chr	pos	allele1	allele2	variant_id	logfc.mean	logfc.mean.pval	abs_logfc.mean	abs_logfc.mean.pval	jsd.mean	jsd.mean.pval	logfc_x_jsd.mean	logfc_x_jsd.mean.pval	abs_logfc_x_jsd.mean	abs_logfc_x_jsd.mean.pval	active_allele_quantile.mean	active_allele_quantile.mean.pval	logfc_x_active_allele_quantile.mean	logfc_x_active_allele_quantile.mean.pval	abs_logfc_x_active_allele_quantile.mean	abs_logfc_x_active_allele_quantile.mean.pval	jsd_x_active_allele_quantile.mean	jsd_x_active_allele_quantile.mean.pval	logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean	logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean.pval	abs_logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean	abs_logfc_x_jsd_x_active_allele_quantile.mean.pval	quantile_change.mean	quantile_change.mean.pval	abs_quantile_change.mean	abs_quantile_change.mean.pval	closest_gene_1	gene_distance_1	closest_gene_2	gene_distance_2	closest_gene_3	gene_distance_3	peak_overlap	sig.chrombpnet.relaxed	sig.chrombpnet	allele	profile_shift	profile_diff	count_shift	count_diff
0	chr1	8319388	G	A	rs11121162	-0.158405018	0.042127344080598	0.158405018	0.0416958858806378	0.0233133234260285	0.3745545348672252	-0.0038675948089733	0.0846092493509306	0.0038675948089733	0.0836636268063025	0.0579434858632178	0.4151302838992025	-0.0095641420415129	0.1660699530779432	0.0095641420415129	0.1631954707467489	0.0013177882217883	0.3940619560972199	-0.0002263332297207	0.1734823155441855	0.0002263332297207	0.1705892798603018	-0.0208224736894196	0.0977348450893399	0.0208224736894196	0.0961169290745329	SLC45A1	1273	ERRFI1	293079	PARK7	365096	False	False	False	ref	-35	0.05493	-65	0.02417
1	chr1	8320734	C	T	rs12408399	0.0996661852	0.1109012962510693	0.0996661852	0.1123843593777379	0.0322422914753641	0.190396194159554	0.0033621797598724	0.1065405808085039	0.0033621797598724	0.1077897128574381	0.0196397347497607	0.6282537917819082	0.0019250674612472	0.3954975935557697	0.0019250674612472	0.4006843897691309	0.0006771768295668	0.5338856540564839	6.955251014826684e-05	0.3298178356597528	6.955251014826684e-05	0.3345939031421547	0.005559037973013	0.3311916465290573	0.005559037973013	0.336042800507312	SLC45A1	2619	ERRFI1	294425	PARK7	366442	False	False	False	alt	-35	0.003052	50	0.02808
2	chr1	8332335	G	A	rs11586622	-0.257576734	0.0131537654160767	0.257576734	0.0130381099037609	0.03340754156751	0.1765982635079966	-0.0088237311488678	0.0261442415590178	0.0088237311488678	0.026043855383398	0.0867201675959222	0.3316425497703167	-0.0233744131510379	0.0753190346030915	0.0233744131510379	0.0738592493503057	0.0030123505483539	0.248182154909165	-0.0008283835655311	0.067375922373112	0.0008283835655311	0.0661203054429963	-0.0422478638118174	0.0313262177248117	0.0422478638118174	0.0308536914536698	SLC45A1	14220	ERRFI1	306026	PARK7	378043	False	True	False	ref	100	0.2544	-80	0.07935
3	chr1	8332532	G	A	rs4908751	0.0303431798	0.4785508031780899	0.0303431798	0.4841346778528165	0.0427172316467854	0.0926818939924784	0.00114752301386	0.3297608992655188	0.00114752301386	0.33365915843681	0.1262421233215664	0.2608567678665992	0.0037235679073474	0.3177603739420652	0.0037235679073474	0.3224153464758343	0.0050393057212954	0.1614773482921551	0.0001238819982442	0.2473339737420525	0.0001238819982442	0.2512757152661458	0.0067335290818514	0.3065908532143021	0.0067335290818514	0.3111381224239944	SLC45A1	14417	ERRFI1	306223	PARK7	378240	False	False	False	alt	-90	0.05536	-90	0.535
4	chr1	8406670	T	C	rs301796	0.00860729189	0.8052543015012864	0.00863157635	0.8114772398819136	0.0173131717307162	0.5908284317870744	0.000144577071207	0.7995898745660777	0.0001449871281213	0.805700049491407	0.0101365840783873	0.721277581110969	0.0001006219377363	0.8072928817648912	0.0001007925883262	0.8130557438303625	0.0001702484892098	0.7344448279296428	1.6546625715989004e-06	0.811810485113	1.6575441038069492e-06	0.8172573580453081	0.0003728019530863	0.7980647441494293	0.0003744515192504	0.8026152684542142	SLC45A1	88555	ERRFI1	380361	RERE	442251	False	False	False	alt	-5	0.001709	-40	0.0709
5	chr1	8409277	A	G	rs301789	0.1681405319999999	0.0390814942487545	0.1681405319999999	0.0394950323535654	0.0487017743960201	0.0622890443742167	0.0088184175134226	0.0293738013244711	0.0088184175134226	0.0295964929992652	0.4716076671835307	0.0498493870507478	0.0837840258778847	0.0137750947784143	0.0837840258778847	0.0139027857132681	0.0234282900110915	0.0172381745527169	0.0044584685665216	0.0118033038756317	0.0044584685665216	0.0119050085949392	0.0532974827620335	0.0187229505204908	0.0532974827620335	0.0190133215831827	SLC45A1	91162	ERRFI1	382968	RERE	439644	True	False	False	alt	35	0.08716	30	0.04395
6	chr1	8413271	G	A	rs1763838	0.0027738011999999	0.7727633374582664	0.0102428196	0.7741221077674189	0.0791187857221334	0.0115308511021356	0.0001477467739427	0.3812908733083781	0.000780955294982	0.3826072593009677	0.0135833525782718	0.6789187017925656	1.4084283465683922e-05	0.7543669270503319	0.0001384089787811	0.7557088198453412	0.0010658838680054	0.4320287162939055	2.1205885731480685e-07	0.566330358407228	1.0451015961146306e-05	0.567311697308107	5.938438190756003e-05	0.7571237838176984	0.000451981128963	0.7583975355265797	SLC45A1	95156	ERRFI1	386962	RERE	435650	False	True	False	alt	45	0.02435	-80	0.0631
7	chr1	8430260	T	G	rs302719	-0.0036603733999999	0.6919158468151407	0.0147318781999999	0.6906912915508676	0.0278118879894072	0.2658761348225907	-9.914259274036e-05	0.558857051126245	0.0004163947819382	0.5576200347587583	0.0194574576886278	0.6132332419314158	-0.0001030941630821	0.6606153843124289	0.0002901993578351	0.659113067923022	0.0005373396977429	0.550060934807366	-2.8683508603055743e-06	0.6038488705436863	8.167938456578745e-06	0.60237606096828	-0.0003653789053478	0.6534280647343684	0.0009295305334696	0.6517818271065083	SLC45A1	112145	ERRFI1	403951	RERE	418661	False	False	False	ref	-100	0.02386	90	0.1019
8	chr1	8435530	A	G	rs172531	-0.0335127426	0.4436298034612831	0.0335127426	0.4383884867617044	0.0129431815993393	0.7754027003984857	-0.0004671583082963	0.5634702029823324	0.0004671583082963	0.557360576829298	0.0353699976906073	0.5277563370589582	-0.0007274759906121	0.5253802159474652	0.0007274759906121	0.5198047247607015	0.0004365480575126	0.6075081777953163	-9.584367459831125e-06	0.5832567747270442	9.584367459831125e-06	0.5773954445607896	-0.00210484642539	0.5100191985720246	0.00210484642539	0.5043957223032016	SLC45A1	117415	ERRFI1	409221	RERE	413391	False	False	False	ref	-90	0.02847	65	0.107
9	chr1	8443182	G	A	rs301818	0.0308637843599999	0.2723132407905627	0.05496326044	0.2736915394044613	0.0217723192231168	0.422804805030615	0.0007238672420037	0.303015130565462	0.0012625139422351	0.3042251253711086	0.0109143545247599	0.723285821856257	0.0005191806821104	0.5997913117724231	0.0005855350866177	0.602020280178576	0.0002332313616873	0.7006176921486221	1.189350234748094e-05	0.5792563004620331	1.337346623733022e-05	0.5815758814980002	0.0016470918148527	0.5659816414905049	0.001869783247006	0.5684873272631003	SLC45A1	125067	RERE	405739	ERRFI1	416873	False	False	False	alt	100	0.03488	-80	0.068
10	chr1	28647287	G	T	rs7368197	-0.0049887938599999	0.8108340859709229	0.00854063306	0.8072089111699585	0.0333154573738642	0.1757864309279983	-0.0001740983685645	0.6521316672757742	0.0003072168142084	0.6489830810938628	0.0001558840025073	0.998880406462594	-5.068968079586231e-07	0.9938292658563016	1.2246235627276051e-06	0.9935563743508532	5.199933790127181e-06	0.9940886975590708	-1.6847500447614097e-08	0.9880316823802548	4.3746991707190834e-08	0.9850271807547036	-1.3552527156068806e-21	0.9946607692855886	3.299132328197684e-06	0.9943895520406506	TAF12	1004	GMEB1	21492	RAB42	55086	False	False	False	ref	-45	0.005615	-25	0.0315
11	chr1	28688564	C	A	rs61786043	-0.00377304658	0.7796775093385793	0.01048219702	0.7807550721518993	0.0175785164657307	0.5805929053362955	-6.827589738859748e-05	0.7651649621458633	0.0001861392824854	0.7661073021218694	0.0021007225099798	0.9210060899822752	-1.824823223103125e-05	0.9197344907286066	3.069488340472612e-05	0.9213024530990288	3.595819382509322e-05	0.920373220700602	-3.167674060021713e-07	0.9160699363492298	5.302781506562607e-07	0.917685549373398	-5.526046649731288e-05	0.9086944455031036	0.0001212431130612	0.9103565005722458	GMEB1	19785	TAF12	40273	YTHDF2	48058	False	False	False	ref	-100	0.03244	-100	0.1417
12	chr1	28725056	G	A	rs61787564	-0.0647494292	0.2094753561086143	0.0647494292	0.2066016740868699	0.0145694376354997	0.7031783578262347	-0.0009746213710941	0.3357729008079766	0.0009746213710941	0.3316084135947197	0.0011456237009666	0.9569355867172296	-8.084198132077935e-05	0.8248180485545185	8.084198132077935e-05	0.8180906376328977	1.67829382316126e-05	0.9607577094259117	-1.1918045172299126e-06	0.8376060797694737	1.1918045172299126e-06	0.8307203391332574	-0.0003002210418659	0.825043434667382	0.0003002210418659	0.8182148539732627	YTHDF2	11566	GMEB1	56277	TAF12	76765	False	False	False	ref	95	0.07043	100	0.308
13	chr1	28727199	T	G	rs61787565	-0.01049798248	0.5405815070862818	0.02499171328	0.5373721432270464	0.0236084475442399	0.3686655560169784	-0.0002836290211366	0.4767172433222089	0.0006088495742072	0.4732889817834413	0.000785193494111	0.97696726591183	-5.233552465157868e-06	0.9351296721403908	2.065444962863538e-05	0.9309315969965646	1.7788532488527277e-05	0.9635982212063972	-1.3399673688871406e-07	0.9136837806620456	4.800217059272247e-07	0.9094522038677856	-2.639305862558261e-05	0.9309342461714324	7.75296097126226e-05	0.9267257714979528	YTHDF2	9423	GMEB1	58420	TAF12	78908	False	False	False	ref	0	0.0	-45	0.0419
14	chr1	28786062	T	G	rs113507743	-0.013489828224	0.7029769711819933	0.013489828224	0.6978954314406413	0.0381423747282513	0.1280584610552704	-0.0005262696840121	0.5404650062824241	0.0005262696840121	0.5356843428547433	0.0239121111147767	0.5794519450808238	-0.000283725947377	0.7224355167350237	0.000283725947377	0.7158832307340091	0.0008793899763202	0.4670964426662309	-9.956805083153266e-06	0.638606499544372	9.956805083153266e-06	0.632402255829897	-0.0009922140477054	0.7021129028261173	0.0009922140477054	0.6958040145816647	OPRD1	26109	YTHDF2	49440	EPB41	101030	False	False	False	ref	85	0.02216	-60	0.0862
15	chr1	28790639	A	T	rs61787581	-0.113662308	0.0631420883779642	0.133997076	0.0627369882824363	0.0235910156304627	0.3652774455354493	-0.0031667846937186	0.1049371473626727	0.0034501934162067	0.1042651281877181	0.020128831117416	0.6310893903760745	-0.0023371312761982	0.3600399972683963	0.0026510988642749	0.3566239024690412	0.0004377401234007	0.6094721716106862	-5.712608385828081e-05	0.3502526062484022	6.150189732944403e-05	0.3468441082655125	-0.0064316584738213	0.2839150710213404	0.007512124311306	0.2808661420526331	OPRD1	21532	YTHDF2	54017	EPB41	96453	False	False	False	ref	90	0.05527	30	0.1144
16	chr1	28810174	A	G	rs569356	-0.0598748026599999	0.2765890290070285	0.0598748026599999	0.2736215654243315	0.082422780945843	0.0094087652103198	-0.005193803037087	0.1107093191105135	0.005193803037087	0.1093959748520794	0.0310943221932631	0.5769353343269226	-0.0022968219367785	0.4964110087980328	0.0022968219367785	0.4908646929164928	0.0027615471233119	0.3061646868249905	-0.0002135372097606	0.3025542852107977	0.0002135372097606	0.298382574046409	-0.0055887301639668	0.431961815618887	0.0055887301639668	0.4270367314545294	OPRD1	1997	YTHDF2	73552	EPB41	76918	False	True	False	ref	-80	0.1101	80	0.1665
17	chr1	28814643	G	A	rs533123	-0.098350963	0.1084176679400444	0.098350963	0.1069162301721225	0.0667835915750462	0.0213727140258547	-0.0065208566442387	0.0385923340254411	0.0065208566442387	0.0382929690831114	0.4932590478704101	0.045721595849672	-0.0492685461466984	0.0285197541617262	0.0492685461466984	0.0280526742117021	0.0328527466903591	0.007312637640231	-0.0032664055467003	0.0139970415766053	0.0032664055467003	0.0138567904009769	-0.0313029923130216	0.0494416476567387	0.0313029923130216	0.0486939272861919	OPRD1	2472	EPB41	72449	YTHDF2	78021	False	False	False	ref	-100	0.02267	60	0.162
18	chr1	28824876	T	C	rs369247	0.0204403336	0.5909813873498019	0.0204403336	0.5971263272730326	0.0564775876081327	0.0386028254416607	0.0011784265920184	0.2882549288427027	0.0011784265920184	0.2921858925608202	0.0003554815083632	0.9943194319143454	8.432150927237483e-06	0.960330628962216	8.432150927237483e-06	0.967381198093478	2.1021122166516585e-05	0.9581661630323048	5.09958011143795e-07	0.9038619409004552	5.09958011143795e-07	0.9107216879781044	3.216654019991306e-05	0.9598271211322268	3.216654019991306e-05	0.9668939295511174	OPRD1	12705	EPB41	62216	YTHDF2	88254	False	False	False	alt	40	0.00824	-100	0.2224
19	chr1	28828321	T	G	rs4654375	-0.03634827654	0.4116924234895392	0.03634827654	0.4065801023754641	0.018954551871712	0.5217816229555665	-0.0007030117955375	0.4487647989592656	0.0007030117955375	0.4434643122446183	0.0171538385404638	0.642395031782927	-0.0005740907999489	0.5936274409528675	0.0005740907999489	0.5875487983646768	0.0003285975246465	0.6414435677416249	-1.1204723019716145e-05	0.591683219134687	1.1204723019716145e-05	0.5855771189179274	-0.0018904028240572	0.5586772796194355	0.0018904028240572	0.5527903411947968	OPRD1	16150	EPB41	58771	YTHDF2	91699	False	False	False	ref	100	0.04828	100	0.2832
20	chr1	28833590	A	G	rs2236859	0.262407348	0.0142935676507525	0.262407348	0.0143941763074312	0.0486260097636173	0.0633113355903117	0.0141403550155615	0.0156778454914899	0.0141403550155615	0.0157851278867713	0.0308279172577611	0.5427603276334217	0.0082620630466559	0.1908218978586047	0.0082620630466559	0.1940947423438063	0.0015684632047016	0.376378622058204	0.000465445383153	0.1205083972306487	0.000465445383153	0.1227796299077397	0.0165105077364652	0.1302831569107473	0.0165105077364652	0.1325497413232659	OPRD1	21419	EPB41	53502	YTHDF2	96968	False	True	False	alt	100	0.0654	100	0.094
21	chr1	28835487	C	A	rs2236855	-0.2330233853999999	0.0288206916384476	0.2330233853999999	0.0286371670192256	0.0235051006047502	0.370637658073544	-0.0062762922231895	0.0699292188505041	0.0062762922231895	0.0694919671424086	0.8769332915443238	0.0025268197925199	-0.2096646010839076	0.0033082298674485	0.2096646010839076	0.0033237686064914	0.0206890676677106	0.0215468737644666	-0.0056645384675616	0.0118985926849677	0.0056645384675616	0.0118348181599853	-0.0200991389264622	0.1120642732845775	0.0200991389264622	0.1101790871539637	OPRD1	23316	EPB41	51605	YTHDF2	98865	True	False	False	ref	75	0.05518	75	0.5273
22	chr1	28836056	A	G	rs760588	0.05038392264	0.2861287458993488	0.0513156853599999	0.2891468369793704	0.0190968006422323	0.5153655436448585	0.0010714502416459	0.3281571318134145	0.001081976462148	0.3312274693256266	0.5242758404539606	0.0391747319643239	0.025885077654421	0.0733880807493053	0.0264290080891711	0.0743068635328102	0.0098708398482297	0.0756090232278635	0.0005484599112144	0.1029893244591444	0.000554604750008	0.1040744904287109	0.0156040711292929	0.1412953149181298	0.0158828478110256	0.14314701738504	OPRD1	23885	EPB41	51036	YTHDF2	99434	False	False	False	alt	-100	0.03937	10	0.02576
23	chr1	28841542	C	T	rs4233254	-0.0512603718	0.2581113535758381	0.0552253654	0.2557758317517889	0.0152372063201765	0.6743081691491474	-0.0008534339904429	0.3698583188764505	0.0008980237589609	0.3664775187106225	0.0372043152650852	0.541682332840671	-0.0027543009632705	0.4005693036321245	0.002785106810107	0.39645536637246	0.0005915314186344	0.5824210846753256	-4.4453008172088165e-05	0.44180826511819	4.479944644486028e-05	0.4376165528907964	-0.0066048629210517	0.3337115144837266	0.0067087855893899	0.3303010436482095	OPRD1	29371	EPB41	45550	YTHDF2	104920	False	False	False	ref	100	0.1254	-20	0.0315
24	chr1	28917939	G	T	rs150082	-0.0347742723999999	0.3079031531122989	0.0472895803999999	0.3051319732889729	0.0242654952142622	0.3491871064369997	-0.0008807352959569	0.2886712543769155	0.0011692208345503	0.2864309935383386	0.0006243607931113	0.982502048044299	-2.26684292616572e-05	0.900751821277993	2.989411925376081e-05	0.8963568715622235	1.5463418385164574e-05	0.966746094954834	-5.86629322489226e-07	0.8709283262471189	7.531859166426292e-07	0.8664089223973147	-8.577744053311868e-05	0.8977075041696498	0.0001204183299791	0.8933123455638007	EPB41	30847	OPRD1	105768	YTHDF2	181317	False	False	False	ref	20	0.01291	-95	0.197
25	chr1	28959599	A	T	rs3102739	-0.0588603274	0.239989926563866	0.0588603274	0.2368281755410261	0.0187602556127444	0.5189289542729071	-0.0012034403383587	0.2949134143065279	0.0012034403383587	0.2914053837655232	0.0093373692718814	0.7550568559898457	-0.000583292547741	0.5988458567499877	0.000583292547741	0.5925576007423506	0.0001876232957969	0.7543616846403172	-1.2626173966527406e-05	0.5960952258757006	1.2626173966527406e-05	0.589840945411825	-0.0020405133449902	0.5529677637776506	0.0020405133449902	0.5467441074015225	EPB41	72507	OPRD1	147428	TMEM200B	164304	False	False	False	ref	80	0.01046	25	0.0256
26	chr1	28983862	T	G	rs2985339	0.320643632	0.0069330272910607	0.320643632	0.0069567618179356	0.050751337439755	0.0541704917060728	0.0165514527550722	0.0091824922297566	0.0165514527550722	0.0091782059268885	0.5342895318531227	0.0376780061601988	0.1701097891719365	0.0028821056876159	0.1701097891719365	0.002859070861268	0.0270384203338139	0.0117758865118941	0.0087486497352076	0.0037187064841945	0.0087486497352076	0.0036991941682151	0.103823694368381	0.0036616792704546	0.103823694368381	0.0036457571195298	EPB41	96770	TMEM200B	140041	OPRD1	171691	False	True	True	alt	85	0.07007	90	0.1558
27	chr1	28989957	G	A	rs7513398	-0.00082801158	0.8803387803661762	0.00486719618	0.8789288259048225	0.0131633957153095	0.7771035892689628	-1.0595445168356575e-05	0.8964972464603029	6.426035218699e-05	0.8952043358399737	0.0014103790703044	0.944874390802146	-6.227232968889168e-06	0.9610813657777916	8.61037850291508e-06	0.961069890477936	1.8617044922257982e-05	0.956116477601072	-8.125386862304336e-08	0.9650527621856534	1.13324103701759e-07	0.9652901303609006	-2.7217841707629384e-05	0.966495271296322	3.216654019992596e-05	0.9643761412512007	EPB41	102865	TMEM200B	133946	OPRD1	177786	False	False	False	ref	100	0.04443	-100	0.211
28	chr1	29040724	C	T	rs2486201	0.00353902008	0.7331845878790269	0.01285277352	0.7346051681334915	0.0177869373325994	0.5696434614734254	3.626950050295835e-05	0.7182619528779409	0.0002393557344004	0.7196732607505238	0.0005410577018243	0.9866899602439868	5.245256021116542e-06	0.9672359984372312	7.747611092802165e-06	0.9710169961879368	9.50383423373468e-06	0.984230944501547	8.62521609638047e-08	0.963168504640104	1.4094954562461696e-07	0.966794487212762	2.061957705123552e-05	0.9670987470539516	2.886740787172973e-05	0.9683146418726024	TMEM200B	83179	SRSF4	141176	EPB41	153632	False	False	False	alt	-100	0.02582	0	0.0
29	chr1	29944296	C	A	rs10914662	-0.151172576	0.0526834454126975	0.151172576	0.0520508974019641	0.0289697227310892	0.247764216290372	-0.0051731278106649	0.0751363532210813	0.0051731278106649	0.0744218627914479	0.5187827851275115	0.0402736155102837	-0.079691677774018	0.0152522320941311	0.079691677774018	0.0149613582294886	0.0151999420527734	0.0413555907273152	-0.0027227400025125	0.0239600300518749	0.0027227400025125	0.0235917816980292	-0.045512355250569	0.0279260805079216	0.045512355250569	0.027439950867014	ENSG00000289710	632529	PTPRU	707779	MECR	713354	False	False	False	ref	70	0.0174	-20	0.04102
30	chr1	29954792	A	G	rs56335113	0.0340140929999999	0.2266897688775049	0.0680113149999999	0.2264865463181253	0.0285744365728117	0.2504136531184929	0.0009761551152963	0.2197686398543986	0.0020176890280051	0.2192990372308605	0.4580746263732638	0.053628845894108	0.0185508492957451	0.0651012025398182	0.0350881213220856	0.0650925444526416	0.0131775552529797	0.050112624730734	0.0005332332969701	0.0722360039586159	0.001044147571091	0.0722196930096165	0.0099823496420441	0.1148639720303965	0.0206022566065124	0.1146685753922194	ENSG00000289710	622033	PTPRU	718275	MECR	723850	False	False	False	alt	-45	0.1487	35	0.02783
31	chr1	29958713	G	A	rs1009080	-0.0704948748	0.1870848813475166	0.0704948748	0.1842798034325641	0.0796740473179986	0.010880836372721	-0.0056341766346833	0.052405053851576	0.0056341766346833	0.0520053647738375	0.2752466101415327	0.1266900537798518	-0.020840203320147	0.0920776795834239	0.020840203320147	0.090311406869346	0.0210379738113292	0.0228014325687258	-0.001598596731094	0.0377224854948156	0.001598596731094	0.0372140318634456	-0.0218047903401404	0.0923068942524369	0.0218047903401404	0.0907051006424051	ENSG00000289710	618112	PTPRU	722196	MECR	727771	False	True	False	ref	100	0.297	-100	0.3862
32	chr1	29961039	C	G	rs6679167	-0.0504555424199999	0.3170076514170796	0.0504555424199999	0.3129252857343417	0.0925685352308435	0.0058335783747659	-0.0046643503768742	0.0953469090635349	0.0046643503768742	0.0945839229073297	0.7845699581010195	0.0083403189861296	-0.0404538888264209	0.0556302296419628	0.0404538888264209	0.0546062936138122	0.0728759306987886	0.0006020412340796	-0.0037541343900185	0.0205522775729775	0.0037541343900185	0.0203358378224283	-0.0071360232258915	0.3056057631518969	0.0071360232258915	0.3012791779854908	ENSG00000289710	615786	PTPRU	724522	MECR	730097	True	True	True	ref	100	0.05444	100	0.1699
33	chr1	29961104	T	C	rs1498232	-0.31987945	0.0086981978491491	0.31987945	0.0087169052357592	0.0735072792633458	0.01475345579485	-0.0242278266848644	0.005772255999829	0.0242278266848644	0.0057495406088106	0.7873874171093003	0.0081486598325928	-0.2499352815045513	0.0014369789986594	0.2499352815045513	0.0014728144299031	0.057875793863026	0.0013283249307217	-0.0189394366352405	0.0014219142072814	0.0189394366352405	0.0014215695156262	-0.0557272937217511	0.0196376820549051	0.0557272937217511	0.0194203522892996	ENSG00000289710	615721	PTPRU	724587	MECR	730162	True	True	True	ref	35	0.0537	50	0.1387
34	chr1	29990225	C	T	rs10127492	-0.1041820555999999	0.1142511939222941	0.1041820555999999	0.1129957319032173	0.0621602918665101	0.0273837452946979	-0.0067941786246201	0.0516280146286252	0.0067941786246201	0.0512645009171124	0.4778488007653986	0.0489233490277827	-0.0457722321018093	0.0378875553674233	0.0457722321018093	0.0373016160913799	0.0290036101343776	0.010052066892315	-0.0029619164551706	0.0205146810953129	0.0029619164551706	0.020321528312279	-0.0333938174260169	0.0562071269731895	0.0333938174260169	0.0552805629985473	ENSG00000289710	586600	MATN1	733360	PTPRU	753708	False	False	False	ref	55	0.04944	55	0.1562
35	chr1	29998186	G	T	rs10798981	0.0389336266	0.373858062845248	0.0389336266	0.3785987995995787	0.0405789353986405	0.1056738190730302	0.001670096390786	0.2258207284979076	0.001670096390786	0.2289514869725581	0.0001072218006664	0.9996611567825716	3.2658023623116853e-06	0.977439604945769	3.2658023623116853e-06	0.9845617326084029	4.075220633371366e-06	0.9965776042189416	1.308069920244029e-07	0.9559169894370038	1.308069920244029e-07	0.963031549167434	7.423047738444791e-06	0.9844023952346446	7.423047738444791e-06	0.9894057060711652	ENSG00000289710	578639	MATN1	725399	LAPTM5	759588	False	False	False	alt	60	0.1051	30	0.1244
36	chr1	30001463	C	T	rs143052415	-0.1686513152	0.0389294530098505	0.1686513152	0.0384617512574171	0.0240530126461167	0.357978006900408	-0.0045094502049994	0.0781774515196533	0.0045094502049994	0.0772910764298747	0.3830902972518227	0.0755434284457155	-0.0653300380144558	0.0193717608671538	0.0653300380144558	0.0190238357461445	0.009281417020529	0.0836031432828726	-0.0017575306214397	0.0333948465431036	0.0017575306214397	0.0329530548234504	-0.0585472270792781	0.0157055778727658	0.0585472270792781	0.0155069790126073	ENSG00000289710	575362	MATN1	722122	LAPTM5	756311	True	False	False	ref	30	0.0274	35	0.0752
37	chr1	30059087	G	A	rs1966008	-0.194830814	0.0255327062433644	0.194830814	0.0253249499724918	0.0237081314149635	0.3659892093845868	-0.004649112657239	0.0624617322697511	0.004649112657239	0.0617888980644226	0.0695465342614891	0.3845433726392897	-0.0129500170048462	0.1263589400923404	0.0129500170048462	0.1240887424545258	0.0016639772692554	0.358968290779734	-0.0003097227679485	0.1351633453725826	0.0003097227679485	0.1328901036907203	-0.0262759394279304	0.0668631721185799	0.0262759394279304	0.0657874244635866	ENSG00000289710	517738	MATN1	664498	LAPTM5	698687	False	False	False	ref	50	0.02832	70	0.2607
38	chr1	30059135	C	T	rs1966007	0.1318468589999999	0.0417033217168167	0.190493965	0.0417203737600554	0.0381470800901225	0.1358381942893032	0.0081421502766055	0.049539584916067	0.0096836667568266	0.0496886501177837	0.0966076671835306	0.3100056680207544	0.012886712817792	0.1117153658163494	0.0186495542748974	0.1122429170299751	0.0038243282169671	0.2137047192527507	0.00084255363072	0.0864294048223301	0.0009937557019022	0.0866317671766937	0.020711952756425	0.0602300429536119	0.0329665797895153	0.0604754907240466	ENSG00000289710	517690	MATN1	664450	LAPTM5	698639	False	False	False	alt	25	0.005127	20	0.1189
39	chr1	30059448	C	T	rs616924	0.0933979801999999	0.1355931726179032	0.0933979801999999	0.1371427465870513	0.0425366938600782	0.0924294242625813	0.0040549433788096	0.0950546834815707	0.0040549433788096	0.096088817077102	0.1233083698987165	0.2654974482704718	0.0099378290561377	0.1564277429799754	0.0099378290561377	0.1595132485330393	0.0049634182990567	0.1617246097478885	0.0004124823711271	0.1113050169342668	0.0004124823711271	0.1135108239939682	0.0186153541618553	0.1119867927591868	0.0186153541618553	0.1141442298705807	ENSG00000289710	517377	MATN1	664137	LAPTM5	698326	False	False	False	alt	-85	0.02016	90	0.07166
40	chr1	35702473	C	A	rs28734113	-0.041672992	0.184226231771587	0.0747698588	0.1840054397184012	0.0402613061743071	0.1063592097924494	-0.0017539034483867	0.1222726857886315	0.0030578456722492	0.1223197855580598	0.6264070799379763	0.0235806982812171	-0.0253148742359801	0.0337449678636722	0.0466458907026527	0.0337402469921554	0.025185377301742	0.0137020801334048	-0.0010669026742658	0.0293309055527997	0.0019053253137804	0.0293564701540591	-0.0121647256771468	0.1074544055898262	0.0200480023753752	0.1074459301465044	C1ORF216	16421	PSMB2	60947	CLSPN	67505	True	False	False	ref	10	0.0581	100	0.2974
41	chr1	35713267	G	T	rs12562583	-0.0029723821199999	0.8308283362613067	0.00746132508	0.8314650147240416	0.0187495743646281	0.525533442393914	-5.0040646830136045e-05	0.7993053071601411	0.0001434581024017	0.799877987386972	0.001087064102141	0.958838781325566	-2.574849424565776e-06	0.9644927694475288	6.679082995910866e-06	0.965684204542774	2.02688890834768e-05	0.950914356795372	-5.2395178636676164e-08	0.9576551998751786	1.3024872602153322e-07	0.9588182327493676	-7.423047738444719e-06	0.9590554938582976	3.0516974035828702e-05	0.9602542694533004	C1ORF216	5627	CLSPN	56711	PSMB2	71741	False	False	False	ref	50	0.00676	-90	0.1538
42	chr1	35720505	A	G	rs6658453	0.01256901054	0.6814980853429137	0.0152763041399999	0.6857120267193253	0.0446897387828292	0.0792447100969141	0.0005256785910071	0.4572814448574939	0.0006530850902373	0.4606774565127576	0.0010829401867308	0.9656656878436344	1.680759087093307e-05	0.9326315665350502	2.0246303046096632e-05	0.936982650697078	4.690406772312368e-05	0.8972069462580342	6.863636128522155e-07	0.875421055912322	8.481910095188351e-07	0.879838819382993	5.93843819075519e-05	0.9267319721123112	8.08287420408368e-05	0.9310650100698477	C1ORF216	1611	CLSPN	49473	PSMB2	78979	False	False	False	alt	-100	0.01389	-80	0.04248
43	chr1	35729771	C	T	rs11264194	0.041490398	0.2546806354618734	0.055093882	0.2568309264190333	0.048215208495963	0.0640478352687629	0.0021648155339427	0.126682137695042	0.0026849905008859	0.1274787784063583	0.0043672264194516	0.8586164589243657	0.000225624535116	0.6985721994383501	0.0002702237329373	0.7020526277320471	0.0001972071054857	0.7354036691696849	1.0583586215568438e-05	0.5729749173624781	1.2288986477518982e-05	0.5765407709911101	0.0007126125828906	0.6780111907137543	0.0009039622579261	0.6815951948916529	C1ORF216	10877	CLSPN	40207	AGO4	78246	False	False	False	alt	0	0.0	-25	0.03534
44	chr1	35754957	C	A	rs16822339	0.0493156128	0.1795056515885498	0.0705695548	0.181026370494589	0.0404972872298207	0.106012230513448	0.0020826275107131	0.1158522553970594	0.0027860185905529	0.116631981744365	0.0003241397512453	0.9948116014767292	1.3334889422456535e-05	0.9102441744346637	2.1924536379880648e-05	0.9145781092331884	1.305649385926492e-05	0.9764640911815198	5.808721679168339e-07	0.8445986481645644	8.651432486478458e-07	0.8490203745481864	3.381610636402626e-05	0.92709823020304	6.350829731780541e-05	0.9314755824063742	CLSPN	15021	C1ORF216	36063	AGO4	53060	False	False	False	alt	70	0.10614	85	0.127
45	chr1	35796132	T	G	rs12037102	0.235841902	0.0169548583349278	0.235841902	0.0170769055006408	0.0795491095147573	0.0108750548081703	0.0193787138384224	0.0076423003055809	0.0193787138384224	0.0076614209114393	0.0479537131734353	0.5429981522268085	0.0112843443680041	0.2032938228568541	0.0112843443680041	0.206526608267221	0.0039876277455065	0.2821054837958641	0.0009425722062584	0.0978631931898056	0.0009425722062584	0.0990682612175363	0.0194970472765662	0.1413209419740471	0.0194970472765662	0.1432391057859557	AGO4	11885	CLSPN	26154	AGO1	73677	False	True	False	alt	-35	0.01135	40	0.03125
46	chr1	35810036	T	G	rs515346	-0.01688071466	0.6459358364366831	0.01688071466	0.639553424181119	0.0419613457887575	0.1038094535210754	-0.0006846337129901	0.4581365159847456	0.0006846337129901	0.453062241399108	0.161367160436805	0.2145289242974179	-0.0031931931980659	0.3468789948524086	0.0031931931980659	0.3421402528158167	0.0060673586302847	0.1332531021032063	-0.0001097571022911	0.2733155160106336	0.0001097571022911	0.2691709978042687	-0.0048291049453993	0.3777351762527624	0.0048291049453993	0.3725560687075115	AGO4	2019	CLSPN	40058	AGO1	59773	False	False	False	ref	100	0.2389	100	0.615
47	chr1	35890856	A	G	rs2765012	-0.00803033196	0.7317541203470009	0.0122016219599999	0.7275618423307831	0.0116548983370462	0.8329858599587753	-0.000105026087102	0.7889480945451636	0.0001487187139369	0.78458243288546	0.0014128534195506	0.9420106493836048	-1.9153609729313064e-05	0.9265240518107966	2.083941029617877e-05	0.9221202286005816	1.7382676985315416e-05	0.9565524583892872	-2.5014297193881364e-07	0.9379623249789684	2.6780107225643295e-07	0.933524004987693	-8.907657286131191e-05	0.9205642992583792	9.237570518950958e-05	0.9161698776211644	AGO1	21047	AGO3	39863	AGO4	82839	False	False	False	ref	55	0.01034	80	0.123
48	chr1	35898381	G	C	rs647690	-0.3342553	0.0069135575029436	0.3342553	0.006896663642847	0.0716067813754574	0.0167445327982181	-0.0249927217838849	0.0051999788415533	0.0249927217838849	0.0051786440759916	0.0058031737652997	0.8103684302121463	-0.0022412100599311	0.384016742034114	0.0022412100599311	0.3787760231355142	0.000439480718676	0.6028250609934763	-0.0001729431692433	0.2212106027478001	0.0001729431692433	0.2176935343040304	-0.0045725974068819	0.3772328521948679	0.0045725974068819	0.3720355487950793	AGO1	28572	AGO3	32338	AGO4	90364	False	True	True	ref	-40	0.03003	-95	0.07745
49	chr1	35905567	T	C	rs2791962	0.0359555778	0.2620910148355742	0.0533813258	0.2642880894506932	0.0268311290086709	0.2870645060842103	0.0010948459040687	0.2368710632679242	0.0014412431085831	0.2386718901103612	0.0017592623140113	0.933335244794192	6.098709223771495e-05	0.7891473165038895	9.68463867356947e-05	0.7934317057951893	4.624959892368263e-05	0.895552162006278	1.852258269309587e-06	0.7434070212933113	2.565086141421632e-06	0.7476805966461882	0.0002218666490712	0.7845025016503175	0.0003554815083632	0.7887641024806287	AGO3	25152	AGO1	35758	AGO4	97550	False	False	False	alt	25	0.03326	-100	0.1477
50	chr1	35959384	A	G	rs10796876	0.1120035032	0.0880629538676369	0.1120035032	0.0892911428830851	0.0258493226163827	0.3061369216097639	0.0033488744918102	0.1148684405293607	0.0033488744918102	0.1164345673709022	0.0044389825475899	0.8374130885734602	0.000492384076867	0.576807652423549	0.000492384076867	0.583007318040042	0.0001143688815005	0.7917856177854611	1.4351066764787845e-05	0.5297825496674301	1.4351066764787845e-05	0.53586300118609	0.0016454422486885	0.5526845382968741	0.0016454422486885	0.5589180153517296	AGO3	28665	AGO1	89575	TEKT2	124711	False	False	False	alt	-90	0.0992	85	0.06604
51	chr1	35975547	G	T	rs709309	-0.0068577144	0.6040962919649653	0.0199303632	0.6039754743237707	0.0270888607041276	0.2858176413631753	-9.801881278768404e-05	0.5313215829192769	0.0005233044239607	0.5310984921266948	0.0023580548315792	0.9058872516087396	-3.871769823649133e-05	0.8646180127711127	6.139248399517621e-05	0.8654001707264035	5.965934295613072e-05	0.8713092963871778	-8.261709553489605e-07	0.8343574656954301	1.5478776947830674e-06	0.8350779745559198	-0.0001798027118867	0.8592071430133423	0.0002457853584507	0.8598582777642997	AGO3	44828	AGO1	105738	TEKT2	108548	False	False	False	ref	70	0.0093	100	0.06152
52	chr1	36027819	T	C	rs274728	-0.02453214132	0.5442911852789757	0.02453214132	0.5382685791670194	0.0165562644091981	0.6117077982742867	-0.0004079249050246	0.5782971312592382	0.0004079249050246	0.5723555257020876	0.0003439345452145	0.9946876267225342	-9.32105963891829e-06	0.9681164146732156	9.32105963891829e-06	0.9611017210661752	5.892860366548422e-06	0.9925559715184844	-1.587486948766545e-07	0.9639187514375058	1.587486948766545e-07	0.9568688742951112	-3.2166540199927416e-05	0.9691976375250038	3.2166540199927416e-05	0.962467495914228	TEKT2	56276	ADPRS	61074	AGO3	97100	False	False	False	ref	45	0.005127	40	0.11566
53	chr1	36044355	A	T	rs812106	-0.01926342644	0.6246707167224052	0.01926342644	0.6180804248700517	0.0260790665670421	0.3029360315227098	-0.0004610354744379	0.5586949119291907	0.0004610354744379	0.5524775268775125	0.0008470522252647	0.9707623008033124	-1.561696746566547e-05	0.9470919380210988	1.561696746566547e-05	0.9401177959483756	2.257632717388543e-05	0.9460821067406616	-3.7930053638262633e-07	0.9245101826208956	3.7930053638262633e-07	0.917548870628413	-7.340569430238958e-05	0.9351496308077414	7.340569430238958e-05	0.9282101266566506	TEKT2	39740	ADPRS	44538	COL8A2	80867	False	False	False	ref	-5	0.006287	-5	0.01694
54	chr1	36128255	T	C	rs7542594	-0.0525439254	0.2575642668637273	0.0597657774	0.2555283445724626	0.0536080562199103	0.0447849399115725	-0.0026537153241967	0.129693840786907	0.0030611104635998	0.1290545079934327	0.0437580416350499	0.4655407889416066	-0.0028471958934789	0.3522615912144881	0.0031254817771437	0.348816268977759	0.0023011729307345	0.2885157929393956	-0.0001423147985202	0.2354834041338026	0.0001580133080653	0.2332496421958003	-0.0069817887895483	0.2885039480877421	0.0077273926957209	0.28550383324527	COL8A2	3033	MAP7D1	27325	TRAPPC3	27798	False	False	False	ref	-45	0.04562	-15	0.06238
55	chr1	43337449	C	A	rs839993	-0.0304443006	0.4724588550177125	0.0304443006	0.4672251635728582	0.0218390952660016	0.418338579551625	-0.0006567826783742	0.444631637659947	0.0006567826783742	0.4393353483495081	0.076938240242816	0.3575649274830434	-0.0027002171893246	0.3565600599250794	0.0027002171893246	0.3517040506809014	0.0016795073790956	0.348360105844376	-5.867477980355967e-05	0.3525791180336987	5.867477980355967e-05	0.3477625419493559	-0.005575533634654	0.332674343719767	0.005575533634654	0.327918887301874	MPL	370	CDC20	21533	ELOVL1	30625	False	False	False	ref	100	0.08734	100	0.3003
56	chr1	43350861	T	C	rs839996	-0.0037127261488	0.8035646555265751	0.0092350508688	0.80300537025316	0.013732824266773	0.7514689977562131	-5.4053071351651e-05	0.833687190448633	0.0001266566094151	0.833152930507832	0.0023283626406254	0.911388094551254	-2.87345400611567e-06	0.943023949737734	1.5328164854005148e-05	0.9434739405233658	3.197439229768716e-05	0.928648367381104	-4.434740009514473e-08	0.9490796751914964	2.0916654359562586e-07	0.9495561016061632	-4.123915410242084e-06	0.9406860418163048	6.020916498960281e-05	0.940655307949076	CDC20	8121	MPL	13042	ELOVL1	17213	False	False	False	ref	55	0.02942	-95	0.1602
57	chr1	43376073	T	C	rs11587504	-0.1380523152	0.0629209802838361	0.1380523152	0.0623277550959915	0.0300167564353539	0.2243705381964116	-0.0044025971704864	0.0798913522254445	0.0044025971704864	0.0791679431033757	0.0173484873478274	0.6512565851551145	-0.002577570611366	0.3824359264790339	0.002577570611366	0.3774975221532605	0.0005519602518377	0.5706448651461843	-8.83666813437955e-05	0.3280196662957755	8.83666813437955e-05	0.3235765924644374	-0.0065347563590775	0.3183216418007462	0.0065347563590775	0.3140459506405145	ELOVL1	7999	MED8	13735	SZT2	13810	False	False	False	ref	-25	0.01477	-70	0.0849
58	chr1	43376500	A	G	rs685756	-0.0132496142719999	0.7129728211115888	0.0136111461279999	0.7088691149571207	0.0192501622436087	0.5129356213328776	-0.0002623942027169	0.6857248497481458	0.0002685955360758	0.6815777447937246	0.0172000263930585	0.6381321309905323	-0.0002223667677379	0.726015157123946	0.0002284422944242	0.7222500437088152	0.0003245061544525	0.6373572185811833	-4.2949611203530365e-06	0.7163292722561857	4.399174250228932e-06	0.7125138123916851	-0.0007439543400085	0.7134477262952543	0.0007604500016495	0.7096532507738712	ELOVL1	8426	MED8	13308	SZT2	13383	False	False	False	ref	-100	0.08	-100	0.1414
59	chr1	43398186	G	A	rs839761	0.268300186	0.0138919236093249	0.268300186	0.0139890025230625	0.048459769566926	0.0629237302840542	0.0143015929289106	0.0152477083631015	0.0143015929289106	0.0152883572946833	0.037402263204777	0.5267705590102209	0.0144949719138603	0.1567081087705544	0.0144949719138603	0.1589173512290914	0.0020784288153248	0.3516047477218623	0.00084925565103	0.1011513629578562	0.00084925565103	0.1024671083058458	0.0240069611692124	0.096330606623973	0.0240069611692124	0.0975485786258862	SZT2	8303	MED8	8378	ELOVL1	30112	False	True	False	alt	50	0.06836	-10	0.0166
60	chr1	43410148	T	C	rs3001721	0.0994631088	0.1040357504976654	0.0994631088	0.1054684256829413	0.0234998174215469	0.3689400823140913	0.0023619293865484	0.1426392459850306	0.0023619293865484	0.1444844553698263	0.0135478869057437	0.6931833524040226	0.0012613049493381	0.4468930767991241	0.0012613049493381	0.4522199081835381	0.0002840738814407	0.6665640401045533	2.6642560729786225e-05	0.4292286984664492	2.6642560729786225e-05	0.4346148757670465	0.0037865791296888	0.394926095243898	0.0037865791296888	0.4000101016815296	SZT2	20265	MED8	20340	ELOVL1	42074	False	False	False	alt	-75	0.01526	0	0.0
61	chr1	43414425	A	T	rs72671121	-0.00227319868	0.9191842720328508	0.0033594691999999	0.9201405587594031	0.0080142136882075	0.960404069435552	-1.8150548790117862e-05	0.956123717205692	2.5790391174319192e-05	0.9574122769337406	0.3165946356108343	0.1020115349204592	-0.0007778410529705	0.5272805912525501	0.0011066801435029	0.5269248471311913	0.0025471812476785	0.2703491931303718	-6.30804909152079e-06	0.6497683703189544	8.601335846329396e-06	0.6499455933090553	-0.0007810695787008	0.6602253679160468	0.0011720167595922	0.6603055103876851	SZT2	24542	MED8	24617	HYI	39564	False	False	False	ref	100	0.1305	100	0.3865
62	chr1	43441225	A	G	rs2027130	0.0039139010399999	0.7624113815687328	0.0114931424	0.7613578395487428	0.0835684122969935	0.0094791608094641	0.0003738287321277	0.4141307832130592	0.001032625909968	0.4130005524915766	0.1021477351456566	0.3083431809108192	0.0002478000822923	0.5653579233159002	0.0009029103467946	0.5639223986587161	0.0076401768692045	0.1049083058676872	2.518829456979725e-05	0.3599015946172438	7.98785557252676e-05	0.3584689911732237	0.0004651776582758	0.5821863689883444	0.0019943254923954	0.5807325112449226	HYI	12764	SZT2	51342	MED8	51417	False	True	True	alt	50	0.01927	100	0.1362
63	chr1	43458495	A	T	rs2494994	-0.0186305931999999	0.581623032828527	0.0217969656	0.5777392518640755	0.0323878095357196	0.1873077511401421	-0.0005985495563889	0.4369862949670561	0.0007010634557906	0.4337475339382207	0.0075302695391111	0.7857209345316413	-7.602191222805396e-05	0.7702552734031028	0.0001389476992914	0.766872169187722	0.0002432590930542	0.7036415055540475	-2.420950604545101e-06	0.6989365426990716	4.458224536521123e-06	0.6956747008737346	-0.000301045824948	0.7588817048821347	0.0005088911616244	0.7554456971518043	HYI	4506	PTPRF	66693	SZT2	68612	False	False	False	ref	-60	0.01114	-45	0.03906
64	chr1	43461740	T	C	rs2842196	0.2918318279999999	0.0097480335472727	0.2918318279999999	0.0098366926874276	0.063861819131445	0.0249171660431045	0.0193648239088782	0.007766481389447	0.0193648239088782	0.0077709822764265	0.0057074989277819	0.8157693926103731	0.0018482953356346	0.4055126554758899	0.0018482953356346	0.410575141923387	0.0003906776391329	0.6297348814741359	0.0001300798863098	0.2488697740412994	0.0001300798863098	0.2526169020598782	0.0041057701824419	0.3885797246345093	0.0041057701824419	0.3936765204822789	HYI	7751	PTPRF	63448	SZT2	71857	False	True	True	alt	-100	0.00852	-100	0.06116
65	chr1	43473130	A	C	rs7413861	-0.036443997	0.163788354194733	0.084018881	0.1630578433017672	0.0710126344530206	0.0172538318005683	-0.0036625664333206	0.0569108619523171	0.0064806046664002	0.0567772549280231	0.3942347662564745	0.0716878682224631	-0.0115812996537575	0.0568649358935958	0.031353443067311	0.0565508604869284	0.0278043467737827	0.0112013380980141	-0.0012285709128113	0.025325869513452	0.0023814723877192	0.0252806210161238	-0.013352413315298	0.0688746882633291	0.0289672066246577	0.068600846306715	HYI	19141	PTPRF	52058	SZT2	83247	True	True	False	ref	-90	0.02673	-95	0.0919
66	chr1	43483103	G	A	rs10789433	-0.0273605883999999	0.4983399223132693	0.0273605883999999	0.4924513006271698	0.0201228937005152	0.4693257374910944	-0.0005429672809598	0.4829634034264493	0.0005429672809598	0.477225409074708	0.0001212431130612	0.9992514535113026	-3.133826559381662e-06	0.9926484263770646	3.133826559381662e-06	0.985886711039554	2.538649963156695e-06	0.9982641082762564	-6.459739275606203e-08	0.9871166391983688	6.459739275606203e-08	0.9802516660823382	-1.1546963148691882e-05	0.9900458838679984	1.1546963148691882e-05	0.984764533043706	HYI	29114	PTPRF	42085	SZT2	93220	False	False	False	ref	25	0.001968	40	0.11005
67	chr1	43483424	A	G	rs10732843	-0.0204223866	0.5971194055760768	0.0204223866	0.5909540121829652	0.049900366690399	0.0566669965578753	-0.0010343833759528	0.3152832767591171	0.0010343833759528	0.3110487190961988	0.0001030978852561	0.9995510595419546	-1.973978547244612e-06	0.9959398895483772	1.973978547244612e-06	0.9905620212933336	4.857424512304703e-06	0.9951641738649564	-9.485421849202789e-08	0.9785747602808458	9.485421849202789e-08	0.971522345663856	-4.123915410247106e-06	0.9983260930917568	4.123915410247106e-06	0.9930962047534636	HYI	29435	PTPRF	41764	SZT2	93541	False	False	False	ref	100	0.0101	-100	0.1737
68	chr1	43580248	A	G	rs2077652	0.0723757286	0.171423373448734	0.0781912205999999	0.1727391296581787	0.0307607018673524	0.2122451062248712	0.0023898357046366	0.1565652622672522	0.0025519180336531	0.1575155387320602	0.0232893998878294	0.5951184760355799	0.0010110553962682	0.4442760087801474	0.0012231814610432	0.4476301985733061	0.0006824582626974	0.5197850333045992	3.293218221140527e-05	0.3820460478572139	3.884430239941689e-05	0.3853139398627265	0.0029634456138035	0.400191262050279	0.0036513147042327	0.4036167752527079	PTPRF	55060	ENSG00000284989	69902	ST3GAL3	125577	False	False	False	alt	-95	0.1724	-45	0.08984
69	chr1	43582229	G	C	rs16830935	-0.0275663254	0.4734986306488883	0.0306288318	0.4694061821296005	0.0184471384547992	0.5399800717756195	-0.0005924572410493	0.4902095834710646	0.0006399657307557	0.4862939040791262	0.1255418824849064	0.2612630102184675	-0.003352418048852	0.3112765773867364	0.0038452849617348	0.3080173173624907	0.0023064046422957	0.2888367069623871	-7.141564451601453e-05	0.3297019304619861	7.90614612607263e-05	0.3264529704830186	-0.0064423806538879	0.2970938466612982	0.0072638646036091	0.2938657253175517	PTPRF	57041	ENSG00000284989	67921	ST3GAL3	123596	False	False	False	ref	100	0.0733	85	0.1555
70	chr1	43596766	C	T	rs10890265	-0.0028583134	0.4748486325738286	0.0289069742	0.4731753452799325	0.0203215067531036	0.4712293292878747	-2.9989105958799908e-06	0.4678678404031439	0.0006154931440707	0.4663596488411575	0.0195514829599814	0.6242175946287868	-0.0001266910972021	0.5792737801510404	0.0006340615040319	0.5773606558727572	0.0004120890013091	0.6119780513479155	-1.8369484746213048e-06	0.5671233499916609	1.371104198979786e-05	0.5654295281918248	-0.0005765233743525	0.5421381706078012	0.0020396885619081	0.5401356479999045	ENSG00000284989	53384	PTPRF	71578	ST3GAL3	109059	False	False	False	ref	70	0.03064	70	0.01672
71	chr1	43613740	T	C	rs603542	0.03802036326	0.3694357492388029	0.04247119606	0.3719500179467566	0.0220412876870768	0.4121370628890106	0.0010334067930768	0.3795433291262499	0.0011090845852433	0.3821826416072285	0.1241933621457556	0.2677794638144635	0.0069032332279135	0.2682183119191095	0.0072869598783263	0.2710407379290451	0.0028403881702237	0.2638341640383383	0.0001816676754922	0.272171043022008	0.0001881922042237	0.2745339466342217	0.0103353568011612	0.2396333602578162	0.0111568407508824	0.2418028560237075	ENSG00000284989	36410	PTPRF	88552	ST3GAL3	92085	False	False	False	alt	-55	0.03412	-60	0.02527
72	chr1	43618949	G	T	rs16831024	-0.01802895852	0.5545866555683687	0.02308961692	0.5499505839341764	0.0143646324418513	0.7177497253586432	-0.0002890782092597	0.6188538949006063	0.0003467102645165	0.6141939845630789	0.0666441225957572	0.380717172211263	-0.0014499859523797	0.4276085741440512	0.0017374873041804	0.4235510247680547	0.0009700259238058	0.445475133135797	-2.3098074309730903e-05	0.4746416990523078	2.637221238344443e-05	0.4704321370541479	-0.0033312988683976	0.4056264671164681	0.004073603642242	0.4014000427655734	ENSG00000284989	31201	ST3GAL3	86876	PTPRF	93761	False	False	False	ref	95	0.01947	-95	0.003052
73	chr1	43621160	C	T	rs1143702	0.211997236	0.0273150139037212	0.211997236	0.0274593817222477	0.0311813731166935	0.2056160888685193	0.0072076596206053	0.0453002804949408	0.0072076596206053	0.045528446097209	0.4404234436343241	0.0572355150133877	0.1107882465046711	0.0115912744963629	0.1107882465046711	0.0116115744884389	0.0143717036668048	0.0462886948598057	0.0038346246985721	0.0187503001431984	0.0038346246985721	0.0188351355871785	0.0647858863118999	0.0152749569906732	0.0647858863118999	0.0154571421814099	ENSG00000284989	28990	ST3GAL3	84665	PTPRF	95972	False	False	False	alt	-55	0.01563	60	0.09814
74	chr1	43636916	C	T	rs11210894	-0.04693372976	0.3094666408491267	0.04693372976	0.3055149870176733	0.0174539275695991	0.5672871676362502	-0.000902310096397	0.3843779679513845	0.000902310096397	0.3796774357118355	0.0171158985186895	0.6462110045816171	-0.0009437672602974	0.5484377920960738	0.0009437672602974	0.5423353971002803	0.0003284529720332	0.6543260316698417	-2.011902335631933e-05	0.5570049248662889	2.011902335631933e-05	0.5509448440027597	-0.0030492230543366	0.4931360983005197	0.0030492230543366	0.4871414227758321	ENSG00000284989	13234	ST3GAL3	68909	PTPRF	111728	False	False	False	ref	-40	0.003601	35	0.05408
75	chr1	43640118	C	T	rs12045413	-0.26846312	0.0117134235020722	0.26846312	0.0116697753664004	0.033198414442604	0.1789425002174123	-0.0093068965390826	0.0246815395587682	0.0093068965390826	0.0245718890392048	0.0582478308204941	0.4153283914690307	-0.0165877639443318	0.1087269843155773	0.0165877639443318	0.1068156043101474	0.0020451149119619	0.3222157119049296	-0.0005941798883228	0.0922021972643196	0.0005941798883228	0.0906831718089847	-0.0319133317937381	0.052438876980938	0.0319133317937381	0.0516375485776344	ENSG00000284989	10032	ST3GAL3	65707	PTPRF	114930	True	True	False	ref	100	0.02643	10	0.05615
76	chr1	43652524	A	T	rs12041746	-0.00259198596	0.6713478030512732	0.01653175244	0.6721700922657673	0.0287620131788296	0.2522317850945244	-4.0105271910500006e-05	0.6102699612877285	0.0003701188379629	0.6115177005152125	0.0016883309689551	0.932362493606136	-1.751562799624039e-06	0.908519533280196	3.0332919932776315e-05	0.9099513171391452	4.5205662770313015e-05	0.8943044557531805	-3.803167433739005e-08	0.8845858883657013	6.496598572389832e-07	0.8860065229472216	-8.24783082033079e-07	0.9185407848576498	8.990135594336496e-05	0.9198905459857792	ENSG00000284989	2374	ST3GAL3	53301	PTPRF	127336	False	False	False	ref	100	0.139	-65	0.06445
77	chr1	43706787	C	T	rs34550543	-0.060848554	0.229552208791809	0.060848554	0.2261659052002103	0.0264496335953652	0.2939360187569783	-0.0016448745694767	0.2152118518793885	0.0016448745694767	0.2121411553536965	0.719676025205371	0.0137730496305745	-0.0440213768867447	0.0338487938736079	0.0440213768867447	0.0332795684531144	0.0191119770915504	0.0252343332890663	-0.0011949630785321	0.0442935550824687	0.0011949630785321	0.0435756774500243	-0.0119890468806703	0.1759394304876929	0.0119890468806703	0.1726937801666501	ST3GAL3	962	ENSG00000284989	56637	PTPRF	181599	False	False	False	ref	-20	0.011475	85	0.1337
78	chr1	43765809	G	A	rs56352978	0.0598369554	0.2204714008438571	0.0649534562	0.2226743787486425	0.0234983248402345	0.370711385077851	0.0014585679323628	0.2408364750311002	0.0015741721948267	0.2428813723470704	0.4842548909636764	0.0468229105383845	0.0326183725964187	0.0541372190845564	0.0344182672702978	0.0548893388596072	0.0114209587222386	0.0615215525136313	0.0007954398573596	0.0712893000473949	0.0008361073972006	0.0719790703022884	0.0171835307314176	0.1072374501181145	0.019059087459998	0.1085106192933234	ST3GAL3	59984	ENSG00000284989	115659	ARTN	167512	False	False	False	alt	25	0.0352	15	0.003906
79	chr1	43767861	C	T	rs11590088	0.01270698848	0.7098854308145209	0.01270698848	0.7166807948729876	0.0233197486363507	0.3777102693501572	0.0002942326148385	0.6323469462287297	0.0002942326148385	0.6387052612068247	0.0019844280954108	0.920901258140416	2.572954729695812e-05	0.8958314987001698	2.572954729695812e-05	0.9028930727718252	4.703001016368251e-05	0.8930700223475105	5.994161650312695e-07	0.871539167553626	5.994161650312695e-07	0.878538005067773	0.0001088713668304	0.8918675743177107	0.0001088713668304	0.898913948648597	ST3GAL3	62036	ENSG00000284989	117711	ARTN	165460	False	False	False	alt	10	0.002075	-50	0.0503
80	chr1	49392239	C	T	rs3957	-0.0412270822	0.3738887077707306	0.0412270822	0.3692157026080002	0.0154147617003257	0.6734570548235039	-0.0006693710364394	0.4663869713235423	0.0006693710364394	0.4610377774941346	0.013969351060671	0.6945424800798417	-0.0003796580568808	0.628869055041887	0.0003796580568808	0.6230152042383088	0.0002068463064134	0.7272325614372028	-5.847348253608402e-06	0.65308586184913	5.847348253608402e-06	0.646994513783858	-0.0012800633433406	0.6029913645576177	0.0012800633433406	0.5971579754962578	BEND5	615270	AGBL4	631715	ELAVL4	631791	False	False	False	ref	-10	0.01027	35	0.03088
81	chr1	49508120	T	C	rs1167295	-0.00915209124	0.7395156629158703	0.01198812176	0.7351561133741666	0.0260025357256154	0.3047940621774591	-0.0002586885103997	0.6316314092017051	0.0003185481689082	0.6273880698569476	0.0005509550988089	0.9865570874791026	-5.072883210087142e-06	0.97459615729415	6.406175913377987e-06	0.9701968579580657	1.4319619336412757e-05	0.9710711876646132	-1.4105875373872374e-07	0.9572710906352856	1.692003569106984e-07	0.9528512967788692	-2.2269143215334374e-05	0.9726817477200396	2.5568275543532062e-05	0.9682184676521716	AGBL4	515834	ELAVL4	515910	BEND5	731151	False	False	False	ref	35	0.003891	100	0.06665
82	chr1	49509401	C	T	rs1167294	0.031767696	0.4342856178901938	0.031767696	0.4397086662508923	0.027623028537195	0.2681568304866907	0.0008862917298461	0.3442590906982617	0.0008862917298461	0.3489137751152348	0.0095526376562963	0.7375034095952887	0.0002783553244781	0.652936556045857	0.0002783553244781	0.6591035865887311	0.0002608722798634	0.6765258227055787	7.671546190577316e-06	0.5979916297815192	7.671546190577316e-06	0.6041215109993069	0.0010771667051565	0.6199577863705885	0.0010771667051565	0.6261915037037068	AGBL4	514553	ELAVL4	514629	BEND5	732432	False	False	False	alt	-90	0.01433	70	0.01347
83	chr1	49552771	T	C	rs1405913	0.0152396242	0.3867363542435084	0.0398090418	0.3888027014148834	0.0505913548338538	0.0542122037847914	0.0005833312016224	0.2031831121282125	0.0019482335619566	0.2048434968161224	0.1291816502259905	0.2531617064107448	0.0015875381059062	0.2458314780318616	0.0059156171839588	0.2476013718004505	0.0065058330747207	0.1250229051273275	4.997442143141148e-05	0.1613804663326911	0.0002904117594606	0.1626379797603115	0.0030343769588598	0.2250275927351454	0.0099708026788954	0.2265055497607551	AGBL4	471183	ELAVL4	471259	BEND5	775802	False	False	False	alt	-20	0.006958	40	0.04907
84	chr1	49561483	C	T	rs1305494	0.0958172358	0.1459151419004	0.0958172358	0.1476422957727082	0.0407116918505942	0.1049300597957713	0.0042967213516886	0.1090416182176516	0.0042967213516886	0.1101669730385828	0.000185576193461	0.998444723115388	1.917181022885309e-05	0.9342493747996312	1.917181022885309e-05	0.9412152004684028	7.767286926386342e-06	0.9893257730846332	8.421143738033374e-07	0.8805524915594748	8.421143738033374e-07	0.8873964004755703	4.61878525947661e-05	0.9508314110772303	4.61878525947661e-05	0.9566052360956931	AGBL4	462471	ELAVL4	462547	BEND5	784514	False	False	False	alt	-100	0.01486	-100	0.2368
85	chr1	49615927	C	T	rs11205633	-0.0699877759999999	0.1946236027721192	0.0699877759999999	0.1917674852738881	0.0417549483976867	0.0978006051477975	-0.0030695327224028	0.1195565524609163	0.0030695327224028	0.1181386568307875	0.0080333872191613	0.7600885103236936	-0.0005861116287804	0.5734950430161871	0.0005861116287804	0.5676459885875242	0.0003471160066974	0.6303332226388062	-2.610382838967949e-05	0.4595917024287198	2.610382838967949e-05	0.4540813076814808	-0.0020165946356108	0.5288684175595327	0.0020165946356108	0.5230781713911857	AGBL4	408027	ELAVL4	408103	DMRTA2	807516	False	False	False	ref	20	0.003143	-100	0.12384
86	chr1	49620517	C	G	rs6684606	-0.13041572	0.0629097596088306	0.13041572	0.0620974953279672	0.0645887494628954	0.0242585876971427	-0.0085488545601591	0.0262729079847295	0.0085488545601591	0.0261598312850101	0.0209066015637886	0.613122933162342	-0.0027900193017973	0.3393583401168427	0.0027900193017973	0.3346668363373785	0.0012835831453914	0.4015380525563843	-0.0001715958920765	0.2012094366216399	0.0001715958920765	0.1979978557756269	-0.0073653129227012	0.27165479246281	0.0073653129227012	0.2674051048499846	AGBL4	403437	ELAVL4	403513	DMRTA2	802926	False	False	False	ref	-20	0.01541	5	0.001709
87	chr1	49647919	T	C	rs6588355	-0.02965056662	0.4447552620091954	0.03548734662	0.4425092482347607	0.0172701487501072	0.5829730743463668	-0.0007497802530608	0.4847545836301488	0.0008086197098663	0.482323907489033	0.003288410148131	0.8752673253348235	-0.0001083801560529	0.8152432411812477	0.0001246998784218	0.8116351247549239	5.8355988150915286e-05	0.8790642067495091	-2.679169189815893e-06	0.80825418640617	2.843685172933148e-06	0.8044689040360284	-0.0003381610636402	0.8007712921230731	0.0004206393718451	0.7971611734932116	AGBL4	376035	ELAVL4	376111	DMRTA2	775524	False	False	False	ref	-70	0.218	100	0.3323
88	chr1	49652929	T	C	rs6660689	0.138689116	0.0587337457962445	0.138689116	0.0594346068789302	0.0393059468915608	0.1150037069170251	0.0057502836313637	0.0524288191066634	0.0057502836313637	0.0528814589935516	0.0566073372702978	0.4385623674521544	0.0108888785834572	0.1826094186017552	0.0108888785834572	0.1857036249856529	0.0024093437330226	0.3129032379566874	0.0004840113108387	0.1377263360592652	0.0004840113108387	0.1401189830997107	0.0206822605654712	0.115712941570366	0.0206822605654712	0.1174309991427643	AGBL4	371025	ELAVL4	371101	DMRTA2	770514	False	False	False	alt	-100	0.2394	-100	0.1455
89	chr1	49716626	C	T	rs12137221	0.0935375869999999	0.1171171340980057	0.0935375869999999	0.1188535530405491	0.030009007994585	0.2224661495614815	0.0029690167807377	0.1151902094584605	0.0029690167807377	0.1167026439621768	0.0009254066180594	0.9735195118728922	8.39292659509015e-05	0.8241843789305318	8.39292659509015e-05	0.8308895038389362	2.717100715205129e-05	0.9466450116737544	2.614344346706645e-06	0.7665319565971291	2.614344346706645e-06	0.7730214158331501	0.0002746527663224	0.8271220107187933	0.0002746527663224	0.8337644888796625	AGBL4	307328	ELAVL4	307404	DMRTA2	706817	False	False	False	alt	-30	0.00496	-100	0.12024
90	chr1	49752696	T	G	rs4926540	-0.0010343835599999	0.7154363523993137	0.0135608143599999	0.7139205657168475	0.0325970680846795	0.1849024088850571	-4.548691349842749e-05	0.5512986170859775	0.0004473307642624	0.5495969404346823	0.0033766619379102	0.9038316655669324	2.762538965631164e-05	0.9020754245913034	4.118363675869269e-05	0.9008321704399048	0.0001164707758815	0.8415140470601236	9.52271345254888e-07	0.8506919683653507	1.397223541767311e-06	0.849584481843538	0.0001039226683382	0.8976408301746687	0.0001484609547688	0.8963990862187226	AGBL4	271258	ELAVL4	271334	DMRTA2	670747	False	False	False	ref	-55	0.0403	80	0.1965
91	chr1	49850920	C	T	rs68007327	-0.0508642654	0.2887180259896908	0.0508642654	0.2846677173060049	0.022773404570302	0.3935402876393265	-0.0011957171486219	0.2911746449587494	0.0011957171486219	0.287375713750055	0.0018986506548777	0.929831979557299	-0.0001137084000226	0.8109580372834165	0.0001137084000226	0.8042057850635432	4.575552077540317e-05	0.9060409108081964	-2.805719052518782e-06	0.7805576830026699	2.805719052518782e-06	0.7737737876130606	-0.000385998482399	0.808371374805738	0.000385998482399	0.8016035890668639	AGBL4	173034	ELAVL4	173110	DMRTA2	572523	False	False	False	ref	45	0.01889	100	0.0726
92	chr1	60578378	C	T	rs987335	-0.0303962081	0.457423120746695	0.0303962081	0.4517683438796073	0.0469758092383204	0.0692009498133383	-0.0014938934611299	0.260778391476377	0.0014938934611299	0.2577189429714552	0.0318885883012767	0.5269429959077979	-0.0009563086752352	0.5139286395410533	0.0009563086752352	0.5080820088999813	0.0014983314414612	0.3699140229705563	-4.6447228055812886e-05	0.3913631530337604	4.6447228055812886e-05	0.3861721707320139	-0.0028512751146447	0.4756959629745506	0.0028512751146447	0.4697491938440992	NFIA	286882	C1ORF87	504608	CYP2J2	651605	False	False	False	ref	80	0.0307	-100	0.06506
93	chr1	60586229	C	T	rs11207639	0.0086502428	0.7475309319093901	0.0112359731999999	0.7521559004858646	0.0249890316155524	0.3309549864771274	0.0002406646412107	0.6442431156999722	0.000288920936729	0.6487753686674449	0.0078849262643924	0.7645913825768158	5.0319577384911066e-05	0.8035556942151059	7.878001356532887e-05	0.8079105377869497	0.0001824531505471	0.7268932512216479	1.3582027454679765e-06	0.76714874901298	1.8893467721354644e-06	0.7714195749929521	0.0002028966381841	0.8022865998926378	0.0002936227772095	0.8066536073986417	NFIA	279031	C1ORF87	512459	CYP2J2	659456	False	False	False	alt	65	0.0125	-80	0.01736
94	chr1	60596802	G	A	rs484743	0.302155758	0.0093862503973808	0.302155758	0.0094198512508737	0.0738456333458918	0.0153173737647067	0.0243257286392715	0.0060144146593557	0.0243257286392715	0.0060364438669308	0.0381297218831447	0.5069680689659132	0.0115311548033014	0.1455652374726886	0.0115311548033014	0.1483049125831352	0.0028229035956198	0.2698771332463141	0.0009120110903631	0.0651616479734183	0.0009120110903631	0.0663615074536284	0.0223326515126521	0.0882267922536926	0.0223326515126521	0.0897407605416467	NFIA	268458	C1ORF87	523032	CYP2J2	670029	False	True	True	alt	-80	0.06012	-80	0.02783
95	chr1	60597975	G	T	rs10218679	0.0052443679999999	0.5695756381097284	0.022065284	0.5731556681135976	0.0149944460645523	0.6871153472476075	-1.7721421374152037e-05	0.6364960445846483	0.0003477916003262	0.6400984944181718	0.2084251591831348	0.1726145301949913	0.0006674267207635	0.2824035621091351	0.004420584357609	0.2850121275500815	0.0030335408297132	0.246966776048485	-1.0417068636576403e-05	0.3398644728609109	7.113782083878359e-05	0.3426044042410774	0.0012116063475305	0.3141713982760414	0.0063071162284318	0.3167352715383922	NFIA	267285	C1ORF87	524205	CYP2J2	671202	False	False	False	alt	-100	0.01344	65	0.0271
96	chr1	60620463	T	C	rs2987774	-0.0155099045999999	0.668983055428001	0.0155099045999999	0.6622280358390045	0.0144045547054772	0.7186013148063137	-0.0002236125026431	0.7121133551483273	0.0002236125026431	0.7054113894663139	0.0130084787700834	0.6819161390353385	-0.0002216770505082	0.7113795968414087	0.0002216770505082	0.704789547256918	0.0001900324711637	0.7207741964823295	-3.253009155483825e-06	0.7353965002868847	3.253009155483825e-06	0.7288821770194592	-0.0008165352512288	0.6953968877966362	0.0008165352512288	0.6889011267150409	NFIA	244797	C1ORF87	546693	CYP2J2	693690	False	False	False	ref	90	0.0209	100	0.1465
97	chr1	60646465	A	G	rs494011	-0.01396153176	0.7119199254123009	0.01396153176	0.7053216665476211	0.0193557483704675	0.5085019960571397	-0.000258857359898	0.6895988844510457	0.000258857359898	0.6828433158227454	0.0033238758206591	0.8713179612800185	-3.842277086074053e-05	0.8846455790559621	3.842277086074053e-05	0.8776576128227812	6.532925244133964e-05	0.859368970383908	-7.252745750485609e-07	0.8734245358700997	7.252745750485609e-07	0.8665033206360337	-0.0001558840025073	0.8783216174770352	0.0001558840025073	0.8714354407769268	NFIA	218795	C1ORF87	572695	CYP2J2	719692	False	False	False	ref	-5	0.000839	-60	0.02719
98	chr1	60653642	T	C	rs554774	0.234381344	0.0160673888035848	0.234381344	0.0161925044488339	0.0308764574974119	0.2121262990609603	0.0072699628632432	0.0331043490800179	0.0072699628632432	0.0333303573778092	0.0852223615189204	0.3354385818904065	0.0202036144376023	0.0824173582818195	0.0202036144376023	0.0841147188075684	0.0027890624602398	0.2622732154641188	0.0006612500608543	0.0768901215328394	0.0006612500608543	0.0782648870728097	0.0374954636930486	0.0365556150147491	0.0374954636930486	0.0372038786840808	NFIA	211618	C1ORF87	579872	CYP2J2	726869	False	True	False	alt	-30	0.00537	100	0.1393
99	chr1	60656200	C	A	rs489543	-0.202421676	0.0228600604183052	0.202421676	0.0226904788072616	0.0257823630154555	0.3111815050901863	-0.0052462518056115	0.0517329257069892	0.0052462518056115	0.0512615093225757	0.1843381940549635	0.1910651157149335	-0.038455303191238	0.0417820515770919	0.038455303191238	0.0408949640108464	0.0048787938895086	0.1693826050214458	-0.0010245741559381	0.0530022329130748	0.0010245741559381	0.0520835001016984	-0.0541090693147701	0.017969943139539	0.0541090693147701	0.0176856008289419	NFIA	209060	C1ORF87	582430	CYP2J2	729427	False	False	False	ref	-85	0.02701	-45	0.1909
100	chr1	60656438	A	G	rs471660	-0.00952020996	0.775430820658992	0.010176329	0.7709811553608216	0.0105334641494775	0.8920035857014842	-9.710282782336084e-05	0.8536687857670583	0.0001045916474655	0.8492775416926597	0.1219054138761505	0.2670813417555516	-0.0013532551508503	0.4698798738085059	0.0014231697848105	0.4662132069805584	0.0012880770180457	0.3948356306493815	-1.3775633457018928e-05	0.5617937416776044	1.4573625979261606e-05	0.5578566056671075	-0.0025411566757942	0.5044009923038972	0.002671472402758	0.5006333399192113	NFIA	208822	C1ORF87	582668	CYP2J2	729665	False	False	False	ref	-85	0.0396	-85	0.1411
101	chr1	65843709	A	C	rs4077431	-0.0064728222	0.6946372247307502	0.0142516634	0.6927239229945655	0.0239241383591598	0.3571451262591891	-0.0001491437902539	0.6065674285042961	0.0003404163924559	0.6048686425130372	0.0042608294018672	0.8401832294457122	-3.068636746993816e-05	0.8355011804671464	6.279889220185067e-05	0.8342260325428625	0.0001030157975884	0.8027673369556831	-7.205544300417892e-07	0.8015891134970817	1.5147098955370482e-06	0.8001633492538708	-0.0001146448484048	0.8235469290113315	0.0002565075385173	0.8222669508548306	PDE4B	51194	LEPR	423056	LEPROT	423121	False	False	False	ref	30	0.0152	50	0.0348
102	chr1	65847114	A	G	rs4133072	0.0309328634	0.4463635448278432	0.0309328634	0.4518498205186028	0.0265801196912707	0.2907722747363622	0.0008295461667934	0.3628812748617252	0.0008295461667934	0.3677091612557542	0.0355902147735145	0.5103732835849857	0.0011511191317556	0.4599591216886127	0.0011511191317556	0.4651800392681064	0.0009617349322834	0.457326614906684	3.136000657629056e-05	0.4174675297723112	3.136000657629056e-05	0.4225355164298626	0.0031778892151363	0.4259416168452252	0.0031778892151363	0.4312452235617731	PDE4B	54599	LEPR	426461	LEPROT	426526	False	False	False	alt	-95	0.02803	-90	0.2496
103	chr1	65858829	G	A	rs12129719	-0.0157747457	0.4096368613413415	0.0345500001	0.4069663692499951	0.0156790619210169	0.6572151290051295	-0.0003266377508721	0.482834545760981	0.0005688350270453	0.4798781927125645	0.0580853485533304	0.4092847786554225	-0.00098474708474	0.371042889200032	0.0023138686022619	0.3684818504595761	0.0009608184818175	0.4543191003926444	-2.3210542552186825e-05	0.4089022183007009	4.035596188341151e-05	0.4062563596808106	-0.0022376365016	0.3365644827139102	0.0054872818448747	0.3338697320516081	PDE4B	66314	LEPR	438176	LEPROT	438241	False	False	False	ref	-25	0.006836	-25	0.03198
104	chr1	71655902	C	A	rs954299	-0.1800175333999999	0.0406425727921603	0.1800175333999999	0.0402820515918657	0.0384313256628987	0.122110195770121	-0.0075207309170049	0.0443693856986654	0.0075207309170049	0.0440866957176824	0.3077958496915311	0.1061589059270207	-0.064948578555071	0.0268267456432844	0.064948578555071	0.0264936880146177	0.0121661710057175	0.0578530689778011	-0.0027328533784126	0.0268288747431009	0.0027328533784126	0.0265514031842436	-0.0596012998581372	0.0188013133108057	0.0596012998581372	0.0185921677692062	ZRANB2	574613	PTGER3	608086	NEGR1	626637	False	False	False	ref	-25	0.03894	0	0.0
105	chr1	71656412	G	T	rs2422013	-0.00033785594	0.65745303889608	0.0168094648599999	0.6581165521337825	0.018109559505384	0.5509069853633758	-2.79570606306208e-05	0.6587622912904415	0.0002962469546734	0.6592847258388745	0.0811083435056579	0.3518027719777433	0.0004564882030685	0.4655004279817561	0.0013544280205563	0.4663484702766205	0.0013309550466659	0.3906693566978256	4.590332077407212e-06	0.4880592896632191	2.2027561311206985e-05	0.488751186187565	0.0004973441984757	0.46909437405076	0.002938702121342	0.4697919515136985	ZRANB2	575123	PTGER3	608596	NEGR1	626127	False	False	False	ref	85	0.01274	-90	0.3298
106	chr1	71657276	G	A	rs2901616	-0.0305166456	0.3511515933649717	0.04310132	0.3496038864419907	0.0152622574425016	0.6818168186918205	-0.0005463872790534	0.450471985060998	0.000709937529558	0.4488006744349194	0.1896555705849361	0.1857740394110425	-0.0072995897723156	0.1938438841438944	0.0090394090900314	0.1928346515867501	0.0029659203550098	0.2486661982186829	-0.0001291758815495	0.2462099300998854	0.0001521181694403	0.244942034890524	-0.0093687110289993	0.1848722270958014	0.0126167068061099	0.1839045975491973	ZRANB2	575987	PTGER3	609460	NEGR1	625263	False	False	False	ref	-100	0.0418	-70	0.1826
107	chr1	71661749	C	A	rs2422016	0.0073778370999999	0.7575383024767426	0.0110677676999999	0.7616360771762989	0.021945138306063	0.4191135268556488	0.0001455147180811	0.7014604282211362	0.0002393230564005	0.705864166536291	0.0127082577282174	0.693169361132365	0.0001186663281993	0.7497789903789787	0.0001558109315006	0.7538561098636014	0.0002693181634802	0.6725966786646325	2.335385901893923e-06	0.7291523083709873	3.279705430438833e-06	0.7332205452769639	0.0004412589488964	0.7441759955107461	0.0005616772788756	0.7484496240714228	ZRANB2	580460	PTGER3	613933	NEGR1	620790	False	False	False	alt	10	0.001053	-95	0.0917
108	chr1	71662548	G	A	rs12120761	-0.0433596928	0.3444058484712581	0.0433596928	0.3398206416195835	0.0174114378304691	0.5857330698074444	-0.0007797481325463	0.4040369126862714	0.0007797481325463	0.3991144250911135	0.0049874632971528	0.8262566480556115	-0.0001865485863242	0.7135111704282886	0.0001865485863242	0.707176812203095	8.165543466603386e-05	0.8341897096182952	-3.1970343765261305e-06	0.7199297619328157	3.1970343765261305e-06	0.7135299564775761	-0.0007076638843983	0.6960772293931018	0.0007076638843983	0.6896857465286255	ZRANB2	581259	PTGER3	614732	NEGR1	619991	False	False	False	ref	-85	0.0345	-90	0.07947
109	chr1	71664478	C	T	rs2422021	-0.0321370794	0.4578648325125899	0.0321370794	0.4526100491179094	0.0172593107953758	0.5866502049334891	-0.0006011699040209	0.4971426817127499	0.0006011699040209	0.4917557905577217	0.0250280426247896	0.5729375602699953	-0.0008812101869131	0.5331109564960891	0.0008812101869131	0.5275757431573425	0.0004554555349485	0.5921658433973432	-1.6778147620327977e-05	0.5464352304816992	1.6778147620327977e-05	0.5406250696922116	-0.0026195110685889	0.4971613359984769	0.0026195110685889	0.4917569292512943	ZRANB2	583189	PTGER3	616662	NEGR1	618061	False	False	False	ref	-100	0.0632	-100	0.2366
110	chr1	71668902	G	A	rs7531932	0.0048313146399999	0.6763274967052157	0.0146624463599999	0.6779457458202605	0.0246403561765511	0.3396342115885745	0.0001593411933932	0.5875229774072063	0.0003616964813158	0.5892475297777261	0.027321764375969	0.5527018047271994	0.0001179943738548	0.6092300113392319	0.0004448378071803	0.6104835531853646	0.0006688264219894	0.5120324555372917	4.192572366323431e-06	0.572008634174467	1.0850717739570168e-05	0.5732825104406309	0.0003785754346606	0.5954416646346995	0.0013980073240736	0.5966063344683001	ZRANB2	587613	NEGR1	613637	PTGER3	621086	False	False	False	alt	90	0.07996	85	0.11646
111	chr1	71687651	T	C	rs10789321	0.0404127026	0.2510424683953842	0.0567698466	0.2531363398378954	0.0321535390219322	0.1952920405264931	0.0015545962776721	0.1916708261242378	0.0019633621133352	0.1929832528893894	0.2299981854772194	0.1517252991518644	0.0077661017549021	0.1238673047534419	0.0127014820333325	0.1252427888065682	0.0072569204071707	0.1101044875930413	0.0003082543688178	0.1067821551732339	0.0004315897601208	0.1077900696974211	0.0116525353831941	0.1123286632411677	0.0177509814918675	0.1135238027344558	NEGR1	594888	ZRANB2	606362	PTGER3	639835	True	False	False	alt	-85	0.069	-75	0.25
112	chr1	71719533	G	T	rs11209830	-0.5747767319999999	0.0011550059333929	0.5747767319999999	0.0011402416768754	0.1112367731710618	0.0026944003020007	-0.064749650133187	0.0008207570018914	0.064749650133187	0.0008085134056116	0.1437209263963577	0.239483659086738	-0.0882344795161811	0.0126046399744454	0.0882344795161811	0.0124850355555966	0.016478507163595	0.0355456641155054	-0.0101962987040765	0.0036557803926366	0.0101962987040765	0.0036836815130048	-0.1070749892778198	0.0038077534249384	0.1070749892778198	0.0037633566340217	NEGR1	563006	ZRANB2	638244	PTGER3	671717	False	True	True	ref	-45	0.01514	-70	0.1287
113	chr1	71756804	G	A	rs12740031	0.0264952994	0.2759440006188698	0.052746331	0.2768951958470088	0.0201757632369544	0.4797407039686206	0.0006111020389828	0.3266803968058168	0.0010560325789323	0.3274529924730665	0.3711474382237471	0.079790284980556	0.0086777796848404	0.0891234256450957	0.0197233217409127	0.0894633560703268	0.0073503545559063	0.1079568212866861	0.0002071459640983	0.1176568791470064	0.0003892976249095	0.1177416640000831	0.0092004552802613	0.1148231929098874	0.0181295569265282	0.1150287149211469	NEGR1	525735	ZRANB2	675515	PTGER3	708988	True	False	False	alt	-100	0.1039	-100	0.4102
114	chr1	71843759	C	T	rs517762	0.00289007082	0.891322033453609	0.00487424474	0.8926431671615309	0.0186263762201623	0.5330293561994711	5.098501842729791e-05	0.8688954333549744	9.294422582925132e-05	0.8700845971986508	0.1199910923427138	0.2794614071268608	0.0005104478848752	0.591651830271987	0.0006739430460403	0.5928557954239976	0.0020243459828525	0.3176124145742858	7.710937721274573e-06	0.5992091839985446	1.1200906328405109e-05	0.6003378365890386	0.0006491042855728	0.6460009779441358	0.0010878888852231	0.6471238271519582	NEGR1	438780	ZRANB2	762470	PTGER3	795943	False	False	False	alt	50	0.02463	100	0.005432
115	chr1	71885236	A	G	rs11209863	0.1262920719999999	0.0657029099443044	0.1262920719999999	0.0666238128845133	0.0482721005750081	0.0632378848174094	0.0062008147462884	0.0414810812661316	0.0062008147462884	0.0418744046891271	0.1830729768070997	0.1928512214888065	0.0230409333024143	0.0716612681264834	0.0230409333024143	0.0731521324229575	0.0087887196849309	0.0896905581616488	0.0011294292356317	0.0457008869125451	0.0011294292356317	0.0465963360480085	0.033962917752631	0.0419061973476625	0.033962917752631	0.0426172344578763	NEGR1	397303	ZRANB2	803947	PTGER3	837420	False	False	False	alt	40	0.0315	15	0.08057
116	chr1	72810145	T	C	rs12135442	0.0850413826	0.1427212917485611	0.0850413826	0.1447659332813161	0.0193562418325424	0.5024454778814982	0.0017056811053852	0.2116314613890417	0.0017056811053852	0.2144762194587229	0.0046888918214509	0.8429209591141914	0.0004978591355362	0.6148134706266759	0.0004978591355362	0.621093433515423	9.291220833348764e-05	0.8309586352366591	1.0228405949261717e-05	0.6075425791896714	1.0228405949261717e-05	0.6136847118569785	0.0016528652964269	0.5840400744043268	0.0016528652964269	0.5904595037443344	NEGR1	527606	LRRIQ3	1388042	FPGT-TNNI3K	1388091	False	False	False	alt	100	0.01123	5	0.00641
117	chr1	72820726	G	A	rs11210070	0.00869665674	0.7933161595291697	0.00869665674	0.8002429700452028	0.0102109717345973	0.9000760319320564	8.333705525469071e-05	0.8634123949820782	8.333705525469071e-05	0.8702839127746347	0.0660148131041535	0.3922775875540933	0.000568311836127	0.5719248601405096	0.000568311836127	0.5780747571258134	0.000688798008606	0.5173375765005849	5.7013848885708405e-06	0.652683050390149	5.7013848885708405e-06	0.6591553975004301	0.0014252251657813	0.5896492527807076	0.0014252251657813	0.5958609939449919	NEGR1	538187	LRRIQ3	1377461	FPGT-TNNI3K	1377510	False	False	False	alt	-100	0.04642	-85	0.12134
118	chr1	72827649	T	C	rs2422320	-0.006536307302	0.8602790167677618	0.006605302618	0.8562394861857859	0.0219643725799183	0.4158049867195552	-0.0001415043302992	0.8148537729115218	0.0001430567189752	0.8108031327051792	0.007878327999736	0.7726349003261382	-4.408934884998169e-05	0.8904700260745437	4.447773345493799e-05	0.8863375353978936	0.0001742602489266	0.7459799979656647	-9.58116596070193e-07	0.8703091295757174	9.668552163017436e-07	0.8662992598059289	-0.000150935304015	0.8950123317967448	0.000150935304015	0.8896829305822712	NEGR1	545110	LRRIQ3	1370538	FPGT-TNNI3K	1370587	False	False	False	ref	-40	0.02972	-55	0.2332
119	chr1	72837963	T	G	rs1525980	0.1343474732	0.0612088967216121	0.1343474732	0.0619356397674594	0.0398944283874938	0.1107177291097362	0.0055371977395995	0.0520073153658662	0.0055371977395995	0.0525307265544135	0.0046402296196099	0.8327086742266602	0.000640761699589	0.5429683353761566	0.000640761699589	0.5486575745635834	0.0001912168527292	0.7226671917043876	2.707663302024958e-05	0.4364914781024945	2.707663302024958e-05	0.4419590977453678	0.0019786546138365	0.5153859258150632	0.0019786546138365	0.5211933233355592	NEGR1	555424	LRRIQ3	1360224	FPGT-TNNI3K	1360273	False	False	False	alt	-40	0.04834	60	0.03455
120	chr1	72950162	T	G	rs6682845	0.3660668139999999	0.0048444316478407	0.3660668139999999	0.0048653529994817	0.0677997877082462	0.0201156155592508	0.0255202909037617	0.0044930773221164	0.0255202909037617	0.0045063896022628	0.1415987595262445	0.2429941875843119	0.0515798881458243	0.0270146065806935	0.0515798881458243	0.0275709057798173	0.0095586879774316	0.0812799572558999	0.0036102359935972	0.0133527771594318	0.0036102359935972	0.0134688353959884	0.0735063178384084	0.0090067329550988	0.0735063178384084	0.0091052453557718	NEGR1	667623	LRRIQ3	1248025	FPGT-TNNI3K	1248074	False	True	True	alt	60	0.02014	60	0.1931
121	chr1	73065515	C	T	rs11210117	-0.0480057204	0.2995448154001414	0.0480057204	0.2953233171506414	0.013585156313062	0.758126831199109	-0.000675495774506	0.4321908760956838	0.000675495774506	0.4268950588231512	0.4513485203391507	0.0555278171195769	-0.0216074406252067	0.0783695992849643	0.0216074406252067	0.0768589678135438	0.0061234166529689	0.1316522806340688	-0.0003036753698031	0.1370181312701641	0.0003036753698031	0.1346210284980331	-0.0161418296987892	0.1294301719507874	0.0161418296987892	0.1270299910584519	NEGR1	782976	LRRIQ3	1132672	FPGT-TNNI3K	1132721	True	False	False	ref	90	0.1395	90	0.5425
122	chr1	73068063	C	A	rs11210120	-0.193108168	0.0288433098757766	0.193108168	0.0285661352413803	0.0589195678791196	0.0335052264907911	-0.0121446546438732	0.0179360355932394	0.0121446546438732	0.0178128094073733	0.0049388010953118	0.8345283178970203	-0.0011443996492319	0.5087336605229994	0.0011443996492319	0.502810683904918	0.0003011644628293	0.6740644894899717	-7.275304560474333e-05	0.3540382556421608	7.275304560474333e-05	0.3491369692880875	-0.0029518986506548	0.4837692938189905	0.0029518986506548	0.4777673796544288	NEGR1	785524	LRRIQ3	1130124	FPGT-TNNI3K	1130173	False	False	False	ref	-40	0.01688	55	0.03772
123	chr1	73078997	T	C	rs61773608	-0.0326402278	0.3222191144476544	0.051488793	0.3208025556645581	0.0214244825892584	0.4356264755491155	-0.0007299447585416	0.3661942425969344	0.0011519114758474	0.3645211573904299	0.0614207713371382	0.3956594966496417	-0.0021228223737337	0.346019092566061	0.003595337382903	0.3436067041639338	0.0013220820656805	0.3869869067154589	-4.780553204517305e-05	0.3483716426466171	8.077102927654296e-05	0.3460741764858216	-0.0044439312460822	0.2961331380381169	0.0077414140081158	0.2941924049904751	NEGR1	796458	LRRIQ3	1119190	FPGT-TNNI3K	1119239	False	False	False	ref	-20	0.04712	10	0.01123
124	chr1	73091210	A	T	rs4233100	-0.011678143346	0.7310842628517866	0.011791915854	0.7261713539564608	0.0104153480003437	0.8926716864572191	-0.0001215756608354	0.8194918369625477	0.0001227710610395	0.8146013594168433	0.003272739269572	0.8750936336853009	-4.8999504014351166e-05	0.8865662790247204	4.94635311421745e-05	0.8820826727046618	3.378881806205294e-05	0.9197095253584294	-5.024257713035727e-07	0.9141560588139176	5.073012736040559e-07	0.9097450719027635	-0.0002152683844148	0.8769654617736397	0.0002152683844148	0.8714309733132163	NEGR1	808671	LRRIQ3	1106977	FPGT-TNNI3K	1107026	False	False	False	ref	100	0.02179	60	0.04456
125	chr1	73094184	G	A	rs12141350	-0.1840797039999999	0.0337027218246393	0.1840797039999999	0.033290826693669	0.0350571605295849	0.1578588112272584	-0.0071652876461824	0.0435949938720593	0.0071652876461824	0.0431469258397465	0.0270000989739698	0.5593021063179354	-0.0054191525947367	0.2467873514407911	0.0054191525947367	0.24290538882287	0.0009791102996057	0.4548664141171371	-0.0002144697712334	0.1938681369100809	0.0002144697712334	0.1907017766078897	-0.0126241298538483	0.1737007137071518	0.0126241298538483	0.1707215777691163	NEGR1	811645	LRRIQ3	1104003	FPGT-TNNI3K	1104052	False	False	False	ref	-100	0.05722	-80	0.1162
126	chr1	73095920	T	C	rs11210125	-0.0131343859	0.7227883982165239	0.0131343859	0.7160115142655817	0.0184975399154394	0.5348675279181441	-0.000240754301589	0.6944711884866156	0.000240754301589	0.6879541572361811	0.0036356438256738	0.8698389092945739	-5.0301871896881474e-05	0.8716560923401401	5.0301871896881474e-05	0.8648006290576622	6.260450899650815e-05	0.8694974841154215	-8.661008750209473e-07	0.8662850587718204	8.661008750209473e-07	0.8595586669178614	-0.0001888753257892	0.8678432195072152	0.0001888753257892	0.8609471150487994	NEGR1	813381	LRRIQ3	1102267	FPGT-TNNI3K	1102316	False	False	False	ref	100	0.00464	0	0.0
127	chr1	73133797	G	A	rs4428835	0.0095232694	0.3078176448489004	0.0463767946	0.3090109550616197	0.0134453059054382	0.7265337661033717	0.0003475603142687	0.4345239955702599	0.000692747734447	0.4360258957415596	0.0490110850846227	0.4505707105019909	0.0014414432070377	0.353960731091917	0.0026994683393724	0.3559887806314539	0.0007670530254207	0.51570521438891	3.480948161450129e-05	0.4104727985654225	4.675946084033021e-05	0.4126642184734721	0.0033576919270231	0.3003141970415691	0.0067096103724719	0.3019137012246709	NEGR1	851258	LRRIQ3	1064390	FPGT-TNNI3K	1064439	False	False	False	alt	40	0.00597	60	0.03564
128	chr1	73134581	G	T	rs7547148	0.0078666205582	0.689573516427888	0.0151646020417999	0.6933084107589172	0.0405812184576434	0.104801535735041	0.0003281694503677	0.4778085671735278	0.0006369093292248	0.4809264495463733	0.0017353436046319	0.9314866652308152	1.3926099941275996e-05	0.9221250439428836	2.1907184785946973e-05	0.9262872063377768	7.070791154931918e-05	0.8540514154079828	6.049822611271409e-07	0.8623659776113115	9.425889063395744e-07	0.8664015275133969	6.433308039982828e-05	0.9107040227072044	9.897396984590396e-05	0.9137312795002576	NEGR1	852042	LRRIQ3	1063606	FPGT-TNNI3K	1063655	False	False	False	alt	75	0.01534	-80	0.04248
129	chr1	73135379	C	T	rs12118367	0.00643287042	0.7577934595584936	0.01106668282	0.7621375844140823	0.0175608755331503	0.5776045883049689	0.0001388082637944	0.7389867959084843	0.0001981705189073	0.7437052014760405	0.0013147042327867	0.9531312509238252	8.186575027685921e-06	0.9365203857866944	1.4970429663795784e-05	0.9409179872785572	2.2721049086781408e-05	0.9488399406176752	1.796644211745919e-07	0.9309860084257252	2.665701672943543e-07	0.9354155079803316	3.0516974035818816e-05	0.9349091706526858	6.020916498959799e-05	0.9392557584543644	NEGR1	852840	LRRIQ3	1062808	FPGT-TNNI3K	1062857	False	False	False	alt	-95	0.013466	-100	0.0758
130	chr1	73135616	T	C	rs12137150	-0.01570861926	0.67360086457957	0.01570861926	0.6670334715475474	0.0209176642168393	0.448715641390899	-0.0003395804149386	0.6143179504384573	0.0003395804149386	0.6080548566604715	0.0013064564019662	0.9530801428191444	-1.7945917240595294e-05	0.93559097523404	1.7945917240595294e-05	0.9285948458827468	2.6219055957072462e-05	0.9398132417653016	-3.8152329239723513e-07	0.9188203277364612	3.8152329239723513e-07	0.9118072763208842	-6.84569958100981e-05	0.938329978892057	6.84569958100981e-05	0.9312749891231272	NEGR1	853077	LRRIQ3	1062571	FPGT-TNNI3K	1062620	False	False	False	ref	45	0.003723	-95	0.03064
131	chr1	73144531	G	A	rs4391625	-0.1081646874	0.0956583720376571	0.1081646874	0.0944652953222863	0.0333885874612419	0.1744919643530608	-0.0036142632077004	0.0906911929390318	0.0036142632077004	0.0896585792047105	0.160431856421761	0.2266116387635619	-0.018708759257607	0.1036115466777823	0.018708759257607	0.101717198792418	0.0053206435794807	0.1614579006978636	-0.000618719759187	0.0907418615327764	0.000618719759187	0.0892036647368455	-0.0278100359605423	0.0680336291953935	0.0278100359605423	0.066990694245787	NEGR1	861992	LRRIQ3	1053656	FPGT-TNNI3K	1053705	True	False	False	ref	-15	0.00806	-10	0.03076
132	chr1	73146005	C	T	rs57852356	-0.0758778368	0.1735470134231557	0.0758778368	0.170865658860002	0.0463898545191404	0.0707538943707972	-0.0035988358566854	0.0931553413482593	0.0035988358566854	0.0919921345617396	0.0022615552109794	0.9124635593263908	-0.0001934240766309	0.7335003439171592	0.0001934240766309	0.7271360485934718	0.000108423984237	0.8046873529070372	-9.488105139192211e-06	0.6086388981832555	9.488105139192211e-06	0.6026405130503077	-0.000668899079542	0.7187855404212259	0.000668899079542	0.7125738023346173	NEGR1	863466	LRRIQ3	1052182	FPGT-TNNI3K	1052231	False	False	False	ref	85	0.0481	-75	0.06464
133	chr1	73148706	C	T	rs6424521	-0.1062935052	0.1015455246744102	0.1062935052	0.1000538580400563	0.0292125212481317	0.2382950403443891	-0.003051690337769	0.1123770655886711	0.003051690337769	0.1109069005616897	0.0007926165418494	0.9731559894309936	-9.060067174651268e-05	0.8118563700809783	9.060067174651268e-05	0.8051249586313838	2.4420910005736388e-05	0.9427155221327588	-2.7100349617044425e-06	0.7552398478189611	2.7100349617044425e-06	0.748688243821253	-0.0002952723433736	0.8223239518999436	0.0002952723433736	0.8156034661846596	NEGR1	866167	LRRIQ3	1049481	FPGT-TNNI3K	1049530	False	False	False	ref	15	0.00299	90	0.0746
134	chr1	73152946	A	G	rs4454488	0.1585175972	0.0563862886930928	0.1585175972	0.0569776028520953	0.0196489475090041	0.480770927160918	0.0042383061554758	0.1244699464976678	0.0042383061554758	0.1262506728977799	0.0760450001649565	0.3603701642560281	0.0129520126222853	0.1406806205161037	0.0129520126222853	0.1434043919001018	0.0014626793346284	0.3803312189917368	0.0003304878274234	0.168416015729011	0.0003304878274234	0.1713600821213967	0.0240712942496122	0.0846308117932389	0.0240712942496122	0.0861129719646239	NEGR1	870407	LRRIQ3	1045241	FPGT-TNNI3K	1045290	False	False	False	alt	-80	0.0934	30	0.0874
135	chr1	73153069	A	G	rs4369180	0.0852570234	0.1160768025746984	0.1034180342	0.1170736812774804	0.0650451192635687	0.0230842810260877	0.005876948607715	0.0476861408015112	0.0069845115439897	0.0479180442074037	0.0537412160601761	0.4379666139598578	0.0046663624145331	0.2400347950793393	0.0061640271724243	0.2428441880639685	0.0034993414164323	0.229049931151268	0.0003258259592945	0.1323320687328086	0.0004171621740214	0.1337483282143609	0.0106091847844016	0.1704145003939443	0.0137499587608458	0.1723808876177019	NEGR1	870530	LRRIQ3	1045118	FPGT-TNNI3K	1045167	False	False	False	alt	-90	0.0315	-90	0.2266
136	chr1	73153162	G	T	rs4633241	0.014805517	0.5445433830391835	0.023735803	0.5479268138218099	0.0270691493879497	0.28235329680881	0.0003865079880597	0.4386936739355094	0.00063629711756	0.4416194444780947	0.035498663851407	0.5264616066994697	0.0007696693371846	0.5222928181769089	0.000826936479316	0.5257166636950728	0.0010228452812281	0.4680614089450365	2.208224866854452e-05	0.4745401376503153	2.3684068537457684e-05	0.4779642570227823	0.0019382402428161	0.5070311989481481	0.0021922734320873	0.5104216974798066	NEGR1	870623	LRRIQ3	1045025	FPGT-TNNI3K	1045074	False	False	False	alt	-65	0.131	-100	0.1738
137	chr1	73153749	G	T	rs10399828	-0.2466105827999999	0.0166328930786367	0.2466105827999999	0.0165704039792781	0.0454964742674151	0.078741118822114	-0.0126053042892545	0.0193060344032896	0.0126053042892545	0.0191932747924031	0.0023291874237075	0.9160859368974648	-0.0006812265297285	0.5768054574684576	0.0006812265297285	0.5710321776023991	0.0001154108533333	0.8113674757009991	-3.7298610407290205e-05	0.4496380996789356	3.7298610407290205e-05	0.444229419050999	-0.0015398700141862	0.5915663610448062	0.0015398700141862	0.585599239125228	NEGR1	871210	LRRIQ3	1044438	FPGT-TNNI3K	1044487	False	True	False	ref	-60	0.007507	-45	0.10486
138	chr1	73156986	A	C	rs7528640	-0.020381959236	0.5855689618593038	0.020381959236	0.5796040785158655	0.0289288260415368	0.2461185349218719	-0.0006240398851604	0.4616585916312999	0.0006240398851604	0.455966696332077	0.0223573950051136	0.5956876987601598	-0.0004367939057815	0.6420296014691517	0.0004367939057815	0.6357266729563081	0.0006418867244307	0.5285289279807062	-1.383441972889045e-05	0.5813257225243509	1.383441972889045e-05	0.575209942210816	-0.0014021312394839	0.6198857440387441	0.0014021312394839	0.6135826717538522	NEGR1	874447	LRRIQ3	1041201	FPGT-TNNI3K	1041250	False	False	False	ref	80	0.009674	-25	0.02722
139	chr1	73159766	T	C	rs11210151	-0.01282034824	0.7386274681279025	0.01282034824	0.7319812670430752	0.0378456738648252	0.1270365468311525	-0.0004811180365325	0.5682506194937378	0.0004811180365325	0.5621909363953916	0.0026038401900299	0.8966241382483683	-3.923215677285816e-05	0.9036393087934156	3.923215677285816e-05	0.8967759259354137	9.955623316548984e-05	0.8097666748941516	-1.4671802716219134e-06	0.8417725737695171	1.4671802716219134e-06	0.8350266048753555	-0.0001748540133944	0.8826426258184658	0.0001748540133944	0.875849184127674	NEGR1	877227	LRRIQ3	1038421	FPGT-TNNI3K	1038470	False	False	False	ref	20	0.001419	-5	0.001892
140	chr1	73161111	T	G	rs11210155	0.05771235914	0.2609249188264477	0.05771235914	0.2645635863489028	0.0236683734585706	0.366219783438982	0.0015873840823662	0.2655391638573195	0.0015873840823662	0.2689756289204453	0.3304023291874237	0.095706375804173	0.0167230000073745	0.1112995978763652	0.0167230000073745	0.1134653846463455	0.0074402176186993	0.1068349114107976	0.0004465499022452	0.1212911404391356	0.0004465499022452	0.1236658632856249	0.0190409422321929	0.118291799884147	0.0190409422321929	0.1203481487925681	NEGR1	878572	LRRIQ3	1037076	FPGT-TNNI3K	1037125	False	False	False	alt	-15	0.00845	-95	0.1166
141	chr1	73161541	C	G	rs11210158	0.091612475	0.1408802521947516	0.091612475	0.1425757702724235	0.0203415488737149	0.461572129178799	0.0026445888027959	0.2000557794908586	0.0026445888027959	0.2021823826000863	0.3070131305466662	0.1071522427239549	0.0281446258532339	0.0674263565972302	0.0281446258532339	0.0685932577019352	0.0063922644171772	0.1365428031448106	0.0008301520296872	0.0937314347353866	0.0008301520296872	0.0951459021128591	0.0312048431262577	0.0624064425827104	0.0312048431262577	0.0632248956468849	NEGR1	879002	LRRIQ3	1036646	FPGT-TNNI3K	1036695	True	False	False	alt	-65	0.0381	-65	0.1763
142	chr1	73161542	C	A	rs11210159	0.168068304	0.0443656186608704	0.168068304	0.0448509203003272	0.028200842255721	0.2603741050715103	0.0056597027375069	0.0679506273167786	0.0056597027375069	0.0686265008705581	0.3292080432846161	0.0955668229388287	0.0684974761503956	0.025656226521305	0.0684974761503956	0.0259852780351898	0.0100230699976098	0.0818494210399811	0.0025101108765504	0.0350349897976114	0.0025101108765504	0.0355897539349074	0.0542723763650159	0.0210626251989855	0.0542723763650159	0.0213938979639465	NEGR1	879003	LRRIQ3	1036645	FPGT-TNNI3K	1036694	True	False	False	alt	-65	0.03845	-70	0.1626
143	chr1	73163039	C	T	rs6666765	0.00871152682	0.7709428691116256	0.0101844067799999	0.7752126945782086	0.0162352867748371	0.6221712456743548	0.0001342435020042	0.7688819975466834	0.0001653256433765	0.7728853163335154	0.103407178911946	0.3055291111999464	0.0010450194241811	0.4758620253256848	0.0011822561101414	0.4792282054327003	0.0016503278251867	0.357056541037504	1.6207523657466072e-05	0.5054968844147688	1.910362532915624e-05	0.508875918067295	0.0019456632905545	0.5106189102372343	0.0022524825970769	0.5143469727713689	NEGR1	880500	LRRIQ3	1035148	FPGT-TNNI3K	1035197	False	False	False	alt	-80	0.0314	-80	0.1902
144	chr1	73163824	G	T	rs11210163	-7.857658000000027e-05	0.8555536812900115	0.00609889022	0.8566670096389521	0.0110532891190165	0.8661000318724809	-7.932126611589151e-07	0.8940974046270516	6.589721770313163e-05	0.8952878134362526	0.0374872158622281	0.4888198528496895	-4.769683150179869e-06	0.6901158698894084	0.0002280533720297	0.6913471926568291	0.0004166720000466	0.5921469871325342	-8.95061228920339e-08	0.7481111322703483	2.477597821255985e-06	0.7492158492861489	8.247830820507255e-06	0.7004327572719715	0.0006977664874137	0.7016988769451171	NEGR1	881285	LRRIQ3	1034363	FPGT-TNNI3K	1034412	False	False	False	ref	65	0.0097	50	0.01837
145	chr1	73170489	C	A	rs4492565	0.1196296622	0.0881767006305105	0.1196296622	0.0892534094202734	0.0311596616538583	0.2072093422081121	0.0044692536107773	0.0933572837681657	0.0044692536107773	0.0943835835269925	0.014754544554782	0.7035239095123615	0.0024929262900484	0.4201883108176847	0.0024929262900484	0.4253862919348884	0.0005583548705835	0.6082014257058139	0.0001020393403023	0.3507577320476945	0.0001020393403023	0.3552648760248774	0.0062246379202269	0.3523947297224718	0.0062246379202269	0.357146123067021	NEGR1	887950	LRRIQ3	1027698	FPGT-TNNI3K	1027747	False	False	False	alt	-100	0.01191	95	0.12335
146	chr1	73172117	C	A	rs4650196	-0.0099910214	0.7151117560937136	0.01290542852	0.7111865733825673	0.0766136390814672	0.012628137274277	-0.0007772436473798	0.3508341211841397	0.0009959727609104	0.3486544782249411	0.0720819174557091	0.3720660937433092	-0.0009398038642577	0.5231932470575736	0.0010338026516714	0.5195960471236598	0.0056678194989451	0.1499239048128584	-7.495955954022612e-05	0.329910719574419	8.201426079110531e-05	0.3269914540418411	-0.0019967998416416	0.5296350032347337	0.0022904226188511	0.5260169500537225	NEGR1	889578	LRRIQ3	1026070	FPGT-TNNI3K	1026119	False	True	False	ref	55	0.01541	-75	0.02917
147	chr1	73173151	A	C	rs6695455	0.137658541	0.0582249729065038	0.137658541	0.0589750819370916	0.0298748313292523	0.2269600746922876	0.0042040311263082	0.0744460270592759	0.0042040311263082	0.0753361199478015	0.0834268087492988	0.3360042091317541	0.0119431969078006	0.1327939491683603	0.0119431969078006	0.1353398504215354	0.0024602572677564	0.2754411511707191	0.0003608271498337	0.1202076106119894	0.0003608271498337	0.1222500750273638	0.0238428293358845	0.0753636124397143	0.0238428293358845	0.0768142115827096	NEGR1	890612	LRRIQ3	1025036	FPGT-TNNI3K	1025085	False	False	False	alt	100	0.02982	-20	0.07715
148	chr1	73173633	T	C	rs6698500	-0.00356684694	0.6412160706975352	0.01712697014	0.6405468924669345	0.0258285962633672	0.3100675615770865	-0.0001210296079865	0.5495243988747507	0.0005228134549036	0.5493804747881479	0.0192174458117514	0.6109461302364221	-9.684959412570087e-05	0.6968358225739976	0.0003165015864865	0.695659719988181	0.0004902233320058	0.5640671714636367	-3.143180153715053e-06	0.6454333103791394	9.672243218665051e-06	0.6444286805127502	-0.0001814522780508	0.6877389735553862	0.0009946883969515	0.6867233748022177	NEGR1	891094	LRRIQ3	1024554	FPGT-TNNI3K	1024603	False	False	False	ref	-5	0.0004883	-60	0.02014
149	chr1	73174844	A	G	rs12124553	0.15410629	0.0437159875479426	0.15410629	0.0442142615636936	0.0441591308429949	0.0843076241316727	0.0068507309572151	0.0368384717790988	0.0068507309572151	0.0370767607816386	0.0144147339249776	0.6712241209586619	0.0024461580334398	0.3517230530941277	0.0024461580334398	0.3566650752758739	0.000608272788664	0.5358057165876109	0.0001060804918428	0.2601051804651116	0.0001060804918428	0.2642892280309367	0.0067516743096565	0.2863874837386564	0.0067516743096565	0.2908551126801413	NEGR1	892305	LRRIQ3	1023343	FPGT-TNNI3K	1023392	False	False	False	alt	65	0.01538	-45	0.0647
150	chr1	73176803	A	G	rs12126688	-0.1250682739999999	0.0515110412961172	0.1490532539999999	0.0513588174632972	0.06399183819454	0.0265515168447625	-0.0097375899813541	0.0243806932225675	0.0104225701251559	0.0243785886700257	0.0593167496948301	0.5097786222055128	-0.014321876728346	0.2221931690792583	0.0144750914644293	0.220259944875209	0.0044341063584762	0.2746685690338735	-0.0010942071915339	0.1297965721607649	0.0010985828069984	0.1287595423927112	-0.0190623865923261	0.161100997377449	0.0195737521031968	0.1599030835110067	NEGR1	894264	LRRIQ3	1021384	FPGT-TNNI3K	1021433	False	False	False	ref	80	0.02307	-20	0.0984
151	chr1	73179104	C	A	rs4503305	-0.0329025204	0.3537931776193747	0.0445519516	0.3515948378077814	0.0225169144278088	0.4024725247514973	-0.0009787253520831	0.355247319240131	0.0011713705001188	0.3532617149051662	0.0259748936029823	0.5641082963069407	-0.001194272632333	0.4830819214470208	0.0014268404165796	0.4800422593553901	0.0006183588299994	0.536866864033312	-3.447277362877457e-05	0.4609572458965534	3.831871718738783e-05	0.4578481775741521	-0.0030508726205008	0.4316174802272853	0.003872356570222	0.4287077161547524	NEGR1	896565	LRRIQ3	1019083	FPGT-TNNI3K	1019132	False	False	False	ref	-100	0.03815	100	0.0902
152	chr1	73181248	C	T	rs4641264	-0.0366970892	0.3951141781551974	0.0366970892	0.3903586171423012	0.0274798329689746	0.2755247634353001	-0.0010513389815857	0.3324383506738026	0.0010513389815857	0.3286778774300286	0.2716785985285869	0.1263425098868635	-0.0096709018086149	0.1652666567048915	0.0096709018086149	0.1624551049022612	0.007198297172975	0.1113466095680359	-0.0002670257854952	0.1558081472851391	0.0002670257854952	0.1533001515137018	-0.0118191415657681	0.186186903732582	0.0118191415657681	0.1831491060432818	NEGR1	898709	LRRIQ3	1016939	FPGT-TNNI3K	1016988	False	False	False	ref	-100	0.1461	25	0.04248
153	chr1	73181316	G	A	rs4578169	-0.00280077193	0.4178564708911241	0.03493302407	0.419016543772866	0.0377183199766983	0.1272112853948591	-0.0001224816450113	0.2928265880943693	0.0013545037928336	0.2935893540514732	0.273399096037742	0.1250385192503687	-0.0001916013625529	0.2011859941505619	0.0089516796360206	0.2016172465656079	0.0102155528513721	0.0720380462900244	-1.145492829613883e-05	0.1554566405256848	0.0003457121603821	0.1559314661939081	-0.0005493055326449	0.2168200911460246	0.0112236481805284	0.2174206501009738	NEGR1	898777	LRRIQ3	1016871	FPGT-TNNI3K	1016920	False	False	False	ref	-100	0.0296	-80	0.0498
154	chr1	73181365	T	C	rs7514409	0.117732854	0.076779778844111	0.117732854	0.0778108583852284	0.0336794531040316	0.1711313737265626	0.0041358856092458	0.0768162580461067	0.0041358856092458	0.0775914509747293	0.2995298736432318	0.1110369283014958	0.0374895693849262	0.0424659605720983	0.0374895693849262	0.0432288260037242	0.0103256526292657	0.0729958593499541	0.0013422802906171	0.041914840006974	0.0013422802906171	0.0425874638084668	0.0402065256837451	0.0328382115336702	0.0402065256837451	0.0334592385534507	NEGR1	898826	LRRIQ3	1016822	FPGT-TNNI3K	1016871	False	False	False	alt	-65	0.01366	-50	0.10034
155	chr1	73256777	C	G	rs4074990	0.16616541	0.0376335296534237	0.16616541	0.0380594741869797	0.0452305084771373	0.0788938567474861	0.0079149295892532	0.0318710316237136	0.0079149295892532	0.0320731896329592	0.0090594173732308	0.7421410531360699	0.0016217962192028	0.4082696062573338	0.0016217962192028	0.4135767080016219	0.0004141711175814	0.6023605218507558	7.708282382886832e-05	0.2998474034346979	7.708282382886832e-05	0.3044040300387478	0.0045833195869486	0.355472252059837	0.0045833195869486	0.3606951710128515	LRRIQ3	941410	FPGT-TNNI3K	941459	FPGT	941462	False	False	False	alt	-40	0.00952	-95	0.145
156	chr1	73310990	G	A	rs6424546	0.744236258	0.0004444415963285	0.744236258	0.0004461473881995	0.0989233664886549	0.0045443362461712	0.0746033142016921	0.0006087314797943	0.0746033142016921	0.0006169216705534	0.4688941308435881	0.0509903551234532	0.3490285516607678	0.000563932728744	0.3490285516607678	0.0005317750421448	0.0458389751140323	0.0028443736452123	0.0345201443451047	0.00046736495214	0.0345201443451047	0.0004711565426326	0.2424383887037708	0.0002426482707	0.2424383887037708	0.0002329456811512	LRRIQ3	887197	FPGT-TNNI3K	887246	FPGT	887249	False	True	True	alt	-70	0.02124	-75	0.2598
157	chr1	73317255	C	T	rs11210207	-0.02562115034	0.5059795913316159	0.02616600926	0.5012807635507924	0.0475213043737792	0.0661446178044844	-0.0011481809390736	0.3026013213267876	0.0011749079322796	0.2995891618248824	0.005926891227607	0.8045169767923742	-0.0001475793095164	0.766750810845966	0.000151338460306	0.7623874638253973	0.0002792830272723	0.664806777229528	-6.691785307968229e-06	0.6553643196838069	6.876183132329265e-06	0.6511405842162404	-0.000569100326614	0.7462051224825964	0.0005839464220909	0.7417931296656561	LRRIQ3	880932	FPGT-TNNI3K	880981	FPGT	880984	False	False	False	ref	100	0.04315	100	0.0784
158	chr1	73318394	A	G	rs7517355	-0.0131024515999999	0.6961461050207873	0.0148923511999999	0.6919796191065297	0.0113990990632319	0.8513687377678376	-0.000154224721247	0.7726517108848584	0.0001753771998807	0.768404524891544	0.0141565768202962	0.6693757586728779	-0.0001819910692925	0.7162413793764589	0.0002131774602433	0.7125155772149353	0.0001625692315513	0.7442171646435333	-2.148962605218367e-06	0.7663174842755994	2.5175137179637754e-06	0.7624969579344331	-0.0006301342746857	0.6968101302424289	0.0007538517369931	0.6931162970340953	LRRIQ3	879793	FPGT-TNNI3K	879842	FPGT	879845	False	False	False	ref	-100	0.00952	0	0.0
159	chr1	73321175	G	T	rs10732841	0.0010706798999999	0.7206668671619253	0.0130993606999999	0.7221608108018756	0.0205760222310323	0.4638860755162479	3.492918245442e-05	0.6648192308027077	0.0002708684041443	0.6666578277525248	0.0012206789614331	0.9564283249947428	5.486957413587748e-06	0.9349407054314228	1.6448322536182237e-05	0.9365370176829276	2.6606571856573016e-05	0.9404008724437726	1.3652658308162445e-07	0.9192689636230328	3.6190576341433604e-07	0.9209202598309028	1.4846095476886944e-05	0.9406444520606048	5.6085249579358e-05	0.9422352873533836	LRRIQ3	877012	FPGT-TNNI3K	877061	FPGT	877064	False	False	False	alt	90	0.00812	-100	0.10675
160	chr1	73327947	A	G	rs1885247	0.0698426268	0.1801902377770428	0.0698426268	0.182857274912733	0.0296331303679	0.2301970964373017	0.0020760362127043	0.1582171263953638	0.0020760362127043	0.1604620154271689	0.1053899574411929	0.2953967573114333	0.0073603314580864	0.1832934410806229	0.0073603314580864	0.1866828569626154	0.0031447968713298	0.2370505058966389	0.0002201191498235	0.1603823794204684	0.0002201191498235	0.1630782260803068	0.0144163834911417	0.1379578297577912	0.0144163834911417	0.1406251396214538	LRRIQ3	870240	FPGT-TNNI3K	870289	FPGT	870292	False	False	False	alt	-35	0.02367	-100	0.0504
161	chr1	73344546	G	A	rs2208565	-0.18436318	0.03147157154886	0.18436318	0.0311842350386057	0.0381169224994803	0.1251726097129464	-0.0072654528811374	0.0368228493812577	0.0072654528811374	0.0365214301450475	0.0101398832107155	0.7296111923837635	-0.0016407242240527	0.4005389527562104	0.0016407242240527	0.3953749456667494	0.0003837518332771	0.6157019993858659	-6.327919847889894e-05	0.3142949327140032	6.327919847889894e-05	0.3097268403413997	-0.0045882682854408	0.3568703697139187	0.0045882682854408	0.3518959037539029	LRRIQ3	853641	FPGT-TNNI3K	853690	FPGT	853693	False	False	False	ref	-40	0.01642	90	0.261
162	chr1	73355410	T	C	rs2340399	0.0672067028	0.2222529248417751	0.0672067028	0.2253772045754761	0.0147572718173182	0.6861775024336291	0.0012026278975942	0.3405836078518793	0.0012026278975942	0.3446688926361715	0.0033741875886641	0.887627251051621	0.0003608049267994	0.7085808613258469	0.0003608049267994	0.7147937466988352	5.997593351999984e-05	0.8963062836331344	7.339176663352026e-06	0.7230189633759186	7.339176663352026e-06	0.7293865019351375	0.0010647949589257	0.6899250247892459	0.0010647949589257	0.6961895596946506	LRRIQ3	842777	FPGT-TNNI3K	842826	FPGT	842829	False	False	False	alt	-95	0.01228	-45	0.06238
163	chr1	73358596	G	A	rs10890034	-0.054216090846	0.2686107718681716	0.0544904411539999	0.2657652183908369	0.0217410187679905	0.4253041622577544	-0.0012250761874688	0.3032152404358619	0.001230792077657	0.3003970246382973	0.023616013988321	0.5847645936015589	-0.0010119838569804	0.5189980508008484	0.0010249711684522	0.5148446576039811	0.0005181067067808	0.5657489598703276	-2.3572820779809503e-05	0.5026675809498954	2.384340201875744e-05	0.4985498068236066	-0.0029997360694137	0.4770650097141799	0.003022829995711	0.4729265598662391	LRRIQ3	839591	FPGT-TNNI3K	839640	FPGT	839643	False	False	False	ref	-65	0.00923	-85	0.04828
164	chr1	73363940	G	C	rs6689032	0.02903552676	0.4797512411174532	0.0315077685599999	0.4833288678007866	0.0135794381276449	0.7284001317572081	0.0005170215275884	0.5620410804984222	0.0005317180397378	0.5661321955565699	0.0058072976807099	0.8198477926005414	0.0002968507557583	0.7388619919838008	0.0003072091967952	0.7429036393980708	9.109836431897146e-05	0.8482981667836581	5.422070246576278e-06	0.755985192033598	5.483647134272986e-06	0.7603737078802725	0.000951799676685	0.714169073747856	0.0010078849262643	0.7183377690573227	LRRIQ3	834247	FPGT-TNNI3K	834296	FPGT	834299	False	False	False	alt	95	0.0711	95	0.2617
165	chr1	73384090	T	A	rs1923228	0.0184286598	0.6319601687144172	0.0184286598	0.6381907138555754	0.0121349756416397	0.8221306695389403	0.0002420350109699	0.7079459988532263	0.0002420350109699	0.7144671278430123	0.0162671967272606	0.6546204331702793	0.0003543079279681	0.6701077595336284	0.0003543079279681	0.6762196208358907	0.0002077469968191	0.7217484221104788	4.835149301972447e-06	0.7158307853752899	4.835149301972447e-06	0.7221738801576647	0.0011307776054897	0.6444192952283861	0.0011307776054897	0.6506007718495664	LRRIQ3	814097	FPGT-TNNI3K	814146	FPGT	814149	False	False	False	alt	-30	0.01839	-65	0.3196
166	chr1	73389332	C	A	rs11210227	0.0149613102	0.6833432398750702	0.0149613102	0.6896423783288118	0.0155774912369047	0.6641629811459688	0.0002424953694832	0.6973299964785507	0.0002424953694832	0.7038748903789648	0.0034921315693972	0.8692488416886829	6.173582068111321e-05	0.8472133206205162	6.173582068111321e-05	0.8539879120933774	5.624346010332731e-05	0.8818267028653446	1.036443327042844e-06	0.8523720030658974	1.036443327042844e-06	0.8591554128324502	0.0002433110092045	0.8384318417287285	0.0002433110092045	0.8451762045486985	LRRIQ3	808855	FPGT-TNNI3K	808904	FPGT	808907	False	False	False	alt	-80	0.00457	80	0.134
167	chr1	73390408	A	C	rs55994666	-0.0101391352	0.7817015560861988	0.0101391352	0.7748425340961368	0.0150512779329646	0.6880739930531398	-0.00015342040956	0.7909434288358218	0.00015342040956	0.7843705161050479	0.0099089439477417	0.7996424852799217	-0.000103926545783	0.8401081683063174	0.000103926545783	0.8331359279464597	0.000128498483148	0.8282695101970673	-1.3488243493272434e-06	0.8549713884639977	1.3488243493272434e-06	0.8480181595401944	-0.0003464088944607	0.834604939077125	0.0003464088944607	0.8275679390865464	LRRIQ3	807779	FPGT-TNNI3K	807828	FPGT	807831	False	False	False	ref	65	0.0045	-55	0.0919
168	chr1	73469042	T	A	rs11210258	-0.0041264497919999	0.8486055131384566	0.006852966112	0.8471022513256001	0.0110615689244102	0.8677189614394919	-5.330491579994169e-05	0.8884474297274243	8.13292356453368e-05	0.8870319136150836	0.0236712744548183	0.5830622379344346	-6.525848233381729e-05	0.7780034671257965	0.0001287527342442	0.7767599989011813	0.0002615394417686	0.6754242008620062	-8.22584101289007e-07	0.822659196397682	1.5018562925793386e-06	0.8213313072499949	-0.0002391870937943	0.7775289694754398	0.0004453828643066	0.7761782508906131	LRRIQ3	729145	FPGT-TNNI3K	729194	FPGT	729197	False	False	False	ref	-70	0.00589	-100	0.0807
169	chr1	73495142	A	G	rs1546271	0.00224924338	0.8879305139180053	0.00502833118	0.8891325715989786	0.0178276000855022	0.5649474500816573	4.190390144220515e-05	0.8721683825185947	8.98924959243476e-05	0.8735092768316695	0.003473986341592	0.8751606921723024	1.6234097512472263e-05	0.9352815691093032	2.053582511685489e-05	0.9365569068704922	6.14707238007611e-05	0.8724425091702759	2.9022010497817495e-07	0.9302803844460352	3.645820940103985e-07	0.9314828025408194	6.350829731780359e-05	0.935617463646117	7.340569430239666e-05	0.938656467857695	LRRIQ3	703045	FPGT-TNNI3K	703094	FPGT	703097	False	False	False	alt	-70	0.02444	65	0.0618
170	chr1	73517390	G	T	rs11210274	-0.054650743	0.2637493051163251	0.054650743	0.2598378491922338	0.0335175754843965	0.1739187633548025	-0.0018416680024081	0.1925381376956911	0.0018416680024081	0.1899624758934359	0.1437547425027217	0.2351564738503061	-0.0085293121515162	0.1817693405694183	0.0085293121515162	0.1785716571091132	0.0048758918892671	0.1676691091344072	-0.00029194649535	0.1491720015803121	0.00029194649535	0.1465929838262704	-0.0143759691201213	0.1497277915119166	0.0143759691201213	0.1471269301198961	LRRIQ3	680797	FPGT-TNNI3K	680846	FPGT	680849	False	False	False	ref	45	0.0403	5	0.001099
171	chr1	73522466	C	T	rs12042444	0.01367997735	0.6987515769560769	0.01367997735	0.7051331704649755	0.0183109033734181	0.547167330943352	0.000262260947958	0.6834185363618283	0.000262260947958	0.6898186443603422	0.0041453597703803	0.8506826396406606	6.773151872197024e-05	0.8442577290190181	6.773151872197024e-05	0.8510961701513892	7.343826441716167e-05	0.8511872847678345	1.2619515042976914e-06	0.8392524267099756	1.2619515042976914e-06	0.8460762834965894	0.0002457853584506	0.8392148119507261	0.0002457853584506	0.8453949247542629	LRRIQ3	675721	FPGT-TNNI3K	675770	FPGT	675773	False	False	False	alt	-60	0.00815	40	0.03772
172	chr1	83724992	A	G	rs5006353	0.0378807342	0.3741708733066518	0.0378807342	0.3791511533306343	0.0238397256477084	0.3600271886547805	0.0008867738686403	0.3430416573414013	0.0008867738686403	0.3476908364206947	0.0058971990366533	0.8121451840332793	0.0002322417108578	0.6984774591715612	0.0002322417108578	0.7047090117606926	0.0001332537913071	0.7804467914861313	5.168538465376646e-06	0.6668475299749099	5.168538465376646e-06	0.6731154916351537	0.0007901421926033	0.6828137227481453	0.0007901421926033	0.6889803584810728	TTLL7	274158	PRKACB	353071	SAMD13	573375	False	False	False	alt	65	0.03702	-55	0.1103
173	chr1	83753003	G	T	rs17577938	-0.02628453516	0.5444129990917056	0.02628453516	0.5395519293812665	0.0238787914273105	0.361627773441156	-0.0007824371681994	0.4999375172609955	0.0007824371681994	0.495470138886843	0.0309615321170531	0.5291935623842032	-0.001068112017787	0.5622550175376532	0.001068112017787	0.556636889606253	0.000783338402552	0.4945375727318682	-3.3026994039002e-05	0.5264201676617088	3.3026994039002e-05	0.5209415033279361	-0.00270446372604	0.5285231011137577	0.00270446372604	0.5231921310455414	TTLL7	246147	PRKACB	325060	SAMD13	545364	False	False	False	ref	-30	0.02332	25	0.036
174	chr1	83801500	C	G	rs761406	-0.0437816582	0.3527214809534004	0.0437816582	0.3483016522450177	0.0173756662999392	0.575159236513603	-0.0008598067303359	0.4026264232426504	0.0008598067303359	0.3980258354276259	0.0108632179736728	0.7283474121839735	-0.0005459963417916	0.616516620537593	0.0005459963417916	0.6106827554629927	0.0002157305392694	0.7333263942328662	-1.1309131999502975e-05	0.6183613455381763	1.1309131999502975e-05	0.6124552702947148	-0.0017221470753191	0.5821638096774508	0.0017221470753191	0.5764087122893294	TTLL7	197650	PRKACB	276563	SAMD13	496867	False	False	False	ref	-10	0.003233	-90	0.106
175	chr1	96439584	A	G	rs12756558	0.0728305952	0.1710467608277003	0.0728305952	0.1736308153061722	0.0148425418705619	0.6856354388207969	0.001071461985093	0.2950917487172965	0.001071461985093	0.2991670203790507	0.012968064399063	0.6821011256399441	0.0009599237306764	0.4742587876986606	0.0009599237306764	0.4795923484767779	0.0001839427154591	0.7222772903072752	1.355284953183708e-05	0.5167197900353316	1.355284953183708e-05	0.5224234646087876	0.0031020091715878	0.4246458457054842	0.0031020091715878	0.4299938233043939	PTBP2	282082	RWDD3	1205373	TLCD4-RWDD3	1321660	False	False	False	alt	-85	0.00806	60	0.0516
176	chr1	96648359	T	G	rs12071951	0.0464632716	0.3181679812016383	0.0464632716	0.3221393422495252	0.016364731075508	0.6168343025241826	0.0010226417913245	0.3905992855327969	0.0010226417913245	0.3946691939374607	0.0060456599914222	0.8027109224500311	0.0003349610042006	0.6673021186636725	0.0003349610042006	0.6735632136388264	0.0001143052690684	0.8184527241978118	8.491890908694052e-06	0.6764302491168029	8.491890908694052e-06	0.6829173427543461	0.0010944871498795	0.642725280616199	0.0010944871498795	0.6488657106544604	PTBP2	73307	DPYD	1346641	RWDD3	1414148	False	False	False	alt	-25	0.01598	70	0.199
177	chr1	96650059	G	T	rs7528506	-0.02007607512	0.5615230994106952	0.02234090168	0.5568060970463574	0.0977319057617309	0.0046779402960962	-0.0020998750227677	0.1709220148915864	0.0022965989999485	0.1697580318733263	0.0387953218303585	0.5257870614852327	-0.0012013296322457	0.5325456306902246	0.0012314603210955	0.5285240700298104	0.0038671348859911	0.2337809116156274	-0.0001266220313071	0.3093816096504239	0.0001292391981375	0.3061107496521877	-0.002855399030055	0.5059169828809819	0.0029642703968855	0.5018043576649523	PTBP2	71607	DPYD	1344941	RWDD3	1415848	False	True	False	ref	85	0.02277	-75	0.1432
178	chr1	96650984	T	G	rs59012322	-0.008121939754	0.7156047709348586	0.013281264154	0.7117483175691248	0.0156528956933212	0.6601558002116744	-0.0001083857155572	0.7565289478595381	0.0001889531181539	0.7527137464237761	0.0238716967437563	0.5827115437258429	-0.0001142973064526	0.6601844972982023	0.000328531567364	0.6569726553478432	0.0003506675031616	0.6265488751544147	-1.3356158748011608e-06	0.6923015551263157	4.681072873691991e-06	0.6890408623894266	-0.0004503315627989	0.6520667365085752	0.0010606710435155	0.6488540381511101	PTBP2	70682	DPYD	1344016	RWDD3	1416773	False	False	False	ref	25	0.004517	45	0.07056
179	chr1	96652079	C	T	rs6659919	-0.002374677112	0.8823080750819005	0.004673586208	0.8803766626213252	0.0193750498009726	0.5040432789350212	-5.1960426537521466e-05	0.850841452267404	9.590797474497513e-05	0.8489954693878303	0.0153921018772062	0.661043499566085	-6.184622089804426e-05	0.8390768766238385	7.756484935797315e-05	0.8370617525867912	0.000304451787289	0.6561764887652594	-1.318646503159491e-06	0.823819697279624	1.6121348217411523e-06	0.821616118387816	-0.0002573323215994	0.836128362365741	0.0003035201741941	0.8340359553650493	PTBP2	69587	DPYD	1342921	RWDD3	1417868	False	False	False	ref	100	0.02899	-90	0.0636
180	chr1	96664630	A	G	rs12042074	-0.00327577812	0.3576580546651159	0.04090720028	0.3579372915213932	0.0196231608174864	0.4943431984807748	-0.0002094317092929	0.3800316318659645	0.0008556160405599	0.3804486250559482	0.0026203358516709	0.8929227578771659	4.570935187456682e-06	0.7920411956810038	9.995290622645486e-05	0.793161025035945	5.051649514969446e-05	0.8832994125970661	-2.402804715271599e-07	0.7763549264593487	2.047493905607448e-06	0.7773620653962403	1.402131239484248e-05	0.7861790438929097	0.0003752763023324	0.7872750386276599	PTBP2	57036	DPYD	1330370	RWDD3	1430419	False	False	False	ref	45	0.005447	65	0.09076
181	chr1	96667513	A	G	rs6688086	0.0233898754	0.5376973311796667	0.0233898754	0.5439793976438958	0.0222297249656443	0.4063703028682464	0.0005249002328805	0.4853754130483865	0.0005249002328805	0.4912518368253296	0.0028405529345781	0.9014275411568062	6.147569352693605e-05	0.8389579634656847	6.147569352693605e-05	0.8457406487166861	6.200584267620183e-05	0.877787492683888	1.3807861122851623e-06	0.8132008967436117	1.3807861122851623e-06	0.8198808650174872	0.0002391870937942	0.8311254285602718	0.0002391870937942	0.8378038640341972	PTBP2	54153	DPYD	1327487	RWDD3	1433302	False	False	False	alt	100	0.0389	-35	0.0296
182	chr1	96678583	C	T	rs12027165	-0.041114153662	0.2003185584677353	0.072033974338	0.2009081810370198	0.0359122347659064	0.1448054438204988	-0.0013663638721225	0.1747270534650045	0.0025362602941746	0.1753935586404997	0.1126529972617201	0.2887545271978217	-0.0067686293292244	0.2463272770116809	0.0088124347124498	0.2461867681486954	0.0041078561962681	0.2006490020151366	-0.0002424129445049	0.2061737902596183	0.0003191422375592	0.2064239558341538	-0.0102438058790538	0.1873986790761879	0.015138068687935	0.1877805883120453	PTBP2	43083	DPYD	1316417	RWDD3	1444372	False	False	False	ref	-70	0.02344	-70	0.02661
183	chr1	96687003	T	C	rs1496116	0.0645201964	0.2128172949352949	0.0645201964	0.216220860198949	0.1214145592285814	0.0019023873586424	0.0080513111188019	0.0324323600539724	0.0080513111188019	0.0326239686153045	0.0110487941671339	0.7122764728103758	0.000789795286285	0.5276058678610834	0.000789795286285	0.5332958265934924	0.001409021641805	0.3852836460775142	0.0001015029473266	0.2728754303255951	0.0001015029473266	0.2769376583435805	0.0025230114479891	0.4784720541618848	0.0025230114479891	0.4840463031601787	PTBP2	34663	DPYD	1307997	RWDD3	1452792	False	True	False	alt	75	0.1445	100	0.0727
184	chr1	96708350	T	C	rs12031518	0.039930326	0.3504167669762522	0.039930326	0.355082436497737	0.0107675757441361	0.881544529794752	0.0004399186181268	0.5311179513229703	0.0004399186181268	0.5370073378864774	0.057527795189865	0.4125977011515884	0.0021360500111085	0.3527017887891989	0.0021360500111085	0.3574775766525855	0.0006026205454558	0.5320177777076356	2.2812221977745743e-05	0.4459774736814253	2.2812221977745743e-05	0.4515394952159742	0.0053412952393519	0.317297977154452	0.0053412952393519	0.3220525844901762	PTBP2	13316	DPYD	1286650	RWDD3	1474139	False	False	False	alt	55	0.0349	-40	0.04956
185	chr1	96713505	T	G	rs2132427	0.0035570406799999	0.8364883842619733	0.00737723168	0.8382319816917354	0.0141058118143892	0.734820393870901	5.750633189001786e-05	0.8448301641760508	0.0001098184379333	0.8464505121866879	0.0100706014318233	0.7367866043762241	3.4185766311347886e-05	0.8305474846474755	8.136557613398411e-05	0.8318856328892518	0.0001403444431501	0.7763725917834741	5.328007329316481e-07	0.8455803981514031	1.1665873518555644e-06	0.8470191915267559	0.0001129952822407	0.8256745120740845	0.0002878492956352	0.8270588318317496	PTBP2	8161	DPYD	1281495	RWDD3	1479294	False	False	False	alt	-95	0.00833	-100	0.181
186	chr1	96818940	C	A	rs10875035	-0.0089749200599999	0.711874959697514	0.01355156622	0.7094386733256622	0.0680185382852865	0.0198426433312099	-0.0006374920387568	0.3851249445934332	0.0009627632026964	0.3837172534058421	0.0108384744812114	0.7181450847864013	-4.756960758082359e-05	0.7870308562521643	0.0001160927711429	0.7854839884700369	0.000763772524367	0.4985978707770708	-3.3702438831640715e-06	0.6195856639882369	8.365338917046217e-06	0.6181264601877628	-0.0002061957705123	0.7673575906054788	0.0004602289597835	0.7657718255654955	PTBP2	97274	DPYD	1176060	RWDD3	1584729	False	True	False	ref	100	0.019	100	0.1351
187	chr1	97332630	A	G	rs12407539	0.0084952346	0.3463877774359679	0.0426648389999999	0.3477628339039055	0.0223825455210896	0.4041122033325171	0.0002751182905311	0.3499646039840098	0.0009274518425888	0.3509677487549036	0.0230254693015736	0.5825251885048358	-3.4938055045720006e-05	0.4978898009964115	0.0008432083293356	0.4994246211069503	0.00052367341414	0.5585555442780484	6.270122044347077e-07	0.4802333314096898	1.821668343367092e-05	0.481623162014269	0.000135264425456	0.4644637564732767	0.002588169311471	0.4659398026819767	PTBP2	610964	DPYD	662370	SNX7	1329072	False	False	False	alt	55	0.01822	45	0.1265
188	chr1	97337068	A	G	rs36025579	-0.0193754755999999	0.3934632803017689	0.0371661436	0.390761440500175	0.0197019749101788	0.4956848750253615	-0.0003624291826255	0.4063042327844799	0.0007347110892737	0.4035304410210849	0.0014483190920787	0.9488714307809796	-4.13561406033173e-05	0.8567880550268664	6.0578349292919975e-05	0.8525257777566081	2.8670111616802164e-05	0.9369725506345188	-8.020875561077954e-07	0.842072487697515	1.2043254381548633e-06	0.8376931307068993	-0.000185576193461	0.8408993182463371	0.0002532084061891	0.836693515728065	PTBP2	615402	DPYD	657932	SNX7	1324634	False	False	False	ref	-85	0.00444	-45	0.04425
189	chr1	97358196	T	C	rs10875073	0.1526056055999999	0.0565033400732828	0.1526056055999999	0.0571034886286021	0.0332650546292367	0.1763156184486429	0.0049908253310019	0.0757553604936455	0.0049908253310019	0.0764021487249546	0.0189873313318596	0.6642317000790315	0.0024741730226339	0.3944848547646569	0.0024741730226339	0.3996019987038693	0.0005571380877702	0.5827541087896483	7.037560822293319e-05	0.3409372268069574	7.037560822293319e-05	0.3457148192199992	0.0061009204579195	0.3380991544006403	0.0061009204579195	0.3429784925626624	PTBP2	636530	DPYD	636804	SNX7	1303506	False	False	False	alt	65	0.09033	65	0.2333
190	chr1	97368472	G	A	rs72728414	0.01760433326	0.550662633453373	0.02241764486	0.5550878992475803	0.0130646850569652	0.7562642930520355	0.0002970847281922	0.6177904931964217	0.0003486416012201	0.6221529118742452	0.0683835901157994	0.3826029487099568	0.001500330458605	0.4200078085801973	0.001798294154751	0.4236480681695777	0.0009794322954574	0.4612396623853323	2.692758440051188e-05	0.4730700713995233	3.0119165926281884e-05	0.4770447400859152	0.0033939823826333	0.40528310085734	0.0040999967008676	0.4090139450929736	DPYD	626528	PTBP2	646806	SNX7	1293230	False	False	False	alt	-75	0.01675	25	0.00806
191	chr1	97384504	T	C	rs74105186	-0.2081596156	0.0294295295917525	0.2081596156	0.0293012244306191	0.0364248561759521	0.1411099950383511	-0.0084211822287358	0.0385989950282221	0.0084211822287358	0.0383761584569565	0.1385899508429283	0.2460940969111629	-0.0333186881025413	0.0652629371859261	0.0333186881025413	0.0641244764118628	0.0051914068993408	0.1636222039082161	-0.0013421860142292	0.0563366042325037	0.0013421860142292	0.0553834895617993	-0.0465557058493615	0.03110672664541	0.0465557058493615	0.0306751054437177	DPYD	610496	PTBP2	662838	SNX7	1277198	False	False	False	ref	10	0.007004	0	0.0
192	chr1	97385141	C	T	rs1112314	-0.0955976146	0.113360080412693	0.0955976146	0.111720337150641	0.0223297385323358	0.4066135395300804	-0.0021618455018993	0.1587202823136554	0.0021618455018993	0.1566395069467241	0.1215919963049717	0.2653275194801672	-0.0116103495942908	0.1349754208434377	0.0116103495942908	0.1323222370919761	0.0026849090522509	0.2602074343168087	-0.0002600896162051	0.1476233929252281	0.0002600896162051	0.1449974243166047	-0.0214905479858796	0.0881503363054043	0.0214905479858796	0.0864500248597244	DPYD	609859	PTBP2	663475	SNX7	1276561	False	False	False	ref	100	0.07544	-80	0.1051
193	chr1	97388977	C	A	rs12047563	-0.0068361681999999	0.6004242983892583	0.0199073962	0.6001492323669648	0.0137042590487051	0.7361000874376514	-0.0001612815574888	0.6507470956660507	0.0003179867500656	0.6507678780077272	0.0145640196628286	0.6730824282660364	-0.0002324702966634	0.6718356114693798	0.0003777854699614	0.6720895082213445	0.0002138112206529	0.7205228610442608	-4.9886043078670895e-06	0.7002892664189294	6.627762237666201e-06	0.700496132147498	-0.0007489030385008	0.64961375453938	0.0012404737554022	0.6497073389132685	DPYD	606023	PTBP2	667311	SNX7	1272725	False	False	False	ref	-100	0.05853	-100	0.0783
194	chr1	97390265	G	A	rs4503384	-0.0619240959	0.2261324917087577	0.0619240959	0.2232562496463333	0.0385386156498103	0.1207331436351313	-0.0023991137748348	0.1561285855185397	0.0023991137748348	0.1542353399824741	0.0158605786678103	0.6479725432363445	-0.001005726851592	0.5006048058455508	0.001005726851592	0.4949961479412478	0.0006085132968477	0.5286483674435016	-3.881486693154869e-05	0.4047636245343151	3.881486693154869e-05	0.399557048352288	-0.0031168552670646	0.4516553515201603	0.0031168552670646	0.4461947963305777	DPYD	604735	PTBP2	668599	SNX7	1271437	False	False	False	ref	-80	0.02054	10	0.01172
195	chr1	97391983	A	C	rs56682383	0.0166350750939999	0.6043335865158083	0.019291360306	0.6073482369606549	0.0155826643766429	0.664198958821852	0.0002213440151667	0.6733833811304527	0.0002690004270578	0.6762444672491673	0.0207465936458711	0.6077970983927232	0.0002548576878136	0.6556482828663408	0.0003666532164049	0.6575126882659963	0.0003338054867703	0.6421748997565875	3.2442845626077984e-06	0.6820439378765746	5.252125928596487e-06	0.6839979448079234	0.0008990135594338	0.6404185787269749	0.0011975850351357	0.6424928571597824	DPYD	603017	PTBP2	670317	SNX7	1269719	False	False	False	alt	-70	0.1537	-75	0.1477
196	chr1	97393508	T	C	rs9727787	-0.0015344574	0.3974313413367343	0.0365966682	0.3964733738316599	0.0307004243153448	0.2162465095996501	-0.000192204580749	0.3035585409251999	0.0010989345312469	0.3027646786282901	0.0002977466926197	0.9956264044700814	-1.209034704261617e-06	0.965383876109957	9.651752179891351e-06	0.9636821059962238	1.0560180560277374e-05	0.9834732979786576	-1.1205915464714492e-07	0.9376773904081384	3.3719108063746224e-07	0.9359642898449438	-5.773481574345931e-06	0.963314499865052	3.711523869222393e-05	0.9615981715341148	DPYD	601492	PTBP2	671842	SNX7	1268194	False	False	False	ref	100	0.04855	-100	0.1372
197	chr1	97395772	C	A	rs55824522	0.25059165	0.0172178541803913	0.25059165	0.0173201137374095	0.044022295083541	0.0859825209607401	0.0123758777258658	0.0204979798464941	0.0123758777258658	0.0206483249850817	0.0077876018607106	0.7634512198417037	0.0021288844035499	0.3758332100918549	0.0021288844035499	0.3809016789147874	0.0003567037931176	0.6279587222264587	0.0001069464120922	0.2718791820734006	0.0001069464120922	0.2760974264285753	0.0048456006070403	0.3460695854300681	0.0048456006070403	0.3509869331067393	DPYD	599228	PTBP2	674106	SNX7	1265930	False	True	False	alt	95	0.0791	-95	0.1353
198	chr1	97397169	G	T	rs12043021	0.01160624806	0.6606064293706068	0.0168695252599999	0.6645637031631781	0.0150321431318176	0.6930745368639727	0.0001695182752947	0.6905990957810579	0.0002597399125879	0.6950409256233118	0.0016157500577347	0.9403715248939544	1.893462827535793e-05	0.9101978105414976	2.8506669861617165e-05	0.9143184857854524	2.425809112902265e-05	0.94746702030082	2.721626370710581e-07	0.9133759368142608	4.36243919634622e-07	0.9175033650289984	7.17561281382883e-05	0.901276759243848	0.0001096961499125	0.9054327372861336	DPYD	597831	PTBP2	675503	SNX7	1264533	False	False	False	alt	95	0.0966	15	0.01596
199	chr1	97397272	T	C	rs12040699	0.0584105412	0.2462426305555228	0.0584105412	0.2496392489542499	0.0141074445808575	0.7231959261296492	0.0008879836647517	0.3732889983126613	0.0008879836647517	0.3779234466749943	0.0014986308600837	0.948102198595538	0.000105424646842	0.8024890539159887	0.000105424646842	0.8091253637694747	2.298155725007822e-05	0.953195631111214	1.6871080336771526e-06	0.8157110234854901	1.6871080336771526e-06	0.8223896712018912	0.0003472336775427	0.7998019632448881	0.0003472336775427	0.8064835401746279	DPYD	597728	PTBP2	675606	SNX7	1264430	False	False	False	alt	100	0.06714	-85	0.11865
200	chr1	97401301	C	T	rs12026223	-0.108933274	0.0918384637914051	0.108933274	0.0907779629637747	0.0331999326613939	0.1778723464079397	-0.0038084438118306	0.0881540492958903	0.0038084438118306	0.0872148739336526	0.0115304674870508	0.7371325802267802	-0.0011098599993644	0.4935702190757118	0.0011098599993644	0.48786518152425	0.0003628950084832	0.6514984151000714	-3.5669670182686866e-05	0.4207270078066596	3.5669670182686866e-05	0.4155528660597096	-0.0035111015802843	0.4417156523805502	0.0035111015802843	0.436403006916378	DPYD	593699	PTBP2	679635	SNX7	1260401	False	False	False	ref	95	0.01877	-90	0.10144
201	chr1	97412905	G	A	rs6687374	-0.0725218	0.1788174323787416	0.0725218	0.1760635401635645	0.0417158622242606	0.0962538501653448	-0.0029961724016582	0.1076137255013303	0.0029961724016582	0.1062471191216013	0.1131750849526574	0.2846794778644559	-0.0080181753691099	0.1808177062106215	0.0080181753691099	0.1776242178585839	0.0047234973937417	0.1743239727593958	-0.0003313434008222	0.1274123596874675	0.0003313434008222	0.1252250728569648	-0.015021774273366	0.1373788768137898	0.015021774273366	0.134866263943451	DPYD	582095	PTBP2	691239	SNX7	1248797	False	False	False	ref	100	0.03036	100	0.1627
202	chr1	97417845	C	T	rs58941846	0.0306406016	0.4559031896680191	0.0306406016	0.4611148222775904	0.0124810149585935	0.8038218687255682	0.0003567578824776	0.5978285589223912	0.0003567578824776	0.6039905107625033	0.0299874632971528	0.5347670538258624	0.0007488602664308	0.5123827639795452	0.0007488602664308	0.5178716935610114	0.000397698515101	0.6091161062566744	9.049758353371354e-06	0.5746727483110641	9.049758353371354e-06	0.5806160944935707	0.0022739269572102	0.4881055457738005	0.0022739269572102	0.4937798712483136	DPYD	577155	PTBP2	696179	SNX7	1243857	False	False	False	alt	-85	0.02676	-30	0.0862
203	chr1	97434996	A	T	rs12129397	0.0428219581999999	0.3671155278459008	0.0428219581999999	0.3715517571730171	0.0322867674020667	0.1895884939520295	0.0014259001301811	0.2848378727343235	0.0014259001301811	0.2882607520792155	0.0151603378311503	0.6593430416677989	0.0007851758109543	0.560123391257214	0.0007851758109543	0.5659166577856877	0.0004892923815797	0.5691574449969622	2.5781762583909688e-05	0.4861795472207039	2.5781762583909688e-05	0.4918095780845343	0.0023357856883639	0.5192945288291178	0.0023357856883639	0.5250303220220971	DPYD	560004	PTBP2	713330	SNX7	1226706	False	False	False	alt	-100	0.03543	35	0.04816
204	chr1	97437034	T	G	rs11165872	-0.017344726908	0.6294269015196782	0.017735064292	0.6245453428571075	0.0420508798447705	0.0963696897196685	-0.0007591459070033	0.415038731795153	0.0007764970712332	0.4110948004491012	0.005125202071855	0.8164932598153606	-0.0001018566144333	0.8023987515450092	0.0001034421870124	0.7978051204279154	0.0002182079663658	0.6981349799188166	-4.4473018747182894e-06	0.706993511898196	4.517783287268327e-06	0.7025318884729137	-0.0004321863349938	0.7805299020049227	0.0004404341658143	0.7760111565014337	DPYD	557966	PTBP2	715368	SNX7	1224668	False	False	False	ref	100	0.04163	-85	0.0781
205	chr1	97455400	T	C	rs12354219	0.0158104538	0.6536510082067524	0.0158104538	0.6602642266409269	0.0098465198130141	0.9091283639517818	0.0001474511338337	0.7816176529375459	0.0001474511338337	0.7882903171005821	0.0063417571178779	0.7914897543646204	0.00011133356505	0.7809996528696266	0.00011133356505	0.7878020824914796	5.870726104026973e-05	0.8694378973111805	1.02300624135937e-06	0.8399795291166992	1.02300624135937e-06	0.8468526331935579	0.0004379598165682	0.766388284448354	0.0004379598165682	0.7730131719096834	DPYD	539600	PTBP2	733734	SNX7	1206302	False	False	False	alt	-60	0.01132	-90	0.0919
206	chr1	97573370	T	C	rs79917705	0.0414954272	0.3473495521677942	0.0414954272	0.3521282818223603	0.0147463081060694	0.6932078659732004	0.0006302791644911	0.4418682743970293	0.0006302791644911	0.4472056475252152	0.0149005311603047	0.6684164335252818	0.000599085485023	0.5538293976006096	0.000599085485023	0.5594529119807545	0.0002090691147672	0.7108358533135858	8.692253601046944e-06	0.58946530159395	8.692253601046944e-06	0.595325147054417	0.0019266932796673	0.5198273079118462	0.0019266932796673	0.5255557929850705	DPYD	421630	PTBP2	851704	SNX7	1088332	False	False	False	alt	65	0.01674	100	0.07654
207	chr1	97580440	G	C	rs10783069	-0.0058222608	0.3507996513898379	0.0425797608	0.3488888903845377	0.0222891780517161	0.4052193535424068	0.0005137862484722	0.3436660097664847	0.001264672860826	0.3413855531358062	0.000684569958101	0.9812233240738396	9.407224541338966e-07	0.9110403495988108	2.770880786133921e-05	0.907518841687868	1.5973904764101646e-05	0.9639545877214496	4.845984971512251e-07	0.8818820538653775	9.01568124114065e-07	0.8786507507790716	-5.773481574355879e-06	0.9181972955996464	9.155092210747588e-05	0.9146242559440088	DPYD	414560	PTBP2	858774	SNX7	1081262	False	False	False	ref	100	0.0177	100	0.03113
208	chr1	97590907	A	G	rs7537165	0.0037008862	0.2272163836810343	0.0627978238	0.2273173168417376	0.0398405651795576	0.1093134415604289	3.3815974115440126e-05	0.1494070455224846	0.0024594945269456	0.1495845630470246	0.0754470324304707	0.3564836626347547	-8.343429495649983e-05	0.2523616283129457	0.0050484246672587	0.2525533958260102	0.0029920875147018	0.2425146730497428	-1.224529072346872e-05	0.1879293873563093	0.0001983833043454	0.1880879457871446	-0.0002952723433736	0.1982397503268351	0.0109679654250931	0.19829504037513	DPYD	404093	PTBP2	869241	SNX7	1070795	False	False	False	alt	15	0.003906	70	0.05176
209	chr1	97594925	A	C	rs2811202	0.02142876786	0.5598590584124622	0.02142876786	0.5662080056314537	0.0198656792819371	0.4854549584283558	0.0004320296064863	0.5408321342916856	0.0004320296064863	0.5468298295405309	0.0035498663851406	0.8635883279877404	6.93453737852732e-05	0.8165047457530872	6.93453737852732e-05	0.8233341756247357	6.77320838713036e-05	0.8544948961894616	1.330284345979082e-06	0.8038383698371678	1.330284345979082e-06	0.81057197890291	0.0003092936557684	0.7980839611560941	0.0003092936557684	0.8048805210037606	DPYD	400075	PTBP2	873259	SNX7	1066777	False	False	False	alt	100	0.01178	100	0.0731
210	chr1	97611109	C	T	rs2811197	0.330175064	0.0068559122512481	0.330175064	0.0068694138280484	0.0619026697997139	0.0283637335782386	0.0214615340440153	0.0065837902554543	0.0214615340440153	0.0065983012592194	0.0280681930652238	0.5522956844361445	0.0100699181913127	0.1584692045793762	0.0100699181913127	0.1614685147396794	0.0018300175079888	0.3410840420840055	0.0006770034268979	0.0822172273562244	0.0006770034268979	0.083576436108459	0.0193419880571409	0.1036475504592529	0.0193419880571409	0.1054108774233624	DPYD	383891	PTBP2	889443	SNX7	1050593	False	True	True	alt	-15	0.04626	-100	0.0725
211	chr1	97639882	A	C	rs6663670	0.1223690144	0.079744653945056	0.1223690144	0.0807252940028028	0.0264264637394589	0.293535802654055	0.0036234128698688	0.1051402857876935	0.0036234128698688	0.1064507979534477	0.1157376859885849	0.2811588412729309	0.014857716049518	0.1238812271830811	0.014857716049518	0.1262590922651081	0.0032054256657549	0.2442629388806256	0.0004462929081942	0.1221875518193619	0.0004462929081942	0.124587783117197	0.0248152485896208	0.0774072597764819	0.0248152485896208	0.0789219606814361	DPYD	355118	PTBP2	918216	SNX7	1021820	False	False	False	alt	-35	0.02515	95	0.0781
212	chr1	97665524	A	T	rs72975785	-0.0129549549999999	0.629093245416623	0.0186900513999999	0.6249390824128241	0.0149183027224819	0.6767654704530215	-0.0002022534112715	0.6707534040472952	0.0002675815616312	0.6663785372079065	0.0167802118042954	0.6469464472079126	-0.0002301320332744	0.6588789620022814	0.0003206209588265	0.6550722769889556	0.0002280885411146	0.6935661918909636	-3.2722596863396696e-06	0.6912672381725894	4.303013799023274e-06	0.6872640934680964	-0.0007769456632905	0.6405149316188752	0.0010557223450232	0.6368038654680206	DPYD	329476	PTBP2	943858	SNX7	996178	False	False	False	ref	35	0.01425	-20	0.05905
213	chr1	97867312	C	T	rs11590802	-0.008513580262	0.8160236211568229	0.008513580262	0.8129017419759645	0.0405383937986949	0.1047085842476494	-0.0003292229526241	0.6578367989883894	0.0003292229526241	0.652207806746171	0.0117589324007785	0.7035909419532442	-0.0001152284166865	0.8311357600493612	0.0001152284166865	0.8263639611669173	0.000459599840641	0.5783965385553058	-4.337000301815062e-06	0.7618382271902524	4.337000301815062e-06	0.7552410062132101	-0.0003983702286298	0.8208033083125715	0.0003983702286298	0.8156564359952414	DPYD	127688	SNX7	794390	PTBP2	1145646	False	False	False	ref	60	0.0472	100	0.1103
214	chr1	97887860	A	G	rs4970723	0.7945048480000001	0.0003607033219314	0.7945048480000001	0.0003704483231731	0.1225729076003735	0.0018444186253932	0.1044008955944495	0.0003729318928254	0.1044008955944495	0.0003780197236286	0.1065966150902312	0.3226722406719686	0.1058224444550334	0.0147549834746953	0.1058224444550334	0.0148592870282069	0.0149933796522735	0.0553912879864515	0.015266576810736	0.0046283182020446	0.015266576810736	0.0046124480544921	0.0989319059087459	0.0074292221806633	0.0989319059087459	0.0074651668485548	DPYD	107140	SNX7	773842	PTBP2	1166194	False	True	True	alt	100	0.2314	100	0.2876
215	chr1	97946313	G	A	rs12044989	-0.0149579053999999	0.6705256852543	0.016811581	0.6662828167807445	0.1041019089966351	0.0037154425321897	-0.0014703320667854	0.234985279859773	0.0016290118007315	0.2329962475318945	0.01882649863086	0.6190602423068627	-0.000338455269278	0.6607843799592708	0.0003713567724569	0.6570903458549034	0.0018804589979116	0.3258889023909994	-3.182075029990652e-05	0.4289627654265988	3.4637209567599494e-05	0.4255403759762008	-0.0010342779848899	0.6460915540276265	0.0011513971825409	0.6423163919735378	DPYD	48687	SNX7	715389	PTBP2	1224647	False	True	False	ref	-35	0.0199	10	0.01355
216	chr1	97958696	G	A	rs56732321	-0.01007290432	0.6991181286924686	0.01341856872	0.6944199666797244	0.0111388415664093	0.8695098000944923	-0.0001053536063842	0.790105985799579	0.0001457272158553	0.7855472012388961	0.0068489987133383	0.7807635883554227	-7.009047545106696e-05	0.8132286348249224	8.770954611218418e-05	0.8088510180417824	7.699317565618185e-05	0.8427663198880245	-7.497821655295375e-07	0.8527150482753425	9.623992818183542e-07	0.848171457459475	-0.0003068193065223	0.7980284344100292	0.0003711523869222	0.7937126037667614	DPYD	36304	SNX7	703006	PTBP2	1237030	False	False	False	ref	-100	0.00379	-100	0.1165
217	chr1	97977953	C	T	rs11165939	-0.0979359806	0.1170496630470033	0.0979359806	0.1153334971716212	0.0262568971898792	0.3032839319976535	-0.0028851769035673	0.1369515447094276	0.0028851769035673	0.1352985929629056	0.0164511233545577	0.6539817956378082	-0.0016938832199415	0.4216948042210168	0.0016938832199415	0.4165902682596127	0.0004262536965168	0.6016910773854598	-4.7831900478931976e-05	0.3848186232107217	4.7831900478931976e-05	0.3797282364444034	-0.004907459338194	0.3573001054023631	0.004907459338194	0.3524221268887867	DPYD	17047	SNX7	683749	PLPPR5	1249976	False	False	False	ref	95	0.0247	75	0.0979
218	chr1	97980638	G	C	rs12077962	0.00524600014	0.7773533614919034	0.01009656414	0.7808245771367328	0.0094391588261491	0.9324506185901889	5.53262363371548e-05	0.8549941627187299	9.80191373979548e-05	0.8587707901679098	0.0162861667381478	0.6399624890856586	7.926097354039515e-05	0.7239259382711682	0.0001664354257789	0.7274434747229206	0.0001545528647404	0.7467162249446108	8.6111028244562e-07	0.7915662576333558	1.6283880975250633e-06	0.7952489073125159	0.0002647553693378	0.7160180610815238	0.0005996173006498	0.719438033801993	DPYD	14362	SNX7	681064	PLPPR5	1247291	False	False	False	alt	100	0.01924	95	0.07556
219	chr1	98031620	A	C	rs1198572	-0.0088132463799999	0.8088042381141339	0.0088132463799999	0.8019519072167434	0.0164688807366402	0.6219484504317249	-0.0001459644053947	0.7961092233559948	0.0001459644053947	0.7892894786562289	0.0080267889545049	0.7572298301001108	-7.079982128397212e-05	0.8278687584209907	7.079982128397212e-05	0.821060349750337	0.0001294426830958	0.7737754809333572	-1.1480609700369109e-06	0.8309674532798613	1.1480609700369109e-06	0.8242507672293984	-0.0002730032001582	0.8236441973625457	0.0002730032001582	0.8167893086984269	DPYD	36620	SNX7	630082	PLPPR5	1196309	False	False	False	ref	-95	0.01233	95	0.0778
220	chr1	98036428	T	C	rs1702294	-0.00255796406	0.8973652477914504	0.00460662674	0.8928847253486241	0.0128107449807911	0.7766268549362814	-3.4130053166962003e-05	0.906989205585954	6.108196231072136e-05	0.9025544249813288	0.1553569661179109	0.2283478555471394	-0.0004999026785075	0.5372746823652785	0.0007267367660735	0.5336406816928435	0.0019854858584407	0.3270578687723653	-6.696200823530018e-06	0.5926076400660765	9.68039719036382e-06	0.5888170366264366	-0.0007406552076803	0.6178488568151986	0.0011662432780178	0.6140503383541746	DPYD	41428	SNX7	625274	PLPPR5	1191501	False	False	False	ref	0	0.0	-90	0.02234
221	chr1	98060611	T	C	rs1702291	0.0498695618	0.2860582991659391	0.0498695618	0.2902225209086191	0.0178554727045444	0.5629806691524778	0.0008977903872146	0.3548106998050384	0.0008977903872146	0.3595098018896733	0.0267031770644319	0.5603113887717639	0.001200197397606	0.4446931543812221	0.001200197397606	0.4501299777838048	0.0004963205972687	0.5717534073841599	2.2489449206426126e-05	0.4579201122970926	2.2489449206426126e-05	0.4634892818439612	0.0036884299429249	0.3949772730688712	0.0036884299429249	0.4005057316499697	DPYD	65611	SNX7	601091	PLPPR5	1167318	False	False	False	alt	-10	0.001678	-20	0.02905
222	chr1	98070109	A	G	rs11808051	-0.366879518	0.0062239691921649	0.366879518	0.0061852679077794	0.0492646404579759	0.060380046957916	-0.0194387138248529	0.0094591834689227	0.0194387138248529	0.009384240452204	0.1476015307974002	0.2396152871522973	-0.0706478015986491	0.0283100332299667	0.0706478015986491	0.0281409938067765	0.0078753460936636	0.113193263359546	-0.0039506072155854	0.0217521628977726	0.0039506072155854	0.0216770553663144	-0.0825640856454751	0.0104588034094898	0.0825640856454751	0.0103616752474184	DPYD	75109	SNX7	591593	PLPPR5	1157820	False	True	True	ref	95	0.109	95	0.1304
223	chr1	98101149	A	G	rs12027634	-0.065310253	0.215625798324712	0.065310253	0.2127743342157273	0.0279852913237482	0.2615899288866716	-0.0020737389536112	0.1974325577351466	0.0020737389536112	0.1949832746460189	0.0296031143809177	0.5647081789118442	-0.00292622094489	0.3904222763133033	0.00292622094489	0.385188387019405	0.0009759919231718	0.4886287292577894	-0.0001046863719858	0.3429988357169522	0.0001046863719858	0.3380622022630157	-0.0074312955692652	0.3113343077422019	0.0074312955692652	0.3070035051596925	DPYD	106149	SNX7	560553	PLPPR5	1126780	False	False	False	ref	-100	0.0845	-100	0.1543
224	chr1	98112221	A	G	rs4950095	0.37458176	0.0044657081339464	0.37458176	0.0044741856812333	0.0663996477441995	0.0214676056664601	0.0252277307646331	0.0044298717609856	0.0252277307646331	0.0044322682073164	0.073232489855168	0.364762419362209	0.027670977885385	0.0594811456025607	0.027670977885385	0.0606862846033869	0.0049101549927795	0.1683642511828066	0.0018861025874913	0.0277814614844473	0.0018861025874913	0.0282504516718734	0.0468658242882121	0.0243801232704356	0.0468658242882121	0.0247149736958159	DPYD	117221	SNX7	549481	PLPPR5	1115708	False	True	True	alt	100	0.05963	0	0.0
225	chr1	98129502	G	A	rs12567725	0.158183739	0.0507174924627855	0.158183739	0.0513005794297448	0.0370777241543402	0.1360646735084528	0.006407499363824	0.0528166939100928	0.006407499363824	0.0533812499691182	0.0552480947510804	0.4353256901270673	0.0095369993712192	0.1833210059623259	0.0095369993712192	0.1864558223201225	0.0019969289872127	0.3270651884549732	0.0003639916910173	0.1426739484204301	0.0003639916910173	0.1451920916333105	0.0187159776978654	0.1175817242022972	0.0187159776978654	0.119801469475938	DPYD	134502	SNX7	532200	PLPPR5	1098427	False	False	False	alt	-100	0.2253	70	0.1266
226	chr1	98176374	A	G	rs2046585	-0.01566758	0.6474220239018996	0.01641893	0.6427587614902486	0.0197233120092552	0.4964923121607032	-0.0002818886623816	0.6402170591289885	0.0002997726246918	0.6357194204043387	0.0082379334235095	0.755948312977013	-0.0001504548929279	0.7588216243793319	0.0001541421124127	0.7544643055116883	0.0001538948363438	0.7499401952475845	-2.625878488330478e-06	0.7536891229712093	2.7136433061734096e-06	0.7493701302089996	-0.0006210616607831	0.7376747820137625	0.0006326086239318	0.7331271850468661	DPYD	181374	SNX7	485328	PLPPR5	1051555	False	False	False	ref	15	0.001648	100	0.089
227	chr1	114966435	T	C	rs77509205	0.0782365753999999	0.1637479768827436	0.0782365753999999	0.1659828434790971	0.0195232576455227	0.4872371944817567	0.0018871391482696	0.2255425942846517	0.0018871391482696	0.2281903644522886	0.0026492032595427	0.9127704519293492	0.0002934008848298	0.7187186394066143	0.0002934008848298	0.7251089795217706	6.708814805815142e-05	0.8945112861064727	8.747585371998071e-06	0.6989830789709571	8.747585371998071e-06	0.7053185313176003	0.0008709709346441	0.7081579264686535	0.0008709709346441	0.7144578858643789	TSHB	63392	SYCP1	111571	TSPAN2	123068	False	False	False	alt	-100	0.013824	-50	0.02145
228	chr1	115059573	C	T	rs6537851	-0.277772274	0.0108829789669287	0.277772274	0.0108009876001312	0.0418222437739279	0.0986732419772138	-0.0123946523744353	0.0167977829318865	0.0123946523744353	0.0167478530714835	0.0484601299858137	0.4955730923202793	-0.0159992763267908	0.1429846644405359	0.0159992763267908	0.1407735660579636	0.0023819746772595	0.3488640893296881	-0.0008032091825386	0.1027267825171513	0.0008032091825386	0.101356110723388	-0.0276087888885222	0.0840530483959425	0.0276087888885222	0.0829618000931877	TSHB	29746	TSPAN2	29930	SYCP1	204709	False	True	False	ref	-100	0.02022	-25	0.0625
229	chr1	115221028	C	T	rs11102896	-0.1213289113999999	0.0835928511203991	0.1213289113999999	0.0825138196328785	0.0330763611929142	0.1783097682645033	-0.004277521585334	0.0840325828705864	0.004277521585334	0.0829821171731929	0.2980196958199993	0.1105456299723905	-0.0378892173429742	0.0464651209285307	0.0378892173429742	0.0455045531194969	0.0100295997346952	0.0747372171399131	-0.0013506511488469	0.0459225543150374	0.0013506511488469	0.0450513650707829	-0.0409669756853947	0.0349786632222767	0.0409669756853947	0.0343925352017939	NGF	117742	TSPAN2	131525	TSHB	191201	False	False	False	ref	-30	0.003326	-10	0.04224
230	chr1	115255892	G	T	rs2223926	0.013779452	0.3049677439241512	0.0502304344	0.3056232471862141	0.0463034264197905	0.0709600802820062	0.0005313496353106	0.1623765979892136	0.0023280989281926	0.1626868414164043	0.144427765497674	0.2386997301950706	0.0035329687463994	0.1975264116441283	0.0081419714206369	0.1982232345589563	0.0066107368847453	0.1256608275998151	0.0001480320642292	0.1331209214160844	0.0003749603120043	0.133400945304788	0.0046501270165946	0.171746438376871	0.0130959057767806	0.1722506210061796	NGF	82878	TSPAN2	166389	TSHB	226065	False	False	False	alt	95	0.0503	-5	0.02197
231	chr1	115256641	T	A	rs12745199	0.0011166287439999	0.8564405119912897	0.006602784784	0.8576432323503631	0.0684233045008102	0.0198916295371946	5.4905760127383824e-05	0.5879118648231422	0.0004282673700621	0.5881678645664993	0.0361436442215696	0.5172577643543331	0.0002140811698732	0.7270312560335536	0.000316159708771	0.7280513108452179	0.0025774637511866	0.288004757293021	1.2909378337702692e-05	0.5612847881838517	2.0036630057464683e-05	0.5621748133090352	0.0004288872026656	0.7308107019461473	0.0007950908910956	0.7319494819155072	NGF	82129	TSPAN2	167138	TSHB	226814	False	True	False	alt	-100	0.0564	-85	0.0709
232	chr1	150027806	T	A	rs6687454	0.00279346404	0.8536646229508588	0.0064664592	0.8550917645115597	0.0171919199220837	0.5929725110887061	4.004508609195901e-05	0.8402902593326744	0.0001101719711935	0.8414572982974293	0.0027943650819833	0.888698442084576	7.916311410710222e-06	0.920003059814718	2.195764540063536e-05	0.9211656895460556	4.852868229526248e-05	0.8882577470053344	9.797806087353309e-08	0.9168319090087876	3.730043347423866e-07	0.91789848061853	3.0516974035828404e-05	0.9166552984758944	8.66022236151884e-05	0.919511376645622	OTUD7B	17080	VPS45	39474	MTMR11	90927	False	False	False	alt	-35	0.000763	20	0.01031
233	chr1	150036614	A	G	rs77391665	-0.02069662912	0.591096238268731	0.02187728528	0.5871172324444708	0.0164488703440598	0.627697214113939	-0.0003488279785159	0.6217931003581735	0.0003678763128349	0.6175522618121734	0.0029246808089472	0.8860689266094371	-6.692445942992336e-05	0.8516989081764011	6.928101968033199e-05	0.8477469575685738	4.813003038165242e-05	0.8924625238428243	-1.12299657654139e-06	0.8539048020278954	1.161016576749198e-06	0.8499290612170701	-0.0002301144798917	0.8473410418513657	0.0002433110092045	0.8434405390549585	OTUD7B	25888	VPS45	30666	MTMR11	99735	False	False	False	ref	-80	0.02786	100	0.1655
234	chr1	150041153	A	C	rs12063059	-0.0165700976	0.6565686329663578	0.0165700976	0.6499723987186562	0.0302781109796151	0.219941325603971	-0.0005057620055393	0.5030528112071306	0.0005057620055393	0.4972811559197713	0.0016817327042987	0.9345583974177032	-2.8454755161105427e-05	0.9071071998843032	2.8454755161105427e-05	0.9000750768075357	4.954986094454451e-05	0.886933159031194	-8.509035001521186e-07	0.8608567128957357	8.509035001521186e-07	0.853926448790898	-0.0001228926792253	0.8985434818398786	0.0001228926792253	0.8916255630664457	VPS45	26127	OTUD7B	30427	MTMR11	104274	False	False	False	ref	100	0.0177	-20	0.02756
235	chr1	150043194	T	G	rs72692865	0.0797699732	0.1468554105158117	0.0797699732	0.1491057853922586	0.0423697067658235	0.0921698392515012	0.0033779285701297	0.0906106643174404	0.0033779285701297	0.0917461877488718	0.0028751938240242	0.8898212702402574	0.0002345962937399	0.684259615572222	0.0002345962937399	0.6907178712071985	0.0001250753143912	0.7892797710694471	1.0241373502404748e-05	0.5729603600220597	1.0241373502404748e-05	0.5791287282153117	0.0008577744053313	0.6698606383077368	0.0008577744053313	0.6764253791636536	VPS45	24086	OTUD7B	32468	PLEKHO1	105990	False	False	False	alt	-45	0.01758	-100	0.1019
236	chr1	150045258	A	C	rs72692866	0.00518054712	0.782358147651732	0.00943595008	0.7846472583657538	0.0161798802361118	0.6366259879919746	7.634167881105335e-05	0.7788622285599692	0.0001515914777992	0.7810696352971341	0.0005583781465474	0.9849095425350528	3.1477389304420063e-06	0.9692540655084894	5.54114299445665e-06	0.9714117834674464	9.196853127785032e-06	0.9831046759314724	4.673316288795967e-08	0.9673315818409786	9.036228399035046e-08	0.9693413838544273	1.319652931279071e-05	0.9679141206494032	2.144436013328496e-05	0.9713992799904638	VPS45	22022	OTUD7B	34532	PLEKHO1	103926	False	False	False	alt	-45	0.3816	100	0.1581
237	chr1	150047081	C	A	rs72692870	0.008023385	0.6481474196842885	0.0164678298	0.6505769797318828	0.0578942892723845	0.0352099551524998	0.0004131987482369	0.3395877712963741	0.0009336694787288	0.3414574922561125	0.0008734452838902	0.9697937144589788	8.066322370950196e-06	0.9369079433819816	1.4642741163533002e-05	0.938659237739039	5.44194774976817e-05	0.8853306447083633	4.882422117038929e-07	0.856879426481981	9.025569044413988e-07	0.8585722755138893	3.051697403581649e-05	0.9380272288671524	5.526046649729919e-05	0.9397643126228764	VPS45	20199	OTUD7B	36355	PLEKHO1	102103	False	False	False	alt	45	0.00836	35	0.05524
238	chr1	150053395	T	C	rs12074281	0.0163922722	0.579010199670653	0.0207469582	0.5833121428989951	0.0287398311154299	0.249713993131329	0.0005918278749399	0.4413040302359923	0.0006530915966605	0.4452888406244229	0.0002911484279633	0.9958374070028284	4.749972706342988e-06	0.9669267736531124	5.845432444421974e-06	0.9713714044321534	8.165600164777024e-06	0.9872031119379794	1.6352472420440613e-07	0.9455266335441715	1.789361549760615e-07	0.949974158425003	2.309392629738379e-05	0.9673619037460878	2.309392629738379e-05	0.9723194303453	VPS45	13885	OTUD7B	42669	PLEKHO1	95789	False	False	False	alt	-30	0.003601	-55	0.0845
239	chr1	150086719	G	A	rs56212907	-0.02458736132	0.5301847402464843	0.02458736132	0.5243479415953225	0.0126881419539324	0.7851615157301262	-0.000359491175337	0.6271779767281362	0.000359491175337	0.620877814394906	0.0071294249612351	0.776831159455352	-0.0001523439356679	0.7557268323178189	0.0001523439356679	0.7490785264769414	8.892730862136208e-05	0.8252922739214325	-2.166090313190421e-06	0.7881737534309887	2.166090313190421e-06	0.7815456459936556	-0.0006070403483883	0.7369223505379106	0.0006070403483883	0.7303132327543164	VPS45	19439	PLEKHO1	62465	OTUD7B	75993	False	False	False	ref	35	0.02391	-95	0.08746
240	chr1	150090550	C	A	rs72694905	0.016858797	0.6388568520320865	0.016858797	0.6454588534197714	0.0201359011231652	0.4766438522252714	0.0003475095967056	0.5924282229497643	0.0003475095967056	0.5988429516625537	0.0037758569496222	0.8657979943516483	5.651436734475464e-05	0.8370017627446334	5.651436734475464e-05	0.8438679127764604	7.506822912068267e-05	0.8517343276197523	1.1400302082081346e-06	0.8197054132625801	1.1400302082081346e-06	0.826533433643579	0.0002449605753686	0.8214041929085719	0.0002449605753686	0.8282231112440059	VPS45	23270	PLEKHO1	58634	OTUD7B	79824	False	False	False	alt	-55	0.011475	100	0.04385
241	chr1	150109454	A	G	rs72694928	0.08223207	0.1505329679014928	0.08223207	0.1528634604838694	0.0186950777009752	0.5251845411607616	0.0016122641263936	0.2281420760673394	0.0016122641263936	0.2312866144886626	0.025051136551087	0.5644187335111599	0.0022618091463556	0.360540509673219	0.0022618091463556	0.3655761062035417	0.0004771321758587	0.5734916137916461	4.5228804874577416e-05	0.3766263898177656	4.5228804874577416e-05	0.381735878235639	0.0062724753389857	0.2953755627658406	0.0062724753389857	0.3001194371863462	PLEKHO1	39730	VPS45	42174	OTUD7B	98728	False	False	False	alt	-100	0.04077	10	0.01915
242	chr1	150134673	T	G	rs56369603	-0.01008453168	0.7848066587037839	0.01008453168	0.7780460173616257	0.0255925974692421	0.3148977915889387	-0.0002639762668141	0.690452132829062	0.0002639762668141	0.6837315143431222	0.0042030945861238	0.8481585254518412	-4.365918376588381e-05	0.8828628342140257	4.365918376588381e-05	0.8759977060163422	0.0001040275522961	0.8037746573178102	-1.11185513675087e-06	0.8478337892189841	1.11185513675087e-06	0.841174426471649	-0.0001773283626405	0.8753638864490466	0.0001773283626405	0.8685130508939873	PLEKHO1	14511	VPS45	67393	ANP32E	101483	False	False	False	ref	45	0.00499	-35	0.0354
243	chr1	150140312	C	T	rs72694944	-0.0468198636	0.3164113810272668	0.0468198636	0.3121039999702143	0.0235535381572737	0.368802472183232	-0.0011545613650216	0.302653635325605	0.0011545613650216	0.2987108124316908	0.0006730229949522	0.981296331933247	-3.154969125324148e-05	0.9032969271003534	3.154969125324148e-05	0.8964088741733376	1.575972415124845e-05	0.9662958124548816	-7.797688780034257e-07	0.8743795094547133	7.797688780034257e-07	0.8674572783122378	-0.0001096961499125	0.908624275418494	0.0001096961499125	0.9017460508166856	PLEKHO1	8872	VPS45	73032	ANP32E	95844	False	False	False	ref	85	0.0432	15	0.008606
244	chr1	150174687	T	A	rs72694960	0.023572713	0.5421008330172878	0.023572713	0.5483173103589649	0.0118018295859447	0.8339807606934196	0.0002730324220932	0.6557934783109189	0.0002730324220932	0.6623698904653038	0.0004264128534194	0.9920513189179052	1.044207682289786e-05	0.9511821535720096	1.044207682289786e-05	0.9582516162268654	5.098330805218958e-06	0.9945030687365776	1.2311331808219556e-07	0.9591236695660498	1.2311331808219556e-07	0.9661539967292018	3.876480485632279e-05	0.9506128099438907	3.876480485632279e-05	0.9576952160613668	PLEKHO1	25503	ANP32E	61469	CA14	82565	False	False	False	alt	100	0.04623	-100	0.1575
245	chr1	151471857	G	A	rs11204824	0.0175483214399999	0.6133711335493606	0.01879320096	0.61796893450913	0.015819583574883	0.636128478515027	0.0003125737271617	0.6308328487365679	0.0003292554932734	0.6353550081827588	0.0028586981623832	0.8870177430275615	5.191765307714242e-05	0.8501376540094902	5.3930093979289134e-05	0.8545600720603326	4.400008640153721e-05	0.895592917194118	8.685730591529687e-07	0.8523947500745719	8.95540382549618e-07	0.85669163478004	0.0002301144798917	0.8333006766863348	0.0002416614430404	0.8376723433870837	POGZ	12363	CGN	38654	TUFT1	68449	False	False	False	alt	-100	0.00947	100	0.2185
246	chr1	151473276	C	T	rs10888415	0.0049765467999999	0.6300403361507648	0.0184156964	0.6317374458377745	0.0117941139463675	0.8317074520346958	5.570660124974e-05	0.7254968382982032	0.0002143275580774	0.7270002870473592	0.1837690937283494	0.1930971169018571	0.0014977810095713	0.3069986159953079	0.0030806320090241	0.3084350869459381	0.0022464065440289	0.298897740288749	1.7189613490124035e-05	0.3888794217816428	3.705157339457768e-05	0.3902620507484805	0.0020438124773184	0.3410314638905472	0.0049289036983272	0.3426293834485669	POGZ	13782	CGN	37235	TUFT1	67030	False	False	False	alt	100	0.05008	95	0.3647
247	chr1	151611057	C	A	rs58479084	0.00031189036	0.7459368406443759	0.0119944961599999	0.74729341312962	0.0695022519018911	0.0184763603277384	0.000138167366425	0.4019772382305894	0.0007770068994432	0.4037025981384707	0.0138076935765893	0.6777447566799497	-9.036126484955064e-06	0.736454787996761	0.0001836434519248	0.7382699879390296	0.0009122844931103	0.4598564237695302	1.0683025626474711e-06	0.5704405143195572	1.1299647244586548e-05	0.5723453601590972	5.6910032661398816e-05	0.7253794570162321	0.0006260103592754	0.7271772128065024	SNX27	950	TUFT1	70751	RIIAD1	99377	False	True	False	alt	100	0.02203	50	0.0821
248	chr1	151637173	T	G	rs144529710	-0.00440897206	0.8062076432694782	0.0084724453399999	0.8045750519997187	0.072476555070766	0.0163550330945202	-0.0002856803732246	0.4936705844181851	0.0005324529363764	0.4917711809896644	0.0008173600343109	0.975181148206978	-3.568796628930297e-06	0.967808616837522	6.603568088673951e-06	0.966666875257668	5.990448188668229e-05	0.8718688417559982	-2.3167326117861866e-07	0.9052254146141384	4.191907469661399e-07	0.904093054080842	-1.6495661640988424e-05	0.9671963625618056	2.80426247896803e-05	0.9651266613439076	SNX27	25166	RIIAD1	73261	CELF3	79630	False	False	False	ref	80	0.06885	-75	0.1399
249	chr1	151657482	A	G	rs6690942	-0.0709702846	0.1775658266692787	0.0756532382	0.1760093765344767	0.0246711420534416	0.330755236267003	-0.0021372305420886	0.1906222549630795	0.0021924568389463	0.1890538322712329	0.0161937910329582	0.6607038699962134	-0.0013844749898563	0.4753609451862082	0.0014392441189168	0.4712726570807199	0.0004548678768901	0.6151230233857701	-4.420350453455969e-05	0.4347854188555256	4.484939949797454e-05	0.4309042737396677	-0.0040026722971858	0.4139911087056405	0.0041956715383853	0.4100940541220946	SNX27	45475	RIIAD1	52952	CELF3	59321	False	False	False	ref	-80	0.004433	55	0.1643
250	chr1	151707487	C	T	rs2280473	-0.0308277660999999	0.4536582297013156	0.0308277660999999	0.4481824668426867	0.0961555034846182	0.0051792612901117	-0.002986027536421	0.1171597979318097	0.002986027536421	0.1157416746737032	0.2375061858731153	0.1501328143354955	-0.0078045845128784	0.1968223401459616	0.0078045845128784	0.1933230774937703	0.0213397598223082	0.0208735940261305	-0.000702586825568	0.0774550069723152	0.000702586825568	0.0760353147925445	-0.0092928309854507	0.2264615302869926	0.0092928309854507	0.2226755114931077	RIIAD1	2947	CELF3	9316	OAZ3	55413	False	True	True	ref	80	0.04547	100	0.588
251	chr1	153898374	T	C	rs11800001	-0.015107783	0.6961098030428253	0.015107783	0.6895162833592019	0.0209621391794936	0.4455945933716674	-0.0002786402617696	0.670736900803929	0.0002786402617696	0.664077445089709	0.0007225099798752	0.9751450114125004	-8.871164057974191e-06	0.96804430071723	8.871164057974191e-06	0.9610097216323789	1.6254349290110687e-05	0.961265499523588	-1.7478693732046488e-07	0.9570119439798516	1.7478693732046488e-07	0.950041592834566	-3.051697403582856e-05	0.9703026173803622	3.051697403582856e-05	0.9632360845673004	GATAD2B	24986	DENND4B	48344	CRTC2	60241	False	False	False	ref	0	0.0	-35	0.015015
252	chr1	153902212	C	T	rs11264559	-0.098580181	0.1075564276738226	0.098580181	0.1060695013218466	0.0201186537009374	0.4720443862188438	-0.0020955367112811	0.1719211414981278	0.0020955367112811	0.1697090200267448	0.0004074428425323	0.98930861657459	-4.318734716174283e-05	0.8785438594827172	4.318734716174283e-05	0.8714379837819719	7.944984545442542e-06	0.9839155747969692	-8.765663440912939e-07	0.8621023529814003	8.765663440912939e-07	0.8551209401249483	-0.0001558840025073	0.8846918657557387	0.0001558840025073	0.8777483115247985	GATAD2B	21148	DENND4B	44506	CRTC2	56403	False	False	False	ref	-100	0.1444	85	0.1124
253	chr1	153907268	C	T	rs6671132	-0.0271830394	0.1981050530674794	0.0681051434	0.1960725007563621	0.0162078615111759	0.6281222059928915	-0.0002617974968103	0.3009442366334502	0.0012115951006902	0.2982292209068716	0.0795998152485896	0.3485047116623989	-0.003109242007366	0.238051847655604	0.0050445736679925	0.2354741160953728	0.0011853615202847	0.4057348844177751	-3.771809260655098e-05	0.2839841662825106	8.263692950275099e-05	0.2812561788144958	-0.0065298076605852	0.187899792009902	0.010998482399129	0.1856764367786284	GATAD2B	16092	DENND4B	39450	CRTC2	51347	False	False	False	ref	-100	0.07874	-100	0.2158
254	chr1	153910068	A	C	rs10908525	-0.0892354495999999	0.1467712017252043	0.0892354495999999	0.1450452325458323	0.0429447235991571	0.090199341530679	-0.004211305576652	0.0992436463065801	0.004211305576652	0.0982743547298861	0.0002532084061891	0.995770300076921	-2.7711796283477103e-05	0.9179194584825584	2.7711796283477103e-05	0.9108654215235772	1.1230304202697116e-05	0.9773056856410162	-1.3085439347631769e-06	0.8476872412281147	1.3085439347631769e-06	0.840800206820203	-8.000395895879205e-05	0.9347101451028672	8.000395895879205e-05	0.9310967104438644	GATAD2B	13292	DENND4B	36650	CRTC2	48547	False	False	False	ref	-75	0.0429	90	0.0598
255	chr1	153923736	A	G	rs4845357	0.0874824224	0.139805868348625	0.0874824224	0.1415881080141162	0.0219751450266401	0.4161200680119388	0.002181398950823	0.1850184364399247	0.002181398950823	0.1872641396272668	0.8607708422684833	0.0037480851461525	0.0750933978746725	0.0168744097549763	0.0750933978746725	0.0170950984776778	0.018848466352582	0.0266053386511149	0.0018640503290643	0.0338462721753492	0.0018640503290643	0.0343592183038516	0.0093183992609943	0.2268770078309706	0.0093183992609943	0.2306405947586341	GATAD2B	376	DENND4B	22982	CRTC2	34879	False	False	False	alt	70	0.04843	-45	0.04425
256	chr1	153926854	A	C	rs10796968	0.00997647854	0.6726729574546716	0.01534428946	0.6753314969682577	0.1243449321790313	0.0016466866867862	0.0015082909612393	0.1950705979588912	0.0020619350480439	0.1959745026655405	0.0006326086239318	0.9811349221944728	7.690332686632846e-06	0.951109007613567	1.0407068306000518e-05	0.9528276345309452	7.988862941112102e-05	0.833900624520889	1.1215528241301762e-06	0.8174197419635558	1.4024928280494434e-06	0.8193984248030756	3.0516974035828564e-05	0.949510842585186	4.206393718452044e-05	0.951208035854938	GATAD2B	3494	DENND4B	19864	CRTC2	31761	False	False	False	alt	-65	0.0878	-85	0.1672
257	chr1	153928826	A	G	rs3748848	-0.0228184751	0.3417150066335416	0.0431112031	0.339298032000459	0.0177117556321787	0.5609439724412274	-0.0004702945121881	0.4009524411434449	0.0008207493962799	0.3980484145222721	0.5598231665072086	0.0329123750952581	-0.0123127951364034	0.0845924397232079	0.0238288394129684	0.0835491122601632	0.0100276335366843	0.0746764409049798	-0.0002575428107451	0.1225359949502196	0.0004564245989357	0.1211417837502324	-0.0070222031605687	0.1883256055573258	0.01258454026591	0.1866583804445166	GATAD2B	5466	DENND4B	17892	CRTC2	29789	False	False	False	ref	-80	0.09607	100	0.51
258	chr1	153931738	T	C	rs11586593	-0.0189250453	0.504187441640205	0.0267030373	0.5000255529478229	0.0258945189122061	0.3059499612198009	-0.0004848472183204	0.4277642079006188	0.000688382356717	0.4241161752603177	0.0006276599254395	0.9814951212316048	-1.5227895061586588e-05	0.9362072900868368	1.8275094220457097e-05	0.9319825903328848	1.5799368061069807e-05	0.96522647943013	-3.677851138131992e-07	0.9097094367205047	4.4752447472044827e-07	0.9055036146340464	-5.608524957934839e-05	0.9412935452726128	6.43330803998426e-05	0.9370702118271792	GATAD2B	8378	DENND4B	14980	CRTC2	26877	False	False	False	ref	-100	0.1436	35	0.0842
259	chr1	153947280	T	G	rs946682	0.0578177386	0.2425072523097554	0.0578177386	0.2458438186747981	0.0262814226927391	0.2997465276535276	0.0016225580454098	0.2250344800166356	0.0016225580454098	0.2277256623609992	0.4122653492131569	0.0662118579255226	0.0215858320788382	0.0755025508121271	0.0215858320788382	0.0770048555461893	0.0104492990754874	0.0699393263082054	0.0005943634354694	0.0817512543443678	0.0005943634354694	0.0830440458701781	0.0190178483058955	0.1049065643391366	0.0190178483058955	0.1067657766329717	DENND4B	562	CRTC2	11335	CREB3L4	20255	False	False	False	alt	-95	0.1372	-100	0.1614
260	chr1	163732741	G	C	rs10737494	0.0256729092	0.5217253353979883	0.0256729092	0.5274167035140506	0.0095392279413665	0.9234615656883124	0.0002293351476795	0.7045539038836597	0.0002293351476795	0.711130648335016	0.0003398106298043	0.9947648216199654	9.831742614503742e-06	0.9547887269693524	9.831742614503742e-06	0.9618417337119872	3.098884660121704e-06	0.9980512038904374	8.464286405534342e-08	0.9689721779588544	8.464286405534342e-08	0.976040197924291	2.226914321533436e-05	0.9663227950302146	2.226914321533436e-05	0.9734636082103328	RGS5	410950	NUF2	466164	RGS4	663965	False	False	False	alt	90	0.00932	100	0.07056
261	chr1	163739753	C	T	rs3963479	0.0098902358799999	0.7556112760996259	0.01078172548	0.7599207468114416	0.0190298743933833	0.5206442403238469	0.0001979639079479	0.7358307933564902	0.0002146723961092	0.7401933257232811	0.0037709082511298	0.8691987969330971	1.9275245720654945e-05	0.9073230287772016	2.6359722125712223e-05	0.9117443220437272	7.146567826282017e-05	0.8606541332792079	3.8834942162307444e-07	0.8963679543250359	5.21128184641999e-07	0.900885720930048	8.330309128696963e-05	0.9052998738235972	9.979875292795786e-05	0.9097249927924896	RGS5	417962	NUF2	473176	RGS4	670977	False	False	False	alt	-100	0.01434	-100	0.0799
262	chr1	163745482	A	G	rs1932355	0.1137873892	0.0844032015472302	0.1137873892	0.0855577945695268	0.040383525249189	0.1054358772717718	0.004631924790167	0.0638159738443847	0.004631924790167	0.0645118637449287	0.2655158193395137	0.1293222740853703	0.0291729059576275	0.054808761014887	0.0291729059576275	0.0558783863951669	0.0106811924769414	0.0685709081740687	0.0011825499763986	0.0424957765690789	0.0011825499763986	0.0432872918194284	0.0356215565306324	0.0390558891017034	0.0356215565306324	0.0397210096871206	RGS5	423691	NUF2	478905	RGS4	676706	False	False	False	alt	-5	0.002964	30	0.126
263	chr1	163752441	T	G	rs6683086	-0.0361516672	0.4292570364784449	0.038040588	0.426023446631864	0.032147842949661	0.1912498292996793	-0.0012397425528565	0.336329589439106	0.0013019084969903	0.3336494491038289	0.0001468113886047	0.9990539297497656	-5.362774964880045e-06	0.9810924557175432	5.767841930846366e-06	0.9786299005120292	4.79934824146864e-06	0.9949740997337184	-1.8355240891495146e-07	0.9629134029526774	1.968834978552851e-07	0.9593626386502228	-9.072613902543637e-06	0.988772125162521	1.072218006664248e-05	0.9862603374218544	RGS5	430650	NUF2	485864	RGS4	683665	False	False	False	ref	-70	0.02425	-5	0.009155
264	chr1	163764480	T	A	rs1934230	-0.0023517868	0.6510911582821974	0.0168306144	0.6523823794489738	0.0135199559791028	0.7512973294601295	-4.613834842570238e-05	0.7013853950125796	0.0002339713085858	0.7025089226846704	0.0017254462076473	0.9368758732594764	-1.1694194819482138e-05	0.90465466504778	2.91431350807716e-05	0.9061880490737896	2.350700285362116e-05	0.94924682332531	-1.9113317148722365e-07	0.9138596773151664	4.089462324476058e-07	0.9154166969813702	-5.196133416909029e-05	0.905621112959786	0.0001096961499125	0.9071912131647965	RGS5	442689	NUF2	497903	RGS4	695704	False	False	False	ref	65	0.0736	75	0.10034
265	chr1	163775601	A	G	rs10799961	0.0961080366	0.1224350908078596	0.0961080366	0.1239391611589889	0.044497171491507	0.0801449245623766	0.0044282777421214	0.0806828228853106	0.0044282777421214	0.0814886364803313	0.0865246940054765	0.3349320436192207	0.0091664815300133	0.1812133688980946	0.0091664815300133	0.1843768147566485	0.0038411165422647	0.2052803366490964	0.0004164066399174	0.1246355610816356	0.0004164066399174	0.1267166464471155	0.0180033651149747	0.1226254990580909	0.0180033651149747	0.1246153816660406	RGS5	453810	NUF2	509024	RGS4	706825	False	False	False	alt	-35	0.01752	-5	0.004395
266	chr1	163777858	A	G	rs3856207	-0.0044720388399999	0.9037301357950268	0.0044720388399999	0.8968276003802229	0.0193135372315937	0.5083851995661057	-8.699313723920212e-05	0.8781473759851918	8.699313723920212e-05	0.8713539600822096	0.1624080366863514	0.2179491626369474	-0.0007991651984295	0.5419228664808368	0.0007991651984295	0.5361322834779292	0.0030945654672695	0.2457755917143611	-1.4898730985336994e-05	0.5471216145021591	1.4898730985336994e-05	0.5413139969226973	-0.001285836824915	0.6219743962638451	0.001285836824915	0.6158287325297229	RGS5	456067	NUF2	511281	RGS4	709082	False	False	False	ref	95	0.06525	50	0.1041
267	chr1	173645232	G	T	rs969029	0.018528893346	0.5988154511350495	0.018660337454	0.6038105425818298	0.0284117538655654	0.2532343799383687	0.0005235348125411	0.5001273962639126	0.0005274726126763	0.5047222034118585	0.0003604302068555	0.9938009029806372	6.669173994874861e-06	0.9579552901779332	6.726090755537248e-06	0.9647656966017786	1.0284572124232936e-05	0.981725184624702	1.884489772094771e-07	0.937736533898027	1.9015408844876973e-07	0.9443357323011544	3.711523869222394e-05	0.94937646719711	3.711523869222394e-05	0.9555325717210544	TEX50	9893	ENSG00000285777	24605	ANKRD45	24619	False	False	False	alt	-100	0.1431	-95	0.12006
268	chr1	173725120	T	G	rs61826814	-0.01921953214	0.6259643256482548	0.01921953214	0.6199802248824801	0.0146341072464554	0.7072648605452936	-0.0003065082183621	0.6619292222344271	0.0003065082183621	0.6556936614038115	0.0138118174919995	0.6733274186308559	-0.0003008691762395	0.6871602061985018	0.0003008691762395	0.6809433758937361	0.0002107993795059	0.7122920435560296	-4.9613664387058445e-06	0.7095722619683215	4.9613664387058445e-06	0.7032188165812823	-0.0009971627461977	0.6662301581826744	0.0009971627461977	0.6600238642496483	KLHL20	10178	ANKRD45	55269	ENSG00000285777	55283	False	False	False	ref	95	0.04648	95	0.1272
269	chr1	173805138	C	A	rs61827870	-0.00679172079	0.6195499512364667	0.01952245339	0.6185597629337474	0.0288429409106324	0.2449073513389545	-0.0002054308529063	0.5045252549500884	0.0005713706032794	0.5038464520912884	0.008179373824684	0.7786554917916757	-0.0001661811209971	0.7896339671083269	0.0002135017169631	0.7883029714456032	0.0002363703020666	0.715107709046729	-4.9832624966112415e-06	0.7371195555003506	6.294945700390344e-06	0.7356148503726473	-0.0004775494045065	0.7759332222601086	0.0006573521163933	0.7742744437227685	DARS2	19516	CENPL	19745	ZBTB37	62945	False	False	False	ref	90	0.1321	-10	0.0166
270	chr1	173835419	A	C	rs28804123	-0.049727675	0.296708497129032	0.0562755334	0.2943848042688421	0.0239328650557026	0.3603060599658718	-0.0015539352897215	0.2888176325203376	0.0016811019040428	0.2868666691468871	0.0001138200653227	0.999379853983596	-6.3960431630948925e-06	0.9780743540577604	7.368144497501738e-06	0.976588126766439	2.773569452355927e-06	0.9978591432378208	-2.2304507494565334e-07	0.9635213769710173	2.419243519225314e-07	0.9614021298988286	-1.4846095476889578e-05	0.9876490079439784	1.4846095476889578e-05	0.98551347125683	CENPL	10536	DARS2	10765	ZBTB37	32664	False	False	False	ref	-100	0.0995	85	0.196
271	chr1	173855675	C	T	rs9425757	0.0256938944	0.4446408588090067	0.0319877792	0.4485506903933516	0.0523237664743927	0.0502186410624764	0.0010835143162273	0.2244484243874703	0.0015621430913175	0.2266171033760657	0.0036645112335455	0.8761723140673973	0.0001636968262445	0.7747264183414707	0.000175480599618	0.7789672633054426	0.000174719424497	0.7530212170636675	7.015106206680185e-06	0.6596224670896419	7.9112225666277e-06	0.6639111792720548	0.0005987925175678	0.7505195677504417	0.0006449803701625	0.7547258231163295	ZBTB37	12408	CENPL	30792	DARS2	31021	False	False	False	alt	-65	0.01892	30	0.075
272	chr1	173878871	A	G	rs9425765	0.1059117272	0.1015005269278376	0.1059117272	0.1028070544045514	0.0319312306724052	0.1969524372387812	0.0035794858952161	0.1003509824276112	0.0035794858952161	0.1014247039703384	0.0024083665995842	0.909372632415706	0.0003028101647977	0.6764880248552213	0.0003028101647977	0.6827934848907818	7.973993681892765e-05	0.8463018929052796	1.0314405533370192e-05	0.6009577731157121	1.0314405533370192e-05	0.6070738972690407	0.0009600475075054	0.6630545662036736	0.0009600475075054	0.6692383472360234	ZBTB37	10788	SERPINC1	38456	CENPL	53988	False	False	False	alt	100	0.122	-35	0.04663
273	chr1	173884136	C	T	rs60265316	-0.0141237464	0.7059824646304531	0.0141237464	0.6992925071800522	0.0124407919522545	0.800593520926785	-0.0001653856221745	0.7809733452400365	0.0001653856221745	0.7742520805978749	0.0014821351984427	0.9478942501751269	-2.2250823422639364e-05	0.9315055429906184	2.2250823422639364e-05	0.924454922190941	1.795907889489082e-05	0.9632967389841864	-2.565444629852498e-07	0.9464289655136584	2.565444629852498e-07	0.9394390558500764	-7.010656197418876e-05	0.9392918205889914	7.010656197418876e-05	0.9340007839935032	ZBTB37	16053	SERPINC1	33191	CENPL	59253	False	False	False	ref	100	0.0842	-15	0.0367
274	chr1	173886160	A	T	rs1322775	0.0518503900399999	0.287944509966914	0.0518503900399999	0.29182839970836	0.0225766384250584	0.3960849239894124	0.0012359418430169	0.2973610570848754	0.0012359418430169	0.3011130309373279	0.0641442050740654	0.4013851848034618	0.0030426765576274	0.339114635940234	0.0030426765576274	0.3440042634022205	0.0014249863191486	0.3892434994779667	6.906830186486688e-05	0.331465521313996	6.906830186486688e-05	0.3362616755704298	0.0068118834746461	0.2973398650070851	0.0068118834746461	0.3019261479558453	ZBTB37	18077	SERPINC1	31167	CENPL	61277	False	False	False	alt	-75	0.00415	50	0.2
275	chr1	173887899	C	T	rs7349095	-0.1055128398	0.1036914687764951	0.1055128398	0.1024346969672678	0.023994508653848	0.3565379824768778	-0.0026570164622178	0.1431584405560269	0.0026570164622178	0.1413919544597711	0.0357617696545807	0.5258808216106275	-0.0039692707517166	0.3145149106059523	0.0039692707517166	0.3100668041155293	0.0008710796848096	0.4915244082171292	-0.0001021310053156	0.30095882033944	0.0001021310053156	0.2967375181365755	-0.0094091254000197	0.2423877768717404	0.0094091254000197	0.2388277437626898	ZBTB37	19816	SERPINC1	29428	CENPL	63016	False	False	False	ref	-25	0.00835	50	0.02075
276	chr1	173896268	A	G	rs1322779	0.0199695393	0.5789490437730826	0.0199695393	0.5852343830788084	0.0147860319386833	0.7011649850152685	0.0002983266257696	0.627445666290705	0.0002983266257696	0.6336705134129289	0.0284517171983767	0.5465255760936576	0.0005005327847008	0.5670514751115788	0.0005005327847008	0.5730731058550323	0.0004124263202912	0.5956924284312366	7.432332411527694e-06	0.5989154569486387	7.432332411527694e-06	0.6050820388121568	0.0016957540166935	0.5410528315676097	0.0016957540166935	0.5471353343993292	SERPINC1	21059	ZBTB37	28185	CENPL	71385	False	False	False	alt	60	0.0293	0	0.0
277	chr1	173896523	T	C	rs9425434	0.016486282	0.6337921837324098	0.018390206	0.6380918543579925	0.0159779726487326	0.6471243939327921	0.0002572951676119	0.6641540371924812	0.0002907108436739	0.6684929019812641	0.0263468707729866	0.5565233785799684	0.0004893524091443	0.594300058017213	0.0005290345037707	0.5979298260344944	0.0004133155479994	0.5924220333951983	7.53981566981219e-06	0.6179076250418002	8.23627416184914e-06	0.621609293713952	0.0013658407838738	0.583699247142253	0.0015225495694631	0.5875389191993708	SERPINC1	20804	ZBTB37	28440	CENPL	71640	False	False	False	alt	-75	0.2076	-75	0.10693
278	chr1	173900220	T	C	rs73039035	0.0138324168199999	0.6654661322377978	0.01562505614	0.6697847136672501	0.0142190265319872	0.727339925898321	0.0001889255282371	0.7247662511932749	0.0002150416850655	0.729101674562017	0.0680033651149747	0.3921342807403483	0.0014280793311424	0.4830285883111902	0.0015065158024501	0.4869075020139885	0.0009322717025728	0.4652278141132254	1.916511965081965e-05	0.5374798752513866	2.0307825368010324e-05	0.5413174774036809	0.0027019893767938	0.4795063065508727	0.0029576721322292	0.4835446753128609	SERPINC1	17107	ZBTB37	32137	CENPL	75337	False	False	False	alt	95	0.07556	95	0.2494
279	chr1	173912733	C	T	rs941989	-0.0258075088799999	0.3581584442232604	0.04088893992	0.356478352259127	0.0347374352747712	0.1590038576304154	-0.0009632791590766	0.2606825168841533	0.0014240045997188	0.2596873963005339	0.0294727986539539	0.5438070776532685	-0.0005124200420917	0.4715563778845834	0.0011798827914855	0.4706822068819167	0.0010042664521313	0.442478718368972	-2.019976102874693e-05	0.3950166079733521	4.048502111545341e-05	0.393841058742288	-0.0014681138860479	0.42471216094533	0.0035795585760944	0.4237793177445896	SERPINC1	4594	ZBTB37	44650	CENPL	87850	False	False	False	ref	-20	0.005737	-20	0.0376
280	chr1	173916398	G	T	rs2227593	-0.095502426	0.1136230507215912	0.095502426	0.1119076550457132	0.0437771131928231	0.0836958362909402	-0.0041980250374439	0.0708085811200492	0.0041980250374439	0.0700608337725897	0.1173880769357658	0.2737320915654057	-0.0111509171506233	0.1404621112465239	0.0111509171506233	0.1379824065805749	0.0051231375807256	0.1583415806254088	-0.0004891488387588	0.0947174678425793	0.0004891488387588	0.0931116650435103	-0.0208818580713272	0.0919422705212853	0.0208818580713272	0.0902876033770058	SERPINC1	929	ZBTB37	48315	CENPL	91515	False	False	False	ref	85	0.02235	-50	0.11316
281	chr1	173981144	T	C	rs1884994	0.0126562928599999	0.7246236621818396	0.0126562928599999	0.7310925607301497	0.0248887019716324	0.334395551465555	0.000309599796948	0.6448851977901393	0.000309599796948	0.6513034329436034	0.0185741150077529	0.6346577608537824	0.0001767694857558	0.7255087950342175	0.0001767694857558	0.731991207783828	0.0004814583980542	0.5870814921649076	4.369468185391456e-06	0.6856956066232786	4.369468185391456e-06	0.6919797435511257	0.0005707498927781	0.7274052547019004	0.0005707498927781	0.7338310464129336	ENSG00000293562	41154	RC3H1	41213	SERPINC1	63817	False	False	False	alt	-100	0.03436	-10	0.02007
282	chr1	174046493	T	C	rs6696163	-0.04127063128	0.3592484649422658	0.04127063128	0.3546149177348601	0.0200370368163325	0.4729005722979753	-0.000956911793372	0.373484620386828	0.000956911793372	0.368862491026395	0.0014961565108376	0.942357275805566	-6.691335549795855e-05	0.846077276360514	6.691335549795855e-05	0.8398074502744655	3.052184681779666e-05	0.9274985482604768	-1.5174481980204965e-06	0.8232341111117343	1.5174481980204965e-06	0.8173445593671036	-0.0002614562370096	0.8414586414367727	0.0002614562370096	0.8357809067095794	RC3H1	24136	ENSG00000293562	24195	RABGAP1L	112918	False	False	False	ref	80	0.3738	85	0.0868
283	chr1	174052172	G	C	rs12092774	0.1206557887999999	0.0849141973080943	0.1206557887999999	0.086156442611222	0.0265197756872865	0.2956048262221759	0.0034941206845764	0.1097274132910036	0.0034941206845764	0.1113430192929968	0.4659480056745075	0.051519189263154	0.0623109230771414	0.0251355716271463	0.0623109230771414	0.0256409991765782	0.0126248941358991	0.0548007203835261	0.0018378289984429	0.0362722301347151	0.0018378289984429	0.0369809386205348	0.0364389165649433	0.0408470067919609	0.0364389165649433	0.0417138557620707	RC3H1	29815	ENSG00000293562	29874	RABGAP1L	107239	True	False	False	alt	-35	0.02136	-35	0.168
284	chr1	174055925	G	T	rs77574979	0.1112627568	0.0949897645053065	0.1112627568	0.0962498191935512	0.0454138828001196	0.0753909018289386	0.0052412366143085	0.0620469983440153	0.0052412366143085	0.062696667705452	0.0161418296987891	0.7434968032802886	0.0026170870541985	0.5009690900063222	0.0026170870541985	0.5071226668056835	0.0007302105038597	0.6236968492350295	0.0001185206559016	0.4053261776364376	0.0001185206559016	0.4107852528131036	0.0059037973013097	0.4339426845094649	0.0059037973013097	0.4390436986495879	RC3H1	33568	ENSG00000293562	33627	RABGAP1L	103486	False	False	False	alt	30	0.0312	-60	0.2678
285	chr1	174061643	T	A	rs61228022	-0.0307522522	0.4560391645155465	0.0307522522	0.4503965204670991	0.012152276781435	0.8183280928925983	-0.0003791121470888	0.5850708220779174	0.0003791121470888	0.578812043199247	0.0004437332981425	0.9906658127589718	-1.3742395641798943e-05	0.9483489520124552	1.3742395641798943e-05	0.9413247037138592	5.315341295883432e-06	0.9936199759594893	-1.68136456389129e-07	0.9581163239052096	1.68136456389129e-07	0.951105583204058	-5.1961334169113536e-05	0.9491899046110934	5.1961334169113536e-05	0.942165544393829	RC3H1	39286	ENSG00000293562	39345	RABGAP1L	97768	False	False	False	ref	-100	0.00766	-100	0.0674
286	chr1	174062848	G	T	rs55988379	-0.173665122	0.0349242784248581	0.173665122	0.0345498219582703	0.0405783324154126	0.1070734832197144	-0.0069040199162296	0.0359506969328359	0.0069040199162296	0.0357555683050245	0.0062568044604268	0.8097919659185661	-0.0010214148756341	0.4978959308438779	0.0010214148756341	0.4924889421522763	0.0002907190655734	0.6969651370765353	-4.593388880186996e-05	0.3951793444677101	4.593388880186996e-05	0.3901801526775914	-0.0029692190953778	0.46595176670476	0.0029692190953778	0.4605260417593255	RC3H1	40491	ENSG00000293562	40550	RABGAP1L	96563	False	False	False	ref	90	0.06415	-70	0.2106
287	chr1	174063084	C	A	rs61826842	-0.033582772	0.3862084467927596	0.0389341296	0.3826288986749805	0.017111490177373	0.5954383328786358	-0.0006171013350203	0.4403496025088697	0.0007084570079595	0.4367420157729312	0.022147900102273	0.620074886394773	-0.0007360874341434	0.5411271978809028	0.0007772011349732	0.5372481837237607	0.0003332209496309	0.6469558414801015	-1.225748424935484e-05	0.5601765675332573	1.295935658400962e-05	0.5561365021533845	-0.0021625812411335	0.5126230878025458	0.0022994952327537	0.5087023994663679	RC3H1	40727	ENSG00000293562	40786	RABGAP1L	96327	False	False	False	ref	-85	0.03223	50	0.1097
288	chr1	174106636	C	T	rs13376011	-0.01244019058	0.7187298729225865	0.01278068454	0.7140479142123719	0.0281942910301893	0.2559098043586932	-0.0003539843405827	0.622450030189969	0.0003625423484643	0.617630667028728	0.0001946488073636	0.9984137049782104	-1.7453679223283266e-06	0.9911324795862848	1.819788840477101e-06	0.989110016199716	5.648832796239506e-06	0.9929892202633804	-5.252467860421127e-08	0.9819569152726574	5.4395181135162185e-08	0.9794926287155142	-3.299132328197683e-06	0.9926031567072712	4.94869849229653e-06	0.991694103273448	RABGAP1L	52775	RC3H1	84279	ENSG00000293562	84338	False	False	False	ref	100	0.01894	-100	0.1499
289	chr1	174133461	G	A	rs6425273	-0.0778587596	0.1713443608020433	0.0778587596	0.1688055824185995	0.0147322756119508	0.7028111970074395	-0.0011940623216594	0.3003123067264617	0.0011940623216594	0.2964010701857099	0.0004808485368347	0.9898626108132508	-4.398754778918127e-05	0.8902126784702339	4.398754778918127e-05	0.8833695924443343	7.006513965524101e-06	0.9907619328126696	-6.770020997880663e-07	0.8982433786690899	6.770020997880663e-07	0.8913769278683429	-0.0001451618224406	0.8930570794749456	0.0001451618224406	0.8862190370607428	RABGAP1L	25950	RC3H1	111104	ENSG00000293562	111163	False	False	False	ref	25	0.01782	-70	0.08014
290	chr1	177285924	C	T	rs11587684	-0.0487156022	0.3049600628298	0.0487156022	0.3009433469386576	0.0235585880840799	0.3677089713999488	-0.001116826465047	0.3162975884121191	0.001116826465047	0.3122439595011127	0.000284550163307	0.9964863692022268	-1.235882140235657e-05	0.9565434877110288	1.235882140235657e-05	0.9494820963330842	6.311264318896822e-06	0.9928268782084608	-2.697094513399191e-07	0.9414061914959624	2.697094513399191e-07	0.9344657039702194	-3.2991323281976855e-05	0.9681609041270778	3.2991323281976855e-05	0.9628317241476594	BRINP2	114965	ASTN1	120951	SEC16B	698379	False	False	False	ref	-40	0.04163	85	0.0625
291	chr1	177289737	G	A	rs72720790	-0.0181118551	0.3958859648614994	0.0358059763	0.3943951768597293	0.0223267816398376	0.4030052649006815	-0.0004975596187099	0.394035725721729	0.0008480692253713	0.3927892558326018	0.0627585694962224	0.3947064248450385	-0.0008507474460816	0.3866313332942888	0.0022962142067911	0.3850654959897006	0.0014178691078863	0.3791640929085764	-2.719870388266075e-05	0.375283004075176	5.583616628150589e-05	0.3737231205709593	-0.0025790966975685	0.3431826946842794	0.0057050245785357	0.3416504046479812	BRINP2	118778	ASTN1	124764	SEC16B	694566	False	False	False	ref	-45	0.005157	60	0.09094
292	chr1	177291972	G	A	rs11587000	0.1071950142	0.1073086408868608	0.1071950142	0.1086747446015113	0.0179110038553319	0.5586374844235148	0.0023157818707837	0.1949630948499682	0.0023157818707837	0.1974148963026374	0.0102248358681666	0.7377163681113381	0.0010190261063201	0.5000153807111392	0.0010190261063201	0.50541174426754	0.0001874206621338	0.7402677873868416	2.224821620913632e-05	0.5061053474632772	2.224821620913632e-05	0.5118801202620961	0.0028405529345781	0.4661519551680127	0.0028405529345781	0.4716999569124002	BRINP2	121013	ASTN1	126999	SEC16B	692331	False	False	False	alt	45	0.0224	-85	0.04712
293	chr1	177591300	C	T	rs1415339	-0.0239659002	0.199038973410085	0.0681955998	0.1988457069591833	0.0203770010393454	0.4676931559775384	-0.0002878180858	0.2516384132145244	0.0013732398870029	0.2513937588973839	0.5171785820329253	0.0407356907895715	-0.0120260418487106	0.0443066206796958	0.0356969837445682	0.0443348004586831	0.0106237831497882	0.0685100359974197	-0.000140886309256	0.0688080414707592	0.0007213817643946	0.0688376703656586	-0.0076523374352545	0.090400822820474	0.0210979512388241	0.0903470280940426	SEC16B	393003	BRINP2	420341	ASTN1	426327	False	False	False	ref	-25	0.0525	50	0.1787
294	chr1	177605857	A	G	rs34929437	-0.01237188362	0.7406098594000114	0.01237188362	0.7339891505019874	0.02393899852197	0.363606109253093	-0.0002783578592016	0.6836556755464465	0.0002783578592016	0.6772318113053277	0.0250041239154102	0.5821713589069542	-0.0003794666233385	0.6758739203592472	0.0003794666233385	0.6697409371756669	0.000545864819506	0.5563929741000063	-7.989438668992453e-06	0.653639987776421	7.989438668992453e-06	0.6475549108251321	-0.0011439741348025	0.6635337591012258	0.0011439741348025	0.6571850138782072	SEC16B	378446	BRINP2	434898	ASTN1	440884	False	False	False	ref	-100	0.03864	55	0.02142
295	chr1	177711567	T	A	rs12143554	0.204919788	0.0218913650383891	0.204919788	0.0220498189878463	0.0410827856585086	0.1009118861986387	0.0083681687093345	0.025492745678164	0.0083681687093345	0.025624440517979	0.4475545181617234	0.0563572613882023	0.0915560209314899	0.009842490300584	0.0915560209314899	0.0099750223407158	0.0183428027421574	0.0271914506234294	0.0037276514085795	0.0111590530400362	0.0037276514085795	0.0112411738110894	0.0693205436970076	0.0096343953324212	0.0693205436970076	0.0097167960129091	SEC16B	272736	RASAL2	382538	BRINP2	540608	False	False	False	alt	0	0.0	-5	0.007812
296	chr1	177759570	G	A	rs12138989	-0.0440295614	0.3381636717459502	0.0440295614	0.3336646554074275	0.0283561781924488	0.2549679384989108	-0.0012508897994094	0.2775042748516475	0.0012508897994094	0.2735843719077748	0.2610595163472006	0.1312303987160504	-0.0110459597448603	0.1422269333735732	0.0110459597448603	0.1395004967735137	0.0074626014784358	0.1069351822623246	-0.0003167151726793	0.1314564083280018	0.0003167151726793	0.1290940407118217	-0.0142572003563062	0.1485244162231093	0.0142572003563062	0.145899601187661	SEC16B	224733	RASAL2	334535	BRINP2	588611	False	False	False	ref	5	0.0008545	90	0.03772
297	chr1	177759699	C	T	rs55902020	-0.0795320622	0.1565901464649961	0.0795320622	0.1542463823278324	0.0304467381768372	0.2185920229361497	-0.0024102002053387	0.1423473823687743	0.0024102002053387	0.1405491669297327	0.1918932070865361	0.1837268640068131	-0.0153129703335738	0.1098945451954322	0.0153129703335738	0.1076316391132374	0.0060286846459805	0.1380002069962431	-0.0004767794962122	0.0995038570519725	0.0004767794962122	0.0977411780778852	-0.0229001022731021	0.082348586103501	0.0229001022731021	0.0807295726864233	SEC16B	224604	RASAL2	334406	BRINP2	588740	False	False	False	ref	-45	0.1197	65	0.08936
298	chr1	177799814	T	G	rs10913422	0.11551373252	0.1022045187719087	0.11551373252	0.1035020261922201	0.0368971179697216	0.1378091456441054	0.0048091271041144	0.090819853147663	0.0048091271041144	0.0918114385182055	0.1755328098710039	0.2021859157702871	0.0230966096029663	0.1020006605620889	0.0230966096029663	0.1040554703911698	0.0069301347783821	0.1257036626453674	0.0010270156951773	0.0825600472654134	0.0010270156951773	0.0841800068694621	0.0310555573884067	0.0677352532774068	0.0310555573884067	0.0689984949501306	SEC16B	184489	RASAL2	294291	BRINP2	628855	False	False	False	alt	85	0.06165	75	0.10596
299	chr1	177803759	G	T	rs12065872	0.0084824717599999	0.5399433188211961	0.02350825576	0.5435093529973926	0.0203181139361349	0.4656054050805692	0.000218788170836	0.5064399162269637	0.0005055974160532	0.5099490914691699	0.0138184157566559	0.6828472426012623	8.476019576844583e-05	0.6447167327244603	0.000387955246576	0.6486713680555082	0.0003085261256271	0.6665905865406047	3.228356648379113e-06	0.6257989619465496	9.01568483306334e-06	0.6297181645164808	0.0003810497839068	0.6211154561204251	0.0012767642110124	0.624886421981886	SEC16B	180544	RASAL2	290346	BRINP2	632800	False	False	False	alt	100	0.0475	55	0.0778
300	chr1	179110055	T	C	rs3818433	0.0577099518	0.2444338411651343	0.0577099518	0.2476950393440158	0.028057655430423	0.2637301102311077	0.0016396230673155	0.218388171695929	0.0016396230673155	0.2210977770481689	0.0092350961697073	0.7518837970282023	0.000549832298582	0.5921630560963125	0.000549832298582	0.5985822477434571	0.0002454902746483	0.695569232436464	1.4824662175179436e-05	0.5399787776767673	1.4824662175179436e-05	0.5461087556788745	0.0018499884530368	0.5602848528441379	0.0018499884530368	0.5667531767702592	TOR3A	27984	FAM20B	84250	ABL2	119629	False	False	False	alt	-65	0.2402	-65	0.04285
301	chr1	179260586	G	A	rs432798	-0.05252617608	0.2752560453901452	0.05252617608	0.2714331939235408	0.0164636202828333	0.6154554476947457	-0.0008882475763509	0.3704562597868517	0.0008882475763509	0.3655437492026581	0.0081249381412687	0.7648469236324893	-0.0005079121664512	0.6077871769467997	0.0005079121664512	0.6018122195490687	0.0001480986229601	0.7742749184256461	-9.093767326228472e-06	0.6224932437530257	9.093767326228472e-06	0.6164246052124299	-0.001737817953878	0.5714695716447018	0.001737817953878	0.5653794126649013	ABL2	30902	SOAT1	33129	AXDND1	105135	False	False	False	ref	-80	0.0634	-25	0.0703
302	chr1	179264910	A	C	rs3122378	0.03060587994	0.3881934494162138	0.0429681116599999	0.3885105935201468	0.0351677638176006	0.1555420738924946	0.0012831428050038	0.2888991714885032	0.0016818366094631	0.2885713608841347	0.0901743591435451	0.3327908235425635	0.0033706822715583	0.3272555476099753	0.0042557664690282	0.3268962818768721	0.0030043408765791	0.2475360840952232	0.0001412506541545	0.2657283201006001	0.0001666713459133	0.2653977263307295	0.0060027712711557	0.2940763117554699	0.008063079410115	0.2940613094755063	SOAT1	28805	ABL2	35226	AXDND1	100811	False	False	False	alt	-100	0.07654	80	0.1168
303	chr1	179300414	A	T	rs12049237	-0.372284114	0.0046945215766709	0.372284114	0.004722905979971	0.0691496806933907	0.0185505833032781	-0.0264160920695441	0.0042995898721357	0.0264160920695441	0.0042917802885217	0.0036076012008841	0.8834470976670189	-0.0015247287627459	0.4601685388324811	0.0015247287627459	0.4548728553689322	0.0002605716811346	0.7039755923605412	-0.0001117472712043	0.287958658083643	0.0001117472712043	0.2837781141772125	-0.0028916894856652	0.4846407555379315	0.0028916894856652	0.4790525623322885	SOAT1	6699	AXDND1	65307	ABL2	70730	False	True	True	ref	90	0.0332	-100	0.1381
304	chr1	179319605	T	C	rs78993991	0.00358629968	0.8590405401518396	0.0061873708799999	0.8632511898369688	0.0125010958343159	0.7919353533068096	4.368137514060927e-05	0.8871787208963161	7.265733729458575e-05	0.8914743829393639	0.0008487017914288	0.9721379349535164	1.8574014149951829e-06	0.9694612948372574	5.665343653822149e-06	0.9738164983402384	1.00882137020905e-05	0.9809697069739371	2.3134675122604843e-08	0.9746878501396176	6.555519310560466e-08	0.9790352897749428	8.24783082049419e-06	0.9689716723300124	2.3093926297383737e-05	0.9723974026644736	SOAT1	25890	AXDND1	46116	ABL2	89921	False	False	False	alt	95	0.04987	95	0.1345
305	chr1	179343424	A	G	rs13306728	0.0437654306	0.3476732100351896	0.0437654306	0.3522075084449252	0.0207746460651488	0.4544432322505728	0.000921673185158	0.373475166581394	0.000921673185158	0.3781176365554373	0.0004750750552604	0.9887202936593404	2.3862965474765093e-05	0.9138685951513366	2.3862965474765093e-05	0.9207841048345758	1.0023465486969693e-05	0.9805359561640116	5.106703971021128e-07	0.8975349632520531	5.106703971021128e-07	0.9044829598771426	7.835439279468629e-05	0.9192352225899836	7.835439279468629e-05	0.9261752708066392	AXDND1	22297	SOAT1	49709	ABL2	113740	False	False	False	alt	-65	0.03102	90	0.1289
306	chr1	179355418	T	G	rs12141199	-0.01012935752	0.7802397226057001	0.01012935752	0.7733323953611867	0.0156450424796633	0.6547355488926828	-0.0001598790991938	0.7775270177464902	0.0001598790991938	0.7707475266583709	0.0029131338457985	0.8846324992053507	-3.0029847532200305e-05	0.9001011664498925	3.0029847532200305e-05	0.893151645641569	4.542803078690736e-05	0.892978294032737	-4.711841890017391e-07	0.9015479487078044	4.711841890017391e-07	0.8944711568492235	-0.0001360892085381	0.8878320803440104	0.0001360892085381	0.8809457832153158	AXDND1	10303	SOAT1	61703	ABL2	125734	False	False	False	ref	70	0.1172	40	0.01481
307	chr1	179358456	A	T	rs12047160	0.0401297605999999	0.3855322886659452	0.0401297605999999	0.3902915892276979	0.0163343233356696	0.6333134735683549	0.0006898328841201	0.460187225944206	0.0006898328841201	0.465485343858818	0.0019935007093134	0.9271420727166476	0.00011518385586	0.814426826671243	0.00011518385586	0.8211829751425526	3.4909462013383416e-05	0.9259824566729352	2.1005874983774794e-06	0.8158434462598738	2.1005874983774794e-06	0.822642977692261	0.0003950710963016	0.8058902727762944	0.0003950710963016	0.8126624957613777	AXDND1	7265	SOAT1	64741	ABL2	128772	False	False	False	alt	45	0.0214	70	0.0575
308	chr1	179359110	T	C	rs12144580	0.00175735692	0.7757392182303002	0.0094282535999999	0.7750304057191658	0.0273064701626987	0.2806677703035333	0.0001459979045387	0.6421492935705395	0.000324255087387	0.6419778810462609	0.0006590016825574	0.9811937635155722	-1.3565607140501506e-06	0.9749198587173395	4.680081010958023e-06	0.9754901934716164	1.6490528935818775e-05	0.9652980182766864	-9.485622865146277e-09	0.9570986672388232	1.3671112916866213e-07	0.9573446145207966	-7.423047738444805e-06	0.9756968454706212	1.7320444723037842e-05	0.9763559117481476	AXDND1	6611	SOAT1	65395	ABL2	129426	False	False	False	alt	45	0.1154	40	0.115
309	chr1	179365117	G	A	rs6425537	-0.0820066812	0.1548737670659351	0.0820066812	0.1528301975524842	0.0434391375915157	0.0866663331517533	-0.0036529768376996	0.0965090360522823	0.0036529768376996	0.09545247368919	0.3826861535416185	0.0759454873759407	-0.0330371357585293	0.0553822310782419	0.0330371357585293	0.0542785754931954	0.0165058111091531	0.0342730958832211	-0.0014746863341286	0.0413820522378988	0.0014746863341286	0.0406844139365115	-0.0265769852528784	0.0694277186674287	0.0265769852528784	0.0682982928373021	AXDND1	604	SOAT1	71402	ABL2	135433	False	False	False	ref	100	0.05835	-90	0.04236
310	chr1	179365577	G	A	rs56147147	0.0020798392	0.8706133502973066	0.00508715776	0.8726800340078066	0.0148068439473096	0.6985090141803358	3.6632854420218805e-05	0.8685037796512859	8.018144345678121e-05	0.8705467434662094	0.8472114083995909	0.0045838538731522	0.0017198354004929	0.2829380314798922	0.0042709884749237	0.2844932834586817	0.0125171638668919	0.0526705536320121	3.024857910110013e-05	0.3342704298761277	6.717348175685459e-05	0.3358515480134774	0.0002655801524199	0.7376111448662072	0.0005987925175678	0.7396673527929549	AXDND1	144	SOAT1	71862	ABL2	135893	True	False	False	alt	100	0.4653	80	1.006
311	chr1	179365705	C	T	rs55986478	-0.0585542347999999	0.2562591858437382	0.0585542347999999	0.2529380549989199	0.0457388812328872	0.0746425223425628	-0.002726862368606	0.1504425764835999	0.002726862368606	0.1485433115593877	0.8938726864834547	0.0020006196100263	-0.0526827417653569	0.0329583906219553	0.0526827417653569	0.0323040485478307	0.0410112476489339	0.0039698211790779	-0.00246089423678	0.0262081432807067	0.00246089423678	0.0257153070413242	-0.0043697007686977	0.382653712627957	0.0043697007686977	0.3772153247187964	AXDND1	16	SOAT1	71990	ABL2	136021	True	False	False	ref	-35	0.01343	85	0.1553
312	chr1	179365923	C	T	rs55906130	-0.0015901195999999	0.1156351973353728	0.0994868012	0.115588833489054	0.0441419739837968	0.0841060448566098	-0.0008691562939777	0.0812125278722788	0.0047005960292895	0.0812844979049148	0.9204744152287948	0.0009031097993469	-0.0005852528837629	0.0140368964967302	0.0914713555361669	0.0139659803318964	0.0405831542174289	0.0041025449403909	-0.000748228741152	0.0143795131956108	0.0043145527237519	0.0143496239503685	-0.0011217049915871	0.3072341606001583	0.0066922899277489	0.3069258202642499	AXDND1	202	SOAT1	72208	ABL2	136239	True	False	False	ref	-100	0.4612	-80	0.732
313	chr1	179366027	G	C	rs11577489	0.17603214	0.034674626517095	0.17603214	0.0350595287133171	0.0412615851127236	0.0994056889236982	0.007210670178419	0.0347249171319835	0.007210670178419	0.0349664919792115	0.922994952327538	0.0008002623148107	0.163441117545689	0.0035846548630518	0.163441117545689	0.0035547753264398	0.038054022311757	0.0047914617853252	0.0066874306057467	0.0057247630720116	0.0066874306057467	0.0057481717998193	0.0103213354887664	0.1921927745196066	0.0103213354887664	0.1956855380982759	AXDND1	306	SOAT1	72312	ABL2	136343	True	False	False	alt	0	0.0	-40	0.06104
314	chr1	179401787	G	A	rs12135111	0.1020485478	0.1121168324647419	0.1020485478	0.1132842116200723	0.0270706222513964	0.2792248500970713	0.0030127348813683	0.1344635565091236	0.0030127348813683	0.135883334764325	0.0209239220085117	0.6148840754091714	0.0024614701545416	0.3686301304138698	0.0024614701545416	0.3736306570154072	0.00059055276287	0.5509013682073386	7.203752255531453e-05	0.3296533776482491	7.203752255531453e-05	0.3344106133782136	0.0071145788657582	0.2900294682157942	0.0071145788657582	0.2947329180402082	AXDND1	36066	SOAT1	108072	ABL2	172103	False	False	False	alt	-100	0.011795	-20	0.0665
315	chr1	179410866	A	G	rs6674331	-0.002357934328	0.9469173787253792	0.002668726448	0.9431094868276404	0.0171395231632675	0.5934125295842274	-4.093157434335104e-05	0.938309815204728	4.604195711214156e-05	0.9345194520786118	0.0013806868793506	0.9460693704493636	-3.528812414704388e-06	0.9837847056381234	4.029949459490776e-06	0.9831681426556996	2.330298854460377e-05	0.9443206766499032	-5.924595118201886e-08	0.9829373027792292	6.748619260673713e-08	0.9817080519293048	-1.4021312394840138e-05	0.9826245525726544	1.7320444723037767e-05	0.9802109664786276	AXDND1	45145	SOAT1	117151	NPHS2	165086	False	False	False	ref	25	0.003601	90	0.05267
316	chr1	179418596	G	A	rs202196017	0.05347868668	0.2614727538959784	0.05347868668	0.2651303294592517	0.0274490791578416	0.2749565057449997	0.0014505410562764	0.2476295518093628	0.0014505410562764	0.2508036659708648	0.0005526046649731	0.9785254415890026	4.288235104684534e-05	0.8984618257660968	4.288235104684534e-05	0.9054952913767432	1.091376147366942e-05	0.9742494750389574	8.315300184569355e-07	0.8873438231463481	8.315300184569355e-07	0.8943659636840706	0.0001666061825739	0.9016827308364024	0.0001666061825739	0.9069278409027646	AXDND1	52875	SOAT1	124881	NPHS2	157356	False	False	False	alt	30	0.001862	-70	0.07324
317	chr1	179431748	G	A	rs12120123	-0.1701414	0.0353821136065464	0.1701414	0.0350105340347139	0.0416611161361825	0.0964592808252615	-0.0070589582017242	0.0336230244650156	0.0070589582017242	0.0333672583818678	0.0201890402824056	0.6143991171097545	-0.0034284946249412	0.2997069219530064	0.0034284946249412	0.2953228990691699	0.0008362376975969	0.478979535540874	-0.0001418680990696	0.2190298408812944	0.0001418680990696	0.2152915979925224	-0.0089159051169542	0.2308694717533916	0.0089159051169542	0.2269653466163531	AXDND1	66027	SOAT1	138033	NPHS2	144204	False	False	False	ref	90	0.0551	85	0.1664
318	chr1	179432368	G	A	rs12097041	-0.0558816974	0.2642829607576858	0.0558816974	0.260617374766059	0.0186797418260723	0.5332413908253866	-0.0011220563419318	0.3204441318080095	0.0011220563419318	0.316469433596136	0.010649599155422	0.7596834419155254	-0.0009307175510949	0.599745305072348	0.0009307175510949	0.5934349806422159	0.0002308993340839	0.7514425538470014	-2.101974531317927e-05	0.5975201479401431	2.101974531317927e-05	0.5911194786061985	-0.0024858962092968	0.5588771415159695	0.0024858962092968	0.5526087736463485	AXDND1	66647	SOAT1	138653	NPHS2	143584	False	False	False	ref	10	0.002218	-15	0.007233
319	chr1	179438855	A	G	rs12118625	0.1110018844	0.103115327025098	0.1110018844	0.1042766059096921	0.0195759185528368	0.4845406853877853	0.0026697205020364	0.1715181493696222	0.0026697205020364	0.1734869679368886	0.2392835934149318	0.1459390248830413	0.0267096476017322	0.0698621771005278	0.0267096476017322	0.0711035587680615	0.0050156955276316	0.1727723950933696	0.0006517282548664	0.0974925896974839	0.0006517282548664	0.0991186537780964	0.0330993698657252	0.0513075947816761	0.0330993698657252	0.0520473986031533	AXDND1	73134	NPHS2	137097	SOAT1	145140	False	False	False	alt	35	0.073	65	0.06323
320	chr1	179441828	T	C	rs10913758	-0.0082467346	0.391850982382104	0.0390818274	0.3927788085636352	0.0737083404564816	0.014547395677482	-0.000792241324241	0.1289441851927401	0.0029967148945695	0.1293653167819628	0.358210715581802	0.0846828102014297	-0.0010531702673449	0.12688499199992	0.0128547009616225	0.1274308879064512	0.0261946120508093	0.0127847424181317	-0.0001197846205811	0.0549342534208595	0.0009690798003555	0.0551321797100511	-0.0017204975091551	0.1711676637878605	0.0125581472072844	0.1717877916591306	AXDND1	76107	NPHS2	134124	SOAT1	148113	False	True	False	ref	100	0.0481	-45	0.0708
321	chr1	179460507	C	T	rs36144856	-0.0273022102	0.4359758306338149	0.0320455506	0.4322875044872512	0.023428598008811	0.3742317072876589	-0.0006103197055775	0.4274069478061773	0.0007184918805432	0.4238636844520022	0.0003315627989838	0.99488027141979	-6.744521203783033e-06	0.9633810667299456	8.602828924982579e-06	0.9589938276396826	8.129590950919833e-06	0.9884830739265886	-1.581592405200587e-07	0.9487617107592544	2.005380659536168e-07	0.9442894782496384	-2.8042624789680327e-05	0.9626837416042892	3.464088944607569e-05	0.95829129629663	AXDND1	94786	NPHS2	115445	TDRD5	131107	False	False	False	ref	15	0.00403	5	0.0003357
322	chr1	179467153	A	G	rs12131475	0.03804126312	0.3793294855667138	0.03922551168	0.3832047150235083	0.0137617438929241	0.7254875902511907	0.000621637388584	0.4737870517942725	0.0006318891967962	0.4780788403299935	0.0060654547853913	0.8079008915048728	0.000290651754563	0.6983672151226898	0.0002941533967539	0.7024087266603857	8.926297692445173e-05	0.8365285228908163	4.696889060212317e-06	0.718385983577356	4.727202092148513e-06	0.7225842651119684	0.0009419022797003	0.6784647220750495	0.0009583979413413	0.6827002106850273	AXDND1	101432	NPHS2	108799	TDRD5	124461	False	False	False	alt	-10	0.002396	100	0.04214
323	chr1	179469373	C	T	rs1928006	0.0246636354	0.4482195438224227	0.0314074934	0.4519386724943133	0.0276263238622298	0.2685770083110729	0.0006756742695448	0.3638742106799253	0.0008632759930632	0.3668537705378831	0.0036958529906634	0.8918276768115169	0.0001407115741781	0.7985686316317396	0.0001458844387726	0.8023788017650172	0.0001079351862032	0.8416466102919643	4.134870621020019e-06	0.7479954084629625	4.278770197800841e-06	0.7518767179301613	0.0004602289597835	0.7847479348725015	0.000484972452245	0.7886177734009596	AXDND1	103652	NPHS2	106579	TDRD5	122241	False	False	False	alt	-100	0.02747	0	0.0
324	chr1	179474904	G	A	rs36100834	-0.0045797647999999	0.4113893679967594	0.0356353647999999	0.4104174936726201	0.0118562935117565	0.816806089569257	-8.152589754688e-05	0.5526069104379259	0.0004620223625806	0.5517294640872056	0.0019242189304212	0.9340659186056168	-2.6161031163531874e-05	0.8385139903506614	8.168434902417852e-05	0.8375793846674002	2.648754986016106e-05	0.9501633258972272	-4.997958803982433e-07	0.8633794494549646	1.1998042567764816e-06	0.8623110100693193	-8.907657286132709e-05	0.8341634868982102	0.0002771271155685	0.8332445219380545	NPHS2	101048	AXDND1	109183	TDRD5	116710	False	False	False	ref	-85	0.02072	-40	0.1993
325	chr1	179475676	A	G	rs61826032	-0.173067844	0.033972484207771	0.173067844	0.0336561381830815	0.0451470778863776	0.0767104451476188	-0.0079162158514639	0.0292365598124955	0.0079162158514639	0.0290728259587453	0.0034376958859819	0.8771523346955943	-0.0005745137898954	0.5729632986715483	0.0005745137898954	0.5672830177827214	0.0001561710894538	0.761908590595269	-2.64528708418734e-05	0.4498162681861914	2.64528708418734e-05	0.4443902283189641	-0.0016231731054732	0.5677615979455921	0.0016231731054732	0.5619569322716473	NPHS2	100276	AXDND1	109955	TDRD5	115938	False	False	False	ref	95	0.02718	15	0.03735
326	chr1	179484912	C	A	rs35954891	-0.0174224187799999	0.3989884768933306	0.0361624455799999	0.3964553054766542	0.0395445977046671	0.112788037645629	-0.0007635080447166	0.2641415209063324	0.0014801017667399	0.2623606769165675	0.0031919105275311	0.8958299392273802	-7.577379544144946e-05	0.8166223939871283	8.837080784787168e-05	0.8140945068759916	0.0001412531800113	0.8108639560689342	-3.296589809747404e-06	0.7289254296298251	3.77828282832895e-06	0.72585867007021	-0.0002763023324865	0.8125461319609446	0.0003257893174095	0.8098237898076664	NPHS2	91040	TDRD5	106702	AXDND1	119191	False	False	False	ref	-95	0.03284	-95	0.0778
327	chr1	179515686	C	A	rs10913808	0.004013269	0.704430354272379	0.0132710762	0.7065935838725189	0.0128362043251674	0.7871776033565852	5.993097851944154e-05	0.7521525538090992	0.0001752316331067	0.7542146134221218	0.0119956451453267	0.7007900295738276	1.6489868773539718e-06	0.7388364910996705	0.0001640673155969	0.7404510461829237	0.0001503441124583	0.7575571810122894	7.000530852618526e-08	0.7729449438702745	2.1165369349777927e-06	0.7747774190761969	2.969219095377998e-05	0.7320417161021139	0.000569100326614	0.7336645521674701	NPHS2	60266	TDRD5	75928	AXDND1	149965	False	False	False	alt	85	0.03622	40	0.0981
328	chr1	179542905	G	A	rs12135209	-0.2180109579999999	0.0191994400993778	0.2180109579999999	0.0190630950052409	0.0452309210101661	0.075977965485501	-0.0099277357465652	0.0200877103862364	0.0099277357465652	0.0200506883405201	0.0401339447725247	0.4869397790812643	-0.0090299530860395	0.1719936737402621	0.0090299530860395	0.1690105231008265	0.0018374533604587	0.3369934546776685	-0.0004151483271701	0.1147396087980113	0.0004151483271701	0.1127454946327723	-0.0200826432648213	0.1021686437961613	0.0200826432648213	0.1004182462485315	NPHS2	33047	TDRD5	48709	AXDND1	177184	False	True	False	ref	-80	0.0814	-65	0.0857
329	chr1	200895854	C	T	rs296534	-0.0122454562	0.4314649323888551	0.0329883814	0.4298124330823762	0.0375429637981822	0.1289821649366782	-0.0003520460259993	0.2715959470680645	0.0012094516191084	0.2707071165743827	0.2200009897396984	0.1594251041868035	-0.0030279976792165	0.1879379484372814	0.0072471051539145	0.1870585119112534	0.0082392789788047	0.0949892315059122	-9.138238509632e-05	0.1421677719633998	0.0002657626206167	0.1416324306696986	-0.0039408135660321	0.1969187739344227	0.0103361815842433	0.1958677093648375	INAVA	4805	GPR25	22872	KIF21B	127860	False	False	False	ref	75	0.04498	-55	0.1145
330	chr1	200951234	G	A	rs11579874	0.130651142	0.0694138123656869	0.130651142	0.0702634982837814	0.0241637851437136	0.3511572165572679	0.0035724760846089	0.1074604653094258	0.0035724760846089	0.1086562414452195	0.0619362607634191	0.4192771666646232	0.0109485283819194	0.1810496033308293	0.0109485283819194	0.1843865635220286	0.0018075471597351	0.376140697757191	0.0003384524906689	0.1796506889947977	0.0003384524906689	0.1827198186580291	0.0207061792748506	0.1163374615916263	0.0207061792748506	0.1183079060264404	INAVA	60185	KIF21B	72480	GPR25	78252	False	False	False	alt	100	0.1699	100	0.557
331	chr1	200965304	C	T	rs4915471	0.1234504072	0.0736433136853521	0.1234504072	0.0746251317785257	0.0481874430786734	0.0630337557030632	0.0061225199023734	0.0461372460303583	0.0061225199023734	0.0465807652620969	0.1391178120154399	0.2438135387171387	0.0179274754586722	0.0985715117990323	0.0179274754586722	0.1003839681264056	0.0068320954156241	0.1220218610785534	0.0009033110286472	0.0626487214438957	0.0009033110286472	0.0637774513594462	0.028990300550955	0.0591603205538516	0.028990300550955	0.0601646591183927	KIF21B	58410	INAVA	74255	GPR25	92322	False	False	False	alt	90	0.0886	80	0.0884
332	chr1	200971955	T	C	rs148277892	0.0270401345999999	0.415411562013269	0.0330570086	0.4192756736204715	0.0138145166381021	0.7259193369313295	0.0003912268525608	0.5161454154231991	0.0004687593396363	0.5203206148203751	0.6887804757348818	0.0165053357627789	0.018715696316432	0.0713758147203875	0.0228681651148762	0.0724634882254041	0.0094973287976589	0.0795729763299491	0.0002697551448138	0.1281537580920616	0.0003232632017571	0.1298289263184217	0.0061141169872323	0.2639625633062021	0.007227574147999	0.2671208749654563	KIF21B	51759	INAVA	80906	GPR25	98973	True	False	False	alt	90	0.4805	100	0.883
333	chr1	200975712	T	G	rs296563	0.239816456	0.0155595523187994	0.239816456	0.0157290177127405	0.0482847942137904	0.063477221283695	0.0118790528718536	0.0164013260950425	0.0118790528718536	0.0165109351022156	0.0755460064003166	0.3577584285383811	0.018222828343044	0.0897359702269183	0.018222828343044	0.0915640505232416	0.0037747631979744	0.2088700866969199	0.0009241998224328	0.05645108739295	0.0009241998224328	0.0574576073776954	0.0351588532216026	0.0411975025799225	0.0351588532216026	0.0418810727327034	KIF21B	48002	INAVA	84663	GPR25	102730	False	True	False	alt	55	0.04187	-40	0.03796
334	chr1	200991179	G	A	rs2297909	0.0103492828	0.5734724080210932	0.0221037856	0.5757155104303409	0.0236459481879516	0.367584376062591	0.0001979302411398	0.5101579659730181	0.0005222540563812	0.5119824594683571	0.3577974992576952	0.0848139674036328	0.0041218255718847	0.1849711682936693	0.0083329534105362	0.1860036412540874	0.008618631214832	0.0912855522194015	7.675616148088184e-05	0.1876517386941414	0.000198686337517	0.1885312232168373	0.0035506911682227	0.2654610528461137	0.007562436079311	0.2668685018236	KIF21B	32535	INAVA	100130	GPR25	118197	False	False	False	alt	100	0.136	80	0.4275
335	chr1	200992755	T	G	rs59682551	0.168247982	0.0355854445625113	0.168247982	0.0359551451453209	0.0462562128017997	0.0721358977180165	0.0079498768955875	0.029205228630549	0.0079498768955875	0.0293158950345467	0.3293466068424003	0.0961067781163574	0.0560540095688053	0.0227194151641964	0.0560540095688053	0.0231417166778069	0.0153852225290687	0.0384486852865752	0.0026751582487491	0.0179237355814318	0.0026751582487491	0.0181465183595312	0.0571426214905479	0.0151527774058104	0.0571426214905479	0.0153463580802332	KIF21B	30959	INAVA	101706	CACNA1S	119696	True	False	False	alt	-50	0.1614	-95	0.5044
336	chr1	200993159	G	A	rs12140420	-0.053685767644	0.2828395490779102	0.0538720979559999	0.2800124121133585	0.016758592741136	0.6135510640836621	-0.0009695736329258	0.3673949272124603	0.0009718596930708	0.3640876723758066	0.1046765200752201	0.2964733664496667	-0.0063626622708083	0.2513737663760421	0.0063710287237728	0.248152410996172	0.0018327565281186	0.3360400630907461	-0.0001154699925764	0.2880192548226724	0.0001155726393996	0.2846445082935865	-0.0119610042558806	0.204797187407554	0.0119890468806703	0.2020715369336522	KIF21B	30555	INAVA	102110	CACNA1S	119292	False	False	False	ref	65	0.0141	-15	0.05676
337	chr1	200993667	T	G	rs10920084	0.0881137116	0.1397966661371234	0.0881137116	0.1415887451479626	0.0476031033953203	0.0677066759712775	0.0044603577252733	0.0807046117201955	0.0044603577252733	0.0815226105370938	0.055007258091122	0.4272369161674882	0.0049661298902885	0.2524778565803918	0.0049661298902885	0.2565367930946775	0.0025746197778516	0.2759612336702964	0.0002399526805686	0.1695341957250942	0.0002399526805686	0.1723354489956467	0.0113943782785127	0.1879212142127275	0.0113943782785127	0.1911019003755252	KIF21B	30047	INAVA	102618	CACNA1S	118784	False	False	False	alt	75	0.05566	100	0.4478
338	chr1	200997848	C	T	rs55757739	-0.0131733217999999	0.688808741113771	0.0155512698	0.6847811755582502	0.0116669899853994	0.8423216608924845	-0.000168587002882	0.7608729495452317	0.0001926705363815	0.7565605494546638	0.0304377948599518	0.5275123677862468	-0.0004333871927778	0.5965850914542797	0.0005043172912971	0.5930766089737176	0.0003628581265941	0.6158615083259421	-5.689568324670453e-06	0.6572576770537805	6.407938709191981e-06	0.6535813301381297	-0.0012140806967767	0.5884290490441322	0.0014565669228992	0.5848091090709433	KIF21B	25866	INAVA	106799	CACNA1S	114603	False	False	False	ref	55	0.0982	85	0.0231
339	chr1	201015352	G	A	rs12122721	-0.300499144	0.008710141964181	0.300499144	0.0087001916255108	0.045498014709517	0.0763315261664933	-0.0141296774281555	0.012564107069132	0.0141296774281555	0.0125461809619242	0.1087938372208108	0.2959780471032	-0.0324574179375634	0.0522637807671499	0.0324574179375634	0.0513336064992945	0.0047154844740345	0.1733381179858188	-0.0014351387607965	0.0376651284450121	0.0014351387607965	0.0370277183855954	-0.0524182639965688	0.0200054262309931	0.0524182639965688	0.0197677843485083	KIF21B	8362	CACNA1S	97099	ASCL5	111832	False	True	True	ref	-75	0.01645	-20	0.04053
340	chr1	201038700	G	A	rs6701496	0.491377728	0.002084346816025	0.491377728	0.002065173728135	0.0448839277630794	0.0776895954263571	0.0221000505396058	0.0057516713900416	0.0221000505396058	0.0057630647603678	0.8587831150407442	0.003574503723512	0.4256913200144675	0.0003232595097285	0.4256913200144675	0.0003110253089732	0.0385025650982926	0.0046352343735856	0.0191195792247279	0.0012341720615213	0.0191195792247279	0.0012265757243717	0.0569405496354458	0.0156881441813528	0.0569405496354458	0.0159000531787516	KIF21B	14986	CACNA1S	73751	ASCL5	88484	True	True	True	alt	-5	0.00537	-10	0.01563
341	chr1	207053793	A	T	rs4844565	0.149264791	0.0458949501494276	0.149264791	0.0463820861701543	0.0398891857050792	0.1114356761718801	0.0061279149995645	0.0429117760559307	0.0061279149995645	0.0432436709539618	0.77793787733826	0.0088151624040986	0.1162555880993058	0.0063158703512575	0.1162555880993058	0.0063750963654406	0.0311250915650983	0.0084096538566372	0.0047845604900192	0.0085975782459052	0.0047845604900192	0.0086775238540317	0.0249191712579591	0.0701667019051744	0.0249191712579591	0.0714118189776886	YOD1	813	PFKFB2	19426	C1ORF116	21037	False	False	False	alt	100	0.06824	30	0.1422
342	chr1	207065830	C	G	rs2075864	0.096203144	0.1150444810081892	0.096203144	0.1167454976536395	0.0273700589343638	0.2729355777246393	0.0026833331787042	0.1281095370811411	0.0026833331787042	0.1298826089779411	0.1008602487545775	0.3096092097381199	0.0109284935019316	0.1567239240281758	0.0109284935019316	0.1597673664252495	0.0028809043999477	0.2628058595586084	0.0003151250851524	0.1478875485400807	0.0003151250851524	0.1505420713002965	0.0200034640889445	0.1041108301512234	0.0200034640889445	0.1060946997194974	YOD1	12850	C4BPB	23031	PFKFB2	31463	False	False	False	alt	-95	0.005722	-60	0.0942
343	chr1	207065831	C	A	rs2075865	0.0189776119999999	0.5272654850188195	0.0244320092	0.5313667507550256	0.0200351750436855	0.4696243484329035	0.0003953098343913	0.5043959630738643	0.0004825195925006	0.5088993485440936	0.0859885850021443	0.3404887512679225	0.0019975792470305	0.3642473097290384	0.0021604094957106	0.3680402013741752	0.0018826313005657	0.3441247854006977	4.391756995584129e-05	0.3677405444156499	4.652104492760798e-05	0.3715922725412268	0.004189073273729	0.3493778168661646	0.0046921909537791	0.3530649590706764	YOD1	12851	C4BPB	23030	PFKFB2	31464	False	False	False	alt	-95	0.01825	-60	0.0873
344	chr1	208129244	C	T	rs895239	0.20071877	0.0304225587035925	0.20071877	0.0307368213951812	0.0566367372295622	0.0378453389920831	0.0122252584134559	0.0204344224466288	0.0122252584134559	0.0205431810182662	0.3033098545082643	0.1098838043871617	0.0645997614323633	0.0252263532201036	0.0645997614323633	0.0255854536351704	0.0175302841382001	0.0330772504157413	0.0040004924031737	0.016462985263769	0.0040004924031737	0.0167160811443767	0.0609597175942726	0.0172199880528833	0.0609597175942726	0.0174772165795219	PLXNA2	115140	CD34	217842	CD46	377206	True	False	False	alt	95	0.01563	-70	0.2236
345	chr1	208129256	C	T	rs895240	0.2435943012	0.0223871210982276	0.2435943012	0.0225160351203636	0.0906797831420869	0.006481925180631	0.0229377608907382	0.0096414160572331	0.0229377608907382	0.0096780736640356	0.3163513246016297	0.1023221987421655	0.0689310674909741	0.0223403209669095	0.0689310674909741	0.0227276111413866	0.028845734112147	0.0107590003898751	0.0064487044555594	0.0087996305019821	0.0064487044555594	0.0088608332012221	0.0715771502094948	0.0133126658992578	0.0715771502094948	0.0134005060542709	PLXNA2	115128	CD34	217854	CD46	377218	True	True	True	alt	-80	0.01721	-80	0.3008
346	chr1	208151856	A	G	rs600396	0.06231846746	0.2219993434269186	0.0634267209399999	0.2243703341098171	0.0162063419940615	0.6214714674275559	0.0012042478322269	0.3139073983297115	0.0012165458646608	0.3168052394526386	0.5979372175117944	0.02698594337539	0.0356426267657853	0.0529497721368967	0.0363937581586133	0.0536533736034995	0.0094887670340251	0.0797874040368531	0.0006774671092795	0.0934430633356453	0.0006858022406365	0.0946804336228733	0.0177031440731087	0.1297162779155168	0.0179505789977235	0.1314714424444921	PLXNA2	92528	CD34	240454	CD46	399818	True	False	False	alt	100	0.04877	90	0.1648
347	chr1	230096333	A	G	rs7529009	0.012411361	0.2834160960286496	0.0498678674	0.2839972161972464	0.0425344203670057	0.0930541208691586	0.0006779761438784	0.1587263829987421	0.0021897880767775	0.1588420988239391	0.175919633136485	0.2012390321490741	0.0053277961661262	0.1657170156113178	0.009073412291395	0.1664990437066551	0.0077071658048525	0.1072500751542016	0.0002589740316295	0.1147128759197034	0.0004088019073781	0.1148146098930667	0.0058402890039919	0.1481550965141163	0.013837385767543	0.1486468081180756	GALNT2	38342	PGBD5	329999	URB2	470085	False	False	False	alt	-80	0.01317	40	0.1487
348	chr1	230098337	C	T	rs7530960	-0.0699618126	0.1915671137386406	0.0699618126	0.1887321512098398	0.0262266921111486	0.3000563755202068	-0.0019412670088453	0.1915618634778212	0.0019412670088453	0.1891104960626446	0.1032092309722542	0.3023548684290901	-0.0076180534843736	0.1969631491272196	0.0076180534843736	0.193560819515382	0.0027017796845458	0.2668331623130692	-0.0002113528348832	0.1863188605895712	0.0002113528348832	0.1830354292081119	-0.0146481475371976	0.1486922052760673	0.0146481475371976	0.1460386534866077	GALNT2	40346	PGBD5	327995	URB2	472089	False	False	False	ref	90	0.05835	95	0.12335
349	chr1	230103512	T	C	rs3811489	0.058784029	0.2119588729972762	0.065137101	0.2139665941173181	0.0209801928345365	0.4440246440383839	0.0011139120515767	0.2662591060433482	0.0012899298379232	0.26848332026549	0.2161748210220711	0.1697215369264065	0.0144020681423309	0.1278279433626982	0.0148386571409276	0.1291555764092433	0.0040374103069223	0.2043407982937576	0.00026101088562	0.1569998343265338	0.00027310699096	0.1587175117319514	0.016406585068127	0.1215802047568174	0.0174540595823298	0.122944741708307	GALNT2	45521	PGBD5	322820	URB2	477264	False	False	False	alt	-65	0.01184	-50	0.0925
350	chr1	230107008	G	A	rs4412597	-0.0640010104	0.218518320884598	0.0640010104	0.2155235992767432	0.0700724565919462	0.0189976092364982	-0.0043448577935868	0.0755212523797353	0.0043448577935868	0.074659764180445	0.0719120121408069	0.3798633754410324	-0.0043310717078322	0.2702679461391529	0.0043310717078322	0.2659939518088063	0.0043711352193144	0.1840882290042043	-0.0002646197454214	0.1503059775898886	0.0002646197454214	0.1477363380399348	-0.0096681072877832	0.2204064800397839	0.0096681072877832	0.2165792950633807	GALNT2	49017	PGBD5	319324	URB2	480760	False	True	False	ref	100	0.009155	95	0.07056
351	chr1	230107215	C	T	rs2078219	0.1482990059999999	0.0572819817137023	0.1482990059999999	0.0578883269485293	0.033474188105593	0.1740496097495698	0.005207189052845	0.0650087161716739	0.005207189052845	0.0657274609397621	0.0579929728481408	0.438068184391037	0.0110598975274555	0.1865476058669052	0.0110598975274555	0.1896096746366914	0.0020096483644659	0.3446198193040369	0.000407529004648	0.1567727259852396	0.000407529004648	0.1594205127240024	0.0206319487974662	0.1211980874162046	0.0206319487974662	0.1228218849649492	GALNT2	49224	PGBD5	319117	URB2	480967	False	False	False	alt	-45	0.2308	-55	0.17
352	chr1	230111139	G	A	rs880329	-0.029363266	0.3851522295383463	0.0369484012	0.3817275905092183	0.0197740244151695	0.4814742589991438	-0.0006088421946706	0.4099430507959943	0.0007179188200783	0.4061298862836164	0.0510557223450232	0.4519193812514421	-0.0017525510007837	0.402492207585691	0.0019072641338701	0.3987780723049294	0.0009877427207185	0.4625346894763208	-3.323689599842113e-05	0.4146220120547642	3.546171945057709e-05	0.4106869293077717	-0.0042550559202929	0.3663922222028526	0.0047053874830918	0.3628089187349447	GALNT2	53148	PGBD5	315193	URB2	484891	False	False	False	ref	70	0.00928	85	0.06573
353	chr1	230117287	C	T	rs12083455	0.092979996	0.1212190102517232	0.092979996	0.1230248054756347	0.0505323748403268	0.0541944147715278	0.0047828029740883	0.0623318261021445	0.0047828029740883	0.0629926316933595	0.0307800798390023	0.5480113144877233	0.0032509553032441	0.3256452256556722	0.0032509553032441	0.3302945893409273	0.0016011787452051	0.3732640752898207	0.0001719695070989	0.2166396493164764	0.0001719695070989	0.2199649490659128	0.0082049421002275	0.2558603725854229	0.0082049421002275	0.2597230424072304	GALNT2	59296	PGBD5	309045	URB2	491039	False	False	False	alt	85	0.01987	95	0.2084
354	chr1	230117500	C	T	rs7512794	0.16897368	0.0376925828276878	0.16897368	0.0381318713559631	0.0404460921595216	0.1069288308663084	0.0071706297416431	0.0373432807253453	0.0071706297416431	0.0376160117654564	0.0672932268813301	0.398114608871612	0.0117336869771604	0.1462674355927987	0.0117336869771604	0.1487513443038672	0.0026562956833152	0.2778126939083282	0.0004823216890869	0.1070391743963985	0.0004823216890869	0.1087440749377449	0.0233413612219985	0.0844104240293369	0.0233413612219985	0.0856339344037258	GALNT2	59509	PGBD5	308832	URB2	491252	False	False	False	alt	-10	0.01132	-45	0.04297
355	chr1	230117553	T	A	rs7520068	0.2386247979999999	0.0152618098341121	0.2386247979999999	0.015318601239375	0.0380067999777719	0.1247103402358946	0.0091658349956186	0.022955047252394	0.0091658349956186	0.023046654377548	0.0853205107056843	0.3512876953643495	0.0216214595251378	0.0842893264909969	0.0216214595251378	0.0858578310311343	0.0033641442003351	0.2403087662668217	0.0008567829498167	0.0667083003063665	0.0008567829498167	0.0678248639243677	0.0384266437926824	0.0379654606308977	0.0384266437926824	0.0386142891296301	GALNT2	59562	PGBD5	308779	URB2	491305	False	True	False	alt	-65	0.012054	-100	0.1167
356	chr1	230228204	A	G	rs7531956	0.0152415218	0.663488300224528	0.0152415218	0.6700190401984284	0.0239709843240066	0.3511952361828013	0.0003878910417533	0.5642787175280806	0.0003878910417533	0.5704175477305813	0.0385932499752565	0.4984124940440763	0.0005956812542266	0.5629829493164477	0.0005956812542266	0.5691383282980146	0.0009870867894747	0.4625273619189682	1.649961528616929e-05	0.5255072904583699	1.649961528616929e-05	0.531612491365604	0.0016668866088218	0.558369140892975	0.0016668866088218	0.5646593290285024	GALNT2	170213	PGBD5	198128	COG2	414278	False	False	False	alt	-70	0.0929	-65	0.0645
357	chr1	239002470	T	G	rs9428451	-0.0229315804	0.5706914769473079	0.0229315804	0.5645977605160597	0.0280346051902739	0.2609591103195016	-0.000657404805612	0.4496238871027437	0.000657404805612	0.444219948589726	0.0012404737554022	0.9575818426650248	-3.0202435613061247e-05	0.9102016877246724	3.0202435613061247e-05	0.903297744357963	3.4839339836053385e-05	0.9207487063754576	-8.661930001580705e-07	0.8688965753894917	8.661930001580705e-07	0.8621526207274282	-0.0001204183299791	0.9024598280744346	0.0001204183299791	0.8956021577772959	CHRM3	384096	FMN2	1011879	ZP4	1111548	False	False	False	ref	55	0.01022	95	0.05396
358	chr1	243264850	T	G	rs12741781	0.0306526242	0.2972621194746419	0.0516732214	0.2993882935190357	0.040826108000548	0.1034715923684867	0.0014303231514086	0.1847426832126099	0.0022505430980959	0.1860517664077576	0.0735788987496288	0.382728273884775	0.0042948098052729	0.2998899569940253	0.0050090253561092	0.3027948556899174	0.0031168622857988	0.2577451706379786	0.0001947337151301	0.2236552959367971	0.0002226022782786	0.2256269628773893	0.0072547919897067	0.2519731471812092	0.0092144765926561	0.2542797862946867	SDCCAG8	8815	CEP170	9057	AKT3	586229	False	False	False	alt	95	0.02753	70	0.07733
359	chr1	243270352	A	G	rs2275154	0.091688628752	0.150639767703328	0.091688628752	0.1523641431594696	0.0480270945084476	0.0664404263397588	0.0050014920075523	0.097580933467605	0.0050014920075523	0.0982180366497816	0.1697156147933093	0.2052212416199038	0.0178723163443646	0.1354032953627374	0.0178723163443646	0.1377609221901301	0.0083833841223462	0.0982836843869987	0.001000124216322	0.0910369140641334	0.001000124216322	0.0925324413798058	0.024283263501699	0.0982636482608625	0.024283263501699	0.0997171927418026	SDCCAG8	14317	CEP170	14559	AKT3	580727	False	False	False	alt	-40	0.01007	-35	0.0503
360	chr1	243490976	A	G	rs884328	0.0400345375	0.3439378433522591	0.0417013905	0.3472630650614758	0.0187639214670155	0.5074737367895462	0.0008684126247571	0.3704378536626366	0.0008875215102515	0.373889509677743	0.0501039226683381	0.4475802128214304	0.0019477017702815	0.3938865598795973	0.0020538357257743	0.3976266719583019	0.0009981569541585	0.462724089871921	4.617574958872354e-05	0.3995866953115061	4.73924745072107e-05	0.4034271875348953	0.0050542707267987	0.3477088758348027	0.0053313978423674	0.3515097224967704	SDCCAG8	234941	CEP170	235183	AKT3	360103	False	False	False	alt	0	0.0	-80	0.1272
361	chr1	243554380	A	G	rs1352162	-0.0072398144239999	0.8341824772738345	0.0072398144239999	0.827952306342421	0.0131560826283696	0.7692549219950238	-9.984777595921764e-05	0.8544699515507187	9.984777595921764e-05	0.8483509551887412	0.0139248127742403	0.6753291161065073	-8.642535118312544e-05	0.8138834800006776	8.642535118312544e-05	0.807069582924307	0.0001789417801059	0.7308772056941342	-1.1810214811542312e-06	0.8379124221713132	1.1810214811542312e-06	0.8311931383725436	-0.0003158919204248	0.8154899045978049	0.0003158919204248	0.8087296980794341	AKT3	296699	SDCCAG8	298345	CEP170	298587	False	False	False	ref	65	0.003265	-60	0.03955
362	chr1	243629710	T	C	rs145071536	0.1512589486	0.0538657690173554	0.1512589486	0.0545974195618757	0.0207550157215563	0.4502155280474366	0.0033329779947032	0.1136738099651638	0.0033329779947032	0.1152861708952647	0.0015060539078222	0.942298865245728	0.0002197784837381	0.6911580810732909	0.0002197784837381	0.6974311696205037	2.9554526339193992e-05	0.9288513858762238	4.406629761885683e-06	0.6745824521684987	4.406629761885683e-06	0.6808614317134914	0.0006416812378344	0.7013763287426524	0.0006416812378344	0.7077112093341454	AKT3	221369	SDCCAG8	373675	CEP170	373917	False	False	False	alt	100	0.03778	95	0.2463
363	chr1	243746765	C	T	rs11586029	0.0125047098	0.6984893269119726	0.0143505562	0.7028483196356571	0.0706777963419106	0.01726815307777	0.0008442497233578	0.3367403776826846	0.0009939959154812	0.3394158537782497	0.0689246478176239	0.3772851013528695	0.0009754523905848	0.4834977448843868	0.0010841609921221	0.486975790323981	0.004788915384137	0.169691404959588	6.548426826942203e-05	0.3094145868577253	7.430336599679247e-05	0.312076446182142	0.002086701197585	0.4905540692480151	0.0024199135627329	0.4942749383138138	AKT3	104314	ZBTB18	301783	SDCCAG8	490730	False	True	False	alt	95	0.10596	95	0.2632
364	chr1	243847139	T	G	rs61833239	0.0198956182	0.5206616361561204	0.0245989553999999	0.5250633720938667	0.0174267419559738	0.5828325560296294	0.0003544860784097	0.5415803147973993	0.0004375488089941	0.5459925313469847	0.0060951469763451	0.8027324601545708	0.0001453003226181	0.7390761241420564	0.0001556384787129	0.7433889178783051	0.0001098029860576	0.8049594570649039	2.69325987816138e-06	0.7393689859144189	2.875835656762743e-06	0.7436370681395138	0.0005756985912704	0.7150269507970272	0.000618587311537	0.719229378865049	AKT3	3940	ZBTB18	201409	SPMIP3	505497	False	False	False	alt	-60	0.02554	-65	0.1326
365	chr10	3778595	T	C	rs1043003	0.0859925104	0.137550199764182	0.0904732232	0.1388973138853144	0.0255921147705566	0.3166001977078778	0.0022646475613205	0.1648865420137291	0.0023748707044417	0.1662836096460996	0.1771889742997591	0.1965323812285995	0.0146421476629901	0.1129300283954722	0.0154685983055503	0.1143701329382266	0.0044423457545688	0.1773928345799596	0.0003759199100627	0.1182418637144219	0.0003962501544428	0.1194415063886637	0.0225305994523439	0.0813416172134981	0.0239244828610075	0.0822415207363619	KLF6	6686	PITRM1	605754	PFKP	712261	False	False	False	alt	-5	0.000977	-15	0.001953
366	chr10	18421239	T	C	rs11014167	0.0045071743999999	0.7753375622031395	0.0102362224	0.7763552883430829	0.0317667696553132	0.2004674703645471	0.000204897002891	0.623612218605646	0.0003595812559543	0.6245838634802124	0.0060918478440169	0.8040716563285306	4.212561910614368e-05	0.8484135577224488	7.301507419999515e-05	0.8495127968448075	0.0002074655650801	0.7266226863456191	2.027161224060676e-06	0.7883623791450525	2.813529259342697e-06	0.7893210381496177	0.0001195935468971	0.8343619279774179	0.0002746527663224	0.8354337545225173	NSUN6	238046	ARL5B	238193	CACNB2	280814	False	False	False	alt	100	0.02124	90	0.0525
367	chr10	21030071	G	A	rs640729	-0.046612098	0.3207749919240867	0.046612098	0.3163325330138588	0.0877671112613343	0.008051305043578	-0.0041634725480777	0.081903991453257	0.0041634725480777	0.0811044623497318	0.3140790472105836	0.1028927754782046	-0.0147848144464239	0.1149157121227766	0.0147848144464239	0.1127517638741599	0.0280521350100503	0.0113229104593595	-0.0013512048594361	0.0420972644928648	0.0013512048594361	0.0414909028890786	-0.0158985186895846	0.1325342208319248	0.0158985186895846	0.130226389958899	NEBL	262940	MLLT10	494576	SKIDA1	496297	False	True	True	ref	-95	0.046	-95	0.2153
368	chr10	21038664	A	G	rs663759	0.14457606256	0.0626222888410785	0.14508838544	0.0629648795032869	0.0706534068007032	0.0170725982084235	0.0107906094426794	0.0308726926822087	0.0108210213830946	0.0308892271554776	0.1005105407277885	0.3111468016303585	0.0138832198310247	0.1475473891356313	0.0139203835644855	0.1493296454944119	0.0070615902958284	0.1186698378802155	0.0010267856011867	0.0707416916686066	0.0010289916733713	0.0715041199806113	0.0245636897495958	0.0891715257958819	0.0246692619840981	0.0901295007769145	NEBL	254347	MLLT10	485983	SKIDA1	487704	False	True	False	alt	85	0.0858	100	0.4253
369	chr10	21110940	G	A	rs602572	-0.0542473494	0.2692438432951453	0.0542473494	0.2656448091776246	0.0316558853990021	0.2042152348378251	-0.0017962468180557	0.2103105223790324	0.0017962468180557	0.2076146224517712	0.0256161129622908	0.6159638292766827	-0.0017938627589779	0.4723601533917523	0.0017938627589779	0.4672506899608421	0.0009224668265923	0.522185666909952	-6.668470807159523e-05	0.4040412900349227	6.668470807159523e-05	0.3991003630662634	-0.0044043416581438	0.417166793326568	0.0044043416581438	0.4122393911162151	NEBL	182071	MLLT10	413707	SKIDA1	415428	False	False	False	ref	5	0.0003242	-50	0.06226
370	chr10	60375448	G	A	rs10994321	0.0837878656	0.083007018757528	0.1218657456	0.0835048969385705	0.0372086714518887	0.1342035554480029	0.0040215393037074	0.0724579355803316	0.0050604254489943	0.0728946731942399	0.1336041371119395	0.2582588068881389	0.0163254084623102	0.1084538254270531	0.0180079843958449	0.1096687026602035	0.0053024513418268	0.1658977764262834	0.000739576515004	0.0849091702663429	0.000785482560032	0.0856753906162095	0.0247195737521031	0.0669304360003108	0.0289457622645243	0.0674467931882129	ANK3	358042	CDK1	402884	CCDC6	468892	False	False	False	alt	-70	0.01316	80	0.09863
371	chr10	60420054	C	T	rs10994336	0.5240115	0.0020852463699018	0.5240115	0.0020213496225719	0.0823355764114061	0.0098933510093807	0.0479445494892327	0.0021708126583641	0.0479445494892327	0.0021519171193011	0.0809887499587608	0.4183249295334439	0.0780645805755504	0.0493741275741853	0.0780645805755504	0.0494622459019831	0.0081945183037101	0.1536369375955651	0.008157506511529	0.0250921433919906	0.008157506511529	0.0254311559161727	0.0721462505361089	0.0278314789607665	0.0721462505361089	0.0280090747655704	ANK3	313436	CDK1	358278	CCDC6	513498	False	True	True	alt	40	0.0188	-55	0.1265
372	chr10	60421123	A	G	rs10994337	0.0251243001999999	0.52148057089804	0.0251243001999999	0.5276423943012768	0.0201967593634674	0.4727952427573345	0.000521379609893	0.4997885928690824	0.000521379609893	0.5057863684197272	0.0268640097654316	0.5638911342406756	0.0006085147855027	0.5468263463713967	0.0006085147855027	0.5526575386578628	0.0005422661776396	0.5565362665091467	1.2823241693221656e-05	0.5370103135102708	1.2823241693221656e-05	0.5429586937315641	0.0019951502754774	0.5176662778829542	0.0019951502754774	0.5233994958477513	ANK3	312367	CDK1	357209	CCDC6	514567	False	False	False	alt	-70	0.014656	100	0.05453
373	chr10	60447629	T	C	rs61847646	-0.163573452	0.0443264995993655	0.163573452	0.0438636728082847	0.0333102836415726	0.1775389424090306	-0.0057497149405252	0.0547165585691148	0.0057497149405252	0.0541743710455697	0.179975091550922	0.1967690569070785	-0.0322078215966046	0.0603359682835832	0.0322078215966046	0.0591090304390177	0.0059825282086222	0.1399340112831565	-0.0011351224944765	0.0572555342358568	0.0011351224944765	0.0561355825571384	-0.0437497938042294	0.031881700064865	0.0437497938042294	0.0313282868236313	ANK3	285861	CDK1	330703	CCDC6	541073	False	False	False	ref	20	0.005806	-90	0.1819
374	chr10	60514979	T	G	rs9633553	-0.0272478575999999	0.4949292438540734	0.0272478575999999	0.4890315677586958	0.0295107928031752	0.2331840169208258	-0.0007936588983935	0.3819471610863346	0.0007936588983935	0.3769098705430172	0.0024578535845072	0.9092501014709108	-5.882901549528564e-05	0.8459764533746166	5.882901549528564e-05	0.8391585165218057	7.220101457676538e-05	0.8548486939028237	-1.695937852283715e-06	0.7919927192424953	1.695937852283715e-06	0.7852370154448033	-0.0002408366599583	0.8357655244247876	0.0002408366599583	0.8289573614880879	ANK3	218511	CDK1	263353	RHOBTB1	486461	False	False	False	ref	55	0.00989	-20	0.02554
375	chr10	60525580	G	A	rs10821789	-0.0914060116	0.1216924302046918	0.0977981584	0.1207067464585721	0.0226001408248331	0.3951150121991832	-0.0022338975549784	0.1669984939628889	0.0023403133544737	0.1657704322746035	0.1450908910956418	0.2324017206900263	-0.0138177349921004	0.1228801065620097	0.0145194297217194	0.1214185628042696	0.0033452255838851	0.2260133092623511	-0.0003392193366495	0.135434106955023	0.0003509010782894	0.1340482313860353	-0.0225842103526772	0.0822857954115766	0.0240490251063969	0.0814914344228053	ANK3	207910	CDK1	252752	RHOBTB1	475860	False	False	False	ref	-85	0.03003	100	0.04578
376	chr10	62910533	A	G	rs7915640	0.0791079264	0.1580691897985704	0.0791079264	0.1602562313694	0.0232943798397224	0.3783182556800875	0.0020075556205615	0.1898934298737244	0.0020075556205615	0.1922562878322716	0.0177369601794727	0.666491732975383	0.0015120344843675	0.4599679325293904	0.0015120344843675	0.4653759024676239	0.00043901337939	0.6318082845995063	3.889650344561928e-05	0.4357121733113825	3.889650344561928e-05	0.4410553589614674	0.0043028933390517	0.3998079075255981	0.0043028933390517	0.4047905424449898	EGR2	91366	ADO	105812	NRBF2	222715	False	False	False	alt	-95	0.00775	20	0.02122
377	chr10	62915331	C	T	rs10740096	-0.0273375214	0.3490640809331196	0.0423674766	0.3481368334291237	0.0210816532292858	0.4396283444382884	-0.0007816181777202	0.3483814534370476	0.001127712293959	0.3475762767097913	0.0658432582230873	0.3917001158379125	-0.0021443098868529	0.3601802260222209	0.0031367560753662	0.3585657544049674	0.0014751555429448	0.3892511803351825	-6.893792284106242e-05	0.3509715487263616	9.150840756303384e-05	0.3498078679064956	-0.0043812477318465	0.3100902697588614	0.0069364257200355	0.3085847025922387	EGR2	96164	ADO	110610	NRBF2	217917	False	False	False	ref	40	0.031	-100	0.186
378	chr10	62957155	G	A	rs10822098	-0.260899694	0.0130169561442554	0.260899694	0.0128968503082021	0.0533172355811663	0.0469078283709343	-0.0146186317806663	0.0124926814377026	0.0146186317806663	0.0124402043943523	0.0135247929794463	0.6787002275796788	-0.0039016217749794	0.2887253649648642	0.0039016217749794	0.2843520014069098	0.0007727647799035	0.4987529228973558	-0.0002313156503972	0.1804666700459795	0.0002313156503972	0.1772327132932804	-0.0090354986638513	0.2325533321462031	0.0090354986638513	0.2286241199815334	EGR2	137988	ADO	152434	NRBF2	176093	False	True	False	ref	65	0.00537	75	0.1501
379	chr10	62960604	C	T	rs10761684	-0.0066947081999999	0.4395485309601925	0.0326509921999999	0.4390343921297123	0.012315616928404	0.817891324811192	-0.0001210184492144	0.5696037550553845	0.0004128049614506	0.5685392758076239	0.0178210880538417	0.6390766811241887	-0.0002031362349134	0.5698545124507509	0.0006099833484177	0.5686468458146207	0.000225119351112	0.7070745994423845	-3.035308280445935e-06	0.6270982413948151	7.814384942413931e-06	0.6259091163637289	-0.0005979677344858	0.5383656191159083	0.0019060737026161	0.5370499996812783	EGR2	141437	ADO	155883	NRBF2	172644	False	False	False	ref	55	0.01573	-55	0.1326
380	chr10	62988546	A	G	rs73300318	-0.0116056469	0.7324425967266336	0.0125840861	0.7275519847460009	0.0192138839616348	0.5000255728152303	-0.0002562243282492	0.6915233516877146	0.0002685936626623	0.6866683227571729	0.1493203787403912	0.2280431149981828	-0.0014366903630658	0.424265705837571	0.0016216063672793	0.4204365375373484	0.0028145372100851	0.2537585733595811	-3.216991202287654e-05	0.427285252070194	3.4507602372436586e-05	0.4232466270074784	-0.0027621985417834	0.4630476189056898	0.0030426247896802	0.4589441687467959	NRBF2	144702	EGR2	169379	ADO	183825	False	False	False	ref	-95	0.03223	100	0.2327
381	chr10	62998737	T	C	rs10995385	-0.0097681415	0.770400102777766	0.0106059141	0.7658277889469985	0.0152139705076933	0.6813743402540908	-0.0001481184475845	0.7833222264779134	0.0001608715720884	0.7786798224270322	0.0021246412193592	0.9142041955779984	-2.67590482216557e-05	0.9121716696496612	2.78127937628316e-05	0.9078552908307548	3.2350729975345795e-05	0.9217740415863432	-4.0469664317705097e-07	0.9159573367521114	4.207374492116054e-07	0.9115914434035572	-0.0001237174623073	0.9020386240434316	0.0001253670284714	0.8977172655069561	NRBF2	134511	EGR2	179570	ADO	194016	False	False	False	ref	-65	0.011536	-90	0.1367
382	chr10	63090314	C	T	rs113899647	-0.041276791	0.3486647043953672	0.0453364718	0.3459888199598318	0.0162855566146843	0.630179998376	-0.000807823205078	0.4308040833070088	0.0008682899087872	0.4277226693580411	0.0010928375837154	0.9570063991480652	-3.055080800311323e-05	0.8853715829792285	4.138274013052261e-05	0.881521600446449	1.781270726391065e-05	0.9573870846081292	-6.549070646725563e-07	0.8814578822087871	8.162427072605151e-07	0.8775825308379877	-0.0001063970175843	0.8838968442090543	0.000150935304015	0.8801086082023052	NRBF2	42934	EGR2	271147	ADO	285593	False	False	False	ref	-10	0.0007935	50	0.04346
383	chr10	63115969	G	T	rs59113396	-0.143479194	0.0620845219006489	0.143479194	0.0615091027740838	0.0269087519840422	0.2854596534662854	-0.0040647582235837	0.0928395594019422	0.0040647582235837	0.0919004875039749	0.4679794464055953	0.0510375392882309	-0.0744057974311901	0.0201814250395625	0.0744057974311901	0.019830454215743	0.0129600542889707	0.0524516145108964	-0.0021450887483361	0.0315244297820484	0.0021450887483361	0.031132349446564	-0.0438570156048959	0.0320179721829555	0.0438570156048959	0.0316166488634533	NRBF2	17279	EGR2	296802	ADO	311248	True	False	False	ref	-5	0.001709	-20	0.03125
384	chr10	63154433	T	C	rs16918239	-0.0298568202	0.3329496527242798	0.0476424658	0.3324709647582765	0.0167847643869536	0.6063314907963643	-0.0007060321678364	0.40194037478973	0.0009786508892405	0.4011864077604912	0.0968831447329352	0.3094791342062688	-0.0046470952583406	0.2662710667596944	0.0058970001618445	0.265299061769253	0.0017612677770354	0.3474053989579755	-0.0001094089905096	0.3000375504760781	0.0001289579219031	0.2991520535928931	-0.0075979017518392	0.2273903862367322	0.0107271287651347	0.2266102288673666	NRBF2	21185	EGR2	335266	ADO	349712	False	False	False	ref	-100	0.02174	-100	0.1903
385	chr10	63171485	C	T	rs74557321	-0.189160206	0.029561794420427	0.189160206	0.0293217891069195	0.0274789818928421	0.272214967876327	-0.0056020584803146	0.0556295662214008	0.0056020584803146	0.055212816637125	0.1193502358879614	0.2756334006565207	-0.0214836439904793	0.0813246742809591	0.0214836439904793	0.0797376439741098	0.0032673568822021	0.2360565844780947	-0.0006451082778144	0.0839924223186505	0.0006451082778144	0.0825435356142676	-0.0377569199300583	0.0386480094317217	0.0377569199300583	0.0380369628853705	NRBF2	38237	REEP3	349917	JMJD1C	350365	False	False	False	ref	-75	0.0638	-75	0.1396
386	chr10	63174840	A	C	rs112637649	-0.0076387281399999	0.8385618914232684	0.0076387281399999	0.8332273057795323	0.0202917437680963	0.472585508531338	-0.0001612735036123	0.80132835509175	0.0001612735036123	0.7949093788570607	0.004256705486457	0.8461442319599626	-3.331204418163427e-05	0.9105459389440111	3.331204418163427e-05	0.9051151096564684	9.132603022668688e-05	0.8295656830547983	-7.151726823254495e-07	0.8979495502381628	7.151726823254495e-07	0.8916853576130418	-0.000118768763815	0.9152600488589094	0.000118768763815	0.9100510783080812	NRBF2	41592	REEP3	346562	JMJD1C	347010	False	False	False	ref	35	0.009834	40	0.0515
387	chr10	63178899	T	C	rs76032436	-0.0020619933	0.8070631816813508	0.0084373621	0.8057570106556928	0.0212244418405113	0.4392714544269245	-4.4798739768570254e-05	0.7477001622582863	0.0001816064645419	0.7464890290590828	0.0006796212596086	0.9825425617207436	-1.9666424212944536e-06	0.9734908551480292	5.568223351023433e-06	0.9723353144458934	1.4287490481548974e-05	0.9717965965311338	-4.144169145611513e-08	0.96363256388875	1.1871397600509933e-07	0.9625051320102076	-7.423047738444794e-06	0.9677313746740448	2.5568275543532056e-05	0.9666388873920936	NRBF2	45651	REEP3	342503	JMJD1C	342951	False	False	False	ref	-100	0.01114	-100	0.07294
388	chr10	63254190	A	C	rs76460998	-0.0040379471279999	0.7708583022392621	0.0105886255279999	0.769223741462892	0.0362770903353399	0.1412569849446649	-0.0001499228896928	0.5811486055317223	0.0004080460187573	0.5802706241523912	0.0044447560291643	0.8376165789819012	-1.3172016614229032e-05	0.8734290474496077	4.24041099652285e-05	0.872248253926219	0.000162730826012	0.7424904796987232	-4.673548854217008e-07	0.8006579042149387	1.6290709020838735e-06	0.7994732141085051	-7.835439279469886e-05	0.8519608848378826	0.0002103196859225	0.8507858689355001	NRBF2	120942	REEP3	267212	JMJD1C	267660	False	False	False	ref	40	0.006847	25	0.01666
389	chr10	63293746	G	C	rs58429288	0.007241229072	0.8255303461492085	0.007241229072	0.832419654745496	0.0076315261171563	0.9779726825383758	5.273203522798792e-05	0.9123784364130628	5.273203522798792e-05	0.9192010122254274	0.0015835835175348	0.945345247530042	7.58302323629797e-06	0.9565522936981664	7.58302323629797e-06	0.9636043442316172	1.2852464886318577e-05	0.9785672601396368	5.83640952785657e-08	0.9733307161111362	5.83640952785657e-08	0.980418649265475	3.1341757117877904e-05	0.9551025576187064	3.1341757117877904e-05	0.9621427093889064	NRBF2	160498	REEP3	227656	JMJD1C	228104	False	False	False	alt	0	0.0	-70	0.0421
390	chr10	63297322	C	T	rs112188494	-0.0381634358	0.2202547365861517	0.0628456654	0.2182320511631704	0.0150554264796899	0.6595222248602246	-0.0007905397207614	0.329094399364041	0.0010756342835952	0.3260785707266309	0.0267279205568934	0.5549037262146482	-0.0009323373399626	0.3977194947499974	0.0018334614369961	0.3943919381258989	0.0004171498552521	0.5999572701760717	-2.1383278104773848e-05	0.4373223356374912	3.1791802092630935e-05	0.4338420482660834	-0.0030096334663983	0.3345993088536522	0.0053718122133878	0.3312965530312529	NRBF2	164074	REEP3	224080	JMJD1C	224528	False	False	False	ref	-95	0.02087	-95	0.3025
391	chr10	63333623	C	T	rs78005057	-0.2953336439999999	0.0094368953427854	0.2953336439999999	0.0093953214787381	0.0984077556618048	0.0047205758059151	-0.0305061089241155	0.0036505747125765	0.0305061089241155	0.0036444238319724	0.0433176074692355	0.5002378631482338	-0.0151337271916299	0.1455065226501621	0.0151337271916299	0.1428532798838402	0.0048222471267946	0.2012210293865575	-0.0017418720194561	0.0514170213201267	0.0017418720194561	0.0506190805402692	-0.0262412985384843	0.0849558178504443	0.0262412985384843	0.0836438995498704	REEP3	187779	JMJD1C	188227	NRBF2	200375	False	True	True	ref	5	0.004105	0	0.0
392	chr10	64556791	C	T	rs10822313	-0.1659609799999999	0.0397941990181148	0.1659609799999999	0.0394383880414999	0.0469040476866752	0.069754075746957	-0.0082793512225425	0.0312191559294627	0.0082793512225425	0.0310162745016892	0.0089340503447592	0.7583701085277367	-0.001738976146552	0.4343905124455234	0.001738976146552	0.4291944754487845	0.0004579220103149	0.6083094177861884	-9.322233357429154e-05	0.314108103703707	9.322233357429154e-05	0.3097598884361747	-0.0046600244135791	0.3840247131919569	0.0046600244135791	0.3788861997985451	JMJD1C	1034941	REEP3	1035389	NRBF2	1423543	False	False	False	ref	5	0.00235	5	0.006836
393	chr10	64567391	G	A	rs3999058	-0.1863377479999999	0.030921774111542	0.1863377479999999	0.0306178545749975	0.029557105782012	0.233777438251298	-0.0059163151864337	0.0515803132757294	0.0059163151864337	0.0511465902876799	0.1090387977961795	0.2935539859790142	-0.0199089901795074	0.091333501643031	0.0199089901795074	0.0894689471156353	0.0032491712908599	0.2395143552744336	-0.0006557072550158	0.0875154481930264	0.0006557072550158	0.0859017831396996	-0.0351497806077001	0.0448158071382944	0.0351497806077001	0.0439121866533726	JMJD1C	1045541	REEP3	1045989	NRBF2	1434143	False	False	False	ref	-35	0.05603	-30	0.02942
394	chr10	64567820	G	A	rs2394090	-0.0736392646	0.1708565976575885	0.0736392646	0.1683817240594762	0.035483587517967	0.1497770122994094	-0.0026618451611236	0.1255903280464929	0.0026618451611236	0.1239741004491981	0.0366294414568967	0.5026631144697178	-0.0027648183997244	0.3306008488572211	0.0027648183997244	0.3259631413040258	0.001355693015679	0.3945625212412872	-0.000104257359895	0.2610863642739467	0.000104257359895	0.2570629906018619	-0.0074354194846755	0.2638542161402318	0.0074354194846755	0.2597033896554393	JMJD1C	1045970	REEP3	1046418	NRBF2	1434572	False	False	False	ref	-75	0.02344	-100	0.09814
395	chr10	64573330	C	T	rs10822315	-0.0779764982	0.1644068565451399	0.0779764982	0.1620692488683415	0.0231153090633131	0.3830781451050438	-0.001853572443107	0.1948674463851894	0.001853572443107	0.1922451178470484	0.0030236547787931	0.8846071998554369	-0.0002553027447367	0.6924205717248956	0.0002553027447367	0.6863217477461068	7.127239204459274e-05	0.8538820226124222	-6.093833757539361e-06	0.6593705333468616	6.093833757539361e-06	0.6533152441984776	-0.0008388043944442	0.6820180472087666	0.0008388043944442	0.6758806270129535	JMJD1C	1051480	REEP3	1051928	NRBF2	1440082	False	False	False	ref	-70	0.00586	-45	0.03894
396	chr10	64577039	C	T	rs56023698	-0.0208922235399999	0.4834387761274679	0.02763797714	0.4795700091825827	0.0366855507881676	0.1375093861230418	-0.0007232854005287	0.3563789343599735	0.0010201393716901	0.3537787050859146	0.0110900333212364	0.7184225416394245	-0.00022821063244	0.6983114451905761	0.0002850168600427	0.6939000696541487	0.000417957900106	0.6081603582266537	-8.211364445364911e-06	0.6090353804556762	1.0711182205879316e-05	0.6047476606571374	-0.0009122100887466	0.662618060643839	0.0011266536900794	0.6580715323824625	JMJD1C	1055189	REEP3	1055637	NRBF2	1443791	False	False	False	ref	100	0.0864	95	0.1411
397	chr10	90992214	A	G	rs76523509	0.0046664482	0.7559248615839337	0.011623435	0.757493459296821	0.0468802616365792	0.068417405938807	0.000225475197459	0.5019001332964844	0.0005557119909973	0.502884818444575	0.0019266932796674	0.9239356369645942	7.017399563482452e-06	0.9244196766254557	2.020026006752792e-05	0.925748563738683	9.029404333392884e-05	0.8198637722802496	3.3122180453210737e-07	0.8471287111358263	9.658398898635282e-07	0.8482923877832054	4.28887202665469e-05	0.9153758424192002	8.907657286131448e-05	0.9168155116946006	ANKRD1	71127	RPP30	120261	HTR7	134175	False	False	False	alt	20	0.002197	45	0.01355
398	chr10	91029521	G	A	rs60020658	-0.25088933	0.0155608971534675	0.25088933	0.0155032635503821	0.0424651512684011	0.0929773669960229	-0.0100167648363277	0.0205105299401828	0.0100167648363277	0.0204344337394532	0.0001756787964764	0.9987729640398444	-4.255393958327122e-05	0.8915380659149095	4.255393958327122e-05	0.8847213346445706	7.627885639083875e-06	0.9896645342817906	-1.662087156426418e-06	0.813607102983243	1.662087156426418e-06	0.8068429761971146	-6.845699581008496e-05	0.9410187978471836	6.845699581008496e-05	0.9339152311802073	ANKRD1	108434	PCGF5	133492	RPP30	157568	False	True	False	ref	-60	0.05597	-100	0.10406
399	chr10	102490997	A	C	rs4919647	-0.00778495012	0.7751575934768853	0.01022510212	0.770456571905243	0.0361875611163439	0.1455451909448861	-0.0002786759041782	0.5853628536982554	0.00038059864279	0.5813543776660681	0.0098940978522648	0.7385212625154735	-9.472006102233592e-05	0.7988461755211465	0.000101130179415	0.794307833297914	0.0003371438080687	0.6414144082546956	-3.342058152187896e-06	0.7208498672183145	3.609802471476653e-06	0.7165441998189055	-0.0003769258684965	0.7892856337420872	0.0003917719639734	0.7848109364405788	ACTR1A	11715	SUFU	12976	MFSD13A	29601	False	False	False	ref	60	0.03165	85	0.1685
400	chr10	102514400	C	A	rs4919652	0.0630692188	0.2267908362722882	0.0630692188	0.2296874382244697	0.0196334581036099	0.4957797308337238	0.0014014134105516	0.2830037579378018	0.0014014134105516	0.2864151778883368	0.1151974530698425	0.2791248700213911	0.0063129914050374	0.2113880297212537	0.0063129914050374	0.2151207508270635	0.0021333799128681	0.3010400597588612	0.0001280675622672	0.2323390419030984	0.0001280675622672	0.2361596158203429	0.0123585497014284	0.1717668036059718	0.0123585497014284	0.1749393122776155	SUFU	10427	ACTR1A	11688	MFSD13A	53004	False	False	False	alt	85	0.10876	-95	0.5254
401	chr10	102520907	G	A	rs2145307	-0.0287427593999999	0.4771138505246161	0.0287427593999999	0.471590260989875	0.0172468185366311	0.5941049894725616	-0.0005001396516553	0.5081495197337532	0.0005001396516553	0.5022137430033273	0.0486638514070799	0.4724901630467186	-0.0012582846991367	0.4618673944071995	0.0012582846991367	0.4562687487091351	0.0008020297276757	0.5040648019691315	-2.105375591544359e-05	0.4837981872024138	2.105375591544359e-05	0.4781800599435665	-0.0032092309722542	0.439777555635884	0.0032092309722542	0.4343280191677343	SUFU	16934	ACTR1A	18195	MFSD13A	59511	False	False	False	ref	75	0.02492	75	0.1938
402	chr10	102575065	A	C	rs10883740	-0.0032580492399999	0.6599087459348494	0.0155570127599999	0.6599424752179927	0.1339389468679372	0.001255885739345	-0.000108041342251	0.2186936841083707	0.0018837119215838	0.2189438427090737	0.000769522615552	0.9750482461923178	-3.4300327333102883e-06	0.95188933174968	1.1098629892015464e-05	0.9528919585304736	9.643181199845086e-05	0.8125954775775123	-2.3823447939437135e-07	0.8311999786419318	1.2952779798589966e-06	0.8318617028465087	-9.897396984580991e-06	0.9521750948135363	4.288872026655786e-05	0.9531674765172528	TRIM8	67439	SUFU	71092	ACTR1A	72353	False	False	False	ref	-75	0.01239	80	0.1707
403	chr10	102624580	A	G	rs74558061	-0.0123602305999999	0.4706444711462828	0.0293961042	0.4694568211510341	0.0129809125863935	0.7718702958370502	-0.0002381257318075	0.5760239992481188	0.0004179695775553	0.574626701608236	0.4570518953515226	0.0537315442023443	-0.0070855515705041	0.1224844569743725	0.0144372195636603	0.1222267854497589	0.0060478638666755	0.1366364646232632	-0.0001337774477892	0.1923859007672285	0.0002097639902241	0.1918894090901509	-0.0036744086305301	0.2224574888843386	0.009380257992148	0.2217698169046165	TRIM8	17924	ARL3	89817	SFXN2	89959	False	False	False	ref	100	0.04004	80	0.1472
404	chr10	102660261	A	G	rs10883761	-0.0226665534	0.567646933934664	0.0226665534	0.5613802061673145	0.0169582790098821	0.6040385247723977	-0.0003746993932646	0.5935486373751643	0.0003746993932646	0.5871786921664949	0.2119527564250602	0.1655560790852432	-0.0045861269379031	0.251104020797864	0.0045861269379031	0.247045180720365	0.0035689478174983	0.2131433148769304	-7.502290011637953e-05	0.2892272432457329	7.502290011637953e-05	0.2849033278151921	-0.0068803404704562	0.2781525550090095	0.0068803404704562	0.2737195634582066	TRIM8	17757	ARL3	54136	SFXN2	54278	False	False	False	ref	45	0.05103	60	0.59
405	chr10	102667859	T	G	rs884825	-0.180089202	0.0330895486181068	0.180089202	0.0327033925697793	0.0387542036213522	0.1201832388881999	-0.0073006187162108	0.0369809106975025	0.0073006187162108	0.0367042329363473	0.0561792748507142	0.4205876545495151	-0.0107703950009567	0.1542353296880658	0.0107703950009567	0.1516560764437058	0.0022420777904551	0.3038157576395152	-0.0004490394955882	0.114924267999668	0.0004490394955882	0.1130994235661368	-0.0228398931081125	0.0870177161076966	0.0228398931081125	0.0856757570194991	TRIM8	25355	ARL3	46538	SFXN2	46680	False	False	False	ref	-95	0.0511	-100	0.0108
406	chr10	102712218	T	A	rs4919669	0.01714436324	0.6253565620911297	0.01780890832	0.6298410620347237	0.0215325527159583	0.4278340884528084	0.0004469587458294	0.5623864473406456	0.0004575856259403	0.5667173490184402	0.0618067698195374	0.3930951231738576	0.0010774051677697	0.51535293562905	0.0011238845177366	0.5193970316856784	0.0013301529190135	0.3876528725216847	2.814253821626948e-05	0.4923435066646101	2.888579927116997e-05	0.4964452440739529	0.0026533271749529	0.5075645508743447	0.002739104615486	0.5119189560365022	ARL3	2179	SFXN2	2321	WBP1L	31731	False	False	False	alt	45	0.01398	100	0.0429
407	chr10	102744807	C	T	rs999867	-0.1167071022	0.0964468744414581	0.1167071022	0.0951259993337586	0.0233262485555777	0.3712635831480358	-0.0032194323710056	0.1377173681485124	0.0032194323710056	0.1360702740533964	0.2980856784665632	0.1110213466364351	-0.03778117079464	0.0508444468770254	0.03778117079464	0.0497619097355523	0.0072844018221887	0.1151881600673205	-0.0010618831063479	0.067608828222386	0.0010618831063479	0.0663176318205423	-0.0390922437398963	0.041218433758935	0.0390922437398963	0.0404174508700682	WBP1L	858	SFXN2	30268	ARL3	30410	False	False	False	ref	100	0.1636	65	0.41
408	chr10	102768371	G	T	rs10786709	0.0221673224	0.5690208415311602	0.0221673224	0.5749184805991627	0.040801255634186	0.1049135986168152	0.000914027543894	0.3700890059510434	0.000914027543894	0.3744043897493571	0.0041140180132624	0.8627812512110609	0.0001073240390155	0.8080191178179679	0.0001073240390155	0.8147219701231843	0.0001646419691888	0.7673667005073606	4.3765697549711605e-06	0.7242969616086354	4.3765697549711605e-06	0.7306980203895761	0.0003942463132196	0.7969538081579454	0.0003942463132196	0.8036910774412835	WBP1L	24422	SFXN2	53832	ARL3	53974	False	False	False	alt	100	0.01306	80	0.1417
409	chr10	102895758	A	G	rs4363528	-0.0055076126199999	0.7296148757016176	0.0123080982199999	0.7254272567434158	0.0172808353900396	0.5893813496906714	-0.0001009673139354	0.7306364697252145	0.0002110719053827	0.7264282766691658	0.0002796014648147	0.9945394054726252	-1.5605244958562908e-06	0.986856383198928	2.5701310515804656e-06	0.9850801684664108	4.8220545939833365e-06	0.9927057330367696	-2.549287688947137e-08	0.9858525742406264	4.183910966017925e-08	0.9838154675633536	-9.072613902543622e-06	0.9886150270249048	1.0722180066642456e-05	0.9842755416453736	CNNM2	22537	AS3MT	26287	BORCS7-ASMT	41485	False	False	False	ref	75	0.03717	-30	0.05005
410	chr10	102900095	T	C	rs11191453	0.0638764238	0.2280074920952149	0.0638764238	0.2308500159781049	0.0256557087827561	0.3150613307939507	0.0017235960315175	0.2349983565766194	0.0017235960315175	0.2378086953737903	0.005959057767807	0.810542017394867	0.0005301539820418	0.6364471841869331	0.0005301539820418	0.6424183857639184	0.0001592549453963	0.7618873435995164	1.4296027995759113e-05	0.5916675081155557	1.4296027995759113e-05	0.5976832361733234	0.0017023522813499	0.6012654664019303	0.0017023522813499	0.607316937278838	CNNM2	18200	AS3MT	30624	BORCS7-ASMT	45822	False	False	False	alt	-65	0.01175	40	0.06635
411	chr10	102903553	G	A	rs10883799	0.1613245659999999	0.0553629993346316	0.1613245659999999	0.0561172241525081	0.0539040004827875	0.0474481334014933	0.0111891950239225	0.0348925547171127	0.0111891950239225	0.0352249424391081	0.003857510474745	0.8581274155068063	0.0009597788676363	0.5532166618210114	0.0009597788676363	0.5591589877462754	0.0002560381507777	0.7084037850843937	7.809642951647492e-05	0.3984073389237678	7.809642951647492e-05	0.4033943077098098	0.002188149516677	0.5438830318153122	0.002188149516677	0.5497465238562731	CNNM2	14742	AS3MT	34082	BORCS7-ASMT	49280	False	False	False	alt	25	0.003609	-80	0.1984
412	chr10	102932876	C	A	rs112699822	0.02202989382	0.5506090944452429	0.02202989382	0.5569281905293202	0.0304839983220835	0.2156850745045783	0.0007081146084637	0.4279051016554319	0.0007081146084637	0.4332838725463772	0.0016503909471808	0.937135688769974	3.4727462119748265e-05	0.8764894530257897	3.4727462119748265e-05	0.8834950443979035	5.038867504546465e-05	0.8838573796812588	1.1061916913588014e-06	0.8268748016080412	1.1061916913588014e-06	0.8337037285189353	0.000150935304015	0.8683823104831578	0.000150935304015	0.875301882774392	CNNM2	14581	AS3MT	63405	BORCS7-ASMT	78603	False	False	False	alt	90	0.0676	100	0.07764
413	chr10	102947259	A	T	rs11191472	-0.00140522964	0.7440835910250854	0.01194089156	0.7453496983269988	0.0100896538455159	0.9063381986780632	-3.4678149934027225e-05	0.8281458322731998	0.0001249512324329	0.8292067750342734	0.0024446570551944	0.9111979814756612	-2.458964473465128e-05	0.9097896962873756	3.9484803658434766e-05	0.9111724824719606	2.687518027964988e-05	0.9439769504114732	-3.244627807033699e-07	0.9314230231526108	4.576271799348349e-07	0.9328386583003202	-8.165352512288676e-05	0.8977662924602884	0.0001492857378509	0.8992353851614878	CNNM2	28964	AS3MT	77788	BORCS7-ASMT	92986	False	False	False	ref	100	0.168	-10	0.03268
414	chr10	102986892	A	G	rs3902934	0.028127224806	0.4769169112314501	0.028127224806	0.4825489434597926	0.0168990341690041	0.6079877139412008	0.0004627921171414	0.5418611397631404	0.0004627921171414	0.5477212160140625	0.0002647553693378	0.996608178319498	6.318956469700841e-06	0.9613113059547188	6.318956469700841e-06	0.9684194339362688	4.558203327531943e-06	0.9954241655663306	1.0573086537084633e-07	0.959756560524914	1.0573086537084633e-07	0.96685835863019	1.9794793969186096e-05	0.9681390703797844	1.9794793969186096e-05	0.9744074106293424	CNNM2	68597	AS3MT	117421	BORCS7-ASMT	132619	False	False	False	alt	-30	0.0202	-25	0.03955
415	chr10	102988702	A	C	rs1890184	0.0477163788	0.3067573001795954	0.0477163788	0.3110557271541459	0.021836603488692	0.4144618449943847	0.0011880196998002	0.311540595968155	0.0011880196998002	0.3156601350264487	0.0101918445448846	0.7242219218770544	0.0005213666090492	0.5839559191324051	0.0005213666090492	0.589878535319801	0.000246665574168	0.696112070775916	1.4411108609006296e-05	0.557793952540518	1.4411108609006296e-05	0.5637841159643527	0.0017691597109959	0.5441951094374096	0.0017691597109959	0.5501622783401416	CNNM2	70407	AS3MT	119231	BORCS7-ASMT	134429	False	False	False	alt	10	0.0137	-60	0.02759
416	chr10	103009952	T	C	rs11191511	0.0034357314599999	0.8872656528154136	0.0051703687	0.8886216977683736	0.0445764240738337	0.082610766636934	0.0001210070715253	0.7373399169564322	0.0002135456751528	0.7386388704078491	0.0007480782554187	0.9781016318320678	2.413585742265321e-06	0.9826219712975798	3.797247563199961e-06	0.9838064657462016	3.458987841804743e-05	0.919118907084811	8.649863082298648e-08	0.9579963759467373	1.6072701465159524e-07	0.959108752186584	1.2371746230741368e-05	0.9713535414354936	2.39187093794332e-05	0.9725608819584916	CNNM2	91657	AS3MT	140481	BORCS7-ASMT	155679	False	False	False	alt	-90	0.02528	75	0.1301
417	chr10	103013607	C	T	rs11191514	-0.0880261196	0.138516420658929	0.0880261196	0.1366780906944922	0.0215787189023608	0.4319347268116489	-0.0020182141096165	0.1880799664305894	0.0020182141096165	0.1856886658372886	0.0681072877833129	0.389919629124862	-0.0068849504910592	0.2248972673497685	0.0068849504910592	0.2213172754317674	0.0015388535040868	0.3790647681816521	-0.0001644898947793	0.2333157043486072	0.0001644898947793	0.2297447157298226	-0.0139668767114248	0.1606484448275928	0.0139668767114248	0.1580224214685291	CNNM2	95312	AS3MT	144136	BORCS7-ASMT	159334	False	False	False	ref	70	0.012085	100	0.1145
418	chr10	103069712	C	T	rs1926032	-0.0211324193999999	0.5172375126496901	0.0260376461999999	0.5128446879986667	0.1128680780377127	0.002517109263677	-0.0022850300759335	0.1210073388559629	0.0028783924177652	0.1201035905998603	0.6325682095608854	0.0224596674738029	-0.0127934454150074	0.1061675014656339	0.0159246319284558	0.104639347648754	0.0717877241937986	0.0006540747650715	-0.0013917227851308	0.0290289867175652	0.0017704877695003	0.0287167149987348	-0.0056324436673154	0.2868950712861342	0.0068498234964203	0.2836098609207214	CNNM2	151417	RPEL1	176176	AS3MT	200241	True	True	True	ref	-25	0.03076	-35	0.0625
419	chr10	103114004	G	C	rs9633712	0.0404824418	0.3565105489534824	0.0404824418	0.3613352139865153	0.0143766430778876	0.7143841981418628	0.0005948648701331	0.4636620235713257	0.0005948648701331	0.4692156899864216	0.000602091649896	0.9837024405253736	2.5038900595725043e-05	0.9053992223780468	2.5038900595725043e-05	0.912368509656998	8.441054650411472e-06	0.9869116997849432	3.614173759974965e-07	0.9134555873213384	3.614173759974965e-07	0.9204069179111388	9.73244036818145e-05	0.90282274672921	9.73244036818145e-05	0.909860877469689	RPEL1	131884	INA	163135	NT5C2	163601	False	False	False	alt	-5	0.0001221	-65	0.1692
420	chr10	103153896	G	A	rs11191582	-0.0503566369999999	0.2929854750750797	0.0503566369999999	0.2889621221449881	0.0126176587937728	0.7985091280785918	-0.0006417896989316	0.4494320462250999	0.0006417896989316	0.4438395292366935	0.0893289564844445	0.3262743021524275	-0.0048635626093437	0.2603470210035424	0.0048635626093437	0.2562251101548942	0.0011354792455115	0.4177996902013871	-6.290877142082468e-05	0.3356117492238487	6.290877142082468e-05	0.3307432564767512	-0.0097745043053676	0.2191342352311288	0.0097745043053676	0.2154429535982133	RPEL1	91992	INA	123243	NT5C2	123709	False	False	False	ref	-80	0.03882	-80	0.1017
421	chr10	103197872	T	A	rs12414028	-0.005409348734	0.8431051607689707	0.007497905534	0.8392118189996043	0.0272707071158713	0.2828519545155614	-0.0001471238018443	0.7587874135269996	0.0001969721063134	0.7549558289608187	0.0174804526409553	0.6544821242860522	-4.165706161571893e-05	0.8234204222292728	8.112197249370145e-05	0.819885656647337	0.0004823064178836	0.6060133504025711	-1.4319207510126644e-06	0.780781191855164	2.3738433660588743e-06	0.7773415145537537	-0.0001245422453894	0.8254810079666077	0.0002796014648147	0.8220097042571918	RPEL1	48016	INA	79267	NT5C2	79733	False	False	False	ref	70	0.04315	70	0.1348
422	chr10	104732662	T	C	rs1490183	0.0739068056	0.1556040137446085	0.0797648272	0.1572902604863151	0.0193446844912637	0.4947835433079442	0.0015766260485893	0.2209890468844945	0.001661093898869	0.2233565471365277	0.3229273201148098	0.0993395729077116	0.0223317504555163	0.0711034529505201	0.0247655950265473	0.0720249464493399	0.0062734072558745	0.1326258350458797	0.0004904295852949	0.0995104974969363	0.0005255236209261	0.1008301752456291	0.0247929794464055	0.0690317580475592	0.0267658605786677	0.0698461851820706	SORCS3	91371	CFAP58	378828	ITPRIP	394197	False	False	False	alt	-65	0.0839	-20	0.1011
423	chr10	104752646	C	T	rs2491368	-0.1065587396	0.1026875526681699	0.1065587396	0.101252692900642	0.043197170637995	0.0877735630860001	-0.0047878103518613	0.0690196449379889	0.0047878103518613	0.0682125997814853	0.0053058295668239	0.820767478063016	-0.0005579041576182	0.5903211418049459	0.0005579041576182	0.5844175720510415	0.0002205967633376	0.7062519796412817	-2.412253219467268e-05	0.4755024696635993	2.412253219467268e-05	0.4699008259278714	-0.0017625614463395	0.5631973709604282	0.0017625614463395	0.5572970696806968	SORCS3	111355	CFAP58	398812	ITPRIP	414181	False	False	False	ref	-10	0.0006714	-10	0.01428
424	chr10	104828192	A	G	rs12250380	0.0459682175999999	0.3371122610843665	0.0459682175999999	0.3415357294725507	0.0211167341281037	0.4439663971125077	0.0009992637190593	0.3565281015092197	0.0009992637190593	0.3610834462969083	0.0105687704133812	0.7509976317618726	0.0008226855896324	0.6073591812419239	0.0008226855896324	0.6133569539402941	0.0002319688110391	0.7295969618834457	1.8413936652817032e-05	0.5919190149462122	1.8413936652817032e-05	0.5979587084596549	0.0023242387252151	0.5615846003101127	0.0023242387252151	0.5674234499474388	SORCS3	186901	CFAP58	474358	ITPRIP	489727	False	False	False	alt	100	0.1015	-80	0.03824
425	chr10	104851081	A	G	rs1021363	-0.0103498087	0.4745702076613222	0.0311616087	0.4712685329613861	0.0273865930964844	0.2791470646534003	-0.0002270732610817	0.4407801993855775	0.000731139504392	0.4376192683256465	0.0378946587047606	0.5089002660655774	-0.0001251523519855	0.5211452426453237	0.000891836951983	0.517778444665172	0.0012339262280702	0.4427223270523553	-4.401856540971739e-06	0.4799754357663991	2.297112079936998e-05	0.4768101566062053	-0.0005625020619576	0.4922574578315948	0.0025535284220249	0.4889562098078151	SORCS3	209790	CFAP58	497247	ITPRIP	512616	False	False	False	ref	95	0.579	70	0.287
426	chr10	104872279	T	C	rs2451497	-0.0241823334999999	0.2462108482677207	0.0700925322999999	0.2456992976623079	0.0317677919596024	0.1984969128290261	-0.0009304578039267	0.2261769788829919	0.0025090792558979	0.2256897707529748	0.1074535647124806	0.2992582926035242	0.0012158116282656	0.2647411908148124	0.0081362146139923	0.2636752294611699	0.003406057382488	0.2320466767591373	3.169385818433029e-05	0.2287497834175519	0.0002872038797809	0.2278240406075002	-0.0009377783642901	0.2146317421774898	0.0133920029032363	0.2137768993734099	SORCS3	230988	CFAP58	518445	ITPRIP	533814	False	False	False	ref	65	0.05063	80	0.1826
427	chr10	104877022	T	A	rs2932558	-0.01030840668	0.5637830778265263	0.02326097748	0.5606699104572943	0.0092012026293638	0.9101612863277776	-0.0001250929671909	0.7231247923846821	0.0002339072474595	0.7189577763419512	0.0067178582032925	0.7985465588378396	-0.0001146760699606	0.7911098511813522	0.0001311279840763	0.7869293367209563	6.617375582405408e-05	0.8719696659473991	-1.4167660180199522e-06	0.8442186096232049	1.5549782112943846e-06	0.8399058535095852	-0.0004313615519118	0.7724110679350438	0.0004907459338193	0.7682964369799625	SORCS3	235731	CFAP58	523188	ITPRIP	538557	False	False	False	ref	0	0.0	-100	0.2236
428	chr10	104880365	G	A	rs2932559	0.0258145308	0.1951732540631205	0.0797022412	0.1947507458013019	0.0173113102611365	0.5735010593912596	0.0010138927000004	0.2779948653417439	0.0018814479830957	0.2774285538809061	0.2741578964732275	0.1240771316007853	0.0123048436339021	0.0903739030437982	0.028052123926075	0.0900038442135771	0.0053632166495266	0.1649733202874606	0.0004629428308601	0.1285348265499789	0.0007218091768195	0.1282564607858089	0.0074956286496651	0.0900832875791015	0.0254247632872554	0.0896478131347276	SORCS3	239074	CFAP58	526531	ITPRIP	541900	False	False	False	alt	45	0.01126	-65	0.04315
429	chr10	121903955	C	T	rs7073961	-0.0581292796	0.2526675245881939	0.0581292796	0.2493210670362152	0.0251807680240209	0.3263930383666349	-0.0014991877907655	0.2484249188450278	0.0014991877907655	0.2453340267024254	0.0003051697403582	0.994740185479071	-1.5819867395553057e-05	0.944604394510438	1.5819867395553057e-05	0.9376090677375518	7.605861155784164e-06	0.9881749423398748	-4.042773218375246e-07	0.9194715534599588	4.042773218375246e-07	0.9125099945594872	-5.031176800499916e-05	0.9529068505476348	5.031176800499916e-05	0.9458264343258952	ATE1	24846	NSMCE4A	71262	TACC2	85209	False	False	False	ref	75	0.026	-60	0.07684
430	chr10	121921015	C	T	rs6585767	-0.00132617794	0.8970719341067143	0.0042237411	0.8951308766831823	0.0214447433090411	0.4239492428529973	-4.207087298797582e-05	0.8640271682216012	8.609205995836705e-05	0.8620746078185494	0.0724910098644056	0.3659829968271366	-0.0001259577109839	0.6697794442778284	0.0002895786467553	0.6680168222750456	0.0015972296860728	0.3622137175179913	-3.5395146719005723e-06	0.6533010726439222	5.99612786524438e-06	0.6513627659355585	-0.0003266141004915	0.7082070008541329	0.0007241595460393	0.7064284172673011	ATE1	7786	NSMCE4A	54202	TACC2	68149	False	False	False	ref	-100	0.021	85	0.086
431	chr10	121940050	T	C	rs12415401	0.0489363628	0.3136797426574376	0.0489363628	0.3176880315588039	0.0165429958007215	0.6242922314006052	0.0008098579170392	0.4080477689947467	0.0008098579170392	0.4129100021504052	0.0003909471808913	0.9923125392803924	1.9927506257743423e-05	0.9313088684656884	1.9927506257743423e-05	0.9383636466571438	6.371692870566194e-06	0.9917103876874948	3.305022719471795e-07	0.9298072306801236	3.305022719471795e-07	0.936778658128958	5.6085249579360335e-05	0.939474442539403	5.6085249579360335e-05	0.9466109068874334	ATE1	11249	NSMCE4A	35167	TACC2	49114	False	False	False	alt	-85	0.04437	-60	0.1002
432	chr10	121956355	A	G	rs7095093	0.0962735274	0.1151940942676114	0.0962735274	0.1167622332832587	0.0365531862824238	0.1466528654006136	0.0036746036946014	0.0964737653906095	0.0036746036946014	0.0976177472807578	0.016506383821055	0.6561863836669306	0.0016618526814952	0.4207856945969936	0.0016618526814952	0.4258534574789245	0.0005656196435271	0.5537664472386168	5.581010041247076e-05	0.3449807849831808	5.581010041247076e-05	0.3499308436227663	0.0048258058130711	0.3595556987241415	0.0048258058130711	0.3643526128595243	NSMCE4A	18862	ATE1	27554	TACC2	32809	False	False	False	alt	60	0.012024	-15	0.01788
433	chr10	121957884	G	A	rs7923863	0.0289691952	0.4691235442472121	0.0289691952	0.4746903512815534	0.0300920857518561	0.2222054628340075	0.0008655437483623	0.3489966056420635	0.0008655437483623	0.3538524245826802	0.0015406947972682	0.9377098461824216	4.774286759178039e-05	0.8559440255295925	4.774286759178039e-05	0.8628522569393996	4.746751186325158e-05	0.8914695243043413	1.4545543617008695e-06	0.8028439827129039	1.4545543617008695e-06	0.8095572274139443	0.0001954735904456	0.8489132256760499	0.0001954735904456	0.8558439714768654	NSMCE4A	17333	ATE1	29083	TACC2	31280	False	False	False	alt	-55	0.03198	-85	0.1207
434	chr10	121965676	C	A	rs72839625	-0.0225474426	0.4688309788908312	0.0291888162	0.4650411336083176	0.0138525520718584	0.7397007117576935	-0.0003228996933579	0.5750827309683141	0.0004149196901059	0.5710325114062441	0.0103675233413611	0.7229739513869683	-0.0003153044891211	0.6617128647634012	0.0003582769886513	0.6574032635567354	0.0001367233437374	0.7681733616667841	-4.3582771335875895e-06	0.6995052276302727	4.953685462649755e-06	0.6951449050408	-0.0011283032562436	0.6297011351641941	0.0012998581373098	0.6252235481489292	NSMCE4A	9541	TACC2	23488	ATE1	36875	False	False	False	ref	-75	0.02849	-90	0.1643
435	chr10	122144041	T	C	rs7902292	0.009080701048	0.582433080161364	0.021683153752	0.5836029182377654	0.012408197577665	0.7992663905546885	0.0001375456204503	0.6870575239852971	0.0002680772351858	0.6885218787595	0.4791511332519547	0.0484119647656731	0.0040331918631995	0.1658774617551898	0.011317681992959	0.1665531828789039	0.0057623707018543	0.1410064277388106	5.95466311649762e-05	0.2528478109525552	0.0001348864626689	0.2537781965245391	0.0027506515786347	0.3126703012090507	0.0065149615651083	0.3139270250172923	BTBD16	127256	TACC2	154877	NSMCE4A	168824	False	False	False	alt	-50	0.05005	100	0.04694
436	chr10	122152783	T	C	rs4752661	-0.0038528616	0.3748376509902634	0.0389978284	0.3755920099942632	0.0332857137912825	0.1757171858194489	-0.0001049377593111	0.2840027221378314	0.0012605615532586	0.2849664980070521	0.3437794859951833	0.0926571457763877	-0.0033756369684296	0.1309993860903181	0.0155639421875193	0.1314829590892184	0.0115950243872056	0.064858976838378	-9.932965024959544e-05	0.1146023571773634	0.0005034706754954	0.1150251570913199	-0.0023638283131536	0.181391571416362	0.0127461977499917	0.1819119975225793	BTBD16	118514	TACC2	163619	NSMCE4A	177566	True	False	False	ref	-100	0.03915	-55	0.11865
437	chr11	17018871	C	A	rs10832723	-0.03152606548	0.4519193608706457	0.03152606548	0.4465331471125137	0.0178809647741545	0.5613852223559311	-0.000602386487732	0.4766083130323801	0.000602386487732	0.4710138258271958	0.0034022302134538	0.880843103447933	-0.000119376248066	0.8004900923784019	0.000119376248066	0.7936547759682065	6.649555025763265e-05	0.8726667842415594	-2.3850035394360617e-06	0.7908083999623378	2.3850035394360617e-06	0.7840862314411112	-0.0004503315627989	0.7888959690705297	0.0004503315627989	0.7821074923684093	PLEKHA7	4456	RPS13	58844	PIK3C2A	189115	False	False	False	ref	45	0.005234	-65	0.1171
438	chr11	17021494	G	A	rs4456241	-0.1476995662	0.0504958582084006	0.1476995662	0.0498042581253578	0.0421166414393074	0.0939984725361592	-0.006254949031591	0.0425954007289749	0.006254949031591	0.0423068900916481	0.3404300418989806	0.091599807185297	-0.0518642623755097	0.0275786895497988	0.0518642623755097	0.0271378955328004	0.0142116065742069	0.0429348569121323	-0.0021694596893664	0.0235031751606623	0.0021694596893664	0.0232401400618169	-0.0509039622579261	0.0209116550278129	0.0509039622579261	0.0206411046324202	PLEKHA7	7079	RPS13	56221	PIK3C2A	186492	False	False	False	ref	100	0.1115	100	0.3655
439	chr11	17026200	G	T	rs77545208	0.0375850494	0.3852428467731184	0.0375850494	0.3904703674547699	0.0202766527786407	0.472833248778513	0.0007432116262049	0.3997295496390747	0.0007432116262049	0.4048867314482384	0.0057297680709973	0.8380390698998791	0.0002242025504578	0.732512906368136	0.0002242025504578	0.7390732346743972	0.0001316045314975	0.8189554136796813	5.181721260256823e-06	0.7147096959638555	5.181721260256823e-06	0.7212593105936943	0.0007142621490547	0.7166073841800589	0.0007142621490547	0.7230878750406653	PLEKHA7	11785	RPS13	51515	PIK3C2A	181786	False	False	False	alt	-100	0.008484	-100	0.2751
440	chr11	17027833	T	A	rs34902253	-0.01252516484	0.7239011733365884	0.0131113966	0.719345794897161	0.0248973990878375	0.3310114559333915	-0.0003190784083765	0.6308749442555994	0.0003330318572368	0.6259876221621516	0.0011291280393256	0.9579387819076473	-1.673257970624766e-05	0.9405179256209588	1.69985124231261e-05	0.9361080098248504	2.693469952548561e-05	0.9349324406818248	-4.003301472228741e-07	0.918241884735645	4.066598599287985e-07	0.9137627310359092	-4.783741875886644e-05	0.9481698495318726	5.278611725116297e-05	0.9438716040685854	PLEKHA7	13418	RPS13	49882	PIK3C2A	180153	False	False	False	ref	-80	0.003181	-45	0.052
441	chr11	17034171	A	G	rs7950225	0.0625690508	0.0684067121922419	0.1259577428	0.0690724135823537	0.0283571780537237	0.2607489716521731	0.0009802407257365	0.0898148324889505	0.0036803528308912	0.0908422978306814	0.2448096400646629	0.1441988684319917	0.0232332994835784	0.0543760744101486	0.031292034918155	0.0550526034138134	0.0064636772324452	0.1269535120987023	0.0004874523085111	0.0614951499723817	0.000830723134192	0.0623746564267174	0.0235046682722443	0.0376220456703327	0.0370805978027777	0.0380062181392574	PLEKHA7	19756	RPS13	43544	PIK3C2A	173815	False	False	False	alt	-20	0.0271	-15	0.01123
442	chr11	17080007	C	G	rs12577418	-0.0655289992	0.2111223512018118	0.0655289992	0.208637946931063	0.0299745947908527	0.2254685564982811	-0.0019566369852099	0.2003287891343371	0.0019566369852099	0.1979719682348291	0.0039581340107551	0.8544460377553689	-0.0002818319362587	0.6976745644936755	0.0002818319362587	0.6912296671266671	0.0001234590730089	0.7866397697365504	-8.808725985790696e-06	0.6359448401823151	8.808725985790696e-06	0.6296635174127971	-0.0009922140477054	0.6733613293102211	0.0009922140477054	0.6669644711412336	RPS13	2292	PLEKHA7	65592	PIK3C2A	127979	False	False	False	ref	-10	0.002563	100	0.1294
443	chr11	17084183	T	G	rs11024151	0.013880457598	0.6909206710001374	0.0151891115979999	0.6953256644046395	0.0327720954749348	0.1836067319132619	0.0004532403955154	0.5503900407131836	0.0005021747576654	0.5542711372125099	0.0002317640460558	0.9967537975251556	2.3531680242052583e-06	0.9830825517556128	2.855068403385027e-06	0.9874395764543762	7.683901144044577e-06	0.9868417270499702	7.712302320024699e-08	0.968245780073842	9.589053202524909e-08	0.9725033912447164	6.598264656395366e-06	0.9822391116692027	9.89739698459306e-06	0.9854030919566076	RPS13	6468	PLEKHA7	69768	PIK3C2A	123803	False	False	False	alt	-85	0.0659	-100	0.0908
444	chr11	17086101	G	C	rs1987694	0.191942485	0.0415655777197688	0.1968549686	0.0417600425609455	0.0651972297886371	0.0248768416334565	0.0155975995361954	0.0234714940368791	0.0157793579846461	0.0234076647043231	0.4524232126950611	0.0552088536652402	0.0848551336988422	0.0175745119941543	0.0869705234692746	0.0176807448267691	0.0296199474693718	0.0101348217453061	0.0069741821444223	0.0105717065544735	0.0070524500810986	0.0106631388694776	0.0630769357658935	0.0197368714099648	0.0647314506284846	0.0197644870550835	RPS13	8386	PLEKHA7	71686	PIK3C2A	121885	False	False	False	alt	-45	0.05225	-40	0.0371
445	chr11	17171928	T	A	rs214934	-0.0250558624	0.5274915358090101	0.0250558624	0.5213977643822847	0.0112187745668702	0.8568265502510167	-0.0002877559978414	0.6569688395790758	0.0002877559978414	0.6504879598655092	0.0134142720464517	0.6789455347241629	-0.0003409715814787	0.6415890191199722	0.0003409715814787	0.6354942644958399	0.0001467006586998	0.7576475585212648	-3.797018300622345e-06	0.7054632929544794	3.797018300622345e-06	0.6990539417454589	-0.001219029395269	0.6120723222850759	0.001219029395269	0.6060223837540272	PIK3C2A	36058	NUCB2	36226	RPS13	94213	False	False	False	ref	75	0.03032	65	0.0951
446	chr11	17184972	A	T	rs664382	-0.01568159708	0.6820640460997986	0.01612156732	0.6772164615042764	0.0156321258804123	0.661686553097551	-0.0002666573711761	0.7014152054022751	0.0002730076699628	0.6967478291317756	0.0028586981623832	0.8884592062261496	-5.492414289649879e-05	0.8758251918750581	5.5989195731985736e-05	0.8714733914147373	4.524223241706439e-05	0.8972765392047318	-9.54928636072204e-07	0.8785813772313119	9.703010478525496e-07	0.8742560023392787	-0.00020124707202	0.8651451001756439	0.0002061957705123	0.8607608368945122	PIK3C2A	23014	NUCB2	23182	RPS13	107257	False	False	False	ref	45	0.014404	100	0.0609
447	chr11	17185193	A	T	rs665311	-0.00458394748	0.8064521890845979	0.0083846038799999	0.8025817010814581	0.0098043514896705	0.9193679967639156	-4.709144992450345e-05	0.8716945630482972	8.530334182823144e-05	0.8677804049592858	0.0016998779321038	0.93379219718904	-7.684651959597384e-06	0.9491731335364786	1.2182970848065377e-05	0.944934850416384	1.6278303804926687e-05	0.9657501766819584	-7.73262565135447e-08	0.9653670285285864	1.225524655480946e-07	0.96111857302798	-2.391870937943322e-05	0.9456381259892038	5.1961334169113536e-05	0.9414546825255136	PIK3C2A	22793	NUCB2	22961	RPS13	107478	False	False	False	ref	-45	0.0386	-50	0.03192
448	chr11	17188885	T	C	rs615358	0.0508272660999999	0.2931343861999611	0.0508272660999999	0.2964299846479221	0.0392940540334158	0.1140698179433803	0.0021073822471405	0.1965277851580023	0.0021073822471405	0.1987519448815548	0.2340099303883078	0.1490181596159312	0.0115848724208868	0.151255587485898	0.0115848724208868	0.1537844519609739	0.0090874760773589	0.0836062212667735	0.0004737831636666	0.1122036362050847	0.0004737831636666	0.113915895194676	0.0157170664115336	0.1449372328905685	0.0157170664115336	0.1471247944831577	PIK3C2A	19101	NUCB2	19269	RPS13	111170	False	False	False	alt	55	0.0562	50	0.455
449	chr11	17188934	G	A	rs615424	-0.1866146859999999	0.0341894508213363	0.1866146859999999	0.0338748866899454	0.0419501404297882	0.0961444371100955	-0.0083565886041673	0.0340324409434111	0.0083565886041673	0.0337065778074619	0.2302530434495727	0.1518678676049144	-0.0414302052673807	0.0391511522276666	0.0414302052673807	0.0384248166620049	0.0094919902296782	0.0793587493012944	-0.0018398710758554	0.0313350885643132	0.0018398710758554	0.0308098773060871	-0.0553841839596185	0.019489191331434	0.0553841839596185	0.0192103134633045	PIK3C2A	19052	NUCB2	19220	RPS13	111219	False	False	False	ref	15	0.001587	0	0.0
450	chr11	19291073	A	G	rs2553965	0.0064154695999999	0.3299058337360186	0.0448800475999999	0.3308160521246422	0.023194472058483	0.3771013253386488	-0.0003575016082132	0.3125846840397668	0.0013262554740296	0.3137130434382822	0.0191836297053874	0.6333504771160973	-0.0003029975617794	0.5284746347437539	0.0009552887259028	0.5289391834249286	0.0005129889509453	0.6028023307170328	-2.172416574516028e-05	0.4955832788708358	3.365218984248893e-05	0.4959681575074154	-0.0008074626373263	0.4807365480949176	0.0029683943122958	0.4811546831739695	E2F8	49453	NAV2	59652	CSRP3	80502	False	False	False	alt	95	0.0957	-45	0.03458
451	chr11	19300107	C	T	rs712017	-0.06681301148	0.2044008083325797	0.06934227852	0.2022876453463344	0.0811899090868889	0.0105504061345335	-0.0046890611884875	0.0669643233177558	0.0049848953985276	0.0667453801905859	0.0994523440335191	0.3083812578076154	-0.0067295434255812	0.2257947106177992	0.0070136906517493	0.2233890067642396	0.0083349271549959	0.1006226847898545	-0.000481542905901	0.1088669327438626	0.0005147780167103	0.107682018916436	-0.0122859687902081	0.1796323716424411	0.0129012569694169	0.177572166675702	NAV2	50618	E2F8	58487	CSRP3	89536	False	True	False	ref	-95	0.01895	-90	0.2389
452	chr11	19300979	T	C	rs813212	0.0021487611	0.6196925659221989	0.0177081063	0.6207163053538022	0.0361108261622006	0.1431292945378126	0.0001131484161895	0.4416783705671828	0.0006421488161156	0.4429384715781999	0.0183291544323842	0.6406419433663939	-8.08579786118615e-05	0.6838397884575619	0.0002625236796205	0.6844659696758895	0.0006489129954859	0.5333587051911627	-2.318312692755012e-06	0.5950038422887657	9.323936715031108e-06	0.5957571802831374	-0.0002490844907789	0.6710705794842369	0.0009006631255978	0.6715648116059898	NAV2	49746	E2F8	59359	CSRP3	90408	False	False	False	alt	50	0.00783	55	0.0881
453	chr11	19302550	T	C	rs1087110	0.0850881788	0.1359233664735269	0.0850881788	0.1379933015880685	0.0185921501930677	0.5346274409254118	0.001619267370154	0.2105618288308111	0.001619267370154	0.21338971325809	0.0022846491372768	0.918374118558248	0.0002086666560502	0.7208233067845133	0.0002086666560502	0.7273121128340033	4.474683547106449e-05	0.909098060573252	4.125319094453124e-06	0.7119249106481934	4.125319094453124e-06	0.7184188485783928	0.0006911682227573	0.715412459148498	0.0006911682227573	0.7219330939452896	NAV2	48175	E2F8	60930	CSRP3	91979	False	False	False	alt	-65	0.01971	75	0.2485
454	chr11	19307579	C	A	rs1698887	0.212338374	0.0203522623447465	0.212338374	0.0204828367468253	0.0710974141221525	0.0166446378065565	0.0151479014895182	0.010214078364921	0.0151479014895182	0.0102732456799876	0.2019935007093133	0.193945162366435	0.046358726665236	0.0392597843885575	0.046358726665236	0.0398076464740439	0.0143270961152494	0.0524457018475242	0.0032849443382344	0.019305436152294	0.0032849443382344	0.0194749053238176	0.0542723763650159	0.0210156249603193	0.0542723763650159	0.0212203745974223	NAV2	43146	E2F8	65959	CSRP3	97008	False	True	False	alt	100	0.06537	95	0.1272
455	chr11	19311710	T	C	rs11025099	0.129076948	0.0632240309689908	0.129076948	0.0639406981968383	0.0254495986143823	0.3169651223656238	0.0033411940777291	0.0950036970090636	0.0033411940777291	0.096104223552193	0.5003282636666556	0.0436656513227639	0.063703258153191	0.0183137735632115	0.063703258153191	0.0186288841087327	0.0126527410675781	0.0523324134139893	0.001635670702951	0.0298406829742311	0.001635670702951	0.0303323173093902	0.0414090594173731	0.030238200564141	0.0414090594173731	0.030666993096547	NAV2	39015	E2F8	70090	CSRP3	101139	True	False	False	alt	-100	1.407	-90	0.8784
456	chr11	19314074	C	T	rs10833094	0.0713283369999999	0.1772083769454971	0.0713283369999999	0.1799413201690964	0.028861240683067	0.2457948810426315	0.0019994738024507	0.1687583197025006	0.0019994738024507	0.171108653849985	0.005742139817228	0.822284750929266	0.0004251780910635	0.6205587906263156	0.0004251780910635	0.6267652602949789	0.0001657143771497	0.7630430046905825	1.2072277472764436e-05	0.5643852973533926	1.2072277472764436e-05	0.5703844879216462	0.0014879086800171	0.5850545899113279	0.0014879086800171	0.5911311635395755	NAV2	36651	E2F8	72454	CSRP3	103503	False	False	False	alt	-75	0.067	50	0.2367
457	chr11	19321010	G	A	rs57208920	-0.0877764399999999	0.1400478528624402	0.0877764399999999	0.1382747269153937	0.0333610450809214	0.1779666574003592	-0.0032605137919318	0.1184675131159798	0.0032605137919318	0.1172106342945223	0.03164445250899	0.5551387249030665	-0.0038772094360976	0.3397465015639412	0.0038772094360976	0.3351061250417852	0.0012339165094031	0.4482450317352565	-0.0001587568246331	0.275249134960592	0.0001587568246331	0.2713839153103773	-0.0089340503447592	0.264264884203623	0.0089340503447592	0.2604766661871507	NAV2	29715	E2F8	79390	CSRP3	110439	False	False	False	ref	95	0.12445	75	0.1466
458	chr11	19321717	C	A	rs10766541	0.01199358822	0.7102757048072333	0.01289045206	0.7151595746948558	0.0124170106022823	0.8030314259332103	0.0001521800063616	0.7685488501628287	0.0001628891526956	0.7732610527864977	0.0100936953581207	0.7525273664549571	0.000101204696579	0.7883212533196253	0.0001039601465398	0.7928934973761254	0.0001246748816375	0.8046678064476386	1.2152440843121194e-06	0.8204296103630749	1.248145976442044e-06	0.8249131757953425	0.0003769258684965	0.7795290500602204	0.000385173699317	0.7841541970369137	NAV2	29008	E2F8	80097	CSRP3	111146	False	False	False	alt	-75	0.05194	-75	0.2272
459	chr11	19323784	G	A	rs7940014	0.04065840394	0.3534262787303619	0.04172943886	0.3570148521331895	0.0284223879322959	0.2545837523470133	0.0012261643891255	0.3055878026977552	0.0012586677289777	0.3083816757880024	0.0112022038203952	0.7161773026037238	0.0006198839773756	0.6076402412496794	0.0006259306552321	0.6118628847382555	0.0003482014035074	0.6472021413482223	2.0748383152821176e-05	0.5499149822615879	2.093188531481504e-05	0.5541322153164645	0.0019819537461647	0.5639282625822669	0.0020099963709544	0.5680232290627879	NAV2	26941	E2F8	82164	CSRP3	113213	False	False	False	alt	70	0.02362	15	0.0346
460	chr11	19332728	G	A	rs4757792	-0.0481952643999999	0.3039516600629273	0.0481952643999999	0.3002981919322128	0.0159064478484578	0.6357581418583451	-0.0008763069040279	0.3862991056640907	0.0008763069040279	0.3817760711327805	0.0052736630266239	0.8259457194264033	-0.0003333364359237	0.6906578232872516	0.0003333364359237	0.6839249014652333	9.589595704301452e-05	0.8328403013598195	-6.870435852907976e-06	0.6958960990573508	6.870435852907976e-06	0.6892468266458887	-0.0012396489723202	0.6553004212718552	0.0012396489723202	0.6485659808886397	NAV2	17997	E2F8	91108	CSRP3	122157	False	False	False	ref	50	0.01128	5	0.01862
461	chr11	24360352	A	G	rs17234749	-0.0135625375999999	0.6501849792463089	0.0176417548	0.6461705526016724	0.0209073954918369	0.4503982646010409	-0.0002758251174147	0.6034392893878352	0.0003642839049004	0.5995350147163365	0.0053124278314802	0.8184897551226112	-9.827761636890408e-05	0.8019337342393213	0.0001064196319413	0.7980330662258722	0.0001125675958632	0.7987336083726461	-2.075143910850352e-06	0.7817436218311707	2.2517054443821705e-06	0.7778922492697533	-0.0003826993500708	0.784331696742643	0.0004173402395169	0.7804604745438768	LUZP2	136619	CCDC179	1499878	SVIP	1530053	False	False	False	ref	-90	0.011406	-40	0.06274
462	chr11	24366037	C	T	rs1025883	0.00921343082	0.7535979449357697	0.01059765826	0.758242008527259	0.0138684588872903	0.7306588827288811	0.0001402719761484	0.7695396701095657	0.0001559315318887	0.7740590706659382	0.0238980898023819	0.6020426201266379	0.0002720126904008	0.6836131104188854	0.0002917581735877	0.6879506313676613	0.0003449886605009	0.6543486775795705	4.138060106278155e-06	0.7097725839296192	4.361437771588302e-06	0.714180856223775	0.0007983900234238	0.6812869956467132	0.0008726205008082	0.6855864916633848	LUZP2	130934	CCDC179	1505563	SVIP	1535738	False	False	False	alt	100	0.00836	95	0.1533
463	chr11	24367332	A	T	rs11027838	-0.1061456705999999	0.1000183134082981	0.1061456705999999	0.098641668574097	0.0226254534834694	0.3947455163176744	-0.0025506099017728	0.1456344682165467	0.0025506099017728	0.1437310811907325	0.1616574840816865	0.2130244056416534	-0.0176059424361038	0.1004942908592381	0.0176059424361038	0.0986059621873071	0.0037224802757814	0.2085135167268999	-0.0004307856706028	0.1150422738921851	0.0004307856706028	0.1130877122605514	-0.0281605687704133	0.0632465507573661	0.0281605687704133	0.0621186176176478	LUZP2	129639	CCDC179	1506858	SVIP	1537033	False	False	False	ref	-90	0.1422	90	0.0376
464	chr11	24373675	T	C	rs72875837	0.119396374	0.0736051787228384	0.119396374	0.0746462962145307	0.0306277502655811	0.2149175745044874	0.0035865888629669	0.0838264674251461	0.0035865888629669	0.0848492700396238	0.2374649467190128	0.1459731689676113	0.0287460089828726	0.0550797188395733	0.0287460089828726	0.0562588334469326	0.0072418308865064	0.1098831768501429	0.0008611203538356	0.0558767569308201	0.0008611203538356	0.0569361276441846	0.0378369238890171	0.0351558052430129	0.0378369238890171	0.0357631952409254	LUZP2	123296	CCDC179	1513201	SVIP	1543376	False	False	False	alt	-60	0.01685	-60	0.09424
465	chr11	24374405	G	T	rs1470279	0.0204848252	0.4659782545165606	0.0306412324	0.4693481663392571	0.0253122822413738	0.3229084582128423	0.0005746689237007	0.4030882307061342	0.0008309160212331	0.4055578418163209	0.0017815314572267	0.9344052037451048	4.6304341961728285e-05	0.8542733127081418	6.0712494444713855e-05	0.8586334858031225	4.570261742588914e-05	0.899479226192849	1.2727580153344124e-06	0.8161299136768231	1.6362770412292284e-06	0.8202333637289125	0.0001855761934611	0.8328408980161863	0.000251558840025	0.8371895832813485	LUZP2	122566	CCDC179	1513931	SVIP	1544106	False	False	False	alt	-85	0.004868	90	0.2222
466	chr11	24375679	T	C	rs35846200	0.0447765114	0.270943096418951	0.054063115	0.2725433552026091	0.0175890076022622	0.5779680064404712	0.0006674021360057	0.3798906696299189	0.0008532692007587	0.3821389425683651	0.0659917191778561	0.3997506380548832	0.0023052097721073	0.3450090936182294	0.0029491398922774	0.3469942944132987	0.0013059626196771	0.4226719926879094	3.358525202621968e-05	0.3762952603609562	4.808993436047572e-05	0.3780774595622292	0.0058716307611098	0.2941666193615899	0.0071714888984196	0.2962166759149968	LUZP2	121292	CCDC179	1515205	SVIP	1545380	False	False	False	alt	-10	0.00711	-100	0.11743
467	chr11	24384375	A	C	rs11027859	0.0463703698	0.3023482701077977	0.0463703698	0.3068576389486983	0.0123465609752186	0.8027176496277678	0.0005958589916583	0.4539395438850601	0.0005958589916583	0.4593491121553438	0.0191803305730592	0.621695374246918	0.0008432538673778	0.4939044724617772	0.0008432538673778	0.4995726516301616	0.0002404088915586	0.691658601310335	1.0911589939499854e-05	0.5561624855680602	1.0911589939499854e-05	0.562244952036124	0.0028125103097884	0.4472459135697562	0.0028125103097884	0.4528573399494069	LUZP2	112596	CCDC179	1523901	SVIP	1554076	False	False	False	alt	15	0.005554	15	0.0625
468	chr11	24533602	G	A	rs11027983	0.0124045324	0.6279371147312248	0.0185196984	0.6301423436828124	0.0158149122727937	0.6489603933701181	0.0002002792410338	0.6540946171316221	0.0002990070354348	0.6561091484954062	0.0603666985582791	0.4015370441395336	0.0006895260584815	0.4739838913237273	0.0011033737014397	0.4751844703463195	0.0009628329159851	0.4467817033347946	1.1291629538790095e-05	0.5040019463319119	1.7944781283109195e-05	0.5053927378798146	0.0017378179538781	0.466480272241164	0.0027654976741116	0.4680116411623241	LUZP2	36631	ANO3	1655241	CCDC179	1673128	False	False	False	alt	100	0.01146	15	0.02496
469	chr11	24544101	C	T	rs1396844	-0.238199474	0.0197089021043869	0.238199474	0.0195668605412135	0.0439769463920384	0.0881472980288616	-0.0124141183062607	0.0230202506774413	0.0124141183062607	0.0228941759691237	0.0528784929563524	0.4515949517315291	-0.0161397095607227	0.1334035479220859	0.0161397095607227	0.1312589349913184	0.0028420916011872	0.2952020620667022	-0.000936838388747	0.0888868931406501	0.000936838388747	0.0876461786705361	-0.029089274520801	0.0710972991328992	0.029089274520801	0.0702782559015695	LUZP2	47130	ANO3	1644742	CCDC179	1683627	False	True	False	ref	-40	0.01355	-40	0.1343
470	chr11	24547843	A	G	rs11028002	0.0145591796	0.6839024064628982	0.0145591796	0.6905545490316063	0.0117431167396291	0.8422795580606202	0.0001667146736428	0.7625128723230152	0.0001667146736428	0.7691204644991751	0.0723714163175084	0.381144059243667	0.001075791621031	0.4814465675318395	0.001075791621031	0.4867410719420978	0.0009029547586899	0.4833865738863394	1.3183076118466475e-05	0.5544388190847357	1.3183076118466475e-05	0.560224335067301	0.002387747022533	0.4874470731561208	0.002387747022533	0.4929467450735591	LUZP2	50872	ANO3	1641000	CCDC179	1687369	False	False	False	alt	100	0.02083	-75	0.0443
471	chr11	24551870	C	T	rs11028007	-0.0296413168	0.484657744629983	0.0296413168	0.4791449375823345	0.0130820932865135	0.7743404138555994	-0.000437741231152	0.5867471024542554	0.000437741231152	0.5810068004543819	0.006359902345683	0.7900891139000201	-0.0002060273437159	0.730288634315722	0.0002060273437159	0.7238288531736191	8.587011381760668e-05	0.8339106481964141	-3.116887000296032e-06	0.7641881639983218	3.116887000296032e-06	0.7575337682586877	-0.0007216851967932	0.7107481294567345	0.0007216851967932	0.7044251004387264	LUZP2	54899	ANO3	1636973	CCDC179	1691396	False	False	False	ref	100	0.02429	85	0.0689
472	chr11	24551903	T	C	rs10834383	0.0618670684	0.2329241730326531	0.0618670684	0.2359925436378733	0.0126251372921564	0.7912240172967612	0.0008178194125173	0.3994245267391499	0.0008178194125173	0.4042264617920967	0.0077372900927055	0.764160603452282	0.0005440622921873	0.5891117833261178	0.0005440622921873	0.5950038561279343	9.707581122371508e-05	0.8148717675651809	7.104472158353948e-06	0.6421648767320264	7.104472158353948e-06	0.6485169580248132	0.0017642110125036	0.5521612894317004	0.0017642110125036	0.5578307769829225	LUZP2	54932	ANO3	1636940	CCDC179	1691429	False	False	False	alt	95	0.02405	55	0.02979
473	chr11	24558404	A	G	rs1509611	-0.00487935266	0.8477917131977777	0.00692403934	0.8438132280209254	0.0087429947145493	0.9423437669547496	-3.928387557917728e-05	0.9197025624786768	5.518831311200059e-05	0.9156852201020632	0.1379754874468014	0.2424931215450467	-0.000845291579041	0.4914886990895857	0.0010277119525378	0.4882227902716292	0.0012015350976336	0.4093592263193435	-6.749472211701471e-06	0.6121224126527545	8.168415011283714e-06	0.6086798267887503	-0.0013724390485301	0.5420144737660074	0.0018524628022829	0.5385475788226184	LUZP2	61433	ANO3	1630439	CCDC179	1697930	False	False	False	ref	-100	0.07855	55	0.05573
474	chr11	24559498	A	G	rs11028012	0.0896941355999999	0.1347767390619919	0.0896941355999999	0.1364439917450273	0.0191004885849353	0.5158120553546678	0.00187575539546	0.2054289973160038	0.00187575539546	0.2078555483257815	0.0125754676520075	0.7020035323995335	0.0013223104966477	0.4634006893497933	0.0013223104966477	0.4688266584612339	0.000255464242358	0.6945318655377657	2.7905552256567098e-05	0.4630333162419927	2.7905552256567098e-05	0.4687825135264489	0.0039507109630166	0.4053674851330412	0.0039507109630166	0.4107341821147293	LUZP2	62527	ANO3	1629345	CCDC179	1699024	False	False	False	alt	-30	0.01175	65	0.01704
475	chr11	24562187	A	G	rs1509615	0.0139634804	0.6598776245140795	0.016843626	0.6639037930505854	0.0133577936084202	0.7543176261108682	0.0001909904349626	0.7134551287123878	0.000232387084175	0.7175929926848109	0.0006870443073471	0.9814247995804832	1.178894720060633e-05	0.94736284138029	1.3855628174641802e-05	0.9516961975369383	9.686859907711396e-06	0.9834461478358306	1.737818371493029e-07	0.9506940585992204	2.03486469803078e-07	0.954954036513202	3.87648048563119e-05	0.9482230740171128	4.70126356768061e-05	0.952573573134092	LUZP2	65216	ANO3	1626656	CCDC179	1701713	False	False	False	alt	-15	0.00928	-60	0.07715
476	chr11	24562296	C	T	rs6484058	0.001264081	0.8885018359274711	0.0045877338399999	0.8905138354141049	0.03857012963461	0.122678889652066	6.946662189829853e-05	0.7544801087442382	0.0001708685690383	0.7567548575073996	0.0007348817261059	0.9785752330017576	4.318617174684497e-07	0.9789583454194106	3.705882353191713e-06	0.9814644896379956	2.8069276271242088e-05	0.931980211023838	3.614130299256281e-08	0.9570627377853324	1.3420791324459332e-07	0.9588275543287446	2.474349246148297e-06	0.974058246332032	1.8970010887136658e-05	0.9757806899250996	LUZP2	65325	ANO3	1626547	CCDC179	1701822	False	False	False	alt	-100	0.0807	50	0.05237
477	chr11	24562993	A	G	rs11028020	0.1180455972	0.0745224968349702	0.1180455972	0.0755200917770441	0.0306456802012316	0.2151639621021623	0.0035679266948391	0.0844174389730291	0.0035679266948391	0.0855091931160578	0.0912243080069941	0.34044015394357	0.0117703508366187	0.1526254851465473	0.0117703508366187	0.1555062349502523	0.0028457941425433	0.2758017393828853	0.0003650359892792	0.136732605495439	0.0003650359892792	0.1391933826125535	0.020745768862789	0.0977543792660507	0.020745768862789	0.0996610184618497	LUZP2	66022	ANO3	1625850	CCDC179	1702519	False	False	False	alt	-50	0.00659	100	0.2451
478	chr11	24563411	T	C	rs34167424	-0.0155246008	0.6864520093560538	0.0155246008	0.6800708041842916	0.0282951930569013	0.2570331692666384	-0.0004524489580123	0.5525773166959194	0.0004524489580123	0.5464671212265556	0.0647504206393718	0.4034925010043783	-0.0011082591096921	0.4997765157062208	0.0011082591096921	0.4940648668984598	0.0018739942197753	0.3458900758846668	-3.2671571037253134e-05	0.4474480215135624	3.2671571037253134e-05	0.4420632104391686	-0.0023580548315792	0.5078885563265886	0.0023580548315792	0.5021830062255417	LUZP2	66440	ANO3	1625432	CCDC179	1702937	False	False	False	ref	55	0.01166	-95	0.01511
479	chr11	24569034	G	A	rs1876822	0.0154252563999999	0.579586686691934	0.0204772827999999	0.5841433134399787	0.029445314803295	0.2343032842280014	0.0004540983936466	0.4511425303639221	0.0006008905336554	0.4551677005997231	0.0082379334235095	0.7593123262437236	0.0001527119132968	0.7213326976616707	0.0001905050239632	0.7257623263929268	0.0002470926258379	0.6876870674259725	4.631670099394091e-06	0.6601590689003721	5.72979017946415e-06	0.6644638031690914	0.0005880703375012	0.6961593591651706	0.0007381808584341	0.700612064252421	LUZP2	72063	ANO3	1619809	CCDC179	1708560	False	False	False	alt	100	0.015564	90	0.03015
480	chr11	24572012	T	G	rs1509588	0.0548881230359999	0.2676519768985612	0.0550180877639999	0.2701986137944748	0.0296226818699735	0.2322021085681542	0.0017314261110601	0.2359344731446822	0.0017348297981859	0.2380143995017302	0.037768466893207	0.4955220321670273	0.0025323390164854	0.4022993261551519	0.0025360092947967	0.406557821549583	0.001142567503022	0.4215628715411975	8.019863061871744e-05	0.3531315009627258	8.029475269254263e-05	0.3569314241329945	0.0065496024545544	0.333361766919666	0.0065545511530467	0.3372808900445193	LUZP2	75041	ANO3	1616831	CCDC179	1711538	False	False	False	alt	80	0.00196	100	0.1453
481	chr11	24572793	T	G	rs10834390	0.0252885356999999	0.5118747229018763	0.0252885356999999	0.5176244099006769	0.0154071555117214	0.6731306286002359	0.0003953662151901	0.57195060082063	0.0003953662151901	0.5781614348307575	0.0647141301837616	0.3864060449336876	0.0016675234085198	0.4171638593801282	0.0016675234085198	0.4224363166459882	0.0009793233732255	0.4412063724934958	2.5403546305554584e-05	0.4571990838621534	2.5403546305554584e-05	0.4629021458458333	0.0040340140543036	0.3951849697093305	0.0040340140543036	0.4005377257662129	LUZP2	75822	ANO3	1616050	CCDC179	1712319	False	False	False	alt	-60	0.0396	-100	0.1432
482	chr11	24573550	A	G	rs10767214	-0.0278602105999999	0.4806537703411541	0.0312497833999999	0.4773812900011069	0.0208970353525599	0.4521240776741458	-0.0007228540820186	0.4592852944602162	0.0007832367897651	0.4564066326186043	0.0017897792880471	0.9322343947202122	-5.889709469846512e-05	0.8658799267698181	6.293682663339919e-05	0.8619706618496797	3.8593119901645166e-05	0.9159855758612266	-1.526423862973684e-06	0.8418569417334749	1.598388671701331e-06	0.8379648352738392	-0.0001888753257892	0.8667039631535772	0.0002086701197584	0.8628776101660313	LUZP2	76579	ANO3	1615293	CCDC179	1713076	False	False	False	ref	85	0.01048	90	0.02798
483	chr11	24578643	C	A	rs7118822	-0.0682120381999999	0.2009524189046698	0.0682120381999999	0.1984608525132443	0.0153282149946274	0.6734420538201559	-0.0011085960188311	0.3163578124139652	0.0011085960188311	0.3124455733694696	0.0029518986506548	0.8840680762164752	-0.0001870405846448	0.7296044237347467	0.0001870405846448	0.7232097287335618	4.4325440532836365e-05	0.897995751805672	-3.0336522976495632e-06	0.7436566909212988	3.0336522976495632e-06	0.7371773042324614	-0.0006474547194087	0.7234322847504633	0.0006474547194087	0.7170040749946063	LUZP2	81672	ANO3	1610200	CCDC179	1718169	False	False	False	ref	65	0.04324	15	0.0511
484	chr11	24580180	C	T	rs1396842	-0.14408724	0.0515662386591506	0.14408724	0.0508883111526152	0.0365316586875198	0.1386443554038736	-0.0053358715697428	0.0521230825912704	0.0053358715697428	0.0515476351813479	0.1164824651116755	0.2747949126856175	-0.0179680910073732	0.0995085502167289	0.0179680910073732	0.0974611789078384	0.004342842147298	0.1867249586850551	-0.0006800335447729	0.0792153764141368	0.0006800335447729	0.0777097365692903	-0.0314588763155289	0.0524682817703175	0.0314588763155289	0.0514618349957795	LUZP2	83209	ANO3	1608663	CCDC179	1719706	False	False	False	ref	100	0.05386	85	0.168
485	chr11	27999359	A	G	rs7113337	0.01495338728	0.6254845953737775	0.01787283888	0.6297712276129263	0.0878302749648671	0.0079015264120524	0.0014404880435225	0.238332675756138	0.0016362182588782	0.239945037089413	0.0649632146745405	0.3909991070738168	0.0012511368297781	0.4639718473063727	0.0013459604918575	0.4678377842693511	0.0058915238842437	0.1429709895275777	0.0001171521502873	0.2605188595665013	0.0001235094594166	0.2631918383328812	0.0028982877503216	0.4524337365388493	0.0031737652997261	0.4564618522059665	KIF18A	108797	METTL15	108890	BDNF	277301	False	True	True	alt	100	0.0984	95	0.11615
486	chr11	28011926	G	A	rs11606190	-0.065390125	0.2101575378814787	0.065390125	0.2072250686399704	0.0296258076463463	0.2310054807423734	-0.0019305441453235	0.1836725769108968	0.0019305441453235	0.1812775009245285	0.0071846854277324	0.7796173471218336	-0.0003947373617177	0.6183066332011908	0.0003947373617177	0.6124371541810986	0.0002099838725154	0.7115527271437714	-1.156419390795962e-05	0.5541988566395893	1.156419390795962e-05	0.5484090404163187	-0.0013889347101711	0.5899564966964737	0.0013889347101711	0.5839137133750354	KIF18A	96230	METTL15	96323	BDNF	289868	False	False	False	ref	65	0.004913	35	0.0227
487	chr11	28023872	T	C	rs12273233	-0.0268683471	0.5090366411996539	0.0268683471	0.5029433928763841	0.0328555604850788	0.1803655612822817	-0.0008818219939574	0.3667676433287268	0.0008818219939574	0.3621165338782859	0.0013377981590841	0.9507546221477288	-4.077909464317483e-05	0.8859032211262619	4.077909464317483e-05	0.8789660092459805	4.4052582532403206e-05	0.8972395199719798	-1.3314636496783775e-06	0.8275681313528415	1.3314636496783775e-06	0.8207365921583984	-0.000151760087097	0.8858801536711143	0.000151760087097	0.8790163519578299	KIF18A	84284	METTL15	84377	BDNF	301814	False	False	False	ref	35	0.00538	-30	0.02148
488	chr11	28023971	C	T	rs12292666	0.0099075849	0.7714045272369311	0.0099075849	0.7783045056049658	0.0170304013206155	0.5986620627536152	0.0001712987755281	0.7531127219047085	0.0001712987755281	0.7597364609263396	0.0014606908383094	0.9449564786913244	1.38409929819966e-05	0.9332028142398558	1.38409929819966e-05	0.9401541921989024	2.429308912417531e-05	0.9438249485636524	2.339998070826255e-07	0.92900287768241	2.339998070826255e-07	0.9359445087167866	6.103394807165711e-05	0.9265514363616056	6.103394807165711e-05	0.9334985133361816	KIF18A	84185	METTL15	84278	BDNF	301913	False	False	False	alt	100	0.014046	-40	0.0852
489	chr11	28040712	G	T	rs12278238	-0.0722278852	0.1878902904837714	0.0722278852	0.1852479131371508	0.0248411178654416	0.3362315196093823	-0.0019221884437004	0.1981479157322999	0.0019221884437004	0.1955532261651975	0.1024331100920457	0.3297561439100514	-0.0071984563417152	0.2193520134513538	0.0071984563417152	0.2158163868410224	0.0024564487499223	0.3061572674314488	-0.0001924545388902	0.2135486140606358	0.0001924545388902	0.210237109470897	-0.013169311471083	0.1731604444273959	0.013169311471083	0.1704287342695438	KIF18A	67444	METTL15	67537	BDNF	318654	False	False	False	ref	-100	0.1284	-100	0.2515
490	chr11	28115278	G	A	rs113123159	0.0343595332	0.4047741984818264	0.0343595332	0.4102896887488989	0.0547811025916086	0.043559663170431	0.0018266765790356	0.1820588466992057	0.0018266765790356	0.1846362916884909	0.0005204381247731	0.9859645770270004	1.8004000680741432e-05	0.9211197000250836	1.8004000680741432e-05	0.928177152264908	2.633288008036137e-05	0.93909300712377	8.915816408833287e-07	0.8428009878610424	8.915816408833287e-07	0.8499069950544449	7.175612813829801e-05	0.9220092821762688	7.175612813829801e-05	0.929054831365142	METTL15	7029	KIF18A	7122	BDNF	393220	False	False	False	alt	-95	0.0592	-100	0.0664
491	chr11	28144957	C	T	rs17244352	0.0034961268	0.5663803008176591	0.021684506	0.5677608514847565	0.0122582273297753	0.8181992274576638	1.99405889811566e-05	0.6818968612068633	0.0002488889830275	0.6828935055475601	0.021979644353535	0.6230774046689986	0.0001706765167751	0.6430390443826195	0.000391491211828	0.6447647742416937	0.000266015410159	0.7002902072357514	1.6996389365794358e-06	0.7004527837227073	4.388154280563723e-06	0.7019790680546182	0.0005047672462142	0.6246721698259416	0.0012256276599253	0.62646733330992	METTL15	36708	KIF18A	36801	BDNF	422899	False	False	False	alt	75	0.1702	90	0.1371
492	chr11	28146351	T	G	rs12284362	0.203048818	0.0251165550636207	0.203048818	0.0252949256132331	0.0564319802877926	0.0376938118972006	0.0115026839731857	0.0177331719052907	0.0115026839731857	0.0177583933625922	0.2023192900267229	0.1742159892418545	0.0401511677358605	0.0387178778097726	0.0401511677358605	0.0394616948192333	0.0114134061714311	0.062499602235398	0.002277259059057	0.0225910244009914	0.002277259059057	0.0228941135262415	0.0558559598825508	0.0176600196980037	0.0558559598825508	0.0178856501936035	METTL15	38102	KIF18A	38195	BDNF	424293	True	False	False	alt	100	0.0199	100	0.02148
493	chr11	28198959	G	T	rs11030238	-0.1641831692	0.0417542595689274	0.1641831692	0.0413508592975779	0.0300490760726926	0.2251242274416904	-0.0051427173162837	0.0601850750080581	0.0051427173162837	0.0597059113730141	0.0772392860677641	0.3635550555998111	-0.0139704854176136	0.1321645235597437	0.0139704854176136	0.1297505267744164	0.0023902216396569	0.2945897424862501	-0.0004443716855259	0.1189475803808077	0.0004443716855259	0.1170738352686099	-0.0260128336247566	0.072980210562183	0.0260128336247566	0.0717103897530588	METTL15	90710	KIF18A	90803	BDNF	476901	False	False	False	ref	-65	0.00787	75	0.0083
494	chr11	28211322	T	C	rs11030247	-0.01351213636	0.7257290909203192	0.01351213636	0.7204538256424396	0.0257233264456629	0.3129694384784072	-0.0003492900120477	0.6485152013030763	0.0003492900120477	0.6427461499531152	0.0081389594536636	0.7533397883188433	-0.0001282102515288	0.8014627963043149	0.0001282102515288	0.7958377657721115	0.0002067145144803	0.705958571576927	-3.3091123566120924e-06	0.7698684604071869	3.3091123566120924e-06	0.7634474711896272	-0.0004709511398501	0.7860299450127539	0.0004709511398501	0.7804750359247956	METTL15	103073	KIF18A	103166	BDNF	489264	False	False	False	ref	-100	0.0371	-100	0.2156
495	chr11	28236730	T	C	rs6484357	0.1026896752	0.0958720503472069	0.1026896752	0.097276366901383	0.0243770051371479	0.3462158902711618	0.0025165759122991	0.1285437854891781	0.0025165759122991	0.1302756834781769	0.0001261918115535	0.9994644460359032	1.3860815407253613e-05	0.9399081917053396	1.3860815407253613e-05	0.9469395534637908	3.1151218025533447e-06	0.9978598506589562	3.453497783495764e-07	0.9197051610115824	3.453497783495764e-07	0.9266294245094086	3.1341757117878e-05	0.9570836464826188	3.1341757117878e-05	0.9642374291001256	METTL15	128481	KIF18A	128574	BDNF	514672	False	False	False	alt	90	0.05328	100	0.0813
496	chr11	28364633	G	A	rs11030297	-0.016121712	0.6077092815271712	0.018814584	0.6030417611210239	0.0124725026264163	0.8032307740565173	-0.0001929649740394	0.6990686774290328	0.0002345374940569	0.6945810374110333	0.0008157104681468	0.9740290300195346	-1.470941919189414e-05	0.936583965000601	1.613088171747963e-05	0.9321606416620998	9.968088245275763e-06	0.982381622862601	-1.7892323215526708e-07	0.9481948201021976	2.0086775131597653e-07	0.9436627008313764	-6.763221272803685e-05	0.9332865260489058	6.928177889213571e-05	0.9288360736984824	METTL15	256384	KIF18A	256477	BDNF	642575	False	False	False	ref	-40	0.004776	50	0.02032
497	chr11	28378431	G	A	rs7124325	0.1203802172	0.0790457056268752	0.125400356	0.0795182558297352	0.0309856792039213	0.2100072671412343	0.0044454406565087	0.0924164614551732	0.0045525882883281	0.0929010066247604	0.1999529873643231	0.1760827788023834	0.0224619390557512	0.0796129541806103	0.0234197253923007	0.0807315349034043	0.0060772327540902	0.1356820115205274	0.0008164578387042	0.0758224493915233	0.0008369004092169	0.0766581659200235	0.0338499224703902	0.0488819564486325	0.0352685493715152	0.0492481002907366	METTL15	270182	KIF18A	270275	BDNF	656373	False	False	False	alt	85	0.01111	-100	0.3323
498	chr11	28381745	A	G	rs11030309	-0.01100728862	0.7395210094734996	0.01150699138	0.7347168488762622	0.02080666651396	0.4549782718641543	-0.0002337330908187	0.6886870983489142	0.0002440806782653	0.684027978321877	0.0002919732110454	0.9963440697761516	-2.8195415457045663e-06	0.987653077460522	2.984400097789433e-06	0.9833168627540853	5.987798040712584e-06	0.9932070082388068	-5.9202611963228585e-08	0.9815643350853336	6.261641798962688e-08	0.9772569069138438	-1.1546963148691887e-05	0.9881632069723496	1.1546963148691887e-05	0.9832846384312848	METTL15	273496	KIF18A	273589	BDNF	659687	False	False	False	ref	-35	0.0114	0	0.0
499	chr11	28392721	T	C	rs10835321	0.03344787352	0.4159270593033091	0.03344787352	0.4210005395011384	0.0136378231868993	0.7494489426322193	0.0004942316489662	0.5207521911051058	0.0004942316489662	0.5265672101089277	0.0056695589060076	0.8034211232423782	0.0001903996139831	0.7259076719035399	0.0001903996139831	0.7325331060889838	7.789993987246785e-05	0.8379006302209769	2.833437871752184e-06	0.7507442580299934	2.833437871752184e-06	0.7573237291707541	0.0007736465309623	0.696758069097096	0.0007736465309623	0.7033242954238152	METTL15	284472	KIF18A	284565	BDNF	670663	False	False	False	alt	70	0.01318	-90	0.04736
500	chr11	28395099	A	G	rs4923535	-0.0002489344799999	0.7401531693949508	0.01233690152	0.7431571008735249	0.0146872521488811	0.7064622071229953	-1.4892554176867049e-06	0.7716347926548285	0.0001839522070071	0.7746220337907739	0.003789053478935	0.8564051367633301	-8.183433407482567e-06	0.8719747365129474	5.586477691543743e-05	0.8759328723186315	5.622589101386558e-05	0.8757158081689889	-1.1160479225678305e-07	0.8808881232086107	8.320904200105665e-07	0.8848506131943848	-3.546567252813253e-05	0.8617330296678765	0.0002103196859225	0.8656462775778647	METTL15	286850	KIF18A	286943	BDNF	673041	False	False	False	ref	0	0.0	-60	0.06183
501	chr11	28399518	G	A	rs11030323	-0.0090993896319999	0.8075301985087769	0.0090993896319999	0.8010465981928764	0.009966209776417	0.9133587953938792	-9.65660606523333e-05	0.8759964108772219	9.65660606523333e-05	0.8693902125100211	0.0024867209923789	0.900905241427737	-2.5639996650119865e-05	0.93197835950542	2.5639996650119865e-05	0.9267280509895476	2.476539455633767e-05	0.9405402792941842	-2.574456081873716e-07	0.9515128647770108	2.574456081873716e-07	0.9473335417911192	-0.00010062353601	0.9248638704335108	0.00010062353601	0.9195485434155716	METTL15	291269	KIF18A	291362	BDNF	677460	False	False	False	ref	-45	0.014015	-45	0.02957
502	chr11	28400294	C	T	rs7931626	-0.21864381	0.0188870392042192	0.21864381	0.0187283914937641	0.0361024709694272	0.1427972583718358	-0.0078891157836564	0.0281389292764978	0.0078891157836564	0.0279804918296583	0.1583492791395862	0.221864712115093	-0.0339144353893359	0.0501251583679462	0.0339144353893359	0.0490660176988325	0.0057032303882729	0.1485527603349233	-0.0012197412771158	0.0445639256071642	0.0012197412771158	0.0437684663302352	-0.0500791791758767	0.021353827122397	0.0500791791758767	0.0210309895982024	METTL15	292045	KIF18A	292138	BDNF	678236	False	True	False	ref	85	0.0619	85	0.382
503	chr11	28409823	A	G	rs11030324	-0.0031928793358	0.9208418871334372	0.0036916885358	0.9190571161111988	0.0137848991087673	0.738269562490562	-3.880295800384014e-05	0.9348621975701032	4.5643228425629306e-05	0.9329553131833184	0.0016297713701295	0.939735665949209	-6.306848878870382e-06	0.9725957739023888	7.018587122098741e-06	0.971019111307028	2.125515972516112e-05	0.9534642027190536	-7.472205478613834e-08	0.9775553076277052	8.448226381066347e-08	0.9759681607430336	-2.1444360133284976e-05	0.9758788747240492	2.3093926297383832e-05	0.9730438435967976	METTL15	301574	KIF18A	301667	BDNF	687765	False	False	False	ref	-70	0.00449	75	0.07367
504	chr11	28428661	G	A	rs11030331	0.0894153728	0.1514803748277703	0.0894153728	0.1534635064566543	0.0426997158144097	0.0994351380945309	0.0051290439806541	0.100436102379763	0.0051290439806541	0.1015038672442472	0.0214377618686284	0.6198405342491607	0.0016386514255651	0.436516810292799	0.0016386514255651	0.4419836130403723	0.0008285434857772	0.4967687232164259	9.580286513666804e-05	0.328945640282253	9.580286513666804e-05	0.3335338304441811	0.004557751311405	0.3838317725033754	0.004557751311405	0.3890707482911122	METTL15	320412	KIF18A	320505	BDNF	706603	False	False	False	alt	5	0.00296	-100	0.1193
505	chr11	28434247	C	T	rs4543974	-0.0173859742	0.5245163625902262	0.0253423069999999	0.5208047577704715	0.0100773664898141	0.9110983314946848	-0.000160619245292	0.6849166530524612	0.000253009536708	0.6811905161234018	0.0036620368842993	0.8956104128891824	-7.954087015243317e-05	0.8533456937418251	8.574219509563072e-05	0.849207856348172	3.4955453095115585e-05	0.9312216599519226	-7.426825540713671e-07	0.8900381447272061	8.146933961650796e-07	0.8859438441869594	-0.0002993962587839	0.8452208697528194	0.0003274388835736	0.8410274235297677	METTL15	325998	KIF18A	326091	BDNF	712189	False	False	False	ref	-55	0.011765	65	0.1511
506	chr11	28441017	C	T	rs10767724	-0.0595821236	0.2421551889675949	0.0595821236	0.2389918472102288	0.0179175076991747	0.5592735901981473	-0.0011975399553691	0.3164334937307763	0.0011975399553691	0.3127409950474274	0.0114083995909075	0.7005431972505128	-0.0006858719594619	0.5604976753557726	0.0006858719594619	0.5546132054378266	0.0002067219990347	0.7083403180054869	-1.3890242819947955e-05	0.565700605148487	1.3890242819947955e-05	0.5596466429865777	-0.0022821747880306	0.5177269347187017	0.0022821747880306	0.5120545823060931	METTL15	332768	KIF18A	332861	BDNF	718959	False	False	False	ref	-65	0.01514	-100	0.1044
507	chr11	28447818	T	A	rs10835338	0.0963997284	0.1331268190938772	0.0963997284	0.1347917151023909	0.024356960311816	0.3398753041401374	0.0028152659878633	0.1607857885212613	0.0028152659878633	0.1625895519577021	0.0817442512619181	0.3436102721817874	0.0077685602779447	0.2059020822979521	0.0077685602779447	0.2093029530647406	0.0019550662203496	0.3199635156467174	0.0002288081424919	0.1982863619918431	0.0002288081424919	0.2014054993950558	0.0162515258487017	0.1427678067562529	0.0162515258487017	0.1450883984658283	METTL15	339569	KIF18A	339662	BDNF	725760	False	False	False	alt	-40	0.007996	-15	0.03247
508	chr11	28451163	C	T	rs10767725	-0.05969010488	0.2937595567378758	0.06075287272	0.2914241278895081	0.0171490604422599	0.5795214703249462	-0.0012623871338223	0.3864062578001515	0.0012827456169864	0.3832322323340889	0.0088053841839595	0.7565140865357122	-0.0005408278221825	0.6494239011475874	0.0005463062781244	0.6452681232904238	0.0001517215876159	0.7668242200092299	-1.201443021451546e-05	0.6545223854703592	1.2119376042577343e-05	0.6503180818345121	-0.0015464682788426	0.6258493421723231	0.0015679126389759	0.621683663756463	METTL15	342914	KIF18A	343007	BDNF	729105	False	False	False	ref	-90	0.013985	20	0.05316
509	chr11	28451754	G	T	rs11030341	-0.221546512	0.0189014168779018	0.221546512	0.0187558076332308	0.0614994467341461	0.0285656293942785	-0.0139100334249441	0.0124256920868123	0.0139100334249441	0.0123767386668582	0.1203375012371746	0.2859030035996698	-0.0258521372082994	0.0700728471000847	0.0258521372082994	0.0688842476671069	0.0071629296088748	0.1216853509479235	-0.0015507403186462	0.0364983829565202	0.0015507403186462	0.0360015589421015	-0.0421109498201972	0.0321858086373391	0.0421109498201972	0.0317583114003013	METTL15	343505	KIF18A	343598	BDNF	729696	False	True	False	ref	-90	0.09894	95	0.2129
510	chr11	28452419	C	A	rs7130732	-0.0320040266	0.4561254153682277	0.0320040266	0.450756116287427	0.0232160407047524	0.3796657937390832	-0.0007651308258234	0.4161379755678202	0.0007651308258234	0.4112396749588304	0.1668305235723005	0.2060796808331739	-0.0055066321285909	0.2376536090027074	0.0055066321285909	0.2337512273884004	0.0038935858761737	0.1983760852665985	-0.0001319304686501	0.2349026400705125	0.0001319304686501	0.2312198766542498	-0.008997558642077	0.2330625573074224	0.008997558642077	0.2293103038031889	METTL15	344170	KIF18A	344263	BDNF	730361	False	False	False	ref	-80	0.006775	-50	0.05597
511	chr11	28453859	G	T	rs7105555	0.0803492656	0.1519137038118043	0.0803492656	0.1541150687233506	0.016032676977394	0.6414955279272511	0.001362234155294	0.2603088757835767	0.001362234155294	0.2636436050209674	0.0399929068654943	0.5209608277806429	0.0038779077201731	0.3234592478184523	0.0038779077201731	0.3278389579420899	0.0006264636768398	0.56704523521551	6.322666866159737e-05	0.3701791052888732	6.322666866159737e-05	0.3749623366708386	0.0084573257233347	0.2602075932118583	0.0084573257233347	0.2638366161838374	METTL15	345610	KIF18A	345703	BDNF	731801	False	False	False	alt	40	0.02304	-50	0.0889
512	chr11	28460852	G	A	rs11603115	-0.0569544535999999	0.2579598133997556	0.0602393796	0.2553062410794464	0.0197621736390113	0.4844455290348927	-0.0015812749087114	0.2993885563383788	0.0016210125367341	0.2966886043520255	0.0721660453300781	0.3756927960924908	-0.0061121707919584	0.2812543196598913	0.0062788771813694	0.2784566603209039	0.0017949901828674	0.3740585094687479	-0.0002002724244172	0.2901386282788953	0.0002022890654487	0.2874301060189228	-0.0108846623338062	0.224163502410151	0.0113778826168717	0.2217575536484468	METTL15	352603	KIF18A	352696	BDNF	738794	False	False	False	ref	-75	0.02939	-100	0.05176
513	chr11	28479446	G	A	rs1811450	-0.001108440792	0.7239042238598357	0.0132325253519999	0.7246605433072837	0.010880238770194	0.8636652754526866	-5.681241117535989e-05	0.7862673606334727	0.0001750124139759	0.7869218764808826	0.0337080597802777	0.560696089980207	0.0001877957633434	0.6391756580426008	0.0007023553328004	0.6404855843201781	0.0003781372747139	0.657780951484684	2.104044968519122e-07	0.6969697954322207	8.582793164629621e-06	0.697997846390135	0.0001756787964764	0.6307140468790745	0.0015992543960937	0.6317833182632622	METTL15	371197	KIF18A	371290	BDNF	757388	False	False	False	ref	-70	0.02777	25	0.0632
514	chr11	28488553	G	A	rs2582905	-0.0748188416	0.1710086583368623	0.0748188416	0.1685871810761772	0.0183470924878026	0.5414012170066056	-0.0014042452878907	0.2498717938583617	0.0014042452878907	0.2466058217743275	0.0516932796674474	0.4532945083415405	-0.0038127624155013	0.2979248269813174	0.0038127624155013	0.2935607352532523	0.0010057738663804	0.465521358145099	-7.467560152572409e-05	0.318738645170766	7.467560152572409e-05	0.3142915618249386	-0.0092227244234765	0.2320119615556436	0.0092227244234765	0.2282999629614391	METTL15	380304	KIF18A	380397	BDNF	766495	False	False	False	ref	-5	0.0002441	35	0.014404
515	chr11	28580626	C	A	rs2582895	-0.0442593312	0.3313601599202921	0.0442593312	0.3267618286542312	0.0250555537255497	0.331752133791878	-0.001121178955978	0.3010523986430843	0.001121178955978	0.2970616196109462	0.0054386196430338	0.8263051377056503	-0.0002578082956073	0.7010413994945874	0.0002578082956073	0.6946897081474466	0.000143776477477	0.7808951358723062	-6.864537073423123e-06	0.6576534037219145	6.864537073423123e-06	0.6515826466506787	-0.000886641813203	0.6787145701040822	0.000886641813203	0.6725566752303199	METTL15	472377	KIF18A	472470	BDNF	858568	False	False	False	ref	100	0.033	-85	0.138
516	chr11	28580674	A	G	rs2585817	0.233865058	0.0255725957564989	0.233865058	0.0255348790714621	0.0678145505562532	0.0229029223066654	0.019884312952939	0.0147320761223567	0.019884312952939	0.0148045767738168	0.0191811553561413	0.6605301760654493	0.0079669671831429	0.2819173674228825	0.0079669671831429	0.2860241723405433	0.0016366609060348	0.4248628357521006	0.0007573267125315	0.1577938050511782	0.0007573267125315	0.1603529709963891	0.0132196232390881	0.2210332891562602	0.0132196232390881	0.2243625588486565	METTL15	472425	KIF18A	472518	BDNF	858616	False	False	False	alt	25	0.00762	-70	0.02747
517	chr11	28594152	A	G	rs2582896	-0.012594389806	0.7194805902850891	0.012941552754	0.7145189764001876	0.04347172467781	0.0862270069821789	-0.0005702632482877	0.5058911778254587	0.0005868411941883	0.5016015600445193	0.016023060934974	0.6503340565432335	-0.0001936531875101	0.7470833105921502	0.0001999253365112	0.7424350308129157	0.0007038277368572	0.5071237438198426	-9.088414210771394e-06	0.6394247688682754	9.387925860792109e-06	0.6349254323098344	-0.0006672495133779	0.7362844729033428	0.0006804460426907	0.7316838278939188	METTL15	485903	KIF18A	485996	BDNF	872094	False	False	False	ref	100	0.005978	85	0.0705
518	chr11	28594704	T	C	rs10742196	0.1485805274	0.0622809120577549	0.1485805274	0.0627478917652464	0.0434529128315515	0.0859157420482167	0.0067778421564156	0.0516582679156503	0.0067778421564156	0.0519786209232559	0.0525254857972352	0.4528168836063028	0.0106852561387902	0.1908354313291704	0.0106852561387902	0.193856118490383	0.0023574419816884	0.3086154560006772	0.000488190506247	0.1351344560190576	0.000488190506247	0.137085500216142	0.0206195770512354	0.1173885711669743	0.0206195770512354	0.1190316819707249	METTL15	486455	KIF18A	486548	BDNF	872646	False	False	False	alt	-70	0.02246	-70	0.167
519	chr11	28609701	C	A	rs11030386	-0.1005828738	0.0956244621239684	0.1147512098	0.0950021351125667	0.027108378190618	0.2884750684828482	-0.0034830633994478	0.1172587835407599	0.0037393487056199	0.116771694826272	0.0318811652535382	0.5307200805173553	-0.0042651243073402	0.2981643287683727	0.0045525950714485	0.2951818779943556	0.0009492556960407	0.4721997559837391	-0.0001581207616284	0.2692386111283079	0.0001633207043322	0.2664848736542739	-0.0095072745867836	0.2251699554267347	0.0105184586453762	0.2229645491242806	METTL15	501452	KIF18A	501545	BDNF	887643	False	False	False	ref	100	0.00884	5	0.00757
520	chr11	28619515	G	A	rs12226518	-0.1640833466	0.0517186183580282	0.1640833466	0.0512582249286197	0.0346072771761201	0.1598332425456877	-0.0057307082463445	0.0653181149272794	0.0057307082463445	0.0648174286443179	0.271496321467454	0.1301391596076545	-0.0411473589735559	0.0506863218133075	0.0411473589735559	0.0498533117175861	0.009106095209429	0.0891452896995964	-0.0013803693263668	0.0503834156969713	0.0013803693263668	0.0494826676761122	-0.0477021543334102	0.0322527415542973	0.0477021543334102	0.0319049010631927	METTL15	511266	KIF18A	511359	BDNF	897457	False	False	False	ref	80	0.03394	15	0.05078
521	chr11	28620721	G	A	rs10767732	0.1512157196	0.0589673410477226	0.1512157196	0.0593410990236739	0.0386237323012376	0.1236373281948385	0.0069660655951893	0.0572070824732118	0.0069660655951893	0.0574825863631849	0.0065809442116722	0.80766911295536	0.0012641032148954	0.5104301348936658	0.0012641032148954	0.5160053852726402	0.0003028993875954	0.6955650341951817	6.1677679826671e-05	0.4029519894058654	6.1677679826671e-05	0.4078171529841862	0.0033651149747616	0.4713576284812679	0.0033651149747616	0.4767879642277309	METTL15	512472	KIF18A	512565	BDNF	898663	False	False	False	alt	70	0.01712	-65	0.10333
522	chr11	28621752	T	C	rs10835368	0.274498554	0.0110824506266736	0.274498554	0.0111292889117102	0.0422425000582251	0.0936741675183295	0.0120030456116614	0.0161654587875621	0.0120030456116614	0.0162040475551466	0.4744572927320115	0.0492817412876842	0.1232256450067982	0.0056147243212584	0.1232256450067982	0.005665520519741	0.0195338929104007	0.0240945903321924	0.0052552069924929	0.0073567622620299	0.0052552069924929	0.0073985299290555	0.0869717264359473	0.0060137650220099	0.0869717264359473	0.0060229074180508	METTL15	513503	KIF18A	513596	BDNF	899694	True	True	False	alt	100	0.1604	95	0.7124
523	chr11	28622395	T	C	rs10835373	0.0573423011999999	0.1448211831511005	0.0829837132	0.1460283707388111	0.0245125769240343	0.3415285483719464	0.0017325234394494	0.1689325997368195	0.0021354745258278	0.1701456613655504	0.1961771304147009	0.1797296233494807	0.0097726609862602	0.1034905531734416	0.0152131389640645	0.104579470917765	0.0046137461328987	0.1727072984778133	0.0002883655383921	0.1121172574712996	0.0003738618656089	0.1131784867464545	0.0149912572993302	0.0769487804060489	0.0231021741282042	0.0775928292404209	METTL15	514146	KIF18A	514239	BDNF	900337	False	False	False	alt	-100	0.012726	-65	0.01117
524	chr11	28622565	G	T	rs11030388	0.0362610797	0.3951721932003428	0.0362610797	0.4003177232284416	0.0223105963799552	0.4006707821349626	0.0009139369834634	0.3731305896147476	0.0009139369834634	0.3779443775135754	0.0483248655603575	0.4513556249412869	0.0022234652513081	0.390324499165542	0.0022234652513081	0.3955552019448527	0.0011715198827184	0.425807248603785	5.866819305057828e-05	0.3737923738379944	5.866819305057828e-05	0.3788586864035075	0.0054072778859159	0.345878962885016	0.0054072778859159	0.3510530960112502	METTL15	514316	KIF18A	514409	BDNF	900507	False	False	False	alt	-100	0.0285	-95	0.0561
525	chr11	28624925	C	T	rs4576808	-0.0286245014	0.4928700211408257	0.0286245014	0.4869990705706137	0.0102963331131168	0.8997951401714726	-0.0002955623832986	0.6612227761388626	0.0002955623832986	0.6548374440824343	0.001703177064432	0.9385283613694512	-5.922972232241502e-05	0.871976707291111	5.922972232241502e-05	0.865193475065282	1.834783596590292e-05	0.962992848357359	-6.500807384875137e-07	0.9057421735797346	6.500807384875137e-07	0.8988777737531716	-0.0002004222889379	0.8710438199052957	0.0002004222889379	0.8642919930909627	METTL15	516676	KIF18A	516769	BDNF	902867	False	False	False	ref	100	0.02634	95	0.07355
526	chr11	28632479	C	T	rs4290216	0.0027055449199999	0.6658524152679456	0.01542730092	0.667722794256501	0.016779518595811	0.6143565320083939	1.726236465677999e-05	0.6764487879832691	0.0002523623287134	0.6780778992085593	0.0905207680380059	0.3250856594456036	0.0003459045285052	0.420668853328636	0.0014825381199232	0.4226065758291791	0.0014834996501143	0.3684641480828309	2.510362463607213e-06	0.4504644777488446	2.3779575060952176e-05	0.4522548264184121	0.0007637491339777	0.4323811313173019	0.0031589192042492	0.43426968811133	METTL15	524230	KIF18A	524323	BDNF	910421	False	False	False	alt	20	0.001007	40	0.02954
527	chr11	28633321	G	A	rs7935241	-0.06779976302	0.2272816825658539	0.06779976302	0.2243659624468839	0.0223590309385054	0.4031523933521497	-0.0016859312041348	0.2709265252605835	0.0016859312041348	0.2675011069985034	0.0233405364389165	0.5874829812235673	-0.0019994310213091	0.4507674751480431	0.0019994310213091	0.4453298409099618	0.000532690335922	0.5608620514598445	-5.1263372753219e-05	0.4365580765694428	5.1263372753219e-05	0.431238964623047	-0.0053619148164032	0.3820693091941189	0.0053619148164032	0.3770260194913788	METTL15	525072	KIF18A	525165	BDNF	911263	False	False	False	ref	-70	0.005005	-5	0.008545
528	chr11	28634462	T	G	rs7928893	0.0331970335999999	0.2479582931175761	0.0553277575999999	0.2504694021993029	0.0213117774578132	0.4327883021526337	0.0008899818648003	0.2726962682022421	0.0012108214084181	0.2753289350001131	0.0435073075781069	0.4645707375124325	0.0013545438918607	0.3424989609901954	0.0022557880464735	0.3458492650051327	0.0009007509026126	0.4586075615409173	3.445973872900707e-05	0.3415970964574735	4.7525500718161646e-05	0.3451189498004361	0.0039003991950116	0.2895231202925442	0.0061223648180528	0.2926556332599553	METTL15	526213	KIF18A	526306	BDNF	912404	False	False	False	alt	55	0.006805	-65	0.0556
529	chr11	38894025	G	A	rs7122369	-0.1460986339999999	0.0497076577933267	0.1460986339999999	0.0491480283461778	0.0170895646471637	0.5875567558469617	-0.0025799911663597	0.1347073636343294	0.0025799911663597	0.1330187910675072	0.1180734716769489	0.3034049498193293	-0.017112902833102	0.1258887165565627	0.017112902833102	0.1236880145546202	0.0021664762270204	0.3456324756445839	-0.0003174057160718	0.1693571128183474	0.0003174057160718	0.1666178316882279	-0.0254008445778759	0.0813153593550573	0.0254008445778759	0.0797818961799606	RAG2	2295746	IFTAP	2299655	RAG1	2383652	False	False	False	ref	50	0.01672	-25	0.04346
530	chr11	38895917	T	C	rs11034985	-0.0042015098	0.4620177947561377	0.0307368146	0.4608682096455212	0.1183380347002358	0.0023570365184483	-0.0006854681966078	0.0959787137250796	0.0033806517993542	0.0955711104608403	0.0609885850021443	0.4117876533132009	0.0004173563029479	0.4001594902672326	0.0016863545602185	0.3998962298590759	0.0080737196278316	0.1121812263112544	5.384440077977602e-05	0.1797845005739685	0.000201995411122	0.1793099915191814	0.0005113655108706	0.3792279260875346	0.0040645310283395	0.3788348045587679	RAG2	2297638	IFTAP	2301547	RAG1	2385544	False	True	True	ref	85	0.0232	-65	0.1268
531	chr11	38901131	A	G	rs10837065	-0.0029177442	0.8058399075477631	0.0087308858	0.8044950955764962	0.0192649178500799	0.5129881774113877	-4.762900325220463e-05	0.7699152347066626	0.0001676704065367	0.7685897782186577	0.0608170301210781	0.4093161321097171	-9.822153864942002e-05	0.5858117057261294	0.00046312456956	0.5848080987107398	0.0011364150769875	0.4222202022996884	-1.776240000090865e-06	0.5836517215143068	8.681075746225366e-06	0.5826592194730108	-0.0003158919204249	0.6085626427174725	0.0011819141565767	0.6075173564178276	RAG2	2302852	IFTAP	2306761	RAG1	2390758	False	False	False	ref	5	0.02112	100	0.1179
532	chr11	38901349	G	A	rs10837066	-0.0277463338	0.5040638901665301	0.0277463338	0.4980444219297914	0.0140027733344149	0.729957970488639	-0.0004124257095043	0.5858610608766318	0.0004124257095043	0.5794807055475337	0.02179654250932	0.6101099717066014	-0.0006451594774169	0.5754819630009109	0.0006451594774169	0.5697539000401557	0.000304709043841	0.6621204548652005	-9.383405863052994e-06	0.616110876788228	9.383405863052994e-06	0.6099147769555561	-0.0020174194186928	0.5443073686050345	0.0020174194186928	0.5386436439045575	RAG2	2303070	IFTAP	2306979	RAG1	2390976	False	False	False	ref	-80	0.003662	95	0.0537
533	chr11	38910929	A	C	rs12365929	-0.355611424	0.0055648208886511	0.355611424	0.0055289110719267	0.0601570024627447	0.0303708690936974	-0.0217097664257245	0.0060084067682621	0.0217097664257245	0.0059843750735009	0.1082733990960377	0.2939695792525038	-0.0434873635621171	0.0419561787223491	0.0434873635621171	0.0411312991744345	0.006663053583619	0.1284296853054331	-0.002708693386854	0.023152919772607	0.002708693386854	0.0228017459269619	-0.0640402824057272	0.0147513640499995	0.0640402824057272	0.014587845303011	RAG2	2312650	IFTAP	2316559	RAG1	2400556	False	True	True	ref	45	0.02275	25	0.155
534	chr11	38939996	A	C	rs67617610	-0.0068113827379999	0.7372123729536538	0.0118905891379999	0.7339562567441391	0.0224837138209328	0.3995634636644439	-0.0001796800391257	0.6680087382732779	0.0002791405418364	0.6645334839229159	0.0058732803272738	0.8188441592471036	-1.0498951736314064e-05	0.8768819715669899	4.235814894668205e-05	0.8727840436934415	0.0001241941287601	0.7961862325344741	-2.858546180441401e-07	0.8568551821967622	9.097181685004232e-07	0.8526248628084319	-3.546567252808855e-05	0.8654274801666857	0.0001839266272969	0.8613355191294707	RAG2	2341717	IFTAP	2345626	RAG1	2429623	False	False	False	ref	-15	0.01041	100	0.3574
535	chr11	38944032	G	A	rs10837072	-0.0389206982	0.3824155327986285	0.0389206982	0.3778415087169349	0.0169522958940022	0.6048857800519825	-0.0006465720620208	0.4529000596123949	0.0006465720620208	0.4475231020656632	0.0001088713668305	0.9995943744146922	-5.193003345928458e-06	0.9830600502686598	5.193003345928458e-06	0.9771836489502168	1.8185611772374368e-06	0.9993851335038798	-8.486763716965066e-08	0.9817239896161244	8.486763716965066e-08	0.975711594071115	-9.897396984593051e-06	0.9910846520746988	9.897396984593051e-06	0.9875900464760324	RAG2	2345753	IFTAP	2349662	RAG1	2433659	False	False	False	ref	-10	0.0004883	-100	0.10156
536	chr11	38948510	G	A	rs12277025	0.0163170704	0.6661925904551059	0.0163170704	0.6726872409463235	0.0168359976497508	0.6074863655203873	0.0002705471202444	0.6763305468602464	0.0002705471202444	0.6828625913964073	0.0170012536702846	0.639580988390238	0.000254108736787	0.6738510110887361	0.000254108736787	0.6801588342873633	0.0002803250268038	0.6659858859458778	4.1693681999901965e-06	0.6885120935350206	4.1693681999901965e-06	0.6949419886362747	0.0008247830820493	0.665320779056212	0.0008247830820493	0.6715849316396387	RAG2	2350231	IFTAP	2354140	RAG1	2438137	False	False	False	alt	-5	0.0004883	40	0.02736
537	chr11	38953272	A	T	rs10837077	-0.00217036042	0.9234437454131322	0.00340888762	0.9191812418949232	0.0292900983972186	0.2473451895964332	-3.417761773209141e-05	0.8786583804438599	8.546818566709142e-05	0.8742958463995333	0.016390914189568	0.6526397411057084	-5.555934971398158e-06	0.8772369460365724	4.327031735578068e-05	0.8729704730415077	0.00052907113359	0.5829150428000851	2.0366302047607819e-07	0.8349480372677446	1.358185622063675e-06	0.8308396239771643	-4.0414371020425344e-05	0.8908451657424585	0.0001311405100458	0.8866302193250057	RAG2	2354993	IFTAP	2358902	RAG1	2442899	False	False	False	ref	-10	0.0004044	100	0.0551
538	chr11	38961066	G	A	rs10501212	0.00461668084	0.7556785200150383	0.01110320884	0.7596384458100323	0.0121776354272726	0.8172277235026271	4.19958820890344e-05	0.8176085606756304	0.0001280428856359	0.8216118683956286	0.0054163504998185	0.8140157783025763	-2.085454389732772e-06	0.8457940051099189	6.037554877942723e-05	0.8498763177084514	6.874090122110916e-05	0.8567725091030952	-9.021203723521193e-08	0.872720542325407	7.383640295474145e-07	0.8768964360202824	-3.464088944606184e-05	0.846233889132504	0.0002276401306456	0.8502113899062852	RAG2	2362787	IFTAP	2366696	RAG1	2450693	False	False	False	alt	-100	0.001389	-100	0.0289
539	chr11	38963520	T	C	rs10837082	0.0767692516	0.1632582159521684	0.0767692516	0.1657959365797371	0.018141719662337	0.5527033925102445	0.0014376781432177	0.2409204372766175	0.0014376781432177	0.2442211054849533	0.0232283659397577	0.5775573401940618	0.0017480665083699	0.3823198624801401	0.0017480665083699	0.387380194390382	0.0004163338459091	0.5912477012949738	3.227315705148079e-05	0.3991613694440254	3.227315705148079e-05	0.4045081151175929	0.0051631420936293	0.3232734530273937	0.0051631420936293	0.3281066855594721	RAG2	2365241	IFTAP	2369150	RAG1	2453147	False	False	False	alt	100	0.0677	20	0.03778
540	chr11	38964832	G	A	rs11035025	0.0100804364	0.749145652937532	0.0111772484	0.753555437780646	0.0239587302591717	0.3566948696680064	0.0002442506685855	0.6662905125303353	0.0002706104602448	0.6707572399033139	0.0015464682788426	0.9399747776037304	1.7435084618454118e-05	0.9243753181645292	1.908151480089329e-05	0.9283997053582806	3.728110173501893e-05	0.9107469656743178	4.228588080723657e-07	0.9008823960791148	4.624276286490168e-07	0.9048912140235988	7.75296097126308e-05	0.9228882563297008	7.917917587672957e-05	0.9272672818362474	RAG2	2366553	IFTAP	2370462	RAG1	2454459	False	False	False	alt	100	0.07684	-70	0.05927
541	chr11	38965745	C	A	rs7119965	0.047703101	0.2932696914881652	0.051321205	0.295954231496353	0.0323227709633859	0.1883160276990201	0.0015355148662831	0.2403303945118887	0.0016566143238976	0.2422191905686098	0.0118422354920655	0.6981666636123156	0.0006154785971156	0.5792181902745609	0.0006631951712413	0.5832009228863634	0.0003940738551676	0.6083930950371447	2.057013025066864e-05	0.5044299962878345	2.216722398500181e-05	0.5083458839454263	0.0019613341691135	0.5375610305464256	0.002137837748672	0.5415383834116466	RAG2	2367466	IFTAP	2371375	RAG1	2455372	False	False	False	alt	20	0.06232	10	0.00818
542	chr11	38975206	G	A	rs10768438	-0.1271819388	0.0697781488221948	0.1271819388	0.0688310210185773	0.0250271554172659	0.322937229965842	-0.0033979366795525	0.1034590449812066	0.0033979366795525	0.1022542335588426	0.0282504701263567	0.5472269416071471	-0.0038238335582837	0.2903670738469457	0.0038238335582837	0.2859099696730008	0.0007136262473714	0.5049726778773834	-0.0001017340257791	0.2717812024704905	0.0001017340257791	0.2675974859221009	-0.0097844017023522	0.2177717325936691	0.0097844017023522	0.2139926030061372	RAG2	2376927	IFTAP	2380836	RAG1	2464833	False	False	False	ref	-100	0.05878	5	0.001465
543	chr11	38989193	C	T	rs10837090	0.01538886256	0.646707435505616	0.01724098896	0.651132978398936	0.011272382911258	0.8621438866246071	0.0001723071455308	0.7484827045906144	0.000193368556408	0.7530866756659504	0.0081439081521559	0.7618401709783235	0.0001162673943173	0.7766817972496362	0.0001429851626834	0.7808316974236889	9.202783709776604e-05	0.8249836811576272	1.2992724087083265e-06	0.8193828233377313	1.6030928668269664e-06	0.8236445112409178	0.0004107419748605	0.7700099309733864	0.0004932202830655	0.7742781710319923	RAG2	2390914	IFTAP	2394823	LRRC4C	2470580	False	False	False	alt	0	0.0	-5	0.00998
544	chr11	46373500	T	G	rs200720298	-0.0001135210399999	0.8900133265686011	0.00481547936	0.8892063428241602	0.0210420013185676	0.4468890933079619	-1.1537084324316887e-05	0.8744429737843861	8.56200714050919e-05	0.8737363988840455	0.0910923427138662	0.3241057590458477	7.349577295632456e-05	0.6058434348216413	0.0005756207052681	0.6055040345347186	0.0017361635049856	0.3361842386795451	4.5139118351903857e-07	0.608038375571375	9.601644691238787e-06	0.6075803662603996	0.000117119197651	0.6562978056065568	0.0010953119329615	0.655930141259864	MDK	7257	CHRM4	18276	DGKZ	40594	False	False	False	ref	-80	0.0913	85	0.08386
545	chr11	46375773	A	C	rs3740974	0.0401564258	0.2440347492052568	0.0573661406	0.2460631502504259	0.0286211606278395	0.2506616478379743	0.0012686886638668	0.2116781762798137	0.0017735054451373	0.2130837864667752	0.1518953515225495	0.2312137514946728	0.0082947200116297	0.1685045784688509	0.0100307516094025	0.1705021628195372	0.0044062879478288	0.1882749525994674	0.0002626733094897	0.1536188892830381	0.0003135967501822	0.155322870424209	0.0123470027382797	0.1390361832898971	0.0159743987331331	0.1405217046307048	MDK	4984	CHRM4	16003	DGKZ	42867	False	False	False	alt	-95	0.10004	-40	0.2632
546	chr11	46420976	C	T	rs12283172	0.0668887654	0.2018998715701964	0.0689116238	0.2039491372062644	0.0141189201007296	0.6915052915337236	0.0011659783229429	0.3322914078406676	0.0011857690395922	0.3352948984698934	0.0723664676190161	0.3755085650902919	0.0060496207668234	0.2565653079968955	0.0061404745416228	0.2596191891576908	0.0010531494857062	0.4493440124567012	9.837999235697225e-05	0.3173813400476103	9.926886395072913e-05	0.3209196056097376	0.0121144139091418	0.1948990020464962	0.0123486523044438	0.1973967265460788	CHRM4	29200	MDK	40219	DGKZ	88070	False	False	False	alt	100	0.01898	-40	0.105
547	chr11	46438488	C	T	rs2864076	-0.0521702583999999	0.2881054688029691	0.0521702583999999	0.2843804010849742	0.0188819519070894	0.515855184617708	-0.0010816531412715	0.3351512534799585	0.0010816531412715	0.3308011081747252	0.756340932334796	0.0103558377576792	-0.0402338136230128	0.0434761510570906	0.0402338136230128	0.0427270615795029	0.0142722457577336	0.0431945060655031	-0.0008336508007073	0.0723170631061477	0.0008336508007073	0.071000463207624	-0.0084482531094321	0.2462636114935151	0.0084482531094321	0.2423787193984793	CHRM4	46712	MDK	57731	DGKZ	105582	True	False	False	ref	-95	0.1289	-55	0.1758
548	chr11	46452336	T	G	rs115292163	-0.024388061	0.545038121347044	0.024388061	0.5392151391399286	0.0150837370439566	0.6885009252218346	-0.0003820866856138	0.5948571423788451	0.0003820866856138	0.5887718324389599	0.0255822968559268	0.5755600276648	-0.0007556504200625	0.5602228264201466	0.0007556504200625	0.5545134111381511	0.0004117003546422	0.6159323997882888	-1.2645829905798522e-05	0.5905361330386473	1.2645829905798522e-05	0.5846037479532175	-0.0021592821088053	0.5304123552685259	0.0021592821088053	0.5246794304548509	CHRM4	60560	MDK	71579	DGKZ	119430	False	False	False	ref	-65	0.01364	100	0.01962
549	chr11	46478324	C	T	rs7130141	0.1675359602	0.0426435538918396	0.1675359602	0.0431394311758426	0.0373161641475594	0.1415741738143242	0.0075213521762447	0.0474443561868897	0.0075213521762447	0.0479384349897728	0.0120245125531984	0.7081824682238437	0.0019764729679716	0.3829957522248045	0.0019764729679716	0.3881117254859554	0.0004514424519614	0.5984472755259088	8.485308759976576e-05	0.3013122408273408	8.485308759976576e-05	0.3058196144855461	0.0054344957276235	0.3276139226564568	0.0054344957276235	0.3324972613298833	CHRM4	86548	MDK	97567	AMBRA1	115801	False	False	False	alt	90	0.01373	100	0.07916
550	chr11	46494352	A	G	rs3802888	0.017837975	0.3340633632723604	0.0447135065999999	0.334545287787346	0.0198274280660637	0.4864259465316614	0.000281070605739	0.3687799118419687	0.0008623086215139	0.3693115796986614	0.2169921810563821	0.1614093644041347	0.0048255831242057	0.1675350950164419	0.009267158019062	0.1678702911987323	0.0042868792698078	0.1855239482353456	8.373140470911339e-05	0.1911265985932225	0.0001795198340088	0.1913969497543604	0.0053355217577777	0.1617132028911448	0.0133408663521493	0.1620485263591532	AMBRA1	99773	CHRM4	102576	MDK	113595	False	False	False	alt	-65	0.03467	-85	0.1741
551	chr11	46498752	T	C	rs17197116	-0.0040781849999999	0.4202947280520739	0.0369837426	0.4177633043336533	0.0144593508562579	0.7146303580341609	-6.044487680180021e-06	0.5157529840990486	0.0005937148643139	0.5130285751259247	0.5040826762561446	0.0434935790779263	-0.0016361877871769	0.1060982519390164	0.018031022875436	0.1047771087657228	0.007291532167665	0.1095373120494435	3.0642866557942044e-06	0.1626780597120046	0.0002897360659132	0.1609847071840833	-0.0016512157302629	0.2007615125469136	0.0116789284418197	0.1988407934340147	AMBRA1	95373	CHRM4	106976	MDK	117995	True	False	False	ref	70	0.01953	-50	0.05273
552	chr11	46526544	A	G	rs7932866	0.01744835888	0.6148775915966991	0.01883951276	0.6178699591661077	0.0389219838199272	0.1340750332249636	0.0007752339985282	0.4709325603109972	0.0008412014417399	0.4731596676086058	0.0107073339711655	0.7291024962236407	0.0002419830803476	0.7619361663659516	0.0002504040760439	0.7640787986551852	0.0005228549136388	0.6141918195009988	1.5431580566527106e-05	0.6706470290248625	1.584569037387617e-05	0.6730324851352489	0.000802513938834	0.7475167020565449	0.0008289069974596	0.7498383511856723	AMBRA1	67581	ATG13	90984	HARBI1	91365	False	False	False	alt	100	0.01512	-100	0.3044
553	chr11	46564231	A	G	rs11038919	-0.01174083806	0.7511414368054015	0.01174083806	0.7445732160740958	0.02892585108337	0.243426074701317	-0.0003259218440032	0.6300808136289521	0.0003259218440032	0.6235691895646654	0.0064646497971033	0.815726487954922	-5.598449064846793e-05	0.8621309686582148	5.598449064846793e-05	0.855346691222977	0.0002032366150987	0.7483571270413923	-1.6576614991195695e-06	0.8106180468098803	1.6576614991195695e-06	0.8039242447403651	-0.0002061957705123	0.8590587903839552	0.0002061957705123	0.852329552748099	AMBRA1	29894	ATG13	53297	HARBI1	53678	False	False	False	ref	-70	0.01004	-40	0.01251
554	chr11	46589689	G	A	rs61882757	-0.047736174	0.2716771397970826	0.0543359267999999	0.269185703153286	0.0318848991193783	0.1991838343853006	-0.0015666784793484	0.2122228124530887	0.0017286134286548	0.2105840316763857	0.0093167496948302	0.7587394242825198	-0.0004632750481303	0.6141119255921009	0.0004914716751746	0.6102741462788079	0.0003632951010284	0.6683781434720044	-1.7753776678915136e-05	0.5354629451301891	1.8445623729001526e-05	0.5314609764982527	-0.0015778100359605	0.5746087640317409	0.0017147240275807	0.5706036172859376	AMBRA1	4436	ATG13	27839	HARBI1	28220	False	False	False	ref	-100	0.02563	-5	0.01102
555	chr11	46613413	T	A	rs55657382	0.02347709912	0.5448329225176484	0.02347709912	0.5510920085891999	0.0110356388175558	0.8737805875222933	0.0002719191514731	0.6736234293278301	0.0002719191514731	0.6802966038074393	0.0002589818877634	0.996626572408222	5.522793715974019e-06	0.9671767917837883	5.522793715974019e-06	0.9742583622879034	2.806536985890089e-06	0.9981890851582828	6.31815326137233e-08	0.9730666375684358	6.31815326137233e-08	0.9801455920675928	2.226914321533435e-05	0.963917966710526	2.226914321533435e-05	0.9710390065190286	ATG13	4115	HARBI1	4496	AMBRA1	19288	False	False	False	alt	20	0.00806	-25	0.01624
556	chr11	46634411	T	A	rs7128092	0.0017389852399999	0.765623739759919	0.01099581276	0.7644783351799623	0.0906844000899043	0.0071157450322692	-0.0001092225123853	0.3625601694197629	0.0009975740895207	0.3620466837571947	0.0003431097621325	0.994117088557526	-6.46814347309723e-08	0.9882960830363772	2.67256439281336e-06	0.9866909769849672	3.007737829094097e-05	0.9320187206067806	-5.434463651109636e-08	0.9407707571486086	2.466168643224536e-07	0.9389879812488215	-8.247830820494072e-07	0.9839311818290944	1.2371746230741314e-05	0.9822420116914196	HARBI1	16502	ATG13	16883	AMBRA1	40286	False	False	False	alt	65	0.0498	-30	0.1033
557	chr11	46645114	A	G	rs61884274	0.0431529826	0.3312959170081353	0.0431529826	0.3360668332116731	0.0260721316934665	0.3037637574156962	0.0011183110527623	0.2877493069368271	0.0011183110527623	0.2918578985196949	0.009581505064168	0.7326572495402407	0.0004354108071569	0.5997896382493276	0.0004354108071569	0.6056553038850769	0.0002447733048496	0.6821686378257549	1.1064385107907026e-05	0.5547821104963728	1.1064385107907026e-05	0.5605687607216144	0.0014796608491966	0.571319386651332	0.0014796608491966	0.5771981404059345	HARBI1	27205	ATG13	27586	AMBRA1	50989	False	False	False	alt	100	0.00734	100	0.0769
558	chr11	46664710	G	A	rs10838610	-0.23345486	0.0182977268018576	0.23345486	0.0181762534815084	0.0292771976241275	0.2451687164810428	-0.0076123306505322	0.0398660297148501	0.0076123306505322	0.0395887828315727	0.4065364059252417	0.0677940373132399	-0.0949752980584538	0.0104747648086664	0.0949752980584538	0.0103289729240847	0.0121390853947101	0.0584093573769198	-0.0031396157876122	0.0182342195721351	0.0031396157876122	0.0178975520839489	-0.0790653558114215	0.0079241315654733	0.0790653558114215	0.0078416069197746	ARHGAP1	35909	ZNF408	36321	HARBI1	46801	False	True	False	ref	-60	0.0741	50	0.0454
559	chr11	46760922	C	A	rs10466477	0.0327978638	0.4317285367354657	0.0327978638	0.4370879615312409	0.0173215578384348	0.58883892632565	0.0006206716863182	0.4732227408929019	0.0006206716863182	0.4784439137116785	0.0123230840289003	0.7031461985830595	0.0003584108313303	0.6381327325037867	0.0003584108313303	0.6443849890366257	0.0001958921171606	0.7231465538702876	5.815155650865342e-06	0.6513569874733862	5.815155650865342e-06	0.6576293347163407	0.0012421233215663	0.6124330567538785	0.0012421233215663	0.6186389589034662	F2	41725	ZNF408	59891	ARHGAP1	60303	False	False	False	alt	-90	0.009705	-80	0.2297
560	chr11	46775133	A	C	rs7111811	-0.0319447433999999	0.4457366852885874	0.0319447433999999	0.4404470550623492	0.0223897277508761	0.4051601264619652	-0.0007450939269477	0.413498010632834	0.0007450939269477	0.4084827472922187	0.0188067038368908	0.6364300724930266	-0.0007077120263045	0.5681376888263826	0.0007077120263045	0.5622567039062827	0.00043391908725	0.6096430397879768	-1.7179149181961817e-05	0.5446818719095993	1.7179149181961817e-05	0.538854965635533	-0.0021922734320872	0.5290005023895539	0.0021922734320872	0.5231998483298405	F2	55936	CKAP5	71175	ZNF408	74102	False	False	False	ref	100	0.0647	65	0.1943
561	chr11	46777081	A	G	rs6485690	0.01940145228	0.586663314178867	0.01940145228	0.59315704323407	0.0170427451334704	0.5955266608358608	0.0003229245544206	0.6169452045873768	0.0003229245544206	0.6233113015715713	0.0045659991422255	0.8323842029360882	9.24851255084762e-05	0.8044961332177694	9.24851255084762e-05	0.8113379653396612	7.706836509145087e-05	0.8377255655764692	1.523381758615658e-06	0.8074489838413007	1.523381758615658e-06	0.8142023632673251	0.000367853254594	0.7946930772520899	0.000367853254594	0.80143884820984	F2	57884	CKAP5	69227	ZNF408	76050	False	False	False	alt	-85	0.04678	45	0.03104
562	chr11	46799349	A	G	rs7118097	0.0158140053999999	0.6668566206702556	0.0158140053999999	0.6735686032294791	0.0256740421759514	0.3145804394975665	0.0003959063848356	0.5641053849668534	0.0003959063848356	0.5703809487712865	0.0275856949622248	0.5569919711991176	0.0004159469073414	0.6016947001064947	0.0004159469073414	0.6075811559558689	0.0006901072292614	0.5131570015614979	1.0104517978109528e-05	0.5618146518520333	1.0104517978109528e-05	0.5676844993059049	0.0012817129095047	0.5926944359088635	0.0012817129095047	0.5987646273348377	CKAP5	46959	F2	80152	ZNF408	98318	False	False	False	alt	-100	0.01797	85	0.04852
563	chr11	46820494	C	T	rs6485696	0.01564746316	0.6563231463487434	0.01706472248	0.6610703441943876	0.0281060166898168	0.2607241928659885	0.0004267802598391	0.5598131615842161	0.0004727871687148	0.5642342699359374	0.0039597835769192	0.8525108039916963	8.279545185249269e-05	0.8326234908483237	8.620288718774994e-05	0.8369453990068401	0.0001112863491803	0.7971274815566664	2.2799057391521967e-06	0.7875897941582926	2.390517513238092e-06	0.7919252863586816	0.0002960971264557	0.8193448429862656	0.0003125927880966	0.8236953947364267	CKAP5	25814	LRP4	98148	F2	101297	False	False	False	alt	-60	0.03586	75	0.0912
564	chr11	46843154	T	C	rs11824327	-0.01193137258	0.7527125064726639	0.01193137258	0.7459302346302162	0.0277626535685122	0.2683196069299172	-0.0003519872035707	0.6325512343215897	0.0003519872035707	0.6263512990011785	0.0003414601959684	0.9928840222244172	-4.441283422036998e-06	0.9839094059385196	4.441283422036998e-06	0.9793612348185764	9.50962337827626e-06	0.9831715573842684	-1.296955561461694e-07	0.9715102226461174	1.296955561461694e-07	0.964989939290477	-1.6495661640988448e-05	0.9839480176070736	1.6495661640988448e-05	0.9786418592956856	CKAP5	3154	LRP4	75488	CSTPP1	93536	False	False	False	ref	-100	0.1343	70	0.06445
565	chr11	46855531	T	C	rs7938960	-0.00868540592	0.7705690172051263	0.01045205648	0.7661666712270672	0.010501695125337	0.8955533433755083	-9.375652863199254e-05	0.8445542233495131	0.0001133139704137	0.8400867923710985	0.001788129721883	0.9341126328109258	-2.191409951257254e-05	0.9299721357420618	2.447860166883983e-05	0.9255744267687126	1.93990177447374e-05	0.960494069047824	-2.47750392185429e-07	0.9484329440557274	2.7614033109865416e-07	0.9440306318199632	-9.649962059977183e-05	0.9204166107408532	0.000101448319092	0.9165742710641996	CKAP5	9223	LRP4	63111	CSTPP1	81159	False	False	False	ref	-100	0.03787	-70	0.254
566	chr11	46861767	A	C	rs11039012	-0.01003628226	0.6174579361968834	0.01881777186	0.6133803656193839	0.020555203889373	0.4649963463684076	-0.0001766430661647	0.5866853232643326	0.000392029521381	0.5830564922249825	0.000251558840025	0.997220185976076	-1.9152020516720146e-06	0.9801588250974482	4.812331717430745e-06	0.9773482739679402	5.403937744398399e-06	0.9944339924491976	-3.528898541399944e-08	0.973289159443881	1.0634782716001325e-07	0.9702679632934128	-5.773481574345943e-06	0.9823300343597878	1.732044472303784e-05	0.978039964139696	CKAP5	15459	LRP4	56875	CSTPP1	74923	False	False	False	ref	-100	0.09094	-100	0.2256
567	chr11	46868168	T	C	rs12273360	0.0809036282	0.1640623322408309	0.0809036282	0.1665233625027866	0.02298763906019	0.3853613415068558	0.0018486983028747	0.2033604857550821	0.0018486983028747	0.2061495332278899	0.0514639899706376	0.466440860064252	0.002838158748335	0.3230434410795694	0.002838158748335	0.3274510545198185	0.0012410006718245	0.4413209083098751	6.581182246635431e-05	0.313277210975646	6.581182246635431e-05	0.317765522942546	0.006861370459569	0.2748453632727516	0.006861370459569	0.2790631491422973	CKAP5	21860	LRP4	50474	CSTPP1	68522	False	False	False	alt	75	0.09216	75	0.291
568	chr11	46884180	G	A	rs61898529	-0.00536394272	0.6200022630614528	0.01959156232	0.6204261660493108	0.0189678546798788	0.5213721639675879	-0.0001005535967771	0.6262365921218057	0.0003758586629024	0.6269659789570907	0.0014491438751608	0.9445232354780668	-1.2742416150014592e-05	0.90461628407073	3.330645827957905e-05	0.9062064726915722	2.7033914990261394e-05	0.9371972179846576	-2.4400350213265024e-07	0.8969269713948599	6.351371821147338e-07	0.898454118586144	-4.206393718453159e-05	0.8986704668494516	0.0001294909438817	0.9002661738253904	LRP4	34462	CKAP5	37872	CSTPP1	52510	False	False	False	ref	-100	0.01987	15	0.00946
569	chr11	46906904	G	A	rs7128102	-0.0419120129	0.3533203197274618	0.0419120129	0.3488576545093462	0.078817973724605	0.0114643442342506	-0.0031139385405326	0.1164621267318047	0.0031139385405326	0.114969385798153	0.5876406255154895	0.0282968845108988	-0.0262058377486908	0.0734800138574507	0.0262058377486908	0.0721071046339335	0.0458353598754557	0.0028186809006008	-0.0019293923399857	0.0305156266819666	0.0019293923399857	0.0300634940203362	-0.0107510474745141	0.2012263633272164	0.0107510474745141	0.1978722004773722	LRP4	11738	CSTPP1	29786	CKAP5	60596	True	True	False	ref	100	0.02808	-35	0.2183
570	chr11	46912818	C	T	rs7120113	-0.0870646455999999	0.1497462266022221	0.0870646455999999	0.1478537106184629	0.028770131154284	0.2495711837885992	-0.0026356971119488	0.1534047023956155	0.0026356971119488	0.1515874532490115	0.8514747121507045	0.0042393503235135	-0.0749514590000521	0.0180410269405046	0.0749514590000521	0.0177953509028371	0.0245396584276156	0.0149445549283918	-0.0022740721747807	0.026961938589235	0.0022740721747807	0.0266439746647542	-0.0095732572333475	0.2292805568235985	0.0095732572333475	0.2257092611674368	LRP4	5824	CSTPP1	23872	CKAP5	66510	True	False	False	ref	45	0.0498	30	0.0547
571	chr11	47098515	T	C	rs118012321	0.02287033	0.4093632947259723	0.035314686	0.4121626038520421	0.0959125475027917	0.0054383519164136	0.0025180581945014	0.098909890957465	0.0034984906627436	0.0995931283946182	0.00724406980964	0.7769401405062524	0.0001477476042093	0.6754369024177099	0.0002704011418707	0.6788017904452022	0.0006870035980132	0.5141145190441347	1.655007096707595e-05	0.4494374722343108	2.6213368116209364e-05	0.452375285395499	0.0004676520075219	0.6552702063511527	0.0009328296657978	0.6585392209025508	ARFGAP2	78610	PACSIN3	87928	DDB2	115951	False	False	False	alt	-60	0.02966	-55	0.1122
572	chr11	47130722	G	A	rs10838660	-0.2032738939999999	0.0231876155229309	0.2032738939999999	0.0230044811944047	0.0461777817573733	0.0731269009741716	-0.0096960011239124	0.0225717631431699	0.0096960011239124	0.0224542254932858	0.3361584903170466	0.0940954673194777	-0.0659108465770881	0.0182577225685017	0.0659108465770881	0.0179358060898483	0.0145441613913544	0.0418355775230662	-0.002939563019699	0.0156794124857717	0.002939563019699	0.0154772811419207	-0.0648279502490844	0.011689250411489	0.0648279502490844	0.0115536214262665	ARFGAP2	46403	PACSIN3	55721	DDB2	83744	True	False	False	ref	60	0.01709	40	0.1357
573	chr11	47143555	G	A	rs7121418	0.2431717148	0.0177941733982458	0.2431717148	0.01790389326058	0.0493866739849976	0.0621867485004066	0.0136469238192525	0.0178769818736176	0.0136469238192525	0.0179901586233068	0.0352743228530896	0.5254437011954401	0.0088865323514478	0.1872575813164589	0.0088865323514478	0.1906382442013023	0.0018314960233445	0.355625647241645	0.0005171730126457	0.118474125774889	0.0005171730126457	0.1204062648747993	0.0182136848008973	0.122457173612717	0.0182136848008973	0.1244442666165558	ARFGAP2	33570	PACSIN3	42888	DDB2	70911	False	True	False	alt	-75	0.03049	-80	0.1754
574	chr11	57653412	G	A	rs1631684	-0.0101135987	0.7172259713849417	0.01248791562	0.7124067661072583	0.0324762704126231	0.186622183387736	-0.0003236578749834	0.5817492144572963	0.0004062954000234	0.5775059251986593	0.0154630332222624	0.6628552051749524	-0.0001277009920881	0.7433969525639852	0.0001655940282421	0.7392010982971159	0.0004972072595743	0.5726253840837395	-3.9730022545281e-06	0.6743821448118349	5.29186018525043e-06	0.6702768186515973	-0.0004717759229322	0.7281249931540111	0.0006251855761934	0.7238386907629714	YPEL4	3468	CLP1	5223	ZDHHC5	14336	False	False	False	ref	90	0.006554	-50	0.03143
575	chr11	57666650	C	A	rs499188	-0.00123846238	0.8465192323337115	0.00628887054	0.8474865077466281	0.0085423519007301	0.9569442162083728	-6.357904690326293e-06	0.9083339923512624	5.456020568996632e-05	0.909499800170412	0.2051045824948038	0.1702136295899695	-0.0003071463561408	0.4452436252833798	0.0013006066240365	0.4457653041354908	0.0017481165663274	0.3341368759158218	-1.8017050592855057e-06	0.5630860627214126	1.1257447781426024e-05	0.5640288523287834	-0.0004272376365016	0.5315476226860666	0.0019679324337698	0.5321787900485087	ZDHHC5	1098	YPEL4	16706	CLP1	18461	False	False	False	ref	-100	0.04205	-30	0.0679
576	chr11	57741206	G	C	rs12146541	-0.1283856927999999	0.0726119327038405	0.1283856927999999	0.0718629193495803	0.0374064711334125	0.1335023733961958	-0.0053611235129454	0.0657761955035969	0.0053611235129454	0.0652225099086268	0.9592854079377122	0.000107778450512	-0.123057868763838	0.0067740334840907	0.123057868763838	0.0067205520179173	0.0358308667434409	0.005841017951811	-0.0051271118870858	0.0100168910519001	0.0051271118870858	0.009961863403076	-0.0052357230048496	0.3478692092934388	0.0052357230048496	0.3431247101097519	SELENOH	286	ENSG00000254732	574	BTBD18	11469	True	False	False	ref	100	0.1318	100	0.4111
577	chr11	57779528	T	C	rs35808061	-0.347091488	0.0064152822572621	0.347091488	0.0063968386577007	0.0565080542998667	0.0402770944421566	-0.0217613974079818	0.0079168416228671	0.0217613974079818	0.0078530895041728	0.513367259410775	0.0409559485710246	-0.1926718834378957	0.0028987553973044	0.1926718834378957	0.002951852993216	0.0302009448694214	0.0102755792456901	-0.0123999114374692	0.0034923591917504	0.0123999114374692	0.0034824971561894	-0.1050765398700141	0.003857218997617	0.1050765398700141	0.0038345153112609	CTNND1	26284	BTBD18	26853	ENSG00000254732	37748	True	True	True	ref	-35	0.01788	-35	0.08936
578	chr11	57788298	T	C	rs11570181	0.0695707156	0.1916051397163607	0.0695707156	0.1943011359368008	0.0126417059851682	0.8000582684768217	0.0009170775439667	0.3540043199889898	0.0009170775439667	0.358611369780359	0.0310885487116887	0.5392138162958722	0.0017319479952336	0.3797097987752034	0.0017319479952336	0.3846116567705978	0.0003842043364886	0.6187185122588926	2.190813169871758e-05	0.4482680418555876	2.190813169871758e-05	0.4536560977774481	0.0049107584705222	0.3300912556927938	0.0049107584705222	0.3349821940337647	CTNND1	35054	BTBD18	35623	ENSG00000254732	46518	False	False	False	alt	100	0.08234	-90	0.01917
579	chr11	57807627	A	G	rs1268667	-0.0052762878399999	0.7778724508730326	0.01036426676	0.7767170625367263	0.04656323094164	0.0722009567197848	-0.0001997057636712	0.5486307914700488	0.0004450524309248	0.5478941636399145	0.0164313285605885	0.6465399920127299	-6.492117522868333e-05	0.7495956605133849	0.0001465978263045	0.748794023814876	0.0008180135272879	0.4902278409174846	-2.067752502549747e-06	0.6311650967279401	6.579720141187998e-06	0.6305411203959363	-0.0001740292303124	0.743897987391285	0.0005088911616244	0.7431457759109688	CTNND1	54383	BTBD18	54952	ENSG00000254732	65847	False	False	False	ref	-100	0.006042	100	0.07654
580	chr11	63872198	G	A	rs4980505	-0.0981721384	0.0904623494017074	0.1291248256	0.0903810774083762	0.033420769136274	0.1741015711041905	-0.0036868550151968	0.0927169640466117	0.0047047817292269	0.0927784776829532	0.4404077727557652	0.0558503944935872	-0.0451094222522455	0.0320267284980889	0.0600387330433846	0.032074189209533	0.0160756207744239	0.0410991499103332	-0.0016734604316983	0.0357857967005535	0.0022597241920747	0.0358292105943806	-0.0353873181353303	0.0474841402784615	0.0412779189073273	0.0474317674367965	MARK2	33269	RCOR2	44966	SPINDOC	58741	True	False	False	ref	75	0.04602	-55	0.1475
581	chr11	64048350	C	T	rs2014328	-0.163704255	0.0454507965631363	0.163704255	0.0449685765726784	0.0476472641122705	0.0666012715145808	-0.0079574059565512	0.0350230395612274	0.0079574059565512	0.0348464140692409	0.8130769357658935	0.0065141891559424	-0.1357586972196619	0.0059315858933379	0.1357586972196619	0.0059247258398032	0.0389806475132022	0.0046594785879461	-0.006643102047028	0.0067995673324876	0.006643102047028	0.0068250759131441	-0.0210072250997986	0.094187294859604	0.0210072250997986	0.0926404271632454	FLRT1	12418	OTUB1	62496	COX8A	73729	True	False	False	ref	-30	0.03467	10	0.02637
582	chr11	64053900	G	A	rs478294	-0.379918478	0.004643492237994	0.379918478	0.0046608338955361	0.0440756720261578	0.0870543503388219	-0.0182315218453878	0.0095957127378883	0.0182315218453878	0.0095588147677033	0.5659620269869025	0.0322745538670437	-0.2173265649996546	0.0018105127040602	0.2173265649996546	0.0018420725624162	0.0251286805980784	0.0146227481421369	-0.010481657856022	0.0035485636044311	0.010481657856022	0.0035177204715614	-0.1177889215136418	0.0027291085134194	0.1177889215136418	0.0027315376583188	FLRT1	17968	OTUB1	68046	COX8A	79279	False	True	True	ref	-25	0.00879	35	0.0752
583	chr11	64056059	G	A	rs540741	-0.0718237106	0.1586167456051168	0.0890399654	0.1574484970847326	0.0453255520810469	0.0754535564393092	-0.0033365135182333	0.0948885128429172	0.0040852334339837	0.0946078047335358	0.646177955197783	0.0209560596330361	-0.0434221075960599	0.0289072379814394	0.0544957956666017	0.0286975660203964	0.0293470723062271	0.0095521854159789	-0.0020165237311979	0.0227133858726356	0.0024981087744971	0.0226075197424537	-0.0189964039457622	0.0960439667882836	0.0234254890963675	0.0951657425127261	FLRT1	20127	OTUB1	70205	COX8A	81438	False	False	False	ref	90	0.01123	-55	0.07764
584	chr11	64056147	C	T	rs562664	-0.065210121	0.1968281431781604	0.0710360726	0.1951984462831957	0.0261346792821145	0.3011110240032057	-0.0016866501967367	0.2122211138489814	0.0018484915062874	0.2102184329903297	0.6598891491537725	0.0194849472890982	-0.0423435583859858	0.0380241609824391	0.0466939457263783	0.037680186843767	0.0173342120208542	0.0304092652728719	-0.0010966895565094	0.0512624864497527	0.0012175406072953	0.0507496433065595	-0.0157781003596053	0.1357333120891841	0.0169558906007719	0.1342219335291873	FLRT1	20215	OTUB1	70293	COX8A	81526	False	False	False	ref	85	0.09656	-95	0.199
585	chr11	66349440	A	G	rs4930355	0.05289069	0.2776035746630933	0.05289069	0.2814433623487842	0.012808639807486	0.7868228704899328	0.0007005282078452	0.4313326126334996	0.0007005282078452	0.4364663677596783	0.0023324865560357	0.9108003659795088	0.0001341661156284	0.7720338343285984	0.0001341661156284	0.778594864242071	2.9778862771909632e-05	0.9313368945543644	1.7453907726821966e-06	0.8012946515739877	1.7453907726821966e-06	0.8079245607848847	0.0004668272244399	0.7597685871076244	0.0004668272244399	0.7662744731451999	B4GAT1	1811	BRMS1	4315	RIN1	12600	False	False	False	alt	-100	0.05576	-80	0.0841
586	chr11	67004840	G	T	rs11227649	-0.0459391792	0.3246200227434696	0.0459391792	0.3203460482077494	0.0284874435960289	0.2528685076343148	-0.0013326902904319	0.2724212823247954	0.0013326902904319	0.2689368119422508	0.0023242387252152	0.9157397767945517	-0.0001275210961653	0.7982529637733162	0.0001275210961653	0.7914254568915178	6.413400099043844e-05	0.8717613533839376	-3.554593052412148e-06	0.7466788450412943	3.554593052412148e-06	0.7401088656212264	-0.0004989937646398	0.7855230847511542	0.0004989937646398	0.7787194804936647	SYT12	1939	C11ORF86	29562	PC	46454	False	False	False	ref	25	0.04565	65	0.1106
587	chr11	67005606	C	T	rs1253435	-0.271441738	0.0116479146203529	0.271441738	0.0115741775994108	0.030996550048403	0.2164331337415674	-0.0092696786221698	0.0281108443558965	0.0092696786221698	0.0279289197915418	0.023667150539408	0.5816005254986378	-0.0064416844597744	0.2103024946830058	0.0064416844597744	0.206666385182984	0.0007513948633046	0.5026168867077515	-0.0002226267392564	0.1787103234483186	0.0002226267392564	0.1757844237351372	-0.0145104087624953	0.1447903839284313	0.0145104087624953	0.1421947120183122	SYT12	1173	C11ORF86	30328	PC	47220	False	True	False	ref	-95	0.02835	5	0.00867
588	chr11	79499415	A	C	rs112437913	-0.147727298	0.0503158944001844	0.147727298	0.0497136978431863	0.035834587077567	0.1474111682744998	-0.0055522646950573	0.0535925705753397	0.0055522646950573	0.0531122220415092	0.0231953746164758	0.6624487909466739	-0.0034472926438173	0.3748746384217192	0.0034472926438173	0.3697676183199461	0.0008478427074342	0.5635506133102877	-0.0001268445753959	0.3091055678827593	0.0001268445753959	0.304977045515455	-0.0084441291940219	0.2993527678571909	0.0084441291940219	0.2954998973030127	TENM4	58385	NARS2	924221	GAB2	1081067	False	False	False	ref	15	0.02905	-100	0.067
589	chr11	79591215	T	C	rs1893846	0.277204866	0.0105547723278404	0.277204866	0.0105921165052943	0.0344022473939615	0.1637302141452775	0.0098393363596967	0.0219663351023631	0.0098393363596967	0.0220257930852588	0.0186203028603476	0.6633609379325316	0.0055988340426048	0.2585567759201734	0.0055988340426048	0.2623104579469713	0.0006833780584184	0.5603866846092034	0.0002088801035821	0.209053783037662	0.0002088801035821	0.2122890680715711	0.0122785457424697	0.1970481108459768	0.0122785457424697	0.1996640729806908	TENM4	150185	NARS2	1016021	GAB2	1172867	False	True	False	alt	100	0.1244	95	0.298
590	chr11	79634979	A	G	rs2457246	-0.065044863	0.2226284605773798	0.065044863	0.2201002772133391	0.0366192054292506	0.1374766933281894	-0.0025317991484604	0.1627984316041802	0.0025317991484604	0.1608327575461142	0.0277085876414502	0.5944448309973431	-0.0030825694080571	0.4282497144667831	0.0030825694080571	0.4232738865632818	0.0010716571300005	0.4779594955075301	-0.0001236620373317	0.3485416505650359	0.0001236620373317	0.3442061660021556	-0.0066576490383028	0.3562267044279292	0.0066576490383028	0.352065225867297	TENM4	193949	NARS2	1059785	GAB2	1216631	False	False	False	ref	-100	0.01047	-100	0.1433
591	chr11	79637393	C	T	rs591699	-0.0717310306	0.2076380820063455	0.0717310306	0.2048482335210319	0.0155878613532731	0.6655512360576793	-0.0011464334831891	0.3274258829830976	0.0011464334831891	0.3233295232188067	0.0111617894493747	0.7087806941837114	-0.0009071069027354	0.5341839922070053	0.0009071069027354	0.5284276301057701	0.0001760007976045	0.7339406063299703	-1.4766898037354848e-05	0.5629269580722026	1.4766898037354848e-05	0.5569362771097993	-0.0028141598759525	0.4854529266967274	0.0028141598759525	0.4795494393754368	TENM4	196363	NARS2	1062199	GAB2	1219045	False	False	False	ref	90	0.0801	100	0.1126
592	chr11	79643238	T	C	rs12789884	0.15390252	0.0443286116107917	0.15390252	0.0448187715272433	0.0476309568853375	0.0654337542475109	0.0074385469635801	0.0324262215561129	0.0074385469635801	0.032626430183598	0.0401925043713502	0.5118793953407652	0.006732264791752	0.2270958203433958	0.006732264791752	0.230826362352364	0.0020745639513276	0.342588059264044	0.0003476738703438	0.1493025056604754	0.0003476738703438	0.1519431435917854	0.0149764112038533	0.1512593765560182	0.0149764112038533	0.1538865139961288	TENM4	202208	NARS2	1068044	GAB2	1224890	False	False	False	alt	-90	0.0383	95	0.08435
593	chr11	104509903	A	G	rs71464734	-0.016182500132	0.5056078028372917	0.0275508010679999	0.5032425646879227	0.0095120234119818	0.9332151049328836	-0.00015053656234	0.6870533514682352	0.0002670682636099	0.6848461981153384	0.020679786216225	0.6018574344033953	-0.0005046438449845	0.5921776774169666	0.0006479036166584	0.5899397176822525	0.0001958953693819	0.7142762070627751	-4.76653758613136e-06	0.6794372270490543	6.232874106121069e-06	0.6773830635067157	-0.0016108013592425	0.5572983643122048	0.0020413381280722	0.5548692640335743	PDGFD	345524	CASP12	388767	CASP4	459463	False	False	False	ref	-100	0.03693	-15	0.04123
594	chr11	104552280	C	T	rs722354	-0.0692147346	0.1773020208329846	0.0812085033999999	0.1758368225583035	0.0235666749884197	0.3718344879873261	-0.0019433314878358	0.2042516192614532	0.0021762077299806	0.2029610188432402	0.0332799973606941	0.5603405149387074	-0.0043925538820067	0.366301048014825	0.0046186414295806	0.3634098369257739	0.0009383287472029	0.5182411196405556	-0.0001358893286745	0.3505910902634664	0.0001402791430275	0.3477324275886477	-0.0084779453003859	0.2940651858762603	0.0092845831546302	0.2917651745059887	CASP12	346390	PDGFD	387901	CASP4	417086	False	False	False	ref	-55	0.1211	-15	0.0586
595	chr11	104566928	G	A	rs34793132	-0.0761673974	0.1879239712040038	0.0761673974	0.1852263857423967	0.0402871854502362	0.107059255973887	-0.0031952477144458	0.1265275231449713	0.0031952477144458	0.124977938247963	0.0744160535779089	0.3654244997266608	-0.0073976197922353	0.2331005497550328	0.0073976197922353	0.2294729346260093	0.0031081211599403	0.2447109040692291	-0.0003132764067588	0.1721460266413014	0.0003132764067588	0.1693945550391391	-0.0142786447164395	0.1716483943870273	0.0142786447164395	0.1687132264706636	CASP12	331742	CASP4	402438	PDGFD	402549	False	False	False	ref	-90	0.01941	-100	0.196
596	chr11	104574276	T	C	rs59832858	0.0769520249999999	0.1602349208599733	0.0769520249999999	0.1627459004377439	0.0169817947866539	0.5917465648308289	0.0013678016979547	0.2526583909884026	0.0013678016979547	0.2563410591889975	0.0269522615552109	0.5911597019631653	0.0023186612605021	0.3884523130246173	0.0023186612605021	0.3934868940116929	0.0004788486820729	0.614441762220112	4.450759177332579e-05	0.4168155390307625	4.450759177332579e-05	0.4220208661322698	0.0058147207284483	0.3286296046444544	0.0058147207284483	0.3331220596442318	CASP12	324394	CASP4	395090	PDGFD	409897	False	False	False	alt	-55	0.02597	-100	0.09314
597	chr11	104592078	G	C	rs7927714	-0.2647464092	0.0143394408917452	0.2647464092	0.0143125786973836	0.0715017693072538	0.0199448997968439	-0.0233105910332464	0.0093940938549241	0.0233105910332464	0.0093257577822275	0.2078412127610438	0.1695729230319343	-0.0592380616886532	0.0261894106168581	0.0592380616886532	0.0258262991697443	0.0160735284021635	0.0410271675986282	-0.005769275068744	0.013308509872927	0.005769275068744	0.0131002590349628	-0.0755575533634653	0.0104507517180476	0.0755575533634653	0.0103150899487182	CASP12	306592	CASP4	377288	PDGFD	427699	True	True	False	ref	-5	0.001831	70	0.0945
598	chr11	104594377	T	G	rs11226433	0.0024851302199999	0.8320595260922904	0.00751092462	0.8360949328125784	0.0124822710302131	0.8081530922895284	2.9609917345762622e-05	0.8602701004510319	9.345246226444264e-05	0.8642672395077218	0.0138984197156147	0.6798157030965571	8.102285163415054e-05	0.7855681225346494	0.0001071582755901	0.7899697114777197	0.0001716502187752	0.7414772581508556	9.835866016245703e-07	0.8177823696590104	1.3155842639521196e-06	0.8222038746558898	0.0002730032001583	0.7887696083987911	0.0003604302068555	0.7931725241767553	CASP12	304293	CASP4	374989	CASP5	428791	False	False	False	alt	-85	0.01996	100	0.1539
599	chr11	104610096	G	C	rs10895711	0.0753315906	0.1621432211052253	0.0753315906	0.1646327742667433	0.021807361558042	0.4174307158993817	0.0016678775964952	0.2035783182547443	0.0016678775964952	0.2065465604898335	0.059864405661311	0.4023579493795188	0.0046154730745355	0.2440890687916841	0.0046154730745355	0.2481799170206924	0.0012850383022046	0.392595304504896	0.0001001444246344	0.2498425700880184	0.0001001444246344	0.2538729780583048	0.0110735376595954	0.1825603161128454	0.0110735376595954	0.1859357802698003	CASP12	288574	CASP4	359270	CASP5	413072	False	False	False	alt	-10	0.00258	-95	0.0913
600	chr11	104628386	C	T	rs12418899	-0.189290396	0.0308654713370175	0.189290396	0.0306109553031437	0.034893314173023	0.1624590575616283	-0.0074514462522043	0.0415198502146866	0.0074514462522043	0.0410732424003693	0.0020809277160106	0.9153908369078076	-0.0004268339652566	0.6302868075803834	0.0004268339652566	0.624206747612891	7.603345550120173e-05	0.8518006303506939	-1.7955799111265207e-05	0.5431246261164033	1.7955799111265207e-05	0.5373574759616523	-0.0011456237009665	0.6361555441609651	0.0011456237009665	0.6298527753795532	CASP12	270284	CASP4	340980	CASP5	394782	False	False	False	ref	100	0.05945	-90	0.1055
601	chr11	104633688	G	A	rs16894	0.01201103602	0.7365497152422905	0.01201103602	0.7432849641290898	0.012128885627571	0.8224880944887222	0.0001423302559935	0.7951360657916933	0.0001423302559935	0.8019170692505067	0.2458670119758503	0.1407291475951419	0.0028509894143481	0.3328681385148342	0.0028509894143481	0.337693189116048	0.0029849047000185	0.2421602106605768	3.394219132588191e-05	0.41072984781904	3.394219132588191e-05	0.4162713664388509	0.0037997756590016	0.4082514821658489	0.0037997756590016	0.4138770882741496	CASP12	264982	CASP4	335678	CASP5	389480	False	False	False	alt	-100	0.0741	-85	0.1088
602	chr11	104653880	G	A	rs10895715	0.292204688	0.0090989495340499	0.292204688	0.0091566992831718	0.048096488713225	0.0633521010392902	0.0141106530271576	0.0116569656428174	0.0141106530271576	0.0117011862322352	0.072682359539441	0.3655660251869289	0.0224797502993718	0.0745007963796285	0.0224797502993718	0.07601476932005	0.0034978888997757	0.2184540804894703	0.0010819653889305	0.0478109065860168	0.0010819653889305	0.0486947829034462	0.040571904589093	0.0313912367910083	0.040571904589093	0.0318897537247105	CASP12	244790	CASP4	315486	CASP5	369288	False	True	True	alt	-100	0.0708	-65	0.147
603	chr11	104703675	C	T	rs1147010	-0.080325226	0.1513186877867939	0.080325226	0.1491344136505457	0.018373626772395	0.5432545545593641	-0.0015319143609139	0.2294036576571685	0.0015319143609139	0.2263487249365985	0.0028628220777934	0.8897632159636446	-0.0002403628616291	0.6935438928177313	0.0002403628616291	0.6872960374769818	5.457900707845767e-05	0.8835169673518033	-4.763244041093253e-06	0.690525995608548	4.763244041093253e-06	0.6841366488988004	-0.0008569496222492	0.6741601561250166	0.0008569496222492	0.6680443701081219	CASP12	194995	CASP4	265691	CASP5	319493	False	False	False	ref	80	0.05408	-85	0.132
604	chr11	104796270	C	A	rs72972953	0.0166333272	0.6407704100200076	0.01788975448	0.6450213562344574	0.0143427059094889	0.7125289537619132	0.0002792798834824	0.6719902496145871	0.0002947506237668	0.6764735143556916	0.1466835472270792	0.2299127854684214	0.0023931625462433	0.3617544540975861	0.0026323100515904	0.3650217868661383	0.0021596055428461	0.3040324243790844	4.09422646289345e-05	0.4107509520526876	4.3886954748965264e-05	0.414118061974789	0.0041874237075649	0.3841504073606629	0.0045470291313384	0.3876148567868879	CASP12	102400	CASP4	173096	CASP5	226898	False	False	False	alt	100	0.2446	100	0.44
605	chr11	104804375	A	G	rs6591097	0.0021058582	0.7791916560712718	0.009936999	0.7806673880599456	0.0201676531795585	0.4770983915357491	3.192879383497999e-05	0.7298717285529969	0.000198374124924	0.7312254986275478	0.0038294678499554	0.8624491603429768	-1.5557814750912594e-05	0.8818620027470527	3.8629593869630256e-05	0.883112281377346	7.874037178169708e-05	0.8464237467168323	-3.434623844872745e-07	0.865660251215707	7.893768092707644e-07	0.8669165989810496	-8.907657286132211e-05	0.8709530676047004	0.000168255748738	0.8721783600616251	CASP12	94295	CASP4	164991	CASP5	218793	False	False	False	alt	-40	0.00534	100	0.0792
606	chr11	104807143	A	T	rs1144403	0.0316629732	0.1766827902803761	0.0760275032	0.1767824841892268	0.0188193155161103	0.5177392405615342	0.0010664198799218	0.247280094433745	0.0016847586476365	0.2475363250212109	0.1465227145260796	0.2389523361779236	0.002282948742405	0.1531882561772901	0.0123100593501903	0.1538546322452881	0.0027337534797852	0.27137591902867	0.0001287901614136	0.1842591493658541	0.0002677916191018	0.1848670040369803	0.0072539672066246	0.1186381501531748	0.0188999043251624	0.1189172591672582	CASP12	91527	CASP4	162223	CASP5	216025	False	False	False	alt	-90	0.05402	-100	0.2876
607	chr11	104812625	G	C	rs1529338	-0.0590870959999999	0.1152084706680802	0.103227712	0.1150442440759862	0.02705675556239	0.2811187408139721	-0.0014753831052072	0.1338583399576307	0.0028993464037335	0.1335870661163799	0.724982679555277	0.0133671836919277	-0.0430495891671295	0.0174440404989797	0.0750107652379227	0.0175051356055755	0.0196147027078583	0.0240888130092661	-0.0010689025917572	0.027874259424191	0.002103715374155	0.0278556902505672	-0.0125952624459766	0.1016618738572804	0.0209321698393321	0.1014863024932022	CASP12	86045	CASP4	156741	CASP5	210543	True	False	False	ref	-45	0.03027	65	0.165
608	chr11	104813115	G	A	rs4755059	0.0007933592199999	0.8984939812387681	0.00449578682	0.9025873320625498	0.0082727943006148	0.963953681488558	8.104540008203351e-06	0.9434415290277778	3.5409594878628385e-05	0.947657446266999	0.2499076242948104	0.1384414595059136	0.0001369966477039	0.4698248253217124	0.0011127757925391	0.4730922185951521	0.0020835750237616	0.3050872715048975	1.6029919187013808e-06	0.5935016927944983	8.799271514636534e-06	0.5972307972552146	0.0002861997294711	0.5815440909052125	0.0014689386691299	0.5850631666417522	CASP12	85555	CASP4	156251	CASP5	210053	False	False	False	alt	50	0.02814	-95	0.04034
609	chr11	104820457	T	C	rs2555136	0.0114395530399999	0.7516614025938966	0.0114395530399999	0.7582910733960608	0.009467329297966	0.9275730163168596	0.0001082391583386	0.8430003641352101	0.0001082391583386	0.8496060055395878	0.0416787634852033	0.4880180787622478	0.0006453482970291	0.5972949883617189	0.0006453482970291	0.603246033926059	0.0004042821915479	0.6194688070763518	6.206525487530794e-06	0.6883771128784802	6.206525487530794e-06	0.6947198033892438	0.0015580152419912	0.5962555018285336	0.0015580152419912	0.6022627340119653	CASP12	78213	CASP4	148909	CASP5	202711	False	False	False	alt	95	0.02605	100	0.2042
610	chr11	104821521	G	A	rs7131576	0.0039716278	0.8333966060307124	0.007387317	0.8376667604026875	0.0156998262741661	0.6621311288373697	6.394807785012801e-05	0.8301061671966677	0.0001177842847234	0.8343420917240632	0.0003249645343274	0.9931455780718408	8.72128212714835e-07	0.98599525893315	1.8158911181206565e-06	0.9903999531092956	4.909086897964858e-06	0.9929128162966836	1.2695708293639924e-08	0.9856656434937796	2.7570777824987298e-08	0.99006900891641	4.123915410247101e-06	0.9879454409737528	5.773481574345958e-06	0.9910950754501116	CASP12	77149	CASP4	147845	CASP5	201647	False	False	False	alt	-95	0.05554	60	0.1229
611	chr11	104825330	C	T	rs1030395	0.1552474742	0.0593109598027987	0.1626623002	0.0594001356148085	0.0342275264988758	0.1694211972618089	0.0068187453708644	0.0684521352667773	0.0069507973108712	0.0683607831602579	0.1023836231071227	0.310518141627646	0.0219620880615308	0.1124703409354142	0.0222071716550928	0.113481917325826	0.004076053145172	0.2167734349204652	0.0009760744818079	0.094097025978206	0.0009804392186162	0.0946902133059466	0.0347497608129061	0.0610230760661244	0.035531655174689	0.0614346627054994	CASP12	73340	CASP4	144036	CASP5	197838	False	False	False	alt	10	0.0004272	-10	0.007324
612	chr11	104829767	T	A	rs10895736	0.00177039745	0.931853637089326	0.00273209977	0.9357662336269292	0.0094207327026553	0.9261153415724316	1.3224104687941353e-05	0.957224437324521	2.35736717490762e-05	0.961161251775655	0.1901619873973144	0.183284435603977	0.0004058419652519	0.585368134198649	0.0005614590494557	0.5887477150057913	0.0017339235310889	0.3352732547464904	2.9493666341291136e-06	0.6803901340287578	4.624073474652394e-06	0.6838280023594123	0.0005954933852396	0.6764229783638379	0.0008660222361518	0.679893348464742	CASP12	68903	CASP4	139599	CASP5	193401	False	False	False	alt	100	0.01917	-60	0.0383
613	chr11	104829957	T	C	rs10895737	0.0001916890199999	0.8822509845660385	0.00509798554	0.881417621560993	0.0230066789274443	0.3820142392161888	1.2184433776844734e-05	0.8269890010215606	0.0001148190376893	0.8266799526288529	0.2497401933291543	0.1378644926645128	-4.704113856286002e-05	0.4474481829789631	0.0011618769381823	0.4472879756569369	0.0057528881037947	0.1416134963292626	1.1688837027753885e-06	0.4277177139443144	2.6457317272343645e-05	0.427718465633257	6.020916498961997e-05	0.5521838518448661	0.0016635874764936	0.5519183374383029	CASP12	68713	CASP4	139409	CASP5	193211	False	False	False	alt	100	0.03235	-100	0.0955
614	chr11	104832911	G	A	rs7947634	-0.0294246696	0.4662957698344152	0.0294246696	0.4608081874322119	0.069414341189157	0.0180706927753695	-0.0020496553075339	0.1683890543769607	0.0020496553075339	0.1661099499552584	0.0352792715515818	0.5209711177471656	-0.0011924839124168	0.4819892292333956	0.0011924839124168	0.4763456304232429	0.0024268201086754	0.2916975030065701	-8.173140627539535e-05	0.3062914942052016	8.173140627539535e-05	0.302005889777392	-0.0032793375342284	0.4473668356962093	0.0032793375342284	0.4418118419656164	CASP12	65759	CASP4	136455	CASP5	190257	False	True	False	ref	-50	0.02545	-15	0.01166
615	chr11	112393282	T	G	rs12576701	0.1592631226	0.0518321907470509	0.1592631226	0.0524216615142933	0.0312107300036303	0.2129052051304727	0.0060953972033233	0.067782238326957	0.0060953972033233	0.0684784852164923	0.1985459074263468	0.1794597615943025	0.0370369916098323	0.0547702181908505	0.0370369916098323	0.0558062169010134	0.0068798059392342	0.1294702523518378	0.0015212243891575	0.0558431742908201	0.0015212243891575	0.0567777982398559	0.0472765662630727	0.0307401350501984	0.0472765662630727	0.0310961769693127	PLET1	132422	PTS	166914	BCO2	217771	True	False	False	alt	-45	0.01155	-95	0.4236
616	chr11	112393897	G	A	rs6589285	-0.0014733792799999	0.6061726658912622	0.0198529383199999	0.6068874411436465	0.0772130560187534	0.0128464429526257	-4.001165635244004e-05	0.2406025215285663	0.0015193887582915	0.2412948639151906	0.1491018112236481	0.2330556355832607	0.0001906094457743	0.3338597242082311	0.0028120155152183	0.3348464571132317	0.0112237576521829	0.0653693831281918	1.5200665993556395e-05	0.1783847087983224	0.0002147350524684	0.1792555622569018	7.42304773843998e-05	0.3514857072088843	0.0048794167134043	0.3525350108567468	PLET1	133037	PTS	167529	BCO2	218386	False	True	False	ref	-90	0.0467	100	0.0768
617	chr11	112398241	T	G	rs4936065	-0.19277622	0.0292646336414027	0.19277622	0.0289465076867245	0.051594495038101	0.0522650022082708	-0.0109012284749178	0.0221864946825108	0.0109012284749178	0.0220892561100519	0.0303247995777109	0.5306998444439781	-0.0057340776466366	0.2240176406128607	0.0057340776466366	0.2202771578735915	0.0015332024066997	0.3607166825496846	-0.0003177682810027	0.1371813343539592	0.0003177682810027	0.1349638827207585	-0.0137730526871432	0.1515461759225314	0.0137730526871432	0.1486813682820244	PLET1	137381	PTS	171873	BCO2	222730	False	False	False	ref	-80	0.01012	45	0.0631
618	chr11	112400682	C	T	rs12419862	0.125334391	0.0792187857717853	0.125334391	0.0802057313396743	0.0263878783111256	0.2999217347668366	0.0037343713017163	0.1087804445220687	0.0037343713017163	0.1099037642324513	0.2015241991356272	0.1761441409316657	0.0262605195780969	0.0708872262500341	0.0262605195780969	0.0721975026306782	0.0053251819248143	0.1568118657390135	0.0007789435798927	0.0792087146468782	0.0007789435798927	0.080600527161345	0.0347464616805779	0.0459714344532145	0.0347464616805779	0.046673949571769	PLET1	139822	PTS	174314	BCO2	225171	False	False	False	alt	100	0.09375	-35	0.06726
619	chr11	112400714	A	C	rs11214193	0.1070655091999999	0.0972477644716823	0.1070655091999999	0.0985311429769964	0.0456116651846568	0.0743209823204803	0.0050321700142165	0.0623132884558737	0.0050321700142165	0.0628452470685411	0.2144436013328494	0.1648752988819386	0.0210907744092847	0.0794602947849579	0.0210907744092847	0.0810753035477993	0.0097445482920507	0.0777690552968267	0.0009990085778105	0.0529073746397684	0.0009990085778105	0.0539093344273464	0.0304699614001517	0.0541187307178981	0.0304699614001517	0.0551019590366582	PLET1	139854	PTS	174346	BCO2	225203	False	False	False	alt	90	0.1113	-70	0.0703
620	chr11	112477663	G	A	rs11214222	-0.0623236364	0.2334880840922094	0.0623236364	0.2304491075727557	0.0207852353129921	0.4490844359783855	-0.0014086716616795	0.2724197019900866	0.0014086716616795	0.2690183190800781	0.7180808947246874	0.0131547485206013	-0.0425937804689065	0.0366971932650006	0.0425937804689065	0.0360361073364584	0.014903324334872	0.0409430295123853	-0.0009659198297522	0.0594265359042409	0.0009659198297522	0.0583400567331829	-0.0140617267658605	0.1679350950282465	0.0140617267658605	0.1654326375159361	PLET1	216803	PTS	251295	BCO2	302152	True	False	False	ref	100	0.1252	95	0.437
621	chr11	113094734	A	G	rs12279124	-0.361921102	0.0052906223603789	0.361921102	0.0053043386703519	0.0803836664341517	0.0107271582439592	-0.029971444679137	0.0036278205436424	0.029971444679137	0.0036166065912059	0.2388464583814456	0.1469323262466815	-0.0913828540162858	0.0117515707566457	0.0913828540162858	0.0115666770878425	0.0191969934061687	0.0259492399308415	-0.0074453857011225	0.0054750992409335	0.0074453857011225	0.0054570585833691	-0.1052002573323215	0.0038237973814602	0.1052002573323215	0.0037994915038646	NCAM1	133458	TTC12	219846	ANKK1	293046	False	True	True	ref	30	0.00415	55	0.05127
622	chr11	113099611	T	C	rs7946458	-0.0166787076	0.5588228628804005	0.0231178324	0.5564296152864361	0.0262075212520125	0.3026274810877535	-0.0005459219652104	0.4729469428062634	0.0007019159070529	0.4712243812413156	0.0172783807858532	0.6476079221264616	-0.0003201099029409	0.6596121510806738	0.000444589891839	0.6575868381136428	0.0004758912350654	0.5929311372214248	-1.1215051439741522e-05	0.6067647367590514	1.423922545233401e-05	0.6048208503157406	-0.0009889149153772	0.6343247867662883	0.0013897594932532	0.6322445861011183	NCAM1	138335	TTC12	214969	ANKK1	288169	False	False	False	ref	10	0.02798	-45	0.1162
623	chr11	113102292	A	G	rs7118324	0.135524332	0.0696881528667877	0.135524332	0.0704164860149454	0.0761377986435035	0.0151190299870143	0.0131169608614048	0.0259331343785594	0.0131169608614048	0.0261167067397702	0.0031473722411005	0.8764098274676684	0.000405329610946	0.6179351320842051	0.000405329610946	0.6240423006521926	0.0002320906479461	0.6934446003309626	3.792955377428604e-05	0.4183410346807832	3.792955377428604e-05	0.4235444903169283	0.0012173798291048	0.6094556712604781	0.0012173798291048	0.6156511089358766	NCAM1	141016	TTC12	212288	ANKK1	285488	False	False	False	alt	80	0.0263	80	0.10657
624	chr11	113104464	A	T	rs12286447	0.00412871678	0.7320193497920784	0.0127211208199999	0.7335509590744116	0.0099522366045656	0.9059019793337876	2.218386064432569e-05	0.8236022284598405	0.0001283149260014	0.8248096329285043	0.3289119461581603	0.0970649002053282	0.0012010636228552	0.2774937405376076	0.0042036699266175	0.2787209922713993	0.0033559675927734	0.2298694027773423	6.875020641732389e-06	0.3872789412551364	4.401997081613422e-05	0.3883901721583815	0.0012553198508792	0.3829796404140037	0.0041503084688726	0.3844060118046472	NCAM1	143188	TTC12	210116	ANKK1	283316	False	False	False	alt	-65	0.08185	100	0.1932
625	chr11	113346642	A	G	rs3781884	-0.0508135057999999	0.1855180028843632	0.0763881442	0.1853440812798865	0.0349012372849623	0.1561482763079082	-0.001753851112746	0.1579323941422629	0.0025994708683298	0.1578137307286402	0.4464831249381412	0.0565754963752112	-0.0201344456502978	0.0600839007651571	0.0314304295504348	0.0598994505241286	0.0156792297078011	0.0365864409437709	-0.0007002592331792	0.0555949274955266	0.0010709464042254	0.0555179198776933	-0.0186219524265118	0.0818401606251345	0.0268301936590676	0.0818676430754859	TTC12	32062	ANKK1	41138	DRD2	129049	False	False	False	ref	10	0.002441	60	0.1323
626	chr11	113467056	C	T	rs12421616	-0.0518853532	0.2934163287209582	0.0518853532	0.2897562769786614	0.0284726513289042	0.2544798199147719	-0.0015468322786132	0.2475686279082005	0.0015468322786132	0.2445189004189493	0.0138068687935072	0.7050559787937423	-0.0008577204632559	0.5656400187760942	0.0008577204632559	0.5598709367390678	0.0004284723010938	0.632755258633274	-2.668499045353373e-05	0.5061524412722759	2.668499045353373e-05	0.5004982111061107	-0.0024735244630661	0.5250275426921096	0.0024735244630661	0.5193457866822697	DRD2	8635	ANKK1	79276	TTC12	152476	False	False	False	ref	-95	0.0468	-100	0.2286
627	chr11	113484722	T	C	rs7121986	0.0942665048	0.1183199833955954	0.0942665048	0.1199046043164176	0.0270365230203175	0.2841918373324488	0.0026700097550302	0.1347898651852556	0.0026700097550302	0.1364491606175576	0.0212942496123519	0.6579895931068915	0.002378310990394	0.4122511344202064	0.002378310990394	0.4178930036533277	0.0005371153659974	0.6046431622985855	6.152023820442214e-05	0.3795347496478833	6.152023820442214e-05	0.3848130507736055	0.0062691762066576	0.34048989278725	0.0062691762066576	0.3455790600185262	DRD2	9031	ANKK1	96942	TTC12	170142	False	False	False	alt	-100	0.03577	80	0.0945
628	chr11	113493925	G	T	rs4245150	0.0003043652999999	0.7763220744247351	0.0097681506199999	0.7757161452993534	0.013060755562854	0.7818272481904908	6.3189872436492825e-06	0.8187224563867052	0.0001232298552992	0.8179878801618802	0.1029766421431163	0.305234669719812	-0.0003763545630298	0.5071682074788646	0.0008158621074687	0.5058496855273867	0.0013732719356805	0.3929212715376466	-4.589450786053469e-06	0.5630470411922113	1.0539332733066404e-05	0.5617551587119991	-0.0005402329187423	0.5410394407958816	0.0017658605786677	0.5400138995178058	DRD2	18234	ANKK1	106145	TTC12	179345	False	False	False	alt	0	0.0	-100	0.2507
629	chr11	113493969	T	C	rs17602038	-0.00482052144	0.8744196813469625	0.00567113952	0.8702860446237989	0.0092835020915166	0.9328671143477448	-4.046236699610374e-05	0.9256265172471708	4.9705674218059365e-05	0.9216937444396122	0.0956319487974662	0.3216450173598207	-0.0006134039685849	0.5758149765407491	0.0006374434494929	0.5718847729021745	0.0008675103093939	0.476364788124561	-5.3108389558590684e-06	0.6747828229759417	5.572065838806109e-06	0.6708818329311157	-0.001136551087064	0.6264710948379834	0.0012206789614331	0.6225375824372663	DRD2	18278	ANKK1	106189	TTC12	179389	False	False	False	ref	-55	0.01309	-95	0.1243
630	chr11	113530172	G	A	rs2514222	0.063575237	0.1429624717283047	0.083338961	0.1440463919063238	0.0219717425471523	0.4193535242903364	0.0015171016001788	0.185725878349342	0.0018885062283759	0.1870348699238709	0.2576432648213519	0.1338284397867578	0.0191391281449501	0.0766901645123041	0.0229317504290759	0.0773988487286135	0.0059357474061686	0.1437649572549623	0.0004744514588378	0.0954937720952171	0.0005457233220389	0.0962905566309835	0.0193452871894691	0.0670137269055835	0.025635082973178	0.0675830404747778	DRD2	54481	ANKK1	142392	TMPRSS5	176201	False	False	False	alt	-30	0.01813	90	0.1753
631	chr11	113569572	G	A	rs115990434	-0.15682475	0.0434574487623786	0.15682475	0.0429698427552061	0.0356827167746483	0.1472401069984445	-0.0055353855151129	0.0484602250580052	0.0055353855151129	0.0480514186735131	0.1694186928837716	0.2037925670482891	-0.0273562737467394	0.061786060085287	0.0273562737467394	0.0605490003439566	0.0060259547769842	0.1343258221429884	-0.0009623244317841	0.0534265523984746	0.0009623244317841	0.0523989359196819	-0.0418247500907261	0.0301651508489914	0.0418247500907261	0.029686792094842	DRD2	93881	TMPRSS5	136801	ANKK1	181792	False	False	False	ref	90	0.4595	100	0.0896
632	chr11	113580177	A	G	rs59472562	0.0090857403	0.4573623604666266	0.0301738851	0.4590072119561507	0.0227291156063462	0.3951231978547057	0.0001691772956097	0.4326462738298139	0.0006719848702389	0.4343512834961823	0.002521361881825	0.9005031653612301	4.05480581097512e-05	0.8206736408176147	8.764659318785286e-05	0.8225579936607762	5.4472889570740525e-05	0.8798125234044484	7.23839494746714e-07	0.7976497706097537	1.8510422725543024e-06	0.799553591369832	0.000218567516743	0.8103008944130717	0.0003637293391837	0.8123453962798973	DRD2	104486	TMPRSS5	126196	ANKK1	192397	False	False	False	alt	-55	0.03235	-85	0.1533
633	chr11	113590958	C	A	rs11607834	-0.0116236242	0.7224001644139435	0.0132387554	0.7175992754761937	0.0165551992711839	0.6148795467773854	-0.0001958057751414	0.7260833196627334	0.0002200476048593	0.7211602186095275	0.0679184124575236	0.3783110850065374	-0.0007970333957691	0.5123293235807225	0.0009346627114955	0.5083233086340784	0.0010878408737793	0.4210978313713889	-1.3119424896168425e-05	0.5366699296838304	1.5185130941262916e-05	0.532531761237162	-0.0019382402428161	0.5169174449931893	0.0022368117185179	0.5126654984327411	DRD2	115267	TMPRSS5	115415	ZW10	182777	False	False	False	ref	-65	0.01404	-100	0.11633
634	chr11	113590995	C	G	rs11607852	0.021740340406	0.5593099948417178	0.021740340406	0.5655004104863417	0.0253182850977988	0.3222165396501389	0.0005722150540347	0.4789447804781397	0.0005722150540347	0.4844378491944895	0.0846837781663422	0.335815199185568	0.0018703590175343	0.4265743740419377	0.0018703590175343	0.4317976517668719	0.0022111049686709	0.3008541571963279	5.136425571330376e-05	0.3939264143454039	5.136425571330376e-05	0.3989535685323644	0.0039680314077397	0.4165222670899435	0.0039680314077397	0.4215323989739689	DRD2	115304	TMPRSS5	115378	ZW10	182740	False	False	False	alt	-100	0.02869	-100	0.1217
635	chr11	113633414	T	C	rs11605737	0.019870395196	0.2311706257010276	0.065808584804	0.2313916705625296	0.0832603270518341	0.0092974868028161	0.0025212231780517	0.0800419835176529	0.0059698002442645	0.0797494946540343	0.0443131206492692	0.4742595627537606	0.0018017035131276	0.3881498966216113	0.0030846452625458	0.3882169182194855	0.003925365872892	0.2141237816124858	0.0001928827804155	0.2152783683597971	0.0002911395174587	0.2151230135104293	0.0035638876975355	0.3170279817008222	0.0074750090726138	0.3173673762800569	TMPRSS5	72959	ZW10	140321	CLDN25	146383	False	True	False	alt	100	0.01953	-65	0.03735
636	chr11	113633965	T	A	rs11606258	0.0875484098	0.1559506427971383	0.0875484098	0.158141366236133	0.0260494360496207	0.3062768626012192	0.0027928921670994	0.1682981199448959	0.0027928921670994	0.1704441712530719	0.0278661212101216	0.5763488409233631	0.0034473818115429	0.3620873438441508	0.0034473818115429	0.3666070697072476	0.0008207962489145	0.5182730324674075	0.000120547163801	0.3281005612954636	0.000120547163801	0.3321864805382249	0.0079888489327306	0.288846410616297	0.0079888489327306	0.2925280124127468	TMPRSS5	72408	ZW10	139770	CLDN25	145832	False	False	False	alt	60	0.10425	-60	0.02673
637	chr11	113648213	A	G	rs17532254	-0.0426738448	0.3635616092005901	0.0426738448	0.3592719060575893	0.0265453250011349	0.2957126649845746	-0.0013028246014915	0.3136259827205088	0.0013028246014915	0.3098923205936469	0.0034830589554946	0.874436629163515	-0.0002301448072664	0.7707461449286395	0.0002301448072664	0.7640843606206151	0.0001038862148753	0.8284854881947651	-7.620686162801013e-06	0.7196563523988019	7.620686162801013e-06	0.7130109678820495	-0.0007134373659726	0.7554692489868985	0.0007134373659726	0.7488990557385612	TMPRSS5	58160	ZW10	125522	CLDN25	131584	False	False	False	ref	100	0.01494	-45	0.1082
638	chr11	113649400	A	G	rs11602504	0.0605993849999999	0.2358058021537983	0.0605993849999999	0.2387983336618152	0.0733847303169932	0.0152310914108525	0.0048231560240015	0.0833560474713723	0.0048231560240015	0.0842345018925184	0.0242931608986836	0.7179452119932909	0.000395358871933	0.6813404206267272	0.000395358871933	0.688014081343861	0.0013780271424708	0.5441767682620435	2.4694610032560048e-05	0.5194029074740986	2.4694610032560048e-05	0.5256186646741864	0.0009229322688132	0.6968237153311377	0.0009229322688132	0.7033796836544516	TMPRSS5	56973	ZW10	124335	CLDN25	130397	False	True	False	alt	100	0.1012	95	0.2297
639	chr11	113650237	C	T	rs61904990	-0.0114396977999999	0.5899178554939833	0.0200926442	0.585954900968922	0.016755204854793	0.6119410916333856	-0.0002173395856817	0.6166978565146811	0.0003354853841467	0.6125525989652854	0.096180429547029	0.3201838143137995	-0.0018103653233308	0.394993816079998	0.0020909130792072	0.3915813711003079	0.0016397011641016	0.3606568991614104	-3.222991512349771e-05	0.4247590584491232	3.606046454256792e-05	0.4210607801871529	-0.0035647124806175	0.3867345083611094	0.0044092903566361	0.3831476564522977	TMPRSS5	56136	ZW10	123498	CLDN25	129560	False	False	False	ref	-95	0.1526	100	0.0993
640	chr11	113651868	T	C	rs17610915	-0.08537123188	0.1688137179801366	0.08537123188	0.166612639038426	0.0451115142294657	0.0776050070874565	-0.0040329112002404	0.1088529240306623	0.0040329112002404	0.1077013033316211	0.0472204810134934	0.4739615687562186	-0.0044375459396594	0.3354632877230429	0.0044375459396594	0.3308444945175455	0.0022421908179222	0.3256031647722313	-0.0002226379057426	0.2421604182915991	0.0002226379057426	0.2386149208260656	-0.009430569760153	0.2717121549309393	0.009430569760153	0.2679700450336934	TMPRSS5	54505	ZW10	121867	CLDN25	127929	False	False	False	ref	90	0.0764	80	0.2646
641	chr11	113652332	T	G	rs61904994	0.119463812	0.0752965338759062	0.119463812	0.0762981359552437	0.0510534291498611	0.052388055793724	0.0061646390215847	0.0430255502154276	0.0061646390215847	0.0433253015181388	0.0338738411797696	0.5236436939308121	0.0044085523749688	0.2697129374069351	0.0044085523749688	0.2739687463412119	0.0016938522207663	0.3556916858430857	0.0002232119864604	0.1755917160828464	0.0002232119864604	0.1784858362515507	0.0110793111411698	0.1929122232436315	0.0110793111411698	0.1962995119046845	TMPRSS5	54041	ZW10	121403	CLDN25	127465	False	False	False	alt	55	0.0294	90	0.164
642	chr11	113653484	C	T	rs11600745	-0.0417222203999999	0.1587074196810665	0.084956506	0.1576312740833081	0.0324891262065848	0.1934610472215155	-0.001787937400599	0.1391495054884469	0.0032150537502929	0.1383692230499324	0.0011118075946025	0.965743063879442	-0.0001344197531402	0.8296220801760787	0.0001463654871259	0.82536672241502	4.913285384995112e-05	0.9250376676842424	-6.590817904358653e-06	0.7581086902648579	6.985133480508789e-06	0.7537806818781868	-0.0004074428425324	0.8277193470800909	0.0004321863349938	0.8233589842105473	TMPRSS5	52889	ZW10	120251	CLDN25	126313	False	False	False	ref	15	0.004852	95	0.0094
643	chr11	113654447	C	T	rs73004093	-0.0893387718	0.1417695299428451	0.0893387718	0.1398948846835409	0.0291645646410313	0.2440475774174732	-0.0026553167965734	0.1460796997373064	0.0026553167965734	0.1443059821706549	0.0019151463165187	0.93255556701442	-0.0001956665125666	0.7641097182301236	0.0001956665125666	0.7575173397435444	6.649275381303548e-05	0.8828094843396284	-7.041002100948333e-06	0.7004216783977752	7.041002100948333e-06	0.6939612286104356	-0.0006128138299626	0.7617920415921944	0.0006128138299626	0.7551951474778847	TMPRSS5	51926	ZW10	119288	CLDN25	125350	False	False	False	ref	75	0.04776	80	0.02368
644	chr11	113655426	C	T	rs11601890	0.0189797218	0.4678878449706456	0.0286967802	0.4710498009513634	0.0503397404066063	0.0549025172177405	0.0009623585508137	0.2388823872540096	0.0014055412729923	0.2408050513296168	0.0001410379070304	0.9991945181594488	2.065746577368165e-06	0.9753101393077308	3.788856631417417e-06	0.9796294684677356	7.214777955058511e-06	0.990121271629796	1.0778739375981193e-07	0.9419067435230836	1.863762602343665e-07	0.9460581836215164	9.897396984593046e-06	0.9793248134973837	1.1546963148691892e-05	0.983730248128644	TMPRSS5	50947	ZW10	118309	CLDN25	124371	False	False	False	alt	90	0.0559	95	0.0654
645	chr11	113656345	T	A	rs11601548	0.0311612932	0.4395229249038444	0.0311612932	0.4453828372363689	0.0189251526268363	0.5215701991362279	0.0005624101634841	0.4603661019372752	0.0005624101634841	0.4662137558153084	0.0095452146085578	0.7434076825605703	0.0003613374154897	0.6483991864939377	0.0003613374154897	0.6546062974304095	0.0001641354320609	0.7457918486746626	5.881818036726736e-06	0.6513415658186759	5.881818036726736e-06	0.6576788034022196	0.0012742898617662	0.6170983027471805	0.0012742898617662	0.6232041320510694	TMPRSS5	50028	ZW10	117390	CLDN25	123452	False	False	False	alt	-65	0.01938	100	0.1599
646	chr11	113656479	G	A	rs11607747	-0.04783822	0.3226768243691945	0.04783822	0.3184680283537285	0.0314413544690804	0.2009828515853469	-0.0015185521505014	0.2567126774282492	0.0015185521505014	0.2535532158539667	0.025936128798126	0.5753589970707064	-0.0008629906402763	0.5088381055445887	0.0008629906402763	0.5033174443497237	0.0008157948377529	0.4911892496966048	-2.7374727689454405e-05	0.4404568346845707	2.7374727689454405e-05	0.4351041519200496	-0.0026426049948863	0.4744045378038157	0.0026426049948863	0.4689002708700366	TMPRSS5	49894	ZW10	117256	CLDN25	123318	False	False	False	ref	60	0.04498	60	0.09467
647	chr11	113663015	G	A	rs11603480	-0.0611695047	0.2365834327556349	0.0626941444999999	0.2343780981622244	0.0279180754456633	0.2617095463233191	-0.0016227964786979	0.2455224140400747	0.0016721249707463	0.2436450617230568	0.0014458447428325	0.9545814777320772	-0.0001069212109117	0.835414020630672	0.0001071789978168	0.8312626569290681	3.247072457449584e-05	0.9397458153349432	-2.434012272403482e-06	0.8054195614264126	2.4423527600729213e-06	0.8013396700292252	-0.0003538319421991	0.8323292409463435	0.0003571310745273	0.8282307129708701	TMPRSS5	43358	ZW10	110720	CLDN25	116782	False	False	False	ref	80	0.02515	-60	0.08234
648	chr11	123401386	T	C	rs6590000	0.04726065188	0.323942348309526	0.04726065188	0.3271919332743646	0.0700536985737	0.0176608160411449	0.0033201857926445	0.1469950895805513	0.0033201857926445	0.1483762342710206	0.0132649863086007	0.7279483979390791	0.0010010270542919	0.6138983639497219	0.0010010270542919	0.6201086797932215	0.0009023301983799	0.5107108186759105	6.733281614978214e-05	0.4414190764713603	6.733281614978214e-05	0.4467983493668453	0.0026137375870145	0.5655614311026731	0.0026137375870145	0.5714455901085871	GRAMD1B	42957	CLMP	206095	SCN3B	253858	False	True	False	alt	30	0.013535	-100	0.09595
649	chr11	123504651	T	C	rs11219174	0.0826153018	0.1541135292846708	0.0826153018	0.1564910580489072	0.0280895696570211	0.2613577404977409	0.0022877248032678	0.1561149185116055	0.0022877248032678	0.1582057974253052	0.0158160403813796	0.6467260904149874	0.0013014597139281	0.434698529919372	0.0013014597139281	0.4400088010580326	0.0004386149373018	0.5823125668417127	3.575151842326606e-05	0.388705556484624	3.575151842326606e-05	0.3939836779248525	0.0040051466464319	0.3781513349468252	0.0040051466464319	0.383470523023546	GRAMD1B	146222	SCN3B	150593	ZNF202	237024	False	False	False	alt	-50	0.004913	-65	0.10474
650	chr11	123528661	G	A	rs11601260	-0.0769433986	0.1740679654606395	0.0769433986	0.1717007776850132	0.0465812395764077	0.071185237480843	-0.0035858176094532	0.098267739516384	0.0035858176094532	0.0970474992627881	0.0304625383524132	0.5417986372776337	-0.0026791754704032	0.3572999085337599	0.0026791754704032	0.352328537181554	0.0014126734946046	0.3862264068675757	-0.0001228348564413	0.2557002485268663	0.0001228348564413	0.2517273623866699	-0.007177262379994	0.2882241926872515	0.007177262379994	0.2836754790733984	SCN3B	126583	GRAMD1B	170232	ZNF202	213014	False	False	False	ref	100	0.06396	80	0.0836
651	chr11	123533712	C	T	rs111454416	0.0565765088	0.2821438832835247	0.0565765088	0.2851544360878942	0.0387134001041504	0.1214426195218969	0.002529805394493	0.1916702788581024	0.002529805394493	0.1938771738779034	0.002037214212662	0.9196483068990284	0.0001151409827651	0.8079477087277176	0.0001151409827651	0.814701361589421	7.743441150223317e-05	0.8466067831151455	5.048008200691182e-06	0.7187323210397374	5.048008200691182e-06	0.7252508155836749	0.0003728019530863	0.8035348738787729	0.0003728019530863	0.8102475925509587	SCN3B	121532	GRAMD1B	175283	ZNF202	207963	False	False	False	alt	20	0.04514	95	0.1987
652	chr11	124565509	G	A	rs2212756	0.0125912465	0.7246147329013567	0.0125912465	0.731308832745829	0.0195712100109186	0.50131905705914	0.0002466727613782	0.687295817640229	0.0002466727613782	0.6941928032152802	0.0347588334268087	0.5069872000879072	0.000513981436361	0.5913415490694801	0.000513981436361	0.5973387224237069	0.0006881569106062	0.5088938519783701	1.0226199418903211e-05	0.5860427327273803	1.0226199418903211e-05	0.5921189653018587	0.0014804856322786	0.5804663754087195	0.0014804856322786	0.5864761790198234	OR8A1	1152	OR8B12	20176	PANX3	45920	False	False	False	alt	-20	0.007385	70	0.01941
653	chr11	124569987	G	A	rs1942660	-0.288903332	0.0095851337835325	0.288903332	0.0095290900038359	0.0552120678020329	0.0409835950593757	-0.0163922066257365	0.0095719710909532	0.0163922066257365	0.0095600379034435	0.0572160271848503	0.4351964376784384	-0.0170160522516754	0.1125488886153529	0.0170160522516754	0.1105159342124186	0.0031530162764276	0.255084048443009	-0.0009645061634437	0.0646661527359769	0.0009645061634437	0.0636052795628136	-0.0313450562502061	0.05751473792498	0.0313450562502061	0.0566620929861659	OR8A1	3326	OR8B12	24654	PANX3	41442	False	True	True	ref	80	0.02159	80	0.2024
654	chr11	124770773	T	C	rs6590093	-0.00436584658	0.7200790677256804	0.01388200138	0.716498587155542	0.0223164938811223	0.3984441829791809	-0.0001493779223553	0.6731258236600416	0.0002782350322432	0.6691871874983965	0.0051400481673319	0.8299926390308097	1.2477186748403269e-05	0.8384228354082315	8.783001243391675e-05	0.8344011708948728	0.0001008118246231	0.8091791777825527	-1.8147634105609849e-07	0.822982424359187	1.5397240600089594e-06	0.8188913513947994	2.144436013327524e-05	0.8325229222215107	0.0002969219095377	0.8285337477888132	ESAM	8483	VSIG2	18518	MSANTD2	29933	False	False	False	ref	-100	0.01483	-100	0.2137
655	chr11	124782170	A	G	rs11601322	0.0357655515	0.3897917404056786	0.0371636741	0.3934681711385337	0.0127560165344204	0.7922414477168936	0.0004649682258292	0.5357850163784965	0.0004851425442947	0.5400327350414192	0.0003563062914453	0.9927257593422352	9.738284421794087e-06	0.9504550500809208	1.0660802708907808e-05	0.9549030274892324	4.6713822984517775e-06	0.9944620759488826	1.2627294713878373e-07	0.9575931931589612	1.395844963885734e-07	0.9620359635358476	2.639305862558148e-05	0.9593311128766614	2.969219095377915e-05	0.9637493960932098	MSANTD2	18536	ESAM	19880	VSIG2	29915	False	False	False	alt	95	0.04614	5	0.0354
656	chr11	126836666	T	G	rs7938753	-0.00325104674	0.6756748580473678	0.0155717356599999	0.6759061046599878	0.0186179539998389	0.5379533148077679	-5.631649220059999e-05	0.6566011246869704	0.0002910809708502	0.6567923493908671	0.0072580911220348	0.7757070400088512	-2.189206272970364e-05	0.78265181384742	0.0001178849431235	0.7837901505500346	0.0001330575107374	0.7739759262611752	-3.976392924033117e-07	0.7760305555656213	2.180171768438624e-06	0.7772561527528475	-0.0001030978852561	0.7721128439436254	0.0004412589488963	0.7731446662347812	KIRREL3	166794	ST3GAL4	481025	DCPS	532605	False	False	False	ref	80	0.0597	-95	0.1023
657	chr11	130848319	T	G	rs35274053	-0.02303481658	0.5520638941901566	0.02303481658	0.5461716267211078	0.047652983590082	0.0681486442940206	-0.0011771643769703	0.3167036214967745	0.0011771643769703	0.3129585296289874	0.1045115634588103	0.2960107552416267	-0.0026881665284784	0.3725646412099083	0.0026881665284784	0.3676272691463917	0.005023637987012	0.1643423299383662	-0.0001387003901222	0.2629842950660602	0.0001387003901222	0.2593061122728907	-0.0053066543499059	0.3618535096824906	0.0053066543499059	0.3568876654331431	SNX19	68160	ADAMTS15	399673	ADAMTS8	419710	False	False	False	ref	95	0.03693	5	0.004333
658	chr11	130875082	G	A	rs10791102	-0.23903577	0.016403302822207	0.23903577	0.0162752240955519	0.1098287709134328	0.0028661604752073	-0.0264597648075507	0.0042442040544965	0.0264597648075507	0.0042475099012992	0.1845278941638348	0.1911113400137376	-0.0459289965790461	0.0345677775361287	0.0459289965790461	0.0338781420505323	0.0207023635131933	0.0231228943114694	-0.0052251247083308	0.0090780970848977	0.0052251247083308	0.0090079361944167	-0.0632567384777803	0.0136733374286947	0.0632567384777803	0.0135037214594216	SNX19	41397	ADAMTS15	426436	ADAMTS8	446473	False	True	True	ref	100	0.01343	-15	0.11865
659	chr11	130926783	C	T	rs10894286	-0.225993054	0.017727302019794	0.225993054	0.017588013260914	0.0335106506602383	0.1737019215258486	-0.0076957617364133	0.030419291532224	0.0076957617364133	0.030258250198581	0.0239648972320279	0.5993399732030942	-0.0050047195538863	0.2514329487210807	0.0050047195538863	0.2473600920097376	0.0007733542776013	0.5061827088956536	-0.0001637282575656	0.2060013301294893	0.0001637282575656	0.2026237717810411	-0.0124550493220282	0.1790560889442825	0.0124550493220282	0.1761944654957703	SNX19	10304	NTM	443696	ADAMTS15	478137	False	True	False	ref	100	0.03748	95	0.2136
660	chr11	130944198	A	G	rs11222406	-0.238769702	0.0156081883431447	0.238769702	0.015509352395639	0.0485820394714795	0.0629549162876055	-0.0119840883890137	0.0162296442755841	0.0119840883890137	0.0161505493978834	0.0049388010953118	0.828428600533845	-0.0011017594417649	0.4611433715625634	0.0011017594417649	0.4557114077324734	0.0002281404851977	0.6929328664409442	-5.282457665018145e-05	0.3365849744854118	5.282457665018145e-05	0.3318614176961962	-0.0029543729999009	0.4452493205083398	0.0029543729999009	0.4397203388893564	SNX19	27719	NTM	426281	ADAMTS15	495552	False	True	False	ref	-80	0.0961	-75	0.10736
661	chr11	131006455	G	A	rs10894307	0.0054030544	0.4126378812208243	0.0341815064	0.4140252096760556	0.0145821455769539	0.7081217843432503	9.418676275060002e-05	0.4999771628478511	0.0004973860636563	0.5012152213180684	0.0003117680050146	0.9950432275076828	2.23660586439121e-06	0.9511423633082886	1.0662449044549222e-05	0.9529336754919124	4.726298868981343e-06	0.9944685762226594	4.0387614495751946e-08	0.951782762697798	1.608743040440513e-07	0.9536087392169864	1.3196529312790752e-05	0.9549926856665466	3.629045561017453e-05	0.9567697606755594	SNX19	89976	NTM	364024	ADAMTS15	557809	False	False	False	alt	90	0.0751	-5	0.03564
662	chr11	131022000	G	A	rs10894308	-0.01049089356	0.7790503670486882	0.01049089356	0.772358222768808	0.0132816334548983	0.7626624116869669	-0.0001386867861853	0.8093100924830786	0.0001386867861853	0.8025242256379878	0.0043383590115799	0.8426965515122687	-4.377085144075217e-05	0.8732533450605726	4.377085144075217e-05	0.8663420137673477	6.13878196760915e-05	0.8676570304452951	-6.119887030227833e-07	0.8866708781082554	6.119887030227833e-07	0.8797328432896444	-0.0002037214212661	0.8538552733611658	0.0002037214212661	0.8469107261660067	SNX19	105521	NTM	348479	ADAMTS15	573354	False	False	False	ref	-100	0.04507	70	0.06073
663	chr11	131287818	G	A	rs74349870	-0.03687880266	0.3910851836826631	0.03687880266	0.3861331560561539	0.0310561954432279	0.2125055519506419	-0.0012168128971453	0.3109222101328595	0.0012168128971453	0.3073013567451901	0.040722015110026	0.5095246844640325	-0.0012964390550792	0.4909173840898014	0.0012964390550792	0.4852998175905649	0.0011419492529298	0.4458999835613065	-3.9167026412393776e-05	0.4359610933399245	3.9167026412393776e-05	0.4307437953522402	-0.0032463462109464	0.463516797849865	0.0032463462109464	0.4579427369023586	NTM	82661	SNX19	371339	ADAMTS15	839172	False	False	False	ref	70	0.01236	-95	0.0779
664	chr11	131509057	A	T	rs540409	-0.00818849296	0.7414191712119524	0.01237415552	0.739614964693825	0.0110582026436215	0.8620801510204691	-9.305420781950333e-05	0.818998605685032	0.0001385628107138	0.8173058478512839	0.0008602487545775	0.9731587613206166	-1.402687270320482e-05	0.958009493228704	1.4465043487223687e-05	0.9566646193983483	9.099428132397283e-06	0.9843758059666756	-1.462702962956595e-07	0.9693111804406128	1.5043395742272057e-07	0.96799129407539	-5.938438190755074e-05	0.9551921333712788	5.938438190755074e-05	0.9516584608614024	NTM	138578	SNX19	592578	ADAMTS15	1060411	False	False	False	ref	25	0.00733	-60	0.1547
665	chr11	131511160	C	T	rs407056	0.2549325272	0.0162718668052905	0.2549325272	0.0163386305944607	0.0554815549970915	0.0411874947447687	0.015520703919782	0.0140320334237078	0.015520703919782	0.014042261253562	0.2454958595889281	0.1460847065799296	0.0715747070531118	0.0210399838034391	0.0715747070531118	0.0212686085692991	0.0143484471985462	0.0473931321507987	0.0044907913384417	0.0146436411955068	0.0044907913384417	0.0146963409044649	0.0794793969186103	0.0097034156459546	0.0794793969186103	0.0097178674578173	NTM	140681	SNX19	594681	ADAMTS15	1062514	False	True	False	alt	-75	0.09644	100	0.02148
666	chr11	131511952	T	C	rs408376	0.11876314654	0.084859789283973	0.11876314654	0.08589866017702	0.0648033026071969	0.0237351465959982	0.0082190302201388	0.0393861483278288	0.0082190302201388	0.0396280031746937	0.4043111411698722	0.0681610095057788	0.0473525234377608	0.0380268844732529	0.0473525234377608	0.0387304325064039	0.0262304882075359	0.0130027650268927	0.0033134237087651	0.0200634312682767	0.0033134237087651	0.0202414481617142	0.0397702154333409	0.039542195363254	0.0397702154333409	0.0402070314064029	NTM	141473	SNX19	595473	ADAMTS15	1063306	False	False	False	alt	-35	0.006714	-45	0.186
667	chr11	131521018	A	G	rs12279734	0.0141074366	0.6602434560241012	0.0160733498	0.6628237190545624	0.0113416481170474	0.8304884515095294	0.0001329901328459	0.7834078568926819	0.0001570234775519	0.7856601317130868	0.0040835010392266	0.8732970877195737	7.928203859734634e-05	0.8544033850345509	8.206397298660198e-05	0.8564777269238241	5.2487374225713935e-05	0.9015485834159044	9.873050505026003e-07	0.8832767513676454	1.0228924972218792e-06	0.885192202107062	0.0002960971264557	0.8487448249953735	0.0003092936557684	0.8509049220778815	NTM	150539	SNX19	604539	ADAMTS15	1072372	False	False	False	alt	-70	0.007446	-100	0.156
668	chr11	131525093	T	G	rs401560	0.0742064084	0.1716244481274658	0.0742064084	0.1744453649786698	0.0221872677401383	0.4083568620788345	0.0017048069256982	0.2070189089245479	0.0017048069256982	0.209969949331499	0.1379251756787964	0.2439239535056621	0.0104401299469297	0.1469951577279427	0.0104401299469297	0.1496633748912105	0.0029666717514717	0.2447935716897845	0.0002322723313724	0.1600795235007629	0.0002322723313724	0.1628452769886701	0.017741908877965	0.1102421379954306	0.017741908877965	0.1123181504899958	NTM	154614	SNX19	608614	ADAMTS15	1076447	False	False	False	alt	100	0.0928	100	0.1804
669	chr11	131525401	C	T	rs390812	-0.425689834	0.0032009848883572	0.425689834	0.0032082905766953	0.0717465882829943	0.0163212093065619	-0.0317357876239427	0.0032128312339228	0.0317357876239427	0.0032181032078082	0.2492016099765761	0.1395295717403633	-0.1031825117547844	0.0089451186642678	0.1031825117547844	0.0088588498975283	0.0179636116146609	0.0299214949778232	-0.0077483155163835	0.0049706655426482	0.0077483155163835	0.0049907503532412	-0.1131709610372471	0.0029399826614254	0.1131709610372471	0.0029219177661448	NTM	154922	SNX19	608922	ADAMTS15	1076755	False	True	True	ref	95	0.0315	-100	0.1401
670	chr11	131525893	G	A	rs378523	-0.0022153955999999	0.5108486929282418	0.0265502612	0.511874569854629	0.0127894995411452	0.7834693632501373	-7.920601875484e-05	0.608902081935992	0.0003500334756933	0.6096321790037109	0.1523918709379433	0.227592889358617	0.0004505535070203	0.2715737827853949	0.0040828387611968	0.2725984312153552	0.0018522141840252	0.3279666291845888	-1.939952000499243e-06	0.3464545335555766	5.089032337243786e-05	0.3475375261114413	0.0004321863349938	0.278076893727301	0.0067714691036256	0.2789852241623153	NTM	155414	SNX19	609414	ADAMTS15	1077247	False	False	False	ref	-100	0.06104	-100	0.2325
671	chr11	131525976	C	G	rs451456	0.0839847604	0.1363938528153002	0.0839847604	0.138467361838309	0.0406746220492732	0.1042629034782052	0.0034491334102792	0.0903215943851223	0.0034491334102792	0.0914703415662158	0.1309879251756787	0.2556013708514834	0.0116229358758677	0.1371836026590419	0.0116229358758677	0.1398865173593601	0.0051947537940799	0.1572612254326294	0.0004655142599832	0.0994542596703767	0.0004655142599832	0.1011732996115773	0.0199053149021806	0.0961263301114855	0.0199053149021806	0.0979150228976713	NTM	155497	SNX19	609497	ADAMTS15	1077330	False	False	False	alt	-85	0.05496	-75	0.2825
672	chr11	131526164	T	A	rs405479	0.0148909376999999	0.5138765918900725	0.0269726317	0.5153624230316604	0.0313202048256433	0.2042361983557398	0.0004030072459901	0.398580808924767	0.0008430134599718	0.3990256199423354	0.0515060539078222	0.4392668513075718	0.0012443543206337	0.4419839196553518	0.0018217139762702	0.4435472932682907	0.001653959790631	0.3589885213782767	3.65199855541653e-05	0.3821235528769205	5.7432096203234576e-05	0.3833436612146464	0.0025221866649071	0.414186225174247	0.0041008214839496	0.4156487625697235	NTM	155685	SNX19	609685	ADAMTS15	1077518	False	False	False	alt	85	0.0357	-100	0.03015
673	chr11	131526874	T	A	rs426913	0.0664052522	0.2069162068419768	0.0664052522	0.2097884308847637	0.0157110106440931	0.655739843893292	0.0011369026870204	0.3134014325766469	0.0011369026870204	0.3173285019762676	0.0161690475404968	0.6507429274853286	0.0009851929461404	0.4774308916259314	0.0009851929461404	0.4829145287569451	0.0002417461165817	0.6866344511634774	1.5755402835768683e-05	0.509897938549903	1.5755402835768683e-05	0.5156554136816556	0.0030508726205007	0.4314983402000695	0.0030508726205007	0.4367824665669362	NTM	156395	SNX19	610395	ADAMTS15	1078228	False	False	False	alt	55	0.07227	55	0.137
674	chr11	132507166	C	T	rs7119976	0.0028562272319999	0.9271481961744124	0.002930287712	0.9325344713923444	0.01809171453891	0.5524287327265955	5.272272447933263e-05	0.9122300695880464	5.392154448763705e-05	0.9175750436573656	0.0126925868496584	0.6907747361930143	4.894040200060185e-05	0.8707166280909788	4.937379179548015e-05	0.8759593017915689	0.0002250104440611	0.6963242364720046	8.632129500719374e-07	0.8659421815473491	8.702282481146611e-07	0.8710269678310097	0.000183926627297	0.8661371626734038	0.000183926627297	0.8721453280323411	OPCML	1025335	NTM	1136687	SPATA19	1338372	False	False	False	alt	70	0.007477	-75	0.05307
675	chr11	132511185	A	G	rs7106636	0.010281403254	0.7303104976124402	0.012056256746	0.7339532625885972	0.0163921683201538	0.6246596400746001	0.0001464910877752	0.7561050690588241	0.0001785453698931	0.7593369691820899	0.0046715713767278	0.8290126095516756	3.703866742606845e-05	0.873397038438598	4.941925762061657e-05	0.8759780013476334	7.80727128775065e-05	0.8370664947551809	5.2294088843347e-07	0.8773139975510345	7.466098663763422e-07	0.8795719873330383	0.0001402131239483	0.8679142238953232	0.0001929992411995	0.8711173172675952	OPCML	1021316	NTM	1140706	SPATA19	1334353	False	False	False	alt	-25	0.00383	55	0.06384
676	chr11	132511627	G	A	rs2155540	-0.075287174	0.1817966161617385	0.075287174	0.1791889520960496	0.0245203653835927	0.3444727174556719	-0.0020212533871834	0.1968752812714153	0.0020212533871834	0.1943354019165588	0.008111741611956	0.7629579957969204	-0.0008044432339937	0.5610902144212266	0.0008044432339937	0.5551793501613763	0.0002191896363909	0.7161167376084783	-2.3918575552880824e-05	0.5215705191315138	2.3918575552880824e-05	0.5157727440100929	-0.0025180627494968	0.5124390077840489	0.0025180627494968	0.5064759665843246	OPCML	1020874	NTM	1141148	SPATA19	1333911	False	False	False	ref	-10	0.002655	-30	0.02606
677	chr11	132513517	T	C	rs4937706	-0.0295554333999999	0.3896924804364791	0.0371886357999999	0.3866202650565596	0.0364153147163398	0.1400487465043356	-0.0010688315765463	0.2654952830383397	0.0013215008749016	0.2631619293731623	0.0215862228233974	0.594625289183712	-0.0004296490692527	0.5347146059203682	0.0006665576263279	0.5305973361959734	0.0007835695118298	0.4829282451579036	-1.606974050407012e-05	0.4435833440395403	2.3911733260091963e-05	0.4397271067176335	-0.0014788360661145	0.5075592900773922	0.0021370129655899	0.5033017403245909	OPCML	1018984	NTM	1143038	SPATA19	1332021	False	False	False	ref	-100	0.002228	-100	0.07874
678	chr11	132514734	T	G	rs4310627	0.0904453916	0.1294249553487547	0.0904453916	0.1313220984698568	0.0246096520607821	0.3409252476732611	0.0024005051106599	0.1547890304484182	0.0024005051106599	0.1569326233435208	0.0340866352149384	0.5244315141879646	0.00317229437983	0.3187328946174624	0.00317229437983	0.3232318236101027	0.0008311123840435	0.4875568639862899	8.607528694024568e-05	0.3002945702310739	8.607528694024568e-05	0.3045383464049307	0.0079467849955461	0.254109226323402	0.0079467849955461	0.2578011075602353	OPCML	1017767	NTM	1144255	SPATA19	1330804	False	False	False	alt	100	0.03015	-100	0.171
679	chr11	132515145	C	T	rs1939971	0.0045280235999999	0.6576994477173345	0.016261846	0.6598995222431597	0.0221400718628496	0.4123223065243876	3.720709343686e-05	0.5919738691135581	0.0003710982317966	0.5938158302037211	0.0119585299066345	0.7054720981575849	1.2417849345162537e-05	0.7227740659157923	0.0002032832685841	0.7241485932114078	0.0002665500484442	0.684344005852797	-8.331545549232894e-07	0.6987754341225167	4.726637840380374e-06	0.7000666000359683	9.649962059980002e-05	0.7167192902243723	0.0006491042855728	0.7181579895567174	OPCML	1017356	NTM	1144666	SPATA19	1330393	False	False	False	alt	-90	0.0398	-100	0.2422
680	chr11	132515155	T	C	rs1939970	-0.02384916044	0.5236833640228368	0.02571140756	0.5194095581106837	0.0390202194779682	0.1164865996519653	-0.0009046424391566	0.3436895292393596	0.0009785937200707	0.3406540305931507	0.0115205700900662	0.7125627454537287	-0.0002436332325782	0.6893264880277749	0.000269828858196	0.6856796207222808	0.0004657688899958	0.5928935474533654	-9.603452602727208e-06	0.5880704946528124	1.0643701271518607e-05	0.584482813483309	-0.0007596252185674	0.6770504831729554	0.0008668470192338	0.6734189000917138	OPCML	1017346	NTM	1144676	SPATA19	1330383	False	False	False	ref	-80	0.04004	-95	0.2087
681	chr11	132520056	G	A	rs644487	-0.1816523259999999	0.0337776899718741	0.1816523259999999	0.0334841873722632	0.0382210392900461	0.1259617356241245	-0.0075366674578138	0.0381104557644278	0.0075366674578138	0.037943711785148	0.163253439345452	0.2139225130705182	-0.0332272740441547	0.0563138157876731	0.0332272740441547	0.0553235552457886	0.0065649850728463	0.1303902310053983	-0.0014178547499515	0.0467337736683787	0.0014178547499515	0.046091520467062	-0.0481689815578502	0.0266727965252524	0.0481689815578502	0.0263139300618723	OPCML	1012445	NTM	1149577	SPATA19	1325482	False	False	False	ref	-100	0.05273	-100	0.2815
682	chr11	132520069	C	G	rs644475	-0.05762558706	0.2367724644816037	0.06346509066	0.2347825096481109	0.0503530562691747	0.0565261063697839	-0.0030020112851228	0.148408444451159	0.003247358325975	0.1472857237430107	0.1581834977400943	0.2196541821880702	-0.0113995134858235	0.1815024949826928	0.0121607575347009	0.1790896665275077	0.0081798125550101	0.1006073714558009	-0.0006007962623127	0.1217001519296417	0.0006327799699946	0.1202151367677638	-0.0169031044835208	0.1445738131144674	0.0183118339876611	0.1429072908228026	OPCML	1012432	NTM	1149590	SPATA19	1325469	False	False	False	ref	-100	0.0436	-100	0.2236
683	chr11	132520341	T	C	rs654125	0.039178019	0.2892021802928783	0.0506983802	0.2917536804523559	0.0213734462733828	0.4293122208681033	0.0011025849840361	0.3102809151763622	0.0012382327051711	0.3128747408803948	0.1437464946719012	0.2342361571852661	0.0054703387550277	0.1998142612821207	0.0070326245433139	0.2024268665685014	0.0031995449523087	0.2397458174470521	0.0001620751812221	0.2106966585100798	0.000180470481863	0.2132671735257311	0.0099270891755468	0.171315069464707	0.0125960872290587	0.1734056304028619	OPCML	1012160	NTM	1149862	SPATA19	1325197	False	False	False	alt	-85	0.02115	-20	0.01752
684	chr11	132520659	T	C	rs10894572	0.0121092052	0.513342713898269	0.0257664691999999	0.5167612266571482	0.0136112845293475	0.7572999374931852	0.0001624244237322	0.6041045772367781	0.0003599138418627	0.6075707528248278	0.0919352710237207	0.3175604954643704	0.0010407249162929	0.3657633430033065	0.0024802436598688	0.3689131513384183	0.0012587917759045	0.3951063406019263	1.393001167775294e-05	0.4252837951653553	3.4746019224513165e-05	0.428596443198217	0.0025065157863481	0.3522159147922889	0.0052118042954702	0.3550707956564841	OPCML	1011842	NTM	1150180	SPATA19	1324879	False	False	False	alt	85	0.0809	85	0.1592
685	chr11	132521327	T	G	rs639254	-0.0396043207199999	0.398594016874802	0.0396043207199999	0.3939716544867699	0.0150316990669572	0.6844632846410337	-0.0006263896127022	0.494246443374667	0.0006263896127022	0.4887435504012032	0.0563458810332882	0.4265532312799536	-0.0024282145254852	0.401685139977927	0.0024282145254852	0.3968313427333607	0.0008850221404649	0.4788588680746039	-4.059528336746583e-05	0.4453327940234089	4.059528336746583e-05	0.4400923707160949	-0.005476559664808	0.3618659498556381	0.005476559664808	0.3570810603630434	OPCML	1011174	NTM	1150848	SPATA19	1324211	False	False	False	ref	-90	0.01851	-100	0.09186
686	chr11	132521983	T	A	rs2508976	0.01780950574	0.618159359920897	0.01981251706	0.6203642782349224	0.0175815286268607	0.5807042937985041	0.0003603817565237	0.6311461379735691	0.0003904317046084	0.6332625748615696	0.0439922800303519	0.4689484442936987	0.0006159115951099	0.57939176687708	0.0007251704501083	0.5805804206973092	0.0007598149144823	0.4941215838499161	1.2719414367186296e-05	0.5866419396957906	1.4371955438028084e-05	0.5879963900512091	0.0015406947972683	0.5688351457059573	0.001887103691729	0.5702808627755125	OPCML	1010518	NTM	1151504	SPATA19	1323555	False	False	False	alt	85	0.0324	75	0.1641
687	chr11	132524230	T	C	rs2509229	-0.0890837318	0.1422001088648214	0.0890837318	0.1400962375967736	0.0185191432804681	0.5321103480087362	-0.0019948438798877	0.2188331228026379	0.0019948438798877	0.2160779768201065	0.0156840750882517	0.6980527959988917	-0.0024504008713625	0.4654060000871668	0.0024504008713625	0.4598980225021936	0.0004046179214436	0.6843926679473923	-6.940682881721242e-05	0.4671886167434963	6.940682881721242e-05	0.461751912151239	-0.0057173963247665	0.3998445286374521	0.0057173963247665	0.3949383591633642	OPCML	1008271	NTM	1153751	SPATA19	1321308	False	False	False	ref	-70	0.03918	-100	0.103
688	chr11	132527297	C	A	rs2509228	-0.0033389856599999	0.7580347718755387	0.01080205286	0.7567451807342229	0.0143988733258439	0.719210801772453	-3.1172112071233715e-05	0.7912219876570852	0.0001504553043379	0.789875222185429	0.0174672561116425	0.6421441539148002	-0.0001667166004083	0.714901980683919	0.0002338036639866	0.7133028563042475	0.0002321362409959	0.6936552471699374	-2.0395969688934537e-06	0.7483028928269381	2.998540041257248e-06	0.7466344551285813	-0.0005055920292962	0.7026645224372079	0.0007876678433571	0.7008133430562933	OPCML	1005204	NTM	1156818	SPATA19	1318241	False	False	False	ref	-85	0.03305	-100	0.1724
689	chr11	132528266	C	G	rs2512706	0.0095745405	0.717161009697832	0.0127511882999999	0.7210886061267351	0.0122124009016249	0.8105312723379386	0.0001024322335379	0.7815126171700885	0.0001504037455782	0.7853642695366135	0.003205931839926	0.8754436155289913	2.0560305838745893e-05	0.8712351102911136	3.747269864259572e-05	0.8753927658951869	4.1456422248100347e-05	0.9052290148943068	2.0959616397045346e-07	0.8913796886929626	4.649952849334418e-07	0.895499599562725	9.814918676386013e-05	0.8660524387427524	0.0001558840025073	0.8701137968338646	OPCML	1004235	NTM	1157787	SPATA19	1317272	False	False	False	alt	-90	0.03735	10	0.03455
690	chr11	132537875	C	T	rs55945016	-0.0429651766999999	0.3431273052416786	0.0429651766999999	0.3389462548016677	0.0146753685143197	0.6763600920889515	-0.0006703392769608	0.449812788265905	0.0006703392769608	0.4447454793150869	0.0087014615156213	0.771359940811409	-0.0004187690482791	0.6588105316721713	0.0004187690482791	0.6523860442171451	0.0001083415916457	0.8137619148093546	-5.49000420688129e-06	0.6955839792531238	5.49000420688129e-06	0.689117300372134	-0.0014615156213915	0.6248703523062058	0.0014615156213915	0.6183732229013801	OPCML	994626	NTM	1167396	SPATA19	1307663	False	False	False	ref	-10	0.001709	-30	0.04758
691	chr11	132542227	A	G	rs73035374	-0.0186489168	0.5969796013020806	0.0194896432	0.5924287005173678	0.0137311462975736	0.7452322236566657	-0.0002875480431256	0.6560896811152694	0.0002975866306036	0.6513660509609772	0.0113597373890666	0.7425729557259477	-0.0001931877444743	0.7468798947826015	0.0001954482836097	0.7423314934715272	0.0001560675319998	0.7845079105746677	-2.742603709458753e-06	0.7708221453857189	2.7695953916684285e-06	0.7663297967635674	-0.0006466299363267	0.7401999342526975	0.0006532282009831	0.7356342952035836	OPCML	990274	NTM	1171748	SPATA19	1303311	False	False	False	ref	15	0.007782	-70	0.2102
692	chr11	132659602	C	T	rs6590647	-0.01447811712	0.6918651983111935	0.0150514288	0.6875583551146622	0.0179492927106323	0.5636550709907477	-0.0002645432010212	0.6896888017361831	0.0002745143329618	0.6852235236469238	0.0025510540727788	0.9034276429495648	-3.743853968332205e-05	0.9018089851261732	3.850719828992756e-05	0.897414185612374	4.562196462682748e-05	0.8987275146199581	-6.780089760380822e-07	0.8956518450587698	6.965952633476785e-07	0.8912591230034886	-0.0001492857378509	0.8935760370524326	0.0001492857378509	0.888103277809895	OPCML	872899	SPATA19	1185936	NTM	1289123	False	False	False	ref	40	0.0134	100	0.11633
693	chr11	132692230	A	C	rs3862599	0.08442249034	0.1813601138965108	0.08442249034	0.1834598350403599	0.0263241599587392	0.2967898240116692	0.0024022612529668	0.1951421042095268	0.0024022612529668	0.1973724886892238	0.7854293820725149	0.0083242822635959	0.069712608603968	0.0273213792540451	0.069712608603968	0.027530291550439	0.0207905948801547	0.0212079471724121	0.0019878801172484	0.0397559753992883	0.0019878801172484	0.0403273802375636	0.0111395203061594	0.2076295899746013	0.0111395203061594	0.210767204980133	OPCML	840271	SPATA19	1153308	IGSF9B	1264738	True	False	False	alt	100	0.2028	100	0.1904
694	chr11	132692599	G	A	rs3018396	-0.0152426055199999	0.4700037481465118	0.02995969112	0.4664289388249577	0.0263327788916376	0.2986359013282525	-0.0004697538700998	0.3964369721683153	0.0008259290393061	0.3934030649725424	0.7078808023489822	0.0145298435958252	-0.0099831055116889	0.0897256522318228	0.020785495424914	0.08865867013467	0.0185004828728697	0.0265783395704126	-0.0003065700726823	0.0950597403034108	0.0005680038336994	0.0940094608408336	-0.0036323446933456	0.3123750239970538	0.0062963940483652	0.3093479976914238	OPCML	839902	SPATA19	1152939	IGSF9B	1264369	False	False	False	ref	-100	0.2438	-65	0.2915
695	chr11	132698231	C	T	rs1940148	-0.01566296556	0.6298076794994273	0.01832406504	0.625427473813442	0.0147496289146913	0.7011381027942492	-0.0002409769180531	0.6829309047208446	0.0002769417215426	0.6784862234622703	0.0241636699548018	0.5772720757062022	-0.0003755098161981	0.6357505332278729	0.0004056448296742	0.6316501655200807	0.0003607762761714	0.6213271024666511	-5.742011326717426e-06	0.6630214914009015	6.149286533664458e-06	0.6587144056392423	-0.001219854178351	0.6176217524705508	0.0013303751113456	0.6135082668116416	OPCML	834270	SPATA19	1147307	IGSF9B	1258737	False	False	False	ref	100	0.01522	30	0.047
696	chr11	132702875	A	G	rs1939515	0.0481465846	0.292941518821602	0.0481465846	0.2973528209794086	0.0309316998994661	0.2088506565434178	0.0015574867636695	0.230963619272756	0.0015574867636695	0.2340079875311473	0.0176264392464781	0.6631404463472059	0.0006355413222849	0.5605792494842344	0.0006355413222849	0.5662482500635144	0.0005184489067284	0.5875746597879368	1.919842202983947e-05	0.4944367764130343	1.919842202983947e-05	0.5000616840296253	0.0019291676289135	0.531234466201736	0.0019291676289135	0.5370881622156115	OPCML	829626	SPATA19	1142663	IGSF9B	1254093	False	False	False	alt	80	0.0663	90	0.1098
697	chr11	133863969	T	C	rs7946883	0.0707862379999999	0.1951012820518332	0.0707862379999999	0.197498684425476	0.0572780806790115	0.0366975669423463	0.0037384790333097	0.1042914376046715	0.0037384790333097	0.1053031406342397	0.0790579327636831	0.3517693208233603	0.0053015809033376	0.2627996384740987	0.0053015809033376	0.2670091383183008	0.0045130371316241	0.1816467918400878	0.0002735714996579	0.1666810942630554	0.0002735714996579	0.1694051325818842	0.0112063277358054	0.2077755221532703	0.0112063277358054	0.2113757270601818	SPATA19	18431	IGSF9B	92999	JAM3	205103	False	False	False	alt	-55	0.00421	5	0.01488
698	chr11	133951249	G	A	rs118031494	0.00280316314	0.6741508362888466	0.01602290874	0.6754906190547199	0.0804899737582366	0.0104311060311406	0.0002382503338188	0.27816123062951	0.0013701081709228	0.2788171323470654	0.6604384546864176	0.0195050904473886	0.001739177234618	0.1579355966649174	0.0103761751156946	0.1584475185395327	0.0529664420670044	0.0017721517843304	0.0001467024160939	0.0655128304314572	0.0008843252948003	0.065911472655902	0.0007761208802084	0.4048341660979011	0.003874006136386	0.4057784210882286	IGSF9B	5719	SPATA19	105711	JAM3	117823	False	True	False	alt	70	0.01131	-100	0.2197
699	chr11	133952238	G	A	rs73034295	-0.138259174	0.0579742260866293	0.138259174	0.0572272387328205	0.0399714953455706	0.1096137211367348	-0.00571247183182	0.0500086339024387	0.00571247183182	0.0495177496937209	0.2177650028042625	0.1604632314574147	-0.0290401652910252	0.0555020564403781	0.0290401652910252	0.054324365026482	0.0085692805210795	0.0897515723112213	-0.0011839297217729	0.0433073189577305	0.0011839297217729	0.0425479577660378	-0.0408861469433538	0.0312785412932345	0.0408861469433538	0.030757152555955	IGSF9B	4730	SPATA19	106700	JAM3	116834	False	False	False	ref	45	0.05896	-100	0.2332
700	chr11	133970261	C	T	rs73036081	0.158105831	0.0480593801570039	0.158105831	0.0486414448629621	0.0283202587107327	0.2544588018220841	0.0046613975909449	0.0718607456989487	0.0046613975909449	0.0726225126774395	0.2665327768796806	0.1284661703604022	0.0459676762300539	0.0362782806705729	0.0459676762300539	0.0369045064639429	0.0077075704711847	0.104547115385051	0.0013849130868043	0.0444824543275173	0.0013849130868043	0.0451260222837925	0.0518112236481804	0.0226968259146148	0.0518112236481804	0.023036626036973	IGSF9B	13293	JAM3	98811	SPATA19	124723	False	False	False	alt	-60	0.3267	40	0.0654
701	chr11	133972812	G	A	rs11223655	0.0202128466	0.3712451804138892	0.0426369566	0.3724079404199024	0.0249332816779433	0.3312593418200375	0.0006637376940105	0.3473690610371456	0.0011231951614822	0.3484832184528242	0.1831381346705815	0.1906740320525396	0.0044044665391867	0.1963469846691989	0.0082316622169655	0.1971453152766324	0.0045583540953851	0.1779957520120307	0.000144670372103	0.1954600844101929	0.0002172238244082	0.1962164423830431	0.0058955494704892	0.1870121051352909	0.0122331826729569	0.1876766390724449	IGSF9B	15844	JAM3	96260	SPATA19	127274	False	False	False	alt	-15	0.009	60	0.01282
702	chr11	133983113	C	T	rs4936216	-0.0627564633999999	0.2181867574481573	0.0627564633999999	0.2148067222511794	0.0355518157673526	0.1502413866897738	-0.0022176253277129	0.1529086983087489	0.0022176253277129	0.1509176204228832	0.5510722180066643	0.0346749677941739	-0.0346815330245658	0.0449777375818711	0.0346815330245658	0.0440463721704217	0.0195335956855166	0.0241990786892388	-0.0012226343149017	0.0412254022953742	0.0012226343149017	0.0404730276774155	-0.0182384282933588	0.1080812533957864	0.0182384282933588	0.1060578755631835	IGSF9B	26145	JAM3	85959	SPATA19	137575	False	False	False	ref	85	0.02728	-100	0.1393
703	chr11	134100320	T	C	rs470536	0.0392446023999999	0.2506344263866442	0.0598074188	0.2511556748446331	0.068654533069846	0.0188920641854858	0.0028977135317463	0.0967043358956994	0.0042133178176929	0.0965941536452402	0.0382295206360726	0.4913795593696798	0.0020233055425589	0.3732461266965966	0.0026852353287348	0.3745680342685716	0.002624302287109	0.2677171715135952	0.0001455250838387	0.2203950668185057	0.0001878780507318	0.2213160585225979	0.0046344561380356	0.3097172490202579	0.0069026096136715	0.310886585526475	JAM3	31248	VPS26B	124352	NCAPD3	125184	False	True	False	alt	45	0.02576	50	0.08936
704	chr11	134111740	G	A	rs626717	0.02322725574	0.5427567083570589	0.02322725574	0.5488460732014202	0.024376248156786	0.3450506003282194	0.0005662654420232	0.4776294505244999	0.0005662654420232	0.483100050330295	0.0008272574312955	0.9754124338851068	2.4445936378905004e-05	0.9167005374824548	2.4445936378905004e-05	0.923585838458427	2.0005663082669022e-05	0.9584246741653998	5.90772573258734e-07	0.8924395831511073	5.90772573258734e-07	0.8994006088164311	7.423047738442856e-05	0.9258327116205248	7.423047738442856e-05	0.9327843308040276	JAM3	42668	VPS26B	112932	NCAPD3	113764	False	False	False	alt	70	0.02394	-25	0.05432
705	chr11	134128003	A	G	rs470713	-0.0070546559999999	0.4823343015811642	0.0277269832	0.4809691028936339	0.037534765247257	0.1310428376840522	-0.0001696063603242	0.3139726626306771	0.0010115682312498	0.3130804265294957	0.0029114842796344	0.8905429128073277	-5.21973456230144e-05	0.8169281281471782	8.152351647810755e-05	0.8153951278663617	0.0001098974091825	0.80713408419982	-1.701074202350094e-06	0.7356779724176282	3.0069912557883885e-06	0.73426189447504	-0.0001913496750354	0.8121892189778006	0.0003051697403582	0.8106729663533713	JAM3	58931	VPS26B	96669	NCAPD3	97501	False	False	False	ref	60	0.0556	70	0.1804
706	chr11	134171989	C	T	rs10736610	0.0152741828503999	0.498206665693364	0.0306865317303999	0.4989285494126076	0.0240046354075778	0.3543623448558234	0.0003775315163736	0.4842514665530225	0.0007632228714512	0.4848446163690847	0.0343637623305069	0.5285420372540494	0.0008914652009458	0.6028860560124616	0.0010512081053498	0.6041462389357972	0.0008585841483374	0.4893834861287767	2.3244836552443613e-05	0.5748478516743531	2.727706231459785e-05	0.5762230059436712	0.0020108211540365	0.5708350473397755	0.002555177988189	0.5723505882627227	VPS26B	52683	NCAPD3	53515	THYN1	81381	False	False	False	alt	65	0.02539	65	0.1366
707	chr11	134177781	G	A	rs11223722	0.0467222031999999	0.3191198567100979	0.0467222031999999	0.3232940323946525	0.0187602766239946	0.5254219745075314	0.0010222364071384	0.3585105145195563	0.0010222364071384	0.3627557317460491	0.0082098907987198	0.7582331692280978	0.0004801994679323	0.6141126953354414	0.0004801994679323	0.620217067885755	0.0001773063758272	0.751958993140229	1.1886637897123323e-05	0.607496982612227	1.1886637897123323e-05	0.6136974091621311	0.0016388439840321	0.5719003231352819	0.0016388439840321	0.577960496747151	VPS26B	46891	NCAPD3	47723	THYN1	75589	False	False	False	alt	-100	0.01285	65	0.10187
708	chr11	134178248	G	T	rs10894782	-0.0275886189999999	0.500069222991788	0.0275886189999999	0.4943438335164248	0.1243024936019556	0.0016880454091256	-0.0033438600542737	0.0968729287923768	0.0033438600542737	0.0956312903464423	0.0219549008610734	0.5871319510798859	-0.0005773091275316	0.5600884241046254	0.0005773091275316	0.5543872760403186	0.002702549794448	0.258927680313524	-6.946586426794585e-05	0.2982756794169287	6.946586426794585e-05	0.2937891935107005	-0.0018277193098214	0.5361008166599984	0.0018277193098214	0.5302305453075384	VPS26B	46424	NCAPD3	47256	THYN1	75122	False	True	False	ref	100	0.2112	30	0.05823
709	chr11	134225779	C	T	rs523621	-0.0324507137999999	0.4407051787175083	0.0324507137999999	0.4353443040058239	0.0139753580743691	0.7228629312374686	-0.0004805409336972	0.5461038957730526	0.0004805409336972	0.5401577074594829	0.5467520042228894	0.0352726160736116	-0.0185635263232017	0.102063820599893	0.0185635263232017	0.1001273273264518	0.0077015526406643	0.1052562353266379	-0.0002741012630038	0.1650435597629504	0.0002741012630038	0.1624156909364907	-0.0089752894988617	0.2389057367481175	0.0089752894988617	0.2350812597157804	NCAPD3	275	VPS26B	1107	THYN1	27591	False	False	False	ref	-100	0.04898	-100	0.3796
710	chr11	134229207	T	G	rs543528	-0.00127162474	0.6960508007605861	0.01512405274	0.6925841254526246	0.0224363061496985	0.4036527690916278	-1.910012041600442e-05	0.6326961541165542	0.0003586252171179	0.6289534504653066	0.1358549701428524	0.2457622899144333	-0.0007110772518382	0.4087193168142877	0.0017842508131127	0.4053017197720981	0.0030424293017139	0.2415419122076158	-1.609309517715526e-05	0.3949034489441154	4.239674099320842e-05	0.3916828383773035	-0.0011456237009666	0.4344593586622808	0.0034005806472896	0.4311184721269611	NCAPD3	3703	VPS26B	4535	THYN1	24163	False	False	False	ref	0	0.0	90	0.1815
711	chr11	134578234	G	T	rs7936986	-0.1755439514	0.0371105008492298	0.1755439514	0.0367022766556597	0.2155624061655295	0.0001083952917389	-0.0395393067550879	0.0024575911525423	0.0395393067550879	0.0024236621289855	0.5008800435485468	0.0436668760556401	-0.0895905290337163	0.012045915830315	0.0895905290337163	0.0118896894131354	0.1081309025197828	0.0001369381875796	-0.0201126691796827	0.0013348505645296	0.0201126691796827	0.0013441086736668	-0.0558955494704892	0.0178074855402475	0.0558955494704892	0.0175606332800891	B3GAT1	165992	GLB1L2	246245	GLB1L3	303988	False	True	True	ref	100	0.02136	-5	0.001465
712	chr11	134598569	G	A	rs10894852	-0.0439965304	0.3399761252279558	0.0439965304	0.3352587171177256	0.0789963747415661	0.011534697090537	-0.0035836500462228	0.1030962435545777	0.0035836500462228	0.1018176666076979	0.1712645574213981	0.2096924096952441	-0.0093483688894964	0.1958998597819585	0.0093483688894964	0.1926831759356254	0.0135792283602772	0.0522990844807171	-0.00077212023846	0.0911717885212951	0.00077212023846	0.0893429242869161	-0.0124797928144897	0.1836419669829008	0.0124797928144897	0.1806040362032157	B3GAT1	186327	GLB1L2	266580	GLB1L3	324323	False	True	False	ref	100	0.02454	-100	0.2783
713	chr11	134629212	T	C	rs7122771	0.1568212108	0.0426298279323825	0.1568212108	0.0431061676022221	0.0365177111543177	0.1398797260854051	0.0059672600465616	0.0461588814082005	0.0059672600465616	0.0465032758402008	0.0398089802381973	0.4914135661553644	0.0069635728429367	0.2078513161773281	0.0069635728429367	0.2115276716528762	0.0015381399784569	0.3775401932827764	0.0002740091765225	0.1595759734858348	0.0002740091765225	0.1623733565407977	0.0160007917917587	0.133205748413254	0.0160007917917587	0.1356467275767171	B3GAT1	216970	GLB1L2	297223	GLB1L3	354966	False	False	False	alt	-55	0.02654	85	0.0464
714	chr11	134634166	T	G	rs4343039	-0.1013987559999999	0.1249231827874532	0.1029001359999999	0.1236810282368552	0.0314883654282704	0.2041927073630689	-0.0037740104476712	0.124202392770801	0.003808641813872	0.1231857014024354	0.0925307644089604	0.3329249795393228	-0.0103958145317463	0.1887756455583641	0.0104441520728289	0.186355166579201	0.0031191815607891	0.2564593446083434	-0.0003888304995645	0.1603042900560873	0.0003899454705154	0.158344237247621	-0.0188199003662036	0.1296480647740541	0.0189617630563161	0.1281315636307251	B3GAT1	221924	GLB1L2	302177	GLB1L3	359920	False	False	False	ref	-50	0.02905	-45	0.06885
715	chr11	134634720	G	A	rs2187466	-0.0213953359999999	0.5120951761651097	0.0257240984	0.5075878401604021	0.0112800550936928	0.860425958115025	-0.0002275232091893	0.6541231682775611	0.0002830159065907	0.6494844453373492	0.04222476988552	0.4772654899450762	-0.0009021371561901	0.4753765973594558	0.0011128199671319	0.4712588594186234	0.0004656285230607	0.5790887999535205	-9.14856437804941e-06	0.5561396806593257	1.184941891407372e-05	0.5520316579475955	-0.0025296097126455	0.4465515438711326	0.0030937613407673	0.4422991214971654	B3GAT1	222478	GLB1L2	302731	GLB1L3	360474	False	False	False	ref	-85	0.05136	-35	0.0741
716	chr11	134636158	T	C	rs3019649	0.0949627241999999	0.1164914444927628	0.0949627241999999	0.1183008700375096	0.0407241252577424	0.1068078292857228	0.0041177779442182	0.0813336794516782	0.0041177779442182	0.0822565642407305	0.3663826663587476	0.0813224132116297	0.0358948260485507	0.0452331865487179	0.0358948260485507	0.0460864625621704	0.0152219206369268	0.0410036332930312	0.0015722297471805	0.0365763959972916	0.0015722297471805	0.0371095704257597	0.0313739236580778	0.0503862148675752	0.0313739236580778	0.0513620143983595	B3GAT1	223916	GLB1L2	304169	GLB1L3	361912	True	False	False	alt	-40	0.07794	45	0.062
717	chr11	134637729	C	T	rs3019651	-0.049561753	0.2293121457361286	0.060791893	0.2273381838557342	0.0197627509051755	0.4941370610863828	-0.0009507779213725	0.2897732024488481	0.0012155585453687	0.2876384936177245	0.0601275114644848	0.4068656515044774	-0.0035109423628413	0.2930957257146097	0.0041715388439823	0.290187056263638	0.0011860233609359	0.4138786596546539	-6.615428863044653e-05	0.3089209519962723	8.172961945374954e-05	0.306206247836248	-0.0078725545181617	0.233983874757314	0.0094709841311734	0.2315218133208835	B3GAT1	225487	GLB1L2	305740	GLB1L3	363483	False	False	False	ref	-85	0.04193	-100	0.1725
718	chr11	134639072	T	C	rs3019652	-0.0408384114	0.3625044999336277	0.0408384114	0.3577794038812139	0.0308745256272851	0.2131954183259362	-0.0012973596932598	0.2844784914326153	0.0012973596932598	0.281083554735059	0.060315562007192	0.4132113329662539	-0.0017189784493683	0.3948570972177742	0.0017189784493683	0.3896956825431577	0.0017903887544984	0.3434269291850798	-5.552366747835432e-05	0.338229741278977	5.552366747835432e-05	0.3334093356389509	-0.0045528026129127	0.3603985150678776	0.0045528026129127	0.3551046236970842	B3GAT1	226830	GLB1L2	307083	GLB1L3	364826	False	False	False	ref	60	0.07513	20	0.01367
719	chr11	134649712	C	A	rs2226892	-0.00259473022	0.7782838205027263	0.0105977711	0.7789651875752549	0.0159016011550618	0.6479117197105402	-3.629048670203724e-05	0.7911465500914469	0.0001625782228874	0.7918882786099207	0.000167430965656	0.9984351048436864	-7.51946777068645e-07	0.9894260652433374	1.8529498347717783e-06	0.9921982213469588	2.6789717062754934e-06	0.9980903903558463	-1.0774906957566764e-08	0.9890609879606598	2.8463381931340923e-08	0.991757965977782	2.4743492461482675e-06	0.9901020692973164	4.123915410247104e-06	0.9935930878575524	B3GAT1	237470	GLB1L2	317723	GLB1L3	375466	False	False	False	ref	-90	0.02563	0	0.0
720	chr11	134654769	A	C	rs3018003	-0.0547243306	0.0885895522956531	0.1182724106	0.0877514151596298	0.0414996969777774	0.0983597388611453	-0.0028450057547249	0.0675489703183283	0.0049006830173469	0.0672050386055372	0.5749430899673386	0.0298912583110641	-0.0342263037185347	0.0213516442533339	0.0622192433238373	0.02112798298174	0.0240549618073029	0.0157106046488031	-0.0016972057974022	0.019638856061045	0.002602731936775	0.0195087504868573	-0.0154349905974728	0.0483716424657697	0.0356141334828939	0.0476716090632909	B3GAT1	242527	GLB1L2	322780	GLB1L3	380523	True	False	False	ref	-5	0.0008545	-35	0.0703
721	chr11	134657527	C	T	rs11223928	0.038269373	0.3797009867644326	0.038269373	0.384711176059486	0.051104790070709	0.0547367268143841	0.0017546658515988	0.2045853544723673	0.0017546658515988	0.2072896871964748	0.3563912441028009	0.086872853930693	0.0150828305418524	0.1217226059126057	0.0150828305418524	0.1241589740466014	0.0169618383693478	0.0324957712551154	0.0006815838744453	0.0799789924572207	0.0006815838744453	0.0815788214049308	0.012718979908284	0.1716371805056727	0.012718979908284	0.1747325642204137	B3GAT1	245285	GLB1L2	325538	GLB1L3	383281	False	False	False	alt	-100	0.11816	-80	0.1104
722	chr11	134661373	A	C	rs999785	0.2383983652	0.0188475114642314	0.2383983652	0.0189514086959355	0.0444151185072667	0.0857037046304502	0.0124110700587583	0.0218350844262413	0.0124110700587583	0.0219681035780647	0.0714880736366335	0.369524518591651	0.0183079058161308	0.0967720746499184	0.0183079058161308	0.0985966085052731	0.0033385382887525	0.2347339200838279	0.0009715807694232	0.0653011842596383	0.0009715807694232	0.066360345301201	0.0342887070700405	0.0462375439289765	0.0342887070700405	0.0469498550505611	B3GAT1	249131	GLB1L2	329384	GLB1L3	387127	False	True	False	alt	-30	0.00403	60	0.04468
723	chr11	134665000	T	C	rs11223931	-0.02455172608	0.403793395845999	0.03917504832	0.4023876781356359	0.0379269251155348	0.1256597388517114	-0.0008538944832081	0.2940960500777984	0.0014179945262029	0.2935617090776974	0.2652749826795552	0.1301073474544828	-0.0043590385838086	0.1930335654402511	0.007979200301271	0.1919960720693864	0.0103380663931699	0.0734762487062686	-0.000146773534244	0.1488329226543394	0.0002891753694844	0.1481575251798779	-0.0067500247434924	0.208431570112504	0.0112186994820362	0.2074965713793803	B3GAT1	252758	GLB1L2	333011	GLB1L3	390754	True	False	False	ref	-30	0.0326	15	0.084
724	chr11	134716809	T	C	rs10894859	0.0130105875999999	0.2255488554260779	0.0614340676	0.2270853402757137	0.0171152195708981	0.5918967813169715	0.000108527183615	0.3091363187672822	0.0011352066865151	0.3110501624593115	0.0402782818118834	0.4763521367790676	0.0009123120749348	0.3480670882800198	0.0024028306246819	0.3506633553074815	0.0006840927507864	0.503647171844387	1.2036286158694444e-05	0.3730639953140262	4.363841001491384e-05	0.3757479759048124	0.0024331100920457	0.2845158964653989	0.0067549734419847	0.2868991969786664	B3GAT1	304567	GLB1L2	384820	GLB1L3	442563	False	False	False	alt	40	0.03174	65	0.1528
725	chr11	134716814	A	G	rs12277680	-0.112912682	0.0855401239503248	0.112912682	0.0844724195313982	0.0348766991978648	0.1577421771074667	-0.0040626140359786	0.0783669016551726	0.0040626140359786	0.0775202817283366	0.0353370063673253	0.5002196237666356	-0.0040231097572615	0.2701625416353568	0.0040231097572615	0.2659903150793823	0.0012405682621529	0.3982243901516256	-0.0001453729096531	0.2140043492136923	0.0001453729096531	0.2104000266961379	-0.0105110355976377	0.1966235989421418	0.0105110355976377	0.1930957131580403	B3GAT1	304572	GLB1L2	384825	GLB1L3	442568	False	False	False	ref	30	0.02661	60	0.10547
726	chr11	134725880	T	C	rs7951888	0.1007877116	0.1312536841639069	0.1007877116	0.1326962160078976	0.0205966989680108	0.4587735672972596	0.0025984574698782	0.1886462803204222	0.0025984574698782	0.1906939862915213	0.5150234238395301	0.0406339686313308	0.0540072735053129	0.0326464634760896	0.0540072735053129	0.0331519625421275	0.0108342040490641	0.0679631674823047	0.0013866056991987	0.05508527451545	0.0013866056991987	0.0560445460792567	0.0306497641120385	0.0639484404831009	0.0306497641120385	0.0649734098652892	B3GAT1	313638	GLB1L2	393891	GLB1L3	451634	True	False	False	alt	100	0.06003	100	0.1533
727	chr11	134901806	T	C	rs10894902	0.0381727756	0.2723062769076204	0.0569501464	0.2735794858455052	0.0372526520812127	0.1343530488423183	0.0015693796931628	0.1916228313269309	0.0023603038042615	0.1921204665112803	0.2603741216060176	0.1325472643535212	0.0135194427098898	0.1245834071183354	0.0167939996004832	0.1255375035778278	0.0097379273445999	0.0787683304518609	0.0005583657139489	0.0989306044658445	0.0006963342192312	0.0994452644458239	0.0136501600079179	0.1262007881470881	0.0187374220579986	0.1271275570681411	B3GAT1	489564	GLB1L2	569817	GLB1L3	627560	True	False	False	alt	-80	0.0586	80	0.0886
728	chr11	134903531	A	C	rs906627	0.086105436	0.1354280612845825	0.086105436	0.1374676444486831	0.1140610391997585	0.0024058926729889	0.0097782531920377	0.0211058085273978	0.0097782531920377	0.0211615915823022	0.0348866748045263	0.5165795078435604	0.0028092215344088	0.3153207174266342	0.0028092215344088	0.319907854563682	0.0039810666535151	0.2039537207251452	0.0003228164437114	0.1259658303277135	0.0003228164437114	0.1283426827954333	0.0076383161228596	0.2492866393681137	0.0076383161228596	0.2532898899496276	B3GAT1	491289	GLB1L2	571542	GLB1L3	629285	False	True	False	alt	0	0.0	70	0.02295
729	chr11	134905423	C	A	rs1154905	-0.0183351485999999	0.3384214390683253	0.0454520698	0.3378845866351936	0.0148900191307655	0.6939174832025023	-0.0002301815175921	0.4505797817064469	0.0006685994430743	0.4499949146433564	0.3163645211309425	0.1017994770514186	-0.0077665762456903	0.1266153473789103	0.0147314899878969	0.1263443042019223	0.0047061951927776	0.1694761769275422	-0.0001021393086796	0.1828344653397173	0.0002155071172837	0.1824079437458554	-0.0062584540265909	0.144740022489733	0.0157813994919335	0.1445384254427328	B3GAT1	493181	GLB1L2	573434	GLB1L3	631177	False	False	False	ref	95	0.11	55	0.1411
730	chr11	134915107	C	T	rs12226882	-0.0056784926399999	0.8478853843854821	0.00677621072	0.8435499301065199	0.032635853621988	0.1860640654613947	-0.0002239890172626	0.7031887400287933	0.0002555142790843	0.6986485402674318	0.3756655999472139	0.0776857051485853	-0.0018297755229062	0.3889082151519408	0.0022658288238892	0.3860938797236632	0.0119461183609881	0.057223198954996	-7.086218300196777e-05	0.3233306382492413	8.338515669539882e-05	0.3207633429817999	-0.0019167958826828	0.5297748814802794	0.0023440335191844	0.5260666199187995	B3GAT1	502865	GLB1L2	583118	GLB1L3	640861	False	False	False	ref	-90	0.01704	100	0.2178
731	chr11	134937731	T	A	rs7118700	-0.240554798	0.0154021118280064	0.240554798	0.0153349844392264	0.0432281772478689	0.0897413440689659	-0.010882583988192	0.0195074153521195	0.010882583988192	0.019449374170327	0.1891145128831117	0.1956153262271757	-0.0460603026182018	0.0363875977817022	0.0460603026182018	0.0357816533575243	0.0079453792527213	0.107741367397724	-0.0020671770694864	0.0300115140240088	0.0020671770694864	0.0295618663903172	-0.0592631387944969	0.0157810838660855	0.0592631387944969	0.0156391949496809	B3GAT1	525489	GLB1L2	605742	GLB1L3	663485	False	True	False	ref	-100	0.137	75	0.11865
732	chr11	134940387	T	C	rs1319913	0.0446026254	0.3179109666560643	0.0446026254	0.3225295618869837	0.0114421828008399	0.8485947068490176	0.0005156931686349	0.4900926453616381	0.0005156931686349	0.4959501941831808	0.360464022961961	0.0836048582417383	0.0164203665956629	0.097705272845327	0.0164203665956629	0.0997521520527996	0.0041426747864588	0.1892510365379533	0.0001904453815359	0.1753675457472939	0.0001904453815359	0.17843890792206	0.0155578832766981	0.1265204001741285	0.0155578832766981	0.1290924568903497	B3GAT1	528145	GLB1L2	608398	GLB1L3	666141	False	False	False	alt	100	0.0917	-100	0.3914
733	chr11	134951476	C	T	rs11224103	-0.08306704288	0.158644774127994	0.08382842352	0.1574093189471785	0.0270145908224975	0.2848916101863961	-0.002610395993888	0.1708813198985141	0.0026250236161775	0.1696695016524266	0.254605588730164	0.1363166033631367	-0.0234450892306973	0.094327045339856	0.0235554430807599	0.0931206056880766	0.0069865668335221	0.1195337278029045	-0.0007213745201384	0.0987880040787552	0.0007234946350018	0.0978180282718203	-0.0266314209362937	0.0801282707899514	0.0268508132361188	0.0794357581067757	B3GAT1	539234	GLB1L2	619487	GLB1L3	677230	True	False	False	ref	-5	0.003418	0	0.0
734	chr12	1754562	A	T	rs11061971	0.02405349564	0.5196197587081676	0.02405349564	0.5255364985371859	0.0251614183216436	0.3274341173445138	0.000581893659007	0.4673960439234915	0.000581893659007	0.4731970920304426	0.0025362079773019	0.9084464412131316	9.087565274608108e-05	0.829306182912698	9.087565274608108e-05	0.8362734811764485	6.191324611239677e-05	0.8753267258024996	2.178265833665979e-06	0.799243831973431	2.178265833665979e-06	0.8061661661240522	0.0003769258684965	0.8191106178241091	0.0003769258684965	0.8260922077212055	LRTM2	65706	ADIPOR2	65987	FBXL14	159981	False	False	False	alt	100	0.06525	100	0.0625
735	chr12	1769369	C	T	rs7294668	-0.0952482366	0.1239559122338741	0.0952482366	0.1221929852637893	0.0270089999105267	0.282966292808512	-0.0027825936593005	0.1376186447135261	0.0027825936593005	0.1358918425722451	0.022881132262215	0.5821161496786945	-0.0021174797762145	0.3683999281373681	0.0021174797762145	0.3634172078955358	0.000591735792814	0.5304837879664517	-6.040883508888046e-05	0.3330448215991593	6.040883508888046e-05	0.3281999724612398	-0.0060497839068324	0.3028576600920948	0.0060497839068324	0.2983362860893642	LRTM2	50899	ADIPOR2	80794	CACNA2D4	149297	False	False	False	ref	-65	0.01477	-50	0.05017
736	chr12	1777378	C	T	rs7306506	0.000171694126	0.8702813053203446	0.005461414246	0.87098051511983	0.0224716136710672	0.3847882291574037	-4.092687660178266e-05	0.8122663395540067	0.0001230706799888	0.8125374684065696	0.0361560159678004	0.5120514323632978	-3.560108748287881e-06	0.7260233562192955	0.0002122394093087	0.7264468235758665	0.0008185523838089	0.4994788111508854	-2.2129816822517493e-06	0.7038233571553699	4.555904689546775e-06	0.7038176351805332	-0.0001228926792253	0.7304681073038133	0.0006441555870805	0.730700356049724	LRTM2	42890	ADIPOR2	88803	CACNA2D4	141288	False	False	False	alt	-45	0.00512	-100	0.04602
737	chr12	1789481	G	C	rs4766416	-0.0145663988	0.5162198835086467	0.0255537208	0.5143100331911993	0.0147439160031769	0.70175398200741	-0.0002004736810494	0.5851606500306028	0.0003763042139192	0.5833020499897418	0.0011662432780178	0.9571103215144	-2.7324910374297887e-05	0.8917631553800486	3.581824605991193e-05	0.8903990827959867	1.71297289714946e-05	0.961937535816114	-3.96297368779225e-07	0.8985078900746245	5.319008637510106e-07	0.8971397366331479	-0.0001245422453894	0.8854980914136582	0.0001525848701791	0.8841279501743707	LRTM2	30787	ADIPOR2	100906	CACNA2D4	129185	False	False	False	ref	60	0.000931	-95	0.08826
738	chr12	1790548	A	C	rs7294540	0.23738577	0.0168386758264994	0.23738577	0.016929249037965	0.0436496577228066	0.0870954629905605	0.0111771215459336	0.0203020558003954	0.0111771215459336	0.0203361215295244	0.1917134043746494	0.1843979531001721	0.0456293880575323	0.032692059633423	0.0456293880575323	0.0332845536745595	0.0082713556610052	0.0970452187467926	0.0021567608453261	0.0260630968602834	0.0021567608453261	0.0264836118955412	0.0617729537131733	0.0135676106058177	0.0617729537131733	0.0137247871066033	LRTM2	29720	ADIPOR2	101973	CACNA2D4	128118	False	True	False	alt	35	0.006042	50	0.05835
739	chr12	1792998	C	T	rs2286379	-0.0677394484	0.2021798673062882	0.0677394484	0.1993420373515632	0.0557570198460941	0.0392134468150953	-0.0038679322181317	0.0847139755091528	0.0038679322181317	0.0836979953876222	0.050919633136485	0.4323012114141791	-0.0034647894805842	0.2952204955990299	0.0034647894805842	0.2909313839751001	0.0028373528252193	0.2511796411401455	-0.0001975167274248	0.1807219325926979	0.0001975167274248	0.1777402480834027	-0.0086090858104318	0.2348441014104945	0.0086090858104318	0.2310332804838622	LRTM2	27270	ADIPOR2	104423	CACNA2D4	125668	False	False	False	ref	-85	0.02097	-85	0.1726
740	chr12	2189882	C	T	rs2283288	-0.0586579733999999	0.2439154629251415	0.0586579733999999	0.2408940551667935	0.0305732592936461	0.2147142525578142	-0.0019323654534117	0.1984236820378572	0.0019323654534117	0.1958092644637757	0.1732679555276962	0.2116668514714897	-0.0113523566859211	0.1607009308823274	0.0113523566859211	0.1579186570178852	0.0057230257308474	0.1566611319698103	-0.0003990987447809	0.139568314090425	0.0003990987447809	0.1372710272750003	-0.016624327801788	0.1368892671040789	0.016624327801788	0.1348750233677326	DCP1B	185347	CACNA1C	219109	CACNA2D4	271216	False	False	False	ref	-25	0.02524	-95	0.1716
741	chr12	2191041	A	G	rs2238048	0.149875742	0.047051207332998	0.149875742	0.0475854980659393	0.0950988372475835	0.0052164216192855	0.0144041620298225	0.0115904893550689	0.0144041620298225	0.0115873713100235	0.1767939032034574	0.2052692064920809	0.0307426487071411	0.0632843886530641	0.0307426487071411	0.0643429153366047	0.0172156984207033	0.0362196739867017	0.0030377899094528	0.0210823930290231	0.0030377899094528	0.0214341332936423	0.0378831117416118	0.0376511868571389	0.0378831117416118	0.0381814445309855	DCP1B	186506	CACNA1C	220268	CACNA2D4	272375	False	True	True	alt	55	0.0677	-95	0.2588
742	chr12	2191441	G	C	rs11614764	0.004256077772	0.7536913143483805	0.0106961181079999	0.756150883373701	0.0197629734053918	0.4946942043827576	8.513160418465997e-05	0.7443778365462839	0.0002062724876653	0.7462269879354778	0.046579624558741	0.4779572681194363	6.355878763473538e-05	0.6951392639495518	0.0003753017970751	0.6960312108313648	0.0009959147324789	0.4759289106320349	1.3538173793842206e-06	0.6893876150766493	7.239609816814857e-06	0.6904102584392043	0.0001253670284714	0.6892447334297315	0.0011002606314538	0.6901799960439021	DCP1B	186906	CACNA1C	220668	CACNA2D4	272775	False	False	False	alt	-25	0.01715	-35	0.08295
743	chr12	2195191	C	T	rs2239018	-0.167038104	0.0390395612927566	0.167038104	0.0385094533216619	0.0353026351102333	0.1544944984415599	-0.0062510483778176	0.0466080889489595	0.0062510483778176	0.0462437848590038	0.0098215169410444	0.7294298643176808	-0.0016714166544869	0.409821376917818	0.0016714166544869	0.4044701084938117	0.0003675205940482	0.6258466544594361	-6.621020690682116e-05	0.3307713767015996	6.621020690682116e-05	0.3259178185161329	-0.0048423014747121	0.3554368557490316	0.0048423014747121	0.3502541174822965	DCP1B	190656	CACNA1C	224418	CACNA2D4	276525	False	False	False	ref	80	0.02075	-15	0.02576
744	chr12	2207930	T	C	rs2238053	-0.02830546844	0.4423638007652929	0.03351831224	0.4385049156099476	0.0115641418547528	0.8525290577889575	-0.0003176956151445	0.5992213466370209	0.0003874616467719	0.5947469170792081	0.0084251591831347	0.7692061007652907	-0.0001355827045857	0.7253806093181987	0.0002130375731883	0.7214722877647449	0.000100057504627	0.8243148291356646	-1.5029138237300398e-06	0.772858171763322	2.539530117953806e-06	0.7688645340239706	-0.0005369337864141	0.7026846003603769	0.0007827191448648	0.6988093327271565	DCP1B	203395	CACNA1C	237157	CACNA2D4	289264	False	False	False	ref	-100	0.02565	-25	0.0321
745	chr12	2214876	T	C	rs7957545	-0.0060900583999999	0.600097891017565	0.0199850156	0.5988474441172853	0.0125430969820177	0.7580387549129338	-0.0001701376712012	0.6688954263302482	0.0002906471073299	0.6671344612024032	0.0025873445283889	0.9005296001126201	-1.4547282247275248e-05	0.8573744808635837	5.481404426547112e-05	0.8559653463641453	3.142518898028298e-05	0.9277115254514132	-4.5820889851955894e-07	0.8776989086264656	7.729124653007243e-07	0.8760583441322918	-5.36109003332082e-05	0.8332682015355511	0.0002631058031737	0.831945962110715	DCP1B	210341	CACNA1C	244103	CACNA2D4	296210	False	False	False	ref	50	0.04443	95	0.06384
746	chr12	2222406	A	G	rs10848642	0.0330796966	0.3649912395570561	0.038515517	0.3684600314852706	0.0286174649863169	0.2520905557131789	0.000872237377631	0.31330631572818	0.001073554792337	0.3161910085965452	0.1064877437234007	0.2979496988495047	0.0037596985194353	0.2864594142393352	0.0042899694157745	0.2897898590508014	0.0029895590327392	0.2503562389317063	9.707934961596942e-05	0.2579286261393043	0.0001167181088323	0.2607053872107132	0.0070700405793275	0.2594285090403107	0.0081257629243508	0.2625481476630023	DCP1B	217871	CACNA1C	251633	CACNA2D4	303740	False	False	False	alt	-20	0.03296	-50	0.1195
747	chr12	2222938	A	G	rs11062162	-0.35508749	0.00614037655787	0.35508749	0.0061072175900357	0.0579102600732882	0.0356570088026066	-0.0225931845834745	0.0070316772361804	0.0225931845834745	0.0070379875343315	0.1300699416053577	0.2705735610347866	-0.0497929146970231	0.0399918182430875	0.0497929146970231	0.0393674081909436	0.0076773447835652	0.1177169500123761	-0.0033467802865095	0.0236728778376805	0.0033467802865095	0.0235066112399285	-0.0641334828939988	0.0161337172939049	0.0641334828939988	0.0160665158291362	DCP1B	218403	CACNA1C	252165	CACNA2D4	304272	False	True	True	ref	-70	0.0894	-85	0.10693
748	chr12	2223690	C	A	rs1108222	-0.028240365	0.3527326066659579	0.0412762702	0.3499901833857911	0.0313583656302694	0.2085753559687211	-0.0010758066272899	0.2599439331288627	0.001356806052237	0.2580211296647471	0.0101679258355052	0.7405239468095578	-0.0003192807323973	0.6242177159488439	0.0004424425349708	0.6210445882874575	0.0003321532401144	0.6618110531864723	-1.2507016573384184e-05	0.5533998929120038	1.5161868287918385e-05	0.5501319798320549	-0.0009757183860644	0.5936869499954833	0.0014557421398171	0.5904315598139556	DCP1B	219155	CACNA1C	252917	CACNA2D4	305024	False	False	False	ref	90	0.008575	70	0.11414
749	chr12	2225094	G	A	rs11062166	0.38208471	0.0047246583293746	0.38208471	0.0047475589699875	0.0808002323243641	0.0107060256567213	0.0329247325663587	0.00339077363749	0.0329247325663587	0.0034120291983913	0.3007027151859061	0.1094704602766353	0.1105257510253528	0.0071665213296376	0.1105257510253528	0.0072435544281054	0.0238816704319772	0.0156432055241614	0.0093803803983942	0.0036820153017119	0.0093803803983942	0.003683163869981	0.1180660486292104	0.002681339499911	0.1180660486292104	0.0027040970443079	DCP1B	220559	CACNA1C	254321	CACNA2D4	306428	False	True	True	alt	60	0.02063	100	0.1118
750	chr12	2239678	G	C	rs11062170	-0.141386452	0.0554221982867253	0.141386452	0.0548105275560222	0.0320012334105655	0.1942738782742156	-0.0046949781659245	0.066230112837593	0.0046949781659245	0.0655605970654421	0.7547746692619841	0.0108577792529221	-0.1067966886871795	0.0081041358259593	0.1067966886871795	0.0080125622903888	0.0242227494371443	0.0155387696383783	-0.0035590255681223	0.0136231260421818	0.0035590255681223	0.0134825014971918	-0.0253629045561017	0.0710247293406757	0.0253629045561017	0.0698210584342027	DCP1B	235143	CACNA1C	268905	CACNA2D4	321012	True	False	False	ref	65	0.04053	75	0.2378
751	chr12	2259230	A	G	rs2370414	0.071055036	0.1815413123572153	0.071055036	0.1845126764238975	0.0188442043321006	0.5273031002801019	0.0013609641620109	0.2540388122884784	0.0013609641620109	0.2577591017829761	0.3219614991257299	0.0993799532819608	0.0224801547164552	0.0727577829074991	0.0224801547164552	0.0742668774442363	0.0060339823780494	0.1354142648487753	0.0004293593291131	0.1038568176646702	0.0004293593291131	0.1058036553558658	0.0237059153442644	0.0755894590221882	0.0237059153442644	0.0771674897755755	DCP1B	254695	CACNA1C	288457	CACNA2D4	340564	False	False	False	alt	95	0.03284	100	0.3901
752	chr12	2274839	T	G	rs2238057	0.0690923488	0.1852706613239768	0.0690923488	0.1879268107033673	0.0304716671701599	0.2160564287127059	0.0020951810406749	0.159869880255522	0.0020951810406749	0.1620007550764921	0.0641244102800963	0.3963954482096483	0.0048862774866773	0.2500740899651579	0.0048862774866773	0.2540915603928272	0.0019316976174828	0.3256516071747349	0.0001454523248529	0.2155830982231603	0.0001454523248529	0.2191549542942604	0.0109267262709906	0.1906816060313337	0.0109267262709906	0.194075435062913	DCP1B	270304	CACNA1C	304066	CACNA2D4	356173	False	False	False	alt	75	0.1133	-5	0.00296
753	chr12	3606194	A	G	rs6489486	0.00353523142	0.7770046759571915	0.0107067167	0.776231619995078	0.0792973100411319	0.011084993543942	0.0004053906498774	0.4161881071169294	0.0009154208338764	0.4153938048434116	0.1970406783016066	0.1785316632462837	0.0004915756032371	0.4067013716705507	0.0019799296731508	0.4058936998189387	0.0154537795989052	0.0380676730508007	6.145818702437065e-05	0.228213873148969	0.0001682865679724	0.2275541544415103	0.0008618983207416	0.4685892328605915	0.0030607700174853	0.4677235416793074	CRACR2A	158625	PRMT8	224844	PARP11	267254	False	True	False	alt	55	0.0637	-100	0.2384
754	chr12	15549073	C	T	rs7132826	0.0108846012	0.644605471912955	0.0171127324	0.6485817774343428	0.0167725220743338	0.6004324832268533	0.000161552936114	0.6497775142076428	0.0002870022794133	0.6536063203086107	0.0150894064860941	0.6668501210595801	0.0002634411273945	0.6786331334996863	0.0003096214729719	0.6823286767895385	0.000237525841694	0.6901080653844126	3.975724488150634e-06	0.6901965032546561	4.905906267258238e-06	0.693962871088666	0.0007876678433571	0.6593181306159064	0.0009872653492131	0.6629155912216653	RERG	200398	PTPRO	226815	EPS8	333256	False	False	False	alt	-55	0.01065	-55	0.02327
755	chr12	15554198	G	A	rs11056556	0.00196311266	0.9031367550646692	0.0041551995799999	0.9074438057147528	0.0122035117780017	0.8199033083884182	2.368930772751737e-05	0.9179303794963516	5.2193965833851786e-05	0.9222310186422716	0.0107856883639602	0.7171458026633453	2.7916839762360207e-05	0.8644557645248244	4.651208067905137e-05	0.8687814915914803	0.0001357796166118	0.7756955716838124	3.629315382253457e-07	0.8854158946518715	6.047335314156473e-07	0.889705172100536	0.0001105209329946	0.860107660891381	0.0001748540133944	0.864467017192635	RERG	205523	PTPRO	231940	EPS8	328131	False	False	False	alt	35	0.010956	100	0.0825
756	chr12	15554746	T	A	rs10846207	-0.254406146	0.0164682205550539	0.254406146	0.016284430339884	0.0489140188311377	0.0624875299527368	-0.0137749319627923	0.0172361943720481	0.0137749319627923	0.0171219385666764	0.0332049421002276	0.5256123383200728	-0.0104623683456816	0.175921915965587	0.0104623683456816	0.173022987370209	0.0017275800097518	0.3572510522291643	-0.0005815580214295	0.1107968060201389	0.0005815580214295	0.1089191981489746	-0.0202137837748671	0.1090660029454676	0.0202137837748671	0.1072119529976259	RERG	206071	PTPRO	232488	EPS8	327583	False	True	False	ref	-60	0.02516	-100	0.1123
757	chr12	23364933	T	G	rs11046902	0.0045052791	0.7879221371289108	0.0090488846999999	0.7901471452686089	0.0174108613381501	0.5725728732501016	0.0001021404356091	0.7548698611028262	0.0001697520809722	0.7572698344551531	0.0012140806967766	0.9592832024512506	2.968473039774376e-06	0.95881654562783	8.028957462722377e-06	0.9604100883230384	2.009615758986653e-05	0.9572430239798986	7.562179075629758e-08	0.9515088969826124	1.497484407106376e-07	0.9532040366359572	1.1546963148691896e-05	0.9546518253551336	3.62904556101745e-05	0.9562749689228875	ETNK1	739857	C2CD5	820387	ST8SIA1	927892	False	False	False	alt	-95	0.04327	-80	0.09326
758	chr12	23406204	A	G	rs2418108	-0.0185249684	0.5895190374706171	0.0210658104	0.5853161602382666	0.0308591651508108	0.2245547623909181	-0.0004823920305397	0.4947163036853725	0.0006299147577353	0.4914159576134329	0.0037791560819503	0.859699601531752	-7.717732944789328e-05	0.8272992448282318	8.371573733782417e-05	0.8228338000975001	0.0001146885406935	0.8080468191110618	-2.141133601879886e-06	0.7858243989542428	2.520757260659266e-06	0.7814230004606355	-0.0002969219095377	0.8102348404528518	0.0003299132328197	0.8058954680095438	ETNK1	781128	C2CD5	861658	ST8SIA1	969163	False	False	False	ref	0	0.0	90	0.02222
759	chr12	23486608	C	G	rs77777611	-0.123794684	0.0704086798419586	0.123794684	0.0694616066328455	0.0498149206462143	0.0567269187135453	-0.0063344007157226	0.0415377137721805	0.0063344007157226	0.0412910941413639	0.0196661278083863	0.6194338282661743	-0.0026076117475773	0.3481456002008745	0.0026076117475773	0.3435129918842526	0.0010114835195118	0.4491554186822531	-0.0001374698069096	0.2339692630089556	0.0001374698069096	0.2302949793667109	-0.0071137540826761	0.2769302632105979	0.0071137540826761	0.2728105335556468	ETNK1	861532	C2CD5	942062	ST8SIA1	1049567	False	False	False	ref	-100	0.00934	-100	0.1505
760	chr12	23545302	C	T	rs11612157	-0.245556702	0.0155500872212685	0.245556702	0.0153983915648507	0.0428471814233869	0.0894860588419314	-0.0105303950353443	0.0197251645719795	0.0105303950353443	0.0196202667353523	0.0206764870838968	0.6187907570146017	-0.0056147927663356	0.2482455898764262	0.0056147927663356	0.244203048155254	0.0008720347475944	0.4814117524288515	-0.0002363047793024	0.1783933108359824	0.0002363047793024	0.1753915598348351	-0.0130175513839859	0.1769388607192398	0.0130175513839859	0.1739083821911209	ETNK1	920226	C2CD5	1000756	SOX5	1017242	False	True	False	ref	-100	0.007996	40	0.05713
761	chr12	23608548	T	C	rs17468457	-0.0478891610999999	0.3230324553875676	0.0478891610999999	0.3189738131107034	0.0271335822562624	0.2800909880477453	-0.0013163834611411	0.2927087000521316	0.0013163834611411	0.2889721021535206	0.0029634456138035	0.8866493836251075	-0.0001447788712718	0.7713262594226602	0.0001447788712718	0.764612715646026	8.05259818808873e-05	0.8380498280879444	-3.999062774209275e-06	0.7219403091760929	3.999062774209275e-06	0.7155489111640276	-0.0005253868232654	0.756638960893398	0.0005253868232654	0.7498839522625953	SOX5	953996	ETNK1	983472	C2CD5	1064002	False	False	False	ref	100	0.05615	95	0.1727
762	chr12	23614364	T	C	rs17383970	0.0577054718	0.2487623233009361	0.0655309962	0.2496398472557317	0.0237588276112911	0.3660966286096033	0.0015984170074993	0.2732201742374662	0.0017712324271724	0.2742015786919898	0.0830267889545049	0.3449049072799726	0.0060633701446845	0.2628670392223397	0.0064628646386821	0.2641578424791618	0.0019780459682635	0.3226001364326141	0.0001672355139914	0.2576844435691466	0.0001752437025089	0.2587644502216858	0.0111634390155389	0.2076550972835807	0.0122966909702747	0.2084646021798461	SOX5	948180	ETNK1	989288	C2CD5	1069818	False	False	False	alt	30	0.01367	40	0.0785
763	chr12	23616961	A	G	rs73091330	0.043603442	0.3288446982921879	0.043603442	0.3334388543839489	0.0235578456452237	0.3690731716332958	0.0010740535478084	0.3084883620658953	0.0010740535478084	0.3124142727927317	0.0225231764046055	0.6020755726777373	0.0010325921467334	0.4871616434153094	0.0010325921467334	0.4925698434446141	0.000557651225596	0.5668728728376977	2.693778922093278e-05	0.4588260655088654	2.693778922093278e-05	0.4640500617651411	0.0029782917092804	0.4450519637553469	0.0029782917092804	0.4504356279212946	SOX5	945583	ETNK1	991885	C2CD5	1072415	False	False	False	alt	70	0.07886	95	0.1982
764	chr12	23625917	G	A	rs73091349	0.0001329360599999	0.7873684545971419	0.00896997818	0.7881621905286371	0.017655746122456	0.5766724214439036	1.5364875110545556e-05	0.7826213853432121	0.0001505933122537	0.7836177299735537	0.0036958529906634	0.8660384365555561	-4.958988519061043e-07	0.9018763698806844	2.861789773191265e-05	0.9032774604207714	6.349656959276769e-05	0.8677956416495878	1.6523214378323246e-08	0.8994556530980957	4.7231127644709284e-07	0.9008285134892569	-1.814522780509884e-05	0.9038350494673736	0.0001105209329946	0.9051199736418424	SOX5	936627	ETNK1	1000841	C2CD5	1081371	False	False	False	alt	100	0.009125	100	0.1697
765	chr12	23627810	T	C	rs76571125	-0.01491401688	0.7006704537831513	0.01491401688	0.6942618670996418	0.0283028608207641	0.2572017204145243	-0.0004254870831551	0.5769194484371871	0.0004254870831551	0.5706552585198373	0.0105011382006531	0.717124378244588	-0.000171537238985	0.7497405966946976	0.000171537238985	0.7432695141237886	0.000288875504006	0.6548699863162534	-4.800827097938783e-06	0.6954981200905084	4.800827097938783e-06	0.6890353948713671	-0.0006012668668139	0.7341280779191215	0.0006012668668139	0.7276578705180157	SOX5	934734	ETNK1	1002734	C2CD5	1083264	False	False	False	ref	-40	0.0163	-5	0.0002747
766	chr12	23641960	C	A	rs73091376	0.03515548746	0.4170925561692991	0.03515548746	0.4222791780123855	0.020430422984412	0.4694379986008957	0.0007496318234117	0.4238646687048606	0.0007496318234117	0.4288808868564755	0.0308666820626174	0.5291926648465566	0.0010717893583815	0.4903416686352357	0.0010717893583815	0.4959362154359404	0.0006305530143686	0.5232579050247379	2.3050972024906296e-05	0.4827593984616132	2.3050972024906296e-05	0.4884896618721783	0.0029832404077727	0.4558773032526325	0.0029832404077727	0.4617049672809881	SOX5	920584	ETNK1	1016884	C2CD5	1097414	False	False	False	alt	5	0.001434	-20	0.03336
767	chr12	23646344	T	C	rs73073805	0.0091260116	0.6621255480131624	0.01668476	0.6643485253753473	0.0137355121247263	0.750999485793572	0.0001247750735743	0.7223011854973892	0.0002285532506658	0.7242406873192804	0.0041148427963444	0.8476863869002152	3.782966218690604e-05	0.8363149993302469	7.27022867366746e-05	0.83779442096018	5.6574602972658935e-05	0.874812982059294	5.163640895534162e-07	0.8539839571022836	9.963815259993594e-07	0.855517747220842	0.0001179439807331	0.8271142391081431	0.000268054501666	0.8285808757250077	SOX5	916200	ETNK1	1021268	C2CD5	1101798	False	False	False	alt	-70	0.02338	100	0.3428
768	chr12	29778123	C	A	rs10843507	-2.006679999999768e-06	0.9044482343755924	0.0040904957199999	0.9057350463584204	0.0277025467368551	0.2693163646907519	-2.357686571801925e-06	0.8329653693244327	0.0001128378934783	0.8340655410982903	0.0068729174227177	0.7890637144139201	-5.753673744884111e-06	0.8985341003021938	2.8675619184585927e-05	0.8996344083309359	0.0001892828569066	0.7321020602104494	-1.4519896545503288e-07	0.862188759535624	7.798864010319176e-07	0.863261905971253	-2.474349246145406e-05	0.8951987334484841	0.0001171191976509	0.8963154239311059	TMTC1	6636	OVCH1	280437	ERGIC2	396934	False	False	False	ref	95	0.04596	-85	0.01862
769	chr12	29791226	T	C	rs7316162	0.096515818	0.1106267782946805	0.096515818	0.1122720296332131	0.0179680485337752	0.5583834410333658	0.0017636632253757	0.1947314217576693	0.0017636632253757	0.1975606279260698	0.0254264128534195	0.626960683339401	0.0021935238026273	0.4082793379070636	0.0021935238026273	0.4135586813851157	0.0004656270116919	0.6433191333504811	4.010642047365109e-05	0.4304830320962015	4.010642047365109e-05	0.4359349420204627	0.005290983471347	0.3543240576327505	0.005290983471347	0.3593744850957931	TMTC1	6467	OVCH1	293540	ERGIC2	410037	False	False	False	alt	-70	0.005615	90	0.1477
770	chr12	29791874	C	G	rs302350	0.298095718	0.0094226165655761	0.298095718	0.0094378331845698	0.0543373844286099	0.0459305165280226	0.0176284600826664	0.0104517167684996	0.0176284600826664	0.0104537895414625	0.0646654679819207	0.4104959366022785	0.020222225609456	0.0952173934999067	0.020222225609456	0.0969898043330263	0.003725238041454	0.2349382277690993	0.0012487633601448	0.0559310536373834	0.0012487633601448	0.0567543071412329	0.035215763254264	0.0473047811562642	0.035215763254264	0.0480633396593054	TMTC1	7115	OVCH1	294188	ERGIC2	410685	False	True	True	alt	100	0.0185	5	0.02873
771	chr12	29806764	C	A	rs369003	-0.01691975196	0.6410710089208381	0.01827283736	0.636705569869735	0.0234026432638602	0.3697655032538683	-0.000395834206404	0.5850215202241159	0.0004230051304393	0.580585845398999	0.0129433209066015	0.6862872735831697	-0.0002007028675876	0.7298701867871635	0.000214563611902	0.7256392999570785	0.0003080225074397	0.6510603111576051	-4.766803536229886e-06	0.6967305815723345	5.0451372076028e-06	0.6923773303477632	-0.0007084886674804	0.7145948762695881	0.000753026953911	0.7102316308273695	TMTC1	22005	OVCH1	309078	ERGIC2	425575	False	False	False	ref	-25	0.01703	-35	0.09973
772	chr12	29809890	C	T	rs625430	-0.07185623	0.1798627639062612	0.07185623	0.1772947985522514	0.0284088230993804	0.2545349704270256	-0.0020917646916832	0.1676989116293665	0.0020917646916832	0.1654685786162193	0.1482852759724192	0.2274847302859273	-0.0106080122152793	0.1445854423490458	0.0106080122152793	0.1416999322084051	0.0041981006118129	0.1874508979609165	-0.0003086379252862	0.1334131098925409	0.0003086379252862	0.1311159645568698	-0.0183068852891689	0.1081869399865121	0.0183068852891689	0.1061313730056212	TMTC1	25131	OVCH1	312204	ERGIC2	428701	False	False	False	ref	5	0.003784	25	0.04895
773	chr12	29866765	A	G	rs58304678	-0.0622648618	0.2295359514549049	0.0622648618	0.2264448752544581	0.0154286523283579	0.6688511455398873	-0.0009678855311786	0.3474627170713847	0.0009678855311786	0.343017759673618	0.009913892646234	0.7374383639881879	-0.0006776033854743	0.570610560900152	0.0006776033854743	0.5648064128481274	0.0001492925748289	0.7656888879298945	-1.022849316500598e-05	0.6009388720876309	1.022849316500598e-05	0.5948866215232713	-0.0021625812411335	0.529046240192567	0.0021625812411335	0.5234073936871051	TMTC1	82006	OVCH1	369079	ERGIC2	485576	False	False	False	ref	-95	0.02234	0	0.0
774	chr12	29870745	T	G	rs10431276	-0.047312573	0.3121652345710813	0.047312573	0.3078430192160922	0.0264100507515932	0.2961418891838071	-0.0012251540820584	0.2755820949827205	0.0012251540820584	0.2717164344849934	0.0183885388142917	0.6638593746518817	-0.0007313169850009	0.5503211835296479	0.0007313169850009	0.5446762132136672	0.0005147660692259	0.6065557815322219	-2.0025185966679527e-05	0.5041941901340794	2.0025185966679527e-05	0.4987703926049739	-0.002204645178318	0.5135207648331431	0.002204645178318	0.507919839751812	TMTC1	85986	OVCH1	373059	ERGIC2	489556	False	False	False	ref	-75	0.02036	-60	0.0907
775	chr12	29877776	A	C	rs12229602	0.0003596263199999	0.7099172174229352	0.01325666792	0.7109906692867946	0.0197899809402119	0.4904794214367167	3.624523342836001e-05	0.684312627087102	0.0002461062404135	0.6853234058983783	0.0057693576589356	0.814769392917264	3.009677177908167e-05	0.8338691576322634	6.429769432605327e-05	0.8353226584264353	0.0001220542956143	0.7993050801742243	7.448627505207962e-07	0.8205423411832949	1.2779011327555957e-06	0.8219348409556024	0.0001286661607997	0.8275972404522205	0.0002589818877634	0.8290082950760482	TMTC1	93017	OVCH1	380090	ERGIC2	496587	False	False	False	alt	-50	0.0318	-100	0.0696
776	chr12	29889855	G	A	rs10843539	0.1002494894	0.1166441340863282	0.1002494894	0.1180112706349679	0.0521029998852316	0.0496205727800691	0.0050601772926369	0.0675806701602576	0.0050601772926369	0.0682844197609976	0.5340330243146052	0.0373389152809179	0.0563620423139409	0.0286752779541648	0.0563620423139409	0.0290581908551955	0.0275405919601002	0.011183414057092	0.0028038512998271	0.0207879027656029	0.0028038512998271	0.0209800201426883	0.0295775461053742	0.0617923886277472	0.0295775461053742	0.0628769743724075	TMTC1	105096	OVCH1	392169	ERGIC2	508666	False	False	False	alt	25	0.01709	30	0.083
777	chr12	29896727	G	T	rs2351015	0.0075704353	0.7045379015229858	0.0132398370999999	0.7070388321029323	0.0165483991720436	0.62176135133166	0.0001271009031559	0.7044328170635936	0.0002192523966438	0.706826114417246	0.0115032496453432	0.706950232048077	0.0001027559564635	0.7442275689998793	0.000154992470382	0.746202937039907	0.0001903321718311	0.7235715709465258	1.699622597243346e-06	0.7498206623673599	2.5603789085575406e-06	0.7518190278942389	0.0003909471808914	0.7340277116976462	0.000569100326614	0.7359683168267744	TMTC1	111968	OVCH1	399041	ERGIC2	515538	False	False	False	alt	-100	0.00412	45	0.07654
778	chr12	29902763	A	G	rs4622345	-0.00909092008	0.7396236249458706	0.01264528928	0.736064104862328	0.017181660537737	0.597173567973461	-0.000168140780563	0.731928105832279	0.0002233736512023	0.7282387750536813	0.0081876216555045	0.755635326624066	-9.873681169243596e-05	0.7985843918606821	0.0001177334729752	0.7949012843131503	0.0001430743232523	0.7646029153915016	-1.814924013010468e-06	0.7986383938434094	2.110121302560939e-06	0.7950663163967399	-0.0003538319421991	0.774763688197939	0.0004561050443733	0.7710912027629714	TMTC1	118004	OVCH1	405077	ERGIC2	521574	False	False	False	ref	-100	0.01245	95	0.11194
779	chr12	29926235	T	G	rs7970635	-0.0209681538	0.59588592078846	0.0209681538	0.5893305049396955	0.1402879108799375	0.0009552431714134	-0.002752839430738	0.1208377649051923	0.002752839430738	0.1192756936187368	0.0028125103097884	0.8921336325106946	-6.246229789988217e-05	0.850733844442412	6.246229789988217e-05	0.8439361182878135	0.0003791656460675	0.6099280060393514	-7.941445637019886e-06	0.6103662754879663	7.941445637019886e-06	0.6043673590912613	-0.0002581571046814	0.8383762156938728	0.0002581571046814	0.831618075224183	TMTC1	141476	OVCH1	428549	ERGIC2	545046	False	False	False	ref	15	0.01602	15	0.03082
780	chr12	39049882	C	T	rs114974785	-0.0372193418999999	0.3788859723989599	0.0397198416999999	0.3753793873811474	0.0151376534499735	0.68166641240435	-0.0005796605425953	0.4810485005603719	0.0006216880384351	0.4770728089237908	0.0075970769687571	0.7682676704778966	-0.0002747793914419	0.6849992097414668	0.0002883085381125	0.6808986542638492	0.0001091396984059	0.7970015022301905	-4.089512291899279e-06	0.709067964157122	4.316905295024664e-06	0.704815282506192	-0.00096994490449	0.6598059820094634	0.0010128336247566	0.655679593456228	CPNE8	142452	KIF21A	393508	ABCD2	569921	False	False	False	ref	-100	0.0266	-100	0.2954
781	chr12	50070687	A	G	rs706790	0.0851666339999999	0.1194122094620455	0.10056033	0.1205523979764706	0.0283013486014588	0.2564875833980691	0.0023029947372078	0.1354721826317638	0.002781045700576	0.1365679799179672	0.6795280591204514	0.0175765191505201	0.0585643855352321	0.0209529400649045	0.0689776416495515	0.0210683458864724	0.0192444370518092	0.0246681550629121	0.0015851860020026	0.0304648113582828	0.0019085694755152	0.0307408407376741	0.0189889808980238	0.0908191357898637	0.0227928804724357	0.0918022493120954	ASIC1	13138	SMARCD1	14514	GPD1	33296	True	False	False	alt	-85	0.03223	15	0.03516
782	chr12	50187707	C	T	rs7315690	-0.0944141692	0.1272126850423057	0.0989913452	0.1265092041640645	0.0690295638114752	0.0189339564895154	-0.0062389743934663	0.0504123140408814	0.0065417473951327	0.0503640916608096	0.4473417241265547	0.0566588336998291	-0.0437340055538795	0.0403259965726214	0.0456631777543284	0.0399814116449516	0.0309861013820765	0.0086428504073118	-0.0028733997893072	0.0199532983492054	0.0030010115024201	0.0199112901939961	-0.0312221635709807	0.0569130357320411	0.0328337897133053	0.0564988459330303	CERS5	20174	COX14	75624	GPD1	83724	True	True	False	ref	-40	0.0859	-50	0.0327
783	chr12	50189367	A	G	rs7138420	0.01559653272	0.2957245142031975	0.04847445672	0.2971235783843495	0.0551852642922756	0.0410030060425418	0.0006380657055564	0.1513600104500981	0.0026426610360788	0.1522158049106205	0.0131091023060934	0.6803526679858743	6.666471577168258e-05	0.5828632337678752	0.0005945001640175	0.5857297008278398	0.0007309387380733	0.4974506445263635	1.1969690292865152e-06	0.4349951533386818	3.3379549700179066e-05	0.4374754673710916	0.000251558840025	0.5398323271845272	0.0020594833558773	0.5426324710121111	CERS5	21834	COX14	77284	GPD1	85384	False	False	False	alt	55	0.0332	-100	0.1664
784	chr12	50231275	A	C	rs12425229	0.232425119	0.0177867555104344	0.232425119	0.0179081655163616	0.0368565226350889	0.1365426928521841	0.0089930424145271	0.0266054754482649	0.0089930424145271	0.0267202576342101	0.2543367094454158	0.1381008644750595	0.0665786038972784	0.0210748005486189	0.0665786038972784	0.0214206048193166	0.0098774700288215	0.0809384022288305	0.0026589085268968	0.0224758196296633	0.0026589085268968	0.0227578391546525	0.0731384645838144	0.0100617462524071	0.0731384645838144	0.010169734795755	LIMA1	52245	CERS5	63742	COX14	119192	False	True	False	alt	100	0.07916	-25	0.1028
785	chr12	50259146	T	C	rs10783344	0.04711615232	0.3179270577356565	0.04711615232	0.3223157169658383	0.0129687374828841	0.7879735842225677	0.0005815083159982	0.4854621251916627	0.0005815083159982	0.4912861936647714	0.006343406684042	0.7901361338280052	0.0002687184348376	0.6778306535542741	0.0002687184348376	0.6842510922985877	8.362981026569923e-05	0.8326130244776122	3.333172114029928e-06	0.7208401121177037	3.333172114029928e-06	0.7273687457200744	0.0009905644815413	0.6509987279440438	0.0009905644815413	0.6574627005050898	LIMA1	24374	CERS5	91613	LARP4	133238	False	False	False	alt	-25	0.0108	15	0.04456
786	chr12	50260192	T	C	rs1972611	0.0629206806	0.2127097177798117	0.0629206806	0.2160829315979579	0.0278147448760888	0.2653116331200604	0.0017498961388876	0.1942541406228863	0.0017498961388876	0.1969966648189001	0.0054311965952953	0.8237637314727905	0.0003528277145098	0.6462711128397515	0.0003528277145098	0.652408909694071	0.0001514946341366	0.7672439825077032	9.867600258498669e-06	0.59147670776441	9.867600258498669e-06	0.5975532888462773	0.0012281020091715	0.6181786089371843	0.0012281020091715	0.6243184828069017	LIMA1	23328	CERS5	92659	LARP4	132192	False	False	False	alt	65	0.01019	-90	0.0842
787	chr12	50280266	C	T	rs67138019	-0.2610030639999999	0.0121989428396867	0.2610030639999999	0.0121124913788081	0.0573510157002327	0.0357368224353654	-0.0150410062799598	0.010387122300816	0.0150410062799598	0.0103555235616163	0.0079591567417768	0.7642250153880109	-0.0020500408817428	0.3722774243869444	0.0020500408817428	0.3673254135153407	0.0004520140849564	0.5860694164685933	-0.0001167425069433	0.2381681714509778	0.0001167425069433	0.2344967055670585	-0.0053132526145623	0.333664661210959	0.0053132526145623	0.3290496118913236	LIMA1	3254	LARP4	112118	CERS5	112733	False	True	False	ref	65	0.01636	-95	0.1436
788	chr12	50284576	G	A	rs12832940	-0.2638522032	0.0136470586508123	0.2638522032	0.0135523233243568	0.0537267353320057	0.0446247496690277	-0.014607970936674	0.0129165605279904	0.014607970936674	0.0128134097868458	0.1051730394906139	0.2948331464874052	-0.0303291549103275	0.0607793173138524	0.0303291549103275	0.0595930512849333	0.0057949813225659	0.1432846944121188	-0.0017068529592227	0.0359362582674657	0.0017068529592227	0.0352744334301688	-0.0499224703902873	0.0243090623793905	0.0499224703902873	0.0239117672804525	LIMA1	1056	LARP4	107808	FAM186A	112046	False	True	False	ref	60	0.00763	-45	0.2646
789	chr12	50289962	T	C	rs7311973	0.0065015601	0.8299074811276858	0.00711448766	0.8342103892473162	0.0133117720409718	0.7638254819613123	8.465742403063507e-05	0.8516712531669864	9.409653348591628e-05	0.8557177323301691	0.0002301144798917	0.996898465772332	1.720254030383601e-06	0.983876452490773	1.8643307293872203e-06	0.9900010126849412	3.1049640248742484e-06	0.9973556535993192	2.2484543579998885e-08	0.9845717679762186	2.470333064967256e-08	0.9907248893800376	4.94869849229653e-06	0.9885714117177312	4.94869849229653e-06	0.9925797961439528	LIMA1	6442	LARP4	102422	FAM186A	106660	False	False	False	alt	100	0.04385	-10	0.0257
790	chr12	50358938	G	A	rs11169393	-0.0020467211	0.841168095677538	0.0069963853	0.8392781907920692	0.0333526847098836	0.177107382680496	-0.0001378061973195	0.7077356661230559	0.0002454286771628	0.705539245535714	0.0001715548810662	0.9984216437878992	-4.572266313191124e-07	0.99217390350774	8.981264031025052e-07	0.994691896690183	5.722725406553521e-06	0.99179391333495	-2.4746573795856043e-08	0.9867833552381596	3.492294169172658e-08	0.9869439299572368	-2.4743492461482594e-06	0.996145913245004	2.4743492461482594e-06	0.995842172523262	LARP4	33446	FAM186A	37684	LIMA1	75418	False	False	False	ref	30	0.013916	100	0.0687
791	chr12	50465394	G	A	rs12578525	0.00654773244	0.8516782157163504	0.00654773244	0.858373231747795	0.0245768712082125	0.3394296168045085	0.0001495316738536	0.7916244889488595	0.0001495316738536	0.7981410212462263	0.0001666061825739	0.9986777438622482	1.0356566992961255e-06	0.9879652256525988	1.0356566992961255e-06	0.9950670284618004	4.160076976445794e-06	0.9958369926226168	2.4141640455893907e-08	0.9850069921279616	2.4141640455893907e-08	0.992113752447608	2.474349246148265e-06	0.9919256906116052	2.474349246148265e-06	0.9958901843318204	DIP2B	39592	FAM186A	68772	LARP4	73010	False	False	False	alt	75	0.01404	70	0.1577
792	chr12	53250416	T	C	rs140587031	-0.01281834504	0.7280537191897466	0.01281834504	0.7212847468783075	0.0341984797416014	0.1649655182261167	-0.0004466567237253	0.5665983316343324	0.0004466567237253	0.5610010001540016	0.0001657813994919	0.9990015402258704	-2.57481162309625e-06	0.990904901926671	2.57481162309625e-06	0.9883332518364826	5.671937204869861e-06	0.9939620108917818	-9.02291898227838e-08	0.97914677956743	9.02291898227838e-08	0.975190054334388	-9.072613902543623e-06	0.9929520531653516	9.072613902543623e-06	0.9893105232061664	MFSD5	836	ENSG00000283536	8515	RARG	17436	False	False	False	ref	-70	0.03687	-95	0.1194
793	chr12	53336380	G	A	rs61928076	-0.101920634	0.1174436639446038	0.101920634	0.115852912001649	0.0538437568193607	0.0442740246291489	-0.0053189307285154	0.0602614045073094	0.0053189307285154	0.0596999905405862	0.431526508528257	0.0609029499737642	-0.0427269455036489	0.0390468525966946	0.0427269455036489	0.038211991021392	0.0232791516692815	0.0165990570953982	-0.0022332252281499	0.0242296681505521	0.0022332252281499	0.0238794972021443	-0.0340453960608359	0.0500420118307429	0.0340453960608359	0.0492462256048351	SP7	8935	AAAS	11516	MYG1	36684	True	False	False	ref	50	0.0556	-10	0.0249
794	chr12	53471071	A	G	rs11170562	0.0372035756	0.3744980955656685	0.0372035756	0.3795574943455754	0.0388759151606817	0.1201456781509218	0.0014553602718201	0.2289504385793356	0.0014553602718201	0.2322685739939086	0.0067153838540463	0.7834746506543426	0.0002381444918387	0.6695858869677963	0.0002381444918387	0.6758515301496211	0.0002771091748482	0.6678141214550145	9.859819333954422e-06	0.5666886146323548	9.859819333954422e-06	0.5727121533810711	0.0009336544488799	0.6405006117941168	0.0009336544488799	0.6467587206955299	PCBP2	18968	MAP3K12	28992	PRR13	29392	False	False	False	alt	90	0.04694	95	0.0963
795	chr12	53555002	A	G	rs7307025	0.0385705458	0.3705874662343026	0.0385705458	0.3754775366277335	0.0163851334698177	0.6244429220654402	0.0005956417356213	0.4634393189269393	0.0005956417356213	0.469127291209876	0.0001435122562765	0.9990421715899837	5.027774618391958e-06	0.9673665699036256	5.027774618391958e-06	0.9744758415347656	2.297768252791812e-06	0.9988800790388754	7.207395091477453e-08	0.9689715810376376	7.207395091477453e-08	0.9760803089605944	1.2371746230741314e-05	0.9776833358859752	1.2371746230741314e-05	0.9835432804180112	NPFF	47518	TARBP2	54080	MAP3K12	54939	False	False	False	alt	-90	0.02948	-90	0.1554
796	chr12	53684303	A	C	rs55844955	0.787352492	0.0004254437598007	0.787352492	0.000424988583815	0.1781845249632747	0.0003178293125263	0.1501382588713766	0.0001894911915239	0.1501382588713766	0.0001951544820516	0.1637606809409125	0.2216046185333528	0.1503366600837479	0.0066738688108244	0.1503366600837479	0.0066560302906897	0.0308416954000072	0.0113137464414286	0.0288944257722158	0.0012855000923927	0.0288944257722158	0.0012672999317335	0.1412383293193889	0.002368891941743	0.1412383293193889	0.0023350770325356	ATP5MC2	6895	CALCOCO1	43442	ATF7	57893	False	True	True	alt	-75	0.0285	-100	0.2532
797	chr12	71867788	C	T	rs7973727	-0.0090516640199999	0.7388707572864849	0.0126644874199999	0.7349964822518567	0.011709394864429	0.8394331287533887	-0.0001216802856472	0.8016733576498225	0.0001537644512965	0.7975482354846942	0.0020165946356107	0.920632183617399	-2.1774989663807348e-05	0.9165605738208904	2.7183318729540503e-05	0.9126517461539444	2.3935506581906943e-05	0.9461044508982704	-2.865365389414994e-07	0.9331125664705274	3.345659347495367e-07	0.929176501463146	-8.90765728613271e-05	0.9048572800466254	0.000117119197651	0.9008771836110258	TBC1D15	28080	TPH2	71058	RAB21	112924	False	False	False	ref	-100	0.01639	100	0.03235
798	chr12	71878892	A	G	rs61924145	0.0029192727967999	0.8507923831823883	0.0069732914432	0.8524724651582168	0.0134415398146714	0.7501211154333159	2.9152508825951552e-05	0.881236640468886	8.397893774103168e-05	0.8828064610411869	0.0053322226254494	0.8243051985886806	5.825104409345316e-06	0.918603628665972	3.2493577527470354e-05	0.919710571087172	6.578684446740643e-05	0.8609448900060802	3.9544520867444417e-08	0.932329339450638	3.812650431757965e-07	0.933508513421058	1.5670878558936502e-05	0.9115206643171616	0.0001261918115535	0.9117364872075704	TBC1D15	39184	TPH2	59954	RAB21	124028	False	False	False	alt	-85	0.0317	35	0.10596
799	chr12	71890721	G	C	rs12302711	0.0109286076	0.5485760136409007	0.0233876896	0.5523582250852596	0.1154026604949854	0.0023117640731246	0.0013737422547538	0.1268250521712711	0.0026814502114666	0.1280275310747232	0.0374195836495001	0.5026730716805662	0.0005213527887426	0.5165759160792671	0.000731703331237	0.5201483569103212	0.0042653242515116	0.1944357913925251	6.165986415354462e-05	0.2706596282386243	8.373830257021815e-05	0.273663318191294	0.0014821351984427	0.5002591860276402	0.0021139190392926	0.5039792388759292	TPH2	48125	TBC1D15	51013	RAB21	135857	False	True	False	alt	-75	0.01758	50	0.16
800	chr12	71912128	T	A	rs17110384	0.0020183703999999	0.6005995715909389	0.0213300053999999	0.6002196062275809	0.0171965276775363	0.589529214528994	0.0001553592185994	0.6024831381096618	0.0004296540858435	0.6022017680157117	0.0228200983141433	0.640902118086122	0.0005377340130553	0.6575107915337766	0.0005908750479039	0.6574924141266535	0.0004856197202242	0.6450586730240826	1.3599735254759716e-05	0.6524228269060283	1.434186609637399e-05	0.6527102138911969	0.0013617168684635	0.6340874988508641	0.0015827587344528	0.6342854218583152	TPH2	26718	TBC1D15	72420	RAB21	157264	False	False	False	alt	100	0.04205	100	0.1033
801	chr12	71912352	C	G	rs17110387	-0.390842046	0.0047208037538442	0.390842046	0.0046839998569408	0.064371455388225	0.0248516775163382	-0.0275538309798988	0.0050546128873251	0.0275538309798988	0.0050294372740926	0.0298604467025171	0.5775742759798036	-0.0162972872629001	0.1522048379385703	0.0162972872629001	0.1497796014503585	0.0022126912184217	0.3503392420584649	-0.0012569270289757	0.0797412452470668	0.0012569270289757	0.0784959985271611	-0.0240539738048892	0.103458706297873	0.0240539738048892	0.1018165875810154	TPH2	26494	TBC1D15	72644	RAB21	157488	False	True	True	ref	50	0.01318	50	0.01111
802	chr12	71918488	G	A	rs11178985	0.1374010196	0.0645094093566094	0.1374010196	0.0651645857369129	0.0266424428476519	0.2899251057738182	0.0043007519055605	0.092542781084598	0.0043007519055605	0.0934186997556807	0.0398939328956483	0.479521461055548	0.0049419724346756	0.2382546948581788	0.0049419724346756	0.2422690603969702	0.0009983714314188	0.4422554041016	0.0001506626599527	0.2202774713094366	0.0001506626599527	0.2238026227870591	0.0120739995381214	0.1699757343054139	0.0120739995381214	0.1731163562097163	TPH2	20358	TBC1D15	78780	RAB21	163624	False	False	False	alt	15	0.004677	35	0.0332
803	chr12	71927834	A	G	rs10506643	-0.0073674818	0.2971469833497122	0.0521286406	0.2966481718120927	0.0232353204309602	0.3756441225981389	-0.0003169213329633	0.3048585976666098	0.001294379599928	0.3045066903019539	0.026820296262083	0.5609011819963485	0.0001384548389052	0.4509629054355993	0.0015987495741017	0.4498371622456501	0.0006108187377603	0.5308034840872785	-2.069004938417728e-06	0.429349366325799	3.8110370005718914e-05	0.4284455662775125	-4.701263567680014e-05	0.3958772117562716	0.0043969186104054	0.3948919460253502	TPH2	11012	TBC1D15	88126	TRHDE	159433	False	False	False	ref	-80	0.02887	-70	0.1385
804	chr12	74908804	G	A	rs7955462	0.0295935044	0.4495109219443343	0.0295935044	0.455129168304606	0.0182627591458005	0.5449437077289832	0.0005780025818431	0.4672963250354583	0.0005780025818431	0.4728714291473059	0.0023077430635742	0.9048473770236354	7.830573802427292e-05	0.8136872365822255	7.830573802427292e-05	0.8204592625387491	4.34978466277983e-05	0.897878115285483	1.5724901084521886e-06	0.8029345854129301	1.5724901084521886e-06	0.8097320596523186	0.0003323875820658	0.8042809584466823	0.0003323875820658	0.8111352407297503	KCNC2	301035	ATXN7L3B	370968	GLIPR1L1	425867	False	False	False	alt	-30	0.00893	-100	0.1395
805	chr12	74910078	G	T	rs6582256	0.0243017092	0.5260912074900767	0.0243017092	0.5322958719402354	0.0196711917791458	0.4921293655837914	0.0004797027284613	0.508005549145894	0.0004797027284613	0.5139675043270266	0.0412746197749991	0.4781471294879452	0.0009835850754594	0.4727794705103404	0.0009835850754594	0.4783546513234436	0.0008491096175491	0.477827854421859	2.010460319731003e-05	0.4701574271440586	2.010460319731003e-05	0.4758191118407643	0.0027943650819834	0.447134676082504	0.0027943650819834	0.4527074728094706	KCNC2	299761	ATXN7L3B	372242	GLIPR1L1	424593	False	False	False	alt	-100	0.08136	-100	0.2148
806	chr12	74916655	T	C	rs6582260	0.02734235844	0.4815213924619348	0.02734235844	0.487559459397527	0.037883598671805	0.1257588651705774	0.0010109888747157	0.3232597567887232	0.0010109888747157	0.3276935852147564	0.12109630167266	0.2727378336369459	0.0034503181838475	0.3059266211373207	0.0034503181838475	0.3105597499528364	0.0043891951074802	0.1846489064083744	0.0001237832817293	0.2407620425486368	0.0001237832817293	0.2446940147698603	0.0063912441028009	0.2980486316124913	0.0063912441028009	0.3026883095635765	KCNC2	293184	ATXN7L3B	378819	GLIPR1L1	418016	False	False	False	alt	100	0.3066	100	0.6685
807	chr12	74943371	T	C	rs12316904	0.005435544604	0.8462309729683056	0.006749059524	0.8503408733883179	0.0170069166624831	0.599977331151378	9.609257276227636e-05	0.8296309756333226	0.0001163887819437	0.8338252566750727	0.011149417703144	0.7218126132481447	5.223806853480065e-05	0.832984113295034	7.844466496716516e-05	0.8368050952765891	0.0001818267691338	0.7370825475692446	8.83580773482015e-07	0.8329602193393951	1.2885206468784292e-06	0.8369751798202173	0.0001608327009996	0.8255765441237998	0.000284550163307	0.8293229431196044	KCNC2	266468	GLIPR1L1	391300	ATXN7L3B	405535	False	False	False	alt	100	0.0379	-35	0.01516
808	chr12	74945510	A	G	rs1526821	-0.0134665437	0.7178659692484326	0.0134665437	0.7111900564965918	0.0170233063553536	0.5986055523740705	-0.0002226801732657	0.7156735307089498	0.0002226801732657	0.7088078412659045	0.0405372636996469	0.4797072850122842	-0.0005802528481807	0.5754031828777799	0.0005802528481807	0.5695183601441791	0.0006673847359783	0.5120442398046117	-9.26961894771964e-06	0.5933753593467516	9.26961894771964e-06	0.5873268874765977	-0.0016173996238988	0.5713463455748647	0.0016173996238988	0.5653717930687336	KCNC2	264329	GLIPR1L1	389161	ATXN7L3B	407674	False	False	False	ref	15	0.008286	20	0.05374
809	chr12	74946622	C	T	rs12315638	-0.0224079822	0.4785469378306752	0.0288782282	0.4749128966257521	0.0129566413032379	0.7820636157005748	-0.0002598064622983	0.5912259925130444	0.0003624881383712	0.5876970348166664	0.100803338721916	0.3054348382192796	-0.0022772442038715	0.3235193918116544	0.0029031147091297	0.3207158214728597	0.001292760138539	0.3974934568508084	-2.60990700364778e-05	0.3952434127964772	3.6031526050658086e-05	0.3922937013193772	-0.004440632113754	0.311060631012241	0.0057982250668073	0.3080514590330105	KCNC2	263217	GLIPR1L1	388049	ATXN7L3B	408786	False	False	False	ref	-50	0.01923	-40	0.0769
810	chr12	74951873	G	C	rs11180302	-0.1043314068	0.1066500473505427	0.1184339547999999	0.1058956990473955	0.0289454575380478	0.2462611823582488	-0.0037946778910774	0.1206449245616109	0.0041879741602538	0.1197798298461558	0.0425678796476526	0.4861385758490983	-0.0081127339277988	0.2557336828801029	0.0083366411363583	0.2526602484422046	0.0014190796976702	0.4111802666215861	-0.0003042685092584	0.2262240339428342	0.0003105129033576	0.2237273529157254	-0.0157401603378311	0.1778843129024478	0.0164115337666193	0.1759613835038121	KCNC2	257966	GLIPR1L1	382798	ATXN7L3B	414037	False	False	False	ref	-20	0.02075	-40	0.06006
811	chr12	74954419	C	G	rs1526803	0.01561973138	0.6633024391634248	0.0162961915399999	0.6677056803865341	0.0251959375979144	0.3264162849476085	0.0003758164644042	0.5963043333154605	0.0003956581735233	0.6007236762448681	0.0018409158391342	0.9260730142438768	3.016115275545404e-05	0.8994101633474346	3.1254701206743206e-05	0.9038467600017744	4.622922454300334e-05	0.8934541210411118	7.254401989331824e-07	0.8737100036538379	7.57515806693886e-07	0.8780242626285564	9.567483751772114e-05	0.9064202123006904	0.0001022731021741	0.9107789023394351	KCNC2	255420	GLIPR1L1	380252	ATXN7L3B	416583	False	False	False	alt	-90	0.02682	95	0.05853
812	chr12	74959499	A	G	rs952408	-0.0088842380399999	0.7849601463983094	0.01021908252	0.7834259569267532	0.0231269845819997	0.3801395808051658	-0.0002103116241199	0.7340220308038193	0.0002414303665711	0.7322317110941866	0.0626934116327405	0.3972112601704932	-0.00072301216391	0.606839072170233	0.0007750072335174	0.6056493461253244	0.0014382654804274	0.3773509682745969	-1.683400514748922e-05	0.581119410735294	1.8078428719134567e-05	0.5798675475602565	-0.0014936821615914	0.6229525000594647	0.0016635874764936	0.6214952262886613	KCNC2	250340	GLIPR1L1	375172	ATXN7L3B	421663	False	False	False	ref	90	0.012436	65	0.02701
813	chr12	74973452	G	T	rs12300503	-0.0286238615	0.4746258739813511	0.0286238615	0.469012755101242	0.0156457587878526	0.637136721750753	-0.0004540235510972	0.5414607398470667	0.0004540235510972	0.5355797392084412	0.0517394675200421	0.4272550162058207	-0.0013833111567815	0.4447637998200261	0.0013833111567815	0.4393648077801182	0.0008170827078515	0.4762386313221965	-2.225423698768967e-05	0.4820991787324819	2.225423698768967e-05	0.4763195014618963	-0.0038203952360528	0.411163927941285	0.0038203952360528	0.4058180488332243	KCNC2	236387	GLIPR1L1	361219	CAPS2	417476	False	False	False	ref	-100	0.07227	100	0.1073
814	chr12	87265073	G	A	rs17014518	-0.010657635156	0.7190274959898229	0.012873945036	0.7154156774084414	0.0184974626352253	0.5392543412213602	-0.0002257795618781	0.6931023340335672	0.0002584725111544	0.6893059103540391	0.0093340701395532	0.7538184119394183	-9.807696812140436e-05	0.8089000758752846	0.0001159545624824	0.8049835543766071	0.0001813820379992	0.7508937127975568	-2.185878840991631e-06	0.7979597844445346	2.4495925455224607e-06	0.7941010373906052	-0.0003645541222658	0.8047987890769945	0.0004272376365015	0.8014428497162417	MGAT4C	426169	RLIG1	768774	C12ORF50	768964	False	False	False	ref	45	0.01497	-50	0.06616
815	chr12	87287207	T	G	rs66619626	0.0817919672	0.1416260924989786	0.0817919672	0.1437729644324169	0.0168840639039991	0.597881156242854	0.0014461169855308	0.2350208678082333	0.0014461169855308	0.2381024195275588	0.0090907591303486	0.7498316385518428	0.0007174811172093	0.5315374407939726	0.0007174811172093	0.5373737828897269	0.0001452748940616	0.7671099232805665	1.1919274744748374e-05	0.5513297767311428	1.1919274744748374e-05	0.5573841434854064	0.0024190887796509	0.4887616114255798	0.0024190887796509	0.4944796816386304	MGAT4C	448303	RLIG1	746640	C12ORF50	746830	False	False	False	alt	100	0.08704	-90	0.1334
816	chr12	87294412	T	C	rs11104403	-0.0206299238	0.601637660269312	0.02208677148	0.5980742987737643	0.0183222179537279	0.5443214058691573	-0.0003740341351249	0.6265979419323379	0.0004021112905262	0.6228193748910145	0.0002251657813994	0.9971481637583548	-5.1733964302584055e-06	0.9831744019312642	5.239483513460388e-06	0.9815772514395033	4.276654573989042e-06	0.9950334347046034	-9.661428716592748e-08	0.9806315468361404	9.78879531181156e-08	0.9783415560256362	-1.1546963148691887e-05	0.9899139134247082	1.1546963148691887e-05	0.9877524109796336	MGAT4C	455508	RLIG1	739435	C12ORF50	739625	False	False	False	ref	50	0.0126	-95	0.0964
817	chr12	87295117	C	A	rs12815820	-0.0682967338	0.1930920023133912	0.0682967338	0.1904078571855359	0.0149955563532002	0.6747699642008889	-0.0011032790370964	0.3112286584764513	0.0011032790370964	0.307209972394915	9.320048827156248e-05	0.9997983904452592	-6.934179868845917e-06	0.9748072598725576	6.934179868845917e-06	0.9690484652187612	1.3931306182977253e-06	0.9997205801880428	-1.0837486236685398e-07	0.9739107318893968	1.0837486236685398e-07	0.9685646302856596	-2.1444360133284945e-05	0.9785352505626008	2.1444360133284945e-05	0.9729967178942468	MGAT4C	456213	RLIG1	738730	C12ORF50	738920	False	False	False	ref	-100	0.01463	-80	0.05664
818	chr12	87302883	T	A	rs725421	-0.0295401432	0.4150857299034536	0.0339115104	0.4114759899385529	0.0212681272889835	0.4316609914751073	-0.0007170074219294	0.4010856738967712	0.0007838472124431	0.3975679374491506	0.0761901619873972	0.3568973972972046	-0.0015985235729583	0.3609724817772619	0.0021358227139569	0.3579083339326771	0.0015062157249582	0.3615869546950966	-3.90854016268416e-05	0.3578795540168801	4.730090077015404e-05	0.3546408531391203	-0.0043127907360363	0.3327768765560202	0.0052975817360033	0.3296320724651685	MGAT4C	463979	RLIG1	730964	C12ORF50	731154	False	False	False	ref	-60	0.05118	-45	0.06415
819	chr12	87311437	G	A	rs7972062	-0.0419127268	0.3465817050889913	0.0419127268	0.3422557201979828	0.0161233683052916	0.6338265323960556	-0.0006527614739716	0.4435631634115732	0.0006527614739716	0.4383038064850317	0.0836577480122727	0.3416917106723542	-0.0035185550097617	0.3091662628076296	0.0035185550097617	0.304722660497738	0.0013632717025804	0.3880394506480143	-5.53536529174957e-05	0.3522510860330378	5.53536529174957e-05	0.3474914534264307	-0.0076572861337468	0.2707257871911827	0.0076572861337468	0.2666065142685092	MGAT4C	472533	RLIG1	722410	C12ORF50	722600	False	False	False	ref	-35	0.02911	85	0.2434
820	chr12	87318399	T	A	rs10858579	0.0674219947	0.1964306499125208	0.0674219947	0.1992390307812973	0.0192321525930506	0.5078906550206281	0.0012624858839846	0.2708288864800574	0.0012624858839846	0.2744459534703043	0.0876793903203457	0.3261629931172627	0.0059858708490753	0.2197459103354079	0.0059858708490753	0.2234777234092833	0.001720159763105	0.3393958098810771	0.0001143645927233	0.2431200382099068	0.0001143645927233	0.2469321659457813	0.0127428986176635	0.1678706620673111	0.0127428986176635	0.1706736008869922	MGAT4C	479495	RLIG1	715448	C12ORF50	715638	False	False	False	alt	-65	0.04688	-15	0.01855
821	chr12	89434954	C	T	rs1845141	0.0170722318	0.6435656230914322	0.0170722318	0.6500854266449713	0.0151393204427163	0.6677055962325248	0.0002404370463296	0.6837896445359177	0.0002404370463296	0.6905087245716752	0.0138588301276763	0.6853616404221737	0.0002705525034161	0.6821470295807833	0.0002705525034161	0.6883728952499805	0.0001863931212225	0.7309436364091144	3.537555473849538e-06	0.7150582189137015	3.537555473849538e-06	0.7213881743869551	0.0008981887763517	0.6672424364056185	0.0008981887763517	0.6734500509139454	DUSP6	82453	GALNT4	89842	POC1B	91093	False	False	False	alt	-90	0.013794	-90	0.0677
822	chr12	89457189	A	C	rs7308051	0.127963576	0.0697739753052492	0.127963576	0.0705846176270285	0.0251532493273227	0.3243853052401539	0.0036305711689168	0.1031644469802538	0.0036305711689168	0.1042894464952735	0.0148980568110586	0.6650867131995808	0.0017962139250268	0.3868918770428751	0.0017962139250268	0.3919759083652015	0.0003585684347733	0.6232757947168448	4.926296038642465e-05	0.3582967220024249	4.926296038642465e-05	0.3632490920874256	0.0051466464319883	0.3295381440108958	0.0051466464319883	0.3342575626250585	GALNT4	67607	POC1B	68858	POC1B-GALNT4	69073	False	False	False	alt	80	0.01435	80	0.04126
823	chr12	89463361	G	A	rs6538188	0.0863326158	0.1327746095062447	0.0863326158	0.1346074724297938	0.0266538290053683	0.291267128112211	0.0023992119896145	0.1439084617575102	0.0023992119896145	0.1457794477715817	0.035349378113556	0.5107384263422396	0.0032105167556937	0.3038080699610868	0.0032105167556937	0.3083194951208886	0.0009650113973017	0.4545113632576478	9.066846291337872e-05	0.2741600169370458	9.066846291337872e-05	0.2784694143703637	0.0085422783807858	0.2345810337544223	0.0085422783807858	0.2385690155229775	GALNT4	61435	POC1B	62686	POC1B-GALNT4	62901	False	False	False	alt	55	0.02435	-5	0.01074
824	chr12	89488768	T	C	rs9634199	-0.20782028764	0.0332837526508681	0.20782028764	0.0329844483972619	0.0450774905148652	0.0828389550063049	-0.0116019029856829	0.0329191418337717	0.0116019029856829	0.0326740333207867	0.0143000890765728	0.6727905945357487	-0.0036102647602622	0.3386183447902314	0.0036102647602622	0.3337062250097409	0.0007116071853721	0.5206187674157781	-0.0002046897483709	0.2352805650551096	0.0002046897483709	0.2317512909030733	-0.0082404077727557	0.2778653914737675	0.0082404077727557	0.2735183508956834	GALNT4	36028	POC1B	37279	POC1B-GALNT4	37494	False	False	False	ref	80	0.03995	95	0.1511
825	chr12	89499935	A	G	rs10858884	0.5152028740000001	0.0017109258250892	0.5152028740000001	0.0016930931633794	0.0566659014382016	0.0390329617169978	0.0308710642442189	0.003480166065463	0.0308710642442189	0.0034941122719179	0.5647553693378642	0.0322282174503939	0.2981663871974019	0.0008819435892073	0.2981663871974019	0.0008553698821947	0.0326165594586458	0.0079003069068561	0.0182384199013876	0.0015061970599134	0.0182384199013876	0.001506153515623	0.1572853089637425	0.0010587893709302	0.1572853089637425	0.0010606244347801	GALNT4	24861	POC1B	26112	POC1B-GALNT4	26327	False	True	True	alt	50	0.06415	45	0.1763
826	chr12	89503226	T	C	rs10777173	0.1284942468	0.0623432451937312	0.1284942468	0.0631826506735322	0.0341433892990373	0.1657178679726346	0.004385921738233	0.0645425817677108	0.004385921738233	0.0652636615615159	0.0042303124278314	0.8720967781368462	0.0004988138840061	0.6545884573626913	0.0004988138840061	0.6613548044605598	0.0001528768369171	0.8062963478844422	1.80808820798496e-05	0.5764472904166145	1.80808820798496e-05	0.5829297560628569	0.0016446174656064	0.6275965191458595	0.0016446174656064	0.634458126396226	GALNT4	21570	POC1B	22821	POC1B-GALNT4	23036	False	False	False	alt	80	0.05237	-80	0.08813
827	chr12	89545558	G	A	rs11105326	0.0259301921999999	0.2767016645198163	0.0581844158	0.2772612649175697	0.0306819481587717	0.2145006329540429	0.0006891028736049	0.2427101940927962	0.0016244159361565	0.2432430594435927	0.2400341460195968	0.1450380278337245	0.0076837496473799	0.138756750541285	0.0155271253674644	0.1390120346219724	0.0068258306721812	0.1172718436017335	0.0001909557195782	0.1315806624191265	0.0004087872904443	0.1318848642337635	0.0080680281086074	0.130840820794134	0.0185196793243376	0.1309202744932419	POC1B-GALNT4	19296	POC1B	19511	GALNT4	20762	False	False	False	alt	-100	0.02124	90	0.1222
828	chr12	89576410	T	C	rs77966649	0.0554750134	0.2645509381314201	0.0554750134	0.2679327576203301	0.0266931291431999	0.2922214992797531	0.0014881116720028	0.2529966864340699	0.0014881116720028	0.2562565333893579	0.076135726303982	0.3841652319118961	0.004388586546792	0.2934876525296147	0.004388586546792	0.2977637560482135	0.0020053126065886	0.3406116521240849	0.0001129226011643	0.2738014338830065	0.0001129226011643	0.2777409840324733	0.0087501237174622	0.2476654462321979	0.0087501237174622	0.2516476419462651	POC1B-GALNT4	50148	POC1B	50363	GALNT4	51614	False	False	False	alt	90	0.014305	-100	0.1367
829	chr12	91853010	C	G	rs4240748	-0.0344151539999999	0.4357797373233484	0.0344151539999999	0.4304779877232047	0.0279936110611796	0.2618764939930639	-0.0009370056745189	0.3606140202604415	0.0009370056745189	0.3558438835723599	0.0801738642736959	0.3458518385404846	-0.0028870512548355	0.3428302843827068	0.0028870512548355	0.3381957658694636	0.0021738626390945	0.2960882688213828	-7.520333418136371e-05	0.3088342896636222	7.520333418136371e-05	0.3044335978720541	-0.0060374121606016	0.3195802091130985	0.0060374121606016	0.3152185865055845	BTG1	292836	DCN	669793	LUM	741516	False	False	False	ref	-90	0.03278	-100	0.2505
830	chr12	91948482	T	C	rs63482062	-0.0076669982179999	0.83575824794996	0.0077416338619999	0.8313094811299144	0.0191407063089779	0.5124728229242526	-0.0001231746367565	0.8326840778142819	0.0001249553579915	0.828234424052765	0.1255435320510705	0.2599258999526457	-0.000864838305902	0.5418447323273717	0.0008786959838028	0.5379449959050658	0.0024545165451125	0.2810708847029144	-1.3717537838691724e-05	0.5581917035234859	1.404816620860544e-05	0.5542654152506071	-0.0017485401339447	0.5789779912825223	0.0017749331925703	0.5747571413835537	BTG1	197364	PLEKHG7	754362	DCN	765265	False	False	False	ref	60	0.01642	100	0.1273
831	chr12	94783625	G	T	rs10777617	-0.021099686	0.592847615618345	0.021099686	0.5862707793175636	0.0120017620692192	0.8218895741048757	-0.0002698213516742	0.690408108560278	0.0002698213516742	0.6836100472653607	0.0442454884365411	0.4634617760519452	-0.0011597154293582	0.4923112728393258	0.0011597154293582	0.4867244479579438	0.0005669634922506	0.5532371076392828	-1.608840013884817e-05	0.560549359509417	1.608840013884817e-05	0.5546085831922127	-0.0028941638349113	0.4724532304699689	0.0028941638349113	0.466645704645418	TMCC3	133068	NDUFA12	220123	NR2C1	290003	False	False	False	ref	-100	0.06082	100	0.1342
832	chr12	94797338	C	T	rs7311279	-0.19095889	0.0268123508411831	0.19095889	0.0266095891966109	0.0468015294125449	0.0694929780857144	-0.0089821648560252	0.0237716442710972	0.0089821648560252	0.023688551406072	0.045361419946554	0.4575291968080004	-0.0088265594313142	0.1717410251447856	0.0088265594313142	0.1685827202899315	0.002244870527031	0.3013547222985183	-0.0004409225193993	0.1105544325120285	0.0004409225193993	0.1085352192225364	-0.0198508792187654	0.1010926671613916	0.0198508792187654	0.0991345835012813	TMCC3	146781	NDUFA12	206410	NR2C1	276290	False	False	False	ref	100	0.0398	100	0.0884
833	chr12	94797413	A	C	rs7311211	0.0778100811999999	0.1729177000100508	0.0778100811999999	0.1751154589471922	0.019541302388102	0.5035615395990047	0.0016270666011636	0.2392210949976945	0.0016270666011636	0.2421268087585536	0.0618199663488501	0.3979498465173874	0.0055648870408102	0.2522704252761475	0.0055648870408102	0.2563161626497175	0.001199237810368	0.4093220968467038	0.0001134373208491	0.2712069594095064	0.0001134373208491	0.2753734956487073	0.0116739797433274	0.1939569522161096	0.0116739797433274	0.1970855004574884	TMCC3	146856	NDUFA12	206335	NR2C1	276215	False	False	False	alt	45	0.05368	-35	0.04694
834	chr12	94801919	G	A	rs11835590	0.0949278496	0.1305467376657298	0.1131871576	0.1312178461195763	0.1033065042910259	0.0037046870306144	0.0086372249069598	0.0295257792685475	0.0106475302663093	0.0296439011532391	0.274517501897001	0.1232259157017487	0.0357639458958681	0.0659802356070813	0.0411557909804678	0.0664448259873725	0.027682987153906	0.0114313191125649	0.0031671973984556	0.0226126104254633	0.0037608264244537	0.0225358769147262	0.0304963544587773	0.0581824486707554	0.0365733562073174	0.0584793137888643	TMCC3	151362	NDUFA12	201829	NR2C1	271709	False	True	True	alt	45	0.0426	40	0.1968
835	chr12	99042804	T	G	rs1319893	0.0150215666	0.543282604341875	0.0241294434	0.5454248076187865	0.0158046188155289	0.6573293125534521	0.0002471998532327	0.5870906915094308	0.0003950126279034	0.589259045933741	0.3024265118273893	0.1083582399793992	0.0036937362526964	0.2000771027624692	0.0068662432111135	0.2010969113447292	0.0047892386095142	0.1669340257527404	6.100186339961845e-05	0.2460455048235082	0.0001125689485052	0.2469910837618823	0.0049272541321632	0.2501103975316029	0.0081323611890072	0.2513155329934887	APAF1	397654	IKBIP	397691	SLC25A3	449212	False	False	False	alt	100	0.03397	-95	0.3396
836	chr12	99044685	C	T	rs7311721	-0.0636046993	0.2129511692641147	0.0672238803	0.211070847757522	0.0513726730753213	0.0512816215399736	-0.0032149265256438	0.1130213670296833	0.0034045458772577	0.1122809296345695	0.0732027976642142	0.3620910923257428	-0.0050859254378397	0.2605793451426675	0.0053171167280062	0.2576203334040756	0.0037286774893204	0.20549618966925	-0.0002544900326509	0.1677525328684974	0.0002666028124854	0.1657545477110776	-0.0109052819108574	0.2021904414080296	0.0114809805021278	0.1996902617151471	APAF1	399535	IKBIP	399572	SLC25A3	451093	False	False	False	ref	-50	0.00782	75	0.0459
837	chr12	99046453	G	A	rs7955942	0.01225714928	0.7326889428504011	0.01225714928	0.7391793749311811	0.0136233850647596	0.7551947247532317	0.0001669315104565	0.7684875667789034	0.0001669315104565	0.7750791536936606	0.0022772260895383	0.9201463228132518	3.041520650336e-05	0.9066853037394088	3.041520650336e-05	0.913600186524857	3.121592447055605e-05	0.9346442213046576	4.163170176844394e-07	0.9158879769558826	4.163170176844394e-07	0.9227502526059832	0.0001129952822407	0.9039788166850552	0.0001129952822407	0.9108529872401246	APAF1	401303	IKBIP	401340	SLC25A3	452861	False	False	False	alt	100	0.03708	-100	0.09174
838	chr12	99050654	A	G	rs1814453	0.0328388872	0.4157733685921277	0.0328388872	0.4210579228500715	0.0133340504476319	0.7551320275171949	0.0004820844172231	0.5151036968713131	0.0004820844172231	0.5209221455314686	0.0027490020124706	0.8897941578937072	8.54414835938193e-05	0.7990433724616237	8.54414835938193e-05	0.8057736264434481	3.58833726756156e-05	0.9134405998360388	1.2331909870837609e-06	0.8176275049402528	1.2331909870837609e-06	0.8243864861336704	0.000334861931312	0.7922609178593862	0.000334861931312	0.7989887004082844	APAF1	405504	IKBIP	405541	SLC25A3	457062	False	False	False	alt	-30	0.004272	-60	0.07666
839	chr12	99053361	C	A	rs3794799	-0.161247316	0.0417233008614679	0.161247316	0.0412538230527408	0.0479452540160467	0.0652117600773438	-0.007993047755325	0.0309185096226115	0.007993047755325	0.0307492115231111	0.1145574213981722	0.2851058493242061	-0.0177483167830279	0.0989587721285409	0.0177483167830279	0.0970501298196875	0.0053701751685242	0.1574329185816013	-0.0008773044200189	0.063090656859571	0.0008773044200189	0.0620695221113191	-0.0310407112929299	0.0525071130998211	0.0310407112929299	0.0516124528860635	APAF1	408211	IKBIP	408248	SLC25A3	459769	False	False	False	ref	-50	0.02155	-20	0.0752
840	chr12	99068591	A	G	rs6419378	-0.00594630406	0.7084699457079643	0.01338461474	0.7069562288771019	0.0246558188102626	0.3378828177617698	-0.0001314085483049	0.615181874915921	0.0003252546951745	0.6137794338928168	0.0253991950117118	0.5712514935258238	-0.0002172337609072	0.636411769656597	0.0003630715673958	0.6348021099123832	0.0006183755304207	0.5309780736528105	-4.963903768835591e-06	0.5991115006637522	8.751971803055841e-06	0.5975783876068544	-0.0005897199036653	0.6273128460171041	0.0011307776054897	0.6256712049107152	APAF1	423441	IKBIP	423478	SLC25A3	474999	False	False	False	ref	10	0.00946	60	0.0876
841	chr12	99073457	T	C	rs2372634	0.02708947614	0.4976677113463545	0.02708947614	0.5035437908178579	0.0148366187783538	0.7006132617478745	0.0004263463120543	0.5669108025079548	0.0004263463120543	0.5731665781645304	0.0208868067698194	0.5972467436495108	0.0005464048165702	0.575385842529112	0.0005464048165702	0.5813640024088197	0.0003045920988423	0.642613393626442	8.542771463121552e-06	0.6063877853701294	8.542771463121552e-06	0.6125062056667439	0.001788129721883	0.5474050288747082	0.001788129721883	0.5534107379569289	APAF1	428307	IKBIP	428344	SLC25A3	479865	False	False	False	alt	-30	0.00624	-85	0.1011
842	chr12	99074034	C	T	rs7975384	0.00993775244	0.637182460430937	0.01611366844	0.6397870096338917	0.0695347523872182	0.0180216355113872	0.0007019245851605	0.3344577591636171	0.0011027648691191	0.3357843013687483	0.0741875886641812	0.3643279580371287	0.0008312389859717	0.4917664127825984	0.0013248960812351	0.4941121306180341	0.0051008894221367	0.1607248421606978	5.819824903615624e-05	0.3212067304435933	8.967222320571515e-05	0.3228314666335478	0.0020108211540364	0.4862749255908585	0.0030450991389264	0.4885966342520448	APAF1	428884	IKBIP	428921	SLC25A3	480442	False	True	False	alt	65	0.02008	90	0.1536
843	chr12	99075330	A	G	rs2372636	0.209191912	0.0227004525658588	0.209191912	0.0229045550907031	0.0314943840152416	0.2009989069575393	0.0067188145734316	0.0385847345121037	0.0067188145734316	0.0388991747454389	0.0322316980634092	0.5189127862157406	0.0068613854643614	0.1938120089088998	0.0068613854643614	0.1972686913770036	0.0010176361665289	0.4334397877311944	0.0002207611800772	0.1631069219612045	0.0002207611800772	0.1658733327489874	0.0160040909240869	0.1234920542227701	0.0160040909240869	0.1258876066246421	APAF1	430180	IKBIP	430217	SLC25A3	481738	False	False	False	alt	50	0.02979	-90	0.2329
844	chr12	99077062	G	A	rs2372638	-0.014526939408	0.6348690011261418	0.017708978808	0.6303500637581765	0.0160196205313012	0.6406799728513545	-0.0001877576039085	0.6900678931594827	0.0002520013768679	0.6856393966048202	0.1161492527465276	0.3024837923802048	-0.0007176376920156	0.4780292443851849	0.0016221820759114	0.474926171529502	0.0019638352214021	0.3614721202681106	-5.876761493433522e-06	0.5176595023341821	2.413905700441212e-05	0.5145293990803544	-0.002170004288872	0.4908085381262825	0.003172940516644	0.4874406107762862	APAF1	431912	IKBIP	431949	SLC25A3	483470	False	False	False	ref	100	0.02946	-100	0.1803
845	chr12	99080758	T	G	rs7137868	-0.0127225036999999	0.7181241799938776	0.0134583265	0.7140290658088099	0.0117589213697702	0.8400447565623558	-0.0001625162044502	0.7825662170709655	0.0001705151285299	0.7782409110269405	0.3493607931114116	0.088259177386271	-0.0043846377202289	0.2731456749334469	0.0045754149072796	0.270260103064675	0.0040581457087976	0.1939389255887734	-5.4991322176456326e-05	0.3581060735793869	5.706520771673485e-05	0.3549501318837485	-0.0041610306489392	0.3902283987767173	0.004390320345749	0.387049634706951	APAF1	435608	IKBIP	435645	SLC25A3	487166	False	False	False	ref	90	0.03635	-35	0.02771
846	chr12	99087094	A	C	rs6538897	-0.00286765856	0.8235910892070617	0.00761102144	0.8221338171450511	0.0130466803289256	0.7834568111905121	-2.8181399990871584e-05	0.8535659448765703	9.649041470976025e-05	0.8522513284867659	0.4150935304015044	0.0656750001722621	-0.0010437853869587	0.3321844721902734	0.0032171502482813	0.3311510476017784	0.0054235793508481	0.1484660070928957	-9.667630138586565e-06	0.4022908263883119	4.098657007788849e-05	0.4012520982861227	-0.0009839662168849	0.4958435647054481	0.0026153871531786	0.4943936501969463	APAF1	441944	IKBIP	441981	SLC25A3	493502	True	False	False	ref	100	0.01602	100	0.1499
847	chr12	99087253	T	A	rs7299393	0.0089497828	0.590959257946101	0.0203754427999999	0.5948753849281541	0.012357234514331	0.8078952063391988	0.000144565262419	0.684987776564378	0.0002435955228086	0.6893470591514961	0.5835744449209856	0.029574539545614	0.005499970997245	0.129453459109921	0.0120411433309018	0.1313353331411878	0.0072338712490328	0.1110564476603426	8.80384351173632e-05	0.2050927187565648	0.0001447331040012	0.207346126459673	0.0023827983240407	0.3118981594102206	0.0055235723004849	0.3148479703248195	APAF1	442103	IKBIP	442140	SLC25A3	493661	True	False	False	alt	100	0.2427	100	0.7695
848	chr12	99098767	C	T	rs10860390	-0.0794514098	0.1589668906841111	0.0794514098	0.1569020526120689	0.0267361783545428	0.2875877335110949	-0.0022493745239055	0.1665626792648683	0.0022493745239055	0.1644231981030173	0.0560514334729965	0.4299159257266101	-0.0051416921162053	0.2703657072925587	0.0051416921162053	0.2663125556902481	0.0015964965701784	0.3757172268574221	-0.000155333875547	0.2461272672324873	0.000155333875547	0.2424999554580758	-0.0114182969878921	0.2039841467699708	0.0114182969878921	0.2010165325254928	APAF1	453617	IKBIP	453654	SLC25A3	505175	False	False	False	ref	95	0.06555	-90	0.0925
849	chr12	99099957	G	C	rs10745841	-0.135798742	0.0615095889945234	0.135798742	0.0608825608936457	0.0436952960572893	0.0868058009329262	-0.0064490405892891	0.0468239921537039	0.0064490405892891	0.0465164897899414	0.009414898881594	0.7448528358925014	-0.0015205851396638	0.4490256911574543	0.0015205851396638	0.4437757665323637	0.0004532714795331	0.6055557969983044	-7.706380063601155e-05	0.3340393854466404	7.706380063601155e-05	0.3294018318091702	-0.0043202137837748	0.391339179618315	0.0043202137837748	0.3863287727408803	APAF1	454807	IKBIP	454844	SLC25A3	506365	False	False	False	ref	-40	0.003906	-100	0.2551
850	chr12	103913338	A	C	rs80096598	-0.045582406	0.059005699441726	0.135550054	0.0588829831057372	0.0175644613074145	0.5673873186869107	-0.0004502518982328	0.1452261912758366	0.0024365282970299	0.1447174776234646	0.3091707630893074	0.1060485836639589	-0.0095556272038932	0.0360802316908951	0.0423254586087333	0.0359721739983818	0.0058123638358866	0.1472518737530626	-9.326381838958e-05	0.0680327354727567	0.0008158090846129	0.0678661510297923	-0.0137309887499587	0.0263055685533675	0.0450628484708521	0.0262001520600649	HSP90B1	16770	UQCC6	52370	TDG	52485	False	False	False	ref	-90	0.008606	-50	0.1311
851	chr12	103948094	G	A	rs117856328	-0.0275262142	0.513770003893713	0.0275262142	0.5079942740155975	0.0315353934931133	0.199327225612625	-0.0008994858145608	0.3939154127409893	0.0008994858145608	0.3893039193853259	0.0010161327570848	0.9680124159957414	-2.569759122467259e-05	0.920661971952553	2.569759122467259e-05	0.9137310127257128	3.129494265836758e-05	0.9290093433275886	-8.29446833884356e-07	0.8736356604735503	8.29446833884356e-07	0.8667269199351153	-9.155092210748164e-05	0.9236368373271808	9.155092210748164e-05	0.916671008202832	UQCC6	17614	TDG	17729	HSP90B1	17986	False	False	False	ref	-20	0.03934	-100	0.0776
852	chr12	103962513	T	C	rs77165492	-0.0121578056	0.449702613462643	0.0330104132	0.4487492172794623	0.1100337818536768	0.0029098278200741	-0.001901452231251	0.1003991242881443	0.0038781943687532	0.1003330000570519	0.4480205206030813	0.0560170577413438	-0.0041615747848583	0.1247224471508215	0.0132105413926681	0.1242006965642741	0.0490566019977541	0.0023682157697972	-0.0006468782175473	0.0365093415028445	0.0015302429657648	0.036336144511903	-0.0036579129688891	0.202029721655419	0.0108929101646266	0.2014538595087948	UQCC6	3195	TDG	3310	HSP90B1	32405	False	True	True	ref	100	0.1101	100	0.2861
853	chr12	103964469	C	A	rs76093694	-0.0186400912	0.2373066531073259	0.0632900528	0.23581033186992	0.0197808670928782	0.4898298044663297	-0.0004846428692293	0.2958877079192208	0.0013604099725494	0.2943521988340834	0.0059400877569198	0.8127402540922681	0.0001641593079037	0.6506103398698584	0.0004561836393731	0.648092608115303	0.0001121984667159	0.8058857110084557	3.033628901858412e-06	0.6433985975802802	9.133815965868636e-06	0.641098021070491	0.0005031176800501	0.6187466226134043	0.0015225495694631	0.61653822422115	UQCC6	1239	TDG	1354	HSP90B1	34361	False	False	False	ref	30	0.0012455	75	0.1921
854	chr12	104158934	G	T	rs12582033	0.02470202	0.5229143064276621	0.02470202	0.5287992716882186	0.0326371760113629	0.1873346220664192	0.0008363171875175	0.3665352756406944	0.0008363171875175	0.3712760393161251	0.0005649764112037	0.9863109323856348	1.33936595547648e-05	0.942641442637706	1.33936595547648e-05	0.9497188075458188	1.7009806774290043e-05	0.96744156979002	4.1142744132268017e-07	0.9084957768507452	4.1142744132268017e-07	0.9153837424359244	5.196133416910032e-05	0.9405708719886324	5.196133416910032e-05	0.9476250045280472	NFYB	20693	TXNRD1	56846	HCFC2	94402	False	False	False	alt	-75	0.02588	-100	0.2695
855	chr12	104165950	G	A	rs77743764	-0.0726910766	0.1795954836255633	0.0726910766	0.1769413065726263	0.0183955307423097	0.5454511603391904	-0.0014025022576194	0.2548700047597607	0.0014025022576194	0.2515368648421054	0.0118372867935732	0.6979373998401841	-0.0008874439398563	0.5035765696901909	0.0008874439398563	0.4977590625492071	0.0002175908936412	0.7007307394402491	-1.694010315932667e-05	0.5102773095696889	1.694010315932667e-05	0.504368671531192	-0.0029370525551779	0.4535032529998756	0.0029370525551779	0.4477487729576332	NFYB	27709	TXNRD1	49830	HCFC2	101418	False	False	False	ref	5	0.002098	100	0.111
856	chr12	104172873	G	A	rs61939221	0.0563193372	0.2433279255996613	0.0599729552	0.2460618128827675	0.021563272202761	0.4303273896129655	0.0012407816322098	0.2793495143383013	0.0013217657131666	0.2822954233002716	0.4642802942826036	0.052010128427509	0.0257574425414666	0.0668663875141823	0.0270957122544728	0.0678922939862587	0.0099040874070857	0.0747726909965407	0.0005592241937355	0.0887218770032736	0.0005888875423159	0.09006206520797	0.0176231401141499	0.1147038988004579	0.0189114512883111	0.1164136313425538	NFYB	34632	TXNRD1	42907	HCFC2	108341	False	False	False	alt	-100	0.0847	-100	0.2605
857	chr12	104238026	A	G	rs4609668	0.0049219485	0.7693584771005151	0.0101066785	0.7731470025093552	0.0199463723685497	0.4817921440522005	9.389137393308597e-05	0.7395453916900866	0.0002017389929994	0.7434228946323679	0.0034467684998845	0.8695327900577134	1.839540396241047e-05	0.906689207878996	2.493810885321174e-05	0.9109601051557064	7.195943439012e-05	0.8540235377675601	3.612176621546949e-07	0.8938348450536294	4.973125263720126e-07	0.8980508346143108	8.660222361517909e-05	0.8994932880000739	0.0001080465837484	0.9038069962321502	TXNRD1	22246	EID3	65714	NFYB	99785	False	False	False	alt	-80	0.00834	80	0.1765
858	chr12	104242823	G	A	rs4445711	-0.0693451056	0.1984702357093672	0.0693451056	0.1956760155544364	0.0158052415079906	0.6463754535024322	-0.0011741029748314	0.3047535987705586	0.0011741029748314	0.3005709752332289	0.0159653261192306	0.6756471229681351	-0.0014550392702368	0.4871022063170602	0.0014550392702368	0.48160657333319	0.0002768550719504	0.6955713951307527	-2.685572868869392e-05	0.5131367459308435	2.685572868869392e-05	0.5075749226642315	-0.0041973211045494	0.4265243957790774	0.0041973211045494	0.42137577897209	TXNRD1	27043	EID3	60917	NFYB	104582	False	False	False	ref	5	0.012695	40	0.12463
859	chr12	108148814	C	A	rs1981936	-0.0054491857399999	0.7183631283782624	0.01318984734	0.7154955981728783	0.016913268986413	0.584838340257784	-0.0001001981448111	0.7087025699327542	0.0002525507967308	0.7058125625530515	0.1721380027052884	0.2012993285544626	-0.0008539732685334	0.3848288675636067	0.0019134589142047	0.3823324968426261	0.002815168708704	0.2571049832364125	-1.4410857956503442e-05	0.415672739538707	3.5263784770262545e-05	0.4133897578506523	-0.0013130546666226	0.431635609613559	0.0033502688792846	0.4292733741884412	WSCD2	19525	CMKLR1	190503	FICD	366464	False	False	False	ref	60	0.01945	20	0.02588
860	chr12	108166550	G	A	rs7976025	-0.0900888402	0.1563675346951939	0.0900888402	0.154561324846851	0.0208735778491377	0.447865956491147	-0.002137484181527	0.21642957334154	0.002137484181527	0.2138967998878372	0.0117399623898914	0.716347215919944	-0.000669499315425	0.5546720604102533	0.000669499315425	0.5485701428555956	0.0002298219509854	0.7051842512309054	-1.4463318649590298e-05	0.540801896898835	1.4463318649590298e-05	0.53468301584685	-0.0022095938768103	0.5218775261523967	0.0022095938768103	0.5156902106690797	WSCD2	37261	CMKLR1	172767	FICD	348728	False	False	False	ref	-90	0.006348	-85	0.1523
861	chr12	108166873	A	G	rs10778611	0.0443029586	0.1927326743247709	0.068209893	0.1945350622738414	0.0671656593137582	0.0208854924908103	0.0031046949852519	0.0666800159078569	0.0048230417350913	0.0669772095041932	0.0051854112368446	0.8283308599676237	0.0003311899739193	0.6344012260178223	0.0004254421808484	0.6388032578821231	0.0003640975244735	0.6427564196320171	2.41302654316561e-05	0.4549735781191137	3.090478414122725e-05	0.4589791473870722	0.0012462472369766	0.6002905775639469	0.0015299726172016	0.6048877522574806	WSCD2	37584	CMKLR1	172444	FICD	348405	False	False	False	alt	40	0.0108	-60	0.074
862	chr12	108174245	A	G	rs4964233	0.0119441228	0.4088662161911076	0.0359441572	0.4099237495466211	0.013471532841785	0.7378382720854065	0.0002573289998651	0.5106281485681702	0.0005657940350526	0.5120290796659193	0.1050773646530962	0.2974608853743113	0.0002795890849545	0.3092822840003955	0.0038018399176709	0.3096773917624869	0.0014359655291396	0.3821225602372758	1.62278404610107e-05	0.3697054076510242	6.145543184614154e-05	0.3704458033543169	0.0013839860116789	0.2806016656268748	0.0076341922074494	0.281149680657775	WSCD2	44956	CMKLR1	165072	FICD	341033	False	False	False	alt	-100	0.04855	0	0.0
863	chr12	108181786	A	G	rs2374969	0.0350215748	0.405663134819248	0.0350215748	0.4103588448115477	0.0145374186307418	0.7027819511711644	0.0006194306102893	0.4904430431048787	0.0006194306102893	0.4953389927666344	0.0693626076341921	0.3796247028897482	0.0023655612986474	0.369433498868656	0.0023655612986474	0.3743651793300419	0.0010138518762957	0.4477595854810549	4.082538737974612e-05	0.4164913685753972	4.082538737974612e-05	0.4215853729379429	0.0054716109663158	0.3368107356978486	0.0054716109663158	0.3414978383470222	WSCD2	52497	CMKLR1	157531	FICD	333492	False	False	False	alt	100	0.0569	100	0.091
864	chr12	108182784	G	A	rs10778612	-0.0185453810839999	0.6377350777274269	0.018577712916	0.6336154298251002	0.0084318263762509	0.9567388006735266	-0.0001655592684778	0.7897433357032231	0.0001658430184947	0.7853703233224212	0.0037445151925043	0.8731685488672581	-7.763430182506641e-05	0.845874864088971	7.765696856113999e-05	0.8416880075950988	3.0973994523102045e-05	0.9338105505509734	-6.611843440979678e-07	0.8967194592893104	6.613832714794667e-07	0.8926731094309546	-0.0002829005971429	0.8432085555538997	0.0002829005971429	0.837961585284025	WSCD2	53495	CMKLR1	156533	FICD	332494	False	False	False	ref	-10	0.006287	100	0.1655
865	chr12	108183046	A	G	rs10778613	0.0716031654	0.1768093324423764	0.0716031654	0.1795995644222053	0.0404292280954277	0.1068678622158552	0.002944858722496	0.1115167624707647	0.002944858722496	0.1130192143137421	0.0021271155686053	0.925456776883205	0.0001464726682159	0.7535510802058347	0.0001464726682159	0.7601365856263022	8.391147855896874e-05	0.8476874744949242	5.870670764472982e-06	0.6542750389168439	5.870670764472982e-06	0.6605648828118573	0.0005286859555936	0.7411169536673099	0.0005286859555936	0.7476315890355478	WSCD2	53757	CMKLR1	156271	FICD	332232	False	False	False	alt	90	0.00702	-70	0.1272
866	chr12	108187169	G	A	rs2162290	-0.0746907048	0.1814644027716396	0.0746907048	0.1792302254761049	0.0189103087297705	0.5266185796759455	-0.0014236191645678	0.2613134665594523	0.0014236191645678	0.2579493294168531	0.005275312592788	0.8223165667014481	-0.0004794448794617	0.6324461967162202	0.0004794448794617	0.6263816491127456	0.0001010806400416	0.8174560472197753	-9.549956843633404e-06	0.6323717667336809	9.549956843633404e-06	0.6262239486399473	-0.0015316221833657	0.5983140358591352	0.0015316221833657	0.5923901556407508	WSCD2	57880	CMKLR1	152148	FICD	328109	False	False	False	ref	-100	0.02563	-100	0.2144
867	chr12	108192050	A	G	rs1365309	0.0397910594	0.3540385284397099	0.0397910594	0.3584724272862572	0.0353783697700221	0.1521827583824344	0.0014690846893149	0.2437739127871601	0.0014690846893149	0.246924992113859	0.1613622117383128	0.2199107690604834	0.0070062820632639	0.2129410202692451	0.0070062820632639	0.2163224288881411	0.0057588240018936	0.1484593287170799	0.0002612249972765	0.1690006822472382	0.0002612249972765	0.1718232262574112	0.010715581801986	0.2021248679341842	0.010715581801986	0.2053728705994857	WSCD2	62761	CMKLR1	147267	FICD	323228	False	False	False	alt	-55	0.00839	-90	0.01221
868	chr12	108206460	A	G	rs1106752	0.8086459659999999	0.0003140003648435	0.8086459659999999	0.0003089393902708	0.0854593821317418	0.0081575632512386	0.0692197374329379	0.0006652762592211	0.0692197374329379	0.0006860018229233	0.4876967107650688	0.0458570392942465	0.3981052101113154	0.0003988773791331	0.3981052101113154	0.0003766953296546	0.041235843548864	0.0039869698949151	0.0337598315400513	0.0005169173319632	0.0337598315400513	0.0005121160758673	0.2521724786381181	0.0002021333718742	0.2521724786381181	0.0001998408873455	WSCD2	77171	CMKLR1	132857	FICD	308818	False	True	True	alt	50	0.001221	-5	0.004883
869	chr12	108208133	G	A	rs7973976	0.192209828	0.0264465954423655	0.192209828	0.0266930542929636	0.0382815565306555	0.125586226879585	0.0075983741978007	0.0328967652489198	0.0075983741978007	0.0330806898114126	0.0520297911649236	0.4450050321189578	0.0104541972378115	0.1556842217125019	0.0104541972378115	0.1585025170520407	0.0020814040574694	0.326717023731641	0.0004267686282215	0.1169557797433569	0.0004267686282215	0.1188649560921069	0.0214930223351258	0.0904338675674993	0.0214930223351258	0.0920142847709056	WSCD2	78844	CMKLR1	131184	FICD	307145	False	False	False	alt	60	0.0647	45	0.09033
870	chr12	108209193	C	A	rs7313402	-0.0172366125	0.5291449253547011	0.0240109267	0.5264277833973785	0.0152682750248507	0.653097403871972	-0.0003474137239038	0.5670196143469808	0.0004302425189081	0.56439750910876	0.0073141763716142	0.7780822180077922	-7.663745914437246e-05	0.7613133460763759	0.0001287786886371	0.7593497039334871	0.0001009468381453	0.8086861890333605	-1.6563296442400196e-06	0.7727656233000779	2.256404711051863e-06	0.7706784810705851	-0.0003183662696711	0.7528334604375703	0.0004932202830655	0.750729364814304	WSCD2	79904	CMKLR1	130124	FICD	306085	False	False	False	ref	-100	0.013306	5	0.001709
871	chr12	108215857	G	A	rs10861879	-0.0880092033999999	0.1400799726707269	0.0880092033999999	0.1381399798346129	0.0312787554333656	0.2041773611769269	-0.0028691698343889	0.1275293765441929	0.0028691698343889	0.1260041884456379	0.3810555573884068	0.0763621491365165	-0.032367240923565	0.0505602929017696	0.032367240923565	0.0495669969734188	0.0118495258520245	0.0572644695009928	-0.0010465062178019	0.0509229946464713	0.0010465062178019	0.0500459633892959	-0.0299528224077067	0.0567879877114496	0.0299528224077067	0.0559535978514996	WSCD2	86568	CMKLR1	123460	FICD	299421	False	False	False	ref	-90	0.1262	-90	0.1724
872	chr12	108216899	T	C	rs4964661	0.0511209331659999	0.2281963916464544	0.065147389166	0.2292214787836043	0.0203252668849405	0.467958167185519	0.0013708193863001	0.2812001492203791	0.0016063066969246	0.2824689698971533	0.0340223021345385	0.5423431670138151	0.0029492037195443	0.38940690869719	0.0034467192438333	0.3924689465376128	0.000781371818925	0.529728058877974	8.290449818850433e-05	0.3886663052825609	9.125718516139384e-05	0.3916284186827843	0.0066296064135132	0.3154864721253904	0.0081571046814687	0.317551071562442	WSCD2	87610	CMKLR1	122418	FICD	298379	False	False	False	alt	-90	0.0334	-95	0.00293
873	chr12	108224853	C	T	rs3764002	0.0382876345999999	0.3062615780603645	0.0492134194	0.3085196298136787	0.0866030588644641	0.0077467853895491	0.0030767533471354	0.0808649136461563	0.0040584307120219	0.0814213843905374	0.0231896011349014	0.6260441279167578	0.001477920602208	0.4952324574126639	0.0015387025112915	0.4988451590356567	0.0018438214799235	0.3604589589833359	0.0001125373677361	0.2995419082168244	0.0001179985978392	0.3019789197926075	0.0034979050509715	0.4472934467838912	0.0037486391079145	0.4509128528666404	WSCD2	95564	CMKLR1	114464	FICD	290425	False	True	False	alt	-5	0.002686	15	0.05267
874	chr12	108234290	T	C	rs4964665	0.03304032184	0.2464248947170121	0.06064052096	0.2469098346494003	0.0263798176534997	0.2991125455064199	0.001147705195293	0.2468206516106838	0.00175397513925	0.2472966463220473	0.0325178977928804	0.5392691735822894	0.0001165943713433	0.4263125344617817	0.001887894723126	0.4273149773539338	0.0008563547247178	0.4882777718192007	1.2039364356041514e-05	0.3896501459978043	5.121968945040372e-05	0.3909431632318117	0.0005113655108706	0.3767951211850437	0.0048777671472402	0.3775657551899842	WSCD2	105001	CMKLR1	105027	FICD	280988	False	False	False	alt	80	0.02026	30	0.0996
875	chr12	108413407	C	T	rs2559882	-0.0134167557199999	0.4835884089409552	0.03159291332	0.4808748795730938	0.0176555563211346	0.5746768284566305	-9.90097589790127e-05	0.5424319402911354	0.0005411074648518	0.5394385194453271	0.0006804460426907	0.983156681005345	-1.2095327521274596e-05	0.9324916559770544	2.6412102514492155e-05	0.9292049848865866	1.1999288465189128e-05	0.9791210609628018	-9.501161264760768e-08	0.9299412572505944	4.432377591856483e-07	0.9262838273428328	-4.4538286430651895e-05	0.9310708806423076	9.40252713536119e-05	0.9287522059644604	CMKLR1	74090	FICD	101871	SART3	147993	False	False	False	ref	20	0.012955	-100	0.0847
876	chr12	108418329	C	T	rs2559875	-0.1231623342	0.0705156242630429	0.1320955738	0.0699651535155894	0.0312452693810842	0.2054205961909041	-0.0045887473131566	0.0806051328647295	0.0047464107997205	0.0801966086242419	0.0171620863712842	0.6855734829402327	-0.0035006874503868	0.3846672240348481	0.0035052924408555	0.380570968890972	0.000669134230552	0.5864575706812517	-0.0001412690584173	0.3216283386034728	0.0001413503322776	0.3181308804838119	-0.0087245554419187	0.3004759227787698	0.0087394015373956	0.2975494761387918	CMKLR1	79012	FICD	96949	SART3	143071	False	False	False	ref	-25	0.005432	35	0.2183
877	chr12	108460099	A	G	rs75306978	-0.045309708	0.3532603483909979	0.045309708	0.3492669119891245	0.0431654810956934	0.0875664311829948	-0.0019805556184528	0.2120371459495414	0.0019805556184528	0.2094162077314374	0.0109019827785292	0.7210282060633845	-0.0005000196500372	0.6245384453790083	0.0005000196500372	0.6186566655809151	0.0004628236884835	0.5876689734456977	-2.1730291566492186e-05	0.5086408982662356	2.1730291566492186e-05	0.503168028804648	-0.0015934809145194	0.5952284218731902	0.0015934809145194	0.589476976370076	FICD	55179	SART3	101301	ISCU	102484	False	False	False	ref	100	0.05713	100	0.0724
878	chr12	108461238	A	G	rs79715421	-0.0274796807999999	0.2524632956180774	0.0588621712	0.2519117564462563	0.0206143278947236	0.460864159612156	-0.0008098702655694	0.2961640834672709	0.0013079830228178	0.2956041393136772	0.1340907591303486	0.2556152438483776	-0.0081146298670618	0.1882364367972828	0.0102822687476842	0.1870551449690547	0.0030003438756386	0.2609973291234269	-0.0002129513788742	0.207567048542095	0.0002468250781353	0.2063786041018915	-0.0103609250767048	0.1551835874588285	0.01552241760417	0.1543451519932449	FICD	54040	SART3	100162	ISCU	101345	False	False	False	ref	80	0.006836	-55	0.0664
879	chr12	110117013	A	G	rs67917264	-0.0170594004	0.5799504161013124	0.0224744824	0.5766324703735239	0.0433963426325568	0.0866181495098324	-0.0007945027212528	0.3786387548350979	0.0010569695430093	0.3769385212519096	0.006994160535779	0.7777056331110741	-6.140748079812981e-05	0.7794776317614525	0.0001256324146846	0.7759259890476552	0.000303200041781	0.6505894312898084	-2.680362695331336e-06	0.6728536216989889	5.793319127698282e-06	0.6696629265279512	-0.0002433110092045	0.7624233271885422	0.0004824981029988	0.7588168816040576	IFT81	7323	C12ORF76	43377	ANKRD13A	117826	False	False	False	ref	-50	0.02774	75	0.1326
880	chr12	110451052	C	T	rs3759384	-0.0418717214	0.3676825553821948	0.0418717214	0.3630692567396171	0.0125812531196874	0.788415060342402	-0.0005747355419641	0.513728763612987	0.0005747355419641	0.5079588864130764	0.4330762759394279	0.0604766854731039	-0.0191170800303651	0.1013253587454429	0.0191170800303651	0.0994738937925696	0.005637676828232	0.1474035751991363	-0.0002737903550274	0.1733978626956167	0.0002737903550274	0.1704608744511069	-0.013335092870575	0.1669248929661419	0.013335092870575	0.164096251814048	ARPC3	630	FAM216A	17364	GPN3	18216	False	False	False	ref	-90	0.0895	-100	0.1083
881	chr12	110456752	G	A	rs11065647	-0.0087800798	0.3738889147614473	0.039733885	0.3729057250319814	0.0483065192311213	0.0641181253006461	-0.0001191267888291	0.1878390527693139	0.0019598142138856	0.1872614415348957	0.0007406552076803	0.978612515624948	-9.801296121446205e-06	0.90126881647611	3.1279000276026465e-05	0.8997466383990061	3.5714091910445384e-05	0.9172300013846416	-2.323752456145117e-07	0.8101908080923981	1.5295979799095077e-06	0.8086737953836469	-2.886740787172347e-05	0.908594582037992	0.0001063970175843	0.907070344099458	ARPC3	6330	FAM216A	11664	GPN3	12516	False	False	False	ref	35	0.00989	-100	0.1365
882	chr12	110497463	T	C	rs184629901	0.0816785642	0.1495714997035293	0.0816785642	0.1520187213265818	0.020245534525988	0.4706044169316873	0.0018084940151447	0.2097836996824771	0.0018084940151447	0.2126809016967203	0.000668899079542	0.980241116015562	5.558851115371138e-05	0.8441304370792881	5.558851115371138e-05	0.8509317777824654	1.4823656978948356e-05	0.9702909514975188	1.326105076056742e-06	0.8245233168598083	1.326105076056742e-06	0.831171153690869	0.0001715548810662	0.8585745068397695	0.0001715548810662	0.8655105618651895	RAD9B	4193	VPS29	4648	GPN3	28195	False	False	False	alt	-100	0.1339	25	0.0718
883	chr12	110512571	T	C	rs4766497	0.0551666604	0.2556826809601932	0.0597071036	0.2578148167415423	0.0457863491241147	0.0737036046224583	0.0025898305009953	0.1575973721622585	0.0027937351231375	0.1587945933098158	0.2160717231368149	0.1640228740863848	0.0101129070528718	0.1524098362873806	0.0114586486248022	0.154110694780574	0.0096537153914819	0.078038081390353	0.0004619822625931	0.1033262852955386	0.0005224175381448	0.1043473276126529	0.0152452904886014	0.136543542182645	0.0168932070865362	0.1379329707785326	VPS29	10460	RAD9B	10915	GPN3	43303	True	False	False	alt	-90	0.01608	90	0.0952
884	chr12	110540227	C	T	rs12311093	0.00582818994	0.8285267834794167	0.00683709518	0.8308321997067092	0.0156247212627142	0.6527205726446182	7.609586149940604e-05	0.8569604012616234	9.127164762241192e-05	0.8593603900760177	0.1010062353601002	0.2991990556186975	0.0004988239219128	0.5934290639041875	0.0005985180258213	0.5957001051822592	0.0015452447228742	0.3587054457739795	6.541184739115972e-06	0.6272402966209467	8.030872094183624e-06	0.6293473315709456	0.0012462472369766	0.6190094115823258	0.001437596912012	0.6214204692658034	VPS29	38116	RAD9B	38571	PPTC7	43091	False	False	False	alt	100	0.03436	25	0.04404
885	chr12	120682650	T	C	rs12228118	-0.0050568335999999	0.5475473408667135	0.0230153252	0.5456395475408646	0.0513761125268594	0.0525392345939445	-0.0004474270218241	0.2781752644575165	0.0011962152142584	0.2773709313563378	0.0029947873709214	0.8850996654475096	-2.3641735233281327e-05	0.8250673055789025	7.372137026466426e-05	0.8232113942320852	0.0001658938553336	0.7550781235304327	-2.0265610729615955e-06	0.7059547970639103	4.082768936652995e-06	0.7040024870120447	-0.000150935304015	0.8121828199208179	0.0003109432219325	0.8102771798377238	MLEC	4500	UNC119B	27809	CABP1	42023	False	False	False	ref	-25	0.0668	-25	0.0547
886	chr12	120939764	G	T	rs78197988	-0.2152813371999999	0.0234529071038665	0.2152813371999999	0.0232653255921325	0.0361460799446362	0.148982188442016	-0.0085633385947176	0.033797341575898	0.0085633385947176	0.0335685281411252	0.1627800138563557	0.2183390268684405	-0.0422163444541915	0.0485011984072554	0.0422163444541915	0.0475778475987889	0.0061317634054213	0.1449288972913511	-0.0017044066806271	0.0454177367717517	0.0017044066806271	0.0446026662351423	-0.0541841245752366	0.0220890819299458	0.0541841245752366	0.0217359796364387	SPPL3	35406	HNF1A	38780	C12ORF43	76738	False	False	False	ref	-85	0.0648	70	0.401
887	chr12	120968567	G	T	rs2243616	-0.00506441144	0.781770463160118	0.01004337308	0.7804371121100132	0.0589515341703485	0.0349374231082598	-0.0003702113198939	0.5008045929661306	0.0006342297545575	0.4997569341155212	0.0019522615552109	0.9207097193429128	-1.007462097880256e-05	0.9325438053710386	1.9529660417989788e-05	0.9313098639604056	0.0001043812875873	0.8010935249183724	-5.866337701109794e-07	0.8577030204250131	1.0865196705433522e-06	0.8565252443899913	-4.536306951270943e-05	0.9280687334786664	8.165352512288395e-05	0.9259519200609864	HNF1A	9977	C12ORF43	47935	SPPL3	64209	False	False	False	ref	40	0.01221	-30	0.0741
888	chr12	121005313	A	G	rs1169314	0.0488215433	0.3090194495843972	0.0506130095	0.3121139374316816	0.0223258807631849	0.3994443948773949	0.0012022341880071	0.3241356958532757	0.0012391829225193	0.3271589286755283	0.4031193296163109	0.0685095302619408	0.0196437367226647	0.1006818999931597	0.0201953952527687	0.1021139516772517	0.0092713125448525	0.0849514796605704	0.0004894195577145	0.1183422777731998	0.0005007974360208	0.1199418986660691	0.0154770545346573	0.1489805269893564	0.0161137870739994	0.1508679617560384	C12ORF43	11189	HNF1A	26769	OASL	33933	False	False	False	alt	100	0.131	100	0.675
889	chr12	121012362	C	T	rs2264750	-0.01099447174	0.1804008005673217	0.07803727066	0.1809289214207826	0.029046716548399	0.2473865322800341	-0.0005634776201955	0.1716822339700731	0.0025274395225054	0.1722927440740592	0.0109844610867341	0.7341812262858449	-0.000813293654254	0.5719638777264284	0.0010278349319309	0.5719771180526919	0.0002855314779406	0.6893337497789271	-2.6030419745637187e-05	0.5208408424391153	3.1102444921874125e-05	0.5207247218953187	-0.0022401108508462	0.5254377366691368	0.0029510738675727	0.5251274381115956	C12ORF43	4140	OASL	26884	HNF1A	33818	False	False	False	ref	80	0.05972	-25	0.0221
890	chr12	121252752	T	C	rs2686345	0.2220899	0.0201028280106886	0.2220899	0.0202763354297962	0.0328024517140608	0.1862924006749141	0.007860990609623	0.0346343013100168	0.007860990609623	0.0349181825037657	0.0999298934380257	0.3579728513180856	0.0273915757600909	0.1041017822428738	0.0273915757600909	0.1061284752806153	0.0035060734794372	0.2824630497253164	0.0010662373008655	0.1012793714889189	0.0010662373008655	0.1030645224034246	0.0395079344132492	0.0567215551041312	0.0395079344132492	0.0576790225260347	P2RX4	42686	CAMKK2	45556	P2RX7	119932	False	False	False	alt	100	0.08594	100	0.1436
891	chr12	121389941	C	A	rs76170072	-0.143012593	0.0526218655583429	0.143012593	0.051951576598164	0.0223578872087526	0.4029789953882042	-0.0032557565033782	0.1003607719591887	0.0032557565033782	0.0991698654065378	0.0005460064003166	0.985720313635238	-8.329641189345487e-05	0.8151708462725745	8.329641189345487e-05	0.8083808633961201	1.2664141310198509e-05	0.974395734981683	-1.967663294454737e-06	0.7854341702378118	1.967663294454737e-06	0.7787303481862831	-0.0002499092738609	0.8357524392642148	0.0002499092738609	0.8288346329572713	ANAPC5	9955	RNF34	10143	CAMKK2	91633	False	False	False	ref	100	0.1621	-100	0.122
892	chr12	121395414	A	G	rs61697335	0.0515151494	0.2440181672754856	0.0576864002	0.2467115683636777	0.0364968326453037	0.1395867215000411	0.0018599596372242	0.1716973377248379	0.0020917835820314	0.1732516519968155	0.0004956946323116	0.9847986478827542	2.0728907586451728e-05	0.9084881609354976	2.378287349776368e-05	0.9128850637854072	1.891371854461034e-05	0.9557809153571012	7.855578112715882e-07	0.8545443574009391	9.002804918861716e-07	0.8588094220660826	8.660222361518246e-05	0.911395186625907	9.1550922107479e-05	0.9158268340521228	ANAPC5	4482	RNF34	4670	CAMKK2	97106	False	False	False	alt	-60	0.0793	100	0.0737
893	chr12	121398384	A	T	rs11830307	0.0015447462999999	0.7666158921843508	0.0108048553	0.7651442901681994	0.0512894891662463	0.0599466802648486	-0.0001252876044333	0.5002001129073873	0.0005814200873809	0.4987924349446843	0.0473623437036058	0.4726718459545552	-9.390494264401444e-05	0.6199111753417872	0.0003927006068776	0.6181214039265749	0.0020390077864038	0.3263138469321018	-9.090744479882813e-06	0.4963408636479072	1.920570491846425e-05	0.4944658578030281	-0.0002152683844148	0.6317684732807395	0.0010895384513872	0.6300806864611704	ANAPC5	1512	RNF34	1700	CAMKK2	100076	False	False	False	alt	-95	0.02318	55	0.413
894	chr12	121403345	A	G	rs59199848	0.0001876811999999	0.5190630463487907	0.0266688879999999	0.5197221915665894	0.031001329164357	0.2124755418708141	-0.0001467422615197	0.40726569137764	0.0007791873000081	0.4077182957356782	0.0021658803734617	0.9127659549365786	-6.84549190676855e-06	0.8533590615756129	5.853283487811312e-05	0.8541667085052831	7.08551502532015e-05	0.8553168330417904	-6.291450435349919e-07	0.799091201557842	1.806266417576517e-06	0.7997756133563146	-4.288872026656677e-05	0.8506141988465209	0.000217742733661	0.8513495547862218	RNF34	3261	ANAPC5	3449	CAMKK2	105037	False	False	False	alt	-20	0.01233	100	0.2084
895	chr12	121420405	A	T	rs3751135	0.0031462432	0.6834178502999093	0.0150852948	0.68471207163777	0.0147804110741479	0.6952170829746216	3.127433187296e-05	0.7126323596964733	0.0002181301109081	0.7138625185523244	0.0076102734980699	0.7647043224204718	-5.084946200983493e-06	0.771462268027291	0.0001163646860603	0.7725914159592631	0.000113743914567	0.7924444736091703	-1.8047967537891428e-07	0.7886326537197543	1.6960314386443958e-06	0.789778625922344	-2.556827554354e-05	0.760067016450471	0.0004379598165681	0.7611832189230855	RNF34	20321	ANAPC5	20509	CAMKK2	122097	False	False	False	alt	100	0.01791	90	0.2954
896	chr12	121426090	T	C	rs79741351	0.0261273446	0.5039851552221919	0.0261273446	0.5099682570996826	0.0127866650263295	0.7852566118919752	0.0003494723742409	0.5969881430172582	0.0003494723742409	0.6033826092967799	0.0669690871300847	0.391508788522388	0.0014713542666253	0.4070818535418536	0.0014713542666253	0.412254583128188	0.0008110330963501	0.4840799894837355	1.8791922817460868e-05	0.4722860578443834	1.8791922817460868e-05	0.477871341827035	0.003555639866715	0.3967961561259288	0.003555639866715	0.4020664643617785	RNF34	26006	ANAPC5	26194	CAMKK2	127782	False	False	False	alt	-30	0.00383	95	0.0923
897	chr12	121429454	A	C	rs13754	0.01888753032	0.5527821612501986	0.0219664104799999	0.5572917008402907	0.0649489987436238	0.0233304589496967	0.0011755833744679	0.2417157687701789	0.0013964121700686	0.2438082012074109	0.0678788228695852	0.3786654317520595	0.0012737483214308	0.418744499011698	0.0014657148894872	0.422353058055918	0.0044929225724351	0.179917109493243	8.115920005391313e-05	0.2615069496815114	9.49277599854814e-05	0.2641474866477351	0.0030368513081059	0.4060964321528558	0.0035333707234996	0.4098647754895677	RNF34	29370	ANAPC5	29558	CAMKK2	131146	False	False	False	alt	-70	0.003174	-20	0.02124
898	chr12	121457323	G	A	rs111782135	-0.0375818466599999	0.3993658690085619	0.03981378094	0.3963961540832907	0.0540999532557728	0.0434528481712377	-0.0020162455000753	0.218348707184508	0.0021392853972896	0.2167641392693779	0.0409282108805383	0.5087790579487577	-0.0028054156000488	0.4525148757230101	0.0028818021540505	0.4488861084561592	0.0022342275785753	0.3247531664959501	-0.0001495923241158	0.3233942222753447	0.0001538032875737	0.3208592193607159	-0.0057454389495562	0.3982479716245288	0.0059714295140377	0.3950608234443168	RNF34	57239	ANAPC5	57427	KDM2B	124956	False	False	False	ref	-100	0.02272	-90	0.1124
899	chr12	121461233	G	A	rs74543852	-0.0678552945999999	0.2261535649326401	0.0678552945999999	0.2232486365054897	0.022982879776573	0.3869250764924941	-0.00176686946384	0.2509015488533278	0.00176686946384	0.248028840106318	0.0058666820626174	0.8111553216256346	-0.0002996191752497	0.6698323231182894	0.0002996191752497	0.6636245294544073	0.0001232884544853	0.7865243747595023	-7.2013377565835305e-06	0.640377490802129	7.2013377565835305e-06	0.6341815458357516	-0.0009757183860644	0.6624871388918607	0.0009757183860644	0.6561463465148204	RNF34	61149	ANAPC5	61337	KDM2B	121046	False	False	False	ref	80	0.06113	80	0.198
900	chr12	122065538	G	A	rs34974633	0.0482761930999999	0.2906742603990711	0.0503923249	0.2933503129944906	0.1125564567001587	0.0027097506538473	0.005878049704644	0.0583880314747196	0.0060490790697255	0.0584951080258668	0.1265151265217247	0.2632769940829619	0.0061952073894402	0.2259262842844354	0.0065151910755198	0.2285655162044394	0.0141909484790189	0.0464036631560288	0.000768283579722	0.0804342291320879	0.0007941452047485	0.0811072100525897	0.0112195242651182	0.1888436423704221	0.0118925472600705	0.1910816782331868	MLXIP	13219	BCL7A	46115	LRRC43	102201	False	True	True	alt	-15	0.00293	-20	0.01611
901	chr12	122067480	G	A	rs61952902	0.0146889152999999	0.6877740276549739	0.0146889152999999	0.6945845563019474	0.0152146499938241	0.6767268769412029	0.0002428976810843	0.7033853107456806	0.0002428976810843	0.7102255354888201	0.0023473326515126	0.90500283470816	2.4951628625111714e-05	0.9037844710241713	2.4951628625111714e-05	0.9107957590715272	3.506610955642473e-05	0.914618458763528	3.973804753411785e-07	0.9048729977628936	3.973804753411785e-07	0.911858566020921	9.072613902540956e-05	0.9125418689597214	9.072613902540956e-05	0.919586791780844	MLXIP	11277	BCL7A	48057	LRRC43	100259	False	False	False	alt	100	0.02045	60	0.07886
902	chr12	122087073	G	A	rs36167334	-0.13399576	0.0453076724941527	0.158984732	0.0452174997565052	0.0543377267308272	0.0437957906908621	-0.0064556978110616	0.0287594904266226	0.0081800555981748	0.0287969332932483	0.5566353798950876	0.0336903048332442	-0.0713143075605125	0.0120759455510727	0.0871306876698891	0.0120403049203974	0.0307860176497159	0.0089293813789279	-0.0034585498976024	0.0093344456705734	0.0045499552818208	0.0093673498340605	-0.0420210484642538	0.0247553995580713	0.0479759823166506	0.0246871275316616	MLXIP	8316	BCL7A	67650	LRRC43	80666	False	False	False	ref	-15	0.01599	-15	0.1006
903	chr12	122092107	C	T	rs146055085	-0.0395192012	0.385771020573614	0.0395192012	0.3808404162897542	0.0320593553741785	0.1955677956480605	-0.0013612521320267	0.2792629239049046	0.0013612521320267	0.2758564920843065	0.0014846095476889	0.9415814777023832	-5.547111095312226e-05	0.8558908219739283	5.547111095312226e-05	0.8490899149488123	4.607468653955258e-05	0.8921829801124372	-1.8672472383935403e-06	0.7931545855877095	1.8672472383935403e-06	0.7864625692915997	-0.0002152683844148	0.850057800309893	0.0002152683844148	0.8433242543810539	MLXIP	13350	BCL7A	72684	LRRC43	75632	False	False	False	ref	-60	0.01758	-80	0.1456
904	chr12	122097852	T	C	rs373281699	0.0481619656	0.1972337261874304	0.0694664775999999	0.1986116074468713	0.0308560477743082	0.2122570437857671	0.0012325620171466	0.1771493350795534	0.0020381166405463	0.1786114922163707	0.2200908910956417	0.1637791854019436	0.0081186320259119	0.117960927073795	0.0148819412849342	0.1194343277629305	0.007106497603361	0.1203120130300879	0.0001992819873367	0.1073821514077824	0.0004550125591972	0.1085286094691975	0.0137070700405792	0.1014676994288359	0.0204801887103691	0.1023403097618651	MLXIP	19095	LRRC43	69887	IL31	76369	False	False	False	alt	100	0.11035	-100	0.315
905	chr12	122103844	T	G	rs374837345	-0.0095711889	0.7211771534097041	0.0127495538999999	0.7187939884408427	0.0542452103033892	0.0449931945671209	-0.0006894833666901	0.4208467037681476	0.000839502831717	0.4192636896531196	0.0019489624228827	0.9264940068491728	-1.521508888496067e-05	0.9280804378357528	1.9032748931472147e-05	0.9261721531476124	9.524634901922952e-05	0.821217303570869	-9.589392203219937e-07	0.8457952155011595	1.125607319560223e-06	0.8434775383046893	-6.763221272804386e-05	0.9216214419230964	8.577744053313099e-05	0.91969678902607	MLXIP	25087	LRRC43	63895	IL31	70377	False	False	False	ref	-35	0.02594	100	0.161
906	chr12	122114047	A	G	rs28421373	0.02573643662	0.4985001284817588	0.02573643662	0.5047560893068486	0.0217344468113052	0.4237743788050945	0.0005610135725111	0.4764506644682401	0.0005610135725111	0.4824850488500903	0.0062147405232423	0.8086592547131275	0.0001789662195186	0.7401725262472197	0.0001789662195186	0.7468672244435222	0.0001307646579707	0.7863789099666156	3.737468457921779e-06	0.7202247081237726	3.737468457921779e-06	0.7268536643040043	0.0007332321599418	0.7147282751871699	0.0007332321599418	0.721416894820565	MLXIP	35290	LRRC43	53692	IL31	60174	False	False	False	alt	-90	0.0337	-100	0.052
907	chr12	122118352	C	A	rs28430881	-0.024463831	0.3686776400449268	0.0402272678	0.3673924619164944	0.1074571655882809	0.0033035003322479	-0.0019618670044443	0.0852458480514157	0.003827373209687	0.0851730549778674	0.1717998416416482	0.2021557733418302	-0.0037417950269611	0.2075648421215027	0.0067430851495372	0.2066146399557308	0.0189569969624753	0.0271897663067461	-0.0002777854905141	0.0762756983521875	0.0006471049185048	0.0760992745916349	-0.0067327042987694	0.1945482940941069	0.011267361683877	0.1937020376861773	MLXIP	39595	LRRC43	49387	IL31	55869	False	True	True	ref	-70	0.3132	-95	0.833
908	chr12	122119686	T	C	rs28498376	-0.1764901099999999	0.0335425759792679	0.1764901099999999	0.0332296102209856	0.0707677123945769	0.0170237351201971	-0.0128474031683766	0.0146424239329651	0.0128474031683766	0.0145633112030261	0.0158647025832205	0.6762274150662368	-0.0030762150166662	0.347237186519256	0.0030762150166662	0.3424441711705412	0.0010810186705708	0.4536067381498216	-0.0002152216029426	0.1983993280591114	0.0002152216029426	0.1951406096447766	-0.0080383359176536	0.275342338914619	0.0080383359176536	0.2713111106967543	MLXIP	40929	LRRC43	48053	IL31	54535	False	True	False	ref	100	0.00995	100	0.2231
909	chr12	122122115	G	A	rs28478366	0.0747720279999999	0.1902679579426447	0.0747720279999999	0.1927551044458822	0.0188964025777734	0.5241404990690062	0.0015620739677411	0.2572400582500058	0.0015620739677411	0.2605853853619995	0.1109044571277753	0.2822110520094453	0.0092713887983062	0.1828640901731174	0.0092713887983062	0.1859192277468436	0.0021193220111276	0.3042505582293569	0.000197212619271	0.2087935765033673	0.000197212619271	0.2119678582498842	0.0161410049157071	0.1391971444579836	0.0161410049157071	0.1417045834975379	MLXIP	43358	LRRC43	45624	IL31	52106	False	False	False	alt	95	0.0807	85	0.2336
910	chr12	122122290	C	T	rs11059094	0.0505383116	0.251225937685239	0.0585839356	0.2531312426257519	0.0261451132701735	0.3045711407123393	0.0014719413691017	0.2451793077271379	0.0016179808065569	0.2469538133842536	0.0575772821747879	0.4103391034519192	0.0032688865343637	0.3084971656164434	0.0036806438018529	0.311182065795782	0.0014940698475085	0.3665463196847033	9.243247824133062e-05	0.2843801389754767	9.990645393835228e-05	0.2869485386494452	0.0073265481178449	0.2521899183523121	0.0085538253439344	0.2544912736300366	MLXIP	43533	LRRC43	45449	IL31	51931	False	False	False	alt	-80	0.02759	-90	0.1107
911	chr12	122123955	T	C	rs11609875	-0.01356415092	0.694729461270656	0.01432896668	0.6898804425221043	0.0182367011254412	0.5482779856088419	-0.0002771844236752	0.6700618134261148	0.0002894408554017	0.665479322705575	0.689667942331167	0.0163488258653599	-0.0096069400864834	0.1691012145257403	0.0101270026796493	0.1669557441065421	0.0127372383402176	0.0526008442177059	-0.0001997569043606	0.2008799911217282	0.0002080910838438	0.1988207657855931	-0.002820758140609	0.4598063010590335	0.0029857147570188	0.4555864809824027	LRRC43	43784	MLXIP	45198	IL31	50266	False	False	False	ref	80	0.02292	100	0.2192
912	chr12	122124584	C	T	rs11057905	-0.0438259194	0.3423038849100184	0.0438259194	0.3380443970922535	0.0187338066252177	0.5343953631724423	-0.0008607282414398	0.3931379208925162	0.0008607282414398	0.3884731925443986	0.4926594305697601	0.0450052567049241	-0.0204602149920517	0.0886965950408028	0.0204602149920517	0.0869678883414211	0.0091354636523808	0.0838696190648798	-0.0003902069844069	0.1214731739810339	0.0003902069844069	0.1193712827897894	-0.0137969713965226	0.163545203665757	0.0137969713965226	0.1608921174798995	LRRC43	43155	MLXIP	45827	IL31	49637	False	False	False	ref	-100	0.157	-100	0.3977
913	chr12	122125237	C	T	rs114490539	-0.090429236	0.125408299220724	0.090429236	0.1235068405759663	0.0216399495321809	0.4280656311178002	-0.0019256502485896	0.1763512173516314	0.0019256502485896	0.1738468256232161	0.0154250932004882	0.6524046550600139	-0.0014486333634909	0.4249238607589423	0.0014486333634909	0.4197967980885484	0.0003239926808311	0.633535644860592	-3.011945460929832e-05	0.4174303425238281	3.011945460929832e-05	0.41207881627275	-0.0044876447494308	0.3649519443218137	0.0044876447494308	0.359919814653848	LRRC43	42502	MLXIP	46480	IL31	48984	False	False	False	ref	-5	0.002075	100	0.1068
914	chr12	122125472	C	A	rs4758691	0.032748168	0.4521861892402907	0.032748168	0.4575054542280432	0.0354526924958324	0.1504562090136099	0.0012528632152414	0.3056768684816827	0.0012528632152414	0.3096738617731929	0.0182796674474613	0.6209696527396017	0.0005383337061167	0.5689452093078576	0.0005383337061167	0.5746881046498122	0.00063939032335	0.5160297662837113	2.015938356723417e-05	0.4785455919731466	2.015938356723417e-05	0.4841514342242786	0.0016718353073141	0.5485496704944139	0.0016718353073141	0.5544008490676531	LRRC43	42267	MLXIP	46715	IL31	48749	False	False	False	alt	-45	0.1604	0	0.0
915	chr12	122126362	G	A	rs4758690	-0.0485151076	0.3061347342033003	0.0485151076	0.3020243197314641	0.0132549017977087	0.7654849436579882	-0.0006897548524213	0.4409818161055983	0.0006897548524213	0.4358811103730569	0.0829220415030846	0.3399919152262857	-0.0043470656581994	0.2774732894305205	0.0043470656581994	0.2732081102127314	0.0011338396029454	0.4220634729225431	-6.419733886099042e-05	0.3436595768780481	6.419733886099042e-05	0.3390250334617497	-0.0093786084259839	0.2303179462397549	0.0093786084259839	0.226560708526932	LRRC43	41377	MLXIP	47605	IL31	47859	False	False	False	ref	-60	0.1372	-100	0.2219
916	chr12	122126552	C	T	rs7485421	-0.0200934964	0.530521875983596	0.0255121219999999	0.5265966564753161	0.0186266871952606	0.5318369692142944	-0.0004576247616369	0.5275236376710557	0.0005349755224696	0.5239301259199843	0.100802513938834	0.3024307847461221	-0.0019639700775568	0.3552532910340764	0.0025040941098037	0.3519395569276782	0.0018358114598912	0.3305303991058146	-4.387615097028117e-05	0.3709016939919338	5.158640978757022e-05	0.3674372380704709	-0.0040241166573191	0.3481468034198547	0.0051227277226089	0.344876107009637	LRRC43	41187	IL31	47669	MLXIP	47795	False	False	False	ref	5	0.000515	-65	0.0908
917	chr12	122128731	C	T	rs6489242	0.147190662	0.0476437237849777	0.147190662	0.0482902992680432	0.0403537838839645	0.1060235424968955	0.0060101963861504	0.0429334358551593	0.0060101963861504	0.0433497417459635	0.0539490613968526	0.4288622595986378	0.0080690549706522	0.1775464967390698	0.0080690549706522	0.1809193012339918	0.0021779486291292	0.3049989404675061	0.0003300656342357	0.1283848878632611	0.0003300656342357	0.1308772668463178	0.018193065223846	0.1099716647709435	0.018193065223846	0.1120443232799801	LRRC43	39008	IL31	45490	MLXIP	49974	False	False	False	alt	100	0.0252	95	0.0664
918	chr12	122130362	A	T	rs7488268	0.1850253552	0.0352654715554707	0.1850253552	0.0355115262573973	0.0564090450175942	0.038454702410193	0.0111962646634572	0.0233631427103781	0.0111962646634572	0.0235597904312818	0.53441324931543	0.0367686771497568	0.1045937527447471	0.0102885037329542	0.1045937527447471	0.0103646851880085	0.0304606103139796	0.0090825262756895	0.006393450265314	0.0082635080921295	0.006393450265314	0.0082931274210545	0.0562452574972781	0.0193673748607536	0.0562452574972781	0.0195540139891814	LRRC43	37377	IL31	43859	MLXIP	51605	False	False	False	alt	-25	0.076	-10	0.03662
919	chr12	122138453	T	C	rs4758686	-0.008651780942	0.706896920375897	0.014288309342	0.7037223405966746	0.0849131353341198	0.0083474305966635	-0.000834634370327	0.3172610851915433	0.0012614653976477	0.3152361167284659	0.5806241958364949	0.0295656547818651	-0.0038471016333261	0.2175152777032958	0.0077114876142384	0.2157300825566972	0.0487732427587702	0.0022942369804742	-0.0003758669155334	0.0968793493932996	0.0006685009075703	0.0961273953735627	-0.0029205568935369	0.4325324979241436	0.0040026722971857	0.4290836113901413	LRRC43	29286	IL31	35768	MLXIP	59696	False	True	True	ref	95	0.02124	-55	0.3003
920	chr12	122141834	G	A	rs11057509	0.2710975048	0.0132703052591899	0.2710975048	0.0134219833358625	0.0498931221440414	0.0581519352005569	0.0147537349885709	0.0144028533583833	0.0147537349885709	0.0144950536598764	0.3673938504173402	0.0820889512039272	0.1077117122925874	0.0091792080002557	0.1077117122925874	0.0092983190544685	0.0190243546696675	0.0271113113060418	0.0059339827671096	0.0087839776617881	0.0059339827671096	0.008826472577663	0.0933357526970406	0.0059268907221733	0.0933357526970406	0.0060028939731645	LRRC43	25905	IL31	32387	B3GNT4	61848	False	True	False	alt	-35	0.01422	-15	0.04077
921	chr12	122143672	T	C	rs1047796	0.1300919589999999	0.0726328529236416	0.1300919589999999	0.0734257364502115	0.0775444647426107	0.0124041711341679	0.0102384326849473	0.0248130332227154	0.0102384326849473	0.0249674846338219	0.3888019200950149	0.0733451123538035	0.0574330740555211	0.0287488113536657	0.0574330740555211	0.0291917695239629	0.0311013322363024	0.0090642913865772	0.0046888660675551	0.0128908677288063	0.0046888660675551	0.0129416189431149	0.0432409026426049	0.0315868033752895	0.0432409026426049	0.0320273728167962	LRRC43	24067	IL31	30549	B3GNT4	60010	False	True	False	alt	-80	0.02939	40	0.02832
922	chr12	122239744	C	T	rs11057249	0.0129984356	0.5560967741748564	0.022950306	0.5581011367218555	0.0344448708788231	0.1616286724174817	0.0004605829554229	0.4110502099855097	0.0007895353394783	0.4123714276539145	0.0238890171884793	0.576270211997407	0.0004518794365595	0.5826188578869158	0.0006330139681138	0.5844783091535958	0.0008127990662376	0.475746889975073	1.5331280181785883e-05	0.5003814682742346	2.1317580903849416e-05	0.5023377145651661	0.0013295503282636	0.5513872875041428	0.0019497872059647	0.5534164021255684	ENSG00000284934	12210	DIABLO	13682	ENSG00000256861	26679	False	False	False	alt	-100	0.03687	30	0.05835
923	chr12	122853214	G	A	rs12298151	-0.0120034036	0.2053227112523948	0.0683185915999999	0.2044809843473594	0.021408483613375	0.4351780917939263	-0.0002507137844662	0.2453411975504633	0.0014854062552189	0.244422392942672	0.7223524463066214	0.0134440350388101	-0.0095848328413175	0.0310281444350828	0.0490646509280715	0.0308343351265425	0.0154336479090541	0.0371895858222602	-0.0002002447214182	0.0512915696993334	0.0010660119635627	0.0509537127769292	-0.0013749133977763	0.1608791612191031	0.0134332420573388	0.1598984750153491	HIP1R	18760	VPS37B	42913	CCDC62	78687	True	False	False	ref	-30	0.135	-15	0.0498
924	chr12	122963381	T	C	rs4275659	-0.1104072543999999	0.0839097662879765	0.1224952775999999	0.0834440585086044	0.0592474315307711	0.0321372162126973	-0.0065114100270527	0.0399780436015516	0.0073240921512764	0.0400415000003045	0.0965260136584077	0.3082613628552494	-0.0107587898906457	0.1431065224683798	0.0118236354170105	0.141396218012154	0.0057029712053583	0.1414976922073322	-0.0006357038419388	0.0772392786347922	0.0007072937880621	0.0763984516396413	-0.0201436772128929	0.0878616263783675	0.0226642143116359	0.0868144675147825	OGFOD2	11200	ARL6IP4	16680	ABCB9	18268	False	False	False	ref	10	0.001038	-10	0.0094
925	chr12	122966471	G	C	rs61955196	-0.06810901132	0.2330333724869667	0.06810901132	0.2300702290648	0.0895884056946935	0.0067452291604096	-0.0058815387594778	0.0807677041073381	0.0058815387594778	0.0801608594011434	0.9261720167595922	0.000680350058065	-0.0627814234841398	0.0345253977096127	0.0627814234841398	0.0338702611363611	0.0830504029007986	0.0003798797142081	-0.0054251833077443	0.0146117484259739	0.0054251833077443	0.0144700357703558	-0.0041354623733957	0.4360635810907833	0.0041354623733957	0.4305946384844065	OGFOD2	8110	ARL6IP4	13590	ABCB9	15178	True	True	True	ref	20	0.00928	60	0.10254
926	chr12	122985100	G	T	rs3741530	-0.010911909312	0.6662083394308965	0.016341438712	0.6634170301390856	0.0886268651758426	0.0071633187761744	-0.0008125722673128	0.297404019679687	0.0013326467374483	0.2951508923859836	0.5062700009897397	0.0429050807995776	-0.0066594793652669	0.2175975340538325	0.0088590513873022	0.2152742790318917	0.0444650901743325	0.0031290330373555	-0.0005033410968562	0.1017448410534354	0.0007140299374329	0.1006228125328218	-0.0028092111774603	0.397823272802092	0.0045528026129127	0.3945927674771414	ABCB9	3451	ARL6IP4	5039	OGFOD2	10519	False	True	True	ref	-100	0.2401	100	0.272
927	chr12	123017425	T	C	rs12425850	-0.0202944794	0.4901078643651371	0.027776011	0.4878958080233048	0.0131267287590182	0.7752913956132965	-0.0002214222339021	0.6195588326473926	0.0003332848305952	0.6174215144478364	0.007995447197387	0.7866763466368628	-0.0001014598544781	0.7404809458086602	0.000197849844612	0.738758215370965	0.0001065991723081	0.8280217025057578	-1.0000613070472675e-06	0.7770141549609875	2.395349038733774e-06	0.7755089262455183	-0.0004297119857477	0.7246961803686023	0.0007266338952855	0.7227928645310824	ABCB9	35776	ARL6IP4	37364	OGFOD2	42844	False	False	False	ref	45	0.03333	50	0.05374
928	chr12	123102141	T	C	rs1790094	0.0089850244885999	0.7908314864806675	0.0089933141113999	0.7976506079133888	0.0172290995525638	0.5893742814613263	0.0001557508450496	0.7808225772828705	0.0001558983278897	0.7875450329617	0.0278405529345781	0.5643979932908473	0.0002657695967325	0.6819411459869671	0.000265808192392	0.6882881943382237	0.0004681161912012	0.5878775033581736	4.5559904355523775e-06	0.6910040351357843	4.55667710098101e-06	0.6973677682845627	0.0008256078651314	0.6843159137530073	0.0008256078651314	0.6901796643618271	PITPNM2	48949	ABCB9	120492	ARL6IP4	122080	False	False	False	alt	100	0.00664	-60	0.02234
929	chr12	123147820	C	G	rs58991895	0.01642365676	0.6463142554724581	0.01642365676	0.6529297164755382	0.0166302320062892	0.6211969671410346	0.0002724260190633	0.6673765661704671	0.0002724260190633	0.6737915944913112	0.05380719870674	0.4241791718398993	0.000973368540439	0.5239317352641698	0.000973368540439	0.5299456255448423	0.0008849759588604	0.4602364157696275	1.6044786941048262e-05	0.5454443462544529	1.6044786941048262e-05	0.5516020589835684	0.0025131140510045	0.5127251195043645	0.0025131140510045	0.5187330471962897	PITPNM2	3270	MTRFR	85566	MPHOSPH9	96194	False	False	False	alt	-50	0.08826	100	0.062
930	chr12	123148383	G	A	rs1727302	-0.1074467249999999	0.0912745469472146	0.1074467249999999	0.0899649644394662	0.0201420448978071	0.4726969658371809	-0.0021908653531852	0.1571283427393974	0.0021908653531852	0.1551139014325905	0.0393099864735573	0.5005177358761052	-0.0043097864848498	0.2744914398196162	0.0043097864848498	0.2702451616869012	0.0009159761295086	0.4897545684835444	-0.0001017817082565	0.2838720747906694	0.0001017817082565	0.279658240316567	-0.0107172313681501	0.2012243207860308	0.0107172313681501	0.1978579272981841	PITPNM2	2707	MTRFR	85003	MPHOSPH9	95631	False	False	False	ref	40	0.02754	-75	0.1656
931	chr12	123186245	A	C	rs11613128	0.00167800852	0.6779168089043556	0.01551794732	0.6787149760137002	0.0818532856290897	0.0108372292719134	0.0001732148953462	0.3103390440783908	0.0010765505487917	0.3105526134595923	0.0005088911616244	0.9881159755035824	-3.790737224904936e-07	0.9644970529300484	7.78280464135117e-06	0.9660647554789912	4.160861231361355e-05	0.9018337758413818	5.929268504573242e-09	0.8905448763796383	5.299211050995362e-07	0.8918638211294292	-4.123915410247102e-06	0.966541599783718	2.721784170763089e-05	0.968104717414736	PITPNM2	35155	MTRFR	47141	MPHOSPH9	57769	False	False	False	alt	-20	0.008606	20	0.1007
932	chr12	123193263	A	G	rs4460848	0.0014721653	0.8813495814730431	0.00545121206	0.8801365604205479	0.0203792707294002	0.4715101416834794	3.465190682468178e-05	0.8487888430748071	0.0001122945647286	0.8478413503518892	0.0031234535317211	0.8810638055290946	-1.390444648511157e-06	0.9501983406918372	1.137024038963582e-05	0.9487571572222168	6.068819258869308e-05	0.8691100263641186	-2.425675744941788e-08	0.9400822877033111	2.238565140794768e-07	0.938597270458704	-5.77348157434585e-06	0.9401645738338212	5.691003266140996e-05	0.9386998634562712	MTRFR	40123	PITPNM2	42173	MPHOSPH9	50751	False	False	False	alt	-100	0.1548	-100	0.0896
933	chr12	123204258	C	T	rs74917517	-0.082850182	0.1534002045658142	0.082850182	0.1514749635105428	0.0243672785304185	0.3442828036617669	-0.0021409676767932	0.178488007541134	0.0021409676767932	0.1761386538984698	0.0004107419748605	0.9918484183683683	-3.705170405883296e-05	0.8929058043490004	3.705170405883296e-05	0.8858603767108683	1.0320486453300912e-05	0.980208749031644	-9.65246524449926e-07	0.859788175146444	9.65246524449926e-07	0.852862041624757	-0.000117943980733	0.903297797745729	0.000117943980733	0.8962554965842243	MTRFR	29128	MPHOSPH9	39756	PITPNM2	53168	False	False	False	ref	-70	0.02032	90	0.02612
934	chr12	123207195	T	G	rs74240770	-0.0191424915	0.6333995900187798	0.0195720131	0.6289370963474575	0.0146858482346032	0.6967267229257218	-0.0002589525593261	0.7081178177195295	0.0002674825496484	0.7035554294205598	0.0133268450397545	0.681094195377234	-0.000176939605387	0.7406095754475401	0.0001827424193101	0.736370923615059	0.0001943141098638	0.718065420647125	-2.38671121935864e-06	0.7672750681654655	2.501950935533436e-06	0.7628882523959178	-0.0006573521163933	0.7237158985950048	0.0006754973441984	0.7194037947936542	MTRFR	26191	MPHOSPH9	36819	PITPNM2	56105	False	False	False	ref	-100	0.07104	70	0.04996
935	chr12	123213351	T	C	rs1790134	0.00094431818	0.8786418487926224	0.00531271714	0.87980887186888	0.0437006507459435	0.0860015592924545	2.188726845504001e-05	0.6952455232637537	0.000247434109813	0.6965021738167783	0.0013493451222328	0.9484941744916752	2.6059848683064348e-06	0.9657254496831006	7.09956150637712e-06	0.9668659856673528	5.671859017201691e-05	0.8736187788464378	9.896332775998258e-08	0.9244034488248574	3.15073008547347e-07	0.9255731808536464	9.072613902543544e-06	0.9700380059239596	2.226914321533436e-05	0.9711999700168544	MTRFR	20035	MPHOSPH9	30663	CDK2AP1	58983	False	False	False	alt	-50	0.0227	-85	0.05188
936	chr12	123213971	T	G	rs1790133	0.0018675645999999	0.7192068686756106	0.0132286774	0.7203824048169266	0.015760877069653	0.6594343710991633	4.748253722770002e-05	0.7257560120529449	0.0002094657361075	0.7270506425616405	0.0086189832074164	0.7580068131437537	-8.626512788968965e-06	0.7793662867421906	0.0001173007091853	0.780613392559658	0.000138000979424	0.778420994383291	7.364566763308095e-08	0.788943899197409	1.8710752581414604e-06	0.790051964656558	-4.2063937184531627e-05	0.7666330934147383	0.0004396093827323	0.7678837902065705	MTRFR	19415	MPHOSPH9	30043	CDK2AP1	58363	False	False	False	alt	-100	0.0558	95	0.1475
937	chr12	123234332	C	G	rs1727331	-0.0637823136	0.2156680177337901	0.0637823136	0.2125052929462794	0.0181163969331546	0.553611946972914	-0.0012104413682149	0.2914631465199737	0.0012104413682149	0.2877159063622437	0.1232893998878294	0.2659895858238134	-0.0077567229159872	0.1882338029813134	0.0077567229159872	0.1850188278402114	0.0023509048085955	0.2956330078462407	-0.0001533071736885	0.2193505813607411	0.0001533071736885	0.2159861811374064	-0.0139297614727326	0.1502574609210182	0.0139297614727326	0.1475665121912661	MTRFR	946	MPHOSPH9	9682	CDK2AP1	38002	False	False	False	ref	-35	0.02533	95	0.0768
938	chr12	123257159	C	A	rs11554169	-0.00432853751	0.6327589077054253	0.0194197376099999	0.6331324559736329	0.0179160399106856	0.565449002454613	-7.817604978439455e-05	0.657259849197203	0.000355669896029	0.6577855401823642	0.0097514103790702	0.738830508976964	-2.305295843563028e-05	0.7516852121046996	0.0002914859087078	0.7524711998395185	0.0001764928667906	0.7421043750150724	-4.065608477695509e-07	0.7523005248595471	5.3461044116696375e-06	0.7531018624433126	-0.0001360892085381	0.7212556708195625	0.0009592227244234	0.7220928338511208	MPHOSPH9	13145	CDK2AP1	15175	MTRFR	23773	False	False	False	ref	-45	0.009766	-100	0.1087
939	chr12	123260408	G	A	rs1980251	-0.1521923409199999	0.0554962618456598	0.1549831890799999	0.0551426096014508	0.0356825863848433	0.147819694860164	-0.0056578165260497	0.0654630152840245	0.0057532007854291	0.0650777295416036	0.2886551087064102	0.1172889465895187	-0.0484444426586281	0.0428352142036456	0.0491376891220235	0.0423535303914726	0.0102129398786236	0.0755304049282589	-0.0017836355747605	0.0434766739349904	0.0018073290172379	0.0431002957049257	-0.0481681567747682	0.0308090553784835	0.0490589225033815	0.0306152871744471	CDK2AP1	11926	MPHOSPH9	16394	MTRFR	27022	False	False	False	ref	35	0.01758	35	0.1343
940	chr12	123260602	G	T	rs78197735	0.057578949	0.2463514888643362	0.057578949	0.2498902419645086	0.0112232022364917	0.8522121460050639	0.0006622865144392	0.4328245130934474	0.0006622865144392	0.4383243620057298	0.3160346078981227	0.1032219517265154	0.0198761478094957	0.0940791563877292	0.0198761478094957	0.0959648731853304	0.0035006170466396	0.2198041187150122	0.0002244988921762	0.1753509110803114	0.0002244988921762	0.1784551498427498	0.0182359539441126	0.1101415966398307	0.0182359539441126	0.11228402319858	CDK2AP1	11732	MPHOSPH9	16588	MTRFR	27216	False	False	False	alt	-80	0.08154	-85	0.535
941	chr12	123268090	G	A	rs76514049	0.0701147982	0.1584671937866897	0.0820897194	0.1601872680237213	0.0340172368612943	0.1674851203546004	0.0023899623788235	0.1325462937157015	0.0028250770146699	0.1336865657648016	0.840287354425786	0.0049083428655554	0.0605256580477078	0.0192321677357153	0.0701643909781025	0.0193622384532556	0.0286480204150093	0.0102583462901901	0.0020756253497092	0.0232204051786001	0.0024258534423947	0.0234336778382908	0.0070543697007686	0.225705390925076	0.008948071657154	0.2285271735787543	CDK2AP1	4244	MPHOSPH9	24076	MTRFR	34704	True	False	False	alt	65	0.0819	100	0.6904
942	chr12	123290717	T	C	rs74240779	-0.05841901784	0.2427624793210138	0.05929848576	0.240454116082336	0.0326098719544535	0.1840642493649205	-0.0019795831765723	0.1986805171006147	0.0020048812837132	0.1969109433027082	0.0939196991191316	0.3136046866213459	-0.0047586552155692	0.2671934797674953	0.0048699560298595	0.2640125373734167	0.0030290011162466	0.2397388839668223	-0.0001609752323331	0.2199127405996399	0.0001641768271004	0.2173279104861731	-0.0103609250767047	0.2153904911302352	0.0105737191118735	0.2125902963873185	CDK2AP1	18383	MPHOSPH9	46703	MTRFR	57331	False	False	False	ref	-50	0.01306	-95	0.3125
943	chr12	123298270	C	T	rs67382382	-0.01889478778	0.6003451381481555	0.02090718682	0.5959968479819951	0.0899280303846939	0.0068846790396099	-0.0015612139839729	0.2329138797517168	0.0017475949298717	0.2310154753220205	0.0023819735409586	0.9098651680938163	-2.9812655439074768e-05	0.8845035136197398	4.1057750780820336e-05	0.8804285586369134	0.0002145419544593	0.7162437889384267	-2.414448665379865e-06	0.7266168013298383	3.455927755862588e-06	0.7229768596143145	-0.0001039226683382	0.8844361245775111	0.000151760087097	0.880352868508466	CDK2AP1	25936	MPHOSPH9	54256	MTRFR	64884	False	False	False	ref	-70	0.1686	-65	0.1112
944	chr12	123302958	C	G	rs58537268	0.07897114	0.1514420309200023	0.07897114	0.1536055206301347	0.0346977304118651	0.1665327374692379	0.0028376134381685	0.1216056903207103	0.0028376134381685	0.123099645866871	0.0026013658407838	0.9011543284504888	0.0002187747118717	0.6974574380800311	0.0002187747118717	0.7038927813782376	9.667197221441247e-05	0.8283055280717034	8.382887011810889e-06	0.614827654095584	8.382887011810889e-06	0.6210334347873548	0.0007711721817161	0.6878349315229267	0.0007711721817161	0.6943115925216958	CDK2AP1	30624	MPHOSPH9	58944	SBNO1	61889	False	False	False	alt	-100	0.008575	95	0.0814
945	chr12	123307918	G	A	rs117741953	0.00255992036	0.7770129625541553	0.0098952221599999	0.7789839561874305	0.0175562926778123	0.5787486486170942	2.209113883146272e-05	0.7652336268794468	0.0001718579575613	0.766987977338693	0.0002004222889379	0.9980474213247484	1.9505160417439602e-07	0.9891485549508218	1.7095393447329494e-06	0.9910388138710128	3.4774194906851104e-06	0.9972557956650712	5.13325154286765e-10	0.988291764215612	2.9112269472171223e-08	0.989899797565689	1.6495661640988525e-06	0.9898624727430576	4.948698492296524e-06	0.9922530635084844	CDK2AP1	35584	SBNO1	56929	MPHOSPH9	63904	False	False	False	alt	85	0.003403	100	0.2067
946	chr12	123317393	A	G	rs57416942	-0.080424334	0.1224213447247884	0.096720486	0.1215185865963862	0.0277142420841737	0.2662363669754844	-0.0029637251426791	0.1337316660023054	0.0031293945706998	0.1329227972535648	0.0029815908416086	0.8873955578054915	-0.0003204976676918	0.6665977668747182	0.0003500002014753	0.6629524588306449	9.33099161144749e-05	0.8365836432782815	-1.2186985861931446e-05	0.6070727658356299	1.2486913606401705e-05	0.6032948906854599	-0.0009641714229157	0.6513860523590737	0.0010796410544026	0.6475958955675231	CDK2AP1	45059	SBNO1	47454	KMT5A	66740	False	False	False	ref	-75	0.01636	0	0.0
947	chr12	123318143	A	G	rs75225286	0.0514243616	0.2757258896475294	0.0514243616	0.2794948477923054	0.1007247456399734	0.0041689491264938	0.0049630769716752	0.055955428301158	0.0049630769716752	0.056502425642377	0.0004866220184091	0.9891516474365616	2.7976401124048407e-05	0.8985817006766833	2.7976401124048407e-05	0.905579608472441	4.711970632408591e-05	0.8913250984183652	2.596032020669953e-06	0.7420166268088859	2.596032020669953e-06	0.7484297068417557	9.072613902541204e-05	0.9098448330070532	9.072613902541204e-05	0.9168245462788924	CDK2AP1	45809	SBNO1	46704	KMT5A	65990	False	False	False	alt	-90	0.02667	-100	0.10425
948	chr12	123328240	A	G	rs10846519	0.0020375278	0.2991937772326882	0.0509985162	0.2999413153040402	0.0436057618678237	0.0846251161202552	-1.2258921596439976e-05	0.1684544672240203	0.0022702027171417	0.1688204670694368	0.0517345188215499	0.4289070833404789	0.0001918269063534	0.3339227160414641	0.0029092389334869	0.3348377317234715	0.0022643362551033	0.2904972896892004	1.7205601811830849e-06	0.2414325634990189	0.0001298555891868	0.2423034347225344	0.0004866220184091	0.2794810291001456	0.0070980832041172	0.2803567412402971	SBNO1	36607	KMT5A	55893	CDK2AP1	55906	False	False	False	alt	-75	0.006287	-95	0.01233
949	chr12	123336687	T	A	rs7486223	-0.0161017022	0.6203969300786473	0.0179762234	0.6158545591979738	0.0379802664395545	0.1261200030119152	-0.0006143956674626	0.4293949733019331	0.0006841096831571	0.4256351441808463	0.0047507505526046	0.8377492280208555	-9.886576609509408e-05	0.8082314745191853	0.0001031097374769	0.8036262560027344	0.000178793857628	0.7412015645050756	-3.680348739756642e-06	0.7266593766689387	3.838183332050963e-06	0.7222650052674201	-0.0004107419748605	0.7920634813013087	0.0004239385041733	0.7873743928070038	SBNO1	28160	KMT5A	47446	CDK2AP1	64353	False	False	False	ref	80	0.0558	-50	0.09863
950	chr12	123338532	G	A	rs7952835	-0.014445844474	0.7052209243608729	0.014445844474	0.6984412069002988	0.0162215247026435	0.6353564427200673	-0.0002513983918504	0.7120809071912193	0.0002513983918504	0.7053411752507776	0.0041519580350367	0.8454832298670872	-5.5485940419140125e-05	0.8682065640355628	5.5485940419140125e-05	0.8612797971814508	6.7430644801082e-05	0.853750977459554	-9.76498264929754e-07	0.867765084160869	9.76498264929754e-07	0.8608608470563337	-0.000202071855102	0.8678310628360971	0.000202071855102	0.8608963042152868	SBNO1	26315	KMT5A	45601	CDK2AP1	66198	False	False	False	ref	40	0.01294	100	0.0581
951	chr12	123342207	A	G	rs7962723	0.1241084467999999	0.0771751478745776	0.1241084467999999	0.0781804444646048	0.0363705190071455	0.1434603177788222	0.0048472189569041	0.0715283419381313	0.0048472189569041	0.0723299468453104	0.0039449374814423	0.853433076211219	0.0005449652670154	0.5870562310063346	0.0005449652670154	0.5930212416951675	0.0001460671782025	0.768766781874103	2.213762585822956e-05	0.4972451289455238	2.213762585822956e-05	0.5029798507985097	0.0016809079212166	0.5640887790331224	0.0016809079212166	0.5701554591626226	SBNO1	22640	KMT5A	41926	CDK2AP1	69873	False	False	False	alt	85	0.0677	-95	0.09485
952	chr12	123342383	A	G	rs10773011	0.221961936	0.0201352684820205	0.221961936	0.020327319574547	0.0547075665517651	0.0436797312176015	0.0127946300355416	0.016157903994199	0.0127946300355416	0.0162784261377319	0.0064572267493648	0.7923404631032985	0.001647190207001	0.4213804367134071	0.001647190207001	0.4268638734673433	0.0003846773054861	0.62450639474035	9.92545737727006e-05	0.2828150845427656	9.92545737727006e-05	0.2872679380598574	0.0042212398139289	0.3853734845089212	0.0042212398139289	0.390971990869469	SBNO1	22464	KMT5A	41750	CDK2AP1	70049	False	False	False	alt	-75	0.04102	-75	0.1409
953	chr12	123352828	A	C	rs9300256	0.0201294352	0.3870716000556098	0.036915082	0.390513799222281	0.0813968249849303	0.0100263170149313	0.00177878759754	0.10699496702479	0.0029956807796739	0.108008585367715	0.0109646662927649	0.7138224814400821	0.0003491793182724	0.610096763461183	0.0004014423723871	0.6140229722954433	0.000885897355034	0.466087774638375	2.8519012942550016e-05	0.4046072451595502	3.230787817510216e-05	0.4084057082803554	0.0012544950677971	0.5749586636322805	0.0014458447428325	0.5788852543474499	SBNO1	12019	KMT5A	31305	CDK2AP1	80494	False	True	False	alt	50	0.01733	-75	0.12195
954	chr12	123358692	A	G	rs10773016	-0.0190518725	0.3980501135149195	0.0377036525	0.395161347922648	0.0211577087391258	0.4436269149607412	-0.0005557432566532	0.3914964887432328	0.0008825659316686	0.3887571198891512	0.0002919732110454	0.9959710319330652	-2.2475694258631594e-06	0.9586721109424544	1.2016201777713864e-05	0.9546243258356164	6.179273628544612e-06	0.9926219402066316	-1.0490380116671401e-07	0.9447732391455266	2.760730125378209e-07	0.9404304891338688	-8.247830820494217e-06	0.9659777669080776	3.464088944607568e-05	0.961676505809272	SBNO1	6155	KMT5A	25441	RILPL2	77992	False	False	False	ref	80	0.01062	100	0.01477
955	chr12	123939053	G	C	rs4930723	-0.0126209004	0.2608937156639505	0.0574972356	0.2611885441497408	0.018953050586748	0.5122081401087403	-0.0005676424779505	0.324855656100162	0.0012216695733195	0.3253314648092866	0.4897429975916333	0.0458530943753256	-0.0095442898273453	0.06442475299731	0.0298355373262867	0.0645448122309163	0.0096889069697741	0.0812523237365005	-0.0003734285903353	0.0965001457874062	0.0006744720368227	0.0967042417122837	-0.0026813697997426	0.124165712120625	0.0171794068160073	0.1245660014919127	ZNF664	32793	CCDC92	33778	RFLNA	34189	False	False	False	ref	-75	0.0773	-85	0.4949
956	chr12	123943784	T	C	rs4930726	-0.01597207976	0.6523870770753184	0.0165185194399999	0.6474887792308982	0.0284935121582579	0.2516848251424085	-0.0004589183179212	0.5302600413864033	0.0004735506851754	0.5256731845728447	0.2568671439411434	0.1342162977775085	-0.0042341696101689	0.2883034324759609	0.0043316299800639	0.2848485168560759	0.0074253655824966	0.1134075928071239	-0.0001231315082956	0.2569602636980183	0.0001257412673409	0.2538357878729636	-0.0050443733298142	0.3528171144225048	0.0051664412259575	0.3486654515297264	ZNF664	28062	CCDC92	29047	RFLNA	29458	False	False	False	ref	100	0.0653	100	0.2712
957	chr12	123962181	A	G	rs7312404	0.00276814776	0.7017727629473851	0.01358786904	0.7035869832819868	0.0181213432999476	0.5512384419071628	5.506563901788333e-05	0.6741572886006971	0.0002559317952693	0.6758240394738835	0.0690285704859621	0.374815210281859	6.307371483817997e-05	0.4845449923652755	0.0010187404898001	0.4860337695584776	0.0012689433950304	0.3967160517716055	1.4855087305202698e-06	0.4923932521621926	1.939192370726836e-05	0.4938740806493416	0.0003241397512453	0.4951865396119254	0.0023481574345946	0.4966885701212561	ZNF664	9665	CCDC92	10650	RFLNA	11061	False	False	False	alt	-30	0.002472	-50	0.01624
958	chr12	123962799	T	C	rs7134121	-0.0283653326	0.4512295768624796	0.0307756849999999	0.4468937457005003	0.0244318833072853	0.344992254208133	-0.0007077546653498	0.4051660331712197	0.0007516018885991	0.4014153475454375	0.1170515654382896	0.2744337820813937	-0.0032710986397478	0.3017945101393588	0.0035225431430784	0.2986464459993259	0.0029522224838477	0.2508433363405142	-8.443247266907812e-05	0.2861840303835398	8.900655204337807e-05	0.2833000220607112	-0.0064531028339546	0.2858334895882298	0.0069760153079739	0.2826395441478102	ZNF664	9047	CCDC92	10032	RFLNA	10443	False	False	False	ref	100	0.04672	100	0.2114
959	chr12	123982657	C	A	rs35099862	-0.158106514	0.0421010324206559	0.158106514	0.0416095600965773	0.0734535271058498	0.0148276924276702	-0.0114439933576588	0.015945985174485	0.0114439933576588	0.0159492593489618	0.0338359011579954	0.5690768784254528	-0.0049021746865308	0.2812848912053489	0.0049021746865308	0.2768761225259466	0.0024966262000373	0.3270845414530914	-0.0003598715027271	0.1475356575891045	0.0003598715027271	0.145013588565606	-0.0116121210121737	0.206210391229263	0.0116121210121737	0.2029976040884467	RFLNA	9415	CCDC92	9826	ZNF664	10811	False	True	False	ref	-60	0.03543	-85	0.2412
960	chr12	123984025	G	C	rs7978610	-0.1870063284	0.0315192683229288	0.1870063284	0.0312777564944998	0.0374117633124823	0.1323830864825496	-0.0070464248971209	0.0385802548762722	0.0070464248971209	0.0384242722403775	0.4479982514598661	0.0562584193199817	-0.0849660836932009	0.0130894532756674	0.0849660836932009	0.0129537425979987	0.0167351036290199	0.0330355483497386	-0.0031951105270812	0.0159522178998563	0.0031951105270812	0.0158223599836639	-0.0607263039820526	0.0150010682279996	0.0607263039820526	0.0148575013685465	RFLNA	10783	CCDC92	11194	ZNF664	12179	True	False	False	ref	100	0.0792	-65	0.03174
961	chr12	123985512	C	T	rs11837287	0.0235097304	0.5407045928079475	0.0235097304	0.5469737690007271	0.0268197576314332	0.2868523787287053	0.0006324080297102	0.4398919974891693	0.0006324080297102	0.4454671862565759	0.0108071327240935	0.7137227507338291	0.0002711959707194	0.6696822987964397	0.0002711959707194	0.6759949462172222	0.0002914252017643	0.6559293348028807	7.366610673620912e-06	0.6186566968162154	7.366610673620912e-06	0.6248661041815241	0.0009550988090131	0.6483195827055819	0.0009550988090131	0.6545968155064472	RFLNA	12270	CCDC92	12681	ZNF664	13666	False	False	False	alt	100	0.013855	50	0.05676
962	chr12	123990609	A	G	rs7307277	0.0150491916599999	0.4680258567595262	0.02894420766	0.4710907944537024	0.0186482623068822	0.5360986805117549	0.0002853300300595	0.4918464723273266	0.0005373139500353	0.4949352880391475	0.0181295569265282	0.635664944915356	8.142854228297999e-05	0.6005274173364282	0.0004385910868365	0.6038829584953159	0.0003500635842344	0.6378725581758098	1.7165495702559954e-06	0.6013738752217971	8.193636160970511e-06	0.6047385456351675	0.0003167167035069	0.579766755794461	0.0014417208274223	0.5830469024460261	RFLNA	17367	CCDC92	17778	ZNF664	18763	False	False	False	alt	75	0.0852	55	0.1776
963	chr12	123992326	C	T	rs12833624	-0.286863796	0.0099009076398249	0.286863796	0.0098528083742725	0.0805762729594717	0.0104820537996134	-0.0238092852514567	0.0052233795415331	0.0238092852514567	0.0052075029543917	0.1878451717198376	0.187570507286859	-0.0585288882545971	0.0247906122173155	0.0585288882545971	0.0243568072231132	0.01568164996982	0.0388511028963909	-0.0050277466984217	0.0099814792718029	0.0050277466984217	0.0098698283166774	-0.0758091122034904	0.0088197855511496	0.0758091122034904	0.008718297198541	RFLNA	19084	CCDC92	19495	ZNF664	20480	False	True	True	ref	80	0.02478	100	0.0674
964	chr12	123995826	G	C	rs34114498	-0.140295	0.0577210010322164	0.140295	0.0569786663006746	0.0399731673246085	0.1110017479356593	-0.0059068422784015	0.050355806466328	0.0059068422784015	0.0499630053979505	0.1638299627198046	0.2177279668523086	-0.023621734446651	0.0786883141664017	0.023621734446651	0.0772123414748122	0.006466421154438	0.1317564608119646	-0.0009730148682015	0.0604265622064093	0.0009730148682015	0.0595299023008285	-0.0347019233941473	0.0451213195923586	0.0347019233941473	0.0444118878736154	RFLNA	22584	CCDC92	22995	ZNF664	23980	False	False	False	ref	85	0.01785	100	0.1719
965	chr12	124008063	T	G	rs12303671	-0.02251188406	0.5544689510406589	0.0253239548599999	0.5509873311699748	0.0133991983608217	0.7610480291972332	-0.0003547420447576	0.6310721469750085	0.0003878385485848	0.6273461635536296	0.2502903236448813	0.1391638811564464	-0.0042769004683423	0.2660188119276768	0.0053827193976904	0.2638195586019901	0.0032380836075957	0.2293676641674297	-6.688103814474306e-05	0.3324821179020175	7.989590988665659e-05	0.3299456476662122	-0.0064564019662828	0.2951198368970687	0.0075368678037675	0.2925732820130649	RFLNA	34821	CCDC92	35232	ZNF664	36217	False	False	False	ref	-75	0.0751	-50	0.1621
966	chr13	32188974	G	A	rs7992065	0.005638293296	0.6416596113748527	0.018907199096	0.6429444412128997	0.02385946715961	0.3612759699858117	0.000163316701681	0.570938335207756	0.0004992850683514	0.5719759162239262	0.0050658176899475	0.8324844497790961	7.244836112498634e-05	0.8296613712565801	0.0001234177985479	0.8311064927300847	0.0001245359408113	0.7957659635968292	2.024830715699577e-06	0.7928018979499774	3.301397899566269e-06	0.7942370300306003	0.0002688792847481	0.819099669642309	0.0004239385041733	0.8194901493600981	BRCA2	126113	ZAR1L	126389	N4BP2L1	239337	False	False	False	alt	-55	0.00928	65	0.05063
967	chr13	32201923	G	T	rs9567419	-0.0951191442	0.1274438585855571	0.0951191442	0.1257747409205011	0.0694608490930921	0.0182195665670461	-0.0066116981839838	0.0448070516655261	0.0066116981839838	0.0444485094991958	0.1469078882253967	0.2386269232876335	-0.0189696136183741	0.1204106276005633	0.0189696136183741	0.1185306570823519	0.0104448849560631	0.0755168903162621	-0.0013391808009384	0.0584638669071396	0.0013391808009384	0.0577550519758508	-0.0251030978852561	0.086044414503697	0.0251030978852561	0.0847738793249256	BRCA2	113164	ZAR1L	113440	N4BP2L1	226388	False	True	False	ref	100	0.02112	100	0.0349
968	chr13	32202016	T	C	rs9567420	-0.208020532	0.0236880050975122	0.208020532	0.0235127495887307	0.0440281384395599	0.0836401215233018	-0.0096336786833316	0.0244147048101887	0.0096336786833316	0.0242967075384057	0.1599130678631519	0.2216080791650883	-0.0383918568301129	0.0493966600460147	0.0383918568301129	0.0486202453799774	0.007276762484368	0.1179799680942675	-0.0018208075359483	0.0371389029388974	0.0018208075359483	0.0366688217921548	-0.0513815116624327	0.0230119012869816	0.0513815116624327	0.0227028980799396	BRCA2	113071	ZAR1L	113347	N4BP2L1	226295	False	False	False	ref	0	0.0	0	0.0
969	chr13	32202479	T	A	rs61750791	-0.0729631092	0.1985989961573889	0.0747207068	0.1965158723859181	0.068670225625817	0.0193299609009678	-0.0046651024076198	0.0812810473928471	0.0048199468116735	0.0807824265805705	0.1026096136716043	0.3020169296539667	-0.0077456804655624	0.2140494211634864	0.0078932462359746	0.211687990324029	0.0070447865589732	0.1166474127133355	-0.0005083234173072	0.1140536427034437	0.000521323966704	0.1128088295015852	-0.0140650258981887	0.1647390525590038	0.0144262808881263	0.162853795420401	BRCA2	112608	ZAR1L	112884	N4BP2L1	225832	False	True	False	ref	55	0.01694	-95	0.08435
970	chr13	37576532	A	G	rs4512969	0.010506933748	0.767842071569137	0.010506933748	0.774617780813563	0.0189554673302256	0.5243981822608447	0.0002002116891275	0.736174857458914	0.0002002116891275	0.742861896496573	0.0098074956286496	0.7304271420396111	9.740461988515944e-05	0.8064834325803287	9.740461988515944e-05	0.8131462619598716	0.0001879070069909	0.7266741268948742	1.878028655760359e-06	0.7964727242796912	1.878028655760359e-06	0.803047291855269	0.0003530071591171	0.7973992100050264	0.0003530071591171	0.8040055264754123	POSTN	22312	TRPC4	293270	CSNK1A1L	470868	False	False	False	alt	100	0.0368	-80	0.1511
971	chr13	37612750	C	T	rs17258158	-0.0219861696	0.5725305513215978	0.0219861696	0.5664118745920642	0.0153205568599547	0.6731037457226607	-0.0003354665284446	0.613904113720711	0.0003354665284446	0.6074509241940677	0.015472105836165	0.6582800160532969	-0.0003519802575776	0.638240981161421	0.0003519802575776	0.6321092284214869	0.0002477160077138	0.6889110625037791	-5.606010498440956e-06	0.6609433100563086	5.606010498440956e-06	0.6546463728784366	-0.0012322259245817	0.6137168007111276	0.0012322259245817	0.6075996374654195	POSTN	13906	TRPC4	257052	CSNK1A1L	507086	False	False	False	ref	-100	0.0825	-95	0.07574
972	chr13	37636007	G	T	rs73184532	0.0082930766399999	0.7922713582351245	0.0082930766399999	0.7993342519048797	0.0267486253969214	0.2882668563569803	0.000225450038332	0.6927227845060793	0.000225450038332	0.6992416333191163	0.0038344165484477	0.8539073185497388	3.046282079131152e-05	0.8851005623612727	3.046282079131152e-05	0.8921107585549395	0.0001030584268113	0.8032162265279331	8.305581925823056e-07	0.8474736367367905	8.305581925823056e-07	0.8544457133946275	0.0001377387747022	0.8765436139856535	0.0001377387747022	0.883541047894058	POSTN	37163	TRPC4	233795	CSNK1A1L	530343	False	False	False	alt	-100	0.00537	70	0.02657
973	chr13	37638916	A	G	rs73184537	-0.0319045754659999	0.4598998718961891	0.0319045754659999	0.4557131687141477	0.0300208276626592	0.2246532151160607	-0.0009678359657808	0.3713421810613341	0.0009678359657808	0.3673986789783055	0.0104912408036685	0.7152526060320356	-0.0003207546344301	0.692015017587224	0.0003207546344301	0.6859413099880387	0.0003160272484201	0.63889333515629	-9.775685255384665e-06	0.6293490616141605	9.775685255384665e-06	0.6232406576584356	-0.0011076836791923	0.661518681132766	0.0011076836791923	0.6565885974807026	POSTN	40072	TRPC4	230886	CSNK1A1L	533252	False	False	False	ref	25	0.02792	-30	0.09766
974	chr13	37737646	C	T	rs1924300	-0.0001759854599999	0.8306745621598052	0.00685380542	0.8313772904021701	0.0271579439610686	0.2859583465894167	2.43595297221827e-05	0.7636210743912526	0.0001761092463761	0.7647107818140766	0.0011720167595921	0.9594572661623568	1.0981597930200521e-08	0.9568718032639087	9.56631866613496e-06	0.9602027575369014	3.2892969519512764e-05	0.929577461364172	4.850635942592676e-08	0.9422542060008586	2.539175931085379e-07	0.9442619135271866	-8.247830820494288e-07	0.96690593938672	2.721784170763089e-05	0.9690984455492684	TRPC4	132156	POSTN	138802	UFM1	612204	False	False	False	ref	-100	0.03583	-100	0.1302
975	chr13	37740503	G	A	rs12858218	-0.0032593012848	0.7643408736955606	0.0105837292848	0.7617222319600416	0.0693159943397519	0.0181693830222767	-0.0002527718378231	0.4274757347138181	0.0007349933741998	0.4243367008647032	0.016089043581538	0.6633894202760625	1.6125336461605195e-05	0.754282792251452	0.0001844984119933	0.7513822699847333	0.0010978239247768	0.4380696341954622	6.622439906368653e-07	0.5931842222095142	1.254630836912645e-05	0.5897511588345971	-1.1546963148678858e-05	0.7498869756165489	0.0005938438190755	0.7459664204015113	TRPC4	129299	POSTN	141659	UFM1	609347	False	True	False	ref	60	0.0372	-45	0.06366
976	chr13	37743884	G	T	rs2025402	0.0442610916	0.130326504838165	0.0897145656	0.1312119583908583	0.0310382503284171	0.2113210959065434	0.0017330719040272	0.1219796057775819	0.0030211239695327	0.1226251111476968	0.0203803899574411	0.6201173944201668	0.00037632036213	0.3896475557158879	0.0022086077644865	0.3918309832788907	0.000659951039679	0.5364974382652419	2.422827703611755e-05	0.3314648474390144	7.615129566099755e-05	0.3336411888132418	0.0010103592755105	0.3185565990661566	0.0060976213255913	0.3205470436063734	TRPC4	125918	POSTN	145040	UFM1	605966	False	False	False	alt	-25	0.008484	-25	0.0918
977	chr13	37748922	G	T	rs11620255	0.0580772859999999	0.239752677997467	0.0580772859999999	0.2431926254647936	0.0183069546829534	0.5492268986571341	0.0010592973387593	0.307529989005735	0.0010592973387593	0.3119235769948252	0.0049519976246246	0.8323105225695684	0.0002764477612549	0.671977530125248	0.0002764477612549	0.6783086578789086	8.535351403583235e-05	0.8347545186092534	4.798819877360873e-06	0.6743941477774934	4.798819877360873e-06	0.6808266100962199	0.0010169575401668	0.6465938830605709	0.0010169575401668	0.6529487014103014	TRPC4	120880	POSTN	150078	UFM1	600928	False	False	False	alt	-75	0.02208	-100	0.1323
978	chr13	37778264	C	T	rs7330208	-0.144329285	0.0526127721014942	0.144329285	0.0520472376975692	0.0336937762402026	0.1747921774989865	-0.0052309729786073	0.0600778786834038	0.0052309729786073	0.0594804404977206	0.0298051862360198	0.53687170368001	-0.0041768578983129	0.267320456078553	0.0041768578983129	0.2631445964006938	0.0009788859965362	0.4438713563757354	-0.0001481795943676	0.217064280081352	0.0001481795943676	0.2134951925099945	-0.0106001121704991	0.1964445493320968	0.0106001121704991	0.1930001278520564	TRPC4	91538	POSTN	179420	UFM1	571586	False	False	False	ref	-100	0.01172	-5	0.013916
979	chr13	37779028	G	A	rs9566253	0.103944364	0.1055530208977721	0.103944364	0.1070441808187573	0.0286878292575448	0.2479868766059176	0.0032405042195328	0.1171877666999599	0.0032405042195328	0.1185190875235654	0.0135858269275179	0.687400157009275	0.0015686786526169	0.4319762046874323	0.0015686786526169	0.4373990467675926	0.0003892343355003	0.6220081321467931	4.854037089035256e-05	0.3818626893498711	4.854037089035256e-05	0.3869838501227004	0.0044851704001847	0.3761586221037649	0.0044851704001847	0.3812262377315309	TRPC4	90774	POSTN	180184	UFM1	570822	False	False	False	alt	65	0.00928	10	0.03387
980	chr13	37779963	C	T	rs1333376	-0.0330552574	0.4373212481170599	0.0330552574	0.4326459811288111	0.0308276790760002	0.2126641328540536	-0.0010984988400588	0.3425558545081675	0.0010984988400588	0.338914679846594	0.0237751971231565	0.5966827445750981	-0.0011559928253977	0.5396550621863819	0.0011559928253977	0.5337171361927693	0.0007848811912244	0.5093283943394749	-3.918458290512878e-05	0.470240547004346	3.918458290512878e-05	0.4647860036176733	-0.003373362805582	0.4860310513891298	0.003373362805582	0.4802587087745641	TRPC4	89839	POSTN	181119	UFM1	569887	False	False	False	ref	95	0.008575	50	0.1277
981	chr13	38036983	A	C	rs78587501	0.0007560628	0.7399410818846069	0.0120766424	0.7394895608616378	0.0123720823641651	0.8082038799082849	2.173300998192025e-05	0.7974677297297398	0.0001456272771867	0.7969943481463944	0.0033948071657153	0.8705725632059572	-4.710050385549457e-06	0.8791373598661105	4.287760950160864e-05	0.8782292244221434	4.175651688329717e-05	0.9024235503760836	-2.3849226576295204e-08	0.8998902740844349	5.016911725767962e-07	0.8990423278396877	-1.5670878558928283e-05	0.8652403168140944	0.000185576193461	0.8642871349162856	TRPC4	167181	UFM1	312867	POSTN	438139	False	False	False	alt	25	0.01372	50	0.02943
982	chr13	38290033	G	T	rs2652578	-0.0020268123379999	0.9270822834096732	0.0034210067779999	0.9228507378363864	0.0085161653585938	0.9536907975149091	-1.3883028846745289e-05	0.9644891783708748	2.6602446805130004e-05	0.9602110130519248	0.0001385635577842	0.999256609191312	-2.4853956682255665e-07	0.9940511980649552	3.060349669116327e-07	0.9985437520652848	1.2754865948699873e-06	0.9997535680907976	-2.053884920492696e-09	0.9935363411992538	2.578422957772261e-09	0.9991749286556356	-8.247830820494288e-07	0.9990077135948316	8.247830820494288e-07	0.9987402312178618	UFM1	59817	FREM2	397045	TRPC4	420231	False	False	False	ref	90	0.00903	-35	0.07947
983	chr13	38291192	A	G	rs9548286	-0.1172468922	0.0825460676549612	0.1172468922	0.0814276571953766	0.0296827653907659	0.2324012187675349	-0.0038945871514296	0.0936943062854379	0.0038945871514296	0.0927502460953769	0.0001633070502457	0.998842167208488	-2.5050466478496268e-05	0.9302861345520202	2.5050466478496268e-05	0.9232904479690132	5.93911939417864e-06	0.992143919854122	-9.615992623012607e-07	0.8851374417835143	9.615992623012607e-07	0.8782996439044747	-5.2786117251146095e-05	0.9556326237243112	5.2786117251146095e-05	0.948510696530014	UFM1	58658	FREM2	395886	TRPC4	421390	False	False	False	ref	-40	0.01704	-100	0.04608
984	chr13	38293102	A	C	rs665175	-0.0130787955	0.7344930644311675	0.0130787955	0.7278297126304978	0.0151524322364476	0.6706315504310935	-0.0001930827864339	0.7553770798850553	0.0001930827864339	0.7486309600003698	0.0002284649137276	0.9977623054389044	-2.793188803526576e-06	0.9935732509715892	2.793188803526576e-06	0.9869907303147536	3.264203358957705e-06	0.997504045045292	-3.8536966284047455e-08	0.994370674662622	3.8536966284047455e-08	0.9872751365808972	-8.247830820494212e-06	0.9933900224079294	8.247830820494212e-06	0.9896515844006588	UFM1	56748	FREM2	393976	TRPC4	423300	False	False	False	ref	-85	0.03162	85	0.0653
985	chr13	38293934	C	A	rs651360	-0.01442560914	0.6629862678067284	0.01631480406	0.6582681780347382	0.0836827506408671	0.0091375519139133	-0.0011949173463779	0.2730943201245501	0.0013430918671625	0.2706500115742224	0.0113094256210616	0.7144672070167403	-0.0001479992562497	0.7443143969273133	0.000161010025927	0.7401182409320558	0.0010267043121732	0.4547655754713761	-1.28177226138223e-05	0.5430014168293962	1.3838191460570007e-05	0.5390242611621601	-0.0005278611725116	0.7341992740290417	0.000585595988255	0.7300723477855734	UFM1	55916	FREM2	393144	TRPC4	424132	False	True	False	ref	95	0.1453	-100	0.1586
986	chr13	39982666	C	A	rs7322623	0.0812209708	0.148241718105768	0.0812209708	0.1504948194935156	0.0483039993022309	0.0642362761085311	0.0037481428256234	0.0814090538338788	0.0037481428256234	0.0823961454341729	0.2183547227079278	0.1610773105715988	0.0184765122298454	0.0912675986421894	0.0184765122298454	0.0931340927909471	0.0106295768144242	0.0693841905284845	0.0008622198888617	0.0591445087292849	0.0008622198888617	0.0602785515171661	0.0248993764639898	0.0715391281519195	0.0248993764639898	0.0729670160026479	COG6	327038	LHFPL6	379138	FOXO1	683975	False	False	False	alt	-100	0.05676	-45	0.1594
987	chr13	39990357	G	A	rs276423	-0.0594895301	0.257735237633776	0.0594895301	0.2543396826556923	0.0210390041927946	0.4474751644718849	-0.0014019934170976	0.3002889102577856	0.0014019934170976	0.2966635245225264	0.0041189667117547	0.8735855046899046	-0.0001960984955632	0.7452027687838974	0.0001960984955632	0.7386520930233719	8.24333271227467e-05	0.8606163011946348	-4.13015691042263e-06	0.7275949435370039	4.13015691042263e-06	0.721020648667387	-0.0006837451750189	0.7324952561446019	0.0006837451750189	0.7260033727844184	COG6	334729	LHFPL6	386829	FOXO1	676284	False	False	False	ref	90	0.02795	10	0.03113
988	chr13	40062244	C	T	rs277293	-0.2146692493999999	0.0286664606792604	0.2146692493999999	0.0284371620517184	0.0371536839085702	0.1337303053158671	-0.0089008266381808	0.0373671267909471	0.0089008266381808	0.0371016031411202	0.0517526640493549	0.5004484293446041	-0.0163787464297677	0.1725891860413825	0.0163787464297677	0.1700700627257836	0.0021167394246999	0.3769908054119953	-0.0006976046820692	0.1408793812738862	0.0006976046820692	0.138862439374108	-0.0283156279898386	0.1022658443567763	0.0283156279898386	0.1012171469793939	COG6	406616	LHFPL6	458716	FOXO1	604397	False	False	False	ref	-100	0.0119	-100	0.0654
989	chr13	43665632	T	C	rs9567243	-0.200423936	0.0254339571075676	0.200423936	0.0252255831987973	0.038249234738118	0.1244121184781732	-0.0080655635188641	0.031389931334495	0.0080655635188641	0.0312383726412079	0.1747591633400415	0.198903565472967	-0.0364283011260272	0.0451544619684842	0.0364283011260272	0.0442300164551313	0.0068532577751015	0.1200080856366203	-0.0014910025108157	0.0383508914418177	0.0014910025108157	0.0376402298872179	-0.0526904424136451	0.0193014148346448	0.0526904424136451	0.019051134389265	ENOX1	121340	LACC1	213653	CCDC122	214108	False	False	False	ref	90	0.2161	40	0.07983
990	chr13	43720364	G	A	rs12864863	-0.0250301211999999	0.3310889611174215	0.0448782892	0.3279910476259324	0.0188965771154587	0.5246992117945007	-0.0004644190439711	0.3721224195139246	0.0008499622314359	0.3689555986087507	0.0017600870970934	0.9345940143213994	-1.607810763370468e-05	0.8358600138706087	6.870905001970468e-05	0.8318531337907693	3.258035477368547e-05	0.9273510634415082	-2.52485123949864e-07	0.8262573854250717	1.2748213613713894e-06	0.8221759894090667	-9.07261390254e-05	0.8281486264470802	0.0002606314539275	0.8241641766221882	ENOX1	66608	LACC1	158921	CCDC122	159376	False	False	False	ref	40	0.0806	-100	0.0731
991	chr13	43743746	T	G	rs11147926	0.001660314	0.6105461471464494	0.0196202976	0.6119679244278108	0.0375046908583058	0.1293605449749421	3.3199864149820025e-05	0.4121742081494056	0.0007161696225181	0.4130597970096384	0.044092903566362	0.4624165460763617	3.1979943447559984e-05	0.5011538980369427	0.0008845152854464	0.5023250102040259	0.0016410291668408	0.3489867849589643	-6.13528410677782e-08	0.4094264036375941	3.213897483202593e-05	0.4105116717090847	0.000218567516743	0.4856557510837131	0.0024141400811586	0.48682933284294	ENOX1	43226	LACC1	135539	CCDC122	135994	False	False	False	alt	-20	0.00824	95	0.1222
992	chr13	43775613	T	C	rs11619519	0.0803350217999999	0.1549226407262641	0.0803350217999999	0.1572246798597151	0.1131983033495618	0.0024755659427486	0.0088768443099398	0.0252019726786735	0.0088768443099398	0.0253292684485532	0.0100673022994951	0.7295406171670219	0.0008769288993481	0.5078241984700461	0.0008769288993481	0.5137139270826948	0.0011512162658374	0.4227097373179608	9.888320278604513e-05	0.2671269569885303	9.888320278604513e-05	0.2712626997687751	0.0028925142687472	0.4551793194104487	0.0028925142687472	0.4609440694165955	ENOX1	11359	LACC1	103672	CCDC122	104127	False	True	False	alt	100	0.0542	100	0.2283
993	chr13	43777097	G	A	rs11147928	-0.284956564	0.0106038498698548	0.284956564	0.0105965435824501	0.0329608236906528	0.1829426765318487	-0.0097908693970311	0.0237482033163607	0.0097908693970311	0.0236699704660656	0.4136212926000461	0.064898573546386	-0.1177589841705831	0.0071314934212123	0.1177589841705831	0.0070120644415837	0.0132797859378179	0.0490084329045984	-0.0039089179881878	0.0120731005861511	0.0039089179881878	0.0119408176069489	-0.0921274454818382	0.0052042433746174	0.0921274454818382	0.0051915163971297	ENOX1	9875	LACC1	102188	CCDC122	102643	True	True	False	ref	-100	0.05792	35	0.11426
994	chr13	43777105	A	G	rs10870772	0.379977956	0.0061713946335265	0.379977956	0.0061193887826057	0.0390088781655918	0.1266416837538236	0.0177088762604441	0.0150713018779752	0.0177088762604441	0.0151884173849457	0.5311603048398271	0.0374727120017041	0.2097386229603858	0.002830098489807	0.2097386229603858	0.0027820900540697	0.021911143079364	0.0219408930845076	0.0102157642158429	0.0057525417418854	0.0102157642158429	0.0058199196346628	0.1170177493319256	0.0035457637403911	0.1170177493319256	0.0035219987771866	ENOX1	9867	LACC1	102180	CCDC122	102635	True	True	True	alt	-85	0.04993	40	0.0654
995	chr13	43836417	G	A	rs12872943	0.0108363107999999	0.6727573505679022	0.0148306412	0.6772208356231062	0.0166527513980679	0.6146871127543581	0.0001882718908687	0.670461507912462	0.0002532466175539	0.6748845367256373	0.0212893009138596	0.6012829039084912	0.0003392765656749	0.635301853108614	0.0003650227403375	0.6396540153266859	0.0003609358369009	0.6237729559871685	5.863600027222923e-06	0.6455751007178941	6.282406309632768e-06	0.6499672893071613	0.0011555210979512	0.6130092228348173	0.0012511959354689	0.6174334369875343	LACC1	42868	CCDC122	43323	ENSG00000281883	47384	False	False	False	alt	-10	0.005173	45	0.07794
996	chr13	43843305	G	T	rs2875541	0.01246384748	0.7064881678269013	0.0136809786	0.7107971481014418	0.0207688963996315	0.4571765657049425	0.0002395924229368	0.673284066709681	0.0002718109329984	0.6777750497472705	0.0018887532578931	0.9281055314592592	2.4599440795748324e-05	0.9091030203967964	2.6165476693128667e-05	0.9134708142775128	3.787159197191768e-05	0.9129015461088602	4.662884056792966e-07	0.8967046670628451	5.077427256423665e-07	0.9011126576796812	8.000395895876114e-05	0.917142610332514	8.495265745105772e-05	0.9214970111456188	LACC1	35980	CCDC122	36435	ENSG00000281883	40496	False	False	False	alt	-90	0.00757	35	0.03143
997	chr13	43877708	T	A	rs4942255	0.014677845132	0.5035395225281541	0.026934317388	0.5052969826647673	0.0184566194042878	0.5395998652601377	0.000276579873305	0.5187474857470312	0.0005437861770728	0.5204508112584842	0.1764796608491966	0.2004243067843968	0.0036904926215102	0.3168904912334683	0.0045082830976725	0.3181604439828401	0.0031558758049664	0.2366224645658789	7.173615002538783e-05	0.3401131355944057	8.948407184948369e-05	0.341305431184312	0.0050179802711886	0.3120043401281162	0.0072927320114809	0.3131774424897418	LACC1	1577	CCDC122	2032	ENSG00000281883	6093	False	False	False	alt	100	0.01136	-75	0.199
998	chr13	43890691	C	T	rs1445557	0.00647301356	0.7854389826715024	0.00960517736	0.7873741504961285	0.0141521063775009	0.7327219581146212	0.000112417299349	0.8017873219026317	0.0001527978563616	0.8038876001795643	0.0021015472930618	0.9158488026600724	1.2047055733999532e-05	0.9296253032199968	1.871289296283037e-05	0.9314322660567832	2.9544039637326696e-05	0.9302601843728988	2.0675980438272e-07	0.9334995660176096	2.928563893225611e-07	0.9353613616041978	5.4435683415231805e-05	0.9221940676932384	7.917917587671432e-05	0.9240939340722568	ENSG00000281883	6890	CCDC122	10951	LACC1	11406	False	False	False	alt	-100	0.05334	-80	0.10144
999	chr13	43901378	G	T	rs1373903	-0.0053610705999999	0.6574820651580974	0.0172843401999999	0.6605891403376154	0.0125459007681064	0.804498128894912	-7.530434193507303e-05	0.7323796034306861	0.0002269550351444	0.735738538691778	0.0057487380818844	0.804886601464724	-6.878664972100206e-05	0.8122005480661412	0.000126300378752	0.8161944509787756	7.236702659027171e-05	0.8489086868623723	-9.387895543322372e-07	0.8373726809140846	1.665132448897431e-06	0.8413857641838675	-0.0001938240242816	0.791135408392153	0.0004643528751937	0.7951284902944451	ENSG00000281883	17577	CCDC122	21638	LACC1	22093	False	False	False	ref	-60	0.01318	5	0.01532
1000	chr13	43904669	C	T	rs7994883	0.156236936	0.0434916802680207	0.156236936	0.0440062921906295	0.0361552139931225	0.1438753325756367	0.0058050253438635	0.0475533717360561	0.0058050253438635	0.0479894679086573	0.0172387911979149	0.6425034111057825	0.0028231205069294	0.3256403479610917	0.0028231205069294	0.3304051674806041	0.0006561234339665	0.5298617042466062	0.0001096841174438	0.2547343837513484	0.0001096841174438	0.2587695080784848	0.0074222229553626	0.2603717841381135	0.0074222229553626	0.2645010775564441	ENSG00000281883	20868	CCDC122	24929	LACC1	25384	False	False	False	alt	10	0.00058	100	0.03113
1001	chr13	49584803	A	G	rs1359541	0.10874063	0.1074174987848729	0.10874063	0.1088693770372754	0.0226541959799582	0.3821289308123456	0.0031874785222791	0.1514454819493786	0.0031874785222791	0.1532098363451654	0.6989236580779254	0.0157266957313675	0.078415970537913	0.0175201237374211	0.078415970537913	0.017720374110909	0.0162757875120822	0.0382876671753969	0.0023318455373134	0.0341917667623341	0.0023318455373134	0.0348206100979208	0.0216720002639305	0.093132279357475	0.0216720002639305	0.0949630794391312	RCBTB1	755	ARL11	43705	PHF11	89192	True	False	False	alt	85	0.0487	75	0.1299
1002	chr13	49602185	A	G	rs9316462	0.156911536	0.0458099896684848	0.156911536	0.0463199883705781	0.0465178416898204	0.070696109803421	0.0076024893097144	0.0346139259880289	0.0076024893097144	0.0348281740069697	0.0092433440005277	0.7680379479752313	0.0018869011566698	0.4464333476396383	0.0018869011566698	0.4517762840873171	0.000459980994939	0.6235081023119415	9.620175966278016e-05	0.33185949356028	9.620175966278016e-05	0.3365323042578413	0.0047161096631585	0.3940864663823133	0.0047161096631585	0.3992693805624891	RCBTB1	16627	ARL11	26323	EBPL	89301	False	False	False	alt	100	0.01782	-30	0.097
1003	chr13	53619055	C	T	rs4619272	0.0050801591999999	0.6834582045703925	0.0150622276	0.6842629349148271	0.0308390489015647	0.2111972678806583	0.000174934140733	0.5283064500101953	0.0004639487210151	0.5294398398551816	0.0008214839497211	0.9763902061426012	9.479943103461503e-06	0.9474764361933968	1.3331469396014769e-05	0.9487679992969058	2.594405360335541e-05	0.9450799446733164	3.074491381859025e-07	0.914069171962161	4.228865709112534e-07	0.9152179809242392	3.629045561017305e-05	0.9350278019060456	6.268351423575453e-05	0.9362697705050274	OLFM4	590241	PCDH8	770414	CNMD	879235	False	False	False	alt	100	0.0396	100	0.0625
1004	chr13	53668007	G	A	rs7989647	0.0437176644	0.3332788637818605	0.0437176644	0.3379894186080843	0.0218495918037312	0.4201998288799101	0.0009432900402831	0.3345531320532536	0.0009432900402831	0.339132949787478	0.0182705948335587	0.6292282826314148	0.0007285039441711	0.5152086733022577	0.0007285039441711	0.5208600804316013	0.0003991207434796	0.6056942991942637	1.577400561612812e-05	0.4970634082976453	1.577400561612812e-05	0.5026538817475867	0.0024124905149945	0.4744627717319069	0.0024124905149945	0.4799954476377773	OLFM4	639193	PCDH8	819366	CNMD	928187	False	False	False	alt	45	0.1442	35	0.01587
1005	chr13	53716198	C	T	rs2806731	-0.1517536487999999	0.0498420838983838	0.1517536487999999	0.0492695308921927	0.0359167532488503	0.1453721167024784	-0.0057470107295377	0.0529032903463487	0.0057470107295377	0.052371155005629	0.0153780805648113	0.6593485751177082	-0.0027419281305224	0.3527622290858514	0.0027419281305224	0.3478879676339987	0.0005832973024756	0.5473032348194755	-0.0001087101055519	0.2792307382658079	0.0001087101055519	0.2750918651059124	-0.0072366467619015	0.2844865972652887	0.0072366467619015	0.2800870732374277	OLFM4	687384	PCDH8	867557	CNMD	976378	False	False	False	ref	-100	0.02052	-75	0.02826
1006	chr13	53724171	G	A	rs2806738	-0.07424282054	0.1950423521950951	0.07424282054	0.1922580888715226	0.0137214611012777	0.751631288860967	-0.0010231050855014	0.3572217610631463	0.0010231050855014	0.3528441675291525	0.0188685625680445	0.6139104298137605	-0.0014674748565192	0.459370814628985	0.0014674748565192	0.454029364171114	0.0002594394032807	0.6681786903384983	-2.031050330726677e-05	0.5147343532453659	2.031050330726677e-05	0.5090693878871314	-0.0042979446405594	0.3999931411967334	0.0042979446405594	0.3948194219323146	OLFM4	695357	PCDH8	875530	CNMD	984351	False	False	False	ref	75	0.007294	-70	0.1724
1007	chr13	55165620	G	A	rs3120869	-0.078154827	0.170167553645557	0.078154827	0.1680438822668533	0.0297675677294992	0.2304184565721467	-0.0024691900011457	0.1575284372139633	0.0024691900011457	0.1556939780056921	0.0926338622942165	0.3365418612795273	-0.0085399639174917	0.204197968771241	0.0085399639174917	0.2009652225513876	0.0028887509028983	0.2691822258439897	-0.0002691888198864	0.1788185268168781	0.0002691888198864	0.1761475889118982	-0.0158655273663025	0.1485875946196496	0.0158655273663025	0.1462699743831188	PRR20A	1975299	PRR20B	1981869	PRR20D	1995013	False	False	False	ref	40	0.0727	-75	0.0886
1008	chr13	55250174	A	G	rs9527348	0.00499184594	0.6900971109633451	0.01455700394	0.6938033064729424	0.0095414584308138	0.9327950450045802	4.9015474260246815e-05	0.8019812674354682	0.0001390775647265	0.80593430620162	0.005041898980568	0.8277405061830018	2.339941878992138e-05	0.8258555738347443	6.963001740400139e-05	0.8299140435918991	4.741050417412232e-05	0.8961441193818882	2.2169998411631973e-07	0.8747992342495766	6.569906790228235e-07	0.8790714697412855	0.00010062353601	0.8087170550910142	0.0002903236448813	0.8127922930399898	PRR20A	1890745	PRR20B	1897315	PRR20D	1910459	False	False	False	alt	-100	0.01659	-40	0.0602
1009	chr13	55251042	T	G	rs3124390	0.46781792	0.0025642006971681	0.46781792	0.0025502798928325	0.0847832353295423	0.0089678178611691	0.0430489281151316	0.0021334367448729	0.0430489281151316	0.0021578317565406	0.1423847778034376	0.2430784640608768	0.0757860637112813	0.0200502367185696	0.0757860637112813	0.020388274106198	0.0128654749443836	0.0591417601740164	0.0073482718860582	0.008377588451613	0.0073482718860582	0.0083772434509818	0.0916515456434957	0.0065262634322938	0.0916515456434957	0.0065701583679807	PRR20A	1889877	PRR20B	1896447	PRR20D	1909591	False	True	True	alt	15	0.003906	50	0.1733
1010	chr13	55261356	C	T	rs9537039	-0.034389166	0.4242602567769261	0.034389166	0.4189523797137816	0.0563245349252602	0.0386895128782283	-0.0020249457471248	0.1860714424490019	0.0020249457471248	0.1835612055219544	0.003656263402725	0.8674328595085209	-0.000113756752468	0.7807447291957336	0.000113756752468	0.7740556425231279	0.0002104399608394	0.7163799055629129	-6.720968398635968e-06	0.6368322950973467	6.720968398635968e-06	0.6307342818451425	-0.0004173402395169	0.7718301625238809	0.0004173402395169	0.7651418623559338	PRR20A	1879563	PRR20B	1886133	PRR20D	1899277	False	False	False	ref	65	0.002274	-100	0.1096
1011	chr13	55268998	A	G	rs3098275	0.00771793998	0.7871635794435041	0.0095195157	0.7912174146517115	0.0130161085660046	0.7845707513307628	0.0001171574887165	0.8186718117093748	0.000137426726629	0.822964685546023	0.0628171290950479	0.3902183471278059	0.0004860462764469	0.589849130174666	0.0005902976641749	0.593852484875407	0.000816657349943	0.4728677051604332	7.348100827358166e-06	0.6364646715249755	8.521016379418192e-06	0.6406606902471624	0.0011505723994589	0.611101876135866	0.0013980073240737	0.6151949188990097	PRR20A	1871921	PRR20B	1878491	PRR20D	1891635	False	False	False	alt	75	0.007355	-5	0.006004
1012	chr13	55286759	T	C	rs3098269	0.0713729164	0.1800139332425622	0.0713729164	0.1827600797148841	0.0183598691324647	0.5489574222777266	0.0013294387332019	0.2547826205191329	0.0013294387332019	0.2582869413843709	0.0045866187192767	0.8378568668746668	0.0003384880688446	0.6377188222393676	0.0003384880688446	0.6438344716958416	8.190161526731315e-05	0.8369292424515306	6.087854152047587e-06	0.6399912050382058	6.087854152047587e-06	0.6460349253648264	0.0011579954471973	0.6139468220252791	0.0011579954471973	0.6200114317105624	PRR20A	1854160	PRR20B	1860730	PRR20D	1873874	False	False	False	alt	10	0.01706	100	0.1809
1013	chr13	55292856	T	C	rs3098265	0.0207336862	0.5756210721365389	0.0233184145999999	0.5789795318028098	0.021137330189834	0.4435828838489183	0.0005264694675189	0.563729093333529	0.0005772958753711	0.5666339557341759	0.0133953020355646	0.6923488087745703	0.0005069465724038	0.6961417983616561	0.0005185437834518	0.6996891611242703	0.0003093174197917	0.6723514582630172	1.3599417667573576e-05	0.6739914640870918	1.3827466609142676e-05	0.6776296530066398	0.0014252251657813	0.674169256708522	0.0014664643198838	0.6778472486710848	PRR20A	1848063	PRR20B	1854633	PRR20D	1867777	False	False	False	alt	45	0.04663	-100	0.1572
1014	chr13	55328403	G	A	rs3098271	-0.001113342072	0.8377412074068664	0.0070991696479999	0.8368333201799503	0.0191272515958338	0.5152652341020548	-2.5848289160096475e-05	0.8258516695634651	0.0001234009303506	0.8249404565328204	0.0064844445910725	0.82757380665653	-3.8132320297984336e-05	0.9038846167061418	4.5849518162376905e-05	0.9024579546649024	0.0001261056010907	0.8190898327015713	-6.903359952742858e-07	0.9000667250257173	8.234209709778829e-07	0.8987970575191236	-0.0001245422453894	0.9001631563938888	0.0001558840025073	0.8986138466698121	PRR20A	1812516	PRR20B	1819086	PRR20D	1832230	False	False	False	ref	30	0.006493	-90	0.1121
1015	chr13	55333351	T	C	rs1657205	-0.0592147539999999	0.248791056444333	0.0592147539999999	0.2454406263046993	0.018089463068308	0.5571292930215993	-0.0010999230863452	0.3198276210793453	0.0010999230863452	0.3156412346769598	0.0137664544224868	0.6771084570521402	-0.0007693915517929	0.5264457828074007	0.0007693915517929	0.5209652231902826	0.0002472769798373	0.6834221680138074	-1.4136177704904784e-05	0.5344915520017641	1.4136177704904784e-05	0.528830588172376	-0.0024397083567021	0.4862853292558473	0.0024397083567021	0.4807023022264607	PRR20A	1807568	PRR20B	1814138	PRR20D	1827282	False	False	False	ref	-20	0.003601	90	0.266
1016	chr13	55363211	C	T	rs3124426	0.0033946078	0.7514115578111383	0.0110797378	0.7533709772309158	0.0213282393331665	0.433882518302385	8.695588189558e-05	0.6844084372125437	0.0002393827769323	0.6864617151415409	0.0027069380752861	0.8964333955611404	2.677053325144912e-06	0.8981255277010113	2.87805676705702e-05	0.8996936831404729	5.68996206279817e-05	0.875864587898304	7.92602955713286e-08	0.8779171813407519	6.097137736415603e-07	0.8795674441515948	7.423047738437831e-06	0.8924451906986962	0.0001162944145689	0.8940385207796661	PRR20A	1777708	PRR20B	1784278	PRR20D	1797422	False	False	False	alt	-100	0.013336	70	0.05023
1017	chr13	55372303	A	G	rs9537096	-0.00604531236	0.8752434901096191	0.00604531236	0.8685944638133888	0.0141977638166467	0.7297011078701566	-8.452463689520066e-05	0.8862076482794609	8.452463689520066e-05	0.8795331377558797	0.0278570485962191	0.550883414702264	-0.0001580559752967	0.7499240912503691	0.0001580559752967	0.7433231756427277	0.0003918594678065	0.605361577795019	-2.2117375364219983e-06	0.7749409976348771	2.2117375364219983e-06	0.7683332414814866	-0.0004874468014911	0.7595935070379553	0.0004874468014911	0.7530392168441136	PRR20A	1768616	PRR20B	1775186	PRR20D	1788330	False	False	False	ref	-100	0.2069	-100	0.285
1018	chr13	55377716	A	C	rs4885824	-0.02423821376	0.5165611402997244	0.02789757584	0.5142502268405678	0.019728598309301	0.4949730336214654	-0.0004943655495067	0.5245779360878989	0.0005624922282368	0.5223966236222165	0.0033238758206591	0.8731413978892334	-7.635356803503659e-05	0.8245518891536583	9.5009809475781e-05	0.8232012981410162	6.506913547999227e-05	0.8615448080889102	-1.5667538194572896e-06	0.8119571198372312	1.9124970142049043e-06	0.8107576112684632	-0.0002457853584507	0.8142581616707067	0.0003381610636402	0.8129422413456598	PRR20A	1763203	PRR20B	1769773	PRR20D	1782917	False	False	False	ref	-50	0.03644	-80	0.313
1019	chr13	55403301	C	G	rs3124395	0.0792751718	0.1496151038286331	0.0792751718	0.1518410725476193	0.0319886028091718	0.1954503455044463	0.0026456998893484	0.1280934056597193	0.0026456998893484	0.1298485879859027	0.0331208142258585	0.5174079487191675	0.002677529397261	0.3242619200751273	0.002677529397261	0.3289679373612094	0.0010801905077132	0.4300861015596871	9.009967280878234e-05	0.2694875072124069	9.009967280878234e-05	0.2737312870731055	0.0074082016429678	0.2575976655844101	0.0074082016429678	0.2618493304967686	PRR20A	1737618	PRR20B	1744188	PRR20D	1757332	False	False	False	alt	40	0.001526	55	0.05396
1020	chr13	55405727	C	T	rs3105072	0.0182853197	0.6155449327972599	0.0182853197	0.6218520206778685	0.0195097860357476	0.4992773167681488	0.0003732061046909	0.5787578391459006	0.0003732061046909	0.5849115831928795	0.0016899805351192	0.935697588465904	3.088166887333701e-05	0.8881694309442077	3.088166887333701e-05	0.8950963286885676	3.295553218859639e-05	0.9239490641697028	6.271543019992907e-07	0.8736744618137071	6.271543019992907e-07	0.8806740208127272	0.0001245422453894	0.8825469753296954	0.0001245422453894	0.8895209874915311	PRR20A	1735192	PRR20B	1741762	PRR20D	1754906	False	False	False	alt	25	0.0631	55	0.04498
1021	chr13	55406060	C	T	rs4242982	0.00597148402	0.8600730739321161	0.00597148402	0.8668808510372116	0.0413281370124199	0.0995624516317387	0.000257538461676	0.6777386184103716	0.000257538461676	0.6845497044764078	0.0024949688231994	0.9025814754101416	1.4615033900222729e-05	0.9331757039777064	1.4615033900222729e-05	0.9401501390814908	0.0001023677537089	0.8041642439517179	6.245614163949595e-07	0.8736431122693319	6.245614163949595e-07	0.880586927354165	6.103394807165704e-05	0.927729184924294	6.103394807165704e-05	0.9346761408241984	PRR20A	1734859	PRR20B	1741429	PRR20D	1754573	False	False	False	alt	-80	0.06274	30	0.0537
1022	chr13	55421579	T	A	rs3105090	0.006475671138	0.818370689056257	0.008271863582	0.8225671777811817	0.0149543994848501	0.6920670282045941	9.571670561381596e-05	0.8384088413292899	0.000120611212325	0.8423928629053014	0.0015802843852066	0.9359273829908988	1.0260232598095297e-05	0.95285801560464	1.1679319391096778e-05	0.9571559933341162	2.3816482274764365e-05	0.941966281970627	1.5093209730960502e-07	0.9558301691779342	1.7064002262739616e-07	0.9600574669633318	3.299132328197689e-05	0.9564621405709176	3.7940021774273376e-05	0.9597363164954872	PRR20A	1719340	PRR20B	1725910	PRR20D	1739054	False	False	False	alt	0	0.0	-100	0.0819
1023	chr13	55503184	T	C	rs73191591	0.0035224606199999	0.7426618251990244	0.01208319058	0.7418579174319432	0.0087957259285756	0.9479351016776976	3.517248550980566e-05	0.843323212371546	0.0001137431674898	0.8422359047690657	0.0009666457721618	0.966431449760216	1.1352636358655189e-05	0.9450142099832276	1.7101253247177522e-05	0.9435725821746656	9.050534740641208e-06	0.9830146514047662	1.1728101485936697e-07	0.961824567762582	1.700555726732314e-07	0.960816363456334	3.2166540199908104e-05	0.9478646156834448	5.6910032661390745e-05	0.946377740133414	PRR20A	1637735	PRR20B	1644305	PRR20D	1657449	False	False	False	alt	60	0.00644	25	0.04688
1024	chr13	55551859	T	C	rs73193533	0.0378159764	0.0906840904225682	0.1182623084	0.0916774348998396	0.0273776550913691	0.2749779243161437	0.0011452204561858	0.1143901828838301	0.0034181760478179	0.1153256746592557	0.0234939460921776	0.6316358342842716	-0.0010228239083863	0.3594834937130095	0.0041857118677414	0.3610697132735546	0.0006742404938675	0.5698104374103297	-2.5452952565837887e-05	0.3293151083017828	0.000121710629915	0.3309904684878352	-0.0018945267394675	0.2780306981782295	0.0096392398799115	0.2794587830136736	PRR20A	1589060	PRR20B	1595630	PRR20D	1608774	False	False	False	alt	80	0.1406	-70	0.162
1025	chr13	55587333	G	A	rs112311254	0.09205789	0.0764209186773443	0.124631266	0.0768046025391106	0.0428063717774929	0.0955402205369412	0.0057795963023529	0.0601250518719244	0.0063329261826852	0.0603497771265943	0.0146852627758899	0.6932211540635771	0.0014887656478817	0.4178517758605889	0.0018221723196046	0.4214521471435992	0.0006870261940153	0.5617361939042022	9.294146159651316e-05	0.3139689817322091	9.860510170647628e-05	0.3170410054595787	0.0039317409521295	0.3573456066455635	0.0050534459437167	0.3607058958088652	PRR20A	1553586	PRR20B	1560156	PRR20D	1573300	False	False	False	alt	-60	0.0254	100	0.2314
1026	chr13	55587944	G	A	rs611686	-0.0735788084	0.2078261573942186	0.0735788084	0.2053906066705197	0.0213898831776621	0.4335697552394193	-0.0017283597693356	0.2543392611489005	0.0017283597693356	0.2511038095593352	0.0030079839002341	0.9112390166191272	-0.0001486000415773	0.8024512024949932	0.0001486000415773	0.7957419939062997	6.244111326506833e-05	0.8993879220983979	-3.145882851229021e-06	0.7828665146676855	3.145882851229021e-06	0.776238223386879	-0.0004923954999834	0.797463199033145	0.0004923954999834	0.7907143452236303	PRR20A	1552975	PRR20B	1559545	PRR20D	1572689	False	False	False	ref	-95	0.3977	-95	0.3232
1027	chr13	55607494	C	A	rs73193578	0.002540558426	0.8705072527148724	0.005258231934	0.8700242802006806	0.0136126273111884	0.7584655372910272	3.762926694023096e-05	0.8856823482845181	7.150344681912904e-05	0.8849935463172597	0.0027490020124706	0.8945043856692451	2.50653552492223e-06	0.9512365862541208	1.2808694728198457e-05	0.9500001427711892	3.715440263379569e-05	0.9159272067909092	4.649052873796127e-08	0.956330786092262	1.7373521320276938e-07	0.9550906662951916	1.6495661640975315e-05	0.9427674929330068	5.938438190754492e-05	0.9415452977008256	PRR20A	1533425	PRR20B	1539995	PRR20D	1553139	False	False	False	alt	10	0.003601	50	0.02069
1028	chr13	56115935	T	C	rs517462	0.2273232299999999	0.0193326679615409	0.2273232299999999	0.0194726238455411	0.0455010074415897	0.0763958782254612	0.011096149545629	0.0205619062352682	0.011096149545629	0.0206218522378541	0.0500552604664972	0.4426651639600827	0.0125306714502138	0.1371049129354586	0.0125306714502138	0.1396469032669952	0.0024142754859712	0.2907851956883267	0.0006509809109835	0.0898373973833565	0.0006509809109835	0.0914129097387712	0.0247624624723697	0.0747492469783944	0.0247624624723697	0.0761242330825228	PRR20A	1024984	PRR20B	1031554	PRR20D	1044698	False	True	False	alt	-45	0.05515	5	0.0003052
1029	chr13	56148317	C	T	rs3121501	0.0139638258199999	0.6748451059603308	0.0152865111799999	0.6797336745387627	0.022921701479733	0.3864161919564615	0.0003353307987662	0.6042073546870256	0.0003616514267876	0.6088727199282209	0.0010664445250898	0.9633052973462224	2.0112753291769365e-05	0.9266616888632973	2.121459109161321e-05	0.931112122045776	2.459634049239032e-05	0.9443692515238842	4.812539709365383e-07	0.9070250664198732	5.031798677244497e-07	0.9114186120923536	7.010656197419555e-05	0.9302962880803596	7.175612813829436e-05	0.9352035680006232	PRR20A	992602	PRR20B	999172	PRR20D	1012316	False	False	False	alt	100	0.003265	100	0.0967
1030	chr13	56229052	T	G	rs2137410	-0.0085373238	0.8155773926026536	0.0085373238	0.8087408914780377	0.017673421135866	0.5707483609207045	-0.0001602117401801	0.7870094490568015	0.0001602117401801	0.7802672711462432	0.0033956319487974	0.8705475977257748	-2.760658497389772e-05	0.9102207996513398	2.760658497389772e-05	0.9032748636296368	5.950102543037464e-05	0.8701588493119902	-5.23279288487147e-07	0.9023047851783678	5.23279288487147e-07	0.8953434816320291	-0.0001162944145689	0.9031671973429756	0.0001162944145689	0.8962635371172719	PRR20A	911867	PRR20B	918437	PRR20D	931581	False	False	False	ref	-100	0.06287	45	0.0737
1031	chr13	56237999	C	A	rs9569448	0.0037214167199999	0.6716367419864313	0.01569862192	0.6733429734438394	0.0124804035803035	0.7917773881927447	3.954057523626999e-05	0.7381121726988448	0.0001969278347155	0.7398194289401001	0.3056943023984692	0.1067913046398192	0.0010028422713075	0.2639260593542206	0.004423898343054	0.2649202816345237	0.003516513816533	0.2168522369911965	1.0098773591062132e-05	0.3435944306883143	5.2987575344270455e-05	0.3445924386067214	0.0012371746230741	0.3470565714287841	0.0050377750651578	0.3479964163901353	PRR20A	902920	PRR20B	909490	PRR20D	922634	False	False	False	alt	100	0.0834	100	0.2388
1032	chr13	56355578	C	T	rs9597389	-0.2013092765999999	0.0330365593708375	0.2013092765999999	0.0327228775192857	0.0561851904109506	0.0394812391901908	-0.0123864341769429	0.0236464045793972	0.0123864341769429	0.023474582071311	0.0333385569595195	0.5279926338706222	-0.0071154779461395	0.2340247514462975	0.0071154779461395	0.2304284781878921	0.0018881607853405	0.3384124141406167	-0.0004343860780361	0.1384383106727693	0.0004343860780361	0.1360820334623372	-0.0150762099567813	0.1627859309050318	0.0150762099567813	0.1602504028490917	PRR20A	785341	PRR20B	791911	PRR20D	805055	False	False	False	ref	-10	0.002472	95	0.02832
1033	chr13	56365881	T	C	rs2784002	0.0418391344	0.3586440604089973	0.0418391344	0.3633427223074588	0.0239067197156853	0.3592050659245667	0.0010687969018891	0.3351931510974365	0.0010687969018891	0.3394683233105112	0.0038492626439246	0.8575750448504016	0.0001815876391242	0.7311587046802562	0.0001815876391242	0.7376424758438443	9.27732285708794e-05	0.8238589789136015	4.716491963272614e-06	0.6958302797374276	4.716491963272614e-06	0.7021301702949767	0.0006730229949522	0.7063832868951322	0.0006730229949522	0.7127099813615192	PRR20A	775038	PRR20B	781608	PRR20D	794752	False	False	False	alt	-95	0.008606	40	0.03583
1034	chr13	56370450	C	A	rs9591754	-0.0365274431999999	0.1931083616190959	0.0709956712	0.1919544280870385	0.0281909796737858	0.2582590897423292	-0.0012160050732619	0.1868241810797213	0.0020774412333346	0.185685133891946	0.0042674276665236	0.8415123466175081	-0.0001280682787237	0.6662404155856009	0.0003165512957415	0.6626062282237632	0.000119504457895	0.7852724708746893	-4.404070528316788e-06	0.6085154817076334	9.11467207666757e-06	0.604915713727603	-0.0005088911616244	0.645671006948175	0.0011060341130282	0.6419648785586167	PRR20A	770469	PRR20B	777039	PRR20D	790183	False	False	False	ref	95	0.0345	-55	0.04883
1035	chr13	56391810	A	T	rs9316851	-0.0205400042	0.4560979260805979	0.032867935	0.4544132289709118	0.017412418122253	0.5811911664195438	-0.0004222977380672	0.5070560706284288	0.0006364717789506	0.5057066304856865	0.0222930619247137	0.5855333152433057	-0.0006701037151935	0.5410576081562591	0.0009262304802286	0.5391266824597957	0.0004082602019745	0.603190949906428	-1.4232783624256286e-05	0.5545580659586347	1.8835057451070328e-05	0.5528381514962176	-0.0017749331925703	0.5084279175114307	0.0026129128039325	0.5063004360374308	PRR20A	749109	PRR20B	755679	PRR20D	768823	False	False	False	ref	-45	0.01335	65	0.1099
1036	chr13	56405802	C	G	rs59918226	0.1081805127999999	0.1011683458444137	0.1081805127999999	0.1025761746459446	0.0344654417368859	0.1651386116946389	0.0040185799541182	0.0941841340769758	0.0040185799541182	0.0954163144709039	0.0031069578700801	0.8870912847417729	0.0004064188438151	0.636288646761432	0.0004064188438151	0.6424321462039458	0.0001098125903369	0.8072915800691054	1.5093779076377774e-05	0.550530233747437	1.5093779076377774e-05	0.5563437161558002	0.0012421233215664	0.620558741618468	0.0012421233215664	0.6267921448409546	PRR20A	735117	PRR20B	741687	PRR20D	754831	False	False	False	alt	-40	0.00964	35	0.0631
1037	chr13	56417466	G	A	rs9316853	-0.0926732036	0.1285880670643921	0.0980788124	0.1275681479119995	0.0713200736806319	0.0165668682962593	-0.0067818142817206	0.0461489889723281	0.0071234234524995	0.0461297803269227	0.0103584507274586	0.7330331446462903	-0.0009717368901792	0.5135338186612155	0.0010037485956399	0.5095938252685742	0.0007928699254643	0.5063834098825909	-7.610296480743098e-05	0.3276658680907317	7.812595468420218e-05	0.3244956350947962	-0.0030104582494803	0.4611614457115633	0.0031655174689056	0.4572635475324614	PRR20A	723453	PRR20B	730023	PRR20D	743167	False	True	False	ref	55	0.0738	80	0.03235
1038	chr13	56420701	G	C	rs12872193	0.0544476174	0.2501553464945884	0.0544476174	0.2539406956497579	0.0615949479693836	0.0280033389703797	0.003319436586037	0.0922007428291633	0.003319436586037	0.0933634801992933	0.0085521757777704	0.7486765914839183	0.0004565704822181	0.5800417693314166	0.0004565704822181	0.5860161500878164	0.0005372285339152	0.5531287835873194	2.8397105188117937e-05	0.4129566456774851	2.8397105188117937e-05	0.4184004026699017	0.0016520405133449	0.5428621709815687	0.0016520405133449	0.5487313631182341	PRR20A	720218	PRR20B	726788	PRR20D	739932	False	False	False	alt	-90	0.00946	-40	0.0324
1039	chr13	56424533	C	T	rs9597405	-0.0795996252	0.1617614343889296	0.0795996252	0.1597783278076244	0.0340527100811933	0.1668025793986853	-0.0026592488820249	0.1387062814515853	0.0026592488820249	0.137080493896933	0.0067854904160205	0.7871536695142981	-0.0004780006225833	0.6024359828500605	0.0004780006225833	0.5962929281058096	0.0002298715527965	0.6963707396036459	-1.5582053794648204e-05	0.5212375910553835	1.5582053794648204e-05	0.5154487901262284	-0.0016685361749859	0.5692756769695289	0.0016685361749859	0.5632332877811822	PRR20A	716386	PRR20B	722956	PRR20D	736100	False	False	False	ref	-25	0.001526	-25	0.06018
1040	chr13	56429773	C	G	rs4885970	-0.0075762063999999	0.6822778699394044	0.014801234	0.6805920702880609	0.0130023877073637	0.7866395511177708	-0.0001064735042151	0.7453237756556208	0.0001905261843446	0.7434634696810531	0.0028793177394344	0.8879333312927165	-3.626552899773157e-05	0.8681501310066319	5.008835994629004e-05	0.8663410997453886	3.807694062667324e-05	0.9148203037734236	-4.975448510179805e-07	0.8875151159726706	6.588765426182615e-07	0.8856916707481632	-0.0001294909438817	0.8653510556384241	0.0001888753257892	0.8635892048143713	PRR20A	711146	PRR20B	717716	PRR20D	730860	False	False	False	ref	15	0.003174	-80	0.1459
1041	chr13	56437181	C	A	rs71428219	-0.0046954857919999	0.8014776800772674	0.009094912992	0.7971077698965223	0.0153113845183781	0.6766251637582026	-7.843555241163753e-05	0.8127286043633898	0.0001357583547235	0.808422398644825	0.0019530863382929	0.925062249732168	-1.4170567499577114e-05	0.9323965255270862	2.1318856274465085e-05	0.9282087531989032	3.08225219994963e-05	0.9304241475150284	-2.433109428879907e-07	0.9351232339837388	3.364503316861993e-07	0.9307431140654826	-6.103394807163902e-05	0.935217551214924	7.588004354852856e-05	0.9311412468752832	PRR20A	703738	PRR20B	710308	PRR20D	723452	False	False	False	ref	-65	0.01593	-100	0.03043
1042	chr13	56439331	C	T	rs9597412	0.0061573990799999	0.7196254621979826	0.0117888413199999	0.7200442888224702	0.0155329315124956	0.6661387798916211	9.297280614258054e-05	0.7429836507192839	0.0001823549179559	0.7432074549887112	0.0032034574906799	0.8733924181731789	2.54835673881159e-05	0.8815399699724898	3.846979328118986e-05	0.8810945312435443	4.8955780932040816e-05	0.8862298550455946	3.9348468129284453e-07	0.8869091030878938	5.919403919981621e-07	0.8864839141840801	0.0001245422453894	0.8817219859668518	0.0001591831348355	0.8813037399016169	PRR20A	701588	PRR20B	708158	PRR20D	721302	False	False	False	alt	25	0.03162	-100	0.06104
1043	chr13	56461901	G	T	rs12853934	-0.0008542208	0.7244937975389061	0.011606094	0.7254217711175589	0.0137129792428102	0.752742590049587	-1.067682969136648e-05	0.7756233470517588	0.0001516558793792	0.7766701280805607	0.0120434825640856	0.696840921126264	-1.7180227987355355e-05	0.7442906072957706	0.0001829213385886	0.7453391097818087	0.0001594424487798	0.7456548505208843	-2.5173352184904254e-07	0.7748195953150957	2.371490474472762e-06	0.7758573182224144	-9.897396984591868e-05	0.7263116657715671	0.0006796212596086	0.727292143647225	PRR20A	679018	PRR20B	685588	PRR20D	698732	False	False	False	ref	-100	0.0678	35	0.01181
1044	chr13	56497855	T	C	rs13378557	-0.0193211708799999	0.4543457803029166	0.03212486168	0.4522908645733411	0.0168875905252577	0.6042779783253149	-0.0004362632161861	0.494376208124292	0.0006499881921163	0.4930968959291933	0.027989013889347	0.643237817130626	-0.00165660414235	0.5533490157156656	0.0016880365498971	0.5507434384742449	0.0005793611895038	0.651762596850462	-3.6023108765979415e-05	0.5639946208335759	3.656813346861993e-05	0.5614185159022398	-0.0038665830886476	0.4993307015000259	0.0040051466464319	0.4967239960232434	PRR20A	643064	PRR20B	649634	PRR20D	662778	False	False	False	ref	-65	0.05908	-85	0.289
1045	chr13	56500393	A	T	rs12874445	-0.00371442457	0.8969128460617968	0.00476491377	0.8950620721845938	0.0436344351437188	0.1024096524770196	-0.0002712328404781	0.7119114012886517	0.0003239709325257	0.7102617800515119	0.0019242189304212	0.919411095952272	-6.640654709274241e-06	0.9723798393372748	7.54123418774388e-06	0.9706573174813762	6.659722298508398e-05	0.8603565265204648	-3.955145224131489e-07	0.9386614862484468	4.3434444312892e-07	0.9369424553886332	-2.226914321533449e-05	0.971175383725736	2.721784170763089e-05	0.9695049318978608	PRR20A	640526	PRR20B	647096	PRR20D	660240	False	False	False	ref	-100	0.02052	50	0.04593
1046	chr13	56514323	A	C	rs1341548	-0.0219970276999999	0.5706171767371478	0.0219970276999999	0.5641869849748729	0.0439948295050545	0.0826249674691293	-0.0009491761042132	0.3385862631203086	0.0009491761042132	0.3339638877187295	0.0159760482992972	0.6521463486447685	-0.0003293892773222	0.6435568422398881	0.0003293892773222	0.6372777782967521	0.00070442102717	0.5085872513974439	-1.4274452815500085e-05	0.5252177216794389	1.4274452815500085e-05	0.5195733152904781	-0.0011513971825409	0.6227079297277741	0.0011513971825409	0.6166033044653997	PRR20A	626596	PRR20B	633166	PRR20D	646310	False	False	False	ref	80	0.00914	80	0.0934
1047	chr13	57898128	A	C	rs34927497	-0.0239840544	0.547205655333275	0.0239840544	0.541020649390727	0.0281045842103212	0.2600442165114845	-0.0006735641778644	0.4363314647954712	0.0006735641778644	0.4309686125317315	0.0066139355349542	0.7941087814932754	-0.0001784437460558	0.7507264660709708	0.0001784437460558	0.74413571908397	0.0001873715925425	0.7332048088304604	-5.012351637076819e-06	0.696122088325474	5.012351637076819e-06	0.6896857849737492	-0.0006499290686549	0.7356482252939055	0.0006499290686549	0.7291623379706392	PCDH17	266383	PRR20E	730930	PRR20D	737495	False	False	False	ref	55	0.014244	-40	0.02397
1048	chr13	57972643	A	G	rs9563564	-0.0283945153	0.3575927473009008	0.0425909081	0.3553269441320538	0.0207146411335696	0.454677400966587	-0.0006282930633117	0.3721254093693034	0.0009140715178961	0.3699333201281679	0.0002218666490712	0.9978261238033368	-6.687807226995085e-06	0.9649262261177876	9.49795395137723e-06	0.9609798724202164	4.461606126489146e-06	0.9959591511346696	-1.3947488212334096e-07	0.9541195692092116	1.9604413841666178e-07	0.95024408240284	-1.567087855893899e-05	0.9740206604226552	2.556827554353205e-05	0.9700437277012376	PCDH17	340898	PRR20E	805445	PRR20D	812010	False	False	False	ref	-75	0.005337	-20	0.03113
1049	chr13	57978174	A	G	rs9569791	-0.0077884829999999	0.4459873997638394	0.031923285	0.4456071879162229	0.0344795441274306	0.1605490640887792	-0.0002433469032051	0.3156556861138828	0.0010852853923368	0.3158367268018717	0.0053544917686647	0.8278749519767983	1.616897979624085e-05	0.7634870750841024	0.0001197958109115	0.7645523355555502	0.0001882428604741	0.7370800206550394	6.37185910452817e-07	0.681916073942102	4.159670821431589e-06	0.6829257345785934	3.5465672528120006e-05	0.7546591611933984	0.0004495067797169	0.7557055240335454	PCDH17	346429	PRR20E	810976	PRR20D	817541	False	False	False	ref	-75	0.02055	-50	0.0668
1050	chr13	57983580	G	A	rs9569794	-0.049074341	0.3048919715848688	0.049074341	0.3008430124187763	0.0191399118485633	0.5140295926521415	-0.0009975931251076	0.346123894973959	0.0009975931251076	0.3416567412136716	0.0069809640064662	0.7795902037998342	-0.0003098811093943	0.6528037625161774	0.0003098811093943	0.6467525757163034	0.0001254851890003	0.7779328153675493	-6.071067097883055e-06	0.6478319428022533	6.071067097883055e-06	0.6418302847613512	-0.0011250041239153	0.6238309662581842	0.0011250041239153	0.617783596079966	PCDH17	351835	PRR20E	816382	PRR20D	822947	False	False	False	ref	100	0.00824	60	0.05304
1051	chr13	58011963	G	T	rs9316967	-0.034955934	0.214102209262663	0.06432831	0.213663397654143	0.0307383982343342	0.2124522529157299	-0.0011132379983651	0.1784193038041038	0.0020062820715456	0.1782063336508122	0.0166927847975982	0.6494671450535775	-0.0006275888530833	0.4794340232088107	0.0011522687540849	0.4784045326882733	0.0005145898661508	0.5681331344308278	-2.003195851111245e-05	0.415466405460154	3.598454229630777e-05	0.4147151398147639	-0.0016149252746527	0.4252691887712678	0.003472336775428	0.4244045206820842	PCDH17	380218	PRR20E	844765	PRR20D	851330	False	False	False	ref	-95	0.02307	-100	0.1559
1052	chr13	58042891	A	G	rs9634882	0.0695072296	0.2133915723295396	0.0695072296	0.2162653369943696	0.0294294751076159	0.2344206348913866	0.002068498450091	0.1923918630098567	0.002068498450091	0.1950482760037984	0.0033659397578436	0.8835921606992811	0.0003531399480091	0.6957894642434237	0.0003531399480091	0.7021251667314925	9.995893155117253e-05	0.8257688272294552	1.0719101582719807e-05	0.6356515973377558	1.0719101582719807e-05	0.64187141818462	0.0010507736465309	0.6754814758269874	0.0010507736465309	0.6817178807632268	PCDH17	411146	PRR20E	875693	PRR20D	882258	False	False	False	alt	-95	0.0638	-95	0.0834
1053	chr13	58052335	A	G	rs11148423	0.0391725062	0.259021273590578	0.0537495402	0.2610532898437647	0.0190194958921749	0.5162108611371572	0.0008059492042285	0.3194766545352895	0.0010060099021134	0.3221726830407017	0.0088952855399029	0.7454902428237598	0.0004027746607316	0.5894510475558442	0.0004784587603645	0.5936680470233687	0.0001757665674779	0.739231514511485	8.027657182436713e-06	0.5878982800048825	9.066374226732486e-06	0.591968756901397	0.001470588235294	0.5478466243263563	0.0017592623140113	0.5521719057233109	PCDH17	420590	PRR20E	885137	PRR20D	891702	False	False	False	alt	100	0.1105	-30	0.04382
1054	chr13	58057801	T	C	rs7998206	-0.0363632947999999	0.4092320725062892	0.0363632947999999	0.4043308289897997	0.0129553274583435	0.7782437204012363	-0.0004975335920418	0.5280193315578042	0.0004975335920418	0.5224830782602452	0.0609861106528982	0.4028915314470621	-0.001896115751308	0.3918550521065471	0.001896115751308	0.3867915683584987	0.0007520857804917	0.4916883741668449	-2.5253830006010123e-05	0.4567415268856198	2.5253830006010123e-05	0.4511715505406845	-0.0046435287519382	0.366796784798935	0.0046435287519382	0.3616876012276186	PCDH17	426056	PRR20E	890603	PRR20D	897168	False	False	False	ref	90	0.05646	80	0.1924
1055	chr13	58082465	T	C	rs9563574	0.4548055059999999	0.00253442987161	0.4548055059999999	0.0025440691948875	0.0773620221753195	0.0123594419412579	0.0361247732712309	0.0024883586602767	0.0361247732712309	0.0024929865214567	0.0733009468509781	0.3787609873194085	0.0371042275456743	0.0489869559407595	0.0371042275456743	0.049916923083937	0.0056250427917835	0.154092586470806	0.0028977272968706	0.0204922503287095	0.0028977272968706	0.0208778014906821	0.0531935600936953	0.0212318507401776	0.0531935600936953	0.0215445943972034	PCDH17	450720	PRR20E	915267	PRR20D	921832	False	True	True	alt	-50	0.0741	-100	0.02979
1056	chr13	58092895	A	C	rs9569815	-0.013861962262	0.7112250834401614	0.013948291098	0.7067549499274143	0.0194761113124652	0.502042371949297	-0.0002660627260024	0.6930716909326694	0.000267705369204	0.688403193224203	0.0097505855959881	0.7451142946579433	-7.23509862118786e-05	0.8458074841558845	7.469426255954918e-05	0.8413726514367973	0.0001883085781057	0.7377972412725164	-1.3927047678747905e-06	0.8335911753691606	1.437292036327861e-06	0.8290972886100478	-0.0002639305862557	0.8367961852729708	0.0002771271155685	0.8324248174732423	PCDH17	461150	PRR20E	925697	PRR20D	932262	False	False	False	ref	-100	0.02216	-35	0.0561
1057	chr13	58103245	T	C	rs34723208	-0.0044032787	0.8535587763961833	0.00661443498	0.8518152534538567	0.0107768757422586	0.8681447891848799	-5.4313026281047535e-05	0.8857304409299818	7.907280362399769e-05	0.8840359791945454	0.002654976741117	0.8963324439499071	-1.0525392526472795e-05	0.9340076596499656	1.682913662951912e-05	0.9323140842684596	2.8048745085159e-05	0.9333277955076236	-1.0986148205980826e-07	0.9500201765990772	1.8409007918845345e-07	0.9484711210176056	-4.783741875885308e-05	0.926839706595011	7.752960971263213e-05	0.9251328861841058	PCDH17	471500	PRR20E	936047	PRR20D	942612	False	False	False	ref	-5	3.05e-05	0	0.0
1058	chr13	58108334	A	C	rs7989885	-0.0042934933399999	0.6963984961599391	0.0137148913399999	0.6943628356583103	0.0134043270376696	0.7585229446709268	-7.664952189885297e-05	0.7351601110948026	0.000193848183396	0.7330876345373358	0.033529906634555	0.5440676603301388	0.0001028020970067	0.6289939908172218	0.0004475504589224	0.6275203500464094	0.0004280464894159	0.6157084757721227	8.064886632819802e-07	0.6706391129748337	5.912097807357549e-06	0.6691450902804115	-6.680742964598003e-05	0.6253684124111458	0.0012165550460228	0.6238677791218377	PCDH17	476589	PRR20E	941136	PRR20D	947701	False	False	False	ref	-100	0.05157	-90	0.2588
1059	chr13	58166221	A	C	rs4886061	-0.0226019908999999	0.4339006758728547	0.0318300109	0.4299255667838727	0.0216861912724443	0.4224833961000577	-0.0003569370260226	0.4435506668754562	0.0006599435773618	0.4401801132920437	0.6470151100260632	0.0211267731359617	-0.014251327227453	0.0930969898711786	0.0202948569105304	0.0919483221824157	0.0141178096659959	0.0449620476609023	-0.0002256889492074	0.1191912948103567	0.0004241311995664	0.1178865438384397	-0.0056794563029922	0.2655009804542245	0.0079509089109564	0.2624680097795255	PCDH17	534476	PRR20E	999023	PRR20D	1005588	False	False	False	ref	-95	0.06067	40	0.0476
1060	chr13	58166222	A	C	rs66514580	-0.0164177500799999	0.5606711219818771	0.02275811968	0.5563094778193417	0.0233583891903986	0.377231042290701	-0.0003533543518705	0.5341526253074563	0.0004680628422844	0.5299119276660096	0.6450809936986572	0.0213617864128121	-0.0103694056149002	0.1228819076912578	0.0146998700907936	0.1213169099369928	0.0150692174973333	0.0397085221968827	-0.0002238620430046	0.1410815480287231	0.0003022077981506	0.1393461397036027	-0.0040744284253241	0.335039256236015	0.0054336709445415	0.3314127582809523	PCDH17	534477	PRR20E	999024	PRR20D	1005589	False	False	False	ref	-95	0.0641	40	0.05005
1061	chr13	58246923	T	G	rs4884299	0.02605367242	0.4747745644016387	0.03479612838	0.4745797533659395	0.013782647511215	0.734970416272327	0.0004924484264221	0.571870854020138	0.0006123517526142	0.5712512525901378	0.0044554782092309	0.8449621658607516	0.0001648023823776	0.8001542688340579	0.0001925274943171	0.7990218535695167	6.4787461047375e-05	0.8701631673019397	3.158842783437728e-06	0.8122188894526563	3.5428800775429825e-06	0.8111037836140188	0.0004890963676553	0.7834784991162583	0.0006062155653062	0.7826776519550022	PCDH17	615178	PRR20E	1079725	PRR20D	1086290	False	False	False	alt	-100	0.00972	100	0.012726
1062	chr13	58277448	C	T	rs56313517	0.1647522374	0.0427632885675772	0.1647522374	0.0432562584156749	0.0327073988753474	0.1855268889785925	0.0057852017162809	0.0548427538701002	0.0057852017162809	0.0553691235479055	0.0469375804163504	0.4935281054019331	0.0105416407990494	0.2011189176100732	0.0105416407990494	0.2042477705269753	0.0017736718270834	0.3900885033514999	0.0004168667729259	0.1681668136332448	0.0004168667729259	0.1710180102174265	0.0193040480353666	0.1290733190640076	0.0193040480353666	0.1313164340098052	PCDH17	645703	PRR20E	1110250	PRR20D	1116815	False	False	False	alt	-5	0.0004883	-5	0.021
1063	chr13	65885897	C	T	rs9571511	-0.02949029258	0.4505830620917659	0.0324351326199999	0.448109795623588	0.0150990853399319	0.6846562551770319	-0.0004644113253516	0.5486324532171026	0.0005008912053531	0.5458220515090854	0.0082362838573454	0.7594145782330092	-0.0003460403101466	0.6925915539212637	0.0003570664025008	0.6904482001954025	0.0001319988600124	0.7829793715685361	-5.667490650268565e-06	0.7157917634404809	5.808352406617713e-06	0.7135348146322992	-0.0011934611197254	0.6569283978462129	0.001252845501633	0.6545120126802705	PCDH9	1344548	ENSG00000285566	2052844	ENSG00000237378	2139155	False	False	False	ref	100	0.009796	80	0.0371
1064	chr13	79285321	A	C	rs9545047	0.0436587701999999	0.3337701079389638	0.0436587701999999	0.3383954445252071	0.0132344753069045	0.7748487976142981	0.000581046432933	0.4660109075632691	0.000581046432933	0.4718435510030129	0.029007620995678	0.5834587487179963	0.0013318853205691	0.4795415757646564	0.0013318853205691	0.4850454310400202	0.0003769631109853	0.6504431267541003	1.7597467674910535e-05	0.5379014764216167	1.7597467674910535e-05	0.5438345719455508	0.0034434693675562	0.4440759836383776	0.0034434693675562	0.4497391620370278	RBM26	121156	NDFIP2	195835	OBI1	626166	False	False	False	alt	-95	0.1093	-85	0.2222
1065	chr13	79364440	T	C	rs9545087	-0.0239654296	0.5513395506011055	0.0239654296	0.5453354159413548	0.0144423084462755	0.7074358572256545	-0.0003458056583414	0.6165327316138668	0.0003458056583414	0.6102534214011088	0.003940813566032	0.857990374475744	-8.68183849028782e-05	0.8097979975665004	8.68183849028782e-05	0.8030224877754272	5.130399418135585e-05	0.8844846614178058	-1.163040086152418e-06	0.8319043783550898	1.163040086152418e-06	0.8250254100556065	-0.000385173699317	0.785408750801579	0.000385173699317	0.7788130897528036	RBM26	42037	NDFIP2	116716	OBI1	705285	False	False	False	ref	50	0.01371	-80	0.1026
1066	chr13	79370157	A	G	rs9530904	-0.0169176534	0.597784469693347	0.0202907434	0.593075213213575	0.0318735827176068	0.1943661433653382	-0.0005443303969125	0.444108551958303	0.0006506412771318	0.4402706445933058	0.0038987496288475	0.8578332818716445	-5.2618999105755976e-05	0.8282110293969326	7.70455536246266e-05	0.8238590725834224	0.0001257257319688	0.7864296352930173	-1.7370510291448073e-06	0.763634514659649	2.506911416731016e-06	0.759416047360288	-0.0002235162152353	0.8205031137707468	0.0002993962587838	0.8161512891873374	RBM26	36320	NDFIP2	110999	OBI1	711002	False	False	False	ref	80	0.01074	-100	0.3657
1067	chr13	79411175	T	A	rs9545108	0.00730877742	0.8327199958960885	0.00730877742	0.8393295038649253	0.0089305671932708	0.9452007224517636	6.548632855601145e-05	0.897041795747806	6.548632855601145e-05	0.9038497391389548	0.0001905248919533	0.997818115699572	1.1007983275082323e-06	0.9873154634636444	1.1007983275082323e-06	0.994404755166418	1.652374209503536e-06	0.9992362935838502	9.476922586381968e-09	0.9895071799568104	9.476922586381968e-09	0.9965569199411616	2.474349246148262e-06	0.994264434473834	2.474349246148262e-06	0.9968313864506756	RBM26	4698	NDFIP2	69981	OBI1	752020	False	False	False	alt	100	0.02174	-80	0.0293
1068	chr13	79415246	C	T	rs9574422	-0.03375798828	0.3304426262611827	0.04733721772	0.3293485136702813	0.0240772967096192	0.3544787926050679	-0.001138783365046	0.3168346832273878	0.0013978041645203	0.3161224509481177	0.1628954834878426	0.2115840218509552	-0.0058899650754619	0.2183307287852999	0.0079925210063892	0.2175407242166744	0.003906096661205	0.2022658540702285	-0.0001937198113014	0.2125574545877549	0.000233969882033	0.2121457022371901	-0.0088020850516314	0.1966908794177232	0.0124987628253769	0.1961797585615817	RBM26	8769	NDFIP2	65910	OBI1	756091	False	False	False	ref	95	0.03967	95	0.2079
1069	chr13	88392660	A	G	rs1840492	0.0074086575999999	0.3464363257198428	0.0423802448	0.3475071908890987	0.0151015313567585	0.6821532068793259	0.000142488752538	0.4370970406613576	0.0006755075572306	0.4386314115421573	0.0457911319323017	0.4617342120775454	2.069758142815999e-05	0.3938273833579154	0.0018934209765259	0.3955009384750376	0.0006994857663955	0.5130052820641542	6.064846829647463e-07	0.4339336637437037	2.996754427902248e-05	0.4356787219946022	0.0004948698492296	0.3477830274675934	0.0049569463231169	0.3494237247729106	SLITRK5	721288	SLITRK6	2585977	GPC5	3005962	False	False	False	alt	-100	0.04547	-100	0.2263
1070	chr13	88392920	C	A	rs2347140	-0.0523730685999999	0.2802760089661354	0.0523730685999999	0.2761694403106252	0.031609621653	0.2000716789443396	-0.0016646511883426	0.2133650017809376	0.0016646511883426	0.2104849611226465	0.0201469763452211	0.6145876555910285	-0.0011221416327174	0.482342804297361	0.0011221416327174	0.4768743575911101	0.0006126851535165	0.532949435322857	-3.4005115908467866e-05	0.4186440097137363	3.4005115908467866e-05	0.4133547213500848	-0.0032875853650489	0.4363196785118347	0.0032875853650489	0.4308854779311045	SLITRK5	721548	SLITRK6	2586237	GPC5	3005702	False	False	False	ref	-85	0.006622	0	0.0
1071	chr13	88408293	G	A	rs396977	-0.1016151531999999	0.0617530497696547	0.1344778908	0.0615195203015695	0.0275200858362766	0.2729385373981879	-0.0030601194883478	0.0858218283606122	0.0038344801875883	0.0853548000880044	0.0808006994160535	0.3542615115873655	-0.007412959631546	0.1543482703530022	0.0102571839959713	0.1525977686684239	0.0022723987625532	0.304913396316634	-0.0002296142535795	0.1445950080238578	0.0002966340978397	0.1431451358088107	-0.0147396984593051	0.0947179131074136	0.0206781366500609	0.0937236918110172	SLITRK5	736921	SLITRK6	2601610	GPC5	2990329	False	False	False	ref	100	0.01312	-40	0.11487
1072	chr13	88414156	G	A	rs430275	-0.013398281952	0.7224787732987352	0.013398281952	0.7161429360086496	0.0124790504512804	0.7954184374963384	-0.0001497707162517	0.8047685233839282	0.0001497707162517	0.7981638757374763	0.000735706509188	0.9806896514584972	-1.1022365967921953e-05	0.9652620546953532	1.1022365967921953e-05	0.9597489432739352	8.954796608984858e-06	0.9861607428835056	-1.2415867257643098e-07	0.974649057487379	1.2415867257643098e-07	0.9689042938085404	-4.288872026655669e-05	0.9627067756433836	4.288872026655669e-05	0.9587264211840996	SLITRK5	742784	SLITRK6	2607473	GPC5	2984466	False	False	False	ref	-30	0.02155	25	0.006416
1073	chr13	88435587	T	C	rs338708	0.0685517738	0.1956827941458661	0.0685517738	0.1985517458856577	0.0187146526971781	0.5312727343358283	0.0014077659984914	0.2623908638544695	0.0014077659984914	0.2659522267137633	0.1959263963577578	0.179729353293747	0.0151568119446565	0.1171232993632136	0.0151568119446565	0.1195691035639303	0.0038793825579897	0.2077376834544337	0.0003308145655284	0.1476679185545331	0.0003308145655284	0.1503076649305719	0.0209206228761835	0.0953526019695114	0.0209206228761835	0.0973113080564675	SLITRK5	764215	SLITRK6	2628904	GPC5	2963035	False	False	False	alt	-95	0.00928	-10	0.01074
1074	chr13	88450905	T	C	rs447791	-0.0447178166	0.3294974226734612	0.0447178166	0.3249169362246817	0.0172178996245929	0.5784506939987698	-0.0007755412324839	0.3924199462967066	0.0007755412324839	0.3873983889281071	0.1720794431064629	0.2051924892201534	-0.0075883066588255	0.1891953679191153	0.0075883066588255	0.1858641853067986	0.0028697255818454	0.2535761549036994	-0.0001284381067714	0.228831501996984	0.0001284381067714	0.2251458523194933	-0.0120294612516907	0.175049810766364	0.0120294612516907	0.1718880622569584	SLITRK5	779533	SLITRK6	2644222	GPC5	2947717	False	False	False	ref	-100	0.0818	-100	0.331
1075	chr13	88461603	A	G	rs338704	0.0594114438	0.2396219767916995	0.0594114438	0.242751627420447	0.0213350616995452	0.4373953609934227	0.0013220618150026	0.272923952581825	0.0013220618150026	0.2762853290918495	0.1240020124707201	0.2673284515574253	0.0077103373095521	0.195219988452131	0.0077103373095521	0.1986207245943884	0.0026596864375377	0.2702821842816655	0.0001741091553105	0.2075250473881181	0.0001741091553105	0.2109521851301615	0.0137425357131074	0.1567178136229777	0.0137425357131074	0.1593201443748213	SLITRK5	790231	SLITRK6	2654920	GPC5	2937019	False	False	False	alt	-65	0.072	-40	0.1233
1076	chr13	92670299	T	C	rs9516115	-0.2685531339999999	0.0114790587941603	0.2685531339999999	0.0113961904465246	0.0315426862224505	0.2014608609234835	-0.0087628014467503	0.0264533904511388	0.0087628014467503	0.0263207276789494	0.6302250008247829	0.0213460302668771	-0.1697798304426309	0.003079369291423	0.1697798304426309	0.0030765770731114	0.0193552200899922	0.0247616099343667	-0.0054133369697896	0.0076184624092797	0.0054133369697896	0.0075340504045968	-0.0708678367589323	0.0101573181875095	0.0708678367589323	0.0100714333742339	GPC6	556509	GPC5	1271677	DCT	1809383	False	True	False	ref	95	0.1685	-15	0.05762
1077	chr13	92709036	C	T	rs9523786	-0.2386315527999999	0.0178164313727648	0.2386315527999999	0.0176649678614011	0.0533191134938092	0.0493254388908836	-0.0145654968385711	0.0158169194636029	0.0145654968385711	0.0157570117553103	0.000903137474844	0.9731588177045516	-0.0002629020284056	0.7108391200340722	0.0002629020284056	0.704567663534426	5.66228267785753e-05	0.8913854658359174	-1.7852325376176555e-05	0.5607591278800729	1.7852325376176555e-05	0.5551637115286989	-0.0005938438190755	0.7466251186448576	0.0005938438190755	0.7401708954667927	GPC6	517772	GPC5	1310414	DCT	1770646	False	True	False	ref	-45	0.03876	-65	0.1615
1078	chr13	92754331	G	A	rs138907830	-0.0553593382	0.2541764070567561	0.0553593382	0.2505522107729075	0.0205958935249358	0.4628129723526307	-0.0011625936231335	0.2878537420924226	0.0011625936231335	0.284187852950594	0.0002259905644815	0.9977740572385816	-1.346177494729239e-05	0.951921044221061	1.346177494729239e-05	0.9448484452585312	4.919324657136913e-06	0.9947399861327348	-2.970242139490764e-07	0.9376522775944212	2.970242139490764e-07	0.9306373836757944	-4.4538286430668734e-05	0.9574952745206532	4.4538286430668734e-05	0.9503850407407392	GPC6	472477	GPC5	1355709	DCT	1725351	False	False	False	ref	100	0.0818	-95	0.1277
1079	chr13	95836047	T	G	rs11839843	0.0124036983599999	0.6732592428268742	0.0150860858799999	0.6757690578661724	0.0215409342266984	0.4325467456878985	0.0002446918624552	0.6646081302018763	0.0003048902275485	0.6671113354826812	0.0008742700669723	0.9744360704128956	1.3765135763169962e-05	0.94225583048299	1.5399305827165715e-05	0.9447625243868462	1.946621908273997e-05	0.9612867750735774	2.8659163907769377e-07	0.9338596499152032	3.238180224020018e-07	0.936017925913364	5.113655108704231e-05	0.9432912321933832	5.7734815743437697e-05	0.9457080754458514	DNAJC3	158907	DZIP1	191341	UGGT2	217435	False	False	False	alt	-75	0.02628	-80	0.1396
1080	chr13	95849839	T	C	rs8000849	0.00951328068	0.7614750626693996	0.01078415172	0.7657768936971565	0.014911179233977	0.6955079952137263	0.0001375446137052	0.7824944016070297	0.0001575669763957	0.786717168799606	0.0009922140477053	0.9643394296040368	9.911659369373912e-06	0.9487066766862908	1.0933647487870042e-05	0.9530858774449622	1.4704886808867564e-05	0.9682461768852474	1.433811390781418e-07	0.9512479154146344	1.594823924377089e-07	0.9555314110865226	3.5465672528125115e-05	0.9469771237489476	4.371350334861936e-05	0.951297286760848	DNAJC3	172699	UGGT2	203643	DZIP1	205133	False	False	False	alt	100	0.02243	100	0.1512
1081	chr13	95862624	A	C	rs4773928	0.0649790084	0.1661199542686602	0.0770781196	0.1677718673247424	0.0475924113728655	0.0657453751357574	0.003059158231109	0.0924187065278679	0.0036941689777854	0.0931357921749985	0.0018673088977598	0.9299565615794934	8.732825481394554e-05	0.7589894143578831	0.000134180327099	0.7630590029862407	9.27325977016628e-05	0.8320701876315546	4.226963208357224e-06	0.6388918825615634	6.685951245411032e-06	0.6428220014869518	0.0002952723433736	0.7527028338962048	0.0004767246214245	0.7566896518402889	DNAJC3	185484	UGGT2	190858	DZIP1	217918	False	False	False	alt	70	0.0343	-80	0.0797
1082	chr13	95870573	T	C	rs6492824	0.363085752	0.0048908594211412	0.363085752	0.0048867698074819	0.0419503221313518	0.0954446094035564	0.0152750238605984	0.0101307977054266	0.0152750238605984	0.0101636003490852	0.1612747847316155	0.2146466849074818	0.0603832315373713	0.0215717695756984	0.0603832315373713	0.0220477820551803	0.0068163660097792	0.1210958912127061	0.0025646502928648	0.019654479862751	0.0025646502928648	0.0199323734898425	0.0840759130348717	0.0066871355143154	0.0840759130348717	0.0067571426497193	UGGT2	182909	DNAJC3	193433	HS6ST3	219535	False	True	True	alt	-85	0.05527	-65	0.1763
1083	chr13	95873066	C	A	rs9561967	-0.001508551752	0.6475319615159626	0.017025336128	0.6486012761474309	0.0105219501518717	0.8868585198211362	-1.3792370430524428e-05	0.7451211316838693	0.0002083048847081	0.7462243822019385	0.0081670020784533	0.7570494366833268	4.862378517748156e-05	0.7889114132017986	0.0001484854876119	0.7905956888191449	8.75267528124551e-05	0.8274114986904364	6.661233630965134e-07	0.8250515630495994	1.8419663045473523e-06	0.8267655024053684	0.0001954735904457	0.7734518780642182	0.0005534294480551	0.7752078399665098	UGGT2	180416	DNAJC3	195926	HS6ST3	217042	False	False	False	ref	-50	0.03812	0	0.0
1084	chr13	95873890	T	C	rs11616658	0.031809315	0.4425624956354408	0.031809315	0.4484155166674877	0.0167871075655654	0.6130899228306017	0.0005419279836154	0.4897231213780335	0.0005419279836154	0.4955906758125852	0.0130587905380884	0.6974842759945045	0.0004124103229551	0.6268870368744358	0.0004124103229551	0.6328391234084562	0.0002234061566595	0.7127631777228939	7.181417834295813e-06	0.6380452478841317	7.181417834295813e-06	0.6441066308199913	0.0013584177361353	0.6035257815119162	0.0013584177361353	0.609641133207358	UGGT2	179592	DNAJC3	196750	HS6ST3	216218	False	False	False	alt	-85	0.05167	-85	0.1318
1085	chr13	95876601	A	C	rs9556505	0.0561488189999999	0.2241713984187525	0.064970195	0.2260528494022434	0.0610899013491904	0.0294210219270287	0.0036743579313291	0.0908510655609983	0.004141320442506	0.0911478948046269	0.0123981392893668	0.6959815512394087	0.0010616458561658	0.5108859869330082	0.0011258904762286	0.5149101270173082	0.0007840105496697	0.4946972928445261	6.873466576107063e-05	0.3522168251516654	7.21354765011422e-05	0.3555180585959639	0.0031077826531621	0.4516167716188526	0.0033915080333871	0.4557035656235716	UGGT2	176881	DNAJC3	199461	HS6ST3	213507	False	False	False	alt	-10	0.006836	100	0.05676
1086	chr13	95893035	A	G	rs1537030	-0.00417458672	0.8433696573130883	0.0067089065199999	0.8410875375030652	0.0207027055657395	0.4596212528724052	-8.748570754454114e-05	0.8078293607229504	0.0001382936113535	0.8056686780053116	0.008296493022335	0.7521636624844295	-3.815594646032463e-05	0.8650159651784242	5.513696326118999e-05	0.8629558461962265	0.0001717138922968	0.7353940177020076	-7.924366504155152e-07	0.8490922223144792	1.1358619633895951e-06	0.8470383811472113	-0.0001426874731945	0.8625904989973829	0.0002086701197584	0.8606335009937855	UGGT2	160447	HS6ST3	197073	DNAJC3	215895	False	False	False	ref	-100	0.02051	80	0.11487
1087	chr13	95906598	G	A	rs35836619	0.00272452032	0.7039986411384554	0.01446207248	0.7050461470473104	0.0271123706939488	0.2807526072621126	6.836604558334002e-05	0.5883457143099218	0.0004098695726841	0.5894995416915129	0.2008412787436903	0.177237026905366	0.0007176453283254	0.3400571612234914	0.0026446502101908	0.3413570145814003	0.0053080212867691	0.1550831301252897	1.63284825149823e-05	0.306833595622857	7.253679307028738e-05	0.3079653670274191	0.0006227112269472	0.3995583158433958	0.003806373923658	0.4007051115789627	UGGT2	146884	HS6ST3	183510	DNAJC3	229458	False	False	False	alt	100	0.0403	100	0.2927
1088	chr13	95928601	G	A	rs9556506	-0.010378918	0.5198291376383777	0.0253889852	0.5184519983631677	0.0236182243906254	0.3651471175180593	-0.0002599588337388	0.4591358006422892	0.0006135242173038	0.4578889435069708	0.0020594833558773	0.92666636367757	-1.2058877942867593e-05	0.8859973423357487	4.3645592261119975e-05	0.8846555061480631	4.441493939544223e-05	0.9114517097467896	-2.3608275841227585e-07	0.8651060801283933	9.376043191700938e-07	0.8638021784052071	-1.402131239483669e-05	0.8817178439932318	0.0001723796641482	0.8802842728988987	UGGT2	124881	HS6ST3	161507	DNAJC3	251461	False	False	False	ref	10	0.001373	10	0.06152
1089	chr13	95931789	G	A	rs9556508	-0.0142943119999999	0.2577744243301742	0.0561644147999999	0.2577276272582892	0.0237588558788313	0.3593884088382412	-0.0002853864709468	0.2677151544574329	0.0013520766266863	0.267419831920403	0.1549899376463989	0.2248025553926668	0.0006955009645657	0.1795530198027633	0.0090386682689966	0.1796205350285526	0.0037641545184142	0.2116178945115793	2.430861872830156e-05	0.1826208985989918	0.0002199287917597	0.1824613512792542	-0.0012454224538946	0.1519619690539061	0.0148032067566229	0.1519389856506188	UGGT2	121693	HS6ST3	158319	DNAJC3	254649	False	False	False	ref	-100	0.02525	-100	0.1453
1090	chr13	95937483	C	A	rs1411557	0.027520072	0.4862951528636242	0.027520072	0.4920929613042318	0.0189580556570531	0.518317336067395	0.0005245087465535	0.4834171360510057	0.0005245087465535	0.4892954695884531	0.0048357032100556	0.8275261425803173	0.0001398905286581	0.7463936327355836	0.0001398905286581	0.7528983819826371	9.224466219248064e-05	0.8199356775302348	2.6716044640311586e-06	0.7365620967256826	2.6716044640311586e-06	0.7430584193391638	0.0005344594371679	0.7296153392909496	0.0005344594371679	0.7360195426990722	UGGT2	115999	HS6ST3	152625	DNAJC3	260343	False	False	False	alt	100	0.00917	-90	0.05298
1091	chr13	95968179	T	A	rs11619333	0.0020061824888	0.9145097917049588	0.0037301805911999	0.9182234708074284	0.0126835389025691	0.7984403798061598	2.68065807283794e-05	0.92378245556611	4.9318116434897386e-05	0.927675292412804	0.0006557025502292	0.9817559205122972	2.944495352402657e-07	0.984000279723591	2.662828695361164e-06	0.9882564834641347	8.314220309318322e-06	0.9866575963194626	3.737599422840779e-09	0.9852764087540116	3.4720318709367605e-08	0.9895959871393142	-3.299132328197693e-06	0.979776931241476	1.6495661640988424e-05	0.9815670431681484	UGGT2	85303	HS6ST3	121929	DNAJC3	291039	False	False	False	alt	50	0.007385	75	0.0696
1092	chr13	95971316	C	A	rs7324957	0.00795402852	0.6421602099380723	0.01633105348	0.6446798253542445	0.0235107002916547	0.3674131025542025	0.0001800550250486	0.5726901835850993	0.0003920526761084	0.574534639532017	0.0123371053412952	0.6924969217688622	2.1260812229475263e-05	0.7135358775517722	0.0002005212154088	0.7152057711788288	0.0002929172499337	0.6545262024597497	3.046117719530135e-07	0.6811299386962115	4.843659778236981e-06	0.6828439395144774	0.0001476361716868	0.694438359877324	0.0007546765200751	0.6960713950759059	UGGT2	82166	HS6ST3	118792	DNAJC3	294176	False	False	False	alt	-100	0.1351	-100	0.02437
1093	chr13	95979670	G	A	rs9562005	-0.0209910759999999	0.5939768564766276	0.0209910759999999	0.5878342287823471	0.0116918147747497	0.8452455752394544	-0.0002537534168811	0.6952152096680158	0.0002537534168811	0.688692809398685	0.0381239484015703	0.4947771144337118	-0.0007608145563792	0.5223309647976158	0.0007608145563792	0.5166126391406477	0.0004317802776776	0.5900380340482734	-8.928374357441175e-06	0.5931503855089638	8.928374357441175e-06	0.5871976860189683	-0.002137837748672	0.5092033595992407	0.002137837748672	0.5033638631399426	UGGT2	73812	HS6ST3	110438	DNAJC3	302530	False	False	False	ref	-95	0.01218	5	0.00116
1094	chr13	95985541	T	C	rs117227967	0.1059845317999999	0.0949782117024084	0.1059845317999999	0.0963754167622311	0.0225451962454913	0.3959440214316334	0.0025216860187275	0.1410022499210763	0.0025216860187275	0.1429521937525873	0.0490564481541354	0.4379858976817698	0.005289315984049	0.2258429507997597	0.005289315984049	0.2296808852418621	0.00110450686399	0.4196519582128288	0.0001260015642719	0.2277867459655297	0.0001260015642719	0.2316187491937548	0.012984560060704	0.1566857329911211	0.012984560060704	0.1597190857628036	UGGT2	67941	HS6ST3	104567	DNAJC3	308401	False	False	False	alt	100	0.03918	100	0.11743
1095	chr13	96003118	T	C	rs2026819	-0.148577506	0.0597211287896507	0.148577506	0.0590555149565205	0.0490212455536977	0.0609682152546567	-0.0080426652594836	0.0407520083465392	0.0080426652594836	0.0404373317521722	0.0689947543795981	0.392726958068814	-0.0138977672063432	0.1594486491611837	0.0138977672063432	0.1568803471071845	0.0037053543404141	0.232003784987638	-0.0007886822874746	0.1017902195750809	0.0007886822874746	0.1001688853316028	-0.0248102998911286	0.0939808327130588	0.0248102998911286	0.0925401630265534	UGGT2	50364	HS6ST3	86990	DNAJC3	325978	False	False	False	ref	-90	0.1022	-95	0.02441
1096	chr13	96029297	A	T	rs3782990	-0.001049809372	0.7391464808589701	0.012509947748	0.7378809706490402	0.0566407969257756	0.0392838831060371	4.3846768747860345e-05	0.4731578376583451	0.0006880220380687	0.4717465852546135	0.0029914882385931	0.8889384358558868	-1.396806577528118e-05	0.9147615154023834	2.687956144752228e-05	0.9133153125684156	0.0001585996849591	0.7626644499905207	-5.564137890626144e-07	0.831488290513399	1.3774354990202897e-06	0.829932411643744	-5.855959882548941e-05	0.9200940982766368	9.64996205997628e-05	0.9186673592716236	UGGT2	24185	HS6ST3	60811	DNAJC3	352157	False	False	False	ref	-75	0.1123	-85	0.3357
1097	chr13	96053485	T	C	rs2277419	-0.0397685086	0.2896205168522591	0.0528649426	0.2869965386603831	0.0402012747970196	0.1069572398942218	-0.001684242029597	0.1835463302957281	0.0021500155913188	0.1819647936182912	0.9451684207053546	0.0002689007313886	-0.0375221418963209	0.032877643109764	0.0500609371290967	0.0323675610612982	0.0380121254110553	0.0048327077213304	-0.0015920112670712	0.0292429892825907	0.0020379524576044	0.0287858500215148	-0.0017980271188677	0.502145351006946	0.0023737257101381	0.4985686342479337	UGGT2	3	HS6ST3	36623	DNAJC3	376345	True	False	False	ref	5	0.00586	-35	0.03125
1098	chr13	96068177	C	A	rs1854173	-0.0102311772	0.3180170350968141	0.0486868444	0.3176271867388899	0.0202598256086403	0.4695155685971052	-0.0003512005339529	0.3543043757411188	0.0009896570382754	0.3539797241040865	0.0006507538517369	0.97826724071587	1.1779676585072507e-06	0.9104759865107256	2.5130446536094025e-05	0.9094385784805684	1.3156554929045374e-05	0.9705226491858034	-2.3441478619106266e-08	0.8968886421188883	4.959551264826855e-07	0.8959095844033158	1.4846095476862022e-05	0.9232426094547128	7.752960971261798e-05	0.9221567022473428	UGGT2	14695	HS6ST3	21931	DNAJC3	391037	False	False	False	ref	70	0.01657	35	0.0803
1099	chr13	96089608	T	G	rs11618108	0.01390155408	0.7034853290506344	0.01390155408	0.7098587477297086	0.060027187559343	0.0307242887442725	0.0008654661029478	0.3703751028402245	0.0008654661029478	0.3750875021559268	0.5647792880472435	0.0324496337761311	0.007842487272363	0.1787873340815881	0.007842487272363	0.1819791705873092	0.0337526259000733	0.0066408852606516	0.0004864717770084	0.0959618792639956	0.0004864717770084	0.0976079588629489	0.0038847283164527	0.3890035093257232	0.0038847283164527	0.3938161472598555	HS6ST3	500	UGGT2	36126	DNAJC3	412468	False	False	False	alt	60	0.1276	-100	0.1188
1100	chr13	96103960	T	G	rs200086486	-0.0232358662	0.4495009047733884	0.031183785	0.4453406157524916	0.0862386272056499	0.0080583477783719	-0.0022287106903505	0.1277601397356782	0.0027186840565663	0.1267398153265123	0.1059384381907558	0.2916442643258816	-0.002253308229114	0.2990407916160576	0.0033844595634668	0.2959536410434573	0.0087790360852395	0.0878935494602243	-0.0002187903888432	0.1436201461141023	0.0002885236162255	0.1417989149071781	-0.0050526211606347	0.2794987573308592	0.0069298274553792	0.2762641250921951	HS6ST3	13852	UGGT2	50478	DNAJC3	426820	False	True	True	ref	60	0.00505	100	0.06604
1101	chr13	96117228	A	C	rs493423	0.0253039368	0.5405888868307387	0.0253039368	0.5461929204162403	0.0376890241607765	0.1282966442540126	0.0010394442547132	0.3776080206667638	0.0010394442547132	0.3819416871541182	0.0069636435617431	0.7878667215492445	0.0002641604333331	0.7327781028560408	0.0002641604333331	0.7392367638783488	0.0002753732479934	0.6787397847075844	1.1194146591442593e-05	0.6404009848649012	1.1194146591442593e-05	0.646824917404708	0.0008998383425158	0.7052438579024757	0.0008998383425158	0.7117629265221974	HS6ST3	27120	UGGT2	63746	DNAJC3	440088	False	False	False	alt	-85	0.00845	-45	0.04108
1102	chr13	96136335	T	C	rs504340	0.168111204	0.0370451019126884	0.168111204	0.037463854464165	0.0743750440356459	0.0143014386455994	0.0126012311509409	0.0146888232917812	0.0126012311509409	0.0147707550499507	0.0922041503084688	0.3356663288429506	0.0176236129228671	0.1088113184498492	0.0176236129228671	0.1108247230043364	0.0067248677838271	0.1305194542506999	0.0013029934470302	0.0491475345045124	0.0013029934470302	0.0498197017189946	0.0305656362376694	0.0588697642202508	0.0305656362376694	0.0598515350500528	HS6ST3	46227	UGGT2	82853	DNAJC3	459195	False	True	False	alt	95	0.1357	5	0.009766
1103	chr13	96140622	T	G	rs1117183	-0.014616376	0.4885572200524408	0.0287482919999999	0.4870076782094067	0.029235466746806	0.2377045886294223	-0.0004528867891753	0.3833188505745289	0.0008376495378319	0.3819310204162851	0.0979075253208406	0.3067420108439798	-0.0017246989190507	0.3255195115339307	0.003055859114372	0.3244221996746118	0.0028979278850969	0.2497522836850327	-5.339834380261021e-05	0.2847149745778433	8.980015007860941e-05	0.2834990087558614	-0.0032323248985516	0.305012617413713	0.0062724753389858	0.3038094141106788	HS6ST3	50514	UGGT2	87140	DNAJC3	463482	False	False	False	ref	-40	0.04007	100	0.04456
1104	chr13	96141355	C	T	rs640357	0.0124956922	0.569275975945187	0.0218517926	0.5711837862515871	0.0312994098891401	0.2042258738464297	0.0004430157881725	0.4492338295240306	0.0006750128118769	0.4507371216777454	0.3290620566790934	0.0967547923634316	0.0030320645859941	0.2105103079960525	0.0069578689089841	0.2115167619793581	0.0100049269704888	0.0734738619056423	0.000110851891333	0.1834420604043888	0.0002073677254249	0.1840515084705231	0.0041816502259905	0.2826908517135785	0.0071657154168453	0.2839446743890236	HS6ST3	51247	UGGT2	87873	DNAJC3	464215	False	False	False	alt	-85	0.2927	-100	0.3833
1105	chr13	96178713	A	G	rs16951630	0.1046341012	0.1019818351201629	0.1046341012	0.1034767974797744	0.0177201516491241	0.5666191359212424	0.0019381812004369	0.1869329987137004	0.0019381812004369	0.1896975281029373	0.0543647520702055	0.4284418720438659	0.0064172375948957	0.2224197037789591	0.0064172375948957	0.2259053226241452	0.0009720478766523	0.4524528287278455	0.0001190369807482	0.253726160823265	0.0001190369807482	0.2575411062619367	0.0141112137507834	0.1538537998205963	0.0141112137507834	0.1564269992735092	HS6ST3	88605	UGGT2	125231	DNAJC3	501573	False	False	False	alt	-20	0.01526	100	0.1702
1106	chr13	96207822	G	A	rs9590371	-0.0641850704	0.2044813132822311	0.0687729616	0.2022608272200511	0.0198192581416137	0.4859054731513815	-0.0013273888215936	0.2637148520369267	0.0014038226001346	0.2612179827868122	0.0132220975883342	0.7177027415087898	-0.0010147498799792	0.5330336131092643	0.0010250045610288	0.5290684755765355	0.0002524955944366	0.7108693513656226	-1.954986787371005e-05	0.5317965320055174	1.972070976266619e-05	0.5275674227838407	-0.0029444756029164	0.4846958254259578	0.0029824156246906	0.4806689798681408	HS6ST3	117714	UGGT2	154340	DNAJC3	530682	False	False	False	ref	65	0.01016	-15	0.005005
1107	chr13	96221190	T	C	rs1927808	0.0327254508	0.4241441034721417	0.0327254508	0.4298423565123578	0.0135495526067844	0.7490104084053097	0.0004557585380817	0.5264351886183047	0.0004557585380817	0.5325377277257952	0.0411814192867275	0.4862214629159713	0.0014145397513793	0.4308185722930298	0.0014145397513793	0.4362364284933273	0.0005997617756023	0.5500503155672104	2.109684068500665e-05	0.4824181933719755	2.109684068500665e-05	0.4881773373631551	0.0037387417109299	0.3972255228997116	0.0037387417109299	0.4027514097146257	HS6ST3	131082	UGGT2	167708	DNAJC3	544050	False	False	False	alt	95	0.02893	55	0.1257
1108	chr13	96229983	C	T	rs9516643	-0.0507103276	0.2930567712623066	0.0507103276	0.2889067474895997	0.0110199306989335	0.8740291266621851	-0.0005658922539782	0.4855403621282486	0.0005658922539782	0.4798102864390632	0.0261456237009666	0.5679241644964734	-0.001220147052803	0.4530590095785088	0.001220147052803	0.4475602901654428	0.0002870827120115	0.661242231348839	-1.35919981802854e-05	0.5353280564861838	1.35919981802854e-05	0.5296420845314069	-0.0036364686087558	0.4078742775862353	0.0036364686087558	0.4026108132450473	HS6ST3	139875	UGGT2	176501	DNAJC3	552843	False	False	False	ref	100	0.03366	-100	0.2378
1109	chr13	96232625	A	G	rs9584347	-0.227031798	0.0182831096897422	0.227031798	0.0181904858854119	0.0534302770572342	0.0456358387586894	-0.0124610073893423	0.0153166941420082	0.0124610073893423	0.0152501016471367	0.0345567615717066	0.5083250873058551	-0.0080286789063479	0.1806308116994938	0.0080286789063479	0.1773671170341839	0.001840214607223	0.3281607030348269	-0.0004395357698533	0.1055236986004089	0.0004395357698533	0.1037759059493134	-0.0183192570353996	0.1097172545650149	0.0183192570353996	0.1077657305135762	HS6ST3	142517	UGGT2	179143	DNAJC3	555485	False	True	False	ref	-70	0.05237	-70	0.1792
1110	chr13	96234119	A	G	rs9525161	-0.01334701036	0.7230656476098167	0.01334701036	0.7164628128931647	0.017607418593831	0.5730155287259682	-0.0002441435727875	0.7039464245253116	0.0002441435727875	0.6972502668920552	0.0082395829896736	0.8144136832623745	-0.0001641597697504	0.8279879931176618	0.0001641597697504	0.8215976860772953	0.0001510450249723	0.8164101073553393	-3.0546118453827497e-06	0.8235321964637721	3.0546118453827497e-06	0.81706367609523	-0.0004824981029988	0.8207693061903019	0.0004824981029988	0.8142886788892505	HS6ST3	144011	UGGT2	180637	DNAJC3	556979	False	False	False	ref	-95	0.015366	-95	0.5015
1111	chr13	96243278	G	A	rs8002865	0.0057900948999999	0.7537639452130374	0.0107094125	0.7579457850012314	0.0124538692712732	0.8107855349889467	6.784747891770007e-05	0.8021759047800103	0.0001324170460305	0.8063191487929322	0.1606058856520734	0.2188721979145776	0.0010230353759914	0.3953274433119542	0.0017292612060042	0.3986636907927565	0.0019387281508998	0.3216409304023717	1.1323105235985589e-05	0.467272178665143	2.059282485234424e-05	0.470802460097679	0.0016446174656065	0.445415725479817	0.002855399030055	0.4490169981285784	HS6ST3	153170	UGGT2	189796	DNAJC3	566138	False	False	False	alt	100	0.03687	100	0.0882
1112	chr13	96250122	G	A	rs1927804	0.0089281340399999	0.728064610281043	0.01102402356	0.7307025155738254	0.0106372690793219	0.8846097454937818	0.0001045672621773	0.8055871217557322	0.0001250586802659	0.8080434006108312	0.0787923526112631	0.3636551439859155	0.0005956560369237	0.5679644459985759	0.0007726928023115	0.5704338457869007	0.0008187649594284	0.4885356012521079	7.123447329677492e-06	0.6401514580628906	8.782521036590228e-06	0.6426071105167764	0.0015802843852066	0.5828329119334473	0.0018739071624162	0.5856356481000697	HS6ST3	160014	UGGT2	196640	DNAJC3	572982	False	False	False	alt	100	0.0203	20	0.02032
1113	chr13	96251041	C	T	rs9516649	0.00871991636	0.7576608228710376	0.0104967187599999	0.7619588661907273	0.0099388322209843	0.9124687972381677	8.598068119753826e-05	0.8457161771716456	0.000102857762466	0.8500929046667126	0.0381330210154729	0.5032855475854361	0.0003868016520445	0.657517049092606	0.0004474064335854	0.6612328586247268	0.0003621759070658	0.6258451531471787	3.506769785578996e-06	0.7342907911768711	4.0824285364098736e-06	0.7381545830525355	0.0010177823232489	0.6574710828758633	0.0012107815644485	0.6614083407723554	HS6ST3	160933	UGGT2	197559	DNAJC3	573901	False	False	False	alt	40	0.006134	-95	0.06744
1114	chr13	96266681	C	T	rs2104657	-0.0011976911	0.8216727086034374	0.0079694401399999	0.8210588546227635	0.0126337143440351	0.7960091230137198	-8.455663090609664e-06	0.8567188175573596	9.638872867742784e-05	0.8564907600365327	0.0074609877602189	0.8078649313880776	2.1835146765738143e-05	0.8699128596085686	5.398229206474159e-05	0.8702210755331994	8.99762363424675e-05	0.8485159010951365	2.609811201514058e-07	0.8899070562785385	6.357998134164609e-07	0.890637210753371	9.814918676387522e-05	0.8740479625222723	0.0001987727227738	0.8750464885175179	HS6ST3	176573	UGGT2	213199	DNAJC3	589541	False	False	False	ref	-80	0.01164	20	0.07043
1115	chr13	96279985	C	T	rs1927784	-0.15098763	0.0478488209559596	0.15098763	0.0473933379353064	0.0188519393198151	0.5242237400584717	-0.0029361635402137	0.1167665545659093	0.0029361635402137	0.115213487065671	0.4815966150902312	0.0480606392572364	-0.0752092088711283	0.0158656615517653	0.0752092088711283	0.0156835268703284	0.0090991092231245	0.0844359433449871	-0.0014709375922284	0.0378285018478415	0.0014709375922284	0.0371415038941292	-0.0475660651248721	0.0235928896879999	0.0475660651248721	0.0232809439399502	HS6ST3	189877	UGGT2	226503	DNAJC3	602845	False	False	False	ref	85	0.0707	60	0.397
1116	chr13	96289458	G	T	rs61966895	0.110619482	0.0875765507261592	0.110619482	0.0887972850661673	0.0333502409500034	0.1765511510882308	0.0037739972226997	0.0845971278649788	0.0037739972226997	0.0856058296914934	0.0089175546831182	0.7398531874580616	0.0009860323881279	0.4729617409826203	0.0009860323881279	0.4784357486380906	0.0002954484063192	0.6504014776835687	3.335365768131447e-05	0.3978485550080742	3.335365768131447e-05	0.4029843300884714	0.0031011843885058	0.4269225591911955	0.0031011843885058	0.4322533447785657	HS6ST3	199350	UGGT2	235976	DNAJC3	612318	False	False	False	alt	-55	0.022	30	0.03662
1117	chr13	96297443	A	G	rs11619328	0.0655087274	0.1997742611857735	0.0655087274	0.2026332565143323	0.0164653723013902	0.6237960178574014	0.0010998439702976	0.2961544077826284	0.0010998439702976	0.2999863514181025	0.0707573158259377	0.3674675959224728	0.0047119237842558	0.2406772825794761	0.0047119237842558	0.2446361439201246	0.001182810612595	0.4079631181042012	8.027518911733183e-05	0.2788852647179589	8.027518911733183e-05	0.2833378310902646	0.0108772392860677	0.1844688377934281	0.0108772392860677	0.1878799724964291	HS6ST3	207335	UGGT2	243961	DNAJC3	620303	False	False	False	alt	100	0.02939	45	0.02582
1118	chr13	96299179	G	T	rs2038823	-0.0911635129999999	0.1237551421871173	0.0911635129999999	0.1220260685057174	0.0175122110558486	0.5794705840941982	-0.0015975086493288	0.2164235854908242	0.0015975086493288	0.2134649517266509	0.0758107617696545	0.3556329475607678	-0.0065914835782333	0.1994686595841093	0.0065914835782333	0.1959080128716616	0.0013453516453136	0.3865891757205516	-0.0001164252252639	0.2339357469262908	0.0001164252252639	0.2301925787730555	-0.0146126818646695	0.1397143839475075	0.0146126818646695	0.1370317343601821	HS6ST3	209071	UGGT2	245697	DNAJC3	622039	False	False	False	ref	30	0.00821	30	0.03015
1119	chr13	96306638	C	T	rs11618312	0.0378477748	0.250568028567747	0.0578151428	0.2514884990088469	0.0203601677870462	0.4714921841514136	0.000851114492728	0.2958857712491119	0.0012178063025109	0.2966590458397319	0.0346689320708653	0.5244302780239075	0.0017838799496123	0.3873797499583759	0.0022144444750133	0.3892049857176078	0.0007319796830607	0.5185764919828045	3.997095436411767e-05	0.3897743142988443	4.778298219442525e-05	0.3914567888652054	0.0042987694236415	0.3278190899921449	0.0057272937217511	0.3295610066924091	HS6ST3	216530	UGGT2	253156	DNAJC3	629498	False	False	False	alt	20	0.01617	60	0.08875
1120	chr13	96310731	G	A	rs117420459	-0.0164979182999999	0.4449225594893801	0.0345658686999999	0.4439305108092223	0.0187524042562226	0.5298675242929416	-0.0003936226189519	0.4939255006114825	0.0007192082997616	0.4927624312409852	0.0579022467091154	0.4143153563072959	-0.0018379257040475	0.4400982884164282	0.0024032626120781	0.4383836636971097	0.0010920528069662	0.428999189519718	-4.121437452739724e-05	0.451072093556813	5.143988136762105e-05	0.4495852403209192	-0.0038954504965194	0.3990310721666878	0.0054542905215927	0.3976052592979537	HS6ST3	220623	UGGT2	257249	DNAJC3	633591	False	False	False	ref	-20	0.013794	-95	0.01758
1121	chr13	96315469	G	A	rs115587611	0.0195592346	0.6011894144904183	0.0195592346	0.6079348346254219	0.0301992448939417	0.2207775312001644	0.0005756650151178	0.4627053555766079	0.0005756650151178	0.4684084872553984	0.1116929497542146	0.2821645866903242	0.0024882224669559	0.3498987713707747	0.0024882224669559	0.3549454270518489	0.0033064210148037	0.2260657043484343	7.144204897817778e-05	0.3037489499503432	7.144204897817778e-05	0.3084805891796015	0.0047309557586354	0.3525075464057372	0.0047309557586354	0.3577758026629297	HS6ST3	225361	UGGT2	261987	DNAJC3	638329	False	False	False	alt	-5	0.0005493	100	0.10583
1122	chr13	96316993	T	C	rs115470719	-0.000371570986	0.9355284055767816	0.002655187534	0.9368684875840108	0.0107713761357104	0.8667033449431937	-5.157497334178404e-06	0.9517103051699314	2.866949451412873e-05	0.9529928641975388	0.0183629705387482	0.628893514483203	-4.9330416120883724e-06	0.8785310017501848	3.833011780354609e-05	0.8798100166377592	0.0001892084908485	0.7226807135971872	-5.861370303634356e-08	0.9064759844471454	4.054835593953904e-07	0.9076939788747452	-1.649566164097271e-05	0.8758854119171924	0.0001451618224406	0.8771452731759596	HS6ST3	226885	UGGT2	263511	DNAJC3	639853	False	False	False	ref	80	0.01996	-95	0.1565
1123	chr13	96320974	C	A	rs61966906	-0.0116585986399999	0.5895477966275063	0.0207377508	0.5878434740507434	0.0333950270681457	0.1737994054582975	-0.0004003507369809	0.4628370830639575	0.000718774716567	0.461136140343832	0.0528685955593678	0.4610329944735359	-2.9135364902300045e-05	0.5996053997134873	0.0005021076539984	0.5987416152158105	0.0017136661071865	0.3697137506294671	-8.470991149106258e-07	0.5180746068115228	1.739458554728107e-05	0.5172304656559784	-0.0003299132328197	0.5909499426346183	0.0015307974002836	0.589988409380664	HS6ST3	230866	UGGT2	267492	DNAJC3	643834	False	False	False	ref	-100	0.0701	85	0.27
1124	chr13	96325548	C	T	rs61966910	-0.130965884	0.0628085010559085	0.130965884	0.061986205040774	0.0238291791196853	0.3600374105622475	-0.0031214780771579	0.1037127844909966	0.0031214780771579	0.1024077297967026	0.0236061165913364	0.5866180154220317	-0.003270053651777	0.3101727281592297	0.003270053651777	0.30574685528579	0.0005647417907181	0.5490237619191126	-7.758136940881662e-05	0.2972765841071843	7.758136940881662e-05	0.2928148569497704	-0.0088548711688825	0.2339398858324467	0.0088548711688825	0.2300074787759028	HS6ST3	235440	UGGT2	272066	DNAJC3	648408	False	False	False	ref	-30	0.00621	-80	0.03186
1125	chr13	96331923	G	A	rs11616787	-0.04193608748	0.3536502758233816	0.04888027948	0.3509557559797426	0.0173107222818228	0.5837247229101205	-0.0007998962821649	0.4326153321792299	0.0008937553149312	0.4294476213165925	0.3416779387021213	0.0910928141461115	-0.0155126185542502	0.1342050062585042	0.0176460372412886	0.1327033143432644	0.0059371928691569	0.1364321278554497	-0.0002939587088166	0.1776024818646432	0.0003227944046986	0.1758645490089576	-0.0142192603345319	0.1608421868447166	0.0165979347431624	0.1595255915632255	HS6ST3	241815	UGGT2	278441	DNAJC3	654783	False	False	False	ref	-100	0.2341	-65	0.3586
1126	chr13	96336988	A	C	rs11620555	0.0227418777999999	0.4569100846776536	0.0298557177999999	0.4602534865425194	0.0145429035483904	0.7059670677119232	0.0003091078913556	0.5366794227484529	0.0004346598956692	0.5402666745663344	0.0017444162185344	0.9296350414460268	3.354921912867892e-05	0.8497488360141513	5.346895596818264e-05	0.853505815661062	2.719346849652675e-05	0.9341077908494376	4.755323180558937e-07	0.8571890573101151	8.270953270663656e-07	0.8609404511823385	0.0001426874731945	0.8379439346258584	0.0002317640460558	0.8417557159526219	HS6ST3	246880	UGGT2	283506	OXGR1	657742	False	False	False	alt	40	0.0501	40	0.1892
1127	chr13	96338199	A	G	rs11842501	-0.465754782	0.0022894934045063	0.465754782	0.0022858754594899	0.0588326618137596	0.0326487816400616	-0.0275005749848499	0.0037513166109828	0.0275005749848499	0.0037484073294318	0.133862294216621	0.2472862948520613	-0.0610871739342883	0.0202031658537939	0.0610871739342883	0.01988324559141	0.0078385181865487	0.1005044486847143	-0.0035924268002963	0.0119267785253429	0.0035924268002963	0.0118694305032581	-0.0857345518128731	0.0059237126739655	0.0857345518128731	0.0058688741636288	HS6ST3	248091	UGGT2	284717	OXGR1	656531	False	True	True	ref	100	0.1619	-70	0.2373
1128	chr13	96338407	C	T	rs61966935	-0.00484894794	0.4765670434224268	0.03006653526	0.4777071565678382	0.0833370458874665	0.0093491606449825	-0.0001744495447416	0.1587676716686925	0.0022944723416696	0.1596038267533635	0.1707680380060043	0.2031897576841572	-0.0010804908110393	0.2512054052916001	0.0049264625678277	0.252279682737064	0.0143224079051543	0.0436281761716571	-4.527882610786001e-05	0.1180146335511626	0.000369432992427	0.1189047789218138	-0.0012149054798588	0.2506541187470197	0.0081909207878327	0.2517005086404941	HS6ST3	248299	UGGT2	284925	OXGR1	656323	False	True	True	ref	-80	0.095	-80	0.7725
1129	chr13	96342898	G	T	rs11618566	0.0418844022	0.3480684286579717	0.0418844022	0.3525193268600254	0.0115241771209241	0.843328982785812	0.0004965084260925	0.5130388784744103	0.0004965084260925	0.5190719047743334	0.6774421827059484	0.0165941423371545	0.0270748342822144	0.0628633756769907	0.0270748342822144	0.0640700980368801	0.0076612376611746	0.1030526918819481	0.0003140185087185	0.1333154309317081	0.0003140185087185	0.1356215947060029	0.0098800765398699	0.2192150404902573	0.0098800765398699	0.2228193591436437	HS6ST3	252790	UGGT2	289416	OXGR1	651832	True	False	False	alt	5	0.01904	90	0.778
1130	chr13	101365510	G	A	rs7993037	-0.019922386	0.5003259414331874	0.0277497863999999	0.4973951910964292	0.0150299322594451	0.6896912099923737	-0.000297504057803	0.565312112523648	0.000427336971337	0.5619891968093402	0.0328692553858335	0.5427821223620537	-0.0011209921138027	0.5145522769305781	0.0011735754798986	0.511068765311907	0.0004951137585925	0.5933875415733793	-1.746838183868048e-05	0.5538940442404069	1.8340580941922552e-05	0.5504343387750421	-0.0026500280426247	0.4871030098597071	0.0028859160040908	0.4837643951400495	NALCN	50998	ITGBL1	87084	TMTC4	690417	False	False	False	ref	-70	0.0253	-90	0.1921
1131	chr13	101365522	T	C	rs114779898	0.00564347771	0.8506869874601418	0.00573879837	0.8559221671641813	0.0132828820309624	0.7660818763564502	7.32692685307538e-05	0.8748794847853034	7.434438535516648e-05	0.8807317949245724	0.0336932136848008	0.5377957006773267	8.748194985800658e-05	0.8017562877292516	9.387248464174871e-05	0.8060221197881197	0.0004359712357016	0.6107668444200047	1.1519645198185253e-06	0.8253973452856198	1.22404303180459e-06	0.8296442805157734	0.0003084688726864	0.8083687223608079	0.0003282636666556	0.8126795091896168	NALCN	50986	ITGBL1	87072	TMTC4	690429	False	False	False	alt	-80	0.02547	-100	0.2151
1132	chr13	101369769	C	T	rs17486808	-0.0403420446	0.3665440189527802	0.0403420446	0.3616708184495013	0.0470597412846812	0.0705448138765422	-0.0020474813399248	0.1878078415223038	0.0020474813399248	0.1852507540550241	0.0054633631354953	0.8148006682220563	-0.0002425743170215	0.7053341645007494	0.0002425743170215	0.6988503425823505	0.0002807022441232	0.6743456140010462	-1.321258586162505e-05	0.5749501127666372	1.321258586162505e-05	0.5689803776547437	-0.0008495265745108	0.6842408653499659	0.0008495265745108	0.6777760083846571	NALCN	46739	ITGBL1	82825	TMTC4	694676	False	False	False	ref	-25	0.006958	-100	0.1376
1133	chr13	101370676	A	G	rs61973699	0.0406203338	0.3459221234305222	0.0406203338	0.3507940650580563	0.0912344633057498	0.00651234665241	0.0039961718793017	0.086970921195201	0.0039961718793017	0.0878101296209891	0.0147034080036949	0.6788731879514788	0.0004563841475736	0.5832632081663393	0.0004563841475736	0.5892147660662214	0.0012304278127827	0.410540340880888	4.157171476959358e-05	0.3614940549153604	4.157171476959358e-05	0.3665509771178948	0.0015679126389759	0.5549581755807453	0.0015679126389759	0.5610185670597123	NALCN	45832	ITGBL1	81918	TMTC4	695583	False	True	False	alt	40	0.0608	90	0.3555
1134	chr13	101373078	T	C	rs56313970	0.00372930542	0.7356196845988219	0.0123126829	0.7366168488202183	0.0227077139876187	0.3934454509701582	7.269528068223147e-05	0.6736971486934586	0.0002763258145335	0.6750467577429151	0.0068960113490151	0.787297508920686	7.106003188801583e-05	0.8104565084306747	0.0001061352849795	0.8116398734527456	0.0001530398392683	0.7572572104051938	1.5073681246633487e-06	0.785713619647577	2.3392504706861554e-06	0.7870865163955146	0.0002358879614661	0.7965133282329224	0.0003958958793837	0.7976209466386113	NALCN	43430	ITGBL1	79516	TMTC4	697985	False	False	False	alt	-80	0.006287	15	0.0165
1135	chr13	101373348	T	G	rs55865304	0.0066510454	0.6017147747423567	0.0202691689999999	0.603188431177947	0.0335382902170061	0.1730497269996804	0.0002724971715833	0.4253862690958132	0.0007031677426164	0.4269832705685439	0.0142687473194549	0.6718154551697861	0.0002253690041843	0.6631655242476188	0.0003190260364114	0.6644724943544743	0.0004943485972936	0.573699604744243	8.573462224503799e-06	0.5793909280716755	1.144898805877786e-05	0.5810978151707622	0.0007175612813829	0.6381560044968497	0.0010804658374846	0.6398276709576355	NALCN	43160	ITGBL1	79246	TMTC4	698255	False	False	False	alt	95	0.0705	65	0.08527
1136	chr13	101373659	C	T	rs61973707	-0.017925436508	0.4725809976125912	0.028840755308	0.4696516899073357	0.0244358005653724	0.344568314598747	-0.0003494917351146	0.4525979937376442	0.0006371212782358	0.4497831171502973	0.0053445943716802	0.8145965745011591	-8.201461416286495e-05	0.7580437533490979	0.0001577279127602	0.754510053159417	0.0001260227284489	0.7765028774156095	-1.3894235431008869e-06	0.7338479717751539	3.384544503849414e-06	0.73040227585654	-0.0003076440896044	0.7336337037327149	0.00063590775626	0.7301251626139238	NALCN	42849	ITGBL1	78935	TMTC4	698566	False	False	False	ref	-100	0.01343	-100	0.0774
1137	chr13	101374409	G	A	rs12429854	0.240719224	0.0162381577899773	0.240719224	0.0163531679564256	0.0516508954854526	0.0533141006399712	0.0135762310412941	0.0154193054057833	0.0135762310412941	0.0154751222408946	0.0044604269077232	0.8434132648785093	0.0013105179401182	0.463410389392868	0.0013105179401182	0.4692777363458431	0.0002698989104428	0.6941997480248552	8.390585698296489e-05	0.3251454476083958	8.390585698296489e-05	0.329943899902459	0.0030970604730955	0.4530396401866259	0.0030970604730955	0.4589373867372131	NALCN	42099	ITGBL1	78185	TMTC4	699316	False	True	False	alt	-35	0.004395	-55	0.05457
1138	chr13	101383441	G	A	rs9585685	-0.01462187624	0.6252560928390904	0.0192174794399999	0.6217598685375806	0.0203243620679863	0.4734303986109359	-0.0003511991388429	0.5822131388999088	0.0004250004192668	0.5785391768869589	0.0616055227475173	0.4045535687214888	-0.0009695849937162	0.4651627931762127	0.0013643336654174	0.462499769876551	0.0012820259004022	0.4058306152690549	-2.414408304066227e-05	0.4600761659339762	3.0483394140387976e-05	0.4573256439389266	-0.0021295899178515	0.458499596522591	0.0030813895945365	0.4556586057347349	NALCN	33067	ITGBL1	69153	TMTC4	708348	False	False	False	ref	-50	0.004932	-100	0.2131
1139	chr13	111020256	C	T	rs9559929	-0.112133624	0.0858407316446633	0.112133624	0.0846962373428756	0.0206180407092207	0.4610410833689343	-0.002330635150992	0.1468404642462623	0.002330635150992	0.1448958800545791	0.0997814324832568	0.3116042445774265	-0.0107727838565049	0.1475485400187628	0.0107727838565049	0.1447604958537161	0.0020585040061649	0.3169501693893386	-0.0002242893368599	0.1671713037324448	0.0002242893368599	0.1644227684917374	-0.0206839101316353	0.0937228582547687	0.0206839101316353	0.0920301421660648	ARHGEF7	94304	ANKRD10	105187	TEX29	295929	False	False	False	ref	70	0.01172	5	0.04285
1140	chr13	111020704	C	T	rs9559931	-0.205104628	0.0234840510215988	0.205104628	0.0232781247176021	0.0725657162187173	0.016126071218372	-0.0153080182966125	0.0111037508071155	0.0153080182966125	0.0111078112082821	0.1662449275840453	0.216266222123872	-0.0348801805192593	0.0506100445687577	0.0348801805192593	0.0497375199842813	0.0117405886934054	0.0638288475370436	-0.0025356105244101	0.0224611196244691	0.0025356105244101	0.0221819353750517	-0.0488576754313615	0.0235636184622061	0.0488576754313615	0.0232599037672182	ARHGEF7	93856	ANKRD10	105635	TEX29	295481	False	True	False	ref	20	0.009766	35	0.0637
1141	chr13	111020707	C	G	rs9559932	-0.036753038	0.292394774347042	0.055554254	0.2914842943483242	0.0556243856085177	0.0417259551587948	-0.0030232121413169	0.1502667773063445	0.003881739555246	0.150021447651751	0.1696727260730428	0.2120536030321973	-0.0064497510354071	0.2136263423155274	0.0092712128811995	0.2126358781816537	0.0094063653413993	0.0873854425666605	-0.0005208004962442	0.1271546239234366	0.0006505052347263	0.126541460256694	-0.0098594569628187	0.1831426022480543	0.0149846590346738	0.1823104231270583	ARHGEF7	93853	ANKRD10	105638	TEX29	295478	False	False	False	ref	85	0.0105	30	0.0757
1142	chr13	111022866	T	C	rs9559934	0.03774482	0.3767630628206307	0.03774482	0.3818404739891821	0.0227578005156852	0.3942914806289195	0.0008938905529936	0.3560145882669716	0.0008938905529936	0.3605369161743923	0.015571904589093	0.6727710140301721	0.0005404584318255	0.5759115952325392	0.0005404584318255	0.5818730535436814	0.0003274905987002	0.649858353438531	1.1563937040158151e-05	0.5545754426026804	1.1563937040158151e-05	0.5603595004253956	0.001820296262083	0.5426405091041384	0.001820296262083	0.5486876182712629	ARHGEF7	91694	ANKRD10	107797	TEX29	293319	False	False	False	alt	-100	0.0111	-20	0.0443
1143	chr13	111033938	G	A	rs34061305	-0.278911384	0.0115340843768954	0.278911384	0.0114550128926834	0.0813401818623767	0.0106770537751567	-0.0247555046232708	0.0059993283484401	0.0247555046232708	0.0059551122870534	0.079925604565999	0.3543772984738716	-0.0262200253737834	0.0765289986322535	0.0262200253737834	0.0751580227806129	0.0072755411958638	0.122799046177945	-0.0025842640903018	0.0298792645138473	0.0025842640903018	0.0295734553226485	-0.044511068588961	0.0334135948123094	0.044511068588961	0.0329659976542176	ARHGEF7	80622	ANKRD10	118869	TEX29	282247	False	True	False	ref	-70	0.03986	30	0.1024
1144	chr13	111034262	T	G	rs9522088	0.11272181328	0.0949605667540382	0.11272181328	0.0959309354262804	0.0344413767897208	0.1652207449787752	0.004536429592097	0.0923991836447724	0.004536429592097	0.0932484768578442	0.0556852297845666	0.4296087430363777	0.0077039875810628	0.2136494210479746	0.0077039875810628	0.2174763152292968	0.0020738548374403	0.3287634919506074	0.0003159102910315	0.1706962962220329	0.0003159102910315	0.1737193153402223	0.0169682623470027	0.1385713267113515	0.0169682623470027	0.1410033034837069	ARHGEF7	80298	ANKRD10	119193	TEX29	281923	False	False	False	alt	100	0.01133	-100	0.11444
1145	chr13	111038211	T	C	rs9515358	-0.14506907588	0.0683675069778471	0.14565420812	0.0679942936916375	0.0629490381023166	0.0266750918508534	-0.0102815802288026	0.0397839717314035	0.0103178201356651	0.0398720361678317	0.481025865197453	0.0476339455835259	-0.0728313716195952	0.0275238475587565	0.0731780548900846	0.0271823720024397	0.0313240751495656	0.0088907887730939	-0.005324944710438	0.0173303737108332	0.0053464163859801	0.0173139108756086	-0.0465581801986077	0.0363171095871311	0.0467066411533766	0.0360922644604783	ARHGEF7	76349	ANKRD10	123142	TEX29	277974	False	False	False	ref	-100	0.02081	-90	0.2644
1146	chr13	111054544	C	T	rs9559947	0.01681830508	0.5975877400543202	0.0199196977199999	0.6020219455956974	0.0137856726024934	0.7499638215316825	0.0002304728703583	0.6653729228320906	0.0002698794690137	0.669705588387777	0.0025230114479891	0.9113021752958784	4.486586510123383e-05	0.8666547163859399	4.9866708548347205e-05	0.870584128106378	3.492356826756414e-05	0.9279282804896328	6.179194362154009e-07	0.8811491534445101	6.814606426843091e-07	0.8850625248844133	0.0001690805318201	0.8621979503099131	0.0001905248919533	0.8660681186604954	ARHGEF7	60016	ANKRD10	139475	TEX29	261641	False	False	False	alt	-10	0.000839	100	0.09485
1147	chr13	111059584	G	A	rs1888848	-0.1026451644	0.1212615813583787	0.1026451644	0.119765539482628	0.026766922073843	0.2912106854744673	-0.0029913508519136	0.1432454960558339	0.0029913508519136	0.1414670650209436	0.0729586618719276	0.3728581532244703	-0.0068513582819026	0.2205976009457546	0.0068513582819026	0.2170188208798421	0.0020405621421974	0.3256562083883541	-0.0002032779477209	0.2030464846767042	0.0002032779477209	0.199992845765926	-0.0138431592491174	0.1622499336023194	0.0138431592491174	0.1596688413313293	ARHGEF7	54976	ANKRD10	144515	TEX29	256601	False	False	False	ref	-15	0.001099	85	0.03857
1148	chr13	111059590	C	G	rs1888847	-0.0705788857	0.0977613007510741	0.1290415804999999	0.0980134176832513	0.0389238126365929	0.1254783955684661	-0.0051435502935219	0.0904488382990207	0.0067544176466683	0.0907746023487463	0.0756251855761934	0.3636725430853402	-0.0079950703014092	0.1984272563122444	0.0117279304329331	0.1984726422875913	0.0032308919849523	0.2508169075522475	-0.0005834763907926	0.1479467936806708	0.0006860561462017	0.1481621886832651	-0.0111395203061594	0.1327717631054401	0.0205057569859126	0.1331935116490876	ARHGEF7	54970	ANKRD10	144521	TEX29	256595	False	False	False	ref	-5	0.001587	-45	0.0796
1149	chr13	111059715	G	A	rs1810895	0.1013963968	0.1061818591520009	0.1013963968	0.1077147641477633	0.0557385119427892	0.0395644056351792	0.0057510860688778	0.0503183139767035	0.0057510860688778	0.0507877484277011	0.0642522516578139	0.3965908225459401	0.0067813461676917	0.2068713844557309	0.0067813461676917	0.2105105584146625	0.0037444475323997	0.2171108663296486	0.000397386448821	0.1203905526238845	0.000397386448821	0.1225651049447327	0.0149310481343406	0.1412377464246796	0.0149310481343406	0.1438208595400427	ARHGEF7	54845	ANKRD10	144646	TEX29	256470	False	False	False	alt	-100	0.05304	-45	0.1382
1150	chr13	111060764	A	G	rs75592562	0.1546134851999999	0.0426414914376093	0.1546134851999999	0.0430824229572745	0.0312518631829913	0.2065832264655739	0.0048195755287554	0.0579914180693275	0.0048195755287554	0.0586079612919768	0.0932829665797894	0.3312960328498072	0.0149272454066486	0.117786704354095	0.0149272454066486	0.1199961086537144	0.0026106235444976	0.2726924747778301	0.0004101643722387	0.109020165953969	0.0004101643722387	0.1109702551822325	0.026754313615519	0.0673181924629745	0.026754313615519	0.0685695669706651	ARHGEF7	53796	ANKRD10	145695	TEX29	255421	False	False	False	alt	100	0.00785	-45	0.01904
1151	chr13	111060796	C	A	rs74241867	-0.0471682764	0.2958774452414365	0.0529993352	0.2932114986448755	0.033192629998227	0.1780352500522608	-0.0014902733050294	0.2446523564379852	0.0016858963057024	0.2426925061185368	0.078272739269572	0.3686968388395052	-0.0017635400981737	0.3375563273749411	0.0028442270140334	0.3353056597319342	0.00267514190957	0.2815697961173959	-5.869613535547642e-05	0.2811576990300518	9.495150994411762e-05	0.278845888937701	-0.0047062122661739	0.3021915762474685	0.0065421794068159	0.2997154227958686	ARHGEF7	53764	ANKRD10	145727	TEX29	255389	False	False	False	ref	100	0.03033	95	0.0842
1152	chr14	20679686	A	G	rs2319380	0.0678251238	0.2163243502160115	0.0678251238	0.2194822378552395	0.0196788486654043	0.4900479736495842	0.0016028430225898	0.2657674633910647	0.0016028430225898	0.268992185991269	0.0138761505723994	0.675515237256778	0.001132321975605	0.5016148844269014	0.001132321975605	0.5071193730918118	0.0002876638798928	0.6728734227783828	2.851324751040557e-05	0.4966678839848467	2.851324751040557e-05	0.5022663805802571	0.0031754148658902	0.4541629921533263	0.0031754148658902	0.459583395579969	ANG	4492	RNASE4	4875	ENSG00000259171	4902	False	False	False	alt	100	0.02242	-100	0.05286
1153	chr14	20680160	C	A	rs10146921	0.708531252	0.0005372769920992	0.708531252	0.0005364799363481	0.1222535909472005	0.0017419982549749	0.0885824344860338	0.0004338080553671	0.0885824344860338	0.0004432486249614	0.1148757876678433	0.2757809869608005	0.0812307163488958	0.0126054707141745	0.0812307163488958	0.0127445744308719	0.0140823751093035	0.0441655620958987	0.0101509799138634	0.0031553171972995	0.0101509799138634	0.0031102095077303	0.0963767279205568	0.0044199784040198	0.0963767279205568	0.0044120204986987	ANG	4018	RNASE4	4401	ENSG00000259171	4428	False	True	True	alt	50	0.04016	-100	0.1621
1154	chr14	20681949	G	A	rs12587456	-0.0790524768	0.1667147182012137	0.0790524768	0.1646295021905468	0.0314109448088387	0.2080938671582012	-0.00281497966918	0.1484500192175693	0.00281497966918	0.1467918703974303	0.7246329715284879	0.0126777878710213	-0.0581365153761988	0.0256615708586492	0.0581365153761988	0.0252617538492449	0.0230541352336829	0.0177462162652562	-0.0021205365174702	0.0313407716713459	0.0021205365174702	0.0307778571329267	-0.015138068687935	0.1469799050894086	0.015138068687935	0.1445266554706846	ANG	2229	RNASE4	2612	ENSG00000259171	2639	True	False	False	ref	-90	0.03577	20	0.0415
1155	chr14	28990775	G	A	rs60652177	-0.0787920834	0.1743964870403535	0.0787920834	0.1720602037447497	0.0264708091689802	0.2936370985852315	-0.0021966354692989	0.1832698633632381	0.0021966354692989	0.1808348662756486	0.0723087328032727	0.3696428208460056	-0.004638411779967	0.2543432269690985	0.004638411779967	0.250288685393415	0.0018654693560184	0.3286811282000156	-0.0001257052357699	0.2335191968628517	0.0001257052357699	0.2298557244790789	-0.0108021840256012	0.1976917612977102	0.0108021840256012	0.1943014564156677	FOXG1	226445	PRKD1	1201123	G2E3	1568384	False	False	False	ref	-20	0.002625	-40	0.02527
1156	chr14	29000167	T	C	rs10148671	0.0212179536	0.5682141339671312	0.0212179536	0.5742397956041883	0.0248794021081709	0.3333867220846416	0.0005130850238526	0.5103079931025412	0.0005130850238526	0.5160070051287529	0.0037370921447658	0.8614888090453463	7.030725680983256e-05	0.832162997862457	7.030725680983256e-05	0.8390145292330712	0.0001000810535066	0.81893412625718	1.7482635866402615e-06	0.7967971266278023	1.7482635866402615e-06	0.8034423876374429	0.0002952723433736	0.8177965717020363	0.0002952723433736	0.8246221821427009	FOXG1	235837	PRKD1	1191731	G2E3	1558992	False	False	False	alt	-100	0.01474	25	0.0737
1157	chr14	29001268	C	T	rs1886456	-0.230589338	0.0174023145810585	0.230589338	0.0172986363118781	0.0571497907365994	0.0368997795476892	-0.0136990864440693	0.0132500291412673	0.0136990864440693	0.013198773329158	0.0289754544554781	0.552403173769775	-0.0063322057898293	0.2116309844688561	0.0063322057898293	0.2080956156655793	0.001633408382774	0.359177197599997	-0.0003764152870596	0.1205668872241339	0.0003764152870596	0.1185697788347053	-0.0146019596846029	0.1435799660045383	0.0146019596846029	0.1409442402777053	FOXG1	236938	PRKD1	1190630	G2E3	1557891	False	True	False	ref	-20	0.002441	25	0.0697
1158	chr14	29071661	A	G	rs12882564	0.0267517769	0.3487793455726586	0.0414789313	0.3515385184769839	0.0128059582830762	0.7901862580157568	0.0003200423777223	0.4882619919479886	0.0005324096316196	0.4917592131165776	0.0143256573521163	0.6815283422263988	0.0002670450847654	0.5821431083320108	0.0004757862578702	0.5855181153570411	0.0001786738695777	0.7407711984575681	3.071301790145255e-06	0.6328709726697818	6.081373429340741e-06	0.6361719757881968	0.0008363300451981	0.5507320880035422	0.0016660618257397	0.5539751285222492	FOXG1	307331	PRKD1	1120237	G2E3	1487498	False	False	False	alt	40	0.01242	55	0.0547
1159	chr14	29256150	A	C	rs1956235	-0.1154077569999999	0.0861074442848924	0.1154077569999999	0.0848250421750039	0.0340077485452516	0.1716826439921695	-0.004295944632861	0.0826523999206271	0.004295944632861	0.0816378902022195	0.00050311768005	0.9883323101704526	-6.077424425352971e-05	0.8489169858412147	6.077424425352971e-05	0.842095915933009	1.724551680360783e-05	0.9644992313810652	-2.3116059043536056e-06	0.7786625567270413	2.3116059043536056e-06	0.7719981484002366	-0.0001765035795585	0.8694111905075986	0.0001765035795585	0.8625416866058716	FOXG1	491820	PRKD1	935748	G2E3	1303009	False	False	False	ref	-35	0.05762	-95	0.1482
1160	chr14	29262456	A	T	rs4636809	0.00111928626	0.8973028899620527	0.0043547262599999	0.8983376637561992	0.0096862528800636	0.9227911728067584	1.1445519333057649e-05	0.9297240117551824	4.43175651831557e-05	0.9308412742454282	0.0031358252779518	0.8811444079598181	3.031445976054776e-06	0.9560978377003048	9.615796848013848e-06	0.9572794469877371	2.938513608317013e-05	0.9320516522301772	2.7873610302927053e-08	0.969231783074392	9.564838303436481e-08	0.9703684931501708	1.4021312394840072e-05	0.959427937603401	3.381610636402628e-05	0.9605925253299626	FOXG1	498126	PRKD1	929442	G2E3	1296703	False	False	False	alt	100	0.02652	-75	0.04346
1161	chr14	29531826	A	T	rs1191547	0.01124823308	0.6742488632010173	0.01486086868	0.6786807595650963	0.0130092401838252	0.7728651925337464	0.0001462300617227	0.726895793750565	0.0001983678240878	0.7312661991318316	0.157310052456204	0.2206466315459883	0.0012171222552535	0.3533388060876398	0.0022445619861372	0.3566710642619811	0.0021164229977411	0.3130655887318748	1.5683303889952267e-05	0.4183973647122184	3.051137226343338e-05	0.4218362651443329	0.002838078585332	0.3824796841163031	0.0039927749002011	0.3859533384419882	PRKD1	660072	FOXG1	767496	G2E3	1027333	False	False	False	alt	-100	0.02547	-100	0.1766
1162	chr14	29601703	G	T	rs3783301	0.198092392	0.02918125511159	0.198092392	0.0294437667375507	0.0324167084521622	0.1889081316963197	0.00697663971243	0.0440851413952553	0.00697663971243	0.0445829542505637	0.103522648543433	0.301126804835486	0.0244864307484068	0.0825599182051689	0.0244864307484068	0.0840728253432224	0.0036444331598325	0.2235155432243104	0.0009397558508818	0.0754664938510985	0.0009397558508818	0.0766556550982168	0.0398865098479099	0.0406696836460981	0.0398865098479099	0.0412788798059466	PRKD1	590195	FOXG1	837373	G2E3	957456	False	False	False	alt	-85	0.0702	85	0.1952
1163	chr14	29614498	T	G	rs10149921	-0.0265200746	0.5085497757885902	0.0265200746	0.5026776777584852	0.0369040355476357	0.1359112288553415	-0.0009666819489495	0.3284499917958142	0.0009666819489495	0.3239393007635044	0.0123923658077924	0.6895785405779532	-0.00034217950326	0.6400275615500968	0.00034217950326	0.633937823615876	0.0004383265412142	0.5825577777818581	-1.1985659979156156e-05	0.5486609806372031	1.1985659979156156e-05	0.5428883417889993	-0.0011612945795255	0.6219810953912597	0.0011612945795255	0.6159286602393054	PRKD1	577400	FOXG1	850168	G2E3	944661	False	False	False	ref	100	0.03516	-85	0.012436
1164	chr14	29678684	C	A	rs7158984	0.0230456556	0.5525954941807563	0.0230456556	0.5585856163389946	0.0219686132665123	0.4163240993874254	0.0005169496310727	0.4978630747118457	0.0005169496310727	0.5034174693087087	0.0203135825277951	0.6067241362136774	0.0004288141056191	0.5882563350963732	0.0004288141056191	0.5941866791547834	0.0004420410480083	0.5848620799955019	9.49184532174989e-06	0.566133380123065	9.49184532174989e-06	0.5720163470484024	0.0014235755996172	0.5680059646342089	0.0014235755996172	0.5740986119084039	PRKD1	513214	G2E3	880475	FOXG1	914354	False	False	False	alt	-45	0.001278	95	0.07214
1165	chr14	29695765	C	T	rs10150918	-0.191353307	0.0307171794777476	0.191353307	0.0304117288793866	0.0417151865773995	0.1021045825656631	-0.0090074536428117	0.0323053304444302	0.0090074536428117	0.0320788708081696	0.0118983207416449	0.712538672202998	-0.0028805586128993	0.3645958017741564	0.0028805586128993	0.3597306899398828	0.0005923182145779	0.5693479500966084	-0.0001532165509716	0.2678441620843751	0.0001532165509716	0.2640224862896694	-0.00691003266141	0.3046496706418816	0.00691003266141	0.3001282269418667	PRKD1	496133	G2E3	863394	SCFD1	926527	False	False	False	ref	95	0.03094	100	0.0893
1166	chr14	29700781	T	G	rs959388	0.2086907939999999	0.0216976446122159	0.2086907939999999	0.0218571726941115	0.0341352053799878	0.1651035460815287	0.0071548521033364	0.0334416036197929	0.0071548521033364	0.0337192689556893	0.3015373956649401	0.1095020190342644	0.0660282623423947	0.0194327571335804	0.0660282623423947	0.0197458567194268	0.0102378516984498	0.0730899938126124	0.0022544055998715	0.0229915690951014	0.0022544055998715	0.0233327436455057	0.0667645409257365	0.0110565280201192	0.0667645409257365	0.0111789221403785	PRKD1	491117	G2E3	858378	SCFD1	921511	False	False	False	alt	100	0.2747	100	0.9766
1167	chr14	29705233	T	C	rs7140901	0.0004826969939999	0.8034230887114485	0.008411522194	0.8044729224346155	0.0177878427045678	0.5687742716427708	9.70887401192472e-06	0.7865357558569648	0.0001500928079673	0.787644685610464	0.0388984197156147	0.4881426407555523	-7.826264564408841e-05	0.6742277702843588	0.0002834604629469	0.6749557397927618	0.0006950179786711	0.50704727180271	-1.3983404925855617e-06	0.6765179464147386	5.096052855376724e-06	0.6772180780871812	-0.0002119692520867	0.6797869861580161	0.0008651974530697	0.6805860624084813	PRKD1	486665	G2E3	853926	SCFD1	917059	False	False	False	alt	-95	0.0637	-5	0.0119
1168	chr14	32737301	T	C	rs17440692	-0.008743716214	0.7926720270015668	0.009953549014	0.7883198035128521	0.0249695516002994	0.3313768477465715	-0.0002268518806686	0.7093759492833909	0.0002605594116163	0.7051861991476297	0.0063120649269241	0.7953200628821184	-6.580736287264586e-05	0.8629260693116821	7.147015959612054e-05	0.8586535548350167	0.0001513280758362	0.7550036686654549	-1.6463317219056768e-06	0.8301584764092642	1.804104674075293e-06	0.8260765957857896	-0.0002466101415327	0.8576326561718395	0.0002647553693378	0.8533872097165097	NPAS3	197096	AKAP6	408002	ARHGAP5	661186	False	False	False	ref	-100	0.01004	70	0.06744
1169	chr14	32741769	T	G	rs73266980	0.0491247788	0.3061133313128563	0.0491247788	0.3101490044700542	0.030045864865536	0.2232426055149998	0.0014729235945992	0.2551832011178243	0.0014729235945992	0.2583685401857746	0.004490119098677	0.8353024862289925	0.0002074951776155	0.7085327300255279	0.0002074951776155	0.7148951284613233	0.0001358802197461	0.7671168510558912	6.308234860258878e-06	0.6427414266608421	6.308234860258878e-06	0.6490914786541904	0.0007579756524033	0.6875389074840569	0.0007579756524033	0.6939898798836637	NPAS3	192628	AKAP6	412470	ARHGAP5	665654	False	False	False	alt	-55	0.01776	-45	0.002075
1170	chr14	32833853	A	T	rs12882859	-0.00283019814	0.8842794084057438	0.00493972794	0.8824526012736766	0.0128629165866587	0.7841502868333771	-3.144248373271776e-05	0.9081783534280986	5.972903817586268e-05	0.9064742582638068	0.0047317805417174	0.8396904692031218	-1.310180835892575e-05	0.9223314837286904	2.3491754164890805e-05	0.9206846653333411	6.267474096970438e-05	0.8739388473354559	-1.6191931070998526e-07	0.935193072123922	3.008054952846583e-07	0.9335557083048808	-5.3610900333185714e-05	0.9173293880514384	9.155092210745928e-05	0.9157205462530736	NPAS3	100544	AKAP6	504554	ARHGAP5	757738	False	False	False	ref	100	0.00873	15	0.01535
1171	chr14	32836003	C	G	rs12894833	0.215539694	0.0208474895247778	0.215539694	0.0209989969319306	0.0225002389342361	0.3979718296593323	0.0049236108496118	0.0590223893399948	0.0049236108496118	0.0595496319696472	0.7120731747550394	0.0135694984665664	0.1549250818254994	0.0038567895221736	0.1549250818254994	0.0038342176777167	0.0161755573709006	0.0347984290783273	0.0035752841312291	0.0129951715767491	0.0035752841312291	0.0130780995388028	0.0447469565504271	0.0263833161882201	0.0447469565504271	0.026819750563327	NPAS3	98394	AKAP6	506704	ARHGAP5	759888	True	False	False	alt	65	0.0188	5	0.02246
1172	chr14	32836293	T	G	rs12896446	0.009061330798	0.7793486202739063	0.009551383802	0.7824504732207092	0.0175657614268406	0.579616012703513	0.0001625995324518	0.7692384480226212	0.0001721411761288	0.7724079760023612	0.4637045956913331	0.0520279424252166	0.0035783329590374	0.3241061235264657	0.0038362904484994	0.3264897527563041	0.0080759998568028	0.0970788495085137	6.417268172773418e-05	0.355233345391432	6.914379256470143e-05	0.3575177732453924	0.0031143809178186	0.4785654729478116	0.0032529444756029	0.4817164269346368	NPAS3	98104	AKAP6	506994	ARHGAP5	760178	True	False	False	alt	-100	0.1638	-100	0.6533
1173	chr14	32839824	T	G	rs7140259	0.0137227337399999	0.708240627444496	0.0140950586599999	0.7128253784645945	0.0126760143358502	0.7961662189404163	0.0001962107162217	0.7535533044858898	0.0002000026869949	0.7581719812623029	0.0029453003859984	0.8835344196161504	5.259820457404912e-05	0.8722717064515904	5.332139517427415e-05	0.8766778812969709	4.007620440886987e-05	0.9092073901781684	7.99875168209787e-07	0.8851976438190455	8.072405563288346e-07	0.8896264783719698	0.0001765035795585	0.8698510922644981	0.0001831018442149	0.8742675780614138	NPAS3	94573	AKAP6	510525	ARHGAP5	763709	False	False	False	alt	100	0.01962	60	0.07007
1174	chr14	32840087	C	A	rs7161135	-0.0219816967799999	0.5827692452815816	0.0219816967799999	0.5763774365486137	0.0276364303377565	0.2713910131383265	-0.0006213932935278	0.4833748051294415	0.0006213932935278	0.4777998005642752	0.0035861568407508	0.8595740501355456	-7.975544910200439e-05	0.8358705698122546	7.975544910200439e-05	0.8291161621064808	9.59633160740094e-05	0.8112125358475546	-2.190939393311592e-06	0.7901859027809838	2.190939393311592e-06	0.7835365756312612	-0.000301045824948	0.8275871735614737	0.000301045824948	0.8208297129287921	NPAS3	94310	AKAP6	510788	ARHGAP5	763972	False	False	False	ref	-55	0.02493	30	0.02168
1175	chr14	32870195	T	C	rs12434588	0.04953682248	0.3297533319412072	0.05091570552	0.3317329490839704	0.0152395987974959	0.6674717342486693	0.0010880270583449	0.4210767538743308	0.0011057533493486	0.4235936131651657	0.0011711919765101	0.9615868075822868	8.643884960559306e-05	0.8547257077696475	8.67572878406313e-05	0.8596191077116615	2.0714908580899697e-05	0.9603483767528448	1.9825383778059504e-06	0.8510029506949666	1.986632074385608e-06	0.8560805339169154	0.0002672297185839	0.852249825053884	0.0002705288509121	0.8563001838626422	NPAS3	64202	AKAP6	540896	ARHGAP5	794080	False	False	False	alt	55	0.007324	-90	0.0907
1176	chr14	33186914	A	G	rs12887688	-0.029309538	0.1241977755677055	0.090436934	0.1238040492308659	0.0249418761420044	0.3293501615888422	-0.0008967812297299	0.149913486815139	0.0022921840125946	0.1493436851321739	0.1146976345221206	0.2938103329751312	0.0007639991481819	0.1661760444949019	0.00937362705102	0.1656104381607553	0.0026215490168663	0.2795366936090779	-4.188518765597547e-06	0.1686384415023477	0.0002216507576105	0.1680016842221116	-0.0012899607403252	0.1173603940620385	0.0173715812741248	0.1170188948161842	NPAS3	252517	AKAP6	857615	ARHGAP5	1110799	False	False	False	ref	-100	0.063	-60	0.115
1177	chr14	35006989	A	G	rs10133628	-0.0698236246	0.1948030188153391	0.0698236246	0.1920655734837441	0.0286964750654001	0.2518799426756538	-0.0021863305283605	0.1759028825672164	0.0021863305283605	0.1735925495020399	0.0045668239253076	0.8341427132839961	-0.000301535921791	0.6570582062783392	0.000301535921791	0.6508499080288244	0.000126847467705	0.7777787307003794	-9.052324256545496e-06	0.5976578299208571	9.052324256545496e-06	0.5916305638552305	-0.0010845897528949	0.6305943475171818	0.0010845897528949	0.6243946106389222	SRP54	25031	FAM177A1	38129	PRORP	114858	False	False	False	ref	80	0.0452	-55	0.07025
1178	chr14	35007770	T	C	rs72474105	-0.00139275536	0.8834765283948245	0.00510688924	0.8816229464790831	0.0170669891862724	0.5996844112462765	-2.3802173954917e-05	0.8672743138678584	8.84754360770865e-05	0.8652609371406558	0.0174878756886938	0.6497745853537146	-7.922870915611652e-09	0.82144449594907	7.354065097203041e-05	0.8197349134104293	0.000287461514931	0.6700574879883187	-3.2385073919671973e-08	0.8213805437350233	1.2420823118870606e-06	0.8197335053594834	-2.556827554353661e-05	0.8289145877932153	0.0002499092738609	0.8270592821463653	SRP54	25812	FAM177A1	37348	PRORP	114077	False	False	False	ref	-100	0.007736	-100	0.12225
1179	chr14	51182363	G	A	rs61985092	0.173003146	0.039859940366034	0.173003146	0.0402521846275833	0.0399664726642413	0.1110768256657882	0.0072700113731702	0.040382029530202	0.0072700113731702	0.040601220490323	0.5595155224176042	0.0329073035130237	0.099288765266749	0.0105777929161616	0.099288765266749	0.0106772643867345	0.0220125655582394	0.0187548888620444	0.0040919415621233	0.0124583725186099	0.0040919415621233	0.0126312796381394	0.0502614562370095	0.0224856584721906	0.0502614562370095	0.0227227599569185	TMX1	57800	TRIM9	86302	PYGL	237880	True	False	False	alt	-100	0.0973	-95	0.4512
1180	chr14	51241212	T	C	rs75682793	0.0424906243999999	0.3331779716939763	0.0424906243999999	0.3376775312600469	0.0135305606535443	0.7581668169069953	0.0006130835648185	0.4553618555048469	0.0006130835648185	0.4607058981938237	0.0869222394510243	0.3319032180366771	0.0035274716888345	0.2867761582662186	0.0035274716888345	0.2911228825882317	0.0011584110032153	0.4136944943656571	4.943484624864632e-05	0.348939687128281	4.943484624864632e-05	0.35378890879093	0.0077422387911978	0.2505752815109008	0.0077422387911978	0.2546527960879909	TMX1	1049	TRIM9	145151	FRMD6	247889	False	False	False	alt	85	0.1748	75	0.0814
1181	chr14	59450826	T	G	rs112261101	0.0521699156	0.2804934532516425	0.0521699156	0.2845236224582204	0.112389515906217	0.0026174416899217	0.0063419042846306	0.0511151938885609	0.0063419042846306	0.0516666828572094	0.1622571013823364	0.2118191955394581	0.0081811513753327	0.1774817422601078	0.0081811513753327	0.1807485617968955	0.017964281515499	0.0288445087565397	0.0009616988404613	0.0567874759677072	0.0009616988404613	0.0578185938103053	0.0138142918412457	0.1516794070914159	0.0138142918412457	0.1544134609099544	GPR135	14554	L3HYPDH	33582	JKAMP	33618	False	True	True	alt	100	0.01563	-5	0.001953
1182	chr14	59452013	C	T	rs113869004	-0.0497676534	0.2961756930579077	0.0497676534	0.2921428354412406	0.0180708991043087	0.5441909588725924	-0.0009726955000186	0.3488616274175314	0.0009726955000186	0.3444034521396913	0.0050765398700141	0.8262473032107144	-0.0002646569603933	0.6862861269613008	0.0002646569603933	0.6799233083043172	9.59717265627748e-05	0.8232591051166052	-5.269477309028549e-06	0.682193535954955	5.269477309028549e-06	0.675821040307596	-0.0009715944706541	0.6594173466349995	0.0009715944706541	0.6531206331280863	GPR135	13367	L3HYPDH	32395	JKAMP	32431	False	False	False	ref	80	0.02113	-100	0.1381
1183	chr14	59453473	T	C	rs111476301	-0.0284699420799999	0.2989428971855999	0.06113788968	0.2996367704594735	0.0172960636915145	0.5840845516946909	-0.0009405340219517	0.3764556165617794	0.0014327059890421	0.3772544389236391	0.0856570222031605	0.3497868810878136	-0.0011785132737822	0.3221231281102606	0.0038157903573929	0.3224548057759815	0.0013727416696656	0.3936478674927591	-4.726028048582842e-05	0.3489754363873685	8.536535401669854e-05	0.3493946613092821	-0.0027720959387681	0.2878896496162552	0.0079418362970538	0.2883314928081061	GPR135	11907	L3HYPDH	30935	JKAMP	30971	False	False	False	ref	-65	0.01599	-65	0.1033
1184	chr14	59473086	G	A	rs1046701	-0.0367663186	0.4034197002254205	0.0367663186	0.3983562546210068	0.0184017041969289	0.5423473156366154	-0.0007172102689629	0.4307227208302525	0.0007172102689629	0.4254080635344356	0.0019836033123288	0.9232702585864678	-6.85531333856802e-05	0.8347028553499809	6.85531333856802e-05	0.8279448897523799	3.4870249647994026e-05	0.9185092537672482	-1.248743393620528e-06	0.8265940331180144	1.248743393620528e-06	0.819887775868022	-0.0002779518986506	0.8229835694897675	0.0002779518986506	0.8163585158233675	GPR135	7706	L3HYPDH	11322	JKAMP	11358	False	False	False	ref	100	0.063	-75	0.0668
1185	chr14	59480112	T	C	rs1253099	0.0618161365999999	0.2201901769022721	0.0618161365999999	0.223249710562348	0.0319293379687024	0.1947555681673653	0.0020695059547022	0.1735433826493945	0.0020695059547022	0.1758066233976926	0.0071970571739632	0.7709464071500477	0.0004852654408179	0.5872610613941144	0.0004852654408179	0.5934737540255498	0.0002364161745791	0.6882034567923679	1.6637372763333916e-05	0.5104046523268737	1.6637372763333916e-05	0.5163452384987298	0.0017163735937448	0.5496110048732589	0.0017163735937448	0.5558850805567536	L3HYPDH	4296	JKAMP	4332	GPR135	14732	False	False	False	alt	95	0.03955	25	0.1048
1186	chr14	59481143	C	T	rs1253102	0.0029864554799999	0.8373100596687691	0.00732516492	0.8384259107862783	0.0460751774625415	0.0725995323991218	0.000110014385305	0.611118599535877	0.000332684567286	0.6122606274411668	0.001086239319059	0.9652448882680216	5.289845427975759e-06	0.9646958912067032	8.328412254964214e-06	0.9658644238683584	4.836598969626422e-05	0.89357605548771	2.1075489158612481e-07	0.9183111503008544	3.667242871187946e-07	0.9194643127901948	2.226914321533434e-05	0.9616543399766424	3.381610636402626e-05	0.9628335638524074	L3HYPDH	3265	JKAMP	3301	GPR135	15763	False	False	False	alt	-65	0.02367	90	0.0919
1187	chr14	59530395	A	G	rs111758996	-0.0019911913	0.7141417369284379	0.0135252088999999	0.7123116480742576	0.028264785641094	0.2576908363040629	-6.601796226402e-05	0.5788876251516587	0.0003863267906025	0.5776061437319355	0.0003365114974761	0.994801117556022	-1.129269320035387e-06	0.98054691761367	4.311073433024891e-06	0.97884704199208	9.263717209949378e-06	0.98475337332979	-3.489124313576936e-08	0.9654901737455172	1.199570478373274e-07	0.9637439435941992	-1.2371746230741309e-05	0.9704594940481064	2.3918709379433213e-05	0.9686892794319296	JKAMP	45951	L3HYPDH	45987	CCDC175	46417	False	False	False	ref	-45	0.02173	100	0.0721
1188	chr14	70892347	G	T	rs2526886	0.00785516382	0.7140625007374	0.0127297831	0.7159855329733558	0.0446290903537675	0.0804551666695972	0.0003992142364718	0.4746804228457829	0.0005959866292832	0.4766381425878661	0.018392662729702	0.6401792808262504	0.0001315662121272	0.7161852127221271	0.0001926394887178	0.717523121030316	0.0007449433601075	0.5008876279577962	5.878342757153276e-06	0.6015906887344813	8.326640370120245e-06	0.6031792993183664	0.0004363102504041	0.7063648051050428	0.0006771469103625	0.7077511546883781	PCNX1	15059	MAP3K9	82813	TTC9	250430	False	False	False	alt	-60	0.115	85	0.145
1189	chr14	70917131	T	C	rs2810073	-0.031887798	0.4511998712880831	0.031887798	0.4458843063207558	0.0243696161623698	0.3462050243972849	-0.0007722708748346	0.4020646300837083	0.0007722708748346	0.3972099016958704	0.0074395434000857	0.7978234732989878	-0.0003267787722982	0.7150789013709286	0.0003267787722982	0.7087316443551226	0.0001836787994845	0.758456823506386	-8.017330451628874e-06	0.6793939271970916	8.017330451628874e-06	0.673006832068428	-0.0010227310217412	0.6871794995575337	0.0010227310217412	0.6809148132896993	PCNX1	9725	MAP3K9	107597	TTC9	275214	False	False	False	ref	-100	0.03607	-100	0.3235
1190	chr14	70921681	T	A	rs2189806	0.0091635406	0.7404722807917277	0.0114553514	0.7450957977919312	0.0141249502317902	0.7273944864999808	0.0001389076920848	0.762463585941161	0.0001679842233565	0.7669550846563873	0.0036694599320377	0.8630320015626356	2.677167736315006e-05	0.8738743301685346	3.769730412877536e-05	0.8783365813411603	4.810091503938902e-05	0.8904719746849058	3.675699217909702e-07	0.8865002840828036	5.061849054192899e-07	0.8910212876209537	0.0001228926792253	0.8630648828532497	0.0001641318333277	0.8674973095396381	PCNX1	14275	MAP3K9	112147	TTC9	279764	False	False	False	alt	40	0.010826	-10	0.00827
1191	chr14	70936594	T	C	rs2332477	0.19670735	0.0258956686767603	0.19670735	0.026070878842035	0.0252599130660317	0.3242148195033365	0.0052048384890321	0.0572402682323315	0.0052048384890321	0.0577518463976084	0.0120805978027778	0.8165097321923726	0.0017370452291316	0.5315573425157324	0.0017370452291316	0.5373594129142032	0.0002874946999531	0.7969631140968747	4.134015231452285e-05	0.5098185813486514	4.134015231452285e-05	0.5153849798912644	0.0039086470258321	0.4988276476198173	0.0039086470258321	0.5043495535620637	PCNX1	29188	MAP3K9	127060	TTC9	294677	False	False	False	alt	60	0.02136	-90	0.05457
1192	chr14	70940939	A	G	rs2097866	0.186827062	0.0281376319794604	0.186827062	0.0284238663172544	0.0308749626479065	0.216697199956326	0.0059494894411131	0.047306424491946	0.0059494894411131	0.0476154763588317	0.0020611329220414	0.9218657119141664	0.0004012391796103	0.615455399889597	0.0004012391796103	0.6216504092659974	6.4795428571049e-05	0.8732027399387218	1.3124992067248272e-05	0.5513000261023855	1.3124992067248272e-05	0.5571645569960078	0.001135726303982	0.6209353026129603	0.001135726303982	0.6271315700465016	PCNX1	33533	MAP3K9	131405	TTC9	299022	False	False	False	alt	-60	0.00871	100	0.118
1193	chr14	70945161	T	C	rs2526860	-0.186073266	0.0323547118082945	0.186073266	0.0320991036535403	0.0477583333023934	0.0650392755729551	-0.0093963291582305	0.0264667671018043	0.0093963291582305	0.026332424339181	0.0933794662003892	0.3280224839913397	-0.0190099847036131	0.1020648608539575	0.0190099847036131	0.1002998601018832	0.0045570864268145	0.1846567890144982	-0.0009738594468601	0.0657990433130998	0.0009738594468601	0.064683805471417	-0.0334548513740885	0.0513213258248692	0.0334548513740885	0.050476745121114	PCNX1	37755	MAP3K9	135627	TTC9	303244	False	False	False	ref	-90	0.02368	-75	0.0957
1194	chr14	70991112	T	C	rs7157250	0.1122113544	0.0881898599645818	0.1122113544	0.0893550035845189	0.0309978193797663	0.2084966890893064	0.0034817045468781	0.094424054406377	0.0034817045468781	0.0955567230363411	0.0249628847613077	0.6001067173877666	0.0029305774247561	0.347276234350623	0.0029305774247561	0.3519806190598504	0.0007930179798434	0.5165994314266282	9.362549452615578e-05	0.2967872931499871	9.362549452615578e-05	0.3010261585942305	0.0075434660684239	0.2771720043212051	0.0075434660684239	0.2813350677679523	PCNX1	83706	MAP3K9	181578	SIPA1L1	329338	False	False	False	alt	45	0.1289	30	0.03162
1195	chr14	71005509	A	G	rs67981189	0.0698665441399999	0.2250382546337427	0.07071810786	0.2272444757432899	0.0665371837110143	0.022501801563112	0.0040857246680822	0.1138480689236882	0.0041599965535795	0.1143897919676243	0.0329195671538385	0.5311901584637491	0.0025972216070765	0.4185337864105389	0.0026246801900084	0.4220422212372149	0.0022196244628597	0.3161146558998458	0.0001466891354696	0.2765556509135305	0.0001490840245886	0.2792691715214181	0.0061165913364784	0.3594773806475176	0.0061957705123552	0.3628866586839923	PCNX1	98103	MAP3K9	195975	SIPA1L1	314941	False	False	False	alt	85	0.005646	100	0.2408
1196	chr14	71010328	A	G	rs7146932	0.0231983566	0.4584863540692687	0.0302049861999999	0.4622692510593631	0.0116956916786901	0.843750678421804	0.0002627252337142	0.5973688376854925	0.0003472271038593	0.6016755931913591	0.0084837187819602	0.7468306099892557	0.0001480999811874	0.6753309823583927	0.0002320681177176	0.6792520377418813	0.0001008580453793	0.8056766497317543	1.7004718406177926e-06	0.7268260450760451	2.7131505490150795e-06	0.7309215494670749	0.0005633268450397	0.6613318446526064	0.0008322061297878	0.6653711216196009	PCNX1	102922	MAP3K9	200794	SIPA1L1	310122	False	False	False	alt	100	0.03546	-70	0.0815
1197	chr14	71028571	C	T	rs34488204	0.0049052089476	0.8812890365198962	0.0049052089476	0.888179012505775	0.0208168118035956	0.4576259618046106	0.0001136896772216	0.8475745249742875	0.0001136896772216	0.8542250436148068	0.0053239747946289	0.8150223846459775	1.729017293607209e-05	0.935042345258084	1.729017293607209e-05	0.941956672340808	0.0001125811525606	0.7971185146762022	3.9030945731448083e-07	0.9237222185593524	3.9030945731448083e-07	0.9306455761875152	7.093134505624649e-05	0.9282115214701456	7.093134505624649e-05	0.934206567659494	PCNX1	121165	MAP3K9	219037	SIPA1L1	291879	False	False	False	alt	95	0.04428	100	0.1142
1198	chr14	71028982	C	T	rs3814869	0.0053454703459999	0.8747234802488882	0.005355583014	0.8813843881862234	0.0146627376819235	0.7086091408721111	7.356972910257111e-05	0.8885423926246574	7.372854791334982e-05	0.8951521052471403	0.0072968559268911	0.7711227307729477	2.838769154748457e-05	0.9074964486349668	2.84808161043066e-05	0.9138910140863276	0.0001064126883448	0.7993857856014848	3.879207619283765e-07	0.915795365258508	3.893832772052925e-07	0.9221398404036616	0.0001146448484048	0.9020474937905756	0.0001146448484048	0.9078253283212504	PCNX1	121576	MAP3K9	219448	SIPA1L1	291468	False	False	False	alt	-100	0.01549	-100	0.04626
1199	chr14	71060982	A	G	rs4048474	-0.0221792608	0.5647892057756022	0.0221792608	0.5586622958814297	0.031116829720595	0.2060874934703022	-0.0006902623469934	0.4349129671647414	0.0006902623469934	0.4298656812779219	0.1923682821417966	0.1866027716206322	-0.0052512299147103	0.2705850140341244	0.0052512299147103	0.2668006993227257	0.0058863094129353	0.1417384576291414	-0.0001625375126917	0.2332186363397157	0.0001625375126917	0.2296334566930787	-0.0069224044076407	0.2976772642478129	0.0069224044076407	0.2933076441500726	PCNX1	153576	MAP3K9	251448	SIPA1L1	259468	False	False	False	ref	30	0.00795	100	0.06097
1200	chr14	71117756	T	C	rs221923	0.0203399588	0.4688586553604247	0.0305971807999999	0.4707459290425083	0.0312332336645968	0.215926648969955	0.0009100502909132	0.3556927963822462	0.0011074517417096	0.3568240889269575	0.0532974827620335	0.4297127207369277	0.0015957665785455	0.4134476066547721	0.0019559462220957	0.4150258697042808	0.0018498236966156	0.3527771616323481	6.992340192801819e-05	0.3547873967397065	7.671081302628306e-05	0.356423934123185	0.0034838837385767	0.3828394649185835	0.0045264095542871	0.3844413079909851	SIPA1L1	202694	PCNX1	210350	MAP3K9	308222	False	False	False	alt	5	0.003265	-25	0.0481
1201	chr14	71253368	G	C	rs75982415	0.01886163452	0.6196244727421345	0.01886163452	0.6260377502489027	0.022994069147461	0.3858051568830363	0.0004931744808799	0.547870003130908	0.0004931744808799	0.5537739175525794	0.0028133350928705	0.8874364784227643	4.8101253442420295e-05	0.8592074591805314	4.8101253442420295e-05	0.8661330213188435	6.143208818368939e-05	0.8627922820760354	1.234632475547332e-06	0.8299133172476961	1.234632475547332e-06	0.836690405993025	0.0001921744581174	0.849733189408679	0.0001921744581174	0.8565960906961724	SIPA1L1	67082	PCNX1	345962	MAP3K9	443834	False	False	False	alt	60	0.00354	-100	0.07837
1202	chr14	71255117	C	T	rs142859468	-0.2121381667999999	0.0219454483519675	0.2121381667999999	0.0217887676747984	0.0333918430860743	0.1756319184878372	-0.007558363849719	0.0353259735421788	0.007558363849719	0.0350917144875174	0.0866558345155223	0.3917578567916417	-0.0211669198662078	0.122970973839516	0.0211669198662078	0.1209581213362122	0.003147425441717	0.2994544986053353	-0.0007892435421063	0.1088696058070377	0.0007892435421063	0.1072308892961498	-0.0330342120022433	0.0688069786097868	0.0330342120022433	0.0677289361166123	SIPA1L1	65333	PCNX1	347711	MAP3K9	445583	False	False	False	ref	-100	0.04208	90	0.1814
1203	chr14	71271317	G	A	rs57923981	-0.1055342881999999	0.1140885309817126	0.1134550658	0.1136214690799097	0.0473078556961563	0.0677054036224396	-0.0058488528353954	0.0744207562712115	0.0061466064467784	0.074179863035247	0.1511159315100128	0.2332357031123819	-0.0234155195205192	0.1090666214325556	0.0240542761180993	0.1077653722540687	0.0077148004946854	0.114336340367407	-0.0013154176883377	0.0741717944889279	0.0013394294822022	0.0734766748319051	-0.0306646102075154	0.0719856682773626	0.0322086041371118	0.0714785438756022	SIPA1L1	49133	PCNX1	363911	MAP3K9	461783	False	False	False	ref	50	0.01624	55	0.1733
1204	chr14	71299193	A	G	rs723966	0.0001637488999999	0.8319639317117353	0.00776723134	0.8308635324242175	0.0089860609661344	0.9505943411415892	2.738844058060341e-06	0.8998063830862	7.21315823635048e-05	0.8986608098707021	0.007878327999736	0.7582835236198692	-7.804629135114233e-07	0.8613825974128173	6.259257338752686e-05	0.8601399134774295	7.088794025160016e-05	0.8494328609586895	2.021611177025201e-09	0.9050992737175246	5.812913762990909e-07	0.9037684376297542	-1.2371746230750692e-05	0.8512219956801679	0.0002301144798917	0.8500684838706285	SIPA1L1	21257	PCNX1	391787	MAP3K9	489659	False	False	False	alt	100	0.11774	100	0.2595
1205	chr14	71301356	C	T	rs61991204	-0.01639792542	0.6311854246875448	0.01767448118	0.6266723315400897	0.0073937133491372	0.9817192972876037	-0.0001137471067684	0.821873879270793	0.0001245347756134	0.8172836635147636	0.5649731120715252	0.0319811318386103	-0.0098658340171772	0.1586526969612879	0.0104783899952829	0.1565607353479508	0.0041424302129817	0.1880088939163482	-6.831054196505271e-05	0.3068139332490455	7.348701078605373e-05	0.3036513301738528	-0.0045090891095641	0.3536487876556342	0.0049033354227837	0.3502865851333847	SIPA1L1	19094	PCNX1	393950	MAP3K9	491822	False	False	False	ref	-35	0.001282	100	0.1953
1206	chr14	71305380	G	T	rs78053899	-0.0228095284	0.5406635042225675	0.0258767564	0.5373882265006781	0.0123602430470841	0.802680621228055	-0.0003676761344647	0.6388700986739676	0.000393033390697	0.6351017070862233	0.0799066345551119	0.3691549635559367	-0.0036993890063752	0.3932237749112737	0.0037863761027966	0.3902613218317927	0.001179197331822	0.4581421394338075	-6.288994966770336e-05	0.4645368694830627	6.360908567075988e-05	0.461241019242794	-0.0055945036455412	0.3705404821326964	0.0059706047309557	0.3677161990338637	SIPA1L1	15070	PCNX1	397974	MAP3K9	495846	False	False	False	ref	-60	0.02258	-20	0.013336
1207	chr14	71307335	T	G	rs1990241	0.0197513626419999	0.5943056048836343	0.0197513626419999	0.6004745650432828	0.0297813479068219	0.2290353341013701	0.0005909510982414	0.4758192443548108	0.0005909510982414	0.4813464910080259	0.0338177559301903	0.5304258395315471	0.0007982827135818	0.5718415698223862	0.0007982827135818	0.5778418677648802	0.0010095636197028	0.455174697770254	2.381566067007732e-05	0.512242286114512	2.381566067007732e-05	0.5181144865787491	0.0022145425753026	0.5423172021556228	0.0022145425753026	0.5483689266438896	SIPA1L1	13115	PCNX1	399929	MAP3K9	497801	False	False	False	alt	-85	0.01373	100	0.11804
1208	chr14	71314024	C	T	rs34873919	-0.105654609	0.0954271823567896	0.105654609	0.0941097500504131	0.0225183970830432	0.3977883308064434	-0.0024690919199149	0.1408472362791327	0.0024690919199149	0.1390771384175166	0.0011769654580844	0.95367415503381	-0.0001263462625612	0.7650430867816678	0.0001263462625612	0.7584429446589543	2.668250454292713e-05	0.9342367815108764	-2.9552436205047007e-06	0.7341108434414749	2.9552436205047007e-06	0.7275710200674991	-0.0004313615519118	0.7700237450492429	0.0004313615519118	0.7634216443883951	SIPA1L1	6426	PCNX1	406618	MAP3K9	504490	False	False	False	ref	-95	0.01588	100	0.06122
1209	chr14	71315393	C	A	rs80173099	0.010694957486	0.7461236904978461	0.010694957486	0.7531061332851611	0.0141974426756871	0.729512114831841	0.0001518352732898	0.7737130506072653	0.0001518352732898	0.7806353472668031	0.0121144139091418	0.7136755723009941	0.000166427787609	0.7532046041603265	0.000166427787609	0.7599952347734483	0.0001678305869816	0.7527625834646268	2.291691566636281e-06	0.776137458991273	2.291691566636281e-06	0.7828648686274682	0.0006647751641318	0.7319758058546065	0.0006647751641318	0.7379972185172874	SIPA1L1	5057	PCNX1	407987	MAP3K9	505859	False	False	False	alt	100	0.08044	100	0.1373
1210	chr14	71318485	T	G	rs35054229	-0.0123857838999999	0.7477770325352212	0.0123857838999999	0.741137564708491	0.0163256874881832	0.6313271448766815	-0.0002039162263963	0.7559000851070505	0.0002039162263963	0.7492689267128574	0.0112541651545642	0.7219705544139655	-0.0001803448219577	0.790697174260533	0.0001803448219577	0.7843259660400759	0.0001878578112559	0.738362205754911	-3.0233146484511493e-06	0.7977119981187778	3.0233146484511493e-06	0.7912823597525106	-0.0005550790142192	0.7895918382865666	0.0005550790142192	0.7831903253980058	SIPA1L1	1965	PCNX1	411079	MAP3K9	508951	False	False	False	ref	-100	0.0316	30	0.0424
1211	chr14	71332956	A	T	rs116311114	0.004510595732	0.8814080289966085	0.004762581668	0.8846908755078589	0.01239037518397	0.8105223346028134	6.205122432653029e-05	0.8977699390092342	6.472882780799711e-05	0.901299774497238	0.0101761736663257	0.7191062333441423	4.210931071131693e-05	0.8793889445173829	4.4780141949758746e-05	0.8815262689647377	0.0001273123279506	0.7764639704488724	5.824173302793721e-07	0.8960723794944259	6.11825713228267e-07	0.8981873971303939	0.0001550592194252	0.8787697878235521	0.0001633070502457	0.8809604264697157	SIPA1L1	12506	PCNX1	425550	MAP3K9	523422	False	False	False	alt	50	0.01485	65	0.02654
1212	chr14	71350087	C	A	rs113102830	0.0227994521999999	0.5383787409123962	0.0227994521999999	0.5447517850988731	0.0128326670279942	0.7907524573660324	0.0002985324685427	0.6317829863429959	0.0002985324685427	0.6383052639884567	0.1446752004222889	0.2375559603895952	0.0034858874377282	0.308139734399748	0.0034858874377282	0.3128232982973834	0.0018788270817308	0.3299789068467172	4.640366922239569e-05	0.3772190351961001	4.640366922239569e-05	0.3826110006350918	0.0060011217049915	0.3141032819438545	0.0060011217049915	0.3189288026386395	SIPA1L1	29637	PCNX1	442681	MAP3K9	540553	False	False	False	alt	40	0.02103	40	0.1656
1213	chr14	71357783	A	G	rs111590846	0.0127928463999999	0.6031899361599324	0.0197846792	0.6065775604762162	0.1286275651264207	0.0014446432425204	0.0016436230612673	0.1390735232807559	0.0025664590829417	0.1399157948432993	0.022481937250503	0.58783655144223	0.000161265925858	0.6056030420810038	0.0004151757225725	0.6085922728851296	0.0028999941962308	0.2521457201573139	2.0974124806637447e-05	0.3356308095355964	5.4487098672827527e-05	0.3379923913642828	0.0005196133416911	0.5918244581760235	0.00133614859292	0.5947791371508112	SIPA1L1	37333	PCNX1	450377	MAP3K9	548249	False	True	False	alt	-85	0.0866	-95	0.3784
1214	chr14	71360805	C	G	rs77942366	-0.00089736074	0.9222870495351476	0.00350018382	0.9180704560605938	0.0085909942506458	0.9586425433256957	-9.391777530014286e-06	0.9587204543489712	2.8293953328408428e-05	0.954449991917668	0.0032290257662234	0.8768053828158126	1.4064236103575577e-06	0.9566527485789824	1.2375804099730955e-05	0.9523888055300824	2.723265102447587e-05	0.9372484103315536	2.331184719701016e-09	0.976192399667162	9.775786597616053e-08	0.9717809291730052	2.4743492461458145e-06	0.956056807562755	4.701263567681419e-05	0.951791380143472	SIPA1L1	40355	PCNX1	453399	MAP3K9	551271	False	False	False	ref	40	0.01881	100	0.02448
1215	chr14	71372567	T	C	rs76088535	0.0899089677999999	0.1581374667212961	0.0899089677999999	0.159709135887107	0.0212602489313463	0.4364051428670473	0.0021799995137845	0.2161338202055068	0.0021799995137845	0.2184517795444767	0.0286216225132789	0.5472058398833575	0.0027515752416004	0.3839629993483421	0.0027515752416004	0.3890292545686253	0.0006166392267255	0.5341301408573861	6.861610759569575e-05	0.3760674409479104	6.861610759569575e-05	0.3809924038252169	0.0068753917719639	0.3180030676507421	0.0068753917719639	0.3223101346001479	SIPA1L1	52117	PCNX1	465161	RGS6	559863	False	False	False	alt	40	0.002762	-25	0.01349
1216	chr14	71376191	A	G	rs113124653	-0.024915667	0.5385271038998083	0.024915667	0.5323870642946533	0.0227813387345977	0.3919293976766815	-0.0005653221214434	0.482417587165076	0.0005653221214434	0.4767148240518318	0.0011736663257562	0.9566376683580312	-3.005361295642897e-05	0.9049389738639178	3.005361295642897e-05	0.8980442224123548	2.6861217719601648e-05	0.936397311242851	-6.870534308280603e-07	0.8806964366566578	6.870534308280603e-07	0.8736682429180906	-0.000117943980733	0.9028054486096122	0.000117943980733	0.8958643475798268	SIPA1L1	55741	PCNX1	468785	RGS6	556239	False	False	False	ref	75	0.002686	-70	0.05835
1217	chr14	71377271	G	A	rs116767752	0.13242563922	0.0736873697461761	0.13242563922	0.0744863213552125	0.0446500053503092	0.0820654608333752	0.0065660256609493	0.0571792841651222	0.0065660256609493	0.0574491013824491	0.0175060209164988	0.6781438949270836	0.0021867232960088	0.4484660877786545	0.0021867232960088	0.4540259524982665	0.0007697888375587	0.5472381155860796	0.0001041149526563	0.3386143038230503	0.0001041149526563	0.3431309406112199	0.0057941011513971	0.379804225466322	0.0057941011513971	0.384956636619758	SIPA1L1	56821	PCNX1	469865	RGS6	555159	False	False	False	alt	-100	0.0433	-30	0.094
1218	chr14	71935714	C	T	rs71427137	0.0687095446	0.2037083401276873	0.0687095446	0.2062910116335234	0.039222258695329	0.1162969704147318	0.0029505078159756	0.1350895106505757	0.0029505078159756	0.1368506133418597	0.0026318828148196	0.8966111679073906	0.0001825297702732	0.7208758467642745	0.0001825297702732	0.7273006230460045	0.0001035219231443	0.8035607618174185	7.83219783199702e-06	0.6180898733638993	7.83219783199702e-06	0.6242750078187801	0.00063590775626	0.7068416689880571	0.00063590775626	0.7132838301310285	RGS6	3284	SIPA1L1	615264	DPF3	958387	False	False	False	alt	100	0.01001	-40	0.03143
1219	chr14	71938968	C	T	rs2332687	0.03840865534	0.3513578901944567	0.0404935790599999	0.3547786337077798	0.0309680829104748	0.2084362793357932	0.0012435377029493	0.2815759224421132	0.0013046579119578	0.2842708321684907	0.0003340371482299	0.9937006091592532	1.8444213417388594e-05	0.9283917487420724	1.866776269309749e-05	0.9342243203684572	1.075184253224426e-05	0.9801946305900116	6.048848949003547e-07	0.8941159287442552	6.114383137673627e-07	0.8990450713895243	6.350829731777885e-05	0.9343884028361624	6.680742964597652e-05	0.9380344644677931	RGS6	6538	SIPA1L1	618518	DPF3	955133	False	False	False	alt	35	0.004913	100	0.1707
1220	chr14	71949502	T	C	rs2190864	-0.0323739728	0.4362771006657402	0.0323739728	0.4304805832700655	0.0428215034211273	0.0890861478559846	-0.0013875165905839	0.2452307513365947	0.0013875165905839	0.2417501239468284	0.0047796179604763	0.8295914286630351	-0.0001563689762573	0.7400245716985011	0.0001563689762573	0.7334835981305349	0.000203664781678	0.7100017647687936	-6.666992775392175e-06	0.6292254678675003	6.666992775392175e-06	0.6229998826040457	-0.0006062155653062	0.7252109604836536	0.0006062155653062	0.7186792627112507	RGS6	17072	SIPA1L1	629052	DPF3	944599	False	False	False	ref	10	0.0007553	10	0.001953
1221	chr14	71973898	G	C	rs2877774	-0.0216073704	0.2251408884973486	0.0617344808	0.2228015837547845	0.0195089450586905	0.5027805230749369	-0.0002415384977195	0.2768880268045121	0.0012869259596174	0.2742023819010582	0.0538665830886476	0.4347503167578865	-0.0020989235334505	0.3201425086444445	0.0028798274724539	0.3169534900857129	0.0009717726105539	0.4497336121934384	-3.42375356011312e-05	0.3343006682833256	5.458156678080386e-05	0.3312552744740456	-0.0048992115073735	0.2740466039298859	0.0069644683448252	0.2710782352262561	RGS6	41468	SIPA1L1	653448	DPF3	920203	False	False	False	ref	-65	0.01697	5	0.02441
1222	chr14	71981278	C	T	rs145192742	-0.0591650314	0.2704797183429291	0.0591650314	0.2670173045984049	0.0674237776424185	0.0201669086774442	-0.0039546543994912	0.1015208653282766	0.0039546543994912	0.1004589284147523	0.0037948269605093	0.8671736603792158	-0.0003010714485107	0.7140033812530429	0.0003010714485107	0.7078062811434609	0.0002515742434602	0.6906581754133057	-1.998064631844053e-05	0.5439312626505304	1.998064631844053e-05	0.5380007357738208	-0.0009839662168849	0.6930200697409884	0.0009839662168849	0.6865922984078995	RGS6	48848	SIPA1L1	660828	DPF3	912823	False	False	False	ref	-45	0.02669	-30	0.02747
1223	chr14	84174900	T	C	rs1779550	0.1033848999999999	0.1023951244184138	0.1033848999999999	0.1038579138190119	0.0179467226806628	0.5633565258396102	0.0019755042125046	0.1881809047938396	0.0019755042125046	0.1907231981346473	0.099751740292303	0.3102215711346981	0.0114476063274552	0.1464463308266396	0.0114476063274552	0.1491685839319739	0.0018621775679086	0.3398486196656007	0.0002267246591812	0.1815760432207558	0.0002267246591812	0.1844791108635762	0.0211218699482036	0.0935104246229541	0.0211218699482036	0.0950905598424457	FLRT2	1355245	SEL1L	2641047	STON2	2738435	False	False	False	alt	5	0.0012665	100	0.2922
1224	chr14	84176590	C	T	rs2841157	-0.0340420534	0.3916632109439688	0.037466367	0.3880755842888689	0.0357897348524902	0.1457929944940776	-0.0012737570563726	0.264547225336924	0.0013829148360877	0.2620106049740286	0.0717610768367918	0.3778708315150214	-0.002533852609546	0.3513187152366903	0.0028218481098285	0.3478178816835702	0.0026078632593973	0.2782006300473977	-9.8602723623231e-05	0.2800366088738865	0.0001077832346568	0.2771274399060913	-0.0056637854244333	0.3158509274508457	0.0062708257728217	0.3123834959950107	FLRT2	1353555	SEL1L	2642737	STON2	2740125	False	False	False	ref	90	0.05966	-45	0.0459
1225	chr14	84185848	C	T	rs995791	0.091992158	0.1247953981009882	0.091992158	0.1266797711271353	0.0543630830947805	0.0430247137536813	0.0050139098147772	0.0591792586514534	0.0050139098147772	0.0597853848914934	0.3415154564349576	0.0913056853605965	0.0299541814182003	0.0536910455235627	0.0299541814182003	0.0547781859209248	0.0183691700415664	0.0278444373762977	0.0016180260688724	0.0313721327328821	0.0016180260688724	0.0318884194948477	0.0304707861832337	0.0537053058810288	0.0304707861832337	0.0547590356235024	FLRT2	1344297	SEL1L	2651995	STON2	2749383	False	False	False	alt	-90	0.02773	100	0.08887
1226	chr14	84185979	G	A	rs1157827	-0.1376342048	0.0589451620513974	0.1376342048	0.0583495533164052	0.0261667425323253	0.3005363543637747	-0.0038547327268262	0.0888911630445494	0.0038547327268262	0.0878695214205906	0.1887582065916663	0.1883110896363753	-0.0284703162521662	0.0653990581275267	0.0284703162521662	0.0641252084314337	0.0052253109210232	0.1628490200099949	-0.0008366249099271	0.0735869491223503	0.0008366249099271	0.0722533117017555	-0.0389140905941737	0.0375160925981924	0.0389140905941737	0.036956850545277	FLRT2	1344166	SEL1L	2652126	STON2	2749514	False	False	False	ref	-30	0.004852	-20	0.0315
1227	chr14	84209066	A	G	rs67517866	-0.00412787868	0.7824382446198744	0.00975180428	0.7780950153458217	0.0389276542816635	0.1196363322289257	-0.0001745775019701	0.5730671531458986	0.0004035744637259	0.569646710382561	0.029791989706707	0.5527365405773893	-0.0002074435000415	0.6846247054343891	0.0003165646498325	0.6803890508527078	0.0012674444709434	0.4268019252128508	-9.600384127868966e-06	0.5798592964776387	1.4043617215943566e-05	0.5760443261348331	-0.0006383821055062	0.6778292053788263	0.000953449242849	0.6735120057183009	FLRT2	1321079	SEL1L	2675213	STON2	2772601	False	False	False	ref	100	0.01898	80	0.1649
1228	chr14	84209125	C	T	rs28637508	0.004572980534	0.8033199233715634	0.008982670134	0.8068874557153564	0.0152271497210818	0.682359302618216	7.866499029426084e-05	0.8035210537983669	0.0001452470750266	0.807051786886642	0.0233182672957011	0.5981519112374936	9.926092268247109e-05	0.7554165303180466	0.0001497611850456	0.7588746002844007	0.0003561016199622	0.6396086273053845	1.662265741838422e-06	0.7674930407742327	2.4247713062448e-06	0.7711300886608129	0.0002985714757018	0.7529202474984602	0.0004965194153936	0.7563745860090567	FLRT2	1321020	SEL1L	2675272	STON2	2772660	False	False	False	alt	45	0.01105	65	0.11774
1229	chr14	84211361	C	A	rs7145105	-0.0070854299	0.7353419743773589	0.0129886589	0.7336833017427948	0.014100745133468	0.7350666369323591	-0.0001007204454434	0.7735413008754641	0.0001872641425023	0.77192323622874	0.0209016528652964	0.5977318646675142	-7.766868827821852e-05	0.7259053113036666	0.0002346871068042	0.7247459366003156	0.0002928153967013	0.6499827997743228	-1.0653721964470823e-06	0.7526883468357094	3.369256155378381e-06	0.7515209635500562	-0.0002622810200917	0.7279142008584453	0.0007093134505624	0.7266571656531045	FLRT2	1318784	SEL1L	2677508	STON2	2774896	False	False	False	ref	-95	0.1403	100	0.06573
1230	chr14	84218958	A	C	rs12717596	0.033416048	0.4384284584699928	0.033416048	0.4433592511765671	0.0186912511378688	0.5347283490285824	0.0006651571347677	0.4557102992082628	0.0006651571347677	0.4609984000438663	0.0421323941803305	0.4762674933139909	0.0016674031411344	0.4318253204495836	0.0016674031411344	0.4369334340273558	0.0008162340676905	0.4870862502083182	3.373526618291623e-05	0.4404773211265294	3.373526618291623e-05	0.4455842911748024	0.004106594965524	0.3962829907020258	0.004106594965524	0.4010481745309128	FLRT2	1311187	SEL1L	2685105	STON2	2782493	False	False	False	alt	75	0.0432	75	0.2323
1231	chr14	84221664	C	T	rs7148526	-0.1183016136	0.0818214378560094	0.1183016136	0.0806901886489425	0.0712182876972418	0.01680174781757	-0.0086354280153202	0.0282369743612574	0.0086354280153202	0.0281241870884065	0.0038525617762528	0.8544640770488001	-0.0004740956548193	0.5976642116726235	0.0004740956548193	0.5918605816765624	0.0002801652402	0.6606076172724611	-3.5317381597346096e-05	0.4082103081017885	3.5317381597346096e-05	0.4030576934872587	-0.0014879086800171	0.5784478193703263	0.0014879086800171	0.5725812752845353	FLRT2	1308481	SEL1L	2687811	STON2	2785199	False	False	False	ref	0	0.0	-55	0.0663
1232	chr14	84225088	T	C	rs3001377	0.0022869353999999	0.5438373557454668	0.022843447	0.5439057992431586	0.0127172066983697	0.7931625215934068	4.881373887226e-05	0.6419703514083813	0.0002896159162549	0.6419156019404325	0.0718072646893866	0.371938876602122	0.0004227389079922	0.4005313823316734	0.0018369413163375	0.4007016938044818	0.0009266774816299	0.4588249638265227	7.271844628162004e-06	0.4667880612078596	2.3579569432387245e-05	0.4670465836225821	0.0010920128006334	0.3814590175411814	0.0042872224604928	0.3816323759208578	FLRT2	1305057	SEL1L	2691235	STON2	2788623	False	False	False	alt	20	0.002075	-55	0.0433
1233	chr14	84225401	G	A	rs77782646	-0.20135157	0.0267320375920578	0.20135157	0.0264930377058581	0.045100477847909	0.0783101549473073	-0.0097120957074891	0.0256984123313694	0.0097120957074891	0.0255115245936314	0.1147438223747154	0.2815499760082146	-0.0266746363862362	0.0746940378189302	0.0266746363862362	0.073304167004402	0.0054247275536149	0.159155795750171	-0.0013730369086183	0.0519481839966892	0.0013730369086183	0.0512393888179855	-0.0427476823595393	0.0352371192259795	0.0427476823595393	0.0348151403441306	FLRT2	1304744	SEL1L	2691548	STON2	2788936	False	False	False	ref	85	0.0337	80	0.188
1234	chr14	84225694	T	G	rs8004742	-0.0142072071999999	0.6995641320926211	0.0142072071999999	0.6929144544517359	0.0190329289044008	0.5139984996286399	-0.0002928421637056	0.6571320079481905	0.0002928421637056	0.6507752477822905	0.1541519580350367	0.2217147316368897	-0.0020681664705477	0.3706363663282448	0.0020681664705477	0.3658544962781795	0.0028295728212189	0.2516338390488877	-4.1712231977893536e-05	0.3833262541199827	4.1712231977893536e-05	0.3782735986354065	-0.003656263402725	0.4077991882130664	0.003656263402725	0.4025057884280604	FLRT2	1304451	SEL1L	2691841	STON2	2789229	False	False	False	ref	-100	0.1434	-100	0.5396
1235	chr14	84225890	A	G	rs146120508	-0.0152857996	0.6725005090707978	0.0152857996	0.6658109945767242	0.0228527171641912	0.3865434158890718	-0.0003649771270105	0.5977736725259216	0.0003649771270105	0.5916065807417376	0.2005583781465474	0.1748814081203198	-0.0033471951694146	0.3154314891759376	0.0033471951694146	0.3109695524621051	0.0046542909998535	0.1727340094530219	-8.080043207975029e-05	0.305877813753921	8.080043207975029e-05	0.3015541911142774	-0.0048101349345121	0.363437928715089	0.0048101349345121	0.3583339893790824	FLRT2	1304255	SEL1L	2692037	STON2	2789425	False	False	False	ref	45	0.007294	-95	0.05145
1236	chr14	84226209	G	T	rs8004689	-0.1221544288	0.0717412155125315	0.1221544288	0.0708116913716413	0.0235104895484775	0.366022672509333	-0.0030044758324416	0.1141145392851501	0.0030044758324416	0.1127325007191552	0.1562469070634423	0.2210004829183981	-0.0198663369479776	0.0864135670927186	0.0198663369479776	0.0847719476066746	0.0037245040247504	0.2116770342815168	-0.0004896520189824	0.1001448011155733	0.0004896520189824	0.0984039349107078	-0.0321170532150044	0.048990437068753	0.0321170532150044	0.0482545912373678	FLRT2	1303936	SEL1L	2692356	STON2	2789744	False	False	False	ref	70	0.04364	70	0.1958
1237	chr14	84226409	A	G	rs184858889	-0.0403079678	0.3889055124920292	0.0403079678	0.3843475292755979	0.0409671227461257	0.102637873809533	-0.0017349613898667	0.2330993666774383	0.0017349613898667	0.2302012782084277	0.1197312856718682	0.2727299397130001	-0.0052309748171565	0.2618541467595347	0.0052309748171565	0.257883727219814	0.0050467239963791	0.1647812827119678	-0.0002304939857618	0.1895119722677655	0.0002304939857618	0.1865367209286214	-0.0093596384150967	0.235548118436815	0.0093596384150967	0.2319656988717001	FLRT2	1303736	SEL1L	2692556	STON2	2789944	False	False	False	ref	-70	0.02225	-70	0.06104
1238	chr14	84227306	T	G	rs4144366	0.0608385435999999	0.2202595793929874	0.0608385435999999	0.2237490978701817	0.0175743882235571	0.5743838198950163	0.0011044129122803	0.2989021925532623	0.0011044129122803	0.3028729394155015	0.0257233347629572	0.5601114723265248	0.0016065001513602	0.3993806386165998	0.0016065001513602	0.4046205344152888	0.0004395875021895	0.5847969601319771	2.819460539056548e-05	0.4231905807758466	2.819460539056548e-05	0.4285215870384357	0.0046171356933126	0.34690266288987	0.0046171356933126	0.3520111923765228	FLRT2	1302839	SEL1L	2693453	STON2	2790841	False	False	False	alt	95	0.003876	-80	0.04932
1239	chr14	84228495	A	G	rs186989036	-0.01943943406	0.6192912513275521	0.01943943406	0.6128603630666616	0.0295581227205293	0.2332862923022881	-0.0005625854318193	0.5076773605543009	0.0005625854318193	0.5019170011379952	0.0190376430998646	0.6211816416122707	-0.0004842649180132	0.638902468648167	0.0004842649180132	0.6326979453750788	0.000562294148803	0.5477423144070209	-1.3959512438036104e-05	0.581972384595889	1.3959512438036104e-05	0.5757844518511489	-0.0014425456105043	0.6190607128283233	0.0014425456105043	0.612787321526155	FLRT2	1301650	SEL1L	2694642	STON2	2792030	False	False	False	ref	-55	0.0067	-85	0.02478
1240	chr14	84453509	A	G	rs67378160	-0.0309423974	0.4655319435628089	0.0309423974	0.460532412357941	0.01304474558499	0.782888178556628	-0.0004455718117833	0.5800041816876799	0.0004455718117833	0.5742725962251258	0.2288261687176272	0.1526332777484104	-0.0065177786615251	0.2259898338765458	0.0065177786615251	0.2223222426513485	0.0029400834664958	0.2438020848125156	-9.246217853905984e-05	0.2971768536515898	9.246217853905984e-05	0.2929163820177546	-0.0096177955197782	0.23797043000265	0.0096177955197782	0.23431017077491	FLRT2	1076636	SEL1L	2919656	STON2	3017044	False	False	False	ref	20	0.01544	15	0.04736
1241	chr14	93274787	A	C	rs7146851	0.00387389938	0.7619426436066882	0.01084741366	0.7639195781273519	0.0266891126992867	0.2907326958858222	0.0001274027600284	0.6584050573122484	0.0002962927579834	0.6602728555883021	0.0006548777671472	0.9804935369396296	1.7778665606439574e-06	0.9704089447089352	6.7110390843273135e-06	0.972106149094156	1.6496469358266712e-05	0.9646961072657596	6.395975066237257e-08	0.9546104294263552	1.7646639791245705e-07	0.9564628840142846	1.072218006664246e-05	0.9695870361128464	2.3918709379433213e-05	0.9713484292515352	BTBD7	58305	UNC79	58433	UBR7	67545	False	False	False	alt	-100	0.1025	60	0.104
1242	chr14	93353198	C	T	rs17129021	0.00062780068	0.8726898025420698	0.00567823068	0.8763048541550251	0.0183616454799317	0.5424115059603121	1.973077065804324e-05	0.8609352047829653	9.962258232656323e-05	0.8647527785175035	0.000852000923757	0.976073167849949	2.138865774346281e-06	0.9745969821770296	6.054444499787619e-06	0.9788169225116125	1.5506251741413306e-05	0.9701718893750796	4.622662311675675e-08	0.9718193977852312	1.081664328957512e-07	0.9760127827775172	3.299132328197726e-06	0.9708082867752936	2.474349246148265e-05	0.9738347952199672	COX8C	6015	UNC79	19978	BTBD7	20106	False	False	False	alt	-70	0.002686	65	0.09
1243	chr14	93557014	G	T	rs12591010	0.0778377298	0.1632940749684639	0.0778377298	0.1658682427312578	0.0452069873358015	0.0761718249053216	0.0034843696529612	0.0921734033023972	0.0034843696529612	0.0932973203866609	0.0679843951040875	0.3745230941728362	0.0053327509403468	0.2265941112494455	0.0053327509403468	0.2304138431610666	0.0030608006647091	0.2370928349886998	0.0002379068430923	0.153350045308337	0.0002379068430923	0.1560498957167743	0.0121218369568802	0.1686117721988276	0.0121218369568802	0.1715786820163864	COX8C	209831	UNC79	223794	BTBD7	223922	False	False	False	alt	-25	0.00995	-95	0.1844
1244	chr14	93565719	G	A	rs942065	-0.0007039675399999	0.817998575460095	0.00830034542	0.8168608788722305	0.0217500193287153	0.4244006608198855	-1.3460603744498024e-05	0.7591934405017773	0.0001827627854537	0.7581433051581827	0.0712109465210649	0.3765862312146029	-0.0002613589187265	0.5793015269431689	0.0005500383344573	0.5782404877544083	0.0015417521188843	0.3683443180305631	-5.655893867817096e-06	0.5617928191301275	1.2053030448272345e-05	0.5606920629298069	-0.0004676520075219	0.5985785255402077	0.0013518194714789	0.597438717509297	COX8C	218536	PRIMA1	222766	UNC79	232499	False	False	False	ref	100	0.005386	80	0.0939
1245	chr14	99157759	T	C	rs947191	0.165452044	0.0433358730839871	0.165452044	0.0439377275744799	0.0205718820270212	0.4580817430475026	0.0038773742289238	0.0989290044924441	0.0038773742289238	0.1000226387699015	0.0259105605225824	0.576589638069295	0.0043543020133283	0.2716713093278423	0.0043543020133283	0.2759448960606264	0.0005450160576312	0.566941880851636	0.0001065605257197	0.2787721366771852	0.0001065605257197	0.2830040752488453	0.0106141334828939	0.2012460077725513	0.0106141334828939	0.2045690918612375	BCL11B	114438	SETD3	323130	CCNK	323411	False	False	False	alt	-90	0.02734	-95	0.1307
1246	chr14	99220196	A	G	rs2614457	0.0500787108	0.2854314526533728	0.0500787108	0.2895908390503415	0.0205908036024363	0.4617350092662708	0.0010804633290348	0.3134423084084689	0.0010804633290348	0.3176990173400465	0.0428788228695852	0.4743281396844669	0.0024333193879703	0.3579189075040395	0.0024333193879703	0.3625994268932628	0.0008731779106527	0.4708445433116721	5.202358875405694e-05	0.3611523948553043	5.202358875405694e-05	0.3660018493541827	0.0061735013691398	0.3058087395532537	0.0061735013691398	0.3104392199206743	BCL11B	52001	SETD3	260693	CCNK	260974	False	False	False	alt	65	0.011475	10	0.0221
1247	chr14	99220277	A	G	rs2693695	-0.0080341502999999	0.671078810665764	0.0157453489	0.6705098616452031	0.0110953331882885	0.8698337658818102	-0.0001064511091554	0.7647571240846582	0.0001847119167811	0.7646692241694173	0.0295090891095641	0.5496292864406829	-0.0001616515599937	0.6392907197235957	0.0004122683605291	0.6400113555644497	0.0003359485944752	0.644370900474395	-2.354746658700356e-06	0.7005340486184681	4.987419571214081e-06	0.7012432398525796	-0.0004693015736861	0.632512781483592	0.0012050080828741	0.6329378554864715	BCL11B	51920	SETD3	260612	CCNK	260893	False	False	False	ref	-15	0.03662	-70	0.1426
1248	chr14	99246457	C	T	rs12895055	-0.1718145445999999	0.0385083710908476	0.1718145445999999	0.0381666958592607	0.0332017396062985	0.1803691063352167	-0.0059015858695531	0.0510069967937532	0.0059015858695531	0.0505028353639004	0.908313813467058	0.0014759678705424	-0.1561472826799405	0.004040844554961	0.1561472826799405	0.0040129040529953	0.030170302537861	0.0091833937217981	-0.0053663538503371	0.0083575778346605	0.0053663538503371	0.0082634875938504	-0.0127659925439609	0.1692644698089053	0.0127659925439609	0.1662193940071443	BCL11B	25740	SETD3	234432	CCNK	234713	True	False	False	ref	-100	0.04324	-100	0.3335
1249	chr14	102833379	T	C	rs7147531	0.00475498	0.6613290487053052	0.016178966	0.6621471784005358	0.0212125139194098	0.4406417450789498	0.0001019420792202	0.63571418922928	0.0003499591136557	0.6366160913955818	0.0221891392563755	0.6027452361015504	-8.365051646954007e-05	0.686169561167491	0.0003438341543142	0.6866708509084621	0.0004848943377006	0.5840238255349278	-2.022966852988904e-06	0.665769012844582	7.645991425357996e-06	0.6663981124139305	-0.0002754775494044	0.6753634805642863	0.0010771667051565	0.6758085036111806	TRAF3	55929	AMN	89285	CDC42BPB	224170	False	False	False	alt	95	0.03946	55	0.2084
1250	chr14	102839878	G	A	rs2403102	0.0958902636	0.1203606495895141	0.0958902636	0.1221244163482043	0.0445350670689057	0.0799479146597485	0.0044471688685759	0.0742824569309925	0.0044471688685759	0.0750682756159663	0.0124278314803206	0.6871800987158317	0.0011088977932655	0.4549429810463341	0.0011088977932655	0.4602214472305036	0.0005466185989007	0.5437406794705093	5.1032837738224e-05	0.3404408390789348	5.1032837738224e-05	0.345180080154898	0.003489657220151	0.4040543106700288	0.003489657220151	0.4092772886946745	TRAF3	62428	AMN	82786	CDC42BPB	217671	False	False	False	alt	-100	0.009674	100	0.12286
1251	chr14	102875712	T	C	rs1131877	0.0042135996	0.2028954353787592	0.067058546	0.202485159837236	0.0424617709745657	0.0950703359110792	-6.176333775263979e-05	0.1243693332911269	0.0029094264538569	0.1241638130483566	0.0821220019134967	0.3409179753310861	0.0021148119518149	0.2294288129747809	0.0059301612457426	0.2294082266200544	0.0034857584152778	0.2218250808115777	7.132032463072257e-05	0.1642917619037473	0.0002508557987418	0.1642224030635537	0.0032620170895054	0.175178056839822	0.0125540232918741	0.1751476380668782	AMN	46952	TRAF3	98262	CDC42BPB	181837	False	False	False	alt	-90	0.07166	-55	0.119
1252	chr14	103303151	C	G	rs8007609	-0.0259653955999999	0.4060847402524072	0.035047298	0.4020617530845944	0.0120818194796328	0.8250973484082568	-0.0003179617084539	0.5515560353744062	0.0004198732709684	0.5471632952228598	0.0009262314011414	0.9667871677531809	-2.947607663932666e-05	0.8870886345956819	3.501912020656891e-05	0.8827638399873545	1.0972929839072415e-05	0.978236973630986	-3.475456710487077e-07	0.909143393876946	4.097463211928389e-07	0.9048070019966036	-0.0001286661607996	0.880638240105093	0.0001484609547688	0.876277640315964	EIF5	30394	ENSG00000291313	31087	MARK3	82227	False	False	False	ref	65	0.0384	40	0.097
1253	chr14	103303723	A	C	rs58026845	0.0305185669999999	0.4489556683507436	0.0305185669999999	0.4545289540144796	0.0115014601720992	0.8257138206155434	0.0003955774534761	0.5804062934716838	0.0003955774534761	0.5864134182089792	0.0006557025502292	0.9815169332068776	2.102719470144512e-05	0.9133179071831315	2.102719470144512e-05	0.9204208476394132	7.818335508182037e-06	0.9869991954007435	2.803308010089065e-07	0.9259711075389828	2.803308010089065e-07	0.9331665272134588	7.340569430237321e-05	0.919362256500002	7.340569430237321e-05	0.9264184869122042	EIF5	29822	ENSG00000291313	30515	MARK3	81655	False	False	False	alt	55	0.0885	55	0.0729
1254	chr14	103304973	C	T	rs8008665	-0.0340584524999999	0.3944715121519708	0.0365490203	0.39066706941012	0.0368518804195684	0.1414135505467669	-0.0010874489584339	0.2857345570712103	0.0012210123094497	0.2833853636198262	0.0100194648807363	0.7827669622360108	-0.0004030877308657	0.6901991534497953	0.0004089934931235	0.6857432683452701	0.0002445555212043	0.712639985207985	-9.204112011162227e-06	0.6298994619230573	9.52082428902384e-06	0.6254617366850735	-0.0012883111741611	0.6613635482681888	0.0013097555342944	0.6568644034772712	EIF5	28572	ENSG00000291313	29265	MARK3	80405	False	False	False	ref	55	0.002855	-35	0.05173
1255	chr14	103309178	C	G	rs17101455	0.183595246	0.0312747020778595	0.183595246	0.0315925851582685	0.0454791197821525	0.0758440807652077	0.0087494068021096	0.0281381616702468	0.0087494068021096	0.0283321202578566	0.0376991851143148	0.5364682764870774	0.0076228363027103	0.2213372154748495	0.0076228363027103	0.2247503686913302	0.0016581301124883	0.386116601610987	0.0003418409764726	0.1536584387855162	0.0003418409764726	0.1562739949633037	0.0161838936359737	0.1503836255174367	0.0161838936359737	0.1524953682465384	EIF5	24367	ENSG00000291313	25060	MARK3	76200	False	False	False	alt	50	0.0177	35	0.0913
1256	chr14	103312029	C	T	rs7145682	-0.019492726	0.6087552032428586	0.019492726	0.6026490918355452	0.0123548291137737	0.8015838314854633	-0.0002728891155852	0.6831946457562849	0.0002728891155852	0.6767847335928725	0.3367589324007786	0.09332961830162	-0.0069619116908601	0.2141821807826051	0.0069619116908601	0.2105507371419584	0.0042575845692924	0.1890037790723981	-9.814881708710935e-05	0.2909371433400737	9.814881708710935e-05	0.2866921077208233	-0.0067244564679489	0.2970352321137487	0.0067244564679489	0.2924727883895918	EIF5	21516	ENSG00000291313	22209	MARK3	73349	True	False	False	ref	100	0.04486	-100	0.1646
1257	chr14	103315762	C	G	rs7150297	0.190084578	0.0359235256225988	0.190084578	0.0362425499881989	0.0514796619400792	0.0530530215723701	0.010206625371728	0.0273129394268311	0.010206625371728	0.027549238446644	0.3809879251756787	0.0762624230202866	0.0767610504112114	0.0179435906142432	0.0767610504112114	0.0183169115694401	0.0202430410734182	0.0236480940265635	0.0042496777945201	0.0140188606580551	0.0042496777945201	0.0142538784669848	0.0635396390749232	0.0151420773571904	0.0635396390749232	0.0152961869448972	EIF5	17783	ENSG00000291313	18476	MARK3	69616	False	False	False	alt	-30	0.006226	5	0.05725
1258	chr14	103315839	C	A	rs72708820	-0.235260982	0.0169878589767273	0.235260982	0.0168702243802084	0.0433184904593926	0.0913750555398882	-0.0110911115902387	0.0209193934573064	0.0110911115902387	0.0207965973472041	0.3305969779947874	0.0958942990045671	-0.0776174947320539	0.0143481143312705	0.0776174947320539	0.0140993558041965	0.0145296876246685	0.0436885360885255	-0.0037398413081351	0.0141260010379593	0.0037398413081351	0.0139119470324863	-0.0787280195308633	0.0076030026571966	0.0787280195308633	0.0075433756060804	EIF5	17706	ENSG00000291313	18399	MARK3	69539	False	True	False	ref	-100	0.04877	-70	0.06116
1259	chr14	103320219	G	A	rs11850831	-0.0152466001999999	0.6796026198262025	0.0152466001999999	0.6729640564710769	0.0092455301182596	0.9399872753829618	-0.0001401798085663	0.8069262054033145	0.0001401798085663	0.8000488687085144	0.0017279205568934	0.9415156570731784	-2.333803669583353e-05	0.9270479715445042	2.333803669583353e-05	0.9199502871889744	1.5648402975439415e-05	0.971001324792054	-2.1267998725038006e-07	0.953543079657834	2.1267998725038006e-07	0.9464851683012984	-7.917917587671205e-05	0.932830280736461	7.917917587671205e-05	0.925745929551947	EIF5	13326	ENSG00000291313	14019	MARK3	65159	False	False	False	ref	80	0.02454	-80	0.1035
1260	chr14	103330758	A	G	rs8007383	-0.03781869452	0.3827956184028268	0.03781869452	0.378222470547637	0.0368977868895111	0.1361997843382699	-0.0013398195227407	0.2793185952155813	0.0013398195227407	0.2760626888613799	0.0033139784236745	0.879649267578323	-0.000178008174802	0.7789276747677912	0.000178008174802	0.7719602741865227	0.0001227023229438	0.7931317996762882	-6.428743582910625e-06	0.703470310094612	6.428743582910625e-06	0.696921496757249	-0.0007159117152188	0.755581644112274	0.0007159117152188	0.7485763442759986	EIF5	2787	ENSG00000291313	3480	MARK3	54620	False	False	False	ref	100	0.02647	-70	0.10034
1261	chr14	103345983	G	T	rs12432904	0.0639362492	0.2219747374475016	0.0639362492	0.2251910878234985	0.0725325211862557	0.0155699972919966	0.0047225540549589	0.0720334146697799	0.0047225540549589	0.0727292715072849	0.0169352710237207	0.6330325621808973	0.0010643551343444	0.4714559896702377	0.0010643551343444	0.4768640092761848	0.0012269282457015	0.3976024428818397	7.854913146629671e-05	0.291267146068652	7.854913146629671e-05	0.2955426206065976	0.0032479957771105	0.4264314594425886	0.0032479957771105	0.4316899912934768	ENSG00000291313	11745	EIF5	12438	MARK3	39395	False	True	False	alt	-40	0.0155	-70	0.05106
1262	chr14	103568955	G	A	rs12894729	-0.0597473116	0.2448421600428973	0.0597473116	0.2412803312099462	0.012607243110892	0.7846201868328838	-0.0008189131132743	0.4031362382282275	0.0008189131132743	0.3980995373432811	0.5057949259344793	0.04253859773756	-0.0333772182834104	0.056880594790317	0.0333772182834104	0.0558264842093403	0.0066809978431022	0.1258938965397956	-0.000472573074295	0.1187549326127835	0.000472573074295	0.1166507301113086	-0.0170779584969152	0.1241352122508858	0.0170779584969152	0.1219428442705864	ENSG00000256500	5992	COA8	5994	BAG5	6298	True	False	False	ref	100	0.2322	100	0.6035
1263	chr14	103573728	T	C	rs10431750	-0.0214397305999999	0.5997987225611696	0.0214397305999999	0.5932683187860736	0.0178646005728431	0.5660271322883996	-0.0004079644533933	0.6020260213676113	0.0004079644533933	0.5958483672787901	0.0004313615519118	0.9903032334395084	-1.2341673251083885e-05	0.9624072844793228	1.2341673251083885e-05	0.9565770137334616	8.002753152164233e-06	0.9876984773169564	-2.385379439191733e-07	0.9562049438562592	2.385379439191733e-07	0.9500894575208468	-4.1239154102468426e-05	0.9658129468263018	4.1239154102468426e-05	0.9605867658181408	ENSG00000256500	10765	COA8	10767	BAG5	11071	False	False	False	ref	-10	0.02057	-100	0.1758
1264	chr14	103580255	A	T	rs71417868	-0.00356434872	0.912076162722398	0.0042030826	0.907847384202196	0.0168088631107899	0.6095727231132971	-5.632536732789621e-05	0.904267690489456	6.838560733492695e-05	0.9001258830998142	0.0006961169212496	0.9770783755452914	-1.1708277152841204e-06	0.9911963375178726	2.203388863730255e-06	0.9883938705919736	1.218604056281372e-05	0.9735939407478484	-1.7427388805889678e-08	0.9896801094213434	3.692366937546858e-08	0.9867126483658736	-4.123915410247101e-06	0.9883704469455916	1.0722180066642444e-05	0.9859990798801062	ENSG00000256500	17292	COA8	17294	BAG5	17598	False	False	False	ref	0	0.0	-90	0.1206
1265	chr14	103593729	A	T	rs67899457	-0.02122357054	0.5974110673084371	0.02122357054	0.5911514517987356	0.0240966631942575	0.3541379562205263	-0.0005645581138522	0.5167705664818681	0.0005645581138522	0.5109623150428955	0.0346928507802447	0.5340672100553975	-0.0010064717866646	0.5464978441739362	0.0010064717866646	0.5407659907828619	0.0009065493469208	0.4907854545324721	-2.777977250559637e-05	0.5107324792174917	2.777977250559637e-05	0.5050023890092554	-0.0025576523374352	0.5249722154882022	0.0025576523374352	0.5192130364264791	ENSG00000256500	30766	COA8	30768	BAG5	31072	False	False	False	ref	25	0.01254	-20	0.02515
1266	chr14	103723520	G	A	rs56168984	-0.0330077683	0.4461691311963291	0.0330077683	0.4409134937321394	0.0122057486003941	0.8129946991371918	-0.0003810257846717	0.5906501368343426	0.0003810257846717	0.5846278761268815	0.470829071954076	0.0502735875251273	-0.0160033264066917	0.1124407767127428	0.0160033264066917	0.1103856483106717	0.0056584016502076	0.1424048829969885	-0.0001829552390918	0.1913517097936837	0.0001829552390918	0.1882984021961462	-0.0104714460096994	0.2064411873273559	0.0104714460096994	0.2030656086134585	ZFYVE21	7789	XRCC3	8016	PPP1R13B	124055	False	False	False	ref	-100	0.3455	-100	0.231
1267	chr14	103767290	G	C	rs12878682	0.0033960184599999	0.4870593683796536	0.02683040954	0.4867515385462541	0.0356136549165287	0.148931247729467	0.0001456146529816	0.3576203876834224	0.0009363611156086	0.3571889917033308	0.1676338622942165	0.2063121696333907	0.0014262973320117	0.2723253023842048	0.0048564525954546	0.2719949412153172	0.0059697372501039	0.1358460770552797	5.623522861939512e-05	0.2189359358086029	0.0001711937793787	0.2187046902495376	0.0015868826498631	0.27217380472643	0.0079822506680742	0.2716733155051344	ZFYVE21	51559	XRCC3	51786	PPP1R13B	80285	False	False	False	alt	95	0.0935	100	0.503
1268	chr14	103772310	T	C	rs12888002	0.1156505655999999	0.0895252220795379	0.1156505655999999	0.090681115431788	0.0957458195480958	0.0051847801502833	0.011117147385762	0.0209249524585774	0.011117147385762	0.0211246394290326	0.1314621754478571	0.2739223999439122	0.0179065502925373	0.1241154898573478	0.0179065502925373	0.1261369689670283	0.0126419022067785	0.064147168741399	0.001730143302191	0.0467660446541784	0.001730143302191	0.0473174792345468	0.0241224308006993	0.0885248111229477	0.0241224308006993	0.0899965850691487	ZFYVE21	56579	XRCC3	56806	PPP1R13B	75265	False	True	True	alt	-100	0.02612	-100	0.08057
1269	chr14	103787716	A	G	rs66509671	0.0228851762	0.5464572731769464	0.0228851762	0.5525944280544692	0.0597260301226936	0.0311787560409875	0.0013748115194189	0.2580256612465529	0.0013748115194189	0.2614562472299303	0.0015489426280887	0.9369441550509908	3.5543307406342774e-05	0.8831426160318687	3.5543307406342774e-05	0.8901528639766554	9.345257036796512e-05	0.8256163531533403	2.141931649040606e-06	0.7734664654803127	2.141931649040606e-06	0.7802379132582813	0.0001352644254561	0.8874721271675939	0.0001352644254561	0.8944480295177908	PPP1R13B	59859	ZFYVE21	71985	XRCC3	72212	False	False	False	alt	25	0.03552	-90	0.178
1270	chr14	103788746	G	A	rs11160762	0.0139574923999999	0.2207113650922261	0.0627804236	0.2201611122798858	0.0320236859724241	0.1926861757088094	0.0002316550901976	0.1809783736529779	0.0019253671765515	0.1803140474379485	0.1575987265349213	0.2166205468497919	0.0007421000923772	0.1603272791506322	0.0092459575577187	0.1599232925216807	0.0051075156510297	0.1586058254052794	-6.565782388499993e-06	0.136098990849669	0.0002873094334242	0.1358149925289237	0.0023192900267229	0.1282942621208694	0.0161327570848866	0.127820724202615	PPP1R13B	58829	ZFYVE21	73015	XRCC3	73242	False	False	False	alt	45	0.1366	25	0.1268
1271	chr14	103797800	G	C	rs12883337	0.0373654592	0.3784904976550582	0.0373654592	0.3837801366532867	0.0238726428027276	0.3600477388083188	0.0008955389199048	0.342294229232936	0.0008955389199048	0.3470414905881744	0.0040166936095806	0.8505991928967217	0.0001451485318812	0.7341161746553275	0.0001451485318812	0.7405645987898882	9.566756382703258e-05	0.814338327474476	3.455131759480733e-06	0.6984145206090333	3.455131759480733e-06	0.7048167163799397	0.0006161129622908	0.7085168053054506	0.0006161129622908	0.7148990101633912	PPP1R13B	49775	ZFYVE21	82069	XRCC3	82296	False	False	False	alt	-60	0.01065	-100	0.1283
1272	chr14	103805167	G	A	rs66676135	-0.0637799055999999	0.2132954918890072	0.0637799055999999	0.2101285494303684	0.0216029337068691	0.4276337319639826	-0.0014017354558684	0.2460370643565994	0.0014017354558684	0.2424493641426193	0.0015481178450067	0.9396466302401602	-0.0001056032592074	0.792620732894095	0.0001056032592074	0.7860235922818929	3.3876003361862274e-05	0.9208933574104612	-2.36579402217238e-06	0.7676132171188692	2.36579402217238e-06	0.7610544883987661	-0.0003703276038401	0.7920110748467886	0.0003703276038401	0.7853505802301431	PPP1R13B	42408	ZFYVE21	89436	XRCC3	89663	False	False	False	ref	-25	0.002869	-55	0.05182
1273	chr14	103855689	A	G	rs3861678	0.2468246172	0.0176953530566998	0.2468246172	0.0178090838570716	0.0365231660039774	0.1389838761048527	0.0092690472585155	0.0279782978495585	0.0092690472585155	0.0281215866061321	0.7746098776021906	0.0084203193141373	0.1875734594348748	0.0030160250032727	0.1875734594348748	0.0029730506274618	0.0280863239107614	0.0106287898357255	0.0069966961879637	0.0061637230166968	0.0069966961879637	0.0061757881069539	0.0440227970043878	0.032494860191987	0.0440227970043878	0.0330660961731274	PPP1R13B	8114	ATP5MJ	72580	TDRD9	72768	True	True	False	alt	-80	0.1168	30	0.04492
1274	chr14	103857440	G	T	rs6576007	-0.0461445863	0.3197613212164601	0.0461445863	0.3154679092338777	0.0433421888993374	0.0884019960356819	-0.002122265884145	0.1899231984827985	0.002122265884145	0.1875434975326977	0.0780566461020751	0.3627509688239171	-0.003468644073219	0.3149583540856435	0.003468644073219	0.3103006103203458	0.003247088878906	0.2382109878488686	-0.000150456049451	0.2296545462798079	0.000150456049451	0.2259471580563484	-0.0076267691597109	0.2720809918967466	0.0076267691597109	0.2677410302573514	PPP1R13B	9865	ATP5MJ	70829	TDRD9	71017	False	False	False	ref	15	0.001099	-45	0.08026
1275	chr15	34365388	A	G	rs4984237	0.04630291618	0.2767316978987831	0.05489965582	0.2779054456156544	0.0172815616246124	0.5870780446842245	0.0007284447404929	0.3806225023921558	0.0008953485808137	0.3822029586582718	0.1178342845831546	0.278548676896105	0.0057919691842062	0.241458372244901	0.00637338226164	0.2431756064900622	0.0020227670265165	0.317931202332089	9.385737866937075e-05	0.2832231775654108	0.0001047778395714	0.2846310812440242	0.0105712447626274	0.2012381497397232	0.0118744020322654	0.2025718180108725	LPCAT4	1808	NUTM1	22072	NOP10	22208	False	False	False	alt	100	0.01511	100	0.02328
1276	chr15	34367316	G	C	rs117799466	0.344132122	0.0059720970755529	0.344132122	0.0059382961352999	0.0543016367036681	0.0436930183246713	0.0191497684408574	0.0074763685276045	0.0191497684408574	0.0075073472917989	0.973249810299891	2.5294957150915e-05	0.3353128471994597	0.0006146291104451	0.3353128471994597	0.0005903093012735	0.0528698364148955	0.0018130358293115	0.0186690697128846	0.001309447603855	0.0186690697128846	0.001285529280677	0.0102132889050179	0.1939545264509461	0.0102132889050179	0.1974266865670922	LPCAT4	120	NUTM1	24000	NOP10	24136	True	True	True	alt	-35	0.0791	-30	0.1494
1277	chr15	40319660	T	C	rs11070264	0.0260758532	0.4989749578620718	0.0260758532	0.5048047304744376	0.1053624745785228	0.0034018233946937	0.0027367718512873	0.1183330496053745	0.0027367718512873	0.1197798204109927	0.0085398040315396	0.7587716851298117	0.0002443557349387	0.6881435982024321	0.0002443557349387	0.694583403046094	0.0009156131576347	0.4732647700104593	2.596459348954651e-05	0.4513177906583168	2.596459348954651e-05	0.456911643537387	0.0009006631255979	0.6655218226618295	0.0009006631255979	0.6719299314608115	INAFM2	4033	PLCB2	11725	CCDC9B	21279	False	False	False	alt	100	0.01715	-100	0.1207
1278	chr15	40324785	T	C	rs2289334	0.0644379517999999	0.2119990538132243	0.0644379517999999	0.2152570040157208	0.0241696063004988	0.3482261186071773	0.0016835713948026	0.2182214758718859	0.0016835713948026	0.2213263958133347	0.6422759064366071	0.0217198661016103	0.0421032141662922	0.0375265661754142	0.0421032141662922	0.0383051993698698	0.0156284394050742	0.0372839820218962	0.0011006500543336	0.0516913172087905	0.0011006500543336	0.0527035491371623	0.0152667348487347	0.1356871229082615	0.0152667348487347	0.1382795129740305	INAFM2	1092	CCDC9B	16154	PLCB2	16850	False	False	False	alt	50	0.01074	-85	0.02423
1279	chr15	40327542	T	G	rs1077476	0.099331291	0.1021563291583137	0.099331291	0.1036508025110203	0.02026821285392	0.4710635753791223	0.0020158190831201	0.1642070504058282	0.0020158190831201	0.1665207083166986	0.3653351918445448	0.0813983137119336	0.0377120653342072	0.0413602497054992	0.0377120653342072	0.0421190971483777	0.0075578365444721	0.1088279196739747	0.0007813013201508	0.0652201648021913	0.0007813013201508	0.0664167554083023	0.0319702418263996	0.0468412036526896	0.0319702418263996	0.0476567747077388	INAFM2	3849	CCDC9B	13397	PLCB2	19607	False	False	False	alt	-55	0.10986	100	0.1289
1280	chr15	43458039	C	A	rs2467742	-0.0304640428	0.4478455627627094	0.0335038304	0.4443151515248039	0.0198780863399147	0.4789162795939714	-0.000516378416424	0.4788719652698452	0.0006037198562654	0.4751975255940521	9.649962059974131e-05	0.9996005443299124	-1.5972049251227771e-06	0.9934701112341066	2.0986379895958184e-06	0.9895556779423752	2.048292582315492e-06	0.9985035320695224	-2.4613088830016712e-08	0.9904925969822256	3.902063721862516e-08	0.9862342616823688	-8.247830820494261e-07	0.9912346214906108	5.7734815743459445e-06	0.990672546984565	TP53BP1	52689	MAP1A	52920	ZSCAN29	86996	False	False	False	ref	25	0.0155	-35	0.0885
1281	chr15	43471801	C	T	rs518288	0.0199701134	0.5856806998361153	0.0199701134	0.5917302622038503	0.0254399528268278	0.3175478615780729	0.0005181648864254	0.4851565268564535	0.0005181648864254	0.4909469384519885	0.0006573521163933	0.9807447675722314	1.3226797066024004e-05	0.9337006140646722	1.3226797066024004e-05	0.9407607769868586	1.6859077321564278e-05	0.962755676833331	3.4691037275518133e-07	0.9080055284006228	3.4691037275518133e-07	0.9150044873574168	5.7734815743459496e-05	0.9295557105293328	5.7734815743459496e-05	0.9365069509200218	TP53BP1	38927	MAP1A	39158	ZSCAN29	100758	False	False	False	alt	40	0.001953	95	0.1205
1282	chr15	43531615	A	G	rs572837	0.1322626218	0.0629771715585691	0.1322626218	0.0637846155948694	0.0551034652150331	0.0424095687931242	0.0071832234442737	0.0348136723757254	0.0071832234442737	0.0350512384507745	0.2744581175150935	0.1235603839713017	0.0397735943409585	0.0406081715725331	0.0397735943409585	0.0413150177790993	0.0149943376280526	0.0401135656173075	0.0021449117672998	0.0249870437693469	0.0021449117672998	0.0253094078584508	0.0440871300847876	0.0277657771521957	0.0440871300847876	0.0280889153530899	MAP1A	20656	TP53BP1	20887	PPIP5K1	58593	True	False	False	alt	-100	0.0338	-100	0.1221
1283	chr15	43536810	C	T	rs2255663	-0.0352559332	0.4250242347787308	0.0352559332	0.4197752894721752	0.0323732575723574	0.1909728336788854	-0.0011450860317625	0.3198651427775125	0.0011450860317625	0.3157715040067269	0.0001913496750354	0.99810739279054	-6.9652287849811615e-06	0.9768639162228636	6.9652287849811615e-06	0.9698010807349876	5.995524689874574e-06	0.9928476563773146	-2.2264610421970026e-07	0.9538420898468808	2.2264610421970026e-07	0.9468406443455204	-2.0619577051235524e-05	0.9818309236902554	2.0619577051235524e-05	0.9750355806709624	MAP1A	25851	TP53BP1	26082	PPIP5K1	53398	False	False	False	ref	65	0.02235	-30	0.02148
1284	chr15	43632949	T	G	rs7169112	-0.147549406	0.0583832831185097	0.147549406	0.0576652018354258	0.0450717363370772	0.0787882859300782	-0.0070818658631517	0.0432471878365201	0.0070818658631517	0.042904040743382	0.0551680907921216	0.4253493102321531	-0.009033505038959	0.1873054512607379	0.009033505038959	0.1841168292794301	0.0025062778296395	0.2808308505528892	-0.0004362081907112	0.1259764389833699	0.0004362081907112	0.1238036909665667	-0.0185353502028966	0.1180097377355887	0.0185353502028966	0.1158238320578539	ENSG00000284772	666	STRC	14149	CATSPER2	35169	False	False	False	ref	55	0.021	-35	0.04016
1285	chr15	43743165	A	C	rs8033846	0.0498999781999999	0.2980998918097077	0.0498999781999999	0.3020383748517655	0.1463437519377255	0.0008339242477522	0.0077211415711877	0.0402748784926758	0.0077211415711877	0.0405140482305278	0.0002226914321532	0.997449979394154	1.0043265485004705e-05	0.9497580807359016	1.0043265485004705e-05	0.9567554935816897	3.336924025730679e-05	0.9214935154620184	1.5847401578929569e-06	0.802726763589101	1.5847401578929569e-06	0.8092754317065743	2.886740787172973e-05	0.9566944242485208	2.886740787172973e-05	0.9637006669631716	PDIA3	3230	SERF2	33923	ELL3	34150	False	False	False	alt	-65	0.04483	100	0.2332
1286	chr15	43746265	C	A	rs7174732	0.02617204748	0.4256342132222262	0.03459124668	0.4291793278085365	0.1253479628647339	0.0015503566843197	0.0033318476359498	0.0976518730801221	0.0043723305000277	0.098224483334604	0.96532117053215	6.543717833883884e-05	0.0253370549370964	0.061978237045096	0.033478007618586	0.0627208214021245	0.1210021409964843	8.088325983494957e-05	0.0032252783646938	0.0156605910552983	0.0042313742501471	0.0158455930890196	0.0007456039061726	0.6572928654750577	0.0010507736465309	0.6610795147685381	PDIA3	130	SERF2	30823	ELL3	31050	True	True	True	alt	100	0.0586	0	0.0
1287	chr15	43746701	C	T	rs2411284	-0.0085260511999999	0.3965808278762419	0.0373988163999999	0.3958380631328224	0.0177548395829716	0.5719888965823907	-0.0002531654292075	0.4448616426081901	0.0007148206572875	0.4441161431780739	0.9398667150539408	0.0004289479271145	-0.008213266303472	0.0515775424837802	0.0350793002347057	0.0513202563571734	0.0166933775122197	0.0327285586735466	-0.0002413070663109	0.0864089677573715	0.0006708711229936	0.0860708458042386	-0.0002416614430404	0.5483874643953184	0.0018169971297547	0.5471991860135845	PDIA3	306	SERF2	30387	ELL3	30614	True	False	False	ref	-100	0.04633	85	0.1829
1288	chr15	43768685	C	T	rs12441861	0.0274864488	0.4826304727429543	0.0274864488	0.4881039871327239	0.0165864943333774	0.6003577921298473	0.0005491088973378	0.5118830196713964	0.0005491088973378	0.5176039686701956	0.0030030352017418	0.8880786263037943	7.191152135311702e-05	0.8146245290820449	7.191152135311702e-05	0.8214826080416658	4.314626770600631e-05	0.900534241217303	1.1656274093651137e-06	0.8197339512037314	1.1656274093651137e-06	0.8265072161521924	0.0002738279832403	0.8127408746895022	0.0002738279832403	0.8196078137484233	SERF2	8403	ELL3	8630	PDIA3	22290	False	False	False	alt	45	0.01178	80	0.2605
1289	chr15	43977577	A	C	rs2957583	0.01234871301	0.5365335743430961	0.02401535059	0.5371152741076933	0.0162014422540014	0.6319511422235277	0.0002633660225037	0.569559570512035	0.0004419858016361	0.5701143387519197	0.2411913166837121	0.1493602666702902	0.0033005546565054	0.2568886867081011	0.0074337197336513	0.2570316957121304	0.004170459496133	0.2038145400404506	7.414058238558503e-05	0.2991220970998719	0.0001384752746056	0.2994245455664904	0.004123915410247	0.3057882567601303	0.0077348157434594	0.3063149079683136	WDR76	150596	MFAP1	152887	SERINC4	177357	False	False	False	alt	95	0.05035	-15	0.0465
1290	chr15	43988411	T	G	rs4924727	0.00485852786	0.8171831538997768	0.00801227986	0.8214461151271911	0.0204148136422141	0.4693561733582971	0.0001021393695943	0.7735950564425279	0.0001671590075068	0.7778643026817694	0.007744713140444	0.7619073057742715	2.550011850594289e-05	0.8376848692585009	6.160423914133064e-05	0.8418817528224816	0.0001552714607726	0.7476366089576292	4.983912641400669e-07	0.8216196165572939	1.242735375374666e-06	0.8257790016170035	9.567483751770365e-05	0.8327300411328067	0.0002358879614661	0.8369336528881293	WDR76	161430	MFAP1	163721	SERINC4	188191	False	False	False	alt	-90	0.02594	-40	0.1158
1291	chr15	44054563	C	T	rs12437804	0.0203751986799999	0.5709031959660218	0.0226994897199999	0.5732508922541013	0.0183716763861102	0.546146270988062	0.0004785013281116	0.5803734853957454	0.0005150831226894	0.582077538048325	0.0042814489789185	0.8561694462543323	5.002512495493759e-05	0.8530279364202908	6.139564242627056e-05	0.8550575181695614	7.913118939994516e-05	0.8531062123830393	1.019541955828022e-06	0.8440632698079916	1.2325928779981432e-06	0.8459550913124395	0.0002317640460558	0.8406808938240449	0.0002598066708455	0.8426828928269658	FRMD5	140708	WDR76	227582	MFAP1	229873	False	False	False	alt	-100	0.03973	-100	0.0848
1292	chr15	44056202	T	C	rs4419034	0.1140840886	0.0859839041243401	0.1140840886	0.0871455604068518	0.0252063546566683	0.3288348315085668	0.0031741234877285	0.1170006259575409	0.0031741234877285	0.118565775690877	0.0028405529345781	0.8969743187227408	0.0003618595971635	0.6464827545370996	0.0003618595971635	0.6527327029367889	7.778886744152774e-05	0.8588670558451047	1.0633010513225578e-05	0.6021458090070876	1.0633010513225578e-05	0.6081443313983782	0.0010961367160436	0.6363210650981065	0.0010961367160436	0.6425149930098947	FRMD5	139069	WDR76	229221	MFAP1	231512	False	False	False	alt	70	0.0455	55	0.04376
1293	chr15	44097699	G	A	rs2706488	-0.0779160652	0.1656269293550026	0.0779160652	0.163207575088184	0.0224921209490091	0.4014686126717684	-0.0017535202510424	0.2041055847644827	0.0017535202510424	0.2013478480573039	0.0431633730328923	0.4662614818573755	-0.0035315507018116	0.300882904295168	0.0035315507018116	0.296488089026559	0.0009740026909036	0.4457444332206327	-7.958729635206414e-05	0.2976820759877154	7.958729635206414e-05	0.2931680613968906	-0.0088853881429183	0.2346355526164943	0.0088853881429183	0.2307675127781483	FRMD5	97572	GOLM2	191021	WDR76	270718	False	False	False	ref	-30	0.05847	85	0.3193
1294	chr15	44117884	T	C	rs2957581	0.1476932044	0.0504420275533817	0.1476932044	0.0510972673429828	0.0353514997178142	0.1545574100888286	0.0057133797721395	0.0548658921666857	0.0057133797721395	0.0552371272230875	0.0670037280195308	0.3931628563679883	0.0098066369531011	0.1604606347731432	0.0098066369531011	0.1634203624891454	0.0022638589169071	0.3013893138500351	0.0003675487897872	0.1278750455356843	0.0003675487897872	0.1299043937865716	0.0200925406618059	0.0976056312254506	0.0200925406618059	0.0992725471068766	FRMD5	77387	GOLM2	170836	WDR76	290903	False	False	False	alt	-100	0.05933	15	0.00964
1295	chr15	44125178	G	A	rs2615285	0.00063732402	0.6853622543844237	0.01529288442	0.6841788186157641	0.0193225613309673	0.511543055954705	7.524802650025725e-05	0.6590086027714405	0.0003405162185635	0.6578061609493489	0.0028356042360858	0.9030757186670098	-9.670278882661804e-06	0.8978739575347942	4.6744351631122655e-05	0.8964978069780496	5.484781618474552e-05	0.8929678029247012	-2.8704756738219696e-08	0.8852074456637189	9.98166664944887e-07	0.8838097912907273	-4.783741875886612e-05	0.8916064771194173	0.000168255748738	0.8902635972763077	FRMD5	70093	GOLM2	163542	WDR76	298197	False	False	False	alt	-25	0.009865	-70	0.1125
1296	chr15	44127261	C	T	rs2555385	0.01253984514	0.7008108175612066	0.0146972676599999	0.7047176326546687	0.013370746866095	0.7634231776123612	0.0001839550247685	0.7486013893369099	0.0002095233320754	0.7526184010636082	0.0093711853782454	0.7492193893726968	0.0001140565216921	0.7849216988826282	0.0001295729385385	0.7886619249009875	0.0001143544668769	0.7988699596184843	1.59286022430222e-06	0.8129307788966422	1.7767502639877435e-06	0.8167534764789015	0.0003892976147272	0.7706942047765003	0.000468476790604	0.7744294342389819	FRMD5	68010	GOLM2	161459	WDR76	300280	False	False	False	alt	-80	0.0808	-90	0.141
1297	chr15	44128046	G	A	rs2114422	0.0538285221999999	0.2656396118316692	0.0538285221999999	0.2692693882002536	0.0183602558861121	0.5337138241279522	0.0010541379380411	0.3188128549352258	0.0010541379380411	0.3227460846303145	0.0078073966546797	0.7982379142327096	0.0005715027268298	0.6302526432999116	0.0005715027268298	0.6363888971802525	0.0001464152495497	0.7943972549846677	1.0796991947915044e-05	0.6281401414398537	1.0796991947915044e-05	0.6342453406395689	0.0017130744614166	0.5945446442833021	0.0017130744614166	0.6006197806055105	FRMD5	67225	GOLM2	160674	CTDSPL2	299577	False	False	False	alt	-100	0.06757	-60	0.0968
1298	chr15	44133240	A	C	rs8042697	0.0015653461399999	0.8470581179649729	0.00676639002	0.8483140910765852	0.0320551769742398	0.1928431030264115	5.555650122909679e-05	0.7117816185888669	0.0002172504902306	0.7132146168584512	0.0001451618224406	0.9988630995834082	2.076558470158205e-07	0.9917399264502732	8.731325878146429e-07	0.9950300585102592	4.894608151068296e-06	0.9929600108159996	8.614629203767059e-09	0.9866303076261888	2.986789746610739e-08	0.988502092167071	1.6495661640988417e-06	0.9954930388127494	1.6495661640988417e-06	0.9979740093567	FRMD5	62031	GOLM2	155480	CTDSPL2	294383	False	False	False	alt	35	0.0364	-50	0.1262
1299	chr15	44141094	T	G	rs2706472	0.0056411293679999	0.7338562410585713	0.0126473202319999	0.7355984478824422	0.032356566474328	0.1881310688470583	0.0001559472266887	0.5943801213928459	0.00038327201809	0.596497520669412	0.0080482333146382	0.762970954738114	8.026180347275823e-05	0.805905252410816	0.0001039504888359	0.807696510747619	0.0002518013102316	0.6802164545824366	2.2927006965915607e-06	0.748259001821993	3.0655412153504826e-06	0.7500502285483102	0.0002812510309788	0.7963604304299353	0.0003719771700042	0.7980325118206869	FRMD5	54177	GOLM2	147626	CTDSPL2	286529	False	False	False	alt	-95	0.1183	-55	0.04852
1300	chr15	58667074	T	C	rs1427281	-0.2477961352	0.015104755941154	0.2477961352	0.0149630473508173	0.0451850270996202	0.0780292575976453	-0.0118611298711144	0.017855984128113	0.0118611298711144	0.017784463909596	0.394892118372868	0.0718150271939819	-0.096317554372161	0.0099999132248146	0.096317554372161	0.0098710749927638	0.0174821242630278	0.0304802008039163	-0.0045528680904019	0.0102305151124049	0.0045528680904019	0.0101657142536753	-0.0829946224143049	0.007182130477665	0.0829946224143049	0.0071322445678124	ADAM10	82717	MINDY2	104119	ALDH1A2	169208	True	True	False	ref	100	0.05127	100	0.2832
1301	chr15	58685871	C	A	rs74017282	0.0110861926	0.6970760375877596	0.0135278977999999	0.7015156013992669	0.0145005617183263	0.7080051113163387	0.000172076727515	0.7237925706878927	0.000200852868199	0.728117667389916	0.006710435155554	0.7851377660954381	8.637870613081863e-05	0.7943916075279955	9.245054572016536e-05	0.7987596403362495	9.890041835359176e-05	0.8111886021730659	1.304715426224475e-06	0.8082058460584135	1.3762736593428473e-06	0.812545474014905	0.0003794002177426	0.7751750440963415	0.0003991950117118	0.7795478801405737	ADAM10	63920	MINDY2	85322	RNF111	179305	False	False	False	alt	100	0.02362	-75	0.129
1302	chr15	58693802	A	T	rs12912003	-0.0448182544	0.3355934627097868	0.0448182544	0.3312975424790672	0.0358276961913623	0.146530104723061	-0.0016169299766475	0.2228173890605396	0.0016169299766475	0.2198226453208775	0.0012924350895713	0.950115082782464	-5.39927622915611e-05	0.8620789175784872	5.39927622915611e-05	0.8552111389087211	4.604357689493919e-05	0.8958710712758775	-1.9254555215586275e-06	0.7892600467530031	1.9254555215586275e-06	0.782726293166833	-0.0002037214212661	0.8577915866307458	0.0002037214212661	0.8510249747724338	ADAM10	55989	MINDY2	77391	RNF111	171374	False	False	False	ref	-90	0.0217	-95	0.03577
1303	chr15	58756822	A	G	rs640704	0.0790102422	0.1529913437261198	0.0790102422	0.1553412847541859	0.024502415626108	0.3415950951210703	0.0019642767378722	0.1728567647154766	0.0019642767378722	0.1753102910198468	0.0062221635709808	0.7934578726531256	0.0004780248175164	0.5760350693001024	0.0004780248175164	0.5819281951075516	0.0001488974089172	0.7544946467925261	1.15575650909029e-05	0.5397113339619036	1.15575650909029e-05	0.5455440530767885	0.0016314209362937	0.5466215102974	0.0016314209362937	0.5525297333551792	ADAM10	7031	MINDY2	14371	RNF111	108354	False	False	False	alt	-50	0.0315	-85	0.1384
1304	chr15	58757147	C	A	rs12437952	0.0034389302	0.7672785767497747	0.0105748914	0.7688708647146822	0.0250762786670593	0.3278567992622627	3.840043592986e-05	0.6790147543831209	0.0002511600629222	0.6802306490572265	0.0011184058592589	0.9605512125218764	4.204427172196007e-06	0.947053033532584	1.2122363889299424e-05	0.9482968140731296	2.8896280330178347e-05	0.9308981300872898	5.0097463826828274e-08	0.9245495633843984	2.9408489968692946e-07	0.9258399973887098	1.3196529312790752e-05	0.9409217130295524	5.278611725116295e-05	0.9421985378599212	ADAM10	7356	MINDY2	14046	RNF111	108029	False	False	False	alt	-35	0.00996	-40	0.07446
1305	chr15	58774477	C	T	rs8025383	0.01209439948	0.6774203422398912	0.01432975108	0.6816921085067186	0.0128710366610676	0.7883141988683604	0.0001450846378802	0.7522469634448447	0.0001752368853659	0.756266476061273	0.0047936392728712	0.8387980636624979	9.260506083563312e-05	0.8237835037884113	9.713129586325303e-05	0.8280113067873838	6.037183509571664e-05	0.8749616455018705	1.0994334526187186e-06	0.8497132027573476	1.160487003786078e-06	0.8537903721830717	0.0003629045561017	0.8057165976622506	0.0003892976147273	0.8099543948526817	MINDY2	3284	ADAM10	24686	RNF111	90699	False	False	False	alt	-65	0.03378	60	0.1979
1306	chr15	58794504	T	G	rs474875	-0.0081034909999999	0.6926391836557698	0.0151097034	0.6915240282885537	0.028002073594181	0.2632023325133939	-0.0002362880253985	0.5643997439154852	0.0004312652390915	0.5631915610171714	0.0390411071888093	0.4939657056246863	-0.0002064172947198	0.5721458699870291	0.0005911847870634	0.5716151621895769	0.0011313359865191	0.4295892090015689	-6.568768346709906e-06	0.5158074318090524	1.755569423746324e-05	0.5151579280175134	-0.0005806472897627	0.5678978635425463	0.001619873973145	0.5672425431870117	MINDY2	23311	ADAM10	44713	RNF111	70672	False	False	False	ref	100	0.01241	-100	0.11145
1307	chr15	58849507	A	G	rs793571	0.00884367312	0.7338929260177787	0.0116729282	0.7362747580244988	0.0174629830215377	0.5743930960864506	0.0001508429816358	0.7498468136427815	0.0002041545394392	0.7521833771050035	0.0001377387747022	0.9991492930448652	1.3395855260036391e-06	0.9842001195752784	1.7864218581597403e-06	0.9896613351908002	2.497942406809912e-06	0.998515869100178	2.2994598259544133e-08	0.9832550156592302	3.1720673777261455e-08	0.9881770029741764	3.299132328197685e-06	0.9902813286150536	3.299132328197685e-06	0.9943487593173008	RNF111	15669	MINDY2	78314	SLTM	84172	False	False	False	alt	-70	0.0203	100	0.1748
1308	chr15	58882340	G	T	rs7179456	0.162111888	0.0393344672513762	0.162111888	0.0397054109752042	0.0362055988012289	0.142431699641395	0.0060215101715013	0.0442076158052057	0.0060215101715013	0.0445389944257594	0.0595048002375374	0.4140211549157712	0.0101732484114863	0.1567048918694142	0.0101732484114863	0.1596283089867264	0.0021572937633393	0.311356758178709	0.0003749985139005	0.1226029124468979	0.0003749985139005	0.1248798357744876	0.0211928012932598	0.0922854350981203	0.0211928012932598	0.0940713402497385	RNF111	17164	SLTM	51339	MINDY2	111147	False	False	False	alt	-90	0.2347	35	0.10547
1309	chr15	58889786	G	A	rs2270664	0.0419856282	0.3536761592655212	0.0419856282	0.3584230904269169	0.0191189687907628	0.5144204618338533	0.000854354435592	0.3860277971993159	0.000854354435592	0.3907581232491099	0.4123049388010953	0.0662529441006596	0.016781755017826	0.1046858920042059	0.016781755017826	0.1067452671388862	0.0077522353012694	0.1025126998894545	0.000340144865004	0.1343780367716199	0.000340144865004	0.1367495717958643	0.0141318333278347	0.1534314349940936	0.0141318333278347	0.1560801794121438	RNF111	24610	SLTM	43893	MINDY2	118593	False	False	False	alt	-20	0.05164	-35	0.508
1310	chr15	58891447	T	C	rs11071400	-0.0174074498	0.6406293742125266	0.0174074498	0.6341724144518162	0.0231684407736197	0.3766366406620927	-0.0004122519578642	0.5564268248828317	0.0004122519578642	0.5504016151081306	0.0019827785292467	0.9223815435506396	-3.1679830195915695e-05	0.8976614380626743	3.1679830195915695e-05	0.8907363988606127	4.36072851021227e-05	0.8985181794533122	-7.183731200243792e-07	0.8709690298193609	7.183731200243792e-07	0.8640261643883231	-0.000117943980733	0.9009435528675548	0.000117943980733	0.8940152898799822	RNF111	26271	SLTM	42232	MINDY2	120254	False	False	False	ref	80	0.02426	100	0.12286
1311	chr15	58905741	T	C	rs11857223	0.0285741723999999	0.4726634099507837	0.0285741723999999	0.4782738850162135	0.0276980444160899	0.2683648044404108	0.0007548380776572	0.3833513072987151	0.0007548380776572	0.3884113693508426	0.0053289234931212	0.8238084849067207	0.0001790312089393	0.7391850485281226	0.0001790312089393	0.7456608029168827	0.0001378531251291	0.7717894913116002	4.338113467162156e-06	0.691071142061164	4.338113467162156e-06	0.6972035263665229	0.0006293094916036	0.7245130078320834	0.0006293094916036	0.7308097245985972	SLTM	27938	RNF111	40565	MINDY2	134548	False	False	False	alt	100	0.02219	100	0.10345
1312	chr15	58910399	G	T	rs4774315	-0.01078274896	0.7857342392330685	0.01078274896	0.7791984297871152	0.0077029207838035	0.9777461110374368	-9.046818320270508e-05	0.886133649384142	9.046818320270508e-05	0.8793871702689235	0.0018417406222163	0.9312170637897816	-2.86618871818036e-05	0.9383721286072316	2.86618871818036e-05	0.9314922626823458	1.4727157875595782e-05	0.9715171227208677	-2.488642573759231e-07	0.963936954870152	2.488642573759231e-07	0.9569537617147252	-0.0001072218006664	0.932243690322016	0.0001072218006664	0.9253457727166704	SLTM	23280	RNF111	45223	MINDY2	139206	False	False	False	ref	-95	0.02652	-95	0.1146
1313	chr15	58946062	A	G	rs4775106	0.05519880411	0.2681906602763797	0.0555644862899999	0.2709453292083988	0.0308602213045956	0.2135276990150019	0.0019164734361104	0.2203246615079861	0.0019242665647961	0.2222745264675315	0.0011307776054897	0.9608091276012618	6.206465179424783e-05	0.8518512969617887	6.245372672665657e-05	0.8564651017897424	3.4719921406949224e-05	0.9216142642884232	2.1555371620566435e-06	0.7944839570107188	2.1638288185547173e-06	0.7987647636591865	0.0002119692520866	0.8550511142251289	0.0002136188182507	0.8595839373880416	SLTM	12383	RNF111	80886	CCNB2	159065	False	False	False	alt	-55	0.01065	95	0.1567
1314	chr15	59067727	C	T	rs8042896	0.0208453322	0.5854591994118081	0.0208453322	0.591684562688143	0.0251379414364452	0.3259605822287419	0.0005219093278832	0.4914684925580087	0.0005219093278832	0.497170056221133	0.0094916037082246	0.7316168345733913	0.0001928235327809	0.7025716178892589	0.0001928235327809	0.7090020956585612	0.0002347600973955	0.6858038140032389	4.74707657659859e-06	0.6608304439654785	4.74707657659859e-06	0.6670481307186471	0.0006903434396753	0.6913473468364056	0.0006903434396753	0.6977716324616875	CCNB2	37400	SLTM	134048	LDHAL6B	139117	False	False	False	alt	-95	0.01437	-90	0.1849
1315	chr15	59072894	C	A	rs78352043	-0.00992030198	0.5826035552045028	0.02367486682	0.5828194598725878	0.0694479803123437	0.0181499868289367	-0.0006853242434171	0.2956863056995319	0.0016114298078468	0.2958479458784547	0.0008618983207416	0.970494256830934	-1.0607771441395241e-07	0.943948558220752	1.550601072677359e-05	0.9451901836150453	5.978677933261841e-05	0.8707851787546675	-1.999272073954548e-08	0.8576364464874665	1.0615184332563238e-06	0.8585883424273374	-1.649566164109716e-06	0.935311339741578	6.763221272804164e-05	0.9353077483729156	CCNB2	32233	LDHAL6B	133950	SLTM	139215	False	False	False	ref	95	0.007755	95	0.12335
1316	chr15	61539481	T	C	rs11633501	0.1039262952	0.097264607162726	0.1039262952	0.0985690105033831	0.0445375876950438	0.0810461441587208	0.0048012457902933	0.0632409746749411	0.0048012457902933	0.0638707323018465	0.0056159480056744	0.8167285643324015	0.0005656694823771	0.5660453554839825	0.0005656694823771	0.5720074348540564	0.0002313975380021	0.6963501320373526	2.394649416141949e-05	0.4496254185567683	2.394649416141949e-05	0.4552421331602531	0.0019093728349443	0.5326654281962274	0.0019093728349443	0.5387705393600518	RORA	310179	VPS13C	520992	C2CD4A	527497	False	False	False	alt	95	0.0401	65	0.187
1317	chr15	61546114	C	T	rs4635285	-0.0880405669	0.1578824524687487	0.0880405669	0.1559076629215752	0.0197821128664134	0.4850999939503264	-0.0017368878316949	0.2461358512141463	0.0017368878316949	0.2430001162000598	0.4027127115568605	0.0678926474361497	-0.0419763850332011	0.0521819630376933	0.0419763850332011	0.051277788538115	0.008054598939119	0.1006867269703671	-0.0008546852815559	0.0857328255015802	0.0008546852815559	0.0842057829403901	-0.0273399096037741	0.0731631833176225	0.0273399096037741	0.0720118534102874	RORA	316812	VPS13C	514359	C2CD4A	520864	False	False	False	ref	-100	0.2605	-10	0.1006
1318	chr15	61559059	G	T	rs55835773	0.0957789764	0.1345159908362988	0.0957789764	0.1360724274730591	0.050466131045771	0.0565832116302678	0.0057147318441279	0.0747103625712922	0.0057147318441279	0.0753420072154425	0.0161838936359737	0.6588071261182615	0.0018562103288688	0.4361660826467829	0.0018562103288688	0.4414558334801275	0.0008725285246807	0.4878999569228096	0.0001149503691645	0.3056735563697507	0.0001149503691645	0.3096330285201931	0.004958595889281	0.3741009179747642	0.004958595889281	0.3790801552290206	RORA	329757	VPS13C	501414	C2CD4A	507919	False	False	False	alt	85	0.00995	-70	0.1128
1319	chr15	61559075	C	T	rs55835940	-0.0871205063999999	0.1793084906543315	0.0938455219999999	0.1781078922393304	0.0314226431488741	0.2154798392716313	-0.0042631072820095	0.1657955222342324	0.0044520318833036	0.1645019123560997	0.0107914618455345	0.7252480810326218	-0.0008067404162941	0.5472502149406298	0.0009607162254368	0.5438128489784745	0.0003521532949461	0.6442893856662668	-4.237598735407949e-05	0.4685976331940283	4.670160093654577e-05	0.4654025448438418	-0.0019489624228827	0.5186182426368033	0.0024751740292302	0.5151328032106114	RORA	329773	VPS13C	501398	C2CD4A	507903	False	False	False	ref	-65	0.01445	-90	0.1589
1320	chr15	61598711	C	T	rs7169676	-0.0127801048	0.4385743671474643	0.032276034	0.4366372324688138	0.0164638153025703	0.6232169465605729	-0.0002245759750667	0.4876541901665543	0.0005299222510321	0.4858335588419128	0.64359308501864	0.0212793003899791	-0.0078649259600986	0.0796789437000392	0.0206665421920065	0.0793389162776774	0.0106308936575242	0.067498936086836	-0.0001388025918977	0.1209611627213559	0.000340292641526	0.1204107948797175	-0.0032933588466233	0.2459721471979638	0.0079797763188281	0.2448454217388219	RORA	369409	VPS13C	461762	C2CD4A	468267	True	False	False	ref	70	0.0807	100	0.6445
1321	chr15	70282669	G	T	rs28620094	0.6799981239999999	0.0006096859988064	0.6799981239999999	0.0006092258791437	0.1249103651037933	0.0015891477977692	0.0866678161773722	0.0004323422458369	0.0866678161773722	0.0004508431078638	0.0638728514400712	0.4148377967877841	0.0425446482100516	0.0391683373473429	0.0425446482100516	0.0398157377688041	0.0078585256646108	0.1116880900334627	0.0053621026763816	0.0091517824965584	0.0053621026763816	0.0092829462754271	0.0540117449110883	0.0218922884576769	0.0540117449110883	0.0221743640798687	TLE3	184493	UACA	480889	LRRC49	570571	False	True	True	alt	-75	0.01862	-75	0.23
1322	chr15	70283799	G	A	rs1971791	-0.02082164228	0.3592076077615914	0.0434126302799999	0.3565109750454988	0.0367271523598956	0.1371789749786706	-0.0005188564699102	0.2498939780830295	0.0015842462121022	0.2479765345977199	0.0021436112302464	0.9394702272935048	-7.712729846604869e-05	0.8626479883706901	8.756159041882064e-05	0.8584189872265097	7.075747686194137e-05	0.8949528207816088	-2.3948813229383778e-06	0.801122590986406	2.886961966621824e-06	0.7968235735256914	-0.0002581571046814	0.8594511780513017	0.0002812510309788	0.8551111624941734	TLE3	185623	UACA	479759	LRRC49	569441	False	False	False	ref	-70	0.04883	-45	0.2319
1323	chr15	70301656	T	C	rs2415092	0.135695858	0.0607167142660556	0.135695858	0.0614868583293535	0.0366999960254118	0.1370733208893894	0.0051352349378186	0.0581250129076221	0.0051352349378186	0.0588437619052684	0.1849180165616442	0.1989870985003334	0.024711787926068	0.0726739294345726	0.024711787926068	0.074124064974821	0.006911008319563	0.125834527208698	0.0009574133789819	0.0604185043952084	0.0009574133789819	0.0614138821279556	0.0343332453564712	0.0452015780685612	0.0343332453564712	0.0459121588411002	TLE3	203480	UACA	461902	LRRC49	551584	False	False	False	alt	55	0.083	45	0.1357
1324	chr15	78447129	T	C	rs2915695	0.0393883699999999	0.3582500860079372	0.0393883699999999	0.3632557677049481	0.0156531572943204	0.6368702453004874	0.0006690064910463	0.4267496066301635	0.0006690064910463	0.4323689739061955	0.0195852990663455	0.6214094350904261	0.0008050870211302	0.5152193406089922	0.0008050870211302	0.5211490922984944	0.0003365905207507	0.6478613473551904	1.4442168698353672e-05	0.5362865650076503	1.4442168698353672e-05	0.5423431602096687	0.0026294084655735	0.4712349580402653	0.0026294084655735	0.4771100004885181	IREB2	9697	HYKK	60436	PSMA4	93277	False	False	False	alt	90	0.10156	-40	0.1066
1325	chr15	78571130	T	C	rs667282	0.1708617	0.0372069952078492	0.1708617	0.0376621544413356	0.0390939840325695	0.1198665736287412	0.0072552454389452	0.0393393113463698	0.0072552454389452	0.0396613823016426	0.2093901553891326	0.1674867935461068	0.0353687158145408	0.0438056034197174	0.0353687158145408	0.0446284710188093	0.0080456962498498	0.0983383388168511	0.0014736896776254	0.0368325152286026	0.0014736896776254	0.0375081022045944	0.0489352050410741	0.0219903525378492	0.0489352050410741	0.0223169318343071	CHRNA5	5609	PSMA4	30724	CHRNA3	50165	False	False	False	alt	10	0.00896	80	0.4526
1326	chr15	78602417	C	G	rs3743078	0.06696468	0.1937690245037914	0.06696468	0.1968028475982591	0.0190585827779898	0.5110148078868338	0.00134429958823	0.2582253625192609	0.00134429958823	0.2617559628986033	0.007628418725875	0.7755905214988933	0.0004672602966146	0.5857286481777546	0.0004672602966146	0.5919248445255173	0.0001357868879167	0.7772435494667588	8.591865268135677e-06	0.5885635427904243	8.591865268135677e-06	0.5946916389670205	0.0017163735937447	0.5469913460979805	0.0017163735937447	0.5530823273248582	CHRNA3	18878	CHRNA5	36896	PSMA4	62011	False	False	False	alt	-100	0.1067	-100	0.08484
1327	chr15	78617916	C	T	rs3825845	-0.06854101	0.2077416823677222	0.06854101	0.2051972169249613	0.0305291550343909	0.2166158458020116	-0.0020456977385115	0.1894571672485825	0.0020456977385115	0.187233461939956	0.2507538517369931	0.1429063197941071	-0.0165907671151153	0.1191476335263619	0.0165907671151153	0.1171308478558003	0.0076104927736687	0.1098612526245336	-0.0004849219074764	0.1111472028166477	0.0004849219074764	0.1093605781901276	-0.0197486061165912	0.1122774006162573	0.0197486061165912	0.1105413344169486	CHRNA3	3379	CHRNA5	52395	PSMA4	77510	True	False	False	ref	-100	0.1221	-70	0.229
1328	chr15	82569019	T	C	rs698500	0.1130717	0.0855392408927993	0.1130717	0.0864604704985984	0.0224562813979222	0.4024992916977277	0.0025260166337761	0.1344457398115332	0.0025260166337761	0.1361289584774474	0.1400283725380224	0.2476620138442242	0.0164775543844315	0.1074420181215038	0.0164775543844315	0.1095604749040266	0.0031949278957227	0.242545558589054	0.0003741606605685	0.1238903611155206	0.0003741606605685	0.1261569453653537	0.0269687572168519	0.0674237215876603	0.0269687572168519	0.0685812147244828	ENSG00000260836	4175	RPS17	28560	CPEB1	79842	False	False	False	alt	-60	0.0598	60	0.3372
1329	chr15	82577391	T	A	rs2678445	0.00163339482	0.8788492302874337	0.0053844277	0.8804530311560789	0.0145316988641332	0.704620908850563	3.42421438184771e-05	0.8863151767261821	7.654523251436401e-05	0.88800387620342	0.0005319850879218	0.9867667598660744	7.145849252663183e-08	0.984291491699726	2.721528728639088e-06	0.987578087723376	7.353025619373636e-06	0.988045109792288	8.451175857737123e-09	0.9852765191205404	3.543931697290106e-08	0.9884917215461484	2.474349246148254e-06	0.9882421741922628	7.423047738444784e-06	0.9903964478796076	ENSG00000260836	4197	RPS17	36932	CPEB1	71470	False	False	False	alt	80	0.02124	75	0.1156
1330	chr15	82580618	C	T	rs783532	0.00738920058	0.6943936943099756	0.01433083058	0.6979214874323109	0.0600567623325707	0.031031847219089	0.0003696627010477	0.3632796196843624	0.0008453709637319	0.3656619830983413	0.003556464649797	0.8840162289342611	1.589795555803266e-05	0.8787780418384147	3.7625616841023856e-05	0.8824750905792199	0.0001994996242201	0.756903090470053	6.831578510805858e-07	0.772261930987868	2.172149353247248e-06	0.7758377740310406	5.691003266142262e-05	0.8759720814538519	0.0001575335686714	0.8796732475707896	ENSG00000260836	7424	RPS17	40159	CPEB1	68243	False	False	False	alt	-80	0.006943	-45	0.03857
1331	chr15	82590236	A	C	rs71412256	0.00706000014	0.7424031388645584	0.01242947054	0.7461948934925177	0.0441602648521758	0.0822658981837679	0.0002539929668333	0.5248720943306439	0.000534099121511	0.5283251315065468	0.0021832008181847	0.9132819807874524	1.0626760514363244e-05	0.9151427595923016	2.555130507310786e-05	0.9192271881635994	9.963782492526936e-05	0.8123914667699351	3.713777020194144e-07	0.8437766902022532	1.1499380771833146e-06	0.8477504291873118	3.464088944605535e-05	0.9126733164076096	9.897396984589531e-05	0.9168139136253096	ENSG00000260836	17042	RPS17	49777	CPEB1	58625	False	False	False	alt	-100	0.0321	100	0.02542
1332	chr15	82593431	T	G	rs2567635	0.0139289919999999	0.4435552229705609	0.0306445111999999	0.4447137260270217	0.0259389958893063	0.3102536534745247	0.0004739607698719	0.3864015514708066	0.0008765688307754	0.38711269200466	0.0131321962323908	0.6966336403471691	6.780169311320109e-06	0.6316930813560708	0.0004801065346114	0.6328229097999661	0.0003447735182826	0.6475018645556387	1.5274727028357463e-06	0.5863471751329098	1.319069114567284e-05	0.5875544766436274	8.825178977927994e-05	0.5947271696776725	0.0016800831381346	0.595970526349756	ENSG00000260836	20237	RPS17	52972	CPEB1	55430	False	False	False	alt	-75	0.00998	-40	0.0808
1333	chr15	82613877	T	C	rs1269134	0.0753341618	0.1201534242811208	0.098532355	0.1209745668204525	0.0274494934822261	0.2738883816693712	0.0022113595553797	0.1373902748407317	0.0027678199064925	0.1383685739053292	0.4254660024413579	0.0621645598727101	0.0362083324024332	0.0390806098894823	0.0435528133612099	0.0395066237280677	0.0116860674161547	0.0593775258284904	0.0010491173922726	0.048594500267837	0.0012252911312423	0.0492085523078371	0.0243187291742271	0.0531492149399363	0.0322531424235425	0.053463106895926	CPEB1	34984	ENSG00000260836	40683	RPS17	73418	False	False	False	alt	50	0.0163	-5	0.01807
1334	chr15	82630613	A	C	rs28374463	0.035265089	0.3574213057686712	0.0410898233999999	0.3604728935350433	0.0635887169493634	0.0257782772826814	0.0025106044891791	0.1396347985144017	0.0028333981090965	0.1404101353599491	0.0149351720497508	0.6716493052013033	0.0005034694491682	0.5761365973436501	0.0005726971394777	0.5798423898696808	0.0009162137847333	0.4681761288978234	3.314424073128534e-05	0.4071977009385523	3.69806829989525e-05	0.4103010369665938	0.0015101778232324	0.5448625306423278	0.0018186466959189	0.5484857163214969	CPEB1	18248	ENSG00000260836	57419	AP3B2	79499	False	False	False	alt	90	0.1873	95	0.0855
1335	chr15	82697544	A	C	rs10906984	-0.099127352	0.1198728988128914	0.099127352	0.1183200443990744	0.0330168860590571	0.1785843422078959	-0.0034490390522321	0.1102124104493193	0.0034490390522321	0.1089750860848329	0.0061710270198937	0.8194020146180877	-0.000929787666406	0.5801534561935303	0.000929787666406	0.5739217971594649	0.0002142906217123	0.7411946917527403	-3.290864349632291e-05	0.5031353837939946	3.290864349632291e-05	0.4972706445541614	-0.0027646728910296	0.5343386626055913	0.0027646728910296	0.5282227339963553	AP3B2	12568	CPEB1	48683	FSD2	108526	False	False	False	ref	-100	0.01907	-75	0.05414
1336	chr15	82699762	T	G	rs9652567	0.124048772	0.0685214215526318	0.124048772	0.0694359269458566	0.0267510297749729	0.2908628327795757	0.0034120527866344	0.0940845141679594	0.0034120527866344	0.0952457418039507	0.2194640559532842	0.1648135684553612	0.0286966844496239	0.0618065232454605	0.0286966844496239	0.0630237475937443	0.005863868773701	0.146251863443279	0.0007765674265458	0.0700374543662683	0.0007765674265458	0.0713475214005711	0.0351448319092078	0.0416975019875801	0.0351448319092078	0.042482940398844	AP3B2	10350	CPEB1	50901	FSD2	106308	False	False	False	alt	100	0.4167	100	0.467
1337	chr15	82706505	A	G	rs4779054	0.0881422628	0.1343129403779497	0.0881422628	0.1361908730673037	0.0166923636913582	0.6018719025134271	0.0016968432551158	0.2322260307582111	0.0016968432551158	0.2353071919521526	0.1606702187324733	0.2319812559735216	0.0152630747730651	0.1234662606854671	0.0152630747730651	0.1257269076336057	0.0029659046421705	0.2776096511901873	0.0003118551904122	0.1653786839650796	0.0003118551904122	0.1680258129067498	0.0229182475009071	0.0895607307169897	0.0229182475009071	0.0909341641459977	AP3B2	3607	CPEB1	57644	FSD2	99565	False	False	False	alt	-100	0.01466	-70	0.04968
1338	chr15	84549423	A	C	rs34921234	-0.276938898	0.0115090029205686	0.276938898	0.0114462168719908	0.032496038501989	0.1906409116873787	-0.0096939890746268	0.0255633526335336	0.0096939890746268	0.025370668989297	0.0115948005674506	0.7073591567208939	-0.0032506000210019	0.3114420521491492	0.0032506000210019	0.3069267917822076	0.0003723065204707	0.6198412839407135	-0.0001099314392721	0.25827862159914	0.0001099314392721	0.2543076398458037	-0.0074131503414601	0.2670483330268134	0.0074131503414601	0.262855990058407	ZSCAN2	51564	WDR73	104920	NMB	109140	False	True	False	ref	-25	0.01953	-95	0.04834
1339	chr15	84562751	G	C	rs12902973	0.0096859928799999	0.6964850624382153	0.0135746252799999	0.7004619036092945	0.0221290840757003	0.4136802225812039	0.0002211367101845	0.6503123281573021	0.0002907599674403	0.6545072904099776	0.0131206492692421	0.7395965611066857	-4.046780143375056e-05	0.7795670316819991	0.0001393001405811	0.7828296141271982	0.000259188346649	0.7219650003091286	-5.189235104158767e-07	0.763338214152403	2.699696437118679e-06	0.7665666234799099	-8.247830820495077e-05	0.7753300221741277	0.0005047672462142	0.7786039303075368	ZSCAN2	38236	WDR73	91592	NMB	95812	False	False	False	alt	-100	0.04358	100	0.1122
1340	chr15	84582816	G	C	rs34973912	0.146527273	0.0516049238197455	0.146527273	0.0521884759244904	0.0480441592014042	0.0650978917303531	0.0074528673589192	0.0358254542444526	0.0074528673589192	0.0360442056107763	0.0884901520900002	0.342130834750399	0.0138509498100049	0.1309508663469967	0.0138509498100049	0.1334420892112501	0.0045953198519356	0.1926496470868028	0.0007538031510715	0.0824480804928115	0.0007538031510715	0.0841056728591359	0.0246205997822572	0.0775387437796504	0.0246205997822572	0.0790352925823736	ZSCAN2	18171	WDR73	71527	NMB	75747	False	False	False	alt	-90	0.097	-75	0.1951
1341	chr15	84634492	T	G	rs36126054	0.0348194034	0.4024117156073696	0.0348194034	0.4080082055824384	0.0152264632790301	0.6703149881786097	0.0005484643134228	0.4773603789080453	0.0005484643134228	0.4831955459242691	0.5813871201873907	0.0294784271922915	0.0211054365907861	0.0801815483543421	0.0211054365907861	0.0817661310500943	0.0089532276463773	0.0870734821604917	0.0003342014115539	0.1281395394867936	0.0003342014115539	0.1305474714233188	0.0089192042492824	0.2193184952800881	0.0089192042492824	0.2232204679356937	WDR73	19851	NMB	24071	ZSCAN2	33505	False	False	False	alt	-5	0.003231	-100	0.399
1342	chr15	84759142	G	A	rs12899981	-0.00899346254	0.4844370349353666	0.02852863146	0.4844885758944386	0.0194664479999704	0.5002487514930227	-0.0001829012991447	0.4793045524623919	0.0006286821957852	0.479744611868048	0.0092161261588201	0.7401909134472258	-0.0001404321485051	0.6931903987541799	0.000311614544123	0.693694449046057	0.0001889005270951	0.733382949117912	-3.0765650528588145e-06	0.6778193384726959	7.123371342530154e-06	0.678262361745981	-0.0004561050443733	0.6600623874147844	0.0010796410544026	0.6605697814188827	ZNF592	10549	SEC11A	42682	ALPK3	58215	False	False	False	ref	0	0.0	30	0.05768
1343	chr15	89243824	T	G	rs7178152	-0.020133346	0.2331690170966528	0.0593836159999999	0.2323238843155382	0.035837542709872	0.1568826233014397	-0.0005285014816117	0.1822099996780477	0.0018561445442064	0.1817712593104782	0.9399409455313252	0.0004274810356954	-0.0193369736138041	0.0243692432422045	0.0559124717789779	0.0242180512486605	0.0335976133614541	0.0073713484476835	-0.0005109880306478	0.0279533022768706	0.0017459274746318	0.0278255779140301	-0.0005369337864141	0.450844947102649	0.00280508726205	0.4498037892740213	FANCI	122	RLBP1	22210	POLGARF	89985	True	False	False	ref	50	0.2412	75	0.6484
1344	chr15	89248285	A	G	rs2108600	0.0682182392	0.192581611376616	0.0703052688	0.1945888321843922	0.0177598472154081	0.5721526246185573	0.0013114440766144	0.2811925859536656	0.0013429590733658	0.2839374410064128	0.0045453795651743	0.833118150296005	0.0002942378526736	0.6596449711278958	0.0003037052596846	0.6641378597290034	7.982412537649558e-05	0.8357656759656017	5.62528928921268e-06	0.6618324000396961	5.768250988045277e-06	0.6663386576075379	0.0010243805879053	0.6363986957537447	0.0010639701758437	0.6408668641137154	FANCI	4339	RLBP1	26671	POLGARF	85524	False	False	False	alt	-90	0.0332	-90	0.1226
1345	chr15	89251793	G	A	rs6496569	-0.0423742547	0.3572967110217548	0.0423742547	0.3527029563558982	0.0115526270688961	0.8498316716872859	-0.0004982003934886	0.5265493399606799	0.0004982003934886	0.5206525402077344	0.0059310151430173	0.8325840331803182	-0.0003047225219179	0.7135716626901193	0.0003047225219179	0.7073633282716494	6.891007042055665e-05	0.8783236291652832	-3.5411074015757087e-06	0.7629687372017634	3.5411074015757087e-06	0.756574254608131	-0.0009765431691464	0.6939520308956533	0.0009765431691464	0.6876791151087055	FANCI	7847	RLBP1	30179	POLGARF	82016	False	False	False	ref	100	0.0508	95	0.148
1346	chr15	90862916	A	C	rs7168951	0.01438665075	0.6825389120679314	0.01466570845	0.6875746105563459	0.0686661481048862	0.0196771802138119	0.0011535124930338	0.3348287324981299	0.0011676440912416	0.3378327907477555	0.0415426742766652	0.4792433041933757	0.0004735692858694	0.5959884555083121	0.0004877311580855	0.6002477543797691	0.0027037242167116	0.2616001638214249	3.651628358932398e-05	0.4116263463963081	3.723344669655125e-05	0.4158348313589895	0.0014466695259146	0.5887792491149015	0.001486259113853	0.5930939841048446	FURIN	5673	FES	20780	MAN2A2	39303	False	True	False	alt	80	0.003052	-95	0.354
1347	chr15	90866779	G	T	rs3759929	0.0280628094	0.4786988589234478	0.0280628094	0.4843324447182893	0.0155092952662316	0.665908631203735	0.0004549033721059	0.532149811793715	0.0004549033721059	0.5379182989901771	0.0885272673286925	0.3332418388819667	0.0023793695215728	0.3464340298944929	0.0023793695215728	0.3513359761398648	0.0013762765318392	0.388470099697942	3.801063757145685e-05	0.3868231102451592	3.801063757145685e-05	0.3920946776111133	0.0051647916597934	0.3303891968812099	0.0051647916597934	0.3351076548014641	FURIN	1810	FES	16917	MAN2A2	35440	False	False	False	alt	-5	0.004364	-100	0.1534
1348	chr15	90976869	A	G	rs8037254	0.30113639	0.0089555862833759	0.30113639	0.0089984921052272	0.0594189560758101	0.0330963087733653	0.018564907577756	0.0084893547544524	0.018564907577756	0.0085129378038938	0.025301045824948	0.5687455491019562	0.0077962090817689	0.1833801789633979	0.0077962090817689	0.186577201805252	0.0015011948973035	0.3690972731703043	0.0004803793901986	0.1013403810466251	0.0004803793901986	0.1034044154300592	0.016273794991917	0.1249044526559942	0.016273794991917	0.1272080358553395	PRC1	18760	RCCD1	21987	HDDC3	41673	False	True	True	alt	100	0.1002	-100	0.3958
1349	chr15	90977078	C	T	rs12595052	-0.00944897714	0.712633127560995	0.01330047674	0.7089469786550492	0.0299729407680355	0.2240554713098023	-0.0002757712525868	0.5798365480304183	0.0003937014410356	0.5764636513886691	0.0096870772986704	0.749962258529169	-9.380576775480513e-05	0.7845760635600763	0.0001325609204455	0.7808583088410469	0.0003144724467614	0.673035269453416	-3.100319930682093e-06	0.7239050429621594	4.286975187086535e-06	0.7202141331919394	-0.0003233149681633	0.771634391420745	0.0005031176800501	0.7678448199038622	PRC1	18551	RCCD1	22196	HDDC3	41882	False	False	False	ref	-50	0.0907	100	0.1073
1350	chr15	91033716	T	G	rs11632664	-0.003223532	0.5739698057435979	0.0216815879999999	0.5751760317297048	0.0860449867047209	0.0079308649803328	-0.000277366610124	0.192753200943475	0.0018880705104864	0.1937092161951683	0.270844742832635	0.1272078644494971	-0.0005487618382737	0.2246778960906233	0.0061218614839377	0.2256681846287529	0.0228957458247058	0.0183989515073187	-2.95157699594e-05	0.0974093280174453	0.0005196552970587	0.0980396445470411	-0.000467652007522	0.284267287569558	0.0066386790274157	0.2853658882460861	VPS33B	11113	ENSG00000284946	11150	PRC1	38087	False	True	True	ref	85	0.03964	-95	0.194
1351	chr15	97674744	G	T	rs111548674	-0.206407456	0.023269856226574	0.206407456	0.0230736156463198	0.0415048356047325	0.0989221754829151	-0.0086573544652939	0.0264028765600722	0.0086573544652939	0.026296247671097	0.043592260235558	0.4872220330814854	-0.010187346237025	0.1778091251538563	0.010187346237025	0.1747277288573759	0.0017458443277182	0.358012202103481	-0.000408095580034	0.129903104288152	0.000408095580034	0.1278062865689751	-0.0204307017254461	0.1083414237246136	0.0204307017254461	0.1065741014806901	ARRDC4	285960	IGF1R	973796	PGPEP1L	1333048	False	False	False	ref	-10	0.01605	20	0.05615
1352	chr15	97709295	A	G	rs11073569	0.044672558	0.312733737237143	0.044672558	0.31743873075917	0.0254404059276372	0.320788368870795	0.0011300956100914	0.2822247832799607	0.0011300956100914	0.2862761099302581	0.0092153013757381	0.7474026848493223	0.0004417583874385	0.6080965076807932	0.0004417583874385	0.6142169016316349	0.0002275037266224	0.7038142273970224	1.088323682798174e-05	0.5687321159977061	1.088323682798174e-05	0.5747204641433756	0.0015332717495298	0.5754917179230427	0.0015332717495298	0.5815094068145286	ARRDC4	251409	IGF1R	939245	PGPEP1L	1298497	False	False	False	alt	60	0.0111	-75	0.04175
1353	chr15	97717715	C	T	rs12908536	-0.182245054	0.03189027928242	0.182245054	0.0314871477360976	0.0257723229475879	0.3117546924204458	-0.0049096893827514	0.062616129894741	0.0049096893827514	0.0620343159059583	0.0861980799049849	0.3486236636491295	-0.0170453156770847	0.1119180213350717	0.0170453156770847	0.110078130004485	0.0023371855949365	0.3081020575748063	-0.0004728880848613	0.115734153856832	0.0004728880848613	0.1139526679581433	-0.0302571673649829	0.0585081900146587	0.0302571673649829	0.0577382013407412	ARRDC4	242989	IGF1R	930825	PGPEP1L	1290077	False	False	False	ref	45	0.02823	-100	0.2283
1354	chr15	97728980	G	A	rs59251433	-0.0082962822	0.6373184760889747	0.0175990405999999	0.6341063175418756	0.0305764040705932	0.2152097917853475	-0.0002699958479095	0.494797534232279	0.000526910938296	0.4921316623089513	0.6792327867770777	0.0174487784715402	-0.006239667256383	0.1358910390291427	0.011872200368412	0.1346264126209541	0.0208432352243358	0.021050189871316	-0.0002013008137655	0.1205457115747748	0.0003568549717257	0.1194300053652476	-0.00143677212893	0.399122520009336	0.003823694368381	0.3968842891293023	ARRDC4	231724	IGF1R	919560	PGPEP1L	1278812	True	False	False	ref	-40	0.01526	-85	0.1543
1355	chr15	97745844	G	T	rs189443571	-0.01535877522	0.5758264402597961	0.02218652322	0.572718786852234	0.0138297949202501	0.7468664720518893	-0.0002252917208154	0.6572277216453704	0.000301958180306	0.6534742197534085	0.6185815380554914	0.0243462476875282	-0.0087818820805878	0.1441921357021867	0.0137481951891236	0.1430767379348908	0.0084537197400493	0.091200022378871	-0.0001293362492817	0.2136754802019664	0.0001851012910919	0.212190249752246	-0.0043367094454158	0.3510265018005705	0.0056398667150539	0.3485147081825183	ARRDC4	214860	IGF1R	902696	PGPEP1L	1261948	False	False	False	ref	-100	0.5864	-85	1.181
1356	chr15	97760080	T	C	rs73470164	0.1507169968	0.0457994839663035	0.1507169968	0.0462600972025785	0.0649844694090481	0.0236302542493931	0.0097693986306372	0.0209332212067538	0.0097693986306372	0.0210275458385303	0.1148304245983306	0.2829711265956771	0.0163791310685658	0.0988544376055419	0.0163791310685658	0.1008229733365203	0.0073238160672502	0.1138627017500771	0.0010462315142291	0.0481346802742189	0.0010462315142291	0.0489421396819365	0.029490943881759	0.0542374341478175	0.029490943881759	0.0552016138557952	ARRDC4	200624	IGF1R	888460	PGPEP1L	1247712	False	False	False	alt	80	0.1166	95	0.2678
1357	chr16	4392526	C	T	rs4786488	-0.01607912088	0.5883549456814412	0.02083658072	0.5859496292905836	0.019120903657009	0.5088183915845153	-0.0004147220384203	0.572084945823661	0.0004895247660848	0.5699549793481945	0.6708571145788658	0.0178066233945954	-0.0112114852109434	0.1420574554810378	0.0142317740441283	0.1415351902612918	0.012815432559334	0.0517984097405414	-0.0002821171828311	0.1715286343453345	0.0003299145305574	0.1709628895065211	-0.0036579129688891	0.3942257579621351	0.0047697205634917	0.3927059676608915	VASN	20677	CORO7-PAM16	27968	CORO7	33179	True	False	False	ref	80	0.02332	100	0.07196
1358	chr16	4447450	T	C	rs6500602	0.05725007866	0.2442128097068168	0.05864909774	0.2465262323877477	0.0353203426842353	0.1516776014865662	0.0022569406902884	0.1826870618406086	0.0022964884303836	0.1840950125628048	0.0324816073372702	0.54329021190777	0.0025036519324639	0.3984104913510387	0.0025177928209527	0.4024873604034288	0.0012589140560733	0.4291725397131443	0.0001020952854516	0.3204058024190829	0.0001024950228035	0.3237853380822356	0.0066741446999439	0.325470177600915	0.0067318795156873	0.3290413683824396	DNAJA3	21644	CORO7	21745	CORO7-PAM16	26956	False	False	False	alt	-90	0.0511	-100	0.2957
1359	chr16	4452513	C	T	rs6500606	-0.516413416	0.0022329001082906	0.516413416	0.0022066692582582	0.0779006179368527	0.0138560420392563	-0.0486791381046404	0.0025401481741262	0.0486791381046404	0.0025377689080532	0.0739096367655306	0.4230772327493975	-0.0611139770010114	0.055205102829093	0.0611139770010114	0.0549623417333878	0.0080932397596932	0.1544994103657596	-0.0072109973673716	0.0276582704583093	0.0072109973673716	0.0273372839136614	-0.0633012767642109	0.0301131647559489	0.0633012767642109	0.0297958171493053	HMOX2	22178	DNAJA3	26707	CORO7	26808	False	True	True	ref	-40	0.01343	-80	0.1006
1360	chr16	4479000	C	A	rs11076833	0.00547182858	0.8241841541554291	0.0070209932599999	0.8289602502177209	0.0187318748861684	0.5306074467377969	9.916337459618378e-05	0.8009977853420222	0.0001296006635831	0.8054174512934357	0.0032578931740951	0.8920601295160494	2.8280628632224387e-05	0.9048804194751556	3.466286406976934e-05	0.9094034910616317	5.968614966651469e-05	0.8855558959207512	4.955615971938804e-07	0.8988211275443413	6.209568814884056e-07	0.9033219912807928	0.0001294909438817	0.9039486599327248	0.0001443370393586	0.9084934317893898	HMOX2	4309	NMRAL1	16763	DNAJA3	53194	False	False	False	alt	-100	0.1818	-95	0.0792
1361	chr16	4486164	A	C	rs4786501	-0.0327378462	0.4010930762112555	0.0369525034	0.3975948603011167	0.0199583261561012	0.4823349074212016	-0.0007507291288188	0.4039159340483474	0.0008009990380983	0.4004535034834054	0.0026995150275477	0.9014292527559516	-0.0001100751076291	0.8048344802861062	0.0001186438860814	0.8010387495944177	5.5864214373949086e-05	0.8897778177408655	-2.5268155879888144e-06	0.787180720575302	2.6290188527888866e-06	0.7833510163010946	-0.000401669360958	0.786356184021367	0.0004429085150605	0.7826328182208189	NMRAL1	9599	HMOX2	11473	CDIP1	52664	False	False	False	ref	90	0.01169	-10	0.01343
1362	chr16	4487103	T	C	rs4786502	-0.0261960773	0.535904120002252	0.0261960773	0.5298575805608704	0.0140130612934956	0.7373626361589705	-0.0003610474969761	0.6259781979820025	0.0003610474969761	0.6196289475019717	0.0007109630167265	0.9793586376985244	-2.512075145380489e-05	0.9366562595513224	2.512075145380489e-05	0.9296736992777476	1.0168720174012752e-05	0.9823577892147546	-3.6318698753101627e-07	0.9430568130227024	3.6318698753101627e-07	0.9361342465174586	-7.588004354852741e-05	0.9375276332988376	7.588004354852741e-05	0.9323325275628804	NMRAL1	8660	HMOX2	12412	CDIP1	51725	False	False	False	ref	70	0.0387	-100	0.1138
1363	chr16	4508614	G	A	rs2270366	-0.029903905	0.478025082845519	0.029903905	0.4724614674341643	0.0230235106864688	0.3818547421856541	-0.0006519101277955	0.4389432082735903	0.0006519101277955	0.433672340968491	0.0015101778232324	0.940931796447365	-3.979503853253145e-05	0.881340592627671	3.979503853253145e-05	0.874497846156651	3.684928302729821e-05	0.9143647283535208	-9.311256825072572e-07	0.8526938503732583	9.311256825072572e-07	0.8457381364694208	-0.0001476361716867	0.8828150555214257	0.0001476361716867	0.8758772272768898	NMRAL1	12851	CDIP1	30214	HMOX2	33923	False	False	False	ref	-30	0.014984	-25	0.08276
1364	chr16	4510300	G	A	rs1051308	-0.0760012102	0.1688445772730119	0.0760012102	0.1663173508949144	0.0274524772861268	0.2759983365892216	-0.0021626692000313	0.167768892645073	0.0021626692000313	0.1654475761696212	0.0749909273860974	0.3733418988063194	-0.0057275315721561	0.2369109515065539	0.0057275315721561	0.233036445671007	0.0019332867201661	0.3285864597183688	-0.0001504212668727	0.2180782244010086	0.0001504212668727	0.214533377685176	-0.0120368842994292	0.1803628748360133	0.0120368842994292	0.1772513124246512	NMRAL1	14537	CDIP1	28528	HMOX2	35609	False	False	False	ref	-15	0.01453	-60	0.03558
1365	chr16	4519330	G	A	rs11076836	-0.035722389046	0.4064599654859396	0.035903011354	0.4029074888026422	0.0149567279138546	0.660318872856739	-0.0006652766825194	0.4697172813890612	0.0006668786193785	0.4660388525164288	0.2789828775032166	0.1221476351677459	-0.0122742577271135	0.1695091365521666	0.0122974224738827	0.1673635288426559	0.0046104196395802	0.1847208389916369	-0.0002376158174626	0.219120593388175	0.0002378212652966	0.2165895201242628	-0.0122034904820031	0.2009590610908505	0.0122364818052851	0.1985419969462183	CDIP1	19498	NMRAL1	23567	C16ORF96	37011	False	False	False	ref	-20	0.01675	75	0.2268
1366	chr16	4519439	C	T	rs11076837	0.0150218294	0.4585720981488345	0.030092487	0.4620193142103236	0.023778359056684	0.3601833317205508	0.0003496210431758	0.4029328720261555	0.000734791257788	0.4059788595047127	0.4077818283791362	0.0677464889533462	0.0089671024961434	0.1338894561358877	0.0119089161070851	0.13563446334206	0.0096533703572652	0.0789655570046975	0.000214020825443	0.1402923101201645	0.0002892065952067	0.1418729498986157	0.0051969581999933	0.212740618123299	0.0095584111378707	0.215013308270335	CDIP1	19389	NMRAL1	23676	C16ORF96	36902	False	False	False	alt	-35	0.00775	-35	0.0562
1367	chr16	4534405	C	T	rs4786519	-0.0136332991999999	0.3627907575772392	0.0441476124	0.3618908816304386	0.1078550606214896	0.0031202267436785	-0.0008648981108446	0.080951579184791	0.0046654415680597	0.0807155797397729	0.1672189964039457	0.2072005530576211	-0.0024760963109428	0.210878589180936	0.0076273089508769	0.210324537179154	0.0181594118929222	0.0282980167293586	-0.0001644348951431	0.0762330091114576	0.0008076341275013	0.0758392962217631	-0.0037115238692224	0.1932809014024409	0.0119873973145062	0.1930698072777472	CDIP1	4423	C16ORF96	21936	NMRAL1	38642	False	True	True	ref	100	0.0957	25	0.1816
1368	chr16	5738914	A	G	rs12596497	0.2174825739999999	0.0198021393203129	0.2174825739999999	0.0199653733990132	0.0443362098781663	0.0810972649345094	0.0097366473642004	0.0215618833393651	0.0097366473642004	0.0216708108534158	0.123332288608096	0.265507181730965	0.0272461128050853	0.0598378463772282	0.0272461128050853	0.0610136608247256	0.0055005662892292	0.1502367968319366	0.0012203788000346	0.0422583423283107	0.0012203788000346	0.0429727671150506	0.0454298769423641	0.02523380372756	0.0454298769423641	0.0255444325516208	RBFOX1	499111	EEF2KMT	641119	C16ORF89	672804	False	True	False	alt	-100	0.04938	-85	0.2482
1369	chr16	5739574	T	G	rs929468	-0.01404726986	0.6574436967205765	0.01624452826	0.6530180284341306	0.0229905463729816	0.3855964440425996	-0.0003240385404499	0.6021067952045176	0.0003655873289589	0.5978685637066793	0.0625400019794793	0.3904823183568449	-0.0008767664835871	0.4920284518723922	0.0010239130579295	0.4885112040907531	0.0014109142378831	0.3729898516282031	-1.966972958931598e-05	0.4732080500441641	2.245217975838919e-05	0.4695947263117582	-0.0022293886707795	0.4908744119106802	0.0025691993005839	0.4869583773519053	RBFOX1	499771	EEF2KMT	641779	C16ORF89	673464	False	False	False	ref	-5	0.0001831	95	0.1382
1370	chr16	5740082	G	T	rs57105172	-0.1003722459999999	0.1073906603426228	0.1003722459999999	0.105863735898542	0.0457215865167481	0.0756842175887837	-0.0048245276366409	0.0658437719496341	0.0048245276366409	0.0650539482692169	0.1024520801029329	0.2983429452864177	-0.0110815668005004	0.1502149881002163	0.0110815668005004	0.1474436748643885	0.0049811862468997	0.168708983537944	-0.0005613266744431	0.0979592794846575	0.0005613266744431	0.0963251344043151	-0.0210047507505525	0.0965216889039466	0.0210047507505525	0.0948998381496582	RBFOX1	500279	EEF2KMT	642287	C16ORF89	673972	False	False	False	ref	-90	0.0218	-15	0.0166
1371	chr16	5740711	G	A	rs66926752	0.03560741016	0.3775988869057599	0.0384103690399999	0.3813540670064633	0.0205084803789369	0.4512216139381971	0.000833582166043	0.3750880456453661	0.0008696251314376	0.3789530589971253	0.012868265646135	0.710322479598991	0.0002575373022041	0.6365835073235818	0.0003474098131484	0.6402091855784154	0.0002228373595802	0.7080297943448807	6.036044595052366e-06	0.6218814995364266	7.191706136832279e-06	0.6258752469173454	0.0009221074857312	0.6149262362313556	0.0011711919765101	0.6187612392409787	RBFOX1	500908	EEF2KMT	642916	C16ORF89	674601	False	False	False	alt	95	0.0978	-60	0.0421
1372	chr16	5743578	C	T	rs11076959	0.034013301	0.4170371713877528	0.034013301	0.422601501848316	0.0226974682271642	0.3923003027714098	0.0008028279738678	0.3823847098479471	0.0008028279738678	0.3874390007054309	0.0932730691828049	0.3213123602257713	0.0031881620215526	0.3062831023956221	0.0031881620215526	0.3109057870195666	0.0020679975057704	0.3101069489736327	7.315302534792784e-05	0.2988594917657318	7.315302534792784e-05	0.3033814079743583	0.0065949655240671	0.2815569174863181	0.0065949655240671	0.28611060858959	RBFOX1	503775	EEF2KMT	645783	C16ORF89	677468	False	False	False	alt	-100	0.0054	60	0.0837
1373	chr16	5747060	T	C	rs9929010	-0.05908322104	0.1846449609443368	0.07538201896	0.1836934125242734	0.0208010868827906	0.4507437848452479	-0.0013908391414149	0.2411248552649021	0.001673260150211	0.2398784699455541	0.0002977466926198	0.995705507695972	-1.2392970737615407e-05	0.9286870555670524	2.1045207869140933e-05	0.927031492118739	5.8907420091242974e-06	0.993231185183398	-2.9768194528772266e-07	0.912801706484798	4.449134782209578e-07	0.911068015247583	-3.134175711786479e-05	0.943660707328472	5.938438190754511e-05	0.9409542242055576	RBFOX1	507257	EEF2KMT	649265	C16ORF89	680950	False	False	False	ref	-65	0.01262	-70	0.0476
1374	chr16	5755393	C	A	rs6500717	0.0206676115999999	0.3238787180015949	0.0457959356	0.3259195274138007	0.0274171828515547	0.2732959340378839	0.000651242500676	0.2806556639902483	0.0012231526642535	0.282649176735371	0.036584078387384	0.5077021311041201	0.0013192232564407	0.4172431725989495	0.0016204671715833	0.4205122545874012	0.0010800291722515	0.4423568912989742	3.926697016940566e-05	0.3724643032520373	4.6123156230241694e-05	0.3756648153424586	0.0032578931740951	0.3750102046193447	0.0043218633499388	0.3782288054201829	RBFOX1	515590	EEF2KMT	657598	C16ORF89	689283	False	False	False	alt	0	0.0	-100	0.1888
1375	chr16	5758519	A	G	rs7189389	-0.2254996192	0.0244765170325517	0.2254996192	0.0243142494517167	0.0637149262739971	0.0251709194159902	-0.015320575292544	0.0150161552444279	0.015320575292544	0.0149340427077352	0.5546542509320049	0.0331861528893728	-0.1223531507299503	0.0079134370237199	0.1223531507299503	0.0078633726382244	0.0350124257482637	0.0062252334526045	-0.0083436655739635	0.005612979751666	0.0083436655739635	0.0056076973849296	-0.0672627099072943	0.0141155186101451	0.0672627099072943	0.013935085537441	RBFOX1	518716	EEF2KMT	660724	C16ORF89	692409	False	False	False	ref	-90	0.05713	-45	0.169
1376	chr16	5760685	T	C	rs3900820	-0.03589950288	0.4272534994775807	0.03788982712	0.4237761526379873	0.0208864637361504	0.4510273689208108	-0.0010474852076431	0.4238277589127464	0.0010780436085652	0.4208380303416967	0.0123569001352643	0.6997182885936309	-0.0004322358478981	0.6661822422233372	0.000453157858619	0.6621015686212903	0.0002609262646433	0.6832798961736298	-1.3116257373219128e-05	0.6380928246723401	1.3437483017170484e-05	0.6338308227419378	-0.0013765629639404	0.6386076685377868	0.0014441951766684	0.6343921364355609	RBFOX1	520882	EEF2KMT	662890	C16ORF89	694575	False	False	False	ref	95	0.0181	90	0.11
1377	chr16	5770236	A	C	rs9927114	-0.0181529382	0.6054808620092316	0.02008914472	0.6024164181569867	0.06647791026278	0.021694601431609	-0.0014059934437741	0.3227786234804252	0.0015141031929804	0.3214917019695945	0.2162135858269274	0.1648876682661434	-0.0026476139033563	0.3566799085636495	0.0030684539492129	0.3546748834536943	0.0141531851707181	0.0451360287641762	-0.0002095286472984	0.2090793520017526	0.0002328453186089	0.2077799686079299	-0.0045148625911385	0.3873182687861252	0.0051318003365114	0.3849140335471594	RBFOX1	530433	EEF2KMT	672441	C16ORF89	704126	False	False	False	ref	20	0.01915	100	0.1956
1378	chr16	5770244	A	G	rs9927115	-0.03057161046	0.4769601780548703	0.03057161046	0.4715227811826988	0.0193711668749876	0.5022468486676058	-0.0006305680447967	0.4878074521355457	0.0006305680447967	0.4824196007905565	0.2181122364818052	0.1634519495516412	-0.0054190521928538	0.2442814868103869	0.0054190521928538	0.2403948612874682	0.0040529473483805	0.1953705854691257	-0.0001050619080387	0.2657848455981343	0.0001050619080387	0.2616492597557394	-0.0077818283791362	0.2694338634277235	0.0077818283791362	0.2652519840521865	RBFOX1	530441	EEF2KMT	672449	C16ORF89	704134	False	False	False	ref	10	0.01645	100	0.2576
1379	chr16	5770398	A	C	rs9927274	0.531842728	0.0016763966638387	0.531842728	0.0016805491923037	0.0630483362525091	0.0265275390440592	0.0343546633274613	0.0029311331580447	0.0343546633274613	0.0029319739911578	0.4677856223813137	0.0509140760822715	0.2603860371599408	0.0014298387939373	0.2603860371599408	0.0014007970317349	0.028892952416152	0.0102938045922665	0.0166693834913001	0.0017996279412886	0.0166693834913001	0.0017995961401011	0.1761373758701461	0.000835218269456	0.1761373758701461	0.0008320405214865	RBFOX1	530595	EEF2KMT	672603	C16ORF89	704288	False	True	True	alt	85	0.03995	55	0.03613
1380	chr16	5770514	T	C	rs9929578	0.237688122	0.0171603111023142	0.237688122	0.0172886345843425	0.025950377619865	0.3075382375083142	0.006499767521937	0.0436423012817831	0.006499767521937	0.0439764568360954	0.3868537824552142	0.0737927789811944	0.1022099718318888	0.010439721196258	0.1022099718318888	0.0105908394382176	0.0102981609379988	0.074054014182997	0.0028683060620489	0.0205396129836433	0.0028683060620489	0.0208429379614574	0.0799536471907887	0.0076895316188898	0.0799536471907887	0.0077808749200476	RBFOX1	530711	EEF2KMT	672719	C16ORF89	704404	False	True	False	alt	90	0.05292	30	0.126
1381	chr16	5773676	A	G	rs11648113	0.0290677432	0.4704559633417041	0.0290677432	0.4762326923073242	0.0124246085738943	0.8094625778289458	0.0003548013203417	0.5888028202036439	0.0003548013203417	0.5951817625415231	0.0009229322688132	0.9671042607998228	2.602911723882057e-05	0.8967005115717092	2.602911723882057e-05	0.9037200690676004	1.1668952002910171e-05	0.975748221860856	3.240684977954779e-07	0.9119521034535886	3.240684977954779e-07	0.918885769081748	9.732440368178972e-05	0.8984745710318045	9.732440368178972e-05	0.9054848866075988	RBFOX1	533873	EEF2KMT	675881	C16ORF89	707566	False	False	False	alt	40	0.02026	-80	0.0972
1382	chr16	5779439	C	T	rs7198618	-0.222292974	0.0201249625684915	0.222292974	0.0200144107996149	0.0395411308612877	0.1128534564973255	-0.0092608366182045	0.0259973403995786	0.0092608366182045	0.0258481377998615	0.0303050047837418	0.5571340959564514	-0.0079716761518119	0.2170654564331202	0.0079716761518119	0.2136554820771118	0.0012545387647942	0.427123921715676	-0.0003527716488075	0.1615334816070781	0.0003527716488075	0.1587508889602688	-0.0162886410873939	0.1454753509011014	0.0162886410873939	0.1429803477857202	RBFOX1	539636	EEF2KMT	681644	C16ORF89	713329	False	False	False	ref	-100	0.072	-40	0.1185
1383	chr16	5785840	C	T	rs11861310	0.0291003016	0.466907819114871	0.0291003016	0.4727488188562503	0.0323762537965325	0.188200111137785	0.0009517927605192	0.3333592233894554	0.0009517927605192	0.3378182548129815	0.0005921942529114	0.98345645915404	1.788525637497927e-05	0.9208816982905628	1.788525637497927e-05	0.9279267122348	1.873342962873688e-05	0.9569957419845502	5.709549951457059e-07	0.8791846882900228	5.709549951457059e-07	0.8860549914781105	8.577744053312145e-05	0.9105873225589738	8.577744053312145e-05	0.91764538508925	RBFOX1	546037	EEF2KMT	688045	C16ORF89	719730	False	False	False	alt	-60	0.01819	-20	0.07275
1384	chr16	5793138	C	T	rs56142463	-0.01567046566	0.5815990855601916	0.02050147426	0.5773716378896113	0.0117369067614262	0.8218422778573363	-0.0001748260018628	0.6869823697000101	0.0002442745788485	0.682678452347514	0.1164700933654448	0.2810378212561257	-0.0010851162713366	0.3865672467050584	0.0019052728629035	0.3834921162335589	0.001428603856925	0.387151019159886	-1.2623668894534858e-05	0.4613617802406845	2.441390003491416e-05	0.4579432918899103	-0.0026112632377684	0.3945156967051731	0.0039474118306885	0.3913787891312598	RBFOX1	553335	EEF2KMT	695343	C16ORF89	727028	False	False	False	ref	95	0.2986	95	0.3782
1385	chr16	7304888	A	G	rs12051021	-0.01427204554	0.6500771602427752	0.01735617514	0.6462221241240167	0.059025725623503	0.0328341614803375	-0.0008419183924464	0.340299211588481	0.0010152841224579	0.3377951313448797	0.4765126521724786	0.0495064804626397	-0.0063560630101832	0.1866562719185463	0.0080098360896918	0.184731127283431	0.0283891971963033	0.0106649077464106	-0.0003836055038963	0.1027601469324895	0.0004765677361561	0.1018644227059959	-0.0046608491966612	0.3298189126567914	0.0056505888951205	0.3268125821790351	TMEM114	1285623	METTL22	1316796	ABAT	1369709	False	False	False	ref	100	0.03317	45	0.10474
1386	chr16	7305257	C	T	rs17143361	-0.0138935605999999	0.3752102227571997	0.039648379	0.3730273841772251	0.0712005317011125	0.0165842202121942	-0.0011063785438937	0.1367400980967097	0.0027472760248527	0.1357300589472118	0.3068993104813433	0.1065439815891037	-0.0028686138048776	0.1434873256168401	0.0118309906413384	0.1420983010079174	0.0216510176754587	0.0194274802655912	-0.0002391066216788	0.066905761453501	0.0008101198352636	0.0663793470832148	-0.0040488601497805	0.1671056227289035	0.0132880802348981	0.1655671945811678	TMEM114	1285254	METTL22	1316427	ABAT	1369340	False	True	False	ref	-30	0.010956	70	0.1229
1387	chr16	7307170	T	C	rs4331351	0.04361807706	0.3555283529914451	0.04361807706	0.3595889100298758	0.0196282728126448	0.4996164018070302	0.0009541594669737	0.3892496199270417	0.0009541594669737	0.3933466707399876	0.0107757909669756	0.7189575038924608	0.0006128725968718	0.6161631641267309	0.0006128725968718	0.6221914826141086	0.0002199681076445	0.7102439312275582	1.3457561104110235e-05	0.6057129153812959	1.3457561104110235e-05	0.6118048203590823	0.0018491636699547	0.5774515353858433	0.0018491636699547	0.5833538520388514	TMEM114	1283341	METTL22	1314514	ABAT	1367427	False	False	False	alt	35	0.004456	10	0.03687
1388	chr16	7310131	T	C	rs4479249	0.1014263618	0.1043308575344128	0.1014263618	0.1058826434155237	0.0200206124358495	0.4807682462248708	0.0020861111645594	0.1689950385168051	0.0020861111645594	0.1714912974394384	0.3719070634423146	0.0792040785015588	0.0387229745483822	0.0403817316690061	0.0387229745483822	0.0411757683498211	0.0073185603101112	0.109114878041342	0.0007844572261695	0.0651637597644922	0.0007844572261695	0.0663833363069885	0.0343249975256507	0.0428779539639521	0.0343249975256507	0.0436702840778152	TMEM114	1280380	METTL22	1311553	ABAT	1364466	False	False	False	alt	-80	0.2255	-55	0.0669
1389	chr16	7365551	A	G	rs4787008	-0.0769361482	0.1640516825912503	0.0769361482	0.1615840146310227	0.0545125769688838	0.0429476891412777	-0.0040978929910105	0.073713003335981	0.0040978929910105	0.0729481571017454	0.1257068391013163	0.2744154897055474	-0.0105868355147682	0.1624150080969391	0.0105868355147682	0.1595626366154487	0.0064412324342973	0.1321872038592282	-0.0005398833827063	0.0973203596685047	0.0005398833827063	0.0956201659692702	-0.018375342284979	0.1175855630848126	0.018375342284979	0.1155694908697505	TMEM114	1224960	METTL22	1256133	ABAT	1309046	False	False	False	ref	100	0.0324	-30	0.1644
1390	chr16	7490196	C	T	rs8055816	-0.08986935294	0.1501220196579124	0.0921629586599999	0.1488606202303513	0.0363068749940734	0.1410711452085753	-0.0030199299874221	0.1338087100935283	0.0031036176582313	0.132845620093724	0.0645178318102338	0.3970940417311733	-0.0062313595452688	0.2528731686849875	0.0062937297911498	0.2499376945190165	0.0023800609729055	0.2929784878607759	-0.000210426922234	0.2027567762111902	0.0002127026492857	0.2004550154266002	-0.0133293193890006	0.1835589948715791	0.0135206690640361	0.1813788136107081	TMEM114	1100315	METTL22	1131488	ABAT	1184401	False	False	False	ref	85	0.02832	35	0.05518
1391	chr16	9786924	A	G	rs2077923	0.0552773484	0.2518120259111154	0.0552773484	0.2556770437859145	0.019985791144563	0.4829435794104435	0.0011711789462332	0.290486949873871	0.0011711789462332	0.2943224286134578	0.0058064728976278	0.8098163990928731	0.0003427012998903	0.6435511362350838	0.0003427012998903	0.6497399366375145	0.00011739233612	0.7972080610150527	7.349760415940976e-06	0.6317219586515905	7.349760415940976e-06	0.6379663665367782	0.0012157302629408	0.6134094465691377	0.0012157302629408	0.6193731301568791	GRIN2A	396413	ATF7IP2	539511	HAPSTR1	695279	False	False	False	alt	-95	0.02063	95	0.06476
1392	chr16	9789680	C	T	rs2267787	-0.03595802326	0.3882133247036751	0.03738755966	0.3845559066579814	0.0496814511201129	0.0574770234020558	-0.0016371143426468	0.2484600896612594	0.0017188051880398	0.2463262163731674	0.4700719210847547	0.0505084689685074	-0.0188887922753861	0.1287196403124979	0.0194460148126897	0.1271117379794358	0.0231800543223898	0.0170106365785514	-0.0008624089157708	0.090235145444374	0.0008942513933637	0.089222882549871	-0.0107007357065091	0.2248428529222171	0.0112285968790207	0.2222634177057519	GRIN2A	393657	ATF7IP2	536755	HAPSTR1	698035	False	False	False	ref	95	0.04053	0	0.0
1393	chr16	9791950	T	G	rs7195942	0.02097485142	0.4576055495250991	0.03109037222	0.4613141253259982	0.0135550999337448	0.7503146394646881	0.0003559528648774	0.5670324417660725	0.0004878962949649	0.5707773712330069	0.1693395137078948	0.2041559348027792	0.0039379963895682	0.2800144995629536	0.0054264072676734	0.282908872608597	0.0023987745421936	0.2857152388091268	7.124028038147397e-05	0.3449513225993202	9.065460845346828e-05	0.348141765007578	0.0062798983867242	0.2726876270535867	0.0088532216027184	0.2753140208881201	GRIN2A	391387	ATF7IP2	534485	HAPSTR1	700305	False	False	False	alt	-100	0.10626	-100	0.3328
1394	chr16	9792446	C	A	rs7195835	-0.00530314422	0.8188171792321808	0.00770054862	0.814608035343605	0.108631008555781	0.0029987514554415	-0.0006401234345094	0.3736517107624587	0.0008847901874899	0.3711312193663701	0.0201049124080366	0.6170060841976561	-6.202579882389706e-05	0.7690637803039939	0.0001179647081133	0.7655439523483728	0.002073134088819	0.3129743815774943	-6.78654416862966e-06	0.5378287409277461	1.2495381258976551e-05	0.534734154462007	-0.000218567516743	0.7701283919207961	0.0004132163241067	0.766596854033651	GRIN2A	390891	ATF7IP2	533989	HAPSTR1	700801	False	True	False	ref	-85	0.07446	75	0.1515
1395	chr16	9792974	C	G	rs7196962	-0.1458886528	0.0627444374758178	0.1458886528	0.0621743066701227	0.0299376660131566	0.2287949544141483	-0.0050453157292736	0.0808586396483491	0.0050453157292736	0.0801969771833837	0.0228110257002407	0.6044615057525297	-0.0040844102916531	0.3282556528754621	0.0040844102916531	0.323577539316322	0.0008012155517975	0.5169044269340172	-0.0001517634470745	0.2762347565783854	0.0001517634470745	0.2722697947919059	-0.0097827521361881	0.2514713528551092	0.0097827521361881	0.2477085878646945	GRIN2A	390363	ATF7IP2	533461	HAPSTR1	701329	False	False	False	ref	35	0.02344	100	0.06247
1396	chr16	9793050	C	G	rs7197004	-0.516228102	0.0016373156326414	0.516228102	0.0016562875397588	0.1038669164922213	0.0036898475764965	-0.0541863128240108	0.0011586435694686	0.0541863128240108	0.0011441815547062	0.0262322259245818	0.5776315335545276	-0.0148689808098145	0.1303987919118534	0.0148689808098145	0.128061194636722	0.0027542437185888	0.2769683843311588	-0.0015625632444002	0.0431861274104085	0.0015625632444002	0.0424046433260145	-0.0229190722839892	0.094732727497504	0.0229190722839892	0.0930954627842228	GRIN2A	390287	ATF7IP2	533385	HAPSTR1	701405	False	True	True	ref	-45	0.05432	100	0.13
1397	chr16	9793254	C	A	rs9972744	-0.035787009	0.4082674513528037	0.035787009	0.4032006904093735	0.0195654616681735	0.4997637767909575	-0.0007512547193606	0.4223384439582794	0.0007512547193606	0.4172163437770916	0.040706344231467	0.4903750578822815	-0.0016387821821001	0.443509500688225	0.0016387821821001	0.438054683168366	0.0008117005968569	0.4921521723743025	-3.562617282752065e-05	0.4452695078372359	3.562617282752065e-05	0.4398632094115472	-0.0042517567879647	0.4033234897253431	0.0042517567879647	0.3978085871140734	GRIN2A	390083	ATF7IP2	533181	HAPSTR1	701609	False	False	False	ref	-100	0.2092	-100	0.1244
1398	chr16	9798943	T	A	rs11648283	-0.003250363	0.8548286643079033	0.006789417	0.8509660089781211	0.0096108955601616	0.9294218521689374	-2.987030595734273e-05	0.907600832563488	6.564754313491864e-05	0.9036222485785262	0.2235896209296955	0.1566645342448106	-0.0006314036248311	0.4223598194628165	0.0014618454530778	0.4192213560611507	0.0021734516027335	0.2983734750281584	-5.880552066305928e-06	0.5276996421838647	1.42757089210949e-05	0.5243376399723806	-0.0009583979413413	0.5190949521834032	0.0020438124773184	0.5156631916910392	GRIN2A	384394	ATF7IP2	527492	HAPSTR1	707298	False	False	False	ref	-65	0.1553	-30	0.02893
1399	chr16	9805369	C	G	rs9930307	0.1422487417999999	0.0664641531747997	0.1422487417999999	0.0671336576618528	0.027094885870182	0.2834575672248235	0.0043629408011965	0.0928119294417403	0.0043629408011965	0.0937236362248631	0.1252160931674969	0.2644141672829563	0.0186056705688932	0.1038131429655233	0.0186056705688932	0.1056724037699782	0.0034403366453504	0.2276263608914148	0.0005901571010579	0.1046296212717097	0.0005901571010579	0.1062875944675695	0.0298398271254659	0.0618380873493031	0.0298398271254659	0.0627689553969374	GRIN2A	377968	ATF7IP2	521066	HAPSTR1	713724	False	False	False	alt	-90	0.1045	35	0.09814
1400	chr16	9805444	A	G	rs9940856	0.109217237	0.0859731919424605	0.109217237	0.0871138563154916	0.0168267385326262	0.6050987816180667	0.0018722413863752	0.1802659557233057	0.0018722413863752	0.1826851529618765	0.1123148361980798	0.285744621689462	0.0131575718863309	0.1246629974523958	0.0131575718863309	0.1272039648954677	0.0019912866790756	0.3250713769159931	0.0002334083510853	0.1651083822658254	0.0002334083510853	0.1680689583745704	0.0241315034146019	0.0760811415147485	0.0241315034146019	0.0775404558529237	GRIN2A	377893	ATF7IP2	520991	HAPSTR1	713799	False	False	False	alt	-35	0.0137	-45	0.05518
1401	chr16	9812125	T	A	rs7184107	0.00961254858	0.7083306554748204	0.01353515338	0.7128390981657472	0.0198361793222825	0.4884005114485291	0.0002211590410651	0.6571016305511518	0.0002969893339552	0.6613185570924682	0.0042773250635082	0.8451356501201235	5.021689526723425e-05	0.8412608293906386	6.46301480863274e-05	0.8455097878142847	9.067098119803468e-05	0.8311923980673454	1.2336139710703193e-06	0.823341430171256	1.5122454537213715e-06	0.8275800553599256	0.0001822770611329	0.8287680955546856	0.0002548579723532	0.8329771799697399	GRIN2A	371212	ATF7IP2	514310	HAPSTR1	720480	False	False	False	alt	55	0.01056	-100	0.1741
1402	chr16	9813803	G	T	rs10468229	-0.147846452	0.055696158528734	0.147846452	0.055046286309415	0.0410467392992304	0.1011939998846414	-0.0061227746034482	0.0489102370286804	0.0061227746034482	0.0485132270985092	0.1302134538616343	0.2602623729368346	-0.0221038090488458	0.0931235537453956	0.0221038090488458	0.0915433359620577	0.0053199917398396	0.1589053363191882	-0.0009119640078931	0.0704218936364431	0.0009119640078931	0.069268936710084	-0.0336882649863085	0.0512110882551294	0.0336882649863085	0.0505219123269869	GRIN2A	369534	ATF7IP2	512632	HAPSTR1	722158	False	False	False	ref	100	0.04694	20	0.0381
1403	chr16	9814951	G	T	rs11649466	0.0420710748	0.2415739794502246	0.06144417	0.2434492737390468	0.022895017765879	0.3884664444707998	0.0010530443470286	0.2634847072603505	0.0014703085115023	0.2654503534035563	0.0029403516875061	0.8860726176743087	0.0001464228813813	0.7357971472820967	0.0001813361246368	0.7401233676040463	6.65998204860355e-05	0.8595596050858506	3.705087360386364e-06	0.7054103062576772	4.457060405959895e-06	0.709733420886502	0.0005105407277886	0.7273766414011559	0.0006078651314704	0.7316787177851062	GRIN2A	368386	ATF7IP2	511484	HAPSTR1	723306	False	False	False	alt	95	0.0116	95	0.3271
1404	chr16	9818786	C	T	rs11645219	0.004130813374	0.7363089572023757	0.012346767066	0.7390856941553494	0.0578589004018679	0.0349273913594974	0.0001817255488518	0.4823316556479401	0.0006480984701383	0.4843079761299434	0.0118051202533733	0.6975668597118067	1.650183849465451e-05	0.7702582276443066	0.0001646952638596	0.7724970800266442	0.0006801959712263	0.5105317762896892	5.267615838257654e-07	0.6476888371079964	8.929435273073653e-06	0.6495379982674272	0.0001237174623074	0.7616198033435403	0.0005641516281217	0.7634286953903033	GRIN2A	364551	ATF7IP2	507649	HAPSTR1	727141	False	False	False	alt	95	0.09375	90	0.2275
1405	chr16	9820157	A	G	rs1420042	0.00726404146	0.6205932146143268	0.01892724986	0.6222504184383802	0.0177954368523495	0.5678130590203821	0.0001000609258783	0.6286477027458368	0.000322536796406	0.6301489460535937	0.1471058361650885	0.2327274085378074	0.0015652626609718	0.3273063074047315	0.0031184577190435	0.3285437383675185	0.0026738184001858	0.2680514505055151	2.474966371843572e-05	0.3554055960315069	5.466882744469162e-05	0.3565399676687548	0.001986902444657	0.344854257649677	0.0050682920391936	0.3461278439953783	GRIN2A	363180	ATF7IP2	506278	HAPSTR1	728512	False	False	False	alt	95	0.04108	5	0.02466
1406	chr16	9820544	C	G	rs7196708	-0.05184376694	0.3049705571646272	0.05184376694	0.3015880889460137	0.018393764315894	0.533652967836913	-0.0011089873402651	0.3664067225383099	0.0011089873402651	0.3625437743445078	0.4616508858170302	0.0527124810397224	-0.023373119031527	0.0890859411929999	0.023373119031527	0.0876491793863665	0.0081134020576409	0.0970679778465128	-0.0004806770345331	0.1266034879465962	0.0004806770345331	0.1246394101656151	-0.0170210484642538	0.1428867859511713	0.0170210484642538	0.14088767801505	GRIN2A	362793	ATF7IP2	505891	HAPSTR1	728899	False	False	False	ref	-75	0.01817	25	0.06616
1407	chr16	9821156	A	G	rs6497523	0.118755314	0.0785518996088176	0.118755314	0.0796311801436418	0.0138305659986182	0.7369989420967854	0.0017322214672994	0.2062577761534512	0.0017322214672994	0.2090054754621011	0.6451428524298108	0.0208748042405673	0.0801133745546556	0.0141374694404834	0.0801133745546556	0.0143701596197985	0.0091144614684696	0.0849652982552629	0.0011916533447585	0.0469900653498873	0.0011916533447585	0.0477935396598549	0.0266949292336114	0.0619361025171346	0.0266949292336114	0.0630387140138356	GRIN2A	362181	ATF7IP2	505279	HAPSTR1	729511	True	False	False	alt	-85	0.04047	-90	0.2876
1408	chr16	9846107	C	T	rs35440248	0.0171035071	0.4584418265571567	0.0318298151	0.4611999141085076	0.0165541343380675	0.6187553179323051	0.0003702517999965	0.5057662796370265	0.0005686381186856	0.5088761609047595	0.0218278842664378	0.6047632269835348	0.0005966426746759	0.5525441084468257	0.0008227406450494	0.5559025011922824	0.0004065733517527	0.625295454495729	1.3418660768401837e-05	0.5677624825757969	1.646455278977957e-05	0.5713742091585338	0.0015085282570683	0.5189204145791264	0.0023118669789844	0.5222641971327198	GRIN2A	337230	ATF7IP2	480328	EMP2	734525	False	False	False	alt	100	0.00612	100	0.07825
1409	chr16	9849250	G	A	rs8047364	0.00967887022	0.7629794278561177	0.01017756018	0.7677841570892714	0.0194482522047664	0.5037060777488758	0.000196771275973	0.7262515973302793	0.0002059718985735	0.7308822728017453	0.0518244201774932	0.463116335638461	0.0003139995881998	0.6446023610399361	0.0003871162932588	0.6487091445833643	0.000992664484331	0.4741983444458724	6.616486683546059e-06	0.6370191242594363	7.965459561856925e-06	0.6410458841629855	0.000936128798126	0.6574947721902827	0.0010548975619411	0.6618632092456144	GRIN2A	334087	ATF7IP2	477185	EMP2	731382	False	False	False	alt	-20	0.0007935	-25	0.01044
1410	chr16	9854777	G	A	rs9933832	-0.135696912	0.0605009956968937	0.135696912	0.0597557407718128	0.0332207014916259	0.1761832110524629	-0.0045694907421228	0.0664155592568065	0.0045694907421228	0.0657703917138312	0.0170928045923921	0.6658719418041033	-0.0021575462450397	0.3852741100844804	0.0021575462450397	0.3802952842199769	0.000579478375438	0.5705712905277749	-7.327407417646327e-05	0.3187458034226071	7.327407417646327e-05	0.3141664595428068	-0.0057561611296228	0.3257694634552316	0.0057561611296228	0.3211738739392963	GRIN2A	328560	ATF7IP2	471658	EMP2	725855	False	False	False	ref	-25	0.0329	-10	0.02698
1411	chr16	9861707	C	T	rs727605	-0.0482653836	0.3070709022308536	0.0482653836	0.3028282429376953	0.0172248660423726	0.572638645304443	-0.0010068280851367	0.3649921044650062	0.0010068280851367	0.3604656007613959	0.1318861139520306	0.2531919772109052	-0.0068442158633051	0.2262536670511473	0.0068442158633051	0.2224942580431564	0.0024324619095356	0.2936675571007474	-0.0001568752159891	0.2582614708233184	0.0001568752159891	0.2541090627902016	-0.011983273399096	0.1944783496527926	0.011983273399096	0.1913246770574935	GRIN2A	321630	ATF7IP2	464728	EMP2	718925	False	False	False	ref	35	0.007935	95	0.1169
1412	chr16	9864252	T	C	rs9939815	-0.01565214044	0.6883196979767899	0.01565214044	0.6818592796036298	0.0155541048393923	0.6692160766535349	-0.0002482889885076	0.7113634426320775	0.0002482889885076	0.704641965818184	0.0181839926099435	0.6421841800902095	-0.0002649035462295	0.7019449478712418	0.0002649035462295	0.6956965280800608	0.0002895530416261	0.6741197259865027	-4.326912291768056e-06	0.7190648876820767	4.326912291768056e-06	0.7127131487520492	-0.0007992148065058	0.7018496022295851	0.0007992148065058	0.6955769836132857	GRIN2A	319085	ATF7IP2	462183	EMP2	716380	False	False	False	ref	70	0.01556	-20	0.0211
1413	chr16	9864255	T	G	rs9939817	0.0375435438	0.3416245049910792	0.0420121934	0.3449344599002371	0.0223641014443084	0.3901137732480116	0.001052204870118	0.3266321722257807	0.0011113683952063	0.3294923894593387	0.0212860017815314	0.615235402787293	0.0010215393835948	0.5139855613679948	0.0010463439198865	0.5183374068656693	0.0004976837298538	0.5895319959141285	2.7980468603650352e-05	0.4855232653884517	2.830887291548758e-05	0.4897223304615429	0.0031160304839826	0.4661229972840042	0.0031968592260235	0.4704041953709685	GRIN2A	319082	ATF7IP2	462180	EMP2	716377	False	False	False	alt	15	0.0108	-15	0.006317
1414	chr16	9864332	A	G	rs7196023	-0.0146996957	0.5715996702195623	0.0221940271	0.5691476281206264	0.0247217263415331	0.3356747088726996	-0.0003360570196618	0.5103406521253572	0.000520723940955	0.5081695515199188	0.0189131008544752	0.633768551369347	-0.0002350163709129	0.6344422298213567	0.0004284991090812	0.6329765443430798	0.0004617413075261	0.5912372659177145	-5.494462067161587e-06	0.5991863679786903	1.0124021327388918e-05	0.5977669987234069	-0.0008577744053313	0.6152254742272698	0.0013806868793506	0.6137684265584749	GRIN2A	319005	ATF7IP2	462103	EMP2	716300	False	False	False	ref	-60	0.03043	-90	0.09143
1415	chr16	9865264	G	A	rs16966529	-0.0551189248	0.273244710682381	0.0551189248	0.2692073372616225	0.0198109556084796	0.491419978628796	-0.0011531481609997	0.3133825825854623	0.0011531481609997	0.3094892196054618	0.0699836692949754	0.3769284722397121	-0.0036563404082369	0.2902241638549736	0.0036563404082369	0.2858260603428662	0.0014112221654191	0.3846142749509582	-7.756567483178161e-05	0.3018307630816485	7.756567483178161e-05	0.2972989827344351	-0.0082082412325557	0.2458437243842983	0.0082082412325557	0.2419078992315779	GRIN2A	318073	ATF7IP2	461171	EMP2	715368	False	False	False	ref	-75	0.0803	-55	0.06555
1416	chr16	10036400	T	C	rs76655943	0.1007511602	0.1085251568754416	0.1007511602	0.1100925698948467	0.0279225390628005	0.2677881960537108	0.0033735767562382	0.1227739652256616	0.0033735767562382	0.124329562914235	0.0046930157368611	0.839711052263091	0.0005416109710847	0.5908710081053057	0.0005416109710847	0.5967580672034322	0.0001540193998107	0.7788733265053488	2.1123235097976315e-05	0.5293252864489789	2.1123235097976315e-05	0.5350057101887119	0.0016850318366268	0.5626828256610417	0.0016850318366268	0.5686156756641771	GRIN2A	146937	ATF7IP2	290035	EMP2	544232	False	False	False	alt	-15	0.003021	85	0.1392
1417	chr16	10038863	A	C	rs28610230	0.01800932308	0.6283508665082551	0.01800932308	0.6349169289100657	0.0241754350220506	0.3492351871017655	0.0004418655238009	0.5531054325505682	0.0004418655238009	0.5590180775777605	0.364586288806044	0.0823427833920998	0.0064693726965042	0.2148123726392475	0.0064693726965042	0.2185449323155692	0.0090780507089797	0.0872853162269651	0.0001614864512722	0.2123822608292933	0.0001614864512722	0.2157423643507865	0.0059532842862326	0.3128373063090032	0.0059532842862326	0.3176636755191492	GRIN2A	144474	ATF7IP2	287572	EMP2	541769	False	False	False	alt	60	0.02023	30	0.1494
1418	chr16	13643666	A	G	rs55761603	0.358073152	0.0051285621896771	0.358073152	0.005142159611868	0.0613128797762644	0.0288467484929746	0.0222632128419825	0.0055781771027218	0.0222632128419825	0.0055817966466871	0.4384918016561643	0.0580844332007362	0.1615942845177868	0.0036342938881874	0.1615942845177868	0.0036238794282862	0.0268644333804307	0.012401757589843	0.0100168787636964	0.0033366346534328	0.0100168787636964	0.0033483598512571	0.1150852825706838	0.002680357407514	0.1150852825706838	0.0026894320840103	ERCC4	276473	MRTFB	427654	SHISA9	742067	False	True	True	alt	-10	0.003662	95	0.09644
1419	chr16	24118368	T	C	rs9926924	0.0055310068	0.6024581631349342	0.0201157968	0.6025564656573046	0.011321696600375	0.8509765054302176	3.911143941417539e-05	0.7456494839587184	0.0001970590324321	0.7451012855728879	0.2273951700702715	0.1533166417042044	0.0003136524067219	0.2869806806158891	0.0041240598239338	0.2866761172876474	0.0026460462493374	0.2675912719066532	-2.41312149643344e-07	0.3860204501247177	4.104571099193816e-05	0.3857531030528921	0.0014301738642737	0.3183053070109687	0.0061809244168783	0.3185462100148993	CACNG3	137968	PRKCB	282384	CHP2	363341	False	False	False	alt	100	0.09143	100	0.4058
1420	chr16	24120003	T	G	rs2283541	-0.0706068025999999	0.1812286752524568	0.0843525697999999	0.1806643418576695	0.0477468146978461	0.0660440996645548	-0.0039662997707831	0.1120878622345307	0.0045529865801003	0.1121471357467926	0.1098231665072085	0.2900798522465913	-0.0117213256005542	0.1821195144741558	0.0128846300192302	0.1808788899466737	0.0055299595150964	0.1564605927520576	-0.000651796683439	0.1222639377165173	0.0007030317171172	0.1215528412653066	-0.0185271023720761	0.1293804988472816	0.0211086734188907	0.1285027197650824	CACNG3	136333	PRKCB	284019	CHP2	364976	False	False	False	ref	50	0.005493	60	0.05762
1421	chr16	24469698	A	G	rs11640574	0.0197284004	0.5933702186389956	0.0197284004	0.5997696926814261	0.0683383354260416	0.01944925022946	0.0013595542166791	0.2508697539873507	0.0013595542166791	0.2546214067875351	0.0020594833558773	0.9235975552253212	3.223460919685316e-05	0.8818028417062739	3.223460919685316e-05	0.8887959280384382	0.0001421165083594	0.775447121339096	2.2107589215604686e-06	0.7497203675000088	2.2107589215604686e-06	0.7562509365468849	0.0001237174623073	0.8850559733083714	0.0001237174623073	0.8920530804700582	RBBP6	67996	TNRC6A	140512	CACNG3	213362	False	False	False	alt	-5	0.001221	-10	0.010925
1422	chr16	29959513	G	A	rs4788197	-0.08604664992	0.1338891411341435	0.08876423968	0.1326347324593043	0.0261383745204738	0.3001047843712032	-0.0021182457934585	0.1774725042494253	0.00221909691458	0.1760788357815236	0.0662787436904093	0.385221819583019	-0.0060354161859092	0.2350920021842449	0.0061677385377477	0.2318007528115478	0.0017141064409997	0.347927184186585	-0.0001517830891574	0.2305642558894444	0.0001566936380798	0.2276377004992459	-0.0135132460162976	0.1658001029954944	0.0138679027415789	0.163440169404372	TAOK2	14356	TMEM219	18627	KCTD13	33277	False	False	False	ref	-30	0.07947	-15	0.1895
1423	chr16	29959944	G	T	rs4788200	0.0079735397999999	0.7819869472752405	0.009519359	0.7866188024521092	0.0225507657333559	0.3979106187549537	0.0001776248200926	0.7155208571367923	0.0002176155078207	0.7204666983207135	0.0107551713899244	0.717481345845803	9.220398986771188e-05	0.7810078735529078	0.0001073059562511	0.7855586821336061	0.0002510398528769	0.6851379767087729	2.160519304396489e-06	0.7530804813178826	2.5512105519141977e-06	0.7575690327445292	0.0003925967470554	0.7684800134694526	0.0004371350334861	0.7729700898459658	TAOK2	13925	TMEM219	19058	KCTD13	33708	False	False	False	alt	60	0.00583	100	0.1029
1424	chr16	29971245	C	T	rs12934406	0.0345158983999999	0.4041824599473197	0.0352033784	0.4082791964949039	0.0689435392172797	0.0222439050068131	0.0029398218902371	0.1720780401622174	0.0029888278748997	0.1731952080408233	0.0008882913793671	0.9665522198744428	4.150339920640899e-05	0.8783830807916859	4.17812399321428e-05	0.8842791429929068	6.574535034173972e-05	0.8709574365215429	3.9110904604724845e-06	0.7607675594533997	3.930895920936255e-06	0.7652376147035584	0.0001476361716868	0.8829653372768379	0.0001492857378509	0.8877993116637668	TAOK2	2624	INO80E	24471	HIRIP3	24829	False	False	False	alt	-85	0.02966	60	0.3955
1425	chr16	29971798	G	T	rs9932196	-0.00318599972	0.7582598589097821	0.01066996372	0.7543492806448568	0.0289282827747611	0.2435647472858285	-0.0001010180506903	0.650675457903833	0.0002978895359907	0.6470666219623341	0.0180825442908514	0.6243707911813826	-4.06402588760382e-05	0.7364348553117532	0.0001714077775275	0.7325764419388371	0.000510868713091	0.5563228997483852	-1.2612155619990306e-06	0.6798887665598542	4.701156850713578e-06	0.6760420076553193	-0.0002342383953019	0.7290997387895416	0.0005971429514037	0.7252622103190564	TAOK2	2071	INO80E	23918	HIRIP3	24276	False	False	False	ref	-75	0.1572	-70	0.1606
1426	chr16	29981787	C	G	rs11642046	-0.129783922	0.0770976175679649	0.129783922	0.076241656509898	0.0278795990175828	0.2665927008511209	-0.0041420740866785	0.099203758165076	0.0041420740866785	0.09819487350222	0.0857230048497244	0.3418440381837505	-0.0109109725550034	0.1606064750607733	0.0109109725550034	0.157769825019681	0.0025299328254367	0.2897062072048284	-0.000357131066496	0.1479819031786713	0.000357131066496	0.1454790090669399	-0.0206707136023225	0.1030425550627072	0.0206707136023225	0.1010543484184233	TAOK2	7918	INO80E	13929	HIRIP3	14287	False	False	False	ref	-15	0.00415	-15	0.00903
1427	chr16	29983415	T	A	rs3814884	-0.059081138	0.2492133456331601	0.059081138	0.2459266457063104	0.0706162248760259	0.0170659460945571	-0.0042791555608593	0.078835377096725	0.0042791555608593	0.077912999469927	0.1247030780904621	0.267754728338839	-0.0078317995894681	0.200974298229725	0.0078317995894681	0.1976385815012208	0.0087104202016576	0.0923214027217324	-0.0005603124229406	0.0985091799607641	0.0005603124229406	0.0968937443802888	-0.0131198244861601	0.1670906745253121	0.0131198244861601	0.1643671215947361	TAOK2	9546	INO80E	12301	HIRIP3	12659	False	True	False	ref	30	0.006577	-100	0.2118
1428	chr16	29983601	C	T	rs3814883	-0.2030427352	0.0249527435478539	0.2030427352	0.0247760367799148	0.0355462063691524	0.1519578708057465	-0.0077177618266054	0.0348901224065818	0.0077177618266054	0.0346378251872211	0.1436970076869783	0.2421926518424985	-0.0326777289813904	0.0578266154495854	0.0326777289813904	0.056796003738317	0.0054923703419667	0.1617429939998717	-0.0013295292323345	0.0513968046100989	0.0013295292323345	0.0507551339131073	-0.0469384051994325	0.0268174042432175	0.0469384051994325	0.0265501047702431	TAOK2	9732	INO80E	12115	HIRIP3	12473	False	False	False	ref	-100	0.07776	70	0.0851
1429	chr16	29984559	G	A	rs4787489	-0.0009142364	0.4150912085902882	0.0343619708	0.4136874349615931	0.1378271871210792	0.0010595636882265	3.20450547613e-05	0.0608087445805621	0.0048085904954985	0.0606047676202927	0.0260573719111873	0.5682020836873647	-0.0002536705419591	0.5025554591051767	0.0008489819675198	0.5008228617454046	0.0035429904682347	0.2245159436531772	-3.543394119240633e-05	0.2384402295169176	0.0001165381191822	0.2371574574043549	-0.0007736465309623	0.4714687764545561	0.0025617762528454	0.469626053235376	TAOK2	10690	INO80E	11157	HIRIP3	11515	False	True	False	ref	-70	0.01636	-50	0.0953
1430	chr16	29991755	G	A	rs9924686	0.258205682	0.0131790233733393	0.258205682	0.0132398254986331	0.039819094431957	0.1126711312634418	0.0108378831935626	0.0198667454475574	0.0108378831935626	0.0199722584451825	0.5389503810497839	0.0359963866371699	0.1454719371121889	0.0046164167556562	0.1454719371121889	0.0046480438662086	0.0218076991318188	0.0199946051096666	0.00616713871568	0.0071496571124726	0.00616713871568	0.0071971228656008	0.076936590676652	0.0079027043069049	0.076936590676652	0.0079565779416022	INO80E	3961	HIRIP3	4319	TAOK2	17886	False	True	False	alt	-100	0.2377	100	0.2173
1431	chr16	57107341	G	A	rs72777107	-0.206019926	0.0234409086873075	0.206019926	0.0232579585259098	0.0403749675017727	0.1056795592368222	-0.0084864897628076	0.0274661889038099	0.0084864897628076	0.0273269754621103	0.5279015868826499	0.0381755442472371	-0.1070859010342854	0.0077992837526368	0.1070859010342854	0.0077320286975327	0.0212247388011855	0.0203827537679247	-0.0043898159267453	0.0097821373649032	0.0043898159267453	0.0097646958501529	-0.0627519712315661	0.0132805852399039	0.0627519712315661	0.0131410996792244	CPNE2	14757	PSME3IP1	78775	RSPRY1	78797	True	False	False	ref	80	0.1735	-70	0.1445
1432	chr16	58504758	C	T	rs9928398	-0.0319379233599999	0.4490495535192689	0.0319379233599999	0.443291595295101	0.0214837240849726	0.4329683272446071	-0.000727674890047	0.4332821656611021	0.000727674890047	0.4279425186244864	0.0034220250074229	0.8712934911175774	-0.0001329579172433	0.7816920920042035	0.0001329579172433	0.7751080287066504	7.590974419059178e-05	0.8493469547412892	-3.0871495171411263e-06	0.7574675633950841	3.0871495171411263e-06	0.7510933039505221	-0.0004932202830655	0.76653789840868	0.0004932202830655	0.7600907895574507	SETD6	10722	NDRG4	41911	CNOT1	125127	False	False	False	ref	-55	0.0947	100	0.1362
1433	chr16	58505278	G	A	rs8056038	-0.0148493031999999	0.408675037408056	0.0348772372	0.4054233485467997	0.0353727738289553	0.1539823797415649	-0.0008618630305389	0.2852969705123421	0.00117734279943	0.2823320987003828	0.0011670680610998	0.9570024411660636	-2.494503952020072e-05	0.8773041256614342	3.981187054962692e-05	0.8729542576132886	4.119220836396221e-05	0.9032275092994508	-1.1425674268384591e-06	0.8148599639031976	1.376749565337668e-06	0.8105617636400788	-0.0001047474514202	0.8714681793133231	0.0001657813994918	0.8672476860098562	SETD6	10202	NDRG4	42431	CNOT1	124607	False	False	False	ref	20	0.0337	60	0.0869
1434	chr16	58505281	G	A	rs8056039	-0.05047672502	0.2967609314076602	0.05047672502	0.2927306392163497	0.0351400992022996	0.1558494791359984	-0.0020183769007703	0.206912093886905	0.0020183769007703	0.2042564320773563	0.0011456237009666	0.957609619013864	-5.88388383864998e-05	0.8522028469477367	5.88388383864998e-05	0.8464792217075037	4.103633203530822e-05	0.9030148109245646	-2.240791065104455e-06	0.7758436986418118	2.240791065104455e-06	0.7701622395027584	-0.0002243409983173	0.8544055154338354	0.0002243409983173	0.8475412119033734	SETD6	10199	NDRG4	42434	CNOT1	124604	False	False	False	ref	15	0.02942	100	0.0923
1435	chr16	58519260	A	C	rs37035	0.0223175336	0.5537188864220477	0.0223175336	0.559811816898133	0.0258152183531098	0.3106005156662492	0.000609740818931	0.4661534371104874	0.000609740818931	0.4714593910248135	0.0125861898320741	0.7078965660201912	0.0002334095588774	0.690404207556451	0.0002334095588774	0.6967675958443673	0.0002989511531379	0.6644785505095482	6.168789693395297e-06	0.6463141608191169	6.168789693395297e-06	0.6525652765069045	0.0009064366071722	0.665464915093397	0.0009064366071722	0.6718415086151829	SETD6	3780	NDRG4	56413	CNOT1	110625	False	False	False	alt	80	0.0195	65	0.1077
1436	chr16	58530960	C	T	rs37059	-0.0394476284	0.3802286254764498	0.0394476284	0.3751762403116967	0.0352121011542668	0.1567406862186792	-0.0014856245779543	0.2621514305086297	0.0014856245779543	0.2585850265194409	0.0589373494770874	0.4041096053800063	-0.0023550166254504	0.3611001020762529	0.0023550166254504	0.3560702425651899	0.0021451177786507	0.304622847049222	-9.198096046327964e-05	0.2905421756192755	9.198096046327964e-05	0.2861996561563697	-0.005860083797961	0.3182172100214484	0.005860083797961	0.3133023537750034	SETD6	15480	NDRG4	68113	CNOT1	98925	False	False	False	ref	90	0.03534	100	0.2465
1437	chr16	58559618	C	T	rs7201946	0.029473967	0.4182937634214601	0.0347673057999999	0.4217358258152373	0.0234435581378161	0.3736344394800163	0.0007659958309629	0.3785811923593178	0.0008643150385545	0.3816793356761344	0.024651116756293	0.5722360600928796	0.000958877436628	0.498044944815282	0.0010290804050495	0.5016337527791298	0.0006069743804093	0.5368929100992876	2.514854939907264e-05	0.4688047113472918	2.645250906558973e-05	0.4724421225885261	0.0026426049948863	0.4608099843914737	0.0029131338457985	0.4647012995312121	SETD6	44138	CNOT1	70267	NDRG4	96771	False	False	False	alt	85	0.388	90	0.1642
1438	chr16	58572603	A	C	rs7206744	-0.02044749956	0.4682572455107352	0.02963212156	0.4642329596133545	0.0130190998709247	0.7704839512429129	-0.0003341675807176	0.5717567657500471	0.0004222900383601	0.5674177333297901	9.979875292794378e-05	0.9996703818792794	-1.5675419558427477e-06	0.9889818689418022	2.3250740415153862e-06	0.9865771861750638	1.2635122865713603e-06	0.9996635737663911	-2.4403910029611573e-08	0.9896083532358052	3.167210125082883e-08	0.987362766941702	-4.948698492296525e-06	0.9881113489448836	8.247830820494207e-06	0.9871807948562336	SETD6	57123	CNOT1	57282	NDRG4	109756	False	False	False	ref	-35	0.11975	-100	0.1313
1439	chr16	58576353	C	T	rs9936144	-0.1009544368	0.1100108388743499	0.1009544368	0.1085794898116508	0.0634465853638948	0.0251711807250963	-0.0064233627475446	0.0437909227081929	0.0064233627475446	0.0434304876053564	0.0009732440368182	0.965824106989745	-0.0001378475307369	0.8075426148331908	0.0001378475307369	0.800727151458703	6.363228858380704e-05	0.8809921668315954	-9.10239767261923e-06	0.6638187656595433	9.10239767261923e-06	0.6572941625432226	-0.0004503315627989	0.8075098651242334	0.0004503315627989	0.8006470060173867	CNOT1	53532	SETD6	60873	SLC38A7	108417	False	False	False	ref	-100	0.0719	100	0.1624
1440	chr16	58581678	T	C	rs116630925	0.005115537706	0.7887485045977047	0.009635535746	0.7902941793630307	0.0647739344211523	0.0254267110645044	0.0001462604198545	0.5234863914950653	0.0005569355350002	0.5245265144536299	0.0016149252746527	0.936846364178725	1.4263976859379542e-05	0.9339064418037046	2.129952982625731e-05	0.9351397007689334	9.991041357815731e-05	0.8113801629895442	4.591134329499082e-07	0.8619633067047825	1.111981219940054e-06	0.8629973230362848	4.8662201840898713e-05	0.93632690088265	7.670482663057895e-05	0.936683204600006	CNOT1	48207	SETD6	66198	SLC38A7	103092	False	False	False	alt	95	0.02551	-95	0.1098
1441	chr16	58587091	A	G	rs12443835	-0.02348938052	0.5629551747850217	0.02348938052	0.5570692464219162	0.034884888032825	0.1560985091984369	-0.0008312683490409	0.3895396874279671	0.0008312683490409	0.3848472527884136	0.015905941737323	0.6613185879040812	-0.0003194669061132	0.662754110400201	0.0003194669061132	0.6566072878524135	0.0005383168314303	0.5615191949683188	-1.0957723725098322e-05	0.5772664422156207	1.0957723725098322e-05	0.5713952424960772	-0.0010903632344692	0.6411122399249582	0.0010903632344692	0.6350774747423517	CNOT1	42794	SETD6	71611	SLC38A7	97679	False	False	False	ref	-90	0.04388	-50	0.03363
1442	chr16	58622367	G	A	rs9925537	0.0065628828	0.4255562645912366	0.0347242236	0.4267490240489014	0.018430908555902	0.545520640201746	0.0001309047782772	0.4687920369928599	0.000636277020706	0.4698243454353812	0.0022500082478307	0.9179938995968052	5.164479646575066e-05	0.8435234911602831	7.451173829714974e-05	0.8451477390098919	4.268203008595997e-05	0.9109226162353397	1.0075156519361457e-06	0.8351919939193945	1.441705498830404e-06	0.8369620514935612	0.0001723796641483	0.8426346603855105	0.0002614562370096	0.8442192916920112	CNOT1	7518	SLC38A7	62403	SETD6	106887	False	False	False	alt	-5	0.00241	95	0.2196
1443	chr16	58625904	G	A	rs154433	0.0632870618	0.2169078443758679	0.0632870618	0.2199974281711512	0.0289221877095059	0.2476187571924929	0.0021526353503004	0.1955876743025548	0.0021526353503004	0.1980940956479415	0.000518788558609	0.9835862922394164	3.6016185782996845e-05	0.8810474751788353	3.6016185782996845e-05	0.8880927088428445	1.38135377128096e-05	0.967366956376966	1.0446463441173093e-06	0.8372009682364738	1.0446463441173093e-06	0.8440659813784757	0.0001253670284714	0.8920793901951044	0.0001253670284714	0.8991073092690026	CNOT1	3981	SLC38A7	58866	GOT2	108438	False	False	False	alt	-90	0.01648	10	0.013916
1444	chr16	63663230	T	C	rs7193419	0.0408523142	0.2529558306331688	0.0594466834	0.2544770536471462	0.0313084144606024	0.205815139483994	0.0015369435411137	0.2046354837135394	0.0020169782595745	0.2059518651061515	0.0044868199663488	0.8512866906456417	0.0002136733295986	0.7029861747252012	0.0002957993296976	0.7066230093859746	0.000151952257665	0.7860185942301948	8.752888057192977e-06	0.6318678729816783	1.087306383278424e-05	0.6352137328883738	0.0006144633961267	0.6740918175986456	0.0010021114446899	0.6775293566530194	CDH11	1462882	CDH8	1626195	CDH5	2703461	False	False	False	alt	0	0.0	5	0.00708
1445	chr16	63665521	T	G	rs6498914	0.03331180576	0.4372309532079648	0.03331180576	0.4423611958192829	0.1107148398676655	0.0027701133702235	0.0037878917498571	0.1031800147279056	0.0037878917498571	0.1043272009495461	0.1159991422255946	0.2759200530834352	0.0039291911585808	0.2974660123742885	0.0039291911585808	0.3017535680661576	0.0130839553638536	0.0522401755479679	0.0004625944073133	0.1201889126837132	0.0004625944073133	0.1223149926017988	0.0072424202434759	0.2812763485127748	0.0072424202434759	0.285180915078838	CDH11	1460591	CDH8	1628486	CDH5	2701170	False	True	True	alt	50	0.01291	-100	0.1917
1446	chr16	63667853	T	C	rs4353494	0.0191013976	0.611523800751608	0.0191013976	0.6180044655335744	0.0136969220891182	0.7478546600103856	0.0002509355861115	0.6764706770651888	0.0002509355861115	0.6831748018571987	0.0089521955725643	0.7461169610167778	0.000167427214421	0.7268896353036137	0.000167427214421	0.733347770913296	0.0001252265554334	0.7856498007536309	2.309237880029847e-06	0.7565875045326639	2.309237880029847e-06	0.7631508776678188	0.0005905446867473	0.720016960201757	0.0005905446867473	0.726479698975999	CDH11	1458259	CDH8	1630818	CDH5	2698838	False	False	False	alt	5	0.002018	-100	0.0626
1447	chr16	63674238	C	T	rs10775297	-0.00400973794	0.7256515875961126	0.01216246266	0.7243271044542581	0.0101018674568028	0.8985283312245279	-4.9029000558900346e-05	0.8020098996810435	0.0001404428955856	0.8007597819960887	0.0021617564580514	0.9123914155065448	-3.35771931156323e-06	0.911936239990456	2.358294800373719e-05	0.9107617187850202	2.1040003825177227e-05	0.9510399459836888	-3.606088693621525e-08	0.9332020313513766	2.632220389813235e-07	0.9321253607636096	-1.4846095476877625e-05	0.8991764868866698	0.0001138200653227	0.8979587092160474	CDH11	1451874	CDH8	1637203	CDH5	2692453	False	False	False	ref	95	0.0224	-65	0.1437
1448	chr16	63675908	G	A	rs12933055	-0.0357469771999999	0.4052043778355521	0.0357469771999999	0.3999964494793859	0.0378289693027465	0.1271580106520089	-0.0014637946648393	0.2522205574900732	0.0014637946648393	0.2488625522190075	0.0025650753851736	0.9028656982231118	-8.437622200788959e-05	0.8182876645225817	8.437622200788959e-05	0.8115367695933899	9.339366832867824e-05	0.8224574399951237	-3.2920104771358325e-06	0.7307172009265942	3.2920104771358325e-06	0.7242221914755654	-0.0003290884497376	0.81524442475173	0.0003290884497376	0.8084628091152986	CDH11	1450204	CDH8	1638873	CDH5	2690783	False	False	False	ref	70	0.01526	100	0.1234
1449	chr16	64258586	T	C	rs2926123	-0.0730028185999999	0.184330989356645	0.0730028185999999	0.1815766013737038	0.0403784787350463	0.1054014611049186	-0.0029452832362112	0.1173199943107965	0.0029452832362112	0.1157465870549178	0.0152452904886014	0.652214918670047	-0.0010685711224993	0.4672347536118845	0.0010685711224993	0.4617546690796938	0.0006157749308105	0.5223981032005008	-4.313562738017086e-05	0.3659310896210087	4.313562738017086e-05	0.3608280806942927	-0.0034203754412589	0.4150024010483508	0.0034203754412589	0.4095511839690448	CDH11	867526	CDH5	2108105	BEAN1	2168710	False	False	False	ref	100	0.03864	95	0.1506
1450	chr16	64263093	C	A	rs2917686	-0.02104918392	0.6013996349704909	0.02104918392	0.5956233117878375	0.0853734821284678	0.0082359063376232	-0.0018725587174629	0.2125756120552565	0.0018725587174629	0.2098377955385412	0.06348602817459	0.3897424812408293	-0.0013911887499564	0.4516488440382419	0.0013911887499564	0.4463923955431783	0.0054654753992382	0.148386896498138	-0.0001249420472526	0.2523717875458299	0.0001249420472526	0.2486352099004507	-0.0033139784236745	0.4387210205253004	0.0033139784236745	0.4335813593606768	CDH11	863019	CDH5	2103598	BEAN1	2164203	False	True	True	ref	-30	0.03714	-90	0.0735
1451	chr16	64263270	G	A	rs2917688	-0.0160116122	0.6519704065656734	0.0160116122	0.6451919472560994	0.0189796184303214	0.5190416446448078	-0.0003327277299059	0.6397754947142876	0.0003327277299059	0.6334839620634982	0.050084952657451	0.4349077067777669	-0.0008579822666678	0.5535066731909009	0.0008579822666678	0.5475093584873285	0.000955279284831	0.4449407023413797	-1.7811421805902868e-05	0.5508409415499022	1.7811421805902868e-05	0.5449215258452604	-0.0023803239747945	0.5374952169274976	0.0023803239747945	0.5316003598585697	CDH11	862842	CDH5	2103421	BEAN1	2164026	False	False	False	ref	-55	0.0531	-30	0.0415
1452	chr16	64265570	G	A	rs2917696	-0.0528287768	0.2779425539355232	0.0528287768	0.2740393854681011	0.0257520120269098	0.3115661724042298	-0.001425788673129	0.2577393087234735	0.001425788673129	0.2541759043893613	0.0196331364851043	0.6135307699278161	-0.0009070517057511	0.4931394741816525	0.0009070517057511	0.4876131819149455	0.0004902797026508	0.5653682082291945	-2.403759546322381e-05	0.4522249515512863	2.403759546322381e-05	0.4467336135882082	-0.0029601464814753	0.4469990763236403	0.0029601464814753	0.4415163242121481	CDH11	860542	CDH5	2101121	BEAN1	2161726	False	False	False	ref	60	0.003254	-75	0.05624
1453	chr16	64313247	G	A	rs12921977	-0.0052668740999999	0.6643275463941273	0.0157202525	0.6623184893955291	0.0481838022355727	0.0637661001116128	-0.000204066423091	0.404624891896286	0.0007243865797608	0.4030060123389684	0.0541668041305136	0.4537764190210063	7.711741754750003e-05	0.5313840034100196	0.0009207106216705	0.529629749410503	0.0024303072978408	0.3033920254967052	2.9263904397101408e-06	0.4100075899337214	4.04542041467001e-05	0.4083033721239011	-0.0004140411071887	0.5327620973102625	0.0021097951238823	0.5307653813834469	CDH11	812865	CDH5	2053444	BEAN1	2114049	False	False	False	ref	-85	0.04065	85	0.1119
1454	chr16	64337259	G	A	rs8058130	-0.00961327868	0.6707861620583272	0.01613839676	0.6684449651451174	0.0117927685671937	0.8266364477278462	-0.0001493778800941	0.7379530248257743	0.0002237010723413	0.7356352865692166	0.0033090297251822	0.8716933892369662	-3.791344238226735e-05	0.8583039464361214	5.8194322477494176e-05	0.8565611502126389	3.993192005634782e-05	0.9065499293860388	-5.839479005216892e-07	0.8789094378027529	8.174357611971852e-07	0.8770191016213728	-0.0001468113886047	0.848374801403399	0.0002309392629737	0.8466772509467131	CDH11	788853	CDH5	2029432	BEAN1	2090037	False	False	False	ref	0	0.0	-100	0.094
1455	chr16	64340633	G	T	rs934655	-0.0786500516	0.1894983328802633	0.0786500516	0.1868123375331229	0.0205613802135618	0.4568532199001286	-0.002022453267117	0.2365863474869808	0.002022453267117	0.2337104629821154	0.0012775889940945	0.9546071538718152	-9.176882344530908e-05	0.8180456269592996	9.176882344530908e-05	0.8113403709599917	2.5363995390503537e-05	0.9430298373885536	-2.310874121379952e-06	0.7930452786728496	2.310874121379952e-06	0.7862561537602745	-0.0002878492956352	0.8270477341609634	0.0002878492956352	0.8204090115952926	CDH11	785479	CDH5	2026058	BEAN1	2086663	False	False	False	ref	0	0.0	0	0.0
1456	chr16	65343295	C	T	rs4785823	-0.0602942228	0.2331007746188853	0.0602942228	0.2298209291761825	0.0322751750040643	0.190796254782244	-0.0020286868617773	0.1782535679505254	0.0020286868617773	0.1760160806701516	0.0112591138530565	0.7134371946427508	-0.0007539269855281	0.5438398221561132	0.0007539269855281	0.5382648662155656	0.0003852145697379	0.6247025280684926	-2.690847954163161e-05	0.4672192858781178	2.690847954163161e-05	0.4620278199705356	-0.0023753752763022	0.5008020164569524	0.0023753752763022	0.4952262940754305	CDH11	217183	CDH5	1023396	BEAN1	1084001	False	False	False	ref	100	0.0608	-65	0.03622
1457	chr16	66718992	A	G	rs7196496	0.003306182468	0.8524735024550695	0.005995609788	0.8567654790311356	0.0124283540808641	0.8055368216167116	2.692880695841037e-05	0.8819765236835312	7.435329967289036e-05	0.8860715844639682	0.0004338359011579	0.9921517214336916	8.368367237416497e-07	0.9850151626674776	1.9015699190724768e-06	0.989381636742036	5.429918300954965e-06	0.994564161755782	4.789467991817516e-09	0.9871118075677586	2.356462923935801e-08	0.991424956717924	6.598264656395355e-06	0.9842558979210768	8.247830820494212e-06	0.9877444885531578	CMTM4	22249	DYNC1LI2	32617	TERB1	82628	False	False	False	alt	20	0.0426	100	0.06152
1458	chr16	66724067	G	A	rs11862377	0.021493529	0.3456158600617171	0.0407922622	0.3473632633684098	0.0409418172906825	0.1088454296350411	0.0010970686729215	0.2113817005920449	0.0017082172575294	0.2119061010489531	0.0420111510672692	0.4804349746653302	0.0013302119327415	0.3933490897372138	0.0020158813843478	0.395495154875042	0.0016272509990647	0.3612484075961653	5.531131018065563e-05	0.3085804892008631	7.6831373962142e-05	0.310316890753401	0.0033948071657154	0.3440615637844398	0.005291808254429	0.3461675837779139	CMTM4	27324	DYNC1LI2	27542	TERB1	77553	False	False	False	alt	100	0.0326	-100	0.12146
1459	chr16	66749462	C	T	rs13329803	-0.0415259755199999	0.2388951002306766	0.06876607312	0.2376813141266495	0.0174761725341559	0.5755220773696127	-0.0006423381586902	0.3283387378468256	0.0012873392180493	0.3266702236528876	0.011517270957738	0.7007616254972144	-0.0007325876571463	0.5551564183830427	0.000988264069842	0.552129743156825	0.0002005282611419	0.7125185852862992	-1.2223178988615607e-05	0.5658532731433363	1.8277179232344665e-05	0.5628621385133273	-0.0016429678994424	0.5177695300766242	0.0026591006565272	0.5148413603211077	DYNC1LI2	2147	TERB1	52158	CMTM4	52719	False	False	False	ref	-10	0.005432	20	0.07983
1460	chr16	66751701	C	A	rs9929143	0.0117457967999999	0.5647208900725466	0.0227231626	0.566482360756681	0.0273372164697648	0.2739030791644611	0.0003009775695571	0.5024629067191163	0.0006577251380062	0.5038326913061794	0.9001641318333279	0.0018212579307445	0.0107667003061121	0.1268470012190453	0.0207116130575312	0.1268273446022949	0.0246217664886429	0.014888285001842	0.0002767733111234	0.1333306463809409	0.0005999747007887	0.1334486184375073	0.0008668470192339	0.618591558288185	0.0015316221833657	0.6202400957829008	DYNC1LI2	92	TERB1	49919	CMTM4	54958	True	False	False	alt	95	1.231	95	0.1646
1461	chr16	66772160	A	C	rs75228693	-0.00594231293	0.8797026284255421	0.00594231293	0.8727945906588989	0.0168099557218995	0.5982258728466081	-7.202207251888126e-05	0.9076924899630864	7.202207251888126e-05	0.9008919741742776	0.0026648741381016	0.8981936180020575	-1.466300097055614e-05	0.9643859562078068	1.466300097055614e-05	0.9573576331321856	4.3553026736562144e-05	0.9002928982386873	-1.7601031625599345e-07	0.9692172683411764	1.7601031625599345e-07	0.9621506529199096	-5.443568341524355e-05	0.9624113594153346	5.443568341524355e-05	0.957071704247995	DYNC1LI2	20551	TERB1	29460	CA7	72255	False	False	False	ref	-95	0.013	-100	0.05286
1462	chr16	66857678	C	T	rs16957058	-0.222102666	0.0201242751709636	0.222102666	0.0199773998648053	0.0459155214840859	0.0734553943949872	-0.0105040569794907	0.0205343102201031	0.0105040569794907	0.0204336720678343	0.0038863778826168	0.8573057315424545	-0.000823322548921	0.5150703221033804	0.000823322548921	0.5095439245387899	0.0001832135753467	0.7347597664106652	-3.971958765038095e-05	0.3905893932778028	3.971958765038095e-05	0.3855433177892338	-0.002238461284682	0.5042193343047229	0.002238461284682	0.4985890297024686	CA7	13263	NAE1	15578	PDP2	20912	False	True	False	ref	-25	0.007812	0	0.0
1463	chr16	66860753	T	C	rs3026093	-0.0591140316	0.1701774568449092	0.080933966	0.1684713678511687	0.017833650620399	0.5686297247438131	-0.0010951581388202	0.2566254447415011	0.0015082130603831	0.2544978478675834	0.0145450496519414	0.6710165070732691	-0.0013957987131096	0.4619721786646822	0.0015577691266891	0.4582646646901157	0.0002688798976241	0.677570810809043	-2.6591578031246908e-05	0.477106399767322	2.9657704432608285e-05	0.4731954954851951	-0.0037874039127709	0.4036361855995185	0.0043152650852825	0.4000154455836257	NAE1	12503	CA7	16338	PDP2	17837	False	False	False	ref	-70	0.1255	15	0.02417
1464	chr16	66871267	A	G	rs9932517	0.0190912948	0.540638449765963	0.0243714768	0.544180580001877	0.1074735328543954	0.0034385890728813	0.002195883222795	0.1368202138604809	0.0026110290692383	0.1378600655374496	0.0002796014648147	0.9966146536871814	5.2055378590224165e-06	0.966467103527097	6.9475398180753565e-06	0.970730089056234	3.1447061351598686e-05	0.9304824691096918	6.658767727819927e-07	0.8706087962036999	8.028388810738049e-07	0.8746946221689342	1.8970010887136685e-05	0.9659757190423628	2.556827554353205e-05	0.970273071451987	NAE1	1989	PDP2	7323	CA7	26852	False	False	False	alt	65	0.01254	-50	0.0808
1465	chr16	66886549	G	A	rs11861556	-0.00238530526	0.5685883448168938	0.0218789739399999	0.5699752167911085	0.021545758951881	0.4295367117987069	-6.246434457080581e-05	0.5291880938136487	0.0004977931442076	0.5303443505750148	0.0337707432945135	0.5136190086697805	-0.0002302057181834	0.5553890543056015	0.0006956223109278	0.5566561196437074	0.0007347414704416	0.4992081358885108	-5.577388522158006e-06	0.5358022082300281	1.5930625933904624e-05	0.5369110001972381	-0.0004486819966348	0.5323445288626398	0.0020339150803338	0.5335215637659991	PDP2	7959	NAE1	13293	CDH16	32368	False	False	False	ref	100	0.03105	-85	0.1483
1466	chr16	66902190	C	T	rs28442574	0.0024861371999999	0.4556014144444612	0.030354582	0.4564658053353734	0.0258225037255808	0.3108206735673303	0.0001961838794201	0.3901200293300125	0.000757805116925	0.3913371109261767	0.0358533205766882	0.5063431220405409	0.0001238975902619	0.4666321029229776	0.0010388296924694	0.4676086813982306	0.0009377709435423	0.4583304458240916	8.365145929685496e-06	0.4306153415890785	2.58630593556138e-05	0.4319615240944841	0.000218567516743	0.437688945322874	0.0030244795618751	0.4386665598802452	CDH16	16727	RRAD	23345	PDP2	23600	False	False	False	alt	-100	0.03192	-95	0.1083
1467	chr16	66920342	C	T	rs73586830	-0.090247363	0.1251564139675542	0.090247363	0.1233255770234809	0.1152050902349564	0.0022985698138967	-0.0103652504650175	0.0189214220305554	0.0103652504650175	0.0188744843739339	0.6931650225990565	0.0149529511028995	-0.0631271872119531	0.0195527673510572	0.0631271872119531	0.0192221781015507	0.0808276357425125	0.0004449013995578	-0.0073481455636688	0.0048755933453385	0.0073481455636688	0.0048713691861995	-0.0190260961367159	0.1052719083960434	0.0190260961367159	0.1031313807797681	CDH16	1425	RRAD	5193	CIAO2B	14081	True	True	True	ref	55	0.0724	55	0.3926
1468	chr16	66920898	A	G	rs59454517	-0.0567303044	0.2524047717203678	0.0567303044	0.2487647715152603	0.0224401702028979	0.4010683129997945	-0.0013314806999319	0.265396357063215	0.0013314806999319	0.261804971388668	0.5573224242024348	0.0322680554041838	-0.0306574854221163	0.0534120474441948	0.0306574854221163	0.0524195647620344	0.0122468683026989	0.0556250022787424	-0.000702667410914	0.0720551422312021	0.000702667410914	0.0707827698396221	-0.0163051367490349	0.129226029368284	0.0163051367490349	0.1268710963120083	CDH16	1981	RRAD	4637	CIAO2B	13525	False	False	False	ref	-100	0.02704	-95	0.3062
1469	chr16	66930288	G	A	rs17767961	-0.0150287642	0.3394896314566599	0.043391501	0.3377976374276705	0.0845936573779107	0.0084540076456089	-0.0011013574724127	0.1023823074531001	0.0036692253527636	0.1023141778537602	0.0365436640163636	0.4992031170411156	-0.0008905820474808	0.4167828202376382	0.0018238865495113	0.4148683641395963	0.0030393331088703	0.240251171327373	-6.751308493028194e-05	0.2303646646111659	0.000152094786873	0.229318701648921	-0.0025007423047738	0.3602030203515318	0.0051054072778858	0.3582212286690972	CIAO2B	4135	CES2	4157	RRAD	4753	False	True	False	ref	-10	0.0008545	100	0.01233
1470	chr16	67045166	T	G	rs150710353	-0.01825888484	0.6278965843774901	0.01825888484	0.6215013600744113	0.0188010133061738	0.5225376045595499	-0.0003535925529168	0.6091457329487063	0.0003535925529168	0.6029944006174194	0.0007761208802084	0.9778800426886473	-1.8034631345999e-05	0.9439004299553472	1.8034631345999e-05	0.938766770031529	1.4312400719998158e-05	0.9714414808457872	-3.3273524882239664e-07	0.93446996460777	3.3273524882239664e-07	0.9292640155607156	-4.866220184091207e-05	0.954905490531274	4.866220184091207e-05	0.948277816482056	CBFB	16181	CES4A	56576	PHAF1	64776	False	False	False	ref	-40	0.02994	-65	0.1552
1471	chr16	67087027	A	G	rs77801206	-0.0600145034	0.2303804061309831	0.0600145034	0.2270693873216577	0.0202503779376754	0.4741555955045778	-0.0012199516704643	0.2780859357967133	0.0012199516704643	0.2740950511325247	0.1645557718320081	0.2122975680939894	-0.0097532955299086	0.1601758624679072	0.0097532955299086	0.1570957173466762	0.0032495897135057	0.2294445518680939	-0.0001946901456178	0.1818778753852287	0.0001946901456178	0.1786865179920043	-0.0162036884299428	0.1310059927173842	0.0162036884299428	0.1284919797040269	PHAF1	22915	CBFB	58042	B3GNT9	63971	False	False	False	ref	-95	0.288	-90	0.4558
1472	chr16	67096883	G	A	rs148571332	-0.111175905	0.1036068739266253	0.111175905	0.1024417720850793	0.0201007585071063	0.4780440105355019	-0.0024293086672329	0.1745815756675198	0.0024293086672329	0.1728317815734694	0.0102182376035102	0.7378530611292613	-0.0011781252033749	0.5190843291066473	0.0011781252033749	0.5130913028652585	0.0002126339112671	0.7243614721469478	-2.725439156405004e-05	0.5099789518565423	2.725439156405004e-05	0.5040938819304492	-0.0034748111246741	0.4679720487992356	0.0034748111246741	0.4620690971689635	PHAF1	13059	B3GNT9	54115	TRADD	63026	False	False	False	ref	70	0.02698	70	0.1388
1473	chr16	67140459	A	G	rs8047207	0.0551403931999999	0.2664396071488153	0.0551403931999999	0.2703153732511793	0.0218505625698276	0.4182281063320047	0.0013602451950439	0.2809285559136201	0.0013602451950439	0.2848015534154137	0.1647091814852693	0.2140770400978037	0.0100497047939299	0.1737055300503719	0.0100497047939299	0.1766816523199727	0.0037630606374007	0.2156286041585353	0.0002637995641622	0.1836858702895271	0.0002637995641622	0.1866908521051259	0.0142613242717164	0.1533795700142178	0.0142613242717164	0.156126343927643	B3GNT9	10539	TRADD	19450	FBXL8	19474	False	False	False	alt	-65	0.01379	-15	0.10425
1474	chr16	67146210	G	C	rs76171566	0.0375345708	0.3830166959580684	0.0375345708	0.3879370382761822	0.0132638873681278	0.7677740794497199	0.0005426509921349	0.4983453525374807	0.0005426509921349	0.5041558989717777	0.1711771304147009	0.2073960322374433	0.00599319964367	0.2206836506790798	0.00599319964367	0.2245828086171631	0.0021727754069289	0.3011909354224276	8.41593473781775e-05	0.2878195295575302	8.41593473781775e-05	0.2922954855991145	0.0098767774075417	0.2147579267693918	0.0098767774075417	0.2184376504955371	B3GNT9	4788	TRADD	13699	FBXL8	13723	False	False	False	alt	-100	0.09485	-100	0.4585
1475	chr16	68182836	G	T	rs78587942	-0.0009739613	0.8544759320391245	0.0062315541	0.8558968136147899	0.021027330677086	0.4486755060078926	-2.998875306285267e-05	0.8186306161560847	0.0001263115336557	0.820178530396218	0.0022269143215333	0.9153701956273494	-9.825524098279228e-07	0.9419823626991738	1.425946097704357e-05	0.9435162770537026	4.406899399398446e-05	0.9003156990769683	-5.8424240435325024e-08	0.934033614726227	2.7271464803577744e-07	0.9356173646324948	7.423047738433925e-06	0.9427174629407729	5.691003266139914e-05	0.9432615015381453	ESRP2	55266	PLA2G15	62469	SLC7A6	81681	False	False	False	ref	-100	0.01596	100	0.121
1476	chr16	68255156	C	T	rs2290699	0.04962804176	0.3251793604729837	0.04962804176	0.3284715715569801	0.0135075249264983	0.7491341545436193	0.0008839886730829	0.4572562633397145	0.0008839886730829	0.4615613644736793	0.0660577018244201	0.3872260385770179	0.0025135819371572	0.3842604395019823	0.0025135819371572	0.3892174391178488	0.0009047019364895	0.4675506980300459	4.392093012243227e-05	0.4400749616929141	4.392093012243227e-05	0.4453865653208193	0.0058633829302892	0.3432333273881426	0.0058633829302892	0.3477640236740383	SLC7A6	9361	PLA2G15	9851	ESRP2	17054	False	False	False	alt	65	0.041	0	0.0
1477	chr16	68265599	G	A	rs116580887	0.0824629608	0.1569426677206808	0.0824629608	0.1590580030291713	0.0256470806740653	0.315466237615631	0.0022015151637274	0.1737042109501224	0.0022015151637274	0.1761445600114966	0.2967866451123354	0.1115875554210091	0.0232126761177486	0.0729067634497913	0.0232126761177486	0.0743408884466057	0.0075477333933617	0.1049480991323987	0.0006144925184786	0.0813883929757515	0.0006144925184786	0.0828135830911921	0.0267171983768268	0.0673492103466053	0.0267171983768268	0.068522649204582	SLC7A6	1082	PLA2G15	20294	ESRP2	27497	False	False	False	alt	-25	0.02205	-25	0.1388
1478	chr16	68286641	T	G	rs78805615	0.239666788	0.0151284230495181	0.239666788	0.0152407913003637	0.0370752278341011	0.1335740136248591	0.0087631911489994	0.0241298406765182	0.0087631911489994	0.024261022810658	0.0298167331991685	0.5398517380630153	0.0068604881079393	0.1908353256181746	0.0068604881079393	0.194397469640779	0.0011630401879616	0.4217011348210542	0.0002647872755714	0.1441489620371014	0.0002647872755714	0.1468957689133607	0.0161789449374814	0.1227511280649429	0.0161789449374814	0.1251013528393023	SLC7A6	22124	SLC7A6OS	24305	PRMT7	24311	False	True	False	alt	80	0.0325	55	0.1096
1479	chr16	68338869	C	T	rs12925938	-0.1138916929999999	0.0827493203283877	0.1138916929999999	0.0815588195567536	0.0176799674365913	0.5658413993898856	-0.0020671015931826	0.1688992122219096	0.0020671015931826	0.1666323975743694	0.1181361551911846	0.2850023046287021	-0.0125953780423638	0.1352234504219096	0.0125953780423638	0.1327436029478895	0.0019054055753574	0.3303963810067826	-0.0002075252357726	0.1752847529661588	0.0002075252357726	0.172381841779284	-0.0216546798192074	0.0883784888314677	0.0216546798192074	0.0867718119688024	PRMT7	27917	SLC7A6OS	27923	SLC7A6	74352	False	False	False	ref	0	0.0	30	0.0657
1480	chr16	68361619	C	T	rs71395853	-0.09624331068	0.14448763632549	0.09624331068	0.1428190242430381	0.0376761838958427	0.1308382059331733	-0.0042431931309119	0.1164283088955429	0.0042431931309119	0.1152970132369976	0.5024405331397842	0.0439285991271645	-0.0511108111749282	0.0413805006432224	0.0511108111749282	0.0406107586116753	0.019106800759857	0.0257614650728915	-0.0022727995663954	0.0384621973342389	0.0022727995663954	0.0379384016145113	-0.0296682722443996	0.0733243102234067	0.0296682722443996	0.0722204022086656	PRMT7	50667	SLC7A6OS	50673	SMPD3	86889	False	False	False	ref	15	0.0904	-30	0.04993
1481	chr16	68381072	C	G	rs11862968	-0.0047005255599999	0.5808485479082233	0.0227686312399999	0.5810772146189018	0.0161346590573929	0.6328574149235818	-2.1280725967309182e-05	0.6333989515126063	0.0003683014350287	0.6338850068884658	0.1600788492626438	0.2172687711386598	-0.0020629091398019	0.3391976612328936	0.0037259668543028	0.3391871819326251	0.0025261467277315	0.2736310525861447	-2.56201234150864e-05	0.385275333596376	5.737654443144631e-05	0.3855584869398342	-0.0024058922503381	0.3523896523674132	0.0058023489822176	0.3524552965832589	SMPD3	67436	PRMT7	70120	SLC7A6OS	70126	False	False	False	ref	75	0.1013	-100	0.1396
1482	chr16	69246420	T	C	rs34669336	-0.1217557859999999	0.0727174977314649	0.1217557859999999	0.0717705001214229	0.0236948292186295	0.3641521677456469	-0.0028935053989574	0.1141104336598387	0.0028935053989574	0.1126483726350546	0.0002309392629738	0.996674682103412	-2.675179563179322e-05	0.918669697194752	2.675179563179322e-05	0.9117286033629796	5.908875745869726e-06	0.9918636021233284	-6.880455064410097e-07	0.8915114771544528	6.880455064410097e-07	0.884590506749716	-7.423047738442958e-05	0.9376169588527212	7.423047738442958e-05	0.9305322294134863	ENSG00000260914	53263	SNTB2	59272	VPS4A	64917	False	False	False	ref	-100	0.00772	-90	0.0293
1483	chr16	69251934	C	A	rs11641316	-0.00292676044	0.7481586497084616	0.01126634236	0.7496538756935242	0.0183662291391202	0.5408687100619014	-3.761653902044407e-05	0.7231156040198862	0.0002156789219627	0.7244325390289443	0.00086932136848	0.9692829532273012	-4.771402958507806e-06	0.9603673289089328	9.853780698981833e-06	0.9617914171303714	1.6353428117640525e-05	0.9633618763528924	-7.93051381509473e-08	0.9530210297533456	1.8855634195704781e-07	0.9545765499899534	-1.484609547687638e-05	0.957081841431666	3.958958793835901e-05	0.9585726443895664	ENSG00000260914	47749	VPS4A	59403	SNTB2	64786	False	False	False	ref	-100	0.005493	90	0.10376
1484	chr16	69255754	C	G	rs13339524	0.0020069068999999	0.6647435717788822	0.0150823516599999	0.6649827260008021	0.0166339988661884	0.6155105890631561	-4.935360317570476e-05	0.7073450441007896	0.0002436756855574	0.7067879963032174	0.0019967998416415	0.9194675497164124	1.900729961920156e-05	0.922430578447368	2.734197206479317e-05	0.9225427351458684	3.060515715502347e-05	0.9284534925214432	1.7411463979190376e-07	0.9285234252219372	3.5587425230553065e-07	0.9286758263763022	8.495265745107872e-05	0.918194710431786	0.0001162944145689	0.9175321521663068	ENSG00000260914	43929	VPS4A	55583	SNTB2	68606	False	False	False	alt	55	0.03387	50	0.1383
1485	chr16	69328549	C	G	rs2242413	0.0511949078	0.278973104736094	0.0511949078	0.2831010764722385	0.0110235461329446	0.8620890997093081	0.0005976393798776	0.4689776965047079	0.0005976393798776	0.474407587441625	0.0658655273663026	0.3944671764635085	0.0039376426614058	0.2938516433625981	0.0039376426614058	0.2980978219138475	0.0008104973812578	0.502610334668528	5.111962396842367e-05	0.3838120939041098	5.111962396842367e-05	0.3886346245362968	0.0083072152024017	0.2467966119452032	0.0083072152024017	0.2505144480143434	PDF	2039	ENSG00000272617	6322	NIP7	9448	False	False	False	alt	-100	0.02348	-70	0.11035
1486	chr16	69362682	C	T	rs9939870	-0.0200672555	0.5992291988636632	0.0200672555	0.5930417468583459	0.0394787454571587	0.1137113887065267	-0.0008034885376831	0.4086302858190932	0.0008034885376831	0.404062790734751	0.0348347134703572	0.5088738280095771	-0.0005742916218534	0.5861666167424896	0.0005742916218534	0.580324069499702	0.0013368959546149	0.3885025539109123	-2.1673530831530425e-05	0.4861198798934616	2.1673530831530425e-05	0.4805787059656022	-0.0017435914354524	0.56541654879846	0.0017435914354524	0.5594808269360927	ENSG00000260371	6376	TMED6	10896	ENSG00000259900	10952	False	False	False	ref	100	0.03485	25	0.1197
1487	chr16	69366304	T	G	rs35124791	0.0432255442	0.2510427112702996	0.0618970629999999	0.2523505095118373	0.0379421750956542	0.1268159646111808	0.0018614167869471	0.183181395165917	0.0024506212908183	0.183730466885832	0.0636650061033947	0.4076525290641136	0.0023140419066594	0.3371357902993498	0.0032178083026411	0.338917444214433	0.0025732756306576	0.2915915557841509	0.0001061155353769	0.2598882145814719	0.0001387206267305	0.2615202092000727	0.0051812873214344	0.2930224915220091	0.0073059285407937	0.2946591867168454	ENSG00000260371	9998	TMED6	14518	ENSG00000259900	14574	False	False	False	alt	70	0.03403	50	0.10706
1488	chr16	69373083	A	G	rs3785074	0.123148308	0.0782812280234442	0.123148308	0.0793058895682835	0.0340893279637408	0.1661694699058924	0.0043791216054414	0.0776038293538613	0.0043791216054414	0.0784699203189772	0.1457202005872455	0.2482944821817863	0.0151993858096391	0.1123148721367955	0.0151993858096391	0.1146057792733912	0.0049826989346432	0.1779727826782361	0.000528670181088	0.0942322743625933	0.000528670181088	0.0960666299673937	0.024199960410412	0.0763963722763164	0.024199960410412	0.0777233092488383	ENSG00000260371	16777	TMED6	21297	ENSG00000259900	21353	False	False	False	alt	5	0.004517	0	0.0
1489	chr16	82418914	C	A	rs11150463	-0.0251763753999999	0.3629638527002341	0.0403109761999999	0.3613454038813837	0.0194596272262763	0.4950989643232988	-0.0006244968833072	0.3883328996760457	0.0008736859289323	0.386830501545074	0.0286785325459403	0.5575821771557962	-0.0008147049999083	0.4832051314464403	0.0011836277374611	0.4813482924240261	0.0005875127436366	0.5592358921306936	-2.097875390977012e-05	0.483862502325843	2.748570177568857e-05	0.4818157787631127	-0.0020998977268978	0.4458908950881715	0.0032463462109464	0.4439828220635441	CDH13	208052	MPHOSPH6	248690	HSD17B2	383909	False	False	False	ref	80	0.05145	-100	0.2241
1490	chr16	82619943	C	T	rs9940266	-0.0476187333999999	0.304106372946014	0.0476187333999999	0.2998355003791496	0.0234885261696118	0.3540461891127944	-0.0011355719371857	0.2995663893495538	0.0011355719371857	0.2958101062755662	0.1338655933489491	0.2535093848719965	-0.0061836366546353	0.2189089994662645	0.0061836366546353	0.215272651352782	0.0034766980404856	0.2381092060191647	-0.0001646031750047	0.2182730977234767	0.0001646031750047	0.2148617468116198	-0.0106454752400118	0.1961633377388524	0.0106454752400118	0.1927948083495805	CDH13	7023	MPHOSPH6	449719	HSD17B2	584938	False	False	False	ref	95	0.0432	-25	0.02748
1491	chr16	82623390	C	T	rs4782721	-0.047174647	0.3264814549562174	0.047174647	0.3219617096041742	0.0825198122159018	0.0098568452431486	-0.0042439823551507	0.1051283303441054	0.0042439823551507	0.1041263644459018	0.4374690706344231	0.058689589563565	-0.0178190302993339	0.107963812326222	0.0178190302993339	0.1057805401975105	0.0362063372230461	0.0059197009829195	-0.0015896212304574	0.0431350228467204	0.0015896212304574	0.0424608614247041	-0.0156296394048364	0.1554303652871866	0.0156296394048364	0.152731861195912	CDH13	3576	MPHOSPH6	453166	HSD17B2	588385	False	True	True	ref	90	0.01404	-20	0.02197
1492	chr16	82628858	C	T	rs7202931	-0.271547584	0.0115094408266192	0.271547584	0.0114021002127568	0.0441140176399146	0.0832578633607828	-0.0123691736063011	0.01557464375235	0.0123691736063011	0.0154645605668085	0.4106256804460427	0.0665896708707187	-0.1098265980033989	0.0073313946518152	0.1098265980033989	0.0072724389161949	0.0179096203872916	0.0285461055426885	-0.0049506126605398	0.0083780243616966	0.0049506126605398	0.0083445164819539	-0.0934240044868199	0.0049561977461684	0.0934240044868199	0.0049346909828537	CDH13	1892	MPHOSPH6	458634	HSD17B2	593853	False	True	False	ref	65	0.01254	10	0.0371
1493	chr16	82637526	G	A	rs12930379	0.301507724	0.0092142959392041	0.301507724	0.0092434541881961	0.0507235094004858	0.0549807215663996	0.016102197997949	0.0110711610022466	0.016102197997949	0.0110839014671885	0.0694764276995149	0.3739545354230228	0.0227031229188798	0.0786246421183777	0.0227031229188798	0.0801727708972727	0.003550703646948	0.2170153020311435	0.001208486518027	0.0483947949173593	0.001208486518027	0.04920261516658	0.0401256969417042	0.034299378268398	0.0401256969417042	0.0349094694785571	CDH13	10560	MPHOSPH6	467302	HSD17B2	602521	False	True	True	alt	10	0.005615	0	0.0
1494	chr16	89327154	T	C	rs3114896	0.085794285	0.1356759715475016	0.085794285	0.1375107696135886	0.0190530330645823	0.5100671913589337	0.0018370090130529	0.2038380065439164	0.0018370090130529	0.2065534942936243	0.0297730196958199	0.5580028673170777	0.0025870716131098	0.3489103814547064	0.0025870716131098	0.3537231363879406	0.0005723686952616	0.567074792943743	5.446579130831263e-05	0.3620503394526936	5.446579130831263e-05	0.3669607537470697	0.0070263270759789	0.2803588195979815	0.0070263270759789	0.2845700349110659	ENSG00000288715	91138	ZNF778	109450	SLC22A31	125503	False	False	False	alt	-45	0.07996	-25	0.02893
1495	chr16	89356224	T	C	rs3114881	-0.0169455978	0.242405111473848	0.0678070422	0.2444264687283902	0.0191304695499354	0.5137954300421901	-0.0004927784409891	0.3065077671072089	0.0014326209727025	0.3087842486771269	0.2393446273630035	0.1449428062578288	-0.0027632272269036	0.127285383264681	0.0150626198245684	0.1288484562731173	0.0045539675945125	0.1733731332846385	-8.880162085026858e-05	0.1557392808924833	0.0003161636594815	0.1574080531013374	-0.0030459239220085	0.1149302356839254	0.0202030615948005	0.1163525932722847	ENSG00000288715	62068	ANKRD11	134337	SPG7	134496	False	False	False	ref	100	0.02007	95	0.2886
1496	chr16	89463115	C	T	rs369449674	0.0471129944	0.2899906938543203	0.0548370852	0.2923460222324535	0.0321744617214077	0.1913406496356184	0.0016052721457406	0.2307383210733055	0.0018616403026978	0.2323148309539826	0.0001294909438817	0.9973042088828632	2.8506421414705536e-06	0.9798013554716238	2.88249563799648e-06	0.986740035866241	3.702386056665716e-06	0.9927110897059036	9.643758509980169e-08	0.9672198689761398	9.74948256929743e-08	0.973765377386208	8.247830820494215e-06	0.984742674076708	8.247830820494215e-06	0.9885396319365176	ANKRD11	27446	SPG7	27605	ENSG00000288715	44823	False	False	False	alt	15	0.002987	85	0.1685
1497	chr16	89498995	A	G	rs4785573	0.339253244	0.0067559486938961	0.339253244	0.0067556203407528	0.043527775026698	0.0875705635834297	0.0159973603672599	0.0118282194816539	0.0159973603672599	0.0118701038673509	0.4258313813467057	0.0625402088321286	0.1457357105429114	0.0045109926124924	0.1457357105429114	0.0045137196587224	0.0186152858143745	0.0271758377863209	0.0068725953372778	0.0062613464986704	0.0068725953372778	0.0062660488793287	0.1164593711853782	0.0029878761733784	0.1164593711853782	0.0030146892662947	SPG7	8275	ANKRD11	8434	RPL13	61683	True	True	True	alt	20	0.006836	60	0.09814
1498	chr16	89526790	C	T	rs34607811	-0.330642164	0.0074890847047504	0.330642164	0.0074806284442403	0.0340632435275397	0.1673189457629028	-0.0117390866266734	0.0184401088152438	0.0117390866266734	0.0183518305886204	0.7444516842070537	0.0047775458497533	-0.2657217318557942	0.0014296366606783	0.2657217318557942	0.0014652367772209	0.0256557668646796	0.0140600530244358	-0.0094697099895806	0.0043276080593249	0.0094697099895806	0.0043435089114277	-0.0478877305268713	0.0257741181993043	0.0478877305268713	0.0254811728632366	RPL13	33888	SPG7	36070	ANKRD11	36229	False	True	True	ref	100	0.08765	100	0.6895
1499	chr16	89649256	C	T	rs72805595	-0.02554186866	0.4556874184447156	0.0330966546599999	0.4525932448485625	0.027670747380801	0.2688810572946716	-0.0006708748421541	0.4347192024637539	0.0008356537019381	0.4315641210866875	0.0911921414667941	0.3418133964337736	-0.0046271001664013	0.3676952018904257	0.0050682280311246	0.3647737176426261	0.0024910432393847	0.2964693290406204	-0.0001182595052188	0.3548463042772125	0.0001278810282455	0.3519283294929504	-0.007060143182343	0.3364176560513876	0.0081373098874995	0.3335151609459146	CHMP1A	8482	SPATA33	8485	CDK10	31482	False	False	False	ref	100	0.03192	30	0.067
1500	chr16	89650989	A	G	rs467357	0.0907332274	0.1470811488316011	0.0907332274	0.149094389701686	0.0281717735518987	0.2626147696294578	0.0032658317443698	0.1537257441950242	0.0032658317443698	0.1556701294652009	0.0327974992576951	0.5451779893781475	0.0041121781307234	0.3310312091678061	0.0041121781307234	0.3357726956674835	0.0010451404063181	0.4753841438554428	0.0001642162574832	0.2910108689738022	0.0001642162574832	0.2950093941237478	0.0099295635247929	0.2524690096843819	0.0099295635247929	0.2559490853118107	CHMP1A	6749	SPATA33	6752	CDK10	29749	False	False	False	alt	-95	0.1111	-50	0.09155
1501	chr16	89738447	C	T	rs1230	-0.0879172418	0.1343506809789998	0.0879172418	0.1322704492888156	0.0799721312715478	0.0106672375192528	-0.0069740319273403	0.0353898902134188	0.0069740319273403	0.0351487087835398	0.3729537131734353	0.0792674157522819	-0.0311284211876593	0.050764607350984	0.0311284211876593	0.0497461286026494	0.0298868252876117	0.0094514446159828	-0.0024646065844952	0.0189525703682232	0.0024646065844952	0.0186510381829156	-0.0295783708884563	0.0552634976049524	0.0295783708884563	0.054260809582293	VPS9D1	17549	ZNF276	18046	SPATA2L	36742	False	True	False	ref	90	0.1182	0	0.0
1502	chr16	89746354	C	A	rs12102297	-0.1037374092	0.1243384905165057	0.1037374092	0.1230548274416169	0.0404103242104028	0.107896179896428	-0.0045188089198159	0.1009890494465612	0.0045188089198159	0.1002423497216982	0.3022269143215333	0.1095928741051406	-0.0305961930989812	0.0698056354292358	0.0305961930989812	0.0685979498608908	0.0120140931930438	0.0577378600538266	-0.0013331906045523	0.056000468674791	0.0013331906045523	0.0552466807070261	-0.0337171323941802	0.0603246465490742	0.0337171323941802	0.0595565905868699	VPS9D1	25456	ZNF276	25953	SPATA2L	44649	False	False	False	ref	35	0.00928	95	0.08887
1503	chr16	89763487	C	T	rs12447465	-0.0101830225	0.376948561606052	0.0391778062999999	0.3760920248793739	0.0200611607701565	0.4803596938815726	-0.000193430056231	0.407728730375602	0.000848708926412	0.4066640855774064	0.0001880505427072	0.9976984363351526	-6.978552471131666e-06	0.9625447468264364	8.620365037583767e-06	0.962118470157334	3.9501480402643525e-06	0.9950080698091408	-1.5401965917815348e-07	0.953002949486072	1.906469020243573e-07	0.952494306192536	-2.969219095377768e-05	0.9686220175996468	3.134175711787653e-05	0.9659123004731912	VPS9D1	42589	ZNF276	43086	FANCA	53490	False	False	False	ref	70	0.03247	100	0.1334
1504	chr16	89769113	A	G	rs4785595	-0.02559567632	0.532504634015936	0.0270579448799999	0.5285044776581111	0.0974131661238412	0.0050425292918512	-0.0022964725421152	0.1852347927095881	0.0024910961631987	0.183906954525138	0.097380488931411	0.3322355105558649	-0.0020537890731092	0.4083365823657723	0.0021338771129786	0.4046244805111887	0.0089001768639957	0.098864838892674	-0.0001795026036677	0.2127175077909366	0.0001901620850095	0.2105093586780519	-0.0038616343901553	0.4092966055272179	0.0040975223516214	0.4056430144986863	FANCA	47864	VPS9D1	48215	ZNF276	48712	False	True	True	ref	95	0.09076	100	0.2544
1505	chr16	89770373	G	A	rs886952	0.187186006	0.033463777824046	0.187186006	0.0337035594761053	0.0386184904278084	0.1212408497811288	0.0078389982579374	0.037161660784345	0.0078389982579374	0.0373534957892743	0.0941828049223054	0.3226690868646636	0.0192414614406766	0.0971204878538752	0.0192414614406766	0.0990883403341516	0.0038014709619339	0.2142235345424832	0.0008257248390041	0.074068238089948	0.0008257248390041	0.0753993161752855	0.0336313549536471	0.0490613798346747	0.0336313549536471	0.0499469918802267	FANCA	46604	SPIRE2	47807	VPS9D1	49475	False	False	False	alt	-30	0.003067	-65	0.0681
1506	chr16	89773589	G	A	rs4785721	-0.0255952468	0.5203774542776732	0.0255952468	0.5144639056290885	0.0142015737431284	0.7252860456453979	-0.0003786953273296	0.5892219120686687	0.0003786953273296	0.5829864870181719	0.0153731318663191	0.6767391495551396	-0.0004232580869487	0.6410252242424783	0.0004232580869487	0.6349720572589216	0.0002154676657031	0.7232234568120572	-6.18841174832808e-06	0.6753620994413612	6.18841174832808e-06	0.6689949768453594	-0.0013229520636072	0.6176262800834992	0.0013229520636072	0.611763348868678	FANCA	43388	SPIRE2	44591	VPS9D1	52691	False	False	False	ref	-100	0.10944	5	0.008736
1507	chr16	89775966	T	G	rs1558184	-0.0073508536	0.6913113616882554	0.0142088536	0.6873359400934297	0.0159852153102635	0.6409043820067027	-0.0001352383100414	0.701488376368208	0.000228602456881	0.6974293125364734	0.0266479165979347	0.5660060084516443	-0.0002822874945596	0.6230109979337537	0.0004102626963043	0.6188695361509454	0.000428222948308	0.5989607289523488	-4.980950372293578e-06	0.6425821977219041	6.723192316015596e-06	0.6384299312241172	-0.0009047870410081	0.6117656602978377	0.0012990333542278	0.6077413974813829	FANCA	41011	SPIRE2	42214	VPS9D1	55068	False	False	False	ref	-85	0.12195	-75	0.05072
1508	chr16	89783907	G	A	rs17232672	0.0509970278	0.1900626676563865	0.0723260958	0.1911337975041737	0.0268967221676364	0.2839825187101376	0.001769849724619	0.1916390159164473	0.002211189519211	0.1927165361419493	0.0164032859357988	0.6573234902008395	0.0014591785665173	0.4606697933519809	0.0015946358434839	0.4646551802636193	0.0004766917543847	0.5957049116565027	4.869456007288769e-05	0.4138297860920092	5.149743396220052e-05	0.4174500185272411	0.0043325855300055	0.3905438537249476	0.0048027118867737	0.3942664552456032	FANCA	33070	SPIRE2	34273	VPS9D1	63009	False	False	False	alt	30	0.004333	-100	0.2866
1509	chr16	89791140	A	G	rs8045232	0.0465454386	0.2989049990878529	0.0465454386	0.3033803218871544	0.0262584113673301	0.2987366754944013	0.0012309708932304	0.265083219953638	0.0012309708932304	0.2688567878305993	0.0302266503909471	0.5555658670572424	0.0015638716483697	0.4288704297308897	0.0015638716483697	0.4343553345016357	0.0008004810842726	0.5012527413296336	4.158728590496266e-05	0.3913334625467767	4.158728590496266e-05	0.3965775084725133	0.0044183629705387	0.3775360932391819	0.0044183629705387	0.382698855013619	FANCA	25837	SPIRE2	27040	VPS9D1	70242	False	False	False	alt	20	0.05487	-5	0.008575
1510	chr16	89801389	A	G	rs9938865	0.04156558868	0.3423874390318318	0.0422293417199999	0.3462203065908658	0.0171829367381292	0.5908833172473236	0.0007479863680451	0.4042396969088702	0.0007575400721427	0.4083537285319022	0.0228621622513278	0.6014649935325869	0.0012461291373116	0.4860956488050367	0.0012492496152971	0.4905584246414491	0.0004157974042944	0.6152920064365821	2.283060730436113e-05	0.500223102968689	2.2875521785371617e-05	0.5047919397432684	0.0036001781531456	0.4364467690049306	0.0036133746824584	0.4411392109751247	FANCA	15588	SPIRE2	16791	TCF25	72182	False	False	False	alt	-100	0.04083	15	0.09485
1511	chr16	89806819	T	C	rs9940552	0.0773040412	0.1099683192215532	0.1058986948	0.1100482944375467	0.0477658444418174	0.0660677452208872	0.0045554870546021	0.069708840473229	0.0055541681238522	0.0694035382092913	0.0214509583979413	0.6055581702052388	0.001441114619817	0.3998645248516946	0.0019470365667847	0.4014377195512899	0.0009904547975566	0.4499404661799251	8.509976900164202e-05	0.2819344500205249	0.0001029639936673	0.2832196456536185	0.0035820329253406	0.3413684963273335	0.0052794365081982	0.3430669163879687	FANCA	10158	SPIRE2	11361	TCF25	66752	False	False	False	alt	-75	0.01233	-100	0.4446
1512	chr16	89806969	G	A	rs9927381	0.0144889246	0.4101910425266822	0.0369772554	0.4092314565921861	0.0206119187275846	0.4607491142288154	0.0002779868514938	0.4307783190336077	0.0007739965011124	0.4295633304632614	0.0182178087163075	0.631395971429964	0.0003359631635801	0.5871412672645486	0.0006176663314791	0.5860424760096822	0.0003678269634001	0.620309842325981	6.810103419570677e-06	0.5760230010544704	1.2726922016852158e-05	0.5748368678634865	0.0007670482663059	0.5556357057054824	0.0018623601992675	0.5545042438392589	FANCA	10008	SPIRE2	11211	TCF25	66602	False	False	False	alt	-40	0.0307	90	0.44
1513	chr17	1342148	T	G	rs75329315	-0.083585552	0.1462525190710214	0.083585552	0.1442239981635036	0.0308760969729098	0.2107173145718469	-0.0026600350482875	0.1328292663278247	0.0026600350482875	0.1311391559911307	0.2090709643363794	0.1751276405245986	-0.0199590576146955	0.099001930292734	0.0199590576146955	0.0972541975792893	0.0065628250932627	0.1314732017552312	-0.0006352147121005	0.0919544341996168	0.0006352147121005	0.0902659031622989	-0.0251369139916201	0.0775307640562882	0.0251369139916201	0.0761964511020142	YWHAE	58074	TRARG1	62485	BHLHA9	71703	False	False	False	ref	85	0.04785	75	0.03485
1514	chr17	2008591	G	A	rs7225625	0.088497945	0.1259999241400232	0.088497945	0.1279180998166963	0.0389310823672684	0.116585603450167	0.0034699495118084	0.088734510576463	0.0034699495118084	0.0898737354085327	0.035916828874006	0.5086929501133375	0.0032216291022688	0.2992152334141323	0.0032216291022688	0.3036973434835702	0.0013991661775435	0.3852346339529733	0.0001264137565189	0.2251680300651201	0.0001264137565189	0.2288684061353905	0.0085835175348882	0.2299493670224645	0.0085835175348882	0.2338259346350386	RTN4RL1	16743	DPH1	21547	OVCA2	33432	False	False	False	alt	-30	0.00812	-70	0.08154
1515	chr17	2008698	T	C	rs9906314	0.149026416	0.0462600341750783	0.149026416	0.0467925181846158	0.0247219350371787	0.3339159708951112	0.0037144398350755	0.0835620115943585	0.0037144398350755	0.0844800099474187	0.0448294348586321	0.4692538071552909	0.0070664582267378	0.1969803625024851	0.0070664582267378	0.2006535571049141	0.0012385080668889	0.4263116133787009	0.0001966254335285	0.191090464927349	0.0001966254335285	0.1945504680372823	0.016573191250701	0.1250540122936251	0.016573191250701	0.1273139018965342	RTN4RL1	16636	DPH1	21440	OVCA2	33325	False	False	False	alt	30	0.001068	-25	0.15
1516	chr17	2008993	C	T	rs59539549	-0.01098855094	0.7057119701632932	0.01406316918	0.7014618097779309	0.0944777601927826	0.0054898081685673	-0.0010525564893231	0.2870507902274059	0.001354552972531	0.2851712740079602	0.0167463956979313	0.658926828488345	-0.000140436940329	0.7465259490032593	0.0001594054207943	0.7421491143146924	0.00150513258042	0.3822071666799529	-1.3028412521481436e-05	0.5291939533087738	1.4891542816089708e-05	0.5253961942835615	-0.0004536306951271	0.7446057785046803	0.0005410577018243	0.7403322040167284	RTN4RL1	16341	DPH1	21145	OVCA2	33030	False	True	False	ref	80	0.05524	60	0.10004
1517	chr17	2011265	G	A	rs73292184	-0.01976169182	0.6036707235893414	0.0204412421799999	0.5994653820482472	0.0157862169264305	0.640154071826543	-0.0002995182081705	0.6513642993563783	0.0003126677499798	0.6471102155330865	0.0315149615651083	0.5481076334390612	-0.0006257276256818	0.5946102488906567	0.0006527316313702	0.590822391032718	0.0005463673919755	0.5800022697505488	-1.0541302910627733e-05	0.6201713222146508	1.1063840045968614e-05	0.6161886715984025	-0.0016941044505294	0.5800754494554874	0.0017732836264062	0.5760333918720575	RTN4RL1	14069	DPH1	18873	OVCA2	30758	False	False	False	ref	100	0.03888	100	0.2029
1518	chr17	2011464	C	T	rs12449566	0.1448015346	0.0593288023605834	0.1448015346	0.0601045388926838	0.0274108526946958	0.279162441182486	0.0047060414050738	0.0855918571406953	0.0047060414050738	0.0864580481265065	0.1787131734353864	0.1982836686563606	0.0224914332989847	0.0738269041739528	0.0224914332989847	0.0753260952703953	0.0044772873503656	0.177795471183262	0.0006813355194712	0.0786843322698143	0.0006813355194712	0.0801096574048605	0.0346045989904654	0.0434904687441932	0.0346045989904654	0.0443190131777218	RTN4RL1	13870	DPH1	18674	OVCA2	30559	False	False	False	alt	35	0.0439	-30	0.0851
1519	chr17	2011483	A	G	rs12450430	-0.08726113356	0.1433006260376919	0.08726113356	0.1413163560521016	0.0348800360323471	0.157212438593831	-0.0033790160549005	0.1160502196376181	0.0033790160549005	0.1147315064356858	0.157011480980502	0.2258785946218982	-0.0142674243177205	0.1398479542172231	0.0142674243177205	0.1372468740073818	0.0053115866331776	0.1586954160543831	-0.000524810518368	0.1138509633201822	0.000524810518368	0.1119854216528351	-0.0220761439741347	0.100673330270552	0.0220761439741347	0.0990350381134217	RTN4RL1	13851	DPH1	18655	OVCA2	30540	False	False	False	ref	15	0.007652	-50	0.08435
1520	chr17	2011813	C	T	rs11078769	0.1278475872	0.0764999305563628	0.1278475872	0.0773760387078083	0.0374810104762924	0.1296816940103945	0.0047750740116373	0.0724258057261634	0.0047750740116373	0.0731192447615403	0.4822985054930553	0.0474670873452598	0.0573721222933314	0.0252389917836211	0.0573721222933314	0.0256638930640602	0.0178415999788632	0.0288936303759011	0.0020911987279813	0.0258101757663764	0.0020911987279813	0.0262316321800411	0.0401075517138991	0.0372842305450644	0.0401075517138991	0.0379348117697598	RTN4RL1	13521	DPH1	18325	OVCA2	30210	False	False	False	alt	100	0.2054	100	0.3494
1521	chr17	2014316	A	G	rs4239070	0.00594319048	0.6006531816429311	0.02126911408	0.601628674833604	0.0130510259147381	0.7720004098574306	0.0001247141109758	0.6705776654036243	0.0003108272031883	0.6716106110639433	0.0415030846887268	0.5074052906420089	0.0008050178602276	0.5607171764392351	0.0009892721662595	0.5621502682536235	0.0005986302409292	0.5744713267332554	1.45698090347631e-05	0.6062911212886819	1.666859110386602e-05	0.6079983945518526	0.0016809079212167	0.5435712098664907	0.0023077430635742	0.5452820730799323	RTN4RL1	11018	DPH1	15822	OVCA2	27707	False	False	False	alt	75	0.04953	100	0.2632
1522	chr17	2016777	G	A	rs4467122	0.499062572	0.0020333684156803	0.499062572	0.0020305186260843	0.0619426934450574	0.0282169059514519	0.0320385417134247	0.0033426593217181	0.0320385417134247	0.0033411394609901	0.528354392794695	0.0384162475473529	0.2693789352932171	0.0012176578045722	0.2693789352932171	0.0011829813511966	0.0323394876609525	0.0075937588281046	0.0171692246379503	0.0016093372027296	0.0171692246379503	0.0016032454832425	0.1593200488271584	0.0011350604976367	0.1593200488271584	0.0011173038447033	RTN4RL1	8557	DPH1	13361	OVCA2	25246	False	True	True	alt	-40	0.05786	-70	0.08594
1523	chr17	2023847	C	T	rs4530175	-0.009972387034	0.6585799017588491	0.015563170166	0.6560241457852668	0.0753899655486159	0.0138420860182935	-0.0008443573563343	0.2923189365481806	0.001244172987995	0.2911027502257458	0.9278776681732704	0.0006339241172472	-0.0093313696121276	0.1330703408288174	0.0143345932960809	0.1323195632600105	0.0699210091762647	0.000725095412097	-0.0007904657963144	0.0587943595089706	0.001148025890364	0.0586293075344552	-0.0005484807495628	0.6704169291420066	0.000952624459767	0.6684967392862321	RTN4RL1	1487	DPH1	6291	OVCA2	18176	True	True	False	ref	-80	0.0586	-80	0.295
1524	chr17	2028408	T	G	rs7207749	0.1565964597999999	0.047865016852802	0.1565964597999999	0.0485143791905124	0.0265582558792967	0.2933325414263474	0.0049648991747389	0.0786293207922601	0.0049648991747389	0.0794482452968777	0.5040166936095807	0.0433342699690843	0.0749460742949631	0.015299692306687	0.0749460742949631	0.0154933057021715	0.0127552359587912	0.0524598401417358	0.0022730336024565	0.0262409428663956	0.0022730336024565	0.02661808627287	0.0505369337864141	0.0231485562943864	0.0505369337864141	0.0234986016975707	DPH1	1730	RTN4RL1	3074	OVCA2	13615	False	False	False	alt	45	0.1288	-100	0.1812
1525	chr17	2028568	A	G	rs7222716	0.0156222913999999	0.5185421102533773	0.0263210398	0.5201394996821641	0.0975860232039112	0.0048083725109278	0.0013241357294739	0.1570604499326856	0.0024438592176019	0.1572093105363363	0.4745315232093959	0.049794065480305	0.0061113733239029	0.1441230532132129	0.0113985794617605	0.1446258729786968	0.0470295006484243	0.0027548670028614	0.0005047859803027	0.0506713713765627	0.0010624131809149	0.0506694258560001	0.0050608689914552	0.2478750841297243	0.0086404275675496	0.2488798450874993	DPH1	1570	RTN4RL1	3234	OVCA2	13455	False	True	True	alt	50	0.02753	-95	0.1987
1526	chr17	2028599	A	G	rs7222728	0.0646370208	0.2161852500144383	0.0646370208	0.2192921812126412	0.0209584504650667	0.4514766428398706	0.0014197493403329	0.2552810298032959	0.0014197493403329	0.2586923398402628	0.4822300484972451	0.0480473277180696	0.032141764699263	0.0530799741201816	0.032141764699263	0.0541676357131702	0.0101851594441821	0.073314469005032	0.0007064056849489	0.0757549853795149	0.0007064056849489	0.0771173877039213	0.0199968658242881	0.0984534732680955	0.0199968658242881	0.1002916207121734	DPH1	1539	RTN4RL1	3265	OVCA2	13424	False	False	False	alt	25	0.004395	-100	0.1659
1527	chr17	2061791	C	T	rs7214308	-0.124672909	0.0739265270068909	0.124672909	0.0729152160561253	0.0421617413956991	0.0963164471525779	-0.005515458232429	0.0563791135932402	0.005515458232429	0.0557951618665863	0.6134167463956979	0.0251025335570667	-0.0743231438415489	0.0153189433683435	0.0743231438415489	0.0150542034749062	0.0254060174961246	0.013668301105935	-0.0032403872663756	0.0150823963574867	0.0032403872663756	0.0149116527639354	-0.0341039556596614	0.0466089526548478	0.0341039556596614	0.045792981231587	HIC1	7636	OVCA2	19768	DPH1	31653	False	False	False	ref	-100	0.2251	-100	0.4211
1528	chr17	2061802	C	T	rs12939002	-0.0136249638	0.3445234839187021	0.0422212438	0.3440042109062231	0.0495726580161936	0.0584979372788166	-0.0009153295863395	0.1635134213052956	0.0021473786758019	0.1635385804472303	0.6070189040282405	0.025892326584341	-0.0053897846364968	0.0643098496230777	0.0251261870922359	0.0642380323981982	0.0296592790662988	0.0093720657158363	-0.0004103747646852	0.0401348215279349	0.0012620704767471	0.0400982765580333	-0.0048596219194351	0.1838209908018887	0.0113391178120153	0.1833026535401443	HIC1	7647	OVCA2	19779	DPH1	31664	False	False	False	ref	-95	0.2114	-95	0.3977
1529	chr17	2099914	G	A	rs6503245	0.120431265	0.0751725661444668	0.120431265	0.0760342550591827	0.0851900343503712	0.0084358513841651	0.0106267636953467	0.0207843949923841	0.0106267636953467	0.0209382454643172	0.0735755996173006	0.3714510360515939	0.0084459628142977	0.1722580594764673	0.0084459628142977	0.1754832013258061	0.0059397608337453	0.1395962805122392	0.0007182124659927	0.0707181570123006	0.0007182124659927	0.071899968836537	0.0179060407112928	0.1119148954385546	0.0179060407112928	0.1140175919013992	HIC1	45759	OVCA2	57891	DPH1	69776	False	True	True	alt	50	0.02966	-100	0.3882
1530	chr17	2107303	T	C	rs8082647	0.02960903628	0.3999535788106814	0.03694823932	0.4020067323256747	0.013591034144078	0.7531642447224363	0.000375940911634	0.5402796137745505	0.0004895026845526	0.5421921734143641	0.0431039886509847	0.4644413626093962	0.0014543615851618	0.4344263885919868	0.0017137600331664	0.4362977627057415	0.0005938266948251	0.5346110914140956	1.935194558330226e-05	0.4966270384813018	2.3358596170983263e-05	0.4982876265506518	0.0036315199102635	0.3959987693094242	0.0043705255517798	0.3979380100799853	HIC1	53148	OVCA2	65280	DPH1	77165	False	False	False	alt	10	0.003906	-50	0.02203
1531	chr17	2115743	A	G	rs2760742	0.0026951188399999	0.8581247922230143	0.00631899008	0.8570189491657302	0.0162454824133719	0.6329414867158393	3.809684335928631e-05	0.8641706204162564	0.000100447253063	0.8630116700368219	0.0009303553165517	0.9706411954414876	1.53191884844828e-06	0.9803178895431393	4.808699911101436e-06	0.9788180127191544	1.4829344882247105e-05	0.9697462121975702	2.1677050868014683e-08	0.9795011066838984	7.586274860737443e-08	0.9779841303960854	6.598264656395409e-06	0.9769643273435312	2.144436013328491e-05	0.9754652536431692	HIC1	61588	OVCA2	73720	DPH1	85605	False	False	False	alt	-35	0.0667	20	0.01483
1532	chr17	2124812	A	G	rs2760751	0.026376315408	0.4834906308699023	0.026616384312	0.487838315249678	0.0217028020626559	0.4203222982325462	0.0006495532787722	0.4628798178847989	0.0006536809848919	0.4668741018106792	0.2430627494968822	0.142765630151982	0.0065627042516077	0.2528880052399786	0.0066115668792634	0.2558852517314987	0.0054313383434909	0.1517084717160872	0.0001677467003651	0.2564195019731918	0.0001685868365184	0.2593860752937081	0.008762495463693	0.2703584506193748	0.0088367259410774	0.2737371466043369	HIC1	70657	OVCA2	82789	DPH1	94674	False	False	False	alt	15	0.00567	80	0.04688
1533	chr17	2126940	G	A	rs8067895	-0.0181245199999999	0.5528552947958759	0.0226872956	0.5485782078433477	0.0174685740769269	0.5768756804298645	-0.0003570155855728	0.5590548864081295	0.0004156301151285	0.5544792359225656	0.0081389594536636	0.7617425984691135	-0.0002052134970374	0.7174465172825549	0.0002279061958691	0.7128616669488392	0.0001501532403785	0.7648130010033675	-4.083744653799055e-06	0.7150168589069482	4.37526061600826e-06	0.71046302389025	-0.0008000395895879	0.6874274724237919	0.0008841674639569	0.6828453770843844	HIC1	72785	OVCA2	84917	DPH1	96802	False	False	False	ref	90	0.252	85	0.125
1534	chr17	2133359	A	G	rs2760736	0.0456888784	0.3055203447342009	0.0456888784	0.3098140834672437	0.0179980505509695	0.5617429578231139	0.000839643170167	0.3601370663271758	0.000839643170167	0.3649350155301921	0.0032653162218336	0.8828595854159977	0.0001629010380938	0.7463698715557787	0.0001629010380938	0.7530344262526111	5.839393142155515e-05	0.8798396898817977	2.9689606873645783e-06	0.7433764191842512	2.9689606873645783e-06	0.7498779661146797	0.0006474547194087	0.7281174894025368	0.0006474547194087	0.7347558956946911	HIC1	79204	OVCA2	91336	DPH1	103221	False	False	False	alt	-55	0.1846	-55	0.0713
1535	chr17	2149410	C	T	rs6503302	0.01067770326	0.6752390375504387	0.01457352794	0.6779082775032843	0.0153361239479933	0.6413307003606554	0.0001824180881255	0.6830522162069963	0.0002423573183032	0.6856756802595457	0.0128327999736068	0.6861814030893546	8.474873400425494e-05	0.7289956365352531	0.0001664152305585	0.7306673139892375	0.0002070850058299	0.7147212811266568	1.5670510793526032e-06	0.7384682704754335	2.893272470268009e-06	0.7402983050824353	0.0003274388835736	0.7166232546172359	0.000619412094619	0.7183313081777981	HIC1	95255	OVCA2	107387	DPH1	119272	False	False	False	alt	5	0.001221	-5	0.01312
1536	chr17	2178125	G	A	rs9910413	-0.0449691716	0.0844245478711309	0.1239821956	0.084431683218062	0.0447198925702898	0.0807359893740277	-0.0031942014906335	0.0581112376815141	0.0061658652163602	0.0582659051315859	0.2921117746032792	0.1141591863164245	-0.0129228360460013	0.0502065735507943	0.0351771256388207	0.0500455806061667	0.0129989562090069	0.0510012761417158	-0.0009114164873046	0.0360044934545878	0.0017505176603454	0.0360379722057597	-0.0126101085414535	0.03828230822388	0.0393677212893008	0.0382731952123063	HIC1	123970	SRR	125259	SMG6	125660	False	False	False	ref	-30	0.04492	-100	0.304
1537	chr17	2182304	G	A	rs7214741	0.069727487	0.1708810347621105	0.0782063714	0.1723293682919502	0.0240515954756892	0.3538275328802824	0.0019200097047826	0.1957607317297883	0.0020779172611651	0.1969360437169121	0.415002804262479	0.0652572411082723	0.0306644387850641	0.053294592451189	0.0344347744180381	0.0537993905866438	0.0100187161439732	0.0756328420681898	0.0008310774409673	0.0687745136570903	0.0009012947547709	0.0694063396685133	0.023014747121507	0.0738026912772587	0.0259344792319619	0.0744414838002127	SRR	121080	SMG6	121481	HIC1	128149	False	False	False	alt	30	0.007217	100	0.04395
1538	chr17	2182359	T	C	rs7223390	0.0429250554	0.2795259963252175	0.0508980653999999	0.2823743505443117	0.0284207414840381	0.2527015292621832	0.0012299203488721	0.2463626134580027	0.0014665271573127	0.248593286547477	0.3514128534195506	0.0873371645837891	0.0136372893785695	0.1043737528242863	0.0165446393152715	0.1057923173998952	0.0100500743014973	0.0742391080834173	0.000397153510559	0.1011531768310174	0.0004834319401009	0.1024676977303569	0.0146390749232951	0.1237743575018434	0.0174070469466529	0.1252179551218737	SRR	121025	SMG6	121426	HIC1	128204	False	False	False	alt	-25	0.0169	45	0.06274
1539	chr17	2185741	A	G	rs57130712	0.55280429	0.0012744341287529	0.55280429	0.0012868715959014	0.0669824494595296	0.0208785166412268	0.0378284331955569	0.0021729964402328	0.0378284331955569	0.002199169133738	0.1594437662894658	0.2222172164684064	0.0932564011569679	0.0114111665592771	0.0932564011569679	0.011508720028758	0.0113140632298348	0.0678597648600824	0.0067277284648404	0.0068187566441188	0.0067277284648404	0.0068266001461995	0.1123824684108079	0.0032633089533946	0.1123824684108079	0.0033251447589545	SRR	117643	SMG6	118044	HIC1	131586	False	True	True	alt	-20	0.0293	-65	0.10205
1540	chr17	2186554	G	A	rs2270478	-0.01403780624	0.7154802174428525	0.01403780624	0.7092043955509916	0.0142784360346631	0.7127771032857256	-0.0002099871117019	0.7582372278127207	0.0002099871117019	0.7517303127464797	0.0080589554947048	0.7650995966969294	-7.561459979174956e-05	0.843530574764917	7.561459979174956e-05	0.8366983110069991	0.000102836241597	0.8060562167305089	-1.0911867618027329e-06	0.8587224143523263	1.0911867618027329e-06	0.8519252281943749	-0.0003117680050146	0.8233802193102918	0.0003117680050146	0.8165679908765824	SRR	116830	SMG6	117231	HIC1	132399	False	False	False	ref	85	0.00983	-70	0.03738
1541	chr17	2187213	T	G	rs11867782	-0.0531045761999999	0.2737499075763183	0.0564420334	0.2712443922301307	0.1078797611443276	0.0031590185029981	-0.0054790747103042	0.0635182374877671	0.0058931551551916	0.0632443291304267	0.0154151958035036	0.6554321372255081	-0.0009202084715244	0.5331816469623909	0.0009819372778327	0.5290746849058263	0.0016002903795804	0.3538920416523414	-8.699486554262255e-05	0.3024567839122913	9.465359832659673e-05	0.2991224727469141	-0.0026788954504965	0.4896038860379718	0.0028817920886806	0.4853386119834294	SRR	116171	SMG6	116572	HIC1	133058	False	True	False	ref	5	0.00586	-10	0.00842
1542	chr17	2192418	C	A	rs2126202	0.1255011528	0.0656701809504446	0.1255011528	0.066552272462863	0.0369274092769502	0.1349377320776717	0.004619569994994	0.0601803787011848	0.004619569994994	0.0608322272429626	0.6617119197651018	0.0194215974551956	0.0836281987464055	0.0116843889114282	0.0836281987464055	0.0118232692258889	0.0243932535543471	0.0148188678403829	0.0030742281944062	0.0142858902585167	0.0030742281944062	0.0144518990509952	0.0301210781564448	0.0505514714317233	0.0301210781564448	0.0514337960594388	SRR	110966	SMG6	111367	HIC1	138263	False	False	False	alt	95	0.03513	50	0.168
1543	chr17	2229030	T	C	rs143499	0.0145687258739999	0.6853042278597541	0.0145687258739999	0.6915773714541802	0.0240427592545129	0.3567542674158378	0.0003675912763683	0.6422356512396521	0.0003675912763683	0.6479506379409296	0.0021559829764771	0.9184154912243492	3.678726366589773e-05	0.8991834915132496	3.678726366589773e-05	0.9062168878352318	5.212582841553259e-05	0.8900515553975656	9.040348710588238e-07	0.881438867759606	9.040348710588238e-07	0.8883390749386639	0.0001476361716868	0.8910931781264627	0.0001476361716868	0.8981057254226865	SRR	74354	SMG6	74755	TSR1	107627	False	False	False	alt	100	0.06555	95	0.0671
1544	chr17	2232686	A	T	rs7212249	0.0048538244799999	0.5334575234079214	0.0250993175199999	0.5335055739748937	0.0775468951418919	0.0122335073743332	6.685666811513998e-05	0.2284791197749574	0.0019456866830263	0.2281137799608968	0.1676734518821549	0.2119210614262835	0.0014870259262528	0.2948411146375416	0.0048728868979967	0.2952345876252717	0.0131377859707519	0.0516527744821603	5.344872343587061e-05	0.1535256310184611	0.0003739771403026	0.1538025395799102	0.0023019695819999	0.3030975143576694	0.0075574873808188	0.3031289492952081	SRR	70698	SMG6	71099	TSR1	103971	False	True	False	alt	-100	0.0234	-100	0.0821
1545	chr17	2234722	A	T	rs2169356	0.0095895668879999	0.7913332658687797	0.0095895668879999	0.7978070423859069	0.0122729978005237	0.8182452708457202	0.0001213892818447	0.8321820775774599	0.0001213892818447	0.8387997810667723	0.0169641384315924	0.6767749099496584	9.1498648286507e-05	0.8071586600735906	9.1498648286507e-05	0.8139080290671239	0.000216931348154	0.7382877049222993	1.1662377890737098e-06	0.8349141850425322	1.1662377890737098e-06	0.8417384688064776	0.0002894988617992	0.8111089993057021	0.0002894988617992	0.8177472299515848	SRR	68662	SMG6	69063	TSR1	101935	False	False	False	alt	50	0.01404	-65	0.174
1546	chr17	2242035	A	G	rs216218	0.075009771	0.1486258640057328	0.0822695386	0.1499968927659617	0.0385963436818185	0.1233262827130571	0.0029995009637253	0.1096578891726843	0.0032188361537016	0.1104940644671658	0.072463792022698	0.3663437004418414	0.0058630988927738	0.2185013926571908	0.0062092497615361	0.2212463921886684	0.0028031544394924	0.2582202701103147	0.0002296083481966	0.1652625491344166	0.0002400664057768	0.1671281663178088	0.0128377486720992	0.1575358835636622	0.0137103691729074	0.1595191565665518	SRR	61349	SMG6	61750	TSR1	94622	False	False	False	alt	-55	0.003296	-65	0.0625
1547	chr17	2252991	T	C	rs216224	-0.0276546142	0.4558434871608814	0.0317434626	0.4517761160407576	0.0215774583662348	0.4288961658982594	-0.0006145576243029	0.4499393941022647	0.0006925552751155	0.4462379340220959	0.0048340536438916	0.8280311332327489	-0.000181276457732	0.7489428941293647	0.0001874311115157	0.7443458831516119	0.0001073740349445	0.804482535494595	-4.035863158415776e-06	0.727510956743227	4.153267494080304e-06	0.7228805324452376	-0.0006886938735112	0.7256445083617209	0.000701890402824	0.721010660050162	SRR	50393	SMG6	50794	TSR1	83666	False	False	False	ref	100	0.11633	-5	0.010895
1548	chr17	2253616	C	G	rs12950555	0.0370400112	0.3812554413480437	0.0370400112	0.3863347013965863	0.0293378924033899	0.2381068986562695	0.001119063330108	0.295130673233601	0.001119063330108	0.2989969330026068	0.0094734584804196	0.748090864179917	0.000383691605836	0.6364207170178177	0.000383691605836	0.6423944099234709	0.0002834370067878	0.6845048802868412	1.1946508989058252e-05	0.5777084771664991	1.1946508989058252e-05	0.5836115842050237	0.0012982085711457	0.6054576808062656	0.0012982085711457	0.611356913622445	SRR	49768	SMG6	50169	TSR1	83041	False	False	False	alt	25	0.003204	100	0.0853
1549	chr17	2261017	G	A	rs9891227	0.0088326804799999	0.6170979403843799	0.01846666912	0.6193286059632074	0.0804841819915109	0.0108696894671003	0.0008592498305897	0.2591879142695073	0.001396362507883	0.2603497107271597	0.0020240176833492	0.9236306281972396	3.57683480633782e-05	0.8786554151852796	4.375147985081964e-05	0.881309084963899	0.0001697125428065	0.7550231026388347	3.088393706179511e-06	0.7396803826048565	3.538489396930828e-06	0.7418146771641814	0.0001377387747022	0.8714565744331043	0.0001707300979842	0.8733364707291228	SRR	42367	SMG6	42768	TSR1	75640	False	False	False	alt	55	0.03793	15	0.05908
1550	chr17	2265215	G	C	rs216176	-0.116323791	0.0839511853427593	0.116323791	0.0828012879876158	0.0402351126483105	0.1084003273226587	-0.0048819990623829	0.064374772018326	0.0048819990623829	0.0637084716079702	0.0056893536999768	0.8244490071296287	-0.0006533416640636	0.5708331651269067	0.0006533416640636	0.5651782298958455	0.0002127193746991	0.721221216163569	-2.506615584848425e-05	0.4674093090715702	2.506615584848425e-05	0.4618903865739546	-0.0020924746791593	0.538014727902741	0.0020924746791593	0.532383935584439	SRR	38169	SMG6	38570	TSR1	71442	False	False	False	ref	55	0.00824	-90	0.1332
1551	chr17	2267564	A	G	rs1122645	0.1691071479999999	0.037691322425156	0.1691071479999999	0.0381004813724928	0.0416081609445407	0.0995232157915631	0.0076498181588827	0.0360225843776314	0.0076498181588827	0.036274327871188	0.0145994853353567	0.688158977788157	0.0025707323460436	0.3593961668838592	0.0025707323460436	0.3644690454231266	0.0006239355173454	0.5562397488765158	0.0001193023337095	0.2675085069060624	0.0001193023337095	0.2714778276145178	0.0067830160667743	0.2954733849531197	0.0067830160667743	0.2999649443541615	SRR	35820	SMG6	36221	TSR1	69093	False	False	False	alt	100	0.1489	35	0.1188
1552	chr17	2273238	A	G	rs11869805	0.0813354222	0.1494241811418723	0.0813354222	0.15168151145974	0.0172612900285192	0.5926766360436826	0.0014211037924686	0.240157320862185	0.0014211037924686	0.2434338503457943	0.0013575929530533	0.9479750715263248	0.0001094090897727	0.7731428578246746	0.0001094090897727	0.7797980596987153	2.327329923969456e-05	0.9461676967956628	1.905593452539505e-06	0.7727929877153984	1.905593452539505e-06	0.7794990984358031	0.0003620797730196	0.7774156913448211	0.0003620797730196	0.783952741020719	SRR	30146	SMG6	30547	TSR1	63419	False	False	False	alt	30	0.01826	-100	0.07355
1553	chr17	2273670	A	G	rs6502155	0.1168946514	0.0770670195353313	0.1168946514	0.0781752901337697	0.0325593165091028	0.1867636513093365	0.0039023251241756	0.0790533691360806	0.0039023251241756	0.0799694331066406	0.0212150704364751	0.6025215223378727	0.002354661179765	0.3372216583880949	0.002354661179765	0.3418477698220623	0.0006738941103551	0.5127774540153734	7.706556444517247e-05	0.279583674546196	7.706556444517247e-05	0.2839489899235485	0.0067252812510309	0.2715577833686489	0.0067252812510309	0.2758328872532378	SRR	29714	SMG6	30115	TSR1	62987	False	False	False	alt	80	0.0177	5	0.01138
1554	chr17	2282806	C	T	rs749240	0.0260431178	0.1717751994855338	0.0752186418	0.173404966176934	0.0387373293397577	0.1209691339350555	0.00093936327038	0.1235119333412827	0.0027401763357865	0.1244935554958104	0.1943320906601563	0.1855272224795736	0.010901148953101	0.1179962926763107	0.0147078271159858	0.1195511831965114	0.0071155871380229	0.1157793549342203	0.0003633743302992	0.0931634111402679	0.0005027752988038	0.094499208345835	0.0127214542575302	0.095938899027807	0.0205107056844049	0.0969515866677924	SRR	20578	SMG6	20979	TSR1	53851	True	False	False	alt	100	0.0374	-55	0.05984
1555	chr17	2287024	C	T	rs410378	0.10270846292	0.1229212371822437	0.10481820788	0.1240830216024018	0.0275986598174484	0.2729723638468041	0.0032465253082164	0.147146121251473	0.0032933894486319	0.1484813910912443	0.0296855926891226	0.5477567592737125	0.0037998597704957	0.3351931041032604	0.0038172170879398	0.3389145225582808	0.0008669862986954	0.4836305190086102	0.0001206189658515	0.3004682157326308	0.0001210045270344	0.3039243355655534	0.0089728151496156	0.2624661231417974	0.0090453960608359	0.265629692589967	SRR	16360	SMG6	16761	TSR1	49633	False	False	False	alt	-60	0.0094	-60	0.0976
1556	chr17	2294093	T	C	rs216202	-0.0639247054	0.1297835688074575	0.0897170254	0.1285917473659855	0.0843550934185905	0.008536152609974	-0.0053892749680352	0.0323230261133629	0.0076791835507589	0.0320692192345094	0.1458612384942759	0.2483693993190834	-0.0142420390123933	0.1303044933876338	0.0163853006147739	0.1288526412193021	0.0125204496503246	0.0632933841880179	-0.0012431553839309	0.0532114160593677	0.0014334396781717	0.0528403177337534	-0.0172602355580482	0.0980780671423828	0.0216942694071458	0.0969414959001746	SRR	9291	SMG6	9692	TSR1	42564	True	True	True	ref	-100	0.502	-100	0.3591
1557	chr17	2295506	C	T	rs216201	-0.0732663824	0.1731618879627521	0.0732663824	0.1707346145266232	0.0399998500943276	0.1099539678985165	-0.003058702357295	0.110520187052729	0.003058702357295	0.1091925884866489	0.0806406914981359	0.3601893594022883	-0.006316666652562	0.2263278038597409	0.006316666652562	0.2225839974886026	0.0034493612594966	0.2395687635481288	-0.0002802552670341	0.1638957892922591	0.0002802552670341	0.1612956014628406	-0.0129334235096169	0.170903842543669	0.0129334235096169	0.167988216522277	SRR	7878	SMG6	8279	TSR1	41151	False	False	False	ref	-30	0.010445	-100	0.1475
1558	chr17	2296455	C	A	rs394752	-0.0070958044599999	0.6244794719655045	0.01981064326	0.623090583190461	0.0184037081459068	0.5455009243863098	-0.000163703520504	0.6160120249244168	0.0003906764787348	0.6147691959219113	0.0023572300484972	0.9159924901586534	-2.3338987556779428e-05	0.8748135092043736	6.3475131503999e-05	0.8737916080164544	4.5183997236888754e-05	0.9078753799842548	-5.520625995774586e-07	0.8643464495988873	1.2799877104923744e-06	0.8632871257145144	-5.361090033320961e-05	0.8742387976226297	0.0002070205535943	0.8733331811071154	SRR	6929	SMG6	7330	TSR1	40202	False	False	False	ref	40	0.02098	-95	0.1157
1559	chr17	2298650	A	G	rs216197	-0.02577556396	0.5243058364087964	0.02577556396	0.5186166062134882	0.0179832498882061	0.5565757001252746	-0.0005577056719515	0.5565553545602581	0.0005577056719515	0.5507902912880489	0.0187563920688858	0.6639765350795137	-0.0011824414958447	0.6403528619303397	0.0011824414958447	0.6340236680906545	0.0004011954896212	0.664801516030107	-2.791006887006425e-05	0.63968723714666	2.791006887006425e-05	0.6333550447262195	-0.0030929365576853	0.5841367849566189	0.0030929365576853	0.5782243837027211	SRR	4734	SMG6	5135	TSR1	38007	False	False	False	ref	-10	0.002625	100	0.1621
1560	chr17	2299649	T	C	rs216196	-0.1282227654	0.0649825446085986	0.1464113226	0.0647463857556962	0.0308323031213212	0.2121402478527727	-0.0043794927506217	0.0790305130792478	0.0049035604945073	0.0788160991931953	0.7274463066213585	0.0125954946822031	-0.0963745669015252	0.0099433408145912	0.1104484062002336	0.010039500251094	0.0225351950434177	0.0178838874200691	-0.0033160137763951	0.0165867465265997	0.0037215239659839	0.0164692091922792	-0.0245661640988419	0.0688174685391519	0.0276261093332453	0.0682384268006445	SRR	3735	SMG6	4136	TSR1	37008	False	False	False	ref	80	0.09375	70	0.05457
1561	chr17	2302629	T	C	rs2224770	-0.0192831686	0.6206352152158501	0.0192831686	0.6141743410899114	0.0132727284677237	0.763172868998119	-0.0002498706918975	0.6933623195418528	0.0002498706918975	0.686570382801077	0.1467016924548843	0.2310470587731639	-0.0028984867591875	0.322887528269316	0.0028984867591875	0.3180855395704627	0.0018600462585342	0.3235030360563107	-3.624081446712384e-05	0.3932383504149147	3.624081446712384e-05	0.3877560010527757	-0.0049709676355118	0.3455965113404127	0.0049709676355118	0.3405041689716478	SRR	755	SMG6	1156	TSR1	34028	False	False	False	ref	-10	0.003326	100	0.10364
1562	chr17	2312964	T	C	rs391300	0.1356621772	0.0687026505746475	0.1356621772	0.0694829769278861	0.0338835802528334	0.1680647488808896	0.004923447910528	0.0716364630248635	0.004923447910528	0.0722948506115518	0.0081900960047506	0.7571139512309751	0.00130627680343	0.4638180410042836	0.00130627680343	0.4691848049592806	0.0002911522065021	0.6612584912274136	4.95427398233145e-05	0.3846103874051644	4.95427398233145e-05	0.3896258737483541	0.0035704859621918	0.4194991647631862	0.0035704859621918	0.4248428509544082	SMG6	9179	SRR	9580	TSR1	23693	False	False	False	alt	65	0.001701	5	0.001099
1563	chr17	4273906	T	C	rs28756069	-0.00723890784	0.7994542632507304	0.00906536456	0.7995606588251986	0.0129895858957315	0.7858328908343789	-0.000104158157899	0.8312768075676459	0.0001270064964203	0.8315407134477371	0.0036207977301969	0.868031496146044	-1.7705708716485875e-05	0.9215248624532216	2.3399718586924604e-05	0.9227050529359334	4.589750907714163e-05	0.8965589936359842	-2.2779618715095265e-07	0.9314962339641306	3.009323119192288e-07	0.932784664408636	-7.010656197419046e-05	0.9151970397649386	9.979875292796956e-05	0.9163746673444026	ANKFY1	9911	UBE2G1	92769	CYB5D2	130737	False	False	False	ref	50	0.02628	35	0.2224
1564	chr17	4281346	C	A	rs9913489	-0.1313879195999999	0.0819871418588665	0.1313879195999999	0.0807703372598274	0.0315711339463121	0.2068001280207076	-0.0053797133324152	0.0903935045108381	0.0053797133324152	0.0892850049484376	0.00370657517073	0.8650196147251521	-0.0007093728733549	0.6017154088051357	0.0007093728733549	0.5957888918903631	0.0001403491079715	0.790142934645693	-3.341657999778885e-05	0.519239498956555	3.341657999778885e-05	0.5137720239677315	-0.001854112368447	0.5815655282954486	0.001854112368447	0.5758527845844462	ANKFY1	17351	UBE2G1	85329	CYB5D2	138177	False	False	False	ref	-30	0.011475	-100	0.1327
1565	chr17	4282032	T	C	rs11868068	0.0422547592	0.3380060176323452	0.0422547592	0.3427127573174019	0.0157713955778577	0.6551368672796125	0.0006933788948822	0.4213470724034507	0.0006933788948822	0.4267045972802589	0.0040109201280062	0.8572859698386079	0.0001746688487855	0.7354091664193436	0.0001746688487855	0.7419607628873681	6.45627694431342e-05	0.8666587278744885	2.988152877723618e-06	0.7452754632024801	2.988152877723618e-06	0.7517923796235558	0.0006837451750189	0.7148766145571191	0.0006837451750189	0.7214945073724517	ANKFY1	18037	UBE2G1	84643	CYB5D2	138863	False	False	False	alt	75	0.01898	10	0.05017
1566	chr17	4302040	C	A	rs1866175	0.0497403979	0.2807695548820276	0.0536651149	0.2833833111627687	0.0169821694104818	0.6059212303201651	0.0008590377657381	0.3710780437373365	0.0009227480939075	0.3741746192179973	0.2282158292369106	0.1534014918002621	0.0136452258333137	0.136216529035304	0.0143785125477606	0.1379957320001589	0.0039276508489398	0.2004970820009735	0.0002369629814523	0.1801717458063194	0.0002488664988554	0.1822310959213305	0.0160469796443535	0.1304190224880568	0.0172973507967403	0.1321119115764563	ANKFY1	38045	UBE2G1	64635	SPNS3	131901	False	False	False	alt	55	0.03586	100	0.1389
1567	chr17	4309599	A	G	rs9303185	0.0023421717999999	0.4982658824786593	0.0269212798	0.4986387634297747	0.051184412236177	0.0525844117444732	-1.4946205077779988e-05	0.2414780915600257	0.0014138101029437	0.2419297070796751	0.0185386493352248	0.6250858553719985	-2.767038856218001e-05	0.5770480307666808	0.0005136297872163	0.5776883536927785	0.00096559689061	0.449808561469514	-3.752302630059803e-06	0.4349331787167619	2.7379280091196537e-05	0.4351563955095108	-0.0001583583517534	0.5436456804906299	0.0017386427369601	0.5442103900819043	ANKFY1	45604	UBE2G1	57076	SPNS3	124342	False	False	False	alt	10	0.003174	5	0.00891
1568	chr17	4321545	C	T	rs4456561	-0.0804448436	0.1608808180214223	0.0804448436	0.1585547649015877	0.0958463634886122	0.0051524158741198	-0.0078693329566778	0.0328423262547778	0.0078693329566778	0.0325497245071595	0.0109638415096829	0.7163417741619116	-0.0007725329980372	0.5162492878481753	0.0007725329980372	0.5105522156123338	0.0010787047099103	0.4356101122456358	-7.652993213773244e-05	0.2919716485858145	7.652993213773244e-05	0.2874603592027048	-0.0026005410577017	0.4699106592041265	0.0026005410577017	0.4641011563609515	UBE2G1	45130	ANKFY1	57550	SPNS3	112396	False	True	False	ref	-85	0.0429	-95	0.327
1569	chr17	4322762	T	G	rs34499321	0.102504806	0.0976665824893061	0.102504806	0.0990765556639396	0.080845326779777	0.0103435458949944	0.0082090225107383	0.0270157645075473	0.0082090225107383	0.0271212162485433	0.0313623766949292	0.5314133279433398	0.0030060193436796	0.3027578232453776	0.0030060193436796	0.307285607534354	0.0026109500111309	0.2732642646738959	0.0002510055481655	0.1497224366239485	0.0002510055481655	0.1523490491611427	0.0082041173171455	0.2339453568183186	0.0082041173171455	0.2379156198424554	UBE2G1	43913	ANKFY1	58767	SPNS3	111179	False	True	False	alt	90	0.08624	95	0.189
1570	chr17	4323051	T	C	rs35513053	0.0447074985999999	0.280360988174117	0.0503001798	0.2833756577610935	0.0224969682640757	0.3986972297097768	0.0009632011793622	0.3022097226638104	0.0010871540332229	0.3051239539374125	0.0350334861931311	0.5156812180278069	0.0012952253912185	0.4141703639809788	0.0015921710920291	0.4179795433376786	0.0008197501307495	0.4890163899378328	2.990518170123415e-05	0.3995384385728022	3.6486509410051904e-05	0.4032693822376261	0.0037494638909966	0.3626472000831537	0.0044950677971692	0.3663736457761896	UBE2G1	43624	ANKFY1	59056	SPNS3	110890	False	False	False	alt	-70	0.02335	-70	0.1826
1571	chr17	4366050	A	C	rs76655185	-0.0442239398999999	0.3378860124726008	0.0465221365	0.3347222139928649	0.0232685899759441	0.3767627756117315	-0.0011393733887399	0.3316413546692116	0.0011890300754814	0.3287674412967415	0.9088870377090824	0.0014024567710696	-0.0404703965195369	0.0425631974400834	0.042529540404754	0.0420340166219401	0.0211833113189589	0.0205599781991469	-0.0010443561576742	0.0607158551927339	0.0010888476790893	0.0599494814108145	-0.0027358054831579	0.4621849987513546	0.0029255055920292	0.4584508667351044	UBE2G1	625	SPNS3	67891	ANKFY1	102055	True	False	False	ref	70	0.0481	10	0.05884
1572	chr17	4382134	A	G	rs9891529	-0.0319996926	0.2796925226045778	0.0563484029999999	0.2784712579637404	0.0236937155862205	0.3643738471552669	-0.0009368064239985	0.2830351407812751	0.0014357216868586	0.2821046191213338	0.0956352479297944	0.311312528675201	-0.0038286373092344	0.2461498659293284	0.0058028002010764	0.2450202871081922	0.0023472633813382	0.2884367351937558	-0.0001100731721372	0.2394429585850954	0.0001516784913867	0.2386321056555577	-0.0066947642769951	0.2022206812750083	0.0112079773019695	0.2012065781909447	UBE2G1	15459	SPNS3	51807	SPNS2	116748	False	False	False	ref	95	0.08136	45	0.0984
1573	chr17	5313674	C	T	rs16954519	-0.07690883468	0.1769737239310103	0.07748015332	0.1752461157435437	0.0165011694652433	0.6154073552674076	-0.0013723032806	0.2896525396261289	0.001380242449248	0.2869336425709149	0.0220060374121605	0.5935660431658123	-0.0017930443404476	0.4381957129905226	0.0018046739003497	0.4345962209244224	0.000382319571677	0.6193568575088005	-3.39551941691375e-05	0.4649123804092708	3.411680107936263e-05	0.4611280182283511	-0.0049924119956451	0.3738300841542846	0.0050353007159116	0.3701364729126351	RABEP1	31408	SCIMP	78814	RPAIN	105968	False	False	False	ref	-55	0.00464	-70	0.07385
1574	chr17	12960072	C	T	rs10445248	-0.3170699879999999	0.0075685091363697	0.3170699879999999	0.0075961354204877	0.0489454078618296	0.0612251285705242	-0.0161671558215006	0.0103585667418208	0.0161671558215006	0.0103579377806576	0.3923352908185147	0.0727374278511356	-0.1223090309284317	0.0060072754325218	0.1223090309284317	0.0059624228972274	0.0189046111758535	0.0255790766536951	-0.0061663108467373	0.0063769633832763	0.0061663108467373	0.0063431805589036	-0.1082717495298736	0.0033373934299017	0.1082717495298736	0.003321514735619	ELAC2	57993	ARHGAP44	170573	MYOCD	294181	False	True	True	ref	-15	0.0169	95	0.239
1575	chr17	12963798	C	T	rs9646399	-0.0885086743	0.1505231790831164	0.0885086743	0.1487622116512363	0.025072559823965	0.3300925966443307	-0.0024593577052139	0.1784011175899149	0.0024593577052139	0.1765339265847176	0.0932079113193229	0.3462810926917293	-0.0115556577796509	0.2017111573097756	0.0115556577796509	0.198577602990732	0.0025474404852034	0.3082472910123424	-0.0003305056924061	0.1995052118742046	0.0003305056924061	0.196496264822161	-0.0194566329055458	0.14088392459568	0.0194566329055458	0.1387321139464641	ELAC2	54267	ARHGAP44	174299	MYOCD	297907	False	False	False	ref	-100	0.0505	-95	0.11084
1576	chr17	13018133	T	C	rs2051975	0.1517920058	0.0522977305996524	0.1517920058	0.0530138712397391	0.0336706587275203	0.1701440469049817	0.0050792103988878	0.0608299591231634	0.0050792103988878	0.0614966045764962	0.995961037247204	1.1486972062998293e-06	0.1511069451452115	0.004615094427445	0.1511069451452115	0.004598734992979	0.0335369203827014	0.0067856052114914	0.0050568811206047	0.0088408401635367	0.0050568811206047	0.0089188331599432	0.0012239780937612	0.619225125624038	0.0012239780937612	0.6254828860891477	ELAC2	68	ARHGAP44	228634	MYOCD	352242	True	False	False	alt	-85	0.1292	25	0.1309
1577	chr17	17831426	G	A	rs1889018	0.1479588832	0.0444567666656975	0.1701308888	0.0445795543113577	0.0453290113784556	0.0775297476455071	0.0079470805243011	0.0370761194417102	0.0087266165594116	0.0371127228822175	0.2075921282702649	0.1714447037470823	0.032173805354086	0.0507997068801657	0.0355472257706785	0.0513381388482966	0.0091756180101093	0.0853393159450109	0.0015900574346726	0.0368954345965277	0.0017086620768791	0.0371632595594748	0.03998713338392	0.0294437187205707	0.0454010095344923	0.0295755990650354	SREBF1	5576	TOM1L2	140996	DRC3	141388	False	False	False	alt	-70	0.02246	-20	0.05933
1578	chr17	17928159	C	A	rs56886154	0.0211145161	0.5779487410634162	0.0211145161	0.5840310953464571	0.0366530403416105	0.1439708952538066	0.0007926213055859	0.4153061852963739	0.0007926213055859	0.4202328845368134	0.3923088977598891	0.072746213286982	0.0081688139077242	0.1940260553170331	0.0081688139077242	0.1974479383849642	0.0130400167014656	0.0494065193001131	0.0002889505569559	0.1554954563288345	0.0002889505569559	0.1583837081335072	0.0072745867836758	0.2873003496068785	0.0072745867836758	0.2913816210792067	TOM1L2	44263	DRC3	44655	SREBF1	91157	False	False	False	alt	100	0.01903	100	0.3276
1579	chr17	19250104	T	C	rs4273100	-0.02089000594	0.4877920585214681	0.02720222066	0.4852876991836698	0.1098659319389435	0.0030209424885701	-0.0026509391615151	0.1489964429349575	0.0033169154115919	0.1490094518709138	0.3861238494276005	0.0740101432441761	-0.0072306967683633	0.1844424072780282	0.0102739961000533	0.1833063384424119	0.0453504343368599	0.0036146559136519	-0.0009515553892014	0.0633751749162849	0.0012779073822903	0.0632480381861431	-0.0077537857543466	0.2521668913671165	0.0096689320708653	0.2505158562911754	EPN2	34488	GRAPL	122568	MAPK7	127618	False	True	True	ref	10	0.008606	-70	0.3794
1580	chr17	19269192	A	G	rs28760541	0.0271895722	0.4333467431394631	0.033089257	0.4367387618503732	0.0308535004267618	0.2112555071778777	0.0008640126015237	0.3306783279791343	0.0010431454241015	0.3332330587507544	0.0376274289861765	0.4886220093679901	0.0009082503430528	0.4531936233913145	0.0011704526124881	0.4562634210195255	0.0011539531568491	0.4106501616791099	2.873955730164848e-05	0.391569751229988	3.670083550477984e-05	0.3945762045965743	0.0024933192570353	0.4200711235483332	0.0033115040744283	0.4231814092629438	EPN2	53576	MAPK7	108530	B9D1	109001	False	False	False	alt	-10	0.001343	100	0.04666
1581	chr17	19299719	A	G	rs16960499	0.0165109432	0.1883885343648983	0.07409207	0.1879187609146779	0.0572380191968154	0.0362581091892742	0.001385324567782	0.0834280223306079	0.0043622473254193	0.082883789065204	0.1775469301573685	0.2013592477059813	-0.0012162952477728	0.1358496199931745	0.0138311647663204	0.1355218359417105	0.0098416153581457	0.0788208471919949	9.817097313939965e-06	0.0772304762467065	0.0007838365397061	0.0770620169603651	0.0016743096565603	0.112469253271355	0.0195160172874533	0.1122811869436318	MAPK7	78003	B9D1	78474	EPN2	84103	False	False	False	alt	40	0.01851	-95	0.09766
1582	chr17	19372886	G	A	rs2048230	-0.0555121084	0.254324607291453	0.0555121084	0.2507776108762202	0.0309983935446874	0.2081246570184449	-0.0017007496854507	0.2196635278636708	0.0017007496854507	0.2169172889626783	0.1827389396588697	0.20284883204905	-0.0119245311515192	0.1615522974684458	0.0119245311515192	0.1587912048412331	0.0055810078982115	0.1575805216455913	-0.0003690221625101	0.1470439155869122	0.0003690221625101	0.1445089493337403	-0.0159009930388307	0.146218357155981	0.0159009930388307	0.1436417480675242	MAPK7	4836	B9D1	5307	MFAP4	14304	False	False	False	ref	100	0.1401	100	0.5024
1583	chr17	19488817	A	G	rs2428582	0.046903814	0.3128017250030807	0.0507867672	0.315102335581078	0.0264617454410612	0.2998009840369178	0.0014846054810036	0.2800175952661909	0.0015446340738001	0.2822357874546117	0.0215944706542179	0.5934125252898392	0.0008993721107462	0.4962919672177035	0.0010001737590431	0.4996805258555389	0.00053188331775	0.548678718615444	2.800611691798376e-05	0.4529193793820786	2.956446203879056e-05	0.4563526255579366	0.0025362079773019	0.4543633795613855	0.0029304542905215	0.4577839941940223	SLC47A1	6569	RNF112	77691	MFAP4	101627	False	False	False	alt	55	0.01404	-80	0.2122
1584	chr17	20014143	C	A	rs9915039	0.0236937514	0.4396790500164788	0.0324171325999999	0.4430423481010606	0.0236508710687785	0.3666645210113788	0.0005524884795063	0.3920669053368958	0.0007741999310533	0.3950278915295834	0.0072036554386196	0.7722208301283852	0.0001796017719006	0.6798844563186809	0.0002465143158646	0.6833645611295516	0.0001712978669521	0.7342509603973955	4.197457915287824e-06	0.6451896316607617	5.89809176058115e-06	0.6485811793221858	0.0006342581900959	0.6495895841940207	0.000936128798126	0.6529577731262796	SPECC1	5277	AKAP10	35800	ULK2	146207	False	False	False	alt	-100	0.0701	-70	0.06903
1585	chr17	20016845	T	C	rs28767032	0.209219478	0.0215814449165905	0.209219478	0.0218063240069434	0.0281621432774515	0.2606437214737689	0.0060141453055624	0.044288718390496	0.0060141453055624	0.0446988055415282	0.3799181815182607	0.078050506828946	0.0782815353460355	0.0142507693260276	0.0782815353460355	0.0144570673268123	0.0102175852757012	0.0739031982569203	0.002141169769223	0.0231633509817767	0.002141169769223	0.0235507832726357	0.0636913991620203	0.0119546198976986	0.0636913991620203	0.012098910669097	SPECC1	7979	AKAP10	38502	ULK2	148909	False	False	False	alt	5	0.010254	-95	0.2432
1586	chr17	20037695	G	T	rs8082671	-0.0187345979999999	0.5344301715712999	0.0250125704	0.5309497578881839	0.0254087741862648	0.319845560125749	-0.0005063268539412	0.4495547749510812	0.0006430876536787	0.4462928096672099	0.0013509946883969	0.9472348169000456	-1.894775471567689e-05	0.899962992975318	2.951080428347233e-05	0.8960805866900894	3.384202020902194e-05	0.9188007795010464	-5.168961004009048e-07	0.8656000354955258	7.470040079794729e-07	0.8619439311919164	-7.835439279466336e-05	0.8975986701210097	0.0001162944145689	0.8936653042561127	SPECC1	28829	AKAP10	59352	ULK2	169759	False	False	False	ref	-100	0.0609	100	0.0906
1587	chr17	20038566	C	A	rs8065337	-0.00972855574	0.6742625567915738	0.01664195694	0.6703506596416495	0.0194873698092914	0.5007158982928623	-0.0002210524232696	0.6631772452767929	0.0003313939414692	0.6594259120267777	0.0035985285869815	0.8699644121313467	-6.784139518603451e-05	0.8655138419171864	7.858977138319793e-05	0.8614420326573712	7.29438409465571e-05	0.855366825954301	-1.4951895551604183e-06	0.8533414018282911	1.6667392910699609e-06	0.8492138231393234	-0.0002400118768763	0.8518447314659602	0.0002829005971429	0.8477764549871022	SPECC1	29700	AKAP10	60223	ULK2	170630	False	False	False	ref	-45	0.0611	-100	0.1351
1588	chr17	20039537	G	A	rs28807825	-0.0223130558	0.5350112266609538	0.0257105613999999	0.5307988730842066	0.0176336520830096	0.5675428804386845	-0.0003539825284805	0.5633583756252631	0.0004301806911287	0.559485997817452	0.0378163043119658	0.493987732130057	-0.0009483099841929	0.4951662089051569	0.0011006238504257	0.4919150370241081	0.0006794676157464	0.513271106911939	-1.5074736459553045e-05	0.5122669889612844	1.849078272224707e-05	0.5089719728595906	-0.0025114644848404	0.4656515731327719	0.0029667447461317	0.4621421244582316	SPECC1	30671	AKAP10	61194	ULK2	171601	False	False	False	ref	-50	0.01886	-95	0.2334
1589	chr17	20043976	A	C	rs9914328	-0.00376204292	0.5992303284816104	0.01890494868	0.5983478792037262	0.0121818619111923	0.8216557200691855	-3.514584732133084e-05	0.7132135992962526	0.0002141139656467	0.7120191377026197	0.061833162878163	0.4068890114193645	-6.653787478913404e-05	0.5129495466692502	0.0010493314356022	0.512299757225939	0.0007849317867799	0.4995651843316468	-6.948976098676572e-07	0.5824467824838566	1.230366416274205e-05	0.5815309210468003	-0.0001113457160766	0.4973633166155079	0.0027588994094552	0.4967205920286235	SPECC1	35110	AKAP10	65633	ULK2	176040	False	False	False	ref	90	0.07513	-90	0.1353
1590	chr17	20044376	G	A	rs7221669	0.18042136	0.0336416876218694	0.18042136	0.0339191322072025	0.0574311326783123	0.0359973672610816	0.0108666430658524	0.0207214742662008	0.0108666430658524	0.0208389827019764	0.1020091715878723	0.2995009273039921	0.0185358966980426	0.0900911281316021	0.0185358966980426	0.091834951724344	0.0059257248983522	0.1382614538856378	0.0011281201409706	0.0480898370478695	0.0011281201409706	0.048899561259702	0.034564184619445	0.0434987874638975	0.034564184619445	0.0442899153892168	SPECC1	35510	AKAP10	66033	ULK2	176440	False	False	False	alt	-100	0.01772	-100	0.1403
1591	chr17	20044649	T	C	rs3909257	0.06519951314	0.2298822112237317	0.06519951314	0.2326803617876245	0.0139714723787034	0.7286083708548292	0.001089889042562	0.3638019574944472	0.001089889042562	0.3677413089075855	0.0456814357823892	0.4596190571306055	0.0035191742553051	0.3399242312368252	0.0035191742553051	0.344664527503475	0.0006618797981604	0.5265778257880159	5.834771554942685e-05	0.395173204420955	5.834771554942685e-05	0.4001392252502229	0.0081356603213354	0.2742925644646747	0.0081356603213354	0.2783555824757067	SPECC1	35783	AKAP10	66306	ULK2	176713	False	False	False	alt	-15	0.007202	85	0.03918
1592	chr17	20078963	G	A	rs4925077	-0.01732669458	0.619415839164992	0.02051812222	0.6189498676032278	0.0104102907649567	0.8949761742851092	-0.0001645938821572	0.7682184985083828	0.0002011151444155	0.7683480889862215	0.0126777407541815	0.6942248484425013	-0.0002771952636381	0.7247476701869684	0.0003085753791548	0.7255750509072165	0.0001280175399217	0.7803935504798795	-2.609835125751695e-06	0.7879159643606093	2.965265491012121e-06	0.7887824010385185	-0.0008717957177262	0.6979935276563478	0.0010153079740027	0.6986755289202884	SPECC1	70097	AKAP10	100620	ULK2	211027	False	False	False	ref	0	0.0	-100	0.1644
1593	chr17	20111810	G	T	rs35602968	-0.373687292	0.0044218276273981	0.373687292	0.0044167327007336	0.1166647390698816	0.0021750720681485	-0.043822490102663	0.0016316461930874	0.043822490102663	0.0016156151113734	0.3732572333476295	0.0791190260585716	-0.1413744743389971	0.0046425087732884	0.1413744743389971	0.0046095846058532	0.0445009501891276	0.0033878825484629	-0.0169784520707131	0.0014963269223868	0.0169784520707131	0.0015196076729702	-0.1206542179406815	0.0023170900725367	0.1206542179406815	0.0023230828122877	SPECC1	102944	AKAP10	133467	ULK2	243874	False	True	True	ref	30	0.05548	-90	0.2627
1594	chr17	20142345	A	G	rs7212500	0.00027081188	0.8274644853413088	0.00710454092	0.8290284964150403	0.0126298013645631	0.7940880451899965	1.7702326366891755e-05	0.8516079497792125	9.309980319507569e-05	0.8532180009470199	0.0531069578700801	0.4264407753442882	0.0001010589715007	0.635843676420315	0.0004114106007183	0.6370837654818821	0.0006891219108294	0.5103292459889662	2.175474871120265e-06	0.6804769109005565	5.562072886523464e-06	0.6818809974576893	0.0002598066708455	0.6473021380091197	0.0011241793408333	0.6484935713076042	SPECC1	133479	AKAP10	164002	ULK2	274409	False	False	False	alt	-95	0.014465	-85	0.1202
1595	chr17	20235578	C	T	rs2703777	0.070033932	0.1894924446776737	0.070033932	0.192384812829031	0.023796856758659	0.361049263133581	0.001724997112348	0.2099958988946824	0.001724997112348	0.2128840877152749	0.2316378542443337	0.1523970250896757	0.0152218539223563	0.1048230076012371	0.0152218539223563	0.1069095886218032	0.0053560747605323	0.1528464091164589	0.0003627887375404	0.1164475433309888	0.0003627887375404	0.1184742153912266	0.0201898650654877	0.0930429142797823	0.0201898650654877	0.0948240169116529	SPECC1	226712	LGALS9B	231961	AKAP10	257235	False	False	False	alt	0	0.0	-35	0.05737
1596	chr17	20268211	C	T	rs2158472	0.0007682071399999	0.4685427569869623	0.03215915514	0.4711507716283704	0.0123667859180768	0.7997378798079174	-0.0001334579239551	0.5828091459742064	0.0004946476824048	0.5857772007367654	0.0717181881165252	0.368644317819734	-0.0007467676386211	0.3945026440006243	0.002473261469015	0.3968720579624389	0.0009396555187513	0.4643613662983191	-2.297837918482485e-05	0.4639163088791691	4.145160849537515e-05	0.4663681205797079	-0.0008792187654647	0.3678939641312733	0.0052340734386855	0.3701653620346219	LGALS9B	199328	SPECC1	259345	AKAP10	289868	False	False	False	alt	50	0.01178	-25	0.02243
1597	chr17	38855676	C	A	rs72625942	0.01307043678	0.6491576932769881	0.0173432940199999	0.6516805248791412	0.0241317779110908	0.3531712048335925	0.0002665910958869	0.6027098178011486	0.0003917852447769	0.6049498858992651	0.1357114578865758	0.247759487389009	0.0029024343543662	0.3799696352469098	0.0032255936448977	0.3820050254547858	0.0030817350005408	0.2381423687207578	6.0170435935101326e-05	0.3707168684322097	6.921062892419912e-05	0.3725868974681112	0.0041494836857906	0.399559029466745	0.0048719936656658	0.4016174710705197	RPL23	12968	LASP1	14184	SPMAP1	14238	False	False	False	alt	20	0.00293	20	0.03528
1598	chr17	38859453	C	T	rs117001874	-0.0106785034	0.7676794402912812	0.0106785034	0.7609523047126889	0.0253346752640971	0.3227401515556867	-0.0002722227641674	0.6768732777777801	0.0002722227641674	0.6703981998530076	0.000118768763815	0.9993737214703584	-1.5253862243254843e-06	0.9945877836414316	1.5253862243254843e-06	0.9920119931508228	2.9526326520174186e-06	0.9978376760716524	-3.870731782588407e-08	0.9902859445445936	3.870731782588407e-08	0.9869395964850164	-1.6495661640988417e-06	0.9984919022277576	1.6495661640988417e-06	0.9966913971860252	RPL23	9191	LASP1	10407	SPMAP1	18015	False	False	False	ref	-55	0.01955	50	0.04773
1599	chr17	38861770	G	A	rs72625945	0.0551187836	0.2494775048006531	0.0551187836	0.2532539419838882	0.0163922360159199	0.6281448618752875	0.0008993802909945	0.3402744183048255	0.0008993802909945	0.3451353468561977	0.2451593480914519	0.1643338173804545	0.0163908698341467	0.1492036732401493	0.0163908698341467	0.1516744052572766	0.0039121205694359	0.2480586351574153	0.0002621674951191	0.2051605830467165	0.0002621674951191	0.2083736643147663	0.011200554254231	0.192016675998728	0.011200554254231	0.1954703149439564	RPL23	6874	LASP1	8090	SPMAP1	20332	False	False	False	alt	-25	0.02002	-50	0.0918
1600	chr17	38871150	G	T	rs76297940	-0.1406238148	0.0649692316175455	0.1406238148	0.064323516177752	0.0745037328005149	0.0143507879166989	-0.0107938706094448	0.0239290234888027	0.0107938706094448	0.0238198020525586	0.7122513279007621	0.014114383997731	-0.0970441448301742	0.011017756456401	0.0970441448301742	0.0109050760754244	0.0529115048285905	0.0018222380681055	-0.0074515070166858	0.0058746644873376	0.0074515070166858	0.0058418747572372	-0.0312535053280986	0.0600638534480851	0.0312535053280986	0.059117885161667	LASP1	1290	RPL23	2506	SPMAP1	29712	False	True	False	ref	-100	0.144	-90	0.09985
1601	chr17	45627990	G	A	rs383241	-0.0101436654	0.7832670648597168	0.0101436654	0.7765677443781843	0.01889482318456	0.5201001343112797	-0.000184420545254	0.7555651576964996	0.000184420545254	0.7489466527485593	0.0134967503546566	0.6809175627779931	-0.0001276282086462	0.7708116774887169	0.0001276282086462	0.7642690719826546	0.0002488429457962	0.6807248715414345	-2.288789020442957e-06	0.7632881377654706	2.288789020442957e-06	0.7567064148111327	-0.0004379598165681	0.7677474780034227	0.0004379598165681	0.761165875979448	LINC02210-CRHR1	7645	PLEKHM1	137232	CRHR1	156288	False	False	False	ref	90	0.139	30	0.012375
1602	chr17	45632761	T	A	rs81632	-0.00441951524	0.8664026413901751	0.00623369176	0.86231910938322	0.0140111332304757	0.7379012587853381	-6.479987098882761e-05	0.8745808768742082	8.887375466946879e-05	0.8705955732748792	0.0193461119725511	0.6173139279960317	-9.396922274237612e-05	0.7710415114653639	0.0001327608546126	0.7669536921101658	0.0002748538292486	0.6684886074452776	-1.397764515827376e-06	0.7937728854194918	1.91252436738343e-06	0.7895862505403075	-0.0003076440896044	0.7721522813172278	0.0004280624195836	0.7680616905498091	LINC02210-CRHR1	12416	PLEKHM1	142003	CRHR1	151517	False	False	False	ref	-25	0.01837	80	0.1741
1603	chr17	45634173	G	C	rs2942169	0.135569986	0.0588228716571263	0.135569986	0.0594904043131791	0.0288209000507433	0.244845844131505	0.0040951986568247	0.0775373485251217	0.0040951986568247	0.0783944184156721	0.019110224011085	0.6562806394678968	0.0028520759771807	0.3600173369370294	0.0028520759771807	0.3649273814054939	0.0005957017111088	0.5825236198146312	9.211281674024437e-05	0.3141711955386411	9.211281674024437e-05	0.3186408086683455	0.007729042261885	0.2831961607202485	0.007729042261885	0.2874484685788128	LINC02210-CRHR1	13828	PLEKHM1	143415	CRHR1	150105	False	False	False	alt	80	0.2079	10	0.03296
1604	chr17	45636559	A	G	rs241041	0.0619557791999999	0.2182640106241464	0.0619557791999999	0.2213813358569431	0.013806258897215	0.7472160987616435	0.0008505045020114	0.3596683824890864	0.0008505045020114	0.3645686458540995	0.0644106100095674	0.4017477680368405	0.0045718512153193	0.2751262451631234	0.0045718512153193	0.2793784528421943	0.00089451122338	0.4744744935893789	6.295200810974325e-05	0.338618124193877	6.295200810974325e-05	0.3434250342573525	0.00961449638745	0.2211807304817852	0.00961449638745	0.2248829475813276	LINC02210-CRHR1	16214	PLEKHM1	145801	CRHR1	147719	False	False	False	alt	-100	0.03772	-100	0.2063
1605	chr17	45638558	A	G	rs117368197	0.0034542965799999	0.9168463421417145	0.0034542965799999	0.9236660450227184	0.017412976371867	0.5807290522881364	6.267829579632793e-05	0.9005003137546039	6.267829579632793e-05	0.9073684984438828	0.0009452014120285	0.965146768101898	2.918178719435738e-06	0.9786315593877564	2.918178719435738e-06	0.985718953132924	1.594058203789308e-05	0.9637151808016592	4.924068313256144e-08	0.9764109648900616	4.924068313256144e-08	0.9835255002649624	1.4846095476889578e-05	0.973181013570908	1.4846095476889578e-05	0.9803120231840704	LINC02210-CRHR1	18213	CRHR1	145720	PLEKHM1	147800	False	False	False	alt	-80	0.02234	100	0.1079
1606	chr17	45639519	A	G	rs413778	0.26447246	0.0119984446776582	0.26447246	0.0120652323510462	0.0532282135209418	0.0469506016403076	0.0146019301555275	0.0118086800364459	0.0146019301555275	0.0118390159031011	0.0174111708620632	0.6400110814110261	0.0046647574291562	0.2521743645615841	0.0046647574291562	0.2561121565024494	0.0009526819949894	0.4592809350344436	0.0002609447285804	0.1556813204482384	0.0002609447285804	0.1583802271792657	0.0108483718781959	0.1915916748644726	0.0108483718781959	0.1949716324514383	LINC02210-CRHR1	19174	CRHR1	144759	PLEKHM1	148761	False	True	False	alt	30	0.006012	-15	0.03256
1607	chr17	45645823	G	A	rs413917	-0.046026551	0.3204089007762239	0.046026551	0.3161638929404902	0.026070294716698	0.3033816044870905	-0.0012686717609178	0.279586995275736	0.0012686717609178	0.2760580225216669	0.0514326482135198	0.4507806171002594	-0.002692795112852	0.363024073808552	0.002692795112852	0.3581647347233203	0.001400610464578	0.4012581500065263	-7.69492490927059e-05	0.3315514498319711	7.69492490927059e-05	0.3269001544377967	-0.0062114413909141	0.3146590712806179	0.0062114413909141	0.310177248480641	LINC02210-CRHR1	25478	CRHR1	138455	PLEKHM1	155065	False	False	False	ref	60	0.03375	95	0.3643
1608	chr17	45646239	T	C	rs393675	-0.0039472332799999	0.7335261407041819	0.01262851948	0.7322575181723268	0.0109987736431314	0.8725417721870129	-3.3459931197204435e-05	0.815827615582166	0.0001404570910951	0.8144887657872184	0.0994523440335191	0.3057108176698964	-0.0005201265615742	0.4979376817457946	0.0011191830003633	0.4970510895879542	0.0010676777519414	0.4258296136848695	-4.978237632010863e-06	0.5792035973234614	1.2200122423932506e-05	0.5783193026886813	-0.0009394279304542	0.5161573225040108	0.0024174392134868	0.5153053438389602	LINC02210-CRHR1	25894	CRHR1	138039	PLEKHM1	155481	False	False	False	ref	60	0.1242	-100	0.3564
1609	chr17	45648396	G	A	rs434598	0.0586996952	0.1782006976683569	0.0759773128	0.1799758293263739	0.0638443217554711	0.0251130779995259	0.0039361895526243	0.0671056678685464	0.0050435920840859	0.0675537677686778	0.4709272211408399	0.0508248567809596	0.0315942830305379	0.046076541946181	0.0377602396348662	0.0467836163689283	0.0305115069820856	0.0090918709467404	0.0021534638971999	0.0234930319058031	0.0025486686094646	0.0237313495940391	0.0175843753092936	0.0807744823401604	0.0237059153442644	0.0817686603812261	LINC02210-CRHR1	28051	CRHR1	135882	PLEKHM1	157638	False	False	False	alt	15	0.02545	100	0.2444
1610	chr17	45648626	G	A	rs434971	-0.0803084794	0.1592767108171809	0.0803084794	0.1570007695063984	0.0308576345224702	0.2109444798066321	-0.002522568859882	0.1432516218710279	0.002522568859882	0.1415017253026755	0.4656453102833954	0.0520834090325317	-0.0390684597254293	0.0426693887031406	0.0390684597254293	0.0419180288708766	0.014193223955454	0.0434925268638079	-0.0012166860620333	0.0462196312005111	0.0012166860620333	0.0455490825097973	-0.0257538517369931	0.071075312121227	0.0257538517369931	0.0697220794147824	LINC02210-CRHR1	28281	CRHR1	135652	PLEKHM1	157868	False	False	False	ref	100	0.1082	100	0.2925
1611	chr17	45650771	G	A	rs422112	-0.092572444	0.1345278882086162	0.092572444	0.13278706130954	0.0241882474526331	0.3499207046282489	-0.0024229211348013	0.1657992499505076	0.0024229211348013	0.1637710786801942	0.2799709676355117	0.1206204782012338	-0.0262973349425098	0.0704786010705038	0.0262973349425098	0.0691830204940497	0.0066498531414757	0.1213769121321399	-0.0006809138421754	0.0843744662850466	0.0006809138421754	0.0829785719110071	-0.0305862558147206	0.0600810879255242	0.0305862558147206	0.0591152034794789	LINC02210-CRHR1	30426	CRHR1	133507	PLEKHM1	160013	False	False	False	ref	-100	0.2008	-100	0.03955
1612	chr17	45656779	T	C	rs241032	0.0768091908	0.1846391590446991	0.0768091908	0.1870722488086732	0.0254743868129983	0.3198074566929091	0.002162939031266	0.1996713817273969	0.002162939031266	0.2021518730294911	0.0109935337006366	0.7237319019588948	0.000621359045337	0.5512272115696047	0.000621359045337	0.5571697022735245	0.0002796803733905	0.6767582640880578	1.7212062248991135e-05	0.5073810428185376	1.7212062248991135e-05	0.5132341244694312	0.001970406783016	0.520675587564568	0.001970406783016	0.5265795907817253	LINC02210-CRHR1	36434	CRHR1	127499	PLEKHM1	166021	False	False	False	alt	30	0.1061	100	0.3267
1613	chr17	45656938	T	C	rs241031	0.0886679486	0.1305663871594482	0.0886679486	0.1324338931085934	0.0252202687556743	0.322227034236758	0.0023542145064731	0.1524286023198306	0.0023542145064731	0.1543713351111185	0.0118529576721322	0.7198018619769747	0.0010872028105619	0.4855997060996411	0.0010872028105619	0.4912648651809598	0.0003044901739501	0.6718183694909696	2.885241859481274e-05	0.4472107187428932	2.885241859481274e-05	0.4529258364213139	0.003389033684141	0.4311882946870974	0.003389033684141	0.4366429572440903	LINC02210-CRHR1	36593	CRHR1	127340	PLEKHM1	166180	False	False	False	alt	35	0.005615	0	0.0
1614	chr17	45660364	T	C	rs241022	-0.039976483	0.3938826509628618	0.039976483	0.3892775653866843	0.0117863044321884	0.7789368754356357	-0.0006436486970675	0.5326023569251294	0.0006436486970675	0.5275259296185248	0.1385239681963643	0.2561128785606439	-0.0054269463023821	0.288071700158748	0.0054269463023821	0.2839687866767513	0.0019383303470048	0.3702190029092105	-0.0001157182082485	0.3679074988343894	0.0001157182082485	0.363640537142034	-0.0086602223615188	0.2705340741677581	0.0086602223615188	0.2668649563432522	LINC02210-CRHR1	40019	CRHR1	123914	PLEKHM1	169606	False	False	False	ref	100	0.05518	35	0.05396
1615	chr17	45661310	C	A	rs241020	0.0005452383059999	0.6732043060068579	0.014768572306	0.6747614515014985	0.0383075641562037	0.1247197868549904	6.557287464616001e-05	0.5182185168419473	0.0004931017773954	0.5196036205334152	0.0437522681534755	0.4743514055863462	0.0001419518411585	0.5728772180502255	0.0006726337855173	0.5748226382888344	0.0017724454242847	0.3543621375076922	6.999575616004788e-06	0.4894777092107223	2.272483861081755e-05	0.4914116823052011	0.0003967206624657	0.5605277436744224	0.0019093728349443	0.5624627608395529	LINC02210-CRHR1	40965	CRHR1	122968	PLEKHM1	170552	False	False	False	alt	90	0.012146	90	0.1157
1616	chr17	45669052	T	A	rs79675109	0.0005098745999999	0.7566203943792978	0.010983337	0.7575428019688384	0.0531277611587717	0.0502272283542565	3.151744616618039e-06	0.5244511991959743	0.000504392574139	0.5251946195709459	0.0172866286166737	0.6357798843419546	-6.670145624811406e-05	0.7371922461740434	0.0001861952368774	0.7379739946040863	0.0009510983790628	0.4619923864599687	-3.089591888612259e-06	0.6115610681464683	8.931059683947671e-06	0.6122674319072932	-0.000216917950579	0.7389957658854924	0.000619412094619	0.7396477082851239	LINC02210-CRHR1	48707	CRHR1	115226	SPPL2C	175830	False	False	False	alt	-15	0.004654	-60	0.084
1617	chr17	45671046	A	G	rs62053950	0.222166115	0.0222408476914772	0.222166115	0.0224688953047216	0.0410057310985631	0.101997187348618	0.0093778583551963	0.0270808997969401	0.0093778583551963	0.0272609634789624	0.216288641087394	0.1690397410349856	0.0502703342250433	0.035245556569032	0.0502703342250433	0.035792980871757	0.008951438897984	0.0937689301649557	0.0021564831122049	0.0311070346530036	0.0021564831122049	0.0314222723518374	0.0592887070700405	0.0180021847664298	0.0592887070700405	0.0182447489815533	LINC02210-CRHR1	50701	CRHR1	113232	SPPL2C	173836	False	False	False	alt	-20	0.005127	-15	0.0683
1618	chr17	45672088	G	A	rs62053953	0.0611315963999999	0.2421067455139913	0.0611315963999999	0.2453637506171737	0.0213430624649866	0.4364096372142482	0.0013029181306178	0.2892495768129074	0.0013029181306178	0.292988433228196	0.4718023159908943	0.0486695067486976	0.02610539175548	0.0712173060196516	0.02610539175548	0.0725010006357796	0.0102926897145594	0.0742683345780731	0.0005703894027267	0.0939924421015477	0.0005703894027267	0.0957620345779903	0.0198434561710269	0.1178032831457711	0.0198434561710269	0.1197800079139923	LINC02210-CRHR1	51743	CRHR1	112190	SPPL2C	172794	False	False	False	alt	85	0.1028	70	0.3257
1619	chr17	45672213	T	C	rs17687534	0.0570186708	0.2159109545298445	0.0665820104	0.2179811797970129	0.0135707065388286	0.7567715870426952	0.0006784681682703	0.3789146128563379	0.0008512246264379	0.3823825877898851	0.5157500577348156	0.0383948555076662	0.0310156005059179	0.0529371820815457	0.035031889166909	0.0535593724756716	0.0067511572819383	0.1198224158362301	0.000362358583705	0.1109628417768362	0.0004349106251685	0.1124258555403525	0.0158622282339744	0.1177289182831156	0.0191399162020388	0.1191505137821296	LINC02210-CRHR1	51868	CRHR1	112065	SPPL2C	172669	False	False	False	alt	-40	0.01016	-55	0.03955
1620	chr17	45672576	A	G	rs1631850	0.194994321	0.0305400498067017	0.194994321	0.0308130426787119	0.0492610888783476	0.0608399914541244	0.0105762681674182	0.0249550210350454	0.0105762681674182	0.025122933268164	0.5535671868298637	0.0312374649580568	0.1056482449676597	0.0091965921571576	0.1056482449676597	0.0092782333676712	0.0269523181920449	0.0126658093709312	0.0057045826594387	0.0088210497829157	0.0057045826594387	0.0088454872964904	0.0567714691036256	0.0201556286582764	0.0567714691036256	0.0203496793993064	LINC02210-CRHR1	52231	CRHR1	111702	SPPL2C	172306	False	False	False	alt	-40	0.04565	-35	0.2944
1621	chr17	45672614	T	C	rs62053955	0.0830524051999999	0.1455557377824358	0.0830524051999999	0.147721394832635	0.0217319792692766	0.4236205985855049	0.0018381505435306	0.1916687586755079	0.0018381505435306	0.1943348546014499	0.4901347695556068	0.0434910901856022	0.0404318333145507	0.0395129861624898	0.0404318333145507	0.0402192718752549	0.0105370600013728	0.0709463766303393	0.0008885470774389	0.0598731793911496	0.0008885470774389	0.0609670662962488	0.0247698855201081	0.0776000214317341	0.0247698855201081	0.0788434792478521	LINC02210-CRHR1	52269	CRHR1	111664	SPPL2C	172268	False	False	False	alt	-80	0.1362	-70	0.6465
1622	chr17	45675200	C	T	rs62055662	0.0109640917399999	0.6911397049994616	0.0146725773399999	0.6950855242837777	0.0336822861062762	0.1706442620165241	0.0003157036328145	0.5233970995833754	0.0004641044042579	0.5268402373184518	0.0155471610966315	0.6678271671565027	7.253038137402578e-05	0.7031859847754973	0.0002102481738127	0.7064734988064483	0.0005542545650636	0.5688106892559355	1.5122522007565662e-06	0.6242795137118542	7.023242216129612e-06	0.6271805544900327	0.0002829005971429	0.6966548055203542	0.0007051895351522	0.7000148396040978	LINC02210-CRHR1	54855	CRHR1	109078	SPPL2C	169682	False	False	False	alt	-65	0.0214	-65	0.12085
1623	chr17	45679467	C	A	rs757500	0.075137723	0.1258940708686206	0.101536089	0.1262643347464746	0.021865368477235	0.4182632045577612	0.0019696908802044	0.1756614475644634	0.0024402714992771	0.1761810198603352	0.1676973705915344	0.2065795365002658	0.0096755929532597	0.1162478574925745	0.0147674707411169	0.1169374101743951	0.0035768717646133	0.2117196720922768	0.0002575425312205	0.1316004093724884	0.0003481552780674	0.1323212371240692	0.0163406024215631	0.0814364879142503	0.0241595460393915	0.0818884887869236	LINC02210-CRHR1	59122	CRHR1	104811	SPPL2C	165415	False	False	False	alt	100	0.2625	100	0.3904
1624	chr17	45679544	T	C	rs62055693	-0.06642632568	0.2224616739442712	0.0681671199199999	0.2205755758213778	0.019630210874882	0.4997241874533711	-0.0015015989969109	0.2832904164576528	0.0015284106575642	0.2811819513966301	0.1630843588136319	0.214836165913563	-0.0100571675801543	0.1762878386570327	0.0104480077936797	0.1741728617779289	0.0031564094230089	0.2377473877652716	-0.0002319241928559	0.1991035896812112	0.0002379439020413	0.1972125599104611	-0.0160816205337995	0.143934876628958	0.0166589686912341	0.1423651192665422	LINC02210-CRHR1	59199	CRHR1	104734	SPPL2C	165338	False	False	False	ref	90	0.2642	90	0.3394
1625	chr17	45682353	A	G	rs17687849	0.380438112	0.0049204444650997	0.380438112	0.0048780051688504	0.0931124983056381	0.0061188362038689	0.0385220787043913	0.0027085020673369	0.0385220787043913	0.0027188543922485	0.1717503546567252	0.2039013273250285	0.0646120865150775	0.020092075114348	0.0646120865150775	0.0204437958012801	0.0163120997676587	0.0361764145060192	0.0066132720975917	0.0070721364381671	0.0066132720975917	0.0070672769201255	0.08551598429613	0.0066286914228791	0.08551598429613	0.0066786197360074	LINC02210-CRHR1	62008	CRHR1	101925	SPPL2C	162529	False	True	True	alt	25	0.03903	85	0.05652
1626	chr17	45683319	T	C	rs62055706	-0.0070968686799999	0.7780276886138349	0.01024976268	0.7738181781237533	0.0170932684724185	0.5960304258503669	-0.0001124993390466	0.7676762385578485	0.0001717047978574	0.7635127507107594	0.0003134175711787	0.9952949746711806	-2.293581531577068e-06	0.987312952697801	3.242747063480704e-06	0.982976733086272	5.347163900715116e-06	0.9937749553162558	-3.65432229991976e-08	0.9852387159557616	5.436677918832448e-08	0.9809341817228728	-9.072613902543642e-06	0.9905622228395988	9.072613902543642e-06	0.9868263992385664	LINC02210-CRHR1	62974	CRHR1	100959	SPPL2C	161563	False	False	False	ref	-15	0.00415	15	0.03021
1627	chr17	45684573	G	C	rs2158474	0.1525194968	0.0570737175430376	0.1525194968	0.0577030882111098	0.0310224061208647	0.2122740432686329	0.0053936391875075	0.071609937945093	0.0053936391875075	0.0722070439151081	0.0278265316221833	0.5748084723842767	0.0062191645815163	0.2770853910961771	0.0062191645815163	0.280959240336864	0.0009717227535926	0.4854923912906019	0.0002331988380688	0.2345184530132849	0.0002331988380688	0.2377610658096624	0.012601860710633	0.2021477680847417	0.012601860710633	0.2053078961431895	LINC02210-CRHR1	64228	CRHR1	99705	SPPL2C	160309	False	False	False	alt	50	0.0008926	65	0.0823
1628	chr17	45684608	C	A	rs62055708	-0.28071314	0.0117212151457169	0.28071314	0.0116996103084019	0.0603384485554695	0.0323782772144628	-0.0178270835992073	0.0102056773518904	0.0178270835992073	0.01016802625991	0.0181097621325591	0.6372340807442523	-0.0058115613077798	0.2478070538292181	0.0058115613077798	0.2441259108308917	0.0010153832697213	0.4454822780715313	-0.0003298876868639	0.1443210565739242	0.0003298876868639	0.1420738210594204	-0.0120195638547061	0.1886451442842179	0.0120195638547061	0.1856426711699806	LINC02210-CRHR1	64263	CRHR1	99670	SPPL2C	160274	False	True	False	ref	-30	0.00609	30	0.05835
1629	chr17	45687430	G	T	rs62055714	-0.03657573192	0.3932795388166056	0.0411426707199999	0.3905267606748382	0.016077017178983	0.6278599278001754	-0.0008493887869398	0.4513488697148505	0.0008958833120284	0.4483230324436323	0.048665500973244	0.4442520391588123	-0.0023249387288854	0.4113237157474704	0.0024985851598839	0.40821710938579	0.0008654460350553	0.4845477377337162	-5.646090448662266e-05	0.4376078967769081	5.822874257063869e-05	0.4342291935318713	-0.0052027316815676	0.3677922524697213	0.0057058493616178	0.3647846018616348	LINC02210-CRHR1	67085	CRHR1	96848	SPPL2C	157452	False	False	False	ref	100	0.0356	75	0.148
1630	chr17	45691267	G	A	rs56323832	0.0079939854	0.4384314986719678	0.0318271234	0.4391749332203882	0.1109109463497338	0.0028476899042894	0.0004106367222053	0.0943590599648725	0.0035825267189211	0.0944595520386515	0.3920639371845204	0.0723818753277721	-2.9348162099220725e-05	0.1330403826039116	0.0121204677316214	0.1332360666406184	0.0450639376596911	0.00350814368845	-0.0002275431370287	0.0395345339813474	0.001429991225856	0.0395617265284778	0.0031284022302134	0.1990259101435148	0.0104293820725149	0.199311852417879	LINC02210-CRHR1	70922	CRHR1	93011	SPPL2C	153615	False	True	True	alt	-80	0.04926	-80	0.355
1631	chr17	45693629	G	A	rs62056864	-0.029480519	0.2598162613429894	0.055505871	0.2576469416413043	0.028986723306514	0.2428800655323774	-0.0007884112302013	0.219678455682715	0.0016575856450247	0.2178978805659811	0.1055491405760284	0.3117846382700629	-0.0014098695658155	0.2383219053107144	0.0065036854481301	0.2360922351123936	0.0031799227997924	0.2533533256726048	-3.132970365113082e-05	0.2110670335950084	0.0002014489957477	0.2089853102527305	-0.0041338128072316	0.2002990479433121	0.0114446900465177	0.1984743188272551	LINC02210-CRHR1	73284	CRHR1	90649	SPPL2C	151253	False	False	False	ref	20	0.004944	-70	0.0757
1632	chr17	45694652	G	T	rs56200760	0.0710237582599999	0.2160795934581457	0.07158459094	0.2179610807046106	0.0177313154250665	0.5622040419781211	0.0016404700074609	0.2938273858103479	0.001646957132078	0.2962293579689832	0.009998845303685	0.7277860333102815	0.0006405327555565	0.58835358344278	0.0006447536639432	0.5924485793367995	0.0001675094318063	0.7402608599804642	1.3210494152529578e-05	0.5870920484814307	1.3259317197076523e-05	0.5913060722963136	0.0019935007093134	0.5510618276884383	0.0020182442017749	0.5553573837351333	LINC02210-CRHR1	74307	CRHR1	89626	SPPL2C	150230	False	False	False	alt	80	0.02238	75	0.1466
1633	chr17	45694743	C	A	rs17688391	0.1020154571999999	0.1112123333148498	0.1020154571999999	0.1125654850701389	0.0300263568364244	0.2243398999352268	0.0032665333241983	0.1139188687270207	0.0032665333241983	0.1152492719153167	0.0220546996140014	0.6003370442309657	0.0027061582990289	0.3576652278183536	0.0027061582990289	0.3623350288356144	0.0006965552094397	0.520255259253041	9.055414327151846e-05	0.3069024532063809	9.055414327151846e-05	0.3110692105821592	0.0071624162845171	0.2872729975360876	0.0071624162845171	0.2914130825368991	LINC02210-CRHR1	74398	CRHR1	89535	SPPL2C	150139	False	False	False	alt	55	0.0199	55	0.05878
1634	chr17	45694885	C	T	rs17688410	0.2148955079999999	0.0234287661735847	0.2148955079999999	0.0235904925569543	0.0657884270218921	0.0222216712673237	0.0148103987386653	0.0130297511463819	0.0148103987386653	0.013150590438103	0.0568118834746461	0.4220282942634432	0.0144470680217568	0.1304490996628784	0.0144470680217568	0.1329524522920171	0.0038870124723407	0.209291992977984	0.0010388838708785	0.0639652836556533	0.0010388838708785	0.0652803177582215	0.0274314605258816	0.0692737072611856	0.0274314605258816	0.0705924516246806	LINC02210-CRHR1	74540	CRHR1	89393	SPPL2C	149997	False	False	False	alt	-75	0.02441	-100	0.1798
1635	chr17	45696577	A	G	rs17688558	0.0608080348	0.2223463841410334	0.0608080348	0.2256229765355807	0.0173675167527412	0.571018044640197	0.0010965808823593	0.3028841831492812	0.0010965808823593	0.3067798114445635	0.0182021378377486	0.6255389206481916	0.0011937917539631	0.4521260144700855	0.0011937917539631	0.4575331003776698	0.0003189068363521	0.6414612435060629	2.1672650068657943e-05	0.4704201674984891	2.1672650068657943e-05	0.4761747438075159	0.0037123486523044	0.3980663900075125	0.0037123486523044	0.4034940579867538	LINC02210-CRHR1	76232	CRHR1	87701	SPPL2C	148305	False	False	False	alt	90	0.02304	-95	0.0385
1636	chr17	45697131	A	T	rs56162163	0.03434556102	0.423500608496805	0.03434556102	0.4280032872886883	0.0766714171449209	0.0125097166182192	0.0025324184202772	0.1797707378255446	0.0025324184202772	0.1815764376058675	0.170345749067995	0.2057154682187059	0.0067748481771757	0.2541219764239698	0.0067748481771757	0.2579807689008748	0.0129378181017833	0.0518282616547293	0.0004955708852129	0.1317717346202131	0.0004955708852129	0.1337254527104499	0.0101514301738642	0.2444791653039245	0.0101514301738642	0.2478712322227911	LINC02210-CRHR1	76786	CRHR1	87147	SPPL2C	147751	False	True	False	alt	-100	0.01758	70	0.3103
1637	chr17	45697479	C	T	rs56391096	0.09223779428	0.1363941026244748	0.09223779428	0.1378513463926381	0.0218091946493469	0.418771897873632	0.0021088958515499	0.1920103569850774	0.0021088958515499	0.1942306090715474	0.1745521427864471	0.2004547193840216	0.0175612898987507	0.117118959049403	0.0175612898987507	0.1191453951639106	0.0037877889951625	0.2054941302110709	0.0003910808886771	0.1364160510074864	0.0003910808886771	0.1387796447252695	0.0258322061297878	0.0825222323176382	0.0258322061297878	0.0838696844182549	LINC02210-CRHR1	77134	CRHR1	86799	SPPL2C	147403	False	False	False	alt	50	0.0824	-100	0.4988
1638	chr17	45697649	T	C	rs62056872	0.00555227734	0.8517845305029909	0.0063411504199999	0.8559271534478667	0.0856395224236881	0.0082115779640787	0.0004136007608248	0.5173426699252582	0.0004931198421599	0.5211881073048353	0.0651331199894427	0.388212633762284	0.0003551046953298	0.6243229079752657	0.0003924324373545	0.6279215959296018	0.0056322876465211	0.1468089278040931	2.721398196358325e-05	0.4169578674003685	3.0976650381149554e-05	0.4204328891821972	0.0008742700669723	0.6551985839255945	0.0009600475075054	0.6590280970136495	LINC02210-CRHR1	77304	CRHR1	86629	SPPL2C	147233	False	True	True	alt	-100	0.04727	90	0.2373
1639	chr17	45698036	T	C	rs12150608	0.0184983545	0.5971435533869305	0.0193003851	0.6017006430759585	0.036970870034931	0.1356153579655184	0.000656706641633	0.4243509026008856	0.0006869811238693	0.4284327879885277	0.0022508330309128	0.9140722546420992	3.986130732286528e-05	0.8749050277569144	4.2431239759406245e-05	0.8793530397614648	8.258568941125569e-05	0.8387470731867156	1.405455009177774e-06	0.8123713051830426	1.50246299595494e-06	0.816823531221605	0.0001814522780508	0.8628380548199028	0.0001880505427072	0.8673674910081509	LINC02210-CRHR1	77691	CRHR1	86242	SPPL2C	146846	False	False	False	alt	-100	0.03217	-100	0.1265
1640	chr17	45698180	A	G	rs12150547	0.0648125555999999	0.2078395217061246	0.0648125555999999	0.2110407194227442	0.01532036605696	0.6784141527987485	0.0009991056880829	0.3194310319112987	0.0009991056880829	0.3239856299501562	0.0015431691465144	0.9386459844249244	0.0001004566990665	0.7901014828414296	0.0001004566990665	0.7968084047645372	2.3363426631005168e-05	0.9453029621646852	1.5384522786736536e-06	0.8017681332116118	1.5384522786736536e-06	0.808453713772529	0.0003414601959684	0.7928845700210018	0.0003414601959684	0.7995421543856868	LINC02210-CRHR1	77835	CRHR1	86098	SPPL2C	146702	False	False	False	alt	-75	0.2341	-80	0.0906
1641	chr17	45700212	C	T	rs62056874	-0.02033408016	0.4824981649436388	0.03094943864	0.4824473970702185	0.0133817392590468	0.75579914464538	-0.0003510801744299	0.5790313684829428	0.0004771336653445	0.5790046015355191	0.0279321038566856	0.5491758665597358	-0.0003887839868881	0.5574550721341707	0.0008113747161714	0.5582938128124034	0.0003711506705173	0.6137298937607261	-7.11323606307669e-06	0.59884655406948	1.215076646247208e-05	0.5995949961518787	-0.0011118075946026	0.5264753272613706	0.0023572300484972	0.5271251218942304	LINC02210-CRHR1	79867	CRHR1	84066	SPPL2C	144670	False	False	False	ref	45	0.02173	45	0.0924
1642	chr17	45703582	T	C	rs17762308	-0.0172760628	0.4203584740294984	0.0358372152	0.4208561454750867	0.0820005804441244	0.0096239400773418	-0.0013694327220181	0.1352511795387523	0.0028896872706913	0.1361119297830166	0.0504544554782091	0.4422947549002569	-0.0016765602297392	0.4057847152483217	0.0022698989266639	0.4062761892601413	0.0041558650195634	0.1955603588284335	-0.0001340029726764	0.2239720875409607	0.0001842235231631	0.2249006595263442	-0.003337897133054	0.3642733014650429	0.0052184025601266	0.3645701233965044	CRHR1	80696	LINC02210-CRHR1	83237	SPPL2C	141300	False	True	True	ref	-55	0.0332	-95	0.1796
1643	chr17	45706437	A	G	rs62056909	0.0172028527	0.5690049540814486	0.0211577344999999	0.5735055148393458	0.0105482730198861	0.8937938420495244	0.0001822984164104	0.6990828443849231	0.00022485012792	0.703776277584966	0.0652535383194219	0.4097572388136924	0.0009819956137298	0.4674388328866237	0.0012216977756799	0.4707781809519707	0.0006903437241234	0.5323621484959108	1.056690318681535e-05	0.5552748770141515	1.3145927732592465e-05	0.5590191953259456	0.0023258882913793	0.4550350138127343	0.0029494243014086	0.4584829960127851	CRHR1	77841	LINC02210-CRHR1	86092	SPPL2C	138445	False	False	False	alt	55	0.03793	55	0.348
1644	chr17	45706856	T	C	rs62056910	-0.0241302296	0.5428766332100411	0.0241302296	0.5368917986097562	0.0221229029283156	0.4116780282439465	-0.0005221390188616	0.5028850949289823	0.0005221390188616	0.4974113761812544	0.181710435155554	0.2050628686587755	-0.0039466559690856	0.2989321466775736	0.0039466559690856	0.29468717895691	0.0041802546138876	0.211502627055876	-8.850123586954088e-05	0.2995714418453927	8.850123586954088e-05	0.2953275113108023	-0.0059681303817095	0.3176425137113881	0.0059681303817095	0.3132197553020849	CRHR1	77422	LINC02210-CRHR1	86511	SPPL2C	138026	False	False	False	ref	-55	0.02516	85	0.1857
1645	chr17	45707582	G	T	rs62056912	0.073309261344	0.2085111982023045	0.073309261344	0.2110159135972462	0.0249880034636572	0.3277880133634832	0.002085201424693	0.2314412857542427	0.002085201424693	0.233940985647241	0.0903310679291346	0.325188834598225	0.0070978489645528	0.2595724843548216	0.0070978489645528	0.263651286848534	0.0022374539841329	0.2961108945211472	0.0001939752030953	0.2492865831183914	0.0001939752030953	0.2528722467868846	0.0136402626109332	0.1969004172159055	0.0136402626109332	0.1996802511453811	CRHR1	76696	LINC02210-CRHR1	87237	SPPL2C	137300	False	False	False	alt	-100	0.02307	60	0.1006
1646	chr17	45707983	T	C	rs61667602	0.248201826	0.0145216038834719	0.248201826	0.0145958423243105	0.0848928870518003	0.0085302069325987	0.0218147261489034	0.0060763074292983	0.0218147261489034	0.0061034046071216	0.111400976543169	0.2819953029435238	0.028472647850171	0.0582312049499334	0.028472647850171	0.059479380303723	0.0096683222795326	0.0792743643904946	0.002568266450721	0.020643997191546	0.002568266450721	0.0209358138004982	0.0475017320444722	0.023201531242715	0.0475017320444722	0.0235629109537149	CRHR1	76295	LINC02210-CRHR1	87638	SPPL2C	136899	False	True	True	alt	-100	0.09796	15	0.05115
1647	chr17	45708572	C	T	rs62056916	0.0180050292	0.4576177305521124	0.029777988	0.4612799579466552	0.0197085004273796	0.4902926394918162	0.0004074782945969	0.4713262237883039	0.0005848112657702	0.474927415628443	0.3424020982481607	0.0907134426697637	0.0063675585867558	0.1626487575784464	0.0095423850962416	0.1645151410271481	0.0069494176579693	0.1181194109726379	0.0001430111541449	0.1881220386799126	0.0001908327273814	0.1901849424743735	0.0064291841245752	0.2084032486501003	0.0103469037643099	0.2103751631801113	CRHR1	75706	LINC02210-CRHR1	88227	SPPL2C	136310	False	False	False	alt	100	0.1394	95	0.502
1648	chr17	45708647	G	T	rs62056917	-0.0388842193999999	0.2880943371470501	0.0515438378	0.285933255055685	0.0202198769150808	0.4731959000953167	-0.000922692815069	0.322343315895929	0.0011297889943943	0.3199873045496937	0.3589554947048926	0.0839615294271468	-0.013052777581799	0.0948708462823823	0.0183481011456001	0.0939682254292952	0.0070423268387372	0.1134599607341414	-0.0002998797224625	0.1210057419241443	0.0003865048683369	0.1199642774599275	-0.0129358978588631	0.1203065714657262	0.017374880406453	0.1192110448336811	CRHR1	75631	LINC02210-CRHR1	88302	SPPL2C	136235	False	False	False	ref	100	0.0503	20	0.187
1649	chr17	45709764	T	C	rs17762535	0.062784707	0.2114419003607049	0.062784707	0.2144909894476421	0.0690127010337584	0.0194669262474995	0.0046237056445482	0.0687584016570492	0.0046237056445482	0.0694230051871978	0.2097192438388703	0.1754632287533032	0.0146628818078042	0.1212741420243246	0.0146628818078042	0.1237672481193382	0.0148033822389019	0.0459073777999992	0.0010681378119198	0.0567382849389851	0.0010681378119198	0.0576826875993081	0.0190005278611724	0.1069855042065059	0.0190005278611724	0.1088771227818467	CRHR1	74514	LINC02210-CRHR1	89419	SPPL2C	135118	False	True	False	alt	95	0.2693	65	0.3599
1650	chr17	45709860	G	A	rs62056920	-0.179668659	0.0319636638296442	0.179668659	0.0317296025990932	0.0333156123630656	0.1768386863754535	-0.0062588930028267	0.0443081903327035	0.0062588930028267	0.0440675504928188	0.2157071690145491	0.1697270837018623	-0.0428534761455642	0.0407231719941253	0.0428534761455642	0.040097971610025	0.0077314122116115	0.1147010347271986	-0.0015706545204303	0.0414414464513009	0.0015706545204303	0.0409120967842486	-0.0521353633994259	0.0211742762308634	0.0521353633994259	0.0209341379222209	CRHR1	74418	LINC02210-CRHR1	89515	SPPL2C	135022	False	False	False	ref	100	0.007812	-35	0.04028
1651	chr17	45714886	C	A	rs55973918	0.0154243196	0.5346354214657552	0.0248428607999999	0.53854904312761	0.028813386122882	0.2477893783652105	0.000317595175304	0.4394549603131381	0.0006675889407553	0.4428667054594686	0.0370904951997623	0.5134487127884451	0.0007618390707893	0.5167469735365817	0.0009602014222157	0.5205176122640658	0.0010099002841688	0.4528012580836733	1.749004949553204e-05	0.4700618382151349	2.486121079077163e-05	0.4736427475194855	0.0019753554815083	0.4902746105839024	0.0025856949622249	0.493885860804257	CRHR1	69392	LINC02210-CRHR1	94541	SPPL2C	129996	False	False	False	alt	-45	0.03476	0	0.0
1652	chr17	45716299	A	G	rs7502937	-0.0601598482	0.2351607456739496	0.0601598482	0.2316438332916329	0.026396665682209	0.2964860544120666	-0.0016255198816234	0.2214819850757419	0.0016255198816234	0.2183445375735748	0.2826086239319059	0.1189926691644164	-0.0179463413401831	0.099362556210775	0.0179463413401831	0.0973959096933891	0.0075362185436898	0.1061859943471137	-0.0004889510016349	0.1022904403416584	0.0004889510016349	0.1004187514799627	-0.0205057569859126	0.0986369422880264	0.0205057569859126	0.096839821903489	CRHR1	67979	LINC02210-CRHR1	95954	SPPL2C	128583	False	False	False	ref	75	0.07996	100	0.4775
1653	chr17	45716920	C	T	rs75310534	-0.0555743514	0.2539636435173059	0.0555743514	0.250493773804329	0.0296483090084227	0.2328305725588363	-0.001703803420746	0.2114304900492219	0.001703803420746	0.2085472241281144	0.2237603510276797	0.1572439032504509	-0.0129871982590506	0.1312270392778229	0.0129871982590506	0.128785061967601	0.0065872910641637	0.1245040057106039	-0.0003979098287999	0.120458275573514	0.0003979098287999	0.1181722355986042	-0.0176462340404473	0.1196500330943608	0.0176462340404473	0.1175431464022702	CRHR1	67358	LINC02210-CRHR1	96575	SPPL2C	127962	False	False	False	ref	-100	0.02133	90	0.2124
1654	chr17	45718207	C	T	rs111415173	0.062705623	0.2221585721055241	0.062705623	0.2254110317613477	0.0158720143213447	0.6391420944889369	0.0010351286324446	0.3287023503934656	0.0010351286324446	0.3331507565348166	0.0007901421926032	0.9755348003516472	4.778405570519022e-05	0.8590407226202954	4.778405570519022e-05	0.8659098225183511	1.3250646616663088e-05	0.9737514298820203	8.295086037589949e-07	0.8603380049025202	8.295086037589949e-07	0.8671789768098539	0.0001864009765431	0.8532080379013219	0.0001864009765431	0.8601070721316169	CRHR1	66071	LINC02210-CRHR1	97862	SPPL2C	126675	False	False	False	alt	100	0.1188	-100	0.1256
1655	chr17	45718268	C	T	rs113991678	-0.008402151794	0.6413604385829655	0.017084804606	0.640977837836619	0.0112498590902391	0.8576963690684256	-0.0001191064057926	0.7325248962699134	0.0002077379820379	0.7326268511417139	0.0007208604137111	0.9778479635097956	-7.860532304939484e-06	0.9451505172427134	1.2628251058749082e-05	0.9464938578773944	8.201979698781597e-06	0.9850927478291538	-1.0459492204582068e-07	0.9544334182209258	1.519148751869782e-07	0.9557786999821554	-3.464088944605768e-05	0.941635283487652	5.608524957934262e-05	0.9420721044326568	CRHR1	66010	LINC02210-CRHR1	97923	SPPL2C	126614	False	False	False	ref	50	0.02063	-95	0.05432
1656	chr17	45721536	C	T	rs55838058	0.0525605762	0.2616440214589178	0.0525605762	0.265658025455124	0.0124031539916346	0.811681874993685	0.0006586006027796	0.4196710915916713	0.0006586006027796	0.4251480745386334	0.0088895120583286	0.7570413746802209	0.0004573649861539	0.5949301583496215	0.0004573649861539	0.6009651862906469	0.0001148042543079	0.8071305584025522	5.959174131785365e-06	0.647313506988712	5.959174131785365e-06	0.6536383141976873	0.0015514169773349	0.5618655981033891	0.0015514169773349	0.5678114992272189	CRHR1	62742	LINC02210-CRHR1	101191	SPPL2C	123346	False	False	False	alt	55	0.1211	-5	0.002075
1657	chr17	45722301	C	A	rs62054378	0.03098755414	0.454981773873759	0.03098755414	0.4603567898070389	0.0178801112528272	0.5641957397435754	0.0005871639418303	0.4861931460384943	0.0005871639418303	0.4917483187200476	0.4514813104153606	0.0534177945591381	0.0145761962129432	0.1273738166535945	0.0145761962129432	0.1296533742638103	0.0079357251728488	0.1006124997388433	0.0002713722495051	0.1644861811901823	0.0002713722495051	0.1671478315674537	0.0096755303355217	0.2222156110415812	0.0096755303355217	0.225864473188854	CRHR1	61977	LINC02210-CRHR1	101956	SPPL2C	122581	True	False	False	alt	35	0.2197	85	0.1465
1658	chr17	45722438	C	A	rs77819001	-0.0477554865999999	0.2618284985373538	0.0630252321999999	0.26071628190497	0.0986396246062264	0.0045069214545701	-0.0048552226443806	0.064076338107238	0.0062426621526266	0.0641596062790824	0.4308361650885818	0.058876062424814	-0.0257529632432279	0.0780090260191917	0.0318433248251774	0.0776220751795165	0.0428982551238348	0.0038146724012113	-0.0025669015473108	0.0261368174390568	0.0031451791176937	0.0261896807256003	-0.013969351060671	0.1265030275195053	0.0186112302464451	0.1258404931759383	CRHR1	61840	LINC02210-CRHR1	102093	SPPL2C	122444	True	True	True	ref	-60	0.03027	-55	0.0625
1659	chr17	45722444	G	C	rs76667867	-0.1833294476999999	0.048470934338289	0.1854381563	0.0484133896597201	0.119862164680964	0.0019493012069586	-0.0239458831197935	0.0121800974149782	0.0241588268864963	0.0120975793298105	0.4257546765200752	0.0603604862996689	-0.1009843190563461	0.0194509268040997	0.1016394772329196	0.0195678797169591	0.0528693985349158	0.0022458573832354	-0.013403118779484	0.0064710275968489	0.0134692786325061	0.0064863771174489	-0.0551194285902807	0.0258210167265894	0.055926066444525	0.0256902244434613	CRHR1	61834	LINC02210-CRHR1	102099	SPPL2C	122438	True	True	True	ref	-65	0.02344	-60	0.05078
1660	chr17	45723819	A	G	rs62054381	0.0106323008	0.6423922412233363	0.01822851348	0.6443677821622559	0.0287294781404176	0.249196374466277	0.0003120837362869	0.5194770093136944	0.0005422173775279	0.521363344045335	0.0013056316188841	0.9528836902909298	7.240992493304735e-06	0.9294187046293008	2.047753408596383e-05	0.9305772941946734	3.73744363706532e-05	0.9157531941244846	2.0157143388138845e-07	0.8932895294377962	6.068261671304715e-07	0.8944044736023645	2.969219095376348e-05	0.924271808480939	8.082874204082754e-05	0.92536562685374	CRHR1	60459	LINC02210-CRHR1	103474	SPPL2C	121063	False	False	False	alt	-95	0.02142	90	0.1255
1661	chr17	45725541	T	C	rs62054383	0.259853184	0.0125070090689192	0.259853184	0.012604896152995	0.0941897337135764	0.0055180653698342	0.0247658533749835	0.0046590656299988	0.0247658533749835	0.0046503829835736	0.0071987067401272	0.7836520314701818	0.0021371358767078	0.3812135448386182	0.0021371358767078	0.3863033756783497	0.0006823311425059	0.521021301216019	0.0002070191625322	0.1919423953367112	0.0002070191625322	0.1952284832342443	0.0048662201840915	0.3535215151316077	0.0048662201840915	0.3585383869140592	CRHR1	58737	LINC02210-CRHR1	105196	SPPL2C	119341	False	True	False	alt	70	0.01979	55	0.1406
1662	chr17	45727253	C	T	rs56380663	-0.0645079562	0.2090805005547117	0.0645079562	0.2060671927415193	0.0466259117219382	0.0704788115065854	-0.0028979067068009	0.1133283157796979	0.0028979067068009	0.1119501334234457	0.0033700636732539	0.8760758268899489	-0.0001958079206307	0.7104083296040103	0.0001958079206307	0.7040267748828334	0.0001607189319454	0.7566562567101669	-8.842316911771983e-06	0.5876843006081199	8.842316911771983e-06	0.5817718368377593	-0.0007274586783675	0.6949251628137467	0.0007274586783675	0.6885589164108429	CRHR1	57025	LINC02210-CRHR1	106908	SPPL2C	117629	False	False	False	ref	-25	0.00116	95	0.1037
1663	chr17	45728224	C	T	rs62054388	-0.0053225688	0.6578109886995567	0.0158763127999999	0.6556992066018914	0.0237719638579778	0.3486700828927825	-0.0002265454963561	0.569757301946478	0.0003947014814651	0.5675411913815207	0.0276261093332453	0.5805522023190697	-5.622002586611269e-05	0.6207477965484446	0.0004848559433938	0.6190234120877799	0.0005661679067311	0.5596835128738038	-5.331963184990871e-06	0.5952492599994276	1.0715905691995623e-05	0.5932495698108072	-0.0003521823760351	0.6084308013911683	0.0014161525518788	0.6067013913451662	CRHR1	56054	LINC02210-CRHR1	107879	SPPL2C	116658	False	False	False	ref	100	0.05884	95	0.1633
1664	chr17	45728649	G	A	rs4401083	-0.0791051696	0.1604161640325599	0.0791051696	0.1581564822710074	0.0194447854401182	0.5058676748307924	-0.0015695441399473	0.2281917526800567	0.0015695441399473	0.2252335065161446	0.0570370492560456	0.4527670459856452	-0.0053580009899844	0.2808291055868593	0.0053580009899844	0.2768320953971337	0.0010729377986079	0.465273324980624	-0.0001036811126709	0.304257939297837	0.0001036811126709	0.3001157487899232	-0.0109184784401702	0.2152228774312059	0.0109184784401702	0.2120935197442398	CRHR1	55629	LINC02210-CRHR1	108304	SPPL2C	116233	False	False	False	ref	-95	0.0338	35	0.062
1665	chr17	45728898	C	T	rs1880752	-0.0252080671999999	0.5233950400583002	0.0252080671999999	0.5175982285122961	0.0155359147052157	0.662461991446886	-0.0003852052982147	0.575573879615265	0.0003852052982147	0.5694936962667199	0.0868867737784962	0.3638093651803142	-0.0025462933517024	0.3831270245798872	0.0025462933517024	0.3781589253030854	0.0012746920463145	0.4258965876221458	-3.696030709234105e-05	0.430164039637075	3.696030709234105e-05	0.4250008410189761	-0.0048431262577941	0.3696590316598064	0.0048431262577941	0.3648175571105403	CRHR1	55380	LINC02210-CRHR1	108553	SPPL2C	115984	False	False	False	ref	-20	0.00409	-90	0.0989
1666	chr17	45729697	C	T	rs2864087	-0.56025161	0.0013502143600486	0.56025161	0.0013338594316331	0.095388596269648	0.0053557319638644	-0.0565323774084049	0.0012366207647632	0.0565323774084049	0.0012143052680074	0.1065553759361287	0.3104493050289698	-0.0615871399879712	0.0263817628700844	0.0615871399879712	0.0259921138207457	0.0100891287145443	0.0834959313166968	-0.0061354288200582	0.0092258986792232	0.0061354288200582	0.0091459839620118	-0.0758767444162184	0.0108101925695839	0.0758767444162184	0.0106442817902384	CRHR1	54581	LINC02210-CRHR1	109352	SPPL2C	115185	False	True	True	ref	-100	0.08264	90	0.153
1667	chr17	45729747	C	T	rs4609899	-0.5020306459999999	0.0020814205732086	0.5020306459999999	0.0020526355617903	0.0793752487846115	0.0112404637182968	-0.0427202886739619	0.0021907137446857	0.0427202886739619	0.0021722089608023	0.1175629309491603	0.2896856016903228	-0.0672220698741133	0.0244722854135082	0.0672220698741133	0.0241791214026039	0.0097666340772663	0.0884535772567551	-0.0058195520609364	0.0110419322408359	0.0058195520609364	0.0109622996615064	-0.0826688330968954	0.0093771962660898	0.0826688330968954	0.0092138708665035	CRHR1	54531	LINC02210-CRHR1	109402	SPPL2C	115135	False	True	True	ref	-75	0.04477	75	0.1321
1668	chr17	45731898	T	G	rs62054393	-0.1110830233999999	0.098973721951466	0.1110830233999999	0.0976879419032555	0.0360908853245181	0.1452359622141255	-0.0043765545276024	0.0854750874824609	0.0043765545276024	0.0846827144090046	0.0125523737257101	0.7339067654872182	-0.002143530261656	0.4638343460565521	0.002143530261656	0.4585745546429138	0.0005273511076348	0.6244181611250114	-9.532841072275325e-05	0.3775842416063487	9.532841072275325e-05	0.3732166495844323	-0.0052604664973111	0.3953039537751581	0.0052604664973111	0.3904576820182929	CRHR1	52380	LINC02210-CRHR1	111553	SPPL2C	112984	False	False	False	ref	40	0.03044	80	0.0735
1669	chr17	45733416	G	C	rs113790915	0.297011604	0.0087820149083053	0.297011604	0.0088334485173845	0.0498485039495179	0.0566574795223957	0.015069048549526	0.0107293608978139	0.015069048549526	0.0107867443232762	0.2344594371680247	0.1485748584591245	0.0699298574551307	0.0159955335238066	0.0699298574551307	0.0162431660115634	0.0117845136116734	0.0585579349626704	0.0035692381903242	0.0124327006418578	0.0035692381903242	0.0125038726480269	0.0879845600607039	0.0056030848479273	0.0879845600607039	0.0056344449793162	CRHR1	50862	SPPL2C	111466	LINC02210-CRHR1	113071	False	True	True	alt	-75	0.1465	-45	0.177
1670	chr17	45733507	A	T	rs75022332	0.255578138	0.0130380788792099	0.255578138	0.0131069315148193	0.0529343768567386	0.0466734762472738	0.0137839018241093	0.0124078839648085	0.0137839018241093	0.0124334169106286	0.1933134835538253	0.1811332414844641	0.049163445643337	0.0274593770041708	0.049163445643337	0.0279768258485596	0.0102440815905	0.0716330617618141	0.0026501821719731	0.0177374746972732	0.0026501821719731	0.0179639998016833	0.0687135033486192	0.0099833454393	0.0687135033486192	0.0100809862034695	CRHR1	50771	SPPL2C	111375	LINC02210-CRHR1	113162	False	True	False	alt	-100	0.03275	5	0.00708
1671	chr17	45733530	C	T	rs77804065	-0.0562520776	0.2518899695354524	0.0562520776	0.2482827084723795	0.012128537489805	0.8165713115639321	-0.000697368565275	0.4223734359429237	0.000697368565275	0.4170315156943759	0.1165542212398138	0.2752161910190943	-0.0071078144612	0.2047656220508343	0.0071078144612	0.2013039727716593	0.0014278516811209	0.3773275599774485	-8.818895784151566e-05	0.2860643375933815	8.818895784151566e-05	0.2817470836481106	-0.0131825080003958	0.1645913188206417	0.0131825080003958	0.1616274982224172	CRHR1	50748	SPPL2C	111352	LINC02210-CRHR1	113185	False	False	False	ref	5	0.001007	-15	0.0166
1672	chr17	45735233	A	G	rs62054398	-0.05167354364	0.290149795600934	0.05243066476	0.2872608576825357	0.0271849499130621	0.2789460432523182	-0.001496702456999	0.2624974729762011	0.0015134833038894	0.2599725749890803	0.012784962554848	0.7906840185611511	-0.0006839361349819	0.6665168325202318	0.0006847822792051	0.662361915282541	0.0002974854937171	0.753131909665653	-1.6130998014398655e-05	0.6274164999381537	1.6149751971325578e-05	0.6232917330662414	-0.0017518392662729	0.6374160756290981	0.0017584375309293	0.6334067391673435	CRHR1	49045	SPPL2C	109649	LINC02210-CRHR1	114888	False	False	False	ref	-15	0.010376	95	0.1621
1673	chr17	45735258	G	A	rs62054399	-0.03288532892	0.4237553365161238	0.03507724188	0.419819924415734	0.0878316061097329	0.0078844251970225	-0.0027274438802229	0.1563333424249531	0.002905698173512	0.1549744158665033	0.0135800534459436	0.7737967636242175	-4.521783175933724e-05	0.7555444153689073	0.0001691190173478	0.7517452295884219	0.0010956574752071	0.5386046176876074	-2.916907759214537e-06	0.5718683926371982	1.2993000589017183e-05	0.5685230658905558	-0.0002919732110454	0.7484527665038125	0.0005905446867473	0.744540956321638	CRHR1	49020	SPPL2C	109624	LINC02210-CRHR1	114913	False	True	False	ref	100	0.0327	95	0.1825
1674	chr17	45737970	A	G	rs56298110	0.252402068	0.0143289540095869	0.252402068	0.0143692457880237	0.0299356436804826	0.2272232505052371	0.0080448986642088	0.0319588660368649	0.0080448986642088	0.0320890735051603	0.1816988881924053	0.192751257617001	0.048022712449176	0.0319029364096577	0.048022712449176	0.0325047385565041	0.0055627671837047	0.1498645862385805	0.0015804430156792	0.0374441033092332	0.0015804430156792	0.0381423371019108	0.0649574411929662	0.0122220878315255	0.0649574411929662	0.0123424025084455	CRHR1	46308	SPPL2C	106912	LINC02210-CRHR1	117625	False	True	False	alt	80	0.0669	100	0.144
1675	chr17	45739239	A	C	rs62054419	-0.167256224	0.0372703753117216	0.167256224	0.0368090352246408	0.0438214097944266	0.085335503909184	-0.0075041892588405	0.0330441313447823	0.0075041892588405	0.0328480852536884	0.2487867440863052	0.1389593334720052	-0.0418491946549729	0.036063793186326	0.0418491946549729	0.0353893660544364	0.0107761789152568	0.0673316934836069	-0.0018390224290111	0.0279600584098153	0.0018390224290111	0.0275520657231038	-0.0521889742997591	0.019198117683325	0.0521889742997591	0.0189261898170583	CRHR1	45039	SPPL2C	105643	LINC02210-CRHR1	118894	False	False	False	ref	75	0.01665	90	0.1111
1676	chr17	45740856	C	A	rs17563827	0.1302556668	0.0775227355608235	0.1302556668	0.078395703582846	0.0225974666353005	0.3928793146617431	0.0031399290316127	0.1291090394409729	0.0031399290316127	0.1306708309242723	0.7595650094025272	0.008901726977201	0.1056824141489844	0.0128950867207747	0.1056824141489844	0.0129691967370449	0.0174030506318998	0.0305913842969064	0.0025563404379752	0.0284664699156041	0.0025563404379752	0.0287894783948173	0.0184512223285275	0.1187106838654787	0.0184512223285275	0.120611588253835	CRHR1	43422	SPPL2C	104026	LINC02210-CRHR1	120511	True	False	False	alt	-100	0.301	-100	1.047
1677	chr17	45742018	G	A	rs62054424	-0.0956594964	0.1207663850247126	0.0956594964	0.1189376260704012	0.0245887993271546	0.3407038890085269	-0.0025246822799606	0.1493661788698818	0.0025246822799606	0.1472260626956183	0.1670499158721255	0.2085073148690243	-0.017901024127988	0.1049679106802894	0.017901024127988	0.102908217789483	0.0043404603912599	0.1893301770137795	-0.0004972856712683	0.1124542490738477	0.0004972856712683	0.1103109016699771	-0.0261208802085051	0.0715919521014509	0.0261208802085051	0.0701825469828955	CRHR1	42260	SPPL2C	102864	LINC02210-CRHR1	121673	False	False	False	ref	-50	0.08563	-90	0.5654
1678	chr17	45743375	A	T	rs62054426	0.02601872642	0.4291915990553731	0.0346646851	0.4308824112042547	0.0206735737793048	0.4575071352836233	0.0004349525264685	0.4727642586540012	0.0006628913677599	0.4744050205416074	0.0214097192438388	0.6421984207963162	0.000858922881242	0.5948848789170594	0.0010428105881804	0.5974292512955893	0.0004926647853919	0.620802411540984	1.782410787025753e-05	0.5846956138434513	2.3035561964457152e-05	0.5871141169256473	0.0023151661113127	0.5482513275402289	0.0029139586288805	0.5507583154289444	CRHR1	40903	SPPL2C	101507	LINC02210-CRHR1	123030	False	False	False	alt	35	0.01834	-100	0.2651
1679	chr17	45744319	C	A	rs74464991	0.005780970586	0.7147152877284692	0.012004870454	0.7175552831769385	0.0658603008507544	0.0229098746217691	0.0003447321073322	0.4102736785601072	0.0007343697485592	0.4117182312973237	0.0330094685097818	0.5370962026226698	0.000317013128745	0.6346644031362758	0.0005333747512736	0.6365877038388236	0.0019874362762113	0.326812422543847	1.6205247761678773e-05	0.4818542405944173	2.9754961778900702e-05	0.4834726583617106	0.0008651974530698	0.6181392484697622	0.0015398700141862	0.6212980224949018	CRHR1	39959	SPPL2C	100563	LINC02210-CRHR1	123974	False	False	False	alt	-100	0.3005	-80	0.3896
1680	chr17	45745032	T	C	rs2004260	0.0285995276799999	0.426525968867085	0.03547586992	0.4278574643544606	0.0432590356377768	0.0874503302445884	0.0012989309664496	0.2854181357323758	0.0015508938456808	0.2862720874174257	0.0531127313516544	0.4467071965264371	0.0021700323268906	0.4265965755510525	0.0023895424906749	0.4287928157651602	0.0023261526149051	0.3056017943960413	9.694623912801004e-05	0.3278863498688348	0.0001049381293185	0.3296836026245656	0.0045998152485896	0.3849675529521415	0.0053206756623007	0.3871191526223874	CRHR1	39246	SPPL2C	99850	LINC02210-CRHR1	124687	False	False	False	alt	-15	0.011154	95	0.2233
1681	chr17	45748112	G	A	rs75715199	-0.11086133824	0.1303636579298843	0.11086133824	0.129241888345414	0.0639178867267721	0.0245375257645188	-0.0072116782004926	0.074654698337706	0.0072116782004926	0.074244411962034	0.3628055821318993	0.0832341573589485	-0.0326563276942429	0.0754758228737544	0.0326563276942429	0.0742879973074116	0.0232525364660898	0.0171788786857097	-0.002144544959967	0.0412476247121187	0.002144544959967	0.040558702900368	-0.0352380323974794	0.0667065257281507	0.0352380323974794	0.0659973617541203	CRHR1	36166	SPPL2C	96770	LINC02210-CRHR1	127767	True	False	False	ref	-10	0.01001	-35	0.1206
1682	chr17	45748359	G	T	rs62054439	-0.0160489007999999	0.4711235539706476	0.0299965248	0.4686722837230518	0.0199255412938694	0.4869142628853828	-0.0003498686336421	0.4666517961533317	0.0006302219411269	0.4645769194856003	0.3143330803998548	0.1042756243632131	-0.0051359310975159	0.1708219936019891	0.008858260649603	0.1694265659867036	0.0061895227548124	0.1329090104170141	-0.0001076669728221	0.1920107563120889	0.0001837975127574	0.1907820329967844	-0.005491405760285	0.2146493429657615	0.0099105935139058	0.2130809237941872	CRHR1	35919	SPPL2C	96523	LINC02210-CRHR1	128014	False	False	False	ref	-10	0.05853	-100	0.346
1683	chr17	45748985	A	G	rs12150363	0.1158167039999999	0.0840845383835676	0.1158167039999999	0.0853206553281627	0.0278652478936316	0.2646598136111424	0.0033728279751839	0.1021692958100126	0.0033728279751839	0.1034516501051162	0.3870542047441522	0.0743282064903878	0.0415349787753514	0.0349186942989523	0.0415349787753514	0.0356690916448086	0.0104281438585713	0.0695195184303522	0.0011740205616431	0.0430433057648179	0.0011740205616431	0.0438545459293899	0.0380728118504832	0.0361706994389991	0.0380728118504832	0.0368055684112423	CRHR1	35293	SPPL2C	95897	LINC02210-CRHR1	128640	False	False	False	alt	5	0.001465	65	0.08887
1684	chr17	45750025	G	C	rs62054440	0.016684471	0.5031323769837146	0.0260387906	0.5070499257713407	0.0297785498111411	0.2305071800138357	0.0004689378749816	0.3820750060645713	0.0007629796377806	0.3855883595585512	0.1187555672858037	0.2780003114559984	0.0015191703625448	0.3062649474365586	0.0031760276884192	0.309283166556229	0.003365658803774	0.2272984050137938	3.558959125695014e-05	0.2683522629569196	8.767090543419014e-05	0.2710146276102609	0.003322226254495	0.3022260335591759	0.0059285407937712	0.3053545049298538	CRHR1	34253	SPPL2C	94857	LINC02210-CRHR1	129680	False	False	False	alt	-95	0.031	-100	0.0508
1685	chr17	45750855	T	A	rs12150604	0.0954942452	0.1134030365918111	0.0954942452	0.1150947090113941	0.0502824679970558	0.0558103739770772	0.0049242497191	0.0600720793503235	0.0049242497191	0.0606455595619446	0.1109374484510573	0.2891728719778493	0.011796064765679	0.1420385963289278	0.011796064765679	0.1447947934233498	0.0056480970066642	0.1497810984096613	0.0006143030069487	0.0875604248292856	0.0006143030069487	0.0892445058068114	0.021146613440665	0.0937813424118303	0.021146613440665	0.0955751598056064	CRHR1	33423	SPPL2C	94027	LINC02210-CRHR1	130510	False	False	False	alt	5	0.0421	-5	0.003174
1686	chr17	45751332	C	T	rs17426064	-0.0936953088	0.1199273516952948	0.0936953088	0.1182705861924906	0.0217364996735227	0.4212989036653131	-0.002093719922501	0.1696439710663293	0.002093719922501	0.1673785027826117	0.4117218171620863	0.0663716659320172	-0.0389441212071342	0.0414800570161212	0.0389441212071342	0.0406868986401976	0.0087877751372785	0.0874767761444993	-0.0008576927769126	0.0619966193363176	0.0008576927769126	0.0608882307848522	-0.0314465045692982	0.0519106335448703	0.0314465045692982	0.0510049621351421	CRHR1	32946	SPPL2C	93550	LINC02210-CRHR1	130987	False	False	False	ref	-100	0.0426	-5	0.001465
1687	chr17	45751987	A	G	rs62054442	0.09239132834	0.1302541906801413	0.09409167806	0.1314118938362472	0.0394400152503465	0.114192803108218	0.0039619268496794	0.0987062849266922	0.0040107445773847	0.0992277180777511	0.6111230246445184	0.0256222503362225	0.0564022359475068	0.0285714947958377	0.0574018316072315	0.0289022238782125	0.0239926850743221	0.015475877202488	0.0023984906352502	0.026908479765046	0.0024271894308095	0.0270580919808759	0.0243154300418989	0.0837261757024107	0.0247921546633235	0.0847460961753598	CRHR1	32291	SPPL2C	92895	LINC02210-CRHR1	131642	False	False	False	alt	-100	0.03647	-90	0.0991
1688	chr17	45754971	A	G	rs35631660	0.0380967098	0.3740709303304514	0.0380967098	0.3791464401804244	0.0260222355975737	0.3034935388127457	0.000987743402394	0.3163383948499478	0.000987743402394	0.3208730370221561	0.2665690673352908	0.1285134120046168	0.0100875855348324	0.1455778433825891	0.0100875855348324	0.1483052595035247	0.0070325771582627	0.115615648952016	0.0002647625322382	0.1415827429656392	0.0002647625322382	0.1440850005832552	0.0122538022500081	0.1631505097025178	0.0122538022500081	0.1662250631461483	CRHR1	29307	SPPL2C	89911	LINC02210-CRHR1	134626	False	False	False	alt	100	0.01581	-25	0.06042
1689	chr17	45755574	A	G	rs62055876	0.0978684829999999	0.1047193840314916	0.0978684829999999	0.1061674410470054	0.0437518992706708	0.0867212365312555	0.0043252399962606	0.0679084274288448	0.0043252399962606	0.068574589328697	0.3025073405694302	0.1090507319222816	0.0298930911864073	0.053547665214976	0.0298930911864073	0.0545486368014132	0.0127914665999914	0.0526401790449519	0.0012824012734602	0.039596456936007	0.0012824012734602	0.0402521894009522	0.0310844247962785	0.0484910838682064	0.0310844247962785	0.0493430616840707	CRHR1	28704	SPPL2C	89308	LINC02210-CRHR1	135229	True	False	False	alt	-75	0.11865	-75	0.5796
1690	chr17	45756615	A	G	rs34579278	0.237279756	0.0169934695013692	0.237279756	0.0171248722972939	0.0243358741486871	0.3499257290796432	0.0062682517241104	0.0474399424731567	0.0062682517241104	0.0478502474770574	0.3717190128996074	0.0804475425265405	0.0948284175481328	0.0119378638683855	0.0948284175481328	0.0121207377177146	0.0093070749601367	0.0875268611795197	0.0025973828913245	0.0241492890896232	0.0025973828913245	0.0245782295805685	0.0754569298274553	0.0091176495440952	0.0754569298274553	0.0092479121817707	CRHR1	27663	SPPL2C	88267	LINC02210-CRHR1	136270	False	True	False	alt	-20	0.00293	100	0.3608
1691	chr17	45756708	C	G	rs34211253	0.1438987152	0.0580585136963104	0.1438987152	0.0587054196899738	0.0657855281524115	0.0224734270598515	0.0102287842965125	0.0251765927380939	0.0102287842965125	0.0252677159160324	0.347147075319191	0.0908679445669453	0.0570680032726995	0.0289065328159611	0.0570680032726995	0.0293474617003685	0.024046681505234	0.0177007104113176	0.0041570433233891	0.0154559571831009	0.0041570433233891	0.0155600426442954	0.0470909900696116	0.0271497294458207	0.0470909900696116	0.0274863562044414	CRHR1	27570	SPPL2C	88174	LINC02210-CRHR1	136363	False	False	False	alt	-95	0.0166	65	0.09375
1692	chr17	45757985	T	C	rs11079717	0.03812023996	0.3838654692639843	0.03812023996	0.3885142085210344	0.0143547464674995	0.7187896644293631	0.0005298075230017	0.505859500545937	0.0005298075230017	0.5117241567401548	0.334080036950282	0.0949326029218511	0.0133299384418209	0.1498960623471195	0.0133299384418209	0.1522979899324842	0.0048940943401804	0.1682465500170688	0.0001881538717874	0.2157538847621498	0.0001881538717874	0.2191078410203897	0.0121119395598957	0.1927373005115864	0.0121119395598957	0.1956589126457865	CRHR1	26293	SPPL2C	86897	MAPT	136543	False	False	False	alt	-95	0.03763	95	0.0644
1693	chr17	45759725	T	C	rs56168907	-0.0232869714	0.5607511883540955	0.0232869714	0.5547650128864174	0.0170461353983584	0.5955297039850683	-0.0004101970137912	0.5788266398470164	0.0004101970137912	0.5728907242137725	0.019877272277391	0.64275727963898	-0.000251817737699	0.6971089668310937	0.000251817737699	0.6905802068247947	0.0003208279984838	0.6668391545148219	-4.350466119659088e-06	0.7027683519537603	4.350466119659088e-06	0.6963384012791166	-0.0008272574312955	0.6911186605554237	0.0008272574312955	0.6846531995833197	CRHR1	24553	SPPL2C	85157	MAPT	134803	False	False	False	ref	100	0.11743	40	0.2299
1694	chr17	45759871	A	G	rs55801356	-0.2156547499999999	0.0220877817496607	0.2156547499999999	0.0219147752839748	0.0502194492640934	0.0552237442011347	-0.0111000040873133	0.0187726900338506	0.0111000040873133	0.0187236393668391	0.0257068391013163	0.6012700131188908	-0.0068340905506118	0.2579933045292914	0.0068340905506118	0.2540977476464888	0.0013423488761438	0.4357532237094799	-0.0003647112523382	0.1711495062754609	0.0003647112523382	0.1686149738321726	-0.0139775988914914	0.1833213914333356	0.0139775988914914	0.1805470743877137	CRHR1	24407	SPPL2C	85011	MAPT	134657	False	False	False	ref	20	0.00958	-100	0.2015
1695	chr17	45763315	C	T	rs62055890	-0.223526526	0.0183777643759543	0.223526526	0.0182391842949535	0.0374976242649176	0.1296255557677317	-0.0085208526147432	0.0261783707909517	0.0085208526147432	0.026057895559019	0.2194195176668535	0.1630071071492169	-0.0487069099537583	0.029835332368819	0.0487069099537583	0.0292966169595365	0.0081052605166208	0.0999076037001489	-0.0018243061339024	0.0284214469558391	0.0018243061339024	0.0280163720415193	-0.0628484708521658	0.0128151344030492	0.0628484708521658	0.012686704810816	CRHR1	20963	SPPL2C	81567	MAPT	131213	False	True	False	ref	85	0.01416	5	0.006836
1696	chr17	45764205	T	A	rs56369036	-0.139911877	0.0566711949712629	0.139911877	0.0561150488691257	0.0353481149598261	0.1514667331438574	-0.0052156780534314	0.0585693108519435	0.0052156780534314	0.0580063027663279	0.0186994820362244	0.6385651687632388	-0.0032210167203168	0.3425173541262415	0.0032210167203168	0.3376569653324476	0.0007299168497599	0.5285884976916267	-0.0001305819822096	0.2720674241081173	0.0001305819822096	0.2679144649713829	-0.0084383557124475	0.2650003860699775	0.0084383557124475	0.2611092907529715	CRHR1	20073	SPPL2C	80677	MAPT	130323	False	False	False	ref	100	0.08673	50	0.134
1697	chr17	45765096	T	C	rs55707339	0.05790593012	0.2675123873767522	0.05790593012	0.270954085627676	0.0295028111206837	0.2360932126374359	0.0018979665134736	0.2328658650523648	0.0018979665134736	0.2354994090614401	0.1474555441918775	0.2337940784892627	0.0069237169988277	0.208560035319527	0.0069237169988277	0.2121255040259761	0.0042793726041293	0.1882550556824111	0.0002240428692247	0.1822773415324429	0.0002240428692247	0.1852947131675988	0.0122933918379465	0.1799777501208961	0.0122933918379465	0.1831673332774024	CRHR1	19182	SPPL2C	79786	MAPT	129432	False	False	False	alt	-100	0.05197	-100	0.209
1698	chr17	45766577	G	A	rs62055894	-0.05155537318	0.2872256683892782	0.05241588282	0.2844319017691202	0.0168159992412506	0.6029609950425412	-0.001020261945741	0.363810906575978	0.0010294174659886	0.3606626385547853	0.0757208604137111	0.3666830194532771	-0.0048949846979935	0.2985274389840336	0.0049290980531083	0.2951945466049472	0.0013759657497589	0.4015148511218931	-9.936290260564668e-05	0.3292154210224708	9.972585671529611e-05	0.3256752204683464	-0.00974728646366	0.2433243032599786	0.0098512091319982	0.2404523696693564	CRHR1	17701	SPPL2C	78305	MAPT	127951	False	False	False	ref	85	0.5	60	0.0773
1699	chr17	45766678	A	G	rs62055895	-0.008904624	0.2736414314504256	0.054552656	0.2714824045925573	0.0202655177834197	0.4710798326352736	-0.0002421653536678	0.3200170041018441	0.0011079865070131	0.3174689290574942	0.085498663851407	0.3436218089944467	0.0009927101218797	0.2605155487268891	0.0059054724696254	0.2583367354657943	0.0017578357750421	0.3484240452080679	1.093628634674861e-05	0.2773989610546554	0.0001199037978767	0.2749891062028876	9.485005443571962e-05	0.2102234340443992	0.0112508660222361	0.2081440385812788	CRHR1	17600	SPPL2C	78204	MAPT	127850	False	False	False	ref	35	0.010254	-40	0.03992
1700	chr17	45767194	T	G	rs55657917	-0.0400180788	0.3799895825263045	0.0400180788	0.3752502054734326	0.0179194703350587	0.564524212092562	-0.0007514783296534	0.4247487572616714	0.0007514783296534	0.4198413628160695	0.0755501303157269	0.3631733690435012	-0.0026726630650374	0.33609254835105	0.0026726630650374	0.3314353947751082	0.0013616366193931	0.3900286143495694	-5.0221786248484e-05	0.3576862211983404	5.0221786248484e-05	0.3527933361824287	-0.0061017452410015	0.3060724379745471	0.0061017452410015	0.3017209302123011	CRHR1	17084	SPPL2C	77688	MAPT	127334	False	False	False	ref	-10	0.000595	100	0.257
1701	chr17	45767493	A	G	rs56109643	-0.0840649008	0.1480289769533161	0.0840649008	0.1457861596360354	0.0314438184275291	0.2024870940640289	-0.0026772371887784	0.131540688652409	0.0026772371887784	0.1299239984295654	0.07303206756623	0.3678262747449706	-0.0058386783880048	0.2217958175743543	0.0058386783880048	0.2179751106521938	0.0022607516560698	0.2934840480114393	-0.0001830937337858	0.1868529164397727	0.0001830937337858	0.1837122732396317	-0.0129746626637194	0.162663320888738	0.0129746626637194	0.1598803586074733	CRHR1	16785	SPPL2C	77389	MAPT	127035	False	False	False	ref	-5	0.001495	-75	0.2388
1702	chr17	45771384	T	C	rs62055935	0.0240054178	0.3203876601010503	0.0457045109999999	0.3225089362311629	0.0252306328079508	0.3246717741202597	0.0006067016841127	0.2955181390746774	0.001152811468694	0.2975998197571396	0.713551186038072	0.0144347002884253	0.0181091108757607	0.0505777399792548	0.0328233454217277	0.05116012909887	0.0180095212950963	0.0281007626078807	0.0004576348036635	0.062879287346825	0.0008279538466605	0.0634461898025571	0.004289696809739	0.2222814413793972	0.0091476691630101	0.2241660822523908	CRHR1	12894	SPPL2C	73498	MAPT	123144	False	False	False	alt	60	0.007812	90	0.3672
1703	chr17	45775255	T	C	rs62055948	0.0581511558	0.2317926799323569	0.0581511558	0.2350429426555026	0.0152804701751637	0.6569037925605836	0.0009239680024753	0.338436365211942	0.0009239680024753	0.3429447414393553	0.6528281811883474	0.0194857651902353	0.039044908936242	0.0386932739292506	0.039044908936242	0.0393311297715971	0.0099912212922002	0.0751877889706115	0.0006220524838714	0.0793040448478624	0.0006220524838714	0.0807775429168334	0.013170136254165	0.1518382109327928	0.013170136254165	0.1546864759739196	CRHR1	9023	SPPL2C	69627	MAPT	119273	True	False	False	alt	-25	0.01294	35	0.2117
1704	chr17	45775743	G	A	rs55787105	-0.190913445	0.0332259879452081	0.190913445	0.032969262891555	0.0306038912118564	0.2157391672148076	-0.0059897151777212	0.0533733018469924	0.0059897151777212	0.0530595002116839	0.7948896440236217	0.0070742165622471	-0.1578386285300151	0.0045235561254865	0.1578386285300151	0.0045762033198222	0.0246131149647879	0.015180835324989	-0.0049680880684473	0.0104434861071509	0.0049680880684473	0.0103749999478352	-0.026421101250371	0.0688949078405402	0.026421101250371	0.0677770633963727	CRHR1	8535	SPPL2C	69139	MAPT	118785	True	False	False	ref	-100	0.08594	-80	0.2627
1705	chr17	45775767	T	C	rs62055950	0.2023647478	0.0331268188698163	0.2023647478	0.0333427335670138	0.0463350972917838	0.0709530949773066	0.0091920788270201	0.032376162459509	0.0091920788270201	0.032626456038249	0.8154506614760318	0.0058060677557765	0.166808651831215	0.0048441793516901	0.166808651831215	0.0048432327076081	0.0376927767526303	0.0049098288507204	0.0075811935006404	0.0064397181292503	0.0075811935006404	0.0064991621927606	0.0280789152452904	0.0690520207184609	0.0280789152452904	0.0699796139106773	CRHR1	8511	SPPL2C	69115	MAPT	118761	True	False	False	alt	-100	0.121	-95	0.294
1706	chr17	45780960	C	T	rs62057067	0.010234047	0.7681236146871873	0.010234047	0.7748641367983184	0.0158498890952603	0.646524491228617	0.0001690390490924	0.7628588969637715	0.0001690390490924	0.7698208369472965	0.0038179208868067	0.857912204887134	3.860701849797619e-05	0.8697031718918419	3.860701849797619e-05	0.8766921837490345	5.93487549992846e-05	0.8691939867118424	6.132951279758922e-07	0.872168208384317	6.132951279758922e-07	0.8791819986002333	0.0001773283626405	0.8581780384758788	0.0001773283626405	0.8651988370027158	CRHR1	3318	SPPL2C	63922	MAPT	113568	False	False	False	alt	-45	0.04675	95	0.2034
1707	chr17	45815893	G	A	rs117365970	-0.2231626353999999	0.023207126508482	0.2293515245999999	0.0231252694245574	0.0452523826842945	0.0798548795357708	-0.0116195630161181	0.0264052935385048	0.0118239692923399	0.0264490847623045	0.2052951073867572	0.1710411923569511	-0.0490588232308075	0.0353316887159385	0.0499697707170871	0.0349382020969605	0.0092948462168234	0.0834302048111683	-0.0024818349259049	0.0280784787198705	0.0025119216469422	0.02790296021414	-0.063937184520471	0.0155590231878491	0.0653607601200883	0.0155413548992283	SPPL2C	28989	CRHR1	31615	MAPT	78635	False	False	False	ref	-70	0.02655	-30	0.03638
1708	chr17	45815894	T	C	rs117646503	-0.1885971476	0.0383399012692669	0.1885971476	0.0380592760155291	0.0585948263646876	0.0353897096709166	-0.0127945615335848	0.0253147994394781	0.0127945615335848	0.0252003700529892	0.2039655570584936	0.1722592517994519	-0.0403928800776537	0.0465573440613385	0.0403928800776537	0.0457146517169348	0.0117278947066511	0.0598122880606762	-0.0026510107625376	0.0273477302205842	0.0026510107625376	0.0269670097998768	-0.0534096532611922	0.0236063932205607	0.0534096532611922	0.0234146499102547	SPPL2C	28988	CRHR1	31616	MAPT	78634	False	False	False	ref	-70	0.0296	-30	0.05347
1709	chr17	45816793	C	T	rs28364023	-0.0662347356	0.2149838209785969	0.0662347356	0.2122184042903897	0.0153637273886339	0.6581663181890178	-0.0010874442934941	0.332608904930576	0.0010874442934941	0.3285531632463084	0.156960344429415	0.2205444688085731	-0.0104164638668903	0.1605047496710981	0.0104164638668903	0.1577566355050345	0.0025535801823401	0.2806620466979594	-0.0001840972394074	0.212052466847467	0.0001840972394074	0.2087241128473334	-0.016940219722213	0.1293748211065401	0.016940219722213	0.1273200575584427	SPPL2C	28089	CRHR1	32515	MAPT	77735	False	False	False	ref	-95	0.05182	-55	0.2335
1710	chr17	45817243	A	G	rs56099546	0.0138367206	0.3275729686057166	0.0455250818	0.3285951551568341	0.0222791400031029	0.408926983974251	0.0004244283613419	0.3230187783808145	0.0010987077755384	0.3239086425986151	0.0677847975982316	0.3792526817244271	0.0014096096570502	0.3125662373386936	0.0030372714986324	0.3140059854691301	0.0015227402023765	0.3648854510267476	3.884704744280595e-05	0.3059569208481488	7.407264744382086e-05	0.3072741300111552	0.0029197321104549	0.2721404093446481	0.0070238527267328	0.2735758405186752	SPPL2C	27639	CRHR1	32965	MAPT	77285	False	False	False	alt	80	0.0352	-60	0.02917
1711	chr17	45818287	A	G	rs4277389	0.0743249412	0.166779725279205	0.0743249412	0.1692670541097057	0.0210543216105445	0.4439046763246155	0.0015633553777131	0.2183840524936627	0.0015633553777131	0.221344063117051	0.0348446108673418	0.5173191589281864	0.002671420973559	0.3344444887922794	0.002671420973559	0.3390693310151663	0.0007120844811633	0.5075507223577908	5.393671479449045e-05	0.3374288015590604	5.393671479449045e-05	0.342198296590364	0.0072976807099732	0.2680995689675207	0.0072976807099732	0.2723468527745001	SPPL2C	26595	CRHR1	34009	MAPT	76241	False	False	False	alt	-95	0.021	-100	0.06155
1712	chr17	45818431	T	C	rs4309444	0.0146094563999999	0.54984905943571	0.023225994	0.5516828438977947	0.0134611754291627	0.7561236535484623	0.0002149202316703	0.6284631086775394	0.0003244962852277	0.6302624092243563	0.0642506020916498	0.4011941078181901	0.0009597093829253	0.4350146882333328	0.0015181951917634	0.4368008912716768	0.000913247255668	0.4741533428538151	1.50900058053651e-05	0.4888516508008817	2.228768914275654e-05	0.490588077314334	0.0021526838441489	0.4235922720053642	0.0035185246280227	0.4253117061285407	SPPL2C	26451	CRHR1	34153	MAPT	76097	False	False	False	alt	50	0.01221	-70	0.05524
1713	chr17	45822245	C	T	rs78917479	0.0921866858	0.1382906791042	0.0921866858	0.1400754202771236	0.0346446268226653	0.1591125145433573	0.0033868057283849	0.115482878568493	0.0033868057283849	0.116760934600638	0.0680850186400976	0.383513074967429	0.0080840334515114	0.211431140670615	0.0080840334515114	0.2148666903016962	0.00242478236131	0.287347915588935	0.0003062962321091	0.1705151343596198	0.0003062962321091	0.1730607376667493	0.0154853023654778	0.1503571628876625	0.0154853023654778	0.1527531109990787	SPPL2C	22637	CRHR1	37967	MAPT	72283	False	False	False	alt	10	0.0217	95	0.11365
1714	chr17	45824850	C	T	rs4335809	-0.0721175136	0.1876886153917	0.0721175136	0.1848868857108764	0.0167930297899434	0.6087440640651113	-0.0012917701791351	0.2842610086774736	0.0012917701791351	0.2805915230287641	0.5641870937943321	0.0325040778254204	-0.0407577207573815	0.0398161903922156	0.0407577207573815	0.0390905202448931	0.009435575106004	0.0795562758462089	-0.000725321961893	0.0755055754488063	0.000725321961893	0.074153459568696	-0.0210501138200653	0.0966543508573695	0.0210501138200653	0.0949409149566826	SPPL2C	20032	CRHR1	40572	MAPT	69678	False	False	False	ref	100	0.2476	100	0.867
1715	chr17	45825156	G	A	rs4523962	-0.0821285725999999	0.1562570667313398	0.0821285725999999	0.1541405254225342	0.0212267387932026	0.4426252773574511	-0.0017942031090764	0.2169406321572265	0.0017942031090764	0.2141866357613612	0.6606174326152222	0.0196665201468384	-0.0547110574263976	0.0289011252701708	0.0547110574263976	0.0284291999619577	0.0140506985073416	0.0448716728624113	-0.0011963227138643	0.0516208423427599	0.0011963227138643	0.050747394496007	-0.0190665105077364	0.1115139051817399	0.0190665105077364	0.1096637309073268	SPPL2C	19726	CRHR1	40878	MAPT	69372	False	False	False	ref	-100	0.2058	-100	0.815
1716	chr17	45825372	C	A	rs3885074	-0.0959003306399999	0.1272532478021444	0.09742215736	0.1262391153470229	0.0809318830695281	0.0103880812409877	-0.0084702182982348	0.0397543276948351	0.0085548958751355	0.0397666385038784	0.6017073009798424	0.0268285789299098	-0.0571090685983701	0.0291267691857003	0.0580012985700577	0.0288583941907145	0.0486992337148491	0.002375416941513	-0.005031550613518	0.012068209409956	0.0050811961289778	0.0120629958814506	-0.0262643924647817	0.0784335033692013	0.0267427666523703	0.0775636596087076	SPPL2C	19510	CRHR1	41094	MAPT	69156	False	True	False	ref	95	0.0441	-100	0.04858
1717	chr17	45825932	G	A	rs62057147	-0.1106154628	0.0904120348225267	0.1106154628	0.0894640684567456	0.0327982810327525	0.1831725618066815	-0.003848954475709	0.0887564906810114	0.003848954475709	0.0878444980225687	0.240637887235657	0.1471857613315526	-0.0289277144687552	0.0629779478925708	0.0289277144687552	0.0619037073178578	0.0080923913816487	0.1015353678294872	-0.0010326427856544	0.0592789212633926	0.0010326427856544	0.0583689943971336	-0.0353922668338226	0.0449083760155769	0.0353922668338226	0.0442766352743962	SPPL2C	18950	CRHR1	41654	MAPT	68596	False	False	False	ref	10	0.007202	100	0.06946
1718	chr17	45825970	G	A	rs17763050	-0.0069834654	0.2579628501663858	0.0556136178	0.2584441182070748	0.030793364297935	0.2141760677424009	-0.0001585686483641	0.2125648072066985	0.0018759081664216	0.2131788312501566	0.2254181650225989	0.1590065078768075	-0.0014610960952009	0.1344869442521296	0.0140030038897295	0.1349401404284626	0.0070404647875589	0.1195989304529934	-3.766564009983881e-05	0.1204954342483191	0.0004773947574069	0.1209800869891536	-0.0020932994622414	0.1234661655081913	0.0181023390848206	0.1239410837035976	SPPL2C	18912	CRHR1	41692	MAPT	68558	False	False	False	ref	-35	0.01172	70	0.1074
1719	chr17	45826182	C	T	rs62057150	-0.0949674705999999	0.125968068521501	0.0949674705999999	0.1242441465159774	0.0228767594411645	0.3891819237213745	-0.0021215509596904	0.1713815804047468	0.0021215509596904	0.1690916407201967	0.2039573092276731	0.176571997174478	-0.0173395641047187	0.0988215216596019	0.0173395641047187	0.0968903310685987	0.0046948907685858	0.1767155261837492	-0.0003971422374361	0.1141477238655885	0.0003971422374361	0.1119380712392911	-0.0251476361716867	0.0734355607476747	0.0251476361716867	0.0720870038503999	SPPL2C	18700	CRHR1	41904	MAPT	68346	False	False	False	ref	-100	0.2256	-95	0.3616
1720	chr17	45826476	C	T	rs62057151	-0.0224054556	0.4305966391984457	0.0359855476	0.4275213761918717	0.0357639394389978	0.1468454898990197	-0.0008994603792347	0.2990376482829591	0.0013436777744395	0.2969162494497409	0.1954752400118768	0.1821487916412305	-0.0041691905553302	0.2299461784262768	0.005767352383381	0.2272891108453748	0.0069104249212863	0.1181807926813121	-0.000162188477773	0.1794512152694913	0.0002144658350317	0.1773803000019874	-0.0064984659034673	0.2325303629184677	0.0094214971462504	0.2301684907322619	SPPL2C	18406	CRHR1	42198	MAPT	68052	False	False	False	ref	-100	0.0719	20	0.00415
1721	chr17	45827162	T	C	rs62057153	-0.0180466906799999	0.5281808693480909	0.02626622548	0.5246990147022237	0.0227672605106837	0.3909057464970096	-0.0004636733614786	0.4929375553645301	0.000609612403113	0.4897127120479263	0.4222122331826729	0.0630917914169714	-0.0084370414343743	0.16308828122474	0.0108427556601916	0.1614458466269206	0.0097270416683632	0.0775584449194012	-0.0002107551344467	0.1744914066732442	0.0002534689415748	0.1730128655328699	-0.0059062716505558	0.2576186699229673	0.0085455775131139	0.2554222130004567	SPPL2C	17720	CRHR1	42884	MAPT	67366	False	False	False	ref	90	0.12036	-45	0.1853
1722	chr17	45827307	C	T	rs62057155	0.00042680794	0.8147230585039114	0.0080162369799999	0.8131570069415325	0.0367480455433348	0.1383061786879355	2.9241787711549407e-05	0.6688886274904762	0.0002811665481185	0.6677519224245333	0.4362170499158721	0.0592391048442298	-0.0004861497627463	0.3277014515810565	0.0032028192941977	0.3263673462550422	0.0161528117631648	0.0350306556684633	-1.1637180125755817e-05	0.2642147859810209	0.0001114691715125	0.2633374756624224	0.0001880505427072	0.4921443129338575	0.0027069380752861	0.4908928461866505	SPPL2C	17575	CRHR1	43029	MAPT	67221	False	False	False	alt	-60	0.02905	-90	0.1782
1723	chr17	45834077	T	C	rs1876829	0.0732527037199999	0.1848919282983853	0.0732527037199999	0.1874473977778935	0.1156192379783098	0.002298923641099	0.0081827060156549	0.0375677774364309	0.0081827060156549	0.0379189336376828	0.3448071657154168	0.0897979809207768	0.0253335529832397	0.0746237242402223	0.0253335529832397	0.0760241533226505	0.0396970645236053	0.0044317979176815	0.0028498121611627	0.0210332958467133	0.0028498121611627	0.0212871042640008	0.0252325888291379	0.0806328438532616	0.0252325888291379	0.0820710223477952	SPPL2C	10805	CRHR1	49799	MAPT	60451	False	True	True	alt	75	0.0465	70	0.2642
1724	chr17	45835216	C	T	rs878887	-0.1303786144	0.0779842223623521	0.1303786144	0.0772546326718968	0.0498853519523181	0.0570449462921068	-0.0068952272831973	0.0522745767613406	0.0068952272831973	0.0519715176959353	0.1806406914981359	0.2038252744547228	-0.0324502919306957	0.0768173611810361	0.0324502919306957	0.0757923798375136	0.0090360002420805	0.0930394067592076	-0.0016627489700746	0.052633507593836	0.0016627489700746	0.0521671843321752	-0.0392143116360396	0.0490154644462698	0.0392143116360396	0.0484153242553381	SPPL2C	9666	CRHR1	50938	MAPT	59312	False	False	False	ref	10	0.003754	-60	0.1116
1725	chr17	45836191	T	G	rs75104593	-0.1293134676	0.0662203461636079	0.1664223876	0.0659827880512913	0.0732922959714639	0.0148596425582421	-0.010170359143564	0.0316415723445707	0.0127401593613192	0.0314525176136857	0.2144493748144237	0.1656168698912422	-0.0344975592758769	0.0635096764542669	0.0384726185433892	0.0630063663096435	0.0160338888523675	0.03690967021166	-0.0026989359026033	0.0306360516885626	0.002974209568336	0.0304775012948964	-0.0421620863712843	0.0389551116162764	0.0494317244564679	0.0386537014810611	SPPL2C	8691	CRHR1	51913	MAPT	58337	False	True	False	ref	-65	0.03857	85	0.06067
1726	chr17	45836192	T	G	rs74998289	-0.1624768811999999	0.0455626226254954	0.1819206523999999	0.0453435502106953	0.0591603892357761	0.033075707969139	-0.0112405003520025	0.0274659578723331	0.0122319421938599	0.0273032768558179	0.21428689254726	0.1668014144045808	-0.0354724192263595	0.04912896681465	0.0419789878710799	0.0486411666808447	0.0129637118866699	0.0538052569190611	-0.002532805338758	0.0281803717161962	0.00286457659448	0.0279029882908156	-0.0479471149087789	0.0268614223833302	0.0545420804328461	0.0266381244880299	SPPL2C	8690	CRHR1	51914	MAPT	58336	False	False	False	ref	-70	0.04776	80	0.07275
1727	chr17	45837443	C	T	rs62054804	0.0487178056	0.1166566275419257	0.1027607184	0.1161117565339091	0.1032631537930101	0.0037580113715522	0.0038855912114913	0.0261904514691788	0.0100212800010585	0.0259910037621761	0.1549726172016759	0.2235336889012457	0.0124853100836533	0.1089008664478202	0.0190556861111842	0.1085415561418607	0.0158255300605507	0.0370232535615372	0.0010576041719377	0.0369774683095996	0.001820340581382	0.0364449319291698	0.0164305037775065	0.0719820758077348	0.0286752334136121	0.0715327757563026	SPPL2C	7439	CRHR1	53165	MAPT	57085	False	True	True	alt	-10	0.005493	30	0.0663
1728	chr17	45841158	A	G	rs74922289	-0.00648597448	0.7459571508768118	0.01157786368	0.7423991841403473	0.008939947857839	0.9405788096078236	-6.918744579057561e-05	0.8465384039040497	0.0001050709567164	0.8426009053876187	0.2640501798027118	0.1302452959193828	-0.0018186060659987	0.3039524219576711	0.0031834888902187	0.3016854296808053	0.0023365622529784	0.2853174170651398	-1.902785413916172e-05	0.4264638201576147	2.8646442797856124e-05	0.4235653085471136	-0.0020355646464979	0.3904826953321361	0.0038484378608425	0.3879932590494571	SPPL2C	3724	MAPT	53370	CRHR1	56880	False	False	False	ref	85	0.0917	100	0.54
1729	chr17	45841247	T	C	rs56971664	0.1931771272	0.0274513236942469	0.1931771272	0.0277114200440302	0.0277912411978196	0.2690500484941687	0.0056932171195048	0.0531620981480621	0.0056932171195048	0.0537293166781455	0.3359357988848933	0.0935079772253147	0.0659422041330821	0.0186288983473938	0.0659422041330821	0.0190186187017233	0.0092661416413072	0.0827606569373485	0.0019152591748956	0.0281483189730865	0.0019152591748956	0.0286189821136856	0.0644048365279931	0.011991934835547	0.0644048365279931	0.012170304863235	SPPL2C	3635	MAPT	53281	CRHR1	56969	False	False	False	alt	100	0.01503	90	0.4075
1730	chr17	45843844	G	T	rs17763596	0.0550604046	0.266115073590304	0.0550604046	0.2698471332875326	0.0177329745768103	0.5702724492192888	0.001055191815185	0.3324143430092655	0.001055191815185	0.3366926664083582	0.002238461284682	0.9132881613710908	0.0001203645244543	0.7678814063633859	0.0001203645244543	0.7745468582909087	3.876257185900072e-05	0.9130226099758888	2.2772431335469864e-06	0.7652156929473684	2.2772431335469864e-06	0.7719264631676995	0.0004115667579426	0.7649433723915003	0.0004115667579426	0.7715751786920947	SPPL2C	1038	MAPT	50684	CRHR1	59566	False	False	False	alt	-85	0.04074	10	0.02113
1731	chr17	45845900	G	A	rs62054815	-0.0884531772	0.1431691013873177	0.0884531772	0.1411079258507997	0.0495659912781659	0.0577454908542747	-0.0044844942233074	0.0746104566679754	0.0044844942233074	0.0737679062814766	0.1070090066312559	0.3050948848842711	-0.0080030382564737	0.1894289968102901	0.0080030382564737	0.1860000490326988	0.00496373083069	0.1719022131080122	-0.0003759833906471	0.1208489454050109	0.0003759833906471	0.1187463482151225	-0.0148922833294842	0.1432753884159274	0.0148922833294842	0.1406711210440106	SPPL2C	1018	MAPT	48628	CRHR1	61622	False	False	False	ref	0	0.0	45	0.03882
1732	chr17	45846568	T	C	rs11079725	-0.0470601566	0.1944529402807959	0.0674375605999999	0.1925760232413387	0.0309650147199275	0.2106786675868225	-0.0017147608403952	0.1637208946277239	0.0021218981344382	0.1623475336599748	0.0832593777836428	0.3435396802775224	-0.0049458906994176	0.2283088008402776	0.0056695134004117	0.2254351784101755	0.0025405518699568	0.2786675648444223	-0.0001604710994327	0.1957058700167584	0.0001749289663746	0.1933099192178296	-0.0101885454125564	0.1740901468937395	0.0121696743756391	0.1717984301327312	SPPL2C	1686	MAPT	47960	CRHR1	62290	False	False	False	ref	45	0.02563	80	0.321
1733	chr17	45847410	C	T	rs55943825	0.41663341	0.0034877248994981	0.41663341	0.003477366892644	0.0582172676746269	0.0357249766956761	0.0255502412348993	0.0049862944697408	0.0255502412348993	0.00499856036505	0.262284319224044	0.1309677974179701	0.1140912525145407	0.0077768925685	0.1140912525145407	0.0078184130440498	0.0158788174886594	0.0385159988806161	0.0072668112575791	0.0061502853789107	0.0072668112575791	0.0061546371476754	0.1228415426742766	0.0024366892393221	0.1228415426742766	0.0024114952579337	SPPL2C	2528	MAPT	47118	CRHR1	63132	False	True	True	alt	50	0.01491	-50	0.042
1734	chr17	45848600	G	A	rs62054817	0.17650053	0.036364190532664	0.17650053	0.0366914566859384	0.0448369992790533	0.0826692863457335	0.0090379146959218	0.0323482935597351	0.0090379146959218	0.0326734551590357	0.6079014219260335	0.0251640167401149	0.114524746537115	0.0083818045513182	0.114524746537115	0.0084108356903895	0.0280340335728133	0.0119818791663028	0.0060257078865006	0.0094463184183177	0.0060257078865006	0.0094738587925808	0.0439634126224802	0.0269922706451811	0.0439634126224802	0.0274383670390723	SPPL2C	3718	MAPT	45928	CRHR1	64322	False	False	False	alt	100	0.0748	-95	0.0747
1735	chr17	45852626	C	T	rs62054824	0.0301554679999999	0.4461769053549079	0.0301554679999999	0.4516506790487854	0.0567115405860637	0.0378110347804489	0.0017659439193108	0.2158658454242264	0.0017659439193108	0.2186396801026803	0.4728258717957178	0.0502531928451181	0.0140103282176076	0.1207414557658085	0.0140103282176076	0.1231193922668471	0.0267009072897808	0.0121596197811679	0.000813918279376	0.067912243888828	0.000813918279376	0.0691414757629848	0.0101588532216026	0.2109442850881977	0.0101588532216026	0.21455794834995	SPPL2C	7744	MAPT	41902	CRHR1	68348	False	False	False	alt	100	0.2317	15	0.01486
1736	chr17	45852667	G	A	rs62054825	-0.0657161608	0.1723737921734995	0.0778448048	0.1713027448430309	0.0423432270472931	0.0945525028023114	-0.0031642692210244	0.109729186237392	0.003626733404432	0.1093536890019802	0.4710336181584243	0.0507223341386327	-0.031886687426935	0.0463336752410171	0.0372506142114539	0.0459862399954913	0.0200426669004157	0.02321916796072	-0.0015524755700423	0.035994507551028	0.0017570016558395	0.0357971278535334	-0.0214418857840387	0.0757728587373308	0.0256317838408498	0.075254713292716	SPPL2C	7785	MAPT	41861	CRHR1	68389	False	False	False	ref	100	0.756	100	1.145
1737	chr17	45853878	G	C	rs56026128	0.309367986	0.0079807710520277	0.309367986	0.0079822635828865	0.0473986909947904	0.0669779590513027	0.0151541864277193	0.0110290330734395	0.0151541864277193	0.0110448026131504	0.0618851242123321	0.4028370354569505	0.0212351643371745	0.0886772317526952	0.0212351643371745	0.0904830909231966	0.0030458342284987	0.2529812822395892	0.0010830758561363	0.0578289556144574	0.0010830758561363	0.0589833888942764	0.036966777737455	0.0415949610286527	0.036966777737455	0.0423328425780974	SPPL2C	8996	MAPT	40650	CRHR1	69600	False	True	True	alt	65	0.01056	-25	0.07983
1738	chr17	45853879	G	A	rs56329743	0.1609729671999999	0.0430824487712872	0.1609729671999999	0.0436663682537441	0.0409138537925349	0.1036972853836262	0.0065076783628887	0.0409760489197212	0.0065076783628887	0.0412687500244159	0.0429365576853287	0.478388647100456	0.008805745980175	0.1984195214605533	0.008805745980175	0.2018167373829021	0.0016559264464521	0.3572204141598278	0.0003355800157872	0.1493768362729227	0.0003355800157872	0.1520926933719425	0.018192240440764	0.1260398274468988	0.018192240440764	0.1283617473396802	SPPL2C	8997	MAPT	40649	CRHR1	69601	False	False	False	alt	-30	0.00238	-25	0.06885
1739	chr17	45859967	T	G	rs62054844	0.1083020255999999	0.0943455344366895	0.1083020255999999	0.0955844203600713	0.033001071301397	0.1790882938835993	0.0036739653519701	0.0905152727472698	0.0036739653519701	0.0916783117695204	0.0040793771238163	0.8568804372597773	0.0005241907287277	0.604596361176925	0.0005241907287277	0.6110026575004479	0.0001365302669746	0.7825106549125831	1.7940097398430058e-05	0.525912693029558	1.7940097398430058e-05	0.5318883127222492	0.0017782323248985	0.5677433993386928	0.0017782323248985	0.5741554257239627	SPPL2C	15085	MAPT	34561	CRHR1	75689	False	False	False	alt	45	0.01088	-100	0.07526
1740	chr17	45860094	G	A	rs76627340	-0.0796545623999999	0.1566003108560353	0.0796545623999999	0.1545697305784863	0.0268391274588289	0.2878800594146407	-0.002328908145511	0.1626839076162304	0.002328908145511	0.1607513701806097	0.0013914090594173	0.9448540535780507	-0.0001121270098818	0.7925677452174064	0.0001121270098818	0.7859161000183335	3.620524305538875e-05	0.9150602292830152	-3.15332961618146e-06	0.7451103876527007	3.15332961618146e-06	0.7385954826627054	-0.0004165154564349	0.7879985080954853	0.0004165154564349	0.7812259187229242	SPPL2C	15212	MAPT	34434	CRHR1	75816	False	False	False	ref	40	0.02641	75	0.05627
1741	chr17	45861268	A	G	rs62054846	-0.040661749	0.1358044075920959	0.087360633	0.1347240657441344	0.0456168518106716	0.0741251472703063	-0.0018473385174473	0.0790739157949557	0.0040168577883638	0.0785319193523011	0.5054064531028339	0.0420210965166613	-0.0140812746015839	0.0356584142015345	0.04301001637957	0.0352462984135812	0.0232279232392911	0.0172343293534524	-0.0006533644967918	0.0263762349477582	0.0019973251764161	0.0260998000243886	-0.0133268450397545	0.0688845729559119	0.0262099567813664	0.0682359965397787	SPPL2C	16386	MAPT	33260	CRHR1	76990	True	False	False	ref	100	0.09143	90	0.4543
1742	chr17	45862243	A	T	rs56227067	0.0259675504	0.27989852516198	0.0534095136	0.2812785334876364	0.016862523459661	0.6051811756531661	0.0005402824274838	0.3638576792023846	0.0009312691072023	0.3655579171832967	0.2285152254956945	0.1534064276945776	0.0028932675955271	0.143990871867091	0.0113707419525741	0.1446612764311053	0.0037486278742622	0.2047269596823992	7.134210080916082e-05	0.1859158608236177	0.0001920032457352	0.1867252824550739	0.0063895945366368	0.1351829338799472	0.0157508825178977	0.1359040100688943	SPPL2C	17361	MAPT	32285	CRHR1	77965	False	False	False	alt	-10	0.003418	-95	0.4812
1743	chr17	45862272	G	A	rs55719714	-0.390629142	0.0038679196415449	0.390629142	0.0038562998936683	0.06633776038676	0.0219410428958973	-0.026108563386106	0.0041028855070806	0.026108563386106	0.004116668565206	0.1964658044934182	0.1804788096574056	-0.0776418408944247	0.014260260885281	0.0776418408944247	0.0140565568390148	0.0130479453355671	0.0518844262417044	-0.005191326222972	0.0080556933944261	0.005191326222972	0.008003580148383	-0.0989731450628484	0.0042377424709275	0.0989731450628484	0.0042226603292306	SPPL2C	17390	MAPT	32256	CRHR1	77994	False	True	True	ref	-40	0.05322	-95	0.643
1744	chr17	45863319	G	A	rs62054859	0.017696823	0.5163875033155473	0.026095919	0.519817788971179	0.0302959520444814	0.2209613954933727	0.0005891234698523	0.4075876380593057	0.0008120725471948	0.4101769485100036	0.0066790933984361	0.7932277605626695	5.416578317012941e-05	0.7452338453728176	0.000170512010221	0.7485911687634634	0.0001948738105555	0.7219384731592926	1.9839099008676964e-06	0.6850995425729365	5.072252213863367e-06	0.6882469407845606	0.0001657813994919	0.7258904331831294	0.0006474547194087	0.7290986517821387	SPPL2C	18437	MAPT	31209	CRHR1	79041	False	False	False	alt	75	0.1265	60	0.0804
1745	chr17	45866289	A	C	rs62055469	0.0453029672	0.2854114411224799	0.0490271004	0.288532016029856	0.0271439751733825	0.280914808732956	0.0012357064951275	0.2583008104997535	0.0013314658839211	0.260851093579953	0.0563475305994523	0.4189116898950336	0.0021786058821591	0.3390801284744614	0.0024926771946215	0.3426450162892928	0.0014962739650491	0.3675575512304153	5.825536381696012e-05	0.3063857527862242	6.633114282800151e-05	0.3097937258383267	0.0057124476262742	0.2907084257469541	0.0064118636798521	0.2942244562028092	SPPL2C	21407	MAPT	28239	CRHR1	82011	False	False	False	alt	20	0.003418	-20	0.05908
1746	chr17	45866591	G	C	rs56327054	0.0561776454	0.2519243619880355	0.0561776454	0.2554707072472381	0.0174931882565822	0.5838445329473024	0.0010460231497261	0.3242322339357068	0.0010460231497261	0.328344481214444	0.0630587905380884	0.3934856247811451	0.0033988768222804	0.289056323457712	0.0033988768222804	0.2935029306583506	0.0010948378030119	0.4236394890092887	6.21801029379854e-05	0.3168058012346795	6.21801029379854e-05	0.3212515550822031	0.007961631091023	0.2418246878733044	0.007961631091023	0.245863560004811	SPPL2C	21709	MAPT	27937	CRHR1	82313	False	False	False	alt	100	0.02649	-100	0.05438
1747	chr17	45867740	T	C	rs62055475	0.1085919866	0.0786209120209912	0.1241828734	0.0791235164606597	0.0169668131849718	0.5952017696620664	0.002190190585374	0.1736420472670074	0.002359300175058	0.1749537082722868	0.81334911418297	0.0063327397483835	0.0891473805067012	0.0098849342912081	0.1010796605433299	0.0099363074114401	0.0138774956698863	0.0464578318406	0.0018042972374789	0.0318663775313538	0.0019337230366999	0.0320786822391004	0.0147289762792385	0.1212319356151373	0.0174903500379399	0.1224552527703221	SPPL2C	22858	MAPT	26788	CRHR1	83462	False	False	False	alt	95	0.2664	100	0.7666
1748	chr17	45870562	A	G	rs56289364	0.24220302	0.014892189585201	0.24220302	0.0149929675726138	0.0348395095990827	0.158541930308413	0.0086567078482983	0.0260335636623885	0.0086567078482983	0.026179602134997	0.4828544092903566	0.0477600511489353	0.1180945584264444	0.0063717820278534	0.1180945584264444	0.0064628272867019	0.0167404648109333	0.0326570812570564	0.0042075875409873	0.0102965397368981	0.0042075875409873	0.0103817847999129	0.078772557817294	0.0073477452008701	0.078772557817294	0.0074083281208621	MAPT	23966	SPPL2C	25680	CRHR1	86284	False	True	False	alt	20	0.01752	55	0.275
1749	chr17	45873854	T	G	rs34416056	0.1330878444	0.0680421508303818	0.1330878444	0.0688036843220323	0.0544499595285315	0.0434262360341394	0.0075511073352117	0.0384007406100077	0.0075511073352117	0.0385863724797697	0.2460517633862293	0.1415207189047111	0.0332437655650328	0.0517692374537981	0.0332437655650328	0.0526577974403569	0.0135027579436499	0.0484906881467564	0.0018764670548191	0.0307313512329867	0.0018764670548191	0.0311599673233712	0.040638712018739	0.0341931961183437	0.040638712018739	0.0346168945951764	MAPT	20674	SPPL2C	28972	CRHR1	89576	True	False	False	alt	25	0.0327	40	0.07983
1750	chr17	45876163	A	G	rs62055497	0.1320378308	0.0641091250505827	0.1320378308	0.0649433617655582	0.0379967656209266	0.124792638206973	0.0050536066618559	0.0576208203916552	0.0050536066618559	0.0581977797286187	0.0008668470192339	0.9697411148669428	0.0001112528426697	0.791692069743919	0.0001112528426697	0.7984863719169716	3.566456296629126e-05	0.9269195348151804	4.573837796186657e-06	0.7023143499189748	4.573837796186657e-06	0.7088881854586031	0.0003604302068555	0.8040001519871144	0.0003604302068555	0.810924621528336	MAPT	18365	SPPL2C	31281	CRHR1	91885	False	False	False	alt	100	0.0736	-100	0.1292
1751	chr17	45877999	C	A	rs55905252	0.0600992857999999	0.2346720727303986	0.0600992857999999	0.2378500507311992	0.026074493381468	0.301980204544649	0.0015664406144992	0.2258426935884908	0.0015664406144992	0.2289615838826744	0.0736539540100952	0.3685456759816406	0.0037119419912377	0.2726664431968915	0.0037119419912377	0.2768817481799142	0.0019547799757482	0.3263703755436704	9.7168186065482e-05	0.250351648202328	9.7168186065482e-05	0.2543989227183086	0.008830127676421	0.22234342597145	0.008830127676421	0.2262485825098487	MAPT	16529	SPPL2C	33117	CRHR1	93721	False	False	False	alt	-10	0.01282	-60	0.1553
1752	chr17	45879368	C	A	rs55768605	0.0077059283399999	0.803950603831032	0.00836627226	0.8085414612565238	0.0158605684598179	0.6405224550383702	0.0001170270219353	0.8075277371057877	0.0001299654454497	0.8122105143801004	0.0003389858467222	0.994518405929082	2.4724630172082075e-06	0.9787933995842456	2.7066584343469744e-06	0.9850491538866734	5.183845053751499e-06	0.994232952285767	3.5174609709946554e-08	0.9790523042540836	3.976330862385995e-08	0.9850022053669644	7.423047738444794e-06	0.982547295648777	7.423047738444794e-06	0.9887869133475772	MAPT	15160	SPPL2C	34486	CRHR1	95090	False	False	False	alt	-95	0.02014	-5	0.0099
1753	chr17	45881747	A	G	rs55975673	0.2167337888	0.0233696069629618	0.2167337888	0.0235795627356197	0.0357652168861227	0.1470231724430449	0.007942641142349	0.0336157189169953	0.007942641142349	0.0338233054186785	0.0128839365246939	0.7264509207003782	0.0036863397146283	0.3696688034224688	0.0036863397146283	0.3747065328228061	0.000439086633673	0.6331945280867807	0.0001259202132851	0.3078435808760655	0.0001259202132851	0.3124130002466349	0.0077414140081158	0.3131665745005087	0.0077414140081158	0.3173190851141566	MAPT	12781	SPPL2C	36865	CRHR1	97469	False	False	False	alt	100	0.007416	20	0.125
1754	chr17	45883234	T	C	rs56194412	0.093175396	0.1247153382213328	0.093175396	0.1264314226698703	0.0284524212530156	0.2538226221001149	0.002732377337351	0.1303655240259195	0.002732377337351	0.1321934628268022	0.0015522417604169	0.9448204963390868	0.0001739306479635	0.7519564311173808	0.0001739306479635	0.7583865737846291	4.495372399842333e-05	0.9072463891445004	5.206831186413816e-06	0.6955981752076196	5.206831186413816e-06	0.7016847642058588	0.0005534294480551	0.7493856661058897	0.0005534294480551	0.7557705771486719	MAPT	11294	SPPL2C	38352	CRHR1	98956	False	False	False	alt	65	0.02115	70	0.274
1755	chr17	45885616	G	A	rs77426526	-0.205522016	0.025370830452419	0.205522016	0.0251299958727612	0.0294195206936941	0.2389209529307647	-0.006564625315866	0.0466077812603907	0.006564625315866	0.0462025993540677	0.0455717396324766	0.5273305385540202	-0.0121525095642312	0.1981925840194058	0.0121525095642312	0.1952052642383371	0.0015347070939183	0.4420133170148799	-0.0004196044877304	0.1787792942612092	0.0004196044877304	0.1761997617377411	-0.0214501336148592	0.125175371296632	0.0214501336148592	0.1234424252223364	MAPT	8912	SPPL2C	40734	CRHR1	101338	False	False	False	ref	30	0.009766	-15	0.005127
1756	chr17	45885754	C	T	rs74863825	0.19629226	0.0257200721153822	0.19629226	0.0259578062730084	0.0368514057663049	0.137027012964207	0.0074305528404643	0.0334910922233412	0.0074305528404643	0.0336785347555851	0.0590511695424103	0.4707861280850829	0.0144035603781147	0.1651036326675203	0.0144035603781147	0.1677223765524254	0.0023553915784946	0.3524895669947697	0.000585956839175	0.1336840927330642	0.000585956839175	0.1356909302673119	0.0241570716901454	0.1014282988878795	0.0241570716901454	0.1028806930481844	MAPT	8774	SPPL2C	40872	CRHR1	101476	False	False	False	alt	10	0.01465	-20	0.0691
1757	chr17	45888589	A	G	rs62055552	-0.021573219226	0.5500975316592597	0.0256978263739999	0.5478613081687295	0.0150574774204247	0.688609561837406	-0.0002842724912916	0.6384045904039323	0.000364258877287	0.6360821002703828	8.165352512286031e-05	0.9997777833193412	-1.7636753728522678e-06	0.9927766646604506	2.00070421874894e-06	0.9917823874776316	1.1909078292106211e-06	0.9996915426592118	-2.185728296892441e-08	0.9934426459689264	2.646055677348069e-08	0.9922882440583874	-4.123915410247104e-06	0.9955655205292712	4.123915410247104e-06	0.9953226536762816	MAPT	5939	SPPL2C	43707	CRHR1	104311	False	False	False	ref	95	0.0257	-95	0.1832
1758	chr17	45889589	A	G	rs62055558	0.22109359	0.0203545886132397	0.22109359	0.0205066590650584	0.0435665036908644	0.0878953943428218	0.0104508070815496	0.0228910787511402	0.0104508070815496	0.0229963518761344	0.0019192702319289	0.9255922447579232	0.0005392484619949	0.6079636186813479	0.0005392484619949	0.613923529442482	9.544342853476816e-05	0.8372921681026358	2.822145013819628e-05	0.4857181271789724	2.822145013819628e-05	0.491157953328772	0.001285836824915	0.6226906146826424	0.001285836824915	0.6287794331765618	MAPT	4939	SPPL2C	44707	CRHR1	105311	False	False	False	alt	80	0.02039	55	0.1364
1759	chr17	45890853	A	G	rs17691466	0.0690465896	0.1963264851060389	0.0690465896	0.1991528903786655	0.0284197191208184	0.2560087197901323	0.0020668445511215	0.1805644852864293	0.0020668445511215	0.1829523288497838	0.0251765035795585	0.5739295243850555	0.0017431575228905	0.3998310074539979	0.0017431575228905	0.4047446683320785	0.0006965458760579	0.5103061377999857	5.108954979000125e-05	0.3539431237100889	5.108954979000125e-05	0.358749065122487	0.0048868397611427	0.3461674241310533	0.0048868397611427	0.3509340868351808	MAPT	3675	SPPL2C	45971	CRHR1	106575	False	False	False	alt	50	0.01712	80	0.0647
1760	chr17	45891628	T	C	rs55960528	-0.0158550861199999	0.6742641814630057	0.0158550861199999	0.667904597237277	0.0368375268756573	0.1373360827918934	-0.0006035959957435	0.4715009139903801	0.0006035959957435	0.4659475267645062	0.0046278578733792	0.838977889929725	-6.736769795485722e-05	0.8433907128835304	6.736769795485722e-05	0.8366651520119998	0.0001714555279995	0.7473519760234941	-2.533550076413633e-06	0.764411558218111	2.533550076413633e-06	0.7576135228366229	-0.0002507340569429	0.8404602519544218	0.0002507340569429	0.8337824169278856	MAPT	2900	SPPL2C	46746	CRHR1	107350	False	False	False	ref	-90	0.08813	-100	0.2183
1761	chr17	45891802	T	A	rs17691556	-0.00079360604	0.7976151816691595	0.00945449756	0.7989744330579386	0.0090289684357322	0.9312962751904936	1.2057203607972843e-05	0.8837433174321658	8.11206362581417e-05	0.8853780855138467	0.0039036983273398	0.8557666435398072	-1.4899237330407687e-05	0.8983177695064354	3.658970555555571e-05	0.8999323584555254	3.188167475274454e-05	0.925708596159751	-6.748452777657311e-08	0.9365006161302312	2.8259508846232977e-07	0.9381821252924152	-6.10339480716316e-05	0.8931666239078233	0.0001369139916201	0.8946724330552526	MAPT	2726	SPPL2C	46920	STH	107449	False	False	False	ref	-85	0.01968	75	0.1375
1762	chr17	45892742	C	A	rs78729125	-0.0147459786599999	0.6979282874966742	0.0147459786599999	0.6913611412164574	0.0413314633376724	0.1030349215933551	-0.0005921037506097	0.4709515943439854	0.0005921037506097	0.4652765531651446	0.0002400118768763	0.9970177257964172	-3.218430332759111e-06	0.9907950035416352	3.218430332759111e-06	0.9840705659328332	9.66295895380348e-06	0.982306348130068	-1.280250155099536e-07	0.967618713391102	1.280250155099536e-07	0.9606141607638826	-1.237174623074132e-05	0.989279518373712	1.237174623074132e-05	0.9825635732018536	MAPT	1786	SPPL2C	47860	STH	106509	False	False	False	ref	-35	0.003174	-70	0.1339
1763	chr17	45894419	A	G	rs11575895	-0.00723081764	0.5331623916985164	0.02685761984	0.5335572182398489	0.0496728722984958	0.0594703605925347	-0.0001607055894326	0.3390861522488652	0.0013377876175829	0.3392517683094787	0.9627593942793048	7.79741169534487e-05	-0.0071767756641177	0.1041997749299643	0.0260313886522837	0.1042236610945017	0.0478102595564122	0.0025587789929661	-0.0001641316493096	0.0705230978490801	0.0012950296241403	0.070494816367356	-4.453828643067208e-05	0.7180280283669802	0.0007917917587674	0.7192661258922609	MAPT	109	SPPL2C	49537	STH	104832	True	False	False	ref	-5	0.01172	-20	0.1533
1764	chr17	45896533	T	C	rs62056781	0.31151418	0.0082999600327831	0.31151418	0.0083659685584953	0.0621987692064161	0.028794517132768	0.0210406005244071	0.0075946952823304	0.0210406005244071	0.0076330690874105	0.8669088779650952	0.0034173827512811	0.2711974297726511	0.0011312180498789	0.2711974297726511	0.0011045693611075	0.0541576290760582	0.001801191339515	0.0184001267112744	0.0015382222867464	0.0184001267112744	0.0015566095968887	0.0330300880868331	0.0451098780445306	0.0330300880868331	0.0459844226711627	MAPT	2005	SPPL2C	51651	STH	102718	False	True	True	alt	-50	0.013	65	0.2593
1765	chr17	45896864	C	T	rs62056782	0.09736467248	0.1382625426566998	0.09736467248	0.1399042465976812	0.0458771157279628	0.0765720072975253	0.0054011644536754	0.0911786332141439	0.0054011644536754	0.0917759490203997	0.7916086569232291	0.0079459615466368	0.0754825713370944	0.0235600032279286	0.0754825713370944	0.0239420983899636	0.0360844507083132	0.0059168814616273	0.0041734587353472	0.0204206707697459	0.0041734587353472	0.0206724832061697	0.015689023786744	0.1616231050623118	0.015689023786744	0.1642354058889847	MAPT	2336	SPPL2C	51982	STH	102387	False	False	False	alt	100	0.0393	-75	0.3264
1766	chr17	45897110	G	T	rs80346216	0.564774188	0.0013060885361352	0.564774188	0.0013077763847857	0.1397523975476046	0.0009740777418379	0.0839701435928038	0.0005673418240002	0.0839701435928038	0.000565168056252	0.8426503579558575	0.0045470162143966	0.4756709227396996	0.000234476119708	0.4756709227396996	0.0002240795756975	0.1176689296404216	9.368169930978636e-05	0.0706074662012508	0.0001637555854388	0.0706074662012508	0.000152035167463	0.0786917290752531	0.0081295341637263	0.0786917290752531	0.0081478080428777	MAPT	2582	SPPL2C	52228	STH	102141	False	True	True	alt	85	0.2974	30	0.2361
1767	chr17	45897183	G	C	rs62056783	0.0091597124999999	0.6158376897515475	0.0199261903	0.6158339614577889	0.0791726605628656	0.0110222210745622	0.0006482400952118	0.2612245051643698	0.0015469883829811	0.2606704063057708	0.7641582263864604	0.0096386735325938	0.006375132175956	0.1304818702716237	0.0145893461972541	0.1301027049050147	0.0606311023308063	0.0011581452601123	0.0004504100239044	0.0551459897697644	0.0011365092623014	0.0550273198551458	0.0016173996238989	0.4361679302109853	0.003639767741084	0.436084509857881	MAPT	2655	SPPL2C	52301	STH	102068	False	True	False	alt	55	0.244	-40	0.127
1768	chr17	45902138	G	A	rs62056801	-0.0078658398	0.689974991623985	0.0145299958	0.6881754010953246	0.0354757592959759	0.1507410184842601	-0.0002901337269617	0.5257042955944699	0.0005078005732056	0.5243336148485748	0.0187349477087525	0.6226928355933461	-0.0002123687237868	0.6755927062713879	0.000320806513975	0.6739589693630934	0.000671745420577	0.5176378864362627	-7.872062735098036e-06	0.5929334349804759	1.1437987521792124e-05	0.591489710289581	-0.0006433308039985	0.6522181516348449	0.0010623206096796	0.6503729293387789	MAPT	7610	SPPL2C	57256	STH	97113	False	False	False	ref	-100	0.0381	-20	0.008484
1769	chr17	45903164	A	C	rs1984937	0.1571926656	0.0476302916991751	0.1571926656	0.0481098373403828	0.0599242127925822	0.0308440772678825	0.0094448314744613	0.0255547783039601	0.0094448314744613	0.0257101976722191	0.697430800699416	0.0152382473635016	0.1119874265172008	0.0081843091783446	0.1119874265172008	0.0082203561297352	0.0421200266673206	0.0036542985653719	0.0067777725737573	0.006268213490851	0.0067777725737573	0.0062776117502855	0.0335645475240011	0.0467710103774742	0.0335645475240011	0.0475465078628509	MAPT	8636	SPPL2C	58282	STH	96087	False	False	False	alt	65	0.01233	10	0.001953
1770	chr17	45908231	C	T	rs74509629	-0.0943920682	0.1225932813496244	0.0943920682	0.1208395671715417	0.0220231173278671	0.4116726276007736	-0.0021656665931579	0.1693945571849099	0.0021656665931579	0.1671100686204537	0.2975264755369338	0.1108864629787755	-0.0276685117093663	0.0615702717625453	0.0276685117093663	0.0603872233602248	0.0065502325783793	0.1231525072163353	-0.0006371449956256	0.0807730521984993	0.0006371449956256	0.0793777478993847	-0.0315702220316056	0.0519323827562398	0.0315702220316056	0.0510892819808604	MAPT	13703	SPPL2C	63349	STH	91020	False	False	False	ref	90	0.1343	100	0.3088
1771	chr17	45911721	A	G	rs62056838	0.0230185208	0.5358938818726565	0.0243732692	0.5404873329551036	0.041044609600817	0.1057787872486155	0.0007603195459942	0.386646787744411	0.0008243289446514	0.3902423221097138	0.0309301903599353	0.5314198279027099	0.0008727325709461	0.538056424714354	0.0008984656837305	0.5421495068133597	0.0011547541899299	0.4103343878898207	2.6904014632112123e-05	0.4506514446479238	2.811985743759125e-05	0.4546493317038796	0.0024298109597175	0.5072249395043156	0.0025238362310711	0.5114162065172136	MAPT	17193	SPPL2C	66839	STH	87530	False	False	False	alt	25	0.007812	-30	0.006226
1772	chr17	45914415	G	T	rs17564020	-0.0446572321999999	0.3249999251814598	0.0446572321999999	0.3204186278320589	0.0236861915134636	0.3652373027331435	-0.0010659920659762	0.3070177047041317	0.0010659920659762	0.3026534975709817	0.1343612879812608	0.2486502492633825	-0.0060436155129528	0.2152550002666885	0.0060436155129528	0.2115150109084575	0.0031928397843257	0.2338846382122436	-0.0001447228546668	0.2122619485737923	0.0001447228546668	0.2088240634298116	-0.0109234271386625	0.1897896997195703	0.0109234271386625	0.1863783492551345	MAPT	19887	SPPL2C	69533	STH	84836	False	False	False	ref	95	0.0327	-80	0.0696
1773	chr17	45914522	G	A	rs55682376	0.0530601537999999	0.2449497085284374	0.0578284122	0.2473787011714659	0.0516895664036297	0.0509486473067243	0.0028132944334189	0.1296711132521831	0.0030622166356264	0.1304360197478576	0.201902774570288	0.1750120933432576	0.0125349418513135	0.1413713427939687	0.013281481587796	0.1434131936147255	0.0108135702588611	0.0690388461075012	0.0006933141937932	0.087856843864828	0.0007322865611136	0.0889056772956025	0.0173163208076275	0.1221163222750154	0.0185881363201477	0.1235993208337551	MAPT	19994	SPPL2C	69640	STH	84729	False	False	False	alt	100	0.0767	40	0.098
1774	chr17	45915090	G	A	rs62056848	-0.0997437699999999	0.1080724796546483	0.0997437699999999	0.1065113251045483	0.0137591350422088	0.7511900831989863	-0.0013590605992951	0.2521478022050405	0.0013590605992951	0.2487235491387056	0.3494053313978423	0.0882207887707368	-0.0349267852454315	0.0461411360453344	0.0349267852454315	0.0451698137187553	0.0047500974436088	0.1674994164186515	-0.0004696969648097	0.0971379975407688	0.0004696969648097	0.0955212755616492	-0.0334160865692322	0.0451513572568031	0.0334160865692322	0.0444230008413295	MAPT	20562	SPPL2C	70208	STH	84161	False	False	False	ref	95	0.1659	25	0.2422
1775	chr17	45915097	G	C	rs62056849	0.1766554728	0.0342038431455796	0.1766554728	0.0345074254974146	0.018648162735644	0.5339364542689391	0.0032944311852152	0.0987698486787916	0.0032944311852152	0.1000521876918753	0.4112549899376464	0.0668166343809983	0.0704174353396706	0.0159280096062062	0.0704174353396706	0.0162397555689188	0.0076529532730182	0.1032034002895024	0.0013072529957161	0.0377070484190966	0.0013072529957161	0.0383792211614618	0.0600590544686746	0.0144829202022906	0.0600590544686746	0.0146210185391459	MAPT	20569	SPPL2C	70215	STH	84154	False	False	False	alt	90	0.1475	20	0.1294
1776	chr17	45920535	G	C	rs17649700	-0.0242631636	0.4616071426611797	0.0317336811999999	0.458102533573065	0.068186790712037	0.0199192743049	-0.0019566432198479	0.1858640880410657	0.0024166047333164	0.184703963145529	0.0307338919864075	0.5301096397097106	-0.0007874058354551	0.5121687152983738	0.0009356220779094	0.5083090068887193	0.0020933221857726	0.3057147811504072	-6.246152533242308e-05	0.3325757633661235	7.158723399139775e-05	0.3295746915728299	-0.0023844478902048	0.4718421612596482	0.0028661212101216	0.4680099402107479	MAPT	26007	SPPL2C	75653	STH	78716	False	True	False	ref	70	0.01398	70	0.0997
1777	chr17	45922868	A	T	rs8079501	-0.0026017175999999	0.6211564811278835	0.0189460248	0.6197127893580837	0.0361595032699541	0.1430903674869019	-0.000126676158759	0.420113519878397	0.0006947656160751	0.419060228274608	0.0441795057899772	0.4668283323108709	-0.0003492127760375	0.5070454787821242	0.0008639106888833	0.5056391888543198	0.0016701339158109	0.3558893154485683	-1.5111101588291356e-05	0.4164186206286883	3.284762244400565e-05	0.4149845848189472	-0.0008561248391672	0.4916696410571959	0.0023291874237075	0.490219222011866	MAPT	28340	STH	76383	SPPL2C	77986	False	False	False	ref	25	0.00951	65	0.03857
1778	chr17	45924591	T	G	rs55685451	0.239170886	0.0161482212075251	0.239170886	0.0162170289317673	0.0330014119939693	0.1796504268010171	0.0080986547039058	0.0293159021625878	0.0080986547039058	0.02943453034463	0.4382550889116162	0.0588819430303363	0.1025260953871675	0.0082594542955041	0.1025260953871675	0.0083355352045086	0.0143669709727658	0.0423983113811045	0.003446787657697	0.0128666378656036	0.003446787657697	0.0129882116458448	0.0800262281020091	0.0072675867617997	0.0800262281020091	0.0073318695262185	MAPT	30063	STH	74660	SPPL2C	79709	False	True	False	alt	-100	0.2778	-95	0.4243
1779	chr17	45928047	A	G	rs17564780	-0.1421729674	0.0557271458168821	0.1421729674	0.0550929726755814	0.0439980131036927	0.0827822057581296	-0.0063670410163398	0.0433502234731746	0.0063670410163398	0.0430858722421955	0.0059912243080069	0.8084085544210536	-0.0008122645959443	0.527704834444165	0.0008122645959443	0.5217920282969738	0.0002769107916282	0.6801120331733969	-3.823061829884383e-05	0.4075347092728972	3.823061829884383e-05	0.4024194838325072	-0.0025469301573685	0.4932480911218048	0.0025469301573685	0.4873660690780974	MAPT	33519	STH	71204	SPPL2C	83165	False	False	False	ref	20	0.005737	20	0.1033
1780	chr17	45933086	C	A	rs62061714	-0.0715798172	0.1943141643449628	0.0715798172	0.1916180800321515	0.0443720953146321	0.0807452086948422	-0.0031842901607604	0.1132023784093192	0.0031842901607604	0.1117007281780294	0.0054295470291313	0.8395982941054728	-0.0003774393829511	0.6690553864940005	0.0003774393829511	0.6629494571199136	0.0002379434114037	0.7250335366830901	-1.683644302352483e-05	0.5523580380666183	1.683644302352483e-05	0.5465198938811833	-0.0012718155125201	0.6470690845899939	0.0012718155125201	0.6410335196022096	MAPT	38558	STH	66165	SPPL2C	88204	False	False	False	ref	85	0.119	100	0.1473
1781	chr17	45934730	A	G	rs62061716	0.03784259368	0.3893007738119077	0.03784259368	0.3935413224704647	0.0347317029872516	0.1580028093105193	0.0014794894146398	0.2838361839196994	0.0014794894146398	0.2871096455254591	0.228220777935403	0.1531014674308327	0.0096069512648897	0.1971774541219997	0.0096069512648897	0.2002871792001831	0.0081339950953822	0.0980354121691961	0.000378383251024	0.157780203636046	0.000378383251024	0.1600893465603532	0.0122587509485004	0.2036544809715982	0.0122587509485004	0.2064665687026022	MAPT	40202	STH	64521	SPPL2C	89848	False	False	False	alt	-45	0.01312	-100	0.3975
1782	chr17	45935549	T	C	rs77924424	0.0798508749999999	0.1590250071646431	0.0798508749999999	0.161256011218513	0.0138067236866979	0.7261739446310813	0.0012562627441784	0.2930786181686071	0.0012562627441784	0.2970246485874304	0.1465359110553923	0.235353979770566	0.0126067123647108	0.1379883067774418	0.0126067123647108	0.1406452933175682	0.0021505120822331	0.314741877593002	0.0002157571350134	0.1983824179566556	0.0002157571350134	0.2019989046369104	0.020512355250569	0.1017808602314187	0.020512355250569	0.1036709723557141	MAPT	41021	STH	63702	SPPL2C	90667	False	False	False	alt	85	0.1267	-10	0.02585
1783	chr17	45935823	C	T	rs62061720	0.0790548814	0.1511453083308442	0.0790548814	0.153418067787487	0.0311520616575324	0.2053088573869058	0.0025610535688415	0.1334092711147525	0.0025610535688415	0.1351086414923144	0.0557982250668073	0.4307003132434438	0.0046098334740026	0.2611234123041223	0.0046098334740026	0.2653728874055479	0.0017532858990179	0.3535656622632792	0.0001496809602352	0.2204161145328868	0.0001496809602352	0.2241078312019626	0.0106537230708323	0.1984582434282673	0.0106537230708323	0.2018686050957954	MAPT	41295	STH	63428	SPPL2C	90941	False	False	False	alt	-70	0.03314	70	0.2115
1784	chr17	45936771	G	T	rs12150460	0.0895869823999999	0.1807866052006545	0.0895869823999999	0.1825896323262687	0.0299444309536846	0.2278460468295545	0.0030801645725259	0.1779756098664907	0.0030801645725259	0.179675678644805	0.1847703803899574	0.1887090343181173	0.0188172721651366	0.1269134541495588	0.0188172721651366	0.1292375014535701	0.005585738704377	0.1463150408066018	0.000655439160182	0.1182251514001968	0.000655439160182	0.1202329348916827	0.0249826795552769	0.0989226319610025	0.0249826795552769	0.100425018315065	MAPT	42243	STH	62480	SPPL2C	91889	True	False	False	alt	-5	0.00177	-75	0.2622
1785	chr17	45940575	G	T	rs62061732	0.203434296	0.0233230367070149	0.203434296	0.0234981569017458	0.0591197009494941	0.0323069857901724	0.0122493194766841	0.0150313041657122	0.0122493194766841	0.0150520562231998	0.2155174689056777	0.1667777977775437	0.0460995544579942	0.0359467261164313	0.0460995544579942	0.0366351179863111	0.0125260656050148	0.0579095711544687	0.0027207385062847	0.0204457728089637	0.0027207385062847	0.0206984580082451	0.0535878064069149	0.0183749877897267	0.0535878064069149	0.0186107631104642	MAPT	46047	STH	58676	SPPL2C	95693	False	False	False	alt	90	0.083	15	0.00842
1786	chr17	45941033	A	G	rs62061733	-0.00787812246	0.5981380869219175	0.02047425954	0.5973467857812589	0.014939260231945	0.6937745393041426	-0.0001568719677849	0.6353346571037649	0.0003291605239164	0.6343789405014607	0.1689328956484444	0.2204827221691745	-0.0032380951530415	0.3201608464811125	0.0037305829400436	0.3188584672131171	0.0026755384102753	0.2912939789163609	-5.629479289239926e-05	0.369001719500634	6.269100503329733e-05	0.3676643125701173	-0.0036381181749199	0.3534657193334799	0.0050451981128962	0.3522849655740757	MAPT	46505	STH	58218	SPPL2C	96151	False	False	False	ref	-30	0.01694	-25	0.11523
1787	chr17	45942314	T	C	rs62062770	0.03593409024	0.4278788924209455	0.03593409024	0.4328653347511625	0.0178000420746155	0.5670191382264511	0.0007192032163848	0.4751712207816557	0.0007192032163848	0.4804416594658026	0.6281127313516545	0.0230387813286639	0.0199377027326066	0.1053715804025096	0.0199377027326066	0.1074931896423821	0.0110661954072378	0.0636909521182389	0.0003953514028005	0.1424941269817643	0.0003953514028005	0.1450526149776053	0.0105184586453762	0.2469012857599805	0.0105184586453762	0.2505467717525067	MAPT	47786	STH	56937	SPPL2C	97432	True	False	False	alt	100	0.03308	100	0.0547
1788	chr17	45942948	C	T	rs62062772	0.005847795676	0.7197650781066236	0.0128493184759999	0.7214162183117637	0.0695629131300524	0.0189788373443973	0.0003485654406781	0.4000311581043874	0.0008535284283452	0.4005935600963043	0.3174746791593811	0.1017414637694153	0.0022275873579165	0.3005340841993945	0.0044208267143084	0.3011751212036643	0.0212789815076054	0.0201136493058177	0.0001390516199639	0.1744362148913332	0.0002886091873476	0.174572041327947	0.0020017485401339	0.3982148285658352	0.0044018673088977	0.3990442120556626	MAPT	48420	STH	56303	SPPL2C	98066	False	True	False	alt	-85	0.004333	20	0.01535
1789	chr17	45944953	G	A	rs75839508	-0.057706469	0.2415884731080001	0.057706469	0.2380816889826925	0.0163843593720309	0.6260032325314169	-0.000958931044832	0.3331313279943561	0.000958931044832	0.3284919729347279	0.0064407310877238	0.7935431743800601	-0.0004147942876988	0.6257697103744925	0.0004147942876988	0.6195810817034796	0.0001093312111859	0.8036537424489381	-7.138342780969469e-06	0.6397510079980914	7.138342780969469e-06	0.633450197636537	-0.0014648147537197	0.5958109675966079	0.0014648147537197	0.5896992520312888	MAPT	50425	STH	54298	SPPL2C	100071	False	False	False	ref	-100	0.01617	-40	0.0626
1790	chr17	45947196	G	T	rs62062785	-0.0528604746	0.1747790279932298	0.0775161413999999	0.1733570605548004	0.0521277626629964	0.0492586933596068	-0.0030261020600633	0.0823102506348485	0.004182950108584	0.0819827763612628	0.1106883639602784	0.3076286732240703	-0.002422531860015	0.1947815271654904	0.0092225454446289	0.1934483607682308	0.0057084398893142	0.1606351990196763	-0.0001761283835536	0.1215328162100807	0.0004951861669861	0.1205372156008089	-0.0066502259905644	0.1526827460850476	0.0151933291544323	0.1512748420616022	STH	52055	MAPT	52668	SPPL2C	102314	False	False	False	ref	70	0.01105	100	0.1456
1791	chr17	45947294	G	C	rs62062786	-0.315899646	0.0076355964516848	0.315899646	0.0075800857151192	0.0513205836104053	0.0532715871993702	-0.0170338752131702	0.0096050599108311	0.0170338752131702	0.0095642824303246	0.0718823199498531	0.3901566007272211	-0.0233807204688874	0.0865569811018215	0.0233807204688874	0.0850399619422217	0.0034771287535963	0.2360893753529915	-0.0011477274644303	0.0545045029958408	0.0011477274644303	0.0536205840396165	-0.0391722476988551	0.0417574690831662	0.0391722476988551	0.0411577788665107	STH	51957	MAPT	52766	SPPL2C	102412	False	True	True	ref	15	0.011475	30	0.03247
1792	chr17	45949182	T	C	rs242561	0.0357243218	0.226757352399839	0.0599808058	0.2288882947520387	0.0588772008294629	0.0332425418913574	0.0023535917531901	0.0895263933715785	0.0035404860172298	0.0901199867639941	0.5872554518161723	0.0287550579368066	0.0210624029103114	0.0435338418736612	0.0348396674092834	0.0440665574604524	0.0346368403361884	0.0063163172485426	0.0013808108657257	0.023712806811135	0.0020549463284782	0.023868225407705	0.0101918445448846	0.1190799847040807	0.0168709379433208	0.1205259253015464	STH	50069	MAPT	54654	SPPL2C	104300	True	False	False	alt	95	0.0249	5	0.003906
1793	chr17	45949724	C	T	rs62062795	-0.0898846889999999	0.1377933432893021	0.0898846889999999	0.1358090613213292	0.0188394908504436	0.5233905365206702	-0.0016865795382969	0.2191378803116932	0.0016865795382969	0.2161868186703389	0.2380332222625449	0.1484127334944212	-0.0202376648913652	0.0874798847097104	0.0202376648913652	0.0858105015420411	0.0045439262268059	0.1793666576241275	-0.0003796109273521	0.1193042575713614	0.0003796109273521	0.117226742686289	-0.0265621391574015	0.0692924892609747	0.0265621391574015	0.0680194696936748	STH	49527	MAPT	55196	SPPL2C	104842	False	False	False	ref	-25	0.012344	-100	0.1367
1794	chr17	45950017	A	G	rs62062798	0.0977439278	0.1128704718945434	0.0977439278	0.1145191361208723	0.0283859139509277	0.2544047081750681	0.0028431795022055	0.122600814418258	0.0028431795022055	0.1242322227424878	0.0543779485995182	0.4403477628155346	0.0057197660523729	0.2367763276950732	0.0057197660523729	0.2408166291481095	0.0015991289422271	0.375314807527057	0.0001675073761214	0.2117458637030115	0.0001675073761214	0.2152601361286061	0.0130653888027448	0.1691768230711763	0.0130653888027448	0.1721562311104771	STH	49234	MAPT	55489	SPPL2C	105135	False	False	False	alt	-100	0.04657	-20	0.03287
1795	chr17	45950645	T	G	rs62062801	-0.00377605424	0.8564639884546497	0.00640873532	0.8520817329046665	0.0109567127547176	0.855977418183315	-3.998767614390903e-05	0.8955063859663768	6.86983264428544e-05	0.8910560379795236	0.0682598726534921	0.409381110902469	-0.0005232978034518	0.6153496176086255	0.0005720455275147	0.6113442557878724	0.0007566430093859	0.5257343121833004	-5.7145517749630325e-06	0.684755529209334	6.246169091458137e-06	0.6803702444302968	-0.0010169575401669	0.6444932233048902	0.0011852132889049	0.6402122042227975	STH	48606	MAPT	56117	SPPL2C	105763	False	False	False	ref	85	0.03558	-70	0.01607
1796	chr17	45950679	G	T	rs62062802	-0.00626226242	0.8668643423773635	0.00626226242	0.8600940531784572	0.0155259841738245	0.6444715973274674	-8.920720021506871e-05	0.8727299281059823	8.920720021506871e-05	0.8658625202745671	0.0910197618026458	0.3467020258932403	-0.000532316657132	0.5948947791754013	0.000532316657132	0.5889208979809376	0.0015074958616569	0.3974034062194024	-8.317307577011209e-06	0.6211538684317324	8.317307577011209e-06	0.6150857376160414	-0.0010953119329615	0.6359178470823783	0.0010953119329615	0.6296741311568588	STH	48572	MAPT	56151	SPPL2C	105797	False	False	False	ref	50	0.01068	-40	0.0846
1797	chr17	45955636	T	C	rs62063262	0.1720708848	0.0426053841043381	0.1720708848	0.0430020493636761	0.0347879639396591	0.1663377744359288	0.007457303122905	0.0525541667857501	0.007457303122905	0.053020920562028	0.078422849790505	0.3577558671388329	0.0130996121792344	0.1343409628794639	0.0130996121792344	0.1371391137942594	0.0024422124453286	0.2836649422586159	0.0005088027350784	0.1122781246427201	0.0005088027350784	0.1144139475954686	0.0252391870937942	0.0783087824830045	0.0252391870937942	0.079782879735613	STH	43615	MAPT	61108	SPPL2C	110754	False	False	False	alt	-95	0.1201	80	0.1658
1798	chr17	45957467	G	A	rs62063269	0.0078372522	0.4990998687228722	0.027589905	0.5021826579201647	0.0124559598045854	0.8082005170821431	6.740948419155357e-05	0.6182069723607873	0.0003541159768583	0.6215287521243538	0.0427501567087855	0.4875762765984824	0.0009548751117255	0.500106869649381	0.0011104604071685	0.5040060158675244	0.0005300253504327	0.5738526849274408	1.1530159307331202e-05	0.5667849601739091	1.378845415488492e-05	0.5707414290385168	0.0023060934974101	0.4740549448147599	0.0028273564052653	0.4777492171265416	STH	41784	MAPT	62939	SPPL2C	112585	False	False	False	alt	100	0.05426	100	0.4407
1799	chr17	45957493	A	G	rs17571809	0.2740808119999999	0.0121340093958105	0.2740808119999999	0.0121859444926218	0.0395578064548827	0.1137472466302778	0.0117432262643369	0.0194176156823868	0.0117432262643369	0.0194764614083412	0.0851819471479	0.3430041125831599	0.0234346278623606	0.0753986890217846	0.0234346278623606	0.0768312522992585	0.0034421363886057	0.2329631459867314	0.0010215537872234	0.0582834455721013	0.0010215537872234	0.0592445321778925	0.0402543631025039	0.0344495457732032	0.0402543631025039	0.0349216000773102	STH	41758	MAPT	62965	SPPL2C	112611	False	True	False	alt	85	0.05432	85	0.3074
1800	chr17	45958150	G	A	rs77555455	0.01454316758	0.6733077155469258	0.01454316758	0.6800805953610446	0.0098144449261309	0.9217574561455036	0.0001444058600564	0.7845813597376682	0.0001444058600564	0.7915611514477038	0.0327702814159875	0.5179475336255924	0.0004722725838388	0.5989618622583361	0.0004722725838388	0.6051474788317196	0.0003169638644865	0.6377031421332091	4.588148641571825e-06	0.6805653916798721	4.588148641571825e-06	0.6870328553834891	0.0014301738642736	0.5897480052717641	0.0014301738642736	0.5958468012829543	STH	41101	MAPT	63622	SPPL2C	113268	False	False	False	alt	-5	0.002563	30	0.05212
1801	chr17	45963457	C	T	rs55711941	-0.070791609	0.188983027277389	0.070791609	0.186306005275214	0.0678116294386837	0.0199126815996549	-0.0049719267082699	0.0625202024234391	0.0049719267082699	0.0619561104335195	0.027805912045132	0.5643365078426683	-0.0022109910392031	0.3869955452183907	0.0022109910392031	0.3820234388021318	0.0019691607107198	0.335167091462845	-0.0001588106019609	0.2275026178210052	0.0001588106019609	0.2240331792533451	-0.0061586552736629	0.3185838971231842	0.0061586552736629	0.3140330251020501	STH	35794	MAPT	68929	SPPL2C	118575	False	True	False	ref	50	0.01935	95	0.08923
1802	chr17	45963735	T	C	rs55709241	0.095274051	0.1166264014305483	0.095274051	0.1182763130314777	0.0192587229542739	0.5113399186673538	0.0017783619461441	0.1918245636496004	0.0017783619461441	0.1945328512470666	0.078238923163208	0.3535897702644431	0.0068902269490378	0.1903013284802327	0.0068902269490378	0.1937462460577518	0.0015299940130359	0.3669954459116413	0.000128977509243	0.2142893925288641	0.000128977509243	0.2178501777403726	0.0151652865296426	0.1326894519805889	0.0151652865296426	0.135145057348057	STH	35516	MAPT	69207	SPPL2C	118853	False	False	False	alt	-95	0.04102	100	0.0334
1803	chr17	45964196	G	T	rs112058117	-0.0019688068	0.4826995497025279	0.0286417288	0.4821794861365963	0.0498931477028698	0.0597539473628397	3.727147490848008e-05	0.2523980889165927	0.0014528456017294	0.2516812598302223	0.0430025403318926	0.4729836435932092	0.0002518434809338	0.4612637699718281	0.0011228612288108	0.4610558828324521	0.0022113118448555	0.3089458875802667	1.876550442712001e-05	0.3344288942175999	5.8774872617376046e-05	0.3340183376777993	0.0006672495133779	0.4346545076103043	0.003139949193362	0.4345451587112459	STH	35055	MAPT	69668	SPPL2C	119314	False	False	False	ref	-100	0.0803	-100	0.1952
1804	chr17	45966012	T	C	rs62063291	0.0348695304	0.4231391391308918	0.0348695304	0.4280667152324079	0.0147767543869569	0.6986930339064124	0.0004994483048127	0.5223111105306598	0.0004994483048127	0.5282163276695773	0.1168206261753158	0.279578769812358	0.0034605584255313	0.3033870460512073	0.0034605584255313	0.3079171445266727	0.0017766398498992	0.3456133615052685	5.081783050959556e-05	0.3551405996864544	5.081783050959556e-05	0.3600453710301733	0.0069570452970868	0.2863277653764188	0.0069570452970868	0.2906783443737805	STH	33239	MAPT	71484	SPPL2C	121130	True	False	False	alt	-70	0.0741	-5	0.00757
1805	chr17	45967142	A	C	rs17650991	0.194585038	0.02664713903661	0.194585038	0.0268952800283231	0.0412410013118265	0.1033130964951487	0.0086562138846131	0.0291959949854154	0.0086562138846131	0.0294132731140903	0.0192925010722179	0.6579361896376075	0.0041110793317202	0.3084159245226748	0.0041110793317202	0.3129397754380041	0.0008829667079267	0.5212463324626689	0.0001951936102453	0.2259817786404551	0.0001951936102453	0.2293772449018258	0.0093109762132558	0.2427373444493829	0.0093109762132558	0.2464229277708166	STH	32109	MAPT	72614	SPPL2C	122260	False	False	False	alt	-10	0.003952	85	0.0643
1806	chr17	45971767	T	C	rs62063303	-0.0298340622	0.3857712903866597	0.039618999	0.3829181194095093	0.1074179460488808	0.0031440431416192	-0.0033144098045388	0.0808220230830795	0.0042809606330149	0.08037016529808	0.4537453399755864	0.0548083464282185	-0.0128734262505764	0.0996243356307018	0.0181644942491794	0.0985770904036216	0.0483563334567754	0.0023559186535889	-0.0014269155531963	0.0289641873778926	0.0019495644171873	0.0286936459770452	-0.009847085216588	0.1696996267584025	0.0128806373923657	0.1681862493476007	STH	27484	MAPT	77239	SPPL2C	126885	False	True	True	ref	100	0.1536	40	0.2363
1807	chr17	45971963	C	T	rs75242405	-0.1066772875999999	0.116641976002517	0.1066772875999999	0.1148337722010418	0.0249704714366698	0.3316641512421417	-0.0029157441760652	0.147578995591038	0.0029157441760652	0.1455529738520594	0.4799643693708555	0.0487153200002407	-0.0507475736395207	0.0331163507372535	0.0507475736395207	0.0324344316926822	0.0118904348754783	0.0577295799441698	-0.0013779629751428	0.0471974501725565	0.0013779629751428	0.0462526146742872	-0.0349724522450595	0.0517204248440658	0.0349724522450595	0.0507840953512817	STH	27288	MAPT	77435	SPPL2C	127081	False	False	False	ref	100	0.1594	-40	0.3503
1808	chr17	45973484	A	G	rs62063776	0.0540710742	0.1136447617967367	0.0959217622	0.1145756435130808	0.0692872536076277	0.0187148946621376	0.0040549397406725	0.0381970197191043	0.0067630933012946	0.0383391914267018	0.1595278941638349	0.2260155336158147	0.0026150623636868	0.1125329893967805	0.015828798529257	0.1136017534654463	0.0105006708650484	0.0736149622585456	0.0001993270439864	0.0530912300007839	0.0010543864816013	0.053669334545172	0.0082874204084325	0.0791627602022032	0.0236019926759261	0.0800726775335315	STH	25767	MAPT	78956	SPPL2C	128602	False	True	False	alt	75	0.03735	85	0.5117
1809	chr17	45977022	T	C	rs17572467	0.1702468449999999	0.0353650959157785	0.1702468449999999	0.0356733407053909	0.0442344278031065	0.0816627540039539	0.0077425972440397	0.0309804930217224	0.0077425972440397	0.0311437952237999	0.2779271551581933	0.1211599247930887	0.0495392153409694	0.028591098636222	0.0495392153409694	0.0291163692314991	0.012522733966375	0.0542376522012155	0.0022916375691642	0.0226711301017563	0.0022916375691642	0.0230104861317477	0.0558980238197353	0.0163364959197993	0.0558980238197353	0.0164989018600293	STH	22229	MAPT	82494	SPPL2C	132140	False	False	False	alt	-80	0.2603	85	0.4282
1810	chr17	45977230	T	G	rs17572495	0.51369678	0.0017265002948341	0.51369678	0.0017262543506082	0.0597307374645263	0.0311381556240626	0.0312655449651394	0.0031108061330809	0.0312655449651394	0.0031241425167607	0.3940450661476032	0.0711768290027821	0.2108348180567098	0.0021053259781312	0.2108348180567098	0.002079674409132	0.0238576582163736	0.0161766167702558	0.0130206530351813	0.0023787486875203	0.0130206530351813	0.0023761939268312	0.1715383854046385	0.0008416427845959	0.1715383854046385	0.0008228724703136	STH	22021	MAPT	82702	SPPL2C	132348	False	True	True	alt	-65	0.0282	60	0.1118
1811	chr17	45982882	G	A	rs56234850	-0.280528084	0.0111367842612277	0.280528084	0.0110754106834114	0.0837875232749319	0.0088782165128231	-0.0237680875680006	0.0052712477345961	0.0237680875680006	0.005270327376716	0.5502061957705123	0.0340847133036681	-0.1522461110749534	0.0041561233964223	0.1522461110749534	0.0041599914712019	0.0462943652029151	0.002924331509098	-0.0130040426349078	0.0023033790024078	0.0130040426349078	0.0023189810335135	-0.0810192669327966	0.0076043989928899	0.0810192669327966	0.0075536105824999	STH	16369	MAPT	88354	SPPL2C	138000	False	True	True	ref	30	0.06018	100	0.1265
1812	chr17	45988044	G	A	rs10445371	0.200600719	0.0320564129802883	0.200600719	0.0322872972560837	0.0662988624341506	0.0218844025487966	0.0145523589074457	0.0164229414890893	0.0145523589074457	0.0165542128171708	0.5343852066906403	0.0373945997303229	0.101939357426903	0.0099408347381647	0.101939357426903	0.0099872085169391	0.0350131538894067	0.0060426498223715	0.0072611041742169	0.0062331948773599	0.0072611041742169	0.0062186830801215	0.0623379301243772	0.0167393185655942	0.0623379301243772	0.0168360725899827	STH	11207	MAPT	93516	SPPL2C	143162	False	False	False	alt	-20	0.00708	-50	0.1177
1813	chr17	45988535	C	T	rs919464	-0.502390646	0.0018696039976676	0.502390646	0.001898298246885	0.0810001089935426	0.0104436872055892	-0.042415880512233	0.0019995611190604	0.042415880512233	0.0019901235901222	0.1826053247995776	0.1933341578488606	-0.09394569344926	0.0110921965136678	0.09394569344926	0.0109732456344564	0.0151348047639234	0.0415437502105921	-0.0080633357872753	0.0051974888096037	0.0080633357872753	0.0051635810108618	-0.1139132658110916	0.0031863289745348	0.1139132658110916	0.0031730314720968	STH	10716	MAPT	94007	SPPL2C	143653	False	True	True	ref	-45	0.003983	-35	0.03955
1814	chr17	45990034	T	C	rs10445337	0.01736810372	0.6312133122234502	0.01736810372	0.6376476736976601	0.0094163975284412	0.9217144862472488	0.0001641413375899	0.7637312102034258	0.0001641413375899	0.7704041814804787	0.0025172379664148	0.9022333127453036	4.149478934086752e-05	0.8687429207136455	4.149478934086752e-05	0.8757205585070074	2.60068760740394e-05	0.9422524744568817	4.292058541535009e-07	0.9028850016637192	4.292058541535009e-07	0.9099410308453773	0.0001707300979841	0.862136484087736	0.0001707300979841	0.8690844158977852	STH	9217	MAPT	95506	SPPL2C	145152	False	False	False	alt	100	0.014946	75	0.0468
1815	chr17	45990923	G	A	rs62063796	-0.231549944	0.016357093052708	0.231549944	0.0162128701851857	0.0682968077263126	0.0195438430623988	-0.0158348227381793	0.0095160097162697	0.0158348227381793	0.0094570704256573	0.194260334532018	0.1801874045071117	-0.0444162216109409	0.0321983630411911	0.0444162216109409	0.031589042564107	0.0133370649349612	0.0485892291348377	-0.0030585411509113	0.0148037520600635	0.0030585411509113	0.0146578980655528	-0.0622661739962389	0.0125718906024878	0.0622661739962389	0.0124415643939353	STH	8328	MAPT	96395	SPPL2C	146041	False	True	False	ref	-100	0.2388	30	0.07324
1816	chr17	45991114	T	C	rs77290642	0.0419376194	0.3510889546908324	0.0419376194	0.3558595276309532	0.0363073911094233	0.1406932059021712	0.0015217361794708	0.2329510168592087	0.0015217361794708	0.2362408672834988	0.2419707366962488	0.1430761956407465	0.00978623896603	0.1541721115856353	0.00978623896603	0.1571120201856964	0.0088018178288711	0.0874295412961196	0.0003563246051984	0.1197950330659694	0.0003563246051984	0.1219389671340298	0.0132418923823033	0.1575386548818362	0.0132418923823033	0.1603718733219493	STH	8137	MAPT	96586	SPPL2C	146232	False	False	False	alt	-60	0.0605	-100	0.05267
1817	chr17	45991558	G	A	rs1052551	-0.190118755	0.0289341567592677	0.190118755	0.0286495926736534	0.0312964699314111	0.2045147363056052	-0.0061437942445347	0.0456266487701365	0.0061437942445347	0.045204163246263	0.1714707531919105	0.2030831642435582	-0.0327089693297117	0.0505476736805062	0.0327089693297117	0.049565656145749	0.0054822626614982	0.1501537728619001	-0.0010723046918108	0.050919771359712	0.0010723046918108	0.0500780046106061	-0.0489071624162844	0.0225551015430705	0.0489071624162844	0.0221980898269255	STH	7693	MAPT	97030	SPPL2C	146676	False	False	False	ref	60	0.02684	25	0.1118
1818	chr17	45992402	A	G	rs74759276	-0.843080906	0.0002629216263503	0.843080906	0.000264848254463	0.1096129499334892	0.0028633102323052	-0.0934017749484019	0.0004018149950673	0.0934017749484019	0.0003931112372684	0.4517617366632576	0.0545927706240445	-0.3908077394712868	0.0003899959916425	0.3908077394712868	0.0004095089819811	0.0498811001259568	0.0022599227894903	-0.0436201369466503	0.0003528863616715	0.0436201369466503	0.0003529341442259	-0.275034640889446	0.0001355640004844	0.275034640889446	0.00013760475951	STH	6849	MAPT	97874	SPPL2C	147520	True	True	True	ref	5	0.005493	80	0.1602
1819	chr17	45992474	G	A	rs17651887	0.1137817337999999	0.0866807745785728	0.1137817337999999	0.0876515002286586	0.0273317251620945	0.2748909431750917	0.0033025403965781	0.1066255017582426	0.0033025403965781	0.1078289206866644	0.4873478275213618	0.0461639943502531	0.05578365667486	0.0243971506187354	0.05578365667486	0.0247791842568061	0.0133886721376757	0.0482689782679925	0.0016266372481141	0.033933875710373	0.0016266372481141	0.0344259870320701	0.0369849229652601	0.0399995641031772	0.0369849229652601	0.0405875055541244	STH	6777	MAPT	97946	SPPL2C	147592	True	False	False	alt	5	0.0003662	5	0.007812
1820	chr17	45993590	T	A	rs55913645	-0.01197634634	0.7395106895996799	0.01197634634	0.7328207054540515	0.0118972589805193	0.8240120683417669	-0.0001475550131068	0.799207871346099	0.0001475550131068	0.792531822406216	0.0950908910956417	0.3207644884661285	-0.0012477796848356	0.4677826825014942	0.0012477796848356	0.4620778098942336	0.0010936260566174	0.4298066736076719	-1.5327036302764398e-05	0.541983502882103	1.5327036302764398e-05	0.5360404258121451	-0.0025131140510045	0.4920964136937267	0.0025131140510045	0.4865192726771049	STH	5661	MAPT	99062	SPPL2C	148708	False	False	False	ref	-50	0.01888	-90	0.156
1821	chr17	45995696	T	G	rs62063849	0.0364672162	0.2423064323847222	0.0581840614	0.2442970900933798	0.0949893258668969	0.0052300307183021	0.0035099430536034	0.0502068884292054	0.0055210512335294	0.0504423588597995	0.1314728976279238	0.2511304670092122	0.0047571751412401	0.1830025863879936	0.0073966412463167	0.1850986781445199	0.0125547176206461	0.0536062477733826	0.0004613956834664	0.0681445016246324	0.0007058258419846	0.0688044084862195	0.0087328032727392	0.1492716535501119	0.0135841773613539	0.1508775255105185	STH	3555	MAPT	101168	SPPL2C	150814	False	True	True	alt	15	0.01822	95	0.165
1822	chr17	45997069	C	G	rs62063851	-0.0597575914	0.265714823297858	0.0597575914	0.2629260575924039	0.0238880537472701	0.3649549717176298	-0.001962918631815	0.2714648760812569	0.001962918631815	0.2689918587779855	0.0998078255418824	0.3075924219171739	-0.0043516293929969	0.2749894404692695	0.0043516293929969	0.2707596694860481	0.0021219555113729	0.3028820249358689	-0.0001147458577981	0.2667561074110706	0.0001147458577981	0.2627431165196863	-0.0091097291412358	0.238211792248522	0.0091097291412358	0.2345792151987276	STH	2182	MAPT	102541	SPPL2C	152187	False	False	False	ref	-55	0.2399	-100	0.0906
1823	chr17	45997733	T	C	rs2004673	0.02377795748	0.5043704114125733	0.0270279551199999	0.5072650428288985	0.1131229827984942	0.0026191544850439	0.002301613259145	0.1785536621226569	0.0027484151790971	0.1787539918581172	0.1047771436112301	0.3113887586623248	0.0054898162060676	0.3498022703296008	0.0056657099635345	0.3522690082284309	0.0111630635713145	0.0705618159338914	0.0005453223778112	0.1704328259222959	0.0005693276054332	0.1712252043722837	0.0074865560357626	0.3359446022561391	0.0079269902015769	0.3385367992249309	STH	1518	MAPT	103205	SPPL2C	152851	False	True	True	alt	100	0.05527	100	0.1351
1824	chr17	45998471	T	C	rs1078269	0.159321838	0.0445127544788275	0.159321838	0.0449995764419719	0.0554104787312867	0.0421952269318475	0.0091059374086389	0.0274220203824273	0.0091059374086389	0.0276325381355215	0.1383944772524825	0.2472383453683091	0.0256586992951358	0.0747886967905909	0.0256586992951358	0.076066507732688	0.0081562485497474	0.1048888864327023	0.0015672409277202	0.043513046116652	0.0015672409277202	0.0441138858292047	0.0393908152155982	0.0387122780243533	0.0393908152155982	0.0392450454286698	STH	780	MAPT	103943	SPPL2C	153589	False	False	False	alt	-95	0.0199	-100	0.0713
1825	chr17	46001466	G	A	rs62064660	0.010771234738	0.7645048362915845	0.010771234738	0.7712009043143937	0.0138283947006811	0.7454099130374073	0.0001465345247687	0.797492594910197	0.0001465345247687	0.804285216883623	0.0239236580779254	0.5741864809674312	0.0002838483727478	0.6907211440148678	0.0002838483727478	0.6970802911605546	0.0003260160156097	0.6325917904674302	3.792452690846783e-06	0.7251549573307392	3.792452690846783e-06	0.7316163795046172	0.0008792187654646	0.6834729339085572	0.0008792187654646	0.6897763514507981	STH	2215	MAPT	106938	SPPL2C	156584	False	False	False	alt	75	0.1089	-55	0.1067
1826	chr17	46004161	T	C	rs62064665	-0.0432684072	0.0528256980953097	0.1545197672	0.0525325041980483	0.0830948756429539	0.0093027911549139	-0.0022458713505602	0.0171846464355933	0.0124848295969058	0.0171388361151051	0.3739615980996997	0.079621199728782	-0.0092912363047613	0.0261419469422681	0.0621127817576191	0.0260247306651046	0.0307636742053391	0.0096498332548466	-0.0001272751545778	0.0111278287050261	0.0049886775366266	0.0110395631058768	-0.0132385932499752	0.0254655694168543	0.0500948500544356	0.0253393103982431	STH	4910	MAPT	109633	SPPL2C	159279	True	True	True	ref	0	0.0	0	0.0
1827	chr17	46005237	A	C	rs17573593	-0.0418202741999999	0.3590298179111184	0.0418202741999999	0.3546478639021295	0.0274007705690284	0.2735251312982862	-0.0011822682098432	0.3040080964283669	0.0011822682098432	0.3003753096580011	0.0091748870047177	0.735531497435846	-0.0004157372227699	0.633931144265083	0.0004157372227699	0.6279805054729296	0.0002515761054609	0.675346444442536	-1.1677114014535613e-05	0.5788250238433632	1.1677114014535613e-05	0.5729491912634244	-0.0014186269011249	0.6015160567769121	0.0014186269011249	0.5954584452577296	STH	5986	MAPT	110709	SPPL2C	160355	False	False	False	ref	70	0.012054	-50	0.0634
1828	chr17	46005957	C	T	rs17652337	-0.0650900936	0.2118192716126423	0.0650900936	0.2086102166296299	0.0280568472381122	0.2606521076382742	-0.0018746817935516	0.1920183982036222	0.0018746817935516	0.1893792140541748	0.1147693906502589	0.2818912931368605	-0.0081629254438146	0.190256404402727	0.0081629254438146	0.1868795710843703	0.0032825314921478	0.2372588133953538	-0.0002370728612219	0.1743300922277854	0.0002370728612219	0.1712124734194593	-0.0147636171686845	0.1470183594345395	0.0147636171686845	0.14427342466176	STH	6706	MAPT	111429	SPPL2C	161075	False	False	False	ref	100	0.116	100	0.5117
1829	chr17	46007167	T	C	rs74829364	0.008926779456	0.7347625794613043	0.011831607456	0.7389765381693497	0.0178072100550972	0.5666479103028721	0.000151161718671	0.728507908503837	0.0002066763627076	0.7327155966231594	0.0034096532611922	0.8689854640061844	3.754731383662544e-05	0.8624020201749473	5.002970825764711e-05	0.8665808964716305	6.239139934749387e-05	0.8660906347740215	6.824404487138926e-07	0.8591473066889544	9.209935279845906e-07	0.8633847936335052	0.0001402131239483	0.8520131142085487	0.0002045462043482	0.8561232066473998	STH	7916	MAPT	112639	SPPL2C	162285	False	False	False	alt	-80	0.01016	-55	0.0718
1830	chr17	46009155	G	A	rs62064672	0.0938555702	0.1244093141057689	0.0938555702	0.1258744119730488	0.0510767766241702	0.0556283317506625	0.0053384961475667	0.0690632421797251	0.0053384961475667	0.0696229284420565	0.1192463132196232	0.2761434630851291	0.0121965282447021	0.1521560934785135	0.0121965282447021	0.1549720420581891	0.0062503711420349	0.1386706789268915	0.0007018820850871	0.0932328849116072	0.0007018820850871	0.0947009326869716	0.0211276434297779	0.1033863588591634	0.0211276434297779	0.1049507437673844	STH	9904	MAPT	114627	SPPL2C	164273	False	False	False	alt	-60	0.06384	100	0.1758
1831	chr17	46011406	C	A	rs62064674	0.00756551018	0.7499768209873184	0.01061268086	0.754442179171443	0.0147779487170461	0.7001691200705096	0.0001173455855614	0.7643435036119055	0.000159405492374	0.7687352651197649	0.0507456039061726	0.43851493020756	0.000378912638885	0.5642365074418837	0.0005764042027916	0.568203704795167	0.0007475490131326	0.4941699260944306	5.919772426979208e-06	0.5961220619020345	8.645736167315702e-06	0.6001730172339249	0.0011175810761769	0.5680719815910751	0.001571211771304	0.5721748653852661	STH	12155	MAPT	116878	SPPL2C	166524	False	False	False	alt	-100	0.03372	35	0.1162
1832	chr17	46011742	T	C	rs76723223	0.066831899	0.1982827294757983	0.066831899	0.2011681385085363	0.0256818660872247	0.3137776342332006	0.0017054483959166	0.200609426244785	0.0017054483959166	0.2032705025151707	0.0611815842433439	0.399896218581918	0.0042562240609427	0.260496211938687	0.0042562240609427	0.2646730110901051	0.0015447361031583	0.3595830126684489	0.0001071795062741	0.2439492771802026	0.0001071795062741	0.2479896360552928	0.0099848239912902	0.2024525870257018	0.0099848239912902	0.2059257847147899	STH	12491	MAPT	117214	SPPL2C	166860	False	False	False	alt	-100	0.01825	-50	0.05798
1833	chr17	46012197	C	T	rs733966	-0.129110505	0.0639359864304657	0.129110505	0.063163570997689	0.0546073094450246	0.0423577365319711	-0.0071264430422148	0.0338195553733836	0.0071264430422148	0.0335993902099055	0.1592656131437431	0.2167329754991372	-0.0206463046102288	0.0812923516810274	0.0206463046102288	0.0797066408113972	0.0085520673531673	0.0907847458707888	-0.0011214784939627	0.0455642198295778	0.0011214784939627	0.0448329647142518	-0.0333352578271914	0.0451865254730111	0.0333352578271914	0.0444768475398262	STH	12946	MAPT	117669	SPPL2C	167315	False	False	False	ref	100	0.8325	100	0.3015
1834	chr17	46012361	G	A	rs733969	-0.0361957098	0.3486679177193149	0.0436379094	0.3457727325560512	0.1098897687186498	0.0028806690827564	-0.0039047948344913	0.0677977134888224	0.0047743884705381	0.0673878609436863	0.1843538649335225	0.1911008401479466	-0.0054117480823777	0.1930011601234398	0.0070861570213073	0.1911647895694015	0.0201096721799911	0.0231455249414544	-0.0005754634101817	0.0643595795279173	0.0007711119371265	0.0637147615143127	-0.0089530203556464	0.1824984345325793	0.0115411896671175	0.1806324284927504	STH	13110	MAPT	117833	SPPL2C	167479	False	True	True	ref	-45	0.06055	-45	0.1807
1835	chr17	46012870	T	C	rs4306559	0.0534911064	0.275679896114532	0.0534911064	0.2796340995906638	0.0500591179462558	0.0563767909403534	0.0028090952461864	0.1395457589713529	0.0028090952461864	0.1414363540534089	0.193926297383788	0.182775863493637	0.0104531572341111	0.1581285137541253	0.0104531572341111	0.1610516545096073	0.0096543612949615	0.0788711486804259	0.000552846303613	0.0982295135308976	0.000552846303613	0.1000589157671674	0.0155331397842367	0.1413616206306683	0.0155331397842367	0.1439210970388588	STH	13619	MAPT	118342	SPPL2C	167988	False	False	False	alt	-35	0.04715	-85	0.08264
1836	chr17	46013829	T	C	rs62062270	-0.0281751948	0.3516027556819964	0.041120568	0.3487829366241852	0.0143185417639619	0.719579134755959	-0.0004554222409174	0.457960140567433	0.0005976518311712	0.4544456038111497	0.5038616343901554	0.0429241995358599	-0.0137353205923406	0.0797285565469928	0.0210665015009205	0.0789225262041585	0.007102253224531	0.1124812570601341	-0.000221279594305	0.1342831853221037	0.0003018265841833	0.1329785389375301	-0.0086915641186367	0.164912330101675	0.0124740193329154	0.1630098450713849	STH	14578	MAPT	119301	SPPL2C	168947	True	False	False	ref	80	0.0808	15	0.3953
1837	chr17	46016130	A	G	rs62062275	0.181509972	0.0291964198010578	0.181509972	0.0294714074896751	0.048219827207653	0.0630976377953314	0.0087682483718676	0.0240146364518171	0.0087682483718676	0.0240865392860077	0.009396753653789	0.7503385139082093	0.0017235823212836	0.4053218712321961	0.0017235823212836	0.4105312792360696	0.0004318250419295	0.6069594811028513	7.965272271864748e-05	0.2910950479633306	7.965272271864748e-05	0.2954047633095417	0.0049462241430503	0.3517534611264399	0.0049462241430503	0.356565218404313	STH	16879	MAPT	121602	SPPL2C	171248	False	False	False	alt	-55	0.01462	-90	0.1012
1838	chr17	46024197	T	C	rs9468	-0.0035702437999999	0.3265351662215761	0.0458324386	0.3252490681647563	0.100404093339608	0.0041882338610057	-0.0006307781772675	0.0762885193564077	0.004794604551291	0.0759863765770459	0.4353097885256177	0.0596786515227062	-0.0028978760647603	0.0933255690100406	0.0195748864370446	0.0925989548367269	0.0435070036085072	0.0032938746924252	-0.0003996925628273	0.0291173722119922	0.0020455098979455	0.028918821804128	-0.0011637689287717	0.1418172085322699	0.0159125400019794	0.1408917697554834	STH	24946	MAPT	129669	SPPL2C	179315	False	True	True	ref	-50	0.01251	-60	0.0537
1839	chr17	46025272	A	G	rs1052590	0.156459078	0.0499990834717203	0.156459078	0.0505866771955453	0.0410238799834147	0.1037482699678786	0.0070773444462858	0.0445772382714892	0.0070773444462858	0.0449152123923771	0.1564242354260829	0.2191870296244123	0.0285900437706899	0.0685344406399136	0.0285900437706899	0.070056463407704	0.0068169242717648	0.1240564355994576	0.0013518409782615	0.0517837573949627	0.0013518409782615	0.0527347661296865	0.0408003695028207	0.0361144859081783	0.0408003695028207	0.0367540938749922	STH	26021	MAPT	130744	SPPL2C	180390	False	False	False	alt	-60	0.0379	20	0.02832
1840	chr17	46026250	C	T	rs17652748	0.06334824094	0.2214472004252678	0.06334824094	0.2242051570713903	0.0297767644955132	0.2294345655232113	0.0019368403890849	0.2070795988323665	0.0019368403890849	0.2095242508543276	0.153773382600376	0.2240117153296182	0.0096619267220209	0.1904051106915957	0.0096619267220209	0.1935638653086912	0.0044858809550732	0.1783087807046108	0.0002868992084299	0.1733271807962543	0.0002868992084299	0.1760492631798224	0.0157418099039952	0.1520157283843811	0.0157418099039952	0.1545331882363766	STH	26999	MAPT	131722	SPPL2C	181368	False	False	False	alt	-100	0.054	-75	0.1595
1841	chr17	46026459	T	C	rs75010486	0.112914504	0.0838862610177111	0.112914504	0.0850602399608393	0.0181723877250165	0.5502414933591772	0.0020979078440346	0.1635750398557155	0.0020979078440346	0.1657657193506265	0.1593192240440763	0.2203764934762263	0.0201205785723477	0.0907617252167226	0.0201205785723477	0.0925444631678174	0.0029824857732775	0.2531134546699314	0.0003863747917785	0.124887493807635	0.0003863747917785	0.1272454169396044	0.0298934380257991	0.056876910094788	0.0298934380257991	0.057922205021633	STH	27208	MAPT	131931	SPPL2C	181577	False	False	False	alt	75	0.01889	80	0.1777
1842	chr17	46028854	A	G	rs79772576	0.21130632	0.0244546859354721	0.21130632	0.0246356874152494	0.0285697443866366	0.2561137177070447	0.0068607374492329	0.0482332351946445	0.0068607374492329	0.048672940175872	0.1829096697568539	0.1923093925429133	0.0417441278252382	0.0401259634969791	0.0417441278252382	0.0409443758080618	0.0052777620586364	0.1579389635352062	0.0013683464214381	0.0480018085484088	0.0013683464214381	0.0488637180560503	0.0560481343406683	0.0180487777487894	0.0560481343406683	0.0182408858875092	STH	29603	MAPT	134326	SPPL2C	183972	False	False	False	alt	-100	0.02939	100	0.1738
1843	chr17	46031540	A	G	rs34579536	-0.276937116	0.0106837758014718	0.276937116	0.0106367619024022	0.0408681693049753	0.1040314412917997	-0.0118038629186425	0.0168669733312655	0.0118038629186425	0.0168171166469423	0.467939032034575	0.0511477035338343	-0.1308719656881205	0.0053050423916004	0.1308719656881205	0.0052972850075687	0.0193178235944307	0.0250800367467089	-0.0056495205307231	0.0074410474374244	0.0056495205307231	0.0074268366014244	-0.0921662102866945	0.0049448810426147	0.0921662102866945	0.0049406376537197	STH	32289	MAPT	137012	SPPL2C	186658	False	True	False	ref	80	0.1743	20	0.01221
1844	chr17	46033743	A	G	rs62062321	-0.05957926414	0.2605183935552937	0.05969028546	0.2583294188439832	0.0255329324654871	0.3139741830339185	-0.0015485757929365	0.2812096589134526	0.0015518241168944	0.278995574299405	0.0444294150638381	0.4576247589618463	-0.0023982733188011	0.4030798888459838	0.0024039954349085	0.3990969409326652	0.0011386519432753	0.4129735804470119	-6.215720023370949e-05	0.378361064883338	6.23246211074255e-05	0.3745796301566115	-0.0063516545148625	0.3396639368469132	0.0063697997426676	0.3357597270458534	STH	34492	MAPT	139215	SPPL2C	188861	False	False	False	ref	5	0.0006104	50	0.02173
1845	chr17	46035019	A	G	rs62062322	-0.0533824872	0.2682873030020001	0.0533824872	0.2643719605803074	0.0183823075041407	0.5466027441486462	-0.0009852072955133	0.3278134893436251	0.0009852072955133	0.3233614634536746	0.3745183266800831	0.0784887133098685	-0.0202300664427649	0.0836975333376185	0.0202300664427649	0.082069111958665	0.0068937423094356	0.1166937868126726	-0.0003738787946768	0.1166390808743904	0.0003738787946768	0.114512322333247	-0.0181361551911846	0.1105373123024613	0.0181361551911846	0.1084917812700218	STH	35768	MAPT	140491	SPPL2C	190137	False	False	False	ref	95	0.2236	95	1.058
1846	chr17	46038074	T	C	rs8077487	-0.0463077228	0.1362599785639475	0.0971469088	0.1362291980470674	0.071074034214166	0.0173687142453073	-0.0036612958280129	0.0497244486895709	0.0074006806286962	0.049815265407284	0.0414379268252449	0.4830704021030235	-0.0025884283777199	0.3032802221839168	0.0039471007655426	0.3015129789706706	0.0029307325753872	0.2551193140071265	-0.0001934904339903	0.1626881226858913	0.0002952389980807	0.1622966456672675	-0.0055540892745207	0.2389706940781764	0.0092029296295073	0.2374755921876106	STH	38823	MAPT	143546	KANSL1	187315	False	True	False	ref	50	0.1517	-35	0.0729
1847	chr17	46039584	T	G	rs7221390	-0.0587254511999999	0.2074894624661021	0.0676323408	0.2055172783609535	0.0206166887708768	0.4556018659596998	-0.001147147821525	0.2641805646962654	0.001387383814949	0.2622189719264357	0.1705824618125432	0.2057169257644775	-0.0078863195262547	0.1500407157209988	0.0102991959772254	0.1482698574714479	0.0036402344968658	0.2179056557894116	-0.0001480925391893	0.1712369960473529	0.0002131724706004	0.169607128739904	-0.0138555309953481	0.1215622648061494	0.0170111510672692	0.1201908524161049	STH	40333	MAPT	145056	KANSL1	185805	False	False	False	ref	80	0.36	70	0.526
1848	chr17	46041482	G	A	rs62062137	-0.0732993228	0.1128342120363788	0.0965796008	0.1121586809507764	0.0237287426879482	0.3645676232613961	-0.0020609685771098	0.1481827447885527	0.0024313913759511	0.1472052977494674	0.0127932103856685	0.6873460854280927	-0.0006317346643447	0.4572612460681907	0.0011137802710388	0.4541881506988003	0.0002848968349106	0.6572976120256957	-1.8823357082216097e-05	0.4337759765455018	2.6493397962516e-05	0.4305550160940337	-0.0019580350367852	0.4066220322827397	0.0035465672528124	0.4036205016642164	STH	42231	MAPT	146954	KANSL1	183907	False	False	False	ref	-60	0.01271	40	0.04004
1849	chr17	46041954	C	T	rs55893711	-0.0284269401999999	0.4830664824660094	0.0284269401999999	0.4772273921192004	0.0712466004231361	0.0166611247867967	-0.0020389213749442	0.1737350827561954	0.0020389213749442	0.1715492914365812	0.011333344330441	0.7206603468804644	-0.0003027066943373	0.6682901418461192	0.0003027066943373	0.6618169258526122	0.0008612970521891	0.4915980620927765	-2.3396952438845946e-05	0.4788743314225677	2.3396952438845946e-05	0.4731320307144284	-0.0011398502193922	0.6371837574831064	0.0011398502193922	0.6307278878495639	STH	42703	MAPT	147426	KANSL1	183435	False	True	False	ref	50	0.05273	-90	0.0518
1850	chr17	46045882	T	C	rs62063670	0.1983111548	0.0297533272354496	0.1983111548	0.030090390124479	0.0377984792148678	0.1276260979008003	0.0080013159911522	0.0357882806992302	0.0080013159911522	0.0360782599380636	0.0795717726237999	0.3582482993234433	0.0190829633994167	0.1066725078701378	0.0190829633994167	0.1086342197526677	0.0031402912669641	0.2484437846606163	0.0008070325003233	0.0842232854730672	0.0008070325003233	0.085515244134195	0.0320584936161788	0.056514986668744	0.0320584936161788	0.0572433370885086	STH	46631	MAPT	151354	KANSL1	179507	False	False	False	alt	-90	0.2308	-85	0.1514
1851	chr17	46047169	T	C	rs79065019	0.260390382	0.0124323527349648	0.260390382	0.0125549490463054	0.0637463810600957	0.0264338753938527	0.0172985247871696	0.0093719754320022	0.0172985247871696	0.0094071096885937	0.0598066708455675	0.4388096409421235	0.0166074936956861	0.1159149857527353	0.0166074936956861	0.1180665666811015	0.0036806734294551	0.235872591916908	0.0010540554991457	0.0606215277554386	0.0010540554991457	0.0615842616252199	0.0305656362376694	0.0613310988277658	0.0305656362376694	0.0621298620658623	STH	47918	MAPT	152641	KANSL1	178220	False	True	False	alt	-50	0.01645	-45	0.08264
1852	chr17	46056168	C	T	rs111259120	-0.0043417615	0.849918885206367	0.00686938458	0.8455108294450683	0.0107025326326349	0.885955795897022	-4.920672713506206e-05	0.8899013916985136	7.654987037186345e-05	0.885636049150233	0.0009633466398336	0.968217289499827	-4.2873068356557805e-06	0.972744546884208	6.976622392394784e-06	0.9683783144375484	1.0428271768497825e-05	0.9818651245205514	-4.969324209413221e-08	0.980189188153892	7.878553101191273e-08	0.9758073529088428	-2.226914321533436e-05	0.9691516096160944	3.0516974035828564e-05	0.9647536582980726	STH	56917	MAPT	161640	KANSL1	169221	False	False	False	ref	-10	0.00795	-95	0.1707
1853	chr17	46059211	A	C	rs111372048	0.026341578	0.5108925303104863	0.026341578	0.5164953295242207	0.0286185932598044	0.2507288790886069	0.0008230303645928	0.399121669595801	0.0008230303645928	0.4036560060029942	0.0130497179241858	0.6805174404515543	0.0003556786863581	0.6377670157462951	0.0003556786863581	0.6440100202387874	0.0003788154902479	0.6142960093842454	1.1306313340152534e-05	0.5767543879595316	1.1306313340152534e-05	0.582715535539053	0.0012314011414997	0.6114446764723501	0.0012314011414997	0.6174955120014058	STH	59960	MAPT	164683	KANSL1	166178	False	False	False	alt	-70	0.1001	-30	0.03622
1854	chr17	46059268	G	A	rs62060785	-0.00659676842	0.7593187931605879	0.01027545478	0.7594270414245554	0.0385738423485635	0.1229249888592472	-0.0002443066083198	0.5937046484924522	0.0003951564040782	0.593067291454408	0.0119791494836857	0.6948178106684397	-8.179007593571337e-05	0.7801878701803815	0.000128919940453	0.7808853994812784	0.000451814765959	0.5802007699107105	-2.7008132286609006e-06	0.6968629842993688	4.652789466410363e-06	0.6973180031807485	-0.00030187060803	0.7647732123993211	0.000501468113886	0.7654253345262055	STH	60017	MAPT	164740	KANSL1	166121	False	False	False	ref	-100	0.01289	-90	0.252
1855	chr17	46063981	A	G	rs2838	0.0092444022	0.6735217101603385	0.0144979906	0.6759074060046179	0.0717739228040149	0.0169447810008363	0.0005727037573291	0.3193052632830341	0.0010402439669981	0.3212877621395768	0.1368777011645937	0.2445550981785982	0.0016864413994228	0.3829222714735509	0.0020950823181594	0.3854464529204244	0.0098752789890568	0.0790243236832517	0.0001166209196252	0.2248551986171833	0.0001520291957493	0.2266445966207114	0.0029609712645574	0.4050697793910749	0.0038764804856322	0.4077204208269998	STH	64730	KANSL1	161408	MAPT	169453	False	True	False	alt	50	0.01236	-30	0.02954
1856	chr17	46064755	G	A	rs76307183	-0.020326435102	0.5767835433689799	0.020326435102	0.5712512146597322	0.0147217078191499	0.6923927718526929	-0.0003336700516961	0.6300844091955814	0.0003336700516961	0.6249241119860351	0.0365279931378047	0.5125299282240742	-0.001001289487717	0.5798386871978144	0.001001289487717	0.5733463634407311	0.00055269456625	0.5665310435632072	-1.7732405488822125e-05	0.6064238776023309	1.7732405488822125e-05	0.5998541751916435	-0.0027564250602091	0.5425600497770401	0.0027564250602091	0.5362163450846227	STH	65504	KANSL1	160634	MAPT	170227	False	False	False	ref	-30	0.01582	-70	0.05667
1857	chr17	46068970	A	C	rs62060802	0.0411247056	0.3425382171624845	0.0411247056	0.3467329081201588	0.0695229490918727	0.0185793976136195	0.0029196783768764	0.1239568601052901	0.0029196783768764	0.1253909936151234	0.0007678730493879	0.974539457961681	3.401351879879904e-05	0.8795263141972308	3.401351879879904e-05	0.8866542547059049	5.430177144444252e-05	0.875864663604687	2.4242074104268783e-06	0.7543260502930056	2.4242074104268783e-06	0.7608845910228018	0.000135264425456	0.8812429829996996	0.000135264425456	0.8883080787864996	STH	69719	KANSL1	156419	MAPT	174442	False	False	False	alt	100	0.04602	-95	0.09406
1858	chr17	46075892	A	G	rs62060840	0.0750848272	0.1654284690318725	0.0750848272	0.1679156807179793	0.0193425727097903	0.5082328863992464	0.0015125644812556	0.2301610282128748	0.0015125644812556	0.2333775092937286	0.0015580152419913	0.940102943690083	0.0001169939826996	0.7674352582776693	0.0001169939826996	0.774053879213598	3.134708798728087e-05	0.930406441471219	2.431067643247175e-06	0.7550834926280487	2.431067643247175e-06	0.7615488376974526	0.0004123915410246	0.7641211660942985	0.0004123915410246	0.7706325097627539	STH	76641	KANSL1	149497	MAPT	181364	False	False	False	alt	25	0.03943	-100	0.1749
1859	chr17	46082483	T	C	rs17576165	0.113898483	0.080264033026309	0.113898483	0.0813131696100138	0.0412394311374169	0.0993550192128727	0.004707202023668	0.0595473036676117	0.004707202023668	0.0602268573001338	0.0524644518491636	0.4251380973123803	0.0060421254163411	0.2071095600527553	0.0060421254163411	0.210731581500344	0.0021633540444856	0.2972010762173145	0.0002495870233093	0.1471606764547068	0.0002495870233093	0.1498700535998008	0.0144510243805878	0.1388000763049668	0.0144510243805878	0.141581545126795	STH	83232	KANSL1	142906	MAPT	187955	False	False	False	alt	80	0.03116	95	0.0849
1860	chr17	46103631	C	T	rs62061812	-0.082930579	0.1592875981714392	0.082930579	0.1570891784315434	0.0823232540239395	0.009395881323359	-0.006983472165837	0.048582023387953	0.006983472165837	0.0481285219095468	0.0055912045132129	0.8111504345222048	-0.0005792047146573	0.6061905171761665	0.0005792047146573	0.600096985259418	0.0004658666099217	0.5796062336603262	-4.927390708499164e-05	0.4024034988001649	4.927390708499164e-05	0.3969899115636005	-0.001837616706806	0.5726031777149869	0.001837616706806	0.5664847476287513	STH	104380	KANSL1	121758	LRRC37A	189103	False	False	False	ref	90	0.03864	-55	0.05176
1861	chr17	46106250	C	A	rs17576989	-0.0156164419999999	0.5126439845897733	0.027397122	0.5091519593789254	0.0151292025353612	0.6838458365382493	-0.0002696983936928	0.5727607622259467	0.0004412155474045	0.5692190723480448	0.012618356372274	0.6963097643490832	-0.0003150531500313	0.670311234989324	0.0003677166100316	0.6665039554463466	0.0001899872628654	0.7283493099574988	-5.277275280931084e-06	0.6903626709437911	6.044012581843001e-06	0.6864708324285724	-0.0010235558048233	0.6477762130220838	0.0012116063475305	0.6438276851510374	STH	106999	KANSL1	119139	LRRC37A	186484	False	False	False	ref	90	0.1139	-65	0.05328
1862	chr17	46107062	T	C	rs111295615	-0.0139191012	0.2898030820635943	0.0492823203999999	0.2888228821939407	0.0690902339812465	0.0188055286691877	-0.0010297165718319	0.0936939453902973	0.0033188793909055	0.0936286095114891	0.09346029494243	0.3352464697678984	-0.0017748230609213	0.2720547375558924	0.0044605161226678	0.2707576316455483	0.0065417728000603	0.1380024635209991	-0.0001310387055335	0.146560133865721	0.0003054767571276	0.1460987327944498	-0.0025271353633994	0.2382466355344826	0.0086668206261752	0.2371806608209967	STH	107811	KANSL1	118327	LRRC37A	185672	True	True	False	ref	-50	0.01678	60	0.0586
1863	chr17	46114469	A	G	rs17577313	0.021575039	0.5683992859351233	0.021575039	0.5747392602633657	0.0176735124167519	0.5727951215394577	0.000358641456547	0.5874544548761911	0.000358641456547	0.5939530777318638	0.0042385602586519	0.853817427282054	0.0001036020242849	0.7959842237719134	0.0001036020242849	0.8027269774648789	7.31181983556131e-05	0.8564387654706316	1.7535753703026271e-06	0.7989087984914621	1.7535753703026271e-06	0.8055127729018184	0.0004255880703374	0.77420474248574	0.0004255880703374	0.7807741406440308	KANSL1	110920	STH	115218	LRRC37A	178265	False	False	False	alt	-15	0.04047	-50	0.04565
1864	chr17	46115029	G	T	rs4548919	0.0236808418999999	0.5429950295487095	0.0236808418999999	0.5489735365361365	0.0164392582087515	0.6139470004255944	0.0003588003656376	0.5940608525519916	0.0003588003656376	0.6004148470854495	0.0027267328692553	0.892892702112773	6.808346072541037e-05	0.8295148621319781	6.808346072541037e-05	0.8362470148850008	4.280329609534517e-05	0.8993972103579126	1.019457416083341e-06	0.8379754100254303	1.019457416083341e-06	0.8447015509694278	0.0002796014648147	0.8145510521527309	0.0002796014648147	0.8212968194876383	KANSL1	110360	STH	115778	LRRC37A	177705	False	False	False	alt	-30	0.003296	-100	0.08154
1865	chr17	46118769	G	A	rs77560794	-0.065993318	0.2192938552555976	0.065993318	0.2160923970763525	0.017186115037323	0.5742616313133819	-0.0012974015046654	0.3061375064161628	0.0012974015046654	0.302128302998034	0.063869552307743	0.4013456674059967	-0.0049560902617086	0.2753256026726162	0.0049560902617086	0.2712845932547422	0.00125122089073	0.4279446273287299	-0.0001105840210463	0.3065000569274405	0.0001105840210463	0.3023002343420505	-0.0104689716604532	0.2175276731408691	0.0104689716604532	0.2140488679764647	KANSL1	106620	STH	119518	LRRC37A	173965	False	False	False	ref	100	0.04443	30	0.03848
1866	chr17	46121440	T	C	rs3087534	-0.0320705782	0.1728135392419101	0.0751463162	0.1725236739682664	0.0215723517814175	0.4284392491007894	-0.0011699324556329	0.2187782403498178	0.0017360854504601	0.2184365910596291	0.008746824585134	0.7801175728053418	-0.0007385128845614	0.5756460098300948	0.0008129871269882	0.5742077960839478	0.0002312406385175	0.7448106571335833	-2.097356466260321e-05	0.5502322019200541	2.194671355365184e-05	0.5485735741026319	-0.0020157698525287	0.5373550921735029	0.0023225891590511	0.5356285379664404	KANSL1	103949	STH	122189	LRRC37A	171294	False	False	False	ref	10	0.01605	80	0.1041
1867	chr17	46124314	A	C	rs55672516	-0.04815082996	0.3259424948260491	0.04815082996	0.3217931314346852	0.0465486234850847	0.0708795190976501	-0.002440318032702	0.1877140098739119	0.002440318032702	0.1854883048769276	0.0403426148922832	0.4779114561025329	-0.0022515083373453	0.412774457815407	0.0022515083373453	0.4076959274161851	0.0019222405423088	0.3233031202544193	-0.0001143225241844	0.2998766977336747	0.0001143225241844	0.2955280192920146	-0.0057182211078485	0.3582458018734657	0.0057182211078485	0.3533176522210118	KANSL1	101075	STH	125063	LRRC37A	168420	False	False	False	ref	60	0.0918	65	0.3674
1868	chr17	46143984	G	A	rs2532307	-0.1309050258	0.0790911385804875	0.1309050258	0.07801673588161	0.0319551548573863	0.2010280829014312	-0.0050409839401385	0.0860711059860088	0.0050409839401385	0.0849709688782171	0.001086239319059	0.9582913568183794	-0.0001670392510062	0.7584769336962234	0.0001670392510062	0.7518576159626995	3.739260333946121e-05	0.9126906337487262	-6.920233959440837e-06	0.6816493987159544	6.920233959440837e-06	0.6753188627297927	-0.0004618785259476	0.7731631930172296	0.0004618785259476	0.7664070925758326	KANSL1	81405	STH	144733	LRRC37A	148750	False	False	False	ref	-100	0.1132	90	0.05237
1869	chr17	46169258	C	A	rs2532276	-0.08880597	0.1291292371405075	0.08880597	0.1271834665918198	0.0253791061293454	0.3168268098547414	-0.0023017381383814	0.1498018284360006	0.0023017381383814	0.1477406717576465	0.0106248556629605	0.7222663626916541	-0.0009907574149969	0.4928757246634377	0.0009907574149969	0.4873586501321234	0.0002759726080747	0.6710901051155286	-2.613094605324253e-05	0.4543911107645595	2.613094605324253e-05	0.448829661563665	-0.0031440731087723	0.4405874907200821	0.0031440731087723	0.4351858497664422	KANSL1	56131	LRRC37A	123476	STH	170007	False	False	False	ref	-50	0.007324	-95	0.09155
1870	chr17	46189165	G	A	rs2696566	-0.075804827	0.1835460143959778	0.075804827	0.1809296955468183	0.1427123911228249	0.0008570342433585	-0.0112461746412833	0.0220300611469144	0.0112461746412833	0.0219148902081933	0.0312798983867242	0.5311037938928855	-0.0026377884902163	0.358370736556645	0.0026377884902163	0.353461285477922	0.0047271892238546	0.180597626457613	-0.0004123122593775	0.1340417773041529	0.0004123122593775	0.131556713356869	-0.0069323018046252	0.2931721808711208	0.0069323018046252	0.2886371128154251	KANSL1	36224	LRRC37A	103569	ARL17B	172601	False	True	False	ref	100	0.1421	90	0.3987
1871	chr17	46708970	T	A	rs199437	7.533677999999912e-05	0.5724154854006708	0.0212473036199999	0.572611134281657	0.0243747320796364	0.3459850613858247	2.2033278439919e-05	0.5026106632379632	0.000539763607677	0.5024796722787078	0.0001286661607996	0.9992919803829886	3.774598660747915e-07	0.9840616259341788	2.5161759005364505e-06	0.9862055162877964	3.088121613800064e-06	0.9979114916787928	9.947495339815929e-09	0.9771318908654624	6.319957866281776e-08	0.9781012140221672	3.299132328197681e-06	0.9849022848542563	8.24783082049421e-06	0.9872756984048068	NSF	118300	WNT3	124184	WNT9B	124232	False	False	False	alt	-55	0.02832	-80	0.1011
1872	chr17	46709947	G	C	rs538628	-0.1510008352	0.0532028326391549	0.1510008352	0.0526314208316869	0.0207049431080295	0.4601988598086575	-0.0033818139431081	0.1116270317437391	0.0033818139431081	0.1102770926380138	0.0012495463693048	0.9557013893245178	-0.0002428192738409	0.7248845679931485	0.0002428192738409	0.7183981944533153	2.8308031205939184e-05	0.9392738560509578	-5.778888628850313e-06	0.7029556728359848	5.778888628850313e-06	0.6965544671846297	-0.0006326086239318	0.7454851260230887	0.0006326086239318	0.7388644029658291	NSF	119277	WNT3	123207	WNT9B	123255	False	False	False	ref	-100	0.00986	-35	0.05774
1873	chr17	46711919	A	G	rs199436	0.00099861396	0.6854392435153123	0.01462874764	0.6839109990098067	0.012872013916497	0.7918292723383469	2.394657763520958e-05	0.7488328627532373	0.0001891499885231	0.7476007920245409	0.0780797400283725	0.3539808459946181	0.0001901503048306	0.5124354756198612	0.0009996932588018	0.5111489891689491	0.0010285839886196	0.4393252414516396	3.498313327224689e-06	0.5691580794588459	1.3452150951057438e-05	0.5679607909713557	0.0002226914321533	0.5141381273247878	0.0024166144304047	0.5127751557178957	WNT3	121235	NSF	121249	WNT9B	121283	False	False	False	alt	-100	0.02455	100	0.12036
1874	chr17	46714277	G	A	rs199438	0.01304316992	0.6935437629559887	0.01416627688	0.6980228106677666	0.0244928283680756	0.3431036853662406	0.0003054913077486	0.6128119389141254	0.0003360407938899	0.6174865396281036	0.0436458711358912	0.4882654490552023	0.0004062196506828	0.5942044309272105	0.0004885463058278	0.5982170034474636	0.0011014163833959	0.4487979004423218	9.498541229018486e-06	0.5579241991703756	1.1737897882382709e-05	0.5619662267752458	0.001201708950546	0.5922505889784436	0.0013831612285968	0.5963716599249158	WNT3	118877	WNT9B	118925	NSF	123607	False	False	False	alt	95	0.01848	95	0.2141
1875	chr17	46723580	C	T	rs199453	0.0285588278	0.4632211848544572	0.0285588278	0.4687812698569974	0.0095011431347915	0.9280704854746852	0.0002756236407647	0.6470932459870608	0.0002756236407647	0.6533918343542132	0.0044018673088976	0.8408068928696367	0.0001196833173323	0.7596595292965647	0.0001196833173323	0.7663288484725949	4.087644457661105e-05	0.9065938149415392	1.120133199537525e-06	0.8206907836283349	1.120133199537525e-06	0.827546621905978	0.0004445580812245	0.7512008687240679	0.0004445580812245	0.7579138381212462	WNT3	109574	WNT9B	109622	NSF	132910	False	False	False	alt	-25	0.02017	-55	0.08795
1876	chr17	46724418	G	A	rs199451	-0.35578747	0.0052004279406735	0.35578747	0.0051936258300509	0.0546196790609119	0.0423768450032282	-0.019680165541725	0.0067653783150783	0.019680165541725	0.006757224181915	0.0259955131800335	0.5638221794342999	-0.0093277903765125	0.1649263881741965	0.0093277903765125	0.1619666425963264	0.0013796668892942	0.3805459767875151	-0.0005003532837552	0.0952535367853789	0.0005003532837552	0.0934173555412168	-0.018392662729702	0.1110738057138696	0.018392662729702	0.1090370609204304	WNT3	108736	WNT9B	108784	NSF	133748	False	True	True	ref	-75	0.02003	0	0.0
1877	chr17	46742756	G	A	rs199442	0.0025924239999999	0.2609272058412583	0.0541920056	0.2616021514947886	0.019068603652305	0.5169938537612212	0.0002302271578381	0.3163491842992442	0.0010409583410659	0.316942805505835	0.0939328956484444	0.3211533333609404	0.001982669041604	0.2423751312695345	0.0048911273674921	0.2435297729007129	0.0018559409692513	0.3377451861387326	5.2794564202537456e-05	0.2633652492230593	9.8824308061055e-05	0.2645407316016632	0.0027786942034244	0.2016999578118091	0.0100994688396951	0.2026956299568041	WNT3	90398	WNT9B	90446	NSF	152086	False	False	False	alt	-10	0.002472	100	0.05908
1878	chr17	46746847	T	G	rs199534	0.0258903314	0.137328218555577	0.0891583794	0.1387212234688992	0.0410686123550615	0.1012820744975757	0.0013937021067239	0.0920941865575257	0.0036019318207472	0.0927651500662697	0.0125383524133152	0.7199843851550429	-3.517288364069996e-05	0.4804374160816033	0.0015274295416496	0.4835273850124663	0.0004991872682228	0.5952776434603132	5.144458951696586e-06	0.3841119044728996	5.968360215581659e-05	0.386922887658277	0.0003266141004915	0.4207783325677185	0.0041222658440829	0.423804660214427	WNT3	86307	WNT9B	86355	NSF	156177	False	False	False	alt	5	0.001831	30	0.1067
1879	chr17	46765770	C	T	rs199528	-0.0929962467999999	0.1337222893506504	0.0929962467999999	0.1319952030957634	0.0434045822323849	0.0876790278792213	-0.0045886048898461	0.0855834638785762	0.0045886048898461	0.0847997636567836	0.240605720695457	0.144496903564928	-0.0222491475248111	0.0820807635851898	0.0222491475248111	0.0805418258206901	0.0104930814908049	0.0698904920804336	-0.0010963885804641	0.0570510545277062	0.0010963885804641	0.0561485137574809	-0.0291296888918214	0.0622444888099799	0.0291296888918214	0.0613692664620136	WNT3	67384	WNT9B	67432	GOSR2	157306	False	False	False	ref	-60	0.02179	-100	0.2041
1880	chr17	46771151	C	A	rs199523	-0.1486902302	0.0555835165831511	0.1486902302	0.054986072282203	0.0578680254820442	0.0363913680685573	-0.0096882562932736	0.0295380469531507	0.0096882562932736	0.0292708796523256	0.833146382501402	0.0055066825478189	-0.1250885065136532	0.0065979736378569	0.1250885065136532	0.0066012295067841	0.0484540514706906	0.002501910877815	-0.0081873395857609	0.0055373325288031	0.0081873395857609	0.0055730045834862	-0.0183316287816303	0.1131297166766503	0.0183316287816303	0.1110709619762285	WNT3	62003	WNT9B	62051	GOSR2	151925	True	False	False	ref	55	0.01251	-35	0.04697
1881	chr17	46777214	A	C	rs199518	0.0296555898	0.3488012747545454	0.0423647978	0.3512912665166123	0.096399106850678	0.0057315861388983	0.0035577389837759	0.0789338328288099	0.0045582147794438	0.0793164731217554	0.0645854640229619	0.4009403143135446	0.0005732313338685	0.3427180275603473	0.0023831645020688	0.3447588894082058	0.0057144933458281	0.1484509944781167	8.787850855942256e-05	0.1630590885031107	0.0002303574380396	0.1643527641857354	0.0020627824882055	0.3086193909650156	0.0056786315199102	0.3106581829012539	WNT3	55940	WNT9B	55988	GOSR2	145862	False	True	True	alt	100	0.1367	90	0.0626
1882	chr17	46777221	A	G	rs199517	0.009932445652	0.7204847879493309	0.012904481892	0.7241814449062399	0.0475223330936157	0.0707706071377774	0.0005005267582904	0.5169939783100764	0.0005993161193514	0.5199747061462288	0.0621383326185212	0.410177776299354	0.0002624404603226	0.5604764884147035	0.0006816960244616	0.5633492997490768	0.0025713153214824	0.2748295037971166	1.5456031347261754e-05	0.4562584144028563	2.939192786095178e-05	0.4587804966674689	0.0008082874204084	0.5770279855837588	0.0016512157302628	0.580086018757611	WNT3	55933	WNT9B	55981	GOSR2	145855	False	False	False	alt	90	0.148	80	0.05667
1883	chr17	46779275	G	C	rs199515	0.10684862154	0.118451331892189	0.10684862154	0.1196110279639835	0.0422559948912322	0.0945098387777246	0.005011555025356	0.0965995307877756	0.005011555025356	0.0974381372736836	0.705841938570156	0.0144848699066321	0.0786906174512922	0.0246248843682381	0.0786906174512922	0.0249391722408495	0.0303144839297238	0.0091801079339534	0.0037603398525908	0.0250304114835537	0.0037603398525908	0.025276309285537	0.0205478209230971	0.1184918099884151	0.0205478209230971	0.1207358834446984	WNT3	53879	WNT9B	53927	GOSR2	143801	True	False	False	alt	100	0.05444	70	0.1802
1884	chr17	46783637	C	T	rs199504	-0.0264293167	0.5223367668384172	0.0264293167	0.5167392497760106	0.089006711955565	0.0069000918732849	-0.0023284634655801	0.1540874657778181	0.0023284634655801	0.1519793413248867	0.3750602091649896	0.0760692823656696	-0.0101534659671307	0.1617088814840685	0.0101534659671307	0.1589571091032387	0.0326169022558994	0.0078406482184899	-0.0008760250549028	0.0627812105250671	0.0008760250549028	0.0615928007435046	-0.0083558774042426	0.2437355480424324	0.0083558774042426	0.2398757861079325	WNT3	49517	WNT9B	49565	GOSR2	139439	False	True	True	ref	-100	0.1313	-100	0.398
1885	chr17	46784796	G	A	rs199503	0.0424946084	0.3472755405329732	0.0424946084	0.3520948306799711	0.062511108414945	0.0287599052002873	0.0029406822697377	0.1385674864784576	0.0029406822697377	0.1403251781327843	0.0343513905842763	0.513692526304177	0.0015162314839227	0.4276394646774175	0.0015162314839227	0.4328967610976505	0.0022914546558896	0.3040928166712066	0.0001136253684878	0.2722269954689839	0.0001136253684878	0.276288668027867	0.0041915476229751	0.383064972965208	0.0041915476229751	0.3881255233304842	WNT3	48358	WNT9B	48406	GOSR2	138280	False	False	False	alt	60	0.03445	-55	0.185
1886	chr17	46788237	T	C	rs199498	-0.047665264	0.292041603644638	0.0515314559999999	0.2891916787607894	0.0301941992447185	0.222373714876611	-0.0015300605911857	0.234249689418196	0.0016188732354947	0.2323462226303264	0.0205222526475536	0.6278141537168014	-0.0008138325178075	0.519836113400393	0.000891255846491	0.5163640258060378	0.000636471778944	0.5515956069819364	-2.714320409856153e-05	0.4538963471517594	2.8921742421137225e-05	0.4504619659774759	-0.0023770248424663	0.4824555250880461	0.0026459041272144	0.4788334819696651	WNT3	44917	WNT9B	44965	GOSR2	134839	False	False	False	ref	45	0.06616	50	0.0904
1887	chr17	46881571	A	G	rs4968282	0.01857869434	0.625588122267488	0.01857869434	0.632287973567294	0.0982474344698569	0.0045964352594652	0.001784489477479	0.2318665802067989	0.001784489477479	0.2348072677691898	0.0189287717330341	0.6385366474433656	0.0004141919382423	0.6680064377873409	0.0004141919382423	0.6742609915873758	0.0018601551725889	0.345077036627707	3.916456688148658e-05	0.4443401604531631	3.916456688148658e-05	0.4498372944266293	0.0011703671934281	0.6513382680410144	0.0011703671934281	0.6575828664568262	GOSR2	41505	ENSG00000262633	41563	WNT9B	48369	False	True	False	alt	-100	0.0455	-100	0.1918
1888	chr17	46885958	G	A	rs34316808	0.1474592506	0.0523509176234094	0.1474592506	0.0528737087479411	0.0341859410421495	0.1656457605384666	0.0052089034206559	0.058770817893619	0.0052089034206559	0.0594449361447252	0.0580581307116227	0.4241661096116504	0.0097575156895967	0.1749854380963854	0.0097575156895967	0.1781631080452931	0.0020254155559265	0.3288685361401371	0.0003475527892124	0.143082097082444	0.0003475527892124	0.1458113449805241	0.0197032430470785	0.1098786287766443	0.0197032430470785	0.1119299395552215	GOSR2	37118	ENSG00000262633	37176	WNT9B	52756	False	False	False	alt	65	0.04453	-50	0.2437
1889	chr17	57657987	A	G	rs4530197	-0.0421627603	0.3890407454412061	0.0421627603	0.38423087638391	0.0293011456788283	0.2368944986860537	-0.0011895897275185	0.3356678658106498	0.0011895897275185	0.3314720786195175	0.0822886080960707	0.3434688844239438	-0.0029164172804025	0.3425348829999576	0.0029164172804025	0.337943872928293	0.0024433657979656	0.2826257300141215	-8.35750110752806e-05	0.3019248053573425	8.35750110752806e-05	0.2976447593897956	-0.00631041536076	0.3138781518243703	0.00631041536076	0.3092770757213243	CCDC182	87312	MRPS23	192069	CUEDC1	297425	False	False	False	ref	-95	0.01874	-10	0.01074
1890	chr17	57668632	G	T	rs12603880	-0.0398641964	0.3113737611275664	0.0510907604	0.3094221523578356	0.0953155670262416	0.0052664991834062	-0.0037774979770266	0.0798001867734647	0.0050187008857741	0.0793955471840109	0.0103592755105406	0.7275610525527102	-0.0005323220789776	0.6114651204912764	0.0005638043108921	0.6075416891098565	0.0009501654849917	0.4556023471170073	-5.092897639815516e-05	0.3852700084232483	5.44096351439418e-05	0.3821602607110353	-0.0016800831381346	0.5728896883983261	0.0018252449605753	0.5689716447558812	CCDC182	76667	MRPS23	181424	CUEDC1	286780	False	True	False	ref	-15	0.007317	50	0.12225
1891	chr17	63480868	A	G	rs4305	0.0208510246	0.4831250522984958	0.0287009385999999	0.4870971959809673	0.0330835517059469	0.1782770222663177	0.0007120572338455	0.358910508670845	0.000953741868428	0.3619816584589519	0.2681023390848206	0.1266109013765455	0.0055227518754124	0.1937551019935039	0.0078446932488696	0.1960434725557233	0.0089486843952295	0.0859094335996895	0.0001907038091802	0.1605148902944446	0.0002621921801513	0.1623875809422653	0.0069463231170201	0.2247146899386294	0.0095757315825937	0.2271732476852949	ACE	3806	ENSG00000264813	3956	CYB561	34514	False	False	False	alt	75	0.1895	85	0.3792
1892	chr17	80556797	A	G	rs72855201	0.00975614562	0.783040217377755	0.00975614562	0.7893178217123242	0.0297137707847055	0.2310839062740404	0.0002790306575794	0.6880690949657197	0.0002790306575794	0.6943627231140116	0.0019794793969185	0.9268741599600986	1.940487022732117e-05	0.9324999807395664	1.940487022732117e-05	0.9394526729451256	6.603118380141134e-05	0.8726813315759658	5.989116149000577e-07	0.9012333407376784	5.989116149000577e-07	0.9082081904004567	5.855959882550618e-05	0.9412954312266264	5.855959882550618e-05	0.9471652049824104	ENSG00000289764	11721	RPTOR	11977	NPTX1	78954	False	False	False	alt	-40	0.005737	-100	0.1191
1893	chr17	80581712	G	T	rs114177791	-0.0172573088	0.2962791140868848	0.0516680995999999	0.2958492196399945	0.0681582302573829	0.0196727637522654	-0.0016666771595105	0.1043635696096643	0.0036805691995371	0.1045328296000095	0.3996742106825904	0.0694993503977718	-0.0008833470578582	0.0914691429812429	0.0199080053560296	0.0912732159318367	0.0263992814055171	0.0126951045975469	-0.0002502626118064	0.04231854852751	0.0013646400739641	0.0422836306524035	-0.0065562007192108	0.1337084754719439	0.0164519481376397	0.133382271318802	ENSG00000289764	36636	RPTOR	36892	NPTX1	103869	False	True	False	ref	-100	0.3943	-100	0.4148
1894	chr18	4999143	G	A	rs11665120	-0.04805739008	0.3036838508434338	0.04805739008	0.2997700235591192	0.0388750139455078	0.1180216946953897	-0.0018735952632822	0.2085820197075794	0.0018735952632822	0.2060172342648299	0.0273687770116459	0.5742939266167103	-0.0016523521246836	0.4747489672535484	0.0016523521246836	0.4693326103688204	0.00103554089162	0.4539747326596959	-5.9668009510351e-05	0.386720762170829	5.9668009510351e-05	0.3816975998987409	-0.0045899178516049	0.4129557733125241	0.0045899178516049	0.4077575559852329	AKAIN1	198360	ZBTB14	297910	DLGAP1	543836	False	False	False	ref	70	0.03052	0	0.0
1895	chr18	29784902	T	C	rs113895388	-0.02058908666	0.5997881446409353	0.0215797502599999	0.5956472732301753	0.0126280213863865	0.7985091610072148	-0.0002901272420859	0.6872189784092924	0.0003016131569524	0.6830874894395856	0.0004882715845732	0.9890690019803994	-1.6250367522320986e-05	0.9625254079723624	1.6499577698825266e-05	0.9582241183210156	6.492467304926022e-06	0.9911970152172253	-2.3763048111807694e-07	0.9659914483702196	2.405198645385111e-07	0.9617148904207616	-5.278611725114596e-05	0.9609163454651822	5.44356834152448e-05	0.95655722464021	DSC3	1257913	DSC2	1317698	DSC1	1377954	False	False	False	ref	20	0.0058	-25	0.02768
1896	chr18	29821318	T	G	rs188275234	-0.0141030425999999	0.3413666651530679	0.0422469546	0.3389628355761878	0.0364435018839546	0.1391492180718015	-0.0005597940422869	0.2263132238407304	0.0015375564209564	0.2248865219864135	0.098983867242915	0.3034934213800963	-0.0020495607173048	0.2694187061099405	0.0040249549292471	0.2671119435940155	0.0036236093777589	0.2109088372695205	-7.878423125196842e-05	0.2091040699369443	0.000147412434235	0.2070912661612912	-0.0038682326548117	0.2331966627360321	0.0086486753983701	0.2310679123478912	DSC3	1221497	DSC2	1281282	DSC1	1341538	False	False	False	ref	-50	0.0195	-40	0.1138
1897	chr18	29901722	G	T	rs11083369	-0.00068561424	0.7632348850703427	0.01056452504	0.7648434198598961	0.0191219306667925	0.5112495495325969	1.1818096576545077e-05	0.7308627110330248	0.0001999299565089	0.7326378944790455	0.0039581340107551	0.8537075850640686	-9.546715714326723e-07	0.8724069074896585	4.34593488116453e-05	0.8741192507748391	7.69063932571635e-05	0.8421182419024555	6.86220003344504e-08	0.8601263706653683	8.248813171795929e-07	0.8618884702908168	2.0619577051224733e-05	0.8610382327208409	0.0001822770611328	0.8626773236023559	DSC3	1141093	DSC2	1200878	DSC1	1261134	False	False	False	ref	-30	0.0376	-50	0.1991
1898	chr18	53185406	A	C	rs7505145	-0.0122944392	0.5411169757124196	0.0237819676	0.5410812761735022	0.0376647323853605	0.129375012193772	-0.0004148444301203	0.3858994861937449	0.0008943500317693	0.3866345814501702	0.0204183299792154	0.6297865858692561	-0.0006191675679507	0.6124424119375264	0.0007104470859774	0.6122580564999108	0.000720598852444	0.518393583570584	-2.252738808506745e-05	0.5229760178571533	2.62248897365208e-05	0.5227762629275244	-0.0018433901883804	0.5771750301416337	0.0021601068918873	0.5765868376255672	DCC	845208	MBD2	1039263	POLI	1084112	False	False	False	ref	100	0.02003	65	0.1329
1899	chr18	53198529	G	A	rs62099231	-0.0724122618	0.180298009212568	0.0724122618	0.1777554458909727	0.0384040769914904	0.1220508494984744	-0.0028352881691276	0.1208840554011199	0.0028352881691276	0.1193548801126345	0.0229858797136352	0.5951632112870544	-0.0019487610861819	0.4085095120599589	0.0019487610861819	0.4034267532096721	0.0009021326962142	0.472823722368544	-7.830495708642556e-05	0.320563772700164	7.830495708642556e-05	0.3159941972798089	-0.0052398469202599	0.348195389228639	0.0052398469202599	0.3433651366393527	DCC	858331	MBD2	1026140	POLI	1070989	False	False	False	ref	-15	0.01111	-15	0.03027
1900	chr18	53256222	A	G	rs4100041	0.00927276146	0.3677954762297883	0.04135287854	0.3675945595625554	0.0176241087260826	0.5726074315766772	0.0002887891969539	0.4178919724364996	0.0008194389544675	0.4177119109945743	0.0001080465837484	0.9996753769151314	1.2884051979685251e-06	0.9821462348617126	3.6030567302319263e-06	0.9833790562537266	1.914779855292885e-06	0.9992950710361684	3.4193358045764074e-08	0.977845954670492	6.998784089147988e-08	0.9791003690300768	4.123915410247102e-06	0.9861641542991656	1.0722180066642473e-05	0.9866282912710148	DCC	916024	MBD2	968447	POLI	1013296	False	False	False	alt	-10	0.001251	-25	0.0657
1901	chr18	53318766	T	G	rs77916462	-0.0001766083999999	0.5809421366897948	0.0220604396	0.5801384552563498	0.1027502946728961	0.0043875240062811	0.0002984037299252	0.1724371380146039	0.0021979402508715	0.1716551501021321	0.0003925967470554	0.9927873584586628	-3.1404535850157696e-06	0.9668477137622934	8.539937103423365e-06	0.9653019330339964	3.9737286341215e-05	0.9139431047101338	-1.8488409739461665e-07	0.8685160232465021	8.47093648469298e-07	0.8670948390724501	-6.598264656395371e-06	0.9709272612930268	2.6393058625581457e-05	0.9693161047654032	MBD2	905903	POLI	950752	DCC	978568	False	False	False	ref	-40	0.01459	90	0.1724
1902	chr18	53318768	T	G	rs75048819	-0.00629079888	0.6039831552842947	0.01992974192	0.6021660129237602	0.0948052961724731	0.0068341667247581	0.000227252117376	0.2023976834524064	0.002198823153199	0.2011896479056868	0.0003942463132195	0.9927833282201594	-2.599049373755223e-06	0.9687266746603556	7.331751645305018e-06	0.9675689954565464	3.780536345946506e-05	0.9206583692150048	3.4083395646065134e-08	0.8793392123721786	8.137808108011311e-07	0.8782776744592004	-6.598264656395387e-06	0.9681148554066789	2.804262478968032e-05	0.9669537291507608	MBD2	905901	POLI	950750	DCC	978570	False	False	False	ref	-45	0.01346	90	0.1411
1903	chr18	53425189	G	A	rs138740375	0.0570759135999999	0.1893173626550678	0.0697745388	0.1911061374431304	0.0162937718195923	0.6191365317336177	0.0011120740834714	0.2825584237822623	0.0012637790286063	0.2853176386371473	0.0210212464121935	0.6288759009201783	0.0017929293283377	0.4316730520691532	0.0019084532586438	0.4358516195524156	0.0003930296913864	0.6450977252400115	3.671756649526505e-05	0.4531972732718419	3.809768059974683e-05	0.4575106405019734	0.0050344759328296	0.3625764091696026	0.0054287222460492	0.3664295953127297	MBD2	799480	POLI	844329	C18ORF54	932718	False	False	False	alt	95	0.1191	-95	0.1296
1904	chr18	55083457	T	G	rs11874716	-0.0147189864	0.543380936819311	0.0238898636	0.5395500269479739	0.0460007296534895	0.0740726244635113	-0.0007787711424026	0.2964223911079945	0.0011242489359766	0.2936739279490716	0.0216645772161921	0.6097731631543966	-0.0001505816779436	0.5917442966736105	0.0004916417324015	0.5878187479016443	0.0009115466345161	0.4634847718053199	-7.999754304959181e-06	0.4697974313797469	2.084789005786235e-05	0.4661881956111116	-0.000686219524265	0.5725125378742254	0.0015258487017913	0.5687112722511205	CCDC68	123996	RAB27B	365596	DYNAP	495699	False	False	False	ref	-50	0.02774	-55	0.0141
1905	chr18	55085469	C	T	rs4801131	-0.1007363976	0.1143555128960235	0.1007363976	0.1128645144215894	0.0299707611262614	0.2291659450676534	-0.0032845138113493	0.1184734920241538	0.0032845138113493	0.1170646064922698	0.0253884728316452	0.5629057967824577	-0.0025903654223907	0.3485241418046678	0.0025903654223907	0.3435597056750647	0.0007994650214708	0.4855014646632228	-8.995485539963955e-05	0.2981419450224284	8.995485539963955e-05	0.2938056777223732	-0.0068630200257331	0.2861381803897528	0.0068630200257331	0.2816355326286069	CCDC68	126008	RAB27B	367608	DYNAP	497711	False	False	False	ref	15	0.01584	-80	0.1433
1906	chr18	55086009	C	T	rs4589643	0.0015073741399999	0.6850422013719221	0.01561413306	0.6839481945795527	0.0821789393287291	0.0102066658320511	-0.0001169514365461	0.3137012811801401	0.0012274618664995	0.3130972489688824	0.0120533799610702	0.6991703251878527	2.6696351113663165e-05	0.7505203060913709	0.0001754434768266	0.7495021637100899	0.001056815140591	0.4432715066455087	-7.404615948197339e-07	0.5568388896592088	1.4093245888716274e-05	0.5559499345594541	0.00010062353601	0.737362073391116	0.0006103394807164	0.7364571630987904	CCDC68	126548	RAB27B	368148	DYNAP	498251	False	True	False	alt	-95	0.0696	-90	0.1176
1907	chr18	55157406	C	T	rs4608411	-0.0053054534	0.6014280476237089	0.019881767	0.6004398715500364	0.0122409190032998	0.8207003801064449	-9.032836294833636e-05	0.6881373575087087	0.0002556724653452	0.686782486601383	0.0003554815083632	0.9925276364282468	-5.406205810957736e-06	0.967820376015522	9.302247569684185e-06	0.967527162633184	4.838731845252746e-06	0.9939186042839102	-8.672751766494392e-08	0.9710488875707538	1.314210598411605e-07	0.9714754218751916	-2.391870937942348e-05	0.9658870914903632	3.711523869221421e-05	0.966038343760875	CCDC68	197945	RAB27B	439545	TCF4	507381	False	False	False	ref	70	0.03027	-100	0.1154
1908	chr18	55205375	T	G	rs78468782	-0.13466734316	0.0759701644857936	0.13512436084	0.0755085723499444	0.034793866176082	0.1597454558837796	-0.0052763352382215	0.0814559808508458	0.0052877126305806	0.0811768826995614	0.0470489261324271	0.4788678135355967	-0.0068647019058129	0.2480133388752554	0.0068670898235809	0.2447466122116376	0.0015726659115554	0.3833521251533372	-0.0002396299952567	0.2013554508358595	0.0002396894421412	0.1989096673974349	-0.0146629936326745	0.1714867591739089	0.0146761901619873	0.169222482887233	CCDC68	245914	TCF4	459412	RAB27B	487514	False	False	False	ref	-100	0.02588	-100	0.07544
1909	chr18	55207250	G	T	rs79694868	-0.1765931359999999	0.0322723258722267	0.1765931359999999	0.0319023569648974	0.0255312281516452	0.3183667157884794	-0.0044706040092738	0.0642552254438681	0.0044706040092738	0.0635525805311881	0.1651677608788888	0.2336178265209003	-0.0320036531914824	0.0672546362463418	0.0320036531914824	0.0662606063704358	0.004330479807288	0.2130663635727784	-0.0008283330850634	0.0804920336927474	0.0008283330850634	0.0793614638536277	-0.0378336247566889	0.040902498068553	0.0378336247566889	0.0402843744321849	CCDC68	247789	TCF4	457537	RAB27B	489389	False	False	False	ref	-85	0.0448	-25	0.176
1910	chr18	55210035	C	T	rs9953026	-0.08783557236	0.150444320115009	0.08783557236	0.148714868032089	0.0250237162454707	0.3369080039603235	-0.0025038912357997	0.1840468278935035	0.0025038912357997	0.1822638504928488	0.0030673682821417	0.8912771442395836	-0.0003081693142751	0.7280480621425804	0.0003081693142751	0.7216426549275408	9.92046326154684e-05	0.8498415435281578	-1.1834704918933855e-05	0.6786444860681777	1.1834704918933855e-05	0.6723554160659998	-0.0009278809673055	0.7119897459736895	0.0009278809673055	0.7057509593169453	CCDC68	250574	TCF4	454752	RAB27B	492174	False	False	False	ref	-100	0.02002	60	0.1407
1911	chr18	55212207	T	C	rs74776973	-0.01194801588	0.7503629995947487	0.01194801588	0.7436504179881019	0.0305163460804708	0.2154687526248253	-0.0003799302730094	0.6054423516471086	0.0003799302730094	0.5989137548391302	0.0031366500610339	0.878297916394563	-4.2404136589873326e-05	0.8891516840125387	4.2404136589873326e-05	0.8822187969009193	9.57761939937868e-05	0.8135546142889021	-1.3608769542888166e-06	0.8367109868081614	1.3608769542888166e-06	0.8297949428383675	-0.0001542344363432	0.8871011535873303	0.0001542344363432	0.8802975581827822	CCDC68	252746	TCF4	452580	RAB27B	494346	False	False	False	ref	100	0.01276	-30	0.01807
1912	chr18	55213644	C	A	rs79467351	-0.0015392596	0.5422563896253237	0.0240941795999999	0.5421211301665579	0.0141870577419175	0.7180654506935138	4.7247397570113024e-05	0.6160760630770433	0.0003526546220727	0.616043173721945	0.0748127742403747	0.3704862910216724	-0.0007736092134888	0.4179331116838491	0.0021319496743234	0.4176619810262203	0.0010176645379995	0.444720903753187	-5.259935236410448e-06	0.4722990774261835	2.932987658049038e-05	0.4723084880283066	-0.0009171587872389	0.4012596816928526	0.0044686747385437	0.4010937480651261	CCDC68	254183	TCF4	451143	RAB27B	495783	False	False	False	ref	-100	0.0468	10	0.01837
1913	chr18	55219838	T	C	rs76339649	-0.027239468	0.2555205531541518	0.0547103719999999	0.2538658461169429	0.1416615623848314	0.000879075576826	-0.0028672392801396	0.0318216447329342	0.00779124115631	0.031717228262222	0.0190063013427467	0.6270305854618398	-0.0003990177682902	0.4870344767618746	0.0010583521052727	0.4844338648067433	0.0027749216195008	0.2681261529684069	-3.821251728522783e-05	0.2192199644733523	0.0001563944104894	0.217325048694034	-0.0011951106858895	0.4376409671592157	0.0032471709940285	0.4352811212483914	CCDC68	260377	TCF4	444949	RAB27B	501977	False	True	False	ref	-60	0.0198	-45	0.01892
1914	chr18	55220120	A	T	rs187698281	0.0011405937259999	0.885987295250475	0.004925082834	0.8851493723106991	0.0123537694498543	0.7984159357856555	9.318089176992193e-06	0.8963126762208047	6.726116653528238e-05	0.8960184403166992	0.0202748177229388	0.6094844022990551	1.067180274584406e-05	0.806398230168853	0.000109813448721	0.8056069129816482	0.0002607949557303	0.6820149613014281	-3.761042477841996e-08	0.8315324051568573	1.526520858883334e-06	0.830588773966352	7.752960971264228e-05	0.8039096910382477	0.0003695028207581	0.8031873687174848	CCDC68	260659	TCF4	444667	RAB27B	502259	False	False	False	alt	15	0.001007	95	0.1752
1915	chr18	55221949	T	A	rs116959829	0.084025666	0.1369207785383169	0.084025666	0.1390884972938012	0.0155775809596521	0.6599525128688668	0.0013272532358093	0.2496769047147532	0.0013272532358093	0.2531669244731703	0.2395425753026953	0.1474592866734509	0.0196282084365816	0.0818385641857342	0.0196282084365816	0.083563972956577	0.0036759976481778	0.2105028617853281	0.000304597759043	0.1284700738774167	0.000304597759043	0.1308201013645268	0.0255897199036653	0.0655436143137578	0.0255897199036653	0.0667986444622796	CCDC68	262488	TCF4	442838	RAB27B	504088	True	False	False	alt	-45	0.05457	-30	0.2427
1916	chr18	55236277	G	T	rs73487018	-0.0694270272	0.2034705141997119	0.0694270272	0.2007805197349263	0.0373967744470315	0.1347265634089729	-0.0028116523654194	0.1419290193390787	0.0028116523654194	0.1401695002400298	0.0363341691135231	0.4945873409368142	-0.0025441887249148	0.3484742128916373	0.0025441887249148	0.3437808154544734	0.0013440567824179	0.3857923311296168	-0.0001026529292752	0.2731922968869772	0.0001026529292752	0.269037625460343	-0.0068044604269076	0.2844002846951299	0.0068044604269076	0.280067261221649	CCDC68	276816	TCF4	428510	RAB27B	518416	False	False	False	ref	100	0.0703	100	0.06506
1917	chr18	55236451	A	G	rs73487023	0.0362020906	0.3404394505508124	0.0431252006	0.3434521506387751	0.051304485741674	0.0515258151144853	0.001869220629541	0.1644218587835629	0.0022028652263171	0.1655983941344025	0.0505484807495627	0.432805085632004	0.0019476813396617	0.3621135232779314	0.0022926834086289	0.3654334779606765	0.0025734203228817	0.2667982270545754	9.984840363807042e-05	0.2441455276441448	0.0001164750462242	0.2466593658886862	0.0047936392728712	0.3190203548491443	0.0056860545676486	0.3222643054426284	CCDC68	276990	TCF4	428336	RAB27B	518590	False	False	False	alt	-70	0.04346	-5	0.01807
1918	chr18	55242449	A	C	rs150458109	-0.011730236	0.6005827866047329	0.0196478104	0.598514029861017	0.0230483792724631	0.3838330476629564	-0.0002785938556896	0.5482547900368523	0.0004636883523198	0.5464039862759004	0.007362013790373	0.7756397663359307	-7.876103622713887e-05	0.757303428774916	0.0001643308795429	0.7560259735245001	0.0001737051462188	0.7411993360079993	-1.9662406693373727e-06	0.7267921504185946	3.97474604695674e-06	0.7254670826541982	-0.0002878492956351	0.7410358233740337	0.0006144633961267	0.7396618035409745	CCDC68	282988	TCF4	422338	RAB27B	524588	False	False	False	ref	45	0.04626	45	0.0485
1919	chr18	55247745	T	C	rs142300078	-0.01708657046	0.6376209119355389	0.01708657046	0.6310011517208717	0.0263103178062143	0.2999144176561406	-0.0004311146336206	0.5465569257043345	0.0004311146336206	0.5405695647297527	0.0276327075979017	0.5962778499520219	-0.0006066206965716	0.6156509189320138	0.0006066206965716	0.6091172391404175	0.0006811024042466	0.5533329181676276	-1.4733106931122891e-05	0.5817959128531881	1.4733106931122891e-05	0.5754248329215104	-0.0018103988650984	0.5884472560512901	0.0018103988650984	0.5818502183998345	CCDC68	288284	TCF4	417042	RAB27B	529884	False	False	False	ref	-55	0.014755	-75	0.02197
1920	chr18	55272905	G	T	rs146016468	-0.041973773	0.3511288009133805	0.041973773	0.3464295657936957	0.0200569897685063	0.4809379341751544	-0.000827380632945	0.3751839209887058	0.000827380632945	0.37030376421621	0.3153789053478935	0.1031757324199623	-0.0142899949124732	0.1233389819623856	0.0142899949124732	0.1210554059274747	0.0063521006739367	0.1302355934581575	-0.0002841873675276	0.1493845085647466	0.0002841873675276	0.1467058835067831	-0.0137986209626867	0.1529937895453352	0.0137986209626867	0.1501501783218602	CCDC68	313444	TCF4	391882	RAB27B	555044	False	False	False	ref	-85	0.1624	-90	0.6025
1921	chr18	55273297	A	G	rs1261115	-0.00830035278	0.7431709250452753	0.01156886198	0.7386715192468636	0.0119111538300757	0.8287657508294751	-8.26606383752e-05	0.8150034710682331	0.0001337663409025	0.8106568345116082	0.1453342021048463	0.2332949367254936	-0.0010128452262382	0.4467676882860189	0.001377062801405	0.4430819605762777	0.0017017047981476	0.3412715631880987	-1.0171190732799026e-05	0.5231948556011806	1.5866017643789743e-05	0.5191604810891309	-0.0020817524990927	0.4790914519385106	0.0027696215895219	0.4754694498694667	CCDC68	313836	TCF4	391490	RAB27B	555436	False	False	False	ref	-90	0.10657	-20	0.0296
1922	chr18	55278031	G	A	rs56666482	0.065540682	0.2252335330443987	0.065540682	0.2283113618188828	0.0140074161407447	0.7306567928897953	0.0010246062708726	0.3579121952661711	0.0010246062708726	0.3622919894544329	0.0067417769126719	0.7896270954456841	0.0004922658621056	0.611501815091369	0.0004922658621056	0.6175138648702084	0.0001006713232379	0.8207150234566611	8.093718444018011e-06	0.6438994247245988	8.093718444018011e-06	0.6500512568177873	0.0015406947972682	0.5788003645505332	0.0015406947972682	0.5846891919739177	CCDC68	318570	TCF4	386756	RAB27B	560170	False	False	False	alt	75	0.01224	100	0.0485
1923	chr18	55282426	T	C	rs1261117	0.01162709612	0.6044737032103762	0.0198728042799999	0.6059488386394052	0.018918012365465	0.5268367361202574	0.0002671614830713	0.5988772983445563	0.0004012697129491	0.6005528779193181	0.0014128534195506	0.9429409775145738	1.8618048205297603e-05	0.9025466276507956	3.1298802402439534e-05	0.9037511685847454	2.647817478103945e-05	0.936744259393976	4.2803646811697293e-07	0.892811382685887	6.340796158397406e-07	0.8939769381974703	7.50552604664833e-05	0.9004549677191083	0.0001195935468971	0.901724433771292	CCDC68	322965	TCF4	382361	RAB27B	564565	False	False	False	alt	100	0.004356	100	0.05542
1924	chr18	55286318	T	C	rs1788031	0.012419658992	0.6642568064432423	0.015655072192	0.6685533879854426	0.0551639791653044	0.0488730933652239	0.0009965075123508	0.379501856578713	0.0010748303715789	0.3821790091932383	0.0261414997855563	0.5790090487694656	0.0005557192810763	0.6415910462571092	0.0006236196202247	0.6453883996860861	0.0016361090040384	0.3944767408541122	4.435175098327552e-05	0.4953224032559205	4.5995481933308144e-05	0.4991319241841201	0.0013749133977763	0.6270372591525518	0.0015646135066477	0.6310844629035562	CCDC68	326857	TCF4	378469	RAB27B	568457	False	False	False	alt	30	0.01178	30	0.0605
1925	chr18	55341866	A	G	rs79926379	0.0472326525	0.2788013951942293	0.0526251067	0.2815315579072794	0.0392017311120897	0.1157097916252423	0.0019170101476742	0.1842208402320726	0.0021515119724906	0.185895533411204	0.0155001484609547	0.6551294136977797	0.0009042409751366	0.5147228509268272	0.0009834083439287	0.5188629283252124	0.0006265648866674	0.5291867232406587	3.85754551878175e-05	0.4161136590143457	4.201820904098345e-05	0.419910507418089	0.0026871432813169	0.4678467644749	0.0029609712645573	0.4720246990524637	TCF4	322921	CCDC68	382405	RAB27B	624005	False	False	False	alt	-70	0.00836	100	0.0213
1926	chr18	55364663	T	C	rs77355441	0.0759198358	0.1671507978076744	0.0759198358	0.169580344416664	0.0253730755115071	0.3194594696090816	0.0018936419598564	0.1893062334812876	0.0018936419598564	0.1918890889879855	0.0010557223450232	0.9644588608535116	6.783179250723351e-05	0.8182749440107262	6.783179250723351e-05	0.8252500995431008	2.799121105468968e-05	0.9374791074603176	1.7338826454862698e-06	0.7793999755903291	1.7338826454862698e-06	0.7860021322170193	0.0002400118768763	0.8261310287844573	0.0002400118768763	0.8330281069507948	TCF4	300124	CCDC68	405202	RAB27B	646802	False	False	False	alt	70	0.003296	95	0.05737
1927	chr18	55396445	G	T	rs78322266	-0.0779267146	0.1677413323173374	0.0779267146	0.1652695684062089	0.0340652423673373	0.1669027297592534	-0.00276211129506	0.1318573193476956	0.00276211129506	0.1300676003862453	0.0383086998119494	0.4924694234074969	-0.0031584608404032	0.3241609006864275	0.0031584608404032	0.3196104508809658	0.0012970321956216	0.3970062694043324	-0.0001106621598541	0.2636744017566477	0.0001106621598541	0.259839073553498	-0.0080721520240176	0.2587998128036355	0.0080721520240176	0.2547202806511698	TCF4	268342	CCDC68	436984	RAB27B	678584	False	False	False	ref	95	0.0252	-40	0.08777
1928	chr18	55398661	A	G	rs17594721	-0.026383224	0.399453090656691	0.0364253252	0.3965310995075835	0.0146046160082515	0.6950786715803594	-0.0004670609229689	0.4920481096135304	0.0005655173028703	0.4886603894110569	0.010599287387417	0.73163368078291	-0.0003227248189376	0.6404587064469934	0.0003892337366512	0.636831177935251	0.0001467514356386	0.7706374949882154	-5.086216287356126e-06	0.6743672001899275	5.738293693749963e-06	0.6705830891352956	-0.0010375771172181	0.6084152318506324	0.0013460459899046	0.6046965843598163	TCF4	266126	CCDC68	439200	RAB27B	680800	False	False	False	ref	-95	0.01538	45	0.03516
1929	chr18	55414923	G	T	rs1371833	0.2484631544	0.0206827254935812	0.2484631544	0.0207864716908611	0.0422220855096803	0.0968410899850511	0.0125541572686688	0.0254922424307651	0.0125541572686688	0.0256217138583715	0.304607238296328	0.1075883770597158	0.0863385249727481	0.0171679709824433	0.0863385249727481	0.0172503165386122	0.0135670783375209	0.0516326756959036	0.0044942682657883	0.0173957683311468	0.0044942682657883	0.0175976464118476	0.0824370690508395	0.0097400649213389	0.0824370690508395	0.0097257080991402	TCF4	249864	CCDC68	455462	RAB27B	697062	False	False	False	alt	-70	0.09845	-100	0.1567
1930	chr18	55428385	A	G	rs73477275	0.1954657534	0.0308904332503415	0.1954657534	0.031130404822794	0.036983367687719	0.1350265406999896	0.0076424306972493	0.0377097118134456	0.0076424306972493	0.0379983634524757	0.0077199696479825	0.7831084748707154	0.0019749005584615	0.4238125790453089	0.0019749005584615	0.4290661657907613	0.0003041232733995	0.6744325360168154	7.955051967051546e-05	0.338000094116847	7.955051967051546e-05	0.3424785016943091	0.004641879185774	0.3842375602272122	0.004641879185774	0.3891196834213491	TCF4	236402	CCDC68	468924	RAB27B	710524	False	False	False	alt	-95	0.006866	-50	0.08325
1931	chr18	55486362	T	C	rs140282719	0.0564751452	0.2499332881689319	0.0564751452	0.2531077504640802	0.0262587003002561	0.2973319877605732	0.0015539226439264	0.2394322032773079	0.0015539226439264	0.2426070294294555	0.0011546963148691	0.9601375140138364	7.056060475505825e-05	0.8304664539092127	7.056060475505825e-05	0.8373415380024009	3.126103932421826e-05	0.9286481380071	2.0300365892233987e-06	0.7864388486299427	2.0300365892233987e-06	0.7932957745615956	0.0002598066708455	0.8325979402150357	0.0002598066708455	0.8394418854290515	TCF4	178425	CCDC68	526901	RAB27B	768501	False	False	False	alt	80	0.146	-90	0.168
1932	chr18	55536474	C	T	rs78431385	-0.0231503844	0.541702550202051	0.0263972774	0.5379867348277134	0.0194774356977974	0.5032925740604148	-0.0004879217059796	0.5459234141886443	0.0005497318666713	0.5421029689989642	0.0007365312922701	0.9809596066686572	-2.383775241404574e-05	0.9338053984438006	2.6663023852681297e-05	0.9296321492610666	1.4823221695452618e-05	0.9730826701969696	-5.235548033528212e-07	0.9225963435050804	5.773386768061817e-07	0.9183735912218236	-7.42304773844342e-05	0.9392229661808532	8.577744053312612e-05	0.9350245366589208	TCF4	128313	CCDC68	577013	RAB27B	818613	False	False	False	ref	-85	0.004105	90	0.0692
1933	chr18	55715473	G	T	rs184174206	0.001954037598	0.9488780484456616	0.001954037598	0.9558309635042485	0.0242805280306764	0.3496089796910647	5.305535898341615e-05	0.914124041651892	5.305535898341615e-05	0.9210395925748855	0.0214237405562336	0.6351899197291321	3.7847577512316965e-05	0.8919355414092236	3.7847577512316965e-05	0.8989774706661127	0.0005696862809559	0.5993511760034306	1.228147057236313e-06	0.8613453242136563	1.228147057236313e-06	0.8682583575860555	0.0001113457160766	0.90764798757755	0.0001113457160766	0.913666717819114	TCF4	50686	CCDC68	756012	WDR7	935871	False	False	False	alt	-100	0.06134	-100	0.2078
1934	chr18	55737463	A	G	rs813043	-0.8615947160000001	0.0002441783104882	0.8615947160000001	0.0002534811270671	0.106885128842275	0.0032080655255015	-0.0934884422931102	0.0004213546075882	0.0934884422931102	0.0004173428094885	0.3288286430668733	0.0968616232114886	-0.308147264322979	0.0010584336670849	0.308147264322979	0.0010736634505328	0.0353729961498901	0.0066697611775603	-0.0335507931412766	0.0006752956002009	0.0335507931412766	0.0006734742597544	-0.2376884629342482	0.0002580483834374	0.2376884629342482	0.000269242713613	TCF4	72676	CCDC68	778002	WDR7	913881	False	True	True	ref	-40	0.04004	-30	0.08594
1935	chr18	55737755	C	T	rs17527878	0.006123338548	0.728642148603731	0.011105588948	0.7329379205370128	0.0265269319566539	0.2965775071396561	0.0001053243912321	0.6458572108851476	0.0002904884127502	0.6496303244909422	0.2781737652997261	0.1225533315692467	0.0017465356944713	0.3847698714576776	0.0027402819021534	0.388267193615625	0.0072414282549892	0.1126358629768396	3.3692714526282524e-05	0.35673186337989	7.062502896966816e-05	0.359675156268184	0.0019077232687803	0.4650324757469792	0.003356042360859	0.468817576569018	TCF4	72968	CCDC68	778294	WDR7	913589	False	False	False	alt	-100	0.039	-100	0.02315
1936	chr18	55747832	T	C	rs77882218	-0.0004086192999999	0.7062255571747174	0.0135107234999999	0.7075794588167565	0.0166758649529219	0.6187890836953627	-2.9862191143600025e-05	0.7078055782705255	0.000229842110656	0.7088662090802869	0.0219095377915607	0.6090652896005652	-0.0002384496973837	0.6570288925883968	0.0004271745116481	0.6580191014836869	0.0003827870869936	0.6306306662615738	-4.797072829160391e-06	0.6681050951130758	7.653242593452474e-06	0.668988353849395	-0.0004981689815578	0.6399846489977086	0.0012470720200586	0.640885101336266	TCF4	83045	CCDC68	788371	WDR7	903512	False	False	False	ref	100	0.3179	100	0.06885
1937	chr18	55786122	A	G	rs72932579	0.0769743908	0.1776174312169076	0.0769743908	0.1802529220377118	0.0190452346894572	0.5188628578214655	0.0015881905991719	0.2445680321508641	0.0015881905991719	0.2479811722420824	0.0028133350928705	0.8963595604403226	0.0002551234293611	0.7138303578464116	0.0002551234293611	0.7200678913484254	5.71572625525488e-05	0.8848869693088096	5.658901200108945e-06	0.7017031680904886	5.658901200108945e-06	0.7078143800416054	0.0008231335158852	0.6935291262201828	0.0008231335158852	0.6999249201949931	TCF4	121335	CCDC68	826661	WDR7	865222	False	False	False	alt	100	0.00856	-100	0.2554
1938	chr18	55822147	C	A	rs75882620	-0.01766186344	0.6037913743549552	0.02105914816	0.6016653888189925	0.0229615538042536	0.3837322508724471	-0.0003790761816319	0.5667163932967441	0.0004626121729151	0.5648961624337738	0.0439419682623469	0.463419137994636	-0.0006599810591804	0.5674414157249072	0.0007828305160349	0.5659562488779254	0.0010295313336814	0.4368175461996439	-1.4363200012866691e-05	0.5474222727816042	1.7385660493291005e-05	0.5458605214923483	-0.001703177064432	0.5504196547647421	0.0021172181716208	0.5486067017832631	TCF4	157360	WDR7	829197	TXNL1	829453	False	False	False	ref	-95	0.05087	-20	0.049
1939	chr18	55889643	G	A	rs148652326	-0.0403600506	0.3594075910155397	0.0403600506	0.3546480221683451	0.0135505255071309	0.7491019272117291	-0.0005519169149704	0.4794667328885932	0.0005519169149704	0.4737590979398926	0.0001072218006663	0.9996917799595804	-4.340325661043164e-06	0.9851319152168134	4.340325661043164e-06	0.9787233002176046	1.4114812101740904e-06	0.999697379172906	-5.759841194188378e-08	0.98641603732369	5.759841194188378e-08	0.980488758508846	-1.2371746230741314e-05	0.9893710485354156	1.2371746230741314e-05	0.984054966343464	TCF4	224856	WDR7	761701	TXNL1	761957	False	False	False	ref	-85	0.00983	-25	0.142
1940	chr18	55898056	T	C	rs17602354	0.0609104888	0.2452928197025942	0.0692025276	0.2461246057352963	0.0706674316548543	0.0171698235794203	0.004816144393624	0.1115170306364515	0.0054197941062487	0.111733392807792	0.5956385470621226	0.0273150343561844	0.0413176276118988	0.0589255311032449	0.0462683244053688	0.0593912469497246	0.0423371544695012	0.0036827833346812	0.0032698758716062	0.0310329249317399	0.0036309833918528	0.0308744416529544	0.0134670581637029	0.1748068127767389	0.0156939724852363	0.1760733907460245	TCF4	233269	WDR7	753288	TXNL1	753544	False	True	False	alt	95	0.04175	85	0.2178
1941	chr18	55924568	C	T	rs61576172	-0.0563433862	0.2477035688841749	0.0563433862	0.2439875258077067	0.0144965880755793	0.7122567846855727	-0.0008156205147243	0.3699894496905254	0.0008156205147243	0.3650769321072672	0.0066056877041337	0.7836969953972935	-0.0003711676672491	0.621189158112605	0.0003711676672491	0.6151151320487782	9.709392614932805e-05	0.8114042951148325	-5.44710704007283e-06	0.6525922406530467	5.44710704007283e-06	0.6463569577845781	-0.0013468707729866	0.5916878799057419	0.0013468707729866	0.5855751514225404	TCF4	259781	WDR7	726776	TXNL1	727032	False	False	False	ref	-100	0.04596	-75	0.05496
1942	chr18	55953317	C	G	rs118115105	-0.133346636	0.0641270056347404	0.133346636	0.0634147217300503	0.0424355480008441	0.0918978684779731	-0.0058070728897357	0.0499596288182682	0.0058070728897357	0.0495069265186814	0.3244927584045396	0.0982413376173446	-0.0428180076055698	0.03612891745755	0.0428180076055698	0.0354172225172702	0.0137092792736406	0.0460421556671088	-0.0018557638948702	0.0287309345225621	0.0018557638948702	0.0281815974253831	-0.0448681996634884	0.0272111240373182	0.0448681996634884	0.0267664617593422	TCF4	288530	WDR7	698027	TXNL1	698283	False	False	False	ref	90	0.05563	95	0.4534
1943	chr18	55957436	C	T	rs56062547	-0.0311969274	0.4481178112816789	0.0311969274	0.4424702332441738	0.0143664927061806	0.71967086012526	-0.0004484262924635	0.5331721012730201	0.0004484262924635	0.5270675286537063	0.052588169311471	0.4299928801369992	-0.0016310611404139	0.4062352550383199	0.0016310611404139	0.4009125322627881	0.0007396469919018	0.494334153535602	-2.293337284755952e-05	0.4563413910350606	2.293337284755952e-05	0.4508278415221071	-0.0042063937184519	0.3758429411922818	0.0042063937184519	0.3706088880434046	TCF4	292649	WDR7	693908	TXNL1	694164	False	False	False	ref	75	0.04907	95	0.06226
1944	chr18	55973548	G	A	rs1424401	0.068281275	0.1918225925067497	0.068281275	0.1946903407772393	0.0335896271613535	0.1738933126667903	0.0023653802548955	0.1473619593765895	0.0023653802548955	0.1495295383134368	0.0315809442116722	0.5328898629087253	0.0019081092562339	0.3653998398301591	0.0019081092562339	0.3703217390874417	0.0010106498442837	0.4415015253432127	6.272226313392066e-05	0.301860072183741	6.272226313392066e-05	0.3064518886060193	0.0055573884068489	0.3071067315703089	0.0055573884068489	0.3116978407188783	TCF4	308761	WDR7	677796	TXNL1	678052	False	False	False	alt	100	0.0605	100	0.242
1945	chr18	55983078	A	G	rs2902193	-0.0840369652	0.1414884951174981	0.0840369652	0.1394753073221239	0.0180060610224407	0.5540834990419775	-0.0015302466148637	0.2241947291696152	0.0015302466148637	0.2209784896343246	0.3015712117713041	0.1118595963685335	-0.0279698882860097	0.0680251614606581	0.0279698882860097	0.0667030836644043	0.0055583024312257	0.1549679572357193	-0.0005191674553425	0.1034202683305766	0.0005191674553425	0.101562182718633	-0.0259056118240902	0.0698591904233932	0.0259056118240902	0.0685538296729759	TCF4	318291	WDR7	668266	TXNL1	668522	False	False	False	ref	100	0.10583	85	0.01563
1946	chr18	55983715	G	A	rs10164243	-0.106960139	0.098023842362101	0.106960139	0.0967999133063555	0.0229495854985725	0.3854906886496325	-0.0025888423418513	0.1412994535089092	0.0025888423418513	0.1394491423222902	0.3328255418824848	0.0952006971295281	-0.033818509716799	0.0491431144852616	0.033818509716799	0.0481199153619385	0.0072632509052746	0.1102541456147021	-0.0007822995514167	0.0666425554316496	0.0007822995514167	0.0654103206308795	-0.0346070733397115	0.0438226735105753	0.0346070733397115	0.043090131969393	TCF4	318928	WDR7	667629	TXNL1	667885	False	False	False	ref	-80	0.1062	-60	0.375
1947	chr18	55998167	G	T	rs1862920	0.3891637719999999	0.0041246719478281	0.3891637719999999	0.004125580718386	0.0649285594558643	0.023366346764992	0.0257902400360704	0.0043961732547954	0.0257902400360704	0.0044138586385524	0.8596235690013527	0.0033150227064261	0.3333582105914965	0.0006249272764234	0.3333582105914965	0.0006009184638006	0.0555804525259357	0.0015034972065009	0.0219924377372072	0.000956845801719	0.0219924377372072	0.0009583437440348	0.0461268186466959	0.0262504099105649	0.0461268186466959	0.0266847680962258	TCF4	333380	WDR7	653177	TXNL1	653433	True	True	True	alt	75	0.1019	100	0.2495
1948	chr18	56112798	T	A	rs1789562	0.0037934227	0.8327708063358524	0.00762579346	0.8344425665561552	0.0099385608025012	0.9107547128840164	3.751873348181943e-05	0.8973829214684241	7.096741966154465e-05	0.8987652437820154	0.0795437299990102	0.3473560952536169	0.0002506833283636	0.5814661766307715	0.0006106426087863	0.5830511779541955	0.0008036933864369	0.4822891200963144	2.4816436290306845e-06	0.6714004573208799	5.683737646114699e-06	0.6728512554650103	0.0005641516281218	0.6127498370042819	0.0013559433868892	0.614457542500151	TCF4	448011	WDR7	538546	TXNL1	538802	False	False	False	alt	-65	0.00464	-20	0.0888
1949	chr18	56221791	A	C	rs75104423	-0.0307144629999999	0.1814809836877076	0.072625677	0.1805585124668522	0.0191289068477332	0.5151351181537112	-0.0006375428347971	0.2587430264870785	0.0013818273585242	0.2576846459342721	0.6990729438157764	0.0155861128811233	-0.0188630566524163	0.0314560067215214	0.0502707169650537	0.0312782629168282	0.0133868122316835	0.0478756451664355	-0.0003979150317943	0.0590519076623256	0.0009555509098785	0.0587350302341117	-0.0078552340734386	0.1416029205131437	0.0154135462373395	0.1408937048882452	WDR7	429553	TXNL1	429809	TCF4	557004	True	False	False	ref	-80	0.1471	-65	0.3066
1950	chr18	56333783	C	T	rs62091470	0.0340658518	0.4204266458456627	0.0340658518	0.4258293192953325	0.0285051936117671	0.2538382495808565	0.0010213236042701	0.3289678184732863	0.0010213236042701	0.3332914038271156	0.0216785985285869	0.6026460956420866	0.0007233987715678	0.5299175900585119	0.0007233987715678	0.5355211644214938	0.0006482677304192	0.5340430865065726	2.2377550417707587e-05	0.4719838420969062	2.2377550417707587e-05	0.4774770428383187	0.0021906238659232	0.5003147259094503	0.0021906238659232	0.5058907258459195	WDR7	317561	TXNL1	317817	TCF4	668996	False	False	False	alt	-45	0.006516	100	0.11145
1951	chr18	56339270	C	T	rs62091471	-0.03182874436	0.456522134150134	0.03182874436	0.4509495288639094	0.0112663409412775	0.8610940172475954	-0.0003850422000363	0.6047460113586581	0.0003850422000363	0.5983198910899775	0.0244762627428985	0.611144141329438	-0.0004490553552088	0.6052417439239243	0.0004490553552088	0.599106720936807	0.0002472996821665	0.704117399297962	-5.230282729224936e-06	0.6719684191736518	5.230282729224936e-06	0.6657338446822674	-0.0014392464781761	0.587097546373522	0.0014392464781761	0.5810651004714568	WDR7	312074	TXNL1	312330	TCF4	674483	False	False	False	ref	100	0.02805	-90	0.1205
1952	chr18	69858790	T	C	rs1808094	0.0283367787999999	0.4701641504771326	0.0283367787999999	0.4760780927096947	0.0682596707060388	0.0195666217981981	0.0019400995583308	0.1761366078543116	0.0019400995583308	0.1785027603937179	0.062751971231566	0.3918965600194475	0.0017200514533816	0.3834445560616863	0.0017200514533816	0.3885824071937063	0.0043250586893092	0.1836848008898809	0.0001184392380063	0.2262764730483961	0.0001184392380063	0.2300226304019468	0.0043334103130876	0.3597173977932589	0.0043334103130876	0.3647701231201934	CD226	103013	RTTN	346936	SOCS6	430256	False	True	False	alt	5	0.0001221	-100	0.2612
1953	chr18	69860524	T	G	rs1790947	0.00880239014	0.7955978406072961	0.00880239014	0.8022102320051839	0.0138902788281624	0.7341411280147877	0.000122932931722	0.8206458104362337	0.000122932931722	0.8273788290324071	0.0026409554287221	0.897406423133458	2.214546826998721e-05	0.9145761557447394	2.214546826998721e-05	0.921534956176047	3.498264228638549e-05	0.9185244250794696	3.005389365592524e-07	0.9232839941396024	3.005389365592524e-07	0.9302139524586112	8.660222361515452e-05	0.9101875233991888	8.660222361515452e-05	0.9171617089764031	CD226	101279	RTTN	345202	SOCS6	428522	False	False	False	alt	100	0.05145	0	0.0
1954	chr18	69866096	T	C	rs56249713	0.01678578758	0.4874564391627896	0.02874434438	0.4906326399012163	0.0374788989704944	0.1322141825477625	0.0004774886884179	0.3492978336125882	0.001034257449601	0.3511879275287331	0.0952698690244465	0.3115214988370022	0.0015756267482902	0.3482561351402859	0.0030262591220323	0.3505810145986424	0.0036281789899638	0.2138480530098604	4.396787802778909e-05	0.2798177569449956	0.0001115066968979	0.2818252668183329	0.0032512949094387	0.3298970443650702	0.0060060704034838	0.3320880420759138	CD226	95707	RTTN	339630	SOCS6	422950	False	False	False	alt	-45	0.02098	55	0.04224
1955	chr18	74871632	C	T	rs2554138	0.00733172214	0.8110014715528812	0.00794127526	0.8157379330242047	0.0111305354984354	0.8647749918650914	8.606831743273752e-05	0.8567398280282725	9.243346247046537e-05	0.8613731581815464	0.0732671307446141	0.3638465403264728	0.0004879902960985	0.5796664022345992	0.0005405124963723	0.5838545211534054	0.0008105654630416	0.4775052406750029	5.57620674545693e-06	0.6477593028917318	6.124660031468136e-06	0.6520265461397343	0.0012314011414997	0.5952856710669585	0.0013749133977763	0.5995706583397489	ZNF407	273761	CNDP1	337131	PTGR3	337507	False	False	False	alt	100	0.01535	100	0.06885
1956	chr18	74903496	T	C	rs2554132	-0.0217519701999999	0.5877626966740896	0.0217519701999999	0.581701952655079	0.0227062028244668	0.3914325829693524	-0.0004793461260523	0.5314957901356748	0.0004793461260523	0.5254473872682872	0.0039680314077397	0.8536102304059721	-9.312215887882376e-05	0.8150241432111743	9.312215887882376e-05	0.8083969907526951	8.904708952781419e-05	0.8239470973199817	-2.039556522019384e-06	0.7873645284585576	2.039556522019384e-06	0.7807478830889435	-0.0003323875820658	0.8077915462285002	0.0003323875820658	0.8011893358898217	ZNF407	305625	PTGR3	305643	TSHZ1	307260	False	False	False	ref	55	0.006165	-70	0.0685
1957	chr18	74934989	G	A	rs17055966	-0.0896404988	0.1495756089969331	0.0896404988	0.1482379173715275	0.0447391662862829	0.0851818385031035	-0.005212108427411	0.0946676545234792	0.005212108427411	0.0936283834977182	0.0725066807429645	0.3706075772444196	-0.0075289703212428	0.2237027290058324	0.0075289703212428	0.2199391930132659	0.0035634881770563	0.2298651691688371	-0.0004451919488766	0.1487829242239632	0.0004451919488766	0.1463789576307062	-0.0158713008478769	0.1557257186720732	0.0158713008478769	0.1531931916678824	PTGR3	274150	TSHZ1	275767	ZNF407	337118	False	False	False	ref	-90	0.03375	95	0.04813
1958	chr18	74937840	T	C	rs2930551	0.0225400514	0.5538528986225989	0.0225400514	0.5599683983638153	0.0164951468981197	0.6170969270708667	0.000356711752981	0.5889983982362158	0.000356711752981	0.5951870814951162	0.0156659298604466	0.6676843895848286	0.0004089902560271	0.6427430564512482	0.0004089902560271	0.6489727216220276	0.0002498768264978	0.691874449012964	6.113232986157905e-06	0.6599366665627474	6.113232986157905e-06	0.6661750740660505	0.0013509946883969	0.6170771745046524	0.0013509946883969	0.6233726945435126	PTGR3	271299	TSHZ1	272916	ZNF407	339969	False	False	False	alt	90	0.01497	100	0.09467
1959	chr18	74938238	T	C	rs4891202	0.1787577511999999	0.0365894431673315	0.1787577511999999	0.0369847344687234	0.056340804444847	0.0388789676332177	0.0108358039492445	0.0227166801742377	0.0108358039492445	0.0228127971138641	0.0222180066642472	0.6107889809420375	0.0048901194183978	0.2830899717885213	0.0048901194183978	0.2871142043222841	0.0013693976949064	0.4115890201961511	0.0003108502930045	0.1721688103179277	0.0003108502930045	0.1749301845886072	0.0108071327240935	0.2135552175598472	0.0108071327240935	0.2168690809052437	PTGR3	270901	TSHZ1	272518	ZNF407	340367	False	False	False	alt	-100	0.05368	-75	0.2869
1960	chr18	74943689	G	C	rs7243542	-0.0533668901999999	0.2660267535237459	0.0533668901999999	0.2620985387966261	0.0155435670477277	0.6665932291744522	-0.0008455334123876	0.3676334369852009	0.0008455334123876	0.362670249818216	0.0240613968526277	0.606206942752235	-0.0011199362374662	0.4778582630100407	0.0011199362374662	0.4724547462768773	0.0003589847460644	0.6446092511341412	-1.6993342862987826e-05	0.5124920790319255	1.6993342862987826e-05	0.5068101856449028	-0.0032875853650489	0.4297355549992646	0.0032875853650489	0.4244584627415842	PTGR3	265450	TSHZ1	267067	ZNF407	345818	False	False	False	ref	100	0.1044	-85	0.1193
1961	chr18	74966476	G	T	rs61019476	0.0558505234	0.2533438983405631	0.0558505234	0.2569769536740633	0.0484098540461029	0.0618420218822657	0.0026408099683579	0.1268027333159981	0.0026408099683579	0.1284689134705267	0.0033428458315462	0.8860468562767063	0.0002227262648204	0.7199510170087159	0.0002227262648204	0.7261479426907769	0.0001585860291421	0.7668752805036259	1.041099357484648e-05	0.5959678057393866	1.041099357484648e-05	0.6020387542936375	0.0007555013031572	0.7025346636218637	0.0007555013031572	0.7087741705660099	PTGR3	242663	TSHZ1	244280	ZNF407	368605	False	False	False	alt	70	0.011444	-30	0.05457
1962	chr18	74973700	A	G	rs4891041	0.2168351122	0.0243845833867031	0.2217478037999999	0.0244548355048693	0.0413062701594714	0.101880129851252	0.0098743295572605	0.0307493991317763	0.0100258843814167	0.0306959312972717	0.0340503447593282	0.5270777930233299	0.0092290778150054	0.1923811010804531	0.0092698602377111	0.1950073739900447	0.0015562345954964	0.3867471222306746	0.0004452034626118	0.1368475889222653	0.0004464615861521	0.1382968126488451	0.0191275444558081	0.1178051115730658	0.0192842532413974	0.1192270983457638	PTGR3	235439	TSHZ1	237056	ZNF407	375829	False	False	False	alt	-100	0.01051	10	0.05615
1963	chr18	74977743	G	A	rs4334389	0.0164536138	0.3593365904714559	0.0405465378	0.362430482944473	0.0171530482215852	0.5841740044396975	0.0003767843560664	0.434995957458569	0.0006273052431782	0.4384960255144189	0.0090379730130975	0.7551722307279147	0.0002572064468365	0.6337596137455535	0.0004153830821959	0.6378461290110885	0.0001485682953583	0.7676320662798203	4.591502775826557e-06	0.6514811550657904	6.236240875369866e-06	0.6555468708201861	0.0009328296657978	0.5946841529203749	0.0014590412721453	0.598724345370581	PTGR3	231396	TSHZ1	233013	ZNF407	379872	False	False	False	alt	-15	0.004044	45	0.0471
1964	chr18	74983478	T	C	rs9963429	-0.009923010484	0.4888125170241053	0.027428513284	0.4866186619697635	0.0151474659719366	0.6846367132320749	-0.0001560233860695	0.5552262588195552	0.0004374738960642	0.5530394294657488	0.2090668404209693	0.1678049444045635	-0.0022422787941158	0.2501934137467139	0.0059108918234184	0.2482211925315895	0.0031967020852923	0.2316293033733879	-3.569494048646102e-05	0.3017249230602088	9.467827993794102e-05	0.2993450051779743	-0.0029354029890138	0.257071244471634	0.008746824585134	0.2548592949465412	PTGR3	225661	TSHZ1	227278	ZNF407	385607	False	False	False	ref	20	0.0131	10	0.02588
1965	chr18	74984205	A	G	rs4891211	0.02432160022	0.526295443518952	0.02432160022	0.5317809995672077	0.0127861544432196	0.7878993241264393	0.0003121924152501	0.6424008385967266	0.0003121924152501	0.6486065819357543	0.0571822110784863	0.4140825686091389	0.0016151418861997	0.4598136090051075	0.0016151418861997	0.4654388381122002	0.000751950157483	0.4952452155815738	2.152056830236092e-05	0.523566896771858	2.152056830236092e-05	0.5295506369554231	0.0039515357460987	0.4299792759186975	0.0039515357460987	0.43552070858969	PTGR3	224934	TSHZ1	226551	ZNF407	386334	False	False	False	alt	5	0.003462	-95	0.05722
1966	chr18	74984423	G	A	rs4891042	0.007411166244	0.7517024575207255	0.010582419356	0.7554327991655073	0.0251596206939191	0.3246309518647994	0.0001878163797407	0.6541291127383358	0.0002729796689434	0.6574908799722806	0.025852825706839	0.5703428625303845	0.0001588170961756	0.7063322405493484	0.0002202045425552	0.7085499234828507	0.0006321884088446	0.5270670699642961	4.06778132170427e-06	0.6646209929583193	5.708599772418064e-06	0.6670058731910992	0.0005575533634653	0.6987748794038992	0.0007555013031572	0.701077029699213	PTGR3	224716	TSHZ1	226333	ZNF407	386552	False	False	False	alt	-100	0.042	-90	0.0611
1967	chr18	74984773	A	G	rs9964094	-0.0180962584599999	0.3082456656444163	0.0530969463399999	0.3090737305228997	0.041646802547817	0.0984495954688907	-0.0011964905799798	0.1928829087381635	0.0024871209224276	0.1937791654155392	0.0082354590742634	0.7721008745796069	-0.000458490586083	0.6338842699658316	0.0006664613514325	0.6347903850111171	0.0003849429666185	0.6408961314960385	-2.610785174884713e-05	0.5185420936119461	3.414833738373495e-05	0.5191602961217819	-0.0011431493517205	0.6038912755617359	0.0018788558609085	0.6044929146841997	PTGR3	224366	TSHZ1	225983	ZNF407	386902	False	False	False	ref	-15	0.006042	30	0.02036
1968	chr18	74984839	A	G	rs9964170	0.1108655951999999	0.0869971557419298	0.1108655951999999	0.0881755182888248	0.0369470780803954	0.1359142725324364	0.0041445591609819	0.0738146850408389	0.0041445591609819	0.0747224236495288	0.0116046979644353	0.724186267313539	0.0014461810435833	0.4528277308402638	0.0014461810435833	0.4582743451771401	0.0004349705467765	0.6161886698705413	5.497391784603148e-05	0.3674834978967948	5.497391784603148e-05	0.3723093038568404	0.0040414371020421	0.4001496400668133	0.0040414371020421	0.4054160402595673	PTGR3	224300	TSHZ1	225917	ZNF407	386968	False	False	False	alt	-80	0.01187	-35	0.0647
1969	chr18	74986065	T	G	rs2920353	0.1619845108	0.0394855104377091	0.1619845108	0.0398805524826096	0.0497457954719829	0.0569991912840233	0.0080708003530706	0.0280798083693066	0.0080708003530706	0.0282120220741176	0.1892654481871267	0.1892268772222484	0.0323965950755185	0.0526613358411375	0.0323965950755185	0.0536392358281321	0.0091132181456823	0.0863366949256317	0.0015605262858177	0.0347559127890374	0.0015605262858177	0.0352983981584813	0.0439799082841212	0.0280903083497397	0.0439799082841212	0.0285382660506476	PTGR3	223074	TSHZ1	224691	ZNF407	388194	False	False	False	alt	45	0.04297	30	0.05518
1970	chr18	74986330	T	C	rs9947731	0.0733177148	0.1807792576351878	0.0733177148	0.1835849764848234	0.0145248745869629	0.7088889071399961	0.0011572937504645	0.3077566866404503	0.0011572937504645	0.3117167743136804	0.0973211045495034	0.3138855582484898	0.0067762514538123	0.2006569540693323	0.0067762514538123	0.2042530214348524	0.0013403935491469	0.3882621396183079	0.0001010566533725	0.2587983133770554	0.0001010566533725	0.2628981607199248	0.0134431394543234	0.1543551741784726	0.0134431394543234	0.1571350625495317	PTGR3	222809	TSHZ1	224426	ZNF407	388459	False	False	False	alt	-95	0.1279	-100	0.11646
1971	chr18	74994128	A	G	rs7241108	0.0511333833999999	0.2733597415084886	0.0511333833999999	0.2773531120215638	0.0283649431058729	0.2543103426326769	0.0014648424079321	0.2283086314510929	0.0014648424079321	0.2315396288058427	0.1526508528257068	0.222937465035282	0.0078971676573681	0.1744597827531014	0.0078971676573681	0.1777725907153371	0.0043114088525171	0.1826184742341851	0.0002252251040102	0.1578311649226536	0.0002252251040102	0.1606849486255661	0.0136897495958562	0.1468715699387164	0.0136897495958562	0.1496489692014305	PTGR3	215011	TSHZ1	216628	ZNF407	396257	False	False	False	alt	-70	0.04468	-100	0.2219
1972	chr18	74997815	C	T	rs9961644	-0.0042652685999999	0.6564058893713568	0.0165321046	0.6559858483530894	0.0106846523883089	0.8851509919020415	-5.412225675215946e-05	0.7570232313751835	0.0001839650980031	0.7563109119284556	0.0184198805714096	0.621485056715655	-0.0001333251349769	0.6549744423550689	0.0003060911464675	0.6541461411715683	0.0002021883110063	0.7134953717147147	-1.6002541827044563e-06	0.7200077010370887	3.459994706258204e-06	0.7189700820886428	-0.0003134175711787	0.6406993166330053	0.0010062353601002	0.6398371805302583	PTGR3	211324	TSHZ1	212941	ZNF407	399944	False	False	False	ref	-100	0.0707	-30	0.0861
1973	chr18	75010176	C	T	rs7234127	-0.0443314078	0.2518677154295241	0.0555253166	0.2494172053947899	0.0194845120495416	0.4972662997621847	-0.0009894301081935	0.2998546215994664	0.0011293092984794	0.29719387514246	0.1375564976411203	0.2419801509157842	-0.0064827991659708	0.1850465425128605	0.0076473925890289	0.1824993193154855	0.002756294724043	0.2605263967715358	-0.0001434723598163	0.2070429248737514	0.0001580251303143	0.2044984502351635	-0.0119403846788294	0.1497486881250656	0.0140996667876348	0.1478030767199859	PTGR3	198963	TSHZ1	200580	ZNF407	412305	False	False	False	ref	95	0.04694	-90	0.04095
1974	chr18	75017058	T	C	rs9950694	-0.0238520079399999	0.5089781589290451	0.0286320316599999	0.5064970982255049	0.0155356031808403	0.666393450421148	-0.0004226801765796	0.5632439699422304	0.0004967956930493	0.5608136208727784	0.0030772656791263	0.8813171128698772	-4.690208927262864e-05	0.842927798463839	7.011870762991138e-05	0.8415644724097514	4.723864486752021e-05	0.8953087493167031	-8.251390419099919e-07	0.8459060768639218	1.1902496087190003e-06	0.8445408283904156	-0.0001525848701791	0.8392267642094129	0.0002416614430404	0.8379279693221892	PTGR3	192081	TSHZ1	193698	SMIM21	410645	False	False	False	ref	-75	0.00787	70	0.09406
1975	chr18	75019182	T	C	rs894577	-0.0274927147999999	0.4985519482033937	0.0274927147999999	0.4924172558705311	0.0329546090889849	0.1798800632244639	-0.0009151393584297	0.3495720517687249	0.0009151393584297	0.3449184377524615	0.0144485500313417	0.6854046918768774	-0.0003673549655889	0.6380735332231551	0.0003673549655889	0.6317882674999747	0.0004790627648863	0.5923892338968495	-1.2297389908660776e-05	0.5591112089682145	1.2297389908660776e-05	0.553065260490927	-0.0013443964237405	0.6051199339306542	0.0013443964237405	0.5989255666471335	PTGR3	189957	TSHZ1	191574	SMIM21	408521	False	False	False	ref	100	0.0421	100	0.1959
1976	chr18	75024241	T	C	rs9319675	-0.01642387318	0.626383146815149	0.02103617666	0.6245804191244246	0.0381652829838052	0.1238255522901881	-0.0006890047933383	0.4808476992770317	0.000851641584009	0.479232120888977	0.0249364917026821	0.5643159307407111	-0.0003976254581507	0.6462198409411689	0.0005105595639572	0.6445054056272582	0.0009585289061198	0.4446154167491759	-1.6716905067514133e-05	0.5500016603794252	2.069255615306813e-05	0.5481730898836534	-0.0011093332453564	0.6316672206468779	0.0014573917059813	0.6297803858774309	PTGR3	184898	TSHZ1	186515	SMIM21	403462	False	False	False	ref	100	0.01312	100	0.0321
1977	chr18	75026772	G	A	rs4891221	-0.0843935079999999	0.1657058385640585	0.0843935079999999	0.1634575530079761	0.0233201483237185	0.3766666175353928	-0.0021860228317354	0.1992607137965227	0.0021860228317354	0.1968519801979904	0.0417167035069776	0.4748949342807951	-0.0038066054066169	0.3070966969631173	0.0038066054066169	0.3026597810010426	0.000977366124118	0.4469114436524504	-9.796062512619016e-05	0.2968814793395369	9.796062512619016e-05	0.292637663455485	-0.0090742634687076	0.2406915455024661	0.0090742634687076	0.2368381470930264	PTGR3	182367	TSHZ1	183984	SMIM21	400931	False	False	False	ref	95	0.07465	-100	0.1433
1978	chr18	79736856	C	A	rs115000070	0.0024040773	0.7148947032946182	0.0134684853	0.7143213949002079	0.1373077042033615	0.0010297416479056	0.0002077228363519	0.2040239529136242	0.0018719814947265	0.2035540496821885	0.313519019497872	0.1046441080576442	0.0002264330536188	0.2827354601102932	0.0038331488581118	0.2822456330763364	0.0436577140296194	0.0036072932642156	8.455838306668838e-06	0.094367373855417	0.0005446221098748	0.0938440686721702	0.000484972452245	0.3785384562895862	0.0043004189898056	0.3780502002083606	CTDP1	57052	KCNG2	61083	SLC66A2	214801	False	True	True	alt	0	0.0	25	0.04395
1979	chr18	79787535	A	G	rs12457876	-0.0904107002	0.1360897253149701	0.0904107002	0.1341631599304634	0.0566918645429349	0.0380461002722311	-0.0055679049033402	0.0607923427139717	0.0055679049033402	0.0602499409283313	0.3942949754214641	0.0722215857275728	-0.0366045654533423	0.0473816582419493	0.0366045654533423	0.0464678185284203	0.0225099356103437	0.0184536006104148	-0.0022469459439358	0.0267732093956448	0.0022469459439358	0.026411109670429	-0.0303957309227672	0.0575062114262653	0.0303957309227672	0.0565732841760551	KCNG2	10404	CTDP1	107731	SLC66A2	164122	False	False	False	ref	-100	0.05066	100	0.1814
1980	chr18	79818986	G	A	rs11664298	0.0067568313999999	0.439932560657863	0.0317828473999999	0.4420325979608776	0.0882777310151319	0.0071570257349169	0.0008113295973053	0.1222131684687355	0.002860007698919	0.1227625303690462	0.265938108277523	0.1279778459470026	0.0013454046185257	0.1778071496826048	0.0079038528642314	0.1789493740925101	0.0231337376341816	0.0167902732895679	0.0001666580249285	0.069579751909856	0.0007024097222793	0.0703059380732907	0.0024603279337534	0.2011215737581143	0.0102561776252845	0.2024103053626791	KCNG2	21047	SLC66A2	132671	CTDP1	139182	False	True	True	alt	-90	0.01813	20	0.0691
1981	chr18	79871198	A	G	rs59183289	0.2783551979999999	0.0112616609439875	0.2783551979999999	0.0112870110211124	0.1025379856712667	0.0039490294844556	0.0301304295807584	0.0038274228200487	0.0301304295807584	0.0038475356521838	0.519225693642572	0.0400474382709601	0.151291069410475	0.0044444686223117	0.151291069410475	0.0044265565177622	0.0543679096441324	0.0017963865069202	0.0168050706237266	0.0018720155342391	0.0168050706237266	0.0018610023746479	0.0867886245917323	0.0059189742475461	0.0867886245917323	0.0059632081528171	KCNG2	73259	SLC66A2	80459	HSBP1L1	93385	False	True	True	alt	-100	0.04648	-45	0.0475
1982	chr18	79871679	A	C	rs72980085	-0.004574639	0.1284377066992729	0.092787533	0.1288336150193648	0.0429473968928785	0.091467412429541	-0.0013322562894326	0.0834442063194318	0.0042697113200889	0.0839250279060455	0.7249472138827489	0.0129071452040068	-0.0014473787435163	0.0186982871208961	0.0676640505839604	0.0187988705208288	0.0311212078677709	0.0085985910700028	-0.0008791456204713	0.0174745581624964	0.0030845249625733	0.017566454632292	-0.001568737422058	0.1148946849134986	0.0181353304081025	0.1152352604506599	KCNG2	73740	SLC66A2	79978	HSBP1L1	92904	True	False	False	ref	60	0.0839	90	0.1699
1983	chr18	79876077	C	T	rs56197868	-0.114965648	0.0833813799027128	0.114965648	0.0822263265857464	0.0679083521326144	0.0198875874587524	-0.007935590975051	0.0301091029940414	0.007935590975051	0.0299843040928238	0.3691324931543004	0.0805784325497108	-0.0428338182259332	0.0352533927017404	0.0428338182259332	0.0345521027341968	0.0252726543585011	0.0140657357581132	-0.0029830806227995	0.0163182847286738	0.0029830806227995	0.0160807443340357	-0.0397034080036949	0.0332371958341946	0.0397034080036949	0.0326784176421054	SLC66A2	75580	KCNG2	78138	HSBP1L1	88506	False	True	False	ref	-100	0.04846	45	0.04944
1984	chr18	79881226	A	G	rs4239346	0.1365045894	0.0760507994440196	0.1365045894	0.0770263719855294	0.0333979777801172	0.1768024532904533	0.0044850843871072	0.0875794413228385	0.0044850843871072	0.0884670787064559	0.7353815446537559	0.0112625192693509	0.1035555370387415	0.0125840485811188	0.1035555370387415	0.0127020617705196	0.0249349785197655	0.0146823182140877	0.003450280743541	0.018476795451013	0.003450280743541	0.0188100030935746	0.0235624030879878	0.0910277743429053	0.0235624030879878	0.0925784528885904	SLC66A2	70431	KCNG2	83287	HSBP1L1	83357	False	False	False	alt	-5	0.01831	35	0.2461
1985	chr18	79881902	C	G	rs11662267	0.0281235214	0.1757219854568404	0.0834370094	0.176149677081805	0.0168026387018128	0.6024609621156185	0.000596163965995	0.2737365816338988	0.0016425215016412	0.2741688112984907	0.524248622612253	0.0391570868850379	0.0213744245113107	0.040800519456539	0.0496197374671197	0.0411272428440754	0.0090341771375936	0.0878157078207189	0.0004626888820832	0.0780282486608171	0.0009957590855572	0.0784875154185648	0.0041313384579855	0.0936595630824385	0.0225668899079541	0.0941377848998089	SLC66A2	69755	HSBP1L1	82681	KCNG2	83963	False	False	False	alt	70	0.01959	-60	0.03943
1986	chr18	79956624	G	A	rs12953577	-0.235297422	0.0191906834057163	0.235297422	0.0190360030429954	0.0467025215739707	0.0725538695140441	-0.0114128924506727	0.020624447949068	0.0114128924506727	0.0204683728115541	0.0689444426115931	0.4028974282175707	-0.0195111699852891	0.1176602561092322	0.0195111699852891	0.1157728876780671	0.0029341381382419	0.2658721433057858	-0.0008612622643069	0.0835692801394244	0.0008612622643069	0.0822672781213837	-0.0324494407970703	0.064924512469892	0.0324494407970703	0.0639484049805902	SLC66A2	4967	HSBP1L1	7959	TXNL4A	77325	False	True	False	ref	-95	0.01686	5	0.01709
1987	chr19	2129707	A	G	rs56862829	0.103816759	0.0952291597289773	0.103816759	0.0966097578215121	0.0297148250050002	0.2292191830794271	0.0030762447088225	0.1027550269202107	0.0030762447088225	0.1040845313270281	0.5942289927749002	0.0268532593052654	0.0638786685225975	0.0190682062820379	0.0638786685225975	0.0193536878950718	0.0176968133493626	0.0294380943234097	0.0018920465910866	0.0262571060867531	0.0018920465910866	0.0266376182244329	0.0274364092243739	0.0587824636681288	0.0274364092243739	0.0598339879849716	MOB3A	33034	IZUMO4	33277	DOT1L	34227	False	False	False	alt	-100	0.0679	75	0.05566
1988	chr19	2131294	C	T	rs72486339	-0.0087831762	0.6977157810666335	0.0147345582	0.6934971053058446	0.0138827638448251	0.7434952111378591	-0.000122234045908	0.7387559542912546	0.0002034089022856	0.7346024437582882	0.1358722905875754	0.2579205653136087	-0.0015557209520972	0.3950853025788565	0.0019434757350345	0.3913542082270249	0.0017825555450297	0.3442756178359271	-1.9853527880474583e-05	0.4545102551564611	2.5142373332255387e-05	0.4505211954314083	-0.0023316617729536	0.4353872798422848	0.0032438718617003	0.4313422239978955	DOT1L	32640	AP3D1	33174	MOB3A	34621	False	False	False	ref	-100	0.004395	-100	0.1034
1989	chr19	2141944	A	G	rs117443676	-0.00439260756	0.8165277207721432	0.00806450384	0.8144688511312007	0.0209688687278288	0.4407655841674592	-0.0001079607682043	0.754223052859024	0.0001743090633129	0.7519153680819215	0.0018194714790009	0.9259262649433166	-1.023561758604999e-05	0.9350693670287046	1.5896999714153445e-05	0.933340222377708	3.887176793666597e-05	0.9067744769056734	-2.4748512196508137e-07	0.9175944310547184	3.477417572008872e-07	0.9156477433836624	-4.2063937184505e-05	0.9349928901200156	6.350829731778984e-05	0.9332908178029364	DOT1L	21990	AP3D1	22524	MOB3A	45271	False	False	False	ref	10	0.02716	45	0.03528
1990	chr19	2144047	T	C	rs149339216	0.0086719234999999	0.5760581940488476	0.0212253127	0.5798244545007555	0.080588734428522	0.0104419860894837	0.0006865343888862	0.2040438636536271	0.0016576282919177	0.2062871956916019	0.0258239582989673	0.5794436966471341	0.0004675939781531	0.5786411999487738	0.0005677672173723	0.5825367747249915	0.0019984967118626	0.3257940157494446	3.415696471370341e-05	0.3792440457370761	4.190607684447259e-05	0.3827215295480444	0.0013815116624327	0.5569584866788623	0.0017130744614166	0.5608894327198595	DOT1L	19887	AP3D1	20421	MOB3A	47374	False	True	False	alt	-30	0.007935	100	0.0852
1991	chr19	2149216	G	A	rs75138150	-0.169932406	0.037351837418428	0.169932406	0.0369839888717841	0.0275203757193175	0.2693290355839646	-0.0048453956466593	0.0636749492471231	0.0048453956466593	0.0630392576360196	0.037067401273465	0.505472383635222	-0.0066871551685013	0.2187464609812849	0.0066871551685013	0.2149678134750154	0.001021496320456	0.4469844426846873	-0.0001870653302136	0.2004096214704465	0.0001870653302136	0.1969301544120112	-0.0153129227013295	0.1458208256807627	0.0153129227013295	0.143175464318664	DOT1L	14718	AP3D1	15252	MOB3A	52543	False	False	False	ref	85	0.03024	45	0.1427
1992	chr19	2165384	G	A	rs141958336	0.1427499659999999	0.0517762067889878	0.1427499659999999	0.0523268676141224	0.0845554275823849	0.0084618439684824	0.0119666175640541	0.0151163647180027	0.0119666175640541	0.015198343558133	0.7884249942265183	0.007985268569977	0.1118350805724005	0.0069486404957692	0.1118350805724005	0.0069902164541017	0.0668206828784267	0.000818688026102	0.0093998494708002	0.0033212749717334	0.0093998494708002	0.0033117613547429	0.02359951832668	0.0779676099609685	0.02359951832668	0.079385317021386	AP3D1	916	DOT1L	1450	MOB3A	68711	False	True	True	alt	-100	0.1831	65	0.08594
1993	chr19	2191797	A	C	rs111785160	0.276542582	0.0101961506856555	0.276542582	0.0102572421275458	0.045898117185277	0.0739846684947039	0.0126420151121982	0.013701971312505	0.0126420151121982	0.0137643869621451	0.299016033783115	0.1104019655261616	0.0835114629779486	0.0117563930835898	0.0835114629779486	0.011948279499919	0.013761551957577	0.0460274447281621	0.0038254078482683	0.0111614780528407	0.0038254078482683	0.0112481130531365	0.0915550460228959	0.0049594837417721	0.0915550460228959	0.0049796809624686	AP3D1	27329	DOT1L	27863	SF3A2	45028	False	True	False	alt	-95	0.0964	-100	0.1841
1994	chr19	2196157	C	T	rs77188636	-0.065069504	0.2075643650320935	0.065069504	0.2044597235358322	0.0833024077584012	0.0093272833188179	-0.0054413006427738	0.0518955942328143	0.0054413006427738	0.0514425199932173	0.373766124509254	0.0791620898310001	-0.0262592527578917	0.0677552872924349	0.0262592527578917	0.0665067040517507	0.0309286521247006	0.0088991849584058	-0.002159026332361	0.0253662121381961	0.002159026332361	0.0249682061140493	-0.021429514037808	0.0897985125669115	0.021429514037808	0.0881163002008939	AP3D1	31689	DOT1L	32223	SF3A2	40668	False	True	True	ref	-100	0.05713	-80	0.1218
1995	chr19	2279747	C	T	rs62119705	-0.0243392424	0.5406442279585827	0.0243392424	0.5348060995527745	0.0172309608782179	0.5952681803192933	-0.0004256433072417	0.5640114375782307	0.0004256433072417	0.5580278178706103	0.0009946883969515	0.9652551888765823	-2.471130487053504e-05	0.920722167643128	2.471130487053504e-05	0.9137258017278996	1.588900572884784e-05	0.9663794816639176	-3.951252746410171e-07	0.920426567137612	3.951252746410171e-07	0.91344598822764	-9.320048827155074e-05	0.9192775152566796	9.320048827155074e-05	0.912267235867783	PEAK3	2428	JSRP1	9988	ENSG00000273734	10221	False	False	False	ref	-50	0.00682	-25	0.0808
1996	chr19	4957122	G	A	rs4807003	0.0127223325399999	0.462209487819636	0.03236544094	0.4627586397661998	0.0129533285312264	0.7735165942575178	0.000267545359117	0.5698842499395231	0.0004859145219762	0.5710464796704878	0.0124566988881923	0.7083052105733978	0.0001845085259744	0.6691549689033373	0.0003170714435904	0.6704955773547	0.0001654240988996	0.7591638197323771	3.627701477866601e-06	0.706615504625635	5.049113685592468e-06	0.7079850263127287	0.0004602289597836	0.6482963022975216	0.0010441753818745	0.64970308253964	KDM4B	11992	UHRF1	54041	ARRDC5	54174	False	False	False	alt	100	0.0268	-100	0.1555
1997	chr19	4966030	C	T	rs35502362	0.0374700617799999	0.3228573123238444	0.04710009578	0.3249682136572809	0.0307362162477762	0.2134503700175765	0.0011926714022978	0.2741758030819987	0.0015205726246331	0.276006667396794	0.0240902642604994	0.591192126977908	0.0008865933254561	0.4965864541007312	0.0012705826358366	0.5005805229165794	0.0007404224102605	0.5094397111565205	2.603115416984623e-05	0.434587978396934	3.910593279295431e-05	0.4380736246269298	0.0026780706674144	0.4403424044229489	0.0037222460492889	0.4440393268999751	KDM4B	3084	UHRF1	62949	ARRDC5	63082	False	False	False	alt	50	0.001526	100	0.0337
1998	chr19	5020463	G	A	rs34009962	-0.259863464	0.0190368583391943	0.259863464	0.0187630822788846	0.0393962027292741	0.1241775225612243	-0.0139407426094298	0.0278281351688753	0.0139407426094298	0.0274957042330314	0.0875622711226946	0.3335457529674164	-0.0245062855448185	0.0827735359961397	0.0245062855448185	0.0815058565016179	0.0035758115408249	0.2271014005082745	-0.0012758091800032	0.0638393523103757	0.0012758091800032	0.063098956336825	-0.0388184157566559	0.0401083344909886	0.0388184157566559	0.0396375922032783	KDM4B	51349	UHRF1	117382	ARRDC5	117515	False	True	False	ref	15	0.00537	100	0.279
1999	chr19	11270403	A	G	rs113848170	0.1064463358	0.0913427967569597	0.1064463358	0.0925386852494358	0.0362566474124459	0.1437064946232388	0.0039466545165018	0.0783921286243787	0.0039466545165018	0.0792150915222888	0.0002309392629737	0.9959945167290892	2.7626802763999944e-05	0.8969827322590732	2.7626802763999944e-05	0.9040266683955226	8.135236526236239e-06	0.9842840934003836	9.896714788829595e-07	0.8428382962771428	9.896714788829595e-07	0.8498357710582756	8.33030912869861e-05	0.9123564147200656	8.33030912869861e-05	0.91943170844668	DOCK6	7879	TSPAN16	25737	ANGPTL8	32900	False	False	False	alt	50	0.01596	65	0.1475
2000	chr19	19370570	G	T	rs34538000	0.004746858354	0.8810597460971547	0.005167818334	0.8830038935233275	0.0206632925356232	0.4586930960688322	0.0001030664446042	0.8497554173443715	0.0001112685060866	0.8521016053214285	0.0001921744581174	0.9978591349918828	7.383129403285021e-07	0.988588013277923	8.247081222588389e-07	0.9951926472971376	3.991452298878537e-06	0.9956663881722924	1.63946827038812e-08	0.9867033242223576	1.8066329874958945e-08	0.9930579949831596	4.94869849229653e-06	0.9884087069318148	4.94869849229653e-06	0.9924554944514928	GATAD2A	15257	MAU2	49740	SUGP1	50061	False	False	False	alt	-10	0.001556	100	0.05908
2001	chr19	19381164	T	C	rs2965180	0.326248338	0.0066879643379582	0.326248338	0.0067128842004502	0.0440142352812131	0.086277394959078	0.014976699424475	0.0115309654479297	0.014976699424475	0.0116084241828943	0.0610636402626108	0.4077391116022656	0.0210031322511415	0.0819127948474589	0.0210031322511415	0.0835616962284881	0.0027506847236751	0.2695927452350642	0.0009670267809143	0.05729064635117	0.0009670267809143	0.0582789516276648	0.0381981788789547	0.0373434789049674	0.0381981788789547	0.0377806541767028	GATAD2A	4663	MAU2	60334	SUGP1	60655	False	True	True	alt	30	0.06525	95	0.4524
2002	chr19	19417515	T	G	rs2916073	0.219427668	0.0211500411840191	0.219427668	0.0214464042352069	0.0410274972206906	0.1048847772843929	0.0097495975935697	0.0259710665223755	0.0097495975935697	0.0262285909072058	0.1640485302365477	0.2125598060810878	0.034910160128828	0.0459761514936633	0.034910160128828	0.0468792352739525	0.0064901958763506	0.1262743187681051	0.001505162210941	0.0371954155779895	0.001505162210941	0.0377107546843799	0.0528422025007422	0.020019434368012	0.0528422025007422	0.0202792618769397	GATAD2A	31688	MAU2	96685	SUGP1	97006	False	False	False	alt	100	0.05115	100	0.1321
2003	chr19	19417997	A	G	rs1469713	-0.02335576038	0.3778098145855433	0.03991112002	0.3771366479862899	0.0238756397101252	0.3620416765533736	-0.0006582523647119	0.375346094948498	0.0009988654532194	0.3747986030700247	0.1370459569133317	0.2529858349322418	-0.0054980958979823	0.2632753534119728	0.0064377736098024	0.2620492708693103	0.0033041009089058	0.2380161303569709	-0.0001472647114485	0.2612833555343906	0.0001666054192344	0.2602671428630796	-0.0076407904721058	0.2380490294348	0.0102899937316485	0.2373585802758459	GATAD2A	32170	MAU2	97167	SUGP1	97488	False	False	False	ref	-100	0.03403	-70	0.0537
2004	chr19	19468237	T	G	rs10405625	0.0972790784	0.1099073787863986	0.0972790784	0.1113767638927276	0.0372283276934293	0.1318573207410098	0.0037671011247274	0.0857468679002273	0.0037671011247274	0.0867507005316588	0.0590495199762462	0.415055903450559	0.0060485454683071	0.2243619200750414	0.0060485454683071	0.2280484181692707	0.0021954047139201	0.3080322893593748	0.0002333977303703	0.1712053981301669	0.0002333977303703	0.1740527327576772	0.0132460162977136	0.1589162181227912	0.0132460162977136	0.161743878241385	TSSK6	47311	NDUFA13	47500	ENSG00000258674	47991	False	False	False	alt	-75	0.01828	-90	0.1049
2005	chr19	19505217	T	C	rs3752151	0.1393641496	0.0593212034771746	0.1393641496	0.0599792676694863	0.028805678545198	0.2479143052657055	0.0042745790920951	0.0786274987638752	0.0042745790920951	0.0795417096335411	0.2011934611197254	0.178743406812745	0.0305444711907104	0.05987595025573	0.0305444711907104	0.0610281254800536	0.0058591151684896	0.1439671331852367	0.0009443471223171	0.0637077689426621	0.0009443471223171	0.0648099624615069	0.0398469202599715	0.0359090512057041	0.0398469202599715	0.036431237770006	TSSK6	10331	NDUFA13	10520	ENSG00000258674	11011	False	False	False	alt	-65	0.2045	65	0.1611
2006	chr19	19508508	T	C	rs10282	0.1216718272	0.071998782387384	0.1216718272	0.0729864424367003	0.0256905144819209	0.3139134624626907	0.003073686240036	0.1025248604966558	0.003073686240036	0.1039062894417145	0.0929307842037543	0.3218434430646768	0.0115796286604514	0.1359805315924669	0.0115796286604514	0.1384757515324629	0.0023345473709685	0.2885020774495923	0.0002865374841967	0.1368361637094551	0.0002865374841967	0.1392797456404099	0.0226295734221899	0.0820937608441039	0.0226295734221899	0.0835007126372447	TSSK6	7040	NDUFA13	7229	ENSG00000258674	7720	False	False	False	alt	-15	0.00293	70	0.12164
2007	chr19	19520635	A	T	rs7253807	0.0067789986999999	0.729032294494076	0.01279479102	0.731221357694797	0.0211801322057778	0.4430111227339438	0.0001354314376258	0.6992736145567507	0.0002582637949653	0.701215798816217	0.006343406684042	0.8007493576232491	4.763400966640958e-05	0.8225619009280124	8.549212365888669e-05	0.8243372790326804	0.000115135309335	0.7924633047109682	8.384287750020749e-07	0.8141387570627733	1.558109389602543e-06	0.8159608353532857	0.0001839266272969	0.8104817065592416	0.0003307380159017	0.8121846567786463	ENSG00000258674	4407	NDUFA13	4898	TSSK6	5087	False	False	False	alt	-100	0.0252	100	0.354
2008	chr19	19546823	A	C	rs7245983	0.0591352463999999	0.2087902269294426	0.0679144332	0.2106823822085421	0.2108785669282109	0.0001163281914669	0.0136712203094987	0.0151796114077264	0.0151047890769207	0.0152246315113176	0.4325080003958958	0.0606910319831312	0.0265958374837018	0.0603670199548954	0.0304668720383029	0.0610164969074101	0.0909871525253855	0.0002771911852116	0.0061140943492012	0.0075998612971053	0.0067462023552943	0.0075919856507468	0.0196133416911352	0.0901593655937967	0.0225693642572003	0.0911321095765395	CILP2	8574	YJEFN3	17961	ENSG00000258674	30595	False	True	True	alt	15	0.0381	-75	0.2656
2009	chr19	30496516	A	G	rs2053079	-0.254268672	0.0142196565793116	0.254268672	0.0141104742285406	0.0479121988657845	0.0652355708088458	-0.0128814149152139	0.0155596191898138	0.0128814149152139	0.0154892017978566	0.2477211243442974	0.1447294564110558	-0.0629131544679417	0.0216507205044573	0.0629131544679417	0.0212894945549392	0.0119348056037354	0.0613837037037205	-0.0032102853247201	0.0169971146646486	0.0032102853247201	0.0168396845523821	-0.0741694434363761	0.0095852418206349	0.0741694434363761	0.0095264324019598	ZNF536	271624	URI1	572871	CCNE1	684524	False	True	False	ref	95	0.03384	10	0.042
2010	chr19	30500744	T	C	rs2075419	0.05923225992	0.2001287422728722	0.0730308760799999	0.2004859814800503	0.0305234975363508	0.2166796994002421	0.0021002651050831	0.192458199904385	0.0024357171574805	0.192919355960898	0.0147858863118999	0.6746640510194875	0.0013448958276733	0.4842074187355875	0.0015898710256759	0.4866604697828748	0.000451838872023	0.6025571785826277	4.965443952378506e-05	0.4289043953772949	5.521198737449166e-05	0.4313467844721706	0.0037527630233248	0.4194268612721174	0.0045033156279898	0.4220093863930274	ZNF536	275852	URI1	577099	CCNE1	688752	False	False	False	alt	80	0.057	100	0.3687
2011	chr19	30524769	C	T	rs10411290	0.0017728433799999	0.7043355721779199	0.01255684498	0.7057519054398255	0.0407759366626536	0.106314978761126	0.0001313702902069	0.5347561710799318	0.0004538851859198	0.5358679024171199	0.0912094619115172	0.3208656652345505	0.0004009358771498	0.4713296808326207	0.0013121876633837	0.4727920782028148	0.0036769434921925	0.210606009859557	2.111939492597095e-05	0.3805959766539507	4.740216606637471e-05	0.3818799754649596	0.0007084886674804	0.4815299957398362	0.0028710699086139	0.4830829384434565	ZNF536	299877	URI1	601124	CCNE1	712777	False	False	False	alt	-75	0.03784	65	0.09595
2012	chr19	30532140	C	T	rs3786795	-0.00262049996	0.8649771228506586	0.00623262644	0.8663953922958005	0.0139969643127772	0.72901277119534	-3.595711074080038e-05	0.8761044833040537	8.801615800294241e-05	0.8774606394762433	0.0065380554914057	0.7896602764626481	-1.73717330762514e-05	0.8845290308909907	4.084363979788264e-05	0.8860242831946116	8.860203435947191e-05	0.8242482214379344	-2.2379497482217162e-07	0.8963799076279292	5.617357180703952e-07	0.8980573504577737	-6.763221272804226e-05	0.8760564940420926	0.0001633070502457	0.8775665552936128	ZNF536	307248	URI1	608495	CCNE1	720148	False	False	False	ref	80	0.0214	-80	0.0824
2013	chr19	30544460	C	G	rs4303654	-0.0259879226	0.338870098842321	0.0453404973999999	0.3369121854071102	0.0264372435007586	0.2993786338795991	-0.0009483467025529	0.3052898354007351	0.0013462723419991	0.3035864099830073	0.0296047639470818	0.5370233547536485	-0.0008947643611503	0.4561603190223047	0.0013833512684847	0.4531254709914497	0.0008012005089984	0.4842553653107734	-3.401495666700909e-05	0.41513523814027	4.406123015142697e-05	0.4121958867193841	-0.0022599056448153	0.4122664288878059	0.0038665830886476	0.4092715176523777	ZNF536	319568	URI1	620815	CCNE1	732468	False	False	False	ref	80	0.02118	-10	0.01563
2014	chr19	33437829	A	G	rs142436687	0.0435033871999999	0.2714645140292241	0.0565107811999999	0.2728027430359245	0.0684977306437664	0.0189983962501065	0.0029684291379523	0.1078518668753314	0.0038720654613199	0.1077951074819067	0.7995521427864472	0.007373038005207	0.0342654824642932	0.0428021424459048	0.0442771786282237	0.0428760988652669	0.0547397001224804	0.001578870860787	0.0023369482184319	0.0212396045618934	0.0030327566976378	0.0211679975451093	0.0069859127049586	0.2570263361698477	0.0090511695424102	0.2580531179642244	CEBPG	64143	PEPD	83994	CEBPA	135295	True	True	False	alt	25	0.04376	100	0.3052
2015	chr19	33449354	G	A	rs79051716	-0.090318448	0.0919834390500602	0.109551998	0.0914570873826816	0.0718727070123056	0.0164702928322438	-0.0059249969289778	0.0314332500559537	0.007546969744755	0.031473314488219	0.0545767213222921	0.4280905867812262	-0.004519048213286	0.2263486055372064	0.005648767846919	0.2240948917737777	0.0042339275094962	0.2002896635272524	-0.0003273161930949	0.1114806252535827	0.0004225858922763	0.1104613336855507	-0.0102256606512487	0.1587449133112975	0.0132064267097752	0.1568432036880936	PEPD	72469	CEBPG	75668	CEBPA	146820	False	True	False	ref	-80	0.2382	45	0.0503
2016	chr19	33450805	G	A	rs116925323	-0.242892118	0.0151378877496998	0.242892118	0.0150842942098551	0.060169949820588	0.0303462671429645	-0.0147504573075164	0.011028789124828	0.0147504573075164	0.0110042377912366	0.5668387714031209	0.0318682243637355	-0.1390188247701101	0.0046422389480368	0.1390188247701101	0.0046592388227539	0.0341754474911934	0.0064985018709895	-0.0084510928718399	0.0040033989569512	0.0084510928718399	0.0040033190615791	-0.0717882946784995	0.0092406163795634	0.0717882946784995	0.0091630362421	PEPD	71018	CEBPG	77119	CEBPA	148271	False	True	False	ref	90	0.01782	15	0.1328
2017	chr19	33451314	G	A	rs1345756	0.0058657742	0.8047936800451064	0.00886408788	0.8068690672670343	0.0165919409177277	0.6169589828477635	0.0001219815357821	0.7952108231391486	0.0001634652079401	0.797602836377849	0.3788707070040579	0.0769867248205209	0.0022150258036818	0.328031817179525	0.0033229324141911	0.3300775205670731	0.0062109615739322	0.130185277645845	4.5836538086143045e-05	0.3617171914656285	6.0903491235861406e-05	0.3638350150333955	0.0020256672495133	0.4657396394999398	0.0030962356900134	0.4681884025314433	PEPD	70509	CEBPG	77628	CEBPA	148780	False	False	False	alt	-100	0.01999	-80	0.2134
2018	chr19	33451622	C	T	rs77157349	-0.0585651354	0.2498614795334307	0.0585651354	0.2466107387446487	0.0166488861051713	0.5983190237710065	-0.001189733266618	0.3363910818268983	0.001189733266618	0.3325229578694209	0.0975792616541849	0.3075289357501806	-0.0055404154510715	0.2338016388262945	0.0055404154510715	0.2299313181390802	0.0015537918293978	0.3635263729200235	-0.0001034576855077	0.2768069172248185	0.0001034576855077	0.2726617551957953	-0.0112624129853848	0.1902414131643907	0.0112624129853848	0.1868513033999752	PEPD	70201	CEBPG	77936	CEBPA	149088	False	False	False	ref	60	0.008606	-100	0.0894
2019	chr19	33453441	C	T	rs190662727	0.03602019084	0.3916163237386037	0.03602019084	0.3964429783337798	0.0378620349790721	0.1366143685049135	0.0016564181420264	0.2652560444336213	0.0016564181420264	0.2682096829955221	0.0094470654217939	0.7465537132739392	0.000421373485571	0.645448594907571	0.000421373485571	0.6517289671562541	0.0004130384420133	0.6342332367617857	2.12622565198476e-05	0.5472465356292072	2.12622565198476e-05	0.5529565093330354	0.0014804856322786	0.6073502687604119	0.0014804856322786	0.6135367566748612	PEPD	68382	CEBPG	79755	CEBPA	150907	False	False	False	alt	-70	0.0713	75	0.11584
2020	chr19	33457934	C	T	rs35208092	0.0004895659999999	0.1605044888970124	0.080646826	0.1609489745089046	0.0281541576528819	0.2584020145945861	0.0003627034442498	0.1638452087787336	0.0024425986513334	0.1643964759305171	0.1581331859720893	0.2220684686118824	0.0034785696933011	0.1334818545170308	0.0154741156359698	0.1339333032456474	0.0048607160181972	0.178393571910899	0.0001869098232343	0.1273288630046104	0.0005088570607947	0.1278311874062317	0.0029312790736036	0.1000928436038778	0.0223912111114776	0.1004854544789384	PEPD	63889	CEBPG	84248	CEBPA	155400	False	False	False	alt	30	0.01168	25	0.0547
2021	chr19	33461291	C	T	rs7254613	0.01244645658	0.7204734221852834	0.01244645658	0.7267094837786224	0.0203237198159351	0.4681249794348098	0.0002927507046489	0.6739379273435983	0.0002927507046489	0.6803368966845471	0.0401240473755401	0.4863112509728476	0.0004049561687105	0.6504347071822629	0.0004049561687105	0.656704554879314	0.0008183744870292	0.4833177062777353	1.0032495461066058e-05	0.6303946678939245	1.0032495461066058e-05	0.63672592835974	0.0012338754907458	0.6426496841336825	0.0012338754907458	0.6488641786471682	PEPD	60532	CEBPG	87605	CEBPA	158757	False	False	False	alt	100	0.04163	45	0.08276
2022	chr19	33461673	T	C	rs148767361	0.0162750053	0.6465009240050412	0.01640813522	0.6512631631982917	0.1398002715972061	0.0009279235031227	0.0023820094096232	0.195257543409639	0.002399287048344	0.1968462633811612	0.0992535713107452	0.3088757804937433	0.0016703921347662	0.4480861751377689	0.0016785291087015	0.4521058372671311	0.0140071388294918	0.0464970230718713	0.0002485666010303	0.1996557478632297	0.0002496226198167	0.2025755996299169	0.0034541915476229	0.4558081930175697	0.0034739863415921	0.4600887018721372	PEPD	60150	CEBPG	87987	CEBPA	159139	False	True	True	alt	-10	0.00177	90	0.3223
2023	chr19	33462837	A	G	rs6510386	0.0781198014	0.1710562342225872	0.0781198014	0.1736321640958994	0.0203371112291816	0.4645835571617292	0.0016244866843549	0.2273891277183491	0.0016244866843549	0.2306531113139	0.6441209461911518	0.0214590924624964	0.049423659590776	0.0303957824032117	0.049423659590776	0.0310432285257911	0.0130744842755023	0.0497213098326328	0.0010280061919092	0.0530821327972582	0.0010280061919092	0.0540950513459007	0.0197708752598066	0.1040628905770704	0.0197708752598066	0.1060147094834729	PEPD	58986	CEBPG	89151	CHST8	159117	False	False	False	alt	-95	0.04645	15	0.04004
2024	chr19	33463547	T	C	rs76144939	-0.138378376	0.057632188389298	0.138378376	0.0568969340010057	0.0371599147493117	0.1326119640115764	-0.0052875084984576	0.0548539263982141	0.0052875084984576	0.0543421557225096	0.4866574840816865	0.0471618588198299	-0.0681411594938778	0.0179352628215838	0.0681411594938778	0.0176046354908747	0.0180738049582037	0.028175883659659	-0.002601959412441	0.0193634004273576	0.002601959412441	0.0190684656566472	-0.0444681798686945	0.0267031092539377	0.0444681798686945	0.0262906177742299	PEPD	58276	CEBPG	89861	CHST8	158407	True	False	False	ref	-35	0.051	-30	0.4102
2025	chr19	33471266	G	A	rs10423840	-0.0905720208	0.1280778011453095	0.0905720208	0.1262667297155392	0.0242601674184636	0.3515650406739011	-0.0021884542180325	0.1593087800054166	0.0021884542180325	0.1573118838720803	0.1013344990267559	0.3036908392385928	-0.0093035251401588	0.1663531301877197	0.0093035251401588	0.1634408523724345	0.0024002310416708	0.2821130876936203	-0.0002190027272494	0.1690806425329403	0.0002190027272494	0.1663079734801005	-0.0180404803536669	0.1136230221973002	0.0180404803536669	0.1116569322485995	PEPD	50557	CEBPG	97580	CHST8	150688	False	False	False	ref	15	0.0057	15	0.073
2026	chr19	33479231	G	T	rs10404501	0.00802904482	0.821742072833629	0.00802904482	0.8284667983950654	0.0115062671457569	0.8252834090350528	8.218312035735864e-05	0.8763501160373739	8.218312035735864e-05	0.8830702710063425	0.0657187159776978	0.389542961915481	0.0006724895596452	0.5862787108041969	0.0006724895596452	0.5922633546932274	0.0007236030135913	0.4998262950525103	6.714173079212104e-06	0.6604890092283179	6.714173079212104e-06	0.666771498473349	0.0014087295041403	0.6162458401886242	0.0014087295041403	0.6224152557679782	PEPD	42592	CEBPG	105545	CHST8	142723	False	False	False	alt	-95	0.04428	-100	0.0841
2027	chr19	33479609	G	C	rs12461525	-0.03164950108	0.3062574917624375	0.05055518412	0.3053153426472245	0.0182301320290658	0.5490593365547647	-0.0008723276457046	0.3652092304504059	0.001152211652934	0.3643704419783866	0.0736753983702285	0.3597941922842596	-0.0024047660340469	0.316727237599892	0.0036912407859313	0.3151412985079602	0.0013266922315964	0.3872435348998121	-6.616876445200251e-05	0.3374954015161643	8.522476742812033e-05	0.3360640058459518	-0.0050402494144039	0.2690093672818553	0.0082585530005608	0.2674727032412837	PEPD	42214	CEBPG	105923	CHST8	142345	False	False	False	ref	100	0.07117	-95	0.02417
2028	chr19	36169545	A	G	rs1476503	0.091441938	0.1191446868945621	0.102649134	0.1199892408379691	0.0384155961187269	0.1224249360036228	0.003432083933077	0.0970413403418649	0.0039452460531034	0.0974306317880295	0.5908976939065026	0.0274587610483261	0.0559630118674241	0.0249428030482837	0.0616891325944179	0.0251854485086702	0.0226856196677923	0.0177292698176358	0.0021224314285303	0.0252099273111966	0.0023846226332937	0.0254671703907902	0.0254956946323117	0.0672101650744503	0.0289152452904885	0.0676553795436669	COX7A1	17096	CAPNS1	29591	ZNF146	45058	True	False	False	alt	85	0.1251	85	0.1816
2029	chr19	36169552	A	G	rs1476504	-0.0643175108	0.0532394959904474	0.1547491332	0.053113056090759	0.019919788312567	0.4817151720984781	-0.0010078306366603	0.1178946955949158	0.0032358175445179	0.1174680642561941	0.5807223450232588	0.0291314085648307	-0.0432547899293454	0.0134154476532523	0.0920363806011925	0.0134013689912037	0.0115268186124968	0.0603914155951551	-0.0007121379582368	0.0327704560848544	0.0019103540377555	0.0327371073716541	-0.0144229817557981	0.0347137355963574	0.0426305631618883	0.0345416827835392	COX7A1	17103	CAPNS1	29598	ZNF146	45051	True	False	False	ref	80	0.1251	100	0.1318
2030	chr19	36190511	A	G	rs7249719	0.00295602158	0.5724581703566685	0.02165367042	0.5722006326044867	0.0199922533352841	0.4793648688154609	2.2783712297103423e-05	0.561830513769301	0.000417895875987	0.5614883476761179	0.2235137408861469	0.1626839528548489	0.0007446544731463	0.2759238171480714	0.0049132292019491	0.2756068233193413	0.0045241891299698	0.1863395911876839	3.990836101322676e-06	0.2921942814892358	9.610083896724826e-05	0.2920350446796551	0.0017073009798423	0.3211483621828883	0.0062056679093398	0.321028093408641	ZNF146	24092	COX7A1	38062	CAPNS1	50557	True	False	False	alt	0	0.0	25	0.0801
2031	chr19	36194408	C	T	rs2287897	-0.1147504718	0.0997222937631782	0.126509919	0.0995211076019868	0.0166824796601669	0.613191145599625	-0.0019840315559364	0.2183813959871017	0.0022332678877207	0.2171359412415348	0.119593546897166	0.2769089730571091	-0.017507358767567	0.1372681126802448	0.0179554522530635	0.1356823622992392	0.0019303623033495	0.3262463509038506	-0.0003130865896582	0.1897498341224039	0.000322583734695	0.1876867319628037	-0.0268186466959189	0.0859809375480459	0.0280112830325623	0.0853006652062622	ZNF146	20195	COX7A1	41959	ZNF565	51849	False	False	False	ref	-40	0.01074	-25	0.0945
2032	chr19	36225931	T	C	rs2432051	-0.01354447788	0.7031576785751219	0.0147015857199999	0.698641277520275	0.0313475447247014	0.2034054572868958	-0.0004249096206015	0.5552621861193132	0.0004618306765504	0.5510905283831856	0.0019308171950776	0.9228329027486633	-1.9862494525886445e-05	0.9230857196027906	2.3069154151582387e-05	0.9187816653699812	6.228477335058652e-05	0.8696347679865135	-6.519505124805418e-07	0.8784716658188062	7.542687698691743e-07	0.8742474251828973	-8.660222361517305e-05	0.9132842509447155	0.0001030978852561	0.9090546330502766	ZNF146	11328	ZNF565	20326	COX7A1	73482	False	False	False	ref	-40	0.05667	-100	0.231
2033	chr19	36243589	G	A	rs2972537	-0.0201161929999999	0.4336844657481042	0.032046893	0.4300237277912087	0.0121686218730846	0.811097938422133	-0.0003014459197545	0.5692627106952252	0.000407426307949	0.5648975313312452	0.1645351522549569	0.2236034944485072	-0.0018102695852519	0.2554119748698187	0.006005901584992	0.2531787456682944	0.0018690871610701	0.340726996902964	-3.466011855136699e-05	0.3427578324042232	7.192991170933691e-05	0.3397806061705739	-0.004424136452113	0.2565555384555587	0.0087080597802777	0.2542703546396416	ZNF565	2668	ZNF146	28986	COX7A1	91140	False	False	False	ref	85	0.3489	35	0.1743
2034	chr19	38046684	C	T	rs149760493	-0.0682699388	0.197850597743267	0.0682699388	0.194812146332815	0.0236045463529746	0.367209914461381	-0.0016372426161439	0.21969391716599	0.0016372426161439	0.216655851692814	0.1405042723763649	0.2400439252266439	-0.0097549062258621	0.1603102561877211	0.0097549062258621	0.1572866148054839	0.0032428667432454	0.2299738551359045	-0.0002322157203778	0.1668579224012637	0.0002322157203778	0.1637626911787345	-0.0169360958068027	0.1235213754423925	0.0169360958068027	0.1211217015798502	SIPA1L3	139475	WDR87	140007	DPF1	183030	False	False	False	ref	-80	0.10425	70	0.1279
2035	chr19	38049395	C	T	rs140163185	-0.0596298172	0.1244533637100335	0.0901679131999999	0.1232767058805234	0.0184781739013399	0.53593629652657	-0.0011656699616262	0.2045467558258669	0.001723288649208	0.2028330957425673	0.0558848272904225	0.4438443165248873	-0.0041481367335999	0.2595861619951831	0.0049954377001517	0.2566244010329178	0.0010707027712252	0.461563310977783	-8.045137029226207e-05	0.2858615118776437	9.592289271832166e-05	0.2830172210086787	-0.0090519943254923	0.1948697013021728	0.0113102504041436	0.1926786426927251	SIPA1L3	142186	WDR87	142718	DPF1	180319	False	False	False	ref	-50	0.00717	-40	0.168
2036	chr19	38050594	G	A	rs150020955	-0.01151704064	0.7290703293776486	0.01179867948	0.7244627496976389	0.0153051580211271	0.6773198689582812	-0.000178553950119	0.7478780536560987	0.0001825829817937	0.7432379004709415	0.0014474943089967	0.9433025272012254	-1.7766264286745807e-05	0.9318602870988484	1.7897508672998476e-05	0.9275025894317696	2.254658953034748e-05	0.9472918982054154	-2.781811845106264e-07	0.9330914560783042	2.800587231073713e-07	0.9286121962247372	-7.670482663057554e-05	0.9293815226482656	7.670482663057554e-05	0.9240901374715694	SIPA1L3	143385	WDR87	143917	DPF1	179120	False	False	False	ref	-80	0.1034	10	0.0197
2037	chr19	38055616	A	G	rs148362166	0.0276598034	0.4764558265525125	0.0276598034	0.4822659854857204	0.0217082362126655	0.4195843353380381	0.0006266351457582	0.4384089672140497	0.0006266351457582	0.4438984573331511	0.3715656032463462	0.0792584649717922	0.010243557689716	0.144777267940222	0.010243557689716	0.1475722145747019	0.0078629822777489	0.1000174852783469	0.0002254940787679	0.1590629596274911	0.0002254940787679	0.1619716316953971	0.0096920259971627	0.2055511526843718	0.0096920259971627	0.2091387904580244	SIPA1L3	148407	WDR87	148939	DPF1	174098	False	False	False	alt	100	0.07263	70	0.1719
2038	chr19	38095543	T	C	rs12983497	-0.2985678859999999	0.0084347949866838	0.2985678859999999	0.0083865108694736	0.057123584497508	0.0363351911427758	-0.0170110829340818	0.008373637444973	0.0170110829340818	0.0083330745600806	0.5876282537692588	0.0285760580894319	-0.1752814297842609	0.0027318049837731	0.1752814297842609	0.0027302904850965	0.0331852251450574	0.006968030996781	-0.0098608098971627	0.0030102343313326	0.0098608098971627	0.003006184296834	-0.085298241562469	0.0060084044031733	0.085298241562469	0.0059717386666106	DPF1	134171	SPINT2	148493	PPP1R14A	160989	True	True	True	ref	0	0.0	-20	0.0376
2039	chr19	38100867	G	T	rs3810356	-0.528214216	0.0015466204522948	0.528214216	0.0015548176756287	0.0832263601895119	0.009093936238589	-0.0448886975015291	0.0016649550920876	0.0448886975015291	0.0016528516865828	0.3414973112071525	0.0916901902647073	-0.1740963893834718	0.0028342033371175	0.1740963893834718	0.0028399477509246	0.0280453959778991	0.0109971605220282	-0.0145108533761928	0.0017779834072003	0.0145108533761928	0.0017939199632944	-0.1605926891227607	0.001016502395491	0.1605926891227607	0.0010086809324911	DPF1	128847	SPINT2	143169	PPP1R14A	155665	False	True	True	ref	-45	0.02661	-35	0.0657
2040	chr19	38124082	C	T	rs569675332	0.0210805374	0.319022767514019	0.0481029214	0.3197840717806911	0.0245682180493647	0.3427135002847398	0.0006716819071711	0.3019265559003544	0.0012810773075147	0.3025325562590633	4.866220184091074e-05	0.9997925209505352	1.394707603056052e-06	0.9845338895408248	1.506145632369548e-06	0.9910302206134756	1.1290243298352136e-06	0.9992305126634228	3.330799381794722e-08	0.9800861385313944	3.582108890035776e-08	0.9862783108894791	3.299132328197685e-06	0.9909539261526306	3.299132328197685e-06	0.9947747718583828	DPF1	105632	SPINT2	119954	PPP1R14A	132450	False	False	False	alt	-100	0.03577	5	0.02051
2041	chr19	38124126	G	A	rs182522360	0.02436252286	0.5188151914141852	0.0252945611399999	0.5233001626689388	0.0412376743666078	0.099775828696009	0.0009963159989021	0.342642427965888	0.0010373730053188	0.3455819135640063	5.113655108705073e-05	0.9996962258934192	1.7286665332404836e-06	0.9825895891425634	1.7325101803323565e-06	0.9896697946409924	1.941760192366773e-06	0.997701514934866	6.46911208918551e-08	0.9712007035583398	6.486043651331575e-08	0.9781970858553494	2.474349246148265e-06	0.99312267314694	2.474349246148265e-06	0.9960102952307311	DPF1	105588	SPINT2	119910	PPP1R14A	132406	False	False	False	alt	-45	0.00418	-35	0.1821
2042	chr19	38131300	G	A	rs855616	0.256175754	0.0135844783265203	0.256175754	0.0136479658488007	0.0644519966151159	0.0238894995924658	0.0166946761713588	0.009266641073348	0.0166946761713588	0.0093079113671674	0.0334325822308732	0.5196968426987995	0.0088488802265872	0.1683875490713668	0.0088488802265872	0.1715061897646416	0.0021264403123601	0.3053955453630277	0.0005735507657618	0.0858205712207516	0.0005735507657618	0.08751926817152	0.0190945531325261	0.1030026528794372	0.0190945531325261	0.1048880313582901	DPF1	98414	SPINT2	112736	PPP1R14A	125232	False	True	False	alt	55	0.06665	100	0.0773
2043	chr19	38135855	T	C	rs8110434	0.0747280536	0.1689345940636262	0.0747280536	0.1714753199676655	0.0276940837944369	0.2664384556914773	0.0021485362853466	0.1658430487533613	0.0021485362853466	0.1680805569891372	0.0382674606578469	0.5077484460597486	0.0028232111259816	0.3344480868823076	0.0028232111259816	0.3392650739885258	0.0010437743057436	0.4486497159771458	8.05333052443692e-05	0.2983695272375401	8.05333052443692e-05	0.3029008146777382	0.0075723334762956	0.2659123202811486	0.0075723334762956	0.2703288800632766	DPF1	93859	SPINT2	108181	PPP1R14A	120677	False	False	False	alt	-25	0.0004883	-35	0.1478
2044	chr19	38138144	A	T	rs4803805	0.00280358714	0.6145699561314613	0.01807242274	0.6160748610802053	0.0376713758612813	0.1289489257602891	0.0002060825465091	0.4444344608342306	0.0006573765280269	0.4459029482907948	0.0011843885058229	0.9573563289523652	-3.0683409801205886e-05	0.9140537319015556	3.7371124680213526e-05	0.917207063623086	3.60553652809428e-05	0.9295364844361588	-8.397505784808129e-07	0.8789167394593695	1.106809964558892e-06	0.8807176082149618	-0.0001088713668305	0.9138578333905288	0.0001369139916202	0.9156303987643564	DPF1	91570	SPINT2	105892	PPP1R14A	118388	False	False	False	alt	100	0.08203	50	0.06555
2045	chr19	38139285	G	T	rs61185863	0.586090604	0.0012003056731463	0.586090604	0.0011917865791944	0.0950436182211766	0.0057850150456177	0.0613851604647989	0.0011871281662158	0.0613851604647989	0.0011989623912952	0.0619939955791626	0.4172890117483014	0.0408506175236129	0.0453547327232072	0.0408506175236129	0.0460115571390594	0.0062443453470127	0.1482504829650963	0.0044438449838805	0.0156162845338427	0.0044438449838805	0.0157693788652195	0.0528595229454652	0.0237273484137127	0.0528595229454652	0.0239366437882852	DPF1	90429	SPINT2	104751	PPP1R14A	117247	False	True	True	alt	-10	0.002502	45	0.06616
2046	chr19	38180561	A	G	rs10401165	-0.0107846642	0.5555565955024486	0.0236374702	0.5521912523835348	0.0379746119976281	0.126701999297956	-0.0005480765168643	0.3682605128128873	0.0009270070359888	0.3657462540350116	0.0004791989706706	0.988495802276451	-4.120082803234497e-06	0.9559970070018498	1.2229677073846536e-05	0.9519584966189736	1.7314533523790452e-05	0.9636152871697136	-2.2203765175921082e-07	0.9135118152359166	4.611272950655221e-07	0.9092548750098046	-1.4021312394840156e-05	0.9600621579320636	3.7115238692223945e-05	0.9574799262397304	DPF1	49153	SPINT2	63475	PPP1R14A	75971	False	False	False	ref	95	0.0323	-60	0.01709
2047	chr19	49661592	G	T	rs66675705	-0.00063867526	0.7708655186689051	0.01007353818	0.7721159373294912	0.060401911654719	0.0306806013587219	5.478242105962004e-05	0.5013154377767651	0.0005210568201431	0.5020592232340823	0.1025848701791428	0.2981059401396227	-0.0001108986518678	0.5021989944086732	0.0008927063278511	0.5030339510964202	0.0063590928836125	0.1309553605041553	8.224018169646446e-07	0.351867193936729	4.688199573618183e-05	0.3524976591569217	-0.0001897001088713	0.5322414263644822	0.0019745306984262	0.5329806103335434	BCL2L12	3551	IRF3	4283	PRMT1	14195	False	False	False	ref	-75	0.004852	-80	0.1846
2048	chr19	49665614	G	A	rs2304206	0.0013106417999999	0.4420092407227028	0.0317226054	0.4411253728522937	0.0171249573574401	0.5934429976582312	3.556050416296816e-05	0.4955366037606072	0.000543152371385	0.494773710835972	0.9102743228530896	0.0013846561511385	0.0013635203935878	0.0644356987834711	0.0289249439551902	0.0641901511922805	0.0155920279944008	0.0368852334754829	3.578710334403296e-05	0.1046181223459569	0.0004951890378144	0.1043461981894948	-0.0002226914321533	0.5240368747825042	0.0020537098743029	0.5223743949695043	IRF3	261	BCL2L12	471	PRMT1	10173	True	False	False	alt	100	0.0931	100	0.1504
2049	chr19	49665670	A	C	rs2304205	0.14983244	0.0472464791261153	0.14983244	0.047825114689405	0.0409479364234427	0.1015251712817922	0.0062517457504039	0.0418951621698357	0.0062517457504039	0.0422016243599349	0.928351918445449	0.0007456013241658	0.1391354738553289	0.0045946056989521	0.1391354738553289	0.0045994282307404	0.0380255326853348	0.0048019480806484	0.0058076585762659	0.0066374511801172	0.0058076585762659	0.0066598907712274	0.0088078585332057	0.2229344629128797	0.0088078585332057	0.2266729044979983	IRF3	205	BCL2L12	527	PRMT1	10117	True	False	False	alt	100	0.1995	100	0.5366
2050	chr19	50466719	C	T	rs2278999	0.1149012512	0.0869188511758193	0.1149012512	0.0879502419503347	0.0470161010768171	0.0678667526331657	0.0054338369213966	0.0570811223944277	0.0054338369213966	0.0575920289701419	0.7705403978753588	0.0098184206909308	0.0894046172301046	0.0123283374210422	0.0894046172301046	0.012434135768703	0.0362220334277102	0.005507424621634	0.0042264374458145	0.0116363318986171	0.0042264374458145	0.0116749369167455	0.0193419880571409	0.10394884644779	0.0193419880571409	0.1057393282227624	EMC10	9682	GARIN5A	10129	MYBPC2	33826	True	False	False	alt	-100	0.0984	-70	0.2393
2051	chr19	56675761	T	C	rs2052241	0.1954457568	0.0252031038359631	0.1954457568	0.0254102600729762	0.0328129625506684	0.1816741235082137	0.0065925261260953	0.0386230565893709	0.0065925261260953	0.0388596349609836	0.016472567714691	0.7120312295847809	0.0037619129351268	0.3507109419150477	0.0037619129351268	0.3553918823624568	0.0005842158337953	0.6201489681574844	0.0001347118626448	0.2933266027950108	0.0001347118626448	0.2972347673737321	0.0081307116228431	0.2892619120007813	0.0081307116228431	0.293007582198227	ZNF835	3978	SMIM17	32601	ENSG00000293626	80458	False	False	False	alt	-50	0.002388	-70	0.1023
2052	chr19	56678350	C	T	rs758749	-0.0078598084	0.2108111299576536	0.0660479876	0.2116432319655801	0.0865920513575175	0.0078241224252806	-0.0007621968254551	0.0542081707455604	0.0057624234710529	0.0544681796731193	0.5085868166672165	0.0412827846066676	-0.0009185260649587	0.0521548998957641	0.0342601277357268	0.0523197737392212	0.0439624011662019	0.0033333717998616	-0.0001283703391311	0.0188237445808013	0.0029928930698822	0.0187912820405574	-0.0044719738708719	0.1076604127690108	0.0196331364851044	0.1080250731258013	ZNF835	6567	SMIM17	35190	ENSG00000293626	83047	True	True	True	ref	-55	0.002686	-55	0.0635
2053	chr2	2312029	A	G	rs17247190	0.07486053994	0.1828895107462548	0.07486053994	0.1850964261340238	0.0205667323478462	0.4654363868028404	0.0015706257024884	0.2477251676449429	0.0015706257024884	0.2505895358664607	0.1034962554848074	0.2987360187989616	0.0070448694709401	0.2063585643345017	0.0070448694709401	0.209934003796241	0.0021544039522435	0.3035617710133357	0.0001500869245382	0.2222142372578132	0.0001500869245382	0.2258438536294612	0.0139289366896505	0.1568906562568323	0.0139289366896505	0.1597311430656876	MYT1L	19635	PXDN	567177	TPO	937962	False	False	False	alt	45	0.0363	45	0.1912
2054	chr2	2322151	T	C	rs10206268	0.0009169157233999	0.8337526512361334	0.0071961156033999	0.8355293356049248	0.0133865331971049	0.767701008916487	7.548605298419793e-06	0.8530682966594806	9.66995717716598e-05	0.8547844988927965	0.0559458612384942	0.414638115829599	2.9327853744522383e-05	0.6597102620230981	0.0003573388220766	0.6609863453622783	0.0007509398649958	0.4891713166233081	1.7318100396618894e-07	0.6968393126794293	4.848002340758625e-06	0.6981870799897869	0.0001311405100458	0.6711852080806889	0.0009806670845567	0.6715858570801672	MYT1L	9513	PXDN	577299	TPO	948084	False	False	False	alt	0	0.0	-25	0.02682
2055	chr2	17824042	G	A	rs35983183	-0.007679334316	0.6086298257925882	0.018618558644	0.6070514178213076	0.0446785329944294	0.0805094975942027	-0.0002855030904619	0.4250616895323495	0.0007311684978014	0.4239918151783439	0.0010573719111873	0.958635866689604	1.87071487644608e-06	0.9191030747837292	2.232693471422842e-05	0.9181420931674052	4.6163884743422525e-05	0.8947017046483199	9.403164985459224e-08	0.8645670722564842	8.865579752910406e-07	0.8635006825965333	1.732044472303754e-05	0.9128219205173794	0.000101448319092	0.911766669988118	MSGN1	7581	SMC6	23800	KCNS3	53806	False	False	False	ref	-65	0.005066	-5	0.005737
2056	chr2	17826046	T	C	rs35925486	0.0917767308	0.1214179220490414	0.0917767308	0.1232545603107502	0.0336480367504829	0.170601976225678	0.0031984865212004	0.103820772628719	0.0031984865212004	0.1051643325289852	0.0005402329187423	0.986297622129315	4.402399570696671e-05	0.8654512726154723	4.402399570696671e-05	0.8723396399169903	1.6883670933751483e-05	0.9649804538964704	1.4331630397907194e-06	0.8044573794112468	1.4331630397907194e-06	0.8111817122936785	0.0001311405100458	0.8855746783873678	0.0001311405100458	0.8925369860416262	MSGN1	9585	SMC6	25804	KCNS3	51802	False	False	False	alt	-95	0.1895	65	0.0454
2057	chr2	17872369	A	T	rs6531063	0.0167755013	0.6445115337205112	0.0167755013	0.6507331222847916	0.0096621502448363	0.9201585769009252	0.0001631899917631	0.7664015411136869	0.0001631899917631	0.7730469029426212	0.0011489228332948	0.9575942627740278	1.997928167312781e-05	0.9164012035819544	1.997928167312781e-05	0.9234626066312352	1.1452321797485226e-05	0.97639086623984	2.0213466133014328e-07	0.9380040615624664	2.0213466133014328e-07	0.9450592402125604	9.072613902541784e-05	0.9070094443107206	9.072613902541784e-05	0.9140572660277524	KCNS3	5479	MSGN1	55908	SMC6	72127	False	False	False	alt	-40	0.03217	95	0.047
2058	chr2	17894785	A	G	rs2061607	0.147513975	0.0508185095276056	0.147513975	0.0513856017167105	0.0332865284469147	0.1790171541336724	0.0053058109299626	0.0597832363458025	0.0053058109299626	0.0603075191607096	0.0340363234469334	0.5354654610559766	0.0063056481127013	0.2433135561800792	0.0063056481127013	0.2471511883474589	0.0013337802539212	0.4280780259364782	0.0002567931494258	0.1960855715603988	0.0002567931494258	0.1992682139253567	0.0140773976444194	0.1663016685552489	0.0140773976444194	0.1690023712943131	KCNS3	16937	MSGN1	78324	SMC6	94543	False	False	False	alt	60	0.00711	100	0.06946
2059	chr2	22333905	A	C	rs4552217	-0.0863572116	0.1410842230151735	0.0863572116	0.1390139148796919	0.0187045611081949	0.5250835954626609	-0.0016857328077875	0.2171044611582719	0.0016857328077875	0.2142598960180624	0.0784830589554946	0.3508602633009517	-0.0071452451227311	0.2020824652788745	0.0071452451227311	0.1985585013957597	0.0015639994507534	0.3655108606952154	-0.0001465346500751	0.2270196856807699	0.0001465346500751	0.2233086438711207	-0.0150349708026788	0.1432561020442307	0.0150349708026788	0.1407609255061319	KLHL29	1051275	TDRD15	1209936	APOB	1289832	False	False	False	ref	90	0.02283	-75	0.1732
2060	chr2	22333932	T	G	rs4277554	0.0463948084999999	0.3203005945833677	0.0463948084999999	0.3245509652712061	0.0123110055826313	0.8117153607698715	0.0005962932116288	0.4731550750784723	0.0005962932116288	0.4787374796589693	0.0904176701527498	0.324804221547868	0.0045689461334074	0.2690080906897102	0.0045689461334074	0.2733498950684812	0.0011435060680624	0.4186111187381212	5.9449230880260615e-05	0.3445151614205284	5.9449230880260615e-05	0.349457196719443	0.0092392200851175	0.2306238645925777	0.0092392200851175	0.2344751511972359	KLHL29	1051248	TDRD15	1209963	APOB	1289859	False	False	False	alt	45	0.02646	-100	0.2065
2061	chr2	22345778	C	A	rs7608960	-0.00597669598	0.8135863158136378	0.0084961228199999	0.81397760168242	0.0322037833505107	0.1899219532622648	-0.0001774126670407	0.695725084310778	0.0002641744295698	0.6959408375162988	0.0031077826531621	0.8798459266309827	-6.601966673903324e-06	0.932876362179688	1.703260935084638e-05	0.9340290352110072	0.0001013328472368	0.8088838160474305	-1.901452665702515e-07	0.8911792114348309	5.503895798452832e-07	0.8921835777024464	-3.2991323281958776e-05	0.9328850753263984	6.928177889213347e-05	0.9329076607638712	KLHL29	1039402	TDRD15	1221809	APOB	1301705	False	False	False	ref	-55	0.005703	-100	0.0313
2062	chr2	22415696	T	C	rs11895519	-0.00337134216	0.5897318431115239	0.02030898104	0.5902984970189832	0.0724703005163519	0.0155971812106477	-0.0002669079022048	0.255286130140509	0.0014288243529493	0.2561687449262642	0.0110636402626108	0.7220426067058299	3.625599227235215e-05	0.7108592584016126	0.0002602384687423	0.712012634645627	0.0007792165755357	0.4964785500809428	2.4273840935498693e-06	0.5362676653016599	1.7849661503782423e-05	0.5373368153314135	9.40252713536318e-05	0.6997403496606074	0.0008429283098544	0.7009408712721792	KLHL29	969484	TDRD15	1291727	APOB	1371623	False	True	False	ref	-85	0.0424	-100	0.2058
2063	chr2	22417579	A	C	rs140227113	-0.0083816428	0.8240985862316011	0.0083816428	0.8173162963900799	0.0209226621458928	0.4515384798336839	-0.0001661200188869	0.7829868542560193	0.0001661200188869	0.7762764507482214	0.002454554452179	0.9044777884498192	-2.401197165999284e-05	0.9272019910337684	2.401197165999284e-05	0.920302907451859	5.089767283348632e-05	0.8871246908526961	-4.691184225081804e-07	0.9144802016923748	4.691184225081804e-07	0.9075484783380976	-9.814918676387236e-05	0.9179848591070436	9.814918676387236e-05	0.911125487454182	KLHL29	967601	TDRD15	1293610	APOB	1373506	False	False	False	ref	-10	0.003326	70	0.03528
2064	chr2	22509148	T	C	rs1463977	-0.0002291803599999	0.430349007197464	0.03406938164	0.4301876906486286	0.013219642199777	0.7689553162804963	-6.559251347539236e-05	0.5585641321930739	0.0004527970294949	0.5584664206686405	0.2756293094916037	0.1241248974784461	-0.0029810676289926	0.1969995610315332	0.0091474113306119	0.1967686079308392	0.0038142661872207	0.2086088495122036	-5.747507481712265e-05	0.2709854205452794	0.0001279582423339	0.2708118061139082	-0.0015217247863811	0.2187485592667182	0.0108467223120318	0.2185735363950675	KLHL29	876032	TDRD15	1385179	ATAD2B	1417975	False	False	False	ref	-100	0.2114	-30	0.2473
2065	chr2	26765143	T	A	rs34995758	-0.01519783974	0.6857391638732075	0.01519783974	0.6794218700921719	0.0075661421766732	0.9700297009930164	-0.0001094328424677	0.8512523986591474	0.0001094328424677	0.8444223781271154	0.4038575104747451	0.0690287759770186	-0.0062391320599752	0.2514597804107175	0.0062391320599752	0.2475756615430318	0.0030362769464012	0.2398493013635436	-4.465831129357532e-05	0.4086096666043617	4.465831129357532e-05	0.4035909996352934	-0.0050171554881066	0.3786280337755654	0.0050171554881066	0.3737687277805593	CENPA	853	SLC35F6	858	KCNK3	72420	False	False	False	ref	50	0.03088	75	0.2842
2066	chr2	26769202	C	T	rs3769126	-0.163224662	0.0459597299136902	0.163224662	0.0454649005007721	0.0290370151588371	0.2409788992725765	-0.0049619358952108	0.0677685132346602	0.0049619358952108	0.0671561523555184	0.1422025007423047	0.2410971943707416	-0.0272542469353166	0.075310791328881	0.0272542469353166	0.0739118256458934	0.0043826610016889	0.1908816995957588	-0.0008582952496398	0.0771338906288339	0.0008582952496398	0.0757913772378381	-0.0413942133218963	0.038322731768884	0.0413942133218963	0.0376566693380021	CENPA	4912	SLC35F6	4917	KCNK3	76479	False	False	False	ref	10	0.013	30	0.06152
2067	chr2	26774622	A	C	rs4665905	-0.0039766118	0.3888489742404882	0.0368830582	0.3885173526814566	0.01628821483149	0.6305450592453363	-0.0001002500565968	0.4656517209448376	0.0005823313032981	0.4650534824853287	0.0157649038302925	0.6515816913457421	-7.542940663963997e-05	0.5604984826175313	0.0006174461621937	0.5602519019501332	0.000244839737867	0.6800975705935198	-1.434885606435861e-06	0.5864954919754564	9.375934290819116e-06	0.585941885501324	-0.0001162944145689	0.5191114191323012	0.0020891755468311	0.5191224760638607	CENPA	10332	SLC35F6	10337	DPYSL5	73126	False	False	False	ref	-40	0.03677	85	0.05444
2068	chr2	26808217	C	T	rs34736994	-0.0907621978	0.1261883663291096	0.0907621978	0.1245649007971445	0.0332906875658153	0.1759494494428983	-0.0031294633226886	0.1106913207343759	0.0031294633226886	0.1094837839882601	0.2827298670449671	0.1207424835357405	-0.0239092196168841	0.0729837132073273	0.0239092196168841	0.0716889945025541	0.0090715548608196	0.0861327705777123	-0.0008132236540269	0.0659395400630509	0.0008132236540269	0.0648994027914753	-0.028822869585299	0.0616766984199071	0.028822869585299	0.0606587858465115	DPYSL5	39531	CENPA	43927	SLC35F6	43932	True	False	False	ref	-100	0.3496	-100	1.107
2069	chr2	26810572	G	A	rs2082610	0.205846872	0.0220176754474141	0.205846872	0.0221746447267283	0.0298200233950835	0.2277060396614327	0.0063295129885898	0.0411974698672905	0.0063295129885898	0.0416099782904012	0.1346260433505987	0.2489668272762056	0.0286760744907435	0.0572826535593899	0.0286760744907435	0.0584310532210812	0.00417963516292	0.1945979558298627	0.0009238394905582	0.0588331090766625	0.0009238394905582	0.0598475385774785	0.0467627264029559	0.0244022442481564	0.0467627264029559	0.0247914839688887	DPYSL5	37176	CENPA	46282	SLC35F6	46287	False	False	False	alt	-10	0.0009155	-100	0.0825
2070	chr2	26813614	T	C	rs11891133	0.154986638	0.0448666109559029	0.154986638	0.0454845333749147	0.0375201286462256	0.1308898266694119	0.0061494316241292	0.046431417333581	0.0061494316241292	0.0469757571123686	0.0443543598033716	0.4803066562366609	0.0075669291074371	0.203212822775525	0.0075669291074371	0.2065541939134366	0.0017459434172138	0.3608964838565389	0.0003197858771374	0.1550241136295115	0.0003197858771374	0.1575244255568911	0.01689073273729	0.1321142386159644	0.01689073273729	0.1341242910462212	DPYSL5	34134	CENPA	49324	SLC35F6	49329	False	False	False	alt	100	0.2837	80	0.12085
2071	chr2	26814228	C	G	rs2082611	-0.2288636379999999	0.0177812754677411	0.2288636379999999	0.0176133956986726	0.0567882853772166	0.0385896237412993	-0.0137743193929074	0.0136980206070949	0.0137743193929074	0.0136634031249472	0.1779180825442908	0.1982909369301954	-0.040219123176263	0.0380320891825399	0.040219123176263	0.0373620825070641	0.0099545123708927	0.0766026373177663	-0.0024038689366786	0.0219060185453919	0.0024038689366786	0.0216460278917694	-0.058879614661344	0.0149898649984546	0.058879614661344	0.0147925439609842	DPYSL5	33520	CENPA	49938	SLC35F6	49943	False	True	False	ref	75	0.10706	40	0.04993
2072	chr2	26815782	G	T	rs35610357	-0.1346441102	0.0697965291069253	0.1346441102	0.0689687911482989	0.0319957566783698	0.1953431780124457	-0.0045657884565808	0.0781050021265198	0.0045657884565808	0.0771387611184416	0.3505534294480552	0.0882491828237741	-0.0427188186161274	0.0376084514246193	0.0427188186161274	0.0367730820522402	0.0108311586322185	0.0666376845313704	-0.0014177358307608	0.0399303315843511	0.0014177358307608	0.039188536177611	-0.0428227376200059	0.0326110301358705	0.0428227376200059	0.0320658168291013	DPYSL5	31966	CENPA	51492	SLC35F6	51497	False	False	False	ref	-65	0.1385	-15	0.03564
2073	chr2	26816924	G	A	rs12475388	0.1720878019999999	0.0384050836130344	0.1720878019999999	0.0387977006453603	0.025616572251036	0.3178701119522719	0.0047300656132333	0.0705025110801491	0.0047300656132333	0.0713550988992459	0.3127866121210122	0.103409851794549	0.0545509340506436	0.0256628462188937	0.0545509340506436	0.0261260632899118	0.0079715405287983	0.0989673360014551	0.0014909756209916	0.0376956959988215	0.0014909756209916	0.0383372827649749	0.0574972782158292	0.0165702310565265	0.0574972782158292	0.0167804515643811	DPYSL5	30824	CENPA	52634	SLC35F6	52639	False	False	False	alt	60	0.05518	75	0.2405
2074	chr2	26843235	G	T	rs2196150	-0.342771334	0.0056970326314474	0.342771334	0.0057009308838414	0.095475600514736	0.0053585633953434	-0.0332113153873863	0.0027927543342039	0.0332113153873863	0.0027688584130136	0.2124311306126488	0.1647533377444309	-0.0729809734685566	0.0151832572904149	0.0729809734685566	0.0149328102214269	0.0201418663530792	0.0228088511930562	-0.0070103887310929	0.0051208520920894	0.0070103887310929	0.0051308207126212	-0.0951502754775493	0.0045265415028326	0.0951502754775493	0.0045239250809252	DPYSL5	4513	CENPA	78945	SLC35F6	78950	False	True	True	ref	-100	0.00943	45	0.04248
2075	chr2	26870976	A	C	rs1368889	0.0748980828	0.1900290372593197	0.0748980828	0.1926113518575742	0.0300107313401201	0.2268101314701588	0.0026795185707134	0.1669774209430631	0.0026795185707134	0.1691252925221523	0.0042608294018672	0.8441594680921368	0.0003647635692526	0.6501162612408605	0.0003647635692526	0.6561872867326174	0.0001347126452684	0.7770863862828716	1.3296155155489564e-05	0.5779893884447375	1.3296155155489564e-05	0.5838383006265149	0.001253670284715	0.6189541211064186	0.001253670284715	0.6251687879560196	DPYSL5	23228	MAPRE3	99662	CENPA	106686	False	False	False	alt	10	0.000702	0	0.0
2076	chr2	27712485	C	A	rs4665386	-0.0329658	0.4432212272987463	0.0329658	0.4376104771134416	0.0217772084103726	0.4228291173935002	-0.0007218990909585	0.4230956365589868	0.0007218990909585	0.417865201198439	0.0010458249480386	0.966874577411872	-3.715927970191709e-05	0.8988479573459232	3.715927970191709e-05	0.8918869240748142	2.290506017664896e-05	0.9511072254577728	-8.16173139513065e-07	0.8778522559881266	8.16173139513065e-07	0.8709089229146882	-0.0001525848701791	0.8867962407825787	0.0001525848701791	0.8799332474367992	SUPT7L	48645	SLC4A1AP	49058	MRPL33	59233	False	False	False	ref	100	0.0645	-100	0.094
2077	chr2	27796239	C	T	rs4666013	-0.0351236989	0.4067455199072982	0.0351236989	0.4017553516467066	0.0175946175351706	0.5796331451787025	-0.0006160797678898	0.4566873303582394	0.0006160797678898	0.4513146253390523	0.458877140312098	0.053521806709351	-0.0164915700913881	0.1060964692415858	0.0164915700913881	0.1041385143559212	0.0080086113175281	0.0979004263123196	-0.0002859478995899	0.1449378418139073	0.0002859478995899	0.1425006940369187	-0.0111931312064926	0.190770369648398	0.0111931312064926	0.1875067035545484	MRPL33	24521	BABAM2	93703	RBKS	94442	False	False	False	ref	-75	0.1418	-75	0.637
2078	chr2	27796500	G	A	rs4666015	-0.02013542366	0.6125894778636147	0.02013542366	0.606379059898194	0.0274057186779606	0.2737392341303247	-0.0005463617313695	0.5073614589654035	0.0005463617313695	0.5017512703346034	0.4259707696875721	0.0622878829373329	-0.0083985338554397	0.1865510837760965	0.0083985338554397	0.183363774495365	0.0118186948224914	0.058836472130368	-0.0002334742707272	0.1734634279660266	0.0002334742707272	0.1703834830992419	-0.006677443832272	0.3002024318372224	0.006677443832272	0.2958601366879329	MRPL33	24782	BABAM2	93442	RBKS	94181	False	False	False	ref	80	0.02094	95	0.2137
2079	chr2	27799808	G	A	rs7570730	0.0203239183999999	0.430645722480954	0.0340699443999999	0.4341745481343885	0.0143261370336238	0.7157674406466102	0.0002831541807304	0.5194342124247784	0.0005279414280089	0.5230474823706898	0.5031102570024084	0.0430542922544777	0.0081941475639062	0.109553205984097	0.016117635762419	0.1111087693348059	0.0071721648012473	0.1116008518526812	0.000108811796683	0.1653991180585051	0.0002499121294349	0.1674603625777283	0.0072704628682656	0.2057055075411573	0.0108582692751805	0.2081024313472342	MRPL33	28090	BABAM2	90134	RBKS	90873	True	False	False	alt	-60	0.01523	45	0.1865
2080	chr2	27802713	G	C	rs11891769	-0.1784244479999999	0.0349473549885269	0.1784244479999999	0.0346133940656677	0.0364140877456721	0.1404700943814661	-0.0066836844089745	0.0414921572744243	0.0066836844089745	0.0411923671808226	0.0891994655405627	0.3542625222072898	-0.0193794902082922	0.1163613386283669	0.0193794902082922	0.1144387028040791	0.0034208179859113	0.2507972401181853	-0.0007578408051215	0.0956309994135392	0.0007578408051215	0.0940190407309871	-0.0319652931279073	0.0630952803486789	0.0319652931279073	0.0621021939204301	MRPL33	30995	BABAM2	87229	RBKS	87968	False	False	False	ref	100	0.0859	90	0.1526
2081	chr2	27807570	A	G	rs12986980	-0.0421272996	0.2714533681375073	0.0589898932	0.2698331953073569	0.0294724378399582	0.2345455634145784	-0.0014684162710542	0.2369278064818382	0.0019538924273065	0.2353324184356938	0.3787824552142786	0.0768051311702358	-0.0227774016390378	0.0871428060758327	0.0281615291373045	0.0864018628538482	0.0114741732637605	0.0638255928369011	-0.0008126570414968	0.0883245802633641	0.0009676667384625	0.0875191459517084	-0.0126290785523406	0.1288800987414812	0.0183580218402559	0.1274399891818845	MRPL33	35852	BABAM2	82372	RBKS	83111	True	False	False	ref	-25	0.07886	-10	0.0786
2082	chr2	27811517	C	T	rs4233716	-0.04291407652	0.3615983130099425	0.04291407652	0.3570880346175503	0.0152025222736681	0.6740637556386908	-0.0006961705524511	0.4552564578482531	0.0006961705524511	0.4498989684409836	0.087568869387351	0.331224237979289	-0.0032335337441296	0.3116841854971062	0.0032335337441296	0.3072184521714632	0.001298556557031	0.3917772242330982	-5.120378868221108e-05	0.3582673527109539	5.120378868221108e-05	0.3534588526746897	-0.0071731384645837	0.27954815358479	0.0071731384645837	0.2752354479451007	MRPL33	39799	BABAM2	78425	RBKS	79164	False	False	False	ref	-100	0.0646	-100	0.2449
2083	chr2	27815932	C	T	rs12617171	-0.0261420327199999	0.4945772975563459	0.0272865079199999	0.4899435719135717	0.0238055467851068	0.3593415239810997	-0.000652217335005	0.4534574757887245	0.0006781162013912	0.4493526322559718	0.0570906601563788	0.4106964288072996	-0.001274458069685	0.4682405160153867	0.0013504077871419	0.4642605341585745	0.0013367876451985	0.3835277754656318	-3.1473847440124715e-05	0.4401551430146574	3.319254922283759e-05	0.4361243053817899	-0.0034525419814588	0.4346244696188915	0.0036636864504634	0.4304348189906021	MRPL33	44214	BABAM2	74010	RBKS	74749	False	False	False	ref	60	0.01141	60	0.1089
2084	chr2	27835359	C	T	rs12464988	-0.0186876146919999	0.6098635061650223	0.0186876146919999	0.6036066529023607	0.0229588564988372	0.3849223810064983	-0.0004491873883907	0.5494039223932327	0.0004491873883907	0.5435259437574195	0.0068267295701229	0.785749785791743	-0.000154955703268	0.774035692639343	0.000154955703268	0.7672688566967388	0.0001579970713843	0.7530002429836602	-3.715621028979504e-06	0.7438709450412556	3.715621028979504e-06	0.7373476955381091	-0.0006581768994753	0.7439355748594514	0.0006581768994753	0.7371141302597612	BABAM2	54583	RBKS	55322	MRPL33	63641	False	False	False	ref	-15	0.0105	-10	0.01099
2085	chr2	27856477	C	A	rs4233719	-0.025231396724	0.5569269894837985	0.025326942376	0.5527220297841965	0.0219143529753367	0.4177499754254989	-0.0005336476997875	0.5613107801883936	0.0005352390773881	0.557040837474015	0.0888043944442611	0.3297126423633619	-0.003016178828584	0.4297678457586768	0.0030208826654413	0.4259760333601226	0.0019481224400475	0.3248026074402861	-6.41635745037547e-05	0.4344033572062815	6.42419200952748e-05	0.4306221051454754	-0.0056786315199102	0.4042505501923132	0.0056901784830589	0.4004305539785848	BABAM2	33465	RBKS	34204	MRPL33	84759	False	False	False	ref	-85	0.03555	100	0.09845
2086	chr2	27873925	A	G	rs12466717	0.0662204364	0.214172757504479	0.0662204364	0.2171881844524866	0.0239564343064107	0.3590128304919822	0.0017490363543878	0.2266638882610028	0.0017490363543878	0.2295433717731377	0.0089175546831182	0.7433869114980433	0.0005415655863785	0.5715535614152554	0.0005415655863785	0.5772334662701668	0.0002013062853911	0.7108296908624325	1.3584332234024425e-05	0.5386387825382825	1.3584332234024425e-05	0.544367635684761	0.0017856553726369	0.5367735181717747	0.0017856553726369	0.5424839812186945	BABAM2	16017	RBKS	16756	MRPL33	102207	False	False	False	alt	-85	0.01456	-100	0.06335
2087	chr2	27880131	G	A	rs6547814	-0.184417042	0.0298397551627921	0.184417042	0.0295754293737329	0.028873305071542	0.2449905564202074	-0.0053328301638417	0.052816802892804	0.0053328301638417	0.0522863863997334	0.1349468839695159	0.2461624035798909	-0.025736938452538	0.0660709536867909	0.025736938452538	0.0648189951877534	0.0037640090947739	0.2036762649587108	-0.0007132514903477	0.0697623231333492	0.0007132514903477	0.0685462767191228	-0.0420499158721256	0.0299044336761843	0.0420499158721256	0.0294618753071986	BABAM2	9811	RBKS	10550	MRPL33	108413	False	False	False	ref	85	0.01373	95	0.11
2088	chr2	27901304	G	A	rs10177845	-0.113858825	0.1074417669039073	0.113858825	0.1061096209643234	0.0523101849141833	0.0498807222990717	-0.0067424482226657	0.0611753333788973	0.0067424482226657	0.0604708543911066	0.0165476229751574	0.6724268514571601	-0.002326826462381	0.4224150931010743	0.002326826462381	0.4172999485692003	0.0009689599772593	0.4892641755799915	-0.0001458789065236	0.2901877639419367	0.0001458789065236	0.2861819658196641	-0.0059186433967866	0.3546761820451202	0.0059186433967866	0.3500656256944721	RBKS	10623	BABAM2	11362	MRPL33	129586	False	False	False	ref	25	0.012665	25	0.07605
2089	chr2	27913484	A	G	rs1458396	-0.01163611248	0.6611873463979108	0.01644222008	0.6569572828819088	0.0282849264318109	0.2558292447291163	-0.000320845012354	0.5366573768664665	0.0004617186852198	0.5326965747213218	0.0017106001121704	0.9379650344697436	-1.6272460400657783e-05	0.9140665913035858	2.6935610405937044e-05	0.9097305565987682	4.857877352634533e-05	0.8964411977488411	-4.4878873736572083e-07	0.875000879531893	7.613404347769621e-07	0.8707001100193149	-4.28887202665555e-05	0.9223118736435684	8.57774405331155e-05	0.9179990788260676	RBKS	22803	BABAM2	23542	MRPL33	141766	False	False	False	ref	-70	0.09595	-70	0.0658
2090	chr2	27933773	T	G	rs13012050	0.01085043826	0.7215122194640443	0.01342124814	0.7237057786666838	0.0616558961991603	0.0286617652884914	0.000519819259356	0.435745953535388	0.0007107027350423	0.4377584828809694	0.0014153277687967	0.9429151906479136	1.819431438439425e-05	0.923633415425006	2.1652524919025248e-05	0.9267984092388044	8.48026279701022e-05	0.827314060342106	8.737677822439093e-07	0.8386593345857891	1.1338142513487336e-06	0.8403116811027499	6.103394807165192e-05	0.9307727918234732	6.763221272804726e-05	0.9342204882881394	RBKS	43092	BABAM2	43831	MRPL33	162055	False	False	False	alt	-55	0.007904	90	0.1442
2091	chr2	27936777	A	G	rs10184052	0.1563864344	0.0499387500492253	0.1563864344	0.050406330167814	0.0335563799383609	0.1763165275887648	0.0059605383259396	0.059347997905124	0.0059605383259396	0.0597896074491999	0.0004288872026656	0.9900907301437096	6.83244910128046e-05	0.8348926852068763	6.83244910128046e-05	0.841738585067246	1.4440106437388182e-05	0.9723297873337472	2.483317686017608e-06	0.7672803589588044	2.483317686017608e-06	0.7739174007144838	0.0001864009765431	0.8596568916797787	0.0001864009765431	0.866468113780347	RBKS	46096	BABAM2	46835	MRPL33	165059	False	False	False	alt	25	0.00708	100	0.2075
2092	chr2	28019441	G	A	rs4616436	0.0322025544	0.4160215257835413	0.03637085	0.41923848591475	0.0127886629345546	0.7879930746256301	0.000477545595619	0.5370110621090024	0.0005142913592	0.5408652725126694	0.003338721916136	0.8925763700583356	0.0001564448589303	0.7850918603329878	0.0001629081853769	0.7892172146155044	4.598339951037587e-05	0.9151275634592858	2.260767565149453e-06	0.8103765239623398	2.31774525932996e-06	0.8145789335523196	0.0005303355217577	0.7688198788733437	0.0005583781465474	0.7729740763319742	RBKS	128760	BABAM2	129499	MRPL33	247723	False	False	False	alt	-85	0.1653	-45	0.1525
2093	chr2	36985060	G	A	rs6712162	-0.040142999	0.3924671679552957	0.040142999	0.3876828700471788	0.0224874096471381	0.4026976458149029	-0.0009030915556906	0.3837834844789423	0.0009030915556906	0.3790884722383409	0.000701890402824	0.9785844535981644	-2.6736424718971333e-05	0.9193154534180908	2.6736424718971333e-05	0.9123657714345424	1.5600370319564906e-05	0.9667518588326304	-5.994203549411077e-07	0.8974625875684459	5.994203549411077e-07	0.8906205888275345	-9.155092210747684e-05	0.9213098046771748	9.155092210747684e-05	0.9143203972781664	STRN	18524	HEATR5B	99312	GPATCH11	99459	False	False	False	ref	40	0.00441	65	0.04144
2094	chr2	37005187	C	T	rs1123648	-0.1564753186	0.0511773648125089	0.1564753186	0.0505495454226567	0.038182548158116	0.1263564510802692	-0.0064780833278282	0.0505117732562518	0.0064780833278282	0.0501118155117727	0.2117110949820196	0.1654992975225018	-0.0359656744796275	0.051818562591593	0.0359656744796275	0.0507987458343181	0.0081511200388094	0.0981821510578069	-0.0014673253283209	0.043832133829187	0.0014673253283209	0.0430715650199559	-0.0459610372472039	0.0282960343038171	0.0459610372472039	0.0279155462593838	STRN	38651	HEATR5B	79185	GPATCH11	79332	False	False	False	ref	75	0.03052	70	0.3193
2095	chr2	37011373	C	G	rs6753260	-0.0798135886	0.1663379999965161	0.0798135886	0.1639459360181475	0.0182062081272195	0.552929273974401	-0.001542819387944	0.2473552778183352	0.001542819387944	0.2442057469387756	0.0097893504008445	0.7278456659733478	-0.0008002113703514	0.5260118499969615	0.0008002113703514	0.5200464047276929	0.0001765737269747	0.730639085250046	-1.534748248968868e-05	0.5327664388189468	1.534748248968868e-05	0.5268801717659151	-0.0026335323809837	0.4804127845148613	0.0026335323809837	0.4744502073695438	STRN	44837	HEATR5B	72999	GPATCH11	73146	False	False	False	ref	-85	0.01082	15	0.0528
2096	chr2	37020872	T	C	rs17020136	-0.02076179592	0.5879786947508928	0.02076179592	0.5814630522982386	0.0198055411453638	0.4900266267059779	-0.0004209392457555	0.5731343654127931	0.0004209392457555	0.5668932787044068	0.3250140213123947	0.1005159970663623	-0.0073402301454852	0.2235537806747328	0.0073402301454852	0.21978132024752	0.0064423072822899	0.1299764463827247	-0.0001498493647262	0.245455510564291	0.0001498493647262	0.2413276927720578	-0.0065479528883903	0.3094940953603431	0.0065479528883903	0.3049630803024572	STRN	54336	HEATR5B	63500	GPATCH11	63647	False	False	False	ref	-85	0.1256	-70	0.2046
2097	chr2	37179000	C	T	rs28463756	0.04867107498	0.3407143563838444	0.04942281902	0.3434778523599294	0.0462900453721918	0.0724720765793121	0.002511978446862	0.217389893250825	0.0025493001998541	0.2190259880948855	0.0012767642110124	0.9530301720116228	7.707346274296691e-05	0.8520818347411193	7.787329596485636e-05	0.8560978571673	6.106604963866815e-05	0.8676667377987086	4.043259281022656e-06	0.7573636140584853	4.082968513116454e-06	0.7613423818264256	0.000235063178384	0.854121379553913	0.0002400118768763	0.8580723032489297	CEBPZOS	17489	SULT6B1	17598	EIF2AK2	21478	False	False	False	alt	100	0.0331	-85	0.1814
2098	chr2	37180035	A	G	rs4374352	0.0423633416	0.3654847815350633	0.0423633416	0.3699258778375111	0.0507839625824854	0.0547787743839671	0.0023656921712778	0.1855404694697571	0.0023656921712778	0.1879315376188319	0.0096936755633267	0.741113461538962	0.000303267148615	0.6507612700358864	0.000303267148615	0.6569708133927302	0.0004522663986264	0.587320441405156	1.5575945112976852e-05	0.5123248530236505	1.5575945112976852e-05	0.5179969434016537	0.0010285045033156	0.63408492431996	0.0010285045033156	0.6402505811729788	CEBPZOS	16454	SULT6B1	16563	EIF2AK2	22513	False	False	False	alt	30	0.05975	100	0.04382
2099	chr2	37181405	C	T	rs6750763	-0.04233556346	0.3588627056700674	0.04233556346	0.3544288415177559	0.0683220291324878	0.0193651557962901	-0.0028101682666882	0.1419882948112437	0.0028101682666882	0.1404296417721707	0.0491966612780838	0.4462862159656211	-0.0021805576324664	0.3998605034177346	0.0021805576324664	0.3947943490803939	0.0034067920826224	0.2263025525326981	-0.0001460006654972	0.241614764881959	0.0001460006654972	0.2380195263775001	-0.0053990300550954	0.3505057051673761	0.0053990300550954	0.3456921142566912	CEBPZOS	15084	SULT6B1	15193	EIF2AK2	23883	False	True	False	ref	95	0.02289	-90	0.1847
2100	chr2	37183173	T	G	rs11124565	-0.0075665940599999	0.8138870832579393	0.0087445727799999	0.8098857976637377	0.0323720416641914	0.1874387373823802	-0.0002329043077737	0.6850890919280652	0.0002710140973018	0.6810238005929046	0.0032677905710797	0.8782071802328054	-1.6654792154814163e-05	0.9335365239610538	1.93606338333816e-05	0.9295676507253576	0.000106585058253	0.8097406690755818	-5.209729276434868e-07	0.8885517492830589	6.085119100555396e-07	0.8846150188271048	-7.093134505622016e-05	0.9275003493104962	8.247830820491216e-05	0.9234933014594096	CEBPZOS	13316	SULT6B1	13425	EIF2AK2	25651	False	False	False	ref	-45	0.02342	30	0.03564
2101	chr2	37183820	T	G	rs4670673	-5.8423168000000006e-05	0.7753526047986226	0.010147697568	0.7745942624998666	0.0498001419610843	0.0568831377098021	4.294800840385253e-05	0.5225055025275597	0.0005067916649668	0.5217994429441121	0.0024875457754609	0.8984273574796879	-1.223847656321539e-05	0.9065963259498844	2.848003333356796e-05	0.906799382429532	0.0001206242966855	0.7842346256649204	-4.739175355628354e-07	0.8289194524510336	1.3812900513971446e-06	0.8278545058551063	-4.948698492295639e-05	0.8979944424061446	0.0001204183299791	0.8969313530142928	CEBPZOS	12669	SULT6B1	12778	EIF2AK2	26298	False	False	False	ref	-55	0.01825	-95	0.0796
2102	chr2	37198486	A	G	rs2287093	0.1629658199999999	0.0389190231576359	0.1629658199999999	0.0393114450397831	0.022718607036449	0.3931565025531025	0.0037954246829541	0.0839622494668896	0.0037954246829541	0.0849231263583598	0.2006227112269473	0.1782083814542288	0.0352124002119636	0.0474625352683736	0.0352124002119636	0.0483145003998973	0.0046044721703141	0.1807407910153544	0.0008198782098701	0.0663825971689928	0.0008198782098701	0.0675671054485684	0.0470060374121605	0.0247679806519185	0.0470060374121605	0.025079296486107	SULT6B1	1888	CEBPZOS	1997	CEBPZ	33110	False	False	False	alt	55	0.004395	-35	0.05963
2103	chr2	37227075	C	G	rs10182759	0.0878879912	0.1290314943801606	0.0878879912	0.1308886832018153	0.0344467002189017	0.1620571124401843	0.0029781256866958	0.1086016024759515	0.0029781256866958	0.1099017106667821	0.0695003464088944	0.3721178967905602	0.0061729955723693	0.2068479449915243	0.0061729955723693	0.2105079441847505	0.0023736301499991	0.2819219854268966	0.0002091038844246	0.166560054130036	0.0002091038844246	0.1694779215077336	0.0140823463429117	0.1457910162392291	0.0140823463429117	0.1484229407700901	CEBPZ	4521	NDUFAF7	4557	SULT6B1	30477	False	False	False	alt	-15	0.00482	20	0.04468
2104	chr2	37281990	C	A	rs2041836	-0.1416134	0.0553927681287513	0.1416134	0.0548089185895008	0.0605642136162825	0.0306415313096682	-0.0081614673845475	0.0281475370940995	0.0081614673845475	0.0280035525262676	0.0873766949292335	0.3369690227210457	-0.0128698586700467	0.1354078846735137	0.0128698586700467	0.1328960891557331	0.0050586503493371	0.1640124912668067	-0.000704376364161	0.0740839759364652	0.000704376364161	0.0728377189983538	-0.024852363828313	0.0780643001789477	0.024852363828313	0.0767343732292107	PRKD3	42843	NDUFAF7	50358	CEBPZ	50394	False	False	False	ref	75	0.06036	-45	0.07886
2105	chr2	37292625	C	T	rs11682607	-0.167838163	0.0368209779847868	0.167838163	0.0364211836363022	0.0512865658707368	0.0516042472645725	-0.008694962089731	0.0251930466472134	0.008694962089731	0.0250828188262348	0.0005954933852396	0.9831526679013828	-9.962237122315618e-05	0.7913098294720157	9.962237122315618e-05	0.7845932190494576	3.075468147796344e-05	0.926338155208651	-5.190307119503552e-06	0.661207950942671	5.190307119503552e-06	0.6549975755069861	-0.0002730032001583	0.8213051196165543	0.0002730032001583	0.8145124280387966	PRKD3	32208	QPCT	50203	NDUFAF7	60993	False	False	False	ref	-100	0.1602	95	0.06006
2106	chr2	37292826	A	G	rs11693917	0.0056274743	0.6914646646102899	0.0142142908999999	0.692994486351865	0.0232405605441286	0.3745868591381585	6.970674858216e-05	0.6413597614860083	0.00029815848054	0.6426522854478992	0.0009188083534029	0.9678277436273656	8.791746283577152e-06	0.9389108922396996	1.433437972598928e-05	0.940545812828961	2.1219377020472884e-05	0.9515072382386364	1.3990912265575332e-07	0.9269791176297698	2.860954151904839e-07	0.9286145895300536	3.299132328197402e-05	0.933802819667146	6.433308039985205e-05	0.9353730179772544	PRKD3	32007	QPCT	50002	NDUFAF7	61194	False	False	False	alt	-25	0.0176	-70	0.237
2107	chr2	37299694	A	C	rs74177070	0.0202522574	0.4149661104195825	0.0333620694	0.4184394360251982	0.0212768090522298	0.4397838401437411	0.0004434929858477	0.4011421719429079	0.0007132313732691	0.4044754671223727	0.1231937250503117	0.275775960461306	0.0035152146681348	0.2720752454311085	0.0042162593962261	0.2752038813297036	0.0026713178964075	0.2772764777428372	7.72898358627472e-05	0.276689826231984	9.171404518317908e-05	0.2796057433201711	0.0057050245785358	0.2618326356855729	0.007361189007291	0.2647730028530369	PRKD3	25139	QPCT	43134	NDUFAF7	68062	False	False	False	alt	40	0.00873	-45	0.0841
2108	chr2	50826690	C	T	rs67986063	-0.0075515253399999	0.7608712991680128	0.0107055355	0.7588091752501233	0.0192785507086462	0.5087046557154603	-0.0001261676663642	0.750899597173636	0.0001917964007326	0.748917052862971	0.0155092210748572	0.6654894258370265	-0.0001291398281598	0.7726750945179736	0.0001591520907158	0.7709090516874846	0.0003026114599217	0.6612469582804074	-2.3055080415037843e-06	0.7655538686808161	2.9499557056890866e-06	0.7639184753643556	-0.0004074428425324	0.7677809626592187	0.0005278611725115	0.7660014354238808	NRXN1	398885	FSHR	1672163	LHCGR	2070960	False	False	False	ref	90	0.00905	100	0.04547
2109	chr2	50834102	T	C	rs17504263	0.0170679836	0.5534284795699522	0.0225289779999999	0.557575974468888	0.0193975196548584	0.5054150036988875	0.0002940375765921	0.5388458834731099	0.0004264016865109	0.5428917253631013	0.0064234106430008	0.79679804046283	8.955415524503288e-05	0.749643439307747	0.0001333343544896	0.753704398245356	0.0001292076104725	0.7863800008042864	1.5524828240342198e-06	0.7383242784434121	2.6136315393612583e-06	0.7423419854302112	0.0003884728316452	0.7369402893645624	0.0005105407277885	0.7410180703210927	NRXN1	391473	FSHR	1679575	LHCGR	2078372	False	False	False	alt	45	0.1076	90	0.05225
2110	chr2	50841977	A	G	rs17041068	-0.0061846783	0.8111385607477543	0.0084231227	0.8065254218134907	0.0160995742396414	0.6382918915414199	-0.0001063508220216	0.7981749769587957	0.0001442267049418	0.7937281018681338	0.0098272904226188	0.7420578035982847	-6.012846685022116e-05	0.8370817616478098	8.876351108690033e-05	0.8330413905038133	0.0001581894474177	0.7631158581443135	-9.871406675785676e-07	0.839299417622263	1.4716635669319302e-06	0.8351632442072422	-0.000202071855102	0.8323783543978949	0.0003059945234402	0.828281099360178	NRXN1	383598	FSHR	1687450	LHCGR	2086247	False	False	False	ref	100	0.0067	-55	0.0879
2111	chr2	50865054	G	A	rs67206190	-0.043871834	0.3314070507858438	0.043871834	0.3269857295448497	0.0214285330939235	0.4318988366969549	-0.0009555439015018	0.336103712358672	0.0009555439015018	0.3318394890789217	0.0057099732770281	0.8086122622247501	-0.0002633224937138	0.6827628493410227	0.0002633224937138	0.676399047123378	0.000123891541206	0.786444582696843	-5.838740457067805e-06	0.6603598797258642	5.838740457067805e-06	0.6540766244085351	-0.0009773679522285	0.6555898212810142	0.0009773679522285	0.6492292983122054	NRXN1	360521	FSHR	1710527	LHCGR	2109324	False	False	False	ref	20	0.009155	-90	0.1313
2112	chr2	50865455	T	C	rs66848903	-0.031087852	0.2499181287745616	0.0577537423999999	0.2480256740457383	0.0201374038781587	0.4711632349988578	-0.0008650299417851	0.2898398922347848	0.0012484978680527	0.287685988680632	0.0087055854310316	0.7454466462799384	-0.0002414545141333	0.5905662722421611	0.0004762359285246	0.5871854070186591	0.0001650331442667	0.7403517894729106	-6.620013674898754e-06	0.5843360138914597	9.996279810053668e-06	0.5808826230774227	-0.000885817030121	0.5523139424995673	0.0017007027151858	0.5487955446910445	NRXN1	360120	FSHR	1710928	LHCGR	2109725	False	False	False	ref	100	0.00763	65	0.1311
2113	chr2	54640404	C	A	rs2941582	-0.0899981582	0.1457930612377143	0.0899981582	0.1442481143630671	0.0270313860903051	0.2815893590097182	-0.0028502360398528	0.1549408225513345	0.0028502360398528	0.1532955489275338	0.0111873577249183	0.7430277424462135	-0.0017799474297724	0.507586433122221	0.0017799474297724	0.5018711086649564	0.0003627790719724	0.6766984926150214	-6.229562978936104e-05	0.454544097614331	6.229562978936104e-05	0.4492195490931643	-0.0046979644353534	0.4430814696177732	0.0046979644353534	0.4377600684730958	EML6	83096	SPTBN1	184076	C2ORF73	310369	False	False	False	ref	100	0.1809	100	0.0873
2114	chr2	54699238	A	G	rs354216	-0.0139626844	0.2065219064554349	0.065848818	0.2065426719479724	0.033294319284581	0.1759459361069629	-0.0005989010163575	0.1637824177280862	0.0021736245109239	0.1636351522030127	0.0037577117218171	0.8861028683270731	-9.709558046904732e-05	0.7336806910895813	0.0003786003906336	0.7331590621092771	0.0001207601549477	0.8392113539498428	-4.046348209199744e-06	0.6770241083543611	1.233495690499617e-05	0.6764798242353303	-0.0001212431130612	0.6991734199547792	0.0012478968031407	0.6990505105245605	EML6	24262	SPTBN1	242910	C2ORF73	369203	False	False	False	ref	-100	0.0545	10	0.09595
2115	chr2	54719299	C	A	rs73934803	-0.0156778953	0.6728799476116041	0.0156778953	0.6662203471378256	0.0173853118678246	0.5875873677659181	-0.0002681838825529	0.6727431582587146	0.0002681838825529	0.6662175374610344	0.0007835439279468	0.9769250331758744	-1.1982068404001525e-05	0.9557339377751716	1.1982068404001525e-05	0.948768067735158	1.3369048300793388e-05	0.9742356052752248	-2.0272977743957122e-07	0.9516966938344914	2.0272977743957122e-07	0.944694903603212	-4.618785259476765e-05	0.9542836713580988	4.618785259476765e-05	0.94726381036172	EML6	4201	SPTBN1	262971	C2ORF73	389264	False	False	False	ref	70	0.0393	75	0.01776
2116	chr2	54745089	C	T	rs148661029	-0.1845757579999999	0.0288388044846071	0.1845757579999999	0.0285421395990906	0.0392021685601562	0.1153235334077799	-0.0072971098356652	0.0328018322676261	0.0072971098356652	0.0326009330530016	0.0462785787337929	0.4830546436193025	-0.0088182674006144	0.1884320749259586	0.0088182674006144	0.1852941860432195	0.0019799955127168	0.3507238493464353	-0.0003777577824963	0.1383471031813737	0.0003777577824963	0.1360610407747365	-0.0192990993368743	0.115614295319217	0.0192990993368743	0.1138030349713543	EML6	21589	SPTBN1	288761	RTN4	367532	False	False	False	ref	-70	0.0796	-80	0.29
2117	chr2	57722969	G	A	rs10180540	0.0039077051481999	0.6026300446623991	0.0204625352517999	0.6037447804584678	0.0226744513875586	0.3960008860293441	0.0001319285212408	0.5422982702048778	0.0005023424689334	0.5431807020540372	0.0192793045429051	0.6222694952257898	0.0001774438098687	0.6310336116038483	0.0005161866352861	0.6315607089864204	0.0004667563547296	0.5902487065639808	5.70541242563611e-06	0.6029254089007571	1.3301509033486429e-05	0.6034323697998808	0.0004660024413579	0.6071558919743704	0.0015596648081554	0.6072920729722964	VRK2	184661	FANCL	518441	CCDC85A	1538978	False	False	False	alt	-10	0.002686	100	0.0523
2118	chr2	57734094	C	T	rs41335055	-0.0033010779599999	0.6160615294661543	0.01942595116	0.6146534026667273	0.0752441464116298	0.0136025796071189	-0.0002242739231687	0.2745819843485217	0.0014379767239651	0.27396115621689	0.0820906601563788	0.3517077458375198	-0.0009956486417462	0.4442043698064005	0.0016894584477842	0.4425153707737376	0.0059720830833378	0.1400762956894881	-7.254044307410011e-05	0.2694714574993115	0.0001220104614493	0.2685644871830716	-0.0016413183332783	0.4449451597023615	0.0034624393784434	0.4432416450165067	VRK2	173536	FANCL	507316	CCDC85A	1550103	False	True	False	ref	-45	0.01868	-35	0.05603
2119	chr2	57837206	A	G	rs77011057	-0.149149068	0.0498737340108132	0.149149068	0.0492407885824156	0.0357538415365329	0.1488092414362355	-0.0055670758494547	0.0530483835183283	0.0055670758494547	0.0525147464337868	0.0148535185246279	0.6585408205772578	-0.002274397605023	0.3584235466836344	0.002274397605023	0.3534201683001691	0.000533121030885	0.5521564838881269	-8.537306763293133e-05	0.2855265892908771	8.537306763293133e-05	0.2811207029744032	-0.0063359836363036	0.2942814134045832	0.0063359836363036	0.2898185078047668	VRK2	70424	FANCL	404204	CCDC85A	1653215	False	False	False	ref	-75	0.03552	-20	0.0512
2120	chr2	57844611	C	T	rs79017955	0.01226540044	0.714431955908412	0.01226540044	0.7212165898570015	0.0204589041286792	0.4668225333474773	0.0002601526287829	0.6663695913889474	0.0002601526287829	0.6727395444132822	0.0026129128039325	0.8996352544820044	3.63955303561434e-05	0.8825322588034221	3.63955303561434e-05	0.8894645930427018	5.4578693762913455e-05	0.8825083538349543	7.834685558140894e-07	0.8656540836270933	7.834685558140894e-07	0.8726070983618857	0.0001443370393586	0.8783582824029599	0.0001443370393586	0.8845173622038947	VRK2	63019	FANCL	396799	CCDC85A	1660620	False	False	False	alt	5	0.000557	-95	0.04395
2121	chr2	57874972	T	A	rs59159185	0.0098464652	0.5911501305236978	0.020216272	0.5933714981796103	0.0126472410955752	0.7913127252176486	0.0001110433790509	0.6790771195324257	0.0002572769992372	0.6809928626083501	0.191706806109993	0.1832871078128763	0.0029442214784428	0.2777128286578533	0.0043629278425994	0.2792913161350445	0.0024167848267585	0.2809436934543558	3.501859309068847e-05	0.3545778872638983	5.474729799325176e-05	0.3561166884602445	0.0037478143248325	0.3040905994516704	0.006344231467124	0.3056988500429797	VRK2	32658	FANCL	366438	CCDC85A	1690981	False	False	False	alt	45	0.0277	-15	0.2329
2122	chr2	57883101	G	A	rs17828225	-0.164513618	0.0388697052109937	0.164513618	0.0383990257852302	0.0391755812441129	0.119426931681376	-0.0066953453896997	0.0404856730589582	0.0066953453896997	0.040234386753944	0.2826704826630595	0.1198150409278001	-0.043332913993092	0.0332956718911439	0.043332913993092	0.0326707516733453	0.0107681491166137	0.0683486560864889	-0.0017153232914016	0.0299125390145884	0.0017153232914016	0.0293339078437782	-0.0501468113886047	0.0202216200797699	0.0501468113886047	0.0199587880282579	VRK2	24529	FANCL	358309	CCDC85A	1699110	False	False	False	ref	-65	0.02632	60	0.3452
2123	chr2	57892439	C	T	rs2678915	0.0080593509	0.7292832344769308	0.0127267624999999	0.7335932440357178	0.0270298907534634	0.284586401161334	0.0002078003368391	0.6225254321102563	0.0003328111202462	0.6264326351596664	0.0632501402131239	0.3916816227088468	0.000388275230027	0.5141908013347771	0.0008260135011809	0.5173849166381757	0.0017762196944633	0.3425481564336806	1.064048511247635e-05	0.4694065130514191	2.236475697848863e-05	0.4726227224427385	0.0010936623667974	0.5251641471481328	0.0019976246247236	0.5286765230592895	VRK2	15191	FANCL	348971	CCDC85A	1708448	False	False	False	alt	25	0.003082	-35	0.02881
2124	chr2	57892828	G	A	rs77843640	-0.0201121683999999	0.5871392630820412	0.0218039903999999	0.5824523420706855	0.0164368433843239	0.6184061247749826	-0.0003635527410705	0.6049082980951884	0.000383746005563	0.6002702152282451	0.054773844478902	0.4174442509000286	-0.0012140634033845	0.4679105790356559	0.0012950655683812	0.4641664865834731	0.0009174947208103	0.4539508697799223	-2.200236882931613e-05	0.4903450464371878	2.296919523209916e-05	0.4863168836625319	-0.0030822143776186	0.4478968570023535	0.0032851110158027	0.443968392495969	VRK2	14802	FANCL	348582	CCDC85A	1708837	False	False	False	ref	-100	0.00592	30	0.10034
2125	chr2	57921981	G	A	rs2717007	-0.0345243556	0.4242762318100631	0.0345243556	0.4191402996501641	0.0153346573443991	0.675403617454501	-0.000559720811656	0.4961594568965361	0.000559720811656	0.4906222790920508	0.0550889116162448	0.4245645044947566	-0.0021690865595235	0.3866446757484874	0.0021690865595235	0.3815386672150926	0.0008828210021442	0.4724932077919985	-3.715901626078376e-05	0.4264995228435095	3.715901626078376e-05	0.4212558117754953	-0.0051887103691728	0.3476337693112274	0.0051887103691728	0.3427395186665893	VRK2	14351	FANCL	319429	CCDC85A	1737990	False	False	False	ref	-100	0.03455	-100	0.275
2126	chr2	57932338	T	G	rs2717019	0.0338739443	0.4340156680663585	0.0338739443	0.439426828529817	0.0394681277108166	0.1139175705565612	0.0014004833178487	0.285815811004744	0.0014004833178487	0.2894517399769663	0.0026566263072811	0.9015507162820228	0.0001327814906104	0.8038123610469009	0.0001327814906104	0.8106552985394879	0.0001127291663268	0.8113505851022321	5.92991807903184e-06	0.7162416290854159	5.92991807903184e-06	0.7227902149857282	0.0004651776582758	0.7855602349722909	0.0004651776582758	0.7923160366451963	VRK2	24708	FANCL	309072	CCDC85A	1748347	False	False	False	alt	-25	0.00702	65	0.05917
2127	chr2	57935056	A	G	rs2678888	0.0230081044	0.553621354588142	0.0230081044	0.5598094570613793	0.0100303814699438	0.9111241069961408	0.0002223654395953	0.7094120441692987	0.0002223654395953	0.7161929244737285	0.0017980271188676	0.9354265327924434	3.819494424141701e-05	0.8793662763774208	3.819494424141701e-05	0.8862803043473058	1.940420044829151e-05	0.9621546791755216	3.876996137951714e-07	0.9112257607444484	3.876996137951714e-07	0.918202253561618	0.0001303157269637	0.8806658855312512	0.0001303157269637	0.887557639852358	VRK2	27426	FANCL	306354	CCDC85A	1751065	False	False	False	alt	-100	0.03665	100	0.0896
2128	chr2	57939046	G	A	rs970941	-0.003224808572	0.7348898993059605	0.0112848463079999	0.7337467208422358	0.0289018587662898	0.2461492487523869	-0.0001261664925207	0.6398569700170484	0.0002999335916712	0.6384898851150581	0.0027094124245323	0.9082753890233608	-1.1268815797142762e-05	0.9372044081786598	1.7175626982813945e-05	0.9355263536747704	8.800091683803088e-05	0.852514560371273	-3.838023380926856e-07	0.9049218794316034	5.132234619286908e-07	0.9032866459079736	-3.7115238692209525e-05	0.9386737716271428	6.185873115369223e-05	0.9370623630073316	VRK2	31416	FANCL	302364	CCDC85A	1755055	False	False	False	ref	80	0.0004272	-85	0.0881
2129	chr2	57939508	T	G	rs2678891	-0.0134240519599999	0.7338538604771669	0.0134240519599999	0.7273797957150322	0.0154703123611002	0.6706022209246486	-0.0002017732180252	0.764644974742972	0.0002017732180252	0.7580770515105079	0.002588169311471	0.90677010753494	-4.5540505805301954e-05	0.9125006442690988	4.5540505805301954e-05	0.9056468134238426	4.100464939270446e-05	0.914392979781857	-6.864121053388385e-07	0.9162219270174154	6.864121053388385e-07	0.90934675968191	-0.0001690805318201	0.8967928060675759	0.0001690805318201	0.8900046674685242	VRK2	31878	FANCL	301902	CCDC85A	1755517	False	False	False	ref	100	0.0087	-100	0.0316
2130	chr2	57943026	C	A	rs1568254	-0.0020555983999999	0.6501063780656312	0.016648172	0.6498639287145483	0.0172429133580423	0.5911100243130241	-1.2989303231559993e-05	0.653029303261209	0.0002815474328627	0.6525691541181378	0.0038096730559862	0.8681387439242427	-2.5495336785105066e-05	0.8544087167381236	5.694211510715997e-05	0.8535555549229173	6.51163863827033e-05	0.8714533374749956	-3.6050207158958827e-07	0.8525669864127099	9.324618308168765e-07	0.851887032181751	-6.680742964601306e-05	0.853304827170886	0.0002086701197584	0.852508351265284	VRK2	35396	FANCL	298384	CCDC85A	1759035	False	False	False	ref	-65	0.006096	30	0.0453
2131	chr2	57944085	A	C	rs1518393	0.1146121297999999	0.0881120517443034	0.1247798798	0.0887573897284041	0.0280978763566489	0.2623071967735519	0.003801215757244	0.1068778756570971	0.0039783479166532	0.1075658635491128	0.221613440665105	0.159865396006831	0.0295236463122319	0.0698262439400678	0.0312241975470559	0.0707068087163067	0.0066137042432682	0.1313795008517463	0.0010169892316004	0.0738828155255361	0.0010466144990652	0.0747669863708979	0.0311248391672989	0.0511875838296139	0.0342045791956715	0.0517068418802617	VRK2	36455	FANCL	297325	CCDC85A	1760094	False	False	False	alt	-100	0.0816	-100	0.54
2132	chr2	57946820	G	C	rs59913344	0.0531554342	0.2452172820595093	0.0586502505999999	0.2478432513553286	0.0143681031438687	0.7195527388822434	0.0008188034493439	0.374557007234285	0.0008909068490907	0.3779121947757673	0.031877041338128	0.5249011025803362	0.0020180884775582	0.387527172476972	0.0021719962660906	0.3913066377228198	0.0004686978990616	0.5796148152554523	3.224121872088589e-05	0.43791162376611	3.4260808519473954e-05	0.4417130075075676	0.005357790900993	0.3250731947800674	0.005826267691597	0.328537629754746	VRK2	39190	FANCL	294590	CCDC85A	1762829	False	False	False	alt	70	0.03796	-20	0.05438
2133	chr2	57983104	T	C	rs6732310	-0.0438156672	0.241674996171642	0.060104864	0.2400669165592446	0.0327278175564538	0.1838405692459429	-0.0014932135826108	0.1983977575867191	0.0020388311023947	0.1974145141588039	0.0078906997459667	0.7711578424907587	-0.0001177970067314	0.6422508457737479	0.0003289960560874	0.6390111707861503	0.0002587016061851	0.6839309510139046	-3.889658809922255e-06	0.5643352661672179	1.0963911895438922e-05	0.5613647406109369	-0.0004000197947939	0.6147969290988896	0.0012050080828741	0.6116917543851325	VRK2	75474	FANCL	258306	CCDC85A	1799113	False	False	False	ref	-100	0.05832	35	0.10345
2134	chr2	58011459	T	C	rs17049298	-0.164797068	0.0415249423977383	0.164797068	0.041074245171761	0.0373130797279328	0.1386763881994986	-0.0069456553676182	0.0464373921280697	0.0069456553676182	0.0461036986415725	0.0205469961400151	0.6084950831654721	-0.0034023227834457	0.3030904450184689	0.0034023227834457	0.2986123712056734	0.000734262897048	0.5023659531414773	-0.0001398686834557	0.2376771500361526	0.0001398686834557	0.2340962050621145	-0.0089101316353798	0.2314822620493717	0.0089101316353798	0.2277109503529348	VRK2	103829	FANCL	229951	CCDC85A	1827468	False	False	False	ref	15	0.004154	90	0.0639
2135	chr2	58053663	A	C	rs3771204	0.02112928808	0.5728577331841918	0.02112928808	0.5790479201018071	0.0982113799931061	0.0046464580972397	0.0021085487082592	0.1888164686714033	0.0021085487082592	0.1910404533103315	0.0242634687077298	0.5898627579085617	0.00038234070256	0.6378496859774908	0.00038234070256	0.643976627015912	0.0023884187003286	0.2969074287961972	3.782766735097151e-05	0.408076472934879	3.782766735097151e-05	0.4135702377394221	0.0012083072152023	0.6254712677436864	0.0012083072152023	0.6316637461080428	VRK2	146033	FANCL	187747	CCDC85A	1869672	False	True	False	alt	85	0.01416	65	0.03992
2136	chr2	58084549	T	C	rs12620940	0.128606815	0.0682130263974191	0.128606815	0.0691864775478359	0.0302232041857488	0.2249533182957553	0.0041456187598271	0.0818632787945342	0.0041456187598271	0.082971839018837	0.0042641285341954	0.8462528008821287	0.0006301877962832	0.56153571084062	0.0006301877962832	0.5672932681114516	0.0001417890937739	0.7764258962566565	2.239634471788096e-05	0.4930679075079885	2.239634471788096e-05	0.4987431366933251	0.0019019497872059	0.5330195681072591	0.0019019497872059	0.5387393831485057	FANCL	156861	VRK2	176919	CCDC85A	1900558	False	False	False	alt	-100	0.0238	-100	0.1265
2137	chr2	58095091	A	C	rs2118899	-0.0342230647999999	0.4196814780098822	0.0342230647999999	0.4144842647922266	0.0223771951008131	0.3998589492062982	-0.0007568616343365	0.3922934503646443	0.0007568616343365	0.387199662269868	0.000185576193461	0.9982372808767904	-6.442851342442979e-06	0.9763083470376568	6.442851342442979e-06	0.9691464132335544	4.193274383395072e-06	0.9957324673882608	-1.440535018993292e-07	0.9635529673843976	1.440535018993292e-07	0.956505765419375	-2.3093926297383788e-05	0.9769109511002748	2.3093926297383788e-05	0.9697803838332048	FANCL	146319	VRK2	187461	CCDC85A	1911100	False	False	False	ref	100	0.2367	-70	0.1411
2138	chr2	58136314	A	C	rs17049366	0.0199750834	0.514436314473227	0.025489485	0.5186046088781903	0.0144699181876499	0.7147931060124547	0.0002917771224938	0.5806774195589757	0.0003731407884313	0.5851877229061384	0.0257975652403417	0.5785303595400492	0.0007153343803546	0.5479682507353578	0.0007468078214026	0.5519769420751179	0.000358855967753	0.6309400140642376	9.957952632464196e-06	0.5869519990810509	1.0422335668562938e-05	0.5910443468211628	0.0020289663818415	0.5181526983975494	0.0021642308072976	0.5221237548327088	FANCL	105096	VRK2	228684	CCDC85A	1952323	False	False	False	alt	40	0.00952	-75	0.0685
2139	chr2	58155355	G	A	rs848293	0.007709505	0.447247853161784	0.0304114314	0.4481967367912211	0.076248980138205	0.0130459011933405	0.0006774361743974	0.1556622486163157	0.0025261153895028	0.1562055294153941	0.0111609646662926	0.7081614478451039	0.0002134439058747	0.6405575570164128	0.0003702972510953	0.6420095336022356	0.0008573356399053	0.4706238013608447	1.8266335123083104e-05	0.4435612371716608	3.097318016062398e-05	0.4447203321015755	0.0006548777671472	0.6086978903609865	0.0013443964237405	0.6102117082480344	FANCL	86055	VRK2	247725	CCDC85A	1971364	False	True	False	alt	-5	0.006927	-80	0.0632
2140	chr2	58211263	T	C	rs113506287	0.0922228932	0.1227167865486137	0.0922228932	0.1246722103743313	0.0161173000877747	0.6389463627138725	0.0015345280343806	0.2300433562949086	0.0015345280343806	0.233222923045992	0.0298159084160865	0.5727831473459203	0.0021086941029539	0.3678247123652624	0.0021086941029539	0.372758791948644	0.0004825546282011	0.6084162711842869	3.575167443587e-05	0.4037127427996146	3.575167443587e-05	0.4088238149885676	0.0057058493616178	0.311599415885024	0.0057058493616178	0.3161466232243486	FANCL	30147	VRK2	303633	CCDC85A	2027272	False	False	False	alt	-100	0.02582	-35	0.04684
2141	chr2	58225396	G	A	rs79064653	-0.0089078175	0.7217169096358566	0.0124225990999999	0.7171695491302081	0.0369955083787563	0.1345374413799285	-0.0003286713766513	0.5266502806234838	0.00047072568943	0.5228521573649529	0.0266182244069809	0.5626137974820841	-9.714148426442e-05	0.6568765259174146	0.0002944138338161	0.6532280484051219	0.0009995113408853	0.4484828955564301	-3.1225659350051323e-06	0.5611883318620995	1.1095575720723297e-05	0.5578903241340878	-0.000418989805681	0.6583991974296259	0.000918808353403	0.654705186944996	FANCL	16014	VRK2	317766	CCDC85A	2041405	False	False	False	ref	-90	0.02435	-30	0.1033
2142	chr2	58226795	A	G	rs79588315	0.02568470456	0.5274522424839285	0.02568470456	0.5336503591770617	0.0408068910272567	0.1029589264401521	0.0010550921723684	0.3504339032684986	0.0010550921723684	0.3548024954164145	0.0706187522681534	0.3718509714312432	0.0021805078407109	0.4027418746178778	0.0021805078407109	0.4080321523142509	0.0028682528404112	0.2523238725023715	9.066590855711467e-05	0.313343265339584	9.066590855711467e-05	0.3180624810123713	0.0047062122661739	0.3829337487374281	0.0047062122661739	0.3883239378962592	FANCL	14615	VRK2	319165	CCDC85A	2042804	False	False	False	alt	100	0.03732	95	0.0839
2143	chr2	58235134	G	A	rs80099621	-0.045145481	0.3363853477056963	0.045145481	0.3319378862537657	0.0232955336137484	0.3781092470901931	-0.0010459843844822	0.3370526169535521	0.0010459843844822	0.3326445810796749	0.0018095740820163	0.9278011332743448	-7.701344872384438e-05	0.8252972227975426	7.701344872384438e-05	0.8184812359867111	4.105166243937252e-05	0.9038037269074556	-1.7443153369499192e-06	0.7968440366538181	1.7443153369499192e-06	0.7900724532986815	-0.0002837253802249	0.8226154928925964	0.0002837253802249	0.8158911611620339	FANCL	6276	VRK2	327504	CCDC85A	2051143	False	False	False	ref	100	0.02704	-10	0.01312
2144	chr2	58275544	T	C	rs112144830	0.204596834	0.0240753365185763	0.204596834	0.0242918971691801	0.028433042505269	0.2543273210489385	0.0060838235507168	0.0471026151550013	0.0060838235507168	0.047485836840099	0.4195217907690277	0.0638621852730188	0.0875467862200393	0.0117826628165969	0.0875467862200393	0.0119021871384412	0.012085888006798	0.0571546095138249	0.0026242138457762	0.0199321163754545	0.0026242138457762	0.0201240430094553	0.0682103856685691	0.0106484130939124	0.0682103856685691	0.010786950280567	FANCL	34134	VRK2	367914	CCDC85A	2091553	False	False	False	alt	100	0.10583	100	0.4434
2145	chr2	58316524	G	A	rs184071680	-0.120168648	0.0771592619715787	0.120168648	0.0761603666518124	0.0170641983785394	0.5828317264634465	-0.0021698272629135	0.1681147484832679	0.0021698272629135	0.1658066036732228	0.0852611263237768	0.3364507260115312	-0.0108805461938625	0.1516565598009458	0.0108805461938625	0.1490879484652669	0.0014990287900981	0.3743459352294217	-0.0002011937599554	0.1914950161294022	0.0002011937599554	0.1884645356826153	-0.0217082907195407	0.0918970985688251	0.0217082907195407	0.0903183911615165	FANCL	75114	VRK2	408894	CCDC85A	2132533	False	False	False	ref	-100	0.00989	65	0.0311
2146	chr2	60075401	G	A	rs10199158	0.02304765316	0.5429470639149089	0.02304765316	0.5493428106236188	0.0095784807377997	0.9241518877348792	0.0002301475352772	0.6993065059473689	0.0002301475352772	0.7062942952365718	0.0092887070700405	0.7466766752339473	0.0002000555615705	0.7042450254855361	0.0002000555615705	0.7107195787559034	8.630190563177077e-05	0.8318660298623658	1.951895288734813e-06	0.7715147041159383	1.951895288734813e-06	0.7782401005471512	0.0007563260862392	0.684977341224949	0.0007563260862392	0.6915903491084406	BCL11A	479066	PAPOLG	680853	REL	806091	False	False	False	alt	-35	0.0239	30	0.0962
2147	chr2	60076419	C	A	rs11691553	-0.0018420638	0.7553324228682693	0.0117327693999999	0.7540981668797588	0.0274556121466146	0.2740339499338073	-6.177198912357392e-05	0.6439849430860961	0.00032558356481	0.6429089030729385	0.0753818745669888	0.3577029503721937	-0.0002523104491691	0.5178562345455101	0.0009545318700852	0.5167266764847949	0.0020428133987768	0.3092134207291543	-7.550165377357938e-06	0.4710829818412931	2.61420892238753e-05	0.4699472548653235	-0.0004717759229322	0.5291037796236098	0.0021642308072976	0.5279272224323709	BCL11A	478048	PAPOLG	679835	REL	805073	False	False	False	ref	0	0.0	100	0.1227
2148	chr2	60096992	A	G	rs13415334	-0.094510117	0.1181846281136023	0.094510117	0.1166239584967233	0.087049151420902	0.0075826952136895	-0.0082249375137208	0.0289179822869416	0.0082249375137208	0.028733604823545	0.0112096268681336	0.7238924627001316	-0.0013081029683074	0.4818640742721179	0.0013081029683074	0.476232638745047	0.0009643556829261	0.4662005981385863	-0.0001123975203521	0.2772825073532877	0.0001123975203521	0.2733136571081171	-0.0038278182837913	0.4239295387570415	0.0038278182837913	0.418614991000536	BCL11A	457475	PAPOLG	659262	REL	784500	False	True	False	ref	-100	0.1175	25	0.06836
2149	chr2	60105895	C	T	rs974135	-0.0070760042999999	0.6252991060021358	0.0185189461	0.6239475770398515	0.0120694584322646	0.8276061279430073	-8.405653138292e-05	0.7116457234025998	0.0002260118992546	0.7103267417267151	0.4650910560522582	0.0514113239369238	-0.0045915695047638	0.1681631413534511	0.0087512737169609	0.1675353602673925	0.0055433567275923	0.1452579480442864	-5.470268651094016e-05	0.2482436174426971	0.0001057378527378	0.247513883535424	-0.0018788558609085	0.3065270480888548	0.0058757546765199	0.3057115016684161	BCL11A	448572	PAPOLG	650359	REL	775597	False	False	False	ref	100	0.939	100	0.3577
2150	chr2	60455312	A	G	rs12621957	-0.0214207846119999	0.5805096581282572	0.0214207846119999	0.5741914675295524	0.0268337087798092	0.2867559246927895	-0.0005673978159521	0.4975938659732331	0.0005673978159521	0.4919088974719551	0.0549478737092144	0.4169258054664934	-0.0011929820442713	0.4906928370728011	0.0011929820442713	0.4847723201549758	0.0014746946278386	0.3665470931008205	-3.1467784422906786e-05	0.4503117607056742	3.1467784422906786e-05	0.4446867622057018	-0.0030360265250238	0.4734932760062196	0.0030360265250238	0.4674238420275249	BCL11A	99155	PAPOLG	300942	REL	426180	False	False	False	ref	15	0.000519	30	0.05377
2151	chr2	60456238	A	G	rs17028290	0.189637632	0.030854971870899	0.189637632	0.0312195950837163	0.0331900545767224	0.1875372843115269	0.0072811338556761	0.0454258147889039	0.0072811338556761	0.0459413262967259	0.2706228761835637	0.1263515180977744	0.0553328806046609	0.0279481779138048	0.0553328806046609	0.0285834579912871	0.0096139788203927	0.0856509766494709	0.0022476578856216	0.0314284219008666	0.0022476578856216	0.0320000136134396	0.0599353370063672	0.0155719435301125	0.0599353370063672	0.0157974666893576	BCL11A	98229	PAPOLG	300016	REL	425254	False	False	False	alt	65	0.03952	-90	0.0542
2152	chr2	60474200	T	C	rs58469620	0.0337528852	0.4082311117851377	0.0337528852	0.4134576072812834	0.0135144727481162	0.7570359032489421	0.0004580658468327	0.5217799583665446	0.0004580658468327	0.5276099083437613	0.2689172247698855	0.1264311811708949	0.0081650437143843	0.1704341481813303	0.0081650437143843	0.1737071122299301	0.0036272936529458	0.210336067709456	0.000110424820765	0.2352742658274136	0.000110424820765	0.2392137832975709	0.0109729141235854	0.1877135190849327	0.0109729141235854	0.1909826250975566	BCL11A	80267	PAPOLG	282054	REL	407292	False	False	False	alt	75	0.00894	100	0.1831
2153	chr2	60491212	C	T	rs7599488	-0.0652215834	0.2170628934438044	0.0652215834	0.2141985931988858	0.020738699649307	0.4578368750070151	-0.0014900779321355	0.261063847064284	0.0014900779321355	0.2578401369330871	0.0059128699152122	0.8071670849936217	-0.0003780671393732	0.6412587715298239	0.0003780671393732	0.6351418028847168	0.0001179456975623	0.7945442603656769	-8.571057784216532e-06	0.626581648736885	8.571057784216532e-06	0.620407426768684	-0.0012982085711457	0.613995009352327	0.0012982085711457	0.6078794655340441	BCL11A	63255	PAPOLG	265042	REL	390280	False	False	False	ref	-100	0.0484	-100	0.1033
2154	chr2	60492835	C	A	rs766432	0.1375869468	0.0570184491116313	0.1375869468	0.0578079122987556	0.0521092806497399	0.0496368002954389	0.0074281587471233	0.0337109638094859	0.0074281587471233	0.0339927781038145	0.042958826828544	0.4684570530283782	0.0057408090155798	0.2148089915572428	0.0057408090155798	0.2185253359144443	0.0021917641665236	0.2974133360137775	0.0003022751824405	0.1318222133625996	0.0003022751824405	0.1342652266371325	0.0139644023621787	0.1439203392973722	0.0139644023621787	0.1466458713515229	BCL11A	61632	PAPOLG	263419	REL	388657	False	False	False	alt	-60	0.006317	-85	0.2153
2155	chr2	60558802	A	G	rs12328348	0.1032423634	0.0995783309290389	0.1032423634	0.1010284936333364	0.0281229816391538	0.2593777950643132	0.0028588561303572	0.1148184364269586	0.0028588561303572	0.1162291316330087	0.0125639206888587	0.7421098841839161	0.0016744990747778	0.4761631550995464	0.0016744990747778	0.4816772620537679	0.000351021823346	0.6841529091254757	4.6754857483334026e-05	0.4335730891644037	4.6754857483334026e-05	0.4388129815109709	0.0045371317343537	0.4175366574722737	0.0045371317343537	0.4225992393736542	BCL11A	4335	PAPOLG	197452	REL	322690	False	False	False	alt	100	0.3398	95	0.1929
2156	chr2	60584584	G	A	rs356998	-0.0021177886	0.5499651308788206	0.023883155	0.5495110258500725	0.0193280571997082	0.5089547451769967	-2.567870834383999e-05	0.5352151855164902	0.0004932220012437	0.5344458022202496	0.0206822605654712	0.6066127709819354	-0.0001430875083094	0.5917321193122529	0.0005259400636584	0.5906067800732188	0.0004101223692535	0.6052764589391532	-2.5167646987045152e-06	0.5859405938949537	1.0899647116560107e-05	0.5848460588483928	-0.0003620797730196	0.5695278943139901	0.0016289465870475	0.5683627036819592	BCL11A	30117	PAPOLG	171670	REL	296908	False	False	False	ref	-95	0.03622	65	0.0691
2157	chr2	60712744	C	T	rs55710238	-0.046889053	0.3217710342311478	0.046889053	0.3175537745419997	0.0250574519972057	0.3284733664682493	-0.0011512436294712	0.2988178893343663	0.0011512436294712	0.2948134044118175	0.0008099369865724	0.975833108658496	-4.909031326572892e-05	0.8909683306661534	4.909031326572892e-05	0.8841015178526046	1.947261923961606e-05	0.9597389221119234	-1.1630212849360407e-06	0.8615489190793233	1.1630212849360407e-06	0.8547380000032901	-0.0001534096532611	0.8964155143071797	0.0001534096532611	0.8895661544814597	PAPOLG	43510	BCL11A	158277	REL	168748	False	False	False	ref	25	0.02495	-25	0.1034
2158	chr2	72913722	C	T	rs34419497	-0.0144044949539999	0.401999041255962	0.035485439446	0.400862606852676	0.0319270658171826	0.1958509162921175	-0.0005038579015685	0.354847396052442	0.0010397740188067	0.3534806702343999	0.0796088878624921	0.3583168033847497	-0.0016917942970759	0.3936966040719274	0.0030130463271989	0.3925657257898088	0.0026045419114746	0.2796095543106183	-5.568208179627039e-05	0.3481859400392391	8.937312178467649e-05	0.3472084454118108	-0.003121803965557	0.3478284864014819	0.0066683712183695	0.3469313536993361	EMX1	2539	SPR	26339	EXOC6B	87681	False	False	False	ref	100	0.02122	80	0.06433
2159	chr2	73140117	T	C	rs1430346	-0.0257221852	0.5263093699126373	0.0257221852	0.5202435980601736	0.0226301702527237	0.3957354828994719	-0.0005806702503532	0.4856188951556415	0.0005806702503532	0.4799738308816414	0.0030954109069314	0.8825551849178314	-7.781888549436607e-05	0.8301513251881155	7.781888549436607e-05	0.8233661990848693	6.944345834661479e-05	0.8542877254798908	-1.7396067391058442e-06	0.8030933334637514	1.7396067391058442e-06	0.7963779346555954	-0.0003026953911121	0.8154514519976263	0.0003026953911121	0.8086629622505414	RAB11FIP5	16604	NOTO	62458	SFXN5	64498	False	False	False	ref	60	0.005123	-85	0.03903
2160	chr2	73155786	C	T	rs60796597	-0.0715618101999999	0.1825367881175497	0.0715618101999999	0.1800604869737085	0.0237136286860411	0.3673310074905704	-0.0017436853572919	0.2063003011126714	0.0017436853572919	0.2036615950968429	0.014554122265844	0.6760293096137	-0.0011106351378251	0.4860848621814658	0.0011106351378251	0.4806501834558354	0.0003504124935569	0.6420333325620925	-2.798640525895216e-05	0.4603282192911311	2.798640525895216e-05	0.4550104701780187	-0.0034244993566691	0.4326084438338708	0.0034244993566691	0.4274089869780181	RAB11FIP5	935	NOTO	46789	SMYD5	58437	False	False	False	ref	55	0.013885	-80	0.0717
2161	chr2	73344289	G	A	rs7604588	-0.1882782059999999	0.0287702567207392	0.1882782059999999	0.0285008631784106	0.0487425104673931	0.0630320930313959	-0.0096994468869754	0.0241006889175811	0.0096994468869754	0.0239501404455594	0.0486894196826234	0.467633785321797	-0.009797455877361	0.1835973366075413	0.009797455877361	0.1803561279215548	0.0025171411773982	0.3069506071750599	-0.0005248649467582	0.1179145758820177	0.0005248649467582	0.1157033225043334	-0.0196224143050377	0.1154495143873815	0.0196224143050377	0.113316240722871	ALMS1	41470	EGR4	50588	FBXO41	59811	False	False	False	ref	-100	0.04193	-100	0.01587
2162	chr2	73347970	G	A	rs6546822	0.0313334224	0.4396521651686044	0.0313334224	0.4449704935700097	0.0175528435420333	0.5773316376460149	0.0005664182479162	0.4692494110802797	0.0005664182479162	0.4747199166083954	0.0050930355316551	0.8192247020523358	0.0001486630861325	0.732052449124856	0.0001486630861325	0.7385865722186578	8.859095950774968e-05	0.8227686599946809	2.657689458081399e-06	0.7311643970391637	2.657689458081399e-06	0.7377321079169654	0.000602916432978	0.7090530801146187	0.000602916432978	0.7155056559853578	ALMS1	37789	EGR4	54269	FBXO41	63492	False	False	False	alt	100	0.161	-60	0.2432
2163	chr2	73364113	T	C	rs1522926	-0.263165398	0.013205014473267	0.263165398	0.0131332519596515	0.0310687513579642	0.2075840765930676	-0.0084845955544616	0.0291774201693845	0.0084845955544616	0.0290393201019984	0.1962158952195572	0.1827216270473326	-0.0536812415383373	0.0287896316383771	0.0536812415383373	0.0283303408632515	0.0061100020705673	0.1377238430679719	-0.0017317318455847	0.0344977077276945	0.0017317318455847	0.0339464501137201	-0.0698294348586321	0.0114851985837242	0.0698294348586321	0.0113638877385132	ALMS1	21646	EGR4	70412	FBXO41	79635	False	True	False	ref	65	0.069	20	0.0547
2164	chr2	73379365	C	T	rs6546827	0.04837908508	0.3033839870962911	0.04837908508	0.3071978449865342	0.1065279828368502	0.0032905377732089	0.0052217383356861	0.0701274779174753	0.0052217383356861	0.0706836858704351	0.0039201939889808	0.8579547347665231	0.0001886606647579	0.734546511165822	0.0001886606647579	0.741074931612795	0.0004151099643925	0.6084936952807294	1.9663305692585308e-05	0.5087103910346845	1.9663305692585308e-05	0.5145739626874964	0.0007233347629572	0.7094673932808251	0.0007233347629572	0.7160057681388435	ALMS1	6394	EGR4	85664	FBXO41	94887	False	False	False	alt	-100	0.1103	95	0.06555
2165	chr2	73395535	C	T	rs56672945	0.00384803624	0.8461044143978182	0.0066607671199999	0.8478434048934657	0.0220617033167766	0.4127826406811004	8.305651910010913e-05	0.7914634074069661	0.0001474855491099	0.7932030007570109	0.0019761802645903	0.9202725721520232	8.13104111919033e-06	0.9419784487358296	1.3362615232101392e-05	0.9434457234923496	4.419152270814912e-05	0.8966177057609608	1.7784099092995297e-07	0.925215343223648	2.989505682793192e-07	0.9266663577449868	4.453828643064347e-05	0.9296214400840396	6.928177889212608e-05	0.9310929788335212	ALMS1	9776	EGR4	101834	FBXO41	111057	False	False	False	alt	-100	0.05063	5	0.00502
2166	chr2	73410391	A	G	rs10179134	-0.0075704289	0.6974661126408408	0.0145755193	0.6940238275325192	0.0140506570866349	0.7360026364012033	-0.0001096509092797	0.7377369585692698	0.0002002686744112	0.7343302239753795	0.000252383623107	0.9971523820371048	-2.330662050320364e-06	0.9869801626321996	3.4573096386223807e-06	0.983028013048353	3.615794898694046e-06	0.9972058815929226	-3.3841314639589185e-08	0.9879287615216816	4.841561456424055e-08	0.9839325630746996	-1.2371746230741309e-05	0.989541069788116	1.2371746230741309e-05	0.9842479193582012	ALMS1	24632	EGR4	116690	FBXO41	125913	False	False	False	ref	-70	0.02815	65	0.1565
2167	chr2	73426010	A	G	rs6753344	0.054646373	0.2521386543665336	0.054646373	0.2556781786486502	0.0319768137403104	0.1937167404681563	0.0017165623426196	0.1961479154966766	0.0017165623426196	0.1990023509929046	0.1275015670878558	0.2615490608433668	0.0066420999849865	0.199817531396858	0.0066420999849865	0.2033957582525522	0.0040789025171253	0.1965366445894394	0.0002087364935927	0.1677674948788945	0.0002087364935927	0.1706146121786303	0.0123404044736233	0.1668494186238553	0.0123404044736233	0.1698588843221832	ALMS1	40251	EGR4	132309	FBXO41	141532	False	False	False	alt	85	0.01291	-100	0.1322
2168	chr2	73450771	G	C	rs6546837	0.1368903252	0.0571817756353333	0.1368903252	0.0578286458242728	0.0340824529551898	0.1681119225451935	0.0048596631447143	0.0621369676857607	0.0048596631447143	0.0627496079583786	0.0335332057668832	0.5371451741081029	0.0053115414128182	0.2554847937577752	0.0053115414128182	0.2594928541330754	0.0012631951900405	0.4327801750678487	0.0002117146579952	0.2049158236719005	0.0002117146579952	0.2085215795017912	0.0126554716109662	0.1787208321091122	0.0126554716109662	0.1818454240339085	ALMS1	65012	EGR4	157070	FBXO41	166293	False	False	False	alt	-20	0.007446	-65	0.0963
2169	chr2	73473004	A	C	rs62151652	0.24672098	0.015562402142288	0.24672098	0.0156331717818996	0.0485379226815376	0.0619111872984306	0.0124910405646931	0.0162072272731115	0.0124910405646931	0.016208361635887	0.2598116195440598	0.1317159100278963	0.0639094792401671	0.0191230847596349	0.0639094792401671	0.019442238634814	0.0126715705396536	0.0521548348339382	0.0032574917335444	0.0148007659700108	0.0032574917335444	0.0150193893704129	0.0765571904589092	0.0083136685141841	0.0765571904589092	0.0084113250638702	ALMS1	87245	NAT8	169418	EGR4	179303	False	True	False	alt	-45	0.0732	-50	0.3096
2170	chr2	73485902	A	G	rs10195357	0.0637277594	0.2087446708885525	0.0637277594	0.2117711366787356	0.0206139634826899	0.4563922763161183	0.0013173592799336	0.2523340701314077	0.0013173592799336	0.2559844809148031	0.1798752927979941	0.1949051539665495	0.011332070276292	0.1364245449355827	0.011332070276292	0.1390265719059106	0.0036193967679808	0.2125617406932723	0.0002266810404443	0.157744904405643	0.0002266810404443	0.1605112383982651	0.0172445646794892	0.1130844219413253	0.0172445646794892	0.1152627319845423	ALMS1	100143	NAT8	156520	EGR4	192201	False	False	False	alt	30	0.0603	-65	0.1469
2171	chr2	73492748	A	C	rs13421462	0.01117251584	0.6896849852275826	0.0143958429599999	0.6920636909289193	0.0171799998574358	0.5873705756146289	0.0002281473613327	0.6812105935728399	0.0002736402123194	0.6835650953007446	0.0171587872389561	0.6345115267380748	0.0001731494948329	0.6978445886816	0.0002432697741296	0.699540450215719	0.0002932918952245	0.6505538101841701	3.610534898554575e-06	0.6988661015335403	4.62454267266169e-06	0.7005111066690294	0.0006037412160601	0.6861833003259988	0.0008610735376595	0.6879917489412699	ALMS1	106989	NAT8	149674	EGR4	199047	False	False	False	alt	100	0.1777	100	0.03946
2172	chr2	73493131	C	A	rs13398956	0.0186986056	0.6064834289854181	0.0186986056	0.6128291869643538	0.0122537862959065	0.8164268778755058	0.0002266194050349	0.6956540080778159	0.0002266194050349	0.7022719800931243	0.0031935600936953	0.8742475843802747	5.992076326375043e-05	0.8296715509744499	5.992076326375043e-05	0.8364755086700241	3.981681950837258e-05	0.9050893696511032	7.410676099909065e-07	0.8554401967991825	7.410676099909065e-07	0.8623871123369209	0.0002408366599584	0.8227051879498208	0.0002408366599584	0.8295576621322321	ALMS1	107372	NAT8	149291	EGR4	199430	False	False	False	alt	-75	0.2196	-70	0.0742
2173	chr2	73494123	A	C	rs73947808	0.0935486324	0.1150172969632161	0.0935486324	0.1166907812062856	0.0175660765613262	0.5776599944550574	0.0017054405546009	0.2026727387390182	0.0017054405546009	0.205593263278589	0.0124278314803206	0.702931683833584	0.0011611482693359	0.4648486537143926	0.0011611482693359	0.470413066413877	0.0002016094642089	0.7204052052672698	1.922586503972495e-05	0.4863903401580188	1.922586503972495e-05	0.4921449254171269	0.0035292468080894	0.4141830910724393	0.0035292468080894	0.419690134704177	ALMS1	108364	NAT8	148299	EGR4	200422	False	False	False	alt	25	0.006317	30	0.03467
2174	chr2	73506740	C	T	rs11693586	0.0471517558	0.2461383867788437	0.0582776981999999	0.2481974190242379	0.0294875200611609	0.2362023826176689	0.0015356264500611	0.205079986806224	0.0018123884413092	0.2065289900542772	0.0040538088482728	0.8820559854783717	0.0003072025143833	0.7291768790773729	0.0003102766381973	0.7330876822284633	0.0001300306475947	0.8299439246816184	1.0385916318014356e-05	0.6673987728888112	1.046238630173982e-05	0.6713777892400411	0.0009773679522285	0.7050998804378593	0.0009889149153772	0.7089782633193777	ALMS1	120981	NAT8	135682	NAT8B	194600	False	False	False	alt	20	0.01245	55	0.0979
2175	chr2	73506748	C	T	rs11693588	-0.0406938562	0.2605431463774272	0.0555306738	0.2593337615191179	0.0241054435130109	0.3519102824821977	-0.0011395780190454	0.2680643460855724	0.0014193043677531	0.2669731738741491	0.0030879878591929	0.902082671769126	-0.0002528390783805	0.7553869487942201	0.0002706062013784	0.7529990307708212	7.897084047134878e-05	0.8735771631439123	-6.790415842545584e-06	0.7218395678006199	7.120011279688977e-06	0.7193465164189233	-0.0008256078651314	0.7318023378032469	0.0008981887763517	0.729336589343005	ALMS1	120989	NAT8	135674	NAT8B	194592	False	False	False	ref	30	0.00885	85	0.0807
2176	chr2	73519516	T	C	rs6711033	-0.014438047	0.7033212588097583	0.014438047	0.6967360333789346	0.0259900064370465	0.3038294114725219	-0.0003677900130887	0.5923327183151221	0.0003677900130887	0.5860029898439876	0.0416028834416547	0.4975255941843109	-0.0005943981251869	0.5793406102568619	0.0005943981251869	0.5733998533969243	0.0010444226983377	0.4525279026501679	-1.4710969844846576e-05	0.5380486318840464	1.4710969844846576e-05	0.5322841830256997	-0.0015184256540529	0.5841841498347727	0.0015184256540529	0.5781818540061361	NAT8	122906	ALMS1	133757	NAT8B	181824	False	False	False	ref	-45	0.004883	0	0.0
2177	chr2	73519796	C	T	rs11884776	0.0212970912	0.5526970756836389	0.0239705188	0.5563207006836163	0.0172240377626166	0.5940052878975067	0.0003890562346701	0.5857723947919262	0.000423211520638	0.5895928929813741	0.0333987661245092	0.5446249926910042	0.0009035984191428	0.5524793473374527	0.0010120732876059	0.555689608344444	0.0005598181924432	0.5712404712458862	1.6471463473450382e-05	0.5711977612043992	1.7857321159761364e-05	0.5747908225100736	0.0021832008181848	0.5247435923707249	0.0025329088449737	0.5281010733986484	NAT8	122626	ALMS1	134037	NAT8B	181544	False	False	False	alt	100	0.06232	100	0.2219
2178	chr2	73521927	T	G	rs6719753	-0.01863004612	0.6313269746191125	0.01863004612	0.6249900138135375	0.0244897323759309	0.3432212075639455	-0.0004213667608106	0.5749336303999176	0.0004213667608106	0.5687024008418278	0.0168956814357823	0.636017408709593	-0.0003423052554029	0.6679585517027427	0.0003423052554029	0.6618530058598545	0.0004037162453091	0.5975618846589403	-7.644679030969299e-06	0.6362195260451551	7.644679030969299e-06	0.6301466657920758	-0.0011027349807	0.6504693004524026	0.0011027349807	0.6441932174674045	NAT8	120495	ALMS1	136168	NAT8B	179413	False	False	False	ref	-85	0.0886	10	0.01654
2179	chr2	73526060	C	T	rs13409668	-0.05682047918	0.2553677761968267	0.05682047918	0.2519724435569511	0.0257131265070251	0.3152434090593448	-0.0015939151140019	0.2597262363184635	0.0015939151140019	0.2564624051955498	0.0007307578106957	0.9799019029675226	-4.8620895183284106e-05	0.8803325026246702	4.8620895183284106e-05	0.8748031566138038	1.9557590387497407e-05	0.9608588386912136	-1.4334459367642184e-06	0.8469692416174817	1.4334459367642184e-06	0.8406601012517533	-0.0001699053149021	0.8813070019725678	0.0001699053149021	0.8760807239912078	NAT8	116362	ALMS1	140301	NAT8B	175280	False	False	False	ref	-75	0.00657	-85	0.021
2180	chr2	73529690	G	T	rs7566385	-0.178993672	0.0327733927058044	0.178993672	0.0324890347657924	0.0206037148948212	0.4626020671285085	-0.0037944634186551	0.0861532849603362	0.0037944634186551	0.0850995764083872	0.0134604598990464	0.6896847264908711	-0.0027277781944022	0.3571847144329116	0.0027277781944022	0.3523444247890433	0.0002768329710429	0.676567370934291	-5.672097794923751e-05	0.3619906827410944	5.672097794923751e-05	0.3569881764944649	-0.006994160535779	0.2941062447543995	0.006994160535779	0.2897533026277479	NAT8	112732	ALMS1	143931	NAT8B	171650	False	False	False	ref	-90	0.02783	-60	0.08057
2181	chr2	73555073	A	G	rs13431267	-0.003831046978	0.8655475287538785	0.005435133498	0.8632748053219869	0.0220014192089163	0.4168605956017945	-0.0001004832381969	0.8131869428971217	0.0001289244531154	0.8108333126037909	0.0079509089109563	0.7695531080851938	-1.2334079824854828e-05	0.8763524482763603	4.316052585377131e-05	0.87478547747165	0.0001643635439318	0.7476476070363265	-4.028200738472617e-07	0.8579769509324835	9.49387580363154e-07	0.8562571260673147	-6.103394807165666e-05	0.8724957317306413	0.0001798027118867	0.8688548502676291	NAT8	87349	NAT8B	146267	ALMS1	169314	False	False	False	ref	-60	0.006287	-35	0.04462
2182	chr2	73560899	G	A	rs7604682	-0.0373109762	0.3492941213393011	0.0430925918	0.3462579099314555	0.0384912075573868	0.1243030304046467	-0.0015673204491425	0.2221177028332786	0.0017557610325903	0.2204982617734125	0.8219532512949094	0.0060892479930941	-0.0306757439500981	0.0473339429304693	0.0353409398368155	0.0469097799981862	0.0315267630013374	0.008204686285008	-0.0012833262547844	0.0406315736580788	0.001435379297903	0.0402475334370337	-0.0047589983834251	0.3229178689477887	0.0056629606413512	0.3199756249163518	NAT8	81523	NAT8B	140441	ALMS1	175140	True	False	False	ref	100	0.3308	100	1.395
2183	chr2	73560999	A	G	rs7580750	0.244659564	0.0170577526191028	0.244659564	0.0172191064988038	0.0333733998533744	0.1746512364944013	0.0077544761070576	0.0312531013977131	0.0077544761070576	0.0314720343896565	0.8798934380257993	0.0027769092811886	0.2153215928855948	0.0020849673022529	0.2153215928855948	0.0020486000662912	0.0294066694011226	0.0095935381595279	0.0068268929605505	0.0054938024484064	0.0068268929605505	0.005464885072083	0.0242007851934941	0.0768863128567699	0.0242007851934941	0.0784471293990712	NAT8	81423	NAT8B	140341	ALMS1	175240	True	True	False	alt	25	0.021	25	0.06445
2184	chr2	73562931	A	G	rs6735946	-0.01781610572	0.6491810910403052	0.01781610572	0.6430064552931134	0.0319653560021677	0.1941108449818502	-0.0005867398720132	0.4928966598274671	0.0005867398720132	0.4871430457032975	0.0004932202830654	0.9878782782434044	-7.945663857165204e-06	0.9720857833659776	7.945663857165204e-06	0.9650017695378782	1.5637736324607602e-05	0.966262710263083	-2.600670443987368e-07	0.9435653247360952	2.600670443987368e-07	0.9366230313027072	-3.5465672528125136e-05	0.964159103917224	3.5465672528125136e-05	0.9570889194654252	NAT8	79491	NAT8B	138409	TPRKB	174469	False	False	False	ref	45	0.01994	95	0.04028
2185	chr2	73570496	T	A	rs10197755	0.00348354858	0.7501055130128094	0.01140948358	0.7520648184687069	0.0135153182796201	0.7619770143535101	4.763910231246187e-05	0.7876673060628054	0.0001551471338327	0.7896623314646001	0.0012784137771765	0.950674853659372	5.4351029455516e-06	0.934608359771184	1.7400995396225236e-05	0.9364377598473878	1.7188693343217616e-05	0.961472846646817	7.297717331371183e-08	0.942173787414578	2.3351058028389042e-07	0.944082379982184	4.1239154102470574e-05	0.9310686687232615	7.09313450562497e-05	0.9328944563246048	NAT8	71926	NAT8B	130844	TPRKB	166904	False	False	False	alt	100	0.013145	-85	0.1307
2186	chr2	73570869	T	G	rs7583255	0.0390177734	0.3746485460484826	0.0390177734	0.3792629238543482	0.0322128425389979	0.1920903844178896	0.0013760692904871	0.2710103118872889	0.0013760692904871	0.2743020105096169	0.0008305565636237	0.975548012065264	3.514434581352773e-05	0.8939378757090297	3.514434581352773e-05	0.9008653890811248	2.711486229384656e-05	0.9427821560810756	1.2658647052043916e-06	0.840628230651703	1.2658647052043916e-06	0.8473501869374327	0.0001253670284714	0.89528718496844	0.0001253670284714	0.902261407909338	NAT8	71553	NAT8B	130471	TPRKB	166531	False	False	False	alt	35	0.05563	80	0.09656
2187	chr2	73583782	T	G	rs7558944	0.0002394941399999	0.6807300081139563	0.01520718374	0.6811829214018336	0.0163573026024776	0.6305202436227337	7.258843211477881e-06	0.6981973322576466	0.0002433752097605	0.698793177722391	0.0015819339513707	0.9401700588165168	3.62914101336226e-06	0.9135426833031386	2.6985806786955704e-05	0.9150000200201324	2.572196445171137e-05	0.9408282517764932	6.215618545569176e-08	0.9136031620819396	4.305003124745722e-07	0.9150171904144696	-9.897396984596377e-06	0.9061737815816794	0.0001105209329946	0.9075256186668454	NAT8	58640	NAT8B	117558	TPRKB	153618	False	False	False	alt	100	0.009094	50	0.01654
2188	chr2	73588201	G	A	rs11903916	-0.00516971028	0.660576012510025	0.01654576348	0.6579973218360323	0.0212437117386134	0.4384563421218225	-8.692732953778954e-05	0.6332430788061224	0.0003518628558474	0.630854671285853	0.0541329880241496	0.4315307279305386	-0.0006818216890351	0.5573589774573935	0.0008933563769567	0.5544941584569096	0.0011293725727004	0.4243187793484427	-1.343111064630736e-05	0.5461844248740934	1.8357516440121425e-05	0.5433166565987321	-0.0013881099270891	0.5571203011826928	0.0021172181716207	0.5543937516393471	NAT8	54221	NAT8B	113139	TPRKB	149199	False	False	False	ref	95	0.2493	-45	0.0586
2189	chr2	73590111	G	A	rs7603647	0.0186637912	0.5098446426403854	0.0260736044	0.5118769859084259	0.0143515705880867	0.7010203966152978	0.0003275636150393	0.5714994597714832	0.0004169908022495	0.5735818866986183	0.0045965161162613	0.8445196093573842	5.890015035044432e-05	0.8036761207460794	9.472067426848904e-05	0.8051287393080792	6.400257451198657e-05	0.8690373301513451	1.1409044244981368e-06	0.8157273685981158	1.5585149111181666e-06	0.8173158407360587	0.0002169179505789	0.7946861654556959	0.0003554815083632	0.7961164784165662	NAT8	52311	NAT8B	111229	TPRKB	147289	False	False	False	alt	25	0.001427	70	0.04846
2190	chr2	73610624	T	C	rs6546856	-0.0014835686799999	0.595603261056524	0.01952979148	0.5933149837246593	0.0395529383448915	0.1125969711921264	-8.539826707960009e-05	0.411346169803943	0.0007393723874951	0.4089192409405062	0.0339777638481079	0.5172501168990409	-0.000118426192163	0.5740700580258645	0.0005451567542698	0.5715768197240492	0.0013808005752726	0.3908287027746492	-5.447128107336023e-06	0.4717187588919557	2.0911347394322307e-05	0.4692342541658631	-0.0001418626901124	0.5558018232386847	0.0017320444723037	0.5535133119527369	NAT8	31798	NAT8B	90716	TPRKB	126776	False	False	False	ref	-100	0.06067	-100	0.12463
2191	chr2	79206501	C	T	rs13407231	-0.1854109248	0.0312422072441281	0.1854109248	0.0309931584383608	0.0439767967479155	0.0855003851448496	-0.0089489091230057	0.0292934334717891	0.0089489091230057	0.0291536846093659	0.0382072514928573	0.4919840155018595	-0.007067338100572	0.2006907203967893	0.007067338100572	0.1971411909165208	0.0017049460869806	0.3496132551361879	-0.0003367884423587	0.1359852814463357	0.0003367884423587	0.1335448871560171	-0.016339777638481	0.1284497385385001	0.016339777638481	0.1259653006568364	CTNNA2	21269	REG3A	46748	REG1A	86138	False	False	False	ref	80	0.0362	85	0.127
2192	chr2	79206616	C	G	rs17016552	0.0956026122	0.1227468887098634	0.103338451	0.1237901481594066	0.0157674251420416	0.6385139727585544	0.0019110701683141	0.239277938052984	0.0020117935309091	0.2410731137004278	0.0556151232225924	0.4229393035979101	0.0068511145291413	0.2393370352704024	0.0070377090030801	0.2424729877363589	0.000987592394644	0.465426901360163	0.0001445793557566	0.2841294703683594	0.0001470088819509	0.2872455072270822	0.0142324568638448	0.1686223912906913	0.0147504206393718	0.1709315784970062	CTNNA2	21384	REG3A	46863	REG1A	86253	False	False	False	alt	-35	0.02634	-30	0.09265
2193	chr2	79211546	G	A	rs13406464	0.0478070919	0.3284939458021973	0.0478070919	0.3322168977207762	0.0469318103284269	0.0702501689985507	0.0025785549877791	0.192116996850692	0.0025785549877791	0.1940939549564878	0.04255880703375	0.4763765745768408	0.0026849893567638	0.4000337076751091	0.0026849893567638	0.4050522885598583	0.0021942851933601	0.3151608148003353	0.0001557136970167	0.2855660657199558	0.0001557136970167	0.2893706895929818	0.0061586552736629	0.3430542510947865	0.0061586552736629	0.3477639595005257	CTNNA2	26314	REG3A	51793	REG1A	91183	False	False	False	alt	-35	0.02083	-100	0.1849
2194	chr2	104359740	G	A	rs4535062	-0.01021468076	0.7522820207475654	0.01120115516	0.7475165697388083	0.0179725678477593	0.5478217737703832	-0.0001780590501716	0.7424627687307381	0.0001961005693563	0.7379953449204844	0.0279609712645573	0.5731458930157538	-0.000329427287877	0.6871487707354257	0.0003502358081056	0.682961850461293	0.0004548814838961	0.5977956565010103	-5.290834507583296e-06	0.6966975602754819	5.671399197916696e-06	0.6923968520452313	-0.0009534492428491	0.6758824820238016	0.0010342779848899	0.671705347817699	POU3F3	493548	MRPS9	678330	GPR45	882004	False	False	False	ref	-100	0.01779	100	0.03958
2195	chr2	104365522	A	G	rs17029753	0.00163753986	0.7882486859612959	0.01000427034	0.7875269441827155	0.0247873332328431	0.3353518652737724	5.03642735572492e-05	0.7132382327727229	0.0002532648876331	0.7125144761174995	0.0166837121836956	0.640734574203723	5.938487408088177e-06	0.759871344224775	0.0001636292711051	0.7589157628860513	0.0004088914959769	0.5966390845998379	3.167542090284451e-07	0.7209077013330379	4.106299129529598e-06	0.7200716252178344	2.0619577051260007e-05	0.7579405068143859	0.0005385833525782	0.756976471115339	POU3F3	487766	MRPS9	672548	GPR45	876222	False	False	False	alt	35	0.002747	-45	0.04962
2196	chr2	104365851	T	G	rs60641243	0.0165839305	0.5212317293451602	0.0246864703	0.5233415200211718	0.0205359124121245	0.4625218391396902	0.0003272421514845	0.5109110867922685	0.0005076468875525	0.5127755109226304	0.0116088218798455	0.699907790524895	0.0002103174837397	0.6824703741166407	0.0002811402696111	0.6840829013715867	0.0002412933725329	0.6833163144392077	4.277996500262661e-06	0.6665996735291324	5.850000386142647e-06	0.6683095416646473	0.0007084886674804	0.6584399592236829	0.0010120088416745	0.6601509689537385	POU3F3	487437	MRPS9	672219	GPR45	875893	False	False	False	alt	65	0.0235	-10	0.10254
2197	chr2	104367098	C	G	rs7598321	0.0434538692	0.3339098559761701	0.0434538692	0.3383280442608812	0.0313406496785632	0.2035851158018143	0.0014141351915124	0.2478120509798892	0.0014141351915124	0.2510507300737704	0.0175835505262115	0.6376669106151923	0.0008088695869451	0.5187529390961001	0.0008088695869451	0.5245741854199467	0.0005566498791191	0.554011263272121	2.6558477555402272e-05	0.4483612003758619	2.6558477555402272e-05	0.4539847488374635	0.0025122892679224	0.482347663761758	0.0025122892679224	0.4881700550855724	POU3F3	486190	MRPS9	670972	GPR45	874646	False	False	False	alt	-45	0.05215	-40	0.05554
2198	chr2	104367929	C	T	rs62152284	0.0124382683	0.7239183178085149	0.0124382683	0.7305660551050753	0.0108891909539977	0.8654539855396125	0.0001377561580709	0.7983107234961072	0.0001377561580709	0.8051574111529773	0.3540010227310217	0.0867551625730635	0.004673245829091	0.2639833388411864	0.004673245829091	0.2682292341677247	0.0038750353620095	0.2015214988771667	5.22251361926386e-05	0.3586590153373718	5.22251361926386e-05	0.3635280175486409	0.0041964963214674	0.3832417546361579	0.0041964963214674	0.3882950623900066	POU3F3	485359	MRPS9	670141	GPR45	873815	False	False	False	alt	0	0.0	95	0.2394
2199	chr2	104389309	T	C	rs112338729	-0.0908708114	0.1283774163198793	0.0908708114	0.1265522219192895	0.0244529790706203	0.3432572487225195	-0.0022838235145063	0.1572853902111056	0.0022838235145063	0.1552276090005206	0.0080416350499818	0.7653525274094297	-0.0006950342115099	0.5426151011778415	0.0006950342115099	0.5367994358018188	0.0001925382988791	0.7276880307612935	-1.7444251756716048e-05	0.5088907482849316	1.7444251756716048e-05	0.503071495832415	-0.0023110421959024	0.5045302172460844	0.0023110421959024	0.4985455767475372	POU3F3	463979	MRPS9	648761	GPR45	852435	False	False	False	ref	30	0.01455	-5	0.015366
2200	chr2	134086836	T	C	rs6729836	0.0737366262	0.1821422265105143	0.0791151926	0.1838020318556234	0.0214275255956403	0.4340466324570044	0.0012699099402267	0.2614214446526289	0.0014462981319739	0.2634630896225675	0.0822308732803272	0.3379090383563823	0.0057050994835574	0.2295861204423382	0.0062776734283359	0.2321070243703018	0.0018185113658525	0.3332754251977829	9.541505616959256e-05	0.2482676401356849	0.0001141924174483	0.2507593219491712	0.0117968724225528	0.1751835963031004	0.012951568737422	0.177193711128406	MGAT5	33148	NCKAP5	518373	TMEM163	632164	False	False	False	alt	100	0.0679	40	0.1445
2201	chr2	140300603	T	C	rs10203500	0.15491916	0.0436227628413321	0.15491916	0.0441048408635854	0.0353094573259398	0.1536007789367721	0.0057442347999981	0.0494721575663759	0.0057442347999981	0.0498304423486365	0.0284632641615254	0.5537805383949312	0.0048606030944096	0.2507047446891864	0.0048606030944096	0.2547954782121929	0.0010720926826102	0.4438225541599558	0.0001906373478594	0.196157155704705	0.0001906373478594	0.1993289038697401	0.0122892679225363	0.1733454856176879	0.0122892679225363	0.1763299787045115	NXPH2	1520213	SPOPL	1798832	LRP1B	1830413	True	False	False	alt	-25	0.003967	-40	0.05713
2202	chr2	140302839	G	A	rs12692042	-0.0131569916279999	0.3575017543672703	0.041957312828	0.357473641318276	0.0210155210417529	0.4476156076114466	-0.0004201729929228	0.3805572370721142	0.0009212638778129	0.3803569130963522	0.0007785952294545	0.9756595652281318	-2.055011637341619e-06	0.9162747243556788	2.2320118163532937e-05	0.9176331741303289	1.632608251960139e-05	0.9656910577003036	-1.1505972954392548e-07	0.8995803422334925	4.919496024427229e-07	0.9009776578754046	-9.072613902531744e-06	0.9161503016089688	8.825178977926626e-05	0.9169008293613032	NXPH2	1522449	SPOPL	1801068	LRP1B	1828177	False	False	False	ref	35	0.002666	40	0.06433
2203	chr2	140315675	C	A	rs17477145	0.0187734404	0.6080287108287634	0.0187734404	0.6143097774937462	0.0231386917501938	0.3804954886824213	0.000433166393876	0.5330895507940532	0.000433166393876	0.5391163727105814	0.0047515753356866	0.8297291982637511	9.333013357731356e-05	0.7909639953824683	9.333013357731356e-05	0.7976617502536097	0.0001085187113235	0.7989100556429805	2.121036808258395e-06	0.7605929114086135	2.121036808258395e-06	0.7671950365972965	0.0003538319421991	0.7830132551973814	0.0003538319421991	0.7897115046349632	NXPH2	1535285	SPOPL	1813904	LRP1B	1815341	False	False	False	alt	-100	0.0927	-5	0.00206
2204	chr2	140315711	A	C	rs13386580	-0.0197251055	0.6101125794618004	0.0197251055	0.6040566205415961	0.0153754988142932	0.6709113379609856	-0.0003181209211593	0.6395573163994739	0.0003181209211593	0.6333098692263374	0.0046319817887894	0.8337723108484495	-8.846115972064079e-05	0.8180748508136195	8.846115972064079e-05	0.8113178143441275	6.937336624463189e-05	0.8539241706229187	-1.4126865082335372e-06	0.8267812018987674	1.4126865082335372e-06	0.8201123498848184	-0.0003340371482299	0.8077617641903874	0.0003340371482299	0.8010390095130964	NXPH2	1535321	SPOPL	1813940	LRP1B	1815305	False	False	False	ref	-75	0.03574	30	0.0327
2205	chr2	140329524	G	A	rs10208226	0.0579859525999999	0.2438182438437499	0.0579859525999999	0.2470052937997338	0.0392688661638379	0.1138129700576717	0.0023739899203407	0.1593355578913162	0.0023739899203407	0.1613426311511286	0.150051136551087	0.2343572610813939	0.011279040751641	0.1735757286435872	0.011279040751641	0.1763435247315246	0.0060549080915195	0.1434206210121299	0.0004680454608718	0.1302491567818807	0.0004680454608718	0.1321977217969273	0.0153434396753653	0.148456674068447	0.0153434396753653	0.1508478750005704	NXPH2	1549134	LRP1B	1801492	SPOPL	1827753	False	False	False	alt	-100	0.06165	-100	0.1777
2206	chr2	140345146	A	G	rs1401123	0.1073203866	0.1041413395768861	0.1073203866	0.1053107471526911	0.0412863041467975	0.1012508674696688	0.0050137536122234	0.0761942646456521	0.0050137536122234	0.0769822490322305	0.0053701626472237	0.8164780755743177	0.000739024164398	0.5606009712352539	0.000739024164398	0.566432363718789	0.0002415544611721	0.6974513784057296	3.7174832177605146e-05	0.4461514252254728	3.7174832177605146e-05	0.4515365354819994	0.0022475338985846	0.5258815081640925	0.0022475338985846	0.5315382300884605	NXPH2	1564756	LRP1B	1785870	SPOPL	1843375	False	False	False	alt	0	0.0	-65	0.0746
2207	chr2	140355793	C	T	rs10202846	0.00461540148	0.8227182145194356	0.00761626492	0.8248428980459315	0.0181651077590384	0.5514523384811136	9.025415251483048e-05	0.7942439726240667	0.0001401999890087	0.7964676027261874	0.0676124179340833	0.3799642403452682	0.0002472907039022	0.5823261900634387	0.0004858923918119	0.5846058139972907	0.0012311499953936	0.4017976870923759	5.063908762509296e-06	0.5848568823877905	9.022258338783946e-06	0.5870512023005295	0.0007068391013163	0.5983954500058694	0.001285836824915	0.6005878767578892	NXPH2	1575403	LRP1B	1775223	SPOPL	1854022	False	False	False	alt	60	0.01146	-85	0.02914
2208	chr2	144469483	C	T	rs9287360	-0.0492950786	0.3064120172385296	0.0527455834	0.3037918348672304	0.0893933383586384	0.0070724222619078	-0.0040642389646181	0.0932607664677226	0.0044592907890523	0.0928218673393102	0.1363539639074923	0.2430477628706193	-0.0072909058122969	0.2168472491726458	0.0077007464480939	0.214667902238283	0.0118809078159188	0.057234106012166	-0.0005907706886843	0.0956263038346063	0.0006376937638359	0.094756690310121	-0.0119989442776549	0.1860806826328075	0.0129260004618784	0.1840879284276238	ZEB2	51574	GTDC1	136915	ARHGAP15	1378120	False	True	True	ref	70	0.03967	30	0.0432
2209	chr2	145662536	C	A	rs67082009	0.00377372432	0.8473425661769011	0.0069537762399999	0.8468364362665811	0.0178521040948632	0.5640377542953383	6.997067634543792e-05	0.8400742589527465	0.0001226468735355	0.8397077500082373	0.0156989211837286	0.6522225238985734	6.275285227299133e-05	0.8078207898117354	0.0001233726379572	0.8071265602311272	0.0002772139334864	0.6626281822260588	1.156296476902346e-06	0.8053346132684418	2.1628024747188804e-06	0.8048712723660911	0.0002202170829071	0.8102421293158125	0.0004082676256144	0.8096750059909867	ZEB2	1141479	GTDC1	1329968	ACVR2A	2181982	False	False	False	alt	100	0.04208	90	0.1713
2210	chr2	145677776	G	A	rs72857431	-0.0162672239	0.635802096834834	0.0176700653	0.6311902220232	0.0153289292552119	0.6770456157879662	-0.0002453242757198	0.6751843480997927	0.0002689510201803	0.670484762749834	0.0693345650094025	0.3717544474513127	-0.000975073246255	0.4659706961618249	0.0011119742032121	0.462286843482607	0.0010554343393868	0.4267765470307733	-1.428049363666546e-05	0.504700831721931	1.6586188272743783e-05	0.5009188500566849	-0.0024397083567021	0.4669173907440437	0.0027300320015835	0.4630126725040707	ZEB2	1156719	GTDC1	1345208	ACVR2A	2166742	False	False	False	ref	-100	0.06995	-100	0.06238
2211	chr2	145680858	A	G	rs72857434	0.0365781612	0.3827540733899893	0.0365781612	0.3877739057622176	0.0719734113411085	0.0160888037472303	0.0025635573962799	0.1266114501651718	0.0025635573962799	0.1283128654252229	0.0160923427138661	0.6502629034119715	0.0006374923146075	0.548528480484352	0.0006374923146075	0.5544281495464626	0.0011154930355982	0.4202481195534618	4.3340236366826016e-05	0.3646490848197265	4.3340236366826016e-05	0.3698594137071021	0.0020743294513542	0.5118993589018282	0.0020743294513542	0.5177963078773398	ZEB2	1159801	GTDC1	1348290	ACVR2A	2163660	False	True	False	alt	75	0.06018	100	0.03528
2212	chr2	145883473	G	T	rs6721450	0.088232855	0.1518037119246989	0.088232855	0.1540770836347516	0.0220876627657506	0.4126732489845534	0.0023375433608666	0.1942177609589317	0.0023375433608666	0.196625355025748	0.0398493946092177	0.496398359106245	0.004221259714001	0.3068367047469913	0.004221259714001	0.3109830520718233	0.000883586078146	0.4832249182926741	0.0001173554697412	0.3059455031152951	0.0001173554697412	0.3099510869853425	0.0094676849988452	0.2404244523908522	0.0094676849988452	0.2439597485315064	ZEB2	1362416	GTDC1	1550905	ACVR2A	1961045	False	False	False	alt	65	0.01445	-20	0.04016
2213	chr2	146811485	T	C	rs34624969	-0.0524112068	0.2919347513046204	0.0524112068	0.2879956395711314	0.0249816787004876	0.328335278575258	-0.0014549815296194	0.2705837807710262	0.0014549815296194	0.2669275445317464	0.001403780805648	0.94944001144292	-6.977316635017995e-05	0.8373749425746753	6.977316635017995e-05	0.8306164778680618	3.415242626768426e-05	0.920460292365299	-1.9010703205221007e-06	0.7962257928895711	1.9010703205221007e-06	0.7896413787046139	-0.0002523836231071	0.8329267669671299	0.0002523836231071	0.826266665097618	ACVR2A	1033033	MBD5	1209527	ORC4	1210119	False	False	False	ref	-45	0.002014	0	0.0
2214	chr2	146823071	C	T	rs4556924	-0.1369335766	0.063620621868184	0.1369335766	0.063029315071719	0.0221920450897881	0.4047157925508164	-0.003271953755247	0.1141197419306413	0.003271953755247	0.112874158348986	0.0433514235755995	0.464476569805156	-0.0058843732198734	0.2274629354446733	0.0058843732198734	0.2236376767719236	0.0009600495533164	0.4461245942227128	-0.0001398438209097	0.2297391307008427	0.0001398438209097	0.2260764669531496	-0.0143355547491009	0.152060898831099	0.0143355547491009	0.1493086732694498	ACVR2A	1021447	MBD5	1197941	ORC4	1198533	False	False	False	ref	-75	0.02515	100	0.1543
2215	chr2	146834002	A	C	rs7559983	0.00117455834	0.8192015431023514	0.0083009985	0.8206426769686554	0.0145196714416745	0.714822771346689	1.7262587708329097e-05	0.8310573174647571	0.0001195689792115	0.8325313806141477	0.001719672726073	0.9353745722557422	3.249469265966532e-06	0.9402587759990022	1.5599824890506573e-05	0.94188923499795	2.536516421144807e-05	0.9440065453937178	5.2013376449050253e-08	0.9435712219903604	2.292883958356883e-07	0.9452096565358132	2.061957705122694e-05	0.944034894707844	5.691003266140146e-05	0.9444524479914396	ACVR2A	1010516	MBD5	1187010	ORC4	1187602	False	False	False	alt	25	0.0067	80	0.09503
2216	chr2	146853682	G	A	rs3934919	-0.01944139578	0.6371753723784529	0.01944139578	0.6313874862251158	0.013102091505394	0.7798549662688696	-0.0003011703245045	0.7063146121140826	0.0003011703245045	0.7003538990231604	0.0060885487116887	0.8179214548078354	-0.0001384039634186	0.8388437356123034	0.0001384039634186	0.8321499152814754	7.921290924060663e-05	0.8559130834293132	-2.2916130463693672e-06	0.8561834214934086	2.2916130463693672e-06	0.8493970329136211	-0.0004610537428655	0.8251202491167033	0.0004610537428655	0.8184069239260318	ACVR2A	990836	MBD5	1167330	ORC4	1167922	False	False	False	ref	-100	0.00757	100	0.0809
2217	chr2	146859620	C	T	rs13022139	0.0960485966	0.1185587783001622	0.0960485966	0.1201745020068165	0.0298195511869814	0.2300355723704586	0.0031927614051904	0.1190184782798549	0.0031927614051904	0.1204214244370439	0.0169435188545412	0.6358005577131735	0.0015816485182478	0.40423765835565	0.0015816485182478	0.4094521096025941	0.0005039744194182	0.5632251242190426	5.250059685955924e-05	0.3484741509403772	5.250059685955924e-05	0.3534097770769842	0.0047730196958199	0.3439706440262245	0.0047730196958199	0.3489615040357057	ACVR2A	984898	MBD5	1161392	ORC4	1161984	False	False	False	alt	-75	0.02058	-20	0.042
2218	chr2	147051395	T	C	rs2254296	0.0274736001	0.4937200240619642	0.0279185531	0.4980397802991805	0.0200868432386992	0.4797894579428143	0.000584534692396	0.4991563622270106	0.0005929628258508	0.503726178862226	0.0105770182442017	0.733811208202954	0.0002839177199002	0.7038865466070207	0.0002878922184586	0.7079798462558646	0.0002213647476072	0.7201087863274489	6.075528762448103e-06	0.688156154035595	6.15081222828242e-06	0.6923139366286347	0.0009616970736696	0.6800317802507412	0.0009732440368182	0.6841504352587789	ACVR2A	793123	MBD5	969617	ORC4	970209	False	False	False	alt	-35	0.015594	-40	0.04465
2219	chr2	147059580	T	C	rs1451083	-0.0151847019	0.6957261858402471	0.0151847019	0.6891990060686266	0.0187294047997655	0.5333898153723782	-0.0002839969582763	0.6725024832173186	0.0002839969582763	0.6657761451305718	0.0803478935040084	0.3559514257024236	-0.0013119864755385	0.4681177046887279	0.0013119864755385	0.4628699592701646	0.0015681984983163	0.3730767520965486	-2.511539991205408e-05	0.4766726023899913	2.511539991205408e-05	0.4712137602565182	-0.0027498267955527	0.4755640058500061	0.0027498267955527	0.4701258258924024	ACVR2A	784938	MBD5	961432	ORC4	962024	False	False	False	ref	85	0.004333	-90	0.1543
2220	chr2	147060558	C	T	rs6743215	-0.127541962	0.0672763598824481	0.127541962	0.0663350479811783	0.0154007492445986	0.6711923023230287	-0.0019662146799898	0.1773971066313929	0.0019662146799898	0.1750565908524302	0.0421455907096433	0.4813437516197523	-0.0054965468207435	0.2372305820663539	0.0054965468207435	0.2333843062537363	0.0006471802526077	0.5303653438611298	-8.394401175749627e-05	0.2886751646665741	8.394401175749627e-05	0.2843849805021479	-0.0130505427072679	0.1645664868677427	0.0130505427072679	0.1615617230777608	ACVR2A	783960	MBD5	960454	ORC4	961046	False	False	False	ref	-60	0.07556	-80	0.10693
2221	chr2	147065200	G	A	rs61064806	-0.046770137	0.3168932241976058	0.046770137	0.3130632969569925	0.013189985695228	0.7558484426659471	-0.0006206292600257	0.4676435585955227	0.0006206292600257	0.4623851592220299	0.0002573323215993	0.9960480777021408	-1.6489359466758145e-05	0.9459651598111488	1.6489359466758145e-05	0.9388425625455686	3.672157757187672e-06	0.996150005939896	-2.3119767709081813e-07	0.9516621551642525	2.3119767709081813e-07	0.9449955259113414	-5.5260466497310734e-05	0.9544648859071032	5.5260466497310734e-05	0.947335539817522	ACVR2A	779318	MBD5	955812	ORC4	956404	False	False	False	ref	-95	0.01955	10	0.0004883
2222	chr2	152147871	C	A	rs4664536	0.013036935	0.6514868938794763	0.0162283166	0.6560050241222171	0.0355375387996613	0.1502655940399528	0.0005021161659309	0.4582043696242922	0.0005949374427744	0.4621793557290507	0.004790340140543	0.8326684509091192	6.814164819349468e-05	0.8139253597807057	7.713060309535117e-05	0.8184417694637753	0.000180109598268	0.7393139659652038	2.680402257598187e-06	0.7344681084611415	2.9418458427822887e-06	0.7388849849830186	0.0002639305862557	0.8053995691613149	0.0003035201741941	0.8098919213904635	STAM2	27892	CACNB4	48704	ENSG00000283228	173922	False	False	False	alt	5	0.000908	65	0.02446
2223	chr2	152160749	T	C	rs191529620	-0.0140127368	0.3781773492255001	0.0398706672	0.3789668889991812	0.028605772670311	0.2520352606253825	-0.0005536590864119	0.308819710574135	0.0012279329350218	0.3099056795196991	7.588004354852957e-05	0.9990730943668223	2.538461598495245e-07	0.9878151416632828	1.7409913261158906e-06	0.990867579336455	1.8615577468054448e-06	0.9976629874975812	-4.2888394678722966e-10	0.9829058763447605	4.69557723621383e-08	0.984519765205452	1.6495661640988468e-06	0.9941423360347558	1.6495661640988468e-06	0.9970498474091924	STAM2	15014	CACNB4	61582	FMNL2	174426	False	False	False	ref	-50	0.03107	-95	0.3174
2224	chr2	152161260	G	A	rs3963509	-0.0084730175999999	0.3679389193251887	0.0439227176	0.3654907083672371	0.0362834816683226	0.1427866343247143	-0.0001637896256401	0.2580474452322425	0.0017178654980287	0.2564328089376973	0.0004462076473886	0.9893141095686516	8.78056293868829e-06	0.9426353450679432	2.1919664285553703e-05	0.9398098748699	1.6827258871138657e-05	0.9651036776465644	4.289649686301987e-07	0.8958488369760469	9.168992935254706e-07	0.8919097245574259	2.8867407871726783e-05	0.9415249246354874	7.670482663059322e-05	0.9391827271391175	STAM2	14503	CACNB4	62093	FMNL2	173915	False	False	False	ref	100	0.03723	100	0.158
2225	chr2	152202955	A	C	rs62177360	-0.0177247988	0.565332506730313	0.0221210168	0.5610055433626495	0.0151019714589752	0.6881681728358077	-0.0002533879750486	0.6173130196821157	0.0003292215120825	0.6128537524017903	0.1150151760087096	0.2810408964610193	-0.0021503463034022	0.3405951894403538	0.0026493281487108	0.337312467719199	0.0017407073190388	0.3434151185727879	-3.091134238018889e-05	0.3880621143001497	3.95186402249672e-05	0.3846110557208813	-0.0041354623733957	0.3402298111339453	0.0051169542410345	0.3368467041203083	STAM2	27192	CACNB4	103788	FMNL2	132220	False	False	False	ref	-95	0.2317	-100	0.399
2226	chr2	152278659	C	T	rs6732917	0.4509936899999999	0.0026057318686307	0.4509936899999999	0.0025842551060751	0.0704743989228536	0.0178733087674655	0.0332127821926982	0.0029981711622033	0.0332127821926982	0.0030045146519215	0.793708554650127	0.00776898309092	0.3557830779840729	0.0005211972732589	0.3557830779840729	0.0004944363252755	0.0555240506842932	0.0015694134377248	0.0259986282877334	0.0007916959482895	0.0259986282877334	0.000786928691098	0.0802118042954702	0.0077988503981414	0.0802118042954702	0.00781093312088	FMNL2	56516	STAM2	102896	CACNB4	179492	True	True	True	alt	85	0.0738	80	0.671
2227	chr2	155028649	G	T	rs72865150	0.0001491041	0.730519595313367	0.0128958854999999	0.729320048906867	0.0497819882525992	0.0612916886980123	7.150135364882e-05	0.5074331775913737	0.0005187721671539	0.5066016089889345	0.0074321203523473	0.7741107318500843	3.195127862087503e-05	0.8133153591583393	9.22955458547848e-05	0.8123205307955008	0.0004045902494557	0.6225030663499246	1.9214894737872574e-06	0.7076947617061423	4.0024979773635685e-06	0.7067797555379308	0.000101448319092	0.7986459544144162	0.0003620797730196	0.7976996446899172	KCNJ3	330793	GALNT13	1156726	NR4A2	1313699	False	False	False	alt	70	0.068	-50	0.05743
2228	chr2	155059850	G	A	rs34849522	0.0466135882	0.3052835876070012	0.0466135882	0.3095513946063325	0.0373539707175852	0.1312312800527612	0.0018097770018881	0.2006001051138169	0.0018097770018881	0.2031712038561573	0.0376092837583715	0.4935095624910916	0.0018685628913578	0.3912214559449608	0.0018685628913578	0.3965701645234477	0.0014080761885927	0.3784773463389281	7.299500032960162e-05	0.3093118021916242	7.299500032960162e-05	0.3140104081692516	0.0051532446966447	0.339037700049839	0.0051532446966447	0.3441875135558433	KCNJ3	361994	GALNT13	1187927	NR4A2	1282498	False	False	False	alt	100	0.02376	100	0.0625
2229	chr2	155061910	T	C	rs62177111	0.03370987719	0.4508773203904	0.03370987719	0.4555549831536064	0.0158572820180481	0.6484700097234292	0.0006427905649628	0.5076530505198306	0.0006427905649628	0.5126768293141051	0.0608920853815445	0.4120442804369162	0.0029399155107056	0.4161118897808528	0.0029399155107056	0.4211586134575271	0.0010923007009141	0.4518024890217548	5.747079224516672e-05	0.4441803834118246	5.747079224516672e-05	0.4494172076273971	0.0060605060868991	0.371146960450885	0.0060605060868991	0.3758604575193405	KCNJ3	364054	GALNT13	1189987	NR4A2	1280438	False	False	False	alt	-65	0.0174	25	0.04678
2230	chr2	155062957	T	C	rs13019836	0.1245336406	0.0738655901533478	0.1245336406	0.0746305466343944	0.028968266498638	0.242123024450957	0.0038516116173693	0.090737756866941	0.0038516116173693	0.0916416295941584	0.2891153376661937	0.1164214917096213	0.0356151146348581	0.0470841517876143	0.0356151146348581	0.0479087477401584	0.0083060556918922	0.0955776112135588	0.0010948167749961	0.0522663255338262	0.0010948167749961	0.0531075482451316	0.0400316716703506	0.0351438713328674	0.0400316716703506	0.035477904254888	KCNJ3	365101	GALNT13	1191034	NR4A2	1279391	True	False	False	alt	-65	0.02563	40	0.0979
2231	chr2	155076158	G	T	rs17643843	0.00753567878	0.8169143042552128	0.00753567878	0.8237801576918938	0.0220039028127625	0.4158080650765337	0.0001654159663054	0.7687913819485747	0.0001654159663054	0.7754450608957753	0.0239385041734023	0.5766904107755889	0.0002138934240347	0.7190771396577483	0.0002138934240347	0.7255793721973894	0.0005253859619206	0.555910667774665	4.744743731325179e-06	0.6984208191015105	4.744743731325179e-06	0.7048306882199037	0.0006911682227573	0.714349558768865	0.0006911682227573	0.720980934393778	KCNJ3	378302	GALNT13	1204235	NR4A2	1266190	False	False	False	alt	-100	0.1142	-5	0.0065
2232	chr2	155085458	G	A	rs12986694	-0.0362491206	0.365811857049643	0.0408324394	0.3620360327986566	0.0107514690490653	0.8705742840983466	-0.0004271269966939	0.5424224942796573	0.0004639990584244	0.5381084686230504	0.0151595130480683	0.6613266208963762	-0.0005811008971032	0.5617768345359367	0.0006345724469511	0.5579205427063715	0.0001561963617305	0.7496937777138916	-6.448512519403097e-06	0.6381167787679042	6.878682518065579e-06	0.6340177393003944	-0.001953086338293	0.5207358284180541	0.0021246412193592	0.5167016298938234	KCNJ3	387602	GALNT13	1213535	NR4A2	1256890	False	False	False	ref	85	0.05893	85	0.1709
2233	chr2	155096418	C	T	rs36078004	0.0515881218999999	0.2854597114084337	0.0515881218999999	0.2892691697612443	0.069145636673286	0.0185801199713739	0.0036950460058304	0.1133426950346359	0.0036950460058304	0.1145007532131593	0.0498449407805746	0.4470562446879051	0.0024913813172781	0.3607302600464131	0.0024913813172781	0.3658852121947163	0.0033350293152211	0.2293278435861619	0.0001681708131287	0.2134935112010307	0.0001681708131287	0.2170801593517452	0.0063178384084985	0.3086448073123468	0.0063178384084985	0.313576649135223	KCNJ3	398562	GALNT13	1224495	NR4A2	1245930	False	True	False	alt	-90	0.0745	-95	0.05786
2234	chr2	155115610	G	A	rs67625651	0.0063263187999999	0.4994709734043274	0.0272082336	0.4993342768569813	0.0137585788613157	0.7411383093983055	9.863108966316e-05	0.5967138025216103	0.0003782939377759	0.5961581642265481	0.0755105407277885	0.3568872685635895	3.061651010386e-05	0.3808679745764594	0.0019253815472622	0.3804445297523279	0.0009988384248666	0.4373466699791963	1.7730559547488132e-06	0.4426340765783427	2.602896682709105e-05	0.4418916715715054	0.0004585793936194	0.3656978262691505	0.0044274355844412	0.3653713639506849	KCNJ3	417754	NR4A2	1226738	GALNT13	1243687	False	False	False	alt	-60	0.03357	-100	0.175
2235	chr2	155135427	A	C	rs12995353	0.0571823938	0.2002000131372995	0.0677399138	0.2019167686013273	0.020396347945669	0.4716900897351129	0.0012420805036576	0.2509195709836054	0.0014282472887813	0.252792508103288	0.0173806538880274	0.6602679704399471	0.001506302842986	0.4669059870361	0.0015593760525743	0.4704643297061169	0.0003810928382521	0.6462370730176614	3.3325348059798414e-05	0.4621795579730615	3.426121833406281e-05	0.4659315275683222	0.0040183431757447	0.4079833098988328	0.0042476328725544	0.4116568132427255	KCNJ3	437571	NR4A2	1206921	GALNT13	1263504	False	False	False	alt	-30	0.01394	0	0.0
2236	chr2	155138982	T	C	rs62174916	0.051552243	0.2777795407313814	0.051552243	0.2816891085353173	0.0242062952728098	0.3541329091074076	0.0013577794566055	0.2695273140634277	0.0013577794566055	0.2730434150044593	0.0028677707762858	0.890829092683589	0.0001389534223172	0.7502333246061995	0.0001389534223172	0.7569872891265153	6.91278408428647e-05	0.8571517340398551	3.608351853207264e-06	0.7123605899879125	3.608351853207264e-06	0.7189206763824278	0.000519613341691	0.7338249298168052	0.000519613341691	0.7404633569920415	KCNJ3	441126	NR4A2	1203366	GALNT13	1267059	False	False	False	alt	-85	0.00821	-90	0.1052
2237	chr2	155156657	T	C	rs67338739	-0.0011021930879999	0.9216140779163884	0.003462496592	0.9198029441485834	0.0276061651560935	0.270556061770752	-3.587190036938072e-05	0.8558324614789731	9.783708471659191e-05	0.8539532406546806	0.0079005971429513	0.7626704022846704	-1.2678265538787017e-05	0.9183217545118558	2.2082800256701783e-05	0.9163600821556712	0.0002134937200868	0.7061119965935115	-3.741743158729792e-07	0.883664207979436	6.193597402747464e-07	0.8816684115476162	-5.443568341525906e-05	0.9159853112046188	9.072613902543358e-05	0.9141513485104578	KCNJ3	458801	NR4A2	1185691	GPD2	1278634	False	False	False	ref	50	0.005836	-30	0.02771
2238	chr2	155157754	C	G	rs35204416	-0.0522419624	0.282550385628131	0.0522419624	0.2785589772406719	0.0810181396928251	0.0105507048836447	-0.0045157499690067	0.0735915504205637	0.0045157499690067	0.0728090813824992	0.0664428755237372	0.4006705043193466	-0.0031247056080062	0.3168495046160458	0.0031247056080062	0.312299768466363	0.0052031248363324	0.1680944535662299	-0.000253165129609	0.1599528266567324	0.000253165129609	0.1571209576736663	-0.0070477714361122	0.2746712782912592	0.0070477714361122	0.2705361320313114	KCNJ3	459898	NR4A2	1184594	GPD2	1277537	False	True	False	ref	10	0.01184	55	0.063
2239	chr2	155198803	G	A	rs72871781	0.01146200988	0.6985775865538058	0.01434367652	0.7026610484637139	0.0187624460296582	0.5272314785652199	0.0001898652748552	0.6804971761862957	0.0002543767675724	0.6844797559951613	0.000918808353403	0.9702092042301824	9.899576478672937e-06	0.9452303438983732	1.2145605131563183e-05	0.9491238584946716	1.7330841136843447e-05	0.9616102669378632	1.6756924121494068e-07	0.9376265029280796	2.178507896772817e-07	0.9415263050322642	3.4640889446075684e-05	0.9444111706981084	4.61878525947676e-05	0.9483847003086232	KCNJ3	500947	NR4A2	1143545	GPD2	1236488	False	False	False	alt	95	0.01108	100	0.06714
2240	chr2	155205181	C	A	rs62176163	0.084937781	0.1530230602227745	0.084937781	0.1549279496950809	0.0477267523322362	0.0647138295636154	0.004183618558497	0.0895592532635722	0.004183618558497	0.0905590105810904	0.1684619445085942	0.2055458665575605	0.0148976697759929	0.1228541726638308	0.0148976697759929	0.1251423824618843	0.0080796228879183	0.0979117424926936	0.0007376250785314	0.0792837000971921	0.0007376250785314	0.0805967590982969	0.02336610471446	0.0886385728887623	0.02336610471446	0.0901154579266543	KCNJ3	507325	NR4A2	1137167	GPD2	1230110	False	False	False	alt	70	0.0365	40	0.1035
2241	chr2	155257913	T	G	rs11892879	0.00257032222	0.7439643401923276	0.01137130818	0.7424435831839218	0.0175753713851969	0.5796408390624982	8.807136614756851e-05	0.7250455571932987	0.0002181794969009	0.7240395590858664	0.0413950381049783	0.4779585382332838	0.0002136268473688	0.6415249489345239	0.0004094647622513	0.6406109085705729	0.0007330693399142	0.5026445664593977	5.427119241699514e-06	0.6432623490355414	8.323853430496875e-06	0.6425579633744966	0.0004989937646399	0.6428440933552038	0.001186862855069	0.6420179152937927	KCNJ3	560057	NR4A2	1084435	GPD2	1177378	False	False	False	alt	-100	0.00659	-100	0.1
2242	chr2	155938680	A	G	rs12612835	-0.0043369304545999	0.6679110082016462	0.0155604584546	0.6671015538152656	0.0200410993240254	0.4823934366934156	-0.0001331730243244	0.6534067277449722	0.0002938167680058	0.6518420097604257	0.0081637029461251	0.7596593162413905	-6.426362831195881e-05	0.7821034616402077	0.0001331818134509	0.7805924692061592	0.0001658385546168	0.7473962821796495	-1.6140636989961416e-06	0.7731000473803351	2.600498220876015e-06	0.7713167056578156	-0.0001542344363432	0.7680935580811763	0.0004956946323116	0.7661102216457665	NR4A2	403668	GPD2	496611	KCNJ3	1240824	False	False	False	ref	-80	0.1774	70	0.1512
2243	chr2	155979281	G	T	rs1881046	0.00684166564	0.6569337900139826	0.01648813724	0.660756826340381	0.0199159892184241	0.4857949769627614	0.000115891965849	0.6396926535171007	0.0003149025504563	0.6435792461015444	0.0027993137804757	0.8918824306643635	1.973234579288494e-05	0.8661049687697421	4.837483344035064e-05	0.8701950134904403	5.5702611765233215e-05	0.8769057242936833	3.376519791261527e-07	0.8548193951770583	9.285580071243226e-07	0.8589415048862858	8.990135594337916e-05	0.853048634665411	0.0001971231566097	0.8571014552063317	NR4A2	363067	GPD2	456010	GALNT5	1278425	False	False	False	alt	-10	0.0356	-100	0.01489
2244	chr2	155981422	T	C	rs2103263	0.235690996	0.0161854763952438	0.235690996	0.0162857893955914	0.044019991426185	0.0856464312624246	0.0106646125765904	0.0198323381247735	0.0106646125765904	0.01990314841838	0.0673526112632377	0.3799478083298168	0.0162465432274414	0.1002253769686251	0.0162465432274414	0.1021652505777254	0.0028837109932842	0.2492801556579004	0.0007105569005364	0.0693490724110535	0.0007105569005364	0.0706738750517261	0.0323834581505063	0.0471805420118053	0.0323834581505063	0.048051701724948	NR4A2	360926	GPD2	453869	GALNT5	1276284	True	True	False	alt	75	0.01782	70	0.2205
2245	chr2	155988494	A	T	rs35377330	0.00577197724	0.8462359571076397	0.00694123272	0.8503503094811681	0.0128928624320281	0.776728981877769	6.491438477666924e-05	0.8739241725311121	8.452106318080518e-05	0.877936939145089	0.0473582197881956	0.4483595187148156	0.0003674360539095	0.6409572903565208	0.0004030940831448	0.644659565618627	0.0005919870509396	0.5310849224389308	4.254969505809981e-06	0.6902389595157628	4.852901720181766e-06	0.6941282701229345	0.0008602487545775	0.6593169714686955	0.0009823166507208	0.6631313942422831	NR4A2	353854	GPD2	446797	GALNT5	1269212	False	False	False	alt	-60	0.01085	40	0.0268
2246	chr2	155999745	G	A	rs13026547	-0.0021771369	0.8291173539866127	0.00788828666	0.82769456776412	0.0277484599021718	0.2673213568024922	-6.99887779851955e-05	0.7268372131266876	0.000214585715838	0.7253138404961608	0.0029073603642241	0.8950015476298776	-4.6374544775745365e-06	0.916515103846433	2.981061224552622e-05	0.915302727077436	7.896401539949823e-05	0.8475274796192325	-1.5573150833657036e-07	0.8838432417360466	7.915245659800751e-07	0.882684193357021	-2.47434924613416e-06	0.9162217456107926	0.0001113457160766	0.9150602678516369	NR4A2	342603	GPD2	435546	GALNT5	1257961	False	False	False	ref	5	0.00232	100	0.02954
2247	chr2	161949898	G	A	rs7604885	-0.0900386419999999	0.1263351763180982	0.0900386419999999	0.1244364238615038	0.014672566188826	0.6913963919092052	-0.0013546233763961	0.2523203896434304	0.0013546233763961	0.2489302565905748	0.0229916531952096	0.5821416569173101	-0.0021133190667384	0.3669302289277036	0.0021133190667384	0.3618271740483471	0.0003292935434452	0.6312356561215144	-3.112457912368676e-05	0.4159206887332981	3.112457912368676e-05	0.4105391116214741	-0.0060753521823759	0.3027168265517199	0.0060753521823759	0.2980302905425767	DPP4	124496	GCG	202506	FAP	295253	False	False	False	ref	75	0.007904	100	0.11194
2248	chr2	161966199	G	A	rs13021985	-0.2098840679999999	0.0242495416552087	0.2098840679999999	0.0240543896460098	0.0372674083172454	0.1362923956193199	-0.0083435410272439	0.0322811266772749	0.0083435410272439	0.032126041689509	0.0394633961268185	0.5374170856576624	-0.0086291904742348	0.2272980278604969	0.0086291904742348	0.2236684694349514	0.0018147766205679	0.4107200690311143	-0.0004031600272882	0.1746523337032534	0.0004031600272882	0.1719251226523658	-0.0158968691234204	0.1634516121739155	0.0158968691234204	0.1607307317018899	DPP4	108195	GCG	186205	FAP	278952	True	False	False	ref	15	0.00757	-40	0.02905
2249	chr2	161975246	G	T	rs4295021	0.0057525424	0.8338625605789828	0.0067065616	0.838554148511352	0.0329826312288939	0.1790241077936292	0.0001986169440088	0.6917132833068086	0.0002280452897699	0.6962228792663883	0.0340033321236514	0.5231466287997656	0.0001380010985896	0.7017118235190863	0.0002057299770184	0.7059219982830903	0.0011116427635396	0.4295029783906162	4.90192217766765e-06	0.6227791227006705	6.991134725405936e-06	0.6269782684528702	0.0004899211507373	0.7063967619179478	0.0006598264656394	0.7107532798813738	DPP4	99148	GCG	177158	FAP	269905	False	False	False	alt	100	0.0504	90	0.0528
2250	chr2	161986568	T	C	rs2909455	0.0026532803999999	0.3522220184241276	0.0421396771999999	0.3530796571222216	0.0150496126608409	0.68502673313812	2.762426911613998e-05	0.4534053016699272	0.000618802528969	0.4544554202092478	0.0147174293160898	0.6709268113999923	3.2339471221199662e-06	0.5530611654093426	0.0007256157755608	0.5543933857598128	0.0002160351424296	0.7086726660761653	-4.567708843305695e-07	0.5889625356561977	1.051605973668164e-05	0.5904627135900763	8.825178977929999e-05	0.5139551428619566	0.0022161921414667	0.5151774108515818	DPP4	87826	GCG	165836	FAP	258583	False	False	False	alt	-90	0.01654	90	0.1782
2251	chr2	168583520	C	T	rs975341	-0.00056489284	0.7142571248552605	0.01301998356	0.71567369962039	0.0127025647781055	0.7956803965583878	-1.1631897402735093e-05	0.7851761040017035	0.000151466878757	0.7868584787906797	0.1416845369667776	0.242163137451348	-0.0007077599941948	0.4163008537349116	0.0023106214531332	0.4172972228629956	0.0016860688953687	0.3458615932122698	-8.004858877730365e-06	0.4950132981335951	2.543755915566264e-05	0.4961244659047956	-0.0002927979941275	0.4501376331407817	0.0034715119923459	0.4511126067713217	CERS6	127270	NOSTRIN	203020	G6PC2	317772	False	False	False	ref	-85	0.02023	-25	0.04025
2252	chr2	168629017	T	A	rs6722396	0.00172044924	0.6894849241551393	0.01458194404	0.6901416449470424	0.0151120038723907	0.6792659749753408	7.23139346393819e-05	0.7111916137144457	0.0002374590170808	0.7124999100290185	0.0127552703638942	0.7022643196346638	-2.0216250763354384e-05	0.760082249246741	0.0001423169547515	0.7608991607375701	0.0001781918081178	0.7402749166968874	1.262116155753057e-07	0.7752890054626337	2.2009235021700794e-06	0.7762907836188436	-3.546567252814003e-05	0.7449678353518657	0.0005270363894295	0.74584487441125	NOSTRIN	157523	CERS6	172767	G6PC2	272275	False	False	False	alt	-85	0.02155	70	0.0691
2253	chr2	168633437	T	C	rs10189241	0.1329671968	0.0632083498423491	0.1329671968	0.0641039415269323	0.0321097286942445	0.1956023951193314	0.004552830873307	0.0717258114210319	0.004552830873307	0.0725781099275321	0.1713503348619312	0.2018263128793385	0.0218549853873808	0.0743965403553022	0.0218549853873808	0.0759271123994831	0.0054493093311697	0.1487509328448466	0.0007481221288063	0.0680321671698502	0.0007481221288063	0.0691985611922276	0.0345534624393784	0.0417626696649054	0.0345534624393784	0.0424614639733748	NOSTRIN	153103	CERS6	177187	G6PC2	267855	False	False	False	alt	-95	0.2825	-15	0.02148
2254	chr2	168635396	G	T	rs7564698	-0.0458000079999999	0.3335773197743236	0.0458000079999999	0.329205608447724	0.0171701082708018	0.5937088731062415	-0.000803745383493	0.4005495108327976	0.000803745383493	0.3955826479011939	0.1594553132526145	0.2245604340700337	-0.0089318314699911	0.1997696806150238	0.0089318314699911	0.1964969123490851	0.002876636829125	0.2647676219819166	-0.0001625673818086	0.2380952261197019	0.0001625673818086	0.2346639670094358	-0.0126076341922074	0.1832116955427696	0.0126076341922074	0.1803779129669919	NOSTRIN	151144	CERS6	179146	G6PC2	265896	False	False	False	ref	-5	0.00037	5	0.01855
2255	chr2	168635458	A	G	rs4668081	0.1422264992	0.0563874132939701	0.1422264992	0.0571282281086088	0.0221695556745138	0.4075926359464223	0.0034526207067371	0.1052093789048734	0.0034526207067371	0.1064513928183167	0.2056538880274487	0.1744392997506087	0.030331339663358	0.0599644792809349	0.030331339663358	0.0613461388517615	0.0046541528962131	0.1813408412873927	0.0007673709930954	0.0794994873915241	0.0007673709930954	0.0811275030231736	0.0382220975883342	0.0368038307925417	0.0382220975883342	0.0374853564475018	NOSTRIN	151082	CERS6	179208	G6PC2	265834	False	False	False	alt	-65	0.005276	-55	0.0635
2256	chr2	168637414	G	A	rs4277491	-0.05821856924	0.2461850057552787	0.05821856924	0.2427457831187775	0.0287496481743469	0.2478900850713551	-0.0018603632642887	0.2132555828731025	0.0018603632642887	0.2105852395200308	0.0106842400448681	0.7214961921068895	-0.0007418321450467	0.5550094831405998	0.0007418321450467	0.5491074719399196	0.000338841037527	0.6462812178515983	-2.4404217995144887e-05	0.4909255146515088	2.4404217995144887e-05	0.4850209225007001	-0.0024661014153277	0.5081740726932157	0.0024661014153277	0.5022922812654824	NOSTRIN	149126	CERS6	181164	G6PC2	263878	False	False	False	ref	-90	0.002472	100	0.034
2257	chr2	168638121	C	T	rs75696288	0.0051197204259999	0.6348665683386847	0.017052524894	0.6382014246027694	0.0276542298776265	0.2667089453474377	0.0001419940277006	0.5537024284834767	0.000461463882253	0.5565250652413328	0.00177080927716	0.9286730098628307	2.2841592756732764e-05	0.8940804090874462	3.421665590117656e-05	0.8981150654012304	4.980986774222252e-05	0.8863529339665089	6.354116175005146e-07	0.8626471654357152	9.399231150973856e-07	0.8666498187844275	9.23757051895188e-05	0.8877537293277836	0.0001451618224406	0.891128616301172	NOSTRIN	148419	CERS6	181871	G6PC2	263171	False	False	False	alt	-80	0.03308	15	0.0004158
2258	chr2	172047370	G	A	rs1008151	-0.0836711815999999	0.162470665592876	0.0836711815999999	0.1600884526958574	0.0196853121439244	0.4973602540135832	-0.0016352592994732	0.2376460246734358	0.0016352592994732	0.2345315934901757	0.556991686186533	0.0331223420830334	-0.0470578517241857	0.0368139842470866	0.0470578517241857	0.0360158137493583	0.0111698851951346	0.0639517799931736	-0.0009248854878492	0.0638764372351151	0.0009248854878492	0.0626649054568796	-0.0240622216357098	0.0859659138183302	0.0240622216357098	0.084314098913086	DLX1	37371	METAP1D	47426	SLC25A12	47511	True	False	False	ref	-5	0.0002441	-65	0.1826
2259	chr2	172107630	G	T	rs1001780	0.0155581199	0.670081421857659	0.0155581199	0.6766934308613846	0.0158341115937651	0.6259050292479369	0.0002446508391999	0.6842513795095028	0.0002446508391999	0.69077587529946	0.3438710369172907	0.0908179385337406	0.0055181463649658	0.2264090827530273	0.0055181463649658	0.2302683913313768	0.0056916200188857	0.1481059656287692	8.960853653175598e-05	0.2730837087554611	8.960853653175598e-05	0.2774067339338278	0.0053190260961366	0.3231373486995819	0.0053190260961366	0.3278961301128575	DLX2	4730	DLX1	22889	METAP1D	107686	False	False	False	alt	100	0.772	25	0.03076
2260	chr2	172110061	C	T	rs62184960	-0.2850993	0.0095788886839404	0.2850993	0.0095470165848271	0.0375049801600231	0.1299832760742052	-0.0109152685295518	0.0181231903471927	0.0109152685295518	0.018053178260047	0.4506284847085217	0.0554635982331839	-0.129783995032216	0.0053962584465473	0.129783995032216	0.0053403460415776	0.0168572587999364	0.0328580225946142	-0.0049453230985271	0.00852083766618	0.0049453230985271	0.0084922360704708	-0.0938900069281778	0.0046865012985784	0.0938900069281778	0.0046791239896057	DLX2	7161	DLX1	25320	METAP1D	110117	False	True	True	ref	95	0.07495	45	0.1323
2261	chr2	184751506	A	G	rs145078188	0.0042983754	0.5868949976614569	0.019888423	0.5887608154441908	0.0210872478251238	0.4427562055100102	0.0001343163482373	0.5575375396904666	0.0004179120052867	0.5591581134633884	0.0208802085051631	0.6741774368310702	-8.511714573937558e-05	0.7042649936069868	0.0002628760149147	0.7057363408416776	0.0004297673108404	0.6619591847043983	-1.4196036263424952e-06	0.6868511904647993	5.432637342170931e-06	0.688382666573313	-7.752960971265165e-05	0.6937426516015468	0.000819834383557	0.695232721618797	ZNF804A	152976	FSIP2	987299	NUP35	1633992	False	False	False	alt	-15	0.002998	100	0.1794
2262	chr2	184787402	A	G	rs11675794	0.0413456734	0.342955002722367	0.0413456734	0.3477058495868955	0.0302067022035117	0.2208707311145999	0.0012400402130873	0.2630528836158284	0.0012400402130873	0.2666207635391839	0.1565784698624261	0.2238458257301636	0.0070500416449929	0.2014587750619145	0.0070500416449929	0.2049833739903565	0.0045247832985515	0.1793299089464374	0.0002040905784537	0.1774053365068049	0.0002040905784537	0.1804880015123269	0.0111444690046517	0.186232261774085	0.0111444690046517	0.1896041933427399	ZNF804A	188872	FSIP2	951403	NUP35	1669888	False	False	False	alt	100	0.095	100	0.767
2263	chr2	184937190	A	G	rs728534	-0.00600097054	0.754115905115152	0.01131118002	0.7521196918342836	0.0131703433712922	0.7748430230342529	-8.322005835176856e-05	0.7938389207474986	0.0001542685362623	0.7919593836596583	0.0032578931740951	0.8749672078002723	-2.02665536833632e-05	0.900459625448182	3.16679722681936e-05	0.8987145104837924	4.113116972141268e-05	0.9057982694816784	-2.758775567776259e-07	0.9142435537101996	4.286642141872126e-07	0.9124264924376196	-8.82517897792718e-05	0.8946316443761633	0.0001294909438817	0.8928856154178815	ZNF804A	338660	FSIP2	801615	ZC3H15	1549064	False	False	False	ref	15	0.006683	85	0.03827
2264	chr2	192886081	C	T	rs1445542	-0.000372413522	0.9678172955055816	0.001446511282	0.964639041907686	0.0233280802250074	0.3738801581127541	-1.0577226736920044e-05	0.942231941007464	3.709476479208697e-05	0.9391272537869476	0.0648007324073768	0.388023023704812	-4.89800581670999e-05	0.830866386995799	8.327315697863487e-05	0.8269773735845559	0.0014728507157259	0.3693625025449584	-1.3118537217001335e-06	0.7975679054725572	2.158488522692769e-06	0.7938674470290779	-0.00010062353601	0.8467312850885415	0.0002457853584506	0.8428653982449281	TMEFF2	691148	CAVIN2	1038993	NABP1	1208012	False	False	False	ref	-100	0.01747	-85	0.04944
2265	chr2	192982358	T	G	rs11680198	-0.0109868788599999	0.7324047489354243	0.0122777803399999	0.727758173155936	0.0141588312479242	0.7115991927074817	-0.000150930528776	0.7666979110052309	0.0001702371794753	0.7620591283568137	0.0018293688759855	0.9328260684234614	-2.8816320926365435e-05	0.9169114263203904	3.0115271632820063e-05	0.9125787227135675	2.382666135830008e-05	0.9458150396419862	-3.579591073259611e-07	0.9264440536990668	3.77386141944725e-07	0.9220629692645408	-0.0001072218006664	0.91264390884276	0.0001121704991586	0.9082777389326716	TMEFF2	787425	CAVIN2	1135270	NABP1	1304289	False	False	False	ref	60	0.00454	25	0.014496
2266	chr2	192986694	G	A	rs968109	0.03184	0.4361969181000777	0.03184	0.4418749562799467	0.0144958213499231	0.7120663317072843	0.0004757919181065	0.5169512756133399	0.0004757919181065	0.5231475962090485	0.0299536471907887	0.5502753798444687	0.0008973042047416	0.4936992297459157	0.0008973042047416	0.4994254068711639	0.0004112166363574	0.6049767618559463	1.260176460821202e-05	0.535502909373514	1.260176460821202e-05	0.5413312098187735	0.0026483784764606	0.4633525410438486	0.0026483784764606	0.4690138872039542	TMEFF2	791761	CAVIN2	1139606	NABP1	1308625	False	False	False	alt	20	0.001718	-100	0.2234
2267	chr2	193005369	G	A	rs4471907	-0.014163592	0.4527906942379903	0.0306921112	0.4510364862986794	0.0357692465170846	0.1464831434894517	-0.0005280851457573	0.3031364900526518	0.0011118791207565	0.3018886119234272	0.0018689584639239	0.936885592121713	-3.374816019560582e-05	0.864412772451099	5.44138478383582e-05	0.8624071131156829	6.77931368892983e-05	0.8740301371813075	-1.1576004324923644e-06	0.7948534041856359	1.9691684744345274e-06	0.7928984641276714	-0.0001294909438817	0.854955492951077	0.0002086701197584	0.8529839865858125	TMEFF2	810436	CAVIN2	1158281	NABP1	1327300	False	False	False	ref	100	0.066	5	0.003326
2268	chr2	193015267	G	A	rs10175759	-0.0098658643799999	0.6884422860995609	0.01543981042	0.6881709626840545	0.0214487012430067	0.4342160144422211	-0.0002587928523558	0.6601303284793881	0.000370330913184	0.6602269327676804	0.0012569694170432	0.9556018158570192	-3.2524115532941736e-05	0.9206160443009904	3.676061454962063e-05	0.9215107810435548	2.8404468357833068e-05	0.9385337867173998	-8.306434371286135e-07	0.9049289302764496	9.127723087236076e-07	0.9056779027739058	-0.0001220678961433	0.9135300570349904	0.0001385635577843	0.914365137480701	TMEFF2	820334	CAVIN2	1168179	NABP1	1337198	False	False	False	ref	5	0.0006943	-100	0.0371
2269	chr2	193017382	G	A	rs6712343	-0.03161931826	0.4559229193328007	0.03161931826	0.4504777114503628	0.0194772046824248	0.4982868473320329	-0.0006626111204486	0.4638057110886294	0.0006626111204486	0.4584878149490525	0.0149112533403714	0.6579559355620518	-0.0005281734194913	0.612351572822302	0.0005281734194913	0.6062964341482526	0.0002988306663506	0.6516229497633087	-1.132291596618991e-05	0.6017632731340213	1.132291596618991e-05	0.5956774594336539	-0.0017106001121704	0.5817291114770918	0.0017106001121704	0.575662226228966	TMEFF2	822449	CAVIN2	1170294	NABP1	1339313	False	False	False	ref	-45	0.04626	-45	0.1324
2270	chr2	193030136	A	G	rs6714301	0.01389648684	0.7079906158937622	0.01389648684	0.714614679593495	0.0113152854834501	0.8428355070876674	0.0001900951374965	0.7699269495379577	0.0001900951374965	0.7765333891834376	0.007060967965425	0.8037449522422508	0.0001853263614852	0.8157637069399692	0.0001853263614852	0.8221779313829175	9.003250020321279e-05	0.8540528406806631	2.754241290182464e-06	0.8406835881446565	2.754241290182464e-06	0.8472355609674808	0.0005641516281217	0.8048343307730191	0.0005641516281217	0.8106183337064661	TMEFF2	835203	CAVIN2	1183048	NABP1	1352067	False	False	False	alt	55	0.01709	100	0.1678
2271	chr2	193031520	T	C	rs7557329	0.0019448609999999	0.8808996755322971	0.0052517705999999	0.8827018220332788	0.0194816735355364	0.5008106388235716	4.372193073419491e-05	0.8545467508422641	0.0001024741437028	0.8561310332587773	0.0047820923097224	0.8288418617694471	2.9666283679279583e-06	0.9171029811836662	2.3660588667770624e-05	0.9185863931846036	9.151796527338154e-05	0.8193441535237903	8.83128620858506e-08	0.906420735996094	4.50298658062713e-07	0.9078784909454234	4.123915410237798e-06	0.9154366072291724	9.320048827156508e-05	0.9169862156952522	TMEFF2	836587	CAVIN2	1184432	NABP1	1353451	False	False	False	alt	-100	0.0352	25	0.0333
2272	chr2	193105038	G	T	rs1902746	0.0217729536	0.5667363460957999	0.0217729536	0.5727717635099967	0.0273453003251932	0.2752754062560363	0.000586615863385	0.4605670351378059	0.000586615863385	0.4662843107858724	0.0116121210121737	0.7061343373708551	0.0002659803340925	0.6756307790317252	0.0002659803340925	0.6819606237000226	0.0003105938818524	0.6463753232660557	7.025535818609012e-06	0.6250555058882223	7.025535818609012e-06	0.631226531587805	0.0009212827026491	0.6567946696676399	0.0009212827026491	0.6631387605855357	TMEFF2	910105	CAVIN2	1257950	NABP1	1426969	False	False	False	alt	-100	0.002213	-80	0.05847
2273	chr2	193108463	A	G	rs1037708	-0.00196346446	0.795508044891566	0.00971945554	0.7939975491281192	0.0173311814404849	0.585351066711901	-6.10565875688878e-05	0.7798178180360125	0.0001724763824307	0.7779534446414048	0.0025799214806505	0.8962578626402353	-1.4055865792679303e-05	0.9187500087006382	2.472591764148786e-05	0.9170512616999278	4.53004611085909e-05	0.8929318798721396	-3.10852133593591e-07	0.9122015140177814	4.622609165735031e-07	0.9103861009809092	-7.258091122033042e-05	0.9084268320985468	0.0001105209329946	0.9066958610411492	TMEFF2	913530	CAVIN2	1261375	NABP1	1430394	False	False	False	ref	-25	0.002823	-95	0.01514
2274	chr2	193124314	C	A	rs12617537	0.0100118352999999	0.7614695837494752	0.0100118352999999	0.7683963956716167	0.0176305719386939	0.576413329357722	0.0001805773494847	0.7413812595694422	0.0001805773494847	0.7481027974334313	0.0025593019035993	0.8966899214376467	2.962751667772056e-05	0.8884585290675694	2.962751667772056e-05	0.8955482202916445	4.467045825400137e-05	0.8940021878753425	5.275052385450893e-07	0.8834281802212836	5.275052385450893e-07	0.890499899683048	0.000135264425456	0.8807857207332805	0.000135264425456	0.8869306981699688	TMEFF2	929381	CAVIN2	1277226	NABP1	1446245	False	False	False	alt	100	0.00403	50	0.034
2275	chr2	197126458	G	A	rs62279220	-0.065505361	0.1935872879190119	0.0721619006	0.1914711898562043	0.0198051085881983	0.4864390868951759	-0.0011434091965459	0.2703325538667839	0.0012840897508629	0.2675635156339765	0.0146580449341822	0.6934772086804294	-0.0007265243109509	0.543355333220615	0.0007923518223226	0.5392714320067494	0.0003339854257051	0.6747549742437624	-1.6152070804581247e-05	0.5356957915687375	1.754328178925779e-05	0.5313055463557778	-0.0022549569463231	0.5076910824834773	0.00247105011382	0.5032954811697192	ANKRD44	184715	PGAP1	198662	SF3B1	308621	False	False	False	ref	100	0.03687	-90	0.1368
2276	chr2	197135526	C	A	rs10191006	-0.1099686565999999	0.0960999100758264	0.1099686565999999	0.0948232774678521	0.0426075048725867	0.0935230725495295	-0.0051442614468019	0.066512334223782	0.0051442614468019	0.0659714265535508	0.0565578502853749	0.4267036417465073	-0.0076161376163284	0.2153669056303367	0.0076161376163284	0.211853629246442	0.0026380091759885	0.2847819522637694	-0.0003785750375304	0.1488165210228198	0.0003785750375304	0.1466476381440705	-0.0160420309458612	0.1424175479242573	0.0160420309458612	0.1402142185237446	ANKRD44	175647	PGAP1	207730	SF3B1	299553	False	False	False	ref	100	0.02661	100	0.0231
2277	chr2	197140324	T	C	rs2697260	0.0229193556999999	0.5638746728682027	0.0229193556999999	0.5701498761975422	0.0256298162873653	0.3149990637903953	0.0006276725208323	0.4698271973456428	0.0006276725208323	0.4754429762328248	0.0012718155125201	0.9519219596388456	2.1945750408953296e-05	0.9150436399321524	2.1945750408953296e-05	0.922030302906999	2.908493301811825e-05	0.9307938702883908	5.920374565979518e-07	0.8846955379715427	5.920374565979518e-07	0.8916166351915957	9.402527135361332e-05	0.9040023567023752	9.402527135361332e-05	0.9109883799529528	ANKRD44	170849	PGAP1	212528	SF3B1	294755	False	False	False	alt	100	0.01936	-45	0.0717
2278	chr2	197166561	C	A	rs7595352	-0.00729104872	0.7699190686723263	0.0101882050399999	0.7677115784536779	0.0118534861504565	0.8331351909319928	-8.832422248407866e-05	0.8251525981628559	0.0001242838661511	0.823165402444064	0.0267930784203754	0.5588574533194073	-0.0002038241441253	0.7003510105761013	0.0002664999358112	0.6985104413269775	0.0003164170901286	0.6433289821707185	-2.5598445582625e-06	0.7476132490380271	3.335322408523924e-06	0.7458074706480357	-0.0006161129622909	0.7012578377525885	0.0008289069974596	0.6992604102579381	ANKRD44	144612	PGAP1	238765	SF3B1	268518	False	False	False	ref	100	0.01135	-65	0.2024
2279	chr2	197368952	T	G	rs788007	0.00336972662	0.6663096997954441	0.01595047082	0.6676953019224922	0.016245210122768	0.6310410577780753	9.784981239707673e-05	0.6780745158142604	0.0002727108926909	0.6796095527076609	0.0278158094421166	0.5550309852442035	0.0002641540670327	0.6391460614779634	0.00047631939321	0.6406080772256998	0.0004798915583252	0.5825970718784443	5.620376943784231e-06	0.6521006422007822	8.766245152866363e-06	0.6536342786425153	0.0005666259773679	0.6348166653547984	0.0013485203391507	0.6363780584254584	ANKRD44	57779	SF3B1	66127	COQ10B	84542	False	False	False	alt	-50	0.01657	100	0.0956
2280	chr2	197381241	C	T	rs55775495	-0.0154859752599999	0.4487140051646662	0.03468219074	0.4486747916416961	0.0312522187845072	0.2045930265053702	-0.0003843575472122	0.3722668615219781	0.0009974732708279	0.3728358209691683	0.0044307347167694	0.8543508443817228	4.397022364305809e-06	0.798558071677283	0.0001041419629079	0.7997817664945547	0.0001510287903379	0.7811474213598505	4.101043599338617e-07	0.7353531784571065	3.158381419349848e-06	0.736497007062811	1.9794793969158703e-05	0.7989901003441657	0.0003497080267889	0.8002955477367732	SF3B1	53838	ANKRD44	70068	COQ10B	72253	False	False	False	ref	100	0.0168	50	0.0547
2281	chr2	197418581	T	C	rs788023	-0.0152201112	0.593419584292001	0.0192894144	0.5906319087638519	0.0226612603140285	0.3941289127380965	-0.0003498453140078	0.5497442612838568	0.0004420267584776	0.5471077336637806	0.0050006598264655	0.821025197868769	-5.919843323049191e-05	0.8062719018777605	8.815651969486532e-05	0.8041141536459214	0.0001129484321889	0.7912780056657953	-1.357316094892607e-06	0.7793765184365861	2.0107916586997914e-06	0.7772108043382894	-0.0002705288509122	0.7864749105430866	0.0003876480485631	0.7843504188381518	SF3B1	16498	COQ10B	34913	HSPE1	81560	False	False	False	ref	-10	0.001617	-45	0.01349
2282	chr2	197500319	C	G	rs1116734	0.0335198994	0.351495809103198	0.0402925038	0.3548831363049734	0.0703616846950415	0.0173140055423168	0.0024606683127777	0.1167662535923813	0.0028722598184249	0.1175506571523012	0.985478869057438	5.532641936248436e-06	0.0329333198111366	0.0377258646966836	0.039649003772362	0.03805554635993	0.069332356991753	0.0007202559087628	0.0024181388535302	0.0169520915312669	0.0028262711220666	0.016988715375093	0.0007216851967932	0.6762220657160957	0.0008239582989673	0.6804303030421387	HSPE1-MOB4	95	HSPE1	178	MOB4	15253	True	True	False	alt	-25	0.01807	-100	0.3662
2283	chr2	197545160	A	G	rs11680291	0.090675844	0.1196491280414643	0.090675844	0.1214282630873535	0.0190501447370009	0.515730674560797	0.0017553180141181	0.1916282716787613	0.0017553180141181	0.1942987229192739	0.0076861535416185	0.7664867181840062	0.0006704140135291	0.5267200918067019	0.0006704140135291	0.5323035422517512	0.0001401404771603	0.7655615927888703	1.2494744946162812e-05	0.5304557510920422	1.2494744946162812e-05	0.5362528150412411	0.0022788756557024	0.4844375971234357	0.0022788756557024	0.4900823880983068	HSPD1	28423	MOB4	29588	HSPE1-MOB4	44746	False	False	False	alt	-100	0.00821	0	0.0
2284	chr2	197613596	G	A	rs1455653	0.0860653383399999	0.1183419102033504	0.11071229034	0.1191709231339083	0.0389422025697948	0.1199088014433798	0.0028715325363242	0.1073307071214294	0.0041579681883039	0.1080504711436789	0.1268854541255649	0.268605341028446	0.0087104147637483	0.145919518526504	0.0158207768239993	0.147559237326971	0.0055062764633696	0.1672146406178999	0.0002671598627567	0.1163167535350283	0.0006382817575895	0.1176521234450746	0.0166523704265777	0.1007060870504322	0.0244069809640064	0.1019144997036579	RFTN2	62449	MARS2	91774	HSPD1	96859	False	False	False	alt	45	0.02454	100	0.2075
2285	chr2	197624529	C	T	rs34139878	-0.0859124028	0.1446756698962383	0.0859124028	0.1427051026438807	0.0273076701367992	0.2722665409133167	-0.0025931348956551	0.1504071249888691	0.0025931348956551	0.1484584898926359	0.0004288872026656	0.9887228775979454	-4.979410540257906e-05	0.8833326400810009	4.979410540257906e-05	0.876394227455892	1.2876110167196648e-05	0.9722372661379188	-1.6171805891715288e-06	0.8385868844435335	1.6171805891715288e-06	0.8317079301156005	-0.0001633070502457	0.8945184277972393	0.0001633070502457	0.8875012646784958	RFTN2	51516	MARS2	80841	HSPD1	107792	False	False	False	ref	-30	0.00586	45	0.128
2286	chr2	199144171	A	G	rs1376584	0.1016764752	0.1130526063252173	0.1016764752	0.1143116431254585	0.025416871634757	0.3168480333622427	0.0027442034419827	0.1392617578806174	0.0027442034419827	0.1407556891131419	0.2695498333938174	0.126939397106414	0.0306722423357553	0.0633855578908808	0.0306722423357553	0.06445872553867	0.0068154606923377	0.119593433234071	0.000826931312274	0.074930954812757	0.000826931312274	0.0761102674517007	0.0338400250734056	0.0520129150378204	0.0338400250734056	0.0526567763539998	SATB2	327095	FTCDNL1	707021	C2ORF69	767123	False	False	False	alt	100	0.1367	100	0.2874
2287	chr2	199146723	G	T	rs6733580	0.00811290068	0.6618761181838534	0.01558040692	0.6643049247379607	0.0189477414616196	0.5199896270042513	0.0001640363641152	0.646576111654776	0.0002952298710623	0.6488589787219788	0.325568275543532	0.0981608312242102	0.0024378747442734	0.24999970024602	0.0052564013937556	0.2516887141670701	0.0061935916507886	0.1313173055160026	4.977449038166499e-05	0.2724668878209469	9.942588098016765e-05	0.2741172913319648	0.0031325261456236	0.3388799731209814	0.0055062518557618	0.3407858085945953	SATB2	324543	FTCDNL1	704469	C2ORF69	764571	False	False	False	alt	40	0.03558	100	0.0712
2288	chr2	199149294	G	T	rs2345458	-0.028944296	0.424833543235054	0.0339120003999999	0.4211220801248197	0.0138384969875799	0.7191609400988004	-0.0005521785906451	0.5134541489187003	0.0005904939432076	0.5098737066401189	0.0013476955560686	0.9530254882171436	-4.524190506026666e-05	0.8748966842078583	5.3969108389614495e-05	0.8704381783564685	2.0855866492441206e-05	0.9597049047955184	-1.0093191015605242e-06	0.8817043175421198	1.076631051807968e-06	0.8772441966648837	-0.0001649566164098	0.8722099230075754	0.0001946488073636	0.8677017692529414	SATB2	321972	FTCDNL1	701898	C2ORF69	762000	False	False	False	ref	-100	0.04858	80	0.10016
2289	chr2	199150705	G	T	rs921465	0.0141047671999999	0.0971080182199745	0.1091144152	0.0972338333516926	0.0317553729351497	0.1991472319784109	0.0005878406980787	0.0966109358252594	0.0037892111089117	0.0965597026932121	0.0175497344198475	0.6630173623357781	-0.0002246021661533	0.4181484094962134	0.0017594053459369	0.4189059476339222	0.000589398752158	0.5760522842619253	-3.974764663754496e-06	0.3524313207883878	6.273197653741475e-05	0.3530288190205712	-0.0004585793936194	0.3614683445733105	0.0048827158457325	0.3619625567766777	SATB2	320561	FTCDNL1	700487	C2ORF69	760589	False	False	False	alt	45	0.00864	-30	0.0919
2290	chr2	199150838	C	A	rs1868915	-0.10571461	0.10231279852406	0.10571461	0.1008655824972817	0.0212835081391589	0.4371428509685791	-0.002177476593788	0.1644886268222781	0.002177476593788	0.1623215830937092	0.0228341196265381	0.6195202535759736	-0.002497757666105	0.3872766176597961	0.002497757666105	0.3824250994821116	0.0004842735517014	0.6022816303235099	-5.139077084987352e-05	0.3874122105925345	5.139077084987352e-05	0.3824740190724594	-0.006510837649698	0.3204694807932835	0.006510837649698	0.3160840273120028	SATB2	320428	FTCDNL1	700354	C2ORF69	760456	False	False	False	ref	100	0.01483	-85	0.1531
2291	chr2	199154272	G	A	rs1376593	-0.0739453753999999	0.1758267864683847	0.0739453753999999	0.1732317654627368	0.0148779167891943	0.695520662804734	-0.0011623950627959	0.3023187955205814	0.0011623950627959	0.2984235783007972	0.0203342021048463	0.6321007259079068	-0.0015507406594413	0.4411637494348918	0.0015507406594413	0.4359969571477459	0.0002875245035051	0.6759275358138583	-2.2996317957226247e-05	0.4864660520921671	2.2996317957226247e-05	0.4808761066524588	-0.0044727986539539	0.3826323079284281	0.0044727986539539	0.3777035168705811	SATB2	316994	FTCDNL1	696920	C2ORF69	757022	False	False	False	ref	60	0.02441	35	0.0737
2292	chr2	199158357	A	C	rs6731445	0.036461543	0.4033098977915932	0.036461543	0.4082121012779119	0.0300941650442365	0.2233710377134086	0.0011434428012078	0.3136022828356329	0.0011434428012078	0.31759658921722	0.002137837748672	0.9242982857122336	8.406061438235401e-05	0.8257746133757846	8.406061438235401e-05	0.8324124126503383	6.578816200598458e-05	0.8709572727703139	2.695603292051819e-06	0.766622154066582	2.695603292051819e-06	0.7732590574288211	0.000319191052753	0.8164392498438114	0.000319191052753	0.8230507776105637	SATB2	312909	FTCDNL1	692835	C2ORF69	752937	False	False	False	alt	-100	0.04086	-40	0.04694
2293	chr2	199161140	A	T	rs6743084	-0.0452092388	0.317999557708282	0.0452092388	0.3137488373395355	0.0152902956992392	0.6687684554763998	-0.0007368875971922	0.4088073085539068	0.0007368875971922	0.4036217988458266	0.098465078684306	0.3055039154265335	-0.004295817701795	0.2616950734047731	0.004295817701795	0.257498427122881	0.0014941053451337	0.3654061452102797	-6.9584350215035e-05	0.3087033000420337	6.9584350215035e-05	0.3041631694454049	-0.0091254000197947	0.2258379064032738	0.0091254000197947	0.2220189687650229	SATB2	310126	FTCDNL1	690052	C2ORF69	750154	False	False	False	ref	-90	0.0725	100	0.1484
2294	chr2	199163975	T	C	rs60642146	0.0926587748	0.1214873686425827	0.0926587748	0.1233871482335934	0.0388233228868492	0.1184130261850135	0.0036433555863087	0.0885563824434862	0.0036433555863087	0.08964350954599	0.1127486720992378	0.2903403615118961	0.0090678154310928	0.1573240702680031	0.0090678154310928	0.1605022233111567	0.0042632223368808	0.1915882071331012	0.0003483204944295	0.1167805622525175	0.0003483204944295	0.1189443059188013	0.0176478836066114	0.1098903277290581	0.0176478836066114	0.1120311803952169	SATB2	307291	FTCDNL1	687217	C2ORF69	747319	False	False	False	alt	-65	0.02466	-80	0.2786
2295	chr2	199163981	G	A	rs896350	-0.0813615248	0.1553159985941461	0.0813615248	0.1534401990411423	0.0440390271589397	0.0828145907274955	-0.00385346806124	0.0973653487156246	0.00385346806124	0.096307358212479	0.0946323117020223	0.3288520382819539	-0.0096805642332135	0.1935696383233147	0.0096805642332135	0.1904525869838581	0.0044029182086821	0.1959757463726354	-0.0004704599650301	0.1329724198900995	0.0004704599650301	0.1308266420667169	-0.0180742964600309	0.1334308258884497	0.0180742964600309	0.1316338390775805	SATB2	307285	FTCDNL1	687211	C2ORF69	747313	False	False	False	ref	-70	0.03088	-90	0.2974
2296	chr2	199167672	C	T	rs2122844	-0.114939312	0.0835767048497884	0.114939312	0.0824041053759339	0.0342023303844492	0.1653169374799635	-0.0039813477046426	0.0792040797350516	0.0039813477046426	0.0782630912697871	0.0977079278149846	0.3106508461307447	-0.0113308950068719	0.1429290333954978	0.0113308950068719	0.140359219985447	0.0034918282649614	0.2238624041988418	-0.0004082751110404	0.1153423469025896	0.0004082751110404	0.1133526735730043	-0.0218410807957507	0.0876422154235683	0.0218410807957507	0.0859974578743519	SATB2	303594	FTCDNL1	683520	C2ORF69	743622	False	False	False	ref	-100	0.0638	-85	0.11255
2297	chr2	199923081	A	G	rs281760	0.0237903746	0.3976626979050098	0.0362645354	0.4010357898120038	0.0178927914660923	0.561520989697665	0.0005045733401115	0.4367508878081453	0.0006799520582482	0.4401200697383599	0.0723227541156675	0.3832157148042326	0.0002599716392783	0.3628790670959372	0.0023318136266495	0.3657637083228563	0.0011305956965546	0.4254059289039058	8.231720963459431e-06	0.3909971234089532	3.736049382215489e-05	0.394214398240373	0.0017526640493549	0.3400224310188762	0.0050435485467321	0.342879510636845	C2ORF69	11787	MAIP1	32237	TYW5	32655	False	False	False	alt	-90	0.0282	-90	0.2803
2298	chr2	199949997	A	T	rs176008	0.00401872374	0.7772052073223401	0.00993959906	0.7786045944019979	0.0257620096307853	0.323195071455153	0.0002284356291663	0.6673481070604101	0.0003208167442513	0.6688620255769154	0.0032842862327207	0.8772104272560571	1.6945707927752065e-05	0.8975570220600095	3.1789890203649175e-05	0.8989496470812787	9.017737744807751e-05	0.8396310318421475	8.528407970374639e-07	0.8631097072426098	1.1183229327391107e-06	0.8645451041540722	8.577744053311514e-05	0.8864495861051197	0.0001369139916201	0.88796483035952	MAIP1	5321	TYW5	5739	C2ORF69	38703	False	False	False	alt	-90	0.01535	95	0.0372
2299	chr2	199955782	T	G	rs281766	0.020141319	0.3921030322241838	0.0366043469999999	0.3955933086756755	0.0243697313395479	0.3464206992883186	0.0004130432173363	0.3481534590622586	0.0009005549331555	0.3512409875025794	0.7691300188050543	0.0092395795442317	0.0157913858132528	0.0561416484691415	0.0287579687844273	0.0569727579868475	0.0188464752478066	0.0261429608598088	0.0003252414493123	0.0694157267864678	0.0007092146256381	0.0703221274429063	0.0028257068391013	0.3052559498157611	0.0056992510969614	0.3083020519059547	TYW5	46	MAIP1	464	C2ORF69	44488	True	False	False	alt	-100	0.1583	-100	0.249
2300	chr2	199965270	G	A	rs10178177	-0.0017363663039999	0.8319071168713441	0.007669400064	0.8309569507178718	0.013176943631701	0.7756604493029032	-2.6356196652579982e-05	0.8600908532779364	0.000102563022632	0.8594788687526247	0.0007967404572596	0.9746393378692212	1.0096947689628437e-06	0.9730191696812625	6.160697445598492e-06	0.9739436653648512	1.07410564888611e-05	0.9793355307432654	1.0232899842872746e-08	0.9762838547959812	8.192166820172134e-08	0.9771822135112348	-1.649566164098836e-06	0.9767526923948168	1.9794793969186096e-05	0.976979264420276	TYW5	9534	MAIP1	9952	C2ORF69	53976	False	False	False	ref	-100	0.01596	-60	0.05627
2301	chr2	199983267	G	A	rs281793	-0.0947390504	0.127853059415887	0.0947390504	0.126001854523526	0.0186300906212731	0.5346495985442675	-0.0017418062909154	0.2094715453065713	0.0017418062909154	0.2064744550267413	0.0821211771304146	0.3513941457574078	-0.0067090033779066	0.2041715347144116	0.0067090033779066	0.2006881745063717	0.0015165935091825	0.3731916816567325	-0.0001225070118974	0.2318054756191542	0.0001225070118974	0.2280449854385277	-0.0143223582197881	0.14714808110125	0.0143223582197881	0.1444864444864341	TYW5	27531	MAIP1	27949	C2ORF69	71973	False	False	False	ref	-75	0.0797	85	0.1202
2302	chr2	200017887	C	T	rs2202922	0.368102538	0.0051147781807983	0.368102538	0.0051245778591862	0.0443608557447708	0.0834336398750971	0.0174527279589469	0.0098429099172264	0.0174527279589469	0.0098925915083753	0.0612615882023027	0.4268538627132063	0.0228895423203516	0.0852154095711409	0.0228895423203516	0.0867315148192622	0.0025756635107262	0.2906502977895412	0.0010281454630683	0.0618802329249579	0.0010281454630683	0.0630015942508932	0.0379606413513245	0.0428038693717603	0.0379606413513245	0.0434739734325584	TYW5	62151	MAIP1	62569	C2ORF69	106593	False	True	True	alt	-100	0.09735	5	0.02295
2303	chr2	200019892	A	C	rs3106089	0.00262437128	0.7507706044254522	0.01082556512	0.7522015470374551	0.023638145258952	0.3683853321461424	8.387565842026e-05	0.6699774112761937	0.0002556288603319	0.6714286892733644	0.0085059879251756	0.7537392693451541	3.323980006883071e-05	0.8002765546614666	8.707749546642569e-05	0.8016001716834926	0.000211198462565	0.7154509442712712	1.0301375509250944e-06	0.7661956607533702	2.157974891155229e-06	0.7675868216274361	0.0001410379070304	0.7841349954771301	0.0003604302068555	0.7854765201340307	TYW5	64156	MAIP1	64574	C2ORF69	108598	False	False	False	alt	-5	0.001221	20	0.03815
2304	chr2	200043420	G	A	rs1509830	0.01871957682	0.6031897773345565	0.02144719758	0.6051255445594151	0.0111646269247442	0.8667459668658186	0.0002186255307775	0.7185034144003098	0.0002468613053711	0.7205278958460312	0.0087946620038929	0.7794982331267339	0.000298287152	0.7678914227974755	0.0003151310557178	0.7692558463451608	9.892785257256085e-05	0.839474498434523	3.408445104981773e-06	0.8126383480846393	3.589086083399425e-06	0.8139296133199763	0.0008396291775262	0.7490919911344717	0.0009072613902543	0.7505500255751089	TYW5	87684	MAIP1	88102	C2ORF69	132126	False	False	False	alt	-100	0.05823	-95	0.02637
2305	chr2	200046051	C	A	rs2079196	-0.1018199135999999	0.1096135282547621	0.1018199135999999	0.1081558238871408	0.0702343851133831	0.0173364009872799	-0.0072416347106767	0.0369960216595069	0.0072416347106767	0.0367444298279239	0.0528735442578601	0.4573669731542543	-0.0051751906566638	0.2691780320171638	0.0051751906566638	0.2651965961945106	0.0037969352708637	0.2285363896905963	-0.0003769349949291	0.1420473712284083	0.0003769349949291	0.1395780200863225	-0.01074939790835	0.2088811754569816	0.01074939790835	0.2054345771474183	TYW5	90315	MAIP1	90733	C2ORF69	134757	False	True	False	ref	55	0.02646	80	0.3594
2306	chr2	200048521	A	C	rs3115414	0.1134705359999999	0.0815204920364489	0.1134705359999999	0.0826577694159966	0.0322224035140645	0.1900842215398341	0.0036454120107204	0.0832742507243133	0.0036454120107204	0.0843590140499154	0.1162416284517171	0.2768629976351086	0.0131879423860535	0.1211967160365631	0.0131879423860535	0.1237088439822116	0.0036006683896966	0.2135143575856793	0.0004048132934134	0.1053887479208146	0.0004048132934134	0.1074042972646194	0.0241537725578172	0.0730910151484642	0.0241537725578172	0.0745417199264884	TYW5	92785	MAIP1	93203	C2ORF69	137227	False	False	False	alt	100	0.03038	100	0.2969
2307	chr2	200064808	C	T	rs76568708	-0.2064174583999999	0.0280645647189756	0.2064174583999999	0.0277826601850857	0.0499814997914084	0.0573045886647714	-0.0112064838885073	0.0238077699142987	0.0112064838885073	0.0236342854540763	0.0592177757249842	0.4157997204275386	-0.0137129867299154	0.143164738742499	0.0137129867299154	0.1408038701655515	0.0030117732687226	0.2547092284664597	-0.0007553281505526	0.0887927123464244	0.0007553281505526	0.0872794127883264	-0.0258849922470389	0.0800147954911274	0.0258849922470389	0.0787137176426865	TYW5	109072	MAIP1	109490	C2ORF69	153514	False	False	False	ref	-100	0.02783	-95	0.0647
2308	chr2	200104182	G	A	rs10931887	-0.0172419682	0.4068297876113787	0.0348164286	0.4047856974438478	0.011398981303925	0.8505283624792318	-0.0001925249580953	0.5679059042867814	0.0003935546209788	0.5657636686084019	0.1294208373197848	0.2629417818773968	-0.0026723408316376	0.2612992622076747	0.0048954854850215	0.2601393520963496	0.0014426856655092	0.382178990501793	-2.8629367285841924e-05	0.3541539367938116	5.387244836217672e-05	0.3529753932411273	-0.0042369106924878	0.2455441232914342	0.0083608261027349	0.2442927306407331	TYW5	148446	MAIP1	148864	C2ORF69	192888	False	False	False	ref	-45	0.006607	-55	0.0842
2309	chr2	200114365	G	A	rs112403441	-0.1365772932	0.0630921618369905	0.1365772932	0.0623540272697934	0.035440936095309	0.1530721741324074	-0.0052905656532156	0.0632032601336343	0.0052905656532156	0.0625502533908874	0.0003472336775427	0.9934068081817352	-4.444214048081039e-05	0.8927113340833769	4.444214048081039e-05	0.8857254693652854	1.1347612216257448e-05	0.9805533554919672	-1.5368020969129745e-06	0.8345214220328716	1.5368020969129745e-06	0.8277667405267456	-0.000134439642374	0.906481973140099	0.000134439642374	0.8994855889348766	TYW5	158629	MAIP1	159047	SPATS2L	191517	False	False	False	ref	30	0.000862	30	0.0337
2310	chr2	200141009	G	A	rs74266489	0.03112180448	0.4403494608905531	0.03112180448	0.4459024451063386	0.0133497835375718	0.769333721615582	0.0004349460592256	0.5459680208180775	0.0004349460592256	0.5518850065127411	0.0152857048596218	0.6750563264999568	0.0003828105219169	0.6257279860834708	0.0003828105219169	0.6319649824246868	0.0001966367534565	0.7296222469282474	5.10882189246088e-06	0.6672803345556143	5.10882189246088e-06	0.673545116655516	0.0013625416515456	0.5938548790121203	0.0013625416515456	0.600065531921764	SPATS2L	164873	TYW5	185273	MAIP1	185691	False	False	False	alt	50	0.1035	95	0.1738
2311	chr2	200144413	C	T	rs11684942	-0.0459400816	0.3255664808104803	0.0459400816	0.3211060925965978	0.0789315681410659	0.0111529004152093	-0.0036615328357227	0.0893431226154247	0.0036615328357227	0.0882024206118205	0.0424614826300682	0.4859035811000745	-0.0016440671909794	0.4038240428397556	0.0016440671909794	0.3987145046150945	0.00324811519387	0.2397935662313611	-0.0001273260487388	0.2254244974409614	0.0001273260487388	0.2217466236739514	-0.004423311669031	0.3647139402075002	0.004423311669031	0.3596356449114621	SPATS2L	161469	TYW5	188677	MAIP1	189095	False	True	False	ref	-75	0.07166	-100	0.127
2312	chr2	200154353	G	A	rs72932296	-0.1222805832	0.0761610294639457	0.1222805832	0.0752247753115851	0.0205962742373987	0.4481773780183968	-0.0027149699447384	0.1357964869372659	0.0027149699447384	0.1341003413828904	0.0851580284385206	0.3450057503715931	-0.009738909126888	0.1652896603192404	0.009738909126888	0.1623982774714045	0.0017766868479765	0.3522244999143894	-0.0002195893647647	0.1840824264350253	0.0002195893647647	0.1811154006765714	-0.0192471380027052	0.107213191579226	0.0192471380027052	0.1054287508091438	SPATS2L	151529	TYW5	198617	MAIP1	199035	False	False	False	ref	100	0.0912	95	0.0857
2313	chr2	200159789	T	C	rs1569178	-0.00461028248	0.4228652146435968	0.03639762248	0.4207551990677805	0.0407635642758293	0.1032128618441464	-0.000274966713746	0.2669431735667389	0.0015421388002814	0.2650435233222146	0.6303957309227674	0.0228350654107293	-0.0024121652554722	0.0851024769370714	0.0243356341464431	0.0842758012834792	0.0259155319181273	0.0131919720759446	-0.0001628173198021	0.0644818836692373	0.0010367755944233	0.0638694595338231	-0.0017246214245652	0.2594747817717962	0.0080935963841509	0.2575412023296816	SPATS2L	146093	TYW5	204053	MAIP1	204471	True	False	False	ref	100	0.1287	100	0.5347
2314	chr2	200176258	C	T	rs11679676	-0.0393278476	0.3842821707558224	0.0393278476	0.3794476207919423	0.0168249860222463	0.6067766364091715	-0.0006848899159854	0.4474579848078644	0.0006848899159854	0.4420354234141117	0.0065660981161953	0.8028409145189752	-0.000327700211081	0.7052315893898121	0.000327700211081	0.6987406097002458	0.0001092039390936	0.8151162047437006	-5.472497170333629e-06	0.715053405827379	5.472497170333629e-06	0.7087051378552776	-0.0011464484840486	0.677233158370516	0.0011464484840486	0.6708114869280423	SPATS2L	129624	TYW5	220522	MAIP1	220940	False	False	False	ref	35	0.07874	15	0.0199
2315	chr2	200184663	A	G	rs55906940	-0.00335176642	0.8196456996887818	0.0073914255	0.8173412857577214	0.0214081557272821	0.4227244638113956	-0.0001246798759575	0.7456676891936707	0.0001895830424186	0.7431850273693279	0.0471231566098115	0.4522323116475064	-0.0001116163192886	0.6661728953244339	0.0003550645064798	0.6639756288936771	0.0009982400933362	0.4454523293719727	-4.809769151223031e-06	0.6390015495136184	8.761366358730904e-06	0.6366393772126229	-0.000451156345881	0.6699866995735578	0.0010384019003001	0.667708186806935	SPATS2L	121219	TYW5	228927	MAIP1	229345	False	False	False	ref	90	0.04144	90	0.424
2316	chr2	200206248	C	T	rs149828043	0.0111809435	0.7104055843015549	0.0139347198999999	0.7141476688689835	0.0227790326653433	0.3897178614470932	0.0002529345343222	0.6480075356067908	0.0003086392432675	0.6519414859467606	0.0028776681732703	0.897977805822216	3.954245874063343e-05	0.8952985786142662	4.894550873169275e-05	0.8991954924099165	6.626604169587273e-05	0.8756525270349255	9.194004658441632e-07	0.8766434479173291	1.1096098741724031e-06	0.8803449775696525	0.0001146448484048	0.8975123841199466	0.0001542344363432	0.901465781184516	SPATS2L	99634	TYW5	250512	MAIP1	250930	False	False	False	alt	95	0.01929	-100	0.03418
2317	chr2	200252130	A	G	rs77089299	-0.01103042978	0.7652896031554848	0.01103042978	0.7586441747013994	0.0151816228507906	0.677465299985107	-0.0001662424678864	0.7756259253047691	0.0001662424678864	0.7688937720540426	0.0264054303718121	0.563172688616038	-0.0002506496127505	0.6785650108224935	0.0002506496127505	0.6722235718362234	0.0004095768316326	0.6056298168185127	-3.8743289463911845e-06	0.7004801482018802	3.8743289463911845e-06	0.6940583967754761	-0.0008000395895878	0.6796307080023244	0.0008000395895878	0.6732929255247336	SPATS2L	53752	SGO2	257879	KCTD18	267654	False	False	False	ref	40	0.01169	-45	0.0341
2318	chr2	200278008	G	A	rs66621598	0.24306163	0.0159437442423848	0.24306163	0.0160283426067623	0.0525966764807584	0.0488203129342854	0.0134329023776923	0.0145790971032414	0.0134329023776923	0.0146246270388324	0.0033477945300385	0.8882403428365989	0.0009765452023922	0.5184127433165306	0.0009765452023922	0.5238243600102702	0.0001903888544073	0.7503911368644344	5.674392775636054e-05	0.3735564051003995	5.674392775636054e-05	0.3783926647485384	0.0022269143215333	0.5211323888546346	0.0022269143215333	0.5267249246411162	SPATS2L	27874	SGO2	232001	KCTD18	241776	False	True	False	alt	30	0.005768	-80	0.0434
2319	chr2	200278601	T	C	rs4673871	-0.020985114	0.5571547662095659	0.0227187068	0.5525419663267769	0.0251007367283127	0.3275957652278266	-0.0005257527317163	0.4773621712774896	0.0005695883306345	0.4730550244158394	0.0084309326647091	0.7712100410957612	-0.0001440464089159	0.7490880007457447	0.0001676101381592	0.7450894591568146	0.0002143261865364	0.7245665463038912	-3.6731122759753167e-06	0.7062642636753383	4.26894437502474e-06	0.7022920580817725	-0.0005278611725116	0.7248870608947675	0.0006301342746857	0.72090445309272	SPATS2L	27281	SGO2	231408	KCTD18	241183	False	False	False	ref	90	0.03857	90	0.1466
2320	chr2	200278686	T	C	rs11688415	0.0294942372	0.4577833118710475	0.0294942372	0.4634705059272709	0.0181877242382367	0.5510146728236299	0.0005451660708521	0.4735651881537551	0.0005451660708521	0.4793023275194901	0.0154077727557651	0.6739293518305913	0.0004180303897399	0.6097546787405064	0.0004180303897399	0.6156373271954204	0.0002767023679238	0.6801479418338678	7.577712333985242e-06	0.6114492397348231	7.577712333985242e-06	0.6174424634622366	0.0014128534195506	0.5815250762950559	0.0014128534195506	0.5875378656813408	SPATS2L	27196	SGO2	231323	KCTD18	241098	False	False	False	alt	-95	0.00978	25	0.02832
2321	chr2	200279387	C	T	rs55826210	-0.4857170559999999	0.0021379246550612	0.4857170559999999	0.0021298203487326	0.0862703010031544	0.0079445101573611	-0.0425347239623838	0.0018872527798865	0.0425347239623838	0.0018687765535375	0.2269852528784929	0.1571115147212323	-0.118094393475393	0.0073300653379529	0.118094393475393	0.0073252572413013	0.019908476494019	0.0243940603402228	-0.0104419231381261	0.0034921165025713	0.0104419231381261	0.0035137800927888	-0.1324296460031011	0.002123394871379	0.1324296460031011	0.0021164211820667	SPATS2L	26495	SGO2	230622	KCTD18	240397	False	True	True	ref	-75	0.01709	-75	0.1992
2322	chr2	200285346	A	C	rs1436162	-0.0222151754	0.5666804809387087	0.0222151754	0.5604347048521259	0.0214271323449461	0.4328947018697183	-0.0004804943906544	0.5282484014075783	0.0004804943906544	0.5222137079702803	0.0260672693081719	0.5636577845486312	-0.0006218532974684	0.5735220985886638	0.0006218532974684	0.56773118145367	0.0005610186821971	0.5482922559884924	-1.3510559273996785e-05	0.5570707686309249	1.3510559273996785e-05	0.5511824106171159	-0.0017724588433241	0.5596795563149121	0.0017724588433241	0.5538808329350933	SPATS2L	20536	SGO2	224663	KCTD18	234438	False	False	False	ref	100	0.06824	100	0.06934
2323	chr2	200308897	A	G	rs3769481	-0.1341955818	0.0749566295323752	0.1430501742	0.0746031632670822	0.045172874576842	0.0853414387406007	-0.0087261995757068	0.0584938019147298	0.0089896805394566	0.0581504666478058	0.3279345782059318	0.0966996958778139	-0.0540812902197858	0.0387220560631408	0.0563314539585064	0.0385411751545481	0.0162735794558259	0.0406360833672315	-0.0036992084766371	0.0311758481586171	0.0037661652907812	0.0311249703914691	-0.0450661476031803	0.0345963496107048	0.047982580581307	0.0344503435485017	SPATS2L	3015	SGO2	201112	KCTD18	210887	False	False	False	ref	-100	0.203	-95	0.5034
2324	chr2	200311348	C	T	rs17592552	0.05192219464	0.2936682219010846	0.05309437976	0.2966618609006592	0.0282839018942055	0.2564090506111184	0.0016428590365414	0.2570009990715861	0.0016699353075092	0.2594669216775692	0.1475718386064464	0.2310526988335382	0.0076446065471049	0.2033706267173751	0.0077544058487293	0.2059258872977918	0.0040540268373198	0.1945246396114307	0.0002285441748335	0.1855229450939534	0.0002310804257769	0.1876447151926185	0.0126925868496585	0.177175967866784	0.0129334235096169	0.1794712590186914	SPATS2L	5466	SGO2	198661	KCTD18	208436	False	False	False	alt	95	0.006744	25	0.05835
2325	chr2	200317342	C	T	rs67067836	-0.0023076127	0.8409694660772868	0.0070326833	0.8391793782157203	0.0135648032116832	0.7524187591674196	-3.010320364435383e-05	0.8517621189208776	9.93267138858098e-05	0.8500030622174192	0.0190178483058955	0.6279446179582889	3.3357799642233294e-05	0.7674823254073622	0.0001328848486648	0.7661749594971579	0.0002673326575268	0.6830286432510437	6.003625070276391e-07	0.7921255323776171	1.936722413292095e-06	0.7907910809524686	3.216654019994001e-05	0.7803650838851945	0.000401669360958	0.7790430768069558	SPATS2L	11460	SGO2	192667	KCTD18	202442	False	False	False	ref	95	0.0058	-50	0.0816
2326	chr2	200322935	A	G	rs3769474	-0.0162301055799999	0.6787015201853193	0.0162301055799999	0.6721380928172057	0.0083431799060838	0.9651789330531152	-0.0001326262678345	0.8248859273803659	0.0001326262678345	0.8182190532864313	0.0368950216093167	0.5033903434174299	-0.0007420867461938	0.5710526006212218	0.0007420867461938	0.5652308460896341	0.0003000616764555	0.6542559317230404	-6.0589735120729045e-06	0.6839601896918424	6.0589735120729045e-06	0.6777098558726963	-0.0019811289630826	0.5562694755205969	0.0019811289630826	0.5504257375759213	SPATS2L	17053	SGO2	187074	KCTD18	196849	False	False	False	ref	85	0.004868	-75	0.1344
2327	chr2	200362466	A	G	rs295127	-0.276821506	0.0114275923819085	0.276821506	0.0113652334479777	0.0524776965276217	0.0487344065518238	-0.0152123839214521	0.0117563351035212	0.0152123839214521	0.0117292430257499	0.0762124311306126	0.3638888673803612	-0.0230794349869111	0.0840109976696173	0.0230794349869111	0.0822977826100617	0.0041772969167509	0.1995169979255256	-0.0013039621176105	0.0495856360082493	0.0013039621176105	0.0486776956395244	-0.0396275279601464	0.0374440392532904	0.0396275279601464	0.0368589045820055	SPATS2L	56584	SGO2	147543	KCTD18	157318	False	True	False	ref	-10	0.00415	-70	0.1399
2328	chr2	200364340	G	A	rs78412932	-0.0471674084	0.2570983148558359	0.0559296564	0.2549613993329419	0.0102630520880089	0.9040032998110356	-0.0005093407974955	0.4721787271465751	0.0005878024583707	0.4684951117383556	0.1499967008676717	0.2414543150330402	-0.0096668705878179	0.181435094965295	0.0106638649987461	0.1797321556134941	0.0015677275723857	0.3795392224838538	-0.0001049626414401	0.2875957782354075	0.000113890240683	0.2851112081484045	-0.0120970934644188	0.1611563535227053	0.0142019398898089	0.1597691311125223	SPATS2L	58458	SGO2	145669	KCTD18	155444	False	False	False	ref	-80	0.00964	5	0.01709
2329	chr2	200365261	T	C	rs295130	-0.0403613938	0.3718069376414399	0.0403613938	0.3669692736883934	0.0130733539326037	0.7722532030224549	-0.0005134949206927	0.5135263592609935	0.0005134949206927	0.507722321708831	0.0410915179307841	0.4946083893003908	-0.0012898288330848	0.4429541799230467	0.0012898288330848	0.4379012580269352	0.0005610943366871	0.5673903067377702	-1.6887699546894878e-05	0.5043073268168157	1.6887699546894878e-05	0.4986732193765387	-0.0036034772854738	0.4079902515795495	0.0036034772854738	0.4028590233525538	SPATS2L	59379	SGO2	144748	KCTD18	154523	False	False	False	ref	50	0.05258	85	0.1652
2330	chr2	200367999	G	T	rs296789	-0.0556350314	0.2728171044840192	0.0556350314	0.2691244129245804	0.0163662077534428	0.62960232002354	-0.000959318696253	0.3616578103360403	0.000959318696253	0.357203720478109	0.0159818217808715	0.6531939000562869	-0.0009369340188866	0.510317502960199	0.0009369340188866	0.5046876181880663	0.0002734598812538	0.6729305970971182	-1.6734301364302727e-05	0.530921760474159	1.6734301364302727e-05	0.5252037869111678	-0.0029436508198343	0.4613504872597438	0.0029436508198343	0.455663261840771	SPATS2L	62117	SGO2	142010	KCTD18	151785	False	False	False	ref	5	8.39e-05	25	0.026
2331	chr2	200369849	T	G	rs3769459	-0.0190987746	0.6175923948435748	0.0190987746	0.6111586653654525	0.0216475787931122	0.4237426426494294	-0.0004374265295644	0.5559659401301019	0.0004374265295644	0.5499063455686088	0.0046328065718715	0.8400396396339492	-7.820990133954084e-05	0.8192014742886791	7.820990133954084e-05	0.8123966107940815	0.0001024811042284	0.8142783836197123	-1.8201277256068725e-06	0.7921731785766967	1.8201277256068725e-06	0.7854330967407757	-0.0003142423542608	0.8095668558874203	0.0003142423542608	0.8027824602610835	SPATS2L	63967	SGO2	140160	KCTD18	149935	False	False	False	ref	40	0.03812	-40	0.05045
2332	chr2	211421177	G	A	rs3791705	0.009687302354	0.7670022804402434	0.009779905246	0.772559399839416	0.0172933788176252	0.5829913511942787	0.000174931815787	0.7485443477772097	0.0001763936318443	0.7537682706085765	0.001069743657418	0.964171634529738	1.0446590978229086e-05	0.945037775981752	1.053518864632298e-05	0.9517733326781612	1.7417086136400942e-05	0.9630221040810486	1.7661124923017193e-07	0.9416663732413056	1.780098393678206e-07	0.9484186077836624	3.381610636402626e-05	0.9536546824722336	3.381610636402626e-05	0.9598920243261412	CPS1	943494	LANCL1	943525	MYL1	1106003	False	False	False	alt	-55	0.01172	100	0.03043
2333	chr2	211436236	A	G	rs6738323	0.0023405477999999	0.6165928620197915	0.0203507185999999	0.6134946580662095	0.0182580710614907	0.551158581728395	9.544564820118822e-05	0.6128157869611225	0.000410945947947	0.6096575719104014	0.0160329583319586	0.6460385015581546	-1.6146885990936573e-05	0.6704486775276203	0.0003207395734926	0.6664913570519124	0.0002861115638056	0.6539050282161467	4.767224434777543e-07	0.668437372003962	6.320746484727178e-06	0.664742050751013	-0.0001591831348355	0.6531022837460423	0.0010565471281052	0.6493057046184584	CPS1	958553	LANCL1	958584	ERBB4	1102605	False	False	False	alt	80	0.01566	30	0.0779
2334	chr2	212537917	G	C	rs1384292	-0.310815426	0.0077789416172065	0.310815426	0.0077256837270451	0.0818448139707841	0.0102362300959101	-0.0262199237156309	0.0044717453556806	0.0262199237156309	0.0044652039762412	0.7164173072481936	0.0141174533425651	-0.2222570206161647	0.0015949976660111	0.2222570206161647	0.0016204156378567	0.0587239330000616	0.0013366275215112	-0.0187715441714387	0.0012857603894656	0.0187715441714387	0.0012846485319092	-0.0677435584441291	0.0108565577939091	0.0677435584441291	0.0107509922539457	ERBB4	924	IKZF2	614510	SPAG16	746473	True	True	True	ref	-30	0.01538	-95	0.155
2335	chr2	212539248	G	A	rs6735626	-0.0644860102	0.2122360412102025	0.0644860102	0.2092006531159905	0.0898494545519907	0.0069482657628035	-0.0061425660117647	0.0505626803946782	0.0061425660117647	0.0501448462917571	0.9210253703276038	0.0007670420157441	-0.0597268982632511	0.0232711003788554	0.0597268982632511	0.0229202312661027	0.0827870712260947	0.0003946367323434	-0.0056831505116223	0.0083601861464304	0.0056831505116223	0.0082794840868564	-0.0037197717000428	0.4033480517396962	0.0037197717000428	0.3978960056871238	ERBB4	407	IKZF2	613179	SPAG16	745142	True	True	True	ref	25	0.00598	-40	0.2603
2336	chr2	212540110	T	C	rs10182996	0.0551139886	0.300366979402755	0.0551139886	0.3039105638603867	0.0152531385821693	0.6752867287186375	0.0009921673956355	0.4016232451118279	0.0009921673956355	0.4059192567619654	0.3447535548150836	0.0899898128656327	0.0186465784604279	0.1119606919923747	0.0186465784604279	0.1140846692612706	0.0051964376026856	0.1569167934108677	0.0003330177611617	0.1630582065590406	0.0003330177611617	0.165599549995482	0.0181806934776153	0.1330227401622713	0.0181806934776153	0.1351698448515965	ERBB4	1269	IKZF2	612317	SPAG16	744280	False	False	False	alt	-20	0.00833	5	0.0006104
2337	chr2	212544613	A	G	rs10207878	0.0038122683399999	0.8563618602033811	0.00640457974	0.8580598905773834	0.0153389246985135	0.6768374531100599	6.823834850855237e-05	0.8539705834986363	0.0001072410542449	0.8557695560018318	0.0114306687341228	0.7017589271145627	3.77814609207467e-05	0.8432617300645124	7.424383589599543e-05	0.8447119601730292	0.0001761450855912	0.7313275819128607	6.907155188971163e-07	0.8485691080491616	1.2449069211293135e-06	0.8500362120684278	0.0001484609547688	0.8321480537312437	0.0002804262478967	0.8335521757427534	ERBB4	5772	IKZF2	607814	SPAG16	739777	False	False	False	alt	95	0.00838	-80	0.05426
2338	chr2	224444261	T	C	rs1523921	-0.067989637	0.120371167897829	0.0913855314	0.1193283104385703	0.0344564390620908	0.1607891109615027	-0.0023454798521126	0.1010858880991753	0.0031547218609034	0.1003634576712203	0.1321566428029427	0.2630092956515331	-0.009761157567338	0.1419615341976324	0.0125315615203142	0.1401157468737717	0.0043496854662508	0.1929677276862463	-0.0003146325020187	0.1181980780246268	0.0004104581719092	0.1166727029688629	-0.0148757876678433	0.1034499078260213	0.0197205634918016	0.1020159250147381	FAM124B	42154	CUL3	141136	CCDC195	272104	False	False	False	ref	100	0.04398	55	0.1073
2339	chr2	224470254	T	C	rs12470077	-0.00995286724	0.7670955864219319	0.01044047276	0.7623694408173974	0.0309130312910675	0.2091218375294363	-0.0003074484861285	0.6230892284064808	0.0003224694343846	0.6185231774203348	0.0489822176767509	0.4423809881146726	-0.0005589343944494	0.5833820400900541	0.0005747114761186	0.5790977128295715	0.0015152120363861	0.3635305935455342	-1.7281362379648955e-05	0.5152737999048635	1.7767383791089988e-05	0.5110734134581154	-0.001486259113853	0.5862386009799446	0.0015439939295964	0.5819311148524027	FAM124B	68147	CUL3	115143	CCDC195	246111	False	False	False	ref	100	0.003555	-65	0.07166
2340	chr2	224488932	T	C	rs147137183	-0.0006214099	0.5789327018875735	0.0227169711	0.5767350604744362	0.0259451944953852	0.3071617609409301	-6.416105155303999e-05	0.5093128418026449	0.0005807094109908	0.5067277789146151	0.0100689518656592	0.7330084530386537	-7.46161067025467e-05	0.7258759143219619	0.0002349877020327	0.722206446683723	0.0002687828523269	0.6820245029317545	-2.452482585866452e-06	0.681789880478105	6.201637647603528e-06	0.6781095027754632	-0.0002045462043482	0.7048732471827216	0.000785193494111	0.7011907109113447	FAM124B	86825	CUL3	96465	CCDC195	227433	False	False	False	ref	20	0.024	-10	0.03336
2341	chr2	224567753	C	A	rs72974238	-0.0023311648	0.7041212349544899	0.0142679919999999	0.7028773889240588	0.0552937814508827	0.0463124577506287	-0.0001350330560229	0.4106890691416441	0.0007273212983844	0.409550001679262	0.000435485467322	0.9910924580505832	9.254915523308226e-07	0.9726627381288409	6.683608196890364e-06	0.9710839105402244	2.637975600433781e-05	0.938522361188568	-1.362448874642074e-08	0.9207526610351244	3.772852142820741e-07	0.9190876877046772	9.897396984593048e-06	0.9672514141642378	3.134175711787798e-05	0.9657160240218436	CUL3	17644	CCDC195	148612	FAM124B	165646	False	False	False	ref	60	0.02792	60	0.0835
2342	chr2	224577415	A	G	rs80236857	-0.00133352632	0.7088099533932135	0.01380270232	0.7072361468920577	0.0147537191903428	0.6984590647543095	3.1636297090453978e-06	0.7283539329236705	0.0002161494508059	0.7270836805346175	0.0011909867704793	0.9550656325165346	-2.6179550472682725e-06	0.9473695103351334	1.2485521590973603e-05	0.9456215581824112	1.582928926362322e-05	0.9647131358048318	-1.6520593126523213e-08	0.9496936005646562	1.900789472280693e-07	0.947912602590201	-1.5670878558936414e-05	0.9489190611432556	4.7012635676814406e-05	0.9471946425042514	CUL3	7982	CCDC195	138950	FAM124B	175308	False	False	False	ref	95	0.1597	-100	0.12427
2343	chr2	227390758	G	A	rs73090183	-0.0863224302	0.1335754387150717	0.0863224302	0.1317195727573123	0.0297562866091644	0.2288634165406714	-0.0025467616879366	0.1302899952622428	0.0025467616879366	0.1285883446921517	0.3827587344528388	0.0754333561579848	-0.03230283188455	0.0487267739924586	0.03230283188455	0.0477482831145817	0.0115156236169169	0.0609616712929701	-0.0009647135692722	0.0517709577563859	0.0009647135692722	0.0508983454713901	-0.0295453795651743	0.054845074679121	0.0295453795651743	0.053946902976605	SCYGR1	2809	TM4SF20	8763	MFF	65606	False	False	False	ref	80	0.01294	-25	0.1216
2344	chr2	227399077	A	C	rs34376789	0.0552704612	0.2561990235276935	0.0552704612	0.2597304632461327	0.0378898575646395	0.1271709484072603	0.0021162049908576	0.1673107781724868	0.0021162049908576	0.1697674507986759	0.0024966183893635	0.9060887451524512	0.0001520342827196	0.7556612186821615	0.0001520342827196	0.7621811068375061	0.000103011578105	0.8212542507934917	6.389313173681636e-06	0.6609528072964832	6.389313173681636e-06	0.6670400069372409	0.0005229124740193	0.746240310664658	0.0005229124740193	0.7526803260058206	SCYGR1	11128	TM4SF20	17082	AGFG1	73076	False	False	False	alt	-100	0.2126	-100	0.2605
2345	chr2	227401845	C	T	rs11884034	-0.0643713472	0.2150366755471731	0.0643713472	0.2121133446565141	0.0258562611281136	0.3084362600140589	-0.0017349249712654	0.2118645882443627	0.0017349249712654	0.2090210130769622	0.0374566988881923	0.5516339531952323	-0.0031958166130774	0.3910602012843259	0.0031958166130774	0.385921708696934	0.0009968144935152	0.5005775863486497	-8.967654698620603e-05	0.3629458017108928	8.967654698620603e-05	0.3581507887660303	-0.0073240737685988	0.3243971962368404	0.0073240737685988	0.3204892180532832	SCYGR1	13896	TM4SF20	19850	AGFG1	70308	False	False	False	ref	75	0.03394	90	0.2578
2346	chr2	227402151	C	T	rs55828602	-0.250710068	0.0137245749298802	0.250710068	0.0136184286190824	0.0318169822324338	0.1972871795142547	-0.0079520643438221	0.0285300421829638	0.0079520643438221	0.0283658497188309	0.0467924185939097	0.5104419682527284	-0.0107501915812084	0.1764026530662333	0.0107501915812084	0.1736090737610076	0.0014042513769188	0.4289589594771402	-0.0003187934891943	0.1553533267697457	0.0003187934891943	0.1529877870293142	-0.0207342218996403	0.1140803735012558	0.0207342218996403	0.112266334558027	SCYGR1	14202	TM4SF20	20156	AGFG1	70002	False	True	False	ref	-25	0.02899	-95	0.1871
2347	chr2	227403944	T	G	rs56161331	0.01348043674	0.5865686000909849	0.02014151054	0.5885148494085048	0.0211447326489187	0.4457499175727759	0.0003044854298966	0.5678869083458662	0.0004417943270664	0.5697424327358435	0.036232720794431	0.5255615905935974	0.0006753896293092	0.5482081373575266	0.0009861611096214	0.5497725826219637	0.0007510402721359	0.515754735695426	1.423843381203278e-05	0.5399151201401029	2.0640329069460604e-05	0.5415346046143512	0.0016825574873808	0.522061061580719	0.0026145623700966	0.5235700432339693	SCYGR1	15995	TM4SF20	21949	AGFG1	68209	False	False	False	alt	-95	0.01819	40	0.0974
2348	chr2	228111817	C	T	rs12620112	-0.0011504284	0.8471553290142091	0.0069643521599999	0.8453918853114996	0.0310977390362315	0.2080376240500791	-6.97812718732911e-05	0.7327174676710312	0.0002065821468105	0.7307164542342117	0.0181411038896769	0.6395912000446504	1.2926531106202682e-05	0.7967354996585776	0.0001120855059754	0.7950025496079642	0.000520062070538	0.5664668744625029	-9.204762502718061e-08	0.7382337666467036	3.088579115434308e-06	0.7365201720465955	-5.773481574360118e-06	0.7935427822512713	0.0003802250008247	0.7918293637277931	SPHKAP	69870	DAW1	240762	CCL20	306077	False	False	False	ref	0	0.0	100	0.132
2349	chr2	228111818	A	G	rs12613751	0.034099892	0.4246064893176928	0.034099892	0.4298046150294053	0.0211177420885048	0.4436526881369199	0.0006913277157568	0.4216439453148949	0.0006913277157568	0.426823536664991	0.0199721223318266	0.6225883146128236	0.000735795376857	0.5444193587138316	0.000735795376857	0.5501590975432515	0.0003979881322016	0.613119786169856	1.4382168116362022e-05	0.5362990757635566	1.4382168116362022e-05	0.542148577407715	0.0021963973474975	0.5138420559128253	0.0021963973474975	0.5195617183215832	SPHKAP	69869	DAW1	240763	CCL20	306078	False	False	False	alt	-50	0.001308	90	0.1345
2350	chr2	228114794	C	T	rs10933235	0.02126938086	0.5507975910836068	0.02396077794	0.5547408235004839	0.0476979233870236	0.0659650176578645	0.0010285093309214	0.3471376489279142	0.0011373961022689	0.349559094171447	0.0155158193395136	0.6558683640829642	0.0004021366066169	0.6597889566937586	0.0004183856800217	0.6635754274033624	0.0007670347341852	0.4933030294152962	1.94356490098622e-05	0.533235296008987	2.009304332732422e-05	0.537082890212896	0.0012594437662894	0.6295380219007605	0.0013435716406584	0.6334723235478049	SPHKAP	66893	DAW1	243739	CCL20	309054	False	False	False	alt	-50	0.1726	70	0.00711
2351	chr2	228115397	T	G	rs10175063	0.0602701157999999	0.2270916887084107	0.0602701157999999	0.2300571635718078	0.0267410331407315	0.2857289966388163	0.0017543503951046	0.2091869183393999	0.0017543503951046	0.211808354787106	0.011601398832107	0.7065228010272288	0.0007444553168183	0.5450049468802886	0.0007444553168183	0.5508438567215604	0.0003154986428323	0.6531050046572661	2.1922986053816843e-05	0.4931246453258061	2.1922986053816843e-05	0.4988049472511657	0.0023762000593843	0.5005887149122419	0.0023762000593843	0.5063479008256901	SPHKAP	66290	DAW1	244342	CCL20	309657	False	False	False	alt	-30	0.00531	-100	0.05548
2352	chr2	228119268	G	A	rs67681818	-0.0053338833999999	0.442837136596329	0.0316328594	0.4422233673367924	0.017740118584108	0.5734208952925381	-0.000172793904002	0.4820038064713137	0.0005471838453165	0.4812657431871294	0.1547441522879482	0.2209365976535265	-0.0001461563118852	0.242194699497091	0.0047822862941352	0.2420645162601939	0.0027166317425732	0.2586783955748304	-1.5288926347689383e-05	0.2744151738996763	8.133873074614674e-05	0.2741994108004686	-0.0003068193065223	0.2369784373874988	0.0083715482828015	0.2367343343832695	SPHKAP	62419	DAW1	248213	CCL20	313528	False	False	False	ref	-80	0.02966	-85	0.1609
2353	chr2	228119928	C	A	rs67890737	0.00583441352	0.803445636229238	0.00867895448	0.8076131354098769	0.0098193206196215	0.9139496686287868	5.588325979273358e-05	0.868848324458572	8.559052555033231e-05	0.8728605388495833	0.0190475404968493	0.6159005569064865	9.466224929526788e-05	0.7317834743807576	0.0001497259030485	0.7358041667959648	0.000190920634682	0.7223087603236831	9.455752462195588e-07	0.7939416181955365	1.5206383646673518e-06	0.797997506876915	0.0003546567252812	0.7275427452555162	0.0005344594371679	0.7315576695456306	SPHKAP	61759	DAW1	248873	CCL20	314188	False	False	False	alt	-90	0.01733	30	0.03458
2354	chr2	228122334	A	G	rs10191681	0.0473455879999999	0.3258650006523358	0.0473455879999999	0.3295135177488209	0.0211124158731186	0.4379542115429669	0.0010800393330452	0.3563375673623677	0.0010800393330452	0.360267053612975	0.0346342911814192	0.5161915560555131	0.0017576783788736	0.4446544822876987	0.0017576783788736	0.450299216242886	0.0007010861171805	0.5085633168623128	3.926716889198923e-05	0.4388896704193022	3.926716889198923e-05	0.4446062249109721	0.0045651743591435	0.3955024134147954	0.0045651743591435	0.4010062742813152	SPHKAP	59353	DAW1	251279	CCL20	316594	False	False	False	alt	20	0.02747	70	0.10046
2355	chr2	228125369	T	C	rs12618505	0.0279892262	0.4737117168539653	0.0302468846	0.4776654001568481	0.01869404922702	0.5298667009284675	0.0005331886881532	0.4956963232953132	0.0005736338166334	0.4997411671528601	0.0048340536438915	0.8437800789722247	0.0001707309823032	0.7722404944223901	0.0001823969035807	0.7764651710131011	8.750887612748583e-05	0.8410678304245918	3.173655072690005e-06	0.7664939597863174	3.3826458103169127e-06	0.7708012140104421	0.0005723994589422	0.757197747704833	0.0006152881792088	0.7613371798167229	SPHKAP	56318	DAW1	254314	CCL20	319629	False	False	False	alt	-50	0.03815	40	0.08716
2356	chr2	228125644	T	C	rs4450589	-0.008635502742	0.6932354409100717	0.015439999542	0.6911141255058982	0.0195902337037072	0.4978275991010747	-0.0001404330222283	0.6818173647176422	0.0002884252853341	0.6791595658418402	0.004190722839893	0.8684538086501497	-2.073592892625929e-05	0.8513048568709928	8.592202495837928e-05	0.8500896212371726	8.288154457490433e-05	0.8593529511524953	-2.344212059877962e-07	0.8445855833713223	1.6521657013634714e-06	0.8430871739444206	-8.577744053313883e-05	0.8394413787712778	0.0003150671373428	0.8374105018609657	SPHKAP	56043	DAW1	254589	CCL20	319904	False	False	False	ref	-80	0.00775	-80	0.06085
2357	chr2	228127142	G	A	rs10933236	0.418435684	0.0033989376016925	0.418435684	0.0033967042553145	0.0743303760765594	0.0145922118553354	0.0328671066312738	0.0031660275302375	0.0328671066312738	0.0031832757957566	0.1057619346111972	0.2992171805055967	0.0508194213516461	0.0337575413321898	0.0508194213516461	0.0343016793961706	0.0086079820752562	0.1001950758477725	0.0043407024963072	0.0148701017457958	0.0043407024963072	0.014902937439002	0.0695094190227969	0.0118035357763758	0.0695094190227969	0.0118628147940072	SPHKAP	54545	DAW1	256087	CCL20	321402	False	True	True	alt	5	0.001587	-100	0.0835
2358	chr2	228129701	A	C	rs66499548	-0.012113022	0.7416968084256841	0.012113022	0.7349085708443995	0.0148687860930461	0.6972367863127024	-0.0001809833443238	0.7574116358132131	0.0001809833443238	0.7506174884751696	0.003572960311438	0.8672018709464943	-4.18477637172119e-05	0.8770578312107425	4.18477637172119e-05	0.870137857054265	5.438180221137597e-05	0.8824895725621359	-6.386462055423054e-07	0.8841136909264444	6.386462055423054e-07	0.877144377172017	-0.0001781531457226	0.8646199810643704	0.0001781531457226	0.8578069487915045	SPHKAP	51986	DAW1	258646	CCL20	323961	False	False	False	ref	100	0.10944	20	0.0159
2359	chr2	228129788	T	C	rs13388454	0.0053692207	0.7640685736216186	0.0108045546999999	0.7680926047155744	0.0158031925646138	0.6437255175050636	9.273860204734e-05	0.7701145417826627	0.0001650068263618	0.7742741757518328	0.0039680314077397	0.8575442907778804	3.146792272968589e-05	0.869279349175389	4.944463904187571e-05	0.8735753131232994	6.192050639537355e-05	0.8693891674067259	5.193349717400535e-07	0.8742128797856202	7.583534629655035e-07	0.8785675126621565	0.0001319652931278	0.8459951616348593	0.0002210418659892	0.8503042233266861	SPHKAP	51899	DAW1	258733	CCL20	324048	False	False	False	alt	70	0.00232	-65	0.01953
2360	chr2	228130469	A	G	rs4973071	0.0004994024	0.7055217640785298	0.0141137116	0.7046945742763987	0.0271722017412912	0.2784163335894872	9.46756159728e-06	0.5851953735943207	0.0003802034321134	0.5845182086699731	0.0044290851506053	0.8413020921377974	-1.9843364333762035e-05	0.8454001971688054	5.985911504480414e-05	0.8442081116758767	0.0001202922057296	0.7874972738968474	-5.586537576109368e-07	0.7995649528048733	1.6093165658421266e-06	0.7983665427105229	-6.268351423576002e-05	0.8301366419280367	0.0002457853584506	0.829058918401805	SPHKAP	51218	DAW1	259414	CCL20	324729	False	False	False	alt	100	0.0658	95	0.02747
2361	chr2	228131708	A	G	rs4246653	-0.0120506002	0.5343163684366956	0.0242698154	0.5327315927990882	0.0145506581314739	0.6985256646424055	-0.000256712978402	0.5919394121613201	0.0003834827327422	0.5902573880630195	0.0202607964105439	0.602994501167629	-0.0001907703768161	0.5916673780487368	0.0004656019825505	0.5905170773302997	0.0002905710113641	0.6545189546381974	-4.274305790708284e-06	0.6260897341140055	7.1472229602070015e-06	0.6246677591675668	-0.0006540529840651	0.5664808892054861	0.0015761604697963	0.5651262838795245	SPHKAP	49979	DAW1	260653	CCL20	325968	False	False	False	ref	5	0.00116	-70	0.04715
2362	chr2	228134826	T	C	rs6436754	-0.1016347302	0.1223046104471917	0.1016347302	0.1210124184470436	0.0209079974494169	0.4446920607556435	-0.0024655447720077	0.1779787920575954	0.0024655447720077	0.1760452703665813	0.007628418725875	0.8213411646059703	-0.0012149188417344	0.5921337791252057	0.0012149188417344	0.5861556776685596	0.0001979782480197	0.7935115020887213	-3.2191420338595525e-05	0.5680147646202287	3.2191420338595525e-05	0.5622478541857917	-0.0033279997360693	0.5399612163584513	0.0033279997360693	0.5342653572851234	SPHKAP	46861	DAW1	263771	CCL20	329086	False	False	False	ref	-20	0.0007324	70	0.06714
2363	chr2	228138147	C	T	rs4246655	-0.0993056882	0.1058530472728393	0.0993056882	0.1043653077520974	0.0223370041557207	0.4016714176507971	-0.002278463261393	0.1511053098351003	0.002278463261393	0.1491255733618084	0.0202195572564415	0.6106783318115734	-0.0018841974224062	0.379713733839055	0.0018841974224062	0.3746863569649584	0.0004432697960336	0.5867651264614766	-4.202824148487781e-05	0.3686276874788142	4.202824148487781e-05	0.3635061558111447	-0.0057297680709972	0.3122749202640067	0.0057297680709972	0.3075792406225761	SPHKAP	43540	DAW1	267092	CCL20	332407	False	False	False	ref	55	0.10596	60	0.1276
2364	chr2	228139166	G	T	rs4321353	-0.00203522492	0.7960429861023457	0.0090936225199999	0.7947144769398113	0.0127425539053454	0.7946197639507044	-4.129813008619671e-05	0.8307709379008971	0.0001167489850341	0.8293854728520773	0.0102215367358384	0.7225573322639657	-9.81083623512862e-06	0.8034406086923779	8.336204048366204e-05	0.8023043597552385	0.000127385886106	0.7779768533794373	-2.61425038763955e-07	0.8335119373970971	1.0524706351778415e-06	0.8324859035862626	-2.1444360133259992e-05	0.7987722617268006	0.0003134175711787	0.7976733085044201	SPHKAP	42521	DAW1	268111	CCL20	333426	False	False	False	ref	25	0.006374	-20	0.0516
2365	chr2	229594594	A	C	rs55784527	0.02894421638	0.4839153309016432	0.02907180722	0.488050706220055	0.1076554529434694	0.0035779919298573	0.0032745798578323	0.1394268698463498	0.0032838634951791	0.1402344057820781	0.0026558015241991	0.8969503807204412	8.790721677674338e-05	0.8297792776066643	8.822449960565138e-05	0.8347332336373723	0.000281710943031	0.6672475508179895	9.82501242512578e-06	0.6370187623122339	9.848098241001664e-06	0.6413816384971288	0.000317541486589	0.8206163039498792	0.0003191910527531	0.8250899097961196	DNER	119961	PID1	323307	FBXO36	327709	False	False	False	alt	0	0.0	95	0.1244
2366	chr2	229732201	A	T	rs62193248	-0.07590975166	0.2013545095347029	0.07590975166	0.1991575971948239	0.0190345645997428	0.5218379685452214	-0.00154996554888	0.283212348310699	0.00154996554888	0.280142201723416	0.2615321170532149	0.1321812111516136	-0.0230742831927382	0.1040432371125338	0.0230742831927382	0.1023911634548275	0.0050000447472714	0.1652633175397387	-0.0004719222068629	0.139993533153018	0.0004719222068629	0.1378848592953345	-0.0237743723400745	0.098945304591868	0.0237743723400745	0.0975111787732226	DNER	17646	FBXO36	190102	TRIP12	191038	False	False	False	ref	-75	0.0622	-85	0.104
2367	chr2	229738161	G	C	rs11886634	0.1404072219999999	0.0533192854301414	0.1404072219999999	0.0540284238389318	0.03176497886808	0.1999587052464533	0.0045080593562036	0.0649434576713479	0.0045080593562036	0.0657094603025042	0.060181122364818	0.4218587527544054	0.0090540177497082	0.1837102180427854	0.0090540177497082	0.1870353739204764	0.0019073085587135	0.3470888350857427	0.0002912048894414	0.1592421538420154	0.0002912048894414	0.1620805166070335	0.0179736729240209	0.1191854235854373	0.0179736729240209	0.1214854430392213	DNER	23606	FBXO36	184142	TRIP12	185078	False	False	False	alt	65	0.002136	60	0.04712
2368	chr2	229750034	A	G	rs11885896	-0.0412075202	0.3550569038637774	0.0412075202	0.3503241058928856	0.0185884024810495	0.531362665494047	-0.000797574419102	0.3881837293112691	0.000797574419102	0.383245666577661	0.0009221074857312	0.9703760252692932	-3.909520353185531e-05	0.8866639181440019	3.909520353185531e-05	0.8797246554758513	1.7318648090506936e-05	0.963149478829198	-7.580528129997077e-07	0.8749935319056275	7.580528129997077e-07	0.8680495219985276	-0.0001146448484048	0.90532876332171	0.0001146448484048	0.8983448021480006	DNER	35479	FBXO36	172269	TRIP12	173205	False	False	False	ref	85	0.0769	-100	0.0988
2369	chr2	229753804	A	G	rs62190392	0.01137062946	0.5707222054995176	0.0216672230599999	0.5743994929295997	0.0124457617882017	0.7952098930409683	8.489616829846397e-05	0.6694115942876768	0.000272243405299	0.6729449248010334	0.3273151661113127	0.0973349015965622	0.0035661815176626	0.2037194627954803	0.0067418505925893	0.2060436031627134	0.0040607217290012	0.1926455158403976	2.7504043130926656e-05	0.2824830740804449	8.528556287952665e-05	0.2850994247809228	0.0040810266899805	0.2693503510722173	0.0073801590181781	0.2720537117644821	DNER	39249	FBXO36	168499	TRIP12	169435	False	False	False	alt	100	0.1289	95	0.2656
2370	chr2	229786402	T	G	rs370430952	0.0022840738	0.4591161898153293	0.0311457133999999	0.4600830922124619	0.0723211700347196	0.0170690963843599	0.0006288686603114	0.1790030693932221	0.0024311312430401	0.1792439378912308	0.0138769753554814	0.6698319678150431	-6.933852082461533e-05	0.6156658661680032	0.0004859125615328	0.6167217809808897	0.000994640104343	0.4422486624808149	1.8560957490982823e-06	0.4298677395282916	3.6112794850596335e-05	0.430649521218526	-0.0001756787964765	0.5860470919412926	0.0015877074329451	0.5870797589687062	DNER	71847	FBXO36	135901	TRIP12	136837	False	True	False	alt	100	0.01855	50	0.07874
2371	chr2	229800587	T	C	rs7592697	0.0062875357	0.8301640100984903	0.0073561929	0.8343714012744203	0.013560972294401	0.7552963882511102	8.297963374022087e-05	0.849438474199153	9.876179967383048e-05	0.8534523050225136	0.0802109795123882	0.3433556965886765	0.0005497480306449	0.5546424213924266	0.0006261574943316	0.5581082217551083	0.0010826248062219	0.4211875241936437	7.228934951758986e-06	0.601048451551578	8.357366845118344e-06	0.6048607227785592	0.0011654184949357	0.5961700194120182	0.0013320246775097	0.5998900672290456	DNER	86032	FBXO36	121716	TRIP12	122652	False	False	False	alt	75	0.01279	15	0.0227
2372	chr2	229803073	C	G	rs13035379	-0.071880895	0.1477512818090988	0.083863883	0.146330901615088	0.0318453953987931	0.1955369281777091	-0.0023183274892172	0.1317750712790841	0.0027126318791115	0.1307176872910478	0.0038839035333706	0.8550293561987875	-0.0003475516124776	0.6466019340195218	0.0003856519869707	0.6424868405163794	0.0001284315839174	0.7832417078887928	-1.165942721907189e-05	0.5721257858857305	1.2913133318377805e-05	0.5679847195413489	-0.0011307776054897	0.6304913705777557	0.0012610933324535	0.6262561600467343	DNER	88518	FBXO36	119230	TRIP12	120166	False	False	False	ref	100	0.05106	20	0.0742
2373	chr2	229893844	A	G	rs6749080	0.0601910961999999	0.2287747245203379	0.0601910961999999	0.2320604631059382	0.0240938180903856	0.3526677783384362	0.0014889323876243	0.2318719618452187	0.0014889323876243	0.2350577105099679	0.0079476097786281	0.7725199393070319	0.000393259849807	0.6145887025696644	0.000393259849807	0.6207482766061623	0.0001775629004652	0.7412847379332209	9.07699943330136e-06	0.5823276708351968	9.07699943330136e-06	0.5883768721132868	0.0014112038533865	0.5844154904014088	0.0014112038533865	0.5905957209504827	FBXO36	28459	TRIP12	29395	SLC16A14	175149	False	False	False	alt	-20	0.00483	-20	0.00508
2374	chr2	232727777	G	A	rs6704763	-0.0255063756	0.3686820861579173	0.0398287415999999	0.3658081202694216	0.0204945313909303	0.4610520971799127	-0.0007128629769426	0.374975973999101	0.0008973840888039	0.3718644258645328	0.0080111180759459	0.759234089370619	-0.0002680936337045	0.648691342483062	0.00036348235727	0.6446034788170721	0.0001756292974851	0.743473020188397	-7.431916957545456e-06	0.6318826131895677	8.660850330149316e-06	0.6277829161886915	-0.0009542740259311	0.6165224157306612	0.0012825376925868	0.612379707640044	GIGYF2	30477	KCNJ13	48788	EFHD1	121719	False	False	False	ref	-40	0.02155	-100	0.09125
2375	chr2	232730453	C	A	rs6716488	0.02027090634	0.5324745481619806	0.02460325606	0.5352058240419114	0.0175995015827786	0.5796492520631539	0.0003774815202712	0.5595695837061752	0.0004495165269575	0.562060344563663	0.0005014681138859	0.986943618547562	1.0138536570493856e-05	0.947621778226079	1.1877746128826722e-05	0.949847819816148	8.7678132893261e-06	0.984258620309954	1.8806199747273522e-07	0.9430026677334936	2.163198277310969e-07	0.9448542059898788	3.2991323281971874e-05	0.95078766403776	4.123915410246612e-05	0.953900132980393	GIGYF2	33153	KCNJ13	46112	EFHD1	124395	False	False	False	alt	30	0.02582	65	0.1687
2376	chr2	232769842	T	C	rs2293782	0.01725331786	0.5830425848419031	0.02170144134	0.5853123972413102	0.015960991228864	0.6401244779643157	0.0003446079179341	0.6018326643597565	0.0003966271957026	0.6042001812437974	0.0044530038599848	0.8351425693702061	6.508341414526028e-05	0.8144463798102038	8.818308856197971e-05	0.816360318500262	7.080205927392764e-05	0.851690118489645	1.3160270598751707e-06	0.8160280476955413	1.5961947104793825e-06	0.8178933178222568	0.0002400118768763	0.8058581037167626	0.0003274388835735	0.807710231286738	KCNJ13	6723	GIGYF2	72542	SNORC	87429	False	False	False	alt	-100	0.01462	55	0.1032
2377	chr2	232776161	T	G	rs56054779	-0.0162218375	0.6794601652671663	0.0162218375	0.6730828134154427	0.0175653607151827	0.5765466614606268	-0.0002606050739521	0.6947088588883696	0.0002606050739521	0.6881962212033356	0.043777011645937	0.4623638073229677	-0.0006342225944838	0.5607925910363186	0.0006342225944838	0.555032436714053	0.0007614800379093	0.4870944355931055	-1.0254221584680614e-05	0.5761007569812524	1.0254221584680614e-05	0.5702658966744787	-0.0017642110125036	0.5595964069463013	0.0017642110125036	0.5536570777956017	KCNJ13	404	GIGYF2	78861	SNORC	81110	False	False	False	ref	90	0.06006	95	0.00812
2378	chr2	232825372	C	T	rs12993791	0.01443426336	0.6891886153740195	0.01560558684	0.693487607159086	0.016695985261625	0.6169058382214417	0.0002537157040151	0.7087202160438045	0.0002726442585578	0.7130347489242639	0.005475734881726	0.8471252097445813	0.0001170594103258	0.8363101003601978	0.0001178274501127	0.8406768268740602	9.334610470160232e-05	0.8536395388848148	2.0684052411132502e-06	0.837876259792354	2.0808167425990903e-06	0.8421805189301435	0.0004049684932862	0.8272907524146083	0.0004082676256144	0.8304447258946236	SNORC	31899	KCNJ13	48807	GIGYF2	128072	False	False	False	alt	-5	0.003418	-100	0.1478
2379	chr2	232847538	G	A	rs12328151	-0.159543038	0.0439990482121422	0.159543038	0.0435322410956519	0.0281018949555265	0.2616888609857477	-0.004477201872355	0.069255214152882	0.004477201872355	0.0684001984104225	0.2218715977697865	0.1588030607019466	-0.0355942823575357	0.0464390436533986	0.0355942823575357	0.0456051724911813	0.0061751477768832	0.132081062418722	-0.0009894177211473	0.0537603070060626	0.0009894177211473	0.0528145473527109	-0.0474555441918774	0.0247666257063227	0.0474555441918774	0.0243818050830569	SNORC	9733	KCNJ13	70973	GIGYF2	150238	False	False	False	ref	45	0.00415	-100	0.09326
2380	chr2	232871534	C	T	rs2675968	-0.0712824788	0.1843832922013054	0.0712824788	0.181876438280907	0.0298413288047991	0.2290016842593296	-0.0022262187650068	0.1651680530187363	0.0022262187650068	0.1630611629587321	0.2075715086932136	0.1693644487115575	-0.0149540440658326	0.1156239176463291	0.0149540440658326	0.1135688257159468	0.0060739002226822	0.1334126887918336	-0.0004544943732253	0.1068483751985583	0.0004544943732253	0.1049266883761231	-0.0214031209791824	0.0933404688340959	0.0214031209791824	0.0916899685308866	SNORC	14263	KCNJ13	94969	NGEF	141722	False	False	False	ref	-20	0.005127	35	0.09045
2381	chr2	232904078	G	A	rs938575	0.02393728	0.0533750874743795	0.15004436	0.0531732444440945	0.0465110951400734	0.0705094865444832	0.0021068459616507	0.0395646535236731	0.0072428912704747	0.039520566223539	0.1435287519382402	0.2608583493089886	0.0094553199902146	0.0894461095879808	0.0257596650689604	0.0890528797350132	0.0069985351614928	0.1364953720926191	0.0006033253672504	0.062610849707167	0.0013028253559137	0.0622102922049534	0.0095501633070502	0.0541315554366338	0.0357139322358219	0.0538859103142088	SNORC	46807	NGEF	109178	KCNJ13	127513	False	False	False	alt	30	0.006836	-10	0.01123
2382	chr2	233107579	C	T	rs79340715	-0.1134192115999999	0.1073203653884854	0.1134192115999999	0.1061863847799558	0.0370264948520994	0.1357235062931955	-0.0049437362507149	0.0901619848880572	0.0049437362507149	0.0892831642720796	0.1143767939032034	0.2899517128114502	-0.0159002335449577	0.1390554681256691	0.0159002335449577	0.1368641494164856	0.0043470576067111	0.1967664439797878	-0.000704923134085	0.1099075263136185	0.000704923134085	0.1081454297025035	-0.0252771271155685	0.0895376402529971	0.0252771271155685	0.0882339131774031	INPP5D	47611	NEU2	74906	NGEF	94323	False	False	False	ref	95	0.0928	100	0.12146
2383	chr2	235876563	G	T	rs4663623	-0.02075932928	0.4049774787312472	0.03817290072	0.405358499839686	0.0735186019517021	0.0147411391921011	-0.0017836462612873	0.1502004372255388	0.0030038941745893	0.1512179159470661	0.0412803932565734	0.4776511735727864	-0.0005983056983152	0.4606124124836613	0.0013398182258477	0.4616648608972442	0.0029152137031813	0.2476801062892191	-5.078659042028316e-05	0.2788769770227182	0.0001020420486092	0.2797232253854124	-0.0013823364455148	0.430940314493685	0.0035300715911714	0.4318914429004791	GBX2	291823	AGAP1	382519	ASB18	387846	False	True	False	ref	-60	0.00647	35	0.00638
2384	chr2	235877371	C	T	rs4663624	-0.200992412	0.0254485822969	0.200992412	0.0251864758117901	0.0249754940726828	0.3364163869966552	-0.0056374702642278	0.0595644238811317	0.0056374702642278	0.0591124302166485	0.2570477714361122	0.1370458195088707	-0.0495874407786088	0.0317209036790029	0.0495874407786088	0.0311447796813857	0.0062316342131343	0.1400319634842158	-0.0013325991559378	0.0468539321644905	0.0013325991559378	0.0460938200392793	-0.0536595625350532	0.0189025568023382	0.0536595625350532	0.0186094790080969	GBX2	291015	AGAP1	383327	ASB18	387038	False	False	False	ref	90	0.0531	75	0.2034
2385	chr2	235884746	G	A	rs35772117	-0.203390808	0.0233855502430339	0.203390808	0.0231816160369208	0.0312839473667149	0.2039010398755683	-0.0064842370539894	0.0397898690238951	0.0064842370539894	0.0395502474258344	0.0271205173039489	0.5565761879077845	-0.0057331845691918	0.2261434675821487	0.0057331845691918	0.2223429130443732	0.0008798006188806	0.4703874261784406	-0.000188739498917	0.1897711963234307	0.000188739498917	0.186649713616895	-0.0139990432516247	0.1513209284976548	0.0139990432516247	0.1486014193930364	GBX2	283640	ASB18	379663	AGAP1	390702	False	False	False	ref	90	0.06165	80	0.1772
2386	chr2	235886699	A	C	rs13025591	-0.02304830632	0.3476719275840451	0.04352916088	0.34798852267224	0.0222245315775586	0.4039940468498197	-0.0006915492005645	0.351816897117007	0.0010815390588548	0.3521591344464173	0.2137417109300253	0.1672233767309298	-0.0076820159885583	0.1734864794498394	0.0113946586541501	0.173610785716137	0.0052657779320738	0.167242619771654	-0.0002294137857817	0.1846642178329332	0.0003008039599291	0.1848014119673282	-0.0081983438355712	0.1701454177898518	0.0142786447164395	0.1706755771175023	GBX2	281687	ASB18	377710	AGAP1	392655	False	False	False	ref	-45	0.008865	-65	0.1997
2387	chr2	235889289	A	C	rs10192764	-0.27333554	0.0111320167847712	0.27333554	0.0110849254136465	0.0364466002610615	0.1418738183442185	-0.0099840215768067	0.0208265945861389	0.0099840215768067	0.0207608999775161	0.0386056217214872	0.4937277013234478	-0.0117495507609996	0.1498024777667368	0.0117495507609996	0.1471386977326051	0.0013506506240086	0.3880211990176151	-0.0004095065436513	0.1192767179334902	0.0004095065436513	0.1171883151605516	-0.0230832041173171	0.0867274414028184	0.0230832041173171	0.0850283433008035	GBX2	279097	ASB18	375120	AGAP1	395245	False	True	False	ref	-45	0.009766	-5	0.01001
2388	chr2	235904913	T	C	rs6747286	-0.01835160068	0.6300824214004836	0.01835160068	0.6232658268853081	0.0167048515988694	0.6054689143003197	-0.0003208057942067	0.644029729596263	0.0003208057942067	0.637393221911501	0.1729867044967173	0.2004147495265008	-0.003435879031823	0.3204842604939605	0.003435879031823	0.3158318865255404	0.002958223167733	0.2455982329428151	-6.061519626860267e-05	0.3532807885939952	6.061519626860267e-05	0.3482709496121544	-0.0055565636237669	0.3450965253662298	0.0055565636237669	0.3400043375413071	GBX2	263473	ASB18	359496	AGAP1	410869	False	False	False	ref	80	0.00908	75	0.143
2389	chr2	235913925	C	G	rs1962550	0.0275519602	0.4948995912511463	0.0275519602	0.500632572549485	0.0153698070313542	0.6730132967642162	0.0004272652194344	0.5508765557333389	0.0004272652194344	0.5567394359961418	0.2319842631387945	0.150247628034368	0.006742028409403	0.2016312818850498	0.006742028409403	0.2050734126612903	0.0036295890305695	0.2129400054215913	0.0001058252441437	0.2513101467636157	0.0001058252441437	0.2552327529600431	0.0087220810926725	0.2268868843808104	0.0087220810926725	0.230706946318098	GBX2	254461	ASB18	350484	AGAP1	419881	False	False	False	alt	85	0.01027	40	0.08093
2390	chr2	235917218	A	G	rs13031349	0.0690209109999999	0.1881817812751444	0.0690209109999999	0.1911574420013241	0.0173434583807306	0.5872076293558656	0.0012103217318595	0.2729885818506426	0.0012103217318595	0.277073115534044	0.8027481772293887	0.0072892656332235	0.0548577072406444	0.0233757227291031	0.0548577072406444	0.0238062888717031	0.0138997426371411	0.0447999821329369	0.0009611686649076	0.0511148262299832	0.0009611686649076	0.0520584127169066	0.0103279337534228	0.1978253598043483	0.0103279337534228	0.2012348753854033	GBX2	251168	ASB18	347191	AGAP1	423174	True	False	False	alt	95	0.1107	85	0.6484
2391	chr2	236009895	T	C	rs3738994	-0.108481148	0.0931980930817035	0.108481148	0.0921745400343659	0.0700291798680908	0.0189157658366674	-0.0071013521933418	0.0355807904148403	0.0071013521933418	0.0353220359534928	0.6632410675992214	0.0192675465911291	-0.0703365168846175	0.016727851755304	0.0703365168846175	0.0165199754409128	0.04683650992854	0.0028330543982044	-0.0046507669778958	0.0090161125816889	0.0046507669778958	0.0089639277829463	-0.0273225891590511	0.0677150589443246	0.0273225891590511	0.0666031184602949	GBX2	158491	ASB18	254514	IQCA1	497640	False	True	False	ref	-45	0.1257	-30	0.04932
2392	chr2	236010027	C	T	rs3738993	-0.1189633109999999	0.0783131470943427	0.1189633109999999	0.0772660764312659	0.0365801216618946	0.1396667618636923	-0.0044285591834699	0.0696089022012658	0.0044285591834699	0.068832461969113	0.6243649170268221	0.0239126149193721	-0.0745856746440051	0.0151465619361193	0.0745856746440051	0.0149256129971154	0.0229938344396919	0.0173241094605875	-0.0027937500107163	0.0175765327314493	0.0027937500107163	0.0173305286470088	-0.0307677080927715	0.0519420321518721	0.0307677080927715	0.0509542825259015	GBX2	158359	ASB18	254382	IQCA1	497508	False	False	False	ref	-90	0.0575	-95	0.4536
2393	chr2	236011530	C	T	rs12053257	-0.03610757244	0.4125494455194036	0.03610757244	0.4077005166901708	0.012085103834736	0.8244789200324362	-0.0004403332434991	0.5773997376965387	0.0004403332434991	0.5713544013091877	0.1953473986341591	0.1785422229556572	-0.0072562162454518	0.2177405351599549	0.0072562162454518	0.2142383986847315	0.0023432047134345	0.2825702554922979	-8.807860302859047e-05	0.3053361141655685	8.807860302859047e-05	0.3008146929630455	-0.0107955857609448	0.2135683342325943	0.0107955857609448	0.2103646628877618	GBX2	156856	ASB18	252879	IQCA1	496005	False	False	False	ref	-100	0.08984	25	0.0526
2394	chr2	236014543	C	T	rs2123511	-0.02509953396	0.5089923450476318	0.02621070964	0.5045300753144444	0.0196570223342337	0.4841512129940166	-0.000577290529609	0.494799301808144	0.0005965767984682	0.4907522216944782	0.5888951205832866	0.0280593111532429	-0.0138202668713425	0.123403176655982	0.0145771088949322	0.1217673555792226	0.0112978724827639	0.0629648099059163	-0.0003084785695179	0.1516473618025947	0.0003216147990369	0.1497164301146887	-0.0073752103196859	0.278679216293851	0.0076193461119725	0.2753142462717419	GBX2	153843	ASB18	249866	IQCA1	492992	False	False	False	ref	30	0.0282	100	0.2944
2395	chr2	236027733	T	C	rs11692136	-0.2186402786	0.0254842458959979	0.2186402786	0.0253003907069605	0.0915489223076806	0.0062801220610714	-0.0207914350589463	0.0086420039640492	0.0207914350589463	0.0085451674528412	0.1725363729339183	0.2097982981667103	-0.0469253689075991	0.04405384709375	0.0469253689075991	0.0433481884546825	0.0158056626286146	0.0399656889859251	-0.0045454828256619	0.0164413784855702	0.0045454828256619	0.0162477582401861	-0.0583146382501401	0.0210705721873059	0.0583146382501401	0.0208427868199011	GBX2	140653	ASB18	236676	IQCA1	479802	False	True	True	ref	-25	0.04968	90	0.03735
2396	chr2	236035028	C	T	rs876739	-0.0379059021999999	0.3807122132787733	0.0379059021999999	0.375522233110285	0.0112957897224434	0.8559569064723339	-0.0004216234001212	0.5540173542166585	0.0004216234001212	0.5478657493301348	0.0699292336115601	0.37474470850924	-0.0025241575516713	0.3356962604488777	0.0025241575516713	0.3310940360576534	0.0008014820530563	0.4837536799754734	-2.83168438590912e-05	0.4248521037624921	2.83168438590912e-05	0.4195217853948603	-0.0060225660651248	0.3004033847986785	0.0060225660651248	0.2959509282191975	GBX2	133358	ASB18	229381	IQCA1	472507	False	False	False	ref	30	0.01581	-90	0.0611
2397	chr2	236041990	A	G	rs3754659	-0.0510744376	0.2875099194800958	0.0510744376	0.2836187776710638	0.0171444635091901	0.59141105154283	-0.0009534800592112	0.3612731211905031	0.0009534800592112	0.3564691947421807	0.0340998317442512	0.5175550471235851	-0.0018093040130306	0.4111088745223848	0.0018093040130306	0.405833188509239	0.000580910446042	0.5421017624351294	-3.2645230643393304e-05	0.4329652621450174	3.2645230643393304e-05	0.4273335737187657	-0.0050517963775526	0.3582136935942486	0.0050517963775526	0.3532019323738626	GBX2	126396	ASB18	222419	IQCA1	465545	False	False	False	ref	-85	0.069	-45	0.1499
2398	chr20	38769266	A	G	rs2247983	0.0830906434	0.1533161398029778	0.0830906434	0.1556471730975664	0.0505852741965993	0.0539903843336399	0.0043622813721582	0.0765015364236031	0.0043622813721582	0.0773760051370317	0.1452871894691695	0.2567736097182145	0.011505356606865	0.1558540183474489	0.011505356606865	0.1585598880438462	0.0073817985122644	0.1235260155659457	0.0006106643936914	0.0959555791419964	0.0006106643936914	0.0976277351854095	0.0177575797565239	0.1230375436481077	0.0177575797565239	0.1251447195540453	ACTR5	20805	PPP1R16B	36432	SLC32A1	44779	False	False	False	alt	100	0.03802	-10	0.01221
2399	chr20	38817104	C	T	rs6129108	0.22352982	0.0196058265973488	0.22352982	0.0197504789726614	0.0356098780929466	0.1484333693938332	0.0080702894870326	0.029754402416949	0.0080702894870326	0.0298873711654904	0.0198731483619807	0.613891947496416	0.0045701655662448	0.2560370576957222	0.0045701655662448	0.2600239993904284	0.0007144666162849	0.5074791167077455	0.0001661394129453	0.200610253589642	0.0001661394129453	0.203813158205191	0.010716406585068	0.1921157449134484	0.010716406585068	0.1953159023502168	PPP1R16B	11406	ACTR5	68643	SLC32A1	92617	False	True	False	alt	-90	0.1034	-90	0.12384
2400	chr20	38828463	G	A	rs6129111	-0.0538843696	0.2270150168545023	0.0705585232	0.2261207633649188	0.0335580850724522	0.1780166214134074	-0.0025895819234899	0.1819225142882957	0.0031568710845938	0.1815796185117003	0.2121721487248853	0.1705320607644527	-0.0049664811859525	0.1599085049651888	0.011027578068491	0.1586667139725636	0.0068463725356422	0.1248845788382986	-0.0002225033226881	0.1303365266202532	0.0004287143644943	0.129494449034185	-0.0095575863547886	0.1515747120796813	0.0152090000329912	0.1504978117193	PPP1R16B	22765	ACTR5	80002	FAM83D	97850	False	False	False	ref	-100	0.02863	-25	0.02893
2401	chr20	38829366	G	T	rs1006945	-0.0916609987999999	0.1409319012776463	0.0916609987999999	0.1391054615085932	0.0551332870903742	0.0451686864371431	-0.0057521542326003	0.0724551085142257	0.0057521542326003	0.0718709766541005	0.0736424070469466	0.3672597826585214	-0.0077758631451815	0.2155720027681102	0.0077758631451815	0.2122032182628669	0.004081521123991	0.1995817758182112	-0.0004812790036391	0.1310471853610755	0.0004812790036391	0.1288524143346373	-0.0159075913034871	0.1497380828018469	0.0159075913034871	0.1474826996820663	PPP1R16B	23668	ACTR5	80905	FAM83D	96947	False	False	False	ref	10	0.009125	25	0.1643
2402	chr20	38853973	A	G	rs4812319	-0.3325405152	0.0093822049121861	0.3325405152	0.0094116462354477	0.0666063356784845	0.0214763646058197	-0.0233395076112237	0.0085412982255847	0.0233395076112237	0.0084693212567893	0.620862063277358	0.0235303794849254	-0.2026750216821692	0.0029562855745989	0.2026750216821692	0.0030588487480453	0.0408613967356919	0.0039667119139126	-0.0139896000946106	0.0028832448644007	0.0139896000946106	0.0029078270874643	-0.0964979710336181	0.006903008349545	0.0964979710336181	0.0068141340191215	PPP1R16B	48275	FAM83D	72340	ACTR5	105512	False	True	True	ref	90	0.08154	60	0.1465
2403	chr20	38855668	G	A	rs6028167	-0.1289709359999999	0.067028222706321	0.1289709359999999	0.0662002348144564	0.0375187235552314	0.1290605258587346	-0.0048944911823406	0.0605211166691269	0.0048944911823406	0.0599652776157943	0.2925992214047705	0.1135425166277591	-0.0383672032094718	0.0411249089413361	0.0383672032094718	0.0403304057345849	0.0109314350580682	0.0647024593739258	-0.0014502944131686	0.0364035354345775	0.0014502944131686	0.0357646637046479	-0.0436623667975322	0.028359354709666	0.0436623667975322	0.0279417276574098	PPP1R16B	49970	FAM83D	70645	DHX35	106632	False	False	False	ref	30	0.03473	-20	0.1707
2404	chr20	38856737	T	A	rs4812324	-0.01141389136	0.7489878431042897	0.01141389136	0.742211208606623	0.0072164134532032	0.9842751981968416	-8.506261507966139e-05	0.8764104811672597	8.506261507966139e-05	0.8694135431073781	0.002739104615486	0.8946625718001486	-2.6995184322747862e-05	0.909447388914753	2.6995184322747862e-05	0.902326839942414	1.9643232724632783e-05	0.9550449898799752	-2.035210963612263e-07	0.948520494652049	2.035210963612263e-07	0.941747119140005	-0.0001245422453894	0.8998098279942702	0.0001245422453894	0.892797132793299	PPP1R16B	51039	FAM83D	69576	DHX35	105563	False	False	False	ref	75	0.04504	65	0.101
2405	chr20	43178221	T	C	rs2425614	0.00750430786	0.4346039944818113	0.03274702226	0.4353603436457379	0.0423768176334271	0.0945674684799545	0.0002039689201859	0.3247369493997324	0.0012140429081173	0.3250988239539344	0.2323743855366038	0.1547116453487157	0.0067940727769274	0.2162599901095614	0.0115173776426186	0.2164476424987473	0.0095246622133649	0.0832074817707844	0.0002246253067396	0.1733791505451439	0.0004132596821486	0.1736593215996656	0.003054996535911	0.2454458350269165	0.0106380521922733	0.2458371347431883	PTPRT	11749	SRSF6	279673	ENSG00000288000	279834	False	False	False	alt	45	0.0166	100	0.252
2406	chr20	43185524	A	G	rs926288	0.0288971094	0.4292978776746233	0.0338981994	0.43316385816108	0.0136873410994851	0.7512456114925631	0.0004124957895147	0.5376330957229439	0.0004755146271234	0.5418877594852765	0.0216167397974332	0.6071858276955702	0.0007611196476496	0.5392417622224771	0.0008671686284884	0.5431130257109241	0.0002958038218629	0.6651849283794434	1.0778410794858024e-05	0.586675149241774	1.2114736151099508e-05	0.5906817073051565	0.0021576325426412	0.5057338304642643	0.0024809475108046	0.5096914120463713	PTPRT	4446	SRSF6	272370	ENSG00000288000	272531	False	False	False	alt	-70	0.1206	-10	0.03995
2407	chr20	43261438	T	C	rs3950190	0.0830245335999999	0.1491115380812573	0.0830245335999999	0.15128651470176	0.0156703586219743	0.6602873209629043	0.0013918097537131	0.2601748837966025	0.0013918097537131	0.2635693937438303	0.0235368348124443	0.5751396678621833	0.0019170666131869	0.3727015319597798	0.0019170666131869	0.3777836889096422	0.0003649441486462	0.6134896446460247	3.215795087095241e-05	0.4098299677691422	3.215795087095241e-05	0.415151640675017	0.0055441918775361	0.3116383966636328	0.0055441918775361	0.316442898589098	PTPRT	71468	SRSF6	196456	ENSG00000288000	196617	False	False	False	alt	-100	0.03693	-100	0.1346
2408	chr20	43263195	T	C	rs1569440	0.123705701	0.0770100756138168	0.123705701	0.0781051127841918	0.022466311756279	0.3953888243362727	0.0030977016298615	0.1236590944085026	0.0030977016298615	0.1253305460596284	0.1374154597340898	0.2431649694001081	0.019026178651807	0.0982476259991456	0.019026178651807	0.1001953147487043	0.0032114324869164	0.2377692492901246	0.0004884314597591	0.1138700598752756	0.0004884314597591	0.1158675696264768	0.0305829566823924	0.0573615016929937	0.0305829566823924	0.0585460067303045	PTPRT	73225	SRSF6	194699	ENSG00000288000	194860	False	False	False	alt	75	0.04413	5	0.01587
2409	chr20	44995017	C	T	rs6017460	0.005424993694	0.7468343240641283	0.010347420254	0.7492201336434855	0.0256646428802863	0.3156165755949636	0.0001104506704714	0.6640349661509604	0.000271826911749	0.6661713550238081	0.0028875655702549	0.8908188942004839	1.597861913960281e-05	0.9141724343256664	2.5783560324979165e-05	0.9159708108325638	7.356587411436132e-05	0.852749525793417	4.0115843334600137e-07	0.8863237757488078	7.156788579188595e-07	0.8882459658805701	8.33030912869858e-05	0.9048903733189606	0.0001261918115535	0.9056401474683284	STK4	28522	TOMM34	34620	PABPC1L	84956	False	False	False	alt	35	0.02397	70	0.1089
2410	chr20	46052214	G	A	rs12624433	-0.04784268596	0.4025761463329828	0.05340840992	0.402365386005894	0.0299105375832331	0.2387756965380272	-0.0028150998869809	0.3587739844504949	0.0029450781578869	0.3591346061449936	0.4286455412226584	0.0618846018655666	-0.0244326914262859	0.1668145225621672	0.0269719591661272	0.1665352733025664	0.0135263022700735	0.0532387276644335	-0.001433454535542	0.1564473692025089	0.0014938762579059	0.156197482501733	-0.0147116558345155	0.2459333750812093	0.016473392497773	0.2456260992527912	SLC12A5	30523	NCOA5	37748	MMP9	43305	True	False	False	ref	-70	0.3198	-100	0.506
2411	chr20	46093017	T	C	rs4578918	0.0587028656	0.239175881255989	0.0587028656	0.2426507930950739	0.0190710970186965	0.5193785459272753	0.00114977115132	0.2940362896831571	0.00114977115132	0.298009359029174	0.0010837649698128	0.9572009548348396	6.25080686220978e-05	0.84802584805249	6.25080686220978e-05	0.8550013495845211	2.0107660066129344e-05	0.9525613151423132	1.1752352502277586e-06	0.8415744792931481	1.1752352502277586e-06	0.8484161769340123	0.0002193922998251	0.8485888145808845	0.0002193922998251	0.8546670630105149	NCOA5	3055	CD40	25255	SLC12A5	71326	False	False	False	alt	-100	0.08057	-100	0.1672
2412	chr20	46107215	A	G	rs6065926	-0.0303921154	0.4361210127700911	0.0344470826	0.4327348804052098	0.0445568930601525	0.0795684224414869	-0.0014721130048117	0.2653104433268987	0.0016291141119619	0.2633924428168599	0.2260829401867308	0.1609286868255565	-0.008614003151425	0.2297162864473489	0.0095843672242742	0.2277828427440528	0.0103511607276159	0.0837420133298476	-0.0004234443118536	0.1635731412472663	0.0004610150792553	0.1620082351262692	-0.0070708653624096	0.2740734837122074	0.0084845435650423	0.2716682827470673	CD40	11057	NCOA5	17253	SLC12A5	85524	False	False	False	ref	70	0.05087	100	0.3894
2413	chr20	46111557	C	T	rs6074022	-0.04315941564	0.1575111741784728	0.08110016836	0.156824680829484	0.0395283522812991	0.1147302497357716	-0.0013410610241169	0.1205234032494938	0.0032896168377112	0.120095758869601	0.0191176470588234	0.6326661478156557	-0.0007241751117874	0.4793487971910447	0.0012461626912924	0.477428400563601	0.0007512013730165	0.5095020927213453	-2.48384030253536e-05	0.3829524853550373	5.142035462320147e-05	0.3815289993141878	-0.0022434099831744	0.4210908043158235	0.0039111213750783	0.4191523235846833	CD40	6715	NCOA5	21595	SLC12A5	89866	False	False	False	ref	60	0.00659	-30	0.06494
2414	chr20	46119308	T	G	rs4810485	0.0384536842	0.3737971811111324	0.0384536842	0.3787802749980626	0.022159837048103	0.4099738619439216	0.0008593339459588	0.3605113510622376	0.0008593339459588	0.3653576957307867	0.3283279997360694	0.097155438278112	0.0136253242181645	0.1230218134123513	0.0136253242181645	0.1255790143819378	0.0073594694496258	0.1097453509921412	0.0003079566055887	0.1376880201570112	0.0003079566055887	0.1402913707397705	0.0127998086503249	0.1605832556298907	0.0127998086503249	0.1635685381204456	CD40	1036	NCOA5	29346	SLC12A5	97617	False	False	False	alt	-100	0.02164	90	0.2537
2415	chr20	49483086	C	T	rs74361372	0.00139631484	0.7472114861478361	0.01177026356	0.7458820356821283	0.014490385281964	0.7126696106525632	2.1269807818513013e-05	0.7684828866711848	0.0001725273177197	0.7671026002827976	0.7773588796146613	0.0091284120556277	0.0006407718872474	0.1630929201359681	0.0089929706935317	0.1621534841798384	0.0112452529545054	0.0622283047771047	1.006918609870519e-05	0.2204988935722535	0.0001315861976978	0.2194514461223769	0.0006359077562601	0.523633694119227	0.0020858764145029	0.5224794634746212	KCNB1	1211	PTGIS	85051	ZNFX1	204660	False	False	False	alt	80	0.0929	-20	0.0867
2416	chr20	49486664	T	C	rs6012677	-0.01783287868	0.5467683390044012	0.02352397228	0.5423399702298162	0.0126534513732608	0.7872834609454452	-0.0002545623768908	0.6443295706781024	0.0003110768205704	0.6398441417297691	0.0151570386988221	0.6686821036626363	-0.000273279369363	0.6536620337197295	0.0004032539505387	0.6492301898887406	0.0002007422772956	0.7302117494232524	-4.371363366307977e-06	0.6975011471128958	5.662053994700861e-06	0.6933609341919903	-0.001051598429613	0.6194683690759643	0.001435947345848	0.6149085093059652	KCNB1	2367	PTGIS	81473	ZNFX1	208238	False	False	False	ref	100	0.0531	85	0.175
2417	chr20	49488780	T	C	rs11696755	-0.169739261	0.0360688466642443	0.169739261	0.0356962138535224	0.0394079949643821	0.1134163288531522	-0.006748510373146	0.0372416518408841	0.006748510373146	0.036965135689994	0.0538088482729041	0.5033093605020884	-0.009889076649823	0.2172310348728978	0.009889076649823	0.2139196535998851	0.0020734478411554	0.3818445254647125	-0.0003812452055783	0.1690502630331339	0.0003812452055783	0.1662081670181252	-0.0171851802975816	0.1541243463138302	0.0171851802975816	0.15185169770434	KCNB1	4483	PTGIS	79357	ZNFX1	210354	False	False	False	ref	0	0.0	-85	0.1282
2418	chr20	49493651	C	T	rs6095541	-0.0064191406	0.6527268100454243	0.0163678017999999	0.6499392511893172	0.006975028425405	0.9875266712883534	-3.7459513853072514e-05	0.8320410792535392	0.0001133096782112	0.8285813850102245	0.0049305532644914	0.8359363159892719	1.7833239370609455e-05	0.817517352065083	9.552556946023052e-05	0.8140556196825984	3.517337481779314e-05	0.9222218165262276	1.7971671191485268e-07	0.8879156090755458	6.84548753269485e-07	0.8844520949285296	0.0001204183299792	0.8038657758173862	0.0003991950117118	0.8006242315077385	KCNB1	9354	PTGIS	74486	ZNFX1	215225	False	False	False	ref	-80	0.01497	85	0.09174
2419	chr20	49506550	T	G	rs5596	-0.0126252994	0.7380841254128591	0.0126252994	0.7314864204797126	0.0185059682660705	0.5419932237000579	-0.0002426329323434	0.711682181576947	0.0002426329323434	0.7053308217296377	0.0581942199201609	0.4277527218230088	-0.0008898459765072	0.5632432617999865	0.0008898459765072	0.557527624617268	0.0010856345849151	0.444532375448146	-1.7105733898829755e-05	0.567098379310778	1.7105733898829755e-05	0.5612096928969886	-0.002054534657385	0.5620400046775732	0.002054534657385	0.5561240061997468	KCNB1	22253	PTGIS	61587	B4GALT5	207328	False	False	False	ref	75	0.06824	-100	0.1024
2420	chr20	49510639	T	C	rs729824	0.3062198399999999	0.0085638301696074	0.3062198399999999	0.0085758839018256	0.0602145683832834	0.0308645814242136	0.0186922942858527	0.0078183889360964	0.0186922942858527	0.0078414003090164	0.4330111180759459	0.0596201172008814	0.1323459201843776	0.005462653442307	0.1323459201843776	0.0054690455185022	0.0253196622144164	0.0138004449712738	0.0079068750422993	0.0045715992159426	0.0079068750422993	0.0045519256248278	0.0994688396951601	0.0043091456300577	0.0994688396951601	0.004299535923811	KCNB1	26342	PTGIS	57498	B4GALT5	203239	False	True	True	alt	95	0.03162	100	0.2646
2421	chr20	49513791	C	T	rs495146	0.01402923076	0.5688283015529066	0.02255708996	0.5718519602865043	0.0307315147177349	0.2129596033817868	0.0004146186442201	0.463255390486403	0.0006815514874326	0.4656175835884021	0.0751690805318201	0.4411639145990653	0.0006961747381622	0.4969546613738516	0.0016533468315372	0.4996862330388267	0.0025825864060998	0.3633019912326043	2.665574047643756e-05	0.4393907828876292	5.661644448536139e-05	0.4420255804371084	0.000835505262116	0.506074948881772	0.0028710699086139	0.5090195885292877	KCNB1	29494	PTGIS	54346	B4GALT5	200087	False	False	False	alt	-100	0.0638	-100	0.2137
2422	chr20	49514764	G	C	rs6012680	-0.0658054455799999	0.2082515768764864	0.06594789842	0.2060684086990911	0.0127625050495248	0.782139590097224	-0.0009501636967415	0.3665599934754703	0.0009515590548812	0.3627573402644289	0.1452830655537593	0.2442130239548119	-0.0117109059552248	0.1788524770051816	0.0117169274558194	0.1761597757930185	0.00199682820832	0.336541167700436	-0.0001747232164513	0.2525170655891197	0.0001747821984254	0.2490390481573007	-0.0179019167958826	0.1403048935589225	0.0179167628913595	0.1381508774742316	KCNB1	30467	PTGIS	53373	B4GALT5	199114	False	False	False	ref	100	0.1938	55	0.3516
2423	chr21	14982650	C	T	rs1810404	-0.0487320342	0.3148217819419074	0.0487320342	0.3105738219163501	0.0157985549277703	0.6514693234469544	-0.0007731471267384	0.4090442627090485	0.0007731471267384	0.4038851845067535	0.055141697733496	0.4277989911682011	-0.0027375720855675	0.3472254017084371	0.0027375720855675	0.3424989607901988	0.0008312713593194	0.4767406565795656	-4.175257655841126e-05	0.3899540682926884	4.175257655841126e-05	0.3850485554339264	-0.0064588763155289	0.3012002022426142	0.0064588763155289	0.2967947579298901	NRIP1	83286	SAMSN1	323829	HSPA13	599166	False	False	False	ref	-10	0.00421	-55	0.1725
2424	chr21	14991212	G	A	rs34570637	-0.0398714046	0.3992102612868683	0.0398714046	0.3942833416099118	0.0244391404699857	0.3471634717047887	-0.0010028602803926	0.3732370273914699	0.0010028602803926	0.3686674817403032	0.0161583253604301	0.6812331824641035	-0.0012364116655904	0.5773097705224746	0.0012364116655904	0.571399345640566	0.0004126053338052	0.638045317562619	-3.2309398794392825e-05	0.5460245937341602	3.2309398794392825e-05	0.5403086987359943	-0.0030739665467981	0.5273603372028836	0.0030739665467981	0.521746202055493	NRIP1	74724	SAMSN1	332391	HSPA13	607728	False	False	False	ref	-60	0.01291	-15	0.0662
2425	chr21	15022260	T	C	rs73172392	-0.172149254	0.0337407227600245	0.172149254	0.0334063018486711	0.0504296383934464	0.0546002803764238	-0.0086934701619095	0.0245144322308306	0.0086934701619095	0.0244163451393981	0.3064349576061495	0.108351797123421	-0.0541105617141308	0.0256540811003891	0.0541105617141308	0.0252731628125422	0.0156775728643473	0.0383048188028651	-0.0027685720449135	0.0179567911122141	0.0027685720449135	0.0177618519291413	-0.0562130909570782	0.0163747379801735	0.0562130909570782	0.0161651174662284	NRIP1	43676	SAMSN1	363439	HSPA13	638776	False	False	False	ref	-95	0.0646	90	0.436
2426	chr21	20758576	C	T	rs2826495	0.0002742863999999	0.8335605515929199	0.0075365855999999	0.8349706542392926	0.0175802569789376	0.5365954906280297	-2.62368016133207e-05	0.8278820185051041	0.0001239923785336	0.8291389758149929	0.0197288113226221	0.6242975352161725	6.59987596062831e-05	0.758915012838657	0.0001218665828588	0.7608780919909034	0.0003553490370403	0.6535981025268729	8.036565411040622e-07	0.7750392156330409	1.8985824514470084e-06	0.7768705302962078	0.0002152683844148	0.7620704234013438	0.0004214641549272	0.7639433683388207	NCAM2	239834	TMPRSS15	2272697	CHODL	2857312	False	False	False	alt	95	0.04285	-100	0.05817
2427	chr21	33900088	T	G	rs3746862	0.05102813854	0.2977468303221961	0.05102813854	0.3017525350542856	0.0261324047927525	0.3038455109447491	0.0013891244936658	0.2915600763597156	0.0013891244936658	0.2952755241527134	0.1320147801128303	0.2509442101646231	0.0074044859109313	0.2277291252777713	0.0074044859109313	0.231600742956503	0.0034758868158089	0.2196593007516716	0.0002050420775161	0.2182399024160446	0.0002050420775161	0.2218184235767525	0.0128237273597043	0.1919014053091831	0.0128237273597043	0.1951341485203138	ATP5PO	15726	ENSG00000249209	31519	MRPS6	173137	False	False	False	alt	85	0.0381	5	0.007812
2428	chr22	19990499	C	T	rs4819527	-0.0086715469	0.7034553751094667	0.0150850223	0.7017471637029383	0.015985462213251	0.6390297890737084	-0.0001707423519097	0.7224733890172635	0.0002514865678398	0.7207470257413557	0.3049800402494144	0.1073231108558316	-0.002073267605844	0.2935672843456883	0.004299807090827	0.2925576792369351	0.0048240464650736	0.1652278382332345	-4.270042668598079e-05	0.3387893429430416	7.064932614522951e-05	0.3375561385150599	-0.0027968394312295	0.3742594550921891	0.0050188050542707	0.3726846115103991	ARVCF	26324	TANGO2	26516	TXNRD2	48679	False	False	False	ref	-100	0.1292	100	0.268
2429	chr22	20080563	G	C	rs61174903	-0.1425891464	0.0605039228922496	0.1425891464	0.0596822077889012	0.0198809117489545	0.4876547384207921	-0.0032870186705074	0.1268122895013599	0.0032870186705074	0.1251772986534196	0.9642984395104086	6.1932826102235e-05	-0.1371982463639836	0.0055918283532228	0.1371982463639836	0.0055506053234433	0.0191717054965371	0.0259421840468688	-0.0031660498055579	0.0193931519413272	0.0031660498055579	0.0191470933973854	-0.0051590181782191	0.3504299314542748	0.0051590181782191	0.3456990004614453	DGCR8	341	RANBP1	35376	TRMT2A	36829	True	False	False	ref	100	0.03247	-15	0.0891
2430	chr22	21676839	C	T	rs138647105	0.0907601026	0.146681800761616	0.0907601026	0.148595726885887	0.0264381631087865	0.3010079702121524	0.0028952055846884	0.1594350469831277	0.0028952055846884	0.1611555623119153	0.002889215136419	0.8984200518201532	0.0002015051837684	0.7391500486185325	0.0002015051837684	0.7457454882114234	6.726545622091876e-05	0.8721853266251701	5.159507724335708e-06	0.697613473772098	5.159507724335708e-06	0.7040960904991637	0.0007068391013163	0.7305268513374872	0.0007068391013163	0.7372002075172503	PPIL2	10838	SDF2L1	34536	CCDC116	44122	False	False	False	alt	100	0.03143	-100	0.5137
2431	chr22	21713850	C	T	rs7349039	0.1740745992	0.037473212723663	0.1740745992	0.0377711790620686	0.0466501204733497	0.0732060734004668	0.0086100239695273	0.0315227820266316	0.0086100239695273	0.0316763586441453	0.4495859588928111	0.0556587866766768	0.0819992845787548	0.01423515780284	0.0819992845787548	0.01443274229731	0.0209252647704486	0.0215510814228388	0.00402264276536	0.0130801450792548	0.00402264276536	0.013230984831602	0.0592540661805945	0.0161708829123689	0.0592540661805945	0.0163098540825293	YPEL1	21944	PPIL2	47849	SDF2L1	71547	False	False	False	alt	-60	0.04343	20	0.04333
2432	chr22	38825665	A	G	rs75974641	0.0212093686	0.5401253133596495	0.023801111	0.54417812243899	0.0112379562619351	0.8522207395945448	0.0002557560883468	0.6568963177189777	0.0002782327241739	0.6611988924776712	0.006510837649698	0.8017129366886783	0.0001583571717013	0.7489092719198179	0.0001695583281444	0.7529364067647824	7.741436507210722e-05	0.8535550788669763	1.9850211421230187e-06	0.7908702161489389	2.082162090734139e-06	0.7950100160782859	0.0006012668668139	0.7374939400685981	0.0006342581900959	0.7416844003563962	NPTXR	18363	DNAL4	31467	SUN2	31522	False	False	False	alt	100	0.1229	100	0.03625
2433	chr22	38828900	C	T	rs8136346	-0.411448732	0.0042210495552711	0.411448732	0.004175825193989	0.067252697646012	0.0233764813482094	-0.0322715284450305	0.0047472782171105	0.0322715284450305	0.0046871222314884	0.1935988585002144	0.1922161782605073	-0.095478530456859	0.0144966653043773	0.095478530456859	0.0143653247343836	0.0150291736917595	0.0495390983346142	-0.0081095895767559	0.0090299830463447	0.0081095895767559	0.0089353772239567	-0.1068803404704562	0.0050558957782659	0.1068803404704562	0.0050035558597262	NPTXR	15128	DNAL4	34702	SUN2	34757	False	True	True	ref	-80	0.05542	-100	0.2292
2434	chr22	38851745	C	T	rs6001259	0.3489612080000001	0.0070741488093915	0.3489612080000001	0.0071197466142045	0.0701474281168137	0.0193471857660503	0.0281171200752555	0.0057708761807466	0.0281171200752555	0.0058047528693967	0.3104978390683249	0.1044517224385615	0.1133846348157893	0.0085633969116852	0.1133846348157893	0.0086049210799779	0.0222340866086307	0.0196646307385975	0.0092508294410744	0.0053053173077606	0.0092508294410744	0.0053354383430835	0.1116715053940813	0.0035046772135724	0.1116715053940813	0.003531375969336	NPTXR	7717	CBX6	20504	DNAL4	57547	False	True	True	alt	100	0.01776	-30	0.02734
2435	chr22	38861668	G	A	rs1053197	-0.308333762	0.0082747283482686	0.308333762	0.0082633023808342	0.0622239991350856	0.0276288136364028	-0.0200141040865463	0.0072815576802086	0.0200141040865463	0.0072602139800569	0.401135726303982	0.0694263481880092	-0.1242589231538585	0.0059624159983964	0.1242589231538585	0.0059547854926983	0.025012690677824	0.0142894751681111	-0.0080637798533088	0.0046051848475198	0.0080637798533088	0.0045901789407077	-0.1054435683415261	0.0035610165277153	0.1054435683415261	0.0035768760549132	CBX6	10581	NPTXR	17640	DNAL4	67470	False	True	True	ref	-10	0.0005493	-30	0.06104
2436	chr22	39604216	G	T	rs5750857	-0.190570284	0.0278761259398683	0.190570284	0.0276597063979466	0.1432420252203473	0.0008466818561343	-0.02817589649942	0.0039044277788462	0.02817589649942	0.0038833431086712	0.0972674936491701	0.3133738613619429	-0.0198146011928872	0.0922488835047273	0.0198146011928872	0.0904606649883245	0.0142930000322243	0.0469331546797007	-0.0029961349045825	0.0189034190875864	0.0029961349045825	0.0186884896514678	-0.0353254594041766	0.0434978746842545	0.0353254594041766	0.0427156709641273	CACNA1I	33462	RPS19BP1	71455	ATF4	84520	False	True	True	ref	60	0.03625	-95	0.1465
2437	chr22	39650072	A	G	rs136828	0.047660111	0.2528331135773288	0.058154473	0.2550532353652301	0.0434521356112154	0.0874710753449537	0.0022351475603846	0.1455929277559449	0.002627459798096	0.1465757080403249	0.5724514202764672	0.0308053462371315	0.0252485521044984	0.0520986891480044	0.0317188086267827	0.0526578787110067	0.0248336541802861	0.0144542716514574	0.0011875246614581	0.0383573622677171	0.0014294031919381	0.0387521321248279	0.0142126620698756	0.1248652364635632	0.0171010524232126	0.126249362785403	CACNA1I	79318	RPS19BP1	117311	ATF4	130376	False	False	False	alt	-20	0.1648	50	0.6436
2438	chr22	41062993	A	C	rs35060074	-0.0059761842039999	0.8306731678145793	0.0075137914039999	0.8266213062164554	0.059847890528452	0.0321666001550574	-0.0003449547778881	0.5505234683433857	0.000465684990064	0.5471942548757478	0.0155001484609547	0.6620744228590022	-0.0001036132061354	0.779222713724937	0.0001378480609584	0.7761544771934363	0.0010137206728009	0.4584481406527669	-6.143471917131939e-06	0.6353949877885987	8.831532421312281e-06	0.6318984616292335	-0.0003637293391837	0.7702942624104048	0.0004923954999834	0.766396775174584	EP300	29518	RBX1	111645	L3MBTL2	142290	False	False	False	ref	75	0.00354	50	0.1172
2439	chr22	41381909	T	C	rs2234059	0.0489289852	0.2646375088394562	0.0590504568	0.2667715388516457	0.0182429075610906	0.5498230680309808	0.0010117592898253	0.3336379102388329	0.001199633469829	0.3362349521072248	0.9990143842169508	9.999990000010005e-07	0.048875353534668	0.0301168465192068	0.058987308228518	0.0303142110263394	0.018224517436008	0.027563508882354	0.0010106187802843	0.0585222859122743	0.0011983163110804	0.0592664644352426	7.917917587677196e-05	0.9172613066715668	9.237570518954755e-05	0.921541453045162	TEF	14575	TOB2	64892	ACO2	65922	True	False	False	alt	-20	0.003174	-95	0.1162
2440	chr22	41394496	T	C	rs2273071	0.22443083	0.0217902534521309	0.22443083	0.0219178733666431	0.0632232209155301	0.0260379576984025	0.0154812069059276	0.0135171299250344	0.0154812069059276	0.0135623594870198	0.0759328296657978	0.357209248379056	0.0192320219767503	0.0948806553144345	0.0192320219767503	0.0967836860729045	0.0050251926026853	0.1659132871497164	0.0013716122913181	0.046966349006413	0.0013716122913181	0.0475605205365802	0.0347679060407112	0.0459045579863763	0.0347679060407112	0.0464461169506826	TEF	27162	TOB2	52305	ACO2	53335	False	False	False	alt	100	0.01703	100	0.341
2441	chr22	41935405	G	C	rs10154646	-0.0309046903399999	0.473074801699121	0.03232111954	0.4694091617419294	0.0185785109976194	0.5368689165641297	-0.0006203398976494	0.5101609446813837	0.0006460531084606	0.5062774330346015	0.3702170829071954	0.0790269803715641	-0.0127559590501875	0.1638402850680405	0.0132110204091055	0.1619553289228499	0.0069024428820686	0.118377448872798	-0.0002545828567421	0.2001303256313728	0.0002628438333193	0.198144911569209	-0.0100211144469004	0.2354930204827122	0.0105440269209197	0.2330863929258109	TNFRSF13C	8599	CENPM	11747	SMIM45	11790	True	False	False	ref	-95	0.04672	-100	0.05933
2442	chr22	43750399	G	C	rs76365544	-0.0819562154	0.1500416119072486	0.0819562154	0.1478556702508604	0.0306136052208448	0.2154319479614521	-0.0025143886854992	0.1370429588465061	0.0025143886854992	0.1350930763899289	0.3557470885157203	0.0857135730032172	-0.0284154023719527	0.0572475528821306	0.0284154023719527	0.0560968305583371	0.011017580069518	0.06548412871057	-0.0008794753497919	0.0575436670365256	0.0008794753497919	0.0564971758283054	-0.0279321038566856	0.0607528737597099	0.0279321038566856	0.059677729740847	EFCAB6	61938	SULT4A1	112114	PNPLA5	141614	False	False	False	ref	100	0.067	10	0.006348
2443	chr22	49834093	G	A	rs138891	-0.1820030319999999	0.0318320984365383	0.1820030319999999	0.031552379901652	0.0433881391806489	0.086475283663465	-0.0080607715271899	0.0300938268772602	0.0080607715271899	0.0299284193295462	0.0260400514664642	0.5667356558329883	-0.0045617607478062	0.2552479039705756	0.0045617607478062	0.2511006675905001	0.0011401596085636	0.4224180396579524	-0.0002045696986111	0.1778565456514929	0.0002045696986111	0.1747531618774234	-0.0117275906436606	0.1809729721569863	0.0117275906436606	0.1777436377352317	BRD1	6220	ZBED4	19752	CRELD2	84075	False	False	False	ref	70	0.06354	70	0.1079
2444	chr22	49842658	G	A	rs2319458	-0.01112547126	0.6658381075653288	0.01687030726	0.6619144737423595	0.0208287032879467	0.4526171440825574	-0.0002680088488078	0.6292840560278863	0.0003617306963449	0.625429575072674	0.0024265118273893	0.9028608333924684	-2.3978440007462767e-05	0.889504350570442	4.23865165104588e-05	0.8852309380957949	5.017445259569832e-05	0.8863354515915842	-6.018377746162649e-07	0.8718184151639019	9.021490293435691e-07	0.867573378983026	-6.103394807166396e-05	0.8929135613856621	0.0001435122562765	0.8886677295583951	ZBED4	11187	BRD1	14785	CRELD2	75510	False	False	False	ref	-100	0.004837	-100	0.1965
2445	chr22	49865504	A	T	rs13056783	-0.0001574307999999	0.6411813842182048	0.0175703672	0.6416586260636999	0.0341965077374697	0.169408805859323	0.0001671572421549	0.4684440392251549	0.0006283951507925	0.4688735545335283	0.4050270528850913	0.0682968285557165	-0.0017757879216683	0.202172385884388	0.0068602174814758	0.2022789442839614	0.0129077931939982	0.0507775426958343	-5.223279669806091e-06	0.1668389858572999	0.000225022214166	0.1671059797811725	-0.0001195935468971	0.3243094127160058	0.0055004783741875	0.3244147589872727	ZBED4	11659	BRD1	37631	CRELD2	52664	False	False	False	ref	-100	0.983	-100	0.552
2446	chr22	49867412	G	C	rs2295409	0.087454119826	0.1471403148788364	0.087648596174	0.1485118128766873	0.0273058189516446	0.2715616962875998	0.0029821907602734	0.1565172595406891	0.0029855114729512	0.1577105380163374	0.052404242684174	0.4274775931850109	0.0051110734975634	0.2828222093293006	0.0051181808570479	0.2863444570989056	0.0014933493116765	0.376337247576903	0.0001732978420539	0.2511554785841942	0.0001734192012789	0.2540189644654243	0.0119733760021114	0.2060644373661495	0.0119882220975883	0.2087468751635029	ZBED4	13567	BRD1	39539	CRELD2	50756	False	False	False	alt	5	0.002441	-100	0.09717
2447	chr22	49867475	G	T	rs8139758	0.048998211	0.3159788424393651	0.048998211	0.3201210898615214	0.1093390618735276	0.0030394055228498	0.0057626071490138	0.0634730584434924	0.0057626071490138	0.0639513836230016	0.0441316683712183	0.4596863202928728	0.0022698527447722	0.374696353918021	0.0022698527447722	0.3795901660518037	0.0047876931110249	0.167962709767524	0.0002674850475373	0.1670073181206669	0.0002674850475373	0.1696976643489487	0.0056703836890897	0.3247750325561824	0.0056703836890897	0.3292845996883461	ZBED4	13630	BRD1	39602	CRELD2	50693	False	True	False	alt	-55	0.02747	-65	0.1536
2448	chr22	49869993	G	T	rs5769761	-0.0322898226	0.3994418499494539	0.0360992266	0.3955474943138853	0.0715890262246534	0.0163579673795839	-0.0021603578371724	0.1446618918636362	0.0024769856684464	0.1435616408652863	0.0438149516677113	0.470425267142858	-0.0012228891393549	0.4342143729703814	0.0013838188949821	0.4301763659351427	0.0032491483583405	0.2378113295307738	-8.503166663881322e-05	0.2626856386043328	9.84077326856718e-05	0.2597796074365471	-0.0033783115040744	0.4021740207022515	0.0037841047804427	0.3979682871084034	ZBED4	16148	BRD1	42120	CRELD2	48175	False	True	False	ref	-100	0.013916	-100	0.1401
2449	chr22	49870394	G	A	rs5769762	0.0602820984	0.2287260888106985	0.0602820984	0.2322060695589555	0.0277600706175464	0.2674269104083845	0.0016332511003749	0.2081725952962223	0.0016332511003749	0.2112500094188714	0.0237817953878129	0.5973302417081262	0.0015259978011324	0.4326292638086689	0.0015259978011324	0.4381204068725681	0.0006138766150743	0.5399284552941683	3.877827836224434e-05	0.3923966837504488	3.877827836224434e-05	0.3976951351031139	0.0043433077100722	0.3786367589412781	0.0043433077100722	0.3839756534283366	ZBED4	16549	BRD1	42521	CRELD2	47774	False	False	False	alt	-45	0.00903	100	0.05542
2450	chr22	49874174	T	C	rs4824106	-0.0738852306	0.1851339315254444	0.0738852306	0.1822340661803068	0.0857844372875066	0.0084598065982017	-0.0058819319421256	0.0462901658994863	0.0058819319421256	0.0459108964615922	0.0299858137309886	0.5450818644430783	-0.0019955428161963	0.3801355408822681	0.0019955428161963	0.3750414923402392	0.0025442498337705	0.2822407657365401	-0.0001576526609573	0.2023632886457781	0.0001576526609573	0.1991069091275973	-0.0055070766388439	0.3250277676515136	0.0055070766388439	0.3201463663989668	ZBED4	20329	CRELD2	43994	ALG12	44264	False	True	False	ref	-70	0.05542	75	0.1348
2451	chr22	49879526	A	G	rs8184990	0.19983624	0.0256337825940728	0.19983624	0.0259013325005725	0.0168770340600026	0.587369609787579	0.0038429257844648	0.099958385480796	0.0038429257844648	0.1010448889879537	0.9019489624228828	0.0008280366347515	0.179952393195302	0.0028167212164445	0.179952393195302	0.0028040321181455	0.0151210218400469	0.0415577169043558	0.0034421988204277	0.0162499365481958	0.0034421988204277	0.0165017379008983	0.0153929266602883	0.1416741102611836	0.0153929266602883	0.1439700709603989	ZBED4	25681	CRELD2	38642	ALG12	38912	False	False	False	alt	100	0.2	80	0.576
2452	chr22	49884920	A	G	rs910799	0.64566426	0.0008890151170559	0.64566426	0.0008873653653773	0.1021146714808756	0.0043647149843677	0.0721056526253281	0.000882719701293	0.0721056526253281	0.0008885187172813	0.6939980535119263	0.0154115606248821	0.4673195979123809	0.0002854795711095	0.4673195979123809	0.0002754000318972	0.0724417736638944	0.0007412779868287	0.0528623907981924	0.0003410353217369	0.0528623907981924	0.0003330670143178	0.1513072811850482	0.0012764854963388	0.1513072811850482	0.0012685021236988	ZBED4	31075	CRELD2	33248	ALG12	33518	False	True	True	alt	-75	0.2212	-40	0.2471
2453	chr22	49884994	C	T	rs910800	-0.267671056	0.0159641178391555	0.267671056	0.0158712071767286	0.0685817385777998	0.0218699797290364	-0.0218165391421305	0.0104717374676112	0.0218165391421305	0.0103936419397861	0.6103386559334895	0.0254122460440821	-0.1695969197529167	0.0042693842635298	0.1695969197529167	0.0042749342971194	0.0427008906872577	0.0040444632786693	-0.014022453637134	0.0034915543344862	0.014022453637134	0.0034738333593287	-0.0715020949490284	0.0114842105309167	0.0715020949490284	0.011359632934817	ZBED4	31149	CRELD2	33174	ALG12	33444	False	True	False	ref	-100	0.07355	50	0.1627
2454	chr22	49893179	G	A	rs768618	-0.1152774024	0.0817818073191368	0.1152774024	0.0808103166068203	0.0400806589218391	0.1090226642279159	-0.0047714084160074	0.0636046409010986	0.0047714084160074	0.0630541723749476	0.0143083369073932	0.6809817736400436	-0.0018351159607853	0.4130635022988609	0.0018351159607853	0.4078764324248389	0.0006292867248754	0.5499367970761102	-8.349862454085475e-05	0.3155263834810896	8.349862454085475e-05	0.3111092816036376	-0.0052645904127214	0.3458271283080409	0.0052645904127214	0.3409884624466254	CRELD2	24989	ALG12	25259	ZBED4	39334	False	False	False	ref	-30	0.02393	-45	0.1987
2455	chr22	49893618	C	T	rs768619	0.0175796869999999	0.5002363161306893	0.0262956654	0.5045602368299427	0.032080026933762	0.1923245797848493	0.0005468721231226	0.371446858875642	0.0008418712246172	0.37477476154276	0.0204158556299692	0.6100306818337168	0.0003340057819472	0.5856199295098236	0.0004511830820332	0.5897956688041024	0.0006499370082355	0.5236121238255522	1.0013221839129212e-05	0.5135733202873743	1.3979179209690071e-05	0.5175174835257852	0.001153046748705	0.5612523556601432	0.0015291478341195	0.5654876060511116	CRELD2	24550	ALG12	24820	ZBED4	39773	False	False	False	alt	35	0.02353	-90	0.1346
2456	chr22	49898221	A	G	rs8138687	0.0031815245299999	0.9247193644336325	0.0031815245299999	0.931556261567962	0.0104370847847833	0.8958060696317668	3.2687951746172555e-05	0.945605234667918	3.2687951746172555e-05	0.9524691568984316	0.0002532084061891	0.995841079025998	7.276374873105476e-07	0.9894448729217434	7.276374873105476e-07	0.9965605360991632	2.664602773928243e-06	0.9976001611281392	7.428947505871996e-09	0.9904485217179002	7.428947505871996e-09	0.9975501471065874	2.474349246148265e-06	0.992855087209186	2.474349246148265e-06	0.9958004800430909	CRELD2	19947	ALG12	20217	ZBED4	44376	False	False	False	alt	-70	0.0632	80	0.1571
2457	chr22	49915587	T	A	rs3883952	0.00087167874	0.7915235833170728	0.0088233535399999	0.7927680953488814	0.0127501981593199	0.793212323205524	1.2311388191843324e-05	0.8239517341491402	0.0001156117645905	0.8250460160053347	0.0364471643957639	0.5190829597921455	0.0001311697209141	0.6549091746899699	0.0003630457496814	0.6562939014673197	0.0004776191133561	0.5919658176635034	1.7632787799915576e-06	0.6954914624819796	4.806823053751339e-06	0.6968252115399909	0.0002235162152353	0.6567072989331495	0.0010384019003001	0.6578737355435774	CRELD2	2581	ALG12	2851	PIM3	45182	False	False	False	alt	-100	0.04926	90	0.2212
2458	chr22	49919710	G	C	rs8137331	-0.054791714	0.2626995065757717	0.054791714	0.2594071292297751	0.1050504615724141	0.0035153522663249	-0.0059222874286498	0.0533922119722897	0.0059222874286498	0.0530192712804227	0.1709775329088449	0.2044141677586614	-0.0099498784560176	0.1692098668556615	0.0099498784560176	0.1662301154767704	0.0179555546260363	0.0295298308735023	-0.0010708618133371	0.0575679051334059	0.0010708618133371	0.0565875703927811	-0.0155735541552571	0.1433991963804418	0.0155735541552571	0.1411197591904965	ALG12	1272	CRELD2	1542	PIM3	41059	False	True	True	ref	-80	0.06555	-50	0.04807
2459	chr22	49920698	A	G	rs7284417	0.008986256	0.7368754869396787	0.0129475008	0.7388598226188381	0.0151263709581499	0.6750070603245826	9.922088723071528e-05	0.7818376032069643	0.0001719702600347	0.7836851390313118	0.1591286991521229	0.2158480030745794	0.001178652886032	0.4114718800211477	0.0018006033721638	0.4126671771046656	0.0024405840756377	0.2795212350445218	1.2621451264207512e-05	0.459776578049061	2.424300370300491e-05	0.4608881919035645	0.0021320642670977	0.4547416976061398	0.0031910857444491	0.4563342865890412	ALG12	2260	CRELD2	2530	PIM3	40071	False	False	False	alt	-75	0.03445	100	0.3347
2460	chr22	50660705	G	A	rs6010043	0.01154668674	0.7458351324595868	0.01154668674	0.752573528432752	0.0284948876934828	0.2519554524339291	0.0003113802904036	0.6239517716546684	0.0003113802904036	0.630413902180758	0.0006053907822242	0.9857345819273222	7.37769621354046e-06	0.9620711082151604	7.37769621354046e-06	0.9691720261298322	1.7177160471831835e-05	0.9658183743720554	1.951106992683153e-07	0.9424930497851828	1.951106992683153e-07	0.9495027228193887	3.299132328197683e-05	0.9556246205525568	3.299132328197683e-05	0.9627290988634918	SHANK3	13704	ARSA	32532	CHKB	59250	False	False	False	alt	100	0.00865	85	0.0504
2461	chr3	2325211	G	A	rs4685508	-0.0483743	0.2460723174887233	0.062120514	0.2444675125770886	0.0223565361185548	0.3913344124105007	-0.0016500462568047	0.2589889803991804	0.0018266708389615	0.257482991865733	0.0567706443205436	0.4127209672796628	-0.0037220551020268	0.3071247259790114	0.0042562894058687	0.3048394996467093	0.0013934086815073	0.3937268433681735	-0.0001224622697528	0.2964607861260411	0.0001293312701245	0.2942109162184184	-0.0082412325558377	0.2443708016201883	0.0096796542509319	0.2423591840823487	CNTN4	226397	IL5RA	801402	TRNT1	801723	False	False	False	ref	30	0.00711	35	0.05273
2462	chr3	2326193	G	A	rs12638682	0.0269648832	0.4710289222685632	0.0302690648	0.4749870623445871	0.0180967928802013	0.554366465276901	0.0005364015064702	0.4891103829521485	0.0005771204769192	0.4929233830902569	0.1788286430668733	0.1973648257817233	0.005011645533669	0.2362727311491281	0.005691454930611	0.2384592577161427	0.0031175917414716	0.2376430144445325	9.65999936319479e-05	0.2661097871329186	0.0001049776017432	0.2688137361692966	0.0074651116756292	0.2424697406059273	0.0085010392266833	0.2450441041395979	CNTN4	227379	IL5RA	800420	TRNT1	800741	False	False	False	alt	-60	0.11224	-100	0.11475
2463	chr3	2331105	A	C	rs56251018	-0.0278191544	0.491318239635123	0.0283732228	0.4871756208274975	0.0158449744393384	0.6473616271200728	-0.0004724020319941	0.5502283358064997	0.0004809538603887	0.5459676496923428	0.0010087097093463	0.9684680236398764	-3.2485046123383465e-05	0.9053692216464152	3.268155020294082e-05	0.9008841839592135	1.5191641725354178e-05	0.9704540429993848	-5.166092537676534e-07	0.9083007798080368	5.196422172212464e-07	0.9038429909372552	-0.0001253670284714	0.9008493241544075	0.0001303157269637	0.8963999613179073	CNTN4	232291	IL5RA	795508	TRNT1	795829	False	False	False	ref	-15	0.006958	-65	0.05185
2464	chr3	2343483	G	A	rs1720179	0.139049364	0.0276155192275182	0.208977332	0.0277115840711044	0.0535929769728059	0.0456289618756697	0.0087090149727633	0.0218004962236438	0.0119087567866577	0.0218685039368097	0.4683555474910099	0.0504593813024867	0.0599210428074171	0.0108553014243267	0.1004310929350791	0.0109821145662121	0.0249526294487726	0.014330255519395	0.0037784688030886	0.0091477295969966	0.0056321148847447	0.0092109909960146	0.0497814324832568	0.0131066195004535	0.0689180495529675	0.0131010134535592	CNTN4	244669	IL5RA	783130	TRNT1	783451	False	False	False	alt	-80	0.0569	-80	0.3154
2465	chr3	2348928	C	A	rs1685495	-0.0664378436	0.2088705626646738	0.0664378436	0.2058604393936998	0.0198300253785399	0.4838087630538873	-0.0014210193368782	0.2596957080625402	0.0014210193368782	0.2562515557104197	0.0059103955659661	0.8087576447953969	-0.0003801032080682	0.6398212100194088	0.0003801032080682	0.6337168421403828	0.0001155244907871	0.8021994822496913	-8.180514249731412e-06	0.6308380199554221	8.180514249731412e-06	0.6246812371949261	-0.0012742898617663	0.6184829981036952	0.0012742898617663	0.6123203002852527	CNTN4	250114	IL5RA	777685	TRNT1	778006	False	False	False	ref	35	0.00827	-85	0.1349
2466	chr3	2351034	T	G	rs4685517	-0.0060005606659999	0.8176509550439157	0.008117362254	0.8156925708248994	0.0160713084678561	0.6418285785861395	-8.744327906553794e-05	0.8268812505188194	0.0001188369668471	0.8251071722358273	0.0696347860512684	0.3728298140079262	-0.0002862184195837	0.6168915109890886	0.0004529463497942	0.6155886935043599	0.0011505421182886	0.4168109432443472	-4.398404539804989e-06	0.6403595290539951	6.876604611302209e-06	0.6389934620864571	-0.0007439543400085	0.6346720394248543	0.0011744911088383	0.6330126032132883	CNTN4	252220	IL5RA	775579	TRNT1	775900	False	False	False	ref	-100	0.047	-100	0.3376
2467	chr3	2394813	A	G	rs6787394	0.0014992889999999	0.9026680635778882	0.00391109976	0.904260631857012	0.0515710440866813	0.0511303551763879	7.787850082566672e-05	0.737356495120066	0.0001895903357485	0.7388018284060573	0.0273827983240407	0.5796022578210274	9.312875389188384e-05	0.7840219865680912	0.0001353557638049	0.7858206203379332	0.0013676697430861	0.4080000679470023	4.579686064503745e-06	0.67429855631371	6.549112659883367e-06	0.6759503909008331	0.0002268153475635	0.7955750733052609	0.0004033189271221	0.7972275018286045	CNTN4	295999	IL5RA	731800	TRNT1	732121	False	False	False	alt	-90	0.006897	-70	0.1326
2468	chr3	2507826	T	G	rs67888396	-0.0067486947199999	0.6671754864379779	0.0153669673999999	0.665507968595943	0.0137679944752117	0.7494459711111328	-0.0001002237501009	0.7215810781971552	0.0002139493933965	0.719966612172699	0.0156923229190722	0.6471351333406101	-9.082219628742188e-05	0.7199651801631584	0.0002149739166573	0.7186491048992238	0.000215855171186	0.6975773031520767	-1.3406717647641387e-06	0.7487539063534326	2.9804817600211724e-06	0.7473702107023279	-0.0002614562370096	0.7119380598310786	0.0007398304245982	0.7106734320587522	CNTN4	409012	IL5RA	618787	TRNT1	619108	False	False	False	ref	-50	0.005005	70	0.0822
2469	chr3	2507907	T	C	rs67733815	0.0446660332	0.3244849963704563	0.0446660332	0.3289622789251827	0.0204194084988443	0.4624754640336529	0.0009748257219868	0.3419396977302043	0.0009748257219868	0.3462512861477075	0.0212711556860545	0.5931790841518323	0.0009909020728086	0.4811222697059352	0.0009909020728086	0.4866819506804792	0.0004398611341785	0.5851442608734883	2.1726113880627508e-05	0.4731445066785961	2.1726113880627508e-05	0.4788560349073367	0.0031102570024083	0.4344817400409335	0.0031102570024083	0.4400431328051203	CNTN4	409093	IL5RA	618706	TRNT1	619027	False	False	False	alt	-100	0.1539	75	0.11084
2470	chr3	3558477	A	G	rs1072848	-0.0184050175999999	0.2822759357993967	0.0510471755999999	0.2811554021902789	0.0212303685574577	0.4406687606052509	-0.0002537903096106	0.3058428774238332	0.0010663591447776	0.30471975891274	0.0060844247962785	0.8339434458539939	0.0001431506445051	0.7001287680455875	0.0002956943438048	0.6995833200317124	0.0001484449991096	0.8077529520201069	4.174421212798526e-06	0.6755926103059612	7.272630735765705e-06	0.6750589275654044	0.0003876480485632	0.6830121536510072	0.0009237570518952	0.6825394701258831	LRRN1	240955	CRBN	378750	TRNT1	431543	False	False	False	ref	100	0.0177	65	0.08545
2471	chr3	3562021	G	A	rs7642870	-0.00198118282	0.8932650230557517	0.00512011962	0.8892550496070359	0.0116767759865867	0.8439390548900985	-2.6662677330886308e-05	0.9149745484759636	6.252739196330842e-05	0.9108923783994958	0.0058270924746791	0.8220829930008706	-1.886958187335048e-05	0.9213051263128228	2.451347515475621e-05	0.9168705842995214	6.993548492479647e-05	0.8663596968598611	-2.389284787775284e-07	0.9360423128568008	3.034142082970759e-07	0.9315071561104888	-8.24783082049389e-05	0.9215122100415876	9.237570518953195e-05	0.9171156273161756	LRRN1	237411	CRBN	382294	TRNT1	435087	False	False	False	ref	-75	0.02509	-60	0.0857
2472	chr3	16730989	G	T	rs56345807	-0.4110755519999999	0.0036917843863775	0.4110755519999999	0.0036861594342052	0.0771176362034779	0.0125490293131211	-0.0334820542052143	0.0031201529341196	0.0334820542052143	0.0031164426548498	0.0659018178219128	0.4092747616366312	-0.0291715344997101	0.073591060428999	0.0291715344997101	0.0721894362673189	0.0051225209046412	0.1796072893524106	-0.0023212000298034	0.0309872937866127	0.0023212000298034	0.0304979886221994	-0.0435402989013889	0.0357281310895888	0.0435402989013889	0.0352179335427591	DAZL	60683	PLCL2	71663	RFTN1	216963	False	True	True	ref	25	0.01172	55	0.1357
2473	chr3	16745264	C	T	rs138823185	-0.0386840578	0.3781645067728186	0.0386840578	0.3731825450495029	0.0157973540796728	0.6458429355956388	-0.0006490755167837	0.450711131805917	0.0006490755167837	0.445216468371081	0.0095402659100656	0.7342192381816633	-0.000423364938822	0.6298869402079922	0.000423364938822	0.623714709627455	0.0001527834693474	0.7559763585319755	-7.323613050206632e-06	0.6483615615031498	7.323613050206632e-06	0.6421011776088816	-0.0015019299924119	0.5928007291200083	0.0015019299924119	0.5868235993080974	PLCL2	57388	DAZL	74958	RFTN1	231238	False	False	False	ref	100	0.0105	15	0.04187
2474	chr3	16748700	A	G	rs9874028	0.226204114	0.0178864386291809	0.226204114	0.0180329741884855	0.0589784968443373	0.0325507627228207	0.0133640849601394	0.0128095220806137	0.0133640849601394	0.0128671802026487	0.1629276500280426	0.2118491149154323	0.0354967522529248	0.0416129313069599	0.0354967522529248	0.0424458704880661	0.0095474254087188	0.0787781719840054	0.002084273065766	0.0224148316535088	0.002084273065766	0.0227487762842785	0.0550155059219425	0.0166618495622868	0.0550155059219425	0.0168732708163754	PLCL2	53952	DAZL	78394	RFTN1	234674	False	True	False	alt	-100	0.0396	80	0.0945
2475	chr3	17411731	T	C	rs6787756	0.076124847	0.1651194799475851	0.076124847	0.1677141042839862	0.0163828043722338	0.615352697114719	0.0012246356917542	0.2677169404489833	0.0012246356917542	0.2714588974646999	0.028472336775428	0.5463739703313412	0.0023543202563901	0.3525805809696624	0.0023543202563901	0.3575412994629673	0.0004688828048152	0.577195541596956	3.793495180432307e-05	0.3870031897497661	3.793495180432307e-05	0.3923564088651042	0.006610636402626	0.2858176204594781	0.006610636402626	0.290445708705646	PLCL2	609079	DAZL	741425	RFTN1	897705	False	False	False	alt	-90	0.2296	60	0.09515
2476	chr3	17613896	T	C	rs9681617	-0.0553403376	0.2649373885040668	0.0553403376	0.2616263515557112	0.0238890984841863	0.3601741262451758	-0.001302069100416	0.2782741995700319	0.001302069100416	0.2748104500130854	0.0021411368810002	0.9239639149149452	-0.0001173633442971	0.8175761537318854	0.0001173633442971	0.8109721264317116	5.0831145797014566e-05	0.8972987588117014	-2.685364577708868e-06	0.7871802492699959	2.685364577708868e-06	0.780665661796757	-0.0003901223978093	0.8112989169783215	0.0003901223978093	0.8047616418763893	PLCL2	811244	TBC1D5	830921	SATB1	831725	False	False	False	ref	30	0.0063	-100	0.2903
2477	chr3	17648935	C	T	rs55701200	-0.227173102	0.018613854686637	0.227173102	0.0185412291234193	0.0374565151109775	0.1294275795918709	-0.0085420646890795	0.0266561993747936	0.0085420646890795	0.0264912596644877	0.1758660222361518	0.1996572053532529	-0.04461482544898	0.0390299717749424	0.04461482544898	0.0383060404021096	0.006673795398418	0.1240520228971398	-0.0017048148615519	0.0353640602779267	0.0017048148615519	0.0348280719456415	-0.0593497410181121	0.0160445020582821	0.0593497410181121	0.0158958070696951	TBC1D5	795882	SATB1	796686	PLCL2	846283	False	True	False	ref	30	0.003784	-10	0.01953
2478	chr3	17655683	T	C	rs11128837	0.0274401242	0.5004289558980008	0.0274401242	0.5063266190819954	0.0187574969876879	0.5315541517693365	0.0005237630326221	0.5142065261934137	0.0005237630326221	0.5201115095096234	0.0296361057041997	0.5375123490221815	0.0007591430441905	0.5233443260517958	0.0007591430441905	0.5288759892247169	0.0005439612298398	0.5498398275878587	1.3856022197974342e-05	0.5300110743124588	1.3856022197974342e-05	0.5356642984310958	0.0021625812411335	0.5053043596941464	0.0021625812411335	0.5110156427986036	TBC1D5	789134	SATB1	789938	PLCL2	853031	False	False	False	alt	90	0.01358	90	0.06158
2479	chr3	17672024	T	A	rs13083917	0.0237081297999999	0.3939808760371632	0.0361285158	0.3971112973235347	0.0219220805917073	0.4174680059246682	0.0005343338635739	0.3771972571462771	0.0008007080978929	0.3799729096056393	0.048216818976609	0.4425773662757582	0.0012023927728175	0.3879698204239281	0.0017115769715459	0.3909170280369317	0.0010788328608653	0.4261555588857277	2.812435902926256e-05	0.3770623238804471	3.904459534349644e-05	0.3801646392924089	0.003022005212629	0.3515849851015137	0.0045264095542871	0.3547738784552692	TBC1D5	772793	SATB1	773597	PLCL2	869372	False	False	False	alt	-25	0.03244	-40	0.1492
2480	chr3	17678612	C	A	rs4909009	-0.1101721329999999	0.0896956703883374	0.1101721329999999	0.0884025430726497	0.0421350043411328	0.094331956880073	-0.0047324768774656	0.0629495782210235	0.0047324768774656	0.0623731137514422	0.0037865791296888	0.8620096085870707	-0.0004170366504984	0.6163998695504876	0.0004170366504984	0.6102298530221055	0.0001567606239828	0.7523012374774675	-1.755076159456389e-05	0.5021907784574299	1.755076159456389e-05	0.4964820805203377	-0.0014211012503711	0.5925061052484416	0.0014211012503711	0.5863667949734275	TBC1D5	766205	SATB1	767009	PLCL2	875960	False	False	False	ref	-40	0.01697	50	0.05347
2481	chr3	17693826	A	G	rs6797952	0.259254978	0.0138321898028583	0.259254978	0.0139194715487561	0.056940107397859	0.0383451443638126	0.0152180779912056	0.0121557605204155	0.0152180779912056	0.0122036984936666	0.5878550691168223	0.0282876838583696	0.1561585335830874	0.0042808310116483	0.1561585335830874	0.0042624209386139	0.0348485026212399	0.0069594906160219	0.0095737578265569	0.0042242054143935	0.0095737578265569	0.0042389246512797	0.0681510012866615	0.0109102914061257	0.0681510012866615	0.0110057392549923	TBC1D5	750991	SATB1	751795	PLCL2	891174	False	True	False	alt	-100	0.9233	-100	0.465
2482	chr3	17699917	C	G	rs35642812	0.8341133403999998	0.0006451272204959	0.8341133403999998	0.0006452280923527	0.096422859360829	0.0070962137550714	0.1092348506238819	0.0011528199443609	0.1092348506238819	0.0012002121347768	0.1018194714790009	0.4147709064943673	0.1499674228268674	0.0274200533167622	0.1499674228268674	0.0274945392179079	0.013879778837709	0.1064956644840701	0.0219313582875604	0.0152659091421656	0.0219313582875604	0.015209184817628	0.0943452871894691	0.0221795308787141	0.0943452871894691	0.0224723136724765	TBC1D5	744900	SATB1	745704	PLCL2	897265	False	True	True	alt	20	0.00647	-90	0.1777
2483	chr3	17712309	C	A	rs6810235	0.1925594686	0.038320897926127	0.1952626154	0.0385135504600922	0.0337923193352026	0.1726947602828334	0.0083947256531234	0.0500905401691682	0.0084266307662617	0.050349897991522	0.0867564580515324	0.3322944163391312	0.0182224968126085	0.1208361152995684	0.0184663382959018	0.1227056689605605	0.0030948423391339	0.2525681048630777	0.0008330290888188	0.0994125998137523	0.0008359071382266	0.1008183130258664	0.0312130909570782	0.0651132078034591	0.0317211573356207	0.0659668585351385	TBC1D5	732508	SATB1	733312	PLCL2	909657	False	False	False	alt	-40	0.005035	35	0.0674
2484	chr3	17716436	G	C	rs13071934	-0.344524466	0.005637678170196	0.344524466	0.0056246234434274	0.0748604992590854	0.0136267708178568	-0.0258775988209978	0.0041033656504639	0.0258775988209978	0.004112287548647	0.0125886641813202	0.6970468694182139	-0.0045532295017335	0.266297900171825	0.0045532295017335	0.2620877597466026	0.0009630871617925	0.4612089211314204	-0.0003496135071089	0.1331738454114548	0.0003496135071089	0.130819227486612	-0.0097868760515983	0.2216282918624412	0.0097868760515983	0.2180751408234908	TBC1D5	728381	SATB1	729185	PLCL2	913784	False	True	True	ref	-75	0.01474	0	0.0
2485	chr3	17735631	A	G	rs9880456	-0.043526462	0.2075857826645799	0.0715910664	0.2068306456370748	0.0841182227259003	0.0087231955900068	-0.0042540040185393	0.0657335629985284	0.0063742112239447	0.065683084835937	0.1366310910230609	0.2617865534105555	-0.0143592304892394	0.1738625939563707	0.0169903953630856	0.1731385422342633	0.01220621283946	0.0717630065073097	-0.0014075493517334	0.0820254550696952	0.0016002785109059	0.0817752787750564	-0.0134134472633697	0.1446109676135694	0.0192430140872949	0.1439729765984197	TBC1D5	709186	SATB1	709990	PLCL2	932979	False	True	True	ref	100	0.02565	-50	0.24
2486	chr3	17757432	A	G	rs4566568	0.01110418146	0.6459532714828919	0.0178568957	0.6475485407742955	0.0088173481658886	0.9447080115696986	0.0001106619111122	0.789717416113496	0.000164710457353	0.7913384259280271	0.005893075121243	0.8037713943552731	8.081574206615869e-05	0.8038061033691328	0.0001225200832083	0.8049974929137975	5.257324094223389e-05	0.8860510996575531	7.931298690821763e-07	0.8616606410092111	1.12687056384453e-06	0.8628285732868278	0.0002540331892712	0.7861119742610099	0.0004486819966348	0.78727909100912	TBC1D5	687385	SATB1	688189	PLCL2	954780	False	False	False	alt	60	0.05328	20	0.0748
2487	chr3	17762972	A	G	rs7609916	-0.1181422063999999	0.0848861552967489	0.1181422063999999	0.0840915827055278	0.0369927430673238	0.1380167605031269	-0.0049262395636101	0.0750404181351019	0.0049262395636101	0.0743720497797469	0.0129614661344065	0.6978294054114056	-0.0012707026206348	0.4565780786029988	0.0012707026206348	0.4514366609430306	0.0004412721168553	0.5932199411441621	-4.98850358294874e-05	0.3682898099257519	4.98850358294874e-05	0.3634600299201667	-0.0037684339018837	0.4057106020761884	0.0037684339018837	0.4005195409225386	TBC1D5	681845	SATB1	682649	PLCL2	960320	False	False	False	ref	40	0.00804	5	0.01874
2488	chr3	17780701	A	C	rs11709790	0.0302307445999999	0.4680679338806976	0.0302307445999999	0.4736604513415108	0.08191396202086	0.0101388234305376	0.0025558031754735	0.1526857934809557	0.0025558031754735	0.1546138971893184	0.1426454092573652	0.2469151956975994	0.0047771264570115	0.278339966297657	0.0047771264570115	0.2824244916098804	0.0120981715667117	0.0649429314094201	0.000408544005543	0.1354012457198258	0.000408544005543	0.1377690473360953	0.0074263468707729	0.279127955699651	0.0074263468707729	0.2835124802008377	TBC1D5	664116	SATB1	664920	PLCL2	978049	False	True	False	alt	-65	0.0622	-95	0.2498
2489	chr3	17782174	A	G	rs4616675	0.167558248	0.0426671488947818	0.167558248	0.043036945498245	0.0236848810507983	0.3648121856396962	0.0044097927324933	0.084351215307775	0.0044097927324933	0.0852288186826721	0.0043977433934874	0.8607933546611949	0.0009051016929319	0.6122073886747287	0.0009051016929319	0.618854555498049	0.0001338593956014	0.821597664610753	2.918802400210862e-05	0.572672050372118	2.918802400210862e-05	0.578932211750493	0.0023564052654151	0.5871210656732215	0.0023564052654151	0.5937658182850072	TBC1D5	662643	SATB1	663447	PLCL2	979522	False	False	False	alt	-25	0.00806	-90	0.4346
2490	chr3	17803260	C	T	rs17200916	-0.1035075508	0.0981867314619819	0.1035075508	0.096876820771865	0.0804518574241622	0.0103140052379397	-0.0083721447535189	0.0265637668501597	0.0083721447535189	0.0264439664129226	0.0827397644419517	0.3469791441964301	-0.0085968733350604	0.1761896246311483	0.0085968733350604	0.1731112778279379	0.0067815422951997	0.1245312092945361	-0.0007105458736203	0.0741904477772811	0.0007105458736203	0.0728853423188838	-0.0175018970010886	0.116284707482217	0.0175018970010886	0.1142394555938344	TBC1D5	641557	SATB1	642361	PLCL2	1000608	True	True	False	ref	-90	0.04663	-100	0.0454
2491	chr3	17811044	G	T	rs11128871	-0.0270481227999999	0.1569669283821846	0.0842603788	0.1555887668888544	0.0251563126230326	0.3168969215163523	-0.0005726733098975	0.1726591631673967	0.0025019775198823	0.1710843262026649	0.0291329880241496	0.5475250439848135	-0.001661068855796	0.3562732992383399	0.0028657708872743	0.3540017241516802	0.0008172038990871	0.4972112746994676	-4.98141618189206e-05	0.3243311391336738	9.04389650924006e-05	0.322400193747506	-0.0036150242486225	0.286545553547317	0.0073347959486654	0.2847531187632366	TBC1D5	633773	SATB1	634577	PLCL2	1008392	False	False	False	ref	-90	0.06323	75	0.12
2492	chr3	17811429	G	A	rs12495352	-0.0311376254	0.4101650296654646	0.036039373	0.4067042890404254	0.0740107884275292	0.0142698888784445	-0.002281533393701	0.1331100996529539	0.0026526203258965	0.1321280423103159	0.0131288971000626	0.6977857012570994	-0.0005294917988864	0.6054177646146857	0.0005547597903852	0.6015858688972174	0.0009385664383801	0.4682667402460031	-3.781233426192598e-05	0.4169622732007541	3.9725248159704107e-05	0.4136103501879901	-0.001671010524232	0.5699046389280977	0.001788129721883	0.5659849660817288	TBC1D5	633388	SATB1	634192	PLCL2	1008777	False	True	False	ref	100	0.00856	70	0.2434
2493	chr3	17815368	G	A	rs6771673	0.1031053658	0.0987288475731009	0.1031053658	0.1001015340963402	0.0289786713838374	0.2477579954307479	0.0031684472269555	0.1081861366310008	0.0031684472269555	0.1095471653138507	0.0342375705189534	0.5192300664252808	0.0033582327721436	0.2914224239746367	0.0033582327721436	0.295869134999583	0.0009923979273949	0.4513180214457936	0.0001039686177346	0.2541160530030005	0.0001039686177346	0.2582652236015767	0.0088235294117646	0.2239357230918095	0.0088235294117646	0.2278617659058231	TBC1D5	629449	SATB1	630253	PLCL2	1012716	False	False	False	alt	-100	0.04306	-100	0.0842
2494	chr3	17815640	T	A	rs4908979	-0.02866514054	0.431136806914162	0.03615983294	0.4282667890278245	0.0189203605154756	0.5148912188421866	-0.0005508352230083	0.476135671144713	0.0006887256491385	0.4731029795154151	0.0199638745010062	0.6294760244339771	-0.0004045152294156	0.5829384698168533	0.0007595494282135	0.5800915478006475	0.0003656524220328	0.6334405292689748	-7.231983930195119e-06	0.588661748690346	1.3764048712612348e-05	0.5857043425668217	-0.0011901619873972	0.5429098326176858	0.0022904226188511	0.5397925478554938	TBC1D5	629177	SATB1	629981	PLCL2	1012988	False	False	False	ref	95	0.0873	-60	0.06
2495	chr3	17816952	T	C	rs2033373	0.173454864	0.0339739863770582	0.173454864	0.0343348386349072	0.0293566477540494	0.2421354762420935	0.0049857029271961	0.0563379637088669	0.0049857029271961	0.0569727621355673	0.0005930190359935	0.9753818047555454	0.0001116465182926	0.8423514150630147	0.0001116465182926	0.8492806059995898	2.1866293372870407e-05	0.953404653412766	4.132702776297189e-06	0.7964873202461356	4.132702776297189e-06	0.8034403200523359	0.0003043449572762	0.8646103610854825	0.0003043449572762	0.8696283134780869	TBC1D5	627865	SATB1	628669	PLCL2	1014300	False	False	False	alt	100	0.03442	-75	0.0639
2496	chr3	18869767	C	T	rs7638304	-0.0221225964	0.3032624841020875	0.0502538656	0.3026999999677883	0.0543384917144565	0.0441956789316615	-0.0010430871495163	0.1517427446773971	0.0024285904073848	0.1516337792130851	0.0377989838672428	0.5003488094569378	-0.0003068326955587	0.4012090067693311	0.0019483173567808	0.4009416663906137	0.0019535861143574	0.3255995427511796	-1.1194958847538416e-05	0.2811904204588939	9.202015588327644e-05	0.2809189843969474	-0.0006779716934446	0.351863386360402	0.0051994325492395	0.3514285145231556	KCNH8	278744	SATB1	424146	TBC1D5	424950	False	False	False	ref	-80	0.006317	-80	0.2216
2497	chr3	24451001	A	G	rs6781559	-0.00592391746	0.734592482972731	0.01267184666	0.730708351614829	0.0152893752990861	0.6715390653638788	-0.0001042730005326	0.7504967856018222	0.0001884498206181	0.7463921781794438	0.0076168717627263	0.7665490363352524	-7.42017577840644e-05	0.8022136796714678	9.075935139304668e-05	0.7980242730825435	0.0001216559118884	0.7860304415801779	-1.216860988158072e-06	0.8115529163319379	1.4234081490519574e-06	0.807426316579809	-0.0002903236448813	0.7985663456796119	0.0003431097621325	0.7943599583757824	THRB	44755	RARB	236887	NKIRAS1	504410	False	False	False	ref	-100	0.1932	-45	0.0951
2498	chr3	24458364	G	C	rs58274299	0.146187256	0.0510076510999477	0.146187256	0.0515632164726694	0.0333415718704628	0.1755032633369858	0.0052886023565238	0.0592859426319918	0.0052886023565238	0.0598073864061977	0.1033931575995512	0.2975068422896705	0.015048476378706	0.1071292224080596	0.015048476378706	0.109301295410283	0.0034267485208029	0.2229383017038855	0.0005459006394846	0.0909083769334004	0.0005459006394846	0.0925927376025154	0.0288360661146118	0.0575602485569195	0.0288360661146118	0.0585339622883316	THRB	37392	RARB	229524	NKIRAS1	511773	False	False	False	alt	-85	0.01245	-70	0.1306
2499	chr3	24461494	G	A	rs78158283	-0.200910066	0.0237335682739871	0.200910066	0.0235599346350418	0.0446983663441086	0.0791950271505096	-0.0091443822581814	0.0235495375607945	0.0091443822581814	0.0234609089408922	0.033296493022335	0.5120417169753285	-0.0064975625526474	0.201134301298602	0.0064975625526474	0.1975398874196004	0.0014557605235786	0.367323538603982	-0.0002884417540154	0.135438265665134	0.0002884417540154	0.1330973892867117	-0.0157805747088515	0.1286688017363479	0.0157805747088515	0.1261695897375487	THRB	34262	RARB	226394	NKIRAS1	514903	False	False	False	ref	90	0.011215	50	0.05713
2500	chr3	24472985	G	A	rs77704657	-0.140124994	0.055847670160977	0.140124994	0.0551678634758654	0.0548278648384021	0.0422595503573701	-0.0075308289149976	0.0314439053742396	0.0075308289149976	0.0313324980464697	0.2724761637689287	0.1247372870709231	-0.038966551733659	0.0410640578385763	0.038966551733659	0.040282335553057	0.0147739316127446	0.0413529164228052	-0.0020817089258419	0.0247609215081638	0.0020817089258419	0.0243471885689851	-0.0451601728745339	0.0261656557952489	0.0451601728745339	0.0258458380347021	THRB	22771	RARB	214903	NKIRAS1	526394	False	False	False	ref	-100	0.03105	-100	0.0676
2501	chr3	24515284	G	C	rs2362188	0.0205350485999999	0.5767777058348315	0.0205350485999999	0.5830987484781205	0.0103018277222461	0.8915412903197211	0.0002310426459013	0.7027384306680654	0.0002310426459013	0.7095011195438974	0.0058543103163867	0.8042393431445104	0.0001408551928966	0.7595658966784196	0.0001408551928966	0.7661639277349471	6.19772543598515e-05	0.8670740761755007	1.6037050303023315e-06	0.8090444733885961	1.6037050303023315e-06	0.8157128446718421	0.0005542542311371	0.7411118589668283	0.0005542542311371	0.747736098343821	THRB	19528	RARB	172604	NKIRAS1	568693	False	False	False	alt	-85	0.03	50	0.0603
2502	chr3	24583168	C	A	rs79369190	0.032879032308	0.4356165272583936	0.032879032308	0.4407459962108284	0.0238518437830268	0.3619493785352391	0.0008706153929262	0.3950167938595427	0.0008706153929262	0.3995671321679183	0.2588235294117647	0.1335675526051004	0.0082664189146062	0.2096912723779967	0.0082664189146062	0.2131413140394226	0.0058970995083068	0.1369832058971738	0.0002105314072421	0.2088827678661032	0.0002105314072421	0.2120799255370777	0.0102998911286331	0.2303392059996227	0.0102998911286331	0.2338369451077577	THRB	87412	RARB	104720	NKIRAS1	636577	False	False	False	alt	-10	0.004547	-15	0.0293
2503	chr3	29687101	T	C	rs1440502	0.01597410108	0.6528522171152543	0.01597410108	0.659445444484856	0.0141645548807293	0.7285561166235794	0.0002225900961119	0.6992938646969525	0.0002225900961119	0.7060637805575912	0.0268343175744778	0.5674695019089141	0.0004701876582145	0.6007151538496561	0.0004701876582145	0.6066833379395388	0.000390007976606	0.6204653490800831	6.7573883711814405e-06	0.6372204544766283	6.7573883711814405e-06	0.6432848105464604	0.0014689386691299	0.5806435673000762	0.0014689386691299	0.586654913632561	TGFBR2	919378	RBMS3	1112309	GADL1	1207560	False	False	False	alt	95	0.0232	55	0.0983
2504	chr3	29700840	A	G	rs7634119	0.0617348418	0.2596329720770159	0.0617348418	0.2624528625584079	0.0135708244358586	0.7230740147799811	0.0013565374504654	0.3815498518519928	0.0013565374504654	0.3849126006067446	0.0434058592590148	0.4707438989051072	0.0021244044551674	0.3829558516119108	0.0021244044551674	0.3879259424506998	0.0005294802307134	0.5601832020953318	4.23959773751308e-05	0.4401818175815602	4.23959773751308e-05	0.4454465935038055	0.0054229487644748	0.3358751405236028	0.0054229487644748	0.3404041999733345	TGFBR2	905639	RBMS3	1126048	GADL1	1193821	False	False	False	alt	-90	0.04706	-50	0.1207
2505	chr3	29702478	C	A	rs140030786	-0.0065594668	0.3351175316027107	0.047478412	0.3360153392085552	0.0239287008141385	0.3587887392294491	-0.0002851202209695	0.3417210865200817	0.0011443244332935	0.3426051687022562	0.0169303223252284	0.7827366363166055	0.0001776389067857	0.8150487890865902	0.0001973822622	0.8186808088107232	0.0003080594138026	0.7895771873823249	3.0780225850323936e-06	0.8067704926341749	3.678852571710549e-06	0.8101608983733967	0.0004049684932862	0.8244148467061634	0.0004742502721783	0.8268671629557827	TGFBR2	904001	RBMS3	1127686	GADL1	1192183	False	False	False	ref	-35	0.00988	80	0.665
2506	chr3	29714011	T	C	rs7632532	-0.0221592834	0.4192329847187706	0.0349572238	0.4174281431816757	0.0757328073460497	0.0135393318084515	-0.0015228347421711	0.1428978786065124	0.002523025879505	0.1426219893779785	0.0048637458348453	0.841404656353352	-0.0001437693908691	0.7498275490006522	0.0001901557900253	0.7480544943178521	0.000395127325331	0.6347657629093619	-1.0997830143927056e-05	0.567833085649774	1.4578768614860684e-05	0.5660925492467461	-0.0004783741875886	0.7260486041115737	0.0006994160535778	0.7242472988443192	TGFBR2	892468	RBMS3	1139219	GADL1	1180650	False	False	False	ref	95	0.05603	90	0.0357
2507	chr3	29750230	T	G	rs7634890	-0.02701813452	0.4999223995260802	0.02936422436	0.4960168369905749	0.0355462772929643	0.1489274128334118	-0.0010107515666515	0.365399347115979	0.0010966881069652	0.3629942050934407	0.0058435881363201	0.8047232766386648	-0.0001650887471852	0.7621985682981332	0.0001818943543816	0.7582874488461382	0.0002101048427641	0.709647099168847	-6.084329814491666e-06	0.6794491559282475	6.6999139692747065e-06	0.6756733683723783	-0.0005550790142192	0.7489343981817468	0.0006243607931113	0.7449695582459368	TGFBR2	856249	GADL1	1144431	RBMS3	1175438	False	False	False	ref	0	0.0	45	0.01788
2508	chr3	29752250	T	G	rs1595901	0.0900023218	0.134796309017005	0.0900023218	0.1364259882340678	0.0424893255233965	0.0915175969268137	0.003773616913904	0.0966683279107074	0.003773616913904	0.0976125573651712	0.1454183299792154	0.242710290203071	0.0159439920557395	0.1278629381341795	0.0159439920557395	0.1301509304884117	0.0063393266778563	0.1370130722911737	0.0006790318575574	0.0942568910309571	0.0006790318575574	0.0958565122317258	0.0249323677872718	0.0879999314801915	0.0249323677872718	0.0893620498467044	TGFBR2	854229	GADL1	1142411	RBMS3	1177458	False	False	False	alt	-70	0.02927	-65	0.09045
2509	chr3	29758222	A	G	rs6780082	0.0686640558	0.1929267475845606	0.0686640558	0.1957731757049335	0.0237301620810496	0.3660608900246248	0.0016671266392022	0.2105752681563491	0.0016671266392022	0.2134021314978725	0.0024726996799841	0.9149850223073356	0.0001893357769119	0.7343922853184829	0.0001893357769119	0.7407689203804844	5.9851282758388806e-05	0.8842009887086859	4.613714449748456e-06	0.6979962584035132	4.613714449748456e-06	0.704328106253324	0.0006491042855728	0.718520462167482	0.0006491042855728	0.7248022738849582	TGFBR2	848257	GADL1	1136439	RBMS3	1183430	False	False	False	alt	-100	0.02737	-50	0.02026
2510	chr3	29758779	G	A	rs17551079	-0.0327235993	0.4519273607130341	0.0327235993	0.446411205785649	0.0756598038050204	0.0131953416762925	-0.0024089793829143	0.1505235191911203	0.0024089793829143	0.1485712470541673	0.0857799148823858	0.3458476776778599	-0.0034743695660326	0.3361502627800803	0.0034743695660326	0.3317551478227784	0.0064454325165119	0.1341520099578954	-0.0002581238523019	0.1827781788170364	0.0002581238523019	0.1798914897660087	-0.0065281580944211	0.3090674874724226	0.0065281580944211	0.304848412079128	TGFBR2	847700	GADL1	1135882	RBMS3	1183987	False	True	False	ref	-80	0.02498	-10	0.02039
2511	chr3	29760935	C	T	rs2028408	0.01161165048	0.7266998272863012	0.01161165048	0.7336464297595159	0.0210329336711563	0.4459807395694446	0.0002623618683602	0.6659135385562032	0.0002623618683602	0.6722780039835357	0.0961235195143676	0.3123691515865848	0.0011687113613196	0.4699500800984341	0.0011687113613196	0.4757670179702963	0.00199685426822	0.3162248176372273	2.5810131254278305e-05	0.4609672433661938	2.5810131254278305e-05	0.466772165111581	0.0023786744086304	0.4993454195773213	0.0023786744086304	0.5055308474935957	TGFBR2	845544	GADL1	1133726	RBMS3	1186143	False	False	False	alt	100	0.03625	30	0.08264
2512	chr3	29760939	T	G	rs2028409	-0.0172214331199999	0.6566584700872544	0.0172214331199999	0.6501093133642988	0.0189385002837117	0.5162731025259183	-0.0002795291679996	0.6632727123479029	0.0002795291679996	0.6566266538990958	0.0928111906568572	0.3191156361729339	-0.0016151113886569	0.4190370527912586	0.0016151113886569	0.4136020298281916	0.0017045195442368	0.3447498908319368	-2.6370880969432648e-05	0.4404762898864783	2.6370880969432648e-05	0.4350072037563456	-0.0034096532611922	0.428918026618461	0.0034096532611922	0.4232631792821855	TGFBR2	845540	GADL1	1133722	RBMS3	1186147	False	False	False	ref	100	0.04004	25	0.0688
2513	chr3	29764026	T	C	rs12715161	0.00227821602	0.7685376837035559	0.01109010958	0.7675265296059813	0.0166210240244422	0.6160384855474533	4.308031044944467e-05	0.7565443697145572	0.0001967480554135	0.755731346476973	0.3332272112434429	0.0947963735383	0.000748336398709	0.2945176415152221	0.0035732026301739	0.2933857840461015	0.0053450502519988	0.1502218454790762	1.562245070112662e-05	0.3308663985687204	6.183993146231725e-05	0.3296740467141162	0.0006218864438652	0.4061539981184929	0.0037412160601761	0.4050638111355004	TGFBR2	842453	GADL1	1130635	RBMS3	1189234	False	False	False	alt	100	0.07764	100	0.3118
2514	chr3	29764085	A	T	rs7340606	0.031881789	0.4489517192471128	0.031881789	0.454468016342487	0.0152225896424107	0.6771656901791018	0.0005234142998791	0.5120226679111712	0.0005234142998791	0.5179168223649673	0.3591847844017023	0.0844137714440135	0.0108320751596621	0.1402077755681584	0.0108320751596621	0.1429042669957549	0.0052674545308034	0.1525298549707734	0.0001722328456354	0.1914066266352068	0.0001722328456354	0.1947590039777965	0.0107246544158885	0.1920400066577482	0.0107246544158885	0.1954584616225116	TGFBR2	842394	GADL1	1130576	RBMS3	1189293	False	False	False	alt	100	0.2301	100	0.792
2515	chr3	29963152	T	C	rs7612854	-0.0530390008	0.2825392075920593	0.0530390008	0.2784385553375787	0.0188665398050691	0.4969395341941156	-0.0012029951447939	0.319895753249986	0.0012029951447939	0.3156833670630112	0.0469516017287452	0.4782751383123076	-0.0020855326247831	0.3890977735793844	0.0020855326247831	0.384088064904223	0.0008551154587188	0.4991043495853366	-4.328855428794544e-05	0.4005292998850466	4.328855428794544e-05	0.3952007253580336	-0.0052233512586189	0.3457263763755026	0.0052233512586189	0.3408554845804445	TGFBR2	643327	GADL1	931509	RBMS3	1388360	False	False	False	ref	25	0.1606	45	0.04565
2516	chr3	29970451	T	C	rs1449281	0.002524868	0.759610251041756	0.0113829542	0.7587298405307447	0.0239279678231435	0.3670929808945287	0.0001254440624249	0.682773903391997	0.0002864579641572	0.6820515599760273	0.0008495265745108	0.9726522906898808	1.4674360484403708e-06	0.9592509644656818	9.804877409091008e-06	0.9577658394217176	1.912904730381521e-05	0.9602245786685368	7.944029372468406e-08	0.9469785304277416	2.2833794381322775e-07	0.9455615176169748	4.948698492296573e-06	0.952340062472945	4.453828643066868e-05	0.9508702335966628	TGFBR2	636028	GADL1	924210	RBMS3	1395659	False	False	False	alt	20	0.003363	25	0.014084
2517	chr3	29990864	A	G	rs3773124	0.0725546604	0.1735460262600637	0.0725546604	0.1760738641992172	0.016505457550514	0.6179575984627188	0.001218375465043	0.2702485983759789	0.001218375465043	0.2739529844463403	0.0019291676289135	0.9229807781169465	0.0001345837912014	0.7479061572952452	0.0001345837912014	0.7545237440542243	3.27302264853752e-05	0.923763065661649	2.3570068717193454e-06	0.7520776174886908	2.3570068717193454e-06	0.7586280252525226	0.0005006433308039	0.7410051966096297	0.0005006433308039	0.7476377385372538	TGFBR2	615615	GADL1	903797	RBMS3	1416072	False	False	False	alt	65	0.02374	100	0.04462
2518	chr3	30001813	A	G	rs4680866	0.0035089982219999	0.8969594700736401	0.004671419778	0.8967444289513663	0.0105455441477077	0.8927424235378091	3.476742103318687e-05	0.9333030838091504	4.66590286861841e-05	0.9329473252914944	0.054357329022467	0.4291125423022595	0.0001416532220502	0.7352057497426872	0.0002336531091196	0.733967222286973	0.0005633161532221	0.5481446821872888	1.4223451296718223e-06	0.7955152683481096	2.349219538256744e-06	0.7941934108379054	0.0004099171917785	0.7533599710086193	0.0006425060209164	0.7523841419750348	TGFBR2	604666	GADL1	892848	RBMS3	1427021	False	False	False	alt	-25	0.01367	35	0.05145
2519	chr3	30056807	C	T	rs62237196	0.01656461938	0.6525120989895346	0.01656461938	0.6589981485743369	0.0224074811981061	0.404544098176723	0.0003908853697755	0.5995056565853913	0.0003908853697755	0.6057016579267617	0.0054963544587773	0.8068035644832052	9.458820399616192e-05	0.812056792813495	9.458820399616192e-05	0.8188428828621609	0.0001230413279287	0.7797502797031041	2.22278240505412e-06	0.7862947719012864	2.22278240505412e-06	0.793021026880691	0.0003422849790504	0.8053682978008856	0.0003422849790504	0.8121523020832432	TGFBR2	549672	GADL1	837854	STT3B	1475832	False	False	False	alt	-100	0.01514	80	0.12103
2520	chr3	30058734	T	C	rs56077410	-0.01382457204	0.712619651200545	0.0139212182	0.7076939783930188	0.0279149096405028	0.2630749357201097	-0.000392797428562	0.6132287904703497	0.0003954659986521	0.6085365249550351	0.0115477879317738	0.6983028431049029	-0.0001690694864145	0.7625278603539041	0.0001700898015299	0.7579245375813932	0.0003243436282815	0.6331060702050705	-4.8252102347136105e-06	0.7120349436472747	4.853382925447969e-06	0.7076195735169841	-0.0006111642637985	0.7520649956593622	0.0006111642637985	0.7468143955451547	TGFBR2	547745	GADL1	835927	STT3B	1473905	False	False	False	ref	-100	0.02542	-5	0.001617
2521	chr3	31981188	G	C	rs76150980	0.02771336536	0.4896179260130655	0.02771336536	0.4952485255469958	0.0295580439498267	0.2319322603719822	0.0008655035844438	0.4006233321744288	0.0008655035844438	0.4055286397276769	0.8765604895912376	0.0030266647076677	0.0241348073000318	0.0801573880748043	0.0241348073000318	0.0815759224437185	0.0259604885154811	0.0138203874972748	0.0007559980719148	0.0834641496943276	0.0007559980719148	0.0848305842136846	0.0028331298868397	0.4834755107388256	0.0028331298868397	0.488881072514605	ZNF860	563	OSBPL10	96392	GPD1L	124502	True	False	False	alt	100	0.019	100	0.482
2522	chr3	31996113	G	A	rs62244405	-0.0207396066399999	0.5706212093583595	0.02191964496	0.5659315501465706	0.0117553323495256	0.8381244870830497	-0.0002438678436824	0.6811370558508668	0.0002575630121242	0.6763412446414078	0.0630134274685757	0.3968098330165495	-0.0014448259630047	0.4446155816948406	0.0014973974469132	0.4407189650715745	0.0007251291044715	0.4992360777806143	-1.6576600826592802e-05	0.5211197222434	1.7186729594521335e-05	0.5169746244653196	-0.0033832602025666	0.4299433170581328	0.0035053280987099	0.4258493528858391	ZNF860	14362	OSBPL10	81467	GPD1L	109577	False	False	False	ref	-100	0.1049	-100	0.25
2523	chr3	31996388	T	C	rs17028710	-0.0454528642	0.2087714727759328	0.0819707786	0.2092985288547718	0.0194276903969154	0.4958495282660505	-0.0021536146587804	0.2679874133350752	0.0026497747605934	0.2691745604209798	0.0820304509913892	0.3408048370970061	-0.0049224227494684	0.2488543831532898	0.0070399336829381	0.2492103719825618	0.0016641092015699	0.359331568407056	-0.0002072591807123	0.2634181076549881	0.0002355867417174	0.2637746273837314	-0.007828016231731	0.1947215018172662	0.0134959255715746	0.1950015327859313	ZNF860	14637	OSBPL10	81192	GPD1L	109302	False	False	False	ref	-25	0.002945	20	0.02954
2524	chr3	31999737	T	C	rs17028714	0.0258971785999999	0.5027403539969028	0.0258971785999999	0.5084855824771775	0.0233760507627361	0.3744460182384359	0.0005974138402875	0.4482585356128643	0.0005974138402875	0.4538059187802545	0.0053982052720134	0.8210054218529825	0.0001408919147428	0.7489642385931502	0.0001408919147428	0.7554415907777641	0.0001278132301586	0.7879122201149273	3.2694216796960446e-06	0.7174965300644348	3.2694216796960446e-06	0.7237997932751651	0.0005130150770346	0.7400288516684487	0.0005130150770346	0.7465101589922676	ZNF860	17986	OSBPL10	77843	GPD1L	105953	False	False	False	alt	-35	0.004326	100	0.1805
2525	chr3	32000088	G	C	rs17028716	0.018937793	0.4416640166968705	0.0309260594	0.4453468689523446	0.01132232173244	0.8555962255916038	0.0002522961424839	0.592951240620252	0.0003523239967667	0.5971560998254322	0.0099452344033518	0.7366995481688855	8.397198821938124e-05	0.6581398468336938	0.0003197940968559	0.6621978515686903	0.0001053293777759	0.8059222318759913	1.4630233713861682e-06	0.7178418731660698	3.4306789458033457e-06	0.721887548263624	0.000451156345881	0.6299483384477224	0.0011571706641152	0.6340964354018946	ZNF860	18337	OSBPL10	77492	GPD1L	105602	False	False	False	alt	10	0.002502	-100	0.074
2526	chr3	32010168	C	G	rs1376606	0.00623803572	0.8101975549271111	0.00869747828	0.8122699167303223	0.0107135175506531	0.8761697190096035	8.418109050553804e-05	0.8554495751515103	0.0001035019163449	0.857326441515949	0.2373065883672593	0.1494558675095083	0.0023134682169516	0.3787974712876378	0.0026122213474706	0.3810266799753951	0.0027557491401803	0.2730778045513011	3.0138951181339857e-05	0.4690339149960259	3.249304915310932e-05	0.4711495261484759	0.002253307380159	0.4792501953541552	0.0027927155158192	0.4815868151081202	ZNF860	28417	OSBPL10	67412	GPD1L	95522	False	False	False	alt	50	0.01289	-100	0.1464
2527	chr3	36818214	T	C	rs1553656	0.05380625426	0.268963541302829	0.05662041214	0.2714732734490129	0.0181440606933772	0.5551542155453496	0.0010306259385541	0.3430397236282199	0.0010761810587861	0.346009500319012	0.0385775790966975	0.4976124858552007	0.0019830334138665	0.3940674220951418	0.0020697601868704	0.3978313311428041	0.0007066739495345	0.5114325525699241	3.7847575851100594e-05	0.4098231094480867	3.925149445116996e-05	0.4134859792722838	0.0052043812477318	0.3405841470958636	0.0054914057602849	0.3442686746830418	DCLK3	53661	TRANK1	126843	EPM2AIP1	174917	False	False	False	alt	70	0.02637	70	0.08887
2528	chr3	36821489	C	T	rs4624519	0.170431526	0.0370482453418166	0.170431526	0.0374338883096538	0.0582840125893841	0.0340038052420199	0.0101861784231582	0.0211824200201654	0.0101861784231582	0.0213011796379859	0.3059054468674738	0.1067404420581109	0.0495577638738075	0.0270115382738429	0.0495577638738075	0.0275879190734771	0.0176117606135972	0.0292937821673942	0.0029219654923858	0.0155645132054954	0.0029219654923858	0.0157920606193428	0.0557404902510639	0.0165847668346675	0.0557404902510639	0.0168140214028837	DCLK3	56936	TRANK1	123568	EPM2AIP1	171642	False	False	False	alt	100	0.04807	85	0.298
2529	chr3	36823035	G	T	rs142802540	0.02536654086	0.5040880828440771	0.02576595394	0.5085316202385067	0.0504247979744702	0.0604375012944489	0.0013629406382527	0.2730346697775074	0.0013755255511157	0.2755678279199809	0.002204645178318	0.9150402238223198	5.713845287078769e-05	0.8482328704065853	5.7836842705308495e-05	0.8527620110588328	0.000124187352946	0.8015128135680769	3.3970549426873222e-06	0.7417667225012741	3.4190601679104724e-06	0.746254932224081	0.0002160931674969	0.8447965347247952	0.000217742733661	0.8493568783973866	DCLK3	58482	TRANK1	122022	EPM2AIP1	170096	False	False	False	alt	100	0.035	50	0.05054
2530	chr3	36827948	T	C	rs4789	-0.00854659268	0.4084466219489833	0.03545991332	0.408332267361742	0.0148813640295573	0.6836026095713688	-0.000121857432119	0.5078457736507053	0.0005449467544555	0.5078147629749588	0.055192009501501	0.4248388029419969	-0.0003389427935679	0.394986794584693	0.0022992079378299	0.394778564487875	0.0008485248010621	0.4815772550289984	-4.192467864712997e-06	0.4423887337728774	3.527824670497853e-05	0.4422073142026094	-0.0013592425192174	0.352821354546349	0.0055326449143874	0.3523147483116576	DCLK3	63395	TRANK1	117109	EPM2AIP1	165183	False	False	False	ref	70	0.02318	100	0.1393
2531	chr3	36830403	C	A	rs12637912	0.0005880443	0.77769624146689	0.0105298857	0.7741985442272875	0.0191637247114394	0.5140738342501644	-7.224607297425417e-06	0.7730753113979647	0.0001807342735193	0.7695893639226132	0.0022953713173434	0.9073672546750812	-1.1097092379793049e-05	0.9282757963051672	2.278869007180544e-05	0.9238714869017844	4.339215828913949e-05	0.8987910759441194	-2.2556058507703245e-07	0.9230866325241504	4.080230775987414e-07	0.9186196454630536	-6.35082973177883e-05	0.9153657746806992	0.0001030978852561	0.9124285854353472	DCLK3	65850	TRANK1	114654	EPM2AIP1	162728	False	False	False	alt	5	0.001648	60	0.177
2532	chr3	36830702	C	A	rs3732385	0.1088296198	0.1001426913699572	0.1126851477999999	0.1009275482381904	0.0335866025671716	0.1712949366957646	0.0036871585842018	0.1045575965614607	0.0038210146843863	0.1050278372540375	0.0202772920721849	0.6408387303181416	0.0022928352712874	0.4137950331438058	0.0024289699674378	0.4173475216502237	0.0007195849384709	0.5414865050896478	8.475654516702596e-05	0.3466111250544449	8.948286535515968e-05	0.3494235030288071	0.0059268912276071	0.3476432163183615	0.0063706245257496	0.350562370769377	DCLK3	66149	TRANK1	114355	EPM2AIP1	162429	False	False	False	alt	60	0.02722	-30	0.1007
2533	chr3	36837072	A	G	rs4678909	0.0374649108	0.3022788008377488	0.0472900704	0.3050003293749938	0.0240925799254487	0.3510797043306007	0.0009750569040041	0.2858351844987865	0.0011695183324471	0.2882406941996277	0.0305499653591105	0.5777085111711797	2.787469242139999e-05	0.4920510159499818	0.0010049693279443	0.4951179568638404	0.0006736107235135	0.551052006989795	4.03012506551519e-06	0.4644013211867887	2.336896800580302e-05	0.4675306913280491	0.0007340569430239	0.4582762012378753	0.0028471511992345	0.4614416958580878	DCLK3	72519	TRANK1	107985	EPM2AIP1	156059	False	False	False	alt	60	0.11304	60	0.4717
2534	chr3	36844469	C	T	rs9863798	-0.0472246376	0.262504368761482	0.0677929143999999	0.2619695903187092	0.0310685534981975	0.2119221184069065	-0.0019842025973936	0.2255523808784456	0.0025403757483869	0.2253251479558168	0.0373280327273926	0.5048548609093929	-0.0034418613608041	0.3757532495042643	0.0041915409873885	0.3742083850641033	0.0012434377438445	0.4217453175341232	-0.000143291302978	0.3236179259645438	0.000163223322635	0.3224086320581299	-0.0065454785391441	0.3080630241238403	0.0087163076110982	0.30699290912796	DCLK3	79916	TRANK1	100588	EPM2AIP1	148662	False	False	False	ref	-100	0.05484	35	0.0382
2535	chr3	36844815	G	A	rs35979223	-0.04942389252	0.3217058554478516	0.04990703028	0.3186696800746486	0.0120724699035789	0.81357443053683	-0.0006776115875985	0.4859039833135603	0.0006828486503726	0.4818275392684555	0.0049206558675067	0.8447678177394842	-0.0003074568677223	0.7185164954489065	0.0003080665479909	0.7143885265740415	5.862075298295713e-05	0.8852933601461376	-4.033433536713424e-06	0.7599992993421817	4.040042281100258e-06	0.7558519341809913	-0.001035102767972	0.6936127578716706	0.0010367523341361	0.6892610203560181	DCLK3	80262	TRANK1	100242	EPM2AIP1	148316	False	False	False	ref	70	0.006157	30	0.0349
2536	chr3	36846482	C	G	rs4678910	0.020025562	0.4951297658304665	0.0276805984	0.4987100282675235	0.0093088827549821	0.9351832358459742	0.0002012832638662	0.6739482726057165	0.000273936377627	0.677794881908445	0.0036950282075813	0.8672542979564153	3.7436567975469606e-05	0.7999401059084509	9.05351596911096e-05	0.8033509417686258	3.352206982769297e-05	0.9234640389390496	3.556135886527954e-07	0.8550985446618503	8.595665155842124e-07	0.858574352546243	0.0001228926792253	0.791290064319543	0.0003472336775427	0.7946154317045392	DCLK3	81929	TRANK1	98575	EPM2AIP1	146649	False	False	False	alt	-45	0.01111	-70	0.2086
2537	chr3	36846573	G	T	rs4678911	0.1505607688	0.0478713792901844	0.1505607688	0.0484990921937412	0.0676132556978441	0.0203153530245764	0.0106305811284213	0.0202371892641439	0.0106305811284213	0.0203135498633558	0.0061784500676321	0.8018925752240589	0.0008926643318042	0.4929649652321153	0.0008926643318042	0.4983370485904643	0.0004091471411092	0.6046466707847136	6.105216933554617e-05	0.3193053823245452	6.105216933554617e-05	0.3239212755270613	0.00267229718584	0.4612102605377164	0.00267229718584	0.4666960531972985	DCLK3	82020	TRANK1	98484	EPM2AIP1	146558	False	False	False	alt	75	0.04187	-90	0.1582
2538	chr3	36846681	T	G	rs9819304	-0.00792648404	0.7909670686810653	0.00921594412	0.7862084329160871	0.0121689046454406	0.8204178180607915	-0.000101654079443	0.8304162418118299	0.0001157428850034	0.8257520365412102	0.0036933786414172	0.8664931112607817	-3.373485617035132e-05	0.8890812677166525	3.856325896631e-05	0.8845527253631973	4.6572072530028086e-05	0.8973510352941502	-4.485366395617092e-07	0.9057897679628568	5.012923860267824e-07	0.9012581727273928	-0.0001534096532611	0.8783274216875369	0.0001748540133944	0.8737422051870487	DCLK3	82128	TRANK1	98376	EPM2AIP1	146450	False	False	False	ref	-40	0.08496	85	0.1763
2539	chr3	36853088	C	T	rs9883001	-0.08723538622	0.1439661070645833	0.08723538622	0.1422190765581067	0.0249872586724691	0.3290691897781887	-0.0022570476298905	0.1799207733894856	0.0022570476298905	0.1777579015186142	0.0316667216522054	0.5499030663818041	-0.0023297729200012	0.4000337042849047	0.0023297729200012	0.3948973885741587	0.0007971784113739	0.506262838092956	-6.105573255839246e-05	0.3734318838234331	6.105573255839246e-05	0.3684339166362894	-0.0061817491999603	0.3349775913374512	0.0061817491999603	0.3300990261117505	DCLK3	88535	TRANK1	91969	EPM2AIP1	140043	False	False	False	ref	10	0.00232	40	0.037
2540	chr3	36854744	C	T	rs11706780	0.02652509614	0.4941460646231391	0.02652509614	0.4998283404911057	0.0305641627191417	0.2153558640926998	0.0008147976034992	0.3853340588896786	0.0008147976034992	0.3900374918147734	0.0099188413447262	0.7430025705662877	0.00032511595677	0.6857643009333818	0.00032511595677	0.692512063824895	0.0003127031261921	0.6662426120561709	1.0311801378844914e-05	0.6189033628620026	1.0311801378844914e-05	0.6255403587145116	0.0011761406750024	0.6573098115222191	0.0011761406750024	0.6640877598692578	DCLK3	90191	TRANK1	90313	EPM2AIP1	138387	False	False	False	alt	60	0.01068	40	0.01825
2541	chr3	36881851	A	G	rs11129739	0.0557797857999999	0.161218615537915	0.0824130897999999	0.162581882409657	0.0247016989797697	0.3355106583380084	0.00176007368887	0.1861961898472013	0.002246894051102	0.1874866907288954	0.0922891029659199	0.3332214202081847	0.0054988030822736	0.2186367308096733	0.0065305789274067	0.2214157793761218	0.0023033228157608	0.305288522156805	0.0001644466598032	0.2101198102349985	0.0001833061105092	0.2127347263897612	0.0108698162383292	0.1674539079151508	0.0134975751377387	0.1694501297943611	TRANK1	63206	EPM2AIP1	111280	MLH1	111376	False	False	False	alt	-75	0.006165	10	0.02588
2542	chr3	36979390	C	T	rs6807351	-0.001642109788	0.8849303801577632	0.005225474852	0.8859664496363168	0.0100060285697364	0.9158548117841236	-1.5740464770373227e-05	0.92365558149043	5.183409658143309e-05	0.9248222522045688	0.0182186334993896	0.6760535261535492	-4.6905705762079e-05	0.8632829880573246	7.826606496012387e-05	0.8644647608250022	0.0001824832547252	0.7639183552964687	-4.596809035975147e-07	0.8985613563923649	7.774757759677763e-07	0.899652639924943	-0.0001468113886048	0.861681604205	0.0002589818877635	0.8628504040889418	EPM2AIP1	13741	MLH1	13837	TRANK1	34333	False	False	False	ref	-95	0.1359	-100	0.1311
2543	chr3	37835756	G	A	rs6778309	0.00750082544	0.8092367638527197	0.00846566316	0.8133959396138625	0.0174667368722465	0.5846762065169807	0.0001363185008928	0.7876479601105981	0.0001513797700733	0.7919074184262678	0.0077653327174952	0.7650034176849478	5.8434088027295e-05	0.8374962088254517	6.645158984500127e-05	0.8414205436206431	0.0001362910991124	0.7709959940890452	1.0703649431630711e-06	0.8331610051675886	1.195519414306674e-06	0.8370224912770745	0.0002111444690046	0.8277942459647518	0.0002490844907788	0.8316340764377568	CTDSPL	26125	VILL	152304	PLCD1	193886	False	False	False	alt	-20	0.003357	30	0.0534
2544	chr3	37839605	G	A	rs113888150	-0.1001463854	0.1078209374942236	0.1001463854	0.1064051529706277	0.0233742661411477	0.3699100811399947	-0.0026517310942357	0.1474404251376412	0.0026517310942357	0.1458224947772205	0.0591831348355382	0.4217779142796323	-0.0067174815749623	0.2312073867473919	0.0067174815749623	0.2273559818985988	0.0015999059795951	0.3925441488341933	-0.0002000064432611	0.2286993715783046	0.0002000064432611	0.224908385597289	-0.0143561743261521	0.163443882304281	0.0143561743261521	0.160589932255228	CTDSPL	22276	VILL	148455	PLCD1	190037	False	False	False	ref	-90	0.1023	-95	0.05548
2545	chr3	37845490	G	A	rs72862271	0.014238881	0.6459902030630851	0.017212715	0.6503240993188608	0.0345064703952759	0.1606215834561441	0.0004969541783364	0.4711430748058921	0.0005964210133233	0.4745695152772434	0.0007818943617828	0.9759274077221306	1.0395500902697936e-05	0.9454902082306532	1.1953008592524252e-05	0.9494605953946038	2.6464708879880258e-05	0.93920977507696	3.550421280185632e-07	0.905827982270659	4.07136615347132e-07	0.9098659375877488	4.453828643066875e-05	0.9413680508022358	5.113655108706409e-05	0.9453411162786628	CTDSPL	16391	VILL	142570	PLCD1	184152	False	False	False	alt	100	0.01419	20	0.0489
2546	chr3	37903926	G	A	rs1812423	0.044210578	0.3246583696810516	0.044210578	0.3291418946070976	0.0189925798071869	0.5192056066694363	0.000856799961084	0.3610083534876364	0.000856799961084	0.3657928567775224	0.0480444393124607	0.4972352379094494	0.0027951622809951	0.3903635311953359	0.0027951622809951	0.3953943635734755	0.0010022906088903	0.5017737407743118	5.950360206384477e-05	0.4022208628413387	5.950360206384477e-05	0.4072015915306959	0.0059087459998019	0.3434009445480997	0.0059087459998019	0.3479682226446439	CTDSPL	42045	VILL	84134	PLCD1	125716	False	False	False	alt	100	0.096	100	0.374
2547	chr3	37928204	C	G	rs9878581	-0.0527829315999999	0.2738961340690807	0.0527829315999999	0.2699214615626357	0.020557407753546	0.4571994012403382	-0.00109968884154	0.3090190822766472	0.00109968884154	0.3048317775996942	0.0370245125531984	0.523573809416406	-0.0014848695205154	0.4313356711472705	0.0014848695205154	0.426166287642264	0.0006525901561522	0.5319585788688928	-2.9298012075575548e-05	0.433505463096495	2.9298012075575548e-05	0.4281852546904785	-0.0042608294018672	0.3834767898726651	0.0042608294018672	0.3785047815759666	VILL	59856	CTDSPL	66323	PLCD1	101438	False	False	False	ref	100	0.004517	-100	0.1611
2548	chr3	37929755	G	A	rs34054543	-0.02358750902	0.5208706469658559	0.02492158298	0.5164209700555833	0.0194513214214348	0.5043297262701969	-0.0004635170377087	0.5235516894498002	0.0004900121194043	0.5190433680765725	0.0025807462637325	0.9018635339936716	-6.0073041416779774e-05	0.8445564420564059	6.443031505934257e-05	0.8400596174570716	5.095303892669373e-05	0.8877140412130919	-1.1949147982208608e-06	0.83150789141799	1.281451470975225e-06	0.8270006544226931	-0.000250734056943	0.8352226172154377	0.0002639305862558	0.8307512700689201	VILL	58305	CTDSPL	67874	PLCD1	99887	False	False	False	ref	-70	0.02078	-90	0.2747
2549	chr3	44578516	G	A	rs7627777	-0.29140796	0.009456158059136	0.29140796	0.0093902582240921	0.0543062183766277	0.0444743280627002	-0.0167032778836903	0.0100789846439164	0.0167032778836903	0.0100420372353958	0.2178631519910263	0.1616856757923046	-0.0618014470353967	0.0207587181263055	0.0618014470353967	0.0204088584800954	0.0116163028151808	0.061200973095391	-0.0034921789093346	0.0140852311095196	0.0034921789093346	0.0139287866240269	-0.0786694599320378	0.0074745493460798	0.0786694599320378	0.0074371758880802	ZNF660	292	ZNF197	6373	ZKSCAN7	23322	False	True	True	ref	-85	0.0296	-85	0.05225
2550	chr3	44581242	C	T	rs140503691	-0.02374990274	0.5325344100736833	0.02650111034	0.5286378832936515	0.0383868197790391	0.1220242086460998	-0.0009332754269814	0.3626635874866372	0.0010203045693968	0.3598264148003872	0.599915047342549	0.0271441549151061	-0.0147475380399424	0.1207188867729632	0.0162899696751949	0.1195135449824576	0.0229435238817291	0.0170783825477681	-0.0005729701597298	0.0932110027288607	0.0006217620086175	0.0924230153916725	-0.0057677080927715	0.3035567918904508	0.0066205337996106	0.3007982978023045	ZNF660	3018	ZNF197	3647	ZKSCAN7	26048	False	False	False	ref	20	0.008484	0	0.0
2551	chr3	44625794	C	G	rs10212378	0.14068872	0.0548183348988849	0.14068872	0.055497344172864	0.0424239342897365	0.0928380439029331	0.0062123561142739	0.0445979309287996	0.0062123561142739	0.0448658941652566	0.6416688660882187	0.0217688614343073	0.0899933753197907	0.0106711530282796	0.0899933753197907	0.010765229046146	0.0272195809845163	0.0115717851337187	0.0039734518364801	0.0112809929995475	0.0039734518364801	0.0114036075335618	0.0362888060440103	0.0387509570817131	0.0362888060440103	0.0393139164805173	ZNF35	22939	ZNF197	40905	ZNF660	47570	True	False	False	alt	100	0.0353	-60	0.0764
2552	chr3	44693574	C	T	rs9756189	0.00398678596	0.8597760201605266	0.00567181052	0.862124987510601	0.0152182798460122	0.6771145337040247	6.484130879531396e-05	0.8566479695982993	8.85995998825569e-05	0.8590748658426444	9.897396984589783e-05	0.9997199880526568	3.985458651783029e-07	0.9903324198468784	5.546310504328838e-07	0.9968201723673974	1.531449980839921e-06	0.9994916409925854	6.7571166333425666e-09	0.9898619861250272	8.91911154591136e-09	0.9963392711707112	1.6495661640988417e-06	0.993507280081212	1.6495661640988417e-06	0.9972822030460164	ZNF502	19070	ZNF501	36023	ZNF35	44841	False	False	False	alt	-90	0.0442	10	0.02954
2553	chr3	44843511	T	A	rs3804582	0.0028972041399999	0.9031410662406222	0.00422157874	0.90717149254837	0.0103412443770784	0.8954649686377797	2.823254071008225e-05	0.9314985834567204	4.304567129244877e-05	0.9355923504226036	0.0084218600508065	0.7497031955212884	3.0045836707512284e-05	0.8799836252612155	3.933603332226279e-05	0.8841286998022081	8.831856685214406e-05	0.8246227708095931	3.072137950712949e-07	0.9101791796714952	4.111246488892383e-07	0.9143457035036796	0.0001237174623073	0.8756146749416313	0.0001550592194252	0.8798124221101624	TMEM42	18394	TGM4	31098	KIF15	81789	False	False	False	alt	10	0.00525	25	0.05518
2554	chr3	45265828	A	G	rs17635268	0.040779954346	0.3781357683552001	0.040779954346	0.3822842246659133	0.0322221245814498	0.1894284839498444	0.0013380740223187	0.3191884226400133	0.0013380740223187	0.3227188472386132	0.0445811751509352	0.4674006765701944	0.002246633079387	0.4449571944413741	0.002246633079387	0.450420750975616	0.0014664355184752	0.3782784636124473	7.40557771895821e-05	0.3869308288554594	7.40557771895821e-05	0.3920044982500847	0.0052703638942957	0.39143793668596	0.0052703638942957	0.3964554233530294	TMEM158	39541	CDCP1	119406	LARS2	122734	False	False	False	alt	100	0.02576	30	0.07904
2555	chr3	45273808	C	T	rs2215709	-0.06083541482	0.2524975989179802	0.06083541482	0.2498334693351201	0.0150077379365048	0.6702643053906212	-0.0009770608138031	0.3850439587978622	0.0009770608138031	0.3809485577955062	0.0826209956781365	0.3728140839922899	-0.0070245815045189	0.2963618495403513	0.0070245815045189	0.2922781249292054	0.0010432597576833	0.4556216707444828	-8.734557491365662e-05	0.3685549578829485	8.734557491365662e-05	0.3638038414946639	-0.0110867341889082	0.2445583986376112	0.0110867341889082	0.241304847459134	TMEM158	47521	LARS2	114754	CDCP1	127386	False	False	False	ref	-100	0.0317	15	0.00586
2556	chr3	45287158	C	T	rs17635696	-0.1187618028	0.0535084783087232	0.1468804252	0.0532480063945378	0.0828819124214004	0.0095007530895501	-0.0099365428875294	0.0163232885405524	0.0120821477560639	0.016318012526881	0.0241051103559763	0.5976867462014208	-0.0022779195801034	0.3211101264551543	0.0029907184456002	0.3183564890138836	0.0021702353586724	0.3284096514398886	-0.0002178676133664	0.1567604466188265	0.0002722580703246	0.1553661830962427	-0.0057561611296228	0.2531140575528	0.0080012206789614	0.2507010048415977	TMEM158	60871	LARS2	101404	CDCP1	140736	False	True	False	ref	75	0.01962	60	0.0625
2557	chr3	49931139	T	C	rs6771546	-0.170097746	0.0373820967901743	0.170097746	0.0369807914901972	0.0297950839946418	0.2289919264597971	-0.0052372898904803	0.0592422568896991	0.0052372898904803	0.058716781203744	0.0654432384282933	0.4210388488604675	-0.0093644777642559	0.1792233556451836	0.0093644777642559	0.176139395186493	0.0021577684962373	0.3439024587168482	-0.0003277223914741	0.1558958351411327	0.0003277223914741	0.1532993132955261	-0.0188240242816138	0.1165034556612679	0.0188240242816138	0.1144213494764906	MON1A	966	RBM6	8869	MST1R	27266	False	False	False	ref	-95	0.01044	-75	0.1476
2558	chr3	49938221	C	T	rs7609971	-0.0003982019999999	0.6805691906586195	0.014658198	0.6809048921940986	0.0971657049204557	0.0047935258330309	-7.592205090039931e-06	0.2457783095880229	0.0014124552943799	0.2467479581238516	0.0349188413447262	0.5256048661198522	7.540104200744364e-05	0.5935538790299318	0.0005164731237377	0.5944496039503087	0.0034193499117823	0.2404734905243912	7.608061257215775e-06	0.3669070169517594	4.966166208579245e-05	0.3680489852170581	0.0001410379070304	0.589452829869855	0.0014903830292632	0.590217310878653	RBM6	1787	MON1A	8048	MST1R	34348	False	True	False	ref	95	0.1054	75	0.1709
2559	chr3	49963320	G	A	rs58621288	-0.101082185	0.1071056650687441	0.101082185	0.1055476973362635	0.0205352657985057	0.457143736207402	-0.0022110207610008	0.1679356138024015	0.0022110207610008	0.1656532422741768	0.0066617729537131	0.7859112694258124	-0.0007505129572142	0.5383778873181669	0.0007505129572142	0.5325367317786811	0.0001440044391088	0.7655219256833331	-1.680840612116929e-05	0.525104944666649	1.680840612116929e-05	0.5192948520159999	-0.0025065157863481	0.4918707379740055	0.0025065157863481	0.4859408178478082	RBM6	23312	MON1A	33147	MST1R	59447	False	False	False	ref	-95	0.0494	90	0.05713
2560	chr3	49976681	G	A	rs2624821	0.01524566773	0.6787400755897618	0.01524566773	0.6851852648174184	0.0208771537160653	0.4528983052880307	0.0003231265760023	0.6340601734893482	0.0003231265760023	0.6403480665015	0.0029840651908547	0.8806258086465311	4.231130428325901e-05	0.8737639578843366	4.231130428325901e-05	0.8807442881539104	6.227020501243156e-05	0.8613142969730352	8.995719608387386e-07	0.8561130831311278	8.995719608387386e-07	0.8628741594013415	0.0001674309656559	0.8671132020327847	0.0001674309656559	0.874027912980318	RBM6	36673	MON1A	46508	MST1R	72808	False	False	False	alt	70	0.01102	35	0.0845
2561	chr3	49984226	G	A	rs62262138	-0.00864870422	0.7865404133103593	0.01020084818	0.7846045912650769	0.0086372858916496	0.949411757171639	-6.811887122642751e-05	0.8869856330740777	8.305128394932487e-05	0.8854722573775273	0.0287123486523043	0.5533128239364612	-0.000150580184799	0.72487850727491	0.0002010654069106	0.7237669484574498	0.0002548691523533	0.6859074551083872	-1.1837106616798628e-06	0.8069194641026028	1.6685094979101854e-06	0.8059047234346284	-0.0004833228860809	0.7201141477137083	0.0006565273333113	0.7188071222572584	RBM6	44218	MON1A	54053	MST1R	80353	False	False	False	ref	-30	0.02104	-100	0.0542
2562	chr3	49984656	G	A	rs199956414	-0.17706002	0.036923776510102	0.17706002	0.0365603098894646	0.0372889723157721	0.1342774103303849	-0.0070612229087326	0.0416965106152705	0.0070612229087326	0.0413475986542872	0.120678961433143	0.277525303917968	-0.0247816861230346	0.0874497718333602	0.0247816861230346	0.0855695787071464	0.0046254146422799	0.1860889498659235	-0.0010403349893547	0.0714894898852741	0.0010403349893547	0.0701830258098756	-0.0366558345155223	0.0460564346849054	0.0366558345155223	0.0452216517929369	RBM6	44648	MON1A	54483	MST1R	80783	False	False	False	ref	0	0.0	60	0.1199
2563	chr3	49984859	G	A	rs4688690	-0.0154054518	0.663169671238384	0.016309441	0.6588007474386813	0.0141804308181019	0.7155084787741631	-0.0002289878946968	0.716828512970629	0.0002378127629798	0.7122151710319001	0.1610570419979545	0.2149382914991106	-0.0026149312497521	0.3639713209081363	0.0027199222081176	0.3606382401351642	0.0022551050852573	0.2951799860140996	-3.707236455720339e-05	0.4227979578912716	3.8097300906432846e-05	0.4190691069486767	-0.0042121672000263	0.3978713714988389	0.0044183629705386	0.3943979559009227	RBM6	44851	MON1A	54686	MST1R	80986	False	False	False	ref	-100	0.07574	-100	0.2944
2564	chr3	49986605	A	C	rs111439884	0.03573496594	0.3989080269080165	0.03737932806	0.4026060240416803	0.1058711846013723	0.0033728837459324	0.0036913601279699	0.0940345699176267	0.0038564325782063	0.0946637487024466	0.0005121902939526	0.988103813821098	1.6843478271660816e-05	0.9339153781376224	1.798272161141054e-05	0.9382876811714552	5.270213713448421e-05	0.88516829908506	1.69785212361616e-06	0.7970010017616289	1.812217253600786e-06	0.8012679806832179	5.443568341524264e-05	0.9394704790177252	5.938438190753916e-05	0.943872516364648	RBM6	46597	MON1A	56432	MST1R	82732	False	False	False	alt	90	0.08594	45	0.2449
2565	chr3	49988596	A	C	rs34080578	0.0383527614	0.3298147820977321	0.0455474666	0.3327136063753815	0.0170356046536184	0.5893782488459507	0.0008195640796024	0.3878369786888862	0.0009027303080044	0.3909184254570667	0.0007744713140443	0.9766746926114108	4.123975667994472e-05	0.8843485029181446	4.349470374276333e-05	0.8883349990358621	1.4439640148597403e-05	0.9715598660015076	8.732029571222511e-07	0.8756527327602818	8.992687144321354e-07	0.8796787563641413	0.000134439642374	0.8879905075637169	0.0001459866055227	0.8919510471720297	RBM6	48588	MON1A	58423	MST1R	84723	False	False	False	alt	-100	0.05273	-15	0.02759
2566	chr3	49990341	C	T	rs2353579	0.031010692	0.2618950564914197	0.0572561868	0.2630134969798598	0.0207721170104553	0.4410341697663635	0.0010736888256351	0.2883913126394978	0.0014300177547124	0.2896158729051488	0.0837204315265084	0.3457760774767393	0.0017189304079163	0.2612055506347212	0.0048122440155049	0.2620669419140304	0.0016893726351817	0.354203255867234	7.658966649937104e-05	0.2708249892110853	0.0001210579280131	0.2717784865437644	0.0039490613968526	0.2167165208973258	0.0098924482861007	0.2174803756548368	RBM6	50333	MON1A	60168	MST1R	86468	False	False	False	alt	45	0.0625	60	0.07764
2567	chr3	49997890	T	C	rs4688757	0.0312196362	0.4522494420505148	0.0312196362	0.4576477795514521	0.0201780482786464	0.4786392722735819	0.0006484412607704	0.4567797183619498	0.0006484412607704	0.4620054554006852	0.0239022137177921	0.5737402360423368	0.0006834160156886	0.5431803121361987	0.0006834160156886	0.5489058837907074	0.0004832419270389	0.5671822595240881	1.4203643440020584e-05	0.5353171969140436	1.4203643440020584e-05	0.5411749906975846	0.0021642308072976	0.5083171140199515	0.0021642308072976	0.5141278857887753	RBM6	57882	MON1A	67717	RBM5	91030	False	False	False	alt	-5	0.001221	-20	0.01904
2568	chr3	50003880	C	T	rs6765484	0.3376014559999999	0.006417016015219	0.3376014559999999	0.0064101885015716	0.0473613100640616	0.0697567546834209	0.0171670625290878	0.0101231472309006	0.0171670625290878	0.0101741242045637	0.5713734287882286	0.0303737571865635	0.1903017963166467	0.0024534462254014	0.1903017963166467	0.0024146700826072	0.0266921217915745	0.0125500157077314	0.0094538328862784	0.0037672723375897	0.0094538328862784	0.0037546681844566	0.0992296526013657	0.0043818454695472	0.0992296526013657	0.0043942235858276	RBM6	63872	MON1A	73707	RBM5	85040	True	True	True	alt	100	0.10675	100	0.5654
2569	chr3	50011866	T	G	rs7634917	-0.00219630816	0.8339003698980217	0.0075241033599999	0.8329160763589932	0.0219038980130451	0.4194608032998736	-7.059888845813338e-05	0.7783119677371556	0.0001680780139496	0.7773177658940429	0.0005600277127115	0.9837924214186176	2.248816742429609e-07	0.977618119855486	4.532695966409098e-06	0.9778465454063155	1.173822378138315e-05	0.9770752670110002	-1.0664417718743366e-08	0.971548145610465	9.508017168319777e-08	0.9713492001927514	6.598264656395387e-06	0.984099082652504	1.3196529312790732e-05	0.9822058027023952	RBM6	71858	RBM5	77054	MON1A	81693	False	False	False	ref	10	0.00477	-45	0.1206
2570	chr3	50019045	T	A	rs75729494	-0.043980317	0.344535356832914	0.043980317	0.3400989694959293	0.1047898058171204	0.0038372720850882	-0.004475227398759	0.0788837356464554	0.004475227398759	0.0781090456411739	0.0017460657846985	0.934645266276414	-8.719088810673946e-05	0.8320477540874885	8.719088810673946e-05	0.8252857024013042	0.0001825520753525	0.7370405976723117	-8.503837925128602e-06	0.6301336994732786	8.503837925128602e-06	0.624027933205617	-0.0002944475602915	0.8306099334927308	0.0002944475602915	0.8239107295161406	RBM5	69875	RBM6	79037	MON1A	88872	False	False	False	ref	30	0.0559	-50	0.0581
2571	chr3	50022325	T	C	rs6446193	-0.0221167412	0.5816603147206212	0.0221167412	0.5755074634134488	0.018150905309183	0.5499669748118665	-0.0003872767533305	0.5911027691806758	0.0003872767533305	0.5847673521320486	0.0017955527696215	0.9279896223675992	-3.580636325024393e-05	0.8912258222174815	3.580636325024393e-05	0.8843072606409429	3.434766405014546e-05	0.9181244554185792	-6.622597797319014e-07	0.8829189197981655	6.622597797319014e-07	0.8759767447917951	-0.0001393883408663	0.8877938822759889	0.0001393883408663	0.8808983057105046	RBM5	66595	RBM6	82317	MON1A	92152	False	False	False	ref	-45	0.03647	-100	0.1338
2572	chr3	50031924	G	A	rs11130240	-0.0525677128	0.2768904629637443	0.0525677128	0.2727442538039645	0.020634832497832	0.4574722900131459	-0.0011275106747532	0.303799353991076	0.0011275106747532	0.2995726554221526	0.0009311800996337	0.97005606955722	-4.517641164912296e-05	0.8740955029576819	4.517641164912296e-05	0.8671983661994541	1.819575203227541e-05	0.9615817524590868	-9.360113678632016e-07	0.8564996950368714	9.360113678632016e-07	0.8496759005388477	-0.0001707300979841	0.8724047647504503	0.0001707300979841	0.8654735008016723	RBM5	56996	RBM6	91916	MON1A	101751	False	False	False	ref	35	0.003448	-35	0.04663
2573	chr3	50032019	G	T	rs9866695	-0.01211998374	0.7540960767785698	0.01211998374	0.7474359089427698	0.0091947214872969	0.9403062372617536	-0.0001115343453952	0.8553591257049136	0.0001115343453952	0.848561395451452	0.0008107617696545	0.9739321333363558	-9.996955420436976e-06	0.9681677584312772	9.996955420436976e-06	0.9611213366945196	7.2013698201297565e-06	0.9882982465841836	-9.047258891471132e-08	0.9812687933928098	9.047258891471132e-08	0.9750591500246588	-4.536306951271782e-05	0.9616963168633568	4.536306951271782e-05	0.9563598412923616	RBM5	56901	RBM6	92011	MON1A	101846	False	False	False	ref	95	0.002739	60	0.05542
2574	chr3	50056838	T	A	rs12486470	-0.231314108	0.0171126038427257	0.231314108	0.0169977532379467	0.0389445096536741	0.1174735716499143	-0.0092076713882197	0.0237481606391681	0.0092076713882197	0.0237099153841432	0.0206162779189072	0.6530173354903456	-0.0052638253450313	0.2869449690075403	0.0052638253450313	0.2828051070099862	0.0008455176305258	0.5270675105988204	-0.0002166763289007	0.2178999026063144	0.0002166763289007	0.2145811757453039	-0.0115684075088251	0.2184030806402737	0.0115684075088251	0.2153338601802588	RBM5	32082	SEMA3F	98208	RBM6	116830	False	True	False	ref	15	0.00717	5	0.001465
2575	chr3	50079987	G	C	rs62263590	0.338939752	0.0065992615863474	0.338939752	0.006563690375665	0.0565065558423205	0.0393903965249321	0.020446234291483	0.0076417102322615	0.020446234291483	0.0076573744606694	0.0005979677344858	0.984675862320842	0.0002170690198573	0.6965841205377573	0.0002170690198573	0.7030771467922087	3.6503324588481445e-05	0.9200343822488896	1.3783366379050142e-05	0.5430956294165885	1.3783366379050142e-05	0.5491299670677235	0.0004272376365015	0.7620948996364016	0.0004272376365015	0.7688648642206987	RBM5	8933	SEMA3F	75059	GNAT1	111624	False	True	True	alt	-95	0.04532	-100	0.0914
2576	chr3	50108661	T	A	rs3733133	0.0229478334	0.4743195228286904	0.0288346957999999	0.4781718843731237	0.0224814183348393	0.3932953230403079	0.0004600329309252	0.4407832631030546	0.0006493448593792	0.4441545647465978	0.0003035201741941	0.9940773280975316	9.31612326056606e-06	0.951950206291244	1.0044430940986892e-05	0.9559677532426346	6.273294486873071e-06	0.990434488364464	1.86566691217288e-07	0.9406643748789651	2.099878825901399e-07	0.944676190296874	3.3816106364022464e-05	0.952366199860966	3.876480485631899e-05	0.9563405811521232	RBM5	19741	SEMA3F	46385	GNAT1	82950	False	False	False	alt	-70	0.02036	95	0.0382
2577	chr3	50136764	G	T	rs2624847	-0.031444952314	0.4630550040175166	0.031444952314	0.4574624577820561	0.0410980262304638	0.1009736555184225	-0.0013372044136074	0.2925140467614971	0.0013372044136074	0.2890099105308085	0.3442850780244795	0.0902373719791904	-0.0113639029525585	0.1676486394924206	0.0113639029525585	0.1646927447237611	0.0143215113953969	0.0434981487080531	-0.0004902046560829	0.1221210491429808	0.0004902046560829	0.120077298144284	-0.0105811421596119	0.2207389079397832	0.0105811421596119	0.2172349436201686	SEMA3F	18282	RBM5	47844	GNAT1	54847	False	False	False	ref	100	0.1272	100	0.6294
2578	chr3	50151221	C	T	rs12054052	-0.0085354769999999	0.321175542052327	0.0478683278	0.3206673792436109	0.0173618709506599	0.588675161754097	-0.0002278072402784	0.3949559349856109	0.0008399453063297	0.3945395827413154	0.2530418000065982	0.1366430022447134	-0.0034087014500203	0.1470672079751626	0.0110216763061125	0.1467644358214282	0.0043903376887228	0.1810352707526037	-7.482547529929527e-05	0.1849975014151402	0.0001937861920428	0.1846439200973847	-0.0029321038566856	0.1514418178056994	0.0142976147273266	0.1511656195598535	SEMA3F	3825	GNAT1	40390	SLC38A3	54026	False	False	False	ref	-85	0.1632	-70	0.3481
2579	chr3	50171616	G	A	rs2624835	0.03421849734	0.3832374129970757	0.03903503454	0.386461787908074	0.0261827723130015	0.302179912572204	0.0009423561447117	0.3554436932479204	0.0010479061260413	0.3580894161120789	0.3054955296756952	0.1080286723516386	0.0112789611348708	0.1545051059119552	0.0128685567069366	0.1561834712084745	0.0079365152298188	0.1005385221155395	0.0003091406288721	0.1551708981217411	0.0003439751522541	0.1567421570593402	0.0111609646662927	0.1873843609318723	0.0129936326746065	0.1894766129051915	SEMA3F	16570	GNAT1	19995	SLC38A3	33631	False	False	False	alt	-100	0.1186	-5	0.02539
2580	chr3	50191334	G	T	rs3755831	0.0121535747999999	0.6442766405630354	0.0174680542	0.6481041355705672	0.0732579010663126	0.0147921825801733	0.0009050707861381	0.2732561069953521	0.0012811870317669	0.2754292886090347	0.047131404440632	0.4452259966639628	0.000537720161845	0.5078221632856011	0.0008051886821252	0.5108142340383508	0.0034384085323544	0.2178211391900003	3.9890627192013046e-05	0.321540197510398	5.881990477133234e-05	0.3243397726084112	0.0013947081917455	0.4942872409011666	0.0022409356339282	0.4973141050308778	GNAT1	277	SLC38A3	13913	GNAI2	34959	False	True	False	alt	80	0.04813	40	0.1561
2581	chr3	50202031	C	T	rs4688683	-0.095616126	0.0466270752299434	0.161626394	0.0463131080152985	0.0253678782284465	0.3209989093735736	-0.0031905161817024	0.0819664053123894	0.0044999034034021	0.0814957277616943	0.1749818547721948	0.2066905957005138	-0.0058244722959325	0.0736013534940477	0.0253146617223729	0.0727596455113377	0.0040692543413949	0.1967038321237219	-0.0002630712248595	0.0849466152265759	0.0006496808587879	0.084045229900388	-0.0161434792649533	0.0419788408174338	0.0370137903731318	0.0415234711042123	SLC38A3	3216	GNAT1	10420	GNAI2	24262	False	False	False	ref	-85	0.02533	15	0.0718
2582	chr3	50206077	G	T	rs2236939	0.075249988	0.132532108880012	0.0873745299999999	0.1336928366524548	0.0786836553906479	0.0118498031413597	0.0061482681481995	0.0385227620156985	0.0069752924431532	0.0385213165041278	0.816119560555574	0.0064146546886965	0.0613445077212083	0.0164224972446608	0.0713640251890304	0.0165098185559563	0.064193365141302	0.0009871158145255	0.0050110831415693	0.0074572821120328	0.005694522092846	0.0073974153122174	0.0111106528982877	0.1689576040150039	0.0124385536603872	0.1711366847639511	SLC38A3	830	GNAT1	14466	GNAI2	20216	True	True	False	alt	5	0.0007324	5	0.02002
2583	chr3	50206647	G	A	rs2236940	-0.0594616799999999	0.2484009949063737	0.0594616799999999	0.244909592044894	0.0200782490234848	0.4812103222394402	-0.0011883285197399	0.2974787845824778	0.0011883285197399	0.2936189628648966	0.2973928606776417	0.1114402812811192	-0.0170421096690253	0.1016821749077654	0.0170421096690253	0.0998289220000556	0.0058500271213892	0.137903328706212	-0.0003338022031285	0.1278841796688885	0.0003338022031285	0.1257391849049752	-0.0191663092606644	0.1074839898246588	0.0191663092606644	0.1055382360777117	SLC38A3	1400	GNAT1	15036	GNAI2	19646	False	False	False	ref	-80	0.02576	-15	0.0387
2584	chr3	50235333	T	G	rs4688743	-0.0175741686599999	0.5895636618481952	0.0207542238599999	0.5851658324368426	0.0609430594710904	0.0308940702890783	-0.0009579922755571	0.3155241765436135	0.0011488876498463	0.3129743489972389	0.6686574180990399	0.0187269109501519	-0.0119787267176664	0.1325340418692033	0.0141037120525041	0.131164084905865	0.0409341810001908	0.0041647188266293	-0.0006604279219808	0.0742704754826433	0.000787988555366	0.0736670235481711	-0.003855036125499	0.3787054294261874	0.0045643495760614	0.3754916714308284	GNAI2	9040	SLC38A3	30086	SEMA3B	32226	False	False	False	ref	40	0.02303	-85	0.1188
2585	chr3	50278688	T	C	rs6776145	0.2210250991999999	0.0206371646353954	0.2210250991999999	0.0207687284501749	0.0369588487968408	0.1372179618640746	0.0088553242971792	0.0294143978564726	0.0088553242971792	0.0295429059785285	0.0589076572861336	0.412431000048923	0.0117653270595406	0.1308391848765717	0.0117653270595406	0.1334843741017723	0.00205974782196	0.3128072618455524	0.0004358583596253	0.1024348429131354	0.0004358583596253	0.1043344656371014	0.024634621094652	0.0721463851961084	0.024634621094652	0.0735280005700864	LSMEM2	400	SEMA3B	11129	IFRD2	14230	False	False	False	alt	20	0.01178	45	0.021
2586	chr3	50303565	T	C	rs28365992	0.1673782268	0.0401163433062188	0.1673782268	0.0405939158163876	0.0251261420531073	0.3293643195341533	0.0044151439839079	0.0743123751267335	0.0044151439839079	0.0753395409898508	0.6172115733562072	0.0229456120948075	0.0999841482251368	0.0092946076782034	0.0999841482251368	0.00943314061696	0.0152671097237148	0.0389444317458499	0.0026029582100026	0.0195924994714185	0.0026029582100026	0.0198718612937351	0.0433374022632047	0.0310917274893839	0.0433374022632047	0.0316541908438649	NAA80	4149	HYAL3	4160	HYAL1	8816	False	False	False	alt	80	0.0853	85	0.5044
2587	chr3	50314167	C	T	rs12492683	-0.180468928	0.0354018748653716	0.180468928	0.0350657401700105	0.0591938950820182	0.0324949184248656	-0.0110229830669377	0.020235571562515	0.0110229830669377	0.0201613658934089	0.0060374121606017	0.8280648691486279	-0.0010576812734471	0.5151036556765197	0.0010576812734471	0.5097239867058965	0.0003814066354318	0.6587436073285954	-6.721826316337024e-05	0.3538833924674944	6.721826316337024e-05	0.3491585286363038	-0.0027968394312295	0.4892987462337083	0.0027968394312295	0.4839115578160267	HYAL1	1786	HYAL2	8615	TUSC2	14084	False	False	False	ref	-60	0.0092	-20	0.02649
2588	chr3	50314953	T	C	rs12054403	0.378118168	0.0046728975794438	0.378118168	0.0046948413636252	0.0706549608059552	0.0179863309844459	0.0289096076127546	0.0042186668504028	0.0289096076127546	0.0042877766421322	0.0496750354656724	0.4744421218832501	0.0217767588458708	0.0977206552968593	0.0217767588458708	0.0993463546097212	0.0037141858962472	0.2414700940697571	0.0018091322020658	0.0460180818922119	0.0018091322020658	0.0468437505164774	0.0343076770809276	0.0531332587836206	0.0343076770809276	0.0537015953034101	HYAL1	2572	HYAL2	7829	TUSC2	13298	False	True	True	alt	100	0.06464	50	0.031
2589	chr3	50334001	C	A	rs2236947	0.13958687904	0.0687804079150542	0.14075068896	0.0691580356566913	0.13748036952226	0.000998542730098	0.0191231871800448	0.0139900768235837	0.0192963835142749	0.0140657560354505	0.3137796509517996	0.1066142767309716	0.0417997308673504	0.0506137290925514	0.0421544440931641	0.0511389615982075	0.044059106304167	0.003883589732403	0.0058981609386103	0.012729066044673	0.0059509487939843	0.0127515167633446	0.0390732737290092	0.0438299277534836	0.0394427765497673	0.0442596803236982	TUSC2	5750	RASSF1	6979	HYAL2	11219	False	True	True	alt	-40	0.08545	-100	0.1719
2590	chr3	50354037	T	C	rs58181992	-0.0140649225599999	0.7076012585652725	0.0140649225599999	0.7009115435589011	0.0100992857676912	0.9049168760841722	-0.0001408193412401	0.8080216637247586	0.0001408193412401	0.8012537420698158	0.2099510078849262	0.1662962852263956	-0.0029746084538577	0.3285479119923984	0.0029746084538577	0.3238151439362018	0.002072072072089	0.3034042350105406	-2.8992821390248643e-05	0.4345171415205596	2.8992821390248643e-05	0.429005039259435	-0.0044488799445745	0.3761297447277598	0.0044488799445745	0.3707728056401359	ENSG00000272104	3144	CYB561D2	3191	NPRL2	3211	False	False	False	ref	100	0.0357	100	0.1914
2591	chr3	50418039	G	A	rs6446206	0.1059013525199999	0.1189285147206921	0.10669177548	0.1198586731733991	0.0229249140589432	0.3846971717237324	0.0029738421897532	0.1643911804824474	0.002985808537448	0.1656064859658382	0.0361362211738312	0.5245716644705904	0.0065567267610321	0.2989906434363407	0.0065659156790337	0.3025545217075278	0.0009492742113783	0.490559420292025	0.0001965406646998	0.2915281389434698	0.0001966797772916	0.29508710891041	0.0134604598990465	0.217417351742729	0.0134934512223284	0.2199808600720589	TMEM115	58518	ENSG00000272104	67146	CYB561D2	67193	False	False	False	alt	-80	0.1826	-60	0.05902
2592	chr3	50454725	G	A	rs2157328	-0.0059805325	0.5497749022285509	0.0238709291	0.550677386798656	0.0149521225610261	0.6932843116808597	-0.0001225193039925	0.6063838095333697	0.0003700227292938	0.6070464615540345	0.6205849361617894	0.0242168346649257	-0.0037544669701847	0.1378419783523344	0.0145867430705567	0.1380974303101294	0.0092819866066274	0.0815119630186776	-7.639990620757282e-05	0.1949034982540335	0.0002264736347894	0.1954251207097826	-0.0012990333542278	0.3310157716541482	0.0061025700240836	0.331611044278873	CACNA2D2	49519	TMEM115	95204	ENSG00000272104	103832	False	False	False	ref	60	0.01689	-100	0.1853
2593	chr3	50462430	A	G	rs9311454	0.01345932158	0.71649315339388	0.01345932158	0.722763446530815	0.0202605909176046	0.4747339638880346	0.0002742645409122	0.6820384148389323	0.0002742645409122	0.6885610520408295	0.0654234436343241	0.3898572388530332	0.0006805865590575	0.5599010830538121	0.0006805865590575	0.5655591409440363	0.0013057238352024	0.3937487373171572	1.3385172526180072e-05	0.5546346135771782	1.3385172526180072e-05	0.5604925414947611	0.0017460657846985	0.5646477002444409	0.0017460657846985	0.5705510867650522	CACNA2D2	41814	TMEM115	102909	HEMK1	106723	False	False	False	alt	55	0.0263	100	0.359
2594	chr3	50483208	C	A	rs80049775	-0.00658417902	0.5187471251427652	0.02525724218	0.5196179944136649	0.0298814750595585	0.229169657694927	-0.0003130789013669	0.4152449898339506	0.0007778987285078	0.4158901916432738	0.1939477417439213	0.187163651904927	-0.0026442050850979	0.2581338222360833	0.0057713509786087	0.2585795058486411	0.0059106853909625	0.1479633942102487	-0.0001037910230007	0.2279225895130652	0.0001794751728981	0.2284295816645915	-0.0022343373692718	0.2804914900971193	0.0075409917191778	0.2808416829909373	CACNA2D2	21036	HEMK1	85945	C3ORF18	87819	False	False	False	ref	100	0.03717	100	0.2803
2595	chr3	50556413	G	A	rs17051014	0.0685255898	0.1426053350561652	0.089856477	0.1437027861445097	0.0191060608260804	0.5134776725814856	0.0017049556498368	0.2165009018480131	0.0019796406557909	0.2181087818719483	0.1687209263963577	0.212788097147066	0.0144990001156363	0.1204576426481844	0.0173075153072287	0.1218339750376466	0.0031987113505295	0.2429337702136265	0.0003181852323141	0.153013954043684	0.0003543514268685	0.1546219012241183	0.0183802909834713	0.0920713018236364	0.0232762033585166	0.0929044043063977	HEMK1	12740	C3ORF18	14614	CACNA2D2	52169	False	False	False	alt	-80	0.03113	65	0.186
2596	chr3	52646807	C	T	rs2028216	0.0173811154	0.6426050797307042	0.0173811154	0.6490971393039403	0.0148186514886212	0.6976751599680115	0.0002676006545755	0.6818774021542209	0.0002676006545755	0.6886165505351246	0.006226287486391	0.8208253258901853	5.785791944146481e-05	0.8473620455004169	5.785791944146481e-05	0.8541473001659173	9.019803593660736e-05	0.8442994263160977	8.858161840599968e-07	0.8555542489872991	8.858161840599968e-07	0.8623771216559114	0.0002375375276301	0.8343154949634357	0.0002375375276301	0.8411160656053654	GNL3	34350	PBRM1	39110	SPCS1	58149	False	False	False	alt	-100	0.01732	-70	0.1313
2597	chr3	52664401	T	C	rs12488461	-0.00773894536	0.7986080628102133	0.00887497572	0.7939152887544026	0.0308473629569745	0.2100379908226848	-0.0002502178514195	0.6631876328526187	0.0002843612656331	0.6587490079898382	0.0006408564547523	0.9807501462521518	-5.517506470690765e-06	0.9716792788532944	6.060954066390895e-06	0.968474686241768	2.0380002014531725e-05	0.9522605214199484	-1.8005939984013614e-07	0.9486535490569528	1.963927278760748e-07	0.9443966655947116	-2.556827554353206e-05	0.9727868491808012	2.556827554353206e-05	0.9674400581687213	GNL3	16756	PBRM1	21516	SPCS1	40555	False	False	False	ref	-75	0.07404	-70	0.1067
2598	chr3	52715318	C	T	rs35526119	-0.089858328	0.1350848811003855	0.089858328	0.1331913744662964	0.0383832824166584	0.1230554883429071	-0.003681381872429	0.0970277131963773	0.003681381872429	0.0959007737346198	0.3014252251657813	0.1102493459144653	-0.0235782372089986	0.06944262467301	0.0235782372089986	0.0681305613276503	0.011123757932356	0.0642858339654326	-0.0009320601582266	0.0547423331957333	0.0009320601582266	0.0537361413868732	-0.0273753752763022	0.0636465460677585	0.0273753752763022	0.0625163451758785	GLT8D1	9286	SPCS1	10362	PBRM1	29401	False	False	False	ref	35	0.01525	-100	0.05035
2599	chr3	52781889	T	C	rs2710323	0.0470617094	0.3039311750504518	0.0470617094	0.3080509258224145	0.0151864394684763	0.6799925501367355	0.0007423091027095	0.3998277096622749	0.0007423091027095	0.4049503480329729	0.0033741875886641	0.8778172051236889	0.0001359230430034	0.7518453858285419	0.0001359230430034	0.7585152233963506	4.7862020927156936e-05	0.8947041577385052	2.070607643786108e-06	0.7687635364633715	2.070607643786108e-06	0.7754060390872742	0.0005493055326448	0.7307331020556257	0.0005493055326448	0.7372265949407782	ITIH1	4293	NEK4	10943	ITIH3	12880	False	False	False	alt	30	0.0081	60	0.1257
2600	chr3	52820897	G	A	rs2535646	-0.2423857292	0.0192781799734722	0.2423857292	0.0190815145079903	0.0531478190076325	0.0475902568170754	-0.0138723272564283	0.0174791782741408	0.0138723272564283	0.017337019891985	0.4233628055821318	0.0619845701675062	-0.1100703918550179	0.0100349221504922	0.1100703918550179	0.0099806436173101	0.022930575719203	0.0184787581306301	-0.0063285540516898	0.008875061859228	0.0063285540516898	0.0088471376534416	-0.077705288509122	0.0098317300491988	0.077705288509122	0.0097298295422091	ITIH4	9791	MUSTN1	14122	ENSG00000243696	14832	True	True	False	ref	-15	0.02344	-60	0.2285
2601	chr3	52894317	G	A	rs62253582	-0.0824208958	0.1566300284251412	0.0901766262	0.1552364161697339	0.0240498545645407	0.3474201508994256	-0.0027575093736268	0.1824566802035645	0.0028419138229316	0.1808973875629636	0.1559029725182276	0.2233763748641684	-0.0140809936237201	0.1385318262738983	0.015909773386672	0.1367500953928705	0.0038272148100258	0.2153086953655479	-0.0005292992650821	0.1459410315522043	0.0005492016008774	0.1440726853167967	-0.0205478209230971	0.1021648282607456	0.0228803074791329	0.1009194064357931	STIMATE	3231	STIMATE-MUSTN1	3245	ENSG00000243696	58588	False	False	False	ref	-100	0.01712	-85	0.2864
2602	chr3	52894318	G	A	rs62253583	-0.100654492	0.1290248942633477	0.100654492	0.1273896056229922	0.0256274742897182	0.3172392485516244	-0.0032142178206909	0.1544656174779531	0.0032142178206909	0.1526616109797516	0.1545725974068819	0.2248370998969105	-0.0190595264143422	0.1169969065638113	0.0190595264143422	0.1148299483723203	0.0041972228841814	0.2001314287935667	-0.0006514489945732	0.1227694754135913	0.0006514489945732	0.120536201991761	-0.0264408960443403	0.0813016953973279	0.0264408960443403	0.0799565237932136	STIMATE	3230	STIMATE-MUSTN1	3244	ENSG00000243696	58589	False	False	False	ref	-100	0.02542	-85	0.2715
2603	chr3	52957291	A	T	rs2465101	0.006637893	0.5039330518537605	0.0276360546	0.5053847454727981	0.0206498137390103	0.4603208596578302	0.0001492680631608	0.4768132296320214	0.0006146926851691	0.478386208915486	0.001387285144007	0.950629691124168	-1.869056406242084e-05	0.8920022270441824	4.42689727218702e-05	0.8929480087226271	2.9332256503384084e-05	0.940076961434568	-4.364523184819982e-07	0.8738098757312859	1.0039449203408483e-06	0.874846208394884	-5.691003266140068e-05	0.8863958693139147	0.0001608327009996	0.8873022919521438	STIMATE-MUSTN1	59729	STIMATE	59743	SFMBT1	89459	False	False	False	alt	-80	0.01079	-55	0.0803
2604	chr3	52975579	T	C	rs6801235	-0.0145616655999999	0.6364414675080173	0.0187258519999999	0.6327224284619173	0.0315910233864731	0.1994030552389564	-0.0005075434658031	0.477548044900547	0.0006207906802653	0.4742324654851392	0.0003868232654811	0.9926674563115832	-5.401891566900744e-06	0.9724629817980118	7.462621908639203e-06	0.9685328771414202	1.2330546756328864e-05	0.9759324872555786	-1.9526505590019145e-07	0.945600423086353	2.513076878468363e-07	0.9417232812743092	-1.402131239484015e-05	0.975682491888302	2.2269143215334374e-05	0.9717600660215016	SFMBT1	71171	STIMATE-MUSTN1	78017	STIMATE	78031	False	False	False	ref	100	0.02689	0	0.0
2605	chr3	52980641	C	T	rs2581816	-0.1437897286	0.060148618161131	0.1437897286	0.0595939289262662	0.0208094281422743	0.4438608902829652	-0.0033253461944782	0.1175886645111754	0.0033253461944782	0.1164801154769911	0.0646646431988386	0.3906485975934371	-0.0100128512242668	0.1803046498942275	0.0100128512242668	0.1769986974345472	0.0013536145316158	0.3923483487367143	-0.0002393363696198	0.1961893150617011	0.0002393363696198	0.1927676350511603	-0.0206228761835636	0.1113875656027955	0.0206228761835636	0.1095118280045358	SFMBT1	66109	STIMATE-MUSTN1	83079	STIMATE	83093	False	False	False	ref	-65	0.2024	10	0.02344
2606	chr3	52992088	T	C	rs6771610	-0.018141224	0.3489850084002553	0.043827616	0.3462203155027215	0.0231031166280175	0.379753084294933	-0.0005189737770817	0.3412502513221706	0.0010214508492516	0.3383537118480483	0.0025131140510045	0.9106619050772876	3.504266449045705e-05	0.8097723110433069	0.0001278753817025	0.8062432949600843	5.2814494964939646e-05	0.892601100585578	4.6890252109146914e-07	0.7846242486952282	2.7180994625008817e-06	0.7809652153927767	0.0001030978852562	0.7995805414497663	0.0004363102504041	0.7961982841665696	SFMBT1	54662	STIMATE-MUSTN1	94526	STIMATE	94540	False	False	False	ref	90	0.02354	-30	0.05438
2607	chr3	53235301	T	C	rs2035450	-0.2719398768	0.0157707155976226	0.2719398768	0.0156539967497179	0.0562148596799053	0.0398942539569273	-0.0168682621040069	0.013716918644867	0.0168682621040069	0.0136942769857515	0.2877659925439609	0.1167715122438506	-0.0910306730031507	0.0152863180903323	0.0910306730031507	0.0150443948281761	0.0168456706295352	0.0345261685218134	-0.0057533011252585	0.0113449067266538	0.0057533011252585	0.0112580974055012	-0.0898320741644947	0.0076391853399424	0.0898320741644947	0.0075686679207679	TKT	20751	PRKCD	79291	CACNA1D	93663	False	True	False	ref	-80	0.0323	-40	0.168
2608	chr3	53236328	T	C	rs3773744	0.0569779958	0.2461708580269602	0.0637392898	0.2480565298142586	0.0230088119136859	0.3882729750004823	0.0014904878625716	0.2661456326276875	0.0016197033411876	0.2680093869555127	0.1323347959486654	0.2476693239146962	0.0080091637965434	0.1931375416212669	0.0089443318655331	0.1951215197574742	0.0030389614242499	0.2398091698196259	0.0002065674996109	0.1968221083781613	0.0002244395507528	0.1986695422031945	0.0130711622843192	0.1575771247816171	0.0149401207482431	0.1592195160200872	TKT	19724	PRKCD	80318	CACNA1D	92636	False	False	False	alt	-40	0.0449	-65	0.1335
2609	chr3	53259970	G	A	rs12490667	-0.274312836	0.0131393541067842	0.274312836	0.0130509971866163	0.0750859999340536	0.0147205761870092	-0.0228567258444126	0.0074804801767271	0.0228567258444126	0.0074260633933376	0.2298596219194351	0.1572289824229428	-0.0767169656786226	0.0218478463826693	0.0767169656786226	0.0214249341795186	0.0188811183991971	0.0319556681418444	-0.006612225361062	0.0105861580173213	0.006612225361062	0.0104635083648612	-0.0790084457787601	0.0098067599321436	0.0790084457787601	0.0097051628177019	TKT	3918	CACNA1D	68994	DCP1A	87616	False	True	False	ref	-90	0.04547	0	0.0
2610	chr3	53421542	G	T	rs2358740	-0.035857297	0.1399174570435527	0.084866737	0.1385047907239847	0.0263786335258719	0.2984222578852853	-0.0006267142551699	0.1525047755931055	0.0023583799166954	0.1510567332186713	0.4911888423344661	0.045625706689159	-0.0137594344461688	0.0367533187536265	0.0410593462383004	0.0361710685495654	0.0131052888587996	0.050135682100025	-0.0001982072608998	0.0469521395043166	0.0011628034782998	0.0462728864769506	-0.0121284352215366	0.0634316189402924	0.027388571805615	0.062582258300689	DCP1A	73956	CACNA1D	92578	TKT	165490	False	False	False	ref	-85	0.1276	-40	0.0869
2611	chr3	53441047	T	C	rs9799015	0.1079465839999999	0.0904751330958365	0.1079465839999999	0.0917851616484893	0.0183412992499552	0.5478501319883062	0.0020180915018056	0.1695170773940147	0.0020180915018056	0.1718002767057183	0.0017576127478472	0.9389536307134988	0.0001997784725031	0.735199971546577	0.0001997784725031	0.7417291393963308	3.3768708904745784e-05	0.931722674148537	3.870225623575588e-06	0.7288887594593146	3.870225623575588e-06	0.7355072979755718	0.0006779716934445	0.7238741246599488	0.0006779716934445	0.7303710969571625	DCP1A	93461	CACNA1D	112083	TKT	184995	False	False	False	alt	60	0.06018	60	0.1687
2612	chr3	53474106	C	A	rs11715213	0.0044252054	0.7985457720463398	0.0092111358	0.7999642008740431	0.0268524822782609	0.2886766706515681	7.320770356856e-05	0.7001606651999357	0.0002386786800585	0.7017071946002555	0.0057677080927715	0.8067496883861321	3.130616256037236e-05	0.8546014422465769	5.49257586658578e-05	0.85579369466325	0.0001571326168458	0.7555181501080532	6.570722070519443e-07	0.8151009805291427	1.4492878995903732e-06	0.8162257566885016	0.0001294909438817	0.8469691312372838	0.0002152683844148	0.8482854063509343	DCP1A	126520	CACNA1D	145142	TKT	218054	False	False	False	alt	45	0.006668	60	0.1621
2613	chr3	53485740	G	A	rs998411	0.00049483046	0.6426205986334625	0.01689680406	0.6428522829393616	0.0154714728905944	0.6617391440022284	-1.2407254175086262e-05	0.6643713997474386	0.0002666000488353	0.6646472138955639	0.0217264359473458	0.6336938575682223	0.0002440475250385	0.6602562001254099	0.0004345983667003	0.6609453243157472	0.0003397495535757	0.668451254349503	3.8228888170858e-06	0.6805879116649896	6.854975886230753e-06	0.6812644522894314	0.0004404341658143	0.6467789382703579	0.001202533733628	0.6475246188978779	DCP1A	138154	CACNA1D	156776	TKT	229688	False	False	False	alt	75	0.02118	65	0.03955
2614	chr3	60291445	A	C	rs10049216	0.7582526380000001	0.000418706512541	0.7582526380000001	0.000419453649143	0.1178925685739327	0.0021202641009574	0.0889305687561987	0.0004292421166033	0.0889305687561987	0.0004338234299368	0.4228728844313945	0.0628996768994574	0.3292583697281337	0.0007049852003484	0.3292583697281337	0.0006816215497103	0.0495863605492012	0.0022920524477334	0.0383145737008151	0.0004269002260086	0.0383145737008151	0.0004183689215288	0.2439477417439213	0.0002311873210403	0.2439477417439213	0.0002249494529321	FHIT	960014	CFAP20DC	1241361	PTPRG	1270125	False	True	True	alt	-100	0.01245	30	0.04053
2615	chr3	60307186	C	G	rs4679526	-0.0367321456	0.3870156151412748	0.0367321456	0.3820921919024129	0.0288874604367206	0.2439669172674402	-0.0010800696332205	0.3131162126498653	0.0010800696332205	0.309006739969724	0.0111205502952723	0.7149474007770593	-0.000455773134765	0.6180518549095223	0.000455773134765	0.6117883759426685	0.0003094332839935	0.6490836893291312	-1.2959257129879211e-05	0.5599057509067102	1.2959257129879211e-05	0.5538803663974594	-0.0016091517930783	0.5845124091192399	0.0016091517930783	0.5782125920254366	FHIT	944273	PTPRG	1254384	CFAP20DC	1257102	False	False	False	ref	15	0.05566	-100	0.0825
2616	chr3	60324743	G	T	rs1882900	-0.0795020888	0.155357496807552	0.0795020888	0.1531103408571145	0.0221496040142386	0.4061744199030787	-0.0018547423978728	0.1952433806416974	0.0018547423978728	0.1925495060897561	0.1469375804163504	0.2419474334918625	-0.0132748002237698	0.139726486571508	0.0132748002237698	0.1371319479856581	0.0033710853826661	0.2384341532444121	-0.0003116554484934	0.1544084785072516	0.0003116554484934	0.1516871734935355	-0.0202830655537593	0.1045200204316748	0.0202830655537593	0.1027347418889685	FHIT	926716	PTPRG	1236827	CFAP20DC	1274659	False	False	False	ref	-100	0.1746	-100	0.4895
2617	chr3	60346500	T	C	rs6787076	0.25825789	0.0124496455401573	0.25825789	0.0125353865160712	0.112874655181913	0.0027991318781323	0.0293236366114858	0.0035607819794746	0.0293236366114858	0.0035588999850181	0.2182763683151331	0.162737640958805	0.0580146608662256	0.0227309903744171	0.0580146608662256	0.0230773644725806	0.024381845044163	0.0164128857505388	0.0064905449566671	0.0062288485316593	0.0064905449566671	0.0062708299175741	0.0735153904523109	0.0089485333295268	0.0735153904523109	0.0090183001914404	FHIT	904959	PTPRG	1215070	CFAP20DC	1296416	False	True	True	alt	-50	0.02637	-15	0.02441
2618	chr3	60384629	G	A	rs9847855	0.2429811	0.0149198554871155	0.2429811	0.0150162136996949	0.0489828160284727	0.0595861984763237	0.0120878946897649	0.0152353297758184	0.0120878946897649	0.0153084664340039	0.1225569925109695	0.283207543345297	0.0320576675900388	0.0621042633891106	0.0320576675900388	0.0634517732298818	0.0061280053738234	0.1489778496270629	0.0016221955736668	0.0415452811377694	0.0016221955736668	0.0423312996819815	0.0470588235294116	0.0286241733567909	0.0470588235294116	0.0290794918104199	FHIT	866830	PTPRG	1176941	CFAP20DC	1334545	False	True	False	alt	-15	0.001038	-75	0.11816
2619	chr3	60384904	C	T	rs9848065	-0.0103926044	0.4177765848673105	0.0342546168	0.4158411071857292	0.0144591233898954	0.7122182280763826	-0.0001145365616977	0.5151976397723215	0.0004959642849742	0.5132694226447103	0.0989063376332024	0.3277630667442773	0.0001194789844405	0.3081061132936204	0.0041288075158912	0.3065510747482413	0.0014648308474737	0.3993197299544982	7.90088364379487e-06	0.3669533351556963	6.16716311741474e-05	0.3652707070086804	-0.0016404935501962	0.2904640172611673	0.0071335488766454	0.2887820105593778	FHIT	866555	PTPRG	1176666	CFAP20DC	1334820	False	False	False	ref	-30	0.00299	50	0.10815
2620	chr3	60391307	C	A	rs2687176	-0.00197882092	0.8404148746007397	0.00703081612	0.8396146159937758	0.0203297221943419	0.4620481090122353	1.273402150959611e-06	0.8028900422622143	0.0001344419953289	0.8024859897999523	0.0015176008709709	0.9427099110051084	3.776706647126366e-07	0.9548665928816954	1.0212141286931429e-05	0.9547014576032667	3.283821762591151e-05	0.9235902830960172	7.057438039996338e-08	0.942984820091406	2.1840568210105e-07	0.9422311536438208	5.773481574342104e-06	0.94820943520056	4.8662201840912097e-05	0.9472505275007648	FHIT	860152	PTPRG	1170263	CFAP20DC	1341223	False	False	False	ref	-45	0.1026	65	0.05243
2621	chr3	60394062	T	C	rs68056303	0.0919898242	0.1198865137856242	0.0919898242	0.1218412133235544	0.0141620486897109	0.733114895768766	0.0012938820227827	0.2544577468403592	0.0012938820227827	0.2581679699362346	0.1239343802579921	0.2716280384283179	0.0121136553310535	0.141974378984591	0.0121136553310535	0.1445812378620864	0.0017035692571441	0.3509012113661432	0.0001662386900288	0.204039433014971	0.0001662386900288	0.2073520453485343	0.0203160568770412	0.0986329963597366	0.0203160568770412	0.1004149345844379	FHIT	857397	PTPRG	1167508	CFAP20DC	1343978	False	False	False	alt	-100	0.1333	-60	0.1663
2622	chr3	60397868	C	T	rs9862806	-0.1608274142	0.0483187092061683	0.1644788618	0.0481128622021406	0.0654509404903258	0.0228497005297371	-0.0103851614344287	0.0283409503977786	0.0106448962497354	0.0281743309836844	0.1049841641648245	0.305316555889338	-0.0183426189049439	0.1125894812070436	0.0184882925218897	0.1108817745159123	0.0067547523096929	0.1264755400114453	-0.0011780827322006	0.0590382197556701	0.001188444789718	0.0584382429962272	-0.0321896341262247	0.0601281459287911	0.0325822308732802	0.0594046423109928	FHIT	853591	PTPRG	1163702	CFAP20DC	1347784	False	False	False	ref	100	0.0517	95	0.419
2623	chr3	60397871	C	T	rs9862809	-0.494514968	0.0018298486771315	0.494514968	0.0018528870508605	0.0749010609096644	0.0138530362532715	-0.0372953352054778	0.0022239238619646	0.0372953352054778	0.0022012300062144	0.1065256837451749	0.3027499632057572	-0.0518388539832659	0.0279800537507445	0.0518388539832659	0.0275958716218718	0.0080377269362334	0.1052362317541892	-0.0039421933918051	0.0122813474573473	0.0039421933918051	0.012235593492176	-0.0741323281976839	0.0097680529376785	0.0741323281976839	0.0097176361800853	FHIT	853588	PTPRG	1163699	CFAP20DC	1347787	False	True	True	ref	100	0.0699	100	0.4478
2624	chr3	60437276	T	C	rs2687189	0.1386042492	0.065325469443739	0.1422333948	0.0656700027197046	0.0679992888975913	0.0205079533597823	0.010616982738775	0.0295687456287255	0.0107887633129498	0.0295712487004855	0.0465936458711358	0.474317529860069	0.0086185279106853	0.2243234470346876	0.008682224441658	0.2269130879756724	0.0037198465725511	0.2388596976382704	0.0007394712093051	0.115702078740678	0.0007424861961237	0.1173198104611967	0.0166169047540496	0.1491449970070256	0.0168527927155157	0.1511256727886658	FHIT	814183	PTPRG	1124294	CFAP20DC	1387192	False	False	False	alt	-90	0.0472	45	0.0896
2625	chr3	60442238	C	A	rs77635360	0.1653793848	0.0421416848179284	0.1653793848	0.0425426877240679	0.048694624311448	0.0612476438843023	0.0084169583102165	0.0311242524701759	0.0084169583102165	0.0312788956917558	0.0010458249480386	0.9629909524865472	0.0001854637420473	0.7189633928710585	0.0001854637420473	0.7252414874084944	5.183814969297728e-05	0.8852316931224087	9.549544831058108e-06	0.5887879453326635	9.549544831058108e-06	0.5947640820861242	0.0005328098710038	0.734119615602747	0.0005328098710038	0.7405310599240322	FHIT	809221	PTPRG	1119332	CFAP20DC	1392154	False	False	False	alt	-20	0.04468	20	0.0652
2626	chr3	60449492	A	C	rs12629110	0.0003772908	0.3916773124217007	0.0391834068	0.3908594603233869	0.0428973672377762	0.0894225616481857	-5.1178271250300064e-05	0.2477946479702208	0.0018152522510899	0.2469923236098421	0.0835892910164626	0.3441150108389997	-0.0012005178436346	0.3439975590457375	0.0032620420275262	0.3426551333560061	0.0037180143266921	0.2157759789559003	-6.379425304513081e-05	0.2514661547394145	0.0001557036340314	0.2501873310263044	-0.0019011250041239	0.3083299425445441	0.0070032331496816	0.3073858540831634	FHIT	801967	PTPRG	1112078	CFAP20DC	1399408	False	False	False	alt	100	0.0227	45	0.0876
2627	chr3	60486253	A	G	rs9818182	-0.00935935908	0.7921540375230914	0.00935935908	0.7852448858903821	0.0143850367176108	0.7126706938563171	-0.0001314980465862	0.8111627035796244	0.0001314980465862	0.8042695412444957	0.0051499455643165	0.8258433768651187	-4.8123695201292936e-05	0.8690465372505014	4.8123695201292936e-05	0.8621585142502268	7.132713069610779e-05	0.8551648654275987	-6.556493261743699e-07	0.8831364562311458	6.556493261743699e-07	0.8762565263645321	-0.0001864009765431	0.868910803160146	0.0001864009765431	0.8620256194608961	FHIT	765206	PTPRG	1075317	CFAP20DC	1436169	False	False	False	ref	95	0.01542	95	0.1113
2628	chr3	60487965	A	G	rs9828307	-0.0328449346	0.3066376955152194	0.0548394718	0.3062171623464107	0.0148975472497854	0.6840399007257169	-0.000725106194373	0.4166043680486359	0.0009785126291248	0.4154956991130574	0.0311891722476988	0.5436339885369899	-0.0021523904940541	0.435493208548245	0.0024523068930823	0.4341782096453878	0.0005392458624419	0.5824049443661824	-4.314129238178301e-05	0.4710711005121276	4.6873125921369845e-05	0.469546354579416	-0.0045462043482563	0.378610972622329	0.0056580119428589	0.3774115174854064	FHIT	763494	PTPRG	1073605	CFAP20DC	1437881	False	False	False	ref	100	0.02908	100	0.181
2629	chr3	61848270	C	T	rs606506	-0.1177964848	0.0821513950875005	0.1177964848	0.0810223130185108	0.0226765186410375	0.3928088193140747	-0.0027854005280781	0.1290606908504719	0.0027854005280781	0.1274641544591507	0.089237405562337	0.3636013838323748	-0.0108552107682705	0.176403407729551	0.0108552107682705	0.1733332301373173	0.002098581185723	0.3505126476216965	-0.0002598296720896	0.186276772975022	0.0002598296720896	0.1835365181440029	-0.0187332981425884	0.1205151253000613	0.0187332981425884	0.1185934080082439	PTPRG	286700	CEP15	470746	FEZF2	526054	False	False	False	ref	100	0.003952	100	0.2231
2630	chr3	61851594	G	T	rs640732	0.0271294095999999	0.4853829494312326	0.0271294095999999	0.4914059490524574	0.0248813718133854	0.3321122706269315	0.0006720728720344	0.4163478717470472	0.0006720728720344	0.42183822658538	0.02016264722378	0.617629384445099	0.0005427019537287	0.5699985702425479	0.0005427019537287	0.5759860943728068	0.000489742973699	0.5754637878835267	1.3073590492410358e-05	0.5336530268596177	1.3073590492410358e-05	0.5395395602030633	0.0018021510342779	0.5390492421957038	0.0018021510342779	0.5449798380283583	PTPRG	290024	CEP15	467422	FEZF2	522730	False	False	False	alt	-60	0.0336	-55	0.1597
2631	chr3	61852543	C	T	rs626136	-0.0313746822	0.4065741611960853	0.0351691878	0.4028414691390288	0.0159996819133762	0.6211361995857995	-0.0006202919741823	0.4603579267760733	0.0006582932415397	0.4563726930391028	0.005025403318927	0.8282843473158576	-0.0001305536734545	0.7558878891697254	0.000154307670637	0.7516686955151619	7.624085192980063e-05	0.8463205742355829	-2.4621769015286344e-06	0.7606569686916546	2.700068771841665e-06	0.7564242400387962	-0.0005245620401833	0.7353141747046691	0.0006070403483883	0.7310732187483645	PTPRG	290973	CEP15	466473	FEZF2	521781	False	False	False	ref	75	0.008865	85	0.0995
2632	chr3	61853094	C	T	rs623843	-0.090826725	0.12853155872052	0.090826725	0.1267031774378654	0.0149145447885391	0.6850145785202655	-0.0014222300590118	0.2533642550734116	0.0014222300590118	0.2498994544309591	0.0204669921810563	0.6206518820303532	-0.0017749249345157	0.4034298250477172	0.0017749249345157	0.398349017758307	0.000275938006799	0.6695726170674228	-2.4851898098319346e-05	0.4525228713569458	2.4851898098319346e-05	0.4471352601966568	-0.0051359242519217	0.3403922945516933	0.0051359242519217	0.3355998151353417	PTPRG	291524	CEP15	465922	FEZF2	521230	False	False	False	ref	95	0.02603	15	0.05896
2633	chr3	61864460	T	G	rs623808	0.0785193159999999	0.1782363888172514	0.0785193159999999	0.1806152598876903	0.0203278320774149	0.4720999228779583	0.0017489137545888	0.2376748345386167	0.0017489137545888	0.2404085238899771	0.0290958727854573	0.5480795218481412	0.001863783060433	0.3845841492301779	0.001863783060433	0.3895865469746231	0.0005306931361801	0.5533135610968528	3.616439373396829e-05	0.3909981149345169	3.616439373396829e-05	0.3961696921488819	0.0050740655207679	0.3333661864139707	0.0050740655207679	0.3382643094905302	PTPRG	302890	CEP15	454556	FEZF2	509864	False	False	False	alt	70	0.01222	90	0.1729
2634	chr3	62068373	A	C	rs9863323	0.225458936	0.017908910198192	0.225458936	0.0180361048935046	0.0513546657980538	0.0532394725942249	0.0119284023715876	0.0162146164739098	0.0119284023715876	0.0162619982446523	0.0166177295371316	0.6547961767887438	0.0040484524159032	0.2826007991115872	0.0040484524159032	0.2870221400389695	0.0009278114375692	0.477990013787839	0.0002333752284352	0.1824867117164167	0.0002333752284352	0.1857082442301831	0.0095740820164296	0.219746787178977	0.0095740820164296	0.2235827159364966	CEP15	250643	FEZF2	305951	PTPRG	506803	False	True	False	alt	50	0.05548	-50	0.004883
2635	chr3	62069778	G	A	rs6787306	0.138816354	0.0547446821109834	0.138816354	0.0553694379694592	0.0606747480988684	0.0294448459391172	0.0083361965156492	0.0261662090363215	0.0083361965156492	0.0262769056768009	0.1207845336676453	0.2749530843294224	0.0167824497487098	0.1028926574834411	0.0167824497487098	0.1048787186512101	0.0073745902171592	0.1155031899660579	0.0010137302475367	0.0537176637240698	0.0010137302475367	0.0547712870789402	0.0292756754973441	0.0575852462804895	0.0292756754973441	0.0585866550767907	CEP15	249238	FEZF2	304546	PTPRG	508208	False	False	False	alt	-10	0.006104	-10	0.01782
2636	chr3	62070952	A	G	rs6766287	0.002313724274	0.757074014626365	0.010821966674	0.7586733110612598	0.0187351097840334	0.5269242883382851	0.0001001795564536	0.7193163522206635	0.0002206418969339	0.7209612009398877	0.3410774966183892	0.0917059081299074	0.00102200314342	0.2978645678906008	0.0039392960297488	0.2982858344816156	0.0064834402288853	0.1272638533271534	3.96305360396513e-05	0.3177077840313431	8.096745490061461e-05	0.3183280688880393	0.0007637491339777	0.4151712023952282	0.0037709082511298	0.415807177410891	CEP15	248064	FEZF2	303372	PTPRG	509382	False	False	False	alt	80	0.03137	100	0.2451
2637	chr3	62079095	A	G	rs11130874	0.0566101637999999	0.2471570336152948	0.0566101637999999	0.2505290182670582	0.0160780948113324	0.6216816889350865	0.0010251433642361	0.339507565447494	0.0010251433642361	0.3436600295233628	0.0551532446966447	0.4321608504025203	0.0025478169382081	0.3287281835828012	0.0025478169382081	0.3334092222555594	0.0007981135095504	0.4881397387948742	3.992230613403219e-05	0.3698962670858547	3.992230613403219e-05	0.3750752642955243	0.0063912441028009	0.2831102101917404	0.0063912441028009	0.2873680939697664	CEP15	239921	FEZF2	295229	PTPRG	517525	False	False	False	alt	-100	0.09436	80	0.1011
2638	chr3	62079251	C	T	rs11715438	-0.0701912394	0.213593313705125	0.0701912394	0.2111292254371027	0.0241447792008616	0.3530035366234826	-0.001924443006705	0.2331067471421131	0.001924443006705	0.2306551195696841	0.0575871795717725	0.4339111565490784	-0.0060303005354703	0.2999557784655597	0.0060303005354703	0.2958662219609391	0.0015159461835381	0.3975031451200452	-0.000171886669961	0.288216033573383	0.000171886669961	0.2841902859570699	-0.0120187390716241	0.2315964129486801	0.0120187390716241	0.2282796705270173	CEP15	239765	FEZF2	295073	PTPRG	517681	False	False	False	ref	50	0.02316	60	0.0558
2639	chr3	62080406	T	C	rs1859404	0.0937476634	0.1146278401006833	0.0937476634	0.1162592565534568	0.0368095745041281	0.1365817682579279	0.0035327654711499	0.0894977958407779	0.0035327654711499	0.0905311212188319	0.0007719969647982	0.9757453292085196	6.801946839172067e-05	0.821889359331278	6.801946839172067e-05	0.8287479521404267	2.942268305678828e-05	0.9330083968814888	2.6615384419127664e-06	0.7405678671627796	2.6615384419127664e-06	0.7470705558479012	0.0002416614430404	0.8256306186848361	0.0002416614430404	0.8325555665349051	CEP15	238610	FEZF2	293918	PTPRG	518836	False	False	False	alt	-90	0.01045	95	0.3071
2640	chr3	62084622	A	C	rs7646226	0.0163214055999999	0.2415945383888479	0.0596884247999999	0.243123412386998	0.017340544455902	0.5891061504076683	0.0002595901607058	0.3289764522994029	0.0010658090755216	0.3307164289583526	0.4022541321632411	0.0683219424332293	0.000576223688977	0.0819959229132802	0.0248312297592703	0.0826633203616075	0.0070459990622509	0.1193916477495593	-2.41615060185814e-06	0.1224536363967324	0.0004482745044298	0.1231608964963403	0.00540892745208	0.1167600897599453	0.0186483454851373	0.1176797943671641	CEP15	234394	FEZF2	289702	PTPRG	523052	True	False	False	alt	50	0.02576	-35	0.1611
2641	chr3	62093006	A	G	rs35831310	-0.0022755175199999	0.3477350490675854	0.0425386964799999	0.3488177376865805	0.0215513669906215	0.4315013575995964	-0.0001347235703597	0.3668330946602174	0.000949149394933	0.3680006714573406	0.0058823529411764	0.8067784306366714	-3.35972606951683e-05	0.6961634828891081	0.0002902686498324	0.697628401446366	0.000127653300932	0.7830933764232911	-1.389530390206087e-06	0.6743794584510017	6.552780554216482e-06	0.675732623351113	3.546567252812e-05	0.6618314606556196	0.0010482992972847	0.6633310016322245	CEP15	226010	FEZF2	281318	PTPRG	531436	False	False	False	ref	45	0.0216	100	0.1823
2642	chr3	62119521	A	G	rs113467722	-0.365165748	0.00635528076259	0.365165748	0.0063141483905976	0.0674078812386121	0.0209908490637225	-0.0273325983118402	0.0056143468679761	0.0273325983118402	0.0055971692688573	0.1695902477648378	0.2102537925339752	-0.0796368864764507	0.0240775256797761	0.0796368864764507	0.023838684275003	0.0125177693490442	0.0637708136268013	-0.0064529332825965	0.0131603352486992	0.0064529332825965	0.0129995529454496	-0.0854260829401866	0.0088186353232554	0.0854260829401866	0.0087435886148861	CEP15	199495	FEZF2	254803	PTPRG	557951	False	True	True	ref	-90	0.03357	15	0.03955
2643	chr3	62122990	G	A	rs2366683	-0.197994426	0.0263032023474758	0.197994426	0.0260710225987937	0.038061264949176	0.1246035186389892	-0.0077225441950166	0.0323384165289701	0.0077225441950166	0.0321191139841066	0.0575129490943881	0.4228963290456627	-0.0122765091509545	0.1458681413161648	0.0122765091509545	0.1433736441226184	0.0022254073911357	0.3091523101184916	-0.0004867925865882	0.1107820734547445	0.0004867925865882	0.1090388852981004	-0.0238774702253306	0.0826899575184965	0.0238774702253306	0.0812997562861061	CEP15	196026	FEZF2	251334	PTPRG	561420	False	False	False	ref	45	0.006073	-100	0.1323
2644	chr3	62440565	G	T	rs13081552	0.00119036	0.3138669392113233	0.0474490172	0.3141386476989466	0.0303229572090273	0.2213039935757522	0.0002554270342698	0.2506562376112844	0.0014340627481595	0.2510336012236959	0.0297812675266404	0.5486103945478148	0.0001331114610081	0.4475932553049439	0.001225991256118	0.4479200595659219	0.0008604336103751	0.4753912195801929	9.884422973492134e-06	0.3916748336156422	3.5975888442893724e-05	0.392151849033146	0.0002061957705123	0.4042433589457354	0.0036076012008841	0.404518107623267	FEZF2	66241	CEP15	121549	CADPS	434851	False	False	False	alt	100	0.1008	100	0.02917
2645	chr3	62479364	C	A	rs1452082	-0.3300396559999999	0.0064023318452364	0.3300396559999999	0.0064028806650922	0.074925144209722	0.0135867249554187	-0.0247359725982317	0.0044237765068682	0.0247359725982317	0.0044136477214394	0.5238040645310283	0.0395030400857785	-0.1741822649197438	0.0028173495187895	0.1741822649197438	0.0028194712004209	0.0393848287843634	0.0044087027110267	-0.0130963482025622	0.002033294583497	0.0130963482025622	0.0020467283466584	-0.1057487380818844	0.0033722281811035	0.1057487380818844	0.0033679687092462	FEZF2	105040	CEP15	160348	CADPS	396052	True	True	True	ref	100	0.1383	100	0.5586
2646	chr3	62574848	T	C	rs6786550	-0.0183871309999999	0.5399950221469905	0.0238630001999999	0.5358577745667009	0.013690992990808	0.7401426075828123	-0.0002623792006623	0.6144613207446998	0.0003288100423071	0.6101936012905478	0.0054740853155619	0.8223285412938479	-8.139525076400112e-05	0.7798193109694456	0.0001168490232258	0.7757415242762108	6.939428464105136e-05	0.8588191462038091	-1.0521558735583791e-06	0.8076074263878185	1.4822654929302628e-06	0.8034464263149325	-0.0003398106298043	0.7595950181506222	0.0004635280921117	0.7556175368404235	FEZF2	200524	CEP15	255832	CADPS	300568	False	False	False	ref	25	0.00867	65	0.06146
2647	chr3	63811581	A	C	rs72886387	0.0099983641199999	0.7465248108723701	0.0115959187199999	0.7508070382982233	0.0309757068420116	0.2162088832985109	0.0002394308549372	0.6356198126251417	0.0003205545306667	0.6398474721299522	0.0067929134637589	0.8022162211379847	6.640287629940905e-05	0.8454307915059096	7.195012391961761e-05	0.8497187868799503	0.0001976225884806	0.7385637720560295	1.725548238124312e-06	0.8002653937614845	2.007236960717904e-06	0.804406269163967	0.0002276401306456	0.8425847969085616	0.0002490844907788	0.8468156045689221	C3ORF49	7719	ATXN7	51575	THOC7	52287	False	False	False	alt	-85	0.009705	-80	0.207
2648	chr3	63871194	G	A	rs3774702	-0.008308475298	0.7095028011178559	0.013247533698	0.7078423970611984	0.019303950692749	0.509381723533819	-0.0002044580323275	0.680631207467584	0.0002943890656458	0.6788315031314681	0.0544694995216257	0.4233448244841298	-0.0002794241071674	0.6257576370949501	0.0005115000518415	0.6228745056296944	0.0010124306348085	0.4374862259667282	-6.6441332655079575e-06	0.6189444424370883	1.0869802963099442e-05	0.6157659347969597	-0.0006738477780343	0.6269866394400619	0.0014145029857147	0.623787281977874	THOC7	7326	ATXN7	8038	C3ORF49	51894	False	False	False	ref	-100	0.02757	-45	0.0464
2649	chr3	63966089	C	T	rs3774720	-0.10338135	0.1034143465444176	0.10338135	0.1019530663786598	0.0204529321755008	0.4688999378992313	-0.0021219740619076	0.1664600323797441	0.0021219740619076	0.1642876426976028	0.0611741611956055	0.425804178595397	-0.0074392502664236	0.2326085192041864	0.0074392502664236	0.2288612071300075	0.0012343277448611	0.4297539437809392	-0.0001509183414358	0.2523747778831373	0.0001509183414358	0.2483399603853785	-0.0143776186862854	0.1683483656934542	0.0143776186862854	0.165470829325537	PSMD6	57921	THOC7	102221	ATXN7	102933	False	False	False	ref	100	0.0427	85	0.09625
2650	chr3	64027666	G	A	rs35838	-0.01582579576	0.6422330669380385	0.01660675624	0.6374177222684797	0.0096112829851404	0.9197127176018196	-0.0001647734204542	0.7638010159450183	0.0001717794121331	0.7591945519281229	0.6607221800666425	0.0193614661718235	-0.0108841641692221	0.1590406982817206	0.0113725189092959	0.1570990783725131	0.0064221089364011	0.1261806041174691	-0.0001145997380977	0.2688042150143316	0.0001189807653742	0.2660069647939611	-0.0034310976213255	0.4262623789560189	0.0036109003332123	0.4222553290430698	PSMD6	3656	THOC7	163798	ATXN7	164510	True	False	False	ref	100	0.0681	100	0.3
2651	chr3	64057955	G	A	rs704375	-0.1448170452	0.0507261049113219	0.1448170452	0.050071518534158	0.0267942666739561	0.2893062801632368	-0.0039893490466527	0.0787820721775311	0.0039893490466527	0.077848413656115	0.0133994259509748	0.6967378810633233	-0.0018918161388637	0.398024588509496	0.0018918161388637	0.3928056236961006	0.0003541301758666	0.639181891113231	-5.17101638502305e-05	0.3608387942747949	5.17101638502305e-05	0.3558457236221224	-0.0056794563029922	0.3302693177535999	0.0056794563029922	0.3253250512224978	PSMD6	33945	THOC7	194087	ATXN7	194799	False	False	False	ref	100	0.008316	65	0.02534
2652	chr3	64083760	G	T	rs26936	-0.0195090037	0.6015721622117912	0.0195090037	0.5951213071665622	0.0212969076598397	0.4373956421026101	-0.0004445979740278	0.5531502344402217	0.0004445979740278	0.5470108981248517	0.1203498729834053	0.2670700905954086	-0.0023930689017075	0.3571491807572873	0.0023930689017075	0.3523278087641615	0.0026085588887571	0.2677218829603234	-5.540407487730271e-05	0.3525117158019083	5.540407487730271e-05	0.3477037885525116	-0.0047598231665071	0.3617600026085482	0.0047598231665071	0.3567443556225131	PSMD6	59750	THOC7	219892	ATXN7	220604	False	False	False	ref	-100	0.1106	65	0.0511
2653	chr3	71482316	T	C	rs35483362	-0.0098881808999999	0.7961795723814827	0.0098881808999999	0.7895830062480546	0.0128165873364091	0.7891112342430678	-0.0001257378096934	0.8323913672289587	0.0001257378096934	0.8257550139861782	0.0145532974827619	0.6675042270506071	-0.0001293193194728	0.7700156458305547	0.0001293193194728	0.7634163303880546	0.0001814950106941	0.7285371558173347	-1.5942821858369948e-06	0.8046412329666238	1.5942821858369948e-06	0.7979640026966536	-0.0004734254890963	0.7609855317799887	0.0004734254890963	0.7544490255378209	FOXP1	101662	GPR27	271540	ENSG00000285708	271913	False	False	False	ref	100	0.010254	100	0.212
2654	chr3	71482962	T	C	rs6805189	0.0465622151999999	0.3032362068579438	0.0465622151999999	0.3076256542713546	0.0163046000535626	0.6300071594839525	0.0007706545395531	0.3832293406640179	0.0007706545395531	0.3884181349307292	0.0416416482465111	0.4787064146319102	0.0019226517009063	0.3720393853324553	0.0019226517009063	0.3768707246709853	0.0006858166520889	0.5129674426368598	3.198680119879394e-05	0.4033683937665884	3.198680119879394e-05	0.4088028969225448	0.0052365477879317	0.3237136438787445	0.0052365477879317	0.3284570869504509	FOXP1	101016	GPR27	270894	ENSG00000285708	271267	False	False	False	alt	-15	0.004616	-80	0.08093
2655	chr3	71522194	C	T	rs6803008	0.148709271	0.0522951944856415	0.148709271	0.052903439895075	0.0301224476037798	0.2253199099955898	0.0050044274312196	0.0688208068785396	0.0050044274312196	0.0694661712499063	0.3908952195572564	0.0717893978357691	0.0655080707311086	0.0224004275943457	0.0655080707311086	0.0227421674810143	0.0123333304465005	0.0583971960245239	0.0023063386484308	0.0293014299138447	0.0023063386484308	0.0297984242438313	0.0483776516776087	0.0232724046368172	0.0483776516776087	0.0235611529228397	FOXP1	61784	GPR27	231662	ENSG00000285708	232035	False	False	False	alt	75	0.02713	-100	0.2563
2656	chr3	71523984	T	G	rs17008723	-0.167152221	0.0375039236264283	0.167152221	0.037146150809315	0.0397263846803369	0.1123234116258751	-0.006900669475079	0.0379777336833881	0.006900669475079	0.0377828606060091	0.0965029197321104	0.3123353373024089	-0.0156391998422528	0.1081943874382042	0.0156391998422528	0.1060691836674875	0.0037144884404771	0.2101330495362972	-0.000629543954531	0.0797798356192474	0.000629543954531	0.0783286510492102	-0.0294084655735541	0.0558972167215012	0.0294084655735541	0.0548662729507892	FOXP1	59994	GPR27	229872	ENSG00000285708	230245	False	False	False	ref	-25	0.003693	60	0.07666
2657	chr3	80616803	C	T	rs1437046	-0.0742354992	0.1730537340260127	0.0742354992	0.1703519109758629	0.0141212130589009	0.7270861333385592	-0.0010887726794647	0.3106260859923104	0.0010887726794647	0.306512335881087	0.2942248688594899	0.1132869065469312	-0.0223912519072225	0.0780811028665342	0.0223912519072225	0.0765470405170389	0.004366157630923	0.1884355171841612	-0.000348849607555	0.1331805503780573	0.000348849607555	0.1308213502037007	-0.0237232357889874	0.0771735223899446	0.0237232357889874	0.075723053612057	ROBO1	848805	GBE1	1144842	CADM2	4342187	False	False	False	ref	65	0.04626	65	0.2803
2658	chr3	80652442	T	C	rs678585	-0.02279313346	0.569116710477561	0.02279313346	0.5632514416337725	0.0204744296713625	0.4615661189052893	-0.0004940908180858	0.533186996724656	0.0004940908180858	0.5274897516050282	0.0019126719672725	0.9258907835943996	-4.3119365431188055e-05	0.8836173696246338	4.3119365431188055e-05	0.8767921816896187	3.885230365674932e-05	0.911341384019237	-9.230843719177716e-07	0.8645173166336958	9.230843719177716e-07	0.8578076808732339	-0.0001550592194252	0.8836900134462188	0.0001550592194252	0.8768249369728399	ROBO1	884444	GBE1	1109203	CADM2	4306548	False	False	False	ref	100	0.512	100	0.2002
2659	chr3	80655819	C	T	rs500298	-0.0673791222	0.2099019207807167	0.0673791222	0.2070259318329451	0.0232465873750875	0.3795503479490226	-0.0016945518250984	0.2288847625367546	0.0016945518250984	0.2259912300882045	0.3771815512520207	0.0773709005718405	-0.0265155489399974	0.0693481203415525	0.0265155489399974	0.0679257009537661	0.0089734646283286	0.0877257831000058	-0.0006752751929453	0.0848017363249915	0.0006752751929453	0.08329685635547	-0.0221767675101447	0.0892909331110443	0.0221767675101447	0.0877560371396823	ROBO1	887821	GBE1	1105826	CADM2	4303171	False	False	False	ref	-100	0.06335	-100	0.0713
2660	chr3	80664787	A	C	rs658551	0.00235503176	0.8053749350241616	0.00882007488	0.8062791343355142	0.0207173755354772	0.4584514099178761	4.263892838806272e-05	0.7601916654974633	0.0001804559439884	0.7611376578513563	0.0075896539210187	0.7711075374236124	4.593735149211293e-05	0.8404281885956675	7.122294010187202e-05	0.8415281616671456	0.000155853795608	0.7534653528697983	9.005975739082845e-07	0.8229950217257151	1.440703737278171e-06	0.8241058564078989	0.0001534096532611	0.8407084775572075	0.0002474349246147	0.8418084029913862	ROBO1	896789	GBE1	1096858	CADM2	4294203	False	False	False	alt	-85	0.00597	40	0.03174
2661	chr3	80677674	C	A	rs627529	0.0155042478599999	0.6251378658089912	0.0163532295	0.6283959798321037	0.017921038163715	0.5658654669729992	0.0002580975805665	0.6667610428205312	0.0002743549668581	0.6698484727830747	0.3033370723499719	0.1092178741974182	0.0042790670055881	0.3241179769060963	0.0046212209321735	0.3267733911843758	0.0054860433850212	0.1509534034570546	7.122555106714157e-05	0.3607180277496527	7.780806944464158e-05	0.3629845467790399	0.0054765596648081	0.3852314201377087	0.0057470885157202	0.3881103224550878	ROBO1	909676	GBE1	1083971	CADM2	4281316	True	False	False	alt	-40	0.03912	100	0.145
2662	chr3	80686336	C	T	rs7617921	-0.0574502627999999	0.2180716857850969	0.0659357268	0.2163037600806815	0.0151733796293919	0.6830032867356043	-0.000900612661198	0.3439198398717457	0.0010106980130932	0.3409059333032482	0.3400019794793968	0.0918238403362864	-0.0195596209095955	0.0894174873454105	0.0221813566195817	0.0884501201478857	0.005290285638794	0.1596529538293657	-0.0003097143036295	0.1415211418080947	0.000343727139932	0.140151659461581	-0.0167266009039622	0.1079111250508637	0.0198591270495859	0.1066949018507994	ROBO1	918338	GBE1	1075309	CADM2	4272654	False	False	False	ref	-65	0.0487	-55	0.1758
2663	chr3	80695967	A	T	rs613707	-0.0026430784	0.510699729385807	0.0263053023999999	0.5108563695993812	0.0318098411331061	0.1966822563413885	-0.0001723871683615	0.368460843168145	0.0008663829535655	0.3687371664309753	0.0850730757810695	0.3372218743246027	-0.0006358402846173	0.3550602375411197	0.0023925118885709	0.3550998820430737	0.0027888122368185	0.2615193970055496	-2.7051494653258752e-05	0.2979628843273789	8.076594157308955e-05	0.2980995687428638	-0.0012330507076638	0.3423684456796741	0.0050336511497475	0.3423708426566329	ROBO1	927969	GBE1	1065678	CADM2	4263023	False	False	False	ref	15	0.002106	0	0.0
2664	chr3	80732296	C	G	rs9832758	-0.0345545504	0.4299051020629068	0.0345545504	0.4249484837299604	0.0191948873959273	0.514200442249203	-0.0006429106880613	0.4491229423808643	0.0006429106880613	0.4437750835389527	0.0084350565801193	0.7542844980833602	-0.0003272644199059	0.6690697166502757	0.0003272644199059	0.6630168596841598	0.0001596780363476	0.7491541835549024	-5.9545928979333385e-06	0.66438445456646	5.9545928979333385e-06	0.6583761883817285	-0.0010779914882385	0.6453684261466218	0.0010779914882385	0.6391776367100772	ROBO1	964298	GBE1	1029349	CADM2	4226694	False	False	False	ref	-70	0.003902	-100	0.11035
2665	chr3	80772172	C	T	rs7633748	0.0338335736	0.422430152485017	0.0338335736	0.4274283758677428	0.01505296151376	0.6833525987106538	0.0005024371333371	0.5042821868660178	0.0005024371333371	0.5098070405435471	0.0043334103130875	0.8454364466755823	0.0001603863934163	0.7518502022975949	0.0001603863934163	0.7583732467156239	6.260607846567137e-05	0.865718291927849	2.264632620080772e-06	0.7693807056136132	2.264632620080772e-06	0.775996188417497	0.0005897199036652	0.7299498486123609	0.0005897199036652	0.7362878058554917	GBE1	989473	ROBO1	1004174	CADM2	4186818	False	False	False	alt	-55	0.015594	-35	0.06866
2666	chr3	80789484	C	T	rs9865863	0.0547569666	0.2719852857416243	0.0547569666	0.2756780433433131	0.0253431892086334	0.3224100702713912	0.001396143758765	0.2607249894465003	0.001396143758765	0.2640295508354036	0.0121639008940648	0.7037604251565313	0.0007519332523543	0.5486258048087811	0.0007519332523543	0.5542814656416146	0.0003171700449661	0.6563671524464791	1.998654235678698e-05	0.5096136736820255	1.998654235678698e-05	0.515309541700334	0.0023143413282306	0.5079073851564886	0.0023143413282306	0.5135421484392093	GBE1	972161	ROBO1	1021486	CADM2	4169506	False	False	False	alt	-70	0.02399	95	0.06177
2667	chr3	80793900	C	G	rs9812564	0.183269066	0.0296687855687245	0.183269066	0.0299757298663145	0.0611144954620881	0.0292532429628594	0.0115784015539947	0.0169879458581743	0.0115784015539947	0.0170522936708575	0.0462530104582494	0.4572635726461446	0.0086667484869874	0.1670439771633982	0.0086667484869874	0.1701949568205525	0.0028697620916249	0.2561568507385522	0.0005532841402585	0.087739776482339	0.0005532841402585	0.0892562969918333	0.0196092177757249	0.0987088777906833	0.0196092177757249	0.1004237462951163	GBE1	967745	ROBO1	1025902	CADM2	4165090	False	False	False	alt	-65	0.02596	-100	0.0656
2668	chr3	80815717	A	C	rs78929026	-0.0127567253999999	0.7386867664617405	0.0127567253999999	0.732111235321221	0.0131229754834157	0.7794531362381233	-0.0001615390818319	0.7861574219618171	0.0001615390818319	0.779526631489212	0.0020768038006004	0.9179443520097	-2.18416094526298e-05	0.923356405096426	2.18416094526298e-05	0.9163311009923876	2.7461585820999864e-05	0.9345679546568348	-2.823332321511712e-07	0.9345396915636058	2.823332321511712e-07	0.927439314080165	-9.897396984591944e-05	0.9141948124260234	9.897396984591944e-05	0.9071964210632124	GBE1	945928	ROBO1	1047719	CADM2	4143273	False	False	False	ref	100	0.00403	-60	0.1393
2669	chr3	80864077	T	G	rs9831201	0.0146264593	0.504969880258771	0.0258580657	0.5084548393588523	0.0223778528193939	0.4023463174624258	0.0002977407232978	0.4826775749324389	0.0005549678205654	0.486003318419998	0.0178779980865032	0.6284292105612256	0.0002245622982897	0.6276358785530377	0.0004002472116822	0.6318838690832341	0.0003805852631928	0.6069219162061973	4.376785848795361e-06	0.6048083230724907	8.400334972611278e-06	0.6088197963950773	0.000852825706839	0.604832020729556	0.0013724390485301	0.609253368017766	GBE1	897568	ROBO1	1096079	CADM2	4094913	False	False	False	alt	100	0.0971	-100	0.1068
2670	chr3	80930843	T	C	rs9839468	0.010311615892	0.764796860123382	0.010677711068	0.7690520165542922	0.0160460250044185	0.63295773226138	0.0001763374216944	0.7709774547889571	0.0001802343829699	0.775469275684253	0.0014747121507043	0.9487823680134436	1.551304291083445e-05	0.9417257679417268	1.630867880519951e-05	0.946183563352928	2.108774495525294e-05	0.9558461270874928	2.4744042638016983e-07	0.941733169438392	2.559097056524632e-07	0.9467723533831528	5.855959882549064e-05	0.9374314591971284	6.515786348188589e-05	0.9418889201853156	GBE1	830802	ROBO1	1162845	CADM2	4028147	False	False	False	alt	40	0.00906	-95	0.0692
2671	chr3	80956286	G	A	rs2679046	-0.03896993152	0.3720693359951193	0.03896993152	0.3672766610872978	0.0169291859282099	0.602740207599216	-0.0006897080763896	0.4322633792771062	0.0006897080763896	0.427133335730301	0.0743665665929859	0.3967539620699554	-0.0024199797495605	0.4004317612946298	0.0024199797495605	0.3953856074400406	0.0012791315478101	0.4374865680151598	-4.62946334221054e-05	0.4268223085178916	4.62946334221054e-05	0.421698974678868	-0.0048835406288145	0.3760508141383733	0.0048835406288145	0.3709794407531072	GBE1	805359	ROBO1	1188288	CADM2	4002704	False	False	False	ref	75	0.003098	80	0.03833
2672	chr3	80957854	T	A	rs2679042	-0.01199862838	0.7493243605060347	0.01199862838	0.7426156119543601	0.019982939009069	0.4830969647867923	-0.0002380545436409	0.7165240214315262	0.0002380545436409	0.7097722822552548	0.0877000098973969	0.3785282407017611	-0.000917458497257	0.5602353981693833	0.000917458497257	0.5545323499475133	0.0016332282177339	0.4008574909062376	-1.7192693594185437e-05	0.5605664172952025	1.7192693594185437e-05	0.5547128126853476	-0.0017221470753191	0.5864177738606741	0.0017221470753191	0.5803962430081664	GBE1	803791	ROBO1	1189856	CADM2	4001136	False	False	False	ref	95	0.00989	-45	0.08276
2673	chr3	80987800	C	A	rs2372667	0.041024483	0.3461366853838418	0.041024483	0.3512165836954918	0.0228172674459721	0.3885797204814372	0.0009418909959648	0.3291364797080013	0.0009418909959648	0.3336829480576491	0.0038443139454322	0.8655776650243314	0.0001664987380829	0.736050458160262	0.0001664987380829	0.7424318107523441	8.456938531867358e-05	0.8356002599323371	3.654139078576287e-06	0.7058626118657029	3.654139078576287e-06	0.7121754920043628	0.0006095146976344	0.7186816207125023	0.0006095146976344	0.7249750033714795	GBE1	773845	ROBO1	1219802	CADM2	3971190	False	False	False	alt	100	0.010315	-20	0.03577
2674	chr3	80999051	G	T	rs2250739	-0.0169762324	0.490228880048096	0.0300260604	0.4866566841798058	0.0247989005527285	0.3339207036653131	-0.0004523009391546	0.4356596035430367	0.0007428933264232	0.4323958990091949	0.0546014648147536	0.4255555229260714	-0.0002662059259761	0.4366215275199529	0.0014614678322647	0.4337070386934267	0.0013308772835291	0.3905353289055295	-8.539335581806076e-06	0.408776734260017	3.5155320377901805e-05	0.4057179721779448	-0.0011134571607666	0.4166377642560499	0.0035713107452739	0.4136372671444318	GBE1	762594	ROBO1	1231053	CADM2	3959939	False	False	False	ref	-20	0.00934	80	0.10864
2675	chr3	81004094	G	C	rs2639255	-0.48729186	0.0019784036704228	0.48729186	0.0019870496506683	0.0670228973084598	0.021543504730882	-0.0336857703440361	0.0028305033476655	0.0336857703440361	0.0028240758080677	0.1233916729900035	0.26609609199733	-0.0643771479960344	0.0224688842678828	0.0643771479960344	0.0220187776189428	0.0086045529289982	0.096903516493449	-0.004603206380203	0.0116139221606701	0.004603206380203	0.0115395027655248	-0.0855374286562633	0.0067738542010006	0.0855374286562633	0.0067548201509861	GBE1	757551	ROBO1	1236096	CADM2	3954896	False	True	True	ref	30	0.01828	25	0.02783
2676	chr3	81005089	T	G	rs2639254	0.0445536707999999	0.3455545098028814	0.0445536707999999	0.3501942234382185	0.0207053968468056	0.4571657915658498	0.0010117876231609	0.3583683611378642	0.0010117876231609	0.3628614187179957	0.0621226617399623	0.4107807944910456	0.0033991288770062	0.3383060842227666	0.0033991288770062	0.3430338875480071	0.0013200367553807	0.4052728739743957	7.979063390729773e-05	0.3398048509024091	7.979063390729773e-05	0.34449193867385	0.0072135528356041	0.2945791584509896	0.0072135528356041	0.2987972593606853	GBE1	756556	ROBO1	1237091	CADM2	3953901	False	False	False	alt	-25	0.03485	100	0.1733
2677	chr3	81006191	A	G	rs2639213	-0.0204762016	0.1606081624381086	0.0839432764	0.1599342796169613	0.044396744092465	0.0894463942842757	-0.0023449004543944	0.1078153368268648	0.0039061750766693	0.1076656861932465	0.0161071888093431	0.6585534467769779	-0.0007704081197183	0.4589241249678205	0.0015027828514775	0.4571541103915224	0.0006863743766839	0.5231151440490936	-4.666639888740194e-05	0.3564624450607275	6.423950939463327e-05	0.3545810152701467	-0.0022887730526871	0.4018867576498567	0.0043507307578106	0.400265191896001	GBE1	755454	ROBO1	1238193	CADM2	3952799	False	False	False	ref	20	0.003906	90	0.02808
2678	chr3	107845612	T	C	rs7644809	0.1775170127999999	0.0319355861403345	0.1775170127999999	0.0322703490983725	0.0362450489501643	0.1464855787535357	0.0066963741857539	0.0402999325103654	0.0066963741857539	0.0405670731585724	0.3801153046748705	0.0756533916577532	0.0672684055074662	0.0176409800779172	0.0672684055074662	0.0179685824978767	0.0129017330636482	0.0510498353724752	0.0023770565363985	0.0206264225089172	0.0023770565363985	0.0209272371663854	0.0578865758305564	0.0147821216549269	0.0578865758305564	0.0149498563394222	CD47	246250	BBX	322675	IFT57	376823	False	False	False	alt	-35	0.01367	-70	0.1113
2679	chr3	108046402	T	C	rs3206652	0.01490733794	0.5931920136082228	0.02114708166	0.5950423832626941	0.0159471495765311	0.6427234832367292	0.0002808926093769	0.6142076823070649	0.0003777874547912	0.6160465840013319	0.2009707696875721	0.1757412207702935	0.0023737479847861	0.3024553699675609	0.0042430224147546	0.3034367605000497	0.003246220230818	0.2310335566890588	4.680800593972883e-05	0.3409122228561316	7.589023714536821e-05	0.3420535378020858	0.0039309161690475	0.3295439242058503	0.0062238131371448	0.3308020088650659	CD47	45460	IFT57	176033	HHLA2	250128	False	False	False	alt	-100	0.0692	-75	0.681
2680	chr3	108061891	T	C	rs3804638	0.0233135492	0.5472407638608571	0.0233135492	0.5536995536479732	0.0184276031209732	0.5410568011252299	0.0004211402365281	0.5496625944600553	0.0004211402365281	0.5559282828413801	0.0360067302299494	0.5057861412860252	0.0009754620655487	0.497230886312126	0.0009754620655487	0.5028061817379958	0.0006680627888885	0.5212732072836324	1.7740217422719178e-05	0.5083131353702423	1.7740217422719178e-05	0.5140998314136276	0.0026483784764606	0.4729451361618468	0.0026483784764606	0.4786885037654786	CD47	29971	IFT57	160544	HHLA2	234639	False	False	False	alt	-55	0.02338	0	0.0
2681	chr3	108097467	G	A	rs7628325	-0.02831237634	0.4746353550793032	0.02932728166	0.470300329039342	0.0148658878751458	0.6913981602068356	-0.0004768976388743	0.5403669908526347	0.000487051737292	0.5358515794539401	0.1609069314770214	0.2198308262450787	-0.0038198867966036	0.2915326454970234	0.0039372658832968	0.2879807451719295	0.0023413982874493	0.2919203224271278	-6.254461015530954e-05	0.3392089005108251	6.371898451662026e-05	0.3354236633537263	-0.0066881660123387	0.2930513603675333	0.0069290026722971	0.2893988234563366	CD47	5605	IFT57	124968	HHLA2	199063	False	False	False	ref	55	0.03937	-100	0.2236
2682	chr3	108097886	C	T	rs34910554	0.091973891	0.112008305345561	0.105777583	0.1128649327440161	0.0509625576698724	0.0532817955225837	0.0053114075053978	0.0614240158884265	0.0059208263851938	0.0615731006968819	0.2515233743525452	0.1379485088566445	0.026156227114496	0.0675845081207829	0.0290415407833167	0.0685694805252274	0.0132278823960552	0.0507353596953685	0.0015511079569301	0.0422148205319817	0.0016784916020645	0.0426227503003544	0.0293457820593183	0.0513000922408209	0.0337187819603444	0.051838616674241	CD47	6024	IFT57	124549	HHLA2	198644	False	False	False	alt	-65	0.0101	10	0.03003
2683	chr3	108098452	G	A	rs17231503	-0.2544878579999999	0.014512867976156	0.2544878579999999	0.0144190970074271	0.0459703690493658	0.0772590897140699	-0.0127776946657401	0.0175204762879335	0.0127776946657401	0.0173917402119445	0.2638580053445943	0.1296658776242898	-0.0674512175791438	0.0191242713950589	0.0674512175791438	0.0187352341141418	0.0119704339418625	0.0590993839096537	-0.0033859348696221	0.0163196138563747	0.0033859348696221	0.0161197891742254	-0.0778916894856652	0.0081439636151135	0.0778916894856652	0.0080710651793064	CD47	6590	IFT57	123983	HHLA2	198078	False	True	False	ref	-55	0.01282	85	0.1848
2684	chr3	108100194	G	A	rs326361	-0.0129277764139999	0.5214805865145615	0.0272499012139999	0.5200229225024114	0.0127286298334508	0.7894249792980558	-0.0002217571827794	0.6405516809043714	0.0003595264690837	0.6387771253161291	0.1723722411005905	0.2087373202683025	-2.4217452799628865e-05	0.3286554967459677	0.0033931375389332	0.3281022243159228	0.0021258517819527	0.3113541597939867	-7.841530066649372e-06	0.4071212857074536	4.184886961367305e-05	0.4066037373659565	-0.0013765629639404	0.3413896667013544	0.0057825541882484	0.3406215735138063	CD47	8332	IFT57	122241	HHLA2	196336	False	False	False	ref	-5	0.001587	40	0.0674
2685	chr3	108149425	A	G	rs60140727	0.0706028148	0.1819231684433526	0.0706028148	0.1847121260540314	0.0113404834036389	0.8607913114714002	0.0008147508163878	0.372589045518302	0.0008147508163878	0.377663391224171	0.0017840058064728	0.9292574356596736	0.0001460095792574	0.7525143238663038	0.0001460095792574	0.7591242670056677	2.066098106606576e-05	0.9525185621352495	1.6969160617496986e-06	0.796939903109493	1.6969160617496986e-06	0.8035181278355148	0.0005196133416911	0.7472630306462857	0.0005196133416911	0.7538757997221911	CD47	57563	IFT57	73010	HHLA2	147105	False	False	False	alt	-30	0.0253	-75	0.04846
2686	chr3	108149814	G	A	rs10514750	0.0365446926	0.4094394603546726	0.0365446926	0.4146334520605608	0.02263794690997	0.3960331369705934	0.0008574634876166	0.3893528714156792	0.0008574634876166	0.3942210890981006	0.0153673583847447	0.6772044534354693	0.0004147540879023	0.6123982268968657	0.0004147540879023	0.6183780361147106	0.0003445480167156	0.6474820046330354	9.762291672865945e-06	0.5838301230268172	9.762291672865945e-06	0.5897851670041143	0.0013641912177096	0.5913682929980612	0.0013641912177096	0.5972964551821305	CD47	57952	IFT57	72621	HHLA2	146716	False	False	False	alt	100	0.004517	5	0.0166
2687	chr3	108157520	A	G	rs11926978	0.16230826	0.0470204969827335	0.16230826	0.0475845360703809	0.0367387932715135	0.1382449174676854	0.0063906141101672	0.0505774679785154	0.0063906141101672	0.051109363549098	0.0260755171389924	0.5887966097658551	0.0061515553099816	0.2818439944906656	0.0061515553099816	0.2860391962487091	0.0011000922718536	0.468471863169362	0.0002775499804201	0.2217245259736205	0.0002775499804201	0.2252478401709675	0.0124525749727821	0.2096597446539891	0.0124525749727821	0.2131404132952286	IFT57	64915	CD47	65658	HHLA2	139010	False	False	False	alt	100	0.003754	85	0.0967
2688	chr3	108157585	G	A	rs11919348	0.1022771938	0.1062886600722627	0.1022771938	0.107690543065822	0.0477233051588494	0.0650620484647546	0.004930866317429	0.0653020241187286	0.004930866317429	0.0659109272169906	0.0212876513476955	0.6039581807693877	0.0016278532591059	0.3930674806036327	0.0016278532591059	0.3982480889829424	0.0009996806529316	0.4458255018107472	7.621865499878177e-05	0.2789710970032243	7.621865499878177e-05	0.2831665785972712	0.0049107584705222	0.3357147213984527	0.0049107584705222	0.3405510172735845	IFT57	64850	CD47	65723	HHLA2	138945	False	False	False	alt	35	0.01973	20	0.05518
2689	chr3	108160883	G	C	rs62264146	-0.0487118014	0.3226836829388375	0.0487118014	0.3187620343393634	0.0315966347143327	0.2021837615432875	-0.0016558966954323	0.2526498622900743	0.0016558966954323	0.2497930035872202	0.0674218930421299	0.4129611141423071	-0.0043974946558228	0.3305294986409338	0.0043974946558228	0.3259906563108706	0.0023074402242774	0.3264233247274166	-0.0001525324003605	0.2798747203245502	0.0001525324003605	0.2760623795548711	-0.0085266075022268	0.282916837279117	0.0085266075022268	0.2788501604803005	IFT57	61552	CD47	69021	HHLA2	135647	False	False	False	ref	90	0.0634	100	0.398
2690	chr3	108162072	T	C	rs2035	0.118956311	0.0740650107116454	0.118956311	0.0751699732578055	0.0190648154886073	0.5191032668175923	0.0023242882498838	0.1454564266000778	0.0023242882498838	0.1474723793954404	0.0150498168981557	0.6759021064918754	0.0015983227321581	0.403052866345336	0.0015983227321581	0.4082191082967423	0.0002650935641603	0.6789485358637164	2.944996469642116e-05	0.4140355499057048	2.944996469642116e-05	0.419437468825127	0.0049396258783939	0.3413341254186468	0.0049396258783939	0.346157997536934	IFT57	60363	CD47	70210	HHLA2	134458	False	False	False	alt	80	0.0176	20	0.02632
2691	chr3	108163444	G	T	rs28494587	-0.00788936246	0.577995482073703	0.02031237206	0.5749306262714272	0.0228478439805988	0.387702981480497	-0.0001710858446108	0.525012631121771	0.0004858578789008	0.5222428791411282	0.0578610075550129	0.4220929215559168	-0.0009220938856667	0.4829980196556184	0.0013178567597521	0.4797497400425091	0.0013183563209946	0.4001931702449252	-2.166088182626816e-05	0.4606223224715885	3.16886521278536e-05	0.45760983471926	-0.0019299924119956	0.4626344876996601	0.0032380983801259	0.4595683125467741	IFT57	58991	CD47	71582	HHLA2	133086	False	False	False	ref	-100	0.11316	-80	0.0762
2692	chr3	108167028	A	G	rs2305551	0.0278335591999999	0.4820279001118713	0.0278335591999999	0.4877964576007528	0.0108069142622442	0.8803697423607464	0.0003048422567734	0.6286917216360688	0.0003048422567734	0.6350002054974432	0.0416136056217214	0.4772539122036217	0.0012406719338591	0.4488005498219561	0.0012406719338591	0.454038758520314	0.0004424782261374	0.586819390943075	1.3382430693935552e-05	0.5346208780537897	1.3382430693935552e-05	0.5403561562865683	0.0033255253868232	0.4200481260132088	0.0033255253868232	0.4252678526649962	IFT57	55407	CD47	75166	HHLA2	129502	False	False	False	alt	-100	0.0503	-80	0.1831
2693	chr3	108168909	A	G	rs9826261	-0.177578036	0.0341127464197377	0.177578036	0.0337822164222316	0.0431797960994818	0.0889978955760521	-0.0074496034788956	0.0319963379133346	0.0074496034788956	0.0317961829505169	0.0606957870080168	0.4313596942946984	-0.0088930510300351	0.1808287016195768	0.0088930510300351	0.1777724682259102	0.0026461446758441	0.2943872904076431	-0.000386619802773	0.1262907684848647	0.000386619802773	0.1241535417699159	-0.0187720629474447	0.114984492843713	0.0187720629474447	0.1131635935503547	IFT57	53526	CD47	77047	HHLA2	127621	False	False	False	ref	60	0.04834	100	0.1785
2694	chr3	108169059	A	C	rs9830118	0.0481396578	0.1176104704430053	0.0935673794	0.1186813596171277	0.0171077805716002	0.5949759217801354	0.0007553938223465	0.2110994790728048	0.0016424348992793	0.2131782383249747	0.0721627461977499	0.3902894942971663	0.0058115896695157	0.2212411245095271	0.0061139565614297	0.2243422094263562	0.0011466534242124	0.4335421824404494	9.266437156329712e-05	0.2625797464106906	9.85685165031276e-05	0.2657173896338575	0.0122983405364388	0.162572643693732	0.0132122001913496	0.164857218012261	IFT57	53376	CD47	77197	HHLA2	127471	False	False	False	alt	-85	0.1475	90	0.148
2695	chr3	108171371	C	T	rs11928715	-0.1101190761999999	0.1074530499042182	0.1101190761999999	0.1063417598612167	0.0232635245285599	0.3730753942299352	-0.0027029193532991	0.1588615147465541	0.0027029193532991	0.1572625475228508	0.0548159084160865	0.4214277666938689	-0.0062807747475018	0.2391614339789014	0.0062807747475018	0.2352870830494267	0.0012644790665508	0.3984571154889869	-0.0001531060648365	0.2388751679729581	0.0001531060648365	0.2351394517853484	-0.0141483289894757	0.1662530236106006	0.0141483289894757	0.1634829987400663	IFT57	51064	CD47	79509	HHLA2	125159	False	False	False	ref	90	0.007416	85	0.0984
2696	chr3	108171457	T	C	rs11917405	0.06211897988	0.2396796084865466	0.06211897988	0.2426311653958374	0.0296954531767167	0.2305473432241664	0.0019426942816025	0.2187135065518429	0.0019426942816025	0.2211558363170443	0.064904655075715	0.3893998071066774	0.0044247024335471	0.2888674181773971	0.0044247024335471	0.2933908494029562	0.0019563398088234	0.3208631062963515	0.0001384259350029	0.2515918548451769	0.0001384259350029	0.2554224834228691	0.0101712249678334	0.2253228002037182	0.0101712249678334	0.2290680705103132	IFT57	50978	CD47	79595	HHLA2	125073	False	False	False	alt	80	0.09015	-5	0.03223
2697	chr3	108171613	A	G	rs11921090	0.18869141	0.0285977357023661	0.18869141	0.0288409211147594	0.0545455764029589	0.0428061106232281	0.0105833460115241	0.0197294533103352	0.0105833460115241	0.0197873297037952	0.1219293325855299	0.2631304160776013	0.0232200375475036	0.0704550490744765	0.0232200375475036	0.0720215836244222	0.0066591919057524	0.1210378576407143	0.001304392942944	0.0395815019422421	0.001304392942944	0.0403546180458979	0.0396283527432284	0.0323404524331818	0.0396283527432284	0.0329265041543895	IFT57	50822	CD47	79751	HHLA2	124917	False	False	False	alt	-75	0.02588	-60	0.1775
2698	chr3	108172218	C	T	rs17829242	-0.107170741	0.096772857078325	0.107170741	0.0954033075046839	0.0264365121330441	0.2955290399463691	-0.0029838516843339	0.1199266655532531	0.0029838516843339	0.1183078212903443	0.036784500676322	0.4964829252225871	-0.0042269824086821	0.2737942330157079	0.0042269824086821	0.2694983833319393	0.0010599790016574	0.438940221974813	-0.0001264063568736	0.2485663994492058	0.0001264063568736	0.2447230297756755	-0.0108648675398369	0.1991204472658116	0.0108648675398369	0.1956336706236892	IFT57	50217	CD47	80356	HHLA2	124312	False	False	False	ref	15	0.0002441	-45	0.05438
2699	chr3	108174732	T	C	rs28377152	-0.2850580219999999	0.0107577646211205	0.2850580219999999	0.0107175973102112	0.066570223637387	0.0222938438894338	-0.0203953398973001	0.0077747053091863	0.0203953398973001	0.0077579501696638	0.0131049783906832	0.7003900908242369	-0.0041825659827116	0.3022714859707263	0.0041825659827116	0.297912311046108	0.000877160155781	0.4875887686407749	-0.0002890204620388	0.1723462699002571	0.0002890204620388	0.1694856010382765	-0.0088730163966876	0.2514697728386203	0.0088730163966876	0.2477071231039621	IFT57	47703	CD47	82870	HHLA2	121798	False	True	False	ref	40	0.002563	95	0.1342
2700	chr3	108175645	C	A	rs11917750	-0.245151144	0.0180360909419804	0.245151144	0.017937813640184	0.0539374207780056	0.0463162986626594	-0.014776084809527	0.0156311874881494	0.014776084809527	0.0155070161149135	0.0619634786051268	0.3987056923858464	-0.0181606959695245	0.1136293722870617	0.0181606959695245	0.1114453095000189	0.0036308316926123	0.2227805945362808	-0.0011687046050209	0.0656649841066051	0.0011687046050209	0.0643458515613598	-0.032094784071789	0.0574193178232418	0.032094784071789	0.0563259615437048	IFT57	46790	CD47	83783	HHLA2	120885	False	True	False	ref	70	0.04462	75	0.10254
2701	chr3	108175745	T	C	rs723271	-0.122289816	0.072873724461285	0.122289816	0.0718655701954017	0.0357771844414156	0.1464701373487139	-0.0044573271295945	0.0673537519581144	0.0044573271295945	0.0666358716410614	0.0763485203391507	0.3560946262057599	-0.0098070671851029	0.1615826941666045	0.0098070671851029	0.1586884653532611	0.0027544366919306	0.259336378824384	-0.0003592135915767	0.1263183434274652	0.0003592135915767	0.1241247340134299	-0.019978720596483	0.1001070794865794	0.019978720596483	0.0982089546842689	IFT57	46690	CD47	83883	HHLA2	120785	False	False	False	ref	100	0.02495	-10	0.04993
2702	chr3	108176360	C	T	rs7610003	-0.07908213	0.1413201320305766	0.0883452192	0.1403369463641589	0.0358721251026831	0.1501569431795816	-0.0035762251793828	0.1102269852613601	0.0037339876833491	0.109654365908387	0.0586750684569957	0.4135611655681718	-0.0055221863134622	0.2473845495336562	0.0059361236449843	0.2446165824878914	0.0022575710041291	0.3113381418227992	-0.000246270033369	0.190555044452498	0.0002533199265307	0.1886296368882143	-0.0118480089736399	0.1782121211843052	0.0129532183035861	0.1762888367778367	IFT57	46075	CD47	84498	HHLA2	120170	False	False	False	ref	-100	0.04697	-100	0.1129
2703	chr3	108176479	A	G	rs7632036	-0.00077694032	0.7122317457960233	0.01398545712	0.7131161374202247	0.0316526119492336	0.1987215724260613	-3.0193611095547683e-05	0.5683143134888383	0.000460352045905	0.5696558667378074	0.0421389924449869	0.4800637805298728	-0.0001830069663162	0.582784786415961	0.0007157474037575	0.5836961904800989	0.0013692048766528	0.3931463437670557	-6.437178821356221e-06	0.5093010624130188	2.388525429024816e-05	0.5102899022184078	-0.0003447593282966	0.5785786953507908	0.0017551383986011	0.5791995304878392	IFT57	45956	CD47	84617	HHLA2	120051	False	False	False	ref	-10	0.002075	-100	0.04037
2704	chr3	108178447	G	A	rs11915212	0.01641132672	0.6517898123875535	0.0167818274799999	0.6561643641030515	0.0352536179468503	0.1532891389864436	0.0006050143612688	0.4761205892106218	0.0006173021194683	0.4803543007746581	0.1205313252614561	0.2689971547238224	0.0018654557908241	0.4043374325287651	0.001914737120859	0.4078850004471455	0.0043127383369562	0.1868870392349572	7.093925976435443e-05	0.3282280884652468	7.257368849059289e-05	0.33147051474922	0.0036777077628583	0.4134456283788613	0.0037816304311965	0.4172723782436032	IFT57	43988	CD47	86585	HHLA2	118083	False	False	False	alt	100	0.02872	100	0.2644
2705	chr3	108178698	C	A	rs11915231	-0.0140114428	0.6070876008955892	0.0190466181999999	0.6048773237979336	0.0277197178185219	0.2678767006568802	-0.0003876180805269	0.5112511970133186	0.000531859543654	0.5094653386586254	0.1268887532578931	0.261341100957192	-0.002269286143829	0.3664273538560737	0.0027082042587105	0.3647606974352524	0.0034522630665954	0.2219646414372326	-6.333220721822887e-05	0.3302044515685841	7.510521019849059e-05	0.3286984720928012	-0.0039812279370525	0.3725832291124802	0.0049363267460657	0.3708483114969887	IFT57	43737	CD47	86836	HHLA2	117832	False	False	False	ref	15	0.1359	-95	0.074
2706	chr3	108179746	C	T	rs9818755	-0.1361184368	0.0619059590152904	0.1361184368	0.0612225577952929	0.0630943606927693	0.0259515289148035	-0.0089155783908584	0.0276531143411602	0.0089155783908584	0.0274175336904357	0.1069083830952459	0.289063690660263	-0.0144646430333585	0.1174683792600433	0.0144646430333585	0.1151070303223701	0.0067188625866382	0.1207875697854491	-0.0009444030156695	0.0581513441342712	0.0009444030156695	0.0570602364807755	-0.0268169971297548	0.066698413490687	0.0268169971297548	0.0653762027445079	IFT57	42689	CD47	87884	HHLA2	116784	False	False	False	ref	-25	0.011055	-100	0.1237
2707	chr3	108181114	A	T	rs7647452	-0.0553091362	0.2862506817164497	0.0553091362	0.2823044252753818	0.0246483412322672	0.3419314910093246	-0.0015264132873251	0.2743746208719038	0.0015264132873251	0.2710246186991769	0.0188166012338754	0.6445015094216004	-0.001264382656839	0.5063499948237354	0.001264382656839	0.5007407206765365	0.0005389490978516	0.593180493674836	-3.74930682577663e-05	0.4672059071942339	3.74930682577663e-05	0.4615891548188574	-0.0034772854739202	0.45892870145674	0.0034772854739202	0.4533973464068871	IFT57	41321	CD47	89252	HHLA2	115416	False	False	False	ref	-100	0.01346	50	0.084
2708	chr3	108182218	G	A	rs17829536	0.0210955896	0.5716153935942174	0.0210955896	0.5776745222095676	0.0107204060693317	0.8798934973867558	0.0002177106466471	0.7068504803076611	0.0002177106466471	0.713407834756437	0.0467981920754841	0.4471563774794327	0.0009371549454704	0.4785399111519557	0.0009371549454704	0.4841597491574642	0.0004978475501532	0.5597508077844784	9.6278999324238e-06	0.5647351983346705	9.6278999324238e-06	0.5706759665562101	0.0025230114479891	0.4691005067480439	0.0025230114479891	0.4748864515822176	IFT57	40217	CD47	90356	HHLA2	114312	False	False	False	alt	65	0.00811	100	0.02661
2709	chr3	108184228	A	C	rs10514752	-0.155814382	0.0423433498830963	0.155814382	0.0418891066027109	0.0410533176005119	0.1013104543609379	-0.0064415306172289	0.0387220371066871	0.0064415306172289	0.0384315129986518	0.0150003299132327	0.6665013885238626	-0.0024039103808806	0.3533617268771096	0.0024039103808806	0.3487038870167956	0.0006196899980878	0.5341560827953765	-9.966105444167793e-05	0.2636799416395012	9.966105444167793e-05	0.2595599306212197	-0.0065463033222262	0.290407021460966	0.0065463033222262	0.2860687658313918	IFT57	38207	CD47	92366	HHLA2	112302	False	False	False	ref	-40	0.008545	-10	0.00928
2710	chr3	108185223	A	G	rs72933710	0.0049014005999999	0.6211462392097726	0.01877496164	0.6229129972723774	0.0143460191454455	0.7214856278937387	4.726977853957029e-05	0.6764283511833546	0.0002721976733856	0.6779549003769997	0.1697651017782322	0.2047198330510213	0.0011807934303877	0.3252010003685162	0.0031799337840863	0.3269864515040777	0.0024429194728307	0.2780247934743158	1.3829510854204678e-05	0.3806094307103064	4.621485160432749e-05	0.3823054465518855	0.0018054501666061	0.3505798713925505	0.0051540694797267	0.3523022866243938	IFT57	37212	CD47	93361	HHLA2	111307	False	False	False	alt	-90	0.01715	-75	0.1292
2711	chr3	108186492	A	G	rs13433942	0.0940907948	0.1145324669909605	0.0940907948	0.1161642461744701	0.0201884525994163	0.4725847546068141	0.0019813633566763	0.1749644376110821	0.0019813633566763	0.1773683605265219	0.0536372933918378	0.4260783909008128	0.0051080233614186	0.2331337862203183	0.0051080233614186	0.2371201971713784	0.0010998628266286	0.426608151231696	0.0001094569236807	0.2463449996620428	0.0001094569236807	0.25037821283876	0.0122999901026029	0.1657099344288249	0.0122999901026029	0.1688231242155919	IFT57	35943	CD47	94630	HHLA2	110038	False	False	False	alt	-100	0.1605	-90	0.1267
2712	chr3	108189077	C	T	rs9816413	0.0156429674599999	0.6804524046113624	0.0156429674599999	0.6868630898408725	0.0241718517631241	0.3509349140293792	0.0003559617607308	0.611825579986742	0.0003559617607308	0.6179285329386057	0.010565471281053	0.7175333691617929	0.0001328357160504	0.7540602574328065	0.0001328357160504	0.7607323675087615	0.0002567391746498	0.676987425153512	3.103633893833539e-06	0.7182131642390913	3.103633893833539e-06	0.7247358724475107	0.0004742502721783	0.7468541551546977	0.0004742502721783	0.7533917578963442	IFT57	33358	CD47	97215	HHLA2	107453	False	False	False	alt	-55	0.00232	90	0.04843
2713	chr3	108189334	C	T	rs17239988	-0.0764626569999999	0.1715139212788025	0.0764626569999999	0.1689469228660256	0.0158088629759851	0.6553525449206414	-0.0012957782013216	0.2826049097479495	0.0012957782013216	0.2789527811474388	0.0259542740259311	0.5771839559801208	-0.0020479105736807	0.3900436064841683	0.0020479105736807	0.384873794213572	0.0004092385695509	0.6114872509867387	-3.421892804042299e-05	0.4265590019801448	3.421892804042299e-05	0.4211265734410023	-0.0058856520735046	0.3241085210636916	0.0058856520735046	0.3193260061572395	IFT57	33101	CD47	97472	HHLA2	107196	False	False	False	ref	85	0.006897	-20	0.00897
2714	chr3	108190452	A	G	rs9859939	0.1019569905999999	0.1462526839989327	0.1019569905999999	0.1478103902021105	0.0358017081632261	0.1541581150575692	0.0046684016389878	0.1328505520185282	0.0046684016389878	0.1343254093522225	0.0118546072382962	0.7309642243966682	0.00220912717841	0.5066469319926341	0.00220912717841	0.512532768344003	0.0005832724112937	0.6119829244951208	0.0001263791116643	0.414313187707463	0.0001263791116643	0.4195637023861306	0.004958595889281	0.4509430792987088	0.004958595889281	0.4563798705004671	IFT57	31983	CD47	98590	HHLA2	106078	False	False	False	alt	-30	0.0717	100	0.114
2715	chr3	108193588	T	C	rs13323116	0.0064664050599999	0.7660785490920776	0.01028727162	0.7681310493488899	0.0750375246120222	0.0140979233675828	0.0004082206424088	0.4136307344568669	0.0007185788386792	0.415354219420937	0.0340660156378872	0.5236053207113381	0.0001910471355477	0.6523912613228048	0.0003421199698932	0.6543695232554461	0.0024393451746356	0.2878883535124057	1.3240418139701414e-05	0.4659982834863692	2.385177306102116e-05	0.4678438058571728	0.0006144633961268	0.6518973833889732	0.0010169575401668	0.6539914945260458	IFT57	28847	CD47	101726	HHLA2	102942	False	True	False	alt	-55	0.005157	-100	0.08026
2716	chr3	108195394	T	C	rs9868740	-0.252586054	0.0145926968797943	0.252586054	0.014546056080768	0.0531527879376229	0.0479444215239343	-0.0143321462398374	0.0137652719216242	0.0143321462398374	0.0137087268997245	0.0125762924350895	0.6928275183670126	-0.0035967948382409	0.3086756635539088	0.0035967948382409	0.3043154752722907	0.0007373604601061	0.5123734828832454	-0.0002244587568288	0.1953175148854923	0.0002244587568288	0.1923303576925105	-0.0080663785424432	0.2560450369729661	0.0080663785424432	0.2522192955587911	IFT57	27041	HHLA2	101136	CD47	103532	False	True	False	ref	65	0.05307	35	0.11145
2717	chr3	108196350	A	C	rs9863548	-0.0053848886419999	0.7658685715178281	0.009934515122	0.7647160074380877	0.0187683212552681	0.5322920421682691	-8.102136226095428e-05	0.7692166038364364	0.0001751593688379	0.7677080780868679	0.0697403582857708	0.3745236863782277	-0.0004334360686797	0.6141326267362892	0.0006275917289316	0.6122075371142629	0.0012846455678033	0.392358761107177	-6.9337211838406544e-06	0.6216397302669274	1.0884677027925492e-05	0.6194661420194523	-0.0010812906205667	0.6206158792176111	0.0016075022269142	0.6185401415150285	IFT57	26085	HHLA2	100180	CD47	104488	False	False	False	ref	-45	0.013214	-40	0.08167
2718	chr3	108197419	C	T	rs13318120	0.0305095884	0.4706465582465123	0.0305095884	0.4760066801276356	0.0378423080614008	0.125985987264717	0.0011748954215105	0.3092213898409944	0.0011748954215105	0.3129771044305037	0.0017320444723037	0.9337914009088016	5.637058823493157e-05	0.8550903568560624	5.637058823493157e-05	0.861860654901916	6.574073219607332e-05	0.8580704469009575	2.1753639068887566e-06	0.7777553250889229	2.1753639068887566e-06	0.7843520795062976	0.000202071855102	0.849816953760378	0.000202071855102	0.8565940125602531	IFT57	25016	HHLA2	99111	CD47	105557	False	False	False	alt	-35	0.00725	-95	0.1482
2719	chr3	108199003	A	G	rs9875102	-0.01740774614	0.6403233934636157	0.01740774614	0.6336959845489548	0.0224084815552104	0.401115416676398	-0.0003966661993079	0.584511093009646	0.0003966661993079	0.5781476096936399	0.0016437926825244	0.935081065873252	-2.98232895218814e-05	0.90480574344274	2.98232895218814e-05	0.8978102845836436	3.5492855735632635e-05	0.9143790415910672	-6.470919086636409e-07	0.8849440243072705	6.470919086636409e-07	0.8779652741286088	-0.0001154696314868	0.9038167592354	0.0001154696314868	0.8969412213277772	IFT57	23432	HHLA2	97527	CD47	107141	False	False	False	ref	-100	0.02008	-90	0.1028
2720	chr3	108200293	T	C	rs72933753	0.425214598	0.0032633966198205	0.425214598	0.0032400029164138	0.0605052334616939	0.0301806196489707	0.0265846909382806	0.0043711087501337	0.0265846909382806	0.0043668995922814	0.1130983801260268	0.2834677615000743	0.0449104044486745	0.0317685710395361	0.0449104044486745	0.0323518078075421	0.006710949469895	0.1229137495401727	0.0027650409529938	0.0173864687373922	0.0027650409529938	0.0176379656549774	0.0668198013922337	0.0111726283263952	0.0668198013922337	0.0113003176848758	IFT57	22142	HHLA2	96237	CD47	108431	False	True	True	alt	-100	0.10077	-65	0.199
2721	chr3	108200444	G	A	rs921582	0.019246182	0.5601191611712394	0.0226448824	0.5642581489003051	0.0126383574231017	0.8001434219720078	0.0002739131415135	0.6483918103962429	0.0003121502875097	0.6525178007223069	0.0543169146514466	0.4463864436889392	0.0007659747765951	0.4843477540018763	0.0010187104425728	0.4878276361805126	0.0006204849612674	0.5399286789111948	9.711704849317178e-06	0.5482618403253794	1.2555112426618377e-05	0.5517872972835975	0.0018912276071392	0.478178087890644	0.0025329088449737	0.4815967629466997	IFT57	21991	HHLA2	96086	CD47	108582	False	False	False	alt	-100	0.02719	-95	0.04218
2722	chr3	108202233	G	A	rs1377275	0.3756781219999999	0.0048169888569837	0.3756781219999999	0.0048063959851889	0.0477265597064556	0.067667228749555	0.0189428840792265	0.0083695793302346	0.0189428840792265	0.0084013904840569	0.5001385635577843	0.0442953768663557	0.1908899098774828	0.0025386857027473	0.1908899098774828	0.0025303237313109	0.0244535905193308	0.0157351096742619	0.0097866021387148	0.003758604019341	0.0097866021387148	0.0037562707208958	0.1222914123585496	0.0024374568050649	0.1222914123585496	0.0024327226493591	IFT57	20202	HHLA2	94297	CD47	110371	False	True	True	alt	-10	0.0177	-15	0.1289
2723	chr3	108208573	T	C	rs59142860	0.159841718	0.0460171720213065	0.159841718	0.0466315739449709	0.0301073110300505	0.2260769476664839	0.005369901968189	0.0642811586329563	0.005369901968189	0.064801132360093	0.0031094322193262	0.8854315574043293	0.0006660188913869	0.5939730897266239	0.0006660188913869	0.6000321307822936	0.0001023781351367	0.8284564950050395	2.4176984438301327e-05	0.5261624478248373	2.4176984438301327e-05	0.5319053304507595	0.0017658605786677	0.5846182145097074	0.0017658605786677	0.5906165644027861	IFT57	13862	HHLA2	87957	CD47	116711	False	False	False	alt	-100	0.104	-100	0.196
2724	chr3	108210293	C	T	rs72933787	0.0203669121999999	0.5856477350080084	0.0203669121999999	0.592066078748916	0.0131810265780396	0.7741007008146837	0.0002675633115399	0.6624254143353605	0.0002675633115399	0.6690018396255637	0.013969351060671	0.6957790419251513	0.0003776524750108	0.6709271834687467	0.0003776524750108	0.6774387716543622	0.0001769875612486	0.7497835190704223	4.729482439457413e-06	0.7119720428093057	4.729482439457413e-06	0.7185065406587322	0.0011414997855563	0.6492390475801524	0.0011414997855563	0.6556964120312876	IFT57	12142	HHLA2	86237	CD47	118431	False	False	False	alt	100	0.012695	-85	0.03824
2725	chr3	108210974	C	A	rs1289771	0.0494743204	0.2646966996548595	0.0554799332	0.2672080954692981	0.0490746078330603	0.0591458983453052	0.0024540893219626	0.1336483793622484	0.0027546565193232	0.134626825628766	0.0017683349279139	0.9308969031586014	7.686846736417484e-05	0.8055215600807362	8.977188628951361e-05	0.8093371700381268	8.645510941437041e-05	0.828612360327552	3.792390980901221e-06	0.6858538911038106	4.438177617043465e-06	0.6895524692771031	0.0002573323215993	0.7946563070597606	0.0003332123651479	0.7983728631818322	IFT57	11461	HHLA2	85556	CD47	119112	False	False	False	alt	35	0.000761	80	0.1631
2726	chr3	108211666	C	T	rs1289769	-0.00441151022	0.8424075083869287	0.0073036181	0.8406172399498719	0.0175954437794721	0.5667116516641229	-8.669631053583496e-05	0.8297230148951418	0.0001256812058865	0.8277204271108446	0.0026013658407838	0.8995866639180771	-9.56117629906392e-06	0.9460019882104772	1.655347009645717e-05	0.944409577448878	4.423447605398749e-05	0.8992087903230402	-1.8482512295946088e-07	0.9414037516718294	2.8195162899167937e-07	0.939751311730476	-4.123915410245875e-05	0.9384289396529149	6.928177889213916e-05	0.9368197009105744	IFT57	10769	HHLA2	84864	CD47	119804	False	False	False	ref	-80	0.02306	-5	0.008446
2727	chr3	108216039	T	C	rs62267923	0.01186134768	0.7357216979374093	0.01234678364	0.7401822624758934	0.0165399604827684	0.6225043158794561	0.000200224834536	0.736095806439368	0.0002082040291042	0.7407291739717571	0.0064201115106726	0.789191672641559	6.924228835751653e-05	0.8292685602628873	7.403282754956185e-05	0.8335932948101537	0.0001061081394685	0.7999923635817093	1.1629336369664993e-06	0.8309185993925682	1.2416765545611108e-06	0.8351220686567141	0.0002606314539275	0.8240186935265302	0.0002787766817326	0.8281875650289352	IFT57	6396	HHLA2	80491	CD47	124177	False	False	False	alt	95	0.005707	100	0.02905
2728	chr3	108218724	G	A	rs1289759	-0.03289756084	0.4818235674891949	0.03289756084	0.4767592255655161	0.0358377525487382	0.145542700536067	-0.0012504010420278	0.361020585268931	0.0012504010420278	0.3569722539923647	0.0093538649335224	0.7566000125402225	-0.0005957633872352	0.6960058465491158	0.0005957633872352	0.6897326053326519	0.00034597205546	0.6537499416142458	-2.313994160887307e-05	0.6117252207687287	2.313994160887307e-05	0.6056211071097418	-0.0016338952855398	0.664657401508193	0.0016338952855398	0.658353977483981	IFT57	3711	HHLA2	77806	CD47	126862	False	False	False	ref	-10	0.00557	40	0.05457
2729	chr3	117798492	A	G	rs9842435	-0.0730235544	0.2027612915600273	0.0730235544	0.2001389223907587	0.0204170388657904	0.4671298654377104	-0.0017568774124458	0.2572511908847526	0.0017568774124458	0.2541182369894222	0.5751822770611329	0.0306847771581531	-0.0437532143858345	0.0438844662413479	0.0437532143858345	0.0431093975608993	0.0117241167073547	0.0603504264569999	-0.0010591752541909	0.0696072689274002	0.0010591752541909	0.0684572255245731	-0.0196743756392068	0.1129438462346191	0.0196743756392068	0.1109524017097306	LINC03051	199100	IGSF11	1347576	TEX55	1347660	True	False	False	ref	90	0.02548	80	0.1909
2730	chr3	117801450	G	T	rs6799997	-0.0250692612999999	0.5441093863532204	0.0250692612999999	0.5385016831584453	0.0148072582884853	0.6928135115132712	-0.0004225217089194	0.61950694534814	0.0004225217089194	0.6138253706849136	0.4269126719672725	0.0617574025713071	-0.0095531668710808	0.2048505372204101	0.0095531668710808	0.2016286245153113	0.0062687742748756	0.1293241518760219	-0.0001595455132878	0.265565569059155	0.0001595455132878	0.2619450943336702	-0.0088276533271748	0.2897943840986499	0.0088276533271748	0.2862183674596916	LINC03051	196142	IGSF11	1344618	TEX55	1344702	False	False	False	ref	100	0.0709	70	0.3062
2731	chr3	117879459	A	C	rs55979908	-0.03518216972	0.3904355997407918	0.0396072653199999	0.3870031523123025	0.0220250643998253	0.4158285200711411	-0.0008913098191902	0.3937161348654288	0.000968626338749	0.390794159072794	0.0085026887928474	0.7698253628218352	-0.0002872965416329	0.691385375361866	0.0003626455090913	0.687190564918746	0.0001894588540042	0.7454498205374943	-7.906336910009269e-06	0.6645407538570322	9.222855291365378e-06	0.6604481488410022	-0.0009254066180594	0.6633596400575448	0.0011761406750024	0.659189752364392	LINC03051	118133	IGSF11	1266609	TEX55	1266693	False	False	False	ref	-100	0.011566	60	0.063
2732	chr3	117886764	C	T	rs62263082	0.0234860495999999	0.5406885675224089	0.0234860495999999	0.5467703518792074	0.0279666970142304	0.2610386479212273	0.0006503742316356	0.4246742997168027	0.0006503742316356	0.4300271518071874	0.0843645871135891	0.3456413215523354	0.0018620989043921	0.3770068989913978	0.0018620989043921	0.3820164012501103	0.0023620559625626	0.2934750161077576	5.177102741813037e-05	0.3349964288612829	5.177102741813037e-05	0.3399184239642379	0.0040579327636831	0.3723808735599138	0.0040579327636831	0.3776284462309497	LINC03051	110828	IGSF11	1259304	TEX55	1259388	False	False	False	alt	-95	0.0646	-90	0.1332
2733	chr3	117897584	C	T	rs55704727	-0.1725941499999999	0.0426683566192809	0.1725941499999999	0.0421366263334019	0.0314958345517003	0.2079019423828567	-0.0063951186938045	0.0593529315480373	0.0063951186938045	0.0585772873972747	0.0249142225594668	0.5864846048458411	-0.0060026140899234	0.2746320901989624	0.0060026140899234	0.2705583019284932	0.0009316170281441	0.4912849197874933	-0.0002551559664746	0.2302158486908447	0.0002551559664746	0.2266793242991273	-0.0125655702550229	0.2007253058976049	0.0125655702550229	0.1977561337778272	LINC03051	100008	IGSF11	1248484	TEX55	1248568	False	False	False	ref	-60	0.0961	-50	0.2437
2734	chr3	117905670	C	T	rs6769144	-0.01415340168	0.633016404152352	0.0195100087199999	0.6312732499009814	0.0145094888035916	0.7074971945920738	-0.0002689473382498	0.6658367013415672	0.0003347048868774	0.6642847299283201	0.0044760977862821	0.8483346010362905	-9.548525082922276e-05	0.8329840754477594	0.000111059770345	0.8318057242112348	7.022691148920257e-05	0.8669100762369077	-1.9141633039852634e-06	0.8389504072297198	2.103518570823696e-06	0.8377731299843024	-0.0003084688726864	0.8263711650740809	0.0003810497839068	0.825274960216557	LINC03051	91922	IGSF11	1240398	TEX55	1240482	False	False	False	ref	65	0.1113	-90	0.01878
2735	chr3	117911328	T	G	rs62263119	0.0842382172	0.0496863398697388	0.1744307908	0.0491212353517128	0.0481318614655562	0.0631102564783014	0.004093124307827	0.0382581050373284	0.0085630007718519	0.0378970622801911	0.7056052258256079	0.0142396276034939	0.0677372533693826	0.0086636083960222	0.1278471739944676	0.0084842542903207	0.0340394350953122	0.0065662378088808	0.003303266841325	0.0088904385782509	0.0062791289435774	0.0087562773653134	0.0148427963445613	0.0511958907076229	0.0353073141763715	0.0507305575705607	LINC03051	86264	IGSF11	1234740	TEX55	1234824	True	False	False	alt	-90	0.0823	-90	0.04688
2736	chr3	117911406	A	G	rs62263120	0.099568002	0.125823389433773	0.099568002	0.1275144978267213	0.0297959028031214	0.2307319492654032	0.0032451183413264	0.1282114853732149	0.0032451183413264	0.1298899089176601	0.6805969779947875	0.0169404406333223	0.0664599101422375	0.0213264027004324	0.0664599101422375	0.0217844800559406	0.0202403198130037	0.022346037194217	0.002157572347006	0.0285780442976311	0.002157572347006	0.0291189980479138	0.0231409389330605	0.0924271847117712	0.0231409389330605	0.0940919697943952	LINC03051	86186	IGSF11	1234662	TEX55	1234746	True	False	False	alt	-80	0.0884	-70	0.272
2737	chr3	117918458	G	A	rs62264763	-0.0468383678	0.3232877704194672	0.0468383678	0.3187850439934118	0.0135752175823071	0.7509162308772697	-0.0006116152838428	0.467655832183784	0.0006116152838428	0.4620725243526472	0.0016520405133449	0.9365794291498152	-7.904126908590482e-05	0.8296414706250537	7.904126908590482e-05	0.8229113795615127	2.1811435624032064e-05	0.9504110087035962	-1.000852368974649e-06	0.8530735578660128	1.000852368974649e-06	0.8462283227131897	-0.0002763023324865	0.8277390634199453	0.0002763023324865	0.8210571551470541	LINC03051	79134	IGSF11	1227610	TEX55	1227694	False	False	False	ref	85	0.04105	100	0.0973
2738	chr3	117920728	G	A	rs62264764	-0.469526974	0.0027147037721245	0.469526974	0.0026870729486085	0.1184397975832407	0.0021883371447513	-0.0602912454979388	0.0012564361770849	0.0602912454979388	0.0012344001013753	0.4937184520471116	0.0456652838243447	-0.2341372508196038	0.0016594855774344	0.2341372508196038	0.0017104456957522	0.0586220034152872	0.0013747950291905	-0.0300178091240865	0.0007685726003906	0.0300178091240865	0.0007646429663448	-0.1573281976840091	0.0012600132719886	0.1573281976840091	0.0012409664782166	LINC03051	76864	IGSF11	1225340	TEX55	1225424	True	True	True	ref	-100	0.165	-85	0.3225
2739	chr3	117921320	G	C	rs7649429	-0.133427165	0.0604078021764009	0.133427165	0.0596923974973427	0.0492833956129525	0.0592747190963054	-0.0065231794246144	0.0385889834549169	0.0065231794246144	0.0383119074298924	0.114202764672891	0.2776939341423736	-0.0157018806575734	0.1087886915199108	0.0157018806575734	0.1065650836486475	0.0057239636768119	0.1447031055669751	-0.000785402098056	0.0670706850521344	0.000785402098056	0.0658974501564345	-0.0282966579789514	0.0601985827220642	0.0282966579789514	0.0591357972965184	LINC03051	76272	IGSF11	1224748	TEX55	1224832	False	False	False	ref	-100	0.1256	-75	0.02222
2740	chr3	117931269	T	C	rs7631320	-0.010819593752	0.7532950411497504	0.010819593752	0.7465759058429969	0.0105854159924487	0.8822087045413141	-0.0001139766068808	0.8307452829882339	0.0001139766068808	0.8247565685648267	0.0070997327702813	0.7768929471600031	-6.796322469184378e-05	0.838824484713807	6.796322469184378e-05	0.8320283764096831	7.577180390201587e-05	0.8452680596242836	-7.32980232788634e-07	0.8765239713719822	7.32980232788634e-07	0.8694329341237742	-0.0002870245125531	0.8255803424316328	0.0002870245125531	0.8188260041488294	LINC03051	66323	IGSF11	1214799	TEX55	1214883	False	False	False	ref	-95	0.03964	90	0.2001
2741	chr3	117934780	G	T	rs62264778	-0.0359363877	0.421895512612213	0.0359363877	0.4169287576199538	0.0186506488125705	0.5339412908668161	-0.0008013740060774	0.4453410041012015	0.0008013740060774	0.4408521924385702	0.0106083600013195	0.7166427723161073	-0.0004491023173194	0.6517087565388574	0.0004491023173194	0.6455477737686061	0.0002091989781593	0.7183413026421985	-1.019404858888194e-05	0.6451784391765355	1.019404858888194e-05	0.6390203290051718	-0.0014813104153607	0.6118987352918508	0.0014813104153607	0.6058329120937216	LINC03051	62812	IGSF11	1211288	TEX55	1211372	False	False	False	ref	-5	0.003479	5	0.005737
2742	chr3	117936022	T	C	rs62264780	0.0612923433999999	0.2433124779922998	0.0633431613999999	0.2457469515125936	0.0239342498483736	0.3600342037435302	0.0015820591979942	0.2610207549225575	0.0016253905508298	0.2634004684805395	0.1161649236250865	0.2764939654353281	0.0070997441978503	0.2176630547913111	0.0073192560076691	0.2202243767704249	0.0028395367590981	0.2561372227162969	0.0001857644952062	0.2145133326569051	0.000190402519615	0.2168092318189589	0.0128765134769555	0.17638214856642	0.0133466398337236	0.1784616919342848	LINC03051	61570	IGSF11	1210046	TEX55	1210130	False	False	False	alt	-10	0.01233	90	0.0464
2743	chr3	117938350	C	T	rs73168397	0.077945461	0.1543393585526127	0.077945461	0.1567229244667113	0.0224815655221974	0.3979912847574929	0.0017375842078119	0.1911117889850384	0.0017375842078119	0.1938128309444966	0.0021180429547028	0.9167018055339486	0.0001575677516296	0.7280113278117938	0.0001575677516296	0.7344674556194044	5.01065845038248e-05	0.8914857941983941	3.687415209424162e-06	0.6988360671683066	3.687415209424162e-06	0.7053755827362583	0.0005814720728447	0.7175158237156297	0.0005814720728447	0.7238520191412778	LINC03051	59242	IGSF11	1207718	TEX55	1207802	False	False	False	alt	-75	0.02043	40	0.1079
2744	chr3	117953094	T	C	rs62264819	0.077934932	0.1574416720384639	0.077934932	0.1597220474121565	0.050932111344573	0.0527388771638571	0.004058200453651	0.0765388222127231	0.004058200453651	0.0773849542359925	0.0402815809442116	0.5093013423772131	0.0025756231320893	0.3427169140935188	0.0025756231320893	0.3475552897593456	0.0020101913279367	0.3389243628577623	0.0001284142651649	0.2317619151171216	0.0001284142651649	0.2355584574602673	0.0065850681270825	0.2861817291089405	0.0065850681270825	0.2907088788390194	LINC03051	44498	IGSF11	1192974	TEX55	1193058	False	False	False	alt	-70	0.01343	-90	0.09155
2745	chr3	118000691	A	C	rs1499972	-0.067144393	0.2165834769973569	0.073380445	0.2149624316729424	0.0392612731952596	0.1149429540304529	-0.0029727955284143	0.1513174483343334	0.0032170109544142	0.1505530768748989	0.1531712909504799	0.2297427951905637	-0.0098019359579264	0.172035742079313	0.0106323877564651	0.1703803512291321	0.0057958115663045	0.1440939375674099	-0.000400897314917	0.1287024700441839	0.000433419355333	0.127619197312965	-0.0147982580581306	0.1415521844150936	0.0165006103394806	0.140210438932834	LINC03051	3099	IGSF11	1145377	TEX55	1145461	False	False	False	ref	100	0.012634	60	0.1074
2746	chr3	118001626	C	T	rs2925312	-0.529626852	0.0015030075955139	0.529626852	0.0014914671008528	0.0704215158012052	0.0173800968198746	-0.0374948506678774	0.0022022310876101	0.0374948506678774	0.0021858693649655	0.6297350796740457	0.0231760364588615	-0.3337830498864972	0.0005499796675753	0.3337830498864972	0.0005756801621061	0.044331926716571	0.0031064434940018	-0.0236197511962846	0.0008481563045416	0.0236197511962846	0.000853010171801	-0.153940813566032	0.0011794539650009	0.153940813566032	0.0011631066834114	LINC03051	4034	IGSF11	1144442	TEX55	1144526	False	True	True	ref	25	0.002441	0	0.0
2747	chr3	118002581	A	G	rs843852	0.0274012252	0.4930859217702849	0.0274012252	0.4990988837995239	0.1024424509583946	0.003844937240779	0.0027785042313199	0.1290703222766583	0.0027785042313199	0.1308635866491866	0.0119321368480089	0.6930153494601818	0.0003475569138819	0.6358143355926054	0.0003475569138819	0.641916067642683	0.0012114424310255	0.4006603570396808	3.48823487989552e-05	0.4004809974269429	3.48823487989552e-05	0.405884245157275	0.0012751146448483	0.6028928468217085	0.0012751146448483	0.6089864187347513	LINC03051	4989	IGSF11	1143487	TEX55	1143571	False	True	False	alt	-95	0.01874	50	0.07623
2748	chr3	118007409	C	T	rs1093464	-0.329888556	0.0068198761874665	0.329888556	0.006811356796225	0.0475150068717754	0.0667663643307669	-0.0162950342093779	0.0102205876298309	0.0162950342093779	0.0101898918147823	0.0081109168288739	0.7613921714601646	-0.002844699269351	0.3338273004386256	0.002844699269351	0.329237616939968	0.0004038360896008	0.6116796697692428	-0.0001477571093162	0.2288597379225802	0.0001477571093162	0.2253117454536228	-0.0059062716505558	0.312333579390467	0.0059062716505558	0.3078218705991279	LINC03051	9817	IGSF11	1138659	TEX55	1138743	False	True	True	ref	-25	0.010216	100	0.2355
2749	chr3	118031005	C	T	rs846184	-0.119778168	0.0786000278522743	0.119778168	0.0774896184922209	0.022567593578474	0.3998905096215386	-0.0028168850710293	0.1262714585649151	0.0028168850710293	0.1246286090428871	0.0279106594965523	0.5786345954809323	-0.0037369091382914	0.3226882575706455	0.0037369091382914	0.318220576110145	0.0006355532495807	0.5526392987721614	-9.03432440940016e-05	0.3173286544319617	9.03432440940016e-05	0.3130224051518648	-0.0090981821780871	0.2486567072372188	0.0090981821780871	0.2449511239454203	LINC03051	33413	IGSF11	1115063	TEX55	1115147	False	False	False	ref	85	0.134	-70	0.105
2750	chr3	118082483	T	C	rs1499976	0.10758015	0.0931583788665378	0.10758015	0.0944042272255593	0.0316060632342554	0.1998977266943636	0.0034663913348513	0.095550726713003	0.0034663913348513	0.0968104252468524	0.0223087328032726	0.6122203853961441	0.0023955279597406	0.3707283604220245	0.0023955279597406	0.3753702592266863	0.0007229302789048	0.5235816821395534	7.84563751548758e-05	0.3120155095248006	7.84563751548758e-05	0.3164352747534629	0.0062741249051498	0.3091122051239831	0.0062741249051498	0.3134145200155682	LINC03051	84891	IGSF11	1063585	TEX55	1063669	False	False	False	alt	-40	0.03027	-60	0.04993
2751	chr3	128072865	T	C	rs7612065	0.207956756	0.0228078928693921	0.207956756	0.0230774902403248	0.0406571990475011	0.1054938868275008	0.0089361053008147	0.0269780691830215	0.0089361053008147	0.0271778200660906	0.0428078915245289	0.4973935874007074	0.0092130551164391	0.1788721427950608	0.0092130551164391	0.1820807554183416	0.0018366317416501	0.3624630424868526	0.0004262709416577	0.1281983389663778	0.0004262709416577	0.1305073543835588	0.0196232390881197	0.1095595479174474	0.0196232390881197	0.1115456835442264	MGLL	20675	SEC61A1	21223	EEFSEC	80617	False	False	False	alt	-100	0.1423	-65	0.1409
2752	chr3	128088271	G	A	rs6439112	-0.004667434406	0.842899018832913	0.007154841366	0.8413574986759719	0.0558294741910991	0.0409095675495711	-0.0002919046843769	0.5900908258808879	0.0004296403009852	0.588659228738096	0.0039820527201345	0.8533915964915506	-2.4298885810237617e-05	0.9008496159329996	3.609024117417389e-05	0.9012557643608322	0.0002218513888394	0.7075806782572631	-1.283756583175847e-06	0.8090133270833363	1.9703319859360856e-06	0.8081305303626597	-8.165352512288593e-05	0.8891769927221371	0.0001492857378509	0.889733005811245	MGLL	36081	SEC61A1	36629	EEFSEC	65211	False	False	False	ref	85	0.0895	85	0.158
2753	chr3	128100219	G	C	rs4857866	0.1818441576	0.0456941404354962	0.1856045384	0.0458603389324831	0.0393149376579289	0.1159267744111965	0.0082172541450913	0.0530926992229321	0.008372809386195	0.0533969509120202	0.4460872290587575	0.0567022197943311	0.0894380831845299	0.0187947277157217	0.0910619812028452	0.0187944746805824	0.018047987572103	0.0293330003312846	0.0041309093813076	0.0215231297436817	0.0041980849866269	0.0215658164633653	0.0604071129292995	0.0218572569335186	0.0618273893965886	0.0219349835551518	MGLL	48029	SEC61A1	48577	EEFSEC	53263	True	False	False	alt	85	0.1312	90	0.6562
2754	chr3	128173194	T	C	rs2999052	0.0292368909999999	0.4661522052413365	0.0292368909999999	0.47180130176837	0.0170022665048421	0.5999475543938724	0.000495301700461	0.5123803898007668	0.000495301700461	0.5183546755799135	0.3568168321731385	0.0845469126537288	0.010403524471375	0.149257958518673	0.010403524471375	0.1521432265001628	0.0059600144863535	0.1389873939789447	0.0001777604021421	0.1925579184843043	0.0001777604021421	0.1957474034417844	0.0096408894460756	0.2088899839023964	0.0096408894460756	0.212573777609254	RUVBL1	19280	EEFSEC	19712	MGLL	121004	False	False	False	alt	100	0.02869	70	0.4185
2755	chr3	128176383	A	G	rs2687729	-0.27819179	0.0105467632433552	0.27819179	0.0104861840729379	0.0490816743841179	0.0615864607622946	-0.0142165805944582	0.0126605451255143	0.0142165805944582	0.0126068798487863	0.0365972749166968	0.5016809023697032	-0.0100712464254958	0.1549329387698285	0.0100712464254958	0.1519074244435898	0.0017076807824143	0.343304215731983	-0.0004872735345034	0.0986084750682161	0.0004872735345034	0.096781178469987	-0.0218270594833558	0.0899094294012872	0.0218270594833558	0.0883004923117568	RUVBL1	22469	EEFSEC	22901	MGLL	124193	False	True	False	ref	40	0.01906	5	0.007812
2756	chr3	128186805	A	T	rs2999059	-0.00541216204	0.8842771337916623	0.00541216204	0.8774327713875705	0.0209287658253331	0.4492190849411608	-0.0001329879208608	0.8313843713576596	0.0001329879208608	0.8245200113458082	0.0015910065652732	0.9384352569921648	-8.223871693859682e-06	0.9736775140586388	8.223871693859682e-06	0.9665972631666274	3.240968317388191e-05	0.9288276617883666	-2.061362737136848e-07	0.9627391034311918	2.061362737136848e-07	0.9557500794185512	-2.6393058625581484e-05	0.9759016476269544	2.6393058625581484e-05	0.9705684611185632	RUVBL1	32891	EEFSEC	33323	MGLL	134615	False	False	False	ref	60	0.01492	-45	0.03894
2757	chr3	128194985	T	A	rs940062	-0.01852249354	0.1939001244868138	0.07037671754	0.1934969742122336	0.0153750012781931	0.6651890719918397	-0.0004278210198202	0.3115036495401895	0.0011957606639386	0.311026602792048	0.3700892415294777	0.0801076624560113	-0.0103757625887875	0.0820121869027407	0.0244476536716261	0.0818778936806258	0.0056138879000352	0.1451688266187311	-0.0002151365991392	0.1321631427699329	0.0004167311889089	0.1319612064756859	-0.0069875622711226	0.089028936635057	0.0244432714196165	0.088812803329168	RUVBL1	41071	EEFSEC	41503	MGLL	142795	True	False	False	ref	-20	0.0177	25	0.0293
2758	chr3	128204967	G	A	rs2999058	-0.0253712897999999	0.5245338838027347	0.0253712897999999	0.5183862919631158	0.0150210565835451	0.689972604858741	-0.0003859204087661	0.5804626467529279	0.0003859204087661	0.5740423409488913	0.0534591402461152	0.4334257234991926	-0.0013547580587582	0.4390770561379016	0.0013547580587582	0.4337176399964011	0.0008140707234627	0.4860175993029968	-2.0812699482274816e-05	0.4788990255641304	2.0812699482274816e-05	0.473226550084492	-0.0034640889446075	0.4167537761104275	0.0034640889446075	0.4112295237238956	RUVBL1	51053	EEFSEC	51485	MGLL	152777	False	False	False	ref	-85	0.1387	70	0.04288
2759	chr3	128206349	A	G	rs2955125	0.0731553294	0.1844614948700016	0.0731553294	0.1871550584599401	0.0267502339866992	0.2913593636547723	0.0021858021726781	0.1820397881864413	0.0021858021726781	0.184438537785004	0.0566650720860413	0.4170185470479514	0.0049184284512315	0.2640374137171835	0.0049184284512315	0.2683031087548709	0.0016247393530229	0.3633980792583906	0.0001591516800637	0.2397394106802167	0.0001591516800637	0.2437899572919264	0.0108615684075087	0.2034546490870664	0.0108615684075087	0.2067888454086445	RUVBL1	52435	EEFSEC	52867	MGLL	154159	False	False	False	alt	-80	0.02606	40	0.03674
2760	chr3	128207673	A	G	rs2955127	-0.355873736	0.0057986211758674	0.355873736	0.0057705070758935	0.0617590276973972	0.0280451180704043	-0.0228806351610657	0.0059224520584726	0.0228806351610657	0.0059145321610937	0.4090107551713898	0.0664776201767408	-0.1559484324571236	0.004476794561358	0.1559484324571236	0.0044468579086533	0.0261100169457225	0.013731277922995	-0.0102851835865891	0.0038066417556604	0.0102851835865891	0.0038077436906832	-0.1174515852330836	0.0027663953915695	0.1174515852330836	0.002753439407253	RUVBL1	53759	EEFSEC	54191	MGLL	155483	False	True	True	ref	-5	0.0012665	-15	0.02979
2761	chr3	128209434	C	T	rs2955128	0.0335534975999999	0.4153439582444313	0.0335534975999999	0.4207175256412044	0.033480924626077	0.1732144232172035	0.0011227363721148	0.2965676942233303	0.0011227363721148	0.3006331736663902	0.0031622183365774	0.8817819538695125	0.0001178054686854	0.7805048300636503	0.0001178054686854	0.7871713445292536	0.0001019218543494	0.8129650748458449	3.748330138784664e-06	0.7117925351134095	3.748330138784664e-06	0.7182969517891789	0.0004717759229322	0.7623700196928389	0.0004717759229322	0.7690630440718608	RUVBL1	55520	EEFSEC	55952	MGLL	157244	False	False	False	alt	-75	0.0723	75	0.1133
2762	chr3	128215931	C	A	rs4384971	-0.2409324119999999	0.0154090341692723	0.2409324119999999	0.01531217435078	0.0489704058614307	0.0596463304144646	-0.0119090463462049	0.0154265103143315	0.0119090463462049	0.0154129526607279	0.1362310712282669	0.2469765171045864	-0.0346716898853049	0.0489855276721871	0.0346716898853049	0.0480848366603057	0.0067909300823475	0.1216051052261023	-0.0017371700672188	0.0320614575019096	0.0017371700672188	0.0315127244683592	-0.0536356438256738	0.0188532676807314	0.0536356438256738	0.0186139784303832	RUVBL1	62017	EEFSEC	62449	MGLL	163741	False	True	False	ref	80	0.05707	-10	0.04712
2763	chr3	128225634	C	G	rs6775988	-0.043657806932	0.3357540344322399	0.043657806932	0.3313108106527978	0.0121997403471795	0.7978336005146244	-0.0005952033173321	0.4813287474401279	0.0005952033173321	0.4756128951429841	0.0475611164263798	0.458773302295772	-0.0025200362336626	0.3997265442322413	0.0025200362336626	0.3944615133569153	0.0005801147139959	0.5530727807043232	-3.253502065169053e-05	0.469764224539566	3.253502065169053e-05	0.4642099317356543	-0.0059103955659661	0.3465327456909319	0.0059103955659661	0.3414406385116753	RUVBL1	71720	EEFSEC	72152	MGLL	173444	False	False	False	ref	-25	0.01416	20	0.0906
2764	chr3	128229217	A	G	rs4857877	0.0603354289999999	0.2244345135041305	0.0603354289999999	0.2275541554395486	0.0283502578047292	0.2549440254168219	0.0018077023228159	0.197830768588305	0.0018077023228159	0.2005362534428423	0.0468724225528685	0.4539798423288553	0.002937012097912	0.3154799748525586	0.002937012097912	0.3201927000097176	0.0013082313037388	0.392929737419824	8.679008694881298e-05	0.278666291878583	8.679008694881298e-05	0.2830511805132485	0.0076498630860083	0.2564888498244418	0.0076498630860083	0.2608995096647717	RUVBL1	75303	EEFSEC	75735	MGLL	177027	False	False	False	alt	60	0.0817	95	0.131
2765	chr3	128339774	A	T	rs3849531	-0.00123520422	0.8484871540531119	0.00682320618	0.8500119978916038	0.0141809761526755	0.7146008683150548	-2.242407279271824e-05	0.8642476090996059	9.449842515416571e-05	0.8657871490100035	0.0277151859061066	0.5556920560625973	4.407265789153242e-05	0.7339062428672282	0.000191162954259	0.7357251338563915	0.0003877427051447	0.6134368877047973	3.5754065948565186e-07	0.7627858206873944	2.5941557434433105e-06	0.7645091492151903	0.0001270165946356	0.7389022957560195	0.0005723994589422	0.7407648573034212	DNAJB8	127194	GATA2	153427	RUVBL1	185860	False	False	False	ref	-60	0.054	90	0.0696
2766	chr3	135959783	A	G	rs1403770	-0.0119110479199999	0.7434343311789315	0.0119110479199999	0.7365282521747846	0.0182120792416392	0.5533337755927551	-0.0002180819657979	0.721133523467174	0.0002180819657979	0.7142370416359128	0.0511283032562435	0.4363292629772721	-0.0006165090547405	0.5610889324034184	0.0006165090547405	0.5550537081279299	0.0009152051337885	0.45558526112193	-1.1086403102421248e-05	0.5668889952904379	1.1086403102421248e-05	0.5609130641256989	-0.0016165748408168	0.569244244085604	0.0016165748408168	0.5631694586449465	PPP2R3A	5946	MSL2	237458	PCCB	290558	False	False	False	ref	95	0.0454	-55	0.04028
2767	chr3	135965617	G	T	rs184442184	0.27327397	0.0125654890152985	0.27327397	0.012594643012767	0.0620552574207932	0.0279980874661924	0.0179126779499795	0.0095901099896403	0.0179126779499795	0.0096076537865593	0.962619181155356	8.200799594063709e-05	0.2627346729312241	0.0012814805935235	0.2627346729312241	0.0012368084854537	0.059721043972355	0.001233158922168	0.0172205413192157	0.0016515716985564	0.0172205413192157	0.0016489239148238	0.0104689716604532	0.1982464448347966	0.0104689716604532	0.2017084676047418	PPP2R3A	112	MSL2	231624	PCCB	284724	True	True	False	alt	60	0.01465	90	0.0869
2768	chr3	135968499	G	A	rs9862763	-0.183109802	0.0297763639766925	0.183109802	0.0294636990014855	0.0307108737837739	0.2129215151324888	-0.0057149426375239	0.0472102614770786	0.0057149426375239	0.0467800520002	0.1470885157203655	0.2337595882775734	-0.0267220714351621	0.0619946822278924	0.0267220714351621	0.0607611423577989	0.0044765432338872	0.1796189257850842	-0.0008262723978838	0.0613705652994003	0.0008262723978838	0.0603142366391168	-0.0435130810596812	0.0277192848125189	0.0435130810596812	0.0272941027128931	PPP2R3A	2770	MSL2	228742	PCCB	281842	False	False	False	ref	25	0.006836	-95	0.1439
2769	chr3	135989606	T	C	rs9836374	-0.0993371818	0.1148587934756274	0.0993371818	0.1133132179280426	0.0195568459055456	0.4965676759238855	-0.0020769086921042	0.1857908974002842	0.0020769086921042	0.1833589983826798	0.1055846062485565	0.2976083542779624	-0.0128340455989491	0.1502493503616369	0.0128340455989491	0.1473700229201371	0.0021863400902613	0.3095544876600328	-0.0002808290015636	0.1766826698225758	0.0002808290015636	0.1736714403274193	-0.0226939065025897	0.096959981335577	0.0226939065025897	0.0951706304065257	PPP2R3A	23877	MSL2	207635	PCCB	260735	False	False	False	ref	-85	0.02965	-85	0.1978
2770	chr3	135990140	G	A	rs34311570	-0.0599439972	0.2340564454643864	0.0599439972	0.2307495164743423	0.0301183527803594	0.2225477864175608	-0.0018112785615773	0.1953686730921551	0.0018112785615773	0.1928454800455823	0.0297994127544454	0.531889739414043	-0.0017625197389179	0.3935884097175097	0.0017625197389179	0.3884324943402351	0.0008901836673694	0.4559539510326448	-5.2973396823359975e-05	0.3399324460287584	5.2973396823359975e-05	0.3351478098419282	-0.0051722147075318	0.3356202227943431	0.0051722147075318	0.3307662572603223	PPP2R3A	24411	MSL2	207101	PCCB	260201	False	False	False	ref	10	0.01218	10	0.02754
2771	chr3	136012398	T	C	rs6809006	0.002583315294	0.596821472416366	0.022492927694	0.5960643931974526	0.0165316780588224	0.6232478432581058	1.7552361094043878e-05	0.6433429809197526	0.0003844986833367	0.642276717455373	0.0434726666886608	0.4783161960707791	0.0005467740654324	0.5798099079019773	0.001220195399632	0.5787759203983989	0.0007312374917407	0.5103938747593181	7.624341059361307e-06	0.6023018065011035	2.070616988402697e-05	0.601303493035907	0.0010425258157104	0.5450890628015155	0.002904886014978	0.5444435393240398	PPP2R3A	46669	MSL2	184843	PCCB	237943	False	False	False	alt	-100	0.03845	95	0.05124
2772	chr3	136021627	G	A	rs4073308	-0.0008577251139999	0.8689782272758009	0.006098724314	0.8674790054059832	0.0243167526655896	0.3488597244360948	-2.145611530712318e-05	0.8092631740566715	0.0001566015745481	0.8067250908039039	0.0048497245224505	0.8243676074716785	5.85691727214082e-06	0.9242665441113572	2.999977505937666e-05	0.921972688904774	0.0001172740092971	0.7855973458649116	1.5355951351641133e-07	0.9034818535524408	7.710483717434556e-07	0.8999028170648531	1.5670878558949486e-05	0.913394329263456	0.0001245422453894	0.9097054838703876	PPP2R3A	55898	MSL2	175614	PCCB	228714	False	False	False	ref	-100	0.007385	-95	0.0606
2773	chr3	136032494	T	C	rs9877082	-0.00290835186	0.8155664933494425	0.00854753746	0.8124032982536281	0.0209075863862658	0.4557218347474293	-8.753760817165943e-05	0.782163093985393	0.0001673331467298	0.7789004781021462	0.0001773283626405	0.9986183216600324	-7.576310997632504e-07	0.991864459592388	1.5715744762419737e-06	0.9927027927128246	3.3255615964331934e-06	0.997916710925422	-1.6302399161796118e-08	0.9922768196728864	2.78198509513255e-08	0.991419965603942	-4.123915410247104e-06	0.9935576809050264	5.7734815743459504e-06	0.9915888199415466	PPP2R3A	66765	MSL2	164747	PCCB	217847	False	False	False	ref	-20	0.01965	-75	0.01538
2774	chr3	136043056	G	T	rs7643661	0.0089470463	0.7838196395160034	0.01023260282	0.7878505678210764	0.068324005523691	0.0194910907205731	0.0005615609315706	0.4740131694621937	0.0006596038051529	0.4773258491777241	0.0988461284682128	0.3129984346319512	0.0007088014361314	0.5253723373022531	0.0008474204451716	0.5286528613867977	0.0067236757997117	0.1260904448001662	4.453345612328003e-05	0.3503212607838434	5.510522468732104e-05	0.353348403941999	0.001486259113853	0.5636361986857644	0.0017666853617498	0.5671475523460192	PPP2R3A	77327	MSL2	154185	PCCB	207285	False	True	False	alt	5	0.0004883	-100	0.02673
2775	chr3	136046467	A	G	rs9837355	-0.036058072	0.3302226078317967	0.0460223532	0.3274730304139851	0.0712555227376584	0.0169626661523553	-0.0028925736945184	0.1086049348036756	0.0033448007615511	0.1079124701886907	0.01165088581703	0.7279763050276544	-0.0007698458851255	0.5927847683348476	0.0008068696449397	0.588771193608112	0.0008563053215323	0.5020861334030698	-5.790684262965442e-05	0.407128120834322	5.95871591294256e-05	0.4034746703903429	-0.002187324733595	0.5491143781995855	0.0023291874237075	0.5449001841793676	PPP2R3A	80738	MSL2	150774	PCCB	203874	False	True	False	ref	60	0.0119	60	0.0648
2776	chr3	136047322	G	A	rs9880721	-0.0809732732	0.1628462900600883	0.0809732732	0.1605105109919666	0.027352867741791	0.2754165317939905	-0.0023384477954417	0.1691535128290503	0.0023384477954417	0.1669457861946446	0.0007291082445316	0.9805598172612676	-7.051783945542496e-05	0.8693886743709544	7.051783945542496e-05	0.8626413025088736	2.18497502903782e-05	0.960911143324424	-2.189291766737611e-06	0.8244927955048093	2.189291766737611e-06	0.8178449355354217	-0.0001995975058559	0.8793093516037007	0.0001995975058559	0.8726094823308137	PPP2R3A	81593	MSL2	149919	PCCB	203019	False	False	False	ref	-30	0.013306	-80	0.4165
2777	chr3	136104082	C	T	rs34864445	0.0324683826	0.4274174692227327	0.0324683826	0.4329951023867259	0.0124171487516834	0.7992072862882134	0.0004097166662643	0.551069030085358	0.0004097166662643	0.5574635448089408	0.0240795420804328	0.5760353030263703	0.0007836212347122	0.5051853528055464	0.0007836212347122	0.5107836899661132	0.0003041601607291	0.6480529529832845	1.0041074023898554e-05	0.5649406278820086	1.0041074023898554e-05	0.570755861663887	0.0026120880208504	0.4597780206002377	0.0026120880208504	0.465317350201162	MSL2	93159	PPP2R3A	138353	PCCB	146259	False	False	False	alt	50	0.02924	-100	0.05167
2778	chr3	136142824	G	T	rs9881400	-0.2458696759999999	0.0164925715148617	0.2458696759999999	0.0163519816278104	0.0704281875305251	0.018600245618703	-0.0175038259480612	0.0096078429435441	0.0175038259480612	0.0095968658435861	0.1864719078882253	0.1886498706293998	-0.0502114200583019	0.0322983639351397	0.0502114200583019	0.0317282229393454	0.0134497327908893	0.0502618410445261	-0.003582597249436	0.0154637500123297	0.003582597249436	0.0152842795032327	-0.067874698954175	0.0125471943692378	0.067874698954175	0.0124498461727307	MSL2	54417	PCCB	107517	PPP2R3A	177095	True	True	False	ref	-10	0.0006104	-10	0.0327
2779	chr3	136189336	G	A	rs6769762	0.02324163012	0.3585177141720468	0.03985503948	0.3598880980688236	0.0208288532738606	0.4503861007134081	0.0005464474325177	0.366969234712345	0.0009145193046039	0.3679660454512883	0.0058122463792022	0.8028594826404659	6.69630833324675e-05	0.7114726740727687	0.0002302602730435	0.7128367287697704	0.0001239491485493	0.7839618499893107	1.7271252341298724e-06	0.6869503542798024	5.359835620292127e-06	0.6882763340262267	0.0002160931674969	0.6852415094889629	0.00086932136848	0.6865798350433597	MSL2	7905	PCCB	61005	PPP2R3A	223607	False	False	False	alt	-100	0.0637	-100	0.2607
2780	chr3	136215869	G	A	rs28631273	-0.1119536994	0.0960909940540711	0.1174703846	0.0953089015456929	0.0292409885964915	0.2391381636715187	-0.0034120010753186	0.1118929685130698	0.0035384941192324	0.1112096594922819	0.0008882913793671	0.9718479092992284	-0.0001300678233922	0.7959504445170189	0.000132843365238	0.7916384601236506	2.5956878277725964e-05	0.941291774091061	-3.859772772536181e-06	0.7400099578683752	3.9234136593326045e-06	0.7358287761287229	-0.0003719771700042	0.8097513457990282	0.0003818745669888	0.8055929187496742	MSL2	18628	PCCB	34472	PPP2R3A	250140	False	False	False	ref	35	0.09106	-100	0.1335
2781	chr3	136234378	A	G	rs9826454	0.231655524	0.0166195116783478	0.231655524	0.0167399876180582	0.0694161170915931	0.0181878453407869	0.0162361676607429	0.0092854818969803	0.0162361676607429	0.0093258182505315	0.043593909801722	0.4803156140512367	0.0109495924735895	0.1532715116026237	0.0109495924735895	0.1560308054362663	0.0030983747326174	0.2522286285317247	0.0007831810986376	0.0725526203599419	0.0007831810986376	0.0738776728409329	0.0222460492890369	0.0880185717437991	0.0222460492890369	0.0896491581090407	PCCB	15963	MSL2	37137	PPP2R3A	268649	False	True	False	alt	-70	0.003372	100	0.1122
2782	chr3	136234634	C	T	rs661739	0.0546850436	0.2699014459735354	0.066158316	0.2703677442342521	0.0888585841959469	0.0069717198301485	0.0044527110129528	0.1014274420603972	0.0054789610403909	0.1008834682310228	0.0377395994853353	0.5168290322919595	0.0039124193972621	0.4015592065534621	0.0040845261434703	0.4030753232681608	0.0032210981415651	0.2479362415457762	0.0003164041808513	0.2254635184814944	0.0003316909711067	0.2263283784376179	0.0079071954076078	0.3312112577262798	0.0084548513740885	0.3324448742729278	PCCB	15707	MSL2	37393	PPP2R3A	268905	False	True	False	alt	100	0.02246	5	0.01367
2783	chr3	136286083	C	T	rs1153877	-0.0008991473	0.6832136448603305	0.0142496839	0.684155954313141	0.0257542205821571	0.3102760807167775	-6.730921771230714e-05	0.5851764315265074	0.000367925789854	0.5854046957301313	0.0083278347794529	0.7530986897494473	1.3214534100473635e-05	0.7681480456482265	0.0001240181863947	0.7693622491525797	0.0002132999070087	0.7041175869398675	-1.957702336949661e-07	0.7257119642772761	3.177954905638747e-06	0.7267365584488992	8.000395895880593e-05	0.7464043432914509	0.0005319850879218	0.7476623162784426	PCCB	35742	MSL2	88842	PPP2R3A	320354	False	False	False	ref	-100	0.07666	65	0.1588
2784	chr3	136302583	C	T	rs146516051	0.0138704904	0.6763932127069718	0.01438250348	0.6812450751175371	0.0254569983778671	0.3170183437682794	0.0003788393410019	0.5894160679651489	0.0003909146292659	0.5938057392344205	0.0744531688166011	0.3652101233508735	0.0013480601535195	0.4932521105988201	0.0013782313569931	0.4972330830569167	0.0019346692638007	0.3274203483898703	3.714166234294636e-05	0.4554765849443262	3.785321835398729e-05	0.4594576170726887	0.0028941638349113	0.4873629271385806	0.0029799412754445	0.4913471217182953	PCCB	52242	MSL2	105342	PPP2R3A	336854	False	False	False	alt	95	0.04947	-100	0.1558
2785	chr3	136349853	A	T	rs480162	0.0002335391399999	0.8715042978199761	0.0055586998599999	0.8724661994574661	0.0119437729810054	0.8341810189540562	6.785115552789502e-06	0.89888922978498	6.55439604878221e-05	0.9000240739604035	0.074350070931345	0.3611258904737301	-2.3610398773860025e-05	0.6032727234522594	0.0004233436503579	0.6040338764970683	0.0008770822582763	0.462189649958848	9.853486795703597e-08	0.6632170244256924	4.915777244641525e-06	0.6641613273478959	-6.433308039984005e-05	0.6394198444203543	0.0009963379631156	0.6402145087902762	PCCB	99512	MSL2	152612	PPP2R3A	384124	False	False	False	alt	-40	0.015274	-85	0.08057
2786	chr3	136443779	A	C	rs35418151	0.0763948947999999	0.2107624378637947	0.0763948947999999	0.2133599688334084	0.0248608600260268	0.3329979192542837	0.0024111201508392	0.2205723195618538	0.0024111201508392	0.2233017488498517	0.000886641813203	0.97302964350869	9.624366678758112e-05	0.8335277585947021	9.624366678758112e-05	0.8402688714812103	2.4842926012490267e-05	0.9478364562777952	3.158696486798951e-06	0.7874705945861603	3.158696486798951e-06	0.7942230007377329	0.0002639305862557	0.8454262849765521	0.0002639305862557	0.8521892808076283	PCCB	193438	MSL2	246538	STAG1	308624	False	False	False	alt	20	0.00655	85	0.0955
2787	chr3	136446853	G	A	rs10804640	0.1960193408	0.0258688942433808	0.1960193408	0.0260384324570695	0.052965100251291	0.0467305692963037	0.0106286045833316	0.0193355861643845	0.0106286045833316	0.0194099562294155	0.0040661805945035	0.8452408246635608	0.0007902250291912	0.5069301236212851	0.0007902250291912	0.512673134691995	0.0002169306078969	0.7012292961373492	4.29524881986629e-05	0.3649040280809238	4.29524881986629e-05	0.3700800123398819	0.0022961961004255	0.4888942068837385	0.0022961961004255	0.4947966179425442	PCCB	196512	MSL2	249612	STAG1	305550	False	False	False	alt	20	0.02869	-80	0.1467
2788	chr3	136476946	A	T	rs1394094	0.001570274688	0.9053126103077056	0.003672459088	0.90958902979953	0.0150117456264683	0.6737101741555331	3.598420806798933e-05	0.8915293579233535	6.262713122027062e-05	0.8958711456224713	0.0410280096334663	0.4783004210823773	9.630803951355454e-05	0.7885148566585548	0.0001435986945103	0.7925951601076869	0.0006548074554052	0.5266366254816583	2.0976418073590875e-06	0.7931544208390097	2.6969999025872823e-06	0.797351785850082	0.0002738279832403	0.806337579352245	0.0004123915410246	0.8105502400351824	PCCB	226605	STAG1	275457	MSL2	279705	False	False	False	alt	30	0.007294	-60	0.09155
2789	chr3	136494468	T	C	rs73226190	0.02193519852	0.5723759904954806	0.02193519852	0.5786963640094498	0.0223524259314904	0.4062036850478112	0.0005451681291824	0.5198783184743265	0.0005451681291824	0.5256683415144509	0.0055062518557618	0.8177343753995376	0.0001367502878377	0.7809895600814468	0.0001367502878377	0.7876100705555291	0.0001243013606773	0.7897030929003959	3.3439357409445187e-06	0.751227371726823	3.3439357409445187e-06	0.7577721175676565	0.0004989937646398	0.7640497822148492	0.0004989937646398	0.7707830419812	PCCB	244127	STAG1	257935	MSL2	297227	False	False	False	alt	-100	0.01375	5	0.00319
2790	chr3	136526973	G	A	rs1070228	0.0830329568	0.1511230786728369	0.0830329568	0.1532215556858738	0.0260640818756515	0.3065877898738732	0.0024387185494205	0.1623806708971263	0.0024387185494205	0.1643812264035165	0.0003398106298043	0.9932810360969688	2.9160977480390763e-05	0.9129115596406108	2.9160977480390763e-05	0.919894386334332	8.874331160286264e-06	0.9863452811742892	8.016846439471679e-07	0.8816882348742059	8.016846439471679e-07	0.8884733725870371	9.567483751772148e-05	0.9186421487365586	9.567483751772148e-05	0.9256510192965124	STAG1	225430	PCCB	276632	SLC35G2	291675	False	False	False	alt	80	0.01524	-45	0.1871
2791	chr3	136789166	C	A	rs1280622	-0.079048056	0.1595443682111688	0.079048056	0.1570921317852568	0.0342559115998964	0.1650776573701318	-0.0026821119506895	0.1271570529706596	0.0026821119506895	0.12549068929565	0.0024454818382764	0.9089217646071616	-0.0002042069245421	0.7209808840707609	0.0002042069245421	0.7146608692807306	8.499642965749412e-05	0.8378788933659095	-6.999122988144324e-06	0.6393561437368087	6.999122988144324e-06	0.633316609817136	-0.0007249843291213	0.7060438550298641	0.0007249843291213	0.6996916453590659	SLC35G2	29482	STAG1	36763	NCK1	73043	False	False	False	ref	-80	0.01746	-5	0.02922
2792	chr3	136791759	G	T	rs56695781	-0.0971108827999999	0.1113642528604979	0.0971108827999999	0.1097264518976444	0.0230240704608735	0.3835238463700411	-0.0022599760741246	0.1517309962651919	0.0022599760741246	0.1496907530523204	0.0028471511992345	0.8903876438444374	-0.0002594044653697	0.6781684986556054	0.0002594044653697	0.6719297957678882	6.457676147990948e-05	0.8640598073076121	-5.947219085768584e-06	0.6479287247438604	5.947219085768584e-06	0.6418396776080126	-0.0009229322688132	0.6604208067358837	0.0009229322688132	0.6542478952501792	SLC35G2	26889	STAG1	39356	NCK1	70450	False	False	False	ref	100	0.0579	-100	0.373
2793	chr3	136794440	T	C	rs4420814	0.00577019278	0.7339820255484973	0.0127236247799999	0.7376777405804663	0.015421595482131	0.672391874923045	9.42209189137391e-05	0.7528225979169652	0.0001929131040698	0.7566785276861381	0.0043004189898056	0.8402279074860628	2.666133595186496e-05	0.856358062130589	5.553742750096697e-05	0.8605183584961676	6.667379691587139e-05	0.8557928241292977	4.39374182852041e-07	0.8634086798850751	8.492213936511308e-07	0.8676466860748672	9.155092210746268e-05	0.8590097781189827	0.0001905248919533	0.86320484387834	SLC35G2	24208	STAG1	42037	NCK1	67769	False	False	False	alt	10	0.002808	35	0.12134
2794	chr3	142964032	G	T	rs149346914	-0.1457412579999999	0.0527415834839342	0.1457412579999999	0.0520621626614161	0.0519241748351324	0.0519072949509978	-0.0080696614550666	0.0332468337694347	0.0080696614550666	0.0330043657578779	0.9004478572135529	0.0017793302501507	-0.131811529979163	0.0054476490674957	0.131811529979163	0.0053968475804139	0.0468732368776525	0.0027567925835165	-0.0073150379245227	0.0056126108016444	0.0073150379245227	0.0055746863755596	-0.0110100293622776	0.1887209416866687	0.0110100293622776	0.1852948979349978	PAQR9	358	U2SURP	466	PCOLCE2	74826	True	False	False	ref	-65	0.1438	-15	0.0442
2795	chr3	143003051	G	T	rs4683442	0.037138513	0.3877015740458718	0.037138513	0.3928380656189602	0.0268431138698584	0.2858635654387776	0.0009943475570897	0.3227761365730297	0.0009943475570897	0.3270248428079318	0.066990531490218	0.3795293944385023	0.0024374985720676	0.3348571178867233	0.0024374985720676	0.3395758084574415	0.0017691180745361	0.3333474995866015	6.467109791208318e-05	0.3029860576914249	6.467109791208318e-05	0.3076595396211259	0.0058138959453663	0.3017235844132457	0.0058138959453663	0.3062988064707668	U2SURP	38553	PAQR9	39377	PCOLCE2	113845	False	False	False	alt	-20	0.003418	-100	0.166
2796	chr3	143030201	G	A	rs3886152	-0.121682594	0.0760107344241825	0.121682594	0.0752727994406303	0.028101480220406	0.2591481996043396	-0.0038060977434914	0.0952650497562718	0.0038060977434914	0.0942871112313636	0.0246478176239648	0.5973250258573835	-0.0029716762361788	0.343462928673634	0.0029716762361788	0.3387084375185034	0.000646136441708	0.541755006525596	-8.395336835380894e-05	0.3078497195997199	8.395336835380894e-05	0.3035850014816521	-0.0079649302233511	0.2696538922897641	0.0079649302233511	0.2657305188464767	U2SURP	65703	PAQR9	66527	CHST2	89571	False	False	False	ref	70	0.01158	75	0.2812
2797	chr3	143073506	T	C	rs4683725	0.2649909519999999	0.0126087904101028	0.2649909519999999	0.0126906813983337	0.0438606999491392	0.0832242988276833	0.0115696280994277	0.016634192575218	0.0115696280994277	0.0167047146937929	0.0201362541651545	0.6146039698696933	0.0049646558217626	0.2353297094433681	0.0049646558217626	0.2393179967860152	0.0008657455410794	0.470457714085717	0.0002126439622703	0.1635472152964968	0.0002126439622703	0.1664943544666552	0.011750684569958	0.1752485898726501	0.011750684569958	0.1783146618374808	CHST2	46266	U2SURP	109008	PAQR9	109832	False	True	False	alt	100	0.02771	100	0.0803
2798	chr3	143073800	A	G	rs9289654	0.1026962556	0.101330360207112	0.1026962556	0.1026304354636426	0.0251370504935362	0.325630679918454	0.0027159750526167	0.1287753719225941	0.0027159750526167	0.1303640508218915	0.0127231038236943	0.7057434992906729	0.0011680702423559	0.4616661110425254	0.0011680702423559	0.4673454331665349	0.0003233681809686	0.6595291920394504	3.050664807204165e-05	0.4270775305695223	3.050664807204165e-05	0.432539065644594	0.0035944046715713	0.4090154931746796	0.0035944046715713	0.4146667016080673	CHST2	45972	U2SURP	109302	PAQR9	110126	False	False	False	alt	-80	0.0274	-100	0.3281
2799	chr3	143081405	G	C	rs750869	0.0031343524	0.8181626539569418	0.0079529184799999	0.8196634857056683	0.0143481263156606	0.7178816120852155	3.752598829608673e-05	0.8384572436893467	0.0001067625190376	0.8397990088494487	0.0242651182738939	0.5972202881694133	-3.281930211199842e-05	0.7212279609194725	0.0002238628917313	0.7222005663001899	0.0003409026255985	0.6489917553532817	-5.355055827927998e-07	0.7496115184867805	3.0664600419348275e-06	0.7506987873157452	-2.7217841707645898e-05	0.7246856356304149	0.0006721982118702	0.7256896824452376	CHST2	38367	U2SURP	116907	PAQR9	117731	False	False	False	alt	-35	0.00949	100	0.0515
2800	chr3	143081550	A	G	rs10804685	0.05577482152	0.2696657307917363	0.05577482152	0.2726889424007005	0.0318700040617467	0.1990924395600426	0.0020469598596381	0.2149517823789625	0.0020469598596381	0.2172659420188396	0.1006680742964599	0.3124218767025773	0.0047706649355057	0.270820836599763	0.0047706649355057	0.2751318740012133	0.0030370605824902	0.2475315590136254	0.0001734661393034	0.2244660959989433	0.0001734661393034	0.2276928015086745	0.0099303883078749	0.2274003499708642	0.0099303883078749	0.2310155992927149	CHST2	38222	U2SURP	117052	PAQR9	117876	False	False	False	alt	30	0.02507	100	0.01337
2801	chr3	143097702	G	C	rs8179934	-0.01707075294	0.6532626155331595	0.01707075294	0.6464391077235281	0.0128197935591796	0.7778502908425492	-0.0001993774386202	0.748510836824426	0.0001993774386202	0.7417367755922909	0.0046484774504304	0.8446626414737628	-9.71451492296912e-05	0.8215450288205992	9.71451492296912e-05	0.8147426210785822	5.544258149179253e-05	0.887516107061243	-1.1237618421569063e-06	0.8572906075021615	1.1237618421569063e-06	0.8505159662475519	-0.0003744515192504	0.8083930995952716	0.0003744515192504	0.8016544032789522	CHST2	22070	U2SURP	133204	PAQR9	134028	False	False	False	ref	-85	0.01688	95	0.0922
2802	chr3	161757749	C	A	rs9832859	0.01338530114	0.6635199826281687	0.0159020374199999	0.6678392739329219	0.0342842221237289	0.1626904198393451	0.0004381032029216	0.5041771919799909	0.0005278253900287	0.5077956434974077	0.0015307974002836	0.9417930762128668	2.1686022437077524e-05	0.9088705254062526	2.541201433459308e-05	0.9129085791561896	5.221239403921548e-05	0.8805351771101898	7.088393534164811e-07	0.8582618195785322	8.416717623251793e-07	0.862099149335165	7.093134505622699e-05	0.9099788141143328	9.237570518951188e-05	0.9138857797016284	OTOL1	260940	SPTSSB	384869	B3GALNT1	652338	False	False	False	alt	45	0.05814	80	0.1584
2803	chr3	161760357	G	A	rs514816	-0.1364866699999999	0.065406121895327	0.1364866699999999	0.064633074872121	0.0333337311333225	0.1775619297312902	-0.0049624988596437	0.070380281291026	0.0049624988596437	0.0697014087066549	0.0075145986605522	0.7755851256743905	-0.001030910082856	0.4957367113081869	0.001030910082856	0.4902542057093658	0.0002547752602763	0.6863598039658514	-3.820563721241678e-05	0.4167539559229898	3.820563721241678e-05	0.4115412426488061	-0.0029642703968855	0.4589707351724559	0.0029642703968855	0.4534886843595859	OTOL1	263548	SPTSSB	387477	B3GALNT1	654946	False	False	False	ref	60	0.03275	15	0.1543
2804	chr3	161767619	G	A	rs308693	-0.0805300041	0.1535887542204242	0.0806513423	0.1520494113801064	0.0178874325427682	0.5677581890823908	-0.0014565334665232	0.2530756697418638	0.0014585889390581	0.2505824360431187	0.0211276434297779	0.6181746107795052	-0.0015927832005336	0.4634657886703771	0.0015958856090607	0.4590440499461562	0.0003730505505517	0.6296968880050483	-2.847048479760229e-05	0.4816756784211114	2.852303968574431e-05	0.4771343843308503	-0.0047466266371943	0.394868972950007	0.0047565240341789	0.3905362743388887	OTOL1	270810	SPTSSB	394739	B3GALNT1	662208	False	False	False	ref	-20	0.005554	-50	0.1036
2805	chr3	161770560	A	T	rs308698	0.1157637644599999	0.1028020138371949	0.1157637644599999	0.1039236206402976	0.0263219103664581	0.296346988499393	0.0034568998881073	0.1315687085601562	0.0034568998881073	0.1328775554985851	0.2691258948896439	0.1281922753317392	0.0430435697475897	0.0706665167301523	0.0430435697475897	0.071590826237202	0.0073886002934524	0.1194042288552408	0.001299621912409	0.0833784937692481	0.001299621912409	0.0847433889594737	0.032594602619511	0.0655668519163568	0.032594602619511	0.0665360253401215	OTOL1	273751	SPTSSB	397680	B3GALNT1	665149	True	False	False	alt	-20	0.01276	-15	0.04932
2806	chr3	161770581	G	A	rs308699	0.1136240168	0.1160959648939527	0.1136240168	0.1174375526495332	0.0436088302565034	0.0962789530058481	0.0071179059968014	0.0889419751578926	0.0071179059968014	0.0898580756269994	0.2597184190557883	0.1353533527765651	0.0299980615403271	0.0831609592249105	0.0299980615403271	0.0843618311939669	0.0128817902580696	0.0632611630876772	0.0021147801101022	0.0616638966990473	0.0021147801101022	0.0624374396533895	0.0349328626571211	0.0680189682157928	0.0349328626571211	0.0689004564665318	OTOL1	273772	SPTSSB	397701	B3GALNT1	665170	True	False	False	alt	-40	0.013306	-35	0.04834
2807	chr3	161964926	A	G	rs9865618	-0.0708612716	0.1886136760119952	0.0708612716	0.1857563499560084	0.0249981683450455	0.3299270948190435	-0.0017670467826726	0.1983340334237779	0.0017670467826726	0.1956793553657037	0.0066716703506977	0.8110586756646776	-0.0004970885008318	0.6232112425403402	0.0004970885008318	0.6172874929773784	0.0001593731503937	0.7699828894557345	-1.177956820610411e-05	0.5848162982203062	1.177956820610411e-05	0.5789296871233096	-0.0015596648081554	0.5930390408960452	0.0015596648081554	0.5871154540479789	OTOL1	468117	SPTSSB	592046	B3GALNT1	859515	False	False	False	ref	75	0.01524	10	0.0091
2808	chr3	161988675	C	A	rs4586823	0.0071836342	0.7718696946473098	0.0107657754	0.7735189208663856	0.0188309620728846	0.5291390264589051	0.0001357202263901	0.7459469835051986	0.0002016388422266	0.747743883307724	0.0013658407838738	0.9492863995822176	6.327674150814918e-06	0.9516591441754624	1.1899873964405978e-05	0.9528255623778464	2.59088586214826e-05	0.9416972764332616	1.1932988451077114e-07	0.9439360794429124	2.2224019125362966e-07	0.945092959670868	1.4846095476889546e-05	0.9639036345309208	2.9692190953779176e-05	0.9650699516341196	OTOL1	491866	SPTSSB	615795	B3GALNT1	883264	False	False	False	alt	-85	0.006256	-55	0.0963
2809	chr3	162001353	G	A	rs7615033	-0.0710361456	0.1873991086928803	0.0710361456	0.1845878832172595	0.0226932797766219	0.3955929557068667	-0.0016671421062742	0.2170078887428235	0.0016671421062742	0.21400656471535	0.0095163472006862	0.7323452633764587	-0.0006363346315186	0.5454928314378098	0.0006363346315186	0.5398539889397269	0.0002116721226876	0.703113289673413	-1.464185673934554e-05	0.5209868301006316	1.464185673934554e-05	0.5153558899317866	-0.002154333410313	0.5067838334730635	0.002154333410313	0.5011016673571671	OTOL1	504544	SPTSSB	628473	B3GALNT1	895942	False	False	False	ref	-95	0.06525	60	0.07294
2810	chr3	162001354	T	A	rs7626556	0.0712669163999999	0.2136786876726732	0.0712669163999999	0.2163393236606286	0.0222879838927656	0.4038136427930512	0.002007409444165	0.2448339723966376	0.002007409444165	0.2476725593536333	0.0131808584342317	0.6861084424836662	0.0013285882835062	0.506219924854778	0.0013285882835062	0.5116223755170796	0.0003437813235138	0.6536678778433216	4.125715879847481e-05	0.4767590082084042	4.125715879847481e-05	0.482241256471294	0.0036348190425917	0.4521559944309077	0.0036348190425917	0.4574463918156	OTOL1	504545	SPTSSB	628474	B3GALNT1	895943	False	False	False	alt	-100	0.07825	60	0.0927
2811	chr3	162017708	A	G	rs1912454	0.0421710504	0.3522521248678813	0.0421710504	0.3568356651154786	0.0226055571585365	0.3930788056446308	0.0009921046619512	0.3384359059767503	0.0009921046619512	0.3428488222308397	0.1917340239517006	0.1851455432902278	0.0094564197282001	0.176010608135976	0.0094564197282001	0.1791042122348308	0.0043537083010669	0.1873384246622509	0.0002269719814363	0.1848803657327457	0.0002269719814363	0.1879634074015443	0.0123478275213618	0.1726661835852203	0.0123478275213618	0.1756488475910792	OTOL1	520899	SPTSSB	644828	B3GALNT1	912297	False	False	False	alt	-100	0.217	-95	0.4055
2812	chr3	162030893	T	G	rs28532919	-0.00448245806	0.7952710474120936	0.00941845334	0.7937341778946324	0.0254622574178513	0.3166986381743888	-0.00014263647924	0.6907217148410718	0.0002478021713805	0.6889877885035424	0.0137227409191381	0.7000695154171531	2.222767455333092e-05	0.7909569200937179	0.0001059922800797	0.7898879983383488	0.0003197334277796	0.6591215074397427	1.5588695883995358e-07	0.7513476228993328	2.538919799362009e-06	0.7503013210154797	2.3918709379440016e-05	0.7823976172314898	0.0003736267361683	0.7813379543495831	OTOL1	534084	SPTSSB	658013	B3GALNT1	925482	False	False	False	ref	-90	0.00969	95	0.0883
2813	chr3	162032242	T	G	rs62280491	0.06551983	0.1991604866962791	0.06551983	0.2021000620263406	0.0981198931025701	0.0045976654679309	0.0064795083135114	0.039558826993063	0.0064795083135114	0.0398090430258452	0.0473384249942264	0.4504961674247738	0.0033192004748028	0.2998070455230303	0.0033192004748028	0.3043503200917463	0.00471487838132	0.1732227668174258	0.0003327624693475	0.129949031885257	0.0003327624693475	0.1320898481900161	0.0082544290851505	0.2403153503444263	0.0082544290851505	0.2443975924607019	OTOL1	535433	SPTSSB	659362	B3GALNT1	926831	False	True	False	alt	45	0.00525	-70	0.0537
2814	chr3	162033487	A	G	rs56315604	-0.113375041	0.092609471733274	0.113375041	0.0914345623703963	0.0236126679363014	0.3626331121726842	-0.003045627534668	0.1340178329685814	0.003045627534668	0.13243077813022	0.0227029791164923	0.6356912783962094	-0.003471175528656	0.376967734897893	0.003471175528656	0.3721257552600587	0.0006992095138061	0.5833829481984126	-0.0001124984136943	0.3512441588924506	0.0001124984136943	0.3468960136378057	-0.0081348355382534	0.3009113623620776	0.0081348355382534	0.2968183451076898	OTOL1	536678	SPTSSB	660607	B3GALNT1	928076	False	False	False	ref	-100	0.01276	70	0.02368
2815	chr3	162040151	G	T	rs1397242	0.03980353924	0.3883043579098961	0.04176351044	0.3919629749153732	0.0351712467544985	0.1548906971552266	0.0014457538372905	0.2970605465508953	0.0015270789653356	0.2997096799099943	0.0112351951436771	0.7058121992435465	0.0005348724830413	0.6281370392195453	0.0005543680886763	0.6321274039017525	0.0004030750740473	0.6024660785489411	1.943659398658021e-05	0.5424468619222003	2.0245525599051275e-05	0.5464933541833928	0.0016075022269142	0.5967284419207611	0.0016767840058064	0.600752582486744	OTOL1	543342	SPTSSB	667271	B3GALNT1	934740	False	False	False	alt	65	0.02802	50	0.0758
2816	chr3	162043735	A	C	rs13100661	0.0023874103599999	0.7388096370957874	0.01260712484	0.7380219895671696	0.0284169336394815	0.2550587520861754	7.704107889997788e-05	0.6130842461449872	0.0003670351583265	0.6122530428114095	0.0281498465903467	0.5474519428069282	0.0001860347502556	0.6426339268355818	0.0003918906343369	0.641756979599867	0.0007847209237761	0.4834558012015154	5.534565135847711e-06	0.5853683623126248	1.119724710769834e-05	0.5846854079358633	0.0004387845996503	0.6389408018004462	0.0011316023885717	0.6382829076737064	OTOL1	546926	SPTSSB	670855	B3GALNT1	938324	False	False	False	alt	60	0.006744	100	0.06604
2817	chr3	162044696	T	C	rs6791872	0.0931678184	0.0698221939019738	0.1533382376	0.0700083463256884	0.0475399421841999	0.0660947671417356	0.0051668706762815	0.0550661881646695	0.0078204803130367	0.0550617385038358	0.2727656626307281	0.1274975192919165	0.0502922833484905	0.0529590594294685	0.0595065126075743	0.053016115549993	0.0133133512508697	0.0561979471100767	0.0026863946441349	0.0415603003939207	0.0030917250750816	0.0415691767088708	0.026937415459734	0.0475029621380979	0.0410544026920919	0.0476365439290849	OTOL1	547887	SPTSSB	671816	B3GALNT1	939285	False	False	False	alt	-15	0.009766	-15	0.04102
2818	chr3	162044770	G	A	rs6779000	0.0469871310999999	0.2917005522960327	0.0489895900999999	0.2948154997409827	0.0954066103090035	0.0053672553166486	0.0040925522469403	0.0774560299439416	0.0043136015979467	0.0777933488045719	0.2446026195110685	0.1462989701771359	0.0135245575896873	0.1445166420900038	0.013818962535505	0.1466265191204509	0.0218763674313249	0.0211019824817093	0.0011196895546987	0.0570772368139163	0.0011521886079003	0.057639778033311	0.0138588301276764	0.1573022971513615	0.0142679225363728	0.1596037946379975	OTOL1	547961	SPTSSB	671890	B3GALNT1	939359	False	True	True	alt	-90	0.05273	-90	0.1987
2819	chr3	162046589	A	C	rs35298688	0.0298057568	0.4718363865561075	0.0298057568	0.4769224675911471	0.0277758756737237	0.2689759907514217	0.0009515238018784	0.3902887625514428	0.0009515238018784	0.3944054634631881	0.0093192240440763	0.7602958755051143	0.0002720084678689	0.704885604775294	0.0002720084678689	0.7111946581778517	0.0002574365823967	0.7016201967258929	8.658591341136708e-06	0.6481164817267892	8.658591341136708e-06	0.6543529057621065	0.0008973639932697	0.6864441327096812	0.0008973639932697	0.6928158490389638	OTOL1	549780	SPTSSB	673709	B3GALNT1	941178	False	False	False	alt	-95	0.01788	-85	0.166
2820	chr3	162051464	C	G	rs6800277	0.365479428	0.0054312398250094	0.365479428	0.0054850765595574	0.0550044315436523	0.0435363075913017	0.022474100842672	0.0073857225765374	0.022474100842672	0.0074187589682971	0.0750882517897792	0.39420680479443	0.0400756077300215	0.0676127063919886	0.0400756077300215	0.0685393001252384	0.0050935635832326	0.2049499137808491	0.0029468799761624	0.0430297738251724	0.0029468799761624	0.0434192429839336	0.0525914684437992	0.0330040984267939	0.0525914684437992	0.0335287725142998	OTOL1	554655	SPTSSB	678584	B3GALNT1	946053	False	True	True	alt	55	0.031	-100	0.1113
2821	chr3	162052502	G	A	rs12637049	-0.1159516446	0.0911611592345252	0.1159516446	0.0899895366572137	0.1077360375907076	0.0030941011310682	-0.0122611922126697	0.01848822592864	0.0122611922126697	0.0183711297454234	0.2272046451783181	0.1533797195469268	-0.0283231274427068	0.0673295158060027	0.0283231274427068	0.0660664565681547	0.024323136802454	0.0150365029286188	-0.0029948970705895	0.0194533632421269	0.0029948970705895	0.019169294411349	-0.0370814225858598	0.0441602693812468	0.0370814225858598	0.0434318024919426	OTOL1	555693	SPTSSB	679622	B3GALNT1	947091	False	True	True	ref	65	0.01367	-85	0.1525
2822	chr3	162053790	A	T	rs61342226	-0.0289887052	0.4023045296582958	0.0354127588	0.3983959401327482	0.0117582184183732	0.8360897081559465	-0.0003668847488727	0.551014909263679	0.0004298648734258	0.5465649600477348	0.0559483355877403	0.4562034214209155	-0.0004481439590275	0.4333519437721062	0.00147723557694	0.4301658306183559	0.0005891554132251	0.5663952141558468	-6.172593174752697e-06	0.5150062133562064	1.6261599386469784e-05	0.5114229769150193	-0.002020718551021	0.4071930620571649	0.0036554386196429	0.4037565177361366	OTOL1	556981	SPTSSB	680910	B3GALNT1	948379	False	False	False	ref	100	0.1084	100	0.1335
2823	chr3	162053854	C	T	rs34809784	-0.13221839	0.0624789008444699	0.13221839	0.0616123812158075	0.0354196636303971	0.1504238597872182	-0.0047035416062378	0.062239866372974	0.0047035416062378	0.0616133023361626	0.0579979215466331	0.4496359554471147	-0.0074194379641062	0.2205279219517382	0.0074194379641062	0.2170061501786292	0.002068987112858	0.3462714031326934	-0.000265819075754	0.1759105047766622	0.000265819075754	0.1731249414700974	-0.0146745405958232	0.1545301241739218	0.0146745405958232	0.1519218252578857	OTOL1	557045	SPTSSB	680974	B3GALNT1	948443	False	False	False	ref	90	0.0384	90	0.09326
2824	chr3	162055731	A	C	rs13098556	0.01542578954	0.6212751556293358	0.01859385994	0.6255243585193508	0.0184732843769998	0.5398583531023423	0.000314158939775	0.6102881717004696	0.0003688188420646	0.6142904195245763	0.0024067170334201	0.9061731127235412	4.565471834537333e-05	0.867654025312139	5.146857837457083e-05	0.8720119979034926	4.526632932842045e-05	0.8989967148998793	9.128910076767048e-07	0.8566246008136086	1.0131997096283369e-06	0.8609307375522679	0.0001897001088713	0.8603355734046835	0.0002078453366764	0.8647283189883892	OTOL1	558922	SPTSSB	682851	B3GALNT1	950320	False	False	False	alt	80	0.005432	60	0.06726
2825	chr3	162058404	T	A	rs12629678	0.04663556844	0.34524231731217	0.04709594316	0.3483057694928597	0.0177429049929716	0.5621862924441213	0.0010378578015903	0.3981292296480779	0.0010440818754647	0.4014518303976496	0.0009658209890798	0.9702801520280684	5.321004907593343e-05	0.8747896262408186	5.357456999138605e-05	0.8793682479730043	1.8367568239477887e-05	0.9638690858561284	1.231756043055218e-06	0.8614426422234595	1.2366842134549602e-06	0.8660579061344169	0.0001723796641483	0.8769773970597896	0.0001756787964765	0.8812621981652189	OTOL1	561595	SPTSSB	685524	B3GALNT1	952993	False	False	False	alt	65	0.01886	-70	0.05118
2826	chr3	162059288	G	A	rs13090291	-0.176975748	0.033792218531952	0.176975748	0.0334808133860287	0.0442832637983974	0.0810110982845637	-0.0079744973092846	0.0301663317526359	0.0079744973092846	0.0299688335084475	0.0014013064564019	0.948214399211968	-0.0002547799376609	0.6849309220335118	0.0002547799376609	0.6787569290680294	6.35353879610577e-05	0.8653047295479472	-1.1678005284100588e-05	0.5632963019118815	1.1678005284100588e-05	0.557509689751076	-0.0007258091122034	0.6998905464725141	0.0007258091122034	0.693573322670378	OTOL1	562479	SPTSSB	686408	B3GALNT1	953877	False	False	False	ref	75	0.0706	-65	0.126
2827	chr3	162059363	G	A	rs1119975	0.1092157209999999	0.0879716493694593	0.1092157209999999	0.0892217789258062	0.0243695110349697	0.3478664349314295	0.0027733688138299	0.1223016681820239	0.0027733688138299	0.1238442549125136	0.0031077826531621	0.8816760847057828	0.0003165303797961	0.6327299669162383	0.0003165303797961	0.6388423687819448	7.254916814534228e-05	0.8479561076338746	7.70437921835261e-06	0.5957756815382598	7.70437921835261e-06	0.6019015723123788	0.0011052093299461	0.6134842352434547	0.0011052093299461	0.619566496736261	OTOL1	562554	SPTSSB	686483	B3GALNT1	953952	False	False	False	alt	10	0.003479	15	0.02597
2828	chr3	162061881	A	G	rs35626895	0.145130508	0.0489036345176489	0.145130508	0.0495415312650216	0.0248362316421208	0.3330560478784325	0.0036060308777512	0.084387439643705	0.0036060308777512	0.0854747296706512	0.0112822077793539	0.7119780001746602	0.0017481840706709	0.3964246389535816	0.0017481840706709	0.4014683705385808	0.0002728614918139	0.6693607480901917	4.242633591400114e-05	0.3713326933590447	4.242633591400114e-05	0.3763051957528031	0.005041898980568	0.3355740517466594	0.005041898980568	0.3403570687862463	OTOL1	565072	SPTSSB	689001	B3GALNT1	956470	False	False	False	alt	-60	0.05103	95	0.0819
2829	chr3	162062409	C	T	rs871932	0.011116755932	0.7345798256782734	0.011116755932	0.741643763650123	0.0317152355305603	0.1987021399745497	0.0003606821848298	0.5938648958306069	0.0003606821848298	0.6003033889175271	0.008730328923493	0.7465713946574258	8.911108827685868e-05	0.803548002537343	8.911108827685868e-05	0.8104190134796254	0.0002828181249184	0.661969140394295	2.9941501120071747e-06	0.7412432030421433	2.9941501120071747e-06	0.7479024084054988	0.0003398106298043	0.8000058130933791	0.0003398106298043	0.8061487037284859	OTOL1	565600	SPTSSB	689529	B3GALNT1	956998	False	False	False	alt	80	0.02026	75	0.06
2830	chr3	162063361	C	T	rs6804840	-0.0799809869999999	0.1620243852736851	0.0799809869999999	0.1598775999378215	0.0208917157752042	0.453850280860357	-0.0017091091354754	0.2181877794394743	0.0017091091354754	0.2154915675709744	0.0090701395532974	0.7394413570304755	-0.0006482399916613	0.5465772733777663	0.0006482399916613	0.5409673933011877	0.0001914587878778	0.7214669461409737	-1.3975765546976523e-05	0.5334992248898583	1.3975765546976523e-05	0.5277099043749002	-0.0021394873148361	0.5090792810362971	0.0021394873148361	0.503461090815679	OTOL1	566552	SPTSSB	690481	B3GALNT1	957950	False	False	False	ref	-95	0.1267	-75	0.08905
2831	chr3	162065913	A	G	rs35797074	0.0100481724	0.5663175035853251	0.024157678	0.5661740370271153	0.015700813535445	0.6459686039545128	0.0002836054343498	0.59798692354442	0.000447193445375	0.598143026704147	0.0029535482168189	0.8887448466238629	5.031550226371311e-05	0.8447745162361305	8.989042259896284e-05	0.8434773504287906	4.985378446645441e-05	0.8950383281824869	1.2734725256548009e-06	0.8428668913143172	1.7300979192825473e-06	0.8417309605150587	0.0001723796641483	0.8339651328031967	0.0003191910527531	0.8326541239073583	OTOL1	569104	SPTSSB	693033	B3GALNT1	960502	False	False	False	alt	70	0.010254	-65	0.071
2832	chr3	162072290	A	T	rs12638648	0.0046509952	0.5906571598765011	0.0210017204	0.5917148860316278	0.0242448734962423	0.3510586429295952	8.845746549776002e-05	0.5116090621944656	0.0005355068860013	0.5122266704162857	0.1221693444624063	0.2645303654118042	0.0006933867669599	0.3442890085331015	0.0024500655221165	0.3450675141383124	0.0028886971817701	0.2479944125134482	1.2881153770018946e-05	0.3259785372675314	6.090868317499952e-05	0.3264898550452226	0.0012099567813665	0.3533717543486603	0.0046987892184355	0.3540098355000385	OTOL1	575481	SPTSSB	699410	B3GALNT1	966879	False	False	False	alt	95	0.00908	-30	0.1002
2833	chr3	162077857	C	A	rs6789240	0.0033117611799999	0.8196489285314345	0.0081520509	0.8212893660107181	0.0124063191776932	0.8099547665337803	4.18238945593406e-05	0.8534879595220891	0.0001020549544975	0.8551225812277792	0.0070436475207019	0.7756451886251561	2.9859122749310817e-05	0.8606710497111341	5.030218039930864e-05	0.8625539441237242	8.655283862904404e-05	0.8250654511363764	3.639370804577321e-07	0.8826378585313888	6.170254210979277e-07	0.8845428501643611	0.0001220678961432	0.8590868750613931	0.0001897001088713	0.8610116783625055	OTOL1	581048	SPTSSB	704977	B3GALNT1	972446	False	False	False	alt	80	0.01634	-60	0.02986
2834	chr3	162106620	G	A	rs13088846	0.004707491684	0.8182809326041518	0.008353801356	0.8199691779855737	0.0152588843942373	0.682530074366406	8.246487198697509e-05	0.8238987015488579	0.0001356537997943	0.8259144995890592	0.0019827785292467	0.919221290028914	1.394294039672833e-05	0.940248481482332	1.897567485124052e-05	0.9417002928639916	3.0086884123166584e-05	0.9277063593962496	2.392336796064228e-07	0.9407809771698308	3.125179569432512e-07	0.94221354281004	4.701263567680466e-05	0.9312931203465014	7.83543927946827e-05	0.9326291374835792	OTOL1	609811	SPTSSB	733740	B3GALNT1	1001209	False	False	False	alt	-65	0.01073	30	0.0343
2835	chr3	177012411	G	A	rs6792256	-0.0457802447999999	0.337651742712129	0.0457802447999999	0.3332859914110702	0.0184727542492607	0.5304996105051238	-0.0008713618472129	0.3901846942298025	0.0008713618472129	0.3853056616075944	0.0076894526739466	0.7669046277195068	-0.000366614612044	0.6537423179947155	0.000366614612044	0.6476463709078719	0.0001328404646531	0.7705966593262378	-6.624478239383647e-06	0.6558785817826568	6.624478239383647e-06	0.6497997720694121	-0.001219854178351	0.6295900906034029	0.001219854178351	0.6236344335842597	TBL1XR1	215589	KCNMB2	1260522	ENSG00000275163	1406713	False	False	False	ref	60	0.03073	50	0.0702
2836	chr3	177020270	T	G	rs7612699	0.0901297089999999	0.1213402616045514	0.0901297089999999	0.1231763593691159	0.0742014138775066	0.0146192715358925	0.0068162582851785	0.0365204856213899	0.0068162582851785	0.0367151576469758	0.0248366929497541	0.5686716764900669	0.0023464036934913	0.3433336746818236	0.0023464036934913	0.3480786156951528	0.0018904957293118	0.3277034355114697	0.0001811840239771	0.1859006216688482	0.0001811840239771	0.1890559292858947	0.0066782686153541	0.275476479092227	0.0066782686153541	0.2798668921678425	TBL1XR1	207730	KCNMB2	1252663	ENSG00000275163	1398854	False	True	False	alt	-25	0.003418	5	0.001709
2837	chr3	177021010	T	C	rs6983	-0.111253572	0.0874817428952177	0.111253572	0.0861931882312453	0.0274937677550673	0.2771064033366111	-0.0030818507124255	0.110201247397513	0.0030818507124255	0.1087766002733201	0.0541585562996931	0.4276653039227681	-0.0062445987567547	0.2205046209138353	0.0062445987567547	0.2169601712222102	0.0015385966118729	0.3703254518234116	-0.0001792385155235	0.202178996351363	0.0001792385155235	0.1989615672243351	-0.0141425555079013	0.1506710193550114	0.0141425555079013	0.1479906011482189	TBL1XR1	206990	KCNMB2	1251923	ENSG00000275163	1398114	False	False	False	ref	-95	0.0293	-95	0.211
2838	chr3	177049320	G	A	rs9825834	-0.191451056	0.0271464585805044	0.191451056	0.0269372887454979	0.0491038012092555	0.0591056690421297	-0.0093939795152426	0.0220742865818449	0.0093939795152426	0.0220324692888726	0.0211053742865626	0.594256868937022	-0.0040913998316697	0.2671880552336828	0.0040913998316697	0.2629956384882351	0.0010302468048181	0.4293406948006106	-0.0001995697441506	0.1742952333584406	0.0001995697441506	0.171367924572295	-0.0104953647190788	0.1964067345253405	0.0104953647190788	0.1929306003836386	TBL1XR1	178680	KCNMB2	1223613	ENSG00000275163	1369804	False	False	False	ref	60	0.0178	-15	0.0371
2839	chr3	177051099	G	A	rs28649009	0.0111305846	0.7495339594374333	0.0111305846	0.7563871769044718	0.0132842619009356	0.7667696415196092	0.000148666954488	0.7829950247622527	0.000148666954488	0.789905636320431	0.5130093035531654	0.0416855928488088	0.0058078539121628	0.2236103630817143	0.0058078539121628	0.2274261986071283	0.0067885924914404	0.1181654594481552	7.724546431675045e-05	0.2908266863697849	7.724546431675045e-05	0.2953635657303739	0.0033840849856487	0.4199138392173143	0.0033840849856487	0.425278285879597	TBL1XR1	176901	KCNMB2	1221834	ENSG00000275163	1368025	False	False	False	alt	-50	0.2	-50	0.5293
2840	chr3	177076829	C	A	rs9838212	-0.0551580619999999	0.2650653640007094	0.0551580619999999	0.2616922662205516	0.0242383100817056	0.3487167667490226	-0.001408119375038	0.2637060710492237	0.001408119375038	0.2602549392257428	0.0120880208505162	0.7375096132808541	-0.000998493751097	0.5796359608923644	0.000998493751097	0.5732237934270161	0.0003134761049748	0.696241339828084	-2.7045244497997792e-05	0.545434700996668	2.7045244497997792e-05	0.5393144138373808	-0.00323974794629	0.5153512232478332	0.00323974794629	0.509063526595709	TBL1XR1	151171	KCNMB2	1196104	ENSG00000275163	1342295	False	False	False	ref	100	0.0695	100	0.0871
2841	chr3	177130159	G	A	rs9854353	-0.0102559394	0.6232476091338431	0.0183543346	0.6200602007977953	0.059373427676125	0.0328624897260764	-0.000454547013763	0.3072351670324513	0.0010576294542601	0.3049324680763615	0.0026178615024248	0.8941013614633079	-2.8251912527481707e-05	0.858422837709404	5.036079049972449e-05	0.8544590494825204	0.0001511377525776	0.7534287374353646	-1.2292724814197716e-06	0.7349455906383165	2.8757068435700635e-06	0.7314260978112143	-0.000101448319092	0.850125979192823	0.0002070205535943	0.8462641944090038	TBL1XR1	97841	KCNMB2	1142774	ENSG00000275163	1288965	False	False	False	ref	-95	0.04297	-75	0.0878
2842	chr3	180864866	G	A	rs3866226	-0.0363881938	0.4144200418475329	0.0363881938	0.4093225602168622	0.0148170283255132	0.693621699325885	-0.0005521142456669	0.5049961162460338	0.0005521142456669	0.4991902972213332	0.0012751146448483	0.9538334075005814	-5.45459926672229e-05	0.8740824461935179	5.45459926672229e-05	0.8672432532978629	1.873821744190506e-05	0.9594813541045344	-8.094425225805406e-07	0.8828548217919845	8.094425225805406e-07	0.8760383425188094	-0.0002061957705123	0.8653945789348424	0.0002061957705123	0.8585788980886109	FXR1	3276	DNAJC19	124908	CCDC39	179924	False	False	False	ref	-100	0.01248	55	0.02972
2843	chr3	180871053	G	T	rs875250	-0.302145456	0.0088271992737819	0.302145456	0.0087971205594909	0.0689185366863981	0.0197631917610867	-0.022315257772052	0.0065964834533392	0.022315257772052	0.0065326098661864	0.2137425357131074	0.1701107173880001	-0.0676971873836231	0.0215695576005985	0.0676971873836231	0.0212582440529253	0.0140312863369629	0.0479243092437857	-0.0047903693040461	0.0114217093858955	0.0047903693040461	0.0113755438535247	-0.0777935402989013	0.0087215732381808	0.0777935402989013	0.008670334622623	FXR1	2911	DNAJC19	118721	CCDC39	186111	False	True	True	ref	70	0.02075	-75	0.05804
2844	chr3	180889457	T	C	rs62291400	-0.0273871899999999	0.1063842242981091	0.101645538	0.1060214777006667	0.0366335405045263	0.1385398917301717	-0.0007476621503415	0.0873490285941075	0.0037276044707543	0.0871138412626883	0.3164412259575732	0.1035048120612258	-0.0081110953215233	0.0548386836738735	0.0334746652023051	0.0547165304244944	0.012166090465897	0.0631991963835706	-0.0001848068277929	0.0483850639188323	0.0012672890101727	0.0481933390232251	-0.0120286364686087	0.0551502235737897	0.030909570782884	0.0549546435515173	FXR1	21315	DNAJC19	100317	CCDC39	204515	False	False	False	ref	-100	0.1018	-95	0.1641
2845	chr3	180891133	A	T	rs62291403	0.131077322	0.0718703462352244	0.131077322	0.0727787682327346	0.0192297884352869	0.5072443934462149	0.0028322223692953	0.1417180330380882	0.0028322223692953	0.1436879607372016	0.0044818712678565	0.8509773778081524	0.00081033091919	0.5645369046331146	0.00081033091919	0.5704095795513834	0.0001031018334383	0.8321638164555172	1.9628228250480788e-05	0.55383657799483	1.9628228250480788e-05	0.5597234775360088	0.002203820395236	0.5398796238834638	0.002203820395236	0.545711700469912	FXR1	22991	DNAJC19	98641	CCDC39	206191	False	False	False	alt	100	0.0973	65	0.1755
2846	chr3	180895330	T	C	rs13098541	0.0379613076	0.3795281886767614	0.0379613076	0.3845249197930679	0.0156075562407758	0.6549292214339977	0.0006024972464968	0.4635085131681065	0.0006024972464968	0.4691788251630471	0.0811314374319553	0.3423988753417242	0.0030750970184041	0.3066261696286592	0.0030750970184041	0.3112971052768736	0.0013139390382542	0.3935430841426905	5.077112703901392e-05	0.3501069352485911	5.077112703901392e-05	0.35520821638909	0.0069199300583946	0.273537169290783	0.0069199300583946	0.278049847030256	FXR1	27188	DNAJC19	94444	CCDC39	210388	False	False	False	alt	-100	0.1268	100	0.098
2847	chr3	180898828	G	A	rs35709455	-0.153557006	0.0446636873120006	0.153557006	0.0441859993180606	0.0321234955244173	0.1925792024062798	-0.0050420547874913	0.057609040633237	0.0050420547874913	0.0570264558667717	0.307828016231731	0.1064045715239979	-0.0464832097294219	0.0314682413752195	0.0464832097294219	0.0309535406587488	0.0105208999386911	0.0743493426662062	-0.0016137079489103	0.0344706222019655	0.0016137079489103	0.0340163757644836	-0.0482770281415987	0.0224905299669193	0.0482770281415987	0.022200168111953	FXR1	30686	DNAJC19	90946	CCDC39	213886	False	False	False	ref	65	0.03424	45	0.2048
2848	chr3	180902050	T	C	rs7635754	0.01544125042	0.3044072208600122	0.04861281042	0.3063296569561503	0.0651381523188758	0.0232956135363496	0.0007993197576347	0.138430965897915	0.0030659390196958	0.1393683011775141	0.0089068325030516	0.7513250679252313	0.0001450154398831	0.6749056898852698	0.0003119074298357	0.6782134024999806	0.0005811830104104	0.5517798634041645	7.769922839426556e-06	0.5106731275554183	1.917368508627817e-05	0.5133961246095758	0.0004033189271221	0.6488784590980184	0.0011159315100128	0.651938826802916	FXR1	33908	DNAJC19	87724	CCDC39	217108	False	False	False	alt	-35	0.01318	-35	0.1438
2849	chr3	180909664	C	A	rs4854998	0.089411209	0.1307221644474106	0.089411209	0.1323196531825994	0.047817896431701	0.0641244674985016	0.0043625943024193	0.0757267347214916	0.0043625943024193	0.0765116825335179	0.3226633895285539	0.099266006506924	0.0294032716262189	0.0584450546631033	0.0294032716262189	0.0594345850317761	0.015465751543362	0.0375811146788329	0.0014356143145958	0.0388803032455693	0.0014356143145958	0.0394896563415161	0.0305120253373362	0.0553013894969406	0.0305120253373362	0.0561634228987923	FXR1	41522	DNAJC19	80110	CCDC39	224722	True	False	False	alt	20	0.03613	20	0.1963
2850	chr3	180937019	A	G	rs10490806	0.0037847204	0.5839261220943589	0.0220876107999999	0.582555823519583	0.0307170633065699	0.2134027433043202	6.623676589737999e-05	0.4524006500512972	0.0006764942975364	0.4512322108839232	0.0171224967833459	0.6477827305768875	-2.506180893713088e-06	0.6556546103103286	0.0003389349583024	0.6539734330236414	0.00049883412943	0.5702261771341833	-3.7246239484681467e-07	0.5878312444795902	1.0009976542885546e-05	0.5862519768386687	-8.577744053313999e-05	0.6341730387165401	0.0011052093299461	0.6325247077121869	DNAJC19	52755	FXR1	68877	CCDC39	252077	False	False	False	alt	-90	0.01282	35	0.03802
2851	chr3	180944499	A	T	rs13083851	-0.0035198411368	0.8880451942885181	0.0049104406632	0.8861645242423603	0.0192125108912784	0.5107237178875979	-8.053947466458277e-05	0.8568079534288813	9.975581798283318e-05	0.8546522439793034	0.0005484807495627	0.9874890587809246	-3.794677620617168e-06	0.9852793101672168	4.218091331047228e-06	0.9841753397828982	1.177937551022767e-05	0.980406128139194	-9.136525931153717e-08	0.9800072416161392	9.720803939189464e-08	0.978404508542938	-8.247830820494224e-06	0.99234999513585	8.247830820494224e-06	0.99052294280248	DNAJC19	45275	FXR1	76357	CCDC39	259557	False	False	False	ref	100	0.138	-100	0.1301
2852	chr3	180946374	A	G	rs12186104	-0.0030207520199999	0.808489135664618	0.00868003402	0.8046257058999754	0.0139553409147743	0.7355357975616149	-1.638291323465102e-05	0.8193239643513103	0.0001333688915324	0.8156484982632473	0.010932499752565	0.7219844580386426	-3.568216543796793e-05	0.8159712987564129	9.342136597444792e-05	0.8120374435768479	0.0001574667180541	0.7649533824317379	-2.567558775618001e-07	0.8320811248065514	1.4503131270286216e-06	0.8282519108650922	-0.0001468113886047	0.8016140691063551	0.000353007159117	0.7978255584443418	DNAJC19	43400	FXR1	78232	CCDC39	261432	False	False	False	ref	-5	0.00693	-70	0.03387
2853	chr3	180993216	T	C	rs6777005	0.0398177416	0.268170035741111	0.0520872356	0.2706129826541926	0.0185471616584978	0.5345803960847354	0.0008090040001445	0.322513148149439	0.0010252179976056	0.3253647765747761	0.0262272772260894	0.5691631709693167	0.0015248035805853	0.4236360561752743	0.0016590410167313	0.4276897096186108	0.0005169836836871	0.5738051964441985	3.226071221362619e-05	0.4324486332667788	3.462625498384281e-05	0.4366263082053655	0.0045346573851076	0.3589988869676212	0.0049503480584605	0.3628835262076219	DNAJC19	3442	FXR1	125074	CCDC39	308274	False	False	False	alt	15	0.002106	-100	0.22
2854	chr3	180994099	A	G	rs62291437	0.03459335542	0.4595199427755625	0.03459335542	0.4636631869066289	0.0190968212522359	0.5199682965493836	0.0008162251061689	0.4886151136807576	0.0008162251061689	0.4931667031661451	0.0007348817261059	0.980057873736278	2.7274739483205725e-05	0.9252430708769191	2.7274739483205725e-05	0.9322374681218496	1.41442251848575e-05	0.9732834589811724	6.553582222761358e-07	0.9125376527333308	6.553582222761358e-07	0.9193928119129516	0.0001022731021741	0.9165009380835404	0.0001022731021741	0.9235174335520152	DNAJC19	4325	FXR1	125957	CCDC39	309157	False	False	False	alt	100	0.013504	-45	0.04828
2855	chr3	181010627	G	C	rs11705702	0.157743554	0.0410486615374661	0.157743554	0.04156227164806	0.0335163473550891	0.1719465762148989	0.0053109526657207	0.0504576301603427	0.0053109526657207	0.0508781786332004	0.0177930454290521	0.6388469617720087	0.0026262665942287	0.3296310450040516	0.0026262665942287	0.3344030010604547	0.0005965699810225	0.5428666089884379	8.843715765418534e-05	0.2693386832888254	8.843715765418534e-05	0.2736167935457418	0.0072663389528553	0.2634665460281361	0.0072663389528553	0.2678394751882427	DNAJC19	20853	FXR1	142485	CCDC39	325685	False	False	False	alt	10	0.00342	50	0.014404
2856	chr3	181011360	A	T	rs71312200	-0.00160662956	0.8996018421473783	0.0045907794799999	0.897995696673575	0.010190560028444	0.901954025419776	-1.6677063071021404e-05	0.9303738919500382	4.681944162642934e-05	0.9288633074674209	0.0178153145722674	0.6392560576908507	-2.8356699313287244e-05	0.8170451101211762	8.996356355653863e-05	0.8156718470128926	0.0001826953668013	0.7355732596158321	-3.230685108164933e-07	0.8625867061812623	9.275140206963002e-07	0.8611437342860802	-8.33030912869684e-05	0.8210845377706992	0.0002911484279634	0.8198290959173805	DNAJC19	21586	FXR1	143218	CCDC39	326418	False	False	False	ref	80	0.004745	-75	0.1029
2857	chr3	181019853	T	G	rs34293605	-0.01770332672	0.5633063377287736	0.0229222379199999	0.5593947900899945	0.0159420681986628	0.6447221433927978	-0.0002410308345184	0.6156524030385189	0.0003428265615882	0.6119026850351216	0.0527176602553527	0.4344926671077683	-0.0006326013275352	0.4762472045657656	0.0010481117819352	0.4735231553405544	0.0008654702487198	0.4750400061438761	-8.275712862681458e-06	0.5072269357594155	1.6380313118405426e-05	0.5043245522985778	-0.0017848305895549	0.4615546669989476	0.0027943650819834	0.4585206534269196	DNAJC19	30079	FXR1	151711	CCDC39	334911	False	False	False	ref	-15	0.00538	-50	0.0658
2858	chr3	181033387	C	T	rs62289571	-0.0387044198	0.3785660033922466	0.0406620418	0.375074222434393	0.0261560722177649	0.300717162137846	-0.0010092920362847	0.3375471172971677	0.0010594116894447	0.3345901602927806	0.021295899178516	0.6291832697363053	-0.0008141149641037	0.5620157423624429	0.0008789416958718	0.5584668586940329	0.0005436758268893	0.5769239246090172	-2.064097540002607e-05	0.5198644705047121	2.230068975651153e-05	0.5164792567382029	-0.0021667051565438	0.5289180194842683	0.0023794991917125	0.5252506182634615	DNAJC19	43613	FXR1	165245	CCDC39	348445	False	False	False	ref	-100	0.01828	35	0.05212
2859	chr3	181035595	G	C	rs13060352	-0.0484258952	0.2954253338533632	0.0524822287999999	0.2930004473456828	0.0253283387649989	0.3252290876507009	-0.0014704691443534	0.2720786708022298	0.0015321826468414	0.2700212252436002	0.0454298769423641	0.4695935037477147	-0.0021234329885509	0.3846052153710831	0.0024240681959168	0.3818309934394556	0.0011213760215151	0.4340641808109314	-6.706233544770351e-05	0.3545173584679429	7.163623216306232e-05	0.3516690480766065	-0.0050550955098808	0.3349181062118935	0.0058171950776945	0.3320037192884374	DNAJC19	45821	FXR1	167453	CCDC39	350653	False	False	False	ref	100	0.03134	100	0.2091
2860	chr3	181050532	T	G	rs1001416	0.0054469598	0.7478057864353931	0.0113528786	0.7498119261709844	0.0123159614462391	0.8158725411722164	8.20663106526983e-05	0.7936238451663066	0.0001451268736396	0.795356662590387	0.1587979611362211	0.2256290585434346	0.0002016789149146	0.4163609644996721	0.001595371006478	0.4177770185216602	0.0018137817045052	0.3368126033153636	3.877358434911536e-06	0.4896084206129334	1.875961574500984e-05	0.4911323529181592	0.0009468509781927	0.4718894982612356	0.0026376562963939	0.4736749696645425	DNAJC19	60758	FXR1	182390	CCDC39	365590	False	False	False	alt	-90	0.02684	80	0.1239
2861	chr3	181068820	A	T	rs6775889	0.02343583512	0.4858861949182135	0.02895439608	0.4885138162345683	0.0109208051988419	0.8577574068417921	0.0003007275178288	0.623971259838944	0.0003452006141077	0.6267495435677616	0.0176487083896934	0.640017877854399	0.00058848442202	0.5930836489556564	0.0006446167017164	0.5949711073991379	0.0002040044410183	0.7256700300236081	7.2713026098407935e-06	0.6587697702822093	7.724555227366565e-06	0.6607583227899473	0.0017600870970934	0.5600553646195262	0.0019679324337698	0.5622640605090606	DNAJC19	79046	FXR1	200678	CCDC39	383878	False	False	False	alt	10	0.002125	85	0.10547
2862	chr3	181080133	T	G	rs12635178	-0.0067265432799999	0.7695049953466157	0.01012110808	0.7648477801614105	0.0139407000982258	0.7370019245727525	-0.0001008307420916	0.7885154036867261	0.0001466065218818	0.7839147346887122	0.0078667810365873	0.7615638938256668	-5.989549425139392e-05	0.8160684404451496	8.027789098834313e-05	0.8116955516658623	0.0001070480335859	0.7993831734784284	-8.519364581241865e-07	0.8339006121110795	1.1267935041409665e-06	0.8294538376085357	-0.0002532084061891	0.804755424660242	0.0003307380159017	0.8004205821245928	DNAJC19	90359	FXR1	211991	CCDC39	395191	False	False	False	ref	-100	0.02243	95	0.0811
2863	chr3	181092123	T	G	rs1968217	-0.0146430699799999	0.6912859020913881	0.0146430699799999	0.6845220670764954	0.0239583016744699	0.3578799926901523	-0.0003372638423908	0.6194505673614744	0.0003372638423908	0.6130742199319796	0.0047779683943122	0.8380725718495251	-8.187200426674881e-05	0.8388252470431895	8.187200426674881e-05	0.8320659397214827	0.0001134823981482	0.8027009271559514	-1.8523627461207928e-06	0.8102624629517245	1.8523627461207928e-06	0.8036303683334222	-0.0003117680050146	0.8276855471577533	0.0003117680050146	0.8210347479014398	DNAJC19	102349	FXR1	223981	CCDC39	407181	False	False	False	ref	55	0.00801	-65	0.002136
2864	chr3	181114189	G	A	rs2543163	0.0895080714	0.1431534770776191	0.0895080714	0.1452271770987394	0.047006100542789	0.0676682696297916	0.0043205277536805	0.0828714827271496	0.0043205277536805	0.0837735073923625	0.1590668404209692	0.2160740858563329	0.0144139160822997	0.1207252155973441	0.0144139160822997	0.1231219311292847	0.0074834527452364	0.1068606160104915	0.000695524651437	0.0781619636249423	0.000695524651437	0.0795469862492609	0.0230642341064299	0.0864941094409168	0.0230642341064299	0.0881478487229885	DNAJC19	124415	FXR1	246047	CCDC39	429247	False	False	False	alt	5	0.006226	-35	0.01318
2865	chr3	181119890	G	A	rs34718862	-0.0792458366	0.1661862749348826	0.0792458366	0.1637024901112989	0.0288889597621004	0.2447271761179917	-0.002331276840211	0.1572533879006507	0.002331276840211	0.1551062325787486	9.897396984592364e-05	0.9997511842270408	-8.605245926905117e-06	0.9722080122940296	8.605245926905117e-06	0.9659470603627832	2.8082520498530446e-06	0.9983083178580526	-2.516820206348194e-07	0.9512484520075856	2.516820206348194e-07	0.9441646958555576	-1.9794793969186103e-05	0.982060751587336	1.9794793969186103e-05	0.9765282358941972	DNAJC19	130116	FXR1	251748	CCDC39	434948	False	False	False	ref	-30	0.05005	-100	0.1459
2866	chr3	181122700	C	T	rs4456860	0.0266290486	0.4956598487122132	0.0266290486	0.5014829655275819	0.0326299320836094	0.1847049094790853	0.0008635772681219	0.3493614919438415	0.0008635772681219	0.3540777086456813	0.0001773283626405	0.9984898716249532	4.63889870506388e-06	0.969805053290528	4.63889870506388e-06	0.9769432963483116	5.811518319367208e-06	0.9930209919096497	1.5111656457316948e-07	0.948357318764144	1.5111656457316948e-07	0.955364756386371	1.649566164098842e-05	0.9710245508565056	1.649566164098842e-05	0.9773039672083236	DNAJC19	132926	FXR1	254558	CCDC39	437758	False	False	False	alt	45	0.02007	15	0.02411
2867	chr3	181127869	T	A	rs13075474	-0.00841914	0.580372345486381	0.0218144612	0.5788547931787826	0.0129830400570649	0.7783091975769877	-0.0001796019988529	0.6674792392992581	0.0003076856307313	0.6654675603747611	0.0021790769027745	0.9164424359889836	-1.669711688633878e-05	0.8711627419104242	4.74787458392631e-05	0.8697288910745538	2.824386237587437e-05	0.9369916927880868	-3.697406709400962e-07	0.8888302452799578	6.706642945152323e-07	0.8872682417246399	-4.371350334861441e-05	0.8695482291816214	0.0001789779288046	0.8681917198147352	DNAJC19	138095	FXR1	259727	CCDC39	442927	False	False	False	ref	-70	0.00841	-70	0.1663
2868	chr3	181132050	G	A	rs13077643	-0.0210820524	0.5379102396067877	0.024264776	0.5334729419398135	0.0150138312739409	0.6833990058925784	-0.0003474927593381	0.5891034446740193	0.0003792683206964	0.5848221908099143	0.0204084325822308	0.6179189294105261	-0.0005738139850442	0.6006675516017046	0.0006064171892618	0.5966551343870465	0.0003168932773139	0.6580763583228446	-9.218207993390823e-06	0.6280584102473947	9.543710675643447e-06	0.6238649817538497	-0.0016908053182012	0.5716973807586718	0.0018029758173599	0.5675417143402053	DNAJC19	142276	FXR1	263908	CCDC39	447108	False	False	False	ref	-80	0.04147	100	0.11664
2869	chr3	181155199	C	A	rs13071279	-0.0108478166	0.7474432659430384	0.0117000146	0.7428752159524548	0.0140342555667651	0.7355477658545565	-0.000142692024748	0.7816075354169107	0.0001567230973908	0.777078240822551	0.0025403318927121	0.8997830222102247	-2.614521194745117e-05	0.9053773842519938	2.887589478835032e-05	0.9011574835039806	3.6008385423515245e-05	0.917099629691756	-3.428390376457732e-07	0.9156956316502686	3.877985549967525e-07	0.9114631859166644	-9.56748375177238e-05	0.9068330201225626	0.0001072218006664	0.902526860625264	DNAJC19	165425	FXR1	287057	CCDC39	470257	False	False	False	ref	65	0.014206	70	0.0867
2870	chr3	181278250	T	G	rs13092432	0.0350177806	0.3816784081280848	0.0374047042	0.3853695682329409	0.030013980569751	0.2235039361998609	0.001105096124329	0.3005260318703238	0.0011704396179989	0.3034129184531997	0.0314052654151957	0.5498988554031059	0.0014205147924685	0.4678423805516977	0.0014403592308132	0.4721342880195961	0.0009944632307475	0.468833813877308	4.674370732473541e-05	0.4072829397855627	4.728696094239292e-05	0.4113832507955192	0.0039053478935039	0.4155021657725524	0.0039993731648575	0.4196560785879337	DNAJC19	288476	FXR1	410108	SOX2	433676	False	False	False	alt	10	0.01354	5	0.0083
2871	chr3	181305364	A	G	rs12633623	0.049216911	0.1465627251115364	0.083796963	0.1477880488964391	0.0444309177540709	0.0810780976766498	0.0018279977562527	0.0876362105837308	0.0037537379475493	0.0883784634781626	0.171028669459932	0.2027882105202461	0.0111410652029117	0.1148006923571584	0.0147722216374698	0.1160429019449222	0.0073923061648899	0.1074987183168391	0.0004425167129945	0.0783167187440995	0.0006447334102785	0.0790899851971717	0.0155323150011546	0.0811513929409791	0.0233809508099369	0.0820486333368742	DNAJC19	315590	SOX2	406562	FXR1	437222	False	False	False	alt	95	0.0332	-30	0.1687
2872	chr3	181353043	A	G	rs74284696	-0.0105378689199999	0.7376524810701873	0.0123807098799999	0.7331619881165247	0.0226267900998392	0.3919100419595619	-0.0002534673156547	0.6589273271727283	0.0002869221053441	0.6542432853615422	0.0130208505163141	0.7054909938163775	-0.000147936462077	0.7552868039327415	0.000169702060675	0.7510977673341369	0.000319176215339	0.6711404853949549	-3.871509099797165e-06	0.7223461522506409	4.266640065744046e-06	0.7179395207585647	-0.0005229124740193	0.7451897698051151	0.0006037412160601	0.7410884099007283	SOX2	358883	DNAJC19	363269	FXR1	484901	False	False	False	ref	-100	0.04892	90	0.2913
2873	chr3	181363793	G	A	rs141717445	-0.0936668748	0.1214901968134841	0.0936668748	0.1198831512862699	0.0279500903438404	0.2615217598527227	-0.0028126547058433	0.1293569295062815	0.0028126547058433	0.1278455006059904	0.001854112368447	0.9257247908505596	-0.0001731071010109	0.7300699246038814	0.0001731071010109	0.7236010212829234	5.2938800134866485e-05	0.8807550524305294	-5.264499074068063e-06	0.6704187784493305	5.264499074068063e-06	0.6640614192528571	-0.0006070403483883	0.7260716406982719	0.0006070403483883	0.719532928617032	SOX2	348133	DNAJC19	374019	FXR1	495651	False	False	False	ref	25	0.0058	15	0.04858
2874	chr3	181380929	C	T	rs13081180	-0.0676242014	0.175892030244928	0.0738932586	0.1739535112184106	0.0242370311379801	0.3471682642060769	-0.0018644750132966	0.194776150845151	0.0019557722604848	0.1929417009792537	0.2238329319389	0.156789397155222	-0.0130549583457511	0.1141173968705372	0.0152336475159951	0.1125602026384738	0.0050242279814798	0.160157605757603	-0.000355112306159	0.123158946908304	0.0003868408932026	0.1214504362972713	-0.0202624459767081	0.0909554113705482	0.0222666688660881	0.0898503126136116	SOX2	330997	DNAJC19	391155	FXR1	512787	False	False	False	ref	100	0.0277	40	0.1249
2875	chr3	181397839	C	A	rs10937056	0.1129702592	0.0840565569763511	0.1129702592	0.0851797314007187	0.0246841692974325	0.3382591869449748	0.0028829407948081	0.1174120821477969	0.0028829407948081	0.1190327452447947	0.116038731813533	0.2746431133918002	0.013204703432147	0.1201667677909559	0.013204703432147	0.122618911934633	0.0028061146761148	0.2536556451200885	0.0003313473342068	0.1256602324548044	0.0003313473342068	0.1277692814556334	0.0241479990762428	0.0730149098996559	0.0241479990762428	0.0743032613754658	SOX2	314087	DNAJC19	408065	FXR1	529697	False	False	False	alt	100	0.02475	100	0.289
2876	chr3	181409743	T	C	rs9816542	0.024735595	0.541800274731176	0.024735595	0.5474737538571828	0.0189536958413642	0.5235664181413562	0.0004984779963269	0.5452100635188327	0.0004984779963269	0.5508853824735342	0.0031275774471313	0.8869668662347305	7.537255839056952e-05	0.8385750726896036	7.537255839056952e-05	0.8452865811934137	6.340848716117288e-05	0.875737178505437	1.6247864279543504e-06	0.8240376216485115	1.6247864279543504e-06	0.8308021963944339	0.0002581571046814	0.8344002079214707	0.0002581571046814	0.8409266524905644	SOX2	302183	DNAJC19	419969	FXR1	541601	False	False	False	alt	45	0.002838	-95	0.0878
2877	chr3	181412853	T	A	rs6779538	-0.0304080113999999	0.4616525048602072	0.0323682385999999	0.4582798655377192	0.0147362917971006	0.699969350533274	-0.0004550275083405	0.5539271935883854	0.000477672585179	0.5502373023697331	0.0205527696215894	0.6121207797502303	-0.000860463803665	0.572075802250089	0.0008826700336623	0.5684529597678891	0.0003062893183865	0.6546862206630443	-1.2726309723575634e-05	0.6074822721466452	1.298284211311823e-05	0.6036370644808533	-0.002353930916169	0.5321840397200349	0.0024496057536867	0.5283040287550859	SOX2	299073	DNAJC19	423079	FXR1	544711	False	False	False	ref	50	0.01422	55	0.1443
2878	chr3	181419222	C	T	rs79339987	0.0007166264199999	0.8084316383175482	0.00891336422	0.8074060361648785	0.0119177472976599	0.830969366663974	2.5415432638899715e-05	0.8432654611720787	0.0001140760950021	0.8422017002863263	0.0339315759955131	0.5161884179021348	-2.959379105912e-05	0.6656720833886168	0.0002946584910286	0.6648350458539882	0.0003876466197496	0.6060819782480174	1.4860064357930637e-07	0.7179164935565503	3.5412386701376784e-06	0.716960763822197	-9.072613902539966e-06	0.6679094000320362	0.0008849922470389	0.6670854911769192	SOX2	292704	DNAJC19	429448	FXR1	551080	False	False	False	alt	-75	0.05173	-95	0.2017
2879	chr3	181432274	G	A	rs10937057	-0.082520691	0.1491561057195878	0.082520691	0.1470405210274409	0.0279450466399079	0.2620376658950277	-0.0023144731353918	0.1512169891506184	0.0023144731353918	0.1492782298441163	0.209063541288641	0.1754014540397784	-0.0185050473831761	0.1025076424784556	0.0185050473831761	0.1007364109014315	0.0055588221533353	0.153539216730852	-0.000495394020008	0.1041556052158537	0.000495394020008	0.1025511209818431	-0.0234254890963676	0.0826315968165198	0.0234254890963676	0.081360418955332	SOX2	279652	DNAJC19	442500	FXR1	564132	False	False	False	ref	-100	0.0724	-100	0.3677
2880	chr3	181468180	T	C	rs4854918	-0.01794015024	0.6504795160960295	0.01794015024	0.6442179010856406	0.0114233944567994	0.8560567153166077	-0.0002021746997253	0.7524873237593063	0.0002021746997253	0.7458538686087397	0.103638942958002	0.3139460911188667	-0.0017559267658159	0.4423921615574647	0.0017559267658159	0.4372754216624583	0.0012251183720751	0.4259289956992417	-2.0609667885351613e-05	0.5247933910519144	2.0609667885351613e-05	0.5190531320080651	-0.0033106792913463	0.4565104702441067	0.0033106792913463	0.4511797238525876	SOX2	243746	DNAJC19	478406	FXR1	600038	False	False	False	ref	-35	0.0187	100	0.2097
2881	chr3	181468571	C	T	rs11717567	0.097507526	0.1293177865866199	0.097507526	0.1312077824246151	0.024341698147812	0.345717527392155	0.0025199846112337	0.1617420813734772	0.0025199846112337	0.1639398187814213	0.1670664115337665	0.2165093046360572	0.0174280470266278	0.1176581280065484	0.0174280470266278	0.1197050846272045	0.0042546817997984	0.1985575857232269	0.0004582303343209	0.1258131902591572	0.0004582303343209	0.1279511443141335	0.0254816733199168	0.0836868494958951	0.0254816733199168	0.0852353465381794	SOX2	243355	DNAJC19	478797	FXR1	600429	False	False	False	alt	-50	0.01422	-50	0.1431
2882	chr3	181479104	C	A	rs11708101	0.00548756066	0.8254810129464353	0.00775399002	0.8292695373301872	0.016060650314635	0.6394509712152271	8.642854036241401e-05	0.8327814655229706	0.0001190339506838	0.836599567068995	0.0014590412721453	0.9495383127279212	1.3513274371449105e-05	0.9498930481574096	1.408341471342708e-05	0.9538920412866276	2.2262512834796986e-05	0.9538694844623028	1.9512692434934523e-07	0.9523678965211376	2.033291035483544e-07	0.9563780330350696	5.6085249579356696e-05	0.9431919051778932	5.773481574345553e-05	0.947151048557408	SOX2	232822	DNAJC19	489330	FXR1	610962	False	False	False	alt	-60	0.02672	-100	0.1404
2883	chr3	181484570	C	T	rs55844174	0.0280451602	0.4789993401102387	0.0280451602	0.4846543867092047	0.0269361915592667	0.2846827491293464	0.0007494467322006	0.390127967437199	0.0007494467322006	0.395206528293129	0.0186013328494605	0.6220632426337775	0.00052826622798	0.5704425050362514	0.00052826622798	0.5762254209781981	0.000510945512018	0.5624538774308483	1.4479529204670184e-05	0.5197655483491361	1.4479529204670184e-05	0.5254474506541713	0.0016924548843653	0.5438977399741233	0.0016924548843653	0.5497304146367252	SOX2	227356	DNAJC19	494796	FXR1	616428	False	False	False	alt	35	0.006935	70	0.04044
2884	chr3	181488779	A	G	rs16832517	-0.13047759	0.0695394127801942	0.13047759	0.0685902021944907	0.0224086710785722	0.4042464767346122	-0.0031623338016461	0.1193363735097469	0.0031623338016461	0.1179127159799077	0.0451032628418725	0.4732064905153469	-0.0066655647561626	0.2339976996506927	0.0066655647561626	0.2302622516218472	0.0011426471454708	0.4462347103586913	-0.000177397861756	0.2349243127525261	0.000177397861756	0.2313556598751493	-0.0143149351720497	0.1619897883639532	0.0143149351720497	0.159342565615588	SOX2	223147	DNAJC19	499005	FXR1	620637	False	False	False	ref	25	0.00351	55	0.04932
2885	chr3	181702392	T	G	rs75907840	-0.00765349592	0.618332509751668	0.01929826408	0.616282193578521	0.0175380576800052	0.5806722322353067	-0.0001043635452884	0.6203780484075048	0.0003410949130908	0.6188440073533064	0.8131684866880011	0.0066324312950452	-0.0059892004073896	0.1109899180308724	0.0156975617442154	0.1104587581905461	0.0142514206912006	0.0430103225834785	-7.997200237038961e-05	0.1486616363731185	0.0002774485252902	0.1480478174516686	-0.0012478968031407	0.4790276785783301	0.0025691993005839	0.4774422322685575	SOX2	9534	DNAJC19	712618	FXR1	834250	False	False	False	ref	-90	1.457	-100	0.3398
2886	chr3	181713783	C	A	rs11915160	-0.013459013	0.6058707333939111	0.0197916934	0.6017711770231386	0.0318098330916993	0.1970754652304615	-0.0004778325242412	0.4445418523174474	0.0006635815775708	0.4409454587333825	0.1967487050905612	0.1785880288257388	-0.0029946570337804	0.27801621857305	0.0037871300315829	0.2749216006508846	0.0061948111453351	0.1307804305122832	-0.0001022976017159	0.2313216529308639	0.0001255422778372	0.2287244614309735	-0.0043259872653491	0.3106829981040365	0.0057974002837253	0.3075078700189917	SOX2	1857	DNAJC19	724009	FXR1	845641	False	False	False	ref	100	0.010284	90	0.147
2887	chr3	185855290	C	A	rs12638738	-0.0121655872	0.5615222084590199	0.0233681219999999	0.5594541229160533	0.0670500220005834	0.0231517449432761	-0.0003442785140393	0.2568813140621057	0.0013701588325106	0.2561221560553917	0.0001806274949687	0.998458076216559	-2.1139315100986093e-07	0.985437785462898	3.224261666140104e-06	0.9842825606093044	1.2891002436011083e-05	0.9746402749885524	5.0160371777856696e-08	0.9463552936053808	2.203381118256161e-07	0.9453986259410694	8.247830820494085e-07	0.9836553202594316	1.0722180066642474e-05	0.984346590244304	IGF2BP2	30248	TRA2B	82813	ETV5	255028	False	False	False	ref	-100	0.01685	40	0.0925
2888	chr3	185955755	T	C	rs57491362	0.43537866	0.003288156939009	0.43537866	0.0032632021277637	0.0437924785928427	0.0900410053655018	0.0204453396135154	0.0084446296288013	0.0204453396135154	0.0084976753368659	0.2106677443832272	0.1840223337305364	0.1056159102537637	0.0130667364327758	0.1056159102537637	0.0131762560221556	0.0097824751307344	0.093650379895252	0.0048625734254704	0.0144419944056947	0.0048625734254704	0.0146247419127878	0.1095320180792451	0.0050461795391703	0.1095320180792451	0.0050659644612042	TRA2B	17652	IGF2BP2	130713	ETV5	154563	False	True	True	alt	-100	0.1738	45	0.1349
2889	chr3	185955802	C	T	rs112543424	-0.0750561474	0.2003122143788341	0.0784386758	0.1988446164816466	0.0144720387604995	0.7010914319402848	-0.0013707009539922	0.3256141614235679	0.001405203451001	0.3230888955386216	0.0982275411566757	0.3434378525972494	-0.0094129533674844	0.226331652624263	0.00945658665811	0.2237528275401815	0.0016069010034073	0.4032597113875041	-0.0001714518322132	0.2818229708298239	0.0001718969008791	0.2788539391528037	-0.0161698723235788	0.1712649917350078	0.0163496750354656	0.1693337999563213	TRA2B	17699	IGF2BP2	130760	ETV5	154516	False	False	False	ref	-35	0.00506	-5	0.00476
2890	chr3	185955820	T	C	rs60319910	0.537516672	0.0015036489692104	0.537516672	0.0014872276027075	0.0852403613806723	0.0083951926757895	0.0469457221460086	0.0015556902952023	0.0469457221460086	0.0015593147860338	0.2185840124047375	0.1688414228784383	0.1171184763848193	0.0083078905065676	0.1171184763848193	0.008370910746737	0.0177964516639126	0.0326710350927976	0.0098192290241467	0.0040250009513596	0.0098192290241467	0.004036008692698	0.1232968229355679	0.0027787457748066	0.1232968229355679	0.0027754440562274	TRA2B	17717	IGF2BP2	130778	ETV5	154498	False	True	True	alt	-50	0.03732	-20	0.2327
2891	chr3	185971124	C	A	rs115259874	0.163228796	0.0464086805414489	0.163228796	0.046993301906897	0.077718985885722	0.0120247445251568	0.0129551073881098	0.0164654845304464	0.0129551073881098	0.0165209598957289	0.1222089340503447	0.2671287534713076	0.0222453084461866	0.08823537741969	0.0222453084461866	0.0900697412022157	0.0093162792999691	0.0839760019943955	0.0017442581132505	0.0370216418818754	0.0017442581132505	0.0376696209652723	0.0355638217148889	0.0472774556797384	0.0355638217148889	0.0481063462631394	TRA2B	33021	ETV5	139194	IGF2BP2	146082	False	True	False	alt	-90	0.01634	30	0.0533
2892	chr3	188194600	G	A	rs4686478	0.0185411828719999	0.6049591568983159	0.018578091528	0.6109736195295916	0.0112045626767559	0.8522484783661683	0.0001854442369001	0.7356314839886121	0.000185997151018	0.7418695733280557	0.0006458051532446	0.9831883734310206	1.4165664756872016e-05	0.9419639816590352	1.4183168697527137e-05	0.9489179728732364	6.75755004380497e-06	0.9910057714283632	1.3496733339606708e-07	0.9575904440755773	1.3522955306696793e-07	0.964537823089468	3.546567252810958e-05	0.9560897754802848	3.546567252810958e-05	0.9620729277174308	LPP	41315	BCL6	448875	RTP2	492043	False	False	False	alt	-30	0.006477	-10	0.03186
2893	chr3	188197422	G	T	rs4572756	0.0374240654	0.270155732856468	0.0545275053999999	0.2716038026906286	0.0413263493026508	0.099027146863898	0.0016386533205366	0.1666607965969959	0.0022924697801152	0.1670265811025556	0.117290752532084	0.2789432343289166	0.004556971291123	0.2261163839283972	0.0059785548608105	0.227462534148149	0.0048824772290691	0.1709135585340837	0.0001987626304807	0.1623640448168816	0.0002539313613471	0.1632862613611119	0.0088771403120978	0.1891167595328057	0.0116319158061429	0.1904341228163775	LPP	44137	BCL6	451697	RTP2	494865	True	False	False	alt	-60	0.09955	60	0.262
2894	chr3	188279828	G	A	rs79650876	-0.1154956471999999	0.0841315808413871	0.1154956471999999	0.0830530495997575	0.0417041897210228	0.0969210479145632	-0.0049583159140408	0.0615762163211134	0.0049583159140408	0.0609317559904084	0.681505064168124	0.0174262612456295	-0.0793757659462911	0.0138999835856694	0.0793757659462911	0.0137219592323731	0.0285053247949798	0.0103194350080647	-0.0034155988850715	0.0140539333424026	0.0034155988850715	0.0139366474210438	-0.0260499488634488	0.0682104834427526	0.0260499488634488	0.067112730542405	LPP	126543	BCL6	534103	RTP2	577271	True	False	False	ref	100	0.0862	-45	0.251
2895	chr3	188467043	G	T	rs1365261	0.01091323528	0.6420041461551312	0.01849562912	0.6441204203763794	0.0495017441979057	0.0590811698068744	0.0006416791875292	0.4035134954074911	0.0010293017071759	0.4044607233587338	0.014338029098347	0.677589008082636	0.0002580928612227	0.7158382937451785	0.0002946240248252	0.7176045393975033	0.000706973540602	0.5150254345394626	1.454421448250541e-05	0.5840803123508443	1.644509773068045e-05	0.5860588310821601	0.0007926165418494	0.6994483502803734	0.0009410774966183	0.7013574011769624	LPP	313758	TPRG1	480172	BCL6	721318	False	False	False	alt	-100	0.02019	-45	0.0213
2896	chr3	188469462	G	A	rs1426271	-0.0650620058	0.1249310249854478	0.0898942337999999	0.1240320169508895	0.0177742853352057	0.564274283547804	-0.0013314915240558	0.2108065114263735	0.0016628967623154	0.2091586583517518	0.2416325756326086	0.1432312513250165	-0.0163805668321393	0.076902955077754	0.0216043996553641	0.0761444595387668	0.0043450190542235	0.1847800909228463	-0.0003324120666228	0.1120371093325646	0.0004021281458055	0.1108950466876179	-0.0208224736894196	0.0576828830270163	0.0286744086305301	0.0573002793933047	LPP	316177	TPRG1	477753	BCL6	723737	True	False	False	ref	-55	0.09143	0	0.0
2897	chr3	196484162	C	T	rs9683218	0.0063160936199999	0.7742603719161456	0.00969624882	0.7783315514908086	0.0207246962770934	0.4581266004330493	0.0001358589517777	0.7253995568518321	0.0002016891530793	0.7292229203197659	0.0012883111741611	0.952787644912866	8.682765286027262e-06	0.939665221192478	1.4593102296147331e-05	0.943593210846891	2.654173429657301e-05	0.9401375294347872	1.855071895982437e-07	0.9271423283963596	3.0061393859979693e-07	0.9310364666978912	3.546567252812362e-05	0.9277677908113952	6.845699581010051e-05	0.931651183715812	RNF168	19606	SMCO1	31184	UBXN7	51732	False	False	False	alt	100	0.05615	-30	0.0959
2898	chr4	712911	T	C	rs35734242	0.01830971776	0.6202377582350105	0.01830971776	0.6270028470529755	0.0092104543543324	0.9292186153472064	0.0001888168002871	0.752606882845095	0.0001888168002871	0.7596648269552424	0.013236118900729	0.6809132426817824	0.0002304854877601	0.6960377803465818	0.0002304854877601	0.7024088172502541	0.0001236226839373	0.7853562143845805	2.433597597803496e-06	0.7678049984712509	2.433597597803496e-06	0.7744002826001738	0.0008223087328032	0.6812532725192237	0.0008223087328032	0.6875529918308156	PCGF3	7162	SLC49A3	23640	ATP5ME	38581	False	False	False	alt	100	0.0814	10	0.01184
2899	chr4	23372301	G	A	rs199753793	0.02735678424	0.4419752441980525	0.03460373384	0.4449904848994289	0.0209269227133611	0.4490907015168682	0.0006784729439126	0.4413647750336059	0.0008205093724374	0.444265680698626	0.0099411104879416	0.7352427204476136	0.0001694252942571	0.6961841043226923	0.0002445880984044	0.6999499075883667	0.0002053799831877	0.7172190795960103	4.2417423457077335e-06	0.671999616693637	5.714894079978253e-06	0.6755400280093734	0.0005270363894295	0.680946711503973	0.000852000923757	0.6845715749234914	PPARGC1A	531788	GBA3	679386	ADGRA3	856235	False	False	False	alt	-25	0.0169	-100	0.1181
2900	chr4	23398184	T	G	rs73100346	-0.0233239112	0.4931632483519184	0.028003316	0.4893468626709639	0.0378727283811523	0.1256497323563184	-0.0008829359157839	0.3169038339957618	0.0010605671260998	0.3142424392477946	0.2240267559631816	0.1580634409792057	-0.0059235753638358	0.2181503119526861	0.0065657951707638	0.2158569466080954	0.0082503029684356	0.0971596415327638	-0.0002170405306431	0.166700213238908	0.0002414193315706	0.1649441226488767	-0.0072218006664246	0.2413635613610703	0.008529906634555	0.2389636561197314	PPARGC1A	505905	GBA3	705269	ADGRA3	882118	False	False	False	ref	70	0.05927	-95	0.19
2901	chr4	23422922	T	C	rs215407	0.0813637068	0.1501768629018609	0.0813637068	0.1523984421942305	0.0225321110464595	0.3992551246284325	0.0019323743009432	0.1860567329867998	0.0019323743009432	0.1886458968156686	0.0368884233446603	0.4991770246449877	0.0032151099550152	0.3059859521886013	0.0032151099550152	0.3106807563618333	0.0008526917559781	0.4736664993416843	7.749738022183475e-05	0.297936318669845	7.749738022183475e-05	0.3025639301411968	0.0082783477945299	0.2416543047333765	0.0082783477945299	0.2458940940203436	PPARGC1A	481167	GBA3	730007	ADGRA3	906856	False	False	False	alt	95	0.01839	95	0.29
2902	chr4	23423851	T	G	rs215405	0.0185959442	0.4865256001154141	0.0282477514	0.4884793938564497	0.0381070581648773	0.1257131941173076	0.000713433634375	0.3218193145283241	0.0010883228693507	0.3226470065102046	0.2354887664544224	0.150673302877326	0.0023087652129881	0.221783430772671	0.0055534747486241	0.2225589436320827	0.0088437794371467	0.0899613506433095	8.45699074396e-05	0.1677381920705865	0.0002097168955773	0.1680962412016878	0.0047062122661739	0.2465476546587655	0.0080894724687406	0.2477485587788257	PPARGC1A	480238	GBA3	730936	ADGRA3	907785	False	False	False	alt	-100	0.0603	50	0.09204
2903	chr4	23484586	A	G	rs17541787	0.01387347672	0.618274315530414	0.0191630663199999	0.6216703255343973	0.0187512458644255	0.527680411542424	0.0003019033669134	0.6167769231719423	0.000377121677214	0.6204758718305255	0.2659405826267691	0.1283957637013192	0.0034936333416374	0.303761584807087	0.0045873564687204	0.3057962908613176	0.0049048891299771	0.164781382602886	7.327031890039544e-05	0.3263647029316603	8.882313330838272e-05	0.3285443934301533	0.0043466068424004	0.3497060048306756	0.0060275147636171	0.3518518594272206	PPARGC1A	419503	GBA3	791671	ADGRA3	968520	False	False	False	alt	100	0.0194	35	0.04785
2904	chr4	23529438	A	C	rs199797430	-0.00766738972	0.7258165745071133	0.01217860108	0.7234031288530346	0.0657553611001039	0.0225833712987195	-0.0004799798446991	0.4142201198853877	0.0007381488268659	0.4119659998615793	0.0014136782026326	0.9508672417104674	-6.239122325472759e-06	0.9413752405887382	1.4665099568912491e-05	0.9396595161305568	9.708683686001293e-05	0.8263306971353601	-3.973297977877481e-07	0.8607459114380654	8.800563467987491e-07	0.8586866688642116	-3.958958793836596e-05	0.9367909062463512	6.598264656394742e-05	0.93414633070152	PPARGC1A	374651	GBA3	836523	ADGRA3	1013372	False	False	False	ref	100	0.01608	-45	0.08545
2905	chr4	33649250	G	T	rs12641122	-0.137871062	0.0593037050753141	0.137871062	0.058592416101809	0.0292441019482486	0.240351265346859	-0.0042950666228778	0.077672174481068	0.0042950666228778	0.0769213014745007	0.2300872620500808	0.1544547705423932	-0.0289962240524683	0.0580587941565785	0.0289962240524683	0.0568971004118595	0.0064137837871423	0.1284441453793573	-0.0008704667841693	0.0615472860749326	0.0008704667841693	0.0604439041637727	-0.0381627132064266	0.0362494803287916	0.0381627132064266	0.0356715221649078	ARAP2	2595264	DTHD1	2632367	PCDH7	2928880	False	False	False	ref	-100	0.04346	-75	0.03906
2906	chr4	33652135	C	T	rs717947	-0.0733770958	0.1847117989727112	0.0733770958	0.1822592515631567	0.0248575708146991	0.332778862975627	-0.0018671787879924	0.2032399965114062	0.0018671787879924	0.2005867587447515	0.0209915542212397	0.627295585121458	-0.0017297170924426	0.4471307494988911	0.0017297170924426	0.4416493127427607	0.0005253867815553	0.5832699171953798	-4.3924215928408944e-05	0.4178269520469221	4.3924215928408944e-05	0.4125091682239727	-0.0049338523968195	0.3832974653779878	0.0049338523968195	0.3781568989833074	ARAP2	2592379	DTHD1	2629482	PCDH7	2931765	False	False	False	ref	90	0.07666	-5	0.04858
2907	chr4	33653670	A	C	rs16989137	-0.006191303	0.8235843533269256	0.007882969	0.8217380879169821	0.030547779654061	0.21658963816943	-0.0001720211017154	0.7123342138568266	0.0002268924926527	0.7102358095352197	0.0322646893866912	0.5200836701288973	-0.0001766172247074	0.701680351880996	0.0002322473034257	0.7002677811874667	0.0010058697444135	0.4425787096674041	-4.765079244624141e-06	0.6381356157480232	6.652420829978573e-06	0.6365629850461098	-0.0005443568341525	0.7095271048752843	0.000702715185906	0.7080692611711535	ARAP2	2590844	DTHD1	2627947	PCDH7	2933300	False	False	False	ref	15	0.003998	40	0.04828
2908	chr4	33675316	T	G	rs12649881	-0.01123048736	0.7049872099340025	0.01410882216	0.6999921861827663	0.0672429375887269	0.0215740326011223	-0.0005884531574507	0.4094332059375076	0.0008046026005979	0.406266177242713	0.0214608557949258	0.6034427138542716	-0.0002696160534054	0.6806066321144683	0.0003754134437464	0.6764275759097585	0.0014099915526136	0.3865335250477521	-1.3000015426986565e-05	0.5195041570044054	2.094490336689105e-05	0.5157144422203644	-0.0008280822143775	0.6721092025736696	0.0011019101976179	0.6678218682860373	ARAP2	2569198	DTHD1	2606301	PCDH7	2954946	False	False	False	ref	20	0.00496	65	0.02576
2909	chr4	33677917	G	A	rs28430802	-0.1170606099999999	0.0805834468713927	0.1170606099999999	0.0794937399879467	0.018368212689799	0.5408811663770958	-0.0022846321274125	0.1607689869882609	0.0022846321274125	0.1586156106283646	0.0195885981986736	0.6204651362520204	-0.0025605055912903	0.3569040441466181	0.0025605055912903	0.352208970299577	0.0003885171921341	0.6264737705841984	-5.366061084852556e-05	0.3735608433647301	5.366061084852556e-05	0.3687707340629399	-0.0068745669888818	0.2879167351338938	0.0068745669888818	0.2836805144665061	ARAP2	2566597	DTHD1	2603700	PCDH7	2957547	False	False	False	ref	55	0.1337	55	0.3013
2910	chr4	33679486	C	T	rs16989149	0.0326693742	0.4285565797745475	0.0326693742	0.4340063758335603	0.0184998153244067	0.5393423479129414	0.0006653957051851	0.4466560272185915	0.0006653957051851	0.4520270294095113	0.1030615948005674	0.3085313492458879	0.0032894579379859	0.3140243454444255	0.0032894579379859	0.3187030743164567	0.0018571169286199	0.336981871917596	6.76298727655869e-05	0.3324291407857364	6.76298727655869e-05	0.3374442478831919	0.0065479528883902	0.2941701561713123	0.0065479528883902	0.2988496828752398	ARAP2	2565028	DTHD1	2602131	PCDH7	2959116	False	False	False	alt	0	0.0	35	0.03265
2911	chr4	33680838	G	T	rs28379456	0.0214524951999999	0.5702785374819525	0.0214524951999999	0.5767463494573649	0.0296134609462697	0.2340317670607642	0.0006775416943758	0.4355670290387862	0.0006775416943758	0.4409786434909044	0.0257571508693213	0.5669032657285836	0.0005281410489315	0.5662025980856527	0.0005281410489315	0.5721391627959755	0.0007565390326464	0.4935787006916934	1.6210422295676644e-05	0.5026119778312206	1.6210422295676644e-05	0.5084655698264531	0.0016825574873807	0.5469201636981728	0.0016825574873807	0.5529182574640236	ARAP2	2563676	DTHD1	2600779	PCDH7	2960468	False	False	False	alt	-95	0.04474	100	0.156
2912	chr4	33682286	T	G	rs35071135	0.0040091036	0.6490466052859302	0.0166727204	0.6496168997311331	0.0153218952348754	0.6670553362464241	5.2313040268820016e-05	0.6636550227323088	0.0002716070594368	0.6645252939998553	0.0131594140740984	0.6776720673902362	4.329550777504e-05	0.6910191116331168	0.0002158624909027	0.6917240321320586	0.0002023255407342	0.7105079180948872	4.56186693162824e-07	0.7084321746102102	3.530221648215647e-06	0.7090021801085723	0.0001187687638151	0.6786447212902761	0.00076869783247	0.6793326202580804	ARAP2	2562228	DTHD1	2599331	PCDH7	2961916	False	False	False	alt	-95	0.06116	-75	0.0332
2913	chr4	33691030	T	G	rs1965242	0.03050258158	0.4695511021154959	0.03050258158	0.4746603111540154	0.0287220213392659	0.2527343332247999	0.0009900423833279	0.3932404006541919	0.0009900423833279	0.3971581358710084	0.071680248094751	0.3679279193094756	0.0018106135293262	0.415568436287946	0.0018106135293262	0.4208024312567324	0.0021402320794669	0.3105901292348432	5.744763208642198e-05	0.366477190662315	5.744763208642198e-05	0.3714161705487991	0.0043004189898056	0.3952887881549822	0.0043004189898056	0.4003421632857274	ARAP2	2553484	DTHD1	2590587	PCDH7	2970660	False	False	False	alt	100	0.01611	-90	0.1345
2914	chr4	33691708	A	G	rs12641809	-0.0056746893599999	0.87109476948527	0.0057491186519999	0.8687386749737066	0.0264382700155394	0.2951094261266802	-0.0001387428856051	0.8080916085179092	0.0001401126116059	0.8045640115085814	0.036800171554881	0.4970015251982801	-0.0001739600236355	0.7622472137387676	0.0001773885446	0.7582947725631666	0.0009631810288484	0.4497923933882306	-4.46946541725911e-06	0.7252358955886062	4.532560660853069e-06	0.7207070763554159	-0.0005336346540859	0.7743389634562328	0.00053528422025	0.7714107856983278	ARAP2	2552806	DTHD1	2589909	PCDH7	2971338	False	False	False	ref	15	0.003624	-65	0.0792
2915	chr4	33696251	A	G	rs67906834	0.0100453262	0.3494985664431218	0.0407148018	0.3508302338215696	0.0185434410728288	0.5413776963392424	9.907417907439998e-05	0.390368844457423	0.00076161199083	0.3917005551056357	0.1172726073042789	0.2770101061954527	-0.000283656773268	0.2476064704889724	0.004662133812921	0.2484024096452555	0.0023194727783036	0.3001102144424301	-1.718901010223913e-05	0.270752716510775	9.421861407537264e-05	0.2715431250773756	0.0004239385041734	0.2232471385269067	0.0088004354854672	0.2241777390137671	ARAP2	2548263	DTHD1	2585366	PCDH7	2975881	False	False	False	alt	-75	0.0425	5	0.004883
2916	chr4	33699839	G	A	rs73127069	-0.04524492666	0.337615320083726	0.04524492666	0.3334581147116408	0.0705619322463626	0.0174770659586494	-0.0030360965246834	0.1373163069131047	0.0030360965246834	0.1357208063943468	0.0169608392992642	0.6944742012357663	-0.0012656722770389	0.5708687033915587	0.0012656722770389	0.5644343937226991	0.0011933460288181	0.4718145162784189	-8.884340678038534e-05	0.4017539922241974	8.884340678038534e-05	0.3968345733532748	-0.0035267724588433	0.5072604869417658	0.0035267724588433	0.5012242836836375	ARAP2	2544675	DTHD1	2581778	PCDH7	2979469	False	True	False	ref	0	0.0	-90	0.2032
2917	chr4	33702967	A	G	rs67509867	0.1703399867999999	0.0364568688520287	0.1703399867999999	0.0368371144139792	0.0392606675024895	0.1165744974768015	0.0070464720682272	0.0381135673797353	0.0070464720682272	0.0384291223669069	0.0152230213453861	0.6548267667006472	0.0025013402789557	0.3298848503589052	0.0025013402789557	0.3346242810633964	0.0005787175710576	0.5345259077317506	0.0001006194778627	0.2499098703785141	0.0001006194778627	0.2540078361698255	0.0068465243640921	0.2687434670724484	0.0068465243640921	0.2731817185465348	ARAP2	2541547	DTHD1	2578650	PCDH7	2982597	False	False	False	alt	-90	0.0327	-45	0.0867
2918	chr4	33703438	A	G	rs10019596	0.179656372	0.0307822194441866	0.179656372	0.0311622452320217	0.0345430554015499	0.1627327743246365	0.0064317640675009	0.041641871762299	0.0064317640675009	0.0419872298533989	0.0174837517732836	0.6491880611116557	0.0034478286851309	0.3073641137192306	0.0034478286851309	0.311814837162942	0.0006720109140642	0.5398268679031564	0.0001346655686417	0.2443711398499171	0.0001346655686417	0.2480431908472677	0.0087905380884826	0.2381872329177339	0.0087905380884826	0.2420755055101823	ARAP2	2541076	DTHD1	2578179	PCDH7	2983068	False	False	False	alt	100	0.0511	-25	0.01941
2919	chr4	33704374	T	G	rs13130383	0.3956663619999999	0.0042052704106549	0.3956663619999999	0.0042302651474922	0.1106470661572812	0.0028466269683148	0.0472311584034293	0.0018241215233057	0.0472311584034293	0.0018574163840111	0.0096664577216191	0.7426096649271481	0.0046467263581043	0.2774087915082685	0.0046467263581043	0.2815866024010899	0.0011698202178477	0.4425965636760181	0.000585009663329	0.1058259121246465	0.000585009663329	0.1076897618704577	0.0080820494210022	0.2576180899897116	0.0080820494210022	0.2617784043244054	ARAP2	2540140	DTHD1	2577243	PCDH7	2984004	False	True	True	alt	-30	0.01752	-75	0.1667
2920	chr4	33707202	A	C	rs34151233	-0.00550596934	0.759890927275418	0.01128103466	0.758040092646392	0.0128456902375827	0.7766413252545918	-6.294567334176603e-05	0.818491528654767	0.0001334711214624	0.8167272563627405	0.0007241595460393	0.9794775339216002	-2.610388336329127e-06	0.965929425299072	8.296953521638554e-06	0.9642668877367848	9.527180327486147e-06	0.983709780296556	-3.245280473931229e-08	0.9723346423723822	1.0158379824994013e-07	0.9706595268374888	-1.1546963148691874e-05	0.9591238153410698	3.7940021774273376e-05	0.9575669796607044	ARAP2	2537312	DTHD1	2574415	PCDH7	2986832	False	False	False	ref	90	0.188	100	0.1808
2921	chr4	33709195	G	T	rs10025016	-0.00509262722	0.7482485150809903	0.01191895758	0.7467873855625768	0.0223818478026334	0.4039605463358869	-0.0001235061110411	0.6818705158682119	0.0002786230561457	0.6803942557551341	0.0063161888423344	0.8011681518478916	-1.7744168556499255e-05	0.8365505778265951	8.550919534229555e-05	0.834907501613526	0.0001436030991602	0.7723645271670865	-4.377479074294696e-07	0.8089453225777514	2.0103230116664745e-06	0.8074003137587551	-6.928177889212929e-05	0.8285349161315283	0.0002903236448813	0.826817130697636	ARAP2	2535319	DTHD1	2572422	PCDH7	2988825	False	False	False	ref	35	0.011215	100	0.1263
2922	chr4	33710208	G	A	rs34365744	-0.02807562416	0.4963640017249436	0.02807562416	0.4906708164996705	0.0179614723899768	0.5628225870552309	-0.0004891715919914	0.5392553424944856	0.0004891715919914	0.5334688199061256	0.0532578931740951	0.440477713888245	-0.0018191479846585	0.4475636339546929	0.0018191479846585	0.4419370646547619	0.0009613504692661	0.461567874609589	-3.299365792524273e-05	0.4679717633651988	3.299365792524273e-05	0.4624468603895663	-0.0043375342284978	0.4100289821336519	0.0043375342284978	0.4046183652344088	ARAP2	2534306	DTHD1	2571409	PCDH7	2989838	False	False	False	ref	85	0.1134	-60	0.10535
2923	chr4	33713717	A	G	rs4475134	0.0175923834	0.5894847445752054	0.0205298466	0.5940327847035806	0.0143302526807275	0.7161422122308587	0.0002742770667096	0.644501755360627	0.0003081633104808	0.6492772081635194	0.0147273267130743	0.6708018594035449	0.0002714934032592	0.6750425899800588	0.000298543628959	0.6790697319779718	0.0001978406257698	0.7195826461099747	3.80612212579958e-06	0.7059499927981857	4.118170484237903e-06	0.7100917189739002	0.000903137474844	0.649717291000158	0.0010186071063309	0.6539016514324356	ARAP2	2530797	DTHD1	2567900	PCDH7	2993347	False	False	False	alt	-55	0.00925	100	0.1365
2924	chr4	33714149	A	C	rs9992483	0.0500585666	0.301798863805469	0.0500585666	0.3060421229856691	0.0254405369716902	0.3179220811085257	0.0013583505627295	0.2769856937131416	0.0013583505627295	0.2807692277520194	0.0111634390155388	0.7138120954049466	0.0006321153048413	0.5761080923323219	0.0006321153048413	0.5818465701217503	0.0002871764314033	0.6649136836419471	1.7477494416845825e-05	0.5324558317854025	1.7477494416845825e-05	0.5383186680107984	0.0019671076506878	0.5376111328849814	0.0019671076506878	0.543267545637078	ARAP2	2530365	DTHD1	2567468	PCDH7	2993779	False	False	False	alt	-75	0.0539	-100	0.0417
2925	chr4	33714463	T	G	rs9995588	-0.1324357367999999	0.065040388014305	0.1324357367999999	0.0641626261451703	0.0366502575416781	0.1400310043010448	-0.0050562841618189	0.0614693991685504	0.0050562841618189	0.0608714689840517	0.0068621952426511	0.7861017926752369	-0.000967630760652	0.5008856714961724	0.000967630760652	0.4954497679282521	0.0002655930103587	0.6812432548798908	-3.8534403882553765e-05	0.4082044594279494	3.8534403882553765e-05	0.4031861215276355	-0.0028265316221833	0.4633699678592309	0.0028265316221833	0.4580408667978256	ARAP2	2530051	DTHD1	2567154	PCDH7	2994093	False	False	False	ref	10	0.001709	65	0.04834
2926	chr4	33717975	C	T	rs1596581	-0.233287684	0.0168391437470101	0.233287684	0.0167268302776006	0.0525715201788264	0.0482614167349817	-0.0126456574047345	0.014770063218649	0.0126456574047345	0.0147142985157149	0.0681658473821384	0.3888836072177125	-0.0158062353307048	0.1134546109610425	0.0158062353307048	0.111364452756277	0.0036173418485048	0.222389604462198	-0.000873168460675	0.0661494670665657	0.000873168460675	0.0651131928216902	-0.0302217016924548	0.0572191070863541	0.0302217016924548	0.0562906733384671	ARAP2	2526539	DTHD1	2563642	PCDH7	2997605	False	True	False	ref	-40	0.006836	-40	0.02002
2927	chr4	33729254	G	C	rs67655711	-0.0765119472	0.1744492125551491	0.0765119472	0.1720100676118564	0.0144425336204609	0.7158063803895836	-0.001156900375286	0.3093932822142398	0.001156900375286	0.3053307624798682	0.004390320345749	0.8391788362608961	-0.00035061103899	0.6505723305040717	0.00035061103899	0.6445828132640392	6.603943438724637e-05	0.8622082398289144	-5.526651842940023e-06	0.6791168695958946	5.526651842940023e-06	0.6728948085093235	-0.0011711919765101	0.6272279750545937	0.0011711919765101	0.6210805564748204	ARAP2	2515260	DTHD1	2552363	PCDH7	3008884	False	False	False	ref	-35	0.06125	65	0.06183
2928	chr4	33729400	C	T	rs35304177	-0.02792904399	0.4835452114566583	0.02792904399	0.4777195955792649	0.0239064069406728	0.3608543028703967	-0.0006603903091582	0.4496010217057281	0.0006603903091582	0.444365853707407	0.0024001187687637	0.9060756899438656	-6.327761068683005e-05	0.849548584037891	6.327761068683005e-05	0.8426159045424797	5.683737648321247e-05	0.8745438714124356	-1.4809716187548858e-06	0.8221319447826775	1.4809716187548858e-06	0.8154100789501991	-0.0002391870937942	0.8449905334874566	0.0002391870937942	0.839443948414331	ARAP2	2515114	DTHD1	2552217	PCDH7	3009030	False	False	False	ref	-85	0.04758	-80	0.0851
2929	chr4	33730103	T	C	rs28530710	-0.0111537756399999	0.770677953569387	0.0111537756399999	0.7639975289773353	0.0139867684026325	0.7350787422327492	-0.0001651128025389	0.7965328601108972	0.0001651128025389	0.7895813270828096	0.0057891524529048	0.8056257915640775	-5.819249581927477e-05	0.8667546774902466	5.819249581927477e-05	0.8598462470442381	8.037354029329034e-05	0.8367292995958582	-8.539454041643463e-07	0.8785119558528367	8.539454041643463e-07	0.8717244828443645	-0.0002218666490712	0.8572530834300741	0.0002218666490712	0.8503676208027496	ARAP2	2514411	DTHD1	2551514	PCDH7	3009733	False	False	False	ref	75	0.00723	-55	0.03748
2930	chr4	33731591	C	T	rs28801803	0.01592702934	0.3599040779357255	0.04499328334	0.3603440056283828	0.0180603036494567	0.553611935926172	0.0004527380833758	0.4260139217459926	0.0009642501666376	0.4266930931878301	0.0267906040711292	0.5608882306003545	0.0006514376128477	0.5435949287361017	0.0010560024740157	0.5455590397405211	0.0004799663676031	0.5756351699945047	1.613631284721358e-05	0.5460593357315684	2.313166935053983e-05	0.547882851985949	0.0019902015769852	0.4994081830395583	0.003172940516644	0.5014492444526506	ARAP2	2512923	DTHD1	2550026	PCDH7	3011221	False	False	False	alt	70	0.05258	35	0.1301
2931	chr4	33732965	T	C	rs28780405	-0.0472160509999999	0.1915962084161169	0.0716703766	0.1900037461506594	0.032855614141546	0.1847185148864861	-0.0020188210932022	0.1554459249372877	0.0025600477365858	0.1544527592686727	0.0004618785259476	0.9889053025729712	-4.060932484778131e-05	0.9066933604442904	4.383644707239228e-05	0.9021905197965332	1.885145603335992e-05	0.9641666233355084	-1.843144456341389e-06	0.85349886102029	1.914567588984142e-06	0.8490423565207849	-0.0001402131239483	0.9112081981795556	0.0001435122562765	0.9081275888772136	ARAP2	2511549	DTHD1	2548652	PCDH7	3012595	False	False	False	ref	20	0.0781	90	0.1627
2932	chr4	33733709	G	A	rs61139508	-0.19923324	0.0254079116416284	0.19923324	0.0251411838652129	0.0344190677956849	0.1638535567514799	-0.0071660441723465	0.0369936917174315	0.0071660441723465	0.0367081240714002	0.036951931641978	0.5523727665528537	-0.0078204204740479	0.2290747122366449	0.0078204204740479	0.2258213372643843	0.0013781463132008	0.4476125578383825	-0.0003049562600935	0.1864428582888659	0.0003049562600935	0.1837197841940559	-0.0165797895153574	0.1529938886138843	0.0165797895153574	0.1511743761668391	ARAP2	2510805	DTHD1	2547908	PCDH7	3013339	False	False	False	ref	-20	0.01819	-20	0.0984
2933	chr4	33733813	C	G	rs10017591	-0.188613806	0.0279637243508823	0.188613806	0.027646789074079	0.0443004319965924	0.0822323263138769	-0.0083725928440523	0.0267641933302502	0.0083725928440523	0.0266424171792764	0.064354524759988	0.4284352494973555	-0.0122959608494235	0.1530824584745561	0.0122959608494235	0.1504656331306652	0.0026393854514599	0.2934920236090351	-0.0004991193677373	0.1085998260135338	0.0004991193677373	0.1069384830333137	-0.0237850945201411	0.0883451283245551	0.0237850945201411	0.0870797973534936	ARAP2	2510701	DTHD1	2547804	PCDH7	3013443	False	False	False	ref	-75	0.05228	-100	0.28
2934	chr4	33735000	A	G	rs28764846	0.0664788415999999	0.2089594365574016	0.0664788415999999	0.21214685304641	0.0180121323186788	0.5497743727736082	0.0013614065758246	0.2818460842924882	0.0013614065758246	0.2854130742410647	0.2239426280888126	0.1570864503594783	0.0137585301617588	0.1150808167966361	0.0137585301617588	0.1173872965264001	0.0038693179726593	0.2014994900394832	0.0002714878485628	0.1501356251571189	0.0002714878485628	0.1527316844439547	0.0195168420705354	0.0989900489458548	0.0195168420705354	0.1008516277136132	ARAP2	2509514	DTHD1	2546617	PCDH7	3014630	False	False	False	alt	-100	0.02206	-20	0.0633
2935	chr4	33739693	T	A	rs9996627	-0.00194540262	0.8564527754651623	0.0065233103799999	0.8549609482480269	0.0121564862099278	0.8243144417670604	-2.8242585532329147e-05	0.8856680993243755	8.002974004305006e-05	0.8841842114590016	0.0194211672330176	0.6196923026125224	-5.977359989550243e-05	0.7699712758207283	0.000154496909885	0.7683996683194179	0.0002449397612632	0.6926607984212423	-8.189527024437009e-07	0.8073478245611112	1.951948261709342e-06	0.8058512864279479	-0.0001476361716868	0.76896620623424	0.0004824981029988	0.7673893231044439	ARAP2	2504821	DTHD1	2541924	PCDH7	3019323	False	False	False	ref	55	0.0983	-100	0.03625
2936	chr4	33742285	T	C	rs7674046	0.00857042816	0.7125020894238461	0.0136488261599999	0.7157406032449457	0.0072730626094717	0.978223955791846	8.255933647004195e-05	0.8460929546375004	0.0001123893913633	0.8498746758588278	0.1561322622150374	0.2341998806133851	0.0012774881422925	0.3961267970315521	0.0025191917367032	0.3985236061731131	0.0011853786950972	0.4351142439524175	1.4556464390779972e-05	0.5424259500426933	2.1850119972185333e-05	0.5453330249165467	0.0019819537461647	0.438302523728404	0.003672759064366	0.4407580817577188	ARAP2	2502229	DTHD1	2539332	PCDH7	3021915	False	False	False	alt	90	0.07605	-55	0.0668
2937	chr4	33744538	T	C	rs13113238	0.186977456	0.0275154576981307	0.186977456	0.0278023877130901	0.0422882408948643	0.0935754125577345	0.0079666678905407	0.0282453829253505	0.0079666678905407	0.0284160257145941	0.0051779881891062	0.8259767150847543	0.0009954228239046	0.4796845261798524	0.0009954228239046	0.4851507705670069	0.0002333578598802	0.7059404595516772	4.474775228540662e-05	0.3694829960996136	4.474775228540662e-05	0.3742873756193083	0.0028232324898551	0.4544671087467364	0.0028232324898551	0.4599800771948589	ARAP2	2499976	DTHD1	2537079	PCDH7	3024168	False	False	False	alt	-40	0.01855	5	0.01904
2938	chr4	33745786	A	G	rs7693464	-0.0006700581	0.6407646249811624	0.01810135818	0.6393247977470264	0.0134966575232838	0.7597650470727524	4.068060123175224e-05	0.7049162455344782	0.0002620926916372	0.7035654118840287	0.0009592227244234	0.966838843876386	-1.472963899087215e-06	0.9410264405123716	1.663328360104559e-05	0.939555563337056	1.3074718906528045e-05	0.973729603556552	2.200129180539089e-08	0.9469090467121136	2.408092004798765e-07	0.9454507366480964	-1.154696314869458e-05	0.9362912104245876	6.598264656395108e-05	0.9347746241863408	ARAP2	2498728	DTHD1	2535831	PCDH7	3025416	False	False	False	ref	-45	0.08563	40	0.04022
2939	chr4	33746904	A	C	rs1373494	-0.0047468782	0.5143365688123196	0.0278532922	0.511415820229267	0.1113740305370496	0.0026705736687347	-0.0005300871980905	0.1389691811583759	0.0032106096598172	0.13751121048868	0.0237364323183002	0.5759576183743503	-0.0001169127251061	0.5824518577939775	0.0006614887720251	0.5793370009155084	0.0026621485119945	0.2654284668395244	-1.3042890638413328e-05	0.3315072658574158	7.621791731505334e-05	0.3289658070992365	-0.0003571310745273	0.5592675941897733	0.0019308171950776	0.5561752432098681	ARAP2	2497610	DTHD1	2534713	PCDH7	3026534	False	True	False	ref	85	0.1865	-50	0.0922
2940	chr4	33751346	C	T	rs1822683	0.035996524	0.3857928922443939	0.035996524	0.3911269751012011	0.0295092462596372	0.2339327172615304	0.0010574290963092	0.2992762009362384	0.0010574290963092	0.3033655955431757	0.0055219227343208	0.8356363452343524	0.0001637305360966	0.7352821408557725	0.0001637305360966	0.7419027950127683	0.0001730007010008	0.7709974657519367	5.067867020543839e-06	0.6723878526400088	5.067867020543839e-06	0.6787797232871479	0.0005938438190755	0.7237742285377144	0.0005938438190755	0.7304375941765496	ARAP2	2493168	DTHD1	2530271	PCDH7	3030976	False	False	False	alt	85	0.04486	40	0.1052
2941	chr4	33772700	G	A	rs3863828	0.0902947686	0.1046832597152851	0.1033505013999999	0.1053675740972484	0.0557505476852538	0.0393132776972341	0.0051145727522707	0.0510472558972617	0.0058440353211475	0.0510749351396821	0.2366962488865428	0.1487149117483338	0.0159527999799098	0.0787191862342259	0.0206011400845	0.0796559267023197	0.0130156362812454	0.0516065712786789	0.0008827753418083	0.0432125023934832	0.0011424919087476	0.0435676914309045	0.0240473755402329	0.0578922031382689	0.0287106990861403	0.0583267129344694	ARAP2	2471814	DTHD1	2508917	PCDH7	3052330	True	False	False	alt	-5	0.00964	-100	0.05664
2942	chr4	33778147	A	G	rs28538874	0.0114331048	0.7473226031915914	0.0114331048	0.7540765524195151	0.0160025093229752	0.6476909600873104	0.0001797487994676	0.7533994952890264	0.0001797487994676	0.7600600444820454	0.0032867605819669	0.878434814147264	3.1007827690956365e-05	0.8894257162131738	3.1007827690956365e-05	0.8963664212582642	5.285110107007776e-05	0.8883108842597939	4.893839472381424e-07	0.8918435995300042	4.893839472381424e-07	0.8987722888331303	0.0001336148592919	0.87904639974661	0.0001336148592919	0.8859670778112196	ARAP2	2466367	DTHD1	2503470	PCDH7	3057777	False	False	False	alt	-100	0.013405	45	0.01892
2943	chr4	33793271	C	T	rs66770627	-0.0213714927	0.590326775680269	0.0213714927	0.5841170861213201	0.0126444971507934	0.798402504121851	-0.0002800188592853	0.679665427990308	0.0002800188592853	0.6732502853651295	0.0016809079212166	0.936178867642084	-3.675206481085176e-05	0.8971967222280127	3.675206481085176e-05	0.8903361833172337	2.1946003311843875e-05	0.9520240902303072	-4.957367103763095e-07	0.9130302376826412	4.957367103763095e-07	0.9061160806677776	-0.0001369139916201	0.8934730924316072	0.0001369139916201	0.88659291440926	ARAP2	2451243	DTHD1	2488346	PCDH7	3072901	False	False	False	ref	30	0.02313	-100	0.0582
2944	chr4	33797580	C	T	rs6832462	-0.0053458991999999	0.7970132837161317	0.0095244966	0.7927360013815056	0.0122616828824637	0.8021162453871281	-5.806787469785139e-05	0.8370075469985887	0.0001195503689496	0.832935305242155	0.0010103592755105	0.9679789192573508	-6.3014976218596456e-06	0.9639414973832152	1.00236489843989e-05	0.9595126149180514	1.2466001718374158e-05	0.9779069003805588	-6.90772162837328e-08	0.9708291433930804	1.2384371507292253e-07	0.966463035914692	-1.6495661640988404e-05	0.9722034153385958	2.804262478968028e-05	0.9677726892568858	ARAP2	2446934	DTHD1	2484037	PCDH7	3077210	False	False	False	ref	-95	0.000717	50	0.0293
2945	chr4	33804523	A	G	rs59554896	0.0263828726	0.4977849885224676	0.0263828726	0.5034864140760259	0.0173147075270979	0.5869500127858777	0.0004597663922532	0.5198195633628951	0.0004597663922532	0.5256443882124738	0.0278512751146447	0.57055572453142	0.0006729142901923	0.5465395876265527	0.0006729142901923	0.5522396879958654	0.0004773760335449	0.5917080848596808	1.1604952614581869e-05	0.5596160005179174	1.1604952614581869e-05	0.5654921825552106	0.0019489624228827	0.5230305330319773	0.0019489624228827	0.5288072034736258	ARAP2	2439991	DTHD1	2477094	PCDH7	3084153	False	False	False	alt	100	0.02081	-20	0.01764
2946	chr4	33805577	C	A	rs67910708	-0.046770647	0.171731603802271	0.0745080054	0.1700427963691266	0.0280537698986474	0.2597280833483897	-0.0014477646167081	0.1647907558193533	0.0020941364932627	0.1632472834723849	0.0148584672231202	0.6651920201870606	-0.0010107566232745	0.4649737677807843	0.0011755875971131	0.4612672668367954	0.0004241811767712	0.5976227277231387	-2.978252144885117e-05	0.4152360318584988	3.362362646895591e-05	0.411418746971312	-0.0031465474580185	0.4078632851215954	0.0036975025568275	0.404052273245333	ARAP2	2438937	DTHD1	2476040	PCDH7	3085207	False	False	False	ref	-5	0.000977	95	0.08563
2947	chr4	33806081	G	A	rs58656292	-0.0157615763999999	0.2975184143716692	0.0494245684	0.2949583070132778	0.0190296759966894	0.5144933081543421	-6.051267666019986e-06	0.3538401810876396	0.0009894587491861	0.350673732536485	0.0120822473689419	0.6938109589244292	-0.000414315744983	0.5711831744816332	0.0005761837529119	0.5673548323950007	0.0002075303976754	0.7036303186499805	-5.016903211607325e-06	0.5802600993929599	9.745603697621196e-06	0.5764726208259597	-0.0014276995150275	0.5350931602454736	0.0019522615552109	0.5312641260787647	ARAP2	2438433	DTHD1	2475536	PCDH7	3085711	False	False	False	ref	-75	0.01814	-55	0.0598
2948	chr4	33808769	A	C	rs13104973	-0.2132800199999999	0.0203236596963075	0.2132800199999999	0.0201841349106592	0.0502555620151216	0.0553497188338959	-0.0106434512812833	0.0178215483155266	0.0106434512812833	0.0177903733262458	0.0458216489063375	0.4705879473263858	-0.0097983409582074	0.1675040138053392	0.0097983409582074	0.1646042825852817	0.0022438511232881	0.3069147057435218	-0.0004750731153314	0.1048746649366895	0.0004750731153314	0.1029084884462754	-0.0207721619214146	0.0994981800801213	0.0207721619214146	0.097572589807805	ARAP2	2435745	DTHD1	2472848	PCDH7	3088399	False	False	False	ref	50	0.01613	30	0.1472
2949	chr4	33817320	T	C	rs3910837	0.06400053592	0.2251855999719477	0.06534245888	0.2275295308011355	0.0259856121681361	0.3086397243362174	0.0018413672515552	0.2270192736077749	0.0018698528416629	0.2290426629983501	0.0877033090297251	0.3254910372225118	0.0058674950148479	0.2406126406096492	0.0059710965935515	0.2434462273687881	0.002314847659461	0.2869080215153665	0.0001708111599931	0.2243189624171802	0.0001730103563756	0.2268663939302637	0.0117779024116656	0.1901284527203534	0.0120583286595624	0.1926215094375054	ARAP2	2427194	DTHD1	2464297	PCDH7	3096950	False	False	False	alt	50	0.00476	-25	0.0249
2950	chr4	33820204	T	G	rs7689692	-0.00617720314	0.8601324929588533	0.00655984086	0.8558494417611319	0.0211103820678837	0.4333288168159216	-0.0001067901733793	0.8381000826075975	0.0001177873932077	0.8337478264812388	0.0195671538385404	0.6351714745570387	-0.0001754088684153	0.7794829520995559	0.0001776369558371	0.7752359440136929	0.0003496891737929	0.6354820272875035	-2.786224948987076e-06	0.778875861249447	2.850261414287093e-06	0.7746235809492144	-0.0004701263567681	0.788878253449593	0.000484972452245	0.7846722848711023	ARAP2	2424310	DTHD1	2461413	PCDH7	3099834	False	False	False	ref	-25	0.015205	-90	0.03366
2951	chr4	33881744	T	C	rs10008587	0.0541510117999999	0.2622323636137863	0.0541510117999999	0.2661681306066977	0.0258731545935112	0.3100964637704682	0.0014530883400556	0.247866727244212	0.0014530883400556	0.2511291992205215	0.0226848338886872	0.5884495957245314	0.0013215399983586	0.4414573474458919	0.0013215399983586	0.4470902852533001	0.0005819732408414	0.5372729363994153	3.5148597461522547e-05	0.4050577932853394	3.5148597461522547e-05	0.4105120919426289	0.0040125696941703	0.3871191832671439	0.0040125696941703	0.3925952930602649	ARAP2	2362770	DTHD1	2399873	PCDH7	3161374	False	False	False	alt	0	0.0	30	0.01904
2952	chr4	33911934	C	A	rs12640723	0.01430186958	0.5544168411159678	0.0228865635799999	0.5587785909557726	0.0377403711924676	0.1267910072796022	0.0005598569977504	0.3744467514905622	0.0008536447134387	0.3776096848486218	0.0877148559928738	0.329930586339322	0.0007988502614416	0.389054555770462	0.0017240605327671	0.3924393430221404	0.0033121012711911	0.2267211091757313	3.2424569857371435e-05	0.3059605704361259	6.408736620935119e-05	0.3091464575992696	0.0022359869354359	0.3834918490142188	0.003972980106232	0.3870739412566139	ARAP2	2332580	DTHD1	2369683	PCDH7	3191564	False	False	False	alt	100	0.04953	100	0.3801
2953	chr4	33920005	T	G	rs7683507	-0.0605197279999999	0.2299589389178514	0.0605197279999999	0.2265989469719352	0.0225566819424874	0.3989063825763005	-0.0013441936542523	0.2541740321338567	0.0013441936542523	0.250830813991701	0.0763476955560687	0.3640408742525009	-0.004428441370147	0.2627804460089222	0.004428441370147	0.2586744530908734	0.0017730688716433	0.345890085314975	-0.0001014317843053	0.2612712108236276	0.0001014317843053	0.2571866491908615	-0.0097588334268087	0.2137291998013143	0.0097588334268087	0.2101614498428316	ARAP2	2324509	DTHD1	2361612	PCDH7	3199635	False	False	False	ref	80	0.01451	-35	0.08984
2954	chr4	33935499	G	A	rs28691127	0.0124452829999999	0.7192193943560524	0.0124452829999999	0.7258992960787245	0.0108918768655799	0.8725875493437867	0.0001279603700362	0.8084607208018247	0.0001279603700362	0.8151593954288255	0.0120649269242189	0.703954857651172	0.0001763621880482	0.7393250830791914	0.0001763621880482	0.745915161492139	0.0001232621071443	0.787013108177517	1.717349488449406e-06	0.7964752658079163	1.717349488449406e-06	0.80307115044529	0.0006111642637985	0.7340036552216018	0.0006111642637985	0.7405777392399863	ARAP2	2309015	DTHD1	2346118	PCDH7	3215129	False	False	False	alt	-85	0.013016	-40	0.0221
2955	chr4	33965964	C	A	rs16989276	0.14497586	0.0559145266405042	0.14497586	0.0566208370601664	0.0358806744016877	0.1472845381283865	0.0054764630449186	0.0571191247000902	0.0054764630449186	0.0577134229317864	0.0063780475734881	0.8079382542124097	0.0012028609664351	0.4984754260010282	0.0012028609664351	0.5040368272491582	0.0002466129743598	0.7088732134068221	4.79059537688124e-05	0.4112712995614624	4.79059537688124e-05	0.4165354600431983	0.0032174788030747	0.4591987894983758	0.0032174788030747	0.4648886189548193	ARAP2	2278550	DTHD1	2315653	PCDH7	3245594	False	False	False	alt	100	0.00815	75	0.0812
2956	chr4	33967089	G	A	rs34920686	-0.1784893188	0.0365760308710345	0.1784893188	0.0361601360484881	0.0326876196864254	0.1877198718536766	-0.0066752669673302	0.0507237248402931	0.0066752669673302	0.0501672188179052	0.018325855300056	0.6405076652122672	-0.0041155909244165	0.3094049922760922	0.0041155909244165	0.3048804607090125	0.0006930608848186	0.5397751028612321	-0.0001752733053021	0.2516496125931781	0.0001752733053021	0.2480210219528343	-0.0097538847283164	0.2367629286533541	0.0097538847283164	0.2333979508439716	ARAP2	2277425	DTHD1	2314528	PCDH7	3246719	False	False	False	ref	-55	0.00592	-35	0.02368
2957	chr4	33973377	C	T	rs6814473	0.090246246	0.1249839743056541	0.090246246	0.1268497030310884	0.0222040658497845	0.4109042214329607	0.002177298529025	0.1688586303989447	0.002177298529025	0.1711560249565821	0.0443246676124178	0.4711087390372837	0.0047617274649978	0.2687642524954128	0.0047617274649978	0.272997183463079	0.0011340400503969	0.4460923884303212	0.0001320902924419	0.266102442334993	0.0001320902924419	0.2701546560144492	0.0107873379301243	0.2021154852366526	0.0107873379301243	0.2055154126613066	ARAP2	2271137	DTHD1	2308240	PCDH7	3253007	True	False	False	alt	100	0.03137	100	0.1829
2958	chr4	34012097	T	C	rs35883430	-0.0184251668	0.642450808753397	0.0184251668	0.6361368069355624	0.0224082945002299	0.401768860649898	-0.0003933444332624	0.5845040284891336	0.0003933444332624	0.578291691679139	0.0050600442083731	0.8219744931253126	-9.445142052408376e-05	0.8120980495345198	9.445142052408376e-05	0.8053514729162461	0.0001116859913884	0.7949170636885492	-1.9608170697555203e-06	0.7868999891171644	1.9608170697555203e-06	0.7801565277784444	-0.0003785754346606	0.7912798977363614	0.0003785754346606	0.784742293025505	ARAP2	2232417	DTHD1	2269520	NWD2	3232647	False	False	False	ref	-25	0.004242	-5	0.0009613
2959	chr4	34022109	C	G	rs7665880	-0.0624907034	0.2509637411887983	0.0633388486	0.2490445828591182	0.0391863489980934	0.1176238708252876	-0.0029129884817682	0.1852322656822606	0.002943626178075	0.1842487683856906	0.0320700405793275	0.5218148340932011	-0.0019434100219517	0.4357548398905394	0.0019735879977443	0.4318327331177951	0.00123889155572	0.4004761820280576	-8.798407780185975e-05	0.3413368460875993	8.90742020295955e-05	0.3378625436731775	-0.0051375738180858	0.3771004078488777	0.0052398469202599	0.3732437637799259	ARAP2	2222405	DTHD1	2259508	NWD2	3222635	False	False	False	ref	85	0.0564	85	0.3594
2960	chr4	34022788	T	G	rs13130693	-0.0998689032	0.1140967927229269	0.0998689032	0.112577752786153	0.0324667626277285	0.1884705051616028	-0.0035074145438921	0.1057964981019589	0.0035074145438921	0.1046984626913991	0.033195044703243	0.5206621806197188	-0.00371968283509	0.3089398140933377	0.00371968283509	0.3044673244786165	0.0011187685396788	0.4305648648355385	-0.0001369000713015	0.2548448983778035	0.0001369000713015	0.2510720252133078	-0.0089901355943386	0.2392044541706837	0.0089901355943386	0.2353874180776584	ARAP2	2221726	DTHD1	2258829	NWD2	3221956	False	False	False	ref	-70	0.01588	100	0.0769
2961	chr4	34025177	C	A	rs12647107	0.0013000517999999	0.2694000739790704	0.0545693402	0.2690288691046176	0.0170161668956698	0.5797290135433975	9.920287609623996e-05	0.3488635313353769	0.0010809011433008	0.3482789938243306	0.0217561281382995	0.6441723162038859	0.000298121313552	0.4800430626204178	0.0019795845279681	0.4791241786900148	0.0004473832719351	0.651451564337739	8.216230016753671e-06	0.4932444032948663	4.231818504545641e-05	0.4924505547716868	0.0001410379070304	0.4115996352022076	0.0051870608030087	0.4106774814858583	ARAP2	2219337	DTHD1	2256440	NWD2	3219567	False	False	False	alt	100	0.2471	95	0.1257
2962	chr4	34039357	C	G	rs35930604	0.1059503939999999	0.1043220535180945	0.1059503939999999	0.1058241425167496	0.0271029768212328	0.2809341743394634	0.0031947073020089	0.1248661520929565	0.0031947073020089	0.1264374982990831	0.1691143479264953	0.2067302401116925	0.0199343121785809	0.0950920145420132	0.0199343121785809	0.0968302667115421	0.0045736280609677	0.1779299250634365	0.0005943919740092	0.0983767456528069	0.0005943919740092	0.1000250273629255	0.0299717924185938	0.0615821128099838	0.0299717924185938	0.0626307883017348	ARAP2	2205157	DTHD1	2242260	NWD2	3205387	False	False	False	alt	-35	0.006226	55	0.1727
2963	chr4	34039921	G	A	rs67951022	-0.0285084995999999	0.3677453543334391	0.0415795403999999	0.3673036378212492	0.032770027872744	0.1833718170902012	-0.0008009066904527	0.310309622905569	0.0012628498953457	0.3105072526966194	0.6273687770116458	0.0232282695616648	-0.017685063882411	0.0830836140652562	0.0260431886698968	0.0832275444153676	0.0207090903308623	0.0214489508847471	-0.0004989188930528	0.0796736257011231	0.0007960178759365	0.0798666369955913	-0.0068795156873742	0.2296597667240596	0.0102528784929562	0.2294459387944286	ARAP2	2204593	DTHD1	2241696	NWD2	3204823	False	False	False	ref	50	0.05225	20	0.0908
2964	chr4	34041165	A	G	rs6531289	0.0630046458	0.216518514048094	0.0630046458	0.2197374133159703	0.0269052168844167	0.2869667145782923	0.0016717355825154	0.2084624151846594	0.0016717355825154	0.2114018068081473	0.0017056514136781	0.9383892392956712	9.53397064738961e-05	0.7838183349490878	9.53397064738961e-05	0.7904639665353768	4.408164492616448e-05	0.9008867662479868	2.49668884899803e-06	0.7374308401140441	2.49668884899803e-06	0.7439898523921086	0.0003587806406914	0.7764541709887668	0.0003587806406914	0.7830462003989521	ARAP2	2203349	DTHD1	2240452	NWD2	3203579	False	False	False	alt	10	0.002228	-50	0.09045
2965	chr4	34065590	T	C	rs6824096	-0.085316772	0.1475763145187618	0.085316772	0.1454420398564719	0.0304741672843974	0.2180057480031711	-0.002793657629399	0.1353633480126173	0.002793657629399	0.1336123807908865	0.0249043251624822	0.5684170180266104	-0.0020269981121117	0.373650455507095	0.0020269981121117	0.3686870857289206	0.0007379216376594	0.4925091511296093	-6.516921109601805e-05	0.3196841613336376	6.516921109601805e-05	0.3150013130979956	-0.005909570782884	0.308446930437342	0.005909570782884	0.3038627395338136	ARAP2	2178924	DTHD1	2216027	NWD2	3179154	False	False	False	ref	45	0.01733	95	0.349
2966	chr4	34066372	G	A	rs59339146	-0.3844816939999999	0.0042241076451799	0.3844816939999999	0.0042453991805534	0.0609783281430339	0.029409264372981	-0.0238529786948164	0.0050543757831705	0.0238529786948164	0.0050651678669899	0.5514318234304378	0.0336079292762318	-0.2160392210283741	0.0017898332822364	0.2160392210283741	0.0018288870709522	0.03322761814896	0.0070533159148263	-0.0132507446711346	0.0021664162197564	0.0132507446711346	0.0021603051342123	-0.1179002672297185	0.0026049245616648	0.1179002672297185	0.0026071118393656	ARAP2	2178142	DTHD1	2215245	NWD2	3178372	True	True	True	ref	-90	0.1311	55	0.1592
2967	chr4	34068348	T	A	rs35776025	-0.0700746538	0.2056322051364975	0.0700746538	0.2031231503782543	0.0196804797200555	0.4919434774089158	-0.0015125089434967	0.2697787658322254	0.0015125089434967	0.2664914591554242	0.092307248193725	0.3203442930041631	-0.0054018635203261	0.2450137999447578	0.0054018635203261	0.2410510085595329	0.0017542704763695	0.3366318388876858	-0.0001153755501914	0.2613832873089957	0.0001153755501914	0.2575275236533064	-0.0115197453069842	0.1942766602810702	0.0115197453069842	0.1909875354034803	ARAP2	2176166	DTHD1	2213269	NWD2	3176396	False	False	False	ref	-100	0.1181	-100	0.3347
2968	chr4	34068367	T	C	rs6844408	-0.106663975	0.1053068157415117	0.106663975	0.1039917080397606	0.0356014445504588	0.1504413851051366	-0.0040764717026256	0.0909441242498581	0.0040764717026256	0.0898723324032934	0.0855935139058427	0.3347722525321167	-0.0080104814433201	0.1845445979467418	0.0080104814433201	0.1812755382380457	0.0029198562238357	0.2457590134103566	-0.0002970822475906	0.1438938946021255	0.0002970822475906	0.141466262770051	-0.0165278281811883	0.1276912493132582	0.0165278281811883	0.1253400147973775	ARAP2	2176147	DTHD1	2213250	NWD2	3176377	False	False	False	ref	-100	0.1111	-100	0.399
2969	chr4	34069768	T	C	rs10461117	-0.005637046548	0.802010136907131	0.008575088252	0.7996469274323925	0.0187245736769611	0.5191305459355015	-0.0001365144638222	0.7549027566212949	0.0001741192043614	0.7524733529040343	0.0071995315232093	0.7820369196312437	-3.347900399658801e-05	0.8645693964638458	4.722508919454227e-05	0.8626233051478608	0.0001301780515635	0.7803464867652047	-7.7528381384034e-07	0.8504597778081366	9.533255027460532e-07	0.8482397505748318	-0.0001624822671637	0.8477097297520706	0.0002169179505789	0.845782653567486	ARAP2	2174746	DTHD1	2211849	NWD2	3174976	False	False	False	ref	20	0.003296	-85	0.03168
2970	chr4	34073046	A	C	rs113731541	0.0209607383	0.5423804365727145	0.0251496143	0.546126227234217	0.1553675860407975	0.0005649228870539	0.0030725827047525	0.0965773498603627	0.0038849165259382	0.0969889870887357	0.0006804460426907	0.9820692190046072	1.6905241041654374e-05	0.9333919385796942	1.961734848235416e-05	0.937336086261773	0.0001077761205093	0.8028269281875673	2.599710268460009e-06	0.7517055685922697	3.1256596347221264e-06	0.7551584943495269	5.0311768005010736e-05	0.9412939108785516	6.020916498960375e-05	0.9452829524879008	ARAP2	2171468	DTHD1	2208571	NWD2	3171698	False	False	False	alt	70	0.00757	90	0.1807
2971	chr4	34073066	C	A	rs34334195	-0.0172487578	0.442907813340069	0.0329864122	0.4394003945625284	0.0207259906311609	0.4574349902971821	-0.0003806815218708	0.4402193719456428	0.0006907761383161	0.4366776094894672	0.0006425060209164	0.9833651245135704	-5.179855339336032e-06	0.9277346871023372	2.114544105949717e-05	0.9234682154063808	1.316847811803882e-05	0.974708935929745	-1.2462037610135194e-07	0.9118470701292032	4.392061520801193e-07	0.9075240980062956	-2.309392629737916e-05	0.9287559550159634	7.917917587673917e-05	0.9245745858059196	ARAP2	2171448	DTHD1	2208551	NWD2	3171678	False	False	False	ref	45	0.01587	70	0.1736
2972	chr4	34073564	T	C	rs35361741	-0.0209025943	0.5845915236931218	0.0209025943	0.5784726870735012	0.0358867682559103	0.1449160889289477	-0.000760052261509	0.4021472752077165	0.000760052261509	0.3971629194039739	0.0051449968658242	0.8228082936213852	-0.0001103023500277	0.7914198762173974	0.0001103023500277	0.7846794905972371	0.0001844048094681	0.7277184905082006	-3.9886119128171e-06	0.7081023910872521	3.9886119128171e-06	0.7016292353252112	-0.0004577546105373	0.775836780002543	0.0004577546105373	0.7690488181086717	ARAP2	2170950	DTHD1	2208053	NWD2	3171180	False	False	False	ref	60	0.03052	5	0.00656
2973	chr4	34075163	C	T	rs13146184	-0.103198759	0.1011500993109068	0.103198759	0.0997094479727659	0.0328820356778013	0.1825626521237771	-0.0034708729045851	0.0946280920829752	0.0034708729045851	0.0934585093513245	0.0035086272310381	0.8728574465450549	-0.0003949895264918	0.6408704547551693	0.0003949895264918	0.6347197283835455	0.0001221277429956	0.7985867119103967	-1.3941619716017798e-05	0.5600917845262561	1.3941619716017798e-05	0.5542132659729216	-0.0012495463693048	0.625040616575816	0.0012495463693048	0.6188518654653773	ARAP2	2169351	DTHD1	2206454	NWD2	3169581	False	False	False	ref	35	0.006638	-100	0.0633
2974	chr4	34077033	C	A	rs3924935	0.0125848921999999	0.5913302384632827	0.0196666257999999	0.5955857602325215	0.0329445291210304	0.1799835944833797	0.0004202810535731	0.4334120867871019	0.0006392340574108	0.4368021679954691	0.0064159875952624	0.801447886028449	6.836206592816486e-05	0.7620365378913901	0.0001469805005297	0.7662632475900618	0.0002042674611717	0.7201658490546484	2.197212970726034e-06	0.6929725157366623	4.627937321337535e-06	0.6970134493542892	0.0003101184388505	0.7467099584221284	0.0005509550988089	0.7510443357624137	ARAP2	2167481	DTHD1	2204584	NWD2	3167711	False	False	False	alt	40	0.0717	-100	0.1709
2975	chr4	34078601	G	T	rs35921722	0.00769144603	0.8093378579660031	0.00769144603	0.8162868999217935	0.0093392215826112	0.9328968033837168	7.489113761746292e-05	0.8728121999253482	7.489113761746292e-05	0.8797517286879553	0.0220448022170168	0.6032622405999533	0.000176584637555	0.7350659094969209	0.000176584637555	0.741693652671294	0.0002011576611468	0.7188801618665204	1.6692628759168674e-06	0.7968929813351021	1.6692628759168674e-06	0.8036171531423631	0.0006548777671471	0.7206008574350717	0.0006548777671471	0.7271407013759478	ARAP2	2165913	DTHD1	2203016	NWD2	3166143	False	False	False	alt	-10	0.001884	10	0.0199
2976	chr4	34086572	A	C	rs9985883	-0.0149086569999999	0.686534506214951	0.0149086569999999	0.6798355569383849	0.0236498357442736	0.3655437594975618	-0.0003536126980347	0.599109695668057	0.0003536126980347	0.5926911849131867	0.0315636237669492	0.5465782099839506	-0.0005352024261835	0.6028569302179904	0.0005352024261835	0.5967143197888836	0.0007693014330234	0.5112533545954271	-1.3029963125781885e-05	0.5702522518222133	1.3029963125781885e-05	0.5641121557789055	-0.0015118273893965	0.595432849687086	0.0015118273893965	0.5893101621381868	ARAP2	2157942	DTHD1	2195045	NWD2	3158172	False	False	False	ref	-100	0.03836	-100	0.2332
2977	chr4	34089846	A	G	rs13152643	0.01017153946	0.7486127370712542	0.01142162414	0.7530038132875484	0.0179676498682973	0.5640677756696852	0.0001906079482489	0.7260751147347592	0.0002085062776032	0.7304718564057602	0.0012660420309457	0.9557562158732844	1.5561124232545816e-05	0.9368316593823992	1.6576707193938343e-05	0.9408325062196314	2.313925063823066e-05	0.9512000371645624	2.895098502066498e-07	0.9300710767274232	3.04050655866332e-07	0.9340859094819116	5.031176800500375e-05	0.9401983759126834	5.5260466497300285e-05	0.9442073238640614	ARAP2	2154668	DTHD1	2191771	NWD2	3154898	False	False	False	alt	-100	0.0237	20	0.01276
2978	chr4	34092585	T	C	rs10022287	-0.00225983602	0.8299378663356947	0.00763279922	0.8260957380243973	0.0136886983337792	0.7447434466116951	-2.9229170109261395e-05	0.8394390878771933	0.0001111098293156	0.835485576007858	0.0033700636732538	0.8688763690706227	-1.1709837145806692e-05	0.9238998963988244	2.1569989317456166e-05	0.919741081007201	4.394087291806943e-05	0.8963926584044705	-1.4870613001820774e-07	0.931176679537858	2.9896879599276825e-07	0.927036638772534	-3.958958793835687e-05	0.9277322376588756	7.752960971263025e-05	0.9236219005390188	ARAP2	2151929	DTHD1	2189032	NWD2	3152159	False	False	False	ref	-70	0.01614	35	0.04987
2979	chr4	34093031	C	G	rs10010927	-0.143530558	0.0526868993215743	0.143530558	0.0522123421095237	0.0410167670566042	0.101157361030914	-0.0059550923215052	0.0452364363554538	0.0059550923215052	0.0448942821379562	0.0061800996337962	0.7981359906725628	-0.0009182431285552	0.5019281822614592	0.0009182431285552	0.4963626080950293	0.000253049479319	0.6794207726185992	-3.790489294661075e-05	0.3965753466601824	3.790489294661075e-05	0.3913234541969172	-0.0028174590082807	0.4635617728199561	0.0028174590082807	0.4580531440335379	ARAP2	2151483	DTHD1	2188586	NWD2	3151713	False	False	False	ref	-25	0.001831	90	0.0702
2980	chr4	34093997	C	T	rs28473456	-0.030770523	0.4419619993627713	0.0336774694	0.4386331157144443	0.0121434791381716	0.8198659358795254	-0.0003617980742101	0.6083155782485093	0.000399857446818	0.6042368125008881	0.0093365444887994	0.7383819384344372	-0.0002023136089964	0.7016957284258817	0.000233806088478	0.69743375678513	0.0001145136062652	0.7958621631724603	-2.369516643199556e-06	0.7510908698699106	2.78183383762183e-06	0.7467620749876136	-0.0007398304245982	0.6879263343715286	0.000819009600475	0.6835387047579929	ARAP2	2150517	DTHD1	2187620	NWD2	3150747	False	False	False	ref	-100	0.01007	-85	0.0957
2981	chr4	34096803	C	T	rs6854464	-0.062348925	0.2169546493294179	0.062348925	0.2136543788728309	0.0872435176374977	0.0074789934451605	-0.0054113265958537	0.0489873632497744	0.0054113265958537	0.0485649380592485	0.0153030253043449	0.6627249054767202	-0.0009247237516448	0.49224461800669	0.0009247237516448	0.4864976363063127	0.0013495948484742	0.3920066125187693	-8.119940491010456e-05	0.283850946133895	8.119940491010456e-05	0.2794775681061281	-0.0032232522846491	0.4315015149015136	0.0032232522846491	0.4259570080564718	ARAP2	2147711	DTHD1	2184814	NWD2	3147941	False	True	False	ref	-90	0.03217	-90	0.03754
2982	chr4	34106771	A	G	rs34045875	0.0303886130799999	0.4622144200358336	0.0303886130799999	0.4678824648257372	0.0102105359212073	0.8988485516298363	0.0003344548858126	0.6243044633108554	0.0003344548858126	0.6307907399982463	0.0027597241925373	0.8951145006353001	9.240478799908004e-05	0.8106819094922721	9.240478799908004e-05	0.8175189476126651	3.0008659288519795e-05	0.9332763835219708	1.0941549359042131e-06	0.8505542248400765	1.0941549359042131e-06	0.8574822557616326	0.0003464088944607	0.7985573304901542	0.0003464088944607	0.8052733757132324	ARAP2	2137743	DTHD1	2174846	NWD2	3137973	False	False	False	alt	25	0.003082	-25	0.02185
2983	chr4	34108692	T	C	rs13149553	-0.0990222636	0.1059663091023218	0.0990222636	0.1043874525793735	0.0303659105135325	0.2214871876969498	-0.0029964295718237	0.1084995995477834	0.0029964295718237	0.1070755898253317	0.3890716241628452	0.0733371421259583	-0.0390670717261218	0.0388133646849987	0.0390670717261218	0.0381021825758041	0.0117941840558116	0.0586535210620729	-0.0011820683033806	0.0433906478700262	0.0011820683033806	0.0425721377234801	-0.0337987859193031	0.0430317084474319	0.0337987859193031	0.0423165238109041	ARAP2	2135822	DTHD1	2172925	NWD2	3136052	False	False	False	ref	-80	0.0609	-80	0.0995
2984	chr4	34108823	A	G	rs13149360	-0.01182992908	0.6066240140775753	0.02028230972	0.6049869611235628	0.0158732086110865	0.6503404094119757	-0.0001847871448257	0.6429155715525691	0.0003231639376671	0.6415232629881787	0.3141442050740655	0.1027950794334834	-0.0035821257103439	0.2245614025292069	0.0059352641965558	0.2238523955830299	0.0049829710730431	0.1621422322869102	-5.733962655325987e-05	0.2712149608110404	9.587067544106712e-05	0.2704289827582663	-0.003672759064366	0.2907427839027544	0.0067541486589026	0.2897690984638978	ARAP2	2135691	DTHD1	2172794	NWD2	3135921	False	False	False	ref	-100	0.1063	-100	0.02576
2985	chr4	34114145	C	T	rs3924385	-0.023764069	0.5466137397899541	0.023764069	0.5406476820393082	0.0103248309952166	0.8971153188092665	-0.0002453520693583	0.6930276214482368	0.0002453520693583	0.6864531646692276	0.0006466299363267	0.982606369349541	-1.4667289690983016e-05	0.9452426894246536	1.4667289690983016e-05	0.9382492364309392	6.728827064029925e-06	0.9904432949997368	-1.5222458404818577e-07	0.962096573914661	1.5222458404818577e-07	0.9550820798205638	-6.68074296460031e-05	0.9366505709852148	6.68074296460031e-05	0.9296279755688056	ARAP2	2130369	DTHD1	2167472	NWD2	3130599	False	False	False	ref	90	0.02873	90	0.0517
2986	chr4	34117837	C	T	rs28491432	0.0101051106	0.4535951599209362	0.0327359038	0.4552700997340608	0.0256970450261929	0.3145384605734377	0.000335959169442	0.3938777269180555	0.0009256651728754	0.3951755759854848	0.0065256837451749	0.7909808321719006	2.9966533724195588e-05	0.7134502989915537	0.0002352413054284	0.7152974961919415	0.0001709899459231	0.741132356973034	1.274454487792228e-06	0.6653724529234595	6.664069912393866e-06	0.6673198430494245	0.0001410379070304	0.6988533975883927	0.0007893174095212	0.7007369182618319	ARAP2	2126677	DTHD1	2163780	NWD2	3126907	False	False	False	alt	80	0.01682	-100	0.094
2987	chr4	34120165	C	A	rs13126801	-0.0288157018	0.3592861938599045	0.0438062778	0.3582224799625557	0.0365741345057322	0.1384923789013515	-0.0011456597372148	0.2644835947467594	0.0016501907902352	0.264215241304512	0.008312988683976	0.7705817469780235	-0.0004893516379035	0.6607449342456742	0.0005273117699405	0.6590230957868288	0.0003174697148563	0.6647547841345564	-1.914283347694082e-05	0.5729530381331323	2.0445502773524072e-05	0.5710729577973293	-0.0015060539078222	0.6194750564394794	0.0016858566197089	0.6176062907136226	ARAP2	2124349	DTHD1	2161452	NWD2	3124579	False	False	False	ref	100	0.0185	100	0.1096
2988	chr4	34121752	T	C	rs80143073	0.0091145039	0.7819017042942606	0.0091145039	0.7886135126976885	0.0870221613790238	0.0082421954941634	0.0007391612580315	0.4269180116028757	0.0007391612580315	0.4320384213533212	0.000652403417901	0.9807925823168874	7.101347200503174e-06	0.9591148239012012	7.101347200503174e-06	0.9661749976814664	5.695484354067541e-05	0.8762905140679964	5.779198651083545e-07	0.8899864878057014	5.779198651083545e-07	0.8968786894925794	2.9692190953779146e-05	0.9569490622046845	2.9692190953779146e-05	0.9639996497120064	ARAP2	2122762	DTHD1	2159865	NWD2	3122992	False	False	False	alt	85	0.04306	100	0.1458
2989	chr4	34126545	A	G	rs28576298	-0.01788066052	0.6331096340058172	0.01788066052	0.6265468654691058	0.031639708511459	0.1985798747755849	-0.0005741246347349	0.4900049172363206	0.0005741246347349	0.4842213580972787	0.0196603543268119	0.619321486190494	-0.000287931799642	0.6767800494284081	0.000287931799642	0.6703494651617347	0.0006314299264516	0.5315751528332112	-9.374847354873478e-06	0.6057536574066871	9.374847354873478e-06	0.5995328038795309	-0.0010351027679719	0.6561667037473862	0.0010351027679719	0.649696509843572	ARAP2	2117969	DTHD1	2155072	NWD2	3118199	False	False	False	ref	100	0.01224	100	0.03903
2990	chr4	34130538	C	A	rs59815841	0.0084306668199999	0.7978340291147696	0.00911181042	0.8022696364796207	0.0172197227839617	0.5903086425083048	0.0001099320454708	0.8231379262461089	0.0001282055950644	0.8275185055024434	0.0042096928507802	0.8603724843554578	2.7196049388484406e-05	0.9019339775396652	3.410894549217306e-05	0.906088296717874	8.601663271198576e-05	0.8604099496363182	3.113544577859897e-07	0.9056483545955256	4.968119053706173e-07	0.909745902140052	9.485005443567544e-05	0.9004964412652209	0.0001195935468971	0.9046703480057334	ARAP2	2113976	DTHD1	2151079	NWD2	3114206	False	False	False	alt	-5	0.001801	85	0.125
2991	chr4	34141538	A	C	rs7697283	-0.0219194042	0.5799932383154729	0.0219194042	0.573947167250122	0.0362402508429415	0.1412313238451321	-0.0007923332521069	0.3878244733351732	0.0007923332521069	0.3828601997076694	0.0088977598891491	0.7540041814497821	-0.0001641801215137	0.734757450444924	0.0001641801215137	0.7283743192682235	0.0003201726498798	0.6538376342046267	-5.8543469416336255e-06	0.6467451203374429	5.8543469416336255e-06	0.6404415103349285	-0.0005987925175678	0.727053250531526	0.0005987925175678	0.7207506972563616	ARAP2	2102976	DTHD1	2140079	NWD2	3103206	False	False	False	ref	95	0.002441	-45	0.02591
2992	chr4	34145116	C	G	rs9784438	0.0101124800199999	0.2909923403675572	0.04958797162	0.2917224014923724	0.0341884998535726	0.1670172743651731	0.0002635899246292	0.2240757939371565	0.0017971468751623	0.2246589454062097	0.0513707894823661	0.4494998806265844	0.0011101649896807	0.4080698706129306	0.001859600555944	0.4098555014456967	0.0016456488037704	0.3596347638359037	3.677189595756859e-05	0.3380697988364118	6.631332499808233e-05	0.3393546514719226	0.0029601464814753	0.356678046231406	0.0051936590676651	0.3584975692086199	ARAP2	2099398	DTHD1	2136501	NWD2	3099628	False	False	False	alt	-25	0.0216	20	0.03247
2993	chr4	34147877	T	A	rs7434297	-0.0982125135999999	0.1133208243851748	0.1078107439999999	0.1124719295419585	0.0222559332637855	0.4062415420066005	-0.0028076130181522	0.1612491402934615	0.0029174415610338	0.1601322151194603	0.1810027712711556	0.1976140729638665	-0.0232363733326767	0.0981723136726943	0.0246771291413667	0.0969062507959121	0.004389829415385	0.1987753322280848	-0.0007155811532809	0.1172838230591159	0.0007320671201426	0.1159081064374651	-0.0271419616640823	0.069869305109825	0.0298653954010094	0.0692597655217553	ARAP2	2096637	DTHD1	2133740	NWD2	3096867	False	False	False	ref	-100	0.01889	-45	0.0796
2994	chr4	34154339	A	G	rs13146507	-0.01169490982	0.718730753247879	0.01313666098	0.7139127429767136	0.0220362010595472	0.4139710965361341	-0.0002715654574407	0.6492973453854654	0.0003001144319707	0.6444493925877868	0.005908745999802	0.8113799737079127	-0.0001070052388057	0.811527423641636	0.0001092170242321	0.8069235634282097	0.0001368186884705	0.7821027270769725	-2.548081311886845e-06	0.785840329298897	2.591878194722942e-06	0.7811898174019689	-0.0004313615519117	0.7873922087357387	0.0004429085150604	0.7827286917188643	ARAP2	2090175	DTHD1	2127278	NWD2	3090405	False	False	False	ref	-55	0.018	65	0.01892
2995	chr4	34156746	A	T	rs77453134	-0.00873984376	0.8103767209270739	0.00873984376	0.8035746752768649	0.0096456408697328	0.9016863137633618	-7.769299637723167e-05	0.8883689226923014	7.769299637723167e-05	0.8815736285343525	0.0036793573290224	0.8632331382129638	-3.059699392604768e-05	0.905124505732216	3.059699392604768e-05	0.8982311440375955	3.619494994556365e-05	0.9180500563647916	-2.772646490802625e-07	0.937140656589554	2.772646490802625e-07	0.9301879160582798	-0.0001245422453894	0.8994129027639197	0.0001245422453894	0.8924854198308696	ARAP2	2087768	DTHD1	2124871	NWD2	3087998	False	False	False	ref	-100	0.02069	5	0.002914
2996	chr4	34156941	A	G	rs10019288	0.0190792739199999	0.6206249376672608	0.0190792739199999	0.6269568042796018	0.014745140153757	0.6980529987883198	0.0002692051441616	0.670919147178057	0.0002692051441616	0.6775944577578448	0.0019935007093134	0.9228741720610112	3.953645463510186e-05	0.8788655263015502	3.953645463510186e-05	0.8857438050655551	2.9262375373691263e-05	0.9325198846555872	5.555738005663929e-07	0.8878936863752022	5.555738005663929e-07	0.8947835842758325	0.0001550592194252	0.8717435054599417	0.0001550592194252	0.8785987817121235	ARAP2	2087573	DTHD1	2124676	NWD2	3087803	False	False	False	alt	70	0.003872	-90	0.07825
2997	chr4	34164475	C	G	rs13102895	-0.0285375025999999	0.4820389983809627	0.0285375025999999	0.476399408479254	0.0130122123079268	0.7721506731337193	-0.0003668118201149	0.5886990755879539	0.0003668118201149	0.582377256161936	0.0022062947444821	0.914478254840246	-5.939687979806597e-05	0.8452692253507347	5.939687979806597e-05	0.8384580847518772	3.069189532261451e-05	0.9298175405244944	-8.15842771456847e-07	0.8648772107039665	8.15842771456847e-07	0.8578820526531845	-0.0002094949028405	0.8489475360741277	0.0002094949028405	0.8420430385488683	ARAP2	2080039	DTHD1	2117142	NWD2	3080269	False	False	False	ref	100	0.0925	-100	0.05426
2998	chr4	34164875	A	G	rs7435170	0.0014442343999999	0.7830141011492544	0.0100182583999999	0.7815854318605853	0.0146988010636942	0.706328638616637	2.167885120497482e-05	0.7947298113602927	0.0001478448687117	0.7933114428870418	0.0017996766850317	0.9311127224385236	9.001692930333368e-06	0.927458913446914	2.08153179377371e-05	0.9258485920625584	2.6633270674240743e-05	0.9390187866173558	1.3546769185591578e-07	0.930841573605588	3.096264648185504e-07	0.9292674405195908	3.711523869221749e-05	0.9149940427187084	9.64996205997758e-05	0.9134659691885868	ARAP2	2079639	DTHD1	2116742	NWD2	3079869	False	False	False	alt	-100	0.11115	0	0.0
2999	chr4	34170690	T	C	rs7435994	0.0562430274	0.2472466043138197	0.0562430274	0.2508961609453082	0.0156681631489644	0.6537560321104362	0.0009161565050006	0.3448966121550324	0.0009161565050006	0.3494883729026873	0.0448236613770577	0.4607274720878783	0.0026089102214614	0.3344077637721684	0.0026089102214614	0.3390522419638787	0.0007019601404926	0.508636501757426	4.29190137314518e-05	0.3751777560605333	4.29190137314518e-05	0.3800931386823261	0.0066840420969284	0.2801929657541879	0.0066840420969284	0.2845986547178343	ARAP2	2073824	DTHD1	2110927	NWD2	3074054	False	False	False	alt	-60	0.0173	100	0.2251
3000	chr4	34170728	G	A	rs28581574	0.0274922167999999	0.4874075714859554	0.0274922167999999	0.493342834696684	0.0155220523238261	0.6706585873177772	0.0004357402715215	0.5421425028518938	0.0004357402715215	0.5483032817621322	0.0441498135990234	0.4637524311158164	0.0013522085255375	0.4399903275337263	0.0013522085255375	0.4453008817787104	0.0006971616160761	0.5089707897510004	2.174891946879465e-05	0.474849742630278	2.174891946879465e-05	0.4804115906684383	0.0034409950183101	0.4152411784140277	0.0034409950183101	0.420723558557329	ARAP2	2073786	DTHD1	2110889	NWD2	3074016	False	False	False	alt	30	0.001297	65	0.1125
3001	chr4	34179905	A	T	rs35684722	-0.0045184635	0.8383082484151902	0.0073583961	0.8340171121329271	0.0105054508526521	0.8868747279003947	-5.802772124022047e-05	0.8843057827774304	8.012406039588601e-05	0.879936879005261	0.007528619972947	0.7784714688326089	-1.317753220422358e-05	0.869474842136939	4.84061506632603e-05	0.8652266306064812	7.38066608231791e-05	0.8494469828184584	-2.104553274888856e-07	0.9040667838259908	4.845546156196052e-07	0.8996344732920175	-8.660222361518957e-05	0.8597401191134111	0.0001905248919533	0.8555420451744824	ARAP2	2064609	DTHD1	2101712	NWD2	3064839	False	False	False	ref	-40	0.00908	50	0.072
3002	chr4	34188299	G	A	rs58186080	-0.132915084	0.0663258842081017	0.132915084	0.0654561208625788	0.0418342254359919	0.0966994592587353	-0.0056321356187012	0.0522118699801425	0.0056321356187012	0.0517352109636495	0.0520900003299132	0.4455095411477037	-0.008095570364789	0.2095527524340874	0.008095570364789	0.2061585830806604	0.0022231992790335	0.3120071028015573	-0.0003523027807242	0.1517233547927576	0.0003523027807242	0.1491377450243468	-0.0171035267724588	0.1361952653014545	0.0171035267724588	0.1336632997404461	ARAP2	2056215	DTHD1	2093318	NWD2	3056445	False	False	False	ref	5	0.001495	100	0.09436
3003	chr4	34192231	G	A	rs10028563	-0.0003456487215999	0.5609003556316133	0.0236897499216	0.5602351050424745	0.0241706852823988	0.3523984131411113	7.31703092241858e-05	0.4968697391825122	0.0006464531342925	0.4957077677017851	0.0790670053775856	0.3605489218006069	-0.0004404480094717	0.4289748766968254	0.0023190431859066	0.4270209043411287	0.0019588090994871	0.3321617767969663	-3.5986944356437258e-06	0.4044049513417963	6.150973282428371e-05	0.4023459619852258	-0.0006128138299626	0.4095902820485794	0.0046756952921381	0.4078294501678486	ARAP2	2052283	DTHD1	2089386	NWD2	3052513	False	False	False	ref	70	0.09595	80	0.367
3004	chr4	34194071	T	C	rs6531299	0.137137243	0.0551332108864137	0.137137243	0.0558407541625387	0.0405025759341449	0.1046192897535626	0.0055574566919332	0.0470268348705427	0.0055574566919332	0.0474634712958778	0.1369568803404704	0.2508994313514553	0.01884903141798	0.0934357768861281	0.01884903141798	0.0953384318745807	0.0055451894097513	0.1543411743268139	0.0007639315822497	0.0690191456231451	0.0007639315822497	0.0703052449820217	0.030291808254429	0.0534255067820616	0.030291808254429	0.0544086510089712	ARAP2	2050443	DTHD1	2087546	NWD2	3050673	False	False	False	alt	75	0.039	20	0.05054
3005	chr4	34196663	C	T	rs67368133	0.01416341732	0.6905753328752999	0.01416341732	0.6971821000660764	0.012365559444448	0.8077944527080064	0.000196253590149	0.7431057233246444	0.000196253590149	0.7497840096207407	0.0070172544620764	0.7929643527781876	7.705569987398806e-05	0.8190222962050554	7.705569987398806e-05	0.8258004499632847	8.455455220130747e-05	0.8415168727854196	1.027847029887933e-06	0.8431022232548242	1.027847029887933e-06	0.8497740493004273	0.0002829005971429	0.814680250642006	0.0002829005971429	0.8214981032751069	ARAP2	2047851	DTHD1	2084954	NWD2	3048081	False	False	False	alt	100	0.09424	35	0.06207
3006	chr4	34197307	T	G	rs6834907	-0.01628563578	0.6716797717042312	0.01628563578	0.6654475830293533	0.0149223224243684	0.6952864102261224	-0.0002391642234093	0.7115747325878954	0.0002391642234093	0.7052103519232649	0.0075236712744547	0.7667440836893573	-0.000135372032155	0.7806532272490391	0.000135372032155	0.7741072990396073	0.0001114619605165	0.7946515423525516	-1.981887267612754e-06	0.7984180357067294	1.981887267612754e-06	0.7918744084114514	-0.0005105407277885	0.7622892204348057	0.0005105407277885	0.7558622548117006	ARAP2	2047207	DTHD1	2084310	NWD2	3047437	False	False	False	ref	-55	0.03156	-70	0.03995
3007	chr4	34203755	A	G	rs13110566	0.247149622	0.018599653557661	0.247149622	0.0187270999426937	0.0320815082232737	0.1928734444817921	0.0081541906199508	0.034813277535158	0.0081541906199508	0.0349575062573524	0.3067104351555541	0.106891549907018	0.0728076579802804	0.0182298426179228	0.0728076579802804	0.018417336414608	0.0095078776532337	0.0795908179744791	0.0023430034832806	0.0238233305077416	0.0023430034832806	0.0240867839397455	0.0763724390485302	0.0101630417234809	0.0763724390485302	0.0102115210688279	ARAP2	2040759	DTHD1	2077862	NWD2	3040989	False	True	False	alt	-20	0.01605	-35	0.0913
3008	chr4	34206356	T	C	rs34522421	0.0532773956	0.2699685960131947	0.0532773956	0.2736642977181235	0.0235053594111714	0.3772832541851758	0.0015038622920243	0.2696751039057225	0.0015038622920243	0.2730591742689583	0.0124756688990795	0.6939020905263843	0.0007164300687869	0.5412706401088501	0.0007164300687869	0.5468874880187456	0.0003286464506554	0.6607964983279008	2.304470857906296e-05	0.5098730516942143	2.304470857906296e-05	0.5152587898401698	0.002270627824882	0.4991317339373264	0.002270627824882	0.5046576396262502	ARAP2	2038158	DTHD1	2075261	NWD2	3038388	False	False	False	alt	-70	0.01541	100	0.1915
3009	chr4	34213494	G	A	rs7683171	-0.03290952392	0.4495794126711087	0.03290952392	0.4442195531268404	0.0198804999950066	0.4831121954365264	-0.0006286117862184	0.4686144922265889	0.0006286117862184	0.4633462029178759	0.0426239648972319	0.4795550221862466	-0.0013464468695546	0.4680588178206318	0.0013464468695546	0.462742754238641	0.0008692571442483	0.4775111021997364	-2.6691065417463963e-05	0.4693452634508704	2.6691065417463963e-05	0.4639204093208807	-0.0034475932829665	0.4371374190489127	0.0034475932829665	0.4319063141197959	ARAP2	2031020	DTHD1	2068123	NWD2	3031250	False	False	False	ref	85	0.02603	100	0.1941
3010	chr4	34234902	G	A	rs34250047	-0.01809188546	0.5591814120665116	0.02530706386	0.5573498450054526	0.0151800295011997	0.6752586798553328	-0.0003602125336599	0.6160940918093496	0.000441835771457	0.6142363060780499	0.0014549173567351	0.9481239116204756	-2.5302840695619324e-05	0.903947931911964	4.165964076576359e-05	0.9027443961426316	2.0815785688529983e-05	0.957121734938848	-5.46248313010759e-07	0.907584546705011	7.16585982311734e-07	0.9061705573687064	-4.618785259476842e-05	0.9009071630150856	0.0001369139916201	0.8996629597791681	ARAP2	2009612	DTHD1	2046715	NWD2	3009842	False	False	False	ref	40	0.02417	55	0.0882
3011	chr4	34235892	T	C	rs28731006	0.0672271357999999	0.1920423480611151	0.0672271357999999	0.1949176516530819	0.0193333113818671	0.5082616082550935	0.0012954552653201	0.2504861185964797	0.0012954552653201	0.2541667032353851	0.0041832997921546	0.8684105320589564	0.0003139487799511	0.6804836738798682	0.0003139487799511	0.6866527408583436	7.914726981655779e-05	0.8590018777852761	5.910821024461017e-06	0.6729679572818158	5.910821024461017e-06	0.6790761679077577	0.0009757183860644	0.6632431212187385	0.0009757183860644	0.6695093959869678	ARAP2	2008622	DTHD1	2045725	NWD2	3008852	False	False	False	alt	100	0.03302	100	0.1131
3012	chr4	34239457	G	A	rs34202234	0.002561681	0.9120847976213462	0.00362144748	0.9162083182302556	0.0118881422499089	0.8340373968126723	3.119387062117863e-05	0.928269543878625	4.3473093329846525e-05	0.9324518728428912	0.0063961928012932	0.798370169788979	2.598097765172832e-05	0.9045294149311084	3.053929165158589e-05	0.9087660578994984	7.358550002000269e-05	0.849771304634755	2.951266974250736e-07	0.9225409273217916	3.479426276366329e-07	0.9267599664443292	0.0001088713668305	0.8926563128003935	0.0001319652931278	0.8968748188468612	ARAP2	2005057	DTHD1	2042160	NWD2	3005287	False	False	False	alt	-40	0.012024	45	0.04694
3013	chr4	34247663	C	T	rs4266314	-0.00334519006	0.8441065346797981	0.00686930854	0.8425303041439461	0.0109977284672524	0.8634825263763134	-3.030673451515283e-05	0.8892723157768776	7.250210619885259e-05	0.887736550475462	0.0054790340140542	0.8223075196808779	-3.675218888144028e-05	0.8792426621938333	4.6980990331385854e-05	0.8775175268877835	5.420656189581243e-05	0.8815317492493725	-3.196034796029188e-07	0.9117138526164988	4.423619708068022e-07	0.9100469386046126	-0.0001360892085381	0.8827032318116672	0.0001657813994919	0.8808880406160174	ARAP2	1996851	DTHD1	2033954	NWD2	2997081	False	False	False	ref	-95	0.01727	-95	0.06015
3014	chr4	34259025	T	C	rs34352361	-0.00828189163	0.6980368785353996	0.01471013997	0.6969676656514828	0.0410301522682701	0.1021547964721289	-0.0004043844240302	0.4752117313005712	0.0006680957908534	0.4741947741117737	0.0042649533172774	0.8431122668947304	-3.690529242033414e-05	0.8523576567433196	6.275746699152306e-05	0.8511259799739613	0.0001708413201805	0.7376440576018175	-1.62287313912341e-06	0.7692087217944424	2.6844695821596143e-06	0.7679575814912776	-0.0001195935468971	0.8419166973255958	0.0002416614430404	0.8407757076667706	ARAP2	1985489	DTHD1	2022592	NWD2	2985719	False	False	False	ref	60	0.03047	55	0.0334
3015	chr4	34260311	T	C	rs35210319	0.0543780242	0.2529694270593664	0.0543780242	0.2566624818618143	0.0121189229282887	0.821725941176756	0.0006681740089524	0.4199862218858447	0.0006681740089524	0.4255584153733341	0.0548554980040249	0.4320286450191989	0.0027627981992408	0.3200184018679515	0.0027627981992408	0.3246571398861549	0.0006504695367078	0.5274103201801048	3.3010793321284625e-05	0.398504840913306	3.3010793321284625e-05	0.4036910965163585	0.0068968361320972	0.2681206621167636	0.0068968361320972	0.2722942781689367	ARAP2	1984203	DTHD1	2021306	NWD2	2984433	False	False	False	alt	-90	0.04575	-100	0.218
3016	chr4	34262740	T	G	rs4645234	0.0766439898	0.1629117276007815	0.0766439898	0.1651156363207014	0.0589859237852902	0.0335985990976895	0.0046281332014372	0.0712292538034773	0.0046281332014372	0.0718961282728086	0.0080309128699151	0.7855412477716258	0.0006527774870405	0.5835069465433423	0.0006527774870405	0.5892719823890423	0.000521634545328	0.6016356614029271	4.475026357568027e-05	0.4220504518081148	4.475026357568027e-05	0.4271604481908058	0.0020248424664312	0.5439240973583317	0.0020248424664312	0.5496393422537996	ARAP2	1981774	DTHD1	2018877	NWD2	2982004	False	False	False	alt	-10	0.00929	-95	0.1631
3017	chr4	34271016	C	T	rs6841728	-0.171866468	0.034612737500748	0.171866468	0.0342805751817046	0.022011106139204	0.4129442030338879	-0.0038240937844731	0.0823651406290274	0.0038240937844731	0.0813817172322275	0.0633788063739236	0.3934763631753055	-0.0112719587638188	0.1419263600372806	0.0112719587638188	0.1393410758618385	0.0013935656376629	0.3841195330608407	-0.0002485836277516	0.1573418877016936	0.0002485836277516	0.1546425947975417	-0.024100161657484	0.0772149922030956	0.024100161657484	0.0758849020992052	ARAP2	1973498	DTHD1	2010601	NWD2	2973728	False	False	False	ref	0	0.0	20	0.0442
3018	chr4	34277823	G	A	rs9968413	-0.00506320506	0.8924874423374993	0.00506320506	0.8856578496333364	0.0103475311338605	0.8941720594459933	-5.299529538883122e-05	0.9302650084568428	5.299529538883122e-05	0.9233943477877072	0.0015555408927451	0.939688221744039	-5.806639963688891e-06	0.9790623842682676	5.806639963688891e-06	0.9730117930461734	1.611682531729364e-05	0.966070419358244	-5.843911223722058e-08	0.9869520318469446	5.843911223722058e-08	0.9813721997102498	-2.556827554353201e-05	0.9761349832462114	2.556827554353201e-05	0.9690537241772365	ARAP2	1966691	DTHD1	2003794	NWD2	2966921	False	False	False	ref	80	0.012314	-100	0.03833
3019	chr4	34279425	G	A	rs4547813	-0.02297181422	0.5720389784638129	0.0233813314999999	0.5679602276762034	0.0223172482270657	0.4086466663890271	-0.0006002401475103	0.525658233035216	0.0006092159872844	0.5218550248987696	0.0073512916103064	0.777377417643775	-0.0001248500692673	0.7837540915271639	0.0001263987123418	0.7792602890555503	0.0001447795997035	0.7606115783065917	-3.007829496442672e-06	0.7599293821271438	3.0417728052781675e-06	0.7554586233171449	-0.0004552802612912	0.774218100803349	0.0004602289597835	0.7697548442055139	ARAP2	1965089	DTHD1	2002192	NWD2	2965319	False	False	False	ref	20	0.004364	-60	0.1508
3020	chr4	34286733	G	A	rs13131483	-0.0450536442	0.3407700387763857	0.0450536442	0.3366831340293821	0.0186529615592951	0.5262406554963631	-0.0009410933797032	0.3869635584001631	0.0009410933797032	0.3823967927598598	0.0142415294777473	0.7188673812424784	-0.0011252379816977	0.5869004582453788	0.0011252379816977	0.5805231526206208	0.0003139740570459	0.7075817417847879	-2.590462273880133e-05	0.5805120849704055	2.590462273880133e-05	0.5741491868216746	-0.003306555375936	0.5238604137523587	0.003306555375936	0.5177564162179863	ARAP2	1957781	DTHD1	1994884	NWD2	2958011	False	False	False	ref	5	0.002686	5	0.002441
3021	chr4	34293081	A	G	rs13118944	0.003358008018	0.8223210694505857	0.008356123538	0.8214097829089387	0.024112864412578	0.3551310094203598	8.547701271961548e-05	0.7694514119352703	0.0002024922125818	0.768433676711772	0.0113077760548975	0.7298365161293399	-1.554188140310169e-05	0.8500741761852912	7.052586779883281e-05	0.8483272110254972	0.0002765559737488	0.6917878154163437	-3.61394920957433e-07	0.8221027045294182	1.7128115422747162e-06	0.820418594247177	-6.185873115368827e-05	0.8463958024596117	0.0002532084061891	0.8446049187688286	ARAP2	1951433	DTHD1	1988536	NWD2	2951663	False	False	False	alt	-15	0.003487	25	0.03247
3022	chr4	34306193	G	A	rs10010448	-0.0593578471999999	0.2343251280386891	0.0593578471999999	0.2313285351809134	0.0303604587935532	0.2195115672759301	-0.0018697092907284	0.1929267524021184	0.0018697092907284	0.1904320996615441	0.0019407145920622	0.923768966968436	-0.0001180187994865	0.7805283230834807	0.0001180187994865	0.7738158067438123	5.889971481656189e-05	0.8713188672517391	-3.709454379175139e-06	0.716403045185756	3.709454379175139e-06	0.7101282478264528	-0.0004569298274553	0.7675001524837857	0.0004569298274553	0.760876583208615	ARAP2	1938321	DTHD1	1975424	NWD2	2938551	False	False	False	ref	30	0.02136	-60	0.05615
3023	chr4	34308921	T	C	rs7672284	-0.16971566	0.0417964051465228	0.16971566	0.041223161880003	0.0382881920126742	0.12263184923836	-0.0067399301734171	0.0436040464484188	0.0067399301734171	0.0431817996619055	0.0378558938999042	0.5146441742717969	-0.009059220811129	0.2142682719353725	0.009059220811129	0.2105870545588621	0.0015108835763616	0.3913106234281975	-0.0003713182118347	0.1647427979372672	0.0003713182118347	0.1620752273147807	-0.0184520471116096	0.1373104571602707	0.0184520471116096	0.1352256506380375	ARAP2	1935593	DTHD1	1972696	NWD2	2935823	False	False	False	ref	-60	0.0396	-55	0.1381
3024	chr4	34310033	G	T	rs28668075	-0.193404505	0.0336518541796617	0.193404505	0.0333594116169791	0.0341480450230127	0.1704024254727565	-0.0075754543840053	0.0462326297522692	0.0075754543840053	0.0457944331382255	0.39269159710996	0.0712515985215736	-0.0718545267388225	0.0185390145804287	0.0718545267388225	0.018187873849758	0.0129344088871978	0.0511938582433138	-0.0027548595163695	0.0225845792860153	0.0027548595163695	0.0222455900900449	-0.0643718452047111	0.0154088934132382	0.0643718452047111	0.0152410059829814	ARAP2	1934481	DTHD1	1971584	NWD2	2934711	False	False	False	ref	-85	0.04053	-85	0.1514
3025	chr4	34310315	T	C	rs919019	0.0851252236	0.1366221817900496	0.0851252236	0.1386249460179745	0.0172962744068284	0.5717822103300635	0.0016219132860698	0.224619797091007	0.0016219132860698	0.227686324273032	0.2306819306522384	0.1506788796038719	0.0185662840501503	0.0863475791661007	0.0185662840501503	0.0881495187089585	0.0038287761313946	0.2011881149036238	0.0003408736680482	0.1239845022387457	0.0003408736680482	0.1264551961025805	0.0262569694170432	0.0654298619231562	0.0262569694170432	0.0667117475791348	ARAP2	1934199	DTHD1	1971302	NWD2	2934429	False	False	False	alt	100	0.0803	70	0.10474
3026	chr4	34310507	T	C	rs919018	0.00647775258	0.7942361040516253	0.00864324362	0.7976558747654112	0.0201023246751966	0.4786156016914741	0.0001292484169846	0.7514824744119794	0.0001760471415828	0.7546329158826637	0.1449828445118933	0.2316171493805996	0.0008088244044321	0.4743222186157584	0.0011679203461053	0.4764384811303566	0.0029198603888877	0.2456348183496504	1.6206837409211053e-05	0.4694314083876735	2.397123081452977e-05	0.4716777622581986	0.0016314209362937	0.5197416183613572	0.0022087690937283	0.522161232574639	ARAP2	1934007	DTHD1	1971110	NWD2	2934237	False	False	False	alt	95	0.0518	-100	0.0762
3027	chr4	34322125	G	A	rs35418312	0.184469632	0.0328764641412382	0.184469632	0.0332574272963579	0.0541421816937999	0.0434659437463244	0.0102497489624381	0.022089504473915	0.0102497489624381	0.0222319297538004	0.042358384744812	0.4686215200782088	0.0087028347908022	0.1793866583555729	0.0087028347908022	0.1826538864181172	0.0023485466437729	0.288240592325972	0.0004945919035755	0.1056840620629361	0.0004945919035755	0.1075279621465335	0.0184875127841377	0.1118407879229646	0.0184875127841377	0.1139926145731983	ARAP2	1922389	DTHD1	1959492	NWD2	2922619	False	False	False	alt	-5	0.0008545	10	0.02734
3028	chr4	34322194	G	T	rs13135298	-0.0091898652	0.3001356228314698	0.0528102132	0.299117812825609	0.0157223137290618	0.6569895768378553	-0.0002238177943797	0.3946043169737911	0.0009406928545786	0.3936795178091623	0.0301598429613011	0.540469205151043	2.4783546617240183e-05	0.4239791404274716	0.0019794966503859	0.4234270542078656	0.0005022611728314	0.5771358255262234	-2.3107243772388586e-06	0.4569624567162672	3.5859685060585e-05	0.4561626882912429	-0.0001435122562766	0.3684844852657921	0.0050394246313219	0.3679035405991173	ARAP2	1922320	DTHD1	1959423	NWD2	2922550	False	False	False	ref	90	0.0807	100	0.1553
3029	chr4	34324162	C	T	rs61262296	-0.1084976196	0.1231362732115894	0.1084976196	0.1218902625173726	0.019291592290247	0.5070475445264683	-0.002301670053245	0.2047742647970098	0.002301670053245	0.2026512028365834	0.4666548447758239	0.051014115696574	-0.0540983342121273	0.0407053364218525	0.0540983342121273	0.0402739518210705	0.0090433129992358	0.0864713281225241	-0.0011733449467061	0.0708770187625824	0.0011733449467061	0.0700911448953229	-0.0321409719243838	0.0641688106584222	0.0321409719243838	0.0632330080429834	ARAP2	1920352	DTHD1	1957455	NWD2	2920582	True	False	False	ref	-50	0.05847	-25	0.2219
3030	chr4	34333891	T	C	rs7685673	-0.01440730832	0.6995716124143075	0.01440730832	0.6928792454735361	0.024960122793596	0.3293583796351276	-0.0003516714608538	0.6047760220940983	0.0003516714608538	0.5984919307493712	0.0423781795387812	0.4707056323483962	-0.0006751543865668	0.5539501815213888	0.0006751543865668	0.5481133458381848	0.0010421239295833	0.4323817629630787	-1.632561352162603e-05	0.5181667684557331	1.632561352162603e-05	0.5124069740523561	-0.0018005014681138	0.5510262713685187	0.0018005014681138	0.5451539623258483	ARAP2	1910623	DTHD1	1947726	NWD2	2910853	False	False	False	ref	75	0.01016	50	0.2627
3031	chr4	34335946	G	T	rs111284769	-0.0543102778999999	0.2775749451564776	0.0543102778999999	0.2739506567756296	0.0201674632982669	0.4735655161211753	-0.0011419173929869	0.3168960399905987	0.0011419173929869	0.3128436924178635	0.3990275807462636	0.0704544729518464	-0.0226719078118659	0.0841334915854179	0.0226719078118659	0.0825192297378281	0.008097763813889	0.0973417874940527	-0.0004783856733573	0.1103889644716848	0.0004783856733573	0.1085755614980759	-0.0181411038896769	0.1181357053936011	0.0181411038896769	0.1162110082514285	ARAP2	1908568	DTHD1	1945671	NWD2	2908798	False	False	False	ref	100	0.07587	-60	0.0957
3032	chr4	34335967	A	C	rs112181396	0.0118164699999999	0.3737391991406729	0.0389899044	0.374692742421172	0.0179002432745578	0.5569856773085232	0.0003795651702531	0.409107071407006	0.0008160559439425	0.4100905321352283	0.3958859819867374	0.0714848552508017	0.0039130290936546	0.1113438327196447	0.0152792006875673	0.1119062291317986	0.0070421203047496	0.1161841334681404	0.0001386470289014	0.1463343406233338	0.0003203254716577	0.1468919487554099	0.004123090627165	0.1592947452199872	0.0134414898881593	0.1598663555042168	ARAP2	1908547	DTHD1	1945650	NWD2	2908777	False	False	False	alt	65	0.04083	-80	0.185
3033	chr4	34337660	T	C	rs35781550	-0.008189451458	0.8059869175937443	0.008189451458	0.800109950802704	0.0162984069576053	0.6290540155456619	-0.0001493815201997	0.7885795091479453	0.0001493815201997	0.7829733220687477	0.003389033684141	0.8751500690694585	-3.0089413840418368e-05	0.9136273451120792	3.0089413840418368e-05	0.908494895280641	5.657536205093084e-05	0.8809055435404023	-5.627900961590058e-07	0.9081157587389534	5.627900961590058e-07	0.9030663078149528	-0.0001220678961432	0.9136768631196353	0.0001220678961432	0.9082794470059308	ARAP2	1906854	DTHD1	1943957	NWD2	2907084	False	False	False	ref	-85	0.01124	-90	0.010925
3034	chr4	34337807	C	T	rs36044581	-0.0254293818	0.5322345799860179	0.0254293818	0.5261000327054309	0.0105415867951985	0.8862957876654204	-0.0002598660731338	0.6851643998682782	0.0002598660731338	0.6784951080237922	0.0078643066873412	0.7699283362878722	-0.0001968231227303	0.7238075883269921	0.0001968231227303	0.7172913753152728	8.720101215494358e-05	0.8360900846581485	-2.068022843617497e-06	0.7828771605646607	2.068022843617497e-06	0.7761437156114267	-0.0007431295569264	0.701000071472431	0.0007431295569264	0.6946692444903647	ARAP2	1906707	DTHD1	1943810	NWD2	2906937	False	False	False	ref	80	0.3032	-70	0.07654
3035	chr4	34339177	A	G	rs6824510	0.03370207962	0.4392750696194078	0.03370207962	0.4441322741889527	0.0239037845303499	0.3603738896344554	0.0008714653149751	0.4144031712593425	0.0008714653149751	0.4187341734830845	0.0088598198673748	0.7534333259254483	0.0003052291361548	0.7112421010251216	0.0003052291361548	0.717469061268444	0.0002144871085621	0.7145393121402847	7.925307725507568e-06	0.673858390888066	7.925307725507568e-06	0.6802059183948532	0.0009831414338028	0.6865847299660207	0.0009831414338028	0.6928750870343612	ARAP2	1905337	DTHD1	1942440	NWD2	2905567	False	False	False	alt	100	0.0401	95	0.3232
3036	chr4	34339873	T	G	rs7690302	0.0042037750999999	0.7327559797495432	0.0120954339	0.7327506093845553	0.0123777753463527	0.8018775660909484	3.331568827199088e-05	0.7998995971967566	0.0001429967120664	0.7994487489398788	0.0019308171950776	0.9264442270078675	1.353564223379118e-06	0.9202530846186204	2.197678600478835e-05	0.9194058727871924	2.5050592162887043e-05	0.9440382251959129	-2.092389845876387e-08	0.9337842011683832	2.7439933486880094e-07	0.9328852158644588	1.814522780506943e-05	0.91685358717408	9.237570518951432e-05	0.915980354658618	ARAP2	1904641	DTHD1	1941744	NWD2	2904871	False	False	False	alt	-70	0.0279	100	0.0442
3037	chr4	34340047	A	G	rs13113901	0.0006634575999999	0.7721427562163851	0.0102304576	0.7740179453325032	0.0154272693794253	0.6715596069887244	1.4627439709988605e-06	0.7829297652423207	0.0001543298035615	0.7849300335752196	0.0007645739170597	0.977390338416068	-1.408756119859236e-06	0.9614669879536346	8.047105869564859e-06	0.9632087478068356	1.1778141005418946e-05	0.978579551619023	-2.692133563603618e-08	0.9621443822810604	1.2222929528795678e-07	0.9638772124197696	-8.24783082049418e-06	0.9666275215897004	2.639305862558144e-05	0.9683177999670872	ARAP2	1904467	DTHD1	1941570	NWD2	2904697	False	False	False	alt	-100	0.01619	90	0.01544
3038	chr4	34342868	A	G	rs7658506	-0.011738041	0.749529890301317	0.011738041	0.7427388774962754	0.0196940429066764	0.4929144704575439	-0.0002269023385027	0.706737503755119	0.0002269023385027	0.7002216968292049	0.0314827950249084	0.5296734290788676	-0.000372106926326	0.6304948198061073	0.000372106926326	0.6244428279019495	0.0006181337221765	0.5293577517550612	-7.159864585949697e-06	0.6223962911248626	7.159864585949697e-06	0.6164169143466789	-0.001153046748705	0.6222065485365731	0.001153046748705	0.6161009206696884	ARAP2	1901646	DTHD1	1938749	NWD2	2901876	False	False	False	ref	-85	0.0407	100	0.26
3039	chr4	34342904	C	T	rs7681085	0.01165304648	0.7475981181413679	0.01165304648	0.7542876496586441	0.0179327275356041	0.5499577743152114	0.000210612393696	0.730371730935824	0.000210612393696	0.7371306831552505	0.0274157896473227	0.5547939504038805	0.000329473798174	0.6702288889197224	0.000329473798174	0.6763762883090779	0.0004655650262634	0.5745402645010627	5.888305887630693e-06	0.6717449359041023	5.888305887630693e-06	0.6780540953047067	0.0009509748936029	0.6708678449835261	0.0009509748936029	0.6770964071640786	ARAP2	1901610	DTHD1	1938713	NWD2	2901840	False	False	False	alt	30	0.002716	100	0.2322
3040	chr4	34344336	G	A	rs13115626	-0.0237999489999999	0.487137779876356	0.027759819	0.4829545647593964	0.0135238657625915	0.7607242084850334	-0.0003404885312562	0.5802320366178285	0.0003888073365422	0.5757186870467758	0.0040109201280062	0.8483119038425131	-8.472818911537658e-05	0.7872025059682433	0.0001071658410122	0.7829087742371169	5.407224730404406e-05	0.8781545984996865	-1.2341064819763197e-06	0.8108534246702379	1.507893384680838e-06	0.8065705298472365	-0.0003389858467223	0.7724067689815375	0.0004297119857477	0.7681218585453047	ARAP2	1900178	DTHD1	1937281	NWD2	2900408	False	False	False	ref	0	0.0	10	0.005127
3041	chr4	47230269	A	G	rs4695202	0.1423608648	0.0520292139927888	0.1423608648	0.0525807252992739	0.037069659083433	0.1337173117015743	0.0053060013544935	0.0518573652145717	0.0053060013544935	0.0523362566495999	0.0031770644320543	0.8744522155581944	0.0004661743619996	0.5855569059414343	0.0004661743619996	0.5916826077751215	0.0001140764187032	0.7893486131807096	1.6863882547689132e-05	0.4930349099722667	1.6863882547689132e-05	0.498744874597963	0.0015126521724786	0.567874466286486	0.0015126521724786	0.5740485608577419	COMMD8	233433	GABRB1	236545	GABRA4	236688	False	False	False	alt	-85	0.02196	-100	0.04532
3042	chr4	47242132	C	T	rs28584485	-0.04533119546	0.324370127632733	0.04533119546	0.3197691852805371	0.0157497559497673	0.6577386777046073	-0.0007139410451626	0.4316752371425518	0.0007139410451626	0.4261906136032198	0.0001732044472303	0.9988191903308028	-4.92641154572762e-06	0.9808624498307952	4.92641154572762e-06	0.974159782866781	2.810084185568212e-06	0.9983687037934562	-7.590591485424417e-08	0.9806031679916496	7.590591485424417e-08	0.9735321547224232	-1.567087855893899e-05	0.9847514138275943	1.567087855893899e-05	0.9776158693121708	COMMD8	221570	ATP10D	243144	GABRB1	248408	False	False	False	ref	70	0.06995	-100	0.1671
3043	chr4	47273653	A	G	rs4426746	0.0108713874	0.678526875457109	0.0151428678	0.6831353537937508	0.011473735687512	0.8330631446032762	0.0001481958566386	0.7558110157550576	0.0001871120615892	0.760585954573646	0.0127899112533403	0.7132269583312032	9.868433239356376e-05	0.7432357867932979	0.0001573430283654	0.7474212748381177	0.000160363546029	0.7858020599051827	1.4421068297391898e-06	0.7915592960090376	1.9765289969622216e-06	0.7959157511446656	0.0003323875820658	0.7357499911141634	0.0005253868232654	0.7400935189219624	COMMD8	190049	ATP10D	211623	GABRB1	279929	False	False	False	alt	95	0.03223	100	0.1571
3044	chr4	79277722	C	T	rs13108290	-0.219473034	0.0201217112819565	0.219473034	0.0199472119059929	0.0382995594347986	0.1222463237477269	-0.0087001255339209	0.027112952741073	0.0087001255339209	0.0269324879162973	0.1947123156609811	0.1829650155897041	-0.0457669064655266	0.0350269311206825	0.0457669064655266	0.0344754284292727	0.0076899155033087	0.1075068251250773	-0.001861233536183	0.0316051577308972	0.001861233536183	0.0312755833313156	-0.0618768763815116	0.014844620816224	0.0618768763815116	0.0146818291402872	NAA11	48339	GK2	130506	PAQR3	338284	False	True	False	ref	50	0.05298	20	0.06055
3045	chr4	81085512	C	G	rs7671128	-0.11884325	0.0823630879550411	0.11884325	0.081451214128409	0.0411023635036993	0.1022095417966269	-0.0051772616710428	0.063282323284143	0.0051772616710428	0.0626662595554666	0.0177146910362574	0.6527803072886854	-0.0019245743723626	0.3989704508010096	0.0019245743723626	0.3941414402886202	0.0006808263096826	0.5283830921463202	-8.336259574263222e-05	0.3048839517707248	8.336259574263222e-05	0.3005740721396497	-0.0053850087427006	0.339561230579047	0.0053850087427006	0.3349738007587145	BMP3	54803	PRKG2	129710	CFAP299	749781	False	False	False	ref	35	0.010185	55	0.0772
3046	chr4	81113913	T	C	rs7675843	-0.01478146188	0.5266839910184182	0.02664639468	0.5259716428913043	0.024434608371876	0.3460011825628396	-0.000484984315831	0.4857359506946688	0.0007094199093386	0.4851905357162727	0.0302348982217676	0.5503395449640098	-6.294085543799912e-07	0.6141233008633918	0.0004474336304895	0.6139695348284313	0.0007210204862199	0.5174864384802089	-1.7658955846892995e-06	0.5833170886839874	9.960708761869491e-06	0.5828958954277735	3.464088944609995e-05	0.5914026439627029	0.0014615156213915	0.5913260953132807	BMP3	83204	PRKG2	101309	CFAP299	778182	False	False	False	ref	10	0.00328	-70	0.10645
3047	chr4	81114580	C	A	rs9685762	0.00748328616	0.7998578477340689	0.00889809732	0.8039637956782877	0.0142115070619783	0.7255185492129672	0.0001060159036191	0.8167229916797384	0.0001272031752272	0.8208146649169212	0.0066122859687901	0.7848219281089092	5.865000177237656e-05	0.8422375815472397	6.729098733251399e-05	0.8462188644662952	9.413863940183604e-05	0.8150809434903504	8.320073467578238e-07	0.8551267849563102	9.614090047841476e-07	0.859116046757595	0.0002136188182507	0.8348524306452169	0.000251558840025	0.8388680533612501	BMP3	83871	PRKG2	100642	CFAP299	778849	False	False	False	alt	85	0.06036	100	0.1256
3048	chr4	81115574	C	T	rs17005062	0.131253291	0.0616108206932575	0.131253291	0.0623584861663531	0.0258306161467494	0.3103184787901246	0.0035515153877246	0.091408656656912	0.0035515153877246	0.0925112629020652	0.030475734881726	0.545428926131231	0.0044461958636784	0.2704162294965476	0.0044461958636784	0.2746503345239466	0.0008595917899598	0.4924290522542415	0.0001288138720498	0.2491255988442749	0.0001288138720498	0.2529863720870903	0.0107403252944475	0.1979644998010927	0.0107403252944475	0.2013864403539005	BMP3	84865	PRKG2	99648	CFAP299	779843	False	False	False	alt	70	0.089	-55	0.10034
3049	chr4	81115998	T	C	rs1443539	-8.821352399999989e-05	0.8960240698985987	0.0044578432759999	0.8977396279051968	0.0281535510309832	0.2603151834437747	-8.344054836152477e-07	0.798638215464007	0.0001496540996636	0.8001768813647504	0.0109061066939394	0.7195443763011811	1.4418906163548704e-05	0.8708936982110147	5.370882402198831e-05	0.8726216437486054	0.0003166952811734	0.6533737322476058	5.279093906473007e-07	0.8224091834531908	1.810876651750334e-06	0.8240442600217602	7.01065619741962e-05	0.8699057150258603	0.0001971231566097	0.871735661708543	BMP3	85289	PRKG2	99224	CFAP299	780267	False	False	False	ref	-100	0.04797	-95	0.06537
3050	chr4	102211053	T	G	rs151421	0.0114464744	0.5536822370165999	0.0221686212	0.5554110298041824	0.0180082651999263	0.5524327664515497	0.0002091825619861	0.5603431918261245	0.0004131817508639	0.5618423223800143	0.0314687737125135	0.5459975892425235	0.0008060161973874	0.5374841051718721	0.0009177845988464	0.539916493624564	0.0005668602364175	0.5654855889167375	1.5169322593292369e-05	0.5494766188108233	1.729642891938291e-05	0.5518750319952329	0.0021518590610669	0.511174962987195	0.0025494045066146	0.5135926034080571	SLC39A8	220205	NFKB1	290278	MANBA	549941	False	False	False	alt	-100	0.0741	-100	0.126
3051	chr4	102769234	T	C	rs150898	0.0839291678	0.1019491483933098	0.1030068862	0.1025228440119007	0.0244833089505202	0.3410921847227364	0.0018311546918384	0.139851981500512	0.0024728196672436	0.1409029774365052	0.0043243376991851	0.8653672773679433	0.0004122446959275	0.6342360481399159	0.0004212923090039	0.6384997091755024	9.717457769460404e-05	0.8373873023245723	9.621959439713353e-06	0.6041772121807376	9.926269228946672e-06	0.6084236419670039	0.001352644254561	0.6137070247466805	0.0013823364455147	0.618325406596878	MANBA	8240	UBE2D3	99662	CISD2	99741	False	False	False	alt	-10	0.001846	20	0.037
3052	chr4	102772464	C	T	rs223473	-0.0924872579999999	0.1205189884159979	0.0924872579999999	0.1188473315208989	0.0296163503007652	0.2304088457598632	-0.0027833600293272	0.1205491053397194	0.0027833600293272	0.1189904398865133	0.0010466497311206	0.9576104864881396	-0.0001096020474892	0.7996256309340244	0.0001096020474892	0.7929100727801942	3.2882096517782205e-05	0.9227178773415636	-3.464826212600529e-06	0.7408156136651818	3.464826212600529e-06	0.7342055813466273	-0.0003925967470555	0.8022347280093799	0.0003925967470555	0.795492580278837	MANBA	11470	UBE2D3	96432	CISD2	96511	False	False	False	ref	0	0.0	100	0.0779
3053	chr4	102777629	G	C	rs223471	0.00837766753	0.7523656164372978	0.01128264063	0.7547524087737888	0.0087481862706363	0.9539757490797836	7.965492459589684e-05	0.8513350445374873	0.0001039023921074	0.8539132888006937	0.003272739269572	0.8736619550506108	3.190136963066182e-05	0.8826262759856183	4.208542952344305e-05	0.8849576492231586	2.847994581448841e-05	0.932177511403457	2.9378000315032065e-07	0.9179871366225107	3.788212141720959e-07	0.921259369803455	0.0001600079179175	0.8676189482413506	0.0001913496750354	0.8709479226394451	MANBA	16635	UBE2D3	91267	CISD2	91346	False	False	False	alt	-10	0.001984	100	0.0417
3054	chr4	102780174	A	C	rs223465	-0.0258986098599999	0.5210279115663146	0.0258986098599999	0.5148470012953733	0.0208254044154671	0.4531171504524298	-0.0005624309348119	0.5026113562452557	0.0005624309348119	0.4965710162580654	0.0021568077595591	0.9198930105495564	-3.53740559719602e-05	0.8913072088080811	3.53740559719602e-05	0.8843251818369418	4.051649643800005e-05	0.9130323618053234	-7.035997780418096e-07	0.8766691694736424	7.035997780418096e-07	0.8696466467752901	-0.0001418626901124	0.8913562418114916	0.0001418626901124	0.8843741416928876	MANBA	19180	UBE2D3	88722	CISD2	88801	False	False	False	ref	95	0.0988	100	0.3455
3055	chr4	102782903	T	C	rs223460	0.0088405816	0.7090757501226754	0.0133979084	0.7132725778666169	0.0090722267720769	0.9466893218425092	8.877785213734081e-05	0.8197020282439864	0.0001252083176712	0.8240610256083555	0.0294332090660155	0.5492462045921805	5.11698486144e-05	0.6341137137431456	0.0003515924222469	0.6379360058711426	0.0002549559584548	0.6808324342420133	6.991825563964586e-07	0.7239628167967194	3.1007075455063194e-06	0.7278707857180865	0.0003752763023324	0.6221299392338407	0.0010994358483718	0.6259640793063133	MANBA	21909	UBE2D3	85993	CISD2	86072	False	False	False	alt	85	0.03012	95	0.2983
3056	chr4	102788948	A	G	rs223456	0.048898678	0.2825170277098285	0.0509826695999999	0.2854357392831105	0.0231355034985744	0.3810897124420815	0.001131138504443	0.3016994757652987	0.0011860735945124	0.304374686775789	0.0035416185543201	0.8646916443486636	0.0001670754079176	0.7309939107410959	0.0001735038734802	0.7352679437470184	7.702427355732524e-05	0.8376210418855667	3.664028408800249e-06	0.7053978217138441	3.8334860618468855e-06	0.7096518883598373	0.0006680742964599	0.7042081504280822	0.0006977664874137	0.7085242185063337	MANBA	27954	UBE2D3	79948	CISD2	80027	False	False	False	alt	30	0.01167	25	0.02338
3057	chr4	102799902	T	C	rs223434	0.02799036872	0.4886409407584669	0.02799036872	0.4941753714273512	0.0145163680917585	0.7110593129743891	0.000399121413177	0.5851620389168997	0.000399121413177	0.5913316165270186	0.1022533073801589	0.30160604325844	0.0031236671625665	0.3531549164716538	0.0031236671625665	0.3579463425936422	0.0014574738372755	0.3712680263525744	4.470281205572352e-05	0.4117522739117284	4.470281205572352e-05	0.4167797287043603	0.0061240143842169	0.3335750834047397	0.0061240143842169	0.3382604070741761	MANBA	38908	UBE2D3	68994	CISD2	69073	False	False	False	alt	100	0.03406	100	0.154
3058	chr4	102801330	G	A	rs223426	0.00815386884	0.7955423938156845	0.00815386884	0.8025590193488215	0.0160240241792752	0.6445220898915337	0.0001373301620839	0.7917035320222297	0.0001373301620839	0.7983729043592683	0.0009798423014746	0.966751262358275	8.089492599521979e-06	0.95410544584863	8.089492599521979e-06	0.9611826082284604	1.5750047449295086e-05	0.9667302307024944	1.3628525381864752e-07	0.9514384129493262	1.3628525381864752e-07	0.958518881625353	3.7940021774273376e-05	0.9498398829305416	3.7940021774273376e-05	0.956883953372716	MANBA	40336	UBE2D3	67566	CISD2	67645	False	False	False	alt	65	0.02069	90	0.06247
3059	chr4	102811016	C	T	rs223415	-0.0355240636	0.4117981828870975	0.0355240636	0.4063872460846086	0.0098445338436208	0.9153923861065888	-0.0003650314730769	0.6039764925095061	0.0003650314730769	0.5975003680328028	0.0018343175744778	0.927145752250427	-6.515718528112982e-05	0.841407033561491	6.515718528112982e-05	0.8345506445159645	1.795880157813186e-05	0.9586044008050096	-6.557989405219621e-07	0.8839691802435207	6.557989405219621e-07	0.8769850558817394	-0.0002894988617993	0.8203006219399066	0.0002894988617993	0.8136356606372354	MANBA	50022	UBE2D3	57880	CISD2	57959	False	False	False	ref	25	0.01741	90	0.1155
3060	chr4	102812443	T	C	rs223412	0.02736948916	0.4934692243160818	0.02736948916	0.4993184173955338	0.019049758304892	0.5063642987139693	0.0004568767287598	0.5392844006297992	0.0004568767287598	0.5454551309326463	0.0075517138992444	0.7756380151214542	0.0002377886572211	0.7080601413960335	0.0002377886572211	0.7144379325359568	0.0001398239369832	0.7822431120992938	4.242999232908202e-06	0.7173763898634895	4.242999232908202e-06	0.7240120862716507	0.0008841674639569	0.6800828885878657	0.0008841674639569	0.6862776417222972	MANBA	51449	UBE2D3	56453	CISD2	56532	False	False	False	alt	-50	0.0652	-30	0.05814
3061	chr4	102815871	A	C	rs223406	-0.0140450186519999	0.716566145483992	0.0140587083079999	0.7122466586828617	0.0128899793912765	0.7837457899431384	-0.0001702434510096	0.7966489967501096	0.00017043961258	0.7921800522232635	0.0453737916927847	0.4781928906198928	-0.0002714213800391	0.7055200538413436	0.0002721319789166	0.7014531377636289	0.0006000586694294	0.5542289659058177	-3.2646823726669786e-06	0.7501219171845873	3.274864673178599e-06	0.7459478683962815	-0.0008313813467057	0.7091599029373298	0.0008313813467057	0.7041817985230547	UBE2D3	53025	CISD2	53104	MANBA	54877	False	False	False	ref	100	0.0831	100	0.1844
3062	chr4	102823801	A	C	rs223395	-0.0199182288999999	0.6087463663147642	0.0199182288999999	0.6022447504879996	0.0239267770976007	0.3593299739300198	-0.0004788237067155	0.5419345639662334	0.0004788237067155	0.5359226684734236	0.0015745109036323	0.9436767631945876	-2.9994946277479227e-05	0.9110615276985612	2.9994946277479227e-05	0.9040876684987156	3.785027003522312e-05	0.9176416580653292	-7.205716537654832e-07	0.8851071249605162	7.205716537654832e-07	0.8782664937344268	-0.0001212431130612	0.9056054408669588	0.0001212431130612	0.8986574400925833	UBE2D3	45095	CISD2	45174	MANBA	62807	False	False	False	ref	100	0.1555	-60	0.04034
3063	chr4	102833343	G	A	rs223380	-0.0223812538	0.581459993377549	0.0223812538	0.5755889434122495	0.0136433389573821	0.7523894566336202	-0.0003156320144224	0.6536825799138597	0.0003156320144224	0.6475144922022882	0.0066180594503645	0.796367063511717	-0.0001822044474355	0.7641434605792036	0.0001822044474355	0.7577096655246905	9.263050986824846e-05	0.8298375717688141	-2.632718119599581e-06	0.7897958130166313	2.632718119599581e-06	0.7833336638825075	-0.0006309590577677	0.7439649616839313	0.0006309590577677	0.7377534814669783	UBE2D3	35553	CISD2	35632	MANBA	72349	False	False	False	ref	-65	0.03296	85	0.08997
3064	chr4	102849422	C	T	rs223359	0.01237711902	0.7332699086900865	0.01237711902	0.7400243390245084	0.0138206685759508	0.7366253994625558	0.0001726965986196	0.7651024761612372	0.0001726965986196	0.7719431204247108	0.0004585793936194	0.9866507685059568	5.517036900919664e-06	0.9657757787659406	5.517036900919664e-06	0.972812459387258	6.847054225593029e-06	0.9866395626568172	8.422747710336229e-08	0.9656640402979412	8.422747710336229e-08	0.9727233514528087	1.814522780508727e-05	0.968814101357608	1.814522780508727e-05	0.9750022854647762	UBE2D3	19474	CISD2	19553	MANBA	88428	False	False	False	alt	-100	0.02655	90	0.00983
3065	chr4	102851095	A	G	rs223357	0.01561345714	0.662561080598859	0.0167195048599999	0.6668454301520802	0.0134836540278472	0.759221092446051	0.0002336803933436	0.7103456616888881	0.0002474465325106	0.7146788782432495	0.0471916136056216	0.4507501013501278	0.0005859851309711	0.5516360772064787	0.000669173158338	0.5551761315070204	0.000623872364099	0.5244064547587582	8.82769331353018e-06	0.5968451900819622	9.863071749284425e-06	0.6005119613652362	0.0016578139949193	0.5437033448105167	0.0018607106331034	0.5474669817897561	UBE2D3	17801	CISD2	17880	MANBA	90101	False	False	False	alt	10	0.0012665	-30	0.108
3066	chr4	102854547	C	T	rs223353	-0.023351606	0.5428679227243643	0.023351606	0.5370535671567814	0.0192080397047977	0.5087240836644065	-0.0004711391809665	0.5279698193492948	0.0004711391809665	0.5221485780909664	0.0111428194384876	0.7076681538685128	-0.000292310858549	0.6748817854606175	0.000292310858549	0.6684248920019203	0.0002214499693487	0.7015941463002564	-6.0136703881596575e-06	0.6643762376761418	6.0136703881596575e-06	0.6579760690892195	-0.0011076836791923	0.645083123028854	0.0011076836791923	0.6386434400820865	UBE2D3	14349	CISD2	14428	MANBA	93553	False	False	False	ref	75	0.00654	-35	0.0564
3067	chr4	102856235	G	A	rs223351	-0.0432508886	0.3417679327451046	0.0432508886	0.3371256692561563	0.0185353868384065	0.5402591333314865	-0.0007921775180771	0.3949602025673298	0.0007921775180771	0.3899243571295719	0.0006037412160601	0.9847347079297618	-2.6167432970017805e-05	0.9127476322375604	2.6167432970017805e-05	0.9056700424913394	1.08360748356659e-05	0.981277824744243	-4.652059627229383e-07	0.9064080197373412	4.652059627229383e-07	0.8993535159162366	-8.990135594337451e-05	0.920221287038074	8.990135594337451e-05	0.913257357965563	UBE2D3	12661	CISD2	12740	MANBA	95241	False	False	False	ref	-15	0.002441	10	0.01514
3068	chr4	102862343	T	A	rs223341	0.0024986109439999	0.9236773827445852	0.0033986432559999	0.922885010769679	0.0144918744503784	0.7134128996897471	3.1527561629837456e-05	0.9305502571773768	4.740503534803191e-05	0.9297454132782992	0.0012800633433406	0.9534537500978586	3.8052635990040247e-06	0.9747733192169844	4.974242792768584e-06	0.9774533431853069	1.849508349238344e-05	0.96140059796805	4.779844131575596e-08	0.9769458076062886	6.8707630633807e-08	0.979780163403463	7.423047738444773e-06	0.9746636104661396	2.0619577051235548e-05	0.9734997203112624	UBE2D3	6553	CISD2	6632	MANBA	101349	False	False	False	alt	-70	0.01145	0	0.0
3069	chr4	102869029	G	T	rs223332	-0.136592889	0.0638803727030867	0.136592889	0.0629982855105753	0.0831529729954393	0.009098465760161	-0.0113237507601301	0.0184734976306971	0.0113237507601301	0.0183858406651606	0.986950282075814	3.7733913776792807e-06	-0.1348113282454514	0.005461607933576	0.1348113282454514	0.0054433860960022	0.0820705956271933	0.0003955033854777	-0.0111762792823576	0.0028649312654923	0.0111762792823576	0.0028626104918807	-0.0022508330309128	0.5033057654772976	0.0022508330309128	0.4975569181069153	CISD2	54	UBE2D3	133	MANBA	108035	True	True	True	ref	-50	0.05347	-90	0.2168
3070	chr4	102873031	T	A	rs223329	-0.0686362198	0.2172780685925863	0.0686362198	0.2142698555669494	0.0355386383909081	0.1513589713457594	-0.0026537322893228	0.1575372379314191	0.0026537322893228	0.1555244506898227	0.0022656791263897	0.91686463880708	-0.0001938163927919	0.7598797340150593	0.0001938163927919	0.7533215510159245	8.707768544943532e-05	0.8431416535364847	-7.866565355888798e-06	0.6717504576051064	7.866565355888798e-06	0.6653511388299544	-0.0006268351423575	0.7518637192180366	0.0006268351423575	0.7453080227653314	CISD2	4056	UBE2D3	4135	MANBA	112037	False	False	False	ref	-50	0.0514	-100	0.2167
3071	chr4	102888757	C	A	rs223311	0.0588044185	0.1272104433690693	0.0981366205	0.1281635803523698	0.1848234405430753	0.0002413045855702	0.0109182625722645	0.0144843610376431	0.0192859797347954	0.0145745634793002	0.1045280591204513	0.3029955363548379	0.0080907882763707	0.1711001061791051	0.0113380858151346	0.1728696695715283	0.0194201127184987	0.0268952907896111	0.0014954989127845	0.0359253464352351	0.0021863442230426	0.0361798216481689	0.0142233842499422	0.1137887411257183	0.0208035036785325	0.1147909890769654	CISD2	19782	UBE2D3	19861	MANBA	127763	False	True	True	alt	40	0.02197	90	0.248
3072	chr4	102890220	A	C	rs223310	0.2335302139999999	0.0160582413777953	0.2335302139999999	0.0161729058526231	0.0288196044252952	0.2459096801647555	0.0068129815512359	0.0360979171580811	0.0068129815512359	0.0363540390896114	0.2471784170763089	0.142463611297385	0.0596713825586875	0.0221987542658001	0.0596713825586875	0.0225479657804611	0.007570995770917	0.111733629027701	0.0018460633662718	0.0299810683506915	0.0018460633662718	0.0304417572281409	0.0692669327966744	0.0101428877428553	0.0692669327966744	0.0102400788996332	CISD2	21245	UBE2D3	21324	MANBA	129226	False	True	False	alt	10	0.005493	-70	0.0371
3073	chr4	102895366	A	G	rs6830407	0.0304362382	0.45359006771595	0.0304362382	0.4590239619399933	0.012368885095165	0.8122221733144499	0.0003826534814132	0.5776517685012286	0.0003826534814132	0.5838056051789146	0.0078090462208438	0.7645538778672386	0.0002469234156138	0.6834604071621474	0.0002469234156138	0.6896809518868955	9.91627727078566e-05	0.8153594389961468	3.186957575527532e-06	0.7279029984309225	3.186957575527532e-06	0.7342765899816024	0.0008965392101877	0.6567058787991918	0.0008965392101877	0.6628317001050489	CISD2	26391	UBE2D3	26470	SLC9B1	124353	False	False	False	alt	100	0.03323	-100	0.04376
3074	chr4	102896374	C	T	rs10012413	0.00496938	0.8335508630975516	0.00762685304	0.8349979895023247	0.0209445276181086	0.449746616500904	9.269696283021484e-05	0.7991715039017815	0.0001526531159627	0.8009248578795216	0.127320939592887	0.2658076948470134	0.0006731351440436	0.5200033853852161	0.0010628028516579	0.5214164179311783	0.002697456681203	0.2734438453885745	1.2526803585943274e-05	0.5135257274423228	2.129934398482884e-05	0.5147669694768837	0.0011761406750024	0.5650055399870857	0.0018986506548777	0.5665241761716749	CISD2	27399	UBE2D3	27478	SLC9B1	123345	False	False	False	alt	-100	0.01971	80	0.1313
3075	chr4	102897577	T	C	rs4699033	0.163572954	0.0385799978697308	0.163572954	0.0390165783027757	0.0418162611298776	0.0963965698561901	0.0070067042937915	0.0356651017480724	0.0070067042937915	0.0359295934949462	0.1750090726139024	0.2080702765609174	0.0284193131723951	0.0594363513989386	0.0284193131723951	0.0605492464123973	0.007350272557853	0.1160880370422124	0.0012170453577523	0.0449609132638868	0.0012170453577523	0.0457121113491136	0.0410296591996304	0.0316505189931633	0.0410296591996304	0.0321312390432457	CISD2	28602	UBE2D3	28681	SLC9B1	122142	False	False	False	alt	-50	0.03061	-70	0.3079
3076	chr4	102913483	G	A	rs6821247	-0.0512752266	0.2870498455271894	0.0512752266	0.2831893166597553	0.0149448043587982	0.6967200584268581	-0.000790456164296	0.3988868933938629	0.000790456164296	0.3940792561651945	0.0185675167430965	0.666319671819002	-0.0013209886175759	0.5235615542153671	0.0013209886175759	0.5178726381379618	0.0002938790288595	0.7019257378340213	-2.158360494943332e-05	0.560921599293333	2.158360494943332e-05	0.5552472305556045	-0.0033428458315462	0.4798892322410492	0.0033428458315462	0.4744103671505535	CISD2	44508	UBE2D3	44587	SLC9B1	106236	False	False	False	ref	100	0.01804	100	0.124
3077	chr4	102914239	G	T	rs59550147	0.0942452592	0.1277295331375331	0.0942452592	0.1291195068554403	0.0388762123297564	0.1174361184557733	0.0039049645874476	0.1012681061317952	0.0039049645874476	0.1021545127544516	0.0719293325855299	0.3758465724194473	0.0072692312970559	0.2242700843652567	0.0072692312970559	0.2279846415288418	0.0028552493556398	0.2625883338023999	0.0003059333233617	0.1677768234589062	0.0003059333233617	0.1703084652827277	0.0147537197716999	0.1598552566604206	0.0147537197716999	0.1623189076523829	CISD2	45264	UBE2D3	45343	SLC9B1	105480	False	False	False	alt	100	0.00644	100	0.1847
3078	chr4	102925242	C	A	rs7437714	-0.0230279501999999	0.4308144872325655	0.0330795189999999	0.4283509344376016	0.0155824855028412	0.6558564095263184	-0.0003375781657554	0.5187544760406488	0.0005212746387027	0.5165473328576217	0.0001822770611329	0.9980512943641412	-3.2150074281001227e-06	0.9804860581657072	4.43953161744005e-06	0.9787418033902804	2.5191823119566977e-06	0.9983201746859728	-3.758872300476595e-08	0.9820117451628904	5.999950735418904e-08	0.980308407485161	-1.1546963148691892e-05	0.9819304749468356	1.649566164098842e-05	0.9793504305069866	CISD2	56267	UBE2D3	56346	SLC9B1	94477	False	False	False	ref	15	0.01016	100	0.2798
3079	chr4	102928840	T	C	rs3974602	0.0214143734	0.5795971859293654	0.0214143734	0.5857784318016539	0.0076565147788272	0.9808637728212364	0.0001630201486405	0.7731472922535599	0.0001630201486405	0.7798036355551714	0.0082437069050839	0.787834075862855	0.0001839606401845	0.7486822792784089	0.0001839606401845	0.7551010037732447	6.53694714594155e-05	0.8809360817261447	1.4429765889357611e-06	0.8307782226717235	1.4429765889357611e-06	0.8375068473787395	0.0006218864438652	0.7355833202321856	0.0006218864438652	0.7420058410871755	CISD2	59865	UBE2D3	59944	SLC9B1	90879	False	False	False	alt	-100	0.010315	100	0.2908
3080	chr4	102938135	C	G	rs7676943	0.143539846	0.0537425025781867	0.143539846	0.054372825468254	0.0240642547868361	0.3517696230376763	0.0033774333795131	0.0939954745443622	0.0033774333795131	0.095264513445438	0.0509625218567516	0.4549020392847375	0.0080032593149801	0.2016486450292082	0.0080032593149801	0.20510031502868	0.0012502231710945	0.4195738773198686	0.0001918943230602	0.2017390061573218	0.0001918943230602	0.2049859235853059	0.0172594107749661	0.1300111575514439	0.0172594107749661	0.1322731302398863	CISD2	69160	UBE2D3	69239	SLC9B1	81584	False	False	False	alt	95	0.0568	40	0.115
3081	chr4	102938244	A	G	rs4446311	0.14862519	0.0517325265847198	0.14862519	0.0523626887387917	0.0198762786808809	0.4745816134646387	0.0032174560649132	0.1118073786936832	0.0032174560649132	0.1131010307359662	0.057861832338095	0.4329271459740385	0.0103803134090162	0.1716014919354537	0.0103803134090162	0.1746351775628935	0.0013042937344847	0.4228941345716765	0.0002407795898476	0.1896211241872397	0.0002407795898476	0.1926891470963209	0.022048101349345	0.099622323051129	0.022048101349345	0.1011730185679807	CISD2	69269	UBE2D3	69348	SLC9B1	81475	False	False	False	alt	100	0.2351	-70	0.1045
3082	chr4	102938648	G	A	rs6419160	0.02268927342	0.5580698037042663	0.02324418418	0.5627146835638575	0.0153289860645991	0.6693361424567357	0.0003626250394439	0.6015240170928045	0.0003683306902572	0.606209135695358	0.0176157170664115	0.6440351664004748	0.0003465030589871	0.655027225397904	0.0003635127738481	0.658900305395968	0.0002418649275374	0.6890155738514694	5.280466170767409e-06	0.6803706708972832	5.455361845999148e-06	0.6844522000735461	0.0011085084622743	0.6357495277997115	0.0011794398073306	0.6398087309474808	CISD2	69673	UBE2D3	69752	SLC9B1	81071	False	False	False	alt	-75	0.277	100	0.1396
3083	chr4	102940527	A	C	rs10017565	0.02424750256	0.5116671365705391	0.02424750256	0.5176427293039441	0.0244656862907295	0.3401179646024121	0.0006574299052614	0.4560882713467794	0.0006574299052614	0.4612979100795759	0.008562897957837	0.7475840728297249	0.000191761700551	0.7224657264542479	0.000191761700551	0.729074464057225	0.0002065191290039	0.7055680369447777	5.122563217695523e-06	0.6815464761512867	5.122563217695523e-06	0.6879727887149374	0.0007744713140443	0.6988721670954332	0.0007744713140443	0.7055153095920982	CISD2	71552	UBE2D3	71631	SLC9B1	79192	False	False	False	alt	10	0.00537	-65	0.09326
3084	chr4	102940972	C	A	rs11724035	0.00769865522	0.7061633871169771	0.01336285242	0.7105165369912727	0.0266814285659143	0.2898560999138312	0.0002136211807459	0.6038871380034143	0.0003512364326991	0.6082249139276354	0.0091204513213024	0.7390154139628163	4.277404377509975e-05	0.7707500198272685	0.0001262579330751	0.7749006266737928	0.0002395858173953	0.6833970813474268	1.2463717920719845e-06	0.7267354383076113	3.274665606532932e-06	0.7308474675066814	0.0002243409983174	0.7556035554114922	0.000484972452245	0.759840744055774	CISD2	71997	UBE2D3	72076	SLC9B1	78747	False	False	False	alt	85	0.0266	35	0.04523
3085	chr4	102955130	C	T	rs6829718	-0.0107701251199999	0.5585467155815763	0.02333073552	0.555323553808378	0.011814081626245	0.8373838858395858	-0.0001396650868028	0.6669777042385551	0.0002928705334642	0.6635040719689893	0.0057413150341459	0.8110854732348804	-0.0001114759109744	0.7750060924395338	0.000139861705485	0.7708339188468402	6.787216516668643e-05	0.8620253903054631	-1.420934122836044e-06	0.8142915475287148	1.767163976562613e-06	0.8100330438498674	-0.000418165022599	0.763289431578347	0.0005105407277885	0.7590123467903427	SLC9B1	64589	CISD2	86155	UBE2D3	86234	False	False	False	ref	-100	0.01465	100	0.0995
3086	chr4	102955979	G	T	rs4235409	0.0182035124	0.6206612709048663	0.0182035124	0.6269265961166424	0.0269872589901849	0.2826272933235384	0.0005012570428211	0.5059969033073127	0.0005012570428211	0.5116901318903561	0.007728217478803	0.792010449908982	0.0001914870214788	0.7596037300360519	0.0001914870214788	0.7662750842094498	0.0002221780649613	0.735688121208393	5.610484165690192e-06	0.7099398144636322	5.610484165690192e-06	0.716423528729271	0.0006507538517369	0.7415663836123465	0.0006507538517369	0.7482115758525969	SLC9B1	63740	CISD2	87004	UBE2D3	87083	False	False	False	alt	75	0.00641	80	0.07825
3087	chr4	102957720	C	T	rs3857198	-0.0746207122	0.1724983640514837	0.0746207122	0.1700320487413294	0.0250151105622343	0.329167473885449	-0.0018790498189643	0.1876799113292333	0.0018790498189643	0.1851788866201434	0.003172940516644	0.8796904282521735	-0.00025344358673	0.6902550568008136	0.00025344358673	0.6839905320508058	8.10789710007624e-05	0.8382172217801742	-6.5105956619711294e-06	0.6466391560393289	6.5105956619711294e-06	0.6406006052237345	-0.0009245818349773	0.6692102467237064	0.0009245818349773	0.6628816570414615	SLC9B1	61999	CISD2	88745	UBE2D3	88824	False	False	False	ref	35	0.01481	5	0.002563
3088	chr4	102961049	A	C	rs4698867	-0.013805705	0.7121134823198828	0.013805705	0.7054135376656977	0.0152919421937649	0.6791896967198114	-0.0002126516986503	0.7287384536562947	0.0002126516986503	0.7220986097372379	0.0021279403516874	0.9141707675959144	-2.9420416206414568e-05	0.9053133726350744	2.9420416206414568e-05	0.8983213938803104	3.239223845948523e-05	0.923493984268226	-4.5054071787411626e-07	0.9092185691170996	4.5054071787411626e-07	0.9022398344274024	-0.0001146448484048	0.9023102939441816	0.0001146448484048	0.8952790305366086	SLC9B1	58670	CISD2	92074	UBE2D3	92153	False	False	False	ref	-45	0.01434	100	0.1549
3089	chr4	102974160	T	G	rs7659468	0.086418954	0.1323841107394202	0.086418954	0.1345010789024795	0.0193078410487621	0.5063284126505279	0.0016700506416751	0.2008077038591075	0.0016700506416751	0.2036180005753424	0.0009979875292797	0.9661238555483888	8.817423738612283e-05	0.7938749248061323	8.817423738612283e-05	0.8006130172200618	1.9109755705965107e-05	0.9570942631112752	1.6907152406930351e-06	0.7816349284618477	1.6907152406930351e-06	0.7883615176113241	0.0002985714757018	0.804330199159455	0.0002985714757018	0.8111130327654538	SLC9B1	45559	CISD2	105185	UBE2D3	105264	False	False	False	alt	100	0.009766	100	0.1393
3090	chr4	102976939	A	G	rs4699044	0.0471962574	0.305890015985542	0.0471962574	0.3100815398506685	0.0280791989191357	0.2619064507283717	0.0012734172154377	0.27025287251747	0.0012734172154377	0.2741210991515524	0.0003728019530862	0.9923012060126192	2.1624852299460667e-05	0.9129893451713595	2.1624852299460667e-05	0.920020752737442	1.0122045917406146e-05	0.9805175351051966	5.627286608786572e-07	0.8836891105181941	5.627286608786572e-07	0.8906196758387224	7.835439279467798e-05	0.9181682753383632	7.835439279467798e-05	0.9251810731910004	SLC9B1	42780	CISD2	107964	UBE2D3	108043	False	False	False	alt	100	0.1054	-65	0.06494
3091	chr4	102983598	C	G	rs12508069	0.0041270468939999	0.812738557644732	0.008478786374	0.8145066173074876	0.0091640390263227	0.9420133270951762	4.654631408445746e-05	0.881516592218735	8.137836207548202e-05	0.8831954385592419	0.0005641516281217	0.986819553059622	3.989839574346931e-06	0.9737272217419156	6.510553567733488e-06	0.9753318147204352	5.239875865700264e-06	0.9941654936246408	4.363144806273597e-08	0.9819234305110028	6.402897432190777e-08	0.9834853348738304	1.402131239484017e-05	0.9711685794310416	2.721784170763088e-05	0.9719094752839144	SLC9B1	36121	SLC9B2	102231	CISD2	114623	False	False	False	alt	-50	0.000595	10	0.013336
3092	chr4	102994153	T	G	rs7688940	0.0381872228	0.3652294414048287	0.0417362092	0.3685931955623654	0.0224929700099642	0.4022425183294544	0.0006703079365036	0.4100506360455561	0.0007894619782804	0.4135199905016776	0.1010664445250898	0.3277733196478871	0.0015175546685775	0.3626107415016036	0.0020491825608657	0.3660212418461516	0.0025540830586407	0.3085216269097002	2.60370742581676e-05	0.3569867213960355	4.38860045701978e-05	0.3603492599832472	0.003906997459668	0.3462909806826491	0.0048472501732043	0.3497599559118954	SLC9B1	25566	SLC9B2	91676	BDH2	105717	False	False	False	alt	-100	0.0155	-80	0.09033
3093	chr4	103003981	G	C	rs13117110	0.031769742	0.441778596093303	0.031769742	0.447456507405455	0.0118524547158392	0.8329819541025821	0.000362215308913	0.59532590158647	0.000362215308913	0.6016050972125951	0.0034121276104384	0.8743002220965267	9.93893702123932e-05	0.7944927927642843	9.93893702123932e-05	0.8011727751760498	4.054696438352879e-05	0.9100074187004188	1.1040506895683874e-06	0.8319396809742353	1.1040506895683874e-06	0.838770164840278	0.0004057932763682	0.7796859730434793	0.0004057932763682	0.786414068871616	SLC9B1	15738	SLC9B2	81848	BDH2	95889	False	False	False	alt	-45	0.2588	-75	0.0775
3094	chr4	103011399	C	T	rs7695096	0.0525127584	0.2086976395910945	0.0665018224	0.2103329752493697	0.0185343786593115	0.5237200031319205	0.0011526906803419	0.2748851477754967	0.0014183266045301	0.2771446351580587	0.024700603741216	0.5760863243943343	0.0009277305891849	0.4352654963707492	0.001281368554433	0.4392222894554769	0.00041561040464	0.5937384377322542	1.8270185635751223e-05	0.4452879152479013	2.4985355933967178e-05	0.4492821526785154	0.002989013889347	0.3822950702160869	0.0039968988156114	0.3860310289142734	SLC9B1	8320	SLC9B2	74430	BDH2	88471	False	False	False	alt	75	0.0206	-100	0.0956
3095	chr4	104524048	A	C	rs2905625	0.01596627288	0.6557102256967149	0.01596627288	0.6627444299193442	0.0161777985052207	0.6407660065673909	0.0002556556221862	0.6830626046883768	0.0002556556221862	0.6899206235400703	0.216255649764112	0.1642336373323843	0.0039940638651404	0.295400158084721	0.0039940638651404	0.2999197397368302	0.0034537749137654	0.2204031501023589	6.404974598141582e-05	0.3385794089486003	6.404974598141582e-05	0.3435408383751303	0.0052868595559367	0.3417839482836617	0.0052868595559367	0.3469676233736361	CXXC4	29147	TET2	621828	TACR3	804063	False	False	False	alt	100	0.08124	75	0.07434
3096	chr4	104633005	A	G	rs1875310	0.0166199354	0.3146881436833612	0.0500647993999999	0.3148040910855895	0.0271909255796813	0.2795830461265653	0.0003681737874207	0.2980194232757888	0.0013600167161931	0.2979790306652923	0.1586659958430932	0.2167441753989024	0.0013770785001618	0.2191831478303546	0.0070358289363055	0.2187036294727797	0.0043789526666721	0.1832797956734615	2.716605292673372e-05	0.2035706561796941	0.0001939150130173	0.2030265127646142	0.0029485995183267	0.1933650598266219	0.0120904951997624	0.1931101682227657	CXXC4	138104	TET2	512871	PPA2	841062	False	False	False	alt	-100	0.12115	-100	0.2257
3097	chr4	104645245	C	T	rs72662364	-0.279810158	0.013140237998504	0.279810158	0.0130431260868317	0.0522176201782007	0.0525447434269639	-0.0169819510345837	0.0139646805070175	0.0169819510345837	0.0138089425425417	0.3264648147537197	0.0974306089704326	-0.0843018027994944	0.0129838715589346	0.0843018027994944	0.0128473532002123	0.016006437838607	0.0354232199996604	-0.0049500755710859	0.0104995988759046	0.0049500755710859	0.0104986698796107	-0.0892893668965061	0.0065239947309735	0.0892893668965061	0.0065292246358943	CXXC4	150344	TET2	500631	PPA2	828822	False	True	False	ref	50	0.03162	65	0.3667
3098	chr4	104657130	A	G	rs17034785	0.092968699	0.1170373092447033	0.092968699	0.1186593159003875	0.0236160165546504	0.3672402698563586	0.0022140719977894	0.1521701481789284	0.0022140719977894	0.1541959599618258	0.0179200620236877	0.650817318443763	0.0018492127683923	0.4116403131332592	0.0018492127683923	0.4171548269018311	0.0004144877890457	0.6183127359163095	4.263259414120168e-05	0.3927520419655942	4.263259414120168e-05	0.3981955096858771	0.0051548942628088	0.3511574319163916	0.0051548942628088	0.356377481569233	CXXC4	162229	TET2	488746	PPA2	816937	False	False	False	alt	75	0.003418	90	0.2112
3099	chr4	117737811	G	A	rs6856296	0.0763495556	0.1747444064991015	0.0763495556	0.1771736014323172	0.027563363234433	0.2701568042732723	0.0023943034823588	0.1686415075327703	0.0023943034823588	0.1708910181170925	0.0307817294051663	0.5336820370172864	0.0024599130424603	0.3549510772120197	0.0024599130424603	0.3600380256413576	0.0008799351456944	0.4731269148744185	7.797331402534504e-05	0.3131097165202292	7.797331402534504e-05	0.3178609944527136	0.0066312559796772	0.2910257080462117	0.0066312559796772	0.2956736898971706	NDST3	295808	PRSS12	615192	TRAM1L1	652235	False	False	False	alt	100	0.04132	100	0.2944
3100	chr4	117741466	T	G	rs6855141	-0.0032157769199999	0.7610825598933814	0.01148491628	0.7598300123453259	0.0104421463261424	0.8976127525834264	-3.891462585185226e-05	0.8337678995777499	0.0001244013290263	0.8325527536648872	0.0025560027712711	0.8975732763693244	-4.314407307289231e-06	0.9195388779258146	2.5258804010559466e-05	0.9184802522198756	2.657093696196838e-05	0.9367528703403656	-5.692219970763881e-08	0.9404463618612616	2.732873578904372e-07	0.9394001759692376	-2.4743492461487147e-05	0.9150726573411532	9.567483751769896e-05	0.9139942688773688	NDST3	292153	PRSS12	611537	TRAM1L1	655890	False	False	False	ref	0	0.0	100	0.0897
3101	chr4	117743748	A	T	rs7655540	0.00177219146	0.8389335477924423	0.00739347642	0.8399433331247771	0.0138311055821807	0.7375968858673987	1.5040493455588858e-05	0.8559215784934328	0.0001007361482685	0.856652129841329	0.0039713305400679	0.8517063737852345	6.968219845196786e-06	0.9065894143104262	2.7299170914284096e-05	0.9076155427693609	5.4578696757440086e-05	0.8760686313025409	6.86124693875259e-08	0.916024218430347	3.678201311383192e-07	0.9170438027009314	1.7320444723021115e-05	0.9045929133008704	0.0001047474514202	0.90552296116251	NDST3	289871	PRSS12	609255	TRAM1L1	658172	False	False	False	alt	-70	0.1311	-35	0.03452
3102	chr4	117744362	T	C	rs9990663	0.0549886522	0.2531430356966062	0.0549886522	0.2570070545402257	0.0194289633746572	0.5052532411149211	0.0010852889455858	0.3006333600704446	0.0010852889455858	0.3048494530654468	0.0013089307512123	0.9499538775451604	7.337829824949283e-05	0.8123651030145094	7.337829824949283e-05	0.8191026916190419	2.461815740618772e-05	0.9429037031321176	1.399631292100567e-06	0.8021345958600146	1.399631292100567e-06	0.8088098306139058	0.000268879284748	0.8102267414642066	0.000268879284748	0.8169430202677099	NDST3	289257	PRSS12	608641	TRAM1L1	658786	False	False	False	alt	-30	0.002213	-90	0.04443
3103	chr4	117745510	G	A	rs2012723	-0.12353799412	0.0533026960402939	0.15706544588	0.0531589541036401	0.025908452158169	0.3070655871448572	-0.0032707980972689	0.0961630755868498	0.0041501253842536	0.095954683143938	0.4514730625845403	0.0552319645712628	-0.0619435344664665	0.0264865726096063	0.071005735756134	0.0263636488977236	0.0116322601000469	0.0602654115651994	-0.0016331816298902	0.0428293822590852	0.0018706381062313	0.0426277229808614	-0.0416804130513674	0.0287440430025728	0.0525955923592094	0.0286380311052982	NDST3	288109	PRSS12	607493	TRAM1L1	659934	True	False	False	ref	-90	0.0498	90	0.07275
3104	chr4	117755278	T	G	rs4600992	-0.04309484106	0.3613244336393748	0.04309484106	0.3567755460220077	0.0237526630163474	0.3711839570556411	-0.0013726283733365	0.3404368951851343	0.0013726283733365	0.3366086996241945	0.0027836429019167	0.8970266243558274	-0.0001526609497588	0.7941231550810064	0.0001526609497588	0.7874390795940213	7.701891364471343e-05	0.8595524170621988	-5.272954431435001e-06	0.7497584233012831	5.272954431435001e-06	0.7431261161005922	-0.0005154894262808	0.7853189415771525	0.0005154894262808	0.7786304640702898	NDST3	278341	PRSS12	597725	TRAM1L1	669702	False	False	False	ref	-15	0.005737	100	0.1142
3105	chr4	117758445	C	T	rs2169057	0.0915769979999999	0.1342103878833781	0.0915769979999999	0.1359508024699916	0.0312252445158956	0.2083909038233926	0.0033656804581468	0.124519183937218	0.0033656804581468	0.125966313157389	0.0116978984527069	0.7483617977879369	0.0009085595680622	0.5369663308302518	0.0009085595680622	0.5424196207998642	0.0003281573660863	0.6817912511147257	2.8002228796098465e-05	0.4711905163659712	2.8002228796098465e-05	0.4765385127278138	0.0025502292896967	0.5002196373332051	0.0025502292896967	0.5056278356550727	NDST3	275174	PRSS12	594558	TRAM1L1	672869	False	False	False	alt	65	0.01425	85	0.1522
3106	chr4	117759419	T	C	rs1540575	0.0968596675199999	0.1264106640004673	0.0968596675199999	0.128093707422195	0.0453301941338443	0.0756720516992499	0.0046001537834238	0.087176368434879	0.0046001537834238	0.0879448500863575	0.0315017650357955	0.5671203007380023	0.0040610194190352	0.3483375306271006	0.0040610194190352	0.3530146862167435	0.0015210614162755	0.4090484237809012	0.0001997257088567	0.2538230193265149	0.0001997257088567	0.2573680613528931	0.0088985846722311	0.2748712450511881	0.0088985846722311	0.2789350158095178	NDST3	274200	PRSS12	593584	TRAM1L1	673843	False	False	False	alt	5	0.00766	70	0.05664
3107	chr4	117768523	G	A	rs6857739	0.0247373352	0.475424456421199	0.0279393352	0.4797542108198158	0.0428975953913926	0.0892114857148616	0.0010513141742492	0.2824948302307632	0.0011811228705442	0.2851320456918798	0.0098347134703572	0.733053374744875	0.0001540457824125	0.6841848265738897	0.0002212448909421	0.6881363705191109	0.0004164570674344	0.5998671540271486	6.651738783735583e-06	0.5709710961191075	9.375982686301678e-06	0.5746640073533589	0.0006870443073471	0.6586443631467078	0.0008750948500544	0.6628454491328566	NDST3	265096	PRSS12	584480	TRAM1L1	682947	False	False	False	alt	-95	0.0412	75	0.05542
3108	chr4	117768799	G	A	rs1350618	-0.0476582510999999	0.3206888864536951	0.0496400057	0.3177031611298625	0.032659228095839	0.1875580564718981	-0.0016623570591201	0.2512723564171356	0.0017156366882356	0.2491740840233383	0.0096029494243013	0.744824343647567	-0.0006396772354334	0.6150154784649802	0.0006474657121199	0.611196931410589	0.0003376842588959	0.654592835998513	-2.354671227559757e-05	0.5384711177506037	2.375610608703194e-05	0.5345726220413118	-0.0019728811322621	0.578085751044045	0.0020009237570518	0.5738864887737178	NDST3	264820	PRSS12	584204	TRAM1L1	683223	False	False	False	ref	100	0.01892	-95	0.08966
3109	chr4	117771815	C	A	rs1459538	0.184603348	0.0302952504182305	0.184603348	0.0305926532490034	0.1039943560244247	0.0038020865646677	0.02082262316822	0.0074723185506252	0.02082262316822	0.0074951526481478	0.2885305664610207	0.1155092490468019	0.0527655176172396	0.0250998808879559	0.0527655176172396	0.02553837039284	0.0298977195096873	0.0094975638248622	0.00590394291658	0.0072880225091365	0.00590394291658	0.0073056180886493	0.0607700174854013	0.0140070258334648	0.0607700174854013	0.0141633621378633	NDST3	261804	PRSS12	581188	TRAM1L1	686239	False	True	True	alt	-50	0.013855	-85	0.07886
3110	chr4	117772174	A	C	rs10011404	0.0604742276	0.2240697916399306	0.0724446544	0.2259102087898531	0.0700654155421007	0.017858600661463	0.0037350891694843	0.096590732840172	0.0045154690425057	0.0971417327112934	0.4172165220546995	0.0646675607808977	0.0288248072916541	0.0716445581482212	0.033985081753926	0.0722880880503866	0.0288155231765538	0.010158854593899	0.0017626857056488	0.0370026499456511	0.002099095957977	0.0372824146793766	0.0206500940252713	0.1037024460874962	0.0242956352479297	0.10470819132407	NDST3	261445	PRSS12	580829	TRAM1L1	686598	True	True	False	alt	40	0.0509	35	0.06055
3111	chr4	117772414	A	G	rs17867553	0.0923053785999999	0.1005994597742708	0.1086314917999999	0.1016226305170452	0.0208486226922284	0.4539674134888126	0.0022168838578091	0.1605601393929252	0.0025365204286479	0.1621362944068528	0.3182310052456203	0.1011911388738643	0.0332726414659006	0.0472148257442741	0.0377450732454838	0.0479598958693494	0.0069233605785828	0.1206091304703556	0.0008278021830884	0.0707676565403565	0.0009153645289681	0.0716360042577331	0.0316790933984361	0.0412764672920423	0.0369412094619114	0.0417951434239823	NDST3	261205	PRSS12	580589	TRAM1L1	686838	False	False	False	alt	-100	0.0841	-100	0.1821
3112	chr4	117773188	G	T	rs1459540	-0.16734548	0.0503640465701689	0.16734548	0.0499262260865267	0.0829258410576057	0.0092110131034435	-0.0138863706009088	0.0180342499220237	0.0138863706009088	0.0179065817029514	0.1665550460228959	0.2197257823021868	-0.0362162321849399	0.0697983629231224	0.0362162321849399	0.0686356394341114	0.0141855144441668	0.0519288420288537	-0.0030774698741952	0.0295179629945591	0.0030774698741952	0.0291844326796428	-0.0439691861040546	0.0392723183274533	0.0439691861040546	0.0387728586139129	NDST3	260431	PRSS12	579815	TRAM1L1	687612	True	True	True	ref	100	0.02563	15	0.01758
3113	chr4	117776551	G	A	rs17861256	-0.0299650118	0.4837047149763194	0.0318273274	0.4804306835618312	0.0210687146447603	0.4476578408683835	-0.0007427304099276	0.4776513409940088	0.0007764647730396	0.4746289483479003	0.0065693972485236	0.7914393062056715	-0.0002542825527596	0.7522051211631697	0.000264489315549	0.7483580153905675	0.0001426689067023	0.7712539589097347	-6.302622047585615e-06	0.7268020832414736	6.487509417582612e-06	0.7227883367173187	-0.0007802447956187	0.7314065024022037	0.0008346804790339	0.7273833909839358	NDST3	257068	PRSS12	576452	TRAM1L1	690975	False	False	False	ref	-20	0.06757	-100	0.0742
3114	chr4	117778480	G	A	rs1350616	0.0092431842	0.786996788321884	0.0092431842	0.7938633239580394	0.0181110026292717	0.5563888527033319	0.0001643057922071	0.7641931625633788	0.0001643057922071	0.7708447706344986	0.0439832074164494	0.4994259735625301	0.0004292462783132	0.6333968409520867	0.0004292462783132	0.6396269048077299	0.0007571399501341	0.5252425148807197	7.318747795450525e-06	0.640990188949849	7.318747795450525e-06	0.647237055111082	0.0010598462604334	0.6397691509624158	0.0010598462604334	0.6459956054492033	NDST3	255139	PRSS12	574523	TRAM1L1	692904	False	False	False	alt	-100	0.04242	-45	0.1255
3115	chr4	117781119	C	A	rs4295331	0.0140102678	0.6968377705598472	0.0140102678	0.7034718175623093	0.0196353191665071	0.4916518381343041	0.0002708999293012	0.654516845853162	0.0002708999293012	0.6609770486892329	0.0038327669822836	0.8571687088650402	5.29416988367399e-05	0.845899282319623	5.29416988367399e-05	0.8527275215290104	7.408699577851659e-05	0.8447391676559907	1.0101581477777035e-06	0.8315062394250519	1.0101581477777035e-06	0.8383874967569778	0.00020124707202	0.841588129306441	0.00020124707202	0.8483786264918188	NDST3	252500	PRSS12	571884	TRAM1L1	695543	False	False	False	alt	90	0.0654	20	0.01846
3116	chr4	117782152	C	T	rs1380370	0.007641495684	0.787950280068428	0.009747477516	0.7903205475346682	0.028998533872963	0.2441803052585872	0.0002127266292452	0.6847213403514939	0.0002646012579331	0.6871526513542467	0.0129705387483091	0.6829123012528384	0.0001260335269594	0.765213342806559	0.0001547660806619	0.7670636347595374	0.0003610018846155	0.6164832315518272	3.490089544455161e-06	0.7181459388233776	4.188297141011769e-06	0.7196694113338293	0.000400844577876	0.754327957821722	0.0005278611725115	0.7559662346637359	NDST3	251467	PRSS12	570851	TRAM1L1	696576	False	False	False	alt	-100	0.01645	85	0.10333
3117	chr4	117783014	G	A	rs4516794	-0.0342335014	0.4153112945066362	0.0342335014	0.4099933981878181	0.0103981957109264	0.8949912460898249	-0.0003588715761394	0.5919954116333624	0.0003588715761394	0.585876521215321	0.0095394411269835	0.7339267601230544	-0.0003197398136453	0.6469279949079941	0.0003197398136453	0.6409084916701185	9.593316721928707e-05	0.8133184685389121	-3.229341494750337e-06	0.719356891373736	3.229341494750337e-06	0.712880611816411	-0.0011612945795255	0.6186442135626847	0.0011612945795255	0.61265520686191	NDST3	250605	PRSS12	569989	TRAM1L1	697438	False	False	False	ref	-30	0.02112	25	0.0706
3118	chr4	117784084	G	C	rs4568305	-0.170823378	0.036151863541527	0.170823378	0.0358054450135443	0.0446998487332831	0.0789180387739863	-0.0075967274382828	0.0311737043433359	0.0075967274382828	0.0309883413691424	0.3676635544851703	0.0811104067059435	-0.0636151524862553	0.0195811495607582	0.0636151524862553	0.0192959622862183	0.0165161724950154	0.0331910885991814	-0.0028392856718188	0.016697627683659	0.0028392856718188	0.0165172009638853	-0.05951387285144	0.0148791871141604	0.05951387285144	0.0147122789480396	NDST3	249535	PRSS12	568919	TRAM1L1	698508	True	False	False	ref	-100	0.04767	-100	0.4675
3119	chr4	117785060	C	A	rs7661175	-0.00132628086	0.8209037906993636	0.00789299382	0.8223053127548063	0.0218786420296991	0.4189672333564661	-2.1760574502699213e-05	0.7711886425204189	0.0001703641144512	0.7727262958108226	0.0085233083698986	0.753500894559979	-1.2921962209643724e-05	0.833722822482285	6.840533134394509e-05	0.8352110103766143	0.0001804231044196	0.7311482450346202	-2.037461722517563e-07	0.814370501346331	1.4575469238368926e-06	0.8157631605279484	-5.113655108705749e-05	0.8251485547748716	0.0002705288509121	0.8265462803671615	NDST3	248559	PRSS12	567943	TRAM1L1	699484	False	False	False	ref	-15	0.001312	5	0.00946
3120	chr4	117805467	G	A	rs1350617	-0.064844304	0.2091340101872029	0.064844304	0.2060337036724221	0.0158355780858742	0.6502285288758669	-0.0010369778664559	0.3169320650215722	0.0010369778664559	0.31260996864035	0.02857378509452	0.5450101454480004	-0.0019265998729599	0.3852797711464396	0.0019265998729599	0.380333893914729	0.0004780714306896	0.5795889240781389	-3.2679057095024695e-05	0.421030467270419	3.2679057095024695e-05	0.4157445581451768	-0.0053973804889313	0.3276999177236673	0.0053973804889313	0.3230395222842379	NDST3	228152	PRSS12	547536	TRAM1L1	719891	False	False	False	ref	-40	0.00448	-40	0.0909
3121	chr4	117806257	A	G	rs17863939	-0.1385978812	0.0561262599707669	0.1385978812	0.055534254711558	0.0735725759048943	0.0145831343832687	-0.0103082841006861	0.0201367141978027	0.0103082841006861	0.0200558925026786	0.0580927716010688	0.4044239965693751	-0.0081860278238915	0.1766256208078571	0.0081860278238915	0.1733423176049472	0.0042878285843451	0.1832786620459271	-0.0006104878543898	0.0802513628147936	0.0006104878543898	0.078776177204654	-0.0186541189667117	0.1075931987460257	0.0186541189667117	0.1055416873237944	NDST3	227362	PRSS12	546746	TRAM1L1	720681	False	True	False	ref	90	0.02124	-95	0.02026
3122	chr4	117807611	A	G	rs9995094	-0.0245817318	0.3570553932463807	0.0404681798	0.3542448690780226	0.0289537790234414	0.2440162480611016	-0.000609179946924	0.3036520725496036	0.0011262394251774	0.3013416710862938	0.0160321335488766	0.6449084175234532	-0.0003376534921376	0.5582477524783104	0.0006582152999301	0.5541593491596082	0.0004703080722383	0.5728596487183069	-8.273762861147264e-06	0.5008145894651508	1.8707153491174312e-05	0.4970383777924942	-0.0012982085711457	0.5127617473647603	0.0022500082478307	0.508756170701675	NDST3	226008	PRSS12	545392	TRAM1L1	722035	False	False	False	ref	-100	0.0819	-100	0.12036
3123	chr4	117812502	C	A	rs17865121	0.02149525806	0.5422734464185699	0.02244452274	0.5471921416665472	0.018882890702436	0.5088141228457016	0.0004728752074055	0.5216330632574324	0.0004882529184461	0.5263821622076627	0.0476666886608821	0.4639358213816902	0.0015155445706769	0.4815355033767786	0.0015290619858707	0.4859779690198513	0.0009442341914712	0.4747853302296801	3.14566289089286e-05	0.480844769060581	3.1675605667460986e-05	0.4854590293400261	0.0034764606908382	0.4531119587590675	0.0035292468080894	0.4578649133482683	NDST3	221117	PRSS12	540501	TRAM1L1	726926	False	False	False	alt	-60	0.1327	100	0.456
3124	chr4	117815750	G	C	rs6824201	0.101979143	0.1086354379566365	0.101979143	0.1101047911432575	0.0243382960563665	0.3483009804605685	0.0026224292914416	0.1438777978983393	0.0026224292914416	0.1457023823008406	0.0244201774933192	0.5724349989499755	0.0026484257715472	0.3383762538645057	0.0026484257715472	0.3430778063625592	0.0005969420847394	0.5367319838595868	6.60985422274753e-05	0.3209331519371101	6.60985422274753e-05	0.3255436058480008	0.0071640658506812	0.2695435262722878	0.0071640658506812	0.2737022134770045	NDST3	217869	PRSS12	537253	TRAM1L1	730174	False	False	False	alt	70	0.0195	-45	0.05554
3125	chr4	117825076	A	C	rs1459530	0.22557371	0.0174618869768459	0.22557371	0.0176151682724929	0.0377933843012244	0.1312129542781706	0.0083518735136232	0.0273423614814366	0.0083518735136232	0.0274880955496251	0.1666169047540496	0.2089607107759615	0.0367748269074043	0.0400648804656063	0.0367748269074043	0.0408043797917711	0.0060071670984921	0.1361863007618093	0.0012935384595405	0.0374320055434914	0.0012935384595405	0.0381150110344033	0.055309128699152	0.0161581184724247	0.055309128699152	0.0163565116080503	NDST3	208543	PRSS12	527927	TRAM1L1	739500	False	True	False	alt	0	0.0	35	0.04297
3126	chr4	117833987	T	C	rs4834639	0.177876036	0.0337214826059416	0.177876036	0.0339927470704562	0.0347598118164118	0.1588083065800615	0.0067080410873239	0.0430646180936708	0.0067080410873239	0.0433732486975679	0.0737817953878129	0.3921122271974605	0.0158636652986895	0.1314627259197029	0.0158636652986895	0.1336294937653186	0.0027622159761479	0.2913864832808475	0.0006144190976712	0.1084201515935941	0.0006144190976712	0.1100933214130296	0.0282760384019002	0.0732284939445873	0.0282760384019002	0.0743723633790456	NDST3	199632	PRSS12	519016	TRAM1L1	748411	False	False	False	alt	30	0.00929	-70	0.1157
3127	chr4	117861630	C	A	rs4377658	-0.0297435838	0.4822842058187851	0.0299461437999999	0.4779388020506359	0.036699974297989	0.1371535657390721	-0.0011296420449032	0.333447841940317	0.0011360816579935	0.3302510954685396	0.0014796608491966	0.9459037203457686	-5.6056752970051707e-05	0.8761170791322134	5.624637522474499e-05	0.8716787263455601	5.46388686281423e-05	0.8833360972542631	-2.1091607074977614e-06	0.8113817726520383	2.1151890147604254e-06	0.806931134295122	-0.000234238395302	0.8615598927673689	0.000234238395302	0.8561166499198544	NDST3	171989	PRSS12	491373	TRAM1L1	776054	False	False	False	ref	90	0.002167	85	0.1283
3128	chr4	117913276	A	G	rs7680858	0.0306132876	0.4574768288238616	0.0306132876	0.4629966565008908	0.0119119104353187	0.8343089376829094	0.0003621426877109	0.5907861164629014	0.0003621426877109	0.5969019856874793	0.0155446867473854	0.6523324479596522	0.0004806054498211	0.588271913333583	0.0004806054498211	0.5941505647321306	0.0001840385256214	0.7251210277888901	5.653850731680798e-06	0.6486366638367225	5.653850731680798e-06	0.6547279926403093	0.0015959552637655	0.5587267598553358	0.0015959552637655	0.5647329618000759	NDST3	120343	PRSS12	439727	METTL14	772117	False	False	False	alt	-100	0.02454	-60	0.0555
3129	chr4	117917400	A	G	rs67213843	0.142609306	0.0518107299151685	0.142609306	0.0523986055209452	0.0647906352431975	0.0234221527284495	0.0093896973972132	0.0227383785014307	0.0093896973972132	0.0229058488304028	0.0286925538583352	0.5503396214364699	0.0037856099544728	0.2726072832185918	0.0037856099544728	0.2768927434286922	0.0018306915254434	0.3376550890248181	0.000245381341341	0.1517067378670136	0.000245381341341	0.1544680306057764	0.0099081191646596	0.2024195292106083	0.0099081191646596	0.2059454737597414	NDST3	116219	PRSS12	435603	METTL14	767993	False	False	False	alt	-15	0.00415	10	0.01855
3130	chr4	117929247	A	G	rs55923363	-0.06584469452	0.2072349294906855	0.06662833428	0.2049423000090416	0.0154677525543761	0.6493320510601944	-0.0011321892459615	0.3114150506230355	0.00114012910082	0.3080556089884965	0.0357023852726732	0.5225895621563977	-0.0027282849334429	0.3746750732028052	0.0027391821049194	0.370783149438927	0.0005903015107193	0.5605425829094659	-4.699623854962928e-05	0.4083240596614144	4.710664892285524e-05	0.4041464446681597	-0.0070057074989277	0.3066966870012407	0.007043647520702	0.3030714210217409	NDST3	104372	PRSS12	423756	METTL14	756146	False	False	False	ref	-95	0.02728	75	0.1272
3131	chr4	117931831	C	T	rs28521069	0.0462331552	0.3070239259691293	0.0462331552	0.3111196337580643	0.0302909335943305	0.220403235589972	0.0014724337621616	0.2389821952335892	0.0014724337621616	0.2422513381383616	0.0121234865230443	0.7061708977519374	0.0005144081293548	0.5809131658153237	0.0005144081293548	0.5871421717508891	0.0003427459347435	0.6363070239033987	1.5805071100673084e-05	0.5158566171955271	1.5805071100673084e-05	0.5218006695945439	0.0017749331925703	0.5472925533313778	0.0017749331925703	0.5534759498204118	NDST3	101788	PRSS12	421172	METTL14	753562	False	False	False	alt	20	0.007446	60	0.2812
3132	chr4	117937561	T	C	rs7666685	0.042444771	0.3747564169490567	0.042444771	0.3790054916533128	0.0239987842195942	0.3569287681892085	0.001132486218721	0.3545605406709669	0.001132486218721	0.3582435284208168	0.0108104318564217	0.7893448036921961	0.0006966114120311	0.6826449983364032	0.0006966114120311	0.6888919388911693	0.0003018393867261	0.748852545442032	2.01699418436676e-05	0.6455320165139771	2.01699418436676e-05	0.6514008652103752	0.0018219458282471	0.6446314844032204	0.0018219458282471	0.6504322239354358	NDST3	96058	PRSS12	415442	METTL14	747832	False	False	False	alt	-55	0.005554	-55	0.1161
3133	chr4	117946001	A	G	rs6821845	0.0252721743259999	0.52315799893916	0.0252721743259999	0.5290883584290854	0.0122240982503595	0.8140721255934583	0.0002912883466637	0.6571150855223843	0.0002912883466637	0.6635442462165834	0.0001913496750354	0.9978103461873418	5.406685573646686e-06	0.9703038665475614	5.406685573646686e-06	0.977417846367925	2.211364513757909e-06	0.9988697161398524	6.025732819120299e-08	0.9759345788050208	6.025732819120299e-08	0.9829928122837198	1.732044472303784e-05	0.9723588261178554	1.732044472303784e-05	0.9782063184266154	NDST3	87618	PRSS12	407002	METTL14	739392	False	False	False	alt	-30	0.014336	-25	0.00769
3134	chr4	117951461	T	C	rs145065097	0.015474801	0.4491492361110979	0.031960559	0.4512563262963314	0.0146770751645178	0.708128755367124	0.000233887259796	0.5341087168680091	0.0004795906985358	0.536258326325549	0.0007563260862392	0.9804358920362484	1.3775533446934268e-06	0.9221689703550848	2.2530702769198097e-05	0.9236194315613108	1.133358285738772e-05	0.9815911096138716	2.454550705383759e-08	0.9251035071743164	3.39965930617578e-07	0.9266998294296732	7.423047738452893e-06	0.9276233371815534	7.670482663057321e-05	0.9291540042001464	NDST3	82158	PRSS12	401542	METTL14	733932	False	False	False	alt	20	0.0719	-100	0.162
3135	chr4	117956409	G	A	rs12641736	0.0176882582	0.4221196963117047	0.0356853314	0.4228255946172564	0.013894057300306	0.7419076058949496	0.0003064347829575	0.5338962913948244	0.0005219157001124	0.5349845492374345	0.0352924680808947	0.5306659785926233	0.0005476087401173	0.5109542080958767	0.0008343567898975	0.511885334207409	0.000497572095139	0.593195167185482	8.669091826818288e-06	0.5563190142485654	1.217361664051243e-05	0.5575424725293462	0.0012157302629408	0.4885264932649692	0.0023522813500048	0.4894543139131063	NDST3	77210	PRSS12	396594	METTL14	728984	False	False	False	alt	95	0.0177	-15	0.05627
3136	chr4	117959589	T	C	rs4834649	0.0182746864	0.6245367700953575	0.0182746864	0.6308158172212754	0.0105748586536898	0.8930763282370084	0.0001946895665662	0.737757019989228	0.0001946895665662	0.7444311380832926	0.0015943056976014	0.938749544076986	3.066788522658066e-05	0.8947117772581472	3.066788522658066e-05	0.9016748836455462	1.7098900266682577e-05	0.9639736473174736	3.317145956062839e-07	0.91946733525574	3.317145956062839e-07	0.9264218310719208	0.0001162944145689	0.8926551415636375	0.0001162944145689	0.8996265868984857	NDST3	74030	PRSS12	393414	METTL14	725804	False	False	False	alt	10	0.007263	60	0.03125
3137	chr4	117960299	G	T	rs2389473	-0.0031374105999999	0.370215204102276	0.0385284058	0.3707132322267084	0.0889945157399537	0.0075353644240243	-0.0008023918156398	0.0959069828693764	0.0035775123510682	0.0963798253283978	0.0521436112302464	0.446402564910795	0.0008747270091964	0.3942712572245938	0.0018800082016998	0.3954938182876822	0.0042832717587272	0.1937666932796911	5.548282595101536e-05	0.2079053328669786	0.0001610235652673	0.2086363619113307	0.0015967800468476	0.3624782056179857	0.0046105374286562	0.3636574163111238	NDST3	73320	PRSS12	392704	METTL14	725094	False	True	True	ref	50	0.0661	50	0.1067
3138	chr4	117976359	T	C	rs13111689	0.0274403324	0.4985736030274649	0.0274403324	0.5043050526125501	0.0113925041413115	0.8545099332560437	0.0003134219730008	0.6340537269443273	0.0003134219730008	0.6404734068678948	0.0019299924119955	0.9273425473122856	5.531382660670934e-05	0.8525563584697571	5.531382660670934e-05	0.859308795840961	2.052017005245118e-05	0.9556863944981184	5.846830447162032e-07	0.8850478196386151	5.846830447162032e-07	0.891839632845251	0.0002152683844148	0.844772229711503	0.0002152683844148	0.8514455630398061	NDST3	57260	PRSS12	376644	METTL14	709034	False	False	False	alt	-35	0.01712	-45	0.021
3139	chr4	117983309	C	T	rs10005201	0.00050525894	0.8745370765714627	0.0053437467	0.8734009370813276	0.0249635040560794	0.3303506207187652	1.4137513076271912e-05	0.8040347300753016	0.000132324223233	0.8029566725903818	0.0243393487512783	0.5786047330537922	3.4789755870678204e-05	0.7562616826674711	0.0001411195904001	0.755345710979179	0.0005821904108511	0.5413163789278881	1.005150782419418e-06	0.719690354601775	3.438598350682596e-06	0.7189354287589563	0.0001039226683382	0.7618318862273034	0.0004552802612912	0.760810277910886	NDST3	50310	PRSS12	369694	METTL14	702084	False	False	False	alt	30	0.006226	-90	0.06128
3140	chr4	118005778	A	G	rs1994381	-0.00931309722	0.7569305524157101	0.01161958442	0.7526245665921997	0.0112547937961179	0.8473896808818326	-0.0001080198232317	0.8281549675658171	0.0001264957061585	0.8237880443976305	0.0053495430701725	0.8140075051748317	-4.286974569405146e-05	0.8527000041286974	5.9753116518043e-05	0.848399565692594	5.91157694619049e-05	0.8685812693468307	-5.112000143716876e-07	0.8855543491191079	6.464425508893582e-07	0.8811946162734078	-0.0001781531457226	0.841292761468944	0.0002424862261224	0.8370275405503474	NDST3	27841	PRSS12	347225	METTL14	679615	False	False	False	ref	95	0.02406	-75	0.0384
3141	chr4	118006805	C	A	rs2892779	0.00429805984	0.5944405967297299	0.01927018464	0.5971248623336523	0.0359519482578457	0.1441402364789775	0.0001248220227439	0.4206975421232048	0.0006977671879071	0.4231184046740588	0.008362475668899	0.7564558760688476	5.806760245977321e-05	0.743047828576491	0.0001538939443421	0.7464679780272349	0.0002955446818391	0.6545662867152631	1.811843377518268e-06	0.6576730963146471	5.478873895867409e-06	0.6607725211306108	0.0001501105209329	0.7266022787594137	0.0005905446867473	0.7298919273016479	NDST3	26814	PRSS12	346198	METTL14	678588	False	False	False	alt	-50	0.005028	35	0.05063
3142	chr4	142816006	G	A	rs1992418	-0.1449293996	0.0574230429440152	0.1610045364	0.0571322820839148	0.0285053318799137	0.2537618870614016	-0.0041727842993202	0.0920829255065023	0.0046413250646706	0.0919845473076033	0.5461391903929267	0.0356662267375707	-0.0831390023447676	0.0176033410510683	0.0914135629399647	0.0176206835870788	0.0156622344665222	0.0368100253246135	-0.0024116039887015	0.0293088804980079	0.0026529017369146	0.0293069344890753	-0.044025271353634	0.0337174819317148	0.0491653195209659	0.0336598039414107	INPP4B	31426	USP38	368912	GAB1	520871	True	False	False	ref	35	0.0166	20	0.05273
3143	chr4	142880194	C	G	rs6537131	-0.0134867364999999	0.664304873442906	0.0159831947	0.6599529715281527	0.015983184702591	0.6421343482702399	-0.0002317379633423	0.6763987737335777	0.0002744625222086	0.6721060921819594	0.0405644815413545	0.4835439802300206	-0.0005103079664088	0.5659748614239783	0.0006271171072148	0.5619112195800912	0.0006626071067663	0.5271598446252344	-9.034744565072022e-06	0.5904077755337189	1.1033824292302742e-05	0.586344159043232	-0.0014400712612582	0.5554447442432913	0.0017287453399755	0.5513897013824722	INPP4B	32762	USP38	304724	GAB1	456683	False	False	False	ref	-85	0.01259	100	0.04678
3144	chr4	142881443	T	C	rs17016873	-0.00163060616	0.5043256735113091	0.02827835704	0.5051716396195861	0.0142958924133661	0.7206376345464115	-4.947694295799525e-05	0.6046978062967532	0.000393712891295	0.6056821010815164	0.0096408894460756	0.7431358493348043	2.3244355269603493e-05	0.7125973156972233	0.0002275044024347	0.7139741238443609	0.0001342500078959	0.7783902590360945	-7.461087898247432e-10	0.741739684607585	3.082015334603646e-06	0.7428761316804661	7.752960971264597e-05	0.6957378290671039	0.0007983900234238	0.6972048552504324	INPP4B	34011	USP38	303475	GAB1	455434	False	False	False	ref	90	0.00241	95	0.0008545
3145	chr4	142885070	C	A	rs7681616	-0.0623110461999999	0.2421949756248002	0.0623110461999999	0.2388649545715439	0.0209424635151005	0.4518972120893855	-0.0014928521719341	0.2773811431537181	0.0014928521719341	0.2740064015050023	0.0032422222955362	0.8797320397806557	-0.000178283588982	0.7317951984238775	0.000178283588982	0.7253254293996501	6.575461077451456e-05	0.8621669621578835	-4.081559268079883e-06	0.7102522220919366	4.081559268079883e-06	0.7038562430390298	-0.0006400316716702	0.7153711996335181	0.0006400316716702	0.7089693097844894	INPP4B	37638	USP38	299848	GAB1	451807	False	False	False	ref	-100	0.03046	-50	0.0501
3146	chr4	142889951	C	T	rs7679474	-0.0710499679999999	0.1825087206310135	0.0710499679999999	0.1797058244596443	0.0243530432063019	0.3482617220936488	-0.0017284653335549	0.1986577236013863	0.0017284653335549	0.1959287386521621	0.0038096730559862	0.8551112930433811	-0.0002749043950198	0.6669351006420329	0.0002749043950198	0.6607416959412814	9.139335136656572e-05	0.8171067110230696	-6.56627458103731e-06	0.6295484220842175	6.56627458103731e-06	0.6234487301004148	-0.0010293292863976	0.6401160321360374	0.0010293292863976	0.6339680180721049	INPP4B	42519	USP38	294967	GAB1	446926	False	False	False	ref	50	0.01517	35	0.0337
3147	chr4	142891668	T	A	rs10006846	-0.0705752343999999	0.2266220569591623	0.0705752343999999	0.2236277077061386	0.0144948726156361	0.6872457827253529	-0.0013959793881429	0.3449082809063357	0.0013959793881429	0.3409187720632188	0.0083393817426016	0.7621382970025148	-0.0007660843164636	0.5873311636923261	0.0007660843164636	0.5815359294509864	0.0001400065073848	0.7909263270879571	-1.6224490153121767e-05	0.6127330574355376	1.6224490153121767e-05	0.606788520192736	-0.0022161921414667	0.546435517029685	0.0022161921414667	0.5408566613680555	INPP4B	44236	USP38	293250	GAB1	445209	False	False	False	ref	15	0.00351	30	0.03156
3148	chr4	142899155	A	G	rs4690706	-0.0117175915199999	0.7462267140788409	0.0117175915199999	0.7395285661594956	0.015748213526906	0.6590727239518359	-0.0001806210880002	0.7575526595466285	0.0001806210880002	0.750824877794948	0.0051449968658242	0.8218553626006045	-5.6668468803855626e-05	0.8505430762858828	5.6668468803855626e-05	0.8436757881287827	8.116353124801422e-05	0.8381495431585074	-8.685124273145364e-07	0.8570638295606305	8.685124273145364e-07	0.8502290772080047	-0.0002276401306455	0.8424754761385862	0.0002276401306455	0.8356349714472263	INPP4B	51723	USP38	285763	GAB1	437722	False	False	False	ref	-100	0.01755	-100	0.10675
3149	chr4	142901689	C	T	rs28390284	0.0128356711999999	0.7105328578210867	0.0128356711999999	0.7171962816544085	0.0234513930022345	0.3683724422298774	0.0003084679875901	0.6198595993442813	0.0003084679875901	0.6261655019970565	0.0493987331331859	0.4460178033065786	0.0006841129495457	0.5353159532260491	0.0006841129495457	0.5412373042053069	0.0012010860347125	0.4155430006657279	1.69236001942979e-05	0.5037891104968033	1.69236001942979e-05	0.5097421816874307	0.0017584375309293	0.5430367137207451	0.0017584375309293	0.5490093330237994	INPP4B	54257	USP38	283229	GAB1	435188	False	False	False	alt	20	0.01709	15	0.01037
3150	chr4	142904550	T	C	rs4690709	0.1229734237999999	0.078496876897663	0.1229734237999999	0.0794893282315124	0.0390249969500047	0.1164947354986428	0.0049588614260226	0.0672457392186388	0.0049588614260226	0.067863022680392	0.0038146217544785	0.8682824047570075	0.0005185117508648	0.6133451970125288	0.0005185117508648	0.6193262091775267	0.0001598470005633	0.7711033190920692	2.27177658932252e-05	0.5091735344911339	2.27177658932252e-05	0.514614545126428	0.0014656395368017	0.6017889359820491	0.0014656395368017	0.6077437823906277	INPP4B	57118	USP38	280368	GAB1	432327	False	False	False	alt	100	0.02136	35	0.0462
3151	chr4	142906694	G	C	rs1605954	-0.0029041044	0.5567697616721199	0.0230114175999999	0.5552415201037207	0.0157428365101068	0.6562433403105938	-2.3928665615379988e-05	0.6080701130234452	0.000348050213923	0.6069309425408994	0.0032100557553363	0.8839442154488002	1.584996503361176e-05	0.8315285281451993	7.397961540198342e-05	0.8300435463728778	5.337743846830929e-05	0.8918016267620904	2.759588881697176e-07	0.8391724800639888	1.202587375332107e-06	0.8376303863267403	5.773481574343521e-05	0.826353571604893	0.0002738279832403	0.8249311356377869	INPP4B	59262	USP38	278224	GAB1	430183	False	False	False	ref	80	0.009766	-40	0.02881
3152	chr4	142908324	T	A	rs28849788	-0.0076185976999999	0.7898419561175126	0.0092879896999999	0.7855027758667933	0.0116126049358851	0.8381564315145273	-9.270677252499356e-05	0.8366080556008134	0.0001111210199991	0.8324811665474736	0.0063021675299395	0.8009417897065548	-2.8982289363985147e-05	0.8916363735476924	3.5570690167944544e-05	0.8876141843083285	6.928310321420686e-05	0.8562912042695618	-3.5813111448754746e-07	0.9121054178903564	4.308045450606654e-07	0.9081748324112164	-0.0001212431130612	0.8883980167391968	0.0001476361716868	0.8843901611776135	INPP4B	60892	USP38	276594	GAB1	428553	False	False	False	ref	100	0.00809	0	0.0
3153	chr4	142918372	C	T	rs1510139	0.0106836287	0.7171355171169578	0.0128186103	0.7218463350174884	0.0127753612730858	0.7966928745795336	0.0001450332513692	0.7637604362541747	0.0001691535111154	0.7684533252153202	0.013286430668734	0.6802920009095305	0.000107208243305	0.7342775598832372	0.0001483868120603	0.7383709426890346	0.000163094080141	0.7412067604157992	1.403628393958356e-06	0.7707255535192057	1.8688491670805528e-06	0.7749361818376165	0.0004000197947939	0.7316147032130371	0.0005286859555936	0.7357147758775968	INPP4B	70940	USP38	266546	GAB1	418505	False	False	False	alt	-100	0.0216	80	0.01678
3154	chr4	142922142	G	T	rs2083619	0.173027194	0.0364996217684484	0.173027194	0.036900072487107	0.0383604753177318	0.1243328289974018	0.0071160671265291	0.0395331477947142	0.0071160671265291	0.0398904131638759	0.008446603543268	0.7926843582535728	0.0015856615365677	0.4620029410064552	0.0015856615365677	0.4676184628096447	0.0003428781056057	0.6864058962437436	6.60637460997641e-05	0.3692864494405041	6.60637460997641e-05	0.3741646521132158	0.0044216621028668	0.4100890164161895	0.0044216621028668	0.415429461567097	INPP4B	74710	USP38	262776	GAB1	414735	False	False	False	alt	-70	0.005432	-100	0.1024
3155	chr4	142925492	A	G	rs10017013	0.1240736272	0.071029347666847	0.1240736272	0.0720587241435757	0.0190880258682807	0.5177460390019988	0.0024822174081139	0.1417477670950696	0.0024822174081139	0.14361794203176	0.0468551021081455	0.4569720380841342	0.0061892371388366	0.2190360378594911	0.0061892371388366	0.222759244923659	0.0009327623407271	0.4646546230262814	0.0001265707782681	0.2402020616212961	0.0001265707782681	0.2441153001439406	0.0141780211804294	0.1486236614986704	0.0141780211804294	0.1513079810416841	INPP4B	78060	USP38	259426	GAB1	411385	False	False	False	alt	70	0.01709	-65	0.329
3156	chr4	142926884	C	T	rs1876939	-0.0176438902	0.6450886755007204	0.0176438902	0.638882236380882	0.0172275643130761	0.5946453990825439	-0.0003130648134554	0.6444453978435613	0.0003130648134554	0.6380814987928127	0.0571483949721223	0.4164620396808217	-0.0010598131410152	0.4860919147423525	0.0010598131410152	0.4807173701863226	0.00101141909378	0.4470213308753755	-1.913313857027112e-05	0.5048864432431608	1.913313857027112e-05	0.4993260902755704	-0.0025040414371019	0.4848010256577872	0.0025040414371019	0.4792753556789294	INPP4B	79452	USP38	258034	GAB1	409993	False	False	False	ref	-90	0.03308	-15	0.02338
3157	chr4	142932630	G	T	rs2010483	0.0007810210799999	0.8485116111465881	0.0061602190799999	0.8477041607503121	0.0134279150509188	0.7532032972146536	7.306007917430205e-06	0.8601645683798078	8.869204517518066e-05	0.859200159018026	0.002021543334103	0.9241338477410576	8.979591939583488e-07	0.941563985133028	1.564949457481693e-05	0.940077885413784	2.8525635437275463e-05	0.9386867409858136	-1.491093243543413e-09	0.9442815083738464	2.3013124317743577e-07	0.943904315697542	9.072613902552858e-06	0.9428259900612264	6.185873115368714e-05	0.9420502467195356	INPP4B	85198	USP38	252288	GAB1	404247	False	False	False	alt	-55	0.0282	-45	0.0667
3158	chr4	142944753	A	G	rs4690738	0.086417284	0.1319410516309412	0.086417284	0.1338419669804222	0.0272190882175919	0.2781507534312713	0.0024210705687034	0.1400097513074127	0.0024210705687034	0.1418703415187317	0.0034913067863151	0.8690774204980436	0.0003322601354	0.644132641369189	0.0003322601354	0.6503609763785115	9.800301700141565e-05	0.8176635997069138	9.548609853818496e-06	0.5898486841629699	9.548609853818496e-06	0.595979219278112	0.0010878888852231	0.6311926749707576	0.0010878888852231	0.637392019621148	INPP4B	97321	USP38	240165	GAB1	392124	False	False	False	alt	50	0.0695	35	0.008545
3159	chr4	142945462	G	A	rs13115045	-0.0849916218	0.1448961704501979	0.0849916218	0.1430034778374334	0.0582373923362339	0.0338997586151755	-0.0049486321674021	0.0647169422203967	0.0049486321674021	0.0641372515553728	0.0037651347695555	0.8639484426097293	-0.0003283585322896	0.6733081184769201	0.0003283585322896	0.6670323134408009	0.0002250287464304	0.7082961916877011	-1.966763047561181e-05	0.5142441280228554	1.966763047561181e-05	0.5086039898229164	-0.0010590214773514	0.6604858950802797	0.0010590214773514	0.6542872832057293	INPP4B	98030	USP38	239456	GAB1	391415	False	False	False	ref	-25	0.003052	70	0.10876
3160	chr4	142949730	G	A	rs10009395	-0.0243061228	0.4465292016625458	0.0314379856	0.4441410821260539	0.0234881790138786	0.3700193067581576	-0.000636639285517	0.4173234794073969	0.0007993677471471	0.4156653370459852	0.0547185840124047	0.4258407652732353	-0.0017226352095621	0.417749739997995	0.0020601638641924	0.4155122082223408	0.00138688383172	0.3938279349190655	-4.77838612684698e-05	0.3943595954584744	5.563732048138269e-05	0.392372064539225	-0.0040422618851242	0.3789984274374303	0.0049445745768862	0.3767379342057313	INPP4B	102298	USP38	235188	GAB1	387147	False	False	False	ref	30	0.02132	15	0.02942
3161	chr4	142955127	A	G	rs34596213	0.192118706	0.0273710342182538	0.192118706	0.0276406204135999	0.0717368469722107	0.0163303705976416	0.0137996794296895	0.0125285349208207	0.0137996794296895	0.012586065963851	0.1139528553990299	0.3782839385858397	0.0253693615953359	0.137010134652351	0.0253693615953359	0.1389959045064991	0.007599773495683	0.1782105867566129	0.001655562875544	0.0810843480775695	0.001655562875544	0.0821510230013212	0.0312485566296063	0.0960221125640648	0.0312485566296063	0.0973423532404942	INPP4B	107695	USP38	229791	GAB1	381750	False	True	False	alt	100	0.03027	15	0.02515
3162	chr4	142960579	A	T	rs4690740	0.0797806412	0.158656931983747	0.0797806412	0.1607941775954416	0.0250060288962478	0.3289155885487065	0.00220902367123	0.1739146540407244	0.00220902367123	0.1760324975418458	0.1672882781828378	0.2080638138832729	0.0142914645021275	0.1234716876741577	0.0142914645021275	0.1258048161261139	0.0041918526746923	0.1930464398446137	0.0003871216364179	0.1273386625013439	0.0003871216364179	0.1294817330550024	0.0212860017815314	0.0922985214500951	0.0212860017815314	0.0938014474658631	INPP4B	113147	USP38	224339	GAB1	376298	False	False	False	alt	25	0.002892	30	0.07495
3163	chr4	142964484	C	T	rs17678304	-0.248440434	0.0156284584614206	0.248440434	0.0155456306380712	0.035779687010995	0.1526352966269204	-0.0097854453705663	0.0267596888319104	0.0097854453705663	0.0265986652462197	0.0109638415096829	0.7091582110646324	-0.0029203238542421	0.3276897253225693	0.0029203238542421	0.3230826042230283	0.000411582698825	0.6040182414220291	-0.0001185624706109	0.2590404832792752	0.0001185624706109	0.2550163257922263	-0.0068737422057998	0.2802679613903778	0.0068737422057998	0.2759354839790844	INPP4B	117052	USP38	220434	GAB1	372393	False	True	False	ref	45	0.01178	-70	0.02808
3164	chr4	142965389	G	A	rs10026166	-0.0625773799999999	0.2342401887385876	0.0625773799999999	0.2308600387856335	0.017569723904628	0.5771970548083329	-0.00109221956813	0.3184944820642594	0.00109221956813	0.3142716226720069	0.0042253637293391	0.8554287119066593	-0.0002627374143552	0.6985817786838653	0.0002627374143552	0.6924162186823106	7.485792564727402e-05	0.8553171090095453	-4.6610015568509954e-06	0.7016366677703505	4.6610015568509954e-06	0.695438942193653	-0.0008569496222492	0.6829942303399587	0.0008569496222492	0.6769101528326936	INPP4B	117957	USP38	219529	GAB1	371488	False	False	False	ref	-70	0.01944	50	0.0732
3165	chr4	142970712	G	A	rs7666854	-0.0909353194	0.1361272221170653	0.0909353194	0.1346661859130473	0.0372065932428736	0.1354972617746756	-0.0039667205979272	0.1049338016274701	0.0039667205979272	0.1037126099465817	0.0082016429678993	0.76245844381217	-0.0007879387730704	0.5413107729238815	0.0007879387730704	0.5353831536153469	0.0003042672214427	0.6560274703357092	-3.3653669890383444e-05	0.4436103571533111	3.3653669890383444e-05	0.4381960698606607	-0.002570848866748	0.497845206789845	0.002570848866748	0.4919191332301464	INPP4B	123280	USP38	214206	GAB1	366165	False	False	False	ref	-100	0.0606	60	0.1831
3166	chr4	142971699	C	G	rs11936467	-0.0047843202679999	0.5952463013355594	0.020560611732	0.59716563389233	0.0157263385708359	0.6443547861798898	-0.000178560617504	0.6146162460563614	0.0004123895560256	0.6162566903892636	0.0868752268153475	0.3310501383727119	-0.0005527094429554	0.4577193386205105	0.0017344049864578	0.45966257774616	0.0013556198467002	0.3870139139327106	-1.786592713230222e-05	0.4844541577483818	3.546113110221778e-05	0.4864351763621724	-0.0013468707729867	0.4446299585306494	0.0039168948566526	0.446382394568893	INPP4B	124267	USP38	213219	GAB1	365178	False	False	False	ref	70	0.01114	-100	0.12024
3167	chr4	142972938	T	C	rs6820975	0.2507335699999999	0.0134797854097474	0.2507335699999999	0.0135426680099273	0.0384849994756688	0.1220688975065772	0.0099174368926505	0.0211395753589692	0.0099174368926505	0.0211936588018492	0.1808171950776945	0.1950974107223052	0.0450603264910699	0.0318811236889084	0.0450603264910699	0.0324987631789801	0.0069101563789181	0.1190234815821451	0.0017604204103828	0.0290183830130065	0.0017604204103828	0.0295571603211057	0.0633573620137903	0.0120473354141432	0.0633573620137903	0.0122029247182422	INPP4B	125506	USP38	211980	GAB1	363939	False	True	False	alt	100	0.02832	90	0.2056
3168	chr4	142972944	A	T	rs6815888	0.0938850634	0.1316384974396607	0.1001898326	0.1328957980798505	0.016490748811199	0.5952468959694869	0.002274405567581	0.2350092618881784	0.002337827178295	0.2369412896609251	0.1481590841608656	0.2367873091700396	0.0198603989798672	0.1196101374016702	0.0202392238598851	0.1211911568771559	0.0028802377879392	0.284370573770029	0.0005247155715315	0.1663666727874645	0.0005285262873941	0.168282946024827	0.0266553396456731	0.0833776971736351	0.0276764211012503	0.0844467893159798	INPP4B	125512	USP38	211974	GAB1	363933	False	False	False	alt	95	0.03687	80	0.1909
3169	chr4	142973444	C	G	rs13101590	-0.0011564464	0.394947239374628	0.039762918	0.3936776381232739	0.0718026931177246	0.0160885119296974	0.0001190513646501	0.1491784844346015	0.0028328944589107	0.1484899758342765	0.1104689716604532	0.2876440010253632	0.000496560234119	0.2880172242840623	0.0042540674651164	0.2868580768882927	0.008285843944352	0.0990503832823794	5.9364992407291554e-05	0.1535583975464013	0.0003091146238005	0.1527008657615888	3.1341757117899635e-05	0.2636469539149219	0.0081653525122892	0.2623306321816313	INPP4B	126012	USP38	211474	GAB1	363433	False	True	False	ref	45	0.003418	55	0.062
3170	chr4	142973452	A	G	rs13128465	-0.02341246814	0.4765915263145363	0.03279695934	0.4759615404137078	0.0983994425536085	0.0048692911684151	-0.0030454012697875	0.1800596597971859	0.003727818800124	0.1804116368980192	0.1053058295668239	0.2965581347785093	-0.0045830779891585	0.3487690941573234	0.0053879347486909	0.3478825790372882	0.010746603169933	0.0713123276058444	-0.0005746272694995	0.1685283140819638	0.0006324391934108	0.1687938759873322	-0.0064366071723136	0.3228511336778766	0.0083731978489656	0.3223957742890864	INPP4B	126020	USP38	211466	GAB1	363425	False	True	True	ref	-15	0.00928	20	0.02441
3171	chr4	142975241	T	A	rs13147901	-0.0270093194	0.5073059728565764	0.0270093194	0.5017510540844392	0.0107907106976447	0.8642694468115957	-0.0003070401857863	0.6503787515427017	0.0003070401857863	0.6441201576133935	0.2077232687803107	0.1680536449229533	-0.0058630529952963	0.2304456423043544	0.0058630529952963	0.2267981318346453	0.0022188917844583	0.2941461427710713	-6.618607750816766e-05	0.3290069741066261	6.618607750816766e-05	0.3242624989305285	-0.0083030912869914	0.2498028165443803	0.0083030912869914	0.2457392240129989	INPP4B	127809	USP38	209677	GAB1	361636	False	False	False	ref	-80	0.03906	-5	0.01678
3172	chr4	142976607	A	G	rs4690743	-0.00583900906	0.6736907131815892	0.01714289666	0.6744112922540964	0.0239421558804662	0.3570526790114896	-0.0001890096792034	0.6323703259760267	0.0004277387967149	0.6331064756437	0.0056877041338127	0.8053445312689429	-5.102898015007551e-05	0.8285635308953013	0.0001246078986437	0.8296864702387189	0.0001369422155526	0.7667554305150385	-1.5885446546512183e-06	0.8000227362485054	3.131588228366173e-06	0.8010671329892911	-0.0001732044472303	0.8144735968097844	0.000435485467322	0.8144254083069488	INPP4B	129175	USP38	208311	GAB1	360270	False	False	False	ref	-90	0.003815	-90	0.00525
3173	chr4	142976996	T	C	rs13110491	0.135525512	0.0575158209641609	0.135525512	0.0581943114508255	0.0405627130875657	0.1095937327314783	0.0059281356904487	0.0509572159098924	0.0059281356904487	0.0513632690303084	0.0056637854244333	0.8116791806214436	0.0008065002379452	0.5144085706326049	0.0008065002379452	0.5201553989177886	0.0002349618172364	0.7011363311162763	3.561357366779392e-05	0.4108191646403417	3.561357366779392e-05	0.4161460722158142	0.0024759988123123	0.4803587695577617	0.0024759988123123	0.4860290850297146	INPP4B	129564	USP38	207922	GAB1	359881	False	False	False	alt	90	0.09686	80	0.1572
3174	chr4	142977422	T	C	rs9308158	0.04113589646	0.3506529858307197	0.04178931874	0.3543274440227176	0.0158569898715331	0.6490318802547971	0.0007112654490659	0.4366225685542886	0.0007198786120208	0.4406895729371888	0.0078601827719309	0.7732726755896063	0.0003297971148817	0.6843590013870265	0.0003371831732374	0.6888749995423353	0.0001307821817797	0.7893063313750852	6.186777895758882e-06	0.6941506574933511	6.284138093622052e-06	0.6987245995724108	0.0011406750024743	0.6497523554538309	0.0011736663257562	0.6543207323854149	INPP4B	129990	USP38	207496	GAB1	359455	False	False	False	alt	-100	0.004707	-100	0.077
3175	chr4	142990330	C	T	rs1510140	-0.202913956	0.0257448166716251	0.202913956	0.0254953036613636	0.0362488206660805	0.1528605183482794	-0.0085702103880743	0.0367211394398767	0.0085702103880743	0.0363731210035762	0.0549486984922965	0.4226692030310826	-0.0126819943897281	0.1439636909455691	0.0126819943897281	0.1413605869845495	0.0022596383973217	0.3145509287810704	-0.0005979380773362	0.1128993299119618	0.0005979380773362	0.1110953184052733	-0.0248210220711952	0.0799306196542945	0.0248210220711952	0.0785386893856744	INPP4B	142898	USP38	194588	GAB1	346547	False	False	False	ref	-50	0.001312	100	0.1699
3176	chr4	155258235	A	G	rs2341895	0.1352818568	0.057921641477959	0.1352818568	0.0587261958944289	0.0465921031296196	0.0698022038037239	0.0062940905220946	0.0400300864331899	0.0062940905220946	0.0404279126724028	0.0127395994853352	0.7235016127057957	0.0019388692278306	0.421457652107214	0.0019388692278306	0.4267399902090493	0.0005777006149949	0.5756732809635815	8.792461779119915e-05	0.3113004237192131	8.792461779119915e-05	0.3157455535795153	0.0051169542410345	0.3622029310745304	0.0051169542410345	0.3672303583101159	NPY2R	49598	MAP9	118735	GUCY1A1	408492	False	False	False	alt	85	0.02686	85	0.3862
3177	chr4	155281590	G	T	rs12651028	-0.008802341053	0.7696275071153744	0.0106981237469999	0.7672750471275801	0.0178611245656906	0.5613437793555102	-0.0001569767585806	0.7591403116442217	0.0001897272511519	0.756905927723919	0.0005550790142192	0.984894306675314	-3.7801435629966608e-06	0.9838974098134868	4.161652858960844e-06	0.982255867818872	1.065541799841903e-05	0.9799275398944388	-7.74024124673542e-08	0.979817310311305	8.398768940415287e-08	0.9781239865156964	-1.4021312394840138e-05	0.9832399970509172	1.5670878558938986e-05	0.980366968755056	NPY2R	72953	MAP9	95380	GUCY1A1	385137	False	False	False	ref	-100	0.0414	-70	0.0823
3178	chr4	155296326	G	A	rs982012	-0.253883698	0.0152715029186291	0.253883698	0.0151384961214704	0.0556681409960367	0.0412283655514057	-0.0147597889502523	0.0132624578853252	0.0147597889502523	0.0131846855310669	0.2870970934644188	0.1181248503212387	-0.0769877065637402	0.0180463455556404	0.0769877065637402	0.0178496134484636	0.0148079298304446	0.042174083899428	-0.0040612694715966	0.0129612380819393	0.0040612694715966	0.012860837530431	-0.0721107848635808	0.0101795048722032	0.0721107848635808	0.0100988338592097	MAP9	80644	NPY2R	87689	GUCY1A1	370401	False	True	False	ref	-45	0.02313	-45	0.1113
3179	chr4	155297067	G	T	rs877367	-0.0031033774	0.7201521088942792	0.0130413862	0.7191576510913855	0.017297923074082	0.592087251391065	-6.72346247171435e-05	0.7164332727784849	0.0002250706712901	0.7154437182288192	0.0309780277786941	0.5395264543032001	1.939203377413505e-05	0.6307409741487785	0.0004151189437802	0.6301268234400285	0.0005258299050571	0.563748259473179	-1.9135609739341466e-07	0.6419834806759852	7.021905216357702e-06	0.6413232197279095	8.000395895881997e-05	0.6176002180622776	0.0012726402956022	0.6171151647499502	MAP9	79903	NPY2R	88430	GUCY1A1	369660	False	False	False	ref	-80	0.0515	100	0.272
3180	chr4	155322740	T	C	rs1037027	0.0303070059999999	0.2700555413092415	0.051889326	0.2721426115280621	0.0146330067464806	0.6954005539794609	0.0004924397652307	0.3899271523884863	0.000745055519444	0.3928087932810103	0.0528991125334036	0.4276567937281872	0.0015881311464601	0.3172620633918354	0.0027503409832444	0.3198694161014368	0.0007516911568486	0.4893522497706647	2.4607042921610832e-05	0.3717668486820873	3.821042337143564e-05	0.3746700259803521	0.0038583352578271	0.2640290532065618	0.0070419979545379	0.2664887921928069	MAP9	54230	NPY2R	114103	GUCY1A1	343987	False	False	False	alt	85	0.0947	70	0.3367
3181	chr4	155324249	C	T	rs1955154	0.03433722188	0.4132934979125521	0.03433722188	0.4185734259518846	0.0149071329287847	0.6895322551007821	0.0005016260618726	0.5134897711669089	0.0005016260618726	0.5194947241567517	0.0016800831381345	0.9355218873209388	6.30114966196812e-05	0.8434384874788936	6.30114966196812e-05	0.8503726021070996	2.487833739049676e-05	0.9421505874477526	9.212352628868656e-07	0.8546362959847853	9.212352628868656e-07	0.8615315715841115	0.0002400118768763	0.8360815926737356	0.0002400118768763	0.842940560402688	MAP9	52721	NPY2R	115612	GUCY1A1	342478	False	False	False	alt	-100	0.06915	-85	0.06323
3182	chr4	155334090	A	G	rs1899932	-0.0115161282	0.6240782477791212	0.0177148674	0.6212869853018406	0.0147195393483	0.6994086621320098	-0.0002106084085727	0.6652312522885092	0.0002913373773602	0.6628600971683999	0.0317731186697897	0.5388187553195741	-0.0002808156051929	0.6131324509172054	0.0004652725805824	0.6107213289236391	0.0004444853216762	0.5926408910056365	-4.60460299339408e-06	0.6423912760732986	6.920978585233448e-06	0.6401087244936935	-0.0008866418132031	0.6009278769523066	0.0014244003826993	0.5984950001491461	MAP9	42880	NPY2R	125453	GUCY1A1	332637	False	False	False	ref	100	0.0489	95	0.1475
3183	chr4	155342266	G	A	rs1020356	-0.0561663606	0.2257059819022074	0.067173545	0.2234901762423903	0.0682021693908835	0.0195068992913335	-0.003662666667758	0.0803538281358951	0.0045547007465608	0.0796892264176629	0.284647487710732	0.1187552571696529	-0.0110312093376284	0.1090798369794928	0.0158046146663844	0.1076614899673332	0.0196748868727297	0.0250222878004813	-0.0006861233918942	0.0502006016185006	0.0010729652960657	0.0494834191554958	-0.01598924482861	0.1073445870921128	0.0198261357263039	0.1059268181064655	MAP9	34704	NPY2R	133629	GUCY1A1	324461	True	True	False	ref	0	0.0	-10	0.001953
3184	chr4	155349668	C	T	rs116327309	0.0206472240999999	0.590870056664427	0.0206472240999999	0.5971071664195254	0.0374804509486434	0.128992148582301	0.0007719596172412	0.3894485286158058	0.0007719596172412	0.3944192981920101	0.1136913991620203	0.2808418009149449	0.0023805383361265	0.3476763665720788	0.0023805383361265	0.3523618271897467	0.0042795180152446	0.1887343627263988	8.929460235006841e-05	0.2709251168469236	8.929460235006841e-05	0.2750322255569303	0.0044934182310052	0.356905739305813	0.0044934182310052	0.3618244162867698	MAP9	27302	NPY2R	141031	GUCY1A1	317059	False	False	False	alt	100	0.08704	100	0.3105
3185	chr4	155350000	T	C	rs17311826	-0.0035192752339999	0.7988967531981159	0.009419930994	0.7978086049424562	0.0688373197454859	0.0191095366111201	-0.0001213775480546	0.5320182807068126	0.0006025573963152	0.5317926840793259	0.049717924185939	0.4399572419958142	-0.000163553230401	0.6739856700813605	0.0004931483384095	0.6734827182322275	0.0033363109607665	0.2279405215084685	-4.752699448309784e-06	0.5050283049591947	3.186066417381478e-05	0.5047076170389199	-0.0003810497839068	0.674571084416907	0.0012602685493714	0.6739231660960175	MAP9	26970	NPY2R	141363	GUCY1A1	316727	False	True	False	ref	-100	0.1335	-100	0.3281
3186	chr4	155380586	T	G	rs7657567	-0.0500989906	0.2880110644622723	0.0500989906	0.2842029993653752	0.0195380414032944	0.493501839620847	-0.0010332982050068	0.3246316131825091	0.0010332982050068	0.3207474618799011	0.0077207944310645	0.7713345205507564	-0.000361974212339	0.6406841169681531	0.000361974212339	0.6347865424771644	0.0001381059616794	0.7707426739632466	-6.83452164678195e-06	0.635807606780102	6.83452164678195e-06	0.6297913887375125	-0.0012182046121869	0.6151673543563273	0.0012182046121869	0.609189434692949	MAP9	3616	NPY2R	171949	GUCY1A1	286141	False	False	False	ref	-35	0.01953	-90	0.02695
3187	chr4	169282697	A	C	rs13112591	-0.00898993182	0.7573683981976809	0.01134899738	0.7551252393159923	0.0179575737276778	0.5619014881651069	-0.0001510868506881	0.7503327225436163	0.0002012447861977	0.7480897887119091	0.0037008016891557	0.8652207288679303	-3.738462197220742e-05	0.8866751633424275	4.371840647606742e-05	0.8849454964988176	6.23334684660844e-05	0.8660729012917403	-5.888528813063585e-07	0.884577359653517	7.238890827435028e-07	0.882924485910781	-0.0001616574840816	0.8794092025400383	0.0001831018442149	0.877711682757786	SH3RF1	11741	CBR4	272422	NEK1	329935	False	False	False	ref	0	0.0	0	0.0
3188	chr4	169315812	C	T	rs4692712	-0.0066170906	0.2231943912268344	0.0628028958	0.2234011808496337	0.0168561700441496	0.6064861729924693	-0.0001560467194654	0.3101144140004965	0.001149906807132	0.3101872564077861	0.4355514499686582	0.0595109814510076	-0.0038590397850608	0.0610818952833913	0.0289449516704372	0.0612365624414328	0.0075056470757006	0.1077082325982076	-8.396661937049875e-05	0.0990451416895474	0.0005363496101745	0.0989639646839982	-0.0024858962092969	0.0947812481331612	0.0210649599155421	0.0948821401926943	SH3RF1	44856	NEK1	296820	CLCN3	296822	True	False	False	ref	85	0.0421	30	0.01697
3189	chr4	169364223	G	A	rs6839248	-0.0042478230799999	0.870075385350101	0.00570981452	0.8682916957208963	0.009401525751723	0.924694382245579	-4.15624540456905e-05	0.9190009620552658	5.47280400838344e-05	0.9176115288884102	0.0096697568539473	0.7279064717491358	-3.533310099030454e-05	0.8637953399702278	5.0774993997935263e-05	0.8623967522276457	9.278421437514506e-05	0.8215979445994022	-3.5990426709072417e-07	0.9058411651189138	5.00555305735602e-07	0.90444256923329	-0.0001204183299791	0.8662788358667867	0.0001781531457226	0.8648756379232521	SH3RF1	93267	NEK1	248409	CLCN3	248411	False	False	False	ref	100	0.0553	-15	0.0991
3190	chr4	169374686	G	A	rs12641082	0.0105448769	0.7636320235168146	0.0105448769	0.7703600095937366	0.0199105935387618	0.48220790356351	0.0002158403825083	0.7124119845695719	0.0002158403825083	0.7191670486085755	0.0196017947279864	0.6166969293212616	0.0002118178704332	0.7021204220178461	0.0002118178704332	0.7084122354079883	0.000400630153697	0.6074862511216357	4.357651237999628e-06	0.6850695128651566	4.357651237999628e-06	0.6914345585783428	0.0007241595460393	0.6943967856053049	0.0007241595460393	0.7007273243223596	SH3RF1	103730	NEK1	237946	CLCN3	237948	False	False	False	alt	95	0.05307	40	0.06042
3191	chr4	169388304	T	C	rs12500131	0.0044830931999999	0.3906247551797439	0.0399005532	0.390780429176256	0.0276062276923595	0.269751066685149	0.0001312802634891	0.3295037170743641	0.0011873141656943	0.3298177673338834	0.0101934941110487	0.724874592953846	0.0001550338077668	0.6420795969028267	0.0004349772922507	0.6429542797514606	0.00028245617746	0.6630767301791821	4.6717527307102856e-06	0.5844531175547937	1.3097534217074616e-05	0.585320736053085	0.0003596054237735	0.6189904585458853	0.0013575929530532	0.6197053872584976	SH3RF1	117348	NEK1	224328	CLCN3	224330	False	False	False	alt	100	0.0842	40	0.04028
3192	chr4	169486897	T	G	rs6553440	-0.0130858575799999	0.687150557640945	0.01376375886	0.6823663100790883	0.025244917051748	0.3217028920574145	-0.0003462283201252	0.6017227498596588	0.0003634903716757	0.5971089920741676	0.0032034574906799	0.8814230438933487	-2.784548201234821e-05	0.9028892497806218	3.0037238299245507e-05	0.8983785510117499	7.771285412492095e-05	0.8429840147956189	-7.177895226910663e-07	0.8722124452722599	7.736003191659091e-07	0.8674777676958668	-0.0001105209329945	0.9059878104758377	0.0001154696314868	0.901388968187353	NEK1	125735	CLCN3	125737	SH3RF1	215941	False	False	False	ref	40	0.001648	-10	0.02148
3193	chr4	169570462	A	G	rs75394761	-0.1925193639999999	0.042104870398804	0.1925193639999999	0.0418113691800124	0.0344275750506904	0.1660295456350722	-0.0073867355515163	0.0551624934178663	0.0073867355515163	0.0547524558695233	0.0014928573785094	0.9452281809565494	-4.327844586002227e-05	0.9087030088475404	4.327844586002227e-05	0.9019436110911726	4.052326073143546e-05	0.9287670679659904	-1.3095476525283006e-06	0.8691596940699171	1.3095476525283006e-06	0.862231600201648	-0.0001649566164098	0.9113790475338752	0.0001649566164098	0.9075090109526353	NEK1	42170	CLCN3	42172	HPF1	187482	False	False	False	ref	-15	0.00903	-5	0.0105
3194	chr4	169590400	T	G	rs4235024	0.04333322766	0.3522798974853189	0.0485858479399999	0.3540603052169362	0.0331980222000668	0.1796377558246263	0.0017206881515489	0.2833924103188805	0.0018970868669735	0.2845269443216613	0.0036191481640328	0.8850376996164863	0.0003408104152249	0.7565677566923305	0.0003480288217045	0.7584862288133308	0.000142898268269	0.8055809301867319	1.4953528159618177e-05	0.6792501304041059	1.5193438640843196e-05	0.6815830070427416	0.0009930388307874	0.7315281734762147	0.0010210814555771	0.7335770377667963	NEK1	22232	CLCN3	22234	HPF1	167544	False	False	False	alt	-5	0.006958	-100	0.07697
3195	chr4	169639180	C	T	rs4692574	-0.0111069131	0.7533341268323618	0.0112224051	0.7486480202187987	0.0862128609620188	0.0081724684488119	-0.0009266658240983	0.361095269617381	0.0009386104494567	0.3576127966693082	0.0130728118504832	0.707891935835943	-0.0001524498260608	0.7627920980707054	0.0001529027676048	0.758105934540236	0.0010948039004653	0.452063421380644	-1.2957793062567534e-05	0.5830295082688026	1.3004638014547869e-05	0.5783984942582224	-0.0005402329187423	0.7515704564047428	0.0005451816172346	0.7468820156144098	CLCN3	26546	NEK1	26548	HPF1	118764	False	True	False	ref	-65	0.02515	-95	0.2922
3196	chr4	169678993	C	A	rs115477840	0.0896129916	0.1326412876301637	0.0896129916	0.1344482704630162	0.0467054136012115	0.0709090881149425	0.0043421544831437	0.0768747431467627	0.0043421544831437	0.0777540492390073	0.0009485005443568	0.9653044946759064	4.689361039497796e-05	0.8675204933068517	4.689361039497796e-05	0.8744691709665467	4.239786963391982e-05	0.9139287175808084	2.3160242898189405e-06	0.7799801501705146	2.3160242898189405e-06	0.7868120996357842	0.0001765035795585	0.8711573157640672	0.0001765035795585	0.8780782682770022	CLCN3	66359	NEK1	66361	HPF1	78951	False	False	False	alt	55	0.08997	-95	0.4844
3197	chr4	169694182	A	G	rs6823311	0.0043647822199999	0.8226369634163188	0.0081486171399999	0.8245218511607301	0.0140085417835587	0.740472036674542	5.367905250732128e-05	0.8445367145101338	0.0001110473442735	0.8463774379239624	0.0017262709907293	0.9301512485786896	8.60888254860245e-06	0.944970145209366	1.3948083343600365e-05	0.9466970040749269	2.383886842553765e-05	0.9433075626841428	1.0869811021287565e-07	0.950257320174782	1.88385763194107e-07	0.951878363414828	3.216654019991425e-05	0.947952623706471	4.866220184090256e-05	0.949669022873194	HPF1	63762	CLCN3	81548	NEK1	81550	False	False	False	alt	100	0.00929	0	0.0
3198	chr4	169736898	C	T	rs6850446	-0.0967870432	0.1193614962648966	0.0967870432	0.1178866234499817	0.0373064843873074	0.1316450687410621	-0.0037130926875872	0.0945419930191121	0.0037130926875872	0.093510224537304	0.0122818448747978	0.6914009826356212	-0.0010439162979907	0.4721466359134496	0.0010439162979907	0.4665902760702213	0.000449020746024	0.5799490506924271	-3.963176687057312e-05	0.3809020981967446	3.963176687057312e-05	0.3757355486525598	-0.003322226254495	0.4235129424915206	0.003322226254495	0.4181006403663274	HPF1	21046	CLCN3	124264	NEK1	124266	False	False	False	ref	-100	0.0426	-90	0.0691
3199	chr4	175797785	G	A	rs1027407	0.0252525228	0.5131196371559861	0.0252525228	0.5191402262323144	0.0345502753066893	0.1604838437623071	0.0008726113241435	0.3480775931425091	0.0008726113241435	0.3527991191134569	0.0070263270759789	0.798529207974967	0.0001885354493925	0.7320960161510235	0.0001885354493925	0.7384148648719421	0.0002289048629641	0.7106967188442379	6.109177909389548e-06	0.6528159841426996	6.109177909389548e-06	0.6588544363040434	0.0006796212596086	0.7076940523256133	0.0006796212596086	0.7139589608295215	GPM6A	204879	WDR17	268057	SPATA4	397800	False	False	False	alt	-100	0.0271	-65	0.0746
3200	chr4	175802229	G	T	rs28376387	0.0457658036	0.304963311826578	0.0457658036	0.309467369611588	0.0261231912982628	0.3009378530468136	0.0012071496531639	0.266541957249267	0.0012071496531639	0.270367392911899	0.0163381280723169	0.6515463146011485	0.0007429385253495	0.5201726909105275	0.0007429385253495	0.525934854195204	0.0004310180005797	0.5968994765202159	1.9747192223030048e-05	0.4753136895327051	1.9747192223030048e-05	0.4810352783875669	0.0023992939856817	0.4809965802899917	0.0023992939856817	0.4869494253524044	GPM6A	200435	WDR17	263613	SPATA4	393356	False	False	False	alt	-100	0.188	-100	0.2004
3201	chr4	175823911	C	T	rs17062106	0.0350691608	0.3941368790238656	0.0350691608	0.3996198432038679	0.0102496239299856	0.9013686289734506	0.0003735605749078	0.5751983095386612	0.0003735605749078	0.5815681099463973	0.2448022170169245	0.1426446906942753	0.0084078068548656	0.1727525243980689	0.0084078068548656	0.1761141115673496	0.0024548523485017	0.2765851568246696	8.75575374764032e-05	0.2719224891718818	8.75575374764032e-05	0.2762351986763753	0.0113250964996205	0.1831736093308846	0.0113250964996205	0.1865582299169151	GPM6A	178753	WDR17	241931	SPATA4	371674	False	False	False	alt	100	0.04733	100	0.2484
3202	chr4	175934070	C	T	rs62334820	-0.118554888	0.0771696900878247	0.118554888	0.0761227377965956	0.0451664078781201	0.0779491357247998	-0.0054601783843903	0.0516990407096381	0.0054601783843903	0.0512331590929508	0.0100037940021773	0.7388447425864075	-0.0011057723544871	0.4721017578008976	0.0011057723544871	0.4664768993161281	0.0004750461283354	0.5956598199986831	-5.2935375370897154e-05	0.3538583886513974	5.2935375370897154e-05	0.3489932586080188	-0.0035465672528124	0.4189751370126181	0.0035465672528124	0.4135148859246244	GPM6A	68594	WDR17	131772	SPATA4	261515	False	False	False	ref	85	0.02376	-70	0.0601
3203	chr4	182609678	A	G	rs12501338	-0.0330237294	0.4413723211593223	0.0330237294	0.4358819357924546	0.0176294915948295	0.5744900467590432	-0.0005933395984554	0.4835536353485849	0.0005933395984554	0.4778175254167592	0.0018656593315957	0.9297015235544064	-7.054436362972192e-05	0.8491394559777561	7.054436362972192e-05	0.8422873762143305	3.367803840431675e-05	0.924036443000498	-1.322072929342958e-06	0.8442896948152787	1.322072929342958e-06	0.8373754987403224	-0.0002812510309788	0.8369744134356942	0.0002812510309788	0.8301603003126397	DCTD	308258	TENM3	465690	WWC2	489580	False	False	False	ref	95	0.009186	-30	0.04688
3204	chr4	182609964	G	T	rs55875929	0.00169963528	0.7548576320238175	0.0107321104799999	0.7588082977410933	0.0198819054001464	0.4874056268826851	3.4397134993141166e-05	0.7127083614395613	0.0002234493097572	0.7161453958729035	0.0012124311306126	0.957387007072406	-6.653059669611302e-07	0.9474819400878378	1.2632645468035316e-05	0.951736685793197	2.3843006370671774e-05	0.9474328521398953	-1.7761231726259165e-08	0.9360783212190976	2.6056852640932106e-07	0.9403638713039733	3.2991323282131544e-06	0.9482685862548612	4.453828643065316e-05	0.9526206687454392	DCTD	307972	TENM3	465976	WWC2	489294	False	False	False	alt	-95	0.02762	45	0.0784
3205	chr4	182610323	C	T	rs55903810	-0.015388153214	0.6835164493158168	0.015723078186	0.6791573625022526	0.020589711574831	0.463271514395907	-0.0003208806714307	0.6525606159788976	0.000327250585643	0.6482660153385166	0.0003043449572761	0.9955952585897284	-4.758111299149084e-06	0.9830948368189296	4.824409007245448e-06	0.9791409809085854	6.416119825463817e-06	0.9922108166135558	-1.003270030715169e-07	0.9765173172402708	1.0158791446584413e-07	0.972573276565643	-1.732044472303785e-05	0.9840701423790594	1.732044472303785e-05	0.9788093101354124	DCTD	307613	TENM3	466335	WWC2	488935	False	False	False	ref	70	0.01663	-70	0.1414
3206	chr4	182617560	T	C	rs17324506	0.0218926894	0.5707204000734233	0.0218926894	0.5769272186995258	0.0135645225635596	0.7533616600346961	0.0002984769761687	0.6460017560025471	0.0002984769761687	0.652567846337355	0.0104236085909405	0.7229013030858984	0.0002359847648554	0.6906850946393868	0.0002359847648554	0.6969385267329076	0.000147503954724	0.7680153433102734	3.349571675736589e-06	0.7254024331107143	3.349571675736589e-06	0.7316697178938542	0.0008000395895879	0.6750552205791717	0.0008000395895879	0.6812081039536888	DCTD	300376	TENM3	473572	WWC2	481698	False	False	False	alt	100	0.02304	100	0.04584
3207	chr4	182664152	T	C	rs28753071	0.0622576362	0.2180856259976531	0.0622576362	0.2212923843083859	0.0312101748663942	0.2062926147328072	0.0020208261241523	0.1743234718014936	0.0020208261241523	0.1765828148931343	0.0370245125531984	0.4965313736967806	0.0022191539107447	0.3482322235596697	0.0022191539107447	0.353043995149078	0.0011527539942958	0.4150812016244046	7.193884194414398e-05	0.2932133621134364	7.193884194414398e-05	0.2977036307404318	0.0060555573884068	0.2934364288298653	0.0060555573884068	0.2978248788896313	DCTD	253784	WWC2	435106	TENM3	520164	False	False	False	alt	15	0.0005493	-35	0.0407
3208	chr4	182691382	G	T	rs7694547	-0.0263905684599999	0.3198474949718244	0.04941446954	0.3207505104792998	0.0454105237425387	0.0756373038123709	-0.0011762631040363	0.2023977888904894	0.0021514855959517	0.2033934405044774	0.2015852330836989	0.176362882994004	-0.0053146805172223	0.1950857468460005	0.0089654755793258	0.1955737438990199	0.0095692812930845	0.0840914743226824	-0.0002317990424464	0.1347107300136025	0.0003933039834076	0.1353987695169599	-0.0072737620005938	0.1789452633320239	0.0136080960707333	0.179501102031192	DCTD	226554	WWC2	407876	TENM3	547394	False	False	False	ref	-100	0.013916	-70	0.05713
3209	chr4	182692684	A	G	rs12501438	-0.0002999937999999	0.7375142088303834	0.0117968253999999	0.7386544799039713	0.0107225900670974	0.8877267319117365	-5.521095940361239e-06	0.8176536350898023	0.0001262571753545	0.8190215629881555	0.0140839959090758	0.6707909966337262	-1.12283375024931e-05	0.7302529995630654	0.0001978535028674	0.7315206131800835	0.0001481515507578	0.7567247338005837	-1.6024767071428305e-07	0.7850650060733727	2.104616059964657e-06	0.7861573577551089	-2.3918709379418668e-05	0.7177758162836418	0.0006985912704958	0.7191034540422014	DCTD	225252	WWC2	406574	TENM3	548696	False	False	False	ref	-100	0.02228	-100	0.06616
3210	chr4	182716504	A	G	rs35751669	-0.139862101	0.0588027901507568	0.139862101	0.058144765500547	0.0291555308318072	0.2423328580891164	-0.0045418601229747	0.0777459169922493	0.0045418601229747	0.0769519579676999	0.3211804295470291	0.0998495087290918	-0.0432119639944893	0.0346383351905871	0.0432119639944893	0.0340212298107438	0.0092027347310945	0.0833486885935622	-0.0013787471718592	0.0410879149695494	0.0013787471718592	0.0404914858709661	-0.0471841905578832	0.0251757698902284	0.0471841905578832	0.0248463515792738	DCTD	201432	WWC2	382754	TENM3	572516	False	False	False	ref	100	0.00209	-10	0.02393
3211	chr5	3417816	T	C	rs10462767	0.1467333316	0.0540316234342413	0.1467333316	0.0547163284891879	0.0405527908243728	0.1050841667372118	0.0060662155624422	0.0487327271778107	0.0060662155624422	0.0491872495242826	0.1717379829104945	0.202791639574573	0.024685864805378	0.0693403107383624	0.024685864805378	0.0707039758178949	0.0067849821478583	0.1185782513331223	0.0009850709231312	0.0530354840421578	0.0009850709231312	0.053954573666046	0.0376257794200124	0.0375780368880294	0.0376257794200124	0.0381450253548268	IRX1	178017	IRX2	666139	IRX4	1530580	False	False	False	alt	-35	0.1299	5	0.01074
3212	chr5	3417881	A	G	rs13170639	0.0801726144	0.0924498980139757	0.1149552815999999	0.0925936683010883	0.03577799588364	0.1480263746587291	0.0033992336880794	0.0837151739786342	0.0044118692856554	0.0834887533261536	0.1386336643462769	0.240379604608683	0.0088884310929867	0.1142596477819779	0.0147041303172695	0.1148125204323744	0.0048714898377942	0.165255965912915	0.0003904813025307	0.0915707341386653	0.0005601600307896	0.0917803759802727	0.0165080333872191	0.0711792213975764	0.0261316023885717	0.0713400306539783	IRX1	177952	IRX2	666204	IRX4	1530645	False	False	False	alt	-100	0.2896	-55	0.418
3213	chr5	3439187	C	T	rs35533030	-0.0426322406	0.3588223872775333	0.0426322406	0.3544055767400778	0.0588918740611052	0.0340708294092865	-0.0028408267990015	0.1541353023635711	0.0028408267990015	0.1523557992540005	0.0997632872554517	0.3012013431687725	-0.0043869439214176	0.2816710714358156	0.0043869439214176	0.2773952580053307	0.0059174850421804	0.1376756017455343	-0.0002957505927385	0.1656287150505931	0.0002957505927385	0.1629303355435417	-0.0088218798456005	0.2475624895328907	0.0088218798456005	0.2436258144377549	IRX1	156646	IRX2	687510	IRX4	1551951	False	False	False	ref	-45	0.026	-50	0.1353
3214	chr5	7236553	T	G	rs6885115	-0.0209076552	0.5364045223172138	0.0248193556	0.5323500411382147	0.0163357814240565	0.6309487823593302	-0.0003595506778097	0.5801712753034941	0.0004373206583045	0.5763995408558867	0.0003125927880967	0.9950702366899344	-9.919158383829797e-06	0.9667022323635264	1.1403258394740369e-05	0.9634830045007604	5.783011698138431e-06	0.9930844934665668	-1.9652323545500185e-07	0.963324455020286	2.2602918298858165e-07	0.9602143997628608	-3.958958793836942e-05	0.9652178208317288	4.453828643066596e-05	0.9625656680942254	ADCY2	159586	TENT4A	523120	NSUN2	603262	False	False	False	ref	25	0.01019	100	0.1599
3215	chr5	7391349	G	A	rs12514566	-0.0771421242	0.1777266954375918	0.080686853	0.1761380995169406	0.0350564750044025	0.1582592736612977	-0.0031064835605966	0.1440420595819723	0.0032059658579255	0.1431518362864296	0.6660857444492099	0.0188480670314007	-0.0526808981996854	0.0323827882143868	0.0551225551551733	0.0321589896528819	0.0236030061448726	0.0166432885963471	-0.0021593712103166	0.0337877448121843	0.0022278959564505	0.0335526489399237	-0.0172371416317508	0.1252742558082833	0.0180388307875027	0.1237225254875226	ADCY2	4790	CFAP90	459802	MTRR	459838	True	False	False	ref	45	0.03687	35	0.0908
3216	chr5	23023862	C	T	rs2680786	0.0156500812	0.2784422877038769	0.0611776308	0.2761995167435726	0.0181745561012115	0.5540438452104083	0.0008132197259159	0.345769072571846	0.0015125864648367	0.3431139299266796	0.0069026096136715	0.8003838256253952	0.0003254111715238	0.6609717009180797	0.0005873788840979	0.6578776165699656	0.0001380494051726	0.7998837477915403	1.1879218147137875e-05	0.6539193042601938	1.5753685895778786e-05	0.6510540934511027	0.000684569958101	0.6334798080209911	0.0016281218039655	0.6307354653423247	CDH12	170518	PRDM9	419725	ENSG00000233974	1539851	False	False	False	alt	-25	0.01178	5	0.00842
3217	chr5	23026318	G	A	rs2680790	0.015852624766	0.5165788179480705	0.024315735234	0.5179678548220275	0.0120717563932899	0.8234752720281862	0.0001764036243157	0.649382545963734	0.000288771844096	0.6500856992099696	0.5130472435749398	0.0399825667126262	0.0062969947125631	0.1734107145308707	0.0106523843757693	0.173700527169591	0.0061939702040464	0.131323276127333	7.11066067637974e-05	0.2578742381447812	0.000128872247258	0.2579660492019133	0.0055837814654745	0.2847207139165651	0.0080993698657252	0.2855550353745044	CDH12	172974	PRDM9	417269	ENSG00000233974	1542307	False	False	False	alt	-100	0.0885	10	0.10254
3218	chr5	23036792	T	G	rs2635639	-0.0757707743999999	0.1745024935775684	0.0757707743999999	0.1723152023496333	0.0432828372236562	0.0868065602158236	-0.0033527745922194	0.105748121380571	0.0033527745922194	0.1045374045984643	0.0806349180165615	0.3469641550364238	-0.0066094112454347	0.2219601356022852	0.0066094112454347	0.2183442218168924	0.0035722004081382	0.217946345290291	-0.0002989555501679	0.153649722402866	0.0002989555501679	0.1512599631135726	-0.0134117976972055	0.1650520426075443	0.0134117976972055	0.1624121926506372	CDH12	183448	PRDM9	406795	ENSG00000233974	1552781	False	False	False	ref	-10	0.01085	100	0.181
3219	chr5	23036849	G	A	rs2680799	-0.0321570699999999	0.4462183631046308	0.0321570699999999	0.4409566429324965	0.0140433263129781	0.7359727525117061	-0.0004498138172891	0.5463027764508968	0.0004498138172891	0.5402478024407514	0.0849427600541057	0.3365260805985244	-0.0029537003862338	0.3298010461106839	0.0029537003862338	0.3252725289982401	0.0012202923099303	0.4071967686732758	-4.194964112725553e-05	0.3882838437670516	4.194964112725553e-05	0.3834301776255772	-0.0061231896011348	0.3069088598312146	0.0061231896011348	0.3025002548198841	CDH12	183505	PRDM9	406738	ENSG00000233974	1552838	False	False	False	ref	-70	0.01947	60	0.06836
3220	chr5	23036893	C	G	rs2680800	0.178329805	0.0367218740539113	0.178329805	0.0371059918422896	0.0716168258403074	0.0165465898496976	0.0135181652785318	0.0159129698745371	0.0135181652785318	0.0159816781432723	0.1323397446471577	0.2532300911948323	0.0276582694646579	0.0706441713031069	0.0276582694646579	0.0718456381777883	0.0097614940610589	0.0811792091212725	0.0021438383335619	0.031689785278364	0.0021438383335619	0.0321554098451213	0.0418618653294183	0.0347436996938399	0.0418618653294183	0.0352280553697567	CDH12	183549	PRDM9	406694	ENSG00000233974	1552882	False	True	False	alt	30	0.003723	15	0.012695
3221	chr5	23038736	A	G	rs2635642	0.146268265	0.050366590715063	0.146268265	0.0510150219753953	0.0190953347934379	0.51454796594609	0.0029108068397737	0.1179140375869908	0.0029108068397737	0.1195399312386506	0.0679984164164824	0.3975745609230183	0.0113917040130393	0.1608454218133004	0.0113917040130393	0.1636713670218464	0.0015001063266879	0.4014920765338233	0.0002592719248971	0.1866768601471853	0.0002592719248971	0.1896776547184843	0.0211259938636138	0.0979885648442779	0.0211259938636138	0.0998196165264097	CDH12	185392	PRDM9	404851	ENSG00000233974	1554725	False	False	False	alt	25	0.03186	45	0.181
3222	chr5	23041513	C	T	rs2680803	-0.0102329835199999	0.7767035444094782	0.0102329835199999	0.7700228091519595	0.0085947339956859	0.9565839774925332	-8.889708588416531e-05	0.8742819088984121	8.889708588416531e-05	0.8674054645660968	0.0081397842367456	0.7593771207614526	-8.132811211755629e-05	0.8258328783415594	8.132811211755629e-05	0.8189296876818414	6.822467241895971e-05	0.8550990845269788	-6.874517124648308e-07	0.8831411069131264	6.874517124648308e-07	0.876170251946893	-0.0003175414865889	0.81750563007964	0.0003175414865889	0.8106250142247547	CDH12	188169	PRDM9	402074	ENSG00000233974	1557502	False	False	False	ref	100	0.03534	55	0.07886
3223	chr5	37804632	G	T	rs75819762	0.0070452111999999	0.2598505856581347	0.055154676	0.2605358804068591	0.027427215830795	0.2723004717951163	0.0001798509461397	0.2402687333748836	0.0016156748288606	0.2409591834574938	0.0156840750882517	0.7265897464370762	0.0007026989315123	0.5792164303008649	0.0008498748322611	0.5811005112372077	0.0004504210640422	0.6661974485378457	2.021063555962043e-05	0.5275097328897858	2.463708177254111e-05	0.529367410480507	0.0019233941473392	0.5353773366943119	0.00247105011382	0.5375039527567803	GDNF	35409	WDR70	425346	NUP155	433508	False	False	False	alt	95	0.0519	-60	0.0381
3224	chr5	37830475	A	C	rs1862574	0.064792476	0.2133389377873066	0.064792476	0.2163375296073041	0.1249202560610124	0.0015944611340169	0.0084581843882876	0.0335152704196363	0.0084581843882876	0.0337168560247587	0.216172346672825	0.1621003824302536	0.0143881671609238	0.1197224160639757	0.0143881671609238	0.1221821798188518	0.0271466092819812	0.011843562646128	0.0018822767032191	0.0313042452388815	0.0018822767032191	0.0317656056560804	0.0203754412589488	0.1009450303250127	0.0203754412589488	0.1029157930477755	GDNF	9566	EGFLAM	427935	WDR70	451189	False	True	True	alt	65	0.03027	100	0.1816
3225	chr5	37833679	C	G	rs2973038	0.100076936	0.1162627782981179	0.100076936	0.117555719638189	0.0362087300690902	0.1524227437396003	0.0045388786596729	0.0963981116255816	0.0045388786596729	0.0974065480599558	0.5630208505163142	0.0326512512011843	0.0558266147637104	0.0271365727758992	0.0558266147637104	0.027589827282243	0.0202380793867508	0.0244444871327925	0.0025328547437137	0.028625328377639	0.0025328547437137	0.0288832149524733	0.0300534459437167	0.0609660799262478	0.0300534459437167	0.0618772212611635	GDNF	6362	EGFLAM	424731	WDR70	454393	False	False	False	alt	45	0.01718	-45	0.1195
3226	chr5	44914183	A	G	rs7702731	0.368942288	0.0046645094214047	0.368942288	0.004654745053262	0.1010129170297466	0.0040930458050577	0.0374269113557649	0.0021618225235495	0.0374269113557649	0.0021740131984339	0.0153211705321499	0.6718191667675325	0.0056411622202678	0.2296929912770422	0.0056411622202678	0.2335390747568131	0.0015840261540801	0.3772651677974534	0.0005873166717526	0.0886036801930633	0.0005873166717526	0.0900443387027482	0.0117548084853683	0.1839209471313126	0.0117548084853683	0.1869700823435566	MRPS30	105235	FGF10	524477	HCN1	782315	False	True	True	alt	-15	0.003113	-75	0.1032
3227	chr5	45011640	A	G	rs11738503	0.0129219123999999	0.5300499868335299	0.0240870032	0.532852779432732	0.0205798952038441	0.4580973525967036	0.0003050377351414	0.5042765862312801	0.0005128900839165	0.5067107941388583	0.0014400712612582	0.9458832794714912	2.476851096255288e-05	0.8844899160692008	3.477084081532594e-05	0.8864086735967542	2.8771818334148013e-05	0.9315698906946832	5.094129159495983e-07	0.8679833573991681	7.033072596829781e-07	0.8700100937193525	9.40252713536056e-05	0.8798767534611586	0.0001385635577842	0.8817306073293724	MRPS30	202692	FGF10	621934	HCN1	684858	False	False	False	alt	90	0.00866	-100	0.1128
3228	chr5	58377428	T	C	rs138471599	0.0886711334	0.1328327841239108	0.0920002234	0.1339311622561675	0.0528169835081974	0.0482690052788845	0.0048065443272423	0.0767753392906231	0.0049402817934415	0.0771809430137442	0.022465441588862	0.5984426052966904	0.0027485853346504	0.3713367110931909	0.0027674900102217	0.375534991001485	0.0012349397250682	0.4195366428513984	0.000149049750772	0.2547767517500511	0.0001498091965629	0.2580145195988584	0.0074750090726138	0.2938512541473363	0.0075393421530136	0.2976206137099203	PLK2	82711	GAPT	114008	RAB3C	204794	False	False	False	alt	75	0.0185	85	0.0845
3229	chr5	58427245	A	G	rs245412	0.0928787532	0.1209456705476511	0.0928787532	0.1229003673441764	0.0347379660048398	0.1613156299714271	0.0033069379148391	0.1019662630018614	0.0033069379148391	0.103318557184791	0.0812023687770115	0.3434529662747582	0.0073696885296457	0.1834249515849225	0.0073696885296457	0.1866797057779234	0.0027488734104443	0.2563162264819774	0.0002529406026085	0.1472946037740278	0.0002529406026085	0.149916722712712	0.0156255154894262	0.1271006158582252	0.0156255154894262	0.1295694578037944	PLK2	32894	GAPT	64191	RAB3C	154977	False	False	False	alt	-40	0.03284	75	0.1765
3230	chr5	58433711	C	T	rs151893	-0.0764917496	0.1683414264375511	0.0764917496	0.1661459187647373	0.0313306064079373	0.204568023635063	-0.002469253607893	0.1467866663897334	0.002469253607893	0.1448153049358782	0.0060671043515554	0.802210165389655	-0.0004481508586065	0.6140766804846943	0.0004481508586065	0.6081755343129406	0.0001893034055087	0.7277176431725128	-1.4458055538876062e-05	0.5417924686150164	1.4458055538876062e-05	0.5360161020259333	-0.0015143017386426	0.5840865930352445	0.0015143017386426	0.5781572973655034	PLK2	26428	GAPT	57725	RAB3C	148511	False	False	False	ref	80	0.001591	-25	0.09033
3231	chr5	58434073	A	C	rs158280	-0.0471049714	0.3194658937394035	0.0471049714	0.315161968212031	0.0182256372386545	0.5520038639026283	-0.0008446338976596	0.3751667185194149	0.0008446338976596	0.3703460931500771	0.0137565570255022	0.6784557211521665	-0.0006763408796545	0.5565582121413204	0.0006763408796545	0.5509444612780808	0.0002499087917719	0.6839553487121071	-1.2006057069898884e-05	0.56436734768746	1.2006057069898884e-05	0.5585657628188858	-0.0021584573257232	0.5168449698005415	0.0021584573257232	0.511205532276278	PLK2	26066	GAPT	57363	RAB3C	148149	False	False	False	ref	100	0.04663	-40	0.0774
3232	chr5	58470131	A	G	rs832636	-0.246424498	0.0186292550288397	0.246424498	0.0184919154168183	0.0520639807298787	0.0524513729783982	-0.0146893901004899	0.0170896232789467	0.0146893901004899	0.0169683705159264	0.0843373692718814	0.3577246058714717	-0.0264507069588783	0.0889053512218734	0.0264507069588783	0.0875189760748289	0.0047446128190895	0.1913922871563957	-0.001627253156773	0.0556716471234312	0.001627253156773	0.0548878791429166	-0.0418371218369568	0.0430004246574077	0.0418371218369568	0.0424109073852249	PLK2	9992	GAPT	21305	RAB3C	112091	False	True	False	ref	-100	0.07404	60	0.0835
3233	chr5	58570576	G	A	rs12153002	0.090738389	0.1241104512735844	0.090738389	0.1258022614724429	0.0411992124648605	0.1000697633872715	0.0038268269531276	0.0837643331615163	0.0038268269531276	0.0847142256842324	0.0362137507835439	0.5020984415843124	0.0035160812962858	0.2945542693526424	0.0035160812962858	0.29896836091922	0.0015422511953454	0.367115970906713	0.0001535768131269	0.2142291786493806	0.0001535768131269	0.2176265207082917	0.0090280756161129	0.2246651672756391	0.0090280756161129	0.2284609794985632	RAB3C	11646	GAPT	79140	PLK2	110437	False	False	False	alt	50	0.0347	90	0.05933
3234	chr5	61082276	T	C	rs117702129	0.0084166892799999	0.7961294514690112	0.0090499327199999	0.8005995356338422	0.0248289523229165	0.3389286316307464	0.0001806608722824	0.7390434959970951	0.0002044800305881	0.7437649046738618	0.0082049421002275	0.7578356895305342	8.45573454239706e-05	0.824176126131861	8.916654111531875e-05	0.8286196108746791	0.000202883993345	0.7166967218248809	1.847510306864421e-06	0.7968834157535408	2.020883069267392e-06	0.8012357444743051	0.0003167167035069	0.8093805423678588	0.0003381610636402	0.813834103748266	SMIM15	80192	NDUFAF2	137098	ERCC8	137203	False	False	False	alt	-75	0.02101	-95	0.2185
3235	chr5	61203304	A	G	rs171748	-0.16881857626	0.0582287097336209	0.1705566957399999	0.0579675260964859	0.0384030330495035	0.1270375089852359	-0.0081985024797689	0.0609067081578492	0.0082400266758088	0.0608718120623655	0.0100466827224439	0.7497472464939497	-0.0028426051530675	0.442437312826663	0.002850618818068	0.4385043980338997	0.0004636981469952	0.6304867093810212	-0.0001460938642227	0.3438932328694055	0.0001462853130828	0.3407965010771828	-0.0059516347200685	0.3865563495624002	0.0059912243080069	0.3828043932081764	SMIM15	40836	ZSWIM6	128955	NDUFAF2	258126	False	False	False	ref	-65	0.02858	100	0.05988
3236	chr5	61210242	A	C	rs177114	-0.0200313358	0.5340370049877359	0.0244461914	0.5297881649667613	0.0180396559828999	0.555525446007529	-0.000337362128423	0.5518337261089392	0.0004283172674038	0.5477105890897683	0.0002218666490712	0.9968030615848044	-3.843070749422151e-06	0.9784444262647638	5.062905673831991e-06	0.9740304704881992	4.094104135254671e-06	0.99530973668712	-6.590549762982356e-08	0.9738454411608328	9.103661468188664e-08	0.9693987385244538	-9.897396984593048e-06	0.9796755287101356	1.6495661640988414e-05	0.9770382686431418	SMIM15	47774	ZSWIM6	122017	NDUFAF2	265064	False	False	False	ref	100	0.06433	-100	0.1931
3237	chr5	61237147	G	A	rs476099	-0.021285765	0.5901342864948522	0.021285765	0.5838461186327184	0.0133049617634543	0.7680723249096706	-0.0002844860467486	0.6628197342399612	0.0002844860467486	0.6561097920429859	0.0494028570485961	0.4678993164006012	-0.0009232318126599	0.5055135589541861	0.0009232318126599	0.4997274319142622	0.0006396367962364	0.5446703002276289	-1.1832833513247354e-05	0.5602213158153317	1.1832833513247354e-05	0.5543023847306056	-0.0023052687143281	0.5004389822075193	0.0023052687143281	0.4944708832758199	SMIM15	74679	ZSWIM6	95112	NDUFAF2	291969	False	False	False	ref	75	0.008766	100	0.06586
3238	chr5	61243041	G	A	rs192070971	-0.0364379126599999	0.41973614701821	0.0364379126599999	0.414755510497944	0.0151395176217881	0.682123033057444	-0.0006069954302809	0.5086257476462961	0.0006069954302809	0.5029856626373932	0.0001897001088713	0.9981157609336724	-5.349072482836819e-06	0.9793181011537156	5.349072482836819e-06	0.974827884430719	3.1901074418437447e-06	0.9973606478752908	-8.920037901995938e-08	0.9773659849129808	8.920037901995938e-08	0.9730332408211464	-1.4846095476889573e-05	0.984528315763566	1.4846095476889573e-05	0.981056959463978	SMIM15	80573	ZSWIM6	89218	NDUFAF2	297863	False	False	False	ref	55	0.01151	-100	0.0556
3239	chr5	61261478	T	G	rs10939891	-0.0392898596	0.3855038831417169	0.0392898596	0.3806392740305965	0.0641209793986881	0.0243982473673581	-0.0024089199981365	0.1486440995374803	0.0024089199981365	0.1467526262589598	0.0372331826729569	0.4973888847265254	-0.0014664654078576	0.4343212734289448	0.0014664654078576	0.4289057949653794	0.0023629704625039	0.2858931218925166	-8.983884561731418e-05	0.2781553171059069	8.983884561731418e-05	0.2738795851163187	-0.0039639074923294	0.3957301731200689	0.0039639074923294	0.3903181529245444	ZSWIM6	70781	SMIM15	99010	NDUFAF2	316300	False	False	False	ref	-100	0.01108	-100	0.161
3240	chr5	61263059	G	A	rs11949390	-0.1843455839999999	0.0287154211593361	0.1843455839999999	0.0284713763747045	0.0372339619348267	0.1321854718927466	-0.006916764607581	0.0348247046544302	0.006916764607581	0.0346056230334266	0.2332733990960377	0.1527603983945556	-0.0439886102458465	0.0354242321974165	0.0439886102458465	0.0348735091106312	0.008827030505965	0.0924122808400143	-0.0016759096231455	0.032828751084726	0.0016759096231455	0.0324067852560395	-0.052805912045132	0.0186588496878359	0.052805912045132	0.0184656157467622	ZSWIM6	69200	SMIM15	100591	NDUFAF2	317881	False	False	False	ref	-100	0.04156	-65	0.1877
3241	chr5	61271790	A	G	rs10939894	0.0266667971199999	0.5092352337897498	0.0266667971199999	0.5150676812603509	0.014645719918237	0.705720590276292	0.000396367820217	0.5830913894329827	0.000396367820217	0.5890350438410751	0.0046715713767278	0.8450050748382775	0.0001208053706883	0.7805437973065983	0.0001208053706883	0.7871346328712245	6.67189928526029e-05	0.8683585961234396	1.737139200037351e-06	0.7995263730723497	1.737139200037351e-06	0.8061518167216433	0.0004577546105373	0.7664086105299929	0.0004577546105373	0.7729470951236977	ZSWIM6	60469	SMIM15	109322	NDUFAF2	326612	False	False	False	alt	-35	0.010315	-5	0.02289
3242	chr5	61278550	C	T	rs13179814	-0.244273758	0.0156031954584987	0.244273758	0.0154891828854849	0.0749694200072718	0.0146499450725387	-0.0192593744830299	0.0082183276324045	0.0192593744830299	0.0082136509206482	0.0165138068687934	0.6449448709129832	-0.0039056769521531	0.2758006297836342	0.0039056769521531	0.2716042848455309	0.0012498633261156	0.4044671820275435	-0.0003150879752219	0.1385598279070263	0.0003150879752219	0.1361937977165213	-0.0094965524067169	0.2163802269749156	0.0094965524067169	0.2126860830552663	ZSWIM6	53709	SMIM15	116082	NDUFAF2	333372	False	True	False	ref	-85	0.02228	65	0.2219
3243	chr5	61278792	G	A	rs62366231	0.0020582076999999	0.5718190111450128	0.0210944024999999	0.5750476331291303	0.0129666980893909	0.7787300987917047	-1.486482648317205e-05	0.6602545733547237	0.0003061632077221	0.6635914444119202	0.0116352149384711	0.7075213047663156	-4.6241532281161306e-05	0.7077296180809828	0.0003470617872951	0.71134463506003	0.0001625723463839	0.7572787857173638	-1.396929255984284e-06	0.7391128480952976	5.235771955493369e-06	0.7426186953523998	2.0619577051227653e-05	0.6725186858508253	0.0011753158919203	0.6760211524605337	ZSWIM6	53467	SMIM15	116324	NDUFAF2	333614	False	False	False	alt	-25	0.00784	-25	0.03186
3244	chr5	61346768	C	T	rs4604142	-0.1243120246	0.0632140128996352	0.1474799014	0.0629957216451905	0.0335088043479349	0.1746221366666225	-0.0045875819394244	0.0709893485232707	0.005307453872705	0.0707668686193221	0.2369948203622446	0.1472852376982613	-0.0265313412410406	0.0574420272997081	0.0310317687816278	0.0568756994465585	0.0077451615598813	0.1022584879014124	-0.000960628814182	0.0535267803770677	0.0011004660331176	0.0530154221016128	-0.0340115799544719	0.0356436788216758	0.0412152353930915	0.0354021074443366	ZSWIM6	14509	SMIM15	184300	NDUFAF2	401590	False	False	False	ref	-65	0.03625	-65	0.03418
3245	chr5	61432163	T	C	rs10939902	0.1341585096	0.0695944135605146	0.1341585096	0.0704500748318756	0.0750669346571637	0.0144123838479598	0.0101338878423799	0.0281494618069352	0.0101338878423799	0.028277421376962	0.4488609745636897	0.0550115160203262	0.0661152759308101	0.0254691128393182	0.0661152759308101	0.02580769295419	0.0324515386381042	0.0075668888158141	0.0047351393246962	0.0127036388258648	0.0047351393246962	0.0127501975937312	0.0415303025304344	0.0349798872935342	0.0415303025304344	0.0355554170858702	ZSWIM6	99904	SMIM15	269695	NDUFAF2	486985	True	True	False	alt	60	0.04413	-70	0.1406
3246	chr5	61522089	G	T	rs34270022	-0.00056450532	0.7850609607959419	0.00889669668	0.7864608891187275	0.0410683373497552	0.1016987001894381	3.374492413209822e-05	0.6033154334566463	0.0003660132607748	0.6041684361152589	0.0028817920886806	0.8917214111316693	8.25591787937595e-06	0.9089712446917868	2.9769483139554133e-05	0.9103834128848088	0.0001242614368103	0.7901939082654019	5.268569657727342e-07	0.8480505667465151	1.300606876726552e-06	0.8495461944641881	3.794002177428465e-05	0.9113467446897296	0.000118768763815	0.911615658515378	ZSWIM6	189830	SMIM15	359621	NDUFAF2	576911	False	False	False	ref	-55	0.01309	100	0.09534
3247	chr5	64173712	A	G	rs3104058	0.0877478679999999	0.1331467035695467	0.0877478679999999	0.1351750001524769	0.0265139757825485	0.2899308882991891	0.0022947218924184	0.1503455025067074	0.0022947218924184	0.1523439413253401	0.0002944475602915	0.9961917939337332	2.739515541712708e-05	0.902053204092436	2.739515541712708e-05	0.9089690124150572	8.112194557500152e-06	0.987508855187332	7.402644272851027e-07	0.8663922032692123	7.402644272851027e-07	0.8733839041607909	7.670482663059467e-05	0.9170652356399844	7.670482663059467e-05	0.9240366797492938	RNF180	7868	HTR1A	211205	RGS7BP	332304	False	False	False	alt	75	0.03265	-80	0.094
3248	chr5	64175997	T	G	rs1603090	0.0038741716199999	0.7839183693110515	0.0100443267799999	0.7833524855048022	0.0236153797642988	0.3711541130475979	6.918400471794001e-05	0.7257905161065528	0.0002205658200429	0.7255334692896294	0.0012635676816996	0.9531802290527684	6.825543649956515e-06	0.9469413475981086	1.4731161758664482e-05	0.9458882721601156	2.792973138437669e-05	0.9360112628071204	1.389745712285745e-07	0.9329780057772538	3.1643081739067085e-07	0.931846391090133	1.73204447230269e-05	0.9434124232467336	5.691003266139918e-05	0.942313869125869	RNF180	10153	HTR1A	213490	RGS7BP	330019	False	False	False	alt	-35	0.00911	-30	0.01563
3249	chr5	64217272	A	G	rs2963002	-0.0136565775599999	0.7141598822872529	0.0136565775599999	0.7077507949137158	0.0175203359112077	0.5816267120547348	-0.0002571735726871	0.70107800936778	0.0002571735726871	0.6945792855415304	0.0035581142159611	0.8704477991507212	-3.559905846238594e-05	0.8961932589582724	3.559905846238594e-05	0.8892606310561149	6.157121000994032e-05	0.8740392714260157	-6.9712234980802e-07	0.890497174833104	6.9712234980802e-07	0.8836087996145254	-0.0001336148592919	0.895952266055234	0.0001336148592919	0.8890387761875846	RNF180	51428	HTR1A	254765	RGS7BP	288744	False	False	False	ref	-45	0.014496	100	0.056
3250	chr5	64223835	A	G	rs11743978	0.0501092729999999	0.291254176030739	0.0501092729999999	0.295390272304221	0.0127071325721769	0.7609694657759434	0.0007072810081331	0.4354021573572532	0.0007072810081331	0.4404688121328947	0.1427443832272111	0.2357164759081942	0.0068676359011477	0.1939112030445822	0.0068676359011477	0.1972849258539402	0.001688977550994	0.3417720097010977	9.113041784833124e-05	0.2706415815722731	9.113041784833124e-05	0.2749012943993765	0.0120987430305829	0.1686809188661889	0.0120987430305829	0.1717050085795823	RNF180	57991	HTR1A	261328	RGS7BP	282181	False	False	False	alt	100	0.0774	70	0.04398
3251	chr5	64326354	T	C	rs6449715	-0.01784092854	0.6425229651326643	0.01784092854	0.6360101466868642	0.032157903321307	0.1912229954043493	-0.0005721577687708	0.4800365032198896	0.0005721577687708	0.4743614859510005	0.0017774075418164	0.9320053695213724	-3.2462449472729776e-05	0.9015823641227988	3.2462449472729776e-05	0.8946096530695213	5.81036842554736e-05	0.8738847973542454	-1.0560991059283095e-06	0.8474709428142492	1.0560991059283095e-06	0.8407043431797359	-0.0001146448484048	0.904547363044837	0.0001146448484048	0.8975414309572038	RNF180	160510	RGS7BP	179662	HTR1A	363847	False	False	False	ref	20	0.003674	-60	0.05597
3252	chr5	64361018	G	A	rs1526875	0.267969092	0.0129280086741749	0.267969092	0.0129985497769298	0.0436221421835988	0.0857007831360891	0.0123865422749299	0.0169434684619	0.0123865422749299	0.0170365378452391	0.1173171455907096	0.27440645498144	0.0323748324333098	0.0518819816204194	0.0323748324333098	0.0528280940134027	0.0051721730609527	0.1600764236894306	0.0014964121218951	0.0378965502743456	0.0014964121218951	0.0385475847385889	0.0511489228332948	0.0209629647969661	0.0511489228332948	0.0211848771112953	RGS7BP	144998	RNF180	195174	SHISAL2B	329425	False	True	False	alt	-100	0.10614	-100	0.2057
3253	chr5	64363665	C	A	rs7732201	0.0256566894	0.4967905243984048	0.0268535186	0.5007380763408598	0.0615905332227795	0.0289505179976173	0.0018267095730465	0.2337009551433822	0.0018925874899071	0.2353638078671777	0.018442974497707	0.6595763270686802	0.0004568509355155	0.6680800420112414	0.0004733063009417	0.671826601573078	0.0011198187890991	0.4578993354591974	3.457298117691671e-05	0.4975104752590252	3.547874548200963e-05	0.5010853993073315	0.0012429481046484	0.6493943980079829	0.0013171785820328	0.6531608402106929	RGS7BP	142351	RNF180	197821	SHISAL2B	326778	False	False	False	alt	-100	0.0556	-100	0.1407
3254	chr5	64367503	G	T	rs10056417	0.0104015292	0.7676130884569413	0.0104015292	0.7744384567029396	0.0133977255414908	0.7683131539049132	0.0001389265171401	0.7988273540235054	0.0001389265171401	0.8055793584983075	0.0358442479627857	0.500184393400954	0.0003500671497158	0.6245917285788438	0.0003500671497158	0.6306966413967878	0.0004758238880485	0.568743643762076	4.661489224204496e-06	0.666122862641231	4.661489224204496e-06	0.6723960342163099	0.0010755171389924	0.6244685461068852	0.0010755171389924	0.6305800800145168	RGS7BP	138513	RNF180	201659	SHISAL2B	322940	False	False	False	alt	100	0.01862	10	0.008026
3255	chr5	64369508	G	A	rs28615727	-0.0585040314	0.2393170012708593	0.0585040314	0.2357149915532867	0.0339007453046218	0.1679014820923017	-0.0019822536339331	0.1736106830543171	0.0019822536339331	0.1712830578368228	0.0007216851967932	0.9811085570388705	-4.092571964845509e-05	0.8851000205317198	4.092571964845509e-05	0.8781587448771798	2.4289889819387444e-05	0.948603909501474	-1.3804633503954386e-06	0.8210163061204332	1.3804633503954386e-06	0.8142150409888697	-0.0001393883408663	0.8901193486338621	0.0001393883408663	0.8831436162967786	RGS7BP	136508	RNF180	203664	SHISAL2B	320935	False	False	False	ref	-85	0.01999	95	0.0701
3256	chr5	64411896	G	A	rs6449731	-0.1106745064	0.0986758032588916	0.1106745064	0.0974225133210328	0.0161237592237482	0.6387928872829207	-0.0019042104130247	0.2053841303722772	0.0019042104130247	0.2027171623448269	0.0326069743657417	0.5287856748543909	-0.0033101787367011	0.3160458160673627	0.0033101787367011	0.3115609910274955	0.0005295199770572	0.5657875789031388	-5.835491559337543e-05	0.3533042172769757	5.835491559337543e-05	0.3486535550517154	-0.0082470060374121	0.2520879453594837	0.0082470060374121	0.2480837401672068	RGS7BP	94120	RNF180	246052	SHISAL2B	278547	False	False	False	ref	-95	0.0415	100	0.12256
3257	chr5	64414512	A	C	rs11949865	0.01007076434	0.7740853092434369	0.01007076434	0.7808245811823642	0.0284918271249922	0.2521759677491642	0.0002908034499751	0.6811191524337258	0.0002908034499751	0.6873302500039532	0.0016784335719705	0.9331954364632988	1.8392059203927096e-05	0.9331028513636266	1.8392059203927096e-05	0.9401600509021298	4.834596320478328e-05	0.8900392892998568	5.337795708714507e-07	0.905589297540005	5.337795708714507e-07	0.9125692638593792	6.103394807164589e-05	0.93668440201799	6.103394807164589e-05	0.9428904491527116	RGS7BP	91504	RNF180	248668	SHISAL2B	275931	False	False	False	alt	-100	0.00943	65	0.02176
3258	chr5	64418618	T	C	rs4084594	0.431636968	0.0031681965310743	0.431636968	0.003180713299183	0.0858439600614912	0.0086372438465638	0.0398561932276275	0.002467055050107	0.0398561932276275	0.0024791398449874	0.0812897957837088	0.3483749658541129	0.0378601789556462	0.0444499009874661	0.0378601789556462	0.045209374067662	0.0074367191471296	0.1149477034991274	0.003645170741554	0.0163484254737978	0.003645170741554	0.0165366883237037	0.0579022467091154	0.0174906764728576	0.0579022467091154	0.0177151963938462	RGS7BP	87398	RNF180	252774	SHISAL2B	271825	False	True	True	alt	-20	0.01624	75	0.0625
3259	chr5	64420602	T	G	rs7735729	-0.0185345926	0.4437312532053387	0.0325530193999999	0.440271461666355	0.0359357185819392	0.1454832736675672	-0.0006069331201951	0.2927064484125863	0.0011741393662464	0.2900892115025453	0.0080061693774536	0.7598688530046241	-0.0001583121285158	0.6824401872240398	0.0002648574448114	0.6787546506444737	0.0002848533635393	0.6584416818824766	-5.135431347782613e-06	0.5914803693824274	9.446412144657536e-06	0.5879892980400511	-0.0005608524957935	0.6594083696649526	0.0009171587872389	0.655860023213452	RGS7BP	85414	RNF180	254758	SHISAL2B	269841	False	False	False	ref	-25	0.001778	100	0.09143
3260	chr5	64424518	A	C	rs7736758	-0.040486354	0.360900178972022	0.040486354	0.3560378669455245	0.0243740899991723	0.3472203299370969	-0.000956323579167	0.3394396053801976	0.000956323579167	0.3348976182583346	0.0045775461053742	0.8527223950217272	-0.0002066951045652	0.7431862499266777	0.0002066951045652	0.7366504531922409	0.0001166033226631	0.815195809885649	-5.090312438932407e-06	0.7082621182479862	5.090312438932407e-06	0.7017845377277193	-0.0007167364983008	0.7241468286785321	0.0007167364983008	0.7176635624761468	RGS7BP	81498	RNF180	258674	SHISAL2B	265925	False	False	False	ref	75	0.02008	80	0.09467
3261	chr5	64438344	C	T	rs4470714	0.0387656676	0.3821490938920021	0.0387656676	0.3867565205909607	0.0237077232199328	0.3649372857781182	0.0009415188270374	0.360758991117297	0.0009415188270374	0.365145747262748	0.003455016330705	0.8707919907594478	0.0001464276344878	0.7671442520086932	0.0001464276344878	0.7737362125610934	8.22013028440597e-05	0.8373135441764952	3.569685544984793e-06	0.7320433829678513	3.569685544984793e-06	0.7385256840665737	0.0005088911616244	0.7511529153758126	0.0005088911616244	0.7575305757083487	RGS7BP	67672	SHISAL2B	252099	RNF180	272500	False	False	False	alt	-15	0.02621	100	0.04907
3262	chr5	64440558	T	A	rs1903305	-0.0054075876179999	0.8742151219956947	0.0056040271579999	0.8697459292358798	0.0107559186270782	0.8771261192187692	-4.9251781511160575e-05	0.9256192279321386	5.207417465800781e-05	0.9213073784967716	0.0747476163768928	0.3655803724189058	-0.0002927007793465	0.6790813607629527	0.0003166351852128	0.6748774561068973	0.0008666157525289	0.4813672054999454	-2.701317274285336e-06	0.7487377715116329	3.045200705727724e-06	0.7445402610085385	-0.0008107617696545	0.700631085467534	0.0008569496222492	0.6962826814228463	RGS7BP	65458	SHISAL2B	249885	RNF180	274714	False	False	False	ref	70	0.1079	100	0.3047
3263	chr5	75484335	A	G	rs75930101	-0.0321713401999999	0.4490390460940017	0.0321713401999999	0.4435346361438516	0.0167763585716717	0.6091461212730852	-0.0005371083878215	0.5007635853346609	0.0005371083878215	0.4948117465887101	0.0181584243343999	0.6276787251031752	-0.0005391410927031	0.5754840787073522	0.0005391410927031	0.5696173604082899	0.0003138369478841	0.6473183333438071	-9.400458871709762e-06	0.5913307640788735	9.400458871709762e-06	0.5853813240502976	-0.0017749331925703	0.5481372061322622	0.0017749331925703	0.5422777021583427	POLK	27511	CERT1	27803	ANKDD1B	126848	False	False	False	ref	65	0.03992	-70	0.0575
3264	chr5	89391697	G	A	rs17508283	0.0695841102	0.1937469944316923	0.0695841102	0.1965924161447113	0.0194901633704846	0.503454990359198	0.0014544217899152	0.2528548044361569	0.0014544217899152	0.256016967856372	0.0563730988749958	0.4409114563876549	0.0042811246674549	0.2912276176507434	0.0042811246674549	0.2953297761929872	0.0012989809814865	0.4421503134350232	0.0001057877580353	0.3040025710023414	0.0001057877580353	0.308019920414501	0.0090792121671999	0.2331685191847388	0.0090792121671999	0.236851753325262	MEF2C	487440	CETN3	1018069	POLR3G	1080052	False	False	False	alt	-100	0.042	-100	0.2812
3265	chr5	89465423	C	T	rs12109397	0.00281984484	0.8530233557009389	0.0062123172399999	0.8573585025455891	0.0178744464814395	0.566676974798102	5.42180122732289e-05	0.8411635311845671	0.0001030259064889	0.8455303242255009	0.0245587410511035	0.5765499193661009	5.011133267591669e-05	0.7460564077730107	0.0001368649943607	0.7503169386071362	0.0004727789287361	0.5890939368211843	1.1535920835320549e-06	0.7466960515295166	2.4017270511656083e-06	0.7509175681079149	0.0001798027118867	0.7513209027937219	0.0004486819966348	0.7555429312524843	MEF2C	561166	CETN3	944343	POLR3G	1006326	False	False	False	alt	-100	0.05746	-100	0.0585
3266	chr5	89468398	G	A	rs10070532	-0.00746959744	0.6977857099577874	0.01495080016	0.6957852785561996	0.0318173925291872	0.1955233710937878	-0.0002656782678506	0.5440780136619551	0.0004853639977034	0.5426076322858417	0.0003497080267889	0.992699684208733	-1.3527478850831788e-06	0.9768566878601932	5.654548499551316e-06	0.97599691681321	1.0955592500354826e-05	0.9796475038666768	-5.4683071434222295e-08	0.9573381195594092	1.8086662285560442e-07	0.9557221802445848	-5.773481574345948e-06	0.9837845939908568	1.402131239484015e-05	0.982786922737161	MEF2C	564141	CETN3	941368	POLR3G	1003351	False	False	False	ref	-40	0.1089	80	0.07654
3267	chr5	91676221	C	T	rs2939257	0.0046398195999999	0.8182466332959346	0.00686619332	0.8227196140372741	0.0840390227442087	0.0090644094970847	0.0003506093763458	0.5031270538099196	0.0005818766110144	0.5061296263027133	0.001186862855069	0.9581072599209962	3.534872044259882e-06	0.9651521059008992	5.894485926439323e-06	0.9694437701661544	9.814579594407609e-05	0.8118763273856999	2.66780179852376e-07	0.891609665696637	5.118878936766946e-07	0.8960269109933182	1.3196529312790752e-05	0.9674153194632568	2.309392629738381e-05	0.97062487347345	ARRDC3	292904	LYSMD3	1146637	ADGRV1	1146876	False	False	False	alt	100	0.008644	-100	0.1183
3268	chr5	91688658	T	G	rs2935244	0.066277908	0.1969507232075344	0.066277908	0.2000076059741027	0.014828832361582	0.7004030946196362	0.0009995874541117	0.3173305904519313	0.0009995874541117	0.3216927121624418	0.0831538055491405	0.3560926342959103	0.0061863376881157	0.2297227614688416	0.0061863376881157	0.2333402563875665	0.0012610303494544	0.4170344626949117	9.452030811442952e-05	0.2835772818421312	9.452030811442952e-05	0.2877705324412656	0.0121135891260598	0.1784379856303579	0.0121135891260598	0.1813985429073306	ARRDC3	305341	LYSMD3	1159074	ADGRV1	1159313	False	False	False	alt	95	0.05328	75	0.00818
3269	chr5	91690039	A	C	rs2973827	-0.0031537058699999	0.8467142605450682	0.00688321427	0.8442787291490653	0.0163241672122247	0.6302442086586073	-6.557839449354906e-05	0.8304419129372809	0.0001233238092073	0.8278940483978529	0.0056175975718385	0.8196740754004374	-3.412616053356938e-05	0.8983913850883882	3.683307174674846e-05	0.8953973075029272	9.274803394966974e-05	0.8303622449785063	-6.439717636161885e-07	0.8955067302332764	6.858839118034514e-07	0.8924842487093139	-0.0001369139916201	0.8935112400578159	0.0001468113886047	0.8895598484187687	ARRDC3	306722	LYSMD3	1160455	ADGRV1	1160694	False	False	False	ref	-45	0.007675	-100	0.1733
3270	chr5	91691174	A	C	rs2939246	-0.0346235804	0.4247756828575494	0.0354158076	0.4210583815068214	0.0302746805206072	0.2236761084052202	-0.0011234702042563	0.3335842239349058	0.001142436217298	0.3306239869020551	0.0022566065124871	0.9332030461577464	-9.111451554482356e-05	0.8595930255588635	9.177119823088573e-05	0.8552586679222179	8.741954743667185e-05	0.8827860194795004	-3.637549000958943e-06	0.8023237707397115	3.653270061883112e-06	0.797949668721664	-0.0002894988617993	0.8583792471875173	0.0002927979941275	0.8540763277513007	ARRDC3	307857	LYSMD3	1161590	ADGRV1	1161829	False	False	False	ref	-20	0.01343	-100	0.132
3271	chr5	91694565	A	G	rs2973829	-0.0108427861	0.7641573509578724	0.01143705842	0.7599215973663154	0.0357035131112083	0.1472477834598458	-0.000355282815875	0.6121131216717737	0.0003807587775982	0.6076028094904208	0.0005971429514037	0.9850266210593536	-6.224544695713709e-06	0.9766634233334944	6.61421057462585e-06	0.972792174759976	2.1215377496835192e-05	0.9509238062862972	-2.006116280280821e-07	0.9516970235027832	2.173162810995197e-07	0.9477968175864112	-2.639305862558148e-05	0.9767378830303622	2.639305862558148e-05	0.9714407809941232	ARRDC3	311248	LYSMD3	1164981	ADGRV1	1165220	False	False	False	ref	-100	0.02896	-30	0.02939
3272	chr5	91696606	G	C	rs2973831	0.0087799962399999	0.7166258613232629	0.01340098656	0.7184141729305477	0.0080062749561427	0.9586992820092032	8.452363710795834e-05	0.8381810581783616	0.0001136814321597	0.8399901103210238	0.0020916498960772	0.9277782546369322	3.19675819789129e-05	0.9057728413389116	3.749973110606449e-05	0.907254231555233	1.6505602274986318e-05	0.9699745292677564	2.6920451582752384e-07	0.9405873249508476	3.0354199052184185e-07	0.94240288497359	0.000117943980733	0.8949077878460513	0.0001443370393586	0.8964502485319698	ARRDC3	313289	LYSMD3	1167022	ADGRV1	1167261	False	False	False	alt	95	0.1162	90	0.296
3273	chr5	102325209	T	C	rs9327836	0.0255035914	0.5102905975859127	0.0255035914	0.5162518212322548	0.0110313779024832	0.8630033860284488	0.0002859177843187	0.6422025042890417	0.0002859177843187	0.648496733690599	0.0432409026426049	0.464060941956907	0.001093268871208	0.453584261420706	0.001093268871208	0.4589832292249174	0.0004610513270295	0.5736115992994284	1.1896690427319845e-05	0.5371773034841496	1.1896690427319845e-05	0.5429199167144806	0.0029626208307214	0.4329021709803659	0.0029626208307214	0.4383482259013898	SLCO4C1	28925	SLCO6A1	173807	PAM	428773	False	False	False	alt	25	0.01907	20	0.06384
3274	chr5	102340107	C	T	rs6884162	0.1207242214	0.085270232676195	0.1207242214	0.0863673239371901	0.0319335056701638	0.1955235580968255	0.0042597484209954	0.0887270042779394	0.0042597484209954	0.0896071404088126	0.0951478011283032	0.3322762845768706	0.0165983988693698	0.1426928247942437	0.0165983988693698	0.1452814614843721	0.0034240038419845	0.2505385250788383	0.0006326973738778	0.1243895212348334	0.0006326973738778	0.1266819692546787	0.0250882517897792	0.0907400172079282	0.0250882517897792	0.0922622509844763	SLCO4C1	43823	SLCO6A1	158909	PAM	413875	False	False	False	alt	100	0.03967	65	0.09155
3275	chr5	102340678	A	C	rs1452060	0.0385140928	0.3909413477107633	0.0385140928	0.3957482873195078	0.0343577032952587	0.1708873594058462	0.0013003258691019	0.2886583878983351	0.0013003258691019	0.292411527739328	0.0785869816238328	0.3495224076136823	0.0031128687452008	0.3202983537897426	0.0031128687452008	0.3249579338586694	0.002749065589643	0.2632702087938993	0.0001060480064572	0.2649613147426528	0.0001060480064572	0.2691519985543765	0.0067632212728052	0.2885305009051617	0.0067632212728052	0.2930441004236069	SLCO4C1	44394	SLCO6A1	158338	PAM	413304	False	False	False	alt	-70	0.00235	65	0.1866
3276	chr5	102343745	T	C	rs1869103	-0.1742631138	0.0474200213230256	0.1742631138	0.0468374423920301	0.0517401296484675	0.0508967033467935	-0.0099629561912608	0.0345863833588779	0.0099629561912608	0.0343536898213861	0.0208315463033221	0.6303445365035831	-0.0054203429960178	0.3104279325296987	0.0054203429960178	0.3055853032758763	0.0011684540604427	0.4485573348456035	-0.0003193269766787	0.2065839204008785	0.0003193269766787	0.2034194593963833	-0.0118941968262346	0.2282063733290048	0.0118941968262346	0.2250495124684342	SLCO4C1	47461	SLCO6A1	155271	PAM	410237	False	False	False	ref	100	0.00894	20	0.1128
3277	chr5	102347720	T	C	rs10079075	0.1106397703999999	0.0900115101142227	0.1106397703999999	0.0913085267017771	0.0285945083867112	0.2500611430614673	0.0032458202627012	0.1036907094756313	0.0032458202627012	0.1050612228609486	0.0028281811883474	0.8940235708838056	0.0003557496605439	0.6416137691562193	0.0003557496605439	0.6477433223654815	8.393064487699985e-05	0.8380868971404162	1.0818443340331837e-05	0.5794657301545602	1.0818443340331837e-05	0.5853817990823927	0.0010928375837154	0.632003630200213	0.0010928375837154	0.6382496228776107	SLCO4C1	51436	SLCO6A1	151296	PAM	406262	False	False	False	alt	100	0.03992	75	0.1219
3278	chr5	102349145	G	A	rs1823693	-0.06313855774	0.2556810776195606	0.06313855774	0.2529094089932018	0.0247224475718193	0.3464841344479664	-0.0023882846749345	0.2594769724621295	0.0023882846749345	0.2574729289636273	0.0102693741545973	0.737810763743209	-0.0007614867760071	0.6023688398756225	0.0007614867760071	0.596537164828213	0.0002671920012518	0.6998552234111259	-2.9925044912470948e-05	0.5556849276840458	2.9925044912470948e-05	0.5499456365914059	-0.0022376365016	0.5577400579642716	0.0022376365016	0.5520087496029662	SLCO4C1	52861	SLCO6A1	149871	PAM	404837	False	False	False	ref	-100	0.03247	-100	0.2128
3279	chr5	102351737	A	G	rs1901510	0.0802037432999999	0.1396054089874083	0.0852991447	0.140915660518392	0.0360430593192007	0.1447655147661659	0.0031575580286237	0.1098706389136587	0.0032829131352369	0.1107489388496013	0.0002169179505789	0.9968912431000724	1.654917987105375e-05	0.9215071084041676	1.780996013390094e-05	0.9260354390046156	7.60492644897265e-06	0.9859580058876378	6.38849270290602e-07	0.8695805440598441	6.698665016455299e-07	0.874299767207599	5.361090033320973e-05	0.9342045705069646	5.5260466497308586e-05	0.9389472309056254	SLCO4C1	55453	SLCO6A1	147279	PAM	402245	False	False	False	alt	5	0.001083	-90	0.1371
3280	chr5	102356524	G	T	rs2198246	-0.0356021107999999	0.171099148805139	0.0808394308	0.1709007196777691	0.0228715220974911	0.389872332942464	-0.0014077429077932	0.2059465045344191	0.0021446357370506	0.2057521078804801	0.0017460657846985	0.9303446258280864	-0.000116930361099	0.7756313471634706	0.0001470162261209	0.7738164583630395	4.389980507910917e-05	0.9030114815024032	-3.733327306007826e-06	0.7399288367247561	4.224072358792399e-06	0.7380902283383354	-0.0003703276038402	0.7710026098937022	0.0004726007060142	0.7691315172905816	SLCO4C1	60240	SLCO6A1	142492	PAM	397458	False	False	False	ref	-45	0.0188	-40	0.0548
3281	chr5	102364998	A	G	rs7718122	0.10922783	0.1065782515104417	0.1240595404	0.1066971534739259	0.0264518574742032	0.2957483662747828	0.0034487533147441	0.1375959033279496	0.0037731859403646	0.1377698413771862	0.0067005377585694	0.7941187731146792	0.0012053744603319	0.5343173933053763	0.001257723182452	0.5365169055902446	0.0001902606067466	0.7379616675757886	3.74291738361576e-05	0.4850664443496426	3.8562490409178376e-05	0.4872243237729945	0.0030269539111213	0.4914440954378658	0.0032413975124542	0.4936078939589515	SLCO4C1	68714	SLCO6A1	134018	PAM	388984	False	False	False	alt	50	0.06174	55	0.02393
3282	chr5	102365686	G	C	rs6861350	-0.025013389	0.4492117314618763	0.0319383462	0.4456620489702431	0.028961919360799	0.2451294990574166	-0.0007837805383698	0.3636992728802796	0.0009751228760217	0.3612607760971221	0.0051944838507472	0.8210680041337292	-6.221495247052838e-05	0.7657440994200496	0.0001337240268188	0.7617052122445394	0.0001445957280505	0.7638952641852593	-1.7897243138081488e-06	0.7092176943955879	3.765579669456611e-06	0.705277807636123	-0.0002573323215994	0.7552809587559317	0.0005047672462142	0.7511991168897564	SLCO4C1	69402	SLCO6A1	133330	PAM	388296	False	False	False	ref	-10	0.02362	-55	0.0293
3283	chr5	102367872	A	G	rs1597766	-0.0108896031	0.770992061696306	0.0108896031	0.7642585915264599	0.0155730885974229	0.6584702138389715	-0.0001645993482566	0.7769893350542681	0.0001645993482566	0.7704125851603911	0.0018054501666061	0.9265082543302452	-1.8234082784802107e-05	0.9339449475636028	1.8234082784802107e-05	0.9269455329971032	2.8899457990190784e-05	0.9290170168731758	-2.860272199431938e-07	0.9333903718452816	2.860272199431938e-07	0.926486016967774	-8.742700669722153e-05	0.9233427307996732	8.742700669722153e-05	0.9163772757110052	SLCO4C1	71588	SLCO6A1	131144	PAM	386110	False	False	False	ref	35	0.001648	65	0.11194
3284	chr5	102377587	T	G	rs10041806	-0.0101003685399999	0.7273627044446953	0.0125747022599999	0.7231331749467966	0.0142103751183046	0.720806768013476	-0.0001208675365974	0.7688475849855072	0.0001667851978653	0.7649400224618467	0.0022252647553693	0.9120717335963544	-1.407451032088515e-05	0.9148022988390546	2.443151241663983e-05	0.9110520468816689	3.326676656969581e-05	0.9237593073721247	-1.3874092754791788e-07	0.9231187897599138	3.3094188671660325e-07	0.9194689717633076	-6.350829731780987e-05	0.8971349389065877	0.0001212431130612	0.8934868948813459	SLCO4C1	81303	SLCO6A1	121429	PAM	376395	False	False	False	ref	-80	0.03023	-90	0.03857
3285	chr5	102378038	T	A	rs9327850	-0.00708130448	0.7591840015020065	0.01110973764	0.7573497032628022	0.013942142837855	0.7420535348405122	-0.0001049029029834	0.7928306955214808	0.0001552892734313	0.7910335411032264	0.0066114611857081	0.7837455758622909	-4.321960009059767e-05	0.8327986792345572	6.760357494447626e-05	0.8311182505353027	9.317854980870138e-05	0.8173303000997609	-6.457800374138684e-07	0.8500344349561032	9.503083377363132e-07	0.8482929743016522	-0.0001220678961432	0.8319024457165758	0.0002441357922865	0.8303261795378454	SLCO4C1	81754	SLCO6A1	120978	PAM	375944	False	False	False	ref	-35	0.01286	-5	0.005554
3286	chr5	102379394	G	T	rs9327851	0.0555400474	0.280200225933413	0.0555400474	0.2837179744149677	0.0181627782893196	0.5447143994996789	0.0012056574726695	0.3359014055249288	0.0012056574726695	0.3398933665849538	0.0018318432252317	0.9308285552289464	0.0001240958030055	0.7950211728238118	0.0001240958030055	0.8016840565304557	3.46679648324417e-05	0.9237131334852816	2.860774212227188e-06	0.7836367753474004	2.860774212227188e-06	0.7902563685255773	0.0004008445778759	0.7967959776153966	0.0004008445778759	0.8034766885257962	SLCO4C1	83110	SLCO6A1	119622	PAM	374588	False	False	False	alt	-65	0.1282	95	0.05853
3287	chr5	102390944	C	A	rs6874612	0.00134804028	0.8831933181519892	0.00514596536	0.8846484121339102	0.0150771816299778	0.6834278525813923	4.499679264149024e-06	0.8890369896540075	7.434783639048423e-05	0.8906316267912915	0.0459041272145425	0.4612231358715984	9.828447936840468e-06	0.6944263587884189	0.000248118432692	0.6956516656936631	0.0007273359913481	0.5127647561259414	-6.721898201592171e-07	0.7183173603249399	3.7238619968792886e-06	0.7195697880772677	9.732440368182e-05	0.7172000519083219	0.0006466299363267	0.7185027235059068	SLCO4C1	94660	SLCO6A1	108072	PAM	363038	False	False	False	alt	5	0.001251	-90	0.0547
3288	chr5	102400017	G	A	rs9285946	-0.0031328089599999	0.9137038055180446	0.00413830616	0.9094520201873546	0.0191472590161418	0.5163421058014352	-5.381412161862651e-05	0.8997263401998015	7.261358276206841e-05	0.8953542797431823	0.0240242816139355	0.5801710529287094	-5.213335292333859e-05	0.8136397371250094	0.0001023277692802	0.8095974010897685	0.0004471144116535	0.5877753705687735	-8.188522873978678e-07	0.8078568329030272	1.7573213132521958e-06	0.8037849973594032	-0.00020124707202	0.8094968339814678	0.0003464088944607	0.8054358591053595	SLCO6A1	98999	SLCO4C1	103733	PAM	353965	False	False	False	ref	55	0.003853	55	0.03027
3289	chr5	102400632	A	C	rs7721084	0.0004078015399999	0.9042506441492342	0.00423919874	0.9057625808305716	0.0188097554333479	0.5289363494876558	1.3573115817960046e-05	0.8795703816920849	8.078352886738103e-05	0.8810458435524985	0.0052736630266239	0.8191172282467486	-8.209869533675291e-06	0.9154964256058072	2.5176570248002868e-05	0.916894978589238	9.604193526571136e-05	0.8156435614068028	-1.105946130920783e-07	0.9073632584176295	4.560467782655074e-07	0.908736499108168	-4.288872026655734e-05	0.9123291081010992	9.897396984591816e-05	0.9137570327247326	SLCO6A1	98384	SLCO4C1	104348	PAM	353350	False	False	False	alt	-100	0.069	-80	0.0718
3290	chr5	102406880	C	T	rs10057126	-0.00080457004	0.8143895528199951	0.00832290316	0.8153612029870246	0.0182716026842772	0.5514569219628083	-1.7769314085491385e-05	0.7868961772836712	0.0001551969995869	0.7876210132354672	0.4717660255352842	0.0496497131638934	0.0003419418698566	0.2756455922948036	0.0038064570855075	0.2761711314748151	0.0085014738221842	0.0913011064782411	5.384110386931978e-06	0.2997938565808108	7.018851433535084e-05	0.3003799059533517	-0.0004981689815578	0.4661615052440003	0.0026706476196759	0.4663748958685919	SLCO6A1	92136	SLCO4C1	110596	PAM	347102	False	False	False	ref	60	0.00816	65	0.0551
3291	chr5	102407922	T	G	rs1901522	0.0246586682	0.5265923556163219	0.0246586682	0.5328687040656896	0.0176960369345768	0.5646952910491454	0.0004493786791598	0.5338481354049224	0.0004493786791598	0.5399699551233282	0.0740284055293457	0.3631333627203433	0.0017747119712108	0.3816304090169942	0.0017747119712108	0.3868696785474784	0.0013078104391449	0.3940742436887543	3.198422127274112e-05	0.4028719941074261	3.198422127274112e-05	0.4083556136645849	0.0041412358549701	0.3680344077541973	0.0041412358549701	0.3733881236243139	SLCO6A1	91094	SLCO4C1	111638	PAM	346060	False	False	False	alt	-100	0.0342	70	0.05142
3292	chr5	102409208	C	G	rs2060834	-0.00918303932	0.79624309540611	0.00918303932	0.7893523461442589	0.02180475321773	0.4223511311810368	-0.0001957496174574	0.7380138655091157	0.0001957496174574	0.7313939999311511	0.0021955725644155	0.916730032266284	-1.9585360714344804e-05	0.931637725073154	1.9585360714344804e-05	0.9246160720178368	4.792953074096331e-05	0.8952961730809975	-4.2018254276331613e-07	0.9140740261081172	4.2018254276331613e-07	0.9071829963644495	-7.505526046649582e-05	0.932015430730646	7.505526046649582e-05	0.9249728020811784	SLCO6A1	89808	SLCO4C1	112924	PAM	344774	False	False	False	ref	-40	0.04425	-85	0.11597
3293	chr5	102412134	T	C	rs9986226	0.097437108	0.1056797370172174	0.097437108	0.1071644172260153	0.0337033898327495	0.1704830551473868	0.0033237099175117	0.0941689395342839	0.0033237099175117	0.0953191664371251	0.0334325822308732	0.529142029633301	0.0031617134466964	0.3058819406878841	0.0031617134466964	0.3104102885644472	0.0011065048484398	0.4361457374574967	0.0001055872255654	0.2499739338654175	0.0001055872255654	0.2540206340225038	0.0081051433472996	0.2404009651616128	0.0081051433472996	0.2444726637783498	SLCO6A1	86882	SLCO4C1	115850	PAM	341848	False	False	False	alt	100	0.02763	-60	0.04877
3294	chr5	102418079	A	C	rs1597770	-0.027149785	0.5152275121978914	0.027149785	0.509144146822468	0.0133261815321074	0.7589516688088831	-0.0003527850989995	0.621657570115462	0.0003527850989995	0.614931941805814	0.0020669064036158	0.9206521372383418	-6.383945250665115e-05	0.8624671665271777	6.383945250665115e-05	0.8556545451535548	2.658755373916148e-05	0.937268491151687	-7.878227370200635e-07	0.8826825034966829	7.878227370200635e-07	0.8757013631503756	-0.0002391870937942	0.8524774205014023	0.0002391870937942	0.8457390361198603	SLCO6A1	80937	SLCO4C1	121795	PAM	335903	False	False	False	ref	-100	0.014465	30	0.00432
3295	chr5	102418412	T	A	rs1470794	-0.00260206364	0.8199187475064449	0.00796110004	0.8187181165391948	0.0098169541087241	0.9163874658454642	-2.935782628366126e-05	0.8874597836348175	7.647317098466783e-05	0.8861348027610055	0.0062609283758371	0.7956531767433747	-3.20068142901467e-05	0.8505096635101586	6.697722166576328e-05	0.8492219075416844	5.9635617332390245e-05	0.8709158223512684	-3.63862642576976e-07	0.894024599505909	6.42029967904015e-07	0.8927343366553024	-8.247830820493546e-05	0.8400240979620358	0.0002606314539276	0.838717509892931	SLCO6A1	80604	SLCO4C1	122128	PAM	335570	False	False	False	ref	100	0.0357	-45	0.0313
3296	chr5	102421561	G	T	rs6878326	-0.0376042003999999	0.3994271994539507	0.0376042003999999	0.3944431701291263	0.0110912556259442	0.871416735581223	-0.0004341188036394	0.570995500667355	0.0004341188036394	0.5647168001261846	0.3759748936029824	0.078359266828165	-0.014464759553721	0.1233313207285313	0.014464759553721	0.1209764780556682	0.004170056606549	0.1901309818642572	-0.0001675711227737	0.2114021776183788	0.0001675711227737	0.2079670353887118	-0.0122669987793209	0.1776782866815878	0.0122669987793209	0.1745326152664551	SLCO6A1	77455	SLCO4C1	125277	PAM	332421	False	False	False	ref	80	0.10657	-80	0.09674
3297	chr5	102424248	A	G	rs4413509	0.0563685788	0.2470102918938885	0.0563685788	0.2506588599396052	0.0233798585517369	0.3752479232053017	0.001309523583962	0.2571887918529137	0.001309523583962	0.2607071882583929	0.0047317805417174	0.8315291455180684	0.0002844888391674	0.6623565139902401	0.0002844888391674	0.6684112744671603	0.0001134774841046	0.7979731882677047	6.7934072119727335e-06	0.6306906663684256	6.7934072119727335e-06	0.6367395022381211	0.0010268549371514	0.6334280729255053	0.0010268549371514	0.6393210347022662	SLCO6A1	74768	SLCO4C1	127964	PAM	329734	False	False	False	alt	0	0.0	0	0.0
3298	chr5	102426015	C	A	rs9765316	-0.0362402698	0.3999847164059514	0.0362402698	0.3946277546977213	0.0107709282962455	0.8834990923438736	-0.0003701227109767	0.5892494338840113	0.0003701227109767	0.5829454666639374	0.0010548975619411	0.9666873918541912	-3.694298626357078e-05	0.8963424623648688	3.694298626357078e-05	0.8894204057890972	1.1504776322819775e-05	0.9813948894169192	-3.713336022721108e-07	0.925153517757247	3.713336022721108e-07	0.9181987619343464	-0.0001204183299791	0.9030999325439604	0.0001204183299791	0.8961942173553485	SLCO6A1	73001	SLCO4C1	129731	PAM	327967	False	False	False	ref	-30	0.01721	100	0.1589
3299	chr5	102434280	T	C	rs10038801	0.1073600897139999	0.1063639147221012	0.107399406286	0.1075158108456144	0.0417423285146874	0.1008000562519551	0.0048544744330039	0.0813085950832355	0.0048554500218212	0.0819258660669897	0.0273811487578766	0.553969846784193	0.0028560946157638	0.3660482236894106	0.0028571457578042	0.3699370224791249	0.0011416204679163	0.422702742468719	0.0001295252401416	0.2714758942635622	0.0001295513228439	0.2747907257219242	0.0074255220876908	0.2933852256498079	0.0074271716538549	0.297115294074827	SLCO6A1	64736	SLCO4C1	137996	PAM	319702	False	False	False	alt	-5	0.003235	-5	0.006348
3300	chr5	102440831	T	A	rs6872341	0.0927956428	0.1270763247414496	0.0927956428	0.1288408900628961	0.0238200712813006	0.3553207515494991	0.0025310446371015	0.1575563852100671	0.0025310446371015	0.1593364115818936	0.0203020355646464	0.6152188605871932	0.0022278105529789	0.3836966781268365	0.0022278105529789	0.3889407782078631	0.0005226302291656	0.5756123073075838	6.198737583391911e-05	0.3591284994613452	6.198737583391911e-05	0.3642307051334155	0.006059681303817	0.31662343664316	0.006059681303817	0.321514103214111	SLCO6A1	58185	SLCO4C1	144547	PAM	313151	False	False	False	alt	-100	0.0638	-5	0.006165
3301	chr5	102442539	C	T	rs1376909	-0.0749301892	0.1687125031705395	0.0749301892	0.1662335855733929	0.0140378675890915	0.7377721116835539	-0.0010444261823466	0.3099772133293969	0.0010444261823466	0.3057565602334501	0.0117993467717989	0.7166247552494697	-0.0010608120272073	0.512180458297191	0.0010608120272073	0.5064903762177311	0.0001612245413506	0.7598051509204191	-1.4576382886211596e-05	0.561313084494662	1.4576382886211596e-05	0.5552270484691334	-0.0033279997360693	0.4564005220781426	0.0033279997360693	0.4508506411187802	SLCO6A1	56477	SLCO4C1	146255	PAM	311443	False	False	False	ref	100	0.0336	100	0.2421
3302	chr5	102443908	A	G	rs7724920	0.028411210724	0.5085269709249866	0.028574101276	0.5124981112865754	0.0982556562160425	0.0047680997675618	0.0029614878720853	0.1820601920190954	0.0029735913864536	0.1835816422087107	0.065872125630959	0.3854341038177081	0.0014919248207893	0.4584133226013413	0.0015000972931326	0.4626333879314744	0.0066101881959161	0.1246939454116934	0.0001568510922865	0.246305613300138	0.0001574583444219	0.2494824717407922	0.0036496651380686	0.4400954678589508	0.003672759064366	0.4444538892041971	SLCO6A1	55108	SLCO4C1	147624	PAM	310074	False	True	True	alt	25	0.005615	-25	0.0338
3303	chr5	102445473	C	A	rs2400797	0.0310400052	0.3703544235824761	0.0419280036	0.3721854362812096	0.0177510567048442	0.5728027484187295	0.0007370044445499	0.4250586803468857	0.0008897040892575	0.4273531486927188	0.0439848569826135	0.4622703238076254	0.0009255349091758	0.4213333665787758	0.0015612458743919	0.4237302628257525	0.0007546530779603	0.4888838051670717	2.257195034977136e-05	0.4383527362780544	3.148753202709099e-05	0.4409893355410088	0.002321764375969	0.3879445639029266	0.0041478341196264	0.3901800761356185	SLCO6A1	53543	SLCO4C1	149189	PAM	308509	False	False	False	alt	-35	0.00898	100	0.0852
3304	chr5	102452723	G	T	rs2400799	0.00878975176	0.7990054387505457	0.00878975176	0.8056777031109871	0.0143923086802074	0.7191321058818486	0.0001337087841945	0.8079028521496642	0.0001337087841945	0.8145823386762601	0.0032413975124541	0.8767954040811751	2.5005700073952275e-05	0.9045814501817568	2.5005700073952275e-05	0.9115672124911652	4.440866361686325e-05	0.8990602072056384	3.594689250533606e-07	0.9113927447324114	3.594689250533606e-07	0.9182592948324912	9.897396984591716e-05	0.8995246770817328	9.897396984591716e-05	0.9064506314393376	SLCO6A1	46293	SLCO4C1	156439	PAM	301259	False	False	False	alt	-40	0.00806	-90	0.001045
3305	chr5	102462150	G	A	rs58080162	-0.00844798024	0.7817203855701178	0.01048217864	0.7776079988271765	0.0135909791948056	0.7588686004126426	-0.0001162862217743	0.8110393844769571	0.0001421991632143	0.8069882342041231	0.0010474745142027	0.9656441823393658	-8.99232865098984e-06	0.9611890568309952	1.1316043566763086e-05	0.9570206990226888	1.4227500355552644e-05	0.9716661788103964	-1.236403445960029e-07	0.9653403860161388	1.532413342486376e-07	0.9611497053361758	-2.639305862558148e-05	0.959066416311147	4.288872026656988e-05	0.9548546570545652	SLCO6A1	36866	SLCO4C1	165866	PAM	291832	False	False	False	ref	35	0.00537	-10	0.01227
3306	chr5	102466680	T	A	rs10055704	0.00927596526	0.6029046604993302	0.01897820134	0.6047308249000397	0.013672413627658	0.7323443277682986	0.0002276498718414	0.6543488398197597	0.0003231635375746	0.6563551419700647	0.0181666721652205	0.6333939912147133	0.0002075368775462	0.6904688069286998	0.0003172486285083	0.6923847520081883	0.0002508545879569	0.6896585946807992	4.562984020996205e-06	0.715586342355792	5.642115534956724e-06	0.71749428923972	0.0007266338952855	0.6648553270878395	0.0011439741348025	0.6669774756817541	SLCO6A1	32336	SLCO4C1	170396	PAM	287302	False	False	False	alt	-10	0.001831	-10	0.01807
3307	chr5	102495921	G	A	rs11242471	-0.01390354102	0.6512282240121624	0.01679419678	0.6467612230337605	0.0155158439790784	0.664760521572819	-0.0002331201255569	0.670295277556359	0.000270870478032	0.6654745269858018	0.0021634060242155	0.9212210484674364	-3.203816660297423e-05	0.8980451669592826	3.464882615654649e-05	0.8936738553234997	3.1393439759596586e-05	0.929853822471696	-4.796400000721309e-07	0.9030617429582114	5.137337580809635e-07	0.8987648139393836	-0.0001360892085381	0.8895181206100599	0.000150935304015	0.8851509003367874	SLCO6A1	3095	SLCO4C1	199637	PAM	258061	False	False	False	ref	-100	0.03326	-5	0.006714
3308	chr5	107400716	T	C	rs252810	0.0266975562599999	0.4913124329832732	0.0266975562599999	0.4972416119454456	0.0218481303746257	0.4186176100533759	0.0005912871085007	0.4596627445302262	0.0005912871085007	0.4652702846270151	0.0234287882286957	0.5928583027100065	0.0007602635670808	0.5416702768274663	0.0007602635670808	0.5477086224791571	0.0005240005217088	0.5680338689271374	1.6946433099553278e-05	0.5215693397551503	1.6946433099553278e-05	0.5275686983744776	0.0023844478902048	0.5062865553801716	0.0023844478902048	0.5124192412778199	EFNA5	270221	FBXL17	981382	FER	1347126	False	False	False	alt	35	0.003143	-100	0.0752
3309	chr5	107434606	A	G	rs152611	0.0718178866	0.1946026045528197	0.0718178866	0.1972151024567096	0.039559715673108	0.1144091654719927	0.0030698985373123	0.1289305541033346	0.0030698985373123	0.1303866320840934	0.014887334630992	0.6631903932196824	0.0012294757464495	0.4693579185098693	0.0012294757464495	0.4750942781330532	0.0006159493294732	0.5364359708820495	5.299099692566741e-05	0.3690270776233491	5.299099692566741e-05	0.3740339920316203	0.0037172973507967	0.4128666048357174	0.0037172973507967	0.4184077588976917	EFNA5	236331	FBXL17	947492	FER	1313236	False	False	False	alt	-100	0.05096	-5	0.011475
3310	chr5	107454811	T	A	rs115779	0.0078839669	0.8147069632399502	0.0078839669	0.8215185596771024	0.0109156600124752	0.8657073455250405	7.889692888760857e-05	0.8778537619801478	7.889692888760857e-05	0.8845927932938054	0.0392184355514499	0.489358882605075	0.0003014738167234	0.6619183590178016	0.0003014738167234	0.6683421876658819	0.0004360262073824	0.5947812825918738	3.173734540432222e-06	0.7282360311428622	3.173734540432222e-06	0.7347432512528705	0.0008891161624492	0.6686224229689238	0.0008891161624492	0.6750660779423585	EFNA5	216126	FBXL17	927287	FER	1293031	False	False	False	alt	100	0.03555	-40	0.046
3311	chr5	107666975	T	C	rs967270	0.00702400042	0.8067147327600716	0.00891651298	0.8087169844914486	0.016625967067609	0.6183929239502227	0.0001262321105094	0.7988251047594296	0.000154249005403	0.8008245071649474	0.0010450001649565	0.9639072085681653	5.2557958688015206e-06	0.9652973256112648	7.904446743239621e-06	0.9675750661893504	1.6449643013088174e-05	0.9647306934548422	9.429176604921977e-08	0.9636793917109296	1.317320234172622e-07	0.9655175959100796	2.804262478968032e-05	0.958538498022084	3.7940021774273336e-05	0.9598866719833556	EFNA5	3962	FBXL17	715123	FER	1080867	False	False	False	alt	85	0.000946	55	0.004333
3312	chr5	109658233	T	C	rs25913	0.0956659461999999	0.1133187020522478	0.1037686018	0.1144638824554103	0.0506560019900391	0.0551369616962799	0.0052170170729017	0.0642370774894232	0.0056326844980643	0.0644910891743503	0.2407145920622876	0.1456321733538907	0.0270856039300177	0.0720647701792501	0.0289449295777887	0.0730276436334182	0.0131198575853966	0.055055179151805	0.0016112234200284	0.0459606211421359	0.0017066071017188	0.0464495758839542	0.0290859753884728	0.0561272845362942	0.0318803404704561	0.0567596404269866	MAN2A1	31695	PJA2	248259	FER	910391	False	False	False	alt	95	0.03613	75	0.03857
3313	chr5	109663016	A	G	rs31609	0.137556626	0.0551736666349766	0.137556626	0.055799075896011	0.0233706228573976	0.3673307013276883	0.0033423949142529	0.0977642907365753	0.0033423949142529	0.0989325108802321	0.016022236151892	0.6430790354075364	0.0022394521873763	0.3444156128975845	0.0022394521873763	0.3492898785205842	0.0003786057588764	0.6098699652245247	5.507475097598861e-05	0.3293931561826201	5.507475097598861e-05	0.3340631920648455	0.0064654745801853	0.2787973911134506	0.0064654745801853	0.2832962536936522	MAN2A1	26912	PJA2	253042	FER	915174	False	False	False	alt	-15	0.001038	5	0.00879
3314	chr5	109671803	G	A	rs31598	0.0260420153999999	0.5176212037487493	0.0260420153999999	0.5235881333828767	0.0189410668163254	0.5190540762912256	0.0005113540705765	0.5190697285876957	0.0005113540705765	0.5249823759392114	0.1156279898386723	0.2941275484813427	0.0027558488561179	0.3455801098598818	0.0027558488561179	0.3504073427186391	0.0021016090984325	0.3242996276012886	5.215999348562239e-05	0.3632558886568633	5.215999348562239e-05	0.3682238104353345	0.004724357493979	0.3543477547904514	0.004724357493979	0.3593039304352881	MAN2A1	18125	PJA2	261829	FER	923961	False	False	False	alt	95	0.06537	95	0.2766
3315	chr5	109672899	T	C	rs253243	0.1301257106	0.0716913280816239	0.1301257106	0.0725174707468145	0.0305655230880089	0.2162272568224156	0.0041579217248759	0.0844894249992801	0.0041579217248759	0.0852929294840213	0.071446009699449	0.368504490968722	0.0102874917917859	0.1603698570032697	0.0102874917917859	0.1631375806277621	0.0022400610296905	0.2958148391493448	0.0003319183542467	0.1395906825209888	0.0003319183542467	0.141902124792629	0.0211556860545676	0.0963994267887297	0.0211556860545676	0.0978710744642027	MAN2A1	17029	PJA2	262925	FER	925057	False	False	False	alt	55	0.01309	10	0.01904
3316	chr5	109682839	G	T	rs845739	0.00219926752	0.7929085709435401	0.00884739248	0.7930079938157925	0.0121297630507506	0.825718326197139	2.455603932407352e-05	0.8361264274621824	0.000107692931545	0.8359668512517855	0.0716959189733099	0.3686294593734943	-5.218004808905999e-05	0.5673335066227446	0.0005416408302771	0.5670189881389767	0.0008749426028063	0.4651581139731089	-7.809418696782302e-07	0.6261097736283265	6.643215913355248e-06	0.6257225245807757	0.0001237174623074	0.5817941189392776	0.0014136782026326	0.5817058064702438	MAN2A1	7089	PJA2	272865	FER	934997	False	False	False	alt	-100	0.10034	-100	0.3228
3317	chr5	109688776	G	A	rs1438662	-0.0211420467	0.4780470949442484	0.0307545825	0.4764149651833273	0.0191125655854299	0.5131416512770853	-0.0004347075181343	0.4921226485025099	0.0006304485137832	0.4907807949399931	0.8138035696611791	0.0068113475038123	-0.0171519474137594	0.0767777883705101	0.0250435073436763	0.0765358286295143	0.0155467745282242	0.0371849170382398	-0.0003520533209189	0.1083712877895524	0.0005128646626723	0.1080875363007734	-0.0029997360694137	0.4015416613215068	0.0041197914948368	0.3998776884138926	MAN2A1	1152	PJA2	278802	FER	940934	True	False	False	ref	-45	0.03125	100	0.1565
3318	chr5	109699795	A	G	rs3819904	-0.1490671474	0.0663257751107317	0.1515333982	0.0661022490195829	0.0377509653236532	0.1310075225707804	-0.0070741665222988	0.0670224388955335	0.0071290387085514	0.0668353516059	0.0499166969087129	0.4777578652705327	-0.0120735511195306	0.219207443921147	0.0121122401182782	0.2168202695957642	0.002237198298323	0.3488299248688254	-0.0005859432417717	0.1685833884422185	0.0005868040422918	0.1666716438941247	-0.0224192537362673	0.1375495707813212	0.0225743129556926	0.1361341488850918	MAN2A1	9867	PJA2	289821	FER	951953	False	False	False	ref	-85	0.0338	-55	0.05884
3319	chr5	109703598	T	C	rs1370960	-0.00044424148	0.7707610937284773	0.01017901072	0.7718446795669344	0.011186451238471	0.867000815835491	-2.965489430723392e-06	0.8312757358500008	0.0001140915892005	0.8324600267450899	0.0548653954010094	0.4280660631981264	7.601978118625997e-05	0.5872816201149506	0.0004442527226636	0.588580468306092	0.0006105701417262	0.5373474411439494	1.032703338508684e-06	0.6562888102234695	4.909568910618879e-06	0.6575322517529962	0.0001237174623074	0.5977326380995354	0.0012487215862227	0.5990666733346148	MAN2A1	13670	PJA2	293624	FER	955756	False	False	False	ref	-30	0.01274	55	0.0936
3320	chr5	109708857	C	A	rs6897334	0.05283639844	0.3060852623621527	0.05283639844	0.309751781443664	0.0166325618902709	0.6173830113937268	0.0009510042130852	0.4031145881037773	0.0009510042130852	0.4078641964442452	0.0083352578271913	0.7566655568992081	0.0004469407846934	0.6527848119544519	0.0004469407846934	0.6594303471028662	0.0001392617964012	0.769997602384969	8.069829366802976e-06	0.6612585213868841	8.069829366802976e-06	0.6679122541509739	0.0014895582461812	0.6185537187546534	0.0014895582461812	0.6253348247214021	MAN2A1	18929	PJA2	298883	FER	961015	False	False	False	alt	-65	0.05695	85	0.2218
3321	chr5	109716958	G	T	rs2269201	-0.0936483173999999	0.1381169353810723	0.0936483173999999	0.1363606328394607	0.0403253181850505	0.106528167282954	-0.003569674529005	0.1080360098402365	0.003569674529005	0.1066880313042291	0.0276327075979016	0.5603738857076347	-0.0025967762735328	0.3664433741011664	0.0025967762735328	0.3614263551516932	0.0011231703526374	0.431497838979003	-0.0001008773581814	0.2844488006799823	0.0001008773581814	0.2801175831142071	-0.0068968361320972	0.2992856986161763	0.0068968361320972	0.2946395373980948	MAN2A1	27030	PJA2	306984	FER	969116	False	False	False	ref	-95	0.006687	5	0.01343
3322	chr5	109730763	A	C	rs34387996	-0.012217502	0.7197182437431919	0.0127007772	0.7149698081771942	0.0232169590823303	0.3770517412024247	-0.0002863049277241	0.6454315404643867	0.000296199899026	0.6408533267223177	0.0046336313549536	0.838781991543537	-6.550464124437944e-05	0.8426626858201721	6.649515531861723e-05	0.8380719553971941	0.0001059559100874	0.8072845414968173	-1.4969972913769227e-06	0.8151621347894716	1.5172778856209637e-06	0.8106452932674659	-0.0002779518986506	0.8310054530176247	0.0002829005971429	0.8264361299951101	MAN2A1	40835	PJA2	320789	FER	982921	False	False	False	ref	30	0.00891	0	0.0
3323	chr5	109731623	G	T	rs10463428	0.05519692944	0.301032430019759	0.05519692944	0.3046576810951192	0.0159738325986247	0.645118763588371	0.0008877067856809	0.4272511740278764	0.0008877067856809	0.4320788904030309	0.0001228926792253	0.9990104165972608	6.166441208193158e-06	0.9727656876446188	6.166441208193158e-06	0.9798181126410112	2.62635425747794e-06	0.9976956748273254	1.1130541024021857e-07	0.969912618739284	1.1130541024021857e-07	0.9769219977980071	7.423047738444786e-06	0.9864529188999688	7.423047738444786e-06	0.991127627200146	MAN2A1	41695	PJA2	321649	FER	983781	False	False	False	alt	100	0.0976	-100	0.1411
3324	chr5	109736510	G	T	rs2416217	-0.0469221496	0.3184366140269929	0.0469221496	0.314010395778417	0.0796694566183967	0.0110328690669061	-0.0038171089387408	0.0872866499787055	0.0038171089387408	0.0861968458856775	0.002254132163241	0.9104521511243864	-0.0001082206708128	0.7876066606345223	0.0001082206708128	0.7809742676828287	0.0001828323828124	0.7252632671423725	-8.902404388350316e-06	0.5970082697791924	8.902404388350316e-06	0.5910919403823094	-0.0004008445778759	0.7807069855627784	0.0004008445778759	0.7741718722135248	MAN2A1	46582	PJA2	326536	FER	988668	False	False	False	ref	-5	0.01511	70	0.0669
3325	chr5	109736511	G	C	rs2416218	-0.022997387	0.5639703099149007	0.022997387	0.5575687841824785	0.0418319804138486	0.0991591679159345	-0.000890608590921	0.3623510322620656	0.000890608590921	0.3575650055013112	0.0022351621523538	0.9108025647581054	-5.239260412201044e-05	0.859994405461614	5.239260412201044e-05	0.8530702966879194	9.474868970218376e-05	0.8234568223436817	-2.0645445181454006e-06	0.7811114395883052	2.0645445181454006e-06	0.7743797359399371	-0.0002037214212661	0.8573272897134032	0.0002037214212661	0.850531260242174	MAN2A1	46583	PJA2	326537	FER	988669	False	False	False	ref	-30	0.02304	75	0.1109
3326	chr5	109739808	C	T	rs3756597	-0.1227859626	0.0769942794993969	0.1227859626	0.0762086815264792	0.0294508337470032	0.2331019427681066	-0.0039861083384613	0.0912716090370277	0.0039861083384613	0.0903035579327288	0.1882583880439444	0.1935359237694946	-0.0264701232446475	0.0791557813551206	0.0264701232446475	0.0777436635056698	0.0055889018741782	0.157550824348169	-0.0008526175008042	0.0804813759832138	0.0008526175008042	0.0791021062644787	-0.0346400646629935	0.0505398369271021	0.0346400646629935	0.0497040491567601	MAN2A1	49880	PJA2	329834	FER	991966	True	False	False	ref	100	0.0213	100	0.1631
3327	chr5	109759726	T	G	rs13187248	-0.00554135966	0.5969221611844209	0.0203213951399999	0.5953166228779535	0.0248524727465558	0.3347888473593047	-0.0001455160750486	0.5179348984852349	0.0005031689656442	0.5162272578505495	0.0010887136683051	0.968181275296508	-1.0510308391471949e-05	0.9381158197287118	2.0239338395481504e-05	0.9367973897041536	2.843475980919173e-05	0.9510607664819888	-2.8677063926056254e-07	0.9153601597037972	5.225998745304185e-07	0.914009945673556	-4.041437102040347e-05	0.9315948428915904	8.165352512287454e-05	0.9303115826890908	MAN2A1	69798	PJA2	349752	SLC25A46	978411	False	False	False	ref	-100	0.0755	-75	0.06143
3328	chr5	109759844	T	G	rs13187428	-0.026170582	0.377564238529043	0.040799946	0.3749650737989604	0.014616551527439	0.7045143285505309	-0.0004213134049614	0.472717530875131	0.0006625179066009	0.4697836315483041	0.001286661607997	0.9621052414192198	-6.492713493616142e-05	0.8809243701958093	7.162379376265007e-05	0.8766145431641957	2.056271263545269e-05	0.9648389543786056	-1.0735276856259731e-06	0.8861508714593009	1.1839401583338703e-06	0.8818912823561353	-0.0002268153475635	0.8718911519058031	0.0002548579723532	0.8674345870859851	MAN2A1	69916	PJA2	349870	SLC25A46	978293	False	False	False	ref	35	0.0047	-15	0.0299
3329	chr5	109768576	T	G	rs10041575	-0.0031331631999999	0.8422018026791601	0.0066409244	0.8402733119877657	0.015771442488837	0.6553756654771897	-5.1579934109055394e-05	0.8412603436721552	0.0001041866067223	0.8392192445047559	0.0293606281547952	0.5509519483044164	-0.0001290334321981	0.7231256757991112	0.0001903005397837	0.7210338688997081	0.0004937909604518	0.5842289399433109	-2.1651779729891208e-06	0.734879593482589	3.08730230021356e-06	0.7328116039025258	-0.0004272376365015	0.7278044030266027	0.0006119890468806	0.7257495960795463	MAN2A1	78648	PJA2	358602	SLC25A46	969561	False	False	False	ref	10	0.002014	30	0.02924
3330	chr5	109772236	G	A	rs3753174	0.200699529	0.0304591595685287	0.200699529	0.0306946915809836	0.0515004525118214	0.054689456948334	0.0124135178198081	0.0235546887382811	0.0124135178198081	0.0237443651251666	0.0030343769588597	0.8867146589339454	0.0006367960517624	0.5606099914765698	0.0006367960517624	0.566230311951829	0.0001610638784718	0.7557126011460886	4.0201930146903385e-05	0.4157994459093813	4.0201930146903385e-05	0.4211278913944456	0.0015794596021245	0.5632884279825555	0.0015794596021245	0.5691257436425089	MAN2A1	82308	PJA2	362262	SLC25A46	965901	False	False	False	alt	10	0.002441	-100	0.0913
3331	chr5	109776323	A	T	rs2042164	0.0041512048659999	0.8945431746297273	0.004761761894	0.896050949434813	0.0158769433225225	0.6442633177055552	7.44338819194325e-05	0.884319109184122	8.445703275284423e-05	0.8857682863349119	0.0172437398964072	0.6388826717539958	8.669034204281944e-05	0.8440685040887442	9.591010974163492e-05	0.8454955889619745	0.0002962407400234	0.6674558375389157	1.78216020969652e-06	0.8462680282569708	1.93455535719664e-06	0.8475911026045478	0.000251558840025	0.8425589824820798	0.0002960971264557	0.8440196758031641	MAN2A1	86395	PJA2	366349	SLC25A46	961814	False	False	False	alt	45	0.001617	95	0.05725
3332	chr5	109777887	C	T	rs34595717	0.0128868434	0.3778185944710387	0.0375689769999999	0.3792260109275707	0.0144732606164334	0.7084319572100264	0.000189757624135	0.4741701754499569	0.0005787573990334	0.4756045613850925	0.0101753488832436	0.7407403893221209	1.0436210598351178e-05	0.6443908289999823	0.0003501203763157	0.6458529983071083	0.0001501465824225	0.7715854038049375	3.377896710796283e-07	0.6703240628003251	5.537211423691866e-06	0.6717999122066293	0.0001369139916201	0.6125060375364787	0.0012800633433406	0.6141308184068324	MAN2A1	87959	PJA2	367913	SLC25A46	960250	False	False	False	alt	-35	0.03564	-75	0.08746
3333	chr5	109781470	A	G	rs13189822	-0.0402130092	0.2865390319205036	0.0549897772	0.284326689454819	0.0294044404931827	0.2337755171402162	-0.0014723916701459	0.2379842261256197	0.0017608238539293	0.2360436791365865	0.003606776417802	0.8693939169160899	-0.000250671951861	0.7219209697644988	0.0002809582076418	0.7178540391389534	0.0001142968310421	0.8050999955505744	-8.99581668406224e-06	0.655454696855291	9.586983238037564e-06	0.651340451875681	-0.0007785952294546	0.7014092623882495	0.0009006631255979	0.6972233905614711	MAN2A1	91542	PJA2	371496	SLC25A46	956667	False	False	False	ref	-15	0.00943	-30	0.02177
3334	chr5	109786878	A	G	rs2269205	-0.00902106978	0.7168722334391939	0.0130490524599999	0.7148968677191673	0.0141873653954887	0.7248387956747432	-0.0001081715248796	0.7732644673460289	0.0001709862520045	0.7715128537398813	0.1165971099600804	0.2797334996750867	-0.0004376458819097	0.4745561267822248	0.0010428325672766	0.472929951035769	0.0017290823603118	0.350450904474532	-4.4586447236104885e-06	0.5238483892854789	1.3952727110064112e-05	0.5223634420954276	-0.0011736663257563	0.5095430598869939	0.0022145425753026	0.5075222522595512	MAN2A1	96950	PJA2	376904	SLC25A46	951259	False	False	False	ref	-10	0.01685	65	0.0586
3335	chr5	109786985	G	A	rs2269206	-0.103798514	0.1014925923417024	0.103798514	0.1001710838907926	0.1467125222026174	0.0008089295631773	-0.015910780559768	0.0112080116857673	0.015910780559768	0.0111756843034501	0.1073834581505063	0.2968990568396262	-0.0102325475199276	0.1569342943093063	0.0102325475199276	0.1540038611960809	0.0159306140345766	0.0398035022668466	-0.0016226476406357	0.0373570071126914	0.0016226476406357	0.0366640471740222	-0.0194475602916432	0.1058042565807016	0.0194475602916432	0.1039943396396462	MAN2A1	97057	PJA2	377011	SLC25A46	951152	False	True	True	ref	35	0.001953	-35	0.0803
3336	chr5	109796377	A	T	rs2301009	0.00049337332	0.8597379088702243	0.00615681356	0.8614867246409461	0.0092942496565631	0.921235434872561	3.392641716698272e-06	0.9147746812905998	5.512421283589709e-05	0.9165089856500476	0.338302101547293	0.0925966107389878	0.00058013605525	0.3700590574829503	0.0020235200357635	0.3716034728511201	0.0031259713259372	0.2368470994881729	4.782841852714202e-06	0.4870949828630146	1.7861228450350783e-05	0.4887591629484838	0.0002540331892712	0.5141388163534205	0.0020817524990926	0.515522596726423	MAN2A1	106449	PJA2	386403	SLC25A46	941760	False	False	False	alt	-90	0.0188	100	0.1277
3337	chr5	109799795	A	G	rs1008661	0.00207531088	0.8549152340555806	0.0065663997599999	0.8563844962690692	0.0158014046783268	0.655823760424795	3.0239921638789605e-05	0.8494831155193652	0.000106890865123	0.8508202868762625	0.0003587806406914	0.9936666510323512	3.8293107769678994e-07	0.9864049010585983	2.2927998114861924e-06	0.9892606927628328	5.7099790696693286e-06	0.9931063084558996	5.041933085207289e-09	0.9852308492891356	3.77633438927789e-08	0.9882682341183924	-1.649566164098836e-06	0.985301801451088	9.897396984593038e-06	0.9864584291539564	MAN2A1	109867	PJA2	389821	SLC25A46	938342	False	False	False	alt	30	0.01105	30	0.109
3338	chr5	109808927	T	G	rs34052755	0.057066393	0.1888586338529097	0.0693845162	0.1904319663937907	0.0320961728733339	0.1939452502661865	0.0019906542541034	0.1549637138706994	0.0022774906680718	0.155989687317764	0.001652865296427	0.932536880182814	8.707137755109332e-05	0.7715458946911032	0.0001133852066163	0.7753204959994566	5.020345799270928e-05	0.8839592231265362	2.9356005713138083e-06	0.7050281371474549	3.548337129145932e-06	0.7088602405483548	0.000285374946389	0.769628351778325	0.0004057932763682	0.7733843288855572	MAN2A1	118999	PJA2	398953	SLC25A46	929210	False	False	False	alt	-90	0.2366	95	0.0915
3339	chr5	109816784	G	T	rs4141495	-0.01948406908	0.6360175316094926	0.01948406908	0.629700555021386	0.0332810515041364	0.1755795459226691	-0.0005696157473953	0.5287536015239136	0.0005696157473953	0.5231194390175876	0.0031490218072646	0.8764651860012674	-7.778362651419393e-05	0.8630362230202906	7.778362651419393e-05	0.8560909933736603	0.0001032380085295	0.8031060057228886	-2.204637440815809e-06	0.8104913925585714	2.204637440815809e-06	0.8036365705845888	-0.0002631058031737	0.861044988634986	0.0002631058031737	0.8541081456665772	MAN2A1	126856	PJA2	406810	SLC25A46	921353	False	False	False	ref	65	0.02637	-35	0.02344
3340	chr5	109822362	A	C	rs10515405	0.033279346	0.4183154419073593	0.03445322	0.4222064099934862	0.0110838772155647	0.8633537463816116	0.0004050156670233	0.5747154356606204	0.0004158778614027	0.5793014999346666	0.0049000362904555	0.8266248945257786	0.0002116938107943	0.7313860562395993	0.000215982898732	0.7358069267804687	5.638393488025969e-05	0.8748704978488534	2.673549309140908e-06	0.7751600094439761	2.7132374760611195e-06	0.779577027134373	0.0008099369865725	0.7044505289315663	0.0008280822143776	0.7088813080035231	MAN2A1	132434	PJA2	412388	SLC25A46	915775	False	False	False	alt	-95	0.04745	80	0.02325
3341	chr5	109836474	G	A	rs12518625	0.02778792404	0.4484199282956361	0.03870744524	0.4497223079601499	0.0380576798422982	0.124730236328966	0.0013139185114619	0.3303846692189829	0.0016957940554243	0.3308043535826321	0.2564539276170366	0.1423839330124915	0.0115292998052911	0.2043037320063842	0.0143260816734821	0.205112115058896	0.0104086262624866	0.0813396002455143	0.0005369449937092	0.1627028781598918	0.0006365907451357	0.1634698102048131	0.009363762330507	0.2427984162617339	0.0125061858731153	0.2434988016980512	MAN2A1	146546	PJA2	426500	SLC25A46	901663	False	False	False	alt	40	0.00879	40	0.0996
3342	chr5	109841677	C	T	rs10065099	-0.303041354	0.0085317221490022	0.303041354	0.0085194014094541	0.0509305165901096	0.0533066996371843	-0.0158502774390468	0.0103236629084047	0.0158502774390468	0.0102824699346495	0.088436541189667	0.345065610630767	-0.0305656339287047	0.0663598528601881	0.0305656339287047	0.0653129820713524	0.0049402739194054	0.1839720972132868	-0.0017468832733944	0.0418063011824487	0.0017468832733944	0.0413834227779316	-0.0481970241826399	0.0286104942497287	0.0481970241826399	0.0282815457597159	MAN2A1	151749	PJA2	431703	SLC25A46	896460	False	True	True	ref	90	0.01291	75	0.11316
3343	chr5	109847218	C	T	rs17162347	-0.02700893652	0.517613893463498	0.02700893652	0.5119220518462545	0.0558740687393819	0.0404246939326529	-0.0014704319733658	0.2622249042305629	0.0014704319733658	0.2587495310027994	0.0495521427864471	0.4436290584231888	-0.0013217671562835	0.4596108590344401	0.0013217671562835	0.4540185518855515	0.0028460541455639	0.2621753598316337	-7.49980669212643e-05	0.3193011744067371	7.49980669212643e-05	0.3145722898462534	-0.0033016066774437	0.439933367794634	0.0033016066774437	0.4343391213078813	MAN2A1	157290	PJA2	437244	SLC25A46	890919	False	False	False	ref	-100	0.037	25	0.007324
3344	chr5	109864270	T	G	rs12187114	-0.0097792088	0.7660864381395818	0.010734847	0.7616297788482618	0.0162552525026052	0.6345684632999539	-0.0001674476406434	0.7614582891573299	0.0001817329419238	0.7569033142801116	0.0348792517567879	0.5118915770736352	-0.0002951000692441	0.6534901125520829	0.000333843755975	0.649340375931099	0.0005556611780492	0.5485103617860552	-4.9004314579275966e-06	0.6679106033474821	5.479589176608473e-06	0.6637333018048843	-0.0008503513575929	0.6528673613436726	0.000985615783049	0.6486412624262015	MAN2A1	174342	PJA2	454296	SLC25A46	873867	False	False	False	ref	-90	0.01587	-100	0.2013
3345	chr5	109864280	A	G	rs11241042	-0.0140027273399999	0.6564707485922604	0.01696148626	0.6519772522336569	0.0206415190570332	0.4599428845598418	-0.0002781928289303	0.6130977828015599	0.0003430401297606	0.6088135484093142	0.0344998515390451	0.514069198801556	-0.0006115567331419	0.5633725479945253	0.0006589114202612	0.5593409239698732	0.000691990225415	0.5086545330708758	-1.2037712788561846e-05	0.5542345615359379	1.3075588372188111e-05	0.5502245445191825	-0.0016594635610834	0.5587609236410718	0.001786480155719	0.5545872357918571	MAN2A1	174352	PJA2	454306	SLC25A46	873857	False	False	False	ref	-95	0.031	-95	0.1807
3346	chr5	109873641	T	C	rs12656279	0.11793398	0.0773908919696785	0.11793398	0.0785134893810479	0.0203631739192507	0.4733104805395945	0.0024987150039288	0.1416370780528804	0.0024987150039288	0.1434604915874515	0.0166111312724752	0.6459344586151726	0.0018164812876728	0.3760426222738651	0.0018164812876728	0.3810022571254415	0.0003346852931588	0.6403475487309934	3.8961840656797126e-05	0.3801934399499603	3.8961840656797126e-05	0.3851886064438273	0.0054476922569363	0.3124678451520987	0.0054476922569363	0.3171610555325535	MAN2A1	183713	PJA2	463667	SLC25A46	864496	False	False	False	alt	-75	0.02443	55	0.1282
3347	chr5	119388814	G	A	rs6888436	-0.0031572182199999	0.7779813067438437	0.01050623098	0.7787457566495748	0.0428142980112877	0.1012067640563137	-0.0001214284062658	0.603692907116109	0.0003994288523726	0.6042966336481906	0.0133152980766058	0.6894219407210533	-0.0001267388336331	0.7640374912855746	0.0001947074627367	0.7647728456868297	0.0004973506222979	0.5785717305921595	-3.542600704754845e-06	0.688697229901964	6.026724706238153e-06	0.6893821981406905	-0.000350532809871	0.7578792195172197	0.0006045659991421	0.7586102317330679	HSD17B4	63652	TNFAIP8	120121	FAM170A	240745	False	False	False	ref	-10	0.00989	-60	0.1827
3348	chr5	119389627	T	C	rs1848554	-0.03988378734	0.3987712227566705	0.0418537501399999	0.3952680783347753	0.0151919727788584	0.6820677874425461	-0.0006821762015105	0.5027980419499176	0.0007134085877654	0.4991859915970991	0.1164272046451782	0.2774602242167031	-0.0030663958079778	0.3289816131102793	0.0033330160432157	0.3255721733532341	0.0016930368129915	0.3435536052516275	-4.833288422905596e-05	0.377468014163827	5.255996220611041e-05	0.3737476093425834	-0.0063714493088317	0.3106817221191894	0.0068580713272409	0.3072671277361813	HSD17B4	62839	TNFAIP8	120934	FAM170A	239932	False	False	False	ref	-40	0.02747	40	0.0713
3349	chr5	119442221	A	C	rs32643	0.0085715914119999	0.6063907955033778	0.0215114001879999	0.6073688325971128	0.0166627695541994	0.6112766363919543	0.000143565412703	0.6356203277894745	0.0003830859833184	0.6361846775762445	0.0003604302068555	0.9939443844274172	5.465377952514462e-06	0.9718152139297316	7.4870579845571985e-06	0.9734607365293784	5.705692324243662e-06	0.9931813517823403	9.039409330392602e-08	0.9695059635115364	1.274620812085197e-07	0.9710868524856224	1.4846095476889574e-05	0.97304558700368	2.474349246148264e-05	0.973354843271841	HSD17B4	10245	TNFAIP8	173528	FAM170A	187338	False	False	False	alt	-35	0.00515	-100	0.1262
3350	chr5	126910206	C	T	rs11956061	0.0776756718	0.1619162870754164	0.0776756718	0.1643268376854313	0.035105422135919	0.1547514592179305	0.0028330644812374	0.1230637339917126	0.0028330644812374	0.1245489660837532	0.1140567780673682	0.2760683231450725	0.0092816886225713	0.162773788545405	0.0092816886225713	0.165819124810552	0.0040611143673384	0.1937431599028837	0.0003414677024542	0.1284588794185042	0.0003414677024542	0.1307842818733855	0.0171035267724588	0.1184908950410696	0.0171035267724588	0.1206890628744801	MARCHF3	120352	LMNB1	133582	C5ORF63	163300	False	False	False	alt	-100	0.04877	-100	0.2837
3351	chr5	126971918	C	T	rs4836307	-0.1095756347999999	0.104060446920618	0.1095756347999999	0.10289392874399	0.0698261058592359	0.0178466068661547	-0.0080123063627784	0.0401615826320451	0.0080123063627784	0.0397957117222256	0.2040785523407343	0.1732456743124203	-0.0265568505818319	0.0787738453151461	0.0265568505818319	0.0774844811661728	0.0145164484630607	0.0433000509327336	-0.0019849461022167	0.0368687251120787	0.0019849461022167	0.036429532875857	-0.0345179967668502	0.0523505888870727	0.0345179967668502	0.0516812137773689	MARCHF3	58640	C5ORF63	101588	LMNB1	195294	False	True	False	ref	25	0.034	-50	0.1951
3352	chr5	126981234	G	A	rs12657369	0.0364238777	0.3365005865711366	0.0445529863	0.3384598461289689	0.0833006443582847	0.0096498428653328	0.0037101613485099	0.0995812308082409	0.0042537860713	0.099472773201278	0.0345188215499323	0.5159070692504063	0.0014035497471489	0.4350464956424816	0.0017019792802049	0.4370949675350274	0.0030870971799025	0.2519356101385607	0.00014415432728	0.2381917565497409	0.0001663063462343	0.2395783053174093	0.0037073999538121	0.3869628086049941	0.0045041404110718	0.3890083241385902	MARCHF3	49324	C5ORF63	92272	LMNB1	204610	False	True	False	alt	-100	0.07477	-100	0.4778
3353	chr5	126988408	C	T	rs10057084	0.1010859549999999	0.1004056521679574	0.1010859549999999	0.1019099965049592	0.0232026253296363	0.3770308476614764	0.0023723405860443	0.1395874016139559	0.0023723405860443	0.1415417842436178	0.0296773448583022	0.5370624215826617	0.0031100656385988	0.3026292067522657	0.0031100656385988	0.3071902532934043	0.000689056141358	0.5069980264174588	7.283521162965674e-05	0.2917560741913746	7.283521162965674e-05	0.2961574115470827	0.0084828939988782	0.2305298573337166	0.0084828939988782	0.2343089126079922	MARCHF3	42150	C5ORF63	85098	LMNB1	211784	False	False	False	alt	-95	0.0696	-40	0.0155
3354	chr5	127011852	G	A	rs9327428	-0.1329087116	0.0442345682950556	0.1576870984	0.0440388965983068	0.0243380045141015	0.3473238363408897	-0.003656922001185	0.0816907607492777	0.0040824773031785	0.0811982019229896	0.1743063574279963	0.2008280333390825	-0.0268287201953191	0.0600482945391953	0.0292895146038744	0.0592038889565452	0.0043209124049947	0.1869119087265113	-0.0007177157393003	0.0731844882221238	0.0007599785431611	0.0723084920729541	-0.0391318333278347	0.0293835967509717	0.0439881561149417	0.0290976418460282	MARCHF3	18706	C5ORF63	61654	LMNB1	235228	False	False	False	ref	75	0.1217	-20	0.03174
3355	chr5	127021395	T	A	rs2108458	0.0013896442999999	0.7297278585655105	0.0129445695	0.7332499217038194	0.0098204722530075	0.9182842120264756	3.138878638717336e-05	0.8275094041992305	0.0001230088755514	0.831415000617516	0.0486539540100953	0.4548183280633543	9.797952713154002e-05	0.5753710146891209	0.0005757814571901	0.5789839916891338	0.0004705628069367	0.5846792482848715	1.74027933187908e-06	0.6645280417623517	5.528815812240856e-06	0.6684735768436413	0.000285374946389	0.5779656720566355	0.001520900003299	0.5814019683340528	MARCHF3	9163	C5ORF63	52111	LMNB1	244771	False	False	False	alt	100	0.039	100	0.157
3356	chr5	127024983	G	A	rs7706333	-0.0762207282	0.1734524437735408	0.0762207282	0.1709446301305542	0.0183796016873033	0.546332229157373	-0.0014988954991617	0.2502952764678829	0.0014988954991617	0.2471216144766279	0.0293111411698722	0.5410028672665858	-0.0022477680801606	0.3629286190151553	0.0022477680801606	0.3580180563169181	0.0005361621285274	0.5547524245847947	-4.387925553752632e-05	0.3806516825881276	4.387925553752632e-05	0.3757157266440487	-0.0062081422585859	0.3009847121420348	0.0062081422585859	0.2963979962585751	MARCHF3	5575	C5ORF63	48523	LMNB1	248359	False	False	False	ref	25	0.00213	5	0.00903
3357	chr5	127028162	G	A	rs1013662	-0.0236764668	0.5467777967536664	0.0236764668	0.54060416582311	0.0373970034856959	0.1333583224750407	-0.0008533896965289	0.3634941638448822	0.0008533896965289	0.3586600951236678	0.0978440170235227	0.307148644098482	-0.0022948356408359	0.3533122098266764	0.0022948356408359	0.348497355074273	0.0036748115865113	0.211731858030927	-8.31900542934623e-05	0.2790848336261338	8.31900542934623e-05	0.2747683086747716	-0.0048093101514301	0.3487235097591081	0.0048093101514301	0.3437882835187358	MARCHF3	2396	C5ORF63	45344	LMNB1	251538	False	False	False	ref	-25	0.00595	80	0.0678
3358	chr5	127055270	T	C	rs6899133	0.0784098944	0.1600338314400651	0.0784098944	0.162299032985666	0.0181172139023795	0.5405333205905334	0.0016194532012384	0.2332223254086619	0.0016194532012384	0.2362840292780528	0.0012619181155355	0.9549223422798284	9.155155643673984e-05	0.7931659579273349	9.155155643673984e-05	0.7998415081133079	2.1787151025344283e-05	0.9497895312478132	1.851625451081359e-06	0.7839708273488782	1.851625451081359e-06	0.7907254474876098	0.0003167167035069	0.79877638618789	0.0003167167035069	0.8055448137863028	C5ORF63	18236	MARCHF3	24712	MEGF10	235527	False	False	False	alt	-65	0.02376	100	0.11914
3359	chr5	127073496	C	G	rs13154281	-0.38529796	0.0048550717072459	0.38529796	0.0048450956338753	0.1294087022110053	0.0013391436065696	-0.0522520282236275	0.0015028242155029	0.0522520282236275	0.0014694676313553	0.8329377123816435	0.0042431226634859	-0.3324534822247752	0.0006905526373731	0.3324534822247752	0.0007108552098541	0.1089405486478378	0.00012645425646	-0.0453665469983805	0.0003800147117338	0.0453665469983805	0.0003729884871157	-0.0453869882220975	0.0260334936645638	0.0453869882220975	0.0257028663717371	C5ORF63	10	MARCHF3	42938	MEGF10	217301	False	True	True	ref	-55	0.0525	-60	0.3276
3360	chr5	127091854	G	A	rs2191209	-0.24880119	0.0146497646607333	0.24880119	0.0145636578419204	0.0420300909544453	0.0956185599544456	-0.0108451699296927	0.0195753616052544	0.0108451699296927	0.0194642754618749	0.3483553825343934	0.0889887622442194	-0.0911727815838079	0.0119724578576352	0.0911727815838079	0.0118083928772455	0.0146916526870412	0.0430399540056479	-0.0039804383989156	0.013059903462254	0.0039804383989156	0.012920777242977	-0.0821360232258915	0.0072193421133632	0.0821360232258915	0.0071648721406264	C5ORF63	18348	MARCHF3	61296	MEGF10	198943	False	True	False	ref	-100	0.10425	0	0.0
3361	chr5	127092895	C	T	rs7731621	-0.13117633	0.0720748241822955	0.13117633	0.071302090323214	0.0193793281717765	0.4958630582314213	-0.0029467238391393	0.1445069660537723	0.0029467238391393	0.1427583958691263	0.0269464880736365	0.5716640256472894	-0.0030539663980601	0.3238702199881977	0.0030539663980601	0.3194343497859895	0.0004597604736035	0.5877144336093562	-5.627469514700861e-05	0.3444149180205477	5.627469514700861e-05	0.3397813633623655	-0.0078857510474744	0.259336281840927	0.0078857510474744	0.2552707821127281	C5ORF63	19389	MARCHF3	62337	MEGF10	197902	False	False	False	ref	55	0.01181	85	0.1062
3362	chr5	127115607	G	A	rs13190493	0.05627388294	0.2541443241531757	0.05627388294	0.2572017800161162	0.0309174615170416	0.2078793805673691	0.0018587508986627	0.218224856781743	0.0018587508986627	0.2210175724847488	0.1869783247006037	0.1885564998139311	0.011706555946775	0.1619678032124525	0.011706555946775	0.1646899493117951	0.0059482179255421	0.1397380932142005	0.0003917241733524	0.1435039365528757	0.0003917241733524	0.1458013181063475	0.0170655867506845	0.1381601218185763	0.0170655867506845	0.1401267525860751	C5ORF63	42101	MARCHF3	85049	MEGF10	175190	False	False	False	alt	5	0.004456	100	0.251
3363	chr5	127172658	T	C	rs248081	-0.0838914668	0.1175768293961194	0.1089989812	0.1174396339419589	0.0307667320506634	0.2113700139752451	-0.0022702950490757	0.1319271811248033	0.0031003384486936	0.1317892075760876	0.3973087328032726	0.071111641991229	-0.0369715355950516	0.0449157634357941	0.0463436734091244	0.0447379776398249	0.0120868166519989	0.0573423945196898	-0.0009888355937211	0.051822327029675	0.0012986849831716	0.0517379784752245	-0.0237545775461053	0.0558953394871123	0.0330069941605357	0.055780846378996	C5ORF63	99152	MEGF10	118139	MARCHF3	142100	False	False	False	ref	40	0.03656	40	0.0654
3364	chr5	127175105	A	G	rs248090	0.02074579378	0.5569173581148374	0.0211242797	0.5619201381926494	0.0109014810274939	0.8791508176715671	0.0002143428378387	0.7053964893712774	0.0002190379217879	0.7101933539926815	0.0022458843324205	0.9140122330358014	4.1020322968345566e-05	0.8678886197613627	4.228148481658263e-05	0.8724442803629471	2.464778363417174e-05	0.9457292801490425	4.164120278123608e-07	0.8990281413392885	4.320566280851351e-07	0.9036867692887132	0.0001723796641482	0.8612083246375775	0.0001789779288046	0.8657476076447884	C5ORF63	101599	MEGF10	115692	MARCHF3	144547	False	False	False	alt	95	0.04987	85	0.2401
3365	chr5	127182851	A	G	rs248104	0.462472528	0.0024130695201371	0.462472528	0.0023925934517189	0.0571908430707865	0.038167265296513	0.0265847317102243	0.0042403828149787	0.0265847317102243	0.0042643727515544	0.0009262314011414	0.961710735411198	0.0003591472773692	0.765413826135738	0.0003591472773692	0.7721382043088855	5.887037473108928e-05	0.9122130852890392	2.2840029658078925e-05	0.638347255148122	2.2840029658078925e-05	0.6447882208220296	0.0007249843291214	0.8006830784930591	0.0007249843291214	0.806901227778826	MEGF10	107946	C5ORF63	109345	MARCHF3	152293	False	True	True	alt	-45	0.00818	95	0.784
3366	chr5	127185450	G	A	rs248115	-0.0309574543999999	0.4485666861213192	0.0332190604	0.4447948169936971	0.0103258246606625	0.8966154933843538	-0.000347909833359	0.6260210019976239	0.0003692425071509	0.6217591424959138	0.0704496717363333	0.3845716422467382	-0.0017723102144321	0.3999516889216645	0.0019655028986784	0.3967129056077155	0.0007229997856591	0.5127682721622154	-1.8710693955499007e-05	0.4982556285297152	2.05329903368689e-05	0.4944289318663983	-0.0039531853122628	0.3816802319203021	0.0044348586321796	0.378409411227909	MEGF10	105347	C5ORF63	111944	MARCHF3	154892	False	False	False	ref	-80	0.0934	-15	0.04886
3367	chr5	127185845	G	T	rs248116	-0.00391846564	0.7930894275647454	0.00994770004	0.7919867228713029	0.0160594624956998	0.6422480310944066	-8.427163494340746e-05	0.792624005969077	0.0001704398286223	0.791139464524199	0.0249645343274718	0.5845612651169836	-7.483540127726387e-05	0.7368090563564847	0.000184814277806	0.735833248239826	0.0003997246918119	0.6143122304325525	-1.5711456613509766e-06	0.7451808087181332	3.171428984097925e-06	0.7441352485111249	-0.0002210418659892	0.7397996637431586	0.000585595988255	0.7389248031967804	MEGF10	104952	C5ORF63	112339	MARCHF3	155287	False	False	False	ref	-15	0.0873	100	0.4285
3368	chr5	127185953	C	T	rs248117	0.236654672	0.0176125008325395	0.236654672	0.0177613051721625	0.0663143244277691	0.0215619012560939	0.0160996338079732	0.0107478900777076	0.0160996338079732	0.0107635696415337	0.0372529774669261	0.5223296304086387	0.0113941933445253	0.171630352315913	0.0113941933445253	0.1748010335469217	0.0026124888116775	0.2961002924959948	0.0008113834196766	0.0898697033640192	0.0008113834196766	0.0912335643580098	0.0225561677278875	0.1035508003215943	0.0225561677278875	0.1050666095874623	MEGF10	104844	C5ORF63	112447	MARCHF3	155395	False	True	False	alt	-5	0.001343	100	0.10376
3369	chr5	127191359	A	G	rs1860439	-0.1671557612	0.0475239872724589	0.1671557612	0.0472628665913011	0.0436634149522804	0.0847444138971072	-0.0077153343759896	0.0426273500228038	0.0077153343759896	0.0423424260870841	0.1060398865098478	0.2897313755299757	-0.0192409160679369	0.1042655574259062	0.0192409160679369	0.1023398675816084	0.0046939381602766	0.1702756429860971	-0.0009014727048722	0.0727668759622485	0.0009014727048722	0.0713398405355848	-0.0333220612978786	0.0540183850754618	0.0333220612978786	0.05317801089229	MEGF10	99438	C5ORF63	117853	MARCHF3	160801	False	False	False	ref	95	0.1848	95	0.1499
3370	chr5	127192961	A	G	rs173555	0.1083467258	0.0924607770158978	0.1083467258	0.0937268506235726	0.051564283978729	0.0511183254022433	0.0057147520358963	0.0497669278336301	0.0057147520358963	0.05014780161591	0.0418198013922337	0.4697768150685936	0.0044507931263143	0.2489359119169855	0.0044507931263143	0.2529859553641247	0.0021719721741146	0.2981464623519121	0.0002366922554471	0.1559098341164697	0.0002366922554471	0.158634066833837	0.011433967866451	0.177880337980518	0.011433967866451	0.1811754667911819	MEGF10	97836	C5ORF63	119455	MARCHF3	162403	False	False	False	alt	100	0.008194	100	0.2607
3371	chr5	127194980	T	C	rs248127	0.39130244	0.0040203418816638	0.39130244	0.0040272385556848	0.0834345258398781	0.0090634618314942	0.0334229161012471	0.0027966652436645	0.0334229161012471	0.0027944924348376	0.0858698162383292	0.3332901532459428	0.0353108471384281	0.0461255042743424	0.0353108471384281	0.0471076473375215	0.0073243007767622	0.1118869563922966	0.003074544267151	0.0168954595421161	0.003074544267151	0.017096685447361	0.0564572267493648	0.0169384661281488	0.0564572267493648	0.017207746023426	MEGF10	95817	C5ORF63	121474	MARCHF3	164422	False	True	True	alt	-65	0.00482	15	0.0476
3372	chr5	138545415	T	C	rs188731	0.0068157731	0.7033259331059758	0.0140656835	0.7072440930930017	0.0152474231904948	0.6628694085100668	0.0001360702761481	0.7184493651409041	0.0002190335120442	0.7226944726817277	0.0006466299363267	0.9826144851172368	4.728234055545793e-06	0.9575039093903572	8.644874303139785e-06	0.9617375569891152	1.0003316016739096e-05	0.9824343701323796	9.25449443006275e-08	0.956840333939195	1.373644153770664e-07	0.961069156415816	1.2371746230741302e-05	0.9614449187820449	2.8867407871729748e-05	0.9657559802297728	ETF1	2179	HSPA9	30260	CTNNA1	65553	False	False	False	alt	-55	0.015076	100	0.135
3373	chr5	138547009	T	C	rs187653	0.06658745826	0.2247161669048528	0.06848030454	0.2266649230498169	0.0298662758271877	0.2322426636779085	0.0026757662776486	0.2024417857699409	0.0027078132432084	0.2038269808050804	0.0013295503282636	0.9464198372809972	0.0001453248392091	0.8218189943373346	0.000146472312077	0.8263901628841459	5.348252071576006e-05	0.9038629948420632	6.474247740784755e-06	0.7542520032062262	6.493675110127901e-06	0.7588826951714163	0.0004907459338193	0.815506588305863	0.0004989937646398	0.8200341001583257	ETF1	3773	HSPA9	28666	CTNNA1	63959	False	False	False	alt	40	0.0116	35	0.0966
3374	chr5	139487202	A	G	rs6421150	0.129910999	0.0648223273439749	0.129910999	0.0656064653633805	0.0295460279497218	0.2336330993530666	0.0040140443158236	0.0804161662060635	0.0040140443158236	0.0812556870083261	0.0645755666259773	0.3876061791982284	0.0087246217684197	0.1673819422156078	0.0087246217684197	0.1704847968769285	0.0019663929555725	0.3206263305168627	0.0002776249382539	0.1472799169922965	0.0002776249382539	0.1498584552016074	0.0188545412556497	0.1034489171102347	0.0188545412556497	0.1052990707486092	STING1	4267	SMIM33	16197	ECSCR	24459	False	False	False	alt	95	0.0213	15	0.0271
3375	chr5	139578493	T	C	rs355163	0.0343115028019999	0.4805461645652622	0.0384704763579999	0.4826097149540431	0.071444415745536	0.0167005137629019	0.0025869986417498	0.2932086898014566	0.0028255093935616	0.2935328623876463	0.0427270627824881	0.4951723064112392	0.0014303142585971	0.5963218158802333	0.0016285966706278	0.5978344939173444	0.0029106635724208	0.2683920426953188	0.00010679507373	0.432904549728641	0.0001181767857251	0.4338226738487259	0.0031308765794596	0.5510842807952433	0.0036686351489558	0.5523517711038791	UBE2D2	52061	CXXC5	68807	STING1	95558	False	True	False	alt	60	0.031	-95	0.04376
3376	chr5	139686403	T	G	rs9687282	0.0559291066	0.256992091321194	0.0559291066	0.2603881465100967	0.0748792020771155	0.0137528806973671	0.0044248253348989	0.0793630817979706	0.0044248253348989	0.0803136551754509	0.3772260895384513	0.0781843001802816	0.022090197119632	0.0823364480741405	0.022090197119632	0.0838954744751129	0.0281863814713453	0.0110876220804191	0.0017571748034075	0.0349698532010026	0.0017571748034075	0.0354312959780143	0.0186854607238295	0.1114498279944363	0.0186854607238295	0.1132794890416864	CXXC5	39103	PSD2	109406	UBE2D2	159971	False	True	False	alt	-95	0.3364	-100	0.0498
3377	chr5	139857377	C	T	rs4912894	-0.335823844	0.0062215714540031	0.335823844	0.0062052860598211	0.0730570942395887	0.0154482670902366	-0.0253847810685156	0.004682582783981	0.0253847810685156	0.0046792011807512	0.199684108079575	0.1775228903576961	-0.0692801668356944	0.0178552512545309	0.0692801668356944	0.0175728954404386	0.0148574706540415	0.0424968203811056	-0.0053376453257624	0.0085775838213198	0.0053376453257624	0.008506318613144	-0.090237867440863	0.0055595652888634	0.090237867440863	0.0055313755448329	PSD2	61568	NRG2	185922	CXXC5	210077	False	True	True	ref	10	0.01521	-90	0.1879
3378	chr5	140679308	C	T	rs2073512	-0.1215776092	0.074834304159889	0.1215776092	0.0738109188750766	0.0249308653601046	0.3306238038872015	-0.0031414014583005	0.1086826922428784	0.0031414014583005	0.1073490279518943	0.3984056943023984	0.0707401844962054	-0.0469566305195349	0.0298907775344766	0.0469566305195349	0.0293586489151962	0.009820388097821	0.0755599561156888	-0.001205365313561	0.0429709716168053	0.001205365313561	0.0422332226865391	-0.0415929860446701	0.0305829726305641	0.0415929860446701	0.0300898462889593	DND1	5732	HARS2	12123	HARS1	12229	False	False	False	ref	100	0.271	70	0.4697
3379	chr5	140729085	G	T	rs12186884	-0.00396423072	0.7920876995498727	0.0086461476799999	0.7906056247978914	0.0120131340043597	0.8089033102351503	-4.004134883442773e-05	0.8279740611994459	0.0001134321218563	0.8266538776902037	0.0191448649005311	0.6268204985571767	-5.724632081384119e-05	0.7759487877821837	0.0001218429993634	0.7746167019761439	0.0002146405456619	0.7088809131514431	-6.191644395719677e-07	0.8106729049317002	1.5135887018877051e-06	0.8094000387204598	-0.0002028966381841	0.7731979930329173	0.0004486819966348	0.7718185759162748	ZMAT2	30404	HARS1	37548	HARS2	37654	False	False	False	ref	-55	0.02661	100	0.1251
3380	chr5	140733127	C	T	rs801174	-0.020086529	0.1755272930664752	0.077470085	0.1751397003505189	0.0157115473221213	0.6586678142802852	-0.0003007026225527	0.2875042020810863	0.0013424391705761	0.2867295995479516	0.0819454983339381	0.3541591500718558	-0.0043770882170049	0.2176720287707301	0.0082034706230773	0.2167765186423245	0.0013742724893534	0.4042269495204963	-7.991785001511479e-05	0.2665984621942332	0.0001488338733021	0.2657385200676445	-0.0063516545148625	0.1605480259755978	0.014754544554782	0.1600960836849165	ZMAT2	34446	HARS1	41590	HARS2	41696	False	False	False	ref	50	0.02823	60	0.05127
3381	chr5	140767663	T	C	rs12659129	0.148387962	0.0513831269776333	0.148387962	0.0521079718069782	0.0338593168295355	0.1761888679465914	0.0056474961852249	0.0592983540614299	0.0056474961852249	0.059936118823402	0.0005311603048397	0.9881087968371276	8.5395121465917e-05	0.8099689392412213	8.5395121465917e-05	0.8166923979043365	1.9206951922826736e-05	0.9616418510177112	3.38287603285528e-06	0.7336788144294669	3.38287603285528e-06	0.7402334474046489	0.0002301144798917	0.8339065943793335	0.0002301144798917	0.8406602115485696	PCDHA1	18474	PCDHA2	27190	PCDHA3	33366	False	False	False	alt	30	0.006287	95	0.0773
3382	chr5	140776679	T	C	rs7710380	0.32245744	0.0072850264698662	0.32245744	0.0073077146825716	0.0412251566430879	0.1080069625941307	0.014877937802095	0.0142474726394454	0.014877937802095	0.0143618122566081	0.3887293391837946	0.0733052364013516	0.1238593534812542	0.0059373905251453	0.1238593534812542	0.0059841530935791	0.0157766928190496	0.0378987777854854	0.0055288331121396	0.0084268459983759	0.0055288331121396	0.0084400269836035	0.1067541486589026	0.0034500079268449	0.1067541486589026	0.0034329345389993	PCDHA1	9458	PCDHA2	18174	PCDHA3	24350	False	True	True	alt	-70	0.09564	-60	0.2725
3383	chr5	140785333	T	C	rs1548699	-0.00773050462	0.8058020344004405	0.00933472842	0.8016608598516024	0.0198868088908092	0.4885103743775548	-0.0001479450476618	0.7781065851962087	0.0001825470460411	0.7736478605654142	0.0050221041865988	0.823957422411801	-4.5102751078649534e-05	0.8791429609183258	5.4417633153935474e-05	0.8750123172073995	0.0001003027504861	0.8104674200418114	-8.648589005475801e-07	0.8667145255592851	1.065774466340464e-06	0.8625486169131084	-0.000167430965656	0.8716458945565095	0.0002004222889379	0.867536671900068	PCDHA1	804	PCDHA2	9520	PCDHA3	15696	False	False	False	ref	25	0.00858	-55	0.02289
3384	chr5	140793333	T	C	rs13184940	-0.09287709174	0.1253192102100052	0.09343555866	0.1242305515946876	0.0502592054813136	0.0559858319483816	-0.0049594421140358	0.0744056241134065	0.0049812755696133	0.0741212380966475	0.0863044769225693	0.3344146416415644	-0.0079801636775299	0.2139384127423468	0.0080320103978908	0.211192026519949	0.0044747611771606	0.1841855540536187	-0.0004440544692836	0.1335752114842893	0.0004460814345436	0.1322580307671544	-0.0164214311636039	0.1459539284014646	0.0165055590379729	0.144363298269247	PCDHA2	1520	PCDHA1	7196	PCDHA3	7696	False	False	False	ref	0	0.0	90	0.1261
3385	chr5	140800976	A	G	rs3756338	0.0829142936	0.1517330172346542	0.0829142936	0.1541971114765783	0.0168439042981297	0.6022265943953166	0.0013890471354712	0.2536830192350663	0.0013890471354712	0.2572406839679027	0.5384381907558312	0.0366976158906661	0.0441334823763062	0.0350144257840041	0.0441334823763062	0.0357464330745867	0.0090919420275257	0.0843545268455186	0.0007393062320626	0.0691305693014768	0.0007393062320626	0.0704919138216273	0.0245100788492625	0.0762296434062721	0.0245100788492625	0.0776832671613137	PCDHA3	53	PCDHA4	6062	PCDHA2	6123	False	False	False	alt	10	0.0001221	100	0.03467
3386	chr5	140801152	C	T	rs3806845	0.0153257526	0.6395157111763754	0.017113734	0.643870116594559	0.030301453486533	0.2191660583822491	0.0005054493601687	0.5321793320933467	0.0005593851247675	0.5358939812013339	0.6435081323611891	0.0213131826535555	0.0094303823046657	0.1777647931366667	0.0107187364190072	0.1795271665358001	0.0194262811176348	0.0242613376579747	0.0003117115230952	0.1574821352528142	0.0003505756659675	0.1591355996017647	0.004189073273729	0.4117624771752507	0.0045057899772359	0.4150668176974876	PCDHA3	123	PCDHA4	5886	PCDHA2	6299	False	False	False	alt	-20	0.0809	-30	0.708
3387	chr5	140821679	C	T	rs4151682	-0.11411973	0.0825778619965453	0.11411973	0.0814694862314256	0.0189906331038809	0.5199268625120712	-0.0022224754821656	0.1579170025931672	0.0022224754821656	0.1558420465344254	0.600035465672528	0.0266847676327774	-0.0671990283077843	0.0172575773032719	0.0671990283077843	0.0169555177200209	0.0111806922938007	0.0629394199003489	-0.0012893071968645	0.0395167031449989	0.0012893071968645	0.038823388028296	-0.0308848272904225	0.0522745148276679	0.0308848272904225	0.051408031948917	PCDHA5	74	PCDHA6	6280	PCDHA7	12570	False	False	False	ref	-70	0.01074	0	0.0
3388	chr5	140821835	T	C	rs11958868	0.087254212	0.1364484599993703	0.087254212	0.1385601154982083	0.0210749959908854	0.4386791141630916	0.0019078142784508	0.1922685951916987	0.0019078142784508	0.1948286261238066	0.7137161426544819	0.013980243257344	0.0617382664173899	0.0204125042768516	0.0617382664173899	0.0207956882170542	0.0152191914908112	0.0403220452820712	0.001366236653647	0.0400355484433289	0.001366236653647	0.0407217620799023	0.0182227574147998	0.112236427766562	0.0182227574147998	0.1141603354397947	PCDHA5	230	PCDHA6	6124	PCDHA7	12414	False	False	False	alt	100	0.02238	100	0.1794
3389	chr5	140831031	G	A	rs10038174	-0.0150457416	0.3684504544398471	0.0386605164	0.3660822221556725	0.0130254082232901	0.7824927606604767	-0.0002055891461558	0.5050004989778735	0.0004935830555361	0.502045835994537	0.1213759031374748	0.2724958165876953	-0.0007926059140151	0.2521689501567258	0.0049084022453602	0.2502031151420227	0.0016222465157281	0.3599091814985999	-1.3470098968598848e-05	0.3235116411856574	6.366428009151886e-05	0.3211088756773111	-0.002087525980667	0.2280664985293827	0.0091097291412358	0.2261832935641841	PCDHA6	3072	PCDHA7	3218	PCDHA5	9426	False	False	False	ref	-85	0.02344	100	0.04547
3390	chr5	141038323	T	C	rs35123355	-0.00833667768	0.7657688066143148	0.01081916272	0.7613094873330669	0.0165091714508531	0.616262836966093	-0.0001466198863039	0.7557964239588291	0.0001812798214353	0.7513184354115375	0.0419171257959156	0.4791737067574358	-0.0003432498955762	0.6027254594654171	0.0005016044466634	0.5989438601115216	0.0006741488531028	0.5161815658074992	-5.975134057786662e-06	0.6199684034722073	8.186047078691073e-06	0.6160125688797502	-0.000986440566131	0.602540713645509	0.0013724390485301	0.5985569078442025	PCDHB1	13052	PCDHB2	56284	PCDHB3	62151	False	False	False	ref	-35	0.004936	-50	0.03372
3391	chr5	141040639	C	T	rs31745	0.039099796	0.382078298392399	0.039099796	0.3869150659165686	0.0276482000442671	0.2694863728158044	0.0011604030880311	0.320325475909754	0.0011604030880311	0.3244845273200726	0.964353699976906	6.14245653703172e-05	0.0374907947735275	0.045592790409345	0.0374907947735275	0.0465513350572411	0.026604949876092	0.0123633263098241	0.0011095344547906	0.0540001045956183	0.0011095344547906	0.0550811069651051	0.001421101250371	0.6001137773992805	0.001421101250371	0.6061541574098832	PCDHB1	10736	PCDHB2	53968	PCDHB3	59835	False	False	False	alt	-65	0.0346	100	0.10596
3392	chr5	141049461	A	G	rs34907800	0.095015828	0.1244500557974101	0.095015828	0.1263372013374732	0.0175988029752702	0.5613370508172205	0.0018779333436797	0.2107746757378984	0.0018779333436797	0.2137401954334317	0.0012932598726534	0.9583123607918176	0.0001825072648729	0.774999562484556	0.0001825072648729	0.7813844398961755	2.655679751125793e-05	0.9464903994185804	3.9596259796144085e-06	0.764528493555859	3.9596259796144085e-06	0.770884178812018	0.0005328098710038	0.777359207439732	0.0005328098710038	0.7838532837748047	PCDHB1	1914	PCDHB2	45146	PCDHB3	51013	False	False	False	alt	55	0.05072	0	0.0
3393	chr5	141086238	A	G	rs31860	0.1056467628	0.0958555210890324	0.1056467628	0.0970235921696373	0.0268935726109685	0.2862070336556817	0.0030821583554018	0.1157912096329691	0.0030821583554018	0.1171213424793504	0.0155017980271188	0.6570655279737394	0.0016343922598825	0.4010712026345159	0.0016343922598825	0.4062880695762424	0.0004169821907791	0.6007908569778504	4.810005681373758e-05	0.3607499150180823	4.810005681373758e-05	0.3657989405245879	0.0049717924185938	0.3392288712012823	0.0049717924185938	0.3440607112654734	PCDHB2	8369	PCDHB3	14236	PCDHB1	34863	False	False	False	alt	-75	0.03278	-40	0.09753
3394	chr5	141086467	G	A	rs31859	0.02028436368	0.6012473473574134	0.02028436368	0.6072592039740345	0.0113996990810568	0.8555008741954608	0.000230427692683	0.7085881401623303	0.000230427692683	0.7151327603997838	0.0082156642802942	0.7522306455746618	0.0001575161001004	0.7365844053525226	0.0001575161001004	0.7429971728762219	9.387872443834849e-05	0.8163233502884742	1.791527988614171e-06	0.7847704335357075	1.791527988614171e-06	0.7913747729738391	0.0006012668668139	0.7134373846539475	0.0006012668668139	0.7198203302743859	PCDHB2	8140	PCDHB3	14007	PCDHB1	35092	False	False	False	alt	-45	0.006947	-90	0.1683
3395	chr5	141087672	T	A	rs35110655	0.0889688952	0.1292096740434449	0.0889688952	0.1311402668377176	0.0233277537942924	0.3742230046658513	0.0022265809629931	0.1633921554869501	0.0022265809629931	0.1656795645012002	0.0041857741414007	0.846297083688749	0.0003992856795916	0.6156840556384237	0.0003992856795916	0.6215996569150454	0.0001009738510534	0.8127152244755993	1.026342253830844e-05	0.5821252007144633	1.026342253830844e-05	0.587976140027677	0.001370789482366	0.5858137665322914	0.001370789482366	0.5917863484422597	PCDHB2	6935	PCDHB3	12802	PCDHB4	34147	False	False	False	alt	-95	0.054	-100	0.0661
3396	chr5	141092802	A	G	rs34580312	0.0548358536	0.2566086270579932	0.0548358536	0.2603010701719217	0.0336857392684329	0.1735028701740677	0.0019620301204757	0.1850604428363653	0.0019620301204757	0.1875200840514384	0.0013823364455147	0.946352931696976	7.133866495577168e-05	0.8141594938690602	7.133866495577168e-05	0.8209546393958141	4.52385471489232e-05	0.8948863003608146	2.4594917224971407e-06	0.7435113037012071	2.4594917224971407e-06	0.7500075058098831	0.0002565075385173	0.8165633111284909	0.0002565075385173	0.8233559359547806	PCDHB2	1805	PCDHB3	7672	PCDHB4	29017	False	False	False	alt	-10	0.00601	-100	0.03824
3397	chr5	141095172	G	A	rs31853	-0.0067674606	0.7597019663455252	0.0107216594	0.7550392483113473	0.0100222466170916	0.9108948062536985	-5.722953040065361e-05	0.8438609034368252	0.0001055651696894	0.8394809750397397	0.8375886641813203	0.0052619377795895	-0.0055369142695605	0.1666627012375857	0.0089402049025617	0.1646307496506621	0.0084112006134182	0.0919948070090912	-4.66091204696328e-05	0.2703940826449106	8.82105245067128e-05	0.2676615100366154	-0.0008973639932697	0.6029987710546978	0.001286661607997	0.5986818537883248	PCDHB2	565	PCDHB3	5302	PCDHB4	26647	False	False	False	ref	90	0.006073	-60	0.1707
3398	chr5	141099537	A	C	rs13183611	-0.0311715939999999	0.3218579345018144	0.0445547751999999	0.3187662730635938	0.0182801406291679	0.5379659571196177	-0.0006424759848531	0.3646863353697928	0.0008623958749836	0.3615331970492804	0.0507456039061726	0.4355765411944174	-0.0017178426379312	0.3535882374264877	0.0024090560743395	0.3501391457640251	0.0009365756895984	0.4551903979947515	-3.573000180506458e-05	0.3708301432973741	4.708840594874914e-05	0.367274522834235	-0.0044224868859489	0.307136279220676	0.0060753521823759	0.3038073920259058	PCDHB3	937	PCDHB2	4930	PCDHB4	22282	False	False	False	ref	-65	0.011795	-75	0.0747
3399	chr5	141100595	T	G	rs1055410	0.10702106	0.0912445843493131	0.10702106	0.0925024374705139	0.0442347734688344	0.0818055429131204	0.0047467597255012	0.0598740481275805	0.0047467597255012	0.0605030524836028	0.9434644188578404	0.0003407975659729	0.1010208521907212	0.0084378863594763	0.1010208521907212	0.0085601448449278	0.0417033915100567	0.003705259251416	0.0044783061174957	0.0092179527613431	0.0044783061174957	0.009264498254701	0.0050715911715218	0.3267713538052602	0.0050715911715218	0.3315476190702398	PCDHB3	121	PCDHB2	5988	PCDHB4	21224	False	False	False	alt	-65	0.267	-65	0.668
3400	chr5	141107252	G	A	rs34535102	-0.0027682149	0.8562230259514888	0.0067616305	0.8521838325433477	0.0239440969219838	0.3612834147923949	-4.601580206028134e-05	0.7994880517267035	0.0001518059932955	0.7956084664918697	0.0021799016858565	0.9160798469758792	-2.601672585500612e-06	0.9404876782809016	1.834556580805562e-05	0.9363103402868692	5.179000929710199e-05	0.8876830864231386	-6.898741446637123e-09	0.9229643995211324	4.239726701397682e-07	0.9187987562253178	-1.6495661640989545e-05	0.9325159334676848	7.752960971262954e-05	0.9300419399391788	PCDHB3	6778	PCDHB2	12645	PCDHB4	14567	False	False	False	ref	50	0.00261	5	0.00897
3401	chr5	141123949	C	T	rs17844417	-0.0360613182	0.3134843509148827	0.0469309354	0.3105680316686459	0.0244884087241606	0.3406968950233112	-0.0010562329077804	0.2906633043545007	0.0012225814262849	0.2881092402367132	0.5189559895747419	0.0406209886085077	-0.0202434072634641	0.0694586521160684	0.0252201900268218	0.0685153307961041	0.0129249912422153	0.0517491058517127	-0.0005909101161771	0.0814000509482654	0.0006670747536663	0.0804242600904164	-0.0105555738840684	0.1496601659888569	0.0139998680347068	0.1477147837985575	PCDHB4	2130	PCDHB5	11258	PCDHB3	23475	False	False	False	ref	-100	0.03107	-40	0.2063
3402	chr5	141128290	A	G	rs74601574	-0.003538704248	0.8587244398120113	0.006558920008	0.854430033329029	0.0310657403849871	0.2075625597137476	-0.0001211944025108	0.7362482293401698	0.0002115157323443	0.7317620993587562	0.0094520141202863	0.7586794815411328	7.511143311091522e-06	0.8586712048456914	7.353428606058848e-05	0.8546038069222454	0.0002915450977992	0.6808493481811821	1.084184943401818e-07	0.8035922920533469	2.315292754163344e-06	0.799678490947347	-1.0722180066622474e-05	0.8635203736061691	0.0002334136122199	0.8611041202827189	PCDHB4	6471	PCDHB5	6917	PCDHB6	21768	False	False	False	ref	-75	0.01753	65	0.03784
3403	chr5	141129143	A	C	rs35737105	0.0429181332	0.3291611749504716	0.0429181332	0.3339247027496178	0.0193114950636715	0.5025726751323788	0.0008563924348461	0.3581317225416821	0.0008563924348461	0.3631199385464994	0.0136650061033947	0.678925186953965	0.0005910649964016	0.555821908589707	0.0005910649964016	0.5615980314743816	0.0002696039640293	0.6720422521672892	1.1937809799677294e-05	0.5498825959661474	1.1937809799677294e-05	0.555863288633679	0.0020132955032826	0.5179489461937583	0.0020132955032826	0.5237618634805034	PCDHB5	6064	PCDHB4	7324	PCDHB6	20915	False	False	False	alt	-100	0.05545	40	0.0539
3404	chr5	152478563	A	G	rs3864272	0.265188588	0.0129009032694063	0.265188588	0.0130054299637031	0.0539416778263292	0.0461498089413099	0.0153987422638495	0.0124748635053244	0.0153987422638495	0.0125468406429626	0.0329987463297152	0.524304208040019	0.0096358281402466	0.1663779252400765	0.0096358281402466	0.1694728776894928	0.001896547061368	0.3395753214846226	0.0005821257506109	0.0968892668443064	0.0005821257506109	0.0985301638934795	0.0193758041635049	0.1044846029815485	0.0193758041635049	0.1063422509230831	NMUR2	45195	GLRA1	553712	ATOX1	706031	False	True	False	alt	-100	0.03424	-100	0.1251
3405	chr5	152593173	T	C	rs12657267	0.206746476	0.0238374157126011	0.206746476	0.0240207339117514	0.0612938611129295	0.0296656827015129	0.0135311470614185	0.0148870462948417	0.0135311470614185	0.0149814056341333	0.3385379895087591	0.0928679369800766	0.0687013603948511	0.017173740626562	0.0687013603948511	0.0174854544581259	0.0207885256549081	0.0220325059090165	0.0045550649894961	0.0104464376688407	0.0045550649894961	0.010547882010836	0.0689081521559829	0.0108931112849131	0.0689081521559829	0.0109878076290649	NMUR2	159805	GLRA1	668322	ATOX1	820641	False	False	False	alt	100	0.03387	25	0.05078
3406	chr5	152642535	G	A	rs17454953	0.025230974	0.3408019492530706	0.0426069528	0.3433034480519723	0.0362215538941107	0.1423892967404757	0.0010626232011817	0.2237914471862413	0.0016211102046826	0.2252250853870277	0.6417810365873775	0.0207439805521048	0.018721332365609	0.0603482204691416	0.027912641016935	0.0608999088115608	0.0236304114888771	0.0163881634508529	0.0007797412255814	0.0514650830558927	0.0010751620751288	0.0518227856786309	0.0050889116162449	0.2025888307661204	0.0102124641219359	0.20447016944163	NMUR2	209167	GLRA1	717684	GRIA1	847081	True	False	False	alt	-85	0.02121	-95	0.1589
3407	chr5	152676834	T	C	rs17455625	-0.0294739815999999	0.4709639348747785	0.0294739815999999	0.4650647118299198	0.0129097148678548	0.7899081481056236	-0.0003803467113504	0.5835322071995133	0.0003803467113504	0.5771452689734149	0.2680058394642208	0.1283051662748385	-0.0080380931571713	0.1819519954235141	0.0080380931571713	0.1786456803746895	0.0034118152634223	0.2216047524979242	-0.0001026349657552	0.2548006961841567	0.0001026349657552	0.2508428683644944	-0.0095691333179373	0.2156640461785044	0.0095691333179373	0.2120076320118578	NMUR2	243466	GLRA1	751983	GRIA1	812782	False	False	False	ref	15	0.01221	70	0.07935
3408	chr5	152678555	C	G	rs12657990	0.01886068652	0.5145484629058621	0.02790451652	0.5174832665003705	0.0208501219779798	0.4457183587449085	0.0003416955665096	0.522612750790578	0.0005701858125798	0.5253712491302622	0.0489517007027151	0.4449877920805825	0.0006866654406871	0.4820264983196545	0.0011532755646111	0.4848334013030721	0.0009959546215539	0.4413850550450535	1.15327545243139e-05	0.4775762297832364	2.332155012898028e-05	0.4804663769335977	0.0016602883441654	0.4601565960707945	0.0030624195836494	0.4630615770788287	NMUR2	245187	GLRA1	753704	GRIA1	811061	False	False	False	alt	25	0.004395	75	0.06323
3409	chr5	152699630	G	C	rs77257050	0.0497674056	0.2792088287955975	0.0497674056	0.2832732924847042	0.0166839990132557	0.6169826662290416	0.0008259428773048	0.3593814357347479	0.0008259428773048	0.3643368517526949	0.002354755699251	0.906073498417336	0.0001181445708978	0.7593442772994147	0.0001181445708978	0.7660408613134527	4.086850109437097e-05	0.905601786731848	2.036466529670288e-06	0.7629653232402671	2.036466529670288e-06	0.7696300040929059	0.0004569298274553	0.7473168649303469	0.0004569298274553	0.7539499514381127	NMUR2	266262	GLRA1	774779	GRIA1	789986	False	False	False	alt	95	0.02219	95	0.2382
3410	chr5	152706014	A	C	rs4133347	-0.0288865551999999	0.4800406454756103	0.0288865551999999	0.4742885443295265	0.0169950209055279	0.6020487139486387	-0.0005085459566178	0.5111899427692488	0.0005085459566178	0.5052724627678484	0.0042715515819339	0.8417532390085386	-0.0001233861391364	0.7688078486229303	0.0001233861391364	0.7621884338618381	7.074002243638363e-05	0.8482664930446525	-2.139076060548163e-06	0.7716159681295606	2.139076060548163e-06	0.7649673600348665	-0.0004816733199168	0.7525701964386604	0.0004816733199168	0.7460169560021697	NMUR2	272646	GLRA1	781163	GRIA1	783602	False	False	False	ref	35	0.004845	10	0.01294
3411	chr5	152718002	T	C	rs55737372	0.0193429014	0.4411327510713756	0.0329441674	0.4440534485051893	0.0294366069958682	0.2423245925414303	0.0008708312230052	0.3364241463709044	0.0011242408921786	0.3384646750992388	0.0300212794035168	0.5697305824348887	0.0008389216801414	0.512267284278465	0.0012891598814517	0.5154999126660018	0.0010169184705609	0.4979341318558979	4.026391033943219e-05	0.4555863998153799	4.865244673898482e-05	0.4586074711534151	0.0017386427369601	0.4812274626884689	0.0030401504404341	0.4843559381357185	NMUR2	284634	GRIA1	771614	GLRA1	793151	False	False	False	alt	-10	0.006287	-70	0.0882
3412	chr5	152719145	C	G	rs11167589	-0.147103866	0.0593548167834317	0.147103866	0.0586722203392266	0.0272926231529137	0.2778415452876653	-0.0044823009440136	0.0869811019237892	0.0044823009440136	0.086152809164681	0.0872142126620698	0.344624444585614	-0.0168813102302863	0.1358711549855388	0.0168813102302863	0.1333792979386921	0.0027512370350858	0.2858293008360805	-0.0005650204348775	0.131267945044588	0.0005650204348775	0.1290212233884748	-0.0277300320015835	0.0793169637785031	0.0277300320015835	0.0779069168577556	NMUR2	285777	GRIA1	770471	GLRA1	794294	True	False	False	ref	-60	0.03992	65	0.06055
3413	chr5	152721189	A	G	rs72799143	0.0534708224	0.2601673899471038	0.0534708224	0.2640766234203424	0.0159649459474871	0.6464670809116686	0.0008746368426039	0.3572467895476015	0.0008746368426039	0.3618885016756278	0.0058980238197353	0.8001943527826272	0.0003032279759964	0.641369158998794	0.0003032279759964	0.6475102014598878	9.198993712141544e-05	0.8191019805060865	4.860007555839938e-06	0.6610893033858668	4.860007555839938e-06	0.667216476252403	0.0011233545577512	0.6138367297484124	0.0011233545577512	0.619849569523226	NMUR2	287821	GRIA1	768427	GLRA1	796338	False	False	False	alt	90	0.0365	-85	0.1024
3414	chr5	152731277	C	A	rs72799151	0.0156493337999999	0.5060403127160088	0.0266810117999999	0.5082383199522069	0.0180628311498153	0.5572792599327369	0.0003123170580314	0.5393417407781387	0.0004945603929067	0.5414116641708802	0.0087690937283494	0.7434982849681392	0.0001509436004542	0.7034337185570628	0.0002400386008697	0.7053183709080939	0.0001613246269228	0.745928609607799	2.9623666367018785e-06	0.7026898107378841	4.50381661557683e-06	0.7046236287618901	0.0005921942529114	0.6740695614702481	0.0009155092210748	0.6760424867609842	NMUR2	297909	GRIA1	758339	GLRA1	806426	False	False	False	alt	-80	0.09534	-55	0.07245
3415	chr5	152749963	C	T	rs72799160	0.0196907478	0.592103732096809	0.0196907478	0.5985247310908518	0.026089597419475	0.3043011066966214	0.000513327824614	0.4868218484204353	0.000513327824614	0.4927914918078193	0.0055466662267822	0.8136948714092187	0.0001203476218882	0.7682531160471158	0.0001203476218882	0.7748453799190442	0.0001453933193452	0.7652002636856852	3.1519854714902025e-06	0.7239426256326321	3.1519854714902025e-06	0.7304674947094755	0.0004569298274553	0.757257021091096	0.0004569298274553	0.7638368446532161	NMUR2	316595	GRIA1	739653	GLRA1	825112	False	False	False	alt	5	0.0004272	35	0.02713
3416	chr5	152759038	A	G	rs56208248	-0.0168630059	0.656202427312164	0.0168630059	0.6496133277976557	0.0132798968270612	0.7698505776424621	-0.000226741647376	0.7104043445763779	0.000226741647376	0.7037676914007147	0.0158110916828873	0.6637072721820213	-0.0002713544285373	0.6859839583223735	0.0002713544285373	0.6797584871683409	0.000209377808203	0.7192833196356774	-3.634843910795616e-06	0.7240922174591429	3.634843910795616e-06	0.7176035977537596	-0.0008792187654646	0.6759934699364878	0.0008792187654646	0.6698648910573981	NMUR2	325670	GRIA1	730578	GLRA1	834187	False	False	False	ref	60	0.05338	45	0.03522
3417	chr5	152770806	G	A	rs56286804	0.161126818	0.0409726545420605	0.161126818	0.0413282167454367	0.0396524339079334	0.1198501169197377	0.0070807449698297	0.0423744670580548	0.0070807449698297	0.0426270601068169	0.0189254726007059	0.6166135250882296	0.002992315207117	0.3064361793771803	0.002992315207117	0.310892079076465	0.0006901367411786	0.5066347951678224	0.0001212747250554	0.234314100788377	0.0001212747250554	0.238165048735624	0.0082486556035762	0.2369792376764774	0.0082486556035762	0.2409559353941079	NMUR2	337438	GRIA1	718810	GLRA1	845955	False	False	False	alt	-45	0.02531	100	0.145
3418	chr5	152777929	A	G	rs72799178	0.0675064888	0.201728099642198	0.0675064888	0.2047488656259317	0.019831768279106	0.4882222640200528	0.0014528014429226	0.25320901006065	0.0014528014429226	0.2565948060757057	0.0138778001385635	0.686343360412444	0.0011395199701213	0.4927997574219313	0.0011395199701213	0.4982116974446315	0.0002992033932147	0.6742905773217188	2.646445554724733e-05	0.4866381571019684	2.646445554724733e-05	0.4922356715837966	0.0032743888357361	0.4447112548004084	0.0032743888357361	0.4501446935777342	NMUR2	344561	GRIA1	711687	GLRA1	853078	False	False	False	alt	70	0.01665	90	0.06213
3419	chr5	152797561	A	G	rs111294930	0.0345568464	0.4106941880414516	0.0345568464	0.4159545464132875	0.0200008191049209	0.4801350724953889	0.0006833754439051	0.4245552044507962	0.0006833754439051	0.4300582884909822	0.0876661937910329	0.3295762136094599	0.0027930119119494	0.320934443252992	0.0027930119119494	0.3255423505460594	0.0018105582980622	0.3350613607946556	5.829955612703706e-05	0.3281609111335811	5.829955612703706e-05	0.3329811121083618	0.0060242156312889	0.2987728343932632	0.0060242156312889	0.3035199936085984	NMUR2	364193	GRIA1	692055	GLRA1	872710	False	False	False	alt	95	0.03546	95	0.1477
3420	chr5	152808222	C	T	rs55918828	-0.0239941768	0.5560557026132582	0.0239941768	0.5498313590168465	0.0702928229078242	0.0180373406249458	-0.0016539211396841	0.244560931531737	0.0016539211396841	0.2413796686199274	0.0346590346738807	0.5160789260878407	-0.0006921933155806	0.5588978853408828	0.0006921933155806	0.5531444041264698	0.0023774923476362	0.2882200642532693	-4.479163975386424e-05	0.3793036201562711	4.479163975386424e-05	0.3742844824833695	-0.0020462868265645	0.5390111807521146	0.0020462868265645	0.5332668021031701	NMUR2	374854	GRIA1	681394	GLRA1	883371	False	True	False	ref	5	0.0004025	100	0.1271
3421	chr5	152808566	C	T	rs55830548	-0.0398680272	0.3671373198830149	0.0398680272	0.3623627543124793	0.0158469144950446	0.6484630601445813	-0.0006469630075451	0.441361298715846	0.0006469630075451	0.436127376462919	0.1379119791494836	0.2421187935064617	-0.0056850075767951	0.2303058436769173	0.0056850075767951	0.226550100732353	0.0021642621984306	0.2982420768617986	-9.119516106343942e-05	0.2754844177412001	9.119516106343942e-05	0.2713601407263754	-0.0102165880373461	0.206491022568907	0.0102165880373461	0.2030817086421266	NMUR2	375198	GRIA1	681050	GLRA1	883715	False	False	False	ref	30	0.02463	-95	0.163
3422	chr5	152810407	T	G	rs55829928	-0.0101306256799999	0.6812463684774293	0.0150662736799999	0.6776102369686718	0.0138419209627671	0.7463354514651177	-0.0001386402308485	0.7243628550835592	0.0002101524597748	0.7205572473713289	0.0539721553231499	0.427274866443091	-0.0005464151557291	0.5129117340854941	0.000839861578065	0.5099585244715035	0.0007428634214343	0.4969902405366128	-7.358447648885165e-06	0.5600167248251269	1.1610170639013531e-05	0.5567495934924972	-0.0012676915971099	0.5159277572689488	0.002104021642308	0.5128366179638936	NMUR2	377039	GRIA1	679209	GLRA1	885556	False	False	False	ref	45	0.03583	30	0.08093
3423	chr5	152811145	A	G	rs72799198	0.561135212	0.0014159604188986	0.561135212	0.0013870306066739	0.0881007697640309	0.0074939655244717	0.0534640082510456	0.00145835332645	0.0534640082510456	0.0014599140275522	0.1071549932367786	0.3091387584120352	0.0792144799293884	0.0233700597122065	0.0792144799293884	0.0234152938272563	0.0107826999188608	0.0839016745718532	0.0084359147066335	0.0094418799935972	0.0084359147066335	0.0094950732156127	0.0883119989442776	0.0088434635235402	0.0883119989442776	0.0089367222657757	NMUR2	377777	GRIA1	678471	GLRA1	886294	False	True	True	alt	-95	0.06555	-75	0.03198
3424	chr5	152812435	C	T	rs72799201	-0.0061427112	0.3501963945785348	0.0459231872	0.3476680814085229	0.0202917212134305	0.4734897860810606	1.871536752839968e-06	0.373680103408718	0.001041842749988	0.3711104450058176	0.0724538946257134	0.3870892962375237	-0.0023609973621044	0.330168632585125	0.0042301981118253	0.3273237047070452	0.0014786483779368	0.3945748502995089	-4.4185740797428206e-05	0.340139338303159	9.32276751740682e-05	0.3374739792865201	-0.0036801821121045	0.2885985370055994	0.0079756524034178	0.2861560341608112	NMUR2	379067	GRIA1	677181	GLRA1	887584	False	False	False	ref	-100	0.10095	-100	0.2145
3425	chr5	152840904	T	G	rs115283145	0.0313306812	0.4586389572539362	0.0313306812	0.4641476025175002	0.0177519027175961	0.5720480554617013	0.0005953675917715	0.482148677710682	0.0005953675917715	0.4877768016974432	0.0232357889874962	0.5844111725524481	0.0008207042537067	0.5263825346823948	0.0008207042537067	0.5319197556208192	0.0004245940186946	0.5986996181041723	1.5756863555631608e-05	0.5353066442461227	1.5756863555631608e-05	0.5410864208472791	0.0024034179010919	0.4935512602009652	0.0024034179010919	0.4990706697863958	NMUR2	407536	GRIA1	648712	GLRA1	916053	False	False	False	alt	-65	0.03217	-45	0.08746
3426	chr5	152867047	A	C	rs72802883	0.0189885524	0.5884390428883532	0.0200863292	0.5926380099682698	0.0169144532586333	0.603676613976778	0.0004047067977059	0.6021193577010341	0.0004187980761532	0.6061202734885303	0.0373560753521823	0.5037339828367967	0.0009432148528	0.5781842893480683	0.0009880154183887	0.5824248602226251	0.0006831830565545	0.5316661514130524	2.1686218130183948e-05	0.5855091271859867	2.2261286964577903e-05	0.5895517692111372	0.0023151661113127	0.5487580273771919	0.0024454818382764	0.5528488994642886	NMUR2	433679	GRIA1	622569	GLRA1	942196	False	False	False	alt	-80	0.006897	80	0.05188
3427	chr5	152868292	C	A	rs12153071	-0.088197567	0.1375144681917238	0.088197567	0.1359075845070983	0.0205918392058539	0.4617617015259284	-0.0019643676545454	0.1977319471902795	0.0019643676545454	0.1951996941556424	0.1745612154003496	0.2001992051567329	-0.0168771511625032	0.1111806648221272	0.0168771511625032	0.1091199676220964	0.0036109747890941	0.2140834314841929	-0.0003695254216952	0.1347675040107176	0.0003695254216952	0.1325661190714253	-0.0256936425720035	0.0770739821247714	0.0256936425720035	0.075865666166503	NMUR2	434924	GRIA1	621324	GLRA1	943441	False	False	False	ref	-90	0.007812	-90	0.11914
3428	chr5	152871641	T	C	rs4958587	-0.00410577256	0.8672017449053029	0.0061529956	0.8633524373927062	0.0238641686239102	0.3599592225360397	-9.722189473129056e-05	0.8002788951885724	0.0001471375988668	0.7966316216512286	0.0015052291247401	0.9425877310812352	-7.113123439320095e-06	0.9610653711864944	1.0034254264285097e-05	0.9571264218030768	3.634712133335202e-05	0.9150166975516124	-1.7187037445941005e-07	0.9435111650423036	2.430938314177924e-07	0.939648979166166	-2.474349246148269e-05	0.9588383947440569	3.794002177427346e-05	0.9550086559536548	NMUR2	438273	GRIA1	617975	GLRA1	946790	False	False	False	ref	60	0.0009155	70	0.01727
3429	chr5	152875585	G	T	rs72802890	0.009481728922	0.7574207337231427	0.011181872318	0.7613372625357677	0.0161055296783816	0.6361910144312368	0.0001401688153171	0.7934245622510435	0.0001646065777003	0.7970739148627579	0.0375243311009204	0.497310634297489	0.0003944176952193	0.6710683619564902	0.0004593106069471	0.6729146140471416	0.0006267275938884	0.532639495145862	5.90069358704999e-06	0.691069090247875	6.833814753651478e-06	0.6929260532043817	0.0010598462604334	0.6649908366726617	0.001285836824915	0.6671767044972874	NMUR2	442217	GRIA1	614031	GLRA1	950734	False	False	False	alt	20	0.00779	-35	0.11664
3430	chr5	152876625	A	G	rs72802893	0.0525452554	0.2815288559184286	0.0525452554	0.2855229902292781	0.0118420875489113	0.8338614265902201	0.0006631801948416	0.4523933485192533	0.0006631801948416	0.4576870549305702	0.0047928144897891	0.8542961786678458	0.0002871117576788	0.7044412502621442	0.0002871117576788	0.7107431869686451	6.625378432846619e-05	0.8892029848940708	4.162692175875017e-06	0.7473728592986703	4.162692175875017e-06	0.7539286178274924	0.0009245818349773	0.6832523638376288	0.0009245818349773	0.6894471977037337	NMUR2	443257	GRIA1	612991	GLRA1	951774	False	False	False	alt	50	0.002983	50	0.09985
3431	chr5	152900050	C	G	rs9324737	-0.016838848344	0.6404612803714471	0.018804929936	0.6383759419633234	0.043333875036024	0.0873243905976469	-0.0008798514304364	0.456311129752844	0.0009697833497768	0.4549544341167495	0.1275155884002507	0.2645515535067014	-0.0019701015761077	0.4402638949042732	0.0021886198484051	0.4378771188370655	0.0053924626536732	0.1553546314998578	-9.94223102702852e-05	0.3329527023255656	0.0001094947544641	0.3312605434893257	-0.0035152254956946	0.4593746628979217	0.0039507109630167	0.4571665351940173	NMUR2	466682	GRIA1	589566	GLRA1	975199	False	False	False	ref	-70	0.01534	30	0.01668
3432	chr5	152902870	A	C	rs11167604	-0.001245729734	0.8944496739251713	0.00458518223	0.8939461398418438	0.0103263530775601	0.897554786678405	-1.3379205930240617e-05	0.9268696464540732	4.607626926567068e-05	0.9270924529186408	0.0049660189370195	0.837000580981434	-1.063291455128711e-05	0.9203723344580532	3.06347908528224e-05	0.9200862956863284	4.897602383973108e-05	0.8963413051918324	-1.0006802195556648e-07	0.9421344304465212	2.956486384605793e-07	0.9425099417550518	-3.794002177428963e-05	0.922515500551038	0.0001039226683382	0.9216889668985312	NMUR2	469502	GRIA1	586746	GLRA1	978019	False	False	False	ref	-100	0.0133	85	0.03876
3433	chr5	152908997	G	T	rs4463219	-0.0474473654	0.3261218142320248	0.0474473654	0.3218295426066754	0.0300112654041785	0.224129828888925	-0.0014575589952078	0.2616199188262423	0.0014575589952078	0.2582614903468049	0.0239879911583253	0.5763140940373763	-0.0009428295024185	0.4848454897806619	0.0009428295024185	0.4793435851533679	0.000715039030591	0.5005183933401315	-2.849233342593601e-05	0.4239753001780055	2.849233342593601e-05	0.4186287218318228	-0.0030401504404341	0.438308788828982	0.0030401504404341	0.4327956824465543	NMUR2	475629	GRIA1	580619	GLRA1	984146	False	False	False	ref	-100	0.1576	5	0.02942
3434	chr5	152930047	G	A	rs72804778	-0.0375842172	0.1825328980090872	0.0729267731999999	0.1808463230372352	0.0244345226813745	0.3465784021084218	-0.0009444160091882	0.1976878850147971	0.0018873105913976	0.1960045654486641	0.0626595955263765	0.4140188622644319	-0.0036830207827004	0.2664194199598484	0.0050749305352431	0.2637364687107661	0.0015930917024308	0.3793420387892411	-9.97662551203776e-05	0.2540719854134124	0.0001369006422244	0.2517329561271234	-0.0073512916103064	0.2057477054581537	0.0108285770842267	0.2036716880493342	NMUR2	496679	GRIA1	559569	GLRA1	1005196	False	False	False	ref	60	0.01495	20	0.0488
3435	chr5	152934890	T	C	rs72804781	0.0264435858	0.4655324015508829	0.0304328249999999	0.4693133135011508	0.0193842736755178	0.5076227573636436	0.0005914622222707	0.4635340344494318	0.0006460883463719	0.4673847016688663	0.030575533634654	0.5623795187270956	0.0014005288481281	0.5014625170894929	0.0014244654668428	0.5054597177443705	0.0006730051135741	0.556660346356076	3.269483148846838e-05	0.4988910029567392	3.302260445276907e-05	0.502936218289869	0.0032496453432747	0.4672738522665083	0.0033700636732538	0.4714404675460789	NMUR2	501522	GRIA1	554726	GLRA1	1010039	False	False	False	alt	-55	0.03162	40	0.11005
3436	chr5	152937432	T	A	rs116618941	0.0016285119999999	0.6171136121958198	0.0196778763999999	0.6168635757925268	0.0108764894354826	0.8686462159094336	-1.7169986361325287e-05	0.732286060836471	0.000223078247467	0.7316424890363364	0.0011060341130282	0.9588256954972382	8.721409849477781e-06	0.9252070694173228	2.243695873157235e-05	0.9241400233811384	1.1169171865014376e-05	0.9788660402393958	6.580464819280404e-08	0.9459326565146612	2.352789481022022e-07	0.9448331773730172	3.2991323281964434e-05	0.9151383911822748	9.567483751772046e-05	0.914038326834972	NMUR2	504064	GRIA1	552184	GLRA1	1012581	False	False	False	alt	65	0.00641	-100	0.296
3437	chr5	152943061	C	T	rs72804789	-0.0535997286	0.1949197309266264	0.0706844954	0.1931338031960234	0.02172189127548	0.4247474729049848	-0.0012536162176847	0.2348109392597248	0.0015896728898979	0.2327391712086599	0.1235896209296954	0.2676710431948069	-0.0060816810294715	0.1850098533171639	0.0080531141037313	0.1828040329465187	0.0027701522692146	0.2642459617524621	-0.0001479994356792	0.1945850230261166	0.0001867774442619	0.1923586293395598	-0.0111444690046517	0.1436148171731414	0.0148757876678433	0.1418879036470222	NMUR2	509693	GRIA1	546555	GLRA1	1018210	False	False	False	ref	-5	0.000393	-20	0.08813
3438	chr5	153036592	G	A	rs184754715	-0.03395264084	0.4586317309010767	0.03456478068	0.4546594144401552	0.0223879802563556	0.4035196273881303	-0.0008792361906826	0.4586673804328499	0.000892048167344	0.4549954444787947	0.2042187654646827	0.178125812067124	-0.0080796358057631	0.2603478384200509	0.0082279046745447	0.2576225338850623	0.0046163400107443	0.1809203144003602	-0.0002105885478194	0.2665896200044477	0.0002136917885457	0.2640428509505271	-0.0103081389594536	0.269172327190665	0.0104945399359968	0.2661711247190669	GRIA1	453024	NMUR2	603224	FAM114A2	1002344	False	False	False	ref	-100	0.0936	-100	0.3071
3439	chr5	153078038	A	G	rs75040818	-0.045533849	0.3352751081412627	0.045533849	0.3310060707097728	0.1091046774717159	0.0029496684905625	-0.0045961139954586	0.0727583888891384	0.0045961139954586	0.0719578690008119	0.0644394774174391	0.3923699243897987	-0.0034029897351557	0.3356203609210847	0.0034029897351557	0.3309546595005259	0.0069932690100971	0.119621623432559	-0.0003364983580292	0.1486163982154305	0.0003364983580292	0.1461004755240176	-0.0074585134109728	0.2887465590214912	0.0074585134109728	0.2843914827838231	GRIA1	411578	NMUR2	644670	FAM114A2	960898	False	True	True	ref	100	0.02179	65	0.08496
3440	chr5	153081063	G	A	rs73802032	-0.2880334639999999	0.0109707869561672	0.2880334639999999	0.0109138982118992	0.031278746996034	0.2068916550992055	-0.0097586193268275	0.026218803652111	0.0097586193268275	0.0261126028446503	0.6002771271155686	0.026891880438431	-0.1732529628788675	0.003199731715249	0.1732529628788675	0.0032173398482951	0.018815773292532	0.0267827133275456	-0.0058870940404826	0.0078875312047008	0.0058870940404826	0.007836450896464	-0.0833583517534888	0.0073482473101473	0.0833583517534888	0.0072935587588928	GRIA1	408553	NMUR2	647695	FAM114A2	957873	True	True	False	ref	75	0.104	75	0.0947
3441	chr5	153115323	A	C	rs6868545	0.0549440326999999	0.2613518165223339	0.0549440326999999	0.2652753793099341	0.0384399187733022	0.1211911286893072	0.0020894543548773	0.1715385594698202	0.0020894543548773	0.1737794900868571	0.0527077628583681	0.4349066642696931	0.002393781599232	0.3375665572993995	0.002393781599232	0.3422466752217311	0.0020537944809102	0.3170484073730654	9.185100253591635e-05	0.2589990027256807	9.185100253591635e-05	0.2631771567533052	0.0062139157401602	0.2918469253620416	0.0062139157401602	0.2963722300200296	GRIA1	374293	NMUR2	681955	FAM114A2	923613	False	False	False	alt	100	0.04703	100	0.0702
3442	chr5	153130559	G	A	rs2118792	-0.0429717265999999	0.1799783371863588	0.0792649738	0.1792696259697157	0.1233494987987215	0.0018561731596213	-0.0073800910287463	0.0299953802344689	0.0111674528430308	0.0300088715000121	0.2668024809475107	0.1321355476413133	-0.0019413704317375	0.1045764178114498	0.0208109799068746	0.1041079317430362	0.0332962711705198	0.00968462898305	-0.000834379414787	0.0278121098934019	0.0028333278851402	0.0276898442826618	-0.009712645574214	0.1100163355616058	0.0197799478737091	0.1094451897699663	GRIA1	359057	NMUR2	697191	FAM114A2	908377	False	True	True	ref	-45	0.1206	0	0.0
3443	chr5	153148011	A	G	rs2962809	0.199388956	0.0272191788991226	0.199388956	0.0274480352063278	0.0479263575811423	0.0646088155092062	0.0101158833787084	0.0239120330263957	0.0101158833787084	0.0240476010687814	0.3821673649830094	0.0756851104063293	0.0830719935249844	0.014328344626751	0.0830719935249844	0.0145522756012983	0.0186766084664432	0.0271034619766653	0.0043124507906564	0.012455320600402	0.0043124507906564	0.012620815749966	0.0691159974926594	0.0113821956595959	0.0691159974926594	0.0114895564700019	GRIA1	341605	NMUR2	714643	FAM114A2	890925	False	False	False	alt	35	0.1043	-20	0.0957
3444	chr5	153152663	G	A	rs2973157	-0.167996668	0.0363380658498021	0.167996668	0.0360197135135494	0.0457191267436864	0.0742037924045774	-0.0077523612345684	0.0298684330016426	0.0077523612345684	0.0297632587036906	0.0344553132526145	0.5064937548243953	-0.0057677405968419	0.2208194020619345	0.0057677405968419	0.2171234148069331	0.001564714267517	0.356905205334857	-0.0002640982420075	0.1475211040328495	0.0002640982420075	0.1450439143339187	-0.0141087394015373	0.1470237564672709	0.0141087394015373	0.1443209655195792	GRIA1	336953	NMUR2	719295	FAM114A2	886273	False	False	False	ref	100	0.01172	100	0.1521
3445	chr5	153156462	A	G	rs2910030	0.0857788182	0.1527399762144107	0.0857788182	0.1547855813682229	0.0626019354152345	0.0267231934708186	0.0057524126725904	0.0604158852683005	0.0057524126725904	0.060924442853515	0.0126051598429612	0.6971892712664551	0.0012837500124868	0.4737124789887026	0.0012837500124868	0.4791587601939581	0.0008283234899772	0.4886016386972623	8.782822101482546e-05	0.3109777899563586	8.782822101482546e-05	0.315435954603035	0.00373874171093	0.4208446739333948	0.00373874171093	0.4262513289855336	GRIA1	333154	NMUR2	723094	FAM114A2	882474	False	False	False	alt	90	0.01627	100	0.0974
3446	chr5	153160794	C	T	rs2910032	-0.0468313428	0.3212456388946243	0.0468313428	0.3168651728941236	0.0124115580237826	0.8013605980805522	-0.0005868729609718	0.4799530607833765	0.0005868729609718	0.4741578707448552	0.0135082973178053	0.6866149323352659	-0.0007655677493735	0.5568470892647015	0.0007655677493735	0.5512042630647433	0.0001700740477028	0.7483473175991817	-9.767863599346445e-06	0.6168251825637606	9.767863599346445e-06	0.6108457122545973	-0.002354755699251	0.515048421136942	0.002354755699251	0.50927503211385	GRIA1	328822	NMUR2	727426	FAM114A2	878142	False	False	False	ref	-100	0.02478	85	0.1077
3447	chr5	153171303	T	C	rs2973138	0.2567405453999999	0.0161302479371308	0.2567405453999999	0.0162608949277825	0.0336295423229617	0.1741847003120361	0.0093941306506767	0.0296231611984244	0.0093941306506767	0.0297574199251359	0.1420697106660947	0.2556527001778894	0.0452994968947993	0.0450210176399836	0.0452994968947993	0.0457288990956638	0.0052068825080695	0.1777017019648594	0.0017000410236918	0.0458053704698162	0.0017000410236918	0.0462981316679508	0.0616525353831942	0.0184475887423899	0.0616525353831942	0.018618678784946	GRIA1	318313	NMUR2	737935	FAM114A2	867633	True	True	False	alt	30	0.01733	30	0.05176
3448	chr5	153171563	A	C	rs2962826	0.0751233132	0.1833931046576582	0.0751233132	0.1860557663934376	0.0370424435463956	0.1419508743113153	0.003335171882298	0.1320348788768933	0.003335171882298	0.1334489257487231	0.1105877404242683	0.3011984731322332	0.0102622100605722	0.1823622554875569	0.0102622100605722	0.1856102857527771	0.004659619396248	0.1988524022465548	0.0004918275038072	0.1394639184128052	0.0004918275038072	0.1417944312613743	0.0173649830094684	0.1356181064953049	0.0173649830094684	0.1381966981513673	GRIA1	318053	NMUR2	738195	FAM114A2	867373	False	False	False	alt	-100	0.10516	-100	0.3882
3449	chr5	153176386	C	T	rs55827458	0.004710219526	0.6009893590073161	0.019146683526	0.6023907843450348	0.0289512051562954	0.2429097670164084	0.0001894475444201	0.4979413915593447	0.0005541645141789	0.4988759414065935	0.0022112434429744	0.9236463150554388	1.3004474046811763e-05	0.8946512442346556	3.62839734686337e-05	0.8960672783119121	6.302557704635056e-05	0.8785479395742578	4.923209257142045e-07	0.8572610235021577	1.0587366111153255e-06	0.8587386618517264	5.938438190756117e-05	0.8895705188978309	0.0001484609547688	0.8902354124598519	GRIA1	313230	NMUR2	743018	FAM114A2	862550	False	False	False	alt	-100	0.0628	50	0.02667
3450	chr5	153179839	C	A	rs7717923	0.0076271113199999	0.8061933069464313	0.00881462188	0.8082804755437256	0.0235893245169064	0.3680977726887979	0.0001889204386705	0.7309391432363912	0.0002127280283283	0.7332924097396677	0.0023440335191844	0.9088265404494732	1.4392656332092138e-05	0.9336082643832186	1.7636161852859022e-05	0.9352126500096016	5.447342865060504e-05	0.8806274422061614	3.487900942756376e-07	0.912557199097316	4.149631612352421e-07	0.9142294078511356	4.453828643065066e-05	0.9345397681793712	6.43330803998366e-05	0.9361263791278222	GRIA1	309777	NMUR2	746471	FAM114A2	859097	False	False	False	alt	20	0.003418	95	0.05243
3451	chr5	153185089	T	G	rs1870861	0.0147270324	0.6649672623864634	0.0147270324	0.6717868547754796	0.008984037082454	0.938847730894264	0.0001463668123171	0.7826289216537854	0.0001463668123171	0.789469456434706	0.0008825178977928	0.9738041783696232	9.881386940093848e-06	0.9459430260123318	9.881386940093848e-06	0.9529913428769882	7.357935415672144e-06	0.9902639103544546	9.165493564912617e-08	0.9617108530293502	9.165493564912617e-08	0.968776168835358	4.3713503348619295e-05	0.9420017403540304	4.3713503348619295e-05	0.94909611491739	GRIA1	304527	NMUR2	751721	FAM114A2	853847	False	False	False	alt	-100	0.01936	-40	0.0004272
3452	chr5	153209119	C	T	rs1462120	-0.0282320212	0.487775935649709	0.0282320212	0.4822679181952446	0.0145066285804785	0.7149859596201534	-0.0004243322206122	0.5650516534095529	0.0004243322206122	0.559062611990749	0.0096829533832601	0.7341018359040475	-0.0002885732989928	0.6749735697482323	0.0002885732989928	0.6686708286043176	0.0001433605200315	0.7682771685913153	-4.378454140671456e-06	0.7022727161992486	4.378454140671456e-06	0.6959581166338886	-0.0010326284187258	0.6502190507313649	0.0010326284187258	0.6439348592094387	GRIA1	280497	NMUR2	775751	FAM114A2	829817	False	False	False	ref	-85	0.03607	80	0.03778
3453	chr5	153227010	A	G	rs3112532	0.0378284592	0.3813950486906977	0.0378284592	0.385935777565957	0.0442311368212953	0.083502770738911	0.0018344871329866	0.2118434734550611	0.0018344871329866	0.2147040290507642	0.0034921315693971	0.8729815682614152	0.0001488091469028	0.7607121502832939	0.0001488091469028	0.7671869852174305	0.0001669575059656	0.7529913573051316	7.620473122053066e-06	0.6433727527636987	7.620473122053066e-06	0.6496424374329262	0.0005625020619576	0.7442010141212582	0.0005625020619576	0.7506514389079153	GRIA1	262606	NMUR2	793642	FAM114A2	811926	False	False	False	alt	-100	0.05222	-100	0.273
3454	chr5	153235946	G	A	rs296175	-0.0475569558	0.2866289611760742	0.0523557642	0.2843313336584813	0.0165204705367243	0.6168313832099759	-0.0009080595915187	0.3717583452987862	0.000977728491874	0.3690135378960241	0.0087558971990366	0.7477197197915283	-0.0005000690094194	0.6182835529724441	0.0005394112900389	0.6142079478285023	0.0001457187366514	0.7649255098611681	-9.601190966096824e-06	0.6310323082108208	1.0172360565855715e-05	0.6269700714683046	-0.0017279205568935	0.5755113751477298	0.0018796806439905	0.571369203564777	GRIA1	253670	NMUR2	802578	FAM114A2	802990	False	False	False	ref	-100	0.0121	60	0.03357
3455	chr5	153239904	T	G	rs2546328	0.0551640214	0.151303101519042	0.0977637998	0.1511100117652258	0.0470691552165793	0.0689829671404781	0.002628523662911	0.0948209777637088	0.0045492052598571	0.094587887032717	0.1350136913991619	0.2544077767170877	0.0021401496725942	0.1618074565132938	0.0111240170444755	0.162353836139273	0.0064782737328343	0.134949920705394	9.812614128312268e-05	0.1074525471076547	0.0005244321748003	0.1075198133753846	0.005707498927782	0.1253311445178996	0.0177658275873444	0.1255487728646465	GRIA1	249712	FAM114A2	799032	MFAP3	799056	False	False	False	alt	-90	0.01062	-85	0.0674
3456	chr5	153258478	C	A	rs2349576	0.0297155154599999	0.4772082117970135	0.03111574134	0.4805306155637791	0.0149398067972912	0.6821252389148729	0.0005850187838251	0.5464159656710154	0.0006030232052342	0.5503573412990306	0.0811619544059912	0.3473289247580882	0.0019784163228361	0.4148537718712352	0.0021152699138089	0.4180889350667934	0.0011789017991479	0.4121517757457125	3.6616177735287455e-05	0.4529884680549103	3.837587218365636e-05	0.4565723658716665	0.0044125894889643	0.3986945187567439	0.0047507505526046	0.4019999922683711	GRIA1	231138	FAM114A2	780458	MFAP3	780482	False	False	False	alt	45	0.02556	55	0.1896
3457	chr5	153264409	G	T	rs2926288	-0.07626493334	0.1339290799821427	0.09267233066	0.1335822753131185	0.0394892312398482	0.115445963005759	-0.0036462042030596	0.1033645559529658	0.00408597346353	0.1034401432003859	0.031693114710831	0.5425755156802192	-0.0024318356185427	0.3711674692615986	0.0027420507608201	0.3691789946932721	0.0012722341254108	0.4154779123275358	-0.0001124471542672	0.2825538237546425	0.000121758187234	0.2809755352817625	-0.0058543103163868	0.3015997908255609	0.0069644683448252	0.2997423616633738	GRIA1	225207	FAM114A2	774527	MFAP3	774551	False	False	False	ref	-45	0.0971	-65	0.1614
3458	chr5	153266205	C	T	rs2964817	-0.0225732036	0.4597737648350323	0.0314510999999999	0.4568242121794618	0.0765417828401194	0.0125590847384193	-0.0015963355284874	0.1551610844248354	0.002322715524564	0.1542724037120992	0.0023333113391177	0.9236194287563616	-8.416659036192587e-05	0.8457746355394226	9.174521107357196e-05	0.8419388997578483	0.0001772009808007	0.7624612629686376	-6.223369886101329e-06	0.6872399849846788	6.843444525621001e-06	0.6835754271684094	-0.000285374946389	0.8368003424276576	0.0003150671373428	0.8328630118621857	GRIA1	223411	FAM114A2	772731	MFAP3	772755	False	False	False	ref	70	0.006042	40	0.06384
3459	chr5	153272205	A	G	rs2199123	0.0460096166999999	0.3740031778611914	0.0460096166999999	0.3784588149061652	0.0304887397781639	0.2154402427207555	0.0014040121978362	0.3292791523434697	0.0014040121978362	0.3332743871357829	0.06542179406816	0.3923525527057195	0.0036261194276361	0.3753536658936631	0.0036261194276361	0.3799367636715251	0.0019533590037127	0.3216534845065649	0.0001099867896211	0.3295248772026737	0.0001099867896211	0.3338710874561678	0.0073174755039424	0.3293323681621826	0.0073174755039424	0.3335165775797371	GRIA1	217411	FAM114A2	766731	MFAP3	766755	False	False	False	alt	35	0.02478	-20	0.004517
3460	chr5	153274919	C	T	rs17504622	-0.0909164886	0.1370468398185533	0.0940750614	0.1359288361020531	0.0297709974750211	0.2304310305738831	-0.0032286703248779	0.1392144824656306	0.0032979665662927	0.1383580057395773	0.0674020982481607	0.3795059011789102	-0.0057500748083922	0.2394124948945219	0.0059532755191231	0.2361658309725976	0.0019811807679017	0.3154097589959564	-0.000202652008719	0.2054616133537442	0.0002071100493894	0.2027162885867388	-0.0129862096268681	0.1737640511743647	0.0134431394543234	0.1712331959419278	GRIA1	214697	FAM114A2	764017	MFAP3	764041	False	False	False	ref	-100	0.05554	-85	0.3032
3461	chr5	153305895	C	T	rs308267	0.03578535128	0.3879530857945296	0.03694891992	0.3918280476558354	0.0285209222496766	0.2527743297354986	0.0009791966682656	0.3439025978550256	0.0010158433680773	0.3470083818741681	0.0156840750882517	0.659700407761581	0.0007426691911732	0.565769019751943	0.0007506154386018	0.5703662786134207	0.0004419280270412	0.5946635086272165	2.0532537623824697e-05	0.5182892466369848	2.0782805409810875e-05	0.5226463618999643	0.0023935205041073	0.5177605154325872	0.0024265118273893	0.5224079386009481	GRIA1	183721	FAM114A2	733041	MFAP3	733065	False	False	False	alt	100	0.05536	-45	0.1307
3462	chr5	153320574	A	G	rs2609671	0.0174470864	0.6312628924899973	0.0174470864	0.6378156824004569	0.0389782120688494	0.1171957717919734	0.0006474402286908	0.4314081151576251	0.0006474402286908	0.4366150122984093	0.0031754148658902	0.8879857968133024	5.9342188682585454e-05	0.849851937695927	5.9342188682585454e-05	0.856722551084763	0.0001278419830842	0.7958241819725969	2.3367816827202343e-06	0.7734977328994826	2.3367816827202343e-06	0.7803582145676181	0.0002565075385173	0.8412123621995357	0.0002565075385173	0.8482302603369437	GRIA1	169042	FAM114A2	718362	MFAP3	718386	False	False	False	alt	10	0.013794	-95	0.06934
3463	chr5	153325578	T	C	rs300325	0.1170751096	0.0881093817704008	0.1170751096	0.089285788758619	0.0218278649015678	0.421644382288292	0.0029436622802716	0.1398326602096442	0.0029436622802716	0.141568005114645	0.1321879845600606	0.2529682499610495	0.015435246105795	0.1133944448011527	0.015435246105795	0.1156453432834691	0.0028848456253654	0.2547342573753821	0.0003842405773481	0.1300528893620651	0.0003842405773481	0.1323269872020802	0.0258585991884133	0.0713107368680674	0.0258585991884133	0.0727200359895004	GRIA1	164038	FAM114A2	713358	MFAP3	713382	False	False	False	alt	-85	0.02332	100	0.3047
3464	chr5	153335525	C	T	rs2617267	-0.118849126	0.0786273962016429	0.118849126	0.0775299857380186	0.0318624061850592	0.2000359216501844	-0.0041146273131911	0.0838311731534385	0.0041146273131911	0.0829764469756868	0.0081876216555045	0.7855221261664516	-0.0011334697298715	0.5134006528694737	0.0011334697298715	0.5076978749004898	0.0003035282109882	0.6971979644778168	-4.4999930851728415e-05	0.4359590130788668	4.4999930851728415e-05	0.430625594845569	-0.0032933588466232	0.4632616514395247	0.0032933588466232	0.4578303602015147	GRIA1	154091	FAM114A2	703411	MFAP3	703435	False	False	False	ref	40	0.0003629	-85	0.0976
3465	chr5	153335769	T	C	rs2964819	0.1896968899999999	0.0316727863708478	0.1896968899999999	0.0319111906586833	0.0555178118118125	0.0399148571528542	0.0106718697504255	0.0212743092574703	0.0106718697504255	0.0213186374550999	0.0273531061330869	0.5735254024912818	0.0057392315743653	0.2520359785444721	0.0057392315743653	0.2559264120417431	0.0015344364368312	0.3815067809414679	0.0003271487945975	0.1534118045316027	0.0003271487945975	0.1558729106399808	0.0125886641813202	0.1798400828576978	0.0125886641813202	0.1828624304959963	GRIA1	153847	FAM114A2	703167	MFAP3	703191	False	False	False	alt	0	0.0	100	0.005737
3466	chr5	153335978	A	C	rs2560245	0.146142861	0.0513813625863278	0.146142861	0.0518998027227115	0.0374751616680452	0.1333128980219435	0.0058830553776259	0.0514511635373528	0.0058830553776259	0.051822488380682	0.0251096961499125	0.5774403772759011	0.0033185788378193	0.2924116542311126	0.0033185788378193	0.2968310155298922	0.0009374094652641	0.4620161887720669	0.0001356437431109	0.2241329396500989	0.0001356437431109	0.2278430811871402	0.0090651908548051	0.2205146079535325	0.0090651908548051	0.2244189444610233	GRIA1	153638	FAM114A2	702958	MFAP3	702982	False	False	False	alt	45	0.01224	-25	0.05927
3467	chr5	153336647	T	G	rs2446429	0.0505048363999999	0.298711703367959	0.0509030448	0.3017535673074232	0.0264454329418643	0.2946515851082385	0.0014100529432416	0.2772666499356589	0.0014191302699832	0.2798545810852232	0.0600376101085414	0.4428205231119508	0.0049133308304764	0.3443399645801083	0.0049173804406956	0.3477060788098562	0.0016905387804932	0.3896587551297526	0.0001410890899136	0.3192239577385277	0.0001411814024724	0.322314240906668	0.0087072349971956	0.290596563627105	0.0087204315265084	0.2934622145317571	GRIA1	152969	FAM114A2	702289	MFAP3	702313	False	False	False	alt	-100	0.09045	-85	0.09
3468	chr5	153336750	T	A	rs2560247	-0.02276323656	0.549881344507303	0.02276323656	0.5436476973913333	0.0105230112182889	0.8887229812994972	-0.0002455507766992	0.6871621731879185	0.0002455507766992	0.6806805099837483	0.0581084424796278	0.4465066081981201	-0.0012565223149976	0.4901238506643093	0.0012565223149976	0.4844028245163154	0.0006444442063578	0.563402720591649	-1.3905634416661349e-05	0.5736035845451999	1.3905634416661349e-05	0.5675732583124361	-0.0029131338457985	0.4739154550346873	0.0029131338457985	0.4680985711222618	GRIA1	152866	FAM114A2	702186	MFAP3	702210	False	False	False	ref	85	0.1357	55	0.0385
3469	chr5	153337784	T	C	rs170027	0.00371063316	0.7096746164963192	0.01271704396	0.7137120469764602	0.0183186017982828	0.5482828623395434	5.13157292232527e-05	0.6865584489177765	0.0002452187399407	0.6902795730968263	0.0012091319982844	0.9575516571398256	9.261475365191922e-06	0.9266188942629576	1.966114476907405e-05	0.9308622511310126	2.2524694159347343e-05	0.9513832818018612	1.518571751326989e-07	0.9187888438982637	3.75756267050285e-07	0.9230269492828675	4.783741875886e-05	0.9243913539577184	7.752960971263918e-05	0.9286946777379308	GRIA1	151832	FAM114A2	701152	MFAP3	701176	False	False	False	alt	100	0.013275	-25	0.04025
3470	chr5	153338784	A	G	rs304859	-1.5361467000000002	1.2186680310974606e-05	1.5361467000000002	9.98345542835724e-06	0.297059441553957	1.2261912448646462e-05	-0.4595423986131075	9.485752953364283e-06	0.4595423986131075	7.176834882251125e-06	0.1908539804031539	0.1860479618446886	-0.3103628045592665	0.0008822102403124	0.3103628045592665	0.0009030031977403	0.0579315032215976	0.0016369555219615	-0.0946067899038596	8.341412611825708e-05	0.0946067899038596	8.972498836169397e-05	-0.1890237867440863	0.0006683898247581	0.1890237867440863	0.0006729463911855	GRIA1	150832	FAM114A2	700152	MFAP3	700176	False	True	True	ref	95	0.03564	100	0.0166
3471	chr5	153340362	C	T	rs35407853	-0.085992448	0.1553966845659836	0.085992448	0.1535593938166037	0.0148423039289124	0.6969224383220787	-0.0013938921282708	0.2924576085550821	0.0013938921282708	0.2889584868498241	0.0946686021576325	0.3150020604266436	-0.0066014885947663	0.2160602519579099	0.0066014885947663	0.2124053860629025	0.0013395106893078	0.3846532921992555	-0.0001016360688871	0.2724346010215625	0.0001016360688871	0.2683435908518569	-0.0137128435221536	0.1632026865144672	0.0137128435221536	0.1603609751708618	GRIA1	149254	FAM114A2	698574	MFAP3	698598	False	False	False	ref	100	0.0598	55	0.1267
3472	chr5	153340428	T	C	rs304863	0.0731822152	0.1757710528741627	0.0831833512	0.1771421667535312	0.0328980266619444	0.1857481345347334	0.0031179887475828	0.1524925168193995	0.0034278687125573	0.1533205597663158	0.1221701692454884	0.2641558132523527	0.0078592435231962	0.1787583887071516	0.0092456552170829	0.1809873535326118	0.0039775196214031	0.1973958531020136	0.0003404639869946	0.146844934461638	0.000383421226209	0.1484224111652424	0.014237405562337	0.1373913206239091	0.0165484477582395	0.1389688590682838	GRIA1	149188	FAM114A2	698508	MFAP3	698532	False	False	False	alt	45	0.00598	-15	0.04785
3473	chr5	153341302	T	C	rs304864	0.08948916	0.1354355470670933	0.08948916	0.1371324700566168	0.0622881174721722	0.0270665901579238	0.0056622494743388	0.0567533425932635	0.0056622494743388	0.0572035200543173	0.133495265745109	0.2470420950352782	0.0121829283131843	0.1360784358229225	0.0121829283131843	0.1387932144873011	0.0081869315500822	0.0950069599317127	0.0007661538400471	0.0706530525027178	0.0007661538400471	0.0718497842456821	0.0214691036257463	0.0926020646785738	0.0214691036257463	0.0942665444114553	GRIA1	148314	FAM114A2	697634	MFAP3	697658	True	False	False	alt	85	0.02985	85	0.0845
3474	chr5	153344984	A	G	rs159759	0.3866352919999999	0.0043090394452918	0.3866352919999999	0.0043032731975283	0.0600521597597702	0.0305510023219529	0.0236447210608113	0.0051275121971992	0.0236447210608113	0.0051725501250431	0.1845666589686912	0.1962389410259455	0.082935841500175	0.0176867258651597	0.082935841500175	0.017807883076766	0.0114801567658724	0.0678100013177418	0.0052342082061246	0.0114294356054652	0.0052342082061246	0.0114463678867197	0.0950702715185905	0.005759509624444	0.0950702715185905	0.0057869408840513	GRIA1	144632	FAM114A2	693952	MFAP3	693976	False	True	True	alt	-95	0.1194	-60	0.1919
3475	chr5	153347798	G	C	rs160066	-0.01292362892	0.6580872849321646	0.01626991508	0.6555129110045924	0.0840632349234669	0.009256813457328	-0.0012284771011185	0.2724019781003609	0.0014902345930372	0.2716447774305899	0.0132262215037444	0.6852901688567424	-0.0001895995267046	0.7265453098927236	0.000229737000869	0.7249085585307513	0.0011551959321002	0.4247548172281383	-1.7490713892349075e-05	0.5209932683524747	2.0670814292291023e-05	0.5189904729356489	-0.0006367325393421	0.7042086342482808	0.0008016891557519	0.7024076132928333	GRIA1	141818	FAM114A2	691138	MFAP3	691162	False	True	False	ref	-10	0.011505	-20	0.05005
3476	chr5	153347834	G	C	rs150618	0.109759706	0.0873057930560917	0.109759706	0.0884436798101534	0.028565213256137	0.2518696232072622	0.003234633560009	0.1024703791294069	0.003234633560009	0.103649595825193	0.0212356900135263	0.5975487461917939	0.0022243096140055	0.3446780437979776	0.0022243096140055	0.3494637422845333	0.0006019726439228	0.5311879370511197	6.453299113152833e-05	0.30360551447263	6.453299113152833e-05	0.3080940208130209	0.0064456797862161	0.2788928802307205	0.0064456797862161	0.283410252083017	GRIA1	141782	FAM114A2	691102	MFAP3	691126	False	False	False	alt	90	0.0365	-55	0.09485
3477	chr5	153347885	G	A	rs149095	0.0006449183999999	0.5014189406622794	0.0270942756	0.4989254694429293	0.0107060899472173	0.8472924498369896	0.0001259866899004	0.6307523431556987	0.0003606462863372	0.6285000705525127	0.0167958826828543	0.6419013461430749	-3.924287573193682e-05	0.6374696412870583	0.00041216760832	0.6345888869697043	0.0001772478818237	0.7357021883845024	1.2428389157673236e-06	0.700206135958893	5.299437413515041e-06	0.6973585328370807	1.649566164120021e-06	0.6101230786062141	0.0014648147537197	0.6077837969513498	GRIA1	141731	FAM114A2	691051	MFAP3	691075	False	False	False	alt	25	0.0321	-100	0.0779
3478	chr5	153352846	G	A	rs159972	0.0272753586	0.3291411754523972	0.0427862106	0.3319358833370643	0.0331997837534097	0.1781378996756632	0.0009686919685758	0.2332617546863336	0.0014489627040884	0.2351099457107364	0.232494803866583	0.1520842028466587	0.0061871809540564	0.1474281894811283	0.010516298252553	0.1490262759197324	0.0076422467349111	0.1061100089702336	0.0002161507835379	0.1230096751494742	0.0003501955325925	0.1243135810091297	0.0084738213849757	0.1493741859225908	0.0137491339777637	0.1509643933164792	GRIA1	136770	FAM114A2	686090	MFAP3	686114	True	False	False	alt	0	0.0	50	0.11487
3479	chr5	153353281	A	C	rs159973	0.0897634728	0.1218965508936673	0.0897634728	0.1236693606130702	0.0234391444479846	0.3704518633267155	0.0021264865135407	0.1569395683723616	0.0021264865135407	0.1590205076507958	0.264204414239055	0.1304852099256611	0.0238467435083255	0.0678225075893394	0.0238467435083255	0.0692205289941447	0.0062153469141356	0.1325226071742359	0.0005641260500176	0.0823193469999967	0.0005641260500176	0.0839044342578541	0.0289630827092474	0.055168656497595	0.0289630827092474	0.0561718062114487	GRIA1	136335	FAM114A2	685655	MFAP3	685679	True	False	False	alt	-5	0.001472	-20	0.03857
3480	chr5	153368956	C	T	rs304883	-0.00554072248	0.4972406646186258	0.02850184432	0.4962387414048834	0.0192915308041923	0.5058037941594387	-0.0002060040368256	0.5268672163981278	0.0005411958849691	0.5256710219147378	0.0097349147174292	0.744986487471267	-3.0247094864891974e-05	0.7142263733417413	0.0002416877314045	0.7126974757717592	0.0001759309845627	0.7460384624726939	-1.2745165640336016e-06	0.7128872689745908	4.343585364340428e-06	0.7113208256051455	-7.505526046646915e-05	0.6996963797128242	0.0008338556959519	0.698244166488169	GRIA1	120660	FAM114A2	669980	MFAP3	670004	False	False	False	ref	-85	0.03099	75	0.0928
3481	chr5	153369539	G	A	rs304884	0.342723174	0.0070867804891663	0.342723174	0.0071062226652541	0.0789239223839986	0.0119166251016286	0.0297392974018707	0.004611150490285	0.0297392974018707	0.0046352756408915	0.019427765497674	0.628750610440847	0.0079186901116845	0.2044995937027848	0.0079186901116845	0.2078831902624655	0.0017168260513419	0.3692118471708702	0.0007509533567626	0.0911424086323356	0.0007509533567626	0.0928403547818979	0.0145310283395466	0.1542726267788816	0.0145310283395466	0.1568656424000044	GRIA1	120077	FAM114A2	669397	MFAP3	669421	False	True	True	alt	45	0.01129	-95	0.1448
3482	chr5	153378718	T	C	rs304853	0.0188543683	0.6062492904876835	0.0188543683	0.6127060356647817	0.0129311928553513	0.7908297550332969	0.0002346875400279	0.6903493542367057	0.0002346875400279	0.6970728164670481	0.0028141598759525	0.9016777392052427	4.7530717964307913e-05	0.8620853895648087	4.7530717964307913e-05	0.8690686390098196	3.545406338407468e-05	0.9233319296796092	5.819959160411279e-07	0.8820035150299153	5.819959160411279e-07	0.8891116059245885	0.0002169179505789	0.8480764418286998	0.0002169179505789	0.8549902176056058	GRIA1	110898	FAM114A2	660218	MFAP3	660242	False	False	False	alt	-55	0.02711	-55	0.348
3483	chr5	153379453	G	A	rs304855	-0.1680504472	0.0368362276590885	0.1680504472	0.0364507849728573	0.0363230760404668	0.141205059692168	-0.0061625633136642	0.0424121485524876	0.0061625633136642	0.0420363105542361	0.0069520965985945	0.7860449913859672	-0.0010791411215998	0.4706844114025328	0.0010791411215998	0.4651929120599415	0.0002503660312602	0.6876774162459078	-3.955117925286178e-05	0.3843062999636968	3.955117925286178e-05	0.379228801346251	-0.0033362475668898	0.4283387501609488	0.0033362475668898	0.4229974827124446	GRIA1	110163	FAM114A2	659483	MFAP3	659507	False	False	False	ref	15	0.01611	95	0.0956
3484	chr5	153384330	C	A	rs160161	-0.0999792182	0.1103483932592096	0.0999792182	0.1088140674034431	0.0227457614607706	0.3943951423372553	-0.0023909709954217	0.1559333773904423	0.0023909709954217	0.1539117426526715	0.0011019101976179	0.9642401084333811	-0.0001062293076476	0.807461331650536	0.0001062293076476	0.8007605791779651	2.4237181255949345e-05	0.9501060748556996	-2.4001761504210707e-06	0.7809469751260427	2.4001761504210707e-06	0.7743861786384489	-0.0003629045561017	0.8088099684522303	0.0003629045561017	0.8019779252978319	GRIA1	105286	FAM114A2	654606	MFAP3	654630	False	False	False	ref	85	0.04877	-65	0.1283
3485	chr5	153426785	T	C	rs13172447	-0.0221373164	0.5777811411217247	0.0221373164	0.5713383696598817	0.0230222547964459	0.3858249501241003	-0.0005227864068193	0.5116216171812626	0.0005227864068193	0.505619666222984	0.0233694038467882	0.5907364466382505	-0.0005647496653679	0.5882533823975522	0.0005647496653679	0.5822729002150265	0.0005448540527162	0.5606522356460483	-1.3510498259228613e-05	0.560786867262662	1.3510498259228613e-05	0.554767176979308	-0.001703177064432	0.5655360055821518	0.001703177064432	0.5595022682760301	GRIA1	62831	FAM114A2	612151	MFAP3	612175	False	False	False	ref	55	0.00815	-50	0.1699
3486	chr5	153436929	C	T	rs4246043	-0.03011997408	0.3494960565736196	0.04144563888	0.346765582664609	0.1043631349093317	0.0036772871865563	-0.0031430612643636	0.082266049467354	0.0044087786998073	0.0818730364052821	0.0592722114083995	0.4074371926524591	-0.0018813093810059	0.3598641920752154	0.002571158236892	0.3567356506893251	0.0062511550572024	0.1335996733455905	-0.000205824164597	0.1646856962670046	0.0002829193054762	0.163224072527772	-0.0046460031011843	0.3130961468311792	0.0063714493088317	0.3101958797779883	GRIA1	52687	FAM114A2	602007	MFAP3	602031	False	True	True	ref	90	0.07947	-30	0.02002
3487	chr5	153492525	C	T	rs3811983	0.0048486847399999	0.8453335131621805	0.0064947717	0.8496350520930547	0.0118188872744452	0.8295010188886062	6.227590409073759e-05	0.8746382593805619	7.770123532897749e-05	0.8790102174298273	0.0236679753224901	0.6089267359919928	0.0001844718901175	0.74123226789526	0.0001917829143372	0.7456022876941978	0.0002774887315635	0.6871763111401915	2.1918077911445444e-06	0.7825924364817332	2.2603187349586064e-06	0.7870286561615083	0.0004923954999834	0.760424272275543	0.0005138398601167	0.7648560756721186	GRIA1	2909	FAM114A2	546411	MFAP3	546435	False	False	False	alt	-15	0.00148	25	0.03427
3488	chr5	153986878	C	T	rs1347798	0.1793131844	0.0589351695176477	0.1793131844	0.0594163716206471	0.0535305916464908	0.0453420615999901	0.0105315660601903	0.0420530502843663	0.0105315660601903	0.0422891711546864	0.2296154861271485	0.1564156184520815	0.0588758898788108	0.0510803005096174	0.0588758898788108	0.0513503116918348	0.0129342173610324	0.0561575527071638	0.0035262759294634	0.0354505493893432	0.0035262759294634	0.0356544055746395	0.054991587212563	0.0338580104287954	0.054991587212563	0.0341539891991519	FAM114A2	52058	MFAP3	52082	GALNT10	203853	False	False	False	alt	75	0.01915	-15	0.001465
3489	chr5	153987245	G	A	rs425263	-0.252818828	0.0139716631324081	0.252818828	0.0138736866188274	0.0489423688052818	0.0615980274928512	-0.0128551133714493	0.0149158072969047	0.0128551133714493	0.0148639728995089	0.2558378146547458	0.1378259970161745	-0.0624560883298148	0.0216679059894387	0.0624560883298148	0.0213364155550408	0.0120717466260177	0.0590345924082688	-0.0030346742724912	0.0166410286620225	0.0030346742724912	0.0164416318105206	-0.0699638745010061	0.0100750820130485	0.0699638745010061	0.0099805263763596	FAM114A2	51691	MFAP3	51715	GALNT10	203486	False	True	False	ref	100	0.0218	100	0.335
3490	chr5	154008356	C	A	rs6580047	0.00521329634	0.8201480545061288	0.00717388886	0.8249262355646808	0.0280593372277123	0.2596544022671417	0.0001563732611779	0.714014389552615	0.0002061852865609	0.7184965623822946	0.0014351225627659	0.947948139127444	6.177103858852715e-06	0.9492020009634458	9.831667482049892e-06	0.9536607715223988	3.9613041824718576e-05	0.9082904768444724	1.85194286582498e-07	0.923091589167878	2.7804438833239426e-07	0.9274969014399672	3.46408894460637e-05	0.9456178846767644	4.4538286430656665e-05	0.950059273429642	FAM114A2	30580	MFAP3	30604	GALNT10	182375	False	False	False	alt	45	0.007812	75	0.02356
3491	chr5	154020162	C	T	rs552556	-0.0161114524	0.3803796449757329	0.0380098308	0.37837985474437	0.03843830782882	0.1244445474608126	-0.0006454943683953	0.2464430807436381	0.0013894499670347	0.2450747268340357	0.0011283032562435	0.9620124962584324	-1.5536433396188866e-05	0.8743247925034023	3.990522808846101e-05	0.872686296455598	4.2752871009678445e-05	0.9035342448298614	-6.001693469464059e-07	0.8032128092750068	1.421881540773855e-06	0.801307782689524	-6.680742964600212e-05	0.8711219795052372	0.0001558840025073	0.8694953212026961	FAM114A2	18774	MFAP3	18798	GALNT10	170569	False	False	False	ref	70	0.0766	75	0.10516
3492	chr5	154020867	C	A	rs2118660	-0.05126756712	0.2811737766500626	0.05126756712	0.2774759341986937	0.0245983125152686	0.3398017510422316	-0.0013203743885692	0.2779394586384779	0.0013203743885692	0.2745464680463426	0.0065240341790108	0.8048472899634485	-0.0004519812393573	0.6550354091261038	0.0004519812393573	0.6483761677628788	0.0001683151164516	0.761817784805405	-1.19294011365612e-05	0.6154858495400972	1.19294011365612e-05	0.6090019012242904	-0.0015802843852066	0.6188631379883562	0.0015802843852066	0.6121513392851078	FAM114A2	18069	MFAP3	18093	GALNT10	169864	False	False	False	ref	95	0.02255	90	0.1737
3493	chr5	154025854	T	G	rs2560047	0.0163721974	0.6364447664892504	0.0182113838	0.6404308717256328	0.0135094638731903	0.7581083839178162	0.0002111915471317	0.7066018834805112	0.0002374846850507	0.7106984342608632	0.0631074527399293	0.3922060608239337	0.0008256515572792	0.4800853559599092	0.0009852477476736	0.4833095652235352	0.0008683963069807	0.4659344333813612	1.0775896702074372e-05	0.5334630908558506	1.3057495000102745e-05	0.5368943223172027	0.0019464880736366	0.4904264445442605	0.0023242387252151	0.4937783300012939	FAM114A2	13082	MFAP3	13106	GALNT10	164877	False	False	False	alt	95	0.01401	-50	0.06024
3494	chr5	154026830	A	C	rs10038905	0.00037277182	0.5218258494511575	0.02439997022	0.5225402564254827	0.0215136226223211	0.4309139656431746	7.545193850580999e-06	0.4975186048798195	0.0005239872317971	0.498188559733258	0.1977763848107947	0.1787362779012668	0.0008865983942937	0.2629828844878049	0.0048066883389436	0.2635573589452113	0.0042507769475136	0.1871702381542181	1.9275397468815898e-05	0.2688462146576924	0.0001029194415167	0.2693545779085699	0.0005765233743525	0.2792576380517442	0.0073578898749628	0.2797041759549093	FAM114A2	12106	MFAP3	12130	GALNT10	163901	False	False	False	alt	-50	0.0171	30	0.0271
3495	chr5	154030460	G	A	rs2578375	-0.0575726934	0.2440795032575793	0.0575726934	0.2407253980767255	0.0173354320576179	0.5853319405900002	-0.0010558103741374	0.3240480534523379	0.0010558103741374	0.319964052782813	0.0272599056448153	0.5654092319297419	-0.0014626439830576	0.4343702576295526	0.0014626439830576	0.4290304373919667	0.0004149325874488	0.5994472403978841	-2.302347860370395e-05	0.4628499754555286	2.302347860370395e-05	0.4573312607748116	-0.0041956715383853	0.3854201084925798	0.0041956715383853	0.3802573192338221	FAM114A2	8476	MFAP3	8500	GALNT10	160271	False	False	False	ref	95	0.0432	90	0.1743
3496	chr5	154030660	C	T	rs2578376	-0.0238268087	0.549279523462252	0.0238268087	0.5429986558525632	0.0241718936712069	0.3528836685254867	-0.0005887219397638	0.5064536716889269	0.0005887219397638	0.5007330029469786	0.0260285045033155	0.586489839644331	-0.0008768896173619	0.5836580026801792	0.0008768896173619	0.5773884262644287	0.0006619670041742	0.5453340320845379	-2.3160297925494447e-05	0.5532207593117966	2.3160297925494447e-05	0.5469998505600907	-0.0024199135627329	0.5522409964185642	0.0024199135627329	0.5458729996892827	FAM114A2	8276	MFAP3	8300	GALNT10	160071	False	False	False	ref	-50	0.1287	-70	0.1087
3497	chr5	154040248	C	T	rs567749	0.01942168276	0.606070319818565	0.01942168276	0.6122817321044918	0.032351027083216	0.187722616699823	0.0006258400793267	0.4559244663435364	0.0006258400793267	0.4614468815301684	0.0141928672759063	0.6665513749231959	0.0002916902390512	0.6700854769593103	0.0002916902390512	0.6762705737079483	0.0004577769244685	0.5760127452642602	9.37004650182535e-06	0.5951207824642225	9.37004650182535e-06	0.6011501351112304	0.0009913892646233	0.6531052573506764	0.0009913892646233	0.659284769818018	MFAP3	1288	FAM114A2	1312	GALNT10	150483	False	False	False	alt	25	0.00839	20	0.02261
3498	chr5	154046393	C	A	rs411245	0.065432282	0.2108778742190755	0.065432282	0.2139106190921927	0.0178864365407712	0.5610685240885933	0.0012622390619949	0.2871055928358515	0.0012622390619949	0.2909996732642402	0.1265019299924119	0.2586811180885771	0.0079911324351679	0.1798069892345203	0.0079911324351679	0.1830699776272004	0.002203154173389	0.2951285214127167	0.0001480096753868	0.2129590537760857	0.0001480096753868	0.2163600383307375	0.0149162020388637	0.140429421761925	0.0149162020388637	0.1429331132594169	MFAP3	7433	FAM114A2	7457	GALNT10	144338	False	False	False	alt	60	0.0227	85	0.0526
3499	chr5	154071230	C	T	rs1438590	-0.0159110547999999	0.603272521055124	0.0203206536	0.5992183406521004	0.0179938838962282	0.5612468761696815	-0.0002719994804515	0.6049586560672728	0.0003526177587134	0.6011000829877753	0.0029593216983933	0.8865589854742212	-5.697880634760405e-05	0.8450415444028182	6.818065114779554e-05	0.841207814198928	5.184283662764038e-05	0.8833355928091104	-9.43889076937714e-07	0.8407749919867442	1.1486862603420762e-06	0.8370489453621413	-0.0001995975058559	0.8280175598118175	0.000268879284748	0.8242863827281186	MFAP3	32270	FAM114A2	32294	GALNT10	119501	False	False	False	ref	-85	0.195	-50	0.1068
3500	chr5	154072442	A	G	rs816028	0.0792986468	0.1507747883581482	0.0792986468	0.153089191440385	0.0827757941693458	0.0094950556549464	0.0066634704517084	0.0375348777681182	0.0066634704517084	0.0377992208550386	0.7722221305796576	0.009585322618372	0.0611915761511652	0.0195073150392036	0.0611915761511652	0.0198575920021174	0.0638833945831221	0.0009798960290681	0.0051383232668253	0.0076993510457659	0.0051383232668253	0.0077139767857639	0.013101679258355	0.1521320966846704	0.013101679258355	0.1549914254404805	MFAP3	33482	FAM114A2	33506	GALNT10	118289	True	True	True	alt	70	0.0654	75	0.168
3501	chr5	154076692	T	C	rs1478350	0.0587372042	0.2447326417918561	0.0587372042	0.248218547831097	0.0181437813300952	0.5497712842847033	0.0012111088546962	0.3076525608329335	0.0012111088546962	0.3115281796675604	0.0046690970274817	0.8342654536007514	0.0002302826791299	0.6748154040043822	0.0002302826791299	0.6810790525459236	7.642429950589632e-05	0.8384878386440641	4.4087490489316506e-06	0.6749311787233399	4.4087490489316506e-06	0.6812873343340065	0.000836330045198	0.6580871365677663	0.000836330045198	0.6643830995866852	MFAP3	37732	FAM114A2	37756	GALNT10	114039	False	False	False	alt	20	0.01306	-50	0.02203
3502	chr5	154081968	A	G	rs816009	-0.0099888432	0.3556153043493303	0.041519514	0.3552665491170004	0.0157143348143074	0.6562226542446054	-0.0002198446175354	0.4384799326828343	0.0006982304207783	0.4381866296097014	0.1009988123123618	0.3062577784728602	-0.0022775051083679	0.2681218315227275	0.0051851686264812	0.2673260841085628	0.0016599065364935	0.35951197578994	-4.697892248427397e-05	0.3138592461049322	9.145838845001832e-05	0.3131478664151921	-0.0030063343340701	0.2369282662007411	0.0092614892283328	0.2362854467148746	MFAP3	43008	FAM114A2	43032	GALNT10	108763	False	False	False	ref	-100	0.05377	-100	0.08527
3503	chr5	154083148	G	A	rs816010	-0.03801212348	0.3434436366460422	0.04286618988	0.3404828257946091	0.019400482251217	0.4957917941022131	-0.0008296730980308	0.3745732015149445	0.0009140388504928	0.3715037410810003	0.015039094718089	0.6795369622675206	-0.000865262153408	0.5718200022312315	0.0009302197807343	0.5675059231900994	0.0003027901199075	0.6722926432490972	-1.864000862415532e-05	0.5641983111864619	1.976900002471567e-05	0.5599708152967208	-0.0026591006565272	0.5180107146802506	0.0029015868826498	0.5136929081393083	MFAP3	44188	FAM114A2	44212	GALNT10	107583	False	False	False	ref	-95	0.02371	10	0.04193
3504	chr5	154084867	G	A	rs816012	-0.00621057216	0.7176120899769999	0.01379347864	0.7161607019266707	0.0731233950490543	0.0150883290993174	-0.0005490713896615	0.3639329863769053	0.0010037219325645	0.3632462066344778	0.1830647289762791	0.1906573860809319	-0.0008200346118945	0.3686428937573075	0.0024308094297433	0.367933623349253	0.0132862430411793	0.0485852338695862	-7.8280279038885e-05	0.2097003877479228	0.0001747107825761	0.2091376566985952	-0.0015769852528784	0.4189049169652575	0.003840190030022	0.4179040319438192	MFAP3	45907	FAM114A2	45931	GALNT10	105864	False	True	False	ref	40	0.00806	-85	0.0753
3505	chr5	154089745	A	G	rs4958355	0.0303579321	0.4119923342088798	0.0345485151	0.4143621480388255	0.0137560625184699	0.7491279659508225	0.0004815486576648	0.5289724083388534	0.0005355598345623	0.53125345331822	0.2114884035498663	0.1740630994619438	0.0076931843155262	0.2234759657455826	0.0084567958403093	0.2252144595413966	0.0030347960609395	0.259773120203038	0.0001299023055491	0.2917545648076818	0.0001396774910064	0.2935789103856337	0.0095716076671835	0.2306142471618363	0.0105530995348222	0.2321747582684522	MFAP3	50785	FAM114A2	50809	GALNT10	100986	False	False	False	alt	-85	0.12427	-20	0.2007
3506	chr5	154094777	A	C	rs815620	-0.00360303586	0.7550441315994952	0.01087802494	0.7536261165672672	0.0113189922922517	0.8618228204753534	-4.768699040709423e-05	0.8188544269921958	0.0001238698141896	0.8173643899591939	0.0110768367919236	0.7082527723323093	-2.9413845908415127e-05	0.773886877692243	0.0001127903695108	0.7725869686264069	0.0001258709226595	0.7793060077674592	-4.194188845634488e-07	0.8161250480841072	1.2908908892368078e-06	0.8147727540984736	-0.0001096961499125	0.7674920133596154	0.00043466068424	0.7660946927627612	MFAP3	55817	FAM114A2	55841	GALNT10	95954	False	False	False	ref	-15	0.000885	50	0.0716
3507	chr5	154096161	A	T	rs890799	0.672609508	0.0006661854027306	0.672609508	0.0006690839897696	0.0662980064001528	0.0217481413762714	0.0453998200907682	0.0015865485508383	0.0453998200907682	0.001600394570953	0.5790463858005344	0.0302095158853864	0.391967993834577	0.0004063768710948	0.391967993834577	0.0003860239990104	0.0384393946247065	0.0047086015188501	0.0264883699649742	0.0007389229478563	0.0264883699649742	0.0007433318468933	0.2149863086008379	0.0003806568024078	0.2149863086008379	0.0003762713840341	MFAP3	57201	FAM114A2	57225	GALNT10	94570	True	True	True	alt	-15	0.005127	-30	0.1396
3508	chr5	154098617	T	C	rs6580052	-0.1567382293	0.0564260328513984	0.1567382293	0.0558761745196454	0.0414869424439624	0.1036555863253609	-0.0075795365126928	0.0500379349883775	0.0075795365126928	0.049710820237521	0.1966752993962587	0.1875046498075936	-0.0398506511388284	0.0596245683971898	0.0398506511388284	0.0586227966200031	0.0088909131133717	0.0991792298673412	-0.0019317000789053	0.0475120711818998	0.0019317000789053	0.046932553202796	-0.0454001847514103	0.0364844332683712	0.0454001847514103	0.0360074155763488	MFAP3	59657	FAM114A2	59681	GALNT10	92114	False	False	False	ref	-75	0.0471	0	0.0
3509	chr5	154110798	G	A	rs1428122	-0.3131627439999999	0.0078952668846793	0.3131627439999999	0.0079226757023664	0.0352722823732941	0.1528292256761825	-0.0116982044323061	0.0181595314490108	0.0116982044323061	0.0180937028809716	0.0533461449638744	0.4598140773812922	-0.0215440599448573	0.1081299522830301	0.0215440599448573	0.1063612618627887	0.0021240748434454	0.3480913727654165	-0.0008837083808534	0.090530289397215	0.0008837083808534	0.0892382118050513	-0.0355712447626273	0.0565233255717915	0.0355712447626273	0.0559036432687536	MFAP3	71838	FAM114A2	71862	GALNT10	79933	False	True	True	ref	-90	0.06744	-50	0.1366
3510	chr5	154183848	C	T	rs77075605	-0.1327403174	0.0675665152446299	0.1327403174	0.0668362807758642	0.0569340003753407	0.037008925481363	-0.0079589523031738	0.0349217745128161	0.0079589523031738	0.0347059780965974	0.2078519349411104	0.171633699323924	-0.0319440045317926	0.0608224692809434	0.0319440045317926	0.0597295764125866	0.0122643843123844	0.0584181963335577	-0.0019467105374016	0.0344896747338463	0.0019467105374016	0.0339846221163712	-0.0408647025832205	0.0368279333439792	0.0408647025832205	0.0362848574752902	GALNT10	6883	MFAP3	144888	FAM114A2	144912	False	False	False	ref	15	0.02023	10	0.01416
3511	chr5	154200245	G	A	rs80336253	-0.1171948918	0.0858846976708248	0.1171948918	0.0847449100732996	0.040422161860113	0.1053443616472554	-0.0047731864144565	0.0658029639513263	0.0047731864144565	0.0651861617100596	0.3422841542674276	0.0911279445459074	-0.0399571513257511	0.0409266947848532	0.0399571513257511	0.040062315376973	0.0138520643857377	0.0455941608276775	-0.0016298298639847	0.0336436460298349	0.0016298298639847	0.0330340014098329	-0.0390155389132657	0.0368729002593665	0.0390155389132657	0.0362700565121842	GALNT10	9514	MFAP3	161285	FAM114A2	161309	False	False	False	ref	45	0.02026	70	0.144
3512	chr5	154243261	G	A	rs73802964	0.0315467901999999	0.4554159281639595	0.0315467901999999	0.4607298134256566	0.0336107548657085	0.1741937401574968	0.0011398770979571	0.3173461787702706	0.0011398770979571	0.3212450736145796	0.1152007522021707	0.2780068797128838	0.0037568448438534	0.2903269298411889	0.0037568448438534	0.2948513327563979	0.0039811513115877	0.2020589009513504	0.0001365878456157	0.234540181097039	0.0001365878456157	0.2383940430558029	0.0070411731714558	0.2763555789961901	0.0070411731714558	0.2807764063865124	GALNT10	52530	SAP30L	202737	MFAP3	204301	False	False	False	alt	30	0.009766	10	0.008575
3513	chr5	154253839	G	A	rs73802970	-0.02804457962	0.4606940558068792	0.0310475499	0.4569551709132504	0.0732267162535788	0.0149649114891551	-0.0021805767904185	0.2002020400375637	0.0024085712827845	0.1991519382621565	0.0103666985582791	0.734827663576118	-0.0003873478171955	0.7037297001126201	0.0003986048690764	0.6989102238587757	0.0007876014234163	0.5089747491022953	-3.1178574792443966e-05	0.5225688469271732	3.2033243862916354e-05	0.5181835914745371	-0.0013691399162019	0.6673603889056773	0.0014021312394839	0.662367211737613	GALNT10	63108	SAP30L	192159	MFAP3	214879	False	True	False	ref	0	0.0	-100	0.04257
3514	chr5	154259120	A	T	rs531293	0.018446002	0.6086636123361266	0.018446002	0.6151390677640973	0.0344670952132113	0.1642218881550095	0.0006197952548279	0.4467140978589567	0.0006197952548279	0.4520788066023029	0.0833303091286991	0.354973104160997	0.0014786862686479	0.4320199090084707	0.0014786862686479	0.4373061426717008	0.0029888557942326	0.2640181599350327	5.042794266283632e-05	0.3586663388675228	5.042794266283632e-05	0.363544198276231	0.0032075814060901	0.4332902108568794	0.0032075814060901	0.4387318059125012	GALNT10	68389	SAP30L	186878	HAND1	219107	False	False	False	alt	35	0.02907	85	0.158
3515	chr5	154260334	C	G	rs2434528	-0.03324894326	0.1605576639331468	0.08695959086	0.1604717060992673	0.0237928199466288	0.3553403894299359	-0.000716448645973	0.1868740481008939	0.0024737659308558	0.1864962101546528	0.2954876117581076	0.1118301671949258	-0.0128302064312828	0.0798877338991143	0.0286045444108302	0.0796461297870839	0.0072695221202686	0.1141735959147018	-0.0002931936805699	0.0933806787010126	0.0008180575141953	0.0932391726122574	-0.0113440665105077	0.0721046824114337	0.0295123882418923	0.0721667251553265	GALNT10	69603	SAP30L	185664	HAND1	217893	True	False	False	ref	100	0.0526	100	0.3809
3516	chr5	154262375	C	G	rs2434535	-0.0934911985999999	0.1226374235826301	0.0934911985999999	0.1210359173616886	0.0256816468545577	0.3100911338804351	-0.0026370359677313	0.1450960291975246	0.0026370359677313	0.1434211535667198	0.0466596285176997	0.4513371029663635	-0.0047578411489893	0.2635684991944439	0.0047578411489893	0.2594165659277569	0.0012251018978386	0.4078195373136819	-0.0001375062166323	0.2451925786255538	0.0001375062166323	0.2412565929275294	-0.0118249150473425	0.1883075015685169	0.0118249150473425	0.1850203050736335	GALNT10	71644	SAP30L	183623	HAND1	215852	False	False	False	ref	10	0.003784	-50	0.1309
3517	chr5	154263006	G	A	rs693446	-0.0642904352	0.2115740984266496	0.0642904352	0.2084812355410844	0.0290800272375131	0.2397646344940015	-0.0019382064121112	0.1844465009844074	0.0019382064121112	0.1818705761188886	0.152071030319026	0.2237355987071211	-0.0098986289271471	0.1566282286590493	0.0098986289271471	0.1536481666077481	0.0044507273211382	0.1787578801494536	-0.0003005499870025	0.1403323388810829	0.0003005499870025	0.137864026909055	-0.0171068259047869	0.1221421580663452	0.0171068259047869	0.1199314463090952	GALNT10	72275	SAP30L	182992	HAND1	215221	False	False	False	ref	-100	0.0874	40	0.06964
3518	chr5	154274876	C	A	rs73281462	-0.27506159	0.0117114664906756	0.27506159	0.0116542352443911	0.0443067532456302	0.0812032963625831	-0.0126927910539406	0.0156568631268643	0.0126927910539406	0.0155736929755726	0.141823100524562	0.2371373976146966	-0.0364387336773154	0.0430207824259314	0.0364387336773154	0.0422451199944314	0.0061603163414438	0.1323386813826643	-0.0016613366955258	0.0314691854695813	0.0016613366955258	0.0310130194281672	-0.0569974596681072	0.0162191588028948	0.0569974596681072	0.0160238598064396	GALNT10	84145	SAP30L	171122	HAND1	203351	False	True	False	ref	40	0.006836	40	0.0542
3519	chr5	154275577	C	T	rs73281464	0.03640008666	0.3876285794191287	0.03911519054	0.3907681345198498	0.0788758952392476	0.0111313941077417	0.0027284902362741	0.1275621803447564	0.0029605298489656	0.1284731481466251	0.1546319817887895	0.2317969906725949	0.0069263403976518	0.2309376311451265	0.0071153881609575	0.2333703610660863	0.01198235159269	0.0630932208716955	0.0005209956682938	0.1124298159677292	0.0005371521660202	0.1135114455372874	0.0098660552274751	0.2212780832416064	0.0103097885256176	0.2238924554587344	GALNT10	84846	SAP30L	170421	HAND1	202650	False	True	False	alt	90	0.00958	-95	0.3481
3520	chr5	154291416	C	T	rs73279685	-0.0705977228	0.1830665789661212	0.0705977228	0.1804063422819032	0.027031945238648	0.2801864374203786	-0.0019351194938326	0.1784618458281755	0.0019351194938326	0.1760544532553856	0.0011670680610998	0.9585843395969422	-8.443479124877052e-05	0.817261258171354	8.443479124877052e-05	0.8104357972934796	3.188485790791649e-05	0.9265393364761444	-2.3461685923457657e-06	0.7687823136861635	2.3461685923457657e-06	0.7622198696727245	-0.0002993962587839	0.8189968082561567	0.0002993962587839	0.8121475407684666	GALNT10	100685	SAP30L	154582	HAND1	186811	False	False	False	ref	75	0.0086	100	0.0769
3521	chr5	156384661	G	A	rs7702643	0.0301254529	0.4593835771405112	0.0320651305	0.4632360462411806	0.0148637947373527	0.6793600193615491	0.0004853417520866	0.5408457529856524	0.0005078831850516	0.5450971382248999	0.0584037148230014	0.4325375825068361	0.0022161824131947	0.4281407830603206	0.0023386161247844	0.4319660534784868	0.000794575969709	0.503148075655541	3.42335011863523e-05	0.4798025517154665	3.565633107056293e-05	0.48381827107083	0.0046822935567945	0.3924824367536342	0.0049676685031836	0.3960587899812657	PPP1R2B	465635	SGCD	514316	TIMD4	578565	False	False	False	alt	-100	0.361	-100	0.1559
3522	chr5	156391078	C	T	rs6556578	-0.0476117043999999	0.3089263911015612	0.0476117043999999	0.3047276912090513	0.0184749645458506	0.5302715439630024	-0.0010153336326362	0.3529285076093638	0.0010153336326362	0.3484092276821925	0.2109036323446933	0.166756303304302	-0.0106517410095613	0.1555367601852562	0.0106517410095613	0.1526013895959771	0.0040842198580701	0.198793076216041	-0.0002408712766008	0.1849393053261714	0.0002408712766008	0.1816463726867407	-0.0148328989475767	0.1483975001599589	0.0148328989475767	0.1456195136855939	PPP1R2B	459218	SGCD	520733	TIMD4	572148	False	False	False	ref	35	0.00961	-100	0.03958
3523	chr5	156392721	G	A	rs10036164	0.293916066	0.0093181975177299	0.293916066	0.0094003966722753	0.0577412847706162	0.0355700912248987	0.0176283079194697	0.0089469948817651	0.0176283079194697	0.0089755062560052	0.1463660057404902	0.232365733192417	0.0423126258195686	0.0343667509215505	0.0423126258195686	0.0349942067086471	0.0084297051494222	0.0934330335157952	0.0025546631833102	0.0197229060298635	0.0025546631833102	0.0199576725062562	0.0647108310514334	0.0120685526872499	0.0647108310514334	0.012189808621669	PPP1R2B	457575	SGCD	522376	TIMD4	570505	False	True	True	alt	20	0.02766	-90	0.1771
3524	chr5	156414643	G	A	rs35414747	-0.374002522	0.0050565845452174	0.374002522	0.0050405825513815	0.0491892467880953	0.0615873505619509	-0.0200385130378155	0.0082782276619884	0.0200385130378155	0.0082452238642918	0.245044703243047	0.1406614274320567	-0.0946773780251673	0.0107632492547205	0.0946773780251673	0.010620046248856	0.0122150231066303	0.0564075730029899	-0.005103903640507	0.0096913199970087	0.005103903640507	0.0095761157638456	-0.1085043383590115	0.0034133916208228	0.1085043383590115	0.0034074229352693	PPP1R2B	435653	SGCD	544298	TIMD4	548583	True	True	True	ref	25	0.01245	-25	0.0737
3525	chr6	16343362	A	G	rs9367911	0.00287095186	0.8940060771343643	0.00481257094	0.8953507120375401	0.0159598174069501	0.6428395518406869	4.6866326702493903e-05	0.8876362980434992	7.779223587789914e-05	0.8888478945841544	0.0368537824552142	0.5220681602583207	0.0001224861567853	0.7566158068253255	0.0001704306752003	0.7576899432366496	0.0005543354868408	0.5661965970978549	1.831049371954184e-06	0.7697392157567254	2.5837951590742776e-06	0.7707641397101299	0.0002763023324865	0.7793004228252299	0.0004247632872554	0.7804261846511585	ENSG00000288708	14931	GMPR	104774	MYLIP	214275	False	False	False	alt	-70	0.1087	95	0.2988
3526	chr6	50830050	A	G	rs2857504	0.1534393839999999	0.0541608379657466	0.1534393839999999	0.0549634682481713	0.0248385288909202	0.3342519619721198	0.0041353762780942	0.0908071883864252	0.0041353762780942	0.0917547542095657	0.8377395994853354	0.0046467781441183	0.1318682545079147	0.0067330291312314	0.1318682545079147	0.0066868029585546	0.0208865778682613	0.0210150816942906	0.0035687452791861	0.0161422275576051	0.0035687452791861	0.0163222809765146	0.0174474613176734	0.1176918061204144	0.0174474613176734	0.1197440079224087	TFAP2B	11326	TFAP2D	116523	DEFB112	780121	False	False	False	alt	100	0.2686	75	1.088
3527	chr6	50842827	T	C	rs2245173	0.0408702152	0.3476319406153699	0.0408702152	0.3522767122375695	0.0232106359197022	0.3772930663090219	0.0009612610961611	0.3414735490432746	0.0009612610961611	0.3460080042656779	0.6947774735244631	0.0161717212757092	0.0283962329240727	0.0622047173190127	0.0283962329240727	0.0632188700192356	0.0161479015784048	0.0343999104678564	0.0006687282425044	0.0791242051522997	0.0006687282425044	0.0804461262491022	0.0088589950842928	0.238154003397232	0.0088589950842928	0.2419932847410161	TFAP2B	24103	TFAP2D	129300	DEFB112	792898	False	False	False	alt	95	0.1458	95	0.4668
3528	chr6	50843402	A	T	rs2857513	0.0061691524	0.8153330217760961	0.0082588056	0.8193375133598019	0.0084680203524134	0.9516935827524068	4.7371293208920005e-05	0.8947754727165559	6.694087771561137e-05	0.8986748054519085	0.7658762495463693	0.0101526274898022	0.0047890713810977	0.2026219179779839	0.0063251415654213	0.2048616796677906	0.00649639701146	0.1241321552842753	3.695269475115648e-05	0.3315549622896253	5.133797925485657e-05	0.3344763646145845	0.0009880901322952	0.5770442605589543	0.0014219260334531	0.5803641986228717	TFAP2B	24678	TFAP2D	129875	DEFB112	793473	False	False	False	alt	-100	0.08264	100	0.1252
3529	chr6	50846914	C	A	rs13195969	0.1111778972	0.0841474399341514	0.1111778972	0.0852604626568188	0.0316976256374155	0.1992436640198179	0.0035897241145794	0.087033884715408	0.0035897241145794	0.0880190719348218	0.1329278149846589	0.2478411771196337	0.0147953974066166	0.1072275219322117	0.0147953974066166	0.109468010043947	0.004141585283172	0.1900190283886683	0.0004655900681502	0.0948813070791064	0.0004655900681502	0.0967441987193127	0.0260466497311206	0.0649900305313849	0.0260466497311206	0.0662511737857632	TFAP2B	28190	TFAP2D	133387	DEFB112	796985	False	False	False	alt	5	0.002136	-20	0.0322
3530	chr6	50847801	T	A	rs56240592	-0.0151767083999999	0.6800209017174486	0.0151767083999999	0.6736041150774567	0.0107069763385023	0.8848144459411551	-0.0001646366784788	0.7777476284079398	0.0001646366784788	0.7712103050729667	0.0377222790406122	0.4897528519411114	-0.0005962568837244	0.5612673432472317	0.0005962568837244	0.5552289636310669	0.000402326874593	0.599594893196813	-6.410962999481049e-06	0.6404989038254534	6.410962999481049e-06	0.6343384735279121	-0.0017246214245652	0.5546524713283675	0.0017246214245652	0.548539449145546	TFAP2B	29077	TFAP2D	134274	DEFB112	797872	False	False	False	ref	-20	0.01062	-100	0.02765
3531	chr6	50854368	C	T	rs9463650	-0.0581426342	0.252921747155346	0.0581426342	0.2494260483285267	0.01682072578099	0.6087116359212094	-0.0010308081914172	0.3400535225633744	0.0010308081914172	0.3358196460639495	0.6570024083665997	0.0199888103902725	-0.0380733640176745	0.0449843913335722	0.0380733640176745	0.0441324677209712	0.0110130261086093	0.064022399453997	-0.0006710207698815	0.0815857271247784	0.0006710207698815	0.0800122993951663	-0.0139611032298505	0.1598353731864717	0.0139611032298505	0.1572246393211256	TFAP2B	35644	TFAP2D	140841	DEFB112	804439	True	False	False	ref	-100	0.5513	-100	0.668
3532	chr6	50934857	T	A	rs9463664	-0.0022264320859999	0.7847289300998767	0.0100291972859999	0.7834605280475955	0.0119153565542555	0.8147438152657891	-4.6251187817950565e-05	0.8531526026384628	0.0001118442785809	0.852142967372489	0.0092796344561379	0.7485256299175428	-2.957935558257109e-05	0.8646479655226282	7.466065389429108e-05	0.8624247673567417	0.0001267291812478	0.8012937154581985	-5.049048513261274e-07	0.8947718796079813	8.838758526088937e-07	0.8923711705003837	-0.0001245422453894	0.8482236315345111	0.000301045824948	0.845840468810321	TFAP2B	116133	TFAP2D	221330	DEFB112	884928	False	False	False	ref	-75	0.01526	50	0.078
3533	chr6	50956814	T	G	rs2894780	-0.00171742336	0.7556095538116059	0.01012188864	0.7579895061354036	0.0696678399686927	0.0179359234290055	-0.0001816055949668	0.434997693195509	0.0007482435406358	0.4373418733216209	0.0179555276962158	0.6298583161316874	3.937128666507272e-05	0.7501209343119002	0.0001360434452199	0.7536443712143418	0.0012348852896749	0.4027968744912382	2.146529104428256e-06	0.575499422455713	9.73907507987157e-06	0.5783439471616375	3.4640889446020024e-05	0.7539874650835163	0.0004816733199167	0.7572793765366994	TFAP2B	138090	TFAP2D	243287	DEFB112	906885	False	True	False	ref	-90	0.002129	-95	0.2695
3534	chr6	63416275	T	C	rs9341835	-0.1088315272	0.0986491507145192	0.1088315272	0.0975010115427208	0.0598324754049397	0.0308165237825311	-0.0065496351101688	0.0441170775667036	0.0065496351101688	0.0438420462482646	0.0476963808518359	0.4614955405842108	-0.0063221486762865	0.2438522779959597	0.0063221486762865	0.2402258357193853	0.0028555173751544	0.2628708296994025	-0.0003796794588951	0.1411818030789713	0.0003796794588951	0.139150320441643	-0.0139586288806043	0.1698455387077261	0.0139586288806043	0.1673700659718087	LGSN	96292	PTP4A1	105472	ENSG00000285976	156206	False	False	False	ref	-50	0.02985	-50	0.2009
3535	chr6	63442896	C	T	rs9344129	-0.01683172572	0.2605255642132508	0.05583904108	0.259676246159016	0.0430952439909102	0.0879804182470924	-0.0007786620279853	0.1736076706730914	0.0023074603987487	0.1730652183419328	0.0217891194615815	0.6837186780774253	-0.0001918438887637	0.7246935989696748	0.0002613039845473	0.72292943336828	0.0010443813485186	0.5530430913313102	-8.351798318842136e-06	0.6227288219821224	1.1319803556472907e-05	0.6210281310316382	-0.0007266338952855	0.7128504678923496	0.0009377783642901	0.7107779985548591	PTP4A1	78851	LGSN	122913	ENSG00000285976	129585	False	False	False	ref	5	0.002337	100	0.4558
3536	chr6	63481681	T	C	rs10943823	0.0043291534799999	0.8886203376544853	0.0047165539999999	0.8929314038264267	0.0199032461899845	0.483356768625806	8.242364534994389e-05	0.86108205058512	9.2013846760306e-05	0.8654557435681249	0.0022623799940615	0.9085131213300236	1.0308358477112114e-05	0.9478592103103328	1.1226982507328954e-05	0.9522529746549846	4.549859666113269e-05	0.8930980807717999	1.9892918127485403e-07	0.939236034532926	2.216699594204043e-07	0.9436181268599504	3.876480485631073e-05	0.9493659494940972	4.2063937184508445e-05	0.95373717465851	PTP4A1	40066	ENSG00000285976	90800	PHF3	154122	False	False	False	alt	-50	0.0226	100	0.1753
3537	chr6	72433995	A	C	rs2789588	-0.1535857357999999	0.0516223343314604	0.1535857357999999	0.0512140828758849	0.0473710571968932	0.0684047143538081	-0.0082075927194188	0.0382254215000063	0.0082075927194188	0.0379730870986596	0.1261076836791923	0.2566382318729981	-0.0178545435533063	0.0986611782566965	0.0178545435533063	0.0968505838992573	0.0057300533671165	0.1406054321958236	-0.0009357414139976	0.0621472591987758	0.0009357414139976	0.0611363394518339	-0.032194582824717	0.0522101369529121	0.032194582824717	0.0514014825927922	KCNQ5	187798	RIMS1	547444	KHDC1L	791775	False	False	False	ref	-80	0.0327	90	0.0769
3538	chr6	72448224	C	A	rs1856507	0.0129132445999999	0.4760521497503353	0.033272527	0.4766526431071685	0.0258771501879415	0.3068656653422355	0.0004907749227192	0.4368991406438707	0.0009296871029184	0.4376434600730732	0.0003612549899376	0.9936726697191276	4.625973024044727e-06	0.955208668030614	1.3137108188737393e-05	0.956813971274525	9.14684399483186e-06	0.985406868815694	1.827980670379117e-07	0.935112671673982	3.66358481870538e-07	0.9367009239857388	1.0722180066637524e-05	0.9567275185009516	4.041437102041668e-05	0.9583267698284836	KCNQ5	173569	RIMS1	561673	KHDC1L	777546	False	False	False	alt	-25	0.003904	100	0.10205
3539	chr6	83582853	C	T	rs2023569	-0.0403024826	0.3580814673950497	0.0403024826	0.3530430942558267	0.040457809115642	0.1070441885051209	-0.0016310967592949	0.2091657307664775	0.0016310967592949	0.206261629797176	0.0241306786315198	0.5733778322610203	-0.0009821999855663	0.4805267566630409	0.0009821999855663	0.4749912801124188	0.0010279154319721	0.440082004704169	-4.186885188980212e-05	0.377223611564105	4.186885188980212e-05	0.3720189735405811	-0.0030516974035827	0.4398559350200475	0.0030516974035827	0.4343950174525899	PRSS35	70318	SNAP91	126838	ME1	151802	False	False	False	ref	100	0.01172	-75	0.06805
3540	chr6	83583552	A	G	rs2022265	0.0521108046	0.2795659942526336	0.0521108046	0.2831902808549051	0.0359306800575053	0.1456221068207528	0.0019215701899032	0.1917135352804173	0.0019215701899032	0.1942252117450549	0.0238774702253307	0.5809894850970269	0.0012979176842567	0.4542419905147996	0.0012979176842567	0.4594816970914764	0.0008462025022777	0.4732018157494566	4.740589450900352e-05	0.3715568950504122	4.740589450900352e-05	0.3764680029731326	0.0037156477846325	0.4046232616745076	0.0037156477846325	0.4097760592576693	PRSS35	71017	SNAP91	126139	ME1	152501	False	False	False	alt	-60	0.02818	-55	0.08044
3541	chr6	83585701	G	A	rs2208335	0.199442492	0.0279970832559136	0.199442492	0.0281713556787244	0.0374011889751137	0.1372600250452501	0.0086510228565073	0.0358253887861948	0.0086510228565073	0.0360042410359491	0.0393479264953316	0.5263539822174093	0.0080694223526523	0.2084645627777638	0.0080694223526523	0.2117596420549253	0.0014636002450723	0.4153573169445901	0.000352652311778	0.1611865402343371	0.000352652311778	0.1636501423268876	0.0167472204810134	0.1374565461238282	0.0167472204810134	0.1395516971767431	PRSS35	73166	SNAP91	123990	ME1	154650	False	False	False	alt	-100	0.1252	-70	0.0742
3542	chr6	83590652	C	T	rs2324447	-0.03786080946	0.3675860055222205	0.03999460414	0.3639031904473834	0.0133743469355007	0.7491424957591708	-0.0006100815278212	0.4827453866156427	0.0006342534777948	0.4788143525991353	0.001603378311504	0.9372004642123932	-8.056460644030491e-05	0.8457731434573252	8.360926416332695e-05	0.84132075102921	2.460909663784428e-05	0.9437891915913754	-1.474085896085139e-06	0.8549109125223698	1.508576240724239e-06	0.8504421198279745	-0.0003076440896044	0.8351726060590985	0.0003224901850813	0.8307138896868925	PRSS35	78117	SNAP91	119039	ME1	159601	False	False	False	ref	-50	0.1293	100	0.0499
3543	chr6	83597609	T	C	rs2207944	-0.042859325	0.3587954380547689	0.042859325	0.3541739119487991	0.0201883334629562	0.4783947605278749	-0.0008779875838302	0.384043193699401	0.0008779875838302	0.3792527714688249	0.2741108838375506	0.1239020548151773	-0.0116456209623341	0.1478517905842865	0.0116456209623341	0.1452573357022802	0.0056166474687531	0.1459778458296046	-0.0002423817491285	0.1703548574886394	0.0002423817491285	0.1675658881822523	-0.0137054204744152	0.1617453197492274	0.0137054204744152	0.1589417338110446	PRSS35	85074	SNAP91	112082	ME1	166558	False	False	False	ref	-35	0.01706	85	0.358
3544	chr6	83634970	G	C	rs217331	0.0183808532	0.621689735749928	0.0183808532	0.6283073493575858	0.0087252684361022	0.945972048468013	0.0001638951973524	0.769213907204239	0.0001638951973524	0.7760188250020765	0.0022821747880307	0.911974052909821	5.0486363910064366e-05	0.8662088807402571	5.0486363910064366e-05	0.8730734054722338	1.9034119701786234e-05	0.9580944532107052	4.231245047939085e-07	0.908366900800928	4.231245047939085e-07	0.915315612313863	0.0001880505427072	0.8613272419877164	0.0001880505427072	0.8681004898772615	SNAP91	74721	PRSS35	122435	ME1	203919	False	False	False	alt	90	0.0749	-45	0.06836
3545	chr6	83654421	C	T	rs217311	0.02092609754	0.6067446203217927	0.02092609754	0.6127955797964968	0.0285298701687162	0.2508771051211081	0.0005507352727938	0.5242517853142237	0.0005507352727938	0.5297847127812256	0.0094033519184454	0.7547636107677812	0.0001724200008624	0.7568793749683393	0.0001724200008624	0.7632170748118458	0.0002899515277858	0.6874993841434728	4.835163357778229e-06	0.7029253124045877	4.835163357778229e-06	0.7091774049353137	0.0006111642637985	0.73760262235841	0.0006111642637985	0.7438356564370286	SNAP91	55270	PRSS35	141886	RIPPLY2	198940	False	False	False	alt	-75	0.01573	30	0.1168
3546	chr6	83665314	G	A	rs217303	-0.0460342081999999	0.3189432133344753	0.0460342081999999	0.3145221507416344	0.0325255073602181	0.1857906608343819	-0.0015131822774057	0.2305873569735934	0.0015131822774057	0.2273639158572699	0.0159867704793638	0.6481295622448628	-0.0007574411735921	0.5285753801831768	0.0007574411735921	0.5229166460011401	0.0005036271534297	0.5592084742226179	-2.389632020696991e-05	0.4550990017249037	2.389632020696991e-05	0.4495844636612944	-0.0024570288014251	0.4853953679363235	0.0024570288014251	0.4797810837127691	SNAP91	44377	PRSS35	152779	RIPPLY2	188047	False	False	False	ref	-100	0.02571	95	0.2627
3547	chr6	83692088	G	A	rs217289	0.171652118	0.0362651823129586	0.171652118	0.0366226458764752	0.0542818292100997	0.0434549148842922	0.009470141142973	0.023484498636106	0.009470141142973	0.0235251322256225	0.0216027184850383	0.6165710165822842	0.0043190389701254	0.2934219187083022	0.0043190389701254	0.297752620176352	0.001139584108511	0.4365743135087513	0.0002298068509315	0.1892759717191179	0.0002298068509315	0.1923640771745905	0.0100334861931311	0.2240869889872558	0.0100334861931311	0.2277305093570281	SNAP91	17603	RIPPLY2	161273	CYB5R4	167569	False	False	False	alt	0	0.0	-20	0.01221
3548	chr6	92391260	G	A	rs6917686	0.02063990168	0.5582098295442216	0.02443421248	0.5620253473660887	0.0271267041761987	0.2796707073977938	0.000592997535931	0.4669725081458635	0.0007003763653828	0.4702594935467599	0.0070230279436507	0.775932174399575	0.0001518760406574	0.7447624043509838	0.0001750498637745	0.7483881319112812	0.0001865005482989	0.7208162048984241	4.173386764338421e-06	0.6937771374238981	4.829204975623903e-06	0.6973917031179451	0.0005163142093629	0.7246787993586725	0.0006268351423575	0.7283583916994939	EPHA7	1028427	MAP3K7	1804174	BACH2	2094417	False	False	False	alt	-85	0.0327	85	0.02565
3549	chr6	92391262	T	C	rs6940316	0.0194960928199999	0.6048358138277584	0.01995299078	0.6092455104796276	0.0161698501802059	0.6353092298231939	0.0003010551241473	0.6420921692888069	0.000309627869877	0.646573814352648	0.0069372505031176	0.7773905376295686	0.00013646398077	0.7674703690601937	0.0001391602831939	0.7716156397497905	0.000112316128754	0.7922856409359932	2.12770610513474e-06	0.7781999215228387	2.1782966462717424e-06	0.7823621332007071	0.0004973441984757	0.752637039549532	0.0005121902939526	0.7566920387425896	EPHA7	1028425	MAP3K7	1804176	BACH2	2094419	False	False	False	alt	-85	0.02936	80	0.03848
3550	chr6	92397226	G	A	rs12193330	0.030548111	0.4540382153057562	0.030548111	0.4596508450009099	0.0336527819712082	0.1712700881324823	0.0010537401884308	0.3235569387324921	0.0010537401884308	0.3277058208234606	0.0100367853254593	0.7324002509503645	0.0003465125932596	0.6571867369455724	0.0003465125932596	0.6634386817565131	0.0003388107474188	0.6382568922689029	1.206267576105517e-05	0.5762440229221782	1.206267576105517e-05	0.5823472873032941	0.0011827389396588	0.6295488731374075	0.0011827389396588	0.6357998446290027	EPHA7	1022461	MAP3K7	1810140	BACH2	2100383	False	False	False	alt	40	0.006306	-85	0.05508
3551	chr6	92404307	C	T	rs1593657	-0.0516882026	0.2805791589336325	0.0516882026	0.276392734298638	0.0247866178340202	0.3365072414199346	-0.0013675913490106	0.2654062328368936	0.0013675913490106	0.2619541676019325	0.0190475404968492	0.6254095429136249	-0.0009271250230402	0.4997669601683841	0.0009271250230402	0.4942330714207645	0.0004356420478046	0.5963064019177043	-2.2328896975876103e-05	0.4739432906484358	2.2328896975876103e-05	0.4684382731375018	-0.0029172577612087	0.4559809100827935	0.0029172577612087	0.4504381477690242	EPHA7	1015380	MAP3K7	1817221	BACH2	2107464	False	False	False	ref	0	0.0	100	0.1094
3552	chr6	92413581	T	C	rs1346296	0.168893184	0.036483114600851	0.168893184	0.036888699757377	0.0351994902301002	0.1522957869843214	0.0060303211376989	0.0439000659784354	0.0060303211376989	0.0443337592892303	0.0060019464880736	0.7995283425930253	0.0011371925321428	0.4649498883315246	0.0011371925321428	0.4705718278550029	0.0002158644005966	0.7048125473741181	4.1637124941676045e-05	0.3819549435780307	4.1637124941676045e-05	0.3871712086648702	0.003289234931213	0.4269382975224814	0.003289234931213	0.4324322162517645	EPHA7	1006106	MAP3K7	1826495	BACH2	2116738	False	False	False	alt	100	0.04794	-100	0.1492
3553	chr6	92416645	C	A	rs6919658	-0.0247594571	0.5252352407702723	0.0247594571	0.5192802409336909	0.0278254832531306	0.2646907913168972	-0.000699694537674	0.4360521847172277	0.000699694537674	0.4311856476812966	0.0295049651941538	0.5364280663584163	-0.0006330599493572	0.5666773570081287	0.0006330599493572	0.5607556855956727	0.0008147719014652	0.4754432429514966	-1.7898545150933168e-05	0.5117800151395714	1.7898545150933168e-05	0.5059543800164187	-0.0020240176833492	0.5404115184611569	0.0020240176833492	0.5342200064275802	EPHA7	1003042	MAP3K7	1829559	BACH2	2119802	False	False	False	ref	5	0.005466	-40	0.0625
3554	chr6	92422743	T	A	rs142115373	-0.1594767272	0.0409530801216609	0.1594767272	0.0404878893745792	0.0284796331208109	0.2533241188400839	-0.0046226065195612	0.0640242863388059	0.0046226065195612	0.0633304409538353	0.000886641813203	0.9735098371574648	-0.0001502078906021	0.7653578956716433	0.0001502078906021	0.7587569947140245	2.701035326080954e-05	0.9454312522961872	-4.663403415929267e-06	0.7067177691897667	4.663403415929267e-06	0.7003753368382432	-0.0004239385041733	0.7865965788332286	0.0004239385041733	0.7799404040154047	EPHA7	996944	MAP3K7	1835657	BACH2	2125900	False	False	False	ref	-85	0.02124	-65	0.2345
3555	chr6	92605639	C	A	rs139659029	-0.0780175028	0.1686146658394431	0.0780175028	0.1659940207602851	0.0245570031120098	0.3420432006756223	-0.0019760254455137	0.1867615037293805	0.0019760254455137	0.184083502947918	0.0056687341229256	0.8261080330460194	-0.000570145900807	0.6225913739169737	0.000570145900807	0.6165319543960099	0.0001470602639821	0.7836092269330642	-1.5229182394555052e-05	0.5829496501029945	1.5229182394555052e-05	0.5770314138235706	-0.0016495661640988	0.5965593328718454	0.0016495661640988	0.590595226667748	EPHA7	814048	MAP3K7	2018553	BACH2	2308796	False	False	False	ref	20	0.00029	0	0.0
3556	chr6	95985497	C	A	rs648204	0.0062828606799999	0.7595867761038714	0.01050438592	0.7619640095220932	0.0313806930956465	0.2033797805711424	0.0002241831084877	0.6001318276752193	0.0003456735684987	0.6028644782642751	0.001636369634786	0.9341625952030896	1.5684712334006276e-05	0.9203794391093184	1.97096766871366e-05	0.9222202010233036	5.287402555850796e-05	0.8797485137586192	5.558461786684865e-07	0.8755026782800729	6.651596060792307e-07	0.8775405333427435	8.330309128697636e-05	0.903726302227779	0.000101448319092	0.905545595441724	FUT9	30478	MANEA	408011	UFL1	536099	False	False	False	alt	45	0.0072	80	0.055
3557	chr6	95987504	C	T	rs586541	0.0139358352599999	0.6913609375890838	0.0139358352599999	0.6980613402166579	0.0170821376251127	0.5966354379305236	0.000245908946065	0.680681192748437	0.000245908946065	0.6873125046901989	0.0038162713206426	0.861923725865603	5.243385580737551e-05	0.8516718512312775	5.243385580737551e-05	0.8585777713211631	6.428915887226626e-05	0.865104052873649	9.12078970426872e-07	0.8488082941263875	9.12078970426872e-07	0.8555789249182929	0.0002325888291379	0.8347662576796635	0.0002325888291379	0.8416293686370936	FUT9	28471	MANEA	410018	UFL1	534092	False	False	False	alt	65	0.04343	90	0.0749
3558	chr6	95990739	G	A	rs910025	0.0198239907	0.6048324367805146	0.0206468260999999	0.6094739750376834	0.0569991852458639	0.0365916389476608	0.0010435397754887	0.3372114362438305	0.0010959772451619	0.3400938944791722	0.0859588928111906	0.3336384535207484	0.0017257079033684	0.4198180016912851	0.0017893628865481	0.4232976216021283	0.0049190313501129	0.1656452924122672	9.205383484092078e-05	0.2842833826363367	9.611042524375105e-05	0.2872286137874948	0.0036620368842994	0.4167786114568456	0.0038121474052323	0.4206115451505909	FUT9	25236	MANEA	413253	UFL1	530857	False	False	False	alt	100	0.02573	100	0.074
3559	chr6	95991154	G	T	rs474447	0.0201702436	0.1917586840466585	0.074770736	0.1920672736326126	0.0406818037381663	0.1038300432274944	0.0007425291697157	0.1320717783388263	0.0028928368933713	0.1323866075257684	0.2918478440170235	0.1171543396418619	0.0106222475604299	0.0908161563593843	0.0235275649382814	0.0912699777215777	0.0120970545983519	0.0620625814461552	0.0003801390361121	0.0706593581252778	0.0009353440897059	0.0710330607124018	0.007977301969582	0.0967745091799588	0.0223054336709444	0.0970579420527725	FUT9	24821	MANEA	413668	UFL1	530442	False	False	False	alt	-20	0.006195	-85	0.1726
3560	chr6	95993615	G	T	rs675629	0.0074634614999999	0.7319523049983827	0.0119963123	0.735787590907097	0.0176540425278972	0.5752530428751603	0.0001484623476253	0.7137440486454784	0.0002196068555478	0.7177838825877947	0.0071987067401272	0.7845238248844356	8.89769549277421e-05	0.7972541933565478	0.0001142313245227	0.8010390055159843	0.000142700406434	0.7829698540642785	1.980989748050151e-06	0.7919038789169335	2.377364950960564e-06	0.7956955835078746	0.0002829005971429	0.7852482824278916	0.0004264128534195	0.7889657970063101	FUT9	22360	MANEA	416129	UFL1	527981	False	False	False	alt	-45	0.01135	-95	0.1299
3561	chr6	95994527	G	T	rs582112	-0.0206593716	0.5452725961235645	0.0241982204	0.5414485688681498	0.0151455616579766	0.6785410143788427	-0.0003582208958883	0.5894191493871429	0.0004022553193514	0.5854907372776493	0.0102330836989871	0.7243716752056046	-0.0001635527673035	0.7133372166171323	0.0001968706712163	0.7095494707308341	0.0001424399006018	0.7608425022102535	-2.660338710931963e-06	0.7335893872894863	3.0749183551466106e-06	0.7297705418411654	-0.0005649764112038	0.702527482744067	0.0007051895351522	0.6986951995558555	FUT9	21448	MANEA	417041	UFL1	527069	False	False	False	ref	-75	0.1531	-70	0.08545
3562	chr6	96001717	A	G	rs595200	0.1084950272	0.0914341542295087	0.1084950272	0.0928263916278161	0.0156560405490431	0.6611446077058729	0.0017264285182541	0.1994955357115411	0.0017264285182541	0.2022790062329616	0.0682021378377486	0.4024641701776432	0.0086563760053632	0.1969546923187308	0.0086563760053632	0.2004610159595813	0.0010946444228267	0.4504759092608586	0.0001398592268449	0.2466999651936514	0.0001398592268449	0.2505878994335165	0.0172717825211968	0.1320386568778151	0.0172717825211968	0.1341255210921508	FUT9	14258	MANEA	424231	UFL1	519879	False	False	False	alt	90	0.1229	-60	0.08044
3563	chr6	96012692	C	T	rs17592255	0.0137194206	0.701245887936393	0.0137194206	0.7077252770296906	0.0147634764552297	0.7027448219348328	0.0002119348613152	0.721346911791663	0.0002119348613152	0.7279392755108293	0.002671472402758	0.8933592301070227	3.594262220257596e-05	0.8772550076034962	3.594262220257596e-05	0.8841371894983625	4.02042659688562e-05	0.9061995176306756	5.60664550870653e-07	0.8829204272974495	5.60664550870653e-07	0.88994866763089	0.0001459866055227	0.8703803832337815	0.0001459866055227	0.8773018181580985	FUT9	3283	MANEA	435206	UFL1	508904	False	False	False	alt	-95	0.0343	100	0.07874
3564	chr6	96028152	A	G	rs6926151	-0.0298927879999999	0.4733224383391137	0.0298927879999999	0.4676385753334522	0.0184777729514275	0.5401541155392071	-0.0005392566224615	0.4926149540317736	0.0005392566224615	0.4867265298856689	0.0205915344264458	0.607763868131906	-0.000556775840349	0.567153621605431	0.000556775840349	0.5613992258700959	0.0003854772735152	0.613046433578635	-1.0279201033824317e-05	0.5707107383412154	1.0279201033824317e-05	0.5648015308762327	-0.0018268945267394	0.5373696775667426	0.0018268945267394	0.5315966215280471	FUT9	12177	MANEA	450666	UFL1	493444	False	False	False	ref	70	0.01088	-100	0.1087
3565	chr6	104917850	C	T	rs1933801	-0.003564838134	0.5919842959993658	0.021608601334	0.5905781610878337	0.0126678672350713	0.7890034071649615	-5.125303461312051e-05	0.6706860458716085	0.0002997211633121	0.6693053694745392	0.0091188017551383	0.7604107277814579	-0.0001406057654447	0.7523919577655575	0.0002648772251116	0.7509669180518918	0.0001163405762508	0.8074133210041609	-1.7380211969297382e-06	0.7808531260769254	3.5119030663306483e-06	0.7793865964539259	-0.0004000197947939	0.7320305477937483	0.0008157104681468	0.7305010119465033	LIN28B	18767	HACE1	57931	BVES	219307	False	False	False	ref	-60	0.010284	60	0.03503
3566	chr6	104929472	C	T	rs9391254	-0.1069275894	0.0990786099064958	0.1069275894	0.0978339464060678	0.0294638433658002	0.2334297356559762	-0.0033624061292437	0.1076311952369477	0.0033624061292437	0.1064136429281849	0.0042047441522879	0.8506644479386991	-0.0004585631164737	0.6130364093822649	0.0004585631164737	0.6071954558604049	0.0001239749179657	0.7891303645026831	-1.3958100406280311e-05	0.5477749082761718	1.3958100406280311e-05	0.5419462190104755	-0.0014796608491966	0.5917951811349917	0.0014796608491966	0.5856999781995836	LIN28B	7145	HACE1	69553	BVES	207685	False	False	False	ref	-10	0.002434	100	0.1743
3567	chr6	104931079	C	T	rs7759938	-0.23085019	0.0169594252866365	0.23085019	0.0168275219576312	0.0232349517608314	0.376411592651347	-0.0055695929970613	0.0508843972816101	0.0055695929970613	0.0504318247692791	0.1556101745241001	0.2199099320285735	-0.0362446869678485	0.0435739762026583	0.0362446869678485	0.0427511018292632	0.0036946995566206	0.2104359767154138	-0.0008900405104434	0.0599933343278428	0.0008900405104434	0.0589494911845173	-0.0558864768565866	0.0169328665308686	0.0558864768565866	0.0167180056464792	LIN28B	5538	HACE1	71160	BVES	206078	False	True	False	ref	100	0.03943	100	0.09863
3568	chr6	104942692	C	T	rs314265	-0.0828541568	0.1523323458540572	0.0828541568	0.1500361729199514	0.0684561232449092	0.0190580180627738	-0.0057304562551182	0.0501580110933611	0.0057304562551182	0.0496814365679909	0.0240482003233149	0.5878111038235218	-0.0024402500773413	0.3836180411948715	0.0024402500773413	0.3785136977899701	0.0016426677504332	0.3631415731067445	-0.0001693617245176	0.2299346512129974	0.0001693617245176	0.2261674962905521	-0.0064704232786776	0.3135297029107536	0.0064704232786776	0.3088909057938214	LIN28B	6075	HACE1	82773	BVES	194465	False	True	False	ref	45	0.007263	-55	0.0642
3569	chr6	104961091	T	C	rs314275	-0.0608844292	0.2296728474073466	0.0608844292	0.2262404438662587	0.0481585532285545	0.0630588353490073	-0.002942834750615	0.1128825419313241	0.002942834750615	0.1113666657244328	0.0032455214278644	0.8728912462736913	-0.0001942588492944	0.7112604719343946	0.0001942588492944	0.7048660419335965	0.0001565470347744	0.7482511549138218	-9.424096551488055e-06	0.5818122951246892	9.424096551488055e-06	0.5757767698692384	-0.0007150869321367	0.6952838453598128	0.0007150869321367	0.6888989249521313	LIN28B	24474	HACE1	101172	BVES	176066	False	False	False	ref	30	0.00203	-35	0.02148
3570	chr6	105005542	A	C	rs314261	0.145565082	0.0571421735964508	0.145565082	0.0578704559486041	0.0419131337550892	0.0967806486920502	0.0067245420759486	0.0470808763302562	0.0067245420759486	0.0473887860441078	0.0303363465408597	0.589510836617625	0.0071319504564827	0.2847973227784349	0.0071319504564827	0.2886927184860446	0.0015015038557421	0.4372777747320466	0.0003685138474478	0.2081559079698441	0.0003685138474478	0.2113549361065937	0.0134662333806208	0.2084611599877399	0.0134662333806208	0.2114297153402771	LIN28B	68925	BVES	131615	HACE1	145623	False	False	False	alt	90	0.02704	90	0.0443
3571	chr6	105009311	T	G	rs314260	-0.00764477342	0.8431358340111587	0.00764477342	0.8364873930661804	0.0165291782947307	0.6204232993195985	-0.0001211427945903	0.839854165555415	0.0001211427945903	0.8332423587208164	0.0017749331925703	0.9347789818371378	-1.4897821886919506e-05	0.9540435513488912	1.4897821886919506e-05	0.9470351417548284	2.826684756923904e-05	0.9356081845781368	-2.2725775794212177e-07	0.9535792481751888	2.2725775794212177e-07	0.946626533769041	-6.51578634818873e-05	0.9448779196426996	6.51578634818873e-05	0.9378425606886712	LIN28B	72694	BVES	127846	HACE1	149392	False	False	False	ref	-100	0.02184	-100	0.0863
3572	chr6	105017065	T	C	rs191135	-0.0293039744	0.4917909701324141	0.0293039744	0.4859853577858669	0.0219671208482992	0.4068759969945579	-0.0006283751655028	0.4748335410348096	0.0006283751655028	0.4691337502705089	0.0025642506020916	0.8997112427678889	-6.95071681882192e-05	0.8362152309849863	6.95071681882192e-05	0.8294409241262815	6.364809952307045e-05	0.871163333803913	-1.7183316694282263e-06	0.810255271933738	1.7183316694282263e-06	0.8036638698236619	-0.0002812510309788	0.8220818178935165	0.0002812510309788	0.8153129853344508	LIN28B	80448	BVES	120092	HACE1	157146	False	False	False	ref	-100	0.10913	-70	0.2578
3573	chr6	107772376	C	T	rs6909292	-0.39867434	0.0036719905697731	0.39867434	0.0036681373959115	0.078840669371125	0.0111635318718924	-0.0315504045400696	0.0029167548102404	0.0315504045400696	0.0029242610471441	0.1846780046847678	0.1945341011916992	-0.0765986666765442	0.0154882761949077	0.0765986666765442	0.0153369826075081	0.0148533913849062	0.0431678467623224	-0.0061656510334932	0.0070267664899595	0.0061656510334932	0.0069675924175411	-0.0975264755369337	0.0048793839586919	0.0975264755369337	0.0048276287635897	SCML4	51941	SEC63	185832	SOBP	282269	False	True	True	ref	-60	0.02533	-60	0.3247
3574	chr6	107775325	T	C	rs7741285	-0.01761630572	0.6201820026605783	0.01855985628	0.6156042560126619	0.0175790663830428	0.5777525351530493	-0.0003150494454841	0.6321336210803132	0.0003302927918473	0.6275197028723806	0.0977310217412819	0.3183687218822876	-0.0010529774340229	0.4521986409573418	0.001233856272607	0.4483921656073255	0.0016493496642129	0.3564913934916422	-1.832730185904603e-05	0.4703242852378756	2.124945452513428e-05	0.466474523187835	-0.0027316815677476	0.4563401297982949	0.0030022104186598	0.4524498993969012	SCML4	48992	SEC63	182883	SOBP	285218	False	False	False	ref	-100	0.178	-100	0.6895
3575	chr6	107795478	C	T	rs9400146	-0.01659365326	0.6619644969389961	0.01659365326	0.6552555358019958	0.0152293938804447	0.6789439680305105	-0.0002447091437968	0.7023941505361339	0.0002447091437968	0.6957118115129289	0.00270446372604	0.8955498221834275	-4.564697756029645e-05	0.8782804926518297	4.564697756029645e-05	0.8714109991049379	4.3045140555865184e-05	0.9031424331416829	-7.126021072120554e-07	0.8842258645147478	7.126021072120554e-07	0.8772681052188196	-0.0001954735904456	0.8642642892033541	0.0001954735904456	0.8573937702134308	SCML4	28839	SEC63	162730	SOBP	305371	False	False	False	ref	75	0.02722	-100	0.0963
3576	chr6	107843577	G	A	rs75971958	-0.0980136458	0.1124318431349044	0.0980136458	0.1110088400720822	0.0225034342984185	0.4013646295324989	-0.0022794522888159	0.1623078736923283	0.0022794522888159	0.16009599547877	0.0394782422222955	0.5104592152976963	-0.0040423245706043	0.3048759099317282	0.0040423245706043	0.3003124761471503	0.0008811280324864	0.4895851416659787	-9.152667116134222e-05	0.3029872721037263	9.152667116134222e-05	0.2987132743449872	-0.0097769786546137	0.2333376384359045	0.0097769786546137	0.2297319503019036	SCML4	19260	SEC63	114631	OSTM1	322277	False	False	False	ref	100	0.03055	35	0.0663
3577	chr6	107845511	T	G	rs75280747	0.0104798872	0.5214732200098552	0.0269896752	0.5229057736940249	0.0156249147478498	0.6469110236825081	0.000135295642717	0.5994647679720776	0.0003819709500877	0.6006353065089196	0.0216068424004486	0.5910552233522527	0.0002380042460497	0.5782483369260828	0.000579887423088	0.5795454216307744	0.0003231917097256	0.6321215266748049	3.1814604983378734e-06	0.612436239482407	8.083961870713194e-06	0.6136665603304241	0.0006985912704958	0.5561111229374313	0.00177080927716	0.5574900238055935	SCML4	21194	SEC63	112697	OSTM1	320343	False	False	False	alt	-100	0.09735	-60	0.0553
3578	chr6	107846542	A	G	rs9386678	-0.03930409558	0.4049487030710963	0.04188404462	0.4019221145636881	0.0508147709505256	0.0531731992357023	-0.0021675524784828	0.2354826351996819	0.0022985427331474	0.234196854864211	0.004557751311405	0.8535325541348727	-0.000316183657355	0.754371344108329	0.0003184285900931	0.750341840142974	0.0002422492081502	0.7143714871187807	-1.760640526169361e-05	0.6288601160586933	1.77203859276821e-05	0.6247627646937013	-0.0009592227244234	0.731572758550431	0.0009707696875721	0.7273497864075874	SCML4	22225	SEC63	111666	OSTM1	319312	False	False	False	ref	60	0.02867	70	0.0313
3579	chr6	108445865	C	T	rs2355851	0.01063691642	0.75207693307412	0.01063691642	0.7588975231504916	0.0162482119442288	0.6356407768461735	0.0001757244248562	0.752429078609789	0.0001757244248562	0.7590621684634286	0.0099303883078749	0.7361833677372297	8.59825933113047e-05	0.79697303227126	8.59825933113047e-05	0.803811893976325	0.0001602498193381	0.7540840784091274	1.4137928429031332e-06	0.801071903760655	1.4137928429031332e-06	0.8078639953864102	0.0003406354128863	0.7901432981498563	0.0003406354128863	0.7968919440274927	FOXO3	113971	AFG1L	150873	SNX3	184619	False	False	False	alt	-100	0.0672	-95	0.348
3580	chr6	108447854	A	G	rs7762665	0.0761010262	0.1706558934592721	0.0761010262	0.1732645162996888	0.020554766452677	0.4643487896401627	0.0016793824331356	0.2214656873274263	0.0016793824331356	0.2247419546709773	0.0407129424961235	0.4824123771461259	0.0031794737387378	0.3122832561586656	0.0031794737387378	0.3169729421176146	0.0008496254019684	0.477931404481751	7.079887134530015e-05	0.3170521854072018	7.079887134530015e-05	0.3216360650213775	0.0078387384117976	0.2525632481589979	0.0078387384117976	0.256721903081602	FOXO3	111982	AFG1L	152862	SNX3	186608	False	False	False	alt	100	0.0074	40	0.07434
3581	chr6	108453769	A	G	rs6568544	-0.216440742	0.0213921654505762	0.216440742	0.0212014606191657	0.0625029190330022	0.0268151108006323	-0.0138318965741109	0.0133354644026444	0.0138318965741109	0.0132719509550195	0.1986861205502952	0.176556133170235	-0.0444851775890154	0.0352096822641699	0.0444851775890154	0.0345630641005344	0.0125079341728482	0.0540527302839362	-0.0028451579545341	0.0181618525019373	0.0028451579545341	0.0180109598378325	-0.0609003332123651	0.0147590527543156	0.0609003332123651	0.0146184546236272	FOXO3	106067	AFG1L	158777	SNX3	192523	False	False	False	ref	-50	0.003418	90	0.3015
3582	chr6	108598524	G	A	rs78061564	0.0584604315	0.231217753578351	0.0584604315	0.2345412583907712	0.0627696702939742	0.0262999409624327	0.0035480889734143	0.1013584953751065	0.0035480889734143	0.1024671684566018	0.3694310646300023	0.0803132295322341	0.0196523823120216	0.0934009441956078	0.0196523823120216	0.095279054998674	0.0233288216162424	0.0172606335947016	0.0011860800720957	0.049200846950902	0.0011860800720957	0.050019600295353	0.0199308831777242	0.1065401326149964	0.0199308831777242	0.1083846473479443	FOXO3	38688	ARMC2	249893	AFG1L	303532	False	False	False	alt	-65	0.02466	-65	0.04785
3583	chr6	108673623	G	A	rs9398172	-0.069100987	0.191583105785764	0.069100987	0.1887331454110547	0.0278412731689822	0.2661163844414349	-0.0019509012574777	0.1789875616000419	0.0019509012574777	0.1766995280099281	0.0096681072877832	0.7518560433346936	-0.0006315531489358	0.5703325621515776	0.0006315531489358	0.5641676708161197	0.0002923005090861	0.6896534041728452	-1.9499961846761327e-05	0.5142978157147055	1.9499961846761327e-05	0.5083330345217909	-0.0021683547227078	0.5293821585670516	0.0021683547227078	0.5232260096429443	FOXO3	113787	ARMC2	174794	AFG1L	378631	False	False	False	ref	90	0.0533	50	0.1719
3584	chr6	108675545	T	G	rs3800228	0.0101143887399999	0.5609327750228884	0.0222961233399999	0.5621554596358793	0.0113894013905656	0.8503337347197154	0.00016462455047	0.6821106643812805	0.0002801590051228	0.6837435304946787	0.0694120946191151	0.3772387284145106	0.0002588446745638	0.4465103117475215	0.0013969008996261	0.4471553840026736	0.000726130822608	0.4937012786870474	6.176649349774483e-06	0.5303871443634057	1.5960128187549195e-05	0.5316418343216535	0.0008033387219161	0.4375410901602778	0.0033090297251822	0.4383810053802663	FOXO3	115709	ARMC2	172872	AFG1L	380553	False	False	False	alt	-100	0.0699	-100	0.0751
3585	chr6	108676232	G	A	rs9374040	-0.0393024695	0.34787976708476	0.0445297556999999	0.345415607285331	0.0351159603248035	0.1530525739192955	-0.0014514662926277	0.2603799617731877	0.0016209959943883	0.2588491538015056	0.2294538286430668	0.1542906874660315	-0.0089723203044616	0.1819210770849444	0.0102406680530252	0.1804198201720909	0.0081074964953939	0.0987822741431587	-0.0003341446775449	0.1462259909103951	0.000375085161469	0.1451690764548592	-0.012316485764244	0.180187174604481	0.0138258388043944	0.1788890496690381	FOXO3	116396	ARMC2	172185	AFG1L	381240	False	False	False	ref	-70	0.0418	-40	0.04883
3586	chr6	108676408	G	A	rs9400240	0.00705163488	0.8373166291159421	0.0074594121999999	0.8416589499580264	0.0149697255464624	0.6936395172115254	0.000103159302838	0.8483721181454589	0.0001094368566439	0.8526708860653582	0.2199861436442215	0.1621132892366348	0.0014582510108768	0.4402752334567503	0.0015526094636836	0.4435384824973259	0.0032488730578967	0.2321070667786983	2.114061670957975e-05	0.4844247076439413	2.259322393797929e-05	0.4881136794916157	0.0019984494078057	0.5287510404474096	0.0021469103625746	0.5325745944250618	FOXO3	116572	ARMC2	172009	AFG1L	381416	False	False	False	alt	-90	0.1034	-100	0.765
3587	chr6	108677063	A	G	rs3800231	0.06944072058	0.2051503128105498	0.06944072058	0.2081904768453306	0.0280540188539182	0.2619382389178769	0.0022605509845288	0.1871626466953936	0.0022605509845288	0.1894905252864671	0.04175794266108	0.491908988934682	0.0028432677982554	0.3701559463838855	0.0028432677982554	0.3748527516790298	0.0011303520383689	0.437208886480126	8.61975428099421e-05	0.3247094519171038	8.61975428099421e-05	0.3291836184291864	0.0068712678565536	0.3069398268541551	0.0068712678565536	0.311336209231722	FOXO3	117227	ARMC2	171354	AFG1L	382071	False	False	False	alt	75	0.003387	-100	0.1873
3588	chr6	108682786	C	A	rs9400241	-0.260814488	0.0122272772678773	0.260814488	0.0121138569241456	0.0500300924281557	0.0563191348994542	-0.0133031813121139	0.0130509648148563	0.0133031813121139	0.0130094785796028	0.1451519250437134	0.2326776158978945	-0.0379242211231848	0.0400944458887732	0.0379242211231848	0.0393836174376232	0.0072805279712373	0.1107762345299294	-0.0019397184435607	0.0259677558809195	0.0019397184435607	0.0256045927799211	-0.0596045989904654	0.0140939484090385	0.0596045989904654	0.0139472209315806	FOXO3	122950	ARMC2	165631	AFG1L	387794	False	True	False	ref	85	0.08234	-55	0.05444
3589	chr6	111460451	A	G	rs112540208	-0.001977729932	0.7320376971909344	0.0117704051079999	0.7301424806108017	0.0138000555886166	0.7381989989832661	-5.186654684245468e-05	0.7658838976152577	0.0001679673877039	0.7639444680043124	0.0057817294051664	0.801622212216435	-8.338384179881029e-06	0.8404242237484545	6.989645923855968e-05	0.8386732343503555	7.96663544186821e-05	0.8348714660827571	-2.672346495891675e-07	0.8546095830370877	9.970598809516863e-07	0.8527763537941548	-7.42304773844305e-05	0.830199987044132	0.0002870245125531	0.8285474178190864	REV3L	23264	TRAF3IP2	146455	MFSD4B	201123	False	False	False	ref	-65	0.03156	5	0.01593
3590	chr6	111490719	T	C	rs9320364	-0.27585111	0.0107204301160539	0.27585111	0.0106529958406865	0.0574255698927423	0.0355905137421811	-0.015959662729525	0.0096318935349407	0.015959662729525	0.0095899697097752	0.0053858335257826	0.8190523421039946	-0.0016345518060921	0.4246522420188562	0.0016345518060921	0.419269194324222	0.0003173462353818	0.6538199028567475	-9.734619138348248e-05	0.2816980069638964	9.734619138348248e-05	0.2774325933748268	-0.0038938009303552	0.4074857272734099	0.0038938009303552	0.4021380053527879	REV3L	7004	TRAF3IP2	116187	MFSD4B	231391	False	True	False	ref	20	0.004562	35	0.01593
3591	chr6	111501152	G	A	rs7746225	-0.002953569968	0.6689374439168556	0.015352596768	0.6686932149279756	0.1085940375419655	0.0032227401426415	-0.0006127864324498	0.2346840731370547	0.0016927314632174	0.2346331522981485	0.0045800204546203	0.8544415072636263	-7.021114864938978e-05	0.8386480823395356	8.539249317162868e-05	0.8386918943674878	0.0006046618453921	0.5972964808425785	-1.0115924380823125e-05	0.6521321374390439	1.1402935027867595e-05	0.6503503391283888	-0.0002721784170762	0.8239429860772263	0.0003398106298043	0.8235247170507664	REV3L	17437	TRAF3IP2	105754	MFSD4B	241824	False	False	False	ref	75	0.01685	80	0.1241
3592	chr6	111501486	A	G	rs9487653	-0.0035460285999999	0.7635299980920445	0.0105572366	0.7622517708959853	0.0143088200411663	0.7199590781286694	-5.847537344846956e-05	0.798236592725226	0.0001438876120401	0.7970505448100422	0.0045866187192767	0.8678979266010282	-2.5314863913828064e-05	0.8771798926821429	5.364945768234092e-05	0.8759651552591453	8.333526187232766e-05	0.8810168016544291	-5.990373894734818e-07	0.8861512588630206	9.408227409403512e-07	0.8851553717204375	-6.433308039985085e-05	0.8719028098800928	0.0001962983735277	0.8707099203958736	REV3L	17771	TRAF3IP2	105420	MFSD4B	242158	False	False	False	ref	70	0.04703	-100	0.11304
3593	chr6	111515841	T	A	rs9320366	-0.0038951409	0.7908448883741664	0.01013964142	0.7897246288429888	0.0714741377602664	0.0197274898854443	-0.0001322943529573	0.4448475200342525	0.0009257330124879	0.4439032804925606	0.0025700240836659	0.9013137577612405	2.344414580082804e-06	0.9305295116032426	2.6069271253795955e-05	0.9295040586490458	0.0002131157330703	0.7368842020110347	9.719652076832353e-07	0.8179649133772834	2.7316115647236527e-06	0.8171187796521099	1.237174623073968e-05	0.9371247825279384	7.340569430239689e-05	0.9361531797437812	REV3L	32126	TRAF3IP2	91065	MFSD4B	256513	False	False	False	ref	60	0.05383	30	0.0345
3594	chr6	111574657	T	C	rs4945884	0.209957394	0.0253173793575059	0.209957394	0.0255547286746526	0.0412957723476342	0.1027025526358392	0.0093899111247112	0.0291200461548727	0.0093899111247112	0.0293109426662477	0.09713057965755	0.322051030905734	0.0246285776049992	0.0865278025121888	0.0246285776049992	0.0882830330852439	0.0044532637978589	0.2013145357025732	0.0012292445642336	0.0655119076772206	0.0012292445642336	0.0666661592649665	0.0397429975916333	0.0418309679869289	0.0397429975916333	0.0425522904589043	TRAF3IP2	32249	REV3L	90942	FYN	298795	False	False	False	alt	-10	0.003662	-10	0.02148
3595	chr6	113065866	C	T	rs12214623	-0.148857915	0.048394800093098	0.148857915	0.0479334908080271	0.0188708097000556	0.5253245915039766	-0.0028394571244785	0.1183182783267046	0.0028394571244785	0.116898199134541	0.2465680775955923	0.1411313626688997	-0.0346468320824317	0.0450752637175406	0.0346468320824317	0.0441831532841974	0.0046751505329438	0.1724029902792663	-0.0006647997899127	0.0734019063934259	0.0006647997899127	0.0720668421194246	-0.0445902477648377	0.0261977380425579	0.0445902477648377	0.0258811086224995	RFPL4B	718535	MARCKS	791480	LAMA4	810927	True	False	False	ref	-5	0.002686	-30	0.03467
3596	chr6	113082872	C	A	rs1592148	-0.2678210959999999	0.0129622995917724	0.2678210959999999	0.012887349711912	0.0568701633740087	0.0370353522209709	-0.0155435168603635	0.0111790598939902	0.0155435168603635	0.011173388083936	0.1684223549206558	0.2054106289409208	-0.0480984830808587	0.0329977617571397	0.0480984830808587	0.0323080650362932	0.0097029640546071	0.0781118769100014	-0.0027997526835808	0.0194895375868059	0.0027997526835808	0.0191542044946491	-0.067708092771601	0.0118282950876728	0.067708092771601	0.0117049874912542	RFPL4B	735541	MARCKS	774474	LAMA4	827933	False	True	False	ref	-15	0.02197	80	0.3438
3597	chr6	113086653	C	A	rs6568750	-0.0057799531799999	0.4824472191682676	0.03032158802	0.482026857561264	0.0144512544465223	0.6895922835045625	0.0001187599235554	0.5702873901324927	0.0004993869137302	0.5705781326720663	0.0050814885685064	0.8454499083965396	-6.614708079983624e-05	0.8230508739364032	0.0001026500019269	0.8236008432109151	6.624752255773571e-05	0.8855564609137044	-5.077217892834897e-07	0.849239267476409	1.1888108996095493e-06	0.8499171150179211	-0.0002301144798917	0.820341377342605	0.0003554815083632	0.8208636664165972	RFPL4B	739322	MARCKS	770693	LAMA4	831714	False	False	False	ref	-100	0.04745	100	0.10956
3598	chr6	113092775	C	T	rs7738702	-0.057746053	0.2472021838313287	0.057746053	0.2437567356244802	0.0250311630483006	0.3313716523977441	-0.0015381632651983	0.2426236088412454	0.0015381632651983	0.2395331523393193	0.0101860710633102	0.727664696511899	-0.0005241370957438	0.5793189927697211	0.0005241370957438	0.5733381288071605	0.0002413942581152	0.685326367348154	-1.340424904401175e-05	0.5397604576041017	1.340424904401175e-05	0.5339455802722135	-0.0018301936590676	0.5429927389254414	0.0018301936590676	0.5369920342850196	RFPL4B	745444	MARCKS	764571	LAMA4	837836	False	False	False	ref	55	0.08124	45	0.01407
3599	chr6	113140926	T	A	rs6937893	0.0196828823999999	0.3330059383528204	0.0466294067999999	0.3335378439055402	0.0391944519853679	0.1151676567292979	0.0009607341610347	0.2197939871494041	0.0018958766433553	0.2203293681250212	0.0072877833129886	0.7716779324460378	0.0002535526025111	0.6408397988802074	0.0004522242501957	0.6423923175529045	0.0002903606491462	0.6562284207999524	1.18757360690868e-05	0.5398770441536636	1.878040129356975e-05	0.5414698263673834	0.0007200356306291	0.5985251543859729	0.0015563656758272	0.6001460727571588	MARCKS	716420	RFPL4B	793595	HDAC2	870382	False	False	False	alt	20	0.00964	25	0.00891
3600	chr6	113142050	C	T	rs13218679	-0.0377096694	0.3957163403933271	0.0377096694	0.3905758585222554	0.0096110001339135	0.920188708100442	-0.0003857328821153	0.6000576026431379	0.0003857328821153	0.5935940507133344	0.0730510375771172	0.3895737925600061	-0.0025419215827795	0.3626895579972142	0.0025419215827795	0.357987779409578	0.0006773052962677	0.5345790297609039	-2.425427030241921e-05	0.4753476089194827	2.425427030241921e-05	0.4699138843596324	-0.0053973804889313	0.3352681899836477	0.0053973804889313	0.3306941463740998	MARCKS	715296	RFPL4B	794719	HDAC2	869258	False	False	False	ref	-95	0.01772	-90	0.10736
3601	chr6	113147292	G	A	rs2502388	-0.078826304	0.1552175300130817	0.078826304	0.1528376098714026	0.0260251016178967	0.3048139511073909	-0.0020349423580128	0.1657747393935658	0.0020349423580128	0.1634381463725965	0.0393726699877931	0.4880046327683415	-0.0031608223479288	0.3121024607748247	0.0031608223479288	0.307537285818657	0.0010325373043021	0.4392248347226849	-8.24093010769951e-05	0.287329892228213	8.24093010769951e-05	0.2829671836178636	-0.0081546303322225	0.2475100399386492	0.0081546303322225	0.2434092683735514	MARCKS	710054	RFPL4B	799961	HDAC2	864016	False	False	False	ref	-25	0.01361	-100	0.0992
3602	chr6	113155934	C	G	rs13195261	0.137934398	0.0574153273940204	0.137934398	0.0582478188962621	0.0239174280512333	0.3590581100976813	0.0034172649312031	0.0969857277597811	0.0034172649312031	0.0981185638394808	0.0043342350961696	0.8786297261692002	0.0006159748519493	0.6125844456029024	0.0006159748519493	0.6185896216686504	9.902640012130466e-05	0.8513390464139946	1.4229873749831333e-05	0.5805718621912608	1.4229873749831333e-05	0.5867531750125183	0.0017303949061396	0.5935366733177171	0.0017303949061396	0.599647863861219	MARCKS	701412	RFPL4B	808603	HDAC2	855374	False	False	False	alt	75	0.02373	-20	0.0859
3603	chr6	113170851	A	G	rs1321026	-0.0339843799999999	0.4281484848047241	0.0339843799999999	0.4226664479365693	0.0292563802480162	0.237805293003639	-0.0009803035820929	0.3331310986239671	0.0009803035820929	0.3286385896492455	0.0020058724555441	0.932090262077108	-4.8364990349570695e-05	0.8789154210723011	4.8364990349570695e-05	0.8719410743246884	6.092225846380835e-05	0.8926748084396645	-1.4517488305141665e-06	0.8300797631137199	1.4517488305141665e-06	0.8232807534879772	-0.000184751410379	0.871146836784865	0.000184751410379	0.8641641120978701	MARCKS	686495	RFPL4B	823520	HDAC2	840457	False	False	False	ref	100	0.002869	50	0.05316
3604	chr6	118787200	T	C	rs902780	0.03541537008	0.2698576479775175	0.05494722512	0.270911929072857	0.0332178840676948	0.1847469231931963	0.0020137589809395	0.2197759848880802	0.0024284534519635	0.2201245386024702	0.0726576160469795	0.3818667620085219	0.0025370223388464	0.3395469506117154	0.0036538548185662	0.3415286814767773	0.0026789642971455	0.2931353094399281	0.0001629855071669	0.2764962647685502	0.0001876230260347	0.2783640912306147	0.0055425423113721	0.2846076081303657	0.0083006169377453	0.2860873750843655	CEP85L	77125	ASF1A	106953	MCM9	147962	False	False	False	alt	-100	0.0522	-100	0.3403
3605	chr6	118935167	A	C	rs114000233	-0.020924732	0.1519200707046203	0.0828651224	0.1514024480552849	0.036168688414884	0.142049486754247	-0.0006888903009751	0.1198938488181962	0.0029688168274739	0.1195913160961912	0.962783312988684	7.073451319082887e-05	-0.0202346665270124	0.0148221231938821	0.0796342386742728	0.0147715111132096	0.0348390613198437	0.0060991929628595	-0.0006657248647752	0.0179231685786954	0.0028533530815688	0.0178587341832104	-0.0004998185477219	0.4542427626081934	0.0030236547787931	0.4529892067685556	MCM9	5	ASF1A	41014	FAM184A	214220	True	False	False	ref	-10	0.001953	-45	0.08594
3606	chr6	118945469	C	T	rs6901738	0.066319938	0.2066795172428279	0.066319938	0.2098553132053856	0.0347092453014357	0.1589169778777012	0.0023990208417641	0.1506304521517216	0.0023990208417641	0.1526598088242775	0.0047804427435584	0.8400712633747738	0.0003673902226253	0.6463723837622597	0.0003673902226253	0.6523369562200261	0.0001733076810046	0.7501951361404867	1.3753131880657349e-05	0.5575427996866016	1.3753131880657349e-05	0.5634955862972181	0.0012478968031407	0.6151470860848417	0.0012478968031407	0.621241350274009	MCM9	10307	ASF1A	51316	FAM184A	203918	False	False	False	alt	45	0.00932	30	0.01253
3607	chr6	118979312	A	G	rs4946382	-0.0262826767999999	0.5154108577048732	0.0262826767999999	0.5093920900169109	0.0213692532190649	0.4345138033394214	-0.0005556124572551	0.4810839261547172	0.0005556124572551	0.4752977011768476	0.0123230840289003	0.6994786869498927	-0.0003828537514122	0.6480313133380018	0.0003828537514122	0.6418116186424383	0.000259678036352	0.6793928440405531	-7.930180253074758e-06	0.6299373648659958	7.930180253074758e-06	0.6237167740277348	-0.0013336742436738	0.6129090898662595	0.0013336742436738	0.6067712140677077	MCM9	44150	ASF1A	85159	FAM184A	170075	False	False	False	ref	-25	0.0609	95	0.04916
3608	chr6	119012273	A	T	rs1775620	-0.1125263099999999	0.0892071930901012	0.1125263099999999	0.0879232843628539	0.0360264841789673	0.1433102635714705	-0.0040896555423826	0.0773097331308273	0.0040896555423826	0.076398302333686	0.0311091682887399	0.5495238003242554	-0.0041789124212918	0.306141727132689	0.0041789124212918	0.3018872633031391	0.0011444773708349	0.4373669951151385	-0.0001550681012732	0.2432005860436513	0.0001550681012732	0.239713620856367	-0.0098776021906238	0.2313687935585641	0.0098776021906238	0.2279606732731536	MCM9	77111	ASF1A	118120	FAM184A	137114	False	False	False	ref	-100	0.02072	-75	0.0945
3609	chr6	119020840	C	G	rs6931074	0.0678144572	0.1972732740129911	0.0678144572	0.1998950606821227	0.0271276359875835	0.2826035141314587	0.0021469209509999	0.1898790766666596	0.0021469209509999	0.1922537025523358	0.0021064959915542	0.9171948822604638	0.0001597078250765	0.751841173598157	0.0001597078250765	0.7584315220672304	6.355988059130211e-05	0.8740086499628479	5.474987141481516e-06	0.6971496029534127	5.474987141481516e-06	0.7035483723795205	0.0005625020619576	0.74606016503139	0.0005625020619576	0.7527091655209736	MCM9	85678	ASF1A	126687	FAM184A	128547	False	False	False	alt	60	0.01979	95	0.1421
3610	chr6	119023364	C	T	rs2357023	-0.07895115	0.1635358743036726	0.07895115	0.1611199470964974	0.0205280745140493	0.4620193920330582	-0.0017041887592748	0.2168103573262513	0.0017041887592748	0.2139635637848848	0.0277325063508296	0.5502199114613316	-0.0022530603037058	0.3659287995148855	0.0022530603037058	0.3610256542347602	0.0005732105466059	0.54160184959759	-4.867578748022092e-05	0.3661431335445125	4.867578748022092e-05	0.3612110088431073	-0.0063054666622677	0.3005197124983975	0.0063054666622677	0.296114172778062	MCM9	88202	FAM184A	126023	ASF1A	129211	False	False	False	ref	100	0.0116	100	0.177
3611	chr6	119025747	G	A	rs6929403	-0.0957871936	0.1212393993109324	0.0957871936	0.1195051973177187	0.0262264691891231	0.3031579030264141	-0.0027097493688421	0.1410723022892112	0.0027097493688421	0.1393160195518339	0.2778496255484807	0.1227218108462791	-0.0278893427087893	0.0651910322935477	0.0278893427087893	0.0640094912535728	0.0076641763112866	0.1101958158497133	-0.0008081194749394	0.0737517273946542	0.0008081194749394	0.0725501179315501	-0.0304493418231004	0.0555930456872291	0.0304493418231004	0.0546360478166886	MCM9	90585	FAM184A	123640	ASF1A	131594	False	False	False	ref	90	0.02307	40	0.0737
3612	chr6	119027102	C	A	rs794249	0.0964726529999999	0.1223531783180103	0.0964726529999999	0.1241877983659783	0.1383259344595316	0.0010326027757684	0.0142416848152949	0.0155701002008559	0.0142416848152949	0.015704803937733	0.0344099501831018	0.5188062158170844	0.0038654926207521	0.302886135894803	0.0038654926207521	0.3075073205875158	0.0050523466837818	0.1738588761956153	0.0005903942565923	0.1064178226952833	0.0005903942565923	0.1082669989819031	0.0093241727425686	0.2326636739600975	0.0093241727425686	0.2365917792070426	MCM9	91940	FAM184A	122285	ASF1A	132949	False	True	False	alt	-100	0.3237	-100	0.03284
3613	chr6	143306931	C	T	rs7451540	0.0404834252	0.3559787979999981	0.0404834252	0.3608930431997362	0.0203361472922117	0.4684975187906627	0.0008330242602397	0.3658067334159562	0.0008330242602397	0.3708149382924181	0.0001641318333278	0.9990328772879588	6.174976444604045e-06	0.9637669097047362	6.174976444604045e-06	0.9708713787028572	3.273303942707337e-06	0.9977458991406686	1.254406159093989e-07	0.9550216600404328	1.254406159093989e-07	0.9620411135559154	1.319652931279074e-05	0.9749418414402172	1.319652931279074e-05	0.9819910656615924	ADAT2	143764	PEX3	143875	FUCA2	204789	False	False	False	alt	-80	0.02069	90	0.1667
3614	chr6	143323898	G	T	rs9376742	-0.0432971995999999	0.3559421383798839	0.0432971995999999	0.3513728595071754	0.0204976966856832	0.4652138180603496	-0.0009411532410233	0.3685972263454217	0.0009411532410233	0.3638639596411401	0.0139998680347068	0.6758497035142126	-0.0006007095780245	0.5778022532825328	0.0006007095780245	0.5719971197099768	0.0002860525083568	0.6652215458473348	-1.304590901939143e-05	0.5655658550390205	1.304590901939143e-05	0.5597218776665969	-0.001921744581175	0.5420315357427969	0.001921744581175	0.5362986492054949	ADAT2	126797	PEX3	126908	FUCA2	187822	False	False	False	ref	-80	0.1389	-100	0.3096
3615	chr6	143333488	C	T	rs2303386	-0.02287677098	0.5009068489385442	0.02793792062	0.4987211522881523	0.0209032040479823	0.4493408728781255	-0.0004406710839963	0.5213968793990138	0.0005429372637246	0.5192061385755956	0.0075665599947213	0.7761270888538815	-0.0001159085887524	0.734148626522773	0.0001739599039554	0.7325015984952673	0.0001486880380325	0.7621034078252243	-2.2318598279836507e-06	0.7255680882239395	3.33499875116765e-06	0.7239406634735731	-0.0004066180594503	0.7142161815243678	0.0006672495133779	0.7124343521127333	ADAT2	117207	PEX3	117318	FUCA2	178232	False	False	False	ref	10	0.002869	80	0.1232
3616	chr6	144569896	A	G	rs9376824	-0.01519124844	0.5820916012138294	0.02122541804	0.578175962008655	0.0146840527795144	0.7070652074717747	-0.0002507140842411	0.6374679613826928	0.0003375935160411	0.6335789446535302	0.000319191052753	0.9947316560696092	-3.163507983971792e-06	0.9752288479394708	5.975445804418236e-06	0.9722462111479492	4.508641627282957e-06	0.9954793212537848	-5.16726988189116e-08	0.975229003209899	9.215872614151649e-08	0.9722795820837002	-1.5670878558939006e-05	0.9752205205607972	2.2269143215334374e-05	0.972371496910031	UTRN	284560	STX11	419408	SF3B5	474323	False	False	False	ref	-100	0.00738	100	0.08545
3617	chr6	144588611	G	A	rs4896728	-0.00580706694	0.8373511170319673	0.0075795469399999	0.8334103756159861	0.0171698526585467	0.5921707461143481	-9.88391217847746e-05	0.8270521765288084	0.0001347797684945	0.8229395015545758	0.0042525815710467	0.8471917773833206	-2.8282632883047e-05	0.9099347970907736	3.182045892548288e-05	0.9060735360964652	7.176651205895815e-05	0.8508254076987851	-4.889178298685748e-07	0.9056678215980352	5.606544642898546e-07	0.9018211273140316	-0.00010062353601	0.9075399735110156	0.000117119197651	0.9036548708866796	UTRN	303275	STX11	438123	SF3B5	493038	False	False	False	ref	-30	0.006897	-90	0.0984
3618	chr6	144593189	A	G	rs9376826	-0.153146814	0.0596528510825769	0.153146814	0.0588752502847454	0.0262441466501147	0.300522795919197	-0.004856714531233	0.0913138830713591	0.004856714531233	0.0902669925048073	0.5696867473854377	0.0310995157303657	-0.0940159109577497	0.0141947627703185	0.0940159109577497	0.0139968972491752	0.0154208066380968	0.0405760077154814	-0.003055566848226	0.0256463336559232	0.003055566848226	0.0251553386562635	-0.0396728910296591	0.0376280388295989	0.0396728910296591	0.0369919598870888	UTRN	307853	STX11	442701	SF3B5	497616	False	False	False	ref	100	0.01396	25	0.05078
3619	chr6	144674342	A	C	rs9399485	-0.0061862608599999	0.7520076697314468	0.01089384726	0.7482083182860548	0.0200855956071088	0.4719308390541303	-9.418313935694232e-05	0.6992197186791411	0.0002334416661411	0.6959926100945562	0.0035663620467816	0.8654423041769095	-3.407966473873952e-06	0.8807623503512987	3.86438103212392e-05	0.8771812875445388	7.820810265082311e-05	0.8505405857856031	1.464030295063452e-07	0.8627591875574094	8.959340185674423e-07	0.8592919210633809	-9.89739698459074e-06	0.8798295641531215	0.0001567087855893	0.8763449274063629	UTRN	389006	STX11	523854	SF3B5	578769	False	False	False	ref	-35	0.00473	70	0.02809
3620	chr6	144730672	A	C	rs9403593	-0.0093930179072	0.7949413956981021	0.0094082209727999	0.7902554254668688	0.0281659656964107	0.2581844403414601	-0.000290045040914	0.6700276981895139	0.0002903012485862	0.6653147461692133	0.004607238296328	0.8326432043854273	-5.0156282641594576e-05	0.8749154359926239	5.018349277318651e-05	0.8704778017590439	0.000132767784541	0.7740991055922538	-1.494393740716953e-06	0.8275749195103357	1.4948522959021305e-06	0.8229349337408459	-0.0002078453366764	0.863885582812693	0.0002078453366764	0.8585827129194069	UTRN	445336	STX11	580184	SF3B5	635099	False	False	False	ref	-85	0.006386	15	0.02257
3621	chr6	144752704	A	G	rs4131500	0.00200349446	0.7117768791869841	0.01384124086	0.7133346330017309	0.0244462417381961	0.3457020283295782	5.96427278395957e-05	0.6188539692440677	0.0003489970589248	0.6201923139195235	0.0477417439213486	0.4435922653383735	6.681066518442e-05	0.5446067861152463	0.0006852796131161	0.5461068576886295	0.0011834250227712	0.4072500320253202	2.1388028095692333e-06	0.5086030439840332	1.7366562292661837e-05	0.5099562875019126	0.0002870245125531	0.5397873223966486	0.0018293688759856	0.5412025191722329	UTRN	467368	STX11	602216	SF3B5	657131	False	False	False	alt	-15	0.0006104	-70	0.0664
3622	chr6	144757558	T	C	rs6927442	0.0276265637999999	0.4921989551819823	0.0276265637999999	0.4980278609684868	0.0123070266034156	0.812011659662649	0.0003549367155269	0.60424156231422	0.0003549367155269	0.6105960852827502	0.0747368941968262	0.3618131873421871	0.0022704032136109	0.3604281896860459	0.0022704032136109	0.3653967934274787	0.0009385902267296	0.456385988641123	2.942462277727498e-05	0.4336040183833327	2.942462277727498e-05	0.4389276889968032	0.0051186038071986	0.3355107879384474	0.0051186038071986	0.3405668425760269	UTRN	472222	STX11	607070	SF3B5	661985	False	False	False	alt	100	0.04358	-20	0.01404
3623	chr6	144799546	A	G	rs9376859	-0.0065098905	0.4836513069682057	0.0274019055	0.4832119281673429	0.012364051881241	0.799279348248231	-0.0001205588615646	0.5902909949196442	0.0003669724382665	0.5901462907484887	0.0069215796245586	0.7936326063133897	5.14912891318156e-05	0.7327710005230439	0.000195698175775	0.7333231348181597	8.618563875327686e-05	0.8402407080428227	4.043434653702944e-07	0.7666566662924363	2.5638086557488767e-06	0.7672457607001144	0.0001063970175843	0.7155914614415645	0.0006952921381676	0.7160140495099117	UTRN	514210	STX11	649058	SF3B5	703973	False	False	False	ref	-80	0.144	-10	0.0297
3624	chr6	146424720	C	T	rs2268665	0.1080568307999999	0.1078611312267009	0.1080568307999999	0.1092074082008384	0.0327702348432975	0.1859577994207813	0.0037018777672213	0.1057342470829278	0.0037018777672213	0.1068745425335371	0.0533164527729206	0.4386234716470588	0.0060948113548414	0.2512256226650571	0.0060948113548414	0.2553175174677256	0.0015435998942993	0.3667005020997531	0.0001786954730879	0.2156279439157259	0.0001786954730879	0.2192120659335837	0.0125301045824947	0.1881549132347914	0.0125301045824947	0.191306723341216	RAB32	119114	ADGB	174248	GRM1	397073	False	False	False	alt	-45	0.02103	35	0.0625
3625	chr6	146426194	G	A	rs4896868	0.0142548870599999	0.6895481508161742	0.0142548870599999	0.6958954015749672	0.0342684828620895	0.1633960501668027	0.0004845172115649	0.5299492914050524	0.0004845172115649	0.5358087684472373	0.0836998119494572	0.3551679460085735	0.0014511367756317	0.4716504442437315	0.0014511367756317	0.4768109321148927	0.0028420124122834	0.2673761852147401	4.923371141309249e-05	0.3966115274091514	4.923371141309249e-05	0.4015810096665184	0.0027498267955527	0.4857705345785488	0.0027498267955527	0.4911597228354298	RAB32	117640	ADGB	172774	GRM1	398547	False	False	False	alt	90	0.0653	80	0.0874
3626	chr6	146430879	T	A	rs2206959	-0.0213758086	0.5915228789269019	0.0213758086	0.585262910411269	0.0152007046333096	0.679927889143533	-0.0003376836757797	0.6297047307344678	0.0003376836757797	0.6231395285454356	0.0112137507835438	0.7121443676396622	-0.0002527803222559	0.6935501261069938	0.0002527803222559	0.6872796632541587	0.0001836080361718	0.738271875541597	-4.298822544031301e-06	0.7116147075335808	4.298822544031301e-06	0.7053957647943088	-0.0008792187654646	0.6734114798975402	0.0008792187654646	0.6671016013325662	RAB32	112955	ADGB	168089	GRM1	403232	False	False	False	ref	60	0.02525	-80	0.0857
3627	chr6	156835433	A	G	rs9372017	-0.00504280662	0.8270309460291438	0.00808683702	0.8226845386067648	0.0198014231315363	0.4900529749697001	-0.0001061791712334	0.7950114851935107	0.0001544419598079	0.7905475885667661	0.0079913232819767	0.7624811917874993	-4.537100617767629e-05	0.8503688351883786	6.088691470652184e-05	0.8460676128090152	0.0001631645240876	0.7498872618164177	-9.55056774408124e-07	0.836891961110687	1.201059903132226e-06	0.8324907356769033	-0.0001831018442149	0.845670233620262	0.0002325888291378	0.8414078558033429	ARID1B	59412	TMEM242	488168	ZDHHC14	545701	False	False	False	ref	-100	0.1367	90	0.01178
3628	chr6	156903078	T	G	rs287943	-0.0833201663999999	0.171005475078653	0.0833201663999999	0.1686870323903304	0.0316769012278985	0.2140988100599155	-0.0036179490422527	0.1496882146348953	0.0036179490422527	0.1480653124958368	0.0167158787238955	0.6509435045182886	-0.0019989960534671	0.4507623285596299	0.0019989960534671	0.4454440578525441	0.0006758490469449	0.5579150518178214	-0.0001037265943776	0.3774820130462554	0.0001037265943776	0.3728029524364453	-0.0051062320609679	0.3884778752495479	0.0051062320609679	0.3834872764083967	ARID1B	127057	TMEM242	420523	ZDHHC14	478056	False	False	False	ref	65	0.010254	55	0.02374
3629	chr6	157015101	G	A	rs6928411	0.1045994848	0.0939800643315781	0.1045994848	0.0953727304579751	0.0483636429673257	0.0623197115576796	0.0050484540652091	0.0536257526342968	0.0050484540652091	0.0541910131797189	0.0340049816898155	0.5143075885210373	0.0034841980120844	0.2811570875084908	0.0034841980120844	0.2854283605203957	0.001634243311333	0.3515622647067365	0.0001673921461067	0.1866815700446284	0.0001673921461067	0.1899720175432993	0.0094115997492659	0.2094782487735919	0.0094115997492659	0.2131005872221424	ARID1B	239080	TMEM242	308500	ZDHHC14	366033	False	False	False	alt	10	0.001526	25	0.04553
3630	chr6	157019196	T	C	rs1407509	-0.210626094	0.0214743257621307	0.210626094	0.0213239796256755	0.0688473634292879	0.0190441210595645	-0.0147744387550816	0.0111463380764375	0.0147744387550816	0.0111460614804147	0.0856034113028273	0.3375163459524608	-0.0193534639841864	0.0916768345087915	0.0193534639841864	0.0899532448389966	0.0060000502486762	0.1389922202946302	-0.001382994583704	0.0413459103412597	0.001382994583704	0.0407090718817206	-0.0354953647190788	0.0418327943465083	0.0354953647190788	0.0411782555574621	ARID1B	243175	TMEM242	304405	ZDHHC14	361938	False	True	False	ref	55	0.01318	80	0.2354
3631	chr6	164657500	G	A	rs147044092	-0.0958948962	0.1130277678739136	0.0958948962	0.1114828014440051	0.0170850800316398	0.5990659904289907	-0.0016682557169819	0.2104141871358473	0.0016682557169819	0.2076096912953462	0.1456088548711688	0.2310150298375536	-0.0143758395472157	0.1150723608535937	0.0143758395472157	0.1127419232999412	0.0025620292392754	0.2734824688693004	-0.0002574162769619	0.1547497785803049	0.0002574162769619	0.1521330849328034	-0.024416878360991	0.0739397679618248	0.024416878360991	0.0726687997458791	C6ORF118	652105	QKI	1243499	PDE10A	1330617	False	False	False	ref	90	0.012436	-100	0.3767
3632	chr6	164660964	A	G	rs59034682	0.0814788166	0.1445703510987814	0.0814788166	0.1467039291102476	0.0283547628176566	0.2555606221817811	0.0022887164974364	0.1443651400454466	0.0022887164974364	0.1464132984230509	0.0144287552373725	0.6675485106456013	0.0010546252699024	0.4541785403777726	0.0010546252699024	0.4595047238003559	0.0004119160977089	0.6001588017213321	2.9880484149637737e-05	0.4029417627837296	2.9880484149637737e-05	0.4082188124229389	0.0034038797796179	0.4029874924209783	0.0034038797796179	0.4083118081288959	C6ORF118	648641	QKI	1246963	PDE10A	1327153	False	False	False	alt	50	0.004272	-10	0.02051
3633	chr6	164665028	C	A	rs113650580	0.0131066027	0.606305493092706	0.01925927222	0.6088210714339113	0.0159388696472579	0.6493412868391494	0.0001872053476643	0.6643136738694443	0.0002922874281007	0.6665897293111847	0.004423311669031	0.8412203396581425	5.287406155355993e-05	0.830616531688118	7.802449024521278e-05	0.8327109040398231	7.08966536266505e-05	0.8528782842778945	7.608149124957639e-07	0.8395665919526059	1.192313121235894e-06	0.8414304202204909	0.000218567516743	0.822143975703992	0.0003043449572761	0.8242001447710853	C6ORF118	644577	QKI	1251027	PDE10A	1323089	False	False	False	alt	-75	0.0432	-100	0.1476
3634	chr6	164687522	T	G	rs79222572	0.0006392274	0.3367736809781434	0.0436509477999999	0.337479877629769	0.0176937411326405	0.5664297804152857	-7.266330772110006e-05	0.4029850913129993	0.0007539791760113	0.403856369090151	0.1443048728184487	0.2370828239580255	0.000171924034601	0.2233113305781591	0.005419767705423	0.2242058940403442	0.0026462196674125	0.2707282124578158	-3.5988030398666395e-06	0.2553374574861853	9.498696887353337e-05	0.2562266530508412	0.0005336346540859	0.2037929693109452	0.0099856487743722	0.2044647149654624	C6ORF118	622083	QKI	1273521	PDE10A	1300595	False	False	False	alt	-40	0.02667	-100	0.3838
3635	chr6	164715189	A	G	rs55855028	-0.0078803854	0.7759321672757364	0.0104741002	0.7715875804387601	0.0160431389949779	0.6457798669205229	-0.0001379789128562	0.7722519575892545	0.0001743901215138	0.767833584782936	0.0007571508693213	0.975369383220074	-7.224729946887572e-06	0.9665178114664942	8.3371410078913e-06	0.9620742908670048	1.2247463353290268e-05	0.9755309850200928	-1.2395551191464706e-07	0.9647367954869732	1.395718133414955e-07	0.9603333349247162	-2.474349246148261e-05	0.9674963151199876	3.134175711787798e-05	0.963056063356018	C6ORF118	594416	PDE10A	1272928	QKI	1301188	False	False	False	ref	-100	0.05798	100	0.02917
3636	chr6	164716933	A	G	rs75952763	-0.0119455516	0.7550375814020958	0.0119455516	0.7484701493472532	0.0105724794270586	0.8866148562951713	-0.0001266886653513	0.8304787722269592	0.0001266886653513	0.8238531991428057	0.0015176008709708	0.9384381744015424	-1.686998955967011e-05	0.9395419398224852	1.686998955967011e-05	0.9325819376827056	1.665032556148778e-05	0.9606947676488072	-1.852262690292963e-07	0.9561380553101758	1.852262690292963e-07	0.9491629041429206	-6.845699581009813e-05	0.937560811490172	6.845699581009813e-05	0.9305163869626292	C6ORF118	592672	PDE10A	1271184	QKI	1302932	False	False	False	ref	100	0.02393	-30	0.04132
3637	chr6	164718895	A	G	rs9347029	0.0027874807599999	0.7685607532327177	0.0099931575599999	0.7703407863866598	0.0131013483798201	0.7729897768701275	4.553907127718966e-05	0.7935325144986882	0.0001458236485936	0.7954558383717426	0.0082140147141301	0.7735134623226367	3.068289522924477e-06	0.8458771123379591	5.603323320757308e-05	0.8476394888329669	0.0001029279732912	0.819876408466502	6.00635196375396e-08	0.8635839192200155	7.534239175488488e-07	0.8653509557551285	3.6290455610172006e-05	0.8444432774716276	0.0002094949028405	0.8461228291272478	C6ORF118	590710	PDE10A	1269222	QKI	1304894	False	False	False	alt	-70	0.02473	25	0.02057
3638	chr6	164734384	G	A	rs1912669	-0.10688882826	0.1044746208058401	0.10780689774	0.1036308598891912	0.0236037876650586	0.3559306028857357	-0.0029659286185914	0.1419714710692869	0.0029786303995448	0.1409142888519763	0.0053949061396852	0.8529093475306169	-0.0007247732236331	0.6587518376103089	0.0007296117838827	0.6540179667390632	0.0001543735674914	0.8188249763143007	-2.3621392876068487e-05	0.6126977126544481	2.368833588379872e-05	0.607992963292332	-0.0022005212629078	0.6232568228881107	0.0022120682260565	0.6185583021815477	C6ORF118	575221	PDE10A	1253733	QKI	1320383	False	False	False	ref	-25	0.01797	55	0.1433
3639	chr6	164751626	G	A	rs978164	-0.152229474	0.0472148133343557	0.152229474	0.0466347841523294	0.0443377422068561	0.0810109890980163	-0.0068756438803821	0.0374813094104813	0.0068756438803821	0.0371966752377579	0.5404349905974728	0.0360113223066194	-0.0842526136235644	0.0128335381443107	0.0842526136235644	0.0126178091611584	0.024072317257073	0.0156813272440451	-0.0038218435518789	0.0123668394622027	0.0038218435518789	0.0122260907209697	-0.0444434363762329	0.0266617158675427	0.0444434363762329	0.0262477943676719	C6ORF118	557979	PDE10A	1236491	QKI	1337625	False	False	False	ref	90	0.01978	-80	0.2766
3640	chr6	164753774	G	A	rs1467085	-0.158977454	0.0423969875077654	0.158977454	0.0419864472314363	0.0326755105671271	0.1850817455491374	-0.0053037373298888	0.0541747849655357	0.0053037373298888	0.0535742316777017	0.1425060209164989	0.2417018238557214	-0.0219571963782203	0.0797748562582735	0.0219571963782203	0.0781756594866345	0.0048090647558125	0.1762245834933384	-0.0007625494421414	0.0713414698272069	0.0007625494421414	0.0700227408040959	-0.0359539441126983	0.0412014688948573	0.0359539441126983	0.0404914574029034	C6ORF118	555831	PDE10A	1234343	QKI	1339773	False	False	False	ref	-70	0.02283	-75	0.2026
3641	chr6	164757079	C	A	rs1995942	-0.0576088312	0.2510194611090965	0.0576088312	0.2473869005514374	0.0333094512957427	0.1768319099179104	-0.0020105278154554	0.1837673709607546	0.0020105278154554	0.1812349812211664	0.1676000461878525	0.2061890464014341	-0.0093224738284447	0.1601255801233338	0.0093224738284447	0.1571931754066189	0.005546374417941	0.1457044874234734	-0.0003236368804856	0.1308072002265011	0.0003236368804856	0.1286020548549839	-0.0151842565405297	0.1359958480737854	0.0151842565405297	0.1334696250932227	C6ORF118	552526	PDE10A	1231038	QKI	1343078	False	False	False	ref	-75	0.06076	-65	0.05933
3642	chr6	170341644	T	C	rs2092778	-0.038147612	0.3894412930393126	0.038147612	0.3844089965292361	0.0176922186324359	0.5649201001116136	-0.000677837707649	0.4362028006549825	0.000677837707649	0.4308602607144208	0.1188190755831215	0.2787971172749733	-0.0043841459505829	0.2689922520114551	0.0043841459505829	0.264791360514536	0.0019578167866198	0.3237839652764573	-7.10687371331413e-05	0.3044168591641753	7.10687371331413e-05	0.2999656434979846	-0.0079871993665665	0.2513134069343712	0.0079871993665665	0.2471442549386964	DLL1	35079	FAM120B	50940	PSMB1	211663	False	False	False	ref	-70	0.07214	-80	0.1622
3643	chr6	170365688	T	C	rs6914386	-0.0190005602	0.4405109115306978	0.0323223026	0.4375230101219227	0.0233792888992268	0.3740454588992195	-0.0005393452181286	0.4097879767277844	0.0007616268909143	0.4068326466659678	0.4099897726897826	0.0669517237954831	-0.0092424607814616	0.1259718460652756	0.0141326886664164	0.1245499929655285	0.0096572341844159	0.0781551310266331	-0.0002555798080064	0.1378920626050811	0.0003371763440055	0.1364165492235127	-0.0064019662828675	0.1956972049069541	0.0109333245356471	0.1937374371532814	DLL1	59123	FAM120B	74984	PSMB1	187619	False	False	False	ref	95	0.03162	70	0.03906
3644	chr6	170374845	C	T	rs78450636	-0.2220792899999999	0.0187049603638732	0.2220792899999999	0.0185346613935812	0.0471835709275285	0.0672105015254075	-0.0106398413316621	0.0186739107984387	0.0106398413316621	0.0186113238862364	0.0540513344990267	0.4288086555468086	-0.0119265355381164	0.1363678161913782	0.0119265355381164	0.1338200703581823	0.00260013871277	0.2736494728829011	-0.0005817855573132	0.0867851976733219	0.0005817855573132	0.0853842899281081	-0.0251872257596251	0.0730689140189871	0.0251872257596251	0.0718143150827004	DLL1	68280	FAM120B	84141	PSMB1	178462	False	True	False	ref	55	0.1516	-55	0.01416
3645	chr6	170378583	G	A	rs9366218	-0.0316738206	0.410876494708063	0.0378694482	0.4075081432512374	0.0347887313163968	0.1569522975484062	-0.0011145906153287	0.3007740855639428	0.001334037003178	0.2982450568230694	0.2018565867176932	0.1735314340297288	-0.0058321054149137	0.2167594794185738	0.007172752258831	0.2143930133594523	0.006993575195291	0.1143158657087541	-0.0002048479298825	0.1734255243315604	0.0002523330483907	0.1715696693971327	-0.0090536438916564	0.2117686925954557	0.0109753884728315	0.2094221517279819	DLL1	72018	FAM120B	87879	PSMB1	174724	False	False	False	ref	100	0.2284	60	0.1357
3646	chr6	170407171	C	T	rs10081152	-0.133260158	0.0624659638027494	0.133260158	0.0616987892444236	0.0512909137366529	0.0525075860452322	-0.0070394998477357	0.0372269209068348	0.0070394998477357	0.0369612088630057	0.1069883870542047	0.2996103542192522	-0.013925848535023	0.1222684689192249	0.013925848535023	0.1200385423199197	0.0057515911513038	0.1512896876552663	-0.0007782138072623	0.0720942691398149	0.0007782138072623	0.0709013952065007	-0.0259501501105208	0.0703356217443897	0.0259501501105208	0.0692323640727346	DLL1	100606	FAM120B	116467	PSMB1	146136	False	False	False	ref	100	0.2505	100	0.666
3647	chr7	1885818	T	C	rs12532128	0.074151355	0.168721515463721	0.074151355	0.1712839395971047	0.0319319116716347	0.1935397871348693	0.0023873658373537	0.1406501331347439	0.0023873658373537	0.1426208859481134	0.5080292633037511	0.0426603576089907	0.0383967041973539	0.0396403795476746	0.0383967041973539	0.0403867261724283	0.0162617443162993	0.0341147623772334	0.0012380367171424	0.0411756560466289	0.0012380367171424	0.0419278692588511	0.0229108244531688	0.0788493873602822	0.0229108244531688	0.0804716238287501	ELFN1	220072	PSMG3	314813	TMEM184A	324997	False	False	False	alt	-70	0.331	-25	0.869
3648	chr7	1902634	C	T	rs4236277	-0.0717307406	0.1822374514975586	0.0717307406	0.1796076759621223	0.0225184712381713	0.4002359108556489	-0.0016088717304221	0.2186123140131228	0.0016088717304221	0.2156877297318472	0.6718460294942431	0.0172267478355055	-0.0496389754350141	0.0300856536598266	0.0496389754350141	0.0295421437612017	0.0150396307664317	0.039510096621662	-0.0011064907986257	0.0488785962490059	0.0011064907986257	0.0479593487318098	-0.0150324964534326	0.1403332347126661	0.0150324964534326	0.1378085234254731	ELFN1	236888	MAD1L1	330609	PSMG3	331629	False	False	False	ref	65	0.0401	45	0.1587
3649	chr7	1903230	T	C	rs12699439	0.036111407	0.3338984573269103	0.0465811098	0.3362113650371084	0.0685192518271505	0.0191654936122709	0.0021902873909453	0.1281301903701717	0.0029783382056517	0.1289764480202443	0.7144930883177725	0.0087730283088692	0.0249741706286028	0.0555869525200847	0.0344331623426189	0.0562374419002022	0.0490484502392211	0.0024468608175455	0.0015092969475837	0.0269689190659849	0.0022212719089635	0.0273087542868998	0.0072531424235425	0.2774935536304977	0.0080152419913562	0.2799454120520156	ELFN1	237484	MAD1L1	330013	PSMG3	332225	False	True	False	alt	-85	0.1327	-75	0.2021
3650	chr7	2444663	A	G	rs79606759	0.1033354601999999	0.0852580495472248	0.1155869998	0.0858889054868871	0.0172706996129442	0.5824030353546411	0.0019589971663876	0.1726882014068645	0.002119931348022	0.1743568384932157	0.0601621523539308	0.4173805836477866	0.0081784735301268	0.1968075689688054	0.0084794468606442	0.1995278680336284	0.001081428865135	0.4441342826534863	0.0001529117760874	0.2330055275320226	0.0001568653116025	0.2358779217546009	0.017307248193725	0.1253475200693078	0.0182161591501434	0.1269864451830445	GRIFIN	32231	CHST12	41074	LFNG	67867	False	False	False	alt	-100	0.04172	-20	0.0504
3651	chr7	2444919	T	A	rs76150572	0.0342025382999999	0.3942271867121148	0.0364481109	0.3981014917941628	0.0111360111585822	0.8642675618707973	0.0004370387844666	0.5584409457660893	0.0004583178697114	0.5626746831487881	0.1772961961004255	0.1979849429966464	0.0057853073803857	0.2212790581412148	0.0060534281243539	0.2244064368558256	0.001911869765515	0.320986134864392	6.900033086658197e-05	0.3128321885638987	7.154104774779572e-05	0.3164323628808424	0.0093571640658506	0.2151782476514935	0.009848734782752	0.2181939399616541	GRIFIN	31975	CHST12	41330	LFNG	67611	False	False	False	alt	10	0.001404	100	0.2478
3652	chr7	6003864	T	C	rs117831773	-0.00700210772	0.7286739546431837	0.01327871892	0.7247125589163214	0.0066915762996109	0.9911928084378522	-4.006106519568222e-05	0.8808352455616839	8.754334035928222e-05	0.8768320804699148	0.0024529048860149	0.9043535980570518	-2.5317368028281348e-05	0.9017662660775988	3.665465367770935e-05	0.897659931062016	1.5956864974058786e-05	0.9668544103030832	-1.51085739432859e-07	0.9504325462300052	2.368517836151009e-07	0.9462337280397628	-0.0001154696314868	0.8896688697626037	0.0001534096532611	0.8855508538380374	PMS2	5266	AIMP2	5392	ANKRD61	27513	False	False	False	ref	-75	0.006187	-100	0.0751
3653	chr7	6011278	C	A	rs75285243	-0.0009377733999999	0.42572406126168	0.032869751	0.4252009822674858	0.0897537714024916	0.006686765944021	-0.0002106603870355	0.1094005235337847	0.0029555397346126	0.1090972110738417	0.167640460558873	0.2163167065750561	0.0017624552447315	0.2292196402931565	0.0061640735834581	0.2286851336786255	0.0156058078045619	0.0426515710790227	0.0001474775301113	0.0965223098281101	0.0005742467498661	0.0962389220881138	0.000500643330804	0.2334103491349211	0.0086659958430932	0.2327697689926977	AIMP2	2022	PMS2	2148	ANKRD61	20099	False	True	True	ref	-100	0.2764	-60	0.1758
3654	chr7	6011649	A	G	rs76124438	0.1335138988	0.0686054382964016	0.1335138988	0.0696240967951098	0.0189984440878824	0.5191861481853063	0.0028110048295606	0.1416757149657168	0.0028110048295606	0.1436278992668417	0.0910337831150407	0.3251847075443606	0.0116580817637666	0.1396956026226053	0.0116580817637666	0.1424886405236907	0.0017920672105411	0.342702854364956	0.0002532162543788	0.1666413842974407	0.0002532162543788	0.1696368700651087	0.0223631684866879	0.0861692587852341	0.0223631684866879	0.0879817485840794	AIMP2	2393	PMS2	2519	ANKRD61	19728	False	False	False	alt	70	0.009735	-100	0.07513
3655	chr7	6016571	G	A	rs112393694	-0.205542199	0.0249435405627713	0.205542199	0.0247262984435151	0.0333280816350958	0.1793261524763535	-0.007673202312927	0.0386891989650853	0.007673202312927	0.0383357311431994	0.2502878492956352	0.1405157268933617	-0.0550726645488261	0.0271345621800047	0.0550726645488261	0.0267324306894841	0.0088587459476874	0.0933888631911204	-0.0021157708635227	0.0301506267854304	0.0021157708635227	0.0298295040507924	-0.0654259179835703	0.0133972081048368	0.0654259179835703	0.0132613616978581	AIMP2	7315	PMS2	7441	ANKRD61	14806	False	False	False	ref	100	0.03128	-85	0.1915
3656	chr7	6019143	T	C	rs79231966	-0.30725221	0.0082542563352853	0.30725221	0.0081970417865344	0.0699401896021648	0.0181553746506317	-0.0226074561476545	0.0059579274858392	0.0226074561476545	0.0059417999180301	0.0459173237438553	0.4704617493991049	-0.0163886281968913	0.1192399410888956	0.0163886281968913	0.1172194977106901	0.0035166654671803	0.2371823858543355	-0.0013195119111896	0.0544106472570466	0.0013195119111896	0.0536810834630239	-0.0289630827092473	0.0640030953749123	0.0289630827092473	0.0630084724775477	AIMP2	9887	PMS2	10013	ANKRD61	12234	False	True	True	ref	-55	0.02731	-65	0.11523
3657	chr7	8509557	C	G	rs11972718	0.0534033366	0.268466587161487	0.0534033366	0.2721379383247051	0.0363731342860732	0.141443531104919	0.0020504640446033	0.183133429842939	0.0020504640446033	0.1853835632844671	0.1379210517633862	0.2466927326954802	0.0078564698983391	0.1922786996604678	0.0078564698983391	0.1957226101088707	0.0049125562145179	0.1679702988432314	0.0002880948018813	0.1501609940685938	0.0002880948018813	0.1526424332569088	0.0131165253538318	0.1629436804055219	0.0131165253538318	0.1659753686877343	NXPH1	75947	ICA1	246870	GLCCI1	540760	False	False	False	alt	100	0.03516	5	0.006836
3658	chr7	8522315	T	C	rs2040765	0.1004472714	0.107822290923031	0.1004472714	0.1092031728805136	0.1059863261585128	0.0035519088426183	0.0097918319304832	0.022384277162638	0.0097918319304832	0.0224322949540687	0.206344231467124	0.174337619857322	0.0181369812767233	0.0914439084543846	0.0181369812767233	0.0932461595745806	0.0230754458126205	0.0202072899755623	0.0018557458282972	0.0276653256175241	0.0018557458282972	0.0280307915816179	0.0260268549371514	0.0671625383579211	0.0260268549371514	0.0683220761967504	NXPH1	88705	ICA1	259628	GLCCI1	553518	False	True	True	alt	-35	0.013916	-25	0.03662
3659	chr7	8522330	A	G	rs2040766	-0.188104682	0.0287503010634844	0.188104682	0.0285375427385507	0.0431303457814501	0.0882573061560742	-0.007901271877426	0.0288159405317709	0.007901271877426	0.0286905682794917	0.1833319586948632	0.1976684297628956	-0.0336010702350355	0.0503192354944925	0.0336010702350355	0.0494387529650545	0.0075067875115109	0.1106322630427459	-0.0013513100631965	0.0391208857646642	0.0013513100631965	0.0384566550205331	-0.0474159546039391	0.0242738761232498	0.0474159546039391	0.0239324970337194	NXPH1	88720	ICA1	259643	GLCCI1	553533	False	False	False	ref	-50	0.0166	-50	0.04004
3660	chr7	8522348	T	C	rs2040767	-0.0041817732	0.3272861712423676	0.0468545788	0.3281252966588344	0.1010605964478738	0.0045276422350444	0.0004906237753473	0.0779442231777351	0.0039814562717538	0.0782927003355621	0.1935221536735838	0.1863503598678399	-0.003082255858052	0.181975941753446	0.0087698752260862	0.1825389735572823	0.0205029169757671	0.026593298564522	-5.630181952347997e-05	0.0698083183843967	0.0007243411045424	0.0700644838640716	-0.0031498465903467	0.1735634259659407	0.0127618686285506	0.1742368857293175	NXPH1	88738	ICA1	259661	GLCCI1	553551	False	True	True	ref	-70	0.03076	-75	0.1338
3661	chr7	8527374	G	T	rs1557841	-0.1055511232	0.1000844054412567	0.1055511232	0.0986963663346433	0.0807535615323147	0.0103926761864082	-0.0086362091305661	0.0269218054578172	0.0086362091305661	0.0268364683244834	0.2951073867572828	0.1129093866332638	-0.030656027421558	0.0549045626266441	0.030656027421558	0.0536933813128622	0.0233542705772209	0.0168837303970055	-0.0024732641377333	0.0203772129213939	0.0024732641377333	0.0200992972974365	-0.0340783873841179	0.044418884530942	0.0340783873841179	0.0436686802360203	NXPH1	93764	ICA1	264687	GLCCI1	558577	False	True	False	ref	-80	0.0437	-65	0.3057
3662	chr7	16524243	T	G	rs17464820	0.01835041702	0.6182665869332505	0.01835041702	0.6245416540781936	0.0108341032216133	0.8827699694528444	0.0002006357635146	0.7274918819440159	0.0002006357635146	0.7340050858740639	0.0198640757480782	0.6142443274439754	0.0003019659064656	0.6583423522068059	0.0003019659064656	0.6647117648047319	0.0002137661557789	0.705045720954105	3.293845829434199e-06	0.7207293599968391	3.293845829434199e-06	0.7273548337014057	0.001003761010854	0.6459909829157082	0.001003761010854	0.6522886183598386	LRRC72	2583	SOSTDC1	6337	CRPPA	21739	False	False	False	alt	100	0.0211	-100	0.09656
3663	chr7	21439273	G	T	rs9639377	-0.0462287128	0.3294109028182765	0.0462287128	0.3254891555004772	0.0175713150149894	0.5767584938466409	-0.0008849872438706	0.3907280994287434	0.0008849872438706	0.3864212888269567	0.0601819471479	0.406035546499315	-0.0026866666775378	0.3503226785560637	0.0026866666775378	0.3456433227645205	0.0010120913240465	0.4391671674359597	-5.004213921509588e-05	0.3757010643018829	5.004213921509588e-05	0.3709895394088592	-0.0064943419880571	0.3042697312063405	0.0064943419880571	0.3000212920929936	SP4	11229	DNAH11	103767	CDCA7L	506630	False	False	False	ref	55	0.06024	100	0.2318
3664	chr7	21460239	A	G	rs7796796	0.0846862884	0.1343260880659386	0.0846862884	0.1363322321174159	0.0167261325042826	0.6126076565833526	0.0014622970992235	0.232163202334056	0.0014622970992235	0.2352701392740184	0.0853708224736893	0.3974297453086177	0.0061836915683805	0.257666755435292	0.0061836915683805	0.2618418791056639	0.0011607136642447	0.4674152784431578	8.634675816756674e-05	0.3107320111219915	8.634675816756674e-05	0.3154296185917986	0.0108021840256012	0.2124186083100933	0.0108021840256012	0.2161421230412119	SP4	32195	DNAH11	82801	CDCA7L	485664	False	False	False	alt	95	0.0485	-95	0.0709
3665	chr7	21483576	T	C	rs6948810	-0.0081208462599999	0.6227207837193662	0.01923425586	0.6195114399429944	0.0103966823574809	0.8849220079088211	-7.023307001529616e-05	0.7422627662251935	0.0002083686668233	0.7389937719376295	0.0089142555507901	0.743557443680579	-0.0001241913825986	0.7524812066127855	0.0001830839111441	0.749206185177512	8.999692257487774e-05	0.8218231332337947	-1.1909621417418297e-06	0.8074252692178521	1.9229746202910023e-06	0.8038425598095239	-0.0004297119857477	0.7284898495439595	0.000685394741183	0.7251995871391151	SP4	55532	DNAH11	59464	CDCA7L	462327	False	False	False	ref	-100	0.007523	-60	0.05817
3666	chr7	23680160	G	A	rs56359038	-0.239203398	0.0156797991844975	0.239203398	0.0155981979055896	0.0677321971405498	0.0202464339823993	-0.0163881091394664	0.0094200828370115	0.0163881091394664	0.009392998949445	0.9243888357362012	0.000820401308119	-0.2206645053913165	0.0016497774405112	0.2206645053913165	0.0016711941875091	0.0625877015025549	0.0010411652118137	-0.0151119742243152	0.0017048078667368	0.0151119742243152	0.0017113231936481	-0.0155026228102008	0.1350398117418117	0.0155026228102008	0.1325664114452567	FAM221A	29	STK31	30044	CCDC126	82777	True	True	False	ref	-95	0.1084	-30	0.2734
3667	chr7	23867010	G	T	rs6966655	-0.1633467072	0.0413812399005631	0.1633467072	0.0409595324283982	0.052173535398245	0.0498643643928952	-0.0089752127507775	0.0269974841962284	0.0089752127507775	0.0268915597637587	0.0338441489888159	0.5119647992612982	-0.0054281573467449	0.2315187260929153	0.0054281573467449	0.2277117676168606	0.001739161856211	0.337518808135728	-0.0002992052804429	0.1423577374787809	0.0002992052804429	0.1399101959744214	-0.0132699350070931	0.1582163475618229	0.0132699350070931	0.1554543002261703	STK31	156806	FAM221A	186879	CCDC126	269627	False	False	False	ref	100	0.03116	-100	0.0869
3668	chr7	23871880	A	G	rs2106747	-0.004098918048	0.8825948560608843	0.005157772992	0.8806821217526893	0.0119050543512714	0.8251209956492375	-4.7566601350625496e-05	0.9099263966417196	5.9730919188822726e-05	0.9080063752555096	0.0005039424631321	0.9882769341469584	-1.703195394393375e-06	0.9898130281048796	2.388563226516049e-06	0.9882610003596692	5.739037694755437e-06	0.9926683117849971	-1.7846068743203442e-08	0.9922572602918852	2.571114816895069e-08	0.9908786612515248	-9.897396984593038e-06	0.9866410865142494	1.1546963148691896e-05	0.9839040191870748	STK31	161676	FAM221A	191749	CCDC126	274497	False	False	False	ref	-60	0.01251	65	0.05154
3669	chr7	23877113	C	T	rs9769098	-0.1056570224	0.1003530246565286	0.1056570224	0.0990031588493328	0.0148042934514067	0.7008542146250454	-0.0016177891642378	0.2257313708516032	0.0016177891642378	0.222560510653356	0.0645409257365312	0.3987533359006272	-0.0061362845136083	0.2144296117018148	0.0061362845136083	0.2107611278619107	0.0009544776523789	0.4602388400935534	-9.257769455298495e-05	0.2699165852015729	9.257769455298495e-05	0.2657549246430399	-0.0137895483487842	0.1508060186567237	0.0137895483487842	0.1479665734093489	STK31	166909	FAM221A	196982	CCDC126	279730	False	False	False	ref	-55	0.09326	35	0.0985
3670	chr7	23878123	C	T	rs13244145	0.0223415255	0.5481131912413494	0.0223415255	0.5543678272810667	0.0149111328696461	0.6822124243462838	0.0003181011974219	0.6233677157502021	0.0003181011974219	0.629837697874834	0.0065875424763286	0.7873174670797435	0.0001441043373502	0.7471093180298563	0.0001441043373502	0.7537085747954766	9.753321231780936e-05	0.81857586787802	2.001287369392297e-06	0.7731455035425187	2.001287369392297e-06	0.7797775312048342	0.0005913694698293	0.7241868451811911	0.0005913694698293	0.7307797146012527	STK31	167919	FAM221A	197992	CCDC126	280740	False	False	False	alt	100	0.01733	50	0.08673
3671	chr7	23894634	C	T	rs146616002	-0.0548980962	0.2662053764325692	0.0548980962	0.2624836177270732	0.0228334228747825	0.3898062100618689	-0.0012461292226716	0.276390489350146	0.0012461292226716	0.2727193634507769	0.1674548843654119	0.2108516500603457	-0.009698688674715	0.1686086042820399	0.009698688674715	0.1656963733930027	0.003836971540055	0.208063650842219	-0.0002204436085884	0.1772062565458555	0.0002204436085884	0.1742490444383374	-0.014920325954274	0.1447787337145024	0.014920325954274	0.1421401135052249	STK31	184430	FAM221A	214503	CCDC126	297251	False	False	False	ref	-100	0.1078	-100	0.2747
3672	chr7	24732158	T	C	rs17150022	-0.0670881388	0.2092449731825163	0.0670881388	0.2062279317484184	0.0479346363486978	0.064184124136094	-0.0033274760927565	0.1063458165186303	0.0033274760927565	0.1050252566052256	0.0237892184355514	0.6007716089220454	-0.0012307159479201	0.4505573874617086	0.0012307159479201	0.4452544219149253	0.0010716532344352	0.4455451182599343	-5.785968192623068e-05	0.3288085966382146	5.785968192623068e-05	0.3241450733142929	-0.0037131734353864	0.4030753956185363	0.0037131734353864	0.397852776923101	GSDME	25782	PALS2	158889	OSBPL3	249476	False	False	False	ref	0	0.0	-50	0.1426
3673	chr7	24734849	G	T	rs80195870	-0.02141748356	0.5768277995442602	0.0220032342399999	0.5724366057280714	0.0145968550346526	0.7085005936945159	-0.0003154704715505	0.6428241172655117	0.0003233542688329	0.6384329313740545	0.0021840256012668	0.9215124309557614	-6.585212000905516e-05	0.8684734323158678	6.619030208295909e-05	0.8644649838442748	3.1625402506970865e-05	0.9313331449624188	-9.374282576992204e-07	0.8776832788621942	9.419799535337648e-07	0.8735337932370127	-0.0002400118768763	0.8617686007497359	0.0002416614430404	0.8578689731606498	GSDME	23091	PALS2	161580	OSBPL3	246785	False	False	False	ref	-80	0.06506	-80	0.2013
3674	chr7	24737142	G	A	rs114829110	-0.0004575213159999	0.9395281364316737	0.002479915484	0.9409504200768448	0.0162589679650514	0.6331839276290586	-6.300579837269704e-06	0.9313373361343652	4.178975530660615e-05	0.9328939007839394	0.0506878690904291	0.4421068257000574	-3.367384717148478e-05	0.7950333610240162	0.0001023526566343	0.7963792949907835	0.0008100908855499	0.484169328628807	-5.590951246832183e-07	0.7998735511410074	1.6880669843228507e-06	0.8013142082096156	-7.423047738445374e-05	0.8237799552617754	0.0002721784170762	0.8251164839865691	GSDME	20798	PALS2	163873	OSBPL3	244492	False	False	False	ref	-15	0.00256	0	0.0
3675	chr7	24741837	T	C	rs11509873	0.1867400859999999	0.0306965795785235	0.1867400859999999	0.0309442428329622	0.0496855184086444	0.0584270434410181	0.0096058118192359	0.0242085945231571	0.0096058118192359	0.0243097264617707	0.5268623601992675	0.0383378257758761	0.0997689978438119	0.0094335389234005	0.0997689978438119	0.0095251647074314	0.0259530633500336	0.0131213575016689	0.0050802542347522	0.0087706187495583	0.0050802542347522	0.0087949803370805	0.0565801194285902	0.016648564993898	0.0565801194285902	0.0168830324821473	GSDME	16103	PALS2	168568	OSBPL3	239797	False	False	False	alt	-55	0.031	-65	0.11523
3676	chr7	24788436	C	T	rs2391000	-0.02368142776	0.526357853254112	0.02576374712	0.5227220077158491	0.0114868164864048	0.8496628848416988	-0.0003043786320268	0.6601006222289723	0.000323995703911	0.6557447329034145	0.6967701494506945	0.016005495718909	-0.0167517681427141	0.1362189565319454	0.0181959817610475	0.1347809387784685	0.0079815099390903	0.0981191603983304	-0.0002148318731727	0.2277874302653893	0.0002284374913867	0.2254566180947875	-0.0048447758239583	0.3924836005304605	0.0052885091221008	0.3887326691528852	GSDME	30496	OSBPL3	193198	PALS2	215167	False	False	False	ref	-85	0.5225	-60	1.178
3677	chr7	24789520	C	T	rs113041465	-0.022451136872	0.4247292371830442	0.033945663128	0.4229295207169677	0.1296213556386502	0.0013157540255464	-0.0031026609097542	0.0941003940644175	0.00445576401577	0.0941544533208833	0.2488444789020487	0.1383101709987793	-0.0060724272786306	0.2044243324031616	0.0087558996153573	0.2030071400711309	0.0322914979511945	0.0074711076346761	-0.0008348180847227	0.0636518238929939	0.0011507796065356	0.0635410962494869	-0.0075302695391112	0.2145654450383145	0.0111692124971131	0.2134626121015941	GSDME	31580	OSBPL3	192114	PALS2	216251	False	True	True	ref	-95	0.02673	-80	0.0703
3678	chr7	24790454	G	A	rs150936052	-0.285717432	0.0096042925158782	0.285717432	0.0095483000705871	0.0492736522598417	0.0593961713253238	-0.014383610192972	0.0115922120446771	0.014383610192972	0.0115669571473803	0.0071079806011018	0.786682293530133	-0.002089805183375	0.3803499447274412	0.002089805183375	0.3754524728723032	0.0003666945693116	0.6360912480126175	-0.0001094936173761	0.2623896559433749	0.0001094936173761	0.2582752657773511	-0.00484147669163	0.3566863916901423	0.00484147669163	0.3517786325843822	GSDME	32514	OSBPL3	191180	PALS2	217185	False	True	True	ref	100	0.041	-100	0.04633
3679	chr7	24799761	G	A	rs115354522	-0.065569591	0.2040520287167343	0.065569591	0.201104953295259	0.0246303400263599	0.3375685123525664	-0.0015960122134857	0.2139433491979183	0.0015960122134857	0.2110290493085	0.0960641351324601	0.3275609209554173	-0.0067928889572671	0.2202892636619893	0.0067928889572671	0.2164952569911062	0.0024040045077489	0.3015408771704945	-0.0001688280854105	0.2165431005322114	0.0001688280854105	0.213024734532013	-0.0128897100062682	0.1719969309645185	0.0128897100062682	0.168974341076267	GSDME	41821	OSBPL3	181873	PALS2	226492	False	False	False	ref	-20	0.002007	-25	0.03265
3680	chr7	24805117	T	G	rs79631004	0.0029657837399999	0.7660955121487117	0.01113378654	0.7673745215835748	0.0369389401217674	0.1342170501417031	0.0001141473864062	0.5827618510942996	0.000413967627421	0.5838180040981581	0.0085117614067499	0.7477071933604181	4.144872605556613e-05	0.8117203463902727	9.245510314823246e-05	0.8130215540211658	0.0003149849451327	0.6397780470372826	1.576956851470249e-06	0.7295113518192	3.444644197530404e-06	0.7308272773041247	0.0001657813994919	0.793078325181297	0.0003637293391837	0.7944191306364543	GSDME	47177	OSBPL3	176517	PALS2	231848	False	False	False	alt	-35	0.006866	-25	0.04056
3681	chr7	71296756	A	T	rs6976562	0.0044062967999999	0.8218855396270179	0.00808973392	0.8235040589040328	0.0108341924954644	0.8675257886175297	3.569163286141991e-05	0.8807246514522975	8.145578747622465e-05	0.8822220984549931	0.0061809244168783	0.8036848914735197	1.2950097189704358e-05	0.879115478968166	3.7685798330997015e-05	0.8803020917475746	7.54111166746133e-05	0.8560212386196524	6.169488888068202e-08	0.9068455505134376	4.1067150659804573e-07	0.907883672915068	4.041437102044e-05	0.8604604568827806	0.0001723796641482	0.8616856649953257	GALNT17	164611	CALN1	1150395	TYW1B	1531444	False	False	False	alt	-95	0.10626	55	0.08704
3682	chr7	71296858	T	A	rs6942815	0.0322499044	0.4512206328555398	0.0322499044	0.4563388111066931	0.0145097402734797	0.70788928066533	0.0004984795657401	0.5329872410994486	0.0004984795657401	0.5385478290900252	0.0063986671505393	0.7975790023062448	0.0001729066225335	0.724348491517813	0.0001729066225335	0.7307398267993391	9.441602526799664e-05	0.8250543633576212	2.6689325423393143e-06	0.7461860340666246	2.6689325423393143e-06	0.7525709982129517	0.0006441555870805	0.7039231728752485	0.0006441555870805	0.7103093510004362	GALNT17	164713	CALN1	1150293	TYW1B	1531342	False	False	False	alt	95	0.04608	70	0.2742
3683	chr7	71299005	T	C	rs10261998	0.0532868506	0.2630810651651415	0.0532868506	0.2668058108351035	0.0265893956672561	0.2940006141954569	0.0015489002068884	0.2369654813838912	0.0015489002068884	0.2399880106472175	0.0977137012965589	0.324446489969563	0.0058891687324893	0.2430125152968998	0.0058891687324893	0.2470565037973856	0.0027843215511113	0.2784437748003085	0.0001778274645357	0.2217905514565185	0.0001778274645357	0.2253000221456932	0.0112236481805284	0.2005823850647885	0.0112236481805284	0.2040731523488118	GALNT17	166860	CALN1	1148146	TYW1B	1529195	False	False	False	alt	100	0.01761	-85	0.1667
3684	chr7	71301450	G	T	rs28799658	0.0152756226	0.6753207823879149	0.0152756226	0.6818913368932548	0.0179721553443429	0.5604540428541221	0.0002783223580726	0.6543294183998927	0.0002783223580726	0.6607160265322415	0.0240292303124277	0.5829765583342539	0.0003671219755418	0.6273271323417919	0.0003671219755418	0.6333071843923814	0.0003961785762741	0.6038533669472095	6.1501781743840894e-06	0.6354231333836176	6.1501781743840894e-06	0.6414334215283475	0.0011085084622743	0.6211844845536928	0.0011085084622743	0.6272101669935006	GALNT17	169305	CALN1	1145701	TYW1B	1526750	False	False	False	alt	-100	0.3853	-95	0.06445
3685	chr7	71303668	G	T	rs3923570	-0.1865790427999999	0.0324205872143114	0.1865790427999999	0.0321134382271282	0.0297553884765152	0.2331043678419147	-0.006108843454899	0.0546542205246116	0.006108843454899	0.0540357181745244	0.4623461779551977	0.0528587600409747	-0.084910627433125	0.0128330898027905	0.084910627433125	0.0126498674441319	0.0136859246845034	0.047441217063215	-0.0027678482881224	0.0206798533877902	0.0027678482881224	0.0203699651850111	-0.0630299231302167	0.0142661798493215	0.0630299231302167	0.0141103261049453	GALNT17	171523	CALN1	1143483	TYW1B	1524532	True	False	False	ref	65	0.03076	100	0.295
3686	chr7	71304276	T	C	rs6964131	-0.0841532464	0.1514450322824709	0.0841532464	0.1492932142223301	0.0233763262224857	0.3729763917141148	-0.0021544488382897	0.1817959044313792	0.0021544488382897	0.1795317699735501	0.2451139850219392	0.1416530301396706	-0.0208907097713885	0.0855160343834625	0.0208907097713885	0.0839074147441198	0.0057383892171265	0.1428333745944608	-0.0005377760602607	0.0993002892337466	0.0005377760602607	0.0975958914348362	-0.0268343175744778	0.0687091858073397	0.0268343175744778	0.0675032058282939	GALNT17	172131	CALN1	1142875	TYW1B	1523924	False	False	False	ref	-100	0.03723	20	0.05548
3687	chr7	71311932	G	A	rs73356099	-0.067227265	0.223023800393296	0.067227265	0.2202617657878847	0.0437751321259623	0.086264212705974	-0.0029405438743288	0.1444204803195023	0.0029405438743288	0.142716001228554	0.172415954603939	0.2018453003282473	-0.0124522516647183	0.1572790606664429	0.0124522516647183	0.1544502089146561	0.0074268028815716	0.1082566464146186	-0.0005275388142622	0.1124107751080193	0.0005275388142622	0.1103660889073585	-0.0189287717330341	0.1277149209830431	0.0189287717330341	0.1254912774576318	GALNT17	179787	CALN1	1135219	TYW1B	1516268	False	False	False	ref	-5	0.003052	-5	0.03906
3688	chr7	71315719	C	T	rs12534549	-0.007839325	0.6678285340959843	0.015831195	0.667891893435439	0.0096751252069688	0.9260010595612128	-7.678981840615994e-05	0.792272537076209	0.0001530898507971	0.7925154886450677	0.001035927551054	0.9665602480186464	-8.557332373879236e-06	0.9369835694302908	1.6912812495852482e-05	0.9378682407194264	1.0020177827690872e-05	0.9839833813176012	-8.229730833905068e-08	0.9562173794581218	1.627593420498215e-07	0.9571608203185956	-4.123915410244925e-05	0.9337563136681376	6.763221272803075e-05	0.9346234058607964	GALNT17	183574	CALN1	1131432	TYW1B	1512481	False	False	False	ref	-100	0.04675	-55	0.08093
3689	chr7	71317799	C	G	rs73179792	0.0292253122	0.4599258243298251	0.0292253122	0.4654895791232867	0.0482029589446195	0.064228648796241	0.0014317500135876	0.2350744389031963	0.0014317500135876	0.2382269878422822	0.0025254857972352	0.8962520011266616	7.097765668510238e-05	0.8160357579940437	7.097765668510238e-05	0.8229280077509704	0.000109046090176	0.7982934335116508	3.1148072741336577e-06	0.7141056805917783	3.1148072741336577e-06	0.7206238371384517	0.0002812510309788	0.8127662065665221	0.0002812510309788	0.8195978069498362	GALNT17	185654	CALN1	1129352	TYW1B	1510401	False	False	False	alt	95	0.1084	10	0.03894
3690	chr7	71320065	A	G	rs28678480	0.02012110402	0.4723673007747864	0.02887937774	0.4738568713820972	0.0173995509810125	0.5818999271921186	0.0003757268576364	0.5273882620077096	0.0005173080917569	0.5289849031694077	0.2524850714262148	0.1381097680505626	0.0051114132851273	0.2167269814027934	0.007804428071981	0.2176681670763568	0.0044163935157369	0.182286060293749	0.0001009421679376	0.2561412436798713	0.0001430882281114	0.2570287752876598	0.0062798983867243	0.2477517717818218	0.0092903566362046	0.248815763118356	GALNT17	187920	CALN1	1127086	TYW1B	1508135	True	False	False	alt	-100	0.03406	-10	0.208
3691	chr7	71326774	G	A	rs12668780	0.0856753282	0.0634161480606654	0.1373374802	0.0638078399579191	0.0317025990803092	0.2015101572083074	0.0033175484909748	0.0769827788653093	0.004498931084338	0.0772744879439723	0.1789449374814423	0.1951223617402052	0.0162519346526045	0.0750707338475531	0.0232120765010256	0.0758937165480872	0.0055344436654693	0.1467497238300577	0.0005753626076366	0.0710377065417639	0.0007345234236051	0.0717132151279846	0.0226015307974002	0.0428978238056192	0.0354038137969713	0.0432558762996911	GALNT17	194629	CALN1	1120377	TYW1B	1501426	False	False	False	alt	10	0.007935	95	0.04883
3692	chr7	71344341	G	A	rs7385083	0.110204352	0.0960752452948785	0.110204352	0.0972519843565277	0.0550890701727484	0.0414154949185887	0.0065413068718914	0.048928953522974	0.0065413068718914	0.0492722621260961	0.1634002507340569	0.2159736119006886	0.0198424056180359	0.0960707037894396	0.0198424056180359	0.0977983163651525	0.0093804400586141	0.0854957686316248	0.0011939129415607	0.0542997312937427	0.0011939129415607	0.0551273380218509	0.0292179406816007	0.0624893584171813	0.0292179406816007	0.0634219365210026	GALNT17	212196	CALN1	1102810	TYW1B	1483859	False	False	False	alt	-75	0.03162	-35	0.0779
3693	chr7	71348898	A	G	rs73181662	0.071408642	0.1768808332175327	0.071408642	0.179493943829293	0.0796653032487098	0.0107317227855426	0.0057377180210212	0.0477299469889322	0.0057377180210212	0.0481402413027556	0.7924251921744581	0.0077119135501195	0.0564629513627621	0.0228649047095037	0.0564629513627621	0.0232056992090163	0.063243690139249	0.0009857860843561	0.0045428322994897	0.0093638674565415	0.0045428322994897	0.0093816680477712	0.010916004090924	0.1889040025588441	0.010916004090924	0.192161598094791	GALNT17	216753	CALN1	1098253	TYW1B	1479302	True	True	False	alt	100	0.07544	100	0.1875
3694	chr7	71349139	C	T	rs9654908	0.1449263552	0.0866863666986198	0.1449263552	0.0871917849585317	0.0277579621307011	0.2698944503951466	0.0046376875268732	0.1167588704503161	0.0046376875268732	0.1176025679678852	0.8726617399623899	0.0027250589750557	0.1314516873889386	0.0116051019285548	0.1314516873889386	0.0115898633517164	0.0243780835715704	0.0152492126584091	0.0042112752333435	0.021630898519674	0.0042112752333435	0.0218171731885819	0.0113886047969383	0.2126809024073673	0.0113886047969383	0.2157807044822987	GALNT17	216994	CALN1	1098012	TYW1B	1479061	True	False	False	alt	80	0.03046	5	0.1855
3695	chr7	71349164	A	G	rs2527310	-0.349839798	0.0064149061299289	0.349839798	0.0064277794042812	0.0552700355695768	0.0408587874921367	-0.0195956021133923	0.007796880518325	0.0195956021133923	0.0077793563424249	0.8654102471050112	0.0033295370735531	-0.3013217818107131	0.0008588827114658	0.3013217818107131	0.0008946572530993	0.0476624834089747	0.0024737561182429	-0.0168026175873465	0.0015848694097365	0.0168026175873465	0.0016040781576862	-0.039403186961829	0.0371779630853572	0.039403186961829	0.0365722559727628	GALNT17	217019	CALN1	1097987	TYW1B	1479036	True	True	True	ref	85	0.02838	-20	0.2246
3696	chr7	71354911	T	C	rs2141885	0.2440531259999999	0.0155788521691069	0.2440531259999999	0.0156627991656526	0.058830498716431	0.0331399502635395	0.0149724747869182	0.0118773162612441	0.0149724747869182	0.0119194611221316	0.0131074527399293	0.6927277256617845	0.0035782975183183	0.3005773850923633	0.0035782975183183	0.3051392398730492	0.000811306335327	0.4978751603807477	0.0002294996717699	0.1792434217375308	0.0002294996717699	0.1821320511307627	0.0084160865692322	0.2453910083903912	0.0084160865692322	0.2491968809570256	GALNT17	222766	CALN1	1092240	TYW1B	1473289	False	True	False	alt	30	0.008385	-100	0.1102
3697	chr7	71362977	T	C	rs7791195	0.0041043982	0.8195545311382896	0.008180855	0.8230713553266022	0.056013432892457	0.0402108811070791	0.0001953712881388	0.5584249792973462	0.0004770685245864	0.5610259900833457	0.1639388340866351	0.2134607305003842	0.0002943179806461	0.4662520384431862	0.001226754821271	0.4687796110190692	0.0095072177222704	0.0834438549588993	9.929296198982534e-06	0.3232546484946975	7.436390292922254e-05	0.3254267960790879	0.0006606512487215	0.5262665576143062	0.0021073207746362	0.5289694923029385	GALNT17	230832	CALN1	1084174	TYW1B	1465223	False	False	False	alt	-100	0.07825	-90	0.3228
3698	chr7	72242898	T	C	rs7799227	0.0033829097	0.7986472645893827	0.0091426130999999	0.8001876483034125	0.0169630484272488	0.594558714744024	4.083770797182e-05	0.7875410620694262	0.0001489551551911	0.78894670460598	0.0072020058724554	0.7806329390792026	1.3411956664308877e-05	0.8395178714761672	6.488317464712303e-05	0.8409283994436768	0.0001175177828821	0.7918016016592542	1.5410800368940917e-07	0.8407115373245582	1.0304714062147677e-06	0.8421555424662409	6.268351423576001e-05	0.8352564686409534	0.0002391870937942	0.8367238800466745	CALN1	204253	TYW1B	585302	POM121	636452	False	False	False	alt	70	0.0304	60	0.10535
3699	chr7	72258110	C	T	rs13231507	0.00354848136	0.8695007248970464	0.005971838	0.8710349148025699	0.0138520806001258	0.7337846087426124	4.956466713493949e-05	0.8798358615427597	8.260555901133868e-05	0.8813372007847932	0.067190953779156	0.3805123036398858	0.0001479420640831	0.6289681110849272	0.0003486041139578	0.6301097884787492	0.000946967359004	0.4515783721327143	2.0142899450915606e-06	0.6658982917857867	4.8410604509448725e-06	0.6670455066342142	0.0003975454455478	0.6672232432737341	0.0008462274421826	0.6685257249433406	CALN1	189041	TYW1B	570090	POM121	621240	False	False	False	alt	-50	0.00299	-75	0.2864
3700	chr7	72260351	C	T	rs7801170	0.0458158516	0.3365690756222119	0.0477610168	0.3395201389759221	0.0229429440235962	0.3856546049085235	0.0010824218725321	0.3534060432972323	0.0011219286760784	0.3563188056693687	0.0383639602784467	0.512895016458883	0.0025968801554223	0.425511063388063	0.0026570669452311	0.4292527716342609	0.0008788461920617	0.4892880555560844	6.123076732177934e-05	0.4146128393267459	6.245317645958144e-05	0.4181739955955241	0.0058237933423509	0.3688498018807433	0.0059969977895812	0.3722915077749676	CALN1	186800	TYW1B	567849	POM121	618999	False	False	False	alt	-60	0.05188	95	0.0855
3701	chr7	72261158	A	C	rs12537428	-0.01343723436	0.712434907580571	0.01434754248	0.7079834287508631	0.0317483082262927	0.1960941066581145	-0.0003842149917557	0.611113723562987	0.0004161594922767	0.6069421803507308	0.017258585991884	0.6485758161389107	-0.0002393683786625	0.732738735739823	0.0002539828317774	0.7289235526468194	0.0005366806954142	0.5643042882374851	-6.845277221550804e-06	0.6695812850727294	7.358127096712232e-06	0.6658481188140924	-0.0007505526046649	0.7146631006402797	0.0008280822143775	0.7109035068356482	CALN1	185993	TYW1B	567042	POM121	618192	False	False	False	ref	-100	0.04886	-90	0.1417
3702	chr7	72261889	C	T	rs10486883	-0.272217124	0.0124421873102041	0.272217124	0.0123384192288976	0.0438100640388147	0.0882504994555571	-0.0134726716036997	0.0170958052306721	0.0134726716036997	0.0169910000387655	0.0065751707300979	0.7864141717770372	-0.0017679031972357	0.3991408870450464	0.0017679031972357	0.3942308248702671	0.0002888644699016	0.6621368664545684	-8.842238026098655e-05	0.2943191613842694	8.842238026098655e-05	0.2900110607637562	-0.0041931971891392	0.3767558004542797	0.0041931971891392	0.3717797816742441	CALN1	185262	TYW1B	566311	POM121	617461	False	True	False	ref	100	0.05356	95	0.2316
3703	chr7	72289021	C	T	rs12154550	-0.1287446179999999	0.0636360579394098	0.1287446179999999	0.0627828356314131	0.0306980921436876	0.2122236756078276	-0.0039510129221125	0.0753710983615453	0.0039510129221125	0.0745617031587538	0.0034574906799511	0.867159938034121	-0.0004536998606395	0.5969941300797503	0.0004536998606395	0.5908297617291262	0.0001065220227254	0.8009974196281491	-1.3989580023845505e-05	0.5282909821329973	1.3989580023845505e-05	0.5224001462924864	-0.0015151265217247	0.5766742891611008	0.0015151265217247	0.5705756886274109	CALN1	158130	TYW1B	539179	POM121	590329	False	False	False	ref	45	0.0054	50	0.08887
3704	chr7	72298876	C	T	rs4719223	-0.082612408	0.1480680302298379	0.082612408	0.1460019564177146	0.0270575583050932	0.2806696570903162	-0.0022171892673075	0.1556585625980903	0.0022171892673075	0.1536567659599344	0.2823364455148295	0.1195316664391857	-0.0230024899631644	0.0727464374983805	0.0230024899631644	0.0714195779189171	0.0076387080671032	0.1042971679725608	-0.0006179521535466	0.077815705164651	0.0006179521535466	0.0764900706745773	-0.0269844280954108	0.0639543263678565	0.0269844280954108	0.0628884214816476	CALN1	148275	TYW1B	529324	POM121	580474	False	False	False	ref	-35	0.01062	-80	0.1321
3705	chr7	72310924	A	C	rs5025436	0.01106195842	0.6874320450209889	0.0134176595399999	0.6922026981070902	0.0470167247197186	0.0682324902521964	0.0005548133569829	0.475677915483685	0.0006452276120934	0.4790905001843443	0.0095072745867836	0.745274109935158	0.0001391982824918	0.7751496353089516	0.0001743266813873	0.7797509795310861	0.0004378968583613	0.5999375563301818	6.81917263450715e-06	0.6698732356043907	8.167437070190031e-06	0.6743907996167838	0.0005196133416911	0.7565967138875829	0.0006466299363267	0.7612116614373438	CALN1	136227	TYW1B	517276	POM121	568426	False	False	False	alt	-20	0.00775	70	0.1816
3706	chr7	72317475	A	G	rs78928669	0.230279428	0.0174956781952948	0.230279428	0.0176321852080263	0.0532636610262091	0.0466786382782856	0.0129750873590626	0.01489750815764	0.0129750873590626	0.0149811825735352	0.0441572366467618	0.4758667595959453	0.0090252322658936	0.1603610259415085	0.0090252322658936	0.1635224728251608	0.0022010369903259	0.3046145737033789	0.0004730848019264	0.0950490279777356	0.0004730848019264	0.0968738625382939	0.0198846953251294	0.0969225258823724	0.0198846953251294	0.0987622704017275	CALN1	129676	TYW1B	510725	POM121	561875	False	True	False	alt	95	0.02841	-25	0.01538
3707	chr7	72321736	G	A	rs2944829	-0.0582002086	0.2521464248740414	0.0582002086	0.2484704577013735	0.0188895360572695	0.5244984790342337	-0.0011085799622628	0.3106676138795835	0.0011085799622628	0.3065419760781165	0.1608731153706574	0.2140014441456008	-0.0104480816997465	0.1623018329839316	0.0104480816997465	0.1593877514537566	0.0030653716209241	0.2394153035235457	-0.0002011206318524	0.190867740420219	0.0002011206318524	0.1878420483784546	-0.0158127412490514	0.1368021417146182	0.0158127412490514	0.1343642983238197	CALN1	125415	TYW1B	506464	POM121	557614	False	False	False	ref	100	0.0535	95	0.1667
3708	chr7	72328401	T	C	rs2944825	0.145253016	0.0520200800308117	0.145253016	0.0526916366853108	0.0191446665639467	0.5153052939598294	0.0029092272595822	0.1199542988985522	0.0029092272595822	0.1214409662538143	0.0010301540694796	0.9654128906169326	0.0001508571304738	0.7472373180774636	0.0001508571304738	0.7536652109936288	1.793780809512493e-05	0.9619575491075664	2.7441016104416127e-06	0.7402050796578351	2.7441016104416127e-06	0.7467121093744543	0.0004198145887631	0.767171438682493	0.0004198145887631	0.7737827690685493	CALN1	118750	TYW1B	499799	POM121	550949	False	False	False	alt	-100	0.0418	-25	0.11304
3709	chr7	72330742	T	C	rs11768943	-0.0155303202	0.4231172240120262	0.0334747202	0.4207771648651919	0.0266210732453882	0.2904032032352641	-0.0003818900587653	0.3528705793656188	0.0009270606698695	0.3510296210752	0.0049239549998349	0.8262815375958154	-9.409569942862648e-05	0.7382170647555925	0.0001794190688918	0.7346799833982566	0.000130031999555	0.777520232152293	-2.313162569119447e-06	0.6891911370474311	4.905380388570651e-06	0.6858621286278475	-0.0003043449572762	0.7255008834382926	0.0006573521163933	0.7220516964554986	CALN1	116409	TYW1B	497458	POM121	548608	False	False	False	ref	-35	0.03192	10	0.03864
3710	chr7	72348675	G	A	rs2944814	-0.174454846	0.0337012049660801	0.174454846	0.0333924608535687	0.0383909687652982	0.1236906037376745	-0.0069054112072314	0.0373223253067564	0.0069054112072314	0.0370207521276101	0.155225000824783	0.2230439191718544	-0.025869677960258	0.0645726563572821	0.025869677960258	0.0632635656938717	0.0057398752313801	0.1420498198117482	-0.0009848112770746	0.0519000528688165	0.0009848112770746	0.0509603255727293	-0.0408680017155487	0.0309240203037752	0.0408680017155487	0.030427646953778	CALN1	98476	TYW1B	479525	POM121	530675	False	False	False	ref	100	0.0699	100	0.4316
3711	chr7	72350185	T	G	rs11764286	0.01689892156	0.4125769855639087	0.0346694720399999	0.4140335415539878	0.0152064761175164	0.6748737090341335	0.0003289545472783	0.4873260071526489	0.0005851948579903	0.4888452292246862	0.007328197684009	0.7738563891124198	0.0002153764034877	0.6911252660497091	0.0002967210963483	0.6925609193825715	0.0001154662297948	0.7965426025839821	4.113768763639675e-06	0.7043469883415989	5.2779865332841375e-06	0.706035607489913	0.0007159117152188	0.6612626705576464	0.0010606710435155	0.6628567979840494	CALN1	96966	TYW1B	478015	POM121	529165	False	False	False	alt	100	0.1538	40	0.01898
3712	chr7	72354867	G	A	rs2944808	0.0098218625799999	0.6780867603729015	0.01596922478	0.6798954008506423	0.0232419506164999	0.3781585758625846	0.0001878695123237	0.6273200936122917	0.0003468082730938	0.6286514019306836	0.0745059549338523	0.3598015582244744	0.0008825010987643	0.4775961607843984	0.0012050912460825	0.4792530545517578	0.0016974311885794	0.3410872661731517	1.7631636770556383e-05	0.4583923157950789	2.5803034179602244e-05	0.4599319681264144	0.0018277193098214	0.47974049092543	0.0027415789647322	0.4813643949267195	CALN1	92284	TYW1B	473333	POM121	524483	False	False	False	alt	95	0.0332	60	0.1156
3713	chr7	72354869	A	C	rs2968518	0.0319954422	0.4548401440743133	0.0319954422	0.4602083577503897	0.0245144547893884	0.3396107131242004	0.0007418732422642	0.4132390899945624	0.0007418732422642	0.4184326370664445	0.0786372933918378	0.3493378147187856	0.0026178501383214	0.3447720889533351	0.0026178501383214	0.349717574844673	0.0018732768721721	0.3248080093479126	5.951822221949589e-05	0.330150138299089	5.951822221949589e-05	0.3349105192536987	0.0057132724093562	0.3207004138402201	0.0057132724093562	0.3253862149552596	CALN1	92282	TYW1B	473331	POM121	524481	False	False	False	alt	60	0.02338	70	0.0984
3714	chr7	72373222	G	A	rs2968538	-0.0415429658	0.3515672804734887	0.0415429658	0.3467298557066222	0.0153322901310923	0.676825603969343	-0.0006446696463626	0.4411523866791641	0.0006446696463626	0.4357962240096203	0.0037742073834581	0.8571771104285869	-0.0001557650968354	0.7397861402509378	0.0001557650968354	0.7333726866961462	5.579518627691643e-05	0.8733187701981	-2.3485577234005868e-06	0.7571572327190427	2.3485577234005868e-06	0.750626464501714	-0.0006086899145524	0.7227949311635952	0.0006086899145524	0.7164100161107442	CALN1	73929	TYW1B	454978	POM121	506128	False	False	False	ref	55	0.01541	45	0.03064
3715	chr7	82757157	A	G	rs6963266	-0.0542696333999999	0.2673394001521013	0.0542696333999999	0.263497165439327	0.0309952108286093	0.2091153724402155	-0.0016856400361878	0.2093385578174394	0.0016856400361878	0.2064131474687311	0.0094602619511068	0.7334976805692905	-0.0005217254655993	0.580440788574548	0.0005217254655993	0.5745638929988653	0.0002938133617565	0.6534831814949483	-1.6242914644737686e-05	0.510700148586694	1.6242914644737686e-05	0.5050706079634655	-0.001821121045165	0.5415121194465834	0.001821121045165	0.5356174002908455	CACNA2D1	313201	PCLO	405773	SEMA3E	891982	False	False	False	ref	-45	0.02563	30	0.0376
3716	chr7	82804606	C	A	rs6467913	-0.0618814318	0.2314119008292886	0.0618814318	0.22845777767086	0.041228957180806	0.1008561157236506	-0.0024282044332923	0.1636508498689295	0.0024282044332923	0.1617647385296289	0.088269935007093	0.3308787274259039	-0.0054949517368256	0.2584334923192324	0.0054949517368256	0.2543225348088242	0.0036793768227374	0.2143048675564851	-0.0002106234449487	0.1939598106804186	0.0002106234449487	0.1907548257113795	-0.0113292204150307	0.2074735493023713	0.0113292204150307	0.2040023640661297	PCLO	358324	CACNA2D1	360650	SEMA3E	844533	False	False	False	ref	-45	0.012146	-20	0.01465
3717	chr7	82806065	C	A	rs13235048	0.011725889886	0.7236955701332155	0.012553272126	0.7284139531512557	0.0103233609742314	0.8971146362149091	0.0001204694539088	0.8134601271616021	0.0001302656123311	0.8180193188896778	0.2320782884101481	0.1524933139834605	0.0023943018031215	0.3706408326637699	0.0025125704296175	0.3744298207518589	0.002314429892059	0.2880992474492194	2.455303280911409e-05	0.4714932499012645	2.5953326610175063e-05	0.4757471777883964	0.0036018277193097	0.4242792156029414	0.0038426643792681	0.428524904584553	PCLO	356865	CACNA2D1	362109	SEMA3E	843074	False	False	False	alt	-100	0.0354	-100	0.2266
3718	chr7	82810877	T	C	rs17284668	-0.0169962679	0.5853124894854607	0.0222420391	0.5810910910041521	0.045347021177944	0.0756049617628761	-0.0007451533261975	0.3586978320315572	0.0010124202154928	0.3559000418709253	0.4895706179274851	0.0463835554108265	-0.0078270111696506	0.1597249550156977	0.0106058932053957	0.157768264142999	0.0222968109132311	0.0181393446058313	-0.0003423892591082	0.1068020809742238	0.0004839705673149	0.1055725041226768	-0.0054806835802183	0.2878222766057829	0.0071863349938965	0.2848695854027949	PCLO	352053	CACNA2D1	366921	SEMA3E	838262	True	False	False	ref	40	0.209	-55	0.10156
3719	chr7	82815056	G	A	rs2189246	0.04548515336	0.3582020554525448	0.04548515336	0.3624868467520408	0.0254301928825717	0.3209656547872023	0.0012165702664256	0.3311982977575821	0.0012165702664256	0.335280324494184	0.0358838375507241	0.5082027588080289	0.0015038211585061	0.4671584635837765	0.0015038211585061	0.47257811958564	0.000862937486435	0.4691134046921265	3.920175862337295e-05	0.4326053219574225	3.920175862337295e-05	0.4379719527117194	0.0038599848239912	0.4304342969380539	0.0038599848239912	0.4358148171283276	PCLO	347874	CACNA2D1	371100	SEMA3E	834083	False	False	False	alt	70	0.02542	-100	0.1997
3720	chr7	82817929	C	A	rs2189247	0.0160934495999999	0.6447205118378027	0.0160934495999999	0.6512700944633691	0.0257715720505796	0.3114326562026147	0.0004076890312831	0.5470281204395305	0.0004076890312831	0.5530121747346366	0.2733058955494704	0.1236800539912712	0.004404705074771	0.2488572366653146	0.004404705074771	0.2529474399030081	0.0070222642182359	0.1140334097748945	0.0001109103525457	0.2335913971665502	0.0001109103525457	0.2374253636110588	0.0054765596648081	0.3136253716669062	0.0054765596648081	0.3182212917968962	PCLO	345001	CACNA2D1	373973	SEMA3E	831210	False	False	False	alt	100	0.01544	95	0.0619
3721	chr7	82820719	A	C	rs2715148	-0.01647610524	0.6703074138541121	0.01647610524	0.6639135693307949	0.0158303658993965	0.654321316362463	-0.0002639309848031	0.6964750016476268	0.0002639309848031	0.6898576517157584	0.2303363465408597	0.1546681669786864	-0.0033516254643184	0.3086010942224478	0.0033516254643184	0.3041974974797914	0.00355003798676	0.217274988890484	-5.175453387290486e-05	0.3530631410299795	5.175453387290486e-05	0.3483413761455478	-0.0046303322226254	0.3670835214613046	0.0046303322226254	0.3622914427459459	PCLO	342211	CACNA2D1	376763	SEMA3E	828420	False	False	False	ref	-75	0.01435	85	0.1012
3722	chr7	82848332	A	G	rs2522839	-0.0115420002	0.6698582136296785	0.015586543	0.6670078584469072	0.0220484502205757	0.4144570383833123	-0.0002264413892164	0.6331901109073003	0.000319418671376	0.6304735414098763	0.0009064366071722	0.969280269833582	-1.5569383139363758e-05	0.9366461542546282	1.7648933273206872e-05	0.9349743391906298	1.933773307494923e-05	0.9571974225784444	-2.973381765960109e-07	0.9256319564361398	3.460057045239297e-07	0.9238766909595352	-6.515786348189554e-05	0.9348424244098174	7.010656197419206e-05	0.9330949539667128	PCLO	314598	CACNA2D1	404376	SEMA3E	800807	False	False	False	ref	85	0.0274	-50	0.2021
3723	chr7	82849280	C	T	rs2107069	-0.00727229086	0.8066940441743875	0.00902689634	0.8048624241196274	0.0142523955946049	0.7260000663717597	-0.0001055457695964	0.8302972837899684	0.0001311626848977	0.8286053290277507	0.0022747517402922	0.9135153940241738	-1.8018751016286035e-05	0.9330211589374792	2.165206112153146e-05	0.9318462502910996	3.164315352067875e-05	0.9282840091842384	-2.6818805061262737e-07	0.9387617419439308	3.159494288187208e-07	0.9375686617696712	-6.268351423573641e-05	0.92379646323553	8.742700669721902e-05	0.9226708294832006	PCLO	313650	CACNA2D1	405324	SEMA3E	799859	False	False	False	ref	100	0.03275	55	0.1272
3724	chr7	82874126	T	C	rs1986742	0.0834473437999999	0.1653685190832655	0.0834473437999999	0.1672328285502248	0.0217617019246884	0.4182534513266248	0.0023642292131803	0.2055121444699826	0.0023642292131803	0.2078411766445064	0.0325385173699316	0.5347530726646219	0.0028884542670516	0.3523243539927675	0.0028884542670516	0.3569328571603841	0.0007662652671592	0.5165419219373253	8.846689994125425e-05	0.3408563758725829	8.846689994125425e-05	0.3454011003713054	0.0073364455148295	0.2875996330933145	0.0073364455148295	0.2917639961213253	PCLO	288804	CACNA2D1	430170	SEMA3E	775013	False	False	False	alt	100	0.0928	0	0.0
3725	chr7	82965320	T	C	rs11761974	-0.00755542	0.730461899636937	0.0130097552	0.7269959825418622	0.0691789196509403	0.0186667583462589	-0.0005031875547687	0.3570935414231337	0.0009367547917521	0.354913219321281	0.0093167496948302	0.7419577460892219	-9.76418051671884e-05	0.7771578485660051	0.0001395016832153	0.7737553960278436	0.000640440487035	0.5263915518024135	-6.436244326095682e-06	0.6065584340316338	9.763702295257649e-06	0.6034312063238886	-0.0002894988617993	0.767299002229444	0.0004726007060142	0.7639514776322927	PCLO	197610	CACNA2D1	521364	SEMA3E	683819	False	False	False	ref	-80	0.03104	-90	0.03943
3726	chr7	82973122	G	T	rs62458571	-0.14157814	0.0540593784822154	0.14157814	0.0534245920121682	0.0605400578433085	0.0296714108370418	-0.0086347310324284	0.0258600012287942	0.0086347310324284	0.0257187834993246	0.0566790933984361	0.4234104634902939	-0.0087658264280989	0.1845852801056855	0.0087658264280989	0.1813994613817683	0.0034925210215187	0.2273679408335821	-0.0005407456500661	0.1005979391013155	0.0005407456500661	0.0987862348783241	-0.0187893833921678	0.1140382360825314	0.0187893833921678	0.1120490400549853	PCLO	189808	CACNA2D1	529166	SEMA3E	676017	False	False	False	ref	-50	0.0685	50	0.0581
3727	chr7	86603267	C	T	rs13244678	-0.0338877574	0.3953549115923487	0.0376352414	0.3924848874926844	0.0261518596070376	0.2994595525097574	-0.0009418400403372	0.3557756982687755	0.0010554032593293	0.3534942637440899	0.0033477945300385	0.8902505935740594	-0.0001688246280414	0.79074780822524	0.0001742027270096	0.7867332423823451	8.833489140788446e-05	0.8468744861457138	-4.600120011685094e-06	0.7473113505017815	4.763097149561018e-06	0.7432105096734927	-0.0005658011942858	0.775873197619647	0.0005921942529114	0.7717278890244795	GRM3	40643	ELAPOR2	456387	DMTF1	549143	False	False	False	ref	80	0.0261	95	0.1621
3728	chr7	86612034	G	T	rs13231757	-0.04585533114	0.3537260678980987	0.04585533114	0.3502714510350679	0.053667069620306	0.0447297078611638	-0.0024055797353279	0.1951715145701625	0.0024055797353279	0.1930111954631231	0.0410354326812047	0.4917290995894851	-0.0031573086306549	0.4240800487329443	0.0031573086306549	0.4192015313672778	0.0022074507699022	0.31186840192551	-0.0001657677176191	0.2998319455070591	0.0001657677176191	0.2961038255765342	-0.0065545511530466	0.3647136177431077	0.0065545511530466	0.3605050344933372	GRM3	31876	ELAPOR2	447620	DMTF1	540376	False	False	False	ref	100	0.1381	100	0.2487
3729	chr7	87583088	G	A	rs117773249	0.00974721174	0.7825941803467511	0.00974721174	0.7893454760273729	0.008401097205957	0.959642729818954	8.694193864929225e-05	0.8697462578823514	8.694193864929225e-05	0.8766193920338973	0.0147223780145821	0.6661337389314059	0.0001059988522802	0.7734937772229523	0.0001059988522802	0.780151528288321	0.000121877053555	0.7868441636404879	9.03064222452593e-07	0.8431441181195676	9.03064222452593e-07	0.8499777107484802	0.000368678037676	0.7766465494083168	0.000368678037676	0.7832477319616407	RUNDC3B	44461	ABCB4	102653	ABCB1	130235	False	False	False	alt	40	0.010376	-95	0.1423
3730	chr7	87591900	A	G	rs1858923	0.051643196	0.310293690917774	0.051643196	0.3140011971704018	0.0412682726042898	0.0994757440291248	0.002239020811088	0.1948362341582234	0.002239020811088	0.197328341956951	0.0049627198046913	0.8413431832365499	0.0002179188431281	0.7150158628121188	0.0002179188431281	0.7213782604853364	0.0002030851758691	0.7315258082152072	9.26626385242044e-06	0.6080198584085251	9.26626385242044e-06	0.614082315827743	0.0007241595460393	0.7032499174746555	0.0007241595460393	0.7096063411483614	RUNDC3B	35649	ABCB4	111465	ABCB1	121423	False	False	False	alt	-10	0.00354	-85	0.0753
3731	chr7	87714706	T	C	rs28656907	0.1193375929999999	0.0729516643053202	0.1193375929999999	0.073944997680205	0.0585008274968261	0.0340309944375007	0.0069268356701646	0.0343312801692554	0.0069268356701646	0.0345274974402471	0.4298620962686813	0.060531340587901	0.051200755705779	0.0262708693160023	0.051200755705779	0.0267723309557367	0.025411122918123	0.0142962290689503	0.0030062224564583	0.015447920986191	0.0030062224564583	0.0155775994638095	0.0387384117976971	0.0331656735812389	0.0387384117976971	0.0336569716430085	ABCB1	1383	RUNDC3B	87157	DBF4	161511	False	False	False	alt	100	0.0779	100	0.2886
3732	chr7	87801354	G	A	rs12704370	0.0033086857799999	0.7997748150218342	0.00924280642	0.7989181698073682	0.0151270158263709	0.6868357720971857	5.6945326771428016e-05	0.8170184973541322	0.0001427916734032	0.8161827031661892	0.0007084886674804	0.9744872959791918	1.2800661339147864e-06	0.9761998679884728	5.374407720497377e-06	0.9771223615232276	1.0823173043162776e-05	0.9764690202750768	2.2802989455959337e-08	0.9758756079088212	8.285895162237144e-08	0.9768286692598392	8.247830820494072e-07	0.9782144905032798	1.732044472303781e-05	0.9783438247249586	DBF4	74863	SLC25A40	75006	ABCB1	88031	False	False	False	alt	60	0.03244	10	0.01886
3733	chr7	87904753	A	C	rs77491588	-0.00096954378	0.8405272265188389	0.0073708633799999	0.839732311435532	0.0248416837227867	0.3352296777905391	-1.0157701820986596e-05	0.7594433136321708	0.0001838763071232	0.7586957520794102	0.0032166540199927	0.8924425944309001	-2.1094475241508014e-05	0.9243022710044906	2.7727552701790755e-05	0.9231451380983062	6.999174891547239e-05	0.8627939722704376	-4.151640400887888e-07	0.9029312280341584	5.922942099322102e-07	0.9018058956790572	-7.835439279468137e-05	0.9196810198484284	0.0001030978852561	0.9185214206333028	SLC25A40	28393	DBF4	28536	ADAM22	29391	False	False	False	ref	80	0.00734	100	0.0859
3734	chr7	94589318	C	T	rs79065506	-0.096530605	0.1230793737729903	0.096530605	0.1214225789214019	0.0216535020960837	0.4289193297227003	-0.0022857583951727	0.1774049050893781	0.0022857583951727	0.1751619970905711	0.0094206723631684	0.7346034894564204	-0.0009588193309468	0.5083844162643953	0.0009588193309468	0.5025876444473518	0.0002034788522793	0.7133105119099165	-2.327270132180662e-05	0.4930535258906038	2.327270132180662e-05	0.4872115289685941	-0.0030112830325623	0.4592643492558053	0.0030112830325623	0.4534976267297279	PEG10	67008	SGCE	67254	CASD1	80098	False	False	False	ref	85	0.1464	0	0.0
3735	chr7	94589324	G	T	rs78742611	-0.1132419873999999	0.0888713330734314	0.1132419873999999	0.0877156737357877	0.0224130030010271	0.4044660708028482	-0.0025535814938202	0.1407007390327421	0.0025535814938202	0.1388414793735008	0.0092037544125894	0.7379583585751529	-0.0010469600484293	0.4829995315326451	0.0010469600484293	0.4775102686408373	0.0002093308753128	0.7086970259788045	-2.4318058709935e-05	0.4648897022550723	2.4318058709935e-05	0.4592515811020448	-0.0032809871003925	0.4331388722214885	0.0032809871003925	0.4276675316666842	PEG10	67002	SGCE	67248	CASD1	80104	False	False	False	ref	75	0.1356	0	0.0
3736	chr7	94605787	C	A	rs6979891	0.0233813001	0.5477161424217621	0.0233813001	0.5540627550745402	0.025026110768696	0.3258582707363665	0.0005688124154494	0.4692965751208749	0.0005688124154494	0.475205767341024	0.0014276995150275	0.9509783235324508	3.81260221553461e-05	0.8884455806424376	3.81260221553461e-05	0.8953131750446482	3.253651535625748e-05	0.9275583910434826	8.736946198521703e-07	0.8610951232300452	8.736946198521703e-07	0.8679108048462664	0.000133614859292	0.8901401526097144	0.000133614859292	0.8969708761058314	PEG10	50539	SGCE	50785	CASD1	96567	False	False	False	alt	-15	0.000763	-20	0.01117
3737	chr7	94627959	G	A	rs883176	0.01255188928	0.7224489216052187	0.01255188928	0.7291575142203034	0.0283865587004124	0.2545183660696871	0.0003600473688829	0.5904677597323679	0.0003600473688829	0.5967105429327908	0.0049322028306554	0.8289812894499046	6.165571656331094e-05	0.838498552448292	6.165571656331094e-05	0.8453234950305063	0.0001361860300652	0.7719940781651332	1.7148389798038443e-06	0.7899504686818343	1.7148389798038443e-06	0.7966556595751119	0.0002466101415327	0.8263729235540018	0.0002466101415327	0.8331518421166404	PEG10	28367	SGCE	28613	CASD1	118739	False	False	False	alt	90	0.006836	90	0.0345
3738	chr7	94643899	G	T	rs17166402	0.01557968	0.6552089288309791	0.01557968	0.6617312936661278	0.0148825047397626	0.695817068543129	0.0002344761112065	0.6862212686827955	0.0002344761112065	0.6929111871837925	0.1833253604302068	0.1919661406406249	0.0024564270974946	0.3385003416106996	0.0024564270974946	0.3433749266127096	0.0027141216806426	0.2621353214503985	3.6807339716786415e-05	0.3851683931907058	3.6807339716786415e-05	0.3905174149541222	0.0041536076012008	0.3772469062730251	0.0041536076012008	0.3826269036704938	PEG10	12427	SGCE	12673	CASD1	134679	False	False	False	alt	100	0.012985	35	0.005737
3739	chr7	94643922	G	A	rs17166404	0.014561476	0.630076751848984	0.0177117696	0.6342479474841836	0.0152656646362468	0.6802475557718487	0.0002305268372929	0.6638671017889121	0.0002758398325975	0.6681209959403498	0.1875086602223614	0.1879006063557237	0.0024574862443438	0.3109188779581655	0.0029478520853982	0.3136256597491912	0.0029032524092201	0.2530853678580462	4.005830166377361e-05	0.3558694602726134	4.711159505466948e-05	0.3588279442062623	0.0038715317871399	0.3455489569070675	0.0047787931773943	0.3486097891326088	PEG10	12404	SGCE	12650	CASD1	134702	False	False	False	alt	90	0.02492	-20	0.01965
3740	chr7	94644326	T	C	rs17166406	0.172164896	0.0379485317876301	0.172164896	0.038333543697167	0.0393704491646863	0.1132703242650573	0.0067204238640204	0.0396738824475476	0.0067204238640204	0.0399442530858299	0.3606100095674837	0.0831004982037291	0.063186762533897	0.0212689973569994	0.063186762533897	0.0215752073055959	0.0144284247489954	0.0429702175606266	0.0024996046504514	0.0208665974639508	0.0024996046504514	0.0211045384308768	0.0582593777836428	0.0165785254591434	0.0582593777836428	0.0167341346869276	PEG10	12000	SGCE	12246	CASD1	135106	True	False	False	alt	45	0.04544	65	0.1992
3741	chr7	94644720	T	C	rs13241095	0.0081284388	0.3354415489885789	0.0438970416	0.336064040054078	0.0188631069468661	0.5141129633869799	-0.0001139954872106	0.3808075946338963	0.0008130403979245	0.3815501491574527	0.2000156708785589	0.1756142146064263	0.0027837880579804	0.1674800382704817	0.0095971956113343	0.1678083058964229	0.0036079809909105	0.2132817765293576	-7.67879384374169e-06	0.2012309715780582	0.0001640570608889	0.2016696889269891	0.002470225330738	0.1618847295756958	0.0131082775230114	0.162223087231035	PEG10	11606	SGCE	11852	CASD1	135500	True	False	False	alt	-100	0.05795	-100	0.2129
3742	chr7	94645049	T	G	rs13241489	-0.0271633304599999	0.5069207977999354	0.0271633304599999	0.5009966377094605	0.0159427875651222	0.6495350098334415	-0.0004439211791242	0.5536192096284387	0.0004439211791242	0.5476109937271038	0.0336692949754214	0.5127257556099196	-0.0009745161373506	0.5011684129239994	0.0009745161373506	0.4954907967554744	0.0005482775611277	0.5492376431708252	-1.6236253976765893e-05	0.5279879898430038	1.6236253976765893e-05	0.5222227961913302	-0.0027712711556859	0.4729058268338545	0.0027712711556859	0.4672483148685425	PEG10	11277	SGCE	11523	CASD1	135829	False	False	False	ref	0	0.0	-90	0.0704
3743	chr7	94652446	T	C	rs13307062	-0.00260928748	0.8191557967693127	0.00846020348	0.8175482215783235	0.0083552498644989	0.9639722089106286	-2.4357152896919474e-05	0.903141194320964	6.90653336106137e-05	0.9017264708616366	0.0115609844610866	0.712108762801543	-9.888498833132242e-05	0.8033049207661375	0.0001463447357838	0.8014607315479413	9.633425052119602e-05	0.8210841839296269	-8.458816214477824e-07	0.8674534430983072	1.2091687172720896e-06	0.8656680705429224	-0.0002936227772095	0.7962732074036499	0.0004503315627989	0.7944497077425882	PEG10	3880	SGCE	4126	CASD1	143226	False	False	False	ref	-25	0.00592	85	0.04547
3744	chr7	94782211	T	C	rs34376444	0.0423230854	0.3331663922538832	0.0423230854	0.3377332486147202	0.0113418577796583	0.8505680717866196	0.0004822211451357	0.5053051585442873	0.0004822211451357	0.5113808313453945	0.0175406618059449	0.6346947595750028	0.0007309799151601	0.521517395029738	0.0007309799151601	0.5272689992316243	0.0002017213819804	0.7165970567175336	8.398353708484832e-06	0.5930134871988681	8.398353708484832e-06	0.5989767948808047	0.0023663026623997	0.4844237968501209	0.0023663026623997	0.4903752259875842	PPP1R9A	124992	SGCE	125639	PEG10	125885	False	False	False	alt	65	0.01034	-90	0.0268
3745	chr7	94819397	C	T	rs34578239	-0.0868348016	0.0782298708781735	0.1265951544	0.0782161616813595	0.0190877035840539	0.5048683456168652	-0.0022446956076412	0.1486910217557545	0.0028083558011774	0.1485449902851413	0.4769225693642571	0.0491350844274665	-0.0402451898543288	0.0246333227115038	0.0608657034342662	0.0247472454896879	0.0091465326498076	0.0845250069215759	-0.0010754751866714	0.0489872295309434	0.0013694859647052	0.0490260257208376	-0.0296781696413842	0.0360599280330843	0.0417364983009468	0.0360348478110888	PPP1R9A	87806	SGCE	162825	PEG10	163071	False	False	False	ref	80	0.03784	75	0.4023
3746	chr7	100668458	T	C	rs221786	0.1319417852	0.071204719186305	0.1319417852	0.0722890007109887	0.0289518273197338	0.2563851209393624	0.0049692990609561	0.0930543228735254	0.0049692990609561	0.0941879630572527	0.0299478737092144	0.5343961262874042	0.0038161375796207	0.2789695602853781	0.0038161375796207	0.2833197149233047	0.0008464028005011	0.4781171709576813	0.0001445562178609	0.2474487014354608	0.0001445562178609	0.2512709692999578	0.0095798554980039	0.2118041348869812	0.0095798554980039	0.2154465027328012	GNB2	5110	ACTL6B	12010	TFR2	25679	False	False	False	alt	-60	0.003418	-90	0.254
3747	chr7	100681034	A	G	rs221792	0.1412962608	0.0532492820351464	0.1412962608	0.0539628491961547	0.0278522733293815	0.2658901606845537	0.0039455341676291	0.0765053822662247	0.0039455341676291	0.0775016092621143	0.3563632014780113	0.0857652831828727	0.0508377498807251	0.0269953055301674	0.0508377498807251	0.0275647695885644	0.0098231807698279	0.0764015976598007	0.0014099906446744	0.0358625871257643	0.0014099906446744	0.0364883374925781	0.0466381841575665	0.0233775019034822	0.0466381841575665	0.0237635633922224	GNB2	7466	GIGYF1	13216	ACTL6B	24586	False	False	False	alt	100	0.02031	55	0.010925
3748	chr7	100855586	T	C	rs314370	0.1116962665999999	0.0876267122637762	0.1116962665999999	0.0888462875993206	0.0319725870550304	0.1947639615197851	0.0036815914738432	0.0887833899172201	0.0036815914738432	0.0898198525495356	0.0382649863086008	0.4945694545719165	0.0043937542569196	0.2614191808348372	0.0043937542569196	0.2655924692537534	0.0012139032261833	0.4084353725828482	0.0001429492466728	0.217422155212028	0.0001429492466728	0.2210291939128114	0.0110677641780211	0.1874897928003045	0.0110677641780211	0.1909222022128365	TRIP6	11802	SRRT	19518	EPHB4	28063	False	False	False	alt	25	0.02893	-35	0.06744
3749	chr7	100870078	C	T	rs12705090	-0.0561259925999999	0.2727542436711644	0.0561259925999999	0.2690887700491368	0.0263752411442705	0.29714230697697	-0.0016125182691111	0.2482458326698156	0.0016125182691111	0.2451509849697254	0.0922957012305763	0.3194582368592767	-0.0049638284686622	0.2527982786873917	0.0049638284686622	0.2487571641216675	0.0023439335310101	0.2850898710608937	-0.000141052952896	0.2339405547744424	0.000141052952896	0.2302182763728737	-0.0102025667249512	0.2125317368917354	0.0102025667249512	0.2090391976297173	TRIP6	2690	SRRT	5026	UFSP1	19637	False	False	False	ref	85	0.1326	100	0.09656
3750	chr7	100876668	T	C	rs12667888	0.0872099288	0.1288266633967834	0.0872099288	0.1308870912358366	0.0191435164934859	0.5134842072868845	0.0016705508300364	0.1996467509258686	0.0016705508300364	0.2025503494518451	0.0119890468806703	0.7036063957186869	0.0010558381881981	0.4693536466167017	0.0010558381881981	0.4747799981952078	0.0002367257647799	0.6983566600656813	2.0828043053227627e-05	0.4719675743782983	2.0828043053227627e-05	0.4775905519981154	0.0032323248985516	0.4219555516487096	0.0032323248985516	0.4271752968545917	SRRT	1564	TRIP6	9280	UFSP1	13047	False	False	False	alt	-85	0.02957	-65	0.093
3751	chr7	100879824	A	G	rs12705093	-0.102047825	0.10092977752997	0.102047825	0.0994751184495838	0.0628461364681877	0.0265015522527263	-0.0063429007182191	0.0393693337255267	0.0063429007182191	0.0391027490927049	0.4172858038335917	0.0646860750939264	-0.0423518699838939	0.0345158813140753	0.0423518699838939	0.0339033709894348	0.0271541624261031	0.0123674983489271	-0.0027111649548019	0.0175626196705587	0.0027111649548019	0.0173936398865069	-0.0343406684042096	0.0422110517793312	0.0343406684042096	0.0415916851592868	SRRT	4720	UFSP1	9891	TRIP6	12436	False	False	False	ref	-50	0.00583	5	0.003906
3752	chr7	100896090	G	A	rs17884589	-0.0955238893999999	0.1195442689351795	0.0955238893999999	0.1181593115429497	0.0424965193263391	0.0923897358057527	-0.0041612222446312	0.0881176409009198	0.0041612222446312	0.0873807082766341	0.8407995447197388	0.0049469475623998	-0.0806175394859238	0.0158331043528281	0.0806175394859238	0.0156634612564745	0.0356548771239929	0.0057767066039706	-0.0035000173094027	0.0163764662623894	0.0035000173094027	0.0162336269591358	-0.0116739797433274	0.1941512332824201	0.0116739797433274	0.1908208526705712	ACHE	884	UFSP1	6375	SRRT	20986	True	False	False	ref	-95	0.11694	-35	0.0718
3753	chr7	100897329	G	T	rs17883557	-0.0353111247999999	0.4218184170905734	0.0353111247999999	0.416665240139039	0.0960548143710636	0.0050286753593414	-0.0033009076574416	0.1106380811227787	0.0033009076574416	0.1093447275949122	0.8894798917884597	0.0023553003512594	-0.0313562552391285	0.0571814419010975	0.0313562552391285	0.0562226215198027	0.0854258084203159	0.0003376940445213	-0.0029303427050838	0.0180929160452726	0.0029303427050838	0.0178248575044189	-0.0029634456138035	0.4627849043178966	0.0029634456138035	0.4573611081386952	ACHE	355	UFSP1	7614	SRRT	22225	True	True	True	ref	-100	0.0724	-60	0.04346
3754	chr7	100918383	A	C	rs10278546	0.0881363679999999	0.1324909408596162	0.0881363679999999	0.134352696139105	0.0592235487203074	0.0332900503710138	0.0056971757024001	0.0548026371696535	0.0056971757024001	0.0552776858127931	0.0054666622678235	0.8318882282394491	0.0004829790638903	0.610547157240599	0.0004829790638903	0.616650661960731	0.0003477511768352	0.6643291703642061	3.2569351677508484e-05	0.4456675368577803	3.2569351677508484e-05	0.4508417381814934	0.0015695622051399	0.5826897222896621	0.0015695622051399	0.5886277153731924	ACHE	21409	UFSP1	28668	MUC3A	31152	False	False	False	alt	100	0.03244	30	0.11707
3755	chr7	104953806	T	G	rs2252074	-0.01026277268	0.7542877876963605	0.01119306772	0.7494745057466674	0.0189344951984269	0.5223715324255938	-0.0001775183027453	0.7397877850469033	0.0001988961797659	0.7350985190650954	0.0076663587476492	0.7678863517051185	-8.314913784540175e-05	0.8117786181597186	8.893835308510897e-05	0.8072428867310685	0.0001428418106607	0.7672131587558947	-1.4490529364574564e-06	0.8098619296297732	1.5820872161909965e-06	0.8051785096189581	-0.0003315627989838	0.8024366218762913	0.0003513575929529	0.7979627640009743	KMT2E	12862	ENSG00000289360	87043	ENSG00000288914	87053	False	False	False	ref	-65	0.01056	70	0.1371
3756	chr7	104960407	C	A	rs4727614	-0.01935022308	0.6184361538412437	0.01935022308	0.612192979205603	0.0232488280942773	0.3780201047751318	-0.0004314815887066	0.5767529407721061	0.0004314815887066	0.5707731943086204	0.0001228926792253	0.9994581883358156	-2.046607472910754e-06	0.9943187271481848	2.046607472910754e-06	0.9899507215197508	3.004848579665861e-06	0.9980636806719402	-4.770516842211547e-08	0.9906124562079816	4.770516842211547e-08	0.9849244141617908	-5.773481574345942e-06	0.995705444958881	5.773481574345942e-06	0.991743253173729	KMT2E	19463	ENSG00000289360	80442	ENSG00000288914	80452	False	False	False	ref	70	0.00495	85	0.1401
3757	chr7	104965083	C	A	rs7776707	0.00187861754	0.6368070338259796	0.01779662234	0.637265368596055	0.0192295209823115	0.5125003248910448	3.980891561967073e-05	0.618438800198714	0.0003441253461595	0.6190552350826126	0.000117943980733	0.9992624125760596	-2.4554530265072187e-08	0.9885360301855683	1.861646953426167e-06	0.9904447546121532	2.2927104945007674e-06	0.998666025190908	1.543496576129048e-09	0.9860737912720672	3.639519089092144e-08	0.9876259124547748	-1.6495661640988417e-06	0.9941906168361128	3.299132328197683e-06	0.9938962981327144	KMT2E	24139	ENSG00000289360	75766	ENSG00000288914	75776	False	False	False	alt	85	0.2007	-95	0.06006
3758	chr7	104984179	C	T	rs3823752	-0.02384436264	0.4356950775043428	0.03425101704	0.4322312245770952	0.0709491201806903	0.017585278747896	-0.0018003097308752	0.17690413617796	0.0025429516184749	0.1758328150358867	0.9088606446504568	0.001349380248284	-0.0217287182589544	0.0669154305305652	0.031243016827419	0.0661432359087239	0.0647467827266969	0.0009639999059606	-0.001647032662853	0.0318865803290599	0.002325994068248	0.0316632501785673	-0.0015835835175348	0.5223314935254151	0.0022928969680973	0.5183944111730054	KMT2E	43235	ENSG00000289360	56670	ENSG00000288914	56680	True	True	False	ref	-100	0.128	-100	0.3284
3759	chr7	105071264	T	C	rs11760317	0.0519160756	0.3068912906489616	0.0519160756	0.3107643265144236	0.0246473768229416	0.340795878821912	0.0015551328108811	0.2893638946728964	0.0015551328108811	0.2928471816905466	0.0160247105011381	0.6492465869912475	0.0009464979755599	0.5261633887103144	0.0009464979755599	0.5319381619566594	0.0004055452195896	0.6088366914214979	2.930761375834812e-05	0.4872449458160814	2.930761375834812e-05	0.4927618470144651	0.0028083863943782	0.4822471666989729	0.0028083863943782	0.4879084014636721	ENSG00000288914	30405	ENSG00000289360	30415	KMT2E	130320	False	False	False	alt	40	0.1329	60	0.1238
3760	chr7	105075043	T	G	rs10808141	0.2646714559999999	0.0129460037048634	0.2646714559999999	0.0130493681267692	0.0505495682743432	0.0561691879874113	0.0146783631675605	0.0137416563899561	0.0146783631675605	0.013797460036724	0.0391499785556398	0.4875793293216386	0.0108787135913525	0.1445869075892699	0.0108787135913525	0.1473426216394115	0.0020374878902096	0.3179893741245953	0.0006128173014061	0.0871581783400816	0.0006128173014061	0.0886745024046285	0.0225619412094618	0.0828095705457838	0.0225619412094618	0.084253454664448	ENSG00000288914	34184	ENSG00000289360	34194	KMT2E	134099	False	True	False	alt	55	0.05347	80	0.09106
3761	chr7	105101395	A	T	rs10953468	-0.027715518	0.4985557369295542	0.027715518	0.4929802200628512	0.0175556137543273	0.5785361654217882	-0.000497771180064	0.5177645273907507	0.000497771180064	0.5122051806087148	0.0041981458876315	0.860314783865473	-0.0001060739051015	0.8015262260834086	0.0001060739051015	0.7948695890573941	7.450694886582373e-05	0.8602117007854032	-1.9199914673072687e-06	0.7988065457614875	1.9199914673072687e-06	0.7920320967216177	-0.0003868232654811	0.7926921446199466	0.0003868232654811	0.7861614915269003	ENSG00000288914	60536	ENSG00000289360	60546	KMT2E	160451	False	False	False	ref	0	0.0	80	0.04965
3762	chr7	105179032	T	C	rs6943183	0.0034964218	0.695229772533458	0.0146141642	0.6939937547021832	0.0166651542068687	0.6171382614024862	6.660540724369999e-05	0.7019680849982786	0.0002476308864981	0.7007720047572873	0.0116888258388043	0.7042811102513854	-1.0188712788616484e-05	0.7507896277089928	0.000144882270478	0.7491847475876142	0.0001945233164393	0.7220015924538083	-8.852323074402739e-08	0.7574060514180289	2.4352085319565e-06	0.7557753278732837	-6.763221272803996e-05	0.7368459672797947	0.0005328098710038	0.735305872105225	ENSG00000288914	138173	ENSG00000289360	138183	SRPK2	220276	False	False	False	alt	5	0.000763	-45	0.04797
3763	chr7	105187651	C	T	rs3779210	0.0009274342	0.7547525174238694	0.0107920526	0.756255710710201	0.0097401796230655	0.9210165588589904	1.4454428334808746e-05	0.8347686552689447	0.0001082946734502	0.8362268945290947	0.0062361848833756	0.7958033404633824	6.3812769971635406e-06	0.8449762662901122	5.825620995815144e-05	0.846182794904899	5.900511788106133e-05	0.8721626104427174	9.557758309245905e-08	0.8863359537226462	5.802323238489189e-07	0.8875987895014481	1.7320444723032177e-05	0.837922960683006	0.0002284649137276	0.8391645297576236	ENSG00000288914	146792	ENSG00000289360	146802	SRPK2	211657	False	False	False	alt	10	0.01755	75	0.11206
3764	chr7	105195441	T	C	rs10281886	-0.0184086165199999	0.6216274319816332	0.0184086165199999	0.6150764202311608	0.0117518382801714	0.8343757558802842	-0.0002164610228715	0.7170262379224219	0.0002164610228715	0.7102676612848325	0.0343629375474249	0.508605113698934	-0.0006907982642015	0.5554946245173469	0.0006907982642015	0.5497675263101054	0.0003883458768009	0.6034913457419455	-7.719718747550357e-06	0.6236865408409654	7.719718747550357e-06	0.6175007154431902	-0.0020702055359439	0.5335935272848182	0.0020702055359439	0.5277037640522009	ENSG00000288914	154582	ENSG00000289360	154592	SRPK2	203867	False	False	False	ref	95	0.01077	15	0.04932
3765	chr7	105203881	C	T	rs2240463	0.0156008072199999	0.6714762034527014	0.0156008072199999	0.6781864840838145	0.0179569627487852	0.5622050391400156	0.000270327567557	0.6716711310563646	0.000270327567557	0.6781776365675078	0.0623329814258849	0.3967200019221878	0.0007293296770661	0.5402916490277717	0.0007293296770661	0.5460590842412728	0.0011276508958612	0.4199491727886485	1.293334135535454e-05	0.5493717763545047	1.293334135535454e-05	0.5551568741066789	0.0018994754379597	0.5451416546962328	0.0018994754379597	0.551174086975574	ENSG00000288914	163022	ENSG00000289360	163032	SRPK2	195427	False	False	False	alt	70	0.1653	-25	0.011375
3766	chr7	105204072	G	A	rs10281422	-0.0233149419999999	0.5411676855131231	0.0254416768	0.5370732445711671	0.0484978408397496	0.0629292326523695	-0.0010683746587262	0.309220917015546	0.0011650995488347	0.3066556694880573	0.1027176602553528	0.2975372716074252	-0.002284716911717	0.353510169407178	0.0025430600170299	0.3506293155440127	0.0048750131752975	0.1658006776479146	-9.972769480610332e-05	0.2499414618391083	0.0001114772591682	0.2476052965604536	-0.0045791956715383	0.3478391534443804	0.0051466464319883	0.3446183611423934	ENSG00000288914	163213	ENSG00000289360	163223	SRPK2	195236	False	False	False	ref	20	0.002197	100	0.05963
3767	chr7	105204647	T	C	rs41562	0.0987751092	0.1130443366759072	0.0987751092	0.1144772483143248	0.0209445009537478	0.4364142609695629	0.0024448564901805	0.1674295714733097	0.0024448564901805	0.169443506988485	0.1918329979215466	0.1865914336694871	0.0220100841119974	0.0875836728582213	0.0220100841119974	0.0891727306211005	0.0044485074434841	0.1937241675505004	0.0005879945637717	0.1093993644649684	0.0005879945637717	0.1111865956075901	0.030108706410214	0.0605977211144658	0.030108706410214	0.0615450216373225	ENSG00000288914	163788	ENSG00000289360	163798	SRPK2	194661	False	False	False	alt	-40	0.03183	-80	0.1467
3768	chr7	105204806	G	C	rs2237613	-0.044115021	0.3609859027504462	0.0453530678	0.3580053990600267	0.0136436557208513	0.7435521478724784	-0.0007005018182401	0.4830051357551995	0.0007107525371135	0.4791572170723847	0.1550963346639833	0.2243210912611542	-0.0059917773141336	0.2444199061494172	0.0060946857910566	0.2411191471330336	0.0021737302272505	0.3068282131147162	-9.318405339209562e-05	0.3054029408547719	9.403610994587534e-05	0.3018296815661229	-0.0104038137969713	0.2268603407284476	0.0106034113028273	0.2240007787523208	ENSG00000288914	163947	ENSG00000289360	163957	SRPK2	194502	False	False	False	ref	55	0.1989	-100	0.238
3769	chr7	105215424	C	A	rs4730073	0.0244998567999999	0.4824066073564179	0.0291878319999999	0.4857441229545411	0.0434747797097928	0.085553670136842	0.001103905053856	0.2989299539278343	0.0013201057778463	0.3007278351313037	0.040304674870509	0.5113006915649984	0.0015921556573024	0.4811589692972547	0.0016408550152054	0.4849145517367197	0.0017920327624228	0.3647636277151939	7.33655950182195e-05	0.3719132935527459	7.561151903809551e-05	0.3751452480579723	0.0037288443139454	0.4439924514223236	0.0039102965919962	0.4477670296455975	ENSG00000288914	174565	ENSG00000289360	174575	SRPK2	183884	False	False	False	alt	65	0.010254	55	0.04324
3770	chr7	105231445	G	T	rs10953470	-0.0693449344	0.1914987607870257	0.0693449344	0.1886582447819476	0.0157890389374806	0.6524982267348519	-0.0011140694810227	0.3022044879552404	0.0011140694810227	0.2980805819627047	0.1202137837748671	0.2654123706209487	-0.0082604932003953	0.173252418694944	0.0082604932003953	0.1700874932820122	0.0018912320864815	0.3202720743840883	-0.0001322555770598	0.2209971702227118	0.0001322555770598	0.2173864630740624	-0.0157121177130414	0.1304489521464432	0.0157121177130414	0.128078485128136	SRPK2	167863	ENSG00000288914	190586	ENSG00000289360	190596	False	False	False	ref	-10	0.0249	0	0.0
3771	chr7	105241083	A	G	rs3801282	0.01732854968	0.6236039578894718	0.01932158568	0.62814691333831	0.0159529780656799	0.6406436910571519	0.0002489494748771	0.6697259332261675	0.0002917343118699	0.6740050803361257	0.0033420210484642	0.8841869615717107	0.0001015769176717	0.8347490531175998	0.0001043467584897	0.83908681875742	5.1463420529173474e-05	0.894073305736994	1.5173093643410298e-06	0.8450611121622894	1.5767699977192322e-06	0.8493022918133528	0.0003604302068555	0.8213833400967737	0.0003736267361683	0.8257589802011552	SRPK2	158225	ENSG00000288914	200224	ENSG00000289360	200234	False	False	False	alt	-80	0.01337	-85	0.1497
3772	chr7	105266570	C	T	rs3801278	-0.1370422432	0.0574486014207071	0.1370422432	0.0567174475400593	0.0491825531902391	0.059562961042286	-0.0068916100676549	0.0366754695436239	0.0068916100676549	0.0364724478430899	0.0049140576028503	0.8237353497881701	-0.0006781043138345	0.53700801783987	0.0006781043138345	0.5313233035922876	0.0002395211192655	0.6824697826186863	-3.380545075186595e-05	0.4030565966021622	3.380545075186595e-05	0.3979321943832497	-0.0021386625317541	0.5065377412202335	0.0021386625317541	0.5007388552007266	SRPK2	132738	ENSG00000288914	225711	ENSG00000289360	225721	False	False	False	ref	-35	0.005005	-10	0.00476
3773	chr7	105288617	A	C	rs6466055	0.0008722428	0.7220985412612593	0.0129555304	0.7211745641056184	0.0162927003472263	0.6284494090116877	1.5337836192440105e-05	0.721662546280918	0.0002117952360701	0.7208957551954546	0.0005039424631321	0.9891102129412972	-1.0032582178700586e-06	0.9714910968382596	6.416739071204233e-06	0.9707773097727516	7.810083073411856e-06	0.9886200054412542	-1.1560705033490469e-08	0.9701234056138256	9.905579131962449e-08	0.9692369876205312	-7.423047738444773e-06	0.9751683827860912	2.0619577051235504e-05	0.975775777127972	SRPK2	110691	PUS7	233654	RINT1	243553	False	False	False	alt	-85	0.04388	35	0.03284
3774	chr7	105288820	T	C	rs6466056	0.047965782	0.2957018041433271	0.047965782	0.2999549096089671	0.0176039632934785	0.5747996343191081	0.0008598303879806	0.35707004270406	0.0008598303879806	0.361904534134392	0.0004965194153937	0.9888503961905096	2.4296297557768267e-05	0.9077037911826182	2.4296297557768267e-05	0.9147633057456072	8.431669472286707e-06	0.9862380525158088	4.222964448106187e-07	0.9024281991544578	4.222964448106187e-07	0.9094865713329612	7.093134505623321e-05	0.9226731356261312	7.093134505623321e-05	0.929757592096984	SRPK2	110488	PUS7	233451	RINT1	243350	False	False	False	alt	-100	0.02998	-55	0.02551
3775	chr7	105289803	T	C	rs2057884	0.0053395302399999	0.8750858017889577	0.0053395302399999	0.8819248753483756	0.0196458169828661	0.4980234465802881	0.0001092262855164	0.8396872218664198	0.0001092262855164	0.8464096946018957	0.0031448978918544	0.8904772005594859	2.415476960307261e-05	0.926816704310635	2.415476960307261e-05	0.9337932853545626	6.499071811368685e-05	0.8756601532842145	5.175393034202743e-07	0.9144923910401868	5.175393034202743e-07	0.9213987513446792	9.567483751771664e-05	0.9244238255407582	9.567483751771664e-05	0.9314094248050536	SRPK2	109505	PUS7	232468	RINT1	242367	False	False	False	alt	100	0.1641	55	0.05365
3776	chr7	110407907	C	T	rs4730430	-0.179360812	0.0340742198354982	0.179360812	0.0336848586020505	0.0383118052086695	0.1261343801164517	-0.0074978004458279	0.0384129055884537	0.0074978004458279	0.038062088838041	0.003638942958002	0.8633947740616833	-0.0007623315335203	0.5436849792135345	0.0007623315335203	0.5376276404778021	0.0001540574448255	0.7629092170414907	-3.447030171428127e-05	0.4403128959470594	3.447030171428127e-05	0.4346573283609237	-0.0020784533667645	0.5316169497289487	0.0020784533667645	0.5254837144401082	LRRN3	683100	IMMP2L	1154610	DOCK4	1798500	False	False	False	ref	90	0.02983	40	0.03735
3777	chr7	110413547	A	G	rs55634663	-0.0201184957999999	0.5970307978845737	0.0201184957999999	0.590842207317856	0.021441177326727	0.4333467408060654	-0.0004322833202645	0.5455333715594212	0.0004322833202645	0.5395574867927544	0.0039457622645243	0.8541577695087045	-8.219890015934478e-05	0.8183257640344052	8.219890015934478e-05	0.811566623924571	8.332027017995944e-05	0.8341486287213704	-1.7380495314932528e-06	0.7966273797879463	1.7380495314932528e-06	0.7899017572741478	-0.0003150671373428	0.8124239369527254	0.0003150671373428	0.8056760317315935	LRRN3	677460	IMMP2L	1148970	DOCK4	1792860	False	False	False	ref	-95	0.010315	25	0.0212
3778	chr7	110432071	G	T	rs211792	0.2404347839999999	0.0151239995242636	0.2404347839999999	0.0152437824138254	0.0363899541346594	0.1401431932395146	0.008904047618159	0.0245454714824182	0.008904047618159	0.0247227945906125	0.1492469730460888	0.2318893231600507	0.037485588293454	0.0425463891008087	0.037485588293454	0.0432608608366214	0.005709659668677	0.1490859557657076	0.0014601156653949	0.038438554731279	0.0014601156653949	0.0389512760228207	0.057093959288707	0.0167532032023744	0.057093959288707	0.0169895994000831	LRRN3	658936	IMMP2L	1130446	DOCK4	1774336	False	True	False	alt	100	0.1587	60	0.11304
3779	chr7	110467153	A	C	rs56680698	0.0476220132	0.3132528397290187	0.0476220132	0.3175658463310399	0.0154783508636449	0.6527031912079905	0.0008268030216186	0.3979097768111119	0.0008268030216186	0.403000595729763	0.0203069842631387	0.6080551763315235	0.0010111616701644	0.4928244910745799	0.0010111616701644	0.4984134317006501	0.0003156272298782	0.6443321642284802	1.749942735805405e-05	0.520073537600393	1.749942735805405e-05	0.5259329311633296	0.0031160304839826	0.4438500667751442	0.0031160304839826	0.4492328060087438	LRRN3	623854	IMMP2L	1095364	DOCK4	1739254	False	False	False	alt	65	0.0627	100	0.1652
3780	chr7	110668619	C	T	rs1525674	-3.63433199999999e-05	0.7066208443152718	0.0142906535199999	0.705161087037437	0.0160913776765107	0.6438163752366501	1.7425765279452577e-05	0.7165288293858543	0.0002302871791576	0.7151710943902194	0.0290777275576522	0.5516621792499996	-0.0001511045090357	0.6224875213997244	0.0004796657675252	0.621269998008209	0.0004543287698658	0.5877805614595132	-1.7741277965574577e-06	0.6432555814667045	7.461949567602703e-06	0.6421412140184155	-0.0002960971264557	0.6150725164567284	0.0013188281481969	0.6137885606658156	LRRN3	422388	IMMP2L	893898	DOCK4	1537788	False	False	False	ref	-55	0.003841	-35	0.02167
3781	chr7	111227479	A	G	rs214475	-0.025713423332	0.5272344515301299	0.025884623868	0.5231527611101439	0.0186850468043206	0.533222217608755	-0.0004946273756178	0.5428032357173384	0.0004976094282217	0.5384906751457014	0.0052876843390188	0.8303103844717449	-0.0001707069971297	0.784969282608562	0.0001712555719701	0.7804604896303245	0.0001010677613502	0.8232556025118478	-3.3057116323224555e-06	0.7778367730808161	3.31526697062051e-06	0.7734385383096416	-0.0006317838408498	0.762909724569593	0.0006334334070139	0.7582882741375861	LRRN3	136472	IMMP2L	335038	DOCK4	978928	False	False	False	ref	55	0.02036	85	0.0941
3782	chr7	111269113	C	T	rs6959670	0.201394772	0.023629448110692	0.201394772	0.0238417810382124	0.0429577190838363	0.0885855908841183	0.0087261455989982	0.0250833086562691	0.0087261455989982	0.0251537489742036	0.0112937547425026	0.7097153752543123	0.0023198462088774	0.348874256992437	0.0023198462088774	0.3535849072365654	0.0004915207361634	0.57208223739543	0.0001015142614173	0.2543236052144339	0.0001015142614173	0.2582676128987096	0.0060489591237504	0.2978507413869594	0.0060489591237504	0.3023693323914178	LRRN3	178106	IMMP2L	293404	DOCK4	937294	False	False	False	alt	-100	0.006195	20	0.02185
3783	chr7	111277630	C	T	rs13239254	0.0253143819	0.5187306838166462	0.0253143819	0.5245116543766373	0.0189918824171704	0.5168138990280474	0.000485258922796	0.5200619998211276	0.000485258922796	0.5258139677800153	0.0781003596054237	0.3534392595140169	0.0021040891846188	0.3781214130291294	0.0021040891846188	0.3830373688601942	0.001489598900414	0.3695291950021518	4.0240916563795816e-05	0.390089406894721	4.0240916563795816e-05	0.3950488480952477	0.004692190953779	0.3626334875419486	0.004692190953779	0.3674013570737533	LRRN3	186623	IMMP2L	284887	DOCK4	928777	False	False	False	alt	-90	0.007812	-5	0.01611
3784	chr7	111348537	G	T	rs35426637	0.0001948072559999	0.894675824927962	0.004697941256	0.8930779292068771	0.0180650167032465	0.5508491508275599	6.102492299580375e-06	0.8767718058330063	8.527124457466117e-05	0.8752637571057718	0.0034376958859819	0.8688232467890676	-1.344759494533426e-07	0.9391799409610592	1.6598158381278347e-05	0.93744383835025	6.124095726486199e-05	0.8640438800811863	6.3750573933879435e-09	0.9326472685432652	3.0100109581507573e-07	0.93099612161791	2.474349246136054e-06	0.9272673883359152	8.000395895878166e-05	0.9254769101883042	IMMP2L	213980	LRRN3	257530	DOCK4	857870	False	False	False	alt	-25	0.002289	-95	0.03137
3785	chr7	115389596	T	C	rs59369558	-0.03303788284	0.4776678303834438	0.03303788284	0.4733162451980645	0.0182374683477973	0.5291789014055617	-0.0009024456090481	0.483535475055208	0.0009024456090481	0.4793105910856704	0.019894592722114	0.6055461949036566	-0.0005174909843888	0.6277540932060383	0.0005174909843888	0.6217294707079991	0.0003455922837986	0.6298270914618519	-1.3134330680287713e-05	0.6223636826131441	1.3134330680287713e-05	0.6162986375760878	-0.00153739566494	0.6075736956754595	0.00153739566494	0.6016739030186636	MDFIC	467501	TFEC	770300	TES	820911	False	False	False	ref	100	0.08826	100	0.0797
3786	chr7	115405658	A	C	rs12706031	0.0579735778	0.2469779193739515	0.0579735778	0.2504677159503095	0.0169587605296288	0.6041963828008436	0.0010372017939749	0.3348244570893	0.0010372017939749	0.3389440466090276	0.0333995909075912	0.5214315720937505	0.0019258319262753	0.385766541100432	0.0019258319262753	0.3907130383496351	0.0005535788957631	0.550143624374774	3.3791776715578555e-05	0.4137886508352121	3.3791776715578555e-05	0.4189376305469806	0.0052670647619675	0.3323966207933784	0.0052670647619675	0.3369982412291509	MDFIC	483563	TFEC	754238	TES	804849	False	False	False	alt	100	0.01535	-95	0.1545
3787	chr7	115417808	G	C	rs2401924	-0.358512176	0.0057603888630871	0.358512176	0.0057181728045339	0.0659724843613536	0.02391710416695	-0.0264919320521996	0.0057400405893368	0.0264919320521996	0.0056856652611331	0.0815133119989442	0.3499913157682383	-0.0332769359433541	0.0576722544559351	0.0332769359433541	0.0566566600965812	0.0060861701364779	0.1506767078086542	-0.0027613713334059	0.0280665198372292	0.0027613713334059	0.0277589315424247	-0.0517658605786677	0.0239586913586089	0.0517658605786677	0.0236769838825799	MDFIC	495713	TFEC	742088	TES	792699	False	True	True	ref	15	0.00464	-50	0.03003
3788	chr7	115420155	G	A	rs62474713	0.4717095879999999	0.00267903414613	0.4717095879999999	0.0026907002104212	0.1008970273870525	0.0042663741500694	0.051582039566107	0.0016609995822336	0.051582039566107	0.0016663339335058	0.0262775889940945	0.5855423740493959	0.0160932909702086	0.1319592134265557	0.0160932909702086	0.1340241970997033	0.0029393473097267	0.2767086753849899	0.001867709905146	0.0443649107406036	0.001867709905146	0.0450910542193238	0.0224522450595493	0.0968152297709999	0.0224522450595493	0.098344387139983	MDFIC	498060	TFEC	739741	TES	790352	False	True	True	alt	-25	0.01563	100	0.0852
3789	chr7	115421602	A	G	rs2401925	0.0267519146	0.5004767272317636	0.0267519146	0.506290567967659	0.0137049611290727	0.7516197060564204	0.0003714618878078	0.5896130233788476	0.0003714618878078	0.5957293462941704	0.0023572300484971	0.9179269660564948	7.836341131926461e-05	0.8405696786550855	7.836341131926461e-05	0.8473591263519609	3.3191481325378894e-05	0.933917470434611	1.1085640870492149e-06	0.8580281927644364	1.1085640870492149e-06	0.864809764392923	0.000284550163307	0.8317283467788491	0.000284550163307	0.8384952390972399	MDFIC	499507	TFEC	738294	TES	788905	False	False	False	alt	60	0.0763	55	0.0758
3790	chr7	115428659	A	G	rs1358394	0.0004173972659999	0.8650702584920564	0.005973756266	0.8663361206679905	0.0121492604937049	0.8221326170976525	4.058656191229137e-06	0.8872116196177753	7.438755204496004e-05	0.88857484748985	0.011198904688067	0.7060903731702957	-2.664753337878827e-06	0.8242653347449705	7.137022335639148e-05	0.8254921127406712	0.0001380632804245	0.7653735316963868	-5.0638583147959335e-08	0.8508303894299719	8.888874505079795e-07	0.8522325316149373	-2.0619577051250666e-05	0.8290132703934971	0.000251558840025	0.8302854473902694	MDFIC	506564	TFEC	731237	TES	781848	False	False	False	alt	75	0.01214	100	0.11707
3791	chr7	115464509	T	C	rs4730682	-0.00929520094	0.7306163464790156	0.01289271054	0.7262293300905489	0.01454986139069	0.7097141962485592	-0.0001447642714921	0.7578438029718053	0.0001867600240136	0.7533424580136312	0.0188471182079112	0.6189822908784197	-0.0002375337852487	0.6854401234234598	0.0002689708980381	0.6811138950867731	0.0002771203527523	0.6636323650287845	-3.5362113645406885e-06	0.712822750708043	3.903194471305773e-06	0.7085612222860816	-0.0007604500016495	0.6781156501592434	0.00086932136848	0.6737672899451795	MDFIC	542414	TFEC	695387	TES	745998	False	False	False	ref	-100	0.05133	-100	0.1802
3792	chr7	127857531	C	T	rs10269552	0.0063462392	0.665777890703599	0.0152327568	0.6697260179878255	0.0506802405123636	0.0589949324104472	0.0003134883677869	0.4388555168365875	0.0006246915485864	0.4419565975407797	0.014754544554782	0.6794431359958542	0.0002123036133802	0.7008276870807552	0.0002430140062065	0.7052143328899311	0.0006695631456177	0.5273404631812406	8.329442184050093e-06	0.5914679071551875	9.404910930998548e-06	0.595570644385817	0.0007126125828906	0.6858289655964077	0.0008511761406749	0.6902665712790024	LRRC4	174576	SND1	205336	PAX4	239389	False	False	False	alt	-40	0.02075	45	0.1569
3793	chr7	128029531	T	C	rs73238074	0.185299522	0.0321912358985989	0.185299522	0.0325285752896469	0.0400044488048606	0.1124547155050416	0.0082050001336843	0.0352883835285555	0.0082050001336843	0.0355981758165244	0.035115139718254	0.5407031104716407	0.0082291161561898	0.2149869687931707	0.0082291161561898	0.2184031225013859	0.0015572627090144	0.4051712386432622	0.0003880176960891	0.1585034058442088	0.0003880176960891	0.1612215425087577	0.0179489294315594	0.1372900133500856	0.0179489294315594	0.1393268389112799	LRRC4	2576	LEP	211748	RBM28	314377	False	False	False	alt	-100	0.1146	25	0.0801
3794	chr7	128066983	C	T	rs3757753	-0.0715191796	0.2123517346936898	0.0715191796	0.2096796452609796	0.0207971650183362	0.4563633842276668	-0.0015298178305552	0.2694149499115256	0.0015298178305552	0.2661193391723883	0.1240061363861304	0.2680816160983203	-0.0075001444721884	0.2050423386183788	0.0075001444721884	0.201700200367196	0.0025594749711476	0.2762582281552947	-0.0001585414161268	0.2206924034337525	0.0001585414161268	0.2172836954248621	-0.0133169476427698	0.1681440477841067	0.0133169476427698	0.1654243945201094	LRRC4	34876	LEP	174296	RBM28	276925	False	False	False	ref	-60	0.01486	45	0.0609
3795	chr7	128075850	T	C	rs322832	-0.0553710816	0.2536932165053784	0.0553710816	0.2498802848878475	0.0163544913341538	0.6087745815282618	-0.0009872058587536	0.3386249858449668	0.0009872058587536	0.3342243589626136	0.8265316221833657	0.005802167972958	-0.0454934256699308	0.0320653798707581	0.0454934256699308	0.0315551262033175	0.0134263760542219	0.0486226233594054	-0.0008081744478534	0.0672240483191702	0.0008081744478534	0.0660369542716778	-0.0072564415558707	0.2711662028358423	0.0072564415558707	0.2668859585961797	LRRC4	43743	LEP	165429	RBM28	268058	True	False	False	ref	-55	0.071	75	0.12134
3796	chr7	128099669	G	T	rs6954161	0.0548145846	0.2567256123133651	0.0548145846	0.2604452945810951	0.0258176608575279	0.3114264472446473	0.0014328703529582	0.2402505842232429	0.0014328703529582	0.2435020873906355	0.075919633136485	0.3609725265617083	0.0045332806333384	0.260861607746277	0.0045332806333384	0.2650327993233474	0.0020158214337633	0.320854081658467	0.0001214555075406	0.2427025785143408	0.0001214555075406	0.2467565309260748	0.0096557355415525	0.2134745499025056	0.0096557355415525	0.2171167607996119	LRRC4	67562	LEP	141610	RBM28	244239	False	False	False	alt	45	0.006317	-100	0.206
3797	chr7	128100012	A	G	rs6954389	0.0418719434	0.3447428333191314	0.0418719434	0.3494145710929139	0.0269920802457163	0.2808848285236961	0.0011458955689689	0.2905654761173806	0.0011458955689689	0.2945688389608634	0.0369560555573883	0.5088941143495127	0.0014205752588409	0.4270131204541766	0.0014205752588409	0.4321264531815381	0.0009932017345507	0.4537739779452476	3.879766207839023e-05	0.3846196803257817	3.879766207839023e-05	0.389688851435503	0.0039078222427501	0.3878924738106357	0.0039078222427501	0.3929402806236616	LRRC4	67905	LEP	141267	RBM28	243896	False	False	False	alt	-100	0.0645	95	0.1815
3798	chr7	128100939	G	T	rs7792971	-0.02495009866	0.3836525867139242	0.03908829466	0.381172518395954	0.0255477968466558	0.3149041761817107	-0.0006921613923226	0.3484018640111938	0.0010714906013505	0.3460693425186276	0.0488824189238229	0.4518279310263338	-0.0018016624985862	0.4172471972770625	0.0020896878452393	0.4138814556853404	0.0012505214717225	0.4078083016755998	-5.04333725697318e-05	0.3838225837331204	5.816112112882819e-05	0.3806345576939264	-0.0044183629705387	0.3676947874848807	0.0053322226254494	0.364403765382917	LRRC4	68832	LEP	140340	RBM28	242969	False	False	False	ref	65	0.01196	-25	0.02197
3799	chr7	128102510	G	A	rs6467161	-0.06114713316	0.2456255273808817	0.06570230444	0.2443369428031334	0.0390520292844056	0.1161403474144647	-0.0026759448848427	0.1817777171422782	0.0028374414197177	0.1811991536712601	0.0245471940879548	0.5840813936944024	-0.0013555241764498	0.4823071813419988	0.0014363635576443	0.4800647997449882	0.0009340004882087	0.4595161431640366	-5.8133223552567375e-05	0.3838877700751472	6.090858966887314e-05	0.3815633743854588	-0.0039523605291808	0.4255244009640695	0.0041981458876315	0.4231223712982117	LRRC4	70403	LEP	138769	RBM28	241398	False	False	False	ref	-95	0.015564	-100	0.10376
3800	chr7	128103272	G	A	rs7803473	-0.01686312306	0.6391679003737244	0.01686312306	0.632568826436563	0.0748949133451209	0.0139684807799735	-0.0013511220691791	0.2864915773153484	0.0013511220691791	0.2829294627121107	0.6029758173600342	0.0266440301323209	-0.0100523765889087	0.1699737508328108	0.0100523765889087	0.1669179195777402	0.0451641504659387	0.0029813190874308	-0.0008038748086894	0.077700489440922	0.0008038748086894	0.0763769865528944	-0.0045783708884562	0.3871108836752551	0.0045783708884562	0.3819667971410071	LRRC4	71165	LEP	138007	RBM28	240636	False	True	False	ref	-25	0.01143	-85	0.05725
3801	chr7	128103586	G	A	rs6467163	-0.595221912	0.0010476680284195	0.595221912	0.0010403031715075	0.1136497126952842	0.0024520540470828	-0.0681181360538872	0.000749727002357	0.0681181360538872	0.0007303787513095	0.7877849625548481	0.0082257499209847	-0.4723747674797696	0.0002153887638233	0.4723747674797696	0.0002245026709489	0.0895979174554822	0.0002893573879608	-0.0540859638638131	0.0002207574637802	0.0540859638638131	0.0002249284052744	-0.1079228662861667	0.003441569084199	0.1079228662861667	0.003416307859599	LRRC4	71479	LEP	137693	RBM28	240322	False	True	True	ref	85	0.3293	35	0.2056
3802	chr7	128133841	G	A	rs73239723	0.0232155866	0.3668000739670781	0.0383521294	0.3699302131506275	0.009603319340765	0.9223024342364752	0.0002394109536008	0.5712154946614219	0.0003852912780577	0.5751266530077169	0.1003249645343274	0.3075506551604329	0.0029852760284153	0.2770982343801614	0.0038435136672104	0.280169105313805	0.0009227758054327	0.4550286348020941	2.8245249919781533e-05	0.389032659879497	3.651662244525354e-05	0.3926003458619885	0.005658011942859	0.2534273735758397	0.0076737817953877	0.2563533511444992	LRRC4	101734	LEP	107438	RBM28	210067	False	False	False	alt	100	0.04813	100	0.07104
3803	chr7	128266837	G	A	rs142949934	-0.0740339086	0.1770222445141568	0.0740339086	0.1743674676017549	0.1052655802025186	0.0034829283455088	-0.0079135686283242	0.0309576044922694	0.0079135686283242	0.0307658421074997	0.8602998911286331	0.0034567004666236	-0.0637402142643126	0.0198620753655559	0.0637402142643126	0.0195454482233184	0.0907130551925114	0.0002779461476681	-0.0068172970419513	0.0055851053981944	0.0068172970419513	0.0055995147664808	-0.0076589356999108	0.2593678288993123	0.0076589356999108	0.2553492460264597	LEP	25558	RBM28	77071	PRRT4	94853	True	True	True	ref	100	0.10645	45	0.627
3804	chr7	128291271	C	T	rs2122628	0.009081133128	0.7929897755662284	0.009081133128	0.7995786621067816	0.0130884380204292	0.7774291478784418	0.0001212730825506	0.8247418290959906	0.0001212730825506	0.831541205457665	0.0369313120649268	0.5108649041240069	0.0003459631808824	0.6606631374079202	0.0003459631808824	0.6669533980350761	0.0005044056283086	0.5809983540304535	4.74406937385267e-06	0.7000277914687186	4.74406937385267e-06	0.7065026788592241	0.0009930388307874	0.6633916438999219	0.0009930388307874	0.6698925927754397	LEP	49992	RBM28	52637	PRRT4	70419	False	False	False	alt	-60	0.01282	20	0.02386
3805	chr7	128292333	T	G	rs10245775	0.04488712086	0.3387258059790098	0.04488712086	0.3430513119332307	0.0121900928300393	0.8093054474023129	0.0006005398855457	0.4843836309276755	0.0006005398855457	0.4899135646757833	0.198232489855168	0.1784624923614215	0.0089791282402954	0.1945274009351644	0.0089791282402954	0.1978274941824727	0.0023476296167884	0.2853852539424897	0.0001169891937866	0.2741115197606819	0.0001169891937866	0.2780597190241104	0.0129878591930321	0.1827419335839742	0.0129878591930321	0.1856260919027894	LEP	51054	RBM28	51575	PRRT4	69357	False	False	False	alt	-70	0.2224	90	0.1537
3806	chr7	131832443	C	A	rs6944918	0.2104165328	0.0219036599593387	0.2104165328	0.0221039464182423	0.043265988391284	0.087001571028255	0.00934474486666	0.0236363890633666	0.00934474486666	0.0237637319856491	0.3081290620566791	0.1068699974542069	0.0650016570900755	0.0191061133243624	0.0650016570900755	0.019393530292741	0.0132335171943174	0.0500671516178083	0.0028605534279479	0.0171505459954291	0.0028605534279479	0.0173621038602131	0.0668321731384645	0.0110043236540976	0.0668321731384645	0.0111302849842528	PODXL	274226	MKLN1	722346	PLXNA4	816245	False	False	False	alt	40	0.05557	-65	0.1307
3807	chr7	131832656	G	A	rs6945544	-0.1179968513999999	0.0919723410272638	0.1179968513999999	0.0908674477291256	0.0466921726184755	0.0753158245417217	-0.0068179891191421	0.0606646789459194	0.0068179891191421	0.0601859651855846	0.270845567615717	0.1270138410027479	-0.0382453715441552	0.0537569923070285	0.0382453715441552	0.0529577858523716	0.0142284335776133	0.0506584526177872	-0.0023825773552487	0.0380330575675912	0.0023825773552487	0.0375348853317876	-0.0391813203127577	0.0422663687175723	0.0391813203127577	0.0417616803831212	PODXL	274439	MKLN1	722559	PLXNA4	816032	False	False	False	ref	20	0.006256	80	0.2627
3808	chr7	131854604	T	C	rs11975170	0.235836902	0.0155909085610986	0.235836902	0.0156608348583529	0.0617060029015476	0.0283133449083499	0.0148704175806956	0.0109171087284442	0.0148704175806956	0.0109678092383228	0.0139470819174556	0.6782721051753581	0.0032569614565741	0.29686156093472	0.0032569614565741	0.3012936036998325	0.0008558795263965	0.4784546033396649	0.0002039177914319	0.1729477423618791	0.0002039177914319	0.1758160031229	0.0081158655273662	0.2409253124055182	0.0081158655273662	0.244919674982187	PODXL	296387	MKLN1	744507	PLXNA4	794084	False	True	False	alt	95	0.00928	-100	0.09265
3809	chr7	131861984	T	C	rs10954343	-0.05019557992	0.283903354095165	0.05153040888	0.2810603079012532	0.0404832315396446	0.1049706774102025	-0.0020920005161478	0.1859737661051533	0.0021395686139789	0.1843096136676477	0.1959016528652963	0.1803582041498464	-0.01121978301437	0.1654291422533774	0.0113753629662192	0.1630883465553763	0.0080120659385195	0.1004644037416893	-0.0004644261280208	0.1220420905592927	0.0004699703906194	0.120452351757349	-0.0159570782884101	0.1462900771804316	0.0162111114776813	0.1443767901825809	PODXL	303767	MKLN1	751887	PLXNA4	786704	False	False	False	ref	-35	0.006775	-20	0.02344
3810	chr7	131864194	A	G	rs6955090	0.0105173236	0.5597123538902946	0.0221553884	0.5636731908235327	0.0117113295702132	0.8376691905231642	0.000132337129417	0.6622422609423807	0.0002667079144356	0.6662177133967322	0.0010285045033155	0.966714207600688	6.092421673067416e-07	0.9118481755283068	2.4750422494948883e-05	0.9160568832341748	1.2064255366369898e-05	0.9778801167540478	1.4767946866263869e-08	0.9270684013687998	2.934972236320584e-07	0.9313126166512284	7.423047738445228e-06	0.912027047403321	9.155092210748523e-05	0.9162260790168704	PODXL	305977	MKLN1	754097	PLXNA4	784494	False	False	False	alt	-40	0.01593	-20	0.01749
3811	chr7	131885258	C	A	rs73725651	-0.010833290366	0.670277379152439	0.014979104766	0.6665134066119696	0.1271876513823458	0.0014961664574712	-0.0012993164739053	0.2184705554236236	0.0017896507977784	0.2172056968426433	0.1019382402428161	0.3169546515950122	-0.0002780926283531	0.5210210084659304	0.0009121515333127	0.5178497768593192	0.0136829953498835	0.055894939101305	-4.108270570481063e-05	0.2690092864758194	0.0001160742052229	0.2667921150212513	-0.0011596450133614	0.5196367819706158	0.0022516578139948	0.5161511831924037	PODXL	327041	PLXNA4	763430	MKLN1	775161	False	True	True	ref	-95	0.1006	-95	0.2086
3812	chr7	131886936	G	A	rs7799455	0.2453134448	0.0154070497736611	0.2453134448	0.0155356279358858	0.0468477256693128	0.0690187378183978	0.0117910553637673	0.0168388770217796	0.0117910553637673	0.0169313161722897	0.056726930817195	0.4597114234809205	0.0172293655434335	0.1319680997600328	0.0172293655434335	0.1339957646373509	0.0027474217682769	0.3008728665631817	0.0008468641138615	0.08976540643098	0.0008468641138615	0.0910882322097613	0.0285242981095971	0.0750654038960133	0.0285242981095971	0.076125579029887	PODXL	328719	PLXNA4	761752	MKLN1	776839	False	True	False	alt	-55	0.012695	-55	0.1245
3813	chr7	131913188	C	T	rs10260150	-0.0751015174	0.1809769700149109	0.0751015174	0.1786931502212046	0.0482829486589858	0.0626655972023072	-0.0036103237562487	0.0998958687755322	0.0036103237562487	0.0987189653663151	0.2224514202764672	0.1579302357457091	-0.0181556236018256	0.1049125827893032	0.0181556236018256	0.1030508931609811	0.010554933387447	0.0685000722589402	-0.0008632015618167	0.0681262946040802	0.0008632015618167	0.0669722921582311	-0.0241356273300121	0.0860042584845849	0.0241356273300121	0.0846592430237738	PODXL	354971	PLXNA4	735500	MKLN1	803091	False	False	False	ref	30	0.01172	100	0.2896
3814	chr7	132064837	A	G	rs11772439	0.0350231098	0.3146288694840564	0.0499403778	0.3159899138404608	0.0217525159712571	0.4253746498230055	0.0011449517445911	0.3224203323201353	0.0013995214693405	0.3234386487486914	0.0111180759460261	0.7211777898941663	0.0002598665474192	0.6128992128692049	0.0004032561397436	0.6147704234763054	0.000219782530884	0.7052364860645813	6.973187783942298e-06	0.5907129942540439	9.422911479441862e-06	0.5926109695038388	0.0008693213684801	0.5869318193785994	0.0014004816733198	0.5888599453569083	PODXL	506620	PLXNA4	583851	MKLN1	954740	False	False	False	alt	25	0.00928	35	0.11127
3815	chr7	132076501	C	A	rs10954356	-0.1220218502	0.0832435649173544	0.1220218502	0.0821301299301216	0.0244857585730523	0.341355958107107	-0.0032478075430194	0.1197596425709803	0.0032478075430194	0.1183783257211192	0.2462719804691366	0.1412202341307346	-0.0275454497278396	0.0618294798678321	0.0275454497278396	0.0606259328562397	0.0058796566143035	0.137548974460042	-0.0007107151837148	0.0743587818263248	0.0007107151837148	0.0731274741836014	-0.0361766355448516	0.0421321152719428	0.0361766355448516	0.041371870523989	PODXL	518284	PLXNA4	572187	MKLN1	966404	True	False	False	ref	45	0.0895	-60	0.1375
3816	chr7	132145569	G	A	rs2122635	-0.436069542	0.0028276110035448	0.436069542	0.0028450057918446	0.085569124199631	0.0082232343949321	-0.0378508386391168	0.0022262386402516	0.0378508386391168	0.0022179118769293	0.6584358813632015	0.0198867879067505	-0.2869467019200529	0.0008560850305581	0.2869467019200529	0.0008811582572711	0.0564955629684982	0.0014691884639794	-0.0249763448833649	0.0008057525406964	0.0249763448833649	0.0008010420758815	-0.1158490317046616	0.0027425467781567	0.1158490317046616	0.0027297884674833	PLXNA4	503119	PODXL	587352	CHCHD3	936521	True	True	True	ref	15	0.2134	85	0.05176
3817	chr7	137378039	C	A	rs11771579	0.1081398027999999	0.0944567825884898	0.1081398027999999	0.0957094447873509	0.0338728994548093	0.1698646690349679	0.0037708556962666	0.0877024189844692	0.0037708556962666	0.0887496659802824	0.0543185642176107	0.4336503659226151	0.0064997931405567	0.2191840798329951	0.0064997931405567	0.2228321925307281	0.0018713843446649	0.337961705810182	0.0002264491637438	0.1776577270955712	0.0002264491637438	0.1805448348757471	0.0144238065388802	0.1500861224290248	0.0144238065388802	0.1526801279458334	PTN	34265	DGKI	469053	CHRM2	509386	False	False	False	alt	-75	0.00789	95	0.1956
3818	chr7	137386398	T	C	rs4518583	0.0209949668	0.2502723046798996	0.0579371447999999	0.2519034308286171	0.0138690055429307	0.7160630006247807	0.0003385564705634	0.3764924602776335	0.0010051506515487	0.3783639726036069	0.0305400679621259	0.5429661046072269	0.0001090442615125	0.4056853184734001	0.0020659339902847	0.4078932229686284	0.0004728953326647	0.6020236666125477	2.05405473964444e-06	0.4546019459543395	3.736467734676839e-05	0.4568932344851857	0.0006746725611164	0.3475378191694529	0.0054683118339876	0.3493190651329375	PTN	42624	DGKI	460694	CHRM2	517745	False	False	False	alt	100	0.02115	-100	0.1443
3819	chr7	137387785	T	A	rs728055	-0.00800036126	0.7671810897615923	0.0107082968599999	0.7626640288810749	0.0135431396343017	0.737267091435915	-0.0001171989215254	0.8021816570872413	0.0001537238034544	0.7979698407222531	0.0143190590874599	0.6666146747463144	-9.871662762019114e-05	0.7614568917402895	0.0001543856066289	0.7574796837606741	0.000209088013519	0.7215321304942813	-1.7080523547171997e-06	0.7920094501272301	2.4589205890888943e-06	0.7879911906916148	-0.0003191910527531	0.7569877485786602	0.0005105407277885	0.7530082603437016	PTN	44011	DGKI	459307	CHRM2	519132	False	False	False	ref	-75	0.02295	5	0.00409
3820	chr7	137388185	A	C	rs2278829	-0.034621221	0.4268201469778533	0.034621221	0.4215989166694375	0.0180754721302085	0.5551178417841542	-0.000641221269969	0.4583318135969887	0.000641221269969	0.4528615898748603	0.0066378542443337	0.7913320372039127	-0.000239341775826	0.7038288570139279	0.000239341775826	0.6975762084445065	0.0001154038062616	0.7960266322455887	-4.264914666067889e-06	0.7056292521189649	4.264914666067889e-06	0.6993507857743648	-0.0008627231038236	0.6808610132923442	0.0008627231038236	0.6746037648705182	PTN	44411	DGKI	458907	CHRM2	519532	False	False	False	ref	-30	0.009094	-30	0.0627
3821	chr7	137389794	G	A	rs7779548	-0.07185687996	0.1912889149298062	0.07185687996	0.188647521937114	0.041673566129194	0.0968525604403894	-0.0031096649467574	0.1281764355952938	0.0031096649467574	0.1267958033881198	0.1484766256474546	0.2290133326530049	-0.0115219850446082	0.1685199157549343	0.0115219850446082	0.1656212951512231	0.0062624459816471	0.1315780615178711	-0.0005049277082999	0.1207280322188375	0.0005049277082999	0.1185515720906682	-0.0186170037280194	0.1273386490702019	0.0186170037280194	0.1251131806279414	PTN	46020	DGKI	457298	CHRM2	521141	False	False	False	ref	85	0.00979	75	0.517
3822	chr7	137392157	G	T	rs11766321	0.0236529896	0.5409484069647049	0.0236529896	0.5474036926920823	0.0237539763989411	0.3628344169155777	0.0005841487033383	0.4680141689942796	0.0005841487033383	0.4737182908966687	0.007228398931081	0.7693314644994368	0.0001716300324562	0.7159237628619933	0.0001716300324562	0.722451527716154	0.0001709536717939	0.7315083097226093	4.231608907946812e-06	0.6795067504140486	4.231608907946812e-06	0.6858076065075919	0.0006383821055062	0.7018491837112092	0.0006383821055062	0.7083108207291386	PTN	48383	DGKI	454935	CHRM2	523504	False	False	False	alt	80	0.00879	55	0.04254
3823	chr7	137393444	G	C	rs13222414	0.0407892808	0.191714135980077	0.0712114912	0.1921799168468994	0.0170757351782603	0.597890599088017	0.0008521070851076	0.2826945251849224	0.0012981217363006	0.2833325885557853	0.0256425060209164	0.5630645024504141	0.001162779440667	0.4014518132359393	0.0017628678588438	0.4030144716894526	0.0004382274185456	0.5861577439391639	2.376862852903992e-05	0.4235269074085198	3.2469686247094114e-05	0.4253562893730292	0.0032983075451156	0.3383561370796492	0.0052167529939625	0.3398978175322947	PTN	49670	DGKI	453648	CHRM2	524791	False	False	False	alt	-90	0.04907	-90	0.08716
3824	chr7	137394538	G	C	rs17530005	0.0707265192	0.1851981477237868	0.0707265192	0.1878935727295147	0.0254071494537221	0.3218016705648336	0.0018839847807845	0.1917225912614564	0.0018839847807845	0.194340971801203	0.0115923262182045	0.7152887419629582	0.0007529304784049	0.5225039668801419	0.0007529304784049	0.5282895752183363	0.0002754881907236	0.6732905695085403	1.855963405397048e-05	0.4857521487485983	1.855963405397048e-05	0.4914433749761457	0.0024628022829995	0.4816078838374052	0.0024628022829995	0.4873238739469838	PTN	50764	DGKI	452554	CHRM2	525885	False	False	False	alt	-70	0.04218	65	0.1015
3825	chr7	139355181	C	T	rs7801613	-0.0262327154	0.51286020880906	0.0262327154	0.506826234804798	0.0125430771028238	0.8062262225125254	-0.0003331415330234	0.6208759297592562	0.0003331415330234	0.6144454013864457	0.0015670878558938	0.9444015753435068	-4.076869647009754e-05	0.8889290996521031	4.076869647009754e-05	0.8820177180753778	1.882869858532592e-05	0.960205356767928	-4.890161570542252e-07	0.9081906990701794	4.890161570542252e-07	0.9012908849010526	-0.0001542344363432	0.8914854438054414	0.0001542344363432	0.8846505251107526	FMC1-LUC7L2	13820	LUC7L2	14821	FMC1	15723	False	False	False	ref	45	0.01217	100	0.2101
3826	chr7	139385344	A	G	rs6942519	0.00209146418	0.8313485705449863	0.0076379438199999	0.8307202960247636	0.0155724225978581	0.6468467850376409	4.280157190263321e-05	0.8510590562810594	0.00010541902822	0.8506113820309601	0.001654514862591	0.9356120833512916	-2.947430440338177e-06	0.9521338638256416	1.1915046407174616e-05	0.9522867081063624	2.3096054383044377e-05	0.9464421275724166	-1.1127672498292061e-08	0.9592209047882267	1.4547726741806776e-07	0.9588379097540968	-2.5568275543528105e-05	0.9448492029519712	5.855959882550501e-05	0.9438858885689588	FMC1-LUC7L2	43983	LUC7L2	44984	FMC1	45886	False	False	False	alt	-65	0.02484	-75	0.1938
3827	chr7	139387747	G	T	rs2355784	0.00417071598	0.8539362022627075	0.0058968293	0.8561376115698189	0.0142427486007344	0.7223122144251491	6.683263120037564e-05	0.8636065456615416	8.888482128440782e-05	0.8656498171372695	0.0007150869321368	0.9768772224278855	4.219105828744151e-06	0.968351533306219	5.247313247902856e-06	0.9719602047353644	9.643516145812176e-06	0.9811500465176962	6.4674701091043e-08	0.9696812295696708	7.764055109031908e-08	0.9735475219674844	2.144436013328497e-05	0.9657731175242178	2.639305862558148e-05	0.9668477048666696	FMC1-LUC7L2	46386	LUC7L2	47387	FMC1	48289	False	False	False	alt	-25	0.01187	100	0.1661
3828	chr7	139419122	A	C	rs10230398	0.0699155294	0.2100119281124719	0.0699155294	0.2129710405672844	0.0308755170090825	0.2125458040834453	0.0022144148541811	0.1951725741994312	0.0022144148541811	0.1977077821580992	0.0030459239220084	0.8982004489023129	0.0001544917584431	0.7520777808890297	0.0001544917584431	0.7585925194178533	9.880252785466426e-05	0.8375274526501246	5.037704167172894e-06	0.6862453833867175	5.037704167172894e-06	0.6925828271257141	0.0005138398601167	0.7472234641377702	0.0005138398601167	0.7537157713943957	KLRG2	64551	FMC1-LUC7L2	77761	LUC7L2	78762	False	False	False	alt	45	0.01758	45	0.07837
3829	chr7	140951723	G	A	rs801089	-0.1395461582	0.0631593554230673	0.1395461582	0.0626342177518311	0.0294577590435056	0.2388318000759095	-0.0047658373714483	0.0841906942581055	0.0047658373714483	0.083387814015768	0.0008058130711622	0.9755132866677948	-0.0001397724468585	0.782930303323114	0.0001397724468585	0.7764225808251382	2.749230381358368e-05	0.9394757238679272	-5.198831979775448e-06	0.7185805088052842	5.198831979775448e-06	0.7123400588131416	-0.0003876480485631	0.8018014114340903	0.0003876480485631	0.7951968041385448	BRAF	26794	MRPS33	63505	TMEM178B	122342	False	False	False	ref	-100	0.0724	-100	0.1466
3830	chr7	141006357	G	T	rs6662	-0.00510807844	0.4154223720077277	0.03329946796	0.4152718016659265	0.0256417193161047	0.3084885308258525	-0.0003377795014691	0.3648150843831931	0.0009253350916268	0.3648735070153894	0.0113193230180462	0.7103054895659091	-0.0001100850596219	0.6414015611760787	0.000416362811756	0.641546966740005	0.0002964777067775	0.661056605484884	-5.236892740742819e-06	0.5991041556088155	1.167201658836102e-05	0.5988948617487375	-0.0004453828643066	0.6017824214320813	0.00153739566494	0.6016806315755059	MRPS33	8871	TMEM178B	67708	BRAF	81428	False	False	False	ref	-30	0.01146	15	0.01489
3831	chr7	141016390	T	C	rs246745	0.047858226	0.297065413769141	0.047858226	0.3015531820382037	0.1146626764651071	0.0024523660937191	0.0055099200063267	0.0497813524510411	0.0055099200063267	0.0503442359024289	0.0364380917818613	0.5029892043148483	0.0016303521523106	0.3922501664593548	0.0016303521523106	0.3972792547492759	0.0041566723614528	0.1933639949356051	0.0001859253075186	0.1759682267691692	0.0001859253075186	0.1791177142548788	0.0045165121573025	0.3486412921646313	0.0045165121573025	0.3536503782791475	MRPS33	1162	TMEM178B	57675	BRAF	91461	False	True	False	alt	100	0.01489	50	0.1875
3832	chr7	141034465	T	C	rs1089258	0.0893589956	0.1308953414772609	0.0893589956	0.1328098912896849	0.0167540635627356	0.6117260561587748	0.0015284799975386	0.2294106438235843	0.0015284799975386	0.2324080583693488	0.0005039424631321	0.9890791316381063	4.6414102916412974e-05	0.8694277452838091	4.6414102916412974e-05	0.8763003475507771	8.744962502773709e-06	0.9865278857744014	8.019290355923096e-07	0.8662164473367222	8.019290355923096e-07	0.8730640862596449	0.0001468113886047	0.8793683553168994	0.0001468113886047	0.8863659412199604	MRPS33	19237	TMEM178B	39600	BRAF	109536	False	False	False	alt	-65	0.02379	-65	0.0553
3833	chr7	157664118	G	A	rs10241251	-0.0639885484	0.2199733324805973	0.0639885484	0.2171970506652684	0.0262134492902202	0.3010762515258384	-0.0018543719257319	0.2110733871065429	0.0018543719257319	0.2086482479109124	0.3541214410610009	0.0868932299398336	-0.0214041518486304	0.0843583678814856	0.0214041518486304	0.0827473278504372	0.0091178220538166	0.0863227974880622	-0.0006147437117194	0.0898842450604117	0.0006147437117194	0.0883713333802857	-0.0206302992313021	0.0994343535710512	0.0206302992313021	0.0978255386767689	DNAJB6	328736	UBE3C	525191	MNX1	653455	False	False	False	ref	100	0.01236	-100	0.1012
3834	chr7	157664482	G	T	rs10244667	-0.01969743674	0.5914415175676926	0.0200699684599999	0.5865857988365307	0.0672102807587099	0.020381331840415	-0.001350810363418	0.2694820351196286	0.0013732055136026	0.2668704101085887	0.1241529477747351	0.2622052931483161	-0.0022089647282	0.3813288239400223	0.0022768733261155	0.3775577728954508	0.0082407187379402	0.0960200982142639	-0.0001515515975884	0.2267041540006676	0.0001556339968148	0.2241950690365848	-0.0045445547820923	0.3826312743279387	0.0046418791857741	0.3787850331810888	DNAJB6	329100	UBE3C	525555	MNX1	653819	False	False	False	ref	90	0.0644	-100	0.1274
3835	chr7	157665453	C	T	rs2366647	-0.0315727796	0.4494708753449426	0.0315727796	0.4437189262222657	0.0123076510175546	0.80596798675246	-0.0003973560247493	0.5773323378929744	0.0003973560247493	0.5709705152060648	0.1045874435023588	0.3068295843798437	-0.0029538107487915	0.3202601387477708	0.0029538107487915	0.3156846302993322	0.0013000386424735	0.4081373664491401	-3.661963891365428e-05	0.3972892916055895	3.661963891365428e-05	0.3919741135247629	-0.0060423608590939	0.3053733019105131	0.0060423608590939	0.3006991635358138	DNAJB6	330071	UBE3C	526526	MNX1	654790	False	False	False	ref	65	0.02551	80	0.1722
3836	chr8	4325535	A	G	rs13261217	-0.417227056	0.0037700703706049	0.417227056	0.0037334035998575	0.0812378661664705	0.0101592497685854	-0.0349822396715176	0.0029026439569795	0.0349822396715176	0.0028942961827647	0.4779799412754445	0.0487870976311451	-0.2048237776707912	0.0022318967384549	0.2048237776707912	0.0022802870128369	0.0390623728309941	0.0046159797583739	-0.0171586353654852	0.0016340329537969	0.0171586353654852	0.0016402106969092	-0.1382707597901751	0.0017991076038154	0.1382707597901751	0.0017874143384192	CSMD1	669437	MCPH1	2081058	ANGPT2	2237874	False	True	True	ref	-50	0.00928	100	0.10645
3837	chr8	4364481	T	G	rs7813162	0.037704009	0.377918992356126	0.037704009	0.382911692895818	0.0127951114469107	0.7943175580975568	0.0004878768234554	0.513248225488699	0.0004878768234554	0.5190057417533337	0.0070997327702813	0.7839170451993922	0.0002973506924632	0.6699429594381087	0.0002973506924632	0.6760976614923191	8.74903914050856e-05	0.8293817452606613	3.6901271565570032e-06	0.7128974453731607	3.6901271565570032e-06	0.7192633080911611	0.0011299528224076	0.6331599417471769	0.0011299528224076	0.6393969543546244	CSMD1	630491	MCPH1	2042112	ANGPT2	2198928	False	False	False	alt	40	0.007095	-60	0.1003
3838	chr8	4419110	T	C	rs1230767	0.0566363377999999	0.2437593167302435	0.0566363377999999	0.2471544938509477	0.0199946881983561	0.4736110997995059	0.00127062792165	0.2833737990636705	0.00127062792165	0.2870653060271201	0.0420062023687769	0.4839496674035143	0.0023605754301735	0.3557239818451605	0.0023605754301735	0.3607191401541174	0.0008242958193915	0.4884752302328528	5.125450015438776e-05	0.361254183948667	5.125450015438776e-05	0.3663705341794526	0.006226287486391	0.299363424256748	0.006226287486391	0.3041725775377424	CSMD1	575862	MCPH1	1987483	ANGPT2	2144299	False	False	False	alt	-95	0.02617	50	0.0304
3839	chr8	10265517	C	T	rs12679687	-0.186631284	0.0318599400940837	0.186631284	0.0316517008888393	0.046457736950613	0.0708060706263566	-0.0091512031651564	0.0277436968428184	0.0091512031651564	0.0276233519682206	0.114571442710567	0.2792469239178441	-0.0240045678321378	0.0794716889972268	0.0240045678321378	0.0779814736380215	0.0055617833749484	0.1514090130500277	-0.0012239968510962	0.0524169017239041	0.0012239968510962	0.0516462459655173	-0.039637425357131	0.0371562644994076	0.039637425357131	0.0366427928154393	MSRA	211224	PRSS55	260016	PRSS51	282107	False	False	False	ref	50	0.03143	-25	0.05225
3840	chr8	10280381	G	A	rs2952245	0.01854498192	0.6092550105138955	0.01953252528	0.6140212450622698	0.0190990321531518	0.5172567206682307	0.0003743912728994	0.5871856116449915	0.0003889290971039	0.5917186737859704	0.0447964435353501	0.4808206026730009	0.0006171910185067	0.5490077417561973	0.0006897026866364	0.5528010321491045	0.0008302336369139	0.491816406218617	1.2673079606992175e-05	0.5467943590195107	1.374053845015525e-05	0.5506517177836366	0.0017345188215499	0.54195181038995	0.0019110224011084	0.5459385812772864	MSRA	226088	PRSS55	245152	PRSS51	267243	False	False	False	alt	-55	0.01607	100	0.1608
3841	chr8	10398391	G	A	rs11250001	0.2172962048	0.0249932174826343	0.2172962048	0.0252021228601325	0.056527825353984	0.0397412026079499	0.0141633985910078	0.0180428079822256	0.0141633985910078	0.0181609428498089	0.3378822869585299	0.0922251754841813	0.0852612569389119	0.0160490340140393	0.0852612569389119	0.0162299976021691	0.0206119921845096	0.0245530288223093	0.005826986585545	0.0115385855448232	0.005826986585545	0.0116097802715675	0.0740176833492791	0.0110071702835702	0.0740176833492791	0.0111012146012387	PRSS55	127142	PRSS51	149233	C8ORF74	274238	False	False	False	alt	95	0.6875	95	0.1001
3842	chr8	10401678	T	C	rs35388602	-0.0675822214	0.2329409606517102	0.070431943	0.2309767474477971	0.020672470051804	0.4589125133470003	-0.0019933083694632	0.2711504737284426	0.0020255083672365	0.2694461962449979	0.1645904127214542	0.209419277953455	-0.012521144372962	0.1654850075021345	0.0128903925446752	0.1636526433196666	0.003531678628971	0.2249237640318942	-0.0003742371059883	0.1826141600023097	0.0003784093698942	0.1806819754652435	-0.0185304015044042	0.1342942234845594	0.0193073471676948	0.1327471953284284	PRSS55	123855	PRSS51	145946	C8ORF74	270951	False	False	False	ref	-40	0.02948	100	0.0769
3843	chr8	13742372	A	G	rs7839817	0.0291977543259999	0.4569522927701878	0.0309752812459999	0.4610555168670448	0.0157464384854324	0.6541359192100423	0.0005058016147418	0.527948867195306	0.00052821764155	0.5322922262220754	0.0419121770974233	0.4879748740781204	0.0007012043159624	0.5444704614869486	0.0008586166956854	0.5483905674620352	0.0006203717898317	0.5354841783380602	1.2333930982373407e-05	0.5702882676474227	1.4319026161021943e-05	0.574437236892047	0.0020141202863646	0.5193330191773061	0.0024001187687637	0.523472943306412	DLC1	137762	C8ORF48	175502	TRMT9B	796729	False	False	False	alt	30	0.00647	-85	0.0408
3844	chr8	13743692	C	T	rs5012670	-0.0014379649	0.8265898221366169	0.0079281489	0.8276351273782238	0.0142085565741971	0.7153620642333081	-8.49526580730978e-06	0.8435465547175767	0.0001080399451853	0.8446467681025865	0.1531333509287057	0.2265492695843951	-0.0009404267997377	0.4609758140892728	0.0016095870126316	0.4613059944518111	0.0021019806397161	0.3073282917947719	-1.0075755831906048e-05	0.5119923077418235	2.0426601206964503e-05	0.5127083521341765	-0.0007719969647982	0.5327988705190106	0.0021328890501797	0.5335547827973879	DLC1	139082	C8ORF48	176822	TRMT9B	798049	False	False	False	ref	-100	0.025	-100	0.0934
3845	chr8	13744943	T	C	rs13267233	-0.03106501362	0.3691619713208348	0.04177392318	0.3674736210648591	0.029518610827794	0.2340620636135771	-0.0010316773136056	0.3114148877911078	0.0013492506968502	0.3102657415776753	0.0266347200686219	0.5659658367315561	-0.0008820918054677	0.5063284290483359	0.0013264663407999	0.5043343430241412	0.0008145902148882	0.4901106066145625	-3.0505194794357165e-05	0.4454800557863018	4.380530429730197e-05	0.4435288343918352	-0.0024100161657484	0.4571948391777631	0.0035449176866483	0.4553245315376958	DLC1	140333	C8ORF48	178073	TRMT9B	799300	False	False	False	ref	35	0.001282	80	0.04846
3846	chr8	13745057	T	C	rs13267570	-0.0475377347999999	0.3198840152889077	0.0475377347999999	0.315760003142451	0.0161602065804005	0.6231520732946985	-0.0008731257444075	0.4047021596987978	0.0008731257444075	0.3995971177298625	0.0363259212827026	0.5064313734601399	-0.001656255395398	0.4216318214275811	0.001656255395398	0.4165891717820297	0.0006020618794569	0.5469006358182236	-3.0060729679544167e-05	0.4538051591598704	3.0060729679544167e-05	0.4484322782518488	-0.004541255649764	0.3765153293563716	0.004541255649764	0.3715885481421255	DLC1	140447	C8ORF48	178187	TRMT9B	799414	False	False	False	ref	100	0.01639	-30	0.06885
3847	chr8	18565413	C	T	rs13259407	0.04959277756	0.274719297104407	0.05910691476	0.2766856413776532	0.0233803555390774	0.3752748776088079	0.0014931500381783	0.286457642936961	0.0016421412468262	0.2883558376483485	0.6168354722707928	0.0246258774323971	0.031566274475247	0.0573688514540371	0.0376742605740422	0.0580358977697717	0.0145305833592868	0.0426588326086254	0.0009571902193443	0.0750719105320694	0.0010528411645715	0.0759189697036823	0.0123131866319157	0.1665704231513483	0.0146753653789052	0.1679856907711741	NAT2	174130	NAT1	394935	ASAH1	480415	False	False	False	alt	-100	0.0797	70	0.104
3848	chr8	18572066	C	A	rs7018369	-0.074340525	0.1765271669770579	0.074340525	0.1738961602497975	0.1001028020225756	0.004240005511813	-0.0075239261376238	0.0325756649014042	0.0075239261376238	0.0324254288227394	0.0174524100161656	0.6375517630828044	-0.0014460098415203	0.4422809998757577	0.0014460098415203	0.4372438820459002	0.0017753902022478	0.341139267798592	-0.0001487884268355	0.2258080987508539	0.0001487884268355	0.2222799144798172	-0.0042327867770775	0.3838075395632035	0.0042327867770775	0.3788130282838127	NAT2	180783	NAT1	401588	ASAH1	487068	False	True	False	ref	55	0.01135	55	0.1239
3849	chr8	26339117	A	T	rs3808573	0.0288824385999999	0.4788869501398712	0.0288824385999999	0.4842844326339424	0.0174519583744894	0.5841747817270743	0.0005237350276441	0.5063050469543297	0.0005237350276441	0.5121744239958965	0.0092416944343637	0.7374587790919538	0.0002421353911399	0.6765878139492594	0.0002421353911399	0.6828328369186795	0.0001686553527715	0.7442732716020641	4.5566119456933474e-06	0.6792500894898179	4.5566119456933474e-06	0.685666602748765	0.0008651974530698	0.658120085240388	0.0008651974530698	0.6643330771006192	BNIP3L	43938	PPP2R2A	47608	DPYSL2	174915	False	False	False	alt	-75	0.004333	85	0.1212
3850	chr8	26365942	A	C	rs3808566	0.0529231244	0.2634550922916372	0.0529231244	0.267489026770566	0.0329642572978773	0.1807938398983153	0.00174875273745	0.1968065539323232	0.00174875273745	0.19960766771748	0.070011711919765	0.3723826509790676	0.0035414254463064	0.2816510827268406	0.0035414254463064	0.2859390335366844	0.0024174831538439	0.2861078645985744	0.000122382167294	0.2299830544869869	0.000122382167294	0.2337695474409494	0.0081686516446174	0.2363531525876271	0.0081686516446174	0.2403979403048634	BNIP3L	17113	PPP2R2A	74433	DPYSL2	148090	False	False	False	alt	100	0.04498	100	0.2668
3851	chr8	26370083	A	C	rs3824232	-0.0561203322	0.252138056701217	0.0561203322	0.2485319123464528	0.0182579708177397	0.5514934339368218	-0.0010286929728857	0.3194723782269262	0.0010286929728857	0.3151153041148968	0.292858203292534	0.114370549306014	-0.0168960830864527	0.1008142222172084	0.0168960830864527	0.0987901334680364	0.0051621000116239	0.1566967578256329	-0.0002986229044756	0.1366300008046196	0.0002986229044756	0.1342726374126281	-0.0182986374583484	0.1084654886869238	0.0182986374583484	0.1063886733650791	BNIP3L	12972	PPP2R2A	78574	DPYSL2	143949	False	False	False	ref	35	0.0454	100	0.1646
3852	chr8	27389331	A	C	rs56085315	0.0512575855999999	0.2960415023507475	0.0512575855999999	0.3000863604913965	0.0224937968823072	0.3926296084715108	0.0012064084545539	0.3056105835302911	0.0012064084545539	0.3096569708434797	0.240404473623437	0.1469570094744573	0.0100348689390808	0.1469277543720411	0.0100348689390808	0.1497437386548354	0.0053523743330985	0.1554970366299206	0.0002351594020611	0.1584812619822589	0.0002351594020611	0.1611949951507228	0.0140889446075681	0.1471285380594225	0.0140889446075681	0.1497962467877381	PTK2B	77848	TRIM35	78059	CHRNA2	90552	False	False	False	alt	100	0.0216	100	0.2322
3853	chr8	27411233	T	C	rs3757908	-0.0424668238	0.3310546390435627	0.0469451658	0.3283109623975231	0.0252069428801979	0.3239217705060314	-0.0012838676700899	0.3145968700213704	0.0013894973450217	0.3122211527131264	0.0210674342647882	0.6133256344895452	-0.0014725313358822	0.5086275052563989	0.001524039435574	0.5045817897854161	0.0006115639007684	0.5588366624574199	-4.937715035127893e-05	0.4653289102060253	5.059206062883813e-05	0.4613825396682748	-0.0041618554320213	0.4423027106416227	0.0043482564085644	0.4382475691838984	CHRNA2	68650	EPHX2	79549	PTK2B	99750	False	False	False	ref	90	0.0343	-65	0.1576
3854	chr8	27436348	C	T	rs7005936	0.0220360808	0.3872182457055692	0.0385077804	0.388992619115482	0.0257599152234612	0.3092881447895297	0.000594390343304	0.3371979574373869	0.0009932896038093	0.3387070904097853	0.0584251591831347	0.4097933776395895	0.0007366942234336	0.371344282746376	0.0019698540953797	0.3725031165186644	0.0015044158823098	0.3677117323618034	1.997913723173297e-05	0.3405535411894276	5.0524157144465497e-05	0.3417882146742435	0.0022005212629078	0.3377928641796958	0.0049519976246246	0.3393563059255619	CHRNA2	43535	EPHX2	54434	PTK2B	124865	False	False	False	alt	-40	0.0177	-50	0.1761
3855	chr8	27451822	T	C	rs1106359	0.06714697834	0.1316935159835048	0.09062686474	0.1324977800144087	0.0236373675843507	0.3658084926030598	0.0017843469434325	0.1736183875306121	0.0022724807650331	0.1747138021849882	0.3434437992807891	0.0902332282526496	0.0214478188320689	0.0662910097231353	0.0287307201391675	0.06697953629454	0.0080454371462312	0.0976104046506205	0.0005724062377686	0.0823175212718908	0.0007238137187898	0.0831902832701185	0.0239723202797663	0.0601999649991234	0.0314580515324469	0.0606269757317724	CHRNA2	28061	EPHX2	38960	PTK2B	140339	False	False	False	alt	-100	0.03967	-95	0.296
3856	chr8	27470504	A	G	rs2565065	0.358075088	0.0054817345050332	0.358075088	0.0055071230885488	0.0578137864371866	0.0348834749849229	0.0211640180172013	0.0063907969236906	0.0211640180172013	0.0064258519355316	0.304773844478902	0.10733369960732	0.1152856637448595	0.0077675739445921	0.1152856637448595	0.007805169246678	0.0177626619272684	0.0297467177278329	0.0068710635786282	0.0061550946106764	0.0068710635786282	0.0061363777072701	0.1144625713437365	0.0029376168062879	0.1144625713437365	0.002936531920819	CHRNA2	9379	EPHX2	20278	CLU	144196	False	True	True	alt	100	0.03183	30	0.1592
3857	chr8	27609666	A	G	rs867232	0.0758541106	0.1712941284205519	0.0758541106	0.1735740224903895	0.0273577851487748	0.2748606579076191	0.0023536592810404	0.1672072913297452	0.0023536592810404	0.169387187010109	0.3403112731351654	0.0922920215469327	0.023230322509609	0.0693711176386845	0.023230322509609	0.0707477164840018	0.0086856949510688	0.0887590683263079	0.0006873450789071	0.0744553091436475	0.0006873450789071	0.0757545405021311	0.024700603741216	0.0736590649844898	0.024700603741216	0.0749173287633508	CLU	5034	SCARA3	24203	EPHX2	118884	False	False	False	alt	20	0.006176	-70	0.2454
3858	chr8	31309506	C	A	rs2881131	0.01493612372	0.647317033801803	0.01692971228	0.6521564722409422	0.0190669954843048	0.5146390660278756	0.0002697389015985	0.6403211612293902	0.0003045099406808	0.6450454528515746	0.0036051268516379	0.8626582002580143	7.510414130481547e-05	0.8305886604576133	7.946147828044734e-05	0.8351552720450899	6.542196095294453e-05	0.8577023036656606	1.2870708295834233e-06	0.8259049862310477	1.363069026251466e-06	0.8305969675893292	0.0002903236448813	0.8152415611811985	0.0003117680050146	0.8197145721571563	WRN	275717	PURG	275791	NRG1	329717	False	False	False	alt	100	0.01677	20	0.0939
3859	chr8	31323887	C	T	rs2575065	-0.0220972652	0.3243297049958729	0.0450349527999999	0.3230069073175463	0.0139967166558103	0.7299270355051352	-0.0004330216364008	0.4416181750411307	0.0006875733028074	0.4398513795242511	0.1144510243805878	0.2863469584851624	-0.0033864674487849	0.2547744412884168	0.005415305227392	0.2537580621977178	0.0017052509674544	0.3611061862504519	-6.407101901939662e-05	0.3140309049320975	8.692513795391636e-05	0.3129108164130952	-0.0048216818976609	0.2266309900811164	0.0094850054435683	0.225729732470267	WRN	290098	PURG	290172	NRG1	315336	False	False	False	ref	95	0.05023	0	0.0
3860	chr8	31486293	A	G	rs77184019	-0.0104473863999999	0.4267857845720035	0.0331129384	0.4257849346082049	0.0125283082194295	0.7937534697842592	-0.000166505536377	0.54977362495255	0.0004554129212665	0.5481345993428258	0.0017922536372933	0.9388616125061728	-3.883095823415415e-06	0.8707019210955186	4.744954792790223e-05	0.8690385486353159	2.235712189324292e-05	0.954622642936049	-8.36374497681363e-08	0.8869784289395704	6.382869128712603e-07	0.8852538854637271	-2.4743492461478843e-05	0.8693064187170819	0.0001814522780508	0.8676100154855165	NRG1	152930	WRN	452504	PURG	452578	False	False	False	ref	-95	0.012344	-90	0.0925
3861	chr8	31495971	C	T	rs2716947	-0.271708996	0.0123712100342224	0.271708996	0.0123234878710767	0.0639931814283238	0.0251949777661982	-0.0187144166133511	0.0090524905451678	0.0187144166133511	0.0089934105063396	0.0315751707300979	0.5261851682304202	-0.0088678498414095	0.1741788709321123	0.0088678498414095	0.1711842719044147	0.0020380219781389	0.3128393613659642	-0.0006121344370699	0.0889884280720792	0.0006121344370699	0.0874574924898177	-0.0188693873511265	0.1085732251627228	0.0188693873511265	0.1067534020351721	NRG1	143252	WRN	462182	PURG	462256	False	True	False	ref	-75	0.05402	-100	0.05133
3862	chr8	31496226	C	T	rs2681614	0.0234151098	0.54507085135875	0.0234151098	0.55109134172824	0.0254300562237073	0.3200528840167114	0.000605287010285	0.453199807879137	0.000605287010285	0.4586788593983122	0.0465449836692949	0.4512787264351832	0.0010179755620598	0.4609111957539356	0.0010179755620598	0.4663929068040072	0.0011633940131074	0.4096666487739407	2.581631607097691e-05	0.4244866898180605	2.581631607097691e-05	0.4299090210203072	0.0027786942034244	0.4438287877866918	0.0027786942034244	0.4494112139522884	NRG1	142997	WRN	462437	PURG	462511	False	False	False	alt	100	0.1199	35	0.02344
3863	chr8	31498581	A	T	rs2716966	0.0037981683007999	0.8697716346307259	0.0060044212991999	0.8706067773708369	0.0199172211209034	0.4869881313130146	5.777824153952914e-05	0.8591955799159198	0.0001022274999548	0.8596284360725881	0.0002268153475635	0.9977836869111064	8.944281629786004e-07	0.9900276497462526	1.278888215007668e-06	0.9945771486341286	4.592984174578357e-06	0.9957269653770549	1.3396923490354911e-08	0.9901200959003778	2.0975925583156186e-08	0.9937599452468758	3.299132328197683e-06	0.9918274617237984	3.299132328197683e-06	0.9954457182998552	NRG1	140642	WRN	464792	PURG	464866	False	False	False	alt	-10	0.00103	85	0.03064
3864	chr8	31502298	T	G	rs4376462	0.0620116498	0.2239354274020802	0.0681863074	0.2254412858377868	0.0205707895808205	0.4655904303116358	0.0015176945457389	0.278733776777522	0.0016310049935527	0.2806702363353046	0.0082321599419352	0.7644254207366824	0.0006016803337897	0.6004538121654948	0.0006202434186145	0.6049391497162302	0.0001734052314139	0.7480206128115372	1.4283965560514566e-05	0.5843200497676712	1.4624614650186243e-05	0.5884939303493328	0.0018780310778265	0.560783038515323	0.0019588598198673	0.5652521964034846	NRG1	136925	WRN	468509	PURG	468583	False	False	False	alt	-100	0.0844	10	0.04645
3865	chr8	31512712	G	T	rs13251167	0.0027565784999999	0.8028962198436637	0.0087925184599999	0.8041625652892657	0.0160143153743259	0.6374324948113035	4.319069975044211e-05	0.795755235469877	0.00014613797534	0.7969293597891335	0.0086932136848008	0.7546708757075656	-1.1519506428151274e-05	0.8305284639289382	6.72882277787756e-05	0.8318518537276002	0.0001394373346022	0.7734729610969135	-2.287131458728833e-07	0.834273699767184	1.104037129006986e-06	0.8355505225364871	-1.979479396916694e-05	0.8273270637436755	0.0002540331892711	0.8286476915456069	NRG1	126511	WRN	478923	PURG	478997	False	False	False	alt	25	0.00711	100	0.03528
3866	chr8	34277580	G	A	rs4739486	-0.01393033038	0.69768353555533	0.01456184894	0.6932106088711678	0.0167281357985619	0.6107575344973524	-0.0002302779765637	0.7102084978602415	0.0002425552808091	0.706023721956095	0.0019671076506878	0.9252623373259974	-2.8615656277236226e-05	0.9134102481539504	2.911308314639729e-05	0.9093476055106686	3.1822783558246174e-05	0.9280014841265004	-4.702897032942917e-07	0.9123818364936082	4.799601410515496e-07	0.908393552348383	-0.0001237174623074	0.905398043799581	0.0001237174623074	0.9001757211117154	DUSP26	677557	RNF122	710452	TTI2	764395	False	False	False	ref	-30	0.01091	-95	0.03815
3867	chr8	34283979	T	C	rs4483152	0.067417953	0.197054456876932	0.067417953	0.1998427469288536	0.022295761333919	0.4062175839252971	0.0015426202985566	0.2313491451816735	0.0015426202985566	0.2343980201423159	0.0217437563920688	0.6219791433457208	0.0019649323287908	0.4327346909135626	0.0019649323287908	0.438278585925922	0.0004831374332411	0.595412386815343	4.410224496143166e-05	0.4200951536997747	4.410224496143166e-05	0.4255755764744176	0.0054122265844082	0.3648880028306833	0.0054122265844082	0.3699363904744361	DUSP26	683956	RNF122	716851	TTI2	770794	False	False	False	alt	-65	0.0947	-20	0.01355
3868	chr8	34287962	T	C	rs2953935	0.421619914	0.0032594576103578	0.421619914	0.0032801883814251	0.0870964131013747	0.0077191200517386	0.0382809796398002	0.0023521836003449	0.0382809796398002	0.0023624132236895	0.0166507208604136	0.665529870290705	0.0085357093012366	0.2034061164810234	0.0085357093012366	0.2069819451856357	0.0015999681327236	0.3912858500708028	0.0008344336728646	0.0872312431893535	0.0008344336728646	0.0886882148777721	0.0141631750849526	0.1673313660383644	0.0141631750849526	0.1703498240966645	DUSP26	687939	RNF122	720834	TTI2	774777	False	True	True	alt	-50	0.02473	-35	0.00659
3869	chr8	34292544	C	A	rs79845297	-0.0008934902	0.6296897779733124	0.0177572202	0.6310551554613492	0.0786914070868566	0.0118137748784476	0.0001101410138945	0.2504084988622358	0.0014202718917151	0.2513294564306246	0.014587113589126	0.6952577412879979	-1.823474989096819e-05	0.7064861923513673	0.0002488582386913	0.7080280384134802	0.001272482261892	0.4446433214769678	-1.0710723107604568e-06	0.5079796989420016	2.2106497973438894e-05	0.5097011224325542	7.340569430239908e-05	0.6907135323134654	0.0008371548282801	0.6923182041826841	DUSP26	692521	RNF122	725416	TTI2	779359	False	True	False	ref	50	0.01733	65	0.03107
3870	chr8	34313594	C	T	rs2609620	-0.051934128	0.2007194446242112	0.0699678827999999	0.1991674242012421	0.0242920940033071	0.3398142272510003	-0.0017382344632128	0.2111332010048412	0.0020598253271621	0.2095198076631473	0.0332032925340635	0.5353789073892035	-0.0017173572283614	0.3969087357338253	0.0023413932084574	0.393200784586863	0.0008609446490621	0.4962932831324868	-5.933092180561779e-05	0.3653010973506463	7.045917944888006e-05	0.3620407481671914	-0.0045437299990102	0.3305985734965742	0.0062823727359704	0.3274216395158805	DUSP26	713571	RNF122	746466	TTI2	800409	False	False	False	ref	-100	0.06216	-40	0.05334
3871	chr8	34318913	G	A	rs2609622	0.0405272875999999	0.2256532258698181	0.0600208376	0.2274884272471881	0.0621343926780978	0.0270653717705631	0.0026388497119488	0.0872141959190614	0.003819231176848	0.0876559322633835	0.0736960179472797	0.3651398436987714	0.0029141121920838	0.2672081484620431	0.0042403019226098	0.2697809954947398	0.0044862081851997	0.1794500417551774	0.0001858202914273	0.1517727536309957	0.0002661242777129	0.153448247414231	0.0067021873247335	0.2135638077285046	0.0098215169410444	0.2156881082805022	DUSP26	718890	RNF122	751785	TTI2	805728	False	False	False	alt	100	0.01794	80	0.0737
3872	chr8	34328025	G	T	rs2719322	0.10888967046	0.1040325304243311	0.12239652154	0.1041535604714351	0.0341652894490328	0.1681563694889853	0.004162868298811	0.1054959193700028	0.0045557504684387	0.1052647686421145	0.0355333047408531	0.5546754086980419	0.0080888911603405	0.3032916273633885	0.0081636464598524	0.3051111586294965	0.0012712446665356	0.4519330739684306	0.0002916821896022	0.2550998312467133	0.000293796320654	0.2567236389979553	0.0147009336544488	0.2156526918479065	0.0149846590346738	0.2170922867882855	DUSP26	728002	RNF122	760897	TTI2	814840	False	False	False	alt	-50	0.01831	70	0.1409
3873	chr8	34336194	G	A	rs75428749	-0.0205311711	0.5557756880623905	0.0226121881	0.551429373037565	0.0118861687415433	0.8349290453256336	-0.0002623181878609	0.6661633533242072	0.0002854401416437	0.6616368790471846	0.4353180363564382	0.0594617305051498	-0.0084350637021058	0.1703407009266191	0.0093978970851733	0.1682235600141124	0.0052899668538741	0.1573526851018848	-0.0001131858903364	0.2525826003167393	0.0001238838273921	0.250082060758542	-0.0065627989838672	0.2798702431389191	0.0071879845600606	0.276839607866177	DUSP26	736171	RNF122	769066	TTI2	823009	False	False	False	ref	-75	0.2207	-75	0.2208
3874	chr8	34336809	G	A	rs73674310	-0.0142232291459999	0.6321804485272098	0.019252187254	0.6298009598063042	0.013393134893591	0.7681780724978449	-0.0002028226512675	0.7036320856548561	0.0002639207323095	0.7013840454558369	0.0220563491801655	0.5930321271396573	-0.0003855298904662	0.6332864459867769	0.0005076949572135	0.631452472534918	0.0002982108027816	0.6546392239074276	-5.516279782737797e-06	0.6757435061925547	6.999037260506349e-06	0.6740123043932759	-0.0011258289069974	0.609044083675168	0.0015316221833657	0.6071411636289341	DUSP26	736786	RNF122	769681	TTI2	823624	False	False	False	ref	-40	0.01152	-65	0.02722
3875	chr8	34341492	G	A	rs1458903	0.0019721814999999	0.6685130469854349	0.0149302675	0.6699278978514436	0.0144317011226863	0.7176766243850774	4.934808892105952e-05	0.7094975144231719	0.0002163170159603	0.7106914638479717	0.0152461152716834	0.6666999481466245	4.817977662127353e-05	0.7104081226790264	0.0002081471405549	0.7119202342735355	0.0002234190906595	0.7080059895149199	9.295288844576412e-07	0.7343389846573207	3.059314556813989e-06	0.7357211325966726	0.0002276401306456	0.6987855908524191	0.0007340569430239	0.70027434878923	DUSP26	741469	RNF122	774364	TTI2	828307	False	False	False	alt	90	0.0686	95	0.1836
3876	chr8	34367509	C	T	rs73674323	-0.12599241	0.0709326174002005	0.12599241	0.0700398913195295	0.0352753909409734	0.1530270700298124	-0.0045320968535823	0.0681252578895414	0.0045320968535823	0.0674082237633989	0.0157698525287848	0.6740287859323563	-0.0023078901681856	0.3953379497388307	0.0023078901681856	0.3903940752442103	0.0005848595367778	0.5669111274613412	-8.678509849488802e-05	0.3202312064707919	8.678509849488802e-05	0.3159626268584194	-0.0059986473557453	0.3302123558376677	0.0059986473557453	0.3258964613361917	DUSP26	767486	RNF122	800381	TTI2	854324	False	False	False	ref	-100	0.03418	55	0.08716
3877	chr8	34368805	A	G	rs74931817	-0.0141509615539999	0.7162368264395127	0.0141509615539999	0.7094627033004353	0.0079041478446047	0.9754620351125411	-0.0001085680356987	0.8574688988055863	0.0001085680356987	0.8507459570869834	0.0148642407046946	0.6943868425794748	-0.000344995555758	0.7480860911909994	0.000344995555758	0.7415698810201248	0.0001159078872107	0.8134943846660645	-2.599027994921444e-06	0.8317905951282013	2.599027994921444e-06	0.8250601354122848	-0.0009765431691464	0.7317075682254244	0.0009765431691464	0.7251848047174252	DUSP26	768782	RNF122	801677	TTI2	855620	False	False	False	ref	-100	0.057	-100	0.11914
3878	chr8	34372979	A	G	rs1562183	0.12712465	0.0677227044082975	0.12712465	0.0685669420587825	0.0311810824970164	0.2050054383395718	0.0040018647351177	0.0792207287625472	0.0040018647351177	0.0800375797269042	0.029875292797994	0.5464941358652115	0.0038581794764885	0.282940001631275	0.0038581794764885	0.2873409956697325	0.0008980510203164	0.4658603284615406	0.0001165924962396	0.2407442500401262	0.0001165924962396	0.2447180390651456	0.0101093662366797	0.2083778846640694	0.0101093662366797	0.2116985058582003	DUSP26	772956	RNF122	805851	TTI2	859794	False	False	False	alt	35	0.009155	45	0.1203
3879	chr8	34377962	A	T	rs78759621	-0.0235719784	0.5695065175287523	0.0235719784	0.563379503024573	0.0186959761670617	0.531736977419727	-0.0003979564373201	0.5967361094577203	0.0003979564373201	0.5902776329224155	0.0016462670317706	0.93787534175639	-2.5555320880624523e-05	0.9135636001380104	2.5555320880624523e-05	0.906587468839658	3.217550541936217e-05	0.9287825778170068	-4.779818866336478e-07	0.9054711741445366	4.779818866336478e-07	0.8985975073882331	-8.825178977927219e-05	0.9214980433915024	8.825178977927219e-05	0.9145211442065952	DUSP26	777939	RNF122	810834	UNC5D	857514	False	False	False	ref	-85	0.1895	-100	0.132
3880	chr8	34384091	T	C	rs16882072	-0.01519251936	0.6570477453879352	0.01606024144	0.6524544119599747	0.0099082468337854	0.9048277067254126	-0.0001503707861228	0.7752551299185444	0.0001593670225656	0.7705659687586977	0.0045123882418923	0.8451605375132233	-5.434653836085901e-05	0.8459775613724337	6.035111453609221e-05	0.8417328241113474	4.2278543206854685e-05	0.9074422913867316	-4.919301188349941e-07	0.890588600541955	5.541834458076801e-07	0.8861064857139539	-0.0002292896968097	0.83704908729503	0.0002441357922866	0.8327614265700902	DUSP26	784068	RNF122	816963	UNC5D	851385	False	False	False	ref	-95	0.03964	-65	0.06104
3881	chr8	38181915	A	G	rs11779986	-0.01096763558	0.7050104149367812	0.01466941002	0.7048466237753478	0.0203244234203048	0.4714450219361245	-0.0002186516827755	0.6915243341078968	0.0003003180037096	0.691441857799781	0.0231285671868298	0.5913685149256273	-0.0002495227311036	0.7147066130092308	0.0003267012223436	0.7155715843277769	0.0004837764346212	0.5801606675177889	-5.266810806701552e-06	0.7006564326810752	6.956800764852282e-06	0.701426660092678	-0.0007076638843984	0.6989074958674181	0.0009897396984592	0.6996840045313293	LSM1	5185	BAG4	5381	STAR	30923	False	False	False	ref	-100	0.1814	-80	0.1515
3882	chr8	38182985	A	G	rs4537271	0.057897156	0.248496192502201	0.057897156	0.2516889060803722	0.0208245767145455	0.4551237953201666	0.0011801388326188	0.2986743215803656	0.0011801388326188	0.3024000815051769	0.0375705189535151	0.4921925276466776	0.0018437376096137	0.3863378955474224	0.0018437376096137	0.391311880510128	0.0007996870295305	0.4825778002732993	3.8117272634492166e-05	0.3852390394532476	3.8117272634492166e-05	0.3903845570815515	0.0051441720827422	0.3349226194253885	0.0051441720827422	0.3396983469874076	LSM1	6255	BAG4	6451	STAR	31993	False	False	False	alt	95	0.01733	20	0.09174
3883	chr8	38194867	T	G	rs111373244	0.01250457927	0.6264427063029996	0.01809649647	0.6303967735802316	0.0446882312473003	0.0824107014853789	0.0004718604312804	0.4378754398283821	0.0007095375866823	0.4406347124039285	0.0001030978852561	0.9995045111123344	5.761490905273526e-07	0.9868055775809677	1.5908151757373845e-06	0.991128907722687	4.5192964124154165e-06	0.9951102488987796	2.1955322766286786e-08	0.9738142106023808	6.508238405461163e-08	0.9780349710333636	6.598264656395367e-06	0.982774529566696	8.247830820494214e-06	0.9871331832997544	LSM1	18137	BAG4	18333	DDHD2	30352	False	False	False	alt	65	0.0941	-55	0.02344
3884	chr8	38217860	T	G	rs150171772	0.000320045	0.621028440690745	0.0183592842	0.6218442627166216	0.103114376974163	0.0038517130217023	0.0002072386026672	0.198492912538999	0.0018948746536664	0.1989539990416167	0.0024017683349278	0.9147512116967328	-2.74899089819429e-05	0.8729053796071735	4.930067196687515e-05	0.8740263815726441	0.0002246213767209	0.7147564574269356	-2.271518906285696e-06	0.7007359631175716	4.696781167845333e-06	0.7017038826377221	-0.0001121704991587	0.8711694835730648	0.0001880505427072	0.8714940730527588	DDHD2	7359	LSM1	41130	BAG4	41326	False	False	False	alt	35	0.007446	-90	0.2058
3885	chr8	38239069	G	A	rs10103315	0.001118747668	0.9170583705323414	0.0032631888679999	0.9214391413851094	0.0098133688207324	0.8990502221753207	1.298492126953774e-05	0.9404768890510332	3.2571623559749365e-05	0.94486041877846	0.0007150869321367	0.9787342297883772	1.1306555480295135e-06	0.9827990113580802	2.404118696951748e-06	0.9872269237975676	7.307430303761943e-06	0.9879660190817848	1.33626898057614e-08	0.9859766081696268	2.499413189687714e-08	0.9903803428956888	7.423047738444794e-06	0.9836288577282422	9.072613902543652e-06	0.9867908103097603	DDHD2	13850	PLPP5	30174	LSM1	62339	False	False	False	alt	100	0.1323	-90	0.088
3886	chr8	38244605	G	A	rs56058270	-0.0842207492	0.1405216651976326	0.0842207492	0.1385309910973315	0.0334576627024663	0.1732749351482529	-0.0028937827115214	0.1173214301695	0.0028937827115214	0.1158999954730141	0.0001476361716867	0.9990335456258248	-1.3358990149389674e-05	0.949538411424182	1.3358990149389674e-05	0.9424657210977336	5.124939179295329e-06	0.9941460462975428	-4.742782765031004e-07	0.9073975728154112	4.742782765031004e-07	0.9004427331096437	-3.546567252812511e-05	0.9641872582370212	3.546567252812511e-05	0.9571151240889774	DDHD2	19386	PLPP5	24638	LSM1	67875	False	False	False	ref	45	0.1693	-80	0.1941
3887	chr8	38271610	T	C	rs57984710	0.431229028	0.0032656523393524	0.431229028	0.003245527009537	0.1164077125610923	0.0023307090502083	0.0539118498861772	0.0014065322691884	0.0539118498861772	0.0014217292442294	0.0889759493253274	0.3276252449078956	0.0379890957457206	0.0412973776433306	0.0379890957457206	0.0420716687269611	0.0101877203437625	0.0744415628423937	0.0046472944441535	0.0103076944796942	0.0046472944441535	0.0103867599308996	0.0575253208406188	0.0161546161436323	0.0575253208406188	0.0163472701336453	PLPP5	2367	DDHD2	46391	LSM1	94880	False	True	True	alt	0	0.0	0	0.0
3888	chr8	38276094	C	T	rs1488934	-0.071802135	0.1858200469160947	0.071802135	0.1834027771618145	0.0149451622328923	0.6889161262419478	-0.0011327895006505	0.3113031191434064	0.0011327895006505	0.3074019920833837	0.1272937217511793	0.2581926952964055	-0.0086685220101675	0.1724693073945802	0.0086685220101675	0.1693531558911104	0.0017914050556727	0.3304233756946323	-0.0001294342442824	0.2290305165628255	0.0001294342442824	0.2252439099975964	-0.0159463561083434	0.1316204291699103	0.0159463561083434	0.1292872422361076	PLPP5	6851	DDHD2	50875	LSM1	99364	False	False	False	ref	65	0.01999	85	0.2329
3889	chr8	38276275	G	A	rs1488935	-0.00771089786	0.667499924967552	0.01558704066	0.6653680963903574	0.0104656959267659	0.8960889495278682	-7.632991911636954e-05	0.774789149096294	0.0001686402104823	0.7728481596629505	0.0530681930652238	0.4289011975594848	-0.0003383705806395	0.5417886692404705	0.0007224210126074	0.5404285703703768	0.0005391477876773	0.5499602548322137	-3.1741927164762403e-06	0.6248093733415544	7.68638130039635e-06	0.6231870836372325	-0.0009592227244234	0.5392568637579327	0.0019770050476724	0.5377546804442187	PLPP5	7032	DDHD2	51056	LSM1	99545	False	False	False	ref	65	0.009	100	0.07117
3890	chr8	38280012	A	G	rs12674515	0.02026529686	0.5342212604238591	0.02435020566	0.5381520197983058	0.0250398350075872	0.3283243047099627	0.0004975773124293	0.473617878225701	0.0006041613699509	0.4771770909199247	0.0813335092870574	0.3502118419301747	0.0020209653593183	0.3869296528892272	0.0023507559582509	0.3898675002210643	0.0020732347292622	0.3155281726881678	5.09568977376458e-05	0.3624937622557469	5.95618435250734e-05	0.3653270981582807	0.0041890732737289	0.3691621917953521	0.0049825145986605	0.3720678513142569	PLPP5	10769	DDHD2	54793	NSD3	102260	False	False	False	alt	-100	0.01971	-95	0.07214
3891	chr8	38284697	T	C	rs7845284	-0.007104168	0.8200173054840278	0.008006646	0.8153760108301983	0.0185515522651981	0.5380714293182278	-0.0001336269983457	0.7921661927692907	0.0001474920612279	0.7873872705583429	0.0006606512487215	0.9803699285894216	-5.150437598848855e-06	0.974876563127682	5.563551075409965e-06	0.9704698599084358	1.235864868215043e-05	0.9748392641005056	-9.669726608701901e-08	0.969401166282268	1.0304406254676733e-07	0.9649570545319208	-2.144436013328497e-05	0.9722617759711704	2.474349246148265e-05	0.9677925906607514	PLPP5	15454	DDHD2	59478	NSD3	97575	False	False	False	ref	-85	0.02711	100	0.0421
3892	chr8	38285217	T	C	rs7823681	-0.00438535112	0.8398960592481192	0.00722767964	0.836154710765754	0.0185703040259436	0.5353744541345128	-8.306656868307576e-05	0.8075470558116941	0.0001352091725523	0.8037501475637971	0.0015786348190425	0.9413420738718457	-8.9729382905361e-06	0.9541772958011472	1.172749604237102e-05	0.949938915556754	2.872691645483484e-05	0.9343793761384536	-1.642686092015285e-07	0.94683017985341	2.1480105579389762e-07	0.942675653418517	-2.7217841707630912e-05	0.9572356070465886	4.041437102042165e-05	0.953051849500941	PLPP5	15974	DDHD2	59998	NSD3	97055	False	False	False	ref	35	0.00557	-100	0.0198
3893	chr8	38295074	C	G	rs12386951	0.0748091276	0.165670029869038	0.0748091276	0.1681154264137714	0.0388071630904633	0.1202439777674095	0.0030987077306478	0.1135637934200889	0.0030987077306478	0.1148827822354755	0.0024421827059482	0.9082245594426452	0.0002355691051022	0.7203461533801796	0.0002355691051022	0.7269228672427023	0.000112098550754	0.8237117769227541	1.1629584655387854e-05	0.6186119549196633	1.1629584655387854e-05	0.6249283363261942	0.0008429283098544	0.7040941607538035	0.0008429283098544	0.7107248958509796	PLPP5	25831	DDHD2	69855	NSD3	87198	False	False	False	alt	-10	0.001953	45	0.04272
3894	chr8	38350172	A	G	rs28634296	0.1490363682	0.051497141886397	0.1490363682	0.0520640012587227	0.0293769016225126	0.2375196464821414	0.0048594314867306	0.0702571558155003	0.0048594314867306	0.0708734887988477	0.0015712117713041	0.9356395432520512	0.0002686772820952	0.6808457189172403	0.0002686772820952	0.6872077817217693	4.970810177462975e-05	0.8888458602611572	9.013843402378964e-06	0.6132086060222769	9.013843402378964e-06	0.6193984619152682	0.0007876678433571	0.6868148825993589	0.0007876678433571	0.6932989765222612	NSD3	32100	LETM2	36036	PLPP5	80929	False	False	False	alt	35	0.01111	30	0.02951
3895	chr8	38360223	T	C	rs2130033	-0.02606374542	0.500069607208639	0.02751757378	0.4958468540521379	0.032096028618795	0.191950448235768	-0.0008371147648866	0.3744138330132519	0.0008810503030455	0.3709971437980856	0.0065990894394773	0.8049619596735812	-0.0002369000249712	0.7369456515950717	0.0002398138210194	0.7328901749425594	0.0002017125461819	0.7304384110005133	-7.139386240950124e-06	0.6715176198717611	7.227442852185474e-06	0.667293706594662	-0.0008091122034904	0.7150385351235024	0.0008256078651314	0.71103646727134	NSD3	22049	LETM2	25985	PLPP5	90980	False	False	False	ref	-90	0.2212	50	0.1279
3896	chr8	38368759	A	G	rs16887343	0.1738175919999999	0.0375151369397833	0.1738175919999999	0.0378852009043887	0.0359561636722114	0.1469586090499764	0.0066724063514083	0.044507212709012	0.0066724063514083	0.0448386567579371	0.0038525617762528	0.8738850822371587	0.0007869007349857	0.5566354959636919	0.0007869007349857	0.5625798699469641	0.0001522759536304	0.787238558300238	3.139191579974616e-05	0.4616608536085896	3.139191579974616e-05	0.4672118491164689	0.0021419616640822	0.5432215083270054	0.0021419616640822	0.5492923223702647	NSD3	13513	LETM2	17449	PLPP5	99516	False	False	False	alt	-95	0.01654	-20	0.03894
3897	chr8	38382980	G	A	rs60558877	0.0364314716	0.4003701705740651	0.0364314716	0.4057039225235033	0.0386954856623661	0.1195697409855718	0.0013794674456519	0.2563911581328926	0.0013794674456519	0.2599249432921066	0.9392101877206296	0.0004480164875621	0.0342283530947773	0.0486464943743449	0.0342283530947773	0.0496981968294238	0.0363457794956232	0.0054742691065832	0.0012959667235403	0.0411393341670663	0.0012959667235403	0.0419262646695517	0.0017774075418164	0.5404274389962931	0.0017774075418164	0.5463315608982274	NSD3	708	LETM2	3228	FGFR1	85854	True	False	False	alt	25	0.02094	15	0.02856
3898	chr8	38401517	C	A	rs2016875	-0.39494624	0.0051734825957011	0.39494624	0.0051350920151744	0.1156854875226016	0.0023647773117046	-0.0490083434395121	0.0019692910590251	0.0490083434395121	0.0019626478569089	0.3251146448484048	0.0988166056099641	-0.1292853092897835	0.0070188542444598	0.1292853092897835	0.0070066871039085	0.0384501294011018	0.0052658511996256	-0.0164887434789332	0.0022552864629199	0.0164887434789332	0.0022573569247194	-0.1230708323710863	0.0029744689021562	0.1230708323710863	0.0029644819934609	LETM2	15309	NSD3	19245	FGFR1	67317	False	True	True	ref	50	0.02486	100	0.321
3899	chr8	38402922	C	T	rs28681082	0.0201130854	0.6004059559092716	0.0201130854	0.6067850799471017	0.0283068300698802	0.2548058952717982	0.0005305649178013	0.5218389539947437	0.0005305649178013	0.5276254872581092	0.1071236514796607	0.2979386833272639	0.0023980253899097	0.4018324709240936	0.0023980253899097	0.407147552511698	0.0030299047890457	0.2495128118430885	6.399552830145118e-05	0.3655872777654944	6.399552830145118e-05	0.3705505370702248	0.0043886707795849	0.4050687174964376	0.0043886707795849	0.4103725395215136	LETM2	16714	NSD3	20650	FGFR1	65912	True	False	False	alt	-100	0.03424	5	0.00537
3900	chr8	38415024	C	G	rs4647905	0.104441513	0.0946461644754839	0.104441513	0.0959398692526017	0.0673668700341535	0.0204549796397732	0.0068761281555942	0.0345365066343934	0.0068761281555942	0.0347286961440555	0.1761736663257563	0.2043031414832205	0.0199779615531789	0.0891445060921247	0.0199779615531789	0.090922789915783	0.0113242073341654	0.064775746078366	0.0012527394617682	0.0432779867264442	0.0012527394617682	0.0439513952506687	0.0285787337930123	0.0600116806194618	0.0285787337930123	0.0610561190122142	LETM2	28816	NSD3	32752	FGFR1	53810	False	False	False	alt	85	0.03806	-10	0.01343
3901	chr8	38430037	C	T	rs4647907	-0.009995157	0.2373506200618483	0.059017479	0.2367501267754965	0.0208161577928779	0.4517006839684957	-0.0002783999714006	0.2722855806221322	0.0012676823533862	0.2715043962733087	0.8271502094949028	0.0057217458473809	-0.0070504783280574	0.0306282666248713	0.048396357780084	0.0305298816552842	0.0171596786006663	0.0307633083374566	-0.0002041535847695	0.0519141589714786	0.0010360062689496	0.0516140179595218	-0.0020108211540364	0.2604298371992966	0.0075599617300649	0.2595392891305483	FGFR1	38797	LETM2	43829	NSD3	47765	True	False	False	ref	-10	0.00261	75	0.1534
3902	chr8	38431048	C	G	rs7005874	-0.00754712654	0.7114943661707496	0.01280897226	0.7090947929789679	0.0113814867636402	0.8523685276330928	-9.97151712922788e-05	0.7768274104673114	0.0001583465615186	0.7745626820687426	0.492339414733925	0.045326445392769	-0.0041730450460091	0.2257677967958063	0.0063311418294134	0.2244720065498325	0.0056216265564255	0.144301602372894	-5.534411835484349e-05	0.3134338439333007	7.915718584620111e-05	0.3118733549318455	-0.0023366104714459	0.3963980935124873	0.0041148427963444	0.3944590666621927	FGFR1	37786	LETM2	44840	NSD3	48776	False	False	False	ref	-60	0.00995	55	0.1045
3903	chr8	40891512	C	T	rs62640287	-0.161761644	0.041646368813408	0.161761644	0.0411876795427181	0.0316353878383206	0.197489232210126	-0.0053650890698471	0.0557692488811469	0.0053650890698471	0.0552756655598906	0.1125861898320741	0.294119402011645	-0.0189256611469135	0.0999087664409679	0.0189256611469135	0.0980584357133293	0.0038301573609181	0.2213969894405371	-0.0006639220794076	0.0896740900175948	0.0006639220794076	0.0880926006892998	-0.0320081818481738	0.0539722551358968	0.0320081818481738	0.0530466563987113	ZMAT4	6321	SFRP1	417961	GOLGA7	596689	False	False	False	ref	15	0.004944	95	0.1554
3904	chr8	40896455	C	A	rs16890077	0.002947278	0.8048104398044044	0.0085038744	0.8089820511478719	0.0207508235811447	0.4578616903114817	5.881686298300799e-05	0.7519492975407147	0.0001779146250778	0.755994872954589	0.1508313813467057	0.2343198484066247	0.0001894476455458	0.4347776349813217	0.0014485086776949	0.4377311325207895	0.003140825373517	0.2447276668095886	3.3672737490102943e-06	0.4299969687321108	3.0353460852304376e-05	0.4330344954213417	0.0006400316716703	0.4949055374902336	0.0023060934974101	0.4980901859889959	ZMAT4	1378	SFRP1	413018	GOLGA7	591746	False	False	False	alt	-95	0.01846	100	0.1595
3905	chr8	51796358	A	C	rs4498530	0.001351069314	0.9302256516823976	0.002586262594	0.9342631183659164	0.0192602258936895	0.5103278244342978	3.047281643305177e-05	0.9210448116163644	4.537146743804031e-05	0.9251980168871768	0.0062469070634422	0.7932874785470395	4.279792302869657e-06	0.9303581460806878	1.5170406525396503e-05	0.9341959328561475	0.0001153994935773	0.7931992684423568	1.2193524775546973e-07	0.9289304410410572	2.532956278512497e-07	0.9327840574567036	1.8970010887122804e-05	0.9347069613030492	5.691003266139567e-05	0.9385678958982238	PXDNL	13087	PCMTD1	102828	ST18	664601	False	False	False	alt	65	0.01106	0	0.0
3906	chr8	51872765	C	A	rs10105030	-0.0271307936	0.5111619245601579	0.0271307936	0.5054181623247279	0.0169887674434298	0.5993835131547061	-0.0004951522830746	0.5327795245681752	0.0004951522830746	0.5270908118479651	0.0013410972914123	0.9518287329458006	-3.721520365531851e-05	0.8922004758091909	3.721520365531851e-05	0.8852840172836146	2.3004599125131727e-05	0.949397070321488	-6.820911929432046e-07	0.8879961439336567	6.820911929432046e-07	0.8810597160713769	-0.000151760087097	0.8828700308419876	0.000151760087097	0.875982722690743	PCMTD1	26421	PXDNL	63320	ST18	588194	False	False	False	ref	0	0.0	-40	0.0116
3907	chr8	51983360	C	T	rs4873621	-0.00361655544	0.7611068456620669	0.0111975869599999	0.760164892992686	0.0456012043237952	0.0777555260860809	-2.5236589014435472e-05	0.5088354216209483	0.0005502402104354	0.5080245410052836	0.0108442479627857	0.7281738593302624	-7.320951378933936e-05	0.7770737542957711	0.0001486517361535	0.7761295517559177	0.0004934908796266	0.5870606993224466	-1.658727478468696e-06	0.6674325781862384	7.012979360218216e-06	0.6666257775215906	-0.0002367127445481	0.765467138890201	0.0005154894262808	0.7645086360856063	PCMTD1	84174	PXDNL	173915	ST18	477599	False	False	False	ref	-10	0.00238	-70	0.09814
3908	chr8	51997917	T	C	rs16917075	-0.0088949995	0.3920178142856015	0.0365690195	0.3898470746972127	0.0714596808830228	0.0164125540957167	-0.0004907709739555	0.1358030814241643	0.0026570033548868	0.1348613876748378	0.016255649764112	0.6501571572682804	-0.000148504802865	0.5778201802131133	0.0005258030936139	0.5749516037359492	0.0011948368320335	0.4151460691656289	-9.377050449561058e-06	0.3891001613780136	3.891073562721463e-05	0.3865067271644808	-0.0004767246214245	0.5432849620274958	0.0017996766850317	0.5405627337839883	PCMTD1	98731	PXDNL	188472	ST18	463042	False	True	False	ref	90	0.003662	55	0.04364
3909	chr8	54639577	T	C	rs62514618	0.0154316632	0.5485342510142207	0.0226731164	0.5507837776471828	0.020255366257162	0.4704690442209186	0.0003805761128886	0.542150719802026	0.0004925620060341	0.5442491157086095	0.0300097324403681	0.5341388506416054	0.000374332780297	0.5698966179874072	0.0005965004421158	0.5723839270323359	0.0006000371427604	0.5314585562821751	9.354105990804264e-06	0.5600175565485167	1.2657910009614676e-05	0.5624349267777142	0.0012652172478638	0.5418963775553883	0.0019563854706211	0.5447117130821875	RP1	130154	SOX17	181641	XKR4	462452	False	False	False	alt	95	0.014984	0	0.0
3910	chr8	54673079	C	T	rs41444144	-0.0857048192	0.1386220292828557	0.0857048192	0.1367576330175227	0.0433568835346837	0.0865145362904705	-0.0036762205322004	0.0866084157360894	0.0036762205322004	0.0855813578098141	0.0315042393850416	0.5230762380539337	-0.0025895596164556	0.3311522035391995	0.0025895596164556	0.3264893823438488	0.0013673016329009	0.3801370231423965	-0.0001112767935537	0.2393878852710375	0.0001112767935537	0.2355373758826372	-0.0075302695391111	0.2583718657307098	0.0075302695391111	0.2542419678792179	RP1	163656	SOX17	215143	XKR4	428950	False	False	False	ref	-20	0.00592	10	0.031
3911	chr8	54698448	G	A	rs858392	0.2830100379999999	0.0106624017095088	0.2830100379999999	0.0106911169501098	0.0585769760589135	0.0336474532751141	0.0172445116233138	0.0093979010635744	0.0172445116233138	0.0094214803571708	0.0030624195836494	0.8861839669445964	0.0010765872170593	0.4960028451587194	0.0010765872170593	0.501801232802507	0.0001918247603926	0.7355988390174332	6.993919932572531e-05	0.3416788711205897	6.993919932572531e-05	0.3465608358208392	0.0022623799940615	0.507757011517227	0.0022623799940615	0.5136665185411196	RP1	189025	SOX17	240512	XKR4	403581	False	True	False	alt	95	0.2576	-5	0.02075
3912	chr8	54708353	G	T	rs72650344	0.0052212173	0.6683632255390092	0.0150608256999999	0.67160091354758	0.0302618497649178	0.2242390353962979	0.0001213167337843	0.512982896043793	0.0005003870154625	0.5154185396796206	0.001737817953878	0.931682071927474	-1.2659737651237878e-05	0.8944362296043231	3.404521025060212e-05	0.8979335699007955	5.985904259046502e-05	0.8832847370603206	-5.593117306283007e-07	0.8472415209493073	1.2399933657542851e-06	0.8505648460830064	-4.453828643066534e-05	0.8863184395346503	0.0001451618224406	0.8897095250525374	RP1	198930	SOX17	250417	XKR4	393676	False	False	False	alt	85	0.0293	-80	0.02075
3913	chr8	54828520	G	A	rs6984055	0.189761309	0.0292756702789923	0.189761309	0.0296574762142721	0.0427691934831505	0.091168918734568	0.0085743602367011	0.0292855666814932	0.0085743602367011	0.0295169701668192	0.033413612219986	0.5581973858256217	0.0068268823885463	0.2345218680633257	0.0068268823885463	0.238039154302402	0.0014332373617773	0.4160223490814592	0.0003066036737137	0.1689117224413004	0.0003066036737137	0.1716829798122847	0.0150456929827455	0.1608713112485207	0.0150456929827455	0.1632751217730743	XKR4	273509	RP1	319097	SOX17	370584	False	False	False	alt	-30	0.02222	-30	0.1643
3914	chr8	54834669	T	G	rs56956895	0.0122581744	0.7354566185385899	0.0122581744	0.7421130558317399	0.0104320507082795	0.8915794854753748	0.0001306487731053	0.8148113873749321	0.0001306487731053	0.8214815412061236	0.00737685988585	0.7681747268005947	8.532371288671396e-05	0.8005458314484369	8.532371288671396e-05	0.807222415416193	7.642462836471696e-05	0.839149942504216	8.941397868021098e-07	0.8461271479332432	8.941397868021098e-07	0.8530027034254279	0.0003439345452145	0.7860210760771074	0.0003439345452145	0.7926249651907673	XKR4	267360	RP1	325246	SOX17	376733	False	False	False	alt	70	0.009	-100	0.0957
3915	chr8	54836020	C	T	rs9298512	0.218215336	0.0192518277515356	0.218215336	0.0194043098286068	0.1170408145890452	0.0021362199042292	0.0252242221846168	0.0042531467875512	0.0252242221846168	0.0042719438470328	0.0807891524529048	0.3454366836175083	0.0182331102613567	0.0916910583530451	0.0182331102613567	0.0934760643031455	0.0094270491181159	0.0814753935877759	0.0021037226585341	0.0238278261765626	0.0021037226585341	0.0242388622620572	0.0344338688924812	0.0421225006349053	0.0344338688924812	0.0427808635793542	XKR4	266009	RP1	326597	SOX17	378084	False	True	True	alt	95	0.00996	55	0.0687
3916	chr8	54869952	C	T	rs1498180	0.0466679396	0.31316377490309	0.0466679396	0.3173502290347026	0.0340593931959909	0.1655165127575245	0.0016265446662177	0.2193745249960536	0.0016265446662177	0.2222394753801879	0.0864661344066509	0.3520985486060919	0.0040196529491086	0.292715635575498	0.0040196529491086	0.2971555461149183	0.0029077455121819	0.2658054446369099	0.0001370667209426	0.2384635174465499	0.0001370667209426	0.2421568325555398	0.0077240935633927	0.2621369738795707	0.0077240935633927	0.2662072532904042	XKR4	232077	RP1	360529	SOX17	412016	False	False	False	alt	90	0.008575	-50	0.2324
3917	chr8	54876309	G	A	rs1498179	-0.1304030796	0.0711101984217256	0.1304030796	0.070141880561161	0.027621834437965	0.2703293013579591	-0.003747633261432	0.0952889234106589	0.003747633261432	0.0940783642347661	0.0068432252317639	0.7972922753480807	-0.0008037297124687	0.5537272114808919	0.0008037297124687	0.5479180606127111	0.0001715451029857	0.7559583987941888	-2.058810479394284e-05	0.510798407496498	2.058810479394284e-05	0.5048568600622375	-0.0024496057536867	0.5210053332019807	0.0024496057536867	0.5151601038475955	XKR4	225720	RP1	366886	SOX17	418373	False	False	False	ref	-100	0.02228	-40	0.01221
3918	chr8	54877642	T	G	rs10108316	-0.0128636214	0.6273912281615379	0.0190736166	0.625028547705966	0.0147345949688309	0.7042417520605296	-0.0001588002286834	0.6846082452148526	0.0002668674964554	0.6824046380277091	0.0017666853617498	0.9292651147771857	-2.596034616505867e-05	0.894042740640385	3.50192040773732e-05	0.8923889292240544	2.547249166077901e-05	0.9401613158168364	-3.280704333727763e-07	0.9042954783902653	4.813336127628961e-07	0.902761036546745	-7.670482663056683e-05	0.8935944440107104	0.0001245422453894	0.8920311777049768	XKR4	224387	RP1	368219	SOX17	419706	False	False	False	ref	100	0.01349	100	0.1604
3919	chr8	54964104	C	A	rs4737804	-0.0213659684	0.5833048661112363	0.0213659684	0.5771014710629583	0.0081948500262366	0.9691441566107928	-0.0001758003659419	0.766640034319775	0.0001758003659419	0.7599492897269281	0.0021790769027745	0.931105533232926	-4.528411930764608e-05	0.8928959908745931	4.528411930764608e-05	0.8859540025329258	1.8946410450342603e-05	0.9664362810221576	-3.9302632045731204e-07	0.9340146743029324	3.9302632045731204e-07	0.9271227285575896	-0.0001385635577842	0.9078879699629112	0.0001385635577842	0.90089508453843	XKR4	137925	RP1	454681	SOX17	506168	False	False	False	ref	80	0.001404	-95	0.1527
3920	chr8	54975071	G	A	rs4737807	0.114779849	0.0780381429377205	0.114779849	0.0790820647171676	0.0331827204157494	0.1772898431744492	0.0038158310461854	0.0779940573854813	0.0038158310461854	0.0788258686319428	0.0063755732242419	0.7912205536416924	0.0007683624644245	0.5132713371734104	0.0007683624644245	0.519312322735928	0.0002137320096245	0.7069988649941487	2.568681994605009e-05	0.4369240700952881	2.568681994605009e-05	0.4426189663228425	0.0025098149186763	0.4749665309218475	0.0025098149186763	0.4808031561106408	XKR4	126958	RP1	465648	SOX17	517135	False	False	False	alt	-70	0.00792	-100	0.1263
3921	chr8	54996181	G	T	rs34401803	-0.0846347896	0.156218577577482	0.0846347896	0.1545484885885591	0.0490562178553756	0.0595021306402609	-0.0044090731907893	0.0917778154911077	0.0044090731907893	0.0909840436627395	0.0213519844280953	0.5954923884424793	-0.0018283429531106	0.422629829761278	0.0018283429531106	0.4174757296803804	0.0010556433381822	0.4292254613423729	-9.678671031512652e-05	0.2982555280354899	9.678671031512652e-05	0.2940110425610929	-0.0053487182870904	0.3562491280878898	0.0053487182870904	0.3514473443735606	XKR4	105848	RP1	486758	SOX17	538245	False	False	False	ref	-25	0.003052	-100	0.01758
3922	chr8	54997456	T	C	rs17332014	0.0602977952	0.2414332493736051	0.0602977952	0.2448573154791275	0.0692200282725548	0.0189538567756346	0.0046466371736133	0.0797275810097096	0.0046466371736133	0.0806568378449458	0.0534690376430998	0.4291188312721176	0.0035819462896825	0.3044491274882153	0.0035819462896825	0.3088181423195696	0.0038699581639364	0.2102832569367534	0.0002862572546215	0.1663784346406136	0.0002862572546215	0.169308064891118	0.0084078387384117	0.2469546124618499	0.0084078387384117	0.2508983161569965	XKR4	104573	RP1	488033	SOX17	539520	False	True	False	alt	100	0.01685	100	0.177
3923	chr8	59712759	C	T	rs6983076	0.017240916432	0.6333700736995167	0.017240916432	0.6397459210543209	0.0314721072392323	0.2015346676457079	0.0005422173175281	0.5227123297906292	0.0005422173175281	0.5280913263258863	0.0189617630563161	0.6810055571086897	0.0005363635990109	0.7341005304492003	0.0005363635990109	0.7403697948698915	0.0006204444457669	0.5972578900441781	1.7685339163317085e-05	0.6789527490501823	1.7685339163317085e-05	0.6851559550297227	0.0012891359572432	0.7145393119328367	0.0012891359572432	0.7209460032158796	CA8	568641	TOX	593612	RAB2A	804178	False	False	False	alt	90	0.01511	85	0.05017
3924	chr8	59762350	C	T	rs7835908	-0.1005107311999999	0.1048162483100809	0.1005107311999999	0.1032858692185563	0.0187009255468188	0.526185559600643	-0.0019570407441386	0.1843566945429191	0.0019570407441386	0.1819160395089367	0.0425513839860116	0.5277057977855144	-0.0045942226402444	0.319126675576254	0.0045942226402444	0.3144220527972708	0.000798622356944	0.5486585419563507	-8.916028412783231e-05	0.3477549595769203	8.916028412783231e-05	0.343254755055085	-0.0095353172115732	0.2537378430555996	0.0095353172115732	0.2499717692679741	CA8	519050	TOX	643203	RAB2A	754587	False	False	False	ref	-45	0.04593	45	0.04266
3925	chr8	59779158	T	G	rs12680715	-0.1654027672	0.0431922762740828	0.1654027672	0.0426883960116952	0.0398207446517712	0.1145997631852916	-0.0073406571955193	0.0424465416989114	0.0073406571955193	0.0421460705936719	0.1186334993896604	0.2730052697379167	-0.0172381607011166	0.0972850958155748	0.0172381607011166	0.0953959071560963	0.0043986429613691	0.1803253556147099	-0.0007403975308518	0.0718793170986555	0.0007403975308518	0.0707796163645437	-0.0311363861304476	0.0516117135924597	0.0311363861304476	0.0507962421633802	CA8	502242	TOX	660011	RAB2A	737779	False	False	False	ref	20	0.002075	-80	0.1257
3926	chr8	59782341	C	A	rs907211	0.1736846088	0.0376194594078898	0.1736846088	0.0380162667071669	0.033724439542743	0.1806787624385949	0.0066646979481473	0.0509957233725874	0.0066646979481473	0.0513622020919583	0.0251616574840816	0.5750479107036568	0.0048914633623222	0.2607729941801623	0.0048914633623222	0.2649162950771287	0.000905905262756	0.4791326910440456	0.0001917896404677	0.2119336447165118	0.0001917896404677	0.2153549523975337	0.0114760318036356	0.1887433902339369	0.0114760318036356	0.1920863823572129	CA8	499059	TOX	663194	RAB2A	734596	False	False	False	alt	35	0.01257	25	0.06775
3927	chr8	59783967	T	C	rs1473594	0.01958638048	0.5880410868334145	0.0212465414	0.592316898404432	0.0120614045864243	0.8294452697795663	0.0002361364163551	0.6950631468035054	0.0002555295114163	0.6994140233397548	0.0630282735640526	0.4087988529674879	0.0009169582403894	0.4995205656888561	0.0009991488299604	0.5031215214525852	0.0007714623548534	0.5053191353028785	1.1154484740541908e-05	0.5663619247436251	1.2114590420864332e-05	0.5701366758492948	0.0021361881825079	0.499684604403805	0.0023852726732868	0.503471884714736	CA8	497433	TOX	664820	RAB2A	732970	False	False	False	alt	-5	0.000572	0	0.0
3928	chr8	59798438	G	T	rs1034516	0.1082362819999999	0.1045050248528404	0.1082362819999999	0.1058089457328856	0.0267549481627989	0.2890486004024806	0.0031503889781445	0.1272059030525371	0.0031503889781445	0.1288051051824325	0.0571409719243838	0.4180175580565113	0.0077511357093545	0.2136577290954013	0.0077511357093545	0.216949452515066	0.0015858616565644	0.3653453731496109	0.0002212213536852	0.1991730513752153	0.0002212213536852	0.2023792921278979	0.0167472204810134	0.1400843220961906	0.0167472204810134	0.1421915965310455	CA8	482962	TOX	679291	RAB2A	718499	False	False	False	alt	85	0.1383	90	0.09564
3929	chr8	59800123	T	C	rs1034517	-0.0416381368	0.3546727857403554	0.0416381368	0.3498986449114425	0.0172409853371795	0.5837763411198365	-0.0007665812194491	0.4087419699993558	0.0007665812194491	0.4035755982370688	0.0019167958826827	0.929061940088702	-8.9349989633911e-05	0.8242376457734775	8.9349989633911e-05	0.8173846146829408	3.275675951913499e-05	0.9281217111823816	-1.5801327814411656e-06	0.822202154248082	1.5801327814411656e-06	0.815441055689714	-0.0003216654019992	0.8205650505753901	0.0003216654019992	0.8137689403067851	CA8	481277	TOX	680976	RAB2A	716814	False	False	False	ref	100	0.01865	-60	0.10187
3930	chr8	59802172	G	A	rs10504300	0.02682083938	0.4891901170014235	0.0282081354199999	0.4935197319659827	0.0091654730951926	0.9393487110224386	0.0002616700149632	0.6786094720814881	0.0002738470712447	0.6835571421588132	0.004073603642242	0.8545795257865139	0.0001255776874885	0.7892731934034943	0.0001344739849158	0.7938348380346176	3.873127721936912e-05	0.9147479094387082	1.3005050400387517e-06	0.8434592379430527	1.3785927083672623e-06	0.8481093581660938	0.0004552802612912	0.7799088799693205	0.0004816733199168	0.7843870087437128	CA8	479228	TOX	683025	RAB2A	714765	False	False	False	alt	-45	0.02249	15	0.01947
3931	chr8	59875381	C	T	rs7017555	-0.118455862	0.0788397939334244	0.118455862	0.0777305922554747	0.0254488772700904	0.3201693381558131	-0.0032488187363253	0.1115539150527298	0.0032488187363253	0.1101688217073458	0.1695473590445712	0.2040781844646611	-0.0202585860206004	0.0845878058315704	0.0202585860206004	0.082871097520802	0.0043651671166249	0.1845386774744979	-0.0005670384764378	0.0929311169902313	0.0005670384764378	0.091165114898957	-0.0317203325525386	0.0495577401736589	0.0317203325525386	0.0486644436767523	CA8	406019	RAB2A	641556	TOX	756234	False	False	False	ref	-65	0.02649	-55	0.0705
3932	chr8	59957960	G	A	rs782022	-0.04680746812	0.3305324552358525	0.04680746812	0.3263930243281456	0.0271701153706179	0.2823860511417302	-0.0014299102142739	0.2919105324668284	0.0014299102142739	0.2886761297496394	0.0083088647685658	0.7614662383831244	-0.0005256660478275	0.6418633311682267	0.0005256660478275	0.6355327807383078	0.000236528723497	0.7020081208550126	-1.603087584116869e-05	0.5880502651201007	1.603087584116869e-05	0.5817310308563416	-0.001736993170796	0.5973247279867229	0.001736993170796	0.5909945796079422	CA8	323440	RAB2A	558977	CHD7	720781	False	False	False	ref	100	0.00521	85	0.03992
3933	chr8	59963041	T	C	rs522182	-0.1138411579999999	0.0872666312236845	0.1138411579999999	0.0859811246154014	0.0394149882419551	0.1155918600407961	-0.0047723205285071	0.0680878952690637	0.0047723205285071	0.067335372063366	0.0167843357197056	0.6414661980833243	-0.0019930154058796	0.3855864074191308	0.0019930154058796	0.3804229517843657	0.000691368073726	0.5145919446699315	-8.730102533942276e-05	0.2953026373361764	8.730102533942276e-05	0.290904527100421	-0.005675332387582	0.3230781369459128	0.005675332387582	0.3182476216094408	CA8	318359	RAB2A	553896	CHD7	715700	False	False	False	ref	-100	0.01512	-95	0.1252
3934	chr8	64377812	A	G	rs298210	0.0249158383	0.5464622520438821	0.0249158383	0.5519317545981143	0.1135067850543709	0.0026050051768713	0.0030390120430586	0.1576624352696771	0.0030390120430586	0.1593446410706216	0.8622001913496751	0.0037163229397605	0.0218953177520088	0.1002441636185474	0.0218953177520088	0.1022013034851625	0.0983739568932419	0.0002035409748967	0.0026728207456684	0.0292441791364594	0.0026728207456684	0.0295482263827593	0.0022582560786512	0.5305360115018308	0.0022582560786512	0.5362564522943664	BHLHE22	202554	CYP7B1	420925	YTHDF3	1209258	False	True	True	alt	-95	0.06274	-80	0.2289
3935	chr8	64385043	G	T	rs298199	-0.0015695664	0.4707169963761882	0.030004142	0.4711479775636838	0.0392822798631598	0.1138539214025878	-0.0001185997775475	0.29324999578463	0.0012010529743338	0.2938254897377743	0.1384406651050773	0.2478069690385186	-0.0013622013339052	0.2688669045569726	0.0048716731554846	0.2690757559805027	0.0055312605877973	0.1525383525307685	-6.160953189460793e-05	0.2010686899853203	0.0001964979107077	0.2013245262287736	-0.0016454422486885	0.2630623757454411	0.0079401867308897	0.263447627154505	BHLHE22	195323	CYP7B1	413694	YTHDF3	1216489	False	False	False	ref	-5	0.005127	-5	0.03052
3936	chr8	64385745	A	G	rs298200	-0.0258272846	0.5112262826724213	0.028166523	0.5072785558981252	0.0240197666909817	0.3552370971001115	-0.0006618429493515	0.4575551770806187	0.0007176868274695	0.4541601950606904	0.0460154729306192	0.4579605889068215	-0.001269829823501	0.4647926604680281	0.0013246430640909	0.4611827883147056	0.0011124405666616	0.42522559415757	-3.235272381244278e-05	0.4369810973067933	3.366126244308254e-05	0.4332473667442084	-0.0031275774471313	0.4416870427069551	0.0033601662762692	0.4378138599625523	BHLHE22	194621	CYP7B1	412992	YTHDF3	1217191	False	False	False	ref	15	0.01892	-100	0.139
3937	chr8	64388316	G	A	rs298179	0.00204429716	0.6828134479191683	0.01470430404	0.6823319310012723	0.0147764706483733	0.6920517427858436	7.137561111904426e-05	0.7098121795346862	0.0002394794435397	0.709445893320851	0.0016355448517039	0.9353902943209328	1.1396455808609748e-05	0.9137574412732236	2.583757142343478e-05	0.9128751886695942	2.5244735918022905e-05	0.9407129865425404	2.503633537966133e-07	0.9155267634185325	4.413311308375772e-07	0.9146591488954712	5.77348157434422e-05	0.9071432313968564	0.0001138200653228	0.9063376547920242	BHLHE22	192050	CYP7B1	410421	YTHDF3	1219762	False	False	False	alt	-80	0.00206	-40	0.04385
3938	chr8	64397614	G	A	rs2577907	-0.02492732234	0.4831626325299539	0.0277665020599999	0.4788898105625156	0.0137541824067234	0.7439708962703229	-0.0003515238406907	0.5728603373672186	0.000392201197137	0.568461396897675	0.00417340239517	0.8493163165470435	-9.826225730921734e-05	0.7861836866525207	0.0001079686344463	0.7818314635001323	5.64427906397776e-05	0.8762299811819529	-1.36299880978929e-06	0.8081982874262821	1.5020635408028295e-06	0.8038711724584366	-0.0004082676256144	0.7680500800124013	0.000451156345881	0.7637215642703853	BHLHE22	182752	CYP7B1	401123	YTHDF3	1229060	False	False	False	ref	-40	0.0054	-5	0.005127
3939	chr8	64405886	A	G	rs59666344	0.3471208	0.0059737673172356	0.3471208	0.0060082615672904	0.0881670264069181	0.0074457208309054	0.0325552203028892	0.0032991503257509	0.0325552203028892	0.0032996407284557	0.0348264656395367	0.5107200850236518	0.0122237052481737	0.1305519580178987	0.0122237052481737	0.133186737921969	0.0031322700805411	0.2425482118552493	0.0011609303438625	0.0480492768650304	0.0011609303438625	0.048885383235046	0.0237215862228233	0.0768026529673571	0.0237215862228233	0.0780952939552782	BHLHE22	174480	CYP7B1	392851	ARMC1	1228331	False	True	True	alt	-90	0.02414	20	0.02563
3940	chr8	64413850	C	T	rs2612609	-0.2643672019999999	0.0154492248446401	0.2643672019999999	0.0153385476147592	0.0460710237299825	0.07789011660902	-0.0143157954091531	0.018663960519616	0.0143157954091531	0.018521514197827	0.2897265019299923	0.1169387288592525	-0.0654095742970096	0.0195912111906106	0.0654095742970096	0.0192176561642568	0.0119139299107179	0.0581950574916086	-0.0032643532077454	0.0169368243635087	0.0032643532077454	0.0167019381279322	-0.0744482201181089	0.0097593158630185	0.0744482201181089	0.0096130986740947	BHLHE22	166516	CYP7B1	384887	ARMC1	1220367	False	True	False	ref	25	0.01245	45	0.1821
3941	chr8	64428871	T	C	rs2600467	0.0279872499999999	0.4580824020939741	0.0315634744	0.4621906433393369	0.0147616956856265	0.6968687618296617	0.0004521967988901	0.5358956282294628	0.000506100230083	0.5401556687659878	0.1422957012305763	0.2423151002820259	0.0041604688124176	0.2732025547447445	0.0043382712609019	0.2765483114226756	0.0020380569520715	0.3155706608849341	6.715054292106654e-05	0.326703940468539	6.98305096264776e-05	0.3302827045180978	0.0072069545709478	0.2664173747279226	0.00767873049388	0.2697690280039285	BHLHE22	151495	CYP7B1	369866	ARMC1	1205346	False	False	False	alt	100	0.26	100	0.7314
3942	chr8	64449238	A	G	rs2577893	-0.1357275532	0.0656622174183926	0.1357275532	0.0649746927103394	0.0428960793109685	0.0910261344372778	-0.0062456900236271	0.0511905027932475	0.0062456900236271	0.0507276889567879	0.005742139817228	0.8101183821497098	-0.000871356239531	0.5276135706151281	0.000871356239531	0.522080602707554	0.0002612498634049	0.6835463936182374	-4.154266433671476e-05	0.4101797451133392	4.154266433671476e-05	0.4050549896445399	-0.0026005410577017	0.4928397802435958	0.0026005410577017	0.4872572645246612	BHLHE22	131128	CYP7B1	349499	ARMC1	1184979	False	False	False	ref	85	0.03052	90	0.05984
3943	chr8	64451888	T	C	rs2612589	0.0508445322	0.2867624388896661	0.0508445322	0.2907226904434242	0.0226748858045301	0.3932194872695471	0.0012259880292306	0.2893990230908044	0.0012259880292306	0.2932518161610747	0.0181501765035795	0.6282769277380925	0.0009293963182016	0.4922708575726041	0.0009293963182016	0.4977222222027407	0.0004267938310181	0.5972550321490232	2.321406018322034e-05	0.4678884106884419	2.321406018322034e-05	0.4735247712536643	0.0028248820560192	0.4520869345250386	0.0028248820560192	0.4577139378434565	BHLHE22	128478	CYP7B1	346849	ARMC1	1182329	False	False	False	alt	55	0.02544	100	0.317
3944	chr8	64468374	A	G	rs10504376	-0.0194895235999999	0.6139673735878669	0.0194895235999999	0.6075741707182912	0.0283504835246814	0.2534007562702349	-0.0005522082279798	0.4798499986762858	0.0005522082279798	0.4742049715096972	0.0008816931147107	0.969787972007868	-1.6862828101254763e-05	0.938731491896997	1.6862828101254763e-05	0.9317413619960632	2.459119700629461e-05	0.9416557849984016	-4.694855097074242e-07	0.904318550851312	4.694855097074242e-07	0.8973715038142183	-6.350829731780163e-05	0.9400393325483596	6.350829731780163e-05	0.9330441989260104	BHLHE22	111992	CYP7B1	330363	ARMC1	1165843	False	False	False	ref	-100	0.01695	-25	0.02042
3945	chr8	64472801	A	T	rs16931253	-0.0702635152	0.1840111650906405	0.0702635152	0.1813906355153192	0.0252509654158274	0.3242498928670904	-0.0017866568235364	0.1922001121922081	0.0017866568235364	0.189663431633543	0.0999999999999999	0.3078780441586005	-0.0072493657032585	0.2012462853206071	0.0072493657032585	0.1977533050755813	0.002486355821129	0.2801478058489919	-0.000180843015327	0.1944995689774517	0.000180843015327	0.1912663153384241	-0.0141598759526243	0.1505031637863616	0.0141598759526243	0.1477987219392175	BHLHE22	107565	CYP7B1	325936	ARMC1	1161416	False	False	False	ref	-50	0.0562	65	0.1694
3946	chr8	64534132	G	A	rs9643569	-0.0625868744	0.2197464407714941	0.0625868744	0.2169533227240306	0.0119485158529589	0.8263629930606302	-0.0007887002514536	0.3973847000300458	0.0007887002514536	0.3926920903002431	0.0009880901322951	0.9663056079950118	-7.004106135175506e-05	0.8403907394087171	7.004106135175506e-05	0.8334760763494197	1.234016155720257e-05	0.9754940962218116	-9.202667018181554e-07	0.8657717192731483	9.202667018181554e-07	0.85886156705142	-0.0002622810200916	0.8396382601800302	0.0002622810200916	0.8327586181694915	BHLHE22	46234	CYP7B1	264605	ARMC1	1100085	False	False	False	ref	-60	0.1456	80	0.1064
3947	chr8	64579514	C	T	rs4737675	0.01275672766	0.7115263257120732	0.01275672766	0.7183132009567457	0.0097078835854754	0.9134553175306284	0.0001246800436048	0.8094408967958575	0.0001246800436048	0.8162446751842077	0.5360355976378213	0.0372627564729807	0.0069988932021272	0.1969882428899819	0.0069988932021272	0.200491160077245	0.0052149373501115	0.1551247025517725	6.851636886799364e-05	0.307121491180594	6.851636886799364e-05	0.3116459470421703	0.0037964765266734	0.3939235941726743	0.0037964765266734	0.3992319628348675	BHLHE22	852	CYP7B1	219223	ARMC1	1054703	False	False	False	alt	45	0.03958	-100	0.10547
3948	chr8	64606609	A	G	rs3779870	0.166691974	0.0358422873293089	0.166691974	0.0361587081352921	0.0301437989270995	0.2252051766158317	0.005050346300036	0.0548010206425939	0.005050346300036	0.0553287182444494	0.7912638975949327	0.0076573322911011	0.1320348139068168	0.0048919172091209	0.1320348139068168	0.0049234150009152	0.0235494342487438	0.0160983643520366	0.0039462127897998	0.0105185295539287	0.0039462127897998	0.0105821642842896	0.0262668668140279	0.0644704215345688	0.0262668668140279	0.0656492979534462	BHLHE22	26243	CYP7B1	192128	ARMC1	1027608	True	False	False	alt	95	0.0174	-100	0.10864
3949	chr8	64625546	G	A	rs4452822	0.0241381854	0.5216101279535176	0.0241381854	0.5274936901036431	0.0220759520920167	0.4106509106582309	0.0005375477365328	0.4816918485352423	0.0005375477365328	0.4874123012737824	0.008362475668899	0.7856726928584931	0.0002105309959348	0.7283614119195397	0.0002105309959348	0.7350707922104078	0.0001936779193891	0.7566235924760528	4.911390844674585e-06	0.7015607935228199	4.911390844674585e-06	0.7081649583038017	0.00076869783247	0.7098211734847266	0.00076869783247	0.7165959534949193	BHLHE22	45180	CYP7B1	173191	ARMC1	1008671	False	False	False	alt	100	0.1777	-95	0.1186
3950	chr8	64649382	C	T	rs11996031	-0.0396960113999999	0.3639836262823762	0.0396960113999999	0.3591714643643584	0.02098522207508	0.447889957548625	-0.0008300279888581	0.3676392952428393	0.0008300279888581	0.36285011814412	0.0238593249975255	0.5774205440535071	-0.0009243373046472	0.4903997130589369	0.0009243373046472	0.4848267085135189	0.0005004078105621	0.5631642952458479	-1.928918844211701e-05	0.4798726123079221	1.928918844211701e-05	0.4742856197173432	-0.0029213816766189	0.4498499866823723	0.0029213816766189	0.4444539924599555	BHLHE22	69016	CYP7B1	149355	ARMC1	984835	False	False	False	ref	90	0.01083	90	0.0988
3951	chr8	64663044	C	T	rs4236934	0.0325677778	0.4366457926937381	0.0325677778	0.4421658654024893	0.0117937923106312	0.8204980356283604	0.0004086873866967	0.5748792960599828	0.0004086873866967	0.5808559568251467	0.0668833096895516	0.3851141391083683	0.0022771839694694	0.3570846491567279	0.0022771839694694	0.3619800386026331	0.0008222983359221	0.4870265299747948	2.9653866174374144e-05	0.4370035441970656	2.9653866174374144e-05	0.4422894030236231	0.0052002573323215	0.33009572871955	0.0052002573323215	0.3349029564692155	BHLHE22	82678	CYP7B1	135693	ARMC1	971173	False	False	False	alt	-80	0.01407	50	0.06073
3952	chr8	64670080	A	G	rs4486246	-0.1504041059999999	0.0505193340092431	0.1504041059999999	0.0498574029535039	0.0451656665510792	0.0786324729276001	-0.0067658496343226	0.0398362370609803	0.0067658496343226	0.0395684864820946	0.3395021609316749	0.092155977321482	-0.0542093143002771	0.0284159327276698	0.0542093143002771	0.0278115731335225	0.0156385714141639	0.0386107301441669	-0.0024754740545956	0.0229819633766239	0.0024754740545956	0.0225646507958797	-0.049567813665006	0.022615166834524	0.049567813665006	0.0222709404289905	BHLHE22	89714	CYP7B1	128657	ARMC1	964137	True	False	False	ref	-55	0.0536	-60	0.167
3953	chr8	64672852	T	C	rs6999999	-0.0724197074	0.1302779588309165	0.0911518074	0.1291592686935012	0.0182334134048597	0.5416581203711652	-0.0012081096225512	0.2206421530955596	0.0016638973598515	0.2187695714956919	0.0344264458447427	0.5167304954215306	-0.0020012007461813	0.3219604310519801	0.0031829651093403	0.3189714399962745	0.0006798057935787	0.5289918505608572	-3.152762882672134e-05	0.3454378082513317	6.028220969348797e-05	0.3424411258628052	-0.0053017056514136	0.2554168650919996	0.0080333872191613	0.2528131628557285	BHLHE22	92486	CYP7B1	125885	ARMC1	961365	False	False	False	ref	60	0.02734	15	0.03894
3954	chr8	64693162	G	T	rs7827287	0.09199778516	0.1596895357778096	0.09230248124	0.1611217293202088	0.1106382154775336	0.0029649745142585	0.0108065514246972	0.04742317383475	0.0108444228370121	0.0476570371553738	0.0322308732803272	0.5280755813782562	0.0038177669357564	0.3660996074679016	0.0038291047039441	0.370207725935891	0.0038100174368273	0.2175893676355536	0.000474567576065	0.1749039987386519	0.0004759767746782	0.1770317717376485	0.0088812642275081	0.2860602054352109	0.0089258025139387	0.2893446930558428	CYP7B1	105575	BHLHE22	112796	ARMC1	941055	False	True	False	alt	-40	0.2035	-100	0.12177
3955	chr8	64779146	C	A	rs13252547	0.00795971098	0.8122667840284721	0.00795971098	0.8191398076915701	0.0181405906629051	0.5556318456689099	0.0001377635248227	0.7972857577348413	0.0001377635248227	0.8041983908432724	0.0131016792583549	0.6838689871408958	9.798262403258564e-05	0.792616954377223	9.798262403258564e-05	0.7992794915595791	0.0002495907098201	0.6862941704421768	1.7465120132584196e-06	0.7886155994416205	1.7465120132584196e-06	0.7951662321611738	0.0003398106298043	0.7926481173731802	0.0003398106298043	0.7992761757187681	CYP7B1	19591	BHLHE22	198780	ARMC1	855071	False	False	False	alt	85	0.02193	-100	0.0705
3956	chr8	81061024	T	G	rs4574807	-0.1881530656	0.0388874633377277	0.1881530656	0.0386069082895718	0.0391439666250675	0.119783114784737	-0.0085415093530587	0.0424337167477058	0.0085415093530587	0.0420350894463199	0.1434635940747583	0.2428298612380384	-0.0336225722904932	0.0667045593777304	0.0336225722904932	0.0657189468026214	0.0061430100508789	0.1460198659517628	-0.0015895452537029	0.0542737452251827	0.0015895452537029	0.0536622509600964	-0.0479809310151429	0.0333306597178914	0.0479809310151429	0.0330122222084195	PAG1	51044	ZNF704	186243	FABP5	219513	False	False	False	ref	5	0.002625	55	0.1375
3957	chr8	81061053	T	C	rs4265143	0.1451010316	0.0664853427697904	0.1451010316	0.0672610613013103	0.0292808207844843	0.2401691456608066	0.0049584899472139	0.0840854329705779	0.0049584899472139	0.0849978724445597	0.1861477681369799	0.1955905367272882	0.0355519186746031	0.0653749697102906	0.0355519186746031	0.0664242797629717	0.0059244155427077	0.1518999449176389	0.0013073739569798	0.0691131645292851	0.0013073739569798	0.070062490650631	0.0416350499818547	0.0414659494465545	0.0416350499818547	0.0421620145533564	PAG1	51015	ZNF704	186272	FABP5	219484	False	False	False	alt	-20	0.0058	25	0.0957
3958	chr8	81061840	G	T	rs11986552	-0.0767048034	0.1636853573726248	0.0767048034	0.1613110376236565	0.0233962869280916	0.374638200715996	-0.0018151213723437	0.1919597848699269	0.0018151213723437	0.1894434479220819	0.0219334565009402	0.602710879124907	-0.0018322932048608	0.4052436944398261	0.0018322932048608	0.4003107590535394	0.0005179827101354	0.5698884005711465	-4.388876534686927e-05	0.3870149411227053	4.388876534686927e-05	0.3820782356029507	-0.0051796377552703	0.3438217828323925	0.0051796377552703	0.3391151301474071	PAG1	50228	ZNF704	187059	FABP5	218697	False	False	False	ref	-80	0.010315	100	0.06946
3959	chr8	81078844	C	T	rs4534094	-0.0364114098	0.3961439912266038	0.0364114098	0.3909407942596504	0.0221097585049537	0.4082358071005512	-0.0008049854029898	0.3786252965418726	0.0008049854029898	0.373491883272324	0.0186871102899936	0.6215569284606574	-0.0006566900609809	0.5425656612670687	0.0006566900609809	0.5369402783978495	0.0003990787423857	0.600297820220566	-1.409893089668611e-05	0.5233495232095351	1.409893089668611e-05	0.5175981503189769	-0.0021601068918873	0.506330355197628	0.0021601068918873	0.5006581787054453	PAG1	33224	FABP5	201693	ZNF704	204063	False	False	False	ref	10	0.000595	-45	0.08484
3960	chr8	81081544	C	T	rs4739612	-0.00270236558	0.7585118764689178	0.0113455555	0.7569120223047825	0.0170025759223636	0.5959371417647447	-6.71855979076605e-05	0.7556581082997044	0.0001948239695731	0.7537758881249753	0.0352438058790537	0.5138319306496996	-8.696212860925054e-05	0.6284439666053526	0.0005199417106292	0.6266656174986079	0.000663452940183	0.5376614584899367	-2.9374858417652227e-06	0.6394838631303261	9.3559399540366e-06	0.6375695643200096	-0.0002655801524198	0.632775675622637	0.0013262511959354	0.6310505873715958	PAG1	30524	FABP5	198993	ZNF704	206763	False	False	False	ref	100	0.051	100	0.4253
3961	chr8	88351378	G	A	rs58255283	0.01298511848	0.7277178641947252	0.01298511848	0.7342644098984169	0.016883947489345	0.596717970206189	0.0002254176140286	0.7291415940765638	0.0002254176140286	0.7360585776167374	0.0030739665467981	0.878619157954346	3.469812148083953e-05	0.8894825783387528	3.469812148083953e-05	0.896429825017973	5.0996542316517287e-05	0.8823256315073488	6.011162407849463e-07	0.8868624523168083	6.011162407849463e-07	0.8938235925941421	0.0001303157269637	0.8870445531917345	0.0001303157269637	0.8939117047819015	MMP16	23353	DCAF4L2	477363	RIPK2	1406429	False	False	False	alt	-50	0.0192	-50	0.0856
3962	chr8	88354878	T	C	rs13262875	-0.00040902208	0.6899546319794421	0.01450038912	0.6913828203358663	0.0243606712986933	0.3465325610819187	7.012527578640021e-06	0.601533500613095	0.0003487393733661	0.6028665834434994	0.0087567219821186	0.7619543944095085	2.781168981039293e-05	0.7920771759297627	9.992827606271144e-05	0.7937974950498582	0.0002258644747851	0.7184538798650045	8.602210860669656e-07	0.7538461156845839	2.528188277568913e-06	0.7557031449143172	0.0001261918115535	0.780243278650656	0.0003769258684965	0.7818835074779059	MMP16	26853	DCAF4L2	480863	RIPK2	1402929	False	False	False	ref	100	0.03918	100	0.03632
3963	chr8	88430735	A	C	rs73291155	0.0884782732	0.1342088595224086	0.0884782732	0.136177265971402	0.0691142440636441	0.0183952583427428	0.0060181212359914	0.0444730103623295	0.0060181212359914	0.0448162190955656	0.1236712744548183	0.2756921564906776	0.0136457243137129	0.1458741336062786	0.0136457243137129	0.148527465086642	0.0083749764634954	0.1006273676964029	0.0009022040298294	0.0712358904528971	0.0009022040298294	0.0726730576160384	0.0201478011283032	0.1052485871571468	0.0201478011283032	0.1072453929034205	MMP16	102710	DCAF4L2	556720	RIPK2	1327072	False	True	False	alt	0	0.0	100	0.1727
3964	chr8	88502546	T	G	rs6469448	-0.0200583604	0.6031833468698892	0.0200583604	0.5967957911034711	0.0462603203248018	0.0714105519763651	-0.0009638205240811	0.3480424352648434	0.0009638205240811	0.3435156125398279	0.004791164923625	0.8305069174188323	-0.0001125566230593	0.7974579109102261	0.0001125566230593	0.790715340267652	0.0002251698400857	0.6995898890398962	-5.466463681817578e-06	0.6850627417449046	5.466463681817578e-06	0.6785822381772751	-0.0004536306951271	0.7815570768164806	0.0004536306951271	0.7748012010645913	MMP16	174521	DCAF4L2	628531	RIPK2	1255261	False	False	False	ref	100	0.02975	30	0.02823
3965	chr8	88538814	C	T	rs16884208	0.01773960128	0.6312922791997438	0.01773960128	0.6375724168607719	0.0244298096645177	0.3432670373665048	0.0004303026822408	0.5474351830244112	0.0004303026822408	0.5532869067176254	0.0009715944706541	0.9679290535741992	1.80875985202728e-05	0.9280372139031068	1.80875985202728e-05	0.9349894746319294	2.33494627594948e-05	0.9477620623356202	4.317253195802504e-07	0.9051001713308968	4.317253195802504e-07	0.9120124584650772	6.598264656394144e-05	0.931445313900992	6.598264656394144e-05	0.9385132766577942	MMP16	210789	DCAF4L2	664799	RIPK2	1218993	False	False	False	alt	100	0.01979	-40	0.02951
3966	chr8	88540393	T	G	rs7007660	0.0587461152	0.2433547124658932	0.0587461152	0.2466672160991318	0.0128446244486332	0.7935895177051636	0.0007859108372704	0.4005091333277664	0.0007859108372704	0.4053756131734937	0.0046187852594767	0.8419751387648361	0.0003173659970024	0.6703974183759425	0.0003173659970024	0.6766595151646217	6.011337531217681e-05	0.8771579352891838	4.252535304259725e-06	0.7123844016988793	4.252535304259725e-06	0.7189343940618244	0.0011101580284384	0.6429855879971704	0.0011101580284384	0.6491393245904007	MMP16	212368	DCAF4L2	666378	RIPK2	1217414	False	False	False	alt	-95	0.02315	5	0.007126
3967	chr8	88541760	C	G	rs16884246	0.0847193174	0.145409364191993	0.0847193174	0.1473600166415558	0.0302453776490634	0.2239400169807402	0.0028048154302186	0.1363492709137652	0.0028048154302186	0.1380106016065425	0.0116640823463428	0.7039353589682577	0.0011651676501335	0.4780632568911021	0.0011651676501335	0.4834520996869613	0.0003769410467975	0.6257913489106856	4.14240667915376e-05	0.4140690387768705	4.14240667915376e-05	0.4191444260037889	0.0034236745735871	0.4246958816130208	0.0034236745735871	0.429788162208906	MMP16	213735	DCAF4L2	667745	RIPK2	1216047	False	False	False	alt	-70	0.00473	40	0.04977
3968	chr8	88548660	G	A	rs34846572	0.0105716026	0.6327866613900396	0.017165033	0.6352849039860019	0.0123017324475522	0.817421916142108	0.0001114754534002	0.7243972028329172	0.0002025330600466	0.7268565521428947	0.0716126158820229	0.3719716886776034	0.0007574211727194	0.4500768364447781	0.0012030222459314	0.4523217844867049	0.0008684215994416	0.4679768259288491	7.766472112845393e-06	0.5214173955625253	1.3933597043651663e-05	0.5234816029300613	0.0018813302101547	0.4457999784673478	0.0029370525551779	0.4482252745528851	MMP16	220635	DCAF4L2	674645	RIPK2	1209147	False	False	False	alt	0	0.0	85	0.1423
3969	chr8	88570396	A	G	rs10504857	-0.07280031632	0.1943444687920649	0.07422463728	0.1924653979247085	0.0215742422451283	0.4324192549587206	-0.0017548074260505	0.2388364539961243	0.0017775712071633	0.2369719938717978	0.0059788525617762	0.8207321197129455	-0.000547621707325	0.6436494219689975	0.0005522678666814	0.6396523200585384	0.00014405783872	0.7940586012526544	-1.4049358079400436e-05	0.6167186678271996	1.4123613922412102e-05	0.6126583261482754	-0.001653690079509	0.6094278365551801	0.0016767840058064	0.6055676978722195	MMP16	242371	DCAF4L2	696381	RIPK2	1187411	False	False	False	ref	55	0.00643	95	0.0382
3970	chr8	88572819	G	A	rs7838490	0.02141229868	0.5637094588127738	0.02141229868	0.5699414211324976	0.0191039796957514	0.5172671794347874	0.0004081465924603	0.5654970497830103	0.0004081465924603	0.5714952385448869	0.0080474085315561	0.7664589019742264	0.0001920136668481	0.727400713722934	0.0001920136668481	0.733913806779504	0.0001517357642743	0.7606850543764387	3.643391576710277e-06	0.7208315721670944	3.643391576710277e-06	0.7274107998289526	0.0007060143182342	0.7108281011250048	0.0007060143182342	0.7172981465517868	MMP16	244794	DCAF4L2	698804	RIPK2	1184988	False	False	False	alt	-100	0.02509	-50	0.07245
3971	chr8	88581951	G	T	rs71526952	0.02089965262	0.5745138149776743	0.02089965262	0.5810235571012244	0.0170574969626225	0.5994350143825582	0.0003582497899617	0.5896252384554516	0.0003582497899617	0.596173893772131	0.011951106858896	0.7592662972594694	0.0001084313528803	0.7709740853646778	0.0001084313528803	0.7777271869662582	0.0002000907356011	0.7724290597592897	1.8453463961509325e-06	0.7720824339656894	1.8453463961509325e-06	0.7788051422410781	0.0003604302068555	0.776472366724791	0.0003604302068555	0.783143755450265	MMP16	253926	DCAF4L2	707936	RIPK2	1175856	False	False	False	alt	-90	0.03342	-100	0.0684
3972	chr8	102649991	G	A	rs3191333	-0.0159683567	0.6102394002835979	0.0185615235	0.6057797271588279	0.0205960183826397	0.4613582657820925	-0.0003319398227536	0.5803337108242977	0.0003882135338321	0.5761622285965011	0.174149648642407	0.209235603580064	-0.003919547186777	0.3101987893987468	0.0041390522376885	0.3067532762714026	0.0037449178911038	0.2203998235753745	-8.396111649801259e-05	0.3178655423861675	8.872454476496933e-05	0.3145514931638621	-0.0053116030483982	0.3397008036466589	0.0057899772359869	0.3362674281580994	KLF10	5734	ODF1	98401	ENSG00000289653	213869	False	False	False	ref	100	0.1191	100	0.1523
3973	chr8	102657763	A	G	rs4734654	0.094551505	0.1169155353784475	0.094551505	0.1186277452203655	0.0448200483138863	0.078862879030196	0.0043728596905453	0.0712417182892982	0.0043728596905453	0.0719715355601968	0.6327207944310647	0.0224718246399947	0.0599724652024047	0.0210065929502677	0.0599724652024047	0.0213549337852964	0.0285876633094104	0.0103520542771585	0.0028049052764585	0.0175199440734762	0.0028049052764585	0.017734225435967	0.024316254824981	0.0737509539222261	0.024316254824981	0.0750175042153634	KLF10	2038	ODF1	106173	ENSG00000289653	206097	False	False	False	alt	-35	0.01398	0	0.0
3974	chr8	102658852	G	A	rs1434281	-0.0671380333999999	0.2016528664575728	0.0671380333999999	0.1987130900409829	0.0204827319446665	0.4602236889169679	-0.0014841302236133	0.246589104606922	0.0014841302236133	0.2433001103185726	0.0458901059021477	0.4664494779067814	-0.0034361950162868	0.3167277448847868	0.0034361950162868	0.3121505434744235	0.0010069814488912	0.4588301677274315	-8.170472729980785e-05	0.321674507321466	8.170472729980785e-05	0.3169359253331704	-0.0084136122199861	0.2532111779539727	0.0084136122199861	0.2491955721117412	KLF10	3127	ODF1	107262	ENSG00000289653	205008	False	False	False	ref	80	0.014435	15	0.02524
3975	chr8	102665495	C	A	rs2436936	-0.0023236757999999	0.832652517049248	0.0074713374	0.8308473484602059	0.0202486659816638	0.4695213325969813	-4.1718007295992616e-05	0.7982278316749567	0.0001477602290518	0.796573803687594	0.000218567516743	0.997490176846298	-5.623805996984967e-07	0.9928790693577524	1.0631568263117743e-06	0.994000023241682	4.493963811039775e-06	0.9953450094367736	-1.0738608418559903e-08	0.9912197564145911	2.134156578357035e-08	0.9918921181133308	-3.299132328197683e-06	0.9973593922476256	3.299132328197683e-06	0.9951879619071404	KLF10	9770	ODF1	113905	ENSG00000289653	198365	False	False	False	ref	30	0.04315	-30	0.07367
3976	chr8	102916522	A	G	rs7841632	-0.1440464772	0.050675998767499	0.1440464772	0.0500919482647003	0.0412996775254423	0.0994553297338996	-0.0059705299652469	0.0431642332804399	0.0059705299652469	0.0427984790659449	0.0008470522252647	0.9746204913784194	-0.0001269566362043	0.7767319414198337	0.0001269566362043	0.7702237518884671	3.4943938081686705e-05	0.9222419283675478	-5.23941870837361e-06	0.6736347460932735	5.23941870837361e-06	0.6674771972386508	-0.0003711523869221	0.7943509345447891	0.0003711523869221	0.7877736755117534	AZIN1	22658	ENSG00000289653	52662	ATP6V1C1	104542	False	False	False	ref	40	0.01086	40	0.08276
3977	chr8	110459785	G	A	rs36043959	-0.02489971406	0.4750463867591118	0.03073800394	0.4748840936403106	0.0145795887131018	0.682686440482198	-0.0005536631229797	0.5424412503270905	0.0006243656766197	0.5422685169402992	0.0220514004816732	0.5973109458299489	-0.0005888591522224	0.6058323105561149	0.0006923776236719	0.605325127066876	0.0003367551417105	0.6433068441287582	-1.205242915542281e-05	0.6251057025222809	1.3458792870014015e-05	0.6245999107698773	-0.0018038006004421	0.5675284888541356	0.0021700042888719	0.5666815773806523	KCNV1	484014	SYBU	767994	ENSG00000289767	920058	False	False	False	ref	100	0.03906	-30	0.01373
3978	chr8	110466092	A	C	rs13267290	-0.01278363994	0.6633462219180323	0.01716053714	0.6592213091711858	0.0164165296786918	0.613094680294744	-0.0002647190282638	0.6702671568581245	0.0003203558709829	0.665965993482761	0.0049330276137375	0.8235997965494772	-4.8211412130677136e-05	0.8365666820030475	7.613469077914398e-05	0.8324043550761887	8.392527952644822e-05	0.8424814824678286	-1.1783251774843012e-06	0.8406559430339063	1.5332713838387143e-06	0.8365317612584355	-0.0001765035795585	0.8236831499993351	0.0002870245125531	0.8195962448974604	KCNV1	490321	SYBU	774301	ENSG00000289767	926365	False	False	False	ref	10	0.001999	-5	0.007446
3979	chr8	110494336	C	G	rs6995307	0.0374319982	0.3897478926596522	0.0374319982	0.3949435870075189	0.0185893780065922	0.5360350957398826	0.0007220439378739	0.4200512734825624	0.0007220439378739	0.4253320102232027	0.0026962158952194	0.8934696677641607	0.0001024979856014	0.7838635832522796	0.0001024979856014	0.7905108960183262	4.940632665223728e-05	0.8869062599902898	1.948479519083548e-06	0.7758631893980534	1.948479519083548e-06	0.7826674690917987	0.0004140411071887	0.7665028679697804	0.0004140411071887	0.7730937480025177	KCNV1	518565	SYBU	802545	ENSG00000289767	954609	False	False	False	alt	-55	0.0266	-55	0.06323
3980	chr8	110510428	T	C	rs111534212	-0.00268777359	0.8712272235755162	0.00562958265	0.8723254216653669	0.064670899925981	0.0294337153922745	-7.259418674390302e-05	0.6195365790307453	0.0003755467768549	0.6210156362451252	0.0019662828676057	0.9226811602302284	-4.805443316527794e-06	0.9605285265981216	9.91044713007166e-06	0.962003252840937	0.0001187428792322	0.7871174359162998	-1.5344476121608288e-07	0.892640830543228	6.415129356526626e-07	0.8943036259391768	-1.8145227805082327e-05	0.9626537427840786	3.464088944607073e-05	0.9641289252390358	KCNV1	534657	SYBU	818637	ENSG00000289767	970701	False	False	False	ref	100	0.0169	-65	0.1128
3981	chr8	110564460	C	A	rs13280766	0.1264032636	0.0722687432456788	0.1264032636	0.0730860537014155	0.0453524010315503	0.0775441059049603	0.0062975239768691	0.0505144566173114	0.0062975239768691	0.0509310133488302	0.0070180792451584	0.7805811838308402	0.0009705398477272	0.4963117909210499	0.0009705398477272	0.5018679104530757	0.0003238772061325	0.6453920443442731	4.775937898474345e-05	0.3751352897966694	4.775937898474345e-05	0.3801152624044039	0.0028710699086139	0.4593195623208704	0.0028710699086139	0.4647522120351421	KCNV1	588689	SYBU	872669	ENSG00000289767	1024733	False	False	False	alt	-60	0.021	-60	0.1154
3982	chr8	110588499	G	T	rs6990323	0.0144433825999999	0.6025695042030255	0.0191609034	0.6067503011888258	0.0235449498276865	0.3667189991824394	0.0004037369771609	0.5198944672456649	0.0004840581721693	0.5237844109136881	0.0035086272310381	0.8663974435082678	2.740932611335979e-05	0.8352863752081031	6.013205750724083e-05	0.8395634101041141	7.794565690231953e-05	0.8399177029352132	8.88499054947871e-07	0.8040511107114129	1.445641057868044e-06	0.8084211261563091	0.0001072218006663	0.8325081233732267	0.0002375375276301	0.8367906884507466	KCNV1	612728	SYBU	896708	ENSG00000289767	1048772	False	False	False	alt	-65	0.000992	-75	0.031
3983	chr8	110607825	A	T	rs16880919	0.0385122032	0.3783246785593384	0.0385122032	0.3833306471733608	0.0212620062577017	0.438334992642044	0.000927885100498	0.3719315009739948	0.000927885100498	0.3765792841000648	0.0077166705156543	0.7791909717444472	0.0003128175726583	0.6659034922235976	0.0003128175726583	0.6721415181536275	0.0001693800373743	0.7545651052025951	7.566559049405758e-06	0.6399742273514282	7.566559049405758e-06	0.6462486016833796	0.0010977862822077	0.6381031059742227	0.0010977862822077	0.6442376040313946	KCNV1	632054	SYBU	916034	ENSG00000289767	1068098	False	False	False	alt	70	0.008934	75	0.1231
3984	chr8	110609036	C	T	rs7007361	-0.1063971012	0.1030404265758038	0.1063971012	0.1017535715112904	0.0284273562460717	0.2552714463772478	-0.0034415413829531	0.1148906983819751	0.0034415413829531	0.1135636326878853	0.0092837583715482	0.7375139796996723	-0.0010340451815059	0.4898114123423407	0.0010340451815059	0.4844403066220153	0.0002739770019059	0.6701639996493169	-3.409958338712445e-05	0.4320270789294852	3.409958338712445e-05	0.4267325844614968	-0.0031539705057569	0.4440638369083161	0.0031539705057569	0.4387836455056011	KCNV1	633265	SYBU	917245	ENSG00000289767	1069309	False	False	False	ref	-100	0.002243	-10	0.003418
3985	chr8	110614839	C	T	rs34921000	-0.0883604566	0.1318403328274322	0.0883604566	0.1298208794713073	0.0246037949801306	0.3405770342831256	-0.002167092158956	0.1596325046707457	0.002167092158956	0.1574649536971691	0.0073075781069578	0.7791181289885882	-0.0006009795771111	0.5597905549493671	0.0006009795771111	0.554128043488909	0.0001812032073537	0.737699608792029	-1.5071730265515422e-05	0.5239376245970834	1.5071730265515422e-05	0.518216039863071	-0.0020157698525287	0.5203675872342057	0.0020157698525287	0.514682023607687	KCNV1	639068	SYBU	923048	ENSG00000289767	1075112	False	False	False	ref	15	0.004395	-55	0.0475
3986	chr8	115831047	T	C	rs800531	0.0273620986199999	0.4922363454389226	0.0273620986199999	0.4981286789069366	0.0176332557938591	0.5688156402025661	0.0005304834734017	0.5143828237823991	0.0005304834734017	0.5202778124734817	0.0254214641549271	0.5768001362991132	0.0009686859008196	0.5325926044168815	0.0009686859008196	0.538493233838846	0.0004908059286493	0.5878063668558978	2.002456412893439e-05	0.5398182451037116	2.002456412893439e-05	0.5459013665739896	0.0027151859061066	0.4941840585772833	0.0027151859061066	0.5002818251516472	TRPS1	21374	UTP23	935459	EIF3H	935878	False	False	False	alt	-100	0.05597	50	0.1028
3987	chr8	115835299	T	C	rs800524	0.01293424154	0.6075458464066236	0.02097227606	0.6072081047422693	0.0146643723842165	0.6897368722066215	0.0001745671510606	0.6794129215960029	0.0002945555197791	0.6788121988483035	0.0206360727128764	0.6021455920844564	0.0002910377196236	0.6386210219255165	0.000450705214181	0.6376776324070417	0.0003128628941384	0.6463571964423842	3.917103252577355e-06	0.670921485134796	6.434113473563592e-06	0.6697564565917912	0.0007653987001419	0.6203579200131859	0.0013559433868891	0.6196438155236972	TRPS1	25626	UTP23	931207	EIF3H	931626	False	False	False	alt	-95	0.01897	90	0.119
3988	chr8	115852305	C	G	rs800582	0.3658899599999999	0.0052017091185204	0.3658899599999999	0.0052492654369331	0.0623205992163626	0.0280647515398681	0.025031836035722	0.0056318333822349	0.025031836035722	0.0056648047752734	0.007061792748507	0.8434183912012055	0.0040103987144945	0.4056297444911252	0.0040103987144945	0.4103932502756179	0.0006027487471515	0.668379932137158	0.0003553354802695	0.2541865574899445	0.0003553354802695	0.2572245659470614	0.0060341130282735	0.3971645781828598	0.0060341130282735	0.4015059036137118	TRPS1	42632	UTP23	914201	EIF3H	914620	False	True	True	alt	-100	0.0337	60	0.0679
3989	chr8	116058513	G	T	rs4876349	0.0686778355999999	0.1887897466067136	0.0686778355999999	0.1918016448417099	0.0366394937877563	0.1373539062550853	0.0025531239656448	0.1315157095419283	0.0025531239656448	0.1332393015798635	0.0521271155686054	0.4277766385755436	0.0038827699684009	0.2755171345757334	0.0038827699684009	0.279798152070861	0.0019363376133701	0.3199706613788848	0.0001460649665431	0.2132067239771364	0.0001460649665431	0.2169009630136822	0.0094594371680247	0.2146062192747065	0.0094594371680247	0.2183651944042458	TRPS1	248840	UTP23	707993	EIF3H	708412	False	False	False	alt	-15	0.00995	-15	0.04285
3990	chr8	116320147	C	T	rs76032162	-0.0571280577999999	0.2736426811147875	0.0571280577999999	0.2702479906701619	0.0247732189568328	0.3382044025269822	-0.0015607182860875	0.270967060377109	0.0015607182860875	0.2680231065082111	0.0146258783939823	0.6739185675108814	-0.0011544926087757	0.5271260250164069	0.0011544926087757	0.5212927275967776	0.0003954716723447	0.625117355060796	-3.371105353044139e-05	0.489383628459047	3.371105353044139e-05	0.4838872425895256	-0.0032710897034079	0.4716051044309929	0.0032710897034079	0.4659802343700404	UTP23	446359	EIF3H	446778	TRPS1	510474	False	False	False	ref	75	0.01628	-50	0.09973
3991	chr8	134793233	T	G	rs10099070	-0.00032812986	0.8589961590604336	0.00627006826	0.8596369928461731	0.0097077418051963	0.9180150901828787	-4.667947901849604e-06	0.9058984349174912	6.328637187096356e-05	0.9067320038806688	0.0495661640988419	0.4500909456406907	-0.0002012196845302	0.6737170636687797	0.0003663694790559	0.673953637591404	0.0004758659822737	0.5819584110550234	-2.0581212782649893e-06	0.7467930674205506	3.666852817677864e-06	0.7471920143926987	-0.0004255880703374	0.6844889075117847	0.0009600475075055	0.6846466453456088	ZFAT	80184	KHDRBS3	664224	ST3GAL1	1221307	False	False	False	ref	-55	0.01744	15	0.015076
3992	chr8	134797509	A	C	rs10111734	-0.002727268128	0.880551023720093	0.0050499874719999	0.8811635395401287	0.0230046359386038	0.382385093040135	-8.078398941497241e-05	0.8162119207504955	0.0001302498169854	0.8166993758227921	0.0020578337897132	0.9181316572464716	-7.849619016611574e-06	0.9500425920625326	1.120608124260727e-05	0.9511108625605462	4.606916281460932e-05	0.8928697380438534	-2.0391248808144778e-07	0.9334490116545744	2.748711956009848e-07	0.9343414022433096	-3.381610636402632e-05	0.9525080857830416	4.3713503348619295e-05	0.95264599182651	ZFAT	84460	KHDRBS3	659948	ST3GAL1	1225583	False	False	False	ref	45	0.00874	-100	0.1075
3993	chr8	134799373	C	T	rs6577846	0.0371456889999999	0.3824517239933872	0.0371456889999999	0.3875844070002513	0.018721244747459	0.5292290047419947	0.0006896678226658	0.4112442934050014	0.0006896678226658	0.4164778220256296	0.0034657385107716	0.8673294735621112	0.0001286230521772	0.7519032940812914	0.0001286230521772	0.7584558154929689	6.668641374897462e-05	0.8576613947577839	2.464270743821991e-06	0.7432960351387128	2.464270743821991e-06	0.7497527217137356	0.0005047672462142	0.7339314005117875	0.0005047672462142	0.7403930067468142	ZFAT	86324	KHDRBS3	658084	ST3GAL1	1227447	False	False	False	alt	-95	0.001883	-5	0.00763
3994	chr8	134800305	A	C	rs10095483	0.01128339296	0.7550080327822107	0.01128339296	0.7617233173732311	0.0122648242602461	0.8146345359277767	0.0001508539929639	0.7987040153539239	0.0001508539929639	0.8055020476436322	0.2823248985516808	0.1199333320990158	0.0036324242325831	0.3240781802671127	0.0036324242325831	0.3283432171970148	0.0034074593200437	0.2227039629141124	4.739791362497997e-05	0.4018316666421653	4.739791362497997e-05	0.4070095908561729	0.003656263402725	0.425859333071876	0.003656263402725	0.4310066856148323	ZFAT	87256	KHDRBS3	657152	ST3GAL1	1228379	True	False	False	alt	100	0.1073	100	0.266
3995	chr8	134830526	T	C	rs7844406	0.0061498568999999	0.724286426939437	0.0129245488999999	0.7281736290708376	0.0204296400981182	0.469448094301407	0.0001428489077005	0.6848242259163939	0.0002737092794143	0.6884557506808614	0.0191828049223054	0.6423421154416807	0.0002012185628772	0.7028162790943749	0.0002948117262305	0.7069409262138441	0.0003603966788454	0.6382320359343208	3.833421769896929e-06	0.6946077218705976	5.641273066626387e-06	0.6985885262369862	0.0006012668668139	0.6901878117247328	0.0009097357395004	0.69441853696254	ZFAT	117477	KHDRBS3	626931	ST3GAL1	1258600	False	False	False	alt	100	0.01694	-80	0.1677
3996	chr8	134830700	A	G	rs7840432	-0.0257616664	0.5299496408767047	0.0257616664	0.5238766911373623	0.0162936993318778	0.632480304962359	-0.00041582886442	0.5720276690616937	0.00041582886442	0.5656467672479956	0.0402923031242782	0.4984143544114491	-0.0008713487636924	0.5072800263865387	0.0008713487636924	0.5018267484153967	0.0007071811400826	0.5304356173537905	-1.471439644453784e-05	0.5310889584907376	1.471439644453784e-05	0.5254337870759551	-0.0023893965886971	0.4904480690588435	0.0023893965886971	0.484761771668508	ZFAT	117651	KHDRBS3	626757	ST3GAL1	1258774	False	False	False	ref	-40	0.007584	60	0.05774
3997	chr8	139680130	C	T	rs13274282	0.005223489	0.6417870855793932	0.0166994592	0.6434511604727585	0.0194953234766123	0.4978766051835268	0.0001792557515539	0.6265790983635664	0.000348326154886	0.628502345351414	0.0308180198607765	0.5379625660052864	0.0002023245796974	0.6275322036744523	0.0004027695862464	0.629097611438793	0.0006294964489461	0.5360600888140586	5.414937633774758e-06	0.6169506131253557	8.717174666641525e-06	0.6186391584063292	0.0005921942529114	0.612953698746402	0.0013048068358021	0.6145797804116889	KCNK9	23979	COL22A1	766089	TRAPPC9	778449	False	False	False	alt	50	0.01196	45	0.1021
3998	chr8	139680274	G	A	rs62520201	-0.0285377168	0.4130652996048606	0.0351123728	0.4101894900407771	0.0319368567519505	0.1941885568609831	-0.0008650258988007	0.3117399815245823	0.0010869023585075	0.3094188964160531	0.0292063937184519	0.5479737286761477	-0.0007162620857123	0.4995100540550261	0.0009647286004217	0.496281832758926	0.0009279030493252	0.4597958777949987	-2.1445644865270783e-05	0.4306298999266225	2.983070258669465e-05	0.4276166615800523	-0.0020248424664313	0.4680605674103495	0.0027588994094552	0.4648397361685421	KCNK9	23835	COL22A1	766233	TRAPPC9	778305	False	False	False	ref	-95	0.01053	-20	0.0526
3999	chr8	139683304	A	G	rs2319423	0.32275034	0.0075284863967741	0.32275034	0.0075600003572488	0.0455133607287491	0.0760218280731085	0.0154357341892637	0.0115528609811429	0.0154357341892637	0.0115832715590605	0.326836791923724	0.0974015797398038	0.1029343551726135	0.008342561174119	0.1029343551726135	0.0084527454601475	0.0147173539188172	0.0406408756278602	0.0048759362503896	0.0087477215652413	0.0048759362503896	0.0087920493221289	0.1049528224077067	0.0036938945314948	0.1049528224077067	0.0036809221308089	KCNK9	20805	COL22A1	769263	TRAPPC9	775275	False	True	True	alt	55	0.0224	40	0.2588
4000	chr8	139683481	C	T	rs10101804	0.0171038625	0.2877221315372072	0.0494586225	0.2891509450444722	0.1013905873449041	0.0040402493574759	0.0017761373180056	0.0673359671400798	0.0051995188011426	0.0677297215535884	0.1033972815149615	0.3019017994732436	0.0019558975158631	0.2412644719578048	0.0062087909607265	0.2431027744838831	0.0107369982397059	0.0701407162278749	0.0002052425418101	0.0954244455544989	0.0006552312480286	0.0959885080482685	0.0036678103658737	0.1957201394772049	0.0118974959585628	0.1971625806031055	KCNK9	20628	COL22A1	769440	TRAPPC9	775098	False	True	True	alt	-95	0.11597	-95	0.485
4001	chr8	139686423	A	G	rs9693845	-0.00244878558	0.7271034489113787	0.01276316414	0.7256123964135976	0.0146213631465435	0.7057862781158387	-1.868441013558561e-05	0.7782782254982774	0.000168779751644	0.7768901209013798	0.0063318597208933	0.820385886311161	6.318536170300297e-05	0.8457445616653669	9.776858573983436e-05	0.844607244094864	0.0001011167647395	0.8388568593048188	9.101041643094204e-07	0.859411875932111	1.4423570807345695e-06	0.8583595461434501	0.0002037214212662	0.8378104544486108	0.0003323875820659	0.836780981801487	KCNK9	17686	TRAPPC9	772156	COL22A1	772382	False	False	False	ref	-100	0.0641	-55	0.09106
4002	chr8	139688714	A	G	rs16893602	-0.06468953908	0.2332593830975607	0.06569833252	0.2309024559464799	0.0259444676335954	0.3096749086685627	-0.0018328101026385	0.2341189470813261	0.0018535514317712	0.2321438023834077	0.0078841014813103	0.7968369018245269	-0.0006552903069271	0.6442669638083739	0.0006581109081407	0.6401136535257259	0.0002340064689981	0.7435244707031543	-2.0234773769584298e-05	0.5953951404133696	2.029276682966123e-05	0.5910915127103917	-0.0019167958826828	0.6096599994820721	0.0019266932796673	0.605226203138426	KCNK9	15395	TRAPPC9	769865	COL22A1	774673	False	False	False	ref	-85	0.0558	90	0.2201
4003	chr8	139692798	T	C	rs741469	0.026663128632	0.4676881997970875	0.030570270968	0.4693578238898948	0.0164501951497328	0.626832268536433	0.0004494511128706	0.5442824834459757	0.0005087338643759	0.5462920254838962	0.0116013988321071	0.722353559881453	0.0001296167053815	0.7283303986896126	0.0002180082529782	0.7298547994485505	0.0001882800999844	0.742409858254734	2.281536175950166e-06	0.7389344618509123	3.618361588728512e-06	0.7405047848293812	0.0004255880703375	0.7129306320710139	0.0007423047738444	0.714513859078972	KCNK9	11311	TRAPPC9	765781	COL22A1	778757	False	False	False	alt	20	0.03064	-40	0.03333
4004	chr8	139700268	G	C	rs199211	-0.1311094911999999	0.0685549646440098	0.1311094911999999	0.0676396568736358	0.0535882873144614	0.0456183182569505	-0.0071540519454447	0.0377780631268961	0.0071540519454447	0.0376036509012132	0.442024347596582	0.0576997673645846	-0.0537310834497158	0.0253320978063745	0.0537310834497158	0.0248580135969047	0.0234459062349586	0.0165327125775885	-0.0029241340320179	0.0163905795244327	0.0029241340320179	0.0161927708082098	-0.0437489690211474	0.0298691078448707	0.0437489690211474	0.0294047617942532	KCNK9	3841	TRAPPC9	758311	COL22A1	786227	False	False	False	ref	45	0.0007935	-100	0.4397
4005	chr8	142221528	T	C	rs11786405	-0.320808614	0.0071692405536248	0.320808614	0.0071519039252324	0.0549703839504244	0.0445658625638501	-0.0188554246646644	0.008662260196753	0.0188554246646644	0.008646245608578	0.252703638942958	0.1359007443476698	-0.0982600629689047	0.0191477387282741	0.0982600629689047	0.0189841301340593	0.018001674100948	0.0520173153619006	-0.0073883779275947	0.0147951208273501	0.0073883779275947	0.0145158314493478	-0.0581092672627098	0.0150817971201027	0.0581092672627098	0.0149019270067065	TSNARE1	181654	ADGRB1	227903	ARC	392951	False	True	True	ref	100	0.0731	-50	0.08887
4006	chr8	142232905	A	G	rs4976978	0.0133137167608	0.4368418749726968	0.0381878007608	0.4388718769811047	0.0281438701051315	0.2614242020516232	0.0006820898701713	0.3830027302861776	0.0013293679330521	0.3849346629354613	0.686314374319554	0.0168925038054318	0.0076503749011876	0.1242588407342767	0.0253896028881846	0.1253958125702254	0.0190720992971671	0.0254362690696009	0.0004134507075487	0.1251889773974674	0.0008750642193438	0.126418320333164	0.0039597835769192	0.3147120830222755	0.0086841410708983	0.316156505621719	TSNARE1	170277	ADGRB1	216526	ARC	381574	True	False	False	alt	-100	0.2142	-90	0.298
4007	chr8	142234411	A	G	rs4976981	-0.03548656634	0.3913465379434397	0.04239473434	0.3880654235839696	0.017858724194457	0.5631505835919288	-0.0007246672347471	0.4517936414052976	0.0008331119319242	0.4484936485227158	0.0025230114479891	0.899702399468474	-6.120578852386302e-05	0.8282418949861388	8.271475706451029e-05	0.8241279093008447	4.390963917215202e-05	0.8980192625093627	-1.2077757686120784e-06	0.8236495683444601	1.5454244207876476e-06	0.8195311720697893	-0.0002152683844148	0.8218148950789373	0.0002960971264557	0.8177854630311757	TSNARE1	168771	ADGRB1	215020	ARC	380068	False	False	False	ref	-50	0.00714	75	0.05603
4008	chr8	142241656	G	A	rs7832212	-0.1332276208	0.0658438298630908	0.1332276208	0.0651613245391414	0.0426489474155766	0.0906253552724891	-0.0054852552984609	0.0541640918005187	0.0054852552984609	0.053655367680153	0.0770273168156774	0.3745507514767413	-0.0124257893425861	0.1711120266312039	0.0124257893425861	0.1681394510549742	0.0031931405548754	0.2522927783456118	-0.0005029961789259	0.1261309689504536	0.0005029961789259	0.1239141145719392	-0.0215870476064794	0.1092568857834206	0.0215870476064794	0.1071852444256432	TSNARE1	161526	ADGRB1	207775	ARC	372823	False	False	False	ref	85	0.01569	50	0.0718
4009	chr8	142241748	T	C	rs7822538	0.225049802	0.0199500602931765	0.225049802	0.0201066997789382	0.0235845797165829	0.3673038576410495	0.005696921942943	0.054452413227346	0.005696921942943	0.0550255983872359	0.0968682986374582	0.3307368112035688	0.0254366853028999	0.0869760390162412	0.0254366853028999	0.0887353712603641	0.0024218037771657	0.3092528123301143	0.000661019815764	0.1022486213364298	0.000661019815764	0.1040212784854793	0.0382963280657186	0.0435851464178849	0.0382963280657186	0.044365323512797	TSNARE1	161434	ADGRB1	207683	ARC	372731	False	False	False	alt	-10	0.006836	-40	0.012695
4010	chr8	143158840	C	G	rs9694368	-0.0033762497599999	0.8368889015881079	0.00719904856	0.832666482738741	0.0884914626705462	0.0070209066809399	-0.0002962831474344	0.4719730749223284	0.0006359670671517	0.4691727930088736	0.2829715284880075	0.118443661853762	-0.0010616437508419	0.3989709727838391	0.0018798735014382	0.3959680110478401	0.0249952685907349	0.0140641967582439	-9.319280800431643e-05	0.2097914253731627	0.0001658985699437	0.2078435671085658	-0.001219029395269	0.5092151824210607	0.0023836231071227	0.506068636452136	LY6H	1871	GPIHBP1	54379	LY6L	78209	False	True	True	ref	-100	0.0727	-100	0.1133
4011	chr8	143169111	G	A	rs7830479	-0.0073498568	0.7107295870142148	0.013728736	0.7067582787598496	0.0747643116062108	0.0142197388678766	-0.0006499917111774	0.3161278131355039	0.0010628284011848	0.3133312324110193	0.0738081884464385	0.3876224731737623	-0.0009960188961756	0.4949325620743634	0.0012023365330045	0.4913964611317487	0.0059747005002228	0.16058761468319	-8.69466576068276e-05	0.3071540636429076	0.0001002993932462	0.3042192612432852	-0.0018178219128368	0.5050744921456131	0.0023935205041073	0.5016635997191689	LY6H	8400	GPIHBP1	44108	ZFP41	77711	False	True	False	ref	90	0.02878	-75	0.1215
4012	chr8	143169632	T	C	rs7824786	0.245334056	0.0215275671677679	0.245334056	0.0219068743382197	0.0649213570612455	0.0270636727734472	0.0219888044541506	0.014285689483129	0.0219888044541506	0.0144454755810074	0.1095699581010194	0.3036455401180763	0.0452230515355044	0.0654576772658584	0.0452230515355044	0.0661567000479634	0.0096333305071389	0.1092929025232134	0.0049602728126283	0.0358911145329998	0.0049602728126283	0.0362311118590773	0.0557776054897561	0.0315080792348156	0.0557776054897561	0.0322506584817375	LY6H	8921	GPIHBP1	43587	ZFP41	77190	False	False	False	alt	-15	0.00946	-25	0.04016
4013	chr8	143193560	C	T	rs11996840	-0.1330551882	0.0672942161313284	0.1330551882	0.0666980663097601	0.0351253658067362	0.1545861373617245	-0.0049506323953555	0.0686627822210607	0.0049506323953555	0.0680757811449631	0.3053652139487314	0.1086679203771906	-0.0418000630166284	0.0411420079598526	0.0418000630166284	0.0405386420498558	0.0108018860824622	0.0685537361913767	-0.001578833754659	0.0397090642342522	0.001578833754659	0.0392789006135986	-0.0442380653888026	0.0308692943346874	0.0442380653888026	0.0305493355903965	GPIHBP1	19659	LY6H	32849	ZFP41	53262	False	False	False	ref	95	0.1514	55	0.3132
4014	chr8	143668507	T	C	rs117423761	0.0977562182	0.1423206934366262	0.0977562182	0.1441021122022862	0.0287777934054724	0.2485075297476218	0.0031949004468774	0.151634263561096	0.0031949004468774	0.1533373674848668	0.0210567120847216	0.6538280450546928	0.0036402854023483	0.4083814825726548	0.0036402854023483	0.413316904251986	0.0006485026537849	0.5839020937168927	0.0001289497413044	0.3664211063359316	0.0001289497413044	0.3709616927688957	0.0085703210055755	0.3255482635791254	0.0085703210055755	0.329154816500485	ZNF707	15946	ZNF623	32487	CCDC166	39602	False	False	False	alt	-95	0.08936	10	0.02893
4015	chr8	143691909	G	T	rs11136313	-0.178411286	0.034250285005189	0.178411286	0.033941691736267	0.0541531692667049	0.0441442416631928	-0.0100880479305492	0.0225343133164481	0.0100880479305492	0.0224198522349018	0.1473029593216983	0.2363425934231083	-0.0313558335319263	0.0662170845621725	0.0313558335319263	0.0648561419970591	0.008311346530739	0.1027094191209646	-0.0018711640279574	0.0396229527792628	0.0018711640279574	0.038983778255952	-0.0434182310052455	0.0329680667675569	0.0434182310052455	0.032425369673205	ZNF707	7456	CCDC166	16200	MAPK15	24432	False	False	False	ref	-100	0.04678	-50	0.0968
4016	chr9	10236246	A	G	rs10756010	0.1198830739999999	0.0860693615955855	0.1198830739999999	0.0872091459763333	0.0255829693673181	0.3169683683093947	0.0034272385025898	0.1176923997425227	0.0034272385025898	0.1190209529494503	0.2820716901454917	0.119145374635243	0.0336987996235846	0.0504517269516189	0.0336987996235846	0.0513933818050911	0.0071184495620841	0.1142544929013993	0.0009584196264367	0.0625270507551409	0.0009584196264367	0.0636041535548682	0.0387895483487841	0.0379420004024167	0.0387895483487841	0.0385404076086632	PTPRD	376756	DMAC1	2347866	TYRP1	2449194	True	False	False	alt	55	0.010345	95	0.1389
4017	chr9	10236249	G	A	rs10958968	-0.04313156076	0.3547246171853157	0.04313156076	0.3502294332749607	0.0337340514688794	0.1718832522192697	-0.0015434683625151	0.2739704108864144	0.0015434683625151	0.2709242849502455	0.240454785391442	0.1446644631327928	-0.0105380561503198	0.1792875460471398	0.0105380561503198	0.176168732454657	0.0080331282178377	0.097764100080163	-0.0003755681866118	0.1489250631079606	0.0003755681866118	0.1463440340607043	-0.0140270858764144	0.1790657785289386	0.0140270858764144	0.1760188795779795	PTPRD	376753	DMAC1	2347869	TYRP1	2449191	True	False	False	ref	30	0.005768	95	0.12354
4018	chr9	10244630	A	G	rs12237121	-0.00887438204	0.7794397777316029	0.0103918861999999	0.7753392470600299	0.0190886308007845	0.5197555167414809	-0.000177475850127	0.7468003539813745	0.0002047494117712	0.7426410888114562	0.0368785259476757	0.5068412281007808	-0.0001518836226241	0.6674030717572441	0.0002778771214382	0.6642374543870961	0.0006922634245794	0.5157013341291561	-3.1297767650914626e-06	0.660829683657992	5.394213011767152e-06	0.6575897459471703	-0.0005451816172346	0.6698678308694405	0.0008553000560851	0.6665685799235951	PTPRD	368372	DMAC1	2356250	TYRP1	2440810	False	False	False	ref	-100	0.02399	40	0.02155
4019	chr9	10246014	T	G	rs7032426	0.0101425414	0.6395891903793753	0.0183928186	0.6413509842760899	0.0186460921319468	0.5366417085014527	0.0001850051402901	0.6304275835202652	0.0003385553307025	0.6319481965154509	0.0010672693081718	0.9622400101809512	1.29824543377573e-05	0.9287578066061156	2.202877013624144e-05	0.9301031375305628	1.942661007898713e-05	0.956258283078652	2.2808784751558546e-07	0.9215456350521898	3.943993986796793e-07	0.92285189343732	2.556827554352123e-05	0.928538077902468	7.010656197418988e-05	0.9298712468117302	PTPRD	366988	DMAC1	2357634	TYRP1	2439426	False	False	False	alt	-100	0.006958	25	0.02148
4020	chr9	10251323	G	A	rs1322146	-0.00377427168	0.8796048386040102	0.00541451988	0.8782046443199409	0.0354001839745694	0.1534345143571745	-0.0001497530737582	0.7590069699786838	0.0001975867833395	0.7574758103401953	0.0197032430470785	0.6149546566434708	-5.195728369190116e-05	0.813561882583449	9.65054330835604e-05	0.8124961095779069	0.0006989052805747	0.5080686205441155	-2.4317268228419e-06	0.73905866336977	3.684679437957539e-06	0.7379158022463389	-0.000134439642374	0.8101492267758844	0.0003373362805581	0.8090704558935983	PTPRD	361679	DMAC1	2362943	TYRP1	2434117	False	False	False	ref	95	0.007866	55	0.0862
4021	chr9	22758754	T	C	rs686870	-0.0514071688	0.2804936452814001	0.0514071688	0.2763421117043658	0.017179665479028	0.5959181931973933	-0.0008945047947936	0.357386234920811	0.0008945047947936	0.3527486693653363	0.0125919633136484	0.7158227152069684	-0.0007274529167466	0.5687935620230332	0.0007274529167466	0.5631393755201154	0.0002139723124263	0.7326525547794933	-1.2646885043058435e-05	0.5873013699328035	1.2646885043058435e-05	0.5814386600053563	-0.0022780508726204	0.5256617583753965	0.0022780508726204	0.5200343302112717	DMRTA1	311929	CDKN2B	749449	CDKN2A	763453	False	False	False	ref	95	0.0325	100	0.3186
4022	chr9	26668919	T	C	rs1434479	-0.0103194705999999	0.3344909664298138	0.0443584346	0.333300872516884	0.0287416831544848	0.2470912958214533	-0.000327478574027	0.2716881486467143	0.0012815486280801	0.2704912492668492	0.1366294414568968	0.2495199765683165	-0.0020939670595561	0.2206456535306818	0.0066056430659481	0.2198258235828493	0.003927626339672	0.2038823975250053	-6.416130705706258e-05	0.1966634598889924	0.0001907879944063	0.1960102343694868	-0.0025832206129787	0.1971758932119278	0.0108557949259344	0.1963796983570228	CAAP1	223884	IFT74	278121	PLAA	278323	False	False	False	ref	-50	0.02081	-50	0.2217
4023	chr9	26676300	T	C	rs10967473	-0.1248635724799999	0.0815785117263534	0.1248635724799999	0.0806985907617419	0.0236127094805972	0.3681382346348318	-0.0031806637050421	0.1295285377958192	0.0031806637050421	0.1282453526295064	0.4610232258915904	0.0528650779982839	-0.0549228470392429	0.0310570866949392	0.0549228470392429	0.0305964792282224	0.0106291917953268	0.0673900314864923	-0.0013733628370618	0.0484432124249682	0.0013733628370618	0.0476705076150912	-0.0415459734089933	0.0389266772797032	0.0415459734089933	0.0385284006119027	CAAP1	216503	IFT74	270740	PLAA	270942	False	False	False	ref	-95	0.0629	-100	0.2632
4024	chr9	36307780	T	C	rs7865569	0.1108977083999999	0.0886923240711961	0.1108977083999999	0.0897115081884828	0.0470739597647905	0.0676079421658121	0.0052101259622192	0.0562628343744852	0.0052101259622192	0.0567504493921639	0.0079591567417768	0.7772250233583281	0.0010958209134229	0.505674749368295	0.0010958209134229	0.5115772864370075	0.0003621812806986	0.6412432480993212	4.96592299268718e-05	0.3871004601659551	4.96592299268718e-05	0.3923321038954334	0.003322226254495	0.4552319294079047	0.003322226254495	0.461004699607935	GNE	30738	CLTA	116923	CCIN	138391	False	False	False	alt	70	0.0752	55	0.10144
4025	chr9	36351697	G	A	rs10972866	-0.10397345726	0.1167396851674031	0.10397345726	0.115292968311656	0.0237427557950598	0.3609332037325619	-0.0030464431695461	0.1555613100698706	0.0030464431695461	0.1536698756814022	0.0021568077595591	0.9235933623511798	-0.0003185719161337	0.7161642882923995	0.0003185719161337	0.7095877432747872	5.681939879016031e-05	0.8892926261893238	-9.35999411320394e-06	0.6719192576159805	9.35999411320394e-06	0.6656560902780015	-0.0009212827026491	0.709277473477966	0.0009212827026491	0.70275626545888	GNE	74655	RNF38	135851	CLTA	160840	False	False	False	ref	10	0.00264	-40	0.05756
4026	chr9	36399023	T	C	rs4144593	-0.2551173171999999	0.0169826932321817	0.2551173171999999	0.0168676478227155	0.0559249653856055	0.0411559425129374	-0.0160060127965592	0.0141629991297779	0.0160060127965592	0.0140783484601309	0.0366401636369634	0.5189138652779569	-0.0124079864966094	0.1686568896305763	0.0124079864966094	0.1662085695754056	0.0023179242424043	0.3189067042338235	-0.0008255802274051	0.0959100805881257	0.0008255802274051	0.0945221349993919	-0.0223408993434726	0.1032397072064816	0.0223408993434726	0.101686135311382	RNF38	88525	GNE	121981	MELK	173840	False	True	False	ref	-100	0.012405	30	0.01489
4027	chr9	36409392	T	C	rs10814385	-0.109952457	0.0988867697457406	0.109952457	0.0977203704769246	0.0346171668051881	0.1589917101136026	-0.003839399617396	0.0919661325151682	0.003839399617396	0.0907976895180229	0.0019093728349443	0.9224136610042812	-0.0002219881016603	0.7108901563824777	0.0002219881016603	0.7043318177732724	6.528949425678705e-05	0.8561778249144316	-7.637655547503371e-06	0.6278592304773314	7.637655547503371e-06	0.6216498055504871	-0.0006928177889214	0.7104373604292343	0.0006928177889214	0.7039099893401937	RNF38	78156	GNE	132350	MELK	163471	False	False	False	ref	100	0.02505	60	0.1844
4028	chr9	36415389	T	C	rs2483657	0.00266706046	0.678260051555082	0.01545545926	0.6791492270004187	0.0149853141536323	0.6859427809853136	1.352876096773572e-05	0.7052098690842795	0.0002342642890138	0.7061368473470091	0.1320329253406353	0.2544917466347503	0.0011441636057102	0.3761044508499747	0.0024147708921792	0.377282358048878	0.0019317263028907	0.3237035680466277	1.3034118847311267e-05	0.4239542487544553	3.538805034699199e-05	0.4249372674392678	0.0012215037445152	0.4045128699003242	0.0039218435551449	0.4056372031295105	RNF38	72159	GNE	138347	MELK	157474	False	False	False	alt	60	0.2559	-20	0.05902
4029	chr9	36422433	A	C	rs4446808	-0.0051059394	0.5150861651384957	0.025954347	0.5133760456285723	0.0487192289706477	0.0616303196454242	-6.795437743349995e-05	0.2757819283317019	0.001242615759987	0.2743588819914443	0.0019629837352775	0.9227946063444248	-1.0363327695167971e-05	0.8542840365640095	5.581026002043203e-05	0.8525640334520102	9.40906088364621e-05	0.8193331226815682	-1.5923233859704172e-07	0.7521257738639006	2.67654186450922e-06	0.7504953801267548	-6.268351423574692e-05	0.8390278675179326	0.000234238395302	0.8373300285218138	RNF38	65115	GNE	145391	MELK	150430	False	False	False	ref	-100	0.0191	55	0.06146
4030	chr9	36435008	C	T	rs6476556	-0.163539292	0.0387124216814001	0.163539292	0.038295370273121	0.0320259301185497	0.1894704673203825	-0.0054241260412862	0.0548498536538695	0.0054241260412862	0.0543192447792598	0.0575797565240341	0.4247282009474833	-0.0103024737380525	0.1690283008669476	0.0103024737380525	0.1660753100614603	0.0020878889822077	0.3311626057324102	-0.0003785032655332	0.1415524357467094	0.0003785032655332	0.1391529456247327	-0.0211375408267625	0.0997727224990504	0.0211375408267625	0.0979293034134853	RNF38	52540	MELK	137855	GNE	157966	False	False	False	ref	70	0.01538	65	0.12036
4031	chr9	36442935	G	C	rs7856743	-0.0035341429999999	0.4915421466480256	0.0286490386	0.4902795283495416	0.0276244667425484	0.2701173236084613	-2.6704485345739995e-05	0.4058898579949286	0.000785973117667	0.4049164978655924	0.0523366104714459	0.4358649049331421	-0.000916593120652	0.4372032127544513	0.0015972252222898	0.4356226862100082	0.0014243386043482	0.3822478366869494	-2.1840859087017904e-05	0.3960928808405451	4.22990133543977e-05	0.3947136623437751	-0.0018590610669393	0.4166477276687024	0.0037527630233248	0.4149562086148898	RNF38	44613	MELK	129928	GNE	165893	False	False	False	ref	-60	0.0202	-60	0.2607
4032	chr9	80492272	A	G	rs11138693	-0.0570494562	0.2483322061877597	0.0570494562	0.2450625125832308	0.0206220277853724	0.4596698970562813	-0.0012351185014962	0.2857231013244128	0.0012351185014962	0.2817924778307059	0.094977895813401	0.3259468828852165	-0.0062336294897114	0.2374773845623738	0.0062336294897114	0.2336171509622019	0.0019957618223945	0.3287208942116279	-0.0001389353300629	0.2501566978606391	0.0001389353300629	0.2463550846100705	-0.0122785457424696	0.1884749552631113	0.0122785457424696	0.1853440850649981	TLE4	920498	TLE1	1197275	SPATA31D4	1436157	False	False	False	ref	95	0.192	100	0.2335
4033	chr9	80492929	C	T	rs10867555	0.006527214614	0.8352931664244909	0.007302758174	0.8398205840699354	0.0127783574777355	0.792244021575556	9.253861476046636e-05	0.8606674442873915	0.0001016509208612	0.8653177780906376	0.0481104219590247	0.4699096299062721	7.238740410743867e-05	0.7587886856356305	0.0001558943907976	0.7629595539964344	0.0005929567351995	0.5532874561086306	1.024226807732024e-06	0.7921688460371091	2.0053982978357725e-06	0.7963204342562147	0.0003002210418659	0.7704490108076016	0.0004635280921117	0.7748373753404493	TLE4	921155	TLE1	1196618	SPATA31D4	1435500	False	False	False	alt	25	0.05844	100	0.2722
4034	chr9	80505747	C	T	rs11138702	-0.0570863754	0.2431845687465683	0.0570863754	0.2397187484516099	0.0148031590226939	0.682038084282573	-0.0008922467769536	0.3581692619247724	0.0008922467769536	0.3534023129858195	0.0818283791362871	0.345479715830301	-0.0044414440218015	0.2583649392753008	0.0044414440218015	0.2542787424424168	0.001175302625432	0.41289142931994	-6.750060606415108e-05	0.3122859399771535	6.750060606415108e-05	0.3075414189060788	-0.0097522351621523	0.2124270042488716	0.0097522351621523	0.2087094021195606	TLE4	933973	TLE1	1183800	SPATA31D4	1422682	False	False	False	ref	-95	0.01088	-100	0.2262
4035	chr9	80564618	C	A	rs145585805	0.0017933377999999	0.3168333097399391	0.0446490806	0.3167329045703965	0.0156513862267814	0.6571459512008555	-1.950807260418003e-05	0.4067917794709771	0.0007165890620726	0.4064628394697323	0.3809648312493814	0.0762265171021986	-0.0004660764696394	0.0980189081392534	0.017101236220858	0.0978660124928	0.0060884007017291	0.1360974803580459	-2.5885458933446445e-05	0.1454529450277636	0.0002802368827672	0.1451887156492606	0.0006375573224242	0.1371646793481238	0.0148964072448945	0.1370205096943827	TLE4	992844	TLE1	1124929	SPATA31D4	1363811	False	False	False	alt	15	0.003218	0	0.0
4036	chr9	82145230	A	G	rs7853639	-0.0133056964599999	0.64765435284638	0.01812961894	0.6457761759307857	0.0208177541544275	0.4560245411038198	-0.0003109477056273	0.6189331544950325	0.0003934169727575	0.6170470448176925	0.007394180330573	0.7903147957741647	-0.0002263042987367	0.7845731496782162	0.0002436477340867	0.7831334513113853	0.0001615696747868	0.770176523685564	-5.1844782891566405e-06	0.7662881938567131	5.487530794093985e-06	0.7647911546356817	-0.0006631255979677	0.7661432577768087	0.0007291082445316	0.7644993752584118	SPATA31D1	156457	SPATA31D3	201729	SPATA31D4	216801	False	False	False	ref	100	0.11816	100	0.1322
4037	chr9	82148110	C	T	rs11139500	-0.040819387	0.3642942248619454	0.040819387	0.3596543804193576	0.0243812497403043	0.349988932222902	-0.0010452983820359	0.3344068835849126	0.0010452983820359	0.3302932543666267	0.0051730394906139	0.8384719450274852	-0.0002452840147592	0.7223268821285084	0.0002452840147592	0.71607369948569	0.0001339295946535	0.7971090708072424	-6.502102917465497e-06	0.6815834504524914	6.502102917465497e-06	0.6753795365728945	-0.000836330045198	0.7021784161753757	0.000836330045198	0.6959607024612788	SPATA31D1	159337	SPATA31D3	204609	SPATA31D4	219681	False	False	False	ref	-100	0.01744	35	0.0794
4038	chr9	82151895	A	G	rs1409880	0.0003151028199999	0.3346753775768267	0.04696285478	0.336195070815407	0.0211968890471115	0.4375732131881125	-2.70990095396696e-05	0.3506919233387719	0.0010799703419305	0.3524222106240293	0.0123255583781464	0.7034691367583835	-0.0004561040392034	0.5971750605304925	0.0008045346674916	0.5986297906054951	0.0002682508941402	0.6824464936494548	-1.1091601425016774e-05	0.575841462751428	1.8887426218659064e-05	0.5772387607068346	-0.000950974893603	0.5573293702512688	0.0022607304278974	0.5585090643487065	SPATA31D1	163122	SPATA31D3	208394	SPATA31D4	223466	False	False	False	alt	-95	0.01126	-30	0.0759
4039	chr9	82173221	C	A	rs2788116	-0.0516720542	0.2833135534092929	0.0516720542	0.2792869818751102	0.0204862437839331	0.4688080210101027	-0.0010334791533938	0.3229624766952054	0.0010334791533938	0.3186629874922547	0.0018508132361188	0.9253845679226816	-9.204312442589168e-05	0.8006576007632887	9.204312442589168e-05	0.7938836480672136	3.711299091704565e-05	0.9132002335842098	-1.8107402689590247e-06	0.786176197677332	1.8107402689590247e-06	0.7795475860181273	-0.0003604302068555	0.79042213934724	0.0003604302068555	0.7836414196872842	SPATA31D1	184448	SPATA31D3	229720	SPATA31D4	244792	False	False	False	ref	60	0.01239	90	0.05777
4040	chr9	82176422	C	T	rs2767717	0.022683981	0.4225121176318978	0.0331431762	0.4263442122511485	0.0252234474914129	0.3254816205553418	0.0006499006066301	0.3590221571730978	0.0008844134704182	0.3621211819939499	0.0091988057140971	0.7572045598309236	0.0002826860038114	0.6552030121233975	0.0003562274887798	0.6594473483433165	0.0002520027015552	0.7046769087969574	8.271472190726528e-06	0.6074044987241459	9.920396808681916e-06	0.6117044458763561	0.0009798423014747	0.6280604778437203	0.0012371746230741	0.6324691379091215	SPATA31D1	187649	SPATA31D3	232921	SPATA31D4	247993	False	False	False	alt	-10	0.001953	20	0.0224
4041	chr9	82178446	C	T	rs2767715	-0.0402850664	0.380403825534636	0.0402850664	0.3756270563693887	0.0183572649709812	0.5439885920576957	-0.0007573508215017	0.4191935724052978	0.0007573508215017	0.4141457527349581	0.0019951502754775	0.9290474130500688	-0.000118231007087	0.8240724169177129	0.000118231007087	0.8174741755745146	3.785956506935279e-05	0.9208959895395172	-2.284444860356808e-06	0.815095856251634	2.284444860356808e-06	0.808500298727621	-0.0003868232654811	0.8192518836424572	0.0003868232654811	0.8127218345462549	SPATA31D1	189673	SPATA31D3	234945	SPATA31D4	250017	False	False	False	ref	-80	0.01375	-30	0.06082
4042	chr9	82184622	A	C	rs2767713	0.01745249406	0.604773378372345	0.02047552926	0.6085852333874612	0.0108881750567856	0.8722622919419601	0.0002163591641787	0.7099083130129907	0.0002483017264323	0.714031586353984	0.0138274883705584	0.6756984198668622	0.000278874995719	0.6796094495396036	0.0003292281655145	0.6831880361294943	0.0001556064773435	0.756802951446239	3.642188297784855e-06	0.7347904216539958	4.174239405231993e-06	0.7384613192129064	0.0008503513575929	0.6595652254327222	0.0010433505987924	0.663283950395348	SPATA31D1	195849	SPATA31D3	241121	SPATA31D4	256193	False	False	False	alt	-50	0.003632	-60	0.1012
4043	chr9	82336311	T	C	rs1933580	-0.3102418059999999	0.0092777124116415	0.3102418059999999	0.0092288671344913	0.0538375616098621	0.0458620317155317	-0.0184855266822713	0.0102196731542908	0.0184855266822713	0.0101788863350782	0.0042352611263237	0.859437765348842	-0.0015403761474201	0.4566751413204885	0.0015403761474201	0.4514073814572589	0.0002440288538689	0.7121681951448212	-9.547339337990736e-05	0.3150306793551404	9.547339337990736e-05	0.3106529787819799	-0.0030789152452904	0.4641831148106218	0.0030789152452904	0.4589346659582992	SPATA31D1	347538	SPATA31D3	392810	SPATA31D4	407882	False	True	True	ref	-10	0.00406	95	0.05692
4044	chr9	82344732	A	G	rs1330834	0.118380955	0.0784573034470603	0.118380955	0.0794473387811681	0.032991915478952	0.1801163276633829	0.0040263737414997	0.0791515919375317	0.0040263737414997	0.0800726042902141	0.000318366269671	0.9954518697479772	4.0898651624745686e-05	0.8719420510203142	4.0898651624745686e-05	0.8788740077085296	1.0897749057308784e-05	0.981696676443076	1.4268812506934625e-06	0.8110945853408045	1.4268812506934625e-06	0.8178332391251878	0.0001121704991586	0.8948724347512976	0.0001121704991586	0.901948232730274	SPATA31D1	355959	SPATA31D3	401231	SPATA31D4	416303	False	False	False	alt	-100	0.03195	-80	0.06152
4045	chr9	82365229	T	C	rs4877231	0.0180322855	0.5322625119536937	0.0245468425	0.534843774016801	0.0214936997535543	0.4302802875632537	0.0004108894240019	0.5028444052547091	0.0005453136919484	0.5052515518390839	0.036433967866451	0.4965770888407135	0.0008563724389452	0.5116510910341175	0.0010531783128391	0.5139488158974062	0.0007904903122913	0.4804822294942678	1.942550661521532e-05	0.4955442958319858	2.3487895382696982e-05	0.4978511629441468	0.0022747517402923	0.4848671718357039	0.0028372538022499	0.4873349038322379	SPATA31D1	376456	SPATA31D3	421728	SPATA31D4	436800	False	False	False	alt	100	0.0105	70	0.02881
4046	chr9	82379894	A	T	rs7848263	-0.0056673516	0.8200666022665095	0.00788002948	0.8154725199826686	0.0129253951813434	0.7870755518086534	-6.633018327483237e-05	0.8542681959392485	9.79253981102201e-05	0.849814803169737	0.0068283791362871	0.7956249457281591	-2.7483495403356976e-05	0.8723429918394439	4.583366221120661e-05	0.8680780182450152	9.355195172523104e-05	0.8363344641301993	-3.463881454915898e-07	0.8911321130814529	6.084133881178837e-07	0.8869437507993765	-7.670482663058964e-05	0.8684301589186985	0.0001707300979841	0.864175524747663	SPATA31D1	391121	SPATA31D3	436393	SPATA31D4	451465	False	False	False	ref	90	0.03943	-100	0.2051
4047	chr9	82380322	A	C	rs7020546	-0.0563426234	0.2598501705323198	0.0563426234	0.256427893651894	0.0118905950389841	0.836799052616421	-0.000690910232869	0.4389372159126917	0.000690910232869	0.4339153671173139	0.0019984494078056	0.935762221070435	-0.0001423655268082	0.8095487948004058	0.0001423655268082	0.8029839505436766	2.6353677752292704e-05	0.9516115682324596	-1.9098740949147163e-06	0.8407643004985128	1.9098740949147163e-06	0.8340472425885064	-0.0004882715845732	0.7962385156581748	0.0004882715845732	0.7898123062729624	SPATA31D1	391549	SPATA31D3	436821	SPATA31D4	451893	False	False	False	ref	15	0.001617	30	0.02298
4048	chr9	82400432	G	A	rs80020015	-0.00973045304	0.7717667274347791	0.01021176628	0.76932339869137	0.0167894822741653	0.6078072580161256	-0.0001745065987559	0.7671241631890927	0.0001826576884839	0.7646853928763973	0.0011068588961102	0.9646703314968113	-1.438335457595903e-05	0.950290686010544	1.4708135858197295e-05	0.9488421094242712	1.876785099342828e-05	0.960693705816418	-2.5883321854119293e-07	0.9462450747875838	2.643945141186033e-07	0.9447531967662264	-6.35082973177871e-05	0.9477707339251612	6.35082973177871e-05	0.943919553380957	SPATA31D1	411659	SPATA31D3	456931	SPATA31D4	472003	False	False	False	ref	0	0.0	-25	0.06323
4049	chr9	82404112	G	A	rs10113923	-0.268355472	0.0130924814705356	0.268355472	0.0130469230234197	0.0492377328892745	0.0628528720444021	-0.0150623257705225	0.0148170150583584	0.0150623257705225	0.0147715218119779	0.072647718649995	0.3747184195001804	-0.0217782099413594	0.0938175712697806	0.0217782099413594	0.092085574575242	0.0037493687698591	0.2225684187449028	-0.0013043415772323	0.0601943414757166	0.0013043415772323	0.0591603070949475	-0.0373214344627362	0.0447490707319608	0.0373214344627362	0.0440016990760518	SPATA31D1	415339	SPATA31D3	460611	SPATA31D4	475683	False	True	False	ref	-60	0.00757	85	0.05994
4050	chr9	93426142	G	A	rs10116211	-0.0733072206	0.1756087805460557	0.0733072206	0.1729189471053061	0.0294114614335971	0.2337167745615075	-0.0021513057539249	0.1591418452318867	0.0021513057539249	0.1570277712962169	0.0009328296657978	0.9705838272174768	-7.202173634366251e-05	0.8311121305887551	7.202173634366251e-05	0.8243249587211694	2.7148199237115302e-05	0.9379445046611588	-2.0882296922435807e-06	0.7751044860125065	2.0882296922435807e-06	0.7684777301207935	-0.0002424862261224	0.8388121458416047	0.0002424862261224	0.8320303412627587	FAM120A	25544	FAM120AOS	27439	PHF2	150443	False	False	False	ref	0	0.0	-100	0.1222
4051	chr9	93435814	T	C	rs6479482	-0.01626756212	0.6260158581262468	0.01880717148	0.6217524279076451	0.0243761531547338	0.3478366090554542	-0.0003942290134271	0.5466705433581535	0.0004529015377613	0.542768432820864	0.2636328395631948	0.1315645864297806	-0.0043486579447775	0.2517897510760765	0.0051481141729177	0.2491761287377341	0.0062430122198884	0.1314048805947432	-0.0001033550685741	0.244689576354548	0.000121824883462	0.2424026498240894	-0.0050996337963115	0.3120200189644861	0.0059986473557454	0.3088405232314204	FAM120A	15872	FAM120AOS	17767	PHF2	140771	False	False	False	ref	-30	0.12354	-75	0.1731
4052	chr9	93457832	C	T	rs12344021	0.016858880086	0.6532077154940498	0.017231342714	0.65768103300168	0.0115690115221006	0.834214587922669	0.0001869892049447	0.7498851530882765	0.0001916901321075	0.7544014462224717	0.0100870970934643	0.7320993234146479	0.0001632178989356	0.7510159086166331	0.0001658383223829	0.7553781662002024	0.0001121432136152	0.797552234091575	1.7588463508342165e-06	0.7989558482282023	1.7919192523379972e-06	0.8032524965499803	0.0005674507604499	0.741173029170693	0.0005756985912704	0.7456282562289211	FAM120AOS	4251	FAM120A	6146	PHF2	118753	False	False	False	alt	-100	0.01802	-50	0.0547
4053	chr9	93462293	T	A	rs12336645	-0.0053238790799999	0.7280862300533752	0.01336025636	0.7260516884384872	0.0159379831835371	0.6516974895440544	-0.0001074603048023	0.7401894610576397	0.0002219851920098	0.7382100166142705	0.007043647520702	0.777025191216532	-6.492282114146373e-05	0.8100492410709077	0.0001193022342624	0.8083675131050303	0.0001126489345363	0.7950930655211232	-1.241589817487625e-06	0.8166220854882433	2.016048004351331e-06	0.8149492490348613	-0.0002119692520866	0.80063922824392	0.0004297119857476	0.7989696834654175	FAM120AOS	8712	FAM120A	10607	PHF2	114292	False	False	False	ref	65	0.02054	-85	0.04352
4054	chr9	93463196	A	T	rs7023933	0.00322010642	0.7505478123008252	0.01126597978	0.751436338469782	0.0168513672369844	0.5853294238786443	2.197602898284858e-05	0.7504926799150019	0.0001798430911447	0.7510383026853622	0.0173641582263864	0.6326431632085083	2.460231412934e-05	0.7128727368862326	0.0001840166275839	0.7135608446751944	0.0003200753581009	0.652835357097059	-6.86469155211694e-08	0.7222875421800504	3.258668125332127e-06	0.7228713419537943	6.350829731780003e-05	0.706075080413079	0.0006507538517369	0.7067181377268603	FAM120AOS	9615	FAM120A	11510	PHF2	113389	False	False	False	alt	-95	0.04443	-70	0.0228
4055	chr9	93485602	A	G	rs10125504	0.0232381588	0.4699958895256605	0.0294968536	0.4740400864129711	0.0163789040307455	0.6324119972838886	0.000406348515887	0.5206059763326197	0.0005055953289891	0.5246942757336146	0.0050014846095476	0.83426430376906	6.920416420904513e-05	0.7823745592587558	9.697607718804166e-05	0.786779935096417	7.764349034730999e-05	0.8478063079152338	1.0823733956361285e-06	0.790160475684452	1.522764552715719e-06	0.7944400249592962	0.0003200158358351	0.7640338834109844	0.0004156906733528	0.7683628771864595	FAM120AOS	32021	FAM120A	33916	PHF2	90983	False	False	False	alt	60	0.01654	-50	0.0801
4056	chr9	93507955	G	C	rs12554020	0.0972988392	0.1115726975951661	0.0972988392	0.1130580868661405	0.0757040200836978	0.0136552450970016	0.0071935893690449	0.0360451194788505	0.0071935893690449	0.0363688205330414	0.0455742139817227	0.4987291074892231	0.0032871168384491	0.3054998144559766	0.0032871168384491	0.3099654945938616	0.0033174263377293	0.2574454753333108	0.0002410395581585	0.1611991298959217	0.0002410395581585	0.1639567621842207	0.0084589752894988	0.2417812564857208	0.0084589752894988	0.2455893385307034	FAM120AOS	54374	FAM120A	56269	PHF2	68630	False	True	False	alt	-75	0.014465	-75	0.0691
4057	chr9	93541696	A	G	rs28464341	-0.020646589	0.4012705784969498	0.0358564289999999	0.3985980843696078	0.019069546791634	0.5180538116522383	-0.0003796095861746	0.4201707402803001	0.0006869219695045	0.4175047371399815	0.0789284418198013	0.3565518558500752	-0.0008436392214655	0.3252770572316064	0.0028979787660123	0.3232257824236008	0.001546303311314	0.3694977341372369	-1.5504556479035574e-05	0.3392582705084931	5.701215759255558e-05	0.337099607492057	-0.0023027943650819	0.2913761109474528	0.0064662993632674	0.2892885331998279	PHF2	34889	FAM120AOS	88115	FAM120A	90010	False	False	False	ref	100	0.02982	75	0.203
4058	chr9	98302833	T	G	rs7869257	-0.00854219374	0.5245794973004176	0.02412024626	0.5247777686690982	0.0171743746370461	0.5891053640953593	-0.0001622718870458	0.5443191933192185	0.000457450011994	0.5445590921401396	0.468241727425687	0.050800241532387	-0.0049416256649111	0.1531361006092583	0.0121910434721388	0.1532819881895052	0.0082126030579587	0.0964762027734111	-9.371297889807471e-05	0.1920793971996886	0.0002326190565534	0.1924932155947074	-0.0025560027712711	0.2786561893716653	0.0076168717627263	0.2788608867201633	TBC1D2	47184	CORO2A	110196	TRIM14	183611	False	False	False	ref	-45	0.03247	-45	0.1997
4059	chr9	98307051	C	T	rs7867834	-0.1454958439999999	0.053639139315828	0.1454958439999999	0.0530744450321583	0.0359833816439706	0.1455831595327626	-0.0052108973633357	0.0572546484154334	0.0052108973633357	0.056616977370037	0.3676247896803141	0.081365405738651	-0.0547295916000981	0.0260260959759885	0.0547295916000981	0.0255302034434329	0.0129539454881846	0.0502263711046565	-0.0019404547962218	0.0275326918918992	0.0019404547962218	0.0270465752726151	-0.0505270363894294	0.0219153682760662	0.0505270363894294	0.0215887409091601	TBC1D2	51402	CORO2A	114414	TRIM14	187829	False	False	False	ref	100	0.02545	-100	0.566
4060	chr9	98308808	T	C	rs10985817	0.02362169848	0.5518880742560834	0.02362169848	0.5580242747783426	0.0363171682333648	0.1420668819779433	0.0008990948506295	0.3763589649885824	0.0008990948506295	0.3809746087955941	0.048884068489987	0.456484779912496	0.0011368759312316	0.4816375339027328	0.0011368759312316	0.4869238516561829	0.0016944279207984	0.3513908332323698	4.0462293489640895e-05	0.3957216271555786	4.0462293489640895e-05	0.4006913909513175	0.0027984889973936	0.4663119526635176	0.0027984889973936	0.4716200608066165	TBC1D2	53159	CORO2A	116171	TRIM14	189586	False	False	False	alt	100	0.0676	100	0.3037
4061	chr9	98309453	G	A	rs3780444	0.183731764	0.039490819214473	0.183731764	0.0398132266321531	0.0339712850796529	0.1746396908209685	0.007925499590239	0.0512453538348232	0.007925499590239	0.0517074992057735	0.0157715020949489	0.6709216454723925	0.0040351504142151	0.33591898770626	0.0040351504142151	0.3405991983183843	0.0005881730245014	0.5791479176528105	0.0001947207821622	0.273797607612845	0.0001947207821622	0.2777825321744813	0.0083393817426016	0.2778831899699899	0.0083393817426016	0.2819888159923167	TBC1D2	53804	CORO2A	116816	TRIM14	190231	False	False	False	alt	95	0.04358	-50	0.08716
4062	chr9	112194636	A	C	rs10817282	-0.00331543048	0.8886470766130693	0.00490092556	0.8846898757825699	0.0135224469403018	0.7451291713774431	-4.440080531894252e-05	0.8951646215978872	6.766868717764641e-05	0.8911283455998448	0.1299874632971528	0.259452653197407	-0.0003850045430731	0.5570383673400259	0.000652283207066	0.5536340721611217	0.0018756689159287	0.3384864127779455	-5.812718444615208e-06	0.6002003263470876	9.735157800872412e-06	0.5968286533179681	-0.0007629243508957	0.6094070789312467	0.0012709907294381	0.6058969194016728	SUSD1	19339	PTBP3	139028	HSDL2	185445	False	False	False	ref	-15	0.006935	30	0.02184
4063	chr9	112195177	A	G	rs1887518	0.044907668	0.3185022630410297	0.044907668	0.3228275449210748	0.0195775680102049	0.4956005193434003	0.0009182683823605	0.3486246761285467	0.0009182683823605	0.3532888946844993	0.0079641054402691	0.7703115351054253	0.0003681412814952	0.6367775139229691	0.0003681412814952	0.6430507713634028	0.0001567660063229	0.7609525205605115	7.872930210847577e-06	0.6276004766234209	7.872930210847577e-06	0.6338747633468087	0.001319652931279	0.6043294795344791	0.001319652931279	0.6105150327221319	SUSD1	19880	PTBP3	138487	HSDL2	184904	False	False	False	alt	80	0.02808	35	0.0406
4064	chr9	112204377	T	C	rs10114558	0.0437254036	0.3267656445085155	0.0437254036	0.3314937047641912	0.0211726237037469	0.4420429981705892	0.000964827940192	0.3343481613978776	0.000964827940192	0.3389819785890098	0.0056992510969614	0.8291822804569771	0.0002378596434571	0.6966749642728649	0.0002378596434571	0.7031337121582936	0.0001166840518129	0.8104997107412769	5.002070821624978e-06	0.6767841089634471	5.002070821624978e-06	0.6832329439296562	0.0008701461515621	0.6766995382950055	0.0008701461515621	0.6831383971285352	SUSD1	29080	PTBP3	129287	HSDL2	175704	False	False	False	alt	-90	0.012695	100	0.1516
4065	chr9	112207436	A	G	rs7861162	6.953508800000007e-05	0.7296209908613084	0.0121706285279999	0.7314673533522335	0.084564795427833	0.0085012013576083	5.1306445690216815e-05	0.3432581278066534	0.001035998192908	0.3438418666059532	0.0887491339777638	0.346810174884822	0.0002896310534336	0.5057095559432134	0.0011712015401042	0.5070846729706974	0.0080262945090233	0.1142869932765915	3.352065109541118e-05	0.3024602751530443	0.0001055909615623	0.3033179551234721	0.0002919732110455	0.526179348004053	0.0022780508726204	0.527471470341699	SUSD1	32139	PTBP3	126228	HSDL2	172645	False	True	True	alt	-90	0.01587	90	0.1104
4066	chr9	112207709	G	C	rs7861788	0.0061884077999999	0.4847811263439495	0.0278632802	0.4866945940113382	0.011628285651948	0.8430379492755568	5.832687490094083e-05	0.6111776940512701	0.0003411813247397	0.6129289749820004	0.0531927353106132	0.4336845828607427	0.0005670915661148	0.4441231464090708	0.0013416618937022	0.4459564439642717	0.0006156762265885	0.5362644010312128	6.199561050110448e-06	0.5189808812962343	1.622591199304234e-05	0.5210026255558347	0.0013518194714789	0.4216506557390646	0.0034451189337203	0.4237037553628172	SUSD1	32412	PTBP3	125955	HSDL2	172372	False	False	False	alt	30	0.0889	-55	0.08276
4067	chr9	112220269	C	T	rs7869523	0.00926645732	0.3794302258701043	0.03734203068	0.3793694073205716	0.0928319906758974	0.0059333108738982	0.0007078700683775	0.1067463094931528	0.0033918111444801	0.1063434695727768	0.0940120748243211	0.3275243508940145	0.0009109093934841	0.3215126232059875	0.0032723753989355	0.3211276656929864	0.008612595273833	0.0960438180798832	6.109138995210155e-05	0.1522412228552453	0.0002871860948238	0.1519543726467343	0.0018186466959189	0.2912555617657535	0.0069916861865329	0.2909347937351955	SUSD1	44972	PTBP3	113395	HSDL2	159812	False	True	True	alt	60	0.02017	-100	0.3062
4068	chr9	112225574	A	C	rs7871559	-0.0154590513399999	0.6721092742421457	0.0154590513399999	0.6656539843130179	0.0205176500338612	0.4640105330095465	-0.0003227021524668	0.6316799397612437	0.0003227021524668	0.625323215326917	0.0048653954010094	0.8257066951949217	-8.314689796770628e-05	0.8222921525849514	8.314689796770628e-05	0.8155159546420246	0.0001000010858897	0.8098294544650921	-1.7471748682003026e-06	0.805787182731571	1.7471748682003026e-06	0.7992403324079689	-0.0003637293391837	0.8023534912833283	0.0003637293391837	0.7955915441835733	SUSD1	50277	PTBP3	108090	HSDL2	154507	False	False	False	ref	90	0.02267	70	0.0753
4069	chr9	112226051	A	T	rs3780514	-0.0068466985029999	0.807307047414818	0.009056977703	0.8049233302819513	0.0286608866742847	0.2510026566841173	-0.0002208758742965	0.6894371044954973	0.0002778629692917	0.6867027764714997	0.0114743822374714	0.7108439899809327	-6.988501774173211e-05	0.8364392098693357	8.267336888399178e-05	0.8323905708681842	0.0003404755982169	0.6470691427925136	-2.5270413423306727e-06	0.7857440759230998	2.8567603151390435e-06	0.7815947211380327	-0.0002449605753686	0.8325520010538099	0.0002878492956352	0.8281216322497542	SUSD1	50754	PTBP3	107613	HSDL2	154030	False	False	False	ref	65	0.03406	65	0.1458
4070	chr9	112228093	A	G	rs3736985	0.009690726388	0.7700808965704434	0.010791990012	0.7718882956125883	0.0155983661406733	0.6656197870468362	0.0001669756498453	0.7756775621591439	0.0001829758351506	0.7776292385238021	0.0129631157005707	0.6811511113483245	0.0001018777797647	0.7965501956677128	0.0001208275531346	0.7979677586192865	0.0001992062306256	0.7105585485048115	1.7556623593002627e-06	0.8044986828367167	2.029814570243736e-06	0.8058521737758902	0.0003596054237735	0.7859670139857795	0.0004387845996502	0.7874984374402725	SUSD1	52796	PTBP3	105571	HSDL2	151988	False	False	False	alt	-5	0.0009155	100	0.07605
4071	chr9	112228592	C	T	rs7026917	0.12624598	0.0680696094721055	0.12624598	0.0689413882403885	0.0200510621534068	0.4757019734405839	0.0026335290132738	0.1308254869126415	0.0026335290132738	0.1325086184675305	0.0486275609514697	0.4572741885862028	0.0064928838736328	0.2154327973513145	0.0064928838736328	0.2190469181011181	0.0009942887666162	0.4571933425623201	0.00013520989491	0.2323673817058837	0.00013520989491	0.2360044604769954	0.0149178516050278	0.1436829425711531	0.0149178516050278	0.1461112653582812	SUSD1	53295	PTBP3	105072	HSDL2	151489	False	False	False	alt	-75	0.03378	-95	0.11365
4072	chr9	112240034	C	A	rs7021564	0.0181308678	0.6162716405678664	0.0181308678	0.6226497764674468	0.0131557604225958	0.776897054819615	0.0002341289034541	0.6903226566671138	0.0002341289034541	0.6970045960770063	0.007278710699086	0.7851079930417854	0.0001320606111958	0.758563049396791	0.0001320606111958	0.7652760610166147	9.167119265685024e-05	0.8259119403624722	1.6464100644210092e-06	0.7903005629846177	1.6464100644210092e-06	0.7969983965222625	0.0005171389924449	0.7462597303752617	0.0005171389924449	0.7530153716760069	SUSD1	64737	PTBP3	93630	HSDL2	140047	False	False	False	alt	-85	0.1261	-65	0.2014
4073	chr9	112248027	C	A	rs7033486	0.0263778472	0.5102585596322832	0.0263778472	0.515975006701982	0.031021296520749	0.207523167119572	0.0007905340391426	0.3827561720348756	0.0007905340391426	0.3878149690914845	0.0040034970802678	0.8658989612205672	0.000139430620003	0.7850116518585469	0.000139430620003	0.7915067863310772	0.0001190272119008	0.8002800319808747	4.019428138984197e-06	0.7242609800925895	4.019428138984197e-06	0.7306876360306491	0.0004915707169014	0.7675256404193425	0.0004915707169014	0.7738630415214608	SUSD1	72730	PTBP3	85637	HSDL2	132054	False	False	False	alt	-45	0.009415	95	0.0977
4074	chr9	112253684	T	A	rs11792718	0.12459980672	0.0776927322022283	0.12459980672	0.0783997383087262	0.0170224327049132	0.5950919781336267	0.0022783930293379	0.1732121497392637	0.0022783930293379	0.1750595980476519	0.0150927056184223	0.6638191159356897	0.002185911550171	0.3983880759189139	0.002185911550171	0.4034494385962125	0.0002599059797882	0.6813758871180264	3.948949569220899e-05	0.4231439426550452	3.948949569220899e-05	0.4282726513665366	0.0058567846656329	0.3308284919812553	0.0058567846656329	0.3354321852501403	SUSD1	78387	PTBP3	79980	HSDL2	126397	False	False	False	alt	-75	0.00659	90	0.1382
4075	chr9	112254581	T	C	rs6477903	-0.0248081042	0.5420749428792904	0.0248081042	0.5358620882826909	0.0407573307347683	0.1031965920689	-0.0009966050980042	0.3489732073367038	0.0009966050980042	0.3445032534957856	0.0005740490251063	0.9860407083199544	-1.3458401151302564e-05	0.9522547408624829	1.3458401151302564e-05	0.9452228994172036	2.3315435874125302e-05	0.948139645069178	-5.369240719804968e-07	0.900696348410862	5.369240719804968e-07	0.8938121047005816	-5.113655108706412e-05	0.9512016857231126	5.113655108706412e-05	0.944167686433316	PTBP3	79083	SUSD1	79284	HSDL2	125500	False	False	False	ref	-45	0.003601	-55	0.02335
4076	chr9	112257991	G	A	rs4979090	0.00931039604	0.788353745341852	0.00931039604	0.7951656868140762	0.0187680696020003	0.5301783817779395	0.000181278518766	0.7574727069211715	0.000181278518766	0.7645215333175923	0.1222345023258882	0.26735517204017	0.0012556643092223	0.4720178820661502	0.0012556643092223	0.4777004252207675	0.002288352466258	0.2925460502290999	2.4494183590689668e-05	0.4787318595000197	2.4494183590689668e-05	0.4844687309512515	0.002287948269605	0.5112987125111177	0.002287948269605	0.5172956813778562	PTBP3	75673	SUSD1	82694	HSDL2	122090	False	False	False	alt	45	0.0478	50	0.136
4077	chr9	112258733	G	A	rs7027240	-0.0228645971999999	0.5321438535499646	0.0264126079999999	0.5283779330279897	0.0150895821020938	0.6856886323968626	-0.0004516123590848	0.5855537999764971	0.0005014713512532	0.581999461569691	0.0887722279040612	0.3390700660005711	-0.002826026246426	0.3828838278235457	0.0032229988030841	0.3796612523551834	0.0014890437715741	0.3961274031812808	-6.1626122961641e-05	0.4247582676283766	6.72046436163549e-05	0.4213485718544125	-0.0049990102603015	0.3660446111748948	0.0057809046220843	0.362886282198533	PTBP3	74931	SUSD1	83436	HSDL2	121348	False	False	False	ref	100	0.0277	-50	0.013214
4078	chr9	112273585	C	T	rs10817308	-0.00113102807	0.9035738954793762	0.0044031628699999	0.9013004304880776	0.0468779435245335	0.0687013860477254	-3.581468799419312e-05	0.7406841409921405	0.0002132518474357	0.7380237645344296	0.0193048728184487	0.630686195102068	1.2175029580865834e-05	0.852981884670797	6.977407596369417e-05	0.8490612946706186	0.0009048599127732	0.4728782012619485	8.840819448523851e-07	0.7571911512997379	3.5597497882185347e-06	0.7538017775428658	3.051697403584536e-05	0.8604916191624933	0.000218567516743	0.8565923229096987	PTBP3	60079	SUSD1	98288	HSDL2	106496	False	False	False	ref	15	0.002563	-70	0.04675
4079	chr9	112297115	C	T	rs12376681	-0.0554370415	0.2706784316730661	0.0554370415	0.2669471130294155	0.0170631938332295	0.589314506812215	-0.0010116866368945	0.3581025308591854	0.0010116866368945	0.3536572589772714	0.0058666820626174	0.8113911066320066	-0.0003591462008346	0.6707002444215917	0.0003591462008346	0.6647015827590065	9.600598708741388e-05	0.8200917399067336	-6.2397276521549084e-06	0.6800913853166983	6.2397276521549084e-06	0.673899204547708	-0.0012272772260894	0.6370105986428082	0.0012272772260894	0.630889854233804	PTBP3	36549	HSDL2	82966	SUSD1	121818	False	False	False	ref	15	0.005127	40	0.10394
4080	chr9	112336799	T	C	rs4978484	0.032299189	0.4291282595065657	0.032299189	0.4344653481729321	0.0106610698127054	0.8798875788065409	0.0003465524355475	0.5986090098601161	0.0003465524355475	0.6047688974496935	0.001419451684207	0.944671601470603	4.969455837707643e-05	0.856171657291261	4.969455837707643e-05	0.8630988734634025	1.4047432888601844e-05	0.9701654163691906	4.921684270565956e-07	0.891968697598618	4.921684270565956e-07	0.8990090133107695	0.0001905248919534	0.8534407941932116	0.0001905248919534	0.8603857071319032	PTBP3	3135	HSDL2	43282	KIAA1958	150029	False	False	False	alt	75	0.00888	0	0.0
4081	chr9	112337341	C	T	rs4979103	0.0541419584	0.2638575887345307	0.0541419584	0.2672032972699946	0.0270087737411721	0.2812489613976139	0.0015645315704459	0.2367142366072457	0.0015645315704459	0.2398646378286157	0.0007662234832238	0.9758155794920332	4.074162743706173e-05	0.8672934383837048	4.074162743706173e-05	0.8742158187416073	2.063984777683981e-05	0.9509914924727982	1.1705162699340282e-06	0.823364646463558	1.1705162699340282e-06	0.8303666738680765	0.0001542344363432	0.8665491062428546	0.0001542344363432	0.8734612445568742	PTBP3	3677	HSDL2	42740	KIAA1958	149487	False	False	False	alt	-70	0.05322	-75	0.05334
4082	chr9	112349429	G	A	rs10817323	0.0254190136399999	0.5220922989494932	0.0254190136399999	0.5280510450574548	0.0377478866060434	0.1295235243513581	0.0010525226510294	0.3470968816852425	0.0010525226510294	0.3512708047528366	0.1315545511530467	0.2495570138692141	0.0030377815940391	0.3190113707294151	0.0030377815940391	0.3235508832393393	0.0048316735348866	0.1648622426682824	0.0001234782973908	0.2449661937685268	0.0001234782973908	0.2488242862133836	0.0058180198607765	0.3195266189050915	0.0058180198607765	0.3240317253611104	PTBP3	15765	HSDL2	30652	KIAA1958	137399	False	False	False	alt	100	0.03616	-100	0.1886
4083	chr9	126978004	A	G	rs11790388	0.0990710878	0.1111348260985168	0.0990710878	0.1127193838290907	0.045110565530169	0.0785706303312987	0.0046762169115451	0.0697315973924735	0.0046762169115451	0.0705195781975726	0.0195044703243046	0.6514392620061622	0.0022592536493521	0.400105860055903	0.0022592536493521	0.4053603966900947	0.0009570855720662	0.4941794553050753	0.0001130107447946	0.2914813026619584	0.0001130107447946	0.2957765922221252	0.0062551548942627	0.3270212965162119	0.0062551548942627	0.3318064071560731	RALGPS1	63229	ZBTB34	117364	ANGPTL2	144631	False	False	False	alt	-100	0.01367	-100	0.1205
4084	chr9	137932059	C	A	rs7868607	-0.0031636319999999	0.2809531562640057	0.0532102075999999	0.2819842025562076	0.0195149877600541	0.5009145870056073	-0.0001891671781484	0.3308194734063646	0.0010922793082662	0.3318669498220271	0.2952566724951337	0.1141247889445079	-0.0028957620242022	0.1144449363992624	0.0173896064365831	0.1149916516322206	0.0057908556888017	0.1434381721368249	-9.938624524043176e-05	0.1438034586384716	0.0003633235961155	0.144419863410379	-0.0022689782587179	0.1278934162453029	0.0176346870772986	0.1287221680905654	CACNA1B	54276	EHMT1	313066	ARRDC1	326373	False	False	False	ref	15	0.003326	-10	0.01367
4085	chr9	137950872	C	T	rs56199530	-0.2371926949999999	0.0196707991667583	0.2371926949999999	0.0195263941522334	0.1017004855856028	0.0047604995716886	-0.0268696054895861	0.0064862592054221	0.0268696054895861	0.0064499237030452	0.0562444327141961	0.4248267427254161	-0.0153286391301501	0.1258529281381628	0.0153286391301501	0.1236025281931219	0.0066700407030228	0.1392032902592794	-0.0018748176560172	0.0411586922513931	0.0018748176560172	0.0405972687653723	-0.0297853914420507	0.0641357786291081	0.0297853914420507	0.0630644426441583	CACNA1B	73089	EHMT1	331879	ARRDC1	345186	False	True	True	ref	45	0.011826	-100	0.04285
4086	chr9	137953733	T	G	rs10867090	0.22821433	0.0183796249162307	0.22821433	0.0184940985720538	0.0503905632959624	0.056122204423506	0.0123444181157772	0.0170033023630964	0.0123444181157772	0.0170704339632649	0.4464781762396489	0.0563534053702597	0.106653194104653	0.0086763555184514	0.106653194104653	0.0086915512816719	0.0231273491875973	0.017885145871182	0.0059746744692954	0.0080501952250879	0.0059746744692954	0.0080160847929752	0.0752812510309787	0.008332971153046	0.0752812510309787	0.0083764366032427	CACNA1B	75950	EHMT1	334740	ARRDC1	348047	False	True	False	alt	10	0.02264	-95	0.2437
4087	chr9	137990281	C	T	rs7042228	-0.1710618448	0.0371999652292418	0.1710618448	0.0367888176146148	0.0613928360484642	0.0283908801533647	-0.0107570780156593	0.0194492287335479	0.0107570780156593	0.0193867957722972	0.2447296361057041	0.141899142375394	-0.0430269585820412	0.0362118860420401	0.0430269585820412	0.0355542315837445	0.0151848718413217	0.0394851053343226	-0.0027383380937748	0.0190707005355041	0.0027383380937748	0.018783564309614	-0.0527184850384348	0.0192536337243575	0.0527184850384348	0.0189825334418414	CACNA1B	112498	EHMT1	371288	ARRDC1	384595	False	False	False	ref	100	0.221	40	0.07715
4088	chr9	138034437	A	G	rs7855572	-0.0016781547199999	0.7859185040394095	0.00857179968	0.7885124131130496	0.011672985222572	0.8365644528733301	-2.3316586925338268e-05	0.8276554255587936	0.0001113228952764	0.83070256156756	0.0225388472831645	0.6158384794435012	-0.0001767960652568	0.7582498226559555	0.0002436208093082	0.7607691673765077	0.0002739610950177	0.6912641767315045	-2.3477479443684803e-06	0.7915638329110851	3.174687351313331e-06	0.7944990432113388	-0.0005427072679885	0.7510457175480023	0.0007736465309623	0.7534405437750314	CACNA1B	156654	EHMT1	415444	ARRDC1	428751	False	False	False	ref	-70	0.00792	100	0.0871
4089	chr9	138061209	C	T	rs62580940	-0.1513180288	0.054331341012811	0.1643180192	0.0540125101377816	0.0485163564866722	0.0640622198264942	-0.0087090678945756	0.040402682409473	0.0092304454928078	0.0402647640314584	0.0926676784005806	0.3408778872651238	-0.0117235875179001	0.1555724015549186	0.0134591855479748	0.1536098010431656	0.004366103100368	0.202203801309057	-0.0007302578567875	0.1006513409894372	0.0007998657481683	0.0993470401776894	-0.0201708950546006	0.101493934949534	0.0233677542806241	0.1001490737249374	CACNA1B	183426	EHMT1	442216	ARRDC1	455523	False	False	False	ref	-90	0.006226	-85	0.3525