Query_ID Target_ID Optimal_offset p-value E-value q-value Overlap Query_consensus Target_consensus Orientation 1 M0905_1.02 -2 0.000812159 0.58313 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATTACC + 1 M1012_1.02 -2 0.000980341 0.703884 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATGACT + 1 M0926_1.02 -2 0.00130012 0.933485 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATCGCT + 1 M1070_1.02 -2 0.00142752 1.02496 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATGACC + 1 M0943_1.02 -1 0.00188857 1.35599 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC GCTAATTA + 1 M6315_1.02 -7 0.00207635 1.49082 0.410268 7 AGTTAATGATTAACC CATTAAC - 1 M0104_1.02 -2 0.00235669 1.69211 0.410268 11 AGTTAATGATTAACC TTAATTAATAT - 1 M0949_1.02 -2 0.00321629 2.30929 0.410268 7 AGTTAATGATTAACC TTAATGA + 1 M0939_1.02 -1 0.00355325 2.55123 0.410268 10 AGTTAATGATTAACC GCTAATTGCT + 1 M0959_1.02 -1 0.00382382 2.7455 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC GCTAATTA - 1 M0990_1.02 -2 0.00400435 2.87512 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATTGCT + 1 M0951_1.02 -1 0.00456633 3.27863 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC ACTAATTA + 1 M0948_1.02 -2 0.00499349 3.58533 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC TTAATGAC + 1 M0915_1.02 -2 0.00597546 4.29038 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC TTAATTAC + 1 M0927_1.02 -1 0.00597546 4.29038 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC GCTAATTA + 1 M0916_1.02 -1 0.00715204 5.13517 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC GCTAATTA + 1 M1235_1.02 -2 0.00715204 5.13517 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC CTAATTAT + 1 M1232_1.02 -2 0.00779314 5.59547 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC ATAATTAAT - 1 M0929_1.02 -2 0.00836277 6.00447 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATTACC + 1 M0973_1.02 -9 0.00853418 6.12754 0.410268 6 AGTTAATGATTAACC TTAACTAG + 1 M1056_1.02 -2 0.00876525 6.29345 0.410268 10 AGTTAATGATTAACC ATAATTAATT + 1 M0907_1.02 -2 0.00896915 6.43985 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATTACC + 1 M1017_1.02 -1 0.00930726 6.68261 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC GCTAATTA + 1 M0923_1.02 -1 0.0101389 7.27972 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC GCTAATTA + 1 M1166_1.02 -2 0.0101389 7.27972 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC TTAATTAG + 1 M1223_1.02 -2 0.0101389 7.27972 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC TTAATTAG + 1 M1027_1.02 -2 0.0103019 7.39673 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATTACC + 1 M1054_1.02 -2 0.0103019 7.39673 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC TTAATTGGT + 1 M0975_1.02 0 0.0103019 7.39673 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC AATTAATTA - 1 M1064_1.02 -1 0.0110312 7.92041 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC GCTAATTA + 1 M1014_1.02 -2 0.0119856 8.60565 0.410268 8 AGTTAATGATTAACC TTAATGGC + 1 M0934_1.02 -9 0.0119856 8.60565 0.410268 6 AGTTAATGATTAACC TTAACCAG + 1 M1015_1.02 -2 0.0120978 8.68623 0.410268 7 AGTTAATGATTAACC TTAATTA + 1 M0989_1.02 -1 0.0126433 9.07792 0.410268 9 AGTTAATGATTAACC GATAATGAG + 1 M5697_1.02 -1 0.0138283 9.92871 0.410268 14 AGTTAATGATTAACC ATTATTGATTTTTT + # Tomtom (Motif Comparison Tool): Version 5.0.1 compiled on Aug 7 2018 at 21:56:33 # The format of this file is described at http://meme-suite.org/doc/tomtom-output-format.html. # tomtom -no-ssc -oc /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_164-naivegw/cisbp_tomtomout/m0_p17 -verbosity 1 -min-overlap 5 -mi 1 -dist pearson -evalue -thresh 10.0 /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_164-naivegw/cisbp_tomtomout/query_file /mnt/lab_data/kundaje/msharmin/annotations/Mus_musculus.meme