Query_ID Target_ID Optimal_offset p-value E-value q-value Overlap Query_consensus Target_consensus Orientation 1 M1582_1.02 -8 1.69578e-06 0.00121757 0.00228885 11 ATTATTATTAATTATTTTT TTATTATATAT - 1 M0983_1.02 -6 2.20545e-05 0.0158351 0.0148839 8 ATTATTATTAATTATTTTT ATTAATTA + 1 M1243_1.02 -5 4.91113e-05 0.0352619 0.0172646 10 ATTATTATTAATTATTTTT TATTAATAAT + 1 M0104_1.02 -4 5.11642e-05 0.0367359 0.0172646 11 ATTATTATTAATTATTTTT ATATTAATTAA + 1 M6285_1.02 -3 9.28357e-05 0.066656 0.0250608 14 ATTATTATTAATTATTTTT TTTATTGATTTTTT + 1 M1066_1.02 -6 0.000176264 0.126558 0.0339872 8 ATTATTATTAATTATTTTT ATTAATTA - 1 M5697_1.02 -3 0.000257297 0.184739 0.0388109 14 ATTATTATTAATTATTTTT ATTATTGATTTTTT + 1 M1056_1.02 -5 0.000338605 0.243119 0.0456958 10 ATTATTATTAATTATTTTT AATTAATTAT - 1 M0963_1.02 -5 0.000465941 0.334546 0.0524082 9 ATTATTATTAATTATTTTT ATTTAATTA + 1 M0975_1.02 -5 0.000847075 0.6082 0.0744853 9 ATTATTATTAATTATTTTT AATTAATTA - 1 M0133_1.02 -1 0.00097554 0.700438 0.0774544 12 ATTATTATTAATTATTTTT AAAATATTAATT + 1 M5740_1.02 -5 0.00103489 0.743049 0.0776015 14 ATTATTATTAATTATTTTT CATTAATTATTCAT - 1 M1232_1.02 -6 0.00112992 0.811282 0.0802681 9 ATTATTATTAATTATTTTT ATTAATTAT + 1 M0999_1.02 -6 0.00124177 0.891588 0.0838029 9 ATTATTATTAATTATTTTT ATTAATTAC + 1 M0931_1.02 -5 0.00136352 0.979007 0.0876379 9 ATTATTATTAATTATTTTT AATTAATTA - 1 M0915_1.02 -7 0.00145599 1.0454 0.0893273 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTAC + 1 M1163_1.02 -6 0.00214845 1.54259 0.117837 9 ATTATTATTAATTATTTTT ATTAATTAC + 1 M6399_1.02 2 0.00227705 1.63492 0.117837 19 ATTATTATTAATTATTTTT GTCTTGTTATTGATTTTTTTT + 1 M1166_1.02 -7 0.00235721 1.69247 0.117837 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTAG + 1 M0894_1.02 -7 0.00284153 2.04022 0.12372 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTAG + 1 M0953_1.02 -6 0.00284153 2.04022 0.12372 8 ATTATTATTAATTATTTTT ATTAATTA + 1 M1590_1.02 -10 0.00304357 2.18529 0.127888 9 ATTATTATTAATTATTTTT ATTGTTTTA + 1 M1015_1.02 -7 0.00325574 2.33762 0.127888 7 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTA + 1 M0105_1.02 -5 0.00331351 2.3791 0.127888 9 ATTATTATTAATTATTTTT TTTTAATTG + 1 M0131_1.02 -9 0.003411 2.44909 0.127888 8 ATTATTATTAATTATTTTT ATTTATTT - 1 M1223_1.02 -7 0.00373102 2.67887 0.13391 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTAG + 1 M6250_1.02 -5 0.00571683 4.10468 0.191798 12 ATTATTATTAATTATTTTT TATTGTTTATTT - 1 M5348_1.02 -7 0.0058261 4.18314 0.191798 12 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTAGATTAG - 1 M1235_1.02 -7 0.00626461 4.49799 0.196641 8 ATTATTATTAATTATTTTT CTAATTAT + 1 M1641_1.02 -8 0.0068246 4.90006 0.205888 7 ATTATTATTAATTATTTTT TTTATAT - 1 M1238_1.02 -7 0.00686427 4.92854 0.205888 9 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTATT + 1 M1045_1.02 -7 0.00739799 5.31176 0.208485 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTTATTAC + 1 M1593_1.02 -10 0.00739799 5.31176 0.208485 8 ATTATTATTAATTATTTTT ATTGTTTT + 1 M0948_1.02 -7 0.00802996 5.76551 0.213671 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATGAC + 1 M1600_1.02 -10 0.00870868 6.25283 0.213671 8 ATTATTATTAATTATTTTT ATTGTTTT + 1 M0960_1.02 -7 0.00870868 6.25283 0.213671 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTAA - 1 M0633_1.02 -4 0.00871421 6.25681 0.213671 10 ATTATTATTAATTATTTTT TAATGTATTA + 1 M1032_1.02 -7 0.00886512 6.36515 0.213671 7 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTA + 1 M0928_1.02 -7 0.00886512 6.36515 0.213671 7 ATTATTATTAATTATTTTT CTAATTA - 1 M1018_1.02 -7 0.00886512 6.36515 0.213671 7 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTA - 1 M0951_1.02 -6 0.00943659 6.77547 0.223455 8 ATTATTATTAATTATTTTT ACTAATTA + 1 M0747_1.02 -8 0.010033 7.20371 0.233482 10 ATTATTATTAATTATTTTT TGTTTACATT - 1 M6534_1.02 -8 0.0112669 8.0896 0.248628 11 ATTATTATTAATTATTTTT TAATTAGCTAA - 1 M0906_1.02 -5 0.0115287 8.27757 0.248628 10 ATTATTATTAATTATTTTT AATTAATTAG + 1 M1236_1.02 -7 0.0116049 8.3323 0.248628 9 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATTATC + 1 M5335_1.02 3 0.012005 8.61959 0.253181 15 ATTATTATTAATTATTTTT ATCGATAATTTTATCGAT + 1 M6427_1.02 -5 0.0124521 8.94063 0.258571 13 ATTATTATTAATTATTTTT TATTAATGAGCTG - 1 M1012_1.02 -7 0.0134051 9.62483 0.265279 9 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATGACT + 1 M1014_1.02 -7 0.013914 9.99024 0.265279 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTAATGGC + 1 M1026_1.02 -7 0.013914 9.99024 0.265279 8 ATTATTATTAATTATTTTT TTTATGAC + # Tomtom (Motif Comparison Tool): Version 5.0.1 compiled on Aug 7 2018 at 21:56:33 # The format of this file is described at http://meme-suite.org/doc/tomtom-output-format.html. # tomtom -no-ssc -oc /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_248-naivegw/cisbp_tomtomout/m1_p1 -verbosity 1 -min-overlap 5 -mi 1 -dist pearson -evalue -thresh 10.0 /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_248-naivegw/cisbp_tomtomout/query_file /mnt/lab_data/kundaje/msharmin/annotations/Mus_musculus.meme