Query_ID Target_ID Optimal_offset p-value E-value q-value Overlap Query_consensus Target_consensus Orientation 1 M0104_1.02 3 1.45617e-06 0.00104553 0.00181058 8 TTAATTAA ATATTAATTAA + 1 M0960_1.02 0 2.34283e-05 0.0168215 0.00971015 8 TTAATTAA TTAATTAA + 1 M1015_1.02 0 3.41629e-05 0.0245289 0.0106194 7 TTAATTAA TTAATTA + 1 M0983_1.02 1 0.000117556 0.0844054 0.0142036 7 TTAATTAA ATTAATTA + 1 M5348_1.02 5 0.00012201 0.0876032 0.0142036 8 TTAATTAA CTAATCTAATTAA + 1 M1004_1.02 0 0.000131943 0.0947352 0.0142036 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M0928_1.02 0 0.000145249 0.104289 0.0142036 7 TTAATTAA CTAATTA - 1 M1065_1.02 1 0.000147439 0.105861 0.0142036 8 TTAATTAA GTTAATTAAC + 1 M0906_1.02 0 0.000147439 0.105861 0.0142036 8 TTAATTAA CTAATTAATT - 1 M0972_1.02 0 0.000148503 0.106625 0.0142036 8 TTAATTAA TTAATTAA - 1 M1020_1.02 0 0.000148503 0.106625 0.0142036 8 TTAATTAA CCAATTAA - 1 M1066_1.02 1 0.000210518 0.151152 0.0171073 7 TTAATTAA ATTAATTA - 1 M1032_1.02 0 0.000246655 0.177098 0.0171073 7 TTAATTAA TTAATTA + 1 M0992_1.02 0 0.000283159 0.203308 0.0171073 8 TTAATTAA CTAATTATC - 1 M1000_1.02 0 0.000293645 0.210837 0.0171073 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M1223_1.02 0 0.000327467 0.235122 0.0171073 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M0951_1.02 1 0.000327467 0.235122 0.0171073 7 TTAATTAA ACTAATTA + 1 M1236_1.02 0 0.000349102 0.250655 0.0171073 8 TTAATTAA TTAATTATC + 1 M0963_1.02 2 0.000349102 0.250655 0.0171073 7 TTAATTAA ATTTAATTA + 1 M1056_1.02 2 0.000377528 0.271065 0.0171073 8 TTAATTAA AATTAATTAT - 1 M1232_1.02 1 0.000386842 0.277753 0.0171073 8 TTAATTAA ATTAATTAT + 1 M0975_1.02 2 0.000386842 0.277753 0.0171073 7 TTAATTAA AATTAATTA - 1 M0943_1.02 1 0.000407082 0.292285 0.0171073 7 TTAATTAA GCTAATTA + 1 M5740_1.02 2 0.000429211 0.308173 0.0171073 8 TTAATTAA CATTAATTATTCAT - 1 M0967_1.02 0 0.000453682 0.325744 0.0171073 8 TTAATTAA CCAATTAA - 1 M1051_1.02 0 0.000453682 0.325744 0.0171073 8 TTAATTAA CTCATTAT - 1 M0894_1.02 0 0.000505143 0.362692 0.0175885 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M5631_1.02 1 0.000510396 0.366464 0.0175885 8 TTAATTAA TCTAATTAAC - 1 M1238_1.02 0 0.00052339 0.375794 0.0175885 8 TTAATTAA TTAATTATT + 1 M0958_1.02 0 0.000622743 0.447129 0.0184773 7 TTAATTAA CTAATTA + 1 M1019_1.02 0 0.000622743 0.447129 0.0184773 7 TTAATTAA CTAATTA - 1 M0920_1.02 0 0.00062414 0.448133 0.0184773 8 TTAATTAA CTAATTAG + 1 M0931_1.02 2 0.000639459 0.459132 0.0184906 7 TTAATTAA AATTAATTA - 1 M1235_1.02 0 0.000692679 0.497343 0.0187232 8 TTAATTAA CTAATTAT + 1 M1036_1.02 0 0.000810983 0.582286 0.0210076 7 TTAATTAA CTAATTG + 1 M0953_1.02 1 0.000849058 0.609623 0.0211141 7 TTAATTAA ATTAATTA + 1 M1166_1.02 0 0.000936924 0.672712 0.0217385 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M0959_1.02 1 0.000936924 0.672712 0.0217385 7 TTAATTAA GCTAATTA - 1 M0949_1.02 0 0.000961584 0.690417 0.0217385 7 TTAATTAA TTAATGA + 1 M1034_1.02 0 0.000961584 0.690417 0.0217385 7 TTAATTAA GCAATTA + 1 M0998_1.02 0 0.00103141 0.740555 0.0220658 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M0902_1.02 0 0.00113277 0.813326 0.0228934 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M1018_1.02 0 0.00114155 0.819633 0.0228934 7 TTAATTAA TTAATTA - 1 M0989_1.02 0 0.0011674 0.838194 0.0230402 8 TTAATTAA CTCATTATC - 1 M1243_1.02 2 0.00122454 0.87922 0.0237903 8 TTAATTAA TATTAATAAT + 1 M0980_1.02 1 0.00128839 0.925062 0.0242722 8 TTAATTAA GCCAATTAA - 1 M6303_1.02 0 0.00148167 1.06384 0.0258008 8 TTAATTAA TTAATTGA + 1 M0932_1.02 0 0.00148167 1.06384 0.0258008 8 TTAATTAA CTAATTAA - 1 M0915_1.02 0 0.0019083 1.37016 0.030815 8 TTAATTAA GTAATTAA - 1 M0927_1.02 1 0.00224342 1.61077 0.0348679 7 TTAATTAA GCTAATTA + 1 M1017_1.02 1 0.0024283 1.74352 0.0368209 7 TTAATTAA GCTAATTA + 1 M0973_1.02 0 0.00262609 1.88554 0.0384147 8 TTAATTAA CTAGTTAA - 1 M0923_1.02 1 0.00262609 1.88554 0.0384147 7 TTAATTAA GCTAATTA + 1 M0954_1.02 0 0.00288906 2.07435 0.0412899 8 TTAATTAA CCAATTAGC - 1 M5502_1.02 1 0.00312815 2.24601 0.0428219 8 TTAATTAA CCTAATTAAA - 1 M0984_1.02 1 0.00331512 2.38025 0.0440473 7 TTAATTAA GCTAATTG + 1 M1058_1.02 0 0.00332998 2.39092 0.0440473 7 TTAATTAA CTAATTA + 1 M0105_1.02 2 0.00339524 2.43778 0.0444378 7 TTAATTAA TTTTAATTG + 1 M0971_1.02 0 0.00358283 2.57247 0.0464047 8 TTAATTAA CCAATTAT - 1 M0982_1.02 1 0.00428783 3.07866 0.052269 8 TTAATTAA GGTAATTAA - 1 M1064_1.02 1 0.00454141 3.26073 0.0542955 7 TTAATTAA GCTAATTA + 1 M1163_1.02 0 0.00537951 3.86249 0.0602595 8 TTAATTAA GTAATTAAT - 1 M6052_1.02 0 0.00578913 4.1566 0.0637934 8 TTAATTAA GTAATTAC - 1 M0999_1.02 0 0.0057976 4.16267 0.0637934 8 TTAATTAA GTAATTAAT - 1 M1027_1.02 1 0.00673397 4.83499 0.0715635 8 TTAATTAA GGTAATTAA - 1 M0934_1.02 0 0.0068043 4.88548 0.071698 8 TTAATTAA CTGGTTAA - 1 M0935_1.02 0 0.00737044 5.29198 0.077011 8 TTAATTAA GCAATTAT - 1 M0905_1.02 0 0.00844612 6.06432 0.0864604 8 TTAATTAA TTAATTACC + 1 M0948_1.02 0 0.0086225 6.19095 0.0864604 8 TTAATTAA GTCATTAA - 1 M1025_1.02 1 0.0086225 6.19095 0.0864604 7 TTAATTAA GCTAATTA + 1 M0957_1.02 1 0.0086225 6.19095 0.0864604 7 TTAATTAA ACCAATTA - 1 M1070_1.02 1 0.00910695 6.53879 0.0898687 8 TTAATTAA GGTCATTAA - 1 M0945_1.02 0 0.00931248 6.68636 0.0911733 8 TTAATTAA CTAGTTAA - 1 M0962_1.02 0 0.0100491 7.21522 0.0961143 8 TTAATTAA CTAATCAA + 1 M0907_1.02 1 0.0105797 7.5962 0.0969251 8 TTAATTAA GGTAATTAA - 1 M0914_1.02 1 0.0105797 7.5962 0.0969251 8 TTAATTAA GGCAATTAA - 1 M0997_1.02 1 0.0105797 7.5962 0.0969251 8 TTAATTAA GGTAATTAG - 1 M0924_1.02 2 0.0107318 7.70542 0.0969251 8 TTAATTAA AGCTCATTAT - 1 M6285_1.02 6 0.010795 7.75081 0.0969251 8 TTAATTAA AAAAAATCAATAAA - 1 M0979_1.02 0 0.0108354 7.77982 0.0969251 8 TTAATTAA TTAATTCG + 1 M0955_1.02 1 0.0113945 8.18127 0.0996769 8 TTAATTAA GGTAATAAA + 1 M1012_1.02 0 0.0113945 8.18127 0.0996769 8 TTAATTAA TTAATGACT + 1 M5746_1.02 2 0.0115439 8.28849 0.0996769 8 TTAATTAA AGCTCATTAT - 1 M0921_1.02 1 0.0122633 8.80504 0.103442 8 TTAATTAA GGTAATTAA - 1 M0991_1.02 0 0.0123126 8.84047 0.103442 7 TTAATTAA TTAATTG + 1 M1045_1.02 0 0.0125698 9.02509 0.103723 8 TTAATTAA GTAATAAA - 1 M1582_1.02 4 0.0126798 9.10407 0.103723 7 TTAATTAA ATATATAATAA + 1 M6534_1.02 4 0.0126798 9.10407 0.103723 7 TTAATTAA TTAGCTAATTA + 1 M0950_1.02 1 0.0131884 9.46929 0.107178 8 TTAATTAA GGCAATTAT - 1 M6241_1.02 0 0.013345 9.58171 0.107747 8 TTAATTAA TAAATAAACA + 1 M1583_1.02 0 0.0135247 9.71074 0.107798 8 TTAATTAA TCAATGAA - # Tomtom (Motif Comparison Tool): Version 5.0.1 compiled on Aug 7 2018 at 21:56:33 # The format of this file is described at http://meme-suite.org/doc/tomtom-output-format.html. # tomtom -no-ssc -oc /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_32-naivegw/cisbp_tomtomout/m0_p0 -verbosity 1 -min-overlap 5 -mi 1 -dist pearson -evalue -thresh 10.0 /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_32-naivegw/cisbp_tomtomout/query_file /mnt/lab_data/kundaje/msharmin/annotations/Mus_musculus.meme