Query_ID Target_ID Optimal_offset p-value E-value q-value Overlap Query_consensus Target_consensus Orientation 1 M6456_1.02 -20 2.39327e-06 0.00171837 0.00342515 20 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGGGGGGGGTGGTTTGGGGT + 1 M2310_1.02 -23 1.46741e-05 0.010536 0.0105005 15 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGTTTGTGGTTTG - 1 M6459_1.02 -22 0.000168674 0.121108 0.0804663 14 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TGGGTTTTGTGGTT - 1 M6123_1.02 -18 0.000301164 0.216236 0.107753 15 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGTGGGGGAGGGG + 1 M6552_1.02 -9 0.000676148 0.485474 0.193535 15 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGTGGGGGAGGGG + 1 M6482_1.02 -20 0.00105347 0.756393 0.251281 20 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGGGGGGCGGGGCCGGGG + 1 M5856_1.02 -23 0.00154818 1.11159 0.316527 12 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG AGTGGGCGTGGC + 1 M6535_1.02 -6 0.00244041 1.75221 0.43452 13 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GCGGGGGCGGGGG + 1 M2294_1.02 -25 0.00302763 2.17384 0.43452 11 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TGGGTGTGGCC + 1 M4484_1.02 -21 0.00303615 2.17995 0.43452 15 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG CTGGGAATTGTAGTC + 1 M6540_1.02 -13 0.00457751 3.28666 0.553793 15 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG CAATAGCGGTGGTGG + 1 M1837_1.02 -26 0.00464346 3.334 0.553793 11 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GTCTGTGGTTT - 1 M1956_1.02 -11 0.00671995 4.82492 0.587043 21 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGCGCTGTCCATGGTGCTGAA - 1 M0427_1.02 -18 0.00678049 4.8684 0.587043 10 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGTGGTGG + 1 M6321_1.02 -9 0.00716685 5.14579 0.587043 17 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGCGGGGAGGTGGGGGC + 1 M6336_1.02 -7 0.00716685 5.14579 0.587043 17 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGGGGGGAGGGAGGG + 1 M5962_1.02 -17 0.00738338 5.30127 0.587043 12 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TTCGGTGGTCGC + 1 M6553_1.02 -17 0.00738338 5.30127 0.587043 12 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GAGGGGGGCGGA + 1 M5593_1.02 -24 0.00857906 6.15976 0.646209 11 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GGGGGCGTGGC + 1 M1871_1.02 -31 0.00967581 6.94723 0.667243 9 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TGGGTGGGGC + 1 M5209_1.02 -24 0.00979076 7.02977 0.667243 11 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GTGGGCGTGGC + 1 M0443_1.02 -25 0.011119 7.98341 0.681867 10 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TGGGCGTGGC + 1 M2274_1.02 -26 0.0111932 8.03674 0.681867 14 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG GTGCGTGGGCGGGGG + 1 M6127_1.02 -25 0.0119029 8.5463 0.681867 11 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TGGGTGGGGCC + 1 M0429_1.02 -3 0.0119111 8.55219 0.681867 10 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TGTGGGGGGG + 1 M0421_1.02 -25 0.0127539 9.15729 0.702031 10 GGTTTTGAGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGTGGTTGGGG TGGGCGTGGC + # Tomtom (Motif Comparison Tool): Version 5.0.1 compiled on Aug 7 2018 at 21:56:33 # The format of this file is described at http://meme-suite.org/doc/tomtom-output-format.html. # tomtom -no-ssc -oc /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_80-naivegw/cisbp_tomtomout/m0_p19 -verbosity 1 -min-overlap 5 -mi 1 -dist pearson -evalue -thresh 10.0 /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_80-naivegw/cisbp_tomtomout/query_file /mnt/lab_data/kundaje/msharmin/annotations/Mus_musculus.meme