Index of /kundaje/marinovg/oak/various/papers/2023_ZNFs/2023-09-01-final-figures/motif-alignments-all-vs-all/SP5
Name
Last modified
Size
Description
Parent Directory
-
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.CWM.alignment
2025-05-13 23:49
707
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.CWM.png
2025-05-13 23:49
39K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.PWM.alignment
2025-05-14 00:28
699
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.PWM.png
2025-05-14 00:28
35K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:13
496
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:13
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:09
508
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_0.n_9417.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:09
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.CWM.alignment
2025-05-13 23:28
709
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.CWM.png
2025-05-13 23:28
37K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.PWM.alignment
2025-05-14 01:23
698
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.PWM.png
2025-05-14 01:23
29K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:10
495
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:10
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 20:55
530
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_1.n_2222.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 20:56
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.CWM.alignment
2025-05-13 23:38
710
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.CWM.png
2025-05-13 23:38
38K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.PWM.alignment
2025-05-14 00:27
700
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.PWM.png
2025-05-14 00:27
30K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:12
519
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:12
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:07
534
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_2.n_1768.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:07
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.CWM.alignment
2025-05-13 22:56
709
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.CWM.png
2025-05-13 22:56
43K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.PWM.alignment
2025-05-14 00:40
701
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.PWM.png
2025-05-14 00:40
32K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:13
496
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:13
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:20
499
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_3.n_1325.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:20
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.CWM.alignment
2025-05-13 23:09
707
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.CWM.png
2025-05-13 23:09
37K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.PWM.alignment
2025-05-14 00:54
720
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.PWM.png
2025-05-14 00:54
26K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:15
507
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:15
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:32
508
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_4.n_1184.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:32
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.CWM.alignment
2025-05-13 23:25
711
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.CWM.png
2025-05-13 23:25
42K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.PWM.alignment
2025-05-14 01:09
697
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.PWM.png
2025-05-14 01:09
31K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:21
475
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:21
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:42
496
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_5.n_984.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:42
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.CWM.alignment
2025-05-13 23:37
707
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.CWM.png
2025-05-13 23:37
41K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.PWM.alignment
2025-05-14 01:22
697
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.PWM.png
2025-05-14 01:22
30K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:32
476
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:32
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 20:57
520
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_6.n_618.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 20:58
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.CWM.alignment
2025-05-13 23:47
708
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.CWM.png
2025-05-13 23:47
54K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.PWM.alignment
2025-05-14 00:30
697
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.PWM.png
2025-05-14 00:30
44K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:43
686
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:43
32K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:10
707
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_7.n_601.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:10
44K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.CWM.alignment
2025-05-13 22:56
710
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.CWM.png
2025-05-13 22:56
42K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.PWM.alignment
2025-05-14 00:46
699
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.PWM.png
2025-05-14 00:46
32K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:55
507
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:55
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:24
529
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_8.n_473.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:24
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.CWM.alignment
2025-05-13 23:08
710
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.CWM.png
2025-05-13 23:08
41K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.PWM.alignment
2025-05-14 01:02
699
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.PWM.png
2025-05-14 01:02
31K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 23:08
504
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 23:08
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:37
517
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_9.n_392.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:37
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.CWM.alignment
2025-05-13 22:58
707
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.CWM.png
2025-05-13 22:58
41K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.PWM.alignment
2025-05-14 00:41
700
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.PWM.png
2025-05-14 00:41
30K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:15
487
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:15
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:20
488
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_10.n_289.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:20
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.CWM.alignment
2025-05-13 23:10
711
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.CWM.png
2025-05-13 23:10
47K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.PWM.alignment
2025-05-14 00:55
701
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.PWM.png
2025-05-14 00:55
33K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:15
478
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:15
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:33
492
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_11.n_187.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:33
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.CWM.alignment
2025-05-13 23:25
710
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.CWM.png
2025-05-13 23:25
45K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.PWM.alignment
2025-05-14 01:10
701
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.PWM.png
2025-05-14 01:11
33K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:08
488
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:08
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:44
478
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_12.n_150.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:44
0
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.CWM.alignment
2025-05-13 23:38
714
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.CWM.png
2025-05-13 23:38
29K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.PWM.alignment
2025-05-14 01:22
698
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.PWM.png
2025-05-14 01:23
26K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:10
631
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:10
20K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 20:56
643
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_13.n_146.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 20:56
20K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.CWM.alignment
2025-05-13 23:50
709
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.CWM.png
2025-05-13 23:50
42K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.PWM.alignment
2025-05-14 00:28
696
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.PWM.png
2025-05-14 00:28
34K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:11
540
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:11
25K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:08
552
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_14.n_138.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:08
26K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.CWM.alignment
2025-05-13 22:56
706
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.CWM.png
2025-05-13 22:56
38K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.PWM.alignment
2025-05-14 00:43
700
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.PWM.png
2025-05-14 00:43
41K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:13
705
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:13
40K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:21
705
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_15.n_60.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:21
40K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.CWM.alignment
2025-05-13 23:07
708
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.CWM.png
2025-05-13 23:07
43K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.PWM.alignment
2025-05-14 00:56
700
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.PWM.png
2025-05-14 00:56
36K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:14
581
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:14
26K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:35
604
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_16.n_26.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:35
27K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.CWM.alignment
2025-05-13 23:17
711
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.CWM.png
2025-05-13 23:17
36K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.PWM.alignment
2025-05-14 01:11
706
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.PWM.png
2025-05-14 01:11
43K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.PWM.trim_0.5.alignment
2025-05-13 22:08
704
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.PWM.trim_0.5.png
2025-05-13 22:08
44K
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.PWM.trim_0.25.alignment
2025-05-13 21:46
705
SP5-201-vs-SP5-HepG2-ENCSR019NPF.bestfold.profile.pattern_17.n_23.PWM.trim_0.25.png
2025-05-13 21:46
44K
Apache/2.4.66 (Ubuntu) Server at mitra.stanford.edu Port 443