Query_ID Target_ID Optimal_offset p-value E-value q-value Overlap Query_consensus Target_consensus Orientation 1 M5335_1.02 0 4.94454e-06 0.00355018 0.00523336 18 ATCAATTAATATATTAAT ATCGATAAAATTATCGAT - 1 M0983_1.02 0 1.48893e-05 0.0106905 0.00523336 8 ATCAATTAATATATTAAT ATTAATTA + 1 M0104_1.02 -1 1.65723e-05 0.0118989 0.00523336 11 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTAATAT - 1 M0960_1.02 -1 2.67419e-05 0.0192007 0.00672221 8 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTAA + 1 M1066_1.02 0 3.19305e-05 0.0229261 0.00672221 8 ATCAATTAATATATTAAT ATTAATTA - 1 M0972_1.02 -1 9.33631e-05 0.0670347 0.0147415 8 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTAA - 1 M1020_1.02 -1 0.000140868 0.101143 0.0174773 8 ATCAATTAATATATTAAT CCAATTAA - 1 M1004_1.02 -1 0.000160656 0.115351 0.0174773 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTAA - 1 M0906_1.02 1 0.000184181 0.132242 0.0174773 9 ATCAATTAATATATTAAT AATTAATTAG + 1 M0975_1.02 1 0.000211848 0.152107 0.0174773 8 ATCAATTAATATATTAAT AATTAATTA - 1 M1015_1.02 -1 0.000212003 0.152218 0.0174773 7 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTA + 1 M0967_1.02 -1 0.000234182 0.168143 0.0174773 8 ATCAATTAATATATTAAT CCAATTAA - 1 M1000_1.02 -1 0.000234182 0.168143 0.0174773 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTAA - 1 M0931_1.02 1 0.000235215 0.168884 0.0174773 8 ATCAATTAATATATTAAT AATTAATTA - 1 M0951_1.02 0 0.000264284 0.189756 0.0185463 8 ATCAATTAATATATTAAT ACTAATTA + 1 M0963_1.02 1 0.000320019 0.229773 0.0201279 8 ATCAATTAATATATTAAT ATTTAATTA + 1 M0953_1.02 0 0.000334626 0.240261 0.0201279 8 ATCAATTAATATATTAAT ATTAATTA + 1 M0133_1.02 -3 0.000366451 0.263112 0.0210402 12 ATCAATTAATATATTAAT AATTAATATTTT - 1 M1232_1.02 0 0.000391249 0.280916 0.0214873 9 ATCAATTAATATATTAAT ATTAATTAT + 1 M5348_1.02 -1 0.000413595 0.296961 0.0217681 13 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTAGATTAG - 1 M0980_1.02 0 0.000580586 0.416861 0.0282066 9 ATCAATTAATATATTAAT GCCAATTAA - 1 M0959_1.02 0 0.000730999 0.524857 0.0301899 8 ATCAATTAATATATTAAT GCTAATTA - 1 M1034_1.02 -1 0.000767592 0.551131 0.0301899 7 ATCAATTAATATATTAAT GCAATTA + 1 M0928_1.02 -1 0.000767592 0.551131 0.0301899 7 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTA - 1 M1036_1.02 -2 0.000767592 0.551131 0.0301899 7 ATCAATTAATATATTAAT CAATTAG - 1 M1056_1.02 1 0.000790046 0.567253 0.0301899 9 ATCAATTAATATATTAAT AATTAATTAT - 1 M0943_1.02 0 0.000812913 0.583671 0.0301899 8 ATCAATTAATATATTAAT GCTAATTA + 1 M1065_1.02 0 0.000860413 0.617777 0.0301899 10 ATCAATTAATATATTAAT GTTAATTAAC + 1 M0957_1.02 0 0.000903629 0.648806 0.0308494 8 ATCAATTAATATATTAAT ACCAATTA - 1 M1243_1.02 1 0.00141895 1.0188 0.0422854 9 ATCAATTAATATATTAAT TATTAATAAT + 1 M5704_1.02 2 0.00141895 1.0188 0.0422854 8 ATCAATTAATATATTAAT TAATCGATTA - 1 M1032_1.02 -1 0.00144311 1.03615 0.0422854 7 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTA + 1 M0992_1.02 -1 0.00147466 1.0588 0.0422854 9 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTATC - 1 M1017_1.02 0 0.00150785 1.08264 0.0422854 8 ATCAATTAATATATTAAT GCTAATTA + 1 M0971_1.02 -1 0.00150785 1.08264 0.0422854 8 ATCAATTAATATATTAAT CCAATTAT - 1 M1019_1.02 -1 0.00198809 1.42745 0.0516234 7 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTA - 1 M0940_1.02 0 0.00202316 1.45263 0.0516234 8 ATCAATTAATATATTAAT ACCAATTA + 1 M6413_1.02 2 0.00205013 1.472 0.0516234 13 ATCAATTAATATATTAAT CCATCAATCAATTTA + 1 M1070_1.02 0 0.00209195 1.50202 0.0516234 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTCATTAA - 1 M5502_1.02 0 0.00212516 1.52587 0.0516234 10 ATCAATTAATATATTAAT CCTAATTAAA - 1 M1223_1.02 -1 0.00222721 1.59914 0.0520986 8 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTAG + 1 M6303_1.02 -1 0.00222721 1.59914 0.0520986 8 ATCAATTAATATATTAAT TCAATTAA - 1 M1238_1.02 -1 0.00227771 1.6354 0.0523111 9 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTATT + 1 M1025_1.02 0 0.00245106 1.75986 0.0543171 8 ATCAATTAATATATTAAT GCTAATTA + 1 M6285_1.02 5 0.00267313 1.91931 0.0550038 9 ATCAATTAATATATTAAT AAAAAATCAATAAA - 1 M0911_1.02 1 0.00268981 1.93128 0.0550038 9 ATCAATTAATATATTAAT AAGCAATTAG - 1 M1012_1.02 0 0.00269608 1.93578 0.0550038 9 ATCAATTAATATATTAAT AGTCATTAA - 1 M0998_1.02 -1 0.00269977 1.93843 0.0550038 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTAA - 1 M0993_1.02 0 0.00293076 2.10428 0.0558763 9 ATCAATTAATATATTAAT ACCAATTAG - 1 M0950_1.02 0 0.00318366 2.28587 0.0558763 9 ATCAATTAATATATTAAT GGCAATTAT - 1 M0982_1.02 0 0.00318366 2.28587 0.0558763 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAA - 1 M1027_1.02 0 0.00318366 2.28587 0.0558763 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAA - 1 M0958_1.02 -1 0.00319085 2.29103 0.0558763 7 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTA + 1 M0920_1.02 -1 0.00327342 2.35031 0.0558763 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTAG + 1 M0902_1.02 -1 0.00327342 2.35031 0.0558763 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTAA - 1 M0932_1.02 -1 0.00327342 2.35031 0.0558763 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTAA - 1 M0894_1.02 -1 0.00359522 2.58137 0.0584658 8 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTAG + 1 M0105_1.02 -2 0.00374912 2.69187 0.0584658 9 ATCAATTAATATATTAAT CAATTAAAA - 1 M0905_1.02 0 0.00374912 2.69187 0.0584658 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAA - 1 M0954_1.02 -1 0.00374912 2.69187 0.0584658 9 ATCAATTAATATATTAAT CCAATTAGC - 1 M0990_1.02 0 0.00374912 2.69187 0.0584658 9 ATCAATTAATATATTAAT AGCAATTAA - 1 M1018_1.02 -2 0.00380492 2.73194 0.0585581 7 ATCAATTAATATATTAAT TAATTAA + 1 M1236_1.02 -1 0.00440385 3.16196 0.0618084 9 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTATC + 1 M1054_1.02 0 0.00440385 3.16196 0.0618084 9 ATCAATTAATATATTAAT ACCAATTAA - 1 M1055_1.02 0 0.00440385 3.16196 0.0618084 9 ATCAATTAATATATTAAT AGCCATTAA - 1 M0949_1.02 -2 0.00451403 3.24107 0.0626586 7 ATCAATTAATATATTAAT TCATTAA - 1 M1166_1.02 -1 0.00470603 3.37893 0.0640845 8 ATCAATTAATATATTAAT TTAATTAG + 1 M0997_1.02 0 0.00476895 3.42411 0.0640845 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAG - 1 M1163_1.02 -1 0.00476895 3.42411 0.0640845 9 ATCAATTAATATATTAAT GTAATTAAT - 1 M0921_1.02 0 0.00516144 3.70591 0.0679136 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAA - 1 M5631_1.02 0 0.00530501 3.809 0.0687825 10 ATCAATTAATATATTAAT TCTAATTAAC - 1 M5740_1.02 1 0.00554216 3.97927 0.070525 13 ATCAATTAATATATTAAT CATTAATTATTCAT - 1 M0999_1.02 -1 0.00558323 4.00876 0.070525 9 ATCAATTAATATATTAAT GTAATTAAT - 1 M5697_1.02 5 0.00590968 4.24315 0.0731849 9 ATCAATTAATATATTAAT AAAAAATCAATAAT - 1 M1043_1.02 1 0.00613856 4.40748 0.0738473 9 ATCAATTAATATATTAAT AACCAATTAA - 1 M1063_1.02 1 0.00613856 4.40748 0.0738473 9 ATCAATTAATATATTAAT AAGCAATTAA - 1 M0910_1.02 0 0.00653075 4.68908 0.0742421 9 ATCAATTAATATATTAAT GGCAATTAT - 1 M0961_1.02 0 0.00653075 4.68908 0.0742421 9 ATCAATTAATATATTAAT ACCAATTAG - 1 M1011_1.02 0 0.00653075 4.68908 0.0742421 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAA - 1 M1583_1.02 -1 0.0065828 4.72645 0.0742421 8 ATCAATTAATATATTAAT TCAATGAA - 1 M1024_1.02 0 0.00706406 5.072 0.0783924 9 ATCAATTAATATATTAAT GGCAATTAT - 1 M1051_1.02 -1 0.00713697 5.12435 0.0783924 8 ATCAATTAATATATTAAT CTCATTAT - 1 M0973_1.02 -1 0.00773004 5.55017 0.0834552 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAGTTAA - 1 M1058_1.02 -1 0.00803584 5.76973 0.0860215 7 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTA + 1 M1028_1.02 0 0.00824779 5.92192 0.0868189 9 ATCAATTAATATATTAAT GCTAATTAG - 1 M0915_1.02 -1 0.009767 7.0127 0.0986981 8 ATCAATTAATATATTAAT GTAATTAA - 1 M0633_1.02 -2 0.0108076 7.75986 0.106654 10 ATCAATTAATATATTAAT TAATGTATTA + 1 M0995_1.02 -2 0.0111011 7.97059 0.107104 7 ATCAATTAATATATTAAT CAATTAG - 1 M0918_1.02 0 0.0111124 7.97873 0.107104 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAG - 1 M0929_1.02 0 0.0111124 7.97873 0.107104 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAA - 1 M1235_1.02 -1 0.0113672 8.16166 0.107104 8 ATCAATTAATATATTAAT CTAATTAT + 1 M1157_1.02 0 0.0115786 8.31343 0.107104 10 ATCAATTAATATATTAAT GGTCATAAAA - 1 M0641_1.02 3 0.0115786 8.31343 0.107104 7 ATCAATTAATATATTAAT TGTATCAATT + 1 M0955_1.02 0 0.0119447 8.57633 0.107104 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATAAA + 1 M1641_1.02 -4 0.0120403 8.64491 0.107104 7 ATCAATTAATATATTAAT ATATAAA + 1 M0991_1.02 -2 0.0120403 8.64491 0.107104 7 ATCAATTAATATATTAAT CAATTAA - 1 M0935_1.02 -1 0.0122491 8.79486 0.107448 8 ATCAATTAATATATTAAT GCAATTAT - 1 M1603_1.02 1 0.0122491 8.79486 0.107448 7 ATCAATTAATATATTAAT GAACAATA + 1 M0926_1.02 0 0.0128291 9.21129 0.110994 9 ATCAATTAATATATTAAT AGCGATTAA - 1 M1013_1.02 0 0.0128291 9.21129 0.110994 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTCATTAA - 1 M1582_1.02 -1 0.0130122 9.34279 0.111813 11 ATCAATTAATATATTAAT TTATTATATAT - 1 M1072_1.02 1 0.0132872 9.54022 0.113404 9 ATCAATTAATATATTAAT AGGTCATTAA - 1 M0977_1.02 0 0.013769 9.88613 0.115181 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATAAA + 1 M0907_1.02 0 0.013769 9.88613 0.115181 9 ATCAATTAATATATTAAT GGTAATTAA - 1 M0989_1.02 -1 0.013769 9.88613 0.115181 9 ATCAATTAATATATTAAT CTCATTATC - # Tomtom (Motif Comparison Tool): Version 5.0.1 compiled on Aug 7 2018 at 21:56:33 # The format of this file is described at http://meme-suite.org/doc/tomtom-output-format.html. # tomtom -no-ssc -oc /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_133-naivegw/cisbp_tomtomout/m0_p3 -verbosity 1 -min-overlap 5 -mi 1 -dist pearson -evalue -thresh 10.0 /srv/scratch/msharmin/mouse_hem/with_tfd/full_mouse50/Naive_modisco2019/task_133-naivegw/cisbp_tomtomout/query_file /mnt/lab_data/kundaje/msharmin/annotations/Mus_musculus.meme