168684322451477	0.7931104765714159	-0.0001815423212114	0.7282483014211318	0.0005312744515794	0.719012118730947	0.0009709140820897	0.8000846713290428	-9.582481824103128e-07	0.7345741762587574	4.493301549319675e-06	0.7253493247943779	-0.0012137055363644	0.4501869646650451	0.0042552308633906	0.4440645965704133	LINC03051	59242	IGSF11	1207718	TEX55	1207802	False	False	False	ref	-70	0.0004425	-60	0.03622
2744	chr3	117953094	T	C	rs62264819	0.00671280517	0.5468310973499515	0.00715046053	0.557573060513153	0.0066869047816265	0.7526207996994433	6.592296217108202e-05	0.5741526636665967	6.813070917490631e-05	0.5843888253917583	0.2296517598730277	0.6061506266285486	0.0018976316438149	0.5402700347245085	0.0019846006561173	0.5511182375981465	0.0016340077565778	0.6615504122358816	1.945274440947617e-05	0.5652976207016581	1.9891458520672944e-05	0.5756710382942403	0.0055871948879137	0.4225707142227703	0.0060062863722652	0.4291689150915051	LINC03051	44498	IGSF11	1192974	TEX55	1193058	False	False	False	alt	-95	0.00565	-40	0.01901
2745	chr3	118000691	A	C	rs1499972	0.0025818777199999	0.6181665166465035	0.00407193124	0.6261812746582791	0.0097352659864159	0.3343817544764106	2.6453537299279805e-05	0.5877274162333284	3.9577030403599686e-05	0.5952662024893716	0.2126100893162791	0.6351144254143044	0.0006935653556894	0.6081851278052158	0.0008753877783952	0.6167017825319728	0.0021220211525803	0.5831648441762427	7.12095055863576e-06	0.5872301519773174	8.72233282801734e-06	0.595575652019461	0.0026867498625504	0.4625367204461552	0.0037282544424734	0.4691344460147531	LINC03051	3099	IGSF11	1145377	TEX55	1145461	False	False	False	alt	-75	0.007774	90	0.0508
2746	chr3	118001626	C	T	rs2925312	-0.118056444	0.0011245288181114	0.118056444	0.0010843304547361	0.0337362027849086	0.0025851496313085	-0.0039711507138445	0.0012836234975917	0.0039711507138445	0.001236820328388	0.3347067915642278	0.4390705106543777	-0.0399013933470417	0.0072285379288332	0.0399013933470417	0.0067209664082647	0.0111490763280775	0.0085861817608648	-0.0013250853043782	0.0024947061441982	0.0013250853043782	0.0023836426450617	-0.0933474413634995	0.0003045806550426	0.0933474413634995	0.0002979886471507	LINC03051	4034	IGSF11	1144442	TEX55	1144526	False	True	True	ref	-65	0.002754	-70	0.02722
2747	chr3	118002581	A	G	rs843852	0.0076709067	0.4252545666694214	0.0076709067	0.4376781403170757	0.0075927448745869	0.6765516837321737	5.8573738448010514e-05	0.4759516241099396	5.8573738448010514e-05	0.4879716461000652	0.3154493303872446	0.4713672602667899	0.002402130982055	0.3931572109631808	0.002402130982055	0.4061298666561558	0.0024308597603446	0.5302636981421228	1.8614246310970004e-05	0.4276679148010852	1.8614246310970004e-05	0.4402398938551395	0.005813338312638	0.3227911329279603	0.005813338312638	0.3316051982668982	LINC03051	4989	IGSF11	1143487	TEX55	1143571	False	False	False	alt	-90	0.002384	100	0.04453
2748	chr3	118007409	C	T	rs1093464	-0.035939227	0.0752619887904094	0.035939227	0.0708680840794713	0.0093001858493634	0.3781594584416438	-0.0003441303502407	0.0914557062219386	0.0003441303502407	0.0867010486959196	0.0857602257284826	0.850845104760335	-0.0031772904921122	0.371987264682017	0.0031772904921122	0.3595715956465048	0.0008056594868217	0.84029768344428	-3.071591789349079e-05	0.3636471028216814	3.071591789349079e-05	0.3520436181034131	-0.0263840911212771	0.0415386943645959	0.0263840911212771	0.0403793779396037	LINC03051	9817	IGSF11	1138659	TEX55	1138743	False	False	False	ref	-95	0.00729	95	0.0218
2749	chr3	118031005	C	T	rs846184	-0.0079978977	0.4466759705882867	0.0079978977	0.4341913634822036	0.0101759859669622	0.3034109210084473	-7.586143577677732e-05	0.4203811380373131	7.586143577677732e-05	0.4091265343147375	0.1172647019159949	0.7954782475023779	-0.0008601285168699	0.6499433118957505	0.0008601285168699	0.6362054939324975	0.0012081300576419	0.7597764564276579	-8.322827879280913e-06	0.6264642908694181	8.322827879280913e-06	0.6129584006942416	-0.0065602340273238	0.3103656376138581	0.0065602340273238	0.3016982226561963	LINC03051	33413	IGSF11	1115063	TEX55	1115147	False	False	False	ref	95	0.02031	-80	0.03705
2750	chr3	118082483	T	C	rs1499976	0.0492794768	0.0261795008337973	0.0492794768	0.0280976752128565	0.0106146917306208	0.253832755001258	0.0005408528113549	0.0361581021327012	0.0005408528113549	0.0386130848335396	0.1390159648959013	0.7577273522006034	0.0070458650059172	0.1742355541961607	0.0070458650059172	0.18419771384203	0.0015029303701274	0.69833885233933	7.851051135614019e-05	0.1545673630382105	7.851051135614019e-05	0.1632452578184816	0.0442514963848172	0.0058162811453135	0.0442514963848172	0.0059735644296884	LINC03051	84891	IGSF11	1063585	TEX55	1063669	False	False	False	alt	100	0.00467	45	0.02563
2751	chr3	128072865	T	C	rs7612065	0.0469291054	0.0296210591666074	0.0469291054	0.0317379084726679	0.0126218030603221	0.1397940062310488	0.0005952256156021	0.0281343417502887	0.0005952256156021	0.0299602428936476	0.5309847612527101	0.1257429647592197	0.02512652931693	0.0220939746126203	0.02512652931693	0.024088292216212	0.0067091910870853	0.053928674962505	0.0003189622119054	0.0223694726859622	0.0003189622119054	0.0241185459725959	0.0122822850859448	0.1415704129702741	0.0122822850859448	0.1461892828711245	MGLL	20675	SEC61A1	21223	EEFSEC	80617	False	False	False	alt	95	0.002998	35	0.02803
2752	chr3	128088271	G	A	rs6439112	0.00317709164	0.6780711987541783	0.0031915727599999	0.6907295612370752	0.0330760345175283	0.0027091775929221	0.0001106999545862	0.3179446366585977	0.0001111152209299	0.3271654846770432	0.0560026556292077	0.889279322279262	0.0001692323046668	0.8408011216876727	0.0001699629778944	0.8538300194571039	0.0017466589549098	0.6134208212941314	5.4580065816498565e-06	0.6709359573051169	5.4789596568435455e-06	0.681835238761991	0.0020166184296517	0.6377391352149043	0.0020166184296517	0.6499095046233584	MGLL	36081	SEC61A1	36629	EEFSEC	65211	False	True	True	alt	100	0.012054	90	0.01715
2753	chr3	128100219	G	C	rs4857866	-0.00646037396	0.4926172859775511	0.00646037396	0.4799538826529786	0.0073821329494264	0.6881794397191957	-4.769044845237351e-05	0.5423958294178886	4.769044845237351e-05	0.5302182637535798	0.3374620068672911	0.4365264991322865	-0.0021968129402381	0.4320277431634141	0.0021968129402381	0.4188494021325177	0.0024724300915358	0.5181574969624531	-1.6068229938378948e-05	0.468331798717676	1.6068229938378948e-05	0.4554364171070888	-0.004626604010415	0.413151438314324	0.004626604010415	0.4030787930871661	MGLL	48029	SEC61A1	48577	EEFSEC	53263	False	False	False	ref	-85	0.005207	95	0.03168
2754	chr3	128173194	T	C	rs2999052	0.03919091	0.0498320808382209	0.03919091	0.0533699825451256	0.0085553620762791	0.4915133708322232	0.0003403459640918	0.0748165855858841	0.0003403459640918	0.0794349618992619	0.4428821875745599	0.2678375957175133	0.0173425439577817	0.049645552158767	0.0173425439577817	0.0541188390309092	0.0037828137788596	0.2871182944162117	0.0001504307546127	0.0671024008741147	0.0001504307546127	0.0721251124915708	0.0179524683866014	0.0771627435053328	0.0179524683866014	0.0794421017177625	RUVBL1	19280	EEFSEC	19712	MGLL	121004	False	False	False	alt	-100	0.004314	65	0.0634
2755	chr3	128176383	A	G	rs2687729	0.01652682468	0.2343176405737515	0.01652682468	0.2444110889996313	0.0067012971012107	0.8199487818051402	0.0001174759012224	0.3158367140902588	0.0001174759012224	0.3265816716544686	0.2395543522235707	0.5874734639867303	0.0044700750244822	0.2862289169722573	0.0044700750244822	0.2984161968791821	0.0016561585245322	0.6674433606773577	3.2977279586739434e-05	0.3469378587831818	3.2977279586739434e-05	0.3590515456570561	0.0139628004439879	0.134432368120516	0.0139628004439879	0.1385656230085585	RUVBL1	22469	EEFSEC	22901	MGLL	124193	False	False	False	alt	-95	0.015	0	0.0
2756	chr3	128186805	A	T	rs2999059	0.000753782306	0.8695006809058137	0.001422232214	0.8715537135117349	0.0173132585968296	0.0488821984278359	1.349722718746021e-05	0.7535375189995369	2.3320595669949828e-05	0.7560281329837983	0.0433572962375127	0.917225110132098	2.470375845307272e-05	0.9321467680221254	6.0738190069055526e-05	0.9339455412295224	0.0007170937989959	0.8484790402385607	4.468769866197165e-07	0.8953289627883569	9.738700788441528e-07	0.897092258799493	0.0002302928453614	0.8425894581513353	0.0007655681075529	0.8445881585709857	RUVBL1	32891	EEFSEC	33323	MGLL	134615	False	False	False	alt	-15	0.00296	-15	0.00867
2757	chr3	128194985	T	A	rs940062	0.00128265294	0.5297345217116418	0.00577736666	0.5324816258121154	0.0067823999909835	0.8087161892739636	9.877252544912332e-06	0.59160261550318	4.014106373366951e-05	0.5939291236909939	0.4095291444932001	0.3202874222037838	0.0005373677383874	0.420368128846005	0.0024118127669752	0.423047085754666	0.0027718767817486	0.4626272281869212	4.153710207448751e-06	0.4727139078320738	1.674720454186494e-05	0.475017848600312	0.0006016659923858	0.5397655822025794	0.0030830195333976	0.540271012706586	RUVBL1	41071	EEFSEC	41503	MGLL	142795	False	False	False	alt	15	0.0003967	20	0.01044
2758	chr3	128204967	G	A	rs2999058	0.0095778769119999	0.3817096198889049	0.0099660690879999	0.3909112214942554	0.0068328868180695	0.8148316356795361	6.475696631548954e-05	0.4663477847683311	6.756489738620238e-05	0.4746784695678104	0.2880320335273187	0.5117516243068152	0.0026958637258638	0.3864426320693668	0.0028167884538145	0.3955278016027903	0.0019660209194499	0.6068513436033695	1.816782541358071e-05	0.4462814211651561	1.9042516666834745e-05	0.4548364560151751	0.0076370086826626	0.2768058312787228	0.0079980082780941	0.2825061176819466	RUVBL1	51053	EEFSEC	51485	MGLL	152777	False	False	False	alt	-100	0.002563	-100	0.05536
2759	chr3	128206349	A	G	rs2955125	0.0553372493999999	0.0167082978582522	0.0553372493999999	0.0178019604379804	0.0145671735028866	0.0967573176564982	0.0008965172093028	0.0188141239232391	0.0008965172093028	0.0198339180093988	0.3552858432141412	0.4048177407727806	0.0199184582111395	0.0369243182155074	0.0199184582111395	0.0401906493440751	0.0053357640351757	0.1320250067363903	0.0003337728733037	0.0277634015363656	0.0003337728733037	0.02969085735411	0.0367016255355345	0.0115720293651135	0.0367016255355345	0.0119177280437255	RUVBL1	52435	EEFSEC	52867	MGLL	154159	False	True	False	alt	25	0.001183	45	0.0105
2760	chr3	128207673	A	G	rs2955127	0.0248272378	0.1320482868036545	0.0248272378	0.1395818026417536	0.0075421479052826	0.6595299634903339	0.0001902214672905	0.1812272564737622	0.0001902214672905	0.1893354297871277	0.4994802850651978	0.1752610826775222	0.0125392221268269	0.0879760766796734	0.0125392221268269	0.0950205908279646	0.0037579660054768	0.2933610191048517	9.589624509384767e-05	0.1229348007921984	9.589624509384767e-05	0.1306091861462978	0.007620411000114	0.2464865423722107	0.007620411000114	0.2541482551592605	RUVBL1	53759	EEFSEC	54191	MGLL	155483	False	False	False	alt	-70	0.00476	85	0.02888
2761	chr3	128209434	C	T	rs2955128	0.01034506746	0.341277509545161	0.01034506746	0.352965049178255	0.0094335170731158	0.3705339898262706	9.712382652408488e-05	0.3391362316786102	9.712382652408488e-05	0.3498454944250291	0.2345812715899541	0.5999426290564573	0.0025081223237574	0.3907874175604823	0.0025081223237574	0.4035183278103101	0.0022365853040844	0.5576789986091303	2.386517532546069e-05	0.3781801226356701	2.386517532546069e-05	0.3902833590353017	0.0089689727071857	0.2079997026483484	0.0089689727071857	0.2145909579639956	RUVBL1	55520	EEFSEC	55952	MGLL	157244	False	False	False	alt	100	0.0323	-70	0.0322
2762	chr3	128215931	C	A	rs4384971	-0.0146429562	0.2531245748585954	0.0146429562	0.2430338122051039	0.0080135854494516	0.5923262698993682	-0.0001177797871048	0.2932769106317344	0.0001177797871048	0.283637353226604	0.3434994138943349	0.4250254048074279	-0.0050391739276855	0.2475055476646492	0.0050391739276855	0.236766405837681	0.0027252557848903	0.4718971700879745	-4.015468570545297e-05	0.2728950622656559	4.015468570545297e-05	0.262512676506896	-0.0097366155250572	0.1993473828266936	0.0097366155250572	0.1933665243078216	RUVBL1	62017	EEFSEC	62449	MGLL	163741	False	False	False	ref	100	0.004288	-25	0.04538
2763	chr3	128225634	C	G	rs6775988	-0.0018939130799999	0.7823197410456771	0.00254659636	0.7725407497395308	0.0070196142952054	0.7693888830193083	-1.2715898559970506e-05	0.8195542200732051	1.745150683054763e-05	0.8097035272651709	0.3001421176568221	0.4921438133394738	-0.0005878507450179	0.674730229381424	0.0007512602335742	0.6644828169607282	0.0021066503924612	0.577084014983592	-3.9588588278122726e-06	0.7125492315052344	5.144492554410877e-06	0.7023403459606716	-0.0013236651832487	0.687354380676167	0.0018962852311745	0.6782805391004835	RUVBL1	71720	EEFSEC	72152	MGLL	173444	False	False	False	ref	-100	0.002132	85	0.04126
2764	chr3	128229217	A	G	rs4857877	0.00786762468	0.4176916330514416	0.00786762468	0.4301564303911765	0.0078063300981915	0.5981769391113337	6.227146113491588e-05	0.4513019658236238	6.227146113491588e-05	0.4633361898772744	0.3448313779188581	0.4231369380226065	0.0028177878265659	0.3598008473383207	0.0028177878265659	0.3726683594816297	0.0027028910603712	0.4635945522503723	2.232252681388357e-05	0.3823809549256435	2.232252681388357e-05	0.3947830539596605	0.0048527474351393	0.3687299503638773	0.0048527474351393	0.3786972589792057	RUVBL1	75303	EEFSEC	75735	MGLL	177027	False	False	False	alt	-100	0.007168	55	0.0205
2765	chr3	128339774	A	T	rs3849531	-0.0035096059999999	0.6797299746929758	0.0035096059999999	0.6661700402854531	0.0151727435938657	0.0771701017878062	-5.674206816583466e-05	0.526227185585247	5.674206816583466e-05	0.5140056041527978	0.3730246164379298	0.38002172141634	-0.001330022140335	0.5532170921415082	0.001330022140335	0.5394390739528038	0.0056743484283964	0.0974032908125383	-2.1543981721803107e-05	0.429933082483061	2.1543981721803107e-05	0.4174221094032028	-0.0021722217035446	0.6528250946706838	0.0021722217035446	0.6400117237214692	DNAJB8	127194	GATA2	153427	RUVBL1	185860	False	False	False	ref	10	0.00058	0	0.0
2766	chr3	135959783	A	G	rs1403770	-0.001077881256	0.846920459389227	0.001593618616	0.8457329728984234	0.0248093348289367	0.0098446835113012	-3.232984849363773e-05	0.6526450747135513	4.481221839503108e-05	0.6499096510676585	0.0749800309131836	0.8687992654409626	-0.0001305207427113	0.892515301476165	0.0001732267454269	0.8921580599945955	0.0019336231962585	0.6006711458484254	-4.004497531617726e-06	0.7800947421621558	5.026733635551002e-06	0.7783544039670998	-0.001041504579923	0.770532916743032	0.0013859064928058	0.768551500815401	PPP2R3A	5946	MSL2	237458	PCCB	290558	False	True	True	ref	50	0.002602	45	0.01402
2767	chr3	135965617	G	T	rs184442184	-0.0417925256	0.0465444067679259	0.0417925256	0.0436100198818085	0.0184520107184278	0.0357926596380609	-0.0007726723947468	0.0210958736106322	0.0007726723947468	0.0199601247590875	0.9059596053900972	0.0026038638252717	-0.0377695087432993	0.0081765319530073	0.0377695087432993	0.0076164451907704	0.016702874223527	0.0022096152289843	-0.0006976479485917	0.0074042763345246	0.0006976479485917	0.007037633172225	-0.0073486239483811	0.2739964590046578	0.0073486239483811	0.2660922972148403	PPP2R3A	112	MSL2	231624	PCCB	284724	True	False	False	ref	85	0.00586	90	0.1475
2768	chr3	135968499	G	A	rs9862763	-0.0491728704	0.029138454231905	0.0491728704	0.0272439005386195	0.0095273257867019	0.3445644702408643	-0.0004760537574815	0.0473822313904473	0.0004760537574815	0.0446248785914728	0.3718669280801667	0.3856550198401547	-0.0183402514755481	0.0530693670592461	0.0183402514755481	0.0490179484348336	0.0035447908377174	0.3196485172989995	-0.0001775964821928	0.0619344333983156	0.0001775964821928	0.0578329702558608	-0.0314069648025394	0.0214021440761821	0.0314069648025394	0.0208767741975735	PPP2R3A	2770	MSL2	228742	PCCB	281842	False	False	False	ref	60	0.0066	70	0.047
2769	chr3	135989606	T	C	rs9836374	-0.00314968897	0.7167482387323708	0.00314968897	0.7027937177919096	0.0068680099228972	0.8196362899802029	-2.2062158809302192e-05	0.7621841394221649	2.2062158809302192e-05	0.7484685181255977	0.2353177937530471	0.5988133673713844	-0.0007148173450025	0.6782585307551728	0.0007148173450025	0.6638838229362926	0.0016260775998862	0.6774655311225952	-5.043385580381142e-06	0.7154593673114796	5.043385580381142e-06	0.7012860208824565	-0.0026950487038246	0.5820526663847055	0.0026950487038246	0.5700759911524078	PPP2R3A	23877	MSL2	207635	PCCB	260735	False	False	False	ref	35	0.000595	100	0.01221
2770	chr3	135990140	G	A	rs34311570	-0.0409044572	0.0517960849612345	0.0409044572	0.0485402414859129	0.013000404154993	0.1272252781022838	-0.0005315791845196	0.0376930431972987	0.0005315791845196	0.0355115106061011	0.2635587506094461	0.549333302959172	-0.0112511802442502	0.1176921299905625	0.0112511802442502	0.1102691299101126	0.0034282796618727	0.3332135355695455	-0.0001462459837165	0.0828027654657149	0.0001462459837165	0.0776219058947698	-0.0352928972292243	0.0165347371879769	0.0352928972292243	0.0160674423392536	PPP2R3A	24411	MSL2	207101	PCCB	260201	False	False	False	ref	-100	0.001441	70	0.0231
2771	chr3	136012398	T	C	rs6809006	0.001306217667	0.724431493906259	0.003271316613	0.728791354271765	0.0110253875266254	0.2187381999731253	1.5057254743881654e-05	0.6667381554617825	3.670131334283077e-05	0.6699923383295485	0.1655162397950186	0.7158693123946188	0.0001902713462951	0.7430028215645722	0.0006212314157282	0.7440131565742777	0.001832711409243	0.6385231004307089	2.229889389003676e-06	0.703754371748542	6.976388953983585e-06	0.7048876817740798	0.0016099752072116	0.5560406458118285	0.0030788701127604	0.559730185689039	PPP2R3A	46669	MSL2	184843	PCCB	237943	False	False	False	alt	90	0.003056	-65	0.01407
2772	chr3	136021627	G	A	rs4073308	0.001046758746	0.8795916064297074	0.001046758746	0.8935420225965642	0.0164934513480812	0.0589006276290274	1.9075491686158384e-05	0.7759913478152147	1.9075491686158384e-05	0.78952549874039	0.1097998941897737	0.804975923370613	0.0001362848341477	0.8839921963506108	0.0001362848341477	0.8981017482815068	0.001857999919118	0.6207470922886914	2.5315465931912416e-06	0.819727555381033	2.5315465931912416e-06	0.8338803142172752	0.0010705505243829	0.7896797484255317	0.0010705505243829	0.8033739295579337	PPP2R3A	55898	MSL2	175614	PCCB	228714	False	False	False	alt	10	0.001312	-100	0.02332
2773	chr3	136032494	T	C	rs9877082	0.0221359439	0.1585899220685222	0.0221359439	0.1667934407953248	0.0165507638479217	0.0556053077242939	0.0003788061815226	0.0664563748789969	0.0003788061815226	0.0703695123496881	0.2713721096691874	0.5443470650465452	0.0061025555349541	0.2012620565590444	0.0061025555349541	0.2118952961187019	0.0045060591140944	0.1906158670357713	0.0001046105424791	0.1120172221493695	0.0001046105424791	0.119129444701558	0.0196661791097417	0.0786411377391841	0.0196661791097417	0.080877784252722	PPP2R3A	66765	MSL2	164747	PCCB	217847	False	False	False	alt	100	0.003906	-60	0.03497
2774	chr3	136043056	G	T	rs7643661	0.000887110274	0.8515420837291807	0.0013108934739999	0.8615734604587021	0.01330716032838	0.1207441503659803	1.089194575001674e-05	0.7784137736607598	1.7166621245379173e-05	0.7883413932827104	0.4897519683814147	0.1760594369843374	0.000446995462623	0.6635905802572504	0.0006674265603963	0.673989957329034	0.0065547266784662	0.0606878396890697	5.502542213595296e-06	0.5844340083977976	8.766318587711864e-06	0.5943489899235278	0.0002738617620514	0.9029315501041064	0.0004066432224399	0.9129778247469996	PPP2R3A	77327	MSL2	154185	PCCB	207285	False	False	False	alt	-100	0.00959	-100	0.01338
2775	chr3	136046467	A	G	rs9837355	-0.001343279486	0.8657374074149924	0.001582217086	0.8557179715794397	0.0225461690817063	0.0154551023749551	-2.799837736075368e-05	0.6636228667394672	3.429614094905021e-05	0.6538789811418042	0.1242149814832103	0.7805206190136906	-0.0001805456244543	0.8632427187588307	0.0002036315989413	0.852790697125268	0.0028018103413195	0.4431007435665188	-3.839479749461904e-06	0.7441732099335913	4.447965004095188e-06	0.7335175463787161	-0.0011327918339401	0.7608451087347783	0.0013444122864344	0.7509818742168514	PPP2R3A	80738	MSL2	150774	PCCB	203874	False	True	False	ref	-90	0.00795	10	0.003174
2776	chr3	136047322	G	A	rs9880721	-0.0063873236799999	0.5126871831824293	0.0063873236799999	0.4999321578694786	0.0071149074258687	0.7673637995101755	-4.451986556651414e-05	0.5815538393078804	4.451986556651414e-05	0.5688274558073139	0.1902426373717569	0.6744930344548966	-0.0012166895839168	0.5728532886893238	0.0012166895839168	0.5590980483325142	0.0013456496530753	0.7316422437749589	-8.471602341643967e-06	0.6169533301048165	8.471602341643967e-06	0.6034119966774549	-0.0059938381103537	0.3223630864797261	0.0059938381103537	0.3134810900048874	PPP2R3A	81593	MSL2	149919	PCCB	203019	False	False	False	ref	0	0.0	-95	0.1066
2777	chr3	136104082	C	T	rs34864445	-0.0027189769	0.7647923061547481	0.0027189769	0.7511403769805018	0.0059994432679757	0.9462964109905794	-1.634057703656352e-05	0.8320018079447382	1.634057703656352e-05	0.8182696246789327	0.2135727549040965	0.6351600609259255	-0.00058497955236	0.7239063054210876	0.00058497955236	0.7098411623353044	0.0012982803208883	0.7434143756006867	-3.559291214964301e-06	0.7808142806934243	3.559291214964301e-06	0.7666649738313598	-0.002431560493366	0.613357491618629	0.002431560493366	0.6010579529442116	MSL2	93159	PPP2R3A	138353	PCCB	146259	False	False	False	ref	65	0.0004692	25	0.01305
2778	chr3	136142824	G	T	rs9881400	-0.00382688318	0.6633116572153641	0.00382688318	0.6498502188707596	0.0068537711169051	0.8034680951466568	-2.6271865790584364e-05	0.7151659364834082	2.6271865790584364e-05	0.701845794388301	0.2354485005031172	0.6003317938348215	-0.0009414153097049	0.6231336044868419	0.0009414153097049	0.6089712849933177	0.001610984106836	0.6749394937674092	-6.4533491728606886e-06	0.663982077796017	6.4533491728606886e-06	0.6500624641339793	-0.0035913235614476	0.4878477519124226	0.0035913235614476	0.4767001404183722	MSL2	54417	PCCB	107517	PPP2R3A	177095	False	False	False	ref	-95	0.0011425	100	0.08765
2779	chr3	136189336	G	A	rs6769762	0.00470626118	0.5918337184658989	0.00470626118	0.6046408090633649	0.0178835953131144	0.0409766094930845	8.427795561543485e-05	0.3861764857228242	8.427795561543485e-05	0.3973366316344938	0.3700557059720536	0.3834435034876512	0.0017734535610293	0.4692071752287399	0.0017734535610293	0.4825325704866357	0.0066180208201875	0.0572916422968353	3.1793410245824615e-05	0.3183565208364844	3.1793410245824615e-05	0.3296736434493792	0.0028008589300718	0.5572724208888312	0.0028008589300718	0.5693782926939663	MSL2	7905	PCCB	61005	PPP2R3A	223607	False	False	False	alt	-100	0.0528	40	0.09766
2780	chr3	136215869	G	A	rs28631273	0.0018247153319999	0.7190931382252526	0.003145561628	0.7195805058126818	0.0076825325778076	0.6547800581259318	1.44216321784361e-05	0.737699830807767	2.451217201449597e-05	0.7382845309816426	0.0345688233280427	0.929830760659575	0.0001009832957108	0.902669603889609	0.0001359079495401	0.9001725646363813	0.000255797466712	0.9376140139199768	7.781688679765837e-07	0.9056799194587294	1.0413816425433382e-06	0.9042336515266204	0.0012780215562402	0.720626951376087	0.0017220095644145	0.7194714922377689	MSL2	18628	PCCB	34472	PPP2R3A	250140	False	False	False	alt	45	0.00299	-85	0.00839
2781	chr3	136234378	A	G	rs9826454	0.0124966332	0.2856012698010105	0.0124966332	0.2965149153126264	0.0105132467515031	0.2718880126046359	0.0001403515784327	0.2603349957767973	0.0001403515784327	0.2698176554601812	0.3713295781076566	0.3828144557614201	0.0045796040990414	0.250020670039689	0.0045796040990414	0.2611631472895462	0.0038742894995337	0.2763769637969468	5.100972896312707e-05	0.2258504677075644	5.100972896312707e-05	0.2358552020138373	0.0078237326113341	0.2604241736556066	0.0078237326113341	0.2681268759092859	PCCB	15963	MSL2	37137	PPP2R3A	268649	False	False	False	alt	-85	0.001289	-95	0.01782
2782	chr3	136234634	C	T	rs661739	-0.0318538284	0.0932684710402331	0.0318538284	0.0879898963203514	0.00933490829413	0.3918729309984381	-0.0003136103969874	0.1036986354489362	0.0003136103969874	0.0984418629815274	0.2587205261465367	0.5568892791770439	-0.0079846813218478	0.1671041871894374	0.0079846813218478	0.1578982501237366	0.0023815862791457	0.524079044271063	-7.699136631759795e-05	0.1671572911519866	7.699136631759795e-05	0.1586984948767456	-0.0287783068289089	0.0338382386164498	0.0287783068289089	0.0329688046063704	PCCB	15707	MSL2	37393	PPP2R3A	268905	False	False	False	ref	80	0.003593	15	0.003725
2783	chr3	136286083	C	T	rs1153877	0.00056389258	0.8881385973251121	0.0011705647959999	0.890132142688011	0.0203013666469367	0.0249556125323661	1.0654609310468806e-05	0.7465824002269166	2.335331387163881e-05	0.7488109565572433	0.1216298924262699	0.7876943560185452	7.178988683671028e-05	0.8806830179809965	0.0001461699577939	0.8826228225028546	0.0024182517662506	0.528106863655526	1.3388064189299829e-06	0.7926276281453902	2.866471177565941e-06	0.7943802946985176	0.0004419132978557	0.7970243716920042	0.0010601769727901	0.7991939087509817	PCCB	35742	MSL2	88842	PPP2R3A	320354	False	False	False	alt	70	0.001221	-100	0.03302
2784	chr3	136302583	C	T	rs146516051	0.0017370310399999	0.7294748087720488	0.0027511401999999	0.7387627083060727	0.0280220415438272	0.0057695987237451	5.548257170649631e-05	0.4050806774748471	8.032858671698506e-05	0.4129462934022372	0.2037365532837477	0.6512902420727004	0.0003167325818224	0.7022295522903299	0.0005367776126403	0.7113160816136838	0.005704296740383	0.0959964223086275	1.0174643868987238e-05	0.4688778326445776	1.556582112159767e-05	0.4776868316284862	0.0019647506716874	0.5583395539685	0.0027904853784789	0.5666972430265252	PCCB	52242	MSL2	105342	PPP2R3A	336854	False	True	True	alt	-80	0.000977	-95	0.03186
2785	chr3	136349853	A	T	rs480162	-0.001535891072	0.7300085633911073	0.003118230272	0.722865165871833	0.0181058278198865	0.0402770220205103	-3.559424481903782e-05	0.5191600618338813	5.804216074242715e-05	0.5124566053304156	0.2191972945777445	0.6265527155663311	-0.0002739318860474	0.6939149833754991	0.0006829478372264	0.6871385376159076	0.0039088044215694	0.2671670947562986	-6.719214626523781e-06	0.5485917630183531	1.252173507776306e-05	0.5418859827347393	-0.0018485668938474	0.5605084718493659	0.0029398645214161	0.5540213070783483	PCCB	99512	MSL2	152612	PPP2R3A	384124	False	False	False	ref	-70	0.005325	-95	0.02808
2786	chr3	136443779	A	C	rs35418151	-0.0034519354199999	0.6999391554873643	0.0034519354199999	0.6862899350226509	0.0194898158313188	0.0311067472932062	-6.273500309322006e-05	0.4699194205729705	6.273500309322006e-05	0.4582385757011257	0.0680027801118268	0.8751112363495254	-0.0002376301142862	0.8385384634668238	0.0002376301142862	0.824195025503826	0.0012792057672751	0.7371203393130613	-4.206139370619684e-06	0.7360029994378283	4.206139370619684e-06	0.7218241173258743	-0.0025830143466218	0.5910522038742194	0.0025830143466218	0.5788873133214032	PCCB	193438	MSL2	246538	STAG1	308624	False	False	False	ref	-100	0.002014	65	0.0221
2787	chr3	136446853	G	A	rs10804640	0.0106778984	0.3650675172830585	0.0106778984	0.3774620665557137	0.0067087369376374	0.8025669593691455	7.848097369168813e-05	0.4419310073231348	7.848097369168813e-05	0.454098028289602	0.1725640307472069	0.6963366734813943	0.0020696239485462	0.4760874689199294	0.0020696239485462	0.4901847263876966	0.0011611126581449	0.7574209281970833	1.5357657193352434e-05	0.5239458355506167	1.5357657193352434e-05	0.5377878639494432	0.00931129990975	0.2027231274647258	0.00931129990975	0.2081930490048892	PCCB	196512	MSL2	249612	STAG1	305550	False	False	False	alt	-40	0.001209	-85	0.0163
2788	chr3	136476946	A	T	rs1394094	4.713843699999994e-05	0.8580763834192237	0.001518304577	0.8557657338524606	0.014939477877997	0.0831216148470956	-1.0906592190275057e-06	0.7486877762892437	2.4583464755654912e-05	0.746414012436204	0.1031670453012997	0.8185688937309479	1.0719435424628272e-05	0.8863097603424649	0.0001739449565351	0.8839142080537152	0.0015639152228151	0.6897262325846112	-4.453892284036564e-08	0.8285652693328538	2.8227894192615605e-06	0.8259705520034457	-0.0001058102262471	0.754731246216482	0.0014128777269473	0.7525094103419079	PCCB	226605	STAG1	275457	MSL2	279705	False	False	False	alt	-40	0.001892	-80	0.01358
2789	chr3	136494468	T	C	rs73226190	0.0392362326	0.0522538316526934	0.0392362326	0.055987649052233	0.00808258612234	0.5484814469601511	0.0003287092130644	0.0871715822303347	0.0003287092130644	0.0922290444298619	0.1477214493926285	0.7428102006512957	0.0058697749273854	0.2109287808067049	0.0058697749273854	0.2214774419036789	0.0011834208675653	0.7648563136175635	4.836488546824991e-05	0.2367296466849602	4.836488546824991e-05	0.2469172481025247	0.0353157190427286	0.01477679141631	0.0353157190427286	0.01510804478437	PCCB	244127	STAG1	257935	MSL2	297227	False	False	False	alt	-95	0.0475	-90	0.0147
2790	chr3	136526973	G	A	rs1070228	0.00745512822	0.4425669309656889	0.00745512822	0.455048356448989	0.0065094384174819	0.8735065142617926	4.925945144541884e-05	0.5397135373251426	4.925945144541884e-05	0.5520591561463101	0.2516727351943484	0.5768055812406493	0.0018510820485876	0.4521699243214475	0.0018510820485876	0.4653833746989277	0.0016486885094366	0.6749435444646715	1.2276354896025986e-05	0.5193634776015592	1.2276354896025986e-05	0.5323252911193527	0.0068009004242782	0.2931769809582893	0.0068009004242782	0.3016335452420209	STAG1	225430	PCCB	276632	SLC35G2	291675	False	False	False	alt	-75	0.001968	-60	0.02798
2791	chr3	136789166	C	A	rs1280622	-0.0654484643999999	0.0109238179622823	0.0654484643999999	0.0102831905899874	0.0159937234616558	0.0649874379544056	-0.0011182385787357	0.0129568778945339	0.0011182385787357	0.0123837588880779	0.2332327098828825	0.5986801836029032	-0.0160176128381285	0.0679971948794636	0.0160176128381285	0.063280273224432	0.0039635610009113	0.2210013750151593	-0.0002851909892367	0.0378981038520779	0.0002851909892367	0.0356015808715478	-0.0593491633730639	0.0020999286952619	0.0593491633730639	0.002021821057495	SLC35G2	29482	STAG1	36763	NCK1	73043	False	True	False	ref	-75	0.006897	-20	0.01076
2792	chr3	136791759	G	T	rs56695781	-0.0686241672	0.0085890024354848	0.0686241672	0.0081289413933647	0.0191695727830267	0.0308831662392733	-0.001311661536298	0.0074766241976586	0.001311661536298	0.0071848358779934	0.4179317212834158	0.3069576267414621	-0.0286670214430769	0.0184195497773341	0.0286670214430769	0.0169538461018474	0.0079470780304742	0.0296883837988548	-0.0005435202238557	0.0101975993794137	0.0005435202238557	0.0096189403294916	-0.0361103330947416	0.0131268081231793	0.0361103330947416	0.0127540118499525	SLC35G2	26889	STAG1	39356	NCK1	70450	False	True	True	ref	100	0.015175	-30	0.04993
2793	chr3	136794440	T	C	rs4420814	0.0088363824	0.3813266516986351	0.0088363824	0.3932828155067404	0.009460215118233	0.3582965881767556	8.393287729429177e-05	0.3712298633042891	8.393287729429177e-05	0.3822360626904272	0.1359516177553708	0.7590927110985066	0.0012674264855833	0.5372430942029172	0.0012674264855833	0.5509614156800063	0.0012900129303004	0.733612226525524	1.206109634713108e-05	0.5204426168689406	1.206109634713108e-05	0.5336125584856302	0.0085498812228342	0.2283454386642376	0.0085498812228342	0.2354742437362963	SLC35G2	24208	STAG1	42037	NCK1	67769	False	False	False	alt	-100	0.00586	-20	0.03592
2794	chr3	142964032	G	T	rs149346914	-0.0405722834	0.0530835179859536	0.0405722834	0.0498580768844309	0.0287687221657628	0.0046946506743847	-0.0011812489050282	0.0097177831031348	0.0011812489050282	0.0092461995524654	0.9035404931586428	0.0026673833597617	-0.0366983640717602	0.0092750619133531	0.0366983640717602	0.0086345092709451	0.0259795761238002	0.0006267984555697	-0.0010679742466326	0.0037083890404571	0.0010679742466326	0.0035274067583561	-0.0071287046546125	0.2797942227056746	0.0071287046546125	0.2717649613214538	PAQR9	358	U2SURP	466	PCOLCE2	74826	False	True	True	ref	-30	0.00461	15	0.0105
2795	chr3	143003051	G	T	rs4683442	0.006405266672	0.4831390082091409	0.006405266672	0.4957869955726023	0.0262054643296288	0.0077907981900481	0.0001757068808925	0.2144622312585003	0.0001757068808925	0.2234860488734787	0.4473739354142678	0.2527069989822801	0.0029780166376128	0.3664797528577547	0.0029780166376128	0.3790194607332952	0.0117719418185281	0.0074883826085002	8.187677836763002e-05	0.1650069132656002	8.187677836763002e-05	0.1740370737805965	0.002634882104586	0.571199471914166	0.002634882104586	0.5834250070942426	U2SURP	38553	PAQR9	39377	PCOLCE2	113845	False	True	True	alt	45	0.000717	-100	0.0935
2796	chr3	143030201	G	A	rs3886152	-0.00793657032	0.4728451788510685	0.00793657032	0.4606527191179497	0.0085624071661257	0.4885479932336598	-6.882645011672506e-05	0.4879804611252392	6.882645011672506e-05	0.4762917280907444	0.1892467764188424	0.6734954784285627	-0.0015387178337469	0.5449497314142274	0.0015387178337469	0.5316761149120787	0.0016274443733569	0.6750983543157385	-1.3389821300465872e-05	0.5509471834045746	1.3389821300465872e-05	0.5378785219081192	-0.0072801585078682	0.3034683556306952	0.0072801585078682	0.2955670761571333	U2SURP	65703	PAQR9	66527	CHST2	89571	False	False	False	ref	100	0.003557	70	0.03854
2797	chr3	143073506	T	C	rs4683725	0.0308555186	0.0851877262306638	0.0308555186	0.0907637271475517	0.0096299103804468	0.3332460843149046	0.0003001593054728	0.0899888782834579	0.0003001593054728	0.0952230249564402	0.4738223425554206	0.2152287689344097	0.0146024654796918	0.0663805293596015	0.0146024654796918	0.0719357393222596	0.0045625296346588	0.1798779315694746	0.0001420456182844	0.0718193917179865	0.0001420456182844	0.0770768534782831	0.0115644353157189	0.1534619032360467	0.0115644353157189	0.1583743619248941	CHST2	46266	U2SURP	109008	PAQR9	109832	False	False	False	alt	100	0.01431	100	0.0409
2798	chr3	143073800	A	G	rs9289654	0.0411451747999999	0.0444090687627432	0.0411451747999999	0.0474015688952149	0.0246300766840088	0.0109856808539715	0.0010370918111249	0.0116618424071484	0.0010370918111249	0.0122018518205447	0.5027728503407711	0.1693070720945283	0.0208536605347378	0.0352506062792959	0.0208536605347378	0.0384319253741318	0.0123909022971752	0.0063416686265343	0.0005255069164981	0.0108215382907048	0.0005255069164981	0.0115390288455967	0.0130437037728606	0.1342594782037414	0.0130437037728606	0.1385365099436342	CHST2	45972	U2SURP	109302	PAQR9	110126	False	True	False	alt	40	0.000977	-100	0.05127
2799	chr3	143081405	G	C	rs750869	-0.0024653581	0.6683080797993468	0.00393078646	0.6629659530224552	0.0075008410869804	0.6857901821267125	-1.9238173445273407e-05	0.6951615602443546	3.01280005543396e-05	0.6904082941584495	0.2424672455108455	0.5860343368232571	-0.000716844650233	0.6299593933838944	0.0010482705872067	0.6246946157213829	0.0018556653973762	0.6288262435445874	-5.60083564889585e-06	0.650668684918597	8.122368574156373e-06	0.6456153857916008	-0.0022967043226589	0.5319983951103038	0.0034170478946876	0.5276343622075423	CHST2	38367	U2SURP	116907	PAQR9	117731	False	False	False	ref	35	0.001734	70	0.02115
2800	chr3	143081550	A	G	rs10804685	0.00596953186	0.5024862960059169	0.00596953186	0.5155716326988566	0.0076575248331949	0.6418854928130426	4.543419554802456e-05	0.5456212157856889	4.543419554802456e-05	0.5583433263130474	0.3152667558792102	0.4693501334154983	0.0017916628282858	0.4530549563654493	0.0017916628282858	0.4666077411959634	0.0024341962948165	0.5220571815154107	1.3731352743612788e-05	0.4833137626229413	1.3731352743612788e-05	0.4964795742781722	0.0044129088476021	0.4001934583838515	0.0044129088476021	0.4104483118797034	CHST2	38222	U2SURP	117052	PAQR9	117876	False	False	False	alt	100	0.02448	-75	0.0317
2801	chr3	143097702	G	C	rs8179934	-0.00325225034	0.7149310646229468	0.00325225034	0.7014332478738063	0.0057723320875222	0.928316252997412	-1.8859289158437737e-05	0.7994907829265464	1.8859289158437737e-05	0.7858307445073346	0.1926928702579901	0.6715258770756991	-0.0006446148238991	0.699988093648477	0.0006446148238991	0.6860852129044787	0.0011022812170095	0.7764911626123264	-3.714731216284374e-06	0.7663586286362629	3.714731216284374e-06	0.7524106014341876	-0.0032925652755733	0.5283917539618186	0.0032925652755733	0.5165886473828006	CHST2	22070	U2SURP	133204	PAQR9	134028	False	False	False	ref	75	0.000882	-100	0.0951
2802	chr3	161757749	C	A	rs9832859	-0.00240077888	0.800765377488287	0.00240077888	0.7869892359757832	0.0187458165010933	0.0343525415845915	-4.44542295062732e-05	0.5954584776653271	4.44542295062732e-05	0.5827236633548069	0.102555005757321	0.8165397498351661	-0.0002363419047189	0.8524020935891958	0.0002363419047189	0.8383222622496925	0.0019846391523713	0.5717012446270477	-4.538455183681693e-06	0.7483664609535732	4.538455183681693e-06	0.734585509688309	-0.0017987738462017	0.7007261024615782	0.0017987738462017	0.687595270634649	OTOL1	260940	SPTSSB	384869	B3GALNT1	652338	False	False	False	ref	40	0.01744	35	0.015366
2803	chr3	161760357	G	A	rs514816	-0.0054805956	0.5680724798293544	0.0054805956	0.5548428297972784	0.0083517922870103	0.5324985111149256	-4.604923023831864e-05	0.5773401046428779	4.604923023831864e-05	0.5646984736392294	0.0588865029720225	0.8923870029373989	-0.000321518553464	0.8106737558651558	0.000321518553464	0.7960702987455565	0.0004927665351625	0.8960933506867441	-2.7251709751310453e-06	0.8135504142564165	2.7251709751310453e-06	0.7989732535278691	-0.0035228581209348	0.4942787685024231	0.0035228581209348	0.4829900593561512	OTOL1	263548	SPTSSB	387477	B3GALNT1	654946	False	False	False	ref	70	0.001045	-25	0.00776
2804	chr3	161767619	G	A	rs308693	-0.0359749444	0.0710878286313735	0.0359749444	0.0666869536484811	0.009137982738646	0.3964453716104527	-0.0003379807381154	0.0845714565392939	0.0003379807381154	0.0799950944524096	0.056674861772425	0.8980337534374975	-0.002136993541086	0.4468910956488747	0.002136993541086	0.4338668643857085	0.0005293434653561	0.8883124766194452	-2.049652694521921e-05	0.4350513444145193	2.049652694521921e-05	0.4226397965882217	-0.0221537567817093	0.0610689906773007	0.0221537567817093	0.0594335943073241	OTOL1	270810	SPTSSB	394739	B3GALNT1	662208	False	False	False	ref	-55	0.0739	-55	0.0798
2805	chr3	161770560	A	T	rs308698	0.0122770904799999	0.2909526555249173	0.0122770904799999	0.3017829393533627	0.0126576023511158	0.1405135130581664	0.0001561071242618	0.2229583934237335	0.0001561071242618	0.231660269918871	0.2080975943733856	0.6426394767424772	0.0025979767349551	0.380963998211122	0.0025979767349551	0.3936089440754193	0.0025861277014174	0.4949353453651451	3.234018254703366e-05	0.3068777487337779	3.234018254703366e-05	0.3180958137809697	0.0113154700774903	0.1603762445933175	0.0113154700774903	0.1655197436965708	OTOL1	273751	SPTSSB	397680	B3GALNT1	665149	False	False	False	alt	-10	0.0002339	-100	0.003296
2806	chr3	161770581	G	A	rs308699	-0.00856144816	0.4120593389620945	0.00856144816	0.4000399036062648	0.0085392233079537	0.4866317291121541	-7.301061958514242e-05	0.4271218857476769	7.301061958514242e-05	0.4158084492285983	0.1961887571447836	0.6609652426169127	-0.00179166398068	0.4926112978478335	0.00179166398068	0.4790071619399927	0.001687454884636	0.6573188613206773	-1.5410498674690584e-05	0.4962278691391202	1.5410498674690584e-05	0.4830826565296966	-0.0078361808732455	0.2461049761560385	0.0078361808732455	0.2392024357981936	OTOL1	273772	SPTSSB	397701	B3GALNT1	665170	False	False	False	ref	-20	0.00349	-20	0.007202
2807	chr3	161964926	A	G	rs9865618	0.000808455408	0.8667098432818815	0.001421265816	0.8691251105891529	0.0069263432956821	0.8005314241364444	6.406275060859367e-06	0.8823653490355547	1.0417358304374294e-05	0.886258197938867	0.1255884397141048	0.7831100494177968	0.0001696330429437	0.8624456016467574	0.0002127009112631	0.8650754270053514	0.000893348076615	0.8246553138782997	1.3028079280997117e-06	0.8786659166711097	1.5843700637200506e-06	0.8811920079772064	0.0008402576790215	0.7605899871012911	0.0013257398935672	0.7633937130728269	OTOL1	468117	SPTSSB	592046	B3GALNT1	859515	False	False	False	alt	-20	0.001282	10	0.00537
2808	chr3	161988675	C	A	rs4586823	-0.00565872004	0.561754812597005	0.00565872004	0.5487541890788041	0.0115604281664221	0.195519204383087	-6.511678149598631e-05	0.4778279915533214	6.511678149598631e-05	0.4661653680193735	0.2528905901513501	0.5634413118082539	-0.0014593787850019	0.5469569553784379	0.0014593787850019	0.5334281785084927	0.0030425643935293	0.3922343748013454	-1.7515043528575066e-05	0.4858679235714042	1.7515043528575066e-05	0.4733024862198404	-0.0045851098040435	0.4132262039636973	0.0045851098040435	0.4028488171378277	OTOL1	491866	SPTSSB	615795	B3GALNT1	883264	False	False	False	ref	-90	0.0308	-30	0.02325
2809	chr3	162001353	G	A	rs7615033	-0.0321950491999999	0.0937974448822292	0.0321950491999999	0.0882355796905199	0.0085307859246563	0.4935958780302074	-0.0002796762099311	0.1199521522517683	0.0002796762099311	0.1140112170125988	0.2339256631292855	0.6007357759689596	-0.0077970131348955	0.1794386948809199	0.0077970131348955	0.1697367407885504	0.0020013799712329	0.6069317332648896	-6.773297952344782e-05	0.1944575117004714	6.773297952344782e-05	0.1852604945100101	-0.0284795485430346	0.0287908759887986	0.0284795485430346	0.0281072092392506	OTOL1	504544	SPTSSB	628473	B3GALNT1	895942	False	False	False	ref	100	0.004974	-100	0.01298
2810	chr3	162001354	T	A	rs7626556	-0.0022070412839999	0.8206590680056413	0.0022070412839999	0.8067717905867674	0.0069591096551915	0.779604294142394	-1.4506344291443282e-05	0.8640699845766646	1.4506344291443282e-05	0.8502633435291581	0.2342119731532484	0.6002239457080931	-0.0005013722419857	0.7912263971426475	0.0005013722419857	0.7771385371986457	0.001661710949022	0.6685061145026444	-3.326643655514928e-06	0.824128738033653	3.326643655514928e-06	0.8101384707683713	-0.0019771989335988	0.7055055710727317	0.0019771989335988	0.6926320674966882	OTOL1	504545	SPTSSB	628474	B3GALNT1	895943	False	False	False	ref	100	0.0055	-100	0.01166
2811	chr3	162017708	A	G	rs1912454	0.00615430078	0.5174485528921735	0.00615430078	0.5302635471039684	0.0186582186788983	0.0367543655453653	0.0001051441635912	0.3144824828246381	0.0001051441635912	0.3246060258452989	0.1341984875361777	0.7664184609285082	0.0008359270196744	0.6373982219717006	0.0008359270196744	0.6514838838302512	0.0025477254366881	0.4895563132313543	1.4444438451187067e-05	0.4884758616323207	1.4444438451187067e-05	0.501475739516061	0.0053278560980922	0.3534697627048345	0.0053278560980922	0.3631463995416827	OTOL1	520899	SPTSSB	644828	B3GALNT1	912297	False	False	False	alt	5	0.002983	-100	0.05505
2812	chr3	162030893	T	G	rs28532919	-0.00980592346	0.36967144443644	0.00980592346	0.3581406130029042	0.009393481063773	0.3726902582908618	-9.14825419681266e-05	0.363845092300217	9.14825419681266e-05	0.3532510317942541	0.1825371632485813	0.6842026029289459	-0.0017771574990986	0.4833891674560744	0.0017771574990986	0.4700183239589397	0.001715732047637	0.6573309951495406	-1.6611787599869174e-05	0.4676876606937812	1.6611787599869174e-05	0.4549058852943931	-0.0091785184493614	0.2178018401242587	0.0091785184493614	0.2111030497797578	OTOL1	534084	SPTSSB	658013	B3GALNT1	925482	False	False	False	ref	60	0.00139	95	0.0864
2813	chr3	162032242	T	G	rs62280491	0.0103222904	0.3361724911778183	0.0103222904	0.3476400378435544	0.0081466972263737	0.5539408619829231	8.715528004983135e-05	0.3741625221580719	8.715528004983135e-05	0.3850923706706346	0.1929293872343073	0.6688346310125727	0.0020824145325833	0.434729496673827	0.0020824145325833	0.4476795878039877	0.0016284031060807	0.6790801041376502	1.8151715321020742e-05	0.4511184658115869	1.8151715321020742e-05	0.4635326956703	0.0096536271123144	0.1899478312350554	0.0096536271123144	0.1961738023663974	OTOL1	535433	SPTSSB	659362	B3GALNT1	926831	False	False	False	alt	-80	0.02121	-25	0.00806
2814	chr3	162033487	A	G	rs56315604	0.0169104784	0.2116967579479951	0.0169104784	0.2215052957962512	0.0067501886179775	0.8380081193539354	0.0001182273982793	0.290073498116653	0.0001182273982793	0.3000752134393627	0.1482878453095986	0.7418495221897252	0.002666108516731	0.3734241057161669	0.002666108516731	0.3861281888176953	0.0010248943943127	0.794522948866497	1.9110217824204347e-05	0.4326511987837599	1.9110217824204347e-05	0.4452401491955677	0.0166412514652641	0.0994075550082733	0.0166412514652641	0.1025231852199569	OTOL1	536678	SPTSSB	660607	B3GALNT1	928076	False	False	False	alt	95	0.008095	-45	0.03622
2815	chr3	162040151	G	T	rs1397242	-0.0033796671	0.578722234475497	0.00479794918	0.5694424212901363	0.0072684074811599	0.6878435790065662	-2.6784201920169217e-05	0.6178970960055048	3.6404943417474695e-05	0.6087930416406926	0.0215624643409163	0.9606560566952238	-4.817873100221515e-05	0.916113463748626	9.586234036465516e-05	0.90703437997183	0.0001553652947427	0.965697909784706	-4.0388838873811867e-07	0.9228679506364628	7.273442668360975e-07	0.9137318434723434	-0.0008527059409329	0.7303078702346343	0.0015332109254245	0.7218042874898305	OTOL1	543342	SPTSSB	667271	B3GALNT1	934740	False	False	False	ref	-10	0.001806	-25	0.009186
2816	chr3	162043735	A	C	rs13100661	-0.00527406586	0.5722013097352533	0.00527406586	0.5593238314074479	0.0288927102338607	0.0047689795109244	-0.0001538377175271	0.2380232412035134	0.0001538377175271	0.2290859438084937	0.1848629135157003	0.6785076286435194	-0.0009593619687046	0.6205218727671507	0.0009593619687046	0.6068368210801702	0.0054074567501297	0.122079863687552	-2.836897341906993e-05	0.3599181080862613	2.836897341906993e-05	0.3482938738806502	-0.0049668565026607	0.3915965428064161	0.0049668565026607	0.3816067328668226	OTOL1	546926	SPTSSB	670855	B3GALNT1	938324	False	True	True	ref	50	0.004623	-55	0.02559
2817	chr3	162044696	T	C	rs6791872	0.05170954	0.0252610098882291	0.05170954	0.0269922144237743	0.0142325787895068	0.105175674560704	0.0008078616107075	0.0238755485592281	0.0008078616107075	0.0252153299510799	0.5188871253851182	0.1438483077503371	0.0271468843230116	0.0199450502869871	0.0271468843230116	0.0217767114007302	0.0074496756958573	0.0431483444778823	0.0004270170388396	0.0192528310935596	0.0004270170388396	0.0206523742900689	0.0147449662340895	0.1104302129577046	0.0147449662340895	0.1138772982326965	OTOL1	547887	SPTSSB	671816	B3GALNT1	939285	False	False	False	alt	-75	0.000824	15	0.01978
2818	chr3	162044770	G	A	rs6779000	0.0008566122	0.6941039398588067	0.00326818616	0.6945112853010534	0.0080464827204262	0.5648085044325656	1.0715000383057184e-05	0.706925066365202	2.6769233936705447e-05	0.7080071104957121	0.5007769790143051	0.1726368951232121	0.0004902878754942	0.4842850600031322	0.0016574952367334	0.4847684361879465	0.0040485745685348	0.2484085936166575	5.902251699796978e-06	0.5035671919198028	1.3656674790598005e-05	0.5045531073134133	0.0001825745080342	0.8116243238938106	0.0009502173259058	0.812131671126136	OTOL1	547961	SPTSSB	671890	B3GALNT1	939359	False	False	False	alt	-95	0.011185	-50	0.09753
2819	chr3	162046589	A	C	rs35298688	-0.0071188252	0.4829100164932132	0.0071188252	0.4704711653831748	0.0186830132242643	0.0357334398384439	-0.000139725539381	0.2799489451207632	0.000139725539381	0.2703462505807824	0.4251351155094969	0.293596220862064	-0.003084018223003	0.3674799543283104	0.003084018223003	0.3550285032143901	0.0079998638484348	0.0300442012966283	-6.106025110124115e-05	0.2174897720117334	6.106025110124115e-05	0.2076590343695994	-0.0032448469382462	0.5355224769455421	0.0032448469382462	0.5236353047212394	OTOL1	549780	SPTSSB	673709	B3GALNT1	941178	False	False	False	ref	-60	0.005196	-100	0.1373
2820	chr3	162051464	C	G	rs6800277	0.0550001694	0.0192063699153559	0.0550001694	0.0206591820785952	0.0116916016845191	0.1873214655057892	0.0006713254583534	0.0248670641400778	0.0006713254583534	0.0264997838891379	0.4331268996566354	0.28181391460402	0.0241790686621535	0.0257582939932167	0.0241790686621535	0.0281159504164866	0.0051156367673195	0.1345059293178227	0.0002968350877224	0.0277406948339744	0.0002968350877224	0.0299774324006737	0.0271662569113787	0.0364551894477883	0.0271662569113787	0.0374679763743359	OTOL1	554655	SPTSSB	678584	B3GALNT1	946053	False	False	False	alt	-100	0.00801	60	0.0409
2821	chr3	162052502	G	A	rs12637049	-0.0844870192	0.0041057225682583	0.0844870192	0.0039310455846418	0.0186972376782119	0.0344144804066375	-0.0016097655785156	0.0059083679605833	0.0016097655785156	0.0056712232334716	0.4574279816180666	0.2429599123060192	-0.0385725330016936	0.0074447346053429	0.0385725330016936	0.0068981058682771	0.0085267250610439	0.0242860682104588	-0.0007326295003225	0.0067879884791933	0.0007326295003225	0.0063919412679268	-0.0382244629093662	0.0119494220040919	0.0382244629093662	0.0116208085148059	OTOL1	555693	SPTSSB	679622	B3GALNT1	947091	False	True	True	ref	-80	0.00499	-80	0.0348
2822	chr3	162053790	A	T	rs61342226	-0.007378335	0.4553583489803226	0.007378335	0.4429730357171262	0.0099137386963488	0.3130853592652044	-7.374423589464184e-05	0.4175543309727246	7.374423589464184e-05	0.4063449899141123	0.0242658118860153	0.9574626005086244	-0.000170690746486	0.879953877211216	0.000170690746486	0.8657641489311914	0.0002358535755512	0.9520928142811532	-1.6735744697778782e-06	0.8663161132812203	1.6735744697778782e-06	0.8520191954441219	-0.0025747155053475	0.5990146244026644	0.0025747155053475	0.5866606386069578	OTOL1	556981	SPTSSB	680910	B3GALNT1	948379	False	False	False	ref	-95	0.001888	15	0.003662
2823	chr3	162053854	C	T	rs34809784	0.0007422221799999	0.689669910039494	0.00329174014	0.6898640039576189	0.0067901650992011	0.8176899722460594	7.189516932175994e-06	0.7353542088745051	2.414560030503573e-05	0.7351929247764549	0.025556281704167	0.9550332076638758	2.251728187025722e-05	0.92018293803726	9.617545813125908e-05	0.9185692984119131	0.0001817396059862	0.9634544771405404	2.386692412811491e-07	0.9297280503621448	7.397276319982967e-07	0.928176117384914	0.0002012469009014	0.7508932273051344	0.0014087283063102	0.7498594036014112	OTOL1	557045	SPTSSB	680974	B3GALNT1	948443	False	False	False	alt	-30	0.006645	-50	0.01111
2824	chr3	162055731	A	C	rs13098556	0.0003326418819999	0.8631771184712542	0.001602491998	0.8557696977226408	0.0227106490273242	0.0151001094089609	1.046275898429079e-06	0.699502412203819	3.1899656438616755e-05	0.6928625992432407	0.032523158953931	0.9403621919768576	1.2366233086339762e-06	0.9603512203912854	4.6098366977326014e-05	0.9516258459797754	0.0007596313354845	0.8415150468103175	-1.5205306712537297e-07	0.9139875714220111	9.57938070608335e-07	0.905293464452834	-3.527007541569997e-05	0.8880967138361049	0.0006037407027043	0.8797537475552287	OTOL1	558922	SPTSSB	682851	B3GALNT1	950320	False	True	False	alt	100	0.0404	100	0.01581
2825	chr3	162058404	T	A	rs12629678	-0.01120959766	0.3428880421357347	0.01120959766	0.3314758827028563	0.0128760822194208	0.1378886409214219	-0.000150749930197	0.2618826873071587	0.000150749930197	0.2526031715838335	0.0948744281579683	0.8343447242739894	-0.0011117588711236	0.5997933787708215	0.0011117588711236	0.5862287348529444	0.0012765026534169	0.7479997918030196	-1.5569160519021787e-05	0.511001876750165	1.5569160519021787e-05	0.4983228872492037	-0.00955819043766	0.2183825163648083	0.00955819043766	0.2117592789699779	OTOL1	561595	SPTSSB	685524	B3GALNT1	952993	False	False	False	ref	-35	0.01811	-60	0.0516
2826	chr3	162059288	G	A	rs13090291	-0.081732095	0.0053922002439261	0.081732095	0.0051211242528201	0.020547123619003	0.0231617464187221	-0.0017130812447573	0.0054864872603051	0.0017130812447573	0.00525532913643	0.2660608512536436	0.543268576593799	-0.0217755905647302	0.038068291107062	0.0217755905647302	0.0352302883443587	0.0056589753738156	0.0976232863166715	-0.0004758013479833	0.0164351106791132	0.0004758013479833	0.0153082234592989	-0.0730464008962748	0.0010690720562782	0.0730464008962748	0.0010402652208627	OTOL1	562479	SPTSSB	686408	B3GALNT1	953877	False	True	True	ref	-35	0.002903	90	0.01978
2827	chr3	162059363	G	A	rs1119975	0.0122956864	0.2918641543089984	0.0122956864	0.3030164227229276	0.0071880906017887	0.7489336695105941	8.704975991164614e-05	0.3650673952267395	8.704975991164614e-05	0.3760661379069818	0.2770983101484455	0.524577571761914	0.0034117247879415	0.3153710600523978	0.0034117247879415	0.3277195532450722	0.001958977360481	0.6083868444260978	2.38866028460502e-05	0.3668589673459574	2.38866028460502e-05	0.3788736518294437	0.009771885600473	0.1970332973244092	0.009771885600473	0.2031196134479752	OTOL1	562554	SPTSSB	686483	B3GALNT1	953952	False	False	False	alt	-100	0.000807	10	0.01474
2828	chr3	162061881	A	G	rs35626895	0.00331577384	0.6464436628452711	0.0037413126	0.6568033544391249	0.0057086845341193	0.9475747826354468	1.9706739203732524e-05	0.7354036418177241	2.200256057231988e-05	0.745239622229764	0.1291569414620483	0.7705912030186293	0.0003295257410583	0.7390245007076233	0.0003992812704145	0.7493641019367417	0.0007319290883118	0.8424290421696657	1.9801209921308948e-06	0.7893558155688095	2.35645860213118e-06	0.7994466523847256	0.002877623211859	0.4999227138824945	0.003284266434299	0.5085456676673794	OTOL1	565072	SPTSSB	689001	B3GALNT1	956470	False	False	False	alt	-100	0.0515	-80	0.03043
2829	chr3	162062409	C	T	rs871932	-0.0002914513734	0.809185611587838	0.0021074921466	0.8114929740515373	0.0167301025193249	0.055459219663143	-1.1427644561939854e-05	0.6775038571563861	3.744714622574037e-05	0.6790541426393939	0.2113548895735432	0.6362942978993886	1.650706509084142e-05	0.7801954920807439	0.0005052981288076	0.7830322073153357	0.0035456135886338	0.3066502749881539	-1.465711890272805e-06	0.6810634068102367	8.900855672690068e-06	0.6834143786757463	-0.0003029077065114	0.688508207326514	0.0019460782788202	0.6901731257409403	OTOL1	565600	SPTSSB	689529	B3GALNT1	956998	False	False	False	ref	-100	0.002258	-95	0.02225
2830	chr3	162063361	C	T	rs6804840	-0.001329941286	0.768203409085678	0.002409940846	0.7620310469495107	0.0062835944644258	0.8647159132279902	-9.322952976551214e-06	0.8083417401921018	1.6001077454086755e-05	0.8024854833883796	0.1254494341227606	0.7814086088121074	-5.214248028914215e-05	0.8288982070546732	0.0002414916857537	0.8237202565117103	0.0007717885484903	0.8455543480279882	-4.302223741403623e-07	0.8558852772019282	1.5882254266275625e-06	0.8506089969114663	-0.0011016711791616	0.6533538780273862	0.0020228425606074	0.6480677267505683	OTOL1	566552	SPTSSB	690481	B3GALNT1	957950	False	False	False	ref	5	0.000145	90	0.03464
2831	chr3	162065913	A	G	rs35797074	-0.0045386800599999	0.6111718072197574	0.0045386800599999	0.5980184818064346	0.008115704170827	0.5550993697811323	-3.63938234168028e-05	0.6322203596672066	3.63938234168028e-05	0.6195307851003184	0.02649612547848	0.9524946469953413	-0.0001449878994745	0.8970958138085696	0.0001449878994745	0.8828484287844939	0.0002105548547605	0.95542208456822	-1.1407020678087982e-06	0.9034190798872768	1.1407020678087982e-06	0.8890906509981439	-0.0021099803939874	0.6658690555852003	0.0021099803939874	0.6528073307609874	OTOL1	569104	SPTSSB	693033	B3GALNT1	960502	False	False	False	ref	-55	0.001175	-95	0.03198
2832	chr3	162072290	A	T	rs12638648	0.00502151938	0.5203457347330102	0.0070630060599999	0.5274443061325461	0.007690748789284	0.649413906302763	4.117542295826228e-05	0.5530974148356782	5.6217987374994165e-05	0.5594641196747832	0.2925569767321237	0.5080389529757642	0.0015064804650168	0.4879058577119266	0.0020418669186915	0.4950677561459502	0.0022666227939672	0.55970193011404	1.240241878674457e-05	0.5136350736012769	1.6371718458392104e-05	0.5202641698356261	0.0032054274421933	0.3913747857683172	0.005047770205085	0.3945217974888029	OTOL1	575481	SPTSSB	699410	B3GALNT1	966879	False	False	False	alt	100	0.001091	-10	0.0003052
2833	chr3	162077857	C	A	rs6789240	0.00746610572	0.4260345056111994	0.00746610572	0.4382046895389828	0.0279120690310343	0.0054432310454785	0.0002079291240509	0.1502504616537679	0.0002079291240509	0.1576059063641484	0.0785651303436757	0.8616353581737559	0.0005995127124558	0.6795167534760395	0.0005995127124558	0.6931512178307327	0.0022369983100134	0.5503408169462892	1.7078785910485394e-05	0.4426745712784815	1.7078785910485394e-05	0.4554272773664698	0.0060145852135395	0.3161824409673898	0.0060145852135395	0.325261905181936	OTOL1	581048	SPTSSB	704977	B3GALNT1	972446	False	True	True	alt	100	0.01007	100	0.03094
2834	chr3	162106620	G	A	rs13088846	0.001473828424	0.8346638141224466	0.001473828424	0.8485051705488308	0.0225765808038747	0.015567053623607	3.352413296370771e-05	0.6256185941729725	3.352413296370771e-05	0.6384609633296836	0.0188466685339058	0.9659632050115684	3.487360863578431e-05	0.9445800458236778	3.487360863578431e-05	0.9586480739314864	0.000449666677772	0.9064611276472936	8.501910560498867e-07	0.8984729939965199	8.501910560498867e-07	0.912655716101457	0.0005580970756957	0.8705544432634058	0.0005580970756957	0.8837867881158897	OTOL1	609811	SPTSSB	733740	B3GALNT1	1001209	False	True	False	alt	-60	0.00354	-55	0.0195
2835	chr3	177012411	G	A	rs6792256	-0.00472238894	0.6197746643066973	0.00472238894	0.6066490607804222	0.0175331127754092	0.0457300492928139	-8.232849078971756e-05	0.4069638631203974	8.232849078971756e-05	0.3959100943636636	0.1427379952074191	0.7515941396306391	-0.0006683815275434	0.6976157218048415	0.0006683815275434	0.6837636930125159	0.0026053976358379	0.4686768104513835	-1.220208517010933e-05	0.5565821418812709	1.220208517010933e-05	0.5435426215339337	-0.0043776387721863	0.4299300783080447	0.0043776387721863	0.4194965200380313	TBL1XR1	215589	KCNMB2	1260522	ENSG00000275163	1406713	False	False	False	ref	-100	0.00779	75	0.01703
2836	chr3	177020270	T	G	rs7612699	-0.00719765526	0.469333232314582	0.00719765526	0.4570509161979785	0.00910207577676	0.4055948582197219	-6.697304862957355e-05	0.4647796396514473	6.697304862957355e-05	0.4532595507014194	0.1949874998703305	0.6652958906633745	-0.0014809392140441	0.5375088487499723	0.0014809392140441	0.5241253227764999	0.0017991449681499	0.6485699719380872	-1.3939367873809462e-05	0.5283286375324258	1.3939367873809462e-05	0.5154657676016994	-0.0067448832456768	0.3055806389225541	0.0067448832456768	0.2969321888753813	TBL1XR1	207730	KCNMB2	1252663	ENSG00000275163	1398854	False	False	False	ref	50	0.005554	5	0.002625
2837	chr3	177021010	T	C	rs6983	0.0177373006	0.2147674476102219	0.0177373006	0.2243233185681107	0.0066065579753967	0.8394919289085907	0.0001240513528442	0.299147033493192	0.0001240513528442	0.3092482655013525	0.2165914584176183	0.6218239469929718	0.0043745744034233	0.294427338887926	0.0043745744034233	0.3063778189596945	0.0014951443677447	0.7043325413996584	3.190087750470542e-05	0.3600010064111691	3.190087750470542e-05	0.3719686805852418	0.0150893681469723	0.1178294834310539	0.0150893681469723	0.1214649520745225	TBL1XR1	206990	KCNMB2	1251923	ENSG00000275163	1398114	False	False	False	alt	80	0.004013	100	0.06415
2838	chr3	177049320	G	A	rs9825834	-0.030960099	0.0951110330934014	0.030960099	0.0896278524068918	0.0142998821230421	0.0921097720686756	-0.0004469436854072	0.0553546960262717	0.0004469436854072	0.0521950202498736	0.3053309681635702	0.4813449247055773	-0.0099160196418078	0.1369016615898853	0.0099160196418078	0.1289046414967323	0.0043228874419697	0.2148217434831778	-0.0001413363723144	0.0893994456062006	0.0001413363723144	0.0838176035286455	-0.0231703648378094	0.0490579901000684	0.0231703648378094	0.0477825932031404	TBL1XR1	178680	KCNMB2	1223613	ENSG00000275163	1369804	False	False	False	ref	-100	0.01027	-15	0.02484
2839	chr3	177051099	G	A	rs28649009	0.000971548302	0.6785351692569027	0.0035254755419999	0.6834163032113717	0.0203560197830719	0.0251268149922352	2.84633704970724e-05	0.4569604293001167	6.723255854206364e-05	0.4619027693538923	0.2580400211620452	0.5564441577890771	1.6632543764415384e-05	0.6659963398925772	0.0007697120214854	0.6701396489769574	0.0052792297001338	0.1295167633647399	2.787903932754162e-06	0.5114683952078528	1.4117642021490905e-05	0.5160263893851365	0.0010186827664187	0.519759371459076	0.003139036711999	0.5235565696783444	TBL1XR1	176901	KCNMB2	1221834	ENSG00000275163	1368025	False	False	False	alt	70	0.02046	-80	0.10754
2840	chr3	177076829	C	A	rs9838212	0.00247430288	0.7237652751192007	0.00247430288	0.7377174928344751	0.0219734841057741	0.0176905688060719	5.804144893108676e-05	0.4864190094794416	5.804144893108676e-05	0.499044121590783	0.0333322959781739	0.9381346113202972	9.349997002376424e-05	0.8939960581658405	9.349997002376424e-05	0.9082281778312526	0.0007277696546616	0.8458077685191687	2.169988806165857e-06	0.8072835947659359	2.169988806165857e-06	0.8215277513345939	0.001433624830133	0.7198125702683855	0.001433624830133	0.7333153468198144	TBL1XR1	151171	KCNMB2	1196104	ENSG00000275163	1342295	False	True	False	alt	10	0.000534	-45	0.01367
2841	chr3	177130159	G	A	rs9854353	0.001403969568	0.8521725232502314	0.001403969568	0.8659660721497706	0.0352376868259822	0.0019239641274384	5.108268657470302e-05	0.5311085844449869	5.108268657470302e-05	0.5432719622895399	0.2621562464340916	0.554156475006494	0.0003561361163128	0.7619947852431226	0.0003561361163128	0.7760777229366526	0.0092503528452507	0.0176039111537528	1.2916558695224697e-05	0.5070596904049524	1.2916558695224697e-05	0.520044169756209	0.0013361134451601	0.7432737679308912	0.0013361134451601	0.7566823223479008	TBL1XR1	97841	KCNMB2	1142774	ENSG00000275163	1288965	False	True	True	alt	-100	0.007996	-75	0.09
2842	chr3	180864866	G	A	rs3866226	0.00015052936	0.8333244637531118	0.0017925977199999	0.8381886426289656	0.0250951754819138	0.0093142288116864	8.515129428323249e-06	0.5750125757868995	4.482310293951496e-05	0.5797711163012319	0.1346901938816792	0.7658459872506149	-6.965825838021997e-05	0.8317227415364297	0.0002396804679126	0.8362236168658471	0.0033110866530299	0.3566341344090944	-1.161983602210708e-06	0.6829277079023279	5.8170452106465375e-06	0.6875261518329575	1.4522972229980002e-05	0.7131779732233822	0.0015705557111587	0.7173886648772927	FXR1	3276	DNAJC19	124908	CCDC39	179924	False	True	True	alt	20	0.003101	45	0.005642
2843	chr3	180871053	G	T	rs875250	-0.0182600996	0.2075348064566807	0.0182600996	0.1984410980579984	0.0083187269380179	0.5066345950461921	-0.0001613335815064	0.2326519066726482	0.0001613335815064	0.2237847354455649	0.432145561675951	0.285991757662991	-0.0079286202429383	0.1712020561157711	0.0079286202429383	0.1620084350860199	0.0036153415355793	0.3086268050251607	-7.04667838129003e-05	0.1889436031341671	7.04667838129003e-05	0.1800199038370792	-0.0083942779489413	0.2291782390002558	0.0083942779489413	0.2226527322799681	FXR1	2911	DNAJC19	118721	CCDC39	186111	False	False	False	ref	-95	0.003405	0	0.0
2844	chr3	180889457	T	C	rs62291400	0.0014844749999999	0.6460526046816202	0.0035246276	0.6512556555549569	0.0101311263949199	0.3058246232023661	9.994233284278931e-06	0.615198954449849	3.481426668547272e-05	0.6191287391701537	0.2446913349723544	0.5867706366678187	0.0003958950305239	0.6116480163605262	0.0008647115967184	0.6170231925723868	0.0024677585324304	0.5202706672535437	2.831790958535586e-06	0.5871227367009574	8.519219815062664e-06	0.5916729689278964	0.0014854925880974	0.5088133754725097	0.0032904905652548	0.5122313295519426	FXR1	21315	DNAJC19	100317	CCDC39	204515	False	False	False	alt	100	0.004818	-35	0.002579
2845	chr3	180891133	A	T	rs62291403	0.0462545465999999	0.0325957231716358	0.0462545465999999	0.0345578140162106	0.0175252167864059	0.0467008024820748	0.0008940178345786	0.0215150132697287	0.0008940178345786	0.0225733852659891	0.2469486197989605	0.5732643218187048	0.012040799430138	0.0931383451306702	0.012040799430138	0.0992980903844519	0.0043673619262566	0.1853983183990569	0.0002341415971025	0.0480332958823748	0.0002341415971025	0.050867261359138	0.0412805112086224	0.0105431635350387	0.0412805112086224	0.0107695925372288	FXR1	22991	DNAJC19	98641	CCDC39	206191	False	False	False	alt	50	0.009	60	0.0318
2846	chr3	180895330	T	C	rs13098541	0.0446141286	0.0368815072259142	0.0446141286	0.0394445461597955	0.0104092184581436	0.2708589473942056	0.0004898558694754	0.0464220858712487	0.0004898558694754	0.0493031737170208	0.45255656179006	0.2521348085432527	0.0204959060000708	0.037548015866789	0.0204959060000708	0.0409651955769268	0.0047368448168535	0.167580380556162	0.0002258455754838	0.0435452300948804	0.0002258455754838	0.0468316321409973	0.0192387887841159	0.0791357014973661	0.0192387887841159	0.0814057754611246	FXR1	27188	DNAJC19	94444	CCDC39	210388	False	False	False	alt	-100	0.002106	-80	0.02545
2847	chr3	180898828	G	A	rs35709455	-0.0440902796	0.0430705786333969	0.0440902796	0.040512906644191	0.0123246810455429	0.1581807022358957	-0.0005796203551833	0.0391377809477205	0.0005796203551833	0.0370018981832652	0.4938847913360096	0.1805277277927053	-0.0222055553380404	0.0374210670990496	0.0222055553380404	0.0346212015102198	0.0061354267908047	0.0780040831313672	-0.0002943690545973	0.03451297239744	0.0002943690545973	0.032227077348434	-0.0139379039201651	0.1286087085131768	0.0139379039201651	0.1246984961518718	FXR1	30686	DNAJC19	90946	CCDC39	213886	False	False	False	ref	20	0.0003357	-15	0.00842
2848	chr3	180902050	T	C	rs7635754	0.0511119605999999	0.02169395853964	0.0511119605999999	0.0232154865216342	0.0106759795195202	0.2429620208173935	0.000569556557507	0.0326325468460055	0.000569556557507	0.0346229194770555	0.2620691086007116	0.5474969973878906	0.0132412724197837	0.0776331416709451	0.0132412724197837	0.0838345875457569	0.0027097988888215	0.4525093583359099	0.0001433190276624	0.0727154689752493	0.0001433190276624	0.0778068525894334	0.0432182906461684	0.0058259080823886	0.0432182906461684	0.0060786520337772	FXR1	33908	DNAJC19	87724	CCDC39	217108	False	False	False	alt	-70	0.004547	-35	0.04883
2849	chr3	180909664	C	A	rs4854998	0.00973136538	0.3633482204392764	0.00973136538	0.3751961320515265	0.0190634067860431	0.0332311316875795	0.0001812360950606	0.1911640392998514	0.0001812360950606	0.1993618824701122	0.2424070789116069	0.5917357085968754	0.0024625963515995	0.397369490452659	0.0024625963515995	0.4100418974870129	0.0046386633800646	0.1802378751400148	4.594732221265776e-05	0.2445308427918322	4.594732221265776e-05	0.2550845840120798	0.0085063123061442	0.2251065578730814	0.0085063123061442	0.2325017794235017	FXR1	41522	DNAJC19	80110	CCDC39	224722	False	False	False	alt	100	0.001118	10	0.006958
2850	chr3	180937019	A	G	rs10490806	0.0011188903599999	0.7187832689253825	0.0026988805999999	0.7230329759537882	0.0072605812823308	0.7400824427924872	6.326966415385948e-06	0.7654425448647961	1.8599185478461216e-05	0.7690222404881271	0.1836720297928401	0.6851717892131138	0.0001956149399165	0.7107031930610936	0.0004958637336001	0.7147422880135992	0.0013338940980762	0.7346654623849161	1.0823415956883856e-06	0.7440042352149682	3.4214269213613007e-06	0.7475295226657821	0.0015560327389288	0.5598282041563976	0.0027303187792404	0.5637060513471163	DNAJC19	52755	FXR1	68877	CCDC39	252077	False	False	False	alt	40	0.00531	55	0.02109
2851	chr3	180944499	A	T	rs13083851	0.000373695314	0.896606919057946	0.00114641309	0.8999573393234499	0.0188798937153265	0.0359506336194084	8.45270325912276e-06	0.7990145049202892	1.950715436598864e-05	0.8029182655350092	0.1320802083009159	0.7613325377312782	6.354099918143547e-05	0.8879513239199704	0.0001442719445111	0.8916333859430079	0.0024449524898617	0.4887951620322055	1.3645011760183188e-06	0.8222534738630192	2.465629953185458e-06	0.8264386421420054	0.0003796719882986	0.8233520085258454	0.0009149472504901	0.8268265686583386	DNAJC19	45275	FXR1	76357	CCDC39	259557	False	False	False	alt	-85	0.005646	-100	0.1008
2852	chr3	180946374	A	G	rs12186104	0.00123697572	0.7766126587268777	0.0021921260799999	0.7810724899599935	0.009832995232025	0.3237185757408695	1.0939148981093114e-05	0.7476757130715458	2.0966366570638483e-05	0.7520996335113423	0.1669768358592931	0.7125308151100127	0.0002626655959702	0.759538997058094	0.0004034453841302	0.7642870453890109	0.0016584182895265	0.6728891141884713	2.347532768864183e-06	0.7427551964825713	3.870247813585281e-06	0.7473696929968654	0.0013381881554788	0.6332092979028037	0.0021182792352617	0.6378713692438891	DNAJC19	43400	FXR1	78232	CCDC39	261432	False	False	False	alt	-20	0.0012455	100	0.0192
2853	chr3	180993216	T	C	rs6777005	-0.00739382718	0.4666421874069587	0.00739382718	0.4542290337588396	0.0141802861096281	0.0979962897142254	-0.0001074845536915	0.3373048822425933	0.0001074845536915	0.3268115692596299	0.306407742818909	0.4901409169906228	-0.0022458852973958	0.433352131217381	0.0022458852973958	0.4204432895596391	0.0043349915795229	0.2074248706749375	-3.261353463903747e-05	0.3287788101114496	3.261353463903747e-05	0.3174812981863565	-0.0057884417888151	0.357129320188817	0.0057884417888151	0.3475479303681627	DNAJC19	3442	FXR1	125074	CCDC39	308274	False	False	False	ref	100	0.001236	-85	0.03278
2854	chr3	180994099	A	G	rs62291437	0.00637112142	0.4858441931663498	0.00637112142	0.4988335964638763	0.0091243288871976	0.4205146062046812	5.450820534242314e-05	0.4912763996589852	5.450820534242314e-05	0.5033660329809774	0.2931876886689696	0.5083492943462822	0.0018133714862478	0.4602797668857874	0.0018133714862478	0.4739889913229708	0.0026753691265108	0.4749916700398443	1.5447848748733885e-05	0.4588822749328228	1.5447848748733885e-05	0.4719985321990662	0.0049440346891564	0.3704280472294247	0.0049440346891564	0.3803596109097816	DNAJC19	4325	FXR1	125957	CCDC39	309157	False	False	False	alt	100	0.005493	40	0.01964
2855	chr3	181010627	G	C	rs11705702	0.0219706613999999	0.1593213416110243	0.0219706613999999	0.1674947858612463	0.0072006204316241	0.7382825071229195	0.0001668599733937	0.220569786389545	0.0001668599733937	0.2293326316332312	0.2206309194078776	0.6257188803489669	0.0051305950816801	0.2417736085022817	0.0051305950816801	0.2530607292412104	0.0016193959333058	0.6815541151208944	3.957271490304049e-05	0.2880549318681049	3.957271490304049e-05	0.2990659269799881	0.0206869365864791	0.0690267961124165	0.0206869365864791	0.0710466832231542	DNAJC19	20853	FXR1	142485	CCDC39	325685	False	False	False	alt	100	0.004673	85	0.0227
2856	chr3	181011360	A	T	rs71312200	-0.0024712559199999	0.7762764073515032	0.0024712559199999	0.7626039512915614	0.0156215324592036	0.0705041441803357	-3.846520826852717e-05	0.6087206123831443	3.846520826852717e-05	0.5960257943783664	0.2115395387918961	0.64159137922879	-0.0005278843853583	0.7277625162696875	0.0005278843853583	0.7139618235584337	0.0032720950943246	0.3707059049788112	-8.12228550833797e-06	0.6170100944992798	8.12228550833797e-06	0.6034562480630117	-0.0023713938941274	0.6190410552243842	0.0023713938941274	0.6066490517534406	DNAJC19	21586	FXR1	143218	CCDC39	326418	False	False	False	ref	95	0.00531	-55	0.05273
2857	chr3	181019853	T	G	rs34293605	-0.0039616237999999	0.6558509308103334	0.0039616237999999	0.6425980827161061	0.014973625864468	0.0807092311982107	-6.195727474399187e-05	0.4922940524137604	6.195727474399187e-05	0.4806481276383664	0.255027541779479	0.570747690902607	-0.0010341814907483	0.6029239659900348	0.0010341814907483	0.5893731259443127	0.0038577391480403	0.2794075234121523	-1.631821978934663e-05	0.4856731336527979	1.631821978934663e-05	0.4729281087207291	-0.0034979615971119	0.506405315550863	0.0034979615971119	0.4950334937177691	DNAJC19	30079	FXR1	151711	CCDC39	334911	False	False	False	ref	-50	0.0029	-50	0.0354
2858	chr3	181033387	C	T	rs62289571	-0.00494347804	0.6194657301600439	0.00494347804	0.6062873124922731	0.0073142684628189	0.7290323018595288	-3.831829479179498e-05	0.659169412529225	3.831829479179498e-05	0.6461931510592193	0.1055114679612858	0.8137992045155339	-0.0005357789312666	0.7510992197194765	0.0005357789312666	0.737027061796226	0.000779958208918	0.8410045469092248	-4.210240291677734e-06	0.7721865403517841	4.210240291677734e-06	0.7582076507718764	-0.0042490067324349	0.4582949954657383	0.0042490067324349	0.4474198466466066	DNAJC19	43613	FXR1	165245	CCDC39	348445	False	False	False	ref	-25	0.01171	-80	0.01852
2859	chr3	181035595	G	C	rs13060352	-0.0629989944	0.0146923150567486	0.0629989944	0.0138916348847029	0.028907585462416	0.0079860270771349	-0.0021532041378503	0.0062108470126941	0.0021532041378503	0.0059431382472309	0.2741439226547993	0.5410168922639252	-0.0179280936175186	0.0600600504858193	0.0179280936175186	0.0556822502731278	0.0082299131859808	0.0370987690988212	-0.000626953218944	0.0150766153177627	0.000626953218944	0.0142195134661233	-0.055187294474009	0.0032145314477451	0.055187294474009	0.0031030599879564	DNAJC19	45821	FXR1	167453	CCDC39	350653	False	True	True	ref	25	0.012024	80	0.02191
2860	chr3	181050532	T	G	rs1001416	-0.0008699327079999	0.6437627232858166	0.004355859108	0.6383472934331905	0.0148564405804679	0.0929138550274412	-1.819675368567076e-05	0.5265659928577032	5.784880979552904e-05	0.5214171101623153	0.3906472058838784	0.3520486480184129	-0.0003478298125555	0.5372886208524287	0.001638901551589	0.5319358991554726	0.0058438605171886	0.0958576391057366	-7.413652260466114e-06	0.4391609673801885	2.2099461856937755e-05	0.4338261807208937	-0.0008838265957115	0.6209965995214972	0.0023983651282689	0.6150710117727831	DNAJC19	60758	FXR1	182390	CCDC39	365590	False	False	False	ref	100	0.02113	80	0.02869
2861	chr3	181068820	A	T	rs6775889	-0.0217703382	0.1753421937636714	0.0217703382	0.1670520176124875	0.0086606504289693	0.4739621214790651	-0.0001914918327287	0.1893439214753189	0.0001914918327287	0.1813953726466375	0.1988526851938298	0.6606211842443035	-0.0044786463420232	0.2840225424721217	0.0044786463420232	0.2724663502936865	0.0017273710819984	0.6561643183528361	-3.9507465723919966e-05	0.2903716963427789	3.9507465723919966e-05	0.2793515716449242	-0.0212740796066348	0.0692885010403862	0.0212740796066348	0.0673964366045128	DNAJC19	79046	FXR1	200678	CCDC39	383878	False	False	False	ref	100	0.008224	55	0.03522
2862	chr3	181080133	T	G	rs12635178	0.002720654516	0.734896592346536	0.002720654516	0.748791822259444	0.0155850341560634	0.0705673088147067	4.258581460998998e-05	0.5758204486255318	4.258581460998998e-05	0.5888728376851466	0.2214234587495721	0.6172213098844002	0.0005872836030501	0.703444908782663	0.0005872836030501	0.7176219744527692	0.0035183243700153	0.3241744267466405	9.3607276146457e-06	0.5950766619865783	9.3607276146457e-06	0.6087388376235823	0.0023900662869946	0.594517796378335	0.0023900662869946	0.6068493010487801	DNAJC19	90359	FXR1	211991	CCDC39	395191	False	False	False	alt	5	0.0003233	30	0.006
2863	chr3	181092123	T	G	rs1968217	-0.000633517106	0.9481976692539272	0.000633517106	0.9340732457550924	0.0255786961544577	0.0086108838761562	-1.6778969523078107e-05	0.8124902671029336	1.6778969523078107e-05	0.7986586656344573	0.1180696895196008	0.7971719886659838	-7.80481548657929e-05	0.9371560492105772	7.80481548657929e-05	0.9230176864830704	0.0031277411414251	0.3792743631196301	-2.159681392979957e-06	0.8467214708854844	2.159681392979957e-06	0.8324074857662241	-0.0005560223653772	0.8972172070030052	0.0005560223653772	0.8832095403597472	DNAJC19	102349	FXR1	223981	CCDC39	407181	False	True	True	ref	-35	0.000557	100	0.02805
2864	chr3	181114189	G	A	rs2543163	0.0022820913999999	0.5026737505179015	0.0058877006	0.5072061959506297	0.0098092819285773	0.3273615043499666	2.3095876726829944e-05	0.4836728178310904	5.501085733517734e-05	0.4884824170355942	0.1865289059015134	0.6791818630579357	0.0003756004670469	0.5615793507393464	0.001099422764489	0.5664647487824648	0.001825144153984	0.6415081301802819	3.833967020835993e-06	0.5432455988810078	1.0240866519095716e-05	0.5483377060682878	0.0016576935445388	0.3262861051869667	0.0060477805786366	0.3306006636519483	DNAJC19	124415	FXR1	246047	CCDC39	429247	False	False	False	alt	-100	0.003418	-25	0.01218
2865	chr3	181119890	G	A	rs34718862	-0.0473078368	0.0349812056299759	0.0473078368	0.032788220401198	0.011265092313784	0.2327299913880053	-0.0005592801853128	0.0417654875334625	0.0005592801853128	0.039369186892547	0.3577796450170644	0.3966697444141135	-0.0174408513299486	0.0607979808918775	0.0174408513299486	0.056239609773759	0.0042081348274033	0.2291155430468803	-0.000214980276353	0.0579192990528526	0.000214980276353	0.0541066187243534	-0.0308343447546136	0.0241451032783427	0.0308343447546136	0.0235268809405268	DNAJC19	130116	FXR1	251748	CCDC39	434948	False	False	False	ref	65	0.00657	-85	0.0514
2866	chr3	181122700	C	T	rs4456860	0.00259406558	0.7557666213438498	0.00259406558	0.7695122251536917	0.0193701329541643	0.0303946925663841	5.123358194490682e-05	0.5361268359376967	5.123358194490682e-05	0.548816589135128	0.0034294961565991	0.9926532969845776	9.4577438433288e-06	0.9712580104445218	9.4577438433288e-06	0.985420308807056	6.551775904941718e-05	0.9845476650781332	1.8319194485078424e-07	0.9581164284270078	1.8319194485078424e-07	0.9722573404422824	0.0001784250873971	0.9445895203880118	0.0001784250873971	0.9587726189684675	DNAJC19	132926	FXR1	254558	CCDC39	437758	False	False	False	alt	90	0.003769	-60	0.01391
2867	chr3	181127869	T	A	rs13075474	0.0109818846	0.3088953314006412	0.0109818846	0.3199945939672042	0.0076334176095366	0.6455773057638007	8.358907656484703e-05	0.3603199572685756	8.358907656484703e-05	0.3711487026987624	0.1263955020280292	0.779733203774412	0.0014008945164686	0.507874793832539	0.0014008945164686	0.5215173465771341	0.000972544972811	0.801032009267006	1.0752520047929316e-05	0.5342459072808496	1.0752520047929316e-05	0.5475535527788061	0.0106038444382202	0.1695058069404581	0.0106038444382202	0.1750660613060014	DNAJC19	138095	FXR1	259727	CCDC39	442927	False	False	False	alt	-40	0.000927	-85	0.02637
2868	chr3	181132050	G	A	rs13077643	-0.0240816231999999	0.1518623529195478	0.0240816231999999	0.1441294183188094	0.0095943677299085	0.3577609236086948	-0.000236241171831	0.1495635231252884	0.000236241171831	0.142598513899972	0.0732559466384505	0.8712524205463208	-0.0018164403409155	0.4855715104186098	0.0018164403409155	0.4724113773061562	0.0007236553237643	0.8556750542064957	-1.8307341002653573e-05	0.465035347896552	1.8307341002653573e-05	0.4524772130070812	-0.0175686469776656	0.0913755049630428	0.0175686469776656	0.0888346611884874	DNAJC19	142276	FXR1	263908	CCDC39	447108	False	False	False	ref	10	0.001854	-95	0.003593
2869	chr3	181155199	C	A	rs13071279	0.0005692215159999	0.7988780173308145	0.0020831518639999	0.8019576084460539	0.0224194404560509	0.0163885752751824	2.0044661543393016e-05	0.5604776072327116	4.699529300138022e-05	0.5642689793082479	0.1193165904210624	0.7907231099777572	7.166093997766427e-05	0.8220366938209481	0.0002656062429319	0.8252898265078514	0.002666422091985	0.4728584655288512	2.47804780729026e-06	0.683809489222352	5.929292828153403e-06	0.6877661501735403	0.0007759416591458	0.6606932635937588	0.0019958713264659	0.6641045820417838	DNAJC19	165425	FXR1	287057	CCDC39	470257	False	True	False	alt	95	0.001129	95	0.01488
2870	chr3	181278250	T	G	rs13092432	0.0019248969479999	0.7228350926841468	0.003057309188	0.7312960024679571	0.0270295283882315	0.0067619549921867	5.138049581995446e-05	0.4000414353403752	8.384099341039039e-05	0.406919862680912	0.2432411124596727	0.5873824682563592	0.0003996444159808	0.6613798527065117	0.0007261560874966	0.6696451016471933	0.006692605645836	0.0601255698493122	1.1098511298456706e-05	0.4241700589796751	2.045793961748664e-05	0.4311993492058549	0.0015622568698845	0.579534250345434	0.0025996120291703	0.5870482551106355	DNAJC19	288476	FXR1	410108	SOX2	433676	False	True	True	alt	5	0.000758	-95	0.02397
2871	chr3	181305364	A	G	rs12633623	0.0653820728	0.0103589585575872	0.0653820728	0.0110351560830065	0.0195470560087014	0.0323013564299143	0.0013732432550923	0.008142324501863	0.0013732432550923	0.0085285349974622	0.3023247129119596	0.4934247278848565	0.0201179098497838	0.0383487697840517	0.0201179098497838	0.0417597454463219	0.0060596778281242	0.0912796317220683	0.0004351230029178	0.0180025628769379	0.0004351230029178	0.0192913152188492	0.0538532557391673	0.0030303877769984	0.0538532557391673	0.0030899264837891	DNAJC19	315590	SOX2	406562	FXR1	437222	False	True	False	alt	60	0.001915	80	0.0688
2872	chr3	181353043	A	G	rs74284696	-0.0033773907	0.6518006095638772	0.00395097726	0.6434586284783854	0.0314417487057597	0.0031528280134588	-0.0001176530123692	0.2895269277791746	0.0001328206409793	0.2823322918537458	0.1202522847747383	0.7918437720219647	-0.0004742993505491	0.7366375103240053	0.0005258393763882	0.7282032788551456	0.0038523111245512	0.2774132276825596	-1.6612914860522594e-05	0.4836178538150138	1.797581280573291e-05	0.4750111592120359	-0.0035062604383862	0.4817762886458091	0.0038880071370034	0.4744332988751474	SOX2	358883	DNAJC19	363269	FXR1	484901	False	True	True	ref	-100	0.00148	-100	0.01985
2873	chr3	181363793	G	A	rs141717445	-0.039328488	0.0588331853687188	0.039328488	0.0550780184484551	0.0083475476092277	0.5320693261296191	-0.0003332906259168	0.0893454482155774	0.0003332906259168	0.0844900146917104	0.2376352451788919	0.5964538874569527	-0.0094239217401782	0.1427080065782178	0.0094239217401782	0.1341647353101409	0.001971263035919	0.6134607697068593	-7.947053745013145e-05	0.1612657878597608	7.947053745013145e-05	0.1529124983142365	-0.0364941545036773	0.0144718885375189	0.0364941545036773	0.0141133980130942	SOX2	348133	DNAJC19	374019	FXR1	495651	False	False	False	ref	-15	0.001259	85	0.04654
2874	chr3	181380929	C	T	rs13081180	-0.0965572824	0.00297348736809	0.0965572824	0.0028231117261882	0.0223553548921231	0.0188702982905218	-0.0023601204021613	0.0040877158013864	0.0023601204021613	0.0039286781049163	0.364574321310387	0.3898931968229973	-0.0361108862326032	0.0106882118892473	0.0361108862326032	0.0099379339253276	0.008341904665282	0.0310420475485376	-0.000900858640574	0.0067544842832341	0.000900858640574	0.0064140880483719	-0.0662455004719965	0.0014911670713448	0.0662455004719965	0.0014521648310829	SOX2	330997	DNAJC19	391155	FXR1	512787	False	True	True	ref	-100	0.005157	-100	0.06146
2875	chr3	181397839	C	A	rs10937056	0.0118401191	0.3009859002328108	0.0118401191	0.3120643927502042	0.0097715616608648	0.3324155959116391	0.0001181853175215	0.2903539270492496	0.0001181853175215	0.3001882950007955	0.0344837602049813	0.9322920280762595	0.000387258147607	0.7493640049596157	0.000387258147607	0.7636239287386098	0.0003103708691712	0.928844586447944	3.5961211249347955e-06	0.7352162687111835	3.5961211249347955e-06	0.7493835140445707	0.0049938277368022	0.3676773379806494	0.0049938277368022	0.3775971303244825	SOX2	314087	DNAJC19	408065	FXR1	529697	False	False	False	alt	35	0.001521	-90	0.02222
2876	chr3	181409743	T	C	rs9816542	0.0138825906	0.270716070493059	0.0138825906	0.2811305244532388	0.0132085311185441	0.1259549952459328	0.0001818022225907	0.190475786239235	0.0001818022225907	0.1987284771370815	0.2129316694156577	0.6378840403098885	0.0031086197476054	0.3481398271273617	0.0031086197476054	0.3607826144501473	0.0028223861610488	0.4486379171067064	4.0720079639551365e-05	0.2703435609532973	4.0720079639551365e-05	0.2811762809166477	0.0132159047293021	0.1418175064536026	0.0132159047293021	0.1461287794932035	SOX2	302183	DNAJC19	419969	FXR1	541601	False	False	False	alt	80	0.005424	65	0.03677
2877	chr3	181412853	T	A	rs6779538	0.00770356584	0.4224132826971242	0.00770356584	0.4346716688782969	0.0222869778807471	0.016365722274497	0.0001762567199867	0.1880599623294666	0.0001762567199867	0.1963820467081467	0.1707424350875008	0.7029909623077103	0.0014241451027777	0.5161732193195349	0.0014241451027777	0.529611131757731	0.0038860388977245	0.2643674427289595	3.339143811668118e-05	0.3167034371579881	3.339143811668118e-05	0.3282106764363415	0.0072054689363997	0.2715496202151554	0.0072054689363997	0.2796451285199369	SOX2	299073	DNAJC19	423079	FXR1	544711	False	True	False	alt	100	0.01264	-45	0.01831
2878	chr3	181419222	C	T	rs79339987	0.00764261846	0.4175726013510723	0.00764261846	0.4298329267383255	0.0299797535070404	0.0038948029069252	0.0002264240192852	0.1300141755029513	0.0002264240192852	0.136701697130285	0.180198964719551	0.686034187306454	0.0013124364105182	0.519280988462452	0.0013124364105182	0.532824469464819	0.0055048138114063	0.1140236652869021	3.9428831395838536e-05	0.257364181260845	3.9428831395838536e-05	0.2679256775457645	0.0070145955870911	0.2659972562364731	0.0070145955870911	0.2741421585103884	SOX2	292704	DNAJC19	429448	FXR1	551080	False	True	True	alt	-50	0.02365	-25	0.01105
2879	chr3	181432274	G	A	rs10937057	-0.0636285953999999	0.0117891372765633	0.0636285953999999	0.0111052287506669	0.0122897454464486	0.1529519970618164	-0.0007830618170132	0.0186774974956	0.0007830618170132	0.0176720656475272	0.4026494050768162	0.3309523978359223	-0.0255904453700644	0.02531056428864	0.0255904453700644	0.0233069950416617	0.0049033795995277	0.1484805476912147	-0.0003121745773698	0.0256821181372563	0.0003121745773698	0.0239015553285567	-0.0363904189877487	0.0128076419610833	0.0363904189877487	0.0124246087861737	SOX2	279652	DNAJC19	442500	FXR1	564132	False	True	False	ref	40	0.01131	-55	0.04956
2880	chr3	181468180	T	C	rs4854918	0.003131150992	0.7091989169059066	0.003178138568	0.7199253927120006	0.0071828659038778	0.7525375542540261	2.228257143903065e-05	0.747058891508427	2.265388411846832e-05	0.7576915420901631	0.0994699115136048	0.8203292934187227	0.0003721714661118	0.7777599235371818	0.0003747562969997	0.7897523269118332	0.0007160893851851	0.8480536271711288	2.6885543789505724e-06	0.7991561497870151	2.7089806400015995e-06	0.8113586073368826	0.002634882104586	0.5644931124532608	0.0026473303664975	0.574796597009975	SOX2	243746	DNAJC19	478406	FXR1	600038	False	False	False	alt	100	0.007538	65	0.01231
2881	chr3	181468571	C	T	rs11717567	0.0263991728	0.1175441877632224	0.0263991728	0.1243885852159304	0.0081982140798492	0.5294715370648566	0.000223357743586	0.1432945055759124	0.000223357743586	0.1501902008762085	0.1144576188549673	0.8003661928495487	0.0031066037330045	0.3390752165586264	0.0031066037330045	0.3513167505014018	0.0009428893209195	0.8062023531039424	2.635303673422228e-05	0.3548066124903553	2.635303673422228e-05	0.3667547535906071	0.0236724447349038	0.0493771621259838	0.0236724447349038	0.0507449074590152	SOX2	243355	DNAJC19	478797	FXR1	600429	False	False	False	alt	100	0.00721	-90	0.01996
2882	chr3	181479104	C	A	rs11708101	0.0105190505	0.3402989566081548	0.0105190505	0.3516611811228847	0.0208482404726062	0.0227214242043407	0.0002354803879107	0.1495653331473071	0.0002354803879107	0.1567160693849447	0.1352939345843836	0.7632470959117316	0.0013943373107734	0.5161156614293144	0.0013943373107734	0.5296077014244074	0.0028059087875916	0.4606918037964004	3.1099171515182985e-05	0.3272395230263899	3.1099171515182985e-05	0.3387000483486167	0.0100001037355158	0.1955820386100006	0.0100001037355158	0.2016844886856793	SOX2	232822	DNAJC19	489330	FXR1	610962	False	False	False	alt	65	0.002151	100	0.04913
2883	chr3	181484570	C	T	rs55844174	-0.0010417796599999	0.8852232894129415	0.0014018677559999	0.875366398239869	0.0107651343467113	0.2392175123682771	-1.098214441744033e-05	0.8450623889369757	1.526848207985112e-05	0.8352343876062128	0.1554289982261227	0.7328548970365217	-0.0001448269653291	0.8623195545063811	0.0002121835620145	0.852185654292509	0.0016702899801847	0.6717843082947287	-1.5034217925883446e-06	0.836955641162698	2.3052064659624603e-06	0.826753708270347	-0.0008298841274286	0.7896836982168933	0.0011618377784001	0.7800091167916408	SOX2	227356	DNAJC19	494796	FXR1	616428	False	False	False	ref	-100	0.01007	-100	0.04266
2884	chr3	181488779	A	G	rs16832517	-0.01126627916	0.3549114757857865	0.01126627916	0.3434220606379525	0.0051048513227104	0.9888805857971618	-6.110410422072315e-05	0.5222462469672483	6.110410422072315e-05	0.5103869813230678	0.1977385657527567	0.6633158513050664	-0.002372100738242	0.4431632392739577	0.002372100738242	0.4302874919924238	0.0010276752657096	0.7947515386316593	-1.3078186530654957e-05	0.5613169583991382	1.3078186530654957e-05	0.5482090473866745	-0.0106162927001316	0.1949395668806774	0.0106162927001316	0.18938216470482	SOX2	223147	DNAJC19	499005	FXR1	620637	False	False	False	ref	100	0.01055	95	0.038
2885	chr3	181702392	T	G	rs75907840	-0.003670349908	0.6977487599944021	0.003670349908	0.6841357494831326	0.0231240502482937	0.0141569429813069	-7.365052355166929e-05	0.4882323323960144	7.365052355166929e-05	0.4759190066989228	0.6800630711936846	0.0143818155334847	-0.0025057041199746	0.4726335794184649	0.0025057041199746	0.4589712364663086	0.0157303604424083	0.002742365569006	-5.02538404936152e-05	0.2916992841681016	5.02538404936152e-05	0.2804992721881931	-0.0004522868494486	0.9131050864633048	0.0004522868494486	0.904929303054406	SOX2	9534	DNAJC19	712618	FXR1	834250	False	True	False	ref	-90	0.01251	-100	0.1975
2886	chr3	181713783	C	A	rs11915160	0.0034149233256	0.6769428625034442	0.0034149233256	0.6902467441259266	0.0195256257170141	0.03035333073741	6.928249221650976e-05	0.4710226466160279	6.928249221650976e-05	0.4831804141694498	0.5583439662237161	0.0880781620476711	0.0019853804169244	0.4774853822278782	0.0019853804169244	0.490831217427099	0.0108989685239847	0.009730966616214	4.035172352537344e-05	0.3148741788290958	4.035172352537344e-05	0.3267081873038185	0.0006203383852529	0.8624281023865208	0.0006203383852529	0.8755739711536967	SOX2	1857	DNAJC19	724009	FXR1	845641	False	False	False	alt	100	0.007133	-95	0.03455
2887	chr3	185855290	C	A	rs12638738	0.0026016646339999	0.6640346775066075	0.003870467314	0.6717324399395727	0.0330728376566213	0.0025415230889301	9.554355839488087e-05	0.2963782198141932	0.0001333828260257	0.302613770051206	0.0090104669135571	0.9796412277143922	1.0474417492032809e-05	0.959542803034214	2.2478152394169645e-05	0.9671524659732866	0.0002855398231725	0.9293511078111254	3.618154444986329e-07	0.9056337390657316	7.198006111428731e-07	0.9134115924666012	0.0002572640795028	0.8912807851240067	0.0004688845319971	0.8987479974537227	IGF2BP2	30248	TRA2B	82813	ETV5	255028	False	False	False	alt	55	0.002277	40	0.04504
2888	chr3	185955755	T	C	rs57491362	0.0498498326	0.0264981140100389	0.0498498326	0.0283568319701918	0.0112086542920037	0.2146035701221227	0.0005824263109063	0.0325543751360482	0.0005824263109063	0.0345541738908822	0.3771761117853919	0.3745705516920331	0.0190608746861199	0.0437109166500087	0.0190608746861199	0.0476072250801127	0.0042267001418884	0.2220340587772312	0.0002217943893281	0.0428820341429417	0.0002217943893281	0.0461665895458847	0.0320376767393852	0.0222111539421747	0.0320376767393852	0.0227351219072235	TRA2B	17652	IGF2BP2	130713	ETV5	154563	False	False	False	alt	50	0.003761	55	0.02881
2889	chr3	185955802	C	T	rs112543424	-0.0539210832	0.0217085089975573	0.0539210832	0.0203240863316374	0.0126723856545712	0.1388562277482553	-0.0006889033486571	0.0237834765147845	0.0006889033486571	0.0224566019789459	0.3501343374931275	0.4182142816814588	-0.0187604026469065	0.0502794498183853	0.0187604026469065	0.0463895060927933	0.0044229213067314	0.1926157574533434	-0.0002390252097949	0.0392766570486006	0.0002390252097949	0.0365758321167664	-0.0384506063340905	0.0117842813703441	0.0384506063340905	0.0114808103885397	TRA2B	17699	IGF2BP2	130760	ETV5	154516	False	False	False	ref	100	0.001293	5	0.005066
2890	chr3	185955820	T	C	rs60319910	0.0414513598	0.0427620127528505	0.0414513598	0.0459471395132669	0.0134014971235473	0.1167117153886716	0.0005771032074768	0.0320981833024596	0.0005771032074768	0.0342988883943099	0.3788296559092937	0.3726564404385309	0.0157541926855807	0.0597307921775042	0.0157541926855807	0.0650078783862198	0.0050973494448636	0.1376753258955216	0.0002200371793994	0.0422390446124086	0.0002200371793994	0.0456857933174107	0.0256786896129627	0.0350182593188589	0.0256786896129627	0.0358920200097759	TRA2B	17717	IGF2BP2	130778	ETV5	154498	False	False	False	alt	100	0.004456	-10	0.01764
2891	chr3	185971124	C	A	rs115259874	-0.0076177413799999	0.4063525404133165	0.0086655397	0.3964518306927868	0.0096664845743074	0.3500017264303723	-7.75311510770579e-05	0.3780275484955964	8.783273447784448e-05	0.3692130181395118	0.4932354070062967	0.1822446165859727	-0.0036677501680004	0.2934767411958405	0.0042255998777146	0.28416932425121	0.0047553160634413	0.1676183375181274	-3.7191254871529525e-05	0.2775949724659949	4.267583629746309e-05	0.2688868833358493	-0.0027137210966918	0.5480286649867379	0.0029958817000176	0.5390736834599466	TRA2B	33021	ETV5	139194	IGF2BP2	146082	False	False	False	ref	100	0.007507	50	0.02544
2892	chr3	188194600	G	A	rs4686478	-0.00551878496	0.5287044629082841	0.00587846056	0.5181678027728857	0.0068107250207154	0.8268410526167312	-3.5504933490740366e-05	0.6084316314927647	3.830398844884012e-05	0.5984559773608941	0.1615265718524051	0.7203464642529693	-0.0008804852393917	0.629910647732361	0.0009302247107765	0.6187269094309157	0.0011085347125641	0.7788155845564461	-5.769586525589934e-06	0.6767266978477788	6.156667321515493e-06	0.6657892599413228	-0.0049108393240593	0.3652675608085496	0.0052967354433136	0.3577584016577871	LPP	41315	BCL6	448875	RTP2	492043	False	False	False	ref	100	0.00461	-95	0.05957
2893	chr3	188197422	G	T	rs4572756	0.01185224634	0.3216342035697506	0.01185224634	0.3332384187581995	0.0171920172328869	0.0492700849714154	0.0002076685881217	0.1822018877018146	0.0002076685881217	0.190181925832007	0.3230427701532173	0.4624356425523032	0.0038303178768282	0.3070212883998769	0.0038303178768282	0.3190670204241304	0.0055944529787211	0.1048196381943767	6.768699532821732e-05	0.1914446789581183	6.768699532821732e-05	0.20121697595687	0.0090996794572557	0.2393426354007537	0.0090996794572557	0.2463570550003326	LPP	44137	BCL6	451697	RTP2	494865	False	False	False	alt	-65	0.0008564	-10	0.003601
2894	chr3	188279828	G	A	rs79650876	-0.00390264572	0.5353597188080765	0.00593526748	0.526229506053286	0.0097406087521384	0.3322780237479656	-3.481271210507545e-05	0.503838931754046	5.806474229595324e-05	0.4955848157979224	0.4743513936866564	0.21116787104436	-0.0018159194956153	0.3779209484825289	0.0028228156986818	0.3691741628355647	0.0046538624369348	0.179308644223596	-1.628736133603749e-05	0.3590310475068495	2.7805677892277565e-05	0.3510439120963776	-0.001520762663513	0.6363279582281491	0.0021929688067302	0.6273510252408783	LPP	126543	BCL6	534103	RTP2	577271	False	False	False	ref	-65	0.001068	20	0.01596
2895	chr3	188467043	G	T	rs1365261	0.00445895452	0.5845589959765658	0.0049115151199999	0.5944841779041153	0.0100891942681212	0.3005870994658654	4.781857147946375e-05	0.5482511017752427	5.187927503728748e-05	0.5577107909145558	0.1283498791481239	0.7776450245655807	0.0006696576286021	0.6833908789194304	0.0007186604979266	0.6932631018786423	0.0012967737611319	0.744409264546843	7.044506664262073e-06	0.6612745803727477	7.484196118888825e-06	0.671058684891794	0.004166018319692	0.4258779262224608	0.0045892592246807	0.4334597710628202	LPP	313758	TPRG1	480172	BCL6	721318	False	False	False	alt	95	0.00504	5	0.003601
2896	chr3	188469462	G	A	rs1426271	-0.019161348	0.2037240411130929	0.019161348	0.1946391215727536	0.0078533731357603	0.6278483644200095	-0.0001547168848225	0.2452421831838644	0.0001547168848225	0.2363244381605648	0.3930082262264131	0.3399858271575605	-0.0078220958713531	0.1792679961756219	0.0078220958713531	0.1696290108879924	0.0031158103408713	0.4030256335933484	-6.38174764782771e-05	0.2079696292328992	6.38174764782771e-05	0.1985236407282748	-0.0097532132076058	0.1946097352475777	0.0097532132076058	0.1886683557891895	LPP	316177	TPRG1	477753	BCL6	723737	False	False	False	ref	-40	0.001839	-55	0.00821
2897	chr3	196484162	C	T	rs9683218	0.00665229212	0.463110515372726	0.00665229212	0.4755875893490606	0.0207079584877363	0.0230274084339484	0.00013842995255	0.2370900021736917	0.00013842995255	0.2464812737996384	0.2539756636479631	0.5651863938168228	0.0017071995768506	0.4605454096215122	0.0017071995768506	0.474016704640314	0.0053570325574796	0.1173776538049081	3.613340243174001e-05	0.2772552711749672	3.613340243174001e-05	0.2883620592073026	0.0055643730744094	0.3316148187650196	0.0055643730744094	0.3411065146906813	RNF168	19606	SMCO1	31184	UBXN7	51732	False	False	False	alt	95	0.0177	60	0.04794
2898	chr4	712911	T	C	rs35734242	-0.01351297288	0.2924373814852214	0.01351297288	0.2817309535025737	0.0076373061816026	0.6667205270482026	-0.0001058071871594	0.3421066270627245	0.0001058071871594	0.3318452920156748	0.352070042220355	0.4056061567634162	-0.0046363162116528	0.271969455613903	0.0046363162116528	0.2608076345694217	0.0026627613239889	0.4847965341815959	-3.617047563923031e-05	0.3061650868335374	3.617047563923031e-05	0.2952523854603761	-0.0095644145686158	0.2324049113557454	0.0095644145686158	0.2256358386654707	PCGF3	7162	SLC49A3	23640	ATP5ME	38581	False	False	False	ref	20	0.0002747	-90	0.0666
2899	chr4	23372301	G	A	rs199753793	-0.0197347687	0.1819630270697617	0.0197347687	0.1734126944477373	0.0110898579185532	0.2163458887197901	-0.0002219137639665	0.1496847867710327	0.0002219137639665	0.1428713709900446	0.3102812269836824	0.4829961874300458	-0.0060854439654211	0.212232219508215	0.0060854439654211	0.2021137480638035	0.0034319206554428	0.3407014954130769	-6.824952377173202e-05	0.1782015232296337	6.824952377173202e-05	0.1695541460922399	-0.0152926897581924	0.103074492223523	0.0152926897581924	0.1000122671699167	PPARGC1A	531788	GBA3	679386	ADGRA3	856235	False	False	False	ref	100	0.01412	100	0.013504
2900	chr4	23398184	T	G	rs73100346	-0.000314289988	0.9111460526468173	0.001046975212	0.9080030386871524	0.0236007658972307	0.012652981046367	-6.153630390019093e-06	0.7708915633124876	2.269381914887013e-05	0.767510124612355	0.1037147688254027	0.8182408894778804	-4.840920744738517e-05	0.9088882198668014	0.0001210066217069	0.9054355323071768	0.0024180942820287	0.5201532807798636	-9.693231671318185e-07	0.8233345831154953	2.609157708439726e-06	0.8200230750420695	-0.0002199192937686	0.836263350173947	0.0008713783338001	0.8332839071434067	PPARGC1A	505905	GBA3	705269	ADGRA3	882118	False	True	False	ref	60	0.003014	-45	0.01572
2901	chr4	23422922	T	C	rs215407	-0.000553677018	0.8958502369237002	0.001035979502	0.8920270816277323	0.0278692943712792	0.0057821305300584	-1.3392507142883548e-05	0.6746688428155232	2.8803743869494222e-05	0.67044519159615	0.1203767673938525	0.7881690279364183	-6.023228521080401e-05	0.8865494363751039	0.000125229817631	0.8825496018329149	0.003378606870494	0.3443212338789548	-1.4153808550720426e-06	0.7540220181267306	3.5068043496197385e-06	0.7497807816900494	-0.0005767694685629	0.7916361563235295	0.0010829987862944	0.7876375270436168	PPARGC1A	481167	GBA3	730007	ADGRA3	906856	False	True	True	ref	20	0.001083	10	0.006424
2902	chr4	23423851	T	G	rs215405	0.017000176568	0.2327350134629451	0.017000176568	0.2430398496027097	0.0085537385042937	0.4973707132300232	0.0001523610753588	0.2535832464545617	0.0001523610753588	0.2633846711421265	0.3997697071546385	0.3374156497385754	0.0068748218527424	0.2023444090368507	0.0068748218527424	0.2133281681990324	0.003447585223915	0.3423973924472892	6.222200291918538e-05	0.2170271072848402	6.222200291918538e-05	0.2273210728002494	0.0090270645961057	0.2287583306389769	0.0090270645961057	0.2352379660684704	PPARGC1A	480238	GBA3	730936	ADGRA3	907785	False	False	False	alt	-45	0.0008698	-50	0.04865
2903	chr4	23484586	A	G	rs17541787	0.000912971692	0.7719673494863943	0.002124481208	0.7756644960660087	0.007308381170362	0.7052760025457844	5.048286868715663e-06	0.8002168255936314	1.5465256157863826e-05	0.8038694564712615	0.3762590898245832	0.3773581843964382	0.0003457273103569	0.6519165777752909	0.0007847797799274	0.6538821616252634	0.0027418352558514	0.4673820590993972	1.9158575138420643e-06	0.6847732747620339	5.689886988312302e-06	0.686284189287766	0.0005290511312358	0.7486380347786369	0.0013547858380273	0.7510916238638509	PPARGC1A	419503	GBA3	791671	ADGRA3	968520	False	False	False	alt	-100	0.00662	5	0.001831
2904	chr4	23529438	A	C	rs199797430	-0.0031807167679999	0.7186348988775588	0.0031807167679999	0.7051203422011154	0.027849007927058	0.0057497059860794	-9.719736012075412e-05	0.3920432182428925	9.719736012075412e-05	0.3809848172194156	0.0392908640131121	0.9275727790718892	-0.0001263874970584	0.9067745538105574	0.0001263874970584	0.8924775908687708	0.0010857986977847	0.7789425228507928	-3.75640234578417e-06	0.7780994151273362	3.75640234578417e-06	0.7640538150750379	-0.001724084274733	0.711550479221344	0.001724084274733	0.6984026516637991	PPARGC1A	374651	GBA3	836523	ADGRA3	1013372	False	True	False	ref	95	0.00299	70	0.03198
2905	chr4	33649250	G	T	rs12641122	-0.00451062532	0.3797642323281968	0.0092834814799999	0.3745290719076817	0.0165730689526632	0.0566727444756771	-7.274689431061257e-05	0.2186896439017563	0.0001510905494016	0.2152846824515734	0.3197792508221039	0.4509600326352417	-0.0010570619712623	0.3712416749450241	0.002739609062925	0.3665283713519132	0.0054770338518078	0.1039408926419522	-1.947976665882632e-05	0.240891976521318	4.6848757276458944e-05	0.2371222766225538	-0.0035249328312534	0.2850240944608599	0.0067988257139596	0.2827515818074838	ARAP2	2595264	DTHD1	2632367	PCDH7	2928880	False	False	False	ref	65	0.001038	75	0.01318
2906	chr4	33652135	C	T	rs717947	-0.0407501904	0.0532583657427	0.0407501904	0.0497978262052157	0.00971642988046	0.3315566341998582	-0.0003989181728498	0.0643237287402416	0.0003989181728498	0.0606140546828595	0.276780879469704	0.5317161868551645	-0.0116991746154606	0.113418834271222	0.0116991746154606	0.1060265452763173	0.0027083369026554	0.4738754687137612	-0.000115207087083	0.1132562818316876	0.000115207087083	0.1065388098825531	-0.0341455824230541	0.016984932200641	0.0341455824230541	0.0165480891583412	ARAP2	2592379	DTHD1	2629482	PCDH7	2931765	False	False	False	ref	-100	0.0093	45	0.02515
2907	chr4	33653670	A	C	rs16989137	-0.0028071519	0.7533351940045092	0.0028071519	0.739903968161743	0.0202596708249364	0.0253731699147302	-5.9227016415671726e-05	0.5176256225720695	5.9227016415671726e-05	0.5054887403486943	0.0817664083652319	0.852578676655259	-0.0002681019036531	0.8382826835408812	0.0002681019036531	0.8242766504128134	0.0017070339676874	0.6399029575454647	-5.8317204195557375e-06	0.7119180581511134	5.8317204195557375e-06	0.6981375259318138	-0.0022510606956503	0.6478484531561668	0.0022510606956503	0.6350502664059804	ARAP2	2590844	DTHD1	2627947	PCDH7	2933300	False	False	False	ref	-5	4.58e-05	100	0.01498
2908	chr4	33675316	T	G	rs12649881	-0.00356032939	0.6929951077059747	0.00356032939	0.6795176148342773	0.0292900351385019	0.0045447749511512	-0.000111555135831	0.3587009529617485	0.000111555135831	0.348114397224829	0.0333302212678554	0.9415948228286006	-0.0001375244667683	0.9079726395520812	0.0001375244667683	0.8939032275612779	0.0010208964096297	0.7944708164477002	-4.460608740793375e-06	0.7700137636468367	4.460608740793375e-06	0.7560235358356673	-0.0018402680525731	0.701519740420636	0.0018402680525731	0.6885338451016663	ARAP2	2569198	DTHD1	2606301	PCDH7	2954946	False	True	False	ref	-100	0.006706	90	0.049
2909	chr4	33677917	G	A	rs28430802	-0.0444257398	0.0420824774158152	0.0444257398	0.0392578659897078	0.0094100001566703	0.3676352643569224	-0.0004454046756522	0.0635566257202672	0.0004454046756522	0.0599974566176417	0.0972997645203787	0.8318819960072008	-0.0046705644845044	0.2929927000735235	0.0046705644845044	0.2814092885308534	0.0009532618927584	0.8110347598220083	-4.952709243592522e-05	0.2875477912629338	4.952709243592522e-05	0.2768828682624882	-0.0340480710380812	0.0196680824095117	0.0340480710380812	0.0190706181956077	ARAP2	2566597	DTHD1	2603700	PCDH7	2957547	False	False	False	ref	-35	0.002657	15	0.0217
2910	chr4	33679486	C	T	rs16989149	0.0012337510312	0.8098122183107809	0.0018852515511999	0.8128226812826512	0.010896564370381	0.2378608180905166	1.7527900747388695e-05	0.7588409682317278	2.425312965839896e-05	0.7620262676736375	0.1439537754541022	0.7478468162028452	0.0003769648360773	0.8071039354893779	0.0004293910874322	0.8107783405529009	0.0016506989060401	0.6544542579448284	5.235953564088672e-06	0.7689245246581887	5.764871732710524e-06	0.7727463363479571	0.0012510503220987	0.713439004574156	0.0017780267430159	0.7170202610390333	ARAP2	2565028	DTHD1	2602131	PCDH7	2959116	False	False	False	alt	-10	0.003143	35	0.00958
2911	chr4	33680838	G	T	rs28379456	0.00140532746	0.8049401692011582	0.0019290458199999	0.8143314617864292	0.0182749141505057	0.0380138586166168	2.608013158060545e-05	0.6287553327236295	3.474549738663878e-05	0.6379320721712056	0.300384858764095	0.4942504555335077	0.000405945761204	0.6960517727781147	0.0005570161691118	0.7058448249253028	0.0055237488943333	0.1062258811548892	7.629519605961728e-06	0.5536896489401716	1.0129108055721256e-05	0.5634006932207377	0.0011120447307544	0.7188618699554723	0.0014854925880973	0.7280611887264007	ARAP2	2563676	DTHD1	2600779	PCDH7	2960468	False	False	False	alt	55	0.0003166	100	0.02953
2912	chr4	33682286	T	G	rs35071135	-0.00422118362	0.6312098115416194	0.00422118362	0.6180280320843589	0.018494347633542	0.0392022135088982	-7.912950469438993e-05	0.4033138196847856	7.912950469438993e-05	0.392177905083764	0.219398541478646	0.6273515095544985	-0.0009517869994071	0.6192120746278602	0.0009517869994071	0.605565977025055	0.0040547579230951	0.2453093642367924	-1.777855038189007e-05	0.4570298826028731	1.777855038189007e-05	0.4443729212612177	-0.0041452712165063	0.4464606099047031	0.0041452712165063	0.4357643592566164	ARAP2	2562228	DTHD1	2599331	PCDH7	2961916	False	False	False	ref	100	0.003677	100	0.02087
2913	chr4	33691030	T	G	rs1965242	-0.0004488760119999	0.777686188156129	0.002265294788	0.7837319259826718	0.0272533772090311	0.0062207884007991	-1.3568448259913127e-05	0.5329038790502019	6.216829551120687e-05	0.5369188877073371	0.2368821253332503	0.5970418530896013	-0.0002124112346158	0.7514938680044412	0.0005336837908809	0.7573494300746088	0.0064842352529712	0.0654748525762276	-6.135845181054862e-06	0.560035885571829	1.4683333163026264e-05	0.563894434261041	-0.0004709592423158	0.6729639573955897	0.0019191070446788	0.6784270655418604	ARAP2	2553484	DTHD1	2590587	PCDH7	2970660	False	True	True	ref	40	0.007607	75	0.03046
2914	chr4	33691708	A	G	rs12641809	-0.002269570524	0.7911047615562036	0.002269570524	0.7774320387650516	0.0171303204949372	0.0508709613509439	-3.880832375410706e-05	0.6124474526585626	3.880832375410706e-05	0.599783025425331	0.0370667745516031	0.9325500952998722	-9.019147359437252e-05	0.9311653076820102	9.019147359437252e-05	0.9170192163096268	0.0005910286534071	0.8781140258537422	-1.4426354803066415e-06	0.8849315137029607	1.4426354803066415e-06	0.870751986741066	-0.0012240790879573	0.7860707855031706	0.0012240790879573	0.7725769778506182	ARAP2	2552806	DTHD1	2589909	PCDH7	2971338	False	False	False	ref	5	0.0007324	100	0.05753
2915	chr4	33696251	A	G	rs67906834	0.0354895732	0.0703533628577517	0.0354895732	0.0746975916332633	0.007606401423833	0.6450060553210201	0.0002925347769069	0.1180320056132043	0.0002925347769069	0.1240190922983601	0.0734094752020248	0.8673815265267854	0.0029729036343806	0.3770951795028081	0.0029729036343806	0.3898645025531495	0.0005831281231601	0.8779208127385401	2.498613382778032e-05	0.4044795225754743	2.498613382778032e-05	0.416785627668001	0.0251828338468241	0.0481919386831743	0.0251828338468241	0.0497139183244336	ARAP2	2548263	DTHD1	2585366	PCDH7	2975881	False	False	False	alt	40	0.000994	30	0.01015
2916	chr4	33699839	G	A	rs73127069	-0.0381582018	0.0629099292833169	0.0381582018	0.0589065263733616	0.0113159291056288	0.2038671683357195	-0.0004429470304744	0.05630349008164	0.0004429470304744	0.053023954270871	0.37430263799417	0.3790205002344242	-0.0144378813526374	0.0823056489561802	0.0144378813526374	0.0763518269968604	0.0042486142816699	0.2198059918874237	-0.0001679533614525	0.0703674535665686	0.0001679533614525	0.0656476240421672	-0.023346715214888	0.0541196519214272	0.023346715214888	0.0527559601450499	ARAP2	2544675	DTHD1	2581778	PCDH7	2979469	False	False	False	ref	-75	0.00653	0	0.0
2917	chr4	33702967	A	G	rs67509867	0.0067112837799999	0.4575945570679507	0.0067112837799999	0.4700210400218029	0.0106083161218135	0.2589435949223367	7.191261040550464e-05	0.4053842813084716	7.191261040550464e-05	0.4166374427336955	0.1337337524248176	0.769444535479845	0.0008858218554547	0.6095875369941354	0.0008858218554547	0.6232795037958634	0.0014642001580414	0.7036447394177517	9.826797147096605e-06	0.5649031161472571	9.826797147096605e-06	0.5783080567538553	0.0063506882851481	0.2935754689293547	0.0063506882851481	0.3022300162110283	ARAP2	2541547	DTHD1	2578650	PCDH7	2982597	False	False	False	alt	25	0.001938	-50	0.03162
2918	chr4	33703438	A	G	rs10019596	0.0332171116	0.0761199463295332	0.0332171116	0.0810876043360351	0.0080900960230327	0.5825733648880288	0.000274772725387	0.109496991537972	0.000274772725387	0.1154430203316205	0.2135914272969636	0.6315728449854141	0.0079380984844526	0.1700919429376942	0.0079380984844526	0.1802089793011924	0.0017758604403053	0.6456739313026302	6.731204664587749e-05	0.1948097498271508	6.731204664587749e-05	0.2046701885410787	0.0303841326154835	0.0263479664340259	0.0303841326154835	0.0271037879891474	ARAP2	2541076	DTHD1	2578179	PCDH7	2983068	False	False	False	alt	-90	0.009056	100	0.01512
2919	chr4	33704374	T	G	rs13130383	0.1500577212	0.0005544909344174	0.1500577212	0.0005646438557694	0.0646597247664526	0.000282996806611	0.011902043536526	0.0003088097027642	0.011902043536526	0.0003177324383754	0.264872042241102	0.5502288145945406	0.0428323782175167	0.0065665323653883	0.0428323782175167	0.0070473193183804	0.0184055956612016	0.003656592525505	0.0035991955680623	0.0010378628607513	0.0035991955680623	0.0011133709109882	0.1370512142242139	4.959118731855833e-05	0.1370512142242139	5.268184808143717e-05	ARAP2	2540140	DTHD1	2577243	PCDH7	2984004	False	True	True	alt	-25	0.0005035	-10	0.00769
2920	chr4	33707202	A	C	rs34151233	-0.006366286972	0.496221120334745	0.0065105279879999	0.4869172913607852	0.030974488282446	0.0036191089815714	-0.0002118777289279	0.1798553415782516	0.0002152565173771	0.1734720536489993	0.1653440388385771	0.7107434031447146	-0.0011227574198702	0.5896896938383794	0.0011435409106085	0.5801524997394939	0.005192894905391	0.1251863401793614	-3.752148142394785e-05	0.3185500131634372	3.800832642813511e-05	0.3095282280694263	-0.0065685328685981	0.3292702634302255	0.0066681189638895	0.322906063691915	ARAP2	2537312	DTHD1	2574415	PCDH7	2986832	False	True	True	ref	100	0.0786	100	0.08203
2921	chr4	33709195	G	T	rs10025016	0.002113397654	0.7816840882395258	0.002270920866	0.7894601735963517	0.0185521392464906	0.0372747309877059	3.611163121549056e-05	0.6088570037448999	3.947273557684391e-05	0.6167556726836297	0.0625068724779302	0.8853238526966951	0.0001223573752319	0.8795794766708969	0.0001347126176791	0.8872375266296909	0.0011714868064419	0.7561551153915644	2.0844932017526632e-06	0.8077713508423175	2.3481194849733675e-06	0.8153329843362007	0.0014211765682216	0.7118855548766393	0.001578854552433	0.7196640364927386	ARAP2	2535319	DTHD1	2572422	PCDH7	2988825	False	False	False	alt	40	0.002045	-60	0.01733
2922	chr4	33710208	G	A	rs34365744	-0.0567186688	0.019474191187807	0.0567186688	0.0182655951781097	0.0112600232325771	0.2098460689237485	-0.0006647401923532	0.0291396953003988	0.0006647401923532	0.0274696525548111	0.3055778586914802	0.4865643573202244	-0.0171646574706524	0.0615827475360992	0.0171646574706524	0.056963301756797	0.0034306118593548	0.3387707644460279	-0.0002010383933855	0.0569447428809958	0.0002010383933855	0.0531307447513329	-0.0462120976358675	0.0067809591896791	0.0462120976358675	0.0066210390754738	ARAP2	2534306	DTHD1	2571409	PCDH7	2989838	False	True	False	ref	5	2.67e-05	-50	0.03802
2923	chr4	33713717	A	G	rs4475134	0.0001685026459999	0.8007420336863191	0.002172904686	0.8052297595171751	0.0076443060387882	0.6530439949172874	3.71131308019392e-07	0.8241465521411088	1.5820244492899953e-05	0.8287036691045829	0.0514009481426155	0.9090526305435096	2.9474963733383363e-06	0.903516013411889	0.0001127080641395	0.9084216556700768	0.0004013120316979	0.9176936474246332	1.0215264725124386e-09	0.9113244113346364	8.504899184166138e-07	0.9162076119334144	8.29884127428e-06	0.7744286854605	0.0011950331434972	0.7788727570336318	ARAP2	2530797	DTHD1	2567900	PCDH7	2993347	False	False	False	alt	15	0.000553	-100	0.05582
2924	chr4	33714149	A	C	rs9992483	-0.0041950397399999	0.4998604975751777	0.0063045709399999	0.4908317424180111	0.0127450718151641	0.1387352109062393	-4.876695795302421e-05	0.3885206214792249	7.92229633166064e-05	0.380633372889314	0.0319360159337752	0.942905284036104	-0.0001165632007379	0.8513390114011016	0.0001965905384813	0.8411715671153965	0.0004061665080024	0.9167376301364674	-1.3065365074671125e-06	0.8071499370464367	2.4619179078407687e-06	0.7970005963318914	-0.0019211817549974	0.5342318092239525	0.003095467795309	0.5264249866362062	ARAP2	2530365	DTHD1	2567468	PCDH7	2993779	False	False	False	ref	-65	0.00441	-5	0.004242
2925	chr4	33714463	T	G	rs9995588	-0.0120055292	0.3335541467529921	0.0120055292	0.3222480243669854	0.0095438130254848	0.3461939933269335	-0.0001154634796149	0.3259110330973659	0.0001154634796149	0.3157069058293777	0.0633865496530046	0.8876361271607338	-0.0008003142856312	0.6712943062360451	0.0008003142856312	0.657421500799744	0.0006165391219334	0.8746623266419857	-7.834033266546752e-06	0.6549291978750087	7.834033266546752e-06	0.6412601448879097	-0.0082967665639684	0.2598041809760025	0.0082967665639684	0.2524251838277399	ARAP2	2530051	DTHD1	2567154	PCDH7	2994093	False	False	False	ref	0	0.0	50	0.02797
2926	chr4	33717975	C	T	rs1596581	-0.00081700794	0.8120337791262793	0.00216624994	0.803166366388922	0.0122435923679013	0.1543306912675929	-1.1451303460145365e-05	0.7354549459486315	2.6337559705451225e-05	0.726858526252903	0.0264110623554185	0.9518093105043552	-1.6434593704493404e-05	0.9478366576698936	6.21329436156934e-05	0.9381340360255852	0.0003234810548478	0.9313103245532136	-2.4968389041558494e-07	0.9297090752768395	7.53876118975255e-07	0.9199616825464708	-0.0001887986389899	0.8166002000299819	0.0010145333457815	0.8079283525750957	ARAP2	2526539	DTHD1	2563642	PCDH7	2997605	False	False	False	ref	90	0.0451	75	0.0242
2927	chr4	33729254	G	C	rs67655711	-0.0031462371608	0.6878851343764834	0.0031931521192	0.6789236306797276	0.0075346887830358	0.688907931897197	-2.3969415814078387e-05	0.7210074924968656	2.4299452589613264e-05	0.7123857072815794	0.0016991877509102	0.9963807023423902	-6.925933950645293e-06	0.9900088475069284	6.961461206854777e-06	0.9873307434744736	1.2983119086024044e-05	0.9969027881500896	-5.3177831518983893e-08	0.9907636778138188	5.342775822583818e-08	0.9884917544856344	-0.0001535285635742	0.9711021561809222	0.0001535285635742	0.9641565429286866	ARAP2	2515260	DTHD1	2552363	PCDH7	3008884	False	False	False	ref	30	0.0008087	60	0.02411
2928	chr4	33729400	C	T	rs35304177	-0.0293720435999999	0.1099412567417319	0.0293720435999999	0.1039037095844723	0.0133327317243499	0.1286646054193023	-0.0004036701223831	0.0664500958918052	0.0004036701223831	0.0628392622266938	0.0018755381279888	0.9963892067710032	-5.786228932292709e-05	0.9511330998522562	5.786228932292709e-05	0.9371499617857147	2.8057762556888147e-05	0.9940526353495664	-8.727912053671701e-07	0.9219630656480244	8.727912053671701e-07	0.90779886853553	-0.00076971752819	0.8612127084235364	0.00076971752819	0.8474348339563276	ARAP2	2515114	DTHD1	2552217	PCDH7	3009030	False	False	False	ref	-100	0.001106	-85	0.01245
2929	chr4	33730103	T	C	rs28530710	-0.003021303712	0.7261389205067721	0.003021303712	0.7125645256557432	0.0154621605609841	0.0783982346606366	-5.222913931835609e-05	0.5552591479486285	5.222913931835609e-05	0.5428490546250392	0.0494465710225209	0.9112318325230292	-0.000241642039278	0.8691270479095946	0.000241642039278	0.8579658946532599	0.000940555031073	0.7827735211606633	-4.891328754312051e-06	0.7893377651579043	4.891328754312051e-06	0.7767800350884272	-0.0020809344495274	0.6825733680774763	0.0020809344495274	0.6712155612298546	ARAP2	2514411	DTHD1	2551514	PCDH7	3009733	False	False	False	ref	-15	0.001343	-55	0.01478
2930	chr4	33731591	C	T	rs28801803	-0.0031538808799999	0.4137114077304661	0.0087348852799999	0.4070576182182739	0.0089636229926439	0.4248724546892514	-2.903767951329093e-05	0.4175203928677098	7.849869122133094e-05	0.4106726592342367	0.2850755713233539	0.510591305241616	-0.0009833192631569	0.3986382095119677	0.0027185433653314	0.3906831333398894	0.0025777743253412	0.4820199326887059	-9.185246603455171e-06	0.3962478126270826	2.4563470889117827e-05	0.3884121496504963	-0.0017012624612288	0.3168062330580395	0.0065477857654124	0.3118380551831078	ARAP2	2512923	DTHD1	2550026	PCDH7	3011221	False	False	False	ref	-95	0.003555	35	0.02264
2931	chr4	33732965	T	C	rs28780405	0.002662593386	0.6437036454550705	0.003495245866	0.6539405481601225	0.0064880214796403	0.8559009927050811	1.581186019320936e-05	0.7135591035706746	2.2084602550268623e-05	0.7230282561205433	0.2381954169649062	0.5906646748884775	0.0006342065839767	0.6154798888888938	0.0008769739445894	0.6258644081647573	0.0015810394673552	0.6772591366073243	3.7624341894119214e-06	0.6663950297602835	5.591308935908335e-06	0.6762935004554924	0.0026660027593647	0.5136372302515599	0.0033299100613076	0.5214207705100267	ARAP2	2511549	DTHD1	2548652	PCDH7	3012595	False	False	False	alt	-30	0.000519	-70	0.015564
2932	chr4	33733709	G	A	rs61139508	-0.0011261504625999	0.7961769240153636	0.0020664408774	0.7908107242980409	0.0082211630910787	0.5431352032190829	-8.056550771763634e-06	0.7994840503915591	1.652037097820633e-05	0.794524040039492	0.1099492733327109	0.7974665013220882	-0.0002415867585058	0.8161302365182994	0.0002970003022206	0.8101240815871344	0.0008771805982481	0.8104347262090769	-1.8134100909774568e-06	0.8230326587477023	2.312444638677852e-06	0.8171364940832166	-0.0012178549570016	0.6621985396078159	0.0019149576240417	0.6571234747499334	ARAP2	2510805	DTHD1	2547908	PCDH7	3013339	False	False	False	ref	80	0.003378	100	0.01405
2933	chr4	33733813	C	G	rs10017591	-0.026994725	0.1237434786695191	0.026994725	0.1171388761666955	0.0122997400294033	0.1637576187172091	-0.0003465386177787	0.0851620247749698	0.0003465386177787	0.0809257573270978	0.114449320013693	0.7887382481906312	-0.0028718435500308	0.3773607188965057	0.0028718435500308	0.3648872899705417	0.0013775050477707	0.7018515701814891	-3.719247748888593e-05	0.3025473499230049	3.719247748888593e-05	0.2913399407703303	-0.0216496021742963	0.0599560014360653	0.0216496021742963	0.0581812804357496	ARAP2	2510701	DTHD1	2547804	PCDH7	3013443	False	False	False	ref	-25	0.000963	65	0.01682
2934	chr4	33735000	A	G	rs28764846	0.0469232844	0.0334532238868134	0.0469232844	0.0356848208263558	0.0106149398043023	0.2643123812719741	0.0005362144794077	0.0423833958171614	0.0005362144794077	0.0449566897258052	0.3604809178518449	0.4003128249276613	0.0172170332987782	0.0543186574106937	0.0172170332987782	0.0590818388195138	0.0038449138898016	0.2803491474991023	0.0001978954039865	0.0553650460534448	0.0001978954039865	0.0594683546720897	0.0309940974491436	0.0268314569786321	0.0309940974491436	0.0276270640630105	ARAP2	2509514	DTHD1	2546617	PCDH7	3014630	False	False	False	alt	-55	0.0007973	-25	0.02005
2935	chr4	33739693	T	A	rs9996627	0.0120995354	0.2879882063855409	0.0120995354	0.2989140464256852	0.0211615787170977	0.0205863265892028	0.0002619324476262	0.1174147462854805	0.0002619324476262	0.1236901697001543	0.235875890828743	0.5948565772311426	0.0028716927561533	0.3557456140582693	0.0028716927561533	0.3681472148411579	0.0048534748768066	0.1612138503971043	6.000072628491131e-05	0.1908050521534964	6.000072628491131e-05	0.2002717275786868	0.0105146318945217	0.1662058544462171	0.0105146318945217	0.1716291512681647	ARAP2	2504821	DTHD1	2541924	PCDH7	3019323	False	False	False	alt	-65	0.00354	-100	0.05002
2936	chr4	33742285	T	C	rs7674046	-0.00904965988	0.3996184140041789	0.00941174172	0.390511689910033	0.009489153044513	0.3538784054401678	-9.28953030885273e-05	0.3801739776544749	9.574324935203018e-05	0.3719313483963875	0.4713762590898246	0.2193686640997697	-0.0043328869834333	0.296639339830922	0.0044978875907574	0.2872174701120259	0.0044801064787179	0.1924552543901566	-4.445962115122682e-05	0.2810934411050482	4.575742954560247e-05	0.2724818689260782	-0.0034606168113776	0.504829109380067	0.0035933982717662	0.4971074605847297	ARAP2	2502229	DTHD1	2539332	PCDH7	3021915	False	False	False	ref	100	0.001335	95	0.0709
2937	chr4	33744538	T	C	rs13113238	0.0362182969999999	0.0638108877312793	0.0362182969999999	0.0681497372080982	0.0084388352592749	0.5164490616953012	0.0003249696503737	0.0912085048907629	0.0003249696503737	0.0963306033818677	0.0960943578252886	0.8343839059306101	0.0037551313130781	0.311197259684899	0.0037551313130781	0.3233960050636993	0.0008666746483361	0.8313730775058409	3.5743593086611906e-05	0.322639554275234	3.5743593086611906e-05	0.3341732385659371	0.029431840579259	0.0290546467260183	0.029431840579259	0.0298386990609815	ARAP2	2499976	DTHD1	2537079	PCDH7	3024168	False	False	False	alt	75	0.002354	85	0.02124
2938	chr4	33745786	A	G	rs7693464	-0.0086446672	0.4319297210438078	0.0086446672	0.4197664650764867	0.0068306588564946	0.8113901373212893	-6.105016800188331e-05	0.5116579771918307	6.105016800188331e-05	0.4994089644346876	0.0407224141329266	0.927773909081647	-0.00039547588032	0.7962263814721856	0.00039547588032	0.781878030271668	0.0002826772821063	0.941611636070382	-2.827205780228528e-06	0.8235547793919629	2.827205780228528e-06	0.8091951659804579	-0.0048112532287678	0.4152398236203238	0.0048112532287678	0.4050592214694427	ARAP2	2498728	DTHD1	2535831	PCDH7	3025416	False	False	False	ref	-55	0.0005836	-80	0.00957
2939	chr4	33746904	A	C	rs1373494	-0.0038313683039999	0.6556023118367934	0.003999474056	0.6453003558600962	0.0067050474781702	0.8392955659382777	-2.505025044225803e-05	0.7175726059852301	2.618038956826137e-05	0.7077312364330328	0.2433116526105042	0.5846047806765065	-0.0009373929519955	0.6202675488573055	0.0009706360345878	0.609426097989588	0.0016349296369788	0.6678314733889774	-6.15126426111713e-06	0.6662817299624479	6.37475041926194e-06	0.6558234390361445	-0.0031846803390076	0.5143432551591111	0.0033050135374847	0.5054228123328113	ARAP2	2497610	DTHD1	2534713	PCDH7	3026534	False	False	False	ref	-95	0.00605	60	0.03973
2940	chr4	33751346	C	T	rs1822683	0.00138987752	0.8320179167268209	0.00167870866	0.8413646087446249	0.0120775507477797	0.1739759188425758	1.6715316090766448e-05	0.7725074878520638	1.9472895765768102e-05	0.7819272653136291	0.0365252751584559	0.93534450666956	3.635818055331039e-05	0.9369232325360564	4.818420062865647e-05	0.9461911895124816	0.0004603271541994	0.9059536833084856	4.853286229009187e-07	0.9205809603473464	5.982360905845207e-07	0.9299606255886816	0.0005726200479257	0.8404693450943401	0.0007510451353229	0.8497155643090025	ARAP2	2493168	DTHD1	2530271	PCDH7	3030976	False	False	False	alt	100	0.002651	40	0.02023
2941	chr4	33772700	G	A	rs3863828	0.0102630335399999	0.3517105738872341	0.0102630335399999	0.3633116855533498	0.0070717448216647	0.7769429259709211	7.380197797578654e-05	0.4265825880967144	7.380197797578654e-05	0.4380589770271064	0.0653367773524621	0.8837247567729334	0.0006375293810905	0.6801085871930371	0.0006375293810905	0.6942815711467942	0.0004714111239187	0.9036140558956364	4.652567601989977e-06	0.7124486998971311	4.652567601989977e-06	0.726673964252596	0.0068755899957468	0.2727346315955074	0.0068755899957468	0.2805958789080017	ARAP2	2471814	DTHD1	2508917	PCDH7	3052330	False	False	False	alt	-85	0.007492	-90	0.01536
2942	chr4	33778147	A	G	rs28538874	0.0116364715399999	0.3248611973640557	0.0116364715399999	0.336465933274197	0.0175134821490289	0.0470803456024329	0.0002119784267816	0.1721264866323594	0.0002119784267816	0.1797470396164836	0.0164690505088226	0.9736627808641148	0.0002735487715157	0.8375462627257105	0.0002735487715157	0.8515512973199769	0.0003354764132165	0.9358003154804012	5.699796221638565e-06	0.7443338982004037	5.699796221638565e-06	0.7582234167660533	0.0035726511685805	0.5533100345672481	0.0035726511685805	0.565011981406301	ARAP2	2466367	DTHD1	2503470	PCDH7	3057777	False	False	False	alt	15	0.001343	100	0.01403
2943	chr4	33793271	C	T	rs66770627	0.00483276746	0.5756392023258637	0.00483276746	0.588611623562143	0.0246752671445761	0.010309527977544	0.0001239195360246	0.2865269459937549	0.0001239195360246	0.296742757318078	0.0567163559787964	0.8989089736577418	0.0003039867768004	0.7932634560606062	0.0003039867768004	0.8073680244160336	0.001427534711761	0.7045847733413251	8.00168444938382e-06	0.6298582732896377	8.00168444938382e-06	0.6434419962468493	0.0032738928827062	0.5176730732499534	0.0032738928827062	0.5297056578482617	ARAP2	2451243	DTHD1	2488346	PCDH7	3072901	False	True	False	alt	-90	0.01376	-30	0.01326
2944	chr4	33797580	C	T	rs6832462	-0.0325618616	0.0905473704150942	0.0325618616	0.0853045608508976	0.0154164272601864	0.0741207421431595	-0.0005406511669678	0.0490732901100232	0.0005406511669678	0.0463091554750421	0.0024917270926046	0.9952534037490496	-7.878151889011298e-05	0.9397868755571832	7.878151889011298e-05	0.925688723650787	3.50080689646213e-05	0.9926133403663464	-1.1870664800337375e-06	0.9055573700197792	1.1870664800337375e-06	0.8913682832972709	-0.0010124586354629	0.8242312937089248	0.0010124586354629	0.8105252195123506	ARAP2	2446934	DTHD1	2484037	PCDH7	3077210	False	False	False	ref	25	0.00177	45	0.00885
2945	chr4	33804523	A	G	rs59554896	-0.00224520007	0.7685835035268928	0.00224520007	0.7547412251009555	0.018980984305399	0.0338038117846404	-4.6335147295877605e-05	0.5547920266888071	4.6335147295877605e-05	0.5424296872504232	0.0403883857716365	0.926652882100084	-0.0001032654217225	0.9132043106732084	0.0001032654217225	0.9007116551008479	0.0007886776985553	0.8360890995974437	-2.146892647029205e-06	0.8374377228006994	2.146892647029205e-06	0.8237706807337228	-0.0014502225126816	0.7424080397368518	0.0014502225126816	0.7290606809435953	ARAP2	2439991	DTHD1	2477094	PCDH7	3084153	False	False	False	ref	35	0.002403	35	0.006165
2946	chr4	33805577	C	A	rs67910708	0.01480777166	0.2479109526797597	0.01480777166	0.2582257358427559	0.0187559845446018	0.0356916532254546	0.0002884458284455	0.1060890974916143	0.0002884458284455	0.1118979870938134	0.1875496633782508	0.678473124154397	0.0029296278682567	0.3530621669727413	0.0029296278682567	0.3654489471889172	0.0036784902403995	0.3014152983273288	5.953526068451552e-05	0.2094377189753795	5.953526068451552e-05	0.2193710826100735	0.0145125986784095	0.126417801584659	0.0145125986784095	0.1301857277985013	ARAP2	2438937	DTHD1	2476040	PCDH7	3085207	False	False	False	alt	100	0.002762	100	0.03333
2947	chr4	33806081	G	A	rs58656292	-0.0194604953	0.1954012321393797	0.0194604953	0.1865314229589902	0.0089887608069871	0.4191274802381087	-0.0001681209310111	0.2139262148802007	0.0001681209310111	0.2054116734002115	0.1263000653533749	0.7823674178994342	-0.0025892406460609	0.4148537278955553	0.0025892406460609	0.4022277712034979	0.0011312079233153	0.7730889223621732	-2.225266121762136e-05	0.4194479809216899	2.225266121762136e-05	0.4073175611143905	-0.017896451208	0.088321847018251	0.017896451208	0.0858924794749673	ARAP2	2438433	DTHD1	2475536	PCDH7	3085711	False	False	False	ref	20	0.001303	-75	0.03732
2948	chr4	33808769	A	C	rs13104973	0.0178407502	0.1820722860773931	0.0178407502	0.1909594636664809	0.0078999839860843	0.5911927383439499	0.0001448845578554	0.2150342189384956	0.0001448845578554	0.2237652218644581	0.111949294079814	0.8029500320719377	0.002039066205337	0.4235613261916626	0.002039066205337	0.4369285264211219	0.0008888489978259	0.8145959640903616	1.6622363341607995e-05	0.4397111853372058	1.6622363341607995e-05	0.4527519619574395	0.0165810848660255	0.0831406468445997	0.0165810848660255	0.0858300792147612	ARAP2	2435745	DTHD1	2472848	PCDH7	3088399	False	False	False	alt	-100	0.00434	40	0.02533
2949	chr4	33817320	T	C	rs3910837	0.002171703738	0.7469639644464046	0.002743894062	0.7539730420367365	0.0152863971722524	0.0788920674074175	2.6279719782481512e-05	0.6467878607266062	3.5861215177838195e-05	0.6529445796956542	0.1549538895631697	0.7321783747545685	0.0003576716548515	0.7732800535214234	0.0004787837468815	0.7794140719626428	0.0023651900970729	0.5258987618687169	4.0792850993932455e-06	0.7041999736017295	6.108810161936248e-06	0.7102548194814066	0.0020518885050674	0.6023312204177659	0.0026369568149046	0.607921850388534	ARAP2	2427194	DTHD1	2464297	PCDH7	3096950	False	False	False	alt	95	0.00307	-25	0.0162
2950	chr4	33820204	T	G	rs7689692	1.786999999999982e-05	0.8196981487011104	0.00180689016	0.8205892362782325	0.0237870600446931	0.0126020080869747	3.818144782500289e-07	0.570893568713379	4.218673490060213e-05	0.5710224912518406	0.0463448790962561	0.9162860848427844	5.512737579759308e-06	0.9111482295383988	8.56122538009304e-05	0.9125888413876332	0.0010979036243232	0.7783875584133428	1.2689042375591517e-07	0.8253369946997755	1.98634308112174e-06	0.8264601489361856	-1.2448261911419978e-05	0.7860869070588689	0.0011037458894801	0.7872428616373083	ARAP2	2424310	DTHD1	2461413	PCDH7	3099834	False	True	False	alt	-70	0.001796	-40	0.01488
2951	chr4	33881744	T	C	rs10008587	0.063478037	0.0115729047243921	0.063478037	0.0123618364307708	0.0131381916727341	0.1274939240097094	0.0008642630269113	0.0157839563427349	0.0008642630269113	0.0166476188782238	0.2579985269556738	0.5654231266050271	0.0166859102899887	0.0550664785936483	0.0166859102899887	0.0598550646840537	0.0034171425100052	0.347997657289598	0.0002286101606856	0.0405990255665344	0.0002286101606856	0.0437510866287378	0.0588699052894739	0.0022043392510264	0.0588699052894739	0.0022461112301242	ARAP2	2362770	DTHD1	2399873	PCDH7	3161374	False	True	False	alt	-95	0.014435	-45	0.0213
2952	chr4	33911934	C	A	rs12640723	0.00359840736	0.6563143427324689	0.00359840736	0.6697832941250625	0.0200440111207318	0.0265310952965533	7.098903960776667e-05	0.4132405226420692	7.098903960776667e-05	0.4249135814363878	0.0861523459786926	0.8466863816362656	0.0002664322032886	0.7935051531388975	0.0002664322032886	0.8078533556620447	0.0018227164696802	0.6138655153393223	5.4377812254746e-06	0.6641234742209134	5.4377812254746e-06	0.6781953791529376	0.0027884106681604	0.5418648401173609	0.0027884106681604	0.553735744123958	ARAP2	2332580	DTHD1	2369683	PCDH7	3191564	False	False	False	alt	-50	0.006195	100	0.04132
2953	chr4	33920005	T	G	rs7683507	-0.0088621202	0.4180229874119912	0.0088621202	0.4059799854890954	0.022798409809955	0.0163109687625197	-0.0002205495596037	0.1807830294871524	0.0002205495596037	0.1732830089822706	0.2082469735163227	0.6453199444038391	-0.0019301667880862	0.4774084361075536	0.0019301667880862	0.4642330614151481	0.0048405699153659	0.1610049608201585	-4.860131539143154e-05	0.2730340871274507	4.860131539143154e-05	0.2624404682569037	-0.0087988464610628	0.2494446604827843	0.0087988464610628	0.2424143035014875	ARAP2	2324509	DTHD1	2361612	PCDH7	3199635	False	True	False	ref	15	0.000721	65	0.02904
2954	chr4	33935499	G	A	rs28691127	0.00572633806	0.5287160852233497	0.00572633806	0.5421194111168987	0.0245408512431976	0.0102945156511107	0.0001476476126798	0.2587134827045282	0.0001476476126798	0.2685356656068063	0.0535482733223373	0.9042113683875118	0.0003481233343765	0.778323365259135	0.0003481233343765	0.792525141518115	0.0013214290710944	0.7349617992789461	9.034898765909603e-06	0.6107892343777721	9.034898765909603e-06	0.6244155205997389	0.0042593802840278	0.4583438628667933	0.0042593802840278	0.4691619791003242	ARAP2	2309015	DTHD1	2346118	PCDH7	3215129	False	True	False	alt	-100	0.009735	100	0.01099
2955	chr4	33965964	C	A	rs16989276	0.0069702453	0.4735304843017184	0.0069702453	0.4865439838006778	0.0091703660358387	0.3697247566990114	6.733739426772881e-05	0.4588223168930864	6.733739426772881e-05	0.4711297131919567	0.1296465730972312	0.772246065659124	0.0008704127431302	0.61937933282676	0.0008704127431302	0.6336934533166811	0.0011582704562686	0.7618336702382469	8.129479704767053e-06	0.6073075989492244	8.129479704767053e-06	0.621453026327388	0.0063257917613252	0.3008687670941231	0.0063257917613252	0.3088460425409062	ARAP2	2278550	DTHD1	2315653	PCDH7	3245594	False	False	False	alt	65	0.00981	100	0.03748
2956	chr4	33967089	G	A	rs34920686	-0.0343727492	0.0790878039146087	0.0343727492	0.0742188098307473	0.0101126596231554	0.2877929967103443	-0.0003496700389511	0.0795767524157861	0.0003496700389511	0.0751391991743824	0.0630981649187231	0.8828207768627655	-0.0021502976394288	0.439638303485024	0.0021502976394288	0.4264639440436293	0.0006388747476937	0.8623826134997863	-2.191949972709385e-05	0.4067590616221152	2.191949972709385e-05	0.394448314459935	-0.0218757455990207	0.0534525993403014	0.0218757455990207	0.0519900309123265	ARAP2	2277425	DTHD1	2314528	PCDH7	3246719	False	False	False	ref	-100	0.002144	95	0.07697
2957	chr4	33973377	C	T	rs6814473	0.00110768162	0.7140332758724526	0.00280240818	0.7191858854129074	0.0076084455880728	0.667358811746978	9.730240936187342e-06	0.7442636238340813	2.118012598067895e-05	0.7500609140972253	0.1090841191298664	0.8113707872974867	0.0001772499743775	0.7865252404020456	0.0003074675047944	0.7930667064849912	0.0008622945910217	0.830579308532234	1.5480279173192048e-06	0.8030799013751173	2.427801551117785e-06	0.809726085943564	0.0008485565202958	0.5707942206898239	0.0026452556561789	0.5761500301133008	ARAP2	2271137	DTHD1	2308240	PCDH7	3253007	False	False	False	alt	-100	0.001735	-100	0.02719
2958	chr4	34012097	T	C	rs35883430	0.0005846834399999	0.8075513437975226	0.00194979452	0.8090610626682069	0.0162096232732478	0.062608851228097	6.98886508340757e-06	0.6544877785478488	3.183370135885425e-05	0.6554868694892542	0.2407369371051566	0.5726912438309912	8.22621914032638e-05	0.7272636041147782	0.0004907589520225	0.7279672893969427	0.0041320086402986	0.19623133125618	1.049734937810944e-06	0.6089119886950491	8.47892362289499e-06	0.6089980692862343	0.0003547754644757	0.7194632483459934	0.001549808607973	0.7209967606956871	ARAP2	2232417	DTHD1	2269520	NWD2	3232647	False	False	False	alt	100	0.004578	100	0.01758
2959	chr4	34022109	C	G	rs7665880	-0.0488961352	0.029774439047596	0.0488961352	0.0280587695908176	0.0214874796087907	0.0197492086523753	-0.0010847812988693	0.0123616326943572	0.0010847812988693	0.0118170546397853	0.3984916855983983	0.3334876443113844	-0.0194588385781901	0.0465234977526676	0.0194588385781901	0.043057627762689	0.0084041738824139	0.0250568796748725	-0.0004241087781121	0.0173855289002903	0.0004241087781121	0.016302782981064	-0.0276455149949688	0.0277836187814806	0.0276455149949688	0.0270067381997727	ARAP2	2222405	DTHD1	2259508	NWD2	3222635	False	True	False	ref	85	0.0003662	95	0.0359
2960	chr4	34022788	T	G	rs13130693	0.000462617626	0.9130712433714294	0.0007757393139999	0.9191131079271296	0.0259623275407276	0.0079439789520376	1.137620447908168e-05	0.7551775561050181	1.99110020409658e-05	0.7593475366964266	0.3019056214276081	0.487844139060372	0.0001666766316844	0.8163387527416841	0.0002549681670173	0.8195836712698358	0.0079708857978039	0.03323980900817	4.213605680526018e-06	0.6551349796556892	6.623511302827906e-06	0.6568880751075441	0.0002240687144057	0.8900090029002604	0.0004896316351828	0.8947090459994897	ARAP2	2221726	DTHD1	2258829	NWD2	3221956	False	True	True	alt	35	0.00218	100	0.002136
2961	chr4	34025177	C	A	rs12647107	-0.0143559472	0.2624654145613098	0.0143559472	0.2522984727153766	0.0080357016758105	0.5407780693356833	-0.0001213742738946	0.2967552986031085	0.0001213742738946	0.2869535776065982	0.1515409910891191	0.7366547598186133	-0.0021552117440608	0.442106700053733	0.0021552117440608	0.4290184209220123	0.0012306997966477	0.744585222612323	-1.827764763279944e-05	0.4561057504115853	1.827764763279944e-05	0.443364306205101	-0.0134897664913536	0.1247291730391021	0.0134897664913536	0.1209609039271859	ARAP2	2219337	DTHD1	2256440	NWD2	3219567	False	False	False	ref	-90	0.01332	-45	3.05e-05
2962	chr4	34039357	C	G	rs35930604	0.0385794348	0.0529128094285364	0.0385794348	0.056793064899959	0.0105044891096339	0.2543191379428992	0.0004044857314533	0.054286219549592	0.0004044857314533	0.0578304015530929	0.4430149690349484	0.2567065500107489	0.0172056601073335	0.0511110292036415	0.0172056601073335	0.0556223287966857	0.004612051426102	0.1783984711677604	0.0001788722523693	0.0521659528696268	0.0001788722523693	0.0563615003898661	0.0167989294494755	0.083591465507924	0.0167989294494755	0.0861097948126192	ARAP2	2205157	DTHD1	2242260	NWD2	3205387	False	False	False	alt	5	0.0005493	-45	0.01978
2963	chr4	34039921	G	A	rs67951022	0.00544742066	0.479312991494758	0.0071540145	0.4883863065911075	0.0132122573570821	0.1214790529748889	7.262478811401161e-05	0.3727764367434912	9.50036738696908e-05	0.3804353998842933	0.4461581551675847	0.2523220468837446	0.0022221186507565	0.359473209656676	0.0030696885162133	0.3677937693437818	0.0059554086381856	0.0856917750671241	3.0127651895972616e-05	0.279730404036391	4.124199472565857e-05	0.286875251094179	0.0024668305687818	0.5335788262559419	0.0030436000373447	0.5418829329811886	ARAP2	2204593	DTHD1	2241696	NWD2	3204823	False	False	False	alt	-80	0.007645	35	0.01929
2964	chr4	34041165	A	G	rs6531289	0.0234041815999999	0.1467462121709367	0.0234041815999999	0.1547032321230593	0.0069811964602218	0.7792353313527298	0.0001616589585987	0.2123144029430424	0.0001616589585987	0.2210166129418533	0.1141858318032344	0.8017476656517699	0.0026905856818321	0.3750196158979731	0.0026905856818321	0.3874417977242286	0.0007932676243248	0.8391736801521552	1.8497614530335123e-05	0.4308130436015926	1.8497614530335123e-05	0.4432677636494788	0.0202968910465875	0.0689236693436148	0.0202968910465875	0.0708549708248593	ARAP2	2203349	DTHD1	2240452	NWD2	3203579	False	False	False	alt	40	0.01518	100	0.02805
2965	chr4	34065590	T	C	rs6824096	0.0172499452	0.2083141704578542	0.0172499452	0.2178215863819819	0.0063627548782263	0.8862178562652843	0.0001106940498722	0.3003831906385893	0.0001106940498722	0.3103619129486713	0.0564964366850278	0.8990283649190348	0.0009553944159397	0.5925870938414914	0.0009553944159397	0.6062104897433112	0.0003572409620117	0.9255059023297488	6.104489878863573e-06	0.6534299179889564	6.104489878863573e-06	0.6671502610436478	0.0107138040851045	0.1715528928554134	0.0107138040851045	0.177306155531478	ARAP2	2178924	DTHD1	2216027	NWD2	3179154	False	False	False	alt	-100	0.006195	-100	0.01427
2966	chr4	34066372	G	A	rs59339146	0.003910480468	0.6499048551618305	0.003910480468	0.6631801170008202	0.0080442093206038	0.5818769513609203	3.204967601433906e-05	0.6751875844058529	3.204967601433906e-05	0.6882672627478786	0.1225987821450429	0.7881882649081831	0.0005303551611284	0.7377129075105515	0.0005303551611284	0.7516756852467269	0.0009887179229267	0.8024703171253867	4.345163876511076e-06	0.7509941177540064	4.345163876511076e-06	0.7649343373295682	0.0036369671884562	0.5062425164015069	0.0036369671884562	0.5178291810080485	ARAP2	2178142	DTHD1	2215245	NWD2	3178372	False	False	False	alt	50	0.001755	-45	0.00299
2967	chr4	34068348	T	A	rs35776025	-0.00613803974	0.5348122975735777	0.00613803974	0.5219238167356071	0.0059578091488997	0.9399674322248268	-3.632716945384469e-05	0.652165350822351	3.632716945384469e-05	0.6389418301193862	0.1232357182128444	0.7851255202425693	-0.000849149640716	0.6766283227410352	0.000849149640716	0.6624313840870467	0.0007393346861256	0.8517718701678868	-4.996756428956295e-06	0.7420320901579702	4.996756428956295e-06	0.7278594653984853	-0.005062293177315	0.3825738352638447	0.005062293177315	0.37289602630738	ARAP2	2176166	DTHD1	2213269	NWD2	3176396	False	False	False	ref	-90	0.0057	-100	0.08777
2968	chr4	34068367	T	C	rs6844408	0.0336356154	0.0768075786167392	0.0336356154	0.0817423952990532	0.0091188388431797	0.4080130677784497	0.0003215268988548	0.0930732902347366	0.0003215268988548	0.0982652618813593	0.1492027925600887	0.7421122767036031	0.0055280884337042	0.2367003232295738	0.0055280884337042	0.2476767248431171	0.0013903112254314	0.7249761076499673	5.388231713185398e-05	0.239180977073968	5.388231713185398e-05	0.2494475844427877	0.0299629664208134	0.0268867809574977	0.0299629664208134	0.0275037034936135	ARAP2	2176147	DTHD1	2213250	NWD2	3176377	False	False	False	alt	-100	0.0089	-100	0.1003
2969	chr4	34069768	T	C	rs10461117	-0.00504786706	0.5950658147572646	0.00504786706	0.5820853686804301	0.0300686664155486	0.0042312699517101	-0.0001489291928121	0.253001741902939	0.0001489291928121	0.2440249086247714	0.1675121111214846	0.7100649558873621	-0.0008299864366233	0.6529977774592307	0.0008299864366233	0.6392621334879757	0.0050511227488538	0.1390356062203853	-2.460152916583745e-05	0.3886552137471704	2.460152916583745e-05	0.3768553316588285	-0.0048548221454579	0.4027927025844165	0.0048548221454579	0.3926586300450359	ARAP2	2174746	DTHD1	2211849	NWD2	3174976	False	True	True	ref	95	0.002808	-10	0.007496
2970	chr4	34073046	A	C	rs113731541	-0.00293957565	0.7398235738862007	0.00293957565	0.7262370776577275	0.0297201511535531	0.0045525179539524	-9.817026815544418e-05	0.4083793330975507	9.817026815544418e-05	0.3972212883292319	0.1993443915393312	0.6568758203291084	-0.0005868939590004	0.7291500310375251	0.0005868939590004	0.7150484113086484	0.0059883890339676	0.0864816461854214	-1.9577665734542105e-05	0.4805219953747078	1.9577665734542105e-05	0.4678334165393088	-0.0027448417514704	0.5927115286763349	0.0027448417514704	0.5805037776515249	ARAP2	2171468	DTHD1	2208571	NWD2	3171698	False	True	True	ref	-100	0.00592	-100	0.06244
2971	chr4	34073066	C	A	rs34334195	0.00507649446	0.5532776796282225	0.00507649446	0.5661552993922015	0.0207225059259979	0.0235685831931303	0.000111297345088	0.3100829206104221	0.000111297345088	0.320235865586963	0.2052158217408894	0.6470739318979788	0.0010815779982326	0.568169438909672	0.0010815779982326	0.5817765348413269	0.0043460719268236	0.2056676161992079	2.4054032012961245e-05	0.3785688803048402	2.4054032012961245e-05	0.3905627005211961	0.004844448593865	0.3810264813190284	0.004844448593865	0.3913503538068065	ARAP2	2171448	DTHD1	2208551	NWD2	3171678	False	False	False	alt	-95	0.007263	-85	0.03363
2972	chr4	34073564	T	C	rs35361741	-0.000188414274	0.8405472434440748	0.001665434006	0.8402805399214498	0.0249959179442772	0.0095068135980982	-5.693197202726938e-06	0.6028563471171742	3.940919834465754e-05	0.6026424519838943	0.1744644653990186	0.6977896424282808	-3.399884266082177e-05	0.8097279282831598	0.0002874363352943	0.8096454066871367	0.0044300879500174	0.2066416050168898	-1.1564376359234788e-06	0.6476228749461437	6.88047609829614e-06	0.6476033946008604	-0.00027593647237	0.7183931751622905	0.0015415097666987	0.7179500202609871	ARAP2	2170950	DTHD1	2208053	NWD2	3171180	False	True	True	ref	-85	0.01599	-25	0.00499
2973	chr4	34075163	C	T	rs13146184	-0.0129560671999999	0.2998718401189471	0.0129560671999999	0.2891931072366255	0.0086314969128617	0.4809100757894587	-0.0001165674841662	0.3200679666568966	0.0001165674841662	0.3101444739557585	0.0172097220925527	0.966660251409183	-0.0002184610112728	0.8593897375358699	0.0002184610112728	0.8449099240547628	0.0001473542318795	0.9666735888205136	-1.931475976940673e-06	0.8581898954073177	1.931475976940673e-06	0.8437117229491621	-0.0033257606406705	0.516061357309842	0.0033257606406705	0.5045934990141248	ARAP2	2169351	DTHD1	2206454	NWD2	3169581	False	False	False	ref	-75	0.004856	-50	0.0492
2974	chr4	34077033	C	A	rs3924935	0.00794803756	0.4146973771665422	0.00794803756	0.4268061818377495	0.019452955437766	0.0295422945902595	0.0001553260869658	0.2186754949706687	0.0001553260869658	0.2274101390760895	0.1670245541966202	0.7061057770491085	0.0012506819248663	0.5296694795034996	0.0012506819248663	0.5433459252649409	0.0032654433290704	0.3524342908537585	2.458853649857541e-05	0.354942175164763	2.458853649857541e-05	0.366676340581773	0.0072531872737268	0.2561065696555832	0.0072531872737268	0.2640967307748494	ARAP2	2167481	DTHD1	2204584	NWD2	3167711	False	False	False	alt	100	0.0182	100	0.1294
2975	chr4	34078601	G	T	rs35921722	0.0015326273352	0.7919396383280591	0.0017946163631999	0.8016947279245538	0.0227474096873014	0.0150173970339431	3.9947252549855664e-05	0.5537180823649677	4.530048969604698e-05	0.5630516339891742	0.2503781159555597	0.5778275042694926	0.0004026319310841	0.7302826800994628	0.000465944790734	0.7402957251261267	0.0057423262614363	0.0965409705652748	1.0557736195321204e-05	0.5494905655979813	1.1851411571182704e-05	0.5595980838017206	0.0016556188342202	0.6621667289514768	0.0018755381279888	0.6709267871973215	ARAP2	2165913	DTHD1	2203016	NWD2	3166143	False	True	False	alt	100	0.003815	10	0.01392
2976	chr4	34086572	A	C	rs9985883	-0.001286441654	0.8837405512446016	0.001286441654	0.8697472821918224	0.0126364686819884	0.1565762211280799	-1.755212672888809e-05	0.8118638154562218	1.755212672888809e-05	0.7980556018928286	0.0487079741491094	0.9091309159494084	-6.630451376497291e-05	0.940830755869596	6.630451376497291e-05	0.9266105783479616	0.0006420870448289	0.8654939317717527	-9.534528691414842e-07	0.9148680829319898	9.534528691414842e-07	0.9005575180940468	-0.0008361082583843	0.8461713064704072	0.0008361082583843	0.8323956629030866	ARAP2	2157942	DTHD1	2195045	NWD2	3158172	False	False	False	ref	75	0.005142	-90	0.03168
2977	chr4	34089846	A	G	rs13152643	0.00572700514	0.5239443873913913	0.00572700514	0.5368436735407168	0.0099982935751392	0.3055600410440645	5.697748759225747e-05	0.4892147452424272	5.697748759225747e-05	0.5012397804062181	0.0611188912748057	0.8859621785136181	0.0003639737489999	0.764256662660322	0.0003639737489999	0.7785427366958437	0.0006495064276806	0.8593921213044146	3.881341575974876e-06	0.7390016720018184	3.881341575974876e-06	0.7532307532566672	0.0036950590773762	0.4806393505502006	0.0036950590773762	0.4920412694026697	ARAP2	2154668	DTHD1	2191771	NWD2	3154898	False	False	False	alt	-80	0.003006	20	0.002195
2978	chr4	34092585	T	C	rs10022287	-0.000761244654	0.8134291071868157	0.001746308426	0.8134666046316732	0.0275035415357198	0.005957254286981	-2.2079763273524503e-05	0.5420065194558927	4.893186324175119e-05	0.5401162055860224	0.0395087085965621	0.9274204642145656	-2.405399463132081e-05	0.9228843648803272	6.416433782351919e-05	0.923718630393384	0.0011622727467786	0.754291302103811	-6.843014013575236e-07	0.826696859058199	1.880200423425516e-06	0.8267599904353419	-0.0004439880081743	0.8046030091774119	0.0009626655878172	0.8047123126753238	ARAP2	2151929	DTHD1	2189032	NWD2	3152159	False	True	False	ref	5	4.96e-05	-70	0.02014
2979	chr4	34093031	C	G	rs10010927	-0.0338537416	0.0824192734908253	0.0338537416	0.0773916606108679	0.0091832646294389	0.3914606529486872	-0.0003087406353984	0.0959102395021855	0.0003087406353984	0.0907820430435303	0.0330646583470782	0.9399789476227024	-0.0011825265461111	0.5788853097709102	0.0011825265461111	0.5651615935861115	0.0002991553112678	0.936609985956396	-1.0630622704450322e-05	0.5730436097379996	1.0630622704450322e-05	0.5598599500768336	-0.0147843857301423	0.1278771287720916	0.0147843857301423	0.1240285380414984	ARAP2	2151483	DTHD1	2188586	NWD2	3151713	False	False	False	ref	60	0.02267	-80	0.02887
2980	chr4	34093997	C	T	rs28473456	-0.0648682992	0.01429929716865	0.0648682992	0.0136727712227404	0.0170718854162264	0.0634283408774166	-0.0013692925981977	0.0166699408566215	0.0013692925981977	0.0159912042545917	0.016002240687144	0.9672320456316218	-0.0012981612493143	0.586076696771119	0.0012981612493143	0.5721554217372379	0.0003216019148455	0.9273947889476496	-2.9402209446817776e-05	0.4198412714972869	2.9402209446817776e-05	0.4070968050060362	-0.0123071816097677	0.1836242602581663	0.0123071816097677	0.1788385652607858	ARAP2	2150517	DTHD1	2187620	NWD2	3150747	False	True	False	ref	100	0.01326	85	0.02824
2981	chr4	34096803	C	T	rs6854464	-0.0178399234	0.2212399072771627	0.0178399234	0.2119593692061393	0.0072990921168027	0.7249801689653795	-0.0001322625011348	0.2772444761425917	0.0001322625011348	0.2676727079158457	0.0681625328063568	0.8804838669486827	-0.0012939508962598	0.5673456474386059	0.0012939508962598	0.5539244607716992	0.0004983027063239	0.8998121881755502	-9.574330072264897e-06	0.605540036338616	9.574330072264897e-06	0.5922352390131121	-0.0127864396933577	0.1611830521505199	0.0127864396933577	0.1566227383380363	ARAP2	2147711	DTHD1	2184814	NWD2	3147941	False	False	False	ref	100	0.004868	100	0.03876
2982	chr4	34106771	A	G	rs34045875	0.030749956	0.0937167284335104	0.030749956	0.0995483515141143	0.0093398372629676	0.3812374323155821	0.0002887382135376	0.1058342935787968	0.0002887382135376	0.1115599396454102	0.0133445367690535	0.9753375150628816	0.0004661061145963	0.7517980561181277	0.0004661061145963	0.7656061816509142	0.0001261382646961	0.9734129882275274	4.416079790947648e-06	0.740678389094162	4.416079790947648e-06	0.7543376631846801	0.006147366673928	0.3707045549865652	0.006147366673928	0.3803274720795751	ARAP2	2137743	DTHD1	2174846	NWD2	3137973	False	False	False	alt	-10	0.0003343	-20	0.002483
2983	chr4	34108692	T	C	rs13149553	0.001811257314	0.737878733441355	0.0027789546339999	0.7456942130500975	0.0076319548010071	0.6175594532879913	1.82918412929543e-05	0.7371555331776156	2.4056496227219293e-05	0.7450990812039795	0.0467743441322005	0.9157446728896934	0.0001217472537666	0.8779180830102609	0.0001492827446525	0.8859214296889205	0.000380565775393	0.9211210603581388	1.22541968342393e-06	0.8781530780880824	1.3894509335892728e-06	0.8862119258679602	0.0013693088102573	0.6845766794635717	0.0017718026120602	0.6920925323009298	ARAP2	2135822	DTHD1	2172925	NWD2	3136052	False	False	False	alt	70	0.04974	25	0.01269
2984	chr4	34108823	A	G	rs13149360	-0.00184540101	0.8277941275641784	0.00192657111	0.817392895019681	0.0286148384260006	0.0050387002645402	-5.225334539541404e-05	0.5271336506356203	5.4807393726317085e-05	0.5171772528080879	0.0491913816533366	0.9124359878051432	-0.0001000335497512	0.9176650955362244	0.0001041645107643	0.9073019286289098	0.0014101936541792	0.7217221722724769	-2.830809392515252e-06	0.807630073097064	2.9607916652713e-06	0.7969148486188589	-0.0011971078538158	0.7775074430654029	0.0012344526395501	0.7673606916928671	ARAP2	2135691	DTHD1	2172794	NWD2	3135921	False	True	False	ref	-60	0.001831	25	0.01256
2985	chr4	34114145	C	T	rs3924385	-0.0440051792	0.0463148082348331	0.0440051792	0.0435733920929239	0.0107746704818054	0.2453318927836855	-0.0005211001704964	0.0548112792603451	0.0005211001704964	0.0518796047841678	0.0500523864355439	0.9138279569286238	-0.0025712519087723	0.442092969962793	0.0025712519087723	0.4292056036815381	0.0005744979030694	0.8885675163577241	-3.1652754709727325e-05	0.3952950444970268	3.1652754709727325e-05	0.3832181512357137	-0.0235832321912052	0.0600534374378378	0.0235832321912052	0.0582340077328918	ARAP2	2130369	DTHD1	2167472	NWD2	3130599	False	False	False	ref	90	0.06854	80	0.02419
2986	chr4	34117837	C	T	rs28491432	-0.000603416726	0.8708198050932078	0.001381738954	0.8726805047641764	0.0058147675450777	0.952562946570404	-3.5990317565365943e-06	0.9048820306087056	8.350548724818001e-06	0.9069217422389446	0.0565897986493635	0.9011768460023172	-1.1726861772730386e-05	0.939230844707895	5.943476538920671e-05	0.9415291043882232	0.0003402689227753	0.9327345326363304	-6.116855338416387e-08	0.9522864998378844	3.669854605058996e-07	0.9546618219248372	-0.0001556032738928	0.8574684041668607	0.0006908785360843	0.8593322945486803	ARAP2	2126677	DTHD1	2163780	NWD2	3126907	False	False	False	ref	-95	0.012665	-100	0.0562
2987	chr4	34120165	C	A	rs13126801	0.01117392216	0.3276869580617806	0.01117392216	0.3390977924689283	0.010272888591291	0.2738574518249878	0.0001185053610136	0.3039010196407287	0.0001185053610136	0.3140991962298833	0.1006338240023236	0.8239991084712898	0.0012856862838759	0.5580253409936587	0.0012856862838759	0.571710869442145	0.001061384229685	0.7845008451839862	1.381463057444948e-05	0.520345155165045	1.381463057444948e-05	0.533300627393473	0.009975207211693	0.2118800002358017	0.009975207211693	0.2181819194343746	ARAP2	2124349	DTHD1	2161452	NWD2	3124579	False	False	False	alt	-65	0.002724	80	0.02446
2988	chr4	34121752	T	C	rs80143073	-0.0031978392199999	0.6596555044026374	0.0038045500999999	0.6511902413498731	0.0402251480820921	0.0012147865151037	-0.0001469169158101	0.2360771342596752	0.000165214780983	0.2294419853429257	0.2223404807103808	0.6196195556509727	-0.0007721513529577	0.6346226739285056	0.0008740282299046	0.6258875222451361	0.0090728485044376	0.0206242443298208	-3.526164981457628e-05	0.308411786474015	3.8334166578792456e-05	0.3004229763592681	-0.0029813587277875	0.5075654664552705	0.0034834386248819	0.5002709359288039	ARAP2	2122762	DTHD1	2159865	NWD2	3122992	False	True	True	ref	-40	0.004333	-45	0.01974
2989	chr4	34126545	A	G	rs28576298	-0.00541344454	0.559635864574779	0.00541344454	0.5467587393671014	0.022713427369507	0.014898408623681	-0.0001229880553617	0.2974521658476396	0.0001229880553617	0.2876687017538256	0.0158009937862425	0.9721884242446786	-9.074983232703944e-05	0.9294214927759518	9.074983232703944e-05	0.9153009896131608	0.0003666926856484	0.9274041347214786	-2.098733582789123e-06	0.8483681906845901	2.098733582789123e-06	0.8341782124681559	-0.0015041649809644	0.7414826997721956	0.0015041649809644	0.7282558729599278	ARAP2	2117969	DTHD1	2155072	NWD2	3118199	False	True	False	ref	0	0.0	85	0.0058
2990	chr4	34130538	C	A	rs59815841	0.00178772092	0.8089046863781105	0.00178772092	0.8227980760107152	0.0132640608430978	0.1223956986591607	2.3540061221768383e-05	0.7102800332718823	2.3540061221768383e-05	0.7237767525838864	0.0490565254826294	0.9146769461473164	7.685727155633075e-05	0.9035261919246164	7.685727155633075e-05	0.9177567407967264	0.0006791907241506	0.8638411662356363	1.0517985128363154e-06	0.871454042381905	1.0517985128363154e-06	0.885917872551064	0.0010000103735515	0.7888297374866703	0.0010000103735515	0.802481468651761	ARAP2	2113976	DTHD1	2151079	NWD2	3114206	False	False	False	alt	-90	0.00576	-100	0.03326
2991	chr4	34141538	A	C	rs7697283	-0.000863152614	0.8647440006455602	0.001448541586	0.8592657761395825	0.0193768286543262	0.0302715015200222	-1.5815175280885655e-05	0.6903929468240173	2.8748603626490128e-05	0.6847312560270855	0.1797923214971109	0.6878849501103053	-0.0001515493247397	0.8243098048000008	0.0002541643138543	0.8182803425118194	0.003507872306012	0.316705317090762	-2.8083672180663883e-06	0.704881078934266	5.077693625026826e-06	0.6986461968736349	-0.0007717922385086	0.7495341875570612	0.0013651593896201	0.7440433610411658	ARAP2	2102976	DTHD1	2140079	NWD2	3103206	False	False	False	ref	-20	0.003601	-100	0.03247
2992	chr4	34145116	C	G	rs9784438	0.0586593493999999	0.0150402297766276	0.0586593493999999	0.0161486399300503	0.0124896074289197	0.1450929087837899	0.0007461693816691	0.0192038265188059	0.0007461693816691	0.0204045165448637	0.1904833037687112	0.6689248690569787	0.0120263699301907	0.098909310719366	0.0120263699301907	0.106094644166058	0.0024255297678971	0.5189765701254309	0.000155722955501	0.0753448685442062	0.000155722955501	0.0806212642303731	0.0552723575970704	0.0031933174964806	0.0552723575970704	0.0032976075837478	ARAP2	2099398	DTHD1	2136501	NWD2	3099628	False	True	False	alt	100	0.005165	-10	0.001465
2993	chr4	34147877	T	A	rs7434297	-0.00691501772	0.5278924251547429	0.00691501772	0.5147521916349959	0.0102017681342663	0.274751429644202	-7.443174338373386e-05	0.4764565431157855	7.443174338373386e-05	0.4642626781582755	0.1354536872789136	0.7645318496644201	-0.0009645063508794	0.6635490000514744	0.0009645063508794	0.6495421160470772	0.0013343028886503	0.7374116899001092	-1.0007342778679716e-05	0.6318601869337156	1.0007342778679716e-05	0.6180911307632263	-0.0056909304038423	0.3596990992092579	0.0056909304038423	0.3510450265248425	ARAP2	2096637	DTHD1	2133740	NWD2	3096867	False	False	False	ref	-70	0.002968	-5	0.003647
2994	chr4	34154339	A	G	rs13146507	-0.0031037286	0.7233007228454578	0.0031037286	0.7096628284028103	0.0302557827958987	0.0036699002279178	-9.471718574253056e-05	0.3463653336960956	9.471718574253056e-05	0.3358572927159743	0.0832373779810993	0.8510388373550501	-0.0002473061908895	0.8399958565803419	0.0002473061908895	0.8257181673487037	0.0026268931318916	0.4314090749360734	-7.913150203543134e-06	0.6456078600568192	7.913150203543134e-06	0.6320112462329679	-0.0021493998900403	0.6490521513737958	0.0021493998900403	0.6363146732293321	ARAP2	2090175	DTHD1	2127278	NWD2	3090405	False	True	True	ref	35	0.001633	-100	0.014854
2995	chr4	34156746	A	T	rs77453134	-0.0034858899399999	0.6971434902619683	0.0034858899399999	0.6837976934731823	0.0164706607199048	0.0572605430597932	-5.651271388210412e-05	0.4999283089829036	5.651271388210412e-05	0.487817112466853	0.1523044844863535	0.7340938304314425	-0.0004863487896167	0.7396458758625009	0.0004863487896167	0.725554430739368	0.0025457247172268	0.4875992724603475	-7.963686186904069e-06	0.6209172970406721	7.963686186904069e-06	0.6073471248888265	-0.003269743462069	0.5181493483132203	0.003269743462069	0.5066621407296666	ARAP2	2087768	DTHD1	2124871	NWD2	3087998	False	False	False	ref	-95	0.03058	-100	0.01258
2996	chr4	34156941	A	G	rs10019288	0.0059713391999999	0.5386676054862982	0.0059713391999999	0.551622152282933	0.0097597597347041	0.3298028573565036	5.5242460253998525e-05	0.5185498492713898	5.5242460253998525e-05	0.5306207577396713	0.0989284121204576	0.8260546187851501	0.0005738003450704	0.7105631855718048	0.0005738003450704	0.7244258998273907	0.0010003258878022	0.7969695369276307	5.421952676760463e-06	0.6942410785259626	5.421952676760463e-06	0.7079117652707617	0.0047199659747507	0.4149175972405189	0.0047199659747507	0.4253097067426991	ARAP2	2087573	DTHD1	2124676	NWD2	3087803	False	False	False	alt	80	0.01446	95	0.012695
2997	chr4	34164475	C	G	rs13102895	-0.0259195286	0.1401607032056362	0.0259195286	0.1330073110251873	0.0070034268382571	0.7790153999021073	-0.0001843180917465	0.2044656638234026	0.0001843180917465	0.1962827858091048	0.0234960943578252	0.9588689370323245	-0.0006914372251305	0.7047794840853134	0.0006914372251305	0.6911336841135584	0.0001690177412335	0.9656326906851126	-5.011390814095973e-06	0.7382276343239266	5.011390814095973e-06	0.7245433939396965	-0.0089337026317699	0.260975822950091	0.0089337026317699	0.2536144227236091	ARAP2	2080039	DTHD1	2117142	NWD2	3080269	False	False	False	ref	-15	0.001732	-100	0.02881
2998	chr4	34164875	A	G	rs7435170	-0.00599794752	0.521839612004815	0.00599794752	0.509189429420688	0.0230414667332778	0.0139463548385119	-0.0001387402719241	0.2502205697324988	0.0001387402719241	0.241095777715249	0.0139337544995279	0.9749446892516196	-8.32346875441118e-05	0.9329049171163056	8.32346875441118e-05	0.9187100431161654	0.0003308279708861	0.9319533316183148	-1.9787433381059105e-06	0.8510028383274815	1.9787433381059105e-06	0.8369303626818643	-0.0013195157626116	0.7699262937795422	0.0013195157626116	0.7564196950943771	ARAP2	2079639	DTHD1	2116742	NWD2	3079869	False	True	False	ref	0	0.0	-80	0.02246
2999	chr4	34170690	T	C	rs7435994	0.0328214896	0.0778429894059711	0.0328214896	0.083124626389771	0.0109391685595032	0.2234435731398088	0.000357704164195	0.0668667534480729	0.000357704164195	0.0710747185584572	0.0793265490305915	0.8568345229235736	0.0028621534504354	0.3750909796745307	0.0028621534504354	0.3880011666844341	0.0008608824364356	0.8195820668028974	3.097336977609294e-05	0.3363028911329117	3.097336977609294e-05	0.3482651773059007	0.0239981742549196	0.0533035813174909	0.0239981742549196	0.0548864277889234	ARAP2	2073824	DTHD1	2110927	NWD2	3074054	False	False	False	alt	-10	0.001205	30	0.03076
3000	chr4	34170728	G	A	rs28581574	-0.00584301522	0.5350591280539331	0.00637625894	0.5268890701084021	0.0084045103779152	0.5213990837271689	-5.323292579190407e-05	0.5481079443665736	5.6924386225021446e-05	0.540468176689695	0.0583823483646095	0.8936748934539692	-0.000411578682997	0.7862820000119957	0.0004287212086754	0.7785297750205652	0.0005109751018044	0.8929493859923529	-3.840497517833526e-06	0.7844571070846512	3.959169245571684e-06	0.7765979858100932	-0.0039274266330563	0.4809571709676388	0.0042178860776563	0.4737926961624256	ARAP2	2073786	DTHD1	2110889	NWD2	3074016	False	False	False	ref	-20	0.000763	-5	0.003845
3001	chr4	34179905	A	T	rs35684722	-0.008997616	0.3970592335397281	0.008997616	0.3854174188020807	0.0203209443940973	0.0248139107819143	-0.0001845220970263	0.1999670594496882	0.0001845220970263	0.1918621106288481	0.0472141827197377	0.9143036733004822	-0.0003906738413636	0.7721980577029632	0.0003906738413636	0.7581136375972457	0.0009793858017982	0.8006165556384223	-8.130291251528898e-06	0.6244125068172339	8.130291251528898e-06	0.6109504044494863	-0.0051224597765536	0.3745732181766047	0.0051224597765536	0.3648741715975053	ARAP2	2064609	DTHD1	2101712	NWD2	3064839	False	False	False	ref	-85	0.003609	-65	0.005894
3002	chr4	34188299	G	A	rs58186080	-0.0507722286	0.0266123966997302	0.0507722286	0.0248212334059638	0.0144366760671082	0.090541554259159	-0.0007421784319971	0.0208883728221797	0.0007421784319971	0.0196855149782231	0.164215396425274	0.7174427439128672	-0.0085167833999879	0.1613520142119544	0.0085167833999879	0.1522453516515395	0.0023583024348876	0.5421225317369354	-0.000123344094358	0.1042761451677197	0.000123344094358	0.0978829648630561	-0.0476519465969563	0.0047205187369505	0.0476519465969563	0.0045588608844926	ARAP2	2056215	DTHD1	2093318	NWD2	3056445	False	False	False	ref	25	0.000882	70	0.0551
3003	chr4	34192231	G	A	rs10028563	-0.0525932498	0.0242605111850518	0.0525932498	0.02271669233709	0.011492624521752	0.1931101726604191	-0.0006055205471409	0.0294817257949692	0.0006055205471409	0.0277707797423995	0.2050145748399879	0.6481880048081826	-0.0109017319211117	0.1187017468497185	0.0109017319211117	0.1110781071954268	0.002365945915499	0.5346721149236331	-0.0001260579389369	0.0959389433002527	0.0001260579389369	0.0900070025070739	-0.0508345522256454	0.0040007009306532	0.0508345522256454	0.0039285523759313	ARAP2	2052283	DTHD1	2089386	NWD2	3052513	False	False	False	ref	100	0.006386	-35	0.02954
3004	chr4	34194071	T	C	rs6531299	0.0043758441	0.6187129230075717	0.0043758441	0.6318940457012983	0.0059178537302451	0.9528532467518888	2.6894228648829075e-05	0.7107551837619829	2.6894228648829075e-05	0.7242452255865341	0.0490337036691251	0.913140477924114	0.0002194337604994	0.8333045415367248	0.0002194337604994	0.847442343827703	0.0002928363929677	0.9398983323292992	1.3580348473331438e-06	0.866041329573286	1.3580348473331438e-06	0.8802354093892201	0.0025207730370646	0.5880048409063924	0.0025207730370646	0.6003563968776895	ARAP2	2050443	DTHD1	2087546	NWD2	3050673	False	False	False	alt	-100	0.01484	-100	0.03568
3005	chr4	34196663	C	T	rs67368133	0.00606729928	0.4990961289533581	0.00606729928	0.51192114975322	0.0229991711075611	0.0140553620568471	0.0001420059387299	0.2449796351552944	0.0001420059387299	0.2544572499334863	0.0579591074596208	0.8923101030972053	0.0003896975117887	0.7582746450942148	0.0003896975117887	0.7721383284520227	0.001314748213778	0.7185336082282742	9.019847144188984e-06	0.5974400020140999	9.019847144188984e-06	0.6109714383904632	0.0041701677403292	0.4419319475292746	0.0041701677403292	0.4530029861367536	ARAP2	2047851	DTHD1	2084954	NWD2	3048081	False	True	False	alt	95	0.0017395	-70	0.02464
3006	chr4	34197307	T	G	rs6834907	-0.0044540192199999	0.632271750216142	0.0044540192199999	0.618743181191893	0.0237027585321383	0.0123227653169831	-0.0001127983019595	0.3454799668200582	0.0001127983019595	0.3347950192148834	0.0629155904106888	0.8860088263927886	-0.00028563508946	0.8303675385710697	0.00028563508946	0.8162275120974677	0.0015371368800281	0.681396585807426	-7.601040970074622e-06	0.6731161101279476	7.601040970074622e-06	0.6593339273323833	-0.0032054274421933	0.5473853434269914	0.0032054274421933	0.5353533459364186	ARAP2	2047207	DTHD1	2084310	NWD2	3047437	False	True	False	ref	-70	0.010475	-35	0.00983
3007	chr4	34203755	A	G	rs13110566	0.0378117384	0.0565214358218634	0.0378117384	0.0606121524073272	0.0108233537341013	0.2352827191163204	0.0004202484081489	0.0553708917109567	0.0004202484081489	0.0589898493402429	0.2158383385719768	0.6278267471912558	0.0084027344423802	0.147403846893034	0.0084027344423802	0.1566555904952776	0.0023435284452139	0.538188917004463	9.37453829961643e-05	0.1289131635373852	9.37453829961643e-05	0.1366997902047514	0.0346165416653699	0.0152191822874355	0.0346165416653699	0.0156547103668076	ARAP2	2040759	DTHD1	2077862	NWD2	3040989	False	False	False	alt	-100	0.001766	-60	0.01019
3008	chr4	34206356	T	C	rs34522421	0.0027153216799999	0.6807534628442684	0.0032932318799999	0.6895687451013381	0.009976118315757	0.308543405135047	2.6342464161597168e-05	0.6516753182921194	3.1569019625291e-05	0.660054692226676	0.1916409921264742	0.6562302027176321	0.0005470186645875	0.6698348150501978	0.000681384179432	0.6788417374726651	0.0018973705939044	0.5902252500854996	5.432160936164381e-06	0.6452827957831365	6.647347687144886e-06	0.6540534005506138	0.0024772041203746	0.5569582152643385	0.0028672496602661	0.5645795140900222	ARAP2	2038158	DTHD1	2075261	NWD2	3038388	False	False	False	alt	-5	0.0002441	-55	0.06058
3009	chr4	34213494	G	A	rs7683171	-0.0274457308	0.1250666506759092	0.0274457308	0.1182770585232682	0.0090842535230929	0.404630337945799	-0.0002528857024344	0.1337377468759833	0.0002528857024344	0.1272699459678	0.1255303478251848	0.7833152052675951	-0.0034852011401374	0.3408591843363058	0.0034852011401374	0.3288237455564014	0.0011460874187537	0.7733903095309751	-3.212958934093507e-05	0.3382279232774717	3.212958934093507e-05	0.3269697075966195	-0.0242761854376082	0.0479475721772394	0.0242761854376082	0.0466958247633998	ARAP2	2031020	DTHD1	2068123	NWD2	3031250	False	False	False	ref	-100	0.002716	-100	0.05844
3010	chr4	34234902	G	A	rs34250047	-0.00304457912	0.7434169745056141	0.00304457912	0.7298181268264295	0.0081283553303141	0.5295208484786228	-2.5276018268895524e-05	0.7397484743626507	2.5276018268895524e-05	0.726381952859016	0.0255936264899013	0.9501073845219516	-8.202093271231785e-05	0.9332289957059492	8.202093271231785e-05	0.9190418514583844	0.000210699730023	0.950601166490274	-6.915536782815622e-07	0.93216046592174	6.915536782815622e-07	0.9179670459004652	-0.001259349163373	0.7756082729755972	0.001259349163373	0.7621255290294434	ARAP2	2009612	DTHD1	2046715	NWD2	3009842	False	False	False	ref	100	0.000828	-75	0.04388
3011	chr4	34235892	T	C	rs28731006	0.0419850046	0.0419174477644525	0.0419850046	0.0450607825530455	0.0121494021004353	0.1616938173854059	0.0005123819969543	0.0361506790513974	0.0005123819969543	0.0385805338296101	0.1164078465544248	0.7910284781240682	0.0048323742896316	0.234528200357219	0.0048323742896316	0.2454259364144059	0.0013786316774434	0.7154772585444756	5.751857197121089e-05	0.1854332352657704	5.751857197121089e-05	0.1949135091178763	0.037106194047656	0.0126952085926762	0.037106194047656	0.0130334188948889	ARAP2	2008622	DTHD1	2045725	NWD2	3008852	False	False	False	alt	-35	0.002144	15	0.00806
3012	chr4	34239457	G	A	rs34202234	-0.001371232056	0.86716427964012	0.001371232056	0.8531526239916175	0.0080972565116996	0.5612950706007048	-1.0915532077713155e-05	0.8764330352529652	1.0915532077713155e-05	0.8624895973515325	0.0531001358935258	0.9067943724337124	-0.0001021819439962	0.9255564387778804	0.0001021819439962	0.9128411013325172	0.0004321615806805	0.9143734876988168	-8.23092243661535e-07	0.931814604815181	8.23092243661535e-07	0.9188144547973284	-0.0011659871990373	0.7943777550818696	0.0011659871990373	0.7807296738240943	ARAP2	2005057	DTHD1	2042160	NWD2	3005287	False	False	False	ref	0	0.0	-45	0.007538
3013	chr4	34247663	C	T	rs4266314	-0.00219965238	0.8045444100651264	0.00219965238	0.7906248701826846	0.0089091861425881	0.4356627672162042	-1.9893818478920192e-05	0.7928070678720289	1.9893818478920192e-05	0.7791268619989815	0.1991452193487484	0.6566124723338418	-0.0004438049275471	0.7663101084334275	0.0004438049275471	0.752145322069907	0.0017653273780621	0.6522185050792965	-4.000763727542672e-06	0.7627421795650677	4.000763727542672e-06	0.7485987813470202	-0.0020394402431559	0.6660846368223543	0.0020394402431559	0.6534268841869061	ARAP2	1996851	DTHD1	2033954	NWD2	2997081	False	False	False	ref	-35	0.001862	-95	0.03485
3014	chr4	34259025	T	C	rs34352361	0.00587054828	0.5123035284298345	0.00587054828	0.525134201776459	0.0066754444249946	0.8535073585856678	4.009654673001116e-05	0.5920461025512824	4.009654673001116e-05	0.6047483651965521	0.03548791999917	0.9388013981221422	0.0002287563662794	0.8274974622146672	0.0002287563662794	0.8416935378234143	0.0002444992879082	0.951602553804621	1.61830201484399e-06	0.8504738979441757	1.61830201484399e-06	0.8646672892613962	0.0029917322793804	0.538155936181607	0.0029917322793804	0.5502871683797607	ARAP2	1985489	DTHD1	2022592	NWD2	2985719	False	False	False	alt	-40	0.001717	100	0.02551
3015	chr4	34260311	T	C	rs35210319	0.0343105872	0.0718326063314672	0.0343105872	0.0767290827648346	0.0095686866233124	0.3431166916634672	0.0003350955973948	0.0801660532079128	0.0003350955973948	0.0849025076104664	0.0271662569113787	0.947365122119088	0.0009183351416956	0.6031663764697022	0.0009183351416956	0.6169065291132843	0.0002595402435451	0.9412523516081508	8.973858109087363e-06	0.5825734271158963	8.973858109087363e-06	0.5960114766592944	0.0117075903277004	0.1704642231816397	0.0117075903277004	0.1756677842537804	ARAP2	1984203	DTHD1	2021306	NWD2	2984433	False	False	False	alt	-90	0.00403	15	0.00177
3016	chr4	34262740	T	G	rs4645234	0.089269408	0.0029158546065442	0.089269408	0.0030443874815594	0.0282919866220567	0.0060868505156592	0.0025482117644018	0.0025289387426502	0.0025482117644018	0.0026214273643648	0.316992914864262	0.4637643864944509	0.0285462759331841	0.0159158588184366	0.0285462759331841	0.0173736186619117	0.0092317118881356	0.0199028537043037	0.0008364906557696	0.0052898163966422	0.0008364906557696	0.0055984306560184	0.07006089274785	0.000944562789457	0.07006089274785	0.0009651389023804	ARAP2	1981774	DTHD1	2018877	NWD2	2982004	False	True	True	alt	20	0.000351	-45	0.01099
3017	chr4	34271016	C	T	rs6841728	-0.0655927588	0.0111093962946026	0.0655927588	0.0104911044775358	0.0129043954540582	0.1336421605382836	-0.0008781980859643	0.016936259609282	0.0008781980859643	0.0160255896910278	0.4193155530659031	0.3004259427801277	-0.0279504481955893	0.0211234183844435	0.0279504481955893	0.0194549059441472	0.0054844130828151	0.1145750813357173	-0.0003794782982767	0.0219688873256586	0.0003794782982767	0.0205371011447321	-0.0341372835817798	0.0169848487938988	0.0341372835817798	0.0165316953274263	ARAP2	1973498	DTHD1	2010601	NWD2	2973728	False	True	False	ref	100	0.02304	40	0.0994
3018	chr4	34277823	G	A	rs9968413	-0.0011712763	0.9086127092929778	0.0011712763	0.8945304520784955	0.0063000858371412	0.903013347857686	-7.27443910274976e-06	0.932985799831482	7.27443910274976e-06	0.919271099115102	0.0260645857322171	0.9550194121942216	-2.612913779188423e-05	0.9819471634043796	2.612913779188423e-05	0.9688253463241104	0.0001669462224406	0.9665796790547228	-1.672789142267508e-07	0.9856697246046382	1.672789142267508e-07	0.9748001185591786	-0.0004294650359443	0.9231278415479132	0.0004294650359443	0.909026790038296	ARAP2	1966691	DTHD1	2003794	NWD2	2966921	False	False	False	ref	100	0.05594	80	0.0205
3019	chr4	34279425	G	A	rs4547813	-0.00394260764	0.6664524787185423	0.00394260764	0.6530525507768749	0.0071859028070867	0.762715646512036	-2.787100343799452e-05	0.7132301554525536	2.787100343799452e-05	0.7000536917804141	0.1370180188591167	0.7617321635367417	-0.000514325488073	0.7387248428267386	0.000514325488073	0.7248338017753503	0.0009921720861022	0.7996685721353302	-3.684960770702684e-06	0.7672840960712998	3.684960770702684e-06	0.7533701873691122	-0.0036431913194119	0.4966535859235355	0.0036431913194119	0.4853214304411304	ARAP2	1965089	DTHD1	2002192	NWD2	2965319	False	False	False	ref	100	0.03168	90	0.00978
3020	chr4	34286733	G	A	rs13131483	-0.0032944555	0.6988300406644445	0.0037826109399999	0.6892203877656843	0.0079206410840025	0.6041447407576052	-2.4874164990753108e-05	0.7282873102769818	2.814424386162876e-05	0.7189816484033525	0.0637579228000289	0.8905018340401616	-0.0001985890466727	0.8635042310477957	0.0002226831091417	0.8546181054203855	0.0005254767023312	0.8966823158809535	-1.565017928287471e-06	0.873097487146352	1.7264203833713037e-06	0.8641220990632975	-0.0020145437193331	0.6294649525142084	0.0023464973703046	0.6210617351436031	ARAP2	1957781	DTHD1	1994884	NWD2	2958011	False	False	False	ref	-100	0.01149	-20	0.00838
3021	chr4	34293081	A	G	rs13118944	0.001698463196	0.8199029266153498	0.001698463196	0.8341207317463467	0.0113579383321313	0.2171904698841455	1.9520977294133884e-05	0.7615193112496826	1.9520977294133884e-05	0.7753648619403128	0.0894511353852218	0.8389712213771178	0.0001387162634969	0.8635002123094758	0.0001387162634969	0.8778449333899158	0.0010754884673459	0.7775857019152778	1.6768436202440205e-06	0.8349373025772663	1.6768436202440205e-06	0.8493443830133024	0.0013132916316558	0.7349985878085535	0.0013132916316558	0.7485372463461784	ARAP2	1951433	DTHD1	1988536	NWD2	2951663	False	False	False	alt	60	0.006073	5	0.001373
3022	chr4	34306193	G	A	rs10010448	0.00318964174	0.6717067793427269	0.0036876087	0.6793593442313003	0.0083226772868989	0.5178948179887939	2.7378302646231665e-05	0.6700580724470773	3.1140040942143905e-05	0.6776912174905234	0.06993018599778	0.8771388600381871	0.0002578735576149	0.8120618498356711	0.0002762737309065	0.8199681735769931	0.0005883391550577	0.8781866850312697	2.2036812849092687e-06	0.8127038907366788	2.342679737279516e-06	0.8206575888824911	0.0024232616520918	0.5580232940057436	0.0028133071919832	0.5655245842511745	ARAP2	1938321	DTHD1	1975424	NWD2	2938551	False	False	False	alt	-10	0.000519	-60	0.03275
3023	chr4	34308921	T	C	rs7672284	0.00257561274	0.6140055059898535	0.00425685074	0.6230937238786921	0.0067249537210862	0.8110077130431446	1.9682061359333778e-05	0.679287435887741	2.8874325105655635e-05	0.6883020106573372	0.1506073714457618	0.7318731752931291	0.0004684017285502	0.6712233472567433	0.0006955456225453	0.6807494471801593	0.001027890592738	0.7838107437015241	3.549019920439297e-06	0.7104623674993547	4.790941963532026e-06	0.7197772925314814	0.0022801066401103	0.446365978945814	0.0038734841647734	0.452802123595223	ARAP2	1935593	DTHD1	1972696	NWD2	2935823	False	False	False	alt	-20	0.01404	60	0.005676
3024	chr4	34310033	G	T	rs28668075	-0.00048108484	0.8151607525588661	0.002008154	0.8127736243374132	0.0083175911567514	0.5287146416781013	-3.948024228154559e-06	0.8145747674049386	1.6787872882727216e-05	0.8121922218150851	0.1647568958184213	0.7173386528713679	-7.996950842033999e-05	0.7910426374525872	0.0003392085298923	0.7884816114879124	0.0013654336742064	0.727677744562361	-6.570305380561738e-07	0.7953766008510108	2.828743084567528e-06	0.7927874648921697	-0.0003257295200157	0.6633543611780421	0.0019979460367845	0.6609169843016957	ARAP2	1934481	DTHD1	1971584	NWD2	2934711	False	False	False	ref	45	0.001735	15	0.009
3025	chr4	34310315	T	C	rs919019	0.053751578	0.0204978149513967	0.053751578	0.0219762568045556	0.0117770461906273	0.1892222982928959	0.0006628637325081	0.0265372871986802	0.0006628637325081	0.0281860528330177	0.2751875019450409	0.5396818650796983	0.0149841422154914	0.0661033864606317	0.0149841422154914	0.0717062827261903	0.003252766673023	0.3784270448322728	0.0001856480020657	0.0557238379970377	0.0001856480020657	0.0600110243920106	0.0477702050851149	0.0051519568959414	0.0477702050851149	0.0052893319100073	ARAP2	1934199	DTHD1	1971302	NWD2	2934429	False	False	False	alt	-45	0.003325	75	0.01617
3026	chr4	34310507	T	C	rs919018	-0.0069366266079999	0.5158329798214316	0.006988356672	0.5061028630138606	0.021942960092483	0.017854873187858	-0.0001703044916515	0.272556005738887	0.0001712549378451	0.2650372566497869	0.2615815516758472	0.5608086905115448	-0.0018440178212526	0.5181646596669918	0.0018587733842559	0.5083506303482755	0.0057219517045998	0.0956057998384681	-4.516826031693976e-05	0.3250962053667475	4.543936706062942e-05	0.3156245613587145	-0.0062386539279452	0.3832911491934107	0.0062594010311309	0.3765908570290397	ARAP2	1934007	DTHD1	1971110	NWD2	2934237	False	True	False	ref	-30	0.0001092	-65	0.02725
3027	chr4	34322125	G	A	rs35418312	0.00472640542	0.5789690690699656	0.00472640542	0.592165494738828	0.0198362024929575	0.0280741138100408	9.203473556362048e-05	0.3365257186551174	9.203473556362048e-05	0.3470918508350408	0.0771999709540555	0.8630845503932394	0.0003685917411705	0.7604947163995602	0.0003685917411705	0.7749121340556537	0.0015656037521173	0.6829182075710126	7.319013336658158e-06	0.6213561886205956	7.319013336658158e-06	0.6350757708586349	0.003444019128829	0.4794332245898608	0.003444019128829	0.4908398873165817	ARAP2	1922389	DTHD1	1959492	NWD2	2922619	False	False	False	alt	90	0.005608	15	0.00569
3028	chr4	34322194	G	T	rs13135298	0.01143259702	0.3028968976085144	0.01143259702	0.3139895633375832	0.0310869258840894	0.003314548324742	0.0003583862570316	0.0680199142241087	0.0003583862570316	0.0721778865378824	0.1009554041017022	0.822294061468686	0.0011161750033969	0.5575206555706992	0.0011161750033969	0.5712273618334688	0.0031272828327529	0.3868798869039176	3.5092637161706706e-05	0.2846304428074783	3.5092637161706706e-05	0.2956626534346379	0.0097843338623844	0.1938831233792136	0.0097843338623844	0.2000765500044109	ARAP2	1922320	DTHD1	1959423	NWD2	2922550	False	True	True	alt	75	0.001801	90	0.0396
3029	chr4	34324162	C	T	rs61262296	-0.073790872	0.0085389375882652	0.073790872	0.0080878352006655	0.0161490938194088	0.0646702243577935	-0.001274020580818	0.0107096950070486	0.001274020580818	0.0102375178761712	0.3919646469361715	0.3436730756867817	-0.0301461305754431	0.018121855010598	0.0301461305754431	0.0168891902692581	0.006493574561808	0.0682004850893124	-0.0005306350653499	0.0148539541687138	0.0005306350653499	0.0140209331420241	-0.0426767912530212	0.0087013263105835	0.0426767912530212	0.00848647742649	ARAP2	1920352	DTHD1	1957455	NWD2	2920582	False	True	True	ref	100	0.01947	-50	0.08
3030	chr4	34333891	T	C	rs7685673	-3.108670000000011e-05	0.7378624471138764	0.00294017494	0.7356895579705444	0.0221508426582971	0.0167699920644096	-9.762008805524716e-07	0.4621957411483848	6.543559301189636e-05	0.4606246875650313	0.1352648886399236	0.7631888345854912	-9.55878607154e-05	0.7695437042290199	0.0004002833377828	0.7667497046065916	0.0031106730979238	0.3746919609165982	-2.407059973980547e-06	0.6046954857205363	9.132992287582107e-06	0.6020862575727784	-0.0004522868494486	0.5837803774594439	0.0026182844220375	0.5816014260082799	ARAP2	1910623	DTHD1	1947726	NWD2	2910853	False	True	False	ref	0	0.0	-55	0.0065
3031	chr4	34335946	G	T	rs111284769	-0.0388238491999999	0.0590733824577665	0.0388238491999999	0.0556770813956593	0.0196711201465729	0.0275935067816703	-0.0007975530514542	0.0227500013567198	0.0007975530514542	0.0214314909070406	0.6190935590618161	0.0348994665282494	-0.024067910902644	0.0305915195551375	0.024067910902644	0.0282017669442104	0.0121852875239973	0.0067047553448757	-0.0004948340429546	0.0146352309823404	0.0004948340429546	0.0136470903620871	-0.0042573055737091	0.4341683569388593	0.0042573055737091	0.4237349268382867	ARAP2	1908568	DTHD1	1945671	NWD2	2908798	False	False	False	ref	-85	0.0054	-55	0.04224
3032	chr4	34335967	A	C	rs112181396	-0.0272240835999999	0.1224681636876647	0.0272240835999999	0.1165338708536294	0.0166661925339816	0.0553127713926606	-0.0005220429082344	0.0649120981879961	0.0005220429082344	0.0619960183148427	0.6159379246672684	0.0369736482378744	-0.0167266780365163	0.066436085857395	0.0167266780365163	0.062178627002416	0.0102517520989765	0.0132612227571193	-0.0003203549195109	0.0392627048829393	0.0003203549195109	0.0368731554748729	-0.003168082656459	0.5547466021640356	0.003168082656459	0.5427251258633508	ARAP2	1908547	DTHD1	1945650	NWD2	2908777	False	False	False	ref	-100	0.00679	-75	0.1107
3033	chr4	34337660	T	C	rs35781550	-0.00334300358	0.7092857576094789	0.00334300358	0.6958538239091587	0.0230909712170594	0.0139234917415501	-7.828781785605181e-05	0.4205858115876921	7.828781785605181e-05	0.4094322721738305	0.1478148113569642	0.7448634186412918	-0.0005143147682385	0.7402845525811017	0.0005143147682385	0.7263600045283045	0.0035374087611363	0.3165081313836645	-1.2555358322316286e-05	0.551327412653687	1.2555358322316286e-05	0.5382030812324001	-0.0030913183746719	0.5459688666045561	0.0030913183746719	0.5341276782420473	ARAP2	1906854	DTHD1	1943957	NWD2	2907084	False	True	False	ref	0	0.0	25	0.01471
3034	chr4	34337807	C	T	rs36044581	-0.0176093889	0.2214273502756849	0.0176093889	0.2120135377930007	0.0077170782313435	0.630745594075443	-0.0001437575131396	0.2667276197265523	0.0001437575131396	0.2575262248790487	0.1504455440409132	0.7395010766436454	-0.0027657311352247	0.3983873778555115	0.0027657311352247	0.3858530413874655	0.001192468747424	0.7632330643087439	-2.2887591397492114e-05	0.4250806690666107	2.2887591397492114e-05	0.4128274693027695	-0.0161018267824354	0.0982188318424066	0.0161018267824354	0.0955509169575989	ARAP2	1906707	DTHD1	1943810	NWD2	2906937	False	False	False	ref	-65	0.01971	-100	0.03314
3035	chr4	34339177	A	G	rs6824510	0.001870528358	0.8171031147624702	0.001870528358	0.8310381030440395	0.0077584912677856	0.6328952250159909	1.5357557287966197e-05	0.8245259015299283	1.5357557287966197e-05	0.8383330047718559	0.0937125903795682	0.8280060917078542	0.0001623666855048	0.8683537145180367	0.0001623666855048	0.8824094455944299	0.0007276648045385	0.8428704085000497	1.3318737926976063e-06	0.8738528014004752	1.3318737926976063e-06	0.8880271771209273	0.0014751190365044	0.7295028572240934	0.0014751190365044	0.7429513496881617	ARAP2	1905337	DTHD1	1942440	NWD2	2905567	False	False	False	alt	-95	0.001244	-10	0.01046
3036	chr4	34339873	T	G	rs7690302	0.002987317174	0.7156602844998644	0.003097671786	0.7240343412737424	0.0076043229189737	0.6546441375858565	2.237127124388729e-05	0.7389212476229864	2.327262946975057e-05	0.7468718941642328	0.0426228487847383	0.9234971383442976	0.0001205606673708	0.8880270209962516	0.0001248272224114	0.8958327163896855	0.0003240491703461	0.9315155864807216	9.039061558005796e-07	0.8955366053183198	9.387546719448592e-07	0.9032933629019811	0.0015249120841502	0.7068570556879133	0.0016120499175302	0.7148274291931028	ARAP2	1904641	DTHD1	1941744	NWD2	2904871	False	False	False	alt	80	0.007084	70	0.03622
3037	chr4	34340047	A	G	rs13113901	0.0045077933	0.6039820958543856	0.0045077933	0.6173761795201032	0.0105959621550877	0.2505908037253767	4.712118580034308e-05	0.5409247398859777	4.712118580034308e-05	0.5535737409320837	0.0274172968599258	0.9492276253526942	0.0001196391344286	0.876597504748962	0.0001196391344286	0.8908830859913522	0.0002937222976291	0.9375136654488124	1.2592921203784822e-06	0.8590740450143827	1.2592921203784822e-06	0.8735343736475453	0.0018195209493874	0.6636297721107931	0.0018195209493874	0.6765392507213884	ARAP2	1904467	DTHD1	1941570	NWD2	2904697	False	False	False	alt	15	0.002083	70	0.01353
3038	chr4	34342868	A	G	rs7658506	-0.00322689354	0.718407517916495	0.00322689354	0.7050319262073546	0.0265739201029008	0.007205094515973	-8.4166777826857e-05	0.4093304874686272	8.4166777826857e-05	0.3979384030105762	0.1136671542235915	0.797903305090675	-0.0003730707738032	0.7863187877473131	0.0003730707738032	0.7723787850380124	0.0029822898779519	0.4208973198021532	-9.600454563935732e-06	0.5954711771106961	9.600454563935732e-06	0.5820281970974616	-0.0030104046722476	0.560887565959837	0.0030104046722476	0.5487842400404932	ARAP2	1901646	DTHD1	1938749	NWD2	2901876	False	True	True	ref	-100	0.002472	-70	0.007675
3039	chr4	34342904	C	T	rs7681085	-0.0224771031999999	0.1735002836974312	0.0224771031999999	0.1659317012504576	0.0152783776339221	0.0815146819968992	-0.0004103218878824	0.0910167890386361	0.0004103218878824	0.0871704661490027	0.1031483729084326	0.8146435132599591	-0.0023193599868932	0.4385227001286451	0.0023193599868932	0.4254162661287208	0.0015872063177922	0.6772377847659312	-4.190344676598225e-05	0.3117419495223636	4.190344676598225e-05	0.3002726091619331	-0.0194275874231059	0.092495761607199	0.0194275874231059	0.0899701255923215	ARAP2	1901610	DTHD1	1938713	NWD2	2901840	False	False	False	ref	-95	0.00435	-100	0.0196
3040	chr4	34344336	G	A	rs13115626	-0.0230183734	0.1686478343335994	0.0230183734	0.1605814387996157	0.0081819138415251	0.5521060915759618	-0.0001869469538277	0.2005734350686591	0.0001869469538277	0.1923786978418696	0.0137719270946793	0.9781334583656008	-0.0003935315642801	0.8246251629881031	0.0003935315642801	0.8106602646114265	0.0001089359856095	0.9802026202675114	-3.107821225735414e-06	0.8380144064866676	3.107821225735414e-06	0.8240283610709211	-0.0050125001296693	0.497665049841944	0.0050125001296693	0.487388485569613	ARAP2	1900178	DTHD1	1937281	NWD2	2900408	False	False	False	ref	-85	0.006233	85	0.01078
3041	chr4	47230269	A	G	rs4695202	0.0517560876	0.0234812427124992	0.0517560876	0.0252074393549407	0.0099320147165316	0.3195251259263068	0.0005327611047207	0.0378722341138752	0.0005327611047207	0.0403021903546534	0.1683087998838162	0.7120527536675054	0.0091985519047144	0.1360274840523394	0.0091985519047144	0.1450070985500845	0.0017092386377063	0.665415134299332	9.665102734919728e-05	0.130587696732083	9.665102734919728e-05	0.1383648820439659	0.0498884843203767	0.0041668658308766	0.0498884843203767	0.0043005984183743	COMMD8	233433	GABRB1	236545	GABRA4	236688	False	False	False	alt	-75	0.01814	-20	0.01083
3042	chr4	47242132	C	T	rs28584485	-0.056926688	0.0190871847389715	0.056926688	0.0179172295542468	0.0114652950100579	0.199974076934169	-0.0006752285832749	0.0272651942627816	0.0006752285832749	0.0257321300509224	0.1219556219462857	0.789527662088897	-0.0070475600384852	0.2018969701374534	0.0070475600384852	0.1917737017543701	0.0014166485553478	0.7215503031663786	-8.511414679720578e-05	0.1669930393891096	8.511414679720578e-05	0.1585564491497673	-0.0467058786916876	0.0061029977954292	0.0467058786916876	0.0059194851967298	COMMD8	221570	ATP10D	243144	GABRB1	248408	False	True	False	ref	-100	0.00653	-20	0.02493
3043	chr4	47273653	A	G	rs4426746	0.0109455824999999	0.3191617897349103	0.0109455824999999	0.3303407989232066	0.0144498071252677	0.0880501269268009	0.0001596596999484	0.2144443688973814	0.0001596596999484	0.2231002110607871	0.146609404661874	0.7451289891480645	0.001658260863294	0.4875449828797502	0.001658260863294	0.500868987536703	0.0021069552439945	0.5867264835408896	2.4076224108464253e-05	0.3821159408744803	2.4076224108464253e-05	0.3941353255343399	0.0101308104855859	0.1845903103221528	0.0101308104855859	0.1905585328282441	COMMD8	190049	ATP10D	211623	GABRB1	279929	False	False	False	alt	-50	0.003754	-80	0.0867
3044	chr4	79277722	C	T	rs13108290	-0.0411560812	0.0502528836831018	0.0411560812	0.0471395187367623	0.0136219928910197	0.109894714482013	-0.0005828905198252	0.0373825864204644	0.0005828905198252	0.0351601170306981	0.5193497857861596	0.1450124746291181	-0.0214488884747413	0.0386340692521337	0.0214488884747413	0.035668152558708	0.0071085795200382	0.047982370801011	-0.0003053408723353	0.0306694233887733	0.0003053408723353	0.0284973874023631	-0.0113756366767289	0.1590457975876586	0.0113756366767289	0.15428884761734	NAA11	48339	GK2	130506	PAQR3	338284	False	False	False	ref	100	0.03302	-30	0.0232
3045	chr4	81085512	C	G	rs7671128	-0.02115193126	0.2013900585665917	0.02115193126	0.1925724631551886	0.0125741890905617	0.1475270804470234	-0.0002849373935835	0.1327308409266904	0.0002849373935835	0.1267098771768843	0.2403904604819551	0.594016413764725	-0.0053227407651577	0.2687433698901804	0.0053227407651577	0.257301549216746	0.0030524862764031	0.3957674390008079	-7.19274887167311e-05	0.2062203385101273	7.19274887167311e-05	0.1966100779889301	-0.0191723980539216	0.0944791143668878	0.0191723980539216	0.0919371201280887	BMP3	54803	PRKG2	129710	CFAP299	749781	False	False	False	ref	-95	0.005417	-80	0.02586
3046	chr4	81113913	T	C	rs7675843	0.0211673268	0.1568826922476537	0.0211673268	0.1652240005104934	0.0068060854549118	0.8057971450608987	0.0001451206174363	0.2263522543961526	0.0001451206174363	0.2353849384845957	0.1932281455201817	0.6691020345339268	0.0041089244525712	0.268399545416058	0.0041089244525712	0.2798045331917192	0.0013082748056556	0.738691863969978	2.8052367225389032e-05	0.3290298202818298	2.8052367225389032e-05	0.3404545811117657	0.0204275977966575	0.063475749310556	0.0204275977966575	0.0652672856369023	BMP3	83204	PRKG2	101309	CFAP299	778182	False	False	False	alt	-95	0.00846	-100	0.01744
3047	chr4	81114580	C	A	rs9685762	0.0136639106	0.2616671243183474	0.0136639106	0.2721355743004581	0.0235674326257253	0.0127418374016329	0.0003201027006629	0.0857412714747857	0.0003201027006629	0.0908442953469152	0.1206174337908069	0.7894598256693536	0.0016973072290145	0.4743407453494245	0.0016973072290145	0.4876226974478398	0.0028445343332277	0.4497838207453591	3.9634373762060974e-05	0.2687513249566766	3.9634373762060974e-05	0.2794292684820498	0.0128196350584549	0.1403796862141874	0.0128196350584549	0.1448266725240591	BMP3	83871	PRKG2	100642	CFAP299	778849	False	True	False	alt	85	0.005463	100	0.04877
3048	chr4	81115574	C	T	rs17005062	0.005167873534	0.5744360262231061	0.005644324534	0.5845696202124184	0.0094746318869835	0.3632376554037221	5.286024654331263e-05	0.5557671643134722	5.62920109029779e-05	0.5653060180273195	0.0899615141235904	0.8396029294832982	0.0004780879696861	0.7478764090714578	0.0005174005262174	0.7571578916745734	0.0008561221943492	0.8245672267970854	4.884387132304083e-06	0.7329819373303503	5.167546228526839e-06	0.7423806681152805	0.0042075125260635	0.4539629409350338	0.0046017074865921	0.4615590909105506	BMP3	84865	PRKG2	99648	CFAP299	779843	False	False	False	alt	-45	0.0011215	-10	0.000977
3049	chr4	81115998	T	C	rs1443539	0.00536854204	0.5556725597892881	0.00536854204	0.5690844825191064	0.0081768253796545	0.5532256444120165	4.513455093287203e-05	0.570795192958885	4.513455093287203e-05	0.5838110489757902	0.0242388406518739	0.9540119757716528	0.0001322259205287	0.8729719500116147	0.0001322259205287	0.887304202387671	0.0001968540242884	0.9566475169149578	1.1034784175273763e-06	0.8763781270935638	1.1034784175273763e-06	0.8907468404049246	0.0019398541478645	0.6516032436564415	0.0019398541478645	0.6645443315044919	BMP3	85289	PRKG2	99224	CFAP299	780267	False	False	False	alt	-25	0.00343	-85	0.04373
3050	chr4	102211053	T	G	rs151421	0.0448148064	0.0346620543139774	0.0448148064	0.0371583194836303	0.0149648786572338	0.0805685894654102	0.0006961228897412	0.0239761855198263	0.0006961228897412	0.0254337132480279	0.5839707880787145	0.062899239489424	0.0262022775973851	0.0204002377378837	0.0262022775973851	0.022214411979764	0.0087565535534603	0.0222835984899997	0.0004078657894488	0.0167843195412457	0.0004078657894488	0.0179569431059877	0.007693025861264	0.2504655258991224	0.007693025861264	0.2583737476007468	SLC39A8	220205	NFKB1	290278	MANBA	549941	False	False	False	alt	-40	0.006386	-50	0.0796
3051	chr4	102769234	T	C	rs150898	-0.0226226355	0.1699932463768667	0.0226226355	0.1619459802793276	0.0119482797879814	0.1700396615067291	-0.0002796402281595	0.1224870042366268	0.0002796402281595	0.1166741680425876	0.0479444807518749	0.9103157462298164	-0.0009595070204532	0.6287528645527949	0.0009595070204532	0.6149316637062544	0.0005801175900221	0.8745015112019675	-1.2042408542227393e-05	0.5585472852992132	1.2042408542227393e-05	0.5452588998171956	-0.0105042583429288	0.178670603232454	0.0105042583429288	0.1732875834126104	MANBA	8240	UBE2D3	99662	CISD2	99741	False	False	False	ref	-100	0.00786	90	0.03955
3052	chr4	102772464	C	T	rs223473	-0.0748887036	0.0076205915499345	0.0748887036	0.0072153492651685	0.0178945673521079	0.0432515651297325	-0.0014049801371999	0.0081094689038828	0.0014049801371999	0.007723486486072	0.2818431726470191	0.5209387183054953	-0.0219168893985867	0.0378531544272833	0.0219168893985867	0.0350544602794341	0.0051759267821904	0.1274807816304343	-0.0004205568297808	0.0200105315539982	0.0004205568297808	0.0187887915793112	-0.0654508864199835	0.0015788222173881	0.0654508864199835	0.0015296549958642	MANBA	11470	UBE2D3	96432	CISD2	96511	False	True	True	ref	40	0.02075	-75	0.02618
3053	chr4	102777629	G	C	rs223471	-0.0031941323	0.6911236657315176	0.00356714526	0.6805840996283308	0.0081606312730302	0.561117703758435	-2.7144519233453928e-05	0.6965447914396866	3.0219745479029672e-05	0.6862398157693737	0.1412442037780474	0.7539735170652523	-0.000356106848005	0.7619720837803377	0.0004381821607306	0.751432433400668	0.0011725867571365	0.767598401416692	-3.1483374038696604e-06	0.7668469403740586	3.824989899174664e-06	0.7564060814432089	-0.0027780371165675	0.5374664490983803	0.0030850942437161	0.5286275620242238	MANBA	16635	UBE2D3	91267	CISD2	91346	False	False	False	ref	100	0.002274	-50	0.02586
3054	chr4	102780174	A	C	rs223465	-0.0054218082	0.5763111395398519	0.0054218082	0.5634215462384367	0.0345684381180171	0.0022656918491287	-0.0002041321553324	0.2134566858152406	0.0002041321553324	0.205354815543032	0.2925300054979823	0.5082412306393881	-0.0017575869230209	0.519547347819188	0.0017575869230209	0.5063349106433501	0.0103151855408112	0.0133812602122863	-6.686317275476541e-05	0.2313711139544171	6.686317275476541e-05	0.2217050901258596	-0.003933650764012	0.4837127070944933	0.003933650764012	0.4723419510743492	MANBA	19180	UBE2D3	88722	CISD2	88801	False	True	True	ref	100	0.05847	100	0.1465
3055	chr4	102782903	T	C	rs223460	-0.00431030194	0.6452157230471045	0.00431030194	0.632121569860062	0.0082226272196558	0.548523746371089	-3.52360400456161e-05	0.6588538695845627	3.52360400456161e-05	0.6461138834463745	0.1504061245448604	0.739025318498084	-0.0007127545715711	0.6946064196682328	0.0007127545715711	0.6809071453984179	0.0012580090399551	0.7489565225828227	-5.988977614213402e-06	0.7046009456979901	5.988977614213402e-06	0.690986591393649	-0.0041971389744706	0.4499559991986889	0.0041971389744706	0.439088283830047	MANBA	21909	UBE2D3	85993	CISD2	86072	False	False	False	ref	-100	0.00349	-70	0.0123
3056	chr4	102788948	A	G	rs223456	0.0596466956	0.0157464036656323	0.0596466956	0.0167570500276209	0.0160246384863451	0.0668023922883632	0.0010006855962372	0.0135258076294055	0.0010006855962372	0.0142110058694277	0.168101328851959	0.6979100745743406	0.0114127204748521	0.1071610151501647	0.0114127204748521	0.1142872400762289	0.0028641275671736	0.3967079582466813	0.0002007068266762	0.0602643574636763	0.0002007068266762	0.0641159871409663	0.056330459859542	0.0039182118838691	0.056330459859542	0.0039902133844619	MANBA	27954	UBE2D3	79948	CISD2	80027	False	True	False	alt	-100	0.01889	-85	0.01913
3057	chr4	102799902	T	C	rs223434	0.0427091034	0.0411041370435872	0.0427091034	0.0440943448760239	0.0086260188486507	0.474606113521211	0.0003727314173441	0.0666893629388312	0.0003727314173441	0.070898812386255	0.2325750267118952	0.6013452834546348	0.0105510569912421	0.1156104020248616	0.0105510569912421	0.1236376601634797	0.0020135462983728	0.6067291095474904	9.24472917149003e-05	0.1331848547424267	9.24472917149003e-05	0.1410804577919834	0.0385584912706562	0.0111380628915496	0.0385584912706562	0.0114463593805392	MANBA	38908	UBE2D3	68994	CISD2	69073	False	False	False	alt	70	0.003414	45	0.02481
3058	chr4	102801330	G	A	rs223426	0.00139473678	0.6559347689382145	0.00376093718	0.664130689118465	0.0254655276363298	0.0087221156446065	4.421775523021162e-05	0.3520188291245189	9.83018052471316e-05	0.3586524885729017	0.1367400076764281	0.75943606907284	0.0002105711070435	0.7130050298026386	0.0005791769259587	0.7216552104279855	0.0036434214209037	0.2924239618062632	7.472681625393684e-06	0.5072990395159591	1.5897874616027663e-05	0.5152461461322098	0.0012116308260458	0.5034998747672553	0.0033900766605462	0.5102396910554422	MANBA	40336	UBE2D3	67566	CISD2	67645	False	True	True	alt	100	0.002653	-80	0.0373
3059	chr4	102811016	C	T	rs223415	-0.046978587	0.0356110588112067	0.046978587	0.0333390956022511	0.0107622089516666	0.2407938160879927	-0.000521617259972	0.0435269915658372	0.000521617259972	0.0410531199978965	0.1568875195800786	0.7253449953762017	-0.0075644473363575	0.1834303463211069	0.0075644473363575	0.1737823752075956	0.0017337907667987	0.6394209310387551	-8.623251256913258e-05	0.1554619205651602	8.623251256913258e-05	0.1476030731775717	-0.0440461000632786	0.0076414820240689	0.0440461000632786	0.0074281882996658	MANBA	50022	UBE2D3	57880	CISD2	57959	False	False	False	ref	-100	0.007122	40	0.03085
3060	chr4	102812443	T	C	rs223412	0.0512721648	0.0260839334109011	0.0512721648	0.0277764838348058	0.0121323545936565	0.1651615223800856	0.0006599920914199	0.0279913876345637	0.0006599920914199	0.0297457270394061	0.2159234016950383	0.6292626140470604	0.0120739124019379	0.0990217383175918	0.0120739124019379	0.106056617370483	0.002705220365711	0.4612474719673903	0.0001612508348975	0.0788007066122084	0.0001612508348975	0.0840477759133227	0.0476623201485492	0.0056278303496911	0.0476623201485492	0.0057412879921851	MANBA	51449	UBE2D3	56453	CISD2	56532	False	False	False	alt	-55	0.00225	30	0.02234
3061	chr4	102815871	A	C	rs223406	-0.0069957082199999	0.4710666944995003	0.0069957082199999	0.4589268834085084	0.02971765106159	0.0041186997302979	-0.0002103374658042	0.1703445154403698	0.0002103374658042	0.1628201775442127	0.0348385356694571	0.936753740544152	-0.0002545376580961	0.8337160615165636	0.0002545376580961	0.8194695816399745	0.0010937097599311	0.77234702175436	-8.1127625156886e-06	0.6390218619288058	8.1127625156886e-06	0.625590031873061	-0.0034709903629705	0.5112226215609263	0.0034709903629705	0.4996811001046465	UBE2D3	53025	CISD2	53104	MANBA	54877	False	True	False	ref	70	0.002605	100	0.02415
3062	chr4	102823801	A	C	rs223395	-0.00744745464	0.4768891434687601	0.00744745464	0.4644413755148901	0.0184636928970925	0.0367671610840451	-0.0001366810990316	0.2778856923725552	0.0001366810990316	0.2683244834940956	0.1718980487349453	0.7016844892782721	-0.0012092701520907	0.5867278987278334	0.0012092701520907	0.5730276973036442	0.0032831157281622	0.3526977100000705	-2.2429514948962657e-05	0.4220957069491731	2.2429514948962657e-05	0.4099511991706361	-0.0066266247575181	0.3034567919725942	0.0066266247575181	0.295050676207588	UBE2D3	45095	CISD2	45174	MANBA	62807	False	False	False	ref	70	0.00201	-60	0.02533
3063	chr4	102833343	G	A	rs223380	0.0002285882599999	0.7666724152997735	0.0022681265399999	0.7698424554965856	0.0081927096486459	0.536561736391087	-1.114526422689212e-06	0.7722045083935131	1.9465767556880028e-05	0.7748407360550675	0.0643761864749633	0.8859525718437209	7.441679061785e-06	0.8777526183441867	0.0001326945547278	0.8806780714747239	0.0005380814725441	0.8921708292694772	-9.174717105968785e-08	0.881821432307269	1.1576640913829944e-06	0.8846124426662626	0.0003962696708472	0.704144176026284	0.0016120499175302	0.7069683564530179	UBE2D3	35553	CISD2	35632	MANBA	72349	False	False	False	alt	-65	0.00877	-65	0.03186
3064	chr4	102849422	C	T	rs223359	0.00252344732	0.6914688248904206	0.0031859606799999	0.6998821868639847	0.0251160275089056	0.0093413849189329	6.83479992257839e-05	0.3954816796897299	8.536521158129536e-05	0.4031697871053954	0.027566676002863	0.9539524021548336	9.758682163814336e-05	0.902272777985292	0.0001117856472986	0.910150966767692	0.0007378775431351	0.8553426495439783	2.826073644394464e-06	0.7983215258020108	3.190782414469741e-06	0.8067843844319765	0.001419101857903	0.7150482432443619	0.0016099752072116	0.7230790783398942	UBE2D3	19474	CISD2	19553	MANBA	88428	False	True	False	alt	-100	0.00879	80	0.02646
3065	chr4	102851095	A	G	rs223357	-0.00302406624	0.7394585856200824	0.00302406624	0.7259880618010377	0.0271132574173267	0.0063784073841014	-8.567769093359163e-05	0.4167021994656711	8.567769093359163e-05	0.4052200082183884	0.0951109451342856	0.8347814622887006	-0.0003079757663357	0.8229284124326198	0.0003079757663357	0.8089246453337051	0.0026038177630789	0.4887506793986156	-8.879368487287666e-06	0.6367226246419412	8.879368487287666e-06	0.6231263368403517	-0.0026535544974532	0.6008912570888022	0.0026535544974532	0.588492586636732	UBE2D3	17801	CISD2	17880	MANBA	90101	False	True	True	ref	-35	0.001205	-70	0.03882
3066	chr4	102854547	C	T	rs223353	-0.0432475958	0.0468579183696961	0.0432475958	0.0440798703784731	0.0116112620444664	0.1924746145313877	-0.0005208717330045	0.0450751961543237	0.0005208717330045	0.0425894386057214	0.2066888660670753	0.6469708896973689	-0.009348347859083	0.1498100425008941	0.009348347859083	0.141054101718893	0.0024510133194987	0.5150500260537064	-0.0001154670480727	0.1205056663449668	0.0001154670480727	0.1136617121940888	-0.041369723752321	0.0099515777637679	0.041369723752321	0.0097130390415965	UBE2D3	14349	CISD2	14428	MANBA	93553	False	False	False	ref	55	0.00479	90	0.01875
3067	chr4	102856235	G	A	rs223351	-0.0310276982	0.0956553998214717	0.0310276982	0.0901180554900036	0.0088821385406205	0.4333367677461063	-0.0002796422126388	0.1103739717994	0.0002796422126388	0.1047970923042592	0.1027085343208954	0.8151701399866425	-0.0034178753728678	0.3468034860464332	0.0034178753728678	0.33429908286328	0.0009378273900232	0.7991893531328383	-3.1755702071674034e-05	0.3429709524864359	3.1755702071674034e-05	0.3310877578629003	-0.02665587817301	0.037579627946553	0.02665587817301	0.0365850102855292	UBE2D3	12661	CISD2	12740	MANBA	95241	False	False	False	ref	35	0.02026	25	0.01413
3068	chr4	102862343	T	A	rs223341	0.00074524877	0.886080980770077	0.000871153802	0.8965823386123484	0.0149189475243501	0.0839704912090438	1.150615072398258e-05	0.8003738810627136	1.3723392828449535e-05	0.8109278024050405	0.0524175561987157	0.9057450426009525	3.6375240720691376e-05	0.9299651279804056	4.526313116491448e-05	0.9404123197046584	0.0007964984191627	0.8356858105391287	5.625306212760891e-07	0.897517119571054	7.190502171318308e-07	0.9080674511046238	0.0004979304764572	0.8527641452631272	0.0006307119368457	0.863076319733643	UBE2D3	6553	CISD2	6632	MANBA	101349	False	False	False	alt	-85	0.006042	-70	0.0434
3069	chr4	102869029	G	T	rs223332	-0.0410031969999999	0.0510603719438408	0.0410031969999999	0.0477114998422813	0.0290629167500112	0.0048640284496729	-0.0011874984820441	0.0094104697706904	0.0011874984820441	0.0089929978656393	0.8576935445388438	0.0040986648430805	-0.0352789907257726	0.010053582290458	0.0352789907257726	0.0092694248781915	0.0250131372766773	0.0007400832482072	-0.0010251603592166	0.003893622520381	0.0010251603592166	0.0037159302422867	-0.0079565140717226	0.2457425020002994	0.0079565140717226	0.2383600688862678	CISD2	54	UBE2D3	133	MANBA	108035	True	True	True	ref	-55	0.01257	-55	0.1045
3070	chr4	102873031	T	A	rs223329	-0.0532204624	0.0281950206623219	0.0532204624	0.0267139323093161	0.0159804268160328	0.0731944492580277	-0.0009758051316309	0.0218375804080648	0.0009758051316309	0.0207843945856972	0.3168124150665463	0.4592536567063252	-0.0182985485409939	0.0570597966308319	0.0182985485409939	0.0534070285162036	0.0053071018365541	0.119596415783332	-0.0003446060647435	0.0364204856716324	0.0003446060647435	0.0343302945335074	-0.0397929439102065	0.0143044770428226	0.0397929439102065	0.0140360039785122	CISD2	4056	UBE2D3	4135	MANBA	112037	False	False	False	ref	-95	0.014084	-100	0.11255
3071	chr4	102888757	C	A	rs223311	-0.0079779037199999	0.4477915555083054	0.0079779037199999	0.4348622259143869	0.009262921373782	0.3938035263693971	-7.341890057772003e-05	0.4338420420657427	7.341890057772003e-05	0.4216176104215566	0.2408199255178995	0.5901541113342976	-0.0018983736976586	0.4880601181701882	0.0018983736976586	0.4739459770919574	0.0022321487528107	0.5593841275968425	-1.7505910880613204e-05	0.4750327846986639	1.7505910880613204e-05	0.4617678515952412	-0.0072822332181868	0.2892589825329813	0.0072822332181868	0.282265807205355	CISD2	19782	UBE2D3	19861	MANBA	127763	False	False	False	ref	-90	0.01198	65	0.0285
3072	chr4	102890220	A	C	rs223310	0.00891690832	0.3762423934930133	0.00891690832	0.387963584489202	0.0081073947131423	0.5706673329025032	7.126582187772232e-05	0.4098511656874019	7.126582187772232e-05	0.4212396490192898	0.1347607340325106	0.7669253311730564	0.0011678454998191	0.5518250695404944	0.0011678454998191	0.5656736488693302	0.0010962048428238	0.7800396426788998	9.36399645659988e-06	0.5667807674223758	9.36399645659988e-06	0.5802859402520945	0.0082054793099512	0.2203764186159503	0.0082054793099512	0.2273896810013868	CISD2	21245	UBE2D3	21324	MANBA	129226	False	False	False	alt	100	0.002745	95	0.02226
3073	chr4	102895366	A	G	rs6830407	0.0576761564	0.0184233982105838	0.0576761564	0.019551742757988	0.0110844651517317	0.2360515264336289	0.0007125636290051	0.0285257766951758	0.0007125636290051	0.0300603516557435	0.1693876492494735	0.7024355955541625	0.0111362179667819	0.1167056054716759	0.0111362179667819	0.1243411159102298	0.0020170838423037	0.5745948495081107	0.0001470743210311	0.1003115918967546	0.0001470743210311	0.1062107046164378	0.0545150883307917	0.0043140737719154	0.0545150883307917	0.0044196468712947	CISD2	26391	UBE2D3	26470	SLC9B1	124353	False	True	False	alt	-75	0.003214	-100	0.01443
3074	chr4	102896374	C	T	rs10012413	0.002092351588	0.7925806094225603	0.002092351588	0.8063605171112499	0.0262571880974376	0.00758626696152	5.654438600322545e-05	0.5175832185027852	5.654438600322545e-05	0.5296582301806234	0.2699052894739572	0.5469138956732702	0.000561765564141	0.7076903262569223	0.000561765564141	0.7214719429482885	0.0070374201825692	0.0459353468791884	1.5067421611955558e-05	0.4955583446313524	1.5067421611955558e-05	0.5083274089292198	0.0018070726874759	0.6792299506271512	0.0018070726874759	0.6923304484222442	CISD2	27399	UBE2D3	27478	SLC9B1	123345	False	True	True	alt	90	0.02338	100	0.07825
3075	chr4	102897577	T	C	rs4699033	0.006424337086	0.5148935124747539	0.006453643674	0.5269752657907902	0.0072440903714365	0.7098878065808251	4.847947946921297e-05	0.5620044445534543	4.867059660853766e-05	0.5739859772493334	0.0426850900942955	0.914163340134182	0.0003452080075175	0.7913855669738101	0.0003455317817925	0.8057925709029136	0.0003071397368431	0.9265361806043998	2.5972295231276258e-06	0.8070756911616108	2.599340953260519e-06	0.8215527994092274	0.0035581281963505	0.4818541760816521	0.0035581281963505	0.4921411925345724	CISD2	28602	UBE2D3	28681	SLC9B1	122142	False	False	False	alt	100	0.003489	50	0.005157
3076	chr4	102913483	G	A	rs6821247	-0.049447083	0.0297341329773853	0.049447083	0.0278066059564288	0.0094079968295557	0.3765433824796756	-0.0004736459966533	0.0493775859644255	0.0004736459966533	0.0464617777019677	0.2377742507702361	0.5967584002972481	-0.0117622951716288	0.1086116863115859	0.0117622951716288	0.1013142610565049	0.002256202364641	0.5480957747735448	-0.0001135482265269	0.1126360815485841	0.0001135482265269	0.1057972621145011	-0.0458967416674446	0.0059736622905281	0.0458967416674446	0.0058055769148465	CISD2	44508	UBE2D3	44587	SLC9B1	106236	False	False	False	ref	45	0.002686	70	0.01523
3077	chr4	102914239	G	T	rs59550147	-0.0090625698	0.4025984719129533	0.0090625698	0.3908411049555194	0.0090710862792252	0.4148999694409682	-8.423894612005768e-05	0.3979843067810008	8.423894612005768e-05	0.3870095391571832	0.2561769312959677	0.5641566684902849	-0.0024705339255201	0.4251207295702378	0.0024705339255201	0.412036019274368	0.0023266121781646	0.5357930502380147	-2.3047940600389807e-05	0.4160446719528531	2.3047940600389807e-05	0.403546962741569	-0.0071660494403468	0.2735474716873651	0.0071660494403468	0.26571621813634	CISD2	45264	UBE2D3	45343	SLC9B1	105480	False	False	False	ref	-100	0.004402	-100	0.0708
3078	chr4	102925242	C	A	rs7437714	-0.0256221158	0.1405128672929673	0.0256221158	0.1333274805495989	0.0090216030732169	0.4202332174173387	-0.0002355205270153	0.1506074760029752	0.0002355205270153	0.1437571494896308	0.040531540783618	0.926489917900319	-0.0010657593789569	0.6060916254682568	0.0010657593789569	0.5924011725610047	0.0003645543273379	0.9233637447005828	-9.760276668340928e-06	0.5964811024376275	9.760276668340928e-06	0.5830705130669364	-0.0127428707766677	0.1523784208123537	0.0127428707766677	0.1477360727976684	CISD2	56267	UBE2D3	56346	SLC9B1	94477	False	False	False	ref	-65	0.005676	100	0.0237
3079	chr4	102928840	T	C	rs3974602	-0.002436524054	0.7369003915933325	0.002845629946	0.7325927578220292	0.0074330826246172	0.6796875989590566	-1.8936555824949573e-05	0.7560155630613165	2.1860001293026488e-05	0.7521742666920084	0.1864064979927177	0.6787994671198865	-0.0004821611464754	0.7379604449586002	0.0005478952122549	0.7339198604756365	0.001392157145699	0.7172668075239523	-3.740759837217177e-06	0.7538882153268828	4.2159734229560125e-06	0.7501337567051135	-0.002300853743296	0.5986622467171163	0.0027240946482846	0.594321255304388	CISD2	59865	UBE2D3	59944	SLC9B1	90879	False	False	False	ref	100	0.00283	55	0.01608
3080	chr4	102938135	C	G	rs7676943	0.001706854526	0.4917810958937428	0.0066414765259999	0.4938496235860338	0.0074086329139294	0.6822911139725301	2.0155183180392668e-05	0.5424697339499119	5.1874775385990005e-05	0.5451889049038605	0.2024274110727289	0.6528303532410579	0.0002311135719796	0.550653090278449	0.0013611455468169	0.5521918099555619	0.0014921583259348	0.7030715648600554	3.3025916860063422e-06	0.5826725566665856	1.0561722847776343e-05	0.5848687321401896	0.0007199244805444	0.3294649267108447	0.0060477805786366	0.3309616924796495	CISD2	69160	UBE2D3	69239	SLC9B1	81584	False	False	False	alt	100	0.001543	55	0.03183
3081	chr4	102938244	A	G	rs4446311	0.00777252974	0.4225926683273914	0.00777252974	0.4347272453540934	0.0081948787789851	0.544802643688445	6.356494007894424e-05	0.4513818064196809	6.356494007894424e-05	0.4631077027760527	0.222867457131298	0.6199534547124896	0.0017449428084027	0.4627609875036679	0.0017449428084027	0.476113421112068	0.0018293602067824	0.6363883229716418	1.4293678874951804e-05	0.4789255681065846	1.4293678874951804e-05	0.4917470953522225	0.0070228944283654	0.2741650256986742	0.0070228944283654	0.2824289328995974	CISD2	69269	UBE2D3	69348	SLC9B1	81475	False	False	False	alt	15	0.001118	-65	0.05237
3082	chr4	102938648	G	A	rs6419160	0.005975945258	0.496392583751899	0.005975945258	0.5090184413878526	0.0221178013108117	0.0169855822416833	0.0001321668606652	0.2785426830187298	0.0001321668606652	0.2886257561365455	0.2691003018703513	0.5463480328218429	0.0016570378412023	0.4913676029346285	0.0016570378412023	0.5048711697129685	0.0060567145318818	0.0840540930480474	3.752750915894255e-05	0.3048353455495821	3.752750915894255e-05	0.3161723460032221	0.0051826263757922	0.37299532300422	0.0051826263757922	0.382996915969883	CISD2	69673	UBE2D3	69752	SLC9B1	81071	False	True	False	alt	55	0.003204	100	0.04736
3083	chr4	102940527	A	C	rs10017565	-0.00179613574	0.6960104247346035	0.00335422906	0.6971476056876665	0.0238970920040813	0.0122960612414258	-4.288874540224327e-05	0.4287330321370218	8.285195569126821e-05	0.4287061504173706	0.30485171007998	0.4907757318425627	-0.0006655108638393	0.6111102323460302	0.0011071840053905	0.6120493899862542	0.0073872127479555	0.0434198707852721	-1.6167587521254008e-05	0.4022890220584036	2.7703062523816256e-05	0.401989306545491	-0.0010456540005602	0.6004680246937336	0.0024979512235603	0.6017140491281873	CISD2	71552	UBE2D3	71631	SLC9B1	79192	False	True	False	ref	30	0.002121	35	0.01343
3084	chr4	102940972	C	A	rs11724035	0.0050736379219999	0.5554551696399823	0.005150072078	0.5666754889871031	0.0114255290484091	0.1954353510950705	5.964280582659502e-05	0.4752079292684761	6.055407265499449e-05	0.4854377149487506	0.3552319007458583	0.4098352441352701	0.0017253620623163	0.4833752756115372	0.0017541766108128	0.4953671752766863	0.0040500706530241	0.2502699667935058	2.021121677578289e-05	0.4220726951955656	2.0554750918365968e-05	0.4332411251215835	0.0033050135374847	0.4900463166162733	0.0033506571644933	0.4993990155484631	CISD2	71997	UBE2D3	72076	SLC9B1	78747	False	False	False	alt	45	0.00924	-35	0.01514
3085	chr4	102955130	C	T	rs6829718	-0.00634662708	0.5173718076040598	0.00634662708	0.5045808851203561	0.0085230726113586	0.493745037284411	-5.372119157681419e-05	0.5261545889194733	5.372119157681419e-05	0.5138662439814884	0.2630836419464932	0.5540474664233952	-0.0017295939994656	0.500088862767604	0.0017295939994656	0.486570128017372	0.0022210372505148	0.562633647203879	-1.4481806747491487e-05	0.5064023361598716	1.4481806747491487e-05	0.4933070838398419	-0.0050892644114564	0.3764716031832441	0.0050892644114564	0.3666285210911123	SLC9B1	64589	CISD2	86155	UBE2D3	86234	False	False	False	ref	-100	0.02623	-100	0.03705
3086	chr4	102955979	G	T	rs4235409	-0.015316656	0.2619813769729168	0.015316656	0.2520037306396102	0.0068535482392781	0.7575540487954832	-0.0001086688847019	0.3347623595844602	0.0001086688847019	0.3246642982236041	0.2017074865921845	0.6547543773360888	-0.0030899439493191	0.364655275066729	0.0030899439493191	0.3522129669289341	0.0013672827875801	0.7210702463598525	-2.172128552253594e-05	0.4185071454129764	2.172128552253594e-05	0.4062804276544833	-0.0147242191309038	0.1285312586222025	0.0147242191309038	0.1247847338705554	SLC9B1	63740	CISD2	87004	UBE2D3	87083	False	False	False	ref	-90	0.002083	80	0.01511
3087	chr4	102957720	C	T	rs3857198	-0.0466342134	0.0361061363759731	0.0466342134	0.0336644247747241	0.0106435447861349	0.2462583079117571	-0.0005116338667515	0.0444858656960532	0.0005116338667515	0.0419157424754177	0.0973059886513345	0.8296463727480621	-0.0049674009144031	0.2763092532095471	0.0049674009144031	0.2648314666076948	0.0010725587000038	0.7799725698357615	-5.6218644875465896e-05	0.2445675602023571	5.6218644875465896e-05	0.2342292585305938	-0.0371518376746646	0.0151330749465577	0.0371518376746646	0.0146724005956609	SLC9B1	61999	CISD2	88745	UBE2D3	88824	False	False	False	ref	-100	0.003906	-95	0.05493
3088	chr4	102961049	A	C	rs4698867	-0.00406277332	0.6312555573875238	0.00406277332	0.6177639933450259	0.0238646139359251	0.0120295312797076	-0.0001031907929841	0.3551026934625708	0.0001031907929841	0.3439842399609342	0.1891513397441881	0.672900073504974	-0.0008357743860445	0.6455344424814166	0.0008357743860445	0.6316691673998607	0.00458280195499	0.1735848605508604	-2.132831798336873e-05	0.4293272625253885	2.132831798336873e-05	0.4167352941694308	-0.0040581333831263	0.4632027317717115	0.0040581333831263	0.4521781166168176	SLC9B1	58670	CISD2	92074	UBE2D3	92153	False	True	False	ref	95	0.001837	-100	0.0362
3089	chr4	102974160	T	G	rs7659468	0.0289153346	0.0980303576668421	0.0289153346	0.1043475082714293	0.0103857386558765	0.2711508559941177	0.0003082409377954	0.0924721788832783	0.0003082409377954	0.0978988467181065	0.1283789250925839	0.7744648774481679	0.0036344921823299	0.2970416508539466	0.0036344921823299	0.3088965850989686	0.0012758534196131	0.7453633308672952	3.695156502245236e-05	0.2736061504289461	3.695156502245236e-05	0.2842751014110404	0.0260811834147656	0.0346486575822268	0.0260811834147656	0.0354936620568209	SLC9B1	45559	CISD2	105185	UBE2D3	105264	False	False	False	alt	55	0.005005	-20	0.03284
3090	chr4	102976939	A	G	rs4699044	0.0694216578	0.0106560387456686	0.0694216578	0.0112819713144223	0.0174627526917118	0.0485911119315158	0.0013440189389274	0.0108474248653196	0.0013440189389274	0.011400577900113	0.1097832965072251	0.8057700214380146	0.0089881735154916	0.1544419783979022	0.0089881735154916	0.1638630355379378	0.0020698973110205	0.5624977960817216	0.0001816931131701	0.0757071641168378	0.0001816931131701	0.0801937616232544	0.0585877446861481	0.0040488248852334	0.0585877446861481	0.0041642060909728	SLC9B1	42780	CISD2	107964	UBE2D3	108043	False	True	False	alt	95	0.012856	-75	0.05844
3091	chr4	102983598	C	G	rs12508069	-0.00924788966	0.4451721215711383	0.0102150658199999	0.4347721922123456	0.00714664908242	0.7220510448652223	-8.476457109627637e-05	0.4820241485738133	9.180737399977272e-05	0.4724504728158432	0.0601271797425284	0.8933626900926733	-0.0010351847671646	0.6901200814047073	0.0010628258250155	0.6800006703087932	0.0004987200961704	0.89985873829459	-1.034147428777454e-05	0.6987254661817114	1.0542751500184756e-05	0.688659498178433	-0.0082137781512256	0.3479431428825417	0.0085581800641084	0.3425409554492782	SLC9B1	36121	SLC9B2	102231	CISD2	114623	False	False	False	ref	-35	7.6e-06	-100	0.01566
3092	chr4	102994153	T	G	rs7688940	0.0024332297999999	0.7614942506699196	0.0024332297999999	0.7756809904575727	0.0224774212490567	0.0163519426376945	5.047250660121087e-05	0.5298132792119056	5.047250660121087e-05	0.5426517486036869	0.256127138248322	0.5615816019472575	0.0006969041695565	0.6751574318150871	0.0006969041695565	0.6897934490342315	0.0055180814853532	0.1038818220577978	1.4357937647614996e-05	0.5016849079083907	1.4357937647614996e-05	0.5154697039871091	0.001854791024803	0.6559671311147245	0.001854791024803	0.6689861402491479	SLC9B1	25566	SLC9B2	91676	BDH2	105717	False	True	False	alt	-45	0.00177	-40	0.0306
3093	chr4	103003981	G	C	rs13117110	0.005823757004	0.5417094925545132	0.005823757004	0.5547813385444191	0.008223115851457	0.5420726633286789	4.8520446256653697e-05	0.5558064625433619	4.8520446256653697e-05	0.5684701665559686	0.0121619518874676	0.9775938053975308	8.810889006795283e-05	0.915591383237348	8.810889006795283e-05	0.9298329396362484	0.0001003952272771	0.9781089775541146	7.348237350284281e-07	0.9159949514637616	7.348237350284281e-07	0.9302307799481944	0.0013257398935673	0.7461479452362786	0.0013257398935673	0.7594036660513768	SLC9B1	15738	SLC9B2	81848	BDH2	95889	False	False	False	alt	-100	0.001087	-90	0.0298
3094	chr4	103011399	C	T	rs7695096	0.009048354	0.3796000673586807	0.009048354	0.3914897689222024	0.0082187060493457	0.5377727320803699	7.573145285086333e-05	0.4082123861036257	7.573145285086333e-05	0.4196644229010039	0.0701148352161329	0.8676205168918717	0.0005891675007502	0.6937896511782833	0.0005891675007502	0.7080912330954501	0.0005684086050984	0.8734929391569904	4.892269597642596e-06	0.6995361021960351	4.892269597642596e-06	0.7136510561161161	0.0056805568522494	0.3265926517360201	0.0056805568522494	0.3357263073740074	SLC9B1	8320	SLC9B2	74430	BDH2	88471	False	False	False	alt	-100	0.001812	-100	0.01846
3095	chr4	104524048	A	C	rs2905625	-0.0010981341507999	0.8827334659439476	0.0011308099292	0.8730572190144118	0.0155557791206427	0.0728611142921398	-1.864303525777672e-05	0.7732005937910584	1.9008429699982232e-05	0.7633000385055712	0.1201547733897654	0.7892820621385656	-0.0001200709002047	0.8896045257713241	0.0001250675666719	0.8797299936092214	0.001816403240671	0.6386689135495273	-2.032074779226041e-06	0.8281098727346412	2.087949627228111e-06	0.8179447375199462	-0.0011991825641344	0.7691158017520174	0.0012323779292315	0.7597071166973619	CXXC4	29147	TET2	621828	TACR3	804063	False	False	False	ref	-40	0.001968	-45	0.012245
3096	chr4	104633005	A	G	rs1875310	-0.000637750646	0.910965814348525	0.000839072806	0.9018633317802396	0.0078148183186792	0.6228733720531702	-5.420732254184923e-06	0.9143988814633736	6.596654871711632e-06	0.9052931076912444	0.02677206195085	0.9501025880717204	-1.656144093237165e-05	0.9709389539272276	2.1774151804216663e-05	0.9651688888139756	0.0002082887363326	0.9551238391077396	-1.390740160693033e-07	0.9731522417915768	1.6952145694884216e-07	0.96730239506324	-0.0002987582858743	0.9214339392150994	0.0003817466986171	0.9124714801918782	CXXC4	138104	TET2	512871	PPA2	841062	False	False	False	ref	15	0.0005	-100	0.02148
3097	chr4	104645245	C	T	rs72662364	-0.000366541556	0.7524930484065037	0.002905239756	0.7518925318739194	0.0067489330528451	0.8407954593972623	-2.3715893109207687e-06	0.7909417399061741	2.0494456823893747e-05	0.7912267901146327	0.1339847923733648	0.7635653904876848	-3.7770025297584014e-05	0.8042297798763394	0.0003662442141787	0.8011692771737403	0.000907239144293	0.8155399742161896	-2.398977320966572e-07	0.8300207744291428	2.619826574920771e-06	0.8269867676704801	-0.0002780111826886	0.6107551870486563	0.0025186983267461	0.6079946519894924	CXXC4	150344	TET2	500631	PPA2	828822	False	False	False	ref	-100	0.01235	85	0.04977
3098	chr4	104657130	A	G	rs17034785	0.0056422827159999	0.5516908004171035	0.0056422827159999	0.5645773113252864	0.0102609232841851	0.2804925454724908	5.809439128186769e-05	0.5032398930918311	5.809439128186769e-05	0.5153654666129043	0.1298893142045041	0.7711201950519279	0.0008566221460333	0.658488089285749	0.0008566221460333	0.6723746652111596	0.0013285866424314	0.7271654720965554	8.580859427010919e-06	0.6253245618208595	8.580859427010919e-06	0.6389588164121818	0.0048610462764135	0.3916067568626096	0.0048610462764135	0.4020110526553899	CXXC4	162229	TET2	488746	PPA2	816937	False	False	False	alt	5	0.0002298	15	0.01135
3099	chr4	117737811	G	A	rs6856296	-0.0193380652	0.2052023146309537	0.0193380652	0.1962016806297756	0.0086554001784921	0.4718093928720024	-0.000167727910508	0.2243309140643959	0.000167727910508	0.2156717369647597	0.1750018153715287	0.7002294596013016	-0.0035675317724531	0.3416509573635355	0.0035675317724531	0.3296851895500404	0.0015264159502554	0.6992433250074297	-3.1154108688665056e-05	0.3500948771900617	3.1154108688665056e-05	0.338650793535582	-0.0179918878826543	0.0890986314534605	0.0179918878826543	0.0866625461836619	NDST3	295808	PRSS12	615192	TRAM1L1	652235	False	False	False	ref	-40	0.00854	100	0.03595
3100	chr4	117741466	T	G	rs6855141	-0.0063360035	0.505990952415617	0.0063360035	0.4934515277762524	0.0190170906031692	0.0333468013861887	-0.0001184359987746	0.2951356516390058	0.0001184359987746	0.2853810973889586	0.1858401020757475	0.6778035085923776	-0.001230746960443	0.5721560575517598	0.001230746960443	0.5586108698200485	0.0036244462889394	0.2992762641383716	-2.350533956359437e-05	0.4058790199991063	2.350533956359437e-05	0.3938699281234501	-0.0057593958443551	0.3458328389558834	0.0057593958443551	0.336563766366777	NDST3	292153	PRSS12	611537	TRAM1L1	655890	False	False	False	ref	95	0.01962	100	0.03732
3101	chr4	117743748	A	T	rs7655540	0.0082959625399999	0.401476825930894	0.0082959625399999	0.4135206658867698	0.0228492763424422	0.0145773600404351	0.0001894497086612	0.1752768394451542	0.0001894497086612	0.1831632680223908	0.1381155406176412	0.7565279967992167	0.0010610697683896	0.5682063136406486	0.0010610697683896	0.5818781218879598	0.0031858751917528	0.3583988785695939	2.4385260538289982e-05	0.3603095890187158	2.4385260538289982e-05	0.3721395168709057	0.0074482100436726	0.2485544924103425	0.0074482100436726	0.2563692721388619	NDST3	289871	PRSS12	609255	TRAM1L1	658172	False	True	False	alt	-65	0.001175	-75	0.03317
3102	chr4	117744362	T	C	rs9990663	-0.009414937	0.358408374604003	0.0101837374	0.3496789085480049	0.0076684962724223	0.6245697954768229	-7.786348133689475e-05	0.4036187538982188	8.257118673543245e-05	0.3957083768413833	0.1099658710152594	0.8026083498712121	-0.0011785983148485	0.5689655483675854	0.0012186417472228	0.5593517285565643	0.0008482606690852	0.8242830950835879	-9.45763775306462e-06	0.59199163428315	9.702841425364723e-06	0.5828729169266474	-0.0091992655525472	0.2263979297690408	0.0095561157273415	0.221724473431244	NDST3	289257	PRSS12	608641	TRAM1L1	658786	False	False	False	ref	-100	0.010574	-30	0.01199
3103	chr4	117745510	G	A	rs2012723	-0.0933137184	0.0029184499153064	0.0933137184	0.0027859296916552	0.0311378817774663	0.0062882109401313	-0.0032757383492219	0.0025740056226261	0.0032757383492219	0.0024513984257613	0.1696407639083392	0.7079442435108859	-0.0167174673041474	0.0659155283545324	0.0167174673041474	0.0612574520840428	0.0055648914028985	0.1048824211651959	-0.000606542830878	0.0153806428930024	0.000606542830878	0.0144951537049461	-0.0840423655847052	0.0004177870906721	0.0840423655847052	0.0004262729468366	NDST3	288109	PRSS12	607493	TRAM1L1	659934	False	True	True	ref	-70	0.000982	-50	0.01251
3104	chr4	117755278	T	G	rs4600992	0.0016047811599999	0.5955015202356196	0.00452720556	0.6031880584368846	0.0078051948111363	0.6343248070218218	1.0223214638327408e-05	0.62124777873756	3.646878671940263e-05	0.6288365081796874	0.0677268436394568	0.8731711692359256	6.628399411464e-05	0.790883084941225	0.0002957452016782	0.7999124648864889	0.0005208747110414	0.8860532729396361	3.001508131880848e-07	0.8021038670454712	2.360885209620188e-06	0.8110281516129477	0.001070550524383	0.5178911241749998	0.0031452608429547	0.5247251722836063	NDST3	278341	PRSS12	597725	TRAM1L1	669702	False	False	False	alt	100	0.003382	-75	0.005554
3105	chr4	117758445	C	T	rs2169057	0.0043142623	0.5960599097133819	0.0043142623	0.6094837342328085	0.0105712726422375	0.2630737084659616	4.41153499893938e-05	0.5420472320165454	4.41153499893938e-05	0.554484176398135	0.1819064513117355	0.6751410132648739	0.0008705788147544	0.608384857963434	0.0008705788147544	0.6228370848045565	0.0018744162412586	0.6032015017975495	8.884458508472694e-06	0.5718731868566951	8.884458508472694e-06	0.585775846310139	0.0039896679426134	0.4360603135823582	0.0039896679426134	0.4468406630752669	NDST3	275174	PRSS12	594558	TRAM1L1	672869	False	False	False	alt	-100	0.0007324	80	0.04898
3106	chr4	117759419	T	C	rs1540575	-0.000515436568	0.8307599003816707	0.001743511216	0.8258035581085506	0.0107144285357082	0.2563846695724857	-4.525334940911374e-06	0.8054390470465755	1.6476623503416414e-05	0.8005568031900008	0.291770661521385	0.5111116394764021	-0.0001035977673684	0.7508086186089038	0.0004890554014888	0.7457236819973095	0.0031537435351651	0.3807798387041752	-9.118145515686638e-07	0.7262061098514907	4.660303988595778e-06	0.7211486444440466	-0.0005850683098372	0.7359663299932079	0.0015103891119201	0.7309116634028431	NDST3	274200	PRSS12	593584	TRAM1L1	673843	False	False	False	ref	85	0.003326	-70	0.02505
3107	chr4	117768523	G	A	rs6857739	0.005156960188	0.5500538944698155	0.005156960188	0.5630075314949148	0.0194164204965085	0.0300493394881874	0.0001040617454199	0.3367126435733174	0.0001040617454199	0.3470904698872563	0.2225541758731936	0.6147120696354406	0.0013234668073335	0.5505491033803178	0.0013234668073335	0.5640576814157863	0.0044512133203388	0.1956585686209201	2.693166224025828e-05	0.3798521445513582	2.693166224025828e-05	0.3919445700240224	0.0045913339349992	0.4070105208367365	0.0045913339349992	0.4173084853687962	NDST3	265096	PRSS12	584480	TRAM1L1	682947	False	False	False	alt	-65	0.00946	75	0.04865
3108	chr4	117768799	G	A	rs1350618	-0.0438214972	0.0433254997388994	0.0438214972	0.040577942624024	0.0157603684874135	0.0674517736623532	-0.0007044391546179	0.0246179325465228	0.0007044391546179	0.0232240216437377	0.194481270552599	0.6619480374219601	-0.0088010928636384	0.1582363602335109	0.0088010928636384	0.1493786986810266	0.0030996676020175	0.3856857896893731	-0.0001428396650919	0.0911884924977014	0.0001428396650919	0.0857299918445511	-0.0402805008350708	0.01005862545506	0.0402805008350708	0.0098059105416982	NDST3	264820	PRSS12	584204	TRAM1L1	683223	False	False	False	ref	85	0.01132	-85	0.0709
3109	chr4	117771815	C	A	rs1459538	0.1006969502	0.0026579474948821	0.1006969502	0.0027707049202437	0.0498999675032276	0.0006176620880928	0.0053014186037273	0.0009518689150525	0.0053014186037273	0.0009919412260089	0.456311787466675	0.2437844177397563	0.0465462847108941	0.0044079389856811	0.0465462847108941	0.0047236654426318	0.0229212127390017	0.0010102255713315	0.0024612621467879	0.001171135246056	0.0024612621467879	0.0012333168651961	0.0462203964771418	0.0070358327545249	0.0462203964771418	0.0071861608633623	NDST3	261804	PRSS12	581188	TRAM1L1	686239	False	True	True	alt	-55	0.003357	35	0.02347
3110	chr4	117772174	A	C	rs10011404	0.028488572	0.0967917306858432	0.028488572	0.1023276264366174	0.0124048530026199	0.1614293776815211	0.0003731795783766	0.0720579755123	0.0003731795783766	0.0758497205819936	0.4975591033102003	0.1792217317138302	0.0141298326285371	0.0714721808174558	0.0141298326285371	0.07700814292677	0.0061720116428817	0.0747973595088963	0.0001851831195019	0.0563249504599487	0.0001851831195019	0.0602248449731684	0.0095291444932	0.2028013723717148	0.0095291444932	0.2090315925398931	NDST3	261445	PRSS12	580829	TRAM1L1	686598	False	False	False	alt	40	0.001526	50	0.02515
3111	chr4	117772414	A	G	rs17867553	0.064379242	0.0104613308411551	0.064379242	0.0111716721389752	0.0157831360116138	0.0676211493419593	0.001027027987658	0.0107905819172489	0.001027027987658	0.0114252260237858	0.5139015964895901	0.1533292415834252	0.0330695602433764	0.0104590063516753	0.0330695602433764	0.011396095767922	0.0081282990082609	0.0284707281222952	0.0005286463816924	0.0098762797777257	0.0005286463816924	0.0105858308881412	0.0200479258083589	0.068702594347097	0.0200479258083589	0.0706296790453327	NDST3	261205	PRSS12	580589	TRAM1L1	686838	False	True	False	alt	-100	0.008	-100	0.0556
3112	chr4	117773188	G	T	rs1459540	-0.0141151306	0.2683537727517635	0.0141151306	0.2579736931860252	0.0082946501093927	0.5328240830848183	-0.000116951609128	0.2938018850523418	0.000116951609128	0.2840403754002429	0.3670950943474517	0.3755590759884685	-0.005260932028979	0.2433645189640357	0.005260932028979	0.2325779121725135	0.0030767803203972	0.3899979626944476	-4.403365106791717e-05	0.259072271006341	4.403365106791717e-05	0.2487842056730394	-0.0086868121038599	0.238407108749146	0.0086868121038599	0.2311979010359297	NDST3	260431	PRSS12	579815	TRAM1L1	687612	False	False	False	ref	80	0.00642	55	0.0595
3113	chr4	117776551	G	A	rs17861256	0.00636775208	0.4749069403084581	0.00636775208	0.4873806230902659	0.0249783176433188	0.0094685279026333	0.0001588730307775	0.2039980645799116	0.0001588730307775	0.2127618335764861	0.0111308208591375	0.9819322574882008	7.062626884323837e-05	0.919805960194546	7.062626884323837e-05	0.9339146487139454	0.0002912451713366	0.9453595587021728	1.8583643700930144e-06	0.8428026777259385	1.8583643700930144e-06	0.8569732605222943	0.001186734302223	0.7698032279761875	0.001186734302223	0.7834345968116396	NDST3	257068	PRSS12	576452	TRAM1L1	690975	False	True	False	alt	100	0.00584	70	0.01253
3114	chr4	117778480	G	A	rs1350616	0.000516495965848	0.900557108814718	0.000894823794152	0.905223667787188	0.0160431326749378	0.0654417528380718	1.1324372247282453e-05	0.7949793491910022	1.676834361985262e-05	0.7987063392460888	0.2104503158746459	0.6376779919382649	0.0001554349036152	0.857519515299268	0.0002048200461917	0.8607368215290427	0.0034335936759319	0.3326550690366744	3.2533431905964705e-06	0.7740655982103878	3.9597194302868e-06	0.7779181457087262	0.0005580970756958	0.8314876832246476	0.0008278094171101	0.8341125159155335	NDST3	255139	PRSS12	574523	TRAM1L1	692904	False	False	False	alt	0	0.0	100	0.03021
3115	chr4	117781119	C	A	rs4295331	-0.003196795528	0.7335608388003642	0.003196795528	0.7201287958093144	0.0118372362823928	0.1806107942982081	-3.5908544094350455e-05	0.6619566075236744	3.5908544094350455e-05	0.6490143193493977	0.0492079793358851	0.9109231701352568	-0.000134150935096	0.9041390947818184	0.000134150935096	0.8899299479202538	0.0006006165561194	0.8755669661160788	-1.5598720163926989e-06	0.8780361187732425	1.5598720163926989e-06	0.8638598642845146	-0.0016286476000787	0.7252499260683105	0.0016286476000787	0.7120078126563112	NDST3	252500	PRSS12	571884	TRAM1L1	695543	False	False	False	ref	80	0.002136	-25	0.01332
3116	chr4	117782152	C	T	rs1380370	0.0026407934399999	0.7383114353226138	0.0026407934399999	0.7520478716362995	0.0239300307572945	0.0115909915730724	6.290649767796698e-05	0.4424698226461351	6.290649767796698e-05	0.4541178283073951	0.0447183062064958	0.9192562401031332	0.0001176910236908	0.8758076336588443	0.0001176910236908	0.8901414269990223	0.0010738472212126	0.7818568223979088	2.813450955392321e-06	0.7689377364382798	2.813450955392321e-06	0.7832197408759662	0.0015996016556188	0.6953577788095429	0.0015996016556188	0.7085675045720065	NDST3	251467	PRSS12	570851	TRAM1L1	696576	False	True	False	alt	65	0.003204	65	0.03268
3117	chr4	117783014	G	A	rs4516794	-0.0491731522	0.0310743519164799	0.0491731522	0.0291277488867002	0.0121701492021932	0.1683191048055339	-0.0006321059257757	0.0320039034292567	0.0006321059257757	0.0302052701087765	0.1912550960072199	0.6706731129838599	-0.0098954547948763	0.1423542945756031	0.0098954547948763	0.1338517090726547	0.0023795180691189	0.5216942332105543	-0.0001300709240265	0.1076990437398985	0.0001300709240265	0.1014371291731776	-0.0465772466519361	0.0057072878405207	0.0465772466519361	0.0055266494636973	NDST3	250605	PRSS12	569989	TRAM1L1	697438	False	False	False	ref	20	0.001411	20	0.0163
3118	chr4	117784084	G	C	rs4568305	0.0025023593949999	0.7085066935428169	0.002651831663	0.718599932994926	0.0068266785945705	0.811001093483823	1.768407979981891e-05	0.7490572366723989	1.868851171270761e-05	0.7587392188938326	0.19193767570203	0.6699899546671569	0.0005024275462405	0.7098952124481452	0.0005299453039865	0.720387398966332	0.0013125182057707	0.7317585999113628	3.556560971115263e-06	0.7398059973068244	3.7414763038265536e-06	0.7499493906802503	0.0026556292077718	0.5574541706701903	0.0027842612475232	0.5665897292004201	NDST3	249535	PRSS12	568919	TRAM1L1	698508	False	False	False	alt	95	0.00821	-70	0.06805
3119	chr4	117785060	C	A	rs7661175	0.005024008228	0.5433688853516025	0.005024008228	0.5565477230024358	0.0192451394204026	0.0307940522539009	9.844401297292304e-05	0.3361423407688029	9.844401297292304e-05	0.347132199192929	0.0317202460606437	0.9396399627669444	0.0001809612614919	0.8379620168334909	0.0001809612614919	0.8522412159639469	0.0006151656574846	0.8680005448888168	3.5579753148134943e-06	0.7402343917275812	3.5579753148134943e-06	0.7542761350469387	0.0028216060332575	0.5464999762250103	0.0028216060332575	0.5587491286729421	NDST3	248559	PRSS12	567943	TRAM1L1	699484	False	False	False	alt	-30	0.001352	80	0.006393
3120	chr4	117805467	G	A	rs1350617	-0.037964256	0.0627270198977151	0.037964256	0.0587239397447124	0.0094607794717048	0.3643545328331281	-0.0003679351598343	0.0767603953866094	0.0003679351598343	0.0725256366448105	0.2368032863411446	0.5954674807967434	-0.0091191411648044	0.1483805870457132	0.0091191411648044	0.1397893335662747	0.0022323729264676	0.5661682568442838	-8.797905326342514e-05	0.1493236316325204	8.797905326342514e-05	0.1413878512606234	-0.0344733866533884	0.0162536344689438	0.0344733866533884	0.0157982778596874	NDST3	228152	PRSS12	547536	TRAM1L1	719891	False	False	False	ref	-100	0.005394	10	0.006042
3121	chr4	117806257	A	G	rs17863939	-0.02181608212	0.1429643235227995	0.02470215188	0.1375743710617124	0.0162247417940521	0.0663189088455041	-0.0004383496132256	0.0676189620103399	0.0004626816360432	0.0651566107389269	0.2270044295065301	0.6127187932399433	-0.0054349657242569	0.2336291243592374	0.0059381769649986	0.2256169862393867	0.0037997104119883	0.2724065664419866	-0.0001096859252079	0.1361913142838695	0.000113928423984	0.1305167453250256	-0.0211433728565648	0.0563036280813522	0.0232097843338623	0.0553740781144969	NDST3	227362	PRSS12	546746	TRAM1L1	720681	False	False	False	ref	-60	0.001995	100	0.048
3122	chr4	117807611	A	G	rs9995094	-0.000216750924	0.8200479503362307	0.001852362996	0.819955604604109	0.0094284907716292	0.3632680568580883	-3.749387727291081e-06	0.7872781794363894	1.8258572255154552e-05	0.7869491202336437	0.2162470565047355	0.6329033105907285	-2.80597635111e-05	0.7598019020283641	0.0004046946531323	0.759502667455507	0.002047760629291	0.5940348354956416	-6.464768231185496e-07	0.740073965333928	4.000654252533858e-06	0.7395513160302586	-0.00023236755568	0.6830812193751075	0.0017427566676002	0.6828072129414988	NDST3	226008	PRSS12	545392	TRAM1L1	722035	False	False	False	ref	100	0.008804	95	0.05225
3123	chr4	117812502	C	A	rs17865121	-0.0019863818839999	0.8037032378884799	0.002133992916	0.7933752643772746	0.0076302902299228	0.6610644979743132	-1.4929133227367585e-05	0.8170373299492449	1.605064317870511e-05	0.8069256491822404	0.0335874853473583	0.9386092281609728	-6.543222725289088e-05	0.934577511172312	6.95497602349459e-05	0.924355110979988	0.0002582443799904	0.9447632101215242	-4.942349534732178e-07	0.9396995723072586	5.255188906421367e-07	0.9294595795789732	-0.0009149472504901	0.8155663520491663	0.0009771885600472	0.80542667605622	NDST3	221117	PRSS12	540501	TRAM1L1	726926	False	False	False	ref	-35	0.002058	100	0.0516
3124	chr4	117815750	G	C	rs6824201	0.0021062484	0.7080911483846313	0.0031274557199999	0.7159360332366496	0.0071927989388808	0.7149745012245862	1.5048506384960704e-05	0.7509636193182708	2.262617866712876e-05	0.7585539509885708	0.1434102013506363	0.7496164212178519	0.0003588933349281	0.7332612678535252	0.0004802212255121	0.7414731453086282	0.0010180605242495	0.7936251676103608	2.548648064646972e-06	0.7647907770032292	3.4489383233391854e-06	0.7728831033876392	0.0023568709218975	0.5386806272870482	0.0031452608429547	0.5459931455503385	NDST3	217869	PRSS12	537253	TRAM1L1	730174	False	False	False	alt	100	0.007538	-40	0.01823
3125	chr4	117825076	A	C	rs1459530	-0.00511424242	0.5791869403565009	0.00511424242	0.566316095824912	0.0139250528558554	0.1062373375463549	-7.386284951835473e-05	0.4471587065609028	7.386284951835473e-05	0.4359274201517432	0.2293613004284276	0.6100079229321884	-0.0011940986842651	0.582935321756051	0.0011940986842651	0.569381641109884	0.0032079935105843	0.3746694319177165	-1.721768933087792e-05	0.4795358665106239	1.721768933087792e-05	0.466973342950288	-0.004858971566095	0.4167616274161227	0.004858971566095	0.4064853367711107	NDST3	208543	PRSS12	527927	TRAM1L1	739500	False	False	False	ref	-80	0.009224	-5	0.007477
3126	chr4	117833987	T	C	rs4834639	0.00864661656	0.3917902609248517	0.00864661656	0.4039237386535814	0.0068436713790064	0.8214099875658585	5.881655553287347e-05	0.4741513754554221	5.881655553287347e-05	0.4862821853478298	0.284280957271341	0.5143901597653574	0.0025268810401439	0.386397217282776	0.0025268810401439	0.3994042456797899	0.0019476094577092	0.6101748752313979	1.7234220665488047e-05	0.4425050063624002	1.7234220665488047e-05	0.455487607041411	0.0067262108528095	0.2891241083478589	0.0067262108528095	0.2978685869312278	NDST3	199632	PRSS12	519016	TRAM1L1	748411	False	False	False	alt	100	0.0008726	-100	0.03842
3127	chr4	117861630	C	A	rs4377658	0.001982162564	0.7653643173297288	0.002362162924	0.7726652177740073	0.0266541736137123	0.0078013978355666	6.059911568070127e-05	0.4655148961587036	6.981796211518346e-05	0.4728448788915506	0.034838535669457	0.9354446798767192	6.367569172568998e-05	0.9134408235273496	8.490311021751985e-05	0.920521662585337	0.0009375166001198	0.8068972908586712	1.9984275923118084e-06	0.8134255874879581	2.5134068768447043e-06	0.8204321595377526	0.0009336196433572	0.7530328001588487	0.0013236651832487	0.7601353417274219	NDST3	171989	PRSS12	491373	TRAM1L1	776054	False	True	False	alt	10	0.001648	90	0.0193
3128	chr4	117913276	A	G	rs7680858	0.0303325555999999	0.0971076669339269	0.0303325555999999	0.1029473356550643	0.0086953996953845	0.4668840055158579	0.0002749647275332	0.11884687445063	0.0002749647275332	0.1248562218426376	0.2407618336289795	0.5926551420837857	0.0076139982732908	0.1715386230556144	0.0076139982732908	0.181606238816171	0.0021170736040751	0.5882631676873405	6.951992366201257e-05	0.1828594848467766	6.951992366201257e-05	0.1923774491406186	0.0275417794790401	0.0362419746580706	0.0275417794790401	0.037360818406029	NDST3	120343	PRSS12	439727	METTL14	772117	False	False	False	alt	55	0.002365	-5	0.003036
3129	chr4	117917400	A	G	rs67213843	0.045394044	0.0342298573279566	0.045394044	0.0366879607813582	0.011335368077098	0.2014692547490056	0.0005189706970561	0.0359191756523073	0.0005189706970561	0.0381911864994019	0.4351352192450129	0.277667137930109	0.0196870747561449	0.0387512767887287	0.0196870747561449	0.0423557875674254	0.0049210550448894	0.1463875084989261	0.000224542026627	0.0375898263427213	0.000224542026627	0.0405996744234014	0.0222803141111421	0.0539021219553167	0.0222803141111421	0.0554798906916464	NDST3	116219	PRSS12	435603	METTL14	767993	False	False	False	alt	-100	0.004955	75	0.04926
3130	chr4	117929247	A	G	rs55923363	0.004229469472	0.6332092571588034	0.004229469472	0.6465954882476339	0.0065499205282759	0.8659911894472508	2.680147470819036e-05	0.7061593830689952	2.680147470819036e-05	0.7195106962895539	0.0247367711283311	0.9550938821260172	0.0001191301190513	0.8911977318160345	0.0001191301190513	0.905314585949704	0.0001605258168425	0.965534943275704	7.535717201079611e-07	0.9079201941814844	7.535717201079611e-07	0.9222128973271816	0.0016846647786802	0.6908072145091476	0.0016846647786802	0.7039668123429513	NDST3	104372	PRSS12	423756	METTL14	756146	False	False	False	alt	100	0.0238	45	0.03
3131	chr4	117931831	C	T	rs28521069	0.002135830632	0.7241821586777936	0.002900421432	0.7321032794352774	0.0214866862560952	0.0189740235935214	4.305745054706035e-05	0.4864917145379542	5.955279417274031e-05	0.4941104180661349	0.0797497899355802	0.855487893684995	0.0001582142971947	0.8312614942479268	0.0002154322962968	0.8393593092516807	0.0017336018150284	0.6468915671847566	3.2302757754991693e-06	0.7113211258465179	4.46470153630224e-06	0.7192511126191943	0.0016639176754945	0.6416891335826953	0.0020747103185717	0.6493903860602157	NDST3	101788	PRSS12	421172	METTL14	753562	False	True	False	alt	-100	0.01074	30	0.00531
3132	chr4	117937561	T	C	rs7666685	-0.0074173131399999	0.4742448724505784	0.0074173131399999	0.462018893699764	0.0238529680340377	0.0120049978416697	-0.0001810813683877	0.2139618497194322	0.0001810813683877	0.2055362207981576	0.1303602734468199	0.773799657121594	-0.0010478938848988	0.6199143337829847	0.0010478938848988	0.6061945691262406	0.0031870927600574	0.3797234120543969	-2.621260667059909e-05	0.4019851146135	2.621260667059909e-05	0.3899928152555385	-0.0069627278291267	0.3038883914197929	0.0069627278291267	0.2955344746527859	NDST3	96058	PRSS12	415442	METTL14	747832	False	True	False	ref	85	0.00296	100	0.0337
3133	chr4	117946001	A	G	rs6821845	0.0234250647999999	0.1406250103981763	0.0234250647999999	0.1485169388783267	0.0070382559445988	0.7729575971458794	0.0001676079972466	0.2015265172785728	0.0001676079972466	0.2101267170535692	0.1801222004377638	0.6922843650015689	0.0044476258260381	0.2665574698101525	0.0044476258260381	0.2781128751288178	0.0012902335878872	0.7424570214503242	3.23024504161888e-05	0.3180100030172753	3.23024504161888e-05	0.3294351257010585	0.022392348468345	0.0521796998139679	0.022392348468345	0.0535735630758416	NDST3	87618	PRSS12	407002	METTL14	739392	False	False	False	alt	-25	0.001167	-65	0.01706
3134	chr4	117951461	T	C	rs145065097	0.003893718604	0.6333559930255985	0.004136746856	0.6430976571468332	0.0078644571926107	0.604849395795751	3.4035924945065135e-05	0.6524128262880811	3.543114486027723e-05	0.6617536038941356	0.3029637236900797	0.4948646751937358	0.0012971531936455	0.5785646957054505	0.001368574996947	0.5884788455713238	0.0023878161652765	0.5390383780823638	1.1329347145745377e-05	0.5960896110326055	1.1739378164718174e-05	0.6057383659770073	0.0029045944460004	0.542402330847601	0.003095467795309	0.5510489590618723	NDST3	82158	PRSS12	401542	METTL14	733932	False	False	False	alt	90	0.01582	-95	0.05225
3135	chr4	117956409	G	A	rs12641736	-0.00297182512	0.7124779389140415	0.0034931097999999	0.704846615941636	0.0069992681530847	0.7817499310357068	-2.248772550209458e-05	0.748581073872066	2.5553159983613208e-05	0.7411397334266442	0.1068994491644103	0.8085192809166492	-0.000360553763402	0.7836132887834767	0.0004235303631686	0.776003675811184	0.0007549734217658	0.8421060633128925	-2.7585434558968653e-06	0.8065878702641305	3.128879766146618e-06	0.7989127611356226	-0.0022323883027832	0.5581951607994792	0.002892146184089	0.5515769201473586	NDST3	77210	PRSS12	396594	METTL14	728984	False	False	False	ref	65	0.001503	-100	0.04373
3136	chr4	117959589	T	C	rs4834649	-0.0008093386134	0.805349638342571	0.0022371388654	0.8054967815543649	0.0201174974094561	0.0265528818135202	-1.1860362121483292e-05	0.6604652390762469	3.685384034430495e-05	0.6594081643046974	0.2560005809188891	0.5611292958662386	-0.0002785119839743	0.7671128680795329	0.0005103576571749	0.7646326419077164	0.0052862369912512	0.1181309344289925	-4.2572954855687525e-06	0.6473794551097412	8.441697480006892e-06	0.6447256903728407	-0.0007697175281901	0.7074340184007479	0.0017614290604674	0.7061991784715957	NDST3	74030	PRSS12	393414	METTL14	725804	False	False	False	ref	-30	0.002914	-100	0.0542
3137	chr4	117960299	G	T	rs2389473	0.00562277478	0.5272864032688764	0.0057396316199999	0.5365264350784656	0.0264215461116349	0.0079084385580543	0.000164862207652	0.2443262129942755	0.0001672307210965	0.2518616169618931	0.2542142553345988	0.5671013265854702	0.0015185526407636	0.5183632318581699	0.0015413351117872	0.5282203514197396	0.0069251071610426	0.0567396226484619	4.518998069554342e-05	0.2828494669289337	4.565174732876116e-05	0.2918100611545385	0.0049689312129793	0.3946362424225163	0.0050726667289079	0.4020609811936859	NDST3	73320	PRSS12	392704	METTL14	725094	False	True	True	alt	100	0.014	100	0.0653
3138	chr4	117976359	T	C	rs13111689	0.0305847504	0.094261910427998	0.0305847504	0.1001988489776988	0.008352294542055	0.529862551288176	0.000265384858643	0.1221099497107595	0.000265384858643	0.1285081060330992	0.0961047313768814	0.8235892558926372	0.0034589560127895	0.3632107708490016	0.0034589560127895	0.3763484998641045	0.0008380339007348	0.8264838022022197	3.1206642318334086e-05	0.3797310686425912	3.1206642318334086e-05	0.3922519557797279	0.0218902685712506	0.0653970385153722	0.0218902685712506	0.0673014515533175	NDST3	57260	PRSS12	376644	METTL14	709034	False	False	False	alt	-95	0.02133	-70	0.02301
3139	chr4	117983309	C	T	rs10005201	0.0041696923999999	0.6039732451884072	0.0041696923999999	0.6172579008503644	0.0409646246943256	0.0010409020853218	0.0001703109663781	0.1836194134328715	0.0001703109663781	0.1916996874723852	0.0480170956130249	0.9102442092881312	0.0002058084630431	0.8176656470226112	0.0002058084630431	0.8320027320231163	0.0020279761032815	0.5722970272508241	8.626794618034765e-06	0.5751841204900883	8.626794618034765e-06	0.5888841590227806	0.0026784510212761	0.5574463953509021	0.0026784510212761	0.5695003329151686	NDST3	50310	PRSS12	369694	METTL14	702084	False	True	False	alt	-100	0.00421	-70	0.02766
3140	chr4	118005778	A	G	rs1994381	-0.0024102231	0.789740760146319	0.0024102231	0.7760944396256784	0.0195911490423277	0.0291076798558308	-4.43535013709243e-05	0.584056636693347	4.43535013709243e-05	0.5713539166232525	0.122860195645183	0.7865600622975909	-0.0003050283380329	0.8212472928370254	0.0003050283380329	0.8073091673034659	0.0024006701932532	0.5097035975471542	-5.621833252984733e-06	0.7033462352971556	5.621833252984733e-06	0.6894946196664287	-0.0022303135924646	0.6445097722661524	0.0022303135924646	0.6317335914145514	NDST3	27841	PRSS12	347225	METTL14	679615	False	False	False	ref	50	0.0029	-95	0.04657
3141	chr4	118006805	C	A	rs2892779	0.0002109825279999	0.7699083124740094	0.002377857112	0.7694001328693956	0.0197668843154708	0.0295625107862244	8.82834206484094e-06	0.5568170481674068	5.429243776207768e-05	0.5575330694518789	0.1314868411498044	0.7720099216543683	-1.4620255264465726e-05	0.8107341690880243	0.0003053724398415	0.8096111791336451	0.0026773004384003	0.4639324226093791	-6.056891096503461e-08	0.6706435523091273	7.133915954379295e-06	0.6705244947281377	0.00015975269453	0.6287244846147524	0.0023340491083931	0.6281014008821346	NDST3	26814	PRSS12	346198	METTL14	678588	False	False	False	alt	-40	0.004738	15	0.01101
3142	chr4	142816006	G	A	rs1992418	-0.0285803827999999	0.1184511600677909	0.0285803827999999	0.1120972588352416	0.0081123762905776	0.5724723459588704	-0.0002354478326273	0.1525070626507052	0.0002354478326273	0.1455767772373583	0.2397473002831979	0.5826331938565386	-0.0074606440818878	0.1964832625591608	0.0074606440818878	0.1864877119066912	0.0019788041737189	0.6071976842762098	-6.250953500026485e-05	0.2212024292484933	6.250953500026485e-05	0.2114826358146245	-0.0239317835247253	0.0500317160345482	0.0239317835247253	0.0486537006918533	INPP4B	31426	USP38	368912	GAB1	520871	False	False	False	ref	-100	0.000578	15	0.00482
3143	chr4	142880194	C	G	rs6537131	-0.00075879534	0.8057988938776915	0.0019455812199999	0.800393597896567	0.006829776503819	0.8019202366514131	-4.9295009233904255e-06	0.8375592565810427	1.338491654837058e-05	0.8323305290108037	0.0416352866730982	0.9274298156040892	-4.916366672618635e-06	0.923837203906746	7.523119659265823e-05	0.9188307067953628	0.0002851643643273	0.9418568089159406	-1.0947717287288837e-08	0.9358389684814888	5.178718494358316e-07	0.9308780174606184	-0.00031950538906	0.7801491201366166	0.0011535389371258	0.7752293262032225	INPP4B	32762	USP38	304724	GAB1	456683	False	False	False	ref	90	0.00261	100	0.0245
3144	chr4	142881443	T	C	rs17016873	0.0377541032	0.0596786266908767	0.0377541032	0.0636592151457801	0.0112213158157596	0.2080972247480889	0.0004391267663754	0.0565793681124956	0.0004391267663754	0.0600443346435259	0.0578346248405065	0.9010551908811356	0.0025777512285617	0.4164676485861321	0.0025777512285617	0.4294138374138185	0.000668884872888	0.8675162928983475	3.075028867287598e-05	0.3661586061664454	3.075028867287598e-05	0.3780848169718336	0.0231018993972966	0.0590921971012725	0.0231018993972966	0.0607317770640623	INPP4B	34011	USP38	303475	GAB1	455434	False	False	False	alt	-100	0.01721	-85	0.02733
3145	chr4	142885070	C	A	rs7681616	0.0068694195599999	0.4156862235665599	0.00796199264	0.4246855421735563	0.0198631089663016	0.0279322821217106	0.0001427374537061	0.2125430215033071	0.0001591361925275	0.2193492936210981	0.0550628118548946	0.8989565263415298	0.000366921100243	0.7325464496724327	0.0004317621310416	0.7410904680774718	0.0010986361470117	0.7721803422024063	7.713685557011017e-06	0.5793410056913387	8.686902963805435e-06	0.5882087779091423	0.0046286787207335	0.3658316844031236	0.005280137760765	0.372429524241709	INPP4B	37638	USP38	299848	GAB1	451807	False	False	False	alt	55	0.0005264	85	0.002197
3146	chr4	142889951	C	T	rs7679474	0.000375554294	0.8814538182074718	0.001126870602	0.8834852147116401	0.0074316976619176	0.7066421827397669	2.5823547781284954e-06	0.8952072354699672	8.047199887322e-06	0.8973210208836251	0.0023236755568003	0.9958799236771148	1.406333272800915e-06	0.9830439889968272	1.9238576025272264e-06	0.9954793589544616	1.760223351502272e-05	0.9963431360144124	1.02620383608015e-08	0.9832634439892104	1.4125337233826877e-08	0.9959240100302024	5.186775796429298e-05	0.9737286490665624	5.186775796429298e-05	0.9865892643821202	INPP4B	42519	USP38	294967	GAB1	446926	False	False	False	alt	-100	0.00447	50	0.01398
3147	chr4	142891668	T	A	rs10006846	-0.00807440414	0.4348150799715496	0.00807440414	0.4226300717707961	0.0063593602830813	0.8287479791432671	-5.46768222141072e-05	0.5307226831286582	5.46768222141072e-05	0.5182446417566533	0.0591313187896139	0.8946709863879939	-0.0004997138626352	0.7455990804028299	0.0004997138626352	0.7311458951826938	0.0003783072684773	0.9212082668119728	-3.3978111086721947e-06	0.7876063266324124	3.3978111086721947e-06	0.7730043450913981	-0.0055125053164451	0.3529837111570448	0.0055125053164451	0.3438254085568407	INPP4B	44236	USP38	293250	GAB1	445209	False	False	False	ref	-30	0.0003414	50	0.041
3148	chr4	142899155	A	G	rs4690706	0.00075515634	0.8138711351817657	0.00189163066	0.8155282344365923	0.0143336815101808	0.1022000302179595	7.752896986877273e-06	0.6966442865729845	2.712161421868128e-05	0.697952664632579	0.3151153020259545	0.4759614583582997	0.0002343432496096	0.6953098969552047	0.0005871026410395	0.6966780787540983	0.0045030204041945	0.1807876300211782	2.384498571595087e-06	0.6007853837253737	8.377805141208947e-06	0.6018062101703974	0.0005269764209172	0.7322630232635261	0.0014605960642744	0.7342245517467906	INPP4B	51723	USP38	285763	GAB1	437722	False	False	False	alt	65	0.00364	-40	0.03003
3149	chr4	142901689	C	T	rs28390284	0.00628066798	0.4947678648715323	0.00628066798	0.5073358660200025	0.0288778492683271	0.004881106968124	0.0001869872457596	0.1855360986412345	0.0001869872457596	0.1936733372572286	0.2417514704509382	0.5879472160901488	0.0015009970543636	0.4971121234726817	0.0015009970543636	0.5104992977417933	0.0069945030017516	0.0511203302154623	4.4886968260327456e-05	0.2465445394062958	4.4886968260327456e-05	0.2568535953943335	0.0055498501021794	0.340322441789079	0.0055498501021794	0.3498567889812833	INPP4B	54257	USP38	283229	GAB1	435188	False	True	True	alt	20	0.001953	-5	0.0009155
3150	chr4	142904550	T	C	rs4690709	0.0030705039599999	0.7052624389961071	0.0030705039599999	0.7187936780153834	0.0068391181033912	0.8033997469832006	2.108185343811003e-05	0.7556171178848948	2.108185343811003e-05	0.7692343103237274	0.0116100789427275	0.9792599738148304	3.862832817327787e-05	0.9429576899375024	3.862832817327787e-05	0.957020682744687	8.26159842274388e-05	0.9826879251733583	2.755126034082773e-07	0.949198918059895	2.755126034082773e-07	0.96334344438936	0.0006576831709871	0.8546728382465003	0.0006576831709871	0.8685589698181319	INPP4B	57118	USP38	280368	GAB1	432327	False	False	False	alt	100	0.004833	100	0.03696
3151	chr4	142906694	G	C	rs1605954	-0.00291124304	0.6995526802999208	0.0033749970399999	0.6891596073149147	0.006817615237403	0.8234065647853016	-1.9310424458372943e-05	0.75098585322153	2.26299162988814e-05	0.7408548329752882	0.0533615493936658	0.9073384164633832	-0.0001262938688073	0.877570332494472	0.0001612730203202	0.8672041994185761	0.0003665713373845	0.926320014946274	-8.364993199641244e-07	0.8963752534878592	1.086875622335902e-06	0.8860154682614809	-0.0016888141993174	0.6607103767653474	0.0019917219058288	0.6510986791522793	INPP4B	59262	USP38	278224	GAB1	430183	False	False	False	ref	-100	0.005745	20	0.002594
3152	chr4	142908324	T	A	rs28849788	-0.00112746016	0.8463427417957443	0.00167285012	0.8431797177524218	0.0055087787017643	0.9733565363399784	-7.023986900273093e-06	0.895577286724282	9.767564024592972e-06	0.8926893323538793	0.0898971981037147	0.8417243888275138	-0.0001124077588629	0.8893450988351062	0.0001530075032439	0.8867465199601505	0.0005064425241432	0.8969035686109168	-7.114415527260696e-07	0.9181171527132256	9.115753603867422e-07	0.9156546514213438	-0.000997935663233	0.7500864202880211	0.0014128777269473	0.7469514094009484	INPP4B	60892	USP38	276594	GAB1	428553	False	False	False	ref	100	0.01985	20	0.00688
3153	chr4	142918372	C	T	rs1510139	0.0057220566799999	0.526275809831309	0.0057220566799999	0.538902310267371	0.0153629355246658	0.073845344331793	8.870180218523652e-05	0.3670199830705859	8.870180218523652e-05	0.3778926031870974	0.0645027438043962	0.8830711782097271	0.0003674420147069	0.75951675789871	0.0003674420147069	0.7735995383677744	0.001017728734605	0.791566065122765	5.84036405965165e-06	0.66682982601369	5.84036405965165e-06	0.6805148475851684	0.0040436104108963	0.4392716906078112	0.0040436104108963	0.4502006482332618	INPP4B	70940	USP38	266546	GAB1	418505	False	False	False	alt	95	0.0462	-95	0.01452
3154	chr4	142922142	G	T	rs2083619	0.01522097134	0.2540108212028034	0.01522097134	0.2643956832845121	0.011096869521625	0.2262826655727619	0.0001879846318289	0.2093488648091915	0.0001879846318289	0.2178729681151085	0.3090758202885921	0.4840620501575268	0.0048031144504484	0.2579787127415534	0.0048031144504484	0.2694327947412437	0.0034454862241077	0.342118708800843	5.9776947139158056e-05	0.2220135891724066	5.9776947139158056e-05	0.2319892357103869	0.0118860154150976	0.1704321746110944	0.0118860154150976	0.1751766529863732	INPP4B	74710	USP38	262776	GAB1	414735	False	False	False	alt	-80	0.01045	-100	0.05365
3155	chr4	142925492	A	G	rs10017013	0.0394295446	0.0500546908523444	0.0394295446	0.0537006467877886	0.0113857764354539	0.2039981334521018	0.0004605945132065	0.0467773588557704	0.0004605945132065	0.0499088836744766	0.1075882529901762	0.8142516176178177	0.0043950045389369	0.2752170826599999	0.0043950045389369	0.2869042301923207	0.0012793586217089	0.7482253739349314	5.3011355236490646e-05	0.2316347257855501	5.3011355236490646e-05	0.241877901955653	0.0317596655566965	0.0209352111479224	0.0317596655566965	0.0214947886638682	INPP4B	78060	USP38	259426	GAB1	411385	False	False	False	alt	100	0.004433	-50	0.01398
3156	chr4	142926884	C	T	rs1876939	-0.0398213596	0.0588781259098959	0.0398213596	0.0553115636775791	0.0106500202062594	0.2675642215502473	-0.0004878500674289	0.0662818968912165	0.0004878500674289	0.0629476320039452	0.0609715868421871	0.8904299952017005	-0.0026070602594866	0.4320752267250466	0.0026070602594866	0.4190925153885506	0.0006906587900711	0.8594777800504227	-3.500665948010114e-05	0.3838306457556468	3.500665948010114e-05	0.3717576017318095	-0.0229649685162708	0.0536577574305334	0.0229649685162708	0.0523418865822284	INPP4B	79452	USP38	258034	GAB1	409993	False	False	False	ref	100	0.004044	85	0.02365
3157	chr4	142932630	G	T	rs2010483	-0.0001705167739999	0.8881896054784496	0.001014859746	0.8919499376283859	0.0212168992714784	0.0211143737467061	3.739189527979861e-07	0.756047489657971	1.945341142616872e-05	0.7599124514661714	0.1697320511623564	0.7079675078335809	-2.7006519310485075e-05	0.8670257616553257	0.0001573703194072	0.870813451554946	0.0036813044820263	0.2945944434685256	6.462598341009078e-08	0.7746675904280744	3.0228268275857107e-06	0.7787023177088994	-5.2800645800044084e-18	0.8033834504928153	0.0009709644290915	0.8069702472630229	INPP4B	85198	USP38	252288	GAB1	404247	False	False	False	ref	35	0.0001373	-50	0.03287
3158	chr4	142944753	A	G	rs4690738	0.0192872542	0.1823773432578531	0.0192872542	0.1914482696707842	0.0064316773820006	0.8545390709911412	0.0001258797855954	0.2671933608640349	0.0001258797855954	0.2767341370351878	0.0695484392991628	0.8794646412513497	0.0013752081391151	0.5284908894183615	0.0013752081391151	0.54206630190712	0.0004482588021378	0.9090011818722186	8.97436009620454e-06	0.5927545236032005	8.97436009620454e-06	0.6061490435515149	0.0135852031660079	0.1260112538543811	0.0135852031660079	0.1301139614496237	INPP4B	97321	USP38	240165	GAB1	392124	False	False	False	alt	-90	0.002195	35	0.01938
3159	chr4	142945462	G	A	rs13115045	-0.0093294623999999	0.404520532260848	0.0093294623999999	0.3923099118475554	0.0078416951607572	0.6185484966458649	-7.740930920057869e-05	0.448443950098553	7.740930920057869e-05	0.4367251351585711	0.1788773742466208	0.686933223688242	-0.0016407185706885	0.5134516460601399	0.0016407185706885	0.4997489581115025	0.0013614960039436	0.7281076873372146	-1.2903231239617266e-05	0.540369194982695	1.2903231239617266e-05	0.5272000964450926	-0.0086930362348156	0.2457416604281034	0.0086930362348156	0.2386463705213422	INPP4B	98030	USP38	239456	GAB1	391415	False	False	False	ref	-95	0.001873	80	0.014366
3160	chr4	142949730	G	A	rs10009395	0.00424540336	0.6085809652669848	0.00424540336	0.62179733567443	0.0214904623655352	0.0193530472268689	9.48397986532457e-05	0.3447402419848442	9.48397986532457e-05	0.3556704713283704	0.0697808068548428	0.8814400219922011	0.0003321117684268	0.795470167262989	0.0003321117684268	0.8096605312650943	0.0014844725128766	0.7016897642353237	7.44110374553433e-06	0.6571382614415693	7.44110374553433e-06	0.6711066794804623	0.0030270023547961	0.5460738903283577	0.0030270023547961	0.5582726939273969	INPP4B	102298	USP38	235188	GAB1	387147	False	True	False	alt	-30	0.000618	-10	0.01175
3161	chr4	142955127	A	G	rs34596213	0.0474009185999999	0.0294420765163079	0.0474009185999999	0.0317229948704547	0.0093384029909341	0.3845562131161257	0.0004498363230169	0.0466273208564925	0.0004498363230169	0.0496605322605581	0.5655141650847	0.0819156369321068	0.0267033592742718	0.0191288557109974	0.0267033592742718	0.0209284016166753	0.0052626395817	0.1222817108199292	0.0002526046806098	0.032062992184435	0.0002526046806098	0.0346025888259356	0.010076868017303	0.1944310216772625	0.010076868017303	0.200613771198834	INPP4B	107695	USP38	229791	GAB1	381750	False	False	False	alt	-100	0.0409	-100	0.09686
3162	chr4	142960579	A	T	rs4690740	-0.0071288166	0.5227284722381307	0.0071288166	0.5099362527186659	0.0177403575680191	0.0452699458298645	-0.0001208453738669	0.3411763703968286	0.0001208453738669	0.3308330718509927	0.2443510824801086	0.5859535282276689	-0.0017337160129988	0.529605261279707	0.0017337160129988	0.5162514490295681	0.0044549649832061	0.204915483624326	-3.00558696461748e-05	0.3837273666571023	3.00558696461748e-05	0.3719673113042254	-0.0062469527692195	0.3526897008302448	0.0062469527692195	0.3439078267036271	INPP4B	113147	USP38	224339	GAB1	376298	False	False	False	ref	45	0.00916	30	0.009796
3163	chr4	142964484	C	T	rs17678304	-0.0552637822	0.0203441824058755	0.0552637822	0.0190996955053141	0.0128572392797856	0.1327292966828401	-0.0007256400496954	0.0223493565413749	0.0007256400496954	0.0210167617589723	0.404466851315885	0.3247807253481313	-0.0225153297996194	0.0355814615901398	0.0225153297996194	0.0327097383539166	0.0051936644229371	0.1306650636924934	-0.0002950832923093	0.0303893292488727	0.0002950832923093	0.0282942723060619	-0.0299297710557162	0.0241907569799808	0.0299297710557162	0.0235672368815577	INPP4B	117052	USP38	220434	GAB1	372393	False	True	False	ref	-45	0.013054	-65	0.02283
3164	chr4	142965389	G	A	rs10026166	-0.023505974	0.1557907201156682	0.023505974	0.148197584112268	0.0078387287212967	0.5856551108872475	-0.0001920217330817	0.1932362192628811	0.0001920217330817	0.1853913942930092	0.2199545638440233	0.6208120940766828	-0.0054094744668227	0.2484244601040915	0.0054094744668227	0.2372989201466604	0.0017945425708807	0.6317639558228407	-4.592735339267411e-05	0.2729271842622334	4.592735339267411e-05	0.2620513708606313	-0.0211807176422991	0.0638489209994563	0.0211807176422991	0.0621580838547344	INPP4B	117957	USP38	219529	GAB1	371488	False	False	False	ref	-15	5.7e-06	-100	0.02493
3165	chr4	142970712	G	A	rs7666854	0.0025657587364	0.7122414950850022	0.0025657587364	0.725964242329566	0.0091999405355927	0.4011201004097198	2.354874160594624e-05	0.6932505664668458	2.354874160594624e-05	0.7065953935812253	0.1852799302897332	0.6707438406527058	0.0005598614598668	0.6904618955134566	0.0005598614598668	0.7048083232319189	0.0017397570086432	0.6383445757702005	5.1726170999699016e-06	0.6776677656275369	5.1726170999699016e-06	0.6917074497586428	0.0026701521800018	0.5619590375068456	0.0026701521800018	0.573894037533545	INPP4B	123280	USP38	214206	GAB1	366165	False	False	False	alt	-85	0.06885	-80	0.02551
3166	chr4	142971699	C	G	rs11936467	-0.0201966668	0.1952493918069476	0.0201966668	0.1866583838466709	0.0132754031143122	0.1291793727567703	-0.0003107982113628	0.119696790048094	0.0003107982113628	0.1145292417744843	0.2080353530638284	0.6450136508972214	-0.0042701932098585	0.299495261756807	0.0042701932098585	0.2876800366214219	0.0027935733177864	0.4326048496681608	-6.630285799041644e-05	0.2193739345902004	6.630285799041644e-05	0.2096531031573341	-0.0189628523117459	0.0857938124119077	0.0189628523117459	0.0833054161637699	INPP4B	124267	USP38	213219	GAB1	365178	False	False	False	ref	-65	0.01352	-65	0.03253
3167	chr4	142972938	T	C	rs6820975	-0.003942500432	0.6701443099389287	0.004108818088	0.6603951908854243	0.0072420665483674	0.7134206224461067	-3.209731947623483e-05	0.6968832253688597	3.302378330985329e-05	0.6872695825158244	0.1392587060031742	0.7543967088928049	-0.0005299216920938	0.7471616520320837	0.0005530459523494	0.7372605784886136	0.0010063797094466	0.7915037379194662	-4.326738424820319e-06	0.7648909315112843	4.455550910032701e-06	0.7549761010376655	-0.0033527318748119	0.5132429863910375	0.0034979615971119	0.5046148719890975	INPP4B	125506	USP38	211980	GAB1	363939	False	False	False	ref	5	0.0001593	0	0.0
3168	chr4	142972944	A	T	rs6815888	0.01116231748	0.3136593253507523	0.01116231748	0.3247948833702497	0.0124815831054195	0.1467407756528937	0.0001421386896723	0.2398969923257826	0.0001421386896723	0.2490688673636697	0.149642631147626	0.7373095319352493	0.0017589427151672	0.4727373252848868	0.0017589427151672	0.4863582174874266	0.0018641016684144	0.6249153248810504	2.246046361869014e-05	0.3935436186886418	2.246046361869014e-05	0.4058643459476922	0.010193051795143	0.1730094233313204	0.010193051795143	0.1785287059596983	INPP4B	125512	USP38	211974	GAB1	363933	False	False	False	alt	-35	0.0003443	-5	0.0002441
3169	chr4	142973444	C	G	rs13101590	0.00473679782	0.5963047178765666	0.00473679782	0.6094424807135091	0.0084415536430227	0.5092415046595753	4.054985781881678e-05	0.5992760902951841	4.054985781881678e-05	0.61209397174791	0.1476841046068942	0.7438616418658572	0.0007319841129146	0.6648920109253069	0.0007319841129146	0.6789144196140472	0.0012437545313189	0.7493693045140144	6.262838625274713e-06	0.6668392322362392	6.262838625274713e-06	0.6806415382349235	0.0043817881928235	0.423888677458499	0.0043817881928235	0.4346539816908442	INPP4B	126012	USP38	211474	GAB1	363433	False	False	False	alt	-90	0.00545	-90	0.03836
3170	chr4	142973452	A	G	rs13128465	0.022215967	0.1550714082107245	0.022215967	0.1633187328366124	0.0069152734214666	0.7653184579882308	0.0001585157265347	0.2215316736653116	0.0001585157265347	0.2304372315443421	0.1627651739125924	0.7193748982029087	0.0036187030018894	0.299197079067145	0.0036187030018894	0.3109715072519645	0.0011281346545421	0.7713440405512578	2.582738089926376e-05	0.3538989336726089	2.582738089926376e-05	0.3656057012874574	0.021467027666262	0.0619162719363176	0.021467027666262	0.0635821811046243	INPP4B	126020	USP38	211466	GAB1	363425	False	False	False	alt	-100	0.006344	-100	0.02988
3171	chr4	142975241	T	A	rs13147901	0.00485120014	0.5618105155293412	0.00485120014	0.5749599355781952	0.0223662849353713	0.0168314388953571	0.0001093078993779	0.2899619707253212	0.0001093078993779	0.3002474311958054	0.2251807591365055	0.616629902292751	0.0010767493800947	0.5594646340172412	0.0010767493800947	0.5732378395014677	0.0051170004894512	0.1339640606636771	2.4650165206803844e-05	0.3514976432435141	2.4650165206803844e-05	0.3635328038629034	0.0046328281413707	0.3860422328495391	0.0046328281413707	0.3962581550404544	INPP4B	127809	USP38	209677	GAB1	361636	False	True	False	alt	100	0.003624	-35	0.0315
3172	chr4	142976607	A	G	rs4690743	-0.00161808124	0.8011675428529701	0.0021954476399999	0.791906132830445	0.0189730957969921	0.0336746518297868	-3.0816417229892194e-05	0.6047819737229881	4.0878816410594847e-05	0.5959712961986837	0.0677475907426425	0.8834931189734625	-7.641150598216491e-05	0.891808610518936	0.0001447858128417	0.8828233464687884	0.0013421663230638	0.73136095196096	-1.6750591826905218e-06	0.8099199132414134	2.8666934221214434e-06	0.8009349182592143	-0.0011058205997987	0.7310338023690082	0.001549808607973	0.7222355421746933	INPP4B	129175	USP38	208311	GAB1	360270	False	False	False	ref	95	0.00834	-30	0.02158
3173	chr4	142976996	T	C	rs13110491	0.0208312706	0.163524595804618	0.0208312706	0.1721090444935088	0.0078098917002643	0.6172373168870834	0.0001622159697339	0.2055748887740288	0.0001622159697339	0.2140649954999091	0.0512328966068112	0.9095055747193834	0.001070383188276	0.5751676366024849	0.001070383188276	0.5887896647753426	0.0004065461512261	0.917213240277908	8.51289238669978e-06	0.5977928573320644	8.51289238669978e-06	0.6112630055544364	0.0122241931970248	0.147781513272675	0.0122241931970248	0.1526922581408613	INPP4B	129564	USP38	207922	GAB1	359881	False	False	False	alt	100	0.2255	100	0.0553
3174	chr4	142977422	T	C	rs9308158	0.0030141698599999	0.7162535984380533	0.0030141698599999	0.7299705786214696	0.006631393175378	0.8338514318904069	2.0798494608751654e-05	0.7553670910508848	2.0798494608751654e-05	0.7689329075475598	0.0396290417950393	0.9279131118398836	0.0001102742372401	0.8839171392457321	0.0001102742372401	0.8981565083010288	0.0002617312987089	0.9431514158811388	7.578169212593679e-07	0.8974018303996462	7.578169212593679e-07	0.9116386698304276	0.001477193746823	0.7136697466302823	0.001477193746823	0.7270130058656653	INPP4B	129990	USP38	207496	GAB1	359455	False	False	False	alt	-100	0.03992	-100	0.05362
3175	chr4	142990330	C	T	rs1510140	-0.03826155	0.060373069312909	0.03826155	0.0565640276713572	0.0085561223783268	0.4863946295442327	-0.0003328944330399	0.0881400471576873	0.0003328944330399	0.0833649819837445	0.4413220054149939	0.2689524322296909	-0.0167905516106147	0.0619846678320459	0.0167905516106147	0.0572713632540081	0.0037583567269689	0.2919708678234884	-0.0001453185395211	0.0806185728694024	0.0001453185395211	0.0754534591973344	-0.0170997624456685	0.0855483849805776	0.0170997624456685	0.0831993201103997	INPP4B	142898	USP38	194588	GAB1	346547	False	False	False	ref	-100	0.001227	95	0.02438
3176	chr4	155258235	A	G	rs2341895	0.0272110516	0.1135988093793293	0.0272110516	0.1204256313380251	0.0075615321555786	0.6775143781574084	0.000209049554873	0.1597296293821077	0.000209049554873	0.1673300422499811	0.1345366653181049	0.7649456767491561	0.0036549233048962	0.2967311911722658	0.0036549233048962	0.3084687984875	0.0010178142902945	0.793791179447289	2.810722270959036e-05	0.3340349139118673	2.810722270959036e-05	0.3455053536299391	0.0255791035176712	0.0400171777975566	0.0255791035176712	0.0410726180781962	NPY2R	49598	MAP9	118735	GUCY1A1	408492	False	False	False	alt	100	0.007126	90	0.0725
3177	chr4	155281590	G	T	rs12651028	0.00237401522	0.7639037889900656	0.00237401522	0.7775781041168024	0.021392175878891	0.0200227634472711	5.1280952004560176e-05	0.5161993294572628	5.1280952004560176e-05	0.5283240476669655	0.0754281683419952	0.8667619516693311	0.0001922341604134	0.8431058752977736	0.0001922341604134	0.8573807678186791	0.0017599238699447	0.6110923601884539	4.574212009487612e-06	0.7255744373401779	4.574212009487612e-06	0.7395550020354313	0.0017842508739717	0.67593271520759	0.0017842508739717	0.6890731267823229	NPY2R	72953	MAP9	95380	GUCY1A1	385137	False	False	False	alt	-60	0.01727	75	0.01105
3178	chr4	155296326	G	A	rs982012	0.000416413792	0.7744172421392505	0.002222976528	0.7752341006055387	0.0084424474925464	0.4939018346403807	2.767575926718274e-06	0.7724811361866323	1.8829830916037963e-05	0.7733352566114307	0.1379454143715183	0.7567548457493464	0.0001080807138667	0.797673229778934	0.0002956359628613	0.7991000948208825	0.0011810979090572	0.7590422076388141	8.704472988374619e-07	0.7984981513375591	2.5382798137261925e-06	0.7998757209567294	0.0001078849365657	0.6291638940898605	0.0021742964138631	0.6303461903103813	MAP9	80644	NPY2R	87689	GUCY1A1	370401	False	False	False	alt	75	0.005558	-55	0.02753
3179	chr4	155297067	G	T	rs877367	-0.00566992574	0.5655950447597127	0.00566992574	0.5526502119260736	0.0064306373774287	0.812951894429758	-3.528219734039961e-05	0.6615086615363688	3.528219734039961e-05	0.6485057784966203	0.063685307938879	0.8861813919273246	-0.0003776173309132	0.7981915613089834	0.0003776173309132	0.7840787844626299	0.0004157645035664	0.910832684687564	-2.4092266858326366e-06	0.8350004363333985	2.4092266858326366e-06	0.8207077013749512	-0.0039357254743306	0.4724427893568985	0.0039357254743306	0.4614017503190482	MAP9	79903	NPY2R	88430	GUCY1A1	369660	False	False	False	ref	100	0.004288	100	0.0335
3180	chr4	155322740	T	C	rs1037027	0.0205097056	0.1566494520864833	0.0205097056	0.1648636956034804	0.0075077156264146	0.6319363901183074	0.0001569873190444	0.1990347266522397	0.0001569873190444	0.2075923979269884	0.151885393002002	0.7357707451370434	0.0030989829510705	0.3262650545934829	0.0030989829510705	0.3386102010607573	0.0011334825085373	0.7666728098941595	2.359628396388373e-05	0.3591109025751545	2.359628396388373e-05	0.3711758272861833	0.0195499953319017	0.0633803834426223	0.0195499953319017	0.0652729674882941	MAP9	54230	NPY2R	114103	GUCY1A1	343987	False	False	False	alt	-100	0.0137	55	0.0281
3181	chr4	155324249	C	T	rs1955154	-0.0038323888	0.6266990990928738	0.00436542632	0.6164520117993378	0.0069180904389586	0.8034747522011549	-2.548433070512562e-05	0.697510074437448	2.8702253076270315e-05	0.6878934728541359	0.1806014585213539	0.6802930974700812	-0.0008305913617736	0.651246510004157	0.0009250848576992	0.6407561577802571	0.001229590888147	0.7447909707344817	-5.447384740706425e-06	0.6972878854610746	6.017837498520217e-06	0.6872584332997689	-0.0032946399858919	0.4780091361776875	0.0037718233591634	0.470687847793747	MAP9	52721	NPY2R	115612	GUCY1A1	342478	False	False	False	ref	-100	0.05566	-85	0.0442
3182	chr4	155334090	A	G	rs1899932	-0.00501046172	0.5737663168199397	0.00501046172	0.5609528080495811	0.0269751868576191	0.0064265744822513	-0.0001367229845151	0.2486165236612611	0.0001367229845151	0.2395643152052687	0.066766252761958	0.8833928035830314	-0.0003405809569139	0.7939524992454371	0.0003405809569139	0.7797785132408719	0.0018007181485598	0.6393398660258086	-9.271595111412064e-06	0.5968399231030924	9.271595111412064e-06	0.5834152556856577	-0.0036639384225977	0.4893170175491795	0.0036639384225977	0.4781660771104121	MAP9	42880	NPY2R	125453	GUCY1A1	332637	False	True	True	ref	-45	0.003025	-65	0.02484
3183	chr4	155342266	G	A	rs1020356	0.00166667779	0.7983116012998687	0.002151222562	0.8005018058122287	0.0096398871622378	0.3427105058745945	1.853614924757545e-05	0.7723918921820911	2.2826996224575783e-05	0.7746523101071612	0.0554445585535119	0.902258213561498	0.0001441178902829	0.8967086387704528	0.0001627972654057	0.89813885990666	0.0005496286293491	0.889583809558378	1.5886466488412517e-06	0.8849708522756599	1.7542844304523998e-06	0.8865037906540008	0.0012572744530544	0.7443742435705137	0.0015518833182916	0.7468983740936136	MAP9	34704	NPY2R	133629	GUCY1A1	324461	False	False	False	alt	-100	0.00156	-80	0.002716
3184	chr4	155349668	C	T	rs116327309	0.00727250782	0.4654174987715628	0.00918190738	0.4681043175725504	0.0213078253004917	0.0201897354660833	0.0001595117230748	0.2546580626953165	0.0001991898269249	0.2567649080582619	0.2547599041483832	0.5648842596588723	0.00257547027498	0.4500772489325582	0.0029783854945882	0.4528871333900173	0.0055023788684168	0.1168794793814854	5.654759167106882e-05	0.2844077625084185	6.492347699753118e-05	0.2874992603352017	0.0051411321694208	0.3579597833832867	0.0070457162418697	0.3574294486183091	MAP9	27302	NPY2R	141031	GUCY1A1	317059	False	False	False	alt	95	0.00986	100	0.07434
3185	chr4	155350000	T	C	rs17311826	-0.00490347524	0.6070820539166256	0.00490347524	0.5935305260751067	0.0144421021456191	0.0897790358525351	-7.10216965390067e-05	0.4485531656594215	7.10216965390067e-05	0.4370189219256636	0.2078299567422898	0.6412992573361415	-0.0009650969836131	0.6300495774558007	0.0009650969836131	0.6159837303707192	0.0029722440765671	0.4238509798091289	-1.382887040267529e-05	0.5226746005726934	1.382887040267529e-05	0.5096005099183216	-0.0041888401331963	0.4395524093832713	0.0041888401331963	0.429071755162931	MAP9	26970	NPY2R	141363	GUCY1A1	316727	False	False	False	ref	-50	0.0097	-100	0.03525
3186	chr4	155380586	T	G	rs7657567	0.01117398712	0.3200341882123506	0.01117398712	0.3313895209454227	0.0084185028147755	0.5002888125077144	9.43331982644408e-05	0.3435224235441801	9.43331982644408e-05	0.3542662884168527	0.0774696832954698	0.8663877133767727	0.0006906944267794	0.6634923192607163	0.0006906944267794	0.6774682900322913	0.0006513800501644	0.8707263056092528	5.817683889624621e-06	0.6703489344782919	5.817683889624621e-06	0.6842458632349728	0.0068921876782953	0.2677754309056996	0.0068921876782953	0.2757486830259259	MAP9	3616	NPY2R	171949	GUCY1A1	286141	False	False	False	alt	25	0.01605	40	0.015015
3187	chr4	169282697	A	C	rs13112591	-0.0178373464	0.2146361156989815	0.0178373464	0.2053525035686123	0.0259775108201871	0.0078387889245437	-0.00045751976438	0.049113234716838	0.00045751976438	0.0461671010920062	0.1000881751885392	0.8221904161440432	-0.001816104935747	0.4868699029033894	0.001816104935747	0.4736261960757158	0.0025427013040829	0.4971543884167606	-4.5463191745569904e-05	0.254414544824016	4.5463191745569904e-05	0.2443136446941335	-0.0150022303135924	0.1101507700976359	0.0150022303135924	0.1069484275535435	SH3RF1	11741	CBR4	272422	NEK1	329935	False	True	True	ref	-90	0.01557	-95	0.01431
3188	chr4	169315812	C	T	rs4692712	-0.0020716512444	0.7523256611334377	0.0028548788444	0.7471100706651556	0.0063544286793262	0.9025516973627988	-1.264712135021132e-05	0.8142908746997761	1.7252042681843662e-05	0.8096726671209806	0.415294764468511	0.3125764547143848	-0.0008521698237717	0.6029055717036282	0.0011766763970761	0.596024221320292	0.0026457881884384	0.49161194736191	-5.213814573171372e-06	0.6666249850387713	7.121723970420261e-06	0.6597886756385942	-0.0009294702227201	0.7652279322152272	0.001273872135603	0.7594012406763945	SH3RF1	44856	NEK1	296820	CLCN3	296822	False	False	False	ref	100	0.00567	85	0.06555
3189	chr4	169364223	G	A	rs6839248	-0.00774487684	0.4439532599914368	0.00774487684	0.4318591572854015	0.0065530806248261	0.8643777768695937	-5.100295386455039e-05	0.53977661991721	5.100295386455039e-05	0.527551980042227	0.1122729488895113	0.8002735923978531	-0.0008265706382318	0.6435507576521743	0.0008265706382318	0.6298385098042757	0.0007398795179495	0.8465789686280225	-5.4676655554723656e-06	0.6950041589005127	5.4676655554723656e-06	0.6812291490161468	-0.0067926015830039	0.2903188846669009	0.0067926015830039	0.2819586735552323	SH3RF1	93267	NEK1	248409	CLCN3	248411	False	False	False	ref	100	0.002373	-55	0.02084
3190	chr4	169374686	G	A	rs12641082	0.00330373292	0.6833968252898143	0.00330373292	0.6968375047956362	0.0192745942963982	0.0308082900794101	6.431624617449848e-05	0.465274047512446	6.431624617449848e-05	0.477015286343363	0.1064326393427317	0.8011020478211598	0.0002825735911881	0.787017801357271	0.0002825735911881	0.8012642493674346	0.0020355201943687	0.5538913271500091	5.306792983435141e-06	0.6691018289697555	5.306792983435141e-06	0.683076228930431	0.0023630950528531	0.5989501999774689	0.0023630950528531	0.6112914323505102	SH3RF1	103730	NEK1	237946	CLCN3	237948	False	False	False	alt	-35	0.001984	100	0.03976
3191	chr4	169388304	T	C	rs12500131	-0.00804780492	0.440040205832952	0.00804780492	0.427594690224425	0.008643778414527	0.4698365726709471	-7.07378287360223e-05	0.4480768535730112	7.07378287360223e-05	0.4364881299174108	0.1553667569165654	0.7310799170017933	-0.0010816699715003	0.6050387171827976	0.0010816699715003	0.5913279894229184	0.0013070380137456	0.7371936927776265	-9.278928788730387e-06	0.6097853745762521	9.278928788730387e-06	0.5962967903557317	-0.0070975839998339	0.2958157682638632	0.0070975839998339	0.2877968832283827	SH3RF1	117348	NEK1	224328	CLCN3	224330	False	False	False	ref	55	0.002407	50	0.02975
3192	chr4	169486897	T	G	rs6553440	0.00058009148	0.6572345118634428	0.0035722935599999	0.6615425866857793	0.023420447268426	0.0129413769706432	1.055804005295744e-05	0.3687408182941322	8.275728678468796e-05	0.3719030264970735	0.1147709001130716	0.8015480772548412	3.0975898983959995e-05	0.7519918490872456	0.0004003528159956	0.7562616799609773	0.0026778668134968	0.4768582060824274	1.3907968812941417e-07	0.5758222044812359	9.201142883215216e-06	0.5795432832932158	0.00050830402805	0.4870586891218852	0.0034751397836076	0.4900371218750936	NEK1	125735	CLCN3	125737	SH3RF1	215941	False	True	False	alt	75	0.01242	-5	0.008
3193	chr4	169570462	A	G	rs75394761	0.00697679612	0.4346131556921785	0.0074007170799999	0.4451288078272191	0.0125373343750381	0.1444285033005704	8.484366957863821e-05	0.3613501692510227	8.968239764707877e-05	0.3707018547697593	0.6425626821855	0.0238741798705808	0.004492253414201	0.2604432789453106	0.0047550739346358	0.2705390374094218	0.0080793097576371	0.0287713012360948	5.469780190490321e-05	0.206366485365468	5.7697693843723646e-05	0.215199711538734	0.00062448780589	0.8506968377854749	0.0006659820122615	0.8601976096666165	NEK1	42170	CLCN3	42172	HPF1	187482	True	False	False	alt	-5	0.001099	-5	0.01746
3194	chr4	169590400	T	G	rs4235024	0.01107481038	0.3414542691074422	0.01273855878	0.3501303492185665	0.0124263951793591	0.1932027499212068	0.0002324568102918	0.230625617114656	0.0002447411593657	0.2354312499779227	0.2171101359972613	0.6294947181406788	0.0026681628651503	0.4070596134583095	0.002991199183743	0.4169473405116001	0.0028067114171034	0.3793304335107753	5.696731495442352e-05	0.2968351625171738	5.935246585449346e-05	0.3045886638317408	0.0108030166288031	0.2024208469809693	0.0122055208041576	0.2056853124955034	NEK1	22232	CLCN3	22234	HPF1	167544	False	False	False	alt	-90	0.00551	-30	0.015564
3195	chr4	169639180	C	T	rs4692574	8.953839800000005e-05	0.8640703013503432	0.0014012729219999	0.8626705784941741	0.0079535193043427	0.593002399838315	6.641250626820857e-08	0.8673233984690993	1.1248011584527576e-05	0.865867583843644	0.256127138248322	0.5683359892243726	4.593784990848158e-05	0.7786775282361585	0.000374414531485	0.7747606223423033	0.0020344679199461	0.5971264951880173	1.8200599046364824e-07	0.7872695683292487	2.9981012030793098e-06	0.783300437227245	0.0001390055913443	0.7811280815955008	0.001143165385533	0.7790546008821918	CLCN3	26546	NEK1	26548	HPF1	118764	False	False	False	alt	-35	0.001251	-35	0.0524
3196	chr4	169678993	C	A	rs115477840	0.039240586	0.047176517077322	0.039240586	0.0504202891622404	0.0239825818353201	0.0144295693797129	0.0010814285772241	0.0163254014885698	0.0010814285772241	0.01715092662001	0.6013049927903816	0.0478276500122012	0.0235931956183398	0.0257780178466203	0.0235931956183398	0.0280421405033016	0.0144700498450631	0.0046135632053903	0.0006529706773569	0.0106178018189629	0.0006529706773569	0.0112998982661016	0.0057096027967094	0.3452811561617877	0.0057096027967094	0.3546615349942413	CLCN3	66359	NEK1	66361	HPF1	78951	False	True	False	alt	-10	0.002014	25	0.0224
3197	chr4	169694182	A	G	rs6823311	0.0007436534	0.8042315784857922	0.00211533064	0.8061008059303726	0.0212888291307442	0.0199072977827553	1.7439009638592628e-05	0.5844636436973314	4.40387639597528e-05	0.5862414214530356	0.146798203300864	0.7443778842291439	0.0001076511969936	0.8038766013076868	0.0003015480092173	0.8052549345299788	0.003154890434896	0.3865543245477807	2.49138545169287e-06	0.6679588992549575	6.321387749501715e-06	0.6695692716624099	0.0005746947582443	0.667076147145499	0.0019481529891388	0.668807458699158	HPF1	63762	CLCN3	81548	NEK1	81550	False	True	False	alt	55	0.005585	25	0.002998
3198	chr4	169736898	C	T	rs6850446	-0.0471073904	0.0352895327800804	0.0471073904	0.0329356956433756	0.010220610412249	0.2916581290252925	-0.0004991928601153	0.0465944891680091	0.0004991928601153	0.0438893319276261	0.3832612371497629	0.3658208243758332	-0.0183693050340858	0.0546874535128617	0.0183693050340858	0.0504328079142719	0.0039609972152676	0.2647121602735541	-0.0001964307888574	0.0587835492427983	0.0001964307888574	0.0547460086544309	-0.0279795433562588	0.0337202211580917	0.0279795433562588	0.0328727818549617	HPF1	21046	CLCN3	124264	NEK1	124266	False	False	False	ref	100	0.002483	-90	0.0703
3199	chr4	175797785	G	A	rs1027407	0.0022124437399999	0.7733311225054467	0.0022124437399999	0.7871417780151698	0.0200123951771923	0.0271145227405145	4.440624260480853e-05	0.5541962329427372	4.440624260480853e-05	0.566617024623037	0.1060467432234773	0.8149911537294471	0.0002446051941466	0.8173125225546022	0.0002446051941466	0.8315833209016741	0.0021256420366148	0.5606129285053958	4.929037299671003e-06	0.7025010254087749	4.929037299671003e-06	0.7163573211812225	0.0019170323343602	0.6573916370265652	0.0019170323343602	0.6705101260148889	GPM6A	204879	WDR17	268057	SPATA4	397800	False	False	False	alt	40	0.00206	70	0.013
3200	chr4	175802229	G	T	rs28376387	-0.0033299171699999	0.6519781486428576	0.00389605603	0.6491685777990427	0.0188824127326121	0.033510197276918	-6.364891792824155e-05	0.4802104102991734	7.438348411071843e-05	0.4763343989966676	0.0643554393717776	0.888712414064362	-0.000220704692185	0.8515181029102517	0.0002605828066855	0.8516978117104654	0.0012357636552424	0.7527168822567748	-4.096433703455245e-06	0.7610820566012758	4.890543292739118e-06	0.7602316027694793	-0.0023630950528532	0.6009688987765434	0.002736542910196	0.5993390504601642	GPM6A	200435	WDR17	263613	SPATA4	393356	False	False	False	ref	-15	0.0003567	-100	0.03207
3201	chr4	175823911	C	T	rs17062106	-0.0151015999999999	0.261467410437112	0.0151015999999999	0.2514437725894046	0.0101571817720426	0.2894249807077669	-0.0001590474591005	0.2338378704217564	0.0001590474591005	0.2251359960824321	0.3176236268011078	0.4708383024332077	-0.0048557920793666	0.2656188753347358	0.0048557920793666	0.2543005291849157	0.0032686695855766	0.3667482661161136	-5.176180112382204e-05	0.2411439021722328	5.176180112382204e-05	0.2308356077856513	-0.0112324816647475	0.1764991949153798	0.0112324816647475	0.1711348822697864	GPM6A	178753	WDR17	241931	SPATA4	371674	False	False	False	ref	20	0.002594	-85	0.0349
3202	chr4	175934070	C	T	rs62334820	-0.0135440137999999	0.2788410533936289	0.0135440137999999	0.2683486535993319	0.0094747567306953	0.3497220047205275	-0.0001294972588689	0.2747796586190085	0.0001294972588689	0.2654951075196377	0.2812643284681376	0.5213204664699788	-0.0037604579581351	0.3130557686501605	0.0037604579581351	0.3014386471367977	0.0026011914204344	0.4968956355529517	-3.5066255678487225e-05	0.3038280062536165	3.5066255678487225e-05	0.2929656294657911	-0.0109710681646074	0.1688679854227315	0.0109710681646074	0.1637230591576797	GPM6A	68594	WDR17	131772	SPATA4	261515	False	False	False	ref	65	0.01022	60	0.01978
3203	chr4	182609678	A	G	rs12501338	-0.002227180914	0.8076647749822853	0.002252496206	0.7997607601363785	0.0048655545162598	0.9947007309064282	-1.0822666303814576e-05	0.8863814555128883	1.0954726871785242e-05	0.8788767865880297	0.0882602516623616	0.8459455815655056	-0.0002051738773698	0.8713303527360363	0.0002069845697667	0.8634987176998067	0.0004289520611343	0.9116003896065492	-1.0015010938192466e-06	0.9147335593092072	1.0109468102287295e-06	0.907090959587194	-0.0016784406477245	0.7146906114640951	0.0016991877509102	0.7067042894335585	DCTD	308258	TENM3	465690	WWC2	489580	False	False	False	ref	100	0.003944	100	0.00586
3204	chr4	182609964	G	T	rs55875929	0.0158705876	0.2202244479266096	0.0158705876	0.2299062728179343	0.0219023897950776	0.017337219871333	0.0003478964785284	0.0724600764358875	0.0003478964785284	0.0769740681459016	0.0265542173674	0.9531840462750834	0.0004343939949216	0.7441931653699532	0.0004343939949216	0.7582557581051824	0.0005763479544764	0.8845431703817138	9.424214877311268e-06	0.581207971787143	9.424214877311268e-06	0.5946925531811146	0.0060809759437338	0.3110471866407644	0.0060809759437338	0.3200319931630885	DCTD	307972	TENM3	465976	WWC2	489294	False	True	False	alt	60	0.01935	55	0.01517
3205	chr4	182610323	C	T	rs55903810	0.001663733524	0.7778772710010241	0.002469620924	0.7813766293210157	0.0064345856373236	0.8378132271786252	1.0448599227526317e-05	0.8306451421248717	1.608423333373228e-05	0.8337112540767482	0.0070540150831439	0.9866244623855028	1.6276315663716765e-05	0.9715093138532264	2.049626739459976e-05	0.9775423468682212	4.4221638135232246e-05	0.9899735296380586	1.0082911723218664e-07	0.9754750120102152	1.3035005839227702e-07	0.9824195132840604	0.0003029077065114	0.9195177116035488	0.0003858961192543	0.9223085156591628	DCTD	307613	TENM3	466335	WWC2	488935	False	False	False	alt	-70	0.01672	-80	0.03156
3206	chr4	182617560	T	C	rs17324506	0.0448005886	0.0370572140758861	0.0448005886	0.0395721928368068	0.0099800718080016	0.3149741998484453	0.0004777426275204	0.0492917167860396	0.0004777426275204	0.0522404925374822	0.1820890258197699	0.6874992686418885	0.008867414396489	0.1488020401820791	0.008867414396489	0.1582898175438521	0.0018938333638101	0.625464625152977	9.732148920507264e-05	0.139350911199063	9.732148920507264e-05	0.1474801107102038	0.0431228539715142	0.0085059077248205	0.0431228539715142	0.0087192563372154	DCTD	300376	TENM3	473572	WWC2	481698	False	False	False	alt	15	0.001545	45	0.01755
3207	chr4	182664152	T	C	rs28753071	0.0449836478	0.0355111836227328	0.0449836478	0.0381133421433141	0.0088602383220333	0.4513706253341636	0.0004103731188906	0.0579007888236748	0.0004103731188906	0.0615392016165665	0.3601966825382006	0.3924589259828159	0.0168514691975546	0.0556818673979429	0.0168514691975546	0.0605067152161062	0.0032364638066485	0.3774190002544237	0.000155755625789	0.0713208113003296	0.000155755625789	0.0764964537976747	0.0281704167055674	0.0297555265500437	0.0281704167055674	0.0305401839068381	DCTD	253784	WWC2	435106	TENM3	520164	False	False	False	alt	85	0.002472	-90	0.03534
3208	chr4	182691382	G	T	rs7694547	-0.0094285643199999	0.4109449389654235	0.0094285643199999	0.3989663055547611	0.0103904157128532	0.272491398525316	-0.0001044346288409	0.3733771041795575	0.0001044346288409	0.3624424119485212	0.1942426788659633	0.6646996342575543	-0.0020793896408326	0.484596071498781	0.0020793896408326	0.4714308666206835	0.0020845585625664	0.5813442318143615	-2.3494607736727207e-05	0.4448148784064591	2.3494607736727207e-05	0.4324157450859751	-0.0086805879729042	0.249448598593649	0.0086805879729042	0.2421890402807752	DCTD	226554	WWC2	407876	TENM3	547394	False	False	False	ref	0	0.0	-70	0.02368
3209	chr4	182692684	A	G	rs12501438	0.00848809372	0.4023838768079276	0.00848809372	0.4144789666252328	0.0074464000854771	0.6995088148752455	6.331393609751916e-05	0.4592201647252357	6.331393609751916e-05	0.4712130876469998	0.1901472006971026	0.6754133935921958	0.0016227333225941	0.4899322882294014	0.0016227333225941	0.5033998392823813	0.0014115339766498	0.7210120723412309	1.2058043714581892e-05	0.5267125519903482	1.2058043714581892e-05	0.5398169087465777	0.007823732611334	0.2443619317498476	0.007823732611334	0.2517965084394226	DCTD	225252	WWC2	406574	TENM3	548696	False	False	False	alt	45	0.003975	100	0.0323
3210	chr4	182716504	A	G	rs35751669	-0.0014118626399999	0.7431586639778242	0.0027342538	0.7389821643010107	0.0060607089238223	0.935521097663506	-8.212200925576204e-06	0.8104260320100735	1.6442007461283537e-05	0.8064456835475736	0.3660556644778472	0.3940946790036539	-0.0004919759328545	0.6027712711750252	0.0010012085001604	0.5980931856061442	0.002216719374444	0.5685140365066694	-2.845641367532313e-06	0.6719231607646412	6.014888763672664e-06	0.6676595119954827	-0.0010788493656572	0.6899983406495578	0.0017759520326973	0.6856808693218376	DCTD	201432	WWC2	382754	TENM3	572516	False	False	False	ref	-95	0.01234	55	0.012634
3211	chr5	3417816	T	C	rs10462767	0.0561910564	0.016302752979146	0.0561910564	0.0174246427478625	0.0148928409667895	0.0795018803192393	0.0008432653021183	0.0147376449109236	0.0008432653021183	0.0155435632221163	0.5662382389858817	0.0810252625429651	0.0317141707859955	0.0114624999245627	0.0317141707859955	0.0125492241479273	0.0084209542042599	0.025871334921207	0.0004754313643238	0.0113476240245869	0.0004754313643238	0.0121459599201093	0.0112739758711189	0.1625503746030097	0.0112739758711189	0.1677863259929354	IRX1	178017	IRX2	666139	IRX4	1530580	False	True	False	alt	-70	0.00873	-5	0.01721
3212	chr5	3417881	A	G	rs13170639	0.0413379346	0.0427990104075894	0.0413379346	0.0451687665147442	0.0246637401701137	0.01326846747608	0.0012085698621937	0.0166776572060094	0.0012085698621937	0.0173023488823553	0.5526966047365637	0.096843785403185	0.0227072921099311	0.030795802616182	0.0227072921099311	0.0330646553818745	0.0135226993433079	0.0057464278710989	0.0006592721899319	0.0126892272184788	0.0006592721899319	0.0134111934375986	0.0101038392514445	0.2212212758404432	0.0101038392514445	0.2275112652515535	IRX1	177952	IRX2	666204	IRX4	1530645	False	True	False	alt	-100	0.04446	-70	0.1554
3213	chr5	3439187	C	T	rs35533030	-0.0318036306	0.0907429785702454	0.0318036306	0.0855455393898714	0.0128791922099254	0.1305731519490187	-0.0004116896530845	0.0614130058745994	0.0004116896530845	0.0580170108020428	0.589157563875144	0.0579129570539259	-0.0187591985201783	0.0506225649202352	0.0187591985201783	0.0467130059967273	0.0075840409001537	0.0351374319839138	-0.0002426926904793	0.039373141997584	0.0002426926904793	0.0366298366955104	-0.0049834541852093	0.3836667870684067	0.0049834541852093	0.3737190372572493	IRX1	156646	IRX2	687510	IRX4	1551951	False	False	False	ref	-85	0.006958	-35	0.0603
3214	chr5	7236553	T	G	rs6885115	-0.0094756912	0.394446686581653	0.0094756912	0.3824909788540889	0.0106230341515259	0.2439263633285706	-0.0001027220043085	0.346963487227822	0.0001027220043085	0.3364761813785974	0.0927374765298394	0.8367640919960844	-0.0008951481274709	0.640323716702381	0.0008951481274709	0.6264928417833181	0.0009953108995182	0.7983648789441145	-9.761603348332562e-06	0.5951710914277974	9.761603348332562e-06	0.5816941283066717	-0.0078050602184669	0.2670907617898533	0.0078050602184669	0.2592137716408391	ADCY2	159586	TENT4A	523120	NSUN2	603262	False	False	False	ref	100	0.0536	-35	0.01906
3215	chr5	7391349	G	A	rs12514566	-0.050444154	0.0272545497950084	0.050444154	0.0255235942032434	0.0112361121805525	0.2070328081840074	-0.0005714487628618	0.032912792078091	0.0005714487628618	0.0310304715292043	0.4103465803587173	0.3174809049875081	-0.0208547586847999	0.0413590330997629	0.0208547586847999	0.0380621497881566	0.0046251975428953	0.181076926309021	-0.0002371578743438	0.0407254318491109	0.0002371578743438	0.0379318285622937	-0.0270148030581229	0.0340076841820661	0.0270148030581229	0.0331399147338169	ADCY2	4790	CFAP90	459802	MTRR	459838	False	False	False	ref	-85	0.01335	20	0.004395
3216	chr5	23023862	C	T	rs2680786	-0.0402365142	0.0553569106860279	0.0402365142	0.0518814509340005	0.0101161886342643	0.293254549688737	-0.000415940924702	0.0635796424079733	0.000415940924702	0.0599250703224533	0.0471789126443219	0.9156848484909612	-0.0018896061368434	0.4752587824768161	0.0018896061368434	0.4620911023181649	0.0004832298077133	0.9015525734874904	-1.9795501455165192e-05	0.443929124456587	1.9795501455165192e-05	0.4316631978995929	-0.0204441954792061	0.0708158089845773	0.0204441954792061	0.0689278373643651	CDH12	170518	PRDM9	419725	ENSG00000233974	1539851	False	False	False	ref	-100	0.00452	5	0.001144
3217	chr5	23026318	G	A	rs2680790	-0.00779700328	0.3416245585688257	0.01152815208	0.3333399740632629	0.0099842699169201	0.3164028811209363	-7.26558072166638e-05	0.3226224024769718	0.0001194607308362	0.3156694364254879	0.1081131547007749	0.8055396214682325	-0.0012420825602001	0.5534674917621198	0.0015798246889442	0.5426012001226849	0.0010839783433811	0.7778957994071795	-1.1999564916649412e-05	0.5253091133926633	1.6236328404908267e-05	0.5153452272420033	-0.0067220614321725	0.1910861275475035	0.0099918048942416	0.1882628016162135	CDH12	172974	PRDM9	417269	ENSG00000233974	1542307	False	False	False	ref	-80	0.00124	70	0.02536
3218	chr5	23036792	T	G	rs2635639	-0.00621728624	0.4888895246401972	0.00707793324	0.4787321425483379	0.0185330155702742	0.0363036218174151	-0.0001245596048446	0.2891853968878441	0.0001374695317074	0.2811650240160729	0.3295635846844884	0.4498561177308286	-0.0021496106792816	0.4297495914608581	0.0024195745228949	0.4195928349099064	0.006149699236353	0.0749600596960661	-4.333237800964873e-05	0.2721681502576465	4.738190516737206e-05	0.2633025972571557	-0.0042656044149835	0.4134099451973329	0.004858971566095	0.4056050341842642	CDH12	183448	PRDM9	406795	ENSG00000233974	1552781	False	False	False	ref	60	0.001572	40	0.03247
3219	chr5	23036849	G	A	rs2680799	-0.0657203464	0.0109640927562959	0.0657203464	0.0103678061519187	0.0137771138981472	0.1086542960105856	-0.0009001777831272	0.0144190187566659	0.0009001777831272	0.0136891274426716	0.3332150748451747	0.4435916348097607	-0.0221767194546	0.0361374706539046	0.0221767194546	0.0333074186936008	0.0045921602769131	0.1796413787578345	-0.0003041747361733	0.0277358472895033	0.0003041747361733	0.0258046499271455	-0.0490834967167708	0.0044465847996478	0.0490834967167708	0.0043216481780761	CDH12	183505	PRDM9	406738	ENSG00000233974	1552838	False	True	False	ref	0	0.0	-20	0.01196
3220	chr5	23036893	C	G	rs2680800	0.0537081866	0.0219333843775831	0.0537081866	0.02342074663852	0.0132230459516765	0.1230492843712929	0.0007604516977044	0.0227706990969521	0.0007604516977044	0.0241314505170146	0.3657527567713358	0.3898856481789219	0.0203343476913132	0.0391607657066199	0.0203343476913132	0.0425942036767905	0.0048831428797272	0.1599828479575497	0.0002895520898319	0.0324026546723752	0.0002895520898319	0.0349149055318066	0.0344733866533884	0.018038586276792	0.0344733866533884	0.0185669362339341	CDH12	183549	PRDM9	406694	ENSG00000233974	1552882	False	False	False	alt	-45	0.009094	-65	0.01978
3221	chr5	23038736	A	G	rs2635642	0.075351822	0.0059241869381866	0.075351822	0.0062255024853089	0.0151802819374982	0.0750962336916704	0.0011665785196476	0.0090111598523984	0.0011665785196476	0.0094251474245688	0.3775806802975134	0.3750565073237145	0.0288990232053074	0.0159735880640538	0.0288990232053074	0.01742397718697	0.0057621187054618	0.0943545981147843	0.0004490425238613	0.013695275946635	0.0004490425238613	0.0147002952097073	0.0479320324899635	0.004469312898706	0.0479320324899635	0.0046101797196747	CDH12	185392	PRDM9	404851	ENSG00000233974	1554725	False	True	True	alt	100	0.01137	45	0.0321
3222	chr5	23041513	C	T	rs2680803	-0.0029530402	0.7557422646757196	0.0029530402	0.7419669073150146	0.0057948269229709	0.956102712448614	-1.7046330827611205e-05	0.8292956042652034	1.7046330827611205e-05	0.8155365908792331	0.0359941493169015	0.937519545293742	-7.218914439988256e-05	0.9430721483932326	7.218914439988256e-05	0.9289299256489962	0.0002086782549889	0.9588258291237756	-4.287552156645702e-07	0.9602572596792068	4.287552156645702e-07	0.946138605675392	-0.0010892229172501	0.8066205451478746	0.0010892229172501	0.7931545880759768	CDH12	188169	PRDM9	402074	ENSG00000233974	1557502	False	False	False	ref	-90	0.006428	55	0.0247
3223	chr5	37804632	G	T	rs75819762	0.0238519601199999	0.1558501889158366	0.0238519601199999	0.1638098744760257	0.0164301879104846	0.0635542424393813	0.0004963325060123	0.0762900988395486	0.0004963325060123	0.0796528725143593	0.3935144555441446	0.3416188012620914	0.0099176491803425	0.1453613169558048	0.0099176491803425	0.154618639366089	0.0065809483997866	0.0671465513451164	0.0002054856693236	0.0769600795842167	0.0002054856693236	0.0813450254809425	0.0122387161692548	0.1725515774399866	0.0122387161692548	0.1770363623225063	GDNF	35409	WDR70	425346	NUP155	433508	False	False	False	alt	100	0.04382	100	0.1624
3224	chr5	37830475	A	C	rs1862574	0.0107750353999999	0.3362859200299469	0.0107750353999999	0.3479392218303997	0.0102681878284531	0.2816647967549563	0.0001240674901808	0.28949849818402	0.0001240674901808	0.2996811918122724	0.4190354671728959	0.3059520603371929	0.0046499675992221	0.2677899714715814	0.0046499675992221	0.2796956423735235	0.0043563996529695	0.203783166605813	5.4191323194234616e-05	0.2345236939972903	5.4191323194234616e-05	0.2451477376572015	0.0049004657724664	0.375747333828099	0.0049004657724664	0.3855111211836353	GDNF	9566	EGFLAM	427935	WDR70	451189	False	False	False	alt	10	0.00482	45	0.062
3225	chr5	37833679	C	G	rs2973038	-0.01243250902	0.2446967944743642	0.01737285218	0.2418037353049268	0.0113901968278525	0.201010750486967	-0.000125392052129	0.2317002784804242	0.0001839006258562	0.2290064553264455	0.4815195178373219	0.203416113033754	-0.0061989900674989	0.1832648889539604	0.008540918231226	0.1804399198330811	0.0054681034243082	0.1051825054542342	-6.255533079716824e-05	0.1705397979440307	9.01663209799772e-05	0.1677851082292514	-0.0044170582682393	0.3711410917984151	0.0064004813327938	0.3692108081934763	GDNF	6362	EGFLAM	424731	WDR70	454393	False	False	False	ref	-100	0.00478	-45	0.02493
3226	chr5	44914183	A	G	rs7702731	0.01270511372	0.3062360578811962	0.01270511372	0.3178012226425145	0.0076739114255952	0.6224782619517255	0.0001050762836425	0.3447178650849119	0.0001050762836425	0.3558082186699677	0.2648658181101463	0.5523482372124832	0.0035172753697315	0.3351263291752001	0.0035172753697315	0.3476933084342795	0.0020897816939638	0.5809804938176365	2.955674281196661e-05	0.361040842986797	2.955674281196661e-05	0.3733070950106451	0.0102905631801159	0.1950184344515069	0.0102905631801159	0.2006712574172837	MRPS30	105235	FGF10	524477	HCN1	782315	False	False	False	alt	100	0.00288	-85	0.0329
3227	chr5	45011640	A	G	rs11738503	-0.001615726524	0.8176026589181904	0.0018152606839999	0.8119349724259084	0.0239586127533272	0.0120210436484462	-4.2095703364425625e-05	0.577121360597942	4.697697895619694e-05	0.5688450855588966	0.0859531737881098	0.8440554329492926	-0.0001625959724027	0.8698511207648646	0.0001754478444298	0.8630876751584332	0.0021172191198274	0.566639311921537	-4.265931934438243e-06	0.7414338732960313	4.58033187789521e-06	0.732341605364055	-0.0015560327389288	0.7131490336946833	0.001680515358043	0.7042732895400075	MRPS30	202692	FGF10	621934	HCN1	684858	False	True	False	ref	-50	0.002472	-45	0.00934
3228	chr5	58377428	T	C	rs138471599	0.00090290204	0.5518078945400923	0.00593765356	0.5523388235573493	0.0078385652087361	0.6130927591072427	4.6461571957464685e-06	0.5739345123428038	4.951648718403176e-05	0.574171612202548	0.5542298156619883	0.0966947409292244	0.0004740174565479	0.358218037047285	0.0032707578008781	0.3589344876753157	0.0043408287236849	0.2085482689325028	2.3677445274169846e-06	0.3840414142207511	2.7277806132110294e-05	0.3842264584518743	0.00050830402805	0.757115011469334	0.0013423375761158	0.7582923748869732	PLK2	82711	GAPT	114008	RAB3C	204794	False	False	False	alt	100	0.002163	75	0.0676
3229	chr5	58427245	A	G	rs245412	0.0243625157999999	0.1377306572686762	0.0243625157999999	0.145457277398131	0.0073997032703488	0.6744161042187351	0.0001847546165966	0.1877095381874487	0.0001847546165966	0.1960508960202253	0.178217616365315	0.6922566025055658	0.0043829051520985	0.2667432098935755	0.0043829051520985	0.278298700188323	0.0013241922232492	0.729430548830527	3.3389974279846546e-05	0.3051894460940839	3.3389974279846546e-05	0.3165068459363115	0.0234691231236838	0.0488369584621227	0.0234691231236838	0.0501293403732631	PLK2	32894	GAPT	64191	RAB3C	154977	False	False	False	alt	-80	0.001831	-50	0.03552
3230	chr5	58433711	C	T	rs151893	-0.0507904554	0.0273154006759072	0.0507904554	0.0254802301635809	0.0108639601532898	0.2340517594872397	-0.0005613328498089	0.0370571689954394	0.0005613328498089	0.0347876066404987	0.1433936036680878	0.7521705881492242	-0.0077515562050231	0.1854050455296929	0.0077515562050231	0.1756302144125687	0.0016066003790313	0.67868751870323	-8.771377460794145e-05	0.1615447694308693	8.771377460794145e-05	0.1532169719968903	-0.045560638595836	0.0057761402523546	0.045560638595836	0.0055928654055241	PLK2	26428	GAPT	57725	RAB3C	148511	False	False	False	ref	-100	0.003918	-35	0.01978
3231	chr5	58434073	A	C	rs158280	0.001961365632	0.7416564549793446	0.002667821072	0.7512992476582974	0.0108215531835722	0.2436703926224197	1.8218224693328912e-05	0.7018687412201399	2.6825752501974424e-05	0.7113805830686641	0.1550078320314525	0.7328382566023126	0.0004066676835737	0.7483641987131242	0.0004990648054897	0.7585790640721427	0.0016214977113146	0.6807848654620984	3.819840050552599e-06	0.7241689003095637	4.945616361628467e-06	0.7341826357151503	0.0018423427628916	0.5918986028371601	0.0025643419537546	0.6007470114514271	PLK2	26066	GAPT	57363	RAB3C	148149	False	False	False	alt	45	0.0003433	25	0.015015
3232	chr5	58470131	A	G	rs832636	0.007481472128	0.4436275667331391	0.007481472128	0.4565047413568053	0.0075395931931219	0.6593808758981945	5.434700733681159e-05	0.4957086243721569	5.434700733681159e-05	0.5081907576484835	0.1429350926876834	0.7535218915706321	0.0009654203187899	0.6181428342697938	0.0009654203187899	0.6326003735361114	0.0010620435343213	0.7907747700001936	6.851097812830564e-06	0.6478000372665427	6.851097812830564e-06	0.6619742950636415	0.0065664581582795	0.2902930298329232	0.0065664581582795	0.2980187454458962	PLK2	9992	GAPT	21305	RAB3C	112091	False	False	False	alt	95	0.002163	-30	0.02382
3233	chr5	58570576	G	A	rs12153002	0.002481483312	0.6284822618540368	0.004705429568	0.6280686798383525	0.0081080208946184	0.5696739419484936	2.1658008049352416e-05	0.6582026553873626	3.9099077071854974e-05	0.656995976770382	0.0986918951441404	0.8257118892193148	0.0002842285915798	0.7646793181647816	0.0004854471984981	0.7626406999508027	0.000804338368053	0.8365612594483914	2.467910372228299e-06	0.7759350924488012	4.056145391258355e-06	0.7737931640797544	0.0017718026120603	0.4938071649028516	0.0039585472878349	0.4929206111776255	RAB3C	11646	GAPT	79140	PLK2	110437	False	False	False	alt	95	0.002573	65	0.04712
3234	chr5	61082276	T	C	rs117702129	-0.00486744344	0.5907071110791018	0.00486744344	0.5777269535092393	0.0251938503199094	0.009212136611744	-0.0001287385234841	0.2943378605160798	0.0001287385234841	0.28433753822284	0.0242243176796439	0.9552167514701356	-0.0001076564614276	0.912288281284002	0.0001076564614276	0.8980431189691381	0.0005978147749697	0.8773389120638484	-2.7760712236065373e-06	0.8042878640517925	2.7760712236065373e-06	0.7901702909451567	-0.0018029232668388	0.6955188521692943	0.0018029232668388	0.68242080675937	SMIM15	80192	NDUFAF2	137098	ERCC8	137203	False	True	False	ref	30	0.01012	-100	0.05463
3235	chr5	61203304	A	G	rs171748	0.01182588272	0.2949862007839469	0.01182588272	0.305988479915006	0.0067365988220227	0.8458210247359486	7.991212258820863e-05	0.3826907422986108	7.991212258820863e-05	0.39366068678767	0.1892841212045767	0.674861584032479	0.0022498463260625	0.4053493051953113	0.0022498463260625	0.4182801324878869	0.0012723001386182	0.7417733465004588	1.515775141825122e-05	0.4649457138944442	1.515775141825122e-05	0.477844676558737	0.0112802000020746	0.1620108138957519	0.0112802000020746	0.1674670906540888	SMIM15	40836	ZSWIM6	128955	NDUFAF2	258126	False	False	False	alt	50	0.01604	75	0.03247
3236	chr5	61210242	A	C	rs177114	0.0054297385	0.4887090675124824	0.00602379702	0.4979945750998565	0.0148563036238704	0.0821834492460707	8.494616141248206e-05	0.3502655530945424	9.263946276328278e-05	0.3587697022679034	0.1027873733130011	0.8167783603923792	0.0006431048301266	0.6570468644762953	0.0006858479087009	0.6664262143419467	0.0015426133621644	0.6862645066454816	1.0015859213391057e-05	0.5493045313045672	1.0569399583821806e-05	0.5588058792701756	0.0057282751895766	0.3350471486323094	0.0061556655152023	0.3409890478693165	SMIM15	47774	ZSWIM6	122017	NDUFAF2	265064	False	False	False	alt	90	0.004154	100	0.02411
3237	chr5	61237147	G	A	rs476099	0.00838323538	0.4313019939992571	0.00838323538	0.4442754290244486	0.0091641112483435	0.4020308282244594	8.115066321787428e-05	0.4292544597431364	8.115066321787428e-05	0.4413299235147541	0.1732984781999813	0.7011777815470653	0.0016868405707403	0.5138745411868784	0.0016868405707403	0.527725693401103	0.0016204375320617	0.6789759219889353	1.667752500129101e-05	0.5038405559791893	1.667752500129101e-05	0.5171969989105467	0.0079897094368198	0.2856974350125972	0.0079897094368198	0.2935959246376848	SMIM15	74679	ZSWIM6	95112	NDUFAF2	291969	False	False	False	alt	-100	0.02252	25	0.01675
3238	chr5	61243041	G	A	rs192070971	0.01900275914	0.195931079534301	0.01900275914	0.205397414545343	0.0101907788496327	0.2901348335870782	0.0002148585970932	0.1610273684635295	0.0002148585970932	0.1685034338585982	0.0838722393385823	0.8534279605006233	0.0015689489707665	0.5028170484642793	0.0015689489707665	0.5163359475324119	0.0008453010447171	0.8286515983459919	1.7692050166130282e-05	0.4572334589833856	1.7692050166130282e-05	0.4699696763770843	0.0153404080955195	0.1324431122649058	0.0153404080955195	0.136068211559892	SMIM15	80573	ZSWIM6	89218	NDUFAF2	297863	False	False	False	alt	100	0.0006485	-65	0.02057
3239	chr5	61261478	T	G	rs10939891	-0.001475034734	0.8197108161136839	0.0018284540259999	0.811635508557711	0.021658100474981	0.0192411559478399	-3.0866404054664034e-05	0.6046752548037019	3.795229781923536e-05	0.5965947630641874	0.3209099679457255	0.4530451159478648	-0.000478641252779	0.6939857143781859	0.0005926238229473	0.6853223108153962	0.007016802770871	0.0494651247909881	-1.0116555368770264e-05	0.5190541974054782	1.2401853319376833e-05	0.5107204603623776	-0.0011390159648958	0.7566014420369289	0.0013340387348416	0.7489731617159293	ZSWIM6	70781	SMIM15	99010	NDUFAF2	316300	False	True	False	ref	-60	0.001068	-65	0.06232
3240	chr5	61263059	G	A	rs11949390	-0.068195022	0.0087429963948358	0.068195022	0.0082792263037694	0.0231496211358071	0.0135636883029277	-0.0015949081555848	0.0054619004577664	0.0015949081555848	0.0052745338517902	0.550916503283229	0.1004293954195341	-0.0375532071703608	0.0077164153171095	0.0375532071703608	0.0071594449451472	0.0127338667051653	0.0054665757790437	-0.0008767996915497	0.0047013840177673	0.0008767996915497	0.004486860092079	-0.0153238104129709	0.1067959725810274	0.0153238104129709	0.1037437721514431	ZSWIM6	69200	SMIM15	100591	NDUFAF2	317881	False	True	True	ref	-5	0.0002136	-100	0.0227
3241	chr5	61271790	A	G	rs10939894	0.007022869776	0.4923181887538882	0.007022869776	0.5054293645773507	0.0071468300730975	0.7476588864531954	5.28568176481247e-05	0.5391820600009698	5.28568176481247e-05	0.5522361200119471	0.1273789147190323	0.7763658516592157	0.0007271904887107	0.6519032676178419	0.0007271904887107	0.666060543369365	0.0008990774193165	0.8171195734990727	5.416353148118653e-06	0.6803280686221161	5.416353148118653e-06	0.6941633983956961	0.0062822228446352	0.3470315270419837	0.0062822228446352	0.3559883390992432	ZSWIM6	60469	SMIM15	109322	NDUFAF2	326612	False	False	False	alt	45	0.02264	80	0.04694
3242	chr5	61278550	C	T	rs13179814	-0.03483810914	0.1010041379720135	0.03483810914	0.0972289770957027	0.0254648214384737	0.0132643895701378	-0.0013043500279859	0.0369052472340059	0.0013043500279859	0.0354948314359113	0.2993184576603491	0.4973347882739549	-0.0118378009165861	0.1461065516406488	0.0118378009165861	0.1387476935415418	0.0081094967122958	0.0432079594839036	-0.0004545459135197	0.0521367461537462	0.0004545459135197	0.0497673434177146	-0.0272637682963515	0.0569610975420653	0.0272637682963515	0.0555161958607652	ZSWIM6	53709	SMIM15	116082	NDUFAF2	333372	False	True	False	ref	40	0.00319	95	0.04456
3243	chr5	61278792	G	A	rs62366231	-0.00145861186	0.6646299981887854	0.00401699762	0.6619438952994877	0.0086026289125708	0.4843234305601587	-1.2523314989211538e-05	0.6605840001522417	3.4811336598908444e-05	0.6578408685306575	0.2419070737248311	0.5907141163213118	-0.0003463377554086	0.6160465341781376	0.001027293331911	0.6133955728425521	0.0020882119598387	0.5948976116427859	-3.027315755315977e-06	0.6182594803438334	8.939616586497775e-06	0.6156978229384826	-0.001085073496613	0.5023258000862221	0.0034460938391476	0.4998563704658488	ZSWIM6	53467	SMIM15	116324	NDUFAF2	333614	False	False	False	ref	-100	0.02325	-25	0.005676
3244	chr5	61346768	C	T	rs4604142	-0.00814023204	0.4214248454810449	0.00814023204	0.409391732394116	0.0083423082081094	0.5268622784781375	-6.867887934066088e-05	0.4348102640898332	6.867887934066088e-05	0.4231618226071683	0.1643792985404412	0.7184619041500693	-0.0012840739213945	0.5487014313356292	0.0012840739213945	0.5349562470919779	0.0013696047477368	0.7286342745381433	-1.0790650786197313e-05	0.554980057575349	1.0790650786197313e-05	0.5415761118118124	-0.0080104565400055	0.2513680129558389	0.0080104565400055	0.2445651113489579	ZSWIM6	14509	SMIM15	184300	NDUFAF2	401590	False	False	False	ref	100	0.05328	0	0.0
3245	chr5	61432163	T	C	rs10939902	0.00814318158	0.4287229094143616	0.00814318158	0.4413183998525445	0.0076318722617397	0.6671598014898498	6.265965947978022e-05	0.4797084357907065	6.265965947978022e-05	0.4920838676332133	0.3897944999429454	0.3468451461229347	0.003226705119716	0.350622850506337	0.003226705119716	0.3633720374759708	0.0029890678372702	0.4227790113016688	2.496144782271976e-05	0.3860582959464443	2.496144782271976e-05	0.3984114398731669	0.0040270127283477	0.4415107999366745	0.0040270127283477	0.4523214994953048	ZSWIM6	99904	SMIM15	269695	NDUFAF2	486985	False	False	False	alt	100	0.00421	50	0.04053
3246	chr5	61522089	G	T	rs34270022	0.0009746251399999	0.7511203544465399	0.00266635034	0.758045311082089	0.0296852340673952	0.0041909593495797	3.71871078080909e-05	0.401343040853168	7.87684524582109e-05	0.4069770956892546	0.084861876160541	0.8513033756233125	0.0001436732000322	0.8302081988042531	0.0002361048342746	0.8380757363738528	0.0027081798621618	0.4292341587659971	5.329425689135361e-06	0.6461982374149235	7.601326251094589e-06	0.6539529454657996	0.0011784354609487	0.6407842815119958	0.0020913080011202	0.6476617063489319	ZSWIM6	189830	SMIM15	359621	NDUFAF2	576911	False	True	True	alt	85	0.01262	-20	0.00894
3247	chr5	64173712	A	G	rs3104058	0.0311087142	0.0885916017866868	0.0311087142	0.0943978608273391	0.0107306470743503	0.2475720397024511	0.0003409270619041	0.0771473367402944	0.0003409270619041	0.081813555160581	0.0259131318789613	0.9524596645596456	0.0008465165801417	0.6289370338665567	0.0008465165801417	0.6428228019561817	0.000285555771636	0.9398923599769874	9.421875517703864e-06	0.582930610057431	9.421875517703864e-06	0.5964110280294451	0.0107075799541488	0.1717791193317598	0.0107075799541488	0.1772910284255807	RNF180	7868	HTR1A	211205	RGS7BP	332304	False	False	False	alt	-5	0.0001373	-100	0.010254
3248	chr5	64175997	T	G	rs1603090	-0.00754174158	0.4597737449901867	0.00754174158	0.4475466395205504	0.0201494450228498	0.0255749363900311	-0.0001561245808351	0.2401772290418252	0.0001561245808351	0.2312792879810316	0.0923598792518594	0.837567962648408	-0.0006892778504861	0.6981467215534933	0.0006892778504861	0.6842632603028421	0.0019125550477337	0.6045266236556122	-1.4739350480162308e-05	0.5279970439112527	1.4739350480162308e-05	0.5149485115213297	-0.0059627174555752	0.3423407143380726	0.0059627174555752	0.3332309287434544	RNF180	10153	HTR1A	213490	RGS7BP	330019	False	False	False	ref	-90	0.01262	-85	0.01221
3249	chr5	64217272	A	G	rs2963002	0.000712992012	0.68883220741617	0.0035202471479999	0.6871048063688244	0.0067594393679958	0.822250078020899	7.14295300302208e-06	0.7409276915136676	2.528543157782229e-05	0.7390789791810504	0.0354422763721614	0.9346944610206342	4.19678742012263e-05	0.8875160355362889	0.0001454487376202	0.8847271955294995	0.0002413855156965	0.9493250064956724	3.950097079281557e-07	0.903854228658812	1.04603611907018e-06	0.9021112429797484	0.0003236548096972	0.6840138924773139	0.0018713887073517	0.6823078096001566	RNF180	51428	HTR1A	254765	RGS7BP	288744	False	False	False	alt	100	0.003233	100	0.0505
3250	chr5	64223835	A	G	rs11743978	0.057320258	0.0156319680013088	0.057320258	0.0167009078616952	0.0131983547445118	0.1271553584081111	0.0007758293036306	0.0179346358515652	0.0007758293036306	0.0189995670100261	0.2433572962375128	0.5817372121759747	0.0143794657055193	0.0721231468126242	0.0143794657055193	0.0779309289498989	0.0032437823671556	0.369614741159074	0.0001959353629476	0.0526403385839938	0.0001959353629476	0.0566655144002463	0.0514569653212169	0.0033542436014465	0.0514569653212169	0.0034565427715866	RNF180	57991	HTR1A	261328	RGS7BP	282181	False	True	False	alt	-55	0.01082	75	0.0475
3251	chr5	64326354	T	C	rs6449715	0.0016354774199999	0.7699509069829882	0.00244202026	0.7766838202590379	0.0193083303226637	0.0315239101480238	2.9187527198992964e-05	0.5508821365396949	4.746059020994128e-05	0.5568927527813108	0.1108268757974667	0.8052910421193202	0.0001831723845566	0.8133470922450552	0.0002572931034778	0.8203912394043961	0.0021773895660488	0.5648028860174752	3.372932200058037e-06	0.6979066978915556	5.052213781962322e-06	0.7045907182501545	0.0011369412545773	0.6396651912511468	0.0020622620566603	0.6460001330450467	RNF180	160510	RGS7BP	179662	HTR1A	363847	False	False	False	alt	30	0.000778	-85	0.0261
3252	chr5	64361018	G	A	rs1526875	-0.00598004386	0.5359130563717937	0.00598004386	0.5234099264681317	0.0075435468713585	0.6801166940709353	-4.60610170707809e-05	0.5805904350359508	4.60610170707809e-05	0.5681123205094649	0.0389941804375563	0.928685218486733	-0.0002357667251517	0.8446769772480225	0.0002357667251517	0.830502153079826	0.0002936747982637	0.9376480674821448	-1.8153843858238008e-06	0.8590986168788813	1.8153843858238008e-06	0.8448381645764006	-0.003182605628689	0.5371017128049403	0.003182605628689	0.5254317876652619	RGS7BP	144998	RNF180	195174	SHISAL2B	329425	False	False	False	ref	-100	0.002983	-100	0.01389
3253	chr5	64363665	C	A	rs7732201	0.0095983896	0.362815660415176	0.0095983896	0.3745349589054121	0.0187205151407701	0.035012058674798	0.000176644729212	0.1905313286376271	0.000176644729212	0.1988252896861866	0.1449019180696895	0.7502151925701319	0.0014841865545196	0.5213931602904108	0.0014841865545196	0.5351177827063007	0.0027731376048319	0.4539276812415192	2.765035949016669e-05	0.3562584348001657	2.765035949016669e-05	0.3681498441626897	0.0084793410720027	0.2166070906295427	0.0084793410720027	0.2231986959869453	RGS7BP	142351	RNF180	197821	SHISAL2B	326778	False	False	False	alt	75	0.002512	-85	0.0544
3254	chr5	64367503	G	T	rs10056417	0.001548519004	0.8139428267369863	0.001610126476	0.8237085155346024	0.0187663471084317	0.0348406354010371	3.0014421882644814e-05	0.6318729733070605	3.1047692792713486e-05	0.6417505240079915	0.0497598522806252	0.9118292325006608	7.803905947846759e-05	0.902111639817718	8.10472480285741e-05	0.9127955522280584	0.0009735656571156	0.8022786411651615	1.576514330870388e-06	0.8374012441694008	1.6269672004405413e-06	0.8474938492664426	0.0011286424133029	0.7630599135055609	0.001157688357763	0.7728742468371407	RGS7BP	138513	RNF180	201659	SHISAL2B	322940	False	False	False	alt	35	0.000908	35	0.003555
3255	chr5	64369508	G	A	rs28615727	-0.0411851772	0.0507712908419829	0.0411851772	0.0475291675126192	0.0099763181187046	0.3083180228721771	-0.0004189584611343	0.0587784767889051	0.0004189584611343	0.0554510744748487	0.1331964024523075	0.7664899696195567	-0.0058424615760916	0.2359753480223392	0.0058424615760916	0.2250761404378589	0.0013810123187401	0.7198744902341573	-6.154929958340006e-05	0.2171986404025253	6.154929958340006e-05	0.2073422168201696	-0.0382410605919148	0.0136261731730543	0.0382410605919148	0.0132145497992732	RGS7BP	136508	RNF180	203664	SHISAL2B	320935	False	False	False	ref	0	0.0	70	0.04532
3256	chr5	64411896	G	A	rs6449731	-0.0471932595999999	0.0342955873970641	0.0471932595999999	0.0320885978821664	0.0096619420735144	0.3449113690649859	-0.0004667845357372	0.0526101074595582	0.0004667845357372	0.0495151917753822	0.0796460544196516	0.8613429732945633	-0.0040569647960903	0.3189839000075654	0.0040569647960903	0.3071771974213023	0.0008074711965635	0.8351778712851662	-4.142021639496036e-05	0.3020252883851639	4.142021639496036e-05	0.2910138371288789	-0.0330335376922996	0.0189800034953622	0.0330335376922996	0.0184448670502709	RGS7BP	94120	RNF180	246052	SHISAL2B	278547	False	False	False	ref	100	0.1455	-15	0.0003052
3257	chr5	64414512	A	C	rs11949865	-0.0003839605099999	0.7821780795402098	0.00224761469	0.7834959316129492	0.0185033852604035	0.0371276847010871	-1.1088203888673588e-05	0.5987638004798344	4.241721243440493e-05	0.5992356229152911	0.040313696200168	0.9262509817787682	-5.022338142418643e-05	0.9094292136518972	0.0001011927416546	0.9117351763867269	0.0007877454111859	0.8330682754129523	-1.1471551482745784e-06	0.8454380866338592	2.022534628464312e-06	0.8472090196460067	-0.0006410854884386	0.7678838619188622	0.0012634985840101	0.7688382882703491	RGS7BP	91504	RNF180	248668	SHISAL2B	275931	False	False	False	ref	-95	0.01634	60	0.0313
3258	chr5	64418618	T	C	rs4084594	0.057496592	0.0172334034910426	0.057496592	0.0184277212200498	0.0216838316907876	0.0194905046382059	0.0012875353270477	0.0083883584554175	0.0012875353270477	0.008791807824798	0.3111775018413053	0.4802979205500404	0.0183996433166193	0.0475065683939589	0.0183996433166193	0.051687294742959	0.0068702138688272	0.056635935439791	0.0004191866481704	0.0174887080159081	0.0004191866481704	0.0187781505779531	0.0462847124970175	0.0065493377900119	0.0462847124970175	0.0067194522750453	RGS7BP	87398	RNF180	252774	SHISAL2B	271825	False	True	False	alt	-100	0.012054	-50	0.01423
3259	chr5	64420602	T	G	rs7735729	-0.00489821358	0.5828449077086619	0.00489821358	0.5699393597599364	0.0222992432596191	0.016660239007749	-0.0001161391892221	0.3173922266057583	0.0001161391892221	0.3069041855108325	0.1938277368022489	0.6695064186371567	-0.0009518758863803	0.6217107164185794	0.0009518758863803	0.6080234400945825	0.0044170066214266	0.201543872594891	-2.3207603535574348e-05	0.4180896620069369	2.3207603535574348e-05	0.405588157941425	-0.0050871897011379	0.3986190286533411	0.0050871897011379	0.3887358263111478	RGS7BP	85414	RNF180	254758	SHISAL2B	269841	False	True	False	ref	50	0.0032	90	0.03494
3260	chr5	64424518	A	C	rs7736758	-0.006233641332	0.5024545957220554	0.006510054428	0.4933725450426081	0.0216882008099689	0.0192383121244774	-0.0001504870810161	0.2729161748749512	0.0001549115354681	0.265343415673012	0.0110872519424474	0.9807438341658464	-8.314257977723665e-05	0.9351868054132526	8.558559221826821e-05	0.9273172398206624	0.0002562972708047	0.9510528689946052	-2.0806382407800333e-06	0.8611217812413546	2.119742745941564e-06	0.8528839423353302	-0.001288395107833	0.7684211259925815	0.001346486996753	0.7602975995565231	RGS7BP	81498	RNF180	258674	SHISAL2B	265925	False	True	False	ref	-50	0.000675	-80	0.02258
3261	chr5	64438344	C	T	rs4470714	-0.0001059453499999	0.6572916794726762	0.0037380035699999	0.6544482661429045	0.0138272225122686	0.1073533371424603	4.179688996048078e-06	0.5341427314024237	5.637286307169738e-05	0.5319052404782539	0.1852384360833618	0.6815552068139132	8.884580857051998e-05	0.6894579026507422	0.0006764800496321	0.686469964500992	0.0025571818804927	0.4993384247283647	2.3670177588230744e-06	0.5975316060382961	1.0339356845861532e-05	0.5948343558811087	-0.0003423272025643	0.4834291046200937	0.0038568864822249	0.4814649264490295	RGS7BP	67672	SHISAL2B	252099	RNF180	272500	False	False	False	ref	-60	0.003769	-25	0.03433
3262	chr5	64440558	T	A	rs1903305	0.00059776061	0.886681917201348	0.00112664321	0.8941818411332803	0.0141977927109116	0.1001136917995089	1.021368969784687e-05	0.8133424169521642	1.576643735064702e-05	0.8209683425921871	0.1128331206755256	0.8016223150193198	7.030563969200317e-05	0.8794486266265992	0.0001345457891894	0.8870249150677764	0.0016146141480772	0.6746149520065763	1.234874693570214e-06	0.8322680771840558	1.9093331658223843e-06	0.8402524034371296	0.0006141142542972	0.8002368713611208	0.0009958609529144	0.8076110247959103	RGS7BP	65458	SHISAL2B	249885	RNF180	274714	False	False	False	alt	100	0.008545	100	0.0893
3263	chr5	75484335	A	G	rs75930101	-0.0045883225	0.6491014113230789	0.0045883225	0.6357260992841057	0.0213676550875346	0.019629011996277	-0.0001002094425141	0.4045126051957056	0.0001002094425141	0.3933175721349052	0.1763856471540161	0.6913130121304317	-0.0009288045599407	0.6782860881649369	0.0009288045599407	0.6642375820358827	0.0038568590646552	0.2758335253428695	-2.062322709716501e-05	0.4972934538827969	2.062322709716501e-05	0.4844475345523338	-0.0038236911171277	0.4931949370849876	0.0038236911171277	0.4819331891320558	POLK	27511	CERT1	27803	ANKDD1B	126848	False	True	False	ref	10	0.00537	45	0.01605
3264	chr5	89391697	G	A	rs17508283	-0.0092909976	0.3836969388640621	0.0092909976	0.3720931086123928	0.0062605998692223	0.9057375734362926	-5.873402131382231e-05	0.4936559747593492	5.873402131382231e-05	0.4818782834133742	0.3365200883826595	0.4411029603159021	-0.0031526849250743	0.3523091927345245	0.0031526849250743	0.340303471246385	0.0021084924798586	0.5898456051273636	-1.9938142662638123e-05	0.429290682705798	1.9938142662638123e-05	0.4171646870825266	-0.0063921824915195	0.3137187373667025	0.0063921824915195	0.3049349168492524	MEF2C	487440	CETN3	1018069	POLR3G	1080052	False	False	False	ref	25	0.001419	50	0.0404
3265	chr5	89465423	C	T	rs12109397	-0.002022953472	0.7348771621375607	0.003109747968	0.7308972266656948	0.018538087289749	0.0368810777061371	-2.9193246958897606e-05	0.5467335797820692	5.392743570041914e-05	0.5431794758139842	0.0787124347762943	0.8596560850810041	-0.0001592712646141	0.8394007167379192	0.0002577748083174	0.8358221418284487	0.0014755264373108	0.7010945829806341	-2.236448790714709e-06	0.7439652996478572	4.523954005402773e-06	0.7404813298239895	-0.0012966939491073	0.6364682093408517	0.0022884054813846	0.6329192446332478	MEF2C	561166	CETN3	944343	POLR3G	1006326	False	False	False	ref	30	0.011086	95	0.01264
3266	chr5	89468398	G	A	rs10070532	-0.01510904086	0.2677692668240755	0.01510904086	0.2577165515223563	0.0094758286207897	0.365143327743426	-0.0001715406097825	0.2478547201635695	0.0001715406097825	0.2390938278853044	0.0563325345698606	0.8963581157058664	-0.0009926454974182	0.6280771493351517	0.0009926454974182	0.6138694567238423	0.000579366539027	0.8803167835215924	-1.157150869644946e-05	0.5924583258709706	1.157150869644946e-05	0.5789185484102397	-0.0108258384423074	0.2027298819815015	0.0108258384423074	0.1977094632007868	MEF2C	564141	CETN3	941368	POLR3G	1003351	False	False	False	ref	-90	0.003834	60	0.03586
3267	chr5	91676221	C	T	rs2939257	0.002150955676	0.7597824042487418	0.002150955676	0.7739777723925115	0.033843306152989	0.0022396854484492	7.495899422606386e-05	0.4076862589231161	7.495899422606386e-05	0.4197324298474915	0.081262253757819	0.8537564110661922	0.00014453556103	0.8594282856833969	0.00014453556103	0.8738779574476947	0.0027442295927406	0.4282507847611766	5.05972740973721e-06	0.687298539195497	5.05972740973721e-06	0.701487111193415	0.0016639176754945	0.6854930826308531	0.0016639176754945	0.6985039538174663	ARRDC3	292904	LYSMD3	1146637	ADGRV1	1146876	False	True	True	alt	-85	0.01996	65	0.0381
3268	chr5	91688658	T	G	rs2935244	0.032953603	0.0778562149707666	0.032953603	0.0828364966371044	0.013823235862814	0.1043165245565086	0.0004710827398225	0.049008268204656	0.0004710827398225	0.0522336735739366	0.2907167086795506	0.5113303246830103	0.0097438533696937	0.1242047503233919	0.0097438533696937	0.1324577348144917	0.004071549503229	0.2499418071366422	0.0001407261058272	0.0831871547966365	0.0001407261058272	0.0890496371477816	0.0263363727839499	0.0332044287348838	0.0263363727839499	0.0341128566688795	ARRDC3	305341	LYSMD3	1159074	ADGRV1	1159313	False	False	False	alt	-30	0.0158	50	0.004333
3269	chr5	91690039	A	C	rs2973827	-0.0071778861	0.4644924662089931	0.0071778861	0.452214276369252	0.0201370413207515	0.0259820830287255	-0.0001467873735209	0.2509860895388651	0.0001467873735209	0.2417841989622991	0.1005695079824479	0.821168407780768	-0.000708427676223	0.6740930186345624	0.000708427676223	0.6603052329933684	0.0020037163299135	0.6068328070537221	-1.434744721367888e-05	0.5005686731323964	1.434744721367888e-05	0.4877335620703782	-0.0062511021898566	0.3167755918717969	0.0062511021898566	0.3080123794126974	ARRDC3	306722	LYSMD3	1160455	ADGRV1	1160694	False	False	False	ref	75	0.004803	80	0.05573
3270	chr5	91691174	A	C	rs2939246	0.001903107116	0.7468394510930323	0.0024022445959999	0.755426312799711	0.0079992057790357	0.5833998345762391	1.5036039955501752e-05	0.7560951335144881	1.914608785043644e-05	0.7642792101634424	0.1853815910953432	0.6760923830888732	0.000393225185586	0.72821889600596	0.0004972736495887	0.7370586753080045	0.0014861067641694	0.6928809499667044	3.113183352636611e-06	0.7354682327013792	3.969949630800415e-06	0.7440377666714153	0.0019440035685016	0.6231917692687758	0.0022842560607474	0.6311513700517273	ARRDC3	307857	LYSMD3	1161590	ADGRV1	1161829	False	False	False	alt	-80	0.003279	-100	0.01816
3271	chr5	91694565	A	G	rs2973829	-0.0037818739999999	0.6765050631963673	0.0037818739999999	0.6631563461684208	0.0241985191524255	0.0113372721144671	-9.38168116624368e-05	0.363287370166122	9.38168116624368e-05	0.3527675767057192	0.0064585732217138	0.9896512199082588	-2.6186557687624003e-05	0.983394610182451	2.6186557687624003e-05	0.9703980243787308	0.000187935477359	0.9662233861397064	-7.748750078476266e-07	0.9440039811098306	7.748750078476266e-07	0.929880589166172	-0.0005020798970943	0.9125350314647273	0.0005020798970943	0.8986361586814502	ARRDC3	311248	LYSMD3	1164981	ADGRV1	1165220	False	False	False	ref	70	0.00864	-100	0.02678
3272	chr5	91696606	G	C	rs2973831	0.001090418	0.8439836856320736	0.0016256009199999	0.8532744769331801	0.0085658401469453	0.4873185507604132	9.846499311015154e-06	0.8408152046965374	1.423782790090463e-05	0.8501196513853723	0.0642309567526633	0.8900261059974262	0.0001122569865385	0.8935918111049702	0.0001474051017343	0.9028349548272424	0.0005786649994413	0.8868089555034913	1.0808984164036888e-06	0.8924110394702116	1.3692987245250414e-06	0.9016258178431992	0.0008589300718886	0.7749249563274857	0.0012199296673201	0.7841415870147196	ARRDC3	313289	LYSMD3	1167022	ADGRV1	1167261	False	False	False	alt	-10	0.001291	-35	0.06122
3273	chr5	102325209	T	C	rs9327836	0.0453704709999999	0.0355268049786278	0.0453704709999999	0.0380752464123601	0.0107041480691629	0.2479664631886904	0.000513142155822	0.0430207660168033	0.000513142155822	0.0457764009756567	0.2244234898702268	0.6193074045689412	0.0104849330187143	0.1162675318323898	0.0104849330187143	0.1243407937700139	0.0024215815750224	0.5298212159353188	0.0001194853796579	0.1033348643272858	0.0001194853796579	0.1101107113638156	0.0427182854593926	0.0081555795486769	0.0427182854593926	0.0083914364747512	SLCO4C1	28925	SLCO6A1	173807	PAM	428773	False	False	False	alt	-55	0.001366	5	0.01254
3274	chr5	102340107	C	T	rs6884162	0.0210407564	0.1643549966658997	0.0210407564	0.1730201687224284	0.0161011645972723	0.0611726757618311	0.0003537123399885	0.0795526745985434	0.0003537123399885	0.0843049238371274	0.471417753296196	0.2190712407158341	0.0098893129721344	0.1197501662593498	0.0098893129721344	0.1280799687199788	0.0075816551017826	0.0361557030398164	0.0001657285744657	0.0642956198977834	0.0001657285744657	0.0691698705329046	0.0076826523096712	0.2421342115535727	0.0076826523096712	0.2493716000953952	SLCO4C1	43823	SLCO6A1	158909	PAM	413875	False	False	False	alt	-35	0.001373	95	0.05112
3275	chr5	102340678	A	C	rs1452060	0.0436117451999999	0.0393411939836367	0.0436117451999999	0.0422013845532597	0.0220826398985675	0.0197452832908189	0.0010671172728069	0.0136511507121167	0.0010671172728069	0.0144611857535157	0.3808462743389454	0.3654235572116345	0.0171922143481755	0.0533584568259598	0.0171922143481755	0.057811906838255	0.0086794598884515	0.0289983709695602	0.0004366123599896	0.0199087043669385	0.0004366123599896	0.0213819446171829	0.0256019253311756	0.0402788596909739	0.0256019253311756	0.0414267934704863	SLCO4C1	44394	SLCO6A1	158338	PAM	413304	False	True	False	alt	-100	0.005775	-80	0.03473
3276	chr5	102343745	T	C	rs1869103	-0.0764977902	0.0061599698692677	0.0764977902	0.0058493926700724	0.0321887074319707	0.0040602630424517	-0.00251275481382	0.0028199080696161	0.00251275481382	0.0027233559731537	0.3962924926607122	0.3397130630224953	-0.0307303957632622	0.0158538719935679	0.0307303957632622	0.0146206884750592	0.0129898030001863	0.0066678832733751	-0.0010284122692875	0.0041596590524857	0.0010284122692875	0.0039600763819649	-0.0457556613657817	0.0060494824873858	0.0457556613657817	0.0058970159346971	SLCO4C1	47461	SLCO6A1	155271	PAM	410237	False	True	True	ref	0	0.0	60	0.00836
3277	chr5	102347720	T	C	rs10079075	-0.00366213634	0.54866991271031	0.00555099966	0.5456695678593463	0.0064025342463801	0.871468490775347	-2.553292590976693e-05	0.6302337258680458	3.693000502523644e-05	0.6278831525182328	0.0461062874096203	0.9204318664635996	-0.0002529403101105	0.8209144849079977	0.0003027654031276	0.8193486387187447	0.0003100307621092	0.9381819036951397	-1.804687506287668e-06	0.8482252516483267	2.107038552242592e-06	0.8467730283127959	-0.0024398593346404	0.5310349231510446	0.0032946399858919	0.5280989689390051	SLCO4C1	51436	SLCO6A1	151296	PAM	406262	False	False	False	ref	100	0.003479	-90	0.02165
3278	chr5	102349145	G	A	rs1823693	0.00474218604	0.6020595156508968	0.00474218604	0.6155494155810429	0.0073122399510551	0.7060221789487363	3.775254000041579e-05	0.6454148878411774	3.775254000041579e-05	0.6585864794742984	0.0715609083081774	0.8760103182461892	0.0005236124679614	0.7585999492453305	0.0005236124679614	0.7726958981475166	0.0005540514376424	0.8924129451712759	4.339463575802642e-06	0.7773487061997246	4.339463575802642e-06	0.7913019267474143	0.0040851046172677	0.5059942350743304	0.0040851046172677	0.5171300128157629	SLCO4C1	52861	SLCO6A1	149871	PAM	404837	False	False	False	alt	60	0.006214	-100	0.03836
3279	chr5	102351737	A	G	rs1901510	0.0630887127999999	0.0116740102523267	0.0630887127999999	0.0124391798650791	0.0267397974253523	0.0067829735801679	0.0016992222066651	0.0047347321903523	0.0016992222066651	0.0049307378582757	0.3285324536561582	0.4361094662865891	0.0210249522744902	0.0344066245898331	0.0210249522744902	0.0374717968666899	0.0088949163928074	0.021742150048957	0.0005735065026312	0.0094499119676648	0.0005735065026312	0.0101129141173472	0.0464444651915476	0.0059043618965806	0.0464444651915476	0.0060780719331154	SLCO4C1	55453	SLCO6A1	147279	PAM	402245	False	True	True	alt	-40	0.000492	-90	0.010925
3280	chr5	102356524	G	T	rs2198246	0.00384140788	0.6346492158041273	0.00384140788	0.6482688522849551	0.0135819051637178	0.1161404203582311	5.230694635678121e-05	0.5051636402551763	5.230694635678121e-05	0.5173700905924644	0.0838805381798566	0.8529324946299222	0.000311483802918	0.7846853030218737	0.000311483802918	0.7989040182280119	0.0011123792740441	0.7760634605366524	4.087318087269301e-06	0.7212062566097113	4.087318087269301e-06	0.7354390173298015	0.0029917322793804	0.5274773707587161	0.0029917322793804	0.5391981324602249	SLCO4C1	60240	SLCO6A1	142492	PAM	397458	False	False	False	alt	-60	0.002052	-65	0.02328
3281	chr5	102364998	A	G	rs7718122	0.01238814846	0.2914675278159836	0.01238814846	0.3028241517209651	0.0099685280807705	0.3155220848585448	0.0001359325891058	0.2632059290134489	0.0001359325891058	0.273131700737376	0.238031514849739	0.5969324780275462	0.002819778230308	0.361628451275292	0.002819778230308	0.3743892359600053	0.0023742469590761	0.5373091668592834	3.067864793062259e-05	0.3316003315529798	3.067864793062259e-05	0.3436794766996492	0.0113237689187646	0.1522156203423318	0.0113237689187646	0.1565291364280802	SLCO4C1	68714	SLCO6A1	134018	PAM	388984	False	False	False	alt	-80	0.002228	0	0.0
3282	chr5	102365686	G	C	rs6861350	-0.037114911	0.0671055239630473	0.037114911	0.0630058469265056	0.0102701735564417	0.288271857324533	-0.0003905526920878	0.0730624143257679	0.0003905526920878	0.0690007428358335	0.1637133165281797	0.7141897458719365	-0.0061450995425402	0.2196691792338848	0.0061450995425402	0.2091755109168126	0.0015772125490045	0.6880163349542465	-6.111470565961878e-05	0.2086437757005873	6.111470565961878e-05	0.1990976290621432	-0.0347991161734042	0.0176740423670116	0.0347991161734042	0.0172436782125791	SLCO4C1	69402	SLCO6A1	133330	PAM	388296	False	False	False	ref	75	0.002838	90	0.01938
3283	chr5	102367872	A	G	rs1597766	-0.00437082332	0.6238822046989536	0.00437082332	0.610738592720204	0.0356260329473959	0.001814160324859	-0.0001530866153724	0.2395860293802819	0.0001530866153724	0.2306539214395643	0.0613284370169814	0.8878550800535031	-0.0002921230125054	0.8198094161148277	0.0002921230125054	0.8058316262963575	0.0022042368544519	0.537687843167773	-1.0259408081337812e-05	0.5849874109766293	1.0259408081337812e-05	0.5717201850874203	-0.0032884158549362	0.5264362449232568	0.0032884158549362	0.5149554231363205	SLCO4C1	71588	SLCO6A1	131144	PAM	386110	False	True	True	ref	90	0.03009	90	0.04266
3284	chr5	102377587	T	G	rs10041806	-0.00500269328	0.6003220108531785	0.00500269328	0.5873776019787876	0.0248270468233241	0.0101162515251196	-0.000125208384944	0.2954636732184791	0.000125208384944	0.2857061226498291	0.0169192626479527	0.9697434729295028	-8.793515128543397e-05	0.9339633331819004	8.793515128543397e-05	0.9198613297692692	0.0004726208984812	0.9039228552838016	-2.525776764082396e-06	0.839523937994485	2.525776764082396e-06	0.8254663521262025	-0.0014522972230001	0.7549650494284428	0.0014522972230001	0.7414480512997453	SLCO4C1	81303	SLCO6A1	121429	PAM	376395	False	True	False	ref	-35	0.00943	-100	0.05255
3285	chr5	102378038	T	A	rs9327850	-0.004835413	0.6007411901763023	0.004835413	0.5874762855688223	0.0176452810733682	0.0430371431146328	-8.454661924667763e-05	0.3852185986235176	8.454661924667763e-05	0.3744003421055865	0.008647392607807	0.9832368836571672	-3.678892372293975e-05	0.9650625513549616	3.678892372293975e-05	0.95092953786977	0.0001527264457588	0.9668175247104775	-6.437697156157996e-07	0.9310692021064212	6.437697156157996e-07	0.9167403356602204	-0.0006929532464029	0.8707125615297997	0.0006929532464029	0.8568805389819731	SLCO4C1	81754	SLCO6A1	120978	PAM	375944	False	False	False	ref	-5	0.002258	-10	0.004158
3286	chr5	102379394	G	T	rs9327851	0.0019924557	0.7209484990272765	0.00276334942	0.7304289942247745	0.0098507730197529	0.3229821499663661	1.8146690526558705e-05	0.6974103796547396	2.65421340428385e-05	0.7064188769214511	0.0113113206568532	0.9792209130811644	3.315212434346853e-05	0.9474530944014662	3.618295170977209e-05	0.9576072063205516	0.0001136807753602	0.9767532649734506	3.34302481728075e-07	0.9440631400833388	3.67309806416817e-07	0.9534874693491052	0.0005560223653772	0.8682979878150165	0.0005975165717486	0.877012346859772	SLCO4C1	83110	SLCO6A1	119622	PAM	374588	False	False	False	alt	-40	0.0029	70	0.00573
3287	chr5	102390944	C	A	rs6874612	0.0097797763	0.3396029984658494	0.0097797763	0.3510378816053381	0.0375655479169252	0.0015013890492613	0.0003692229058659	0.0643594722791908	0.0003692229058659	0.0682613666126304	0.2454569030799074	0.5824752552297827	0.0024113432783181	0.3826616791123721	0.0024113432783181	0.3954110421700521	0.0094360789506855	0.0178836529253989	9.285356159526104e-05	0.1212879273191531	9.285356159526104e-05	0.1288611650355887	0.0086411684768513	0.2131268425165213	0.0086411684768513	0.2199456905755354	SLCO4C1	94660	SLCO6A1	108072	PAM	363038	False	True	True	alt	60	0.002396	-15	0.01239
3288	chr5	102400017	G	A	rs9285946	0.001342841352	0.812835962867196	0.001572070952	0.8235157244320493	0.0287653699053613	0.0047910031892692	3.7759490447609305e-05	0.5371860003802791	4.584573431278612e-05	0.5474906954790265	0.0901067438458904	0.8360591801245153	7.928757490401257e-05	0.8684404347313784	0.000123766661973	0.8789667470558837	0.0027847948531796	0.3963694085842907	2.2225333871393488e-06	0.7283402791921114	3.791566172729784e-06	0.7386790564608186	0.0011058205997987	0.7311659031909826	0.0013381881554787	0.7411504464270047	SLCO6A1	98999	SLCO4C1	103733	PAM	353965	False	True	True	alt	50	0.003143	55	0.01805
3289	chr5	102400632	A	C	rs7721084	-0.00595983494	0.5382106415290854	0.00595983494	0.5252822384476874	0.0273511231392285	0.0062703664715161	-0.0001626984474808	0.2245024212754753	0.0001626984474808	0.2159478137706792	0.0835319868463365	0.8509959867525152	-0.0004663305808142	0.7530593475861193	0.0004663305808142	0.7388680969912935	0.0023869559438655	0.4946295399974323	-1.3232377495674466e-05	0.5298539793872842	1.3232377495674466e-05	0.5168173070541542	-0.0044585524746107	0.4191462237764152	0.0044585524746107	0.4086943380777893	SLCO6A1	98384	SLCO4C1	104348	PAM	353350	False	True	True	ref	100	0.0017395	-90	0.01736
3290	chr5	102406880	C	T	rs10057126	0.0003950835799999	0.7607313996039469	0.00258034858	0.7634457307187116	0.0155418219896588	0.0720997663318268	7.712771564586197e-06	0.6103372772448724	3.9156389364835833e-05	0.6128684265008764	0.1423541737984833	0.7514114865093758	7.294092650756001e-05	0.7927761444577052	0.000331539470775	0.7956836706867786	0.0023518861079513	0.5100636124509929	1.7267802709138538e-06	0.7020078290464548	5.444515379611726e-06	0.7049416596068828	0.00050830402805	0.656243306734189	0.0019689000923245	0.6588571070701931	SLCO6A1	92136	SLCO4C1	110596	PAM	347102	False	False	False	alt	-35	0.003784	-15	0.0054
3291	chr5	102407922	T	G	rs1901522	0.0058461540079999	0.5019269315083705	0.0061920803919999	0.5128371367307063	0.0080721840605106	0.5722780557966057	4.69093821770092e-05	0.5261170109790326	4.9569959145084725e-05	0.5364704802977858	0.1436695401404578	0.7523545695540889	0.0007813336039003	0.6313258548144167	0.0008399371553261	0.6425898155135736	0.0011661175940748	0.7674901732692538	6.312449813555291e-06	0.6413172419045489	6.763179411016275e-06	0.6521648926454033	0.0052033734789779	0.3365662518666964	0.0055809707569579	0.3439393620037412	SLCO6A1	91094	SLCO4C1	111638	PAM	346060	False	False	False	alt	-100	0.003403	-100	0.02744
3292	chr5	102409208	C	G	rs2060834	0.00405610352	0.6050051706083005	0.0044755152	0.615621048956977	0.0070016202386792	0.7579896616651379	3.034757510146585e-05	0.6587108522758327	3.2958268215010455e-05	0.6688684944140534	0.1383354599114098	0.7585571168513223	0.0005460093426162	0.6900095403957308	0.0006221742475395	0.700675244087811	0.0009578583426155	0.8043042484327816	4.107378744396091e-06	0.7218945490030693	4.581479032217663e-06	0.7324858607220234	0.0039357254743306	0.4334187369956483	0.0043257710142221	0.4417187480152785	SLCO6A1	89808	SLCO4C1	112924	PAM	344774	False	False	False	alt	65	0.01634	-60	0.04645
3293	chr5	102412134	T	C	rs9986226	0.0329794472	0.0749677976315161	0.0329794472	0.0797874599166602	0.0198075659151769	0.027095387003537	0.000647372617756	0.0257329896687677	0.000647372617756	0.0271938683385946	0.2676687517505368	0.5468479247689497	0.0089119796679592	0.1352024810632715	0.0089119796679592	0.1438929934928558	0.0052452628758892	0.1222716238435314	0.0001724368854495	0.0573469975926686	0.0001724368854495	0.0615900101939469	0.0293239556426933	0.0305618374391708	0.0293239556426933	0.031469768670952	SLCO6A1	86882	SLCO4C1	115850	PAM	341848	False	False	False	alt	-45	0.001278	-60	0.01282
3294	chr5	102418079	A	C	rs1597770	-0.00510155292	0.5678270937768117	0.00533402664	0.557620815359629	0.0158677596619217	0.0640860517775111	-8.292625909457368e-05	0.4062406173896206	8.654060436479879e-05	0.3969605671385858	0.0270127283478044	0.9517609556759244	-0.0002007373254718	0.8762254009012925	0.0002038000296195	0.8666463066548434	0.0004398114934531	0.9092410788911716	-3.3330277308742004e-06	0.8116934104407055	3.38064459923576e-06	0.801911377545413	-0.0024958765132418	0.6290171479854433	0.0025456695608875	0.6195838061373992	SLCO6A1	80937	SLCO4C1	121795	PAM	335903	True	False	False	ref	40	0.00177	-60	0.01697
3295	chr5	102418412	T	A	rs1470794	0.0091859243	0.363592700751202	0.0091859243	0.3754359551056323	0.0233903206496814	0.0135053496879856	0.0002199252977878	0.1401825331717191	0.0002199252977878	0.1472593462194842	0.0686708368344069	0.8762524275502006	0.0006827394068439	0.6639509641095214	0.0006827394068439	0.6778268865908894	0.0017509921058631	0.6186355353852329	1.771415020992262e-05	0.4577978271796776	1.771415020992262e-05	0.4707297179382204	0.0066598201226153	0.2980799049022773	0.0066598201226153	0.3067257001392051	SLCO6A1	80604	SLCO4C1	122128	PAM	335570	False	True	False	alt	-80	0.001678	0	0.0
3296	chr5	102421561	G	T	rs6878326	0.0259370748	0.0937786069737396	0.0298217944	0.0979729404517849	0.0130254746413485	0.1365846238497333	0.0003810950228317	0.0603187066064003	0.0004143081251336	0.0628629795190608	0.5209535368624156	0.1409183166113073	0.0133052282893142	0.064927646695117	0.0154067867241335	0.0687836574586173	0.006765962450868	0.0543439970176683	0.0001959513018429	0.0469354162755198	0.0002139189496925	0.0492469197891121	0.0086307949252584	0.2237939978529789	0.0093569435367585	0.2285115133488344	SLCO6A1	77455	SLCO4C1	125277	PAM	332421	False	False	False	alt	-90	0.001366	40	0.0181
3297	chr5	102424248	A	G	rs4413509	0.038541416	0.0540073272946903	0.038541416	0.0576831997902255	0.0081451774174039	0.5559594434906483	0.0003254519630411	0.0865191087015053	0.0003254519630411	0.0914412606499715	0.1841450637454745	0.6857661926175668	0.00735402104917	0.1731062702847971	0.00735402104917	0.1830836971723027	0.0015254087663187	0.7013816943340353	6.317137973682923e-05	0.1954936731503413	6.317137973682923e-05	0.2051252411268236	0.0376705152543075	0.0136816196961809	0.0376705152543075	0.0141066977672236	SLCO6A1	74768	SLCO4C1	127964	PAM	329734	False	False	False	alt	50	0.00614	0	0.0
3298	chr5	102426015	C	A	rs9765316	-0.0534573391999999	0.0245761446298066	0.0534573391999999	0.0231879264789126	0.0129161314312275	0.1394125460029009	-0.0007544519646838	0.0270238298649691	0.0007544519646838	0.0256653487612855	0.1983609788483282	0.6593340421352504	-0.0108690026526436	0.1239646934241429	0.0108690026526436	0.1163376705630688	0.0026104809600076	0.4871828590876742	-0.0001557008364299	0.0883364939967474	0.0001557008364299	0.0830890817334064	-0.0515420284442784	0.0047556570371256	0.0515420284442784	0.0046637925094937	SLCO6A1	73001	SLCO4C1	129731	PAM	327967	False	False	False	ref	80	0.001282	-90	0.02823
3299	chr5	102434280	T	C	rs10038801	0.01086499926	0.3192936984606864	0.01086499926	0.3304943397431588	0.0081009301221524	0.5533569074586978	8.99446138667474e-05	0.3630881668294452	8.99446138667474e-05	0.373911417180149	0.2577765329515866	0.5668625567585598	0.0028106917727099	0.3563557611360694	0.0028106917727099	0.3688051853460084	0.0021195295161848	0.5863059505758461	2.36235754697861e-05	0.3810894472174842	2.36235754697861e-05	0.393113792187038	0.0091287254017157	0.2028173367256572	0.0091287254017157	0.2094027669075616	SLCO6A1	64736	SLCO4C1	137996	PAM	319702	False	False	False	alt	-100	0.010796	-40	0.02348
3300	chr5	102440831	T	A	rs6872341	0.001171823706	0.6509566004588748	0.0047189194579999	0.6498767874431088	0.0073959059653413	0.690467117312952	1.5871147476261974e-05	0.6856747674748153	3.992653780721415e-05	0.6840155838095165	0.1326237824043817	0.7678486552995156	0.000276079755447	0.742077035138017	0.0006925537885756	0.7394667653836654	0.0009996962837725	0.7958917687848877	3.176557834556979e-06	0.7576119855476405	6.004077104526965e-06	0.7549056939485048	0.0016867394889988	0.5046848651385324	0.0045332420460792	0.5025553927119196	SLCO6A1	58185	SLCO4C1	144547	PAM	313151	False	False	False	alt	-100	0.01852	60	0.02472
3301	chr5	102442539	C	T	rs1376909	-0.0417248762	0.0479570160937884	0.0417248762	0.044849107722492	0.0110445772876221	0.2175340013987956	-0.0004583551440073	0.0484323071012211	0.0004583551440073	0.0456738005028675	0.2851066919781325	0.52056127230272	-0.011800775940436	0.1053294190466255	0.011800775940436	0.0983409016912398	0.0031505237683273	0.3933159304946112	-0.0001297350375092	0.0902650003750673	0.0001297350375092	0.0846123753592509	-0.0355833566738243	0.0145078868952843	0.0355833566738243	0.014114604479941	SLCO6A1	56477	SLCO4C1	146255	PAM	311443	False	False	False	ref	-90	0.001884	75	0.04117
3302	chr5	102443908	A	G	rs7724920	0.00404892966	0.6438697585780337	0.00404892966	0.6578373025553276	0.0056183703320977	0.9610335941912288	2.3161955993156468e-05	0.7416152637171775	2.3161955993156468e-05	0.7554618814940518	0.2142906046743223	0.6363108388079386	0.0008913874413621	0.6379853006457854	0.0008913874413621	0.652268300963061	0.0011954684944274	0.761303345595848	5.074231560258871e-06	0.7116836372794877	5.074231560258871e-06	0.7259245670118513	0.0034357202875548	0.492985451703306	0.0034357202875548	0.5046101176249421	SLCO6A1	55108	SLCO4C1	147624	PAM	310074	False	False	False	alt	-80	0.03108	-55	0.0195
3303	chr5	102445473	C	A	rs2400797	-0.0192833322	0.2124118328181769	0.0192833322	0.2031693091798588	0.0125498309711643	0.1466737322812792	-0.0002425576412817	0.1535496412940325	0.0002425576412817	0.1466264015937342	0.154632309463791	0.7347563917904094	-0.0032659607148504	0.3765863360875874	0.0032659607148504	0.3642477179977636	0.0019778453175255	0.6134268752453286	-4.190187211899961e-05	0.3072495114670929	4.190187211899961e-05	0.296276170936002	-0.0175582734260728	0.094861409501704	0.0175582734260728	0.092266845353323	SLCO6A1	53543	SLCO4C1	149189	PAM	308509	False	False	False	ref	-100	0.005344	35	0.00699
3304	chr5	102452723	G	T	rs2400799	0.00544921538	0.5226446176774024	0.00544921538	0.535604748336741	0.0203587339346046	0.0246972516530771	0.0001132268811828	0.2938645252978993	0.0001132268811828	0.3042348008253855	0.1048558595006171	0.8128518413913963	0.0006152759065681	0.673018851916051	0.0006152759065681	0.6869969976053655	0.0022243481252513	0.5350001504931575	1.3208094932790292e-05	0.5013210667613717	1.3208094932790292e-05	0.5144061560144639	0.0049979771574393	0.3791355913689557	0.0049979771574393	0.3891666157376656	SLCO6A1	46293	SLCO4C1	156439	PAM	301259	False	False	False	alt	0	0.0	-30	0.007572
3305	chr5	102462150	G	A	rs58080162	0.001358594264	0.8526117107553667	0.001358594264	0.8666309174344636	0.0278482975326272	0.0057342769176117	3.9181452998525264e-05	0.6166763257261334	3.9181452998525264e-05	0.6296097982414336	0.0451145758773431	0.924587075230892	0.0001013669502925	0.9148889750624962	0.0001013669502925	0.9290764971650124	0.0013493331027776	0.6964230383507602	3.124267173835517e-06	0.8243073422382636	3.124267173835517e-06	0.8382880974666078	0.00088590130603	0.8223852296602361	0.00088590130603	0.8363865964487186	SLCO6A1	36866	SLCO4C1	165866	PAM	291832	False	True	False	alt	-100	0.00342	-100	0.01857
3306	chr5	102466680	T	A	rs10055704	-0.00722216874	0.4618134099840731	0.00722216874	0.449600784533445	0.0054216349441264	0.9770105151687796	-3.916180407301807e-05	0.6166449976645189	3.916180407301807e-05	0.6038886313948151	0.0604446104212699	0.8921931249207523	-0.0004317155446718	0.7605402180164504	0.0004317155446718	0.746526589346767	0.0003300369788972	0.9302721631242754	-2.3600441691569835e-06	0.8251821506785438	2.3600441691569835e-06	0.8109786487834879	-0.0049772300542536	0.3848146876328602	0.0049772300542536	0.3748854375169344	SLCO6A1	32336	SLCO4C1	170396	PAM	287302	False	False	False	ref	85	0.006878	-25	0.02324
3307	chr5	102495921	G	A	rs11242471	-0.0137470581799999	0.2875441814297274	0.0137470581799999	0.2768078737531076	0.0079033634051097	0.6102880034058914	-0.0001122355528794	0.3300511291907371	0.0001122355528794	0.3198632423533156	0.0659488168964407	0.8771879878918375	-0.0008944329609743	0.6335138169188921	0.0008944329609743	0.6198517198490384	0.000529236908259	0.8854037596288664	-7.394777398033689e-06	0.6476390344658233	7.394777398033689e-06	0.6342708127867244	-0.0093299723026172	0.2231694891770956	0.0093299723026172	0.2165581809243798	SLCO6A1	3095	SLCO4C1	199637	PAM	258061	False	False	False	ref	-70	0.00317	-40	0.0161
3308	chr5	107400716	T	C	rs252810	0.005379047588	0.5449364190832946	0.005379047588	0.558225141597323	0.0116363930509052	0.19618402426521	6.256235574082578e-05	0.4603942953027951	6.256235574082578e-05	0.4722784574695979	0.1627070820236724	0.7177640383644108	0.0008554105344182	0.624502248010682	0.0008554105344182	0.6385942494097038	0.0019437053138668	0.6099725207296945	1.029596087340658e-05	0.5619215590709254	1.029596087340658e-05	0.5756648929781663	0.0049212128756521	0.3746090177811164	0.0049212128756521	0.3845676407640279	EFNA5	270221	FBXL17	981382	FER	1347126	False	False	False	alt	100	0.003029	-100	0.02184
3309	chr5	107434606	A	G	rs152611	0.00383550644	0.6333115513580314	0.00383550644	0.6467389737223553	0.0080251681318657	0.5647048787685954	2.9695179717672025e-05	0.6581999601406355	2.9695179717672025e-05	0.6714270035399161	0.065840931959875	0.8728896334516872	0.0002550818309549	0.7967755102852767	0.0002550818309549	0.8110914835475874	0.0005159838981143	0.8811135169821404	1.9562288617327203e-06	0.8065934611783914	1.9562288617327203e-06	0.8209116126851932	0.0027655888546561	0.5463772037330343	0.0027655888546561	0.5584418427468121	EFNA5	236331	FBXL17	947492	FER	1313236	False	False	False	alt	100	0.01157	-10	0.00728
3310	chr5	107454811	T	A	rs115779	0.0056769382399999	0.5201952458970797	0.0056769382399999	0.5330360846237224	0.0220517153758422	0.0175631947975613	0.0001244013596556	0.2651189289366612	0.0001244013596556	0.2747138346063248	0.1031421487774768	0.8153636757041809	0.0005877006659572	0.6788819077907082	0.0005877006659572	0.6928799328667815	0.0023349163497213	0.522315683589261	1.3236293749718938e-05	0.4908529176296622	1.3236293749718938e-05	0.5039246115877456	0.0050892644114565	0.3619078576299572	0.0050892644114565	0.3716639749682947	EFNA5	216126	FBXL17	927287	FER	1293031	False	True	False	alt	-100	0.00737	-95	0.007355
3311	chr5	107666975	T	C	rs967270	-0.00282979479	0.7365848339428198	0.00282979479	0.722928099257655	0.0204576252912546	0.0237379975862646	-5.517080998674408e-05	0.5193134063693019	5.517080998674408e-05	0.5070473557870268	0.0183072438510772	0.9665135270966686	-5.288240891939456e-05	0.9498122578310056	5.288240891939456e-05	0.9386978021140044	0.0003763276305829	0.921504222648162	-1.0493693869319952e-06	0.9020293259696996	1.0493693869319952e-06	0.8877708745263759	-0.0009564414568615	0.8249702792693486	0.0009564414568615	0.8112924400783902	EFNA5	3962	FBXL17	715123	FER	1080867	False	False	False	ref	40	0.00559	-100	0.013435
3312	chr5	109658233	T	C	rs25913	0.0068149552	0.4526535924407987	0.0068149552	0.4652773353804199	0.0073273869416683	0.7192518744915728	4.925477919625212e-05	0.511920776958476	4.925477919625212e-05	0.5242413722827158	0.1828960881336943	0.6848475883431738	0.0011648233716491	0.5427430365913163	0.0011648233716491	0.5565194923943986	0.0013590016222687	0.7284438308204353	8.549257234769132e-06	0.5777331598595424	8.549257234769132e-06	0.5913214009211454	0.0066162512059253	0.2842256117068672	0.0066162512059253	0.2926453789426415	MAN2A1	31695	PJA2	248259	FER	910391	False	False	False	alt	10	0.004524	55	0.00922
3313	chr5	109663016	A	G	rs31609	0.032544836	0.0788369218922869	0.032544836	0.0841459944182746	0.0079465369654325	0.585634331655305	0.0002584599762103	0.1138846275310448	0.0002584599762103	0.1202012034760673	0.0559777591053848	0.9022315099187964	0.0018916503060033	0.4520971233230004	0.0018916503060033	0.4651927812700931	0.0004415852230135	0.9104013915759672	1.4914636467026575e-05	0.4804056055530825	1.4914636467026575e-05	0.493147733933817	0.0197304951296174	0.0732097892374003	0.0197304951296174	0.0753422121326517	MAN2A1	26912	PJA2	253042	FER	915174	False	False	False	alt	70	0.002716	-95	0.02924
3314	chr5	109671803	G	A	rs31598	0.00228375606	0.7543341858777176	0.00228375606	0.7683386900998468	0.031747125174564	0.0029874587440694	7.252991003249047e-05	0.4063515269889031	7.252991003249047e-05	0.4179066092462337	0.196821543791948	0.6641352477852491	0.0004696688287977	0.726211828095679	0.0004696688287977	0.7404301198662936	0.0060836173143295	0.0777955257073084	1.4413010997948324e-05	0.4847474220958077	1.4413010997948324e-05	0.4978259362187091	0.0022074917789603	0.6129454044479226	0.0022074917789603	0.6255401750334502	MAN2A1	18125	PJA2	261829	FER	923961	False	True	True	alt	-100	0.003494	-45	0.01648
3315	chr5	109672899	T	C	rs253243	0.0495161	0.0264761391034525	0.0495161	0.0284514521891124	0.0188296155638553	0.0338536310948784	0.0009682692579662	0.0130141166694854	0.0009682692579662	0.0137314836152886	0.1453811761532795	0.7446990882381227	0.0075282542585106	0.1649860747720114	0.0075282542585106	0.1744372791105319	0.0028255321848278	0.4244372418083544	0.0001530134879281	0.0778716059874047	0.0001530134879281	0.0832856872478714	0.0443967261071172	0.0063909539950302	0.0443967261071172	0.00658950130384	MAN2A1	17029	PJA2	262925	FER	925057	False	False	False	alt	85	0.01843	65	0.05103
3316	chr5	109682839	G	T	rs845739	0.00813816792	0.4146944466894979	0.00813816792	0.4269129665713139	0.0185106200317387	0.0378060164810738	0.0001502694065805	0.2327437355946895	0.0001502694065805	0.2418192520633969	0.1061048351123974	0.8054700503530976	0.0008497195080667	0.6358062484686136	0.0008497195080667	0.6499093422944573	0.0018179500050735	0.6243896987492388	1.4071394579968523e-05	0.4920059482877237	1.4071394579968523e-05	0.5052386575602567	0.0061162460191495	0.3010838513353917	0.0061162460191495	0.3098154311505851	MAN2A1	7089	PJA2	272865	FER	934997	False	False	False	alt	75	0.001659	-100	0.02527
3317	chr5	109688776	G	A	rs1438662	0.0579859706	0.0156446519557462	0.0579859706	0.0167500340673158	0.0190594793250113	0.033065632358655	0.0011365429630729	0.0095825842714243	0.0011365429630729	0.0100708197220492	0.6808307140115561	0.014542964225478	0.0396695134615523	0.0060717963885704	0.0396695134615523	0.0065961436699779	0.0130337535420502	0.0055924532852813	0.0007816483383567	0.0056161028695253	0.0007816483383567	0.0059518749682333	0.0069606531188082	0.2734976552804468	0.0069606531188082	0.2816741890792697	MAN2A1	1152	PJA2	278802	FER	940934	False	True	False	alt	-100	0.02275	90	0.001953
3318	chr5	109699795	A	G	rs3819904	-0.0286445295999999	0.1110365385748127	0.0286445295999999	0.1049859407395076	0.0142167455357198	0.0982260339079551	-0.0004161979521788	0.0645063603610573	0.0004161979521788	0.0609031803804772	0.2629778317202461	0.5572464898795455	-0.0075078977879347	0.1757547909918205	0.0075078977879347	0.1665290951713927	0.0036737520485564	0.3026686021842423	-0.0001075970061133	0.1172879168252751	0.0001075970061133	0.1105824043411625	-0.0256932125851927	0.0410131399032955	0.0256932125851927	0.0399050671743133	MAN2A1	9867	PJA2	289821	FER	951953	False	False	False	ref	-15	0.001007	-75	0.0531
3319	chr5	109703598	T	C	rs1370960	-0.00288102912	0.6423254660194617	0.00422581004	0.6346566158495657	0.0156433283060454	0.0721955998984305	-5.505075862646741e-05	0.4751516460341103	7.088780592068429e-05	0.4675558465561006	0.0671645971431238	0.8801855645982101	-0.0001442103197221	0.8266302566790603	0.0002685619932052	0.8189829367225834	0.0010355105965643	0.7922180045896223	-2.992512744045456e-06	0.7423742870414842	4.456961955973477e-06	0.7347156042638999	-0.0019191070446788	0.5713300108516772	0.0028527266880361	0.5644258489181491	MAN2A1	13670	PJA2	293624	FER	955756	False	False	False	ref	90	0.00812	70	0.01538
3320	chr5	109708857	C	A	rs6897334	-0.0171283592	0.2227251651208552	0.0171283592	0.2133442695320661	0.0112724967909686	0.2083714267399744	-0.0001875786348324	0.1905495290923893	0.0001875786348324	0.1826369952654248	0.370039108289505	0.3867351358037122	-0.0063997175315647	0.2125708632913982	0.0063997175315647	0.2023145185521226	0.0041735356127592	0.2286648797670704	-7.005692508555962e-05	0.1817482079492754	7.005692508555962e-05	0.1729957921680302	-0.0098279027790744	0.1920388116607693	0.0098279027790744	0.18642024381066	MAN2A1	18929	PJA2	298883	FER	961015	False	False	False	ref	-95	0.00241	-90	0.04248
3321	chr5	109716958	G	T	rs2269201	-0.0572242186	0.0181095807673378	0.0572242186	0.0170076958972268	0.0193314626152159	0.0300415074074715	-0.0011487494967599	0.0109509992873568	0.0011487494967599	0.010455083582943	0.2526250272305729	0.5740396673626587	-0.0145614408904549	0.0789993416523355	0.0145614408904549	0.0733548727429816	0.0048531086806569	0.1543121470427978	-0.0002895978751403	0.0325693877822172	0.0002895978751403	0.0303459905998918	-0.05274536042905	0.0033581205245726	0.05274536042905	0.0032630954506972	MAN2A1	27030	PJA2	306984	FER	969116	False	True	False	ref	100	0.002357	85	0.03174
3322	chr5	109730763	A	C	rs34387996	-0.0008096589	0.8309576833510379	0.00176977886	0.8256161978586641	0.0106531420705041	0.2475989543708074	-8.615040367063446e-06	0.7823261962536656	1.8964642688052103e-05	0.7769237407117187	0.0620442120768887	0.8899965559320215	-6.612827952827579e-07	0.9060247766675888	0.0001015427388569	0.9009544721559978	0.0006708787600543	0.8636596517624961	-1.7056246230527163e-08	0.8889954424994496	1.1026550664136366e-06	0.8838913035089393	-0.0003444019128829	0.763624551176385	0.0012614238736915	0.7588028697860105	MAN2A1	40835	PJA2	320789	FER	982921	False	False	False	ref	-100	0.01181	-85	0.01892
3323	chr5	109731623	G	T	rs10463428	0.0062485179239999	0.4939315417499589	0.0062485179239999	0.5064938604618878	0.0203221680823912	0.0250184162780428	0.0001300081252077	0.2904634996919943	0.0001300081252077	0.3005743851569997	0.0820029253415491	0.8558669094813831	0.0005174702062874	0.7235044499613881	0.0005174702062874	0.7371278887314351	0.0017169486617011	0.6521861934937316	1.1180321294240765e-05	0.5655368359586961	1.1180321294240765e-05	0.5787143711396778	0.0048237014906793	0.4007839605985657	0.0048237014906793	0.4112092951045182	MAN2A1	41695	PJA2	321649	FER	983781	False	False	False	alt	100	0.002428	-45	0.02667
3324	chr5	109736510	G	T	rs2416217	-0.0527370334	0.0255102856329693	0.0527370334	0.0239324881702066	0.0126665588367287	0.1448767795497557	-0.0007006725915801	0.027077012152802	0.0007006725915801	0.025597988584938	0.1348831419413064	0.7642117007434216	-0.0075655229077573	0.1897954279274482	0.0075655229077573	0.1798383107076217	0.0017550132303676	0.650032144574123	-0.0001027645713507	0.1395503524221805	0.0001027645713507	0.1319505686325945	-0.0484756065934293	0.0060097793549718	0.0484756065934293	0.0058859177693725	MAN2A1	46582	PJA2	326536	FER	988668	False	False	False	ref	-40	0.015076	100	0.0247
3325	chr5	109736511	G	C	rs2416218	-0.0260360306	0.1362201280179217	0.0260360306	0.1292756918142598	0.0106257209373769	0.2475880600413217	-0.0002834379504579	0.1153097376713016	0.0002834379504579	0.1096840092980493	0.1343478666791148	0.7650776495367755	-0.0037433548798074	0.3297769735013963	0.0037433548798074	0.3175106872035634	0.0014228330052244	0.7152730006630267	-4.029372277848149e-05	0.2951566488996701	4.029372277848149e-05	0.2842564601567344	-0.024950466291144	0.0497101897972112	0.024950466291144	0.0484048433736322	MAN2A1	46583	PJA2	326537	FER	988669	False	False	False	ref	-40	0.0175	100	0.02585
3326	chr5	109739808	C	T	rs3756597	-0.00477935284	0.4939902199086402	0.00667684456	0.4873627963082538	0.0107800386605485	0.2365286937353301	-5.256348781223175e-05	0.4373481532143449	7.135091477651154e-05	0.4311527297806078	0.2923951493272752	0.51105295650118	-0.0014091993369162	0.4584481507172052	0.0019877828394177	0.452011327005007	0.003145289858425	0.3920086035262222	-1.544278815630091e-05	0.4135098338114897	2.1171453683827544e-05	0.4073451829250994	-0.0034813639145633	0.3759267554263329	0.005236568844075	0.3707069589914689	MAN2A1	49880	PJA2	329834	FER	991966	False	False	False	ref	-95	0.002361	75	0.03207
3327	chr5	109759726	T	G	rs13187248	0.01659650856	0.2347171633733076	0.01659650856	0.2448402729267815	0.011416290760702	0.1965902030142963	0.0001949225350723	0.1919262150095488	0.0001949225350723	0.2002913194187671	0.0608948225603999	0.8940225005733323	0.0011234177976792	0.5895425609509741	0.0011234177976792	0.6032970847043844	0.0007132776239165	0.8583592192410553	1.335993919627778e-05	0.5309320419236807	1.335993919627778e-05	0.5439983095612648	0.0112719011608003	0.1763226367361145	0.0112719011608003	0.1816038798858555	MAN2A1	69798	PJA2	349752	SLC25A46	978411	False	False	False	alt	-45	0.0007305	-80	0.01535
3328	chr5	109759844	T	G	rs13187428	0.0047855681	0.5823928702240162	0.0047855681	0.59540214317355	0.0075188116187678	0.6692324462328008	3.593833905178163e-05	0.6187508730239802	3.593833905178163e-05	0.631688270313621	0.04418925507526	0.9218311178724424	0.0002201005249911	0.828885355714013	0.0002201005249911	0.8430154950469512	0.0003341013096755	0.9303440668851652	1.6602533278199182e-06	0.8407955525234505	1.6602533278199182e-06	0.8550519406783516	0.0025892384775775	0.5722145427653176	0.0025892384775775	0.5844330026262453	MAN2A1	69916	PJA2	349870	SLC25A46	978293	False	False	False	alt	95	0.002424	-40	0.02701
3329	chr5	109768576	T	G	rs10041575	-0.00775664532	0.4487274099647532	0.00775664532	0.4363788672211072	0.0301757439516934	0.0037503804512449	-0.0002313458172484	0.1450187459247064	0.0002313458172484	0.1383388760802875	0.1164348177885662	0.7953796653910233	-0.000800473835647	0.6516022038860103	0.000800473835647	0.6377360656055671	0.0035636757807991	0.3125682747523685	-2.410893840728893e-05	0.3824228753047252	2.410893840728893e-05	0.3705959563347144	-0.0068527681822424	0.2882234203296251	0.0068527681822424	0.2801524493845911	MAN2A1	78648	PJA2	358602	SLC25A46	969561	False	True	True	ref	-100	0.00915	65	0.0211
3330	chr5	109772236	G	A	rs3753174	-0.0113527464	0.2042389206929592	0.018152348	0.1981637048182036	0.0099267051430181	0.3290681385742097	-8.618294019016073e-05	0.1947929437380125	0.0001768341811126	0.1896808155039404	0.1814479403313312	0.6865151160736707	-0.0020988722102765	0.337773988208288	0.0032639156477345	0.3290636737348365	0.0017849924585345	0.6462663335609239	-1.5970348270603526e-05	0.3177945287716244	3.150252750811596e-05	0.3101536032489165	-0.0102179483189659	0.0846105126855721	0.0174379402275956	0.0831310999024217	MAN2A1	82308	PJA2	362262	SLC25A46	965901	False	False	False	ref	-10	0.00466	-5	0.002594
3331	chr5	109776323	A	T	rs2042164	0.0113541172	0.3077418419195523	0.0113541172	0.3187970440956658	0.0198411974527553	0.027853980555837	0.0002273647072565	0.1410080510015255	0.0002273647072565	0.1481338524545369	0.0259401031131027	0.9555026770978224	0.0003127180628514	0.797228671309332	0.0003127180628514	0.8113452007985169	0.0005796767279023	0.8814184426107091	6.993782119152532e-06	0.6683686649740228	6.993782119152532e-06	0.6819774143120506	0.0041888401331963	0.4509612178135461	0.0041888401331963	0.4619924800221202	MAN2A1	86395	PJA2	366349	SLC25A46	961814	False	False	False	alt	75	0.002462	-50	0.012115
3332	chr5	109777887	C	T	rs34595717	0.0010956304399999	0.7503607107489656	0.00277562664	0.7573906327648976	0.0073421270896156	0.6812880920857025	1.3438784995535852e-05	0.7654557165325008	2.2654826580059577e-05	0.7730151357367918	0.0312741833421508	0.9475647028106512	1.9938585272518744e-05	0.9296911084908388	6.694062669755875e-05	0.9370592621329374	0.0002346645829678	0.9561068875037444	2.7855734384933415e-07	0.9349397702264296	5.363988583200286e-07	0.9424620490108	0.0002800858930071	0.8096264300020009	0.0009605908774986	0.8163307318793812	MAN2A1	87959	PJA2	367913	SLC25A46	960250	False	False	False	alt	100	0.04318	100	0.03253
3333	chr5	109781470	A	G	rs13189822	-0.038402659	0.0623768285788254	0.038402659	0.058728652472417	0.0164046078543311	0.057785040142795	-0.0006692685760898	0.0315095738771176	0.0006692685760898	0.0298582865593089	0.1298727165219555	0.7722860436587538	-0.0055061107541828	0.2572477875026908	0.0055061107541828	0.2459435635750432	0.0021754070006563	0.5662776575015714	-9.679600036490004e-05	0.1558973887271895	9.679600036490004e-05	0.1477434538343019	-0.0357638564715401	0.0186793925914612	0.0357638564715401	0.0181305094662554	MAN2A1	91542	PJA2	371496	SLC25A46	956667	False	False	False	ref	-100	0.001507	-25	0.012634
3334	chr5	109786878	A	G	rs2269205	-0.00909475068	0.3950081527794023	0.00909475068	0.3833810647941664	0.0190825425145918	0.0326030636331466	-0.0001740826916373	0.2087545252831626	0.0001740826916373	0.2004362760773103	0.2851585597360968	0.5212056009477071	-0.002704214529665	0.3981229002337888	0.002704214529665	0.3855624990067103	0.0054039693967278	0.120185917250134	-5.154853317105696e-05	0.2430644168152522	5.154853317105696e-05	0.2330108821728167	-0.0073403251071068	0.2703155274067667	0.0073403251071068	0.2624786095866436	MAN2A1	96950	PJA2	376904	SLC25A46	951259	False	False	False	ref	95	0.00409	70	0.00857
3335	chr5	109786985	G	A	rs2269206	-0.00462894082	0.6254655252352781	0.00462894082	0.6119948701061976	0.0072156838308794	0.7481955845708238	-3.237104682874068e-05	0.6850993905000191	3.237104682874068e-05	0.6716736679680212	0.2629716075892903	0.5571791245916388	-0.0012145461958344	0.5973341065094614	0.0012145461958344	0.5834145376794053	0.001911119456457	0.6276452158215653	-8.509189030604854e-06	0.6412503215034191	8.509189030604854e-06	0.6275529295965024	-0.0038817830060477	0.4801101647765222	0.0038817830060477	0.4688549037728575	MAN2A1	97057	PJA2	377011	SLC25A46	951152	False	False	False	ref	10	0.0003948	-85	0.03912
3336	chr5	109796377	A	T	rs2301009	0.009252425	0.3618176933606644	0.009252425	0.3734833142011435	0.0215772535803048	0.0188015419590076	0.000200473474017	0.1589491515616994	0.000200473474017	0.1665953811870236	0.1861824292783119	0.680974279880733	0.001698938851835	0.466184148771022	0.001698938851835	0.4796533746149837	0.0039919647549282	0.2553376193312184	3.6633649133956135e-05	0.2728439103656278	3.6633649133956135e-05	0.2835850097192085	0.0087407545721428	0.2066373783299536	0.0087407545721428	0.2133539326279929	MAN2A1	106449	PJA2	386403	SLC25A46	941760	False	True	False	alt	60	0.003172	-100	0.0436
3337	chr5	109799795	A	G	rs1008661	-0.00131907758	0.7788201006244221	0.00230259882	0.7704612211697726	0.0268210286801591	0.0067708688612007	-3.556971749784403e-05	0.4802334148247604	6.029350523691614e-05	0.4734792268566128	0.1462484050664426	0.7462834594243717	-0.0002043823861758	0.7895065940304518	0.0003446070363096	0.7810486981582541	0.0039188501592363	0.2641863593123755	-5.501947972302927e-06	0.601579992378496	9.026919587006472e-06	0.5933831115557024	-0.0011742860403115	0.6291105027509132	0.0022406871440574	0.621857453697619	MAN2A1	109867	PJA2	389821	SLC25A46	938342	False	True	True	ref	20	0.002289	-65	0.0533
3338	chr5	109808927	T	G	rs34052755	0.023167333	0.1448631113019726	0.023167333	0.1527202620868498	0.0094757943550868	0.3740077437042782	0.0002297704888335	0.1424149014720994	0.0002297704888335	0.1494512905451469	0.1379308913992883	0.7565807616360747	0.0034400403073585	0.3213292441057063	0.0034400403073585	0.333807119451825	0.0013780697801944	0.7177691005238811	3.5867058663532664e-05	0.3058034813617062	3.5867058663532664e-05	0.3172711487436573	0.0223425554206993	0.0590615798623362	0.0223425554206993	0.0607384605233572	MAN2A1	118999	PJA2	398953	SLC25A46	929210	False	False	False	alt	-90	0.03513	-95	0.02415
3339	chr5	109816784	G	T	rs4141495	-0.0119811505	0.3158492576895916	0.0119811505	0.3048424016312029	0.0070188624354431	0.7872291990596116	-8.475599622233569e-05	0.3927822216738456	8.475599622233569e-05	0.3818721672690862	0.0380958308696147	0.930543337999564	-0.000470682401973	0.7561342229048028	0.000470682401973	0.7422800852028396	0.000270172799663	0.942293989962308	-3.398245344888599e-06	0.7852211131358415	3.398245344888599e-06	0.771200233092369	-0.0059896886897166	0.3488648153851413	0.0059896886897166	0.3396411205522291	MAN2A1	126856	PJA2	406810	SLC25A46	921353	False	False	False	ref	-65	0.003124	20	0.004578
3340	chr5	109822362	A	C	rs10515405	0.0233892917	0.1378776610509504	0.0233892917	0.145471327720626	0.009937082908889	0.3137172541001841	0.0002488629856828	0.1247345545747571	0.0002488629856828	0.1308434804190748	0.3708669177066152	0.3792383506599115	0.008561684713283	0.1397594984502513	0.008561684713283	0.1486719699464678	0.0036380368737671	0.2976878666466833	8.982384740555467e-05	0.1293115841960989	8.982384740555467e-05	0.1368228896107864	0.0144731791823566	0.1163065791609324	0.0144731791823566	0.119960770670079	MAN2A1	132434	PJA2	412388	SLC25A46	915775	False	False	False	alt	-95	0.0169	-100	0.03864
3341	chr5	109836474	G	A	rs12518625	-0.00555635302	0.547786654675145	0.00555635302	0.5350807966714878	0.0086548177236249	0.4827777863947484	-4.909623141694488e-05	0.5611676865905731	4.909623141694488e-05	0.5488876885411333	0.259770329567734	0.5561312374165961	-0.0013927932969905	0.5321069575248006	0.0013927932969905	0.518271696728343	0.0022047898489001	0.5640715927166672	-1.1980607168079312e-05	0.5380004755451677	1.1980607168079312e-05	0.5247919893037918	-0.005004201288395	0.4073100554648949	0.005004201288395	0.3972305187223846	MAN2A1	146546	PJA2	426500	SLC25A46	901663	False	False	False	ref	-70	0.015	65	0.06287
3342	chr5	109841677	C	T	rs10065099	-0.00589526784	0.5533187532796363	0.00589526784	0.5405370252071818	0.007350845877644	0.7252562502343711	-4.503335243911948e-05	0.6027747096414333	4.503335243911948e-05	0.5902436957932922	0.0944366642807497	0.8301933746882039	-0.0005397160972416	0.7362219528719394	0.0005397160972416	0.7220884667234294	0.0006926202439738	0.8555093260903103	-4.115070831915224e-06	0.7603793977731829	4.115070831915224e-06	0.746363385215983	-0.004655649954875	0.4196791648607776	0.004655649954875	0.4092914182164736	MAN2A1	151749	PJA2	431703	SLC25A46	896460	False	False	False	ref	100	0.001556	55	0.01355
3343	chr5	109847218	C	T	rs17162347	-0.023859138	0.1560336103235512	0.023859138	0.1483107288970745	0.006927753917732	0.7919332702229616	-0.0001697765827823	0.225064219412298	0.0001697765827823	0.2164100789954033	0.1673025653793088	0.7053934638019188	-0.0044260488501997	0.3014549341752264	0.0044260488501997	0.2895329395810772	0.0011908609979288	0.7593471979661818	-3.220738110319402e-05	0.3548984530038201	3.220738110319402e-05	0.343320007406984	-0.0223218083175136	0.0616592587267876	0.0223218083175136	0.0600512283080046	MAN2A1	157290	PJA2	437244	SLC25A46	890919	False	False	False	ref	-100	0.0284	30	0.01132
3344	chr5	109864270	T	G	rs12187114	-0.00639545624	0.5003580731400873	0.00639545624	0.4878729122121567	0.0360952261053105	0.0017144835768334	-0.0002309959227025	0.1520627587225442	0.0002309959227025	0.14506831763468	0.0394443925766864	0.9297827084555692	-0.0002541148658833	0.8356594369242983	0.0002541148658833	0.8213462562328989	0.0014249120175984	0.7150932877303122	-9.199529655230127e-06	0.6060085730829198	9.199529655230127e-06	0.5925541796722815	-0.0035270075415719	0.5058240018148404	0.0035270075415719	0.4944928148615887	MAN2A1	174342	PJA2	454296	SLC25A46	873867	False	True	False	ref	-40	0.001648	-95	0.02975
3345	chr5	109864280	A	G	rs11241042	-0.00432898954	0.6309861420628826	0.00432898954	0.6178266993904314	0.0155655940902722	0.0741693932764316	-6.676265445625413e-05	0.4560992099831938	6.676265445625413e-05	0.4446327463002291	0.0404630753431051	0.9279691685261496	-0.0001670033131547	0.8777232008898705	0.0001670033131547	0.863417759923316	0.0006370414395079	0.8690668320900832	-2.613524631954658e-06	0.8110040966636434	2.613524631954658e-06	0.7967647657913679	-0.0022406871440574	0.6392346918529639	0.0022406871440574	0.6264034224724649	MAN2A1	174352	PJA2	454306	SLC25A46	873857	False	False	False	ref	-30	0.001312	-100	0.02528
3346	chr5	109873641	T	C	rs12656279	0.0493822938	0.0249555577939014	0.0493822938	0.0268741228402731	0.0111494803600552	0.2149356365186046	0.0005594482338955	0.0312071173524273	0.0005594482338955	0.0333681761469399	0.3566717497069472	0.4079376749379477	0.0178291521638442	0.0481582236131633	0.0178291521638442	0.0525516794624263	0.0040132442562907	0.2539729025238663	0.0002034376445295	0.0456858156502894	0.0002034376445295	0.0494647755967221	0.032624819759541	0.0177976510081856	0.032624819759541	0.0183020881206751	MAN2A1	183713	PJA2	463667	SLC25A46	864496	False	False	False	alt	-100	0.0007114	-90	0.00958
3347	chr5	119388814	G	A	rs6888436	-0.00063238808	0.8556672087750968	0.00159630336	0.8533914437800951	0.0155271254545176	0.0728146859586421	-9.8202643510683e-06	0.7394534033355971	2.441199993035904e-05	0.7370968760475111	0.108970010062345	0.8034722130226073	-7.365587059347998e-05	0.8619616742922911	0.0001785334779413	0.8597993357900815	0.0016651413305234	0.6588585185605894	-1.0652550414120858e-06	0.7975912865480633	2.6764622310481945e-06	0.7954732803364096	-0.0004439880081743	0.7516785071296045	0.0013444122864344	0.7493363245162351	HSD17B4	63652	TNFAIP8	120121	FAM170A	240745	False	False	False	ref	-55	0.002502	-100	0.03372
3348	chr5	119389627	T	C	rs1848554	-4.223246000000002e-05	0.612663813515144	0.00449076946	0.6120754670975284	0.0110230080364403	0.2295517910646496	4.463632475742573e-06	0.5413003085333986	4.990988923409333e-05	0.5409494889896473	0.0805174327534517	0.8522663124117548	5.443984535716839e-05	0.7687467658529475	0.0004032089674212	0.7675547353723604	0.0008919731258579	0.8131242461215873	1.0695833638728043e-06	0.731640407460573	4.552881532803308e-06	0.7307955900110296	0.0005912924407929	0.4868974287532888	0.0035539787757134	0.48652838866716	HSD17B4	62839	TNFAIP8	120934	FAM170A	239932	False	False	False	ref	-100	0.000999	95	0.02829
3349	chr5	119442221	A	C	rs32643	0.00243621036	0.65064076325691	0.00381161824	0.6574147492641386	0.0192266073315122	0.031368956581309	4.194893032801693e-05	0.4356980983738173	6.998996413238871e-05	0.4420420079647105	0.105326818742933	0.8184576633743544	0.0001867393894315	0.7724745316972244	0.00037597511229	0.7784627244897269	0.0020446045246396	0.6019363136004406	3.019249454321082e-06	0.6465566004867226	6.876111647633719e-06	0.6527703126161166	0.0018900611002188	0.5193819526714801	0.0031265884500876	0.5248955948013949	HSD17B4	10245	TNFAIP8	173528	FAM170A	187338	False	False	False	alt	75	0.001709	-70	0.02829
3350	chr5	126910206	C	T	rs11956061	-0.0154337438	0.2572660175941131	0.0154337438	0.2474727128905126	0.0082620707672961	0.5390344926296072	-0.0001339903087152	0.2858064121792957	0.0001339903087152	0.2763226238327699	0.4223902737580265	0.3002994003059343	-0.0064603188668017	0.2117000945097163	0.0064603188668017	0.2015591046467326	0.0034869366299926	0.3400005321890988	-5.6108233849921787e-05	0.2309468883178248	5.6108233849921787e-05	0.2211176044802102	-0.007460658305584	0.2758040115766539	0.007460658305584	0.268393317093736	MARCHF3	120352	LMNB1	133582	C5ORF63	163300	False	False	False	ref	-20	0.0007133	-100	0.04172
3351	chr5	126971918	C	T	rs4836307	-0.0075450773599999	0.473587623305778	0.0075450773599999	0.4607424670478023	0.007218828066193	0.7280317488302693	-5.409515628577218e-05	0.5358935665118661	5.409515628577218e-05	0.5237066677079385	0.3178995632734779	0.4710830872187695	-0.0024492846961606	0.4345019693403737	0.0024492846961606	0.4211742479493551	0.0023035188476777	0.5446796682682836	-1.7611565770433183e-05	0.4776310036921689	1.7611565770433183e-05	0.4646830140692152	-0.0053423790703222	0.3809437371320059	0.0053423790703222	0.3715604837051925	MARCHF3	58640	C5ORF63	101588	LMNB1	195294	False	False	False	ref	-95	0.002953	-65	0.01547
3352	chr5	126981234	G	A	rs12657369	-0.0044762149	0.6118742031345368	0.0044762149	0.5986251599101817	0.0095924760952777	0.3497954592951376	-4.2742762788173695e-05	0.5795634156376273	4.2742762788173695e-05	0.5669538969446514	0.1298001016608056	0.7717435584277446	-0.0005496755451578	0.713624974397241	0.0005496755451578	0.6996059029773698	0.0012392218465199	0.7492633836049587	-5.256219423979692e-06	0.693905936757991	5.256219423979692e-06	0.6800452713627045	-0.004224110208612	0.4437804175576498	0.004224110208612	0.4330920638618753	MARCHF3	49324	C5ORF63	92272	LMNB1	204610	False	False	False	ref	100	0.0004807	95	0.03418
3353	chr5	126988408	C	T	rs10057084	-0.00019041528	0.7184519359728474	0.0030396705999999	0.7181744623014414	0.0082662403179742	0.5487170911500825	-3.175065418587813e-07	0.7265274026290225	2.4053933296630346e-05	0.7264361637164847	0.2607703399412856	0.5584738171630814	5.426559232078001e-05	0.6446301791674061	0.0007901216243284	0.6445317051190189	0.002166941144782	0.570593224748811	7.052716314518419e-07	0.6539543274508022	6.290180208641595e-06	0.654015237285059	-0.0003361030716086	0.588245134072324	0.0024938018029232	0.5878979901904147	MARCHF3	42150	C5ORF63	85098	LMNB1	211784	True	False	False	ref	-95	0.005848	-95	0.02344
3354	chr5	127011852	G	A	rs9327428	-0.01589213926	0.2525248767380491	0.01589213926	0.2424809385408187	0.009868854505316	0.3109623769458953	-0.0001555199833733	0.240033296371467	0.0001555199833733	0.2311979772659291	0.2130188072490378	0.6372638594126995	-0.0035031360670686	0.339497313253247	0.0035031360670686	0.3275222025157884	0.0020966901925357	0.5923448640385985	-3.418717293902419e-05	0.3213842441924049	3.418717293902419e-05	0.3102325877421822	-0.0149337648730795	0.1232615259015527	0.0149337648730795	0.1197102599479807	MARCHF3	18706	C5ORF63	61654	LMNB1	235228	False	False	False	ref	-50	0.00172	100	0.05618
3355	chr5	127021395	T	A	rs2108458	-0.00758660986	0.4464578536517741	0.00758660986	0.4340293908462481	0.0297320692378492	0.0043289664885287	-0.0002345723758228	0.1394610898988555	0.0002345723758228	0.1331477036803875	0.1984003983443811	0.6626366208360837	-0.0015019538610199	0.5191175753720612	0.0015019538610199	0.5055450076916199	0.0058462097624556	0.0881415071612659	-4.615731649458507e-05	0.2532464235494269	4.615731649458507e-05	0.2427667768719507	-0.0075830662143797	0.2702638211282303	0.0075830662143797	0.2625369338337965	MARCHF3	9163	C5ORF63	52111	LMNB1	244771	False	True	True	ref	-100	0.006927	65	0.0516
3356	chr5	127024983	G	A	rs7706333	-0.0412537107999999	0.0526532319525151	0.0412537107999999	0.0495002085117387	0.0100352879829247	0.3084019213589076	-0.0004352148650821	0.0626760662285213	0.0004352148650821	0.0592395233060671	0.2416415108040539	0.5902961624234017	-0.010351498009223	0.1335960245121427	0.010351498009223	0.1254074567711844	0.0024991732655644	0.511652049150086	-0.0001122195462447	0.1265767103216499	0.0001122195462447	0.1194725279841039	-0.0377721760599175	0.0139349877561359	0.0377721760599175	0.0135799400656595	MARCHF3	5575	C5ORF63	48523	LMNB1	248359	False	False	False	ref	-25	0.004433	-15	0.012024
3357	chr5	127028162	G	A	rs1013662	-0.0491954666	0.0313116578566635	0.0491954666	0.0294527428708422	0.0129017489283216	0.1340540088728892	-0.000657814274723	0.0296202923874312	0.000657814274723	0.0279971011572272	0.3137584414776086	0.4773404206763901	-0.0157208648496374	0.0735186009049043	0.0157208648496374	0.068260627364938	0.0040702609920618	0.2477031308941639	-0.00021120958595	0.0535475201270951	0.00021120958595	0.0499921034534494	-0.0385813130841605	0.0123819232847181	0.0385813130841605	0.0120335697040107	MARCHF3	2396	C5ORF63	45344	LMNB1	251538	False	False	False	ref	100	0.001602	85	0.0433
3358	chr5	127055270	T	C	rs6899133	0.0725377426	0.0067219981383058	0.0725377426	0.0070769337672323	0.0136348860489712	0.1106470531311709	0.0010113428211259	0.0114022754308101	0.0010113428211259	0.0119651563761333	0.2697040425730557	0.543857088030933	0.0200589490641209	0.0392070017561199	0.0200589490641209	0.0428451989336274	0.0037117288053791	0.2926635787625481	0.0002810907806277	0.029801860640352	0.0002810907806277	0.0322598579515479	0.0638803307088247	0.0013302663140832	0.0638803307088247	0.0013707010147144	C5ORF63	18236	MARCHF3	24712	MEGF10	235527	False	True	True	alt	-85	0.001616	95	0.01343
3359	chr5	127073496	C	G	rs13154281	-0.045412638	0.0399533788328732	0.045412638	0.0376639128020575	0.0225311851078798	0.0154409207898974	-0.0010477800883348	0.0127292101798992	0.0010477800883348	0.0120493490969347	0.7349184120167221	0.0092836081251855	-0.0334677516980887	0.0129180394187903	0.0334677516980887	0.0119866970991448	0.016548204202219	0.0022965693246103	-0.0007713658640235	0.0066512030381843	0.0007713658640235	0.0062529887757407	-0.0072697849562754	0.2806790314249591	0.0072697849562754	0.2726934500798386	C5ORF63	10	MARCHF3	42938	MEGF10	217301	True	True	False	ref	-50	0.00775	-50	0.04443
3360	chr5	127091854	G	A	rs2191209	-0.0270056638	0.1212647293901114	0.0270056638	0.1145310866053385	0.0100111904622694	0.3042990935469178	-0.0002778449131499	0.1153319997698732	0.0002778449131499	0.1095111183927241	0.1999024886150271	0.6459840979109752	-0.0056726395993171	0.2338183891133737	0.0056726395993171	0.2230086274809328	0.002043163530604	0.5614883351626323	-5.965762918940271e-05	0.2141420080590616	5.965762918940271e-05	0.2042964137953049	-0.0240292949096982	0.0441941143461098	0.0240292949096982	0.0430956677834321	C5ORF63	18348	MARCHF3	61296	MEGF10	198943	False	False	False	ref	100	0.001297	-95	0.03482
3361	chr5	127092895	C	T	rs7731621	-0.047537129	0.0336560551609155	0.047537129	0.0314667902590884	0.0099639307733354	0.298210642711546	-0.0004797690648353	0.0477724010714973	0.0004797690648353	0.0449688713657866	0.3213103870372099	0.460704065759967	-0.0154033633706677	0.0716856451650676	0.0154033633706677	0.0665528156034111	0.0032148464701643	0.3711301748531709	-0.000156191709391	0.0750130481643017	0.000156191709391	0.0701843269701243	-0.0355107418126743	0.0145324318273137	0.0355107418126743	0.0141102932055916	C5ORF63	19389	MARCHF3	62337	MEGF10	197902	False	False	False	ref	-10	0.0005646	-10	0.015015
3362	chr5	127115607	G	A	rs13190493	-0.00319174824	0.718526864461184	0.00319174824	0.7050723329880717	0.0083193472634036	0.5326851708577761	-2.6417938949488606e-05	0.7214705816850376	2.6417938949488606e-05	0.7081974328337983	0.2302783223892363	0.6084617535688949	-0.0007364767531856	0.6712743241388412	0.0007364767531856	0.657162222107012	0.0019170800733793	0.6219799653733146	-6.098822191390582e-06	0.6778594531083277	6.098822191390582e-06	0.6639008962543872	-0.0028174566126204	0.5682621173834703	0.0028174566126204	0.5561963251968012	C5ORF63	42101	MARCHF3	85049	MEGF10	175190	False	False	False	ref	-50	0.000492	90	0.04706
3363	chr5	127172658	T	C	rs248081	0.021875832	0.142372736285782	0.021875832	0.1500947195854509	0.0093498626140895	0.3823209223046367	0.0002100133112828	0.1470752101661946	0.0002100133112828	0.1540880696466978	0.4119856015103891	0.3086154447776578	0.0091020795059881	0.1252260186901116	0.0091020795059881	0.1332184830670635	0.0038635590323263	0.2639963110354993	8.785114245964203e-05	0.1279315985434181	8.785114245964203e-05	0.1352070567670101	0.0115250158196661	0.1576287725420421	0.0115250158196661	0.1627960277287598	C5ORF63	99152	MEGF10	118139	MARCHF3	142100	False	False	False	alt	100	0.00241	90	0.069
3364	chr5	127175105	A	G	rs248090	0.0448467374	0.0363465593420664	0.0448467374	0.03900016348183	0.0123641904312565	0.1500066631342355	0.0005708744188288	0.0331908723576775	0.0005708744188288	0.0353764992310279	0.0687476011161941	0.876477156871759	0.0032931890362579	0.3363505305831787	0.0032931890362579	0.3484280720534302	0.000859100224931	0.8239232431998462	4.194719453012717e-05	0.2702318439924405	4.194719453012717e-05	0.2813244194402914	0.0293861969522504	0.0292833663239116	0.0293861969522504	0.0301161424876143	C5ORF63	101599	MEGF10	115692	MARCHF3	144547	False	False	False	alt	30	0.0006256	-50	0.02466
3365	chr5	127182851	A	G	rs248104	0.1016761972	0.0018456603988379	0.1016761972	0.0019285206963476	0.021993071362562	0.0175789670929051	0.0022462292245106	0.0029849759385531	0.0022462292245106	0.0031072114767256	0.5711428541789852	0.0762129052472888	0.0580823656174612	0.0015442136872724	0.0580823656174612	0.001636485771261	0.0125385404249851	0.0058026695306079	0.0012810983571025	0.0023843190189412	0.0012810983571025	0.0025072103846973	0.0201807072687475	0.0663606546999864	0.0201807072687475	0.0682722262629447	MEGF10	107946	C5ORF63	109345	MARCHF3	152293	False	True	True	alt	25	0.001831	-45	0.04126
3366	chr5	127185450	G	A	rs248115	-0.036269678	0.0700850336612124	0.036269678	0.0657144607959243	0.0101275409859456	0.2910565447577824	-0.0003640778297838	0.0725704259790886	0.0003640778297838	0.0684589053612635	0.3401114119441072	0.4337550049745633	-0.0124908899722746	0.1000066181608107	0.0124908899722746	0.0931794317965466	0.0034286037234801	0.3457828806858369	-0.0001247631893959	0.0963223638602281	0.0001247631893959	0.0902819900899837	-0.0259006836170499	0.0401296137942375	0.0259006836170499	0.0391504162400465	MEGF10	105347	C5ORF63	111944	MARCHF3	154892	False	False	False	ref	90	0.01065	-15	0.04465
3367	chr5	127185845	G	T	rs248116	0.00739386452	0.4312150812030939	0.00739386452	0.4435179404155694	0.0357589182732133	0.0018931739496719	0.0002764822586246	0.1091221413141809	0.0002764822586246	0.1149130886803309	0.212504279090032	0.6344678397586507	0.0017079316014089	0.4726227019794262	0.0017079316014089	0.4860367467990439	0.0077384657248157	0.0386127116663579	6.424863654959081e-05	0.18907581453111	6.424863654959081e-05	0.1985473677022372	0.006912934781481	0.2837807463019433	0.006912934781481	0.2922467496809549	MEGF10	104952	C5ORF63	112339	MARCHF3	155287	False	True	True	alt	-100	0.01274	75	0.0768
3368	chr5	127185953	C	T	rs248117	0.003405614948	0.6871905165379157	0.003405614948	0.7005808924055185	0.0063695453177203	0.8946997347073318	2.151692155939536e-05	0.7575983625135123	2.151692155939536e-05	0.7711894099699435	0.1800495855766138	0.6859975451711077	0.0006227186380056	0.6898606079643093	0.0006227186380056	0.7036176122884613	0.0011344163079274	0.7639748288036388	3.894152398079848e-06	0.7406515966140459	3.894152398079848e-06	0.7545449724618866	0.003153559684229	0.5291702054266094	0.003153559684229	0.5410823534866501	MEGF10	104844	C5ORF63	112447	MARCHF3	155395	False	False	False	alt	100	0.00621	-35	0.01172
3369	chr5	127191359	A	G	rs1860439	-0.0026121189	0.6316753155718152	0.0043095153399999	0.6282003004483265	0.0071690821616024	0.7385277090913952	-2.048936481001312e-05	0.6692131163199324	3.199981888555717e-05	0.6659914789667452	0.3241236942291933	0.4514116774090871	-0.0006411116654991	0.5743532803388235	0.0012689808462746	0.5717547625087938	0.0023165837788973	0.5431462353518572	-5.079349019302253e-06	0.6045666391642357	9.331974977972905e-06	0.6018268556160575	-0.0024398593346403	0.5485424702133775	0.0036307430575005	0.5456303331391047	MEGF10	99438	C5ORF63	117853	MARCHF3	160801	False	False	False	ref	100	0.003798	50	0.05682
3370	chr5	127192961	A	G	rs173555	0.101749263	0.0017702915402445	0.101749263	0.0018280913667126	0.0292505414273221	0.0050883845709206	0.0029722743773568	0.0018987688961551	0.0029722743773568	0.0019709216125529	0.3750204877643958	0.3796451874664067	0.0381790660557675	0.0065366964886505	0.0381790660557675	0.0071106956765586	0.0109494746086284	0.0098879027963358	0.0011130520463083	0.0029218453791027	0.0011130520463083	0.0030598434484823	0.069672921918277	0.0009799275357954	0.069672921918277	0.001006186056671	MEGF10	97836	C5ORF63	119455	MARCHF3	162403	False	True	True	alt	-25	0.000717	-95	0.0329
3371	chr5	127194980	T	C	rs248127	0.0195348834	0.1738263637683373	0.0195348834	0.1826980729126098	0.0083944865278911	0.5085467990106194	0.0001675656733724	0.2020286953739369	0.0001675656733724	0.2105966350801414	0.1597443956887519	0.7223372128434833	0.0030347615177913	0.3352968859589858	0.0030347615177913	0.347593781005295	0.0013356017673584	0.7347212729387735	2.582448667599664e-05	0.3518988415038516	2.582448667599664e-05	0.363626242079702	0.0184669965456072	0.073751348918006	0.0184669965456072	0.0759732931480786	MEGF10	95817	C5ORF63	121474	MARCHF3	164422	False	False	False	alt	-35	0.00862	-60	0.02014
3372	chr5	138545415	T	C	rs188731	-0.00698929526	0.4802413610717474	0.00698929526	0.4679617131906906	0.0102900602487189	0.2885551668693747	-7.496871725213802e-05	0.4354743856777122	7.496871725213802e-05	0.4242432856297861	0.195881700017635	0.6646921180267078	-0.0013643682340092	0.5437459655323649	0.0013643682340092	0.5301204709844065	0.0019893760799883	0.609941207327105	-1.4473065233714532e-05	0.5079033245542568	1.4473065233714532e-05	0.4949272833178589	-0.0068071245552339	0.2971437498672929	0.0068071245552339	0.2888324031833313	ETF1	2179	HSPA9	30260	CTNNA1	65553	False	False	False	ref	85	0.012985	100	0.03021
3373	chr5	138547009	T	C	rs187653	-0.0192782038	0.1999249970847847	0.0192782038	0.1914393177505869	0.0148230594469193	0.0825216980771196	-0.000328950802673	0.1186250430770463	0.000328950802673	0.1132243634976131	0.0788970839946471	0.8506857947958274	-0.0015322248704638	0.5268559232549861	0.0015322248704638	0.5130078460868144	0.0011513450923848	0.7564478497059194	-2.5363101674778068e-05	0.4062171172000305	2.5363101674778068e-05	0.3937618299880128	-0.0139275303685722	0.1327174681994033	0.0139275303685722	0.1289172660891078	ETF1	3773	HSPA9	28666	CTNNA1	63959	False	False	False	ref	0	0.0	95	0.01196
3374	chr5	139487202	A	G	rs6421150	0.0552551294	0.0175355106184112	0.0552551294	0.0186969538108174	0.0152684270622629	0.0736814884406101	0.0008848834117047	0.016297300195824	0.0008848834117047	0.0171120095637385	0.5132667351321072	0.153661640153388	0.0285656768951094	0.0157479946888288	0.0285656768951094	0.0171428086834012	0.0078767139738973	0.0328793675852622	0.0004588350047797	0.0139991052123112	0.0004588350047797	0.0149554805883894	0.0161225738856211	0.0918619211047736	0.0161225738856211	0.0945988521340155	STING1	4267	SMIM33	16197	ECSCR	24459	False	True	False	alt	-80	0.001489	-45	0.01001
3375	chr5	139578493	T	C	rs355163	0.00024687696	0.7889163527660638	0.00202884732	0.7923985911853979	0.0081252010729991	0.5766022950048653	-6.030468817013742e-07	0.7886388560976899	1.770713129345832e-05	0.7917172844442053	0.1077604539466176	0.8103446801147907	1.4893565966604942e-06	0.8345829815158505	0.0002173240973028	0.8383855467429845	0.0008829502914073	0.8209489337761129	-2.8687989030191924e-07	0.8375928284131994	1.92882003630185e-06	0.8414017028502806	0.0002095457421757	0.6611953368991179	0.0019730495129616	0.6642052978646968	UBE2D2	52061	CXXC5	68807	STING1	95558	False	False	False	alt	15	0.007187	-35	0.0323
3376	chr5	139686403	T	G	rs9687282	-0.00856830498	0.423345155865677	0.00856830498	0.4113172193884561	0.0094582636442013	0.3658504211528616	-8.108365059907508e-05	0.4149412186611967	8.108365059907508e-05	0.4036808351823765	0.375620079046463	0.3692137197900152	-0.0032029027526813	0.3562333863139584	0.0032029027526813	0.34412258033777	0.0035156269388241	0.3247920114062819	-2.9946476299165308e-05	0.345496315671828	2.9946476299165308e-05	0.334068591191632	-0.0052552412369422	0.3905442054046067	0.0052552412369422	0.3804863864887327	CXXC5	39103	PSD2	109406	UBE2D2	159971	False	False	False	ref	60	0.0009155	-100	0.04614
3377	chr5	139857377	C	T	rs4912894	0.00508347842	0.5164809912185871	0.00611188738	0.5240839802926544	0.0082795027591941	0.5169172527979866	3.766482465670072e-05	0.5422867902287253	4.825226815637614e-05	0.5490325980171092	0.419340449589726	0.306973636533541	0.0021442800647518	0.3878802567429304	0.0025685031565933	0.3953450509050975	0.0034643726747317	0.3272890527969206	1.5870775795930303e-05	0.4091872401429716	2.023814154417036e-05	0.4157742481643575	0.002475129410056	0.5372085981091087	0.0030311517754333	0.5443952259193526	PSD2	61568	NRG2	185922	CXXC5	210077	False	False	False	alt	-80	0.006393	-95	0.142
3378	chr5	140679308	C	T	rs2073512	-0.0053958155999999	0.5752864943967018	0.0053958155999999	0.5622853716079185	0.0084533323591425	0.512854852987708	-4.635746594622096e-05	0.5842462220067369	4.635746594622096e-05	0.5717155270904363	0.3929252378136702	0.3506002945494721	-0.0021425674865038	0.4527109882049769	0.0021425674865038	0.4396053954729203	0.0033226838285036	0.3685616126830814	-1.8411933603909435e-05	0.4620435026131584	1.8411933603909435e-05	0.44942626837479	-0.0028319795848504	0.5706857199085126	0.0028319795848504	0.5587805978855775	DND1	5732	HARS2	12123	HARS1	12229	False	False	False	ref	100	0.003723	95	0.0461
3379	chr5	140729085	G	T	rs12186884	-0.00398607664	0.6750949590506393	0.00398607664	0.6617345106126574	0.0191577748873837	0.0321508407140112	-7.250105809214643e-05	0.4440412844210869	7.250105809214643e-05	0.43275224012913	0.0254255749540969	0.9540793049601684	-0.0001016143556879	0.9296713434915542	0.0001016143556879	0.915585871043322	0.000492093527169	0.8983055829056702	-1.878507869760766e-06	0.8690727579832382	1.878507869760766e-06	0.8546725639414361	-0.0014108030166287	0.7554279858081737	0.0014108030166287	0.7421062049558205	ZMAT2	30404	HARS1	37548	HARS2	37654	False	False	False	ref	-70	0.00505	95	0.01967
3380	chr5	140733127	C	T	rs801174	-0.04391933	0.0424225303549035	0.04391933	0.0396833204620696	0.0107937074353093	0.2478607336246818	-0.0004880699008871	0.0480983052747238	0.0004880699008871	0.0452686973831451	0.3878919905808151	0.3571919856030413	-0.0172545744391968	0.0605097055834426	0.0172545744391968	0.0558868192254263	0.0042100305480063	0.2283012544647965	-0.0001928336699406	0.0588045430239921	0.0001928336699406	0.0547954608644788	-0.0258571147003599	0.0385077854376366	0.0258571147003599	0.0375273099209091	ZMAT2	34446	HARS1	41590	HARS2	41696	False	False	False	ref	70	0.005154	90	0.05896
3381	chr5	140767663	T	C	rs12659129	0.00073370278	0.7853351206848213	0.0022093578199999	0.7900443590419528	0.0085564328924311	0.4837488977658889	7.308815810153746e-06	0.7758780527137451	1.870181707640348e-05	0.7807053869213774	0.0156495399329868	0.9709282938086712	9.388775499962e-06	0.9538267272598994	2.8360024950740644e-05	0.9585183728667112	0.0001376001134649	0.9695960914536628	1.0028261282362609e-07	0.9519563772344508	2.496376262674932e-07	0.9567127999043662	0.0001908733493085	0.865250110114405	0.00060996483366	0.8700830191974386	PCDHA1	18474	PCDHA2	27190	PCDHA3	33366	False	False	False	alt	100	0.002232	40	0.03693
3382	chr5	140776679	T	C	rs7710380	0.0595108774	0.0137930503594131	0.0595108774	0.0147653919039411	0.0128542997380365	0.1431285069694532	0.000791232707501	0.0177316698465947	0.000791232707501	0.0188166520283263	0.4108943038828204	0.3142354621350977	0.0246432996648144	0.0234281187169392	0.0246432996648144	0.0256222732581426	0.0053220168214077	0.1214210957092534	0.0003302262259406	0.022406282279327	0.0003302262259406	0.0241937349540909	0.0324194234380024	0.0212129582244354	0.0324194234380024	0.0218344015337499	PCDHA1	9458	PCDHA2	18174	PCDHA3	24350	False	True	False	alt	-45	0.001474	-65	0.08215
3383	chr5	140785333	T	C	rs1548699	0.0017842561639999	0.8021204465959669	0.002063658004	0.8118669360569807	0.0129865736058985	0.1301129038717997	2.5580065015907008e-05	0.7065678080454284	2.860577637573323e-05	0.7163269811032853	0.0425294868204026	0.9254506771128688	0.0001406617972716	0.902143747003842	0.000143554389979	0.9126401344984476	0.0005696399982764	0.8828700127073447	1.940945330623757e-06	0.8739246237362229	1.972269928774221e-06	0.8837479783813447	0.0010186827664187	0.7998331988214857	0.0010767746553387	0.8095480636101635	PCDHA1	804	PCDHA2	9520	PCDHA3	15696	False	False	False	alt	70	0.0004768	-90	0.01628
3384	chr5	140793333	T	C	rs13184940	0.0245723902	0.1327885633929396	0.0245723902	0.140422022255923	0.0074833171721815	0.6741257854623424	0.0001928926238008	0.1817657980674987	0.0001928926238008	0.1897695292978537	0.2400211620452494	0.5935018931160871	0.0062386909201157	0.2049620408929998	0.0062386909201157	0.2155714138241244	0.0018316342205682	0.6426939388272591	4.966462616078176e-05	0.2436332914734149	4.966462616078176e-05	0.2540729148438032	0.0212533325034491	0.055617448147399	0.0212533325034491	0.0570996105102475	PCDHA2	1520	PCDHA1	7196	PCDHA3	7696	False	False	False	alt	90	0.01317	-90	0.0867
3385	chr5	140800976	A	G	rs3756338	0.0698412148	0.0090117128037623	0.0698412148	0.0095424664320716	0.0137249115066216	0.119505224691269	0.0010632616663519	0.0145298092739429	0.0010632616663519	0.0153147678696653	0.5407338250396788	0.1068560306723188	0.0386589864239161	0.0075347294286952	0.0386589864239161	0.0081478811956511	0.0075432875704664	0.0423743586055627	0.0005959831529243	0.0117212865222468	0.0005959831529243	0.0125332221965022	0.0158549362545254	0.1014629608887822	0.0158549362545254	0.1045008904172342	PCDHA3	53	PCDHA4	6062	PCDHA2	6123	False	True	True	alt	-45	0.004036	10	0.002869
3386	chr5	140801152	C	T	rs3806845	-0.002123700042	0.7118667478598111	0.0035130906419999	0.7062912812354895	0.0240857522197877	0.0115015115544447	-4.444070873642678e-05	0.4498736780442473	7.838791929980634e-05	0.4437106811954172	0.5853815910953434	0.05916661869284	-0.0012453425490323	0.4991625788633	0.0020674984650715	0.4918838263534895	0.0141504856019215	0.0038283078157762	-2.615514404238177e-05	0.2959554389953831	4.624301561954398e-05	0.2904728370831984	-0.0003589248851128	0.8876741549901209	0.0005912924407928	0.8829090177473813	PCDHA3	123	PCDHA4	5886	PCDHA2	6299	False	True	False	ref	100	0.004776	-25	0.05322
3387	chr5	140821679	C	T	rs4151682	-0.0302771714	0.1049508863813822	0.0302771714	0.0989412154670481	0.0101135192288895	0.2983908587728267	-0.0003164214468171	0.1009670406547885	0.0003164214468171	0.0957434363960845	0.6079440658098113	0.0410541031098873	-0.0184220439611741	0.0535133276048838	0.0184220439611741	0.0493427908504814	0.0061347249811198	0.076139365175515	-0.0001919884738753	0.0583563909085251	0.0001919884738753	0.0543281344796093	-0.0037801222004377	0.4753994354214927	0.0037801222004377	0.4641889639085923	PCDHA5	74	PCDHA6	6280	PCDHA7	12570	False	False	False	ref	100	0.02167	100	0.06116
3388	chr5	140821835	T	C	rs11958868	0.0344563502	0.0693040604771165	0.0344563502	0.0741149365192795	0.0089468379501196	0.4367854153534471	0.0003215289072488	0.0893824866941074	0.0003215289072488	0.0945536137700401	0.6315770910486623	0.0272413061088205	0.0217591588605995	0.031727684932895	0.0217591588605995	0.0346913879404183	0.0056321391328686	0.1017768134202627	0.000202312738521	0.0479532467294211	0.000202312738521	0.051766162446446	0.0033921513708648	0.4868436488794314	0.0033921513708648	0.4981458010917725	PCDHA5	230	PCDHA6	6124	PCDHA7	12414	False	False	False	alt	100	0.01875	100	0.1245
3389	chr5	140831031	G	A	rs10038174	-0.0429092658	0.0470301530409881	0.0429092658	0.0440446186864426	0.0095600233174206	0.3638801275716697	-0.0004351922269388	0.0642848013076371	0.0004351922269388	0.0606552504411524	0.193338105167066	0.6641005615830011	-0.0086652446655959	0.1636583412728562	0.0086652446655959	0.1546028179176373	0.0019203062993037	0.619520180376613	-9.148974256541266e-05	0.1607036241062567	9.148974256541266e-05	0.1526465289525744	-0.0394236454735007	0.0113532056887556	0.0394236454735007	0.011032937458658	PCDHA6	3072	PCDHA7	3218	PCDHA5	9426	False	False	False	ref	65	0.00713	0	0.0
3390	chr5	141038323	T	C	rs35123355	-0.0011856112948	0.7765595107686649	0.0023001565052	0.772842290111866	0.0269444040659878	0.0066963016448002	-4.284105874321399e-05	0.4735582077520029	6.564037417102853e-05	0.4688412651769345	0.0725132003444018	0.8735478349343113	-0.0001063224623307	0.8635686883297782	0.0001981787815146	0.8601445465690177	0.0020564317349109	0.5652828860821951	-4.090557370509229e-06	0.7118784424229597	5.969312646905256e-06	0.7075354677336849	-0.0010352804489673	0.6862717912012021	0.0018693139970331	0.6819879282922233	PCDHB1	13052	PCDHB2	56284	PCDHB3	62151	False	True	True	ref	100	0.0121	-100	0.02673
3391	chr5	141040639	C	T	rs31745	0.01111074088	0.3249392584926348	0.01111074088	0.3364861688195114	0.0144471023444845	0.0906780087631396	0.000166851457555	0.2094399927022812	0.000166851457555	0.2181144315178946	0.6714509486612932	0.0157988302946623	0.0074397941643533	0.1645493145902936	0.0074397941643533	0.1742175922883034	0.0097233932668302	0.0145233036480484	0.0001119823440497	0.1050922332989099	0.0001119823440497	0.1119626076503803	0.0011224182823472	0.7752573022982309	0.0011224182823472	0.7888252098956823	PCDHB1	10736	PCDHB2	53968	PCDHB3	59835	False	False	False	alt	55	0.00579	-100	0.03864
3392	chr5	141049461	A	G	rs34907800	0.040874616	0.0476445588896109	0.040874616	0.0508418808298794	0.0098132201111112	0.3411000692813981	0.0004309288392579	0.059650614074386	0.0004309288392579	0.0632247502555608	0.1563024512702414	0.7263292856183733	0.0075751534243567	0.1883318879968337	0.0075751534243567	0.1986611570321243	0.0017073939967977	0.6519519254974339	8.735145989733678e-05	0.1782762301167064	8.735145989733678e-05	0.1872293976628073	0.0362991317337316	0.0153724638979854	0.0362991317337316	0.0157280911110217	PCDHB1	1914	PCDHB2	45146	PCDHB3	51013	False	False	False	alt	-100	0.00224	0	0.0
3393	chr5	141086238	A	G	rs31860	0.0046052014	0.6221397014055582	0.0046052014	0.6358275110945045	0.0087946546147006	0.4668234206730721	3.795162719136499e-05	0.6301391085385865	3.795162719136499e-05	0.6434256942962651	0.2953080426145499	0.5003244529775711	0.0012840027062677	0.5583928879296177	0.0012840027062677	0.5720588734758936	0.0026744695867073	0.4708388365028956	1.1090172550044854e-05	0.5616864305242314	1.1090172550044854e-05	0.5750312691966469	0.0033817778192719	0.4979079163772686	0.0033817778192719	0.5091839322167567	PCDHB2	8369	PCDHB3	14236	PCDHB1	34863	False	False	False	alt	30	0.000637	-40	0.01996
3394	chr5	141086467	G	A	rs31859	0.0077505100999999	0.4210140796235181	0.0077505100999999	0.4330867873118351	0.0123661807918407	0.1537155021978214	9.600525333784228e-05	0.335039752064608	9.600525333784228e-05	0.3454342731821959	0.274915714893308	0.5315981896684095	0.002186430475701	0.4177961921124106	0.002186430475701	0.4306532223945777	0.0034509439190799	0.3381051259883588	2.749680875639244e-05	0.3471245656433065	2.749680875639244e-05	0.3586394317763294	0.006118320729468	0.3013215902620091	0.006118320729468	0.3102838315163543	PCDHB2	8140	PCDHB3	14007	PCDHB1	35092	False	False	False	alt	85	0.001987	-85	0.0811
3395	chr5	141087672	T	A	rs35110655	-0.0047156578199999	0.6083607828203005	0.0047156578199999	0.5951133873061786	0.0067188454653699	0.8250227169963887	-3.08700760303303e-05	0.6780723059314142	3.08700760303303e-05	0.6648836461035292	0.0848120831128953	0.8518214114441158	-0.0003948619992792	0.7806349886716167	0.0003948619992792	0.7666046072627597	0.0005634817463377	0.8841838763997869	-2.5521151981638377e-06	0.8144458903151137	2.5521151981638377e-06	0.8002363599912665	-0.0038278405377648	0.4688522224435302	0.0038278405377648	0.4580507566090208	PCDHB2	6935	PCDHB3	12802	PCDHB4	34147	False	False	False	ref	50	0.001753	-75	0.02692
3396	chr5	141092802	A	G	rs34580312	-0.001653130116	0.8585469102194723	0.001653130116	0.8446598887261673	0.0065911982744637	0.8355298383940771	-1.1380711576719092e-05	0.8896245404295193	1.1380711576719092e-05	0.8757249727090144	0.0268426021016814	0.947654766351404	-4.84089191405338e-05	0.9654399163858132	4.84089191405338e-05	0.9513556406749172	0.0001741038219315	0.9603375180310738	-3.3249327617383885e-07	0.9744980157480648	3.3249327617383885e-07	0.9604130979716669	-0.0007593439765972	0.869734849119553	0.0007593439765972	0.8559539762303323	PCDHB2	1805	PCDHB3	7672	PCDHB4	29017	False	False	False	ref	100	0.0096	100	0.03503
3397	chr5	141095172	G	A	rs31853	-0.066597368	0.0100724728052068	0.066597368	0.0095078038553373	0.0132960623284642	0.1197625265470112	-0.0009267324373371	0.0157243733704473	0.0009267324373371	0.0149467462295107	0.6331642444423696	0.0265043848400506	-0.0423419913483912	0.005267904510546	0.0423419913483912	0.0049374269135629	0.0084413880246315	0.0259309398322503	-0.0005906343699791	0.0101567255706563	0.0005906343699791	0.0095783057106188	-0.0065747569995538	0.2974909372911604	0.0065747569995538	0.2890966206145151	PCDHB2	565	PCDHB3	5302	PCDHB4	26647	False	True	True	ref	-65	0.0195	-100	0.08307
3398	chr5	141099537	A	C	rs13183611	-0.0001427517160999	0.8718223161247391	0.0012796778480999	0.8785180116487067	0.0066218021125389	0.8488717970852562	-1.5829237978161789e-06	0.8911530570538968	8.690686370142854e-06	0.8980146306106103	0.194738534632102	0.66418324836873	8.596427463967701e-06	0.8363796176366153	0.0002202808680468	0.8432016728238593	0.0012735949827384	0.7434092353913287	-5.74469378329056e-08	0.857548088384952	1.4713896278289142e-06	0.8644613481651469	-2.074710318579931e-06	0.7730954680261258	0.0011307171236215	0.778821694946702	PCDHB3	937	PCDHB2	4930	PCDHB4	22282	False	False	False	ref	100	0.006172	-100	0.01213
3399	chr5	141100595	T	G	rs1055410	0.061149177	0.0127242416814731	0.061149177	0.0136091172409473	0.0123326954792345	0.1531610026374623	0.0007675691712474	0.0178918095551977	0.0007675691712474	0.0189800280756138	0.6684467681200011	0.0165947416269517	0.040970001748763	0.0053478213578921	0.040970001748763	0.0057473371489169	0.0082763082277852	0.0267018728677787	0.0005163232706411	0.0104038032661706	0.0005163232706411	0.0111038188155838	0.0066618948329339	0.2828833512633241	0.0066618948329339	0.291374723779651	PCDHB3	121	PCDHB2	5988	PCDHB4	21224	False	True	False	alt	-100	0.065	-70	0.2651
3400	chr5	141107252	G	A	rs34535102	0.00813348824	0.4187435737639675	0.00813348824	0.4308377401110937	0.0064348447225984	0.8669503721066792	5.367628428868855e-05	0.5184907249070844	5.367628428868855e-05	0.5307893495464691	0.280768472701999	0.5270855349083698	0.0022490324895964	0.4128585546687092	0.0022490324895964	0.4257223195896477	0.0018199842614527	0.6404547245359071	1.5029979660452232e-05	0.4819574390246638	1.5029979660452232e-05	0.4946446379900447	0.0065809811305095	0.2921017491908441	0.0065809811305095	0.300795621527685	PCDHB3	6778	PCDHB2	12645	PCDHB4	14567	False	False	False	alt	25	0.00074	55	0.02744
3401	chr5	141123949	C	T	rs17844417	-0.0382113714	0.0600598502513203	0.0382113714	0.0563114940002975	0.0119998171442624	0.1840420461369536	-0.0004654357462995	0.0506138839845997	0.0004654357462995	0.0477219340063424	0.658608491789334	0.0189330810994811	-0.0252674949485974	0.0258090226957023	0.0252674949485974	0.0237539245110691	0.0079415819194814	0.0325025716289514	-0.000309227335718	0.0278299794823531	0.000309227335718	0.0258881151463931	-0.0037448521250219	0.4757760288162752	0.0037448521250219	0.4646493959526848	PCDHB4	2130	PCDHB5	11258	PCDHB3	23475	False	False	False	ref	-100	0.003674	10	0.02911
3402	chr5	141128290	A	G	rs74601574	-0.0009527629399999	0.8335372050330976	0.00185970554	0.8246746619641482	0.0204498512403	0.0241049886209155	-2.2609160415735467e-05	0.6273134661329641	3.895142011534841e-05	0.6192344384567755	0.0515275054720483	0.9077642016112342	-6.968798236035299e-05	0.9126606994004046	0.0001135208599473	0.9036157844082168	0.0010888491905682	0.7776215200115101	-1.665098471243236e-06	0.8317729253394367	2.4549260414513986e-06	0.8228082867349776	-0.0006991773773586	0.7792854644954026	0.0012510503220987	0.7706187471517733	PCDHB4	6471	PCDHB5	6917	PCDHB6	21768	False	False	False	ref	-90	8.583e-05	-80	0.01685
3403	chr5	141129143	A	C	rs35737105	0.0477322157999999	0.0288994232427373	0.0477322157999999	0.0310337733933783	0.0128976631528782	0.1304557675306748	0.0006164032062238	0.0260879202430745	0.0006164032062238	0.0278570706808688	0.0730899698129648	0.8678280851263646	0.0036532090200949	0.3078760437974802	0.0036532090200949	0.3200217946995991	0.0009209224588424	0.8102779630660564	4.594623744202451e-05	0.2411249179038513	4.594623744202451e-05	0.2517273818497399	0.0323717051006752	0.0216009986479667	0.0323717051006752	0.0222487766497936	PCDHB5	6064	PCDHB4	7324	PCDHB6	20915	False	False	False	alt	100	0.002747	-100	0.01727
3404	chr5	152478563	A	G	rs3864272	0.00065634256	0.6762240269821507	0.0034607851199999	0.6796545507439883	0.006882166004689	0.7946985463432594	2.66977488950772e-06	0.7390405294778263	2.260878140013117e-05	0.7422372889482554	0.0885112916109087	0.8415888413909519	5.634147206439984e-06	0.7860502085351339	0.0003330450911315	0.789465072453609	0.000606562740004	0.8736479112161872	-1.3369528795042056e-07	0.817898490908376	2.181939803012785e-06	0.8213980981643484	0.0005103787383686	0.5517491372871864	0.0029253415491861	0.5546877124213899	NMUR2	45195	GLRA1	553712	ATOX1	706031	False	False	False	alt	85	0.01599	65	0.02274
3405	chr5	152593173	T	C	rs12657267	-0.005615917	0.5681133219227144	0.005615917	0.5552631618636974	0.0056655684761076	0.9652756238996174	-3.148523286019518e-05	0.6938718407769318	3.148523286019518e-05	0.6806844316589632	0.17459309743877	0.6941649888999355	-0.0010390720710367	0.6288419459776059	0.0010390720710367	0.6152322528260762	0.0009972623237363	0.7971888957601738	-5.865630645504352e-06	0.7110250532368811	5.865630645504352e-06	0.6973505782991397	-0.0051079368043236	0.4033823998452807	0.0051079368043236	0.3931964272508043	NMUR2	159805	GLRA1	668322	ATOX1	820641	False	False	False	ref	100	0.00872	-75	0.04663
3406	chr5	152642535	G	A	rs17454953	-0.0511129084	0.0260702945412987	0.0511129084	0.0244039929775554	0.0110114823493823	0.2283940914889358	-0.0005747072928562	0.0338196586278133	0.0005747072928562	0.0318188067595162	0.3840662247533688	0.3580953672655155	-0.0198548242941627	0.0461415872102932	0.0198548242941627	0.0424913340926877	0.0042570359856334	0.2232082144379704	-0.0002246695682038	0.0459559331511417	0.0002246695682038	0.0427592554292904	-0.0304857934210935	0.0230109768074862	0.0304857934210935	0.022397237274513	NMUR2	209167	GLRA1	717684	GRIA1	847081	False	False	False	ref	100	0.0394	-100	0.05066
3407	chr5	152676834	T	C	rs17455625	-0.018970702	0.208387003828917	0.018970702	0.1991084387545461	0.020864609651432	0.0224370894636018	-0.0004118493734945	0.0678130517631952	0.0004118493734945	0.0640690687154955	0.2039502484465606	0.6522555477748115	-0.0038794856511047	0.3123808210707927	0.0038794856511047	0.3007324780327428	0.0042163817185412	0.2295218001232416	-8.313208545000219e-05	0.160520575165495	8.313208545000219e-05	0.1521468135726024	-0.0181225946327243	0.0901850297341748	0.0181225946327243	0.0876866051152849	NMUR2	243466	GLRA1	751983	GRIA1	812782	False	False	False	ref	10	0.000246	80	0.02753
3408	chr5	152678555	C	G	rs12657990	0.00507410298	0.5543093829428354	0.00507410298	0.5671368177831909	0.0076293352866352	0.6611395347318169	3.8827152695584414e-05	0.5953481735516116	3.8827152695584414e-05	0.6079936346458367	0.0390273758026535	0.9237146380721506	0.0001742484587108	0.8413724328469849	0.0001742484587108	0.8557392447080795	0.0002916092392988	0.9324892974959852	1.308056054467278e-06	0.8527466229262367	1.308056054467278e-06	0.8671406734317515	0.0022987790329774	0.5984458449657692	0.0022987790329774	0.6108378613271704	NMUR2	245187	GLRA1	753704	GRIA1	811061	False	False	False	alt	-45	0.000944	-50	0.00887
3409	chr5	152699630	G	C	rs77257050	0.0273421762	0.1187011945237157	0.0273421762	0.1252829451513553	0.0089251032034777	0.4359393612915941	0.0002619634863109	0.1350734798917962	0.0002619634863109	0.1417335999154607	0.095065301507277	0.8343285960652131	0.003312839543006	0.3815732097778384	0.003312839543006	0.3947144865054222	0.000912654439254	0.8173956287825102	3.324213353186724e-05	0.3759861825267642	3.324213353186724e-05	0.3883381149370016	0.0226081183414765	0.0678645971254913	0.0226081183414765	0.0698265488101069	NMUR2	266262	GLRA1	774779	GRIA1	789986	False	False	False	alt	-70	0.005627	30	0.007416
3410	chr5	152706014	A	C	rs4133347	-0.0111316405	0.3313133749689196	0.0111316405	0.3201786764231313	0.0220086809386024	0.017349881628733	-0.0002426279663528	0.1360884201569434	0.0002426279663528	0.1295304478868856	0.0358053506779115	0.9353936690860832	-0.0004026058925819	0.7804792945692658	0.0004026058925819	0.7662574510985557	0.0007740254077107	0.8418104455591902	-8.62989255952311e-06	0.6180296414896315	8.62989255952311e-06	0.6046153599946	-0.0052344941337565	0.3671816325360005	0.0052344941337565	0.3574428215186568	NMUR2	272646	GLRA1	781163	GRIA1	783602	False	True	False	ref	15	0.005486	15	0.002823
3411	chr5	152718002	T	C	rs55737372	0.035031963	0.0669377410739456	0.035031963	0.071484518864855	0.0172224237507677	0.0489374799663857	0.0006323265782475	0.0289449141541256	0.0006323265782475	0.0306699265457755	0.4340916399547713	0.2777690873951032	0.0154273465501718	0.0626069460711822	0.0154273465501718	0.0678854309903233	0.0075550490071492	0.0395049801413789	0.0002806317776564	0.0307423971202378	0.0002806317776564	0.0330416602280546	0.0163839873857612	0.0977883831637548	0.0163839873857612	0.1007307227283135	NMUR2	284634	GRIA1	771614	GLRA1	793151	False	False	False	alt	-45	0.004677	85	0.0213
3412	chr5	152719145	C	G	rs11167589	-0.0047697896799999	0.5559676453659148	0.00529581672	0.545306354689998	0.0090314342271347	0.4021989957918479	-4.419364984969145e-05	0.5367309323357468	4.831636907912497e-05	0.5268643336609097	0.3250075208249048	0.4598028761108473	-0.001435030344777	0.5000228884548842	0.0016298588179773	0.4889742027269134	0.0029300760632839	0.4290038266343223	-1.3333373497375603e-05	0.4852158260566956	1.48603350568077e-05	0.474726842266024	-0.0037137314702434	0.4504785647713371	0.004078880486312	0.4422883933894645	NMUR2	285777	GRIA1	770471	GLRA1	794294	False	False	False	ref	-55	0.0004654	10	0.010864
3413	chr5	152721189	A	G	rs72799143	0.0576674356	0.0160780695579444	0.0576674356	0.0171308002393722	0.0118946802505058	0.1719864806189494	0.0007060801172875	0.0226321025829898	0.0007060801172875	0.0240697858801545	0.4376580669923961	0.2735570327834646	0.0256848703781989	0.0222700314377739	0.0256848703781989	0.0243006999678578	0.0052358763868302	0.1238059813628707	0.0003149260961557	0.0250475404137626	0.0003149260961557	0.0270655166292841	0.0273301590265458	0.0364525206649261	0.0273301590265458	0.037478338465317	NMUR2	287821	GRIA1	768427	GLRA1	796338	False	True	False	alt	-80	0.0019	100	0.01405
3414	chr5	152731277	C	A	rs72799151	0.01668481446	0.2281769259219183	0.01668481446	0.2381816029426962	0.0092051324508808	0.3958593216759596	0.0001631204196016	0.227598121015093	0.0001631204196016	0.2369083666883172	0.0370003838214089	0.933394935529763	0.0007068192278692	0.6632476150791164	0.0007068192278692	0.6769577210982572	0.0003566896209568	0.926726292714508	7.082019990204352e-06	0.6457914317394752	7.082019990204352e-06	0.659416560053971	0.0089378520524071	0.232149646703561	0.0089378520524071	0.2392103275594742	NMUR2	297909	GRIA1	758339	GLRA1	806426	False	False	False	alt	0	0.0	-65	0.02177
3415	chr5	152749963	C	T	rs72799160	0.00115135606	0.777182308634182	0.00211981826	0.781027631943037	0.0196794245544637	0.0304095045396731	2.909101687718167e-05	0.5528353729738783	4.330500255737603e-05	0.5578571116438316	0.0114109067521447	0.9805760120245977	1.852738119963313e-05	0.9615631782257452	2.433945274373107e-05	0.9676955972867426	0.0002561298731212	0.9505855725512198	4.695426374933596e-07	0.931150600919982	5.487625315230524e-07	0.9354922178717234	0.0003298789406528	0.906641277300266	0.0004170167740328	0.9099205665201724	NMUR2	316595	GRIA1	739653	GLRA1	825112	False	False	False	alt	-85	0.007935	55	0.007675
3416	chr5	152759038	A	G	rs56208248	-0.0053473716399999	0.5800130194976723	0.0053473716399999	0.5671608228997871	0.008216529119833	0.5536802347859753	-4.462239702898792e-05	0.5985950520324669	4.462239702898792e-05	0.586095109554061	0.0358177989398229	0.9398923804818572	-0.0002253028567753	0.8710559754259756	0.0002253028567753	0.8569879615776149	0.000313773893588	0.9411976929014734	-1.994512090008912e-06	0.8738491133573358	1.994512090008912e-06	0.8598294137508429	-0.0026452556561789	0.6115869670377458	0.0026452556561789	0.5991442612576284	NMUR2	325670	GRIA1	730578	GLRA1	834187	False	False	False	ref	10	0.0003748	10	0.001369
3417	chr5	152770806	G	A	rs56286804	-0.001066534666	0.713792874863034	0.002874156066	0.7088731253964361	0.005567743235184	0.9608168654840296	-5.525715791878724e-06	0.8041558819372868	1.6254576898807507e-05	0.7996499625625499	0.0591914853888525	0.900506379456737	-9.294362403574024e-05	0.8807043622743006	0.0001699399835143	0.8764948033153926	0.000342590912386	0.9350842813998136	-5.802517498554617e-07	0.9090753570204316	1.025719361147578e-06	0.906562618582146	-0.0009190966711272	0.687258035754909	0.0018195209493874	0.6827637997862497	NMUR2	337438	GRIA1	718810	GLRA1	845955	False	False	False	ref	-100	0.01073	-100	0.0239
3418	chr5	152777929	A	G	rs72799178	0.0253050357999999	0.1311151443426625	0.0253050357999999	0.1384924186748929	0.0080286713494687	0.5690158661096877	0.000210373124607	0.1667462085649617	0.000210373124607	0.1743676260257014	0.1182128445315822	0.7925675078046853	0.0031291266056328	0.3550994696842882	0.0031291266056328	0.367589163002079	0.0009436305882522	0.8133650659822813	2.571774889544257e-05	0.3817519402698117	2.571774889544257e-05	0.3937276281382339	0.0209524995072562	0.0647989495342972	0.0209524995072562	0.0666813276213062	NMUR2	344561	GRIA1	711687	GLRA1	853078	False	False	False	alt	-60	0.005325	100	0.05618
3419	chr5	152797561	A	G	rs111294930	-0.0067402389	0.4986425473119484	0.0067402389	0.4858975189453123	0.0220685600252821	0.0174715412339227	-0.0001595238159569	0.2508975433393524	0.0001595238159569	0.2418110663866145	0.2474382514341434	0.5767108856021201	-0.0015113411837109	0.5180769408510479	0.0015113411837109	0.5045851327549864	0.0053816032206107	0.1120518062394473	-3.498382566926464e-05	0.3148892495497186	3.498382566926464e-05	0.3036848702101351	-0.0067158373012167	0.3375139815660768	0.0067158373012167	0.3288261864593111	NMUR2	364193	GRIA1	692055	GLRA1	872710	False	True	False	ref	25	0.002472	25	0.0751
3420	chr5	152808222	C	T	rs55918828	-0.0180104722	0.2066857552224654	0.0180104722	0.197558023591728	0.0073770810838449	0.6894338001953177	-0.0001348000669308	0.2600298250075226	0.0001348000669308	0.2508139177100784	0.1545928899677382	0.7263873242617797	-0.0028145902580492	0.3817403684514188	0.0028145902580492	0.3690855459794167	0.00115871212416	0.759482984503997	-2.1422987573287263e-05	0.4194774158840058	2.1422987573287263e-05	0.4070863727612643	-0.0162532806356911	0.0958261214951458	0.0162532806356911	0.0930945960973014	NMUR2	374854	GRIA1	681394	GLRA1	883371	False	False	False	ref	-55	0.002316	-100	0.02571
3421	chr5	152808566	C	T	rs55830548	-0.0513545852	0.0263862391872646	0.0513545852	0.0245972589326016	0.0124915289063587	0.1460195825338739	-0.000647021018827	0.027614720938251	0.000647021018827	0.0259284661201987	0.1714789572505938	0.700479728363635	-0.0090648914578927	0.1497487416696431	0.0090648914578927	0.1412421023370434	0.0021985102561514	0.5522827247796706	-0.0001178992002103	0.1133208329007121	0.0001178992002103	0.106701529586503	-0.0473926078071349	0.0050905417694099	0.0473926078071349	0.0049227390329565	NMUR2	375198	GRIA1	681050	GLRA1	883715	False	False	False	ref	40	0.010086	85	0.009346
3422	chr5	152810407	T	G	rs55829928	0.0004712395099999	0.6899071240063815	0.00370927999	0.6876931583259454	0.0231596296300442	0.0142385679343925	-4.962993161956256e-06	0.4721533052531297	8.290765740667273e-05	0.4695711968106796	0.4130810485585949	0.310745397144416	0.0001482497760606	0.5613597730565282	0.001577568533546	0.5588135567703342	0.0097101763354538	0.0157266149650405	-3.560000293917353e-06	0.3707122744266103	3.576569017452756e-05	0.3678542016129971	0.0003941949605286	0.6898557057722968	0.0019294805962717	0.6876669786704201	NMUR2	377039	GRIA1	679209	GLRA1	885556	False	True	False	alt	65	0.00815	65	0.1
3423	chr5	152811145	A	G	rs72799198	-0.00128739534	0.7545251748463477	0.00270156818	0.7513610251821812	0.0069841201264782	0.7798382506027887	-8.956996735058187e-06	0.7918124359405293	1.926924000954785e-05	0.7889846952947971	0.3077065114783348	0.4824013634915184	-0.0003974097932631	0.6444463131231201	0.000822635022566	0.6412937528310834	0.0021370538857965	0.5787888506375347	-2.734040239154568e-06	0.683801902354941	5.827039581534056e-06	0.6811710819469791	-0.0010767746553387	0.6564509324529739	0.0020601873463417	0.6535502419158269	NMUR2	377777	GRIA1	678471	GLRA1	886294	False	False	False	ref	55	0.002102	80	0.043
3424	chr5	152812435	C	T	rs72799201	-0.00516676178	0.5502050101254482	0.00589908062	0.5414373013738855	0.0115219590434179	0.1906211360336827	-6.191125021546174e-05	0.4803201947343494	6.966502408942149e-05	0.4723491331614809	0.2559487131609249	0.5637417729523514	-0.0011945465866429	0.5441540567112735	0.0013981090220635	0.53553329634237	0.0029264368650265	0.4288504072259389	-1.426907059930653e-05	0.4861832561430923	1.6424384707612897e-05	0.4779673536101112	-0.0047946555462193	0.4028859273288926	0.0052759883401279	0.3962189707266538	NMUR2	379067	GRIA1	677181	GLRA1	887584	False	False	False	ref	-95	0.008835	-95	0.1534
3425	chr5	152840904	T	G	rs115283145	-0.000278027252	0.7611629470463794	0.002572745188	0.7632640586492241	0.0170111585907323	0.0523514135759897	2.1316352988078314e-06	0.5830454357160283	4.388482744352432e-05	0.5852756018805312	0.2720941088600504	0.5387622419788465	8.967262168120006e-06	0.693299870421249	0.000648042514962	0.6956968814436502	0.0047157354467261	0.178694814285918	2.09015694754257e-06	0.56022627100542	1.144409394445636e-05	0.5630606058748145	2.2821813504279864e-05	0.6257276256393866	0.0021971182273674	0.6276488824843941	NMUR2	407536	GRIA1	648712	GLRA1	916053	False	False	False	ref	100	0.001759	-80	0.0654
3426	chr5	152867047	A	C	rs72802883	-0.0062940225599999	0.5272424572261714	0.0062940225599999	0.5145578242320145	0.0124079510302762	0.1535050629362393	-8.027441088083695e-05	0.4204852513472266	8.027441088083695e-05	0.4093773752758305	0.0569342005622464	0.8987689016544911	-0.0003852505942714	0.794301648259854	0.0003852505942714	0.7800815103589632	0.0007267721352873	0.8541188709211208	-5.03343897157447e-06	0.737164474584032	5.03343897157447e-06	0.7229121939137825	-0.0041265988236391	0.4492349549906707	0.0041265988236391	0.438399706674038	NMUR2	433679	GRIA1	622569	GLRA1	942196	False	False	False	ref	100	0.01572	-100	0.0324
3427	chr5	152868292	C	A	rs12153071	0.005094186646	0.5603043203665099	0.005681599926	0.5699130494511166	0.009139727735006	0.4078028282196002	5.1171022921653896e-05	0.5539127951494223	5.658242770234002e-05	0.5628067788829111	0.1843193394122345	0.6837750882022816	0.0009046092167959	0.6186598896068695	0.0010052809529721	0.6277966891751229	0.0016815851265781	0.6691231935922963	9.074937795979008e-06	0.6092196990133216	1.000235217145713e-05	0.6180230401084826	0.0055705972053651	0.396782383178036	0.0059896886897166	0.4031147406169675	NMUR2	434924	GRIA1	621324	GLRA1	943441	False	False	False	alt	-5	0.00211	-60	0.01436
3428	chr5	152871641	T	C	rs4958587	0.0012717738739999	0.8693997708581563	0.0012717738739999	0.8834781478786058	0.0165476689486525	0.0576180035037219	1.9625219502733528e-05	0.7682475830502147	1.9625219502733528e-05	0.7818631105063759	0.0244421622630939	0.9555412418174832	3.0882643738723074e-05	0.9466342512982852	3.0882643738723074e-05	0.9608206941414876	0.000408554913457	0.9140879574139352	4.827024123300791e-07	0.9228132720150224	4.827024123300791e-07	0.9370051609847186	0.00053734997251	0.8743304936289934	0.00053734997251	0.8883151187910104	NMUR2	438273	GRIA1	617975	GLRA1	946790	False	False	False	alt	-90	0.008514	25	0.0083
3429	chr5	152875585	G	T	rs72802890	0.0007572128659999	0.7846615148998197	0.0020167071739999	0.7883747812845381	0.0211266567811079	0.0204702198173496	1.2621632581531844e-05	0.5604446535466255	4.2821161102265245e-05	0.5636659030553512	0.1763088828722289	0.6987531780003927	9.959947952808638e-05	0.7858641432906506	0.0003026662829437	0.7893598441850793	0.0037317293052889	0.2964915957299437	1.6118513179678176e-06	0.643855459344135	6.438621608009139e-06	0.6472162423490333	0.0010373551592858	0.6411589659692057	0.0020166184296517	0.6446517824313439	NMUR2	442217	GRIA1	614031	GLRA1	950734	False	False	False	alt	45	0.00267	-35	0.007263
3430	chr5	152876625	A	G	rs72802893	0.0216467938	0.1671348722680825	0.0216467938	0.1752716076862051	0.0093281236651473	0.4144430595322005	0.0002408253803427	0.1692409400062923	0.0002408253803427	0.1762952731563017	0.1361362669737237	0.7638313576152483	0.0036436297491784	0.3526393674008516	0.0036436297491784	0.3656602353528739	0.0014023310059664	0.7080510553757778	4.452029691076546e-05	0.33107782050429	4.452029691076546e-05	0.3431449719342357	0.0205002126578075	0.0764560015194084	0.0205002126578075	0.0787237129310623	NMUR2	443257	GRIA1	612991	GLRA1	951774	False	False	False	alt	-5	0.002167	20	0.003479
3431	chr5	152900050	C	G	rs9324737	0.0006576580199999	0.7035537083367926	0.00286907182	0.7050442361658088	0.0061126004341182	0.8967326742613704	5.861895746500237e-06	0.7781189460219521	1.727024816690706e-05	0.7800875300731238	0.0593284162698782	0.8876015905854593	2.637012547691947e-05	0.841572127871286	0.000184780181404	0.8432756561203236	0.0003516775516045	0.9199999655228704	2.696389507944613e-07	0.8740891916722047	1.0863735001589702e-06	0.8759842021827755	0.0001991721905828	0.6126093566151045	0.002286330771066	0.6144719783492492	NMUR2	466682	GRIA1	589566	GLRA1	975199	False	False	False	alt	85	0.002144	40	0.02011
3432	chr5	152902870	A	C	rs11167604	-0.0064865086399999	0.499505525942683	0.0064865086399999	0.4870701666204458	0.0224180646749485	0.0159774299295979	-0.0001483913768007	0.2494774476584451	0.0001483913768007	0.2402243235428223	0.1099866181184451	0.8064174406818553	-0.0007902062967833	0.667255893015762	0.0007902062967833	0.6535361119130919	0.0025445410954196	0.4767977701739082	-1.881687893836573e-05	0.4713054869314552	1.881687893836573e-05	0.4584983076410565	-0.0061722631977509	0.3367077533029388	0.0061722631977509	0.327720866144543	NMUR2	469502	GRIA1	586746	GLRA1	978019	False	True	False	ref	100	0.0165	100	0.0187
3433	chr5	152908997	G	T	rs4463219	-0.02143281626	0.1885061137453828	0.02143281626	0.1798277928675086	0.0163237911735461	0.0615416217521869	-0.0003475986405121	0.0884984126605764	0.0003475986405121	0.0838387905150279	0.3061401051878131	0.4893936140291602	-0.006697904080661	0.2099314492644211	0.006697904080661	0.1996323617623083	0.0050520493276661	0.1422393638512477	-0.0001103106001954	0.12347602831071	0.0001103106001954	0.1163078613851229	-0.0165209182667869	0.1109751042458927	0.0165209182667869	0.1079413120362898	NMUR2	475629	GRIA1	580619	GLRA1	984146	False	False	False	ref	45	0.0008545	45	0.0261
3434	chr5	152930047	G	A	rs72804778	0.00229204382	0.782504085457561	0.00229204382	0.7962980721927978	0.0064794158263959	0.8792357674502109	1.4534850462505096e-05	0.8318194896767217	1.4534850462505096e-05	0.8456242990197705	0.2185977032956772	0.6246050339999822	0.0004650545766787	0.7446232283978416	0.0004650545766787	0.7586601468940319	0.0014331607290774	0.7127319743848649	2.9843771406550244e-06	0.7855226392816651	2.9843771406550244e-06	0.7996363993982188	0.0019730495129616	0.6649584539721423	0.0019730495129616	0.6777943892397525	NMUR2	496679	GRIA1	559569	GLRA1	1005196	False	False	False	alt	75	0.003023	-70	0.03326
3435	chr5	152934890	T	C	rs72804781	-0.00572907984	0.5308642582424713	0.00572907984	0.5181849749627927	0.0184102573390349	0.0369530623773261	-0.0001088531798636	0.3404180249380465	0.0001088531798636	0.329960242274763	0.1111318582142967	0.8045144592535608	-0.0005782018015108	0.7172161689747714	0.0005782018015108	0.703390354012731	0.0020357068303515	0.5993815600780233	-1.107896852851685e-05	0.5730751326123467	1.107896852851685e-05	0.5599528513568827	-0.0052448676853493	0.390348934649708	0.0052448676853493	0.3805083951307819	NMUR2	501522	GRIA1	554726	GLRA1	1010039	False	False	False	ref	-100	0.001861	-50	0.0442
3436	chr5	152937432	T	A	rs116618941	-0.0141968708	0.2755042276428376	0.0141968708	0.265193847172555	0.0066809841642942	0.8169783869546151	-9.731564937358346e-05	0.3568719738241292	9.731564937358346e-05	0.3461921070324046	0.1672797435658045	0.7081428047118224	-0.002290070896604	0.4245137890217441	0.002290070896604	0.4113833044417951	0.0011026445080024	0.7726952385322308	-1.5461184674725693e-05	0.4807085563862438	1.5461184674725693e-05	0.4677568045969743	-0.0137366570192636	0.1328210610386158	0.0137366570192636	0.1289764489675614	NMUR2	504064	GRIA1	552184	GLRA1	1012581	False	False	False	ref	90	0.008446	95	0.03546
3437	chr5	152943061	C	T	rs72804789	-0.0435991742	0.044075903629023	0.0435991742	0.0412400493309391	0.0116402616007666	0.1936335600584191	-0.0005231879724698	0.0424155217089125	0.0005231879724698	0.0399794709675257	0.3613792674197865	0.4011531822365268	-0.0159353836642578	0.0696742185721661	0.0159353836642578	0.064517478094867	0.0042227989788695	0.2296681071219393	-0.0001920760179978	0.0592537342926648	0.0001920760179978	0.0552274282836725	-0.0290023755433147	0.0305947674866711	0.0290023755433147	0.0297847537893331	NMUR2	509693	GRIA1	546555	GLRA1	1018210	False	False	False	ref	5	9.92e-05	0	0.0
3438	chr5	153036592	G	A	rs184754715	-0.0161972968	0.2323697383948749	0.0161972968	0.222872733430651	0.0149309012314961	0.0801751812107374	-0.0002412287641413	0.1384700146530994	0.0002412287641413	0.1319365925483275	0.5896471955103268	0.0570595534382239	-0.009524170540403	0.1373027042317757	0.009524170540403	0.1291647786481688	0.0088138816495722	0.0203172105347982	-0.0001419259247952	0.0847653303990204	0.0001419259247952	0.0793953915624131	-0.0024398593346403	0.6141277535868015	0.0024398593346403	0.6016928146416946	GRIA1	453024	NMUR2	603224	FAM114A2	1002344	True	False	False	ref	55	0.01758	50	0.05518
3439	chr5	153078038	A	G	rs75040818	0.0017338878439999	0.7690559455288569	0.002452637156	0.7711326150341254	0.0104502787785729	0.2599531721019528	1.9684238820831387e-05	0.7224022877706313	2.707122778234307e-05	0.7246782151533733	0.0469589933505533	0.9152080503557124	8.811761841827721e-05	0.9056692156673178	0.0001174183263236	0.9067999827832052	0.0004903352613559	0.8976802090068733	9.97105730337832e-07	0.8903145813024326	1.2966677015732302e-06	0.8914817540425205	0.0010083092148258	0.7169659209899063	0.0016224234691231	0.7190133697455723	GRIA1	411578	NMUR2	644670	FAM114A2	960898	False	False	False	alt	-45	0.006912	-35	0.00602
3440	chr5	153081063	G	A	rs73802032	-0.073908513	0.0064443835937275	0.073908513	0.0061209013221804	0.015867294597405	0.0637825669229969	-0.0012148337623393	0.0093095960792604	0.0012148337623393	0.0088953271398147	0.3889231216091453	0.354552439451084	-0.0289525203900609	0.0176329906478497	0.0289525203900609	0.0162056372188384	0.0061343535571966	0.0758730517897766	-0.0004722610086707	0.013971912396096	0.0004722610086707	0.0131115655817387	-0.0440274276704114	0.0059965765576887	0.0440274276704114	0.0057993603352823	GRIA1	408553	NMUR2	647695	FAM114A2	957873	False	True	True	ref	-90	0.005875	-15	0.002075
3441	chr5	153115323	A	C	rs6868545	-0.00677289144	0.493946250368493	0.00677289144	0.4813550008228482	0.0219812509227436	0.017878151765279	-0.0001514529690297	0.2494238605070857	0.0001514529690297	0.2402209401478598	0.1498418033382089	0.7340302368936255	-0.0010376349722378	0.6116110546331252	0.0010376349722378	0.5973616038596345	0.0034351335493451	0.3064230880184784	-2.437450760520479e-05	0.4075505998650726	2.437450760520479e-05	0.395057713747539	-0.0062262056660338	0.3305654187346631	0.0062262056660338	0.3216835671011668	GRIA1	374293	NMUR2	681955	FAM114A2	923613	False	True	False	ref	5	0.001343	100	0.0121
3442	chr5	153130559	G	A	rs2118792	-0.002469854908	0.6783180919287712	0.003886617372	0.674188487770457	0.0071679052529934	0.7388027731613935	-1.6420958068987343e-05	0.7327512056124081	2.728478452777632e-05	0.7291757197406157	0.3479475928173529	0.4246740784946482	-0.0009188950348332	0.5684471654975451	0.0014025982151048	0.5643489050574514	0.0024888610769542	0.5182912045272341	-6.130004700446072e-06	0.6162355903646051	9.842157500707827e-06	0.6125610604086974	-0.0014356995404516	0.6088765130242888	0.0025767902156661	0.6052908838317475	GRIA1	359057	NMUR2	697191	FAM114A2	908377	False	False	False	ref	-10	0.0004635	95	0.05527
3443	chr5	153148011	A	G	rs2962809	-0.0044810912199999	0.5811255197832553	0.00480130286	0.5721013732884817	0.0068593239353225	0.7927164774978362	-3.0432357428142465e-05	0.6501352361601074	3.2572972728943244e-05	0.6417204242500213	0.2757850185167895	0.5291184155371497	-0.0012883337518315	0.5407106855331578	0.0013584355821869	0.5311653042985998	0.0019278799770249	0.6100283250455658	-8.944658211253545e-06	0.5891921050761598	9.413289061242647e-06	0.5802415332809053	-0.0038714094544548	0.4566133134567113	0.0041162252720463	0.4491755762764807	GRIA1	341605	NMUR2	714643	FAM114A2	890925	False	False	False	ref	20	0.000698	-100	0.0522
3444	chr5	153152663	G	A	rs2973157	-0.0070927744799999	0.4742296425598605	0.0070927744799999	0.4616237855158511	0.0063044063174939	0.8802665555341451	-4.324204807943378e-05	0.5848463125958565	4.324204807943378e-05	0.5721918992511356	0.0375439579248747	0.9313991052308964	-0.000281649659527	0.8295694317487128	0.000281649659527	0.815014397822795	0.0002355745513924	0.9499181188951206	-1.694994034196844e-06	0.8647735093560268	1.694994034196844e-06	0.8502410454703443	-0.0036660131329162	0.4809689067916493	0.0036660131329162	0.4698235546986929	GRIA1	336953	NMUR2	719295	FAM114A2	886273	False	False	False	ref	-90	0.002031	-35	0.012665
3445	chr5	153156462	A	G	rs2910030	0.0137116772	0.2600831206298576	0.0137116772	0.270516819805557	0.0085279279026725	0.4876866081589885	0.0001190976207432	0.2814702490396324	0.0001190976207432	0.2911980827839736	0.3081961431135177	0.4866968081549563	0.0043087040621732	0.2682920779957539	0.0043087040621732	0.2798244146924588	0.0026358669562918	0.4860115421579795	3.752859901606582e-05	0.278794007655426	3.752859901606582e-05	0.2898149820964152	0.0102200230292844	0.1762085868996789	0.0102200230292844	0.1817414176961157	GRIA1	333154	NMUR2	723094	FAM114A2	882474	False	False	False	alt	-50	0.002335	75	0.0271
3446	chr5	153160794	C	T	rs2910032	-0.0445059619999999	0.0416436020686125	0.0445059619999999	0.0389993329750624	0.0093007115664501	0.379035097716204	-0.0004155700002297	0.059514876666937	0.0004155700002297	0.056077712683554	0.1106567495513438	0.8029867897213808	-0.0048120701452076	0.2575528595616861	0.0048120701452076	0.2466480655640162	0.0010275027528627	0.7874373232057147	-4.4822365642718535e-05	0.2516116402919497	4.4822365642718535e-05	0.2416839795621055	-0.0372161536945403	0.0131453928779005	0.0372161536945403	0.0128120494566543	GRIA1	328822	NMUR2	727426	FAM114A2	878142	False	False	False	ref	65	0.00738	95	0.02936
3447	chr5	153171303	T	C	rs2973138	0.0046395176	0.5622363437167163	0.00524431904	0.5702860683664833	0.0074640865824741	0.6788563305604693	3.825116370737925e-05	0.5950256807172544	4.175719082846116e-05	0.6028887429372987	0.0778161599186713	0.8612175976658661	0.0003622609024993	0.7637502561150679	0.0003973761386809	0.7714507023354571	0.0005871819524656	0.8795050742952076	3.0001826098915666e-06	0.77721231689367	3.2037452381003187e-06	0.7850529708372174	0.0033506571644933	0.4658640615789803	0.0038983806885963	0.4731179415892085	GRIA1	318313	NMUR2	737935	FAM114A2	867633	False	False	False	alt	15	0.0001526	-60	0.008286
3448	chr5	153171563	A	C	rs2962826	0.0370628766	0.0589154978362011	0.0370628766	0.0631491889347571	0.0091678672325174	0.401968321129272	0.0003488122835311	0.0764016409283671	0.0003488122835311	0.0810825995603176	0.0764758970528739	0.8640467983535285	0.002932986124827	0.3556972076720876	0.002932986124827	0.3682814889106834	0.0007338247546104	0.8472621219475215	2.892682301857937e-05	0.3458792118128436	2.892682301857937e-05	0.3577227040579159	0.0255791035176712	0.0339645507456669	0.0255791035176712	0.0349157359911401	GRIA1	318053	NMUR2	738195	FAM114A2	867373	False	False	False	alt	-15	0.000905	-100	0.003113
3449	chr5	153176386	C	T	rs55827458	0.0076602707	0.4244399349627147	0.0076602707	0.4365464953498976	0.0265865520420752	0.007242604811852	0.0002081301052701	0.1552170186453927	0.0002081301052701	0.1627202286032389	0.0252015062396912	0.9539465548383173	0.0001965219136781	0.8347215950401221	0.0001965219136781	0.8490557028181074	0.000697614788396	0.8587819455936354	5.62662048689066e-06	0.6789994125950033	5.62662048689066e-06	0.6927886803622573	0.0030062552516104	0.5346570092462725	0.0030062552516104	0.5466960006339298	GRIA1	313230	NMUR2	743018	FAM114A2	862550	False	True	False	alt	75	0.004692	-65	0.03726
3450	chr5	153179839	C	A	rs7717923	0.0009105886	0.6747061601677289	0.0033798939199999	0.6827143065283784	0.018586930633781	0.0384793543412255	3.150153528035e-05	0.4730501509765848	5.70583391122081e-05	0.4807186074292024	0.0384900258301434	0.9329812452326076	3.0391780611491622e-05	0.8798535815520304	0.0001285758623716	0.8888311029169008	0.0007235827301734	0.8521412705546398	1.157159929801972e-06	0.8100379999096149	2.173345046737958e-06	0.8193395465105182	0.0005000051867757	0.6885599064453004	0.0017116360128216	0.6963892240029216	GRIA1	309777	NMUR2	746471	FAM114A2	859097	False	False	False	alt	55	0.003967	-35	0.006668
3451	chr5	153185089	T	G	rs1870861	0.0100264498	0.3354295658396407	0.0100264498	0.3467364352060363	0.0073233471803956	0.7287966544333473	7.300790167909196e-05	0.4034139218985104	7.300790167909196e-05	0.4145036106981101	0.158692517557236	0.7221131124800421	0.0016250077523772	0.4799355968742293	0.0016250077523772	0.493513478290946	0.0011428517828304	0.764858971600645	1.1612354953858866e-05	0.5204334099036362	1.1612354953858866e-05	0.533710091156519	0.0094025871637672	0.1887167344005463	0.0094025871637672	0.1947577874100826	GRIA1	304527	NMUR2	751721	FAM114A2	853847	False	False	False	alt	-70	0.003489	-40	0.014725
3452	chr5	153209119	C	T	rs1462120	-0.0077649743	0.4629923306293696	0.0077649743	0.4507033248863448	0.0075288229162273	0.6869755464022608	-6.01497462596817e-05	0.5121291556723063	6.01497462596817e-05	0.5001896084837779	0.133455741242129	0.7693574792867652	-0.0010922006701689	0.6165670164592663	0.0010922006701689	0.6029480722692657	0.00102353717948	0.7976342553745436	-8.621794520521266e-06	0.6435738528361464	8.621794520521266e-06	0.6301064700387957	-0.0070291185593211	0.2996468775144014	0.0070291185593211	0.29119784996838	GRIA1	280497	NMUR2	775751	FAM114A2	829817	False	False	False	ref	-80	0.002346	-15	0.01562
3453	chr5	153227010	A	G	rs3112532	-0.0009644190399999	0.7787679941900814	0.00233348932	0.7755456831308813	0.0083930134107372	0.5235306549427134	-7.986471195623963e-06	0.7789627108468177	1.973240074123128e-05	0.7758039052187632	0.0455647880164731	0.921591335946574	-7.093262803262309e-05	0.9025664667713742	0.0001227469055765	0.8997612340396093	0.0003970100927294	0.9223347980630286	-6.338759660109431e-07	0.9033084027403296	1.0816366152193234e-06	0.9004555213734138	-0.0008547806512515	0.7374666768704605	0.0014813431674602	0.734013580196989	GRIA1	262606	NMUR2	793642	FAM114A2	811926	False	False	False	ref	100	0.006622	100	0.0495
3454	chr5	153235946	G	A	rs296175	-0.059623943	0.0154455528736948	0.059623943	0.0145088085362076	0.0133193165925301	0.1207882340673209	-0.0008086333094452	0.0185882857879078	0.0008086333094452	0.0175495145765342	0.2314609072708222	0.6067605541551879	-0.0144527310880611	0.0854383440740158	0.0144527310880611	0.0794072569157112	0.0030936446047846	0.393130334841209	-0.0001945505482646	0.060662339891868	0.0001945505482646	0.0566336872933838	-0.054552433116526	0.0027691887062984	0.054552433116526	0.0026755861393765	GRIA1	253670	NMUR2	802578	FAM114A2	802990	False	True	False	ref	65	0.0006447	55	0.01749
3455	chr5	153239904	T	G	rs2546328	0.0019976761599999	0.6256869168340345	0.00410260824	0.6304250398091066	0.0089929024802722	0.4259989044424733	1.527819567242918e-05	0.6245145672976677	3.5053683529047786e-05	0.6287023890257039	0.0852519217004325	0.8449047866385432	0.0002034712253933	0.7661594066494848	0.0003655902513642	0.7701219161490256	0.0007634937182509	0.8400580836082499	1.532628586788441e-06	0.7645736018681737	3.088718295432471e-06	0.7682881654463284	0.0020477390844303	0.5016571274981065	0.0034377949978733	0.5056351970564474	GRIA1	249712	FAM114A2	799032	MFAP3	799056	False	False	False	alt	80	0.01291	20	0.01367
3456	chr5	153258478	C	A	rs2349576	0.00364478394	0.6531223717867131	0.00364478394	0.6664992508467101	0.0078439481200315	0.6255231236033137	2.778521629959981e-05	0.6816656849795237	2.778521629959981e-05	0.6950285092803635	0.0600919096671126	0.8940368333073322	0.0002214441620725	0.8254547190670768	0.0002214441620725	0.839643250006301	0.000476973436918	0.9028879705802229	1.704120057118749e-06	0.8365086371964118	1.704120057118749e-06	0.8507694535854148	0.0026079108704446	0.5721495601155676	0.0026079108704446	0.5847022749978429	GRIA1	231138	FAM114A2	780458	MFAP3	780482	False	False	False	alt	10	6.104e-05	100	0.01729
3457	chr5	153264409	G	T	rs2926288	0.0198195683	0.1864978020323047	0.0198195683	0.1956925921831373	0.0151754663611361	0.0774200103662367	0.000319693919325	0.0951186223906932	0.000319693919325	0.1004713333116995	0.1610410896378593	0.7219309398598572	0.0036556697241984	0.335420177043854	0.0036556697241984	0.3480462216829731	0.0025256825550614	0.4922040586262757	5.970417585760812e-05	0.2296940281623628	5.970417585760812e-05	0.2401236254376095	0.0178757041048143	0.0853073187785592	0.0178757041048143	0.0875468042817889	GRIA1	225207	FAM114A2	774527	MFAP3	774551	False	False	False	alt	-75	0.00421	-30	0.006042
3458	chr5	153266205	C	T	rs2964817	-0.0534108912	0.0245707167263462	0.0534108912	0.0230476000063779	0.0110157040734981	0.2255853561933965	-0.0006264261401709	0.0348164082318341	0.0006264261401709	0.032871167117144	0.2834780443780537	0.523999493449232	-0.0149917296179603	0.0785707214708068	0.0149917296179603	0.0728451770899869	0.0031018106514074	0.4069392538385006	-0.0001744202783998	0.0704913487851174	0.0001744202783998	0.0658790330951026	-0.045763960207056	0.0068075283607742	0.045763960207056	0.0066448688832746	GRIA1	223411	FAM114A2	772731	MFAP3	772755	False	False	False	ref	-40	0.002445	-10	0.002705
3459	chr5	153272205	A	G	rs2199123	0.00636676096	0.4989122689807615	0.00636676096	0.5119305711277418	0.0066243540298665	0.845390098757627	4.221479716087339e-05	0.581866174043922	4.221479716087339e-05	0.5949287174624668	0.2338862436332326	0.6046320683164397	0.0014545611320152	0.5123048506873257	0.0014545611320152	0.5260041545084916	0.001540563687869	0.6945184960944049	9.566911495224602e-06	0.5706756870494645	9.566911495224602e-06	0.5841669796200987	0.0053465284909594	0.3450176869789544	0.0053465284909594	0.3541563655805112	GRIA1	217411	FAM114A2	766731	MFAP3	766755	False	False	False	alt	100	0.006454	75	0.01099
3460	chr5	153274919	C	T	rs17504622	-0.00645745454	0.4548444249466437	0.00781301066	0.4447302293279627	0.007824225463411	0.5993835900248163	-5.610736365119709e-05	0.4808149798471672	6.579279470125341e-05	0.4712600749843127	0.1133372752829385	0.8021137376345185	-0.0006017071730143	0.6562943833939903	0.0008514751974733	0.6459346882848326	0.0008872489616376	0.8205014319015648	-5.450111696040197e-06	0.6659748262232044	7.234701020733405e-06	0.6556141486447512	-0.0051660286932436	0.3097345420423952	0.006419153725661	0.3041741566210133	GRIA1	214697	FAM114A2	764017	MFAP3	764041	False	False	False	ref	30	0.000988	-85	0.03745
3461	chr5	153305895	C	T	rs308267	0.0055349143999999	0.5593166858078191	0.0055349143999999	0.5727087547406805	0.0080063392719773	0.5810530616095514	4.491258624251844e-05	0.5822581153401122	4.491258624251844e-05	0.595457673795258	0.4996587101525949	0.1739834643331534	0.0028049180205471	0.3791004541568968	0.0028049180205471	0.3921700031546481	0.0040045719887309	0.2550234156995724	2.278060119741827e-05	0.404150468927246	2.278060119741827e-05	0.4166987287042731	0.0016265728897602	0.699520624581197	0.0016265728897602	0.7126509210982256	GRIA1	183721	FAM114A2	733041	MFAP3	733065	False	False	False	alt	-100	0.002388	-95	0.03818
3462	chr5	153320574	A	G	rs2609671	0.026056661	0.120299734975008	0.026056661	0.1274668893864251	0.0091421880012374	0.388289233276758	0.0002400844852658	0.1261140390707808	0.0002400844852658	0.132577041113134	0.0853349101131753	0.8510980247331595	0.0023256783370996	0.4103487944486328	0.0023256783370996	0.4231403309040511	0.0007840791717929	0.8393469947715266	2.159248810519255e-05	0.4029962292473729	2.159248810519255e-05	0.4152141224932633	0.0200728223321818	0.0722012358124315	0.0200728223321818	0.0742722727521115	GRIA1	169042	FAM114A2	718362	MFAP3	718386	False	False	False	alt	65	0.003448	-15	0.01108
3463	chr5	153325578	T	C	rs300325	0.0570923534	0.0154652764629264	0.0570923534	0.0165165147252128	0.0117263105018962	0.1835369189355161	0.0006938436413309	0.0227084784077339	0.0006938436413309	0.0241114987774237	0.5803234473386654	0.0666717244264338	0.0330583193168685	0.0100779990688944	0.0330583193168685	0.0109844607050489	0.0067958402455209	0.053338454444611	0.0004011348655046	0.0158991103075458	0.0004011348655046	0.0171453224433131	0.009800931544933	0.1844499377463701	0.009800931544933	0.1902550453754683	GRIA1	164038	FAM114A2	713358	MFAP3	713382	False	True	False	alt	60	0.002464	100	0.094
3464	chr5	153335525	C	T	rs2617267	0.0079925135	0.4306178346135754	0.0079925135	0.4432181239116968	0.0096610874305893	0.3558501760801341	7.700196119328527e-05	0.4219312559684549	7.700196119328527e-05	0.4334527430236728	0.1597340221371591	0.7224972682774928	0.0012230393881232	0.5575091643655137	0.0012230393881232	0.5715173306809992	0.0015502314246255	0.6918849677479507	1.146366055716903e-05	0.542268792098161	1.146366055716903e-05	0.5557453595494625	0.0073009056110539	0.2687850778695883	0.0073009056110539	0.2763724266673174	GRIA1	154091	FAM114A2	703411	MFAP3	703435	False	False	False	alt	50	0.00054	-85	0.02931
3465	chr5	153335769	T	C	rs2964819	0.0266070774	0.1112481955253634	0.0266070774	0.1180422645400932	0.0098922322460299	0.3092887077365115	0.0002692156214708	0.1087504008102661	0.0002692156214708	0.1147145075826957	0.2216288550711106	0.6213096702992	0.0060653875917035	0.197579797893982	0.0060653875917035	0.2080467052191429	0.0021902078290911	0.5596459036765096	6.158795313476387e-05	0.1862883240745594	6.158795313476387e-05	0.19559619527992	0.0240438178819281	0.0410219228465871	0.0240438178819281	0.0420397366516004	GRIA1	153847	FAM114A2	703167	MFAP3	703191	False	False	False	alt	95	0.002148	100	0.01317
3466	chr5	153335978	A	C	rs2560245	0.00295015979	0.7087267518178509	0.00308466589	0.7170256745846879	0.0117709265527617	0.1790429935057415	3.1208965961308815e-05	0.6591491526962722	3.2996194733227394e-05	0.667407146961883	0.2319629871679166	0.6063090228868317	0.000672585544723	0.6874771229671983	0.0006953722864607	0.6960343727526543	0.0027289591837468	0.4667256656238048	7.208703431693985e-06	0.6439489069764055	7.511478699842019e-06	0.6523449288719446	0.0027386176205147	0.5677664148327239	0.0029419392317347	0.5755624930477861	GRIA1	153638	FAM114A2	702958	MFAP3	702982	False	False	False	alt	95	0.001309	95	0.03723
3467	chr5	153336647	T	G	rs2446429	0.00770920644	0.4246698920661872	0.00770920644	0.4369445214487264	0.0085498357906731	0.4886736338080346	6.459941264437548e-05	0.4374783448627282	6.459941264437548e-05	0.4491252046790786	0.2775983153352213	0.534509427064109	0.0021835052825343	0.4218318420755842	0.0021835052825343	0.4350225262321566	0.0023324427597265	0.5491417518669577	1.8013632228186774e-05	0.4298777466709638	1.8013632228186774e-05	0.4425506923770078	0.0062759987136795	0.2923570260053684	0.0062759987136795	0.300915711247579	GRIA1	152969	FAM114A2	702289	MFAP3	702313	False	False	False	alt	60	0.0007906	70	0.04773
3468	chr5	153336750	T	A	rs2560247	-0.00272731984	0.6599004567712474	0.00398335156	0.6517663063810719	0.0069062367761769	0.7887859405183651	-2.062104386450196e-05	0.7114122565557132	2.8174854315220443e-05	0.7035184280810296	0.2530109233498273	0.5734219327801713	-0.0007411217864369	0.6211169299851798	0.001069504525605	0.6132406062223172	0.0017397851919817	0.6593464099430087	-5.58820652483476e-06	0.6634459031719054	7.563109633678814e-06	0.6556152487492038	-0.0025332212989761	0.5172750614536658	0.0033672548470419	0.5105506268271011	GRIA1	152866	FAM114A2	702186	MFAP3	702210	False	False	False	ref	-95	0.001499	35	0.02863
3469	chr5	153337784	T	C	rs170027	-0.0002337791	0.620002897745242	0.00430818594	0.619105688859369	0.0087902898825743	0.4515392926953167	1.7475655686418562e-06	0.6258826357824896	3.742538678423997e-05	0.6250804047067873	0.1320864324318716	0.7702776966346571	-7.51568768389e-05	0.7198685515123757	0.000574123487102	0.7181720929177451	0.0011595347065985	0.765410911961786	-1.479915108645071e-07	0.7203178076934983	4.955180071903676e-06	0.7187687335487895	0.0001286320397514	0.4519796913293556	0.0041992136847892	0.4512829585842525	GRIA1	151832	FAM114A2	701152	MFAP3	701176	False	False	False	ref	-60	0.0006104	-50	0.02899
3470	chr5	153338784	A	G	rs304859	-0.1232707766	0.0027796062291696	0.1232707766	0.0026271142146035	0.0692799441680302	0.0003110647725767	-0.0105603246681099	0.0012258033097303	0.0105603246681099	0.0011431241264597	0.3117438977582755	0.4725237948189316	-0.040939569299083	0.0112060702317338	0.040939569299083	0.0106406383785781	0.022384066258169	0.0018078765335959	-0.0035028609485208	0.0023321509076163	0.0035028609485208	0.0022035098763494	-0.107613149513999	0.0006366825209873	0.107613149513999	0.0006602293754561	GRIA1	150832	FAM114A2	700152	MFAP3	700176	False	True	True	ref	100	0.0058	100	0.04492
3471	chr5	153340362	C	T	rs35407853	-0.0215116296	0.1765181072627318	0.0215116296	0.168208620767503	0.0066433590941362	0.8539444552027479	-0.0001452014793887	0.2553771108718765	0.0001452014793887	0.2462549715664678	0.1308851751574186	0.7705553070227976	-0.002844377767559	0.3834902578215421	0.002844377767559	0.3710123593562695	0.0008919837182066	0.8192994906550581	-1.9667357456544805e-05	0.447007714299881	1.9667357456544805e-05	0.4345968623343099	-0.0195790412763617	0.0752216599995811	0.0195790412763617	0.0732015195259435	GRIA1	149254	FAM114A2	698574	MFAP3	698598	False	False	False	ref	15	0.002728	100	0.09906
3472	chr5	153340428	T	C	rs304863	0.0274682196	0.1150726118441277	0.0274682196	0.1218876033884565	0.0078216207472836	0.604312541720247	0.0002215269367744	0.1547236399146462	0.0002215269367744	0.1621509517505625	0.1658689405491758	0.7117765615305633	0.0048459072420497	0.2554407079793916	0.0048459072420497	0.2667539243812241	0.0013205167886188	0.7348694595999695	3.958803814849973e-05	0.2849909716283914	3.958803814849973e-05	0.2959889804942574	0.0258737123829084	0.0400017197563676	0.0258737123829084	0.0410914788725694	GRIA1	149188	FAM114A2	698508	MFAP3	698532	False	False	False	alt	75	0.00157	50	0.03735
3473	chr5	153341302	T	C	rs304864	0.00307873396	0.6941451114918441	0.00307873396	0.7076444222943784	0.0113593760027134	0.2080996440883299	3.338912427878613e-05	0.6268026709872714	3.338912427878613e-05	0.6398121039909539	0.0660297305988651	0.8846208886484938	0.0001794609627274	0.8412941621848541	0.0001794609627274	0.8555833984982772	0.000801551695757	0.8388878933792285	1.998329278918083e-06	0.8129628790497041	1.998329278918083e-06	0.8272222369004688	0.0020415149534745	0.635656899512772	0.0020415149534745	0.6485121061274568	GRIA1	148314	FAM114A2	697634	MFAP3	697658	False	False	False	alt	-100	0.0374	-50	0.04205
3474	chr5	153344984	A	G	rs159759	0.0148592598	0.23826870115377	0.0148592598	0.2484764423985351	0.0099223360344038	0.3169231180589911	0.0001534347122053	0.2256751986792848	0.0001534347122053	0.234569358409997	0.0817850807580991	0.8533894410693778	0.0013660561325612	0.5449848463566166	0.0013660561325612	0.5588636305122797	0.0008678006381339	0.8156320083677869	1.5200953242903291e-05	0.5091803035813037	1.5200953242903291e-05	0.5225337467803876	0.0109399475098289	0.1567891377614217	0.0109399475098289	0.1617166450420429	GRIA1	144632	FAM114A2	693952	MFAP3	693976	False	False	False	alt	5	0.0001602	5	0.005676
3475	chr5	153347798	G	C	rs160066	0.0020984075339999	0.5998029333597844	0.004375135386	0.6025490495702895	0.0073085189317509	0.6575103898420032	1.81607298862074e-05	0.6386223736633998	3.2832168793372136e-05	0.6416203110990987	0.2113279183394018	0.6413232086054631	0.0004146417018606	0.6199143006723061	0.0008637031874901	0.6227098250040533	0.0015467076022526	0.6902590386739593	3.519446521410354e-06	0.6477256478538209	6.45314300965003e-06	0.6507551061390511	0.0016348717310345	0.4269555058813241	0.0042324090498863	0.4297213376602485	GRIA1	141818	FAM114A2	691138	MFAP3	691162	False	False	False	alt	-100	0.01071	-25	0.01721
3476	chr5	153347834	G	C	rs150618	0.004535787601	0.6133354877463676	0.004535787601	0.6264906420648563	0.0088134495049313	0.440667230605137	3.935351551695146e-05	0.6129483282911974	3.935351551695146e-05	0.6255472310801554	0.2120229462961233	0.6399809081545264	0.0009666956205072	0.6280182013681179	0.0009666956205072	0.6417717744828684	0.0018966684423854	0.62666941246215	8.501950887885991e-06	0.6264831764551738	8.501950887885991e-06	0.6399787175048366	0.0039938173632506	0.4592337127810926	0.0039938173632506	0.4705492929007389	GRIA1	141782	FAM114A2	691102	MFAP3	691126	False	False	False	alt	-100	0.00992	-65	0.01587
3477	chr5	153347885	G	A	rs149095	-0.00070621731	0.8625287073919377	0.001305571362	0.8652315688148006	0.0097451007580058	0.3264977271793075	-6.45218151386143e-06	0.8465270119435082	1.2631612066756748e-05	0.8491311923766884	0.2094835008661915	0.6440732391464771	-0.00014220440806	0.8304479087025709	0.0002585156115019	0.8311854131896692	0.0020449430104304	0.6005637537321854	-1.3037734361832415e-06	0.8187382539350672	2.50209269478569e-06	0.8192709999368437	-0.0006805049844915	0.7568117985016896	0.0013568605483459	0.756415273709137	GRIA1	141731	FAM114A2	691051	MFAP3	691075	False	False	False	ref	15	0.0007095	-100	0.04208
3478	chr5	153352846	G	A	rs159972	0.01454090704	0.2724106458849929	0.01454090704	0.283213153017379	0.0134589856211457	0.1169552809875631	0.0001987772121451	0.1873067252335079	0.0001987772121451	0.1956112718430627	0.4530959864728887	0.2507812452099139	0.0067014510891371	0.196225923486032	0.0067014510891371	0.2067748214652572	0.0061076927518491	0.0780905309200696	9.156118081697596e-05	0.1394001506277135	9.156118081697596e-05	0.1476802903185624	0.0059502691936637	0.3343837828967447	0.0059502691936637	0.3438122141906993	GRIA1	136770	FAM114A2	686090	MFAP3	686114	False	False	False	alt	85	0.001356	-100	0.06506
3479	chr5	153353281	A	C	rs159973	0.0550906306	0.0193295169763794	0.0550906306	0.0206372474356993	0.0164875007091369	0.0622233635795678	0.0009977117432041	0.0155200931381139	0.0009977117432041	0.0162604670662997	0.4291725017894376	0.2904430440260883	0.0241077791169641	0.0263483215631474	0.0241077791169641	0.0286008499650864	0.0071757798560006	0.0485220880934159	0.0004407588708178	0.0175421479182385	0.0004407588708178	0.0186910353173075	0.0277907447172688	0.035702461807514	0.0277907447172688	0.0367229892787519	GRIA1	136335	FAM114A2	685655	MFAP3	685679	False	False	False	alt	100	0.003199	-15	0.005554
3480	chr5	153368956	C	T	rs304883	0.00250385194	0.7462384131946443	0.00250385194	0.7601345178716006	0.0085108425519567	0.485770779887898	2.116619468894304e-05	0.7438257587225289	2.116619468894304e-05	0.7575090280998487	0.0845236983786138	0.8536810070096628	0.0001965781049272	0.8378242031136495	0.0001965781049272	0.8523268554822955	0.000767580463722	0.8474072414187862	1.7517926321938929e-06	0.835616542390209	1.7517926321938929e-06	0.8502187936140729	0.0018630898660774	0.6554578625005585	0.0018630898660774	0.6682550001142273	GRIA1	120660	FAM114A2	669980	MFAP3	670004	False	False	False	alt	25	0.001287	-100	0.02878
3481	chr5	153369539	G	A	rs304884	-0.0141323063999999	0.2719395479029171	0.0141323063999999	0.2615803289684293	0.0076426663871978	0.6567056514298141	-0.0001097815533164	0.3234216267328649	0.0001097815533164	0.3134478081839361	0.1039616593533127	0.8208755239336746	-0.0015427517287411	0.5341432556505651	0.0015427517287411	0.5208186071133275	0.0008083364024938	0.8413775132870753	-1.2182062013614392e-05	0.5646663332928574	1.2182062013614392e-05	0.551562236123623	-0.0118880901254162	0.1624224057086163	0.0118880901254162	0.1575930680155462	GRIA1	120077	FAM114A2	669397	MFAP3	669421	False	False	False	ref	-25	0.0087	0	0.0
3482	chr5	153378718	T	C	rs304853	0.0556633444	0.018306111866514	0.0556633444	0.0195934266923915	0.0104441391939284	0.2607919343094936	0.0005973954047039	0.0297339758216685	0.0005973954047039	0.0316430487300273	0.0631977510140145	0.8906963395327484	0.0036808545647441	0.319353986013672	0.0036808545647441	0.3317618212253714	0.00066945290264	0.8688512317717157	4.004009527690929e-05	0.2921197650775978	4.004009527690929e-05	0.3032234491708479	0.032077096235438	0.0228633206293999	0.032077096235438	0.0235069652411021	GRIA1	110898	FAM114A2	660218	MFAP3	660242	False	True	False	alt	10	0.0003657	45	0.02249
3483	chr5	153379453	G	A	rs304855	-0.052555168	0.0241904820133739	0.052555168	0.0226503919205374	0.0115034422778825	0.1967768897417868	-0.0006257017702474	0.0312306097328221	0.0006257017702474	0.0294074351302028	0.1168788057967405	0.793831304264905	-0.0062279894821328	0.2161177203687651	0.0062279894821328	0.2057749240337231	0.0013773551445955	0.7196933529307314	-7.587111246267065e-05	0.1778902630706957	7.587111246267065e-05	0.1692020052553454	-0.043147750495337	0.0065356969032346	0.043147750495337	0.0063298818244752	GRIA1	110163	FAM114A2	659483	MFAP3	659507	False	False	False	ref	-70	0.000923	30	0.006104
3484	chr5	153384330	C	A	rs160161	-0.0152883178	0.2806550706869289	0.0152883178	0.2702912925252673	0.0093904306075201	0.3697295168232227	-0.0001469170181609	0.2829559995552403	0.0001469170181609	0.2733945054820361	0.2875714478365958	0.5183414636206819	-0.0047442730109287	0.296736452360958	0.0047442730109287	0.2851402834155059	0.0027357744345061	0.4647050832052357	-4.583126058129892e-05	0.2911575993737733	4.583126058129892e-05	0.2802911683116195	-0.011927509621469	0.1758771374747096	0.011927509621469	0.1707478726738672	GRIA1	105286	FAM114A2	654606	MFAP3	654630	False	False	False	ref	100	0.001659	-70	0.049
3485	chr5	153426785	T	C	rs13172447	0.003206134126	0.7153080323837335	0.003206134126	0.7288912437351306	0.0225544813009446	0.0163260692913136	6.238466304525004e-05	0.4777256760537318	6.238466304525004e-05	0.4895881243197971	0.3011421280303737	0.4975570235722447	0.000965312763394	0.6199419201223763	0.000965312763394	0.6340009812069235	0.0067826896841457	0.0559428868789149	1.8815079055839683e-05	0.4397442957078446	1.8815079055839683e-05	0.4523128626738486	0.0023547962115789	0.605583175638204	0.0023547962115789	0.6180775426971189	GRIA1	62831	FAM114A2	612151	MFAP3	612175	False	True	False	alt	-55	0.0004845	-50	0.03564
3486	chr5	153436929	C	T	rs4246043	0.0075859026939999	0.4481189165842484	0.0075859026939999	0.4607974965555664	0.0079489697003949	0.5841156070667828	6.332085387651616e-05	0.4741311696245075	6.332085387651616e-05	0.4862296249302197	0.3420222201475119	0.4276722199729352	0.0027971626979313	0.3864907373104921	0.0027971626979313	0.3997885723702581	0.0027428406531968	0.4609532718219815	2.341285970966855e-05	0.4036747023994311	2.341285970966855e-05	0.4164574744574199	0.0045664374111764	0.3999169134040582	0.0045664374111764	0.4101172740024233	GRIA1	52687	FAM114A2	602007	MFAP3	602031	False	False	False	alt	45	0.001422	50	0.04486
3487	chr5	153492525	C	T	rs3811983	-0.00018416494	0.7813739702428552	0.0022382427	0.7832316255229915	0.0182071498079625	0.039302183990075	1.1094711938289517e-06	0.5869431407499734	4.007349770471464e-05	0.5886983404090773	0.3739499372400128	0.3805045830795884	-5.600208766681995e-05	0.6271030897156679	0.0008326190307635	0.6286219301607646	0.0068261270747093	0.0524787976473877	6.530052334290967e-07	0.472900828313978	1.4948620002013986e-05	0.4745343701218174	6.22413095569996e-06	0.7589769187000941	0.001259349163373	0.7605953049020768	GRIA1	2909	FAM114A2	546411	MFAP3	546435	False	False	False	ref	-100	0.0081	-100	0.1497
3488	chr5	153986878	C	T	rs1347798	0.0172185667999999	0.2002540377622353	0.0172185667999999	0.2097290144901393	0.0087370918765607	0.4550265274707646	0.0001481040843289	0.2167934970191683	0.0001481040843289	0.2256353607726933	0.332051162356456	0.4474395791519824	0.005729012194418	0.2039465133619296	0.005729012194418	0.2143745765994	0.0029233486791063	0.4322460189532759	4.965597260107729e-05	0.2141776360191462	4.965597260107729e-05	0.2240040601049964	0.0122179690660691	0.1420500925830335	0.0122179690660691	0.1465345367459405	FAM114A2	52058	MFAP3	52082	GALNT10	203853	False	False	False	alt	55	0.002802	45	0.01752
3489	chr5	153987245	G	A	rs425263	-0.030543847	0.0995153930940832	0.030543847	0.0937773702981065	0.0076434677737416	0.6431159202092613	-0.0002345936835054	0.1416291509644939	0.0002345936835054	0.1348383349249832	0.4005892177304743	0.335558022859524	-0.0122018646651927	0.1024163179369716	0.0122018646651927	0.0954232175857282	0.0030632580255866	0.4090288412673596	-9.380917208827893e-05	0.132611388952469	9.380917208827893e-05	0.1250771968639683	-0.0171931244100042	0.0939872127335379	0.0171931244100042	0.0912475571859375	FAM114A2	51691	MFAP3	51715	GALNT10	203486	False	False	False	ref	45	0.001507	-10	0.00824
3490	chr5	154008356	C	A	rs6580047	0.0036119672199999	0.5524713756029346	0.00493892754	0.5624130965547638	0.0180925186935101	0.0393561675975566	6.839256250942781e-05	0.3532849665650736	9.126267076297792e-05	0.3616282599679745	0.0442971400118257	0.9207266625071182	0.0001032371715131	0.830556601475558	0.0002096841698749	0.8405946544553696	0.0008053464417957	0.8315939917453082	2.092211366827679e-06	0.731407142200167	3.926821135857473e-06	0.741257245913276	0.0016244981794416	0.5574512012236724	0.0027780371165675	0.5656732022773115	FAM114A2	30580	MFAP3	30604	GALNT10	182375	False	False	False	alt	90	0.02927	70	0.00903
3491	chr5	154020162	C	T	rs552556	0.001430468504	0.7439719526875923	0.002660181064	0.7517336114417524	0.0057204429965812	0.9660798066806418	8.510528371683486e-06	0.8206779323476168	1.535655343124358e-05	0.8283165811845137	0.1429309432670463	0.754031539901087	0.0002005536549323	0.7758439208606315	0.0004453123636387	0.7829776716112499	0.0008150076521058	0.836899915238588	1.2017525463086657e-06	0.827639315958923	2.5643671254825102e-06	0.8349006237887115	0.0015705557111588	0.6190511988394641	0.0024294857830474	0.626305231005452	FAM114A2	18774	MFAP3	18798	GALNT10	170569	False	False	False	alt	95	0.01135	40	0.00963
3492	chr5	154020867	C	A	rs2118660	-0.00674705982	0.4946976976030333	0.00674705982	0.4822641374735576	0.0115136618726457	0.1930752978509728	-7.787224267022844e-05	0.4171397445281394	7.787224267022844e-05	0.405999484764995	0.2860071162563926	0.5162607843265695	-0.0019677607384597	0.4690101909011512	0.0019677607384597	0.4558353040954319	0.0033599550168775	0.3567253142519132	-2.314743275358933e-05	0.4075392899694893	2.314743275358933e-05	0.3956304915476469	-0.0053299308084108	0.3663371593765255	0.0053299308084108	0.356564449276315	FAM114A2	18069	MFAP3	18093	GALNT10	169864	False	False	False	ref	-65	0.001221	-75	0.07965
3493	chr5	154025854	T	G	rs2560047	-0.00507392464	0.578258264622222	0.00507392464	0.5650864266438267	0.0214575859725893	0.019700994492396	-0.0001098422720461	0.3217282249307995	0.0001098422720461	0.3113701019001284	0.0923391321486736	0.8364382925335201	-0.0004744558262005	0.7466375409994171	0.0004744558262005	0.7327457156687421	0.001995280899726	0.5949058246367895	-1.0308030498727528e-05	0.5747245412332481	1.0308030498727528e-05	0.5614401712737477	-0.0043942364547349	0.4347018828652752	0.0043942364547349	0.4242557426137538	FAM114A2	13082	MFAP3	13106	GALNT10	164877	False	True	False	ref	-45	0.01277	-100	0.02887
3494	chr5	154026830	A	C	rs10038905	0.0393070934	0.0497550366867938	0.0393070934	0.0532766285340671	0.016623412588526	0.0632320320839887	0.0007472020471416	0.0293755175145153	0.0007472020471416	0.0311815477743016	0.2571209244909179	0.5646018454001038	0.0099219014460189	0.1159483989025899	0.0099219014460189	0.1239176016323728	0.0042024823280632	0.2347092546030875	0.0001862155822078	0.0641389447022106	0.0001862155822078	0.0687188778484585	0.03545887405471	0.014295291103936	0.03545887405471	0.0147389316412241	FAM114A2	12106	MFAP3	12130	GALNT10	163901	False	False	False	alt	75	0.012115	-45	0.009384
3495	chr5	154030460	G	A	rs2578375	-0.00693947972	0.4831402692289325	0.00693947972	0.4704412651521027	0.0064221156813071	0.8837993267867279	-4.5397977413461134e-05	0.574287820601691	4.5397977413461134e-05	0.5615864375378706	0.3017956617807238	0.4960805631900747	-0.0020346586629052	0.4518893098818585	0.0020346586629052	0.4385725561505546	0.0019361276026676	0.6206958799773792	-1.3274476372043283e-05	0.5175654003236974	1.3274476372043283e-05	0.5043141476467563	-0.0053382296496851	0.3592735556088738	0.0053382296496851	0.3500790830095657	FAM114A2	8476	MFAP3	8500	GALNT10	160271	False	False	False	ref	-100	0.02019	100	0.10675
3496	chr5	154030660	C	T	rs2578376	-0.056414542	0.0189194072607172	0.056414542	0.0177090522188231	0.0134680652716713	0.1131202989572081	-0.0007613793525312	0.0199799684069241	0.0007613793525312	0.0188799349465173	0.343818919283395	0.4296145515845179	-0.0194607322995156	0.047370351868424	0.0194607322995156	0.0436822218159047	0.0046551299771326	0.173366018012641	-0.0002640970628313	0.0346136123688429	0.0002640970628313	0.0322180128501814	-0.0411995975061981	0.0089698430793841	0.0411995975061981	0.0086973968933139	FAM114A2	8276	MFAP3	8300	GALNT10	160071	False	True	False	ref	40	0.001373	-35	0.002808
3497	chr5	154040248	C	T	rs567749	0.00309814804	0.6749561796828744	0.00309814804	0.6884857851997452	0.0256102743575342	0.0084314803299853	8.315998307500605e-05	0.3722900476313937	8.315998307500605e-05	0.3836530535067797	0.1043247336590627	0.8140647960435691	0.0003625410978728	0.7577436889812926	0.0003625410978728	0.7718849426772433	0.0027592071212386	0.4263298092926404	9.99537332439734e-06	0.568265819150758	9.99537332439734e-06	0.5817814842518477	0.0031162148984947	0.5182037075700797	0.0031162148984947	0.5298363686161823	MFAP3	1288	FAM114A2	1312	GALNT10	150483	False	True	True	alt	35	0.001205	-100	0.03177
3498	chr5	154046393	C	A	rs411245	0.00358052704	0.643236252513353	0.00358052704	0.6569323842076469	0.0133575604933839	0.1275464786283871	5.077125289008808e-05	0.5195396613735558	5.077125289008808e-05	0.532055628190387	0.3551904065394869	0.4067992524835788	0.0012600747144495	0.5315316428445295	0.0012600747144495	0.5453494734606402	0.0047791861421582	0.151449630248662	1.801950845725094e-05	0.4350685673190446	1.801950845725094e-05	0.4479563531105824	0.0023859168663574	0.5995054917216375	0.0023859168663574	0.6120196145125683	MFAP3	7433	FAM114A2	7457	GALNT10	144338	False	False	False	alt	5	0.000248	100	0.0371
3499	chr5	154071230	C	T	rs1438590	0.0031037293044	0.6537330281202572	0.0036210785843999	0.662468784693649	0.00842977681721	0.5058296645272076	2.599912017426776e-05	0.6604902202482147	3.074124861111853e-05	0.668878275306378	0.1155821118476332	0.7960100642581263	0.0003056263257889	0.7626387570501412	0.0003827143135288	0.7709863340977561	0.0009791716211391	0.7980355278817548	2.5466267097071955e-06	0.7644126850555779	3.2532308535979464e-06	0.7726659362721108	0.0027676635649747	0.5145693589559049	0.0032240998350604	0.5221602827548238	MFAP3	32270	FAM114A2	32294	GALNT10	119501	False	False	False	alt	-55	0.0006714	100	0.04626
3500	chr5	154072442	A	G	rs816028	0.0315352784	0.083481711581444	0.0315352784	0.0890571723278381	0.0123656125611668	0.151636577429101	0.0003921700239414	0.0572255050290473	0.0003921700239414	0.0609701201965139	0.5706905673295367	0.0766672507002229	0.0180066893782139	0.0463140296187848	0.0180066893782139	0.0505936961798622	0.0070626912164555	0.0458464933324273	0.0002241121446349	0.0375767897380864	0.0002241121446349	0.0405780459458746	0.0058154130229566	0.3198253221225028	0.0058154130229566	0.3289658993173529	MFAP3	33482	FAM114A2	33506	GALNT10	118289	True	False	False	alt	100	0.00842	100	0.06274
3501	chr5	154076692	T	C	rs1478350	0.0262633208	0.1125176252905214	0.0262633208	0.1193699838051716	0.0091912932110219	0.3995250506894343	0.0002458281666181	0.1228421161562589	0.0002458281666181	0.1293755839237213	0.2208197180468676	0.6226643626757274	0.0059724912931687	0.1982521988536581	0.0059724912931687	0.2085619653786786	0.0020502618067017	0.5887410084485972	5.653487631721721e-05	0.1988473483071608	5.653487631721721e-05	0.2084741886083264	0.0243633232709882	0.0405156927916862	0.0243633232709882	0.0415537083330256	MFAP3	37732	FAM114A2	37756	GALNT10	114039	False	False	False	alt	-100	0.001586	45	0.04984
3502	chr5	154081968	A	G	rs816009	0.0508675562	0.022946804984806	0.0508675562	0.0245839142372504	0.0108880893233111	0.2286727814710658	0.000544876979633	0.0313746106027134	0.000544876979633	0.0334335603278097	0.3385906492805942	0.4338195641541143	0.0172850835609642	0.0496433808587945	0.0172850835609642	0.0540686598456691	0.0036798759028175	0.3006418211999465	0.0001849881162263	0.0493683059503379	0.0001849881162263	0.0532244390718451	0.0370958204960631	0.0125023023413318	0.0370958204960631	0.0128545683908909	MFAP3	43008	FAM114A2	43032	GALNT10	108763	False	False	False	alt	-100	0.005165	-95	0.07806
3503	chr5	154083148	G	A	rs816010	-0.0384634472	0.0590283611856888	0.0384634472	0.0553934423394607	0.0177157060881988	0.0417627158376129	-0.0006957513715549	0.0244048282433316	0.0006957513715549	0.0230665747616709	0.1629830184960424	0.7153441414249014	-0.0066241910897981	0.2079085554334244	0.0066241910897981	0.1978178349250456	0.0030052714073054	0.372521447402929	-0.0001244135144918	0.109087537068919	0.0001244135144918	0.1029383450318106	-0.034809489724997	0.0150344636484671	0.034809489724997	0.0146063338849688	MFAP3	44188	FAM114A2	44212	GALNT10	107583	False	False	False	ref	60	0.001088	-100	0.03738
3504	chr5	154084867	G	A	rs816012	-0.0059104291	0.5483317501842366	0.0059104291	0.5355406716693291	0.0077812884093129	0.6363362043054059	-4.800156098206871e-05	0.5851856182958688	4.800156098206871e-05	0.5727154428675366	0.2743161236112407	0.5360117292144136	-0.0015161771477467	0.5247690506497	0.0015161771477467	0.5113741160462156	0.002122097094451	0.5805791440900647	-1.2212920220907908e-05	0.5505273330671132	1.2212920220907908e-05	0.5374027823638978	-0.0051847010861108	0.4093280229472963	0.0051847010861108	0.3993218666327821	MFAP3	45907	FAM114A2	45931	GALNT10	105864	False	False	False	ref	100	0.009155	-80	0.02634
3505	chr5	154089745	A	G	rs4958355	-0.00286249264	0.7311395972340573	0.00286249264	0.717454615482057	0.0109262075753085	0.2304053486245626	-3.190025858495293e-05	0.653760615974132	3.190025858495293e-05	0.6407279196376612	0.3259618875714478	0.4489009559794605	-0.0009237326272554	0.6173348086683926	0.0009237326272554	0.6030922638944112	0.0035486477244579	0.3123911319386583	-1.0271430044105346e-05	0.5630155909280239	1.0271430044105346e-05	0.5493747506809207	-0.0020726356082531	0.6544624329442115	0.0020726356082531	0.6417291747659218	MFAP3	50785	FAM114A2	50809	GALNT10	100986	False	False	False	ref	-85	0.00989	-90	0.1086
3506	chr5	154094777	A	C	rs815620	0.0075675630999999	0.4311013651171365	0.0075675630999999	0.4433789366152699	0.0070678679723985	0.7490587674266588	5.176153779939976e-05	0.506068663438169	5.176153779939976e-05	0.518403824935723	0.0566084710422306	0.8976666255672984	0.000470934197875	0.7410250210158723	0.000470934197875	0.7552655783858104	0.0003830365627427	0.9174475494738492	3.1261447593522546e-06	0.7717955926241443	3.1261447593522546e-06	0.7861356433607629	0.0047884314152636	0.3808037283217268	0.0047884314152636	0.3909548139780399	MFAP3	55817	FAM114A2	55841	GALNT10	95954	False	False	False	alt	-85	0.001083	60	0.04004
3507	chr5	154096161	A	T	rs890799	0.0036028072	0.564565491422462	0.0064973246	0.5674239903265198	0.0112593862433715	0.2143688784314312	6.339191426729074e-05	0.4779086218072822	8.868429307506337e-05	0.4809843882438299	0.3497235448500503	0.4153470002398702	0.0011361992740513	0.4805721728051924	0.0022095050817744	0.4827148376032717	0.0039365146301538	0.2483373581267174	2.0438160717624823e-05	0.4186567112922478	2.984955006592554e-05	0.4215462772899008	0.0029274162595047	0.4906408552431844	0.0043423686967706	0.4921885257000552	MFAP3	57201	FAM114A2	57225	GALNT10	94570	False	False	False	alt	60	0.05118	-65	0.0543
3508	chr5	154098617	T	C	rs6580052	0.0005911363539999	0.7687152567588259	0.002636688994	0.773590176281897	0.0105039342114846	0.2820913714670502	2.2147885328446908e-06	0.733436910224978	2.579804157065924e-05	0.7378829559214509	0.1798566375169866	0.6888539232324112	0.0001458274220587	0.743958330064833	0.0005251850424758	0.7495074271507025	0.0018197336169717	0.6438130177170313	7.619867994908979e-07	0.7242375007716533	5.022003330693782e-06	0.7293866191426683	0.0004979304764571	0.618186665670026	0.0022987790329774	0.6225161282810008	MFAP3	59657	FAM114A2	59681	GALNT10	92114	False	False	False	alt	55	0.001291	-100	0.06232
3509	chr5	154110798	G	A	rs1428122	-0.0472212138	0.0329289722902735	0.0472212138	0.0307745210774604	0.0106321626853554	0.2535808603531703	-0.0005058313606984	0.0424656111395863	0.0005058313606984	0.0399043106420845	0.2930466083673066	0.5050172711890434	-0.0140046074847105	0.0834581836185052	0.0140046074847105	0.0775070143436775	0.0030895642338622	0.3903245789463219	-0.0001487558336094	0.0787556804671126	0.0001487558336094	0.0736590077409447	-0.0378302679488376	0.0114170019672542	0.0378302679488376	0.0110754796722981	MFAP3	71838	FAM114A2	71862	GALNT10	79933	False	False	False	ref	-80	0.00414	-95	0.06323
3510	chr5	154183848	C	T	rs77075605	-0.01326991464	0.3020770044209308	0.01326991464	0.2910771552374895	0.0104066274488397	0.2787665651759882	-0.00015937908803	0.2572186306039429	0.00015937908803	0.2480766184930555	0.3641116609093455	0.3931391444170727	-0.0048425043518891	0.2806734150839158	0.0048425043518891	0.2690763400794115	0.0037799677439229	0.2810152381009758	-5.751747735835023e-05	0.2463575330673314	5.751747735835023e-05	0.236092351942123	-0.0078590026867498	0.2517902834141198	0.0078590026867498	0.2452443210981952	GALNT10	6883	MFAP3	144888	FAM114A2	144912	False	False	False	ref	60	0.0017395	10	0.01904
3511	chr5	154200245	G	A	rs80336253	-0.0018802203599999	0.5593150760442823	0.00529876004	0.5572830693924102	0.0088961367849038	0.453219537496954	-1.6454454952960188e-05	0.5842601929579172	4.1402779227455314e-05	0.5827687930840171	0.4997997904542578	0.1741954438650002	-0.0010239628068387	0.4046623774641382	0.0027079780561553	0.4034153910350573	0.0044495834206922	0.2035326052195744	-8.86816151732765e-06	0.4237249112428279	2.1156552016473306e-05	0.4223684715351613	-0.0004398385875372	0.7157239530739782	0.001506239691283	0.71648806118527	GALNT10	9514	MFAP3	161285	FAM114A2	161309	False	False	False	ref	-75	0.005962	-80	0.12146
3512	chr5	154243261	G	A	rs73802964	0.008808189	0.4057928462581904	0.008808189	0.4180197778846842	0.0069606633193802	0.7900945286207791	6.175736178091683e-05	0.4796538998156311	6.175736178091683e-05	0.4916456362676104	0.1644768099254141	0.7118842987841465	0.0013972743346443	0.5306854742475973	0.0013972743346443	0.5444466859704059	0.0011202191659561	0.7717448331593015	9.633910075796996e-06	0.5792795013465485	9.633910075796996e-06	0.5927611677501743	0.0079357669685369	0.2573160911166041	0.0079357669685369	0.2652264045963872	GALNT10	52530	SAP30L	202737	MFAP3	204301	False	False	False	alt	-35	0.0004654	100	0.04984
3513	chr5	154253839	G	A	rs73802970	-0.0048469342968	0.6277843010114975	0.0048469342968	0.615346448049908	0.0065948630032162	0.8653641437632706	-3.16472899766768e-05	0.7043972176681754	3.16472899766768e-05	0.6926635055514343	0.2772269421881969	0.536532338375697	-0.0013815614665849	0.5859987909886741	0.0013815614665849	0.5722852732287778	0.0018279092608223	0.6422826065979207	-9.04510123893282e-06	0.6447914058743421	9.04510123893282e-06	0.6313752147237375	-0.0037490015456591	0.49471496757688	0.0037490015456591	0.4833283986953202	GALNT10	63108	SAP30L	192159	MFAP3	214879	False	False	False	ref	5	0.0006866	-70	0.01466
3514	chr5	154259120	A	T	rs531293	0.0066341421399999	0.4807976753840001	0.0066341421399999	0.493185562552677	0.0194709942736161	0.0297320615610166	0.0001313919584269	0.2720837887487887	0.0001313919584269	0.2818075700690444	0.0984055851201775	0.8246089482211764	0.0006274388931182	0.6761362921298995	0.0006274388931182	0.6899136673649605	0.0019204045362161	0.6164136830963335	1.2477768105999724e-05	0.5157109001278185	1.2477768105999724e-05	0.5288216762867228	0.0055477753918608	0.3434778493368735	0.0055477753918608	0.3531272001623645	GALNT10	68389	SAP30L	186878	HAND1	219107	False	False	False	alt	-100	0.1152	35	0.01094
3515	chr5	154260334	C	G	rs2434528	0.001954160988	0.7165049105028942	0.002975299388	0.726149362038705	0.0082512136970206	0.5265297352686132	1.5588505294859872e-05	0.719605959691512	2.473517636054718e-05	0.7290279474185651	0.2810983516426518	0.526345777295203	0.000551115190077	0.6391648332929273	0.0008492716266641	0.64928761612903	0.0023450234127422	0.5321927749690823	4.457408897313743e-06	0.6440527205218776	7.12809376423042e-06	0.6540512187750293	0.0015996016556188	0.6016535759112883	0.0024751294100561	0.6104101058425971	GALNT10	69603	SAP30L	185664	HAND1	217893	False	False	False	alt	100	0.003506	20	0.00964
3516	chr5	154262375	C	G	rs2434535	-0.00247128302	0.6846094218795733	0.0036191911	0.6769550657818746	0.0070662381863875	0.747853988119795	-1.6863258735627982e-05	0.7317258864604281	2.563951291723625e-05	0.724235986912035	0.2339484849427898	0.6016746750207702	-0.0005207016783042	0.6423490166860883	0.0008485971594889	0.6350007317601978	0.0016864003157197	0.6598058339854027	-3.645045690542629e-06	0.6782418995637456	6.1519486163485546e-06	0.671094848801953	-0.0025311465886575	0.5282058227425397	0.0032240998350605	0.5211858902058484	GALNT10	71644	SAP30L	183623	HAND1	215852	False	False	False	ref	-65	0.0016365	-45	0.03256
3517	chr5	154263006	G	A	rs693446	-0.00490954136	0.599956863058765	0.00490954136	0.5863807552905844	0.0077267310901793	0.6147306105304845	-3.778078379903876e-05	0.6330759261337602	3.778078379903876e-05	0.6198068171587637	0.1979833815703482	0.6594681494640313	-0.0010499479592545	0.6299105986561905	0.0010499479592545	0.615410330137614	0.001537322896583	0.6878778155020281	-8.049265401971805e-06	0.6498323140860484	8.049265401971805e-06	0.6356401062014667	-0.0043734893515492	0.4329721722331041	0.0043734893515492	0.4228441603168301	GALNT10	72275	SAP30L	182992	HAND1	215221	False	False	False	ref	-45	0.002304	-100	0.0159
3518	chr5	154274876	C	A	rs73281462	-0.0120732444	0.3091763781427331	0.0120732444	0.2983066200086756	0.0097571403472194	0.3203201677742295	-0.000121846280011	0.2908725180139486	0.000121846280011	0.2811271456152395	0.1991348457971555	0.6536750839568505	-0.0024930643573085	0.4156332762567863	0.0024930643573085	0.4025030345776744	0.0019994855715782	0.5917874353715123	-2.5780831636913733e-05	0.3855012253827336	2.5780831636913733e-05	0.3733113299574389	-0.0107760453946617	0.167729721799436	0.0107760453946617	0.1627866477132589	GALNT10	84145	SAP30L	171122	HAND1	203351	False	False	False	ref	-95	0.002144	15	0.012054
3519	chr5	154275577	C	T	rs73281464	-0.001710932716	0.6920762020486891	0.003774607516	0.6856018404285508	0.0145261970208507	0.0980693816722052	-2.1733022267979548e-05	0.604185207121931	4.506565506086526e-05	0.5973376398684104	0.1414454506789489	0.752011325703042	-0.0003527884899058	0.7506940063134334	0.0006056340970173	0.7422147322215823	0.0019772542253055	0.6106561064667783	-4.353400239387531e-06	0.6932998388945558	7.212161491234264e-06	0.6853623116858703	-0.0012863203975144	0.5353443444740423	0.0032240998350604	0.5292869160055028	GALNT10	84846	SAP30L	170421	HAND1	202650	False	False	False	ref	-65	0.002245	40	0.00985
3520	chr5	154291416	C	T	rs73279685	-0.0718481242	0.0081655941978472	0.0718481242	0.0077707017047697	0.0244317458301476	0.0115204145307067	-0.0017955811263471	0.0052545907316819	0.0017955811263471	0.0050708961473019	0.2558677994585006	0.5687695976589515	-0.0185989111597915	0.0515875277330149	0.0185989111597915	0.0477368765990564	0.0064269714457117	0.0636575207328699	-0.0004777809903304	0.0156765686270261	0.0004777809903304	0.0147681690397598	-0.0673056774447867	0.0013445865602396	0.0673056774447867	0.0013234379073353	GALNT10	100685	SAP30L	154582	HAND1	186811	False	True	True	ref	-60	0.001139	-100	0.0284
3521	chr5	156384661	G	A	rs7702643	0.0118230092	0.3122153206171975	0.0118230092	0.3236490033202546	0.0256702041861324	0.0083703216390351	0.0003133600405049	0.095229560589511	0.0003133600405049	0.1004692968680135	0.1231112355937301	0.782479493164136	0.0014171556048755	0.5180188825250024	0.0014171556048755	0.5315548393814351	0.0031023916355455	0.389981345923833	3.669879551076623e-05	0.2858550773036318	3.669879551076623e-05	0.2968322975495007	0.0106536374858659	0.1819360690628079	0.0106536374858659	0.1878419979347776	PPP1R2B	465635	SGCD	514316	TIMD4	578565	False	True	True	alt	-95	0.002964	100	0.05026
3522	chr5	156391078	C	T	rs6556578	-0.079324776	0.0052583771914085	0.079324776	0.0050478100396041	0.0204387076563087	0.0238247550063568	-0.0016624226250575	0.0054737520952009	0.0016624226250575	0.0052762424950297	0.2595441861430098	0.5564932653629159	-0.0212673187197582	0.0409419511374585	0.0212673187197582	0.037967160429911	0.0052638271464888	0.1284347579535816	-0.0004440093316509	0.0178649294718459	0.0004440093316509	0.0167354840769107	-0.0696023817674456	0.0010201671693205	0.0696023817674456	0.0009913066223877	PPP1R2B	459218	SGCD	520733	TIMD4	572148	False	True	True	ref	-75	0.0073	-95	0.006226
3523	chr5	156392721	G	A	rs10036164	-0.00205528298	0.5122197440901012	0.00601043858	0.508459631138081	0.0074448813121981	0.6914428399342426	-1.6948340617644774e-05	0.5618799359576713	4.505082501225895e-05	0.5573186106223639	0.4107158787954231	0.3183726315299344	-0.0007851440056311	0.3943867011876611	0.0024704516527955	0.3907199439726517	0.003038763051363	0.4154590986023889	-6.442310256776258e-06	0.4325358052873711	1.841689141418632e-05	0.4286284707965696	-0.0010539528418344	0.533609720071597	0.0030996172159462	0.5285091942145287	PPP1R2B	457575	SGCD	522376	TIMD4	570505	False	False	False	ref	90	0.00483	15	0.0119
3524	chr5	156414643	G	A	rs35414747	-0.0020023455599999	0.6841842319246563	0.00366282012	0.6747265067422902	0.0138761123156394	0.1112135235888203	-2.426386477609281e-05	0.5475705881846662	4.9438562650227214e-05	0.5392910975333465	0.2311248041992136	0.6041029338598095	-0.0003010114365665	0.6556999095787444	0.0008492321062014	0.6463207423371355	0.003223021513549	0.3635063936419341	-3.268776068937368e-06	0.5591189962100958	1.1580429812649184e-05	0.5505284157374782	-0.0019481529891388	0.5239772117846416	0.0031929791802818	0.5161165633566063	PPP1R2B	435653	SGCD	544298	TIMD4	548583	False	False	False	ref	-85	0.005615	-45	0.03162
3525	chr6	16343362	A	G	rs9367911	-0.00143954894	0.8706194049356836	0.00143954894	0.8567640198720137	0.0213338832464608	0.0200830619402631	-3.121155239325849e-05	0.6780539056262339	3.121155239325849e-05	0.6649397612731682	0.4015041649809644	0.3273009489291879	-0.0005618037274319	0.7114914640750154	0.0005618037274319	0.6976486776892626	0.0084679896726574	0.0238606442785953	-1.197521750633561e-05	0.5358625288679887	1.197521750633561e-05	0.5227032685654913	-0.0008257347067915	0.8515139555044787	0.0008257347067915	0.8377744983465767	ENSG00000288708	14931	GMPR	104774	MYLIP	214275	False	False	False	ref	-75	0.01031	80	0.08527
3526	chr6	50830050	A	G	rs2857504	0.00365065652	0.6398578338553494	0.0037514471599999	0.6506294385561137	0.0084028019725538	0.5266896986462506	2.916185677769308e-05	0.6562354081176106	3.018814031725074e-05	0.6666520468396245	0.430643471405305	0.2793793888372088	0.00150491853951	0.497827677595151	0.0015554848077668	0.5095804830458995	0.0036703808248072	0.3102883648519681	1.210933705557985e-05	0.5135203602954433	1.2624219479916488e-05	0.524566679887564	0.0017884002946088	0.6665525366172795	0.0018174462390687	0.6768891206210622	TFAP2B	11326	TFAP2D	116523	DEFB112	780121	False	False	False	alt	100	0.007767	95	0.0421
3527	chr6	50842827	T	C	rs2245173	0.0577695184	0.0153091972080272	0.0577695184	0.0163675897573607	0.0139776639212843	0.0989467403639135	0.0008039146816653	0.0155753919236179	0.0008039146816653	0.0165264621878983	0.6333820890258197	0.0266902422389606	0.0365610747143642	0.0076274731802403	0.0365610747143642	0.0082723936536118	0.0088619089343526	0.0204237361316245	0.0005092714450438	0.0099802506011027	0.0005092714450438	0.0106734148603373	0.0057822176578594	0.3183874953000702	0.0057822176578594	0.3275337842358356	TFAP2B	24103	TFAP2D	129300	DEFB112	792898	False	True	False	alt	80	0.0061	90	0.1439
3528	chr6	50843402	A	T	rs2857513	0.00438580716	0.6055625545381194	0.00438580716	0.6190258830283257	0.0138530244027137	0.1100072786130006	5.82274414601476e-05	0.4758157793047587	5.82274414601476e-05	0.4878932969393886	0.6555835641448563	0.0189119461679572	0.0028762407510547	0.3578360383381509	0.0028762407510547	0.3704588807672005	0.0090682227729559	0.0190783707780561	3.812490436632189e-05	0.271525086388612	3.812490436632189e-05	0.2822846468524415	0.0004439880081743	0.8918763620950758	0.0004439880081743	0.9060560835363708	TFAP2B	24678	TFAP2D	129875	DEFB112	793473	False	False	False	alt	65	0.0029	-95	0.1733
3529	chr6	50846914	C	A	rs13195969	0.0240322856	0.138111916880894	0.0240322856	0.1451327758568646	0.0118415854768468	0.1803696647709182	0.0003053038891125	0.1060096589815247	0.0003053038891125	0.1114063973732017	0.5676303696096432	0.0788484873032094	0.0136767359102156	0.0819412028522099	0.0136767359102156	0.0877160670803781	0.0067414822871248	0.0557730652747485	0.0001744250454018	0.0692741590416056	0.0001744250454018	0.0737670552759566	0.0045498397286278	0.4104077368435091	0.0045498397286278	0.4205984241222956	TFAP2B	28190	TFAP2D	133387	DEFB112	796985	False	False	False	alt	95	0.00807	-70	0.03546
3530	chr6	50847801	T	A	rs56240592	-0.00415586332	0.6438099904841187	0.00415586332	0.6305011820577113	0.0212149335411429	0.0203059821097037	-8.553631190813496e-05	0.3926324824670377	8.553631190813496e-05	0.3814267816207832	0.3996908681625328	0.3352842512811906	-0.0016623956874702	0.5085491331169031	0.0016623956874702	0.4949527189990649	0.0084654065133231	0.0238545935238385	-3.416581104692822e-05	0.3184292369751005	3.416581104692822e-05	0.3069015941601334	-0.0023257502671189	0.6247518480156301	0.0023257502671189	0.6120617844201592	TFAP2B	29077	TFAP2D	134274	DEFB112	797872	False	False	False	ref	-80	0.001862	-15	0.02548
3531	chr6	50854368	C	T	rs9463650	-0.00195646219	0.8067513654797865	0.0021414170899999	0.7963241265810794	0.0082846004890837	0.543259569516024	-1.4708401348171167e-05	0.8144724143227801	1.6716027196067407e-05	0.8042361901544373	0.3465616863245469	0.4224446175681873	-0.0006749376889117	0.6760342578163387	0.0007465010126334	0.6649867062596619	0.0028883539899002	0.4386318161308957	-5.040584288787026e-06	0.6880673270880225	5.817381107225826e-06	0.6774205278142374	-0.0012386020601873	0.7451815470471738	0.0013962800443987	0.7350819306889561	TFAP2B	35644	TFAP2D	140841	DEFB112	804439	False	False	False	ref	-95	0.00565	-100	0.03986
3532	chr6	50934857	T	A	rs9463664	-0.0034227176299999	0.6660697717139596	0.00374636701	0.6574106180756585	0.0074841475072028	0.6659823172907533	-2.3377898817191448e-05	0.7198590411222638	2.644019306041808e-05	0.7118324386488288	0.1215157833587485	0.7872919165913491	-0.000378449772952	0.7625254291285288	0.0004297742479286	0.7541178442373192	0.0009297959040804	0.8076515072212884	-2.5714703306340647e-06	0.790150450658971	3.0570904314256235e-06	0.7819688697869052	-0.0034626915216962	0.5003355488929626	0.0037282544424734	0.4927748519374005	TFAP2B	116133	TFAP2D	221330	DEFB112	884928	False	False	False	ref	100	0.02168	-100	0.01959
3533	chr6	50956814	T	G	rs2894780	0.0299155895999999	0.0966731529834898	0.0299155895999999	0.1028099246200758	0.0108382104673234	0.2361144566794621	0.0003254107050538	0.0835019371230115	0.0003254107050538	0.0884892092012457	0.3814873598273841	0.3682907616264833	0.0115631317270052	0.098289312398452	0.0115631317270052	0.1057443822008408	0.0041548818473391	0.2370436763911905	0.0001263298000979	0.0875669876391144	0.0001263298000979	0.0937770521515577	0.0175997676324443	0.0861747274051552	0.0175997676324443	0.088744551412531	TFAP2B	138090	TFAP2D	243287	DEFB112	906885	False	False	False	alt	-60	0.010345	-85	0.06665
3534	chr6	63416275	T	C	rs9341835	-0.0005681105859999	0.7992653973988608	0.002175215546	0.7925931302065206	0.0086291212806367	0.4771131036005313	-2.7940385310019765e-06	0.8090444156972728	1.7228309872552773e-05	0.8025212024543942	0.1538812643284681	0.7328399903808086	-9.945145915471516e-05	0.8020775853825752	0.0003186801865059	0.7949792923721546	0.0013360835742682	0.7366222697067852	-5.944240109165219e-07	0.8111269543935431	2.563434769756271e-06	0.8041020838108267	-0.0008444070996586	0.6596172908595987	0.0019979460367845	0.6532045401982961	LGSN	96292	PTP4A1	105472	ENSG00000285976	156206	False	False	False	ref	-100	0.02216	-55	0.04016
3535	chr6	63442896	C	T	rs9344129	-0.0381332752	0.0552792468718011	0.0381332752	0.0520244327412454	0.0111724894170409	0.2252950114653826	-0.0004956786677949	0.0583456327501017	0.0004956786677949	0.0556761977791539	0.5793151381238394	0.067311769062636	-0.0223156231285072	0.0334611720128795	0.0223156231285072	0.0309216177413348	0.0065381534381896	0.0689262833670785	-0.0002926941243842	0.0388209167398397	0.0002926941243842	0.0365916272682733	-0.0062676998724052	0.3110624543779514	0.0062676998724052	0.3025480785457285	PTP4A1	78851	LGSN	122913	ENSG00000285976	129585	False	False	False	ref	90	0.001631	-5	0.0177
3536	chr6	63481681	T	C	rs10943823	0.00363195616	0.6498375521007516	0.0040873394799999	0.6595554468265071	0.0281703418826699	0.0054640524549272	9.282242371333415e-05	0.329182842196401	0.0001059557315448	0.3369337618647435	0.2345356279629456	0.5991550714481791	0.0007424941198508	0.6314886950612297	0.0008735032089895	0.6410241027341543	0.0068126763837622	0.056244370274699	1.9801447598463446e-05	0.3880737046698745	2.357976507159596e-05	0.3965954119001227	0.0030830195333976	0.4900320925588964	0.0035187087002976	0.4981834826311383	PTP4A1	40066	ENSG00000285976	90800	PHF3	154122	False	True	True	alt	-100	0.02432	-45	0.0501
3537	chr6	72433995	A	C	rs2789588	0.00714817414	0.4465226574027346	0.00714817414	0.4592100310299767	0.006876583882854	0.7779207140309347	4.783120115268911e-05	0.5246713960670546	4.783120115268911e-05	0.536875667483395	0.2660815983568294	0.5522032133915589	0.0019361029881793	0.460239317579466	0.0019361029881793	0.4737869700743025	0.0018039459426005	0.6460977292498764	1.2633018767170729e-05	0.5180081374283441	1.2633018767170729e-05	0.5311971315786564	0.0064087801740681	0.3143357738767537	0.0064087801740681	0.32272513405623	KCNQ5	187798	RIMS1	547444	KHDC1L	791775	False	False	False	alt	70	0.003435	0	0.0
3538	chr6	72448224	C	A	rs1856507	0.0088391663999999	0.3922581455811588	0.0102501501999999	0.4009439888604869	0.0073880263073059	0.6420837611635194	7.562188394258203e-05	0.4343448433296283	8.307053233081328e-05	0.4426670668691908	0.1321901679478002	0.7718962359786831	0.0013714231669612	0.5386726977455619	0.0015591562138941	0.5475003754631503	0.0009851870807663	0.797702864296859	1.1701438697262555e-05	0.5608402046569232	1.2692490100570206e-05	0.569692525600609	0.0086909615244971	0.2447270437588105	0.0097698108901544	0.2488006536620763	KCNQ5	173569	RIMS1	561673	KHDC1L	777546	False	False	False	alt	-100	0.004723	100	0.02792
3539	chr6	83582853	C	T	rs2023569	-0.0191562138	0.1999953282689707	0.0191562138	0.1909066420786794	0.0072566375037241	0.7180849333031951	-0.0001388220432911	0.2634952287239679	0.0001388220432911	0.254265466727162	0.1495658668658387	0.7394718148833229	-0.0029678271702154	0.3743281437697881	0.0029678271702154	0.3617850433782208	0.0010901913817813	0.7786964264079709	-2.164593848458198e-05	0.4207387127236015	2.164593848458198e-05	0.4085841507713462	-0.0180686521644414	0.0849199930160288	0.0180686521644414	0.0825757365097673	PRSS35	70318	SNAP91	126838	ME1	151802	False	False	False	ref	-40	0.003502	-25	0.00532
3540	chr6	83583552	A	G	rs2022265	0.0004193403	0.6703620387619235	0.00373183762	0.6704830239514535	0.0078469312421866	0.6167347889687521	5.773960239565215e-06	0.6896448306826027	2.9229227948516583e-05	0.6903914506142956	0.2263156256807643	0.614389751122129	0.0001136738231869	0.6308131922465005	0.000860798271327	0.6308959965384335	0.0017814405771402	0.6480083204838857	1.4468898945768534e-06	0.6496382432286406	6.756631135261743e-06	0.6501003655257087	0.0005643212066515	0.5116739117208687	0.0032282492556976	0.5124646416359177	PRSS35	71017	SNAP91	126139	ME1	152501	False	False	False	alt	100	0.00566	-85	0.006897
3541	chr6	83585701	G	A	rs2208335	-0.00465188144	0.6054282974155943	0.00465188144	0.592444806742683	0.0098282072118371	0.3194331921924819	-4.580223912403661e-05	0.5654941624447912	4.580223912403661e-05	0.5531723029682056	0.0333696407639082	0.9390262204171532	-0.0001577035868529	0.8809154560815285	0.0001577035868529	0.8665698946603835	0.0003375966727851	0.9284209184857654	-1.6074814601804603e-06	0.8657152413141943	1.6074814601804603e-06	0.8513497407246285	-0.0022220147511903	0.6428340472576903	0.0022220147511903	0.6300523837770817	PRSS35	73166	SNAP91	123990	ME1	154650	False	False	False	ref	85	0.05106	-80	0.04776
3542	chr6	83590652	C	T	rs2324447	-0.0283927376	0.1210039078670187	0.0283927376	0.114627369847215	0.0088765553233422	0.4478897397834103	-0.0002613519815437	0.1360633862308579	0.0002613519815437	0.1297243496475551	0.0890756128175603	0.8447006522621804	-0.0028198384451165	0.4046095114431161	0.0028198384451165	0.3919099872789123	0.0008271218450858	0.8348137470355262	-2.7027154477788404e-05	0.4018460546024308	2.7027154477788404e-05	0.3897941978878387	-0.0230085374329608	0.0621132054625692	0.0230085374329608	0.0604296745164106	PRSS35	78117	SNAP91	119039	ME1	159601	False	False	False	ref	5	0.00116	15	0.007362
3543	chr6	83597609	T	C	rs2207944	-0.00837552594	0.4383890395888433	0.00837552594	0.4259550989941267	0.0126616337920686	0.1462510090709348	-0.0001077473470957	0.3458707120829836	0.0001077473470957	0.3353556706300733	0.1886928287637838	0.6739579112031532	-0.0016865599806239	0.5160065143835307	0.0016865599806239	0.5023960732335351	0.0023708086295828	0.5349234995762633	-2.142794666850217e-05	0.4375047090243383	2.142794666850217e-05	0.4249978990981652	-0.0075560949802383	0.2730099892009069	0.0075560949802383	0.2655483636706782	PRSS35	85074	SNAP91	112082	ME1	166558	False	False	False	ref	-100	0.01449	-90	0.04623
3544	chr6	83634970	G	C	rs217331	-0.00527010374	0.5806238341479901	0.00527010374	0.567472608915819	0.0092064094188094	0.3917444625033985	-5.183351319786152e-05	0.5490196225495262	5.183351319786152e-05	0.5363773845772825	0.1409392213612174	0.7546725784137299	-0.000797887691164	0.671401935933528	0.000797887691164	0.6573704147021024	0.0013340645937988	0.7252392421887114	-8.106019378557397e-06	0.6497074804538173	8.106019378557397e-06	0.6357917715537457	-0.004858971566095	0.3877402400836756	0.004858971566095	0.377901631617693	SNAP91	74721	PRSS35	122435	ME1	203919	False	False	False	ref	10	0.001251	30	0.03485
3545	chr6	83654421	C	T	rs217311	-0.0042154461	0.345894947493338	0.0108084751	0.343724952610168	0.0092029992179806	0.4014653315703115	-4.8409706531550384e-05	0.3334852313048833	0.0001063740639303	0.3314868083676459	0.2352493283125343	0.600182494661047	-0.0012202396953345	0.3899197431225516	0.002709874261907	0.388227838788958	0.0021943959035694	0.5682058978706098	-1.371117155995188e-05	0.3764277587426156	2.686658563127403e-05	0.3749036761751879	-0.004452328343655	0.2027805232048353	0.0104399423230531	0.2036110965267209	SNAP91	55270	PRSS35	141886	RIPPLY2	198940	False	False	False	ref	55	0.001379	-75	0.013275
3546	chr6	83665314	G	A	rs217303	-0.0634930004	0.0141739809432089	0.0634930004	0.0133843563072355	0.0151132683292035	0.0820627960499178	-0.0010735741589445	0.016427685870625	0.0010735741589445	0.0155948874484782	0.1462380315148496	0.7484130394166428	-0.0104030379018256	0.1414890221704526	0.0104030379018256	0.1333579747118619	0.0024402775323408	0.4787774223679113	-0.0001932233475436	0.0887265586578761	0.0001932233475436	0.0838167435106432	-0.0574113839355179	0.0029485626445385	0.0574113839355179	0.0028667606166195	SNAP91	44377	PRSS35	152779	RIPPLY2	188047	False	True	False	ref	-5	0.0004478	85	0.05762
3547	chr6	83692088	G	A	rs217289	0.0029704596	0.6319108909450769	0.00403046728	0.6388147602871674	0.0052894870484199	0.9850020117071908	1.573343662950252e-05	0.7525498072415323	2.117773844555284e-05	0.7594778768523257	0.0339028413157812	0.9348666958428378	7.936671640515673e-05	0.8759209252671439	0.0001259569571748	0.8828728485463733	0.0001790673277387	0.958779334632962	4.240067579564217e-07	0.908875172861237	6.632987298088809e-07	0.915984427284872	0.0009751138497287	0.6684702558648143	0.0018423427628916	0.6746968936055722	SNAP91	17603	RIPPLY2	161273	CYB5R4	167569	False	False	False	alt	-55	0.006927	100	0.0215
3548	chr6	92391260	G	A	rs6917686	-0.0031365119999999	0.7014706009038973	0.003714222	0.6924254343902629	0.0216622823427811	0.018816039306143	-6.06863796140856e-05	0.4785316905867647	7.414773315797696e-05	0.4703152788293952	0.0626666251724602	0.8896310390220702	-0.0002471161357519	0.8518075304996207	0.0002781773602709	0.8429209531266891	0.0013594484398587	0.7193516500690251	-5.028805778793447e-06	0.7422750071933801	5.752570500605799e-06	0.7334808543094369	-0.0020996068423945	0.6286037431142064	0.002518698326746	0.6200953401611702	EPHA7	1028427	MAP3K7	1804174	BACH2	2094417	False	True	False	ref	45	0.001991	-100	0.02367
3549	chr6	92391262	T	C	rs6940316	-0.0084224063	0.4272408516037256	0.0084224063	0.4151971506619205	0.0211838124316094	0.0203714819578451	-0.0001814493348688	0.2102385250553356	0.0001814493348688	0.2018653502274468	0.0624653782715587	0.8900086269294533	-0.0006270492826591	0.7243834085380919	0.0006270492826591	0.7104532089666646	0.0013565711541411	0.7209734561516687	-1.392719578127026e-05	0.5574450526578949	1.392719578127026e-05	0.5443361973516065	-0.0061805620390252	0.3566326678983058	0.0061805620390252	0.347556918859966	EPHA7	1028425	MAP3K7	1804176	BACH2	2094419	False	False	False	ref	-85	0.004463	-95	0.02216
3550	chr6	92397226	G	A	rs12193330	-0.001268837913	0.8148475387116172	0.0021531249069999	0.8117070424414524	0.0206278724717671	0.0234154629865116	-2.499121964137485e-05	0.6277945889007815	4.02333247151801e-05	0.6236625563970493	0.0497017603917052	0.9130388648459684	-6.631759750344518e-05	0.9171513769884806	0.000101164849452	0.9145329775181495	0.0010423217022884	0.787213933147113	-1.3438222021216162e-06	0.8529676318831141	1.9435193609078203e-06	0.8499145388729399	-0.0007468957146858	0.7835096362294687	0.0011742860403115	0.7802997121535262	EPHA7	1022461	MAP3K7	1810140	BACH2	2100383	False	False	False	ref	35	0.000866	-40	0.0083
3551	chr6	92404307	C	T	rs1593657	-0.0341928222	0.0800029639383606	0.0341928222	0.075085453516077	0.0088519848856175	0.4461894927442151	-0.0003029319858854	0.0998021676436278	0.0003029319858854	0.0945016980001328	0.2494610939947509	0.5796580036087636	-0.0085669513851504	0.1539225153735015	0.0085669513851504	0.1450722573184596	0.0022167094185254	0.5621417961738986	-7.61687193589467e-05	0.1628248755862029	7.61687193589467e-05	0.1544039254717671	-0.0314173383541322	0.0233630155072801	0.0314173383541322	0.022762245006162	EPHA7	1015380	MAP3K7	1817221	BACH2	2107464	False	False	False	ref	70	0.02438	70	0.0203
3552	chr6	92413581	T	C	rs1346296	0.0294203213999999	0.0985044448725312	0.0294203213999999	0.1045705911331595	0.0114267427289905	0.1939337203390304	0.0003405954042097	0.0762084725160758	0.0003405954042097	0.0808061015102784	0.0382452100125519	0.9307307666564414	0.001251583321261	0.5513892840365497	0.001251583321261	0.5649508248177103	0.000433176044376	0.9096512327837332	1.4273301312816434e-05	0.5005608772385647	1.4273301312816434e-05	0.5135862024397684	0.0144462079482151	0.1347910868978281	0.0144462079482151	0.1387783244956978	EPHA7	1006106	MAP3K7	1826495	BACH2	2116738	False	False	False	alt	-55	0.0116	20	0.00788
3553	chr6	92416645	C	A	rs6919658	0.0026650500599999	0.592038422485429	0.0043966903399999	0.6010848787107785	0.0181445619977743	0.0416010709374429	6.10318778178051e-05	0.380376741555924	8.426720987747744e-05	0.3883160088205741	0.2692787269577485	0.5458017532780862	0.00078203583087	0.5432160734536355	0.0011993942103366	0.5528000055753477	0.0049681393533808	0.1440325160367056	1.770683904974269e-05	0.3793873848707789	2.330699781772189e-05	0.3883176436042749	0.002446083465596	0.4458008933780518	0.0039855185219763	0.4530704436201593	EPHA7	1003042	MAP3K7	1829559	BACH2	2119802	False	False	False	alt	-5	9.155e-05	-90	0.01984
3554	chr6	92422743	T	A	rs142115373	-0.0056097015599999	0.5344059193837459	0.0056097015599999	0.5213786705567235	0.0056891860544107	0.9602994662798516	-3.242460462630798e-05	0.6466851524364383	3.242460462630798e-05	0.6335859329760373	0.2120789634747248	0.6398281491695115	-0.0011608041486248	0.5728908133565878	0.0011608041486248	0.5589628116626809	0.0012055124952907	0.7551366956539065	-6.708802830393342e-06	0.6510436141010212	6.708802830393342e-06	0.6372819980168881	-0.0057199763483023	0.3609002114398031	0.0057199763483023	0.3519026608649545	EPHA7	996944	MAP3K7	1835657	BACH2	2125900	False	False	False	ref	-80	0.00116	-100	0.07587
3555	chr6	92605639	C	A	rs139659029	0.00740100916	0.4367383210213098	0.00740100916	0.4489708095554501	0.0194183258144557	0.0305029508734985	0.0001406217958276	0.2369935253965919	0.0001406217958276	0.2461612169803454	0.0237844790921067	0.9589202290878286	0.0001692083801513	0.8527542411782048	0.0001692083801513	0.8669935089060452	0.0004822013728648	0.9025278287765616	3.3685731256263386e-06	0.7576998795057608	3.3685731256263386e-06	0.7717331957814508	0.0026120602910818	0.5759474620930952	0.0026120602910818	0.5884353566442099	EPHA7	814048	MAP3K7	2018553	BACH2	2308796	False	False	False	alt	-25	0.004524	-100	0.04477
3556	chr6	95985497	C	A	rs648204	0.0057928574	0.5078798999998747	0.0057928574	0.5207526620711262	0.0230742996272681	0.0140986313131673	0.0001309526022256	0.2449949717561481	0.0001309526022256	0.254413000821773	0.1000715775059906	0.8190529815654021	0.0005728278077277	0.6780538846181831	0.0005728278077277	0.692137444548215	0.0023529777926233	0.5091065392579406	1.319742063896882e-05	0.4854571822007525	1.319742063896882e-05	0.4987059078659271	0.0050249483915807	0.3685685237573851	0.0050249483915807	0.3784576495285199	FUT9	30478	MANEA	408011	UFL1	536099	False	True	False	alt	0	0.0	-100	0.0317
3557	chr6	95987504	C	T	rs586541	0.001700014096	0.8087978809034615	0.001796986064	0.8171232315939024	0.0172603454994991	0.0480919111885952	2.87065674113105e-05	0.6693383043168997	3.041128256633839e-05	0.6780968266191547	0.010798867208166	0.9810583652035156	1.5474875687782843e-05	0.9632241334001986	1.630176140767157e-05	0.9755437702095336	0.0001997147512593	0.9603917333140648	2.732828460109402e-07	0.9466497210836315	2.8781905341384817e-07	0.957487850830947	0.0003091318374671	0.9176725108170664	0.0003298789406528	0.9259640891849192	FUT9	28471	MANEA	410018	UFL1	534092	False	False	False	alt	-95	0.01373	90	0.03568
3558	chr6	95990739	G	A	rs910025	0.0018910485265999	0.7740793149574342	0.0022980685666	0.7814032928083682	0.008342065663149	0.5317388446964725	1.7146919791982516e-05	0.776080561405744	2.060352024416972e-05	0.7832796549119392	0.0915424433863421	0.8358435106971146	0.0001359063923966	0.8726404462082675	0.0001608387401423	0.880017648814544	0.0007437837333838	0.8454021011329473	1.2261436980632347e-06	0.8727416953112431	1.4378806006261805e-06	0.8800353616524477	0.0012863203975144	0.7127604908201649	0.0016597682548573	0.7194683128311763	FUT9	25236	MANEA	413253	UFL1	530857	False	False	False	alt	5	0.00011444	60	0.05
3559	chr6	95991154	G	T	rs474447	0.00967954226	0.3795088914877462	0.00967954226	0.3916571132657048	0.01036323556797	0.2702761618488303	0.0001023011002837	0.3443685563681833	0.0001023011002837	0.3551991809396427	0.0373634581271589	0.9268406088486902	0.0004500824054166	0.7761452615798468	0.0004500824054166	0.7908702897136295	0.0004107029724307	0.905004384178468	5.087558071475521e-06	0.7425126148660796	5.087558071475521e-06	0.7570376761349493	0.0041680930300106	0.4395502099268419	0.0041680930300106	0.4494300616854858	FUT9	24821	MANEA	413668	UFL1	530442	False	False	False	alt	-25	0.003654	-100	0.01451
3560	chr6	95993615	G	T	rs675629	0.0023942095272	0.7393792907341978	0.0024426762728	0.7505678082846245	0.0206191090511055	0.0234648392484292	5.240227343753679e-05	0.4951705316679186	5.319744200212264e-05	0.5053094395920815	0.1315158870942644	0.7722431727658159	0.0002468877029102	0.8012512616707692	0.0002545771022601	0.8114239729414837	0.002675641444592	0.466188126227085	5.353609891392821e-06	0.6656126608122069	5.479765847645231e-06	0.6763465926114237	0.0023112272948889	0.5962101875674266	0.0023361238187117	0.6055124101302556	FUT9	22360	MANEA	416129	UFL1	527981	False	False	False	alt	90	0.00544	-95	0.0845
3561	chr6	95994527	G	T	rs582112	0.00888254408	0.3731047675909443	0.00888254408	0.3847686293313269	0.0291688172601957	0.0044091838747505	0.0002576482222531	0.1143763194584894	0.0002576482222531	0.1205954390909098	0.1449247398831938	0.7498493933753151	0.0013566146371931	0.5272809129164018	0.0013566146371931	0.5408590472160474	0.0042761247889011	0.2272355077018724	3.983354085009108e-05	0.273860775521103	3.983354085009108e-05	0.284667829893437	0.0084399215759499	0.2250631202830158	0.0084399215759499	0.2322212639584022	FUT9	21448	MANEA	417041	UFL1	527069	False	True	True	alt	100	0.005333	-20	0.03072
3562	chr6	96001717	A	G	rs595200	0.0369187296	0.0618288990746044	0.0369187296	0.0658971818776405	0.0082453236631962	0.5662432315199161	0.0003316373235425	0.0931103994095362	0.0003316373235425	0.0980684387787624	0.3172730007572693	0.4578139421147266	0.0112856270150522	0.1001437049135634	0.0112856270150522	0.1076626746196822	0.0025666582199009	0.4952083857924964	9.96593097574088e-05	0.1204293511456236	9.96593097574088e-05	0.1279298393219829	0.0295895185634705	0.0313843952555403	0.0295895185634705	0.0322833934862072	FUT9	14258	MANEA	424231	UFL1	519879	False	False	False	alt	75	0.007812	100	0.1182
3563	chr6	96012692	C	T	rs17592255	0.002958508816	0.7143344863358629	0.002958508816	0.7276362243895894	0.0174606211855538	0.046610918657104	5.375512439296168e-05	0.5447547014200311	5.375512439296168e-05	0.5573853646114102	0.2165665618937955	0.6295693606081644	0.0007106922895392	0.6860206772396625	0.0007106922895392	0.6996585066829816	0.0038320942445964	0.275114537624595	1.3116912028708028e-05	0.5555899116419516	1.3116912028708028e-05	0.5688121867816965	0.0026971234141432	0.5806799191862797	0.0026971234141432	0.5930996278274735	FUT9	3283	MANEA	435206	UFL1	508904	False	False	False	alt	-65	0.06824	-40	0.03061
3564	chr6	96028152	A	G	rs6926151	0.001144933044	0.718913934266298	0.003127004884	0.7201184322509347	0.011904440283474	0.1739207087793536	1.4372382177589725e-05	0.6603453660621361	3.6383425862827486e-05	0.6616112695410064	0.2646853183124306	0.5551948376820554	0.0002964478328378	0.674002961472792	0.000829471690426	0.6745949909367676	0.0031503968854427	0.3949031711540361	3.716219416544323e-06	0.6169683940212228	9.652252689094928e-06	0.6179580730193068	0.0012178549570016	0.6064469742122592	0.0027406923308332	0.6071052581735049	FUT9	12177	MANEA	450666	UFL1	493444	False	False	False	alt	10	0.0002289	95	0.01978
3565	chr6	104917850	C	T	rs1933801	-0.00117537718	0.8797207350157893	0.00117537718	0.8656742650540477	0.0085611390300562	0.4833923331512244	-1.0174445304480628e-05	0.8785216190397382	1.0174445304480628e-05	0.8645076256278073	0.0751107376632537	0.867894259158286	-8.126041952709922e-05	0.931973034011088	8.126041952709922e-05	0.9176287454120228	0.0006847357449186	0.8604316755016983	-7.321317892651369e-07	0.9312573836040636	7.321317892651369e-07	0.9168010044261692	-0.0009398437743129	0.8246516165955033	0.0009398437743129	0.8109448125581535	LIN28B	18767	HACE1	57931	BVES	219307	False	False	False	ref	60	0.004517	60	0.01602
3566	chr6	104929472	C	T	rs9391254	-0.0572097668	0.0181735622330188	0.0572097668	0.0169834247511258	0.0168168680441235	0.0517369768423518	-0.0009578163537986	0.0134139495805911	0.0009578163537986	0.0127236431246517	0.1746408157760972	0.6984822807386886	-0.0099201505672766	0.131411544136871	0.0099201505672766	0.1233155373999058	0.0028885025721166	0.4349789310263657	-0.0001630093442484	0.068385301465023	0.0001630093442484	0.0637737439314716	-0.0553802425336361	0.0027564627223576	0.0553802425336361	0.0026733269254737	LIN28B	7145	HACE1	69553	BVES	207685	False	True	False	ref	-100	0.01358	-75	0.05618
3567	chr6	104931079	C	T	rs7759938	-0.01048620886	0.3491397822699557	0.01048620886	0.3377288961755881	0.0096577676262548	0.3471574271224387	-9.99325873946752e-05	0.3365022912059549	9.99325873946752e-05	0.326406907421948	0.1010944096930465	0.8172707182527895	-0.0010475646680552	0.5970344806810033	0.0010475646680552	0.5830371890223452	0.0009630479989902	0.8002916604540867	-9.869947017071865e-06	0.5786171511383575	9.869947017071865e-06	0.5651576528997562	-0.0088278924055228	0.2179350720463252	0.0088278924055228	0.2115368871333037	LIN28B	5538	HACE1	71160	BVES	206078	False	False	False	ref	85	0.00711	-65	0.01033
3568	chr6	104942692	C	T	rs314265	-0.00258758604	0.7599891385155765	0.00258758604	0.7460519215538691	0.0062495434986577	0.9077485210290775	-1.656885617149383e-05	0.8148476618674111	1.656885617149383e-05	0.80096630311014	0.215871533937074	0.6204312801013506	-0.000520469491884	0.731941479339176	0.000520469491884	0.717734772854484	0.0013841718563198	0.7242757488908727	-3.4041431943816645e-06	0.7776337430144409	3.4041431943816645e-06	0.7634920458043012	-0.002533221298976	0.5993214469842877	0.002533221298976	0.5871132133436904	LIN28B	6075	HACE1	82773	BVES	194465	False	False	False	ref	-70	0.01446	95	0.02837
3569	chr6	104961091	T	C	rs314275	-0.00275860988	0.7554851619378539	0.00275860988	0.7417721903323952	0.0195411315698635	0.0294258277370682	-5.514682564573578e-05	0.5274707588629235	5.514682564573578e-05	0.5153771557016709	0.0384755028579134	0.9267436241980092	-0.000115879791339	0.907353657505486	0.000115879791339	0.8946483563770472	0.0007930578925981	0.828416944472038	-2.46323540309959e-06	0.8272759424599808	2.46323540309959e-06	0.813103928659097	-0.0014709696158673	0.7451318422589633	0.0014709696158673	0.7317520298930911	LIN28B	24474	HACE1	101172	BVES	176066	False	False	False	ref	100	0.02614	100	0.02606
3570	chr6	105005542	A	C	rs314261	0.00306283778	0.6942785575383013	0.0034075595399999	0.7022288325589697	0.00877205855108	0.44689088335215	2.7316299185952445e-05	0.6784216804361313	3.0261738135018145e-05	0.6862305540709306	0.1132791833940185	0.8005560104565728	0.0003631973235314	0.7662258839652862	0.0003997296271325	0.7740905662023468	0.0009937888924145	0.7953316592188914	3.2323293476409767e-06	0.7598296329874729	3.5444757838452453e-06	0.7677137035496087	0.0025269971680203	0.5365055585776708	0.0029958817000175	0.5436892412025904	LIN28B	68925	BVES	131615	HACE1	145623	False	False	False	alt	-90	0.009	90	0.0234
3571	chr6	105009311	T	G	rs314260	-0.00756121948	0.4530921825978551	0.00756121948	0.4407411334608837	0.0321131020349012	0.0027753401512598	-0.0002391604800113	0.13791114069139	0.0002391604800113	0.1312860199673257	0.1543874936461995	0.7302047941235469	-0.0011512069244797	0.5844699689443593	0.0011512069244797	0.5708035430558381	0.0050504879851863	0.1430537815999367	-3.703949459141422e-05	0.2966087029167137	3.703949459141422e-05	0.2856361965908511	-0.0070104461664539	0.2759421787139904	0.0070104461664539	0.2680018083550291	LIN28B	72694	BVES	127846	HACE1	149392	False	True	True	ref	15	0.002472	100	0.0645
3572	chr6	105017065	T	C	rs191135	-0.000282874208	0.9431187323602884	0.000665786904	0.9358462147566852	0.0089773994662773	0.4425757824092763	-1.8621160570508428e-06	0.9338262901053808	6.377693612151986e-06	0.9269671466318588	0.011767756926939	0.9768615504095508	-1.528769464309442e-06	0.9913064561352672	5.6479041459158585e-06	0.9890678059392092	0.0001024101932643	0.976956453185864	-5.95105832366829e-09	0.9909410613743976	5.45268104024231e-08	0.9885063698221008	-4.356891668998606e-05	0.9763966444435404	0.0001224079087957	0.9700471453783962	LIN28B	80448	BVES	120092	HACE1	157146	False	False	False	ref	-100	0.04007	-100	0.05362
3573	chr6	107772376	C	T	rs6909292	-0.0199620396	0.1868135785240869	0.0199620396	0.1780128060714668	0.0090691070822385	0.4154850678089923	-0.000186046844529	0.197924756862475	0.000186046844529	0.189714069957707	0.3892322534466125	0.3569331117956573	-0.0077646841999716	0.1706671027943614	0.0077646841999716	0.1614409472097725	0.003550609233293	0.3231843342132877	-7.278281994323258e-05	0.1768675127357255	7.278281994323258e-05	0.1682484726195326	-0.0113133953671718	0.1659547503591967	0.0113133953671718	0.1609033424119719	SCML4	51941	SEC63	185832	SOBP	282269	False	False	False	ref	50	0.001352	-60	0.0445
3574	chr6	107775325	T	C	rs7741285	-0.0123813129	0.302163438240773	0.0123813129	0.2913733742168883	0.0066146069686055	0.8576303762246208	-8.124856899347136e-05	0.3915394779253436	8.124856899347136e-05	0.3807717484085608	0.2315521945248394	0.6039164912857055	-0.0029290688148654	0.3680184815153263	0.0029290688148654	0.3555861456325857	0.0015252302647929	0.6888903740956375	-1.917674988471112e-05	0.4313517410571175	1.917674988471112e-05	0.4188182509262438	-0.0113714872560918	0.169018279125418	0.0113714872560918	0.1638973045497805	SCML4	48992	SEC63	182883	SOBP	285218	False	False	False	ref	70	0.000725	45	0.0476
3575	chr6	107795478	C	T	rs9400146	-0.0238982072	0.1578109861556962	0.0238982072	0.1500333097320237	0.0074774991069429	0.7022259591600447	-0.0001807726310043	0.2077144720584919	0.0001807726310043	0.1994341548568701	0.0816979429247191	0.8526563125410745	-0.0019846959047973	0.4623001461578582	0.0019846959047973	0.4492769855459113	0.0006116188442146	0.8712701735883448	-1.5037166856194094e-05	0.498673427336077	1.5037166856194094e-05	0.4858484063201549	-0.0183985311050944	0.0894487345188416	0.0183985311050944	0.0869740732598863	SCML4	28839	SEC63	162730	SOBP	305371	False	False	False	ref	-35	0.000702	-70	0.01117
3576	chr6	107843577	G	A	rs75971958	-0.089665471	0.0033915470849812	0.089665471	0.0032438337916343	0.0208733734527269	0.0225654343146047	-0.0019385171977929	0.0045186758234987	0.0019385171977929	0.0043709898435007	0.399074679197917	0.3404172735378787	-0.0361671405200138	0.0095543382493287	0.0361671405200138	0.0088859350124762	0.0083829480538088	0.0262745936484461	-0.0007859362684654	0.0065169905382127	0.0007859362684654	0.0061680337130449	-0.0541499393147231	0.0031893400793537	0.0541499393147231	0.003109342554525	SCML4	19260	SEC63	114631	OSTM1	322277	False	True	True	ref	-45	0.005028	70	0.03522
3577	chr6	107845511	T	G	rs75280747	0.000671866	0.486784117127559	0.0071120272	0.4925019627708225	0.0198773575840691	0.0275370582267075	-6.486431773863747e-06	0.2598673553837236	0.0001501299432674	0.2638568004061685	0.4134669446778494	0.3149764658856852	0.0001865904630986	0.3688072939142974	0.0029723230994045	0.3750398135533886	0.0082763116446723	0.0268122430874071	-4.542428649363179e-06	0.2088746405705126	6.320297956511683e-05	0.2131272740970696	0.0004481374288114	0.5034586483064183	0.0035104098590233	0.509838046726316	SCML4	21194	SEC63	112697	OSTM1	320343	False	False	False	alt	-75	0.0013685	-75	0.02136
3578	chr6	107846542	A	G	rs9386678	0.0176567688	0.2019065523684489	0.0176567688	0.2112685612585386	0.0079991019402884	0.5809055322500457	0.0001413250544392	0.237838821780241	0.0001413250544392	0.2469224998825385	0.2220956648927893	0.6145147430798226	0.0038558147986173	0.285280631321183	0.0038558147986173	0.2970938050778752	0.0017739838443603	0.63556598595721	3.077040802320433e-05	0.3073499331997771	3.077040802320433e-05	0.318831064399397	0.0158424879926139	0.1043700185611476	0.0158424879926139	0.1075244362425189	SCML4	22225	SEC63	111666	OSTM1	319312	False	False	False	alt	-75	0.001556	-75	0.02351
3579	chr6	108445865	C	T	rs2355851	-0.0005622818	0.8254366110802271	0.0020460962	0.8168021923084808	0.0190847555376734	0.034227486605782	-1.118322772166366e-06	0.6434956538677779	4.0353724752595725e-05	0.6367518691815435	0.0321995041442337	0.9459438069322448	1.8593099506593693e-05	0.9379615555972072	8.864592841284629e-05	0.9317521862110856	0.0006526018945539	0.869547757306024	9.045150701857416e-07	0.8834675070796094	1.9311268513865915e-06	0.8748886927411095	0.00013070675007	0.8124440782438157	0.0010809240759758	0.8045176550912644	FOXO3	113971	AFG1L	150873	SNX3	184619	False	False	False	ref	100	0.005302	100	0.021
3580	chr6	108447854	A	G	rs7762665	0.00247857118	0.7451901228748729	0.0026231235	0.7536270337949701	0.0099195063664033	0.322380216205819	2.231573043303186e-05	0.7283448431966872	2.412198186481508e-05	0.736658499107672	0.2454195582941731	0.5743923539558458	0.0007461959126826	0.6648512303139585	0.0007599405219934	0.6739566179775199	0.0023559816260007	0.5311146089488283	6.838945740594931e-06	0.6561595266658053	7.010691304591704e-06	0.6650676066232697	0.0021307274971732	0.6250700243772525	0.0022220147511903	0.6332395523823314	FOXO3	111982	AFG1L	152862	SNX3	186608	False	False	False	alt	-75	0.003605	75	0.03336
3581	chr6	108453769	A	G	rs6568544	-0.0239867156599999	0.1565016395422982	0.0239867156599999	0.1490067603042188	0.0153092402528498	0.0832812294154661	-0.0004275430016459	0.0778940655083973	0.0004275430016459	0.0742277917639779	0.4070042220354982	0.313450150602121	-0.0100334280363616	0.1400911414989022	0.0100334280363616	0.1319195845443541	0.0063621416955411	0.0736026649704189	-0.0001792402701312	0.0782868769435401	0.0001792402701312	0.0737765362580664	-0.0124544860423862	0.1699830213098543	0.0124544860423862	0.1652465520118969	FOXO3	106067	AFG1L	158777	SNX3	192523	False	False	False	ref	35	0.001728	90	0.1262
3582	chr6	108598524	G	A	rs78061564	0.0194661906	0.1792082631125036	0.0194661906	0.1879982531098215	0.0087138695823241	0.4597325260932515	0.0001747820865085	0.195412029062043	0.0001747820865085	0.2037662790885033	0.2709882882602517	0.542880698708025	0.0052528373595764	0.2216597580197401	0.0052528373595764	0.2325057379779991	0.0023530202705491	0.527155034258787	4.714861940236014e-05	0.2310554946379764	4.714861940236014e-05	0.2415138611985599	0.0166246537827155	0.0989943647837612	0.0166246537827155	0.101946753973144	FOXO3	38688	ARMC2	249893	AFG1L	303532	False	False	False	alt	75	0.01718	-15	0.00415
3583	chr6	108673623	G	A	rs9398172	-0.044985541	0.0394470114395212	0.044985541	0.0370073996745105	0.0089374711212203	0.4220439726838381	-0.0004126397629671	0.0621849390241439	0.0004126397629671	0.0587487521768628	0.3451591821491923	0.4212942487406476	-0.0156462772987404	0.0701629985094003	0.0156462772987404	0.0652205806315524	0.0031206361774761	0.3828526663892152	-0.0001453025432059	0.0833030794864064	0.0001453025432059	0.0782971748651017	-0.0320978433386237	0.0242049128686385	0.0320978433386237	0.0235363300305019	FOXO3	113787	ARMC2	174794	AFG1L	378631	False	False	False	ref	-70	0.00299	40	0.03537
3584	chr6	108675545	T	G	rs3800228	-0.0037416386799999	0.649392356153957	0.0042798996399999	0.6414792291446709	0.0081185343323274	0.5645118573095733	-3.0499355306471257e-05	0.6596339116933029	3.466068356747152e-05	0.6520541624407741	0.1775329619601862	0.69297867302103	-0.0006764093979121	0.6728570401898275	0.000780360727345	0.6650971921733484	0.0014419115345096	0.7096276606902466	-5.513399057671966e-06	0.6814920085940479	6.317053122911667e-06	0.6739091959239376	-0.0032614446207947	0.4710728861039733	0.0038465129306319	0.4643272516506218	FOXO3	115709	ARMC2	172872	AFG1L	380553	False	False	False	ref	50	0.0002985	-100	0.01753
3585	chr6	108676232	G	A	rs9374040	0.00455013938	0.4939218112125594	0.00689489242	0.5020627516339194	0.0142337151412113	0.0993787048377291	8.274142020813933e-05	0.3558647748184528	0.000110366795302	0.3627675558655553	0.2486602558117822	0.5775073417451999	0.0012403248629566	0.4864696288485051	0.0018499183291591	0.4945407163148401	0.0036538078788652	0.3020621393294761	2.310713255012924e-05	0.3790121863415456	3.028923143709132e-05	0.386833094115383	0.0046349028516893	0.3420856595189763	0.0062656251620866	0.3470732153451445	FOXO3	116396	ARMC2	172185	AFG1L	381240	False	False	False	alt	75	0.0286	70	0.0589
3586	chr6	108676408	G	A	rs9400240	-0.0042599098999999	0.6062766940256124	0.00506883062	0.5968377820382227	0.0201834183795715	0.0256244669076103	-8.883018518728723e-05	0.3573911013066458	0.0001050641163634	0.3494688712680622	0.2658243342773265	0.5508703855056152	-0.001240497125699	0.5640084909026759	0.0013862134521273	0.5540827925181404	0.0053639598693882	0.1193655727273259	-2.586468432760417e-05	0.3781621041384916	2.87890114977462e-05	0.3692871620239212	-0.0032614446207947	0.4524177322095912	0.0040830299069491	0.4453279283964546	FOXO3	116572	ARMC2	172009	AFG1L	381416	False	False	False	ref	40	0.001526	-100	0.03232
3587	chr6	108677063	A	G	rs3800231	0.000444515139	0.6596809519831837	0.003679749659	0.6608445943242421	0.0088222862934723	0.4637197458668761	1.1156401014922054e-05	0.6637482026323934	3.3680251069197905e-05	0.6654693912555594	0.316600794614052	0.4684628179168989	8.47289551102308e-05	0.5859391340768516	0.0011578958708126	0.5861975458481568	0.0027680565609992	0.4663509372867609	3.012033890860786e-06	0.5893927992399461	1.0505687233780864e-05	0.5903589344844727	0.0004107926430772	0.5736978432175883	0.0029253415491861	0.5750985545912825	FOXO3	117227	ARMC2	171354	AFG1L	382071	False	False	False	alt	-70	0.001581	45	0.01874
3588	chr6	108682786	C	A	rs9400241	0.00263932532	0.5945898053349554	0.0049628371999999	0.5996308042898817	0.0078752856796691	0.6188875135207597	1.9139309277791343e-05	0.6333534685832868	3.698807324207036e-05	0.637942294386731	0.2888847394682517	0.5122492456517821	0.0006497574812131	0.5608015784468108	0.0013786051696932	0.5656088742791323	0.0022774665081707	0.5496881514110754	4.682920816476618e-06	0.5862970536649387	1.0279217567214696e-05	0.5908002092147009	0.0023962904179503	0.4847010424051705	0.003831989958402	0.4889796329162278	FOXO3	122950	ARMC2	165631	AFG1L	387794	False	False	False	alt	-100	0.001513	15	0.015
3589	chr6	111460451	A	G	rs112540208	-0.00797582912	0.4313302591532957	0.00797582912	0.4192824752243326	0.0355588741037822	0.001805890798187	-0.0002837011343499	0.110772686332047	0.0002837011343499	0.105108453044069	0.1330470233093704	0.7690586638192015	-0.001113804204446	0.6144820742453919	0.001113804204446	0.6007957669093006	0.004818800652747	0.1736498083778866	-4.0034016268002384e-05	0.3162799308858451	4.0034016268002384e-05	0.305162218048441	-0.0064481996701209	0.3091452804306329	0.0064481996701209	0.3004950899441172	REV3L	23264	TRAF3IP2	146455	MFSD4B	201123	False	True	True	ref	10	0.002075	15	0.002747
3590	chr6	111490719	T	C	rs9320364	0.0011281826299999	0.8240314508349116	0.0017769806499999	0.8298194325312533	0.0104406566860211	0.2633598979834292	1.111034951970432e-05	0.7824191717697534	1.8195001592301355e-05	0.7882875660365543	0.118596665940518	0.7917819597343712	0.0001240477786943	0.8349142102334889	0.0002065026565098	0.8408961729269365	0.0012453179048429	0.7487992801003209	1.2071030376440643e-06	0.8130070546830357	2.1187184113878023e-06	0.8190742046338919	0.0010871482069316	0.6900841934066733	0.0016639176754945	0.6960077521944256	REV3L	7004	TRAF3IP2	116187	MFSD4B	231391	False	False	False	alt	100	0.09406	5	0.001492
3591	chr6	111501152	G	A	rs7746225	0.00407351936	0.5947867529064708	0.00502777976	0.6031240639482771	0.0369261305177653	0.0020303029832937	0.000193910336223	0.2082758167842409	0.0002222487688442	0.2141527369435909	0.3622174503884894	0.3997009748384127	0.0014708974799162	0.5008515202821385	0.0018524769107218	0.508836746176349	0.013440740779605	0.0051319753607123	7.05276444076489e-05	0.2003390884745786	8.18593134316718e-05	0.2067778766695743	0.0028589508189918	0.5298826240165391	0.0033153870890776	0.5375195723327852	REV3L	17437	TRAF3IP2	105754	MFSD4B	241824	False	True	True	alt	-65	0.003815	-100	0.04755
3592	chr6	111501486	A	G	rs9487653	0.00042576952	0.7577249068847065	0.00262318984	0.7618102545525457	0.0262839618085895	0.0085033741210966	1.4200754798870122e-05	0.4627170119990317	7.954655173386816e-05	0.4661353258858025	0.39183601489642	0.35127889718602	0.000162021202044	0.6064908535665295	0.0010689092097862	0.6106542653828604	0.0104198774878321	0.0122020527460487	5.437366484902105e-06	0.3673047335048864	3.2673558260995513e-05	0.3706930593188954	0.0001722009564414	0.7329525653852379	0.0014875672984158	0.7369749616889075	REV3L	17771	TRAF3IP2	105420	MFSD4B	242158	False	True	True	alt	0	0.0	60	0.00464
3593	chr6	111515841	T	A	rs9320366	-0.00620090568	0.5144548920547383	0.00620090568	0.5019617575704979	0.0269119061579531	0.0071147225953468	-0.0001713168738646	0.2173362564330049	0.0001713168738646	0.2087365611971632	0.0557163456052448	0.8951243087001955	-0.0003345694614294	0.7903485351755304	0.0003345694614294	0.77615630282294	0.0014906403930568	0.6942732519179591	-9.167995150670274e-06	0.5918672029209269	9.167995150670274e-06	0.5784827609920556	-0.0041763918712849	0.4426949428328395	0.0041763918712849	0.4319933518658617	REV3L	32126	TRAF3IP2	91065	MFSD4B	256513	True	True	True	ref	0	0.0	-100	0.00592
3594	chr6	111574657	T	C	rs4945884	0.0634119244	0.0112630661307101	0.0634119244	0.0120445357640154	0.01388802530247	0.1050272276865255	0.0009071439555253	0.0137623443000047	0.0009071439555253	0.0145501638619111	0.291683523688005	0.5043155120956331	0.018855856832369	0.0437382811951696	0.018855856832369	0.0476368348121224	0.0041169611993841	0.2364275433026853	0.0002749490532114	0.030838817351911	0.0002749490532114	0.0331693359429488	0.0526167283892986	0.0029755925063373	0.0526167283892986	0.0030913043693122	TRAF3IP2	32249	REV3L	90942	FYN	298795	False	True	False	alt	-75	0.004128	-65	0.03247
3595	chr6	113065866	C	T	rs12214623	-0.0311931618	0.0964105033830991	0.0311931618	0.0907531215702081	0.0079334482779701	0.5770379812150525	-0.000253125994244	0.1335467442230747	0.000253125994244	0.1270879708155748	0.3071006960653119	0.4812221125597684	-0.0096126796056981	0.1387911448741878	0.0096126796056981	0.1303561085466913	0.0024258861027712	0.5311462905137815	-7.75669497543175e-05	0.1666598037268033	7.75669497543175e-05	0.1582435720334568	-0.024213944128051	0.0412663397543058	0.024213944128051	0.0402038514261518	RFPL4B	718535	MARCKS	791480	LAMA4	810927	False	False	False	ref	20	0.0005074	15	0.005463
3596	chr6	113082872	C	A	rs1592148	-0.00503257544	0.6066885259817217	0.00503257544	0.5933808181345719	0.0087914945891125	0.4547933362829323	-4.371048217464616e-05	0.6058405096728734	4.371048217464616e-05	0.5928329686687281	0.0518449361507899	0.908622555647218	-0.0002592815002106	0.8504368882632367	0.0002592815002106	0.8363451131712967	0.0004549925598554	0.9069720631820484	-2.2706912181208405e-06	0.8488741803979478	2.2706912181208405e-06	0.8347107362619116	-0.0030788701127604	0.5588260910246209	0.0030788701127604	0.5469727381813924	RFPL4B	735541	MARCKS	774474	LAMA4	827933	False	False	False	ref	-65	0.05557	80	0.0366
3597	chr6	113086653	C	A	rs6568750	-0.0151763814	0.258310333871325	0.0151763814	0.2483721009035583	0.0083260325144599	0.5206558216272984	-0.0001321896656021	0.2843232655461561	0.0001321896656021	0.2749312866538808	0.0496000995860952	0.9127592881511308	-0.0008673356972264	0.6733068130288097	0.0008673356972264	0.6593713922120057	0.0004307580648784	0.911690978864618	-7.926373415735509e-06	0.6737577769053683	7.926373415735509e-06	0.6599951409553526	-0.0091308001120343	0.2313215586125229	0.0091308001120343	0.2249370372092009	RFPL4B	739322	MARCKS	770693	LAMA4	831714	False	False	False	ref	100	0.003235	15	0.003723
3598	chr6	113092775	C	T	rs7738702	-0.0307643124	0.099782718443744	0.0307643124	0.0940844230342752	0.0084680697844728	0.5028287084352624	-0.0002594082311734	0.1251489646570151	0.0002594082311734	0.1188768081721186	0.1622755422774094	0.7196434644745704	-0.0049582018588362	0.2529821185024706	0.0049582018588362	0.2421269118019285	0.0013903638726767	0.7194998134388275	-4.231432693015707e-05	0.265646752354214	4.231432693015707e-05	0.2552501878346272	-0.0298841274287076	0.027008030406683	0.0298841274287076	0.026318240111931	RFPL4B	745444	MARCKS	764571	LAMA4	837836	False	False	False	ref	-25	0.00705	85	0.02309
3599	chr6	113140926	T	A	rs6937893	0.0025927940319999	0.6787072527974725	0.003234405072	0.6891728172921355	0.0065752722711197	0.8595509036982856	1.67257889524479e-05	0.7385140260383205	2.131729217991245e-05	0.7488026298086452	0.1899480285065197	0.6730110446323544	0.000471320742765	0.6879207988758491	0.0006168694523147	0.6988582575269165	0.0012617986476365	0.7452976074860282	3.0633005251601905e-06	0.7298232084939096	4.104877642953888e-06	0.7404265282124858	0.0027780371165676	0.497319339084479	0.0034253467359619	0.5055791924914708	MARCKS	716420	RFPL4B	793595	HDAC2	870382	False	False	False	alt	65	0.01179	70	0.0436
3600	chr6	113142050	C	T	rs13218679	-0.0195700534	0.2051720487745526	0.0195700534	0.1962196925467081	0.0070814905150463	0.7677356470964501	-0.0001433782879092	0.2711522496179735	0.0001433782879092	0.26173608538881	0.1524600877602464	0.7356484993401304	-0.0031900636086394	0.3665116645673048	0.0031900636086394	0.354268244489037	0.0011152885824444	0.7762643294564241	-2.398716740072358e-05	0.4138251112721742	2.398716740072358e-05	0.4017164292289362	-0.0185209390138901	0.0917489478969862	0.0185209390138901	0.089167371823869	MARCKS	715296	RFPL4B	794719	HDAC2	869258	False	False	False	ref	25	0.0005608	-95	0.04587
3601	chr6	113147292	G	A	rs2502388	-0.0507626511999999	0.027368958418211	0.0507626511999999	0.0255168586273738	0.0139428120511859	0.0995721180367549	-0.0007247739448828	0.0229063308770836	0.0007247739448828	0.0215730966457256	0.3134119648544072	0.475012748107063	-0.0160226373143661	0.0692294490394451	0.0160226373143661	0.0640430935476942	0.0043409418048707	0.2085257078591403	-0.0002266859053897	0.0451403447352133	0.0002266859053897	0.041993628497937	-0.0394070477909521	0.0101673505081969	0.0394070477909521	0.0098630105713837	MARCKS	710054	RFPL4B	799961	HDAC2	864016	False	False	False	ref	85	0.00982	-100	0.0677
3602	chr6	113155934	C	G	rs13195261	0.0139737863999999	0.2692149624016243	0.0139737863999999	0.2798899917018358	0.0060622460853313	0.9079284455573428	8.674101016324507e-05	0.3737686957228263	8.674101016324507e-05	0.3848661906345719	0.1087812114233549	0.8078792812205726	0.001422929787937	0.5078666523128547	0.001422929787937	0.5213826510241738	0.0006631134814559	0.8604813643387039	8.861475826598399e-06	0.5785273528671149	8.861475826598399e-06	0.5919550983369466	0.012000124482619	0.1617164845228687	0.012000124482619	0.1668149950268661	MARCKS	701412	RFPL4B	808603	HDAC2	855374	False	False	False	alt	-5	0.0008793	95	0.01492
3603	chr6	113170851	A	G	rs1321026	-0.00364429905	0.6694641996867106	0.00386453239	0.6595155720936958	0.0173563369020188	0.0489566728185284	-6.352972862266072e-05	0.4794557523276407	6.67552071354219e-05	0.469930208205623	0.1270884552744323	0.7793466897505179	-0.0004654753013456	0.7524914213424607	0.0004977681496597	0.7426313999152033	0.0022716686358073	0.5357655002438336	-8.664635540995313e-06	0.6296902442234594	9.13758794483642e-06	0.6196524452688156	-0.0033838525295905	0.5141305709520758	0.003516633989979	0.5051892885860056	MARCKS	686495	RFPL4B	823520	HDAC2	840457	False	False	False	ref	100	0.00995	0	0.0
3604	chr6	118787200	T	C	rs902780	0.0348256592	0.0664082043264404	0.0348256592	0.0708502300570864	0.0157785086536023	0.0708972792082879	0.0005940328507792	0.0351798396696176	0.0005940328507792	0.0371573194358368	0.2020269919812446	0.6478914897378188	0.0070257518794815	0.1715325092290546	0.0070257518794815	0.1812583762478699	0.003181740899129	0.352987593344174	0.000119536019657	0.0979378571551707	0.000119536019657	0.104099029655815	0.032711957592921	0.0203448387359313	0.032711957592921	0.020904900348476	CEP85L	77125	ASF1A	106953	MCM9	147962	False	False	False	alt	-65	0.0008535	100	0.07874
3605	chr6	118935167	A	C	rs114000233	0.0251470447999999	0.1178080113235439	0.0251470447999999	0.1247553267710443	0.0173226120668566	0.0471135199932021	0.0004361219670769	0.0494847208924768	0.0004361219670769	0.0525559798849779	0.8426041763918712	0.0046030062330168	0.0211137955403509	0.0327540611863088	0.0211137955403509	0.0356871728045274	0.0145906101555428	0.0035115805200902	0.000365959654872	0.0182003845092079	0.000365959654872	0.0195837831947673	0.0051328333281465	0.3539632929483298	0.0051328333281465	0.3636435701015599	MCM9	5	ASF1A	41014	FAM184A	214220	True	False	False	alt	-55	0.01935	-60	0.06494
3606	chr6	118945469	C	T	rs6901738	0.002565738446	0.7267269081450781	0.0028893285019999	0.7352862065355182	0.0169428561361689	0.0513309747293526	4.649324445741557e-05	0.5588009242929348	5.2130804176285646e-05	0.5672482049848573	0.2181537152875029	0.6280566135065493	0.0005753757004367	0.7008494347109842	0.000644206435827	0.7094332678985772	0.0037478032762567	0.28518043799957	1.0523197883623003e-05	0.5728315672361557	1.1722361381537202e-05	0.5814385451198166	0.0025435948505689	0.5921807536417343	0.0027261693586032	0.6003417682192775	MCM9	10307	ASF1A	51316	FAM184A	203918	False	False	False	alt	-65	0.00905	0	0.0
3607	chr6	118979312	A	G	rs4946382	-0.00798454786	0.433507981879384	0.00798454786	0.421302853014516	0.0299018563915199	0.0039167008180661	-0.0002375507703498	0.1393670644269238	0.0002375507703498	0.1327398708605256	0.1110613180634653	0.7994187147731344	-0.0008472167422547	0.6413316888187085	0.0008472167422547	0.6274491542936544	0.0034044816771984	0.3016185471160818	-2.5780570083483326e-05	0.3757652866953229	2.5780570083483326e-05	0.3638785225297409	-0.006695090198031	0.300501460417884	0.006695090198031	0.2919752111124539	MCM9	44150	ASF1A	85159	FAM184A	170075	False	True	True	ref	-95	0.006104	-5	0.001556
3608	chr6	119012273	A	T	rs1775620	-0.0026965182	0.732359861900513	0.0028474304399999	0.7236686000082337	0.0085951580053933	0.4906278547550684	-2.464196015275532e-05	0.7247400473474265	2.585522588590804e-05	0.7162350995935239	0.0913972136640421	0.8332690305423904	-0.0002192454971026	0.8360021700267447	0.0002356910319836	0.8275621053934389	0.0007788784558758	0.83583101078889	-1.9908566376997966e-06	0.8348889352439727	2.1230712511996178e-06	0.8264229420081923	-0.0021618481519517	0.634971698130208	0.0022365377234203	0.6268453747305727	MCM9	77111	ASF1A	118120	FAM184A	137114	False	False	False	ref	-80	0.000496	-95	0.0652
3609	chr6	119020840	C	G	rs6931074	0.0358367858	0.0607093565376387	0.0358367858	0.0648424136954378	0.0106588030941382	0.2394026527516985	0.0003983093880405	0.0612128327172717	0.0003983093880405	0.0649053229334547	0.2949864625151712	0.5070436332427734	0.0106079023828293	0.1071049401801564	0.0106079023828293	0.1147610673318463	0.003105316843293	0.395873872219167	0.0001168951822582	0.0966014129687844	0.0001168951822582	0.1031756581172904	0.0296662828452576	0.0234596245285678	0.0296662828452576	0.0241150802346834	MCM9	85678	ASF1A	126687	FAM184A	128547	False	False	False	alt	-95	0.005436	-95	0.042
3610	chr6	119023364	C	T	rs2357023	-0.0703562908	0.0092837153319895	0.0703562908	0.0088283737964512	0.0176592228442723	0.0448027028766752	-0.0013127717045566	0.0095971690659573	0.0013127717045566	0.0092141627670384	0.3876471747632237	0.3525757597782294	-0.0275773082781181	0.0216249324778629	0.0275773082781181	0.0200093738877797	0.0068671725491329	0.0539402785274722	-0.0005148271469408	0.0138746072884269	0.0005148271469408	0.0131066753983059	-0.0431062562889656	0.0085812382419228	0.0431062562889656	0.0082954999477981	MCM9	88202	FAM184A	126023	ASF1A	129211	False	True	True	ref	100	0.0196	100	0.1134
3611	chr6	119025747	G	A	rs6929403	-0.0461497223999999	0.0375276449210775	0.0461497223999999	0.0351938395876851	0.0112016295440865	0.2337128148054929	-0.0005577518327404	0.0429123876378837	0.0005577518327404	0.0405437907807646	0.3665722673471716	0.3941267040216688	-0.0171309057104036	0.0619750173543049	0.0171309057104036	0.0573940143070809	0.0041509126479761	0.2377585823777476	-0.0002090309173024	0.0575528671376061	0.0002090309173024	0.0538235547194881	-0.0306372472743492	0.0278512808767423	0.0306372472743492	0.0270474807245794	MCM9	90585	FAM184A	123640	ASF1A	131594	False	False	False	ref	40	0.005344	-10	0.00354
3612	chr6	119027102	C	A	rs794249	0.0042560272	0.4886342514461606	0.0066981657599999	0.4917911885093948	0.0103368571971412	0.2787559923187918	5.00320455099893e-05	0.4494673481670393	7.377410315700627e-05	0.4522705682535666	0.4069751760910383	0.3257553753785871	0.0018386912655967	0.381762739870703	0.0028015624137822	0.3847183841791537	0.0042404404507304	0.2282066447444994	2.173270897908931e-05	0.3496364336669615	3.109363866863443e-05	0.3525630414333156	0.0020871585804831	0.5028894301665813	0.0034938121764748	0.5053804140417939	MCM9	91940	FAM184A	122285	ASF1A	132949	False	False	False	alt	-90	0.00241	50	0.015396
3613	chr6	143306931	C	T	rs7451540	0.0128012669	0.2950143945315482	0.0128012669	0.3059911089664164	0.0093614191107837	0.386564238339535	0.0001212679475253	0.2985558738090387	0.0001212679475253	0.3085887769417575	0.3885745702756252	0.3579282237401456	0.0050407288974363	0.2434191785604119	0.0050407288974363	0.2546403669703195	0.0036427583415062	0.3148968560550751	4.778162442956969e-05	0.2423553187943822	4.778162442956969e-05	0.2527932095016968	0.0072013195157625	0.2794482042250684	0.0072013195157625	0.2878337831842716	ADAT2	143764	PEX3	143875	FUCA2	204789	False	False	False	alt	85	0.01372	100	0.04407
3614	chr6	143323898	G	T	rs9376742	-0.0045285605	0.5321546506676302	0.0060689121	0.5224650957383578	0.008142895665104	0.5663609735670263	-3.571192041513088e-05	0.5503337864633407	5.0069890253532336e-05	0.5411328696519513	0.149758814925466	0.7355355014551587	-0.0007981494780911	0.6260954860985749	0.0009627642752589	0.6152814789904363	0.0012077237370911	0.7506546490739446	-6.375501869205978e-06	0.6358172896253625	7.90991410662765e-06	0.6254076319296779	-0.0042448573117978	0.3494673217020335	0.0055021317648523	0.3431099235553126	ADAT2	126797	PEX3	126908	FUCA2	187822	False	False	False	ref	80	0.001391	100	0.00988
3615	chr6	143333488	C	T	rs2303386	-0.050863789	0.0290449344699097	0.050863789	0.0273302798355239	0.0107322524752018	0.2501671390330522	-0.0005908998313372	0.0416552230897105	0.0005908998313372	0.039422177506875	0.228099876554736	0.6129867763000804	-0.0125069277468987	0.1090302508916056	0.0125069277468987	0.1020470473681893	0.0025147764559137	0.5004170277940703	-0.0001467224542056	0.0993298276558598	0.0001467224542056	0.0935650220370646	-0.0469009014616333	0.006128197910271	0.0469009014616333	0.0059871221867266	ADAT2	117207	PEX3	117318	FUCA2	178232	False	False	False	ref	95	0.00913	35	0.01926
3616	chr6	144569896	A	G	rs9376824	0.002680294174	0.6966549579257364	0.0029030547059999	0.7075752847817133	0.0067564861882852	0.833011373019558	1.7308821967291897e-05	0.758065446262245	1.8938412040017432e-05	0.7685726145683369	0.0213570680193777	0.9577629995199606	7.542781607625664e-05	0.9038076362362036	7.698530732204334e-05	0.9163168192003914	0.0001397307498499	0.9671324839873168	4.77746727008674e-07	0.9191556404551632	4.89140452140854e-07	0.9319075817533898	0.0014232512785401	0.7173467662602538	0.0014522972230002	0.7274014406150813	UTRN	284560	STX11	419408	SF3B5	474323	False	False	False	alt	60	0.005108	55	0.01222
3617	chr6	144588611	G	A	rs4896728	-0.002558027804	0.7761766588977514	0.0027820433239999	0.7659102383809023	0.0206552515459583	0.0238734872956926	-4.24423614503493e-05	0.5960624053813871	4.835057825939672e-05	0.5861276172228639	0.1547132231662153	0.7322471459099787	-0.0003454557595866	0.8043807759319457	0.0003916513049041	0.7940284161160872	0.003218404359572	0.3604490311389043	-5.457597493548129e-06	0.6901441641798944	6.675965339138367e-06	0.6799184934415499	-0.0021079056836688	0.6377965768454801	0.0023361238187117	0.6282915095067482	UTRN	303275	STX11	438123	SF3B5	493038	False	False	False	ref	100	0.00243	15	0.005554
3618	chr6	144593189	A	G	rs9376826	0.00138493918	0.7252743255636275	0.00286094582	0.7284394800912799	0.011298382349169	0.2102698884126293	1.3008975831194577e-05	0.6613620259517778	3.08408644965365e-05	0.6642245185242391	0.5715868421871596	0.074615045075347	0.0007812435737812	0.4858135215185855	0.0016362689561638	0.4892173500473797	0.0064663501949582	0.063450599195367	7.350490071283524e-06	0.435425672617487	1.7675781546486124e-05	0.4383383786964148	0.0002531146588657	0.8950494253038084	0.0004730339526343	0.898386779584023	UTRN	307853	STX11	442701	SF3B5	497616	False	False	False	alt	100	0.04895	100	0.05353
3619	chr6	144674342	A	C	rs9399485	-0.0016598027	0.819547696972832	0.00200215298	0.8099457842551274	0.0177425719990793	0.0454773121091502	-3.100099532970439e-05	0.6429240328476553	3.5185831789200346e-05	0.6331031236456989	0.1273477940642537	0.7781973791291215	-0.0001896318506907	0.8325513135786231	0.0002463226636843	0.8228660825663722	0.0021859399869616	0.5730485315146431	-3.5591389032019696e-06	0.7362638226504814	4.25211854410005e-06	0.7263090975084888	-0.0015871533937073	0.6714582278373551	0.0019025093621302	0.6624053377419628	UTRN	389006	STX11	523854	SF3B5	578769	False	False	False	ref	-60	0.004333	100	0.01312
3620	chr6	144730672	A	C	rs9403593	-0.004043505854	0.6323890691811057	0.004043505854	0.6192581099487999	0.035207885926964	0.0019032473398485	-0.0001431162609217	0.2573165204353341	0.0001431162609217	0.2479520198599178	0.2275314059274473	0.6045859407762648	-0.0010261806831558	0.606954199041028	0.0010261806831558	0.5931682932330655	0.0083639807368075	0.030151771653086	-3.689690343375255e-05	0.3102784450171548	3.689690343375255e-05	0.2992420872662885	-0.0038257658274462	0.4774185336005224	0.0038257658274462	0.4665717859466041	UTRN	445336	STX11	580184	SF3B5	635099	False	True	True	ref	-10	0.0008087	-100	0.0445
3621	chr6	144752704	A	G	rs4131500	0.01212316132	0.2946467547895636	0.01212316132	0.3055111213398255	0.0111016444327109	0.214096796354122	0.0001412064967823	0.2485652240856997	0.0001412064967823	0.2578665571473492	0.0477183373271506	0.9170814402864786	0.0006055027430509	0.6976959532465631	0.0006055027430509	0.7117274990981521	0.0005374125456942	0.8929015689757371	7.103567836204267e-06	0.6508723453777422	7.103567836204267e-06	0.664750239250822	0.006898411809251	0.2779393218244746	0.006898411809251	0.2862364523809201	UTRN	467368	STX11	602216	SF3B5	657131	False	False	False	alt	-30	0.001472	20	0.02574
3622	chr6	144757558	T	C	rs6927442	0.044954118	0.0365613431300199	0.044954118	0.038976145295904	0.0114055639028062	0.2074755579505235	0.0005471446121144	0.0382740904050443	0.0005471446121144	0.0405466984601173	0.2825651718378821	0.5200606819386203	0.013796367462353	0.0820986502571465	0.013796367462353	0.0882277734592822	0.0033472708690439	0.3426099999988486	0.0001729477756417	0.0695822508921311	0.0001729477756417	0.0743014312441587	0.0367659415554102	0.0141435637441655	0.0367659415554102	0.0145685868317289	UTRN	472222	STX11	607070	SF3B5	661985	False	False	False	alt	-55	0.002052	-60	0.0198
3623	chr6	144799546	A	G	rs9376859	0.0008850292799999	0.8688338306956865	0.0013103270399999	0.8765249725709948	0.0068974513705984	0.7927930163577284	5.893593777229083e-06	0.8886832438133144	9.257939954174058e-06	0.8962551170761304	0.1224660006846543	0.7833188514991745	0.0001031005039986	0.8642515975587821	0.0001533955749322	0.8721754604161178	0.0008361124736781	0.8271241742690486	6.735717005477136e-07	0.8827761356253527	1.0714341930753612e-06	0.8905782663813416	0.0009128725401715	0.7685136573502482	0.0011991825641344	0.7761192559590908	UTRN	514210	STX11	649058	SF3B5	703973	False	False	False	alt	-85	0.0008545	-85	0.03278
3624	chr6	146424720	C	T	rs2268665	0.001492068104	0.5770412142045954	0.0052849575359999	0.5803885247819408	0.0070195846985359	0.7281423062016167	8.58141188330322e-06	0.6228367903879932	3.869641267129271e-05	0.6255920167037518	0.3320449382255002	0.4445098021962846	0.000554460431597	0.5112523598845197	0.0017676776891614	0.5148471296931091	0.0023452346294241	0.5302039204840434	3.278304121735696e-06	0.5477579798577619	1.2926253671803926e-05	0.5508898435798096	0.0014937914293716	0.4997376282228855	0.0036058465336776	0.5028594062866547	RAB32	119114	ADGB	174248	GRM1	397073	False	False	False	alt	-85	0.02028	-90	0.02483
3625	chr6	146426194	G	A	rs4896868	0.002977764884	0.6911005404031811	0.003523689604	0.7011313886426778	0.0073475578116078	0.7129241135952809	1.9961062611762293e-05	0.7286269705687568	2.520201408298497e-05	0.7383867252543042	0.2411435803275967	0.5821406744720351	0.0008940055557438	0.6423505909024106	0.0009433544906144	0.6535686250131131	0.0016876074441294	0.6578665072930425	6.143973160664478e-06	0.6769207144304256	6.617729642788094e-06	0.6875965924846051	0.0022780319297917	0.5715433181404905	0.0027220199379661	0.5806903221623434	RAB32	117640	ADGB	172774	GRM1	398547	False	False	False	alt	90	0.003914	75	0.04764
3626	chr6	146430879	T	A	rs2206959	-0.0026958114	0.6742408527868596	0.00369279304	0.6645281172564979	0.0048619236084012	0.996081037705954	-1.2926788041168824e-05	0.8020894929079608	1.7860129109940605e-05	0.7922493071561628	0.1028454652019211	0.8187638006608954	-0.0001612100992996	0.7871461880015233	0.000352789764696	0.777399885096697	0.0005004205382963	0.8975026157564713	-7.573662991682227e-07	0.8549453932433314	1.7053554894910318e-06	0.8449961517491551	-0.0019066587827674	0.5322659777661097	0.0030975425056275	0.5244454291289711	RAB32	112955	ADGB	168089	GRM1	403232	False	False	False	ref	100	0.00283	-45	0.01459
3627	chr6	156835433	A	G	rs9372017	-0.00332222972	0.7151897584406676	0.00332222972	0.7018300951989466	0.0127036366765842	0.1378748305425946	-4.116611992039244e-05	0.6090206103923103	4.116611992039244e-05	0.5961589750122563	0.234155955974647	0.5951223375273572	-0.0007340076944414	0.6733928418647978	0.0007340076944414	0.6594802239167243	0.0029994224008783	0.4094483439927049	-9.211285395372666e-06	0.5993760719282549	9.211285395372666e-06	0.585903916409283	-0.0027199452276475	0.5847660186625423	0.0027199452276475	0.5726677428821144	ARID1B	59412	TMEM242	488168	ZDHHC14	545701	False	False	False	ref	-95	0.081	-100	0.03534
3628	chr6	156903078	T	G	rs287943	0.007750161	0.4158674360725531	0.007750161	0.4279038975606742	0.0093452715774395	0.3907478411110745	7.163359572125883e-05	0.4092263010990798	7.163359572125883e-05	0.4203999777955851	0.1221215987717714	0.784595752306101	0.0009422175510412	0.5907989784809556	0.0009422175510412	0.604465104972916	0.0011631513852395	0.7635914223670303	8.881251208086852e-06	0.5762690329477219	8.881251208086852e-06	0.5897711151099732	0.0070706127656925	0.2642627803006712	0.0070706127656925	0.2724871750272661	ARID1B	127057	TMEM242	420523	ZDHHC14	478056	False	False	False	alt	-15	0.001652	-75	0.0251
3629	chr6	157015101	G	A	rs6928411	-0.0058381019999999	0.4981661643324721	0.0077864927599999	0.4924065704256906	0.0095727085464421	0.353174099932609	-6.017422823056313e-05	0.4841070494211494	7.85646971912941e-05	0.47910716186248	0.2205479309951347	0.6207586701679654	-0.0017847897052514	0.5031358198621919	0.0021281001128659	0.4972153718330385	0.0021386685461038	0.5810649906988044	-1.850741683763389e-05	0.491984894491959	2.1746736264643977e-05	0.4869642628435136	-0.0052261952924822	0.3414211650622379	0.0069648025394453	0.3387005825493526	ARID1B	239080	TMEM242	308500	ZDHHC14	366033	False	False	False	ref	-85	0.003897	35	0.04742
3630	chr6	157019196	T	C	rs1407509	0.0024463450199999	0.5983015256065206	0.00469287458	0.6018888819426869	0.0081255175801176	0.5547406266480049	1.930773073748904e-05	0.6203737470813779	3.697396108576074e-05	0.6232374549726615	0.1866990321476363	0.678577453290477	0.000587705316982	0.6322094507453205	0.0009696337399431	0.6356486929511609	0.0015083907280389	0.6940206957482472	4.537877760950185e-06	0.6438366449143794	7.54120607726012e-06	0.6468970241997176	0.0020415149534746	0.4345193522274294	0.004224110208612	0.4361072618112538	ARID1B	243175	TMEM242	304405	ZDHHC14	361938	False	False	False	alt	-60	0.001724	5	0.001099
3631	chr6	164657500	G	A	rs147044092	-0.059935835	0.0157889291960942	0.059935835	0.0148268761674106	0.0098708681566076	0.3116144464307319	-0.0006081940299586	0.0323520758292216	0.0006081940299586	0.0304896647515126	0.5675370076453076	0.0791896147397572	-0.0342987002149097	0.0113904021489516	0.0342987002149097	0.0105391191809062	0.0056226035487588	0.0994144416739134	-0.0003495189600736	0.023804224548335	0.0003495189600736	0.0222397689935603	-0.011709665038019	0.1608899732269552	0.011709665038019	0.1558687459381605	C6ORF118	652105	QKI	1243499	PDE10A	1330617	False	True	False	ref	-100	0.01183	-100	0.182
3632	chr6	164660964	A	G	rs59034682	0.002589505348	0.651178071692237	0.004189336668	0.6595604109234393	0.0079525615436839	0.5975829571830874	1.963408585083448e-05	0.6706452295801781	3.282091440481786e-05	0.6787563617088627	0.0252761958111597	0.9554506426736006	6.910519730974737e-05	0.90434082838341	0.0001060145517267	0.9130578049270948	0.0002045915749997	0.9579285168251216	5.429786069027873e-07	0.9080013304566162	8.472090107872576e-07	0.9166705725905248	0.0009626655878172	0.7238920063055198	0.0015186879531944	0.7320698381988708	C6ORF118	648641	QKI	1246963	PDE10A	1327153	False	False	False	alt	-65	0.02054	-100	0.02449
3633	chr6	164665028	C	A	rs113650580	0.01216260086	0.3007375468683676	0.01216260086	0.3118910692945389	0.0081989847588653	0.5394573346789578	0.0001043103786082	0.3278250976309914	0.0001043103786082	0.338416939880465	0.1574041224494029	0.7292829972901774	0.0019614028251585	0.4487594933863274	0.0019614028251585	0.4618921226937419	0.0012892898451749	0.7442772923107321	1.690147602788344e-05	0.4637107727951006	1.690147602788344e-05	0.4764665320301122	0.011854894760319	0.1589418046555534	0.011854894760319	0.1636769096922603	C6ORF118	644577	QKI	1251027	PDE10A	1323089	False	False	False	alt	100	0.00939	15	0.01112
3634	chr6	164687522	T	G	rs79222572	0.0429192179999999	0.0404710037694983	0.0429192179999999	0.0435015027878816	0.0107236103080594	0.2412420521871114	0.0004656638129979	0.0442800073300822	0.0004656638129979	0.0472230489498654	0.3355034803265593	0.4333862350899254	0.0149356967141773	0.0686144786501674	0.0149356967141773	0.0743113518915956	0.003600559139888	0.3188308199770577	0.0001621143650754	0.0653622462236395	0.0001621143650754	0.0702970260818366	0.0295148289920019	0.0247128787371069	0.0295148289920019	0.0253263530063446	C6ORF118	622083	QKI	1273521	PDE10A	1300595	False	False	False	alt	90	0.004044	100	0.10315
3635	chr6	164715189	A	G	rs55855028	-0.0034851738959999	0.6971015475714526	0.0035056738639999	0.6863301920762453	0.0144590013722514	0.0906308773150286	-4.979067583340054e-05	0.5514406979658493	5.0112671753808406e-05	0.5413742791805538	0.1649602174296413	0.714793505473703	-0.0005684765230228	0.7280602619047136	0.0005720028093498	0.7168844566255367	0.0023738559545053	0.5353413725003207	-8.059498931834482e-06	0.6397300488858949	8.114886812955688e-06	0.6283449513964676	-0.0031660079461404	0.5291635159500144	0.003182605628689	0.5198010556761211	C6ORF118	594416	PDE10A	1272928	QKI	1301188	False	False	False	ref	-10	0.0004883	80	0.02383
3636	chr6	164716933	A	G	rs75952763	-0.000670435634	0.835242826746348	0.001803351926	0.8328169862127499	0.0077516981230203	0.6237997439565874	-5.5732487280855e-06	0.8544251999815422	1.3252235539829404e-05	0.8520901127760846	0.0542267035965102	0.9049324327795883	-4.177062561474647e-05	0.9162755175688164	9.675926960016291e-05	0.9142473029078416	0.0004275337411543	0.9134931797494672	-3.555095573912722e-07	0.9238811895784572	7.322937145284011e-07	0.921766778110316	-0.0004149420637143	0.7904309743946213	0.0011327918339401	0.7883190484818656	C6ORF118	592672	PDE10A	1271184	QKI	1302932	False	False	False	ref	100	0.01513	-25	0.01384
3637	chr6	164718895	A	G	rs9347029	-0.0003742041279999	0.8533338661647116	0.001526931232	0.85093123642503	0.022334853855191	0.0162600562907965	-1.0943493807649288e-05	0.6480518362634711	3.444455930850349e-05	0.6454393320285944	0.0293343291942862	0.9495832057687872	-3.140594147643781e-05	0.9481575060759836	5.507067567825725e-05	0.9460258430847396	0.0006822242260644	0.862984046103008	-8.228415798340428e-07	0.8926304239453337	1.3079464424719675e-06	0.8903227254720038	-0.0003298789406529	0.8599335612011342	0.0007157750599072	0.8575750853264139	C6ORF118	590710	PDE10A	1269222	QKI	1304894	False	True	False	ref	-30	0.000641	10	0.014404
3638	chr6	164734384	G	A	rs1912669	-0.0273986698	0.1235491513812039	0.0273986698	0.1168106649035096	0.0082401856585112	0.5418777942534228	-0.0002290438181861	0.1559840822773237	0.0002290438181861	0.1488770924476106	0.215527132024191	0.6283462877443583	-0.005933466597078	0.2252369359839466	0.005933466597078	0.2146210118302086	0.0017227639736616	0.6611602196094503	-4.801494314890897e-05	0.248897877714101	4.801494314890897e-05	0.2388055355904962	-0.024863328457764	0.0396405669904202	0.024863328457764	0.0386922798097443	C6ORF118	575221	PDE10A	1253733	QKI	1320383	False	False	False	ref	70	0.05304	-35	0.01721
3639	chr6	164751626	G	A	rs978164	-0.0102989410399999	0.3613346102302521	0.0105985945599999	0.3516488436716384	0.0067135084526646	0.8248353331445387	-7.134558137803652e-05	0.441676653210216	7.309893463084795e-05	0.4325437386895035	0.3615244971420864	0.3968005887236026	-0.0038588095209953	0.3262028018164324	0.0039610813360824	0.3160278095550811	0.0024217465265295	0.5250354447527794	-2.6571570140907108e-05	0.3849026751470026	2.7169989993506705e-05	0.3750984626168505	-0.0063216423406881	0.3125933085148514	0.0065125156899967	0.306082279786035	C6ORF118	557979	PDE10A	1236491	QKI	1337625	False	False	False	ref	80	0.002415	0	0.0
3640	chr6	164753774	G	A	rs1467085	0.0055706997999999	0.4742912213153561	0.0065395685999999	0.4845175335083445	0.0104891876544137	0.2603228400297871	5.789369527434984e-05	0.4215067363596319	6.818801999633523e-05	0.4306615825021999	0.2428469174991441	0.5756876574522325	0.0011989524366922	0.4981175355989232	0.0015380801511018	0.5088591804501388	0.0025461271150957	0.4893801214213789	1.2380724717889495e-05	0.4560432780429233	1.5983989324049633e-05	0.4661671901475168	0.0049066899034221	0.3351542282944185	0.0055705972053651	0.3424350628241531	C6ORF118	555831	PDE10A	1234343	QKI	1339773	False	False	False	alt	-35	0.003624	-65	0.03003
3641	chr6	164757079	C	A	rs1995942	0.0114245243799999	0.3029426999520908	0.0114245243799999	0.3140328541097855	0.0180046766162228	0.042934871526902	0.0002101790867317	0.1532137260382037	0.0002101790867317	0.1605476348128418	0.2405792591209452	0.5940787516676443	0.0027343583094654	0.3586198359263483	0.0027343583094654	0.3710190732631509	0.004304347822045	0.2151469645683472	5.009886416458315e-05	0.2188805620500602	5.009886416458315e-05	0.2287836466625157	0.0107884936565731	0.1697740554988016	0.0107884936565731	0.1752073177839526	C6ORF118	552526	PDE10A	1231038	QKI	1343078	False	False	False	alt	75	0.01041	-55	0.0201
3642	chr6	170341644	T	C	rs2092778	-0.00652597874	0.5247464208490591	0.00652597874	0.5118942576412403	0.007955683374406	0.6006238297938431	-5.06532841229309e-05	0.5649186099379572	5.06532841229309e-05	0.5524516466439693	0.5275054720484653	0.131766061223518	-0.0034053543498395	0.3539332318140558	0.0034053543498395	0.341756593297295	0.004198884212639	0.2313682516908068	-2.6422090682602817e-05	0.3854375401645433	2.6422090682602817e-05	0.3735948651959592	-0.0017157854334587	0.7142755983019912	0.0017157854334587	0.7012084542605185	DLL1	35079	FAM120B	50940	PSMB1	211663	False	False	False	ref	-90	0.00746	-20	0.0058
3643	chr6	170365688	T	C	rs6914386	-0.002142572126	0.6074070746479315	0.004474510674	0.6024773223321871	0.0118255855865347	0.1833308264994829	-2.7002720344933788e-05	0.5347834584488396	5.196873827660509e-05	0.5307045673647237	0.4901025944252534	0.1844981249808834	-0.0010165564593881	0.4403829177652419	0.0022382064178672	0.4353764946276821	0.0057265112499835	0.0953780802937613	-1.245698526997386e-05	0.3859442148147222	2.5539651817652147e-05	0.3814771958218913	-0.0008091370242429	0.748011754130974	0.0013568605483459	0.7440296002554928	DLL1	59123	FAM120B	74984	PSMB1	187619	False	False	False	ref	65	0.001038	90	0.01843
3644	chr6	170374845	C	T	rs78450636	-0.0166686411999999	0.2277587929806804	0.0166686411999999	0.2181565246521718	0.0072784174068967	0.732638600068077	-0.0001224113037436	0.2863600361161731	0.0001224113037436	0.2767439012934279	0.3934937084409588	0.34660730364046	-0.0066545255516609	0.1998132475081648	0.0066545255516609	0.1899169439847713	0.0028663356572892	0.451162233035275	-4.8894041276046e-05	0.2416374388959735	4.8894041276046e-05	0.2317983590533225	-0.0093880641915372	0.2059164510074162	0.0093880641915372	0.1996298520335858	DLL1	68280	FAM120B	84141	PSMB1	178462	False	False	False	ref	-70	0.001453	-95	0.04987
3645	chr6	170378583	G	A	rs9366218	-0.05603449	0.0194553470616844	0.05603449	0.0182202188111283	0.0126653844058643	0.1432833604709998	-0.0007225871812039	0.0232187214409107	0.0007225871812039	0.0218896920598071	0.5894355750578326	0.0577021454203653	-0.0330157697795436	0.0122874687685519	0.0330157697795436	0.0113185129146973	0.0074607382017111	0.0381582551355856	-0.0004254892643452	0.0162356691057456	0.0004254892643452	0.0151655368310301	-0.0088942831357171	0.214955397444917	0.0088942831357171	0.2083605784313776	DLL1	72018	FAM120B	87879	PSMB1	174724	False	True	False	ref	100	0.01386	100	0.03076
3646	chr6	170407171	C	T	rs10081152	-0.0296854776	0.1092597166186772	0.0296854776	0.1031121423162743	0.0091618361102548	0.4115389041736939	-0.0002860401905937	0.1213351426943446	0.0002860401905937	0.1153509915172798	0.3952115685847363	0.3466154220000053	-0.0117851152492032	0.1089713310561336	0.0117851152492032	0.1016093456168952	0.0036295577414658	0.3129959649532144	-0.0001136393639426	0.1176971963521553	0.0001136393639426	0.1107556326356395	-0.0166122055208041	0.1014431781850228	0.0166122055208041	0.0985480727941775	DLL1	100606	FAM120B	116467	PSMB1	146136	False	False	False	ref	-35	0.00983	100	0.0831
3647	chr7	1885818	T	C	rs12532128	0.0562385574	0.0162862516585307	0.0562385574	0.0173152974388899	0.0163935835677112	0.0597543427640815	0.0009812567526763	0.0135722340660835	0.0009812567526763	0.0142767400873332	0.558648948640546	0.0885069997364814	0.0317141323855598	0.0113615942445393	0.0317141323855598	0.0123533378737476	0.0092876974385769	0.0213342921006868	0.0005614390956141	0.0104199197244031	0.0005614390956141	0.0111304047613083	0.0118756418635047	0.14708171151899	0.0118756418635047	0.1519315681869636	ELFN1	220072	PSMG3	314813	TMEM184A	324997	False	True	False	alt	-25	0.002567	-100	0.1056
3648	chr7	1902634	C	T	rs4236277	-0.0558451888	0.0191664023188706	0.0558451888	0.0179498915292865	0.0168407912775543	0.0515424944247343	-0.0009459954363844	0.0130151418313949	0.0009459954363844	0.0123585079175399	0.6388282036120707	0.0242623210636557	-0.0357171903331773	0.0094323197020377	0.0357171903331773	0.0087461901233844	0.0107833421705509	0.0099328456603123	-0.0006062587249827	0.008521766558455	0.0006062587249827	0.0080750222270222	-0.005464786979118	0.3514399219644877	0.005464786979118	0.3420336347453394	ELFN1	236888	MAD1L1	330609	PSMG3	331629	False	True	False	ref	95	0.003067	25	0.04468
3649	chr7	1903230	T	C	rs12699439	-0.0123844063	0.3073335902105817	0.0123844063	0.29653982150474	0.0090895969071955	0.4088552558747926	-0.0001144481334483	0.3131324556066959	0.0001144481334483	0.3031779306308707	0.657784831792861	0.0200236291221142	-0.0081755318498677	0.1652668544127017	0.0081755318498677	0.1561913785448943	0.0060072542700253	0.0810711604308214	-7.602073374339739e-05	0.1708409950399917	7.602073374339739e-05	0.1623690223549483	-0.0014834178777787	0.744005830614019	0.0014834178777787	0.7307545616759584	ELFN1	237484	MAD1L1	330013	PSMG3	332225	False	False	False	ref	-25	0.0003781	-15	0.01965
3650	chr7	2444663	A	G	rs79606759	0.0599861317999999	0.0129068556701265	0.0599861317999999	0.013867679009309	0.0124011427448376	0.1493454485897822	0.0007498988891822	0.0182460239079171	0.0007498988891822	0.0194110492221426	0.5759956016141247	0.0704666165308839	0.0345393319654315	0.0089002485867238	0.0345393319654315	0.0097284349395803	0.0071342064632172	0.0452639380336295	0.00043125959666	0.0134371320366241	0.00043125959666	0.0144433627678992	0.0108445108351746	0.1607826816501534	0.0108445108351746	0.1660489167736695	GRIFIN	32231	CHST12	41074	LFNG	67867	False	True	False	alt	100	0.004974	30	0.04352
3651	chr7	2444919	T	A	rs76150572	0.0146854266	0.2434232861873495	0.0146854266	0.2536219489277396	0.0155649984098682	0.0708381077599637	0.0002377938685299	0.1340505279564234	0.0002377938685299	0.1408174893476095	0.5826346746335542	0.0640495440253661	0.008565593946517	0.1406069019995463	0.008565593946517	0.1494872669427147	0.0090769074047488	0.0189557145833431	0.000138699096723	0.0802731316075023	0.000138699096723	0.0856912566807595	0.0025954626085332	0.5696052024459053	0.0025954626085332	0.5818155908496621	GRIFIN	31975	CHST12	41330	LFNG	67611	False	False	False	alt	-20	0.00116	-60	0.05533
3652	chr7	6003864	T	C	rs117831773	-0.00049325784	0.8252384862608472	0.00191191028	0.8263490166373392	0.0062535686763597	0.8975590261237801	-1.932102783530402e-06	0.87418016744982	1.1457824876293034e-05	0.8757248971592352	0.1037604124524112	0.8156529007772508	-4.070439415990876e-05	0.8625620983907475	0.0001899293460325	0.8639417880356495	0.0006635820942386	0.8628558934764003	-1.244792253744414e-07	0.8909474079322864	1.1652455667764012e-06	0.8925039542758977	-0.0004834075042272	0.7252782219825968	0.0015622568698844	0.7261743073385065	PMS2	5266	AIMP2	5392	ANKRD61	27513	False	False	False	ref	95	0.001474	-15	0.01755
3653	chr7	6011278	C	A	rs75285243	-0.0222204182	0.1634095818145647	0.0222204182	0.1552479802339112	0.0101420807480837	0.2906649717825234	-0.0002300745982279	0.1507657704583143	0.0002300745982279	0.1436963214711133	0.3027417296859925	0.4932338056102151	-0.0068149502189562	0.1951762252699436	0.0068149502189562	0.1853110569709963	0.0030822833041716	0.4062424541330463	-7.079233833431705e-05	0.1797912026646862	7.079233833431705e-05	0.1711708976194242	-0.0169856533781469	0.0903964041843208	0.0169856533781469	0.0878424085157298	AIMP2	2022	PMS2	2148	ANKRD61	20099	False	False	False	ref	-100	0.001936	-35	0.025
3654	chr7	6011649	A	G	rs76124438	0.0534747063999999	0.0194357290725047	0.0534747063999999	0.0209131105406087	0.0098243146624383	0.3183566694117694	0.0005266113730044	0.03369063198027	0.0005266113730044	0.0360951701684693	0.3034284588014397	0.4915507793522926	0.0162480148968486	0.0562913319772083	0.0162480148968486	0.0614021223482339	0.0029872772752056	0.4203650067051328	0.0001602784121893	0.0614328518296894	0.0001602784121893	0.0662031751514675	0.0440129046981814	0.0065757157949367	0.0440129046981814	0.0067700124470609	AIMP2	2393	PMS2	2519	ANKRD61	19728	False	False	False	alt	-5	0.0001354	-40	0.017
3655	chr7	6016571	G	A	rs112393694	-0.091813091	0.0027877748603617	0.091813091	0.0026866659181076	0.0308388100477303	0.0042990263932916	-0.002869819029827	0.002230632843844	0.002869819029827	0.0021545339839111	0.4519196257222585	0.2532448906458461	-0.0414911408312196	0.0055491971916709	0.0414911408312196	0.0051586253270793	0.0139322684345764	0.0045222847393578	-0.0012968343251074	0.0026237456215024	0.0012968343251074	0.0025105506359614	-0.0428946358364713	0.0073211895382386	0.0428946358364713	0.0071351925523262	AIMP2	7315	PMS2	7441	ANKRD61	14806	False	True	True	ref	100	0.004246	100	0.153
3656	chr7	6019143	T	C	rs79231966	-0.0089099449999999	0.4051640396219268	0.0089099449999999	0.3932398042926057	0.007318535343272	0.7081220603691674	-6.65693653614288e-05	0.4702481895993653	6.65693653614288e-05	0.4583472476029254	0.2951856347057542	0.5030738170160981	-0.0025728137161015	0.3994176258258476	0.0025728137161015	0.3866531395975616	0.0021345807182384	0.5841556446596846	-1.9105161588088875e-05	0.4438571820538897	1.9105161588088875e-05	0.4313566066379102	-0.0070830610276039	0.2781927583052692	0.0070830610276039	0.2704649897030652	AIMP2	9887	PMS2	10013	ANKRD61	12234	False	False	False	ref	100	0.03072	40	0.0083
3657	chr7	8509557	C	G	rs11972718	0.0172341018	0.1967974663803257	0.0172341018	0.2061351883388512	0.0086558317598847	0.4663554861389418	0.0001491627644459	0.214865984705651	0.0001491627644459	0.2236741953232546	0.105704416020913	0.8154851668934977	0.0017772680330593	0.4510601106340918	0.0017772680330593	0.4645005816276705	0.0009242997788203	0.812797007318736	1.551371773493402e-05	0.4535725955873433	1.551371773493402e-05	0.4664127187041085	0.0154565918733596	0.1034911922923186	0.0154565918733596	0.106796770117311	NXPH1	75947	ICA1	246870	GLCCI1	540760	False	False	False	alt	-30	0.001202	-60	0.0184
3658	chr7	8522315	T	C	rs2040765	0.028957025	0.0970607673050011	0.028957025	0.1033339526984842	0.0079456359682274	0.5898760383359468	0.0002305294827938	0.1296951983568215	0.0002305294827938	0.1364529902078815	0.0893100550835589	0.838433620977197	0.0025855706548139	0.3665603655859138	0.0025855706548139	0.3793234174010961	0.000715441471075	0.847028678005895	2.074297339567955e-05	0.3874108769881346	2.074297339567955e-05	0.3997439830474745	0.0233425657942509	0.0452103595324366	0.0233425657942509	0.0465141486510998	NXPH1	88705	ICA1	259628	GLCCI1	553518	False	False	False	alt	80	0.002111	-100	0.011734
3659	chr7	8522330	A	G	rs2040766	0.00682103726	0.4637493740034306	0.00682103726	0.4762191067341092	0.0091736392426908	0.4015147719606863	6.271710394343593e-05	0.4597839892530352	6.271710394343593e-05	0.4715435961087114	0.0685069347192397	0.8745367401231032	0.0004640932341157	0.7217386517467922	0.0004640932341157	0.7358604338277706	0.0006261730306787	0.8673042414741323	4.247217879692738e-06	0.7134679001879735	4.247217879692738e-06	0.7275932075875976	0.0051245344868722	0.3599674685640778	0.0051245344868722	0.3698618999103485	NXPH1	88720	ICA1	259643	GLCCI1	553533	False	False	False	alt	65	0.001621	-100	0.0135
3660	chr7	8522348	T	C	rs2040767	0.0031372936599999	0.6753550376796911	0.00343145898	0.6852289395697558	0.0072317937449571	0.7413866982142402	2.365911595395677e-05	0.7092756649415562	2.5485038465512707e-05	0.7189000540500616	0.0645131173559891	0.8809252021219408	0.0002108400416053	0.824041042910759	0.0002295795429345	0.833769858195836	0.000465600801477	0.8982957828855554	1.583219098221272e-06	0.8388949877385123	1.699537629984724e-06	0.8485611656430762	0.0023340491083932	0.5804543372007372	0.0025166236164275	0.589202285429388	NXPH1	88738	ICA1	259661	GLCCI1	553551	False	False	False	alt	45	0.0003586	-50	0.0029
3661	chr7	8527374	G	T	rs1557841	-0.00646573992	0.5078006073224403	0.00646573992	0.4948541909193271	0.0093389812891642	0.3757063216700452	-6.098368303966341e-05	0.4956492345489047	6.098368303966341e-05	0.4834737696118049	0.4654820070747621	0.2311684897373439	-0.0029788507940854	0.3755337996131425	0.0029788507940854	0.3629523268611101	0.004355546299535	0.2080611672661921	-2.8137934259366937e-05	0.3650584081586843	2.8137934259366937e-05	0.3532417147753586	-0.0025352960092946	0.6057808226524298	0.0025352960092946	0.5934050865728907	NXPH1	93764	ICA1	264687	GLCCI1	558577	False	False	False	ref	-55	0.00705	-80	0.0698
3662	chr7	16524243	T	G	rs17464820	0.01146224786	0.3421844508535096	0.01146224786	0.353932642951363	0.0173780981727758	0.0488768062368196	0.0001916682881587	0.1988572464440286	0.0001916682881587	0.2073570947982143	0.0868162532806356	0.8438313864986837	0.0009895658806152	0.6056268985811564	0.0009895658806152	0.6192651222549951	0.0015326281048745	0.6814646604691547	1.64565444578478e-05	0.4674636943435967	1.64565444578478e-05	0.4800172608137155	0.0091059035882114	0.2365159108656264	0.0091059035882114	0.2434751288837189	LRRC72	2583	SOSTDC1	6337	CRPPA	21739	False	False	False	alt	-40	0.00383	10	0.009094
3663	chr7	21439273	G	T	rs9639377	0.00280889328	0.6993797330373667	0.00304607168	0.7092918053569685	0.0098847342097114	0.3111250041298384	2.609900359159293e-05	0.668274568004965	2.888041314019737e-05	0.6779905706620007	0.0974221724291745	0.8225917104576785	0.0002790974762111	0.7843278812448564	0.0002992037214976	0.7945682060645385	0.0009578682103938	0.7976305306176307	2.5987985124137583e-06	0.7688459828460656	2.834586008458277e-06	0.7790793283292099	0.0024440087552775	0.5651695161689795	0.0026182844220375	0.5743996448243385	SP4	11229	DNAH11	103767	CDCA7L	506630	False	False	False	alt	-15	0.001209	20	0.02878
3664	chr7	21460239	A	G	rs7796796	0.0583294173999999	0.0147367310830377	0.0583294173999999	0.015702719980052	0.0129544205561	0.1379151098477409	0.0008054342652747	0.0200890320140319	0.0008054342652747	0.0211992590718484	0.5895455347047169	0.0578637375658458	0.0343436683503653	0.0090666152119249	0.0343436683503653	0.009855868940963	0.0076252275172969	0.0387804578567882	0.0004735857720552	0.0135450099957964	0.0004735857720552	0.0144781090210429	0.0092158632350957	0.1933556882725109	0.0092158632350957	0.1994678300124518	SP4	32195	DNAH11	82801	CDCA7L	485664	False	True	False	alt	80	0.00833	45	0.0719
3665	chr7	21483576	T	C	rs6948810	-0.000639302358	0.8502775880762746	0.001567177162	0.8463282422586926	0.0113778710626926	0.2035548002196621	-7.23380977898735e-06	0.8119652989675933	1.6017180935626876e-05	0.8079994436604548	0.1002396290417949	0.8230749438242839	-7.420359446535745e-05	0.873401766446415	0.0001600866998087	0.8695505948272005	0.0011229694476045	0.775730625544369	-8.251549401163497e-07	0.8551978019709209	1.6366071470689554e-06	0.8510834209486612	-0.0006224130955715	0.7569614506385136	0.0013070675007001	0.7530050766972501	SP4	55532	DNAH11	59464	CDCA7L	462327	False	False	False	ref	-65	0.01303	-80	0.00827
3666	chr7	23680160	G	A	rs56359038	-0.01670627832	0.1942053454241949	0.02077511272	0.1881660074506406	0.0188750010776416	0.034028375456363	-0.0003493953543626	0.072953566555391	0.0004193985880789	0.0707657520410658	0.7927883069326446	0.0065012547550121	-0.0132088885843664	0.0687849797235958	0.0163887324859282	0.0659221084741636	0.0149494096913369	0.003182850540506	-0.0002755853699815	0.0328597642955082	0.0003302937551149	0.0319472242045429	-0.0033900766605462	0.4653695955635967	0.0041162252720463	0.4583615129319364	FAM221A	29	STK31	30044	CCDC126	82777	True	False	False	ref	-25	0.010254	-25	0.10205
3667	chr7	23867010	G	T	rs6966655	0.00116790074	0.7848889644999204	0.002273263152	0.786771785754572	0.0203736560481205	0.0246503111172463	2.872254437131279e-05	0.5787780035348297	4.820648773199267e-05	0.5816660902328816	0.0941773254909282	0.835186615288461	0.0001078462663027	0.8668632410423576	0.000180286195762	0.8682384754634032	0.0019089544996695	0.6201240906941098	2.569138182921636e-06	0.7644380856783274	3.847701046859562e-06	0.766268674460583	0.0011888090125416	0.6815697163620306	0.0018817622589445	0.6838792695315831	STK31	156806	FAM221A	186879	CCDC126	269627	False	False	False	alt	-20	0.004734	-100	0.0407
3668	chr7	23871880	A	G	rs2106747	-0.00482798272	0.6336701122569187	0.00482798272	0.620307319734706	0.0213442505792902	0.020054851244184	-0.0001126616210539	0.3918599049687127	0.0001126616210539	0.3807638229289212	0.0741418479444807	0.8660707935275976	-0.000389696213385	0.8059525500168699	0.000389696213385	0.7921338609825191	0.0015928928021033	0.6820246916228587	-9.149193007514398e-06	0.6581768526395666	9.149193007514398e-06	0.6448089112803894	-0.003846512930632	0.5220497645557679	0.003846512930632	0.5107606479523017	STK31	161676	FAM221A	191749	CCDC126	274497	False	False	False	ref	-95	0.014656	-15	0.010735
3669	chr7	23877113	C	T	rs9769098	-0.032698198	0.0899175807554367	0.032698198	0.0847496020128501	0.0086070126997085	0.4799040179960822	-0.0002917172349432	0.1135121708742653	0.0002917172349432	0.1078762825868733	0.2060685276818223	0.6504516984969114	-0.0068953477004196	0.198665202688649	0.0068953477004196	0.1886646925492091	0.0017960768755744	0.6493969559083307	-6.222246529881315e-05	0.2107323225803124	6.222246529881315e-05	0.2012858037668673	-0.0316102864137594	0.0242135678643651	0.0316102864137594	0.0235982695189726	STK31	166909	FAM221A	196982	CCDC126	279730	False	False	False	ref	100	0.003456	100	0.02615
3670	chr7	23878123	C	T	rs13244145	0.00376774354	0.6629791210930323	0.00376774354	0.6763411671506192	0.0095918315550002	0.3405366137947309	3.5781177379450275e-05	0.6356610109068922	3.5781177379450275e-05	0.6485123689350433	0.0993661759976762	0.8223009073156747	0.000368263221915	0.7641894267985747	0.000368263221915	0.7783618056016613	0.0009499265962743	0.8035063730256271	3.488980971401852e-06	0.7508256786108936	3.488980971401852e-06	0.7649690174572137	0.0031182896088133	0.5224339264467442	0.0031182896088133	0.5342654623662974	STK31	167919	FAM221A	197992	CCDC126	280740	False	False	False	alt	25	0.000881	35	0.01917
3671	chr7	23894634	C	T	rs146616002	-0.0225287721999999	0.1557239064435935	0.0225287721999999	0.1478664562033446	0.0085652568392406	0.4891072069656667	-0.0001915779309327	0.1764416932713454	0.0001915779309327	0.1687696682214468	0.3907799873442671	0.3539204980719387	-0.0088164540793835	0.147917321733677	0.0088164540793835	0.1392676291131857	0.0033437340649481	0.3622770569106788	-7.488928387772678e-05	0.1618882292289249	7.488928387772678e-05	0.1534080559939436	-0.0128466062925963	0.1369035239010697	0.0128466062925963	0.1328195830553325	STK31	184430	FAM221A	214503	CCDC126	297251	False	False	False	ref	-100	0.004147	-100	0.1461
3672	chr7	24732158	T	C	rs17150022	-0.002243749272	0.7725440699362794	0.002602187368	0.765168273091574	0.0079232176962923	0.6172927299549995	-1.9739216747971176e-05	0.7773133881050767	2.2437715605607413e-05	0.769903618468159	0.429979564103362	0.2877515591052055	-0.0009800248484115	0.6141350986579844	0.0011197018894243	0.6065718797117349	0.0034025343731958	0.3551580946599562	-8.595909122920173e-06	0.6292826888761074	9.64746681114417e-06	0.6219836043978154	-0.0011618377784001	0.77101560311203	0.0013361134451601	0.7637491928152386	GSDME	25782	PALS2	158889	OSBPL3	249476	False	False	False	ref	65	0.01219	15	0.02213
3673	chr7	24734849	G	T	rs80195870	-0.0180172154	0.2187246274639332	0.0180172154	0.2094571628983286	0.0093973668565703	0.3769629802758501	-0.0001665713263205	0.2215074303609553	0.0001665713263205	0.2129543910316239	0.0934449527484724	0.8327817903415513	-0.001796373119981	0.4995373999556764	0.001796373119981	0.4862953850429527	0.0008517469979748	0.8232586131847253	-1.6136723152049092e-05	0.4897558186278829	1.6136723152049092e-05	0.4769954031322941	-0.0146350065872052	0.1234900585885988	0.0146350065872052	0.119906566256453	GSDME	23091	PALS2	161580	OSBPL3	246785	False	False	False	ref	-100	0.01012	80	0.014694
3674	chr7	24737142	G	A	rs114829110	0.00743700108	0.4319334220813141	0.00743700108	0.4440170596003087	0.0297286320684749	0.0042209962856981	0.0002210476927189	0.1472695383637047	0.0002210476927189	0.1544978415527147	0.0838099980290251	0.8511459551537752	0.0006496857992447	0.6757031012696879	0.0006496857992447	0.6893378458196131	0.0025835461802184	0.4560581017420547	2.012141079102463e-05	0.4296616308511132	2.012141079102463e-05	0.4423162889429052	0.0058008900507266	0.3335331171048312	0.0058008900507266	0.3429675648595763	GSDME	20798	PALS2	163873	OSBPL3	244492	False	True	True	alt	-5	0.0005035	0	0.0
3675	chr7	24741837	T	C	rs11509873	0.0077925999999999	0.4175957069135928	0.0077925999999999	0.4302067755892018	0.008099484325972	0.5153955295635216	6.602086334359538e-05	0.442959835107823	6.602086334359538e-05	0.4548237546290631	0.4556603284266433	0.2449874763292724	0.0035172098776459	0.3152858730077473	0.0035172098776459	0.3277066998549682	0.0037144834791464	0.288688373499567	2.9774036769758323e-05	0.331440494942145	2.9774036769758323e-05	0.343463486017858	0.0034751397836076	0.4893158748307192	0.0034751397836076	0.5008920471615957	GSDME	16103	PALS2	168568	OSBPL3	239797	False	False	False	alt	-100	0.00571	-40	0.01782
3676	chr7	24788436	C	T	rs2391000	-0.0175500174	0.2167365170928309	0.0175500174	0.2075953645110849	0.0087644011737158	0.4439422074704611	-0.0001612577476499	0.2249115606461116	0.0001612577476499	0.2164505662217569	0.5781761221589437	0.0674563414684752	-0.010175945582948	0.1283354244445495	0.010175945582948	0.1205438304534718	0.0050735411599569	0.1365711457332959	-9.372975064881897e-05	0.1397557690284418	9.372975064881897e-05	0.1321821995951354	-0.0029170427079118	0.5570277116602098	0.0029170427079118	0.5452667338858754	GSDME	30496	OSBPL3	193198	PALS2	215167	False	False	False	ref	-50	0.1794	-85	0.419
3677	chr7	24789520	C	T	rs113041465	-0.0535456415999999	0.0232056173535389	0.0535456415999999	0.0217531617814377	0.0102574620178875	0.2786927038406804	-0.0005601146775087	0.0369571402544257	0.0005601146775087	0.0347753857619919	0.4335833359267211	0.2823587579838941	-0.0232153141337046	0.0328898466586355	0.0232153141337046	0.0303192550974353	0.004451468774383	0.2000841146746166	-0.0002431299613879	0.0409455472830271	0.0002431299613879	0.0381275645883285	-0.0258716376725899	0.0396852860843193	0.0258716376725899	0.0387324538331929	GSDME	31580	OSBPL3	192114	PALS2	216251	False	False	False	ref	-90	0.00688	-95	0.0515
3678	chr7	24790454	G	A	rs150936052	-0.0528490444	0.0230670815694143	0.0528490444	0.0215653230295765	0.0138488350098365	0.1020836089444904	-0.0007306443700812	0.0208395422744536	0.0007306443700812	0.0196553160407591	0.2198591271693689	0.6108178079209604	-0.0117396208320412	0.1087278598068144	0.0117396208320412	0.1017340015555291	0.003159588900432	0.3326278296675703	-0.0001684086382062	0.0711708010726811	0.0001684086382062	0.0667000730860052	-0.0447867716470087	0.0067732162388719	0.0447867716470087	0.0065972228650028	GSDME	32514	OSBPL3	191180	PALS2	217185	False	False	False	ref	65	0.004856	85	0.02994
3679	chr7	24799761	G	A	rs115354522	-0.0426809588	0.0478730913064372	0.0426809588	0.0448084246052128	0.010107995024858	0.2944439392500261	-0.000445443055214	0.0593015491871408	0.000445443055214	0.0559116161889848	0.3406280148134316	0.4332665357363966	-0.0149099535326505	0.08083749175584	0.0149099535326505	0.0750257456858725	0.0034398555735059	0.3421300065768712	-0.0001547780664696	0.0820650872947845	0.0001547780664696	0.0767994228805949	-0.0290936627973318	0.0285416370559923	0.0290936627973318	0.0278413406390636	GSDME	41821	OSBPL3	181873	PALS2	226492	False	False	False	ref	70	0.006546	-70	0.0261
3680	chr7	24805117	T	G	rs79631004	-0.00308407294	0.6908974774191564	0.00376279878	0.6824528066552569	0.0142272468838273	0.0968141038446459	-4.552155210614383e-05	0.5712556079909492	5.30786654349662e-05	0.5631654944948281	0.2055062811854894	0.6461363030557293	-0.000690332195781	0.6889800664479577	0.0007832355163066	0.6802818714979524	0.0029946299935016	0.3871793234762248	-1.0117920287568016e-05	0.5965804438674814	1.1152330503169951e-05	0.5881404241567384	-0.0029834334381061	0.5287573975236152	0.0034896627558376	0.5218326982985165	GSDME	47177	OSBPL3	176517	PALS2	231848	False	False	False	ref	65	0.004143	95	0.03427
3681	chr7	71296756	A	T	rs6976562	0.00492543766	0.5649624554147382	0.00492543766	0.577975466400623	0.0200350645048534	0.0270862335283857	9.573096193347408e-05	0.3215165010061245	9.573096193347408e-05	0.331863772646851	0.0790921067645929	0.8526187788256209	0.0003806804792179	0.7480260042233883	0.0003806804792179	0.7620696157497441	0.0015432364162839	0.6729177729205411	7.236475704037799e-06	0.6096894312724276	7.236475704037799e-06	0.6234395361920823	0.0035394558034833	0.4715585525722704	0.0035394558034833	0.482817423955838	GALNT17	164611	CALN1	1150395	TYW1B	1531444	False	False	False	alt	-80	0.01097	-100	0.07043
3682	chr7	71296858	T	A	rs6942815	0.00857494992	0.3807213096021146	0.00857494992	0.392661519953028	0.0198769963162442	0.0292764499319801	0.0001702237824823	0.1890959386096535	0.0001702237824823	0.197446161732844	0.0833971306756293	0.8440099056403707	0.0007460120608232	0.6403312664235452	0.0007460120608232	0.6545927343440712	0.0017316640004006	0.593491862841225	1.5514198716042787e-05	0.4664060583153507	1.5514198716042787e-05	0.4795444673577957	0.0066183259162439	0.2871184325648903	0.0066183259162439	0.2956084966581273	GALNT17	164713	CALN1	1150293	TYW1B	1531342	False	False	False	alt	-40	0.01158	100	0.06506
3683	chr7	71299005	T	C	rs10261998	0.0408818152	0.0469400074841608	0.0408818152	0.0503193191901065	0.011386444874247	0.2124939878322702	0.0004891746213778	0.0459268425327574	0.0004891746213778	0.0488938251841073	0.4520876772580628	0.2515701035283611	0.0185712059492692	0.0449934675994511	0.0185712059492692	0.0491169521607029	0.0051698522190128	0.1361481606642405	0.0002231844812168	0.043289053409791	0.0002231844812168	0.0467366866037856	0.0175665722673471	0.0899184515175602	0.0175665722673471	0.0925806922109404	GALNT17	166860	CALN1	1148146	TYW1B	1529195	False	False	False	alt	-95	0.002579	95	0.02185
3684	chr7	71301450	G	T	rs28799658	0.00756010666	0.4174405972336417	0.00756010666	0.4295929631870031	0.0422365641681035	0.0009474234085353	0.0003265950562207	0.0799712623267203	0.0003265950562207	0.0844232327070673	0.1983443811657796	0.6560349747032802	0.0015538177110349	0.4788650684837263	0.0015538177110349	0.4925132798087492	0.008647693909241	0.026854726600897	6.889518292597933e-05	0.1666139485650109	6.889518292597933e-05	0.1754580809575852	0.0073258021348768	0.2585340507001736	0.0073258021348768	0.2661483341395045	GALNT17	169305	CALN1	1145701	TYW1B	1526750	False	True	True	alt	-90	0.01855	-100	0.01845
3685	chr7	71303668	G	T	rs3923570	-0.0507425682	0.0276934135021149	0.0507425682	0.0258285555119145	0.0113251195039528	0.2016375923448471	-0.0005849663004859	0.0336858879120569	0.0005849663004859	0.0316344266387712	0.3354661355408251	0.4385584029805348	-0.0173779167310872	0.0605285142629278	0.0173779167310872	0.0559494078695925	0.0037999452124829	0.2865628927357109	-0.0001998604964278	0.0554897191791089	0.0001998604964278	0.0516226054858458	-0.0366871025633045	0.013484119892044	0.0366871025633045	0.0131787436520812	GALNT17	171523	CALN1	1143483	TYW1B	1524532	False	False	False	ref	100	0.004936	100	0.091
3686	chr7	71304276	T	C	rs6964131	-0.006711666248	0.5853511412444289	0.006711666248	0.5715251654364542	0.0074456457000109	0.6808683571453311	-4.944800352261444e-05	0.6381267200728802	4.944800352261444e-05	0.6249963131917108	0.3853069015238747	0.3534466579341542	-0.0029139655648057	0.4740225410565719	0.0029139655648057	0.4600705291261904	0.0028368291714056	0.45521163833888	-2.137962943633676e-05	0.5216378013450804	2.137962943633676e-05	0.5082056775866529	-0.0029564622039647	0.6056842162792745	0.0029564622039647	0.5933131050099542	GALNT17	172131	CALN1	1142875	TYW1B	1523924	False	False	False	ref	60	0.001331	-45	0.03992
3687	chr7	71311932	G	A	rs73356099	-0.0468010623999999	0.0353727856538756	0.0468010623999999	0.0331461910065185	0.0087293769445473	0.4630235520488244	-0.0004176324371399	0.0601892948147195	0.0004176324371399	0.05678926394267	0.2303218913059264	0.6036132393764302	-0.0106588766501595	0.1217188237027145	0.0106588766501595	0.1141117853522853	0.0020111954723622	0.5955007558474699	-9.496997037786994e-05	0.1328131844519681	9.496997037786994e-05	0.1254101776251036	-0.0436622786543428	0.0079948041352151	0.0436622786543428	0.0078066205358215	GALNT17	179787	CALN1	1135219	TYW1B	1516268	False	False	False	ref	100	0.004105	100	0.02788
3688	chr7	71315719	C	T	rs12534549	-0.040368793	0.0530261223728322	0.040368793	0.0495434566212847	0.0091683681473628	0.3956362398291893	-0.0003723656293829	0.0712950574954431	0.0003723656293829	0.0672625540626676	0.0704156682123258	0.8659149898879752	-0.0028765653740837	0.3894586830639531	0.0028765653740837	0.3763609159398955	0.0006562132893368	0.8534309765059643	-2.7058563331493287e-05	0.3789464258690418	2.7058563331493287e-05	0.366700099525782	-0.024097760350211	0.0372992538073614	0.024097760350211	0.0362893226174292	GALNT17	183574	CALN1	1131432	TYW1B	1512481	False	False	False	ref	-30	0.0001893	100	0.002258
3689	chr7	71317799	C	G	rs73179792	0.0195839754	0.1882814039712338	0.0195839754	0.1973519716587098	0.0073977945028018	0.7113728252450385	0.000146375651673	0.2424419283004834	0.000146375651673	0.2516858098654406	0.1466197782134669	0.7374740125765404	0.002818206013803	0.3685473442062163	0.002818206013803	0.3812397117505153	0.0010793249189199	0.7708069164536779	2.0975374857842227e-05	0.4064992095709923	2.0975374857842227e-05	0.4189921446206247	0.0167470616915112	0.0944186125903056	0.0167470616915112	0.09718323726212	GALNT17	185654	CALN1	1129352	TYW1B	1510401	False	False	False	alt	10	0.0005684	-50	0.0228
3690	chr7	71320065	A	G	rs28678480	-0.0156796643	0.2712132703029042	0.0156796643	0.2609943068148162	0.0071141370524775	0.766202313278487	-0.0001151493337558	0.3462234071083279	0.0001151493337558	0.3356989544182834	0.0462494424216018	0.9138343915649396	-0.0006819546513167	0.6969132930252869	0.0006819546513167	0.6829131585324394	0.0003347668515017	0.9278878336395054	-5.113792866364679e-06	0.7293423858764734	5.113792866364679e-06	0.7154425419725585	-0.0083880538179856	0.2764060890965952	0.0083880538179856	0.2691982643119343	GALNT17	187920	CALN1	1127086	TYW1B	1508135	False	False	False	ref	55	0.006927	75	0.02962
3691	chr7	71326774	G	A	rs12668780	-0.0265210905	0.1342147637608976	0.0265210905	0.1272608676768053	0.0096150154115953	0.3445845841743346	-0.0002685153523917	0.1350275965544659	0.0002685153523917	0.1286834415486562	0.083011234556375	0.8479190005688039	-0.0022098778800264	0.4396584046469268	0.0022098778800264	0.4267351075152971	0.0007835888489972	0.8363063706029805	-2.20862866077326e-05	0.4238715582339256	2.20862866077326e-05	0.4116860699518458	-0.0200354775464475	0.0752304835514381	0.0200354775464475	0.0731650214664165	GALNT17	194629	CALN1	1120377	TYW1B	1501426	False	False	False	ref	-70	0.013885	-25	0.011246
3692	chr7	71344341	G	A	rs7385083	-0.00115218416	0.7614363311014506	0.00261869844	0.7593815585587432	0.0090207769917306	0.417554675832187	-1.3120594953822145e-05	0.7419534235725483	2.459699788182741e-05	0.7395974428261702	0.4070768368966483	0.3250917054215699	-0.000459899319239	0.5987465387453175	0.0010405207407346	0.5969723887962116	0.0036829460826154	0.3024704486752427	-5.233835563390055e-06	0.5891274603688527	9.78359999933533e-06	0.5870803750456155	-0.0004834075042272	0.7515930680076053	0.0013381881554787	0.7495940461869115	GALNT17	212196	CALN1	1102810	TYW1B	1483859	False	False	False	ref	100	0.01215	-25	0.0202
3693	chr7	71348898	A	G	rs73181662	0.0455336896	0.0330552454407891	0.0455336896	0.0355120544136292	0.0104136718531804	0.2681181307362988	0.0004728511403543	0.0407410347020881	0.0004728511403543	0.0434043367125723	0.406937831305304	0.3254883667562627	0.0186262511779328	0.0434910923819315	0.0186262511779328	0.0473670538808309	0.0042342873728224	0.224308057867172	0.0001932284820024	0.0465373290483699	0.0001932284820024	0.0502362889791243	0.025440097926327	0.0409148049388426	0.025440097926327	0.0420002246802302	GALNT17	216753	CALN1	1098253	TYW1B	1479302	False	False	False	alt	60	0.002224	100	0.1027
3694	chr7	71349139	C	T	rs9654908	-0.0403112578	0.0538508268594816	0.0403112578	0.0502620707948754	0.0089463165536524	0.4266748024094144	-0.0003641722098525	0.0735480130686236	0.0003641722098525	0.0694031786190107	0.4150457992302824	0.3132911120481346	-0.016816019431021	0.0626432161313502	0.016816019431021	0.0578570563476567	0.0037235660116793	0.2957301013706775	-0.0001523173015654	0.0759355816104992	0.0001523173015654	0.0708163605762858	-0.0206475170904262	0.0665815790492918	0.0206475170904262	0.0648608913385942	GALNT17	216994	CALN1	1098012	TYW1B	1479061	False	False	False	ref	75	0.001659	10	0.005737
3695	chr7	71349164	A	G	rs2527310	0.0285816398	0.1038093064094835	0.0285816398	0.1102606349156466	0.0090312388656389	0.4284361917378024	0.0002667205240191	0.1163597474683972	0.0002667205240191	0.1226529642511363	0.4302824718098735	0.2885584017573376	0.012407849672613	0.088195412775501	0.012407849672613	0.0951723749911256	0.0039032502051185	0.2750218932875135	0.0001163295987514	0.098409396293898	0.0001163295987514	0.1050904425168937	0.013879812031245	0.1226715032090336	0.013879812031245	0.1265543476670201	GALNT17	217019	CALN1	1097987	TYW1B	1479036	False	False	False	alt	100	0.001751	-15	0.00476
3696	chr7	71354911	T	C	rs2141885	0.0704172768	0.0083699256919711	0.0704172768	0.0088975221220994	0.0211502413846569	0.0214798616269386	0.0015586100786096	0.0060324134864717	0.0015586100786096	0.0063111224247424	0.1341964128258591	0.7654075303201745	0.0100773017259338	0.1217025924431392	0.0100773017259338	0.1297231988821488	0.0029133310428417	0.4251599329928073	0.0002281316719897	0.0463722382831901	0.0002281316719897	0.049803794469312	0.063152107387006	0.0020324794764493	0.063152107387006	0.0020829915432104	GALNT17	222766	CALN1	1092240	TYW1B	1473289	False	True	True	alt	100	0.0006485	40	0.013306
3697	chr7	71362977	T	C	rs7791195	-0.00519323284	0.5918935438150695	0.00519323284	0.5788742625602143	0.0260308857552418	0.0085631617987792	-0.0001494502708026	0.2891767158611242	0.0001494502708026	0.2795166212850413	0.4556582537163248	0.244770539205881	-0.0023839364811006	0.4385840308325451	0.0023839364811006	0.4258224928113651	0.0118809089971374	0.0070474506849664	-6.86661288340234e-05	0.2159243893358704	6.86661288340234e-05	0.2063000681169537	-0.0020664114772974	0.6741256211010566	0.0020664114772974	0.6614221670309137	GALNT17	230832	CALN1	1084174	TYW1B	1465223	False	True	True	ref	100	0.005287	-100	0.1296
3698	chr7	72242898	T	C	rs7799227	-0.001633530974	0.8207697645985899	0.001730039566	0.8103055899849715	0.0345551943873323	0.0021544581985022	-5.233578711138144e-05	0.4951904027961558	5.70708757924659e-05	0.4852058579976741	0.1906700276973827	0.6716560948270203	-0.0003208255076387	0.7874570031964917	0.0003381021265508	0.7764150217767276	0.0065722435993932	0.0608109841949843	-1.0380897003256438e-05	0.5581783670519602	1.1228555437155904e-05	0.5472323194328156	-0.0016742912270873	0.689647353298882	0.0017821761636531	0.6798337006406543	CALN1	204253	TYW1B	585302	POM121	636452	False	True	True	ref	-75	0.0163	60	0.05566
3699	chr7	72258110	C	T	rs13231507	-0.00359286136	0.6723836173710053	0.00415297772	0.6645984210486711	0.0157208634209818	0.0686663138378263	-5.671641908764375e-05	0.5267310008079521	6.4138012217473e-05	0.5192899536548797	0.3531136215105965	0.4147526493222503	-0.0013806482314627	0.5572458678078093	0.0015426885507088	0.54926894229861	0.0055797218265238	0.1065594883036243	-2.17310122778356e-05	0.4396192356066751	2.3878061409099188e-05	0.4320083945203256	-0.0020601873463417	0.6116450763067004	0.0025705660847103	0.604610934188571	CALN1	189041	TYW1B	570090	POM121	621240	False	False	False	ref	-5	4.58e-05	95	0.04327
3700	chr7	72260351	C	T	rs7801170	0.0021609655414	0.7785779621136564	0.0021609655414	0.7923829834286957	0.020323025537609	0.0245312974771107	4.347591121959923e-05	0.597217827469792	4.347591121959923e-05	0.6101250333954636	0.1736698513470056	0.698823834136701	0.000331793960453	0.7929946061458646	0.000331793960453	0.8069055624877349	0.0035262312330156	0.3189084230097676	6.668859870321092e-06	0.6675285283474891	6.668859870321092e-06	0.6812117604900192	0.0020871585804831	0.6482837759066997	0.0020871585804831	0.6611501853768142	CALN1	186800	TYW1B	567849	POM121	618999	False	False	False	alt	-100	0.01171	100	0.0369
3701	chr7	72261158	A	C	rs12537428	0.00175688286	0.6363907133913868	0.00407831514	0.6417044827959244	0.0214116934841754	0.0200199479597634	2.9903353243912184e-05	0.3689993959625885	8.291687760206886e-05	0.372993662742254	0.2057510970030809	0.6479003093181945	0.0004406867012215	0.6221290734029278	0.0008752122720177	0.6280416399234303	0.0043203334988194	0.208522410496987	7.7687601320474e-06	0.4364221363098121	1.75426003581043e-05	0.4415606460436771	0.0013713835205759	0.453704772599243	0.0038153922758534	0.4574112102455767	CALN1	185993	TYW1B	567042	POM121	618192	True	False	False	alt	50	0.01738	60	0.01898
3702	chr7	72261889	C	T	rs10486883	-0.068817422	0.0088689433110626	0.068817422	0.0084167621627976	0.0163856021893608	0.0564026895038679	-0.0011492107007736	0.0100684428718135	0.0011492107007736	0.0096382041733457	0.3507754229815661	0.4180867089450634	-0.024254875247753	0.0291053594977544	0.024254875247753	0.0267872675797203	0.0057479580963616	0.0927700224317617	-0.0004050814466999	0.0181267434592273	0.0004050814466999	0.0169382696212344	-0.0487909625618522	0.0042027202225983	0.0487909625618522	0.0040227125918819	CALN1	185262	TYW1B	566311	POM121	617461	False	True	True	ref	-10	0.002438	80	0.0965
3703	chr7	72289021	C	T	rs12154550	0.0031469617	0.6872826705167661	0.0033020765	0.6973631349266933	0.0222257330706839	0.0166022563545114	7.038978161657709e-05	0.4371383811804659	7.328074740345318e-05	0.4466130585304859	0.0749592838099979	0.8660859253278466	0.0002529728422239	0.8178118988408121	0.0002584839802593	0.8277174049894944	0.0016959950346034	0.6587457095962115	5.6160967736334175e-06	0.684199249874358	5.718811094529387e-06	0.694677128734032	0.0025705660847103	0.5651410047585743	0.0026908992831875	0.5737258880216384	CALN1	158130	TYW1B	539179	POM121	590329	False	True	False	alt	-95	0.00812	-25	0.007812
3704	chr7	72298876	C	T	rs4719223	-0.0615791032	0.0141632655108874	0.0615791032	0.0133695751981161	0.016940986207576	0.0526259721807287	-0.001100492009329	0.0124677348103957	0.001100492009329	0.0118807755052946	0.4750609446156081	0.2120239619109015	-0.0289678065496562	0.0183341552058237	0.0289678065496562	0.0168753505948711	0.0079516549852242	0.0317176317970555	-0.0005116217102571	0.0130096285596755	0.0005116217102571	0.0122078382010111	-0.0236330252388509	0.0402179537132545	0.0236330252388509	0.0390867301273592	CALN1	148275	TYW1B	529324	POM121	580474	False	True	False	ref	-85	0.0232	-85	0.09644
3705	chr7	72310924	A	C	rs5025436	0.000711549715	0.8455403487865519	0.0015007691649999	0.8528107542301236	0.0389089447797309	0.0013818380026959	1.978336226732103e-05	0.4989358831065098	5.386942507564403e-05	0.5042462068011869	0.1835869666697787	0.684543068474429	0.000112281871502	0.800885543136058	0.0002790747636926	0.806840668182377	0.0071854996427873	0.0456606614711636	2.9729492499532706e-06	0.5629024051630265	1.0169902465781117e-05	0.5690082390357869	0.0007344474527744	0.7316317449334568	0.0013859064928059	0.737400714410368	CALN1	136227	TYW1B	517276	POM121	568426	False	True	True	alt	-100	0.01135	70	0.0589
3706	chr7	72317475	A	G	rs78928669	-0.00318227674	0.7327271398519835	0.00318227674	0.7192139731248175	0.0071505235648777	0.7560125745518187	-2.227169463575686e-05	0.7728380648970545	2.227169463575686e-05	0.759303996595347	0.4863307710660899	0.1951846472017127	-0.001628737643607	0.554483923611688	0.001628737643607	0.5408164093318979	0.0034696792057496	0.3404352835298234	-1.1394461323799914e-05	0.598374726619685	1.1394461323799914e-05	0.5847693636369601	-0.0010207574767372	0.8191957476169945	0.0010207574767372	0.8055053665873759	CALN1	129676	TYW1B	510725	POM121	561875	False	False	False	ref	-100	0.02179	-85	0.0894
3707	chr7	72321736	G	A	rs2944829	-0.0430784782	0.0434020992553682	0.0430784782	0.0406709836931688	0.0111449497590305	0.2204310269158448	-0.000508958146089	0.0484756193828684	0.000508958146089	0.0456909438811694	0.4400128632039751	0.271263570492093	-0.019190672479984	0.0482859379278499	0.019190672479984	0.0445699935142846	0.0049463792664299	0.1505316863704529	-0.0002286819188274	0.0486687896848147	0.0002286819188274	0.0452586782265379	-0.0192491623357088	0.0719369685146028	0.0192491623357088	0.0699739075062111	CALN1	125415	TYW1B	506464	POM121	557614	False	False	False	ref	-100	0.003832	-100	0.0751
3708	chr7	72328401	T	C	rs2944825	0.0466380212	0.0306051813880987	0.0466380212	0.0326845141887403	0.009892793177746	0.3057803710608784	0.0004725421319379	0.0440410766324237	0.0004725421319379	0.0468232375614366	0.2037095820496063	0.6506820717325731	0.0098672501612066	0.1185459550544393	0.0098672501612066	0.1266315068026589	0.0020362761543589	0.5912939737346646	0.0001007481208259	0.1131402520562478	0.0001007481208259	0.1202214730596493	0.0447867716470087	0.0064139901801314	0.0447867716470087	0.0065921268887663	CALN1	118750	TYW1B	499799	POM121	550949	False	False	False	alt	100	0.003859	-100	0.0681
3709	chr7	72330742	T	C	rs11768943	0.001873797126	0.7661151194400972	0.002462026194	0.7685425669296841	0.0058560714280077	0.9571355778156716	1.042843354501656e-05	0.8357471963316356	1.3987482879574391e-05	0.8373432483880101	0.3223290698036286	0.4619126118438965	0.0005807292440204	0.6634860321997735	0.0007768896163225	0.6663390501641474	0.0018863020169667	0.626696454306971	3.213804584813549e-06	0.7322933564780443	4.400893414474646e-06	0.7342357108869842	0.0015041649809645	0.6817508922603391	0.0018485668938474	0.6845917668869673	CALN1	116409	TYW1B	497458	POM121	548608	False	False	False	alt	-50	0.006184	100	0.0685
3710	chr7	72348675	G	A	rs2944814	-0.035335967	0.0729723469127358	0.035335967	0.0684830321486853	0.0089028191820845	0.4415771474722092	-0.0003248864013618	0.0944434444771684	0.0003248864013618	0.0894004955453422	0.3541986950072096	0.412810636346537	-0.0124999799152367	0.0989320741006456	0.0124999799152367	0.0920273245104176	0.0031465191195749	0.3926940773965761	-0.0001145384723982	0.1104578123615477	0.0001145384723982	0.1037075478379168	-0.0232844739053309	0.0451598878194604	0.0232844739053309	0.0440650295095091	CALN1	98476	TYW1B	479525	POM121	530675	False	False	False	ref	100	0.009026	-55	0.012634
3711	chr7	72350185	T	G	rs11764286	-0.0156747689999999	0.2452925595159489	0.0156747689999999	0.2354534023522584	0.0252312829239891	0.00901639282435	-0.000389271343267	0.0679237348885669	0.000389271343267	0.0640231366730764	0.0802746916461788	0.8586299724683679	-0.001331202514831	0.5648870093248795	0.001331202514831	0.5510406167092241	0.0020060462034062	0.6013700856287578	-3.273420830855508e-05	0.3348610662850432	3.273420830855508e-05	0.3234590655943657	-0.0120187968754862	0.1571946509486026	0.0120187968754862	0.1528579536848003	CALN1	96966	TYW1B	478015	POM121	529165	False	True	True	ref	-95	0.004856	-10	0.005196
3712	chr7	72354867	G	A	rs2944808	-0.0002629993599999	0.6783514989606793	0.0035723154	0.682086350576997	0.0167939153025991	0.0548882993276224	-1.0441444983910183e-06	0.4978714153675041	5.674871396801275e-05	0.5013977188159868	0.3584642994221931	0.4031916766110843	-9.135967648316e-05	0.5467686874961292	0.0012827951242387	0.5509608054575004	0.0060797759667591	0.0784999443067781	-6.88201942979075e-07	0.4111795585836146	2.0665753270393743e-05	0.4151335588063823	-0.0002510399485471	0.6176529775407158	0.0023340491083931	0.6210899387837436	CALN1	92284	TYW1B	473333	POM121	524483	False	False	False	ref	95	0.00714	60	0.07416
3713	chr7	72354869	A	C	rs2968518	-0.0001466248594	0.752977693050396	0.0026640419406	0.7601462699061626	0.0163978977472872	0.0586515652483961	-8.34002327224704e-06	0.6098377369876118	4.690306248167297e-05	0.6157401218373957	0.3585576613865289	0.4030499604139543	-0.0001304600277656	0.6412325092391737	0.0010168520298691	0.6481335649261161	0.0059215034885217	0.0857418999982593	-4.487281604209829e-06	0.519577842737898	1.806290485433794e-05	0.5252681362252506	-2.074710318622844e-06	0.7269186021861759	0.0015581074492473	0.7344181407540371	CALN1	92282	TYW1B	473331	POM121	524481	False	False	False	ref	95	0.00903	55	0.0718
3714	chr7	72373222	G	A	rs2968538	-0.0164408072	0.2385731856567661	0.0164408072	0.228818301747649	0.0129063437162608	0.1359645045137896	-0.0002159957870307	0.1605911358174853	0.0002159957870307	0.153394611817274	0.1683212481457276	0.7099572170410624	-0.0029488457995221	0.3742318697283657	0.0029488457995221	0.3618097939343037	0.002189682739255	0.5651718345851799	-3.877803644389296e-05	0.2947464380821333	3.877803644389296e-05	0.2837269409929003	-0.0163632402825755	0.1092043028676843	0.0163632402825755	0.1060878214050589	CALN1	73929	TYW1B	454978	POM121	506128	False	False	False	ref	-15	0.003212	-80	0.01288
3715	chr7	82757157	A	G	rs6963266	-0.00604766578	0.5324544153093175	0.00604766578	0.5194598587015837	0.0062905753741112	0.9069288954375015	-3.81283922014439e-05	0.6338650750217943	3.81283922014439e-05	0.6207747985207653	0.0765007935766967	0.8671362732371	-0.0004318271499487	0.7717639663978222	0.0004318271499487	0.7577991133386789	0.0004939511729453	0.9025336784183848	-2.811113635237088e-06	0.8152996242749624	2.811113635237088e-06	0.80112844767769	-0.0044461042126992	0.4282544793505928	0.0044461042126992	0.4177985089365213	CACNA2D1	313201	PCLO	405773	SEMA3E	891982	False	False	False	ref	-75	0.01022	75	0.02336
3716	chr7	82804606	C	A	rs6467913	-0.0105070292	0.3416247985687468	0.0105070292	0.3304261852799914	0.0068288207529928	0.8289638830515039	-7.121391756534831e-05	0.426496043860829	7.121391756534831e-05	0.4152908710378931	0.294415917177564	0.5048147183916806	-0.0030660328539929	0.3515496459533045	0.0030660328539929	0.3392781865134319	0.0020125973312473	0.6058839935691838	-2.0801047406641912e-05	0.4096946723294998	2.0801047406641912e-05	0.3975571719229295	-0.0081183414765712	0.2371315154914986	0.0081183414765712	0.2300117645756728	PCLO	358324	CACNA2D1	360650	SEMA3E	844533	False	False	False	ref	60	0.005615	90	0.01105
3717	chr7	82806065	C	A	rs13235048	0.00735365306	0.463273557291563	0.00735365306	0.4760265813015181	0.0248709106870919	0.0097500507155019	0.0001792910367047	0.2061288908123059	0.0001792910367047	0.214485351138129	0.3420948350086619	0.4236321423333364	0.0025834433629622	0.3989822531294954	0.0025834433629622	0.4118136660519318	0.0085975224069021	0.0239336989736104	6.358724591734556e-05	0.2005714861532139	6.358724591734556e-05	0.2101794352743759	0.0050062759987136	0.3886672509851849	0.0050062759987136	0.3987262498757722	PCLO	356865	CACNA2D1	362109	SEMA3E	843074	False	True	True	alt	55	0.00235	0	0.0
3718	chr7	82810877	T	C	rs17284668	-0.00628928448	0.4674505095360392	0.00767737112	0.4598843589484997	0.0104987106565811	0.2806348739078435	-7.027476665932791e-05	0.4366742965859701	8.170487368712277e-05	0.4294479529279632	0.2892602620359132	0.4790936123135193	-0.0019577810547461	0.4667393842526908	0.0021964077219926	0.4586908817172073	0.0033529871161041	0.3263102780389195	-2.453684606102273e-05	0.4270942947544787	2.650180144089821e-05	0.419242185472109	-0.0037946451726677	0.3520388271411984	0.0055249535783565	0.347371039577092	PCLO	352053	CACNA2D1	366921	SEMA3E	838262	False	False	False	ref	-10	0.001343	-25	0.03027
3719	chr7	82815056	G	A	rs2189246	0.00647251738	0.4721378682352147	0.00647251738	0.4846048615446068	0.0216259917769179	0.0185744701709469	0.0001401207331934	0.2419488673550706	0.0001401207331934	0.2514081240574985	0.1026359194597453	0.8164923956198927	0.0007255720369564	0.6542486832158184	0.0007255720369564	0.668247933467308	0.0022793031471384	0.5150947046814306	1.61663902968196e-05	0.4752562698692645	1.61663902968196e-05	0.4881578428417921	0.0055560742331351	0.3478150348797266	0.0055560742331351	0.3573560492238592	PCLO	347874	CACNA2D1	371100	SEMA3E	834083	False	True	False	alt	25	0.00505	80	0.0629
3720	chr7	82817929	C	A	rs2189247	0.0038256281599999	0.6464657212287719	0.0038256281599999	0.6601891410324676	0.0175267083945367	0.0450127328260329	7.217745421791703e-05	0.432240098756398	7.217745421791703e-05	0.4443186793112915	0.4173922966005872	0.3099937825826627	0.0015725114126932	0.4987099615323059	0.0015725114126932	0.5124708883818664	0.0073001534825271	0.0413779783647954	2.967385884074268e-05	0.3380808368085357	2.967385884074268e-05	0.3503494086293423	0.0018506416041659	0.6588052333534604	0.0018506416041659	0.6717775476033129	PCLO	345001	CACNA2D1	373973	SEMA3E	831210	False	False	False	alt	95	0.00322	100	0.08026
3721	chr7	82820719	A	C	rs2715148	-0.005726606748	0.5296227021475866	0.005726606748	0.5173107794033344	0.0168699814925242	0.0523101649448524	-0.0001001944283529	0.3556828344151389	0.0001001944283529	0.3449537551570538	0.1500285272668803	0.7359597790226402	-0.0008574349078784	0.641897987050016	0.0008574349078784	0.6280374872344328	0.0025479524164845	0.4840599485451928	-1.5014069271178012e-05	0.5006383109093232	1.5014069271178012e-05	0.4877064119657397	-0.0058735049118766	0.3563762159481998	0.0058735049118766	0.3471316051852738	PCLO	342211	CACNA2D1	376763	SEMA3E	828420	False	False	False	ref	55	0.0012665	85	0.02869
3722	chr7	82848332	A	G	rs2522839	-0.00378802312	0.6646352987788234	0.00378802312	0.6512997480109645	0.0166884332059268	0.0554347275791206	-6.740616619600921e-05	0.4779100097085635	6.740616619600921e-05	0.4661902406435705	0.0565317067604435	0.8998451707167516	-0.0002200735209661	0.8528339805265569	0.0002200735209661	0.8385543491185257	0.0009630214259781	0.8080750607981434	-3.994757822576302e-06	0.7637367508138697	3.994757822576302e-06	0.7496771903664926	-0.0026867498625503	0.5928643534638953	0.0026867498625503	0.5804953882677841	PCLO	314598	CACNA2D1	404376	SEMA3E	800807	False	False	False	ref	100	0.005432	100	0.03217
3723	chr7	82849280	C	T	rs2107069	0.0049942595	0.5599274978060758	0.0049942595	0.5728703817862167	0.0291990735284943	0.0047017461383692	0.0001410400174258	0.2258503852488096	0.0001410400174258	0.2348776338056258	0.076320293778981	0.8666337317054206	0.0003658318119182	0.765128401549694	0.0003658318119182	0.7790894782661522	0.0023785760997484	0.4815854525898734	1.102958537226964e-05	0.5498595899518888	1.102958537226964e-05	0.5629622943097589	0.0035456799344391	0.4790062333341579	0.0035456799344391	0.4903917759223641	PCLO	313650	CACNA2D1	405324	SEMA3E	799859	False	True	True	alt	-90	0.007156	50	0.02054
3724	chr7	82874126	T	C	rs1986742	0.0445210884	0.0375370500073685	0.0445210884	0.0400631140848658	0.0114220660390243	0.2119709348838043	0.000536550085777	0.0401980263108105	0.000536550085777	0.0426641283982446	0.1754271309868359	0.6922230046016267	0.0089334984035797	0.1485408526980654	0.0089334984035797	0.1575336995571677	0.0021033358108278	0.5585622788851521	0.0001144694598474	0.1252468989898631	0.0001144694598474	0.1322482113690546	0.0421871596178383	0.0093210747119203	0.0421871596178383	0.0095661209313258	PCLO	288804	CACNA2D1	430170	SEMA3E	775013	False	False	False	alt	90	0.003159	0	0.0
3725	chr7	82965320	T	C	rs11761974	-0.000653015848	0.8575001465557842	0.0016361250479999	0.8503517194868587	0.0319012818161094	0.003077642367385	-2.3622011748520632e-05	0.53924207996107	5.3627750852891886e-05	0.5333734049860129	0.1168497598522805	0.7972764592500142	-0.0001038298854439	0.8620213440610993	0.0002031208685778	0.8544673438349126	0.0038217992928179	0.2802125579077192	-3.7425967478727897e-06	0.6777608759707459	6.773083328855564e-06	0.6707032171028925	-0.0007759416591458	0.7408269576686103	0.0014688949055487	0.7340010431835787	PCLO	197610	CACNA2D1	521364	SEMA3E	683819	False	True	True	ref	-90	0.0349	35	0.00479
3726	chr7	82973122	G	T	rs62458571	-0.005153361008	0.6443617060435348	0.005285084688	0.633530002386791	0.0157798582453023	0.0688392454440575	-8.641758407173057e-05	0.5065612960188777	8.890193429597084e-05	0.4968025444004215	0.0889179348333488	0.8476506584966721	-0.0007013995396787	0.7697928228193908	0.0007164181080533	0.7589769495869232	0.0014728551261664	0.7077625979828975	-1.2252010640131014e-05	0.6792202122449196	1.2535265583798735e-05	0.6683120532889608	-0.0042697538356206	0.525516904891415	0.0044108341372835	0.5179565119064526	PCLO	189808	CACNA2D1	529166	SEMA3E	676017	False	False	False	ref	-100	0.0009003	-100	0.01788
3727	chr7	86603267	C	T	rs13244678	-0.00180443834	0.8471253877129277	0.00180443834	0.836116127551197	0.0143504597613339	0.0987302840199311	-2.6315751954693487e-05	0.7462778828812985	2.6315751954693487e-05	0.7342512550303003	0.065477857654125	0.8830062415599718	-0.0001297284185646	0.9187199491846644	0.0001297284185646	0.9056333576424832	0.0010061059110354	0.7901067973226448	-2.101784060292954e-06	0.8747350837676121	2.101784060292954e-06	0.8606996319063801	-0.0013049927903815	0.7814734439972555	0.0013049927903815	0.7685908248152113	GRM3	40643	ELAPOR2	456387	DMTF1	549143	False	False	False	ref	-35	0.001816	-100	0.0575
3728	chr7	86612034	G	T	rs13231757	-0.0445063922	0.0411532277652416	0.0445063922	0.0384288699015394	0.0162240474751003	0.0596382532458301	-0.0007763307797825	0.0250678905613416	0.0007763307797825	0.0237404088112648	0.1269453002624508	0.7756075804003763	-0.0053493134575774	0.2394226010271621	0.0053493134575774	0.2286113000534268	0.0019687741498407	0.6137787815034237	-8.954238436987488e-05	0.1451279206518129	8.954238436987488e-05	0.1373968843081174	-0.0379630494092261	0.0123943150539609	0.0379630494092261	0.0120882862948444	GRM3	31876	ELAPOR2	447620	DMTF1	540376	False	False	False	ref	-100	0.006252	-95	0.02167
3729	chr7	87583088	G	A	rs117773249	-0.0013599779799999	0.783237528632763	0.00247637198	0.7740572269831058	0.0100275505222558	0.3090887993174018	-1.038687051233803e-05	0.7463430665461941	2.445096662685723e-05	0.7376504193121429	0.0386477038143548	0.9259600339256258	-7.743916180779573e-05	0.9240438489151696	9.264497603287226e-05	0.9138751380534254	0.0003701712045812	0.9170325375347816	-6.773420799155008e-07	0.9161733230679469	8.6890172470812e-07	0.9060405556693782	-0.0009232460917644	0.7847081098809148	0.0011929584331787	0.774874160506633	RUNDC3B	44461	ABCB4	102653	ABCB1	130235	False	False	False	ref	100	0.00676	-90	0.01793
3730	chr7	87591900	A	G	rs1858923	0.01697913132	0.2180923639148101	0.01697913132	0.2280962942215906	0.010412122844799	0.2730140659594367	0.0001774364255632	0.1961301607752659	0.0001774364255632	0.2047222006428254	0.1831305303996929	0.687813633652865	0.0031766595924552	0.3515042599083359	0.0031766595924552	0.3643596653489881	0.0019108783067055	0.6280080244083002	3.328829454960914e-05	0.3209745127807534	3.328829454960914e-05	0.3329009740548031	0.0159026545918525	0.0966576959605203	0.0159026545918525	0.0992102678715953	RUNDC3B	35649	ABCB4	111465	ABCB1	121423	False	False	False	alt	-60	0.0004272	100	0.063
3731	chr7	87714706	T	C	rs28656907	0.0543614396	0.0183300545161881	0.0543614396	0.0196928457697428	0.0114873409080428	0.1945277916642818	0.0006379669150364	0.0250094344215077	0.0006379669150364	0.026770604230279	0.3603730329152791	0.3895821902739348	0.0192288171278572	0.0408698310444377	0.0192288171278572	0.044708645959936	0.0041331235561741	0.2351788827722596	0.0002260383786557	0.0388819080857723	0.0002260383786557	0.0420165109022272	0.037236900797726	0.0123762077574839	0.037236900797726	0.0127503027214869	ABCB1	1383	RUNDC3B	87157	DBF4	161511	False	True	False	alt	100	0.02841	100	0.1621
3732	chr7	87801354	G	A	rs12704370	-0.0042976175	0.6460619302605839	0.0042976175	0.6327744806698965	0.0068005255275363	0.8188373266805584	-2.891024714282553e-05	0.7104788619477304	2.891024714282553e-05	0.6971913685981648	0.1123912073776698	0.799745894708167	-0.0004609885863837	0.7510416704830104	0.0004609885863837	0.7370811403244639	0.0007689849016674	0.8385310450620975	-3.1088437513668743e-06	0.7871050937398084	3.1088437513668743e-06	0.7730194378231285	-0.0037655992282077	0.483200356426531	0.0037655992282077	0.4719346810311807	DBF4	74863	SLC25A40	75006	ABCB1	88031	False	False	False	ref	100	0.003944	5	0.001099
3733	chr7	87904753	A	C	rs77491588	-0.000623118442	0.8641281378967565	0.001356354622	0.8633321639660964	0.020648801247356	0.0229882453915284	-1.1194050569393845e-05	0.6928952824498285	2.7274562373281746e-05	0.6918975754851555	0.1911596593325656	0.6718676170764329	-0.0001384903136821	0.8118120500698744	0.0002637079438071	0.8111224360110105	0.0039640198985415	0.259113242927862	-2.590739824918861e-06	0.6847708481082188	5.337656729680866e-06	0.6840226172080122	-0.0005995912820672	0.7500830362309012	0.0013340387348416	0.7490327972216242	SLC25A40	28393	DBF4	28536	ADAM22	29391	False	False	False	ref	95	0.06067	100	0.0706
3734	chr7	94589318	C	T	rs79065506	0.0058519447	0.533443174919213	0.0058519447	0.5466863040982026	0.0247436772559345	0.0099143486104368	0.0001490170243135	0.2586222830746897	0.0001490170243135	0.2681272879413195	0.0522515793732299	0.9019554646804196	0.0002317208169911	0.8187172533602248	0.0002317208169911	0.8328378007164149	0.0012700183255704	0.730636953451926	5.774793617024478e-06	0.6663749708642007	5.774793617024478e-06	0.6801160565825792	0.0028983703150447	0.5461100969160924	0.0028983703150447	0.5582985554090472	PEG10	67008	SGCE	67254	CASD1	80098	False	True	True	alt	85	0.00222	-100	0.00341
3735	chr7	94589324	G	T	rs78742611	0.00744378598	0.4467959071911354	0.00744378598	0.4593200767852542	0.0237046385706784	0.0124676434082743	0.0001830404006207	0.196360317456032	0.0001830404006207	0.2046343303349242	0.0531250324173486	0.9005098535148476	0.0003557114045955	0.7714553746661785	0.0003557114045955	0.7857475180428618	0.0012297289639687	0.7419891725660065	8.449699136542016e-06	0.6027241214940655	8.449699136542016e-06	0.6162683159251923	0.0039834438116577	0.4396430322849343	0.0039834438116577	0.4506621765214967	PEG10	67002	SGCE	67248	CASD1	80104	False	True	False	alt	100	0.002792	90	0.0008707
3736	chr7	94605787	C	A	rs6979891	0.00293182334	0.7013987431297297	0.00293182334	0.7153241180553767	0.0203826204033139	0.0244957721760424	6.224322221862355e-05	0.460845146209329	6.224322221862355e-05	0.4728276931983189	0.0089938692310085	0.9819160665940126	2.32149972146927e-05	0.9530088528848232	2.32149972146927e-05	0.9670620674793604	0.0001784399222471	0.9608095907554998	4.915644894215271e-07	0.922144744692014	4.915644894215271e-07	0.936371792468662	0.0004232409049886	0.8940826591454816	0.0004232409049886	0.908242030103456	PEG10	50539	SGCE	50785	CASD1	96567	False	False	False	alt	100	0.00647	-50	0.006134
3737	chr7	94627959	G	A	rs883176	0.00395140676	0.6235212727831325	0.00395140676	0.6369506099532996	0.0138272781029494	0.1065614482194462	5.346367928964675e-05	0.4886107861617262	5.346367928964675e-05	0.5008686137714249	0.0593159680079668	0.8972227417010276	0.0002047841269829	0.8285507733699662	0.0002047841269829	0.8427908532470387	0.0008895207568153	0.8200942714949313	3.0013689435933774e-06	0.7692466640733691	3.0013689435933774e-06	0.7835741813852104	0.0023713938941274	0.590672937098589	0.0023713938941274	0.6030709974049757	PEG10	28367	SGCE	28613	CASD1	118739	False	False	False	alt	-5	0.000656	65	0.01309
3738	chr7	94643899	G	T	rs17166402	0.00713111904	0.4405681786795997	0.00713111904	0.4528260403819347	0.0269716104617949	0.0064381992025572	0.000194201565344	0.1633617755216461	0.000194201565344	0.1710858205816924	0.0759821159970538	0.8666785671865421	0.0005503015137674	0.6957124143658122	0.0005503015137674	0.7095249796105221	0.0020555964510578	0.5944598036049535	1.5088167393937257e-05	0.4701826041325891	1.5088167393937257e-05	0.4829347109223452	0.0054813846616666	0.3448455725551805	0.0054813846616666	0.3544505574758135	PEG10	12427	SGCE	12673	CASD1	134679	False	True	True	alt	35	0.001236	0	0.0
3739	chr7	94643922	G	A	rs17166404	0.0046462706	0.5756902735996602	0.0049737496799999	0.5859756164910873	0.0199523910614079	0.0267251099107363	9.875600250265764e-05	0.3400863905050648	0.0001041612731839	0.3492234294580092	0.077880475938547	0.8638645232465394	0.0003890682935861	0.761673411520222	0.0004148456480257	0.7718381570028165	0.0015846315661386	0.6841249002251355	8.468586315150825e-06	0.614992070314826	8.894059545474625e-06	0.6252703682311058	0.0036286683471819	0.4595031177764819	0.0038942312679591	0.4683337115523856	PEG10	12404	SGCE	12650	CASD1	134702	False	False	False	alt	0	0.0	-25	0.01465
3740	chr7	94644326	T	C	rs17166406	0.00030347898	0.6576732996822516	0.00398169074	0.6598456343076599	0.0111409418539739	0.2188783228105516	1.0336902102185085e-06	0.5911122519891602	4.363853182400773e-05	0.5928978415334196	0.1555161360595026	0.7316320804466446	9.761552439822002e-05	0.7110980038920935	0.0006049809048914	0.7135717075921132	0.0017620251231154	0.6518191598833758	9.139758855430416e-07	0.6678390121874654	6.780726261844017e-06	0.6703336604426668	0.0007116256392701	0.4968198743670429	0.0034834386248819	0.4991638037016306	PEG10	12000	SGCE	12246	CASD1	135106	False	False	False	alt	0	0.0	100	0.01926
3741	chr7	94644720	T	C	rs13241095	0.029812986	0.0970996930022409	0.029812986	0.1030926311865641	0.0149392680270914	0.0827066018918261	0.0004030556092504	0.0619494301981806	0.0004030556092504	0.0656908901631886	0.1883463521405823	0.676216685000366	0.0060903519312598	0.2257645079796833	0.0060903519312598	0.2373470144553346	0.0027958464266811	0.4576545458352665	8.329922950368555e-05	0.1567756951220483	8.329922950368555e-05	0.165521534442104	0.0276745609394287	0.0302737102762146	0.0276745609394287	0.0312047746850649	PEG10	11606	SGCE	11852	CASD1	135500	False	False	False	alt	100	0.01381	-35	0.02295
3742	chr7	94645049	T	G	rs13241489	-0.00417914014	0.6369133413733407	0.00417914014	0.6234970613645343	0.0197311246520529	0.0284938736083767	-8.574825527161214e-05	0.3994353158540654	8.574825527161214e-05	0.3880978517251028	0.1201008309214825	0.7913477770248545	-0.0005448237250464	0.7329840981438012	0.0005448237250464	0.7187378849065217	0.0024220513328762	0.5152539027224823	-1.151727235253669e-05	0.5758131807441967	1.151727235253669e-05	0.562292467512228	-0.0041141505617277	0.4635577570838607	0.0041141505617277	0.4526799396682195	PEG10	11277	SGCE	11523	CASD1	135829	False	False	False	ref	-100	0.02129	-55	0.02487
3743	chr7	94652446	T	C	rs13307062	0.0029544057	0.7276016903496118	0.0029544057	0.7412697440807825	0.0097417791202675	0.3293147662318443	2.799103496502848e-05	0.7076371284619867	2.799103496502848e-05	0.7211541313353225	0.2276040207885973	0.6153134099178954	0.0007598330343248	0.6775564218520947	0.0007598330343248	0.6915535881204594	0.0022191849696245	0.5688147060397657	7.155960046819167e-06	0.663238846755675	7.155960046819167e-06	0.6770919055058646	0.0025435948505689	0.5921592994763343	0.0025435948505689	0.6045529509475923	PEG10	3880	SGCE	4126	CASD1	143226	False	False	False	alt	30	0.0008345	-95	0.02011
3744	chr7	94782211	T	C	rs34376444	0.048640926	0.0277185237781452	0.048640926	0.0297925708588885	0.0109574211141959	0.2199521125175908	0.0005407376116476	0.0352925270588311	0.0005407376116476	0.0376165820225122	0.1063351279577588	0.8143628274474459	0.0055361287986023	0.2247488886099284	0.0055361287986023	0.2357458086075353	0.0011721690856817	0.7637162083907418	6.19664234771155e-05	0.1945560348014345	6.19664234771155e-05	0.2042608762988622	0.0408863162480937	0.0098615451150226	0.0408863162480937	0.0101818175489764	PPP1R9A	124992	SGCE	125639	PEG10	125885	False	False	False	alt	-100	0.014404	-95	0.02493
3745	chr7	94819397	C	T	rs34578239	-0.00847742324	0.4114971867944034	0.00847742324	0.3996300883930616	0.0077710883486509	0.6196245573162568	-6.726220019918313e-05	0.4529268605956197	6.726220019918313e-05	0.4416128035453761	0.3741657071131444	0.3782190173675303	-0.0031774831823036	0.3491036261938789	0.0031774831823036	0.3369253005427423	0.0028916598121433	0.4443150530151235	-2.507356795330032e-05	0.3771680223977962	2.507356795330032e-05	0.3653699298692501	-0.0052220458718451	0.3728375011800061	0.0052220458718451	0.3632527575497635	PPP1R9A	87806	SGCE	162825	PEG10	163071	False	False	False	ref	90	0.01383	70	0.0963
3746	chr7	100668458	T	C	rs221786	0.0439540046	0.0367722434314766	0.0439540046	0.0395413889689273	0.0095785431664505	0.3415069949695731	0.0004488276609897	0.0546064881215818	0.0004488276609897	0.058047906191272	0.3467670826460854	0.4178515055813779	0.0156822246673075	0.0610249983651173	0.0156822246673075	0.066083923580397	0.0034293527322758	0.3245182371937049	0.0001659654850148	0.0702132300891481	0.0001659654850148	0.0752086136030786	0.0296455357420719	0.0237094373217467	0.0296455357420719	0.0243100770846737	GNB2	5110	ACTL6B	12010	TFR2	25679	False	False	False	alt	35	0.002323	-95	0.0478
3747	chr7	100681034	A	G	rs221792	0.0526439852	0.0207565889537777	0.0526439852	0.022213157048339	0.0118061816525468	0.1773345379790908	0.0006373076163833	0.0266218319472056	0.0006373076163833	0.0283232717159163	0.6210977292295563	0.0338933441122787	0.0327828048532932	0.0104811816084389	0.0327828048532932	0.011394801292464	0.0073404335023172	0.0402198309048349	0.0003971761580703	0.0163434783042069	0.0003971761580703	0.0175908886884509	0.0060228840548137	0.3059652541249624	0.0060228840548137	0.314899107105587	GNB2	7466	GIGYF1	13216	ACTL6B	24586	False	False	False	alt	-80	0.003593	60	0.01544
3748	chr7	100855586	T	C	rs314370	0.0210290834	0.1675449170792891	0.0210290834	0.1760781539840363	0.0071047019659799	0.7658532364935179	0.0001515185788482	0.2300741651488705	0.0001515185788482	0.2390490260205816	0.3108974159482982	0.460679178745765	0.0062037145830517	0.1894510058779245	0.0062037145830517	0.1995990806159999	0.0021736739571482	0.5630259401539931	4.395671822044404e-05	0.2374064730271338	4.395671822044404e-05	0.2476668609538064	0.0167034927748212	0.1088318526001415	0.0167034927748212	0.1120775271451049	TRIP6	11802	SRRT	19518	EPHB4	28063	False	False	False	alt	70	0.00144	75	0.0665
3749	chr7	100870078	C	T	rs12705090	-0.00521479354	0.6093795569790386	0.00521479354	0.5960256875872602	0.0065102947156993	0.8422450462828461	-3.5799849012200564e-05	0.6765390382525011	3.5799849012200564e-05	0.6631362664701407	0.456098092303862	0.2465803300317298	-0.0023836643999135	0.4472037069797319	0.0023836643999135	0.4340625540261846	0.0029710183541513	0.4239500980089392	-1.636879762672169e-05	0.5101517035742602	1.636879762672169e-05	0.4970501560703105	-0.0019668253820059	0.6792239825553127	0.0019668253820059	0.6664384056524647	TRIP6	2690	SRRT	5026	UFSP1	19637	False	False	False	ref	-55	0.00937	100	0.05536
3750	chr7	100876668	T	C	rs12667888	0.0559380531999999	0.0171575801622141	0.0559380531999999	0.0184441274218596	0.0104504107754729	0.260441462638322	0.0005941029442349	0.02845147606733	0.0005941029442349	0.0304277901591967	0.4008402576790216	0.3360013710111889	0.0225107876165857	0.0294569742381238	0.0225107876165857	0.0321191139646563	0.0041965689531043	0.228732833496042	0.0002396679552444	0.0356005123435982	0.0002396679552444	0.0384310060039741	0.0320750215251195	0.0216146672169883	0.0320750215251195	0.0222232063058911	SRRT	1564	TRIP6	9280	UFSP1	13047	False	True	False	alt	-10	0.002008	-100	0.05664
3751	chr7	100879824	A	G	rs12705093	-0.004503429852	0.5864867576118982	0.0050752982919999	0.5786055197061386	0.0270452614607944	0.0069339841928455	-0.0001351696374403	0.2978687202600761	0.0001481748385485	0.2908678337403588	0.5084803784271621	0.1611354709180134	-0.0023191845150222	0.4274725252491306	0.0026027902991414	0.4196919525486508	0.0137578205923405	0.0041582514773186	-6.953783927539778e-05	0.2069845430051618	7.59874876055454e-05	0.2005187256073803	-0.001404578885673	0.7321605284436244	0.0015664062905216	0.7248035436667767	SRRT	4720	UFSP1	9891	TRIP6	12436	False	True	True	ref	100	0.001343	20	0.03357
3752	chr7	100896090	G	A	rs17884589	-0.0457480445999999	0.0374386322658446	0.0457480445999999	0.0350996032757922	0.0126308864763	0.1396533329677041	-0.0005744626482428	0.0336039110045061	0.0005744626482428	0.0317211938783536	0.8500897312212784	0.0043966456537385	-0.0388103462344966	0.0076410384169947	0.0388103462344966	0.0070809487393336	0.0107499652102696	0.0102820882999827	-0.0004878376221242	0.012786533276388	0.0004878376221242	0.0119581756473566	-0.00912250127076	0.2154174856114462	0.00912250127076	0.2087528357745099	ACHE	884	UFSP1	6375	SRRT	20986	True	False	False	ref	-90	0.0352	-95	0.0992
3753	chr7	100897329	G	T	rs17883557	-0.0108178728	0.3373003952041022	0.0108178728	0.3261198888122154	0.0123399829686654	0.1539707156205211	-0.0001328362961191	0.2647163385493887	0.0001328362961191	0.2554968350936003	0.8146661272419837	0.0056174200992895	-0.0087899286844135	0.1497798164907479	0.0087899286844135	0.1410681754069716	0.0100418899090908	0.0125485321350476	-0.0001078337306303	0.1139178811140242	0.0001078337306303	0.1070197132166022	-0.0020581126360231	0.6603368622441951	0.0020581126360231	0.6475196962114058	ACHE	355	UFSP1	7614	SRRT	22225	False	False	False	ref	-100	0.01477	-100	0.06274
3754	chr7	100918383	A	C	rs10278546	0.0933111786	0.0026859468551602	0.0933111786	0.0028044561673896	0.0224099974859813	0.0177281504094055	0.0022929008265094	0.0040040277238482	0.0022929008265094	0.0041743322979456	0.3965124119544808	0.3422679599692755	0.0374731110768623	0.007264347694294	0.0374731110768623	0.007831546005568	0.0090439869841386	0.0250808192241255	0.0009350543804583	0.0056342502215449	0.0009350543804583	0.00592008125126	0.0562640691293477	0.0024241143233488	0.0562640691293477	0.0025155194952317	ACHE	21409	UFSP1	28668	MUC3A	31152	False	True	True	alt	75	0.04285	75	0.05988
3755	chr7	104953806	T	G	rs2252074	-0.0019587299799999	0.7088837525601595	0.00317062222	0.70118169048506	0.0265507069830703	0.0070721687114428	-5.396702489814198e-05	0.3763784815825889	8.32852186286115e-05	0.3703075603371163	0.1062894843307502	0.8072553800965722	-0.0001531053016463	0.78280975450005	0.0003415665594339	0.775342285374907	0.0027569026587991	0.4436358523425833	-4.241701257589645e-06	0.5913376430970737	8.800970982519039e-06	0.5842431969687607	-0.0020020954574217	0.548462561893294	0.0029191174182304	0.5416861456220045	KMT2E	12862	ENSG00000289360	87043	ENSG00000288914	87053	False	True	True	ref	40	0.005394	45	0.0347
3756	chr7	104960407	C	A	rs4727614	-0.002161921634	0.8018231759337504	0.002161921634	0.7879462989500815	0.0177763733438019	0.0436212538782228	-3.745542897666832e-05	0.6173061376632588	3.745542897666832e-05	0.6044110379583814	0.297942924719136	0.4963458047462609	-0.0006679994801062	0.6888908930522493	0.0006679994801062	0.6744463095595052	0.0053018171952876	0.1185364352682433	-1.156883137362939e-05	0.5481590231882075	1.156883137362939e-05	0.5345591968514943	-0.0016556188342201	0.7120683023671259	0.0016556188342201	0.6989218714460386	KMT2E	19463	ENSG00000289360	80442	ENSG00000288914	80452	False	False	False	ref	-65	0.007416	-30	0.02487
3757	chr7	104965083	C	A	rs7776707	-0.00161812122	0.778555881241772	0.00250043494	0.7730410019906211	0.0070260399381779	0.7633622200479561	-1.0721515746130974e-05	0.8124601438341298	1.715832476322624e-05	0.8074153113396473	0.0973350345957945	0.8241051992588944	-0.0001862434217803	0.8275655648856701	0.0002675195202003	0.8221192024429674	0.0006844839297555	0.8518880558594887	-1.2232761846152102e-06	0.8480858069125355	1.826111893607408e-06	0.8427496700676504	-0.0014771937468231	0.6395919518309124	0.0021286527868545	0.6343847676954728	KMT2E	24139	ENSG00000289360	75766	ENSG00000288914	75776	False	False	False	ref	35	0.009705	-95	0.0536
3758	chr7	104984179	C	T	rs3823752	-0.00943232346	0.3776976243242527	0.00943232346	0.3660737744528982	0.0086428780550982	0.4771355113007517	-8.052145965214717e-05	0.3961535108133254	8.052145965214717e-05	0.3854640454506635	0.7631386217699354	0.0077479865062846	-0.0072010022807931	0.1838297907425974	0.0072010022807931	0.1742615796026764	0.0066085681993642	0.0589934631290268	-6.161630638498643e-05	0.1967076969879546	6.161630638498643e-05	0.1874913709928801	-0.0017655784811044	0.7003588248439708	0.0017655784811044	0.6872807213921955	KMT2E	43235	ENSG00000289360	56670	ENSG00000288914	56680	True	False	False	ref	-100	0.0175	100	0.1218
3759	chr7	105071264	T	C	rs11760317	0.00801361768	0.4170455472553802	0.00801361768	0.4291672272345276	0.0072351580791368	0.738186489281792	6.054699045031093e-05	0.4819656729342069	6.054699045031093e-05	0.4938892078465978	0.0310023962904179	0.9460643112621688	0.0002783131510734	0.8082698083303531	0.0002783131510734	0.8224124879841307	0.0002316148414079	0.9545260192901246	2.141659284435249e-06	0.8263909765524108	2.141659284435249e-06	0.840602090608926	0.0035933982717662	0.4908115173219347	0.0035933982717662	0.5023789815670898	ENSG00000288914	30405	ENSG00000289360	30415	KMT2E	130320	False	False	False	alt	0	0.0	60	0.04584
3760	chr7	105075043	T	G	rs10808141	-0.00377323742	0.671996273354557	0.00377323742	0.6588260838232657	0.009054587376437	0.4100890125259319	-3.409305727131272e-05	0.6545595041441787	3.409305727131272e-05	0.6416153727497909	0.196288343240075	0.6652258807255479	-0.0007712868195375	0.6654959582278	0.0007712868195375	0.6517906948169745	0.0017845780431146	0.649224233774015	-6.990009917629822e-06	0.6573670831455845	6.990009917629822e-06	0.6437270172793418	-0.0035975476924034	0.4959861221629222	0.0035975476924034	0.4845563275763048	ENSG00000288914	34184	ENSG00000289360	34194	KMT2E	134099	False	False	False	ref	25	0.007904	-95	0.06195
3761	chr7	105101395	A	T	rs10953468	0.0081084184	0.4078814753765505	0.0081084184	0.4199501884080952	0.0225398367065937	0.0154644687234063	0.0001782219664758	0.1826482232045644	0.0001782219664758	0.1908332392964171	0.1975954107407752	0.6573411680427614	0.001519412085668	0.494679164793608	0.001519412085668	0.5082154796962413	0.0044753563149936	0.1924094392321461	3.330673760034288e-05	0.2951046447442597	3.330673760034288e-05	0.3060367286326741	0.0071556758887539	0.2585993366521063	0.0071556758887539	0.266529580186331	ENSG00000288914	60536	ENSG00000289360	60546	KMT2E	160451	False	True	False	alt	-15	0.0011215	10	0.003555
3762	chr7	105179032	T	C	rs6943183	0.001476889784	0.8534383806325729	0.001600420944	0.8625894450265013	0.0166198873693072	0.0572598067377308	2.28081021864198e-05	0.7483569278736791	2.47389070407434e-05	0.7575701996816357	0.2737974460315978	0.5399811045178216	0.0004295412036688	0.7710207650156072	0.0004590698145624	0.7805185404549535	0.0045902577676399	0.1820482539267257	6.732853466749585e-06	0.6760711090450793	7.194388713569352e-06	0.6856370531135313	0.0011224182823473	0.7662216711137403	0.0012551997427358	0.7752013773037879	ENSG00000288914	138173	ENSG00000289360	138183	SRPK2	220276	False	False	False	alt	-90	0.01351	55	0.01215
3763	chr7	105187651	C	T	rs3779210	-0.0078034003199999	0.4546882647417875	0.0078034003199999	0.4425460765773341	0.0068350467730511	0.8069366364274958	-5.5430319895458426e-05	0.5328680573869369	5.5430319895458426e-05	0.5205131407256822	0.1188788265438437	0.7912430322452931	-0.0009633750886198	0.633863936252778	0.0009633750886198	0.6200809257180913	0.0008189651578073	0.8309501917203924	-6.89841813535097e-06	0.6754093022998889	6.89841813535097e-06	0.6616339402639442	-0.0070498656625068	0.2784124585437329	0.0070498656625068	0.2706469572401488	ENSG00000288914	146792	ENSG00000289360	146802	SRPK2	211657	False	False	False	ref	100	0.00886	35	0.00537
3764	chr7	105195441	T	C	rs10281886	0.00273753756	0.7217619184097125	0.00273753756	0.7354372654032958	0.0073997881253133	0.7104163374739149	2.039435700362445e-05	0.7465958952874472	2.039435700362445e-05	0.7602789652486326	0.2561956036888349	0.5681905108454619	0.0006986238267255	0.6424671579258692	0.0006986238267255	0.6563911819122202	0.0018859547232671	0.6256760400681312	5.177809286863416e-06	0.6686911113452315	5.177809286863416e-06	0.6826146319888567	0.002475129410056	0.5823435189559177	0.002475129410056	0.5947386167567672	ENSG00000288914	154582	ENSG00000289360	154592	SRPK2	203867	False	False	False	alt	85	0.002018	35	0.02158
3765	chr7	105203881	C	T	rs2240463	0.00262204536	0.7363515422386707	0.00262204536	0.7500123756834441	0.021807068072077	0.0181720011406573	5.41525086956184e-05	0.4868397457447426	5.41525086956184e-05	0.499097605775303	0.4585483251900952	0.2304496000603225	0.0011771408625978	0.5479277389708969	0.0011771408625978	0.5619128585254296	0.0100523936214475	0.0129041840954207	2.430275865385797e-05	0.3544891552207779	2.430275865385797e-05	0.3663601452992018	0.0010705505243829	0.7754427614581136	0.0010705505243829	0.7891969293867636	ENSG00000288914	163022	ENSG00000289360	163032	SRPK2	195427	False	True	False	alt	100	4.58e-05	-65	0.01541
3766	chr7	105204072	G	A	rs10281422	-0.0331538578	0.0867696187978636	0.0331538578	0.0815921418144432	0.0101340253344342	0.3024792242201117	-0.0003410199169032	0.0850917410911623	0.0003410199169032	0.0804732277098819	0.4921088393033123	0.1763395998725477	-0.0166033393148726	0.0649296414343892	0.0166033393148726	0.0600284598644931	0.0050255863498541	0.1472650530239398	-0.0001722887527734	0.0674066351767307	0.0001722887527734	0.0629287333114769	-0.0106992811128745	0.1737863505565375	0.0106992811128745	0.1684824814603784	ENSG00000288914	163213	ENSG00000289360	163223	SRPK2	195236	False	False	False	ref	30	0.00525	40	0.0607
3767	chr7	105204647	T	C	rs41562	0.0657471342	0.0092263384039378	0.0657471342	0.0098067239307929	0.0206855197605674	0.0230293588736941	0.00139544607116	0.0065539728537924	0.00139544607116	0.0068368285222687	0.5098953308644281	0.1558144420635351	0.0334694441323016	0.0098284631734977	0.0334694441323016	0.0107126328750441	0.0104893422856836	0.0115496978666466	0.000706259366961	0.0061569442024796	0.000706259366961	0.0065313865005108	0.0204027012728347	0.0561561690285143	0.0204027012728347	0.0576582037113564	ENSG00000288914	163788	ENSG00000289360	163798	SRPK2	194661	False	True	True	alt	20	0.0003338	-20	0.02429
3768	chr7	105204806	G	C	rs2237613	-0.0503339581999999	0.028585565237852	0.0503339581999999	0.0267611387425348	0.0148129074848998	0.083704555203131	-0.0007385189295018	0.0214606127343941	0.0007385189295018	0.0202674248833143	0.4676376310957583	0.2249710642114365	-0.0237487754685661	0.0311391690515046	0.0237487754685661	0.0286658723274359	0.0068931714544566	0.0498352759919415	-0.0003465818685469	0.0224490834689998	0.0003465818685469	0.0209680166745101	-0.0200748970425004	0.0710785353895235	0.0200748970425004	0.0691320564567793	ENSG00000288914	163947	ENSG00000289360	163957	SRPK2	194502	False	False	False	ref	-100	0.003254	-100	0.0689
3769	chr7	105215424	C	A	rs4730073	0.012590437	0.284205980978226	0.012590437	0.2952129233053531	0.0133266509264815	0.1210194630189921	0.0001743588963634	0.2027329095671418	0.0001743588963634	0.2112901641004625	0.1258083590078735	0.777942328072815	0.0015507169098059	0.4919520248345173	0.0015507169098059	0.5053210520610768	0.0016518786611416	0.6721128103954774	2.126511168271734e-05	0.4008261168077843	2.126511168271734e-05	0.4130058906813843	0.0113465907322689	0.1639733354707642	0.0113465907322689	0.1694110126318675	ENSG00000288914	174565	ENSG00000289360	174575	SRPK2	183884	False	False	False	alt	-70	0.005157	25	0.02774
3770	chr7	105231445	G	T	rs10953470	-0.055536898	0.0193427795662301	0.055536898	0.0180854718453037	0.0117410138894028	0.1869269527580837	-0.0006836824339445	0.0277740782762087	0.0006836824339445	0.0262661846230885	0.2381228021037562	0.5964365636174486	-0.0139116936476517	0.0893083063437057	0.0139116936476517	0.0831131681099345	0.002927374462358	0.3948466759336393	-0.000178218610589	0.0740854715449721	0.000178218610589	0.0693445077641373	-0.0495440824074938	0.0038521741320734	0.0495440824074938	0.0036995775458253	SRPK2	167863	ENSG00000288914	190586	ENSG00000289360	190596	False	True	False	ref	-65	0.002007	-10	0.01167
3771	chr7	105241083	A	G	rs3801282	0.002053288966	0.7783734272855134	0.0021141396339999	0.7882425134608069	0.0079646607420019	0.6019518682470034	1.5758166870436964e-05	0.793481253568463	1.6238851196967802e-05	0.8033228607894332	0.1118580068257969	0.8048070993393294	0.0002224453806879	0.8245326503239168	0.0002292804207092	0.8331760943628373	0.0009030903317201	0.8178575939070424	1.7389793802374146e-06	0.8342078461685587	1.7929721590803065e-06	0.8428790029937128	0.0019357047272274	0.6482442964701686	0.0019896471955102	0.6565985951186035	SRPK2	158225	ENSG00000288914	200224	ENSG00000289360	200234	False	False	False	alt	-60	0.00066	30	0.02953
3772	chr7	105266570	C	T	rs3801278	-0.0071191222199999	0.4768646137474828	0.0071191222199999	0.4639821101612411	0.0058714868710217	0.9321086846673016	-4.337492531512784e-05	0.5814195304431569	4.337492531512784e-05	0.5686220296574848	0.1417317607029118	0.7555973761500989	-0.0009153761452653	0.6299116863098025	0.0009153761452653	0.6158142854986595	0.0008210835353896	0.8314512672869484	-5.5467684132274144e-06	0.6927936539046928	5.5467684132274144e-06	0.6787132566264376	-0.006651521281341	0.2976126543557345	0.006651521281341	0.289803603179851	SRPK2	132738	ENSG00000288914	225711	ENSG00000289360	225721	False	False	False	ref	100	0.005745	-25	0.006966
3773	chr7	105288617	A	C	rs6466055	-0.00504366162	0.5827167303027244	0.00504366162	0.5696187481570812	0.0274261262691276	0.0059783439618584	-0.0001360887834001	0.2528579622297651	0.0001360887834001	0.2437497804744401	0.2823016836274234	0.5228699550076635	-0.0013927566326329	0.534674898926079	0.0013927566326329	0.5209002190135277	0.007823015719607	0.0342310631836891	-3.79428164315122e-05	0.2850071565823356	3.79428164315122e-05	0.274367531193028	-0.0040809551966306	0.4504226166166362	0.0040809551966306	0.4396869599465056	SRPK2	110691	PUS7	233654	RINT1	243553	False	True	True	ref	-50	0.007187	-55	0.02026
3774	chr7	105288820	T	C	rs6466056	0.0202767588	0.1735477119515236	0.0202767588	0.1823940111582515	0.0065254636182678	0.8593715748149134	0.0001319537857613	0.260523086374449	0.0001319537857613	0.2700822540707804	0.317831097832965	0.4648720386144032	0.0066227362227489	0.1872790136469491	0.0066227362227489	0.1976268836001385	0.0020694500592566	0.596377950564242	4.2930913912434165e-05	0.2532000956463325	4.2930913912434165e-05	0.2637562025932645	0.0145665411466923	0.1147241207815299	0.0145665411466923	0.1183726739660312	SRPK2	110488	PUS7	233451	RINT1	243350	False	False	False	alt	-90	0.00684	50	0.04816
3775	chr7	105289803	T	C	rs2057884	0.00473046974	0.596282975373178	0.00473046974	0.6096814168090148	0.0061529383528886	0.8893918450994184	2.990878404912032e-05	0.683207993877917	2.990878404912032e-05	0.6966800607827236	0.1630162138611396	0.717144471454891	0.0007799437137978	0.6484962254001905	0.0007799437137978	0.6625550747535739	0.0009872808133972	0.8008445634129744	4.78318418188477e-06	0.7090477695353617	4.78318418188477e-06	0.7231842751807054	0.0041100011410906	0.4330322892101766	0.0041100011410906	0.4440302339685438	SRPK2	109505	PUS7	232468	RINT1	242367	False	False	False	alt	-90	0.003006	45	0.0468
3776	chr7	110407907	C	T	rs4730430	-0.0702878756	0.0090556198418755	0.0702878756	0.0085625904437766	0.0202167527566854	0.024844466994311	-0.001456616616926	0.0068725524582644	0.001456616616926	0.0066179744341434	0.0844988018547909	0.8510784010553095	-0.0062685894005376	0.2220643379810035	0.0062685894005376	0.2116413178414471	0.0017081953682105	0.6647761133521098	-0.0001297214400216	0.1039067466684362	0.0001297214400216	0.0977176469888306	-0.0486312098673222	0.0055146377993702	0.0486312098673222	0.0053374478010375	LRRN3	683100	IMMP2L	1154610	DOCK4	1798500	False	True	True	ref	-30	0.001469	80	0.01085
3777	chr7	110413547	A	G	rs55634663	-0.001054480759	0.8802759749721984	0.001295437455	0.8803732572229447	0.0191005241688412	0.0317815907405128	-2.1539245516221907e-05	0.732819395221344	2.637792671701712e-05	0.7308587112055935	0.0339567837840641	0.9374796510619255	-2.8540136860172583e-05	0.9527563277231388	3.953962905129968e-05	0.954156623801511	0.0006570202711979	0.8630815736998254	-5.712285331007507e-07	0.9164023533465012	7.941909170165334e-07	0.9171341085254916	-0.0003838214089357	0.876400765996426	0.0005912924407929	0.8758908210050071	LRRN3	677460	IMMP2L	1148970	DOCK4	1792860	False	False	False	ref	45	0.0009003	85	0.05203
3778	chr7	110432071	G	T	rs211792	0.0009868078154	0.8717076345147384	0.0011734240914	0.873503755937678	0.0104507692637734	0.270863846712035	1.0747044971499634e-05	0.8317006414979011	1.2820788929007564e-05	0.8336876699409975	0.3097189804873493	0.4764794253916847	0.0003675404918283	0.7870372654671782	0.0004159157779996	0.7896623299032445	0.0032325115505223	0.359499556321221	3.99387302724096e-06	0.7536260137594502	4.536707958967694e-06	0.756354837868442	0.0006991773773586	0.8357016003638981	0.0008153611551986	0.8377827081737005	LRRN3	658936	IMMP2L	1130446	DOCK4	1774336	False	False	False	alt	100	0.01717	75	0.10236
3779	chr7	110467153	A	C	rs56680698	0.0383869743999999	0.0530536335994247	0.0383869743999999	0.0564711604368063	0.0142899850020929	0.1023049595718216	0.000581136226977	0.0359059941794581	0.000581136226977	0.0379569854499716	0.4681832799095426	0.2227133377464533	0.0181810476057835	0.0466231558863016	0.0181810476057835	0.0506608710157545	0.0067591386829462	0.058160464862543	0.0002776323758628	0.0327539980734658	0.0002776323758628	0.0351957289625582	0.0145955870911523	0.1115248848293795	0.0145955870911523	0.1149665375717468	LRRN3	623854	IMMP2L	1095364	DOCK4	1739254	False	False	False	alt	10	0.003906	-95	0.01526
3780	chr7	110668619	C	T	rs1525674	-0.0070260465999999	0.4839559079863674	0.0070260465999999	0.4714491337581193	0.0164495673350698	0.0615977483785999	-0.0001113340911304	0.3147624309680743	0.0001113340911304	0.3049602045534661	0.1224162076370086	0.7857578821072891	-0.0008383723792369	0.6538030630406935	0.0008383723792369	0.6399319562150789	0.0021647484743847	0.5369553218095058	-1.4183070994463812e-05	0.5209922569719774	1.4183070994463812e-05	0.5080629335241877	-0.0061307689913795	0.3173151094357193	0.0061307689913795	0.3085598277527375	LRRN3	422388	IMMP2L	893898	DOCK4	1537788	False	False	False	ref	70	0.004196	-70	0.01236
3781	chr7	111227479	A	G	rs214475	0.0186019626	0.1830195985628966	0.0186019626	0.1920138119316142	0.0096947434714499	0.3462394329255949	0.0001846339724957	0.1754205326701857	0.0001846339724957	0.1834065727806328	0.2455917592506145	0.5816320286612243	0.0046304478677277	0.2480651603707152	0.0046304478677277	0.2592056120118876	0.0024520099484498	0.5159912951318343	4.73491479497414e-05	0.2335396362070374	4.73491479497414e-05	0.2437386786067594	0.0171993485409599	0.0883500677017871	0.0171993485409599	0.0910484008402818	LRRN3	136472	IMMP2L	335038	DOCK4	978928	False	False	False	alt	55	0.001438	70	0.04037
3782	chr7	111269113	C	T	rs6959670	-0.00074040198	0.7472349267736084	0.0025173324599999	0.7467243972672643	0.0054394504286456	0.9816629472594146	-4.325451150054671e-06	0.8344123439281751	1.3412489817833256e-05	0.8338918680404089	0.0825382006037406	0.8531813294972779	-1.283865461930788e-05	0.8583169659882095	0.0001644622036831	0.8585032304810639	0.0004570722337139	0.9047547505702708	-9.764733334937005e-08	0.8973136262861743	8.732577537154048e-07	0.8973294449210933	-0.0002323675556799	0.6787686281258192	0.0018174462390688	0.6784394167195921	LRRN3	178106	IMMP2L	293404	DOCK4	937294	False	False	False	ref	-55	0.001974	15	0.0047
3783	chr7	111277630	C	T	rs13239254	-0.0259934714	0.1368409801050891	0.0259934714	0.1296766910277167	0.0077842177935095	0.6378419335744938	-0.0002033363670585	0.177962685106719	0.0002033363670585	0.1703162625530485	0.1875600369298436	0.6754780455780013	-0.0048463933034817	0.2635856579218708	0.0048463933034817	0.2524746508928681	0.0014593613840267	0.7056062349697143	-3.787362569268472e-05	0.293029155272408	3.787362569268472e-05	0.2822005481560104	-0.0243529497193953	0.0478430341827834	0.0243529497193953	0.0466281714771591	LRRN3	186623	IMMP2L	284887	DOCK4	928777	False	False	False	ref	-70	0.002075	-15	0.010925
3784	chr7	111348537	G	T	rs35426637	-0.0090695283599999	0.3918308585385257	0.0090695283599999	0.3799267202640393	0.0107123625264035	0.2461335609718916	-9.939236531068776e-05	0.3498973118822902	9.939236531068776e-05	0.3394268517607439	0.1475637714084171	0.7426447532277192	-0.0014216949383495	0.5414293281212184	0.0014216949383495	0.5279554308267433	0.0016571721155249	0.665429758341648	-1.6344109742157034e-05	0.4944272772665098	1.6344109742157034e-05	0.4816638300473952	-0.0086245707943027	0.2397530311213569	0.0086245707943027	0.2327101358732057	IMMP2L	213980	LRRN3	257530	DOCK4	857870	False	False	False	ref	-55	0.004578	5	0.0002441
3785	chr7	115389596	T	C	rs59369558	0.0234957996	0.1471817168004004	0.0234957996	0.1550688142371694	0.0082419521604106	0.5457759139436145	0.0002016021662318	0.1758731633634604	0.0002016021662318	0.1837068477861214	0.0404713741843794	0.929739993220148	0.0010243193272015	0.597752678966163	0.0010243193272015	0.6113892538539013	0.0003482589676398	0.931562786842002	9.092071695592804e-06	0.6050917717589751	9.092071695592804e-06	0.6184687398266338	0.0116349754665504	0.1715918272231025	0.0116349754665504	0.1769004686297603	MDFIC	467501	TFEC	770300	TES	820911	False	False	False	alt	-45	0.004898	100	0.02269
3786	chr7	115405658	A	C	rs12706031	0.00587934454	0.5223002195745743	0.00587934454	0.5357011634814844	0.0086236996759181	0.4857597464839976	5.130713396199382e-05	0.5366854895021848	5.130713396199382e-05	0.5494460941503597	0.3363561862674923	0.4346012810018357	0.0020019449256543	0.4508367732962467	0.0020019449256543	0.4643787673763262	0.0029415936965637	0.4293994306388388	1.782784210413784e-05	0.4572954737281347	1.782784210413784e-05	0.4702262707934135	0.0038942312679591	0.4554231805834361	0.0038942312679591	0.4667139339728394	MDFIC	483563	TFEC	754238	TES	804849	False	False	False	alt	-35	0.001678	-25	0.0233
3787	chr7	115417808	G	C	rs2401924	-0.0347355242	0.0730096057654242	0.0347355242	0.0686741130184424	0.0103332971628035	0.2697932799105644	-0.0003659001220994	0.0732689726999375	0.0003659001220994	0.069359444629893	0.2152677932343696	0.6302977037405092	-0.0072741047054054	0.1794910715310569	0.0072741047054054	0.1700819373779586	0.0022216819177614	0.5533757232768327	-7.651662569809002e-05	0.1601303648093157	7.651662569809002e-05	0.1518661860367039	-0.0327576012199296	0.0203958027533354	0.0327576012199296	0.0197856266591195	MDFIC	495713	TFEC	742088	TES	792699	False	False	False	ref	-70	0.02045	-65	0.009766
3788	chr7	115420155	G	A	rs62474713	-0.0324767316	0.0880147992997061	0.0324767316	0.0826848032172018	0.008356719891147	0.51132423207731	-0.0002871730150007	0.1179488054930859	0.0002871730150007	0.1121325905540948	0.2212284359796263	0.6227136136810111	-0.0074347072998039	0.1822996010970337	0.0074347072998039	0.1729110985728391	0.0019185497035515	0.6110666982243282	-6.846335935415822e-05	0.1991860667581331	6.846335935415822e-05	0.1902115995883962	-0.0294214670276662	0.0250374955830523	0.0294214670276662	0.0243416463118961	MDFIC	498060	TFEC	739741	TES	790352	False	False	False	ref	75	0.007904	15	0.01022
3789	chr7	115421602	A	G	rs2401925	0.0376370012	0.0565789986899154	0.0376370012	0.06044196188657	0.0131718009246078	0.1266486765035695	0.0005128114304299	0.039305838790623	0.0005128114304299	0.0417317351287651	0.1319702486540316	0.7696426193273417	0.005238980242196	0.2337082481115342	0.005238980242196	0.2449528884500296	0.0017675769593112	0.6430538428128797	7.248512621263735e-05	0.1676800244755964	7.248512621263735e-05	0.1767238817229177	0.0357161381342129	0.0157076658634847	0.0357161381342129	0.0161405041506815	MDFIC	499507	TFEC	738294	TES	788905	False	False	False	alt	-95	0.0454	-5	0.002472
3790	chr7	115428659	A	G	rs1358394	-0.002240412392	0.7991671884896342	0.002240412392	0.7853305421835308	0.0207537040798573	0.0226498978228993	-4.716771625853213e-05	0.5922017643392194	4.716771625853213e-05	0.5796756727907402	0.0348177885662713	0.9357594864456252	-7.056227767294897e-05	0.9421154530711312	7.056227767294897e-05	0.9279370986930572	0.0007221592513115	0.8487334685006988	-1.475103209355075e-06	0.8852038355658621	1.475103209355075e-06	0.8708090828123106	-0.0011182688617101	0.7993344217177816	0.0011182688617101	0.7856900153717563	MDFIC	506564	TFEC	731237	TES	781848	False	False	False	ref	55	0.01247	40	0.02463
3791	chr7	115464509	T	C	rs4730682	-0.002111528266	0.7897968042825495	0.002257007254	0.7814955467530575	0.0202504641995689	0.0253909143802186	-4.54316707457133e-05	0.5756684692627626	4.79289038912538e-05	0.5671529295015924	0.0391767549455906	0.9264869870921442	-9.341957469927747e-05	0.9170566874580868	9.659630134416e-05	0.9090425740140856	0.0008039732256493	0.831298744434434	-1.99252201666871e-06	0.842895025219632	2.0470524139898727e-06	0.8344074074378262	-0.0013776076515316	0.7475056280784573	0.0014398489610887	0.7391470014744647	MDFIC	542414	TFEC	695387	TES	745998	False	False	False	ref	75	0.00328	-95	0.01743
3792	chr7	127857531	C	T	rs10269552	0.00490421654	0.5228028664351879	0.0055146305	0.5318215145637418	0.0193353296372592	0.0303022463023682	9.360320795198616e-05	0.3209534697578164	0.0001050040102144	0.3287736410463732	0.4694426290729156	0.2226533001072155	0.0023248814622958	0.3805262024466736	0.0026032875726105	0.3897618593648917	0.0090862616703873	0.0182555637115675	4.4436327592190265e-05	0.2300852791971909	4.963616444809459e-05	0.2377666091959227	0.0019647506716874	0.6257810690586645	0.002184669965456	0.6338311617286616	LRRC4	174576	SND1	205336	PAX4	239389	False	False	False	alt	-60	0.0639	45	0.06177
3793	chr7	128029531	T	C	rs73238074	0.1211083492	0.0009065034421006	0.1211083492	0.0009574793699214	0.028606512276409	0.0064599077043632	0.0036235986988458	0.0015780926685721	0.0036235986988458	0.0016463978199867	0.5412545773296402	0.1135225234384839	0.0655794832907439	0.0009795523885722	0.0655794832907439	0.0010414216994727	0.015476136116788	0.0034229872318224	0.0019600954316912	0.0014157814707204	0.0019600954316912	0.0014802978443269	0.033104077843131	0.0204888048363066	0.033104077843131	0.0210110481967878	LRRC4	2576	LEP	211748	RBM28	314377	False	True	True	alt	-5	0.0003586	-5	0.01514
3794	chr7	128066983	C	T	rs3757753	-0.0552235512	0.0202364896130396	0.0552235512	0.0189565956957713	0.0129410210294805	0.1354875902426618	-0.0007294763505593	0.0219187021237486	0.0007294763505593	0.0207158401370404	0.5098683596302866	0.1573027021897194	-0.0281535021270621	0.0193455092196628	0.0281535021270621	0.0177931311179021	0.006615936001969	0.0600978093102558	-0.0003727699825775	0.0199721628886306	0.0003727699825775	0.0186371489827299	-0.0173362794219856	0.0961715145367516	0.0173362794219856	0.0934925759821319	LRRC4	34876	LEP	174296	RBM28	276925	False	True	False	ref	80	0.002565	-80	0.02954
3795	chr7	128075850	T	C	rs322832	0.00206775028	0.6491558002391123	0.00395950476	0.653394482413945	0.0080086282572648	0.5870063674506223	1.8024084815459457e-05	0.672032504387327	3.2120837105260446e-05	0.6760370072633994	0.5417442089648232	0.1111615872036763	0.0010116542793378	0.4522714516235654	0.0020817415914904	0.4567205766720682	0.0043273889499898	0.2093587956490428	8.857635770390513e-06	0.4759560474631511	1.6831830802576388e-05	0.4802819531817399	0.00066805672258	0.8047215243345087	0.0010249068973744	0.8083203598854493	LRRC4	43743	LEP	165429	RBM28	268058	False	False	False	alt	100	0.00219	85	0.07446
3796	chr7	128099669	G	T	rs6954161	0.014478044	0.2361013463669047	0.014478044	0.2462621869250321	0.0188095302306003	0.0353442163022058	0.000275532580729	0.1038632445869255	0.000275532580729	0.1096607473489396	0.3772134565711262	0.3700603222390355	0.0054819019709394	0.2094304255024235	0.0054819019709394	0.2197920532561817	0.0070363914145639	0.0474189690925244	0.0001034276840358	0.1058028578990115	0.0001034276840358	0.1128231102594552	0.0087096339173642	0.2147853263541434	0.0087096339173642	0.221791937522362	LRRC4	67562	LEP	141610	RBM28	244239	False	False	False	alt	-60	0.002064	-45	0.01503
3797	chr7	128100012	A	G	rs6954389	0.0388066692	0.0512842630650369	0.0388066692	0.0547684744864545	0.0138831416034653	0.108978426491664	0.0005634331511431	0.037391696771994	0.0005634331511431	0.0396794041543799	0.4228902789448023	0.2964277886015345	0.0163901101949266	0.0549107455504196	0.0163901101949266	0.0595995470769277	0.0058435141587039	0.0898958056112828	0.0002366475252706	0.0393384501951708	0.0002366475252706	0.0422801431013197	0.019384018506416	0.0698642666536872	0.019384018506416	0.0719590946344899	LRRC4	67905	LEP	141267	RBM28	243896	False	False	False	alt	45	0.0003576	75	0.04944
3798	chr7	128100939	G	T	rs7792971	-0.0076293487	0.442418200419421	0.0076293487	0.4300502268252165	0.008331773056022	0.5232832764946447	-6.467345262137588e-05	0.4531529746093208	6.467345262137588e-05	0.4411797179703657	0.3701345449641593	0.3761360191761033	-0.002855402467026	0.3734168861812804	0.002855402467026	0.3608047038986828	0.0030879531482061	0.3896918455112481	-2.429496897378197e-05	0.3803543647256084	2.429496897378197e-05	0.3682651498589036	-0.0048485980145021	0.4010028855145927	0.0048485980145021	0.3911182293765837	LRRC4	68832	LEP	140340	RBM28	242969	False	False	False	ref	-5	4.96e-05	-50	0.02367
3799	chr7	128102510	G	A	rs6467161	-0.032191539	0.0900615064237125	0.032191539	0.0850550670588702	0.0151412605700064	0.0897787252306257	-0.0005869156289521	0.0557741297931096	0.0005869156289521	0.0530784860400332	0.4147719374682309	0.3040953610889326	-0.0135934702899011	0.0892604826268139	0.0135934702899011	0.0833295849462573	0.0064415339780469	0.0806385630730185	-0.0002549870721142	0.0572803432350269	0.0002549870721142	0.0539543878864717	-0.0170250728741999	0.106367160520093	0.0170250728741999	0.1032475718322555	LRRC4	70403	LEP	138769	RBM28	241398	False	False	False	ref	5	0.0002174	10	0.001358
3800	chr7	128103272	G	A	rs7803473	-0.031897593	0.0902595237918925	0.031897593	0.0848924674892761	0.0081333812549672	0.5394382148293653	-0.0002695752077895	0.1238524825666482	0.0002695752077895	0.1178586246703215	0.628952582495669	0.0291626635119914	-0.0200336807768774	0.043866139854643	0.0200336807768774	0.0404542559007122	0.005108332626881	0.1325274034566674	-0.0001691084332149	0.0687437114290702	0.0001691084332149	0.0641980567588581	-0.0033257606406704	0.5164930437565173	0.0033257606406704	0.5049990120094714	LRRC4	71165	LEP	138007	RBM28	240636	False	False	False	ref	-75	0.00592	-95	0.04968
3801	chr7	128103586	G	A	rs6467163	-0.119517582	0.0010973949413462	0.119517582	0.0010609451955158	0.0388343263008979	0.0013807376247855	-0.0046351548226131	0.0010274077273699	0.0046351548226131	0.0009775440798111	0.7090177283996721	0.0111253407415979	-0.0849515930171982	0.0004341238491311	0.0849515930171982	0.0004067788925639	0.0275508451981675	0.0005165878256108	-0.0032970229784804	0.0006128868738749	0.0032970229784804	0.0005778591225514	-0.0157470513179597	0.1009202705437054	0.0157470513179597	0.0979961879067169	LRRC4	71479	LEP	137693	RBM28	240322	False	True	True	ref	100	0.01483	50	0.12115
3802	chr7	128133841	G	A	rs73239723	0.00842485988	0.4269899181355753	0.00842485988	0.4395742431288795	0.0073265326097359	0.7184621956853148	6.416179040547844e-05	0.4827083876771536	6.416179040547844e-05	0.4946768467521574	0.323970165665619	0.4604263457566466	0.0027124046676328	0.3925057036376578	0.0027124046676328	0.4051433595048238	0.0023639750484526	0.5413301476724687	2.062093361503317e-05	0.4324370991110449	2.062093361503317e-05	0.4448405174301543	0.0063257917613252	0.3331625767830669	0.0063257917613252	0.3424037540787371	LRRC4	101734	LEP	107438	RBM28	210067	False	False	False	alt	-75	0.003708	-85	0.0427
3803	chr7	128266837	G	A	rs142949934	-0.019961667	0.1826599709491601	0.019961667	0.1741075418550477	0.006610621685232	0.8620528469502702	-0.000132333148323	0.2599141028987484	0.000132333148323	0.2505981738141293	0.4431581240469299	0.266176428109267	-0.0088579523820324	0.1468392002603583	0.0088579523820324	0.1383575537599591	0.0029248925576658	0.4362649748969066	-5.861982926649372e-05	0.2019873549637937	5.861982926649372e-05	0.1927640254691088	-0.0089980186516457	0.2208869567410935	0.0089980186516457	0.2141365802264559	LEP	25558	RBM28	77071	PRRT4	94853	False	False	False	ref	-55	0.001942	75	0.077
3804	chr7	128291271	C	T	rs2122628	-0.0024436585308	0.7899702937057339	0.0024436585308	0.7787015250862215	0.0096474776621968	0.3570897766984046	-2.7855418487125463e-05	0.740552397487953	2.7855418487125463e-05	0.729821067160546	0.1799002064336766	0.6909294517811388	-0.0004661993683668	0.7879844330676458	0.0004661993683668	0.7741151232304809	0.0017704036792035	0.6505884222343369	-5.337377933009103e-06	0.7585825233725	5.337377933009103e-06	0.744802099319453	-0.0022801066401103	0.6581248261588557	0.0022801066401103	0.6454669520815447	LEP	49992	RBM28	52637	PRRT4	70419	False	False	False	ref	30	0.0017395	80	0.01608
3805	chr7	128292333	T	G	rs10245775	0.0618809846	0.0117515911613711	0.0618809846	0.0125264534845108	0.0124309424394811	0.1483607379257753	0.0007750515207666	0.0168501105197215	0.0007750515207666	0.0178610266069817	0.624467058786917	0.0312190586536546	0.0386573746527591	0.0063182552928545	0.0386573746527591	0.006850103428884	0.0077603518938866	0.032640832663167	0.0004840551336871	0.0110272354795692	0.0004840551336871	0.0117996858659339	0.0066598201226153	0.2792383525509975	0.0066598201226153	0.2878351334315145	LEP	51054	RBM28	51575	PRRT4	69357	False	True	False	alt	35	0.0007935	55	0.0597
3806	chr7	131832443	C	A	rs6944918	-0.0040058447399999	0.6282577655331413	0.0040058447399999	0.6147303620704192	0.0101453788722179	0.2864396592714106	-4.158662676280826e-05	0.579121710960858	4.158662676280826e-05	0.5665291018141332	0.5219224265811886	0.1417998062495565	-0.0020868585706645	0.4449831158580968	0.0020868585706645	0.4315167218735424	0.0052920618520768	0.1177943471359202	-2.1657486555749405e-05	0.4080116829497144	2.1657486555749405e-05	0.3956604096672176	-0.00113279183394	0.7912200874662909	0.00113279183394	0.7774745553892628	PODXL	274226	MKLN1	722346	PLXNA4	816245	False	False	False	ref	-100	0.00257	85	0.08124
3807	chr7	131832656	G	A	rs6945544	-0.0462002316	0.0364925960932569	0.0462002316	0.0340420549518487	0.012502804020091	0.149001449972066	-0.0005805106226182	0.0325122021411976	0.0005805106226182	0.0305866743238596	0.5137791885807944	0.1530659445512656	-0.0236695114997069	0.0306455138771568	0.0236695114997069	0.0282332431867319	0.0064197449823843	0.0648319534917473	-0.0002972288107992	0.028467096258615	0.0002972288107992	0.0265255765307683	-0.0142325127854022	0.1329897290121437	0.0142325127854022	0.1290703115423119	PODXL	274439	MKLN1	722559	PLXNA4	816032	False	False	False	ref	-100	0.001549	-100	0.0668
3808	chr7	131854604	T	C	rs11975170	0.0828389217999999	0.0044852101003338	0.0828389217999999	0.0047189983386432	0.0306059881983453	0.0040973745097455	0.0025579498296485	0.0025817601668597	0.0025579498296485	0.0026647133025133	0.3959854355335636	0.3451653213153243	0.0328929559849371	0.0110598328412461	0.0328929559849371	0.01208670519238	0.0121379364983143	0.0070466618150181	0.0010172360743585	0.003705394443156	0.0010172360743585	0.0039048654522385	0.0509590348447597	0.0044078411737773	0.0509590348447597	0.0045038699947309	PODXL	296387	MKLN1	744507	PLXNA4	794084	False	True	True	alt	-75	0.00787	-100	0.04285
3809	chr7	131861984	T	C	rs10954343	0.001245822632	0.7941790795661974	0.002064627952	0.8007725410808837	0.0219559250646625	0.017533936466986	2.92639559519148e-05	0.5606455605999264	4.713245456016865e-05	0.5663310933119591	0.4328551126049025	0.284455867028159	0.0005761248107077	0.620024254164082	0.0009094771581201	0.6262283750669219	0.0095268898940116	0.0154301673441034	1.3531560430173804e-05	0.4249438029322821	2.0806190834841185e-05	0.4304836797840061	0.0004626604010414	0.818448208060062	0.0008983495679415	0.8251515588017904	PODXL	303767	MKLN1	751887	PLXNA4	786704	False	True	False	alt	10	0.005432	40	0.007935
3810	chr7	131864194	A	G	rs6955090	0.0027761744399999	0.3075829937490952	0.01328289436	0.3110520811586912	0.0073155583885655	0.7198889925432534	9.360885967830318e-06	0.3647629067058658	0.0001081253114083	0.3677076263597825	0.2183300656645816	0.6256084102037973	0.0006901589129568	0.3890938408423335	0.0026588817656318	0.3938506988097452	0.0015548533453139	0.690113456380418	3.025422862070453e-06	0.4300026180159053	2.122960773169571e-05	0.434229903181397	0.0015352856357431	0.1680119041729473	0.012634985840102	0.1697291631960931	PODXL	305977	MKLN1	754097	PLXNA4	784494	False	False	False	alt	95	0.00316	-20	0.03497
3811	chr7	131885258	C	A	rs73725651	-0.0002367647888	0.9330878480512764	0.0006653361712	0.9361621563018898	0.0090778354266232	0.4099031873441737	-1.3017484109801031e-06	0.9325404992031072	5.293891515395045e-06	0.9357244480351764	0.3807840330293882	0.3618642506605098	-9.655479468414309e-05	0.8205959235274899	0.0002670180902432	0.8235883955730103	0.0034011270360684	0.3459498933646184	-4.861384011677916e-07	0.8222556667581871	2.077031068686052e-06	0.8254174554242759	-0.0001058102262471	0.9255041000321608	0.0003257295200157	0.9285486561697625	PODXL	327041	PLXNA4	763430	MKLN1	775161	False	False	False	ref	-100	0.01868	-100	0.0997
3812	chr7	131886936	G	A	rs7799455	0.0020170073999999	0.6858840907241212	0.00366059756	0.6892876076505099	0.0117751221579735	0.1767399387996777	2.5532945660478674e-05	0.5958582770870683	4.383716351775106e-05	0.5992657487336562	0.1670784966649031	0.7057680937809854	0.0005132679724929	0.6923230426101854	0.0007517026001879	0.6956149075058432	0.0019715246863639	0.5968628983081604	6.328088824560098e-06	0.6337580499938716	8.982039895036957e-06	0.6371637434759301	0.0013278146038859	0.5256252332958414	0.0031494102635919	0.5282713157490189	PODXL	328719	PLXNA4	761752	MKLN1	776839	False	False	False	alt	-25	0.003397	85	0.02077
3813	chr7	131913188	C	T	rs10260150	-0.069551268	0.0100246885432602	0.069551268	0.0095242251259056	0.0178930443524148	0.0562757944182024	-0.0014914364946122	0.0113628961070829	0.0014914364946122	0.0108696312726758	0.3400201246900901	0.4332840045875942	-0.0247783699282514	0.0298512873847462	0.0247783699282514	0.0276513703676977	0.0064854505063599	0.09839397946283	-0.0005692142093498	0.0206220281910059	0.0005692142093498	0.0193481208270329	-0.0503698171142853	0.0044520795314568	0.0503698171142853	0.0043443971345699	PODXL	354971	PLXNA4	735500	MKLN1	803091	False	True	True	ref	-95	0.0044	95	0.03516
3814	chr7	132064837	A	G	rs11772439	0.039153399	0.0504297311695857	0.039153399	0.0540944499708167	0.0095917745329857	0.3767108467222801	0.0003974173377795	0.064285616134891	0.0003974173377795	0.0681527926552808	0.4021016815527131	0.3323538784054128	0.0156101298691808	0.0603449473743642	0.0156101298691808	0.0657011477630942	0.0038061493107032	0.2807277730864077	0.0001558407713667	0.068011320768393	0.0001558407713667	0.0731479683545381	0.0228155893733337	0.0551766521951016	0.0228155893733337	0.0567129760366355	PODXL	506620	PLXNA4	583851	MKLN1	954740	False	False	False	alt	85	0.004707	35	0.06366
3815	chr7	132076501	C	A	rs10954356	-0.0217562088	0.1626019040639603	0.0217562088	0.1546803083232867	0.0090978475038021	0.4107383404523712	-0.0001965210397475	0.1717882391357378	0.0001965210397475	0.1643099360980059	0.4456208051950746	0.2546626607833175	-0.0097363779641269	0.1316773508291395	0.0097363779641269	0.123819287761979	0.004045351124578	0.2470774719319697	-8.78091610177166e-05	0.1384158129410193	8.78091610177166e-05	0.1309887239667994	-0.0096557018226329	0.21349144742136	0.0096557018226329	0.2070630247081948	PODXL	518284	PLXNA4	572187	MKLN1	966404	False	False	False	ref	-85	0.005375	-85	0.138
3816	chr7	132145569	G	A	rs2122635	-0.14974483	0.0005768424913737	0.14974483	0.0005378822707979	0.049005253456243	0.0008103981436216	-0.0078927375536763	0.0005777554128737	0.0078927375536763	0.0005404612449863	0.4315314474216537	0.2855190884257029	-0.0650483993878607	0.0015078049049423	0.0650483993878607	0.0014270375438545	0.0212646281691166	0.0014332348503236	-0.0034361306000332	0.0008258420645642	0.0034361306000332	0.0007635584440274	-0.0862083631572941	0.0005779310774974	0.0862083631572941	0.0005967358168473	PLXNA4	503119	PODXL	587352	CHCHD3	936521	True	True	True	ref	-85	0.003399	85	0.0733
3817	chr7	137378039	C	A	rs11771579	0.0060307214199999	0.4568866677213005	0.00734061646	0.4660274320106037	0.0091004579495328	0.4069350086612435	6.398692786796487e-05	0.4370723554260777	7.299753012476745e-05	0.445516846169311	0.0860984035104098	0.8486150389758692	0.0005205732502172	0.6792321077316491	0.0006268742385515	0.6880302529914593	0.0007928044688011	0.8371563179536475	5.5588006813953495e-06	0.6580263478032857	6.290031725856044e-06	0.6668804092874069	0.0054710111100737	0.32775848823554	0.006375584808971	0.3336536673400687	PTN	34265	DGKI	469053	CHRM2	509386	False	False	False	alt	95	0.002138	55	0.005127
3818	chr7	137386398	T	C	rs4518583	0.0441878628	0.0357802683486734	0.0441878628	0.0383681343453985	0.0097141537424886	0.3190087797502958	0.0004518360799696	0.0525470044479538	0.0004518360799696	0.0558369519491712	0.1334287700079875	0.766688813058126	0.0062275913312836	0.2000795608820477	0.0062275913312836	0.2106719400329737	0.0013522169183428	0.7167138015017126	6.619530249472107e-05	0.1893883525624904	6.619530249472107e-05	0.1989916710948722	0.0395211568584736	0.0083077899959743	0.0395211568584736	0.0085802756381	PTN	42624	DGKI	460694	CHRM2	517745	False	False	False	alt	75	0.00905	-100	0.04657
3819	chr7	137387785	T	A	rs728055	0.0032726985399999	0.683490903584206	0.0032726985399999	0.6972071989171047	0.0172429485790504	0.0486703591133148	5.746546929658932e-05	0.4886440931771176	5.746546929658932e-05	0.5006300616159122	0.0459133393499932	0.9177178972877869	0.0001386430755088	0.8690535826042785	0.0001386430755088	0.8833677799319747	0.0008250278929724	0.831396763035054	2.5481974735507053e-06	0.7974540081500823	2.5481974735507053e-06	0.8116223070516823	0.0018319692112988	0.6663323146296604	0.0018319692112988	0.6792155062443725	PTN	44011	DGKI	459307	CHRM2	519132	False	False	False	alt	95	0.00357	95	0.002821
3820	chr7	137388185	A	C	rs2278829	-0.00691556554	0.4864162900533264	0.00691556554	0.4740222357353701	0.0074550501755227	0.6924985456445738	-5.1791804368874926e-05	0.5419332417483333	5.1791804368874926e-05	0.5298171714444949	0.0585462504797767	0.8955344503851935	-0.0004334682139342	0.7672075680966689	0.0004334682139342	0.7532242120730114	0.0004355869661657	0.9093886880307056	-3.2332176466600022e-06	0.7903057615021095	3.2332176466600022e-06	0.7762238703819276	-0.0049440346891564	0.4046885013152664	0.0049440346891564	0.3944883376924486	PTN	44411	DGKI	458907	CHRM2	519532	False	False	False	ref	-45	0.00251	-70	0.01756
3821	chr7	137389794	G	A	rs7779548	-0.0128477114	0.3017030196323871	0.0128477114	0.2911222006549616	0.0070166378343793	0.768772322365088	-9.367554373468858e-05	0.3782956307316914	9.367554373468858e-05	0.3677228371170709	0.2981068268343032	0.5022291460523173	-0.0038932643109418	0.3135906890443722	0.0038932643109418	0.3017379461054543	0.0021142333087828	0.5884535833907969	-2.872681223781236e-05	0.3661935950771781	2.872681223781236e-05	0.3545129773285163	-0.0101328851959044	0.1959080295891117	0.0101328851959044	0.1900299513223813	PTN	46020	DGKI	457298	CHRM2	521141	False	False	False	ref	-65	0.002964	-85	0.05466
3822	chr7	137392157	G	T	rs11766321	0.00790280794	0.4079685142370224	0.00790280794	0.4198761963128103	0.0223712817840582	0.0168387828642376	0.0001779933653943	0.1861009224490752	0.0001779933653943	0.1944144657523793	0.1353126069772507	0.764016996939207	0.0010868774326764	0.563984476513739	0.0010868774326764	0.5775434949649932	0.0031848511344528	0.3661877147482496	2.561235363223589e-05	0.3593055868162294	2.561235363223589e-05	0.3711177173475098	0.007693025861264	0.2468405995956935	0.007693025861264	0.2545321441710317	PTN	48383	DGKI	454935	CHRM2	523504	False	True	False	alt	100	0.01074	-95	0.02368
3823	chr7	137393444	G	C	rs13222414	-0.000805575486	0.7260111894187803	0.002675317514	0.7257148774094571	0.0072446938420057	0.7265772034332604	-6.650848695290284e-06	0.7591092685386434	1.974902449190781e-05	0.7593033158137921	0.1157646863556675	0.7950732624200522	-0.0001026041632896	0.7931413015759939	0.000314736020424	0.7934695603158013	0.0008347290102901	0.8244732459191457	-8.454400213119072e-07	0.8125437172077036	2.321834077762236e-06	0.813076038266836	-0.000983412691003	0.5803642412026843	0.0026888245728689	0.5806219627600466	PTN	49670	DGKI	453648	CHRM2	524791	False	False	False	ref	-100	0.02483	-100	0.03214
3824	chr7	137394538	G	C	rs17530005	0.0374349912	0.0591756188869664	0.0374349912	0.0632241551887512	0.0088261650605441	0.4454186191939156	0.0003422779659709	0.0804662367648912	0.0003422779659709	0.0852020371467432	0.3603066421850849	0.4026730471335102	0.0139002231281162	0.0774701703815971	0.0139002231281162	0.0837350803224214	0.0032187935702965	0.3805172513181711	0.0001279129823312	0.091331695489593	0.0001279129823312	0.0975415448493318	0.0241330304256267	0.0494478300503646	0.0241330304256267	0.0507881365646771	PTN	50764	DGKI	452554	CHRM2	525885	False	False	False	alt	-55	0.0014515	-45	0.04083
3825	chr7	139355181	C	T	rs7801613	-0.0372914562	0.0667663508354164	0.0372914562	0.062696943036208	0.0089379172658508	0.4329019051736283	-0.0003381468508191	0.0881237844253588	0.0003381468508191	0.0833552950401623	0.1177273623170364	0.7943777210184217	-0.0046279236971986	0.2786684051119738	0.0046279236971986	0.2674352358973043	0.001063752172886	0.7873610250731968	-4.256208814743097e-05	0.283140400064836	4.256208814743097e-05	0.2725466808828988	-0.0331351984979096	0.0207318460332579	0.0331351984979096	0.0202298221069259	FMC1-LUC7L2	13820	LUC7L2	14821	FMC1	15723	False	False	False	ref	100	0.01297	100	0.02557
3826	chr7	139385344	A	G	rs6942519	-0.0030011034599999	0.7429986552470583	0.0030011034599999	0.7293875504099145	0.0141692429830525	0.1020278989763917	-4.120039050630951e-05	0.621580351221237	4.120039050630951e-05	0.6088194514443743	0.0579404350667537	0.8945939436063728	-0.0002118161236758	0.8727962100688431	0.0002118161236758	0.8586044046573776	0.0008129850361507	0.8335899722751686	-2.893935494389259e-06	0.8234382538226728	2.893935494389259e-06	0.8092075490785674	-0.0020850838701645	0.6684764435085369	0.0020850838701645	0.6557376808201889	FMC1-LUC7L2	43983	LUC7L2	44984	FMC1	45886	False	False	False	ref	50	0.00232	-70	0.0477
3827	chr7	139387747	G	T	rs2355784	0.0034501525799999	0.6619491885226562	0.0034501525799999	0.6756167952611213	0.0259298311931461	0.0079454033711429	8.812661162850465e-05	0.3673171484220296	8.812661162850465e-05	0.3782736214800153	0.2411124596728181	0.592255277846303	0.0008334113585449	0.6231502747007087	0.0008334113585449	0.6371273291463072	0.0063015611501194	0.0702232959813491	2.146518561365836e-05	0.3992371233090905	2.146518561365836e-05	0.411610215656395	0.0031411114223176	0.5197416347344397	0.0031411114223176	0.5313681728434897	FMC1-LUC7L2	46386	LUC7L2	47387	FMC1	48289	False	True	True	alt	-90	0.01985	-100	0.05188
3828	chr7	139419122	A	C	rs10230398	-0.001777561426	0.7710832483303162	0.002467624666	0.7632009188975025	0.0290270408707658	0.004707556969146	-5.504573062312189e-05	0.4499570177047789	7.122974105694036e-05	0.4426745944005503	0.0433593709478313	0.9199300511862144	-8.473976657749282e-05	0.9103494087476764	0.0001000229644691	0.9023242077236826	0.001291523812058	0.7338412010316867	-2.5720680227502617e-06	0.7896120827245695	2.930503922253393e-06	0.7813629271417182	-0.0011078953101173	0.7563734137813878	0.0013236651832487	0.7484909075179625	KLRG2	64551	FMC1-LUC7L2	77761	LUC7L2	78762	False	True	False	ref	-40	0.00235	100	0.05405
3829	chr7	140951723	G	A	rs801089	-0.0377021912	0.0667643451086885	0.0377021912	0.062701791354537	0.0108080671919154	0.2374263655506116	-0.0004237943870462	0.064025515926034	0.0004237943870462	0.0604735425807983	0.0220126764800464	0.962380801072817	-0.0009363699648953	0.6670909905357175	0.0009363699648953	0.6529724792362004	0.0002505413876677	0.9508802534219388	-1.085323578444348e-05	0.6194223378658514	1.085323578444348e-05	0.6058634586504448	-0.0105374537080259	0.209874292155169	0.0105374537080259	0.2044679326646854	BRAF	26794	MRPS33	63505	TMEM178B	122342	False	False	False	ref	-40	0.02089	100	0.03723
3830	chr7	141006357	G	T	rs6662	-0.062849864	0.0126686013006269	0.062849864	0.0119814739572502	0.0216751927649183	0.0246167593998202	-0.0015482338521474	0.0089300112182855	0.0015482338521474	0.0085258266853783	0.2997707445097978	0.4991792141049326	-0.0186590245576615	0.0520635689868649	0.0186590245576615	0.0480331396717378	0.0063973306327034	0.0771097337621446	-0.0004520483586376	0.0199340289355308	0.0004520483586376	0.0187024428927997	-0.0517100799800827	0.003368282728217	0.0517100799800827	0.003273312855075	MRPS33	8871	TMEM178B	67708	BRAF	81428	False	True	False	ref	90	0.007404	35	0.02405
3831	chr7	141016390	T	C	rs246745	0.0184105948	0.197777648327622	0.0184105948	0.2069433521801057	0.0069923888153879	0.7844947594258991	0.0001279833887308	0.266452523441559	0.0001279833887308	0.2759584482038407	0.2685608771875226	0.5444800287959616	0.0051783365998086	0.2364756455945053	0.0051783365998086	0.2475060209428185	0.0018935978247995	0.6299367699440918	3.639363869004784e-05	0.2907029067353379	3.639363869004784e-05	0.3016766391774602	0.0152345978692724	0.1107963123271823	0.0152345978692724	0.1142366403055706	MRPS33	1162	TMEM178B	57675	BRAF	91461	False	False	False	alt	-10	0.000205	50	0.0458
3832	chr7	141034465	T	C	rs1089258	0.0368060632	0.0587545002867503	0.0368060632	0.0630491264448316	0.0093900776754152	0.3718115977935181	0.0003473624379439	0.071512800442434	0.0003473624379439	0.0759987183834636	0.3836782539237959	0.3659254671375989	0.0141167149940414	0.0707361955820267	0.0141167149940414	0.0767905500442402	0.0036012844295257	0.3175155475031337	0.0001331349572741	0.0778725664939559	0.0001331349572741	0.0837242970495264	0.0216039585472877	0.0545461671644078	0.0216039585472877	0.0560158576986963	MRPS33	19237	TMEM178B	39600	BRAF	109536	False	False	False	alt	-100	0.00884	-100	0.04968
3833	chr7	157664118	G	A	rs10241251	-0.0336890822	0.0821406685412235	0.0336890822	0.0772590402062672	0.0110387201690952	0.2455194426097279	-0.0003839820723516	0.0731879929363624	0.0003839820723516	0.0691998869545423	0.5283934480648139	0.131566334122341	-0.0177785249189161	0.0560443862363791	0.0177785249189161	0.0517725410678767	0.005808233870978	0.0955708151143855	-0.0002017668777401	0.0546695451010397	0.0002017668777401	0.0509931245072741	-0.0094046618740857	0.2135200905851993	0.0094046618740857	0.2069355691679527	DNAJB6	328736	UBE3C	525191	MNX1	653455	False	False	False	ref	-80	0.002928	90	0.05032
3834	chr7	157664482	G	T	rs10244667	-0.0346417398	0.0741542358341457	0.0346417398	0.0697082877382952	0.0081476774998415	0.5510473289449943	-0.00028342547892	0.10601848313742	0.00028342547892	0.1006869872016972	0.4930175624228466	0.1838039973143733	-0.0170153870169812	0.0600062566613342	0.0170153870169812	0.0555927907956459	0.0040175954355543	0.2460936793065884	-0.0001392660256477	0.083316573704345	0.0001392660256477	0.0781275082288526	-0.0118860154150976	0.1661836980712988	0.0118860154150976	0.1612882187703322	DNAJB6	329100	UBE3C	525555	MNX1	653819	False	False	False	ref	-5	0.0001945	-75	0.06128
3835	chr7	157665453	C	T	rs2366647	-0.0550275149999999	0.020410909293182	0.0550275149999999	0.0190216509372168	0.0147334964924396	0.0827547383746219	-0.0008218599612068	0.0175112356535632	0.0008218599612068	0.0165437997120928	0.4411435803275967	0.2694116157021762	-0.0242550171907928	0.0289845582210063	0.0242550171907928	0.0267283627479401	0.0064812910616879	0.0615788355977028	-0.0003609940229667	0.0209221972804613	0.0003609940229667	0.019474403531003	-0.0255583564144856	0.0410398497739239	0.0255583564144856	0.039929950244386	DNAJB6	330071	UBE3C	526526	MNX1	654790	False	True	False	ref	100	0.003685	25	0.02013
3836	chr8	4325535	A	G	rs13261217	0.0321962707999999	0.0780267380769271	0.0321962707999999	0.0831298713166541	0.0096905678556658	0.3553232373386766	0.0003115421141081	0.090318927821679	0.0003115421141081	0.0955091770485655	0.3933256569051545	0.3479620461761532	0.0128785509307559	0.0836540180141497	0.0128785509307559	0.0901467136148714	0.003862998115339	0.2777564153175534	0.0001259933749987	0.0899604959694608	0.0001259933749987	0.096115312626853	0.0183591116090415	0.0776884975790511	0.0183591116090415	0.0799557284749895	CSMD1	669437	MCPH1	2081058	ANGPT2	2237874	False	False	False	alt	-25	0.001414	-25	0.02185
3837	chr8	4364481	T	G	rs7813162	0.0596627374	0.0150822095718654	0.0596627374	0.0159984515177529	0.0122573527794339	0.1676159559467349	0.0007847130021739	0.0213594891956543	0.0007847130021739	0.0225488001998835	0.4730256537930891	0.2135324394343942	0.0286924948681942	0.0169103730241943	0.0286924948681942	0.0182998829457084	0.0058540521254406	0.0920991421837026	0.0003803260234733	0.0206645454190154	0.0003803260234733	0.0221052152187145	0.0228612330003422	0.0546243123241204	0.0228612330003422	0.0561522991404057	CSMD1	630491	MCPH1	2042112	ANGPT2	2198928	False	True	False	alt	85	0.01324	85	0.0822
3838	chr8	4419110	T	C	rs1230767	-0.00072514976	0.5906167040416107	0.00458001016	0.5903147361913836	0.0073384728135261	0.7100367113612567	-5.943734639097349e-06	0.658133625131631	3.171330322339337e-05	0.657539458997986	0.4065602340273239	0.3191828353994664	-0.000528309356048	0.4817052253282558	0.0018303124893405	0.4813190673163012	0.0030052395141493	0.4221561051768639	-3.987514758508232e-06	0.5313889130854543	1.2722888608553444e-05	0.5307847919952406	0.0003921202502101	0.574342377501581	0.0027323934895589	0.5740109510727607	CSMD1	575862	MCPH1	1987483	ANGPT2	2144299	False	False	False	ref	-25	0.0007095	10	0.00592
3839	chr8	10265517	C	T	rs12679687	-0.001793258507	0.8368263794375468	0.0019039359269999	0.8331309628816407	0.0062742788283921	0.9065738995779294	-1.136403200884966e-05	0.8803644734604353	1.208787356621502e-05	0.877644305575569	0.2759198746874967	0.5335470913194786	-0.0004947490179225	0.8075818201929676	0.000532996270465	0.7992341588052108	0.0017297214533958	0.6557222732316259	-3.126839463660319e-06	0.8455610834652345	3.37698037591576e-06	0.8377198381097135	-0.0014605960642745	0.7595980609408038	0.0015394350563802	0.7515723280912722	MSRA	211224	PRSS55	260016	PRSS51	282107	False	False	False	ref	-100	0.0014515	10	0.01715
3840	chr8	10280381	G	A	rs2952245	0.00476417378	0.5743484916465218	0.00476417378	0.587435464996794	0.0232360965110732	0.013393058149726	0.0001136467554978	0.2951017992835017	0.0001136467554978	0.3054966196778455	0.162393800765568	0.7206049819210405	0.0007693185599519	0.6338979540539049	0.0007693185599519	0.647732557302051	0.0037623469310936	0.2946115128587199	1.833340138031528e-05	0.4280291471456307	1.833340138031528e-05	0.4406143872860569	0.0046245293000964	0.401206708907505	0.0046245293000964	0.4115771234963141	MSRA	226088	PRSS55	245152	PRSS51	267243	False	True	False	alt	-65	0.008896	-100	0.02487
3841	chr8	10398391	G	A	rs11250001	-0.0201526826	0.1868418454646332	0.0201526826	0.1781767999816984	0.0072346036527061	0.7337336664441207	-0.0001532931280391	0.2453466695931869	0.0001532931280391	0.2362501413610395	0.4541955829417318	0.2485322203912228	-0.0091490370582384	0.1453943315374362	0.0091490370582384	0.1368048266617897	0.0032883731005712	0.3726442705848012	-6.963117971469512e-05	0.1861010665607241	6.963117971469512e-05	0.1772163585720122	-0.0084814157823213	0.2444356590988887	0.0084814157823213	0.2371778835515511	PRSS55	127142	PRSS51	149233	C8ORF74	274238	False	False	False	ref	95	0.005	45	0.04303
3842	chr8	10401678	T	C	rs35388602	0.0286363894	0.1020268814462946	0.0286363894	0.108371420198381	0.0105076565677234	0.2678394108607861	0.0003165747205175	0.0942487914580523	0.0003165747205175	0.0995831901445395	0.32239960995446	0.464645836018964	0.0094751632512916	0.12860821676915	0.0094751632512916	0.1374085388659902	0.0034275097092044	0.3370573878263021	0.00010546715231	0.1157914884860802	0.00010546715231	0.1232769623832887	0.0209939937136277	0.0606168491410836	0.0209939937136277	0.0622819964344341	PRSS55	123855	PRSS51	145946	C8ORF74	270951	False	False	False	alt	-65	0.002056	-70	0.03723
3843	chr8	13742372	A	G	rs7839817	0.001188468936	0.8670354396949406	0.0014192977839999	0.8724924050887248	0.0206283823554845	0.0235395851561005	1.8929982408148325e-05	0.755491387316821	2.4121519224649327e-05	0.7614751619267968	0.1077791263394848	0.8127785647650903	0.0001276629040509	0.8904615406192911	0.0001606757562243	0.8956513542026023	0.0022076375157568	0.5613091689337534	1.962937785134956e-06	0.8223568810291858	2.706001817206472e-06	0.8278557288976115	0.0008900507266672	0.7868084852051435	0.0011639124887187	0.7922162989601753	DLC1	137762	C8ORF48	175502	TRMT9B	796729	False	False	False	alt	95	0.000805	-50	0.01371
3844	chr8	13743692	C	T	rs5012670	0.0010444897	0.8178065186136835	0.00175955486	0.8276529029211549	0.007002852918338	0.7754708199185794	6.361402641859266e-06	0.8415732274959198	1.2269130875713376e-05	0.851331945801617	0.1968630379983194	0.6613320457855101	0.0001645203762588	0.7643107548874821	0.0003508843077427	0.7743070242971419	0.0013963104812606	0.7190311728025754	9.375191795315676e-07	0.7895849337614705	2.477221501623608e-06	0.799539864852011	0.0009564414568615	0.6960637330220045	0.001607900496893	0.7054371321564653	DLC1	139082	C8ORF48	176822	TRMT9B	798049	False	False	False	alt	-95	0.00625	10	0.00437
3845	chr8	13744943	T	C	rs13267233	-0.00248916662	0.6020624955451622	0.00518073742	0.5941821530235895	0.0128507040755728	0.1424851980520759	-4.368647588660423e-05	0.5030498298508673	6.728348087991918e-05	0.4951333023568521	0.1865973713420263	0.6788201717009272	-0.0006577268640463	0.6288074192198978	0.001080341377387	0.619906075949461	0.0024545372383319	0.5033646523807156	-1.0897633973282968e-05	0.5511129322933178	1.460269593013745e-05	0.5421784701688798	-0.0023381985290303	0.4265512042524377	0.0047033682922021	0.420390869970735	DLC1	140333	C8ORF48	178073	TRMT9B	799300	False	False	False	ref	-95	0.003418	-100	0.04263
3846	chr8	13745057	T	C	rs13267570	0.0027284451599999	0.6877840564372122	0.00321594668	0.6982052467395263	0.0065112189363998	0.8792133626935182	1.7471959586038883e-05	0.7523747937806423	2.1063778121079223e-05	0.7625905808716159	0.1933941223456674	0.6685188673784972	0.0004358241478684	0.7020547024718745	0.0005627579091561	0.7124316606977064	0.0012734615996162	0.7458788940088531	2.7761383734478494e-06	0.7464966955456502	3.7113622370720815e-06	0.7568153338216725	0.0027261693586032	0.5216138093709177	0.0031701573667776	0.5305545656030053	DLC1	140447	C8ORF48	178187	TRMT9B	799414	False	False	False	alt	5	0.0002975	50	0.01079
3847	chr8	18565413	C	T	rs13259407	-0.0119765886	0.3176449245846782	0.0119765886	0.3066768225817498	0.0095962764354136	0.3489924275040503	-0.0001175162177395	0.3130821146649732	0.0001175162177395	0.3030854360651802	0.4807020819718047	0.2048801365456752	-0.0058106513438352	0.2277410913848744	0.0058106513438352	0.2171886061561418	0.0046168860385748	0.1810655770594157	-5.707427944348939e-05	0.2204120106432584	5.707427944348939e-05	0.2107827656515107	-0.0041909148435149	0.4464291657254563	0.0041909148435149	0.4356654310686642	NAT2	174130	NAT1	394935	ASAH1	480415	False	False	False	ref	90	0.004463	-85	0.03574
3848	chr8	18572066	C	A	rs7018369	-0.01115016386	0.3513624321520204	0.01115016386	0.3398421518903642	0.008855662948238	0.4381102596428652	-9.932026124068478e-05	0.3623866208490632	9.932026124068478e-05	0.3518526722242222	0.1137107231402815	0.8016552880213669	-0.001371031411983	0.5670227283107006	0.001371031411983	0.5535084116984837	0.0010063336555341	0.7994614008842205	-1.215794563672574e-05	0.5683819016768095	1.215794563672574e-05	0.5551819402081523	-0.0099108911918173	0.2150419472403856	0.0099108911918173	0.2086987808254695	NAT2	180783	NAT1	401588	ASAH1	487068	False	False	False	ref	65	0.003952	70	0.01978
3849	chr8	26339117	A	T	rs3808573	-0.00477960748	0.6789558601119151	0.00477960748	0.6644967709351266	0.0107838472160914	0.2504178821052872	-6.487512640072595e-05	0.595376508634488	6.487512640072595e-05	0.5814467613576825	0.1854272347223518	0.6783769925456068	-0.0007196299824439	0.7485076922788992	0.0007196299824439	0.7339570549970111	0.001976891311489	0.6038920478000427	-9.595100856201856e-06	0.6927322359557767	9.595100856201856e-06	0.6782775779350643	-0.0037324038631105	0.5192137815019526	0.0037324038631105	0.5093842684107928	BNIP3L	43938	PPP2R2A	47608	DPYSL2	174915	False	False	False	ref	60	0.002666	95	0.0568
3850	chr8	26365942	A	C	rs3808566	0.029314083	0.1014044263280672	0.029314083	0.1071964716889622	0.007559264584369	0.6801649205025667	0.0002328141407435	0.1493389687112029	0.0002328141407435	0.1563519602695554	0.0977748731833317	0.8285967203990832	0.0034241825001526	0.3522071655552762	0.0034241825001526	0.3651388277880659	0.000774103405959	0.8438313409134027	2.828511028683368e-05	0.3850350450136303	2.828511028683368e-05	0.3974100291211241	0.0252181039222397	0.0496360009666374	0.0252181039222397	0.0510190701440153	BNIP3L	17113	PPP2R2A	74433	DPYSL2	148090	False	False	False	alt	-35	0.00095	95	0.01535
3851	chr8	26370083	A	C	rs3824232	-0.0120874856	0.3126539131113303	0.0120874856	0.3017002601169525	0.0275316944225126	0.0060483635181231	-0.0003240391824569	0.0905941691050072	0.0003240391824569	0.0857239647380835	0.4525150675836887	0.2469082855201297	-0.0054803887922495	0.2373093990608821	0.0054803887922495	0.2266976913209883	0.0123787541846603	0.0060275045402152	-0.0001457189233491	0.0800742496275549	0.0001457189233491	0.0747712021969367	-0.0049253622962893	0.3919786448496172	0.0049253622962893	0.381907556426285	BNIP3L	12972	PPP2R2A	78574	DPYSL2	143949	False	True	True	ref	45	0.00124	65	0.0755
3852	chr8	27389331	A	C	rs56085315	0.0610789376	0.0130725055617993	0.0610789376	0.0139485345563485	0.013268564660526	0.1235165557288392	0.0008454934666083	0.0170058037066633	0.0008454934666083	0.0179472952059365	0.5271258000601666	0.1341129523659351	0.0323774522898853	0.0115539237819965	0.0323774522898853	0.0126167549007142	0.0070351051785529	0.0501111857019911	0.0004505105079026	0.0144385176982541	0.0004505105079026	0.0154617011196416	0.0169545327233684	0.0939884881045964	0.0169545327233684	0.0967739706558726	PTK2B	77848	TRIM35	78059	CHRNA2	90552	False	True	False	alt	-40	0.00206	-100	0.0428
3853	chr8	27411233	T	C	rs3757908	-0.011472025452	0.3686498149129408	0.011628233348	0.3593615515579616	0.0082738433365051	0.54533324807849	-9.798109536599624e-05	0.3993506928524117	9.924127127891096e-05	0.3910559478077661	0.3063579497712632	0.4857229788472284	-0.0033688455696288	0.3739350396972311	0.0034193592545002	0.3646411103605402	0.0025184324716748	0.5112788932024094	-2.85732229567066e-05	0.3924613162578053	2.898073199449009e-05	0.3837974295041232	-0.0091349495326714	0.2666756433012944	0.0092303862073257	0.2615003661835909	CHRNA2	68650	EPHX2	79549	PTK2B	99750	False	False	False	ref	-100	0.01146	-100	0.0393
3854	chr8	27436348	C	T	rs7005936	-0.0658914667999999	0.0113381938900187	0.0658914667999999	0.0107201598767401	0.0235304009424862	0.0157742314945523	-0.0016566939264053	0.0062867974117665	0.0016566939264053	0.0060405838569802	0.4558677994585006	0.2413812246686106	-0.0302567512374222	0.0167023988179385	0.0302567512374222	0.0153802260651009	0.0108036741384191	0.0119846017207376	-0.0007684913683483	0.0075008311556699	0.0007684913683483	0.0070514140837275	-0.0294878577578605	0.0306674390967974	0.0294878577578605	0.0298346012246797	CHRNA2	43535	EPHX2	54434	PTK2B	124865	False	True	False	ref	100	0.001559	-100	0.03348
3855	chr8	27451822	T	C	rs1106359	0.0553913233999999	0.0193499792969579	0.0553913233999999	0.0207653109063992	0.0137063250545727	0.1141425376950044	0.00079161200523	0.0199001978579551	0.00079161200523	0.0211030453399001	0.5394952229794916	0.1138460795471366	0.0300412021418065	0.0148680455244442	0.0300412021418065	0.0162497571269957	0.0074173566736803	0.0405390897170369	0.0004315666147974	0.0159268277468738	0.0004315666147974	0.0171459106852168	0.0141681967655265	0.1241198110789013	0.0141681967655265	0.1280905893011707	CHRNA2	28061	EPHX2	38960	PTK2B	140339	False	False	False	alt	-20	0.000992	-95	0.0856
3856	chr8	27470504	A	G	rs2565065	0.005393743514	0.5675307530815078	0.005480566886	0.5778764611155899	0.019011357804229	0.0330854921284542	9.4818780001121e-05	0.3705365073536417	9.651659621209878e-05	0.379555089342015	0.5165364785941763	0.1499916279847901	0.0028123597735167	0.3989785775260697	0.0028568590153951	0.4098180426715073	0.0098098327710586	0.0138671956609756	4.9421231911128735e-05	0.2555371832032057	5.02914069703698e-05	0.2647730609022953	0.0015373603460616	0.7174385086613316	0.0015705557111588	0.7266185944529464	CHRNA2	9379	EPHX2	20278	CLU	144196	False	False	False	alt	-10	0.0005264	-75	0.015274
3857	chr8	27609666	A	G	rs867232	0.069891632	0.0080767049394663	0.069891632	0.0086055056892373	0.0142493137440056	0.0943330184598174	0.0010139584268108	0.011039619800054	0.0010139584268108	0.0116323334336386	0.4426498200188798	0.2634437914747065	0.031204672373076	0.0130197046871804	0.031204672373076	0.0141603230798271	0.00633718652097	0.0682074536790835	0.0004546825696343	0.0130062651394895	0.0004546825696343	0.0139782771315097	0.0323675556800381	0.0211043094240717	0.0323675556800381	0.0216782050856067	CLU	5034	SCARA3	24203	EPHX2	118884	False	True	True	alt	-100	0.008575	-80	0.07117
3858	chr8	31309506	C	A	rs2881131	0.00689508934	0.4567681442533444	0.00689508934	0.4690999771317402	0.0189300393785349	0.0342904491483072	0.000135053335276	0.2585678889888722	0.000135053335276	0.2682386854912528	0.1503438832353032	0.7385892334906916	0.0010935123027852	0.5667459845670018	0.0010935123027852	0.580417069671096	0.0029471493896734	0.4088389462726295	2.2257408631198463e-05	0.3996905218190046	2.2257408631198463e-05	0.4120172378414492	0.0066867913567567	0.2932693505441012	0.0066867913567567	0.3018968420169362	WRN	275717	PURG	275791	NRG1	329717	False	False	False	alt	15	0.0003982	100	0.03043
3859	chr8	31323887	C	T	rs2575065	-0.0033409005639999	0.6720906189061728	0.003402604636	0.6619674513524515	0.0075920063356282	0.6605099813692761	-2.4777251873677067e-05	0.7117702686312901	2.524793434171471e-05	0.7019227554522653	0.1418541686117075	0.753934325456553	-0.0004830318767871	0.7390251168428367	0.0004917537483512	0.7287745421185174	0.0010810335542188	0.783791885398916	-3.609666252521644e-06	0.7629411288428501	3.6761972259703407e-06	0.752884048484183	-0.003255220489839	0.5206946733936104	0.0033257606406705	0.5117543253883574	WRN	290098	PURG	290172	NRG1	315336	False	False	False	ref	-100	0.003136	-25	0.006042
3860	chr8	31486293	A	G	rs77184019	0.00060378688	0.8506091935587525	0.001687698496	0.8469610421487919	0.0184620858930149	0.0380408676587853	6.53596604618699e-06	0.7344160182433057	2.6398183169055377e-05	0.7311103501834068	0.124594653471509	0.7830374207582541	8.338713488501023e-05	0.8694248501936552	0.0001968424072747	0.8651411655057678	0.0023932855481811	0.5074710335392284	1.0389552197998113e-06	0.7939538401149162	3.141964669778572e-06	0.7897189353261846	0.00045021213913	0.753814376981114	0.0014087283063101	0.7505052959009343	NRG1	152930	WRN	452504	PURG	452578	False	False	False	alt	95	0.003025	-90	0.04883
3861	chr8	31495971	C	T	rs2716947	-0.0009058964599999	0.8755323565489685	0.0013362429399999	0.868609851336935	0.0059362397774739	0.946607598100814	-5.144790706567437e-06	0.9111333393573204	7.774127656509104e-06	0.9042232919584268	0.0555690411726262	0.9010747599474376	-5.598441734974949e-05	0.9312483347510632	7.41805832629358e-05	0.9241060383774148	0.0003318063832135	0.9301337748473706	-3.2142295939081297e-07	0.947963747848798	4.3259815216213043e-07	0.9408167988695896	-0.00050830402805	0.8327222832629823	0.00085685536157	0.8257942167926338	NRG1	143252	WRN	462182	PURG	462256	False	False	False	ref	80	0.00464	-100	0.00476
3862	chr8	31496226	C	T	rs2681614	0.0006188602919999	0.8446941393487837	0.001594398628	0.8500974421505031	0.018788866301706	0.0358286441350998	1.5219874695599162e-05	0.6804452433367849	2.839170447680083e-05	0.6864364891903713	0.1208083071401155	0.7884159960669973	7.134866312316808e-05	0.8489849994107683	0.0001895893816899	0.854537239346631	0.0022617041843166	0.5416388145763369	1.7465302750219618e-06	0.7558992445945987	3.3525589685576006e-06	0.762096731662298	0.0005041546074129	0.7358124560476191	0.0013921306237616	0.7411022197305652	NRG1	142997	WRN	462437	PURG	462511	False	False	False	alt	-85	0.001445	95	0.0251
3863	chr8	31498581	A	T	rs2716966	-0.0101282528	0.3559628086002239	0.0101282528	0.3445645119273156	0.0318392726551411	0.002952079853124	-0.0003186895043544	0.0922523637935347	0.0003186895043544	0.0872674451894896	0.0323862280729052	0.9457512564303104	-0.0003236876213279	0.8174895014689031	0.0003236876213279	0.8033860435816537	0.0010919093285341	0.7723412445837067	-1.0792529557423351e-05	0.599016960216958	1.0792529557423351e-05	0.5856898872396716	-0.0042884262284878	0.4514303137284878	0.0042884262284878	0.440691763491536	NRG1	140642	WRN	464792	PURG	464866	False	True	False	ref	90	0.002289	100	0.01496
3864	chr8	31502298	T	G	rs4376462	0.00143987804	0.7609364588955763	0.00246353184	0.7694693758041585	0.0168653554795223	0.0518142634780568	2.6186875534187688e-05	0.5982815579327645	4.18357346414229e-05	0.6060259293967712	0.0720692123362275	0.8755409614273585	0.0001348496154785	0.8500700020137711	0.0002068777873038	0.8585763773462581	0.0012352394204342	0.756741851287754	2.4842339752155123e-06	0.7735852559500673	3.5853471747754286e-06	0.7820821682462783	0.0012717974252844	0.6594214315667026	0.0020560379257045	0.6674724920450095	NRG1	136925	WRN	468509	PURG	468583	False	False	False	alt	20	0.00254	75	0.01068
3865	chr8	31512712	G	T	rs13251167	-0.0275912756	0.13140467024257	0.0275912756	0.1244852953467006	0.0173009489330798	0.0477988231032341	-0.0004599694224863	0.0540804067511528	0.0004599694224863	0.050967640197673	0.1667589912758431	0.7140256867811721	-0.0049222036244248	0.2833811499113311	0.0049222036244248	0.2719777182627371	0.0028450818659288	0.4482688964225498	-8.200076825456012e-05	0.1731275385322776	8.200076825456012e-05	0.1644732909134549	-0.0250459029657983	0.0458032129338781	0.0250459029657983	0.0446402656078588	NRG1	126511	WRN	478923	PURG	478997	False	False	False	ref	35	0.001709	30	0.01166
3866	chr8	34277580	G	A	rs4739486	-0.001930322432	0.7535411674782103	0.002603383328	0.7500750906489213	0.007584431161448	0.6618979671874545	-1.3653109278835765e-05	0.7724494003806088	1.9316304192681457e-05	0.7695352371339331	0.0346455876098299	0.9422459938244396	-5.473735670778644e-05	0.9344151360698312	6.667901689695086e-05	0.9318665921463818	0.0002580302801684	0.9504613549953048	-3.935687532174561e-07	0.9400528551820512	4.895480525890679e-07	0.9375823364376652	-0.0008112117345615	0.8044655168341386	0.0010269816076929	0.8012182332132305	DUSP26	677557	RNF122	710452	TTI2	764395	False	False	False	ref	-100	0.004757	-40	0.01582
3867	chr8	34283979	T	C	rs4483152	0.00436726136	0.6010404278629228	0.00436726136	0.6141416104191477	0.0067234950183282	0.7855968509547927	3.07495470394891e-05	0.6576336746572211	3.07495470394891e-05	0.6706725636512069	0.0823058330480606	0.8559413819288618	0.0003953214205845	0.7588068295935472	0.0003953214205845	0.7728519656660742	0.0005566188907721	0.8867858473113697	2.77652247600168e-06	0.7881819210960693	2.77652247600168e-06	0.8023584107269223	0.0036909096567391	0.4753331918974756	0.0036909096567391	0.4866636222531367	DUSP26	683956	RNF122	716851	TTI2	770794	False	False	False	alt	-60	0.003517	-15	0.00853
3868	chr8	34287962	T	C	rs2953935	-0.0004828495999999	0.6365855207050081	0.00392141852	0.6370246953172408	0.0065368094188022	0.8755067123337748	-3.349353772332904e-06	0.710989352022704	2.5252818560299653e-05	0.7111893658255668	0.1133165281797528	0.8016257525284368	-4.293746297019998e-05	0.7484553067375597	0.0004084881616659	0.7487185133158281	0.0007525312413097	0.8478093785616398	-3.093024270338812e-07	0.7883834166168844	2.667696614268536e-06	0.788474025822273	-0.0001597526945299	0.468193230314301	0.0036909096567391	0.4680414270754834	DUSP26	687939	RNF122	720834	TTI2	774777	False	False	False	ref	-95	0.00823	95	0.01357
3869	chr8	34292544	C	A	rs79845297	0.000859653817	0.8362670607679487	0.001606851577	0.8446967072814904	0.0078942033174442	0.589392015132992	7.66209706171494e-06	0.8362824689170262	1.349703612501692e-05	0.8446588173825501	0.0699945020176557	0.8723016289489331	9.632386732526966e-05	0.8909555142412959	0.0001323819596439	0.8996125935220018	0.0005785662911128	0.8769437308286924	8.976435603055946e-07	0.890814941325582	1.1792246609651536e-06	0.8994811888053167	0.0006452349090758	0.7843596630048071	0.0011058205997987	0.7925384982115479	DUSP26	692521	RNF122	725416	TTI2	779359	False	False	False	alt	75	0.002144	70	0.01953
3870	chr8	34313594	C	T	rs2609620	0.00672090874	0.4628976496584366	0.00672090874	0.4756297326411572	0.0064564709578402	0.8823821332919889	4.275437309135605e-05	0.5587496959491685	4.275437309135605e-05	0.571404742487603	0.0516727351943484	0.9103858966461108	0.0002973141875009	0.7850544001148905	0.0002973141875009	0.7993460448607089	0.0003425138057162	0.931302990160652	1.942063208876028e-06	0.8187932923260108	1.942063208876028e-06	0.833136560769487	0.0037987945933048	0.4489400274578977	0.0037987945933048	0.4599785615358695	DUSP26	713571	RNF122	746466	TTI2	800409	False	False	False	alt	-45	0.001209	-45	0.01913
3871	chr8	34318913	G	A	rs2609622	0.00999932364	0.3407310028017032	0.00999932364	0.3523434259210407	0.0068493071873164	0.7746056719832349	6.951926427094182e-05	0.4149404144859283	6.951926427094182e-05	0.4264247990882666	0.2083092148258799	0.6432311543973495	0.0020582932346537	0.4196078502695072	0.0020582932346537	0.432726801797549	0.001422933269373	0.7138872200599529	1.42517264718005e-05	0.4707494843026856	1.42517264718005e-05	0.4836978048965848	0.0097158684218715	0.1954578974626525	0.0097158684218715	0.201621965340446	DUSP26	718890	RNF122	751785	TTI2	805728	False	False	False	alt	-100	0.06287	20	0.005615
3872	chr8	34328025	G	T	rs2719322	-0.047873644	0.0331009098682621	0.047873644	0.0309989754504898	0.0104356895373404	0.2753277213445693	-0.0005069797600757	0.0438720654226036	0.0005069797600757	0.0412308388332517	0.1990560068050498	0.6598840338702016	-0.0097451435367892	0.1377405022361094	0.0097451435367892	0.1293710389019799	0.0020541517710823	0.6012148565533894	-0.000101995712516	0.1277466851628997	0.000101995712516	0.120369965626749	-0.0462452930009647	0.0056630565719293	0.0462452930009647	0.0055236389293911	DUSP26	728002	RNF122	760897	TTI2	814840	False	False	False	ref	-95	0.01044	-45	0.0321
3873	chr8	34336194	G	A	rs75428749	0.00295144292	0.70094397022993	0.00317970904	0.709159901186049	0.0217507976409407	0.0186944705449181	6.164397889928077e-05	0.4786649564055776	6.679764083769475e-05	0.486747557645049	0.3919646469361715	0.3513679916971749	0.0011638097702869	0.5662905223234561	0.0012520649013916	0.5747809307225255	0.0085284974296783	0.0236011932677874	2.4300561253745927e-05	0.3799876489659108	2.629313518196746e-05	0.3881287050597001	0.0017261589850516	0.6751035179809721	0.0018713887073516	0.6830259214263426	DUSP26	736171	RNF122	769066	TTI2	823009	False	True	False	alt	55	0.002716	-95	0.02124
3874	chr8	34336809	G	A	rs73674310	-0.041612779	0.0536979035947719	0.041612779	0.0506378411907835	0.0119588459400049	0.171184706001956	-0.000504592361721	0.0514467945905862	0.000504592361721	0.048606442344054	0.1899584020581126	0.6716535676828491	-0.0088197389262283	0.1735528720702971	0.0088197389262283	0.1642075914543928	0.0023175698548986	0.5398273753498588	-0.0001094517434701	0.1397889682552892	0.0001094517434701	0.1324652463286092	-0.0379506011473147	0.0134916892336646	0.0379506011473147	0.0131839549203612	DUSP26	736786	RNF122	769681	TTI2	823624	False	False	False	ref	45	0.000704	100	0.02806
3875	chr8	34341492	G	A	rs1458903	-0.0031448978399999	0.7308701919604624	0.0031448978399999	0.7172525531669421	0.009278723577398	0.4028454093488518	-2.817079122945384e-05	0.7143033120830595	2.817079122945384e-05	0.700775413477718	0.0730795962613719	0.8708723553219433	-0.0002653124354484	0.8457138023303444	0.0002653124354484	0.83150727482914	0.0006633932268991	0.8650011159544359	-2.3128170630654027e-06	0.8414480670914074	2.3128170630654027e-06	0.8272698421337643	-0.0024004398385874	0.6264055435869857	0.0024004398385874	0.6139091872504226	DUSP26	741469	RNF122	774364	TTI2	828307	False	False	False	ref	-100	0.006325	-100	0.0157
3876	chr8	34367509	C	T	rs73674323	-0.00249166997	0.7699005190922079	0.00249166997	0.7562119050777748	0.0101383444324702	0.2870452480904957	-2.5919254616666025e-05	0.7134355896413367	2.5919254616666025e-05	0.7000077154834189	0.1666345086567287	0.7137555170905447	-0.0004073856677129	0.7737054306039566	0.0004073856677129	0.7594548107254147	0.0016679570936829	0.6690478987542406	-4.185133010206102e-06	0.743649541191181	4.185133010206102e-06	0.7293389889034243	-0.0024087386798617	0.6109265200558635	0.0024087386798617	0.5985350448362712	DUSP26	767486	RNF122	800381	TTI2	854324	False	False	False	ref	70	0.004158	65	0.03622
3877	chr8	34368805	A	G	rs74931817	-6.421379599999994e-05	0.8482893621268186	0.001484962244	0.8510310604254288	0.0080288660714385	0.571603650863359	-6.460389554723727e-08	0.8566323897004153	1.1452472046332014e-05	0.8593734298565088	0.1618440025311465	0.7184442828118547	-1.5942031507966765e-05	0.813420719253915	0.0002529214008159	0.8164162287909821	0.0013104809837353	0.7370846025718295	-7.501496552157891e-08	0.8232995046903789	1.976040945733478e-06	0.8263483205007204	0.0001846492183528	0.7276039807955521	0.0014294754094959	0.7301182090083013	DUSP26	768782	RNF122	801677	TTI2	855620	False	False	False	ref	100	0.0294	10	0.006653
3878	chr8	34372979	A	G	rs1562183	0.005385542012	0.5403749160096505	0.005489325668	0.5507975623899257	0.0078489694118143	0.6242780523129103	4.234023688767079e-05	0.5802776375145179	4.325319474399356e-05	0.5899825401690851	0.1668855486052759	0.7125272663223545	0.0008575092960127	0.6258086833304757	0.0008794558907677	0.6365541335898348	0.0013302024459457	0.7356326717892477	6.8270574299294745e-06	0.6475424386754904	7.020115925361373e-06	0.657870353283735	0.0053921721179679	0.3639440875241068	0.0055000570545337	0.3717170932101259	DUSP26	772956	RNF122	805851	TTI2	859794	False	False	False	alt	-50	0.0004017	45	0.02777
3879	chr8	34377962	A	T	rs78759621	-0.00882138368	0.4044880873719912	0.00882138368	0.3927041001408864	0.0228848260266887	0.0144731988640262	-0.0002015175610911	0.1766881016667339	0.0002015175610911	0.169112237762741	0.0496457432131038	0.9064344581922033	-0.000447505203593	0.7589177286665425	0.000447505203593	0.7447309580736206	0.0011230707761016	0.7666872479095391	-1.0114310913648168e-05	0.5805048145175505	1.0114310913648168e-05	0.5670682268328865	-0.0052739136298093	0.3636402758175188	0.0052739136298093	0.3539641370954329	DUSP26	777939	RNF122	810834	UNC5D	857514	False	True	False	ref	-95	0.1661	-80	0.04944
3880	chr8	34384091	T	C	rs16882072	-0.00449950696	0.6268907997660839	0.00449950696	0.6136197085330691	0.0178174415747691	0.0422004122923833	-8.03241750113651e-05	0.4043709053202523	8.03241750113651e-05	0.3933758975175711	0.1364910424381995	0.7604372056073075	-0.0006022269697442	0.7052748216470375	0.0006022269697442	0.6911658686097752	0.0024434916228889	0.520103785594809	-1.080985947622888e-05	0.5635848488748112	1.080985947622888e-05	0.5503393396611516	-0.0043153974626292	0.4295429503757068	0.0043153974626292	0.4191921257971626	DUSP26	784068	RNF122	816963	UNC5D	851385	False	False	False	ref	-60	0.0006485	-40	0.013214
3881	chr8	38181915	A	G	rs11779986	0.00532449888	0.4565234937313117	0.00692501968	0.4662000105235953	0.0209582168757121	0.0211372365941488	0.0001045032322607	0.2483574248298976	0.0001393226264428	0.2554765909973394	0.3546883266423926	0.4066861746302183	0.0018379914475327	0.3946335450145838	0.002404854004172	0.4044182809353172	0.0074368645817034	0.0384113012750089	3.617120449652424e-05	0.2312437563654183	4.850332159487688e-05	0.2392026108448594	0.0037324038631105	0.4196760737041706	0.0046867706096535	0.4272078882772985	LSM1	5185	BAG4	5381	STAR	30923	False	False	False	alt	-70	0.00787	-20	0.05408
3882	chr8	38182985	A	G	rs4537271	0.0432466878	0.0397980413001108	0.0432466878	0.0426673463809231	0.0124688503687819	0.1464740220971638	0.0005582326254668	0.0354812903367618	0.0005582326254668	0.0377989852824135	0.2889283083849417	0.5149974241023089	0.0123958882798731	0.0901843257840321	0.0123958882798731	0.0972782818701367	0.0035425094842827	0.3214180800821256	0.0001572665538031	0.067524494243946	0.0001572665538031	0.0725760871462797	0.0354775464475772	0.0137715592467615	0.0354775464475772	0.0141696185238169	LSM1	6255	BAG4	6451	STAR	31993	False	False	False	alt	-55	0.006958	20	0.0593
3883	chr8	38194867	T	G	rs111373244	-0.007596493732	0.4455767029617135	0.007938018988	0.4364341534756645	0.0338511033715357	0.0025763459207941	-0.0002855681975913	0.1334877167858278	0.000294606723149	0.1284907881322246	0.1765371010072718	0.6830567222409847	-0.0012724856055196	0.5511665791729804	0.001329472023667	0.5415367160322813	0.0057951775811626	0.0941365306393519	-4.577870781312695e-05	0.2699002712685518	4.7286863329208816e-05	0.2616493338672402	-0.0069523542775339	0.3048104861053308	0.0072096183570368	0.2990257557495403	LSM1	18137	BAG4	18333	DDHD2	30352	False	True	True	ref	65	0.00177	35	0.014175
3884	chr8	38217860	T	G	rs150171772	-0.0027208479799999	0.7237692545504071	0.00311531014	0.7144510515340948	0.0406237110612439	0.0011420068551348	-0.0001213265882039	0.2903850665267661	0.0001349479231451	0.2826710189392381	0.1634270065042168	0.716520544288289	-0.0004321637784081	0.7357897433243812	0.0005072269381443	0.7266559915292571	0.006682168567198	0.0591933076474753	-1.969060589757665e-05	0.4258420061220889	2.2282642829096988e-05	0.4170640592708217	-0.0027593647237004	0.5452784781934239	0.0031203643191319	0.5369418520703679	DDHD2	7359	LSM1	41130	BAG4	41326	False	True	True	ref	5	0.0006104	-45	0.00824
3885	chr8	38239069	G	A	rs10103315	0.000269959196	0.9185520753619434	0.0008078555399999	0.9214481127472864	0.0190830139565692	0.0322666862637391	6.349026522259239e-06	0.8149252075742662	1.600726375650573e-05	0.8180725941482685	0.0656106391145135	0.8782052704350591	3.3731432497437243e-05	0.9327757368525906	5.505571937970521e-05	0.935734925330566	0.0012616576721839	0.7385502905580086	7.260240679871239e-07	0.8821792017875792	1.1083946210841395e-06	0.8856187455044744	0.0003817466986172	0.8537163358833091	0.0007012520876772	0.8567884867173423	DDHD2	13850	PLPP5	30174	LSM1	62339	False	False	False	alt	-100	0.00617	30	0.01746
3886	chr8	38244605	G	A	rs56058270	-0.0064369980199999	0.5028081537178783	0.0064369980199999	0.4901173458671194	0.0099721466562871	0.3035015291146422	-6.554172606723917e-05	0.4647546176897477	6.554172606723917e-05	0.453133584391352	0.1642195458459112	0.703945135293598	-0.0010334847657807	0.5960590543067282	0.0010334847657807	0.581898961769033	0.001568020572185	0.6713530598942451	-9.964946892507913e-06	0.572060139397068	9.964946892507913e-06	0.5583957174824938	-0.0057822176578594	0.3434888845043291	0.0057822176578594	0.3346629965621032	DDHD2	19386	PLPP5	24638	LSM1	67875	False	False	False	ref	25	0.002129	75	0.0537
3887	chr8	38271610	T	C	rs57984710	0.0261403298	0.1182720203803445	0.0261403298	0.1248308583351509	0.0191965587514831	0.0365852014996854	0.0006027112247078	0.047829708200949	0.0006027112247078	0.0503051899831485	0.2721812466934303	0.5411835783171309	0.0076849573845082	0.1723331706439143	0.0076849573845082	0.1821813489545722	0.0055254125288683	0.1239562032612809	0.0001866197486605	0.0790668113282332	0.0001866197486605	0.083509716203616	0.0217263664560834	0.05971602993415	0.0217263664560834	0.0614607349350493	PLPP5	2367	DDHD2	46391	LSM1	94880	False	False	False	alt	-100	0.002045	-100	0.02432
3888	chr8	38276094	C	T	rs1488934	-0.0342731528	0.0795930924946231	0.0342731528	0.0746959276055522	0.008004812954169	0.5967026509522018	-0.0002780686565507	0.1167565097222137	0.0002780686565507	0.1108682195481955	0.2940300210583096	0.50755544228067	-0.0103122566969055	0.1290927399066948	0.0103122566969055	0.1209623039570256	0.0023625871211264	0.5391165016211419	-8.395316182075894e-05	0.1543599025881478	8.395316182075894e-05	0.1460950720093979	-0.0278467618958702	0.0314390471921688	0.0278467618958702	0.0307355773814923	PLPP5	6851	DDHD2	50875	LSM1	99364	False	False	False	ref	15	0.000908	-35	0.013275
3889	chr8	38276275	G	A	rs1488935	-2.3714747999999983e-05	0.7005178023724872	0.0031281665879999	0.6945506948238314	0.0066821766137473	0.8306283956829126	4.1899293568983467e-07	0.7552811020561329	2.0960490965252227e-05	0.7488272838189151	0.2564756895818421	0.5672639928431783	6.007457877896562e-05	0.6464863721999977	0.0008562312822947	0.6403342991872985	0.0017270544706971	0.6567025701020084	5.271302406821298e-07	0.6912109523013851	5.783209653232791e-06	0.6848849994444371	-0.0002821606033257	0.5747865419238494	0.0027344681998775	0.5693892310433518	PLPP5	7032	DDHD2	51056	LSM1	99545	False	False	False	ref	-20	0.001213	-85	0.0611
3890	chr8	38280012	A	G	rs12674515	0.00791892328	0.4140553668853994	0.00860192644	0.4244888791164342	0.007636191954987	0.6701916997592384	6.053107552046312e-05	0.4650327815314679	6.616037361402304e-05	0.4747747845633688	0.3152605317482546	0.472001984455169	0.0023901474922016	0.3946438612289135	0.0026490182912443	0.4054655560939068	0.0024311944494161	0.5309471447434253	1.8449241303066303e-05	0.4282587601687206	2.0582849166678984e-05	0.4386339573432368	0.0058154130229566	0.3072100042079585	0.0062220562453966	0.3137641809072439	PLPP5	10769	DDHD2	54793	NSD3	102260	False	False	False	alt	-10	0.000925	15	0.00354
3891	chr8	38284697	T	C	rs7845284	-0.008760767996	0.4695075500837688	0.008760767996	0.4564424791245899	0.0219884443549734	0.0177621382110601	-0.000204541903734	0.2255999648792291	0.000204541903734	0.2171564538564059	0.0505357939397711	0.9035316317380836	-0.0004370033737467	0.7872488212927975	0.0004370033737467	0.7732773313130761	0.0011310189815595	0.7574076523504145	-1.0231182763521367e-05	0.6266249563307059	1.0231182763521367e-05	0.6129922649947304	-0.0051473563003764	0.4392775280488427	0.0051473563003764	0.4286925444575288	PLPP5	15454	DDHD2	59478	NSD3	97575	False	True	False	ref	-15	0.001614	35	0.005676
3892	chr8	38285217	T	C	rs7823681	0.0029487787474799	0.7054435070118408	0.0029487787474799	0.7195455968235114	0.011511417287046	0.2013264133898477	2.966039029822075e-05	0.6676034673147118	2.966039029822075e-05	0.6811464584606749	0.0617247066878286	0.8844335310612123	0.0001807237263314	0.8451459911510213	0.0001807237263314	0.8595879956630634	0.0007188088786277	0.8438362792457265	1.878253691560344e-06	0.8238290422415612	1.878253691560344e-06	0.8383331431514621	0.0021369516281288	0.6278179181586812	0.0021369516281288	0.6400156270000625	PLPP5	15974	DDHD2	59998	NSD3	97055	False	False	False	alt	-50	0.00824	60	0.002071
3893	chr8	38295074	C	G	rs12386951	0.0568120116	0.0167829880090486	0.0568120116	0.0178832159895393	0.0178880682986541	0.0407980638338895	0.0010212702502814	0.01129335134119	0.0010212702502814	0.0119010360746255	0.3512194109897405	0.4115854115669884	0.0203992402839434	0.0365541008760786	0.0203992402839434	0.039711280311533	0.0062618175497863	0.0699284984954652	0.000365224279801	0.0188612217678068	0.000365224279801	0.0202089496293549	0.0390190769613792	0.0104882834967021	0.0390190769613792	0.0107530884425149	PLPP5	25831	DDHD2	69855	NSD3	87198	False	True	False	alt	-20	0.00659	50	0.01889
3894	chr8	38350172	A	G	rs28634296	0.0508643382	0.0235158020395909	0.0508643382	0.0252364686083853	0.009677979115453	0.3446945522483206	0.0005052336211412	0.0387955817157072	0.0005052336211412	0.0413313072526536	0.1421404786356704	0.7543167880728195	0.0077701027512006	0.1674575888491354	0.0077701027512006	0.1775229771571856	0.0014152997778343	0.716676301940098	7.90443505017303e-05	0.1615536989931541	7.90443505017303e-05	0.1705660084415876	0.0462286953184161	0.0053272786798792	0.0462286953184161	0.0055157446448737	NSD3	32100	LETM2	36036	PLPP5	80929	False	False	False	alt	5	0.0001411	60	0.03967
3895	chr8	38360223	T	C	rs2130033	-0.0059004242399999	0.5486734496734665	0.0059004242399999	0.5358430453218122	0.0078562150284959	0.6180992144239659	-4.646066367256939e-05	0.5797051099626753	4.646066367256939e-05	0.5669654126706584	0.1534766958163466	0.7339882795596386	-0.0008802182338554	0.6426894137131015	0.0008802182338554	0.6289472654902674	0.0012162894600551	0.7571279108457205	-7.010319230372203e-06	0.6618451251680538	7.010319230372203e-06	0.648090417004736	-0.0054212180624279	0.3584450331769281	0.0054212180624279	0.3487867850473112	NSD3	22049	LETM2	25985	PLPP5	90980	False	False	False	ref	-100	0.02802	-100	0.04886
3896	chr8	38368759	A	G	rs16887343	0.0515937224	0.0247507903475135	0.0515937224	0.0265080292906728	0.0104760517876084	0.261416446951222	0.0005637790025302	0.0351715153230094	0.0005637790025302	0.0374525857960353	0.136231703648378	0.7593030811014524	0.0084689441775992	0.1687229089128019	0.0084689441775992	0.1781628521475651	0.0015015777893296	0.6969877986595696	9.642978881001894e-05	0.15706932457581	9.642978881001894e-05	0.165280171221418	0.0448614612184773	0.0085427605872027	0.0448614612184773	0.0087586889165094	NSD3	13513	LETM2	17449	PLPP5	99516	False	False	False	alt	100	0.00519	-55	0.02002
3897	chr8	38382980	G	A	rs60558877	-0.00579552148	0.3837814740005605	0.00988840028	0.3772585670981557	0.0165569667826027	0.0558172389047079	-0.0001182312804028	0.2172625043691655	0.0001752556891088	0.212354338551883	0.8880071370034959	0.0031976944710321	-0.0051145211737186	0.1563667820516335	0.008802396118112	0.1519632231829024	0.0146967244599912	0.0034675428721752	-0.0001046145986336	0.0871736661985358	0.0001559962534247	0.0846007053518956	-0.0011950331434973	0.6873494847589658	0.0018257450803431	0.6803038371553611	NSD3	708	LETM2	3228	FGFR1	85854	True	False	False	ref	70	0.00357	-65	0.05078
3898	chr8	38401517	C	A	rs2016875	-0.0009240507799999	0.4948099062994956	0.00760384362	0.4994122434067891	0.0085488262731074	0.5122160285281642	-2.7283499029558e-05	0.494593454979382	7.650991503872201e-05	0.4986113767830626	0.2995342275334806	0.5005867771284176	-0.0003884541484644	0.4480145401066863	0.0023348386106773	0.4538019279355246	0.0025800517396451	0.4970022106552066	-9.390262941945882e-06	0.4498877565891908	2.3755064900448567e-05	0.4549953663987777	-0.0010788493656573	0.3882199333610354	0.0059917634000352	0.3935434959388299	LETM2	15309	NSD3	19245	FGFR1	67317	False	False	False	ref	-80	0.00784	100	0.1233
3899	chr8	38402922	C	T	rs28681082	0.01557821588	0.231895181835652	0.01557821588	0.2422549325943198	0.0070670206457529	0.7670633876628622	0.0001133077619931	0.3036532429657473	0.0001133077619931	0.3139469919086292	0.3862031763814976	0.3593863982116208	0.0060221656484345	0.2022447956174131	0.0060221656484345	0.2127823565180435	0.002731129271144	0.4749552119084576	4.376797658480777e-05	0.2522448450539112	4.376797658480777e-05	0.2627895238072272	0.0090249898857871	0.2127265631932296	0.0090249898857871	0.219262131066279	LETM2	16714	NSD3	20650	FGFR1	65912	False	False	False	alt	100	0.001865	-5	0.003113
3900	chr8	38415024	C	G	rs4647905	0.0408108138	0.0456385579214001	0.0408108138	0.0489880631735147	0.0097600268952267	0.332510234879581	0.0004022326639234	0.0563082797567072	0.0004022326639234	0.059949473118451	0.5613937903920165	0.0877432622750199	0.0229261495686948	0.0278611564005612	0.0229261495686948	0.030517397292672	0.0054813311218838	0.1085814171799906	0.0002260232637656	0.0377109627044154	0.0002260232637656	0.040760666274708	0.0084834904926399	0.2183380435699281	0.0084834904926399	0.2254942193557403	LETM2	28816	NSD3	32752	FGFR1	53810	False	False	False	alt	-100	0.001583	15	0.01294
3901	chr8	38430037	C	T	rs4647907	-0.0582767991999999	0.0162830718205212	0.0582767991999999	0.0152190301486161	0.0118059750821945	0.1744103289998864	-0.0007018121935962	0.0236464769170122	0.0007018121935962	0.022210713189561	0.6390999906638035	0.0246701166541115	-0.0373045635560801	0.0079860695390161	0.0373045635560801	0.0073939176994469	0.0075476332146431	0.0365373867644665	-0.0004493152768805	0.0146826908252171	0.0004493152768805	0.0137364961881813	-0.0056764074316123	0.3436812906815397	0.0056764074316123	0.3343150514658416	FGFR1	38797	LETM2	43829	NSD3	47765	False	True	False	ref	60	0.002533	-100	0.1118
3902	chr8	38431048	C	G	rs7005874	0.0062186328939999	0.4735115907139509	0.006347015026	0.482918307743424	0.0074484820322367	0.6689478280721914	4.640593109462872e-05	0.5339097230629739	4.74358981622282e-05	0.5426365400827561	0.5623377835869667	0.0869460206314499	0.0034753926951817	0.3172900236502075	0.0035495341443937	0.3271384850242936	0.0041899528781423	0.2255619444344672	2.5924650577958795e-05	0.3617832881240088	2.651946272974804e-05	0.3710542836103174	0.0013506364173901	0.7372064699323914	0.0013630846793015	0.747228042850341	FGFR1	37786	LETM2	44840	NSD3	48776	False	False	False	alt	75	0.002235	-45	0.09143
3903	chr8	40891512	C	T	rs62640287	-0.0099339016	0.3608870233974692	0.0099339016	0.3493636228895297	0.0092853642087141	0.3776090374078748	-9.319086622608616e-05	0.3511622638043804	9.319086622608616e-05	0.3406173785553885	0.4623408956524445	0.2270995516542256	-0.00463093168676	0.2657946456813554	0.00463093168676	0.2547577454534216	0.0043123250007114	0.2055913982097029	-4.358387030851077e-05	0.2569810197935587	4.358387030851077e-05	0.2467410006834774	-0.0038880071370034	0.4701103489855419	0.0038880071370034	0.4590547224102319	ZMAT4	6321	SFRP1	417961	GOLGA7	596689	False	False	False	ref	40	0.005005	65	0.0679
3904	chr8	40896455	C	A	rs16890077	0.0104835527799999	0.2696447147641457	0.01566075158	0.2762578942233357	0.0083227370289394	0.5298084222894954	8.468715339007887e-05	0.3037292628710558	0.0001286949190908	0.3097755138822815	0.560843992157595	0.0883555507926802	0.0059170273779844	0.1597030574963586	0.0087951285985712	0.1656812665527403	0.0046624685879532	0.1722140818212099	4.773118091292433e-05	0.1847189428830165	7.219591772457008e-05	0.1904908590636843	0.0023402732393489	0.5278176974326906	0.0033029388271662	0.5348225659152119	ZMAT4	1378	SFRP1	413018	GOLGA7	591746	False	False	False	alt	15	0.0007706	-25	0.0301
3905	chr8	51796358	A	C	rs4498530	0.00544873042	0.5341687327044398	0.00544873042	0.5470378413685262	0.0206390243066123	0.0232501589310472	0.0001141361595872	0.2931395476689027	0.0001141361595872	0.3032858852731531	0.144584487390948	0.7493844416272786	0.0008279515907976	0.6270725198248963	0.0008279515907976	0.6410491138187121	0.0030479777312274	0.4036615184836145	1.774234955519795e-05	0.4460312358506348	1.774234955519795e-05	0.4587130318083094	0.0054315916140208	0.3431025932478287	0.0054315916140208	0.3527746348457226	PXDNL	13087	PCMTD1	102828	ST18	664601	False	False	False	alt	-15	0.000885	-15	0.01006
3906	chr8	51872765	C	A	rs10105030	-0.00350499382	0.6532666328969144	0.00422406734	0.6454439583054149	0.0075439063069583	0.6672000723145437	-2.9102943130203645e-05	0.6734586043085496	3.447396474476329e-05	0.6663603296026903	0.0634882104586146	0.8891120217178955	-0.0001374772813703	0.8610130838714235	0.0001993895512693	0.8549576696518477	0.0004723469251178	0.9041130668869796	-1.1498148543304255e-06	0.8685599821410482	1.607444863245068e-06	0.8625652184894882	-0.0018547910248031	0.5956344190372853	0.0025021006441975	0.589795714204622	PCMTD1	26421	PXDNL	63320	ST18	588194	False	False	False	ref	75	0.00609	-100	0.02513
3907	chr8	51983360	C	T	rs4873621	0.0042324889	0.6062927698358843	0.0042324889	0.619422552709919	0.0313364483275258	0.0031973811028493	0.0001325352310667	0.2468257732087469	0.0001325352310667	0.2561917054145324	0.0374754924843618	0.92930055001156	0.0001479899433548	0.8549276777286486	0.0001479899433548	0.8692675324854148	0.0011409330787239	0.7603616089355238	4.545006418370405e-06	0.6938679669870096	4.545006418370405e-06	0.7080259515383136	0.0020477390844303	0.6313743373253554	0.0020477390844303	0.6440851018609969	PCMTD1	84174	PXDNL	173915	ST18	477599	False	True	False	alt	-100	0.00615	100	0.02844
3908	chr8	51997917	T	C	rs16917075	0.001959076106	0.8150104759223544	0.0020196171739999	0.82298390681083	0.0059432353927155	0.9119445921077032	1.1147812449209522e-05	0.8699585345979018	1.1581116123092383e-05	0.8776169613676075	0.1562775547464185	0.7307121934239128	0.0003186431709858	0.8023411024709243	0.0003269971711774	0.8105575650148787	0.0009284117925339	0.8100963575945277	1.8235535653174769e-06	0.8468371903884031	1.8833446987316183e-06	0.8548173952428103	0.0017386072469631	0.6806451449415091	0.001825745080343	0.6886600392537838	PCMTD1	98731	PXDNL	188472	ST18	463042	False	False	False	alt	-80	0.00082	40	0.02948
3909	chr8	54639577	T	C	rs62514618	-0.0009009169399999	0.7657305685906839	0.00241342894	0.7623836187088592	0.0075941469522742	0.6771611411036148	-6.751596345953534e-06	0.7873362250761082	1.827416386909785e-05	0.7841968862651281	0.0240438178819282	0.9573879614586918	-3.771741674742407e-05	0.9359212047163116	6.10563697313386e-05	0.9331408643535374	0.0001867412572761	0.9620530384828972	-2.955167765560172e-07	0.941649768183068	4.749213176028306e-07	0.938879933772596	-0.0006431601987572	0.8033203089237679	0.0010249068973744	0.8001345755634666	RP1	130154	SOX17	181641	XKR4	462452	False	False	False	ref	30	0.002491	-60	0.01683
3910	chr8	54673079	C	T	rs41444144	-0.0364850396	0.0725274045923449	0.0364850396	0.0680911357020539	0.0105760196127837	0.2529087400223638	-0.0004012259288948	0.0707108739761613	0.0004012259288948	0.0667704392214937	0.1547360449797196	0.7299544799242625	-0.0059777626825121	0.2408766739442274	0.0059777626825121	0.2298735948751146	0.0016629418502601	0.667774837115681	-6.60530550528214e-05	0.2152532001252743	6.60530550528214e-05	0.2054293611779053	-0.0327161070135582	0.0217528996160776	0.0327161070135582	0.0212194747572233	RP1	163656	SOX17	215143	XKR4	428950	False	False	False	ref	70	0.00409	-15	0.004997
3911	chr8	54698448	G	A	rs858392	-0.001190079754	0.6343969868146473	0.004074848954	0.6303513454982589	0.0107686155278833	0.2704347665570489	-3.977176701700818e-06	0.5708151282831324	4.595572181894082e-05	0.5681637235947046	0.1228622703555016	0.7857543223210091	-0.0001894055576487	0.7390376729004706	0.0005146636725208	0.7338207805094046	0.0013148908308866	0.735424622687353	-9.679567756863632e-07	0.6979098351635342	5.701043289854379e-06	0.6935348598032085	-0.0004253156153071	0.4755918772794792	0.0039813691013391	0.4718024614110145	RP1	189025	SOX17	240512	XKR4	403581	False	False	False	ref	-100	0.00585	-50	0.008545
3912	chr8	54708353	G	T	rs72650344	-0.003366584086	0.6903212168052804	0.003366584086	0.6767842117888293	0.0154509251018464	0.0717631279443324	-5.167930936108132e-05	0.5438926252646406	5.167930936108132e-05	0.5316366165800787	0.1934314671314017	0.6589490696653011	-0.0006818809095034	0.6924488629556302	0.0006818809095034	0.6781835256411347	0.0029076191795649	0.4165416122220237	-1.005000169115651e-05	0.5901601142376066	1.005000169115651e-05	0.5766146622189419	-0.0032303239660161	0.5387115985988823	0.0032303239660161	0.5270579046971329	RP1	198930	SOX17	250417	XKR4	393676	False	False	False	ref	95	0.011475	-40	0.03137
3913	chr8	54828520	G	A	rs6984055	0.00661557954	0.4934620509682833	0.00661557954	0.5063766766590188	0.0093751141213798	0.3727185905733453	5.885967962846753e-05	0.4919149059662355	5.885967962846753e-05	0.5040736858053974	0.1965954003672237	0.6611578339421355	0.0012960970109468	0.5481933412780183	0.0012960970109468	0.561964057459264	0.0018336482459421	0.6309740774084625	1.1433835969759291e-05	0.5400330826040525	1.1433835969759291e-05	0.553397588899498	0.0060145852135395	0.3317977396714575	0.0060145852135395	0.3411287974723861	XKR4	273509	RP1	319097	SOX17	370584	False	False	False	alt	85	0.00436	-25	0.008224
3914	chr8	54834669	T	G	rs56956895	-0.0007459007	0.8039894995661647	0.0019834857	0.8045257126407526	0.0122514210431782	0.154619369651261	-7.2436598090404865e-06	0.7374520053443813	2.3399763326737377e-05	0.7379721131855709	0.1969771470658408	0.6598041645083834	-0.0001679787595559	0.767278460402157	0.0003892169670054	0.7678191563088741	0.0023491382624415	0.5437164802110418	-1.72399099472981e-06	0.7220981851288271	4.532185459539905e-06	0.7226975026602719	-0.0008008381829687	0.6750706992543402	0.0018589404454402	0.675495121388183	XKR4	267360	RP1	325246	SOX17	376733	False	False	False	ref	-60	0.003624	-90	0.02911
3915	chr8	54836020	C	T	rs9298512	0.00213750317	0.7145051409899064	0.0031831414099999	0.7237095343399155	0.0077352757643678	0.6338080364321017	1.823287779500229e-05	0.7294730299340003	2.5496923899890483e-05	0.7387178546810158	0.1275677133580223	0.7736322840112027	0.0004011061642443	0.7509882816181795	0.0004763516792332	0.760732270650449	0.0010241933042771	0.7907807919821385	3.424498295458788e-06	0.7622551268881321	3.947228695458885e-06	0.7720069643190596	0.002024917270926	0.5665479310661911	0.0027510658824261	0.5750285263325642	XKR4	266009	RP1	326597	SOX17	378084	False	False	False	alt	-10	0.0006866	-75	0.016
3916	chr8	54869952	C	T	rs1498180	0.00544911628	0.4986629388714687	0.00674046428	0.5087371839318221	0.0076550556506714	0.65698888298848	3.823580406985543e-05	0.5532891681827083	5.084664786778315e-05	0.5623182263926423	0.3137439185053786	0.4768584226402851	0.0016954735248508	0.4472390246924239	0.0021292450462006	0.4571372991880963	0.0024116122131275	0.533729610116242	1.182021080458722e-05	0.4850771504943715	1.605626857511075e-05	0.4943750304165388	0.0038963059782777	0.406774255184461	0.0047801325739893	0.414349818581768	XKR4	232077	RP1	360529	SOX17	412016	False	False	False	alt	-100	0.002296	55	0.03882
3917	chr8	54876309	G	A	rs1498179	-0.0704352046	0.009203657810973	0.0704352046	0.0087116881299267	0.0149377720724903	0.0795805703626488	-0.0010639675528552	0.0115711267926212	0.0010639675528552	0.0110085168817583	0.4596479216589383	0.2372296530556181	-0.0329499921833708	0.013265271668629	0.0329499921833708	0.0123628337661064	0.0068671104039061	0.0508211872081405	-0.0004979088162262	0.0131726920495677	0.0004979088162262	0.0123630534086464	-0.0294671106546747	0.0295035585668293	0.0294671106546747	0.0287325282723745	XKR4	225720	RP1	366886	SOX17	418373	False	True	True	ref	25	0.001435	-55	0.01349
3918	chr8	54877642	T	G	rs10108316	-0.0032122412	0.708553837681686	0.0032122412	0.695118688312897	0.0164339523915515	0.0579362899962932	-5.565290197585282e-05	0.5298032529412273	5.565290197585282e-05	0.5174437167397711	0.1508667102355833	0.7373605570928591	-0.0005591823008382	0.7324733362314634	0.0005591823008382	0.7184881362302041	0.0025420596896795	0.4754607203979905	-9.84004381412621e-06	0.6081725701520961	9.84004381412621e-06	0.5947700650630553	-0.0031037666365833	0.5550510979036273	0.0031037666365833	0.5429233547549354	XKR4	224387	RP1	368219	SOX17	419706	False	False	False	ref	-100	0.0067	-95	0.05396
3919	chr8	54964104	C	A	rs4737804	-0.0097682517999999	0.3638797553568764	0.0097682517999999	0.3525134118805851	0.0083058021838174	0.5154127157973497	-8.175715231783528e-05	0.3958825773562343	8.175715231783528e-05	0.3850834140613652	0.024776190624384	0.9496309387598354	-0.0002380225225983	0.8430348625187296	0.0002380225225983	0.8283942776989148	0.0001861584467215	0.9559474277563276	-1.807127125536837e-06	0.8557142020651538	1.807127125536837e-06	0.8411403777054232	-0.0033050135374847	0.5257704892950963	0.0033050135374847	0.5145948014561516	XKR4	137925	RP1	454681	SOX17	506168	False	False	False	ref	-100	0.003193	-100	0.01309
3920	chr8	54975071	G	A	rs4737807	0.00609074882	0.5278697918482856	0.00609074882	0.5411835423452213	0.0061953510062501	0.8983133609019354	3.750103406828948e-05	0.6303754509885238	3.750103406828948e-05	0.6433269584641298	0.0181744623906886	0.9671662334037976	0.0001415505531814	0.8857126976909556	0.0001415505531814	0.8997318872077782	0.0001115852316893	0.9759295579469224	8.628520903520021e-07	0.9080296496940649	8.628520903520021e-07	0.9221330731080976	0.0021245033662174	0.649927977306478	0.0021245033662174	0.66269963178392	XKR4	126958	RP1	465648	SOX17	517135	False	False	False	alt	-25	0.002556	-80	0.04276
3921	chr8	54996181	G	T	rs34401803	-0.0239939554	0.1387572486546164	0.0239939554	0.1320304616961536	0.010049912812742	0.3113838283320421	-0.0002643200340733	0.1325112232153854	0.0002643200340733	0.1266878456651812	0.1958215334183964	0.6625292285938092	-0.0048921692078531	0.2642404676605663	0.0048921692078531	0.2531334697418286	0.0020090598557572	0.5958463004322305	-5.4859895251836766e-05	0.2400372413673624	5.4859895251836766e-05	0.2299921436318083	-0.0233218186910652	0.050866132337244	0.0233218186910652	0.0493261221566752	XKR4	105848	RP1	486758	SOX17	538245	False	False	False	ref	70	0.001045	-25	0.007538
3922	chr8	54997456	T	C	rs17332014	0.00671815464	0.4940690013852183	0.00671815464	0.5076275275808474	0.0104499217235131	0.263759099042083	6.800108274588622e-05	0.4470102365553673	6.800108274588622e-05	0.459019303847882	0.222925549020218	0.6219243833779307	0.0015782748195857	0.5178765249410787	0.0015782748195857	0.5321252050032963	0.0023195134329496	0.5426079262424676	1.5846789870975847e-05	0.4789086655898724	1.5846789870975847e-05	0.4924009866536115	0.0058444589674165	0.323444270218214	0.0058444589674165	0.3314628099403804	XKR4	104573	RP1	488033	SOX17	539520	False	False	False	alt	-10	0.0007625	-100	0.05383
3923	chr8	59712759	C	T	rs6983076	-0.0092457697	0.3836853963315263	0.0092457697	0.3721763575503377	0.0063231503580428	0.902470440883007	-5.9152613041185536e-05	0.4928103774962408	5.9152613041185536e-05	0.4811643105421875	0.2037904957520306	0.6522646727595364	-0.0019210934153582	0.4638336273141049	0.0019210934153582	0.4505493822112323	0.0012955739702445	0.7418026788537525	-1.2327806165634236e-05	0.5366940535090132	1.2327806165634236e-05	0.5234813706861223	-0.0091785184493614	0.2147727476948084	0.0091785184493614	0.2084424050300569	CA8	568641	TOX	593612	RAB2A	804178	False	False	False	ref	55	0.001385	5	0.003601
3924	chr8	59762350	C	T	rs7835908	-0.0554952013999999	0.0202354975832412	0.0554952013999999	0.0189569455079218	0.0130530695940518	0.1255696347449319	-0.0007271112632198	0.0209499864823255	0.0007271112632198	0.0197565588227464	0.5783649207979336	0.0687199035218922	-0.032101556285864	0.0135196919365632	0.032101556285864	0.0124763116734546	0.007545382456154	0.0359851669372044	-0.0004204010826813	0.0156868584792695	0.0004204010826813	0.0146761585402087	-0.0097926327036586	0.2006559642323114	0.0097926327036586	0.1943386036028823	CA8	519050	TOX	643203	RAB2A	754587	False	True	False	ref	-60	0.001144	5	0.0006104
3925	chr8	59779158	T	G	rs12680715	0.00149660955	0.7837525491305617	0.00232060771	0.7875006947830095	0.0067714732988951	0.8074461052971332	9.483617158867396e-06	0.8294074041370842	1.519669401780549e-05	0.832686870341831	0.3268166682226993	0.457121603114371	0.0005140658981994	0.6801147365118945	0.0007957140222354	0.6840341490824231	0.0022117024206268	0.5639610057430648	3.246280230030327e-06	0.7240645096710411	5.198758553466322e-06	0.7274758005001172	0.0010311310283301	0.7238792751478706	0.0015747051317959	0.7270585228365751	CA8	502242	TOX	660011	RAB2A	737779	False	False	False	alt	100	0.02138	70	0.03397
3926	chr8	59782341	C	A	rs907211	-0.00040939692	0.7173654747230626	0.00295425508	0.7228364871879064	0.0091525897970295	0.3972380972031251	-3.570185352750577e-06	0.703333698854836	2.6984109863187413e-05	0.7089682640959608	0.2687351528542827	0.548633713676034	-3.2032298863419975e-05	0.6602018173947628	0.0007625515336366	0.6664415176414786	0.0024676407477145	0.5249947067898247	-2.4015502199030893e-07	0.6486190049991885	6.977579712367309e-06	0.6548746745554775	-0.0005995912820672	0.6018804395718692	0.0026037614498075	0.6067141662555254	CA8	499059	TOX	663194	RAB2A	734596	False	False	False	ref	-75	0.001133	100	0.02911
3927	chr8	59783967	T	C	rs1473594	0.0519044309999999	0.0220308499458349	0.0519044309999999	0.0236665279769765	0.0140876341928902	0.1013132183113266	0.0007922143435091	0.0217283365720533	0.0007922143435091	0.0230096646893029	0.1564456062822228	0.718140411066482	0.0078004631295025	0.1512911725949781	0.0078004631295025	0.1605332986600188	0.0021008930501668	0.5740795585498643	0.0001133119978828	0.1013602575303615	0.0001133119978828	0.1081986336702879	0.0440357265116857	0.0059398683279955	0.0440357265116857	0.0061480988147975	CA8	497433	TOX	664820	RAB2A	732970	False	False	False	alt	-80	0.003588	5	0.00464
3928	chr8	59798438	G	T	rs1034516	0.00356761134	0.6611973561307963	0.00356761134	0.6747722732447488	0.0090364855755485	0.4194809965667823	3.2515835795927696e-05	0.643348550890156	3.2515835795927696e-05	0.6565725220801817	0.199902488615027	0.6564213141234867	0.0006963923205622	0.6468024580586856	0.0006963923205622	0.6607725252010788	0.0018275407680148	0.6395563965358063	6.400773138025565e-06	0.6387920047339916	6.400773138025565e-06	0.6527051988738667	0.0032884158549362	0.4939890936581946	0.0032884158549362	0.5053014414150824	CA8	482962	TOX	679291	RAB2A	718499	False	False	False	alt	45	0.01706	100	0.01431
3929	chr8	59800123	T	C	rs1034517	0.006591253454	0.4254869031628134	0.0077576138539999	0.4347428955795074	0.0081933634145303	0.5611611275413217	5.3338890178119344e-05	0.454792053167449	6.202531530650343e-05	0.4632634771348549	0.1512588304857934	0.739497647328419	0.0009776445960591	0.5667314401746452	0.0011249293672485	0.5762582269206978	0.0012552499999361	0.7507791096495259	7.950326023017502e-06	0.579985297695663	9.047223844445312e-06	0.5890479582816947	0.0069502795672153	0.265214419388395	0.0079253934169441	0.2698432290525819	CA8	481277	TOX	680976	RAB2A	716814	False	False	False	alt	-95	0.03099	-70	0.03717
3930	chr8	59802172	G	A	rs10504300	0.002681074828	0.7402142625044229	0.002681074828	0.753848099413265	0.0071966513784727	0.7381282852059836	1.9700216741857204e-05	0.7702678056509477	1.9700216741857204e-05	0.7838423795930418	0.0245189265448811	0.9573617289819774	5.745380836292466e-05	0.9259261832530936	5.745380836292466e-05	0.9400554967012146	0.0001747704490496	0.9653503526275544	4.203339697580004e-07	0.933667504054132	4.203339697580004e-07	0.9477929314537016	0.0008381829687029	0.821383645052062	0.0008381829687029	0.8351533272913323	CA8	479228	TOX	683025	RAB2A	714765	False	False	False	alt	65	0.001984	65	0.02084
3931	chr8	59875381	C	T	rs7017555	-0.0433376814	0.0449174022184082	0.0433376814	0.042244444695479	0.0110206039194021	0.2370316193672097	-0.0004973274086311	0.0466006874619601	0.0004973274086311	0.0441408851497471	0.6110291600535276	0.0399167639107359	-0.0264782994436287	0.0241144947109878	0.0264782994436287	0.0222515094845177	0.006738988453946	0.0563916427192977	-0.0003039511956283	0.0296649317832452	0.0003039511956283	0.0277610696766782	-0.0052531665266236	0.3730438813895448	0.0052531665266236	0.3633511251627961	CA8	406019	RAB2A	641556	TOX	756234	False	False	False	ref	95	0.00873	95	0.0514
3932	chr8	59957960	G	A	rs782022	-0.00452868946	0.5986901429311193	0.00452868946	0.5854058063726769	0.0054182913945489	0.983949537311728	-2.427766875484709e-05	0.7234424026802319	2.427766875484709e-05	0.7100669259570186	0.1261631344723492	0.7813134689492235	-0.0005442559223281	0.7199838055705188	0.0005442559223281	0.7057092103222253	0.000686692180532	0.8602761586612091	-2.930099497258583e-06	0.790214734408416	2.930099497258583e-06	0.7758778016178227	-0.0043963111650535	0.4326890316538422	0.0043963111650535	0.4223361937397779	CA8	323440	RAB2A	558977	CHD7	720781	False	False	False	ref	85	0.00371	0	0.0
3933	chr8	59963041	T	C	rs522182	0.002599238214	0.7268094398433397	0.002862638146	0.7372166060499976	0.0066815436744951	0.8163408252367074	1.6710947859389005e-05	0.7739925803855436	1.8702170183968583e-05	0.7841039081948993	0.1324038631106131	0.7707615231219116	0.0002849415298766	0.7743565001701075	0.0003361493033292	0.7849742613017293	0.0008883201886013	0.8204828331764535	1.788987188655801e-06	0.8057454056529344	2.1761021751696228e-06	0.8163640348911915	0.0021079056836688	0.5904181066644361	0.002402514548906	0.5999754969274715	CA8	318359	RAB2A	553896	CHD7	715700	False	False	False	alt	40	0.001889	-95	0.0181
3934	chr8	64377812	A	G	rs298210	0.036817818	0.0594892318737351	0.036817818	0.0636588756103633	0.0131957790862587	0.1226655833048658	0.000494489460606	0.0404690738836234	0.000494489460606	0.0430971977572443	0.8158030684965611	0.0056046026783148	0.0300235301114431	0.0141205804771767	0.0300235301114431	0.0153807406733535	0.0107644231006345	0.0104207170832162	0.0004031567876552	0.0159410704532952	0.0004031567876552	0.0171563194384141	0.0074917789603626	0.2563797783147555	0.0074917789603626	0.2644779546613147	BHLHE22	202554	CYP7B1	420925	YTHDF3	1209258	False	False	False	alt	-10	0.0001221	-80	0.07556
3935	chr8	64385043	G	T	rs298199	-0.0018539467	0.7324204834701353	0.00315172614	0.7289935374280401	0.0206805675662273	0.0228990972190072	-3.5044474791850264e-05	0.5237222295133908	6.151257162884795e-05	0.5204426108892736	0.1277565119970123	0.7750672849204111	-0.0002459732519017	0.7883108984714944	0.0003928195559079	0.7855862818310947	0.0027063698323705	0.4507838300735587	-4.900677980026648e-06	0.6516638585734481	7.910513073363404e-06	0.6485045063870924	-0.0015913028143445	0.5920270496474128	0.0027406923308332	0.5890765335857076	BHLHE22	195323	CYP7B1	413694	YTHDF3	1216489	False	False	False	ref	-30	0.007324	-75	0.03687
3936	chr8	64385745	A	G	rs298200	-0.001320964648	0.8714074913359888	0.001548968596	0.862566194241033	0.0114263622894655	0.1978176232797926	-1.561847038063091e-05	0.8252976782027348	1.7895153545252238e-05	0.8163590023648296	0.1681075529829147	0.7079441780787138	-0.0002264392361022	0.8463507486629	0.0002686109432025	0.83764456672503	0.0019323296317117	0.6146401346789383	-2.7198412001612032e-06	0.8138572382103402	3.140937485653774e-06	0.8052012090242915	-0.0011908837228601	0.7579591683594119	0.0014274006991773	0.7492308108486009	BHLHE22	194621	CYP7B1	412992	YTHDF3	1217191	False	False	False	ref	-100	0.001503	-95	0.0647
3937	chr8	64388316	G	A	rs298179	0.00552747534	0.3376558953504467	0.01261583466	0.3375923421987906	0.0107763741869116	0.2781575795843216	0.0001468935398427	0.286445696946447	0.0001915020119734	0.2875942335763595	0.0833618606002136	0.8557374270215459	0.0009642566423715	0.594789119534359	0.0014509192036461	0.5936607170773402	0.0010778949893382	0.7815367493072066	2.1674007388841864e-05	0.5228628145877623	2.473215094190199e-05	0.5239621872676353	0.0051722528241994	0.2166584424934888	0.0106577869065031	0.2155308824912585	BHLHE22	192050	CYP7B1	410421	YTHDF3	1219762	False	False	False	alt	95	0.010315	100	0.03146
3938	chr8	64397614	G	A	rs2577907	-0.0069882358	0.4891627338997728	0.0069882358	0.4767181498830791	0.0131042257020763	0.1275049257550516	-9.266226707446346e-05	0.3740533476637327	9.266226707446346e-05	0.3633638997182216	0.1456093942883224	0.7469727061335887	-0.0010045832708422	0.6161223274855673	0.0010045832708422	0.6023529891709368	0.0019564979709348	0.6106149318359847	-1.3668843813912822e-05	0.5276363395609824	1.3668843813912822e-05	0.5146570443107092	-0.0062988205271838	0.3108755867634876	0.0062988205271838	0.3022156890042567	BHLHE22	182752	CYP7B1	401123	YTHDF3	1229060	False	False	False	ref	100	0.001415	10	0.003021
3939	chr8	64405886	A	G	rs59666344	0.0633055159999999	0.0105765290528812	0.0633055159999999	0.0112547119070349	0.0180625412063024	0.0406634511716653	0.0012087291651664	0.009065786001423	0.0012087291651664	0.0094964502168043	0.4732144524320792	0.2143340489059064	0.0298336071589266	0.0136167090309257	0.0298336071589266	0.0149095893403714	0.0085001945657723	0.0263284318522092	0.0005674261295079	0.0095299587344254	0.0005674261295079	0.0101356939763676	0.0253114658865755	0.0415649139283139	0.0253114658865755	0.0426639043246006	BHLHE22	174480	CYP7B1	392851	ARMC1	1228331	False	True	False	alt	-100	0.00429	15	0.0116
3940	chr8	64413850	C	T	rs2612609	-0.0227910026	0.1621344109245774	0.0227910026	0.1541337576181005	0.0092762269116428	0.3843571453055417	-0.0002117342498932	0.1670586531601549	0.0002117342498932	0.1596437010996254	0.2444714156785858	0.5853108574549525	-0.0055204010231878	0.2343653787315784	0.0055204010231878	0.223675711032456	0.0022731558508278	0.5501718705455065	-5.1439995353649925e-05	0.2307125375791535	5.1439995353649925e-05	0.2207532712654448	-0.0200811211734561	0.0696381571130347	0.0200811211734561	0.067738070181836	BHLHE22	166516	CYP7B1	384887	ARMC1	1220367	False	False	False	ref	65	0.001204	-5	0.00357
3941	chr8	64428871	T	C	rs2600467	0.00480074636	0.5750602525021673	0.00480074636	0.588062406197691	0.0227275087783561	0.0156581984748796	0.0001070376924588	0.3146382029545623	0.0001070376924588	0.3250894791441215	0.5335304308135977	0.1193834602351653	0.0025716062200944	0.3785321841347758	0.0025716062200944	0.3913980104489056	0.0122064897668716	0.0066268021647991	5.771208901122582e-05	0.1966533091011987	5.771208901122582e-05	0.2063524712995416	0.0011016711791616	0.7743566536441945	0.0011016711791616	0.7880853091883522	BHLHE22	151495	CYP7B1	369866	ARMC1	1205346	False	True	False	alt	100	0.1418	100	0.2822
3942	chr8	64449238	A	G	rs2577893	0.00898737628	0.3764210306440979	0.00898737628	0.388392503081124	0.0067659072635235	0.8358397189234492	5.961312750032492e-05	0.4667283013164056	5.961312750032492e-05	0.4786372962141044	0.2018755381279888	0.6499383085949304	0.0019007973739401	0.4500182469024156	0.0019007973739401	0.46350196346031	0.0013423428934229	0.7266222450104393	1.2418982541179213e-05	0.5106234891522512	1.2418982541179213e-05	0.5239731902527416	0.0079067210240769	0.2354660368126391	0.0079067210240769	0.2428374339934194	BHLHE22	131128	CYP7B1	349499	ARMC1	1184979	False	False	False	alt	40	0.001755	100	0.01953
3943	chr8	64451888	T	C	rs2612589	-0.0003757654	0.8224671873599939	0.00166328712	0.8184850501788704	0.0070153145004493	0.7813956802564574	-2.0570808594125253e-06	0.861826732260604	1.0952059212840748e-05	0.8582100724191435	0.2865320179669913	0.5207039534328106	-0.0001257288180022	0.7414319435957315	0.0004642093675611	0.7372769467668051	0.0020214679178189	0.603652872193859	-7.314860923141106e-07	0.7769033678455356	3.0683637593058404e-06	0.773037305324391	-0.0003838214089357	0.7524035545573291	0.0012966939491073	0.7491319160310083	BHLHE22	128478	CYP7B1	346849	ARMC1	1182329	False	False	False	ref	-70	0.01201	-50	0.05524
3944	chr8	64468374	A	G	rs10504376	-0.00501616206	0.5802325231551232	0.00501616206	0.5671806617916286	0.0168521274280752	0.0539827802095561	-7.911708757395774e-05	0.39741655212168	7.911708757395774e-05	0.3865923656241081	0.0587557962219524	0.895735796129085	-0.0003019589670796	0.8123704677712273	0.0003019589670796	0.7982234851575539	0.0009848740481664	0.7990885720229332	-4.726617440724735e-06	0.7183518727823972	4.726617440724735e-06	0.7046240014587052	-0.0036203695059076	0.4948391941961852	0.0036203695059076	0.4835151884576421	BHLHE22	111992	CYP7B1	330363	ARMC1	1165843	False	False	False	ref	-95	0.02618	-100	0.03894
3945	chr8	64472801	A	T	rs16931253	-0.0163350957999999	0.2380950516048074	0.0163350957999999	0.2283223017811715	0.0134578700367956	0.1151458999122741	-0.0002241573342806	0.162360216442549	0.0002241573342806	0.155069916443152	0.4918577993547651	0.1836474995314038	-0.0080224188887406	0.1686197325485849	0.0080224188887406	0.1593077101272388	0.0066392193991271	0.0577421000211325	-0.0001104329051375	0.117208487972252	0.0001104329051375	0.1101478039900334	-0.0051847010861108	0.3759527130628354	0.0051847010861108	0.3659894794239188	BHLHE22	107565	CYP7B1	325936	ARMC1	1161416	False	False	False	ref	-70	0.01189	-70	0.0708
3946	chr8	64534132	G	A	rs9643569	-0.0187577021999999	0.2071985018279489	0.0187577021999999	0.1983296069041059	0.0081499434442446	0.561598869093906	-0.0001498029770881	0.242982786479198	0.0001498029770881	0.2341379783211188	0.1592858847083475	0.7212844543285102	-0.0030696072698526	0.3707243208672094	0.0030696072698526	0.3579876160814079	0.0012859367945006	0.736898648203687	-2.425788020528101e-05	0.3895399625487759	2.425788020528101e-05	0.3773120180004676	-0.0175313021919313	0.0877692362207762	0.0175313021919313	0.0853292173446391	BHLHE22	46234	CYP7B1	264605	ARMC1	1100085	False	False	False	ref	-10	0.0003548	-60	0.0202
3947	chr8	64579514	C	T	rs4737675	0.000109790414	0.7233460014047689	0.002861904066	0.723400616771007	0.021187372412382	0.0209736500569663	4.520139985352716e-06	0.4874905291645442	5.877175150263488e-05	0.4870120974610104	0.6064461249598024	0.0425904080275896	6.806884668495853e-05	0.4924786466306108	0.001735366039122	0.4922041364627963	0.0128577897066281	0.0052156295530908	2.7557903492062656e-06	0.3133662092308103	3.5635357599982104e-05	0.3132746524185695	5.601717860139079e-05	0.9133204151448098	0.0003879708295729	0.913841333300168	BHLHE22	852	CYP7B1	219223	ARMC1	1054703	False	False	False	alt	70	0.01274	-100	0.09033
3948	chr8	64606609	A	G	rs3779870	0.0446588094	0.0371600891472382	0.0446588094	0.0397448894694131	0.0110745413473995	0.2246125709530159	0.0005208262114703	0.0408109326933896	0.0005208262114703	0.0434212425408159	0.5251527505472049	0.1352177426598904	0.0237527181212043	0.0269648867395833	0.0237527181212043	0.029459803111584	0.0058523911963718	0.0915953991460415	0.0002786919120872	0.0313583058336638	0.0002786919120872	0.033831918335966	0.011956555565929	0.1487487985371645	0.011956555565929	0.1535363726261564	BHLHE22	26243	CYP7B1	192128	ARMC1	1027608	False	False	False	alt	0	0.0	70	0.0445
3949	chr8	64625546	G	A	rs4452822	0.0018821393299999	0.8191340911772034	0.0018943158299999	0.8318294881616717	0.014435177392977	0.0907538028634566	2.8323026804152657e-05	0.7086348641061053	2.8473262792895524e-05	0.7205218194507009	0.3282793389972924	0.4468912523189679	0.000625526362039	0.71268758923125	0.0006295935320255	0.7229035411852215	0.0047854610623596	0.1679042928130832	9.565379945601893e-06	0.6189610072861194	9.615561468247682e-06	0.6292473672818709	0.0012655732943287	0.7581885253872929	0.0012821709768773	0.767554498148706	BHLHE22	45180	CYP7B1	173191	ARMC1	1008671	False	False	False	alt	-100	0.00178	-100	0.05588
3950	chr8	64649382	C	T	rs11996031	-0.038803773	0.0615932420058619	0.038803773	0.0579266854166159	0.0100012397068901	0.3017238270434503	-0.0003965332947524	0.0692834996738489	0.0003965332947524	0.0655246659019365	0.041239017002251	0.928808993329134	-0.0018154355238459	0.5181839883382942	0.0018154355238459	0.5048934077681633	0.000414363205641	0.9174310287296942	-1.8687015608054568e-05	0.4904261546711133	1.8687015608054568e-05	0.4776216904288937	-0.0183176174026701	0.1023681227275387	0.0183176174026701	0.0996221372384362	BHLHE22	69016	CYP7B1	149355	ARMC1	984835	False	False	False	ref	-80	0.003242	-100	0.0468
3951	chr8	64663044	C	T	rs4236934	0.00549363214	0.55041356905618	0.00549363214	0.5635574031790869	0.0127277257417613	0.1459796177537784	7.346604236401191e-05	0.4370137021179464	7.346604236401191e-05	0.4488606499442124	0.1130032469216485	0.8014023413640601	0.000648637482761	0.6903112902339701	0.000648637482761	0.7046420523995103	0.0014210951569982	0.7151173758792867	8.562302676732651e-06	0.6171343299554396	8.562302676732651e-06	0.6309986303997457	0.0045228684944864	0.4029271447324438	0.0045228684944864	0.4133288911931829	BHLHE22	82678	CYP7B1	135693	ARMC1	971173	False	False	False	alt	-95	0.008644	-70	0.03613
3952	chr8	64670080	A	G	rs4486246	-0.0443512807999999	0.045221218588783	0.0443512807999999	0.0431099547950983	0.0130404912438875	0.1482957073659164	-0.0006996426895585	0.0418340441803102	0.0006996426895585	0.0400439219828822	0.3869957157231921	0.352175080256298	-0.017891081361451	0.0599298103277164	0.017891081361451	0.0560597711736024	0.005193212883174	0.132008737706485	-0.0002858169650888	0.0481656400223348	0.0002858169650888	0.0455738653698144	-0.02653969439517	0.0443161529192036	0.02653969439517	0.0431009658086181	BHLHE22	89714	CYP7B1	128657	ARMC1	964137	False	False	False	ref	-100	0.006786	-70	0.01428
3953	chr8	64672852	T	C	rs6999999	0.0513142104	0.023341848073145	0.0513142104	0.0249642347496037	0.0194251314416554	0.0299412347059976	0.0010221601289574	0.0114026759277675	0.0010221601289574	0.012014723498696	0.1805350677911596	0.6899205135177799	0.0093529502797235	0.1248546980278917	0.0093529502797235	0.1334381788321395	0.0035264314694871	0.3221522793707351	0.0001874691371363	0.0515747734050738	0.0001874691371363	0.0555764333590964	0.0514299940870755	0.0041626638006115	0.0514299940870755	0.0042536689061856	BHLHE22	92486	CYP7B1	125885	ARMC1	961365	False	False	False	alt	-30	0.002068	15	0.001251
3954	chr8	64693162	G	T	rs7827287	0.0069256017	0.4579924105147719	0.0069256017	0.470290495074126	0.0081347541809517	0.5571166581621141	5.67907659336253e-05	0.4861099883953907	5.67907659336253e-05	0.4979236152779237	0.0222408946150893	0.9558750621350052	0.0001462882743259	0.8549175503476916	0.0001462882743259	0.8693606343009852	0.0001746081096164	0.9591011106827104	1.1488019407609864e-06	0.8612660917417018	1.1488019407609864e-06	0.8756986748353351	0.0024564570171889	0.5812819566364367	0.0024564570171889	0.5934513106777674	CYP7B1	105575	BHLHE22	112796	ARMC1	941055	False	False	False	alt	-100	0.00621	-80	0.06036
3955	chr8	64779146	C	A	rs13252547	-0.0019604603	0.8243819392988881	0.00202195802	0.8149088968099566	0.0085920732814844	0.48023423626161	-1.6008056522141947e-05	0.8277128208239736	1.6591541501299256e-05	0.8185027693153109	0.1014471104472037	0.8214920074897752	-0.0001926693066648	0.8657143992531416	0.000197406083785	0.8562383213186076	0.000874002210244	0.8213178934911819	-1.5984330210895776e-06	0.8689599530800481	1.6433751467365554e-06	0.8594420266925442	-0.0016701418064502	0.7075658400837672	0.0017074865921845	0.6983274785954686	CYP7B1	19591	BHLHE22	198780	ARMC1	855071	False	False	False	ref	95	0.000576	-100	0.02664
3956	chr8	81061024	T	G	rs4574807	-0.0018566404	0.69869523729988	0.00348224312	0.6955066351219293	0.0102892503398454	0.2775157099510277	-2.0113144786450528e-05	0.6498898786922715	3.645681738630633e-05	0.6465959144806792	0.1786885756076307	0.691874945430034	-0.0003154905665103	0.7120603170317332	0.0006186415642988	0.7090801493737158	0.0018197857764021	0.6389138188978546	-3.3563916811919186e-06	0.6826006196090321	6.388254900922902e-06	0.6796458121921141	-0.0011825848815859	0.5372590961741548	0.0030581230095747	0.5345856403407409	PAG1	51044	ZNF704	186243	FABP5	219513	False	False	False	ref	-65	0.00408	75	0.0396
3957	chr8	81061053	T	C	rs4265143	-0.00573904872	0.5556350179780415	0.00573904872	0.5426852828717855	0.0117146816326439	0.200641274952207	-7.190337343251788e-05	0.4767401580340856	7.190337343251788e-05	0.4647407852832884	0.1749146775381486	0.6977522175581369	-0.0009740609238233	0.6226738747489398	0.0009740609238233	0.6088222128039645	0.0020104325409878	0.6016464731762616	-1.1912420897519083e-05	0.558930730994235	1.1912420897519083e-05	0.5456627865747472	-0.0054585628481622	0.3882041770468005	0.0054585628481622	0.3782506419022134	PAG1	51015	ZNF704	186272	FABP5	219484	False	False	False	ref	-95	0.002863	100	0.03696
3958	chr8	81061840	G	T	rs11986552	-0.0453274917999999	0.039417011643462	0.0453274917999999	0.0368215754940382	0.0139578828466923	0.1020317196457259	-0.0006641388189639	0.0298371922041899	0.0006641388189639	0.0281010266391328	0.1670930196371331	0.7092299369373571	-0.0078978564083469	0.1738924185594827	0.0078978564083469	0.1646849644630067	0.0024212131485764	0.5016204167376462	-0.0001211684842889	0.1167552948918934	0.0001211684842889	0.1101835485530441	-0.0428365439475512	0.0079073595347038	0.0428365439475512	0.0076813440788615	PAG1	50228	ZNF704	187059	FABP5	218697	False	False	False	ref	90	0.014046	5	0.005188
3959	chr8	81078844	C	T	rs4534094	-0.0075704447799999	0.4890268302597333	0.0075704447799999	0.4763233681817381	0.010000026243488	0.3120806853303773	-7.49156416982635e-05	0.4665115260456843	7.49156416982635e-05	0.4547722664144403	0.2804925362296289	0.528632908046229	-0.0020230717316274	0.4755073516933438	0.0020230717316274	0.4624363185873428	0.0027945624836903	0.4461718502233275	-1.979636235230569e-05	0.4523858380137924	1.979636235230569e-05	0.4400081974518071	-0.006491768586811	0.3447687700663295	0.006491768586811	0.3358132629445611	PAG1	33224	FABP5	201693	ZNF704	204063	False	False	False	ref	-100	0.001638	-55	0.02621
3960	chr8	81081544	C	T	rs4739612	0.00677263572	0.4572935216251809	0.00677263572	0.4697629953297738	0.0056342357671148	0.961689133749934	3.809410311030646e-05	0.5963677129026326	3.809410311030646e-05	0.6091708054918543	0.0813410927499247	0.853761535322941	0.0005634137507889	0.6856194728089737	0.0005634137507889	0.6996835454359273	0.0004583093230213	0.9029580079316256	3.170425708524404e-06	0.7540833687514512	3.170425708524404e-06	0.7681925817158631	0.0056577350387451	0.3325031819479696	0.0056577350387451	0.3417277229861784	PAG1	30524	FABP5	198993	ZNF704	206763	False	False	False	alt	-100	0.0919	-80	0.0327
3961	chr8	88351378	G	A	rs58255283	0.00243938492	0.7537200399003419	0.00243938492	0.7675257250245984	0.0149362110508574	0.0899916233769922	3.151841431941006e-05	0.6456233998010875	3.151841431941006e-05	0.6587675095365778	0.2526519984647143	0.5709616582406924	0.0006560130889351	0.6725871692130247	0.0006560130889351	0.6868574710809731	0.0037160318743121	0.2825374041350232	8.389112264445247e-06	0.5900931708665729	8.389112264445247e-06	0.6039662231436713	0.0021016815527131	0.6341930623293316	0.0021016815527131	0.6468628151742153	MMP16	23353	DCAF4L2	477363	RIPK2	1406429	False	False	False	alt	0	0.0	-100	0.04535
3962	chr8	88354878	T	C	rs13262875	0.00152181066	0.5998006760653893	0.0046315722599999	0.60751504809399	0.0142755048336771	0.0943859800395839	1.578921194987574e-05	0.4648436121067732	6.760412045943573e-05	0.471340250772873	0.2130582267450907	0.6361869205926214	0.0004548903005732	0.5989754578413959	0.0010040721386671	0.6081248199068608	0.002980511633412	0.424857255485457	5.204313996560533e-06	0.5005820734580653	1.435479276155716e-05	0.5088841394208353	0.0010498034211972	0.4366842019472467	0.0043319951451778	0.4426623321392756	MMP16	26853	DCAF4L2	480863	RIPK2	1402929	False	False	False	alt	60	0.001546	-40	0.01686
3963	chr8	88430735	A	C	rs73291155	0.00228486934	0.7183254764026252	0.00307467234	0.727317810081749	0.006772691131863	0.8071819311723252	1.4981962499955845e-05	0.7727133400075221	2.0379725999984725e-05	0.7816813971267322	0.0637807446135333	0.8852779267734965	0.0001106701214703	0.8613449378938549	0.0001699715044808	0.8698232410405538	0.0004330372185169	0.9065093946111696	7.319501084447207e-07	0.8804452894944574	1.1372345223204772e-06	0.8890388857781031	0.001375532941213	0.646113808274847	0.0020726356082531	0.6542826203784732	MMP16	102710	DCAF4L2	556720	RIPK2	1327072	False	False	False	alt	-100	0.014465	50	0.01627
3964	chr8	88502546	T	G	rs6469448	0.000312043444	0.86439261912634	0.001365329184	0.8682259067869106	0.0247515666359058	0.0101683805071604	7.377735913716972e-06	0.6385303095557694	3.3707571866265735e-05	0.6421489994939502	0.0965736159088786	0.822680439313256	4.235190145688969e-05	0.883781553375754	0.0001267581875978	0.887589768234176	0.0026319142841761	0.416315614469064	1.3123849819872709e-06	0.7637387255914044	3.460061303035373e-06	0.7678022971997008	0.0001825745080343	0.7908651026982461	0.0010456540005601	0.7944140581581854	MMP16	174521	DCAF4L2	628531	RIPK2	1255261	False	True	False	alt	85	0.00615	100	0.02026
3965	chr8	88538814	C	T	rs16884208	0.001429105324	0.8154316293365789	0.0018659529439999	0.8217393699979314	0.0200462212985117	0.0266663581129039	2.522308378143688e-05	0.6485307087348039	3.340634366189731e-05	0.6539493068414691	0.0249981846284712	0.9563915796629058	2.885065915217497e-05	0.949157300749751	4.034819126741476e-05	0.955585024204217	0.0004876243573632	0.9008109056464232	4.682553683266856e-07	0.9168068406912636	6.842653588890052e-07	0.9220322351667666	0.0004439880081743	0.8683116470992903	0.0006182636749343	0.8746191458356469	MMP16	210789	DCAF4L2	664799	RIPK2	1218993	False	False	False	alt	-60	0.003723	-15	0.0209
3966	chr8	88540393	T	G	rs7007660	0.027045374	0.1169095842937609	0.027045374	0.1236959704707709	0.0085646000538488	0.4864627397163893	0.0002323997190627	0.1385655073082697	0.0002323997190627	0.145518085709852	0.0823680743576177	0.8552818086358188	0.002456779348615	0.411810583001193	0.002456779348615	0.4247609908013893	0.000710008698897	0.8568271665702667	2.1247563862152186e-05	0.4238711367557953	2.1247563862152186e-05	0.4361854107736522	0.0206039481737361	0.0741659767422893	0.0206039481737361	0.0762771687513171	MMP16	212368	DCAF4L2	666378	RIPK2	1217414	False	False	False	alt	60	0.006626	40	0.01964
3967	chr8	88541760	C	G	rs16884246	0.0251486772	0.1429370992517216	0.0251486772	0.1499577199876947	0.0082761276287213	0.5101224864921396	0.0002645345876289	0.1780625937189114	0.0002645345876289	0.1853573314496144	0.0235832321912052	0.9604953326642623	0.0006883571710584	0.7043720898724741	0.0006883571710584	0.7180346253364337	0.0002046582439623	0.961290122518222	6.683755975852273e-06	0.6972000624704047	6.683755975852273e-06	0.7106792729304556	0.0077033994128569	0.3130055289149976	0.0077033994128569	0.3213166306463775	MMP16	213735	DCAF4L2	667745	RIPK2	1216047	False	False	False	alt	95	0.004707	85	0.006973
3968	chr8	88548660	G	A	rs34846572	0.001560502378	0.743807415146906	0.002971079322	0.7488965641374205	0.0075231243821865	0.6904029898032902	1.1852590465880825e-05	0.7715616682588974	2.176487324003832e-05	0.7762954408963914	0.3412794738534632	0.4306404745880215	0.0005345045311167	0.6351404188149212	0.0010061561828051	0.6400772044497195	0.0025699275603125	0.5037656487208707	4.074923193601828e-06	0.6630626578183358	7.3823592584826e-06	0.6678336797715336	0.0007137003495886	0.6852800877678781	0.0017676531914231	0.6891420615489745	MMP16	220635	DCAF4L2	674645	RIPK2	1209147	False	False	False	alt	95	0.01688	75	0.0652
3969	chr8	88570396	A	G	rs10504857	0.00540378488	0.5079518383120467	0.00612801092	0.518312824235352	0.0083153502573177	0.5357511143042827	4.452844014784947e-05	0.5281568651295525	5.09204910398623e-05	0.5378275512024439	0.2797269681220759	0.526270455403592	0.0015017142176732	0.478496876294562	0.0017047325119634	0.4893511883857919	0.0023117978077882	0.5457411565212916	1.2253731162313877e-05	0.4912071192611145	1.4045579534754076e-05	0.501538744992225	0.0042987997800806	0.3847665109097074	0.0049129140343779	0.3925769109114969	MMP16	242371	DCAF4L2	696381	RIPK2	1187411	False	False	False	alt	15	0.001026	90	0.02524
3970	chr8	88572819	G	A	rs7838490	0.000230668824	0.8910173587879723	0.001082190272	0.8939811093092778	0.0098989478783391	0.315974203459593	1.238802938414326e-06	0.8694683387388839	1.0746245725699486e-05	0.8722530599069523	0.0476187512318592	0.9114257849438812	9.083761844315777e-06	0.9354164416815972	5.5563980988595074e-05	0.9385689228556384	0.0004751200984761	0.8974814944447367	3.434445056473995e-08	0.928096864693509	5.529119726574538e-07	0.931111534158836	0.0001348561707071	0.8422076417371477	0.00076971752819	0.8451759703636299	MMP16	244794	DCAF4L2	698804	RIPK2	1184988	False	False	False	alt	95	0.01563	95	0.03204
3971	chr8	88581951	G	T	rs71526952	0.0018397767712	0.8082668202182313	0.0018397767712	0.8220654826595725	0.0197849426636363	0.027595604473632	4.0188441700146526e-05	0.6476672649663207	4.0188441700146526e-05	0.6609412024352948	0.0989927281403333	0.8255234170594109	0.0002351369512776	0.8522867735428684	0.0002351369512776	0.8662966950002313	0.0020113571892699	0.591399113262587	5.298855741819089e-06	0.7551268235751789	5.298855741819089e-06	0.7691230287930985	0.0017655784811045	0.7043826680188565	0.0017655784811045	0.7176989373654016	MMP16	253926	DCAF4L2	707936	RIPK2	1175856	False	False	False	alt	60	0.000351	-100	0.03766
3972	chr8	102649991	G	A	rs3191333	-0.0451688078	0.0391465859506151	0.0451688078	0.0366811754330819	0.0174696262274452	0.0461665908078408	-0.0008187809552624	0.0207344055935874	0.0008187809552624	0.0196802354353453	0.4102345460015145	0.321632262237146	-0.0186165450246081	0.0516724180463289	0.0186165450246081	0.0477512423391213	0.0071967006842577	0.045836239100996	-0.0003391558843896	0.0260465814216143	0.0003391558843896	0.0244073805146799	-0.0247263975767383	0.0463649458710955	0.0247263975767383	0.0451741297651226	KLF10	5734	ODF1	98401	ENSG00000289653	213869	False	False	False	ref	20	0.002031	100	0.0501
3973	chr8	102657763	A	G	rs4734654	0.0177666901999999	0.1896262107475234	0.0177666901999999	0.1987760891549831	0.0126041000110368	0.1424233811904255	0.0002269593104636	0.1326052090919021	0.0002269593104636	0.1395499784779976	0.5731802197118226	0.0739209745321865	0.0101760483606328	0.1104023164148102	0.0101760483606328	0.1182362934696053	0.007221898586171	0.0416141680887504	0.0001299428065536	0.0808434520783339	0.0001299428065536	0.086595770502488	0.0030975425056275	0.5137886095127456	0.0030975425056275	0.5255386202235034	KLF10	2038	ODF1	106173	ENSG00000289653	206097	False	False	False	alt	-85	0.00646	-90	0.05774
3974	chr8	102658852	G	A	rs1434281	-0.0654887668	0.0117862985476913	0.0654887668	0.011132881639383	0.0150615749395074	0.0796496455753248	-0.0010106549053724	0.0134504295867497	0.0010106549053724	0.012830757483135	0.4333219224265812	0.2822038871714038	-0.0286735869595367	0.0192350911315399	0.0286735869595367	0.017796508503375	0.0065649793489245	0.0609667018394213	-0.0004442691522866	0.0162527098425312	0.0004442691522866	0.0153076365406533	-0.0323986763348167	0.0224365292871673	0.0323986763348167	0.0218354174122183	KLF10	3127	ODF1	107262	ENSG00000289653	205008	False	True	False	ref	-25	0.001053	-20	0.01743
3975	chr8	102665495	C	A	rs2436936	0.0022936119	0.7681860915334189	0.0022936119	0.7818358379760505	0.0242236257196294	0.0112064210820483	5.707343338982731e-05	0.4862512345234399	5.707343338982731e-05	0.498024150400744	0.0149275407421238	0.971397661576332	3.559747911654602e-05	0.9416855654606964	3.559747911654602e-05	0.955780143829038	0.0003617670885269	0.92340571388616	8.86638104116829e-07	0.890133379475962	8.86638104116829e-07	0.9044100972777972	0.0006265625162086	0.858771318276524	0.0006265625162086	0.8726398536431477	KLF10	9770	ODF1	113905	ENSG00000289653	198365	False	True	False	alt	100	0.0005493	-100	0.03772
3976	chr8	102916522	A	G	rs7841632	0.001775735862	0.7020455454604319	0.002807625062	0.7109402524595216	0.0198476582799978	0.0272089300384081	3.94492902646466e-05	0.4955737975636188	5.707613336232096e-05	0.503401754040522	0.1845226610234545	0.6787108420869102	0.0002560049192547	0.7191410154668948	0.0004809569592032	0.7278653072405549	0.0036672781625092	0.2818412097788592	5.814420578420399e-06	0.5750377720095238	9.657075665066802e-06	0.5832683114374667	0.001923256465316	0.555583622365786	0.002848577267399	0.5631742211922152	AZIN1	22658	ENSG00000289653	52662	ATP6V1C1	104542	False	False	False	alt	-100	0.01862	-35	0.0465
3977	chr8	110459785	G	A	rs36043959	-0.0290491032399999	0.1151272486047307	0.0290491032399999	0.1097617837961932	0.0120579035647722	0.1979222628869687	-0.0004447379526935	0.0899099651864925	0.0004447379526935	0.0862097221445005	0.2280189628523117	0.5972498242644999	-0.0084275878774235	0.1936944767243217	0.0084275878774235	0.1843939281574677	0.0031248393032489	0.3540386917443765	-0.0001397074619369	0.1446654515082838	0.0001397074619369	0.1379860435221271	-0.0255334598906627	0.054120723773114	0.0255334598906627	0.0526873149947838	KCNV1	484014	SYBU	767994	ENSG00000289767	920058	False	False	False	ref	-5	7.63e-05	-35	0.02075
3978	chr8	110466092	A	C	rs13267290	-0.00370163296	0.687831664294237	0.00370163296	0.6742891912259726	0.021890140587837	0.0178332112565079	-8.290476223053192e-05	0.4290994513946533	8.290476223053192e-05	0.4177701049599097	0.1030529362337783	0.820964145744057	-0.0003684211431407	0.8028335542754406	0.0003684211431407	0.7887653556873083	0.0022785013765662	0.5409462127244608	-8.297339224036934e-06	0.6486618037067116	8.297339224036934e-06	0.6351473027221	-0.0030498241683004	0.560619306296447	0.0030498241683004	0.5486957380216725	KCNV1	490321	SYBU	774301	ENSG00000289767	926365	False	True	False	ref	-100	0.00764	95	0.03494
3979	chr8	110494336	C	G	rs6995307	0.0036815845459999	0.6641437148277465	0.0036815845459999	0.6776479745356202	0.0069771660121066	0.7737991238631396	2.517009322606289e-05	0.7226711780681653	2.517009322606289e-05	0.7362352022535268	0.0184255023392358	0.9659563569953152	7.457696143815142e-05	0.9152724810591718	7.457696143815142e-05	0.9293572614204744	0.0001265753849012	0.971997546896906	5.049123117701409e-07	0.926405175479324	5.049123117701409e-07	0.9405715102794104	0.0012489756117801	0.7568855150423659	0.0012489756117801	0.7704011287631177	KCNV1	518565	SYBU	802545	ENSG00000289767	954609	False	False	False	alt	-100	0.01651	-80	0.02386
3980	chr8	110510428	T	C	rs111534212	-0.00507045272	0.5888557866043145	0.00507045272	0.5758072788816808	0.0333246943504379	0.0024499951101792	-0.0001816946928152	0.2253402497923993	0.0001816946928152	0.2168441022367652	0.0276662620981545	0.9486364028243726	-0.0001637322173801	0.888233924428584	0.0001637322173801	0.8739945171206253	0.0009690020972633	0.7986519111824185	-6.141278638548959e-06	0.7119453418206652	6.141278638548959e-06	0.6981340872665661	-0.0025290718783389	0.6211657878314594	0.0025290718783389	0.6084471328171673	KCNV1	534657	SYBU	818637	ENSG00000289767	970701	False	True	False	ref	-5	0.0001678	-45	0.02005
3981	chr8	110564460	C	A	rs13280766	-0.00800823038	0.4426912033021232	0.00800823038	0.4304587405819705	0.0227353661469943	0.0148641709559657	-0.0001805487512975	0.2109808408527301	0.0001805487512975	0.2025220301511507	0.251442442348987	0.5693085845344984	-0.0022248930261881	0.4521761728205557	0.0022248930261881	0.4394402756950304	0.0056943259181379	0.1023805047640036	-5.017357320102681e-05	0.2607386743782534	5.017357320102681e-05	0.2502652561434729	-0.0069461301465782	0.3010277731840517	0.0069461301465782	0.2925345726115438	KCNV1	588689	SYBU	872669	ENSG00000289767	1024733	False	True	False	ref	-30	0.001312	-30	0.003845
3982	chr8	110588499	G	T	rs6990323	-0.001691289326	0.7742269429742952	0.002663616366	0.7651619210963553	0.0206341272938977	0.0232342792722343	-3.120266257084464e-05	0.5462813942124134	5.217613670045668e-05	0.5383767750320156	0.1668399049782673	0.7089166806716619	-0.0002697507677406	0.7746169319052425	0.0004088333042104	0.7654651878984078	0.0035201189368947	0.3118307656224075	-5.187408919997037e-06	0.630296468666431	8.187473596738706e-06	0.6213101317366791	-0.0016079004968931	0.6125891946264425	0.002446083465596	0.6044141175140741	KCNV1	612728	SYBU	896708	ENSG00000289767	1048772	False	False	False	ref	-45	0.07153	95	0.03004
3983	chr8	110607825	A	T	rs16880919	0.0040728308599999	0.6211254147777616	0.0040728308599999	0.6350700898787154	0.011663352550439	0.1937785483421414	4.7833183815209935e-05	0.5289266570995796	4.7833183815209935e-05	0.541809797931882	0.0576956192491623	0.898443627181152	0.0001856980930155	0.8375147936012995	0.0001856980930155	0.8519685043149573	0.0006749491656048	0.8612253760696301	2.2022661951781505e-06	0.7987102647777994	2.2022661951781505e-06	0.8131397451821764	0.0024294857830474	0.5802553474629023	0.0024294857830474	0.5927076302483103	KCNV1	632054	SYBU	916034	ENSG00000289767	1068098	False	False	False	alt	-80	0.00602	80	0.03513
3984	chr8	110609036	C	T	rs7007361	-0.0042351194	0.6407314154442527	0.0042351194	0.6268881320072082	0.0060357792051151	0.9226393418200112	-2.38549796839136e-05	0.7469592221635865	2.38549796839136e-05	0.7333476308783862	0.0888494693928359	0.8448562869889643	-0.0003253870661784	0.8071600226340707	0.0003253870661784	0.7929231795615745	0.0005507920314376	0.8901699140291937	-1.8846081280277007e-06	0.8540202037402634	1.8846081280277007e-06	0.8397427706994189	-0.0030788701127604	0.5436865079812181	0.0030788701127604	0.5318567560286138	KCNV1	633265	SYBU	917245	ENSG00000289767	1069309	False	False	False	ref	100	0.003548	90	0.010124
3985	chr8	110614839	C	T	rs34921000	-0.0435007512	0.0442693838484599	0.0435007512	0.0413553809257091	0.0093249647185777	0.3869614560969664	-0.0004219306739037	0.0645055271477702	0.0004219306739037	0.0608252548221832	0.2262907291569414	0.6179114386766579	-0.0100004794139558	0.1336935658184574	0.0100004794139558	0.1254179357619878	0.0021325722035554	0.5816967557661012	-9.762835249141412e-05	0.1379702655951316	9.762835249141412e-05	0.1302259277025878	-0.0410709654664467	0.0084664044387927	0.0410709654664467	0.0082379915055408	KCNV1	639068	SYBU	923048	ENSG00000289767	1075112	False	False	False	ref	-100	0.00393	-40	0.03552
3986	chr8	115831047	T	C	rs800531	0.0043595721	0.6187114443866919	0.0043595721	0.6322012659774616	0.0084103440143474	0.503954726419851	3.605084925845648e-05	0.62880129092023	3.605084925845648e-05	0.6420007692846317	0.220512660919719	0.6261082460035773	0.000936079777597	0.6128403955893821	0.000936079777597	0.6267921460152475	0.0018619696820997	0.6362620429232342	7.726168491307315e-06	0.6214677193194366	7.726168491307315e-06	0.6351610103918551	0.0039025301092334	0.4528140832162223	0.0039025301092334	0.4640510125835204	TRPS1	21374	UTP23	935459	EIF3H	935878	False	False	False	alt	60	0.014084	50	0.03036
3987	chr8	115835299	T	C	rs800524	0.0243441167199999	0.1351627580342829	0.0243441167199999	0.1420476923394639	0.0120231920381906	0.1963707965533107	0.0003533508929741	0.1006299429216413	0.0003533508929741	0.1050370990743235	0.1876139793981265	0.6783653330376048	0.0048895136993876	0.2651556128580661	0.0048895136993876	0.277212466751712	0.0022873500100647	0.5339759016291591	7.136892350106464e-05	0.2005255180799257	7.136892350106464e-05	0.2104332545944381	0.0256081494621313	0.0504575882625349	0.0256081494621313	0.0519072633897223	TRPS1	25626	UTP23	931207	EIF3H	931626	False	False	False	alt	-30	0.001583	100	0.05054
3988	chr8	115852305	C	G	rs800582	0.00476846568	0.5808041852861334	0.00476846568	0.5940274031576339	0.0067300152733996	0.8106858477012854	3.163274461311305e-05	0.6554338850242872	3.163274461311305e-05	0.6686982625630549	0.0429610265666656	0.9219062566855378	0.0002083357351746	0.832938002405633	0.0002083357351746	0.847213146192671	0.0002888218941027	0.9366277710746838	1.3817798318063348e-06	0.8560548727066081	1.3817798318063348e-06	0.8704463196002807	0.0027220199379661	0.5596829958907851	0.0027220199379661	0.5718504331801518	TRPS1	42632	UTP23	914201	EIF3H	914620	False	False	False	alt	85	0.01942	85	0.008255
3989	chr8	116058513	G	T	rs4876349	3.052043200000012e-05	0.7718359930085366	0.0024986710719999	0.769721633374505	0.0179470319474852	0.0419290816393935	-4.920534347820004e-06	0.5956596963038724	4.450554625980716e-05	0.5932503371814236	0.0821564539051234	0.8486784476230139	-4.855068832680065e-05	0.8689184268044932	0.0001733117338669	0.8660560178491621	0.0014908060680063	0.6813796906693729	-1.211164237209607e-06	0.7842277298796262	3.162880709107492e-06	0.7809691213448131	-0.0003962696708472	0.6914599519019444	0.0018278197906616	0.68878599804718	TRPS1	248840	UTP23	707993	EIF3H	708412	False	False	False	alt	-100	0.00791	-25	0.0128
3990	chr8	116320147	C	T	rs76032162	-0.0213558306	0.1812985684047309	0.0213558306	0.1728162092048026	0.0070003996220084	0.7762644946128986	-0.0001533955293897	0.2467230305665833	0.0001533955293897	0.2377773264826656	0.0499175302648367	0.9041480417964772	-0.0010228129152761	0.6049660805914913	0.0010228129152761	0.5910126604334961	0.0003405063868015	0.922239494841074	-7.173960972378966e-06	0.6467064841252226	7.173960972378966e-06	0.632865239782956	-0.0117470098237533	0.1590156113423131	0.0117470098237533	0.1542019611269021	UTP23	446359	EIF3H	446778	TRPS1	510474	False	False	False	ref	-90	0.03912	-25	0.01141
3991	chr8	134793233	T	G	rs10099070	-0.00183323224	0.6943204402670698	0.00337110776	0.6926404564772926	0.0080110169259065	0.5950683573149917	-1.626698019449308e-05	0.7043452598335771	2.769210123106597e-05	0.7027238811995064	0.3339868670836834	0.4401833345181614	-0.0006109453606972	0.5749956409686701	0.0011320471848618	0.5736032679938196	0.0026856665899965	0.4782763147885275	-5.483522760126514e-06	0.5906394962551608	9.353780887774106e-06	0.5891943524804828	-0.0013236651832487	0.6048030219926818	0.0024564570171889	0.6029512218568044	ZFAT	80184	KHDRBS3	664224	ST3GAL1	1221307	False	False	False	ref	35	0.0010395	-100	0.0724
3992	chr8	134797509	A	C	rs10111734	-0.0038255565399999	0.6600099267520723	0.0038255565399999	0.6465364649848309	0.0310240355077247	0.0032799252101324	-0.0001166980596273	0.3121810768513616	0.0001166980596273	0.3021422674464011	0.1467214390190769	0.7446793400940289	-0.0006242662917383	0.7088322513287827	0.0006242662917383	0.6947551189258505	0.0046218768920874	0.1761503584203921	-1.912634126044385e-05	0.4563452342897083	1.912634126044385e-05	0.4436428104139907	-0.0038382140893577	0.4889231101215198	0.0038382140893577	0.4776713966301236	ZFAT	84460	KHDRBS3	659948	ST3GAL1	1225583	False	True	True	ref	70	0.000656	-85	0.03506
3993	chr8	134799373	C	T	rs6577846	-0.004677145162	0.6236009209033988	0.004769870758	0.612554786179014	0.0063616101057527	0.8753030532337185	-3.2610782457088035e-05	0.6886576942606281	3.3169687084578e-05	0.6781628382463424	0.0694239566800484	0.8780221394371205	-0.0002293463019006	0.848563163095915	0.0002430253928977	0.838026840100502	0.0004371627980018	0.9130213733081418	-1.625722998406835e-06	0.8722031793038402	1.7081738817929156e-06	0.8616601142975931	-0.0026535544974532	0.5831685880573169	0.0027448417514704	0.5737537805919678	ZFAT	86324	KHDRBS3	658084	ST3GAL1	1227447	False	False	False	ref	40	0.001343	5	0.00963
3994	chr8	134800305	A	C	rs10095483	0.00058573376	0.616316002105731	0.00510454304	0.6128260229721886	0.0084873439622745	0.4870123457647389	5.91108335219444e-06	0.6175714087731149	4.472314913276556e-05	0.6137815490758477	0.4296621334246205	0.2794660230055175	5.390512847689988e-05	0.4849163427820862	0.0020904777920105	0.4806165514604937	0.0036208581309163	0.3137633842461466	8.929141856393293e-07	0.4914213502659651	1.8188615682039967e-05	0.4872843611701117	0.0002821606033258	0.6408071642493652	0.002228238882146	0.636716390532459	ZFAT	87256	KHDRBS3	657152	ST3GAL1	1228379	False	False	False	alt	30	0.002686	-90	0.04602
3995	chr8	134830526	T	C	rs7844406	0.0013694418892	0.7162816683010802	0.0025515383908	0.7252257976921521	0.0056039486697111	0.9770153742015004	6.719968638918985e-06	0.8032421755339874	1.3830161854191907e-05	0.8120356048358466	0.2489693876492494	0.5778692854771635	0.0003472201514756	0.6794410592413954	0.0006559990356481	0.6871533882490636	0.0013943301716763	0.7224132756823923	1.681198682125064e-06	0.7475148351868235	3.538738711992907e-06	0.7552506764105708	0.0013713835205759	0.5967750795979311	0.0024004398385874	0.6034617593664251	ZFAT	117477	KHDRBS3	626931	ST3GAL1	1258600	False	False	False	alt	45	0.003452	-100	0.03268
3996	chr8	134830700	A	G	rs7840432	-0.001760725502	0.8258026923185916	0.001775997358	0.8175571678239494	0.0221266608065131	0.0170971617621767	-4.115036245759132e-05	0.6276090326860126	4.14674402412971e-05	0.6188591129242956	0.3231195344350044	0.456501300238766	-0.0006408554336399	0.7277894069369564	0.0006446322473341	0.7186556866211654	0.0072513064930988	0.045056120824511	-1.5210819487385349e-05	0.5571435211286965	1.528923455770294e-05	0.5475075032253701	-0.001186734302223	0.787031655161113	0.001186734302223	0.7781928044328416	ZFAT	117651	KHDRBS3	626757	ST3GAL1	1258774	False	True	False	ref	-100	0.002405	-35	0.02325
3997	chr8	139680130	C	T	rs13274282	-0.050348515	0.0263697586308162	0.050348515	0.0247607501736036	0.0112225135251249	0.2135425422270239	-0.0005794857914309	0.0338672322848437	0.0005794857914309	0.0319638798570392	0.4885175157418644	0.1856005345115286	-0.0246716382783397	0.0269287228044407	0.0246716382783397	0.0248122465024984	0.0054923970555765	0.1052482428489328	-0.0002842996813648	0.0315146507023415	0.0002842996813648	0.0293159101518301	-0.0177387732237885	0.0930543582945819	0.0177387732237885	0.0904970044514735	KCNK9	23979	COL22A1	766089	TRAPPC9	778449	False	False	False	ref	100	0.00826	45	0.0881
3998	chr8	139680274	G	A	rs62520201	-0.0381281611999999	0.0599013749870532	0.0381281611999999	0.0561197307447746	0.0164337964642694	0.0568578582256782	-0.0006444497281153	0.0292196981259094	0.0006444497281153	0.0275851669651237	0.4820776149130177	0.195290456117808	-0.0185168973721976	0.0511869755383967	0.0185168973721976	0.0473196534775821	0.0079769317535648	0.0311698081863537	-0.0003140497416374	0.0275839685809635	0.0003140497416374	0.0258158927868746	-0.0137698523843608	0.1358815951338961	0.0137698523843608	0.1319120630325691	KCNK9	23835	COL22A1	766233	TRAPPC9	778305	False	False	False	ref	-20	0.00344	-20	0.0605
3999	chr8	139683304	A	G	rs2319423	0.095157143	0.0026059191776715	0.095157143	0.0027306712298272	0.0264489316974916	0.0073008856735353	0.0025551276724421	0.0025687398534413	0.0025551276724421	0.002663676387156	0.4510855921741926	0.2471515146213536	0.042995756410413	0.0048191639177927	0.042995756410413	0.0051769580153769	0.0120175216198074	0.007364816326755	0.0011642830775567	0.0029821944954618	0.0011642830775567	0.0031256688487549	0.0459403105841346	0.0066396729996804	0.0459403105841346	0.006804861352863	KCNK9	20805	COL22A1	769263	TRAPPC9	775275	False	True	True	alt	40	0.000998	-40	0.02032
4000	chr8	139683481	C	T	rs10101804	-0.00695979776	0.4530069590381268	0.00744156084	0.4426847217376592	0.0077277620085741	0.6521463988192002	-5.0423841284370125e-05	0.5067603841800095	5.50219885713313e-05	0.4971965953422457	0.3589248851129161	0.3886931436796858	-0.0027610328652637	0.3826242071991213	0.0028744632560445	0.3717164385786708	0.0027171698582485	0.469237364908405	-2.0078391930312925e-05	0.4187797118168065	2.116101881412041e-05	0.4083040488318222	-0.0037780474901191	0.431553072448988	0.0043133227523106	0.4234627037742712	KCNK9	20628	COL22A1	769440	TRAPPC9	775098	False	False	False	ref	-95	0.006916	-90	0.07935
4001	chr8	139686423	A	G	rs9693845	-0.00618878404	0.5382912188504436	0.00618878404	0.5256678895111413	0.0269779267840734	0.0067401203808168	-0.0001756487418852	0.2314038480233644	0.0001756487418852	0.2228391155415432	0.0254131266921855	0.9552466140288172	-0.0001683971144689	0.8903657254367352	0.0001683971144689	0.8762509387804499	0.0007090208371967	0.857221791546026	-4.9492267644797765e-06	0.7504576180465113	4.9492267644797765e-06	0.736460146222838	-0.002489652382286	0.6257915013123049	0.002489652382286	0.6131749631980665	KCNK9	17686	TRAPPC9	772156	COL22A1	772382	False	True	False	ref	-25	0.001053	-70	0.0235
4002	chr8	139688714	A	G	rs16893602	0.00322198904	0.6832629962609205	0.00322198904	0.6969216332425131	0.0110163085275647	0.2282895330061914	3.3512673208148096e-05	0.6248624295247571	3.3512673208148096e-05	0.637903733148025	0.2077303706469984	0.6444660282958671	0.0007134923609394	0.6535430393590471	0.0007134923609394	0.6675224421455171	0.0022853119898664	0.5453790816725518	7.382464451716876e-06	0.6129422705975932	7.382464451716876e-06	0.6266019138244635	0.0030975425056275	0.5229683710723521	0.0030975425056275	0.5348218362437257	KCNK9	15395	TRAPPC9	769865	COL22A1	774673	False	False	False	alt	-100	0.001375	-70	0.01807
4003	chr8	139692798	T	C	rs741469	0.027897242	0.101223920740778	0.027897242	0.1075929429161528	0.0098844951026543	0.3104080439332083	0.0002890404820578	0.103956809150456	0.0002890404820578	0.1097133478536995	0.3383479081733213	0.4207624590696476	0.0096960324859362	0.1192536660384751	0.0096960324859362	0.1274383080892057	0.0033783076491341	0.3214592181273349	0.0001021528530181	0.1165455358386016	0.0001021528530181	0.1237400055929477	0.0183321403749001	0.0787392562320577	0.0183321403749001	0.0810161924074475	KCNK9	11311	TRAPPC9	765781	COL22A1	778757	False	False	False	alt	90	0.000662	-95	0.05347
4004	chr8	139700268	G	C	rs199211	-0.0187794409999999	0.2024233811677963	0.0187794409999999	0.1931622035874491	0.008038225389912	0.5596255789158057	-0.0001581013412264	0.2343364297193481	0.0001581013412264	0.2253731696052261	0.6113984584902333	0.0388556758682396	-0.0114694532779887	0.1114502082321308	0.0114694532779887	0.1040611854145327	0.0049116920896897	0.148867633289477	-9.647999465772495e-05	0.1353235879419857	9.647999465772495e-05	0.1277325856570633	-0.0020767850288903	0.6546394942992664	0.0020767850288903	0.641874587539839	KCNK9	3841	TRAPPC9	758311	COL22A1	786227	False	False	False	ref	-80	0.03882	-100	0.0404
4005	chr8	142221528	T	C	rs11786405	0.00071531306	0.6318693165491633	0.0046473535	0.635303570979963	0.0075549199459268	0.6748168804622622	4.2131759864746846e-06	0.6600853562612077	3.750985104745919e-05	0.6636469638668892	0.3660701874500772	0.3813595981812649	0.0004705346426377	0.533038228857552	0.0017071797856876	0.5373115590689403	0.0027548801399539	0.4584355122815062	3.311792259013212e-06	0.5597978177389141	1.37174890255696e-05	0.5638939506742703	-0.00015975269453	0.5811961588259771	0.0028942208944075	0.58389156955057	TSNARE1	181654	ADGRB1	227903	ARC	392951	False	False	False	alt	90	0.002953	-65	0.05466
4006	chr8	142232905	A	G	rs4976978	0.051330027	0.0230988354157517	0.051330027	0.0247689569824544	0.0122998123610375	0.1546462610843066	0.0006397776384336	0.0256402809202448	0.0006397776384336	0.0273509213600506	0.6193217771968589	0.0353076020456347	0.031835664024236	0.0116543585360546	0.031835664024236	0.0127514564571221	0.0076193456757443	0.0349239607105506	0.0003968204610474	0.0159677414442706	0.0003968204610474	0.0172163294894159	0.0060581541302295	0.3067631315647657	0.0060581541302295	0.315751770885642	TSNARE1	170277	ADGRB1	216526	ARC	381574	False	False	False	alt	-80	0.005146	-100	0.1533
4007	chr8	142234411	A	G	rs4976981	0.038416233	0.0543438712833965	0.038416233	0.0582190677424034	0.0088161331617374	0.4437647531423155	0.0003438329926891	0.0756090441714008	0.0003438329926891	0.0801278273521864	0.3745889480181329	0.3600488480889146	0.0142533590086238	0.0709712104617113	0.0142533590086238	0.0766970755098193	0.0032845120965297	0.34601015773526	0.0001271332717678	0.0852744319782057	0.0001271332717678	0.0910896658503603	0.0246537827155882	0.0507205660793953	0.0246537827155882	0.0521964263772933	TSNARE1	168771	ADGRB1	215020	ARC	380068	False	False	False	alt	0	0.0	30	0.02008
4008	chr8	142241656	G	A	rs7832212	-0.0351974324	0.0785145667010547	0.0351974324	0.0738343397166438	0.0090945071252306	0.4194479460197449	-0.0003401875485726	0.096815110303246	0.0003401875485726	0.0919180349201506	0.2108445108351745	0.6393027508035086	-0.0082291829155907	0.1840835438105005	0.0082291829155907	0.1742784607264317	0.0020201503280294	0.6016597154945894	-8.233753937741308e-05	0.1871961914589936	8.233753937741308e-05	0.1782649570468171	-0.0309961721594622	0.0239178765235739	0.0309961721594622	0.0233084085560818	TSNARE1	161526	ADGRB1	207775	ARC	372823	False	False	False	ref	-60	0.04083	85	0.04993
4009	chr8	142241748	T	C	rs7822538	0.0668206492	0.0084631867019218	0.0668206492	0.0090476607034196	0.0175643037980348	0.0470761880879362	0.0012776102728245	0.0090399116141126	0.0012776102728245	0.0095110604407381	0.2458552474610732	0.5821731252261394	0.0168619281836155	0.0558365975646382	0.0168619281836155	0.0606289528468387	0.00439456295078	0.193834747308396	0.0003251162461232	0.0282897003304385	0.0003251162461232	0.0303952270101506	0.0577039180904365	0.0019379149543225	0.0577039180904365	0.0019920919321067	TSNARE1	161434	ADGRB1	207683	ARC	372731	False	True	True	alt	-100	0.004066	-10	0.010315
4010	chr8	143158840	C	G	rs9694368	0.008123843	0.4252895130344267	0.0085141692	0.4342868081289242	0.0086829574580304	0.4587211434967441	7.490430905328645e-05	0.4300304355011797	7.768939002956443e-05	0.438211360731262	0.5990477079637756	0.0492001755160765	0.0048153995370426	0.2590965359774801	0.0050525535119598	0.2675897750511589	0.0051943759185136	0.1254355799511543	4.436470221000908e-05	0.2645278323495939	4.605685869275891e-05	0.2727708732918519	0.0012240790879572	0.7571652153389092	0.0012821709768772	0.7650740615480055	LY6H	1871	GPIHBP1	54379	LY6L	78209	False	False	False	alt	-90	0.004368	-100	0.06012
4011	chr8	143169111	G	A	rs7830479	0.001135214822	0.8699950615384024	0.001361532178	0.8739373046136524	0.0094436190421884	0.3869745751695368	9.023916166581849e-06	0.8680027824015021	1.136522327173858e-05	0.8717578909740096	0.5431736843743192	0.1086264925044843	0.0006146242629759	0.6758701943632073	0.0007393802571511	0.6810797208705947	0.0050909693823616	0.1396756021696997	4.891766044357232e-06	0.6760172651231241	6.160956872939713e-06	0.6807398656264995	0.0002904594446	0.9190531036249572	0.0003568501747942	0.9226461290885604	LY6H	8400	GPIHBP1	44108	ZFP41	77711	False	False	False	alt	30	0.0010605	-80	0.1194
4012	chr8	143169632	T	C	rs7824786	0.052626006	0.0221837579233943	0.052626006	0.0235750412503741	0.0134977876723345	0.1290918408131756	0.0008153855391661	0.0265259371830456	0.0008153855391661	0.0278396939467761	0.5503148372908433	0.0975279138630958	0.0296834783182258	0.0153846231837413	0.0296834783182258	0.0166735345303654	0.0075796720326553	0.0435481752179426	0.0004672073125498	0.0190846875791941	0.0004672073125498	0.0203264514441905	0.0109938899781117	0.1582388416174294	0.0109938899781117	0.1633252732235713	LY6H	8921	GPIHBP1	43587	ZFP41	77190	False	False	False	alt	45	0.001139	45	0.04257
4013	chr8	143193560	C	T	rs11996840	-0.0551955964	0.0205289173805313	0.0551955964	0.0192378891583873	0.0109029953203873	0.2392834007223599	-0.0006349294170126	0.0330140789512937	0.0006349294170126	0.0310952068871139	0.5371881451052396	0.1168627439679041	-0.0295846176545545	0.0172247887469762	0.0295846176545545	0.0158493035163225	0.0058420621745903	0.0906251433272032	-0.0003390266333242	0.026013227902533	0.0003390266333242	0.0241989044739804	-0.0143383230116494	0.1253333633392713	0.0143383230116494	0.1216447274211016	GPIHBP1	19659	LY6H	32849	ZFP41	53262	False	True	False	ref	90	0.01857	95	0.11096
4014	chr8	143668507	T	C	rs117423761	0.0610984658	0.0123718280362912	0.0610984658	0.013175230841485	0.0120846971676549	0.169633097975647	0.000744463484839	0.0197046034339683	0.000744463484839	0.0208314144182373	0.4411124596728181	0.2697136829451889	0.0269011282411904	0.0185305355055146	0.0269011282411904	0.0202704228197335	0.005332495755614	0.1113010366920192	0.0003278240217729	0.0214713734620128	0.0003278240217729	0.0231296676270113	0.0292326683886761	0.0275352071368212	0.0292326683886761	0.0283029149633195	ZNF707	15946	ZNF623	32487	CCDC166	39602	False	True	False	alt	-85	0.003937	35	0.03455
4015	chr8	143691909	G	T	rs11136313	-0.0327305513999999	0.0822156968079437	0.0327305513999999	0.0777332168496693	0.0158234423220063	0.0663795249372629	-0.0005499365956271	0.043152958604614	0.0005499365956271	0.0410718239824553	0.5410512557184204	0.1089112722533799	-0.0177404681631189	0.056316580964767	0.0177404681631189	0.0523438181197948	0.0085582310126415	0.023914311356847	-0.000298268363534	0.0331984859218231	0.000298268363534	0.031134551937147	-0.0084191744727641	0.2544126667948285	0.0084191744727641	0.2472518515839478	ZNF707	7456	CCDC166	16200	MAPK15	24432	False	False	False	ref	75	0.003105	-70	0.02734
4016	chr9	10236246	A	G	rs10756010	0.00910051998	0.3889389787917062	0.00910051998	0.4012558232205646	0.0108414055037834	0.2296275255254465	9.91920647481179e-05	0.3440078225031625	9.91920647481179e-05	0.3549037081410315	0.2150063797342296	0.6308065555788128	0.0020894634480832	0.4418621894435863	0.0020894634480832	0.4550740185481426	0.0023335676497654	0.543990735230157	2.2821730075263893e-05	0.3986491633107652	2.2821730075263893e-05	0.4109758801983857	0.0080623242979698	0.2443759611894236	0.0080623242979698	0.2518378953584032	PTPRD	376756	DMAC1	2347866	TYRP1	2449194	False	False	False	alt	-95	0.009125	-40	0.0293
4017	chr9	10236249	G	A	rs10958968	0.0001740416869999	0.7490526304339655	0.0023401525669999	0.75384574815991	0.0223960049910891	0.0160225462219303	5.75098332900236e-06	0.5039976474752986	5.5639862464657e-05	0.5083599355981576	0.2075021525119554	0.643474341668953	-3.744426153581529e-05	0.717291016666004	0.0005305808401993	0.7218600477228446	0.0046857371102449	0.1754865255857474	-6.169901443046763e-07	0.5395785411118824	1.2664882216093938e-05	0.543977622229562	0.0004460627184929	0.6188332028626972	0.0022510606956503	0.6226613791580704	PTPRD	376753	DMAC1	2347869	TYRP1	2449191	False	True	False	alt	-95	0.00824	-40	0.02765
4018	chr9	10244630	A	G	rs12237121	-0.0126288668	0.3023457450068168	0.0126288668	0.2914359226752053	0.0230306618211111	0.0141292444513845	-0.000298803694446	0.1094790329071066	0.000298803694446	0.1038033825425162	0.0087801740681956	0.9839112179767064	-0.0001165156071081	0.9158321265511782	0.0001165156071081	0.901671085447506	0.0002113782893612	0.9564839990370896	-2.8520437108959054e-06	0.8195640853126258	2.8520437108959054e-06	0.8052894270818866	-0.0020269919812445	0.6715166406063139	0.0020269919812445	0.6586905304353193	PTPRD	368372	DMAC1	2356250	TYRP1	2440810	False	False	False	ref	-50	0.0007324	15	0.003021
4019	chr9	10246014	T	G	rs7032426	-0.0109536058	0.353970547975076	0.0109536058	0.342593889655045	0.0299050447718934	0.0038994316761083	-0.0003208628058905	0.0947247141501008	0.0003208628058905	0.0899796193025119	0.048685152335605	0.9129430948728512	-0.0005715534388615	0.723852394748003	0.0005715534388615	0.7099173327011228	0.0014877498631906	0.6991142062887613	-1.7116123749961115e-05	0.4809046075718527	1.7116123749961115e-05	0.4681385489716931	-0.0068569176028796	0.3210019656905618	0.0068569176028796	0.3122726977262008	PTPRD	366988	DMAC1	2357634	TYRP1	2439426	False	True	False	ref	100	0.002518	100	0.03006
4020	chr9	10251323	G	A	rs1322146	0.00224277608	0.7100411703924886	0.00291889184	0.7198437153665741	0.0172044036792852	0.0479492489530467	4.286692275191433e-05	0.514740308355298	5.2824583254299405e-05	0.5243246507732675	0.0044606271849292	0.9921692441360056	4.997283925958868e-06	0.9740274434831262	8.104362564588846e-06	0.9840511619770932	7.391344766735475e-05	0.985001119663332	9.63001117224012e-08	0.962176042564028	1.420603748221905e-07	0.9714085892858764	0.0001037355159285	0.9532915305054256	0.0001493791429371	0.9624864500648914	PTPRD	361679	DMAC1	2362943	TYRP1	2434117	False	False	False	alt	-30	0.001526	60	0.01883
4021	chr9	22758754	T	C	rs686870	0.002916707552	0.7012225620196784	0.002916707552	0.7149470992827893	0.0063747254493954	0.8883349835469802	1.882535262887959e-05	0.7567878493658662	1.882535262887959e-05	0.7704281089610618	0.0792975030861315	0.8621320643343255	0.000197276942811	0.8297011613446783	0.000197276942811	0.8439951521520689	0.0004991605931515	0.8989953753254628	1.2672405081963828e-06	0.8548778736967972	1.2672405081963828e-06	0.8693398829616812	0.0021888193860931	0.6134691548391468	0.0021888193860931	0.6260722737811301	DMRTA1	311929	CDKN2B	749449	CDKN2A	763453	False	False	False	alt	-80	0.002317	100	0.07294
4022	chr9	26668919	T	C	rs1434479	0.0255147691199999	0.127804071916443	0.0255147691199999	0.1347421205848378	0.0116206558429519	0.2081078101068971	0.0003463016503061	0.0936603296450272	0.0003463016503061	0.0981309160890707	0.1542422639238995	0.7310604819102021	0.0045819827841292	0.2926275224794538	0.0045819827841292	0.3051986559806976	0.0018743376129383	0.6084080022382836	6.410656312120657e-05	0.2345227184859637	6.410656312120657e-05	0.2450772004853918	0.0236537723420366	0.0572019222633671	0.0236537723420366	0.0589022155720107	CAAP1	223884	IFT74	278121	PLAA	278323	False	False	False	alt	100	0.006252	-100	0.074
4023	chr9	26676300	T	C	rs10967473	0.0026346262339999	0.5986310162227853	0.0044516985659999	0.6064065103576328	0.0090256718905103	0.4227801177877395	2.170248568617592e-05	0.5963363937269539	3.9857842514427325e-05	0.6032995447573289	0.240458925922468	0.5945871105421996	0.0006126813196088	0.5970584455935554	0.0010639863029111	0.6041106602831889	0.0021965652160172	0.5748809947152357	5.0826781589178985e-06	0.5917813023733435	9.594744551220633e-06	0.5982913116295185	0.0024149628108174	0.444009358798592	0.0041452712165063	0.4484458882913997	CAAP1	216503	IFT74	270740	PLAA	270942	False	False	False	alt	-100	0.00943	-95	0.01429
4024	chr9	36307780	T	C	rs7865569	0.0420584698	0.0415031419518661	0.0420584698	0.0445369544427222	0.0114902731161625	0.2013181610933712	0.0004839029160025	0.0406140072916262	0.0004839029160025	0.0432671673029986	0.4326455668627268	0.2842513829395933	0.0181843329184644	0.0454031071515288	0.0181843329184644	0.0494965562989379	0.0049754495567117	0.14987268536484	0.0002093077400725	0.0424558888399415	0.0002093077400725	0.0458254999335369	0.0203923277212418	0.0644425658177874	0.0203923277212418	0.066305438874374	GNE	30738	CLTA	116923	CCIN	138391	False	False	False	alt	-65	0.00395	55	0.05927
4025	chr9	36351697	G	A	rs10972866	-0.0718019792	0.0072448825462148	0.0718019792	0.0068775203276868	0.020008435612512	0.0261036795390323	-0.0014514470899276	0.0065047118811661	0.0014514470899276	0.0062654077218016	0.2291828753410305	0.6107136183124053	-0.0165766586680864	0.0647890804127317	0.0165766586680864	0.0599102312882264	0.0047367681677115	0.1675214195520677	-0.0003455478173679	0.0246066141744115	0.0003455478173679	0.0229539575597279	-0.0676231081235282	0.0011333018145122	0.0676231081235282	0.0011015723374201	GNE	74655	RNF38	135851	CLTA	160840	False	True	True	ref	-50	0.00457	-85	0.02551
4026	chr9	36399023	T	C	rs4144593	0.0232470222	0.1425902791489763	0.0232470222	0.1504680159420685	0.0075304262335544	0.6845436128869273	0.0001779437147813	0.1907888350978905	0.0001779437147813	0.1991203125402162	0.2020498137947489	0.6533599106738295	0.0047536084554931	0.2425786451058723	0.0047536084554931	0.2537324879543082	0.0015575577131895	0.6917502848915885	3.730202717005317e-05	0.2806666151641951	3.730202717005317e-05	0.2915873300704994	0.0218632973371092	0.056955025507952	0.0218632973371092	0.0585202725960223	RNF38	88525	GNE	121981	MELK	173840	False	False	False	alt	-5	0.0001602	-100	0.00502
4027	chr9	36409392	T	C	rs10814385	-0.0436514375999999	0.0439051800456644	0.0436514375999999	0.0415194885533435	0.0158599479903113	0.0671608356336337	-0.0007317579971215	0.0261793427918042	0.0007317579971215	0.024839777186579	0.2259069077480056	0.6103684505440077	-0.0093118812664606	0.1389465803192389	0.0093118812664606	0.130956699805994	0.0034282382023651	0.3346864121776116	-0.0001475514792127	0.0795737604015368	0.0001475514792127	0.0745345613585318	-0.0407493853670681	0.0116721833350742	0.0407493853670681	0.0115176178393754	RNF38	78156	GNE	132350	MELK	163471	False	False	False	ref	-85	0.002472	-85	0.03473
4028	chr9	36415389	T	C	rs2483657	-0.0011960384	0.8121589609778853	0.0020529074	0.802998315024726	0.0211472092231271	0.0209709150753889	-2.771884089620333e-05	0.5782964258651094	4.3114858914782594e-05	0.5698979379565423	0.4229483708337224	0.2964243809742946	-0.0004659953574544	0.6288158717853883	0.0008656346789441	0.6197826485306771	0.0089785381014448	0.0193960323841996	-1.1060557938687653e-05	0.4378794606706265	1.8241181909012275e-05	0.429644224751204	-0.0006141142542972	0.8257257241287039	0.0009253208020829	0.8167634655373697	RNF38	72159	GNE	138347	MELK	157474	False	False	False	ref	95	0.001312	-75	0.044
4029	chr9	36422433	A	C	rs4446808	0.00025673983	0.803775052946987	0.00229300605	0.7982689838608292	0.0253938044750933	0.0092456991537782	-1.5694090110424102e-06	0.5441677973571939	5.3387698815922415e-05	0.5400791805086733	0.0739406010435792	0.8657048759102863	4.7470947998945645e-05	0.8823216098011655	0.0001708731458345	0.8759184202162171	0.0018358524843838	0.6341873880237727	5.706412767640592e-07	0.7679527001447647	3.866748969394028e-06	0.7619290234053855	4.5643627008620056e-05	0.7142065013077522	0.0016141246278487	0.7090701958377061	RNF38	65115	GNE	145391	MELK	150430	False	True	True	alt	-95	0.01823	90	0.02417
4030	chr9	36435008	C	T	rs6476556	0.0196163531399999	0.1787017077931368	0.0196163531399999	0.1873943895929959	0.0113860004128094	0.2255375143456968	0.0002582402383282	0.1352649144802556	0.0002582402383282	0.1415392172669931	0.3988734322970155	0.3306762541805027	0.0083119983646912	0.1552630714564897	0.0083119983646912	0.1644841172356138	0.0046648615366533	0.1713181578818822	0.0001110073706607	0.123585134204205	0.0001110073706607	0.130460036509537	0.0099959543148787	0.2007227419787885	0.0099959543148787	0.2066189374657416	RNF38	52540	MELK	137855	GNE	157966	False	False	False	alt	95	0.006214	80	0.049
4031	chr9	36442935	G	C	rs7856743	0.01282482422	0.3073030656844985	0.01282482422	0.3183955621273517	0.0089564864264008	0.4350870968327547	0.0001270216154431	0.3112724625807305	0.0001270216154431	0.3215295391175463	0.4010912976275687	0.3354997352121079	0.0053029454375271	0.2440443444516554	0.0053029454375271	0.2552894728626242	0.0036331430632371	0.3130338491426566	5.321313262543304e-05	0.2470771479051854	5.321313262543304e-05	0.2575952848785799	0.0066701936742081	0.3069448147484354	0.0066701936742081	0.315684794926899	RNF38	44613	MELK	129928	GNE	165893	False	False	False	alt	-95	0.00907	-80	0.05432
4032	chr9	80492272	A	G	rs11138693	-0.0019589717999999	0.6583138001746734	0.0042005683599999	0.651656125668095	0.0086775272414924	0.4698110767398282	-1.706931846363253e-05	0.65386185424607	3.757600462725895e-05	0.647565844466881	0.4230438075083766	0.2905212471161527	-0.0010346555762681	0.5012224576474799	0.0017862725664946	0.4943425707430344	0.0036646178171825	0.3105649425546823	-9.078717601577309e-06	0.504466359116084	1.5954697817833665e-05	0.4978506129781183	-0.0007137003495886	0.6855537185392284	0.001883836969263	0.6794540982668926	TLE4	920498	TLE1	1197275	SPATA31D4	1436157	False	False	False	ref	5	0.000511	95	0.03235
4033	chr9	80492929	C	T	rs10867555	0.00223349658	0.7449041494108195	0.00262127574	0.7524642816162953	0.019197924796114	0.0324597406786771	4.272087589696111e-05	0.5373091596731083	5.090983331951706e-05	0.544686984018235	0.1753960103320573	0.6893627711337926	0.0003749927277258	0.7347388833450845	0.0004629881329965	0.741905902517492	0.0035553569274081	0.2852889491684763	7.567672916230146e-06	0.5872856517029075	9.425922935612206e-06	0.5945430489080663	0.0021058309733503	0.5931254516757123	0.0025207730370646	0.6005935298250792	TLE4	921155	TLE1	1196618	SPATA31D4	1435500	False	False	False	alt	-100	0.003336	90	0.02826
4034	chr9	80505747	C	T	rs11138702	-0.0492689734	0.0318335113993355	0.0492689734	0.0298935828421818	0.013887008124367	0.1128771644286419	-0.0007678355398304	0.0300250134411367	0.0007678355398304	0.0285544574231919	0.0795443936140416	0.8586806406928053	-0.0038881037059927	0.3213022874934873	0.0038881037059927	0.3092454466105122	0.0009954593333731	0.7990947065199492	-5.414664636655538e-05	0.2445879526645317	5.414664636655538e-05	0.2344436328490308	-0.0322990902395252	0.0240948526701053	0.0322990902395252	0.0234098605964654	TLE4	933973	TLE1	1183800	SPATA31D4	1422682	False	False	False	ref	100	0.007336	-90	0.02534
4035	chr9	80564618	C	A	rs145585805	-0.0244545997999999	0.1522705475598194	0.0244545997999999	0.1446218250925752	0.01206860234687	0.1643280094953418	-0.0002989149958713	0.1082461872692572	0.0002989149958713	0.1026813004009387	0.502521810392224	0.1657113175863704	-0.0125357701149717	0.1024024436728868	0.0125357701149717	0.0954174679623623	0.0060934047577256	0.0777072384086135	-0.0001539634062034	0.0798096078914845	0.0001539634062034	0.0745624418821941	-0.007184721833214	0.2735026401281261	0.007184721833214	0.2655169667458845	TLE4	992844	TLE1	1124929	SPATA31D4	1363811	False	False	False	ref	-100	0.00989	-100	0.0606
4036	chr9	82145230	A	G	rs7853639	0.0040971746559999	0.6368191346496622	0.0042059811439999	0.647205359623256	0.0091658967699091	0.3989965884925852	3.913078055831315e-05	0.6225520837811109	4.01619930257419e-05	0.6324963742211536	0.3178808908806108	0.4667995222556372	0.0013063193524003	0.559449977273715	0.0013425836663086	0.570315632513385	0.0029264752549016	0.4361591112251828	1.257669027870703e-05	0.5503493633353188	1.2920384978507016e-05	0.5607909355562153	0.0028278301642132	0.5496827790766438	0.0029398645214161	0.5590122007872762	SPATA31D1	156457	SPATA31D3	201729	SPATA31D4	216801	False	False	False	alt	-100	0.007317	45	0.01547
4037	chr9	82148110	C	T	rs11139500	-0.0119718473	0.3176709831568957	0.0119718473	0.3065658529891872	0.0074395577202419	0.6821639845899742	-9.166893424927524e-05	0.379177539854826	9.166893424927524e-05	0.3683504650424903	0.1375636676729011	0.7633796685887351	-0.0018223270125239	0.5086354804762518	0.0018223270125239	0.4953854339478829	0.0011007104621977	0.7839145359854026	-1.4736555634276015e-05	0.5381128299128283	1.4736555634276015e-05	0.5252225887051456	-0.010871482069316	0.19378465051387	0.010871482069316	0.1878595143874665	SPATA31D1	159337	SPATA31D3	204609	SPATA31D4	219681	False	False	False	ref	-100	0.002884	-100	0.02985
4038	chr9	82151895	A	G	rs1409880	-0.00144064724	0.8375640216933201	0.00187223108	0.8297909538888005	0.0084005251216689	0.517493115221718	-1.3917462212891077e-05	0.8241553910847402	1.7331936650602017e-05	0.8165131266170793	0.2620753327316673	0.5556888550963874	-0.0004536828925167	0.7467676917451568	0.0005466221196476	0.7387701167992436	0.0022843986911336	0.5510137771546939	-4.480955428364452e-06	0.7428257261499421	5.216243915303542e-06	0.734848033071022	-0.0010166080561001	0.754765715217259	0.0013983547547173	0.7473497618193892	SPATA31D1	163122	SPATA31D3	208394	SPATA31D4	223466	False	False	False	ref	-65	0.0169	55	0.01984
4039	chr9	82173221	C	A	rs2788116	-0.0197355764	0.187862970149482	0.0197355764	0.1791276060796631	0.0082578268482681	0.5461420620441239	-0.0001651217043943	0.2174398509333435	0.0001651217043943	0.2089492242574969	0.2051888505067479	0.6443917179592025	-0.0040303086417285	0.300365131849988	0.0040303086417285	0.2887385981688023	0.0017089581452308	0.6610171842203093	-3.4087908592647857e-05	0.3182777156205738	3.4087908592647857e-05	0.3071625769226626	-0.01802715795807	0.082995750290271	0.01802715795807	0.0807132366321943	SPATA31D1	184448	SPATA31D3	229720	SPATA31D4	244792	False	False	False	ref	90	0.01794	90	0.07587
4040	chr9	82176422	C	T	rs2767717	-0.0332213308	0.0835216081802122	0.0332213308	0.0784362845816579	0.0078926362545446	0.5820655918803169	-0.000265098401912	0.1198609239682945	0.000265098401912	0.1139087026799308	0.1446010850734965	0.7463203382302457	-0.004795779256084	0.2635787094238719	0.004795779256084	0.252460403803482	0.0011732882410317	0.7559617203423887	-3.939160991317405e-05	0.2881822259702642	3.939160991317405e-05	0.2773400547404827	-0.0296704322658948	0.0258157936501916	0.0296704322658948	0.0251398569130088	SPATA31D1	187649	SPATA31D3	232921	SPATA31D4	247993	False	False	False	ref	-85	0.001583	-100	0.01444
4041	chr9	82178446	C	T	rs2767715	-0.000420689072	0.9032978440316862	0.001041984048	0.901931546489656	0.0127438392775821	0.1415678877365465	-4.924260077846169e-06	0.8457718759533653	1.3805895304029064e-05	0.8435539077602738	0.0127615431695348	0.9800237222917514	5.9442874407860815e-06	0.9812313166290358	1.0646263973181898e-05	0.9854965050521542	0.0001708116909877	0.9695037170455189	9.210884672620597e-08	0.9769079937575568	1.4839584883665645e-07	0.9792683431030004	9.128725401717422e-05	0.9525202228881594	0.0002074710318571	0.954331022607622	SPATA31D1	189673	SPATA31D3	234945	SPATA31D4	250017	False	False	False	ref	100	0.002598	-55	0.01732
4042	chr9	82184622	A	C	rs2767713	0.0075477459999999	0.4354829834514792	0.0075477459999999	0.4479142288248021	0.0079955719950595	0.5714145270535688	6.301946433101511e-05	0.46584037818932	6.301946433101511e-05	0.4777803006680263	0.2645566862726791	0.5547737493749891	0.0020719190625385	0.4377681579509436	0.0020719190625385	0.4508953978476196	0.0021782311446958	0.5740714743211224	1.7714559573499218e-05	0.4547940913672241	1.7714559573499218e-05	0.4675621659340416	0.006176412618388	0.3011110153174464	0.006176412618388	0.3100383130679764	SPATA31D1	195849	SPATA31D3	241121	SPATA31D4	256193	False	False	False	alt	-40	0.006554	85	0.07355
4043	chr9	82336311	T	C	rs1933580	0.00199519998	0.7300894638781845	0.00269246038	0.7392030809884415	0.0071147504871712	0.7686618402000592	1.436646238023926e-05	0.7660099033292771	1.926162124627021e-05	0.7749270565308931	0.0643118704550876	0.8830461775243296	0.000128632172196	0.8435227434293789	0.0001736869446536	0.8526592492981397	0.0004590744820045	0.902412517133418	9.29961552247459e-07	0.8605992673053899	1.2462713124784448e-06	0.8697473239118505	0.0014398489610887	0.6557182958642954	0.0019128829137231	0.6640834424674849	SPATA31D1	347538	SPATA31D3	392810	SPATA31D4	407882	False	False	False	alt	-100	0.004368	-100	0.0008545
4044	chr9	82344732	A	G	rs1330834	0.0004030334587999	0.8165787228404162	0.0020762321411999	0.8125483071156776	0.0103131712567829	0.2823873656766856	4.743594157205575e-06	0.780349509501822	2.237508397844786e-05	0.776370618111812	0.0632911129783503	0.8837702710379511	7.20954957485387e-05	0.8966193953458045	0.0001624855871824	0.8910253127528173	0.0006425920783812	0.866409678832408	8.256969093104091e-07	0.8831145897569923	1.740195509441808e-06	0.8772690567768823	0.0003568501747943	0.7326154986613739	0.0015809292627516	0.7285518825720558	SPATA31D1	355959	SPATA31D3	401231	SPATA31D4	416303	False	False	False	alt	-40	0.002197	100	0.03143
4045	chr9	82365229	T	C	rs4877231	0.0227364197999999	0.1500502235316011	0.0227364197999999	0.1581011847988928	0.0067903256143446	0.8247970629717858	0.0001555885810724	0.2193092673013368	0.0001555885810724	0.228127253479598	0.1845890517536488	0.680630268219953	0.0044760788224169	0.2712649135295735	0.0044760788224169	0.2828848535876186	0.0012676885107507	0.7504766578134408	3.0988963385991704e-05	0.3329359900213457	3.0988963385991704e-05	0.34439833619095	0.0210022925549019	0.0639244929483145	0.0210022925549019	0.0656643856018707	SPATA31D1	376456	SPATA31D3	421728	SPATA31D4	436800	False	False	False	alt	-100	0.000702	70	0.068
4046	chr9	82379894	A	T	rs7848263	0.00303606468	0.6865738908487241	0.00361593656	0.6898410367376807	0.0067967485718891	0.8221758170824557	2.091053942177965e-05	0.7486036267879413	2.477887518516794e-05	0.751189343868898	0.1063600244815817	0.8168865834816935	0.0004251331668108	0.7790988869646338	0.0004768490172909	0.7815284649625381	0.0007192834905282	0.8570019225911323	2.9246848679450702e-06	0.8133373239918366	3.26564383107855e-06	0.8153260500866572	0.0027842612475233	0.5472772472513439	0.0033402836129005	0.5507244477037468	SPATA31D1	391121	SPATA31D3	436393	SPATA31D4	451465	False	False	False	alt	-50	0.00066	40	0.02698
4047	chr9	82380322	A	C	rs7020546	-0.0176582097999999	0.2194267138141123	0.0176582097999999	0.2100745761428854	0.0096464435344803	0.3446081097668408	-0.0001755046772916	0.2137401240204002	0.0001755046772916	0.2053157105835638	0.1278477992510295	0.780359517152249	-0.0024309704404643	0.4326694336146934	0.0024309704404643	0.4199348637466836	0.0012712354121555	0.750341243420614	-2.469375176905828e-05	0.4112349208478483	2.469375176905828e-05	0.3991675717500446	-0.0158362638616582	0.1051516398370357	0.0158362638616582	0.1021632007941476	SPATA31D1	391549	SPATA31D3	436821	SPATA31D4	451893	False	False	False	ref	75	0.006416	80	0.01073
4048	chr9	82400432	G	A	rs80020015	-0.0003047975019999	0.8658057596599863	0.0012348204179999	0.8663639069923083	0.0174380239478645	0.0467364034264011	-6.340736448453319e-06	0.7423600292655517	2.035908517490141e-05	0.7420221148603993	0.1776885652340791	0.6941499479390457	-4.241938847069072e-05	0.8266335173705609	0.0002231205213051	0.8269787492623882	0.0030928924828035	0.3934819920772979	-9.95961662578374e-07	0.7391946668876875	3.686704380615715e-06	0.7388830717644056	-0.0004273903256258	0.7490530055266438	0.0013070675007001	0.749036973400568	SPATA31D1	411659	SPATA31D3	456931	SPATA31D4	472003	False	False	False	ref	55	0.02174	50	0.0364
4049	chr9	82404112	G	A	rs10113923	-0.0489882984	0.0302136868328548	0.0489882984	0.0283526540988675	0.0120227400675963	0.1788478161535385	-0.0006051927826928	0.0316938689815001	0.0006051927826928	0.0299777350493448	0.1465056691459454	0.7341149763640493	-0.0076922920881531	0.1827508349452008	0.0076922920881531	0.1731569406391779	0.0019011585319178	0.5881690235928941	-0.0001017232993014	0.1384554467532857	0.0001017232993014	0.131179407736723	-0.0445834500357886	0.0074368735716442	0.0445834500357886	0.007327593828665	SPATA31D1	415339	SPATA31D3	460611	SPATA31D4	475683	False	False	False	ref	-5	0.0001221	40	0.002686
4050	chr9	93426142	G	A	rs10116211	-0.054168464	0.0218738892799834	0.054168464	0.0205054309841115	0.012690784475306	0.1449166666815417	-0.0006751259015096	0.0246337462869943	0.0006751259015096	0.0232547776424357	0.1954543096920092	0.6627729247388502	-0.0106908966030239	0.1209586616219538	0.0106908966030239	0.1134301915315298	0.0024643098878332	0.4895636181767612	-0.0001324642745004	0.0894339018557915	0.0001324642745004	0.0839748944833869	-0.0526706708575814	0.0037156366432902	0.0526706708575814	0.0036166477757715	FAM120A	25544	FAM120AOS	27439	PHF2	150443	False	False	False	ref	15	0.000763	-25	0.01541
4051	chr9	93435814	T	C	rs6479482	-0.00174334298	0.7358972244664967	0.00296594434	0.7284209392037476	0.0159412441499252	0.0657963391994193	-3.1961719021509346e-05	0.5582188813267677	4.664918376089171e-05	0.5507482305756174	0.5228062531769002	0.1397730173864286	-0.0009473836721508	0.5091274328059157	0.0015524127413628	0.5016764300318142	0.0083622621013539	0.025374871269103	-1.7231301998128556e-05	0.3762618587742451	2.449969176765144e-05	0.3693022908923515	-0.0004709592423157	0.8462378249156202	0.0008070623139243	0.83902674203899	FAM120A	15872	FAM120AOS	17767	PHF2	140771	False	False	False	ref	95	0.002914	-95	0.03473
4052	chr9	93457832	C	T	rs12344021	-0.0110619712	0.3427193578222842	0.0110619712	0.3313931733341331	0.0178551924570246	0.043187149599798	-0.0001951966038902	0.1834501702459719	0.0001951966038902	0.1756139579296527	0.146536789800724	0.7454980660236539	-0.0016127946376187	0.5088879898906952	0.0016127946376187	0.4954906494936227	0.0025815942575659	0.4937734605895881	-2.811732853131552e-05	0.3519179436903173	2.811732853131552e-05	0.34048223121327	-0.0107304017676531	0.1889257184452316	0.0107304017676531	0.1830964404268132	FAM120AOS	4251	FAM120A	6146	PHF2	118753	False	False	False	ref	-60	0.0377	-50	0.0163
4053	chr9	93462293	T	A	rs12336645	-0.0110820075	0.3292848034400975	0.0110820075	0.3181886329377348	0.0214255356744889	0.0193805180535746	-0.0002377268076695	0.1411207267572489	0.0002377268076695	0.1343511747735992	0.1816761584663741	0.6851156551485149	-0.0019856606302885	0.4523256313127515	0.0019856606302885	0.4391511187941181	0.003907152250198	0.2563859736175701	-4.277179803388946e-05	0.2606853868429716	4.277179803388946e-05	0.2504279942806056	-0.0105312295770702	0.1813554585050437	0.0105312295770702	0.1757002323926217	FAM120AOS	8712	FAM120A	10607	PHF2	114292	False	True	False	ref	35	0.00219	-85	0.03888
4054	chr9	93463196	A	T	rs7023933	-0.0008929897499999	0.8680615891894023	0.00149091097	0.8648764532971979	0.0155893754856031	0.0716045362284491	-1.1141288002056047e-05	0.7660960249749873	2.188786418945765e-05	0.7629611622227991	0.1894874428157968	0.6731523387401454	-0.0001330979069785	0.8213370282636069	0.0002726271176612	0.8180616172953923	0.002984585577172	0.4131852775780102	-1.5683231987543544e-06	0.743321670743802	4.051961808091396e-06	0.7404299416838099	-0.0006473096193943	0.7613356916214465	0.001302918080063	0.7579823425109691	FAM120AOS	9615	FAM120A	11510	PHF2	113389	False	False	False	ref	10	0.001038	-65	0.03925
4055	chr9	93485602	A	G	rs10125504	0.00186260485	0.8145938804440037	0.00186260485	0.8283667175828601	0.0201208206318481	0.0259209214419389	3.60274098431324e-05	0.6246419969605655	3.60274098431324e-05	0.6376428792840437	0.1025487816263653	0.8174618949862216	0.0002032937558358	0.8381887910825048	0.0002032937558358	0.8524916630666591	0.0020544804854733	0.5964580304887734	3.903897212888602e-06	0.7374764831808902	3.903897212888602e-06	0.7517565208958852	0.001535285635743	0.7062506845474857	0.001535285635743	0.719512084041511	FAM120AOS	32021	FAM120A	33916	PHF2	90983	False	False	False	alt	-100	0.0175	100	0.0946
4056	chr9	93507955	G	C	rs12554020	0.0423148662	0.0416770579466877	0.0423148662	0.044489695880563	0.0117380072244711	0.2042447551993315	0.0005437326546914	0.0416840534013988	0.0005437326546914	0.0442046128879451	0.3576613865289059	0.4053452493141062	0.0152506340382992	0.0639714351386781	0.0152506340382992	0.0693834130464946	0.0042669135988469	0.2146982913546571	0.0001984932956544	0.0545113367259294	0.0001984932956544	0.0586174569186592	0.0296289380595234	0.0289335335028534	0.0296289380595234	0.0296945548962026	FAM120AOS	54374	FAM120A	56269	PHF2	68630	False	False	False	alt	-100	0.001583	-75	0.05853
4057	chr9	93541696	A	G	rs28464341	-0.001213551848	0.8566758120342987	0.001574177272	0.8531240539195276	0.0263798656056999	0.0073328060313543	-2.80839962537134e-05	0.6431170674187368	3.907695326349267e-05	0.6391093240343255	0.241471384557931	0.5855958507158027	-0.0002006549156467	0.81760925146487	0.0002990100320036	0.8143701987676484	0.0064481211055578	0.0636976501931709	-4.573144811846452e-06	0.6491658528152378	7.573113481144063e-06	0.645775266880044	-0.0010746999450201	0.7551012179107938	0.001419101857903	0.7513624204354017	PHF2	34889	FAM120AOS	88115	FAM120A	90010	False	True	True	ref	70	0.00573	90	0.03029
4058	chr9	98302833	T	G	rs7869257	0.01071659736	0.3465847170076723	0.01071659736	0.3582969902930003	0.0079534493570707	0.6037841492230348	8.419031654787722e-05	0.3901145341260758	8.419031654787722e-05	0.401208565926674	0.4634238944387389	0.2340271569020608	0.0050205973600506	0.2477460600397199	0.0050205973600506	0.2589700430145082	0.0036786220433512	0.3068149322997511	3.9389273812910034e-05	0.2771457111228401	3.9389273812910034e-05	0.2881493139698954	0.004238633180842	0.433963140314352	0.004238633180842	0.4448320908074774	TBC1D2	47184	CORO2A	110196	TRIM14	183611	False	False	False	alt	10	0.0008116	-70	0.0876
4059	chr9	98307051	C	T	rs7867834	-0.0441435632	0.0416027116329446	0.0441435632	0.0388688382868052	0.012086856590857	0.1619189316176631	-0.0005352434719938	0.0378780939043675	0.0005352434719938	0.0355788066402218	0.4796833992053859	0.2057519205253992	-0.0212087774037848	0.0392051381955013	0.0212087774037848	0.0361075957009797	0.0058269238785999	0.0892886669306492	-0.0002584370451358	0.0358162667214781	0.0002584370451358	0.0332481630568207	-0.0166371020446269	0.1010384818754448	0.0166371020446269	0.0982379045821164	TBC1D2	51402	CORO2A	114414	TRIM14	187829	False	False	False	ref	70	0.004135	-70	0.04364
4060	chr9	98308808	T	C	rs10985817	0.0052623556786	0.5296783930269405	0.0052716772134	0.5430096999619402	0.0151027920976097	0.0774818926228119	8.209256607739713e-05	0.3792962972959334	8.222787595191933e-05	0.3908397028824907	0.342157076318219	0.4268005569160834	0.0018450743377009	0.4792815933275848	0.0018474845209718	0.4923639821039143	0.0051183386737693	0.1276606447624846	2.822792460263928e-05	0.3620182630488957	2.826291042845143e-05	0.3736494391791034	0.0035705764582619	0.4833237922781177	0.0035747258788991	0.4935344976087792	TBC1D2	53159	CORO2A	116171	TRIM14	189586	False	False	False	alt	-25	0.00165	-25	0.02704
4061	chr9	98309453	G	A	rs3780444	-0.00153303874	0.6624395033376754	0.0037292122999999	0.6585562285448362	0.007968057814445	0.5773350864916258	-1.295751456407604e-05	0.683533842442774	2.941084223970449e-05	0.6796665104301696	0.17423002313302	0.6899755679054091	-0.0004047779895118	0.7231619893905831	0.0005573187581165	0.7181738681632991	0.0013944276566639	0.7080435340767923	-3.236470502458715e-06	0.7352678944251596	4.395550634547703e-06	0.7303663287945823	-0.0018589404454402	0.5251834350442082	0.0032904905652548	0.5211594811466519	TBC1D2	53804	CORO2A	116816	TRIM14	190231	False	False	False	ref	-20	0.001053	20	0.0313
4062	chr9	112194636	A	C	rs10817282	0.004997633206	0.5816502014341456	0.004997633206	0.5946265442883277	0.015297271361451	0.0764196251477223	7.094466084742632e-05	0.4466420140544296	7.094466084742632e-05	0.4583882533228821	0.3350553428977479	0.4432333887525041	0.0017027396576263	0.4996949627176442	0.0017027396576263	0.5131541354810704	0.0051138779981374	0.1336262739516017	2.424043685267184e-05	0.3943972695038887	2.424043685267184e-05	0.4065173893095107	0.0034751397836076	0.4956464398815071	0.0034751397836076	0.5072043330815518	SUSD1	19339	PTBP3	139028	HSDL2	185445	False	False	False	alt	-45	0.000965	95	0.01886
4063	chr9	112195177	A	G	rs1887518	0.0682607278	0.008801026405082	0.0682607278	0.0093101446672147	0.0144487856028283	0.0894810944182726	0.0010179215687698	0.0116868570866313	0.0010179215687698	0.0123280672134385	0.4027095716760547	0.3238917496826487	0.0281294243869035	0.0177394055386852	0.0281294243869035	0.0192953903008087	0.0058161364385665	0.0931354658453456	0.0004187037258015	0.0159759044548579	0.0004187037258015	0.0171644595293898	0.0374609695121318	0.0114606392110228	0.0374609695121318	0.0118042951932184	SUSD1	19880	PTBP3	138487	HSDL2	184904	False	True	True	alt	-95	0.002678	45	0.013916
4064	chr9	112204377	T	C	rs10114558	0.0426593884	0.0418446283493186	0.0426593884	0.0448597658540746	0.0082881327068709	0.520486728932196	0.0003717623165936	0.0740870417939622	0.0003717623165936	0.0785129430188039	0.2452909262544217	0.5845888798241362	0.0110457975107871	0.1098625869853195	0.0110457975107871	0.1177749981440632	0.002099747628389	0.5911051090251315	9.831477305958907e-05	0.1313402064913928	9.831477305958907e-05	0.1392130030151951	0.0375584808971046	0.0112099181677083	0.0375584808971046	0.0115349965263855	SUSD1	29080	PTBP3	129287	HSDL2	175704	False	False	False	alt	30	0.001152	-20	0.004715
4065	chr9	112207436	A	G	rs7861162	-0.006785051956	0.5332446509587673	0.007124377116	0.5232752644495792	0.0077748889437091	0.6334894788092708	-5.6948268945534704e-05	0.5732073747597923	5.918611122106112e-05	0.5639777089619022	0.2052407182647123	0.6509928869373843	-0.0016190675935467	0.5747802759964082	0.0016816392404454	0.5648159676576713	0.0016120044593481	0.684865396049389	-1.3671913533427902e-05	0.5983671217503158	1.4084572215465657e-05	0.5887995293981226	-0.005885953173788	0.3706840913773069	0.0062718492930423	0.364022018600186	SUSD1	32139	PTBP3	126228	HSDL2	172645	False	False	False	ref	25	0.0108	60	0.0338
4066	chr9	112207709	G	C	rs7861788	0.00974214786	0.3656279472923726	0.00974214786	0.3773392732537385	0.0080872581702062	0.5667094554399388	8.024406182865286e-05	0.3991828782909516	8.024406182865286e-05	0.4104284108687652	0.2098465751719416	0.6432324590021343	0.002147901909151	0.4376165818970332	0.002147901909151	0.4506735888222973	0.0017053821625853	0.6667983537906392	1.773200560359298e-05	0.456297970524293	1.773200560359298e-05	0.4689791913963764	0.0087034097864085	0.2188705167473654	0.0087034097864085	0.225779083841105	SUSD1	32412	PTBP3	125955	HSDL2	172372	False	False	False	alt	-25	0.00789	-80	0.03278
4067	chr9	112220269	C	T	rs7869523	-0.004580077872	0.6152561359665598	0.004580077872	0.6018662743220861	0.0079936448005318	0.5853314084735556	-3.696880604414932e-05	0.6336965549898935	3.696880604414932e-05	0.6206622694092375	0.2419547920621582	0.5902142281481523	-0.0010767104630909	0.6050512664097036	0.0010767104630909	0.5908773322041325	0.001965890729301	0.6148134886053344	-8.911938000736015e-06	0.6168258885756861	8.911938000736015e-06	0.6030156808762376	-0.0039212025021005	0.4711221577416186	0.0039212025021005	0.4603042088583541	SUSD1	44972	PTBP3	113395	HSDL2	159812	False	False	False	ref	5	0.001549	-100	0.06085
4068	chr9	112225574	A	C	rs7871559	-0.0033952303	0.7013792975728396	0.0033952303	0.687744231691591	0.0236165005530128	0.0125996935933265	-8.299837558612829e-05	0.4100506140610714	8.299837558612829e-05	0.3985476501134757	0.0848266060851253	0.8470730610197418	-0.0002621342924349	0.8268266250597981	0.0002621342924349	0.8125930904542028	0.0019660432426277	0.6130903175896196	-6.321998029860869e-06	0.6725065975221374	6.321998029860869e-06	0.6585699685241869	-0.0025892384775775	0.5923596644297002	0.0025892384775775	0.5799580288242024	SUSD1	50277	PTBP3	108090	HSDL2	154507	False	True	False	ref	-100	0.002586	-75	0.02132
4069	chr9	112226051	A	T	rs3780514	-0.00572536222	0.5312710530943726	0.00572536222	0.5185617034495418	0.0279188904520955	0.0061517889024763	-0.0001629963476219	0.2162281709074979	0.0001629963476219	0.2077266547651808	0.1552298260355397	0.7297983573472142	-0.0009127203706216	0.620976551257756	0.0009127203706216	0.6070442732410362	0.0043908184281453	0.1933250496042778	-2.6289282123172133e-05	0.3654220843541533	2.6289282123172133e-05	0.3536127095820522	-0.0056120914117365	0.3507725983172918	0.0056120914117365	0.3415537894663905	SUSD1	50754	PTBP3	107613	HSDL2	154030	False	True	True	ref	-80	0.013336	-100	0.05353
4070	chr9	112228093	A	G	rs3736985	-0.0001242416387999	0.8912352822997203	0.0009270284651999	0.8921284709519866	0.028007935888463	0.0055075836334713	-2.187352579571313e-06	0.6797766824265998	2.7415386540839505e-05	0.679840147525619	0.1982427203601696	0.6563479398658474	3.5155551670380423e-06	0.8393587328429069	0.0002153993733297	0.8398174709181147	0.0056694031629073	0.1029959088636254	4.914674224015485e-07	0.6755365929721938	6.449426836466454e-06	0.6753698733684763	-0.00027593647237	0.7988890419789113	0.0009979356632329	0.7994049396294045	SUSD1	52796	PTBP3	105571	HSDL2	151988	False	True	True	ref	-90	0.00312	-35	0.01077
4071	chr9	112228592	C	T	rs7026917	0.0018135036279	0.8342794876772383	0.0018860844121	0.8432399497026879	0.0079136965356794	0.6104501952805704	1.393085302485992e-05	0.8470663071561241	1.4481727925281147e-05	0.855861303194072	0.1576012199296673	0.722508473055996	0.0002565904223596	0.8506217473863281	0.0002671764224438	0.8579439296052432	0.001266802222083	0.7401551380120427	1.999679897726272e-06	0.8582239492606448	2.0800333287571888e-06	0.8657083352268033	0.0014585213539559	0.7291466634801038	0.0015041649809644	0.7377970085637382	SUSD1	53295	PTBP3	105072	HSDL2	151489	False	False	False	alt	-35	0.002153	-75	0.02223
4072	chr9	112240034	C	A	rs7021564	0.0045878888	0.5916266857586229	0.0045878888	0.6046014635902691	0.0093116668799755	0.3903056952582278	4.2942193305487865e-05	0.5850989164559875	4.2942193305487865e-05	0.5978001691389789	0.2052365688440751	0.6482185188205061	0.0010463698746431	0.5972213986719112	0.0010463698746431	0.610846726485389	0.0018726748013164	0.6340242544133922	9.606806786481165e-06	0.5932475997602706	9.606806786481165e-06	0.6065560143634581	0.0044129088476021	0.4240824908166017	0.0044129088476021	0.4348763680324285	SUSD1	64737	PTBP3	93630	HSDL2	140047	False	False	False	alt	-100	0.0595	-100	0.1548
4073	chr9	112248027	C	A	rs7033486	-0.0049646232599999	0.5787708929267147	0.0049646232599999	0.5658310200226339	0.0067163277128699	0.7941427743921762	-3.372655274302407e-05	0.6455044368127574	3.372655274302407e-05	0.6325032787897229	0.0245500471996596	0.95767961869664	-0.0001123960152668	0.9122111514272936	0.0001123960152668	0.898032068154944	0.000157925698821	0.9669033587421632	-7.384150701953498e-07	0.927992629372668	7.384150701953498e-07	0.9137750332640332	-0.0017116360128216	0.7097107171764268	0.0017116360128216	0.6967398796769649	SUSD1	72730	PTBP3	85637	HSDL2	132054	False	False	False	ref	0	0.0	100	0.0652
4074	chr9	112253684	T	A	rs11792718	-0.0165636534	0.2369234095896021	0.0165636534	0.2274954990599896	0.0130568775974891	0.1320669388584696	-0.0002432964532611	0.1626913637940431	0.0002432964532611	0.1558665073736891	0.1859044180956233	0.6818200452705466	-0.0033704734630179	0.3625032419534503	0.0033704734630179	0.3499524267971906	0.0025303795143581	0.4877160292735643	-5.1863666092324846e-05	0.2775398780982867	5.1863666092324846e-05	0.2671605352966666	-0.0158839821989854	0.1053240052091192	0.0158839821989854	0.1022427500184437	SUSD1	78387	PTBP3	79980	HSDL2	126397	False	False	False	ref	60	0.002232	90	0.04782
4075	chr9	112254581	T	C	rs6477903	0.00067876556	0.6765534676628204	0.00330204036	0.6783724968563685	0.0129120056480595	0.1332571332990196	5.552436878129719e-06	0.5749075867939081	4.098299977402366e-05	0.5761241840718746	0.0642620774074419	0.883202522541889	4.654854371474151e-05	0.8297741211377688	0.00020943943156	0.8304834083550084	0.0008367045478729	0.8272270324031318	4.094553818805185e-07	0.783927492218886	2.611821026131647e-06	0.7845863334830332	0.0007759416591458	0.58365767045704	0.0025477442712061	0.5847105811613048	PTBP3	79083	SUSD1	79284	HSDL2	125500	False	False	False	alt	100	0.001441	75	0.02008
4076	chr9	112257991	G	A	rs4979090	-0.00307178116	0.7434142182303011	0.00307178116	0.7298172449045786	0.0172177036041446	0.0500440163597521	-5.393634597500247e-05	0.54765542947459	5.393634597500247e-05	0.535282065225331	0.0772684363945683	0.8601522701111508	-0.0002095826680306	0.8642144767576695	0.0002095826680306	0.8499666975184207	0.001377178202349	0.7132548920298326	-3.918183076575452e-06	0.7747142710146965	3.918183076575452e-06	0.760460921392289	-0.002083009159846	0.6620648582371711	0.002083009159846	0.6491712858720262	PTBP3	75673	SUSD1	82694	HSDL2	122090	False	False	False	ref	-80	0.005676	-80	0.01068
4077	chr9	112258733	G	A	rs7027240	-0.0029311293748	0.7584288517774602	0.0029384901852	0.7483814203419971	0.0071275434014454	0.723327154174801	-1.948527076588878e-05	0.8039880152207207	1.954404441512126e-05	0.7945411199664835	0.0335044969346154	0.9356442964673406	-0.0001392084389003	0.9193210663590544	0.0001394878319006	0.9098808165624916	0.0002333359243674	0.9456033561705574	-8.856868783094915e-07	0.9334547594293686	8.879177394443752e-07	0.92416182237807	-0.0014875672984159	0.7429673528017338	0.0014875672984159	0.7331882046217058	PTBP3	74931	SUSD1	83436	HSDL2	121348	False	False	False	ref	100	0.003033	10	0.01566
4078	chr9	112273585	C	T	rs10817308	-0.0128626485599999	0.3014343544187117	0.0128626485599999	0.29047305962998	0.0086131610020673	0.4844066568706417	-0.0001071831325894	0.3236448842741209	0.0001071831325894	0.3134457152434982	0.1361383416840423	0.7659051558069286	-0.0016704778879031	0.5076270907711196	0.0016704778879031	0.4940231154083284	0.0012064468326298	0.7634880066658338	-1.4275288369999298e-05	0.5140449681184606	1.4275288369999298e-05	0.5010993824087377	-0.0117345615618418	0.1603467113968955	0.0117345615618418	0.1558387538260807	PTBP3	60079	SUSD1	98288	HSDL2	106496	False	False	False	ref	100	0.003448	75	0.05106
4079	chr9	112297115	C	T	rs12376681	-0.0471197092	0.0357501069201338	0.0471197092	0.0333891569053559	0.0155827668309739	0.0713864423090401	-0.000760352349662	0.0227284060683461	0.000760352349662	0.0214991443150836	0.1825599850620856	0.6859346338339555	-0.0084843900714315	0.1577684949280832	0.0084843900714315	0.1488533162239246	0.0028090223046032	0.4591809990952957	-0.0001351698299809	0.0924352143808853	0.0001351698299809	0.0865168133768894	-0.0450730816709716	0.0062922859050334	0.0450730816709716	0.006105930365709	PTBP3	36549	HSDL2	82966	SUSD1	121818	False	False	False	ref	60	0.003828	45	0.0837
4080	chr9	112336799	T	C	rs4978484	0.0403598954	0.0462783170195152	0.0403598954	0.049593989570607	0.008950360957892	0.4228951417405671	0.0003620144695074	0.0645643676369436	0.0003620144695074	0.0686169107992815	0.2314173383541322	0.6037035789474319	0.0094142632228472	0.1220375765036948	0.0094142632228472	0.1302582339872214	0.0020898075402592	0.5787010196692897	8.51495800980715e-05	0.1287984994641985	8.51495800980715e-05	0.1365934135336846	0.0376580669923961	0.0122954166783077	0.0376580669923961	0.0126359671642595	PTBP3	3135	HSDL2	43282	KIAA1958	150029	False	False	False	alt	-45	0.02173	85	0.01563
4081	chr9	112337341	C	T	rs4979103	0.00062732894	0.6202044813093007	0.00419245298	0.6232420907107344	0.0175765924399796	0.0450117847813489	1.4768362964689292e-05	0.4102152327079635	7.457270460273894e-05	0.41332518910117	0.1132667351321071	0.7949025516600555	0.0001140319937131	0.7354659420438504	0.0004273428198866	0.7391094540816378	0.0019648920620224	0.5968146942891109	2.4793458498969464e-06	0.6085645713548791	7.569397168005698e-06	0.6123128363030818	0.0010912976275687	0.4744829166393861	0.0036431913194119	0.4774379747720921	PTBP3	3677	HSDL2	42740	KIAA1958	149487	False	False	False	alt	-10	0.002182	-50	0.01419
4082	chr9	112349429	G	A	rs10817323	-0.0139174391	0.3493885621087315	0.0139174391	0.3391220528235508	0.0130989643709844	0.1600443984702076	-0.0003225618804471	0.2530304697513784	0.0003225618804471	0.2464262756824949	0.4152180001867238	0.3110906636849863	-0.0058404350009047	0.2931549497048721	0.0058404350009047	0.2819421678066431	0.0054904749174771	0.1321619766969557	-0.0001351994405373	0.2156397479575527	0.0001351994405373	0.2082781691968021	-0.0070623139244182	0.3752087659817306	0.0070623139244182	0.3672674330079253	PTBP3	15765	HSDL2	30652	KIAA1958	137399	False	False	False	ref	5	0.0006857	-100	0.0827
4083	chr9	126978004	A	G	rs11790388	0.0363001678	0.0633240716391479	0.0363001678	0.0677300875017025	0.0101151491877147	0.2969497218986076	0.0003706697979094	0.07020274268925	0.0003706697979094	0.0745897323780715	0.2881357690432473	0.5166247006843372	0.0107521268347714	0.1096124948013915	0.0107521268347714	0.1176014836749272	0.0029077515831906	0.4357713501198428	0.0001095730207586	0.1067231128407982	0.0001095730207586	0.1138406196601085	0.0298218861191505	0.0258063810416612	0.0298218861191505	0.026491810448442	RALGPS1	63229	ZBTB34	117364	ANGPTL2	144631	False	False	False	alt	-20	0.002144	30	0.04388
4084	chr9	137932059	C	A	rs7868607	-0.0138379214	0.2792563955256526	0.0138379214	0.2688904136466039	0.0095275687297469	0.3649352793532926	-0.0001310754963825	0.280567770259461	0.0001310754963825	0.2711473183528334	0.5394724011659872	0.1137490536636127	-0.0075507919684942	0.181167714062243	0.0075507919684942	0.171513124940994	0.005152841224434	0.1337924865489278	-7.165104575602613e-05	0.1810025324845943	7.165104575602613e-05	0.1722266965090049	-0.0030394506167075	0.5448781020011533	0.0030394506167075	0.5330728907978707	CACNA1B	54276	EHMT1	313066	ARRDC1	326373	False	False	False	ref	-55	0.0004683	40	0.02945
4085	chr9	137950872	C	T	rs56199530	-0.1042550184	0.0024649450926613	0.1042550184	0.0023488247729166	0.0588154196120729	0.0004406779647106	-0.0074218927155901	0.000841092878476	0.0074218927155901	0.0007820280855787	0.5046670608616272	0.1656843979781406	-0.0539839087206836	0.0029582039275065	0.0539839087206836	0.0027932201642273	0.0302528698764439	0.0005143868735186	-0.0038853622628693	0.0008907492656137	0.0038853622628693	0.0008222760781085	-0.0340190250936212	0.0181937352123105	0.0340190250936212	0.017778959283821	CACNA1B	73089	EHMT1	331879	ARRDC1	345186	False	True	True	ref	-70	0.00264	100	0.0205
4086	chr9	137953733	T	G	rs10867090	0.0243229586	0.1249104611996609	0.0243229586	0.1321927583596457	0.0133271054390255	0.1173673592262068	0.0003267945455515	0.0804455686062604	0.0003267945455515	0.0852934578637971	0.5396342285708358	0.1121945972437315	0.013275554778178	0.0767404298492099	0.013275554778178	0.0828538568109934	0.0071923894039294	0.0425404207146199	0.0001785012710917	0.0540249540884752	0.0001785012710917	0.0582211215990515	0.0056618844593823	0.3268754014755298	0.0056618844593823	0.336241269715276	CACNA1B	75950	EHMT1	334740	ARRDC1	348047	False	False	False	alt	-100	0.00419	-100	0.0969
4087	chr9	137990281	C	T	rs7042228	-0.0107253430599999	0.3412548702106776	0.0107253430599999	0.3299794277809168	0.0102497918515743	0.2760636536169698	-0.000109344975206	0.3137607076200162	0.000109344975206	0.3038620793385541	0.5983443811657798	0.0501221436684926	-0.0064104079794543	0.2035396142490615	0.0064104079794543	0.1935292053017763	0.0061345814718617	0.0735822983721379	-6.536878648750058e-05	0.186242497791845	6.536878648750058e-05	0.1772925872757086	-0.0014585213539559	0.74485660709007	0.0014585213539559	0.7315541740239778	CACNA1B	112498	EHMT1	371288	ARRDC1	384595	False	False	False	ref	100	0.005005	-60	0.04114
4088	chr9	138034437	A	G	rs7855572	-0.00872377644	0.4150683948491143	0.00872377644	0.4032448128280038	0.0091833147501723	0.4031542019759398	-8.027371909146084e-05	0.4126205327219055	8.027371909146084e-05	0.401427562321047	0.3296196018630898	0.4469440469604336	-0.0029223570875063	0.3802464468950293	0.0029223570875063	0.3678234491351927	0.0030064174063542	0.4223341348374463	-2.672240531356979e-05	0.3742311010621277	2.672240531356979e-05	0.3625476388158482	-0.0059191485388852	0.3369412251552309	0.0059191485388852	0.3276525660844909	CACNA1B	156654	EHMT1	415444	ARRDC1	428751	False	False	False	ref	-100	0.010445	-100	0.0434
4089	chr9	138061209	C	T	rs62580940	0.00173845351	0.7298790007446447	0.0027642400499999	0.7326504139755203	0.0160734891483522	0.0651452115713112	2.617458765550261e-05	0.5665261945856402	4.3536231885118615e-05	0.5697390832677183	0.5048351123974315	0.1680737126170421	0.000878683170971	0.5480453608778805	0.0014006865539028	0.5522422860258562	0.0081035947317566	0.0285515559913172	1.316915074488016e-05	0.4148145852920206	2.200794380313936e-05	0.4187110675193295	0.0003755225676614	0.8528940258649249	0.0006908785360843	0.853662224028048	CACNA1B	183426	EHMT1	442216	ARRDC1	455523	False	False	False	alt	-90	0.00185	-85	0.10547
