Gene_ID miRNA_family_ID species_ID MSA_start MSA_end UTR_start UTR_end Group_num Site_type miRNA in this species Group_type Species_in_this_group Species_in_this_group_with_this_site_type CDC2L6 miR-1/206 9606 2827 2833 2588 2594 1 1a x 1a 9606 CDC2L6 miR-1/206 9615 2177 2183 2053 2059 2 1a x 1a 9615 CDC2L6 miR-10 10090 441 447 352 358 3 m8 x m8 10090 CDC2L6 miR-101 10090 1789 1795 1592 1598 4 1a x 1a 10090 10116 9606 9615 CDC2L6 miR-101 10116 1789 1795 1600 1606 4 1a x 1a 10090 10116 9606 9615 CDC2L6 miR-101 9606 1789 1795 1662 1668 4 1a x 1a 10090 10116 9606 9615 CDC2L6 miR-101 9615 1789 1795 1686 1692 4 1a x 1a 10090 10116 9606 9615 CDC2L6 miR-18 10090 352 358 287 293 5 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 10090 516 522 414 420 6 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 10116 352 358 297 303 5 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 10116 516 522 424 430 6 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 9031 352 358 314 320 5 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 9031 516 522 469 475 6 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 9606 352 358 308 314 5 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 9606 516 522 448 454 6 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 9615 352 358 297 303 5 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-18 9615 516 522 441 447 6 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 CDC2L6 miR-601 10116 2561 2567 2257 2263 7 1a 1a 10116 CDC2L6 miR-601 10116 2596 2602 2292 2298 8 1a 1a 10116 CDC2L6 miR-601 9606 4188 4194 3843 3849 9 1a x 1a 9606 CDC2L6 miR-603 10090 1193 1199 1029 1035 13 1a 1a 10090 CDC2L6 miR-603 10090 1262 1269 1098 1104 10 8mer 8mer 10090 10116 CDC2L6 miR-603 10090 4774 4780 3829 3835 11 1a 1a 10090 10116 CDC2L6 miR-603 10116 1262 1269 1107 1113 10 8mer 8mer 10090 10116 CDC2L6 miR-603 10116 2572 2578 2268 2274 14 1a 1a 10116 CDC2L6 miR-603 10116 2607 2613 2303 2309 15 1a 1a 10116 CDC2L6 miR-603 10116 4774 4780 3775 3781 11 1a 1a 10090 10116 CDC2L6 miR-603 9031 3735 3741 751 757 16 m8 m8 9031 CDC2L6 miR-603 9606 1017 1024 928 934 12 8mer x 8mer+m8 9606 9615 9606 CDC2L6 miR-603 9615 1017 1023 935 941 12 m8 8mer+m8 9606 9615 9606 9615 CDC2L6 miR-603 9615 3947 3962 3316 3322 17 m8 m8 9615 CDC2L6 miR-604 10090 2171 2177 1927 1933 18 1a 1a 10090 CDC2L6 miR-604 9615 4847 4860 4116 4122 19 1a 1a 9615 CDC2L6 miR-605 10090 4313 4319 3441 3447 20 m8 m8 10090 CDC2L6 miR-605 10090 4893 4899 3912 3918 21 1a 1a 10090 CDC2L6 miR-605 9031 411 417 371 377 22 m8 m8 9031 CDC2L6 miR-605 9606 2769 2775 2530 2536 23 m8 x m8 9606 CDC2L6 miR-606 9606 2286 2294 2119 2125 24 1a x 1a 9606 CDC2L6 miR-607 10090 2414 2421 2146 2152 25 8mer 8mer+1a 10090 9606 9615 10090 9615 CDC2L6 miR-607 10090 3800 3806 3074 3080 26 1a 1a 10090 9606 CDC2L6 miR-607 9606 2415 2421 2230 2236 25 1a x 8mer+1a 10090 9606 9615 10090 9606 9615 CDC2L6 miR-607 9606 3399 3406 3151 3157 27 1a x 1a 9606 CDC2L6 miR-607 9606 3800 3806 3490 3496 26 1a x 1a 10090 9606 CDC2L6 miR-607 9615 2414 2421 2236 2242 25 8mer 8mer+1a 10090 9606 9615 10090 9615 CDC2L6 miR-608 9606 4800 4807 4387 4393 28 1a x 1a 9606 CDC2L6 miR-609 9606 3471 3478 3217 3223 29 8mer x 8mer 9606 CDC2L6 miR-609 9615 241 247 189 195 30 m8 m8 9615 FNDC3A let-7/98 10090 2329 2335 2024 2030 31 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 10090 560 566 505 511 32 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 10116 2329 2335 1984 1990 31 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 10116 560 566 485 491 32 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 9031 2329 2335 1960 1966 31 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 9031 560 566 437 443 32 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 9606 2329 2335 2002 2008 31 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 9606 560 566 465 471 32 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 9615 2329 2335 2042 2048 31 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A let-7/98 9615 560 566 493 499 32 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A miR-1/206 10090 2344 2351 2039 2045 33 8mer x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 10090 10116 9606 9615 FNDC3A miR-1/206 10116 2344 2351 1999 2005 33 8mer x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 10090 10116 9606 9615 FNDC3A miR-1/206 9031 2344 2350 1975 1981 33 m8 x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A miR-1/206 9606 2344 2351 2017 2023 33 8mer x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 10090 10116 9606 9615 FNDC3A miR-1/206 9615 2344 2351 2057 2063 33 8mer x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 10090 10116 9606 9615 FNDC3A miR-101 10090 2338 2344 2033 2039 34 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A miR-101 10116 2338 2344 1993 1999 34 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A miR-101 9031 1369 1375 1032 1038 36 1a x 1a 9031 FNDC3A miR-101 9031 1972 1979 1621 1627 35 8mer x 8mer+1a 9031 9606 9031 FNDC3A miR-101 9031 2338 2344 1969 1975 34 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A miR-101 9606 1973 1979 1655 1661 35 1a x 8mer+1a 9031 9606 9031 9606 FNDC3A miR-101 9606 2338 2344 2011 2017 34 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A miR-101 9615 22 30 21 27 37 1a x 1a 9615 FNDC3A miR-101 9615 2338 2344 2051 2057 34 1a x 1a 10090 10116 9031 9606 9615 FNDC3A miR-18 10090 2399 2405 2091 2097 38 1a x 1a 10090 10116 9606 FNDC3A miR-18 10116 2399 2405 2051 2057 38 1a x 1a 10090 10116 9606 FNDC3A miR-18 9606 2399 2405 2071 2077 38 1a x 1a 10090 10116 9606 FNDC3A miR-18 9615 179 188 163 169 39 8mer x 8mer 9615 FNDC3A miR-603 10090 1011 1017 870 876 40 1a 1a 10090 FNDC3A miR-603 10090 1035 1049 888 894 41 1a 1a 10090 FNDC3A miR-605 10090 594 601 539 545 42 m8 m8+1a 10090 10116 9031 10090 10116 FNDC3A miR-605 10090 870 876 766 772 43 m8 m8 10090 10116 FNDC3A miR-605 10116 594 601 519 525 42 m8 m8+1a 10090 10116 9031 10090 10116 FNDC3A miR-605 10116 870 876 731 737 43 m8 m8 10090 10116 FNDC3A miR-605 9031 595 601 472 478 42 1a m8+1a 10090 10116 9031 9031 FNDC3A miR-606 9031 1394 1400 1057 1063 44 1a 1a 9031 FNDC3A miR-607 10090 2649 2655 2318 2324 47 m8 m8 10090 FNDC3A miR-607 10116 943 950 768 774 48 8mer 8mer 10116 FNDC3A miR-607 9031 1568 1574 1227 1233 49 1a 1a 9031 FNDC3A miR-607 9606 1640 1646 1384 1390 45 m8 x m8 9606 9615 FNDC3A miR-607 9606 1730 1744 1466 1472 46 1a x 1a 9606 9615 FNDC3A miR-607 9615 1640 1646 1425 1431 45 m8 m8 9606 9615 FNDC3A miR-607 9615 1730 1744 1510 1516 46 1a 1a 9606 9615 FNDC3A miR-608 10116 288 302 263 269 50 m8 m8 10116 FNDC3A miR-608 10116 303 314 270 276 51 8mer 8mer 10116 FNDC3A miR-609 9615 1119 1125 941 947 52 1a 1a 9615 LIN28B let-7/98 10090 2922 2928 2362 2368 53 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10090 3117 3123 2534 2540 54 m8 x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10090 45 52 36 42 55 8mer x 8mer 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10090 4740 4746 3950 3956 56 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10090 4937 4943 4140 4146 57 1a x 1a 10090 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10116 2922 2928 2258 2264 53 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10116 3117 3123 2403 2409 54 m8 x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10116 45 52 35 41 55 8mer x 8mer 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 10116 4740 4746 3816 3822 56 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9031 2922 2928 2255 2261 53 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9031 3117 3124 2420 2426 54 8mer x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9031 45 52 45 51 55 8mer x 8mer 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9031 4740 4746 3874 3880 56 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9031 4937 4943 4064 4070 57 1a x 1a 10090 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9606 2922 2928 2471 2477 53 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9606 3117 3124 2653 2659 54 8mer x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9606 45 52 44 50 55 8mer x 8mer 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9606 4740 4746 4092 4098 56 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9606 4937 4943 4277 4283 57 1a x 1a 10090 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9615 2922 2928 2499 2505 53 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9615 3117 3124 2671 2677 54 8mer x 8mer+m8 10090 10116 9031 9606 9615 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9615 45 52 45 51 55 8mer x 8mer 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9615 4740 4746 4132 4138 56 m8 x m8 10090 10116 9031 9606 9615 LIN28B let-7/98 9615 4937 4943 4323 4329 57 1a x 1a 10090 9031 9606 9615 LIN28B miR-1/206 10090 3579 3585 2943 2949 58 1a x 1a 10090 LIN28B miR-1/206 10090 5061 5067 4252 4258 59 1a x 1a 10090 LIN28B miR-1/206 9615 2495 2501 2140 2146 60 m8 x m8 9615 LIN28B miR-101 10116 1456 1462 1105 1111 62 1a x 1a 10116 LIN28B miR-101 10116 3538 3544 2780 2786 63 1a x 1a 10116 LIN28B miR-101 10116 4651 4657 3737 3743 61 m8 x 8mer+m8 10116 9606 9615 10116 9606 9606 9615 9615 LIN28B miR-101 9031 2017 2023 1522 1528 64 m8 x m8 9031 LIN28B miR-101 9606 4642 4653 4004 4010 61 8mer x 8mer+m8 10116 9606 9615 9606 9615 LIN28B miR-101 9606 4651 4657 4009 4015 61 m8 x 8mer+m8 10116 9606 9615 10116 9606 9606 9615 9615 LIN28B miR-101 9615 4642 4653 4047 4053 61 8mer x 8mer+m8 10116 9606 9615 9606 9615 LIN28B miR-101 9615 4651 4657 4052 4058 61 m8 x 8mer+m8 10116 9606 9615 10116 9606 9606 9615 9615 LIN28B miR-101 9615 5086 5092 4452 4458 65 m8 x m8 9615 LIN28B miR-18 9606 2456 2462 2081 2087 66 1a x 1a 9606 LIN28B miR-602 10116 3234 3240 2515 2521 67 m8 m8 10116 LIN28B miR-603 10090 377 383 307 313 68 1a 1a 10090 10116 9615 LIN28B miR-603 10090 4366 4372 3628 3634 69 m8 8mer+m8 10090 9615 10090 9615 LIN28B miR-603 10090 4807 4813 4012 4018 70 m8 m8 10090 10116 LIN28B miR-603 10116 381 389 282 288 68 1a 1a 10090 10116 9615 LIN28B miR-603 10116 4807 4813 3876 3882 70 m8 m8 10090 10116 LIN28B miR-603 9606 301 307 257 263 71 1a x 1a 9606 9615 LIN28B miR-603 9615 303 309 296 302 71 1a 1a 9606 9615 LIN28B miR-603 9615 379 385 362 368 68 1a 1a 10090 10116 9615 LIN28B miR-603 9615 4366 4373 3804 3810 69 8mer 8mer+m8 10090 9615 9615 LIN28B miR-604 9031 1947 1953 1453 1459 72 1a 1a 9031 LIN28B miR-605 9031 1172 1178 887 893 74 m8 m8 9031 LIN28B miR-605 9606 96 102 95 101 73 m8 x m8 9606 9615 LIN28B miR-605 9615 96 102 95 101 73 m8 m8 9606 9615 LIN28B miR-607 10090 1743 1749 1447 1453 77 1a 1a 10090 LIN28B miR-607 10116 4433 4439 3551 3557 78 1a 1a 10116 LIN28B miR-607 10116 4907 4913 3973 3979 79 1a 1a 10116 LIN28B miR-607 9031 1109 1115 842 848 80 m8 m8 9031 LIN28B miR-607 9031 2599 2605 1984 1990 75 1a 8mer+1a 9031 9606 9031 9606 LIN28B miR-607 9031 3277 3284 2571 2577 81 8mer 8mer 9031 LIN28B miR-607 9606 2430 2436 2055 2061 76 1a x 1a 9606 9615 LIN28B miR-607 9606 2598 2605 2209 2215 75 8mer x 8mer+1a 9031 9606 9606 LIN28B miR-607 9615 2430 2436 2075 2081 76 1a 1a 9606 9615 LIN28B miR-607 9615 459 465 429 435 82 m8 m8 9615 LIN28B miR-608 9031 738 744 494 500 83 m8 m8 9031 LIN28B miR-608 9031 746 752 502 508 84 m8 m8 9031 LIN28B miR-608 9615 752 758 677 683 85 m8 m8 9615 LPHN1 let-7/98 10090 1321 1329 1189 1195 86 1a x 1a 10090 10116 9615 LPHN1 let-7/98 10116 1321 1329 1169 1175 86 1a x 1a 10090 10116 9615 LPHN1 let-7/98 9615 1321 1329 1240 1246 86 1a x 1a 10090 10116 9615 LPHN1 miR-10 10090 191 197 177 183 87 m8 x m8 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-10 10116 191 197 177 183 87 m8 x m8 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-10 10116 513 519 440 446 88 m8 x m8 10116 LPHN1 miR-10 9606 191 197 190 196 87 m8 x m8 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-10 9615 191 197 187 193 87 m8 x m8 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-601 9615 2408 2464 2244 2250 89 8mer 8mer 9615 LPHN1 miR-602 9606 1126 1134 1061 1067 90 1a x 1a 9606 LPHN1 miR-602 9606 2207 2214 2096 2102 91 8mer x 8mer 9606 LPHN1 miR-603 10090 379 385 335 341 92 1a 1a 10090 LPHN1 miR-603 10116 1128 1138 1003 1009 93 1a 1a 10116 LPHN1 miR-603 10116 2370 2376 2006 2012 94 m8 m8 10116 LPHN1 miR-604 10090 1111 1117 1006 1012 95 1a 1a 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-604 10116 1111 1117 987 993 95 1a 1a 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-604 10116 1163 1170 1027 1033 96 1a 1a 10116 LPHN1 miR-604 9606 1111 1117 1046 1052 95 1a x 1a 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-604 9606 454 462 437 443 97 8mer x 8mer 9606 LPHN1 miR-604 9615 1111 1117 1037 1043 95 1a 1a 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-604 9615 2534 2540 2273 2279 98 1a 1a 9615 LPHN1 miR-608 10090 2967 2974 2422 2428 99 8mer 8mer+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-608 10116 2967 2974 2287 2293 99 8mer 8mer+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-608 9606 2967 2974 2697 2703 99 8mer x 8mer+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-608 9615 1828 1835 1709 1715 100 8mer 8mer 9615 LPHN1 miR-608 9615 2910 2917 2616 2622 101 8mer 8mer 9615 LPHN1 miR-608 9615 2962 2969 2668 2674 99 1a 8mer+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 9615 9615 LPHN1 miR-608 9615 2966 2974 2672 2678 99 8mer 8mer+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-609 10090 1403 1409 1260 1266 102 1a 1a 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-609 10116 1403 1409 1234 1240 102 1a 1a 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-609 9606 1403 1409 1314 1320 102 1a x 1a 10090 10116 9606 9615 LPHN1 miR-609 9606 1712 1718 1612 1618 103 1a x 1a 9606 LPHN1 miR-609 9615 1403 1409 1314 1320 102 1a 1a 10090 10116 9606 9615 NLRP1 miR-10 9606 406 412 359 365 104 m8 x m8 9606 NLRP1 miR-604 10090 315 321 248 254 105 1a m8+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 NLRP1 miR-604 10116 315 321 182 188 105 1a m8+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 NLRP1 miR-604 9606 315 321 274 280 105 1a x m8+1a 10090 10116 9606 9615 10090 10116 9606 NLRP1 miR-604 9615 314 320 275 281 105 m8 m8+1a 10090 10116 9606 9615 9615 ZNF197 miR-101 9606 1491 1497 1411 1417 106 1a x 1a 9606 ZNF197 miR-603 9606 1667 1674 1583 1589 107 m8 x m8 9606 ZNF197 miR-605 9606 605 611 565 571 108 m8 x m8 9606 ZNF197 miR-607 9606 1682 1689 1597 1603 109 8mer x 8mer 9606 ZNF197 miR-607 9606 1731 1737 1642 1648 110 m8 x m8 9606 ZNF197 miR-607 9615 1840 1847 1635 1641 111 m8 m8 9615