608	2761	34	6	27	chr3	3017261	3017595	-156582188	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	9
608	14259	71	10	7	chr3	3017597	3019433	-156580350	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	4639	9
608	1775	93	13	0	chr3	3019413	3019650	-156580133	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2258	1
608	4963	95	66	54	chr3	3019713	3020856	-156578927	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5487	994	9	9
608	2721	37	6	27	chr3	3020857	3021191	-156578592	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	9
608	1046	224	33	4	chr3	3038611	3038853	-156560930	+	MTD	LTR	MaLR	3	251	-168	2
608	1413	189	67	10	chr3	3039678	3039883	-156559900	-	MT2B	LTR	ERVL	-44	557	286	2
608	1413	235	90	101	chr3	3039918	3040145	-156559638	-	MT2B	LTR	ERVL	-244	357	25	2
608	327	283	17	102	chr3	3040287	3040332	-156559451	-	MTE2a	LTR	MaLR	-200	179	135	3
608	327	283	17	102	chr3	3040500	3040569	-156559214	-	MTE2a	LTR	MaLR	-245	134	72	3
608	1341	185	43	34	chr3	3041147	3041471	-156558312	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	3
608	332	257	37	68	chr3	3041755	3041918	-156557865	+	RLTR43A	LTR	ERVK	201	358	-6	3
608	1681	164	147	16	chr3	3042612	3042979	-156556804	+	RMER16-int	LTR	ERVK	256	670	-4736	3
608	739	176	40	0	chr3	3046763	3046911	-156552872	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1090	1243	-4163	3
608	889	203	22	0	chr3	3046927	3047109	-156552674	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5302	5487	-1919	3
608	1353	213	34	78	chr3	3047152	3047581	-156552202	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2339	2694	-4712	4
608	380	186	0	0	chr3	3048247	3048306	-156551477	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1575	1633	-3773	3
608	2353	198	41	17	chr3	3048309	3048886	-156550897	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2326	2839	-2567	3
608	269	288	9	0	chr3	3048901	3049012	-156550771	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3061	3172	-4081	3
608	968	237	144	15	chr3	3049461	3049795	-156549988	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	377	-2	4
608	2437	132	28	8	chr3	3055269	3055657	-156544126	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
608	2201	190	82	7	chr3	3057015	3057454	-156542329	+	RMER17B	LTR	ERVK	487	958	0	4
608	260	325	0	12	chr3	3057784	3057865	-156541918	+	MTE2b	LTR	MaLR	9	88	-291	4
608	1426	148	121	73	chr3	3057917	3058231	-156541552	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
608	1715	200	16	66	chr3	3058373	3058737	-156541046	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	5
608	1246	232	138	9	chr3	3059601	3060057	-156539726	-	RLTR21	LTR	ERVK	-321	1251	737	5
608	1168	219	20	16	chr3	3060306	3060561	-156539222	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1316	256	1	5
608	4606	80	26	2	chr3	3062611	3063184	-156536599	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	5
608	2883	130	52	33	chr3	3063184	3063947	-156535836	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1	1054	-3636	5
608	33648	69	20	0	chr3	3063945	3068176	-156531607	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-1306	6374	2061	5
608	7000	113	15	8	chr3	3068182	3069211	-156530572	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-413	1057	22	5
608	2871	69	0	0	chr3	3069211	3069543	-156530240	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	5
608	381	211	55	31	chr3	3070874	3071001	-156528782	-	RLTR43A	LTR	ERVK	-34	330	201	6
608	1701	166	40	31	chr3	3071272	3071596	-156528187	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	3	6
608	1642	192	71	32	chr3	3072595	3073049	-156526734	+	MT2B	LTR	ERVL	25	562	-39	6
608	1143	219	34	4	chr3	3073874	3074112	-156525671	-	MTD	LTR	MaLR	-174	245	1	6
608	1206	265	226	24	chr3	3080143	3080992	-156518791	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1021	-551	7
608	3156	32	0	3	chr3	3095371	3095718	-156504065	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	7
608	1274	235	93	9	chr3	3097837	3098181	-156501602	-	RLTR30	LTR	ERV1	-6	373	1	7
608	225	281	52	17	chr3	3101166	3101224	-156498559	+	RMER10B	LTR	ERVL	99	158	-240	8
608	2847	66	0	0	chr3	3102148	3102480	-156497303	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	8
608	21276	92	9	3	chr3	3102480	3105327	-156494456	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1	2864	-4816	8
608	32124	65	14	2	chr3	3105353	3109635	-156490148	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	3345	7680	0	8
608	2742	93	0	0	chr3	3109635	3109967	-156489816	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	8
608	7462	74	11	0	chr3	3114113	3115156	-156484627	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	-736	1056	2	8
608	2545	58	61	0	chr3	3115157	3115483	-156484300	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	8
608	335	309	65	14	chr3	3115511	3115649	-156484134	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	524	668	-5469	9
608	3579	197	18	75	chr3	3115655	3115822	-156483961	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1727	1887	-5519	9
608	3579	197	18	75	chr3	3116007	3116763	-156483020	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1888	2598	-4808	9
608	2223	194	62	24	chr3	3117747	3118324	-156481459	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3299	3897	-3509	9
608	1774	279	25	15	chr3	3118346	3119040	-156480743	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4083	4523	-2883	9
608	1457	215	49	14	chr3	3119109	3119458	-156480325	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5121	5481	-1925	9
608	529	198	0	0	chr3	3119558	3119649	-156480134	+	ORR1A1	LTR	MaLR	143	233	-113	9
608	451	152	0	0	chr3	3121327	3121406	-156478377	+	ORR1A1	LTR	MaLR	268	346	0	9
608	1183	250	96	0	chr3	3126616	3126960	-156472823	+	RLTR30	LTR	ERV1	2	378	-1	1
608	2546	112	28	15	chr3	3132477	3132868	-156466915	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
608	2056	196	87	2	chr3	3134231	3134666	-156465117	+	RMER17B	LTR	ERVK	487	958	0	1
608	259	251	0	31	chr3	3134994	3135068	-156464715	+	MTE2a	LTR	MaLR	13	84	-295	1
608	1394	149	103	78	chr3	3135125	3135446	-156464337	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
608	1589	201	22	69	chr3	3135588	3135951	-156463832	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	1
608	1180	229	29	4	chr3	3137066	3137311	-156462472	+	MTD	LTR	MaLR	1	251	-168	1
608	230	154	0	0	chr3	3137407	3137446	-156462337	+	MTD	LTR	MaLR	381	419	0	1
608	1519	168	70	10	chr3	3138135	3138338	-156461445	-	MT2B	LTR	ERVL	-44	557	286	1
608	1519	213	92	104	chr3	3138365	3138592	-156461191	-	MT2B	LTR	ERVL	-244	357	25	1
608	320	220	20	108	chr3	3138635	3138737	-156461046	-	MT2B	LTR	ERVL	-346	255	163	1
608	1515	167	46	34	chr3	3139578	3139901	-156459882	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	1
608	432	256	31	43	chr3	3140185	3140348	-156459435	+	RLTR43A	LTR	ERVK	201	361	-3	1
608	1756	188	149	38	chr3	3141074	3141578	-156458205	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	256	815	-4591	1
608	566	230	18	18	chr3	3141588	3141752	-156458031	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1090	1253	-4153	1
608	3641	191	17	63	chr3	3141949	3142794	-156456989	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1889	2694	-4712	1
608	307	193	0	0	chr3	3143465	3143528	-156456255	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1580	1633	-3773	1
608	2214	205	56	21	chr3	3143529	3144099	-156455684	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3299	3879	-3527	1
608	2057	259	27	18	chr3	3144129	3144834	-156454949	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4083	4533	-2873	1
608	1504	243	0	14	chr3	3144894	3145261	-156454522	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5121	5482	-1924	1
608	592	99	0	0	chr3	3145366	3145447	-156454336	+	ORR1A1	LTR	MaLR	143	223	-123	1
609	490	140	0	23	chr3	3146999	3147087	-156452696	+	ORR1A1	LTR	MaLR	261	346	0	1
609	269	208	65	65	chr3	3147707	3147784	-156451999	-	MT2B	LTR	ERVL	-350	251	175	1
609	2407	122	28	10	chr3	3150935	3151324	-156448459	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
609	359	290	11	0	chr3	3153750	3153843	-156445940	-	RMER15	LTR	ERVL	-86	489	396	1
609	3909	213	46	53	chr3	3154188	3155142	-156444641	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	947	-11	1
609	229	391	78	21	chr3	3155261	3155454	-156444329	-	MLT1K	LTR	MaLR	-255	340	137	1
609	1479	145	100	72	chr3	3155615	3155935	-156443848	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
609	1733	181	16	71	chr3	3156077	3156445	-156443338	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	39	1
609	931	270	120	54	chr3	3156898	3157246	-156442537	-	RLTR21	LTR	ERVK	-241	1331	1028	1
609	931	260	145	42	chr3	3157300	3157672	-156442111	-	RLTR21	LTR	ERVK	-403	1169	737	1
609	1225	228	16	12	chr3	3157913	3158170	-156441613	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1314	258	1	1
609	1105	228	34	4	chr3	3164144	3164382	-156435401	+	MTD	LTR	MaLR	1	245	-174	1
609	1531	179	71	10	chr3	3165214	3165418	-156434365	-	MT2B	LTR	ERVL	-44	557	286	1
609	1531	210	91	99	chr3	3165441	3165668	-156434115	-	MT2B	LTR	ERVL	-244	357	25	1
609	232	261	44	44	chr3	3166029	3166097	-156433686	-	MTE2a	LTR	MaLR	-240	139	72	1
609	1552	154	47	31	chr3	3166670	3166992	-156432791	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	1
609	304	315	0	53	chr3	3167403	3167517	-156432266	+	RLTR43A	LTR	ERVK	257	364	0	1
609	1860	178	120	18	chr3	3168211	3168728	-156431055	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	192	674	-5463	1
609	822	166	26	7	chr3	3168727	3168879	-156430904	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1090	1244	-4162	1
609	3383	209	43	68	chr3	3169025	3169836	-156429947	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1890	2679	-4727	1
609	3383	209	43	68	chr3	3170465	3170534	-156429249	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2680	2748	-4658	1
609	991	188	36	0	chr3	3170582	3170774	-156429009	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3304	3502	-3904	1
609	4218	196	44	58	chr3	3171651	3172622	-156427161	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	1
609	261	258	0	15	chr3	3172945	3173012	-156426771	+	ORR1B1	LTR	MaLR	9	74	-305	1
609	1454	172	103	72	chr3	3173074	3173393	-156426390	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
609	1597	189	36	72	chr3	3173535	3173895	-156425888	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	40	1
609	1266	224	12	8	chr3	3174921	3175178	-156424605	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	258	-1314	2
609	1085	254	147	29	chr3	3175412	3175928	-156423855	+	RLTR21	LTR	ERVK	729	1305	-267	2
609	1546	216	16	71	chr3	3176574	3176942	-156422841	+	ORR1B1	LTR	MaLR	39	386	-8	1
609	1394	164	93	77	chr3	3177084	3177132	-156422651	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	282	2
609	2640	95	19	182	chr3	3177132	3177699	-156422084	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
609	1394	164	93	77	chr3	3177699	3177974	-156421809	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-48	281	1	2
609	3957	171	64	24	chr3	3178438	3178490	-156421293	-	RMER17B	LTR	ERVK	-11	947	853	2
609	3554	48	0	0	chr3	3178490	3178886	-156420897	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
609	3957	178	70	37	chr3	3178886	3179756	-156420027	-	RMER17B	LTR	ERVK	-58	900	1	2
609	342	301	11	0	chr3	3180100	3180193	-156419590	+	RMER15	LTR	ERVL	396	489	-86	2
609	1094	157	56	43	chr3	3188505	3188738	-156411045	+	ORR1A4	LTR	MaLR	5	240	-89	2
609	450	265	31	54	chr3	3188860	3189047	-156410736	+	RLTR43A	LTR	ERVK	201	364	0	2
609	2013	184	151	34	chr3	3189721	3190226	-156409557	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	256	819	-4587	2
609	2554	210	39	27	chr3	3190234	3190400	-156409383	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1727	1891	-5515	2
609	2554	210	39	27	chr3	3190536	3190967	-156408816	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1892	2331	-5075	2
609	3716	194	25	66	chr3	3191172	3192011	-156407772	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1890	2694	-4712	2
609	331	220	0	0	chr3	3192681	3192740	-156407043	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1575	1633	-3773	2
609	2590	214	12	22	chr3	3192738	3193331	-156406452	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2253	2839	-2567	2
609	2223	254	28	16	chr3	3193356	3194064	-156405719	+	RMER16-int	LTR	ERVK	4083	4533	-2873	2
609	953	248	0	18	chr3	3194118	3194336	-156405447	+	RMER16-int	LTR	ERVK	5121	5334	-2072	2
609	680	180	37	80	chr3	3194333	3194474	-156405309	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3267	3407	-3837	2
609	680	180	37	80	chr3	3194657	3194678	-156405105	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3408	3422	-3822	2
609	2036	248	34	13	chr3	3194684	3195252	-156404531	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4086	4533	-2873	2
609	1735	228	6	11	chr3	3195307	3195671	-156404112	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5121	5482	-1924	2
609	512	106	0	45	chr3	3195778	3195867	-156403916	+	ORR1A1	LTR	MaLR	143	227	-119	2
609	2588	71	0	0	chr3	3199594	3199932	-156399851	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	338	-8	2
609	997	229	110	130	chr3	3200253	3200654	-156399129	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	2
609	1436	233	92	6	chr3	3202451	3202800	-156396983	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	379	0	2
609	1029	254	29	4	chr3	3207522	3207767	-156392016	+	MTD	LTR	MaLR	1	251	-168	2
609	226	154	0	0	chr3	3207858	3207897	-156391886	+	MTD	LTR	MaLR	381	419	0	2
609	1644	198	255	7	chr3	3208591	3208791	-156390992	-	MT2B	LTR	ERVL	-44	557	342	2
609	1644	198	255	7	chr3	3208817	3209048	-156390735	-	MT2B	LTR	ERVL	-260	341	20	2
609	308	273	28	142	chr3	3209171	3209232	-156390551	-	MTE2b	LTR	MaLR	-183	196	135	2
609	308	273	28	142	chr3	3209416	3209492	-156390291	-	MTE2b	LTR	MaLR	-245	134	72	2
609	1690	166	40	31	chr3	3210067	3210391	-156389392	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	2
609	485	274	43	25	chr3	3210674	3210835	-156388948	+	RLTR43A	LTR	ERVK	201	364	0	2
609	2136	186	134	35	chr3	3211519	3212033	-156387750	+	RMER16-int	LTR	ERVK	255	819	-4587	2
609	975	173	23	0	chr3	3212039	3212212	-156387571	+	RMER16-int	LTR	ERVK	939	1115	-5022	2
609	1150	243	109	0	chr3	3212219	3212532	-156387251	+	RLTR30	LTR	ERV1	33	379	0	2
609	2623	120	31	10	chr3	3217994	3218382	-156381401	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
609	310	265	33	206	chr3	3220746	3220960	-156378823	-	RMER15	LTR	ERVL	-54	521	345	2
609	4490	176	63	57	chr3	3221186	3222138	-156377645	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	2
609	234	324	0	14	chr3	3222462	3222534	-156377249	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	71	-308	2
609	1605	149	103	72	chr3	3222604	3222923	-156376860	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
609	1798	179	16	68	chr3	3223065	3223430	-156376353	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	2
609	897	235	82	49	chr3	3224131	3224656	-156375127	-	RLTR21	LTR	ERVK	-261	1311	737	2
609	1171	243	12	12	chr3	3224899	3225157	-156374626	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1314	258	1	2
609	1209	222	33	4	chr3	3231101	3231345	-156368438	+	MTD	LTR	MaLR	1	251	-168	2
609	1599	170	6	40	chr3	3232172	3232292	-156367491	-	MT2B	LTR	ERVL	-44	557	449	2
609	2988	39	0	6	chr3	3232292	3232631	-156367152	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	2
609	1599	212	39	69	chr3	3232631	3232931	-156366852	-	MT2B	LTR	ERVL	-153	448	25	2
609	297	298	29	110	chr3	3233057	3233118	-156366665	-	MTE2b	LTR	MaLR	-183	196	135	2
609	297	298	29	110	chr3	3233306	3233380	-156366403	-	MTE2b	LTR	MaLR	-245	134	72	2
609	1627	190	34	25	chr3	3233963	3234287	-156365496	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	2
609	236	245	109	69	chr3	3234359	3234460	-156365323	+	MER90a	LTR	ERV1	40	144	-470	2
609	412	242	25	80	chr3	3234580	3234742	-156365041	+	RLTR43A	LTR	ERVK	212	364	0	2
609	1964	167	184	44	chr3	3241719	3242214	-156357569	+	RMER16-int	LTR	ERVK	256	819	-4587	2
609	713	226	12	6	chr3	3242220	3242380	-156357403	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1090	1250	-4156	2
609	1255	262	7	23	chr3	3245313	3245621	-156354162	-	MTD	LTR	MaLR	-103	316	14	2
609	2994	54	0	0	chr3	3246689	3247021	-156352762	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	2
609	238	256	110	29	chr3	3247778	3247951	-156351832	+	RMER17D	LTR	ERVK	348	534	-355	3
609	1287	159	121	0	chr3	3247946	3248178	-156351605	-	MTC	LTR	MaLR	-161	260	1	3
609	1834	140	256	31	chr3	3255161	3255611	-156344172	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-67	587	37	3
609	65618	36	12	0	chr3	3255724	3263407	-156336376	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	1	3
609	1860	148	247	30	chr3	3263408	3263874	-156335909	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-51	603	37	3
609	545	188	129	1	chr3	3268576	3268702	-156331081	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	167	-401	3
609	365	326	0	0	chr3	3268769	3268861	-156330922	+	RLTR16	LTR	ERVK	414	505	0	3
609	2869	110	27	5	chr3	3275500	3275910	-156323873	-	BGLII	LTR	ERVK	-2	419	1	3
610	321	0	0	0	chr3	3278628	3278666	-156321117	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	3
610	314	139	26	53	chr3	3278666	3278742	-156321041	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	3
610	2891	43	0	20	chr3	3278742	3279062	-156320721	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-114	5371	5058	3
610	6109	76	32	21	chr3	3279062	3279908	-156319875	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	3
610	2891	43	0	20	chr3	3279908	3279944	-156319839	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-428	5057	5022	3
610	6486	55	15	0	chr3	3279939	3280722	-156319061	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-611	4874	4080	3
610	16830	35	20	1	chr3	3280724	3282677	-156317106	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-2446	3039	1050	3
610	8706	48	9	1	chr3	3284356	3285406	-156314377	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4427	1058	1	3
610	3459	57	72	21	chr3	3285406	3285875	-156313908	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	3
610	1328	136	66	0	chr3	3287067	3287310	-156312473	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-68	261	3	3
610	3617	101	81	38	chr3	3294610	3295188	-156304595	-	RLTR1D	LTR	ERV1	0	605	3	3
610	525	165	35	0	chr3	3300695	3300810	-156298973	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	119	-255	3
610	1080	299	64	6	chr3	3301120	3301450	-156298333	+	MER21B	LTR	ERV1	280	628	-235	3
610	282	220	81	41	chr3	3301695	3301818	-156297965	+	MER21B	LTR	ERV1	625	752	-111	3
610	1450	147	96	28	chr3	3305768	3305827	-156293956	-	RMER6C	LTR	ERVK	-8	682	627	3
610	3083	184	22	53	chr3	3305827	3306451	-156293332	+	RLTR1D	LTR	ERV1	1	605	0	3
610	1450	147	96	28	chr3	3306451	3306754	-156293029	-	RMER6C	LTR	ERVK	-64	626	295	3
610	413	288	61	78	chr3	3306875	3307105	-156292678	-	RMER2	LTR	ERV1	-16	551	326	3
610	1423	153	30	19	chr3	3307328	3307595	-156292188	-	RMER6C	LTR	ERVK	-417	273	4	3
610	1679	161	39	101	chr3	3312678	3313092	-156286691	-	RMER10B	LTR	ERVL	-10	388	1	3
610	554	232	12	3	chr3	3313464	3313598	-156286185	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	121	-289	3
610	619	204	102	157	chr3	3319952	3320062	-156279721	+	RMER17C	LTR	ERVK	85	221	-189	3
610	619	204	102	157	chr3	3320085	3320317	-156279466	+	RMER17C	LTR	ERVK	222	408	-2	3
610	2886	16	0	0	chr3	3326677	3326999	-156272784	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
610	43432	15	0	3	chr3	3326999	3331856	-156267927	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	3
610	2890	16	0	0	chr3	3331856	3332178	-156267605	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
610	338	303	31	49	chr3	3332733	3332896	-156266887	-	RNLTR23	LTR	ERVK	0	642	483	3
610	2954	269	64	14	chr3	3333627	3333835	-156265948	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-402	7815	7585	3
610	2954	269	64	14	chr3	3333963	3334603	-156265180	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-633	7584	6941	3
610	2954	269	64	14	chr3	3334631	3334813	-156264970	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-1277	6940	6734	3
610	13864	252	20	14	chr3	3335157	3335371	-156264412	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-1880	6337	6111	3
610	13864	252	20	14	chr3	3335398	3338951	-156260832	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-2107	6110	2547	3
610	3070	69	177	2	chr3	3338951	3339387	-156260396	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	3
610	13864	252	20	14	chr3	3339387	3339413	-156260370	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-5671	2546	2520	3
610	57016	61	8	9	chr3	3339413	3346953	-156252830	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	1	7556	0	3
610	2843	87	170	25	chr3	3346953	3347400	-156252383	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	4
610	2075	290	53	33	chr3	3347420	3348400	-156251383	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-5687	2530	1531	3
610	1451	196	51	97	chr3	3349514	3349926	-156249857	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	4
610	900	315	51	8	chr3	3352483	3352873	-156246910	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4383	4789	-202	4
610	670	269	131	95	chr3	3353718	3354106	-156245677	-	MT2A	LTR	ERVL	-64	537	1	4
610	1548	265	41	57	chr3	3357180	3357672	-156242111	+	RMER19C	LTR	ERVK	126	609	-2	4
610	1563	231	41	9	chr3	3357774	3358115	-156241668	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	41	4
610	1915	178	8	70	chr3	3359670	3359787	-156239996	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-757	346	230	4
610	1915	178	8	70	chr3	3360549	3360800	-156238983	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-874	229	1	4
610	2413	97	97	3	chr3	3363925	3364306	-156235477	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	-3	417	1	4
610	334	113	40	40	chr3	3364307	3364381	-156235402	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2	7404	7331	4
610	814	234	22	28	chr3	3370835	3371218	-156228565	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-981	6425	6096	4
610	4575	186	66	35	chr3	3371223	3372354	-156227429	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1230	4176	3010	4
610	1820	103	41	28	chr3	3378138	3378456	-156221327	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	4
610	2035	218	108	71	chr3	3381509	3382071	-156217712	-	RMER19C	LTR	ERVK	-28	583	1	4
610	558	315	79	85	chr3	3382647	3383001	-156216782	-	MTD	LTR	MaLR	-67	352	1	4
611	1855	106	31	22	chr3	3424247	3424566	-156175217	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
611	17486	161	28	20	chr3	3424566	3431400	-156168383	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1	7234	-172	4
611	1761	119	31	22	chr3	3431400	3431719	-156168064	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
611	975	333	59	18	chr3	3440440	3440896	-156158887	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	49	4
611	3030	73	131	5	chr3	3453481	3453909	-156145874	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	4
611	4316	22	0	0	chr3	3464777	3465270	-156134513	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
611	360	274	143	16	chr3	3466974	3467100	-156132683	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	501	5
611	2198	183	35	47	chr3	3467181	3467668	-156132115	-	RLTR26	LTR	ERVK	-161	481	1	5
611	706	347	84	21	chr3	3468332	3468712	-156131071	-	MER21B	LTR	ERV1	-45	818	415	5
611	236	167	46	77	chr3	3470666	3470731	-156129052	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	5
611	468	354	69	43	chr3	3484516	3484862	-156114921	+	RMER5	LTR	ERV1	123	477	-57	5
611	434	366	29	51	chr3	3490621	3490995	-156108788	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	158	5
611	2294	142	73	23	chr3	3494858	3495192	-156104591	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	341	5
611	2294	113	8	16	chr3	3495366	3495707	-156104076	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-469	340	1	5
611	470	47	0	0	chr3	3499936	3500000	-156099783	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	419	5
611	3478	22	0	0	chr3	3500001	3500418	-156099365	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	-65	417	1	1
611	607	309	112	39	chr3	3522620	3522906	-156076877	-	MLT1B	LTR	MaLR	-58	332	26	4
611	1037	266	53	4	chr3	3530253	3530498	-156069285	+	MTC	LTR	MaLR	150	406	-15	5
612	1805	177	131	5	chr3	3543594	3543968	-156055815	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	7
612	2083	219	86	53	chr3	3543968	3544053	-156055730	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1142	7
612	2083	219	86	53	chr3	3544090	3544554	-156055229	-	MTC-int	LTR	MaLR	-117	1141	692	7
612	630	202	31	8	chr3	3544552	3544682	-156055101	-	MTC	LTR	MaLR	-284	137	5	7
612	944	238	30	82	chr3	3551862	3552132	-156047651	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	100	9
612	679	270	31	11	chr3	3556857	3557048	-156042735	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	311	9
612	476	296	175	16	chr3	3565620	3565809	-156033974	-	RMER15	LTR	ERVL	-87	488	270	1
612	2109	185	84	25	chr3	3583545	3584033	-156015750	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	18	1
612	1553	214	10	31	chr3	3585545	3586006	-156013777	+	RMER17C	LTR	ERVK	15	439	-519	1
612	3196	182	32	19	chr3	3587968	3588555	-156011228	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	98	1
612	2112	126	0	19	chr3	3597684	3598008	-156001775	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	1
612	1181	155	244	8	chr3	3598626	3598892	-156000891	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
612	1815	159	93	48	chr3	3605863	3606030	-155993753	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	213	1
612	1815	159	93	48	chr3	3606524	3606733	-155993050	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-182	212	1	1
612	599	246	29	22	chr3	3621727	3621907	-155977876	-	MTE2a	LTR	MaLR	-6	413	194	2
612	281	351	93	43	chr3	3623946	3624086	-155975697	-	MTE2a	LTR	MaLR	-225	154	8	2
612	1943	219	22	7	chr3	3650018	3650433	-155949350	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
612	370	273	0	0	chr3	3659077	3659165	-155940618	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-19	355	268	2
612	396	351	30	12	chr3	3659200	3659367	-155940416	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-195	170	1	2
612	1572	181	228	17	chr3	3660282	3660637	-155939146	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	2
612	2073	194	122	4	chr3	3666810	3667292	-155932491	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-363	539	1	2
612	1494	157	14	18	chr3	3667304	3667583	-155932200	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	0	5808	5531	2
612	280	113	0	75	chr3	3667598	3667665	-155932118	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1172	6072	6011	2
612	1267	152	18	16	chr3	3667762	3668007	-155931776	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-980	6426	6221	2
612	1751	187	30	95	chr3	3668052	3668674	-155931109	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-1703	3141	2611	2
612	1248	75	17	0	chr3	3668669	3668842	-155930941	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-3509	3897	3722	2
613	1568	164	125	42	chr3	3672084	3672517	-155927266	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-4688	2556	2088	2
613	579	275	114	36	chr3	3672527	3672885	-155926898	-	ETnERV-int	LTR	ERVK	-2927	387	2	2
613	2375	114	61	28	chr3	3672886	3673282	-155926501	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
613	2461	185	25	12	chr3	3674305	3674786	-155924997	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	38	2
613	3833	149	25	62	chr3	3675731	3676722	-155923061	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	983	1	2
613	2710	118	12	2	chr3	3677788	3678205	-155921578	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	2
613	3316	38	5	5	chr3	3678719	3679115	-155920668	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
613	338	106	0	0	chr3	3680511	3680558	-155919225	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-8	370	324	2
613	1745	215	79	26	chr3	3682391	3682912	-155916871	+	RLTR20C	LTR	ERVK	5	532	-2	2
613	8225	22	0	3	chr3	3683197	3684129	-155915654	-	RLTR13B3	LTR	ERVK	0	929	1	2
613	2026	117	3	67	chr3	3687185	3687542	-155912241	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-3	334	1	2
613	55328	11	2	7	chr3	3687542	3694047	-155905736	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	9	2
613	2026	117	3	67	chr3	3694048	3694405	-155905378	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-3	334	1	2
613	1428	221	15	37	chr3	3707431	3707755	-155892028	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-61	317	1	2
613	353	327	40	45	chr3	3741653	3741829	-155857954	+	RMER20A	LTR	ERVK	340	514	-2	3
613	716	184	44	0	chr3	3744212	3744348	-155855435	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	243	3
613	1527	290	101	102	chr3	3744336	3744832	-155854951	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-423	947	422	3
613	1527	290	101	102	chr3	3744978	3745099	-155854684	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-949	421	327	3
613	1527	290	101	102	chr3	3745230	3745501	-155854282	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-1044	326	59	3
613	378	305	13	90	chr3	3745483	3745638	-155854145	+	MTD	LTR	MaLR	241	383	-36	3
613	250	323	78	108	chr3	3745698	3746101	-155853682	-	MLT1C	LTR	MaLR	-13	377	2	3
613	1820	207	61	0	chr3	3746595	3746938	-155852845	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	366	-8	3
613	550	337	35	0	chr3	3759631	3759800	-155839983	-	MTEa	LTR	MaLR	-200	179	5	3
613	605	211	98	0	chr3	3765655	3765778	-155834005	-	MTC	LTR	MaLR	-286	135	1	3
613	1677	244	85	67	chr3	3775690	3776300	-155823483	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	1107	1727	-1	3
613	4094	211	60	3	chr3	3776302	3777161	-155822622	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	3
613	311	306	138	69	chr3	3782823	3783142	-155816641	+	MLT2B5	LTR	ERVL	215	555	-46	3
614	2869	67	33	8	chr3	3801606	3801996	-155797787	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
614	993	215	41	18	chr3	3805807	3806025	-155793758	+	ORR1C2	LTR	MaLR	162	384	0	4
614	255	81	27	0	chr3	3813308	3813345	-155786438	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	38	-358	4
614	930	282	80	17	chr3	3835029	3835328	-155764455	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	325	-54	4
614	308	288	8	99	chr3	3853049	3853105	-155746678	+	RMER15	LTR	ERVL	442	486	-89	4
614	308	288	8	99	chr3	3853128	3853202	-155746581	+	RMER15	LTR	ERVL	487	559	-16	4
614	2316	135	44	50	chr3	3865236	3865712	-155734071	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	473	-2	4
614	5076	61	6	15	chr3	3865712	3866378	-155733405	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	662	-5819	4
614	442	66	0	32	chr3	3866378	3866441	-155733342	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1419	-5062	4
614	1846	111	4	4	chr3	3866430	3866692	-155733091	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2236	2497	-5183	4
614	914	81	24	0	chr3	3866689	3866812	-155732971	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4785	4910	-2770	4
614	20967	15	2	0	chr3	3866814	3869165	-155730618	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4123	6477	-4	4
614	2266	141	44	50	chr3	3869169	3869647	-155730136	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
614	368	127	85	37	chr3	3871814	3871896	-155727887	+	RLTR25B	LTR	ERVK	424	509	-519	4
614	1802	241	80	51	chr3	3892011	3892658	-155707125	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	25	4
614	1742	143	119	35	chr3	3893828	3894205	-155705578	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	5
614	3458	30	0	0	chr3	3897862	3898257	-155701526	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	2	5
614	2387	93	0	0	chr3	3899126	3899437	-155700346	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	5
614	2403	87	0	3	chr3	3900954	3901266	-155698517	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	5
614	2879	25	0	0	chr3	3910275	3910601	-155689182	-	IAPLTR3	LTR	ERVK	0	326	1	5
614	12206	26	16	0	chr3	3910601	3912075	-155687708	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-20	6801	5304	5
614	10924	53	9	40	chr3	3912073	3913592	-155686191	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-5349	1472	1	5
614	2929	15	0	0	chr3	3913592	3913918	-155685865	-	IAPLTR3	LTR	ERVK	0	326	1	5
614	1415	215	109	43	chr3	3919352	3919735	-155680048	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	148	528	-32	5
614	4473	134	74	7	chr3	3919957	3920715	-155679068	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	5
615	2687	82	13	13	chr3	3936605	3936987	-155662796	+	MTB	LTR	MaLR	1	382	-18	5
615	4089	40	2	0	chr3	3937531	3938012	-155661771	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	5
615	777	216	7	0	chr3	3938896	3939049	-155660734	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	525	5
615	382	257	29	0	chr3	3940169	3940274	-155659509	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-218	108	1	5
615	767	144	119	0	chr3	3942043	3942202	-155657581	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	150	5
615	1904	268	59	12	chr3	3942202	3942621	-155657162	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	432	-102	5
615	1904	268	59	12	chr3	3942717	3942807	-155656976	+	RLTR20C	LTR	ERVK	433	533	-1	5
615	730	247	0	6	chr3	3942807	3942982	-155656801	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-172	174	1	5
615	802	289	75	97	chr3	3943097	3943457	-155656326	+	MTE2b	LTR	MaLR	24	375	-4	5
615	725	299	14	19	chr3	3943516	3943731	-155656052	+	MTE-int	LTR	MaLR	236	449	-1131	5
615	530	353	39	10	chr3	3943732	3943938	-155655845	+	MTEa	LTR	MaLR	168	379	0	5
615	257	345	108	8	chr3	3947416	3947536	-155652247	+	LTR33	LTR	ERVL	47	178	-337	5
615	675	156	7	133	chr3	3954964	3955114	-155644669	+	ORR1A2	LTR	MaLR	21	170	-176	5
615	603	280	17	17	chr3	3955161	3955188	-155644595	+	ORR1A2	LTR	MaLR	171	198	-148	5
615	656	338	159	69	chr3	3955471	3956036	-155643747	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-34	620	5	5
615	1018	216	47	17	chr3	3960793	3961028	-155638755	+	MTD	LTR	MaLR	170	411	-8	5
615	2761	92	35	8	chr3	3961123	3961519	-155638264	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-2	407	1	5
615	413	118	25	50	chr3	3961519	3961599	-155638184	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	0	7406	7329	5
615	16124	108	19	30	chr3	3961805	3962187	-155637596	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	6103	5
615	2726	68	143	139	chr3	3962187	3962697	-155637086	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	5
615	16124	108	19	30	chr3	3962697	3964305	-155635478	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1304	6102	4480	5
615	16124	159	31	35	chr3	3964328	3964840	-155634943	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2927	4479	4080	5
615	7044	210	43	19	chr3	3964826	3966330	-155633453	-	ETnERV-int	LTR	ERVK	-1770	1544	6	5
615	1030	109	32	19	chr3	3966330	3966527	-155633256	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-242	195	1	5
615	2694	213	50	60	chr3	3977146	3978010	-155621773	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	5
615	1496	261	115	18	chr3	3981376	3981871	-155617912	-	RLTR1	LTR	ERV1	0	624	82	6
615	304	269	176	69	chr3	3987371	3987559	-155612224	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	208	-200	6
615	2549	90	0	20	chr3	3994204	3994557	-155605226	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
615	2751	52	0	39	chr3	3996959	3997319	-155602464	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	6
615	1102	216	101	93	chr3	4002267	4002644	-155597139	+	RMER10B	LTR	ERVL	19	398	0	5
615	230	269	62	31	chr3	4002819	4002915	-155596868	+	RMER20B	LTR	ERVK	129	227	-400	6
615	535	268	16	39	chr3	4003247	4003375	-155596408	-	RMER20B	LTR	ERVK	-502	125	1	7
615	528	256	135	11	chr3	4003376	4003554	-155596229	+	RMER20B	LTR	ERVK	217	416	-211	6
615	3525	33	35	71	chr3	4004031	4004524	-155595259	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	9
615	1108	68	50	119	chr3	4004525	4004726	-155595057	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	9
615	227	273	0	0	chr3	4004735	4004779	-155595004	+	RLTR27	LTR	ERVK	232	275	-34	1
615	3844	59	2	18	chr3	4004779	4005282	-155594501	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	9
615	2663	67	0	3	chr3	4005282	4005625	-155594158	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	9
615	6869	38	2	17	chr3	4005618	4006459	-155593324	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5651	6479	-2	9
615	3570	30	32	71	chr3	4006461	4006955	-155592828	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	9
615	263	322	24	16	chr3	4007367	4007490	-155592293	-	RMER12	LTR	ERVK	-480	842	719	1
615	370	86	15	40	chr3	4016834	4016902	-155582881	+	ORR1A3	LTR	MaLR	282	326	0	2
615	2823	57	23	3	chr3	4016902	4017288	-155582495	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1	394	-1398	2
615	3600	83	6	27	chr3	4017772	4017913	-155581870	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-514	509	373	3
615	2880	150	26	165	chr3	4017913	4018785	-155580998	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	3
615	3600	83	6	27	chr3	4018785	4019163	-155580620	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-651	372	1	3
615	3162	186	81	18	chr3	4035546	4036254	-155563529	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	754	-2	3
615	870	259	12	63	chr3	4037247	4037499	-155562284	-	RLTR42	LTR	ERVK	0	239	1	4
615	1578	234	78	5	chr3	4037501	4037883	-155561900	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2	5520	5111	4
615	1900	195	175	7	chr3	4039093	4039987	-155559796	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-437	5085	4041	4
615	492	140	11	0	chr3	4041305	4041398	-155558385	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1515	4007	3914	4
615	1158	178	150	88	chr3	4049885	4050250	-155549533	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1600	3922	3519	4
615	1158	178	150	88	chr3	4050395	4050529	-155549254	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2004	3518	3392	4
615	5117	249	60	41	chr3	4050649	4052297	-155547486	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3799	1723	44	4
615	525	264	148	57	chr3	4052333	4052438	-155547345	-	RLTR42	LTR	ERVK	-10	229	116	4
615	2923	73	24	0	chr3	4052438	4052821	-155546962	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-4	392	1	5
615	525	264	148	57	chr3	4052821	4052924	-155546859	-	RLTR42	LTR	ERVK	-124	115	3	4
615	2527	64	12	0	chr3	4062810	4063138	-155536645	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	54	385	0	5
76	5783	122	75	22	chr3	4063138	4064143	-155535640	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1	1058	-6455	5
616	18381	68	11	9	chr3	4064143	4066915	-155532868	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	4788	7513	0	5
616	2485	74	12	0	chr3	4066915	4067241	-155532542	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	55	384	-1	5
616	362	292	27	92	chr3	4071623	4071808	-155527975	-	MTEb	LTR	MaLR	-200	179	7	6
616	4195	35	0	2	chr3	4082421	4082915	-155516868	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	6
616	261	389	61	20	chr3	4107212	4107359	-155492424	-	RMER15	LTR	ERVL	-117	458	306	8
616	1670	235	52	132	chr3	4123309	4123908	-155475875	-	RMER19C	LTR	ERVK	-60	551	1	1
616	1049	240	89	59	chr3	4125389	4125747	-155474036	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	5	1
616	1415	138	21	8	chr3	4137243	4137484	-155462299	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	244	-658	1
616	2335	168	64	11	chr3	4137997	4138478	-155461305	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	247	747	-155	1
616	779	169	68	23	chr3	4138506	4138682	-155461101	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	3	186	-5622	1
616	9436	146	58	16	chr3	4138856	4140644	-155459139	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	175	1932	-5474	1
616	5537	177	51	96	chr3	4147022	4148313	-155451470	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2382	3705	-2103	1
616	7577	140	48	61	chr3	4148350	4149999	-155449784	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2872	6071	-1173	1
616	1598	156	0	0	chr3	4150013	4150269	-155449514	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5529	5784	-24	1
616	534	179	0	10	chr3	4150279	4150375	-155449408	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	95	-807	1
616	1296	203	91	101	chr3	4150377	4150469	-155449314	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	479	562	-340	1
616	1296	203	91	101	chr3	4150798	4151133	-155448650	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	563	902	0	1
616	1556	205	125	14	chr3	4153109	4153461	-155446322	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	393	-1	1
616	3536	68	19	4	chr3	4155848	4156323	-155443460	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
616	7743	41	1	3	chr3	4156323	4157237	-155442546	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	0	7244	6333	1
616	2032	97	13	3	chr3	4157237	4157536	-155442247	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-385	508	207	1
616	8015	50	4	7	chr3	4157558	4158569	-155441214	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1172	6072	5065	1
616	3943	77	33	39	chr3	4158562	4159173	-155440610	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-3258	3986	3380	1
616	11317	44	56	5	chr3	4159143	4160934	-155438849	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-4032	3212	1329	1
616	263	227	43	43	chr3	4161241	4161333	-155438450	-	MMTV-int	LTR	ERVK	-4749	2504	2413	1
616	1132	51	0	0	chr3	4161732	4161870	-155437913	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6426	818	681	1
616	4403	64	107	19	chr3	4162168	4162804	-155436979	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6552	692	1	1
616	3492	70	21	4	chr3	4162804	4163278	-155436505	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
616	3635	41	25	19	chr3	4184614	4185086	-155414697	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
616	350	298	74	30	chr3	4188640	4188775	-155411008	+	MER76	LTR	ERVL	20	160	-531	1
616	235	326	31	143	chr3	4188881	4189042	-155410741	+	MER76	LTR	ERVL	529	671	-20	1
616	353	349	26	16	chr3	4189067	4189259	-155410524	+	MER77	LTR	ERVL	399	592	-15	1
617	935	321	93	6	chr3	4196960	4197314	-155402469	+	MTD	LTR	MaLR	33	417	-2	1
617	737	273	10	31	chr3	4197663	4197856	-155401927	+	ORR1C2	LTR	MaLR	191	379	-5	1
617	376	188	62	0	chr3	4197875	4197955	-155401828	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-1171	87	3	1
617	1765	234	22	15	chr3	4197955	4198358	-155401425	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	2	1
617	430	361	52	75	chr3	4201146	4201508	-155398275	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	6	1
617	302	296	170	40	chr3	4202601	4202876	-155396907	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	73	1
617	370	183	77	68	chr3	4204742	4204859	-155394924	-	RMER15	LTR	ERVL	-420	155	38	1
617	2138	148	43	70	chr3	4205191	4205633	-155394150	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	1
617	3781	166	125	62	chr3	4210361	4211210	-155388573	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	1
617	1957	118	14	31	chr3	4220102	4220469	-155379314	+	RLTR10A	LTR	ERVK	2	347	-12	1
617	249	169	136	0	chr3	4223162	4223221	-155376562	+	ORR1D1	LTR	MaLR	305	371	-3	1
617	557	329	28	14	chr3	4228049	4228262	-155371521	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	252	1
617	2549	228	59	56	chr3	4229825	4230541	-155369242	-	RMER6D	LTR	ERVK	-1	719	2	2
617	1914	170	3	6	chr3	4247623	4247948	-155351835	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-5	324	1	2
617	1527	167	136	0	chr3	4250173	4250460	-155349323	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
617	371	224	84	5	chr3	4252602	4252716	-155347067	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	123	-597	2
617	1183	163	107	24	chr3	4252737	4252989	-155346794	+	RMER6C	LTR	ERVK	418	690	0	2
617	1054	223	9	14	chr3	4271277	4271491	-155328292	-	MTC	LTR	MaLR	-13	408	196	2
617	840	263	35	15	chr3	4271999	4272200	-155327583	-	MTC	LTR	MaLR	-214	207	3	2
617	230	195	0	0	chr3	4292288	4292329	-155307454	-	MT2B	LTR	ERVL	-312	289	249	2
617	249	294	25	107	chr3	4295247	4295369	-155304414	+	MTEb	LTR	MaLR	69	180	-199	2
617	382	285	490	11	chr3	4295949	4296122	-155303661	+	MTE2a	LTR	MaLR	12	267	-112	2
617	3226	29	39	0	chr3	4304980	4305361	-155294422	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
617	9619	16	0	0	chr3	4305361	4306459	-155293324	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
617	3249	26	39	0	chr3	4306459	4306840	-155292943	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
617	2538	34	6	3	chr3	4309227	4309553	-155290230	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	327	-10	2
617	7948	35	8	0	chr3	4309553	4310510	-155289273	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	17	988	-999	2
617	8697	27	1	0	chr3	4310589	4311586	-155288197	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	990	1987	0	2
617	2763	26	2	184	chr3	4311586	4312063	-155287720	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
617	2768	92	20	10	chr3	4312444	4312840	-155286943	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
618	2835	29	6	0	chr3	4334010	4334354	-155265429	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
618	2907	181	71	61	chr3	4336131	4336767	-155263016	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	3
618	2135	273	20	29	chr3	4339588	4340184	-155259599	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1248	1838	-3153	3
618	256	254	84	99	chr3	4340405	4340536	-155259247	+	RMER4B	LTR	ERVK	350	478	-107	3
618	2479	201	47	2	chr3	4341223	4341712	-155258071	+	RLTR11A	LTR	ERVK	13	523	-5	3
618	344	227	138	38	chr3	4350544	4350704	-155249079	-	RLTR21	LTR	ERVK	-311	1261	1086	3
618	238	349	23	53	chr3	4352877	4353010	-155246773	+	MTEa	LTR	MaLR	251	379	0	3
618	976	261	191	18	chr3	4355117	4355453	-155244330	+	MTD	LTR	MaLR	8	401	-18	3
618	654	154	0	0	chr3	4369148	4369252	-155230531	+	RLTR23	LTR	ERV1	327	430	0	3
618	450	291	102	88	chr3	4369569	4369874	-155229909	-	RLTR23	LTR	ERV1	-5	425	117	3
618	411	334	26	18	chr3	4370521	4370670	-155229113	-	MTD	LTR	MaLR	-144	275	111	3
618	1011	234	47	78	chr3	4374036	4374211	-155225572	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	860	3
618	1011	234	47	78	chr3	4374277	4374397	-155225386	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-169	859	742	3
618	1405	206	166	11	chr3	4374470	4374843	-155224940	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-152	951	521	3
618	1047	256	202	18	chr3	4380588	4381038	-155218745	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	3
618	282	373	46	42	chr3	4381539	4381777	-155218006	+	MLT1E2-int	LTR	MaLR	298	536	-873	3
618	955	294	105	43	chr3	4382536	4382888	-155216895	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	376	-3	3
618	1004	296	58	109	chr3	4383699	4384093	-155215690	-	MTE2a	LTR	MaLR	-5	374	1	3
618	307	294	74	81	chr3	4384127	4384275	-155215508	+	MLT1E2	LTR	MaLR	81	227	-400	3
618	428	284	17	97	chr3	4386165	4386403	-155213380	-	MURVY-int	LTR	ERV1	-109	7343	7125	3
618	1903	96	31	22	chr3	4386406	4386725	-155213058	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
618	16107	148	29	21	chr3	4386725	4393551	-155206232	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-198	7208	1	3
618	1872	99	31	22	chr3	4393551	4393870	-155205913	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
618	480	240	0	0	chr3	4393870	4393994	-155205789	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-362	7239	7129	3
618	1354	311	62	25	chr3	4394743	4396335	-155203448	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2009	5547	3537	3
618	584	326	70	53	chr3	4396895	4397592	-155202191	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5781	1997	1159	3
618	2691	132	200	0	chr3	4412822	4413307	-155186476	+	MT2B2	LTR	ERVL	3	584	0	4
618	309	309	131	7	chr3	4416345	4416498	-155183285	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-236	172	1	4
618	2140	211	112	27	chr3	4416775	4417408	-155182375	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	690	0	4
618	4474	10	0	0	chr3	4426680	4427173	-155172610	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
618	475	310	44	12	chr3	4435512	4435672	-155164111	-	MLT1B	LTR	MaLR	-68	322	158	4
619	587	179	16	0	chr3	4463667	4463790	-155135993	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	212	336	-248	4
619	1801	125	88	115	chr3	4486981	4487469	-155112314	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
619	563	283	72	90	chr3	4497544	4497932	-155101851	-	MER110A	LTR	ERV1	-50	418	38	5
619	1662	99	174	8	chr3	4503900	4504165	-155095618	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	8
619	1568	222	33	26	chr3	4504165	4504730	-155095053	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	6907	8
619	3907	312	25	35	chr3	4505076	4507180	-155092603	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4333	3248	1166	8
619	636	249	45	55	chr3	4507555	4507755	-155092028	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1135	852	655	8
619	296	130	0	0	chr3	4507787	4507833	-155091950	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	222	8
619	1641	98	206	4	chr3	4507865	4508122	-155091661	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	1
619	1859	214	42	0	chr3	4508374	4508757	-155091026	+	MTC	LTR	MaLR	5	403	-18	1
619	462	325	48	6	chr3	4540581	4540748	-155059035	-	MTE2b	LTR	MaLR	-201	178	5	4
619	2176	261	41	96	chr3	4547753	4548695	-155051088	-	RMER17B	LTR	ERVK	-43	915	50	5
619	2292	175	50	31	chr3	4554269	4554746	-155045037	-	RLTR44D	LTR	ERVK	0	486	1	6
619	16346	59	19	37	chr3	4554753	4557611	-155042172	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-3	2809	1	6
619	2104	179	49	30	chr3	4557623	4558094	-155041689	-	RLTR44D	LTR	ERVK	-3	483	4	6
619	290	355	78	57	chr3	4563975	4564205	-155035578	-	MT2A	LTR	ERVL	-68	465	231	6
619	226	197	134	15	chr3	4564369	4564436	-155035347	-	MTEa	LTR	MaLR	-304	75	1	7
620	3207	19	50	0	chr3	4609370	4609747	-154990036	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
620	2155	126	3	3	chr3	4610629	4610955	-154988828	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	326	-81	1
620	3463	15	5	0	chr3	4611146	4611539	-154988244	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	396	0	1
620	2080	179	219	28	chr3	4616172	4616748	-154983035	-	RMER6C	LTR	ERVK	-4	686	1	1
620	2061	194	43	13	chr3	4616771	4617381	-154982402	-	RMER6-int	LTR	ERVK	-1974	1203	776	1
620	610	126	18	9	chr3	4617375	4617487	-154982296	-	RMER6-int	LTR	ERVK	-2522	655	543	1
620	2185	196	28	30	chr3	4617538	4618000	-154981783	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2711	3171	-6	1
620	1497	188	31	3	chr3	4618004	4618298	-154981485	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	302	-388	1
620	6407	135	10	15	chr3	4629333	4630361	-154969422	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	1023	0	1
620	1353	110	52	26	chr3	4639360	4639606	-154960177	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-116	249	1	1
620	2914	127	23	21	chr3	4639606	4640090	-154959693	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7680	7196	1
620	18728	76	7	0	chr3	4646277	4648674	-154951109	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-402	7179	4768	1
620	300	241	76	0	chr3	4649068	4649147	-154950636	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4595	811	727	1
620	510	171	34	0	chr3	4649153	4649241	-154950542	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5004	402	312	1
620	1090	158	0	111	chr3	4649337	4649607	-154950176	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6629	952	713	1
620	868	172	0	0	chr3	4649621	4649766	-154950017	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7215	366	222	1
620	248	235	0	19	chr3	4649766	4649818	-154949965	-	RLTR27	LTR	ERVK	-37	272	222	1
620	713	55	0	0	chr3	4649818	4649909	-154949874	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7488	93	3	1
620	2515	82	185	3	chr3	4649909	4650277	-154949506	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-1	435	1	1
620	1157	135	16	10	chr3	4654456	4654650	-154945133	-	RLTR17	LTR	ERVK	-497	195	1	1
620	6504	186	64	60	chr3	4654650	4656470	-154943313	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	0	2842	1016	1
620	514	186	34	0	chr3	4656509	4656627	-154943156	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2232	610	489	1
620	364	291	57	174	chr3	4660449	4660661	-154939122	-	MER21B	LTR	ERV1	-672	191	5	1
620	1232	214	26	89	chr3	4663008	4663311	-154936472	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-70	324	41	1
620	570	347	77	66	chr3	4664692	4665071	-154934712	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-4	511	129	1
620	791	148	79	16	chr3	4674211	4674376	-154925407	+	ORR1C1	LTR	MaLR	170	336	-58	1
620	1471	245	71	0	chr3	4674769	4675136	-154924647	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-14	393	1	1
620	1037	283	112	3	chr3	4676583	4676888	-154922895	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	238	1
620	666	313	65	97	chr3	4679276	4680036	-154919747	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	1172	-408	1
620	1876	171	75	22	chr3	4680193	4680564	-154919219	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-12	391	1	1
620	715	293	116	55	chr3	4680564	4680906	-154918877	+	MTC-int	LTR	MaLR	882	1247	-11	1
620	1477	154	105	4	chr3	4681639	4681909	-154917874	-	RLTR9A2	LTR	ERVK	-79	358	1	1
620	2898	151	14	7	chr3	4682009	4682510	-154917273	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	507	1	1
620	2254	79	35	3	chr3	4683331	4683650	-154916133	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	147	1
620	814	162	7	0	chr3	4683650	4683786	-154915997	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1377	4384	4248	2
620	238	209	0	0	chr3	4686825	4686868	-154912915	-	ORR1E	LTR	MaLR	-46	313	271	2
620	3031	45	45	5	chr3	4688094	4688475	-154911308	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
620	296	207	65	109	chr3	4691068	4691160	-154908623	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	422	2
620	1333	199	153	88	chr3	4693929	4694348	-154905435	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	2
620	2406	199	2	7	chr3	4701893	4702314	-154897469	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	2
77	2055	125	41	41	chr3	4718310	4718677	-154881106	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	2
621	41551	17	4	3	chr3	4718677	4725142	-154874641	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	2
621	2074	125	41	41	chr3	4725142	4725509	-154874274	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	2
621	1513	274	26	3	chr3	4725509	4725857	-154873926	+	ORR1D1	LTR	MaLR	19	374	0	2
621	2311	182	118	47	chr3	4726926	4727570	-154872213	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	2
621	2297	269	30	98	chr3	4734314	4735265	-154864518	+	RMER17B	LTR	ERVK	15	901	-57	2
621	4649	149	109	13	chr3	4736047	4736915	-154862868	+	RMER17B	LTR	ERVK	3	954	-4	2
621	275	27	0	26	chr3	4738887	4738925	-154860858	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	37	-356	2
621	534	220	155	23	chr3	4738933	4739152	-154860631	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	16	263	-3051	2
621	4528	147	65	32	chr3	4739253	4740237	-154859546	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1071	2086	-5320	2
621	4790	140	25	29	chr3	4740261	4741174	-154858609	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2496	3405	-4001	2
621	2704	85	30	8	chr3	4741174	4741567	-154858216	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	249	650	-156	2
621	9555	121	34	25	chr3	4741567	4741670	-154858113	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3403	3509	-3897	2
621	9555	121	34	25	chr3	4741816	4742248	-154857535	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3510	3926	-3480	2
621	9555	121	34	25	chr3	4742296	4743340	-154856443	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3927	4997	-2409	2
621	1805	199	26	56	chr3	4743351	4744092	-154855691	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3529	4173	-1233	2
621	1214	170	23	19	chr3	4744127	4744391	-154855392	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6222	6429	-977	2
621	409	97	0	77	chr3	4744602	4744680	-154855103	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7402	-4	2
621	1842	146	36	100	chr3	4744690	4745110	-154854673	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	2
621	372	351	9	0	chr3	4745516	4745630	-154854153	+	MLT1A	LTR	MaLR	40	154	-220	2
621	287	285	103	44	chr3	4745646	4745782	-154854001	+	MLT1A	LTR	MaLR	211	354	-36	2
621	1853	137	94	97	chr3	4747742	4748218	-154851565	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
621	611	321	248	10	chr3	4754323	4754622	-154845161	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	2
621	479	292	117	48	chr3	4755642	4756015	-154843768	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	2
621	2760	101	8	12	chr3	4758133	4758535	-154841248	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
621	2251	160	21	49	chr3	4761345	4761773	-154838010	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-16	589	174	2
621	6875	103	39	12	chr3	4761774	4763680	-154836103	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	0	3698	1793	2
621	6845	91	15	7	chr3	4763739	4764024	-154835759	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-1906	1792	1503	2
621	271	109	0	0	chr3	4764091	4764137	-154835646	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2197	1501	1456	2
621	495	97	21	11	chr3	4764179	4764273	-154835510	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2181	1118	1024	2
621	1093	128	38	41	chr3	4764451	4764717	-154835066	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2245	1453	1158	2
621	847	243	34	48	chr3	4765025	4765293	-154834490	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2528	771	508	2
621	1271	151	24	28	chr3	4765451	4765703	-154834080	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-10	7571	7321	2
621	253	333	24	30	chr3	4765832	4765996	-154833787	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-512	7069	6907	2
621	1766	314	30	37	chr3	4766496	4767728	-154832055	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2104	5477	4255	2
621	2619	53	6	37	chr3	4767758	4768112	-154831671	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	12	354	-3	2
621	7025	60	2	7	chr3	4768122	4769069	-154830714	+	IAPEy-int	LTR	ERVK	6572	7513	0	2
621	2757	88	21	3	chr3	4769069	4769445	-154830338	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	383	-2	2
621	2339	309	36	38	chr3	4769452	4770996	-154828787	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-3321	4260	2720	2
621	340	219	0	30	chr3	4771317	4771416	-154828367	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1143	844	749	2
621	373	32	8	0	chr3	4771547	4771600	-154828183	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	163	2
621	1998	118	3	26	chr3	4771625	4771930	-154827853	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	12	2
621	2511	77	0	32	chr3	4777213	4777560	-154822223	+	ORR1A1	LTR	MaLR	11	346	0	3
621	240	362	0	11	chr3	4778426	4778521	-154821262	+	RMER15	LTR	ERVL	303	396	-179	3
621	238	231	45	15	chr3	4778974	4779040	-154820743	+	RMER15	LTR	ERVL	412	479	-96	3
621	520	255	35	55	chr3	4780353	4780537	-154819246	+	ORR1C1	LTR	MaLR	2	183	-201	3
621	520	289	68	80	chr3	4780595	4780696	-154819087	+	ORR1C1	LTR	MaLR	174	284	-86	3
621	694	206	141	27	chr3	4780737	4780922	-154818861	+	ORR1C1	LTR	MaLR	173	378	0	3
621	278	326	13	90	chr3	4781044	4781199	-154818584	+	MLT1A	LTR	MaLR	16	158	-216	3
621	3200	56	2	2	chr3	4789589	4789985	-154809798	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
621	2442	96	191	3	chr3	4791687	4792054	-154807729	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	3
621	247	195	81	47	chr3	4832425	4832511	-154767272	+	RMER15	LTR	ERVL	39	127	-448	3
621	540	306	115	63	chr3	4832556	4832842	-154766941	+	RMER15	LTR	ERVL	275	575	0	3
621	727	344	8	16	chr3	4833192	4833449	-154766334	+	MTEa	LTR	MaLR	20	274	-105	3
621	544	316	65	14	chr3	4842195	4842365	-154757418	+	MTE2a	LTR	MaLR	207	369	-5	3
621	704	339	55	39	chr3	4842398	4842705	-154757078	+	MTE-int	LTR	MaLR	64	375	-1205	3
621	1953	319	89	26	chr3	4842770	4843605	-154756178	+	MTE-int	LTR	MaLR	567	1580	0	3
621	562	368	139	4	chr3	4843630	4843911	-154755872	+	MTE2a	LTR	MaLR	61	379	0	3
622	2523	87	90	0	chr3	4853645	4854012	-154745771	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
622	1820	125	28	22	chr3	4861458	4861778	-154738005	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
622	1102	290	88	9	chr3	4868620	4868961	-154730822	+	MTD	LTR	MaLR	49	416	-3	4
622	1760	184	19	65	chr3	4891861	4892292	-154707491	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-4	411	1	4
622	377	99	68	40	chr3	4892292	4892366	-154707417	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	0	7406	7331	4
622	14419	164	43	30	chr3	4893113	4897191	-154702592	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1230	4176	1376	4
622	423	314	34	0	chr3	4906579	4906697	-154693086	+	MTEa	LTR	MaLR	103	224	-155	4
622	597	294	49	36	chr3	4907717	4908045	-154691738	+	RLTR45	LTR	ERVK	103	482	0	4
622	789	227	81	83	chr3	4910045	4910495	-154689288	-	LTRIS3	LTR	ERV1	0	512	1	4
622	919	215	62	5	chr3	4910495	4910719	-154689064	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	0	4690	4454	4
622	2715	225	23	38	chr3	4910798	4911549	-154688234	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-236	4454	3808	4
622	4391	241	34	29	chr3	4911547	4913763	-154686020	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2044	2646	495	4
622	5602	88	15	15	chr3	4913763	4914571	-154685212	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	4
622	1012	271	96	60	chr3	4914574	4915041	-154684742	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-4566	497	14	4
622	868	200	119	67	chr3	4915210	4915624	-154684159	-	LTRIS5	LTR	ERV1	0	512	1	4
622	3297	76	19	83	chr3	4920423	4920938	-154678845	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	4
622	3123	140	123	116	chr3	4922093	4922948	-154676835	+	RMER17D	LTR	ERVK	26	886	-3	4
622	1767	123	141	0	chr3	4922994	4923320	-154676463	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	51	4
622	10001	44	10	3	chr3	4930912	4932181	-154667602	-	ETnERV-int	LTR	ERVK	-2036	1278	1	4
622	1781	115	27	66	chr3	4932181	4932516	-154667267	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	4
622	442	329	60	43	chr3	4937722	4937954	-154661829	+	RMER15	LTR	ERVL	322	557	-18	4
622	2875	216	70	61	chr3	4942586	4943427	-154656356	-	RMER17D	LTR	ERVK	-15	874	26	4
622	238	377	72	20	chr3	4950509	4950704	-154649079	-	MLT1A	LTR	MaLR	-169	205	1	4
622	516	244	112	66	chr3	4951777	4951974	-154647809	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	720	515	4
622	804	222	138	13	chr3	4951957	4952181	-154647602	-	RMER6A	LTR	ERVK	-87	669	418	4
623	2092	182	88	31	chr3	4984665	4985123	-154614660	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	5
623	4184	141	42	51	chr3	4991605	4992502	-154607281	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	889	0	5
623	645	228	183	50	chr3	4992980	4993220	-154606563	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	5
623	892	245	81	16	chr3	4997198	4997620	-154602163	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	590	5
623	4171	141	49	99	chr3	5004374	5005316	-154594467	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-11	895	1	8
623	3031	23	0	0	chr3	5013077	5013423	-154586360	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	1
623	14028	52	6	3	chr3	5013423	5015209	-154584574	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1	1
623	704	56	0	0	chr3	5015209	5015298	-154584485	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	258	1
623	3126	51	13	0	chr3	5019513	5019904	-154579879	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
623	1858	209	25	25	chr3	5020157	5020516	-154579267	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	63	2
623	306	213	16	0	chr3	5021220	5021281	-154578502	-	MTC	LTR	MaLR	-349	72	11	2
623	229	242	63	16	chr3	5022235	5022298	-154577485	-	MTEa	LTR	MaLR	-313	66	1	3
623	2945	95	0	14	chr3	5025417	5025844	-154573939	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	3
623	1964	168	138	28	chr3	5037041	5037550	-154562233	+	RMER16-int	LTR	ERVK	255	819	-4587	4
623	565	142	35	9	chr3	5037555	5037669	-154562114	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1089	1205	-4201	4
623	1019	223	95	39	chr3	5037687	5037971	-154561812	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2454	2753	-4653	4
623	7377	134	98	46	chr3	5037998	5038187	-154561596	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2935	3141	-4265	4
623	7377	134	98	46	chr3	5038250	5039510	-154560273	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3142	4525	-2881	4
623	2664	80	29	99	chr3	5039510	5039952	-154559831	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	4
623	4645	80	21	19	chr3	5039952	5040649	-154559134	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1	1986	1288	4
623	1499	86	5	0	chr3	5040650	5040860	-154558923	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-658	5884	5674	4
623	3357	69	86	14	chr3	5040872	5041359	-154558424	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1015	5527	5006	4
623	599	205	33	7	chr3	5041359	5041511	-154558272	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6040	502	347	4
623	1502	126	75	35	chr3	5041505	5041832	-154557951	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1382	605	55	4
623	2811	58	34	41	chr3	5041832	5042246	-154557537	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	4
623	725	140	0	0	chr3	5042246	5042353	-154557430	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4520	4626	-2780	4
623	3679	156	53	12	chr3	5046110	5047036	-154552747	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	4464	6071	-1173	5
623	1122	91	43	1	chr3	5047065	5047261	-154552522	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	291	509	-524	5
623	2290	189	64	14	chr3	5065953	5066468	-154533315	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	269	6
623	1892	81	11	49	chr3	5067556	5067843	-154531940	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-613	276	1	6
623	1343	239	93	36	chr3	5069370	5069735	-154530048	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	20	6
623	2831	25	0	12	chr3	5080711	5081042	-154518741	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	7
623	903	113	53	53	chr3	5081043	5081230	-154518553	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	7
623	276	264	0	0	chr3	5081230	5081283	-154518500	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	7
623	239	302	0	0	chr3	5081311	5081364	-154518419	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	7
623	3293	70	0	16	chr3	5081364	5082020	-154517763	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	7
623	2442	74	9	3	chr3	5082020	5082360	-154517423	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	7
623	1315	52	0	0	chr3	5082355	5082527	-154517256	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5653	5824	-657	7
623	569	348	99	12	chr3	5084837	5085169	-154514614	-	MT2A	LTR	ERVL	-108	425	65	8
623	256	362	83	49	chr3	5101764	5102039	-154497744	-	MLT1B	LTR	MaLR	-13	377	70	1
623	340	109	18	0	chr3	5105204	5105259	-154494524	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	349	1
624	1668	100	62	0	chr3	5122153	5122394	-154477389	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	256	-702	1
624	2231	195	108	8	chr3	5128491	5129148	-154470635	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-307	2019	1297	1
624	423	199	44	108	chr3	5129158	5129316	-154470467	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1163	1679	1532	1
624	1607	188	128	17	chr3	5129348	5129816	-154469967	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1309	1533	1014	1
624	454	229	46	28	chr3	5129933	5130256	-154469527	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2038	804	370	1
624	646	208	5	48	chr3	5130337	5130544	-154469239	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1993	849	652	1
624	501	84	7	0	chr3	5130564	5130645	-154469138	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2278	564	489	1
624	2355	91	122	5	chr3	5131051	5131427	-154468356	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	2	1
624	3551	161	109	37	chr3	5132015	5132801	-154466982	+	RMER17B	LTR	ERVK	2	874	-84	1
624	743	134	0	0	chr3	5132805	5132917	-154466866	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	847	1
624	2511	113	63	10	chr3	5132948	5133358	-154466425	-	RMER17B	LTR	ERVK	-526	432	1	1
624	3182	51	29	0	chr3	5142144	5142555	-154457228	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-1	474	52	1
624	3148	194	47	18	chr3	5148379	5149003	-154450780	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	1
624	1525	192	118	11	chr3	5160759	5161130	-154438653	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	460	-108	1
624	846	225	132	0	chr3	5161166	5161249	-154438534	+	RLTR20D	LTR	ERVK	461	567	-1	1
624	2273	79	82	0	chr3	5161800	5162128	-154437655	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-2	355	1	1
624	2196	126	0	12	chr3	5163353	5163683	-154436100	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	1
624	775	313	78	36	chr3	5163898	5164256	-154435527	+	MLT1A1	LTR	MaLR	19	391	-17	1
624	322	280	53	11	chr3	5165589	5165683	-154434100	+	MLT1F2	LTR	MaLR	45	142	-418	1
624	3948	146	18	73	chr3	5174302	5174621	-154425162	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	324	-432	1
624	3948	146	18	73	chr3	5174764	5175242	-154424541	+	RMER6A	LTR	ERVK	325	754	-2	1
624	2731	87	3	5	chr3	5181705	5182088	-154417695	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	13	1
624	1415	50	6	0	chr3	5185555	5185737	-154414046	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	214	2
624	3630	67	19	0	chr3	5185739	5186204	-154413579	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	2	2
624	1302	220	81	48	chr3	5188321	5188693	-154411090	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	2
624	3054	61	2	8	chr3	5228375	5228773	-154371010	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
625	427	259	155	34	chr3	5255854	5256158	-154343625	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	2
625	1738	207	32	16	chr3	5266456	5266834	-154332949	-	RMER12	LTR	ERVK	-938	384	1	2
625	3160	56	5	2	chr3	5286550	5286945	-154312838	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
625	552	248	34	0	chr3	5311253	5311370	-154288413	-	MTEa	LTR	MaLR	-258	121	1	3
625	1081	157	11	9	chr3	5313000	5313182	-154286601	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	379	195	3
625	915	161	10	75	chr3	5314831	5315032	-154284751	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	188	-196	3
625	521	291	59	27	chr3	5364274	5364461	-154235322	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-1	364	172	3
625	5013	122	41	22	chr3	5373032	5373910	-154225873	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-11	895	1	4
626	227	275	84	84	chr3	5390382	5390501	-154209282	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-44	324	206	4
626	238	93	22	44	chr3	5416225	5416270	-154183513	-	MT2B2	LTR	ERVL	-297	287	244	4
626	1231	244	113	42	chr3	5418539	5418919	-154180864	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	13	4
626	3388	132	5	31	chr3	5422137	5422709	-154177074	+	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	1	557	0	4
626	283	312	18	35	chr3	5423251	5423364	-154176419	+	LTR41B	LTR	ERVL	643	753	-5	4
626	498	367	34	4	chr3	5426028	5426321	-154173462	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-157	307	1	4
626	333	335	39	24	chr3	5426819	5427027	-154172756	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-571	5143	4933	4
626	1735	185	67	17	chr3	5427656	5428014	-154171769	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	378	0	4
626	1974	118	15	61	chr3	5429518	5429860	-154169923	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
626	1099	292	119	11	chr3	5451462	5451822	-154147961	+	MTD	LTR	MaLR	7	405	-14	4
626	303	318	91	29	chr3	5457373	5457548	-154142235	-	LTR79	LTR	ERVL	-104	423	238	5
626	1359	179	219	0	chr3	5457740	5458097	-154141686	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1889	2323	-3	5
626	2237	157	57	0	chr3	5458100	5458521	-154141262	+	BGLII_A	LTR	ERVK	1	445	0	5
626	2476	112	42	2	chr3	5460098	5460502	-154139281	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	2	5
626	2851	83	34	3	chr3	5469441	5469829	-154129954	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
626	2640	38	22	0	chr3	5483237	5483557	-154116226	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	5
626	863	225	34	3	chr3	5491146	5491367	-154108416	-	RLTR46	LTR	ERVK	-43	268	42	5
626	284	244	37	37	chr3	5498547	5498628	-154101155	-	MTC-int	LTR	MaLR	-873	385	305	5
626	766	133	91	0	chr3	5498598	5498741	-154101042	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-88	241	86	5
626	268	426	72	42	chr3	5499390	5499652	-154100131	+	LTR16E2	LTR	ERVL	213	482	-86	5
626	1894	158	16	0	chr3	5504410	5504726	-154095057	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	7	1
627	297	234	0	15	chr3	5508856	5508921	-154090862	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-320	64	1	1
627	2973	262	42	12	chr3	5508921	5509639	-154090144	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	632	1
627	1160	241	205	32	chr3	5509665	5510133	-154089650	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	3	551	0	1
627	2427	248	60	14	chr3	5510133	5510744	-154089039	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-730	640	2	1
627	973	218	205	11	chr3	5510746	5511024	-154088759	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-42	332	1	1
627	3396	172	21	16	chr3	5511698	5512305	-154087478	-	RLTR17	LTR	ERVK	-82	610	1	1
627	369	358	98	22	chr3	5512325	5512693	-154087090	+	MLT1E2	LTR	MaLR	232	627	0	1
627	925	159	0	124	chr3	5515195	5515260	-154084523	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-88	290	234	2
627	4797	133	93	21	chr3	5515260	5515736	-154084047	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	418	2
627	4797	133	93	21	chr3	5515845	5516213	-154083570	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-489	417	1	2
627	925	159	0	124	chr3	5516213	5516341	-154083442	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-145	233	121	2
627	320	335	73	75	chr3	5516647	5517166	-154082617	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5128	2478	1961	2
627	505	354	52	21	chr3	5517272	5517751	-154082032	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3368	1695	1202	2
627	2006	129	47	41	chr3	5517751	5518116	-154081667	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
627	54561	15	7	4	chr3	5518116	5524567	-154075216	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4	6477	-4	2
627	2006	129	47	41	chr3	5524567	5524932	-154074851	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
627	300	263	44	9	chr3	5524932	5525092	-154074691	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-6329	1449	1187	2
627	309	309	36	21	chr3	5525533	5525725	-154074058	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-6717	839	645	2
627	2718	28	0	0	chr3	5528848	5529171	-154070612	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	32	3
627	309	298	91	14	chr3	5533790	5533933	-154065850	+	MLT2B4	LTR	ERVL	45	198	-358	3
627	1037	292	92	9	chr3	5538699	5539135	-154060648	-	RMER5	LTR	ERV1	-2	532	61	4
627	321	242	105	70	chr3	5555146	5555374	-154044409	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	673	6
627	365	279	138	29	chr3	5578738	5578932	-154020851	-	MLT1D	LTR	MaLR	-128	525	335	8
627	2092	95	6	65	chr3	5579223	5579562	-154020221	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	8
627	234	91	0	0	chr3	5579562	5579595	-154020188	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	1931	8
627	5756	157	28	77	chr3	5579581	5580829	-154018954	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-605	1187	1	8
627	2028	116	24	59	chr3	5580829	5581168	-154018615	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	8
627	477	366	97	97	chr3	5587504	5587855	-154011928	+	MLT1F2	LTR	MaLR	202	552	-8	8
627	1711	198	57	29	chr3	5588017	5588401	-154011382	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	13	8
627	1120	241	102	52	chr3	5588437	5588710	-154011073	+	MTD	LTR	MaLR	5	294	-125	8
627	2361	77	61	3	chr3	5588710	5589037	-154010746	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	8
627	12783	78	19	2	chr3	5589037	5590800	-154008983	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	1792	0	8
627	2423	68	61	3	chr3	5590800	5591127	-154008656	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	8
627	1120	241	102	52	chr3	5591127	5591232	-154008551	+	MTD	LTR	MaLR	295	402	-17	8
627	955	268	40	138	chr3	5591751	5592257	-154007526	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	502	-26	9
627	2232	209	33	79	chr3	5600158	5600728	-153999055	-	RMER20B	LTR	ERVK	-82	545	2	1
627	507	270	16	8	chr3	5601145	5601272	-153998511	+	MTD	LTR	MaLR	5	132	-287	1
627	917	228	82	99	chr3	5601766	5602048	-153997735	+	MTD	LTR	MaLR	129	405	-14	1
627	3034	75	5	2	chr3	5606802	5607201	-153992582	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
627	2938	80	14	5	chr3	5608964	5609379	-153990404	+	BGLII	LTR	ERVK	3	421	0	1
627	896	319	66	11	chr3	5609727	5610092	-153989691	-	MTC	LTR	MaLR	-24	397	13	1
627	514	212	52	31	chr3	5617880	5618021	-153981762	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-206	178	1	1
627	852	282	80	33	chr3	5630529	5630830	-153968953	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	319	-51	1
627	2926	76	2	2	chr3	5632409	5632807	-153966976	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	10	407	0	1
628	2775	32	0	0	chr3	5663447	5663785	-153935998	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-8	338	1	1
628	3826	172	108	43	chr3	5673288	5674188	-153925595	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	1
628	1315	281	50	33	chr3	5674722	5675120	-153924663	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	1
628	290	257	87	29	chr3	5675262	5675366	-153924417	-	LTR40a	LTR	ERVL	-358	161	52	1
628	578	284	88	68	chr3	5687523	5687726	-153912057	+	RLTR10D	LTR	ERVK	2	220	-139	1
628	578	284	88	68	chr3	5687915	5688062	-153911721	+	RLTR10D	LTR	ERVK	221	358	-1	1
628	239	297	54	11	chr3	5700415	5700507	-153899276	-	MLT1C	LTR	MaLR	-129	338	243	2
628	2586	53	152	3	chr3	5701043	5701386	-153898397	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	3	2
628	8060	25	0	10	chr3	5705139	5706077	-153893706	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	2
628	839	318	101	16	chr3	5711050	5711418	-153888365	+	MER74A	LTR	ERVL	130	528	-30	2
628	797	339	78	61	chr3	5711873	5712397	-153887386	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	2
628	371	302	31	16	chr3	5719940	5720068	-153879715	-	LTR40b	LTR	ERVL	-4	458	329	2
628	4618	96	18	43	chr3	5722851	5723621	-153876162	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	2
628	3125	164	55	109	chr3	5723898	5724721	-153875062	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	129	2
628	2443	73	3	17	chr3	5725446	5725794	-153873989	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1450	1792	0	2
628	2464	70	52	3	chr3	5725794	5726124	-153873659	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
628	3049	64	8	2	chr3	5732132	5732526	-153867257	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
628	2733	194	31	72	chr3	5739176	5739304	-153860479	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	591	2
628	2733	194	31	72	chr3	5739794	5740286	-153859497	-	RLTR17	LTR	ERVK	-102	590	98	2
628	1944	218	163	19	chr3	5756805	5757339	-153842444	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
628	250	359	84	0	chr3	5764977	5765108	-153834675	+	MLT1C	LTR	MaLR	34	175	-292	2
629	941	252	39	78	chr3	5787012	5787395	-153812388	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	235	3
629	899	275	144	9	chr3	5794253	5794572	-153805211	+	MTEa	LTR	MaLR	18	379	0	3
629	234	253	25	25	chr3	5794857	5794938	-153804845	+	MLT1A1	LTR	MaLR	317	397	-11	3
629	602	235	138	6	chr3	5796846	5797013	-153802770	+	RMER15	LTR	ERVL	3	191	-384	3
629	977	236	5	5	chr3	5797012	5797212	-153802571	+	RMER15	LTR	ERVL	354	553	-22	3
629	2449	130	14	12	chr3	5798349	5798763	-153801020	-	RLTR9F	LTR	ERVK	0	415	1	3
629	2161	182	40	23	chr3	5805897	5806296	-153793487	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	12	3
629	402	284	97	67	chr3	5808674	5808942	-153790841	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	573	848	-539	3
629	6849	99	26	3	chr3	5808985	5809985	-153789798	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	3
629	406	230	90	4	chr3	5811086	5811201	-153788582	-	MLT2F	LTR	ERVL	-503	126	5	3
629	587	176	37	110	chr3	5813228	5813419	-153786364	-	MTC-int	LTR	MaLR	-2	1256	1080	3
629	299	305	72	39	chr3	5814656	5814837	-153784946	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-363	193	7	3
629	4654	60	3	2	chr3	5820474	5821060	-153778723	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	3
629	4291	103	137	51	chr3	5828072	5828891	-153770892	-	RMER17D	LTR	ERVK	0	889	1	3
629	1702	287	46	36	chr3	5829001	5829604	-153770179	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1121	1729	-3262	3
629	4296	168	48	23	chr3	5829608	5830476	-153769307	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-12	890	1	3
629	3454	276	23	54	chr3	5830476	5831556	-153768227	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1721	2767	-2224	3
629	293	365	28	38	chr3	5831686	5832159	-153767624	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3638	4105	-2986	3
629	3223	184	33	20	chr3	5832174	5832808	-153766975	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	3
629	1330	318	46	31	chr3	5833309	5833894	-153765889	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4200	4793	-198	3
629	230	333	21	84	chr3	5833935	5834030	-153765753	+	RMER4B	LTR	ERVK	350	438	-147	3
629	1426	289	34	17	chr3	5834758	5835170	-153764613	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
629	2474	179	39	191	chr3	5851140	5851694	-153748089	+	RMER17A2	LTR	ERVK	3	412	-494	3
629	2474	179	39	191	chr3	5851721	5852232	-153747551	+	RMER17A2	LTR	ERVK	413	906	0	3
629	341	198	70	122	chr3	5863607	5863722	-153736061	+	MT2B	LTR	ERVL	156	264	-337	3
629	4068	182	25	9	chr3	5881220	5881913	-153717870	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-204	7202	6499	4
629	890	325	15	9	chr3	5881933	5882268	-153717515	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-375	7842	7506	4
629	5130	190	62	91	chr3	5882291	5884120	-153715663	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1337	5907	3583	4
629	318	267	0	55	chr3	5884148	5884239	-153715544	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4867	2539	2454	4
629	468	178	93	0	chr3	5884250	5884368	-153715415	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5557	1849	1721	4
629	1284	231	125	26	chr3	5884368	5884853	-153714930	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4783	623	241	4
629	342	273	24	32	chr3	5885080	5885205	-153714578	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-6940	304	181	4
629	534	268	46	23	chr3	5885774	5885904	-153713879	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	4
629	1138	241	158	19	chr3	5886292	5886660	-153713123	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
629	573	303	76	58	chr3	5892115	5892458	-153707325	-	MT2A	LTR	ERVL	-184	349	1	4
629	1034	256	0	109	chr3	5892738	5893013	-153706770	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	476	4
629	1541	231	57	95	chr3	5893013	5893506	-153706277	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	138	4
629	237	242	0	61	chr3	5893556	5893622	-153706161	-	RMER6D	LTR	ERVK	-272	448	387	4
629	3183	65	12	0	chr3	5895618	5896034	-153703749	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	4
630	1680	229	71	2	chr3	5909384	5909778	-153690005	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
630	902	184	36	41	chr3	5909778	5909999	-153689784	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1039	4
630	234	312	26	26	chr3	5911218	5911333	-153688450	-	MTC-int	LTR	MaLR	-851	407	293	4
630	370	181	213	0	chr3	5911322	5911416	-153688367	-	MTC	LTR	MaLR	-307	114	1	4
630	404	326	69	28	chr3	5924856	5925001	-153674782	+	MTE-int	LTR	MaLR	752	902	-678	4
630	257	314	74	25	chr3	5925050	5925171	-153674612	+	ORR1E	LTR	MaLR	224	350	-9	4
630	1768	206	118	15	chr3	5925247	5925766	-153674017	-	RMER6C	LTR	ERVK	-116	574	3	4
630	426	306	199	49	chr3	5938247	5938573	-153661210	+	MLT2B5	LTR	ERVL	8	382	-335	4
630	416	323	24	37	chr3	5938863	5939027	-153660756	+	MLT2B5	LTR	ERVL	373	534	-20	4
630	311	391	78	0	chr3	5939820	5939999	-153659784	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-41	514	322	4
630	348	172	0	33	chr3	5943982	5944042	-153655741	-	RLTR1	LTR	ERV1	-72	552	495	4
630	1010	210	44	21	chr3	5955658	5955893	-153643890	+	ORR1B2	LTR	MaLR	73	310	-74	5
630	614	316	18	58	chr3	5962700	5962925	-153636858	+	MTEb	LTR	MaLR	1	216	-163	5
630	3879	77	0	9	chr3	5970684	5971232	-153628551	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	2	818	-215	5
630	2170	87	13	6	chr3	5972721	5973035	-153626748	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	493	808	0	5
630	3328	33	5	5	chr3	5975551	5975947	-153623836	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
630	2803	22	0	0	chr3	5978170	5978492	-153621291	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	5
630	530	321	0	6	chr3	5986968	5987128	-153612655	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	163	-211	5
630	2267	215	118	82	chr3	5988801	5989671	-153610112	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	5
630	440	245	10	19	chr3	5993489	5993593	-153606190	+	MTC	LTR	MaLR	314	416	-5	5
630	269	343	71	7	chr3	6004759	6004900	-153594883	-	MLT1B	LTR	MaLR	-240	150	1	5
630	268	333	33	25	chr3	6006385	6006505	-153593278	+	ORR1E	LTR	MaLR	77	197	-162	9
630	453	323	107	110	chr3	6018280	6018617	-153581166	-	MTE2b	LTR	MaLR	-43	336	1	2
631	370	342	73	5	chr3	6029796	6030016	-153569767	-	LTR80B	LTR	ERVL	-61	523	289	3
631	2231	160	8	15	chr3	6030844	6031238	-153568545	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-3	391	1	4
631	668	213	47	65	chr3	6031261	6031469	-153568314	-	MT2B	LTR	ERVL	-300	193	1	4
631	437	168	54	70	chr3	6033115	6033301	-153566482	+	RMER17C	LTR	ERVK	90	272	-138	4
631	284	261	115	98	chr3	6033972	6034206	-153565577	+	RLTR15	LTR	ERVK	105	342	-17	4
631	581	295	39	56	chr3	6035136	6035420	-153564363	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	3775	4053	-2497	4
631	5522	144	21	28	chr3	6050996	6051792	-153547991	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	808	-150	5
631	2510	120	45	13	chr3	6051792	6052188	-153547595	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	5
631	5522	144	21	28	chr3	6052188	6052355	-153547428	+	RMER17B	LTR	ERVK	809	957	-1	5
631	1534	273	69	76	chr3	6052478	6053369	-153546414	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4331	5165	-1385	4
631	265	227	77	39	chr3	6053447	6053525	-153546258	+	RMER4B	LTR	ERVK	458	538	-47	5
631	694	232	78	15	chr3	6053525	6053661	-153546122	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	7873	7919	-1040	4
631	694	174	30	6	chr3	6053699	6053823	-153545960	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	7920	8043	-916	4
631	1535	185	59	0	chr3	6053824	6054127	-153545656	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	5
631	1244	208	8	12	chr3	6054131	6054375	-153545408	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	243	-1720	5
631	2045	109	3	73	chr3	6054376	6054733	-153545050	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-5	332	1	5
631	23299	9	4	0	chr3	6054733	6057679	-153542104	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3525	5
631	919	81	24	0	chr3	6057679	6057802	-153541981	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4785	6
631	1823	107	8	0	chr3	6057799	6058051	-153541732	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2244	6
631	961	50	0	0	chr3	6058046	6058165	-153541618	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5004	1477	1359	6
631	4930	57	13	36	chr3	6058165	6058837	-153540946	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	6	6
631	2047	106	3	78	chr3	6058837	6059196	-153540587	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-5	332	1	6
631	1395	249	3	34	chr3	6059199	6059527	-153540256	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	240	557	-1406	5
631	3018	33	3	35	chr3	6061203	6061580	-153538203	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	6
631	1348	47	6	6	chr3	6061580	6061752	-153538031	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	172	-7409	6
631	242	260	0	0	chr3	6061752	6061802	-153537981	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	272	-37	6
631	364	65	0	0	chr3	6061802	6061848	-153537935	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	222	267	-7314	6
631	346	89	0	0	chr3	6062075	6062120	-153537663	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	93	137	-6405	6
631	2719	67	0	0	chr3	6062123	6062464	-153537319	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	652	992	-995	6
631	3809	22	81	0	chr3	6062532	6062988	-153536795	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	6
631	483	305	30	30	chr3	6063020	6063345	-153536438	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	822	1061	-5481	6
631	1558	96	100	0	chr3	6063357	6063586	-153536197	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	5004	5255	-1287	6
631	4181	152	13	3	chr3	6063590	6064269	-153535514	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6995	7680	0	6
631	2843	33	0	118	chr3	6064269	6064683	-153535100	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	6
631	6121	60	20	31	chr3	6076831	6077662	-153522121	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	8
631	797	250	169	44	chr3	6079141	6079501	-153520282	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	8
631	2312	63	119	11	chr3	6087039	6087391	-153512392	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	1
631	576	156	163	0	chr3	6087531	6087666	-153512117	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	376	1
631	1856	167	59	154	chr3	6088099	6088574	-153511209	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	1
631	1266	234	92	23	chr3	6088574	6088890	-153510893	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	27	1
631	1266	234	92	23	chr3	6088928	6088957	-153510826	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-348	26	1	1
631	385	39	0	19	chr3	6089011	6089063	-153510720	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	51	-510	1
631	421	285	65	0	chr3	6093315	6093438	-153506345	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	289	1
631	390	341	98	6	chr3	6093449	6093623	-153506160	-	MTD	LTR	MaLR	-229	190	1	1
631	679	245	7	0	chr3	6093699	6093846	-153505937	+	MTD	LTR	MaLR	6	153	-266	1
631	5269	120	110	16	chr3	6094054	6094870	-153504913	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	890	-93	1
631	5269	120	110	16	chr3	6094917	6094998	-153504785	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	891	982	-1	1
631	1873	139	115	16	chr3	6100855	6101220	-153498563	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-2	401	1	1
631	270	278	43	43	chr3	6101542	6101636	-153498147	-	MER50-int	LTR	ERV1	-6816	389	296	1
631	1023	293	40	46	chr3	6118689	6119061	-153480722	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
631	749	116	0	0	chr3	6121584	6121696	-153478087	+	ORR1B1	LTR	MaLR	283	394	0	1
631	2648	56	3	0	chr3	6128096	6128435	-153471348	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	-5	340	1	1
631	2098	102	31	19	chr3	6138248	6138569	-153461214	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-2	325	1	1
631	1662	193	13	3	chr3	6147294	6147600	-153452183	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	1
631	2663	141	141	14	chr3	6153878	6154381	-153445402	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	1
631	2196	159	83	55	chr3	6155731	6156165	-153443618	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	1
631	3474	47	28	0	chr3	6157547	6157971	-153441812	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	1
631	7319	48	3	52	chr3	6157971	6158955	-153440828	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	6646	1
78	41078	46	1	3	chr3	6158941	6163895	-153435888	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	870	1
632	1391	97	36	3	chr3	6163893	6164195	-153435588	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7182	399	1	1
632	3388	57	28	0	chr3	6164195	6164617	-153435166	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	3	1
632	828	348	47	22	chr3	6169621	6169982	-153429801	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	2	1
632	1194	189	109	102	chr3	6170103	6170517	-153429266	+	RMER16	LTR	ERVK	1	493	-40	1
632	306	179	44	15	chr3	6170789	6170857	-153428926	+	RMER16	LTR	ERVK	464	533	0	1
632	1651	237	29	11	chr3	6171023	6171402	-153428381	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	2
632	229	220	0	78	chr3	6173598	6173662	-153426121	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	301	2
632	516	300	106	68	chr3	6173907	6174200	-153425583	+	RLTR9A	LTR	ERVK	65	368	0	2
632	7958	204	96	66	chr3	6174744	6178221	-153421562	+	RMER16-int	LTR	ERVK	249	4094	-3312	1
632	254	330	8	8	chr3	6186375	6186494	-153413289	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	119	-437	2
632	389	350	16	63	chr3	6186763	6187016	-153412767	+	RMER15	LTR	ERVL	307	547	-28	2
632	1106	186	97	51	chr3	6188379	6188690	-153411093	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	427	2
632	2541	98	0	70	chr3	6194802	6195275	-153404508	-	RMER17A	LTR	ERVK	-311	440	1	2
632	593	298	42	37	chr3	6195923	6196139	-153403644	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	152	2
632	495	292	217	30	chr3	6196136	6196386	-153403397	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-34	340	16	2
632	388	224	0	0	chr3	6196491	6196567	-153403216	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-296	78	3	2
632	2042	108	177	0	chr3	6201505	6201877	-153397906	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-85	447	10	2
632	615	316	21	14	chr3	6201937	6202216	-153397567	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-51	7727	7447	2
632	262	307	48	38	chr3	6202755	6202860	-153396923	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-2012	5589	5484	2
632	624	292	21	43	chr3	6203065	6203251	-153396532	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1048	4015	3834	2
632	2922	84	23	0	chr3	6206857	6207248	-153392535	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
632	1271	222	101	94	chr3	6216016	6216414	-153383369	-	MTC-int	LTR	MaLR	-488	770	276	2
632	1815	210	51	22	chr3	6218138	6218547	-153381236	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
632	239	304	59	34	chr3	6227811	6227930	-153371853	+	MTEa	LTR	MaLR	258	379	0	2
632	599	214	72	48	chr3	6231471	6231638	-153368145	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	171	-456	2
632	1624	242	21	95	chr3	6232028	6232512	-153367271	+	RMER20B	LTR	ERVK	178	625	-2	2
632	2839	41	15	0	chr3	6235546	6235887	-153363896	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
632	13170	57	32	1	chr3	6235887	6237624	-153362159	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	2
632	2960	38	0	0	chr3	6237624	6237970	-153361813	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
632	1467	155	30	11	chr3	6242706	6242974	-153356809	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	484	3
632	908	177	15	26	chr3	6246162	6246429	-153353354	+	RMER17A	LTR	ERVK	262	525	-226	3
632	2065	168	36	36	chr3	6249716	6250105	-153349678	+	RLTR23	LTR	ERV1	41	429	-1	3
632	2239	109	188	5	chr3	6263797	6264165	-153335618	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	435	-1	3
632	668	78	0	0	chr3	6264165	6264255	-153335528	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3	92	-7489	3
632	250	259	0	18	chr3	6264256	6264311	-153335472	+	RLTR27	LTR	ERVK	222	275	-34	3
632	4479	107	28	7	chr3	6264311	6264992	-153334791	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	225	919	-6662	3
632	3385	35	2	0	chr3	6265003	6265398	-153334385	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
632	8924	41	7	0	chr3	6265398	6266488	-153333295	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
632	3421	25	5	0	chr3	6266488	6266882	-153332901	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
632	523	111	0	0	chr3	6266898	6266979	-153332804	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	872	952	-6629	3
632	1596	183	182	38	chr3	6267071	6267515	-153332268	+	RMER16-int	LTR	ERVK	312	819	-4587	3
632	21314	73	10	28	chr3	6267900	6270765	-153329018	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4768	7581	0	3
632	2197	129	160	5	chr3	6270765	6271140	-153328643	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	433	-3	3
632	242	326	87	0	chr3	6272467	6272559	-153327224	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-258	107	8	3
632	227	388	0	8	chr3	6280653	6280775	-153319008	+	ORR1E	LTR	MaLR	35	155	-204	3
632	369	240	31	20	chr3	6283958	6284056	-153315727	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	99	-280	3
632	266	375	49	0	chr3	6284409	6284593	-153315190	+	MT2A	LTR	ERVL	264	456	-77	3
632	325	317	90	17	chr3	6288075	6288309	-153311474	-	MER34A1	LTR	ERV1	-20	567	317	3
632	2235	183	34	75	chr3	6290555	6291140	-153308643	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	3
633	427	262	40	20	chr3	6291576	6291728	-153308055	+	LTR48B	LTR	ERV1	168	322	-322	3
633	304	267	51	17	chr3	6291702	6291820	-153307963	+	LTR48B	LTR	ERV1	621	742	-45	3
633	560	209	54	7	chr3	6321888	6322037	-153277746	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	690	535	3
633	312	251	81	71	chr3	6322341	6322474	-153277309	-	RMER6D	LTR	ERVK	-156	534	402	3
633	1426	214	101	24	chr3	6322508	6322967	-153276816	-	RMER6D	LTR	ERVK	-255	465	1	3
633	3964	76	16	4	chr3	6324235	6324748	-153275035	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	3
633	510	49	43	5	chr3	6326217	6326301	-153273482	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-6	323	223	3
633	1353	137	79	88	chr3	6328952	6329257	-153270526	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	20	3
633	2902	87	26	3	chr3	6330520	6330911	-153268872	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
633	1744	251	93	60	chr3	6337667	6338185	-153261598	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	29	563	0	4
633	534	268	46	23	chr3	6338681	6338811	-153260972	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7070	7202	-204	4
633	286	307	36	68	chr3	6339381	6339573	-153260210	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	181	366	-6878	4
633	1388	224	104	30	chr3	6339738	6340232	-153259551	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	241	668	-5469	4
633	468	178	93	0	chr3	6340232	6340350	-153259433	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1721	1849	-5557	4
633	345	259	0	59	chr3	6340361	6340469	-153259314	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	2454	2653	-3155	4
633	5113	189	62	91	chr3	6340480	6342308	-153257475	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3583	5907	-1337	4
633	875	321	16	9	chr3	6342331	6342652	-153257131	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7506	7828	-389	4
633	3955	185	27	10	chr3	6342680	6343378	-153256405	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6493	7202	-204	4
633	1091	221	164	157	chr3	6351650	6351880	-153247903	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	466	4
633	1362	236	209	12	chr3	6352513	6352637	-153247146	-	RMER6C	LTR	ERVK	-111	579	445	4
633	1362	236	209	12	chr3	6352660	6353019	-153246764	-	RMER6C	LTR	ERVK	-246	444	2	4
633	2104	116	13	3	chr3	6375236	6375540	-153224243	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	307	-2	4
633	297	146	38	57	chr3	6375567	6375620	-153224163	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	163	267	-7314	4
633	609	250	51	41	chr3	6375659	6375855	-153223928	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	655	852	-1135	4
633	416	348	55	30	chr3	6376203	6376568	-153223215	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	665	1038	-5504	4
633	2531	303	40	42	chr3	6376680	6378212	-153221571	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3950	5478	-2103	4
633	428	314	17	17	chr3	6378699	6378871	-153220912	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6898	7069	-512	4
633	1328	196	4	23	chr3	6379005	6379271	-153220512	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7321	7581	0	4
633	2155	105	13	7	chr3	6379271	6379577	-153220206	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	308	-1	4
633	2180	125	189	5	chr3	6391349	6391798	-153207985	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	4
633	2641	142	34	0	chr3	6392432	6392846	-153206937	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	157	4
633	2975	154	12	47	chr3	6392839	6393397	-153206386	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1403	560	22	4
633	1907	145	22	0	chr3	6393397	6393714	-153206069	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-3	324	1	4
633	1431	214	14	0	chr3	6395972	6396248	-153203535	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	282	-96	4
633	425	331	40	105	chr3	6396256	6396560	-153203223	+	MTEa	LTR	MaLR	96	379	0	4
633	1982	123	149	18	chr3	6400494	6400891	-153198892	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-83	449	1	4
633	1745	314	43	88	chr3	6400997	6402447	-153197336	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-133	4930	3546	4
633	605	333	34	33	chr3	6402794	6403185	-153196598	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-3156	4450	4112	4
633	1028	326	93	49	chr3	6403330	6404396	-153195387	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-5265	2513	1401	4
633	768	111	163	0	chr3	6404643	6404796	-153194987	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	355	4
633	1024	249	84	18	chr3	6409042	6409316	-153190467	+	RMER21B	LTR	ERV1	274	565	-277	4
633	1424	293	77	20	chr3	6409720	6410211	-153189572	-	RMER15	LTR	ERVL	-51	524	6	4
634	226	298	69	69	chr3	6422630	6422731	-153177052	-	RLTR45	LTR	ERVK	-378	104	4	5
634	3159	170	14	14	chr3	6426434	6427017	-153172766	-	RMER4B	LTR	ERVK	-2	583	1	5
634	1375	292	75	33	chr3	6431783	6432265	-153167518	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	610	109	5
634	374	204	21	43	chr3	6433575	6433689	-153166094	-	RMER19C	LTR	ERVK	-620	117	1	5
634	596	292	88	30	chr3	6445196	6445479	-153154304	+	MLT1C	LTR	MaLR	180	497	-8	5
634	1068	245	34	67	chr3	6462890	6463218	-153136565	+	RMER10A	LTR	ERVL	17	333	-109	5
634	474	284	38	13	chr3	6469172	6469329	-153130454	+	RMER10A	LTR	ERVL	282	442	0	5
634	1747	228	146	34	chr3	6480091	6480671	-153119112	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	5
634	2281	66	122	11	chr3	6480718	6481069	-153118714	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	5
634	321	256	10	62	chr3	6484230	6484326	-153115457	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	365	455	-106	5
634	1468	188	17	75	chr3	6494679	6495024	-153104759	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-4	325	1	5
634	262	283	40	20	chr3	6498192	6498293	-153101490	-	MLT1A	LTR	MaLR	-253	121	19	5
634	1688	236	32	62	chr3	6503733	6503878	-153095905	+	MTC	LTR	MaLR	1	145	-276	6
634	2107	142	33	119	chr3	6503878	6504366	-153095417	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	7
634	1688	236	32	62	chr3	6504366	6504654	-153095129	+	MTC	LTR	MaLR	146	421	0	6
634	852	306	72	42	chr3	6523970	6524301	-153075482	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	347	-12	3
634	4503	139	89	12	chr3	6529147	6529979	-153069804	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	896	-10	3
634	237	321	0	0	chr3	6530991	6531047	-153068736	+	MLT1B	LTR	MaLR	279	334	-56	3
634	240	284	15	0	chr3	6548525	6548592	-153051191	+	MT2B2	LTR	ERVL	167	234	-350	5
634	254	321	18	28	chr3	6553439	6553548	-153046235	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	432	5
635	1440	249	27	16	chr3	6554304	6554672	-153045111	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	6
635	550	241	170	51	chr3	6555696	6555956	-153043827	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	104	6
635	2193	295	46	43	chr3	6555975	6558452	-153041331	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-202	7042	3270	6
635	372	267	46	40	chr3	6558501	6558653	-153041130	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-4149	2393	2241	6
635	385	192	64	55	chr3	6558827	6558937	-153040846	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1559	428	318	6
635	544	270	164	21	chr3	6558953	6559191	-153040592	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	6
635	828	210	252	61	chr3	6559395	6559689	-153040094	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	2	351	-45	6
635	291	242	44	132	chr3	6565904	6566018	-153033765	-	MT2B	LTR	ERVL	-345	256	153	7
635	349	277	77	14	chr3	6570765	6570908	-153028875	+	LTR80A	LTR	ERVL	103	254	-329	8
635	588	346	92	15	chr3	6584442	6584805	-153014978	+	MER31A	LTR	ERV1	1	390	-76	1
635	2408	167	170	33	chr3	6585298	6585595	-153014188	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	374	1
635	2408	167	170	33	chr3	6585668	6585976	-153013807	-	RMER6C	LTR	ERVK	-317	373	2	1
635	904	128	57	0	chr3	6587291	6587432	-153012351	+	ORR1A3	LTR	MaLR	178	326	0	1
635	8009	164	55	76	chr3	6587433	6589191	-153010592	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	2	1722	-241	1
635	279	242	49	2	chr3	6592207	6592293	-153007490	+	MTEa	LTR	MaLR	1	91	-288	1
635	349	248	111	8	chr3	6593041	6593167	-153006616	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-4613	1101	963	1
635	742	314	95	17	chr3	6597486	6597845	-153001938	+	RMER5	LTR	ERV1	112	498	-36	1
635	3561	27	48	51	chr3	6598622	6599096	-153000687	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	3	1
635	566	384	101	0	chr3	6628391	6628719	-152971064	-	RMER15	LTR	ERVL	-17	558	198	1
635	3021	61	10	0	chr3	6637940	6638332	-152961451	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
635	1180	372	91	55	chr3	6639279	6640413	-152959370	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	355	1529	-51	1
635	460	357	14	0	chr3	6640413	6640556	-152959227	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	147	-212	1
635	407	349	88	44	chr3	6643842	6644202	-152955581	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	368	-2	1
635	410	350	24	30	chr3	6644204	6644369	-152955414	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1	164	-1416	1
635	1074	112	15	101	chr3	6645722	6645920	-152953863	+	RMER17A	LTR	ERVK	571	751	0	1
635	748	346	8	8	chr3	6648388	6648624	-152951159	-	MTEa	LTR	MaLR	-143	236	1	1
635	2813	23	2	204	chr3	6667018	6667507	-152932276	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
636	287	356	46	100	chr3	6685801	6686041	-152913742	+	MLT1I	LTR	MaLR	63	289	-122	2
636	1115	214	13	26	chr3	6686413	6686639	-152913144	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	223	-404	2
636	1926	117	73	37	chr3	6686708	6687063	-152912720	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	2
636	792	231	243	105	chr3	6688480	6688945	-152910838	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	3	2
636	1429	219	89	3	chr3	6689058	6689406	-152910377	-	RLTR30	LTR	ERV1	-1	378	1	2
636	929	248	166	133	chr3	6689429	6689826	-152909957	-	MT2A	LTR	ERVL	0	601	86	2
636	929	243	177	141	chr3	6690006	6690094	-152909689	-	MT2A	LTR	ERVL	-448	85	1	2
636	5198	229	63	76	chr3	6690094	6690521	-152909262	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-34	5727	5340	2
636	5198	229	63	76	chr3	6690690	6691742	-152908041	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-422	5339	4268	2
636	438	385	51	28	chr3	6692510	6692938	-152906845	-	MLT1F1-int	LTR	MaLR	-215	1274	837	2
636	238	375	56	60	chr3	6693931	6694215	-152905568	-	MLT1F1-int	LTR	MaLR	-1199	290	8	2
636	244	350	86	32	chr3	6694218	6694404	-152905379	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-12	557	362	2
636	3083	162	100	26	chr3	6727224	6727923	-152871860	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	2
636	267	305	63	56	chr3	6737826	6737961	-152861822	-	MTE-int	LTR	MaLR	-47	1533	1361	2
636	1959	155	7	3	chr3	6744992	6745302	-152854481	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	2
636	761	78	10	0	chr3	6745302	6745404	-152854379	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	103	-7478	2
636	234	214	0	0	chr3	6745404	6745446	-152854337	+	RLTR27	LTR	ERVK	231	272	-37	2
636	640	157	52	0	chr3	6745469	6745584	-152854199	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	441	561	-7020	2
636	1084	128	45	25	chr3	6745567	6745768	-152854015	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	668	872	-6709	2
636	1529	186	196	33	chr3	6745745	6746174	-152853609	+	RMER16-int	LTR	ERVK	317	815	-4591	2
636	310	119	0	0	chr3	6746170	6746212	-152853571	+	RMER16-int	LTR	ERVK	951	992	-995	2
636	521	300	34	26	chr3	6746351	6746630	-152853153	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	822	1061	-5481	2
636	319	216	0	13	chr3	6746646	6746721	-152853062	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	447	520	-6022	2
636	1525	100	121	0	chr3	6746688	6746927	-152852856	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	4988	5255	-1287	2
636	2007	117	35	1	chr3	6746927	6747307	-152852476	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6965	7385	-295	2
636	1515	195	47	65	chr3	6747307	6747751	-152852032	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	2
636	652	330	109	33	chr3	6749886	6750252	-152849531	-	MTE-int	LTR	MaLR	-255	1325	932	2
636	2552	43	0	47	chr3	6750722	6751060	-152848723	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
636	483	304	39	65	chr3	6755880	6756207	-152843576	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1084	496	158	3
636	2739	238	13	26	chr3	6756150	6756775	-152843008	+	RMER20B	LTR	ERVK	10	626	-1	3
636	1067	298	44	85	chr3	6757162	6757365	-152842418	+	MTD	LTR	MaLR	2	182	-237	3
636	1067	298	44	85	chr3	6757504	6757736	-152842047	+	MTD	LTR	MaLR	183	419	0	3
636	338	219	0	0	chr3	6758654	6758718	-152841065	+	MTD	LTR	MaLR	13	76	-343	3
636	322	294	11	0	chr3	6758805	6758897	-152840886	+	MTD	LTR	MaLR	226	318	-101	3
636	402	298	27	55	chr3	6758900	6759120	-152840663	-	RLTR15	LTR	ERVK	-9	350	137	3
636	488	274	66	57	chr3	6759640	6759884	-152839899	-	RLTR15	LTR	ERVK	-22	337	92	3
636	392	211	14	7	chr3	6759885	6759997	-152839786	+	MTD	LTR	MaLR	307	421	0	3
636	3756	167	81	69	chr3	6761010	6761940	-152837843	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-181	847	1	3
636	246	294	108	8	chr3	6763610	6763730	-152836053	-	MLT1B	LTR	MaLR	-49	341	210	3
636	275	337	21	21	chr3	6764323	6764420	-152835363	+	MLT1F	LTR	MaLR	393	489	-59	3
636	5176	121	17	67	chr3	6767760	6768710	-152831073	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	3
636	522	345	131	27	chr3	6769014	6769312	-152830471	+	MTEa	LTR	MaLR	1	329	-50	3
636	1927	166	6	0	chr3	6769528	6769853	-152829930	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
636	1835	158	16	6	chr3	6790553	6790871	-152808912	+	ORR1A4	LTR	MaLR	9	329	0	3
636	7144	47	1	0	chr3	6798458	6799309	-152800474	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2041	5639	4788	3
636	4118	117	12	13	chr3	6799309	6799987	-152799796	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-6455	1058	382	3
636	1845	63	0	12	chr3	6799984	6800225	-152799558	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-7275	238	1	3
636	3173	50	3	0	chr3	6800225	6800609	-152799174	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	3
636	317	227	25	51	chr3	6815157	6815236	-152784547	-	MTC	LTR	MaLR	-344	77	1	3
637	1121	220	4	22	chr3	6817221	6817453	-152782330	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-150	234	7	4
637	712	273	52	9	chr3	6821198	6821404	-152778379	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	204	-412	4
637	421	305	51	57	chr3	6822101	6822278	-152777505	+	RLTR18B	LTR	ERVK	93	268	-244	4
637	587	211	26	39	chr3	6823299	6823452	-152776331	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	151	-807	4
637	1460	261	44	50	chr3	6823456	6824060	-152775723	+	RMER13B	LTR	ERVK	321	914	-44	4
637	6999	59	10	1	chr3	6829915	6830800	-152768983	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	4
637	2856	30	3	0	chr3	6837769	6838100	-152761683	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	4
637	1566	147	0	42	chr3	6842110	6842192	-152757591	-	RMER6C	LTR	ERVK	-3	687	612	4
637	5386	148	19	37	chr3	6842192	6843234	-152756549	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	4
637	1566	147	0	42	chr3	6843234	6843436	-152756347	-	RMER6C	LTR	ERVK	-79	611	415	4
637	551	182	81	24	chr3	6843491	6843670	-152756113	-	RMER6C	LTR	ERVK	-487	233	1	4
637	3023	71	2	5	chr3	6861967	6862364	-152737419	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
637	7975	77	17	2	chr3	6862364	6863446	-152736337	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
637	2900	75	18	5	chr3	6863446	6863837	-152735946	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
637	1560	141	54	26	chr3	6864475	6864788	-152734995	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
637	5353	116	78	9	chr3	6864820	6865668	-152734115	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	4
637	499	248	0	34	chr3	6865670	6865787	-152733996	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	3	115	-1613	4
637	4678	142	69	54	chr3	6866166	6867170	-152732613	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	708	1726	-2	4
637	803	160	33	20	chr3	6867172	6867325	-152732458	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	155	-751	4
637	341	155	94	12	chr3	6867303	6867388	-152732395	+	RMER17A2	LTR	ERVK	815	906	0	4
637	284	328	115	74	chr3	6869226	6869549	-152730234	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-1	364	29	4
637	4481	51	20	7	chr3	6874483	6875040	-152724743	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	4
637	329	217	45	67	chr3	6879712	6879801	-152719982	+	RLTR41	LTR	ERV1	91	177	-269	4
637	1773	172	39	7	chr3	6879819	6880124	-152719659	+	RLTR41	LTR	ERV1	132	446	0	4
637	435	330	27	90	chr3	6906926	6907149	-152692634	+	MER54A	LTR	ERVL	211	419	-482	5
637	226	308	12	49	chr3	6907179	6907261	-152692522	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	713	791	-1001	5
637	4412	12	2	0	chr3	6909931	6910423	-152689360	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
637	47156	17	7	0	chr3	6910423	6915746	-152684037	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	5
637	375	179	46	35	chr3	6915746	6915833	-152683950	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	5
637	314	0	0	0	chr3	6915833	6915871	-152683912	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	5
637	4412	12	2	0	chr3	6915871	6916363	-152683420	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
637	4576	117	132	19	chr3	6922464	6923274	-152676509	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	5
637	3238	51	0	5	chr3	6938011	6938409	-152661374	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
637	261	213	0	0	chr3	6938578	6938625	-152661158	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	478	524	-3	5
638	243	222	0	0	chr3	6948732	6948777	-152651006	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	45	-484	5
638	258	275	170	82	chr3	6949442	6949624	-152650159	+	RLTR24	LTR	ERV1	332	529	0	5
638	526	185	12	56	chr3	6950252	6950412	-152649371	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	259	5
638	1362	51	4	4	chr3	6950527	6950704	-152649079	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7314	267	41	5
638	2535	51	102	3	chr3	6950714	6951046	-152648737	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	5
638	621	267	103	0	chr3	6963214	6963379	-152636404	-	MTD	LTR	MaLR	-108	311	130	5
638	4195	151	41	86	chr3	6965992	6966933	-152632850	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-3	899	1	5
638	227	295	0	0	chr3	6966933	6966994	-152632789	-	MTD	LTR	MaLR	-311	108	48	5
638	1397	245	112	3	chr3	6990117	6990493	-152609290	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	5	6
638	613	290	88	91	chr3	6991008	6991372	-152608411	+	MTEa	LTR	MaLR	17	379	0	6
638	763	310	40	49	chr3	6991540	6991595	-152608188	+	MTE-int	LTR	MaLR	82	140	-1440	6
638	4155	58	49	2	chr3	6991595	6992130	-152607653	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	6
638	763	310	40	49	chr3	6992130	6992403	-152607380	+	MTE-int	LTR	MaLR	141	407	-1173	6
638	3416	35	0	0	chr3	6992479	6992875	-152606908	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
638	2806	36	0	114	chr3	7000207	7000619	-152599164	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	1
638	566	365	28	45	chr3	7002575	7002862	-152596921	-	ORR1E	LTR	MaLR	-75	284	3	3
638	290	158	60	95	chr3	7004472	7004556	-152595227	+	RLTR25B	LTR	ERVK	429	509	-519	7
638	427	184	84	89	chr3	7016704	7016895	-152582888	+	RMER17A	LTR	ERVK	221	410	-341	2
638	4954	138	53	12	chr3	7038588	7039452	-152560331	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-6	900	1	4
638	4020	54	78	17	chr3	7047377	7047905	-152551878	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	6
638	2431	97	152	2	chr3	7049879	7050292	-152549491	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
638	3128	89	51	32	chr3	7050332	7051128	-152548655	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	10	662	-5819	6
638	2228	68	0	0	chr3	7051128	7051406	-152548377	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	6
638	6074	47	4	7	chr3	7051405	7052153	-152547630	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6481	0	6
638	2264	96	132	0	chr3	7052153	7052516	-152547267	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	411	0	6
638	263	105	0	0	chr3	7052518	7052556	-152547227	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	40	-1947	6
638	3009	68	22	23	chr3	7052556	7053215	-152546568	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	18	599	-5882	6
638	358	308	41	8	chr3	7053637	7053758	-152546025	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	125	-249	7
638	263	308	68	34	chr3	7058121	7058269	-152541514	-	MER77	LTR	ERVL	-48	559	407	7
638	339	292	32	83	chr3	7060686	7060843	-152538940	-	RMER15	LTR	ERVL	-153	422	274	8
638	1594	148	89	129	chr3	7060929	7061424	-152538359	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	8
638	1290	188	94	34	chr3	7063645	7063942	-152535841	-	RLTR46	LTR	ERVK	-5	315	1	8
638	3077	45	0	0	chr3	7066270	7066627	-152533156	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	9
638	1655	79	4	4	chr3	7075037	7075265	-152524518	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	180	9
639	1577	164	77	62	chr3	7081185	7081509	-152518274	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
639	2511	182	45	21	chr3	7081587	7082099	-152517684	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-3	524	1	1
639	3077	15	0	0	chr3	7106712	7107054	-152492729	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-4	342	1	1
639	13625	51	25	1	chr3	7107054	7108804	-152490979	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1	1
639	2896	35	15	0	chr3	7108804	7109145	-152490638	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	1
639	4005	131	9	65	chr3	7118346	7119135	-152480648	+	RMER17D2	LTR	ERVK	65	809	0	1
639	1023	222	5	14	chr3	7119434	7119653	-152480130	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	67	283	-6636	1
639	4311	214	45	6	chr3	7121078	7122030	-152477753	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	294	1282	-5637	1
639	5371	151	71	4	chr3	7122030	7123095	-152476688	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	4665	5800	-1119	1
639	369	189	0	0	chr3	7123091	7123165	-152476618	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	5951	6024	-895	1
639	4877	110	36	28	chr3	7123196	7123972	-152475811	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-26	782	1	1
639	841	55	0	9	chr3	7124043	7124153	-152475630	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	404	1
639	1806	120	87	38	chr3	7124151	7124497	-152475286	+	RLTR9E	LTR	ERVK	47	409	0	1
639	816	271	75	39	chr3	7128682	7129181	-152470602	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-152	464	1	1
639	1856	243	22	14	chr3	7133415	7133829	-152465954	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	3	1
639	2876	242	78	29	chr3	7133848	7134683	-152465100	-	MTC-int	LTR	MaLR	-3	1255	380	1
639	458	272	48	8	chr3	7138872	7138998	-152460785	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-206	7200	7070	1
639	539	280	62	53	chr3	7139013	7139368	-152460415	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	2	1
639	835	218	63	127	chr3	7141617	7141948	-152457835	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-1	321	12	1
639	443	122	23	68	chr3	7141952	7142040	-152457743	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	0	7406	7323	1
639	536	230	239	22	chr3	7142040	7142400	-152457383	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-371	531	93	1
639	4552	125	9	0	chr3	7142401	7143047	-152456736	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-263	7143	6492	1
639	5817	124	13	81	chr3	7143042	7144213	-152455570	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3744	1100	10	1
639	918	224	20	70	chr3	7144223	7144521	-152455262	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	40	1
639	573	192	33	0	chr3	7153182	7153302	-152446481	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	401	1
639	3042	197	45	19	chr3	7153293	7153915	-152445868	+	RLTR26	LTR	ERVK	5	642	0	1
639	1859	206	45	8	chr3	7153915	7153952	-152445831	-	RLTR28	LTR	ERVL	-112	412	367	1
639	1859	206	45	8	chr3	7154073	7154432	-152445351	-	RLTR28	LTR	ERVL	-158	366	2	1
639	921	192	68	50	chr3	7155145	7155468	-152444315	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	80	1
639	494	285	137	8	chr3	7155531	7155772	-152444011	+	RLTR10A	LTR	ERVK	140	411	0	1
639	337	198	54	54	chr3	7155788	7155900	-152443883	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	318	429	-1558	1
639	780	262	78	60	chr3	7156052	7156499	-152443284	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	2218	2672	-3870	1
639	1528	322	49	47	chr3	7156500	7158405	-152441378	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3208	5080	-1462	1
639	1655	225	11	23	chr3	7158523	7159005	-152440778	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6590	7042	-202	1
639	427	278	207	19	chr3	7159019	7159264	-152440519	+	RLTR10A	LTR	ERVK	104	410	-1	1
639	378	300	11	49	chr3	7159402	7159465	-152440318	-	RMER17C	LTR	ERVK	-157	253	189	1
639	378	300	11	49	chr3	7159642	7159841	-152439942	-	RMER17C	LTR	ERVK	-222	188	2	1
639	983	260	115	17	chr3	7164445	7164793	-152434990	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	1
639	4142	155	97	32	chr3	7166391	7167238	-152432545	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	1
639	442	289	92	7	chr3	7170607	7170760	-152429023	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1388	192	27	1
639	468	188	0	38	chr3	7172394	7172499	-152427284	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	527	1
639	635	266	6	31	chr3	7172546	7172709	-152427074	+	RMER20B	LTR	ERVK	461	619	-8	1
639	726	270	32	50	chr3	7172884	7173014	-152426769	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	182	316	-6603	1
639	2627	43	65	0	chr3	7173014	7173339	-152426444	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
639	726	270	32	50	chr3	7173339	7173485	-152426298	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	317	453	-6466	1
639	2366	235	37	73	chr3	7173959	7174361	-152425422	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	380	-247	1
639	2357	109	23	3	chr3	7174361	7174711	-152425072	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	1
639	2366	235	37	73	chr3	7174711	7174928	-152424855	+	RMER20B	LTR	ERVK	381	598	-29	1
639	249	325	13	25	chr3	7174933	7175012	-152424771	+	RMER20B	LTR	ERVK	528	605	-22	2
639	236	292	69	77	chr3	7175933	7176006	-152423777	-	MT2B	LTR	ERVL	-436	165	94	2
639	328	263	86	43	chr3	7176430	7176569	-152423214	+	RLTR23	LTR	ERV1	286	430	0	2
639	455	153	11	96	chr3	7177611	7177705	-152422078	+	RMER6B	LTR	ERVK	4	89	-372	2
639	363	69	52	0	chr3	7184316	7184374	-152415409	+	RMER6-int	LTR	ERVK	8	68	-3109	2
639	884	165	243	20	chr3	7184376	7184663	-152415120	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	353	-6	2
639	1149	184	62	8	chr3	7184665	7184922	-152414861	+	RMER6-int	LTR	ERVK	59	329	-2848	2
639	418	305	152	27	chr3	7205122	7205378	-152394405	+	MLT1A	LTR	MaLR	87	374	0	2
640	277	314	8	33	chr3	7212123	7212245	-152387538	-	RLTR15	LTR	ERVK	-239	120	2	2
640	379	380	61	17	chr3	7212322	7212552	-152387231	-	LTR53	LTR	ERVL	-86	433	194	2
640	2398	50	66	0	chr3	7213468	7213785	-152385998	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	2
640	12940	79	8	2	chr3	7213789	7215571	-152384212	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	1792	0	2
640	2552	55	65	0	chr3	7215571	7215896	-152383887	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
640	1865	137	79	164	chr3	7215906	7216376	-152383407	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	2
640	1447	93	0	0	chr3	7216845	7217038	-152382745	-	MTB	LTR	MaLR	-205	195	3	2
640	2140	186	198	26	chr3	7224160	7224426	-152375357	-	RMER6C	LTR	ERVK	-10	680	369	2
640	2140	186	198	26	chr3	7224461	7224774	-152375009	-	RMER6C	LTR	ERVK	-322	368	2	2
640	397	316	104	13	chr3	7229390	7229544	-152370239	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	198	2
640	294	200	44	11	chr3	7229542	7229622	-152370161	-	MTE2a	LTR	MaLR	-333	88	3	2
640	563	222	29	36	chr3	7231575	7231715	-152368068	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	890	2
640	1961	189	102	5	chr3	7231711	7232132	-152367651	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-253	775	314	2
640	255	230	12	108	chr3	7237324	7237407	-152362376	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	75	-333	2
640	569	320	32	103	chr3	7241620	7241844	-152357939	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	156	2
640	3196	36	8	0	chr3	7243426	7243811	-152355972	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	2
640	231	312	53	21	chr3	7255471	7255566	-152344217	+	MLT1G	LTR	MaLR	489	586	-5	3
640	1053	227	117	35	chr3	7259579	7259921	-152339862	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	3
640	253	313	30	20	chr3	7262197	7262298	-152337485	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	275	3
640	7393	175	84	35	chr3	7262661	7263022	-152336761	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	399	761	-1565	3
640	7393	175	84	35	chr3	7263044	7264520	-152335263	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	762	2326	0	3
640	2013	217	16	11	chr3	7264520	7264959	-152334824	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	441	0	3
640	1751	109	27	66	chr3	7266553	7266888	-152332895	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
640	2600	44	28	0	chr3	7267755	7268073	-152331710	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	3
640	1487	132	112	50	chr3	7271509	7271812	-152327971	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-7	322	1	3
640	239	220	0	0	chr3	7278433	7278483	-152321300	+	RLTR18B	LTR	ERVK	144	193	-319	3
640	825	191	88	32	chr3	7281450	7281699	-152318084	+	RMER17B	LTR	ERVK	179	441	-517	3
640	4039	203	43	62	chr3	7281709	7282089	-152317694	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	355	-628	3
640	4039	203	43	62	chr3	7283095	7283704	-152316079	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	356	972	-11	3
640	922	146	6	18	chr3	7283700	7283868	-152315915	+	RMER17C	LTR	ERVK	244	409	-1	3
640	323	146	36	0	chr3	7284585	7284640	-152315143	+	ORR1B2	LTR	MaLR	311	367	0	3
640	571	352	65	44	chr3	7288068	7288229	-152311554	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	212	3
640	571	352	65	44	chr3	7288302	7288434	-152311349	-	MTE2a	LTR	MaLR	-168	211	72	3
640	1988	170	65	10	chr3	7288438	7288505	-152311278	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	342	3
640	1988	170	65	10	chr3	7288567	7288885	-152310898	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-66	341	3	3
640	2376	316	132	70	chr3	7288962	7290304	-152309479	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-2	1578	1	3
640	713	319	26	30	chr3	7290305	7290570	-152309213	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-1	378	115	3
640	227	310	53	53	chr3	7293388	7293463	-152306320	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-321	284	210	3
640	2710	26	6	197	chr3	7301490	7301972	-152297811	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	3
640	8759	24	0	0	chr3	7301974	7302969	-152296814	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	990	3
640	346	248	62	39	chr3	7303051	7303181	-152296602	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-5987	1594	1462	3
640	6792	60	86	11	chr3	7303245	7304187	-152295596	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-989	998	9	3
640	2728	28	6	197	chr3	7304188	7304670	-152295113	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	3
640	665	330	60	11	chr3	7308868	7309135	-152290648	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-78	442	163	3
640	235	369	42	68	chr3	7309536	7309728	-152290055	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-119	412	226	3
640	4820	193	62	14	chr3	7323496	7324559	-152275224	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	1	3
640	261	308	559	24	chr3	7326222	7326396	-152273387	-	ORR1E	LTR	MaLR	-109	270	4	3
640	3157	46	21	0	chr3	7326403	7326791	-152272992	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
640	8650	51	5	21	chr3	7326792	7327906	-152271877	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-1	1097	1	3
640	3221	36	15	0	chr3	7327906	7328296	-152271487	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
640	273	284	161	59	chr3	7328361	7328517	-152271266	+	MTEb	LTR	MaLR	205	379	0	3
640	814	162	124	23	chr3	7329733	7329910	-152269873	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2816	3010	-228	4
640	429	184	9	19	chr3	7329877	7329982	-152269801	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2907	3010	-228	4
640	379	178	29	19	chr3	7329949	7330052	-152269731	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2907	3010	-228	4
640	449	175	9	19	chr3	7330019	7330124	-152269659	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2907	3010	-228	4
640	1523	177	45	39	chr3	7330091	7330421	-152269362	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2907	3238	0	4
640	1304	164	34	66	chr3	7330427	7330747	-152269036	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	310	-100	4
641	965	9	0	0	chr3	7350397	7350513	-152249270	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	4	119	-238	4
641	1056	30	8	0	chr3	7350511	7350642	-152249141	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	223	354	-3	4
641	552	254	0	8	chr3	7354375	7354494	-152245289	-	RLTR40	LTR	ERVK	-6	811	694	4
641	316	275	180	19	chr3	7356246	7356379	-152243404	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	241	4
641	1692	25	0	0	chr3	7358232	7358435	-152241348	+	ORR1A0	LTR	MaLR	144	346	0	4
641	485	308	158	28	chr3	7361215	7361469	-152238314	+	RMER5	LTR	ERV1	27	313	-221	4
641	1383	262	28	6	chr3	7361474	7361827	-152237956	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	58	4
641	612	288	60	5	chr3	7361860	7362059	-152237724	+	RMER5	LTR	ERV1	309	518	-16	4
641	1079	221	47	19	chr3	7364438	7364762	-152235021	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	4
641	471	272	56	28	chr3	7365612	7365790	-152233993	+	RLTR41	LTR	ERV1	264	446	0	4
641	305	161	143	0	chr3	7389325	7389381	-152210402	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	64	-628	4
641	2220	193	37	39	chr3	7389379	7389935	-152209848	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	53	561	0	4
641	531	313	79	97	chr3	7393537	7393982	-152205801	-	MER67D	LTR	ERV1	-77	437	1	4
641	1974	191	41	38	chr3	7394129	7394547	-152205236	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	4
641	21524	103	29	8	chr3	7395442	7398545	-152201238	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1184	6222	3055	4
641	555	233	59	40	chr3	7398545	7398697	-152201086	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4798	2608	2454	4
641	691	167	25	0	chr3	7398710	7398830	-152200953	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5077	1060	938	4
641	253	146	0	0	chr3	7398905	7398953	-152200830	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5218	188	141	4
641	263	203	0	17	chr3	7399392	7399452	-152200331	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5095	2149	2091	4
641	953	212	19	111	chr3	7399446	7399770	-152200013	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4549	295	2	4
641	2333	116	12	49	chr3	7399772	7400197	-152199586	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	4
641	508	358	56	48	chr3	7405342	7405679	-152194104	+	LTR16C	LTR	ERVL	148	487	-2	5
641	1741	170	6	9	chr3	7408778	7409099	-152190684	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	1	5
641	1926	194	47	7	chr3	7425398	7425802	-152173981	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	5
641	1734	215	30	5	chr3	7436318	7436688	-152163095	+	ORR1C2	LTR	MaLR	4	382	-2	5
641	4435	130	48	15	chr3	7448978	7449761	-152150022	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	5
641	2723	199	151	13	chr3	7451256	7452116	-152147667	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1028	0	5
641	1211	188	49	132	chr3	7462528	7462975	-152136808	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	5
641	4978	105	46	18	chr3	7466977	7467221	-152132562	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	245	-561	5
641	3011	68	5	10	chr3	7467221	7467619	-152132164	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
641	4978	105	46	18	chr3	7467619	7468158	-152131625	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	246	806	0	5
642	413	117	65	12	chr3	7483711	7483799	-152115984	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-88	306	145	5
642	851	190	82	26	chr3	7489931	7490163	-152109620	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	245	-165	6
642	376	259	123	47	chr3	7490177	7490207	-152109576	+	ORR1C2	LTR	MaLR	154	186	-188	6
642	573	196	116	0	chr3	7490356	7490495	-152109288	+	ORR1C2	LTR	MaLR	187	346	-38	6
642	2172	154	40	72	chr3	7497948	7498404	-152101379	+	RMER4A	LTR	ERVK	4	444	-22	6
642	1991	167	17	14	chr3	7510232	7510591	-152089192	+	ORR1B2	LTR	MaLR	8	367	0	1
642	3214	48	5	8	chr3	7510721	7511118	-152088665	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
642	1419	209	75	25	chr3	7512233	7512552	-152087231	+	ORR1D1	LTR	MaLR	13	347	-27	1
642	2836	194	58	2	chr3	7512574	7513148	-152086635	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	14	619	-751	1
642	755	159	141	0	chr3	7513184	7513354	-152086429	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1177	1370	0	1
642	545	201	74	57	chr3	7513354	7513530	-152086253	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	184	-175	1
642	389	241	198	73	chr3	7513551	7513687	-152086096	+	ORR1D1	LTR	MaLR	185	352	-7	1
642	3953	167	33	6	chr3	7522242	7522939	-152076844	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	716	-4	3
642	490	256	49	8	chr3	7548845	7548967	-152050816	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-210	7196	7070	6
642	3216	48	5	2	chr3	7550215	7550610	-152049173	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
642	2813	12	3	0	chr3	7563040	7563361	-152036422	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
642	41799	21	1	7	chr3	7563361	7568236	-152031547	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	7
642	2803	12	3	0	chr3	7568236	7568557	-152031226	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
642	322	252	48	48	chr3	7569340	7569444	-152030339	+	MLT1N2	LTR	MaLR	392	495	-67	7
642	264	171	0	0	chr3	7571536	7571577	-152028206	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-517	51	11	8
642	1279	214	160	0	chr3	7578674	7579005	-152020778	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	9
642	4610	231	74	34	chr3	7579005	7580258	-152019525	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1370	67	9
642	317	365	55	55	chr3	7581913	7582113	-152017670	-	MLT1G	LTR	MaLR	-391	200	1	1
642	1350	240	107	0	chr3	7583003	7583340	-152016443	+	MTD	LTR	MaLR	18	390	-29	1
642	2365	171	34	30	chr3	7585172	7585697	-152014086	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	1
642	489	268	88	98	chr3	7592752	7592967	-152006816	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	213	-152	1
643	330	322	29	88	chr3	7605566	7605702	-151994081	+	RMER10B	LTR	ERVL	271	398	0	1
643	251	122	0	39	chr3	7606850	7606901	-151992882	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2138	2186	-3951	1
643	1563	257	72	46	chr3	7606917	7607630	-151992153	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8092	8681	-278	1
643	271	211	0	0	chr3	7607816	7607873	-151991910	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3189	3245	-2892	1
643	334	330	9	9	chr3	7608981	7609088	-151990695	+	RMER10B	LTR	ERVL	269	375	-23	1
643	373	331	13	34	chr3	7631108	7631282	-151968501	+	MLT1A1	LTR	MaLR	10	178	-230	1
643	927	339	81	5	chr3	7631872	7632266	-151967517	+	MLT-int	LTR	MaLR	110	533	-1202	1
643	334	357	30	120	chr3	7632299	7632700	-151967083	+	MLT-int	LTR	MaLR	689	1053	-682	1
643	4381	69	2	12	chr3	7650406	7650976	-151948807	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	1
643	2580	111	15	8	chr3	7651649	7652049	-151947734	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	1
643	2930	38	0	0	chr3	7653629	7653975	-151945808	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	1
643	342	208	26	0	chr3	7657737	7657814	-151941969	+	ORR1E	LTR	MaLR	46	124	-235	1
643	248	346	78	8	chr3	7658076	7658204	-151941579	+	ORR1E	LTR	MaLR	123	259	-111	1
643	1533	224	168	0	chr3	7659937	7660329	-151939454	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	76	2
643	298	218	0	0	chr3	7662808	7662863	-151936920	-	MT2A	LTR	ERVL	-475	58	4	2
643	5176	132	11	67	chr3	7663981	7664936	-151934847	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	2
643	403	314	79	47	chr3	7665173	7665520	-151934263	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	2
643	2908	63	199	12	chr3	7665556	7665987	-151933796	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	2
643	943	170	30	143	chr3	7666344	7666707	-151933076	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
643	383	51	31	78	chr3	7666709	7666773	-151933010	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3	7403	7343	2
643	761	222	134	19	chr3	7666773	7667127	-151932656	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-353	549	118	2
643	7388	199	46	38	chr3	7667127	7670120	-151929663	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-378	4466	2356	2
643	3776	165	66	32	chr3	7670349	7671339	-151928444	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3965	3441	2038	2
643	465	171	136	8	chr3	7671364	7671482	-151928301	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-5321	2085	1953	2
643	2330	169	59	92	chr3	7671478	7672473	-151927310	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-5605	1801	1	2
643	1054	191	58	71	chr3	7672474	7672837	-151926946	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	409	1	2
643	851	172	6	37	chr3	7674919	7675076	-151924707	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-15	379	228	2
643	2086	105	3	9	chr3	7675076	7675394	-151924389	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	316	-11	2
643	588	185	43	43	chr3	7675401	7675542	-151924241	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-156	211	71	2
643	3918	147	48	22	chr3	7682486	7683209	-151916574	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	742	-160	2
643	392	149	136	87	chr3	7683190	7683293	-151916490	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	701	808	0	2
643	3549	61	43	2	chr3	7683916	7684379	-151915404	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	2
643	272	250	73	42	chr3	7686523	7686619	-151913164	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	292	2
643	3088	64	8	2	chr3	7690172	7690566	-151909217	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
643	550	350	92	7	chr3	7706881	7707152	-151892631	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-61	304	11	2
643	4806	132	75	7	chr3	7721806	7722635	-151877148	+	RMER17D	LTR	ERVK	3	887	-2	2
643	242	322	110	20	chr3	7724241	7724387	-151875396	+	ORR1C2	LTR	MaLR	66	224	-160	2
644	451	319	50	54	chr3	7746970	7747212	-151852571	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	241	-118	2
644	1452	285	73	42	chr3	7747245	7747725	-151852058	+	MTE-int	LTR	MaLR	3	497	-1083	2
644	704	341	68	63	chr3	7747838	7748248	-151851535	+	MTE-int	LTR	MaLR	645	1056	-524	2
644	428	335	18	49	chr3	7748569	7748792	-151850991	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3093	2621	2406	2
644	1220	338	45	15	chr3	7748887	7749599	-151850184	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3453	2261	1529	2
644	461	367	104	9	chr3	7753237	7753297	-151846486	+	MLT1E3	LTR	MaLR	368	427	-197	3
644	461	367	104	9	chr3	7753361	7753531	-151846252	+	MLT1E3	LTR	MaLR	428	619	-5	3
644	1556	230	181	11	chr3	7753578	7753951	-151845832	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	448	-86	3
644	1556	230	181	11	chr3	7753995	7754074	-151845709	+	RLTR20C	LTR	ERVK	449	529	-5	3
644	676	323	115	46	chr3	7755453	7755826	-151843957	+	LTR16A	LTR	ERVL	1	399	-52	3
644	250	265	13	105	chr3	7765157	7765233	-151834550	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	172	3
644	2963	38	0	47	chr3	7773843	7774226	-151825557	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	3
644	4048	113	8	1	chr3	7774226	7774909	-151824874	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6965	3
644	1276	120	120	0	chr3	7774909	7775134	-151824649	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5004	3
644	354	318	31	31	chr3	7775148	7775426	-151824357	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6017	1564	1316	3
644	2558	54	27	0	chr3	7775566	7775898	-151823885	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-995	992	652	3
644	2710	42	8	175	chr3	7775905	7776373	-151823410	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	3
644	16072	22	2	13	chr3	7776375	7778341	-151821442	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	41	3
644	2710	42	8	175	chr3	7778351	7778819	-151820964	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	3
644	305	133	0	0	chr3	7778821	7778866	-151820917	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6405	137	93	3
644	359	23	0	0	chr3	7779081	7779124	-151820659	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7314	267	225	3
644	257	264	0	0	chr3	7779124	7779177	-151820606	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	223	3
644	1193	49	0	24	chr3	7779177	7779343	-151820440	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1785	202	41	3
644	2778	21	0	35	chr3	7779367	7779715	-151820068	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-29	336	1	3
644	658	320	47	140	chr3	7787371	7787857	-151811926	+	RLTR17	LTR	ERVK	125	565	-127	3
644	336	253	20	81	chr3	7787896	7787995	-151811788	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	461	553	0	3
644	697	118	0	0	chr3	7790584	7790686	-151809097	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	102	-272	3
644	2846	9	3	0	chr3	7790686	7791007	-151808776	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
644	39509	24	2	6	chr3	7791007	7795873	-151803910	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	1	3
644	2817	16	3	0	chr3	7795873	7796194	-151803589	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
644	1193	204	61	27	chr3	7796196	7796458	-151803325	+	ORR1D1	LTR	MaLR	99	369	-5	3
644	753	280	31	134	chr3	7798348	7798736	-151801047	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	348	-31	3
644	4007	146	106	42	chr3	7798880	7799802	-151799981	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	3
644	247	346	47	19	chr3	7803466	7803572	-151796211	+	MER74A	LTR	ERVL	34	142	-416	3
644	487	353	92	49	chr3	7804134	7804653	-151795130	-	MLT2E	LTR	ERVL	-4	624	40	3
644	4359	160	63	19	chr3	7804924	7805763	-151794020	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-26	876	1	3
644	2120	114	85	106	chr3	7811333	7811825	-151787958	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	3
644	561	262	134	12	chr3	7818437	7818684	-151781099	+	RLTR10A	LTR	ERVK	135	411	0	3
644	705	277	133	41	chr3	7819647	7820113	-151779670	+	MLT2B2	LTR	ERVL	4	512	-3	3
644	1621	214	5	59	chr3	7821030	7821417	-151778366	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	3
644	4608	63	3	7	chr3	7822967	7823554	-151776229	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	-2	585	1	3
644	463	366	60	21	chr3	7827239	7827524	-151772259	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-53	312	17	3
644	16146	27	0	2	chr3	7834204	7836152	-151763631	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	1984	-3	4
644	3168	41	2	37	chr3	7836154	7836558	-151763225	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	4
644	283	318	60	45	chr3	7839257	7839458	-151760325	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-140	257	54	4
644	2714	60	0	0	chr3	7854727	7855059	-151744724	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	4
645	1474	161	66	18	chr3	7877540	7877931	-151721852	+	RLTR25B	LTR	ERVK	545	1103	0	4
645	441	291	212	23	chr3	7881150	7881456	-151718327	+	MTC	LTR	MaLR	6	369	-52	4
645	368	219	61	80	chr3	7883866	7884060	-151715723	+	RLTR8	LTR	ERVK	194	362	-3	4
645	332	301	9	26	chr3	7887000	7887116	-151712667	-	MLT1C	LTR	MaLR	-296	171	58	4
645	1005	269	131	25	chr3	7888177	7888543	-151711240	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	4
645	656	243	26	21	chr3	7888566	7888759	-151711024	+	MTD-int	LTR	MaLR	10	203	-1055	4
645	1707	224	150	42	chr3	7888762	7888870	-151710913	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	521	4
645	1707	224	150	42	chr3	7888938	7889401	-151710382	-	RLTR26	LTR	ERVK	-122	520	9	4
645	778	266	78	84	chr3	7889477	7889901	-151709882	+	MTD-int	LTR	MaLR	311	848	-410	4
645	843	266	64	18	chr3	7890043	7890337	-151709446	+	MTD	LTR	MaLR	1	325	-94	4
645	322	207	92	0	chr3	7890385	7890472	-151709311	+	MTD	LTR	MaLR	301	395	-24	4
645	376	229	9	28	chr3	7896688	7896796	-151702987	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3533	3638	-1768	4
645	1660	163	14	3	chr3	7896817	7897101	-151702682	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3693	3979	-1427	4
645	2504	157	65	94	chr3	7899559	7900219	-151699564	-	RMER6A	LTR	ERVK	-7	749	109	4
645	232	310	78	122	chr3	7916598	7916778	-151683005	+	MLT1A0	LTR	MaLR	174	345	-20	4
645	297	352	165	35	chr3	7918833	7919239	-151680544	+	MT2A	LTR	ERVL	75	533	0	4
645	3347	28	5	0	chr3	7922654	7923048	-151676735	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
645	1033	318	40	5	chr3	7923652	7924032	-151675751	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-198	4793	4401	4
645	977	350	47	18	chr3	7924048	7924648	-151675135	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-632	4359	3743	4
645	225	386	39	23	chr3	7928442	7928572	-151671211	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	18	5
645	226	312	47	0	chr3	7933487	7933551	-151666232	-	ORR1E	LTR	MaLR	-291	68	2	5
645	445	190	0	12	chr3	7934220	7934305	-151665478	+	RMER6B	LTR	ERVK	354	437	-24	5
645	2701	183	44	10	chr3	7934682	7935185	-151664598	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	6	525	-2	5
645	1898	128	18	61	chr3	7935971	7936313	-151663470	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
645	307	253	52	10	chr3	7945913	7946009	-151653774	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	1	100	-580	5
645	251	350	134	57	chr3	7946153	7946362	-151653421	+	MLT1E1	LTR	MaLR	428	652	-2	5
645	687	279	50	0	chr3	7952942	7953121	-151646662	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	188	-182	5
645	856	312	9	132	chr3	7955113	7955538	-151644245	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	3	5
645	2360	324	57	25	chr3	7955542	7956420	-151643363	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	673	5
645	4022	124	23	62	chr3	7966056	7966837	-151632946	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	5
645	401	321	28	77	chr3	7992488	7992670	-151607113	+	RMER15	LTR	ERVL	300	472	-103	5
646	3646	156	74	55	chr3	8000586	8001652	-151598131	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	1023	1	2
646	3188	251	32	96	chr3	8001652	8003218	-151596565	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-308	2018	554	3
646	811	160	132	76	chr3	8003929	8004233	-151595550	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2232	6727	6407	5
646	271	204	0	53	chr3	8004361	8004418	-151595365	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	187	7
646	597	97	0	120	chr3	8005563	8005680	-151594103	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3039	3141	-1703	9
646	302	182	15	15	chr3	8005649	8005716	-151594067	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6127	6193	-1213	1
646	1133	180	21	15	chr3	8005715	8006007	-151593776	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6222	6449	-957	9
646	1585	134	4	0	chr3	8005983	8006236	-151593547	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5529	5782	-26	1
646	1468	194	99	35	chr3	8006245	8006684	-151593099	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	531	-371	1
646	462	77	24	71	chr3	8006687	8006771	-151593012	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7327	7406	0	9
646	943	208	43	153	chr3	8006776	8007128	-151592655	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	9	321	-1	9
646	279	159	0	0	chr3	8007744	8007788	-151591995	-	RLTR15	LTR	ERVK	-315	44	1	1
646	666	320	56	0	chr3	8007898	8008095	-151591688	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	154	1
646	934	214	41	23	chr3	8008119	8008339	-151591444	-	RMER19C	LTR	ERVK	-17	594	371	1
646	1550	219	105	162	chr3	8010844	8011492	-151588291	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
646	568	336	105	16	chr3	8013841	8014147	-151585636	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-28	337	5	2
646	726	133	18	0	chr3	8019492	8019605	-151580178	-	RLTR15	LTR	ERVK	-4	355	241	2
646	3422	76	4	11	chr3	8019605	8020057	-151579726	-	RLTR44B	LTR	ERVK	0	449	1	2
646	8747	108	78	35	chr3	8020057	8022677	-151577106	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	0	2812	1	2
646	3334	76	5	5	chr3	8022677	8023126	-151576657	-	RLTR44B	LTR	ERVK	0	449	1	2
646	745	163	130	28	chr3	8023126	8023302	-151576481	-	RLTR15	LTR	ERVK	-113	246	53	2
646	2464	218	26	118	chr3	8023296	8023921	-151575862	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	840	1405	-104	3
646	2464	218	26	118	chr3	8024097	8024209	-151575574	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1406	1509	0	3
646	1239	234	63	57	chr3	8024250	8024585	-151575198	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-25	353	5	3
646	930	258	121	109	chr3	8024589	8024755	-151575028	+	ORR1D1	LTR	MaLR	23	163	-211	3
646	930	258	121	109	chr3	8024833	8025014	-151574769	+	ORR1D1	LTR	MaLR	164	373	-1	3
646	474	344	25	54	chr3	8026288	8026491	-151573292	+	MLT1L	LTR	MaLR	84	280	-330	3
646	3482	23	2	0	chr3	8027350	8027745	-151572038	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
646	640	280	25	15	chr3	8033379	8033582	-151566201	+	MER67D	LTR	ERV1	37	241	-273	5
646	483	267	42	58	chr3	8034375	8034566	-151565217	+	RLTR23	LTR	ERV1	243	430	0	5
646	426	351	59	71	chr3	8034842	8035182	-151564601	+	RLTR17	LTR	ERVK	88	423	-269	5
646	454	322	80	28	chr3	8039649	8039825	-151559958	+	MLT1J2	LTR	MaLR	238	422	-26	6
646	1866	170	17	3	chr3	8047369	8047723	-151552060	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	7
646	297	323	58	51	chr3	8050347	8050484	-151549299	+	MTEb	LTR	MaLR	1	138	-241	8
646	257	273	39	13	chr3	8057058	8057136	-151542647	+	MER67D	LTR	ERV1	28	107	-407	9
646	291	402	35	68	chr3	8058319	8058462	-151541321	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	1824	1968	-3699	9
646	291	402	35	68	chr3	8058793	8058981	-151540802	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	1969	2151	-3516	9
646	393	203	0	16	chr3	8059045	8059136	-151540647	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	333	1
646	321	331	105	57	chr3	8060779	8061131	-151538652	+	MLT1H2-int	LTR	MaLR	84	452	-957	1
646	310	302	107	28	chr3	8061115	8061294	-151538489	+	MLT1H2-int	LTR	MaLR	1041	1229	-158	1
646	504	152	20	11	chr3	8061296	8061399	-151538384	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	227	1
646	295	314	48	24	chr3	8061401	8061525	-151538258	+	MLT1H2-int	LTR	MaLR	1282	1408	-1	1
646	281	264	110	0	chr3	8061606	8061697	-151538086	+	MLT1H2	LTR	MaLR	61	161	-328	1
646	241	301	41	0	chr3	8063213	8063286	-151536497	+	MLT1A0	LTR	MaLR	5	80	-285	1
646	620	330	17	93	chr3	8064774	8065065	-151534718	+	MLT1A0	LTR	MaLR	97	365	0	1
646	1856	193	81	3	chr3	8069888	8070272	-151529511	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	414	-28	1
646	3616	30	2	0	chr3	8087477	8087913	-151511870	+	RLTR13B4	LTR	ERVK	1	437	-366	1
646	2630	93	26	3	chr3	8089883	8090085	-151509698	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	89	293	-182	1
646	2630	93	26	3	chr3	8090116	8090291	-151509492	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	294	474	-1	1
646	435	326	96	0	chr3	8096465	8096652	-151503131	+	RMER15	LTR	ERVL	371	575	0	1
646	4897	105	4	18	chr3	8097246	8098081	-151501702	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	3	1
646	252	303	26	154	chr3	8098244	8098400	-151501383	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	129	1
646	353	264	44	100	chr3	8098493	8098653	-151501130	+	MTEa	LTR	MaLR	229	379	0	1
646	753	348	60	17	chr3	8098697	8099048	-151500735	+	MTEa-int	LTR	MaLR	10	375	-1205	1
646	1180	231	94	29	chr3	8099173	8099481	-151500302	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	43	1
646	266	394	6	42	chr3	8099683	8099850	-151499933	+	MTEa-int	LTR	MaLR	523	683	-897	1
646	4097	113	12	14	chr3	8107494	8108151	-151491632	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1432	2087	-5319	1
646	554	178	0	0	chr3	8108202	8108292	-151491491	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2460	2549	-4857	1
646	10117	174	66	45	chr3	8108300	8110600	-151489183	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1829	4176	-1230	1
646	442	248	0	28	chr3	8110612	8110720	-151489063	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6101	6205	-1201	1
646	408	252	94	59	chr3	8110695	8110976	-151488807	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6233	6425	-981	1
646	399	116	69	42	chr3	8111184	8111256	-151488527	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7404	-2	1
646	1945	146	67	3	chr3	8111265	8111595	-151488188	+	RLTR9A2	LTR	ERVK	31	381	-2	1
646	3529	10	5	0	chr3	8113702	8114096	-151485687	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
646	4532	139	15	109	chr3	8123426	8124420	-151475363	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	2	1
647	1633	225	47	198	chr3	8137776	8138495	-151461288	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
647	704	219	11	39	chr3	8138503	8138669	-151461114	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	212	2
647	3762	203	71	19	chr3	8138662	8139460	-151460323	-	RMER13B	LTR	ERVK	-64	844	5	2
647	1169	196	164	4	chr3	8139470	8139726	-151460057	-	MTC	LTR	MaLR	-124	297	1	2
647	452	325	54	7	chr3	8141808	8142074	-151457709	-	MER70B	LTR	ERVL	-183	395	98	2
647	303	316	19	42	chr3	8145987	8146251	-151453532	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	181	438	-6806	2
647	3021	88	8	26	chr3	8146497	8146990	-151452793	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2718	3201	-4205	2
647	355	226	11	21	chr3	8147393	8147488	-151452295	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	2978	3071	-5146	2
647	268	305	28	28	chr3	8147857	8148002	-151451781	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	6193	6337	-1880	2
647	255	272	22	0	chr3	8147925	8148017	-151451766	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	6013	6106	-1495	2
647	276	259	0	0	chr3	8148462	8148543	-151451240	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	6808	6888	-1329	2
647	1287	307	18	18	chr3	8148888	8149445	-151450338	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7241	7797	-420	2
647	1934	214	57	47	chr3	8151383	8151961	-151447822	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	1	2
647	270	257	78	19	chr3	8152594	8152697	-151447086	+	MLT2D	LTR	ERVL	3	111	-303	2
647	2607	347	42	55	chr3	8162697	8163119	-151436664	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-177	4814	4396	2
647	3780	122	196	1	chr3	8163119	8163545	-151436238	-	RMER17D	LTR	ERVK	0	889	346	2
647	3780	122	196	1	chr3	8163716	8164033	-151435750	-	RMER17D	LTR	ERVK	-544	345	2	2
647	2607	347	42	55	chr3	8164033	8165792	-151433991	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-596	4395	2660	2
647	315	333	24	20	chr3	8165844	8166095	-151433688	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-1862	3455	3204	2
647	6549	182	58	33	chr3	8167743	8169456	-151430327	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-23	2819	1065	2
647	877	252	69	69	chr3	8169470	8169964	-151429819	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2339	503	10	2
647	1542	197	8	0	chr3	8170026	8170290	-151429493	-	RLTR17	LTR	ERVK	-229	463	198	2
647	5163	286	35	61	chr3	8170426	8172468	-151427315	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2274	2717	729	2
647	1996	148	3	3	chr3	8172957	8173268	-151426515	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	2
647	3124	132	157	122	chr3	8173268	8174107	-151425676	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	869	-6712	2
647	1436	172	128	19	chr3	8174094	8174532	-151425251	+	RMER16-int	LTR	ERVK	192	662	-5475	2
647	291	173	58	0	chr3	8174527	8174579	-151425204	+	RMER16-int	LTR	ERVK	950	1004	-983	2
647	412	320	27	27	chr3	8174710	8174988	-151424795	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1316	1564	-6017	2
647	266	151	75	0	chr3	8175007	8175060	-151424723	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	447	503	-6039	2
647	1304	133	102	0	chr3	8175060	8175286	-151424497	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5007	5255	-1287	2
647	3943	115	8	8	chr3	8175286	8175976	-151423807	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6965	7680	0	2
647	308	0	0	0	chr3	8175976	8176013	-151423770	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	37	-399	2
647	734	172	169	19	chr3	8176005	8176212	-151423571	+	RMER17C	LTR	ERVK	173	410	0	2
647	1364	241	65	31	chr3	8200914	8201270	-151398513	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-6	368	1	2
647	2827	178	174	56	chr3	8206608	8206860	-151392923	-	RMER17B	LTR	ERVK	-43	915	611	2
647	2827	178	174	56	chr3	8206885	8207437	-151392346	-	RMER17B	LTR	ERVK	-348	610	16	2
647	2226	222	15	41	chr3	8210671	8211206	-151388577	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	521	-7	2
647	489	276	52	109	chr3	8212340	8212588	-151387195	+	MTEa	LTR	MaLR	126	359	-20	2
647	251	316	90	19	chr3	8212599	8212754	-151387029	+	MLT1D	LTR	MaLR	73	238	-267	2
647	1920	176	31	109	chr3	8218429	8218913	-151380870	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	2
647	359	192	41	0	chr3	8220364	8220437	-151379346	+	RMER13B	LTR	ERVK	2	77	-831	3
647	3414	144	14	5	chr3	8220437	8221016	-151378767	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	2279	2862	-4057	3
647	237	236	53	40	chr3	8221339	8221414	-151378369	+	RLTR8	LTR	ERVK	248	323	-42	3
647	856	83	25	0	chr3	8221419	8221540	-151378243	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	2986	3109	-3810	3
647	1540	89	0	23	chr3	8221543	8221761	-151378022	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-194	213	1	3
647	17594	137	36	4	chr3	8221763	8224702	-151375081	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	3290	6320	-599	3
647	2146	64	26	20	chr3	8224762	8225067	-151374716	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-20	307	1	3
647	17214	62	14	39	chr3	8225067	8227544	-151372239	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	4067	3
647	14084	118	39	26	chr3	8227540	8229979	-151369804	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3816	2665	21	3
647	2043	92	27	20	chr3	8229995	8230295	-151369488	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-20	307	6	3
647	3452	147	43	10	chr3	8230392	8230968	-151368815	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	6321	6915	-4	3
647	596	262	162	20	chr3	8230985	8231245	-151368538	+	RLTR26	LTR	ERVK	7	331	-311	3
647	390	313	141	40	chr3	8240345	8240621	-151359162	+	MLT1A0	LTR	MaLR	17	320	-45	3
647	2954	38	0	0	chr3	8241299	8241645	-151358138	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
647	14426	47	2	1	chr3	8241645	8243435	-151356348	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	3
647	2950	40	0	0	chr3	8243435	8243781	-151356002	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
647	393	126	122	33	chr3	8245271	8245361	-151354422	-	RMER17B	LTR	ERVK	-495	463	366	3
647	1967	201	84	10	chr3	8249272	8249760	-151350023	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	4	527	0	3
647	4758	152	98	112	chr3	8249917	8250092	-151349691	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	937	3
647	4758	152	98	112	chr3	8250204	8250331	-151349452	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-167	936	893	3
647	4758	152	98	112	chr3	8250431	8250939	-151348844	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-211	892	313	3
647	4758	152	98	112	chr3	8251158	8251451	-151348332	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-791	312	14	3
647	422	162	0	0	chr3	8253888	8253956	-151345827	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	329	262	3
647	514	150	0	0	chr3	8253930	8254032	-151345751	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-218	108	7	3
647	8228	163	37	126	chr3	8254031	8255981	-151343802	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-5	1958	182	3
648	1792	209	46	0	chr3	8259288	8259637	-151340146	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-8	370	6	3
648	985	319	10	7	chr3	8260781	8261084	-151338699	+	MLT1A0	LTR	MaLR	74	368	-6	3
648	239	373	25	56	chr3	8261512	8261674	-151338109	-	MER77	LTR	ERVL	-6	601	445	3
648	9446	143	67	39	chr3	8264109	8265905	-151333878	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	3	1848	0	3
648	508	318	92	18	chr3	8266771	8266989	-151332794	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1335	1568	-12	3
648	1158	263	42	71	chr3	8266967	8267348	-151332435	+	MTEa	LTR	MaLR	10	379	0	3
648	685	316	9	113	chr3	8268945	8269273	-151330510	+	MTEa	LTR	MaLR	82	375	-4	3
648	2902	106	12	2	chr3	8272576	8272983	-151326800	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	3
648	259	416	18	47	chr3	8275286	8275455	-151324328	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-185	469	306	3
648	3040	29	0	0	chr3	8276473	8276819	-151322964	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
648	244	200	59	44	chr3	8283260	8283317	-151316466	-	MLT2B3	LTR	ERVL	0	562	501	3
648	322	326	20	41	chr3	8283602	8283749	-151316034	-	MT2A	LTR	ERVL	-107	426	283	3
648	277	316	20	59	chr3	8283856	8283957	-151315826	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-443	274	178	3
648	398	331	91	102	chr3	8287718	8288004	-151311779	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	277	-82	3
648	1595	168	40	20	chr3	8288004	8288356	-151311427	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	3
648	398	331	91	102	chr3	8288356	8288432	-151311351	+	ORR1E	LTR	MaLR	278	359	0	3
648	450	314	95	92	chr3	8290240	8290587	-151309196	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	348	-17	3
648	758	303	84	62	chr3	8292982	8293417	-151306366	+	MLT2B4	LTR	ERVL	62	514	-6	3
648	1243	212	186	87	chr3	8293681	8294166	-151305617	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	3
648	551	188	90	39	chr3	8303442	8303460	-151296323	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-231	163	148	4
648	824	126	7	7	chr3	8304472	8304591	-151295192	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-242	136	17	4
648	824	126	7	7	chr3	8305744	8305760	-151294023	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-362	16	1	4
648	7025	67	10	0	chr3	8308355	8309239	-151290544	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	4
648	460	349	62	70	chr3	8313561	8313918	-151285865	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	4
648	906	232	212	19	chr3	8316348	8316669	-151283114	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	1	4
648	256	359	90	68	chr3	8316974	8317240	-151282543	-	ORR1E	LTR	MaLR	-43	316	45	4
648	4453	155	68	45	chr3	8318779	8319711	-151280072	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	953	-5	4
648	767	294	153	54	chr3	8320578	8321041	-151278742	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-1	577	69	4
648	2614	81	24	97	chr3	8340683	8341136	-151258647	-	BGLII	LTR	ERVK	-1	420	1	4
648	2887	205	39	49	chr3	8341137	8342072	-151257711	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1	2841	1917	4
648	607	166	32	70	chr3	8342070	8342226	-151257557	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1152	1690	1541	4
648	1709	207	117	56	chr3	8342267	8343097	-151256686	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1310	1532	652	4
648	649	218	0	44	chr3	8343130	8343336	-151256447	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1994	848	652	4
648	1362	156	27	19	chr3	8344552	8344813	-151254970	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	159	4
648	1535	121	8	23	chr3	8344817	8345080	-151254703	-	BGLII	LTR	ERVK	-162	259	1	4
648	364	176	44	0	chr3	8348139	8348207	-151251576	-	MTEa	LTR	MaLR	-307	72	2	4
648	1697	157	313	32	chr3	8352163	8352812	-151246971	-	RMER6A	LTR	ERVK	-36	720	1	4
648	226	167	0	0	chr3	8354624	8354684	-151245099	-	MT2B	LTR	ERVL	-8	525	466	4
648	967	219	42	80	chr3	8354714	8355049	-151244734	-	MT2B	LTR	ERVL	-55	546	213	4
648	274	333	53	30	chr3	8355108	8355241	-151244542	-	RLTR24	LTR	ERV1	-75	454	319	4
648	246	296	14	0	chr3	8355370	8355441	-151244342	-	RLTR24	LTR	ERV1	-455	74	3	4
648	494	134	16	3	chr3	8355471	8355558	-151244225	-	MT2B	LTR	ERVL	-445	88	1	4
648	240	294	100	9	chr3	8356279	8356389	-151243394	-	LTR81B	LTR	ERV1?	-84	1309	1190	4
648	429	306	87	51	chr3	8357130	8357405	-151242378	-	LTR81B	LTR	ERV1?	-1102	291	7	4
648	1211	267	39	34	chr3	8358729	8359144	-151240639	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	4
648	332	311	85	89	chr3	8360293	8360332	-151239451	+	MTEa	LTR	MaLR	20	58	-321	4
648	552	294	163	52	chr3	8360578	8360829	-151238954	+	MTEa	LTR	MaLR	59	337	-42	4
648	620	304	107	60	chr3	8366994	8367327	-151232456	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-16	538	94	4
648	620	205	172	13	chr3	8367367	8367527	-151232256	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-545	172	1	4
648	1013	194	9	37	chr3	8368949	8369163	-151230620	-	RMER6B	LTR	ERVK	-6	455	248	4
648	383	135	107	13	chr3	8369381	8369453	-151230330	-	RMER6B	LTR	ERVK	-300	161	83	4
648	2055	126	40	45	chr3	8369453	8369852	-151229931	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	355	4
648	266	349	98	27	chr3	8372812	8373036	-151226747	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-2	529	290	4
648	266	302	57	49	chr3	8373511	8373633	-151226150	+	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	135	257	-546	4
648	294	365	28	9	chr3	8375017	8375125	-151224658	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	118	-241	4
648	1436	40	0	0	chr3	8382058	8382234	-151217549	+	MTB	LTR	MaLR	225	400	0	4
648	1885	99	31	22	chr3	8383519	8383838	-151215945	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
1	17471	146	25	18	chr3	8383838	8390655	-151209128	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-172	7234	19	5
649	1857	103	31	25	chr3	8390673	8390993	-151208790	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
649	784	333	67	14	chr3	8395931	8396427	-151203356	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2847	2820	2299	5
649	3108	29	56	3	chr3	8408326	8408702	-151191081	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
649	736	335	59	21	chr3	8412791	8413078	-151186705	+	MER68	LTR	ERVL	193	490	-73	5
649	1292	243	129	0	chr3	8416626	8416997	-151182786	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
649	2212	157	42	3	chr3	8417073	8417450	-151182333	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	5
649	2734	53	18	0	chr3	8420742	8421082	-151178701	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	5
649	1679	139	229	42	chr3	8441720	8442074	-151157709	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	0	420	1	5
649	4595	62	5	0	chr3	8442509	8443093	-151156690	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	5
649	544	105	0	13	chr3	8453615	8453692	-151146091	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	91	166	-397	5
649	1701	177	49	29	chr3	8454173	8454267	-151145516	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	454	5
649	1701	177	49	29	chr3	8454430	8454683	-151145100	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-107	453	207	5
649	3544	102	28	64	chr3	8454687	8455293	-151144490	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	1	5
649	1118	178	0	55	chr3	8455293	8455505	-151144278	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-360	200	1	5
649	4507	161	45	21	chr3	8455505	8456387	-151143396	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	1424	5
649	315	172	9	75	chr3	8456445	8456552	-151143231	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-809	1517	1418	5
649	530	311	104	96	chr3	8457825	8458095	-151141688	-	MTE2b	LTR	MaLR	-12	367	96	5
649	229	244	60	49	chr3	8459612	8459696	-151140087	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	287	5
649	2521	79	154	0	chr3	8465243	8465599	-151134184	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	5
649	238	272	43	120	chr3	8467400	8467517	-151132266	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-256	109	2	5
649	563	308	89	55	chr3	8468432	8468779	-151131004	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	5
649	259	318	141	63	chr3	8472606	8472689	-151127094	+	MTEb	LTR	MaLR	1	94	-280	5
649	290	304	70	46	chr3	8472898	8473132	-151126651	+	MTEb	LTR	MaLR	95	351	-28	5
649	562	338	141	25	chr3	8476128	8476447	-151123336	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-31	649	294	6
649	3444	33	8	13	chr3	8493154	8493552	-151106231	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
649	1234	203	107	0	chr3	8493753	8494014	-151105769	-	MTD	LTR	MaLR	-130	289	1	6
649	1423	222	76	110	chr3	8494014	8494447	-151105336	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	851	6
649	1423	234	75	99	chr3	8494490	8494602	-151105181	-	MTD-int	LTR	MaLR	-408	850	643	6
649	257	256	127	13	chr3	8494592	8494671	-151105112	-	MTEa	LTR	MaLR	-270	109	22	6
649	1564	223	53	14	chr3	8494680	8495035	-151104748	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	372	-2	6
649	1364	222	53	77	chr3	8496757	8497132	-151102651	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	368	-2	6
649	1203	107	17	0	chr3	8497216	8497393	-151102390	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-213	181	2	6
649	1427	215	13	20	chr3	8498219	8498523	-151101260	-	MTD-int	LTR	MaLR	-804	454	153	6
649	547	280	0	0	chr3	8498761	8498879	-151100904	-	ORR1E	LTR	MaLR	-233	126	9	6
649	362	391	19	38	chr3	8501007	8501217	-151098566	-	LTR16A	LTR	ERVL	-8	443	238	4
650	1711	186	73	53	chr3	8524503	8524900	-151074883	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	3
650	2498	160	116	29	chr3	8531424	8531907	-151067876	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	3	3
650	1606	233	56	5	chr3	8544883	8545276	-151054507	+	MTD	LTR	MaLR	5	417	-2	6
650	711	235	35	12	chr3	8550384	8550556	-151049227	-	MTD	LTR	MaLR	-204	215	40	8
650	442	319	91	21	chr3	8551322	8551565	-151048218	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	275	8
650	300	243	103	37	chr3	8551590	8551697	-151048086	-	RMER5	LTR	ERV1	-381	153	40	8
650	229	259	35	69	chr3	8555770	8555857	-151043926	-	MT2B2	LTR	ERVL	-348	236	153	8
650	700	248	197	21	chr3	8565336	8565649	-151034134	+	MTEa	LTR	MaLR	14	359	0	9
650	247	417	21	0	chr3	8566201	8566345	-151033438	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-456	931	785	1
650	735	232	109	19	chr3	8567537	8567748	-151032035	-	RLTR18	LTR	ERVK	-3	613	384	1
650	4542	119	9	75	chr3	8572643	8573509	-151026274	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	1
650	2436	89	181	5	chr3	8574072	8574476	-151025307	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
650	6130	45	4	19	chr3	8574478	8575233	-151024550	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5736	1
650	2279	61	0	0	chr3	8575232	8575510	-151024273	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	1
650	3660	75	20	39	chr3	8575511	8576162	-151023621	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5821	660	168	1
650	236	244	0	0	chr3	8576162	8576207	-151023576	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	231	1
650	1198	92	10	84	chr3	8576215	8576417	-151023366	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6286	195	9	1
650	2423	92	181	5	chr3	8576418	8576822	-151022961	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
650	448	330	131	59	chr3	8577351	8577824	-151021959	+	MTE-int	LTR	MaLR	661	1167	-413	1
650	333	245	106	26	chr3	8577924	8578037	-151021746	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	287	1
650	2859	17	3	0	chr3	8582163	8582518	-151017265	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	41	396	0	1
650	9376	29	3	2	chr3	8582518	8583615	-151016168	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
650	3516	20	2	0	chr3	8583615	8584010	-151015773	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
650	1009	252	71	71	chr3	8585438	8585831	-151013952	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	1
650	1865	176	68	8	chr3	8592183	8592550	-151007233	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	389	-5	1
650	307	304	139	0	chr3	8596283	8596398	-151003385	-	MT2A	LTR	ERVL	-112	421	291	1
650	253	337	20	0	chr3	8596543	8596641	-151003142	-	MTEa	LTR	MaLR	-274	105	6	1
650	234	347	23	61	chr3	8600184	8600316	-150999467	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-8	357	231	1
650	246	264	47	67	chr3	8600354	8600504	-150999279	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-261	147	1	1
650	630	320	71	92	chr3	8604899	8605378	-150994405	-	RLTR26	LTR	ERVK	-3	639	171	1
650	336	341	65	6	chr3	8611644	8611812	-150987971	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-401	178	1	1
650	1449	181	114	42	chr3	8612354	8612712	-150987071	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	1
650	342	197	12	50	chr3	8613290	8613370	-150986413	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	320	1
650	247	221	62	38	chr3	8616075	8616155	-150983628	-	MER72B	LTR	ERV1	-261	507	426	1
650	1905	172	116	5	chr3	8617400	8617779	-150982004	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
650	243	294	65	11	chr3	8617938	8618031	-150981752	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	266	1
650	1314	184	202	30	chr3	8619684	8620015	-150979768	+	MTD	LTR	MaLR	30	417	-2	1
650	834	197	8	0	chr3	8621109	8621241	-150978542	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	1
650	256	196	96	48	chr3	8626290	8626478	-150973305	+	RMER17C	LTR	ERVK	81	277	-133	2
650	545	190	20	20	chr3	8630652	8630754	-150969029	+	MTEa	LTR	MaLR	64	165	-214	2
650	503	243	131	17	chr3	8630830	8631006	-150968777	+	MTEa	LTR	MaLR	170	365	-14	2
650	3076	34	0	3	chr3	8632153	8632508	-150967275	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	354	-3	2
650	351	220	104	52	chr3	8635867	8635982	-150963801	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-232	133	13	2
650	294	304	32	11	chr3	8636866	8636959	-150962824	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-318	197	103	2
650	369	282	0	0	chr3	8637013	8637098	-150962685	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	95	-264	2
650	289	284	171	18	chr3	8637331	8637442	-150962341	+	ORR1E	LTR	MaLR	249	376	-3	2
650	311	328	116	16	chr3	8642081	8642270	-150957513	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-488	349	142	2
650	271	224	39	26	chr3	8647191	8647230	-150952553	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	307	2
650	1794	256	24	126	chr3	8647230	8647819	-150951964	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	83	2
650	598	55	4	5	chr3	8647998	8648084	-150951699	-	RMER19C	LTR	ERVK	-652	85	1	2
650	1778	139	22	6	chr3	8648084	8648397	-150951386	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-33	361	2	2
651	3367	18	39	0	chr3	8651897	8652278	-150947505	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
651	3144	166	144	12	chr3	8653135	8653786	-150945997	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	2
651	438	239	175	105	chr3	8657918	8658147	-150941636	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	135	2
651	244	339	32	157	chr3	8660077	8660294	-150939489	+	MTE-int	LTR	MaLR	732	921	-659	2
651	5377	110	36	40	chr3	8660910	8661819	-150937964	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	2
651	258	164	0	83	chr3	8671298	8671358	-150928425	+	MT2B2	LTR	ERVL	530	584	0	2
651	1533	274	27	19	chr3	8671407	8671812	-150927971	+	MTD	LTR	MaLR	10	403	-16	2
651	2611	97	15	26	chr3	8672487	8672877	-150926906	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	2
651	1537	96	0	5	chr3	8673179	8673389	-150926394	+	MTC	LTR	MaLR	3	211	-210	2
651	889	197	16	107	chr3	8674286	8674297	-150925486	+	MTC	LTR	MaLR	197	207	-214	2
651	889	197	16	107	chr3	8674363	8674595	-150925188	+	MTC	LTR	MaLR	208	417	-4	2
651	324	315	60	45	chr3	8674566	8674699	-150925084	+	MLT1A	LTR	MaLR	54	188	-186	2
651	240	341	34	68	chr3	8674762	8674852	-150924931	+	MLT1A	LTR	MaLR	218	304	-86	2
651	3091	29	0	0	chr3	8674852	8675198	-150924585	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
651	240	341	34	68	chr3	8675198	8675255	-150924528	+	MLT1A	LTR	MaLR	305	360	-30	2
651	261	304	14	0	chr3	8675579	8675629	-150924154	-	RMER12	LTR	ERVK	-507	815	765	2
651	2396	165	118	17	chr3	8676773	8677249	-150922534	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	1	2
651	1906	126	70	96	chr3	8677354	8677526	-150922257	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	164	-214	2
651	1906	126	70	96	chr3	8677546	8677759	-150922024	+	ORR1C1	LTR	MaLR	165	378	0	2
651	260	254	0	0	chr3	8680398	8680457	-150919326	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	314	2
651	423	321	101	40	chr3	8680517	8680715	-150919068	-	MTEa	LTR	MaLR	-169	210	1	2
651	1824	162	151	18	chr3	8691394	8691784	-150907999	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	442	0	3
651	524	229	137	0	chr3	8692923	8693076	-150906707	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	206	3
651	2201	127	9	12	chr3	8697057	8697384	-150902399	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-2	327	2	3
651	627	288	72	40	chr3	8697640	8697965	-150901818	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	22	3
651	370	309	48	112	chr3	8698972	8699223	-150900560	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	244	-121	3
651	321	267	22	0	chr3	8699320	8699410	-150900373	+	MLT1A0	LTR	MaLR	274	365	0	3
651	266	332	131	30	chr3	8699819	8700018	-150899765	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-449	388	170	3
651	1873	138	16	22	chr3	8700544	8700856	-150898927	+	ORR1A3	LTR	MaLR	17	326	0	3
651	3636	166	35	16	chr3	8702348	8702367	-150897416	+	RMER13B	LTR	ERVK	162	182	-726	3
651	3636	174	36	18	chr3	8702403	8703097	-150896686	+	RMER13B	LTR	ERVK	153	847	-13	3
651	511	176	108	0	chr3	8703069	8703171	-150896612	+	RMER13B	LTR	ERVK	794	906	-2	3
651	1289	228	93	31	chr3	8703367	8703752	-150896031	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	97	3
651	1630	221	53	6	chr3	8704415	8704757	-150895026	-	MTC	LTR	MaLR	-61	360	3	3
651	814	260	46	42	chr3	8704757	8705017	-150894766	+	MLT1B	LTR	MaLR	128	388	-2	3
651	305	155	73	134	chr3	8714153	8714235	-150885548	-	MT2B	LTR	ERVL	-353	248	172	3
651	2067	181	25	25	chr3	8714958	8715400	-150884383	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	3
651	429	318	74	74	chr3	8738616	8738833	-150860950	-	ORR1E	LTR	MaLR	-81	278	62	4
651	915	209	83	66	chr3	8747309	8747474	-150852309	+	MTD	LTR	MaLR	20	196	-223	4
651	915	209	83	66	chr3	8748114	8748189	-150851594	+	MTD	LTR	MaLR	197	264	-155	4
651	227	263	154	26	chr3	8748473	8748551	-150851232	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-487	541	454	4
651	566	203	130	0	chr3	8748979	8749102	-150850681	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	279	4
651	802	235	219	4	chr3	8749294	8749550	-150850233	+	RMER15	LTR	ERVL	264	574	-1	4
651	518	227	9	0	chr3	8750997	8751107	-150848676	+	MTEa	LTR	MaLR	1	111	-268	4
651	683	278	209	19	chr3	8751163	8751478	-150848305	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	5	4
651	504	299	116	98	chr3	8757019	8757356	-150842427	-	ORR1E	LTR	MaLR	-13	346	4	4
651	1805	199	73	23	chr3	8758311	8758708	-150841075	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	4
651	862	280	55	77	chr3	8760324	8760703	-150839080	+	MTEb	LTR	MaLR	1	371	-8	4
651	262	276	60	46	chr3	8765451	8765597	-150834186	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	218	4
651	339	287	65	14	chr3	8769742	8769880	-150829903	+	MLT1B	LTR	MaLR	209	353	-37	4
651	522	222	65	138	chr3	8772078	8772324	-150827459	+	MTEa	LTR	MaLR	140	367	-12	5
651	342	275	9	0	chr3	8773408	8773517	-150826266	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-3	535	426	5
651	739	300	75	62	chr3	8773923	8774307	-150825476	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-4	565	177	5
651	780	264	125	30	chr3	8774481	8774809	-150824974	-	MTEb	LTR	MaLR	-13	366	8	5
651	382	169	127	0	chr3	8775469	8775540	-150824243	+	MTC	LTR	MaLR	1	80	-341	5
651	888	91	8	0	chr3	8776656	8776777	-150823006	+	MTC	LTR	MaLR	95	216	-205	5
651	2936	158	192	21	chr3	8777279	8777879	-150821904	+	MTC-int	LTR	MaLR	441	1142	-116	5
651	2626	161	192	21	chr3	8778220	8778318	-150821465	+	MTC-int	LTR	MaLR	1143	1257	-1	5
651	2410	137	48	36	chr3	8778318	8778734	-150821049	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
81	2616	137	174	22	chr3	8781542	8782048	-150817735	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	583	-2	5
652	563	71	0	12	chr3	8783393	8783478	-150816305	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	803	886	-147	5
652	1871	56	20	0	chr3	8783478	8783730	-150816053	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	256	5
652	917	124	11	66	chr3	8783729	8783910	-150815873	-	RLTR1B	LTR	ERV1	-207	305	135	5
652	837	135	13	51	chr3	8784034	8784190	-150815593	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	884	1033	0	5
652	2793	169	50	21	chr3	8784206	8784727	-150815056	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1	536	-6870	5
652	1181	180	24	8	chr3	8784868	8785114	-150814669	+	RLTR1	LTR	ERV1	371	620	-4	5
652	1025	245	121	73	chr3	8785116	8785688	-150814095	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	25	623	-6933	5
652	1784	195	164	46	chr3	8786350	8786890	-150812893	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1158	1759	-3304	5
652	383	84	0	101	chr3	8786933	8787003	-150812780	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1760	1824	-3239	5
652	14385	113	43	38	chr3	8787055	8788392	-150811391	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1049	2393	-5013	5
652	14385	113	43	38	chr3	8788592	8789667	-150810116	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2394	3473	-3933	5
652	1794	217	19	49	chr3	8789674	8790100	-150809683	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4397	4809	-999	5
652	1904	195	7	5	chr3	8790199	8790604	-150809179	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5392	5780	-28	5
652	1221	148	0	9	chr3	8790613	8790825	-150808958	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	210	-596	5
652	2860	86	6	48	chr3	8790800	8790989	-150808794	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	616	760	-273	5
652	3005	28	31	6	chr3	8790989	8791345	-150808438	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	5
652	2860	72	5	19	chr3	8791345	8791608	-150808175	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	761	1019	-14	5
652	858	258	27	43	chr3	8792046	8792374	-150807409	-	RLTR15	LTR	ERVK	-36	323	1	5
652	265	367	112	30	chr3	8797833	8798128	-150801655	+	MLT1F2	LTR	MaLR	6	324	-236	5
652	317	319	76	114	chr3	8798496	8798839	-150800944	-	MLT1H-int	LTR	MaLR	-553	856	527	5
652	1070	228	60	102	chr3	8799198	8799579	-150800204	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	6	5
652	760	288	100	49	chr3	8800210	8800560	-150799223	+	MTEa	LTR	MaLR	3	370	-9	5
652	2042	156	115	41	chr3	8802668	8803129	-150796654	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	495	-34	5
652	459	203	56	24	chr3	8804093	8804219	-150795564	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	130	-351	5
652	2623	125	221	0	chr3	8807022	8807501	-150792282	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	1	5
652	407	244	8	105	chr3	8829206	8829339	-150770444	-	MT2B	LTR	ERVL	-315	286	167	5
652	363	332	68	27	chr3	8841332	8841654	-150758129	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	24	6
652	317	242	0	0	chr3	8842224	8842290	-150757493	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-13	566	501	6
652	261	301	138	11	chr3	8842314	8842408	-150757375	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-194	354	249	6
652	611	42	0	0	chr3	8846238	8846310	-150753473	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-2892	2593	2522	6
652	1318	201	78	32	chr3	8848613	8848800	-150750983	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	182	6
652	1318	201	78	32	chr3	8848849	8849005	-150750778	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-203	181	25	6
652	875	267	128	7	chr3	8851802	8852107	-150747676	+	MLT2C1	LTR	ERVL	1	342	-55	6
652	1674	174	74	18	chr3	8855226	8855565	-150744218	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	10	6
652	1608	230	87	68	chr3	8856767	8857219	-150742564	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	434	-150	6
652	1608	230	87	68	chr3	8857269	8857389	-150742394	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	435	584	0	6
652	510	180	0	0	chr3	8857886	8857975	-150741808	-	RMER13A	LTR	ERVK	-771	89	1	6
652	1096	239	46	92	chr3	8858167	8858559	-150741224	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	376	-3	6
652	1455	199	98	52	chr3	8861448	8861814	-150737969	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	383	-1	6
652	1266	222	14	24	chr3	8871297	8871353	-150728430	-	MTD	LTR	MaLR	-41	378	322	6
652	2130	173	8	14	chr3	8871353	8871722	-150728061	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
652	1266	222	14	24	chr3	8871722	8871960	-150727823	-	MTD	LTR	MaLR	-98	321	88	6
652	325	318	145	0	chr3	8890515	8890694	-150709089	+	MLT1F1	LTR	MaLR	363	567	-2	6
652	432	299	22	0	chr3	8894384	8894521	-150705262	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	226	6
652	3384	30	8	0	chr3	8901558	8901951	-150697832	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
652	436	305	119	59	chr3	8903920	8904206	-150695577	+	ORR1E	LTR	MaLR	57	359	0	6
652	1509	163	6	89	chr3	8904730	8905080	-150694703	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	6
652	7243	136	70	61	chr3	8905080	8906642	-150693141	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	388	6
81	2248	131	28	3	chr3	8912613	8913004	-150686779	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1562	401	1	6
653	1196	77	138	0	chr3	8913004	8913185	-150686598	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	327	122	6
653	371	336	0	30	chr3	8913807	8913939	-150685844	+	ERVL-int	LTR	ERVL	4177	4304	-1453	7
653	1215	241	70	31	chr3	8919104	8919463	-150680320	+	MTEa	LTR	MaLR	3	375	-4	7
653	1656	171	254	3	chr3	8932770	8933104	-150666679	+	MTC	LTR	MaLR	4	421	0	7
653	1738	186	75	28	chr3	8946637	8946996	-150652787	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	7
653	236	191	104	60	chr3	8950618	8950685	-150649098	+	RMER15	LTR	ERVL	3	72	-503	7
653	791	243	42	28	chr3	8950713	8950925	-150648858	+	RMER15	LTR	ERVL	27	241	-334	7
653	4981	50	2	2	chr3	8950934	8951521	-150648262	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	7
653	804	204	70	154	chr3	8951827	8952256	-150647527	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	7
653	629	263	94	37	chr3	8954986	8955321	-150644462	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	379	0	7
653	1517	196	142	42	chr3	8956264	8956673	-150643110	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	921	1370	0	7
653	1408	203	102	51	chr3	8956674	8957027	-150642756	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	372	-2	7
653	682	228	43	27	chr3	8958524	8958709	-150641074	+	MER31A	LTR	ERV1	1	188	-297	7
653	3048	37	21	8	chr3	8966778	8967161	-150632622	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	388	-8	7
653	344	265	24	12	chr3	8971690	8971774	-150628009	+	MLT1J1	LTR	MaLR	26	110	-334	8
653	328	194	30	0	chr3	8971813	8971880	-150627903	+	MLT1J1	LTR	MaLR	82	150	-362	8
653	271	296	115	39	chr3	8971866	8971996	-150627787	+	MLT1J1	LTR	MaLR	78	217	-295	8
653	242	190	102	17	chr3	8973058	8973117	-150626666	+	ORR1D1	LTR	MaLR	8	71	-303	8
653	237	136	0	64	chr3	8973441	8973488	-150626295	+	LTR48B	LTR	ERV1	41	84	-560	8
653	1167	138	105	0	chr3	8974042	8974252	-150625531	+	MTC	LTR	MaLR	1	232	-189	8
653	326	254	82	33	chr3	8975254	8975376	-150624407	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	128	-280	8
653	1282	195	136	25	chr3	8979970	8980301	-150619482	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-10	368	1	8
653	247	196	0	0	chr3	8980301	8980347	-150619436	+	ORR1D2	LTR	MaLR	325	370	0	8
653	236	213	63	32	chr3	8980582	8980645	-150619138	+	MTD	LTR	MaLR	1	65	-342	8
653	1412	186	153	12	chr3	8980961	8981287	-150618496	+	MTD	LTR	MaLR	48	419	0	8
653	294	307	88	0	chr3	8987182	8987296	-150612487	+	MER57-int	LTR	ERV1	7150	7273	-264	8
653	793	236	249	22	chr3	8987725	8987998	-150611785	+	MTD	LTR	MaLR	18	352	-67	8
653	438	267	246	46	chr3	8988950	8989256	-150610527	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	368	-2	8
653	321	301	176	64	chr3	8992818	8993055	-150606728	+	MLT1F1	LTR	MaLR	1	304	-291	8
653	277	288	25	12	chr3	8994214	8994295	-150605488	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-224	141	60	8
653	1435	136	14	9	chr3	8999778	9000000	-150599783	+	RMER6A	LTR	ERVK	7	229	-527	8
653	2194	145	42	113	chr3	9000000	9000093	-150599690	+	RMER6A	LTR	ERVK	230	322	-434	1
653	2194	145	42	113	chr3	9000240	9000713	-150599070	+	RMER6A	LTR	ERVK	323	756	0	1
653	303	250	62	12	chr3	9004840	9004921	-150594862	+	RMER5	LTR	ERV1	427	511	-23	7
653	1859	135	29	6	chr3	9006233	9006547	-150593236	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	1
653	289	320	66	44	chr3	9009741	9009924	-150589859	+	MLT1E2	LTR	MaLR	177	363	-264	2
653	3039	136	49	9	chr3	9010357	9010892	-150588891	+	RLTR1D	LTR	ERV1	37	592	-13	2
653	331	118	71	95	chr3	9011490	9011574	-150588209	+	RLTR25B	LTR	ERVK	428	509	-519	2
653	1920	148	38	170	chr3	9014606	9015101	-150584682	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	3
653	495	324	112	27	chr3	9016338	9016703	-150583080	-	LTR16A	LTR	ERVL	-4	447	52	4
653	2926	156	46	0	chr3	9018437	9018936	-150580847	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	522	-2	4
653	302	250	0	138	chr3	9019114	9019244	-150580539	+	MT2B	LTR	ERVL	146	257	-344	4
653	256	333	175	18	chr3	9019376	9019606	-150580177	+	RMER15	LTR	ERVL	296	561	-14	5
653	316	303	71	22	chr3	9019614	9019796	-150579987	+	MER89-int	LTR	ERV1	530	720	-6081	5
653	431	291	16	16	chr3	9019984	9020113	-150579670	+	MER89-int	LTR	ERV1	870	998	-5803	5
653	427	284	136	32	chr3	9020371	9020622	-150579161	+	MER89-int	LTR	ERV1	3345	3621	-3180	5
653	334	351	58	14	chr3	9021684	9021892	-150577891	+	HERVL40-int	LTR	ERVL	3993	4209	-1321	5
653	343	313	150	0	chr3	9022091	9022238	-150577545	+	HERVL40-int	LTR	ERVL	4397	4565	-965	5
653	325	337	61	25	chr3	9022586	9022784	-150576999	+	MER68-int	LTR	ERVL	2409	2613	-377	5
653	404	298	86	30	chr3	9025535	9025732	-150574051	-	LTR40a	LTR	ERVL	-230	289	82	7
653	474	267	71	25	chr3	9025768	9025964	-150573819	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-43	5487	5283	7
653	292	130	18	36	chr3	9029253	9029309	-150570474	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	55	-313	8
653	371	228	77	24	chr3	9029388	9029558	-150570225	+	RLTR9E	LTR	ERVK	208	385	-24	8
653	376	301	152	83	chr3	9029807	9029892	-150569891	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	415	8
653	376	301	152	83	chr3	9030032	9030106	-150569677	-	MLT1D	LTR	MaLR	-91	414	350	8
653	376	301	152	83	chr3	9030321	9030555	-150569228	-	MLT1D	LTR	MaLR	-156	349	84	8
653	1672	210	71	32	chr3	9030783	9031199	-150568584	-	RLTR28B	LTR	ERVL	0	481	48	8
653	1825	160	84	171	chr3	9031199	9031544	-150568239	-	RLTR28	LTR	ERVL	-1	523	258	8
653	1825	160	84	171	chr3	9031691	9031918	-150567865	-	RLTR28	LTR	ERVL	-267	257	1	8
653	1672	210	71	32	chr3	9031918	9031964	-150567819	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-434	47	1	8
653	628	167	31	8	chr3	9031964	9032090	-150567693	-	RMER15	LTR	ERVL	-28	547	419	8
653	393	300	35	7	chr3	9032275	9032416	-150567367	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	148	-217	8
653	357	191	0	0	chr3	9036946	9037009	-150562774	-	MTC	LTR	MaLR	-335	86	24	9
653	924	160	56	20	chr3	9037010	9037208	-150562575	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-5	379	175	1
653	350	231	0	117	chr3	9037374	9037477	-150562306	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-198	180	90	1
653	1504	138	185	0	chr3	9037477	9037817	-150561966	+	RLTR28	LTR	ERVL	94	496	-28	1
654	1462	221	30	80	chr3	9046004	9046402	-150553381	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	135	1
654	1423	178	22	4	chr3	9050523	9050799	-150548984	+	MTD	LTR	MaLR	1	281	-138	1
654	313	100	20	0	chr3	9050800	9050850	-150548933	+	MTD	LTR	MaLR	231	281	-138	1
654	800	150	75	0	chr3	9050851	9051024	-150548759	+	MTD	LTR	MaLR	231	416	-3	1
654	3036	210	92	58	chr3	9056528	9057383	-150542400	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	884	-18	1
654	2722	116	7	17	chr3	9057769	9058182	-150541601	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	1
654	295	251	48	0	chr3	9061330	9061438	-150538345	-	MT2A	LTR	ERVL	-4	550	406	1
654	228	174	85	142	chr3	9070047	9070188	-150529595	+	LTR41	LTR	ERVL	186	318	-450	1
654	3084	77	7	12	chr3	9088767	9089176	-150510607	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
654	3281	8	6	3	chr3	9091455	9091821	-150507962	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
654	8198	80	67	11	chr3	9091821	9093123	-150506660	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	2
654	28164	19	1	2	chr3	9093122	9096397	-150503386	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3210	6481	0	2
654	3281	8	6	3	chr3	9096397	9096763	-150503020	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
654	554	343	64	55	chr3	9117855	9118198	-150481585	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	348	-11	3
654	1077	228	69	72	chr3	9120982	9121342	-150478441	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	5	3
654	227	326	57	43	chr3	9121450	9121591	-150478192	+	MTEa	LTR	MaLR	180	322	-57	3
654	257	262	49	113	chr3	9122599	9122741	-150477042	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	133	-275	3
654	355	221	0	144	chr3	9125728	9125860	-150473923	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	152	3
654	428	256	212	65	chr3	9129414	9129631	-150470152	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	257	3
654	3294	31	13	3	chr3	9136231	9136623	-150463160	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
654	323	247	24	24	chr3	9139610	9139693	-150460090	-	RMER15	LTR	ERVL	-157	418	336	3
654	364	296	60	20	chr3	9139865	9139965	-150459818	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-5	4994	4891	3
654	246	311	56	19	chr3	9140191	9140299	-150459484	-	RMER15	LTR	ERVL	-179	396	285	3
654	1282	207	28	158	chr3	9144864	9145299	-150454484	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
654	855	232	48	88	chr3	9147793	9148043	-150451740	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	140	3
654	324	159	101	0	chr3	9148039	9148108	-150451675	+	MTEa	LTR	MaLR	32	107	-272	3
654	1458	184	150	59	chr3	9149158	9149323	-150450460	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	165	-219	3
654	1458	184	150	59	chr3	9149524	9149546	-150450237	+	ORR1C2	LTR	MaLR	166	179	-205	3
654	1458	184	150	59	chr3	9149597	9149749	-150450034	+	ORR1C2	LTR	MaLR	180	372	-12	3
654	2670	147	83	81	chr3	9157149	9157742	-150442041	+	RMER19B	LTR	ERVK	65	658	-244	4
654	280	161	204	80	chr3	9160148	9160236	-150439547	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	166	4
654	329	234	117	66	chr3	9170943	9171080	-150428703	+	MTD	LTR	MaLR	18	161	-258	4
654	280	226	0	0	chr3	9171229	9171282	-150428501	+	MTD	LTR	MaLR	146	198	-221	4
655	3783	35	0	2	chr3	9177259	9177715	-150422068	-	MT-int	LTR	MaLR	-77	1021	567	4
655	820	157	150	6	chr3	9191056	9191229	-150408554	+	MTC	LTR	MaLR	196	393	-28	5
655	727	255	189	35	chr3	9191632	9191879	-150407904	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	279	-91	5
655	727	255	189	35	chr3	9192100	9192165	-150407618	+	ORR1D2	LTR	MaLR	280	361	-9	5
655	3204	43	5	55	chr3	9194131	9194548	-150405235	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
655	369	299	213	15	chr3	9204882	9205079	-150394704	+	RMER15	LTR	ERVL	337	572	-3	5
655	1803	180	29	14	chr3	9208481	9208830	-150390953	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	21	5
655	956	244	99	46	chr3	9209118	9209440	-150390343	+	MTD	LTR	MaLR	76	399	-20	5
655	2361	193	7	5	chr3	9214308	9214719	-150385064	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	10	5
655	1661	171	138	35	chr3	9215059	9215458	-150384325	-	RMER10A	LTR	ERVL	-2	440	1	5
655	1230	174	210	0	chr3	9219582	9219887	-150379896	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	6	5
655	284	193	104	112	chr3	9225341	9225475	-150374308	-	MT2B	LTR	ERVL	-326	275	143	6
655	1543	199	77	57	chr3	9234200	9234917	-150364866	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	6
655	2309	157	32	15	chr3	9235422	9235824	-150363959	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	5	6
655	1443	158	33	4	chr3	9240519	9240792	-150358991	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-87	291	11	6
655	248	244	15	37	chr3	9247124	9247260	-150352523	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	622	6
655	367	209	56	28	chr3	9268151	9268259	-150331524	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	168	7
655	1060	130	120	75	chr3	9273363	9273630	-150326153	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	279	-182	7
655	3526	23	2	0	chr3	9292374	9292769	-150307014	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
655	282	138	17	33	chr3	9294093	9294153	-150305630	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-543	485	427	7
655	1234	144	193	7	chr3	9304100	9304379	-150295404	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	8
655	418	246	98	0	chr3	9305539	9305661	-150294122	+	MLT1A0	LTR	MaLR	232	365	0	8
656	3791	14	121	0	chr3	9310594	9311034	-150288749	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	8
656	48861	16	0	0	chr3	9311034	9316405	-150283378	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5371	-114	8
656	320	139	26	53	chr3	9316405	9316481	-150283302	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	8
656	321	0	0	0	chr3	9316481	9316519	-150283264	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	8
656	3728	20	121	0	chr3	9316519	9316959	-150282824	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	8
656	610	328	95	19	chr3	9323233	9323550	-150276233	+	MLT1G3	LTR	MaLR	1	341	-254	8
656	328	312	15	52	chr3	9323612	9323747	-150276036	+	MLT1G3	LTR	MaLR	450	579	0	8
656	927	201	220	16	chr3	9326537	9326855	-150272928	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	2	8
656	399	277	123	60	chr3	9353382	9353682	-150246101	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	319	-40	9
656	2854	50	0	6	chr3	9358989	9359333	-150240450	+	ORR1A1	LTR	MaLR	5	346	0	9
656	534	285	60	30	chr3	9363291	9363526	-150236257	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-60	337	96	9
656	561	209	57	43	chr3	9367969	9368109	-150231674	-	RMER13A	LTR	ERVK	-573	287	146	9
656	955	200	33	9	chr3	9368115	9368327	-150231456	-	RMER13B	LTR	ERVK	-686	222	6	9
656	2219	121	19	0	chr3	9370469	9370832	-150228951	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	370	-24	9
656	6730	157	111	170	chr3	9370832	9372917	-150226866	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	2	1963	0	9
656	2645	110	0	97	chr3	9372917	9373351	-150226432	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	392	-2	9
656	2162	127	51	11	chr3	9375994	9376368	-150223415	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	389	-5	9
656	261	194	179	0	chr3	9376493	9376560	-150223223	+	MLT1J	LTR	MaLR	100	178	-334	9
656	308	308	8	16	chr3	9376687	9376809	-150222974	+	MLT1J	LTR	MaLR	386	506	-6	9
656	243	236	63	21	chr3	9378935	9379078	-150220705	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	606	754	-755	9
656	469	150	0	150	chr3	9378950	9379083	-150220700	+	MT2B	LTR	ERVL	152	264	-337	9
656	1775	131	117	15	chr3	9379383	9379709	-150220074	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	9
656	1148	172	66	40	chr3	9387102	9387374	-150212409	+	RLTR46	LTR	ERVK	42	320	0	9
656	437	199	47	93	chr3	9387374	9387524	-150212259	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1	143	-7537	9
656	23643	218	20	4	chr3	9387572	9392399	-150207384	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	535	5457	-2223	9
656	4255	119	8	13	chr3	9392725	9393735	-150206048	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6651	7680	0	9
656	1307	157	62	40	chr3	9393744	9394017	-150205766	+	RLTR46	LTR	ERVK	42	320	0	9
656	2024	119	55	0	chr3	9395275	9395585	-150204198	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	9
656	245	217	133	0	chr3	9401689	9401749	-150198034	+	MLT2B2	LTR	ERVL	17	84	-431	1
656	232	282	60	68	chr3	9401843	9401976	-150197807	+	MTEb	LTR	MaLR	239	370	-4	1
656	923	260	114	3	chr3	9402414	9402703	-150197080	+	MTD	LTR	MaLR	99	419	0	1
656	686	301	72	48	chr3	9403702	9403995	-150195788	-	LTR87	LTR	ERVL?	0	624	325	1
656	544	241	68	4	chr3	9408150	9408307	-150191476	-	MTE2b	LTR	MaLR	-15	404	241	1
656	1083	213	42	46	chr3	9409215	9409540	-150190243	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	129	1
656	306	273	132	8	chr3	9410053	9410182	-150189601	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	214	358	-5403	1
656	302	342	188	25	chr3	9410270	9410546	-150189237	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	465	785	-4929	1
656	523	261	147	16	chr3	9411491	9411682	-150188101	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1418	1633	-4128	1
656	718	241	138	5	chr3	9411712	9411929	-150187854	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1631	1876	-3838	1
656	850	158	77	11	chr3	9411930	9412132	-150187651	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	208	-162	1
656	1782	90	68	0	chr3	9413405	9413671	-150186112	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	124	407	0	1
656	3448	23	26	0	chr3	9416686	9417072	-150182711	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
656	8870	49	8	3	chr3	9417072	9418164	-150181619	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
656	3592	18	2	0	chr3	9418164	9418559	-150181224	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
656	677	270	55	5	chr3	9423247	9423448	-150176335	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2609	2819	-2895	1
656	3183	257	60	49	chr3	9423448	9424086	-150175697	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4270	4932	-829	1
656	3183	257	60	49	chr3	9424213	9424515	-150175268	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4933	5220	-541	1
657	538	274	42	18	chr3	9440106	9440273	-150159510	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1197	173	3	1
657	394	323	128	25	chr3	9440969	9441204	-150158579	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	97	1
657	445	305	45	26	chr3	9441312	9441467	-150158316	+	MLT1A	LTR	MaLR	23	180	-194	1
657	392	297	102	13	chr3	9441570	9441727	-150158056	+	MLT1A	LTR	MaLR	189	359	-15	1
657	842	227	214	72	chr3	9443771	9444103	-150155680	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	1
657	804	231	217	47	chr3	9444123	9444445	-150155338	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	1	1
657	277	355	23	61	chr3	9447706	9447838	-150151945	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	127	-247	1
657	613	205	0	0	chr3	9448652	9448764	-150151019	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	116	-243	1
657	773	284	128	20	chr3	9448833	9449131	-150150652	+	BGLII_B	LTR	ERVK	83	412	-29	1
657	1528	183	192	0	chr3	9453144	9453466	-150146317	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	1
657	1568	154	46	45	chr3	9455322	9455695	-150144088	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	342	-42	1
657	353	43	22	0	chr3	9455889	9455935	-150143848	+	ORR1A4	LTR	MaLR	272	318	-8	1
657	480	235	324	9	chr3	9455937	9456156	-150143627	+	ORR1D1	LTR	MaLR	86	373	-1	1
657	239	283	95	38	chr3	9456539	9456697	-150143086	+	LTR33	LTR	ERVL	11	177	-338	1
657	388	287	16	39	chr3	9460745	9460872	-150138911	-	MT2B	LTR	ERVL	-78	523	400	1
657	246	310	9	107	chr3	9461284	9461396	-150138387	+	MT2B	LTR	ERVL	165	265	-336	1
657	254	301	0	14	chr3	9462557	9462631	-150137152	+	LTR33B	LTR	ERVL	431	503	0	1
657	409	268	71	33	chr3	9462856	9463068	-150136715	+	RLTR15	LTR	ERVK	72	291	-68	1
657	2361	107	139	50	chr3	9465369	9465792	-150133991	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	1
657	449	175	91	8	chr3	9474957	9475078	-150124705	+	MTEb	LTR	MaLR	249	379	0	1
657	235	241	104	94	chr3	9475836	9475932	-150123851	+	MTEa	LTR	MaLR	283	379	0	1
657	1509	184	50	59	chr3	9478571	9478911	-150120872	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	337	-41	1
657	969	8	0	0	chr3	9479526	9479643	-150120140	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	117	-205	1
657	3297	46	2	8	chr3	9480231	9480628	-150119155	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	2	1
657	279	267	23	114	chr3	9482880	9483011	-150116772	-	MT2B	LTR	ERVL	-330	271	153	1
657	261	240	159	83	chr3	9483172	9483197	-150116586	+	MT2B	LTR	ERVL	137	171	-430	1
657	1450	192	162	14	chr3	9484680	9485045	-150114738	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
657	232	333	77	19	chr3	9486345	9486449	-150113334	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-2	461	352	1
657	1952	126	58	80	chr3	9486467	9486829	-150112954	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	1
657	262	346	123	14	chr3	9486829	9487039	-150112744	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-168	312	66	1
657	2043	193	29	19	chr3	9487208	9487625	-150112158	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
657	591	276	153	128	chr3	9487687	9488224	-150111559	+	RLTR18	LTR	ERVK	25	574	-42	1
657	641	254	42	30	chr3	9488576	9488822	-150110961	+	MLT1B	LTR	MaLR	211	533	-16	1
657	1797	152	121	12	chr3	9491927	9492267	-150107516	+	ORR1C1	LTR	MaLR	2	378	0	1
657	3516	25	0	8	chr3	9494059	9494458	-150105325	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
657	233	233	64	64	chr3	9503507	9503561	-150096222	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-267	208	155	8
657	5560	107	178	7	chr3	9506797	9507679	-150092104	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	1033	0	1
657	238	363	10	19	chr3	9508605	9508709	-150091074	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	155	1
657	1257	168	52	28	chr3	9519077	9519387	-150080396	+	ORR1B2	LTR	MaLR	11	367	0	3
657	1051	259	53	11	chr3	9519387	9519670	-150080113	+	RMER5	LTR	ERV1	239	533	-1	3
657	1676	169	69	16	chr3	9529816	9530135	-150069648	+	ORR1D1	LTR	MaLR	31	366	-8	5
657	451	219	165	40	chr3	9538460	9538636	-150061147	+	MLT1D	LTR	MaLR	7	204	-301	6
657	2318	172	47	153	chr3	9539038	9539664	-150060119	-	RMER19C	LTR	ERVK	-4	607	50	6
657	2318	172	47	153	chr3	9539855	9539907	-150059876	-	RMER19C	LTR	ERVK	-562	49	1	6
657	1211	173	191	10	chr3	9543666	9543975	-150055808	+	MTC	LTR	MaLR	1	365	-56	7
657	340	325	67	92	chr3	9545428	9545743	-150054040	+	MLT1E3	LTR	MaLR	261	567	-57	8
657	234	341	90	37	chr3	9548250	9548384	-150051399	+	MTEa	LTR	MaLR	44	184	-175	8
657	275	354	10	20	chr3	9548451	9548552	-150051231	+	MTEa	LTR	MaLR	280	379	0	8
657	1275	246	131	0	chr3	9552557	9552907	-150046876	+	MTD	LTR	MaLR	11	406	-13	9
657	330	289	4	89	chr3	9561197	9561329	-150038454	+	LTR16B2	LTR	ERVL	347	463	-17	1
658	4419	95	43	36	chr3	9569678	9570419	-150029364	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	746	-5	1
658	1055	293	91	0	chr3	9576801	9577153	-150022630	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	35	1
658	2441	142	175	4	chr3	9582405	9582886	-150016897	-	RMER15	LTR	ERVL	-4	571	9	1
658	1761	197	74	37	chr3	9583556	9583962	-150015821	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
658	2051	132	6	58	chr3	9586719	9587064	-150012719	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
658	1046	282	65	39	chr3	9588260	9588596	-150011187	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	348	-11	1
658	3312	21	42	0	chr3	9595338	9595718	-150004065	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
658	435	293	152	54	chr3	9604959	9605262	-149994521	+	MLT1E3	LTR	MaLR	307	650	-4	1
658	384	317	69	60	chr3	9611901	9612119	-149987664	+	RMER15	LTR	ERVL	352	571	-4	1
658	926	185	11	28	chr3	9612049	9612227	-149987556	-	RMER15	LTR	ERVL	-7	568	394	1
658	779	247	112	14	chr3	9614519	9614786	-149984997	-	MTD	LTR	MaLR	-89	332	10	2
658	948	216	137	4	chr3	9616371	9616641	-149983142	+	MTEb	LTR	MaLR	1	306	-73	2
658	248	268	29	67	chr3	9617852	9617956	-149981827	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-247	201	102	2
658	300	271	186	16	chr3	9620112	9620236	-149979547	+	LTR33A	LTR	ERVL	309	453	-67	2
658	1055	123	7	7	chr3	9620680	9620835	-149978948	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	-878	155	1	2
658	932	232	82	168	chr3	9621746	9622150	-149977633	-	MTEb	LTR	MaLR	-8	371	3	2
658	229	256	63	13	chr3	9622151	9622230	-149977553	+	MLT1A1	LTR	MaLR	52	134	-274	2
658	1718	185	62	14	chr3	9623134	9623491	-149976292	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
658	1209	181	43	91	chr3	9625425	9625751	-149974032	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	43	381	-147	2
658	1374	241	84	28	chr3	9626903	9627286	-149972497	+	MTD	LTR	MaLR	18	405	-14	2
658	375	360	143	74	chr3	9632334	9632808	-149966975	+	MLT1F2	LTR	MaLR	40	546	-14	2
658	1632	194	64	18	chr3	9635386	9635882	-149963901	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	557	-11	2
658	523	314	236	8	chr3	9637286	9637676	-149962107	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2077	2555	-2444	2
658	1710	165	107	12	chr3	9638617	9638954	-149960829	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	1	2
658	2286	111	66	179	chr3	9639378	9639683	-149960100	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	173	2
658	2286	111	66	179	chr3	9639720	9639917	-149959866	-	RLTR41	LTR	ERV1	-274	172	1	2
658	248	214	149	74	chr3	9640321	9640442	-149959341	+	RMER15	LTR	ERVL	413	542	-33	2
658	993	143	245	13	chr3	9641262	9641495	-149958288	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	742	2
658	3470	149	42	100	chr3	9641731	9642156	-149957627	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-248	855	478	2
658	1272	158	31	134	chr3	9642156	9642515	-149957268	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	2
658	3470	150	49	106	chr3	9642515	9642889	-149956894	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-505	523	137	2
658	2461	153	89	140	chr3	9643025	9643190	-149956593	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-892	136	13	2
658	363	288	43	114	chr3	9643659	9643722	-149956061	-	MT2B	LTR	ERVL	-264	337	172	2
658	1919	132	32	73	chr3	9645799	9646141	-149953642	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-1	328	1	2
658	1111	220	139	3	chr3	9647058	9647382	-149952401	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	1	2
658	467	159	8	130	chr3	9649007	9649130	-149950653	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	157	2
658	1151	149	6	0	chr3	9650508	9650689	-149949094	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	378	197	3
658	4756	245	63	48	chr3	9650688	9651742	-149948041	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-5	1365	296	3
658	4756	245	63	48	chr3	9651788	9652078	-149947705	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1075	295	2	3
658	2303	117	81	0	chr3	9652081	9652439	-149947344	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-7	387	1	3
658	1190	156	120	17	chr3	9652709	9652950	-149946833	-	RMER10A	LTR	ERVL	-169	273	8	3
658	854	288	68	35	chr3	9654077	9654444	-149945339	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	3
658	3055	86	112	35	chr3	9657053	9657535	-149942248	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	3
658	476	337	83	28	chr3	9657939	9658073	-149941710	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	314	3
658	4289	104	66	37	chr3	9658073	9658433	-149941350	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	362	-389	3
658	4289	104	66	37	chr3	9658529	9658895	-149940888	+	RMER17A	LTR	ERVK	363	748	-3	3
658	476	337	83	28	chr3	9658895	9659013	-149940770	-	MT2A	LTR	ERVL	-220	313	190	3
658	932	212	138	35	chr3	9659080	9659398	-149940385	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	351	-91	3
658	332	350	43	0	chr3	9659551	9659668	-149940115	-	MTEa	LTR	MaLR	-244	135	14	3
658	232	409	45	28	chr3	9660523	9660699	-149939084	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-549	288	110	3
658	1707	135	48	57	chr3	9660700	9661031	-149938752	+	ORR1A4	LTR	MaLR	2	329	0	3
658	373	259	107	103	chr3	9661995	9662266	-149937517	+	RMER20B	LTR	ERVK	90	361	-266	3
658	521	269	276	60	chr3	9663427	9663802	-149935981	+	RLTR12B	LTR	ERVK	6	461	-67	3
658	1600	169	58	97	chr3	9664448	9664841	-149934942	+	RMER10B	LTR	ERVL	21	398	0	3
658	362	244	217	22	chr3	9665282	9665420	-149934363	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2991	3155	-83	3
658	2130	158	47	18	chr3	9665457	9665844	-149933939	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	3
658	513	304	19	54	chr3	9667547	9667752	-149932031	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	233	3
658	227	343	49	21	chr3	9668491	9668634	-149931149	+	LTRIS2	LTR	ERV1	354	500	-64	3
658	649	289	159	40	chr3	9673862	9674244	-149925539	-	MLT1D	LTR	MaLR	-65	440	1	3
658	2108	100	83	0	chr3	9674393	9674693	-149925090	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	3
658	1152	275	46	3	chr3	9675096	9675381	-149924402	-	MTEa	LTR	MaLR	-82	297	1	3
658	790	263	146	29	chr3	9677069	9677343	-149922440	+	MTD	LTR	MaLR	102	407	-12	3
658	690	289	78	111	chr3	9677906	9678144	-149921639	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	139	3
658	7538	68	26	34	chr3	9678144	9679171	-149920612	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	5	3
658	690	289	78	111	chr3	9679171	9679302	-149920481	-	MTE2b	LTR	MaLR	-241	138	21	3
658	398	280	32	8	chr3	9679871	9679997	-149919786	+	RMER15	LTR	ERVL	405	533	-42	3
658	3336	157	119	2	chr3	9682160	9682767	-149917016	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	3
658	1196	209	82	0	chr3	9684034	9684278	-149915505	+	ORR1B2	LTR	MaLR	71	334	-33	3
658	1216	156	62	4	chr3	9684399	9684624	-149915159	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-140	238	1	3
658	1085	220	152	7	chr3	9695456	9695726	-149904057	+	MTD	LTR	MaLR	12	320	-99	3
659	226	283	82	16	chr3	9701261	9701322	-149898461	+	MLT1E2	LTR	MaLR	15	79	-548	3
659	299	316	40	10	chr3	9704181	9704280	-149895503	+	MLT1C	LTR	MaLR	22	123	-344	3
659	1939	174	9	6	chr3	9714535	9714882	-149884901	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	12	4
659	259	175	0	34	chr3	9724652	9724711	-149875072	+	MTEb	LTR	MaLR	322	378	-1	4
659	491	373	40	0	chr3	9729717	9729918	-149869865	+	MLT1H	LTR	MaLR	11	219	-330	4
659	2205	79	3	57	chr3	9731167	9731518	-149868265	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	332	-5	4
659	58009	18	6	4	chr3	9731530	9737967	-149861816	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	35	6481	0	4
659	2401	86	3	56	chr3	9737967	9738323	-149861460	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	4
659	290	304	17	35	chr3	9759517	9759633	-149840150	+	MLT1C	LTR	MaLR	349	462	-5	4
659	3774	16	121	0	chr3	9763382	9763822	-149835961	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
659	264	328	43	28	chr3	9764416	9764557	-149835226	+	MLT1C	LTR	MaLR	316	458	-9	4
659	2318	152	82	3	chr3	9765848	9766238	-149833545	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
659	1900	197	8	13	chr3	9770868	9771264	-149828519	-	MTD	LTR	MaLR	-24	395	2	4
659	265	276	42	33	chr3	9781177	9781297	-149818486	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-229	136	16	4
659	691	223	195	38	chr3	9781630	9781953	-149817830	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
659	255	179	18	0	chr3	9790745	9790801	-149808982	+	RLTR12B	LTR	ERVK	9	65	-463	4
659	327	293	56	74	chr3	9790883	9791152	-149808631	+	RLTR15	LTR	ERVK	59	322	-37	4
659	3323	44	179	2	chr3	9791717	9792152	-149807631	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	4
659	486	290	55	103	chr3	9793777	9794088	-149805695	-	ORR1E	LTR	MaLR	-38	321	26	4
659	256	323	0	0	chr3	9804162	9804258	-149795525	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	407	5
659	500	294	60	20	chr3	9810118	9810319	-149789464	-	LTR40a	LTR	ERVL	-310	209	1	5
659	1319	203	101	37	chr3	9813201	9813549	-149786234	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	5	5
659	723	75	9	0	chr3	9818888	9818994	-149780789	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	287	5
659	920	166	6	0	chr3	9820877	9821040	-149778743	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-77	317	154	5
660	995	237	196	19	chr3	9834960	9835282	-149764501	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	5
660	2185	100	45	3	chr3	9835837	9836149	-149763634	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	325	-2	5
660	745	259	125	100	chr3	9837041	9837410	-149762373	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	1	5
660	3881	23	5	0	chr3	9838148	9838582	-149761201	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	5
660	279	290	59	101	chr3	9840519	9840885	-149758898	+	ORR1D2	LTR	MaLR	9	363	-11	5
660	294	288	77	52	chr3	9842416	9842610	-149757173	+	MER21B	LTR	ERV1	178	376	-487	5
660	544	287	67	110	chr3	9844660	9845016	-149754767	+	ORR1E	LTR	MaLR	14	354	-5	5
660	296	318	89	22	chr3	9846904	9847084	-149752699	+	LTR79	LTR	ERVL	5	196	-331	5
660	971	231	158	13	chr3	9861283	9861594	-149738189	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	2	5
660	282	357	30	37	chr3	9862976	9863110	-149736673	+	MLT1A1	LTR	MaLR	220	352	-56	5
660	2942	58	63	2	chr3	9879786	9880183	-149719600	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	6
660	2416	150	25	332	chr3	9882080	9883078	-149716705	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	6
660	794	245	34	21	chr3	9888532	9888820	-149710963	-	MT2B	LTR	ERVL	-59	542	92	6
660	416	175	12	0	chr3	9889176	9889256	-149710527	-	MT2B	LTR	ERVL	-452	81	1	6
660	1729	214	194	25	chr3	9894044	9894529	-149705254	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	6
660	284	245	128	0	chr3	9895515	9895609	-149704174	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	106	-268	6
660	2906	106	18	24	chr3	9898189	9898644	-149701139	+	RLTR11B	LTR	ERVK	2	453	0	6
660	507	318	22	11	chr3	9903033	9903214	-149696569	-	MLT1F	LTR	MaLR	-91	457	275	6
660	3299	59	69	41	chr3	9908619	9909081	-149690702	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	6
660	275	254	149	94	chr3	9911095	9911330	-149688453	-	MLT1F	LTR	MaLR	-140	250	3	6
660	601	286	110	55	chr3	9913115	9913441	-149686342	+	MTEa	LTR	MaLR	23	366	-13	6
660	930	209	173	37	chr3	9914350	9914673	-149685110	+	MTEb	LTR	MaLR	1	367	-12	6
660	1063	203	45	53	chr3	9916150	9916218	-149683565	-	MTD	LTR	MaLR	-144	275	211	6
660	1063	203	45	53	chr3	9916703	9916899	-149682884	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	13	6
660	1102	169	15	0	chr3	9918005	9918200	-149681583	+	ORR1C1	LTR	MaLR	181	378	0	6
660	1925	115	6	9	chr3	9919339	9919656	-149680127	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	316	-11	6
660	2112	138	14	17	chr3	9921689	9922049	-149677734	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	6
660	701	304	148	49	chr3	9931613	9931937	-149667846	+	MLT1E3	LTR	MaLR	62	416	-208	6
660	701	304	148	49	chr3	9932059	9932246	-149667537	+	MLT1E3	LTR	MaLR	417	624	0	6
660	370	326	73	26	chr3	9940352	9940544	-149659239	+	RMER15	LTR	ERVL	324	524	-51	6
660	525	260	26	64	chr3	9941467	9941701	-149658082	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	182	6
660	242	218	206	60	chr3	9944182	9944351	-149655432	+	MLT1D	LTR	MaLR	213	433	-72	6
660	1682	200	82	8	chr3	9946870	9947248	-149652535	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	3	7
660	605	266	92	31	chr3	9957744	9957973	-149641810	+	MTEa	LTR	MaLR	20	262	-117	7
660	1068	205	196	31	chr3	9958254	9958478	-149641305	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	155	7
660	1068	205	196	31	chr3	9958539	9958672	-149641111	-	MTD	LTR	MaLR	-265	154	3	7
661	1206	180	151	20	chr3	9967661	9968013	-149631770	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	11	7
661	854	164	64	73	chr3	9971996	9972325	-149627458	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	85	7
661	592	227	4	100	chr3	9972339	9972618	-149627165	-	RMER17C	LTR	ERVK	-158	252	1	7
661	1910	142	15	25	chr3	9972618	9973010	-149626773	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2905	7
661	1118	148	170	37	chr3	9972997	9973602	-149626181	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-228	3010	2532	7
661	918	177	21	0	chr3	9973590	9973776	-149626007	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-879	2359	2170	7
661	1141	177	189	22	chr3	9973775	9974231	-149625552	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1222	2016	1485	7
661	1634	199	129	34	chr3	9975030	9975478	-149624305	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2746	492	2	7
661	3355	41	5	0	chr3	9976054	9976448	-149623335	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
661	8435	67	7	4	chr3	9976448	9977542	-149622241	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	7
661	3376	36	8	0	chr3	9977542	9977935	-149621848	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
661	1265	236	109	25	chr3	9982457	9982893	-149616890	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	100	553	-7	7
661	2120	124	76	36	chr3	9986910	9987303	-149612480	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	7
661	261	196	73	42	chr3	10028624	10028720	-149571063	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	281	4
661	393	241	86	70	chr3	10028857	10029044	-149570739	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	1	4
661	1256	220	54	27	chr3	10032406	10032779	-149567004	-	RLTR16	LTR	ERVK	-122	383	1	5
661	520	267	43	104	chr3	10036424	10036654	-149563129	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	216	-163	5
661	260	263	109	20	chr3	10040959	10041060	-149558723	+	LTR16A1	LTR	ERVL	327	436	-20	6
661	861	179	10	45	chr3	10041629	10041667	-149558116	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	500	6
661	3152	41	51	0	chr3	10041667	10042058	-149557725	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	6
661	861	179	10	45	chr3	10042058	10042218	-149557565	-	RMER16	LTR	ERVK	-34	499	342	6
661	668	242	106	9	chr3	10043751	10043968	-149555815	+	RMER15	LTR	ERVL	338	575	0	6
661	306	259	17	77	chr3	10051491	10051608	-149548175	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	154	7
661	443	263	6	103	chr3	10055706	10055880	-149543903	+	RMER10A	LTR	ERVL	22	178	-264	8
661	375	294	94	5	chr3	10056113	10056315	-149543468	+	RMER10A	LTR	ERVL	198	417	-25	8
661	944	246	157	48	chr3	10064802	10065216	-149534567	-	RLTR17	LTR	ERVK	-122	570	112	9
661	1794	166	11	79	chr3	10066524	10066904	-149532879	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	1
661	1039	259	83	11	chr3	10071049	10071404	-149528379	-	MTD	LTR	MaLR	-5	374	27	1
661	3464	28	5	0	chr3	10072287	10072681	-149527102	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
661	8337	59	16	3	chr3	10072682	10073765	-149526018	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-1	1097	1	1
661	3580	23	0	0	chr3	10073765	10074161	-149525622	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
661	427	281	246	69	chr3	10075889	10076228	-149523555	+	MER57C2	LTR	ERV1	7	405	-29	1
661	3341	43	5	2	chr3	10076245	10076640	-149523143	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
661	649	285	123	42	chr3	10078010	10078342	-149521441	-	MLT1C	LTR	MaLR	-81	386	38	1
661	452	270	66	18	chr3	10085854	10086020	-149513763	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	343	1
661	1091	239	63	3	chr3	10086136	10086421	-149513362	-	RMER20A	LTR	ERVK	-192	324	23	1
661	448	273	157	8	chr3	10092241	10092455	-149507328	+	MTEb	LTR	MaLR	92	371	-8	1
662	759	251	5	42	chr3	10097374	10097586	-149502197	+	RMER13A	LTR	ERVK	94	297	-563	1
662	342	284	14	36	chr3	10097644	10097783	-149502000	+	RMER13A	LTR	ERVK	507	642	-218	1
662	1764	173	91	11	chr3	10101534	10101884	-149497899	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
662	1061	131	40	10	chr3	10105354	10105554	-149494229	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	838	1043	-920	1
662	5765	97	21	7	chr3	10106434	10107324	-149492459	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1061	1963	0	1
662	2070	135	3	58	chr3	10107324	10107670	-149492113	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
662	431	288	131	39	chr3	10108327	10108587	-149491196	-	RMER20B	LTR	ERVK	-212	415	132	1
662	2981	86	5	0	chr3	10108690	10109085	-149490698	+	MTB	LTR	MaLR	4	400	0	1
662	1013	248	123	9	chr3	10109949	10110283	-149489500	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	48	1
662	568	127	54	9	chr3	10113341	10113452	-149486331	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	284	399	-76	1
662	2703	80	80	3	chr3	10116520	10116896	-149482887	+	RLTR44A	LTR	ERVK	1	405	0	1
662	1662	65	0	4	chr3	10118307	10118537	-149481246	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	275	1
662	1781	171	112	67	chr3	10118531	10118996	-149480787	+	RLTR24	LTR	ERV1	44	529	0	1
662	3960	180	55	34	chr3	10132728	10133613	-149466170	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	904	-4	1
662	237	311	70	55	chr3	10133632	10133833	-149465950	-	MTE-int	LTR	MaLR	-817	763	560	1
662	1276	231	52	25	chr3	10137300	10137664	-149462119	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	2
662	2715	134	24	2	chr3	10144069	10144564	-149455219	+	RLTR28	LTR	ERVL	19	524	0	2
662	310	375	27	11	chr3	10152591	10152777	-149447006	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-1160	227	39	2
662	1691	197	132	5	chr3	10152838	10153210	-149446573	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
662	1584	169	172	0	chr3	10153572	10153885	-149445898	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
662	1385	153	152	41	chr3	10158988	10159356	-149440427	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
662	464	107	25	62	chr3	10159356	10159436	-149440347	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-1	7405	7329	2
662	532	182	342	10	chr3	10159436	10159723	-149440060	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-365	537	154	2
662	5849	202	63	68	chr3	10159723	10162823	-149436960	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-345	4499	2359	2
662	3084	159	37	32	chr3	10163370	10164078	-149435705	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4271	3135	1934	2
662	2187	184	72	102	chr3	10164100	10164785	-149434998	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-5318	2088	1425	2
662	294	189	217	0	chr3	10167273	10167379	-149432404	+	RMER10A	LTR	ERVL	213	341	-101	2
662	465	232	191	7	chr3	10167468	10167620	-149432163	+	ORR1D2	LTR	MaLR	174	353	-17	2
662	256	262	80	24	chr3	10168445	10168522	-149431261	+	RMER12	LTR	ERVK	720	798	-524	2
662	256	262	80	24	chr3	10168702	10168749	-149431034	+	RMER12	LTR	ERVK	799	851	-471	2
662	239	214	51	114	chr3	10169032	10169111	-149430672	+	MamGypLTR2	LTR	Gypsy	260	333	-856	2
662	335	271	50	8	chr3	10173734	10173853	-149425930	+	MER57E1	LTR	ERV1	13	136	-236	2
662	465	302	64	0	chr3	10173980	10174152	-149425631	+	MER57E1	LTR	ERV1	188	370	-2	2
662	323	288	38	53	chr3	10176391	10176523	-149423260	-	ORR1E	LTR	MaLR	-223	136	7	2
662	321	306	88	64	chr3	10176527	10176810	-149422973	+	MLT1A0	LTR	MaLR	20	309	-56	2
662	672	294	25	0	chr3	10177984	10178185	-149421598	+	MTEb	LTR	MaLR	70	275	-104	2
662	417	286	0	31	chr3	10178161	10178291	-149421492	+	MTE2b	LTR	MaLR	197	322	-57	2
662	420	305	14	0	chr3	10179445	10179586	-149420197	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	7	2
662	660	285	90	65	chr3	10181051	10181419	-149418364	+	MTEa	LTR	MaLR	1	377	-2	2
662	807	324	21	88	chr3	10193202	10193578	-149406205	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	351	-8	3
662	514	346	36	52	chr3	10199812	10200141	-149399642	-	ORR1E	LTR	MaLR	-34	325	2	3
662	295	305	12	24	chr3	10200141	10200213	-149399570	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-52	1528	1458	3
662	313	389	36	39	chr3	10200283	10200353	-149399430	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-182	1188	1114	3
662	313	389	36	39	chr3	10200386	10200623	-149399160	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-257	1113	883	3
662	258	182	38	25	chr3	10203699	10203778	-149396005	+	MLT1A1	LTR	MaLR	305	384	-24	3
662	226	35	0	0	chr3	10217034	10217063	-149382720	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	465	3
662	16396	31	24	34	chr3	10217063	10217701	-149382082	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3488	1997	1329	3
662	16396	31	24	34	chr3	10218197	10218965	-149380818	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4157	1328	606	3
662	16396	31	24	34	chr3	10219112	10219721	-149380062	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4880	605	1	3
662	4141	45	0	14	chr3	10219721	10220221	-149379562	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	3
662	1140	194	128	36	chr3	10220947	10221251	-149378532	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	3
662	1426	186	55	17	chr3	10221251	10221595	-149378188	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	6125	3
662	1740	113	58	34	chr3	10221612	10221938	-149377845	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-342	7338	6965	3
662	1296	132	137	0	chr3	10221938	10222157	-149377626	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5007	3
662	351	175	0	0	chr3	10222157	10222214	-149377569	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6039	503	447	3
662	293	260	49	20	chr3	10222231	10222333	-149377450	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-6015	1566	1462	3
662	274	211	58	0	chr3	10222396	10222448	-149377335	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-983	1004	950	3
662	582	231	268	5	chr3	10222443	10222656	-149377127	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5475	662	394	3
662	611	226	176	0	chr3	10222632	10222791	-149376992	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4903	503	317	3
662	772	126	0	0	chr3	10222781	10222900	-149376883	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6750	831	713	3
662	1409	99	45	9	chr3	10223003	10223332	-149376451	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7155	426	1	3
82	1078	194	128	36	chr3	10223332	10223636	-149376147	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	3
663	328	304	56	0	chr3	10249096	10249221	-149350562	+	MTE2a	LTR	MaLR	19	150	-269	3
663	283	286	50	66	chr3	10249275	10249473	-149350310	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	126	3
663	498	236	140	21	chr3	10249640	10249826	-149349957	+	MTE2a	LTR	MaLR	172	379	0	3
663	291	182	185	19	chr3	10251040	10251109	-149348674	-	RMER17C	LTR	ERVK	-133	277	186	3
663	291	182	185	19	chr3	10251273	10251360	-149348423	-	RMER17C	LTR	ERVK	-225	185	96	3
663	294	273	90	90	chr3	10251423	10251624	-149348159	+	MLT1D	LTR	MaLR	22	222	-283	3
663	398	263	228	82	chr3	10258916	10259228	-149340555	+	MTE2a	LTR	MaLR	10	367	-12	4
663	326	327	64	0	chr3	10259850	10259960	-149339823	-	LTR31	LTR	ERV1	-280	339	223	4
663	396	236	224	33	chr3	10260910	10261175	-149338608	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	64	4
663	2200	175	98	12	chr3	10261310	10261801	-149337982	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	358	4
663	932	202	9	2	chr3	10261806	10262008	-149337775	-	RMER19B	LTR	ERVK	-675	227	49	4
663	1454	203	116	6	chr3	10262098	10262435	-149337348	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
663	235	276	103	15	chr3	10265328	10265464	-149334319	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-4	463	316	4
663	1254	183	63	4	chr3	10265466	10265718	-149334065	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	267	-111	4
663	2423	171	67	70	chr3	10265719	10266631	-149333152	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	855	0	4
663	635	144	9	0	chr3	10266631	10266742	-149333041	+	ORR1C1	LTR	MaLR	263	374	-4	4
663	277	296	89	27	chr3	10267018	10267164	-149332619	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-444	183	29	4
663	2254	163	58	2	chr3	10270482	10270881	-149328902	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
663	2976	155	59	98	chr3	10270881	10271648	-149328135	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	522	4
663	420	269	170	0	chr3	10275242	10275454	-149324329	+	RMER20B	LTR	ERVK	236	483	-144	4
663	333	277	75	25	chr3	10279061	10279220	-149320563	+	MLT2D	LTR	ERVL	82	248	-166	4
663	369	233	20	46	chr3	10284011	10284131	-149315652	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	366	4
663	253	316	100	12	chr3	10284168	10284328	-149315455	-	MLT1C	LTR	MaLR	-216	174	1	4
663	935	136	171	19	chr3	10286389	10286599	-149313184	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	180	4
663	1584	239	32	88	chr3	10286599	10287168	-149312615	+	RLTR20A	LTR	ERVK	5	541	0	4
663	797	151	119	0	chr3	10287168	10287327	-149312456	-	MTC	LTR	MaLR	-238	183	6	4
663	4084	134	78	41	chr3	10287725	10288098	-149311685	+	RMER17D2	LTR	ERVK	3	350	-459	4
663	4084	134	78	41	chr3	10288230	10288299	-149311484	+	RMER17D2	LTR	ERVK	351	440	-369	4
663	4084	134	78	41	chr3	10288352	10288685	-149311098	+	RMER17D2	LTR	ERVK	441	807	-2	4
663	1704	197	113	31	chr3	10294686	10295174	-149304609	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	528	0	4
663	479	223	9	18	chr3	10295180	10295294	-149304489	+	MTEa	LTR	MaLR	264	376	-3	4
663	525	119	0	12	chr3	10295296	10295381	-149304402	+	MTC	LTR	MaLR	1	84	-337	4
663	266	267	125	37	chr3	10298411	10298547	-149301236	+	ORR1E	LTR	MaLR	26	173	-186	4
663	5512	51	24	5	chr3	10305524	10306316	-149293467	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	893	1	5
663	2163	106	0	0	chr3	10309564	10309884	-149289899	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	320	-7	5
663	797	224	105	162	chr3	10324992	10325412	-149274371	+	MTD	LTR	MaLR	10	405	-14	5
663	2779	173	158	10	chr3	10338661	10339263	-149260520	+	RLTR17	LTR	ERVK	2	692	0	5
663	3229	107	63	13	chr3	10342652	10343193	-149256590	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	568	0	5
663	1488	208	109	29	chr3	10343863	10344249	-149255534	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	5
664	1926	170	81	21	chr3	10355026	10355410	-149244373	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	5
664	1274	172	42	194	chr3	10361577	10361819	-149237964	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	156	5
664	2247	156	10	24	chr3	10361819	10362232	-149237551	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	407	-2	5
664	1274	172	42	194	chr3	10362232	10362422	-149237361	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-212	155	1	5
664	1845	171	28	43	chr3	10362422	10362809	-149236974	-	MTC	LTR	MaLR	-38	383	3	5
664	7083	85	52	14	chr3	10363708	10364694	-149235089	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	6
664	360	365	39	31	chr3	10370447	10370676	-149229107	+	LTR82A	LTR	ERVL	273	503	-369	6
664	291	318	29	52	chr3	10370839	10370975	-149228808	+	LTR82A	LTR	ERVL	724	856	-16	6
664	1805	189	14	28	chr3	10375394	10375754	-149224029	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	5	6
664	304	130	56	0	chr3	10377053	10377107	-149222676	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	328	6
664	1187	206	79	17	chr3	10377975	10378266	-149221517	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-54	320	12	6
664	1139	141	22	88	chr3	10388498	10388724	-149211059	+	RLTR42	LTR	ERVK	1	211	-28	6
664	357	278	88	92	chr3	10391826	10391891	-149207892	+	MLT1A0	LTR	MaLR	3	69	-296	6
664	1952	121	50	44	chr3	10391891	10392212	-149207571	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-1	325	3	6
664	357	278	88	92	chr3	10392212	10392384	-149207399	+	MLT1A0	LTR	MaLR	70	239	-126	6
664	360	265	135	8	chr3	10393566	10393699	-149206084	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	259	6
664	4683	148	113	32	chr3	10394434	10395269	-149204514	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	6
664	698	175	175	0	chr3	10397874	10398045	-149201738	+	RLTR24	LTR	ERV1	329	529	0	6
664	757	257	159	16	chr3	10399025	10399333	-149200450	+	MTEa	LTR	MaLR	28	379	0	6
664	229	338	45	51	chr3	10400744	10400900	-149198883	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	351	6
664	267	320	13	0	chr3	10400963	10401041	-149198742	-	MLT1D	LTR	MaLR	-340	165	87	6
664	2104	158	69	26	chr3	10401725	10402103	-149197680	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	6
664	1476	259	50	43	chr3	10403167	10403627	-149196156	+	RLTR28B	LTR	ERVL	15	477	-4	6
664	891	274	90	94	chr3	10404910	10405409	-149194374	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	497	-31	6
664	877	207	40	0	chr3	10408950	10409124	-149190659	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-193	181	1	6
664	5938	208	48	48	chr3	10409124	10410493	-149189290	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	1	6
664	791	182	159	0	chr3	10410493	10410669	-149189114	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	181	6
664	433	174	23	119	chr3	10411319	10411463	-149188320	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-190	194	44	6
664	2343	97	52	0	chr3	10413087	10413397	-149186386	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	2	6
664	1774	140	35	16	chr3	10414862	10415175	-149184608	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	319	-10	6
664	2235	178	43	5	chr3	10419792	10420187	-149179596	+	MTC	LTR	MaLR	12	421	0	6
664	1346	167	254	29	chr3	10433198	10433580	-149166203	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	468	-95	7
664	406	250	50	10	chr3	10433667	10433768	-149166015	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	453	557	-3	7
664	664	269	91	19	chr3	10434865	10435110	-149164673	+	MLT1E2	LTR	MaLR	271	525	-99	7
664	3862	64	12	62	chr3	10445407	10445926	-149153857	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	7
664	233	313	0	24	chr3	10446997	10447082	-149152701	+	MLT1N2	LTR	MaLR	447	529	-33	7
664	793	255	77	5	chr3	10447922	10448131	-149151652	-	MTE2a	LTR	MaLR	-43	336	113	7
664	2097	96	13	23	chr3	10452825	10453135	-149146648	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	307	-20	7
664	16609	107	30	24	chr3	10453152	10455714	-149144069	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1	2774	-3707	7
664	12014	49	3	1	chr3	10455712	10457133	-149142650	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4001	5424	-1057	7
664	4609	88	38	21	chr3	10457131	10457789	-149141994	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5813	6481	0	7
664	2047	115	9	6	chr3	10457789	10458104	-149141679	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	316	-11	7
664	354	312	110	59	chr3	10458609	10458928	-149140855	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-169	426	47	7
664	833	229	240	18	chr3	10467593	10467906	-149131877	-	MER57D	LTR	ERV1	-20	414	8	7
664	280	270	119	10	chr3	10469571	10469672	-149130111	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-63	532	421	7
664	2630	149	10	2	chr3	10473660	10474070	-149125713	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	7
664	276	323	104	62	chr3	10474779	10475086	-149124697	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-10	364	45	7
664	227	336	17	42	chr3	10477148	10477266	-149122517	-	RMER12	LTR	ERVK	-472	850	736	7
664	3219	81	126	0	chr3	10481026	10481448	-149118335	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	7
664	1976	149	24	90	chr3	10481876	10482297	-149117486	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	7
664	429	133	26	13	chr3	10482297	10482373	-149117410	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1	7405	7329	7
664	6453	208	82	46	chr3	10482573	10484692	-149115091	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1230	4176	2358	7
664	2999	61	29	10	chr3	10484692	10485107	-149114676	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-156	650	228	7
664	5544	115	53	15	chr3	10485107	10485752	-149114031	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3994	3412	2739	7
10	7612	65	5	0	chr3	10485752	10486641	-149113142	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	7
665	5544	115	53	15	chr3	10486641	10486878	-149112905	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4668	2738	2496	7
665	5399	143	69	10	chr3	10486903	10487862	-149111921	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5321	2085	1071	7
665	1556	192	41	61	chr3	10487877	10488270	-149111513	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2928	386	2	7
665	1802	154	26	92	chr3	10488277	10488692	-149111091	-	RLTR9C	LTR	ERVK	-5	388	1	7
665	4584	47	2	8	chr3	10497341	10497856	-149101927	-	LTRIS3	LTR	ERV1	0	512	1	7
665	652	101	10	20	chr3	10499078	10499179	-149100604	+	MTC	LTR	MaLR	1	100	-321	7
665	2541	132	21	0	chr3	10499181	10499567	-149100216	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
665	1541	170	25	18	chr3	10499568	10499844	-149099939	+	MTC	LTR	MaLR	99	376	-45	7
665	440	180	0	115	chr3	10499847	10499960	-149099823	-	MT2B2	LTR	ERVL	-8	576	477	7
665	291	128	0	0	chr3	10499960	10499999	-149099784	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5225	536	498	7
665	1624	222	19	45	chr3	10500005	10500425	-149099358	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-5076	409	1	1
665	4164	103	34	0	chr3	10500425	10501006	-149098777	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	1
665	388	100	0	91	chr3	10501193	10501219	-149098564	+	MTD	LTR	MaLR	360	384	-35	3
665	2311	105	9	6	chr3	10501219	10501545	-149098238	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
665	388	100	0	91	chr3	10501545	10501584	-149098199	+	MTD	LTR	MaLR	385	419	0	3
665	6488	99	10	34	chr3	10503068	10504070	-149095713	+	RLTR13A3	LTR	ERVK	1	978	0	6
665	598	358	64	39	chr3	10509070	10509381	-149090402	-	ORR1E	LTR	MaLR	-31	328	10	9
665	3189	176	68	141	chr3	10512550	10513458	-149086325	-	RMER21B	LTR	ERV1	0	842	1	1
665	645	249	162	88	chr3	10513806	10514145	-149085638	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	16	1
665	231	380	130	25	chr3	10518467	10518629	-149081154	-	MLT1G	LTR	MaLR	-329	262	84	2
665	2905	52	52	0	chr3	10528802	10529171	-149070612	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	4
665	8040	40	0	2	chr3	10529171	10530167	-149069616	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1	1986	993	4
665	3817	48	20	12	chr3	10530700	10531311	-149068472	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-995	992	302	4
665	294	214	104	28	chr3	10531311	10531417	-149068366	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	277	4
665	1341	72	6	0	chr3	10531442	10531623	-149068160	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7399	182	1	4
665	3010	58	11	0	chr3	10531625	10532006	-149067777	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	4	4
665	430	306	128	63	chr3	10532976	10533311	-149066472	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-8	362	6	4
665	1038	308	117	17	chr3	10533302	10533829	-149065954	-	MLT1E2-int	LTR	MaLR	-39	1541	989	4
665	472	344	65	70	chr3	10543312	10543653	-149056130	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	339	-20	5
665	3471	45	28	7	chr3	10544965	10545392	-149054391	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	5
665	354	349	56	88	chr3	10558600	10558942	-149040841	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	331	-28	7
665	315	336	49	49	chr3	10567255	10567377	-149032406	+	RLTR16	LTR	ERVK	32	153	-352	8
665	230	281	31	0	chr3	10572444	10572508	-149027275	+	MLT2F	LTR	ERVL	33	98	-530	9
665	246	347	192	18	chr3	10572761	10573037	-149026746	+	MLT2F	LTR	ERVL	282	605	-58	9
665	6795	66	7	0	chr3	10584909	10585790	-149013993	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	7	1
665	2560	205	150	58	chr3	10586621	10586893	-149012890	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	908	522	1
665	2560	214	149	68	chr3	10586940	10587522	-149012261	-	RMER13A	LTR	ERVK	-349	559	5	1
665	279	306	11	23	chr3	10587502	10587589	-149012194	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	290	1
665	373	308	22	0	chr3	10587644	10587735	-149012048	-	MTE2b	LTR	MaLR	-182	197	105	1
665	486	327	75	0	chr3	10595792	10595951	-149003832	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	397	1
665	1186	206	35	89	chr3	10607939	10608254	-148991529	+	RLTR25A	LTR	ERVK	804	1101	-2	1
665	841	112	10	93	chr3	10608497	10608753	-148991030	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-970	7989	7813	1
665	2612	183	127	39	chr3	10609046	10609778	-148990005	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	1	1
665	2804	194	55	47	chr3	10612686	10613320	-148986463	+	RLTR26	LTR	ERVK	4	642	0	1
665	2370	161	7	12	chr3	10613586	10613995	-148985788	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
666	2538	197	41	53	chr3	10626633	10627213	-148972570	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	1	1
666	228	261	0	0	chr3	10628832	10628897	-148970886	+	MT2A	LTR	ERVL	3	67	-466	1
666	816	301	84	4	chr3	10628862	10629112	-148970671	+	MTD	LTR	MaLR	150	419	0	1
666	960	216	92	114	chr3	10631901	10631995	-148967788	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	302	1
666	960	216	92	114	chr3	10632056	10632363	-148967420	-	RLTR9C	LTR	ERVK	-92	301	2	1
666	466	298	16	0	chr3	10636101	10636222	-148963561	+	RMER15	LTR	ERVL	296	418	-157	1
666	313	360	54	24	chr3	10638236	10638404	-148961379	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	191	-168	1
666	378	293	44	2	chr3	10643224	10643363	-148956420	+	MLT1A	LTR	MaLR	8	152	-213	1
666	261	306	213	0	chr3	10644662	10644803	-148954980	+	MLT1A	LTR	MaLR	213	401	-7	1
666	716	290	69	108	chr3	10648107	10648525	-148951258	-	RLTR23	LTR	ERV1	-23	407	6	1
666	383	301	58	52	chr3	10672819	10672973	-148926810	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	164	-201	2
666	373	338	57	25	chr3	10673191	10673349	-148926434	+	MLT1A0	LTR	MaLR	181	343	-22	2
666	277	348	0	0	chr3	10674374	10674463	-148925320	-	MLT1I	LTR	MaLR	-2	409	321	2
666	388	290	84	0	chr3	10674781	10674888	-148924895	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-25	383	268	2
666	1999	190	50	0	chr3	10675110	10675474	-148924309	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	3	2
666	297	314	54	77	chr3	10678869	10679090	-148920693	+	RMER15	LTR	ERVL	185	400	-175	2
666	397	286	84	42	chr3	10679097	10679312	-148920471	+	RMER15	LTR	ERVL	314	537	-38	2
666	302	251	135	16	chr3	10683072	10683170	-148916613	-	MTD	LTR	MaLR	-17	404	276	2
666	469	325	64	40	chr3	10683183	10683385	-148916398	-	MTD	LTR	MaLR	-208	211	5	2
666	1489	260	56	32	chr3	10690875	10691284	-148908499	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
666	905	239	82	21	chr3	10710417	10710771	-148889012	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	22	2
666	294	321	120	40	chr3	10719211	10719386	-148880397	+	MLT1B	LTR	MaLR	178	366	-24	2
666	2814	59	146	124	chr3	10742427	10742928	-148856855	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	2
666	908	135	31	19	chr3	10743021	10743180	-148856603	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	0	1033	873	2
666	4383	59	11	14	chr3	10743401	10743967	-148855816	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	2
666	339	271	0	33	chr3	10743967	10744089	-148855694	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	0	4690	4573	2
666	597	174	0	0	chr3	10745084	10745193	-148854590	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-167	4896	4788	2
666	1240	246	48	21	chr3	10745185	10745800	-148853983	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-1235	3828	3632	2
666	7169	97	14	28	chr3	10745799	10747370	-148852413	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-1560	3503	1172	2
666	957	210	142	24	chr3	10747413	10747605	-148852178	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5737	1819	1513	2
83	3435	115	48	23	chr3	10747633	10748318	-148851465	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	-113	920	1	2
667	429	303	68	63	chr3	10749768	10749958	-148849825	-	MER74A	LTR	ERVL	-354	204	14	2
667	3247	56	5	0	chr3	10757237	10757631	-148842152	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
667	7291	76	11	114	chr3	10757631	10758854	-148840929	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
667	3171	63	5	0	chr3	10758854	10759248	-148840535	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
667	5167	136	15	77	chr3	10759504	10760466	-148839317	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	2
667	454	284	11	69	chr3	10762678	10762852	-148836931	-	RNLTR23	LTR	ERVK	0	642	479	2
667	684	245	11	11	chr3	10763573	10763763	-148836020	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-402	7815	7626	2
667	7866	253	2	1	chr3	10763856	10765754	-148834029	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-2595	5622	3723	2
667	793	257	0	9	chr3	10766803	10767019	-148832764	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-7758	459	246	2
667	594	241	12	64	chr3	10767231	10767404	-148832379	-	RNLTR23	LTR	ERVK	0	642	479	2
667	1830	138	58	0	chr3	10769889	10770200	-148829583	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
667	482	327	161	26	chr3	10773499	10773920	-148825863	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-11	478	1	2
667	512	288	70	12	chr3	10777702	10777874	-148821909	+	MER31A	LTR	ERV1	288	469	-16	2
667	3889	159	94	43	chr3	10781895	10782738	-148817045	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	8	3
667	284	235	0	0	chr3	10789808	10789866	-148809917	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-56	521	451	3
667	1248	263	68	42	chr3	10796556	10797012	-148802771	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-87	490	23	3
667	313	245	91	10	chr3	10798562	10798661	-148801122	+	MLT1E2	LTR	MaLR	1	107	-398	3
667	403	333	29	29	chr3	10798729	10798899	-148800884	+	MLT1E2	LTR	MaLR	229	398	-229	3
667	751	276	101	26	chr3	10813000	10813268	-148786515	+	RMER5	LTR	ERV1	69	356	-178	3
667	1000	360	71	2	chr3	10816922	10817329	-148782454	-	MTE-int	LTR	MaLR	-39	1541	1107	3
667	291	350	88	67	chr3	10817579	10817864	-148781919	+	MLT1A0	LTR	MaLR	42	332	-33	3
667	353	354	77	6	chr3	10818056	10818091	-148781692	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-2	552	518	3
667	353	280	182	34	chr3	10818214	10818557	-148781226	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-33	523	61	3
667	725	261	67	67	chr3	10819575	10819768	-148780015	-	MTD	LTR	MaLR	-201	218	26	3
667	799	276	64	53	chr3	10820387	10820762	-148779021	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	3
667	485	239	196	0	chr3	10826078	10826216	-148773567	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-20	347	183	3
667	1473	201	10	40	chr3	10827888	10828120	-148771663	+	ORR1A4	LTR	MaLR	43	275	-54	3
667	1473	201	10	40	chr3	10828344	10828400	-148771383	+	ORR1A4	LTR	MaLR	276	329	0	3
667	9340	148	62	65	chr3	10828400	10830330	-148769453	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	1924	-39	3
667	1993	145	12	3	chr3	10834030	10834356	-148765427	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
667	246	316	79	43	chr3	10834914	10835032	-148764751	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-343	211	88	3
667	246	316	79	43	chr3	10835090	10835110	-148764673	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-467	87	68	3
667	3933	164	40	5	chr3	10836556	10837224	-148762559	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	3
667	435	366	54	43	chr3	10853363	10853643	-148746140	-	LTR16C	LTR	ERVL	0	489	207	3
667	2999	188	104	8	chr3	10866656	10867299	-148732484	+	RMER6D	LTR	ERVK	12	716	-4	4
667	1621	242	45	12	chr3	10870271	10870673	-148729110	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	4
667	733	276	4	47	chr3	10873838	10874070	-148725713	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1311	1532	-3459	4
667	1903	141	244	30	chr3	10875306	10875773	-148724010	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	603	-51	4
83	60374	35	23	3	chr3	10875774	10883400	-148716383	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	1	7778	0	4
668	1862	133	254	31	chr3	10883513	10883962	-148715821	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	585	-69	4
668	363	302	85	30	chr3	10885263	10885427	-148714356	-	MLT1D	LTR	MaLR	-32	473	301	4
668	419	373	104	21	chr3	10887537	10888019	-148711764	-	MER92B	LTR	ERV1	-47	589	68	4
668	261	314	121	24	chr3	10893125	10893249	-148706534	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-161	287	152	4
668	3072	51	13	3	chr3	10893261	10893653	-148706130	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
668	8506	57	14	1	chr3	10893653	10894737	-148705046	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
668	3213	38	10	2	chr3	10894738	10895131	-148704652	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
668	1030	171	67	133	chr3	10896369	10896458	-148703325	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	222	4
668	1030	171	67	133	chr3	10896514	10896769	-148703014	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-101	221	2	4
668	2216	118	185	8	chr3	10914452	10914820	-148684963	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-3	433	1	4
668	252	315	64	27	chr3	10914908	10915078	-148684705	-	LTR81B	LTR	ERV1?	-1129	221	43	4
668	378	198	58	19	chr3	10916321	10916424	-148683359	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	302	4
668	11541	103	8	14	chr3	10936008	10937682	-148662101	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3743	5406	0	4
668	2099	124	57	34	chr3	10937682	10938063	-148661720	+	RMER16	LTR	ERVK	1	448	-85	4
668	387	312	139	26	chr3	10952783	10952901	-148646882	-	RMER21B	LTR	ERV1	-278	564	423	4
668	387	312	139	26	chr3	10953077	10953152	-148646631	-	RMER21B	LTR	ERV1	-420	422	349	4
668	324	222	0	36	chr3	10953263	10953347	-148646436	-	RMER21B	LTR	ERV1	-675	167	87	4
668	308	328	5	64	chr3	10955258	10955368	-148644415	-	RMER17C	LTR	ERVK	-220	190	85	5
668	308	328	5	64	chr3	10955396	10955487	-148644296	-	RMER17C	LTR	ERVK	-326	84	1	5
668	3100	67	12	2	chr3	10959687	10960104	-148639679	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	5
668	269	360	64	93	chr3	10973333	10973783	-148626000	-	MLT1D	LTR	MaLR	-38	467	31	5
668	3086	258	63	51	chr3	10977156	10978193	-148621590	+	MTC-int	LTR	MaLR	98	1146	-112	5
668	2504	102	68	8	chr3	10981096	10981480	-148618303	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	5
668	472	212	61	79	chr3	10990678	10990842	-148608941	-	RNLTR23	LTR	ERVK	-2	640	480	5
668	242	362	60	80	chr3	11000003	11000303	-148599480	+	ORR1D2	LTR	MaLR	50	343	-27	1
668	340	359	64	20	chr3	11000677	11000879	-148598904	+	MLT1E2	LTR	MaLR	308	518	-109	2
668	1613	134	128	0	chr3	11002879	11003169	-148596614	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-5	327	1	3
668	803	356	132	38	chr3	11003212	11004107	-148595676	+	MLT1E2-int	LTR	MaLR	695	1608	-127	2
668	250	255	19	105	chr3	11004140	11004245	-148595538	+	MLT1E2	LTR	MaLR	16	111	-297	2
668	1201	191	28	108	chr3	11004647	11005047	-148594736	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	4
668	246	301	0	14	chr3	11006220	11006294	-148593489	+	MLT1E2	LTR	MaLR	290	362	-46	2
669	3460	25	2	0	chr3	11012718	11013112	-148586671	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	396	0	1
669	4773	124	25	7	chr3	11025843	11026567	-148573216	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	3
669	1984	219	50	63	chr3	11028588	11029109	-148570674	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-28	549	36	3
669	2629	178	37	46	chr3	11030372	11030962	-148568821	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	3
669	250	259	62	106	chr3	11036444	11036604	-148563179	+	RLTR41	LTR	ERV1	251	403	-43	4
669	274	341	7	58	chr3	11039891	11040028	-148559755	+	MLT1H	LTR	MaLR	393	522	-27	4
669	664	271	129	47	chr3	11041167	11041475	-148558308	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	375	1	4
669	1101	272	31	78	chr3	11047819	11048205	-148551578	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	368	-2	6
669	259	235	114	32	chr3	11049161	11049319	-148550464	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	584	754	-755	6
669	2496	50	6	0	chr3	11054950	11055269	-148544514	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	321	-69	6
669	871	17	112	0	chr3	11055422	11055538	-148544245	+	RLTR10	LTR	ERVK	262	390	0	7
669	6836	46	80	0	chr3	11055584	11056493	-148543290	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	13	994	-993	7
669	493	309	26	26	chr3	11056547	11056939	-148542844	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	738	1061	-5481	7
669	8447	20	0	0	chr3	11057021	11058018	-148541765	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	990	1986	-1	7
669	2496	50	6	0	chr3	11058018	11058337	-148541446	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	321	-69	7
669	965	39	15	15	chr3	11058436	11058568	-148541215	+	RLTR10	LTR	ERVK	259	390	0	7
669	1064	233	159	15	chr3	11075450	11075584	-148524199	+	MTD	LTR	MaLR	25	178	-241	8
669	1064	233	159	15	chr3	11075636	11075841	-148523942	+	MTD	LTR	MaLR	179	412	-7	8
669	467	301	138	110	chr3	11078118	11078512	-148521271	-	MER67D	LTR	ERV1	0	514	111	9
669	467	301	138	110	chr3	11078842	11078947	-148520836	-	MER67D	LTR	ERV1	-404	110	1	9
669	338	240	88	93	chr3	11080298	11080491	-148519292	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	318	9
669	2053	155	47	35	chr3	11082549	11082977	-148516806	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2806	3238	0	1
669	517	223	51	16	chr3	11082977	11083254	-148516529	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
669	4030	93	25	48	chr3	11083739	11084340	-148515443	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	1
669	420	208	57	24	chr3	11085713	11085836	-148513947	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-176	4815	4689	1
669	537	297	28	20	chr3	11086079	11086333	-148513450	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-327	4664	4409	1
669	448	353	54	27	chr3	11086336	11086709	-148513074	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-1435	3556	3174	1
669	314	211	0	28	chr3	11087509	11087616	-148512167	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-1319	5772	5675	1
669	2924	67	12	42	chr3	11087775	11088183	-148511600	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
669	441	309	14	47	chr3	11091279	11091554	-148508229	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3188	3903	3638	1
669	4774	289	35	47	chr3	11091766	11093732	-148506051	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2273	2718	777	1
669	725	239	74	23	chr3	11095322	11095539	-148504244	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	229	-141	1
669	2482	172	116	61	chr3	11095961	11096538	-148503245	+	RMER19C	LTR	ERVK	3	611	0	1
669	295	333	73	59	chr3	11096555	11096775	-148503008	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	223	-244	1
669	2122	111	47	41	chr3	11124016	11124381	-148475402	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
669	53897	16	8	13	chr3	11124381	11130893	-148468890	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	1
669	2136	109	47	41	chr3	11130893	11131258	-148468525	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
669	232	228	198	47	chr3	11140638	11140744	-148459039	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	1	122	-532	1
83	2012	126	258	27	chr3	11140746	11141195	-148458588	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	589	-65	1
670	58447	37	12	0	chr3	11141195	11148781	-148451002	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	1	7778	0	1
670	232	228	198	47	chr3	11148781	11148887	-148450896	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	1	122	-532	1
670	1962	135	250	48	chr3	11148889	11149365	-148450418	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	608	-46	1
670	880	264	49	139	chr3	11153782	11154170	-148445613	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	19	1
670	3504	20	2	0	chr3	11154268	11154663	-148445120	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
670	307	293	32	15	chr3	11154701	11154812	-148444971	+	MTE2a	LTR	MaLR	197	309	-70	1
670	233	302	38	45	chr3	11154867	11154887	-148444896	+	MTE2a	LTR	MaLR	310	327	-52	1
670	572	304	26	43	chr3	11158468	11158698	-148441085	+	MER31A	LTR	ERV1	6	231	-254	1
670	475	326	118	73	chr3	11161532	11161889	-148437894	+	MLT1B	LTR	MaLR	17	389	-1	1
670	1934	138	82	0	chr3	11164959	11165277	-148434506	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-4	390	47	1
670	306	261	124	11	chr3	11167086	11167175	-148432608	-	MTD	LTR	MaLR	-311	108	10	1
670	1220	221	101	37	chr3	11169283	11169631	-148430152	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	3	1
670	1075	247	56	38	chr3	11173952	11174431	-148425352	+	RMER19C	LTR	ERVK	64	593	-18	1
670	1229	192	9	4	chr3	11174764	11174989	-148424794	+	MTC	LTR	MaLR	196	421	0	1
670	234	299	40	30	chr3	11180226	11180326	-148419457	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-381	125	25	2
670	299	321	84	78	chr3	11186896	11187075	-148412708	-	MLT2D	LTR	ERVL	-56	358	179	2
670	1868	228	68	4	chr3	11187619	11188056	-148411727	+	RMER4B	LTR	ERVK	20	534	-51	2
670	265	172	276	0	chr3	11188109	11188147	-148411636	+	RMER4B	LTR	ERVK	535	584	-1	2
670	2164	113	3	0	chr3	11188467	11188786	-148410997	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	320	-7	2
670	8469	159	106	41	chr3	11188803	11190646	-148409137	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1963	0	2
670	1982	147	25	12	chr3	11190646	11190969	-148408814	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
670	2328	66	119	11	chr3	11198383	11198735	-148401048	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
670	4461	179	52	20	chr3	11203279	11204141	-148395642	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	2
670	2000	132	12	3	chr3	11204427	11204746	-148395037	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-4	323	2	2
670	4393	106	47	12	chr3	11204747	11205432	-148394351	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	1255	2
670	5143	163	109	25	chr3	11207012	11208158	-148391625	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-716	1247	6	2
670	1562	138	16	0	chr3	11208160	11208413	-148391370	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	69	2
670	903	295	60	118	chr3	11210125	11210525	-148389258	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	2
670	1236	163	92	14	chr3	11210935	11211187	-148388596	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	111	2
670	882	222	177	51	chr3	11211237	11211335	-148388448	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-293	110	9	2
670	519	105	0	0	chr3	11211371	11211447	-148388336	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	0	7406	7331	2
670	1789	177	170	27	chr3	11211447	11211918	-148387865	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-363	539	1	2
670	1523	141	16	8	chr3	11211927	11212177	-148387606	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-28	5780	5529	2
670	347	142	0	53	chr3	11212182	11212258	-148387525	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-1172	6072	6009	2
670	1407	131	37	20	chr3	11212355	11212643	-148387140	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	6222	2
670	969	224	43	13	chr3	11212639	11212870	-148386913	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4714	2692	2455	2
670	650	164	24	8	chr3	11212884	11213007	-148386776	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4196	1210	1086	2
670	324	200	52	26	chr3	11213010	11213087	-148386696	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4587	819	741	2
670	276	146	0	0	chr3	11213080	11213128	-148386655	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5218	188	141	2
670	303	208	27	14	chr3	11213518	11213591	-148386192	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-5080	2164	2091	2
670	571	221	24	78	chr3	11213581	11213787	-148385996	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4545	299	105	2
670	320	204	29	58	chr3	11213819	11213923	-148385860	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4742	102	2	2
670	1963	138	98	11	chr3	11213929	11214295	-148385488	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-5	404	7	2
670	553	276	16	0	chr3	11226450	11226577	-148373206	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7074	7202	-204	2
670	629	277	157	36	chr3	11228879	11229172	-148370611	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	361	-18	2
670	275	274	98	46	chr3	11229989	11230142	-148369641	+	MLT1B	LTR	MaLR	29	189	-201	2
670	254	330	32	12	chr3	11230282	11230420	-148369363	+	MLT1B	LTR	MaLR	270	467	0	2
670	555	307	64	21	chr3	11232784	11233113	-148366670	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2861	2853	2511	2
670	252	344	72	80	chr3	11240542	11240620	-148359163	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	77	-282	2
670	252	344	72	80	chr3	11241188	11241346	-148358437	+	ORR1E	LTR	MaLR	78	237	-122	2
670	434	285	77	63	chr3	11244187	11244525	-148355258	-	MER57C2	LTR	ERV1	-43	368	16	2
670	1531	313	65	46	chr3	11244905	11245392	-148354391	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	513	-129	2
670	1531	313	65	46	chr3	11245670	11245697	-148354086	+	RLTR26	LTR	ERVK	514	536	-106	2
670	1531	313	65	46	chr3	11245754	11245866	-148353917	+	RLTR26	LTR	ERVK	537	642	0	2
670	3096	220	55	51	chr3	11249691	11251546	-148348237	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	8	1759	-204	2
670	340	242	175	58	chr3	11269077	11269248	-148330535	+	RMER5	LTR	ERV1	189	379	-155	3
670	755	246	47	71	chr3	11271694	11271991	-148327792	+	RLTR12B	LTR	ERVK	18	307	-221	3
83	547	264	111	61	chr3	11271988	11272250	-148327533	+	RLTR12B	LTR	ERVK	245	519	-9	3
671	381	284	0	0	chr3	11279295	11279390	-148320393	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	102	-328	3
671	2597	243	53	65	chr3	11279561	11280355	-148319428	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	784	-174	3
671	350	291	43	91	chr3	11280368	11280576	-148319207	+	RMER13B	LTR	ERVK	702	899	-9	3
671	2096	121	44	0	chr3	11284217	11284532	-148315251	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	3
671	753	271	98	84	chr3	11286942	11287360	-148312423	+	RLTR23	LTR	ERV1	3	426	-4	3
671	2086	146	67	18	chr3	11289581	11289971	-148309812	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	3
671	3473	112	53	15	chr3	11291700	11292246	-148307537	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	3
671	246	385	11	0	chr3	11296523	11296614	-148303169	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-261	104	13	3
671	274	214	99	30	chr3	11300651	11300752	-148299031	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	426	3
671	2779	135	11	25	chr3	11301618	11302096	-148297687	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-86	471	1	3
671	614	189	51	17	chr3	11302097	11302271	-148297512	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1	2841	2676	3
671	702	285	111	37	chr3	11302302	11302626	-148297157	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2478	364	17	3
671	1555	105	8	25	chr3	11302708	11302952	-148296831	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-317	240	1	3
671	2873	182	16	4	chr3	11302961	11303469	-148296314	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	514	-2	3
671	1055	231	87	46	chr3	11307700	11308067	-148291716	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	3
671	1905	220	59	85	chr3	11308140	11308682	-148291101	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	528	-83	3
671	890	174	104	6	chr3	11311043	11311216	-148288567	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-3	478	289	3
671	1589	192	10	0	chr3	11312993	11313290	-148286493	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-181	300	1	3
671	2155	247	17	26	chr3	11314217	11314411	-148285372	+	RMER15	LTR	ERVL	1	191	-384	4
671	2155	247	17	26	chr3	11314431	11314814	-148284969	+	RMER15	LTR	ERVL	192	573	-2	4
671	3054	281	110	19	chr3	11314816	11315998	-148283785	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1	1302	-3697	4
671	3054	291	80	20	chr3	11316029	11316097	-148283686	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1303	1362	-3637	4
671	477	323	65	5	chr3	11316111	11316310	-148283473	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1431	1641	-3358	4
671	333	248	29	94	chr3	11316855	11316993	-148282790	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	300	4
671	836	288	28	28	chr3	11316990	11317272	-148282511	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	395	676	-1172	4
671	461	239	80	53	chr3	11317422	11317572	-148282211	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	663	816	-1032	4
671	271	238	94	47	chr3	11317651	11317757	-148282026	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1590	1700	-148	4
671	3297	48	2	0	chr3	11317889	11318284	-148281499	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
671	260	350	25	0	chr3	11319585	11319665	-148280118	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1680	4457	4376	4
671	955	289	29	53	chr3	11319863	11320239	-148279544	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-2311	5290	4924	4
671	452	320	62	9	chr3	11320232	11320443	-148279340	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2105	2326	-2673	4
671	3569	235	40	18	chr3	11320531	11321375	-148278408	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2402	3264	-1735	4
671	2093	237	24	58	chr3	11321564	11322155	-148277628	+	RMER15-int	LTR	ERVL	3250	3820	-1179	4
671	3117	286	33	32	chr3	11322185	11322655	-148277128	+	RMER15-int	LTR	ERVL	3813	4282	-717	4
671	2263	109	98	27	chr3	11322655	11323031	-148276752	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	4
671	3117	272	109	28	chr3	11323031	11323660	-148276123	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4283	4963	-36	4
671	1106	202	224	15	chr3	11323665	11324140	-148275643	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	4
671	1811	191	62	24	chr3	11328520	11328943	-148270840	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	439	-519	4
671	1862	238	91	37	chr3	11328956	11329550	-148270233	+	RMER13B	LTR	ERVK	274	899	-9	4
671	1282	238	107	3	chr3	11346606	11346952	-148252831	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	1	4
671	307	303	60	10	chr3	11347657	11347757	-148252026	+	RMER15	LTR	ERVL	452	556	-19	4
671	710	250	47	54	chr3	11348197	11348455	-148251328	+	RLTR40	LTR	ERVK	19	274	-543	4
671	1088	226	104	71	chr3	11348465	11348945	-148250838	-	RMER6A	LTR	ERVK	-37	719	309	4
671	1752	116	44	19	chr3	11352183	11352500	-148247283	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	-6	379	55	4
671	728	305	112	101	chr3	11355603	11356077	-148243706	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-13	1358	880	4
671	227	273	21	83	chr3	11362954	11363050	-148236733	-	MT2B2	LTR	ERVL	-343	241	152	4
671	2221	155	7	29	chr3	11374229	11374647	-148225136	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	4
671	1250	150	81	4	chr3	11378383	11378617	-148221166	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	252	-209	4
671	1280	187	25	36	chr3	11378626	11378903	-148220880	-	RLTR46	LTR	ERVK	-5	315	42	4
671	912	197	18	65	chr3	11378914	11379131	-148220652	+	RMER6B	LTR	ERVK	255	461	0	4
671	3884	148	55	40	chr3	11388622	11389060	-148210723	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	445	-364	4
671	3884	148	55	40	chr3	11389101	11389459	-148210324	+	RMER17D2	LTR	ERVK	446	808	-1	4
671	625	221	114	0	chr3	11394090	11394230	-148205553	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	156	-218	5
671	244	320	73	70	chr3	11394764	11395036	-148204747	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	365	93	5
671	2361	66	119	11	chr3	11397945	11398297	-148201486	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	5
672	3983	139	77	35	chr3	11406168	11406500	-148193283	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	330	-479	5
672	3983	139	77	35	chr3	11406672	11407115	-148192668	+	RMER17D2	LTR	ERVK	331	808	-1	5
672	1161	245	45	30	chr3	11407384	11407729	-148192054	+	MTC	LTR	MaLR	36	419	-2	5
672	1734	231	76	7	chr3	11407733	11408168	-148191615	+	MTC-int	LTR	MaLR	8	472	-786	5
672	3359	187	22	71	chr3	11411388	11412175	-148187608	+	MTC-int	LTR	MaLR	506	1253	-5	5
672	1238	243	90	23	chr3	11412180	11412525	-148187258	+	MTC	LTR	MaLR	1	368	-53	5
672	2638	123	39	21	chr3	11412559	11412990	-148186793	+	RLTR19B	LTR	ERVK	1	439	-276	5
672	225	183	46	77	chr3	11419456	11419521	-148180262	-	RMER20A	LTR	ERVK	-268	248	186	5
672	299	376	104	16	chr3	11424748	11424940	-148174843	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-189	438	230	5
672	1908	159	14	6	chr3	11428052	11428407	-148171376	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	358	-1	5
672	1594	113	76	4	chr3	11429169	11429418	-148170365	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1581	267	1	5
672	437	321	29	29	chr3	11429418	11429591	-148170192	+	RMER20A	LTR	ERVK	344	516	0	5
672	3680	151	17	8	chr3	11437581	11437992	-148161791	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	189	5
672	3680	151	17	8	chr3	11438017	11438081	-148161702	-	MT2B	LTR	ERVL	-413	188	118	5
672	3680	151	17	8	chr3	11438737	11438856	-148160927	-	MT2B	LTR	ERVL	-484	117	2	5
672	3784	117	47	58	chr3	11439044	11439787	-148159996	-	RMER17A	LTR	ERVK	-16	735	1	5
672	3908	109	191	20	chr3	11446258	11447017	-148152766	-	RMER17D	LTR	ERVK	0	889	1	5
672	954	307	85	14	chr3	11456561	11456915	-148142868	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	5
672	858	208	149	31	chr3	11458497	11458725	-148141058	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-6	1842	1588	5
672	226	327	94	47	chr3	11464501	11464713	-148135070	-	MTEb	LTR	MaLR	-157	222	1	5
672	269	323	10	0	chr3	11464867	11464966	-148134817	+	MLT1A1	LTR	MaLR	36	135	-273	5
672	1723	79	0	0	chr3	11471841	11472081	-148127702	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-92	240	1	5
672	465	333	60	106	chr3	11475399	11475954	-148123829	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	193	721	-688	5
672	654	252	15	0	chr3	11484033	11484164	-148115619	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	6
672	3965	54	0	0	chr3	11489023	11489505	-148110278	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	6
672	1669	220	44	3	chr3	11491266	11491631	-148108152	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	3	6
672	1940	208	68	20	chr3	11491852	11492308	-148107475	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-49	478	1	6
672	298	283	11	32	chr3	11493746	11493841	-148105942	-	RLTR23	LTR	ERV1	-24	406	314	6
672	1666	196	238	9	chr3	11509906	11510334	-148089449	+	RLTR11A	LTR	ERVK	2	528	0	1
672	255	364	82	22	chr3	11510591	11510726	-148089057	+	LTR80A	LTR	ERVL	423	565	-18	2
672	677	305	32	20	chr3	11510915	11511163	-148088620	-	MTD	LTR	MaLR	-107	312	62	2
672	1297	159	54	4	chr3	11514184	11514443	-148085340	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	534	805	-1043	2
672	922	242	97	8	chr3	11514868	11515126	-148084657	+	RLTR40	LTR	ERVK	462	742	-75	3
672	701	320	34	82	chr3	11515230	11515608	-148084175	+	MTEb	LTR	MaLR	6	365	-14	3
672	956	301	98	25	chr3	11515673	11516358	-148083425	+	MTEa-int	LTR	MaLR	681	1572	-8	3
672	650	335	41	19	chr3	11516373	11516644	-148083139	+	MTEa	LTR	MaLR	9	285	-94	3
672	837	273	55	113	chr3	11516641	11517100	-148082683	+	RMER2	LTR	ERV1	120	551	-16	3
672	2685	234	70	37	chr3	11529787	11530567	-148069216	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	806	0	3
673	505	383	95	37	chr3	11535058	11535136	-148064647	+	LTR33	LTR	ERVL	3	82	-433	4
673	505	383	95	37	chr3	11535725	11536131	-148063652	+	LTR33	LTR	ERVL	83	514	-1	4
673	3012	80	2	2	chr3	11545656	11546056	-148053727	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
673	1715	138	31	22	chr3	11546722	11547041	-148052742	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
673	17496	155	26	20	chr3	11547041	11553777	-148046006	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1	7201	-205	6
673	1804	115	31	22	chr3	11553779	11554098	-148045685	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
673	3211	151	88	17	chr3	11571305	11571955	-148027828	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	787	-119	9
673	2540	82	191	3	chr3	11581932	11582299	-148017484	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
673	870	262	42	49	chr3	11584767	11585169	-148014614	+	BGLII_A	LTR	ERVK	1	438	-7	1
673	331	258	32	20	chr3	11585453	11585567	-148014216	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	254	1
673	256	355	42	28	chr3	11585550	11585692	-148014091	-	MTE2b	LTR	MaLR	-235	144	1	1
673	1458	241	19	16	chr3	11590041	11590408	-148009375	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	5	1
673	2389	68	16	71	chr3	11603828	11604192	-147995591	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-2	344	1	1
673	914	242	104	45	chr3	11605234	11605502	-147994281	-	MTC	LTR	MaLR	-52	369	86	1
673	499	187	0	0	chr3	11606471	11606562	-147993221	-	MTC	LTR	MaLR	-330	91	1	1
673	1580	173	174	9	chr3	11614278	11614622	-147985161	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	21	1
673	1641	129	17	76	chr3	11621947	11622249	-147977534	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	284	-45	1
673	3440	30	0	0	chr3	11627821	11628217	-147971566	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
673	570	208	19	65	chr3	11630077	11630231	-147969552	+	RMER17C	LTR	ERVK	264	410	0	1
673	275	297	11	11	chr3	11632294	11632386	-147967397	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-13	395	304	1
673	433	320	0	32	chr3	11632632	11632758	-147967025	-	MTEa	LTR	MaLR	-69	310	189	1
673	257	0	0	0	chr3	11632763	11632794	-147966989	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-875	31	1	1
673	1696	129	15	15	chr3	11635726	11635994	-147963789	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	268	-638	1
673	2986	144	24	26	chr3	11636464	11637030	-147962753	+	RMER17A2	LTR	ERVK	61	895	-11	1
673	1689	247	54	45	chr3	11637559	11638076	-147961707	+	RLTR11A	LTR	ERVK	7	528	0	1
673	375	250	0	0	chr3	11644059	11644135	-147955648	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	731	806	0	1
673	1107	171	10	154	chr3	11647980	11648291	-147951492	+	RMER13B	LTR	ERVK	31	296	-612	1
673	369	192	164	0	chr3	11648287	11648360	-147951423	+	RMER13B	LTR	ERVK	401	485	-423	1
673	640	268	18	124	chr3	11648341	11648614	-147951169	+	RMER13B	LTR	ERVK	606	849	-11	1
673	328	231	129	104	chr3	11657154	11657347	-147942436	+	MLT1B	LTR	MaLR	40	237	-153	2
673	1212	314	18	9	chr3	11664224	11664562	-147935221	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-29	341	1	2
674	1160	188	14	5	chr3	11685521	11685735	-147914048	+	ORR1B1	LTR	MaLR	179	394	0	2
674	4689	212	39	65	chr3	11685735	11686968	-147912815	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1201	-762	2
674	4326	169	40	24	chr3	11686968	11687849	-147911934	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	895	-11	2
674	2168	176	20	5	chr3	11687863	11688258	-147911525	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1196	1596	-367	2
674	1409	236	147	88	chr3	11688270	11688847	-147910936	-	RMER20B	LTR	ERVK	-9	618	8	2
674	1463	233	47	83	chr3	11688854	11689341	-147910442	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1058	1792	0	2
674	1272	214	40	79	chr3	11689341	11689645	-147910138	+	ORR1B1	LTR	MaLR	36	327	-67	2
674	3431	23	2	0	chr3	11690698	11691093	-147908690	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
674	9182	32	2	1	chr3	11691093	11692190	-147907593	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
674	3431	23	2	0	chr3	11692190	11692585	-147907198	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
674	2676	92	44	15	chr3	11705902	11706033	-147893750	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	293	2
674	3204	41	8	5	chr3	11706033	11706428	-147893355	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
674	2676	92	44	15	chr3	11706428	11706706	-147893077	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-130	292	1	2
674	565	191	34	7	chr3	11706710	11706858	-147892925	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-5	2837	2686	2
674	312	250	10	10	chr3	11706898	11706995	-147892788	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-159	2167	2071	2
674	1670	188	126	17	chr3	11707011	11707480	-147892303	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1309	1533	1014	2
674	529	205	43	0	chr3	11707501	11707618	-147892165	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2232	610	489	2
674	455	231	30	58	chr3	11707653	11707884	-147891899	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1907	935	652	2
674	2645	112	55	0	chr3	11708246	11708646	-147891137	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	2
674	3321	46	2	0	chr3	11709354	11709749	-147890034	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
674	8022	67	25	2	chr3	11709749	11710822	-147888961	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
674	3274	46	5	0	chr3	11710822	11711216	-147888567	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
674	3512	20	0	0	chr3	11715746	11716142	-147883641	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
674	9162	29	5	2	chr3	11716142	11717237	-147882546	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
674	3512	20	0	0	chr3	11717237	11717633	-147882150	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
674	1885	204	96	16	chr3	11726983	11727421	-147872362	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	473	-169	2
674	557	162	98	15	chr3	11731096	11731228	-147868555	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-107	1741	1599	2
674	3450	196	53	43	chr3	11731501	11732379	-147867404	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-961	887	1	2
674	2865	30	0	3	chr3	11732664	11733002	-147866781	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
674	55829	17	17	3	chr3	11733015	11739385	-147860398	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-13	6468	8	2
674	2842	36	0	3	chr3	11739385	11739723	-147860060	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
674	6492	59	10	0	chr3	11741355	11742155	-147857628	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	2
674	882	146	33	27	chr3	11742158	11742341	-147857442	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3	186	-5622	2
674	275	260	10	20	chr3	11742414	11742516	-147857267	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	279	379	-6874	2
674	2130	265	87	33	chr3	11742892	11744023	-147855760	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	179	1981	-5272	2
674	18238	125	59	59	chr3	11744769	11746089	-147853694	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	650	1962	-5444	2
674	239	278	0	0	chr3	11746089	11746143	-147853640	+	MTC-int	LTR	MaLR	484	537	-721	2
674	18238	125	59	59	chr3	11746143	11747240	-147852543	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1963	3055	-4351	2
674	18238	125	59	59	chr3	11747389	11748093	-147851690	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3056	3828	-3578	2
674	4646	70	3	2	chr3	11748093	11748679	-147851104	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	2
674	18238	173	97	62	chr3	11748679	11749634	-147850149	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2773	4094	-3312	2
674	5102	63	12	0	chr3	11749634	11750302	-147849481	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	131	806	-2	2
674	2843	186	36	82	chr3	11751986	11752829	-147846954	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	720	4	2
674	245	237	17	0	chr3	11755695	11755754	-147844029	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-968	60	1	2
674	521	264	175	20	chr3	11761732	11761983	-147837800	-	RMER20B	LTR	ERVK	-99	528	239	3
674	509	323	82	63	chr3	11764764	11765081	-147834702	+	MLT1B	LTR	MaLR	66	388	-2	3
674	413	333	32	28	chr3	11768146	11768362	-147831421	+	RMER15	LTR	ERVL	346	562	-13	3
674	1777	141	36	60	chr3	11769348	11769680	-147830103	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-2	327	4	3
674	4975	157	54	11	chr3	11774603	11775494	-147824289	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	929	-29	3
674	1376	172	4	0	chr3	11781424	11781657	-147818126	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-93	236	3	3
674	2379	91	19	30	chr3	11785056	11785660	-147814123	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	206	1098	0	3
674	2886	73	37	3	chr3	11785660	11786043	-147813740	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
674	251	316	123	62	chr3	11790010	11790189	-147809594	+	MLT1B	LTR	MaLR	199	388	-2	3
675	591	235	5	86	chr3	11799337	11799523	-147800260	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	171	-213	3
675	695	237	29	12	chr3	11799918	11800089	-147799694	+	ORR1C1	LTR	MaLR	150	323	-55	3
675	263	234	147	11	chr3	11806146	11806241	-147793542	-	RMER20A	LTR	ERVK	-236	391	284	3
675	293	241	14	57	chr3	11806264	11806398	-147793385	-	RMER20A	LTR	ERVK	-294	222	94	3
675	466	301	94	83	chr3	11809411	11809879	-147789904	+	RMER20A	LTR	ERVK	5	477	-39	3
675	1419	222	51	0	chr3	11816488	11816799	-147782984	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	3
675	602	191	0	0	chr3	11817378	11817488	-147782295	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	285	3
675	2446	198	74	46	chr3	11819059	11819433	-147780350	+	RMER6C	LTR	ERVK	6	404	-286	3
675	2446	204	69	64	chr3	11819457	11819882	-147779901	+	RMER6C	LTR	ERVK	382	720	0	3
675	1636	219	37	74	chr3	11829620	11830000	-147769783	-	RLTR17	LTR	ERVK	-78	614	249	3
675	436	222	7	88	chr3	11830041	11830189	-147769594	-	RLTR17	LTR	ERVK	-452	240	105	3
675	897	265	157	20	chr3	11830384	11830734	-147769049	+	MTD	LTR	MaLR	18	415	-4	4
675	240	270	147	20	chr3	11843506	11843608	-147756175	+	MTD	LTR	MaLR	1	115	-304	4
675	1162	188	37	40	chr3	11844268	11844540	-147755243	-	RLTR46	LTR	ERVK	-7	313	43	4
675	245	217	72	0	chr3	11848647	11848716	-147751067	+	MTEb	LTR	MaLR	287	360	-19	4
675	1981	193	21	5	chr3	11859292	11859678	-147740105	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	4
675	1547	231	242	2	chr3	11860433	11860862	-147738921	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	44	4
675	1844	129	51	10	chr3	11860963	11861131	-147738652	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	151	4
675	1844	129	51	10	chr3	11861905	11862044	-147737739	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-181	146	1	4
675	1334	228	111	39	chr3	11862929	11863289	-147736494	+	RLTR40	LTR	ERVK	432	817	0	4
675	296	259	32	89	chr3	11874215	11874338	-147725445	-	RLTR23	LTR	ERV1	-68	362	247	4
675	2056	205	13	52	chr3	11874604	11875051	-147724732	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	4
675	1828	140	87	46	chr3	11875946	11876314	-147723469	+	RLTR9A2	LTR	ERVK	1	383	0	4
675	1432	185	31	14	chr3	11876443	11876734	-147723049	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	296	-102	4
675	2327	217	35	84	chr3	11879177	11879887	-147719896	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	675	-15	4
675	264	295	45	83	chr3	11887136	11887269	-147712514	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-27	414	287	4
675	526	203	76	173	chr3	11887958	11888017	-147711766	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	57	-621	4
675	590	230	110	122	chr3	11888443	11888678	-147711105	+	RLTR19	LTR	ERVK	58	497	-2	4
675	1443	225	98	6	chr3	11894739	11895056	-147704727	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	348	-19	4
675	3005	71	5	10	chr3	11899693	11900091	-147699692	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
675	4035	176	32	28	chr3	11902603	11904368	-147695415	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3321	4085	2356	4
675	861	170	0	24	chr3	11905066	11905235	-147694548	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-156	650	486	4
675	2503	179	31	6	chr3	11905235	11905725	-147694058	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4409	2997	2496	4
675	4123	186	63	92	chr3	11905752	11906956	-147692827	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3675	1169	1	4
675	1587	189	32	69	chr3	11906957	11907365	-147692418	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	4
675	1447	169	14	1	chr3	11919032	11919288	-147680495	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	238	-720	5
676	917	295	102	6	chr3	11930950	11931284	-147668499	+	MTD	LTR	MaLR	3	368	-51	5
676	3223	48	5	0	chr3	11940079	11940473	-147659310	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
676	4138	116	32	48	chr3	11941766	11942517	-147657266	+	RMER17A	LTR	ERVK	13	751	0	5
676	1720	127	82	158	chr3	11942553	11942991	-147656792	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	5
676	4757	62	3	0	chr3	11942992	11943588	-147656195	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-1	2811	2214	5
676	584	125	5	147	chr3	11943836	11944091	-147655692	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-1871	941	816	5
676	290	214	0	0	chr3	11944101	11944157	-147655626	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-2756	56	1	5
676	2260	139	42	37	chr3	11944157	11944560	-147655223	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	5
676	393	318	70	32	chr3	11956603	11956788	-147642995	-	MT2A	LTR	ERVL	-267	266	75	5
676	365	250	142	9	chr3	11956726	11956839	-147642944	-	MTE2a	LTR	MaLR	-243	136	9	5
676	634	307	72	18	chr3	11957225	11957447	-147642336	+	MTD	LTR	MaLR	1	234	-185	5
676	711	240	142	0	chr3	11958484	11958667	-147641116	+	MTD	LTR	MaLR	208	416	-3	5
676	684	252	56	88	chr3	11961030	11961335	-147638448	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4025	4319	-1818	5
676	750	346	61	11	chr3	11964617	11964954	-147634829	-	MTD	LTR	MaLR	-35	384	7	5
676	2957	69	23	0	chr3	11965040	11965431	-147634352	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
676	390	280	55	101	chr3	11966635	11966674	-147633109	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-431	672	584	5
676	511	214	42	113	chr3	11966674	11966816	-147632967	-	MT2B	LTR	ERVL	-313	288	157	5
676	768	171	25	21	chr3	11966771	11966950	-147632833	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1188	604	420	5
676	390	280	55	101	chr3	11966816	11966873	-147632910	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-431	583	446	5
676	482	360	102	26	chr3	11975423	11975885	-147623898	+	MLT2B1	LTR	ERVL	8	504	-16	5
676	234	300	93	65	chr3	11982974	11983113	-147616670	-	RMER20A	LTR	ERVK	-243	273	131	5
676	2176	187	48	9	chr3	11983297	11983795	-147615988	+	RMER17D2	LTR	ERVK	258	809	0	5
676	332	398	64	12	chr3	12010166	12010401	-147589382	-	MER70A	LTR	ERVL	0	472	224	9
676	332	398	64	12	chr3	12010668	12010681	-147589102	-	MER70A	LTR	ERVL	-249	223	211	9
676	1578	213	65	40	chr3	12012909	12013306	-147586477	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	914	1320	-50	1
676	575	281	32	7	chr3	12013314	12013468	-147586315	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	158	-236	1
676	349	197	158	0	chr3	12014080	12014156	-147585627	+	ORR1B1	LTR	MaLR	221	308	-76	1
676	3360	38	0	2	chr3	12015163	12015560	-147584223	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
676	5839	91	21	7	chr3	12015560	12016424	-147583359	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	223	2
676	310	337	33	61	chr3	12022779	12022959	-147576824	+	ORR1E	LTR	MaLR	38	212	-147	2
676	230	184	61	0	chr3	12023021	12023070	-147576713	+	ORR1E	LTR	MaLR	281	332	-47	2
676	985	258	60	11	chr3	12023552	12023890	-147575893	+	RMER21A	LTR	ERV1	626	947	0	3
676	2621	108	14	59	chr3	12026144	12026585	-147573198	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	3
676	2368	101	223	31	chr3	12035920	12036399	-147563384	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-47	607	37	4
676	415	240	37	0	chr3	12038226	12038329	-147561454	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	107	-263	5
676	1746	28	0	0	chr3	12046640	12046851	-147552932	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	211	-115	6
676	1174	15	0	0	chr3	12046853	12046985	-147552798	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	1341	1472	-5349	6
676	12982	31	0	1	chr3	12046983	12048482	-147551301	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	5304	6801	-20	6
676	2731	43	0	0	chr3	12048482	12048805	-147550978	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	323	-3	6
676	746	144	124	0	chr3	12053261	12053414	-147546369	+	ORR1B1	LTR	MaLR	182	353	-41	6
676	1377	254	64	64	chr3	12056921	12057421	-147542362	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	22	521	-56	7
676	1554	271	11	6	chr3	12057943	12058307	-147541476	+	MTD	LTR	MaLR	46	411	-8	7
677	2586	115	43	3	chr3	12059417	12059808	-147539975	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	8
677	1729	126	61	26	chr3	12059808	12060151	-147539632	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	744	8
677	4226	179	45	11	chr3	12060830	12061646	-147538137	-	MTC-int	LTR	MaLR	-409	849	6	8
677	3246	169	98	13	chr3	12070777	12071468	-147528315	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	752	-4	9
677	1169	224	123	9	chr3	12076584	12077007	-147522776	+	RMER6C	LTR	ERVK	220	690	0	1
677	1366	265	101	73	chr3	12084336	12084931	-147514852	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	512	0	1
677	1523	195	50	74	chr3	12097477	12097881	-147501902	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
677	779	216	42	93	chr3	12098516	12098559	-147501224	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	872	1
677	779	216	42	93	chr3	12099331	12099355	-147500428	-	RMER19B	LTR	ERVK	-31	871	854	1
677	2933	110	12	5	chr3	12099355	12099785	-147499998	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-3	433	1	1
677	779	216	42	93	chr3	12099785	12099930	-147499853	-	RMER19B	LTR	ERVK	-49	853	700	1
677	2434	233	65	24	chr3	12099904	12100528	-147499255	-	RMER19B	LTR	ERVK	-321	581	1	1
677	1168	266	56	47	chr3	12105018	12105426	-147494357	+	MTD	LTR	MaLR	1	395	-24	1
677	3175	41	0	0	chr3	12113116	12113504	-147486279	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-8	388	1	1
677	738	213	0	30	chr3	12116800	12116969	-147482814	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	164	-230	1
677	294	440	27	16	chr3	12122688	12122875	-147476908	+	LTR33	LTR	ERVL	14	202	-313	1
677	2609	187	74	92	chr3	12134135	12134180	-147465603	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	46	-644	1
677	2861	24	101	5	chr3	12134180	12134555	-147465228	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	1
677	2609	187	74	92	chr3	12134555	12135212	-147464571	+	RMER6C	LTR	ERVK	47	690	0	1
677	2032	105	32	0	chr3	12143279	12143593	-147456190	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	34	1
677	1990	224	37	12	chr3	12149361	12149764	-147450019	-	MTC	LTR	MaLR	-7	414	2	1
677	2437	193	44	25	chr3	12158829	12159084	-147440699	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	258	-303	2
677	2437	193	44	25	chr3	12159840	12160132	-147439651	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	259	558	-3	2
677	3059	224	138	81	chr3	12160135	12160678	-147439105	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1008	1095	-1747	2
677	3059	186	35	71	chr3	12160802	12161549	-147438234	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1096	1822	-1020	2
677	3103	208	50	40	chr3	12161576	12162432	-147437351	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1961	2825	-17	2
677	3103	208	50	40	chr3	12162460	12162474	-147437309	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	2826	2839	-3	2
677	2105	184	48	63	chr3	12162476	12163093	-147436690	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	692	0	2
677	242	339	33	57	chr3	12164766	12164888	-147434895	+	MLT1A0	LTR	MaLR	244	362	-3	2
677	2568	73	15	0	chr3	12165906	12166247	-147433536	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	2
677	791	307	105	31	chr3	12173324	12173714	-147426069	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
677	1473	251	56	3	chr3	12182283	12182638	-147417145	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
677	1539	259	58	7	chr3	12182639	12182866	-147416917	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	2	246	-1124	2
677	1539	259	58	7	chr3	12182889	12183093	-147416690	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	247	455	-915	2
677	2368	259	103	20	chr3	12183063	12183764	-147416019	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	612	1370	0	2
677	258	268	0	0	chr3	12183819	12183875	-147415908	+	ORR1D1	LTR	MaLR	106	161	-213	2
678	344	314	54	39	chr3	12196882	12197011	-147402772	+	MTE2b	LTR	MaLR	240	370	-9	2
678	254	225	37	24	chr3	12197027	12197109	-147402674	+	MLT1A	LTR	MaLR	292	374	0	2
678	565	265	46	7	chr3	12204706	12204858	-147394925	+	MTD	LTR	MaLR	4	161	-258	2
678	1006	234	34	0	chr3	12205376	12205585	-147394198	+	MTD	LTR	MaLR	196	411	-8	2
678	1077	321	45	3	chr3	12205910	12206263	-147393520	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	8	2
678	3487	64	125	10	chr3	12215395	12215899	-147383884	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	3	2
678	578	291	44	58	chr3	12218061	12218287	-147381496	+	LTRIS4	LTR	ERV1	235	457	-50	2
678	1328	172	18	33	chr3	12219114	12219345	-147380438	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	181	2
678	1328	172	18	33	chr3	12219435	12219539	-147380244	-	RMER17C	LTR	ERVK	-230	180	80	2
678	1490	226	80	24	chr3	12220226	12220602	-147379181	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-10	397	1	2
678	598	168	0	71	chr3	12221108	12221249	-147378534	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	281	2
678	276	42	0	41	chr3	12221269	12221318	-147378465	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-85	305	259	2
678	2253	48	13	6	chr3	12221358	12221670	-147378113	-	RLTR10	LTR	ERVK	-76	314	1	2
678	8765	12	0	2	chr3	12221672	12222669	-147377114	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	990	2
678	346	238	54	31	chr3	12222751	12222881	-147376902	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-5987	1594	1462	2
678	5300	42	8	38	chr3	12222945	12223663	-147376120	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-989	998	302	2
678	613	168	0	71	chr3	12223663	12223804	-147375979	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	411	281	2
678	2313	52	13	6	chr3	12223914	12224226	-147375557	-	RLTR10	LTR	ERVK	-76	314	1	2
678	5932	30	27	31	chr3	12225506	12226419	-147373364	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	893	1	2
678	2169	142	182	0	chr3	12226702	12227152	-147372631	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	2
678	1306	206	39	100	chr3	12227820	12228296	-147371487	+	RMER16	LTR	ERVK	1	531	-2	2
678	654	291	145	33	chr3	12238755	12239086	-147360697	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	3
678	449	351	82	43	chr3	12244136	12244598	-147355185	-	RMER5	LTR	ERV1	-3	531	52	3
678	4456	12	0	0	chr3	12248345	12248838	-147350945	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
678	38668	14	16	0	chr3	12248838	12254112	-147345671	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	3
678	390	167	46	35	chr3	12254112	12254199	-147345584	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	3
678	302	0	0	0	chr3	12254199	12254237	-147345546	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
678	4456	12	0	0	chr3	12254237	12254730	-147345053	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
678	508	310	39	10	chr3	12287155	12287360	-147312423	+	MURVY-int	LTR	ERV1	3437	3647	-3805	3
678	657	298	17	8	chr3	12287560	12287796	-147311987	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3806	4030	-1033	3
678	1082	253	18	62	chr3	12293348	12293685	-147306098	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	290	3
678	10252	221	65	19	chr3	12294150	12296618	-147303165	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	56	2637	-3124	3
678	1080	263	11	41	chr3	12296643	12296909	-147302874	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-58	309	52	3
678	2258	103	112	12	chr3	12297499	12297900	-147301883	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	40	480	-52	3
678	1408	249	18	83	chr3	12305317	12305907	-147293876	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-15	513	1	3
678	6100	227	36	43	chr3	12305907	12306573	-147293210	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2892	3575	-2186	3
678	6100	227	36	43	chr3	12306619	12307446	-147292337	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3576	4375	-1386	3
678	1986	259	5	0	chr3	12307439	12307860	-147291923	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-920	4841	4419	3
678	2031	201	11	5	chr3	12307878	12308258	-147291525	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4979	5360	-401	3
678	712	250	17	44	chr3	12308249	12308429	-147291354	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-988	4773	4599	3
678	376	254	165	39	chr3	12308429	12308556	-147291227	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	143	-225	3
678	230	261	42	28	chr3	12308551	12308622	-147291161	+	RLTR9A	LTR	ERVK	297	368	0	3
678	1378	170	46	28	chr3	12308642	12308954	-147290829	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5186	5664	-97	3
678	1804	230	95	14	chr3	12315781	12316267	-147283516	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-25	516	1	3
678	1927	180	152	2	chr3	12319745	12320206	-147279577	-	RMER6D	LTR	ERVK	-11	709	180	3
679	563	208	12	102	chr3	12323856	12324022	-147275761	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	151	-217	4
679	308	284	68	10	chr3	12324258	12324361	-147275422	+	RLTR9A	LTR	ERVK	283	391	-18	4
679	749	168	95	0	chr3	12324802	12324939	-147274844	+	RMER16-int	LTR	ERVK	255	404	-5002	4
679	4718	164	82	34	chr3	12324950	12325980	-147273803	+	RMER16-int	LTR	ERVK	458	1537	-3869	4
679	3317	188	49	57	chr3	12326172	12327333	-147272450	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1500	3239	-4167	4
679	3507	137	68	32	chr3	12327334	12327982	-147271801	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2389	3059	-2347	4
679	1892	148	0	13	chr3	12327996	12328311	-147271472	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5359	5669	-1737	4
679	560	249	146	80	chr3	12328496	12328832	-147270951	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	358	-10	4
679	4436	14	0	0	chr3	12328957	12329450	-147270333	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
679	2654	144	5	23	chr3	12331034	12331475	-147268308	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	433	-3	4
679	1293	250	19	31	chr3	12342236	12342554	-147257229	+	ORR1C2	LTR	MaLR	16	329	-55	4
679	602	305	41	55	chr3	12349910	12350254	-147249529	-	RLTR15	LTR	ERVK	-20	339	1	4
679	310	316	31	183	chr3	12358805	12359161	-147240622	+	RMER5	LTR	ERV1	48	349	-185	4
679	858	255	73	9	chr3	12366952	12367185	-147232598	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	120	4
679	1804	227	142	68	chr3	12367186	12367321	-147232462	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	136	-892	4
679	1804	227	142	68	chr3	12367364	12367785	-147231998	+	RLTR25B	LTR	ERVK	137	597	-431	4
679	527	216	28	63	chr3	12367899	12368042	-147231741	+	RLTR25B	LTR	ERVK	890	1027	-1	4
679	434	198	34	0	chr3	12368048	12368152	-147231631	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-249	97	1	4
679	471	229	45	18	chr3	12368152	12368263	-147231520	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-37	347	234	4
679	2072	112	20	53	chr3	12368264	12368621	-147231162	-	RMER17A	LTR	ERVK	-3	748	404	4
679	920	147	13	0	chr3	12368731	12368881	-147230902	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-232	152	1	4
679	942	272	84	17	chr3	12368881	12369180	-147230603	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1509	1191	4
679	8019	32	0	3	chr3	12369180	12370112	-147229671	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	4
679	1050	142	16	27	chr3	12370112	12370300	-147229483	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	1	186	-5622	4
679	275	297	0	0	chr3	12370372	12370473	-147229310	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	279	379	-6874	4
679	310	274	0	0	chr3	12370742	12370815	-147228968	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	1156	1228	-6025	4
679	16392	123	35	27	chr3	12370985	12373891	-147225892	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	186	2895	-2913	4
679	230	283	31	61	chr3	12374969	12375067	-147224716	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	280	-236	4
679	7409	113	59	28	chr3	12376974	12377031	-147222752	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	3920	3976	-1832	4
679	7409	121	105	21	chr3	12377077	12378740	-147221043	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	3977	5780	-28	4
679	8029	32	0	3	chr3	12378752	12379684	-147220099	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	4
679	2011	268	45	34	chr3	12379745	12380360	-147219423	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-887	622	1	4
679	1655	268	14	8	chr3	12380362	12380731	-147219052	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-3	381	11	4
679	227	338	35	77	chr3	12385707	12385877	-147213906	+	RMER4B	LTR	ERVK	25	187	-398	4
679	1875	207	39	5	chr3	12385903	12386404	-147213379	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1028	447	4
679	237	309	52	43	chr3	12386405	12386520	-147213263	-	RLTR23	LTR	ERV1	-1	429	314	4
679	1012	265	84	45	chr3	12386507	12386934	-147212849	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	366	809	-1039	4
679	413	276	17	8	chr3	12386997	12387114	-147212669	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1590	1707	-141	4
679	2105	218	10	79	chr3	12387176	12387695	-147212088	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-620	483	1	4
679	1089	301	11	0	chr3	12387779	12388065	-147211718	-	MTC	LTR	MaLR	-25	396	108	4
679	390	253	0	0	chr3	12388149	12388232	-147211551	-	MTC	LTR	MaLR	-338	83	1	4
679	3151	66	75	0	chr3	12408941	12409383	-147190400	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
679	14406	58	7	3	chr3	12409400	12411201	-147188582	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-17	6464	4656	4
679	1859	99	8	0	chr3	12411200	12411452	-147188331	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2244	4
679	939	59	0	0	chr3	12411447	12411566	-147188217	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5004	1477	1359	4
679	3812	61	4	18	chr3	12411566	12412068	-147187715	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	4
679	228	327	0	0	chr3	12412068	12412123	-147187660	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	221	4
679	1089	83	25	100	chr3	12412123	12412323	-147187460	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6288	193	9	4
679	3058	70	73	18	chr3	12412324	12412774	-147187009	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
679	2498	86	41	15	chr3	12435703	12436093	-147163690	-	RLTR44B	LTR	ERVK	-49	400	1	5
679	2207	184	119	69	chr3	12440069	12440605	-147159178	-	RMER19C	LTR	ERVK	-48	563	1	5
679	1942	144	41	49	chr3	12442054	12442404	-147157379	+	MT2B	LTR	ERVL	1	337	-264	5
679	4566	146	28	13	chr3	12442404	12443197	-147156586	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	805	-1043	5
679	331	354	58	63	chr3	12443391	12443614	-147156169	+	RMER12	LTR	ERVK	1101	1322	0	5
679	1587	139	4	0	chr3	12443614	12443871	-147155912	+	MT2B	LTR	ERVL	344	601	0	5
680	773	280	62	82	chr3	12455743	12456221	-147143562	-	RMER2	LTR	ERV1	-27	540	1	5
680	1507	200	78	83	chr3	12458992	12459465	-147140318	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	5
680	470	280	131	18	chr3	12459971	12460193	-147139590	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-8	360	114	5
680	317	167	19	0	chr3	12460350	12460404	-147139379	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-313	55	1	5
680	325	283	10	10	chr3	12460404	12460483	-147139300	+	RMER4B	LTR	ERVK	98	176	-409	5
680	519	309	58	40	chr3	12488528	12488754	-147111029	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	536	765	-605	5
680	1756	147	81	12	chr3	12488755	12489099	-147110684	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	5
680	2182	137	74	104	chr3	12490187	12490726	-147109057	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2083	2605	-4639	5
680	5415	140	49	33	chr3	12490723	12491780	-147108003	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2839	4176	-1230	5
680	265	340	19	0	chr3	12491902	12492008	-147107775	+	RMER16-int	LTR	ERVK	6306	6413	-993	5
680	282	206	27	27	chr3	12492202	12492277	-147107506	+	RMER16-int	LTR	ERVK	7330	7404	-2	5
680	1902	126	29	68	chr3	12492278	12492661	-147107122	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	5
680	678	337	16	42	chr3	12492661	12492968	-147106815	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	761	1059	-311	5
680	977	271	75	0	chr3	12493153	12493447	-147106336	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1055	1370	0	5
680	513	293	136	44	chr3	12493447	12493786	-147105997	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
680	299	263	117	69	chr3	12495025	12495213	-147104570	+	LTR37A	LTR	ERV1	23	219	-207	5
680	392	341	29	52	chr3	12499676	12499948	-147099835	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	135	400	-1089	5
680	487	258	116	64	chr3	12500072	12500399	-147099384	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-5	523	180	1
680	448	369	49	9	chr3	12501150	12501374	-147098409	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	690	922	-567	6
680	314	229	16	0	chr3	12502118	12502179	-147097604	+	MLT1E2	LTR	MaLR	311	372	-255	7
680	1982	157	6	0	chr3	12508643	12508968	-147090815	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
680	243	389	0	0	chr3	12528082	12528154	-147071629	-	RMER20B	LTR	ERVK	-502	125	54	3
680	254	242	97	21	chr3	12533762	12533855	-147065928	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-86	491	366	4
680	2026	219	33	21	chr3	12539707	12540127	-147059656	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-133	427	3	4
680	3496	184	42	31	chr3	12566263	12566969	-147032814	-	RMER6D	LTR	ERVK	-6	714	1	7
680	233	283	31	61	chr3	12575331	12575429	-147024354	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	280	-236	9
681	1859	137	252	31	chr3	12585036	12585489	-147014294	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	589	-65	9
681	2627	29	0	0	chr3	12585504	12585813	-147013970	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	1	309	-7469	9
681	29792	39	1	1	chr3	12585807	12589322	-147010461	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	4266	7778	0	9
681	1845	134	254	31	chr3	12589435	12589883	-147009900	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	584	-70	9
681	3414	30	2	0	chr3	12595658	12596053	-147003730	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
681	419	291	19	63	chr3	12615214	12615372	-146984411	-	RLTR40	LTR	ERVK	-14	803	653	1
681	3124	68	5	0	chr3	12617349	12617743	-146982040	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
681	1900	158	9	9	chr3	12628845	12629171	-146970612	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	1
681	1100	236	102	60	chr3	12632768	12633083	-146966700	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-50	328	1	1
681	278	341	149	6	chr3	12636708	12636876	-146962907	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	192	-167	1
681	3950	160	29	9	chr3	12638627	12639284	-146960499	-	RLTR17	LTR	ERVK	-22	670	1	1
681	2860	140	130	13	chr3	12640783	12641306	-146958477	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	1
681	1963	127	3	79	chr3	12642755	12643096	-146956687	+	ORR1A2	LTR	MaLR	13	327	0	1
681	890	324	104	45	chr3	12643294	12643756	-146956027	+	MER67D	LTR	ERV1	22	510	-4	1
681	3127	166	268	54	chr3	12651879	12652730	-146947053	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	1033	0	1
681	1682	215	39	0	chr3	12655035	12655398	-146944385	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	2	1
681	1358	196	26	0	chr3	12655742	12656007	-146943776	-	RMER19B	LTR	ERVK	-630	272	1	1
681	1348	214	119	19	chr3	12657537	12657856	-146941927	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	17	1
681	732	246	185	30	chr3	12657860	12658158	-146941625	+	ORR1D1	LTR	MaLR	31	374	0	1
681	700	313	84	38	chr3	12662715	12662886	-146936897	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-5916	905	745	1
681	2783	23	2	207	chr3	12662886	12663374	-146936409	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	1
681	700	313	84	38	chr3	12663374	12663654	-146936129	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-6077	744	433	1
681	429	226	33	50	chr3	12663869	12663990	-146935793	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-6702	119	1	1
681	1737	128	24	49	chr3	12663998	12664326	-146935457	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-7	320	1	1
681	3683	208	152	53	chr3	12666371	12667374	-146932409	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1103	0	1
681	2249	137	32	94	chr3	12667903	12668431	-146931352	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	1
681	3184	118	70	26	chr3	12668604	12669144	-146930639	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	1
681	1101	221	82	67	chr3	12676656	12676883	-146922900	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	221	-189	2
681	1101	221	82	67	chr3	12677049	12677223	-146922560	+	RMER17C	LTR	ERVK	222	408	-2	2
681	405	181	311	20	chr3	12678191	12678339	-146921444	-	MT2A	LTR	ERVL	-298	195	5	2
681	2670	124	5	0	chr3	12678339	12678735	-146921048	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	3	2
681	286	302	133	36	chr3	12680566	12680866	-146918917	+	MLT1A0	LTR	MaLR	9	385	-23	2
681	436	260	19	0	chr3	12683858	12683962	-146915821	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	107	-267	2
681	1854	237	126	16	chr3	12686014	12686640	-146913143	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	665	1359	-150	2
681	2556	139	35	48	chr3	12688337	12688821	-146910962	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	5	2
681	1359	254	83	129	chr3	12691249	12691806	-146907977	+	RLTR20C	LTR	ERVK	4	534	0	2
681	1835	159	23	0	chr3	12704870	12705172	-146894611	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	2
682	2135	91	21	62	chr3	12714288	12714628	-146885155	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
682	2900	95	27	35	chr3	12741477	12741956	-146857827	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
682	1858	134	10	3	chr3	12753770	12754061	-146845722	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	293	-34	3
682	394	335	88	0	chr3	12762044	12762238	-146837545	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	211	-304	3
682	623	321	22	18	chr3	12767867	12768089	-146831694	+	MTEa	LTR	MaLR	153	375	-4	3
682	276	283	163	0	chr3	12773050	12773142	-146826641	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-301	107	1	3
682	1985	149	6	0	chr3	12777315	12777630	-146822153	+	ORR1A4	LTR	MaLR	5	321	-8	3
682	890	169	56	34	chr3	12779130	12779154	-146820629	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	24	-696	3
682	3499	48	79	2	chr3	12779154	12779595	-146820188	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	3
682	890	169	56	34	chr3	12779595	12779748	-146820035	+	RMER6C	LTR	ERVK	25	182	-538	3
682	1440	187	35	43	chr3	12779748	12780095	-146819688	+	RMER6C	LTR	ERVK	347	690	0	3
682	2159	253	10	39	chr3	12781875	12782393	-146817390	-	RMER15	LTR	ERVL	-8	567	65	3
682	265	312	0	0	chr3	12782560	12782628	-146817155	-	RMER15	LTR	ERVL	-504	71	4	3
682	282	365	19	0	chr3	12787261	12787368	-146812415	-	RMER4B	LTR	ERVK	-134	451	343	3
682	822	180	138	5	chr3	12787552	12787770	-146812013	-	RMER4B	LTR	ERVK	-338	247	1	3
682	271	174	0	0	chr3	12801219	12801265	-146798518	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	488	3
682	776	244	61	75	chr3	12801404	12801726	-146798057	-	MT2B	LTR	ERVL	-59	542	186	3
682	1774	247	74	29	chr3	12801924	12802412	-146797371	-	RMER20A	LTR	ERVK	-2	514	5	3
682	443	258	23	102	chr3	12804414	12804591	-146795192	+	RNLTR23	LTR	ERVK	480	642	0	3
682	558	311	26	64	chr3	12809126	12809469	-146790314	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-51	390	61	4
682	792	139	23	30	chr3	12809459	12809592	-146790191	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-74	253	122	4
682	282	299	112	0	chr3	12821596	12821703	-146778080	-	MLT1J	LTR	MaLR	-51	461	343	4
682	2039	133	121	88	chr3	12824884	12825242	-146774541	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	130	4
682	2039	133	121	88	chr3	12825390	12825543	-146774240	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-403	129	4	4
682	947	272	145	6	chr3	12827736	12828061	-146771722	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	1	4
682	3263	41	10	0	chr3	12828069	12828461	-146771322	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
682	5237	104	21	28	chr3	12830081	12830895	-146768888	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	4
682	3521	241	71	23	chr3	12831564	12832129	-146767654	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-24	6526	5931	4
682	3521	241	71	23	chr3	12832170	12832702	-146767081	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-620	5930	5376	4
682	1254	188	94	77	chr3	12832954	12833358	-146766425	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	4
682	1393	87	0	5	chr3	12833358	12833565	-146766218	+	RLTR10A	LTR	ERVK	106	311	-100	4
682	480	185	0	0	chr3	12833565	12833657	-146766126	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7490	7581	0	4
682	1717	172	20	7	chr3	12833657	12833962	-146765821	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	4
682	361	291	61	28	chr3	12835357	12835537	-146764246	-	RMER4A	LTR	ERVK	-28	438	253	4
682	1649	161	43	62	chr3	12835548	12835872	-146763911	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	4
682	770	285	63	88	chr3	12835971	12836891	-146762892	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1765	4785	4149	4
682	2389	102	147	5	chr3	12836906	12837322	-146762461	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
682	264	97	90	77	chr3	12837347	12837425	-146762358	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	81	-1906	4
682	3551	101	37	36	chr3	12837437	12838396	-146761387	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	10	662	-5819	4
682	2599	82	0	3	chr3	12838396	12838739	-146761044	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	4
682	6822	34	5	18	chr3	12838734	12839572	-146760211	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5653	6479	-2	4
682	2425	99	147	5	chr3	12839574	12839990	-146759793	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
682	1109	261	38	36	chr3	12840015	12840380	-146759403	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2411	4139	3774	4
682	386	85	0	0	chr3	12840625	12840684	-146759099	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-465	63	5	4
682	1462	289	16	21	chr3	12841021	12841393	-146758390	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
85	6749	67	23	18	chr3	12844728	12846790	-146752993	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1378	3751	-1312	4
683	3819	59	36	10	chr3	12846790	12847289	-146752494	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	4
683	2167	127	65	0	chr3	12847634	12847958	-146751825	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	345	-1	4
683	2380	124	72	2	chr3	12847959	12848534	-146751249	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	426	-1366	4
683	895	271	137	0	chr3	12848516	12848771	-146751012	-	MTC	LTR	MaLR	-31	390	101	4
683	5978	77	12	8	chr3	12849029	12849833	-146749950	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	4
683	1300	238	128	24	chr3	12852971	12853346	-146746437	-	MTC	LTR	MaLR	-7	414	1	4
683	651	338	81	29	chr3	12854508	12854928	-146744855	-	MER70-int	LTR	ERVL	-7	5016	4575	4
683	251	312	12	0	chr3	12855059	12855139	-146744644	-	MER70-int	LTR	ERVL	-928	4095	4015	4
683	1727	210	11	28	chr3	12858995	12859357	-146740426	+	ORR1B2	LTR	MaLR	4	359	-8	4
683	397	333	79	40	chr3	12870164	12870392	-146729391	-	RMER20B	LTR	ERVK	-282	345	109	5
683	3402	28	5	0	chr3	12885467	12885861	-146713922	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
683	5838	59	7	1	chr3	12885861	12886627	-146713156	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	329	5
683	1904	126	39	21	chr3	12886613	12886945	-146712838	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	42	379	-6	5
683	2383	84	9	0	chr3	12886948	12887282	-146712501	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-761	337	1	5
683	3396	33	2	0	chr3	12887284	12887679	-146712104	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
683	3146	228	118	26	chr3	12893699	12894531	-146705252	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	5
683	759	302	59	17	chr3	12909188	12909427	-146690356	-	MTD	LTR	MaLR	-170	249	1	5
683	626	307	106	40	chr3	12916848	12917199	-146682584	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	9	5
683	2673	206	11	78	chr3	12917951	12918308	-146681475	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	241	5
683	2248	80	119	11	chr3	12918308	12918660	-146681123	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	5
683	2673	206	11	78	chr3	12918660	12918752	-146681031	-	RMER15	LTR	ERVL	-335	240	157	5
683	2673	206	11	78	chr3	12918776	12918941	-146680842	-	RMER15	LTR	ERVL	-419	156	1	5
683	6650	96	52	9	chr3	12919692	12920683	-146679100	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	0	1033	1	5
683	3516	77	23	2	chr3	12929179	12929651	-146670132	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	5
683	16896	59	8	18	chr3	12929651	12931853	-146667930	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	0	7244	5065	5
683	3964	80	33	38	chr3	12931846	12932456	-146667327	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-3258	3986	3380	5
683	11709	46	40	8	chr3	12932426	12934257	-146665526	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-4032	3212	1322	5
683	1128	51	0	0	chr3	12935033	12935171	-146664612	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6426	818	681	5
683	4203	76	112	24	chr3	12935459	12936095	-146663688	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6552	692	1	5
683	3292	84	16	78	chr3	12936095	12936609	-146663174	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	5
683	1473	235	76	3	chr3	12939794	12940136	-146659647	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	5
683	333	128	190	13	chr3	12940156	12940235	-146659548	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-54	1316	1224	5
683	545	152	33	0	chr3	12940208	12940300	-146659483	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-460	1049	955	5
683	1007	303	67	8	chr3	12942833	12943189	-146656594	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	140	5
683	1042	329	85	5	chr3	12946319	12946707	-146653076	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
683	3230	115	11	63	chr3	12960436	12960976	-146638807	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	5
683	748	165	154	5	chr3	12960977	12961178	-146638605	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-42	5021	4791	5
683	1349	305	17	29	chr3	12961177	12961693	-146638090	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-792	4271	3762	5
683	7242	165	112	31	chr3	12961696	12964066	-146635717	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1638	3425	760	5
683	4748	138	14	19	chr3	12964057	12964830	-146634953	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-3962	1444	676	5
683	420	191	107	0	chr3	12964821	12964905	-146634878	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5086	320	228	5
683	438	271	80	76	chr3	12964898	12965174	-146634609	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-4599	464	188	5
683	2259	92	3	3	chr3	12965578	12965894	-146633889	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	249	6
683	641	220	330	91	chr3	12965895	12966386	-146633397	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-6948	608	1	6
683	2951	101	65	59	chr3	12966386	12966892	-146632891	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	4	6
683	2851	103	8	0	chr3	12968847	12969243	-146630540	-	MTB	LTR	MaLR	-1	399	1	6
684	4212	8	38	0	chr3	12981101	12981576	-146618207	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	6
684	1714	153	31	0	chr3	12982566	12982860	-146616923	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	303	-24	6
684	1211	137	94	7	chr3	12992862	12993088	-146606695	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-4	471	92	6
684	450	162	203	0	chr3	12999367	12999478	-146600305	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-224	161	1	6
684	1128	314	18	48	chr3	13000226	13000621	-146599162	-	MTD	LTR	MaLR	-36	383	1	1
684	335	343	49	123	chr3	13001319	13001708	-146598075	+	MTEa	LTR	MaLR	20	379	0	3
684	642	328	127	42	chr3	13001709	13002119	-146597664	+	MTEa-int	LTR	MaLR	2	446	-1134	3
684	468	206	10	19	chr3	13003976	13004080	-146595703	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-902	607	505	8
684	235	294	23	12	chr3	13005760	13005846	-146593937	+	MLT1A1	LTR	MaLR	309	395	-13	1
684	1137	223	30	118	chr3	13012898	13013229	-146586554	+	RMER19C	LTR	ERVK	309	610	-1	2
684	2938	200	85	36	chr3	13015544	13016438	-146583345	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	2
684	478	174	21	11	chr3	13019291	13019384	-146580399	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	94	-467	3
684	1895	205	26	58	chr3	13021500	13021997	-146577786	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	81	561	0	3
684	234	345	11	11	chr3	13035472	13035560	-146564223	-	MER67C	LTR	ERV1	-452	259	172	4
684	1258	313	63	7	chr3	13037982	13038590	-146561193	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	5
684	5020	168	50	11	chr3	13045777	13046699	-146553084	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	6
684	274	302	79	8	chr3	13049871	13049998	-146549785	-	MLT1D	LTR	MaLR	-1	504	369	6
684	1563	184	101	0	chr3	13050400	13050726	-146549057	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
684	1506	236	24	29	chr3	13055818	13056198	-146543585	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	7
684	3028	37	0	0	chr3	13058431	13058785	-146540998	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	8
684	3276	128	15	29	chr3	13058785	13059518	-146540265	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	0	7581	6907	8
684	469	51	0	0	chr3	13059518	13059577	-146540206	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4852	8
684	3386	85	7	0	chr3	13059570	13060015	-146539768	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-4991	2689	2242	8
684	881	117	0	0	chr3	13059995	13060123	-146539660	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-5698	1982	1855	8
684	9111	101	32	10	chr3	13064450	13065919	-146533864	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-5620	1893	22	8
684	2338	66	0	0	chr3	13065919	13066221	-146533562	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	56	8
684	471	143	0	0	chr3	13067159	13067229	-146532554	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-287	70	1	8
684	2303	167	59	88	chr3	13074554	13075132	-146524651	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	9
684	524	307	28	0	chr3	13077146	13077325	-146522458	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	184	-370	1
684	348	389	17	22	chr3	13077347	13077526	-146522257	+	MLT2B3	LTR	ERVL	323	500	-62	1
684	1458	198	3	104	chr3	13080253	13080619	-146519164	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
684	1166	145	11	24	chr3	13080619	13080842	-146518941	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1	1962	1772	1
684	1154	174	121	0	chr3	13080842	13081199	-146518584	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1605	3880	3481	1
684	304	154	0	0	chr3	13081204	13081256	-146518527	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-277	52	1	1
684	1697	214	96	0	chr3	13081591	13081975	-146517808	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
684	244	200	18	0	chr3	13085623	13085678	-146514105	-	MTEb	LTR	MaLR	-30	349	294	1
684	1436	174	206	12	chr3	13086389	13086710	-146513073	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	39	1
684	229	310	142	82	chr3	13087009	13087290	-146512493	-	RLTR17	LTR	ERVK	-269	423	126	1
684	914	302	77	24	chr3	13090425	13090761	-146509022	+	MTEa	LTR	MaLR	26	379	0	1
684	590	250	138	15	chr3	13091004	13091199	-146508584	-	RMER13A	LTR	ERVK	-398	462	244	1
684	2288	246	17	112	chr3	13092821	13093685	-146506098	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	782	-176	1
684	439	266	59	94	chr3	13093701	13093904	-146505879	+	RMER13B	LTR	ERVK	704	899	-9	1
684	3000	118	2	63	chr3	13100947	13101453	-146498330	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	1
684	780	144	152	24	chr3	13101457	13101621	-146498162	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4	5481	5353	1
684	2957	146	24	12	chr3	13101650	13102143	-146497640	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-276	5485	4987	1
684	662	190	67	27	chr3	13102145	13102295	-146497488	-	MT2B2	LTR	ERVL	-224	360	210	1
684	11662	115	16	9	chr3	13102295	13104009	-146495774	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-655	4830	3105	1
685	515	217	188	0	chr3	13118910	13119048	-146480735	-	MTD	LTR	MaLR	-246	173	10	1
685	1922	48	277	0	chr3	13124868	13125139	-146474644	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
685	1332	223	92	22	chr3	13125974	13126332	-146473451	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	1	1
685	1134	189	135	43	chr3	13130176	13130480	-146469303	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	1
685	389	252	41	75	chr3	13130482	13130628	-146469155	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	3	143	-7537	1
685	640	218	71	0	chr3	13130679	13130876	-146468907	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	535	745	-6935	1
685	554	106	0	23	chr3	13131129	13131216	-146468567	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	93	177	-6365	1
685	751	197	33	0	chr3	13131210	13131362	-146468421	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	347	503	-6039	1
685	1445	146	105	0	chr3	13131342	13131589	-146468194	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	4983	5255	-1287	1
685	1768	122	50	0	chr3	13131601	13131922	-146467861	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6976	7338	-342	1
685	1364	210	55	15	chr3	13131939	13132282	-146467501	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6125	6481	0	1
685	1132	223	94	34	chr3	13132282	13132579	-146467204	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	315	-5	1
685	251	309	44	35	chr3	13141667	13141781	-146458002	+	RLTR24	LTR	ERV1	340	454	-75	1
685	2353	123	128	2	chr3	13146017	13146439	-146453344	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	1
685	1307	241	75	36	chr3	13147103	13147464	-146452319	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-8	376	2	1
685	5127	152	10	70	chr3	13150346	13151368	-146448415	-	MTB-int	LTR	MaLR	-138	960	1	1
685	2335	134	24	29	chr3	13151368	13151538	-146448245	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	223	1
685	4177	119	25	76	chr3	13151538	13152328	-146447455	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	2	1
685	2335	134	24	29	chr3	13152328	13152540	-146447243	-	MTB	LTR	MaLR	-178	222	20	1
685	907	244	71	41	chr3	13153680	13154042	-146445741	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	14	1
685	253	331	23	55	chr3	13163443	13163571	-146436212	+	ORR1E	LTR	MaLR	71	194	-165	2
685	358	310	76	14	chr3	13163777	13163921	-146435862	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	267	2
685	1674	51	0	75	chr3	13168429	13168682	-146431101	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	238	-326	2
685	1288	254	14	21	chr3	13171362	13171648	-146428135	+	MTC	LTR	MaLR	84	367	-54	2
685	2551	59	9	0	chr3	13171670	13172009	-146427774	+	LTRIS2	LTR	ERV1	223	564	0	2
685	3768	219	58	112	chr3	13180158	13180797	-146418986	+	MTC-int	LTR	MaLR	148	712	-546	2
685	3768	219	58	112	chr3	13180855	13181389	-146418394	+	MTC-int	LTR	MaLR	713	1258	0	2
685	1386	194	67	8	chr3	13181389	13181695	-146418088	+	MTC	LTR	MaLR	1	319	-81	2
685	1181	303	57	17	chr3	13181871	13182220	-146417563	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	57	2
685	493	283	29	35	chr3	13185318	13185490	-146414293	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	353	2
685	1761	176	31	6	chr3	13193057	13193378	-146406405	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
685	684	265	41	0	chr3	13198419	13198585	-146401198	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	173	-201	2
685	631	174	8	24	chr3	13198585	13198709	-146401074	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	122	-272	2
685	856	293	46	111	chr3	13198764	13199332	-146400451	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-27	500	1	2
685	1169	203	77	4	chr3	13199337	13199584	-146400199	+	ORR1B1	LTR	MaLR	130	394	0	2
685	722	228	87	0	chr3	13199584	13199768	-146400015	+	ORR1D1	LTR	MaLR	169	368	-6	2
685	806	276	75	0	chr3	13207086	13207285	-146392498	+	MTD	LTR	MaLR	7	220	-199	2
685	1565	230	57	61	chr3	13207292	13207769	-146392014	+	RMER6C	LTR	ERVK	216	690	0	2
685	727	233	117	0	chr3	13207769	13207948	-146391835	+	MTD	LTR	MaLR	211	410	-9	2
685	2848	264	80	113	chr3	13207961	13208597	-146391186	+	MTD-int	LTR	MaLR	6	701	-557	2
685	2848	264	80	113	chr3	13208793	13209451	-146390332	+	MTD-int	LTR	MaLR	702	1258	0	2
685	561	223	129	7	chr3	13209451	13209591	-146390192	+	MTD	LTR	MaLR	1	157	-262	2
685	1815	251	76	0	chr3	13210453	13210927	-146388856	-	RLTR28	LTR	ERVL	-14	510	1	2
685	489	336	54	90	chr3	13214203	13214939	-146384844	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2773	2218	1509	2
685	3460	42	28	9	chr3	13215159	13215587	-146384196	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	2
685	248	250	12	59	chr3	13217792	13217877	-146381906	-	RMER5	LTR	ERV1	-433	101	21	2
685	277	204	0	0	chr3	13218031	13218080	-146381703	+	MT2A	LTR	ERVL	411	459	-74	2
685	1121	308	21	43	chr3	13228324	13228603	-146371180	-	MuLV-int	LTR	ERV1	-2354	5252	4982	2
685	3513	221	51	72	chr3	13228603	13229581	-146370202	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	2
685	1121	308	21	43	chr3	13229581	13229721	-146370062	-	MuLV-int	LTR	ERV1	-2625	4981	4842	2
685	2651	183	44	11	chr3	13230350	13230875	-146368908	-	RMER13B	LTR	ERVK	-366	542	1	2
685	2083	130	3	0	chr3	13230963	13231271	-146368512	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	2
685	479	327	64	19	chr3	13231405	13231670	-146368113	-	MuLV-int	LTR	ERV1	-3309	4297	4000	2
685	371	267	108	0	chr3	13231705	13231825	-146367958	+	RMER2	LTR	ERV1	435	567	0	2
685	368	364	101	20	chr3	13232059	13232258	-146367525	-	ORR1E	LTR	MaLR	-144	215	1	2
685	7610	172	45	58	chr3	13232950	13234273	-146365510	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1312	-260	2
685	7610	172	45	58	chr3	13234311	13234571	-146365212	+	RLTR21	LTR	ERVK	1313	1564	-8	2
686	3133	70	163	2	chr3	13240821	13241262	-146358521	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	2
686	1159	206	21	145	chr3	13241416	13241624	-146358159	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	229	2
686	1159	206	21	145	chr3	13241704	13241914	-146357869	-	RMER17C	LTR	ERVK	-182	228	44	2
686	551	170	43	0	chr3	13241937	13242031	-146357752	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	3141	2
686	1881	217	102	68	chr3	13242026	13242699	-146357084	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1536	1702	1007	2
686	1504	226	80	80	chr3	13242748	13243320	-146356463	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2544	694	123	2
686	504	264	95	39	chr3	13243623	13243899	-146355884	-	RMER17C	LTR	ERVK	-3	407	1	2
686	434	329	75	59	chr3	13243900	13243926	-146355857	-	MER67D	LTR	ERV1	-29	485	461	2
686	434	329	75	59	chr3	13244073	13244485	-146355298	-	MER67D	LTR	ERV1	-54	460	40	2
686	493	219	33	16	chr3	13247484	13247605	-146352178	+	MTD	LTR	MaLR	27	149	-270	3
686	886	236	139	4	chr3	13247683	13247921	-146351862	+	MTD	LTR	MaLR	150	419	0	3
686	2577	132	5	5	chr3	13250629	13251032	-146348751	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	3
686	665	296	45	104	chr3	13269583	13269986	-146329797	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	3
686	969	202	62	9	chr3	13277732	13277942	-146321841	+	MTD	LTR	MaLR	5	225	-194	3
686	2172	151	47	5	chr3	13278663	13279049	-146320734	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-1	402	1	3
686	995	256	106	9	chr3	13286775	13287125	-146312658	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
686	2598	28	71	9	chr3	13289445	13289771	-146310012	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
686	839	337	109	30	chr3	13290472	13291032	-146308751	+	MTE-int	LTR	MaLR	2	605	-975	3
686	1636	214	19	44	chr3	13291029	13291067	-146308716	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-9	358	321	3
686	1636	214	19	44	chr3	13291229	13291557	-146308226	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-47	320	1	3
686	896	358	210	9	chr3	13296200	13296834	-146302949	+	MTE-int	LTR	MaLR	785	1545	-35	3
686	645	246	58	53	chr3	13298861	13299050	-146300733	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-372	205	16	3
686	2732	82	3	3	chr3	13308706	13309075	-146290708	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	369	-27	3
686	1281	245	89	14	chr3	13311848	13312196	-146287587	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	11	3
686	2038	207	100	25	chr3	13319083	13319563	-146280220	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	3
686	244	405	46	70	chr3	13329010	13329294	-146270489	+	MLT2B5	LTR	ERVL	85	361	-240	4
686	656	335	90	54	chr3	13329543	13329966	-146269817	-	MER67D	LTR	ERV1	-76	438	1	4
686	516	300	87	15	chr3	13330757	13331107	-146268676	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	4
686	1825	274	31	32	chr3	13335235	13335823	-146263960	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3685	4271	-792	4
686	950	229	31	0	chr3	13335814	13336041	-146263742	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4788	5021	-42	4
686	2475	112	117	43	chr3	13336042	13336488	-146263295	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	479	-85	4
686	875	304	51	11	chr3	13347876	13348232	-146251551	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
686	428	291	99	68	chr3	13348530	13348751	-146251032	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-64	301	74	4
686	357	333	74	0	chr3	13352383	13352545	-146247238	+	MLT1E2	LTR	MaLR	27	200	-427	4
686	296	344	17	49	chr3	13358927	13359076	-146240707	+	MLT1E2	LTR	MaLR	422	586	-38	4
686	296	258	0	136	chr3	13362508	13362530	-146237253	+	MT2B	LTR	ERVL	149	156	-445	4
687	684	240	70	29	chr3	13383406	13383578	-146216205	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	179	-437	4
687	1906	216	86	2	chr3	13383798	13384207	-146215576	+	RLTR18	LTR	ERVK	174	616	0	4
687	376	222	148	27	chr3	13387145	13387304	-146212479	+	MT2A	LTR	ERVL	1	170	-431	4
687	1773	235	34	31	chr3	13387609	13387940	-146211843	+	MTC	LTR	MaLR	8	347	-74	4
687	1773	235	34	31	chr3	13388130	13388210	-146211573	+	MTC	LTR	MaLR	348	420	-1	4
687	1423	247	36	28	chr3	13389171	13389529	-146210254	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	12	4
687	758	263	34	34	chr3	13389959	13390267	-146209516	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	103	4
687	758	263	34	34	chr3	13390447	13390465	-146209318	-	RMER17C	LTR	ERVK	-308	102	85	4
687	489	235	31	70	chr3	13390604	13390860	-146208923	-	RMER17C	LTR	ERVK	-164	246	1	4
687	2127	139	74	16	chr3	13390860	13391226	-146208557	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2852	4
687	7540	148	65	43	chr3	13392437	13393374	-146206409	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-482	2756	1800	4
687	7540	148	65	43	chr3	13393814	13394387	-146205396	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1439	1799	1212	4
687	1334	221	46	72	chr3	13394438	13394662	-146205121	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2816	422	208	4
687	3449	30	0	0	chr3	13394662	13395058	-146204725	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
687	1334	221	46	72	chr3	13395058	13395266	-146204517	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-3031	207	1	4
687	2955	266	91	53	chr3	13395305	13396119	-146203664	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1496	5054	4175	4
687	2955	266	91	53	chr3	13396265	13396686	-146203097	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2376	4174	3772	4
687	1095	277	146	34	chr3	13399218	13399369	-146200414	+	RMER15	LTR	ERVL	22	191	-384	5
687	1095	277	146	34	chr3	13400059	13400401	-146199382	+	RMER15	LTR	ERVL	192	570	-5	5
687	286	372	110	38	chr3	13407982	13408300	-146191483	-	MT2A	LTR	ERVL	-10	523	183	5
687	268	236	0	0	chr3	13408396	13408451	-146191332	-	MTEa	LTR	MaLR	-320	59	5	5
687	1217	238	120	19	chr3	13408468	13408793	-146190990	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-12	362	5	5
687	1034	59	7	0	chr3	13411086	13411222	-146188561	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	260	5
687	2930	120	70	16	chr3	13411220	13411587	-146188196	-	MTB-int	LTR	MaLR	-216	882	380	5
687	2930	102	97	26	chr3	13411862	13412226	-146187557	-	MTB-int	LTR	MaLR	-719	379	1	5
687	3097	70	8	0	chr3	13412226	13412623	-146187160	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
687	625	178	53	18	chr3	13415456	13415626	-146184157	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-777	201	4	5
687	1629	263	40	0	chr3	13420284	13420687	-146179096	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
687	615	144	10	0	chr3	13425249	13425353	-146174430	-	RMER6-int	LTR	ERVK	-293	2884	2780	5
687	988	228	132	4	chr3	13425347	13425581	-146174202	-	RMER6-int	LTR	ERVK	-2913	264	1	5
687	918	282	81	40	chr3	13425581	13425735	-146174048	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	756	589	5
687	1057	215	31	21	chr3	13425757	13426005	-146173778	-	RMER6C	LTR	ERVK	-79	611	346	5
687	1754	215	145	18	chr3	13426041	13426756	-146173027	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	5
687	1745	152	95	0	chr3	13426773	13427089	-146172694	-	RMER6C	LTR	ERVK	-344	346	1	5
687	306	169	64	13	chr3	13427191	13427269	-146172514	+	RMER5	LTR	ERV1	446	527	-7	5
687	851	296	147	43	chr3	13430200	13430757	-146169026	+	MER67C	LTR	ERV1	94	708	-3	5
687	953	299	117	48	chr3	13431217	13431406	-146168377	+	RMER5	LTR	ERV1	1	196	-338	5
687	953	299	117	48	chr3	13431446	13431754	-146168029	+	RMER5	LTR	ERV1	197	531	-3	5
687	1560	212	70	43	chr3	13431925	13432387	-146167396	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	5
687	562	301	37	6	chr3	13432387	13432539	-146167244	+	RLTR33	LTR	ERVK	522	678	0	5
687	1603	205	22	0	chr3	13435321	13435643	-146164140	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	5
687	235	208	0	20	chr3	13437333	13437382	-146162401	+	MTD	LTR	MaLR	367	414	-5	5
687	1141	228	154	144	chr3	13439514	13440227	-146159556	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	720	0	5
687	2672	179	29	48	chr3	13443874	13444419	-146155364	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	535	-107	5
687	2635	70	6	6	chr3	13460047	13460393	-146139390	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
687	370	285	162	79	chr3	13490661	13490901	-146108882	-	MLT1B	LTR	MaLR	-121	269	10	6
687	237	194	40	53	chr3	13494671	13494747	-146105036	+	RLTR3_Mm	LTR	ERVK	314	388	-940	6
687	3120	157	26	37	chr3	13497257	13497782	-146102001	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-5	563	37	6
687	3120	157	26	37	chr3	13497950	13497993	-146101790	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-532	36	1	6
688	2803	63	50	5	chr3	13506819	13507202	-146092581	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
688	379	260	134	4	chr3	13510833	13510962	-146088821	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-19	389	208	1
688	334	136	0	63	chr3	13511308	13511371	-146088412	-	MT2B	LTR	ERVL	-230	371	313	1
688	2318	130	125	5	chr3	13515905	13516329	-146083454	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
688	2512	142	27	10	chr3	13520281	13520685	-146079098	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	191	2
688	2563	185	72	44	chr3	13520686	13521097	-146078686	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	521	2
688	2563	185	72	44	chr3	13521635	13521766	-146078017	-	RMER17B	LTR	ERVK	-438	520	401	2
688	2463	141	29	4	chr3	13522658	13523119	-146076664	-	RMER17B	LTR	ERVK	-521	437	1	2
688	1182	142	26	0	chr3	13523119	13523309	-146076474	-	MT2B	LTR	ERVL	-406	195	1	2
688	255	278	53	40	chr3	13532688	13532763	-146067020	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-433	135	60	4
688	1638	228	70	3	chr3	13533064	13533433	-146066350	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
688	1013	313	45	77	chr3	13547049	13547426	-146052357	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	365	-14	6
688	304	354	114	48	chr3	13550566	13551003	-146048780	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-2	487	43	6
688	361	365	104	18	chr3	13553404	13553742	-146046041	-	MT2A	LTR	ERVL	-113	420	54	7
688	470	291	78	92	chr3	13554829	13555124	-146044659	+	ORR1E	LTR	MaLR	30	320	-39	7
688	345	344	87	31	chr3	13555253	13555778	-146044005	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	497	-127	7
688	288	284	6	152	chr3	13557706	13557864	-146041919	-	LTR84a	LTR	ERVL	-353	404	270	8
688	441	378	65	18	chr3	13570466	13570695	-146029088	-	MLT1D	LTR	MaLR	-263	242	3	1
688	1057	281	94	36	chr3	13573263	13573647	-146026136	+	MTD	LTR	MaLR	1	406	-13	1
688	3116	174	137	126	chr3	13581199	13581629	-146018154	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	567	1
688	3116	174	137	126	chr3	13581684	13582149	-146017634	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-340	566	1	1
688	502	285	123	66	chr3	13584549	13584850	-146014933	-	MER67C	LTR	ERV1	-308	403	86	1
688	2763	159	126	24	chr3	13585823	13586449	-146013334	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	1
688	329	346	31	31	chr3	13589583	13589777	-146010006	-	MER110A	LTR	ERV1	-8	460	267	1
688	448	224	7	94	chr3	13596765	13596903	-146002880	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	153	1
688	595	312	52	43	chr3	13597266	13597605	-146002178	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	470	-58	1
689	3366	106	81	10	chr3	13634533	13635209	-145964574	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	0	1033	1	1
689	1096	215	0	40	chr3	13652001	13652184	-145947599	+	RMER10B	LTR	ERVL	5	185	-213	2
689	1096	215	0	40	chr3	13652274	13652362	-145947421	+	RMER10B	LTR	ERVL	186	265	-133	2
689	329	298	0	62	chr3	13652457	13652586	-145947197	+	RMER10B	LTR	ERVL	198	318	-80	2
689	929	186	56	51	chr3	13653817	13654032	-145945751	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-162	216	1	2
689	529	269	15	99	chr3	13661410	13661612	-145938171	-	MTEa	LTR	MaLR	-194	185	1	2
689	994	330	18	62	chr3	13662032	13662417	-145937366	+	MTEb	LTR	MaLR	9	376	-3	2
689	3300	36	8	0	chr3	13673084	13673477	-145926306	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
689	1520	187	122	36	chr3	13681857	13682217	-145917566	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-3	391	1	2
689	248	393	44	89	chr3	13684007	13684345	-145915438	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-3	557	235	2
689	3356	30	5	0	chr3	13686692	13687086	-145912697	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
689	796	311	61	19	chr3	13692099	13692410	-145907373	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	36	2
689	891	322	61	33	chr3	13692982	13693345	-145906438	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	7	2
689	317	296	78	95	chr3	13693407	13693586	-145906197	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	184	2
689	411	308	55	25	chr3	13703030	13703193	-145896590	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-860	168	1	2
689	2729	91	58	0	chr3	13709296	13709694	-145890089	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	2
689	938	305	65	16	chr3	13716712	13717079	-145882704	-	MLT1B	LTR	MaLR	-5	385	1	3
689	1360	210	103	29	chr3	13721601	13721949	-145877834	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
689	1220	233	44	11	chr3	13728059	13728379	-145871404	+	MTC	LTR	MaLR	27	365	-54	3
689	265	393	62	0	chr3	13761619	13761764	-145838019	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-14	394	241	3
690	692	347	32	95	chr3	13766162	13766563	-145833220	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	1	3
690	978	316	82	40	chr3	13771034	13771387	-145828396	+	MTEa	LTR	MaLR	1	368	-11	3
690	259	200	0	0	chr3	13781272	13781317	-145818466	-	RMER15	LTR	ERVL	-448	127	83	3
690	598	254	42	21	chr3	13781320	13781509	-145818274	-	RMER15	LTR	ERVL	-104	471	279	3
690	761	315	37	107	chr3	13786381	13786783	-145813000	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
690	2316	138	35	60	chr3	13790754	13791241	-145808542	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
690	20895	16	2	2	chr3	13791241	13793599	-145806184	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	4123	4
690	932	73	24	0	chr3	13793601	13793724	-145806059	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4785	4
690	1811	119	4	4	chr3	13793721	13793983	-145805800	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2236	4
690	442	66	0	32	chr3	13793972	13794035	-145805748	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5062	1419	1359	4
690	4799	66	4	33	chr3	13794035	13794722	-145805061	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	3	4
690	2316	138	35	60	chr3	13794724	13795211	-145804572	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
690	7441	92	9	2	chr3	13806225	13807241	-145792542	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	4
690	346	298	70	7	chr3	13818806	13818948	-145780835	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-207	158	8	4
690	2826	25	5	64	chr3	13821263	13821653	-145778130	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	4
690	28717	22	1	2	chr3	13821653	13824930	-145774853	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3210	4
690	7446	93	95	22	chr3	13824929	13826146	-145773637	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5168	1313	8	4
690	2826	25	5	64	chr3	13826146	13826536	-145773247	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	4
690	2149	126	6	15	chr3	13827813	13828143	-145771640	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
690	456	324	133	43	chr3	13833006	13833306	-145766477	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-34	331	5	4
690	272	278	57	45	chr3	13833687	13833813	-145765970	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-243	131	8	4
690	3541	174	42	9	chr3	13849411	13850061	-145749722	-	RLTR17	LTR	ERVK	-21	671	1	4
690	3051	236	107	23	chr3	13850327	13851191	-145748592	-	RMER19B	LTR	ERVK	-2	900	3	4
690	439	290	71	56	chr3	13857042	13857239	-145742544	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	268	4
690	2763	164	258	35	chr3	13858165	13858948	-145740835	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	4
690	459	333	101	55	chr3	13861417	13861763	-145738020	+	ORR1D2	LTR	MaLR	8	369	-1	5
690	270	164	52	52	chr3	13869379	13869437	-145730346	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-577	4422	4365	5
690	2797	167	56	61	chr3	13869851	13870655	-145729128	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	808	1	5
690	5868	201	47	51	chr3	13870668	13872060	-145727723	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-24	5784	4399	5
690	4098	136	34	17	chr3	13872069	13872834	-145726949	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-3932	3474	2697	5
690	1202	147	0	0	chr3	13874053	13874244	-145725539	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	131	5
690	2993	42	3	0	chr3	13874487	13874843	-145724940	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	5
690	305	260	99	66	chr3	13875213	13875394	-145724389	-	RLTR16	LTR	ERVK	-291	214	28	5
690	285	333	73	26	chr3	13877472	13877623	-145722160	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-444	183	26	5
690	460	208	0	33	chr3	13879815	13879943	-145719840	-	RLTR26	LTR	ERVK	-693	116	1	5
690	3279	171	5	12	chr3	13879945	13880518	-145719265	-	RMER12B	LTR	ERVK	-835	569	1	5
690	1469	251	63	6	chr3	13882359	13882723	-145717060	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	37	5
690	587	240	45	4	chr3	13882844	13883069	-145716714	+	RMER19B	LTR	ERVK	6	180	-722	5
690	2644	37	6	39	chr3	13883882	13884220	-145715563	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	5
690	5032	65	15	49	chr3	13884222	13884936	-145714847	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5790	5
690	1180	72	0	0	chr3	13888405	13888558	-145711225	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-678	5803	5651	5
690	2618	76	0	3	chr3	13888551	13888894	-145710889	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4781	1700	1359	5
690	4536	74	26	30	chr3	13888894	13889551	-145710232	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	9	5
690	2684	31	6	39	chr3	13889552	13889890	-145709893	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	5
690	2805	57	2	108	chr3	13892997	13893431	-145706352	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	5
691	580	122	0	0	chr3	13905246	13905336	-145694447	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	270	5
691	302	203	16	0	chr3	13905333	13905397	-145694386	+	RMER6D	LTR	ERVK	49	113	-607	5
691	411	208	0	0	chr3	13905423	13905500	-145694283	-	RLTR23	LTR	ERV1	-346	84	8	5
691	859	212	127	31	chr3	13905494	13905723	-145694060	+	MTC	LTR	MaLR	170	420	-1	5
691	1004	332	25	20	chr3	13905862	13906218	-145693565	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	358	-21	5
691	321	303	139	62	chr3	13927368	13927576	-145672207	+	MLT1D	LTR	MaLR	127	350	-155	5
691	231	326	68	8	chr3	13937830	13937963	-145661820	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-397	1451	1311	6
691	545	368	26	52	chr3	13940695	13941042	-145658741	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-5	360	23	6
691	2291	135	40	20	chr3	13949416	13949816	-145649967	+	MTC	LTR	MaLR	6	413	-8	6
691	1249	280	61	58	chr3	13955512	13955707	-145644076	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	207	6
691	1249	280	61	58	chr3	13955757	13955971	-145643812	-	MTD	LTR	MaLR	-213	206	2	6
691	1383	218	66	69	chr3	13956365	13956744	-145643039	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	378	1	6
691	1008	236	42	141	chr3	13956809	13957037	-145642746	+	ORR1B2	LTR	MaLR	48	289	-78	6
691	1008	236	42	141	chr3	13957206	13957259	-145642524	+	ORR1B2	LTR	MaLR	290	312	-55	6
691	1008	236	42	141	chr3	13957301	13957373	-145642410	+	ORR1B2	LTR	MaLR	313	367	0	6
691	2057	214	70	14	chr3	13957373	13957862	-145641921	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-30	1479	964	6
691	1603	189	101	20	chr3	13957862	13958218	-145641565	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	23	6
691	2231	270	95	48	chr3	13958365	13959162	-145640621	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-535	835	1	6
691	1482	155	63	92	chr3	13959166	13959501	-145640282	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	35	6
691	1572	218	110	3	chr3	13977093	13977466	-145622317	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	5	6
691	285	324	99	117	chr3	13980682	13980955	-145618828	+	ORR1E	LTR	MaLR	81	348	-11	6
691	291	236	192	41	chr3	13994872	13995018	-145604765	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	168	-197	6
691	257	294	0	56	chr3	13995277	13995349	-145604434	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-85	323	256	6
691	427	268	78	8	chr3	13995348	13995476	-145604307	+	MLT1A0	LTR	MaLR	166	302	-63	6
691	305	329	54	46	chr3	14007011	14007302	-145592481	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-1002	391	99	7
691	231	311	122	29	chr3	14013696	14013835	-145585948	-	RMER2	LTR	ERV1	-32	535	384	1
691	1258	232	34	91	chr3	14017444	14017851	-145581932	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	2
691	336	333	56	56	chr3	14022509	14022706	-145577077	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-2	567	371	3
691	301	300	77	39	chr3	14023223	14023379	-145576404	-	MLT1D	LTR	MaLR	-65	440	279	3
86	1481	211	83	21	chr3	14024539	14024878	-145574905	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	40	399	-8	3
692	2857	175	62	44	chr3	14034856	14034870	-145564913	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	679	4
692	2857	175	62	44	chr3	14034920	14035514	-145564269	-	RLTR17	LTR	ERVK	-14	678	73	4
692	1838	146	8	110	chr3	14037583	14037946	-145561837	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	5
692	265	305	132	9	chr3	14040160	14040266	-145559517	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-174	210	92	5
692	1837	191	8	35	chr3	14040787	14041161	-145558622	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-3	364	1	6
692	2893	210	77	48	chr3	14049098	14049898	-145549885	-	RMER13B	LTR	ERVK	-9	899	1	7
692	727	235	68	40	chr3	14050647	14050895	-145548888	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	255	-273	7
692	241	324	14	54	chr3	14051017	14051164	-145548619	+	RLTR11A	LTR	ERVK	287	427	-26	7
692	478	233	78	52	chr3	14051727	14051881	-145547902	-	MER67C	LTR	ERV1	-270	441	284	7
692	302	316	137	0	chr3	14052339	14052478	-145547305	-	MTE-int	LTR	MaLR	-48	1532	1375	7
692	649	342	134	68	chr3	14052733	14053361	-145546422	-	MTE-int	LTR	MaLR	-652	928	260	7
692	238	293	128	50	chr3	14053692	14053998	-145545785	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	45	7
692	310	287	30	69	chr3	14061177	14061308	-145538475	-	MER67C	LTR	ERV1	-581	130	5	7
692	3883	250	89	29	chr3	14061862	14062300	-145537483	-	RMER12	LTR	ERVK	-10	1312	755	8
692	3883	170	62	45	chr3	14062338	14063052	-145536731	-	RMER12	LTR	ERVK	-568	754	1	8
692	776	324	58	38	chr3	14064263	14064609	-145535174	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	1	8
692	487	219	97	41	chr3	14064614	14064809	-145534974	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-7	1363	1158	8
692	483	239	134	52	chr3	14064799	14064971	-145534812	-	ORR1E	LTR	MaLR	-168	191	6	8
692	3979	187	110	28	chr3	14066438	14067275	-145532508	-	RMER13B	LTR	ERVK	-2	906	1	9
692	2713	182	31	7	chr3	14072124	14072671	-145527112	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-1	560	1	9
692	674	335	192	0	chr3	14078299	14078606	-145521177	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	1	1
692	3269	43	5	0	chr3	14100304	14100698	-145499085	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
692	307	272	81	62	chr3	14102418	14102579	-145497204	+	RLTR11B	LTR	ERVK	288	468	-60	1
692	566	295	131	60	chr3	14103061	14103375	-145496408	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	24	1
692	1857	166	42	12	chr3	14104070	14104406	-145495377	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	1
692	569	141	235	7	chr3	14109988	14110124	-145489659	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	937	1
692	226	244	89	89	chr3	14110380	14110470	-145489313	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-203	825	736	1
692	886	170	120	16	chr3	14110579	14110770	-145489013	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-175	853	643	1
692	2577	179	36	52	chr3	14110769	14111292	-145488491	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-586	517	3	1
692	3306	41	2	2	chr3	14111727	14112122	-145487661	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	395	-1	1
692	629	324	31	14	chr3	14117001	14117223	-145482560	-	RMER15	LTR	ERVL	-43	532	307	1
692	320	348	86	0	chr3	14119265	14119452	-145480331	-	MLT1B	LTR	MaLR	-187	203	1	1
692	3548	184	39	28	chr3	14123733	14124579	-145475204	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	1
692	1440	171	8	31	chr3	14134612	14134872	-145464911	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	177	1
692	1306	147	46	116	chr3	14134861	14135145	-145464638	-	RLTR23	LTR	ERV1	-157	273	10	1
692	459	309	79	22	chr3	14137932	14138210	-145461573	-	MER67D	LTR	ERV1	-173	341	48	1
692	511	189	21	57	chr3	14149882	14150022	-145449761	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3910	1081	947	1
692	261	229	15	161	chr3	14153214	14153344	-145446439	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	294	2
692	234	283	119	20	chr3	14153411	14153512	-145446271	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-214	160	50	2
693	1913	137	38	6	chr3	14161244	14161561	-145438222	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
693	256	220	20	0	chr3	14161894	14161944	-145437839	+	RLTR23	LTR	ERV1	380	430	0	2
693	299	243	40	26	chr3	14170006	14170082	-145429701	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-433	135	59	2
693	309	326	69	48	chr3	14173379	14173524	-145426259	-	LTR40c	LTR	ERVL	-315	150	3	2
693	343	262	65	9	chr3	14174204	14174312	-145425471	+	ORR1E	LTR	MaLR	84	197	-162	2
693	868	269	101	52	chr3	14182861	14183268	-145416515	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	427	-54	2
693	1226	229	173	41	chr3	14183974	14184171	-145415612	-	RLTR33	LTR	ERVK	-85	593	404	2
693	1226	229	173	41	chr3	14184195	14184366	-145415417	-	RLTR33	LTR	ERVK	-275	403	177	2
693	310	273	40	40	chr3	14184778	14184904	-145414879	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-507	521	396	2
693	427	240	29	39	chr3	14184904	14185008	-145414775	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1828	4309	4207	2
693	1200	235	65	62	chr3	14185232	14185649	-145414134	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1927	4210	3793	2
693	383	257	86	34	chr3	14185663	14185897	-145413886	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2504	3633	3388	2
693	430	306	47	12	chr3	14186021	14186193	-145413590	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2944	3193	3016	2
693	771	273	77	130	chr3	14186330	14186847	-145412936	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	490	-38	2
693	2224	95	20	178	chr3	14186865	14187365	-145412418	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	2
693	302	167	0	82	chr3	14187460	14187545	-145412238	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4791	1346	1269	2
693	235	311	0	0	chr3	14188941	14189002	-145410781	-	MTC-int	LTR	MaLR	-715	543	483	2
693	792	168	85	70	chr3	14189011	14189210	-145410573	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4971	1166	965	2
693	2647	79	82	114	chr3	14189312	14189810	-145409973	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	2
693	4888	130	36	62	chr3	14190992	14191918	-145407865	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	2
693	1886	255	101	30	chr3	14192585	14193327	-145406456	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5167	970	141	2
693	1151	233	170	39	chr3	14193536	14193894	-145405889	-	RLTR33	LTR	ERVK	-109	569	165	2
693	1454	254	67	27	chr3	14195207	14195579	-145404204	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	33	2
693	1695	158	24	55	chr3	14205484	14205812	-145393971	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	2
693	460	343	17	56	chr3	14207423	14207697	-145392086	+	RMER20B	LTR	ERVK	168	419	-223	2
693	398	269	62	0	chr3	14214262	14214446	-145385337	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1383	1478	-6300	2
693	1278	333	16	24	chr3	14215584	14216076	-145383707	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3536	4023	-1040	2
693	1324	238	93	3	chr3	14217231	14217576	-145382207	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	378	0	2
693	3805	262	60	38	chr3	14217576	14218219	-145381564	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1	652	-718	2
693	3805	262	60	38	chr3	14218254	14218951	-145380832	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	653	1370	0	2
693	1608	196	58	69	chr3	14218951	14219330	-145380453	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	375	-3	2
693	4941	133	51	32	chr3	14221570	14222455	-145377328	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	2
693	3977	199	27	50	chr3	14224454	14225516	-145374267	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-66	8893	7856	2
693	277	352	48	77	chr3	14225581	14225747	-145374036	-	RMER4A	LTR	ERVK	-13	453	288	2
693	277	352	48	77	chr3	14225988	14226030	-145373753	-	RMER4A	LTR	ERVK	-179	287	251	2
693	696	259	12	6	chr3	14228263	14228434	-145371349	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1489	5061	4890	2
693	3213	157	49	54	chr3	14229437	14230051	-145369732	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	32	2
693	312	106	0	0	chr3	14230428	14230475	-145369308	-	RLTR26	LTR	ERVK	-595	47	1	2
693	632	257	78	73	chr3	14230786	14231143	-145368640	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	2
693	7772	268	25	29	chr3	14231143	14234418	-145365365	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	0	6542	3170	2
693	443	233	17	0	chr3	14234466	14234582	-145365201	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6403	139	22	2
693	273	239	21	42	chr3	14234627	14234723	-145365060	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	266	2
693	2707	86	15	132	chr3	14234734	14235272	-145364511	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
693	55557	10	1	5	chr3	14235272	14241769	-145358014	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	2
693	2707	86	15	132	chr3	14241769	14242307	-145357476	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
693	564	292	39	62	chr3	14242307	14242566	-145357217	-	RLTR10D	LTR	ERVK	-106	253	1	2
693	2561	43	6	6	chr3	14242949	14243275	-145356508	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	32	2
693	2310	267	70	48	chr3	14243469	14244122	-145355661	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1647	4903	4226	2
693	2310	267	70	48	chr3	14244149	14244584	-145355199	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2325	4225	3791	2
693	6241	57	29	0	chr3	14244679	14245464	-145354319	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	2
693	377	338	38	43	chr3	14246497	14246707	-145353076	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	696	904	-585	2
693	482	352	63	37	chr3	14246754	14247102	-145352681	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	1013	1369	-120	2
693	348	216	115	18	chr3	14247229	14247342	-145352441	+	MLT1F1	LTR	MaLR	96	219	-350	2
693	279	332	191	20	chr3	14247358	14247604	-145352179	+	MLT1F1	LTR	MaLR	279	566	-3	2
693	2824	90	19	49	chr3	14249577	14250008	-145349775	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	3	420	0	3
693	1799	283	50	28	chr3	14250048	14250913	-145348870	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3096	3979	-1427	3
693	1985	299	40	20	chr3	14251148	14252134	-145347649	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3984	4988	-418	3
693	451	115	0	0	chr3	14252724	14252785	-145346998	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-748	61	1	3
693	2147	109	88	26	chr3	14254782	14255167	-145344616	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	3
693	227	283	128	160	chr3	14264331	14264613	-145335170	+	MLT1J	LTR	MaLR	112	384	-128	3
693	245	268	39	67	chr3	14275890	14275994	-145323789	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	274	3
693	1766	104	0	0	chr3	14278297	14278547	-145321236	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	250	-1558	3
693	293	152	0	0	chr3	14278731	14278790	-145320993	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2355	2413	-3724	3
693	3196	164	41	2	chr3	14280164	14280725	-145319058	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-1215	5704	5122	3
693	14795	161	29	7	chr3	14280721	14283376	-145316407	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-1971	4948	2235	3
86	1583	175	105	23	chr3	14286563	14286914	-145312869	-	RMER10A	LTR	ERVL	-1	441	62	3
694	2037	212	37	98	chr3	14288790	14289328	-145310455	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	505	-11	3
694	1928	175	21	3	chr3	14295955	14296282	-145303501	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	333	-770	3
694	1430	291	101	26	chr3	14312198	14312302	-145287481	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	531	3
694	1430	251	83	25	chr3	14312382	14312842	-145286941	-	RLTR26	LTR	ERVK	-112	530	5	3
694	794	170	6	91	chr3	14312856	14312906	-145286877	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-2	6917	6874	3
694	1431	147	137	124	chr3	14312906	14313294	-145286489	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	3
694	794	170	6	91	chr3	14313294	14313346	-145286437	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-46	6873	6826	3
694	4050	63	62	6	chr3	14313346	14313876	-145285907	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	3
694	794	170	6	91	chr3	14313876	14313947	-145285836	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-94	6825	6758	3
694	771	135	128	0	chr3	14314007	14314148	-145285635	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-154	6765	6607	3
694	2609	205	33	24	chr3	14314155	14314664	-145285119	-	RMER13A	LTR	ERVK	-237	669	1	3
694	716	297	50	45	chr3	14318747	14319145	-145280638	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-566	4433	4034	3
694	357	272	19	10	chr3	14340008	14340112	-145259671	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	362	466	-2772	3
694	836	301	36	52	chr3	14340185	14340606	-145259177	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	736	1149	-3842	3
694	5180	271	28	26	chr3	14340638	14342198	-145257585	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1121	2682	-2309	3
694	386	331	29	47	chr3	14342397	14342841	-145256942	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3639	4074	-3017	3
694	1684	344	26	15	chr3	14343775	14344657	-145255126	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3902	4793	-198	3
694	254	320	61	69	chr3	14344713	14344844	-145254939	+	RMER4B	LTR	ERVK	347	476	-109	3
694	1889	227	8	18	chr3	14352497	14352781	-145247002	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	284	-110	4
694	773	223	151	42	chr3	14352781	14353113	-145246670	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	4
694	1889	227	8	18	chr3	14353113	14353218	-145246565	+	ORR1B1	LTR	MaLR	285	386	-8	4
694	320	294	62	0	chr3	14353262	14353456	-145246327	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1472	4289	3977	4
694	5268	120	12	33	chr3	14354114	14355906	-145243877	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1742	3402	-2004	4
694	6062	150	11	40	chr3	14355875	14356947	-145242836	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6127	7167	-239	4
694	342	273	249	34	chr3	14356947	14357281	-145242502	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	127	531	-371	4
694	478	53	25	74	chr3	14357284	14357365	-145242418	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7327	7403	-3	4
694	857	213	22	116	chr3	14357367	14357722	-145242061	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
694	783	246	50	104	chr3	14358995	14359276	-145240507	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	257	-113	4
694	355	302	101	48	chr3	14359816	14360084	-145239699	+	MTE-int	LTR	MaLR	1157	1438	-142	4
694	394	248	116	45	chr3	14360523	14360747	-145239036	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	935	1174	-84	4
694	266	214	89	11	chr3	14360918	14361008	-145238775	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1162	1258	0	4
694	3408	30	5	0	chr3	14361058	14361452	-145238331	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
694	1392	237	74	11	chr3	14361506	14361869	-145237914	+	MTD	LTR	MaLR	20	405	-14	4
694	714	354	54	23	chr3	14372210	14372518	-145227265	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	345	-34	4
694	1286	167	97	124	chr3	14389671	14390075	-145209708	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	4
694	3023	37	0	3	chr3	14393597	14393952	-145205831	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	354	-3	4
694	9133	121	11	24	chr3	14393953	14395585	-145204198	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	18	1982	-5698	4
694	3272	76	11	0	chr3	14395562	14396009	-145203774	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	2238	2689	-4991	4
694	2739	117	26	33	chr3	14396138	14396790	-145202993	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6984	7581	0	4
694	3029	56	0	0	chr3	14396790	14397147	-145202636	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	4
694	2491	199	122	21	chr3	14400846	14401562	-145198221	+	RLTR25B	LTR	ERVK	55	858	-170	4
694	257	234	47	156	chr3	14401903	14402095	-145197688	+	RLTR25B	LTR	ERVK	834	1004	-99	4
694	1824	132	15	66	chr3	14410308	14410642	-145189141	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	5	4
695	259	155	32	65	chr3	14420556	14420618	-145179165	+	RLTR19B	LTR	ERVK	1	60	-446	4
695	1158	188	0	24	chr3	14420601	14420814	-145178969	+	RLTR19B	LTR	ERVK	508	715	0	4
695	1882	122	54	13	chr3	14421928	14422244	-145177539	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
695	745	273	67	73	chr3	14423610	14423938	-145175845	-	RMER20B	LTR	ERVK	-68	559	234	4
695	699	360	34	8	chr3	14426108	14426424	-145173359	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	345	-34	4
695	3710	159	49	57	chr3	14429134	14430209	-145169574	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	1023	0	4
695	904	136	44	22	chr3	14430212	14430392	-145169391	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3	186	-5622	4
695	3489	124	14	59	chr3	14430669	14431463	-145168320	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	186	787	-5021	4
695	4934	111	69	9	chr3	14431454	14432329	-145167454	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2494	3420	-3986	4
695	348	171	0	26	chr3	14432335	14432413	-145167370	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	3278	3353	-2053	4
695	4397	162	57	9	chr3	14432416	14433301	-145166482	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	4463	5389	-419	4
695	1529	141	4	0	chr3	14433301	14433550	-145166233	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5529	5778	-30	4
695	3724	148	45	60	chr3	14433565	14434638	-145165145	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	1023	0	4
695	282	368	24	77	chr3	14441738	14441947	-145157836	+	RMER12	LTR	ERVK	1010	1207	-115	4
695	1696	143	24	63	chr3	14443078	14443413	-145156370	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	4
695	2636	105	25	10	chr3	14445951	14446354	-145153429	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	5
695	368	85	17	0	chr3	14446373	14446432	-145153351	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-16	7390	7331	5
695	2286	179	27	33	chr3	14446646	14447271	-145152512	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1181	6225	5848	5
695	10775	95	4	1	chr3	14453038	14454542	-145145241	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1549	5857	4349	5
695	3867	111	57	7	chr3	14471413	14471848	-145127935	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3041	4365	3933	5
695	3867	111	57	7	chr3	14471946	14472129	-145127654	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3474	3932	3717	5
695	1136	236	77	15	chr3	14482484	14482757	-145117026	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	131	5
695	3845	63	2	8	chr3	14484625	14485124	-145114659	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-7	496	1	5
695	4982	137	10	21	chr3	14493617	14494481	-145105302	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	5
695	362	308	92	8	chr3	14498852	14498983	-145100800	-	MLT1H	LTR	MaLR	-377	172	31	5
695	1322	167	37	0	chr3	14500302	14500547	-145099236	+	RMER6C	LTR	ERVK	437	690	0	1
695	235	193	85	34	chr3	14506585	14506644	-145093139	-	MTC	LTR	MaLR	0	407	346	1
695	1012	168	70	20	chr3	14507715	14507916	-145091867	-	MTC	LTR	MaLR	-210	211	1	1
695	1814	131	74	0	chr3	14509012	14509309	-145090474	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	2
695	276	302	69	80	chr3	14510192	14510480	-145089303	+	RLTR15	LTR	ERVK	50	334	-25	2
695	414	320	65	103	chr3	14522972	14523484	-145076299	-	RLTR40	LTR	ERVK	-276	541	50	3
695	680	128	0	9	chr3	14525179	14525289	-145074494	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-275	109	1	3
695	1323	225	116	57	chr3	14525507	14525946	-145073837	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1108	4
695	2005	142	12	12	chr3	14525946	14526267	-145073516	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	4
695	4732	164	112	100	chr3	14526302	14527073	-145072710	-	RMER12B	LTR	ERVK	-153	1251	489	4
695	4732	164	112	100	chr3	14527422	14527886	-145071897	-	RMER12B	LTR	ERVK	-916	488	1	4
695	335	286	43	26	chr3	14528360	14528475	-145071308	-	RLTR16	LTR	ERVK	-349	156	40	4
695	1922	154	7	101	chr3	14537970	14538375	-145061408	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	5
696	337	304	86	23	chr3	14573123	14573298	-145026485	+	MLT1A	LTR	MaLR	189	374	0	1
696	524	272	102	75	chr3	14582050	14582304	-145017479	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	262	-128	1
696	840	251	68	107	chr3	14585286	14585566	-145014217	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	288	-82	1
696	840	251	68	107	chr3	14585594	14585630	-145014153	+	ORR1D2	LTR	MaLR	289	297	-73	1
696	840	251	68	107	chr3	14585765	14585830	-145013953	+	ORR1D2	LTR	MaLR	298	368	-2	1
696	1003	264	146	15	chr3	14613134	14613469	-144986314	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	1
696	1914	103	84	65	chr3	14613731	14614054	-144985729	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
696	1715	210	35	3	chr3	14614228	14614842	-144984941	-	RLTR33	LTR	ERVK	-1	677	3	1
696	3984	131	80	41	chr3	14616916	14617569	-144982214	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	1
696	2088	186	13	67	chr3	14618593	14619027	-144980756	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	415	-27	1
696	1097	181	21	237	chr3	14619027	14619550	-144980233	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	1
696	2088	186	13	67	chr3	14619550	14619577	-144980206	+	RMER10A	LTR	ERVL	416	437	-5	1
696	252	217	33	0	chr3	14620329	14620389	-144979394	-	MTD	LTR	MaLR	-33	386	325	1
696	442	299	79	23	chr3	14620728	14620924	-144978859	-	MTD	LTR	MaLR	-184	223	3	1
696	228	325	32	49	chr3	14621147	14621270	-144978513	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	548	428	1
696	519	343	71	21	chr3	14621785	14622110	-144977673	-	MLT1F	LTR	MaLR	-202	346	6	1
696	290	351	96	7	chr3	14622864	14622999	-144976784	-	LTR41B	LTR	ERVL	-208	550	404	1
696	1914	133	3	143	chr3	14623521	14623899	-144975884	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	325	-4	1
696	1297	141	23	5	chr3	14623902	14624290	-144975493	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	447	-1516	1
696	553	149	103	0	chr3	14624286	14624393	-144975390	+	ORR1A4	LTR	MaLR	212	329	0	1
696	3188	162	108	100	chr3	14624615	14625413	-144974370	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	804	-13	1
696	360	250	121	58	chr3	14625611	14625785	-144973998	-	LTR41B	LTR	ERVL	-553	205	21	1
696	529	301	127	18	chr3	14626083	14626467	-144973316	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	501	-55	1
696	1532	251	59	42	chr3	14630272	14630680	-144969103	+	MTD	LTR	MaLR	3	417	-2	1
696	554	296	88	70	chr3	14632844	14633158	-144966625	-	RLTR17	LTR	ERVK	-308	384	32	1
696	1841	216	50	5	chr3	14636960	14637361	-144962422	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
696	1151	239	153	14	chr3	14637483	14637835	-144961948	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	6	1
696	267	95	24	0	chr3	14637798	14637840	-144961943	-	MT2A	LTR	ERVL	-490	43	1	1
696	271	98	24	0	chr3	14652411	14652452	-144947331	+	ORR1D2	LTR	MaLR	329	370	0	2
696	4314	25	0	0	chr3	14668462	14668944	-144930839	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
696	36165	32	16	14	chr3	14668945	14673474	-144926309	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	2	4690	0	2
696	4342	23	0	0	chr3	14673474	14673956	-144925827	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
696	928	244	177	68	chr3	14675923	14675997	-144923786	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	537	2
696	928	244	177	68	chr3	14676220	14676687	-144923096	-	MT2B	LTR	ERVL	-65	536	1	2
696	269	295	8	69	chr3	14677526	14677657	-144922126	-	RLTR24	LTR	ERV1	-402	127	5	2
697	244	304	70	35	chr3	14681343	14681599	-144918184	+	RMER17C	LTR	ERVK	84	348	-62	2
697	1353	157	182	36	chr3	14682578	14682936	-144916847	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
697	1655	190	99	27	chr3	14683536	14683948	-144915835	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	442	0	2
697	3183	35	174	7	chr3	14688054	14688461	-144911322	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
697	2264	146	12	29	chr3	14689461	14689877	-144909906	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
697	787	256	79	46	chr3	14690286	14690527	-144909256	+	MTEa	LTR	MaLR	1	249	-130	2
697	3178	180	42	44	chr3	14690532	14691217	-144908566	+	RLTR25A	LTR	ERVK	5	688	-415	2
697	516	147	167	28	chr3	14691714	14691894	-144907889	+	RLTR25A	LTR	ERVK	690	1027	-1	2
697	373	226	21	11	chr3	14691894	14691988	-144907795	+	MTEa	LTR	MaLR	243	337	-42	2
697	509	314	48	35	chr3	14692103	14692393	-144907390	+	MLT1D	LTR	MaLR	203	496	-9	2
697	2509	136	12	9	chr3	14694286	14694709	-144905074	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	424	-117	2
697	2677	46	9	6	chr3	14705950	14706276	-144893507	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	2
697	53137	40	17	24	chr3	14706277	14712874	-144886909	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	6479	-2	2
697	2771	31	9	3	chr3	14712876	14713201	-144886582	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	2
697	2912	23	2	187	chr3	14716338	14716814	-144882969	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
697	8136	41	1	3	chr3	14716826	14717786	-144881997	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	998	-989	2
697	373	271	31	8	chr3	14717850	14717980	-144881803	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1462	1594	-5987	2
697	8956	21	0	1	chr3	14718062	14719061	-144880722	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	990	1987	0	2
697	2912	23	2	187	chr3	14719061	14719537	-144880246	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
697	2138	50	4	0	chr3	14719549	14719809	-144879974	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	301	-1686	2
697	3153	68	2	0	chr3	14734736	14735131	-144864652	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
697	8513	57	8	2	chr3	14735131	14736222	-144863561	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
697	2995	67	18	0	chr3	14736222	14736611	-144863172	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
697	1333	264	13	6	chr3	14736817	14737134	-144862649	-	RLTR16	LTR	ERVK	-186	319	1	2
697	4575	107	25	28	chr3	14737575	14738326	-144861457	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	3	2
697	4706	55	3	2	chr3	14750556	14751142	-144848641	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	3
697	3373	33	5	0	chr3	14755334	14755728	-144844055	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
697	225	345	34	22	chr3	14759654	14759743	-144840040	-	MLT1G	LTR	MaLR	-264	327	238	3
697	497	246	48	32	chr3	14770932	14771058	-144828725	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7197	-209	3
697	253	256	93	47	chr3	14792612	14792698	-144807085	+	MLT1H2	LTR	MaLR	73	162	-327	3
697	629	296	58	11	chr3	14795870	14796061	-144803722	-	MLT1D	LTR	MaLR	-23	482	283	3
697	328	284	24	87	chr3	14796104	14796231	-144803552	-	MLT1D	LTR	MaLR	-365	140	22	3
697	1202	284	65	30	chr3	14808228	14808631	-144791152	-	MER74C	LTR	ERVL	-16	444	28	3
698	1208	110	35	36	chr3	14816866	14817127	-144782656	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-36	947	565	3
698	2307	130	8	155	chr3	14817127	14817611	-144782172	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-489	413	1	3
698	541	299	86	38	chr3	14818605	14818814	-144780969	+	MT2A	LTR	ERVL	170	388	-145	3
698	290	302	42	54	chr3	14829044	14829212	-144770571	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-52	322	157	4
698	2710	137	71	7	chr3	14838266	14838701	-144761082	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	463	-3	4
698	302	261	73	32	chr3	14843533	14843656	-144756127	-	RMER4B	LTR	ERVK	-451	134	7	4
698	2254	176	8	3	chr3	14844497	14844862	-144754921	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
698	1938	205	8	16	chr3	14850081	14850458	-144749325	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-4	374	1	4
698	478	207	121	0	chr3	14852053	14852164	-144747619	-	MTD	LTR	MaLR	-223	198	75	4
698	5193	121	16	41	chr3	14852229	14853130	-144746653	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	1	4
698	1163	232	41	106	chr3	14859374	14859586	-144740197	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	183	-227	4
698	1163	232	41	106	chr3	14859674	14859874	-144739909	+	RMER17C	LTR	ERVK	184	386	-24	4
698	238	322	120	27	chr3	14906249	14906399	-144693384	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	304	5
698	2102	140	70	42	chr3	14907357	14907760	-144692023	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	3	416	-4	5
698	545	285	39	124	chr3	14910281	14910693	-144689090	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	5
698	2933	54	23	13	chr3	14912626	14913022	-144686761	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
698	3212	163	72	39	chr3	14929162	14930151	-144669632	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	1023	1	5
698	8977	128	19	20	chr3	14937380	14938898	-144660885	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3969	1516	1	5
698	2930	130	12	33	chr3	14938898	14939383	-144660400	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	5
699	2037	122	48	0	chr3	14946802	14947114	-144652669	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
699	332	270	29	29	chr3	14950392	14950495	-144649288	-	MTD	LTR	MaLR	-311	108	6	5
699	243	308	40	107	chr3	14955023	14955172	-144644611	+	MLT1A1	LTR	MaLR	7	145	-263	5
699	1698	174	122	22	chr3	14956696	14957066	-144642717	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	5
699	322	274	30	119	chr3	14958263	14958532	-144641251	-	RMER17C	LTR	ERVK	-158	252	8	5
699	569	285	127	47	chr3	14959463	14959849	-144639934	-	RMER10A	LTR	ERVL	-25	417	1	5
699	758	215	121	15	chr3	14964640	14964838	-144634945	+	MTE2b	LTR	MaLR	18	236	-143	5
699	1236	167	125	100	chr3	14970187	14970357	-144629426	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	212	-198	5
699	1236	167	125	100	chr3	14970485	14970533	-144629250	+	RMER17C	LTR	ERVK	213	261	-149	5
699	1236	167	125	100	chr3	14970678	14970858	-144628925	+	RMER17C	LTR	ERVK	262	409	-1	5
699	877	267	118	47	chr3	14976392	14976730	-144623053	+	MTEb	LTR	MaLR	1	362	-17	6
699	1316	227	169	42	chr3	14980024	14980497	-144619286	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	6
699	595	289	97	40	chr3	14980509	14980736	-144619047	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	964	1203	-167	6
699	458	261	96	7	chr3	14987596	14987731	-144612052	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1224	1370	0	6
699	1538	222	62	3	chr3	14987731	14988067	-144611716	+	ORR1D2	LTR	MaLR	15	370	0	6
699	1444	196	155	36	chr3	14993847	14994233	-144605550	-	RLTR41	LTR	ERV1	-14	432	1	6
699	1813	224	87	42	chr3	14995432	14995927	-144603856	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	5	521	-56	6
699	2002	196	65	28	chr3	14998408	14998838	-144600945	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	6
699	587	215	43	119	chr3	15000726	15000911	-144598872	+	RLTR41	LTR	ERV1	7	177	-269	1
699	337	288	55	41	chr3	15004806	15004951	-144594832	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	534	680	0	6
699	2323	119	76	88	chr3	15006798	15007286	-144592497	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
699	552	331	107	13	chr3	15008584	15008967	-144590816	+	MER110A	LTR	ERV1	50	468	0	1
699	337	297	54	50	chr3	15016060	15016301	-144583482	-	RLTR15	LTR	ERVK	-67	292	51	2
699	1872	219	88	7	chr3	15019104	15019495	-144580288	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	412	-93	3
699	1872	219	88	7	chr3	15019538	15019602	-144580181	+	RLTR16	LTR	ERVK	413	493	-12	3
699	2237	120	3	3	chr3	15020785	15021112	-144578671	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
699	588	317	47	107	chr3	15025716	15026101	-144573682	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	366	-13	4
699	284	134	100	43	chr3	15035615	15035685	-144564098	+	RLTR25B	LTR	ERVK	429	502	-526	4
699	4156	134	86	12	chr3	15037367	15038053	-144561730	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	5
699	776	213	266	20	chr3	15042257	15042554	-144557229	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
699	3736	53	20	2	chr3	15046406	15046893	-144552890	+	LTRIS2	LTR	ERV1	69	564	0	5
699	267	257	40	0	chr3	15054156	15054230	-144545553	+	ORR1E	LTR	MaLR	271	347	-12	7
699	1943	145	61	28	chr3	15055405	15055801	-144543982	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	7
699	443	70	26	66	chr3	15055803	15055879	-144543904	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3	7403	7331	7
699	1784	196	146	8	chr3	15055879	15056352	-144543431	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-363	539	1	7
699	1533	139	8	4	chr3	15056369	15056615	-144543168	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-33	5775	5529	7
699	337	109	0	59	chr3	15056626	15056694	-144543089	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1172	6072	6009	7
699	1302	174	15	11	chr3	15056787	15057141	-144542642	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-977	6429	6127	7
699	4048	247	81	119	chr3	15057110	15057898	-144541885	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-1703	3141	2378	7
699	4048	247	81	119	chr3	15057921	15060398	-144539385	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-2467	2377	2	7
699	1736	143	122	35	chr3	15060400	15060776	-144539007	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	7
699	448	254	63	115	chr3	15063676	15063929	-144535854	+	RLTR40	LTR	ERVK	58	297	-520	8
699	230	304	96	71	chr3	15065122	15065320	-144534463	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-306	214	12	8
699	227	361	173	17	chr3	15065446	15065677	-144534106	+	RMER15	LTR	ERVL	295	561	-14	8
699	2039	199	35	8	chr3	15070527	15070921	-144528862	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	9
700	1149	284	103	8	chr3	15073794	15074174	-144525609	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-48	416	1	1
700	514	329	149	53	chr3	15094300	15094717	-144505066	+	MLT1E2	LTR	MaLR	94	550	-74	1
700	3958	161	72	28	chr3	15098751	15099739	-144500044	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	2	1
700	325	358	43	21	chr3	15101034	15101174	-144498609	+	ORR1E	LTR	MaLR	55	197	-162	1
700	457	347	43	56	chr3	15103013	15103381	-144496402	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	6	1
700	643	274	152	39	chr3	15105676	15105954	-144493829	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	348	1
700	643	274	152	39	chr3	15105986	15106068	-144493715	-	RLTR26	LTR	ERVK	-295	347	243	1
700	306	260	100	0	chr3	15106148	15106248	-144493535	-	RMER13B	LTR	ERVK	-794	114	5	1
700	354	204	272	29	chr3	15106658	15106725	-144493058	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-4	559	471	1
700	387	183	31	3	chr3	15106778	15106847	-144492936	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-93	470	373	1
700	328	301	114	61	chr3	15116471	15116602	-144483181	+	MLT1A0	LTR	MaLR	167	304	-61	1
700	247	331	150	16	chr3	15121830	15122017	-144477766	-	ORR1E	LTR	MaLR	-50	309	98	1
700	232	373	59	0	chr3	15123515	15123633	-144476150	+	MER21B	LTR	ERV1	104	228	-635	1
700	397	293	57	8	chr3	15123798	15123922	-144475861	+	MER21B	LTR	ERV1	469	598	-265	1
700	1033	182	83	53	chr3	15129189	15129396	-144470387	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-100	274	74	1
700	2877	94	38	36	chr3	15129396	15129870	-144469913	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
700	1033	182	83	53	chr3	15129870	15129928	-144469855	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-301	73	1	1
700	2893	36	2	158	chr3	15135989	15136451	-144463332	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
700	238	294	142	35	chr3	15146379	15146520	-144453263	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-252	156	1	2
700	284	186	62	125	chr3	15150796	15150898	-144448885	-	MTEa	LTR	MaLR	0	408	281	2
700	1046	281	71	89	chr3	15155093	15155488	-144444295	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	2
700	308	283	32	32	chr3	15155598	15155693	-144444090	-	MLT1I	LTR	MaLR	0	411	317	2
700	356	320	246	30	chr3	15158642	15158906	-144440877	-	MLT1F	LTR	MaLR	-53	495	175	2
700	653	181	58	7	chr3	15159000	15159139	-144440644	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	146	-481	2
700	8057	31	0	3	chr3	15159142	15160072	-144439711	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	3	929	0	2
700	1859	225	4	71	chr3	15160115	15160622	-144439161	+	RMER20B	LTR	ERVK	151	623	-4	2
700	440	170	89	75	chr3	15164487	15164633	-144435150	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2608	2755	-483	2
700	1476	198	43	113	chr3	15164979	15165395	-144434388	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	387	-11	2
700	1342	196	74	96	chr3	15167065	15167471	-144432312	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	2	2
700	544	54	0	13	chr3	15171180	15171255	-144428528	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-1024	74	1	2
700	3228	39	18	0	chr3	15171255	15171644	-144428139	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
700	1989	115	114	9	chr3	15171676	15172009	-144427774	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	2
700	303	297	171	43	chr3	15172078	15172289	-144427494	+	LTR16B	LTR	ERVL	223	460	-3	2
700	2029	155	15	3	chr3	15173766	15174103	-144425680	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	6	2
700	2383	194	33	47	chr3	15175055	15175148	-144424635	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	102	-414	2
700	3246	215	113	30	chr3	15175148	15175983	-144423800	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	5	2
700	2383	194	33	47	chr3	15175983	15176039	-144423744	+	RMER20A	LTR	ERVK	103	144	-372	2
700	2383	194	33	47	chr3	15176084	15176446	-144423337	+	RMER20A	LTR	ERVK	145	516	0	2
700	4498	180	51	34	chr3	15184366	15185212	-144414571	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	1	2
700	2312	217	73	16	chr3	15187260	15187804	-144411979	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	2
700	3242	53	0	2	chr3	15189733	15190130	-144409653	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
700	7591	85	38	2	chr3	15190130	15191190	-144408593	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
700	3152	53	5	2	chr3	15191190	15191585	-144408198	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
700	3381	197	89	11	chr3	15198651	15199401	-144400382	-	RLTR40	LTR	ERVK	-8	809	1	2
700	345	236	0	114	chr3	15201220	15201325	-144398458	+	MT2B	LTR	ERVL	165	257	-344	2
701	1191	290	72	25	chr3	15207243	15207689	-144392094	+	RMER5	LTR	ERV1	38	504	-30	2
701	283	270	89	113	chr3	15213812	15214025	-144385758	-	LTR37A	LTR	ERV1	-41	385	178	3
701	266	309	109	52	chr3	15214064	15214233	-144385550	+	MLT1D	LTR	MaLR	12	194	-311	3
701	266	309	109	52	chr3	15214304	15214363	-144385420	+	MLT1D	LTR	MaLR	195	253	-252	3
701	504	327	91	74	chr3	15215733	15216083	-144383700	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	4	3
701	580	324	93	18	chr3	15224210	15224490	-144375293	-	MER57D	LTR	ERV1	-53	358	58	3
701	2246	213	15	24	chr3	15225137	15225598	-144374185	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	457	-106	3
701	1838	297	76	88	chr3	15230248	15231052	-144368731	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	794	-66	3
701	297	229	198	9	chr3	15232082	15232188	-144367595	+	MLT1H	LTR	MaLR	424	549	0	3
701	379	306	178	64	chr3	15233042	15233530	-144366253	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-41	560	21	3
701	468	336	94	25	chr3	15237526	15237761	-144362022	+	MER21B	LTR	ERV1	426	676	-187	3
701	381	289	107	76	chr3	15239434	15239859	-144359924	+	MLT1C	LTR	MaLR	11	458	-9	3
701	516	220	10	52	chr3	15242388	15242529	-144357254	+	RMER20B	LTR	ERVK	28	161	-355	3
701	738	271	65	22	chr3	15242631	15242861	-144356922	+	RMER20B	LTR	ERVK	124	363	-264	3
701	1994	118	11	0	chr3	15245228	15245515	-144354268	+	RLTR9B	LTR	ERVK	72	361	-76	3
701	248	176	310	23	chr3	15246706	15246793	-144352990	+	RLTR20C	LTR	ERVK	49	160	-418	3
701	690	217	32	38	chr3	15246822	15246980	-144352803	+	RLTR20C	LTR	ERVK	367	523	-11	3
701	2982	183	70	16	chr3	15254651	15255351	-144344432	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	1379	-1463	3
701	858	241	99	83	chr3	15255351	15255610	-144344173	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	277	-91	3
701	2550	113	9	96	chr3	15255610	15256070	-144343713	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	0	420	1	3
701	858	241	99	83	chr3	15256070	15256172	-144343611	+	RLTR9A	LTR	ERVK	278	368	0	3
701	759	213	38	100	chr3	15256172	15256412	-144343371	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	707	931	-1395	3
701	1094	142	48	11	chr3	15256433	15256773	-144343010	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1102	1355	-971	3
701	3866	156	62	18	chr3	15256988	15257118	-144342665	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1346	1492	-834	3
701	3866	156	62	18	chr3	15257182	15257899	-144341884	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1493	2230	-96	3
701	958	239	28	75	chr3	15258242	15258580	-144341203	+	RLTR20C	LTR	ERVK	45	491	-87	3
701	441	240	163	31	chr3	15258618	15258684	-144341099	+	RLTR20C	LTR	ERVK	492	566	-12	3
701	293	369	10	0	chr3	15263894	15263997	-144335786	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	104	-255	3
701	410	330	110	16	chr3	15264871	15265053	-144334730	-	MTD	LTR	MaLR	-216	203	5	3
701	4436	60	11	2	chr3	15267188	15267743	-144332040	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	3
701	2865	44	3	3	chr3	15268679	15269024	-144330759	+	IAPLTR4	LTR	ERVK	1	345	0	3
701	1566	143	41	8	chr3	15269966	15270233	-144329550	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-51	276	1	3
701	1727	159	18	32	chr3	15270236	15270574	-144329209	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	109	3
701	2902	155	102	66	chr3	15274091	15275037	-144324746	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	902	0	3
701	389	351	53	0	chr3	15275973	15276124	-144323659	-	MTD	LTR	MaLR	-213	206	48	3
701	828	303	30	88	chr3	15281229	15281594	-144318189	+	MTE2a	LTR	MaLR	15	358	-21	3
701	517	320	32	43	chr3	15289692	15289878	-144309905	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	187	3
701	802	264	177	6	chr3	15291109	15291425	-144308358	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	3
701	323	296	80	0	chr3	15292894	15293019	-144306764	-	MLT1B	LTR	MaLR	-248	142	8	3
701	1966	161	3	3	chr3	15295862	15296180	-144303603	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	3
701	990	323	68	9	chr3	15296184	15296524	-144303259	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	362	-8	4
701	822	289	66	106	chr3	15296997	15297480	-144302303	+	RMER5	LTR	ERV1	24	487	-47	4
701	398	362	59	88	chr3	15298180	15298581	-144301202	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	404	-15	4
701	2145	99	74	6	chr3	15316919	15317243	-144282540	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
701	3103	66	13	0	chr3	15323098	15323493	-144276290	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
701	788	306	58	18	chr3	15331244	15331587	-144268196	+	MLT1B	LTR	MaLR	34	390	0	4
701	687	355	33	46	chr3	15332836	15333143	-144266640	+	MTE2a	LTR	MaLR	56	358	-21	4
701	381	354	65	16	chr3	15334149	15334333	-144265450	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	200	-219	4
701	2267	42	22	31	chr3	15335011	15335329	-144264454	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	315	-160	4
702	478	274	156	21	chr3	15340150	15340388	-144259395	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-46	313	37	4
702	551	330	94	14	chr3	15340391	15340603	-144259180	+	MTE2b	LTR	MaLR	151	379	0	4
702	1847	205	10	8	chr3	15341799	15342192	-144257591	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
702	586	326	77	4	chr3	15342643	15342902	-144256881	-	MLT1B	LTR	MaLR	-52	338	61	4
702	2964	67	36	0	chr3	15351456	15351842	-144247941	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
702	400	340	40	54	chr3	15357615	15357839	-144241944	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1102	4
702	2795	132	19	2	chr3	15358049	15358512	-144241271	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-993	855	385	4
702	1657	187	7	82	chr3	15360714	15361120	-144238663	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1453	395	35	4
702	3716	135	10	0	chr3	15366297	15366873	-144232910	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	3	4
702	647	130	171	6	chr3	15366874	15367044	-144232739	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5761	5564	4
702	6577	194	7	6	chr3	15367129	15368268	-144231515	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-365	5396	4257	4
702	10014	170	22	3	chr3	15368267	15370000	-144229783	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1523	3962	2196	4
702	3534	225	14	3	chr3	15370580	15371522	-144228261	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3452	2309	1237	4
702	493	150	53	14	chr3	15371522	15371656	-144228127	-	MT2B2	LTR	ERVL	-333	142	2	4
702	648	324	74	37	chr3	15378616	15378969	-144220814	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	368	-2	4
702	2464	85	122	8	chr3	15405201	15405579	-144194204	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	5
702	679	311	88	76	chr3	15405583	15406059	-144193724	+	RMER5	LTR	ERV1	52	533	-1	5
702	690	278	90	83	chr3	15406805	15407193	-144192590	+	MTE2a	LTR	MaLR	17	403	-16	5
702	2395	204	32	4	chr3	15412754	15413260	-144186523	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	520	-4	5
702	1079	278	207	49	chr3	15418132	15418154	-144181629	+	RMER12	LTR	ERVK	753	769	-553	5
702	1079	278	207	49	chr3	15418245	15418359	-144181424	+	RMER12	LTR	ERVK	770	963	-359	5
702	1079	278	207	49	chr3	15418428	15418782	-144181001	+	RMER12	LTR	ERVK	964	1322	0	5
702	755	316	44	47	chr3	15427049	15427345	-144172438	+	MTE2a	LTR	MaLR	61	355	-24	5
702	541	275	147	45	chr3	15437356	15437642	-144162141	+	MLT-int	LTR	MaLR	1400	1714	-21	5
702	446	270	79	79	chr3	15438537	15438790	-144160993	+	LTR48	LTR	ERV1	532	784	-3	5
702	996	313	27	18	chr3	15439948	15440283	-144159500	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	39	5
702	674	257	187	13	chr3	15440453	15440768	-144159015	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	5
702	1688	225	40	8	chr3	15440789	15441161	-144158622	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	388	-6	5
702	538	316	137	7	chr3	15441443	15441742	-144158041	-	MLT1B	LTR	MaLR	-52	338	1	5
702	904	181	13	124	chr3	15444091	15444324	-144155459	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	207	-404	5
702	2456	134	40	78	chr3	15449399	15449900	-144149883	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	5
702	1275	257	84	92	chr3	15451165	15451655	-144148128	+	RMER19C	LTR	ERVK	176	737	0	5
702	2017	33	0	0	chr3	15458849	15459094	-144140689	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-151	245	1	5
702	595	265	178	12	chr3	15464575	15464860	-144134923	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-24	354	12	5
702	313	275	0	32	chr3	15465026	15465120	-144134663	+	MTE2b	LTR	MaLR	289	379	0	5
87	1846	205	10	8	chr3	15466336	15466729	-144133054	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
703	585	312	85	12	chr3	15467167	15467426	-144132357	-	MLT1B	LTR	MaLR	-52	338	61	5
703	2931	70	36	0	chr3	15475973	15476359	-144123424	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
703	363	330	53	71	chr3	15481629	15481854	-144117929	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1102	6
703	2896	143	10	4	chr3	15482051	15482536	-144117247	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-993	855	368	6
703	1620	165	3	72	chr3	15484692	15485025	-144114758	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1453	395	86	6
703	3744	136	9	0	chr3	15490388	15490967	-144108816	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	6
703	265	79	0	0	chr3	15490967	15491005	-144108778	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	6
703	246	206	13	27	chr3	15491005	15491080	-144108703	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	6
703	308	73	91	0	chr3	15491086	15491141	-144108642	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-138	5623	5564	6
703	6551	189	14	6	chr3	15491226	15492357	-144107426	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-365	5396	4257	6
703	9752	174	24	6	chr3	15492356	15494092	-144105691	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1523	3962	2196	6
703	3611	224	11	5	chr3	15494673	15495618	-144104165	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3452	2309	1237	6
703	503	168	31	14	chr3	15495618	15495754	-144104029	-	MT2B2	LTR	ERVL	-333	142	2	6
703	590	310	77	37	chr3	15502726	15503078	-144096705	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	368	-2	2
703	707	317	12	16	chr3	15516418	15516665	-144083118	+	RMER15	LTR	ERVL	231	476	-99	1
703	1358	111	10	20	chr3	15536889	15537267	-144062516	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	2
703	712	308	86	75	chr3	15537271	15537748	-144062035	+	RMER5	LTR	ERV1	52	533	-1	2
703	707	276	89	83	chr3	15538485	15538882	-144060901	+	MTE2a	LTR	MaLR	10	403	-16	2
703	2428	200	32	4	chr3	15544517	15545023	-144054760	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	520	-4	3
703	2066	35	119	0	chr3	15547841	15548102	-144051681	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	292	0	3
703	1184	272	195	37	chr3	15549860	15549993	-144049790	+	RMER12	LTR	ERVK	758	963	-359	4
703	1184	272	195	37	chr3	15550037	15550391	-144049392	+	RMER12	LTR	ERVK	964	1322	0	4
703	826	315	40	47	chr3	15575593	15575893	-144023890	+	MTE2a	LTR	MaLR	61	358	-21	6
703	555	279	146	43	chr3	15584048	15584377	-144015406	+	MLT-int	LTR	MaLR	1352	1714	-21	7
703	419	262	153	32	chr3	15585348	15585537	-144014246	+	LTR48	LTR	ERV1	532	743	-44	7
703	1028	307	27	18	chr3	15586755	15587090	-144012693	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	39	8
703	671	242	188	28	chr3	15587261	15587580	-144012203	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	8
703	1620	226	40	35	chr3	15587583	15587959	-144011824	+	ORR1B1	LTR	MaLR	14	391	-3	8
703	540	309	149	7	chr3	15588246	15588542	-144011241	-	MLT1B	LTR	MaLR	-52	338	1	8
703	914	181	13	124	chr3	15590899	15591132	-144008651	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	207	-404	8
703	2468	122	48	84	chr3	15596210	15596710	-144003073	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	8
704	795	289	85	13	chr3	15597973	15598441	-144001342	+	RMER19C	LTR	ERVK	176	698	-39	8
704	231	282	34	8	chr3	15598611	15598706	-144001077	+	MTC	LTR	MaLR	272	407	-14	8
704	595	265	178	12	chr3	15663247	15663532	-143936251	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-24	354	12	1
704	313	275	0	32	chr3	15663698	15663792	-143935991	+	MTE2b	LTR	MaLR	289	379	0	1
704	1846	205	10	8	chr3	15665037	15665430	-143934353	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
704	596	316	85	12	chr3	15665875	15666134	-143933649	-	MLT1B	LTR	MaLR	-52	338	61	1
704	2912	75	36	0	chr3	15674758	15675144	-143924639	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
704	392	338	36	53	chr3	15680924	15681149	-143918634	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1102	1
704	2924	128	11	2	chr3	15681346	15681814	-143917969	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-993	855	384	1
704	1602	165	3	72	chr3	15684005	15684338	-143915445	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1453	395	86	1
704	3744	136	9	0	chr3	15689708	15690287	-143909496	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	1
704	265	79	0	0	chr3	15690287	15690325	-143909458	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	1
704	246	206	13	27	chr3	15690325	15690400	-143909383	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	1
704	7024	196	40	4	chr3	15690406	15691726	-143908057	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-138	5623	4257	1
704	9909	172	22	5	chr3	15691725	15693462	-143906321	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1523	3962	2196	1
704	226	324	68	34	chr3	15693891	15694038	-143905745	+	RLTR41	LTR	ERV1	264	415	-31	1
704	3571	226	11	5	chr3	15694067	15695012	-143904771	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3452	2309	1237	1
704	503	168	31	14	chr3	15695012	15695148	-143904635	-	MT2B2	LTR	ERVL	-333	142	2	1
704	556	330	77	31	chr3	15702115	15702465	-143897318	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	368	-2	1
704	1358	111	10	20	chr3	15726913	15727291	-143872492	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
704	601	335	65	60	chr3	15727295	15727775	-143872008	+	RMER5	LTR	ERV1	52	533	-1	1
10	688	282	88	80	chr3	15728520	15728908	-143870875	+	MTE2a	LTR	MaLR	16	403	-16	1
705	2249	218	32	4	chr3	15734500	15735006	-143864777	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	520	-4	1
705	230	281	51	20	chr3	15737574	15737672	-143862111	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	405	1
705	1300	273	181	35	chr3	15739993	15740486	-143859297	+	RMER12	LTR	ERVK	758	1322	0	1
705	818	328	27	33	chr3	15749051	15749351	-143850432	+	MTE2a	LTR	MaLR	61	358	-21	1
705	611	284	144	39	chr3	15753073	15753406	-143846377	+	MLT1A-int	LTR	MaLR	1346	1713	-22	2
705	274	291	66	127	chr3	15753406	15753516	-143846267	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	112	-262	2
705	274	291	66	127	chr3	15754019	15754045	-143845738	+	MLT1A	LTR	MaLR	113	128	-246	2
705	274	291	66	127	chr3	15754196	15754255	-143845528	+	MLT1A	LTR	MaLR	129	184	-190	2
705	415	271	127	98	chr3	15754432	15754677	-143845106	+	LTR48	LTR	ERV1	533	784	-3	2
705	1010	307	27	18	chr3	15755835	15756170	-143843613	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	39	2
705	657	255	191	16	chr3	15756341	15756656	-143843127	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	2
705	1572	211	45	16	chr3	15756677	15757053	-143842730	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	391	-3	2
705	413	319	96	22	chr3	15757341	15757637	-143842146	-	MLT1B	LTR	MaLR	-52	338	1	2
705	2568	130	58	26	chr3	15761271	15761738	-143838045	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	2
705	1291	258	79	92	chr3	15763008	15763500	-143836283	+	RMER19C	LTR	ERVK	175	677	-60	2
705	2654	61	12	0	chr3	15784528	15784870	-143814913	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	2
705	474	35	0	0	chr3	15784870	15784927	-143814856	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1736	2
705	225	238	0	91	chr3	15791180	15791268	-143808515	-	LTR87	LTR	ERVL?	-467	157	78	2
705	1926	204	76	170	chr3	15795905	15796577	-143803206	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	609	-2	2
705	2337	202	26	16	chr3	15796579	15797081	-143802702	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	1	507	-5273	2
705	1010	291	23	20	chr3	15797081	15797382	-143802401	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	302	-203	2
705	4024	211	22	9	chr3	15797646	15798534	-143801249	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	501	1400	-4380	2
705	842	216	170	47	chr3	15802784	15803148	-143796635	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	2
705	4011	158	57	70	chr3	15803165	15804448	-143795335	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	17	2085	-5321	2
705	3617	161	66	67	chr3	15804473	15805436	-143794347	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2012	3441	-3965	2
705	6901	143	20	29	chr3	15805690	15807895	-143791888	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6101	7143	-263	2
705	817	196	221	65	chr3	15807896	15808279	-143791504	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	93	537	-365	2
705	3464	169	91	103	chr3	15815626	15816532	-143783251	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	12	2
705	905	327	61	6	chr3	15819039	15819399	-143780384	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	380	-10	2
705	573	331	55	58	chr3	15820678	15820935	-143778848	+	MTE2a	LTR	MaLR	58	313	-66	2
705	347	117	3	0	chr3	15821379	15821438	-143778345	+	MTE2a	LTR	MaLR	288	358	-21	2
705	3277	46	5	0	chr3	15835527	15835921	-143763862	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
705	4440	112	17	40	chr3	15843203	15843957	-143755826	+	RMER17D	LTR	ERVK	2	738	-151	3
705	589	89	0	0	chr3	15844543	15844622	-143755161	+	RMER17D	LTR	ERVK	188	266	-623	3
705	547	142	319	0	chr3	15845594	15845735	-143754048	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3052	2433	2248	3
705	5526	171	14	1	chr3	15845736	15846718	-143753065	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3460	2301	1307	3
705	519	250	56	28	chr3	15846718	15846862	-143752921	-	MT2B2	LTR	ERVL	-435	149	2	3
705	478	338	62	23	chr3	15847695	15848049	-143751734	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	370	0	3
705	1918	43	0	0	chr3	15848625	15848860	-143750923	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-161	235	1	3
705	1029	282	68	78	chr3	15850636	15851124	-143748659	+	RMER5	LTR	ERV1	52	534	0	3
705	310	230	38	45	chr3	15852735	15852867	-143746916	+	RLTR43A	LTR	ERVK	201	331	-33	3
705	4584	157	34	12	chr3	15854871	15855708	-143744075	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	3
705	7140	110	8	4	chr3	15856830	15857849	-143741934	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	3
706	582	148	93	54	chr3	15863906	15864224	-143735559	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	475	211	3
706	1392	115	39	0	chr3	15871047	15871240	-143728543	+	BGLII	LTR	ERVK	1	194	-227	3
706	1392	115	39	0	chr3	15871323	15871342	-143728441	+	BGLII	LTR	ERVK	195	219	-202	3
706	1392	115	39	0	chr3	15871518	15871538	-143728245	+	BGLII	LTR	ERVK	220	240	-181	3
706	2054	191	119	72	chr3	15871576	15872212	-143727571	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1014	1679	-1163	3
706	2611	226	33	47	chr3	15872230	15873160	-143726623	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1925	2841	-1	3
706	2598	107	47	0	chr3	15873161	15873563	-143726220	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	3
706	1477	203	0	0	chr3	15876175	15876431	-143723352	+	MTC	LTR	MaLR	53	308	-113	3
706	6363	100	6	11	chr3	15881691	15882599	-143717184	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	121	3
706	1078	283	175	28	chr3	15891983	15892005	-143707778	+	RMER12	LTR	ERVK	793	814	-508	3
706	1078	283	175	28	chr3	15892032	15892116	-143707667	+	RMER12	LTR	ERVK	815	938	-384	3
706	1078	283	175	28	chr3	15892247	15892601	-143707182	+	RMER12	LTR	ERVK	939	1321	-1	3
706	1458	185	147	19	chr3	15896488	15896958	-143702825	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1014	1543	-1299	3
706	589	183	41	21	chr3	15896978	15897123	-143702660	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1532	1679	-1163	3
706	2831	212	35	46	chr3	15897141	15898069	-143701714	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1925	2841	-1	3
706	2570	118	40	0	chr3	15898070	15898475	-143701308	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	3
706	2458	152	28	79	chr3	15899502	15900010	-143699773	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	3
706	931	196	0	0	chr3	15901552	15901710	-143698073	+	MTC	LTR	MaLR	53	210	-211	3
706	731	150	0	0	chr3	15902987	15903100	-143696683	+	MTC	LTR	MaLR	196	308	-113	3
706	1819	142	64	82	chr3	15904353	15904743	-143695040	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	383	-47	3
706	665	333	45	66	chr3	15906931	15907272	-143692511	+	MTE2a	LTR	MaLR	53	357	-64	3
706	2491	36	2	259	chr3	15909615	15910140	-143689643	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	3
706	14355	26	45	33	chr3	15910142	15912065	-143687718	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	40	3
706	2488	36	2	259	chr3	15912074	15912599	-143687184	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	3
706	1036	303	35	29	chr3	15912604	15912951	-143686832	+	MTEb	LTR	MaLR	22	370	-9	3
706	504	276	47	16	chr3	15913997	15914126	-143685657	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	3
706	657	196	111	117	chr3	15914138	15914462	-143685321	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
706	6631	97	10	5	chr3	15920858	15921790	-143677993	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	88	4
706	908	298	70	24	chr3	15921895	15922264	-143677519	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	501	-4	4
706	824	224	192	16	chr3	15923672	15923990	-143675793	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
706	512	202	10	0	chr3	15924007	15924106	-143675677	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	104	-290	4
706	1797	252	67	81	chr3	15924105	15924670	-143675113	+	RMER19C	LTR	ERVK	55	611	0	4
706	321	311	74	92	chr3	15925180	15925506	-143674277	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	320	0	4
706	791	279	62	9	chr3	15927656	15927866	-143671917	+	RMER12	LTR	ERVK	1102	1322	0	4
706	554	130	139	0	chr3	15928033	15928141	-143671642	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4789	2617	2495	4
706	2040	140	20	23	chr3	15928133	15928527	-143671256	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5162	2244	1852	4
706	1666	115	264	3	chr3	15935982	15936331	-143663452	-	RLTR44E	LTR	ERVK	-12	440	1	4
706	3285	166	57	51	chr3	15937727	15938528	-143661255	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5548	1858	1053	4
706	300	295	9	18	chr3	15938667	15938781	-143661002	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3090	224	112	4
706	3443	30	0	2	chr3	15939187	15939584	-143660199	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
706	2368	114	79	20	chr3	15939774	15940167	-143659616	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	-4	416	1	4
706	2238	163	18	3	chr3	15940487	15940875	-143658908	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
706	3697	200	42	12	chr3	15940875	15941734	-143658049	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	705	4
706	378	266	75	45	chr3	15943786	15943920	-143655863	+	MT2B	LTR	ERVL	454	591	-10	4
706	1060	241	81	21	chr3	15946371	15946655	-143653128	-	RMER5	LTR	ERV1	-219	315	15	4
706	2982	28	0	0	chr3	15953923	15954245	-143645538	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
706	41192	37	2	9	chr3	15954245	15959124	-143640659	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	4
706	2883	43	0	0	chr3	15959124	15959446	-143640337	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
706	1995	152	64	81	chr3	15965164	15965586	-143634197	-	RLTR9F	LTR	ERVK	0	415	1	4
706	1015	186	5	35	chr3	15969615	15969815	-143629968	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	194	-484	4
706	439	151	27	0	chr3	15969809	15969882	-143629901	+	RLTR33	LTR	ERVK	354	428	-250	4
706	255	204	20	0	chr3	15971193	15971242	-143628541	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3763	1759	1710	4
706	4695	65	11	4	chr3	15977315	15977875	-143621908	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	4
706	496	202	0	10	chr3	15978695	15978795	-143620988	-	RLTR33	LTR	ERVK	-363	315	217	4
706	429	270	72	99	chr3	15978961	15979266	-143620517	+	RMER2	LTR	ERV1	2	360	-207	4
706	821	318	97	48	chr3	15980483	15981275	-143618508	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	1041	1871	-5685	5
706	946	345	63	58	chr3	15981412	15982691	-143617092	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	2125	3394	-4384	5
706	296	200	17	0	chr3	15983363	15983423	-143616360	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1699	1759	-3763	5
706	955	244	196	50	chr3	15985395	15985732	-143614051	+	RMER2	LTR	ERV1	1	386	-181	5
706	3016	171	191	21	chr3	15985729	15986435	-143613348	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	289	1114	0	5
707	259	229	73	127	chr3	15996399	15996509	-143603274	-	MLT1L	LTR	MaLR	-112	498	395	5
707	2489	182	120	46	chr3	15997195	15997760	-143602023	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	607	-71	5
707	490	299	136	44	chr3	16002032	16002326	-143597457	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	4111	4431	-3170	4
707	883	293	27	18	chr3	16002694	16003008	-143596775	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3533	3960	-730	5
707	265	238	16	0	chr3	16003348	16003411	-143596372	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3761	1761	1698	8
707	847	241	55	14	chr3	16004933	16005152	-143594631	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	301	1
707	275	228	0	50	chr3	16015659	16015719	-143584064	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1294	1350	-2348	3
707	371	205	122	66	chr3	16016865	16017027	-143582756	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	981	4
707	306	70	0	136	chr3	16018584	16018650	-143581133	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	772	828	-2870	4
707	456	252	48	87	chr3	16018721	16018951	-143580832	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	832	1052	-2646	4
707	595	200	114	20	chr3	16019245	16019455	-143580328	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1301	1538	-6063	4
707	367	88	0	0	chr3	16019892	16019949	-143579834	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1455	1511	-2187	4
707	883	151	30	12	chr3	16020415	16020583	-143579200	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1612	1782	-1916	4
707	949	305	80	75	chr3	16020593	16021566	-143578217	+	MuLV-int	LTR	ERV1	3864	4810	-2642	5
707	1927	182	58	61	chr3	16024547	16024975	-143574808	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	2	6
707	2234	156	27	22	chr3	16025367	16025774	-143574009	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	6
707	2201	146	45	5	chr3	16028235	16028633	-143571150	+	MTC	LTR	MaLR	2	415	-6	6
707	1239	265	40	35	chr3	16037717	16038089	-143561694	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	8
707	372	187	141	11	chr3	16039825	16039917	-143559866	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	3	106	-290	9
707	1755	144	81	91	chr3	16041918	16042315	-143557468	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	9
707	261	317	47	33	chr3	16056818	16056968	-143542815	+	LTRIS2	LTR	ERV1	360	511	-53	1
707	2416	52	10	1	chr3	16059002	16059326	-143540457	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-76	343	1	1
707	2275	93	93	0	chr3	16060527	16060891	-143538892	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-134	398	1	1
707	281	29	0	0	chr3	16061963	16061998	-143537785	-	RLTR1D	LTR	ERV1	0	605	571	1
707	301	47	0	0	chr3	16062054	16062097	-143537686	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-562	43	1	1
707	710	238	41	35	chr3	16062219	16062389	-143537394	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	171	-203	1
707	541	232	22	44	chr3	16062385	16062520	-143537263	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-13	1015	884	1
707	527	197	106	197	chr3	16062495	16062855	-143536928	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-255	773	447	1
707	816	241	37	44	chr3	16062674	16062969	-143536814	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1009	954	662	1
707	1247	192	57	36	chr3	16062863	16063111	-143536672	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	35	1
707	692	211	176	118	chr3	16062937	16063216	-143536567	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1170	793	499	1
707	2493	218	13	62	chr3	16063139	16063688	-143536095	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-580	523	2	1
707	3195	137	2	2	chr3	16064181	16064687	-143535096	+	RLTR19C	LTR	ERVK	1	506	0	1
707	3497	177	89	34	chr3	16064688	16065548	-143534235	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2	909	-5228	1
707	1097	258	118	23	chr3	16065549	16065898	-143533885	+	RMER12	LTR	ERVK	941	1322	0	1
707	2103	132	52	7	chr3	16065898	16066317	-143533466	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	914	1351	-4786	1
707	311	111	0	22	chr3	16066322	16066368	-143533415	-	RLTR17	LTR	ERVK	-550	142	98	1
707	3290	185	60	46	chr3	16066373	16067279	-143532504	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	0	2842	1925	1
707	2791	184	45	86	chr3	16067283	16067393	-143532390	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1048	1794	1703	1
707	2791	194	40	79	chr3	16067587	16068490	-143531293	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1140	1702	402	1
707	398	226	45	49	chr3	16068499	16068699	-143531084	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1692	1150	1014	1
707	1022	249	67	52	chr3	16068698	16069159	-143530624	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2372	470	3	1
707	740	231	0	0	chr3	16069378	16069525	-143530258	-	RLTR17	LTR	ERVK	-27	665	519	1
707	408	217	11	11	chr3	16069547	16069630	-143530153	-	RLTR17	LTR	ERVK	-324	368	286	1
707	2921	155	209	26	chr3	16069630	16070372	-143529411	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	1
707	8096	144	83	84	chr3	16070451	16071585	-143528198	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1340	2509	-3628	1
707	8096	144	83	84	chr3	16071650	16072419	-143527364	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2510	3305	-2832	1
707	2973	171	156	21	chr3	16072391	16073431	-143526352	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3413	4978	-1159	1
707	2973	180	75	106	chr3	16073606	16074232	-143525551	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4979	5598	-539	1
707	422	316	0	0	chr3	16075072	16075205	-143524578	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	7143	7275	-326	1
707	3155	113	34	20	chr3	16075494	16075991	-143523792	+	RLTR19C	LTR	ERVK	1	504	-2	1
707	2359	179	22	14	chr3	16077888	16078303	-143521480	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	1	1
707	1136	279	28	18	chr3	16079999	16080386	-143519397	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1043	805	415	1
707	385	200	67	39	chr3	16080443	16080547	-143519236	+	RLTR23	LTR	ERV1	324	430	0	1
707	400	370	76	60	chr3	16081349	16081599	-143518184	+	MLT1J	LTR	MaLR	44	297	-215	1
707	279	316	50	20	chr3	16081933	16082033	-143517750	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	155	1
707	4220	125	35	140	chr3	16098144	16099157	-143500626	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	1
707	345	370	83	19	chr3	16110724	16110881	-143488902	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-393	167	1	1
707	305	329	97	39	chr3	16119060	16119215	-143480568	+	MTEa	LTR	MaLR	20	183	-196	2
708	790	234	81	137	chr3	16122232	16122673	-143477110	-	MT2B2	LTR	ERVL	-41	543	8	2
708	1392	142	92	68	chr3	16125358	16125758	-143474025	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
708	283	209	43	29	chr3	16125759	16125828	-143473955	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2	71	-3167	2
708	293	245	29	48	chr3	16127918	16128043	-143471740	-	MTEa	LTR	MaLR	-19	360	226	2
708	428	261	235	30	chr3	16128729	16128895	-143470888	+	MT2A	LTR	ERVL	266	465	-68	2
708	307	274	62	10	chr3	16129434	16129530	-143470253	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	101	-278	2
708	2820	182	199	43	chr3	16129629	16130376	-143469407	-	RMER19B	LTR	ERVK	-38	864	1	2
708	423	335	34	28	chr3	16130377	16130555	-143469228	-	RMER4A	LTR	ERVK	-32	434	256	2
708	260	259	19	0	chr3	16130572	16130626	-143469157	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1432	5118	5064	2
708	268	297	68	0	chr3	16131554	16131628	-143468155	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1514	5036	4958	2
708	2008	165	136	78	chr3	16131630	16132182	-143467601	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	1	2
708	58483	36	13	0	chr3	16132182	16139749	-143460034	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	1	2
708	1252	170	84	94	chr3	16139750	16140301	-143459482	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-51	603	1	2
708	589	147	10	21	chr3	16140301	16140393	-143459390	-	RMER19B	LTR	ERVK	-324	578	488	2
708	264	190	69	0	chr3	16140421	16140479	-143459304	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1592	4958	4897	2
708	773	227	70	22	chr3	16140913	16141143	-143458640	-	RLTR15	LTR	ERVK	-118	241	1	2
708	2160	208	37	88	chr3	16145851	16146442	-143453341	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	2
708	535	319	127	0	chr3	16147260	16147489	-143452294	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	117	2
708	2077	214	59	37	chr3	16149456	16149885	-143449898	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	98	2
708	2731	71	143	139	chr3	16149885	16150395	-143449388	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	2
708	2077	214	59	37	chr3	16150395	16150475	-143449308	-	RMER5	LTR	ERV1	-437	97	14	2
708	4661	132	31	41	chr3	16150671	16151569	-143448214	-	RMER17D	LTR	ERVK	0	889	1	2
708	2482	116	27	32	chr3	16152475	16152886	-143446897	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
708	490	92	0	26	chr3	16152886	16152964	-143446819	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	0	7406	7331	2
708	16384	201	28	26	chr3	16153174	16158939	-143440844	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	4	2
708	2057	127	58	12	chr3	16158942	16159069	-143440714	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	403	250	2
708	2057	103	36	6	chr3	16159123	16159368	-143440415	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-160	249	3	2
708	2852	88	7	12	chr3	16160247	16160651	-143439132	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-1	402	1	2
708	393	143	0	14	chr3	16160654	16160725	-143439058	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-6	7400	7331	2
708	1037	178	72	27	chr3	16160938	16161307	-143438476	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-981	6425	6096	2
708	10336	189	93	62	chr3	16161312	16163901	-143435882	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1153	4655	2254	2
708	10336	189	93	62	chr3	16163980	16165254	-143434529	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1153	2253	1071	2
708	781	273	37	63	chr3	16165257	16165640	-143434143	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2915	399	27	2
708	2738	107	23	5	chr3	16165667	16166063	-143433720	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	2
708	2504	188	31	72	chr3	16177399	16178036	-143421747	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
708	3294	163	36	72	chr3	16181077	16181328	-143418455	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	500	2
708	3294	163	36	72	chr3	16181503	16182030	-143417753	-	RMER6A	LTR	ERVK	-257	499	6	2
708	246	212	80	34	chr3	16182559	16182647	-143417136	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	153	244	-564	2
708	279	310	142	29	chr3	16191185	16191431	-143408352	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-59	3179	2906	2
708	557	272	32	16	chr3	16191490	16191677	-143408106	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-769	5781	5626	2
708	6343	52	24	0	chr3	16192208	16192997	-143406786	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	2
708	307	290	73	95	chr3	16193108	16193287	-143406496	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-200	248	74	2
708	2566	108	77	0	chr3	16195546	16195963	-143403820	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-83	449	1	2
708	858	302	45	24	chr3	16195963	16196425	-143403358	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-42	5021	4550	2
708	552	219	44	0	chr3	16196471	16196585	-143403198	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7188	-218	2
708	340	311	11	16	chr3	16197166	16197349	-143402434	+	RMER16-int	LTR	ERVK	185	366	-6878	2
708	1691	169	123	13	chr3	16197556	16198054	-143401729	+	RMER16-int	LTR	ERVK	192	670	-4736	2
708	535	147	128	0	chr3	16198057	16198166	-143401617	+	RMER16-int	LTR	ERVK	938	1060	-5077	2
708	7433	140	49	71	chr3	16198181	16199951	-143399832	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2935	4382	-3024	3
708	1812	298	36	46	chr3	16200066	16201376	-143398407	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2298	5308	3532	3
708	1024	326	78	33	chr3	16201468	16202711	-143397072	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5191	2415	1040	3
708	360	327	65	40	chr3	16203073	16203350	-143396433	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-6747	809	526	3
708	554	161	136	0	chr3	16203760	16203878	-143395905	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	399	3
708	1809	111	0	11	chr3	16215305	16215569	-143384214	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	261	-148	3
708	628	193	9	69	chr3	16221090	16221292	-143378491	+	RLTR9E	LTR	ERVK	226	409	0	3
708	634	235	15	62	chr3	16221294	16221557	-143378226	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2	317	-2997	3
708	335	156	0	15	chr3	16221606	16221671	-143378112	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	2086	2149	-5095	3
708	262	125	0	0	chr3	16222113	16222161	-143377622	+	RMER16-int	LTR	ERVK	141	188	-5218	3
708	1799	175	94	17	chr3	16222146	16222616	-143377167	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1590	2095	-5311	3
708	553	289	5	37	chr3	16222607	16222794	-143376989	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2428	2608	-4798	3
708	20868	116	27	19	chr3	16222794	16225440	-143374343	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3055	5778	-1628	3
708	20868	116	27	19	chr3	16225467	16226159	-143373624	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5779	6422	-984	3
708	472	96	0	14	chr3	16226374	16226448	-143373335	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7403	-3	3
708	2093	152	29	32	chr3	16226450	16226859	-143372924	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	408	-1	3
708	939	342	29	60	chr3	16230115	16230628	-143369155	+	RLTR17	LTR	ERVK	125	621	-71	3
708	312	191	32	0	chr3	16230599	16230662	-143369121	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	489	553	0	3
708	1759	138	7	28	chr3	16230662	16230952	-143368831	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-42	284	1	3
708	9356	156	55	75	chr3	16230952	16232954	-143366829	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	0	1963	1	3
708	884	168	18	22	chr3	16232958	16233228	-143366555	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	14	3
708	1943	165	148	116	chr3	16233527	16234027	-143365756	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	1	3
708	2958	83	5	2	chr3	16243721	16244120	-143355663	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
708	296	362	54	0	chr3	16246020	16246146	-143353637	-	MER74A	LTR	ERVL	-390	232	42	3
708	2123	96	88	17	chr3	16246254	16246605	-143353178	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-29	382	7	3
708	1582	216	19	125	chr3	16247128	16247352	-143352431	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	251	3
708	1582	216	19	125	chr3	16247522	16247768	-143352015	-	MTC	LTR	MaLR	-171	250	1	3
708	6423	107	63	2	chr3	16248910	16249883	-143349900	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	-1	1032	1	3
709	254	341	95	50	chr3	16260328	16260534	-143339249	+	ORR1E	LTR	MaLR	22	238	-121	3
709	2893	81	2	93	chr3	16260534	16260812	-143338971	+	BGLII	LTR	ERVK	1	245	-176	3
709	2893	81	2	93	chr3	16260994	16261178	-143338605	+	BGLII	LTR	ERVK	246	421	0	3
709	254	341	95	50	chr3	16261178	16261193	-143338590	+	ORR1E	LTR	MaLR	239	252	-107	3
709	229	311	11	22	chr3	16261248	16261340	-143338443	+	ORR1E	LTR	MaLR	289	379	0	3
709	2241	216	66	158	chr3	16262953	16264004	-143335779	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	5	3
709	7499	41	40	1	chr3	16268806	16269728	-143330055	-	RLTR13A2	LTR	ERVK	0	958	1	3
709	1561	218	58	12	chr3	16270590	16270933	-143328850	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	4
709	244	236	0	35	chr3	16278218	16278275	-143321508	+	MTD	LTR	MaLR	1	55	-366	4
709	1483	174	106	45	chr3	16278264	16278662	-143321121	+	MTC-int	LTR	MaLR	835	1256	-2	4
709	1614	214	25	8	chr3	16278664	16279037	-143320746	+	MTC	LTR	MaLR	1	409	-12	4
709	633	262	412	45	chr3	16279930	16280211	-143319572	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	4
709	2970	67	2	32	chr3	16280388	16280788	-143318995	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	4
709	14454	42	25	40	chr3	16280788	16282767	-143317016	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1	1986	39	4
709	3129	47	2	32	chr3	16282777	16283177	-143316606	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	4
709	1370	221	163	3	chr3	16284839	16285170	-143314613	+	MTD	LTR	MaLR	13	396	-23	4
709	1017	247	14	5	chr3	16288004	16288224	-143311559	+	MT2A	LTR	ERVL	4	225	-308	4
709	4545	137	47	24	chr3	16302815	16303606	-143296177	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	4
709	679	330	79	42	chr3	16305156	16305650	-143294133	-	RMER5	LTR	ERV1	-20	514	3	4
709	275	227	15	0	chr3	16306478	16306544	-143293239	-	MLT1E2	LTR	MaLR	0	627	561	4
709	447	371	6	17	chr3	16308045	16308226	-143291557	+	MLT1K	LTR	MaLR	417	595	0	4
709	1345	183	23	19	chr3	16309083	16309345	-143290438	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	266	-108	4
709	619	283	127	54	chr3	16309494	16309859	-143289924	+	RMER13A	LTR	ERVK	182	596	-31	4
709	434	210	80	37	chr3	16309969	16310168	-143289615	+	ORR1D1	LTR	MaLR	156	376	-8	4
709	4331	12	2	24	chr3	16311464	16311968	-143287815	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
709	3893	112	9	50	chr3	16315216	16315877	-143283906	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	2988	3621	-77	4
709	659	93	6	56	chr3	16315868	16316010	-143283773	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3221	3299	0	4
709	4128	48	4	4	chr3	16316010	16316512	-143283271	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	502	-1	4
709	885	293	85	50	chr3	16316682	16317045	-143282738	-	MTD	LTR	MaLR	-43	376	1	4
709	2747	198	58	76	chr3	16332766	16333400	-143266383	-	RMER20B	LTR	ERVK	-4	623	1	4
709	622	232	183	50	chr3	16353066	16353306	-143246477	+	RLTR10A	LTR	ERVK	140	411	0	4
709	356	211	61	52	chr3	16353322	16353437	-143246346	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	318	433	-1554	4
709	314	261	47	47	chr3	16353631	16353780	-143246003	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	2241	2389	-4153	4
709	1369	303	60	42	chr3	16353787	16355730	-143244053	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3511	5080	-1462	4
709	1616	221	11	29	chr3	16355858	16356346	-143243437	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6590	7042	-202	4
709	619	237	183	50	chr3	16356386	16356626	-143243157	+	RLTR10A	LTR	ERVK	140	411	0	4
709	1875	231	70	18	chr3	16358746	16359301	-143240482	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	1	4
709	683	229	89	81	chr3	16360869	16361116	-143238667	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	536	784	-1064	4
709	4588	125	55	12	chr3	16363282	16364057	-143235726	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	4
709	552	300	118	85	chr3	16364182	16364513	-143235270	+	RMER12	LTR	ERVK	981	1322	0	4
709	4383	125	81	93	chr3	16368245	16369162	-143230621	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	5
709	546	266	59	43	chr3	16371413	16371706	-143228077	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	367	-12	5
709	1650	206	57	11	chr3	16371933	16372302	-143227481	+	MTB	LTR	MaLR	1	386	-14	5
709	1554	223	30	24	chr3	16380158	16380530	-143219253	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
709	910	253	47	0	chr3	16380533	16380766	-143219017	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	4	247	-1123	5
709	893	190	32	32	chr3	16380760	16380950	-143218833	+	ORR1D1	LTR	MaLR	185	374	0	5
709	4278	137	72	37	chr3	16382524	16383360	-143216423	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	893	0	5
709	378	303	29	148	chr3	16383595	16383839	-143215944	+	MLT1B	LTR	MaLR	167	381	-9	5
710	967	149	0	12	chr3	16386370	16386540	-143213243	-	RMER6B	LTR	ERVK	-216	245	78	5
710	5281	113	12	32	chr3	16388181	16389005	-143210778	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	5
710	917	264	49	18	chr3	16390324	16390609	-143209174	-	RLTR16	LTR	ERVK	-208	297	4	5
710	2953	56	56	0	chr3	16402750	16403125	-143196658	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
710	1957	137	133	28	chr3	16413791	16414220	-143185563	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	2	5
710	1321	216	141	20	chr3	16415585	16415939	-143183844	+	MTD	LTR	MaLR	3	399	-20	5
710	388	223	48	0	chr3	16419911	16420014	-143179769	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-13	371	264	5
710	571	340	136	24	chr3	16420147	16420442	-143179341	+	ORR1D2	LTR	MaLR	35	362	-8	5
710	7053	60	4	17	chr3	16425244	16426148	-143173635	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	5
710	384	260	30	72	chr3	16427485	16427651	-143172132	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-113	298	140	5
710	242	323	52	64	chr3	16428425	16428597	-143171186	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-340	228	59	5
710	1583	248	16	73	chr3	16436687	16437183	-143162600	+	RMER6D	LTR	ERVK	249	716	-4	5
710	3514	184	97	95	chr3	16437302	16437795	-143161988	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	358	5
710	3514	184	97	95	chr3	16437864	16438271	-143161512	-	RMER19B	LTR	ERVK	-545	357	2	5
710	994	323	21	42	chr3	16438962	16439340	-143160443	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	5
710	5903	77	97	1	chr3	16439667	16440482	-143159301	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	5
710	501	180	18	17	chr3	16456702	16456830	-143142953	+	MT2B	LTR	ERVL	1	131	-402	6
710	1932	220	53	66	chr3	16487398	16487929	-143111854	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-3	550	27	6
710	2454	256	87	59	chr3	16487936	16489158	-143110625	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-192	2650	1395	6
710	2228	208	111	32	chr3	16494968	16495590	-143104193	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	20	6
710	814	321	89	24	chr3	16498145	16498483	-143101300	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	365	0	6
710	1401	278	100	38	chr3	16501353	16501460	-143098323	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-15	563	462	1
710	1401	278	100	38	chr3	16501911	16502333	-143097450	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-117	461	1	1
710	533	255	58	69	chr3	16510017	16510190	-143089593	+	MTEa	LTR	MaLR	2	172	-207	1
710	610	266	47	47	chr3	16512374	16512587	-143087196	+	MTEa	LTR	MaLR	167	379	0	1
710	356	253	42	76	chr3	16513723	16513899	-143085884	+	RLTR11B	LTR	ERVK	288	519	-9	1
710	703	253	170	59	chr3	16514135	16514576	-143085207	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-141	3097	2608	1
710	333	169	0	94	chr3	16514662	16514747	-143085036	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2880	3257	3181	1
711	286	235	44	0	chr3	16515314	16515382	-143084401	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-795	5755	5685	1
711	1594	223	5	71	chr3	16516733	16517158	-143082625	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	2	2
711	1172	244	54	36	chr3	16517171	16517503	-143082280	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	338	-203	2
711	4066	194	48	35	chr3	16518334	16519275	-143080508	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	6	935	-1391	2
711	545	93	12	0	chr3	16519286	16519372	-143080411	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1075	1161	-1165	2
711	4244	170	44	14	chr3	16519372	16520275	-143079508	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1320	2249	-77	2
711	3386	142	55	113	chr3	16545899	16546648	-143053135	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-197	705	1	3
711	2148	63	56	3	chr3	16550007	16550311	-143049472	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	320	-76	4
711	2282	230	53	24	chr3	16550566	16551004	-143048779	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	563	110	4
711	2282	230	53	24	chr3	16551501	16551609	-143048174	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-454	109	1	4
711	227	319	94	34	chr3	16567797	16567914	-143031869	+	RMER2	LTR	ERV1	403	526	-41	6
711	2731	58	6	6	chr3	16568344	16568690	-143031093	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	6
711	1542	213	143	29	chr3	16585432	16585809	-143013974	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	1	8
711	2143	129	212	28	chr3	16599441	16599904	-142999879	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	584	-70	9
711	233	229	21	0	chr3	16616219	16616267	-142983516	-	RMER15	LTR	ERVL	-526	49	1	1
711	363	297	18	88	chr3	16618091	16618261	-142981522	+	MLT1A	LTR	MaLR	21	178	-196	1
711	1687	256	42	0	chr3	16618342	16618725	-142981058	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	7	1
711	886	230	194	11	chr3	16619494	16619865	-142979918	-	RLTR18	LTR	ERVK	-7	609	171	1
711	432	276	121	35	chr3	16620247	16620420	-142979363	+	MER92B	LTR	ERV1	54	241	-395	1
711	345	252	70	0	chr3	16620585	16620700	-142979083	+	MER92B	LTR	ERV1	290	412	0	1
711	1862	159	50	22	chr3	16621096	16621500	-142978283	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1671	2085	-5321	1
711	1619	189	206	27	chr3	16621497	16621972	-142977811	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2428	2987	-4419	1
711	4155	179	34	38	chr3	16621988	16623682	-142976101	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2356	4085	-3321	1
711	1521	165	45	17	chr3	16623651	16624009	-142975774	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6127	6449	-957	1
711	1618	125	12	8	chr3	16623983	16624233	-142975550	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5530	5780	-28	1
711	2003	186	148	8	chr3	16624242	16624715	-142975068	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	539	-363	1
711	501	82	0	27	chr3	16624715	16624790	-142974993	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7403	-3	1
711	1858	153	117	27	chr3	16624792	16625167	-142974616	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	1
711	502	331	148	4	chr3	16625953	16626217	-142973566	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-53	354	53	1
711	3033	71	2	5	chr3	16636355	16636752	-142963031	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
711	1213	274	53	7	chr3	16644308	16644609	-142955174	-	RLTR26	LTR	ERVK	-1	641	327	1
712	2105	102	12	32	chr3	16650089	16650435	-142949348	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	3648	3986	-3258	1
712	8514	138	19	30	chr3	16650427	16651948	-142947835	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	4297	5800	-8	1
712	1596	234	142	80	chr3	16651955	16652804	-142946979	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	1
712	2026	60	8	4	chr3	16653619	16653885	-142945898	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	130	396	0	1
712	7529	90	21	4	chr3	16653885	16654964	-142944819	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
712	3310	41	5	0	chr3	16654964	16655358	-142944425	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
712	1534	199	5	91	chr3	16655468	16655843	-142943940	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	383	-11	1
712	364	332	98	49	chr3	16655996	16656199	-142943584	+	MLT1D	LTR	MaLR	288	500	-5	1
712	240	350	58	71	chr3	16660072	16660312	-142939471	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	82	1
712	2770	78	36	0	chr3	16668976	16669362	-142930421	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
712	3220	88	9	5	chr3	16681685	16682132	-142917651	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	449	-574	1
712	3758	89	82	7	chr3	16682399	16682963	-142916820	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	418	1023	0	1
712	4167	130	101	10	chr3	16686238	16686914	-142912869	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	1
712	504	231	20	27	chr3	16691939	16692086	-142907697	+	MLT1C	LTR	MaLR	300	445	-22	1
712	2924	59	203	9	chr3	16692529	16692958	-142906825	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	1
712	63726	19	1	0	chr3	16692958	16700513	-142899270	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	1	7556	0	1
712	2908	66	200	9	chr3	16700513	16700943	-142898840	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	1
712	1575	157	119	62	chr3	16701384	16701771	-142898012	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	1
712	970	249	211	7	chr3	16704451	16704754	-142895029	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	6	2
712	321	272	0	0	chr3	16723436	16723517	-142876266	-	MTD	LTR	MaLR	-338	81	1	2
712	251	305	139	12	chr3	16725499	16725665	-142874118	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	193	2
712	745	278	5	11	chr3	16725904	16726093	-142873690	-	MTE2b	LTR	MaLR	-191	188	1	2
712	400	356	60	90	chr3	16726959	16727292	-142872491	+	ORR1E	LTR	MaLR	35	357	-2	2
712	459	363	130	17	chr3	16727438	16727668	-142872115	-	MLT1K	LTR	MaLR	-250	345	90	2
712	733	292	20	17	chr3	16728745	16728981	-142870802	+	MTD	LTR	MaLR	9	244	-175	2
712	945	257	52	186	chr3	16729020	16729437	-142870346	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	330	-928	2
712	1306	267	29	63	chr3	16729437	16729989	-142869794	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	2
712	945	284	47	147	chr3	16729989	16730335	-142869448	+	MTD-int	LTR	MaLR	331	571	-687	2
712	327	274	111	46	chr3	16740615	16740768	-142859015	+	MTD-int	LTR	MaLR	1088	1250	-8	2
712	834	319	67	26	chr3	16740779	16741091	-142858692	+	MTD	LTR	MaLR	10	334	-85	2
712	835	322	147	9	chr3	16758931	16759391	-142840392	+	MER74A	LTR	ERVL	22	544	-14	2
712	1323	276	85	64	chr3	16762313	16763095	-142836688	-	RMER13A	LTR	ERVK	-20	840	1	2
713	3081	84	82	44	chr3	16779649	16780147	-142819636	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	517	-2	2
713	835	322	78	106	chr3	16783830	16784518	-142815265	+	RMER13A	LTR	ERVK	95	763	-97	2
713	1207	195	162	108	chr3	16788265	16788702	-142811081	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	2
713	310	232	43	0	chr3	16791804	16791873	-142807910	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1142	1213	-3786	3
713	228	337	193	57	chr3	16792918	16793081	-142806702	+	RLTR26	LTR	ERVK	165	341	-301	3
713	228	337	193	57	chr3	16793250	16793366	-142806417	+	RLTR26	LTR	ERVK	342	482	-160	3
713	412	278	50	43	chr3	16793904	16794043	-142805740	+	RMER15	LTR	ERVL	403	542	-33	3
713	351	370	60	16	chr3	16802006	16802190	-142797593	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	1	3
713	289	276	70	39	chr3	16816316	16816444	-142783339	-	MLT1N2	LTR	MaLR	0	562	431	3
713	868	280	139	30	chr3	16869959	16870290	-142729493	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	13	3
713	301	351	87	36	chr3	16870574	16870769	-142729014	+	MLT1J2	LTR	MaLR	101	305	-143	3
713	3622	198	83	47	chr3	16882013	16882995	-142716788	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1002	-26	4
713	3595	130	51	58	chr3	16883101	16883842	-142715941	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	736	-15	4
713	800	284	96	58	chr3	16883861	16884224	-142715559	+	RLTR28B	LTR	ERVL	101	477	-4	4
713	1125	202	129	36	chr3	16889987	16890290	-142709493	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-1	331	1	4
713	1407	195	55	15	chr3	16890290	16890633	-142709150	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	6125	4
713	1549	117	100	30	chr3	16890650	16890967	-142708816	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-342	7338	6965	4
713	1071	142	0	0	chr3	16891032	16891194	-142708589	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-1374	5168	5007	4
713	373	140	0	0	chr3	16891194	16891251	-142708532	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6039	503	447	4
713	267	270	49	20	chr3	16891268	16891370	-142708413	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-6015	1566	1462	4
713	280	192	58	0	chr3	16891433	16891485	-142708298	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-983	1004	950	4
713	621	221	238	17	chr3	16891480	16891715	-142708068	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5475	662	376	4
713	787	211	117	0	chr3	16891683	16891854	-142707929	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4903	503	313	4
713	844	122	27	0	chr3	16891837	16891985	-142707798	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6722	859	708	4
713	2839	121	2	9	chr3	16892088	16892513	-142707270	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7159	422	1	4
713	978	211	143	37	chr3	16892513	16892813	-142706970	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	4
713	552	321	27	0	chr3	16905068	16905255	-142694528	+	MLT1B	LTR	MaLR	190	381	-9	4
713	952	334	27	30	chr3	16906411	16906781	-142693002	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	6	4
714	2105	200	61	28	chr3	16911734	16912239	-142687544	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	522	-5	4
714	558	265	15	7	chr3	16917113	16917250	-142682533	-	RMER15	LTR	ERVL	-48	527	390	4
714	884	128	0	51	chr3	16918554	16918711	-142681072	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	149	-588	4
714	1052	285	72	20	chr3	16923882	16924422	-142675361	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	568	0	4
714	298	222	23	16	chr3	16929180	16929223	-142670560	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	605	648	-861	4
714	463	308	157	4	chr3	16936200	16936461	-142663322	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	275	4
714	3673	153	51	86	chr3	16946047	16946849	-142652934	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	127	900	-2	4
714	497	327	75	0	chr3	16951868	16952027	-142647756	+	MTD	LTR	MaLR	42	212	-207	4
714	6146	71	11	98	chr3	16958147	16959125	-142640658	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	4
714	707	326	0	0	chr3	16961982	16962160	-142637623	+	MTD	LTR	MaLR	13	190	-229	4
714	413	276	60	8	chr3	16962159	16962276	-142637507	+	MTD	LTR	MaLR	297	419	0	4
714	843	224	71	5	chr3	16962276	16962480	-142637303	+	MTD	LTR	MaLR	202	419	0	4
714	231	360	8	53	chr3	16964212	16964344	-142635439	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-438	131	6	4
714	967	275	78	35	chr3	16969961	16970361	-142629422	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	4
714	2429	103	148	10	chr3	16971791	16972184	-142627599	+	RLTR44B	LTR	ERVK	3	449	0	4
714	1301	207	151	9	chr3	16991052	16991139	-142608644	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-157	371	261	5
714	1301	188	113	0	chr3	16991185	16991415	-142608368	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-308	260	4	5
714	307	282	82	19	chr3	16992070	16992229	-142607554	-	RMER15	LTR	ERVL	-5	570	402	5
714	289	319	117	18	chr3	17006034	17006197	-142593586	-	RMER20B	LTR	ERVK	-216	411	233	1
714	3003	76	2	5	chr3	17006372	17006769	-142593014	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
714	3494	14	163	0	chr3	17010526	17010950	-142588833	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
714	1082	224	47	17	chr3	17012023	17012255	-142587528	+	ORR1B2	LTR	MaLR	78	316	-51	2
714	4891	221	64	38	chr3	17014317	17014589	-142585194	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	286	-1223	2
714	4891	221	64	38	chr3	17014618	17015089	-142584694	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	287	785	-724	2
714	4891	221	64	38	chr3	17015131	17015203	-142584580	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	786	830	-679	2
714	4891	221	64	38	chr3	17015494	17015959	-142583824	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	831	1315	-194	2
714	1886	188	51	42	chr3	17015959	17016387	-142583396	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	432	-102	2
714	283	286	11	32	chr3	17016567	17016661	-142583122	+	RLTR20C	LTR	ERVK	487	578	0	2
714	474	142	53	3	chr3	17016661	17016760	-142583023	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1311	1408	-101	2
714	383	219	64	48	chr3	17017235	17017258	-142582525	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1278	1300	-70	2
714	1899	172	124	30	chr3	17017251	17017742	-142582041	+	RMER17D2	LTR	ERVK	273	809	0	3
714	1347	145	100	0	chr3	17028074	17028315	-142571468	+	ORR1A2	LTR	MaLR	61	325	-2	4
714	1790	221	152	49	chr3	17029700	17030494	-142569289	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	720	0	4
714	2715	32	16	68	chr3	17035709	17036074	-142563709	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
715	466	332	85	25	chr3	17052582	17052865	-142546918	+	MER34A	LTR	ERV1	1	298	-244	7
715	3835	109	19	104	chr3	17061560	17062380	-142537403	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	8
715	368	256	11	34	chr3	17063240	17063329	-142536454	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-295	113	27	8
715	315	106	0	0	chr3	17064867	17064914	-142534869	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	340	8
715	270	313	110	73	chr3	17073639	17073884	-142525899	+	MTE2a	LTR	MaLR	2	255	-124	1
715	290	289	125	20	chr3	17076705	17076857	-142522926	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	201	1
715	820	206	163	5	chr3	17077811	17078001	-142521782	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	356	1
715	1324	251	128	33	chr3	17077981	17078487	-142521296	-	RLTR26	LTR	ERVK	-31	611	31	1
715	1260	235	56	63	chr3	17078501	17078896	-142520887	-	RMER15	LTR	ERVL	-180	395	4	1
715	317	274	30	68	chr3	17079504	17079637	-142520146	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	271	1
715	3698	171	32	25	chr3	17081235	17081658	-142518125	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	343	1
715	3698	171	32	25	chr3	17081744	17082065	-142517718	-	RMER6A	LTR	ERVK	-414	342	7	1
715	3417	49	52	28	chr3	17088611	17089075	-142510708	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	1
715	3523	89	17	32	chr3	17089077	17089909	-142509874	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	662	-5819	1
715	2608	73	0	3	chr3	17089909	17090252	-142509531	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	1
715	6567	50	11	11	chr3	17090247	17091074	-142508709	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5653	6479	-2	1
715	2386	93	88	26	chr3	17091076	17091463	-142508320	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	411	0	1
715	1950	214	52	31	chr3	17108291	17108807	-142490976	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	1
715	2236	132	0	0	chr3	17127944	17128263	-142471520	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	1
715	592	284	21	79	chr3	17138620	17138861	-142460922	+	RLTR9A	LTR	ERVK	142	368	0	1
715	1141	159	91	126	chr3	17139310	17139684	-142460099	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	2080	2440	-4804	1
715	3780	152	36	19	chr3	17140798	17141547	-142458236	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1424	2185	-5221	1
715	4070	242	88	50	chr3	17141817	17142362	-142457421	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2189	2574	-4832	1
715	4070	214	94	58	chr3	17142446	17143298	-142456485	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2575	3497	-3909	1
715	302	396	88	30	chr3	17144147	17144545	-142455238	-	MLT1C	LTR	MaLR	-10	457	37	1
715	1366	173	153	19	chr3	17144557	17144864	-142454919	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	39	1
715	1536	236	79	24	chr3	17152247	17152663	-142447120	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	4	1
715	2106	163	40	58	chr3	17164912	17165381	-142434402	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	2
715	1226	309	45	10	chr3	17165541	17165937	-142433846	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	3	2
715	589	217	61	46	chr3	17165942	17166163	-142433620	-	MTD-int	LTR	MaLR	-3	1255	905	2
715	6712	196	43	105	chr3	17167329	17169400	-142430383	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1963	8	2
716	548	245	35	41	chr3	17171292	17171437	-142428346	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1579	384	241	2
716	461	202	125	0	chr3	17171441	17171545	-142428238	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1390	119	3	2
716	1412	199	15	82	chr3	17171547	17171895	-142427888	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	42	2
716	3234	46	5	0	chr3	17191272	17191666	-142408117	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
716	8602	59	5	0	chr3	17191666	17192759	-142407024	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
716	3260	51	2	0	chr3	17192759	17193154	-142406629	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
716	225	378	0	13	chr3	17233200	17233275	-142366508	+	RLTR41	LTR	ERV1	34	107	-339	2
716	2239	78	120	11	chr3	17237911	17238261	-142361522	+	RLTR10	LTR	ERVK	3	390	0	2
716	2701	56	0	0	chr3	17257660	17257998	-142341785	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	3
716	233	315	45	18	chr3	17258847	17258957	-142340826	+	MER57C2	LTR	ERV1	318	430	-4	3
716	2544	45	3	37	chr3	17263899	17264249	-142335534	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	338	-52	3
717	676	274	118	94	chr3	17306652	17306982	-142292801	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	340	-165	3
717	1631	89	0	0	chr3	17333464	17333688	-142266095	+	ORR1A1	LTR	MaLR	2	225	-121	3
717	291	302	16	79	chr3	17348700	17348826	-142250957	-	MTEa	LTR	MaLR	-235	144	27	4
717	1635	189	54	69	chr3	17371095	17371487	-142228296	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	4
717	3222	48	5	0	chr3	17383161	17383555	-142216228	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
717	1484	183	80	114	chr3	17388144	17388521	-142211262	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-3	364	1	4
717	710	188	45	13	chr3	17391682	17391838	-142207945	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	161	-198	4
717	1274	132	34	0	chr3	17393113	17393317	-142206466	+	RLTR15	LTR	ERVK	149	359	0	4
717	768	209	86	35	chr3	17395252	17395392	-142204391	+	ORR1C1	LTR	MaLR	168	323	-55	4
717	768	209	86	35	chr3	17395665	17395722	-142204061	+	ORR1C1	LTR	MaLR	324	375	-3	4
717	294	367	155	10	chr3	17396607	17396904	-142202879	+	MLT2D	LTR	ERVL	47	386	-28	4
717	1616	202	116	5	chr3	17397534	17397913	-142201870	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
717	235	287	67	38	chr3	17398002	17398050	-142201733	-	MER54A	LTR	ERVL	-790	111	61	4
717	235	287	67	38	chr3	17398073	17398129	-142201654	-	MER54A	LTR	ERVL	-841	60	5	4
717	2878	212	67	11	chr3	17404448	17405087	-142194696	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	835	1509	0	4
717	1227	215	124	40	chr3	17405087	17405441	-142194342	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
717	1047	278	120	22	chr3	17405457	17405825	-142193958	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	16	4
717	229	228	120	65	chr3	17424503	17424611	-142175172	-	RMER20A	LTR	ERVK	-217	299	186	4
717	1521	223	55	33	chr3	17425828	17426194	-142173589	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
717	1148	265	53	85	chr3	17429815	17430359	-142169424	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	4
718	668	312	84	19	chr3	17433794	17434061	-142165722	+	MLT1A0	LTR	MaLR	80	388	-2	4
718	364	271	31	10	chr3	17434532	17434629	-142165154	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-414	101	3	4
718	368	232	273	0	chr3	17434930	17435029	-142164754	-	RLTR16	LTR	ERVK	-379	126	1	4
718	3058	62	15	0	chr3	17437343	17437733	-142162050	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
718	2397	194	55	2	chr3	17440550	17441025	-142158758	+	RLTR16	LTR	ERVK	6	505	0	5
718	249	184	20	0	chr3	17442032	17442081	-142157702	-	RMER21B	LTR	ERV1	-271	571	522	5
718	1054	345	108	105	chr3	17442819	17442866	-142156917	+	MTE-int	LTR	MaLR	144	189	-1391	5
718	1054	345	108	105	chr3	17443072	17444366	-142155417	+	MTE-int	LTR	MaLR	190	1489	-91	5
718	276	374	20	61	chr3	17444578	17444618	-142155165	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	50	-309	5
718	609	336	51	35	chr3	17444618	17444696	-142155087	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	302	5
718	609	336	51	35	chr3	17444777	17445068	-142154715	-	MTE2a	LTR	MaLR	-78	301	2	5
718	276	374	20	61	chr3	17445068	17445175	-142154608	+	ORR1E	LTR	MaLR	51	152	-207	5
718	364	342	78	108	chr3	17450115	17450396	-142149387	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	89	5
718	2631	81	78	5	chr3	17450530	17450913	-142148870	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	5
718	364	342	78	108	chr3	17451158	17451237	-142148546	-	ORR1E	LTR	MaLR	-271	88	5	5
718	931	173	6	13	chr3	17459529	17459687	-142140096	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	157	-535	5
718	460	327	207	36	chr3	17460788	17461105	-142138678	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	370	0	5
718	255	200	0	0	chr3	17463843	17463893	-142135890	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	50	-483	5
718	593	268	81	23	chr3	17465075	17465362	-142134421	+	MT2B2	LTR	ERVL	70	520	-64	5
718	241	308	39	65	chr3	17474523	17474676	-142125107	+	MLT1E3	LTR	MaLR	98	246	-378	5
718	3184	165	52	59	chr3	17476891	17477586	-142122197	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
718	1134	251	132	0	chr3	17478774	17479144	-142120639	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
718	705	282	62	94	chr3	17479544	17479978	-142119805	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-31	497	78	5
718	3859	223	38	60	chr3	17495971	17496907	-142102876	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	5
718	1739	231	51	13	chr3	17499167	17499557	-142100226	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	5
718	268	318	61	56	chr3	17500966	17501146	-142098637	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1157	1337	-4185	3
718	319	245	40	30	chr3	17503812	17503913	-142095870	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	278	6
718	230	275	10	71	chr3	17544449	17544475	-142055308	+	RMER19C	LTR	ERVK	183	204	-407	5
718	230	275	10	71	chr3	17544551	17544622	-142055161	+	RMER19C	LTR	ERVK	205	274	-337	5
718	638	303	58	49	chr3	17544732	17544975	-142054808	+	MTE2a	LTR	MaLR	135	379	0	6
718	2430	82	95	109	chr3	17545856	17546351	-142053432	+	RLTR44C	LTR	ERVK	1	488	-14	6
718	649	332	73	29	chr3	17546358	17546699	-142053084	-	MLT1B	LTR	MaLR	-28	362	7	6
718	397	308	0	8	chr3	17556540	17556658	-142043125	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	117	-439	7
718	231	319	124	54	chr3	17556745	17556884	-142042899	+	MLT2B4	LTR	ERVL	310	475	-81	7
718	3973	163	32	142	chr3	17559720	17560547	-142039236	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	726	-176	7
718	3973	163	32	142	chr3	17560692	17560878	-142038905	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	727	902	0	7
719	1418	262	71	8	chr3	17571705	17572070	-142027713	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	32	9
719	3861	254	80	47	chr3	17572102	17573300	-142026483	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1	1257	20	9
719	657	224	154	8	chr3	17573315	17573557	-142026226	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	13	9
719	4877	135	51	32	chr3	17577583	17578468	-142021315	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-4	902	1	9
719	3758	58	19	0	chr3	17605168	17605634	-141994149	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	1
719	1728	184	13	10	chr3	17611767	17612080	-141987703	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	354	-40	1
719	316	118	78	0	chr3	17613672	17613723	-141986060	+	ORR1B1	LTR	MaLR	340	394	0	1
719	851	217	0	0	chr3	17613723	17613884	-141985899	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	161	-1348	1
719	286	143	0	39	chr3	17614371	17614422	-141985361	+	MTC	LTR	MaLR	373	421	0	1
719	3063	216	67	37	chr3	17615147	17615269	-141984514	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1130	1
719	3063	216	67	37	chr3	17615404	17616042	-141983741	-	MTC-int	LTR	MaLR	-129	1129	475	1
719	1446	215	65	0	chr3	17636063	17636356	-141963427	+	MTC	LTR	MaLR	110	421	0	1
719	1357	117	40	5	chr3	17640941	17641165	-141958618	-	RMER19A	LTR	ERVK	-503	234	3	1
719	758	259	48	10	chr3	17643071	17643278	-141956505	-	MTC	LTR	MaLR	-57	364	150	1
719	1087	104	4	30	chr3	17648731	17648994	-141950789	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	13	396	0	1
719	2769	95	2	24	chr3	17658054	17658288	-141941495	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	176	1
719	2769	95	2	24	chr3	17658436	17658610	-141941173	-	MTB	LTR	MaLR	-225	175	1	1
719	1353	209	4	0	chr3	17662507	17662765	-141937018	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	259	-123	2
719	521	242	28	83	chr3	17662949	17663093	-141936690	+	RLTR14	LTR	ERV1	247	382	0	2
719	3759	68	2	97	chr3	17664431	17664997	-141934786	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	2
720	346	291	19	0	chr3	17704973	17705076	-141894707	-	MLT1I	LTR	MaLR	-11	400	296	2
720	266	319	0	0	chr3	17705184	17705253	-141894530	-	MLT1I	LTR	MaLR	-242	169	101	2
720	343	296	71	8	chr3	17717355	17717481	-141882302	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-8	554	421	2
720	1538	212	75	3	chr3	17717626	17717972	-141881811	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	1	2
720	247	276	9	133	chr3	17726871	17726984	-141872799	+	MTEb	LTR	MaLR	268	366	-13	2
720	1056	145	40	53	chr3	17729284	17729465	-141870318	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	187	-254	2
720	1834	148	47	3	chr3	17729465	17729763	-141870020	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	2
720	1056	145	40	53	chr3	17729763	17729781	-141870002	+	BGLII_B	LTR	ERVK	188	200	-241	2
720	1056	248	192	41	chr3	17729880	17730245	-141869538	+	BGLII_B	LTR	ERVK	107	548	-5	2
720	545	314	31	82	chr3	17733449	17733840	-141865943	-	MTEb	LTR	MaLR	-6	353	5	2
720	1397	151	59	0	chr3	17738492	17738730	-141861053	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	68	2
720	696	311	35	45	chr3	17738730	17739016	-141860767	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	283	-285	3
720	512	270	0	90	chr3	17739006	17739173	-141860610	+	RLTR20D	LTR	ERVK	423	574	-4	3
720	522	186	61	35	chr3	17739132	17739294	-141860489	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-205	141	4	3
720	6770	155	38	45	chr3	17739294	17740615	-141859168	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-34	1929	619	3
720	325	333	0	9	chr3	17741953	17742065	-141857718	+	MLT1A0	LTR	MaLR	248	358	-7	3
720	412	227	56	118	chr3	17744693	17744888	-141854895	+	RLTR8	LTR	ERVK	182	365	0	3
720	377	359	87	68	chr3	17744991	17745359	-141854424	-	MLT1G	LTR	MaLR	-184	411	32	3
720	575	324	144	56	chr3	17745791	17746111	-141853672	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	355	-4	3
720	425	294	71	8	chr3	17746116	17746243	-141853540	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	2	136	-1444	3
720	532	244	8	8	chr3	17746947	17747067	-141852716	-	MER34A	LTR	ERV1	-438	133	14	3
720	606	346	90	19	chr3	17753139	17753436	-141846347	+	MLT1A0	LTR	MaLR	39	366	-8	3
720	299	323	71	171	chr3	17755152	17755492	-141844291	-	ORR1E	LTR	MaLR	-51	308	3	3
720	1684	179	93	48	chr3	17757068	17757489	-141842294	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	440	-2	3
720	889	346	68	42	chr3	17757984	17758488	-141841295	+	MT2A	LTR	ERVL	1	517	-16	3
720	2037	177	61	83	chr3	17760623	17761079	-141838704	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	3
720	2488	193	64	51	chr3	17761477	17761794	-141837989	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	343	-198	3
720	2488	193	64	51	chr3	17761817	17762033	-141837750	+	RLTR20A	LTR	ERVK	344	541	0	3
720	490	330	44	49	chr3	17768766	17768992	-141830791	-	MLT1C	LTR	MaLR	-3	464	240	3
720	305	344	24	16	chr3	17770317	17770444	-141829339	-	MLT1C	LTR	MaLR	-214	253	126	3
720	1073	223	30	117	chr3	17772099	17772399	-141827384	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	274	-238	3
720	623	227	57	0	chr3	17772399	17772540	-141827243	+	RLTR18B	LTR	ERVK	121	269	-243	3
720	3046	42	0	0	chr3	17776297	17776651	-141823132	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	354	-3	3
720	374	205	61	69	chr3	17776651	17776782	-141823001	+	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	17	146	-1324	3
720	2839	129	9	0	chr3	17776781	17777245	-141822538	+	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	571	1038	-432	3
720	797	126	0	0	chr3	17777240	17777359	-141822424	+	IAPEy-int	LTR	ERVK	1236	1354	-6159	3
720	3004	26	79	35	chr3	17781498	17781892	-141817891	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	3
720	853	340	49	27	chr3	17785007	17785376	-141814407	+	MTEb	LTR	MaLR	3	379	0	3
720	2914	91	15	2	chr3	17787452	17787847	-141811936	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
720	1558	183	39	78	chr3	17793376	17793785	-141805998	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	3
720	1735	219	98	8	chr3	17797698	17798076	-141801707	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	1	3
720	3301	34	18	0	chr3	17810627	17811014	-141788769	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	394	-2	3
720	1572	214	83	35	chr3	17812734	17813106	-141786677	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	116	3
720	2214	129	72	8	chr3	17813869	17814245	-141785538	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	400	-3	3
720	3861	66	4	4	chr3	17821974	17822477	-141777306	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	1	4
721	1195	251	42	42	chr3	17828235	17828613	-141771170	+	MTEa	LTR	MaLR	2	379	0	4
721	3558	78	4	6	chr3	17831924	17832412	-141767371	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	487	-16	4
721	574	324	70	65	chr3	17837047	17837484	-141762299	+	RLTR12B	LTR	ERVK	25	352	-216	4
721	403	289	52	54	chr3	17838270	17838409	-141761374	+	RLTR17	LTR	ERVK	60	219	-358	4
721	403	297	112	122	chr3	17838434	17838785	-141760998	+	RLTR17	LTR	ERVK	208	566	-126	4
721	2011	209	53	35	chr3	17838951	17839502	-141760281	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	4
721	665	311	81	37	chr3	17841063	17841360	-141758423	-	MT2A	LTR	ERVL	-138	395	86	4
721	379	238	14	19	chr3	17843126	17843225	-141756558	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	263	4
721	3908	139	79	5	chr3	17843225	17843869	-141755914	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	4
721	592	253	103	13	chr3	17843879	17844035	-141755748	-	ORR1E	LTR	MaLR	-110	249	80	4
721	261	337	24	0	chr3	17845507	17845590	-141754193	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-317	172	88	4
721	263	370	16	8	chr3	17845884	17846012	-141753771	-	MLT1H2-int	LTR	MaLR	-265	1224	1096	4
721	352	236	105	35	chr3	17848130	17848244	-141751539	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-28	346	225	4
721	226	253	85	37	chr3	17848332	17848414	-141751369	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-409	154	69	4
721	948	348	36	30	chr3	17849818	17850183	-141749600	-	MTE2b	LTR	MaLR	-12	367	1	4
721	528	267	80	40	chr3	17850278	17850477	-141749306	+	RMER15	LTR	ERVL	299	505	-70	4
721	400	219	10	30	chr3	17850456	17850555	-141749228	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-471	97	1	4
721	539	194	68	29	chr3	17852603	17852784	-141746999	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-14	405	231	4
721	2545	115	51	40	chr3	17854142	17854612	-141745171	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
721	24919	18	4	0	chr3	17854612	17857556	-141742227	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3525	4
721	885	73	24	0	chr3	17857556	17857679	-141742104	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4785	4
721	1706	123	4	4	chr3	17857676	17857938	-141741845	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2236	4
721	424	38	0	0	chr3	17857937	17857990	-141741793	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5070	1411	1359	4
721	5030	43	6	14	chr3	17857990	17858650	-141741133	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	8	4
721	2545	115	51	40	chr3	17858650	17859120	-141740663	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
721	2871	6	3	0	chr3	17869639	17869960	-141729823	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
721	1016	267	32	43	chr3	17871053	17871331	-141728452	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-95	275	1	4
721	2092	77	30	20	chr3	17885191	17885495	-141714288	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-20	307	1	4
721	642	329	50	14	chr3	17890532	17890813	-141708970	+	MER68	LTR	ERVL	264	554	-9	4
721	549	250	88	60	chr3	17899751	17900036	-141699747	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	293	-66	5
721	1378	209	19	15	chr3	17904273	17904535	-141695248	+	RMER4A	LTR	ERVK	8	270	-196	5
721	3988	236	85	76	chr3	17904562	17905826	-141693957	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	334	1570	-756	5
721	3988	236	85	76	chr3	17906631	17907132	-141692651	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1571	2114	-212	5
721	1015	139	19	0	chr3	17907168	17907326	-141692457	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-49	345	185	5
721	283	185	123	0	chr3	17907330	17907411	-141692372	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8799	8889	-70	5
721	1771	167	22	25	chr3	17907455	17907811	-141691972	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	355	-4	5
721	438	238	48	16	chr3	17907826	17907903	-141691880	+	RMER4A	LTR	ERVK	270	345	-121	5
721	438	238	48	16	chr3	17908003	17908049	-141691734	+	RMER4A	LTR	ERVK	346	397	-69	5
721	433	246	158	79	chr3	17912339	17912542	-141687241	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	219	-408	5
721	408	228	98	10	chr3	17912626	17912728	-141687055	+	RMER20B	LTR	ERVK	147	257	-370	5
721	231	275	32	32	chr3	17912781	17912875	-141686908	+	RMER20B	LTR	ERVK	329	422	-94	5
721	751	280	97	73	chr3	17915728	17916098	-141683685	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	5
721	1575	156	152	22	chr3	17916575	17916890	-141682893	+	ORR1B1	LTR	MaLR	39	394	0	5
721	2880	58	13	3	chr3	17920931	17921311	-141678472	-	MTB	LTR	MaLR	-16	384	1	5
721	650	259	276	6	chr3	17923705	17924024	-141675759	+	MTD	LTR	MaLR	15	419	0	5
721	4746	55	5	0	chr3	17924219	17924803	-141674980	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	5
721	1916	231	9	106	chr3	17930197	17930724	-141669059	+	RMER19C	LTR	ERVK	3	478	-133	5
722	3156	24	45	8	chr3	17969275	17969657	-141630126	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
722	7801	82	19	3	chr3	17969657	17970737	-141629046	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
722	3419	30	0	2	chr3	17970737	17971134	-141628649	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
722	257	298	12	23	chr3	17972985	17973071	-141626712	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-19	389	305	5
722	2681	109	10	2	chr3	17993421	17993818	-141605965	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
722	1090	285	123	20	chr3	18004597	18004955	-141594828	+	MTD	LTR	MaLR	18	412	-7	6
722	2786	109	20	10	chr3	18008561	18008960	-141590823	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	5	407	0	1
722	721	286	190	43	chr3	18020589	18020889	-141578894	-	MTEa	LTR	MaLR	-35	344	1	2
722	1488	141	215	4	chr3	18021279	18021549	-141578234	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
722	3242	43	2	10	chr3	18021811	18022210	-141577573	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
722	307	316	26	17	chr3	18024595	18024711	-141575072	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	117	-248	3
722	2136	178	7	30	chr3	18024705	18025133	-141574650	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	987	1404	-105	2
722	1888	191	82	8	chr3	18026720	18027121	-141572662	+	RLTR25B	LTR	ERVK	594	1024	-4	3
722	557	135	67	0	chr3	18030072	18030161	-141569622	+	MTC	LTR	MaLR	1	95	-326	4
722	2021	147	16	9	chr3	18030888	18031204	-141568579	+	MTC	LTR	MaLR	104	421	0	4
722	671	265	10	8	chr3	18035135	18035326	-141564457	+	MLT2C1	LTR	ERVL	8	202	-212	4
722	2232	84	132	11	chr3	18035807	18036155	-141563628	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	5
722	323	316	132	0	chr3	18036489	18036625	-141563158	+	MLT2C1	LTR	ERVL	189	342	-55	4
722	2126	83	86	0	chr3	18053905	18054206	-141545577	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
722	2595	172	72	8	chr3	18056536	18057063	-141542720	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	8
722	758	210	0	7	chr3	18070146	18070285	-141529498	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	140	-234	9
722	1607	148	231	3	chr3	18070291	18070624	-141529159	+	MT2B	LTR	ERVL	193	601	0	9
722	2618	34	0	0	chr3	18071792	18072112	-141527671	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	320	-76	1
722	3558	49	6	8	chr3	18072095	18072569	-141527214	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	626	1098	0	1
722	3495	23	0	0	chr3	18072569	18072965	-141526818	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
722	386	274	150	64	chr3	18075130	18075317	-141524466	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	168	1
722	1567	124	101	0	chr3	18075598	18075855	-141523928	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1029	1311	-652	1
722	640	322	0	32	chr3	18075890	18076076	-141523707	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-190	180	1	1
722	1134	296	54	95	chr3	18077205	18077461	-141522322	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	297	1
722	1134	296	54	95	chr3	18077625	18077884	-141521899	-	RMER5	LTR	ERV1	-238	296	40	1
723	2692	70	3	0	chr3	18095450	18095793	-141503990	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	3	1
723	2672	83	44	5	chr3	18124016	18124401	-141475382	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
723	1856	192	149	71	chr3	18125114	18125737	-141474046	-	RMER6C	LTR	ERVK	-16	674	3	1
723	594	293	19	79	chr3	18133967	18134182	-141465601	-	MLT1D	LTR	MaLR	-52	453	252	1
723	918	207	36	234	chr3	18134479	18134945	-141464838	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
723	1072	253	72	91	chr3	18135580	18136041	-141463742	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	117	1
723	1007	184	281	22	chr3	18144296	18144655	-141455128	-	RLTR24	LTR	ERV1	-72	457	6	1
723	1607	196	80	39	chr3	18146999	18147387	-141452396	-	MTD	LTR	MaLR	-6	413	10	2
723	241	306	92	92	chr3	18147639	18147923	-141451860	-	MLT2E	LTR	ERVL	-96	533	220	2
723	1478	231	72	25	chr3	18147926	18148326	-141451457	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
723	2038	152	70	3	chr3	18151808	18152177	-141447606	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
723	361	374	52	90	chr3	18152215	18152580	-141447203	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	15	2
723	322	256	14	92	chr3	18153397	18153495	-141446288	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2320	2418	-2581	2
723	322	256	14	92	chr3	18153677	18153720	-141446063	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2419	2450	-2549	2
723	472	315	34	43	chr3	18154316	18154525	-141445258	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4451	4657	-342	2
723	2358	123	27	35	chr3	18156520	18156924	-141442859	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	9	2
723	1231	295	39	6	chr3	18157791	18158146	-141441637	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	1	2
723	1006	141	95	33	chr3	18159539	18159784	-141439999	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-85	274	3	2
723	2231	138	55	3	chr3	18159895	18160258	-141439525	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	5	2
723	2995	87	5	12	chr3	18161202	18161612	-141438171	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	2
723	4385	187	44	28	chr3	18161612	18162539	-141437244	+	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	3	1115	-255	2
723	1102	335	110	74	chr3	18168570	18169457	-141430326	+	MTE-int	LTR	MaLR	58	1014	-566	2
723	1592	278	112	9	chr3	18169853	18170390	-141429393	+	MTE-int	LTR	MaLR	933	1524	-56	2
723	256	307	22	11	chr3	18174604	18174693	-141425090	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	90	-269	2
723	2340	106	73	43	chr3	18183317	18183712	-141416071	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
723	294	227	58	22	chr3	18188442	18188552	-141411231	+	MLT1D	LTR	MaLR	427	502	-3	2
723	4120	39	67	74	chr3	18189392	18190001	-141409782	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	1	605	-49	2
723	4324	39	2	1	chr3	18190001	18190728	-141409055	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1	747	-2951	2
723	869	111	322	21	chr3	18190762	18190942	-141408841	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	185	418	-7138	2
723	5994	66	10	15	chr3	18190983	18192419	-141407364	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	738	2013	-1685	2
723	2689	78	0	0	chr3	18196726	18197072	-141402711	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
723	304	274	46	28	chr3	18198762	18198871	-141400912	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4134	1388	1278	2
723	2360	57	91	3	chr3	18207378	18207696	-141392087	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
90	1976	127	41	13	chr3	18218906	18219224	-141380559	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
724	570	305	121	8	chr3	18220142	18220406	-141379377	-	MTE2a	LTR	MaLR	-16	363	70	2
724	332	320	0	48	chr3	18223358	18223463	-141376320	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-518	1062	963	2
724	1089	335	104	20	chr3	18223439	18224037	-141375746	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-806	774	127	2
724	1982	169	48	6	chr3	18224048	18224400	-141375383	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	28	2
724	356	96	0	0	chr3	18225534	18225586	-141374197	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-342	52	1	3
724	462	282	26	0	chr3	18225586	18225703	-141374080	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-1460	120	1	2
724	534	205	43	53	chr3	18225704	18225888	-141373895	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	405	242	2
724	5477	57	13	31	chr3	18256956	18257728	-141342055	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-14	888	1	3
724	349	293	58	155	chr3	18271960	18272186	-141327597	+	MLT2B2	LTR	ERVL	4	207	-308	3
724	517	279	55	48	chr3	18272179	18272450	-141327333	+	RLTR15	LTR	ERVK	72	344	-15	3
724	329	344	95	71	chr3	18272483	18272693	-141327090	+	MLT2B1	LTR	ERVL	130	344	-176	3
724	292	194	4	12	chr3	18274210	18274272	-141325511	+	LTR48B	LTR	ERV1	1	60	-727	3
724	495	316	69	6	chr3	18276315	18276490	-141323293	+	MLT1D	LTR	MaLR	310	495	-10	3
724	2713	45	3	0	chr3	18295753	18296090	-141303693	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	338	-8	3
724	1984	209	72	22	chr3	18301563	18302066	-141297717	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	3
724	4106	133	76	3	chr3	18316237	18316924	-141282859	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	4
724	247	260	39	59	chr3	18320212	18320314	-141279469	-	RMER4B	LTR	ERVK	-474	111	12	4
724	1658	208	47	11	chr3	18326251	18326610	-141273173	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	4
724	2889	39	0	0	chr3	18348923	18349255	-141250528	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	4
725	864	298	101	40	chr3	18351462	18351689	-141248094	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	244	-126	4
725	3807	28	5	0	chr3	18351689	18352123	-141247660	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	4
725	864	298	101	40	chr3	18352123	18352241	-141247542	+	ORR1D2	LTR	MaLR	245	367	-3	4
725	982	262	16	35	chr3	18352245	18352502	-141247281	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	2	253	-1117	4
725	786	314	32	39	chr3	18359072	18359354	-141240429	+	MER21B	LTR	ERV1	345	624	-239	4
725	440	313	104	33	chr3	18359355	18359680	-141240103	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	19	4
725	395	322	107	0	chr3	18359728	18359877	-141239906	+	MER21B	LTR	ERV1	663	827	-36	4
725	349	353	152	28	chr3	18360191	18360474	-141239309	-	MER90a	LTR	ERV1	-294	320	3	4
725	2837	196	21	12	chr3	18366658	18367216	-141232567	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	563	0	4
725	3368	165	63	24	chr3	18371489	18372155	-141227628	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	4
725	1637	229	65	16	chr3	18374170	18374556	-141225227	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	4
725	242	293	48	12	chr3	18379746	18379829	-141219954	+	MTE2a	LTR	MaLR	279	364	-15	4
725	1641	159	30	100	chr3	18383694	18384135	-141215648	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	4
725	372	271	120	40	chr3	18398616	18398766	-141201017	+	MTD	LTR	MaLR	1	162	-257	5
725	603	237	42	37	chr3	18398766	18398981	-141200802	-	RLTR12A	LTR	ERVK	0	568	353	5
725	1204	149	42	9	chr3	18398992	18399208	-141200575	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-345	223	1	5
725	855	230	164	19	chr3	18399211	18399424	-141200359	+	MTD	LTR	MaLR	161	404	-15	5
725	1748	252	125	63	chr3	18399438	18400508	-141199275	+	MTD-int	LTR	MaLR	6	1258	0	5
725	1309	300	37	8	chr3	18400508	18400915	-141198868	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	5
725	334	260	9	63	chr3	18401084	18401195	-141198588	+	ORR1D2	LTR	MaLR	192	296	-74	5
725	845	241	25	10	chr3	18401453	18401654	-141198129	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	174	5
725	498	318	33	33	chr3	18401698	18401939	-141197844	-	RLTR15	LTR	ERVK	-71	288	48	5
725	2796	248	14	22	chr3	18402010	18402756	-141197027	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-303	6247	5523	5
725	671	194	68	44	chr3	18409252	18409306	-141190477	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1040	5510	5449	5
725	671	194	68	44	chr3	18409354	18409449	-141190334	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1102	5448	5358	5
725	2300	105	49	40	chr3	18409449	18409854	-141189929	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	5
725	671	194	68	44	chr3	18409854	18409908	-141189875	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1193	5357	5301	5
725	414	256	152	24	chr3	18409908	18410072	-141189711	-	RMER4A	LTR	ERVK	-27	439	255	5
725	1429	264	30	15	chr3	18410073	18410451	-141189332	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-403	5377	4749	5
725	1701	244	52	32	chr3	18410781	18411507	-141188276	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-223	2954	1736	5
725	256	307	81	62	chr3	18411508	18411668	-141188115	-	RLTR15	LTR	ERVK	-154	205	43	5
725	614	276	84	54	chr3	18411744	18411947	-141187836	-	MTEb	LTR	MaLR	-170	209	1	5
725	391	317	64	41	chr3	18412140	18412311	-141187472	+	LTR86C	LTR	ERVL	136	310	-311	5
725	745	188	29	0	chr3	18412376	18412514	-141187269	-	MTD	LTR	MaLR	-266	153	12	5
725	336	210	0	0	chr3	18413196	18413258	-141186525	+	MTEb	LTR	MaLR	5	66	-313	5
725	988	283	38	48	chr3	18413260	18413553	-141186230	+	MTEb	LTR	MaLR	35	324	-55	5
725	451	329	91	59	chr3	18423430	18423737	-141176046	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	323	-36	5
725	374	286	47	23	chr3	18429212	18429341	-141170442	+	MLT1A1	LTR	MaLR	277	408	0	5
725	3396	30	5	0	chr3	18434780	18435174	-141164609	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
725	1171	299	45	8	chr3	18436524	18436881	-141162902	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	5
725	2320	219	106	41	chr3	18437575	18438140	-141161643	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	1	5
725	1101	280	36	22	chr3	18439687	18440052	-141159731	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	5
725	3112	153	48	11	chr3	18442613	18443135	-141156648	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	541	0	5
725	2660	184	115	2	chr3	18443447	18443746	-141156037	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	375	5
725	2660	184	115	2	chr3	18443831	18444131	-141155652	-	RMER6C	LTR	ERVK	-316	374	23	5
725	1099	137	53	14	chr3	18444098	18444306	-141155477	-	RMER6C	LTR	ERVK	-473	217	2	5
725	2924	49	0	0	chr3	18458248	18458594	-141141189	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
725	2221	206	30	94	chr3	18460266	18460840	-141138943	+	RMER19C	LTR	ERVK	75	611	0	5
725	2555	62	0	26	chr3	18463507	18463854	-141135929	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	1	5
725	4533	172	150	23	chr3	18467835	18468824	-141130959	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	1	1114	0	5
725	590	286	49	6	chr3	18470657	18470819	-141128964	+	MTEa	LTR	MaLR	211	379	0	5
725	1386	260	45	30	chr3	18472179	18472516	-141127267	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	80	5
725	412	218	46	0	chr3	18473009	18473096	-141126687	-	MTC	LTR	MaLR	-330	91	1	5
725	1031	279	110	12	chr3	18473132	18473462	-141126321	+	MTD	LTR	MaLR	18	405	-14	5
725	1392	169	40	14	chr3	18473476	18473753	-141126030	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	284	-277	5
725	502	204	41	0	chr3	18473740	18473838	-141125945	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-459	102	1	5
725	5394	172	56	40	chr3	18473839	18475119	-141124664	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1	2841	1541	5
90	2785	124	35	34	chr3	18480778	18481292	-141118491	+	MMETn-int	LTR	ERVK	4309	4814	-30	6
726	2785	124	35	34	chr3	18481319	18481339	-141118444	+	MMETn-int	LTR	ERVK	4815	4843	-1	6
726	1905	116	6	59	chr3	18481339	18481679	-141118104	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
726	5647	95	32	14	chr3	18482215	18483051	-141116732	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	173	6
726	1870	120	120	0	chr3	18484102	18484393	-141115390	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	327	0	6
726	277	247	0	124	chr3	18492699	18492796	-141106987	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	173	6
726	420	260	87	0	chr3	18495211	18495338	-141104445	-	RLTR40	LTR	ERVK	-218	599	462	6
726	823	193	60	88	chr3	18495789	18496039	-141103744	-	RLTR40	LTR	ERVK	-574	243	1	6
726	1690	127	124	0	chr3	18497081	18497372	-141102411	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	327	-5	6
726	891	96	20	33	chr3	18497375	18497526	-141102257	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1	149	-7531	6
726	1052	114	22	82	chr3	18497524	18497854	-141101929	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	538	952	-6629	6
726	1522	183	106	37	chr3	18497976	18498427	-141101356	+	RMER16-int	LTR	ERVK	255	659	-4747	6
726	288	139	0	0	chr3	18498463	18498506	-141101277	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	950	992	-995	6
726	265	299	17	8	chr3	18498646	18498764	-141101019	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	822	940	-5602	6
726	251	258	0	0	chr3	18498825	18498891	-141100892	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1499	1564	-6017	6
726	965	161	0	0	chr3	18498965	18499127	-141100656	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5007	5168	-1374	6
726	1583	136	52	2	chr3	18499191	18499522	-141100261	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6965	7338	-342	6
726	1245	205	58	18	chr3	18499539	18499882	-141099901	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	6125	6481	0	6
726	667	136	127	0	chr3	18499882	18500000	-141099783	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	133	-199	6
726	1026	121	121	0	chr3	18500000	18500173	-141099610	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	134	327	-5	1
726	1367	228	66	10	chr3	18507814	18508116	-141091667	+	ORR1B1	LTR	MaLR	76	394	0	9
726	1183	177	158	0	chr3	18508390	18508656	-141091127	-	RLTR24	LTR	ERV1	-2	527	220	1
726	2660	126	60	24	chr3	18508656	18509121	-141090662	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
726	6612	51	8	5	chr3	18509121	18509962	-141089821	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	0	7244	6401	1
726	243	302	35	106	chr3	18509962	18510103	-141089680	+	LTR50	LTR	ERVL	136	266	-529	1
726	470	299	0	13	chr3	18510103	18510262	-141089521	-	RNERVK23-int	LTR	ERVK	-673	7544	7388	1
726	2511	61	3	9	chr3	18510611	18510941	-141088842	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-5599	1645	1318	1
726	327	309	24	24	chr3	18511192	18511361	-141088422	-	SRV_MM-int	LTR	ERVK	-3623	2544	2376	1
726	693	120	8	0	chr3	18511809	18511926	-141087857	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6214	1030	913	1
726	1606	87	0	0	chr3	18512056	18512275	-141087508	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6334	910	692	1
726	4705	67	28	13	chr3	18512631	18513313	-141086470	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6552	692	1	1
726	2538	135	30	79	chr3	18513313	18513820	-141085963	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
726	1138	182	147	13	chr3	18513820	18514093	-141085690	-	RLTR24	LTR	ERV1	-235	294	1	1
726	419	268	235	18	chr3	18516302	18516519	-141083264	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	309	1
726	823	299	72	33	chr3	18516666	18517026	-141082757	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3	4996	4623	1
726	3469	196	66	26	chr3	18517528	18518405	-141081378	+	RMER13A	LTR	ERVK	5	892	-16	2
726	2191	301	64	34	chr3	18519547	18520522	-141079261	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3526	1473	470	1
726	2675	183	105	20	chr3	18520543	18521135	-141078648	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	2
726	492	370	24	20	chr3	18521138	18521389	-141078394	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4553	446	195	1
726	560	337	68	30	chr3	18521437	18521703	-141078080	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	299	1
726	308	337	47	9	chr3	18522550	18522691	-141077092	+	ORR1C1	LTR	MaLR	31	179	-195	2
726	239	269	88	48	chr3	18544327	18544452	-141055331	+	LTR48	LTR	ERV1	1	130	-657	5
726	241	302	80	86	chr3	18547684	18547847	-141051936	-	MLT1J	LTR	MaLR	-17	495	334	5
726	293	326	190	61	chr3	18548910	18549237	-141050546	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	312	680	0	6
726	896	320	7	19	chr3	18554714	18554985	-141044798	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	238	7
726	833	272	100	62	chr3	18556223	18556513	-141043270	-	MTEa	LTR	MaLR	-78	301	1	7
726	683	279	165	54	chr3	18557262	18557550	-141042233	-	MLT1C	LTR	MaLR	-16	451	117	7
726	2725	144	112	52	chr3	18557550	18557729	-141042054	+	RMER15	LTR	ERVL	1	168	-407	8
726	2725	144	112	52	chr3	18557786	18558148	-141041635	+	RMER15	LTR	ERVL	169	575	0	8
726	683	279	165	54	chr3	18558148	18558265	-141041518	-	MLT1C	LTR	MaLR	-351	116	1	7
726	627	315	41	33	chr3	18575334	18575577	-141024206	+	MLT1D	LTR	MaLR	261	505	0	1
726	264	287	35	0	chr3	18576522	18576637	-141023146	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5590	5708	-6	1
726	996	321	29	74	chr3	18576643	18577087	-141022696	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	424	-91	1
726	246	200	40	0	chr3	18577278	18577328	-141022455	+	MLT2B2	LTR	ERVL	499	550	-6	1
726	355	263	40	0	chr3	18577357	18577456	-141022327	+	MLT1D	LTR	MaLR	403	505	0	1
726	352	319	43	43	chr3	18580899	18581063	-141018720	-	LTR90B	LTR	LTR	-476	320	157	1
726	322	306	62	87	chr3	18582367	18582528	-141017255	+	MLT1J1	LTR	MaLR	44	200	-244	1
726	1129	184	127	46	chr3	18586957	18587264	-141012519	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	1
726	2340	104	3	24	chr3	18588397	18588731	-141011052	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
726	244	185	101	58	chr3	18589953	18590022	-141009761	+	ORR1B1	LTR	MaLR	286	357	-37	1
726	968	201	63	55	chr3	18590088	18590582	-141009201	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	410	0	1
726	455	340	77	58	chr3	18592716	18592975	-141006808	+	MLT1A0	LTR	MaLR	32	295	-70	1
726	668	310	183	10	chr3	18593372	18593662	-141006121	+	MER21B	LTR	ERV1	19	358	-505	1
726	887	174	307	9	chr3	18593719	18593947	-141005836	-	RLTR14	LTR	ERV1	-85	297	2	1
726	735	267	27	18	chr3	18594319	18594540	-141005243	-	LTRIS4	LTR	ERV1	0	507	285	1
726	4139	61	40	9	chr3	18596520	18597063	-141002720	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	1
726	230	337	76	0	chr3	18597764	18597856	-141001927	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	102	-257	1
726	1502	204	46	41	chr3	18597983	18598351	-141001432	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	5	1
726	1633	222	30	9	chr3	18609440	18609771	-140990012	+	ORR1D1	LTR	MaLR	37	374	0	1
727	236	191	131	0	chr3	18615873	18615957	-140983826	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-300	506	412	1
727	450	237	487	15	chr3	18623917	18624045	-140975738	+	MTEa	LTR	MaLR	3	192	-167	1
727	617	185	115	23	chr3	18624090	18624233	-140975550	+	MTEa	LTR	MaLR	193	375	-4	1
727	622	268	53	94	chr3	18629432	18629835	-140969948	-	RMER15	LTR	ERVL	-45	530	25	1
727	335	276	0	54	chr3	18638823	18638934	-140960849	-	RMER12	LTR	ERVK	-478	844	740	1
727	376	326	68	37	chr3	18640842	18641033	-140958750	-	MLT1K	LTR	MaLR	-22	573	377	1
727	552	369	132	7	chr3	18641238	18641519	-140958264	+	LTR33B	LTR	ERVL	2	317	-186	1
727	798	293	66	69	chr3	18652139	18652487	-140947296	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	352	6	2
727	324	322	207	22	chr3	18655034	18655302	-140944481	-	MLT1C	LTR	MaLR	-36	431	114	2
727	254	174	73	104	chr3	18660074	18660170	-140939613	+	MLT1I	LTR	MaLR	283	375	-36	2
727	286	250	68	0	chr3	18661595	18661683	-140938100	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	313	2
727	251	300	111	6	chr3	18667991	18668101	-140931682	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	124	-284	2
727	464	228	46	23	chr3	18668121	18668251	-140931532	+	MLT1A	LTR	MaLR	241	373	-1	2
727	2676	150	134	19	chr3	18668728	18669252	-140930531	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	1	2
727	1024	205	11	0	chr3	18671066	18671242	-140928541	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	201	2
727	4249	77	179	9	chr3	18671242	18671935	-140927848	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	811	-997	2
727	1491	137	23	35	chr3	18672205	18672462	-140927321	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1591	1844	-4	2
727	1146	210	34	57	chr3	18672832	18673095	-140926688	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	257	-121	2
727	2117	130	17	6	chr3	18673829	18674184	-140925599	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	2
727	236	309	8	86	chr3	18674833	18674950	-140924833	-	MT2B2	LTR	ERVL	-333	251	144	2
727	724	289	48	62	chr3	18675379	18675670	-140924113	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	104	2
727	245	230	108	0	chr3	18676458	18676532	-140923251	-	MLT1B	LTR	MaLR	-296	94	13	2
727	954	204	39	60	chr3	18688309	18688543	-140911240	-	MTD	LTR	MaLR	-190	229	1	2
727	4313	46	40	9	chr3	18689154	18689697	-140910086	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	2
727	702	290	122	75	chr3	18690413	18690838	-140908945	-	MLT1D	LTR	MaLR	-56	449	5	2
727	240	265	29	29	chr3	18694421	18694491	-140905292	-	ORR1E	LTR	MaLR	-23	356	287	2
727	486	309	26	13	chr3	18694524	18694675	-140905108	-	ORR1E	LTR	MaLR	-206	153	1	2
727	1895	216	56	19	chr3	18695763	18696193	-140903590	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	2
727	322	154	91	15	chr3	18701850	18701916	-140897867	-	MLT1J	LTR	MaLR	-340	172	102	2
727	2387	146	23	5	chr3	18716868	18717255	-140882528	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
727	518	341	167	18	chr3	18719047	18719322	-140880461	-	MTD	LTR	MaLR	-92	327	12	3
727	320	277	108	14	chr3	18719327	18719466	-140880317	-	MTD-int	LTR	MaLR	-4	1254	1103	3
727	227	325	65	41	chr3	18722111	18722281	-140877502	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	-54	533	360	3
727	3418	79	71	0	chr3	18723399	18723879	-140875904	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	71	3
727	3433	35	196	18	chr3	18724238	18724734	-140875049	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	1	3
727	3123	110	48	29	chr3	18728601	18729125	-140870658	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	10	543	-359	3
727	3732	74	25	25	chr3	18729102	18729672	-140870111	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	231	893	0	3
727	271	366	67	18	chr3	18733308	18733472	-140866311	+	LTR40a	LTR	ERVL	33	204	-315	3
727	2918	103	0	0	chr3	18737172	18737568	-140862215	-	MTB	LTR	MaLR	-2	398	3	3
727	5348	166	127	18	chr3	18737575	18737964	-140861819	-	MTB-int	LTR	MaLR	-5	1253	779	3
727	2207	86	16	7	chr3	18737964	18738270	-140861513	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	3
727	5348	166	127	18	chr3	18738270	18739010	-140860773	-	MTB-int	LTR	MaLR	-480	778	1	3
727	2083	114	26	0	chr3	18739014	18739320	-140860463	-	MTB	LTR	MaLR	-8	319	6	3
727	273	289	26	0	chr3	18739926	18740002	-140859781	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-17	348	271	3
727	314	315	44	26	chr3	18740033	18740147	-140859636	+	MLT1F2	LTR	MaLR	1	116	-444	3
727	585	345	116	10	chr3	18741152	18741541	-140858242	-	MLT1D	LTR	MaLR	-45	460	31	3
727	299	162	66	105	chr3	18742100	18742176	-140857607	+	RLTR25B	LTR	ERVK	437	509	-519	3
90	2062	157	80	16	chr3	18743087	18743474	-140856309	-	MTC	LTR	MaLR	-9	412	1	3
728	600	284	77	83	chr3	18745189	18745538	-140854245	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	11	3
728	639	293	115	20	chr3	18745767	18745893	-140853890	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-96	1484	1343	3
728	639	293	115	20	chr3	18745924	18746041	-140853742	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-238	1342	1218	3
728	673	288	43	64	chr3	18746062	18746457	-140853326	-	RLTR33	LTR	ERVK	-30	648	175	3
728	637	356	121	33	chr3	18746513	18747001	-140852782	-	MT2A	LTR	ERVL	-1	532	2	3
728	1155	339	49	41	chr3	18747001	18747509	-140852274	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-371	1209	698	3
728	258	354	0	0	chr3	18748537	18748616	-140851167	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-908	672	594	3
728	853	283	63	38	chr3	18748628	18748944	-140850839	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-1029	551	228	3
728	834	275	85	69	chr3	18749012	18749461	-140850322	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-31	497	42	3
728	629	250	47	32	chr3	18750127	18750317	-140849466	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-1386	194	2	3
728	321	308	7	103	chr3	18750295	18750440	-140849343	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	246	3
728	260	258	37	102	chr3	18751011	18751119	-140848664	-	MTE2b	LTR	MaLR	-253	106	1	3
728	386	225	0	0	chr3	18761907	18761978	-140837805	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-303	71	1	3
728	524	317	7	20	chr3	18762361	18762509	-140837274	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	149	-210	3
728	337	312	39	80	chr3	18762507	18762779	-140837004	+	MTEa	LTR	MaLR	89	379	0	3
728	685	210	0	16	chr3	18766657	18766783	-140833000	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	298	3
728	732	333	91	18	chr3	18766830	18767042	-140832741	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-220	295	86	3
728	732	333	91	18	chr3	18767091	18767153	-140832630	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-430	85	2	3
728	644	233	128	117	chr3	18767266	18767641	-140832142	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	3
728	341	217	15	37	chr3	18774009	18774143	-140825640	+	RMER17B	LTR	ERVK	328	458	-500	3
728	899	184	117	56	chr3	18775380	18775576	-140824207	-	MT2B	LTR	ERVL	-321	280	73	3
728	1430	190	44	22	chr3	18775442	18775807	-140823976	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-1163	800	459	4
728	242	265	101	10	chr3	18779894	18779993	-140819790	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-298	110	3	4
728	1567	263	45	15	chr3	18780097	18780498	-140819285	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	4
728	328	308	0	0	chr3	18780582	18780673	-140819110	+	MLT1C	LTR	MaLR	55	145	-322	4
728	2456	187	44	40	chr3	18784223	18784720	-140815063	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	1	4
728	1547	186	14	77	chr3	18785355	18785704	-140814079	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	327	-2	4
728	9255	140	48	134	chr3	18785707	18786888	-140812895	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	2	1090	-873	4
728	9255	140	48	134	chr3	18786909	18787858	-140811925	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1091	1948	-15	4
728	1868	152	3	73	chr3	18787867	18788221	-140811562	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
728	971	262	91	14	chr3	18789133	18789298	-140810485	+	MTEb	LTR	MaLR	1	181	-198	4
728	971	262	91	14	chr3	18789392	18789578	-140810205	+	MTEb	LTR	MaLR	182	378	-1	4
728	671	357	93	49	chr3	18790834	18791179	-140808604	+	MER77	LTR	ERVL	41	400	-207	4
728	988	240	15	0	chr3	18791306	18791506	-140808277	-	MTEb	LTR	MaLR	-7	372	170	4
728	2329	221	124	59	chr3	18791615	18792293	-140807490	+	RMER13A	LTR	ERVK	76	860	0	4
728	485	257	0	19	chr3	18792293	18792400	-140807383	-	MTEb	LTR	MaLR	-266	113	9	4
728	3261	33	10	0	chr3	18793890	18794282	-140805501	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
728	8751	46	13	4	chr3	18794282	18795370	-140804413	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
728	3349	35	5	0	chr3	18795370	18795764	-140804019	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
728	2130	123	3	59	chr3	18796261	18796599	-140803184	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	4
728	325	328	107	74	chr3	18797264	18797369	-140802414	+	LTR78	LTR	ERV1	270	376	-928	4
728	1360	240	79	10	chr3	18797369	18797761	-140802022	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
728	325	328	107	74	chr3	18797761	18797899	-140801884	+	LTR78	LTR	ERV1	377	521	-783	4
728	501	338	60	23	chr3	18804065	18804413	-140795370	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	1	4
728	1988	151	0	62	chr3	18810288	18810726	-140789057	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
728	1052	263	50	14	chr3	18810726	18811003	-140788780	+	ORR1D1	LTR	MaLR	88	374	0	4
728	407	262	101	162	chr3	18811977	18812323	-140787460	-	RMER20A	LTR	ERVK	-70	557	233	4
728	522	329	32	49	chr3	18815747	18815993	-140783790	+	MLT1C	LTR	MaLR	157	398	-69	4
728	1894	211	48	10	chr3	18817158	18817556	-140782227	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	4
728	1320	253	49	6	chr3	18817705	18818031	-140781752	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	35	4
728	2566	61	58	0	chr3	18819005	18819332	-140780451	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
728	4367	191	33	39	chr3	18826659	18827700	-140772083	-	RMER12	LTR	ERVK	-165	1407	1	4
728	893	310	97	21	chr3	18830922	18831261	-140768522	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	365	0	4
728	275	291	48	57	chr3	18847126	18847250	-140752533	+	ORR1E	LTR	MaLR	220	342	-17	4
728	1411	258	101	93	chr3	18850265	18850638	-140749145	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	233	4
728	1411	258	101	93	chr3	18850974	18851195	-140748588	-	RLTR18	LTR	ERVK	-391	225	9	4
728	434	269	29	147	chr3	18860778	18860948	-140738835	+	RLTR18B	LTR	ERVK	48	197	-315	5
728	873	274	52	93	chr3	18861081	18861463	-140738320	+	RLTR18	LTR	ERVK	110	616	0	5
728	281	316	25	34	chr3	18862502	18862620	-140737163	-	MTE2a	LTR	MaLR	-30	349	233	5
728	260	232	36	0	chr3	18864292	18864348	-140735435	-	RLTR14	LTR	ERV1	-324	58	1	5
728	287	309	42	11	chr3	18864944	18865039	-140734744	+	RMER20B	LTR	ERVK	523	620	-7	5
728	422	306	304	3	chr3	18873019	18873308	-140726475	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	3	5
729	699	234	48	6	chr3	18892927	18893095	-140706688	-	RMER5	LTR	ERV1	-327	207	33	5
729	478	309	145	38	chr3	18894451	18894740	-140705043	+	MLT1A0	LTR	MaLR	24	343	-22	5
729	292	258	66	47	chr3	18905774	18905880	-140693903	+	MTEa	LTR	MaLR	272	379	0	5
729	1683	208	62	8	chr3	18912172	18912559	-140687224	+	MTD	LTR	MaLR	12	419	0	5
729	375	172	10	106	chr3	18912767	18912871	-140686912	+	MER31B	LTR	ERV1	373	466	0	5
729	386	356	85	22	chr3	18914579	18914803	-140684980	+	MLT1D	LTR	MaLR	268	505	0	5
729	394	329	40	34	chr3	18914824	18915000	-140684783	+	MLT1D-int	LTR	MaLR	19	195	-1294	5
729	345	259	63	78	chr3	18915545	18915750	-140684033	+	MLT1D-int	LTR	MaLR	405	606	-883	5
729	395	300	230	16	chr3	18922177	18922434	-140677349	+	MLT1D-int	LTR	MaLR	877	1188	-301	5
729	900	249	34	55	chr3	18922433	18922726	-140677057	+	RLTR14	LTR	ERV1	44	330	-52	5
729	3608	33	5	0	chr3	18926044	18926438	-140673345	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
729	302	313	45	45	chr3	18926447	18926604	-140673179	+	RMER15	LTR	ERVL	351	507	-68	5
729	3329	48	8	5	chr3	18927960	18928355	-140671428	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
729	341	219	0	0	chr3	18930090	18930154	-140669629	+	RMER15	LTR	ERVL	403	466	-109	5
729	1306	232	171	6	chr3	18935158	18935504	-140664279	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	1	5
729	856	181	352	120	chr3	18940951	18941263	-140658520	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	6
729	1140	264	66	30	chr3	18944355	18944719	-140655064	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	6
729	429	259	19	81	chr3	18947353	18947513	-140652270	+	MLT1E2	LTR	MaLR	394	543	-84	6
729	948	210	155	93	chr3	18948229	18948630	-140651153	-	MT2B	LTR	ERVL	-55	546	13	6
729	467	285	142	19	chr3	18955468	18955808	-140643975	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	87	6
729	301	378	59	5	chr3	18964328	18964530	-140635253	+	MLT1J	LTR	MaLR	124	336	-176	6
729	1674	233	143	94	chr3	18968368	18969111	-140630672	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	779	-38	6
729	843	308	151	28	chr3	18983374	18983731	-140616052	-	MLT1F	LTR	MaLR	-62	486	86	6
729	753	139	82	20	chr3	18985284	18985431	-140614352	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	156	-265	6
729	3142	128	6	4	chr3	18985433	18985919	-140613864	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	487	-16	6
729	1429	200	33	4	chr3	18985919	18986195	-140613588	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	124	407	0	6
729	2528	102	6	0	chr3	18987434	18987759	-140612024	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
729	7913	148	63	28	chr3	18987759	18989273	-140610510	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	396	6
729	1152	104	142	0	chr3	18989265	18989448	-140610335	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-114	213	5	6
729	3479	142	31	14	chr3	18993677	18994249	-140605534	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	582	-3	6
729	343	324	98	47	chr3	19002715	19002990	-140596793	+	LTR40c	LTR	ERVL	173	461	-4	6
729	418	215	21	11	chr3	19003086	19003180	-140596603	+	RMER5	LTR	ERV1	413	507	-27	7
729	391	255	75	14	chr3	19004132	19004279	-140595504	+	RMER5	LTR	ERV1	33	188	-346	1
729	1680	188	82	36	chr3	19004738	19005103	-140594680	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	1
730	3929	164	52	7	chr3	19007533	19008238	-140591545	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	1
730	5195	133	25	59	chr3	19009362	19010296	-140589487	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	2
730	5397	116	5	19	chr3	19011465	19012301	-140587482	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7048	1911	1088	2
730	1523	162	39	29	chr3	19012304	19012616	-140587167	-	RLTR46	LTR	ERVK	-5	315	1	2
730	33365	219	28	8	chr3	19012616	19015230	-140584553	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	5020	2
730	33365	219	28	8	chr3	19015667	19020051	-140579732	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2661	5019	536	2
730	481	233	29	122	chr3	19020047	19020252	-140579531	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-7494	186	1	2
730	1525	156	39	29	chr3	19020260	19020571	-140579212	-	RLTR46	LTR	ERVK	-6	314	1	2
730	4319	149	81	41	chr3	19020571	19021624	-140578159	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7862	1097	3	2
730	1755	144	128	63	chr3	19025146	19025575	-140574208	-	RMER6B	LTR	ERVK	-4	457	1	3
730	778	199	51	34	chr3	19027123	19027300	-140572483	-	MTE2b	LTR	MaLR	-18	361	182	4
730	622	289	123	81	chr3	19027303	19027797	-140571986	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	2	4
730	715	217	41	18	chr3	19027810	19027979	-140571804	-	MTE2b	LTR	MaLR	-204	175	3	4
730	4302	132	29	35	chr3	19036464	19037225	-140562558	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	6
730	343	247	6	1	chr3	19038474	19038559	-140561224	+	MTEb	LTR	MaLR	272	367	-12	6
730	338	264	149	62	chr3	19041301	19041495	-140558288	+	RMER10B	LTR	ERVL	188	398	0	7
730	899	152	151	5	chr3	19045174	19045366	-140554417	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	222	-145	7
730	2122	177	75	13	chr3	19055157	19055549	-140544234	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	412	-93	1
730	2122	177	75	13	chr3	19055586	19055657	-140544126	+	RLTR16	LTR	ERVK	413	493	-12	1
730	1584	147	251	29	chr3	19065485	19065828	-140533955	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	1
730	2532	89	3	0	chr3	19066977	19067303	-140532480	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
730	1221	212	182	20	chr3	19067653	19068005	-140531778	-	MTD	LTR	MaLR	0	421	13	1
730	4451	220	43	68	chr3	19068020	19069308	-140530475	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	2	1
730	1262	204	70	30	chr3	19069309	19069680	-140530103	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	1
730	2546	97	6	3	chr3	19072848	19073191	-140526592	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-2	344	1	1
730	1290	239	130	42	chr3	19073500	19073976	-140525807	-	RLTR18	LTR	ERVK	-5	611	94	1
730	444	133	0	0	chr3	19073983	19074058	-140525725	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	828	1
730	283	238	143	0	chr3	19074059	19074143	-140525640	-	RLTR18	LTR	ERVK	-413	99	4	1
730	246	143	0	0	chr3	19074148	19074189	-140525594	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-10	374	334	1
730	2132	82	6	59	chr3	19074189	19074485	-140525298	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	278	-49	1
730	1190	222	82	26	chr3	19074485	19074837	-140524946	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	1
730	895	210	84	0	chr3	19074853	19075067	-140524716	+	MT2A	LTR	ERVL	300	531	-2	1
730	1359	181	167	14	chr3	19076138	19076492	-140523291	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	1	1
730	456	302	60	56	chr3	19077880	19078203	-140521580	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	326	-44	1
730	1735	143	21	0	chr3	19083201	19083488	-140516295	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-35	294	2	1
730	385	315	38	8	chr3	19083937	19084068	-140515715	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-103	457	323	1
730	1806	192	29	53	chr3	19085680	19086097	-140513686	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
730	1662	192	130	16	chr3	19089344	19089768	-140510015	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	472	-430	1
730	2334	93	52	82	chr3	19090786	19091252	-140508531	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	2	1
730	1542	162	241	27	chr3	19092129	19092454	-140507329	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	117	1
730	2259	105	6	24	chr3	19092454	19092787	-140506996	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
730	1542	162	241	27	chr3	19092787	19092900	-140506883	-	MT2A	LTR	ERVL	-417	116	1	1
730	616	226	51	19	chr3	19097459	19097617	-140502166	+	RLTR28B	LTR	ERVL	9	171	-310	2
730	418	292	95	7	chr3	19110562	19110754	-140489029	-	MTEb	LTR	MaLR	-33	346	142	2
730	1364	168	58	29	chr3	19112029	19112305	-140487478	-	MTC	LTR	MaLR	-84	337	54	2
730	404	154	39	0	chr3	19112511	19112589	-140487194	-	MTC	LTR	MaLR	-340	81	1	2
730	1867	152	121	13	chr3	19113725	19114112	-140485671	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-12	429	1	2
730	2257	124	90	8	chr3	19119783	19120172	-140479611	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
730	237	324	68	62	chr3	19122858	19123019	-140476764	+	MLT1A0	LTR	MaLR	69	230	-135	2
730	2095	171	129	81	chr3	19134343	19135209	-140464574	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	855	-47	2
731	226	229	13	114	chr3	19141934	19142013	-140457770	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	171	2
731	974	168	164	0	chr3	19149924	19150132	-140449651	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	242	-285	3
731	5133	153	83	5	chr3	19150132	19151155	-140448628	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	1	3
731	533	203	14	21	chr3	19151155	19151292	-140448491	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	220	355	-98	3
731	1820	80	46	0	chr3	19153956	19154219	-140445564	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	275	-51	3
731	248	322	11	0	chr3	19155624	19155714	-140444069	+	LTR40c	LTR	ERVL	38	128	-337	3
731	1427	175	85	12	chr3	19159113	19159590	-140440193	+	RLTR12A	LTR	ERVK	36	568	0	3
731	978	172	53	24	chr3	19172158	19172367	-140427416	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	207	3
731	858	173	123	50	chr3	19172351	19172570	-140427213	-	MT2B	LTR	ERVL	-366	235	1	3
731	314	67	0	0	chr3	19173835	19173880	-140425903	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	45	-339	3
731	571	125	52	0	chr3	19173880	19173976	-140425807	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	101	-231	3
731	3557	70	0	16	chr3	19174156	19174606	-140425177	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	5203	5645	-1936	3
731	10869	117	26	28	chr3	19174594	19176461	-140423322	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	5761	7338	-342	3
731	1729	126	86	0	chr3	19176461	19176762	-140423021	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	327	-5	3
731	1692	146	14	27	chr3	19176780	19177075	-140422708	+	ORR1B2	LTR	MaLR	35	325	-42	3
731	299	109	0	127	chr3	19177299	19177362	-140422421	+	ORR1C2	LTR	MaLR	330	384	0	3
731	1979	114	32	81	chr3	19179089	19179433	-140420350	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
731	1401	264	98	47	chr3	19181603	19182221	-140417562	+	RLTR18B	LTR	ERVK	4	613	-3	3
731	368	265	19	56	chr3	19183716	19183824	-140415959	-	RMER15	LTR	ERVL	-109	466	363	3
731	1606	170	134	18	chr3	19186433	19186768	-140413015	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
731	2375	190	27	2	chr3	19196772	19197258	-140402525	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	498	-7	3
731	2006	155	88	0	chr3	19200847	19201209	-140398574	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
731	273	241	62	12	chr3	19201916	19201996	-140397787	+	MTEb	LTR	MaLR	294	377	-2	4
731	1162	207	170	12	chr3	19207164	19207487	-140392296	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	32	4
731	576	282	177	29	chr3	19213292	19213686	-140386097	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-8	456	1	4
731	299	288	29	43	chr3	19214021	19214159	-140385624	-	LTR33C	LTR	ERVL	-19	610	475	4
731	496	325	144	30	chr3	19214692	19215121	-140384662	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-78	5589	5112	4
731	279	260	27	14	chr3	19215273	19215347	-140384436	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-783	4884	4810	4
731	342	250	83	38	chr3	19219806	19219939	-140379844	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	270	4
731	1936	181	37	42	chr3	19229351	19229731	-140370052	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
731	403	285	70	111	chr3	19232771	19233125	-140366658	-	RLTR17	LTR	ERVK	-265	427	126	4
731	285	319	14	0	chr3	19234662	19234734	-140365049	-	MTE-int	LTR	MaLR	-42	1538	1466	4
731	491	282	8	21	chr3	19234801	19234947	-140364836	+	MTEa	LTR	MaLR	236	379	0	4
731	431	354	100	60	chr3	19238014	19238483	-140361300	+	MTE-int	LTR	MaLR	2	489	-1091	4
731	254	318	154	83	chr3	19238821	19239216	-140360567	+	MTE-int	LTR	MaLR	738	1160	-420	4
731	1144	213	195	25	chr3	19246623	19246946	-140352837	+	MTEa	LTR	MaLR	2	379	0	5
731	1405	293	72	3	chr3	19260664	19261054	-140338729	-	MER21B	LTR	ERV1	-371	492	76	5
731	1135	252	74	19	chr3	19261595	19261906	-140337877	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	328	-51	5
731	258	231	0	0	chr3	19266064	19266116	-140333667	+	MTE2a	LTR	MaLR	324	375	-4	5
732	286	299	99	126	chr3	19268978	19269338	-140330445	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	20	5
732	2156	199	47	10	chr3	19270591	19270997	-140328786	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
732	2823	78	67	5	chr3	19272852	19273225	-140326558	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
732	2257	101	3	3	chr3	19273331	19273650	-140326133	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
732	1474	117	117	4	chr3	19274803	19274859	-140324924	+	BGLII	LTR	ERVK	127	207	-214	5
732	1474	117	117	4	chr3	19275011	19275219	-140324564	+	BGLII	LTR	ERVK	208	421	0	5
732	621	178	105	31	chr3	19275573	19275718	-140324065	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	432	584	-2258	5
732	621	178	105	31	chr3	19275897	19275942	-140323841	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	585	635	-2207	5
732	2052	179	107	17	chr3	19275940	19276415	-140323368	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1016	1533	-1309	5
732	680	161	43	55	chr3	19276447	19276611	-140323172	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1532	1693	-1149	5
732	3732	198	44	42	chr3	19276580	19277530	-140322253	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1891	2842	0	5
732	1491	85	52	28	chr3	19277532	19277805	-140321978	+	BGLII	LTR	ERVK	3	259	-162	5
732	1386	120	19	98	chr3	19277792	19278107	-140321676	+	BGLII	LTR	ERVK	132	421	0	5
732	269	369	71	34	chr3	19281596	19281865	-140317918	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	358	80	5
732	404	319	207	42	chr3	19281942	19282348	-140317435	+	MLT1D	LTR	MaLR	23	495	-10	5
732	249	436	18	6	chr3	19284257	19284421	-140315362	-	MT2A	LTR	ERVL	-73	460	295	5
732	648	217	0	37	chr3	19284481	19284615	-140315168	+	MTD	LTR	MaLR	7	135	-286	5
732	1552	223	239	0	chr3	19284619	19285041	-140314742	+	RMER15	LTR	ERVL	3	525	-50	5
732	1388	195	62	4	chr3	19285078	19285335	-140314448	+	MTD	LTR	MaLR	134	405	-14	5
732	411	297	136	51	chr3	19285405	19285678	-140314105	+	RMER10B	LTR	ERVL	103	398	0	5
732	347	219	0	0	chr3	19285690	19285763	-140314020	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	73	-1185	5
732	1915	230	119	67	chr3	19286393	19287394	-140312389	+	MTD-int	LTR	MaLR	79	1256	-2	5
732	1847	210	18	25	chr3	19287396	19287791	-140311992	+	MTD	LTR	MaLR	1	392	-27	5
732	420	262	48	32	chr3	19287921	19288047	-140311736	-	MTEa	LTR	MaLR	-251	128	1	5
732	348	331	83	12	chr3	19291044	19291212	-140308571	+	LTR33	LTR	ERVL	324	503	-12	5
732	1089	259	38	17	chr3	19291854	19292200	-140307583	+	RMER15	LTR	ERVL	221	573	-2	5
732	2585	52	153	0	chr3	19298469	19298816	-140300967	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
732	231	278	85	85	chr3	19307920	19308097	-140291686	+	MamGypLTR1b	LTR	Gypsy	606	782	0	6
732	444	318	65	37	chr3	19308509	19308858	-140290925	-	MLT1B	LTR	MaLR	-106	361	18	6
732	334	219	8	34	chr3	19309733	19309851	-140289932	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1071	1185	-1141	6
732	2785	187	72	24	chr3	19312353	19312935	-140286848	+	RMER19B	LTR	ERVK	217	826	-76	6
732	502	97	0	0	chr3	19314515	19314587	-140285196	+	RMER19B	LTR	ERVK	819	890	-12	6
732	312	337	0	56	chr3	19316739	19316846	-140282937	-	RMER15	LTR	ERVL	-104	471	371	6
732	4036	130	83	44	chr3	19317802	19318169	-140281614	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	453	6
732	4036	130	83	44	chr3	19318216	19318626	-140281157	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-357	452	1	6
732	1660	139	16	120	chr3	19320178	19320545	-140279238	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
732	229	319	134	0	chr3	19321274	19321393	-140278390	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	135	-224	6
732	597	276	91	5	chr3	19322041	19322238	-140277545	-	LTR87	LTR	ERVL?	-84	540	327	6
732	324	370	64	92	chr3	19323043	19323148	-140276635	-	LTR87	LTR	ERVL?	-303	321	191	6
732	324	370	64	92	chr3	19323223	19323370	-140276413	-	LTR87	LTR	ERVL?	-303	190	4	6
732	1754	172	53	25	chr3	19324040	19324254	-140275529	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	194	6
732	1754	172	53	25	chr3	19324425	19324609	-140275174	-	RMER17C	LTR	ERVK	-217	193	2	6
732	230	314	102	23	chr3	19324625	19324713	-140275070	+	LTR16D2	LTR	ERVL	111	205	-367	6
732	2046	205	39	2	chr3	19324739	19325145	-140274638	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
732	493	333	30	24	chr3	19330451	19330620	-140269163	+	MLT1I	LTR	MaLR	48	217	-194	6
732	1250	180	0	0	chr3	19337230	19337436	-140262347	+	ORR1B2	LTR	MaLR	162	367	0	6
732	225	286	54	0	chr3	19337658	19337714	-140262069	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1458	122	64	6
732	445	265	77	4	chr3	19338086	19338270	-140261513	-	ORR1E	LTR	MaLR	-185	199	1	6
732	297	304	62	62	chr3	19338534	19338678	-140261105	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	144	-323	6
732	764	297	94	47	chr3	19338735	19339074	-140260709	-	RMER5	LTR	ERV1	-36	498	144	6
732	299	257	132	69	chr3	19339098	19339257	-140260526	+	MLT1B	LTR	MaLR	167	335	-55	6
732	1989	217	16	24	chr3	19341957	19342381	-140257402	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
732	407	233	47	0	chr3	19351078	19351164	-140248619	+	MLT1H	LTR	MaLR	119	208	-341	6
732	435	234	78	72	chr3	19351192	19351372	-140248411	+	MLT1H	LTR	MaLR	369	549	0	6
732	563	234	136	29	chr3	19372286	19372544	-140227239	+	MTD	LTR	MaLR	50	367	-52	6
732	1016	225	58	25	chr3	19379922	19380200	-140219583	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	124	6
732	1574	166	0	17	chr3	19380200	19380494	-140219289	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1057	2181	1893	6
732	3465	140	115	64	chr3	19380721	19381528	-140218255	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1353	1885	1038	6
732	607	249	82	128	chr3	19381946	19382494	-140217289	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2714	524	2	6
732	589	234	92	62	chr3	19382495	19382787	-140216996	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	110	6
732	859	266	98	8	chr3	19387811	19388069	-140211714	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	301	-78	7
732	329	362	10	42	chr3	19391258	19391451	-140208332	-	RMER4B	LTR	ERVK	-395	190	4	7
732	226	175	0	0	chr3	19391818	19391858	-140207925	+	RLTR20A	LTR	ERVK	447	486	-55	7
732	2120	47	63	45	chr3	19396352	19396684	-140203099	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	7
732	732	251	112	23	chr3	19397806	19398116	-140201667	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-33	375	1	7
733	7074	58	24	0	chr3	19400616	19401488	-140198295	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	7
733	1899	125	3	65	chr3	19407225	19407421	-140192362	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	135	7
733	1899	125	3	65	chr3	19408277	19408431	-140191352	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-195	134	1	7
733	570	270	162	50	chr3	19419193	19419552	-140180231	-	MLT2D	LTR	ERVL	-11	403	5	7
733	2078	158	83	25	chr3	19422523	19422918	-140176865	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	4	7
733	367	199	17	10	chr3	19427500	19427603	-140172180	-	MTEb	LTR	MaLR	0	419	278	7
733	275	343	95	34	chr3	19427685	19427833	-140171950	-	MTEb	LTR	MaLR	-208	162	6	7
733	2850	167	83	5	chr3	19427996	19428549	-140171234	-	RLTR17	LTR	ERVK	-96	596	1	7
733	414	218	131	11	chr3	19428702	19428831	-140170952	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	239	7
733	877	217	51	67	chr3	19428900	19429256	-140170527	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	350	-9	7
733	332	294	59	0	chr3	19429293	19429395	-140170388	-	MTEb	LTR	MaLR	-251	108	1	7
733	1489	208	30	53	chr3	19434440	19434801	-140164982	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	7
733	607	266	92	15	chr3	19436829	19437024	-140162759	+	MTD	LTR	MaLR	1	210	-209	7
733	1549	171	92	27	chr3	19437230	19437567	-140162216	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	7
733	1327	135	9	18	chr3	19440803	19441030	-140158753	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	94	7
733	536	109	15	66	chr3	19443162	19443298	-140156485	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-253	141	1	7
733	1069	269	104	12	chr3	19444918	19445264	-140154519	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	379	0	7
733	1040	265	151	17	chr3	19451957	19452256	-140147527	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	357	-2	7
733	2151	87	28	43	chr3	19453569	19453893	-140145890	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	7
733	251	213	66	0	chr3	19454377	19454438	-140145345	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-656	181	117	7
733	964	272	68	76	chr3	19463162	19463620	-140136163	-	LTR55	LTR	ERV	-83	465	12	8
733	255	283	109	79	chr3	19469489	19469654	-140130129	-	MLT1D	LTR	MaLR	-77	428	259	8
733	258	349	142	23	chr3	19479987	19480163	-140119620	-	LTR84a	LTR	ERVL	-104	653	457	8
733	4820	174	79	22	chr3	19480704	19481676	-140118107	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	1028	0	8
733	814	281	44	74	chr3	19486558	19486854	-140112929	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	287	-281	8
733	422	244	76	97	chr3	19486840	19486895	-140112888	+	RLTR20D	LTR	ERVK	423	478	-100	8
733	422	244	76	97	chr3	19486936	19487025	-140112758	+	RLTR20D	LTR	ERVK	479	563	-15	8
733	3807	197	61	22	chr3	19487873	19488909	-140110874	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	1393	-1449	8
733	1166	101	119	0	chr3	19488892	19489111	-140110672	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1067	1311	-1015	8
733	2065	126	3	33	chr3	19489116	19489445	-140110338	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	8
733	9879	137	99	11	chr3	19489449	19491252	-140108531	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1963	0	8
733	1698	165	58	0	chr3	19491252	19491561	-140108222	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
733	854	112	149	0	chr3	19491561	19491749	-140108034	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1358	1573	-753	8
733	3009	187	31	3	chr3	19503919	19504530	-140095253	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1562	2189	-137	3
733	716	151	87	0	chr3	19504529	19504701	-140095082	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	2105	2291	-35	3
733	767	293	24	54	chr3	19504753	19505049	-140094734	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	287	-281	4
733	342	303	82	19	chr3	19505024	19505091	-140094692	+	RLTR20D	LTR	ERVK	411	489	-89	4
733	342	303	82	19	chr3	19505138	19505228	-140094555	+	RLTR20D	LTR	ERVK	490	577	-1	4
733	2121	145	82	6	chr3	19512279	19512479	-140087304	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	157	1
733	2121	145	82	6	chr3	19512518	19512658	-140087125	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-211	156	2	1
733	4541	225	19	27	chr3	19512658	19514172	-140085611	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	90	1
733	327	243	73	55	chr3	19515713	19515822	-140083961	+	MLT1D	LTR	MaLR	253	363	-142	2
733	3185	162	34	87	chr3	19516574	19517252	-140082531	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	2
733	1205	233	45	27	chr3	19520146	19520500	-140079283	-	MT2A	LTR	ERVL	-124	477	2	2
733	3598	36	2	0	chr3	19521026	19521419	-140078364	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	2
733	2942	145	110	58	chr3	19522793	19523703	-140076080	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	893	1	2
733	225	250	0	170	chr3	19524220	19524326	-140075457	-	MER34	LTR	ERV1	-251	320	233	3
733	276	338	0	0	chr3	19524402	19524482	-140075301	-	MER34	LTR	ERV1	-462	80	1	3
733	340	308	43	25	chr3	19524721	19524884	-140074899	+	RLTR23	LTR	ERV1	265	430	0	3
733	819	241	58	120	chr3	19525032	19525306	-140074477	-	MTE2a	LTR	MaLR	-122	257	1	3
733	1198	231	95	43	chr3	19526022	19526370	-140073413	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	1	3
734	636	264	89	45	chr3	19533472	19533674	-140066109	+	MTEa	LTR	MaLR	8	218	-161	4
734	619	247	28	116	chr3	19533736	19533951	-140065832	+	MTEa	LTR	MaLR	184	379	0	4
734	401	352	83	76	chr3	19535526	19535935	-140063848	+	MER77	LTR	ERVL	96	507	-100	4
734	608	278	226	26	chr3	19536070	19536340	-140063443	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	34	5
734	293	316	75	25	chr3	19536418	19536538	-140063245	+	MER21B	LTR	ERV1	488	613	-250	5
734	369	365	35	53	chr3	19538155	19538381	-140061402	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1101	5
734	5267	99	30	44	chr3	19538582	19539449	-140060334	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-993	855	1	5
734	238	265	34	57	chr3	19541341	19541429	-140058354	+	MTEa	LTR	MaLR	6	91	-288	5
734	233	281	0	0	chr3	19542582	19542639	-140057144	+	ORR1E	LTR	MaLR	297	353	-6	5
734	473	352	45	15	chr3	19542718	19542983	-140056800	+	MTE-int	LTR	MaLR	82	354	-1226	6
734	357	297	0	41	chr3	19542990	19543113	-140056670	+	RMER10A	LTR	ERVL	324	441	-1	6
734	1490	164	130	24	chr3	19545702	19545900	-140053883	+	RMER17C	LTR	ERVK	2	218	-192	6
734	1490	164	130	24	chr3	19545942	19546113	-140053670	+	RMER17C	LTR	ERVK	219	409	-1	6
734	1555	180	135	15	chr3	19562488	19562821	-140036962	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	1	8
734	2868	157	50	7	chr3	19568760	19569298	-140030485	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	9
734	1059	258	24	61	chr3	19588035	19588073	-140011710	-	MTEa	LTR	MaLR	-54	325	292	1
734	2735	90	134	0	chr3	19588073	19588542	-140011241	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	1
734	1059	258	24	61	chr3	19588542	19588833	-140010950	-	MTEa	LTR	MaLR	-88	291	8	1
734	2302	193	36	31	chr3	19599719	19600275	-139999508	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	2	1
734	234	380	0	0	chr3	19602858	19602950	-139996833	+	MLT1A0	LTR	MaLR	64	155	-210	1
734	348	271	17	45	chr3	19602995	19603118	-139996665	+	MLT1A0	LTR	MaLR	226	352	-56	1
734	2560	127	14	19	chr3	19604900	19605405	-139994378	-	LTRIS4	LTR	ERV1	0	512	1	1
734	240	304	75	60	chr3	19606831	19606964	-139992819	-	LTR50	LTR	ERVL	-279	516	382	1
734	324	292	188	13	chr3	19607052	19607201	-139992582	-	LTR50	LTR	ERVL	-535	260	86	1
734	242	336	40	24	chr3	19610476	19610601	-139989182	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	270	1
734	848	232	171	29	chr3	19610669	19610805	-139988978	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-60	314	178	1
734	848	232	171	29	chr3	19610843	19610981	-139988802	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-197	177	1	1
734	252	196	36	0	chr3	19623095	19623151	-139976632	-	RMER12	LTR	ERVK	-100	1222	1165	1
734	5859	152	92	45	chr3	19623152	19623436	-139976347	-	RMER12	LTR	ERVK	-56	1266	970	1
734	5859	152	92	45	chr3	19623463	19624387	-139975396	-	RMER12	LTR	ERVK	-353	969	2	1
734	583	307	63	59	chr3	19627856	19628126	-139971657	+	LTR16B	LTR	ERVL	193	463	0	1
734	492	324	118	47	chr3	19630000	19630365	-139969418	-	LTR16B	LTR	ERVL	-2	461	36	1
734	1006	265	69	62	chr3	19633285	19633691	-139966092	-	MLT2D	LTR	ERVL	-2	412	4	1
734	2088	91	9	51	chr3	19633925	19634261	-139965522	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
734	3478	23	2	0	chr3	19638600	19638995	-139960788	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
734	559	208	9	0	chr3	19642230	19642336	-139957447	+	MTD	LTR	MaLR	1	107	-312	1
734	4323	122	15	71	chr3	19642558	19643346	-139956437	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	744	-158	1
734	675	203	73	20	chr3	19643525	19643676	-139956107	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	863	1021	-2	1
734	2680	71	145	139	chr3	19643676	19644185	-139955598	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	2
734	2295	98	67	18	chr3	19648228	19648570	-139951213	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	2
734	227	264	56	0	chr3	19650201	19650273	-139949510	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	333	2
734	4316	40	0	2	chr3	19650345	19650849	-139948934	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	2
734	439	274	93	115	chr3	19651243	19651556	-139948227	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-59	306	1	2
734	304	307	106	62	chr3	19652739	19652899	-139946884	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-86	279	113	2
734	1818	231	20	8	chr3	19654036	19654433	-139945350	+	MTD	LTR	MaLR	1	402	-17	2
734	1002	248	42	99	chr3	19656457	19656811	-139942972	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	26	2
734	414	239	94	81	chr3	19659333	19659556	-139940227	+	RLTR14	LTR	ERV1	154	379	-3	2
734	2974	32	0	3	chr3	19659749	19660096	-139939687	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
735	2033	168	120	24	chr3	19661133	19661590	-139938193	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	501	-4	2
735	292	244	10	62	chr3	19661715	19661811	-139937972	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	100	190	-2652	2
735	389	169	21	43	chr3	19661968	19662061	-139937722	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1021	1111	-1731	2
735	845	220	8	46	chr3	19662246	19662508	-139937275	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1112	1363	-1479	2
735	4636	148	66	96	chr3	19662505	19662931	-139936852	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1101	1513	-813	2
735	4636	148	66	96	chr3	19662952	19663787	-139935996	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1514	2324	-2	2
735	2133	175	122	9	chr3	19663789	19664238	-139935545	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	500	-5	2
735	2559	164	45	133	chr3	19666296	19666966	-139932817	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
735	351	242	248	8	chr3	19667634	19667767	-139932016	-	LTR82A	LTR	ERVL	-125	747	583	2
735	2260	137	43	14	chr3	19667971	19668342	-139931441	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	3	2
735	282	261	129	11	chr3	19668670	19668763	-139931020	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	150	-378	2
735	413	290	55	68	chr3	19669724	19670088	-139929695	+	RLTR12B	LTR	ERVK	94	485	-43	2
735	2319	123	0	0	chr3	19672937	19673263	-139926520	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
735	1023	246	174	14	chr3	19673831	19674119	-139925664	+	MTD	LTR	MaLR	1	334	-85	2
735	349	139	30	62	chr3	19674199	19674275	-139925508	+	MTD	LTR	MaLR	303	419	0	2
735	1677	234	71	48	chr3	19674973	19675494	-139924289	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	2
735	1525	126	16	86	chr3	19678126	19678429	-139921354	+	RMER15	LTR	ERVL	4	285	-290	2
735	333	236	272	31	chr3	19679529	19679691	-139920092	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	201	-207	2
735	286	291	109	0	chr3	19680293	19680403	-139919380	+	LTR33	LTR	ERVL	383	504	-11	2
735	696	182	52	7	chr3	19682563	19682782	-139917001	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	338	2
735	1750	152	41	17	chr3	19683407	19683702	-139916081	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	145	2
735	864	340	93	32	chr3	19685330	19685781	-139914002	+	MLT2B1	LTR	ERVL	15	496	-24	2
735	864	340	93	32	chr3	19685807	19685826	-139913957	+	MLT2B1	LTR	ERVL	497	514	-6	2
735	2332	106	23	3	chr3	19689911	19690261	-139909522	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	2
735	2415	101	3	0	chr3	19691082	19691408	-139908375	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
735	379	275	129	93	chr3	19694762	19695194	-139904589	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	516	63	3
735	4416	108	25	35	chr3	19695231	19695977	-139903806	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	13	3
735	347	152	34	0	chr3	19696174	19696233	-139903550	-	RMER20B	LTR	ERVK	-566	61	1	3
735	2677	170	87	25	chr3	19697347	19697877	-139901906	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-5	563	1	3
735	1582	148	184	9	chr3	19700928	19701255	-139898528	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
735	3429	10	31	0	chr3	19702273	19702657	-139897126	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
735	11167	162	24	44	chr3	19703704	19706135	-139893648	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1278	3659	-3747	3
735	1698	140	30	103	chr3	19706156	19706553	-139893230	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	3
735	229	352	0	79	chr3	19708966	19709080	-139890703	-	MLT1C	LTR	MaLR	-349	118	14	3
735	768	301	145	16	chr3	19709091	19709456	-139890327	+	MER31A	LTR	ERV1	24	435	-50	3
735	457	347	59	92	chr3	19709557	19709928	-139889855	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	3
735	513	281	82	66	chr3	19711827	19712209	-139887574	+	MLT1D	LTR	MaLR	4	370	-20	3
735	227	185	19	0	chr3	19712578	19712632	-139887151	+	MLT1D	LTR	MaLR	336	390	-18	3
735	3425	77	32	4	chr3	19713689	19714158	-139885625	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	3
735	4049	77	107	17	chr3	19714158	19714793	-139884990	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1	692	-6552	3
735	1070	58	0	0	chr3	19715096	19715234	-139884549	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	681	818	-6426	3
735	254	239	22	22	chr3	19715635	19715725	-139884058	+	MMTV-int	LTR	ERVK	2415	2504	-4749	3
735	10942	43	49	12	chr3	19716019	19717843	-139881940	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1322	3212	-4032	3
735	3629	89	35	28	chr3	19717813	19718416	-139881367	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3380	3986	-3258	3
735	4319	79	39	30	chr3	19718409	19719381	-139880402	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	4298	6072	-1172	3
735	2034	104	10	3	chr3	19719403	19719703	-139880080	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	207	508	-385	3
735	7320	42	3	4	chr3	19719703	19720616	-139879167	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6333	7244	0	3
735	3406	73	39	2	chr3	19720616	19721080	-139878703	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	481	-1	3
735	756	238	64	86	chr3	19725560	19725873	-139873910	+	MTD	LTR	MaLR	6	311	-108	3
735	6876	58	10	1	chr3	19726616	19727417	-139872366	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	3
735	494	154	143	9	chr3	19737267	19737372	-139862411	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-107	405	287	3
735	1247	164	14	0	chr3	19741612	19741820	-139857963	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-232	280	70	3
735	1892	137	110	108	chr3	19741820	19742294	-139857489	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
735	7476	64	9	14	chr3	19742294	19743257	-139856526	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5524	3
735	2048	28	5	0	chr3	19743336	19743578	-139856205	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-955	5526	5290	3
735	416	117	77	13	chr3	19743593	19743671	-139856112	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-7430	83	1	3
735	1088	88	64	7	chr3	19743671	19743849	-139855934	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	357	146	3
735	1154	261	123	12	chr3	19744992	19745318	-139854465	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	5	3
735	4746	115	81	12	chr3	19747093	19747850	-139851933	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	3
735	596	282	22	33	chr3	19757711	19757891	-139841892	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	227	3
735	236	311	53	53	chr3	19761191	19761286	-139838497	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-196	198	104	3
735	1580	200	21	109	chr3	19761563	19761984	-139837799	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
735	2293	197	9	9	chr3	19762243	19762664	-139837119	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
735	297	270	261	31	chr3	19766169	19766364	-139833419	+	RMER21B	LTR	ERV1	328	567	-275	3
735	2190	131	117	10	chr3	19768081	19768475	-139831308	+	BGLII_B	LTR	ERVK	6	441	0	4
735	248	208	38	0	chr3	19780808	19780861	-139818922	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	324	4
735	900	183	45	15	chr3	19782442	19782742	-139817041	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-64	314	6	4
735	1645	80	5	0	chr3	19786773	19786997	-139812786	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-41	286	62	4
735	4665	153	43	18	chr3	19787014	19787841	-139811942	-	RMER13A	LTR	ERVK	-12	848	1	4
735	376	114	29	0	chr3	19787841	19787907	-139811876	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-259	68	1	4
735	347	319	25	41	chr3	19788073	19788194	-139811589	-	LTR80A	LTR	ERVL	-123	460	342	4
735	272	154	0	156	chr3	19788773	19788850	-139810933	-	RLTR33	LTR	ERVK	-157	521	457	4
735	1918	171	85	8	chr3	19788853	19789218	-139810565	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	393	-1	4
735	1239	222	147	41	chr3	19789218	19789874	-139809909	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	12	775	-734	4
735	2086	157	65	3	chr3	19791080	19791451	-139808332	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
736	1564	173	79	9	chr3	19796969	19797284	-139802499	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	2506	2842	0	4
736	1577	206	239	25	chr3	19797284	19797774	-139802009	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	595	-97	4
736	4918	46	5	2	chr3	19798479	19799064	-139800719	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	4
736	8089	64	12	3	chr3	19800134	19801148	-139798635	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	4
736	2804	57	16	0	chr3	19805131	19805517	-139794266	+	MTB	LTR	MaLR	3	394	-6	4
736	5913	67	18	3	chr3	19805790	19806677	-139793106	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	2	901	-891	4
736	2367	204	57	46	chr3	19809959	19810628	-139789155	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	569	1244	-265	4
736	1202	150	105	4	chr3	19813149	19813397	-139786386	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1237	1509	0	4
736	2097	142	116	0	chr3	19813397	19813750	-139786033	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
736	813	164	77	62	chr3	19815093	19815288	-139784495	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	198	-307	4
736	1083	219	64	62	chr3	19815325	19815942	-139783841	-	RMER12	LTR	ERVK	-5	1317	580	4
736	2417	182	80	4	chr3	19817162	19817702	-139782081	-	RMER12	LTR	ERVK	-741	581	1	4
736	2917	36	0	0	chr3	19817760	19818097	-139781686	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	4
736	21526	14	2	0	chr3	19818097	19820450	-139779333	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	4123	4
736	953	80	24	0	chr3	19820452	19820577	-139779206	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4783	4
736	1834	123	4	4	chr3	19820572	19820834	-139778949	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2236	4
736	454	66	0	32	chr3	19820823	19820886	-139778897	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5062	1419	1359	4
736	5047	62	0	54	chr3	19820886	19821586	-139778197	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	1	4
736	2593	28	0	0	chr3	19821587	19821913	-139777870	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-11	326	1	4
736	542	169	39	46	chr3	19822869	19822999	-139776784	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	129	-324	4
736	931	241	84	4	chr3	19829119	19829394	-139770389	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	137	433	-94	4
736	2625	208	40	26	chr3	19830717	19831343	-139768440	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5913	6547	-3	4
736	1103	99	5	59	chr3	19831347	19831539	-139768244	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	181	-272	4
736	389	97	0	46	chr3	19831539	19831604	-139768179	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	329	268	4
736	1597	141	10	66	chr3	19831788	19832091	-139767692	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-41	286	1	4
736	472	226	0	46	chr3	19832099	19832229	-139767554	+	RLTR11B	LTR	ERVK	187	310	-143	4
736	2223	107	28	0	chr3	19832827	19833144	-139766639	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	326	-1	4
736	294	335	20	99	chr3	19836192	19836394	-139763389	+	RMER15	LTR	ERVL	258	443	-132	4
736	1076	82	14	0	chr3	19843518	19843664	-139756119	-	MT2B	LTR	ERVL	-451	150	3	4
736	2504	184	55	13	chr3	19844537	19845011	-139754772	+	RLTR16	LTR	ERVK	12	505	0	4
736	315	109	0	0	chr3	19845022	19845068	-139754715	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	386	341	5
736	1508	201	46	52	chr3	19845146	19845472	-139754311	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-43	324	1	5
736	2924	174	99	7	chr3	19845472	19846057	-139753726	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	871	5
736	713	167	31	8	chr3	19846056	19846183	-139753600	+	RLTR33	LTR	ERVK	193	322	-356	5
736	292	322	39	19	chr3	19846718	19846873	-139752910	+	RLTR33	LTR	ERVK	494	651	-27	5
736	3790	192	49	5	chr3	19846892	19847680	-139752103	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-611	898	75	5
736	2120	142	79	3	chr3	19847680	19848046	-139751737	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
736	6293	201	62	13	chr3	19848046	19849442	-139750341	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1465	-44	5
736	535	151	32	21	chr3	19849461	19849556	-139750227	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-61	266	171	5
736	996	106	40	0	chr3	19849526	19849677	-139750106	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-61	266	110	5
736	722	223	27	59	chr3	19849659	19849845	-139749938	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-76	253	74	5
736	1918	175	70	8	chr3	19849871	19850240	-139749543	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	5
736	568	167	49	54	chr3	19850392	19850595	-139749188	-	RMER17C	LTR	ERVK	-137	273	72	5
736	1616	220	19	63	chr3	19851433	19851811	-139747972	+	ORR1D1	LTR	MaLR	14	374	0	5
736	437	306	85	24	chr3	19851959	19852123	-139747660	+	MLT1D	LTR	MaLR	323	496	-9	5
736	497	323	102	64	chr3	19852927	19853241	-139746542	+	MER74A	LTR	ERVL	165	490	-68	5
736	251	257	57	0	chr3	19859353	19859423	-139740360	-	MER57E1	LTR	ERV1	-210	162	89	5
736	310	243	27	13	chr3	19859551	19859626	-139740157	-	MER57E1	LTR	ERV1	-294	78	3	5
736	761	266	112	48	chr3	19859695	19860070	-139739713	+	RMER10A	LTR	ERVL	19	417	-25	5
736	684	349	76	30	chr3	19860627	19861023	-139738760	+	MLT1E2	LTR	MaLR	196	609	-18	5
736	251	324	72	86	chr3	19865146	19865298	-139734485	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	426	5
736	1713	158	181	3	chr3	19868335	19868677	-139731106	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	19	5
736	289	360	50	7	chr3	19875929	19876069	-139723714	-	RMER15	LTR	ERVL	-6	569	424	5
736	318	280	17	10	chr3	19876442	19876539	-139723244	-	MTEb	LTR	MaLR	-12	367	253	5
736	226	296	56	0	chr3	19876772	19876843	-139722940	-	MTEb	LTR	MaLR	-284	75	1	5
736	2059	183	65	12	chr3	19879090	19879489	-139720294	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	1	5
736	638	104	179	0	chr3	19892735	19892869	-139706914	+	RMER17B	LTR	ERVK	306	463	-495	5
736	782	173	7	15	chr3	19900770	19900905	-139698878	+	MT2A	LTR	ERVL	1	134	-399	5
736	255	309	0	42	chr3	19900899	19900970	-139698813	+	MT2A	LTR	ERVL	94	161	-372	5
736	226	298	16	109	chr3	19901024	19901152	-139698631	+	MT2A	LTR	ERVL	144	259	-274	5
736	752	219	20	15	chr3	19901444	19901604	-139698179	+	MT2A	LTR	ERVL	338	495	-38	5
736	752	219	20	15	chr3	19901652	19901686	-139698097	+	MT2A	LTR	ERVL	496	532	-1	5
736	354	257	20	10	chr3	19904598	19904700	-139695083	+	MTD	LTR	MaLR	270	372	-47	6
736	234	318	10	83	chr3	19907679	19907695	-139692088	-	MT2B2	LTR	ERVL	-346	238	150	6
736	632	211	220	12	chr3	19916154	19916346	-139683437	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	165	6
736	978	218	21	0	chr3	19916540	19916733	-139683050	-	MTD	LTR	MaLR	-202	217	21	6
736	733	252	217	31	chr3	19918087	19918441	-139681342	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
736	2049	176	103	18	chr3	19922249	19922637	-139677146	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
737	235	320	13	13	chr3	19923566	19923642	-139676141	+	RMER15	LTR	ERVL	178	253	-322	6
737	1336	181	94	8	chr3	19924087	19924354	-139675429	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	290	-104	6
737	251	118	0	0	chr3	19924355	19924389	-139675394	+	ORR1B1	LTR	MaLR	257	290	-104	6
737	266	276	0	0	chr3	19924401	19924459	-139675324	+	ORR1B1	LTR	MaLR	233	290	-104	6
737	266	276	0	0	chr3	19924471	19924529	-139675254	+	ORR1A4	LTR	MaLR	233	290	-104	6
737	900	130	6	38	chr3	19924511	19924671	-139675112	+	ORR1A4	LTR	MaLR	175	329	0	6
737	828	175	166	79	chr3	19924779	19924850	-139674933	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	306	6
737	828	175	166	79	chr3	19924998	19925155	-139674628	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-69	305	126	6
737	404	284	90	51	chr3	19925170	19925348	-139674435	+	MTEa	LTR	MaLR	137	321	-58	6
737	1940	123	101	6	chr3	19927655	19927983	-139671800	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	6
737	1596	221	62	11	chr3	19929389	19929746	-139670037	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	45	6
737	348	298	69	119	chr3	19932808	19933143	-139666640	+	MTEa	LTR	MaLR	1	306	-73	6
737	683	318	162	12	chr3	19936604	19936642	-139663141	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	330	6
737	2392	118	122	71	chr3	19936642	19937051	-139662732	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	6
737	683	318	162	12	chr3	19937051	19937340	-139662443	-	MTEa	LTR	MaLR	-50	329	2	6
737	833	264	69	77	chr3	19937461	19937810	-139661973	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	387	42	6
737	1781	145	11	95	chr3	19937810	19937854	-139661929	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	288	6
737	8510	68	8	2	chr3	19937854	19938871	-139660912	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	1023	0	6
737	1781	145	11	95	chr3	19938871	19939185	-139660598	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-42	287	1	6
737	2197	164	78	0	chr3	19939364	19939724	-139660059	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	390	-4	6
737	3250	186	200	42	chr3	19939726	19940634	-139659149	+	RLTR21	LTR	ERVK	7	1058	-514	6
737	2743	115	152	0	chr3	19940946	19941408	-139658375	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	6
737	1870	125	33	58	chr3	19941437	19941767	-139658016	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	6
737	3038	65	3	0	chr3	19941798	19942154	-139657629	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	6
737	716	12	0	0	chr3	19943586	19943668	-139656115	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-250	82	1	6
737	8062	102	14	22	chr3	19943675	19944987	-139654796	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-31	4813	3512	6
737	22345	55	4	31	chr3	19945043	19948244	-139651539	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-1703	3141	26	6
737	1789	116	9	73	chr3	19948252	19948265	-139651518	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	314	6
737	2793	55	145	139	chr3	19948265	19948774	-139651009	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
737	1789	116	9	73	chr3	19948774	19949104	-139650679	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-9	313	1	6
737	328	308	126	95	chr3	19949736	19950030	-139649753	+	RMER10A	LTR	ERVL	121	423	-19	6
737	1796	130	102	42	chr3	19950403	19950746	-139649037	+	RMER10A	LTR	ERVL	60	426	-16	6
737	1796	130	102	42	chr3	19950793	19950810	-139648973	+	RMER10A	LTR	ERVL	427	442	0	6
737	396	291	47	8	chr3	19950999	19951127	-139648656	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-43	327	195	6
737	6253	60	4	30	chr3	19951292	19952117	-139647666	-	RLTR13B4	LTR	ERVK	0	803	1	6
737	6557	104	34	15	chr3	19954549	19955546	-139644237	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	1016	-7	6
737	1220	271	85	28	chr3	19956108	19956579	-139643204	+	RMER5	LTR	ERV1	33	530	-4	6
737	325	283	81	24	chr3	19971138	19971261	-139628522	-	MTEb	LTR	MaLR	-65	314	185	7
737	371	118	9	30	chr3	19973342	19973453	-139626330	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	199	7
737	3385	31	3	0	chr3	19983903	19984294	-139615489	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	392	-4	7
737	794	291	50	75	chr3	19984997	19985107	-139614676	+	MTEb	LTR	MaLR	95	216	-163	7
737	794	291	50	75	chr3	19985178	19985341	-139614442	+	MTEb	LTR	MaLR	217	361	-18	7
737	1723	249	61	21	chr3	19985341	19985816	-139613967	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1	494	-1086	7
737	2978	116	99	30	chr3	19989233	19989788	-139609995	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-7	617	1	7
737	1829	184	63	22	chr3	19989849	19990309	-139609474	+	MMETn-int	LTR	ERVK	4366	4844	0	7
737	1729	135	35	16	chr3	19990309	19990625	-139609158	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
737	2160	127	9	6	chr3	19995482	19995807	-139603976	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	7
737	1475	192	48	6	chr3	19996721	19997051	-139602732	+	RLTR18-int	LTR	ERVK	5018	5361	0	7
737	1668	246	143	26	chr3	19997296	19997800	-139601983	+	RLTR18	LTR	ERVK	43	605	-11	7
737	1224	260	50	65	chr3	20001176	20001438	-139598345	+	MTEa-int	LTR	MaLR	441	689	-891	3
737	1224	260	50	65	chr3	20001622	20001772	-139598011	+	MTEa-int	LTR	MaLR	690	850	-730	3
737	2363	252	105	6	chr3	20002236	20002902	-139596881	+	MTEa-int	LTR	MaLR	847	1578	-2	3
737	740	260	116	4	chr3	20002906	20003138	-139596645	+	MTEa	LTR	MaLR	3	260	-119	3
737	1055	148	56	0	chr3	20004860	20005056	-139594727	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	207	-160	1
737	4369	136	91	77	chr3	20011327	20012250	-139587533	-	RMER21A	LTR	ERV1	-9	938	3	2
737	282	355	35	23	chr3	20016011	20016184	-139583599	+	RMER12	LTR	ERVK	690	864	-458	3
737	1684	231	141	63	chr3	20019027	20019987	-139579796	-	RMER17B	LTR	ERVK	-9	899	1	3
737	469	319	24	18	chr3	20021072	20021241	-139578542	+	MLT1F	LTR	MaLR	6	175	-373	3
737	2575	107	0	0	chr3	20031540	20031867	-139567916	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
737	229	259	35	0	chr3	20039563	20039621	-139560162	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	60	-314	5
737	275	377	72	10	chr3	20039644	20039837	-139559946	+	MLT1A0	LTR	MaLR	130	334	-31	5
737	1661	269	77	2	chr3	20049123	20049589	-139550194	+	RLTR18B	LTR	ERVK	5	505	-7	7
738	1033	92	92	0	chr3	20057087	20057251	-139542532	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	179	-228	8
738	2025	161	248	63	chr3	20058089	20058819	-139540964	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	714	-6	8
738	384	43	0	0	chr3	20059731	20059778	-139540005	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	318	272	8
738	10259	133	45	35	chr3	20059988	20061012	-139538771	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-44	1919	58	8
738	10259	138	53	40	chr3	20061186	20061771	-139538012	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-888	1075	463	8
738	3848	122	172	11	chr3	20061771	20062098	-139537685	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	485	9
738	3848	122	172	11	chr3	20062196	20062565	-139537218	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-325	484	1	9
738	10259	138	53	40	chr3	20062565	20063024	-139536759	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1501	462	1	8
738	2256	90	15	50	chr3	20063024	20063363	-139536420	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	8
738	4418	34	0	0	chr3	20063374	20063877	-139535906	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	9
738	510	242	62	31	chr3	20064208	20064336	-139535447	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	132	-401	9
738	550	240	39	0	chr3	20064355	20064484	-139535299	+	MT2B2	LTR	ERVL	91	224	-309	9
738	254	180	0	0	chr3	20064634	20064684	-139535099	+	MT2B2	LTR	ERVL	535	584	0	9
738	3831	204	82	18	chr3	20064694	20065716	-139534067	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	21	1174	-4587	9
738	944	263	35	73	chr3	20065810	20066151	-139533632	+	MT2B2	LTR	ERVL	257	584	0	9
738	3783	185	69	58	chr3	20071226	20072068	-139527715	-	RMER13B	LTR	ERVK	-53	855	5	1
738	1842	173	36	71	chr3	20076690	20077083	-139522700	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	1	1
738	934	182	56	19	chr3	20077335	20077548	-139522235	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1037	221	1	1
738	2035	173	79	10	chr3	20077548	20077940	-139521843	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	1
738	3833	42	8	41	chr3	20079610	20080101	-139519682	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
738	470	173	104	12	chr3	20080281	20080445	-139519338	+	RMER17C	LTR	ERVK	95	273	-137	1
738	1147	215	106	14	chr3	20080769	20081061	-139518722	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	61	1
738	579	256	137	36	chr3	20081879	20082098	-139517685	+	RLTR18	LTR	ERVK	43	283	-333	1
738	897	216	18	6	chr3	20084155	20084323	-139515460	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	210	1
738	353	212	15	0	chr3	20084326	20084392	-139515391	-	MTEa	LTR	MaLR	-103	276	210	1
738	353	212	15	0	chr3	20084395	20084461	-139515322	-	MTEa	LTR	MaLR	-103	276	210	1
738	345	227	15	0	chr3	20084464	20084530	-139515253	-	MTEa	LTR	MaLR	-103	276	210	1
738	1212	254	30	0	chr3	20084533	20084801	-139514982	-	MTEa	LTR	MaLR	-103	276	1	1
738	230	205	11	152	chr3	20085077	20085169	-139514614	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-7	401	323	1
738	1172	273	81	14	chr3	20085224	20085570	-139514213	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	1	1
738	753	300	81	49	chr3	20087671	20088015	-139511768	+	MLT1A0	LTR	MaLR	11	365	0	1
738	281	254	0	17	chr3	20091341	20091401	-139508382	-	RMER15	LTR	ERVL	-113	462	404	1
738	350	263	8	136	chr3	20099792	20099924	-139499859	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-406	121	7	1
738	2173	96	19	0	chr3	20099928	20100241	-139499542	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	1
738	611	130	28	7	chr3	20100724	20100854	-139498929	-	MTB	LTR	MaLR	-6	401	267	1
738	333	300	41	8	chr3	20103162	20103283	-139496500	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	274	1
738	2000	218	35	2	chr3	20104251	20104647	-139495136	+	MTD	LTR	MaLR	9	417	-2	1
738	6991	57	37	8	chr3	20105683	20106603	-139493180	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	1	947	-167	1
738	1068	124	42	36	chr3	20107985	20108180	-139491603	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	940	1114	0	1
738	1302	269	109	72	chr3	20135697	20136291	-139463492	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	616	0	2
738	686	201	0	59	chr3	20158142	20158295	-139441488	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	144	-223	2
738	544	246	102	46	chr3	20160796	20160992	-139438791	+	ORR1E	LTR	MaLR	153	359	0	2
738	229	248	116	124	chr3	20168126	20168255	-139431528	-	RMER6D	LTR	ERVK	-6	714	587	2
738	333	357	119	89	chr3	20175679	20176048	-139423735	-	LTR40a	LTR	ERVL	-40	479	100	2
738	270	218	18	0	chr3	20177194	20177247	-139422536	-	MTC	LTR	MaLR	0	419	366	2
738	533	31	0	0	chr3	20177247	20177312	-139422471	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	418	2
738	2225	117	67	45	chr3	20178356	20178777	-139421006	-	RLTR45	LTR	ERVK	-52	430	1	2
738	2020	147	88	8	chr3	20178777	20179122	-139420661	-	MTC	LTR	MaLR	-48	373	1	2
738	227	329	27	74	chr3	20179294	20179442	-139420341	+	RLTR20D	LTR	ERVK	76	216	-352	2
738	303	258	102	11	chr3	20183999	20184129	-139415654	+	MER34A1	LTR	ERV1	4	144	-443	3
738	1075	92	37	0	chr3	20184852	20185016	-139414767	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	157	3
739	3022	76	75	19	chr3	20190186	20190600	-139409183	-	RLTR9B	LTR	ERVK	0	437	1	3
739	704	287	77	29	chr3	20191006	20191214	-139408569	-	MTE2a	LTR	MaLR	-25	354	137	3
739	359	309	32	58	chr3	20191237	20191426	-139408357	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	247	3
739	287	221	54	75	chr3	20191754	20191847	-139407936	+	RLTR23	LTR	ERV1	340	430	0	3
739	2315	110	71	92	chr3	20191861	20192353	-139407430	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	3
739	1710	131	34	179	chr3	20192365	20192830	-139406953	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	3
739	472	315	259	11	chr3	20195484	20195741	-139404042	+	ORR1D2	LTR	MaLR	6	355	-15	3
739	3509	18	2	0	chr3	20196443	20196838	-139402945	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
739	3439	35	0	0	chr3	20199807	20200203	-139399580	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
739	3023	92	2	2	chr3	20203372	20203777	-139396006	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-2	405	1	3
739	743	174	6	67	chr3	20209501	20209680	-139390103	-	RMER17C	LTR	ERVK	-242	168	1	3
739	1450	210	153	9	chr3	20222601	20222947	-139376836	+	MTC	LTR	MaLR	18	413	-8	3
739	4209	110	29	70	chr3	20229871	20230654	-139369129	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	3
739	1532	258	77	3	chr3	20238129	20238517	-139361266	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	3
739	710	269	145	34	chr3	20242127	20242423	-139357360	+	RLTR17	LTR	ERVK	69	397	-295	3
739	424	228	169	8	chr3	20242434	20242558	-139357225	+	RLTR17	LTR	ERVK	470	613	-79	3
739	425	243	85	0	chr3	20251592	20251761	-139348022	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	2154	2324	-2	3
739	478	58	14	0	chr3	20251762	20251826	-139347957	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	65	-294	3
739	1655	150	37	0	chr3	20252008	20252308	-139347475	+	RLTR15	LTR	ERVK	49	359	0	3
739	1615	220	82	18	chr3	20252800	20253189	-139346594	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	1	3
739	1368	234	30	19	chr3	20256771	20257141	-139342642	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
739	1479	140	97	27	chr3	20262494	20262919	-139336864	+	RMER17C	LTR	ERVK	25	439	-519	4
739	1959	180	93	99	chr3	20273134	20273670	-139326113	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	4
739	710	284	36	60	chr3	20276360	20276611	-139323172	+	MTE2b	LTR	MaLR	135	379	0	4
739	2528	216	108	68	chr3	20279697	20280553	-139319230	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-12	890	1	4
739	867	292	61	30	chr3	20295038	20295366	-139304417	+	MTC-int	LTR	MaLR	525	862	-396	4
739	385	175	82	10	chr3	20295393	20295491	-139304292	+	MTC-int	LTR	MaLR	922	1026	-232	4
739	272	333	0	0	chr3	20300546	20300633	-139299150	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	87	-292	4
739	558	357	28	24	chr3	20300643	20300890	-139298893	+	MTE2b	LTR	MaLR	58	305	-74	4
739	328	264	33	0	chr3	20301050	20301141	-139298642	+	MTE-int	LTR	MaLR	9	102	-1478	4
739	467	324	295	6	chr3	20302889	20303207	-139296576	+	ORR1D2	LTR	MaLR	10	419	0	4
740	620	264	80	20	chr3	20335953	20336154	-139263629	+	MTEb	LTR	MaLR	156	368	-11	4
740	684	317	5	42	chr3	20343165	20343377	-139256406	+	MTE2a	LTR	MaLR	171	375	-4	5
740	2582	76	38	55	chr3	20353805	20354223	-139245560	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-4	411	1	5
740	442	324	39	62	chr3	20361140	20361402	-139238381	-	MTEb	LTR	MaLR	-130	249	1	5
740	442	299	0	22	chr3	20372252	20372389	-139227394	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-22	6520	6387	5
740	324	360	34	22	chr3	20372565	20372886	-139226897	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-339	5067	4743	5
740	2554	158	19	16	chr3	20373266	20373696	-139226087	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1728	4409	3979	5
740	1313	120	139	7	chr3	20374380	20374818	-139224965	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2157	3980	3485	5
740	290	244	89	59	chr3	20375423	20375558	-139224225	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-17	6525	6387	5
740	469	274	82	84	chr3	20381512	20381770	-139218013	-	MTEb	LTR	MaLR	-127	252	1	5
740	983	313	73	22	chr3	20391447	20391803	-139207980	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	46	5
740	390	243	8	59	chr3	20391817	20391935	-139207848	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	254	5
740	1493	257	37	106	chr3	20393009	20393583	-139206200	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	534	-7	5
740	704	313	62	22	chr3	20395116	20395485	-139204298	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-167	4896	4569	5
740	2678	134	0	12	chr3	20400165	20400572	-139199211	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	6	5
740	473	290	0	0	chr3	20401378	20401502	-139198281	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3859	1140	1017	5
740	2015	130	35	7	chr3	20418550	20418860	-139180923	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	6
740	2311	203	96	16	chr3	20419096	20419499	-139180284	+	RLTR20A	LTR	ERVK	2	439	-102	6
740	2311	203	96	16	chr3	20419551	20419647	-139180136	+	RLTR20A	LTR	ERVK	440	540	-1	6
740	2384	146	46	17	chr3	20420929	20421313	-139178470	+	RMER2	LTR	ERV1	133	535	-32	6
740	2384	146	46	17	chr3	20421359	20421384	-139178399	+	RMER2	LTR	ERV1	536	553	-14	6
740	258	328	84	37	chr3	20421628	20421818	-139177965	-	MLT1K	LTR	MaLR	-11	584	386	6
740	725	289	88	25	chr3	20422837	20423075	-139176708	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	118	6
740	2514	69	156	8	chr3	20424340	20424719	-139175064	-	RLTR44C	LTR	ERVK	-67	435	1	6
740	673	306	127	29	chr3	20426112	20426489	-139173294	-	MLT1D	LTR	MaLR	-62	443	30	6
740	1381	211	47	39	chr3	20426576	20426960	-139172823	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	147	6
740	6855	120	46	24	chr3	20426999	20427734	-139172049	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-9	5397	4682	6
740	6877	62	10	2	chr3	20427734	20428536	-139171247	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	6
740	6855	120	46	24	chr3	20428536	20428867	-139170916	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-725	4681	4308	6
740	3782	20	0	0	chr3	20430749	20431145	-139168638	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
740	286	237	125	69	chr3	20432548	20432721	-139167062	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6386	6525	-17	6
740	4244	138	112	74	chr3	20433018	20433431	-139166352	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3485	3966	-2169	6
740	4244	138	112	74	chr3	20434106	20434494	-139165289	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3969	4378	-1759	6
740	309	247	0	63	chr3	20434501	20434596	-139165187	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-378	1948	1860	6
740	2574	94	103	6	chr3	20434603	20435098	-139164685	+	RMER16-int	LTR	ERVK	889	1431	-3975	6
740	868	184	154	51	chr3	20435144	20435380	-139164403	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1313	1537	-3869	6
740	6249	230	58	65	chr3	20435468	20436052	-139163731	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2188	2615	-4791	6
740	6811	153	68	27	chr3	20436276	20437379	-139162404	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1570	3739	-3667	6
740	1256	222	233	21	chr3	20437379	20437816	-139161967	-	RMER16	LTR	ERVK	-1	532	3	6
740	6811	151	68	25	chr3	20437816	20438020	-139161763	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2675	2870	-2536	6
740	3355	137	86	23	chr3	20438179	20438828	-139160955	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2863	3552	-1854	6
740	744	236	57	33	chr3	20438831	20439058	-139160725	-	LTRIS4	LTR	ERV1	0	519	298	6
740	624	332	42	13	chr3	20439205	20439590	-139160193	+	SRV_MM-int	LTR	ERVK	4979	5374	-793	6
740	280	352	8	23	chr3	20440884	20441015	-139158768	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	4579	4707	-815	6
740	370	261	16	16	chr3	20440901	20441022	-139158761	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7341	7461	-317	6
740	261	319	9	9	chr3	20441532	20441646	-139158137	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	5775	5888	-279	6
740	310	237	40	115	chr3	20442239	20442387	-139157396	+	RLTR43A	LTR	ERVK	228	364	0	6
740	907	165	119	28	chr3	20442872	20443221	-139156562	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-4	405	1	6
740	583	348	84	14	chr3	20443269	20443555	-139156228	+	MTE2b	LTR	MaLR	67	372	-7	6
740	1019	282	35	75	chr3	20445321	20445693	-139154090	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	357	-13	6
740	1085	296	82	23	chr3	20445711	20446064	-139153719	+	MTD	LTR	MaLR	46	419	0	6
741	989	67	37	0	chr3	20448542	20448677	-139151106	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	188	6
741	2218	174	35	9	chr3	20451219	20451649	-139148134	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	1	6
741	1947	131	192	5	chr3	20456289	20456689	-139143094	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
741	1599	214	100	18	chr3	20458218	20458598	-139141185	+	MTC	LTR	MaLR	2	412	-9	6
741	1312	271	102	5	chr3	20458964	20459346	-139140437	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
741	3027	170	115	33	chr3	20460057	20460716	-139139067	-	RMER6D	LTR	ERVK	-6	714	2	6
741	751	262	3	86	chr3	20467348	20467562	-139132221	-	MTD	LTR	MaLR	-231	188	9	6
741	2719	184	91	14	chr3	20471144	20471782	-139128001	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	4	6
741	2050	135	0	10	chr3	20472192	20472506	-139127277	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	6
741	3660	125	17	1	chr3	20472506	20473179	-139126604	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6965	6
741	1378	116	112	0	chr3	20473179	20473403	-139126380	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5007	6
741	334	175	0	0	chr3	20473403	20473460	-139126323	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6039	503	447	6
741	390	312	19	19	chr3	20473479	20473728	-139126055	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5481	1061	889	6
741	283	119	0	0	chr3	20473898	20473940	-139125843	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-996	991	950	6
741	1395	176	129	18	chr3	20473935	20474372	-139125411	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5475	662	192	6
741	1312	122	60	8	chr3	20474352	20474601	-139125182	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6712	869	608	6
741	1456	135	0	5	chr3	20474601	20474817	-139124966	-	RLTR10E	LTR	ERVK	-96	215	1	6
741	2807	55	0	14	chr3	20484365	20484716	-139115067	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	7
741	1814	58	58	4	chr3	20484716	20484974	-139114809	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	2	273	-1519	7
741	1396	87	41	6	chr3	20486201	20486544	-139113239	+	ORR1A1	LTR	MaLR	184	435	-1357	7
741	1393	184	141	12	chr3	20487166	20487408	-139112375	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	104	7
741	2015	183	60	18	chr3	20487408	20487843	-139111940	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	7
741	1393	184	141	12	chr3	20487843	20487920	-139111863	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-264	103	7	7
741	1987	170	84	43	chr3	20493163	20493605	-139106178	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	460	-68	7
741	596	259	11	45	chr3	20497077	20497255	-139102528	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	388	7
741	1468	261	50	30	chr3	20497555	20497954	-139101829	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	6	7
741	467	304	132	64	chr3	20498172	20498343	-139101440	-	RMER20B	LTR	ERVK	-94	533	342	7
741	3268	53	2	0	chr3	20498343	20498738	-139101045	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
741	467	313	107	68	chr3	20498738	20498891	-139100892	-	RMER20B	LTR	ERVK	-286	341	168	7
741	381	129	50	15	chr3	20501160	20501239	-139098544	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	89	-305	4
741	1334	212	68	11	chr3	20503855	20504136	-139095647	+	ORR1B2	LTR	MaLR	71	367	0	1
741	227	279	11	92	chr3	20504162	20504249	-139095534	-	MTEa	LTR	MaLR	-106	253	174	1
741	424	191	30	69	chr3	20504262	20504363	-139095420	-	MTEa	LTR	MaLR	-267	112	16	1
741	267	280	25	147	chr3	20505874	20506071	-139093712	-	MTEb	LTR	MaLR	-9	370	198	1
741	2082	213	22	42	chr3	20506770	20507265	-139092518	-	RMER13B	LTR	ERVK	-147	761	277	1
741	989	218	50	31	chr3	20507269	20507682	-139092101	-	RMER17B	LTR	ERVK	-712	246	1	1
741	2628	203	90	110	chr3	20508893	20509804	-139089979	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	10	902	0	1
741	5417	101	23	67	chr3	20513327	20514167	-139085616	+	RLTR13B4	LTR	ERVK	1	803	0	2
741	707	325	109	4	chr3	20514732	20515007	-139084776	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-128	387	84	2
741	628	229	27	27	chr3	20515010	20515158	-139084625	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	4	151	-1697	2
741	567	211	95	0	chr3	20516030	20516177	-139083606	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	263	423	-1425	2
741	577	153	56	8	chr3	20522967	20523092	-139076691	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	412	542	-1266	3
741	913	167	156	13	chr3	20526579	20526810	-139072973	+	RLTR30	LTR	ERV1	116	379	0	3
741	2119	238	59	9	chr3	20527042	20527569	-139072214	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-956	553	1	3
741	979	228	139	6	chr3	20527574	20527741	-139072042	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-13	371	148	3
741	979	243	132	28	chr3	20527818	20527930	-139071853	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-208	176	52	3
741	1044	211	114	28	chr3	20527931	20528185	-139071598	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	276	-91	4
741	2296	182	75	87	chr3	20528186	20528762	-139071021	-	RMER4B	LTR	ERVK	-16	569	1	4
741	980	181	46	5	chr3	20528830	20529024	-139070759	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	31	232	-1277	4
741	258	232	0	18	chr3	20530520	20530577	-139069206	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	218	273	-1097	4
741	2055	109	264	29	chr3	20531765	20532209	-139067574	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	37	4
741	239	220	211	39	chr3	20532211	20532315	-139067468	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-532	122	1	4
741	17457	51	1	0	chr3	20532315	20534378	-139065405	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	5715	4
741	14248	68	44	8	chr3	20534366	20536403	-139063380	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-5553	2225	23	4
741	2027	124	251	34	chr3	20536406	20536872	-139062911	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-51	603	37	4
741	2732	201	64	68	chr3	20537864	20538552	-139061231	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	820	1504	-5	4
741	1901	215	25	6	chr3	20538557	20538917	-139060866	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
741	341	284	45	0	chr3	20538919	20539007	-139060776	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-278	96	5	3
741	7630	59	14	0	chr3	20541928	20542809	-139056974	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	5
741	372	328	112	10	chr3	20544909	20545106	-139054677	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-32	528	312	5
741	279	292	14	0	chr3	20545196	20545268	-139054515	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	347	5
741	937	177	8	104	chr3	20545282	20545522	-139054261	-	RLTR28	LTR	ERVL	-14	510	294	6
741	1007	167	52	0	chr3	20545706	20545898	-139053885	-	RLTR28	LTR	ERVL	-240	284	83	6
741	345	263	126	42	chr3	20546257	20546400	-139053383	+	MLT1A1	LTR	MaLR	254	408	0	6
741	2318	255	116	65	chr3	20549160	20550065	-139049718	-	RMER17B	LTR	ERVK	-7	951	1	7
741	345	292	66	16	chr3	20551554	20551676	-139048107	+	MLT1A1	LTR	MaLR	3	130	-278	7
741	306	327	19	29	chr3	20551846	20551950	-139047833	+	RMER15	LTR	ERVL	296	398	-177	7
741	2007	189	133	68	chr3	20552317	20552773	-139047010	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	476	-92	8
741	2007	189	133	68	chr3	20552816	20552892	-139046891	+	RLTR20D	LTR	ERVK	477	568	0	8
741	700	274	64	137	chr3	20558920	20559496	-139040287	-	RMER20B	LTR	ERVK	-15	612	30	8
741	1639	187	77	53	chr3	20563409	20563748	-139036035	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-47	347	1	9
741	942	132	28	0	chr3	20564545	20564689	-139035094	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-87	240	93	9
741	732	84	9	0	chr3	20570668	20570775	-139029008	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-219	108	1	9
741	9936	138	54	83	chr3	20570777	20572796	-139026987	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-2	1961	2	9
741	366	82	0	0	chr3	20572797	20572846	-139026937	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	326	278	9
741	2484	77	48	3	chr3	20572842	20573196	-139026587	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	27	396	0	9
741	1545	179	57	22	chr3	20573150	20573464	-139026319	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	9
741	778	275	21	11	chr3	20575636	20575827	-139023956	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	193	-319	1
741	271	250	14	27	chr3	20575934	20576008	-139023775	+	RLTR18	LTR	ERVK	120	192	-424	1
741	559	317	169	8	chr3	20576004	20576252	-139023531	+	RLTR18B	LTR	ERVK	116	403	-109	1
741	1284	203	104	13	chr3	20577565	20577864	-139021919	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-22	362	37	1
742	2450	214	174	56	chr3	20578327	20578600	-139021183	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	319	-498	1
742	2450	214	174	56	chr3	20578717	20579174	-139020609	+	RLTR40	LTR	ERVK	320	817	0	1
742	278	302	57	57	chr3	20586028	20586151	-139013632	-	MT2B2	LTR	ERVL	-319	265	143	1
742	2356	62	18	33	chr3	20586911	20587243	-139012540	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	1
742	50979	30	15	19	chr3	20587244	20593821	-139005962	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	6479	-2	1
742	2358	62	18	33	chr3	20593823	20594155	-139005628	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	1
742	877	263	98	47	chr3	20594710	20594965	-139004818	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	136	1
742	644	302	151	9	chr3	20595262	20595586	-139004197	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
742	2277	201	80	77	chr3	20600143	20600757	-138999026	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	616	0	1
742	835	299	60	53	chr3	20601048	20601397	-138998386	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	1	1
742	1049	309	8	34	chr3	20604842	20605161	-138994622	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	335	-84	1
742	262	270	43	43	chr3	20610668	20610761	-138989022	+	MTEa	LTR	MaLR	1	93	-286	1
742	443	220	184	0	chr3	20610838	20610979	-138988804	+	MTEa	LTR	MaLR	211	377	-2	1
742	423	252	182	19	chr3	20610979	20611188	-138988595	-	MER110A	LTR	ERV1	-186	282	39	1
742	587	257	51	28	chr3	20612901	20613077	-138986706	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	200	1
742	662	272	15	56	chr3	20613169	20613364	-138986419	-	MTE2b	LTR	MaLR	-178	201	15	1
742	2677	146	76	43	chr3	20616591	20617013	-138982770	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	93	1
742	3009	62	31	5	chr3	20617013	20617399	-138982384	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
742	2677	146	76	43	chr3	20617399	20617492	-138982291	-	RMER16	LTR	ERVK	-441	92	1	1
742	1872	103	78	62	chr3	20618222	20618543	-138981240	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
742	694	363	71	17	chr3	20621531	20621884	-138977899	+	MT2A	LTR	ERVL	20	391	-142	1
742	1598	239	66	18	chr3	20626251	20626643	-138973140	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	1
742	1508	209	52	121	chr3	20628436	20628601	-138971182	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	156	-290	1
742	1508	209	52	121	chr3	20628641	20628954	-138970829	+	RLTR41	LTR	ERV1	157	446	0	1
742	1367	247	127	6	chr3	20648119	20648461	-138951322	+	MTD	LTR	MaLR	1	386	-33	2
742	1367	247	127	6	chr3	20648492	20648511	-138951272	+	MTD	LTR	MaLR	387	405	-14	2
742	406	351	46	29	chr3	20655403	20655576	-138944207	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-162	203	28	2
742	742	259	172	46	chr3	20670571	20670943	-138928840	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	364	-14	2
742	2040	189	5	29	chr3	20673474	20673560	-138926223	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-127	1382	1303	2
742	497	256	157	74	chr3	20673560	20673898	-138925885	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	3	2
742	2040	189	5	29	chr3	20673898	20674219	-138925564	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-207	1302	985	2
742	356	287	137	67	chr3	20674217	20674516	-138925267	+	MLT1B	LTR	MaLR	61	380	-10	2
742	231	295	40	111	chr3	20674635	20674761	-138925022	+	LTR41	LTR	ERVL	83	199	-569	2
742	279	281	62	62	chr3	20676596	20676725	-138923058	-	MLT1A	LTR	MaLR	-24	341	213	2
742	314	249	16	24	chr3	20676799	20676884	-138922899	-	MLT1A	LTR	MaLR	-314	94	7	2
742	3505	18	2	0	chr3	20679582	20679977	-138919806	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
742	314	26	0	0	chr3	20679977	20680015	-138919768	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-308	38	1	2
742	766	276	188	78	chr3	20680048	20680511	-138919272	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-20	514	1	2
742	977	144	10	5	chr3	20680820	20681016	-138918767	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3203	2319	2123	2
742	454	169	8	87	chr3	20681061	20681243	-138918540	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3396	2126	1913	2
742	435	170	0	11	chr3	20683392	20683481	-138916302	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3895	1627	1540	2
742	1200	237	48	31	chr3	20683560	20683974	-138915809	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3997	1525	1105	2
742	252	158	0	0	chr3	20684957	20684995	-138914788	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-346	38	1	2
742	1912	168	74	33	chr3	20687115	20687478	-138912305	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
742	3118	32	62	0	chr3	20688517	20688890	-138910893	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
742	435	191	352	0	chr3	20695502	20695669	-138904114	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-151	227	2	2
742	1885	171	74	33	chr3	20698935	20699298	-138900485	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	2
742	252	158	0	0	chr3	20701404	20701442	-138898341	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	38	-346	2
742	1200	237	48	31	chr3	20702425	20702839	-138896944	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1105	1525	-3997	2
742	435	170	0	11	chr3	20702918	20703007	-138896776	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1540	1627	-3895	2
742	454	169	8	87	chr3	20705156	20705338	-138894445	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1913	2126	-3396	2
742	977	144	10	5	chr3	20705383	20705579	-138894204	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2123	2319	-3203	2
742	764	276	196	78	chr3	20705898	20706358	-138893425	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	514	-20	2
742	2769	40	0	23	chr3	20706391	20706429	-138893354	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	38	-308	2
742	3475	18	5	0	chr3	20706429	20706823	-138892960	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
742	9408	20	6	2	chr3	20706823	20707917	-138891866	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
742	3517	13	5	0	chr3	20707917	20708311	-138891472	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
742	2769	40	0	23	chr3	20708311	20708624	-138891159	+	ORR1A0	LTR	MaLR	39	344	-2	2
742	679	343	60	56	chr3	20708625	20709091	-138890692	+	MLT2B1	LTR	ERVL	17	484	-36	2
743	515	261	0	113	chr3	20710298	20710351	-138889432	+	MTEb	LTR	MaLR	1	46	-333	2
743	515	261	0	113	chr3	20710548	20710645	-138889138	+	MTEb	LTR	MaLR	47	134	-245	2
743	2767	189	13	10	chr3	20710647	20711170	-138888613	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-3	525	1	2
743	952	238	23	14	chr3	20711178	20711395	-138888388	+	MTEb	LTR	MaLR	154	372	-7	2
743	1351	132	118	0	chr3	20712591	20712819	-138886964	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	75	2
743	9223	164	75	16	chr3	20712853	20714705	-138885078	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	3	2
743	980	112	7	0	chr3	20714707	20714850	-138884933	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	186	2
743	276	50	25	0	chr3	20714845	20714885	-138884898	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-288	41	1	2
743	764	243	5	21	chr3	20715252	20715441	-138884342	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-7	367	182	2
743	1213	264	101	12	chr3	20715530	20715856	-138883927	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	15	3
743	228	262	24	36	chr3	20719338	20719421	-138880362	-	LTR88c	LTR	Genie?	-3	859	778	3
743	375	309	159	35	chr3	20722636	20722837	-138876946	+	MLT1C	LTR	MaLR	45	270	-197	3
743	1777	256	40	2	chr3	20723237	20723636	-138876147	-	MTC	LTR	MaLR	-7	414	1	3
743	309	298	80	51	chr3	20724033	20724171	-138875612	-	RMER15	LTR	ERVL	-12	563	422	3
743	226	326	40	59	chr3	20724436	20724537	-138875246	+	MLT1G3	LTR	MaLR	215	313	-282	3
743	245	332	176	53	chr3	20727723	20728025	-138871758	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-349	353	15	3
743	4066	199	33	44	chr3	20754099	20755008	-138844775	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	899	-9	3
743	4127	56	4	0	chr3	20755839	20756340	-138843443	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	1	3
743	805	318	100	9	chr3	20763843	20764262	-138835521	+	RMER5	LTR	ERV1	41	497	-37	3
743	2012	229	47	38	chr3	20771487	20772019	-138827764	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	737	177	3
743	6974	136	35	43	chr3	20772020	20773418	-138826365	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-11	5769	4231	3
743	1271	246	77	26	chr3	20775572	20775923	-138823860	+	MTEb	LTR	MaLR	1	369	-10	3
743	477	163	11	21	chr3	20783049	20783143	-138816640	+	MMETn-int	LTR	ERVK	4412	4504	-340	3
743	460	259	185	8	chr3	20783143	20783381	-138816402	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	158	437	-465	3
743	242	322	38	76	chr3	20785122	20785253	-138814530	-	MER90	LTR	ERV1	-446	129	4	3
743	1514	204	70	0	chr3	20786171	20786528	-138813255	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	3	3
743	691	191	102	26	chr3	20786531	20786742	-138813041	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-1	1508	1319	3
743	2115	179	114	13	chr3	20787879	20788348	-138811435	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-172	1337	723	3
743	383	272	22	0	chr3	20788355	20788447	-138811336	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-278	96	3	3
743	762	267	143	7	chr3	20794452	20794731	-138805052	-	MTE2a	LTR	MaLR	-35	344	28	3
743	1782	152	38	6	chr3	20805439	20805758	-138794025	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
743	2632	75	3	0	chr3	20814366	20814697	-138785086	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	4
743	1015	180	14	120	chr3	20824925	20825200	-138774583	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	245	-492	4
743	332	306	26	65	chr3	20825278	20825432	-138774351	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	2	4
743	422	267	0	0	chr3	20830746	20830832	-138768951	-	MTD	LTR	MaLR	-96	323	238	4
744	769	332	47	85	chr3	20846382	20846810	-138752973	+	MTD	LTR	MaLR	7	404	-15	4
744	1634	199	12	9	chr3	20855713	20856032	-138743751	+	ORR1A4	LTR	MaLR	10	329	0	4
744	550	287	66	66	chr3	20858786	20858969	-138740814	+	MTD	LTR	MaLR	197	379	-40	4
744	1352	164	8	17	chr3	20862025	20862260	-138737523	+	ORR1A3	LTR	MaLR	94	326	0	4
744	291	331	99	0	chr3	20863388	20863530	-138736253	-	MLT2D	LTR	ERVL	-258	156	1	4
744	524	261	365	11	chr3	20873910	20874054	-138725729	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	368	175	4
744	524	332	19	24	chr3	20874114	20874287	-138725496	-	ORR1E	LTR	MaLR	-185	174	2	4
744	741	293	210	21	chr3	20874551	20874970	-138724813	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	498	-22	4
744	245	172	105	31	chr3	20875627	20875706	-138724077	-	MT2B	LTR	ERVL	-449	84	1	4
744	2311	184	58	21	chr3	20877976	20878062	-138721721	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	446	4
744	2311	184	58	21	chr3	20878088	20878516	-138721267	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-89	445	3	4
744	1122	278	57	15	chr3	20880245	20880578	-138719205	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	33	4
744	1246	171	123	24	chr3	20883439	20883828	-138715955	-	RMER17C	LTR	ERVK	-519	439	16	4
744	3779	152	77	20	chr3	20891812	20892523	-138707260	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	-231	752	1	4
744	535	254	48	16	chr3	20895034	20895158	-138704625	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-209	7197	7070	4
744	2149	114	12	38	chr3	20912476	20912822	-138686961	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	5
744	6376	32	4	19	chr3	20912824	20913607	-138686176	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5709	5
744	3086	22	0	0	chr3	20913598	20913955	-138685828	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2124	4357	4001	5
744	20867	54	39	19	chr3	20913953	20916667	-138683116	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3707	2774	8	5
744	2149	114	12	38	chr3	20916667	20917013	-138682770	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	5
744	398	331	16	47	chr3	20917375	20917502	-138682281	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	372	250	5
744	2020	178	148	2	chr3	20917538	20917977	-138681806	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-25	503	1	5
744	760	231	77	29	chr3	20918281	20918490	-138681293	-	ORR1E	LTR	MaLR	-111	248	30	5
744	1759	142	26	70	chr3	20922055	20922397	-138677386	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	3	5
744	1679	223	99	5	chr3	20925922	20926305	-138673478	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
744	416	339	101	87	chr3	20927019	20927465	-138672318	+	MLT1D	LTR	MaLR	5	456	-49	5
744	1076	248	62	106	chr3	20928393	20928781	-138671002	+	MTE2a	LTR	MaLR	4	374	-5	5
744	876	310	149	6	chr3	20945694	20946044	-138653739	+	MTD	LTR	MaLR	18	417	-2	5
744	352	262	50	76	chr3	20967751	20967949	-138631834	+	RMER15	LTR	ERVL	350	542	-33	5
745	1881	222	43	12	chr3	20971612	20972032	-138627751	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	433	-287	5
745	1625	170	156	11	chr3	20975704	20976151	-138623632	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	878	1389	-120	5
745	2411	122	61	5	chr3	20976894	20977305	-138622478	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-375	434	1	5
745	363	168	14	7	chr3	20978384	20978453	-138621330	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	73	-348	5
745	807	166	21	0	chr3	20978458	20978603	-138621180	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1361	1508	-1	6
745	1554	216	66	3	chr3	20978616	20978951	-138620832	+	ORR1B2	LTR	MaLR	4	359	-8	6
745	976	289	84	3	chr3	20985783	20986068	-138613715	+	MTEa	LTR	MaLR	72	379	0	6
745	1111	250	186	40	chr3	20987524	20988021	-138611762	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	611	0	6
745	1267	301	47	22	chr3	20989343	20989748	-138610035	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	6
745	226	242	97	0	chr3	20992698	20992760	-138607023	+	RMER15	LTR	ERVL	495	562	-13	6
745	233	330	150	22	chr3	20992793	20993019	-138606764	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-42	638	384	6
745	391	321	48	18	chr3	20993095	20993263	-138606520	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-481	173	1	6
745	1404	203	109	6	chr3	21008466	21008754	-138591029	+	RMER20B	LTR	ERVK	21	330	-297	6
745	1404	238	505	21	chr3	21008813	21009008	-138590775	+	RMER20B	LTR	ERVK	331	627	0	6
745	1582	175	84	12	chr3	21010584	21010919	-138588864	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	1
745	572	271	37	8	chr3	21012331	21012465	-138587318	+	RMER20B	LTR	ERVK	10	147	-480	1
745	259	419	23	11	chr3	21017556	21017730	-138582053	+	LTR82A	LTR	ERVL	354	529	-343	2
745	302	299	23	0	chr3	21018847	21018934	-138580849	+	ORR1E	LTR	MaLR	271	359	0	2
745	418	316	98	57	chr3	21019427	21019762	-138580021	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-3	362	14	3
745	613	310	112	27	chr3	21024586	21024845	-138574938	+	MLT1A0	LTR	MaLR	85	365	0	3
745	2066	273	118	101	chr3	21028110	21029410	-138570373	+	RMER12	LTR	ERVK	1	1322	0	4
745	627	275	114	35	chr3	21033940	21034212	-138565571	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-31	343	51	5
745	521	313	25	30	chr3	21040520	21040721	-138559062	-	MTD	LTR	MaLR	-219	200	1	5
745	1444	189	102	19	chr3	21044402	21044726	-138555057	+	ORR1B1	LTR	MaLR	44	394	0	6
745	1877	243	9	7	chr3	21045333	21045752	-138554031	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	6
745	1962	158	63	32	chr3	21046153	21046337	-138553446	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	189	-205	6
745	1962	158	63	32	chr3	21046369	21046564	-138553219	+	ORR1B1	LTR	MaLR	190	392	-2	6
745	2033	199	31	33	chr3	21047488	21047910	-138551873	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
745	1028	192	205	0	chr3	21050110	21050339	-138549444	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	276	-118	7
745	481	178	0	90	chr3	21052644	21052755	-138547028	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-228	101	1	7
745	5448	128	11	20	chr3	21052987	21053901	-138545882	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	7
745	377	296	59	17	chr3	21054117	21054456	-138545327	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	4512	4827	-2092	8
745	283	267	120	22	chr3	21055482	21055574	-138544209	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	328	8
745	2228	87	51	0	chr3	21055590	21055901	-138543882	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	8
745	5034	81	25	14	chr3	21055903	21056692	-138543091	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-22	6799	5653	8
745	2674	22	9	61	chr3	21056712	21057057	-138542726	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	8
745	6111	65	12	0	chr3	21057057	21057876	-138541907	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5653	8
745	2521	70	0	3	chr3	21057871	21058214	-138541569	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4781	1700	1359	8
745	3281	84	13	20	chr3	21058214	21059026	-138540757	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	9	8
745	2161	97	51	0	chr3	21059027	21059338	-138540445	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	8
745	1282	232	101	11	chr3	21059382	21059748	-138540035	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	410	808	-1040	8
745	494	214	59	17	chr3	21059796	21059915	-138539868	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1590	1713	-135	8
745	2323	110	52	82	chr3	21061871	21062276	-138537507	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	8
745	478	107	0	0	chr3	21062277	21062352	-138537431	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1	7405	7331	8
745	3801	185	21	37	chr3	21062566	21064620	-138535163	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3321	4085	2356	8
745	1142	99	0	27	chr3	21065255	21065442	-138534341	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-156	650	469	9
745	1506	133	163	50	chr3	21065446	21066103	-138533680	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4297	3109	2494	9
745	2830	218	50	106	chr3	21066117	21067387	-138532396	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3538	1306	108	9
745	342	176	132	0	chr3	21067424	21067515	-138532268	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4740	104	2	9
745	2452	78	54	86	chr3	21067517	21067923	-138531860	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	9
745	848	245	113	141	chr3	21071985	21072375	-138527408	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	9
745	245	301	0	0	chr3	21075418	21075491	-138524292	-	RMER15	LTR	ERVL	-40	535	463	1
745	251	292	73	28	chr3	21075531	21075640	-138524143	-	RMER15	LTR	ERVL	-459	116	3	1
745	2661	190	56	60	chr3	21084780	21084871	-138514912	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	470	1
745	2661	200	61	60	chr3	21084972	21085493	-138514290	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-99	469	2	1
745	3441	33	0	0	chr3	21086250	21086646	-138513137	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
745	8233	65	7	17	chr3	21086646	21087755	-138512028	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
745	3214	63	0	0	chr3	21087755	21088151	-138511632	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
746	299	359	81	55	chr3	21124707	21124943	-138474840	+	MER74B	LTR	ERVL	58	299	-323	1
746	7303	21	0	0	chr3	21130799	21131621	-138468162	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	1
746	427	252	61	0	chr3	21136066	21136165	-138463618	-	MTD	LTR	MaLR	-36	383	279	1
746	239	333	114	0	chr3	21137406	21137511	-138462272	-	MTD	LTR	MaLR	-301	118	2	1
746	1588	170	31	11	chr3	21137665	21137951	-138461832	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	292	-75	1
746	462	118	0	0	chr3	21138173	21138241	-138461542	+	ORR1B2	LTR	MaLR	300	367	0	1
746	740	244	181	4	chr3	21146104	21146330	-138453453	+	ORR1D2	LTR	MaLR	105	370	0	1
746	363	215	0	0	chr3	21150946	21151011	-138448772	-	MT2B2	LTR	ERVL	-389	195	131	1
746	3713	204	16	5	chr3	21150961	21151696	-138448087	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1219	744	2	1
746	1468	185	67	16	chr3	21151697	21152010	-138447773	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
746	735	261	15	147	chr3	21152178	21152519	-138447264	-	RLTR23	LTR	ERV1	-127	303	8	1
746	1245	223	75	55	chr3	21154536	21154734	-138445049	-	RMER17C	LTR	ERVK	-3	407	202	1
746	1245	223	75	55	chr3	21154801	21155001	-138444782	-	RMER17C	LTR	ERVK	-209	201	1	1
746	2401	165	85	28	chr3	21162769	21163069	-138436714	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-36	3202	2900	1
746	2401	165	85	28	chr3	21163134	21163182	-138436601	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-339	2899	2825	1
746	3032	58	8	5	chr3	21163182	21163577	-138436206	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
746	2401	165	85	28	chr3	21163577	21163755	-138436028	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-414	2824	2646	1
746	6882	156	25	47	chr3	21163750	21165253	-138434530	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-752	2486	1097	1
746	1462	246	56	84	chr3	21165639	21166247	-138433536	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2647	591	1	1
746	688	221	65	145	chr3	21166248	21166649	-138433134	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	42	1
746	333	341	56	54	chr3	21172475	21172767	-138427016	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-42	463	209	2
746	699	316	45	78	chr3	21172814	21173171	-138426612	+	ORR1E	LTR	MaLR	15	359	0	2
746	492	321	29	0	chr3	21173171	21173307	-138426476	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-420	140	1	2
746	227	353	134	29	chr3	21173718	21173890	-138425893	-	MLT1F2-int	LTR	MaLR	-255	1234	1045	2
746	497	312	134	42	chr3	21174093	21174354	-138425429	-	MLT1F2-int	LTR	MaLR	-1145	344	60	2
746	309	259	224	27	chr3	21174537	21174684	-138425099	+	MTEb	LTR	MaLR	204	379	0	2
746	804	258	159	67	chr3	21178024	21178369	-138421414	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	2
746	1757	197	33	11	chr3	21178949	21179308	-138420475	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	2
746	1148	278	85	12	chr3	21188700	21189042	-138410741	+	MTEa	LTR	MaLR	1	367	-12	2
746	277	311	73	40	chr3	21190273	21190397	-138409386	-	MTE2a	LTR	MaLR	-172	207	80	2
746	1259	242	41	67	chr3	21190532	21190921	-138408862	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	2
746	404	252	49	108	chr3	21192487	21192775	-138407008	+	MTEa	LTR	MaLR	5	341	-38	2
746	1023	218	276	0	chr3	21193813	21194106	-138405677	+	MTD	LTR	MaLR	34	407	-12	2
746	687	122	95	11	chr3	21207898	21208046	-138391737	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	230	2
746	1223	251	33	79	chr3	21208173	21208592	-138391191	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	417	1	2
746	681	272	57	97	chr3	21211680	21212030	-138387753	+	RMER5	LTR	ERV1	181	516	-18	2
746	303	321	35	70	chr3	21233375	21233603	-138366180	-	RMER12	LTR	ERVK	-360	962	743	2
747	1019	276	83	46	chr3	21233969	21234318	-138365465	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	17	2
747	274	329	64	45	chr3	21234330	21234486	-138365297	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	224	2
747	787	286	100	50	chr3	21237176	21237396	-138362387	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	132	2
747	787	286	100	50	chr3	21237567	21237706	-138362077	-	MTEa	LTR	MaLR	-248	131	2	2
747	1531	251	97	47	chr3	21243505	21244041	-138355742	+	RMER2	LTR	ERV1	5	567	0	3
747	3652	42	9	0	chr3	21247241	21247673	-138352110	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	3
747	989	268	58	60	chr3	21249630	21250027	-138349756	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	406	1	3
747	284	231	76	13	chr3	21256947	21257026	-138342757	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	296	3
747	320	239	15	0	chr3	21257813	21257880	-138341903	-	ORR1E	LTR	MaLR	-285	74	7	3
747	3278	43	5	0	chr3	21267604	21267997	-138331786	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	3
747	8372	60	7	4	chr3	21267997	21269091	-138330692	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
747	3135	63	5	0	chr3	21269091	21269485	-138330298	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
747	225	157	107	89	chr3	21270736	21270848	-138328935	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-518	510	397	3
747	742	309	70	73	chr3	21274935	21275361	-138324422	-	MLT1D	LTR	MaLR	-7	498	74	3
747	232	277	23	98	chr3	21276603	21276735	-138323048	+	RMER12	LTR	ERVK	494	615	-707	3
747	310	237	113	119	chr3	21298664	21299009	-138300774	-	RMER17C	LTR	ERVK	-61	349	7	3
747	528	231	87	23	chr3	21299036	21299209	-138300574	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-13	3225	3042	3
747	293	286	26	0	chr3	21300696	21300773	-138299010	+	MER67A	LTR	ERV1	3	81	-462	3
747	1049	287	26	44	chr3	21303044	21303430	-138296353	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	3
747	876	269	75	100	chr3	21306948	21307337	-138292446	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	3
747	271	136	0	0	chr3	21307338	21307382	-138292401	+	MT2A	LTR	ERVL	490	533	0	3
747	421	371	113	45	chr3	21308010	21308495	-138291288	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-16	544	27	3
747	1266	278	83	13	chr3	21315372	21315759	-138284024	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	1	4
747	781	303	85	66	chr3	21315807	21316163	-138283620	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	368	-51	4
747	781	291	84	71	chr3	21316197	21316239	-138283544	+	MTE2a	LTR	MaLR	330	374	-5	4
747	250	250	30	50	chr3	21321149	21321250	-138278533	-	MER57A-int	LTR	ERV1	-291	5896	5798	4
747	2087	205	76	22	chr3	21323556	21324055	-138275728	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	526	-3	4
747	324	295	196	54	chr3	21324069	21324273	-138275510	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	335	4
747	1098	244	110	23	chr3	21326959	21327294	-138272489	+	MTD	LTR	MaLR	46	395	-24	4
747	793	318	163	17	chr3	21330199	21330660	-138269123	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	6	4
747	277	340	132	83	chr3	21332746	21333012	-138266771	+	ORR1E	LTR	MaLR	81	359	0	4
747	1029	282	134	11	chr3	21333221	21333594	-138266189	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
747	998	221	163	28	chr3	21336188	21336514	-138263269	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	4
747	980	273	62	12	chr3	21337179	21337435	-138262348	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	107	4
747	477	299	289	25	chr3	21337828	21338146	-138261637	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	4
747	572	243	274	0	chr3	21340837	21341156	-138258627	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	13	4
747	522	283	64	37	chr3	21341219	21341406	-138258377	-	MTEa	LTR	MaLR	-65	314	123	4
747	252	323	188	23	chr3	21341862	21341918	-138257865	-	MT2A	LTR	ERVL	-378	155	1	4
747	305	286	0	0	chr3	21341918	21341995	-138257788	-	MTEa	LTR	MaLR	-302	77	1	4
747	2088	74	30	23	chr3	21344814	21345119	-138254664	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	307	-20	4
747	1286	186	14	164	chr3	21357994	21358193	-138241590	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	180	-230	4
747	1286	186	14	164	chr3	21358314	21358552	-138241231	+	RMER17C	LTR	ERVK	181	372	-38	4
747	2045	154	0	10	chr3	21358552	21358866	-138240917	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	4
747	1415	154	25	92	chr3	21359025	21359340	-138240443	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	228	521	-2717	4
747	324	250	41	124	chr3	21359336	21359490	-138240293	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	464	599	-2639	4
747	324	250	41	124	chr3	21359518	21359532	-138240251	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	600	617	-2621	4
747	2473	88	153	0	chr3	21359535	21359954	-138239829	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	483	-49	4
747	3964	157	59	41	chr3	21360483	21361262	-138238521	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1112	1904	-1334	4
747	1025	131	6	19	chr3	21361254	21361410	-138238373	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2075	2228	-1010	4
747	1013	269	101	37	chr3	21361602	21361950	-138237833	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
747	1646	146	83	107	chr3	21362276	21362651	-138237132	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	27	4
747	1543	260	52	8	chr3	21363565	21363953	-138235830	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	4
93	756	289	58	46	chr3	21364550	21364898	-138234885	+	MLT1A0	LTR	MaLR	9	360	-5	4
748	2368	181	31	42	chr3	21365222	21365701	-138234082	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	474	-89	4
748	279	318	22	11	chr3	21365804	21365893	-138233890	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	467	556	-4	4
748	990	280	64	49	chr3	21366768	21367095	-138232688	+	MTEa	LTR	MaLR	22	353	-26	4
748	1316	260	72	17	chr3	21367698	21368046	-138231737	+	MTE2b	LTR	MaLR	12	378	-1	4
748	722	259	221	30	chr3	21371366	21371511	-138228272	-	MTE-int	LTR	MaLR	-174	1406	1256	4
748	4422	49	62	9	chr3	21371511	21372043	-138227740	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	4
748	722	259	221	30	chr3	21372043	21372227	-138227556	-	MTE-int	LTR	MaLR	-325	1255	1014	4
748	901	336	18	76	chr3	21379882	21380340	-138219443	+	MER31A	LTR	ERV1	33	463	-22	5
748	1290	278	30	52	chr3	21380476	21380841	-138218942	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	5
748	1292	274	32	35	chr3	21381228	21381572	-138218211	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	343	-27	5
748	1071	283	71	57	chr3	21386829	21386886	-138212897	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	61	-318	5
748	1071	283	71	57	chr3	21387086	21387392	-138212391	+	MTE2b	LTR	MaLR	62	372	-7	5
748	954	206	119	12	chr3	21387940	21388191	-138211592	+	MTEb	LTR	MaLR	102	379	0	5
748	3551	23	2	0	chr3	21388826	21389221	-138210562	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
748	439	278	153	0	chr3	21391290	21391466	-138208317	-	RMER15	LTR	ERVL	-37	538	336	5
748	2438	109	161	4	chr3	21403476	21403936	-138195847	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	5
748	446	356	11	18	chr3	21404035	21404307	-138195476	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-131	4932	4663	5
748	1865	258	15	2	chr3	21405141	21405595	-138194188	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1049	4014	3555	5
748	464	351	72	36	chr3	21405968	21406414	-138193369	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-3170	4431	3970	5
748	793	323	97	75	chr3	21406470	21407693	-138192090	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5243	2535	1287	5
748	459	298	35	48	chr3	21408169	21408430	-138191353	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3788	902	526	5
748	2326	125	136	0	chr3	21408798	21409261	-138190522	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-6	526	1	5
748	596	334	25	21	chr3	21411340	21411645	-138188138	-	RMER19C	LTR	ERVK	-126	485	220	5
748	2821	30	108	0	chr3	21421876	21422247	-138177536	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	5
748	398	271	195	39	chr3	21423397	21423654	-138176129	+	LTR88b	LTR	Gypsy?	30	326	-511	5
748	491	199	76	31	chr3	21425204	21425354	-138174429	+	MTD	LTR	MaLR	3	147	-260	5
748	3771	114	40	33	chr3	21426284	21426864	-138172919	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	5
748	855	211	111	64	chr3	21427757	21428055	-138171728	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-201	327	16	5
748	1816	138	4	187	chr3	21431444	21431926	-138167857	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	5	5
748	274	261	146	14	chr3	21431964	21432108	-138167675	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-86	3152	2990	5
748	523	250	79	70	chr3	21432183	21432424	-138167359	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-364	2874	2632	5
748	2037	197	71	54	chr3	21432593	21433129	-138166654	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3130	3007	2463	5
748	2100	140	51	38	chr3	21433731	21434124	-138165659	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	5
748	3381	99	2	35	chr3	21439760	21440251	-138159532	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	5
748	2478	164	60	2	chr3	21444208	21444677	-138155106	-	RLTR28	LTR	ERVL	-26	498	3	5
748	855	263	29	14	chr3	21446508	21446716	-138153067	-	MTEb	LTR	MaLR	-66	313	103	6
748	332	305	54	47	chr3	21448353	21448501	-138151282	+	MTEa	LTR	MaLR	230	378	-1	6
748	1608	212	22	16	chr3	21455154	21455470	-138144313	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	104	6
748	873	264	75	47	chr3	21460343	21460661	-138139122	+	MTEa	LTR	MaLR	3	329	-50	6
748	228	277	0	15	chr3	21465223	21465289	-138134494	-	RMER15	LTR	ERVL	-108	467	403	6
748	2127	187	65	10	chr3	21467394	21467793	-138131990	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
748	294	182	0	18	chr3	21471588	21471644	-138128139	-	MTC	LTR	MaLR	-366	55	1	6
748	1014	224	97	4	chr3	21471979	21472226	-138127557	+	RLTR20C	LTR	ERVK	95	364	-170	6
748	256	204	0	18	chr3	21472232	21472287	-138127496	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-132	428	375	6
748	395	210	37	57	chr3	21472506	21472626	-138127157	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	563	441	6
748	549	319	0	12	chr3	21474030	21474195	-138125588	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	215	6
748	1506	231	62	53	chr3	21474195	21474227	-138125556	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	32	-342	6
748	1506	231	62	53	chr3	21474452	21474775	-138125008	+	ORR1D1	LTR	MaLR	33	359	-15	6
748	2022	170	64	9	chr3	21478355	21478699	-138121084	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	5	6
748	234	333	29	118	chr3	21480020	21480122	-138119661	+	LTR16A1	LTR	ERVL	133	225	-231	6
748	2084	150	28	3	chr3	21480683	21481037	-138118746	+	RLTR14	LTR	ERV1	17	379	-3	6
748	1447	247	146	29	chr3	21481037	21481382	-138118401	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	386	-4931	6
748	1509	221	228	67	chr3	21481449	21482062	-138117721	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	387	1098	-4219	6
748	3553	30	2	8	chr3	21483083	21483480	-138116303	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	2	6
748	464	250	59	59	chr3	21483499	21483703	-138116080	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3359	3562	-1429	6
748	1256	267	29	29	chr3	21483702	21484087	-138115696	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4409	4793	-198	6
748	283	315	101	16	chr3	21484142	21484271	-138115512	+	RMER4B	LTR	ERVK	347	486	-99	6
748	427	121	209	0	chr3	21484741	21484832	-138114951	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1285	1394	-3923	6
748	1387	183	8	21	chr3	21485290	21485524	-138114259	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1389	1619	-3698	6
748	7963	160	135	24	chr3	21485513	21487983	-138111800	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	2576	5317	0	6
748	758	208	6	6	chr3	21488003	21488163	-138111620	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	162	-220	6
749	740	272	41	131	chr3	21498354	21498909	-138100874	+	RLTR18	LTR	ERVK	10	496	-16	7
749	482	322	40	40	chr3	21499689	21499915	-138099868	-	RMER15	LTR	ERVL	-13	562	337	7
749	742	291	79	16	chr3	21501143	21501420	-138098363	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-82	285	4	7
749	1554	195	91	6	chr3	21503367	21503551	-138096232	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	173	1
749	1554	195	91	6	chr3	21503574	21503739	-138096044	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-212	172	6	1
749	2245	121	128	8	chr3	21509125	21509515	-138090268	-	RLTR9B	LTR	ERVK	0	437	1	1
749	2689	173	62	38	chr3	21513822	21514369	-138085414	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	1	2
749	638	318	38	35	chr3	21520754	21521073	-138078710	-	RLTR15	LTR	ERVK	-39	320	1	3
749	823	285	42	121	chr3	21522961	21523340	-138076443	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	29	3
749	932	349	71	3	chr3	21524076	21524430	-138075353	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	1	3
749	871	225	141	124	chr3	21525633	21525783	-138074000	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	121	-258	4
749	871	225	141	124	chr3	21525867	21525904	-138073879	+	MTE2a	LTR	MaLR	122	180	-199	4
749	2727	95	39	5	chr3	21525904	21526294	-138073489	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	4
749	871	225	141	124	chr3	21526294	21526474	-138073309	+	MTE2a	LTR	MaLR	181	374	-5	4
749	349	302	23	0	chr3	21526650	21526736	-138073047	+	MTD	LTR	MaLR	124	211	-208	4
749	278	259	154	41	chr3	21526735	21526904	-138072879	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-84	290	103	4
749	785	257	14	45	chr3	21527216	21527256	-138072527	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-161	213	176	4
749	785	257	14	45	chr3	21527309	21527488	-138072295	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-199	175	1	4
749	1825	177	21	97	chr3	21530614	21531045	-138068738	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	5
749	539	312	13	0	chr3	21533826	21533980	-138065803	+	MER57E2	LTR	ERV1	82	237	-165	5
749	1691	135	75	99	chr3	21535188	21535550	-138064233	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	42	6
749	1082	266	82	25	chr3	21543941	21544257	-138055526	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	338	-21	7
749	713	312	108	28	chr3	21546359	21546682	-138053101	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-13	352	4	7
749	1877	169	69	12	chr3	21546808	21547196	-138052587	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	398	-107	7
749	762	273	107	83	chr3	21547220	21547279	-138052504	+	RLTR20D	LTR	ERVK	399	436	-69	7
749	397	244	48	109	chr3	21550715	21550862	-138048921	-	MT2A	LTR	ERVL	-48	553	416	8
749	557	294	35	53	chr3	21551179	21551405	-138048378	-	RLTR16	LTR	ERVK	-261	244	23	8
749	578	314	40	60	chr3	21551413	21551714	-138048069	-	MT2A	LTR	ERVL	-238	295	1	8
749	240	130	22	0	chr3	21551716	21551762	-138048021	-	MTE-int	LTR	MaLR	-2	1578	1532	8
749	6221	198	32	54	chr3	21551762	21553212	-138046571	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-48	5713	4296	8
749	379	235	0	64	chr3	21553215	21553324	-138046459	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2777	2984	2883	8
749	403	164	0	0	chr3	21553325	21553392	-138046391	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2770	2836	-2925	8
749	468	256	13	93	chr3	21553392	21553543	-138046240	-	MT2B	LTR	ERVL	-296	305	167	8
749	287	346	116	54	chr3	21553842	21554178	-138045605	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	9
749	1774	189	53	6	chr3	21554928	21555289	-138044494	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	9
749	643	264	63	9	chr3	21558739	21558961	-138040822	+	LTRIS4	LTR	ERV1	274	507	0	9
749	327	253	0	108	chr3	21558996	21559098	-138040685	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	770	1
749	4203	65	40	9	chr3	21564290	21564833	-138034950	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	1
749	719	299	73	26	chr3	21568253	21568374	-138031409	+	MER31A	LTR	ERV1	114	242	-243	1
749	719	299	73	26	chr3	21568570	21568750	-138031033	+	MER31A	LTR	ERV1	243	428	-57	1
749	332	288	24	41	chr3	21569939	21570062	-138029721	+	RLTR14	LTR	ERV1	262	382	0	1
749	1439	217	78	75	chr3	21572504	21572942	-138026841	+	RMER10A	LTR	ERVL	2	440	-2	1
749	1524	135	73	63	chr3	21575110	21575427	-138024356	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-7	322	3	1
749	244	292	33	93	chr3	21577525	21577676	-138022107	+	MLT1B	LTR	MaLR	168	309	-81	1
749	610	177	80	0	chr3	21578705	21578818	-138020965	-	MTE2a	LTR	MaLR	-243	136	15	1
749	3918	265	123	38	chr3	21578858	21580080	-138019703	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1	1350	-230	1
749	3918	265	123	38	chr3	21580110	21580329	-138019454	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1351	1565	-15	1
749	615	325	112	35	chr3	21580343	21580690	-138019093	+	MTEa	LTR	MaLR	1	374	-5	1
749	1970	92	3	71	chr3	21584292	21584642	-138015141	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-11	326	1	1
749	29844	9	1	0	chr3	21584642	21587876	-138011907	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3244	1
749	24562	12	12	4	chr3	21587868	21590598	-138009185	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3730	2751	1	1
749	1959	95	3	71	chr3	21590599	21590949	-138008834	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-11	326	1	1
749	2164	88	6	56	chr3	21600162	21600500	-137999283	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	2	1
749	1315	205	139	50	chr3	21601202	21601582	-137998201	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	1
749	1212	255	3	10	chr3	21601994	21602283	-137997500	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	93	1
749	2495	126	7	26	chr3	21604139	21604556	-137995227	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	1
749	479	101	0	71	chr3	21604556	21604641	-137995142	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1	7405	7327	1
749	5639	107	4	16	chr3	21604852	21605787	-137993996	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1179	6227	5543	1
749	4331	51	2	0	chr3	21606357	21606868	-137992915	+	LTRIS3	LTR	ERV1	1	512	0	1
749	302	207	25	75	chr3	21606868	21606988	-137992795	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1	114	-3584	1
749	721	111	60	17	chr3	21607017	21607188	-137992595	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	63	293	-3006	1
749	1026	124	66	17	chr3	21607536	21607717	-137992066	+	RMER16-int	LTR	ERVK	142	331	-5075	1
749	3040	118	146	0	chr3	21607698	21608269	-137991514	+	RMER16-int	LTR	ERVK	685	1339	-4067	1
749	4866	125	100	24	chr3	21608301	21610374	-137989409	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	783	2555	-744	1
749	1294	285	85	14	chr3	21610361	21610774	-137989009	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3705	4146	-917	1
749	990	204	50	0	chr3	21610867	21611087	-137988696	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	4791	5021	-42	1
749	4372	47	2	0	chr3	21611088	21611599	-137988184	+	LTRIS3	LTR	ERV1	1	512	0	1
749	919	309	23	53	chr3	21616816	21617209	-137982574	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	684	1064	-3927	1
749	5785	278	24	41	chr3	21617267	21618099	-137981684	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1098	1917	-3074	1
749	2397	166	26	127	chr3	21618099	21618595	-137981188	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	1
749	5785	278	24	41	chr3	21618595	21619462	-137980321	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1918	2767	-2224	1
749	507	271	162	60	chr3	21620714	21621048	-137978735	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	1
749	1765	333	59	10	chr3	21621817	21622633	-137977150	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3941	4796	-195	1
750	2272	181	30	18	chr3	21629138	21629538	-137970245	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	3	407	0	1
750	2062	180	21	24	chr3	21629629	21630004	-137969779	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
750	1956	117	59	269	chr3	21634547	21635157	-137964626	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
750	1076	277	147	14	chr3	21636290	21636725	-137963058	+	RMER5	LTR	ERV1	42	534	0	1
750	2029	136	35	9	chr3	21637076	21637395	-137962388	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
750	901	208	10	30	chr3	21638121	21638319	-137961464	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-159	225	32	2
750	2419	191	30	101	chr3	21642758	21643363	-137956420	+	RMER15	LTR	ERVL	9	570	-5	2
750	846	297	28	42	chr3	21645291	21645589	-137954194	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	26	2
750	2277	123	3	9	chr3	21645788	21646117	-137953666	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
750	4765	147	117	74	chr3	21646225	21647206	-137952577	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	2
750	2659	120	26	130	chr3	21650978	21651515	-137948268	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	481	-1	2
750	334	272	66	28	chr3	21658091	21658197	-137941586	+	MTE2a	LTR	MaLR	83	192	-187	2
750	629	245	164	39	chr3	21659162	21659375	-137940408	+	MTE2a	LTR	MaLR	177	418	-1	2
750	854	301	103	43	chr3	21662327	21662810	-137936973	-	RMER5	LTR	ERV1	-20	514	3	2
750	2440	171	118	4	chr3	21664395	21664870	-137934913	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	57	2
750	325	169	0	0	chr3	21665075	21665140	-137934643	-	RMER4B	LTR	ERVK	-516	69	5	2
750	2102	194	2	58	chr3	21666994	21667394	-137932389	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	2
750	3793	125	98	8	chr3	21685501	21686123	-137913660	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	2
750	1159	296	7	4	chr3	21689126	21689407	-137910376	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	89	2
750	1642	233	52	50	chr3	21689931	21690455	-137909328	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-33	544	20	2
750	2146	239	77	24	chr3	21694999	21695440	-137904343	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	455	-108	2
750	2146	239	77	24	chr3	21695543	21695635	-137904148	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	456	562	-1	2
750	677	286	73	50	chr3	21697680	21697989	-137901794	-	MTE2a	LTR	MaLR	-128	291	1	2
750	1120	131	12	0	chr3	21698893	21699053	-137900730	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	221	2
750	687	254	5	92	chr3	21699053	21699270	-137900513	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	364	2
750	2033	177	71	36	chr3	21699266	21699789	-137899994	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-20	541	1	2
750	1236	190	4	13	chr3	21699789	21700015	-137899768	-	RLTR14	LTR	ERV1	-156	226	3	2
750	906	211	48	124	chr3	21700815	21701166	-137898617	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	409	1	2
750	1073	276	82	75	chr3	21703616	21704122	-137895661	+	RMER19C	LTR	ERVK	36	490	-121	2
750	727	343	31	81	chr3	21704912	21705296	-137894487	+	LTR40a	LTR	ERVL	2	366	-153	2
750	296	349	29	65	chr3	21706658	21706796	-137892987	-	MLT1G	LTR	MaLR	-401	168	36	2
750	348	281	61	30	chr3	21709543	21709675	-137890108	+	RMER15	LTR	ERVL	337	472	-103	3
750	667	270	119	50	chr3	21710220	21710497	-137889286	+	RMER15	LTR	ERVL	267	562	-13	3
750	768	264	75	13	chr3	21710937	21711255	-137888528	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	7	344	-183	3
750	325	346	10	0	chr3	21711798	21711899	-137887884	+	MLT1F2	LTR	MaLR	2	103	-457	3
750	266	264	149	32	chr3	21712170	21712264	-137887519	+	MLT1F2	LTR	MaLR	416	520	-40	3
750	238	333	52	10	chr3	21712301	21712398	-137887385	+	LTR81A	LTR	ERV1?	1230	1330	-20	3
750	2071	104	24	59	chr3	21715166	21715504	-137884279	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	3
750	966	278	51	21	chr3	21729640	21729974	-137869809	+	ORR1E	LTR	MaLR	16	359	0	3
750	2041	181	88	5	chr3	21730119	21730507	-137869276	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	3
750	1661	221	31	35	chr3	21735340	21735791	-137863992	+	RLTR16	LTR	ERVK	31	479	-26	3
750	1456	222	34	17	chr3	21736887	21737244	-137862539	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	5	3
750	586	292	157	20	chr3	21738422	21738670	-137861113	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	289	-90	3
750	841	169	100	11	chr3	21743332	21743512	-137856271	+	ORR1B2	LTR	MaLR	8	203	-164	3
750	1603	192	60	23	chr3	21743537	21743889	-137855894	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	365	-2	3
750	787	283	84	86	chr3	21744776	21745186	-137854597	+	MTE2a	LTR	MaLR	9	406	-13	3
750	1710	158	56	53	chr3	21745990	21746350	-137853433	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	363	-4	3
750	1240	286	36	22	chr3	21750698	21751063	-137848720	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	5	3
750	450	301	51	14	chr3	21751645	21751783	-137848000	-	MTE2b	LTR	MaLR	-220	159	17	3
750	6281	37	61	5	chr3	21751909	21752674	-137847109	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	3
750	552	316	32	81	chr3	21754359	21754704	-137845079	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	32	3
750	1478	190	30	21	chr3	21755527	21755866	-137843917	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	342	-17	3
750	448	208	10	20	chr3	21755994	21756092	-137843691	+	MTEb	LTR	MaLR	19	115	-264	3
750	746	233	129	0	chr3	21756275	21756485	-137843298	+	MTEb	LTR	MaLR	126	362	-17	3
750	481	95	0	0	chr3	21756642	21756716	-137843067	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-10	397	324	3
93	937	233	139	22	chr3	21757710	21758058	-137841725	-	MTD	LTR	MaLR	-13	408	7	3
751	1606	210	82	17	chr3	21762006	21762508	-137837275	-	RMER4B	LTR	ERVK	-12	573	1	3
751	948	262	65	72	chr3	21763373	21763628	-137836155	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	371	116	3
751	948	281	50	109	chr3	21763684	21763796	-137835987	-	MTE2b	LTR	MaLR	-264	115	27	3
751	2583	272	129	21	chr3	21763806	21764581	-137835202	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-2	1578	710	3
751	2194	112	15	12	chr3	21764581	21764907	-137834876	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
751	2583	272	129	21	chr3	21764907	21765020	-137834763	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-871	709	594	3
751	2591	142	34	10	chr3	21768323	21768734	-137831049	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
751	762	259	117	38	chr3	21770042	21770359	-137829424	+	ORR1D2	LTR	MaLR	9	350	-9	4
751	757	213	302	52	chr3	21772103	21772605	-137827178	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	627	0	4
751	1303	243	12	122	chr3	21773277	21773703	-137826080	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	4
751	255	368	72	14	chr3	21776035	21776242	-137823541	+	MLT1F1	LTR	MaLR	259	477	-92	4
751	1336	230	57	24	chr3	21776239	21776573	-137823210	+	ORR1D2	LTR	MaLR	17	361	-9	4
751	1561	239	65	16	chr3	21784336	21784722	-137815061	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	4
751	834	219	194	28	chr3	21786642	21786895	-137812888	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	297	-73	4
751	810	266	134	73	chr3	21787220	21787548	-137812235	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	8	4
751	249	213	0	0	chr3	21788852	21788899	-137810884	+	RMER15	LTR	ERVL	425	471	-104	4
751	451	270	92	25	chr3	21796774	21796937	-137802846	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	206	4
751	1491	157	12	201	chr3	21798792	21799295	-137800488	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	410	0	4
751	1101	243	65	24	chr3	21803931	21804272	-137795511	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	1	4
751	283	303	143	42	chr3	21809967	21810184	-137789599	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-18	561	323	4
751	240	337	61	0	chr3	21810310	21810408	-137789375	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-473	118	15	4
751	255	224	17	0	chr3	21825158	21825216	-137774567	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-29	379	321	5
751	2193	173	84	10	chr3	21825330	21825722	-137774061	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
751	453	289	52	26	chr3	21825832	21825985	-137773798	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-208	157	1	5
751	276	250	75	67	chr3	21826747	21826867	-137772916	-	RMER15	LTR	ERVL	-129	446	326	5
751	2568	148	40	0	chr3	21826884	21827263	-137772520	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
751	2380	81	3	48	chr3	21831548	21831885	-137767898	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
751	898	147	12	0	chr3	21837858	21838021	-137761762	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-218	166	2	5
751	329	340	102	75	chr3	21842773	21842915	-137756868	-	MLT2D	LTR	ERVL	-143	271	112	5
751	329	340	102	75	chr3	21842996	21843107	-137756676	-	MLT2D	LTR	ERVL	-303	111	11	5
751	3411	33	5	0	chr3	21855025	21855419	-137744364	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
751	1986	75	3	105	chr3	21855419	21855551	-137744232	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	991	5
751	1986	75	3	105	chr3	21855701	21855931	-137743852	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-108	990	774	5
751	1621	132	15	68	chr3	21855931	21856271	-137743512	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
751	5687	45	18	0	chr3	21856271	21857035	-137742748	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-320	778	1	5
751	4022	38	13	0	chr3	21857037	21857506	-137742277	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	5
751	1113	268	64	14	chr3	21858404	21858749	-137741034	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	8	5
751	2068	155	11	8	chr3	21870679	21871037	-137728746	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	6
751	1185	274	42	72	chr3	21873196	21873628	-137726155	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
751	1218	251	74	26	chr3	21873628	21873966	-137725817	+	MTEa	LTR	MaLR	12	365	-14	6
751	459	243	95	48	chr3	21880280	21880581	-137719202	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	353	-26	6
751	234	288	91	73	chr3	21880697	21880862	-137718921	+	MLT2B4	LTR	ERVL	314	481	-75	6
751	528	308	51	10	chr3	21886555	21886752	-137713031	-	MLT2D	LTR	ERVL	-198	216	12	6
752	2886	79	2	25	chr3	21897247	21897293	-137702490	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	494	6
752	3417	17	17	2	chr3	21897293	21897698	-137702085	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	6
752	2886	79	2	25	chr3	21897698	21898082	-137701701	-	RMER16	LTR	ERVK	-40	493	113	6
752	247	218	105	84	chr3	21898527	21898622	-137701161	+	MT2B	LTR	ERVL	151	247	-354	6
752	2170	101	3	89	chr3	21901783	21901834	-137697949	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	277	6
752	2170	101	3	89	chr3	21902022	21902328	-137697455	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-51	276	1	6
752	2025	176	58	32	chr3	21904470	21904905	-137694878	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	7
752	388	315	68	36	chr3	21904962	21905212	-137694571	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-8	672	415	7
752	448	237	136	62	chr3	21906623	21906785	-137692998	-	MTEa	LTR	MaLR	-190	189	16	7
752	300	256	129	41	chr3	21906784	21906955	-137692828	-	RMER10A	LTR	ERVL	-25	417	232	7
752	311	271	7	11	chr3	21907662	21907772	-137692011	+	MLT2D	LTR	ERVL	3	115	-349	7
752	391	325	77	34	chr3	21908738	21908945	-137690838	+	MLT2D	LTR	ERVL	155	370	-44	7
752	3519	18	5	0	chr3	21909763	21910157	-137689626	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
752	9287	36	2	2	chr3	21910157	21911255	-137688528	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	7
752	3509	18	5	0	chr3	21911256	21911649	-137688134	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	7
752	1930	245	7	0	chr3	21913440	21913857	-137685926	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	1	7
752	554	255	50	35	chr3	21915847	21916046	-137683737	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	202	-157	7
752	354	283	20	20	chr3	21916061	21916162	-137683621	+	ORR1E	LTR	MaLR	270	370	-9	7
752	226	150	0	0	chr3	21917651	21917691	-137682092	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	380	7
752	1632	162	53	79	chr3	21917698	21918053	-137681730	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	7
752	1411	228	85	16	chr3	21918050	21918415	-137681368	-	MTD	LTR	MaLR	-29	390	1	7
752	2249	104	3	49	chr3	21918775	21919120	-137680663	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	7
752	2174	163	26	52	chr3	21924446	21924911	-137674872	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	7
752	1758	179	34	36	chr3	21925038	21925426	-137674357	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-20	387	1	7
752	250	220	0	0	chr3	21927108	21927158	-137672625	+	MLT1F	LTR	MaLR	499	548	0	7
752	358	311	82	75	chr3	21927565	21927833	-137671950	-	MLT2F	LTR	ERVL	-271	392	123	7
752	291	312	96	54	chr3	21927928	21928094	-137671689	-	MLT2F	LTR	ERVL	-490	173	1	7
752	1662	214	111	40	chr3	21928322	21928798	-137670985	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	21	530	-47	7
752	497	193	9	9	chr3	21929390	21929505	-137670278	+	RLTR28B	LTR	ERVL	69	183	-298	7
752	305	132	14	81	chr3	21929659	21929733	-137670050	+	RLTR28B	LTR	ERVL	442	510	-14	7
752	890	251	134	41	chr3	21931489	21931642	-137668141	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	187	7
752	890	251	134	41	chr3	21931684	21931850	-137667933	-	ORR1E	LTR	MaLR	-173	186	6	7
752	1359	74	0	0	chr3	21932483	21932672	-137667111	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	2	190	-285	7
752	390	204	106	10	chr3	21934639	21934743	-137665040	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	114	-265	7
752	1019	169	15	125	chr3	21934756	21935020	-137664763	+	RMER15	LTR	ERVL	43	277	-298	7
752	2415	105	34	49	chr3	21936996	21937405	-137662378	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	7
752	1160	202	60	114	chr3	21937423	21937808	-137661975	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1757	4380	4017	7
752	1690	214	63	56	chr3	21937785	21938349	-137661434	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2176	3961	3559	7
752	3125	160	26	14	chr3	21938430	21939008	-137660775	+	RLTR17	LTR	ERVK	12	596	-96	7
752	1680	248	111	87	chr3	21939082	21940360	-137659423	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2573	3564	2014	7
752	533	212	13	27	chr3	21940578	21940728	-137659055	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3505	2017	1870	7
752	1127	266	195	98	chr3	21940922	21941033	-137658750	-	MTC-int	LTR	MaLR	-33	1225	1145	7
752	1127	266	195	98	chr3	21941179	21941338	-137658445	-	MTC-int	LTR	MaLR	-114	1144	1015	7
752	1127	266	195	98	chr3	21941360	21941781	-137658002	-	MTC-int	LTR	MaLR	-244	1014	466	7
752	529	199	52	98	chr3	21941781	21941954	-137657829	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4977	1160	996	7
752	255	218	71	18	chr3	21941944	21942000	-137657783	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3727	1795	1737	8
752	693	218	95	108	chr3	21942246	21942385	-137657398	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4188	1334	1189	8
752	693	218	95	108	chr3	21942568	21942659	-137657124	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4334	1188	1107	8
752	273	176	33	66	chr3	21942759	21942850	-137656933	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-5252	885	798	8
752	1763	106	293	8	chr3	21946189	21946541	-137653242	+	RLTR44E	LTR	ERVK	1	452	0	8
752	1787	176	35	43	chr3	21947461	21947489	-137652294	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	347	8
752	1787	176	35	43	chr3	21947515	21947859	-137651924	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-28	346	6	8
752	256	222	42	0	chr3	21948797	21948869	-137650914	+	RLTR25B	LTR	ERVK	410	484	-544	8
752	4706	172	39	55	chr3	21949843	21950759	-137649024	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	8
752	1483	211	70	46	chr3	21953306	21953679	-137646104	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	384	0	8
752	1847	140	16	0	chr3	21955183	21955497	-137644286	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	8
752	2856	75	5	29	chr3	21956200	21956659	-137643124	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	1	8
752	475	234	279	34	chr3	21959152	21959356	-137640427	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	11	264	-4727	8
752	426	291	92	56	chr3	21959354	21959605	-137640178	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	460	719	-4272	8
752	872	263	76	12	chr3	21962743	21962994	-137636789	-	ORR1E	LTR	MaLR	-87	292	1	8
752	460	326	131	34	chr3	21963396	21963717	-137636066	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	352	-13	8
752	275	337	42	0	chr3	21965740	21965835	-137633948	+	MLT1A	LTR	MaLR	242	340	-34	8
752	1280	151	46	19	chr3	21967918	21968181	-137631602	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	270	-59	8
752	260	235	14	14	chr3	21969502	21969571	-137630212	+	ORR1A4	LTR	MaLR	261	329	0	8
752	262	237	0	33	chr3	21970574	21970635	-137629148	-	RLTR28	LTR	ERVL	-20	504	446	8
752	2222	176	105	30	chr3	21972094	21972620	-137627163	+	RMER15	LTR	ERVL	2	566	-9	8
752	1115	146	333	0	chr3	21990715	21991003	-137608780	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	47	9
752	342	100	0	0	chr3	21991156	21991206	-137608577	-	RLTR23	LTR	ERV1	-370	60	11	9
752	2131	112	18	15	chr3	21996147	21996473	-137603310	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	9
752	239	268	0	101	chr3	22002097	22002176	-137597607	+	RMER12	LTR	ERVK	743	813	-509	5
752	403	222	208	38	chr3	22003508	22003667	-137596116	+	MTD	LTR	MaLR	221	406	-13	1
752	308	298	17	119	chr3	22005294	22005412	-137594371	-	RMER12	LTR	ERVK	-471	851	746	1
752	2068	200	30	2	chr3	22006432	22006838	-137592945	+	MTC	LTR	MaLR	3	419	-2	1
752	1003	234	40	36	chr3	22010073	22010348	-137589435	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	326	2
752	3377	36	15	44	chr3	22013207	22013615	-137586168	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
752	3455	151	90	19	chr3	22016631	22017319	-137582464	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	20	3
753	2537	108	14	39	chr3	22020607	22021020	-137578763	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	4
753	2047	134	65	9	chr3	22026778	22027118	-137572665	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	5
753	1633	170	79	9	chr3	22028250	22028565	-137571218	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	337	-30	5
753	881	232	94	105	chr3	22030600	22030622	-137569161	-	MT2B	LTR	ERVL	-2	599	583	5
753	881	232	94	105	chr3	22030798	22030826	-137568957	-	MT2B	LTR	ERVL	-19	582	560	5
753	881	253	95	94	chr3	22030856	22031286	-137568497	-	MT2B	LTR	ERVL	-42	559	36	5
753	371	322	33	7	chr3	22031412	22031562	-137568221	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	211	5
753	2022	222	18	20	chr3	22031730	22032175	-137567608	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-119	444	1	6
753	738	200	24	18	chr3	22037979	22038147	-137561636	-	RMER5	LTR	ERV1	-16	518	350	7
753	301	232	9	124	chr3	22044199	22044312	-137555471	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-521	507	408	8
753	1623	208	28	28	chr3	22048117	22048473	-137551310	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	11	8
753	2453	71	0	27	chr3	22054789	22055121	-137544662	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	72	1
753	2323	80	80	29	chr3	22055251	22055625	-137544158	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-16	393	1	1
753	1480	155	14	153	chr3	22063913	22064278	-137535505	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	8	1
753	270	215	44	44	chr3	22067284	22067352	-137532431	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-80	482	415	1
753	1488	192	87	77	chr3	22069268	22069646	-137530137	-	RMER10B	LTR	ERVL	-11	387	6	1
753	251	265	60	0	chr3	22069651	22069734	-137530049	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	97	-268	1
753	1413	180	96	28	chr3	22071772	22072126	-137527657	-	RMER17C	LTR	ERVK	-32	378	1	1
753	367	301	82	62	chr3	22076393	22076588	-137523195	-	MLT1B	LTR	MaLR	-7	383	185	1
753	3199	50	40	5	chr3	22089022	22089402	-137510381	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-3	393	1	1
753	1045	226	55	29	chr3	22094692	22095038	-137504745	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-160	393	39	1
753	1637	200	93	14	chr3	22095105	22095460	-137504323	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	1	1
753	2138	100	23	0	chr3	22096116	22096426	-137503357	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	319	-8	1
753	271	275	107	3	chr3	22099990	22100072	-137499711	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-59	503	411	1
753	620	289	204	3	chr3	22100072	22100186	-137499597	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	359	233	1
753	740	219	119	16	chr3	22100219	22100403	-137499380	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-127	232	1	1
753	1194	187	106	40	chr3	22116971	22117331	-137482452	-	MT2B	LTR	ERVL	-65	536	1	1
753	1730	137	40	28	chr3	22118162	22118484	-137481299	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
753	1615	194	73	9	chr3	22118839	22119182	-137480601	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-7	367	3	1
753	339	321	38	91	chr3	22119325	22119534	-137480249	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	198	-905	1
753	300	217	90	14	chr3	22119550	22119574	-137480209	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	598	620	-889	1
753	300	217	90	14	chr3	22119690	22119810	-137479973	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	621	753	-756	1
753	4685	156	58	22	chr3	22121151	22122023	-137477760	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	5	1
753	1269	191	198	5	chr3	22122883	22123251	-137476532	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	439	-1353	2
753	1427	165	66	97	chr3	22123200	22123550	-137476233	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-15	379	41	2
753	1469	137	67	136	chr3	22127889	22128268	-137471515	-	RLTR19A	LTR	ERVK	0	496	146	2
753	1812	196	93	28	chr3	22128268	22128772	-137471011	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	537	-24	2
753	554	230	67	105	chr3	22128770	22128979	-137470804	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	361	561	0	2
753	896	132	26	7	chr3	22128979	22129127	-137470656	-	RLTR19A	LTR	ERVK	-345	151	1	2
753	1087	210	92	51	chr3	22129633	22129969	-137469814	-	MTEb	LTR	MaLR	-12	367	18	2
753	350	287	147	46	chr3	22131483	22131569	-137468214	+	MER57D	LTR	ERV1	4	92	-319	2
753	350	287	147	46	chr3	22131607	22131717	-137468066	+	MER57D	LTR	ERV1	93	220	-191	2
753	992	312	30	18	chr3	22131738	22132077	-137467706	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	15	2
753	560	91	0	0	chr3	22132928	22133005	-137466778	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	0	7406	7330	2
753	16451	193	36	22	chr3	22133118	22138631	-137461152	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1183	6223	2	2
753	2471	111	2	27	chr3	22138639	22139045	-137460738	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-5	404	9	2
753	399	301	28	34	chr3	22146437	22146616	-137453167	-	RMER15	LTR	ERVL	-53	522	345	2
753	2701	69	0	0	chr3	22147846	22148178	-137451605	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	2
753	4996	60	47	0	chr3	22148178	22149074	-137450709	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6743	2
753	3599	79	0	2	chr3	22149064	22149519	-137450264	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-1367	6214	5761	2
753	3452	82	0	16	chr3	22149507	22149956	-137449827	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-1936	5645	5204	2
753	361	103	59	82	chr3	22150212	22150297	-137449486	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4588	2
753	412	97	0	31	chr3	22150459	22150523	-137449260	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2354	1344	1283	2
753	1592	174	101	41	chr3	22150512	22150877	-137448906	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4769	637	251	2
94	4195	150	29	54	chr3	22150986	22151804	-137447979	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6629	952	14	2
754	2732	72	0	0	chr3	22151818	22152150	-137447633	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	2
754	2034	239	49	97	chr3	22160239	22160911	-137438872	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	3	2
754	462	246	28	47	chr3	22161105	22161320	-137438463	+	MT2A	LTR	ERVL	3	316	-268	2
754	2226	176	57	50	chr3	22161320	22161896	-137437887	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	111	2
754	1026	115	6	0	chr3	22162837	22162994	-137436789	+	RLTR1B	LTR	ERV1	355	512	0	2
754	5929	176	99	47	chr3	22162994	22164093	-137435690	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1	1138	-2161	2
754	11044	57	63	11	chr3	22164154	22166115	-137433668	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1139	3299	0	2
754	1185	51	83	14	chr3	22166115	22166455	-137433328	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	410	-102	2
754	488	183	21	0	chr3	22166459	22166552	-137433231	+	RLTR1B	LTR	ERV1	343	437	-75	2
754	2648	157	81	136	chr3	22176944	22177667	-137422116	+	RMER19B	LTR	ERVK	59	902	0	2
754	664	298	156	8	chr3	22184529	22184881	-137414902	+	MER34	LTR	ERV1	119	522	-20	2
754	304	204	0	18	chr3	22186540	22186595	-137413188	+	ORR1A4	LTR	MaLR	276	329	0	2
754	3244	80	2	0	chr3	22186660	22187059	-137412724	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
754	318	221	51	25	chr3	22187162	22187241	-137412542	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-10	514	434	2
754	644	230	231	16	chr3	22187355	22187611	-137412172	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-152	329	19	2
754	371	349	144	41	chr3	22190196	22190516	-137409267	+	LTR16C	LTR	ERVL	137	489	0	2
754	2429	126	74	28	chr3	22192314	22192705	-137407078	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
754	344	97	145	0	chr3	22192715	22192777	-137407006	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5	7401	7331	2
754	2492	184	41	98	chr3	22192979	22194299	-137405484	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1153	4655	2696	2
754	5669	144	67	23	chr3	22195280	22196307	-137403476	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5263	2143	1072	2
754	926	236	107	47	chr3	22196318	22196682	-137403101	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2927	387	2	2
754	2320	118	88	60	chr3	22196683	22197081	-137402702	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
754	596	342	70	4	chr3	22198280	22198553	-137401230	+	MLT1B	LTR	MaLR	89	379	-11	2
754	1339	231	37	118	chr3	22200381	22200789	-137398994	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	379	0	2
754	609	190	152	53	chr3	22202614	22202861	-137396922	-	RMER21B	LTR	ERV1	-320	627	272	2
754	1748	228	56	3	chr3	22203423	22203797	-137395986	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	12	2
754	1940	200	171	39	chr3	22209138	22209605	-137390178	+	MT2A	LTR	ERVL	1	529	-4	3
754	1383	196	78	35	chr3	22210112	22210456	-137389327	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	3
754	329	215	120	60	chr3	22212168	22212308	-137387475	+	MTEa	LTR	MaLR	18	183	-196	3
754	974	252	25	5	chr3	22212334	22212537	-137387246	+	MTD	LTR	MaLR	1	207	-212	3
754	406	242	66	23	chr3	22218874	22219030	-137380753	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-15	404	231	3
754	276	305	78	84	chr3	22219004	22219158	-137380625	-	RLTR8	LTR	ERVK	-21	344	192	3
754	403	292	146	49	chr3	22219427	22219632	-137380151	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-127	243	19	3
754	326	321	53	6	chr3	22232834	22233003	-137366780	-	MER31B	LTR	ERV1	0	466	290	3
754	302	233	181	19	chr3	22233865	22233970	-137365813	-	MER31B	LTR	ERV1	-343	123	2	3
754	275	268	0	14	chr3	22234088	22234160	-137365623	+	MER92C	LTR	ERV1	484	554	0	3
754	3439	30	0	0	chr3	22248042	22248438	-137351345	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
754	278	226	16	0	chr3	22252687	22252749	-137347034	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	408	3
754	261	221	34	34	chr3	22253889	22253978	-137345805	-	LTR33A_	LTR	ERVL	0	531	443	3
754	2221	152	8	19	chr3	22254511	22254886	-137344897	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	24	3
754	301	287	167	0	chr3	22255708	22255858	-137343925	+	MLT1J	LTR	MaLR	24	198	-167	3
754	362	361	61	34	chr3	22256203	22256498	-137343285	+	MLT1J	LTR	MaLR	210	512	0	3
754	1946	195	47	9	chr3	22259036	22259461	-137340322	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	1	3
754	837	133	96	10	chr3	22259461	22259658	-137340125	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	2113	3
754	5172	158	44	13	chr3	22271824	22272900	-137326883	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-207	2119	1011	3
754	2747	39	9	152	chr3	22272902	22273355	-137326428	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	4
754	15770	24	3	52	chr3	22273357	22275444	-137324339	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1	1984	-3	4
754	2767	39	9	152	chr3	22275446	22275901	-137323882	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	4
754	1403	249	60	70	chr3	22275901	22276519	-137323264	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1314	1012	401	3
754	4241	167	68	23	chr3	22277175	22278038	-137321745	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	4
755	780	270	103	17	chr3	22282369	22282727	-137317056	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1580	1968	-358	4
755	1223	294	34	14	chr3	22290871	22291226	-137308557	+	MTEa	LTR	MaLR	18	379	0	4
755	1426	295	147	25	chr3	22291238	22292196	-137307587	+	MTEa-int	LTR	MaLR	14	1120	-460	4
755	772	243	104	18	chr3	22293921	22294250	-137305533	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	1	4
755	6537	76	98	2	chr3	22306134	22307094	-137292689	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-46	1052	1	4
755	3285	43	8	0	chr3	22307094	22307487	-137292296	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
755	2651	173	97	133	chr3	22310795	22311544	-137288239	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	188	4
755	2651	173	97	133	chr3	22311960	22312129	-137287654	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-725	177	11	4
755	647	302	78	82	chr3	22321712	22322218	-137277565	-	MT2A	LTR	ERVL	-44	511	4	4
755	481	220	0	10	chr3	22322758	22322859	-137276924	-	MTE2b	LTR	MaLR	-6	373	274	4
755	897	218	116	72	chr3	22322858	22323150	-137276633	+	RLTR20C	LTR	ERVK	8	312	-222	4
755	327	180	0	16	chr3	22323147	22323209	-137276574	+	RLTR20C	LTR	ERVK	423	483	-95	4
755	926	75	0	7	chr3	22330169	22330304	-137269479	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-210	136	3	4
755	7439	79	18	2	chr3	22330306	22331342	-137268441	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	0	1792	740	4
755	691	176	0	46	chr3	22331570	22331701	-137268082	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	834	4
755	2769	92	5	10	chr3	22331686	22332081	-137267702	-	RMER17B	LTR	ERVK	-565	393	1	4
755	657	287	92	94	chr3	22335321	22335530	-137264253	+	MTD	LTR	MaLR	27	269	-150	4
755	657	273	50	100	chr3	22335708	22335857	-137263926	+	MTD	LTR	MaLR	270	415	-4	4
755	784	266	21	233	chr3	22337713	22337781	-137262002	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	378	308	4
755	1004	239	14	133	chr3	22337839	22338250	-137261533	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-71	307	1	4
755	329	344	23	8	chr3	22339436	22339565	-137260218	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	249	4
755	644	262	152	15	chr3	22339618	22339816	-137259967	+	ORR1E	LTR	MaLR	31	255	-104	4
755	350	255	21	11	chr3	22340031	22340126	-137259657	+	ORR1E	LTR	MaLR	284	379	0	4
755	372	304	55	75	chr3	22341291	22341490	-137258293	+	MLT1E2	LTR	MaLR	15	209	-418	4
755	247	284	81	0	chr3	22341595	22341669	-137258114	+	MLT1E2	LTR	MaLR	383	462	-43	4
755	326	323	101	6	chr3	22360240	22360399	-137239384	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	401	4
755	7063	62	12	0	chr3	22362139	22363017	-137236766	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-4	889	1	4
755	295	310	84	15	chr3	22369828	22369959	-137229824	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	240	4
755	235	278	0	18	chr3	22370161	22370216	-137229567	-	MTEa	LTR	MaLR	-305	54	1	4
755	863	294	53	29	chr3	22390186	22390523	-137209260	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	370	1	5
755	764	290	99	39	chr3	22392374	22392406	-137207377	+	MTD	LTR	MaLR	18	55	-364	5
755	764	290	99	39	chr3	22392491	22392820	-137206963	+	MTD	LTR	MaLR	56	401	-18	5
755	1895	177	31	11	chr3	22393363	22393716	-137206067	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	35	5
755	1112	169	14	28	chr3	22393716	22393839	-137205944	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1963	1845	5
755	2822	84	18	8	chr3	22393839	22394235	-137205548	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
755	1112	138	44	35	chr3	22394235	22394375	-137205408	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-119	1844	1754	5
756	6318	62	9	6	chr3	22432012	22432818	-137166965	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	5
756	1090	181	5	73	chr3	22434665	22434885	-137164898	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	174	5
756	782	222	169	15	chr3	22434979	22435058	-137164725	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-119	265	164	5
756	782	204	118	18	chr3	22435099	22435244	-137164539	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-215	163	1	5
756	398	335	85	35	chr3	22435370	22435563	-137164220	+	MTEa-int	LTR	MaLR	720	922	-658	5
756	361	287	48	67	chr3	22435563	22435793	-137163990	+	RLTR16	LTR	ERVK	3	279	-413	5
756	2087	307	36	7	chr3	22436214	22436827	-137162956	+	MTEa-int	LTR	MaLR	948	1578	-2	5
756	1099	300	78	64	chr3	22436829	22437134	-137162649	+	MTEa	LTR	MaLR	1	312	-67	5
756	1034	262	43	74	chr3	22437134	22437525	-137162258	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	5
756	1099	300	78	64	chr3	22437525	22437593	-137162190	+	MTEa	LTR	MaLR	313	379	0	5
756	482	340	59	31	chr3	22437682	22437904	-137161879	-	ORR1E	LTR	MaLR	-127	232	5	5
756	653	262	80	49	chr3	22438161	22438386	-137161397	+	RMER2	LTR	ERV1	116	347	-220	5
756	988	263	99	49	chr3	22439282	22439626	-137160157	-	MTEb	LTR	MaLR	-18	361	1	5
756	522	147	184	0	chr3	22447032	22447141	-137152642	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-51	343	215	5
756	2524	86	0	96	chr3	22451779	22452176	-137147607	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	5
756	937	195	25	109	chr3	22455200	22455522	-137144261	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2	296	-4548	5
756	341	152	0	17	chr3	22455515	22455575	-137144208	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2091	2149	-5095	6
756	254	133	0	0	chr3	22456016	22456061	-137143722	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	144	188	-5218	6
756	645	192	25	0	chr3	22456136	22456256	-137143527	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	938	1060	-5077	6
756	554	271	0	49	chr3	22456269	22456432	-137143351	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2454	2608	-4798	6
756	6016	172	42	31	chr3	22456432	22458446	-137141337	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1995	4085	-3321	6
756	1282	168	34	11	chr3	22458586	22458849	-137140934	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6222	6451	-955	6
756	311	109	0	68	chr3	22458925	22458984	-137140799	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6017	6071	-1173	6
756	1671	124	4	4	chr3	22458998	22459248	-137140535	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5529	5778	-30	6
756	1832	189	86	3	chr3	22459261	22459644	-137140139	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	415	-487	6
756	306	157	127	14	chr3	22459661	22459732	-137140051	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	459	537	-365	6
756	512	41	26	64	chr3	22459732	22459810	-137139973	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7329	7403	-3	6
756	1575	135	199	20	chr3	22459812	22460159	-137139624	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	6
756	4272	140	31	107	chr3	22463230	22464206	-137135577	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	6
756	382	376	141	9	chr3	22474062	22474403	-137125380	-	MLT1I	LTR	MaLR	-2	409	24	6
756	1029	157	55	15	chr3	22475487	22475687	-137124096	+	RMER17D2	LTR	ERVK	602	809	0	6
756	1757	161	55	0	chr3	22475801	22476111	-137123672	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
756	1929	200	16	13	chr3	22500334	22500714	-137099069	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	381	-146	2
756	712	129	45	0	chr3	22500984	22501116	-137098667	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	390	527	0	2
756	317	333	37	0	chr3	22501213	22501321	-137098462	+	MTEb	LTR	MaLR	251	362	-17	4
756	307	286	35	23	chr3	22506638	22506724	-137093059	+	ORR1E	LTR	MaLR	273	359	0	9
756	1486	237	64	135	chr3	22507580	22508238	-137091545	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	1
756	2127	184	31	20	chr3	22508561	22509009	-137090774	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	1
756	866	298	28	16	chr3	22517389	22517638	-137082145	-	MTD	LTR	MaLR	-155	264	13	1
756	1307	279	275	30	chr3	22517647	22518606	-137081177	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	63	1
756	1089	302	43	38	chr3	22518639	22519056	-137080727	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
756	1583	239	31	33	chr3	22527634	22528054	-137071729	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
756	1069	268	78	24	chr3	22535212	22535545	-137064238	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	355	-4	3
756	1010	260	87	45	chr3	22535725	22536080	-137063703	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
756	324	188	0	0	chr3	22539531	22539600	-137060183	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-459	69	1	3
757	1432	250	50	13	chr3	22562566	22562954	-137036829	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	11	5
757	656	296	79	14	chr3	22564713	22564923	-137034860	+	MT2A	LTR	ERVL	294	517	-16	5
757	1467	203	37	134	chr3	22565728	22566049	-137033734	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	102	5
757	2027	149	34	12	chr3	22566049	22566369	-137033414	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
757	1467	203	37	134	chr3	22566369	22566479	-137033304	-	RMER10B	LTR	ERVL	-297	101	9	5
757	347	357	105	52	chr3	22567639	22567982	-137031801	+	MTEa	LTR	MaLR	10	379	0	5
757	261	393	0	0	chr3	22575097	22575186	-137024597	-	MLT1J	LTR	MaLR	-327	185	97	6
757	1329	271	10	109	chr3	22577218	22577629	-137022154	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
757	801	294	138	17	chr3	22579656	22579947	-137019836	+	ORR1E	LTR	MaLR	23	348	-11	7
757	373	185	111	0	chr3	22581847	22581928	-137017855	+	MTE2b	LTR	MaLR	290	379	0	7
757	351	295	27	226	chr3	22584895	22585088	-137014695	-	RMER20A	LTR	ERVK	-23	604	450	8
757	351	295	27	226	chr3	22585161	22585209	-137014574	-	RMER20A	LTR	ERVK	-178	449	426	8
757	426	278	57	113	chr3	22585356	22585755	-137014028	-	RMER20A	LTR	ERVK	-202	425	1	8
757	2352	160	11	35	chr3	22587303	22587679	-137012104	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	9
757	232	265	59	0	chr3	22596074	22596142	-137003641	+	MTE-int	LTR	MaLR	561	632	-948	1
757	407	278	74	0	chr3	22596691	22596799	-137002984	+	RMER15	LTR	ERVL	371	486	-89	1
757	1017	212	93	21	chr3	22599650	22599886	-136999897	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	253	-145	1
757	5576	51	0	0	chr3	22600364	22600988	-136998795	+	RLTR1	LTR	ERV1	1	624	0	1
757	2067	209	96	21	chr3	22600990	22601551	-136998232	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	3	605	-6951	1
757	3418	41	5	0	chr3	22601551	22601939	-136997844	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
757	11338	94	57	59	chr3	22601941	22603896	-136995887	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	34	1
757	3397	42	5	0	chr3	22603904	22604290	-136995493	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	1
757	307	91	0	22	chr3	22604290	22604335	-136995448	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	428	471	-2828	1
757	890	186	30	95	chr3	22604651	22604913	-136994870	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	535	779	-2520	1
757	369	194	9	114	chr3	22605014	22605119	-136994664	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1068	1161	-2537	1
757	12219	101	126	127	chr3	22605192	22605618	-136994165	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	783	1138	-2161	1
757	12219	101	126	127	chr3	22605678	22607763	-136992020	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1139	3290	-9	1
757	5371	60	7	0	chr3	22607771	22608391	-136991392	+	RLTR1	LTR	ERV1	1	624	0	1
757	343	167	0	53	chr3	22608391	22608456	-136991327	+	RLTR18B	LTR	ERVK	90	152	-464	1
757	2042	217	59	35	chr3	22608456	22608540	-136991243	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	0	551	465	1
757	2042	217	59	35	chr3	22608586	22609012	-136990771	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-87	464	29	1
757	239	200	0	22	chr3	22609027	22609073	-136990710	+	RLTR18B	LTR	ERVK	147	191	-425	1
757	375	328	47	8	chr3	22609309	22609438	-136990345	+	RLTR18B	LTR	ERVK	379	512	0	1
757	281	293	65	43	chr3	22610148	22610287	-136989496	-	RLTR23	LTR	ERV1	-1	429	288	1
757	943	224	20	60	chr3	22610876	22611333	-136988450	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	398	1	1
757	1020	253	97	20	chr3	22640517	22640819	-136958964	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-42	535	240	1
757	807	246	67	40	chr3	22640798	22641104	-136958679	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-242	335	1	1
757	1703	179	20	116	chr3	22642812	22643216	-136956567	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-2	365	1	1
757	1138	282	45	16	chr3	22660566	22660948	-136938835	+	RMER5	LTR	ERV1	112	504	-30	1
757	2352	113	8	11	chr3	22661521	22661886	-136937897	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	660	1
757	2344	114	29	3	chr3	22661882	22662226	-136937557	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	-670	353	1	1
757	865	258	25	101	chr3	22662262	22662716	-136937067	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	412	-29	1
757	1450	209	104	80	chr3	22668189	22668564	-136931219	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	386	-8	1
758	902	135	88	75	chr3	22678219	22678459	-136921324	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1919	2161	-681	1
758	1916	194	33	0	chr3	22679222	22679588	-136920195	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
758	3395	180	83	10	chr3	22679588	22680263	-136919520	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	0	1509	786	1
758	1708	178	20	0	chr3	22680275	22680567	-136919216	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	298	-31	1
758	7681	182	50	67	chr3	22680567	22682306	-136917477	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	1709	-254	1
758	1027	138	337	0	chr3	22684969	22685165	-136914618	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1695	1956	-7	1
758	1656	163	15	78	chr3	22685188	22685521	-136914262	+	ORR1A4	LTR	MaLR	15	326	0	1
758	3151	204	8	11	chr3	22685541	22686162	-136913621	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-887	622	4	1
758	1686	225	19	3	chr3	22686165	22686535	-136913248	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	3	1
758	360	291	80	20	chr3	22687787	22687938	-136911845	+	MLT1D	LTR	MaLR	342	501	-4	1
758	3948	178	52	65	chr3	22688911	22689907	-136909876	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	983	1	1
758	1219	275	20	54	chr3	22693087	22693440	-136906343	+	MTE2a	LTR	MaLR	10	350	-29	2
758	2609	123	5	14	chr3	22706205	22706618	-136893165	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	2
758	3557	68	2	125	chr3	22707026	22707610	-136892173	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	2
758	1564	214	80	38	chr3	22710221	22710682	-136889101	+	RMER19B	LTR	ERVK	137	664	-238	2
758	512	303	68	89	chr3	22710729	22711055	-136888728	-	LTR37A	LTR	ERV1	-91	335	17	2
758	725	273	23	64	chr3	22713658	22713877	-136885906	+	ORR1E	LTR	MaLR	22	231	-128	2
758	397	351	40	7	chr3	22724562	22724704	-136875079	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	147	-267	2
758	652	282	121	11	chr3	22724704	22724933	-136874850	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	281	-103	2
758	1622	156	83	3	chr3	22724933	22725235	-136874548	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	326	-68	2
758	270	193	0	66	chr3	22725247	22725308	-136874475	+	ORR1D1	LTR	MaLR	260	316	-58	2
758	3036	61	13	8	chr3	22726190	22726584	-136873199	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
758	2993	40	8	0	chr3	22733352	22733706	-136866077	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	2
758	328	335	98	51	chr3	22738786	22739000	-136860783	-	RMER15	LTR	ERVL	-52	523	300	2
758	240	263	63	71	chr3	22739042	22739169	-136860614	-	RMER15	LTR	ERVL	-445	130	5	2
758	2090	223	55	32	chr3	22739763	22740236	-136859547	+	RLTR12A	LTR	ERVK	85	568	0	2
758	1218	32	0	0	chr3	22743662	22743817	-136855966	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-191	155	1	2
758	4530	66	19	6	chr3	22743817	22744436	-136855347	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	0	1792	1166	2
758	7109	92	9	69	chr3	22744436	22745592	-136854191	+	MT-int	LTR	MaLR	2	1087	-11	2
758	1029	261	162	116	chr3	22747787	22748149	-136851634	+	MTD	LTR	MaLR	1	378	-1	2
758	2052	199	62	63	chr3	22748390	22748894	-136850889	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	503	-81	2
758	259	167	0	36	chr3	22748873	22748929	-136850854	+	RLTR17	LTR	ERVK	639	692	0	2
758	1154	197	62	12	chr3	22757548	22757790	-136841993	+	MTC	LTR	MaLR	2	255	-166	2
758	231	324	83	56	chr3	22759796	22759976	-136839807	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-295	306	122	2
758	497	292	88	15	chr3	22760291	22760496	-136839287	+	ORR1D2	LTR	MaLR	149	368	-2	2
758	350	187	67	0	chr3	22760501	22760576	-136839207	+	MTEb	LTR	MaLR	300	379	0	2
758	2138	115	45	151	chr3	22765683	22766214	-136833569	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
758	6878	35	2	17	chr3	22766216	22767057	-136832726	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5651	3
758	2610	79	0	3	chr3	22767050	22767393	-136832390	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4781	1700	1359	3
758	3581	58	1	16	chr3	22767393	22767971	-136831812	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	3
758	245	309	0	0	chr3	22767971	22768026	-136831757	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	221	3
758	1005	66	9	201	chr3	22768026	22768255	-136831528	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6288	193	9	3
758	2138	115	45	151	chr3	22768256	22768787	-136830996	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
758	324	351	118	24	chr3	22769954	22770123	-136829660	+	MTEa	LTR	MaLR	195	379	0	3
758	738	233	33	16	chr3	22775143	22775326	-136824457	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-295	186	1	3
758	807	337	115	6	chr3	22775542	22775873	-136823910	+	MTEa	LTR	MaLR	1	367	-12	3
758	1313	281	79	48	chr3	22777460	22777678	-136822105	+	RMER5	LTR	ERV1	3	237	-297	3
758	1300	281	79	48	chr3	22777734	22778019	-136821764	+	RMER5	LTR	ERV1	238	522	-12	3
758	655	322	32	27	chr3	22778640	22778860	-136820923	+	MTD	LTR	MaLR	105	325	-94	3
758	732	304	85	12	chr3	22782662	22782908	-136816875	+	MTE2b	LTR	MaLR	101	364	-15	3
758	2564	207	75	13	chr3	22783869	22783968	-136815815	+	RLTR17	LTR	ERVK	5	116	-576	3
758	2564	207	75	13	chr3	22784651	22785099	-136814684	+	RLTR17	LTR	ERVK	117	585	-107	3
758	671	277	98	37	chr3	22797670	22797884	-136801899	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	227	-132	3
758	1077	266	150	72	chr3	22798078	22798166	-136801617	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	541	440	3
758	1109	234	89	37	chr3	22798226	22798636	-136801147	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-102	439	4	3
758	2299	131	34	53	chr3	22798887	22799300	-136800483	+	RLTR44B	LTR	ERVK	1	405	0	3
758	421	73	0	0	chr3	22799301	22799356	-136800427	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	2	56	-2756	3
758	828	154	0	0	chr3	22799511	22799660	-136800123	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	76	224	-2588	3
758	378	115	0	32	chr3	22799663	22799726	-136800057	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	877	937	-1875	3
758	4351	108	3	1	chr3	22799792	22800450	-136799333	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	704	1489	-1323	3
758	1804	91	86	17	chr3	22803624	22803925	-136795858	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
94	17614	126	23	19	chr3	22803925	22807817	-136791966	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-172	7234	2859	3
759	13985	138	23	13	chr3	22807989	22810681	-136789102	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3573	2594	1	3
759	1888	99	31	22	chr3	22810681	22811000	-136788783	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
759	427	278	6	44	chr3	22814013	22814171	-136785612	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	906	1057	-5485	3
759	6488	137	14	25	chr3	22814633	22815890	-136783893	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	1520	2811	-1	3
759	2577	131	92	5	chr3	22815891	22816304	-136783479	+	RLTR44B	LTR	ERVK	1	449	0	3
759	1435	152	78	0	chr3	22817136	22817392	-136782391	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-308	276	1	3
759	729	287	73	51	chr3	22817969	22818319	-136781464	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	3
759	449	357	48	60	chr3	22819351	22819601	-136780182	+	MTD	LTR	MaLR	24	270	-149	3
759	552	236	27	20	chr3	22819653	22819786	-136779997	+	MTD	LTR	MaLR	262	397	-22	3
759	552	236	27	20	chr3	22819833	22819846	-136779937	+	MTD	LTR	MaLR	398	408	-11	3
759	744	297	48	62	chr3	22821573	22821946	-136777837	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-38	443	76	3
759	1955	190	16	47	chr3	22822146	22822593	-136777190	+	RMER10A	LTR	ERVL	7	439	-3	3
759	1253	228	94	196	chr3	22824127	22824205	-136775578	-	RMER6C	LTR	ERVK	-13	707	629	3
759	1253	228	94	196	chr3	22824272	22824305	-136775478	-	RMER6C	LTR	ERVK	-92	628	612	3
759	2026	206	151	45	chr3	22824762	22825436	-136774347	-	RMER6C	LTR	ERVK	-38	652	1	3
759	317	353	55	82	chr3	22840947	22841311	-136758472	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	21	3
759	594	310	121	83	chr3	22841485	22842112	-136757671	+	RMER13A	LTR	ERVK	2	652	-208	3
759	822	340	64	21	chr3	22842271	22842601	-136757182	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	349	-10	3
759	6186	99	95	6	chr3	22844213	22845153	-136754630	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	3
759	234	343	0	14	chr3	22857347	22857418	-136742365	+	MLT1H	LTR	MaLR	50	119	-430	4
759	476	268	225	0	chr3	22857657	22857795	-136741988	-	MTE2b	LTR	MaLR	-209	170	2	4
759	571	235	63	106	chr3	22859867	22860245	-136739538	-	RMER16	LTR	ERVK	-78	455	1	4
759	930	127	7	13	chr3	22860245	22860397	-136739386	-	RMER16-int	LTR	ERVK	0	5406	5256	4
759	3017	119	4	0	chr3	22866687	22867148	-136732635	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-137	5269	4807	4
759	3355	31	5	0	chr3	22869128	22869520	-136730263	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	394	-2	4
759	4774	63	3	2	chr3	22869520	22870153	-136729630	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	634	-464	4
759	447	191	0	0	chr3	22870187	22870271	-136729512	+	MT2A	LTR	ERVL	1	84	-449	4
759	784	255	60	0	chr3	22870827	22871011	-136728772	+	MT2A	LTR	ERVL	72	266	-267	4
759	247	209	308	0	chr3	22871017	22871108	-136728675	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-253	121	3	4
759	246	135	0	0	chr3	22871208	22871245	-136728538	+	MT2A	LTR	ERVL	497	533	0	4
759	252	280	172	15	chr3	22871245	22871376	-136728407	+	MER31A	LTR	ERV1	135	286	-199	4
759	335	317	83	0	chr3	22873662	22873782	-136726001	+	MLT1A0	LTR	MaLR	12	141	-224	4
759	1371	244	86	122	chr3	22873965	22874256	-136725527	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-43	534	298	4
759	1371	236	87	125	chr3	22874884	22875173	-136724610	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-274	303	5	4
759	905	202	5	57	chr3	22877833	22878027	-136721756	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	184	-200	4
759	2586	182	42	18	chr3	22878187	22878691	-136721092	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	4
759	829	232	42	42	chr3	22878785	22879001	-136720782	+	ORR1C2	LTR	MaLR	167	382	-2	4
759	1630	161	209	29	chr3	22882262	22882640	-136717143	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	4
759	3403	200	181	18	chr3	22889042	22889990	-136709793	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1103	0	4
759	392	328	164	27	chr3	22892844	22893202	-136706581	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	547	-9	4
759	699	319	4	46	chr3	22901602	22901865	-136697918	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-16	354	103	4
759	551	237	31	75	chr3	22926533	22926761	-136673022	-	RMER17C	LTR	ERVK	-129	281	64	4
759	986	281	164	9	chr3	22934336	22934684	-136665099	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	4
759	2160	77	87	0	chr3	22936090	22936348	-136663435	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	278	-68	4
759	2160	77	87	0	chr3	22936376	22936428	-136663355	+	ORR1A1	LTR	MaLR	279	337	-9	4
759	11140	74	28	115	chr3	22936432	22937419	-136662364	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	867	-925	4
760	11140	74	28	115	chr3	22938412	22939386	-136660397	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	868	1792	0	4
760	2575	55	61	3	chr3	22939386	22939713	-136660070	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
760	330	212	38	0	chr3	22942854	22942934	-136656849	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	988	1070	-658	4
760	1472	238	73	112	chr3	22943832	22944499	-136655284	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	1084	1724	-4	4
760	2586	246	147	24	chr3	22944505	22945255	-136654528	+	RMER13A	LTR	ERVK	19	860	0	4
760	2650	226	27	31	chr3	22958132	22958862	-136640921	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	26	752	-1096	5
760	374	274	53	41	chr3	22974626	22974797	-136624986	+	LTR33A	LTR	ERVL	342	514	-6	5
760	1839	184	20	31	chr3	22983518	22983876	-136615907	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	5
760	801	291	134	34	chr3	22986956	22987082	-136612701	-	MTEa	LTR	MaLR	-27	352	193	5
760	801	291	134	34	chr3	22987133	22987326	-136612457	-	MTEa	LTR	MaLR	-187	192	1	5
760	244	322	81	16	chr3	22989238	22989361	-136610422	-	LTR33C	LTR	ERVL	-15	614	484	5
760	363	339	65	73	chr3	22989461	22989709	-136610074	-	MLT2E	LTR	ERVL	-363	265	20	5
760	741	259	6	0	chr3	22991486	22991656	-136608127	+	RMER15	LTR	ERVL	3	173	-402	5
760	961	252	181	31	chr3	22992146	22992433	-136607350	+	RMER15	LTR	ERVL	223	552	-23	5
760	286	186	0	106	chr3	22992433	22992499	-136607284	+	RMER15	LTR	ERVL	515	573	-2	5
760	2138	109	134	5	chr3	22992901	22993297	-136606486	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	447	-85	5
760	1400	246	91	134	chr3	22994808	22995414	-136604369	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	48	5
760	373	316	8	33	chr3	22996511	22996632	-136603151	+	RMER15	LTR	ERVL	312	429	-146	5
760	234	307	134	35	chr3	22996709	22996851	-136602932	+	RMER15	LTR	ERVL	417	572	-3	5
760	2123	196	41	90	chr3	23000103	23000659	-136599124	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	2
760	353	385	94	23	chr3	23001005	23001356	-136598427	-	MER110	LTR	ERV1	-22	469	94	3
760	507	304	52	52	chr3	23002046	23002296	-136597487	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-305	251	2	5
760	643	309	109	27	chr3	23002883	23003212	-136596571	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	4	8
760	1083	268	94	67	chr3	23004017	23004374	-136595409	+	MTD	LTR	MaLR	5	377	-42	1
760	1083	268	94	67	chr3	23004550	23004596	-136595187	+	MTD	LTR	MaLR	378	419	0	1
760	2190	230	41	10	chr3	23004847	23005483	-136594300	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	158	1
760	2190	212	54	2	chr3	23005548	23005612	-136594171	-	RMER13A	LTR	ERVK	-703	157	83	1
760	383	102	0	33	chr3	23005936	23005997	-136593786	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	288	1
760	2031	230	68	21	chr3	23006089	23006617	-136593166	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	553	-15	1
760	713	264	48	71	chr3	23007970	23008391	-136591392	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	3774	4020	-2530	1
760	1201	209	18	94	chr3	23008470	23008904	-136590879	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1015	1415	-911	2
760	572	336	90	50	chr3	23010476	23010931	-136588852	+	MER110	LTR	ERV1	1	473	-18	2
760	2068	136	12	0	chr3	23012175	23012498	-136587285	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
760	2750	135	28	5	chr3	23013579	23014002	-136585781	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-3	433	1	3
760	2408	164	122	100	chr3	23014259	23014857	-136584926	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	3
760	485	316	107	101	chr3	23015550	23015916	-136583867	-	MTE2a	LTR	MaLR	-6	373	6	3
760	1012	247	67	18	chr3	23023355	23023639	-136576144	-	MTD	LTR	MaLR	-119	300	3	4
760	228	372	0	25	chr3	23028306	23028386	-136571397	-	MLT1H	LTR	MaLR	-377	172	95	5
760	415	327	83	48	chr3	23028981	23029209	-136570574	+	RLTR18	LTR	ERVK	53	288	-328	5
760	574	316	67	42	chr3	23029361	23029599	-136570184	+	RLTR18	LTR	ERVK	369	612	-4	5
760	316	270	141	90	chr3	23031270	23031604	-136568179	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	351	-59	5
760	727	281	30	83	chr3	23038297	23038658	-136561125	-	RMER17C	LTR	ERVK	-68	342	1	6
760	370	308	62	15	chr3	23039978	23040126	-136559657	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	223	7
760	353	315	193	7	chr3	23040137	23040287	-136559496	-	MTEa	LTR	MaLR	-196	183	6	7
760	302	309	12	0	chr3	23041945	23042026	-136557757	+	LTR84a	LTR	ERVL	670	751	-6	7
760	1786	153	118	21	chr3	23046778	23047151	-136552632	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	8
760	314	311	95	24	chr3	23054369	23054537	-136545246	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1417	318	139	1
760	2368	196	21	156	chr3	23054638	23055344	-136544439	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
760	1971	168	6	0	chr3	23058075	23058402	-136541381	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
760	1782	222	36	85	chr3	23058403	23058620	-136541163	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	2	229	-1734	1
760	1782	222	36	85	chr3	23058732	23058987	-136540796	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	230	451	-1512	1
760	421	366	73	20	chr3	23061409	23061710	-136538073	-	MER74C	LTR	ERVL	-81	379	63	1
760	303	307	45	26	chr3	23068493	23068647	-136531136	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	649	805	-6751	1
761	2758	329	73	50	chr3	23069363	23072532	-136527251	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	1180	4421	-3135	1
761	2665	31	46	3	chr3	23072624	23072947	-136526836	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
761	53145	23	12	6	chr3	23072947	23079382	-136520401	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	1
761	2665	31	46	3	chr3	23079382	23079705	-136520078	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
761	1418	289	15	4	chr3	23080213	23080668	-136519115	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3555	4014	-1049	1
761	368	287	16	24	chr3	23080862	23080987	-136518796	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	5487	5610	-1991	1
761	577	308	27	27	chr3	23082483	23082783	-136517000	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7341	7640	-138	1
761	302	169	32	117	chr3	23083594	23083688	-136516095	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	155	1
761	1358	202	122	6	chr3	23084318	23084600	-136515183	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	310	-64	1
761	1358	202	122	6	chr3	23084641	23084686	-136515097	+	ORR1D1	LTR	MaLR	311	365	-9	1
761	547	334	95	44	chr3	23086816	23087132	-136512651	+	MLT1B	LTR	MaLR	41	372	-18	1
761	2947	84	5	5	chr3	23101839	23102235	-136497548	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
761	1522	281	65	65	chr3	23110564	23111070	-136488713	+	RLTR11A	LTR	ERVK	6	511	-17	1
761	1213	278	54	86	chr3	23118146	23118486	-136481297	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-9	519	216	1
761	1213	278	54	86	chr3	23118558	23118753	-136481030	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-313	215	2	1
761	1691	215	78	3	chr3	23122954	23123313	-136476470	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	1
761	2081	360	31	24	chr3	23130164	23131012	-136468771	+	MTE-int	LTR	MaLR	700	1553	-27	1
761	661	203	85	237	chr3	23131019	23131348	-136468435	+	MT2A	LTR	ERVL	1	279	-254	1
761	234	186	0	0	chr3	23131350	23131393	-136468390	+	MT2A	LTR	ERVL	491	533	0	1
761	460	301	52	66	chr3	23131396	23131609	-136468174	+	ORR1E	LTR	MaLR	32	241	-118	1
761	296	322	26	0	chr3	23133182	23133297	-136466486	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	422	1
761	1056	193	39	5	chr3	23137448	23137651	-136462132	-	MTC	LTR	MaLR	-52	369	160	2
761	604	167	0	0	chr3	23149001	23149097	-136450686	+	MTC	LTR	MaLR	1	96	-325	2
761	1388	232	6	32	chr3	23149271	23149457	-136450326	+	MTC	LTR	MaLR	105	285	-136	2
761	4459	129	77	8	chr3	23149457	23150213	-136449570	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	2	2
761	1388	232	6	32	chr3	23150213	23150338	-136449445	+	MTC	LTR	MaLR	286	408	-13	2
761	984	147	59	0	chr3	23151700	23151870	-136447913	+	RMER17A2	LTR	ERVK	727	906	0	2
761	1454	211	63	29	chr3	23169168	23169549	-136430234	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
761	3287	43	2	2	chr3	23169718	23170114	-136429669	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
761	7592	71	11	6	chr3	23170114	23171176	-136428607	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	31	2
761	3864	73	72	8	chr3	23171178	23171704	-136428079	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	2
761	676	90	0	2	chr3	23171915	23172024	-136427759	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	139	293	-3006	2
761	838	133	68	19	chr3	23172368	23172529	-136427254	+	RMER16-int	LTR	ERVK	142	310	-5096	2
761	4022	148	52	15	chr3	23172551	23173267	-136426516	+	RMER16-int	LTR	ERVK	703	1444	-3962	2
761	8507	131	71	72	chr3	23173258	23175553	-136424230	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	760	2526	-773	2
761	2670	63	11	3	chr3	23175553	23175936	-136423847	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-21	400	1	2
761	2398	198	120	0	chr3	23183666	23184095	-136415688	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	479	-99	2
761	2398	198	120	0	chr3	23184141	23184227	-136415556	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	480	577	-1	2
761	1228	250	71	136	chr3	23184383	23184777	-136415006	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	382	-145	2
761	1228	250	71	136	chr3	23185222	23185382	-136414401	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	383	524	-3	2
761	5099	139	82	11	chr3	23185574	23186420	-136413363	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	2
761	929	207	31	152	chr3	23189435	23189789	-136409994	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	12	322	0	2
761	4053	144	45	52	chr3	23190207	23191021	-136408762	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	2
761	3453	211	15	4	chr3	23197800	23198485	-136401298	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	2
762	1312	259	65	39	chr3	23225784	23226215	-136373568	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	442	0	2
762	1501	154	116	3	chr3	23227443	23227737	-136372046	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-5	327	1	2
762	648	270	67	118	chr3	23231106	23231598	-136368185	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2532	2998	-3139	2
762	320	164	29	29	chr3	23232384	23232453	-136367330	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3189	3257	-2880	2
762	280	48	71	0	chr3	23233082	23233124	-136366659	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3529	3573	-2564	2
762	1342	181	145	27	chr3	23233127	23233423	-136366360	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	98	2
762	697	82	10	0	chr3	23233518	23233615	-136366168	-	RLTR23	LTR	ERV1	-326	104	7	2
762	658	212	53	63	chr3	23233665	23233871	-136365912	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3600	3803	-2334	2
762	398	283	88	54	chr3	23233931	23234170	-136365613	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2627	2873	-365	2
762	3593	65	2	0	chr3	23234469	23234915	-136364868	-	LTRIS5	LTR	ERV1	0	447	1	2
762	1483	216	43	70	chr3	23234942	23235411	-136364372	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	414	-32	2
762	1483	221	44	91	chr3	23235447	23235483	-136364300	+	RLTR41	LTR	ERV1	415	446	0	2
762	1764	224	22	56	chr3	23235483	23235927	-136363856	+	RMER10A	LTR	ERVL	13	441	-1	2
762	3659	127	93	14	chr3	23239707	23240404	-136359379	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-57	752	1	3
762	5182	131	51	7	chr3	23240406	23241307	-136358476	-	RMER17A-int	LTR	ERVK	-2	1726	786	3
762	282	192	19	0	chr3	23241774	23241826	-136357957	-	RMER17A-int	LTR	ERVK	-1673	55	3	3
762	301	141	30	30	chr3	23241828	23241894	-136357889	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	744	3
762	1224	190	155	0	chr3	23242263	23242534	-136357249	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	380	3
762	575	206	45	52	chr3	23248336	23248490	-136351293	+	MTEa	LTR	MaLR	224	376	-3	3
762	1586	186	63	0	chr3	23249301	23249651	-136350132	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1951	2322	-4	3
762	1902	165	157	3	chr3	23249655	23250037	-136349746	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	441	0	3
762	2301	185	32	35	chr3	23250037	23250570	-136349213	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1791	2322	-4	3
762	1520	221	100	48	chr3	23250570	23250989	-136348794	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	441	0	3
762	486	363	30	34	chr3	23259752	23260017	-136339766	-	MT2A	LTR	ERVL	-160	373	110	3
762	1441	237	65	28	chr3	23262943	23263342	-136336441	-	RMER20A	LTR	ERVK	-92	424	11	3
762	232	327	9	63	chr3	23266104	23266215	-136333568	-	LTR40b	LTR	ERVL	-320	142	38	3
762	1230	178	39	101	chr3	23269022	23269359	-136330424	+	RMER17C	LTR	ERVK	2	317	-93	3
762	2971	41	5	0	chr3	23275184	23275553	-136324230	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	26	396	0	3
762	225	256	0	0	chr3	23276951	23276994	-136322789	-	RMER13B	LTR	ERVK	-7	901	859	3
762	3512	217	43	12	chr3	23277012	23277757	-136322026	-	RMER13B	LTR	ERVK	-136	772	5	3
762	1346	212	40	25	chr3	23280892	23281246	-136318537	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	3
762	1313	222	176	15	chr3	23283581	23283978	-136315805	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	3
762	229	311	63	70	chr3	23284758	23284900	-136314883	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1206	1346	-462	3
762	1028	92	168	0	chr3	23294334	23294519	-136305264	-	BGLII_A	LTR	ERVK	-1	444	229	3
762	1351	201	36	30	chr3	23294516	23294819	-136304964	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	239	543	-10	3
762	1829	182	56	8	chr3	23301681	23302057	-136297726	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
762	3289	192	23	8	chr3	23303479	23304088	-136295695	-	RLTR17	LTR	ERVK	-74	618	1	3
762	3021	56	13	10	chr3	23305650	23306045	-136293738	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
762	790	332	32	92	chr3	23314309	23314710	-136285073	+	MTE2a	LTR	MaLR	2	378	-1	3
762	373	381	72	76	chr3	23316110	23316360	-136283423	-	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	-478	361	113	3
762	251	320	106	10	chr3	23316632	23316736	-136283047	+	MLT1F2	LTR	MaLR	44	157	-403	3
762	405	247	0	0	chr3	23320884	23320969	-136278814	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	335	4
762	664	290	43	5	chr3	23321036	23321223	-136278560	-	MTD	LTR	MaLR	-108	311	118	4
762	726	224	103	83	chr3	23321220	23321532	-136278251	-	MTC-int	LTR	MaLR	-936	322	5	4
762	415	250	93	8	chr3	23323015	23323144	-136276639	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	538	677	-832	4
762	458	275	6	0	chr3	23323301	23323351	-136276432	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	665	843	-666	4
762	2631	190	27	25	chr3	23323351	23323902	-136275881	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	958	1509	0	4
762	1133	213	60	21	chr3	23323905	23324140	-136275643	+	ORR1B2	LTR	MaLR	7	250	-117	4
762	299	231	179	19	chr3	23324435	23324541	-136275242	+	RMER21A	LTR	ERV1	560	682	-265	4
762	489	208	20	0	chr3	23324601	23324702	-136275081	+	ORR1B2	LTR	MaLR	253	355	-12	4
762	2613	120	5	41	chr3	23325954	23326372	-136273411	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	4
762	273	355	24	0	chr3	23326564	23326688	-136273095	+	RMER15	LTR	ERVL	392	518	-57	4
762	3351	215	32	56	chr3	23328201	23328461	-136271322	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	240	-577	4
762	3351	215	32	56	chr3	23328791	23329354	-136270429	+	RLTR40	LTR	ERVK	241	804	-13	4
763	795	291	201	3	chr3	23331621	23331945	-136267838	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	1	4
763	716	253	40	10	chr3	23343541	23343745	-136256038	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-924	4833	4614	4
763	3061	78	0	5	chr3	23358818	23359216	-136240567	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
763	393	284	35	41	chr3	23360657	23360826	-136238957	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-189	7589	7422	4
763	797	297	40	16	chr3	23361439	23361770	-136238013	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-2454	5324	4931	4
763	265	128	419	10	chr3	23361782	23361859	-136237924	+	MTC-int	LTR	MaLR	463	558	-700	4
763	289	323	81	41	chr3	23368308	23368506	-136231277	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-1392	3671	3482	4
763	1416	357	73	64	chr3	23368983	23371858	-136227925	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-3406	4195	1401	4
763	250	222	95	0	chr3	23376025	23376088	-136223695	-	MER34	LTR	ERV1	-471	71	3	4
763	1656	245	37	32	chr3	23376584	23376926	-136222857	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	58	4
763	1656	245	37	32	chr3	23377627	23377685	-136222098	-	MTD	LTR	MaLR	-362	57	1	4
763	2828	51	11	0	chr3	23380281	23380653	-136219130	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	376	-14	4
763	310	241	10	94	chr3	23392854	23392950	-136206833	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	170	4
763	302	318	48	11	chr3	23401691	23401872	-136197911	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	464	270	4
763	417	360	109	36	chr3	23410600	23410874	-136188909	+	MLT1F2	LTR	MaLR	263	556	-4	5
763	1718	240	8	177	chr3	23416468	23417203	-136182580	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	5
763	431	285	143	78	chr3	23431702	23431995	-136167788	-	ORR1E	LTR	MaLR	-47	312	1	5
763	395	309	8	31	chr3	23433650	23433777	-136166006	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	126	-253	5
763	289	291	9	46	chr3	23433793	23433901	-136165882	+	MTE2a	LTR	MaLR	273	376	-3	5
763	740	69	0	29	chr3	23440240	23440345	-136159438	+	RLTR1B	LTR	ERV1	335	436	-76	5
763	240	248	177	41	chr3	23441329	23441476	-136158307	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-235	293	127	5
763	264	0	0	0	chr3	23441478	23441509	-136158274	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	377	407	0	5
763	7412	57	103	3	chr3	23441509	23442507	-136157276	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
763	2990	41	5	88	chr3	23442507	23442698	-136157085	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	192	-204	5
763	2990	41	5	88	chr3	23442797	23443037	-136156746	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	193	396	0	5
763	1029	274	68	41	chr3	23456427	23456796	-136142987	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	5
763	1075	325	11	35	chr3	23456801	23457177	-136142606	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	8	374	-1206	5
763	683	351	49	35	chr3	23457159	23457445	-136142338	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	482	771	-809	5
763	285	329	18	49	chr3	23458855	23459018	-136140765	+	MLT1H	LTR	MaLR	383	540	-9	5
764	253	288	55	0	chr3	23461996	23462069	-136137714	+	MLT1H2	LTR	MaLR	61	137	-352	5
764	1857	184	33	74	chr3	23462510	23462565	-136137218	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	331	5
764	1857	184	33	74	chr3	23462655	23462993	-136136790	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-48	330	1	5
764	1550	149	334	5	chr3	23463264	23463663	-136136120	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	2	532	0	5
764	608	181	8	8	chr3	23463671	23463787	-136135996	+	MTC	LTR	MaLR	3	118	-303	5
764	1392	173	215	9	chr3	23463787	23464126	-136135657	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	695	5
764	2460	70	3	52	chr3	23466344	23466707	-136133076	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	345	-158	5
764	260	182	0	18	chr3	23466725	23466781	-136133002	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-2768	531	477	5
764	644	286	9	45	chr3	23466842	23466866	-136132917	+	RLTR1D	LTR	ERV1	391	413	-211	5
764	820	251	11	11	chr3	23466896	23467112	-136132671	+	RLTR1D	LTR	ERV1	414	605	0	5
764	1482	229	123	117	chr3	23467115	23467732	-136132051	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	3	623	-6933	5
764	274	182	0	18	chr3	23467846	23467902	-136131881	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	477	531	-2768	5
764	2434	138	10	18	chr3	23468322	23468712	-136131071	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1068	1454	-2244	5
764	707	149	27	117	chr3	23468796	23469084	-136130699	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	961	1511	-2187	5
764	4756	122	34	21	chr3	23469814	23470619	-136129164	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1513	2654	-2409	5
764	579	267	15	15	chr3	23471188	23471321	-136128462	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	5
764	5010	207	42	31	chr3	23471323	23472656	-136127127	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	2874	4273	-790	5
764	624	39	0	0	chr3	23472712	23472789	-136126994	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3223	3299	0	5
764	2768	145	28	44	chr3	23472789	23473293	-136126490	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	496	-7	5
764	3075	177	53	34	chr3	23473868	23474493	-136125290	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-466	637	1	5
764	1390	200	28	60	chr3	23474493	23474812	-136124971	+	MTC	LTR	MaLR	113	421	0	5
764	696	321	19	45	chr3	23486016	23486394	-136113389	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	370	0	6
764	971	294	113	16	chr3	23487544	23487914	-136111869	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	14	6
764	243	245	0	0	chr3	23491147	23491200	-136108583	+	MTE2b	LTR	MaLR	9	61	-318	6
764	1447	164	44	4	chr3	23493666	23493936	-136105847	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	281	-1567	6
764	6307	58	8	22	chr3	23496653	23497486	-136102297	+	RLTR13B2	LTR	ERVK	1	822	0	6
764	3298	116	11	11	chr3	23500406	23500945	-136098838	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	267	805	-1043	2
764	1280	172	29	107	chr3	23501135	23501415	-136098368	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1591	1848	0	2
764	1465	256	84	66	chr3	23503908	23504335	-136095448	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-77	435	1	4
764	881	255	150	41	chr3	23504360	23504691	-136095092	-	MTD	LTR	MaLR	-23	396	56	5
764	1287	261	76	9	chr3	23506495	23506824	-136092959	-	MTC	LTR	MaLR	-70	351	1	9
764	2193	215	67	34	chr3	23507076	23507614	-136092169	+	RMER2	LTR	ERV1	1	556	-11	1
764	1930	196	51	124	chr3	23510844	23511415	-136088368	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	1
764	1523	217	57	20	chr3	23512739	23513143	-136086640	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
764	1968	199	58	41	chr3	23519469	23519936	-136079847	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-85	475	1	2
764	3137	220	93	39	chr3	23533015	23533811	-136065972	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	839	-69	5
764	3717	14	121	0	chr3	23533893	23534333	-136065450	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
764	312	322	130	55	chr3	23540695	23540743	-136059040	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-18	352	298	6
764	312	322	130	55	chr3	23540797	23541001	-136058782	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-73	297	82	6
764	879	272	78	34	chr3	23545331	23545697	-136054086	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	7	7
764	4652	159	72	33	chr3	23547384	23548330	-136051453	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	7
764	4845	139	99	2	chr3	23552604	23553475	-136046308	+	RMER17B	LTR	ERVK	4	958	0	8
764	6399	50	16	1	chr3	23554968	23555764	-136044019	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	8
764	289	322	68	0	chr3	23557852	23557970	-136041813	+	MLT1B	LTR	MaLR	263	388	-2	9
764	551	358	121	22	chr3	23560219	23560542	-136039241	-	MER88	LTR	ERVL	-102	362	8	9
764	295	295	49	66	chr3	23561014	23561257	-136038526	-	RLTR15	LTR	ERVK	-66	293	55	1
764	1046	262	23	49	chr3	23561373	23561758	-136038025	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	375	-3	1
764	621	117	11	0	chr3	23563422	23563516	-136036267	+	RMER19B	LTR	ERVK	807	901	-1	1
764	483	359	85	37	chr3	23569758	23570134	-136029649	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-51	505	112	1
764	480	324	52	97	chr3	23570364	23570408	-136029375	-	ORR1E	LTR	MaLR	-26	333	294	1
764	480	324	52	97	chr3	23570604	23570908	-136028875	-	ORR1E	LTR	MaLR	-66	293	1	1
764	1527	343	46	32	chr3	23570908	23571570	-136028213	-	MTE-int	LTR	MaLR	-53	1527	857	1
764	3132	41	7	53	chr3	23571811	23571831	-136027952	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	378	1
764	3132	41	7	53	chr3	23571900	23572294	-136027489	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-19	377	1	1
764	4442	195	31	34	chr3	23577404	23578315	-136021468	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	1
764	3284	50	73	20	chr3	23584370	23584821	-136014962	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
764	6290	60	12	18	chr3	23584823	23585657	-136014126	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5651	1
764	2606	73	3	3	chr3	23585650	23585992	-136013791	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4781	1700	1359	1
764	4301	79	17	32	chr3	23585992	23586747	-136013036	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	9	1
764	3426	61	34	17	chr3	23586748	23587215	-136012568	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
765	1793	203	53	0	chr3	23594395	23594754	-136005029	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
765	1623	192	91	20	chr3	23594756	23594962	-136004821	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-2	1507	1294	1
765	1623	192	91	20	chr3	23594991	23595193	-136004590	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-216	1293	1071	1
765	305	324	26	26	chr3	23595214	23595328	-136004455	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1013	950	837	1
765	3906	222	21	22	chr3	23595496	23596451	-136003332	-	RMER17B	LTR	ERVK	-4	954	1	1
765	2740	231	34	10	chr3	23597025	23597637	-136002146	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-882	627	1	1
765	1685	195	19	111	chr3	23597637	23598053	-136001730	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
765	2911	60	39	3	chr3	23598863	23599245	-136000538	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
765	1568	107	0	0	chr3	23600491	23600715	-135999068	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	184	1
765	1341	88	10	25	chr3	23601136	23601334	-135998449	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-212	195	1	1
765	2378	58	3	0	chr3	23606586	23606896	-135992887	+	IAPLTR4	LTR	ERVK	1	311	-34	1
765	727	343	88	8	chr3	23608159	23608512	-135991271	+	MER68	LTR	ERVL	66	446	-117	1
765	522	225	0	9	chr3	23608834	23608946	-135990837	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	264	1
765	991	220	55	39	chr3	23608949	23609244	-135990539	+	RMER19B	LTR	ERVK	334	902	0	1
765	939	233	95	37	chr3	23611845	23612193	-135987590	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	1
765	1815	98	0	10	chr3	23615002	23615290	-135984493	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	137	1
765	774	236	335	4	chr3	23615395	23615670	-135984113	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	366	-4	1
765	440	261	0	57	chr3	23625074	23625196	-135974587	+	MT2A	LTR	ERVL	13	127	-406	2
765	235	264	68	83	chr3	23628281	23628413	-135971370	+	MLT1A	LTR	MaLR	2	131	-243	2
765	745	318	29	91	chr3	23628540	23628966	-135970817	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	418	1	2
765	1461	269	87	78	chr3	23638766	23639396	-135960387	+	RLTR26	LTR	ERVK	2	637	-5	2
765	1194	206	156	122	chr3	23640886	23641328	-135958455	+	RMER6B	LTR	ERVK	3	459	-2	2
765	2525	140	183	80	chr3	23643906	23644573	-135955210	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	796	-13	2
765	1599	203	60	6	chr3	23651120	23651467	-135948316	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	2	2
765	1061	199	23	228	chr3	23651892	23652327	-135947456	-	RLTR40	LTR	ERVK	-17	800	455	2
765	1517	245	56	22	chr3	23654187	23654637	-135945146	-	RLTR40	LTR	ERVK	-351	466	2	2
765	250	309	12	12	chr3	23656831	23656913	-135942870	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-350	206	125	2
765	311	337	0	0	chr3	23657212	23657310	-135942473	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	98	-281	2
765	720	322	45	79	chr3	23657341	23657671	-135942112	+	MTE2a	LTR	MaLR	48	366	-13	2
765	1051	275	158	3	chr3	23658663	23659010	-135940773	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	2
765	1128	318	30	48	chr3	23659034	23659473	-135940310	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	431	-827	2
765	857	216	70	47	chr3	23659479	23659693	-135940090	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	243	2
765	1475	141	97	0	chr3	23660677	23660925	-135938858	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-28	298	27	2
765	1504	128	8	8	chr3	23660916	23661153	-135938630	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-170	1793	1557	2
765	633	175	25	16	chr3	23661153	23661275	-135938508	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	520	2
765	791	165	91	8	chr3	23661275	23661536	-135938247	-	RLTR26	LTR	ERVK	-301	341	1	2
765	3186	129	24	2	chr3	23661536	23662027	-135937756	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-401	1562	1061	2
765	1692	241	115	76	chr3	23664608	23665425	-135934358	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4845	1292	444	2
765	285	105	0	0	chr3	23665425	23665463	-135934320	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5811	326	289	2
765	556	253	85	163	chr3	23666022	23666069	-135933714	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	379	2
765	3434	18	5	5	chr3	23666069	23666465	-135933318	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
765	556	253	85	163	chr3	23666465	23666876	-135932907	-	RLTR23	LTR	ERV1	-52	378	8	2
765	3747	170	80	1	chr3	23666898	23667663	-135932120	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7776	1183	359	2
765	1001	272	24	67	chr3	23667663	23667994	-135931789	+	MTC-int	LTR	MaLR	759	1075	-183	2
765	922	153	434	0	chr3	23668309	23668537	-135931246	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	327	0	2
765	4921	169	17	65	chr3	23668539	23669642	-135930141	+	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	1	1050	-48	2
765	225	183	46	77	chr3	23670011	23670076	-135929707	-	RMER20A	LTR	ERVK	-268	248	186	2
765	320	206	0	0	chr3	23671728	23671791	-135927992	+	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	1196	1258	0	2
765	2642	127	2	36	chr3	23671794	23671911	-135927872	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	4	120	-287	2
765	3070	42	42	0	chr3	23671911	23672291	-135927492	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
765	2642	127	2	36	chr3	23672291	23672591	-135927192	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	121	407	0	2
765	2643	23	2	248	chr3	23673206	23673723	-135926060	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
765	279	271	0	28	chr3	23674335	23674358	-135925425	+	MTD	LTR	MaLR	175	196	-223	2
765	279	271	0	28	chr3	23675345	23675393	-135924390	+	MTD	LTR	MaLR	197	244	-175	2
765	530	236	81	0	chr3	23675589	23675750	-135924033	+	MTD-int	LTR	MaLR	1081	1254	-4	2
765	636	302	226	21	chr3	23675760	23676003	-135923780	+	MTD	LTR	MaLR	5	297	-122	2
765	429	315	65	139	chr3	23678320	23678707	-135921076	+	ORR1D1	LTR	MaLR	17	374	0	2
765	1647	211	92	32	chr3	23681173	23681253	-135918530	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	382	2
765	1647	211	92	32	chr3	23681289	23681643	-135918140	-	RMER6B	LTR	ERVK	-80	381	3	2
765	782	144	0	193	chr3	23681646	23681895	-135917888	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1196	7763	7563	2
765	335	145	0	0	chr3	23681895	23681957	-135917826	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7006	7067	-1892	2
765	1022	164	5	65	chr3	23682121	23682177	-135917606	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7049	7105	-1854	2
765	1022	164	5	65	chr3	23682208	23682366	-135917417	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7106	7250	-1709	2
765	1742	188	11	59	chr3	23682423	23682632	-135917151	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2160	6799	6606	2
765	1742	188	11	59	chr3	23682658	23682890	-135916893	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2354	6605	6379	2
765	620	218	22	48	chr3	23682977	23683249	-135916534	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-3126	5833	5690	2
765	3445	178	32	22	chr3	23683336	23684062	-135915721	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4277	4682	3950	2
765	1162	132	29	0	chr3	23684060	23684265	-135915518	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5217	3742	3532	2
765	4168	193	43	18	chr3	23684294	23685905	-135913878	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5520	3439	1689	2
765	1343	242	63	18	chr3	23686586	23686918	-135912865	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	351	-43	2
765	547	216	7	63	chr3	23687290	23687433	-135912350	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5554	5688	-73	3
765	459	175	8	70	chr3	23687456	23687585	-135912198	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5641	5761	0	3
765	915	283	88	71	chr3	23687585	23688079	-135911704	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	3
765	764	283	84	4	chr3	23691025	23691252	-135908531	-	RMER12	LTR	ERVK	-93	1229	985	3
765	2334	103	20	86	chr3	23691616	23692021	-135907762	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	512	0	3
765	357	279	0	11	chr3	23692044	23692131	-135907652	-	RMER12	LTR	ERVK	-408	914	829	3
765	2471	231	79	24	chr3	23692264	23692969	-135906814	-	RMER12	LTR	ERVK	-578	744	1	3
765	1621	115	144	59	chr3	23693852	23694193	-135905590	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	69	438	-94	3
765	1507	226	46	0	chr3	23694729	23695057	-135904726	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	345	-22	3
765	259	291	47	46	chr3	23704547	23704680	-135895103	+	MTD	LTR	MaLR	19	159	-262	3
765	298	270	78	20	chr3	23704731	23704833	-135894950	+	MTD	LTR	MaLR	311	418	-1	3
765	327	346	68	0	chr3	23714196	23714329	-135885454	+	MLT1H	LTR	MaLR	408	549	0	3
765	238	386	84	32	chr3	23714619	23714868	-135884915	+	MLT1A	LTR	MaLR	91	352	-22	3
765	935	303	32	109	chr3	23715410	23715821	-135883962	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	3
765	507	263	91	100	chr3	23716503	23716755	-135883028	+	RLTR11A	LTR	ERVK	202	456	-72	3
765	507	263	91	100	chr3	23716798	23716875	-135882908	+	RLTR11A	LTR	ERVK	457	528	0	3
765	501	309	33	13	chr3	23716875	23717023	-135882760	-	MTEa	LTR	MaLR	-228	151	1	3
765	268	281	57	19	chr3	23717111	23717216	-135882567	-	MTD	LTR	MaLR	-18	403	295	3
765	642	293	20	39	chr3	23717218	23717411	-135882372	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	222	-137	3
765	556	323	134	34	chr3	23717471	23717598	-135882185	+	ORR1D1	LTR	MaLR	223	353	-6	3
765	1327	228	32	11	chr3	23717598	23717882	-135881901	-	MTD	LTR	MaLR	-129	290	1	3
765	602	354	71	46	chr3	23722642	23723119	-135876664	+	MER34	LTR	ERV1	53	541	-1	3
766	2580	239	83	59	chr3	23725917	23726949	-135872834	+	RMER12B	LTR	ERVK	1	988	-334	3
766	721	293	79	105	chr3	23727103	23727650	-135872133	+	RLTR21	LTR	ERVK	745	1568	-4	3
766	241	312	53	44	chr3	23731804	23731918	-135867865	+	MLT1A1	LTR	MaLR	287	401	-7	3
766	629	226	22	8	chr3	23732232	23732366	-135867417	-	RMER5	LTR	ERV1	-30	504	369	3
766	304	271	106	0	chr3	23732396	23732481	-135867302	-	RMER5	LTR	ERV1	-221	313	220	3
766	1812	178	65	70	chr3	23734092	23734479	-135865304	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	385	-9	3
766	4721	216	56	55	chr3	23734485	23735746	-135864037	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	2	1264	-699	3
766	455	328	58	108	chr3	23736912	23737189	-135862594	-	MTD	LTR	MaLR	-149	270	8	3
766	1145	238	103	47	chr3	23752163	23752502	-135847281	+	ORR1D2	LTR	MaLR	11	368	-2	3
766	852	280	24	28	chr3	23756660	23756947	-135842836	-	RLTR40	LTR	ERVK	-9	808	523	3
766	1790	240	44	30	chr3	23763128	23763631	-135836152	-	RLTR40	LTR	ERVK	-307	510	1	3
766	616	362	76	18	chr3	23764620	23764963	-135834820	+	MLT1A0	LTR	MaLR	3	365	0	3
766	466	208	18	36	chr3	23773225	23773335	-135826448	-	MTE2b	LTR	MaLR	-72	307	200	4
766	671	269	12	133	chr3	23775886	23776126	-135823657	-	MTE2b	LTR	MaLR	-168	211	1	4
766	1336	233	65	3	chr3	23784451	23784744	-135815039	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	311	-56	4
766	3698	135	145	17	chr3	23786251	23786636	-135813147	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	476	-333	4
766	3698	135	145	17	chr3	23786772	23787103	-135812680	+	RMER17D2	LTR	ERVK	477	809	0	4
766	1638	186	53	0	chr3	23788745	23789084	-135810699	-	RLTR15	LTR	ERVK	-2	357	1	4
766	2613	105	36	10	chr3	23792735	23793119	-135806664	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	394	-2	4
766	3298	41	5	0	chr3	23803970	23804364	-135795419	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
766	3006	170	61	38	chr3	23805042	23805698	-135794085	+	RLTR25A	LTR	ERVK	320	990	-113	4
766	368	260	43	58	chr3	23806077	23806216	-135793567	+	MER67C	LTR	ERV1	148	284	-427	4
766	2477	96	137	35	chr3	23810603	23811034	-135788749	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
766	4798	59	5	37	chr3	23811044	23811693	-135788090	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	35	662	-5819	4
766	442	66	0	32	chr3	23811693	23811756	-135788027	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1419	-5062	4
766	1813	119	4	4	chr3	23811745	23812007	-135787776	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2236	2497	-5183	4
766	919	81	24	0	chr3	23812004	23812127	-135787656	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4785	4910	-2770	4
766	26419	12	3	0	chr3	23812127	23815076	-135784707	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3525	6481	0	4
766	2448	96	140	33	chr3	23815076	23815505	-135784278	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
766	4649	92	137	36	chr3	23826129	23826933	-135772850	-	RMER17D	LTR	ERVK	-4	885	1	4
766	354	264	72	48	chr3	23831585	23831752	-135768031	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	171	-188	4
766	344	283	62	80	chr3	23831721	23832009	-135767774	+	RLTR15	LTR	ERVK	72	354	-5	4
766	5027	112	30	41	chr3	23837783	23838680	-135761103	-	RMER17D	LTR	ERVK	-2	887	1	4
766	648	263	185	56	chr3	23841518	23841788	-135757995	+	MTE2b	LTR	MaLR	12	316	-63	4
767	2466	165	64	69	chr3	23862165	23862743	-135737040	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	5
767	1089	260	35	32	chr3	23862931	23863304	-135736479	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
767	3055	68	5	0	chr3	23870933	23871327	-135728456	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
767	339	323	40	35	chr3	23871843	23872016	-135727767	+	MLT1B	LTR	MaLR	209	382	-8	5
767	263	247	82	0	chr3	23874577	23874650	-135725133	+	MTEb	LTR	MaLR	1	79	-300	5
767	645	273	25	15	chr3	23874812	23875013	-135724770	+	MTEb	LTR	MaLR	177	379	0	5
767	4266	138	41	35	chr3	23879850	23880314	-135719469	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	469	-340	5
767	4266	138	41	35	chr3	23880484	23880822	-135718961	+	RMER17D2	LTR	ERVK	470	808	-1	5
767	236	310	67	22	chr3	23885549	23885638	-135714145	+	ORR1E	LTR	MaLR	267	359	0	5
767	483	173	194	30	chr3	23886216	23886412	-135713371	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	4	237	-291	5
767	508	168	134	64	chr3	23902874	23903046	-135696737	+	MTC-int	LTR	MaLR	1069	1252	-6	5
767	1884	187	77	13	chr3	23903056	23903435	-135696348	+	MTC	LTR	MaLR	11	413	-8	5
767	2916	178	32	34	chr3	23930186	23930807	-135668976	+	RLTR26	LTR	ERVK	23	642	0	6
767	937	252	64	17	chr3	23931692	23931926	-135667857	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-10	567	323	6
767	232	188	0	0	chr3	23931926	23931974	-135667809	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-527	50	3	6
767	3771	9	43	0	chr3	23940631	23941389	-135658394	+	MERVL-int	LTR	ERVL	295	1085	-4400	6
767	2347	7	4	0	chr3	23941389	23941664	-135658119	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	-214	279	4	6
767	691	259	120	48	chr3	23943061	23943415	-135656368	+	MTD	LTR	MaLR	6	406	-13	6
767	235	211	19	0	chr3	23947081	23947133	-135652650	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	327	6
767	634	284	52	90	chr3	23947145	23947489	-135652294	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	331	-285	6
767	628	320	39	22	chr3	23947506	23947813	-135651970	+	RLTR18B	LTR	ERVK	177	591	-25	6
767	415	295	179	51	chr3	23947830	23948116	-135651667	-	MTE2b	LTR	MaLR	-39	340	17	6
767	3019	67	13	5	chr3	23948116	23948509	-135651274	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
767	260	299	88	61	chr3	23948509	23948521	-135651262	-	MTE2b	LTR	MaLR	-363	16	5	6
767	248	257	18	90	chr3	23954254	23954365	-135645418	-	ORR1E	LTR	MaLR	-15	364	262	6
767	277	339	87	46	chr3	23954415	23954588	-135645195	-	ORR1E	LTR	MaLR	-179	180	1	6
767	297	176	158	26	chr3	23964443	23964519	-135635264	+	RLTR25B	LTR	ERVK	424	509	-519	6
767	1899	189	38	3	chr3	23967550	23967916	-135631867	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	379	0	6
767	252	294	47	12	chr3	23968639	23968725	-135631058	+	MLT2B4	LTR	ERVL	163	251	-305	6
767	277	316	43	68	chr3	23968860	23969023	-135630760	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-165	200	42	6
767	575	187	149	55	chr3	23976012	23976193	-135623590	+	RLTR26	LTR	ERVK	266	463	-179	6
767	1747	203	98	8	chr3	23977519	23977896	-135621887	-	MTC	LTR	MaLR	-10	411	1	6
767	440	239	228	1	chr3	23978139	23978312	-135621471	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	208	6
767	2596	120	43	15	chr3	23978722	23979120	-135620663	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	6
768	302	193	30	0	chr3	23987633	23987703	-135612080	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	290	6
768	709	293	108	30	chr3	23993877	23994173	-135605610	-	MTEa	LTR	MaLR	-59	320	2	6
768	233	241	0	17	chr3	23999618	23999677	-135600106	+	MER92C	LTR	ERV1	486	543	-11	7
768	852	288	83	54	chr3	24005706	24006245	-135593538	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	578	0	1
768	375	200	27	0	chr3	24011377	24011452	-135588331	+	MTE2a	LTR	MaLR	294	370	-9	1
768	598	301	102	116	chr3	24013309	24013644	-135586139	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	330	-49	2
768	250	253	161	0	chr3	24013875	24013962	-135585821	+	RMER10A	LTR	ERVL	322	422	-20	2
768	763	350	25	70	chr3	24015497	24015896	-135583887	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	8	2
768	503	340	192	6	chr3	24016009	24016163	-135583620	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	224	2
768	503	340	192	6	chr3	24016189	24016351	-135583432	-	MTEb	LTR	MaLR	-156	223	3	2
768	1120	270	37	56	chr3	24016970	24017346	-135582437	-	RMER13B	LTR	ERVK	-9	899	531	2
768	241	98	0	68	chr3	24020570	24020614	-135579169	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-64	425	385	3
768	736	295	50	9	chr3	24020776	24020995	-135578788	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	230	-149	3
768	660	361	47	33	chr3	24021172	24021536	-135578247	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-66	490	122	3
768	391	325	227	27	chr3	24022574	24022879	-135576904	+	MLT1K	LTR	MaLR	229	594	-1	3
768	501	306	7	30	chr3	24025589	24025775	-135574008	-	MLT1B	LTR	MaLR	-199	175	1	4
768	1184	218	60	121	chr3	24026217	24026544	-135573239	+	ORR1A4	LTR	MaLR	47	355	-39	4
768	1184	218	60	121	chr3	24026721	24026757	-135573026	+	ORR1A4	LTR	MaLR	356	388	-6	4
768	3143	184	41	30	chr3	24026762	24027399	-135572384	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	644	-1319	4
768	4573	193	43	38	chr3	24027766	24029193	-135570590	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	647	1792	0	4
768	1725	201	3	9	chr3	24029193	24029524	-135570259	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
768	3258	175	3	7	chr3	24033646	24034215	-135565568	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1031	1597	-366	5
768	567	271	33	42	chr3	24039373	24039674	-135560109	+	MTEb	LTR	MaLR	1	377	-2	6
768	1406	282	33	83	chr3	24045004	24045488	-135554295	+	RLTR18	LTR	ERVK	153	612	-4	7
768	1322	205	261	41	chr3	24049159	24049626	-135550157	-	RMER6C	LTR	ERVK	-120	570	1	8
768	304	119	0	0	chr3	24049976	24050018	-135549765	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-331	78	37	8
768	1556	169	72	19	chr3	24050013	24050332	-135549451	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-73	336	1	9
768	517	68	0	40	chr3	24050334	24050410	-135549373	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3	7403	7331	9
768	1569	181	107	9	chr3	24050410	24050831	-135548952	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-363	539	51	9
768	310	358	83	28	chr3	24053361	24053542	-135546241	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-13	352	162	9
768	1657	242	24	5	chr3	24064307	24064718	-135535065	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
768	1152	236	48	150	chr3	24065995	24066408	-135533375	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	1	1
768	2363	153	23	2	chr3	24080434	24080828	-135518955	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	159	560	-1403	1
768	2768	83	3	0	chr3	24080842	24081215	-135518568	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	23	396	0	1
768	557	180	0	133	chr3	24081215	24081336	-135518447	+	MT2B	LTR	ERVL	184	287	-314	1
768	7105	153	14	7	chr3	24081295	24082532	-135517251	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	718	1963	0	1
768	2117	138	16	0	chr3	24082532	24082850	-135516933	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	323	-4	1
768	3429	208	57	19	chr3	24083866	24084645	-135515138	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	808	-100	1
768	2072	206	75	34	chr3	24098780	24099286	-135500497	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	1
769	2931	183	14	23	chr3	24123517	24124076	-135475707	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	21	574	-3	1
769	945	321	40	74	chr3	24124332	24124712	-135475071	+	MTEa	LTR	MaLR	1	367	-12	1
769	355	285	15	75	chr3	24130750	24130883	-135468900	-	RMER20B	LTR	ERVK	-502	125	1	1
769	3074	79	27	107	chr3	24131186	24131710	-135468073	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
769	4296	72	109	16	chr3	24131710	24132343	-135467440	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1	692	-6552	1
769	1132	51	0	0	chr3	24132641	24132779	-135467004	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	681	818	-6426	1
769	269	275	11	11	chr3	24133171	24133263	-135466520	+	MMTV-int	LTR	ERVK	2413	2504	-4749	1
769	11818	40	40	7	chr3	24133556	24135387	-135464396	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1322	3212	-4032	1
769	4005	77	33	30	chr3	24135357	24135962	-135463821	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3380	3986	-3258	1
769	8161	45	2	7	chr3	24135955	24136968	-135462815	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5065	6072	-1172	1
769	2053	97	10	3	chr3	24136990	24137290	-135462493	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	207	508	-385	1
769	7171	49	0	6	chr3	24137290	24138153	-135461630	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6333	7190	-54	1
769	490	32	0	0	chr3	24144601	24144663	-135455120	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	7183	7244	0	1
769	3002	88	27	107	chr3	24144663	24145187	-135454596	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
769	491	325	48	111	chr3	24146123	24146200	-135453583	+	MT2A	LTR	ERVL	2	82	-451	1
769	491	325	49	106	chr3	24146237	24146658	-135453125	+	MT2A	LTR	ERVL	83	535	-49	1
769	359	326	68	20	chr3	24146687	24146729	-135453054	+	MT2A	LTR	ERVL	536	584	0	1
769	1050	331	38	32	chr3	24147612	24148142	-135451641	+	MER67C	LTR	ERV1	179	711	0	2
769	536	353	25	69	chr3	24148963	24149240	-135450543	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	109	2
769	983	304	25	41	chr3	24150261	24150628	-135449155	+	MTE2b	LTR	MaLR	7	367	-12	2
769	530	194	32	115	chr3	24151844	24152001	-135447782	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	203	2
769	428	252	44	53	chr3	24155190	24155303	-135444480	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	119	-311	2
769	686	324	60	54	chr3	24155362	24155695	-135444088	+	RLTR23	LTR	ERV1	93	427	-3	2
769	593	343	0	24	chr3	24170096	24170266	-135429517	-	MTEa	LTR	MaLR	-212	167	2	2
769	1720	201	16	91	chr3	24172938	24173346	-135426437	+	ORR1B1	LTR	MaLR	18	392	-2	2
769	6176	212	28	53	chr3	24173348	24174898	-135424885	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1511	-452	2
769	454	192	20	10	chr3	24174896	24174996	-135424787	+	ORR1B1	LTR	MaLR	267	367	0	2
769	370	407	26	17	chr3	24179626	24179856	-135419927	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-279	281	50	2
769	269	333	48	0	chr3	24187701	24187785	-135411998	+	LTR40a	LTR	ERVL	58	145	-374	2
769	893	260	148	43	chr3	24187828	24188266	-135411517	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	20	503	-57	2
769	957	323	8	0	chr3	24195717	24195977	-135403806	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	264	-115	2
769	1969	239	15	114	chr3	24196417	24197093	-135402690	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	609	-2	2
769	484	216	21	0	chr3	24198001	24198098	-135401685	+	MTE2b	LTR	MaLR	286	384	0	2
769	2989	167	104	34	chr3	24199465	24200090	-135399693	+	RLTR17	LTR	ERVK	3	677	-15	2
769	2989	167	104	34	chr3	24200122	24200140	-135399643	+	RLTR17	LTR	ERVK	678	691	-1	2
769	1159	198	120	43	chr3	24203653	24204027	-135395756	-	RMER6B	LTR	ERVK	-58	403	1	2
769	256	290	43	0	chr3	24216617	24216710	-135383073	+	LTR52	LTR	ERVL	1	97	-324	2
769	516	227	124	75	chr3	24216767	24216953	-135382830	+	ORR1B1	LTR	MaLR	200	394	0	2
769	237	359	73	32	chr3	24217294	24217513	-135382270	+	MLT1C	LTR	MaLR	216	443	-24	2
769	330	337	48	19	chr3	24222727	24222933	-135376850	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	177	3
769	371	291	62	158	chr3	24225992	24226315	-135373468	-	RMER20B	LTR	ERVK	-114	513	222	3
769	1411	252	67	18	chr3	24234415	24234803	-135364980	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	11	3
769	324	187	26	13	chr3	24235967	24236043	-135363740	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	343	3
769	2044	125	78	16	chr3	24237167	24237590	-135362193	+	RLTR44D	LTR	ERVK	1	438	-14	3
769	1290	267	23	34	chr3	24237938	24238287	-135361496	+	MTD	LTR	MaLR	46	390	-29	3
769	272	250	12	0	chr3	24240166	24240246	-135359537	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	299	3
769	2203	196	93	57	chr3	24240250	24240718	-135359065	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	491	-87	3
769	2203	196	93	57	chr3	24240771	24240848	-135358935	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	492	566	-12	3
769	917	308	20	8	chr3	24240859	24241114	-135358669	-	MTE2b	LTR	MaLR	-121	258	1	3
769	300	312	84	35	chr3	24242608	24242751	-135357032	+	MLT1B	LTR	MaLR	17	166	-224	3
769	1084	281	16	22	chr3	24245047	24245360	-135354423	+	MTD	LTR	MaLR	12	322	-97	3
770	265	230	101	22	chr3	24254035	24254124	-135345659	+	MTE2b	LTR	MaLR	171	266	-113	3
770	230	146	24	0	chr3	24254117	24254158	-135345625	+	MTE2a	LTR	MaLR	214	255	-124	3
770	236	186	0	0	chr3	24254153	24254196	-135345587	+	MTE2a	LTR	MaLR	213	255	-124	3
770	412	151	27	0	chr3	24258077	24258150	-135341633	-	RMER17B	LTR	ERVK	-1	957	883	3
770	2988	76	2	2	chr3	24258533	24258929	-135340854	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
770	429	310	44	33	chr3	24260365	24260555	-135339228	+	MTEa	LTR	MaLR	164	379	0	3
770	4776	140	8	24	chr3	24261524	24262329	-135337454	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	792	-14	3
770	233	242	94	105	chr3	24262513	24262684	-135337099	+	LTR73	LTR	ERV1	137	305	-267	3
770	366	349	34	0	chr3	24262602	24262751	-135337032	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-13	352	199	3
770	2671	207	47	23	chr3	24296831	24297390	-135302393	-	RMER4B	LTR	ERVK	-13	572	1	4
770	4398	16	0	0	chr3	24298117	24298610	-135301173	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
770	40645	15	14	0	chr3	24298610	24303908	-135295875	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5371	-114	4
770	363	151	13	40	chr3	24303908	24303984	-135295799	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	4
770	314	0	0	0	chr3	24303984	24304022	-135295761	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	4
770	4398	16	0	0	chr3	24304022	24304515	-135295268	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
770	903	259	167	86	chr3	24309230	24309787	-135289996	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	602	-25	4
770	255	292	58	85	chr3	24311537	24311599	-135288184	-	MT2B	LTR	ERVL	-424	160	104	4
770	2149	102	52	26	chr3	24312581	24312925	-135286858	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	55	4
770	315	390	32	23	chr3	24314586	24314804	-135284979	-	MTE2a	LTR	MaLR	-158	221	2	4
770	234	217	72	65	chr3	24315605	24315743	-135284040	-	RLTR40	LTR	ERVK	-118	699	561	4
770	332	336	13	14	chr3	24317540	24317692	-135282091	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	239	4
770	238	260	60	40	chr3	24318899	24318999	-135280784	-	MamGypLTR1a	LTR	Gypsy	-635	149	48	4
770	676	297	99	43	chr3	24320573	24320784	-135278999	+	MTE2a	LTR	MaLR	56	278	-101	4
770	2732	71	13	38	chr3	24326808	24326904	-135272879	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	100	-285	4
770	2732	71	13	38	chr3	24327586	24327884	-135271899	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	101	385	0	4
770	399	382	64	27	chr3	24333574	24333902	-135265881	+	ORR1D2	LTR	MaLR	19	358	-12	4
770	667	335	76	27	chr3	24334052	24334380	-135265403	+	MLT1A0	LTR	MaLR	22	365	0	4
770	230	358	47	47	chr3	24353133	24353303	-135246480	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-388	1460	1291	5
770	2728	110	2	2	chr3	24361576	24361976	-135237807	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
770	1726	144	132	3	chr3	24365724	24366064	-135233719	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
770	558	346	130	32	chr3	24367012	24367382	-135232401	+	MER21B	LTR	ERV1	409	814	-49	5
770	1757	204	99	5	chr3	24371423	24371808	-135227975	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
770	3749	221	151	22	chr3	24371808	24372917	-135226866	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	1255	-3	5
770	1933	201	56	10	chr3	24372920	24373316	-135226467	+	MTC	LTR	MaLR	1	414	-7	5
770	2894	229	66	73	chr3	24373762	24374671	-135225112	-	RMER13B	LTR	ERVK	-1	907	5	5
770	784	227	45	4	chr3	24377749	24377945	-135221838	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-419	197	1	5
771	1495	270	32	37	chr3	24379457	24379918	-135219865	+	RLTR16	LTR	ERVK	4	462	-43	5
771	1614	222	13	34	chr3	24380599	24380981	-135218802	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	374	-4	5
771	391	286	98	0	chr3	24384883	24385016	-135214767	+	MLT1D	LTR	MaLR	10	155	-350	5
771	1032	249	66	107	chr3	24388497	24388938	-135210845	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	430	0	5
771	812	295	132	29	chr3	24393420	24393762	-135206021	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	5
771	971	228	5	0	chr3	24404391	24404580	-135195203	+	RMER19C	LTR	ERVK	422	611	0	6
771	840	314	90	11	chr3	24406498	24406775	-135193008	+	MTD	LTR	MaLR	61	359	-60	6
771	238	298	73	101	chr3	24408136	24408315	-135191468	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-189	181	8	6
771	310	219	0	0	chr3	24409757	24409821	-135189962	+	MTC	LTR	MaLR	10	73	-348	6
771	357	260	55	80	chr3	24410148	24410311	-135189472	+	MTC	LTR	MaLR	71	229	-192	6
771	905	214	36	10	chr3	24412206	24412400	-135187383	+	MTC	LTR	MaLR	223	421	0	6
771	1784	209	18	52	chr3	24425989	24426373	-135173410	+	ORR1C1	LTR	MaLR	8	378	0	6
771	237	297	96	35	chr3	24430264	24430379	-135169404	-	RMER13A	LTR	ERVK	-399	461	340	6
771	251	344	60	42	chr3	24435651	24435818	-135163965	+	LTR40b	LTR	ERVL	53	222	-297	6
771	427	287	67	6	chr3	24436603	24436767	-135163016	+	LTR40b	LTR	ERVL	329	517	-2	6
771	234	266	49	37	chr3	24445053	24445135	-135154648	+	RMER15	LTR	ERVL	403	485	-90	6
771	343	290	75	22	chr3	24445770	24445904	-135153879	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1117	141	1	6
771	489	268	10	12	chr3	24445904	24446037	-135153746	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	248	6
771	341	290	10	61	chr3	24446100	24446199	-135153584	-	MTC	LTR	MaLR	-120	301	208	6
771	349	259	99	18	chr3	24446428	24446610	-135153173	-	MTC	LTR	MaLR	-192	229	12	6
771	232	312	121	48	chr3	24448166	24448331	-135151452	+	LTR33A	LTR	ERVL	18	194	-326	6
771	2881	188	41	11	chr3	24451425	24451980	-135147803	+	RMER19A	LTR	ERVK	135	706	-31	6
771	2734	176	19	39	chr3	24454813	24455385	-135144398	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	6
771	520	281	49	88	chr3	24456132	24456358	-135143425	+	ORR1E	LTR	MaLR	143	359	0	6
771	965	293	111	23	chr3	24458958	24459311	-135140472	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	22	6
771	559	299	16	0	chr3	24461739	24461866	-135137917	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7074	7202	-204	6
771	320	306	25	13	chr3	24462418	24462577	-135137206	+	RMER16-int	LTR	ERVK	169	329	-6915	6
771	1924	171	157	24	chr3	24462831	24463323	-135136460	+	RMER16-int	LTR	ERVK	263	819	-4587	6
771	494	154	133	9	chr3	24463328	24463433	-135136350	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1089	1206	-4200	6
771	1027	254	70	21	chr3	24463450	24463736	-135136047	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2454	2753	-4653	6
771	5820	164	54	117	chr3	24463771	24465292	-135134491	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	4296	5712	-1532	7
771	5820	174	65	89	chr3	24465483	24465896	-135133887	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5713	5907	-1337	7
771	879	275	15	12	chr3	24465885	24466240	-135133543	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	7506	7826	-391	7
771	4258	174	27	14	chr3	24466267	24466653	-135133130	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6493	6876	-530	7
771	4258	174	27	14	chr3	24466809	24467123	-135132660	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6877	7202	-204	7
771	266	188	0	0	chr3	24475347	24475395	-135124388	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	48	-493	7
771	524	230	85	14	chr3	24475398	24475539	-135124244	+	RLTR20C	LTR	ERVK	384	534	0	7
771	1434	258	74	18	chr3	24487876	24488267	-135111516	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	7
771	3401	20	5	0	chr3	24506621	24507015	-135092768	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
772	276	385	48	27	chr3	24542403	24542550	-135057233	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	239	4
772	336	282	0	0	chr3	24568901	24568986	-135030797	+	MTEa	LTR	MaLR	1	85	-294	7
772	878	244	113	42	chr3	24569238	24569521	-135030262	+	MTEa	LTR	MaLR	75	377	-2	7
772	507	361	50	13	chr3	24573077	24573345	-135026438	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-8	672	396	7
772	309	266	59	50	chr3	24581384	24581499	-135018284	+	MTEa	LTR	MaLR	18	133	-246	9
772	1365	224	114	0	chr3	24581499	24581548	-135018235	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	334	9
772	1365	224	114	0	chr3	24582076	24582369	-135017414	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-51	333	5	9
772	3418	25	2	0	chr3	24585101	24585496	-135014287	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
772	228	244	191	34	chr3	24589202	24589291	-135010492	+	MLT1F	LTR	MaLR	189	291	-257	1
772	820	286	74	78	chr3	24591606	24592106	-135007677	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	498	-30	1
772	559	281	82	58	chr3	24600404	24600835	-134998948	-	MT2B	LTR	ERVL	0	493	13	1
772	2149	161	40	0	chr3	24601656	24602035	-134997748	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
772	3147	9	0	0	chr3	24602864	24603210	-134996573	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	1
772	688	260	140	84	chr3	24606227	24606655	-134993128	-	RMER13A	LTR	ERVK	-408	452	1	1
772	420	320	132	66	chr3	24607762	24608080	-134991703	+	MLT1A0	LTR	MaLR	14	352	-13	1
772	1411	253	220	14	chr3	24608596	24609014	-134990769	+	RMER5	LTR	ERV1	15	518	-16	1
772	1668	44	0	0	chr3	24624272	24624478	-134975305	+	ORR1A1	LTR	MaLR	141	346	0	1
772	12860	64	31	3	chr3	24624478	24626221	-134973562	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	1792	0	1
772	2259	39	18	0	chr3	24626221	24626507	-134973276	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	291	-55	1
772	860	286	36	52	chr3	24629715	24630099	-134969684	+	MTEb	LTR	MaLR	2	379	0	1
772	457	294	130	100	chr3	24630147	24630854	-134968929	-	RMER13A	LTR	ERVK	-103	757	30	1
772	250	362	107	30	chr3	24630911	24631079	-134968704	+	MLT1H	LTR	MaLR	13	193	-356	1
772	1063	234	150	51	chr3	24633885	24634218	-134965565	+	ORR1D1	LTR	MaLR	9	374	0	1
772	6852	171	95	39	chr3	24635419	24636457	-134963326	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1126	-446	1
772	6852	171	95	39	chr3	24636517	24636562	-134963221	+	RLTR21	LTR	ERVK	1127	1169	-403	1
772	6852	171	95	39	chr3	24636635	24637039	-134962744	+	RLTR21	LTR	ERVK	1170	1571	-1	1
772	1781	163	10	3	chr3	24640458	24640760	-134959023	+	MT2B	LTR	ERVL	298	601	0	1
773	1901	163	6	0	chr3	24645186	24645511	-134954272	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
773	1382	262	78	10	chr3	24647988	24648373	-134951410	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	1
773	379	351	40	50	chr3	24654511	24654814	-134944969	+	MLT1C	LTR	MaLR	168	467	0	2
773	2659	124	2	17	chr3	24662538	24662947	-134936836	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-4	403	1	2
773	240	290	21	11	chr3	24679345	24679439	-134920344	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	302	2
773	249	311	147	13	chr3	24679469	24679619	-134920164	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-196	212	43	2
773	529	306	99	111	chr3	24704225	24704740	-134895043	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	10	518	-9	2
773	393	282	32	16	chr3	24708515	24708641	-134891142	+	MLT2B2	LTR	ERVL	434	561	-1	2
773	3608	22	57	13	chr3	24709042	24709497	-134890286	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
773	2576	197	29	31	chr3	24721348	24721797	-134877986	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	452	-75	2
773	2576	197	29	31	chr3	24721943	24722012	-134877771	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	453	518	-9	2
773	402	303	136	5	chr3	24730742	24730941	-134868842	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	142	3
773	258	310	35	0	chr3	24736051	24736138	-134863645	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-274	91	2	3
773	1067	257	65	49	chr3	24739005	24739373	-134860410	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
773	1783	265	19	102	chr3	24739882	24740420	-134859363	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-5	507	15	3
773	2122	204	30	2	chr3	24749030	24749427	-134850356	+	MTC	LTR	MaLR	14	421	0	3
773	1139	221	115	107	chr3	24751840	24752128	-134847655	+	ORR1C1	LTR	MaLR	11	332	-46	3
773	1139	221	115	107	chr3	24752270	24752346	-134847437	+	ORR1C1	LTR	MaLR	333	378	0	3
773	463	313	23	107	chr3	24763031	24763419	-134836364	+	MTD	LTR	MaLR	68	404	-17	3
774	456	316	62	98	chr3	24778497	24779128	-134820655	-	RLTR18	LTR	ERVK	-4	612	5	3
774	1006	271	41	37	chr3	24779299	24779594	-134820189	+	ORR1D2	LTR	MaLR	75	370	0	3
774	1684	192	35	13	chr3	24783514	24783825	-134815958	+	RLTR41	LTR	ERV1	129	446	0	3
774	428	274	95	7	chr3	24783825	24783946	-134815837	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-330	182	49	3
774	691	312	21	32	chr3	24794502	24794830	-134804953	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	3
774	323	329	54	30	chr3	24796909	24797075	-134802708	-	RLTR21	LTR	ERVK	-319	1253	1084	3
774	1028	308	67	16	chr3	24801824	24802207	-134797576	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	17	4
774	1834	210	49	0	chr3	24803289	24803655	-134796128	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	4
774	2512	222	105	18	chr3	24809502	24810180	-134789603	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	4
774	840	232	5	25	chr3	24812986	24813189	-134786594	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	199	-195	4
774	508	278	82	12	chr3	24815527	24815698	-134784085	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-436	188	6	4
774	3316	35	5	0	chr3	24817139	24817533	-134782250	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
774	3168	233	29	97	chr3	24818885	24819855	-134779928	+	RMER13B	LTR	ERVK	5	908	0	4
774	339	330	0	0	chr3	24820922	24821010	-134778773	+	MTEa	LTR	MaLR	15	102	-277	4
774	2073	212	89	91	chr3	24831517	24832102	-134767681	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	584	-27	4
774	757	240	114	34	chr3	24839576	24839813	-134759970	+	MTD	LTR	MaLR	20	275	-144	4
774	865	277	131	45	chr3	24840319	24840701	-134759082	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	4
774	1006	225	182	78	chr3	24841952	24842376	-134757407	+	RMER21B	LTR	ERV1	1	468	-374	4
774	686	330	45	110	chr3	24843390	24843771	-134756012	-	MTE2b	LTR	MaLR	-12	367	12	4
774	1001	293	49	46	chr3	24857501	24857870	-134741913	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
774	998	298	87	18	chr3	24868191	24868581	-134731202	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	4
774	939	246	121	26	chr3	24878737	24879051	-134720732	+	MTD	LTR	MaLR	77	406	-13	5
774	3941	158	38	50	chr3	24895395	24896018	-134703765	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	610	-198	5
774	3941	158	38	50	chr3	24896230	24896424	-134703359	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	611	808	0	5
774	257	164	62	62	chr3	24898807	24898872	-134700911	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-1781	5138	5074	5
774	3037	113	8	39	chr3	24899605	24900094	-134699689	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	474	-334	5
774	2287	109	84	100	chr3	24902055	24902545	-134697238	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	5
775	4035	106	35	25	chr3	24905260	24906345	-134693438	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-14	792	1	5
775	1728	157	28	101	chr3	24906773	24907128	-134692655	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	5
775	365	306	0	0	chr3	24920007	24920121	-134679662	+	MER68	LTR	ERVL	197	354	-253	5
775	2934	179	95	25	chr3	24926895	24927495	-134672288	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	5
775	236	282	112	45	chr3	24939501	24939590	-134660193	+	MTE2a	LTR	MaLR	17	111	-268	5
775	801	249	86	18	chr3	24939605	24939826	-134659957	+	MTE2a	LTR	MaLR	143	378	-1	5
775	2291	210	52	10	chr3	24940850	24941351	-134658432	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	522	-6	5
775	358	358	58	37	chr3	24958670	24958911	-134640872	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	246	-119	5
775	1277	244	150	3	chr3	24960036	24960369	-134639414	-	MTD	LTR	MaLR	-37	382	1	5
775	282	240	118	13	chr3	24960708	24960784	-134638999	+	MER34	LTR	ERV1	375	458	-84	5
775	1330	271	57	10	chr3	24980177	24980579	-134619204	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
775	252	305	187	41	chr3	24988125	24988248	-134611535	-	MLT1A	LTR	MaLR	-11	363	223	6
775	2490	77	77	0	chr3	24988417	24988781	-134611002	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-3	393	2	6
775	658	212	20	183	chr3	24989639	24989841	-134609942	+	ORR1C2	LTR	MaLR	216	384	0	6
775	3069	61	8	2	chr3	24996791	24997185	-134602598	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
775	245	218	8	151	chr3	24998426	24998545	-134601238	+	MT2B	LTR	ERVL	163	264	-337	6
775	2149	186	65	23	chr3	24998735	24998826	-134600957	-	RLTR16	LTR	ERVK	-2	503	413	6
775	2149	186	65	23	chr3	24998853	24999239	-134600544	-	RLTR16	LTR	ERVK	-93	412	6	6
775	415	374	52	69	chr3	25010750	25011169	-134588614	+	MTE-int	LTR	MaLR	91	502	-1078	1
775	381	359	12	36	chr3	25011475	25011640	-134588143	+	MTE-int	LTR	MaLR	1367	1527	-53	1
775	272	352	130	37	chr3	25022846	25023008	-134576775	+	MLT1J	LTR	MaLR	1	177	-335	2
775	3891	150	75	45	chr3	25023960	25024834	-134574949	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-5	901	1	2
775	462	280	102	53	chr3	25026941	25027186	-134572597	+	RMER2	LTR	ERV1	290	546	-21	2
775	2814	31	131	0	chr3	25028195	25028545	-134571238	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
776	301	270	136	29	chr3	25036273	25036376	-134563407	+	RMER2	LTR	ERV1	346	459	-108	4
776	3523	5	8	0	chr3	25036988	25037381	-134562402	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
776	9269	24	8	1	chr3	25037381	25038471	-134561312	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
776	3510	8	8	0	chr3	25038471	25038864	-134560919	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
776	2067	155	146	48	chr3	25045445	25045905	-134553878	+	RLTR28	LTR	ERVL	20	524	0	5
776	321	380	94	29	chr3	25047191	25047362	-134552421	+	MER21B	LTR	ERV1	498	679	-184	5
776	1532	165	73	88	chr3	25048159	25048558	-134551225	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	5
776	320	218	28	56	chr3	25048559	25048666	-134551117	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	104	-4740	5
776	3659	186	49	86	chr3	25048701	25049804	-134549979	+	MMETn-int	LTR	ERVK	108	1169	-3675	5
776	2400	184	28	6	chr3	25049831	25050328	-134549455	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2496	3003	-4403	5
776	655	151	13	10	chr3	25050328	25050443	-134549340	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	502	603	-203	6
776	3793	185	47	42	chr3	25051001	25053010	-134546773	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2356	4085	-3321	5
776	436	123	0	0	chr3	25053228	25053301	-134546482	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7333	7405	-1	5
776	1812	171	30	64	chr3	25053301	25053708	-134546075	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	5
776	3518	73	30	2	chr3	25054040	25054509	-134545274	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	6
776	3367	72	66	15	chr3	25054509	25055141	-134544642	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1	692	-6552	6
776	1069	51	0	0	chr3	25055447	25055585	-134544198	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	681	818	-6426	6
776	10914	44	50	7	chr3	25056244	25058022	-134541761	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1358	3212	-4032	6
776	3667	82	39	16	chr3	25057992	25058560	-134541223	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3380	3960	-3284	6
776	7842	45	1	8	chr3	25058558	25059577	-134540206	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5061	6072	-1172	6
776	2032	105	13	7	chr3	25059591	25059898	-134539885	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	200	508	-385	6
776	7419	43	0	3	chr3	25059898	25060813	-134538970	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6333	7244	0	6
776	3539	70	30	2	chr3	25060813	25061282	-134538501	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	6
776	411	298	72	8	chr3	25061991	25062116	-134537667	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	266	6
776	2352	112	25	11	chr3	25062711	25063073	-134536710	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	2	6
776	355	74	0	36	chr3	25063093	25063149	-134536634	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-22	7384	7331	6
776	270	284	33	33	chr3	25063353	25063473	-134536310	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-981	6425	6306	6
776	6192	168	10	21	chr3	25063598	25064780	-134535003	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3331	4075	2872	6
776	6192	201	55	89	chr3	25064817	25066628	-134533155	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3477	3929	1549	6
776	531	326	52	4	chr3	25066701	25066825	-134532958	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1766	1548	1416	6
776	3693	221	82	38	chr3	25066940	25068088	-134531695	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-3869	1537	340	7
776	2274	134	5	8	chr3	25068532	25068901	-134530882	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	7
776	729	229	46	54	chr3	25068905	25069145	-134530638	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	324	7
776	336	148	0	0	chr3	25069606	25069667	-134530116	+	RLTR12A	LTR	ERVK	4	64	-504	7
776	2924	168	10	87	chr3	25069667	25069980	-134529803	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-2	566	256	7
776	2924	168	10	87	chr3	25070053	25070352	-134529431	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-313	255	1	7
776	817	349	147	19	chr3	25070604	25071080	-134528703	+	MLT1F2	LTR	MaLR	24	560	0	7
776	242	358	68	80	chr3	25071279	25071516	-134528267	-	LTR52	LTR	ERVL	-175	246	13	7
776	1082	268	108	20	chr3	25079975	25080280	-134519503	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	88	9
776	790	263	255	21	chr3	25081547	25081873	-134517910	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	6	9
776	243	235	119	36	chr3	25082826	25082910	-134516873	-	LTR33B	LTR	ERVL	-8	495	405	1
776	225	314	27	73	chr3	25083827	25083937	-134515846	+	MamGypLTR2	LTR	Gypsy	56	160	-1029	1
776	288	347	30	61	chr3	25085068	25085200	-134514583	+	LTR33B	LTR	ERVL	138	265	-238	1
776	291	319	0	11	chr3	25085189	25085281	-134514502	+	LTR33B	LTR	ERVL	405	495	-8	1
776	407	220	51	76	chr3	25086882	25087000	-134512783	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	143	1
776	1366	282	32	13	chr3	25098196	25098570	-134501213	-	MTD	LTR	MaLR	-19	400	20	1
776	328	346	33	14	chr3	25099021	25099235	-134500548	+	HERV16-int	LTR	ERVL	2614	2831	-2165	1
776	286	280	80	47	chr3	25100451	25100601	-134499182	+	LTR41	LTR	ERVL	559	713	-55	1
776	295	315	38	45	chr3	25111653	25111786	-134487997	-	MER77	LTR	ERVL	-414	193	62	1
776	598	289	211	7	chr3	25113215	25113504	-134486279	-	MTE2b	LTR	MaLR	-20	359	12	1
776	2455	189	19	15	chr3	25117293	25117815	-134481968	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	1	1
776	356	229	12	12	chr3	25128644	25128728	-134471055	-	RMER12	LTR	ERVK	-472	850	767	1
776	242	356	102	33	chr3	25132830	25133045	-134466738	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	239	-126	1
776	908	192	22	34	chr3	25134106	25134284	-134465499	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-186	181	6	1
776	661	306	75	58	chr3	25138531	25138823	-134460960	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-200	328	32	1
776	3870	205	67	43	chr3	25138830	25139835	-134459948	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-26	8933	7922	1
776	3870	205	67	43	chr3	25139876	25140013	-134459770	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1038	7921	7765	1
776	383	266	85	40	chr3	25140015	25140191	-134459592	-	RMER4A	LTR	ERVK	-27	439	256	1
776	645	243	26	26	chr3	25140227	25140421	-134459362	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1514	5036	4843	1
776	2051	283	50	26	chr3	25140527	25141366	-134458417	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1752	4798	3940	1
776	284	73	0	0	chr3	25141373	25141414	-134458369	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-587	4673	4633	1
776	6433	208	14	40	chr3	25141460	25141602	-134458181	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5136	3823	3691	1
776	6433	208	14	40	chr3	25141784	25141954	-134457829	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5269	3690	3525	1
776	3188	43	10	2	chr3	25141954	25142347	-134457436	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
776	6433	208	14	40	chr3	25142347	25143214	-134456569	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5435	3524	2668	1
776	6433	234	16	37	chr3	25143406	25144307	-134455476	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2041	3219	2100	1
776	543	209	22	36	chr3	25146275	25146414	-134453369	-	RMER10B	LTR	ERVL	-48	350	214	2
776	964	258	122	68	chr3	25146790	25147233	-134452550	-	RMER12	LTR	ERVK	-301	1547	729	2
776	1062	274	77	100	chr3	25147225	25148065	-134451718	-	RMER12	LTR	ERVK	-998	810	1	2
776	1461	223	48	53	chr3	25148509	25148888	-134450895	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	2	2
776	3208	30	26	39	chr3	25149742	25150158	-134449625	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	2
776	2271	45	11	0	chr3	25163265	25163552	-134436231	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	703	992	-995	2
776	415	311	21	17	chr3	25163692	25163931	-134435852	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	822	1061	-5481	2
776	343	140	0	0	chr3	25163988	25164045	-134435738	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	447	503	-6039	2
776	7798	40	6	7	chr3	25164028	25165028	-134434755	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	988	1986	-1	2
776	2670	83	2	79	chr3	25165028	25165448	-134434335	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
777	2019	262	146	80	chr3	25169606	25170843	-134428940	+	RMER12	LTR	ERVK	4	1322	0	2
777	2254	198	91	64	chr3	25171627	25172298	-134427485	-	RMER6C	LTR	ERVK	-1	689	1	2
777	1875	136	86	109	chr3	25174871	25175357	-134424426	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
777	907	123	94	0	chr3	25175358	25175529	-134424254	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	2
777	252	283	0	0	chr3	25175529	25175582	-134424201	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	2
777	3241	97	18	38	chr3	25175582	25176236	-134423547	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	2
777	2475	82	0	3	chr3	25176236	25176579	-134423204	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	2
777	5877	72	12	8	chr3	25176574	25177400	-134422383	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5653	6481	0	2
777	1773	122	75	181	chr3	25177400	25177931	-134421852	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
777	319	243	28	18	chr3	25178111	25178220	-134421563	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3231	3340	-2066	2
777	1969	136	52	0	chr3	25179967	25180275	-134419508	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-2	324	1	2
777	5199	157	70	10	chr3	25181358	25182479	-134417304	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-71	2255	1067	2
777	1218	195	31	86	chr3	25182460	25182785	-134416998	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1364	962	656	2
777	2270	186	11	7	chr3	25182793	25183280	-134416503	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1840	486	5	2
777	282	209	0	110	chr3	25183339	25183457	-134416326	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1626	1216	1112	2
777	1273	240	137	32	chr3	25184597	25185111	-134414672	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	541	1	2
777	1752	154	67	15	chr3	25195843	25196326	-134403457	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-16	552	1	2
777	3107	63	0	10	chr3	25201272	25201672	-134398111	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
777	2125	302	30	54	chr3	25215860	25217066	-134382717	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	3981	5157	-1393	2
777	711	156	11	57	chr3	25217084	25217261	-134382522	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7823	7991	-968	2
777	3119	131	19	14	chr3	25218053	25218571	-134381212	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	506	-1	2
777	793	150	45	7	chr3	25218571	25218725	-134381058	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	16	175	-7381	2
777	250	132	0	0	chr3	25218725	25218763	-134381020	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	103	140	-3159	2
777	1644	197	55	31	chr3	25220360	25220743	-134379040	+	RLTR11A	LTR	ERVK	7	398	-130	2
777	387	371	62	0	chr3	25221516	25221772	-134378011	+	MamGyp-int	LTR	Gypsy	2067	2338	-2724	2
777	240	366	44	52	chr3	25222277	25222548	-134377235	+	MLT1B	LTR	MaLR	67	335	-55	2
777	384	324	113	36	chr3	25222832	25223053	-134376730	+	MLT1A0	LTR	MaLR	125	362	-3	2
777	471	204	11	11	chr3	25223145	25223239	-134376544	-	MTE2a	LTR	MaLR	-6	373	280	2
777	405	297	83	52	chr3	25225621	25225813	-134373970	+	MT2A	LTR	ERVL	228	425	-108	2
777	2596	143	56	31	chr3	25225832	25226316	-134373467	+	RLTR19A	LTR	ERVK	1	496	0	2
777	514	181	47	9	chr3	25230891	25230997	-134368786	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	110	-580	2
777	309	243	14	0	chr3	25230986	25231056	-134368727	+	MT2B	LTR	ERVL	185	255	-346	2
777	759	158	0	0	chr3	25253450	25253570	-134346213	+	MTC	LTR	MaLR	1	120	-301	3
777	2832	58	0	0	chr3	25254251	25254597	-134345186	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
777	1553	182	61	7	chr3	25255327	25255620	-134344163	+	MTC	LTR	MaLR	111	419	-2	3
777	308	330	103	79	chr3	25255670	25255923	-134343860	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	119	3
777	384	277	132	25	chr3	25255918	25256077	-134343706	+	RMER15	LTR	ERVL	254	429	-146	3
777	235	275	43	38	chr3	25256369	25256554	-134343229	-	RLTR21	LTR	ERVK	-318	1254	1069	3
777	892	238	185	131	chr3	25257875	25258296	-134341487	-	MT2A	LTR	ERVL	-89	444	1	3
777	301	262	122	8	chr3	25258297	25258420	-134341363	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4226	4362	-637	3
777	311	180	31	39	chr3	25264859	25264986	-134334797	+	RMER17A	LTR	ERVK	335	460	-291	3
777	282	350	148	33	chr3	25265936	25266119	-134333664	+	MER77	LTR	ERVL	350	553	-54	3
777	1594	201	58	0	chr3	25266260	25266568	-134333215	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	3
777	3014	168	24	13	chr3	25266568	25267122	-134332661	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1	560	-1403	3
777	528	299	40	136	chr3	25269659	25269887	-134329896	-	MTEb	LTR	MaLR	-133	246	41	3
777	250	219	31	15	chr3	25269944	25270009	-134329774	+	MLT1C	LTR	MaLR	59	124	-343	3
777	863	273	164	25	chr3	25270026	25270169	-134329614	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	216	3
777	863	273	164	25	chr3	25270476	25270655	-134329128	-	MTE2b	LTR	MaLR	-164	215	6	3
777	3193	43	8	2	chr3	25270655	25271049	-134328734	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
777	373	265	0	0	chr3	25271425	25271508	-134328275	-	MTEb	LTR	MaLR	-296	83	1	3
777	2267	216	21	94	chr3	25274165	25274824	-134324959	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	3
777	1201	284	45	11	chr3	25276466	25276819	-134322964	+	MTEb	LTR	MaLR	15	379	0	3
777	318	342	34	0	chr3	25278672	25278789	-134320994	-	MLT1K	LTR	MaLR	-10	585	465	3
777	339	339	74	102	chr3	25282486	25282877	-134316906	+	MLT1A1	LTR	MaLR	21	400	-8	3
777	330	392	27	5	chr3	25283003	25283190	-134316593	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	191	-168	3
777	342	378	46	27	chr3	25286467	25286728	-134313055	-	MLT1E	LTR	MaLR	-47	633	368	3
777	974	287	95	66	chr3	25286989	25287474	-134312309	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-56	521	23	3
777	1820	183	31	54	chr3	25292685	25293234	-134306549	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	3
777	472	285	37	37	chr3	25295439	25295683	-134304100	-	RLTR15	LTR	ERVK	-68	291	48	3
778	5078	127	89	9	chr3	25297007	25297382	-134302401	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	399	-559	3
778	5078	127	89	9	chr3	25297464	25297975	-134301808	+	RMER17B	LTR	ERVK	400	957	-1	3
778	286	419	48	55	chr3	25303244	25303641	-134296142	+	LTR33A	LTR	ERVL	116	509	-11	3
778	302	355	84	53	chr3	25306316	25306506	-134293277	+	MLT1A1	LTR	MaLR	213	408	0	4
778	513	214	14	97	chr3	25309077	25309222	-134290561	+	ORR1C1	LTR	MaLR	11	143	-224	4
778	686	195	16	87	chr3	25309610	25309795	-134289988	+	ORR1C1	LTR	MaLR	143	314	-64	4
778	7041	29	2	5	chr3	25310012	25310836	-134288947	+	RLTR13B2	LTR	ERVK	1	822	0	4
778	4578	182	140	2	chr3	25312773	25312913	-134286870	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	141	-962	4
778	4578	182	140	2	chr3	25313060	25313888	-134285895	+	RLTR25A	LTR	ERVK	142	1102	-1	4
778	3684	53	14	34	chr3	25313984	25314490	-134285293	+	LTRIS2	LTR	ERV1	69	564	0	4
778	257	214	71	0	chr3	25315634	25315690	-134284093	+	MTEb	LTR	MaLR	3	62	-317	4
778	2852	55	0	11	chr3	25315769	25316140	-134283643	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	4
778	25326	25	27	10	chr3	25316140	25319156	-134280627	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	3076	-3405	4
778	7215	31	2	7	chr3	25319142	25319998	-134279785	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5630	6481	0	4
778	2843	57	0	11	chr3	25319998	25320369	-134279414	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	4
778	340	251	171	43	chr3	25320376	25320581	-134279202	+	MTEb	LTR	MaLR	109	341	-38	4
778	333	283	49	16	chr3	25341504	25341626	-134258157	-	MTD	LTR	MaLR	-293	126	1	4
778	1278	257	55	63	chr3	25342542	25343053	-134256730	+	RLTR40	LTR	ERVK	188	694	-123	4
778	863	255	77	80	chr3	25344831	25345169	-134254614	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	348	-31	4
778	2587	82	45	25	chr3	25349510	25349911	-134249872	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	4
778	3298	169	153	72	chr3	25352037	25352860	-134246923	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	4
778	3160	46	8	8	chr3	25366123	25366519	-134233264	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
778	411	341	98	43	chr3	25380695	25381063	-134218720	+	MLT1C	LTR	MaLR	56	443	-24	4
778	236	351	178	26	chr3	25387169	25387400	-134212383	+	MLT1D	LTR	MaLR	130	395	-110	5
778	1222	297	11	49	chr3	25388223	25388588	-134211195	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	9	5
778	953	272	81	62	chr3	25390636	25390809	-134208974	+	MTEb	LTR	MaLR	1	192	-187	5
778	1634	131	128	0	chr3	25390809	25391083	-134208700	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	5
778	953	272	81	62	chr3	25391083	25391281	-134208502	+	MTEb	LTR	MaLR	193	379	0	5
778	621	209	0	0	chr3	25400284	25400394	-134199389	+	MTC	LTR	MaLR	1	110	-311	5
778	277	269	0	119	chr3	25400876	25400994	-134198789	-	RMER12	LTR	ERVK	-486	836	733	5
778	237	280	71	51	chr3	25401564	25401662	-134198121	+	MLT1N2	LTR	MaLR	417	516	-46	5
778	478	282	105	60	chr3	25401832	25402197	-134197586	+	MTEa	LTR	MaLR	1	375	-4	5
778	366	249	7	14	chr3	25404159	25404260	-134195523	+	ORR1D2	LTR	MaLR	251	349	-30	5
778	1537	292	61	18	chr3	25404258	25404830	-134194953	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	5	641	-939	5
778	541	288	91	42	chr3	25404846	25405053	-134194730	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	200	5
778	436	210	0	0	chr3	25406646	25406727	-134193056	+	MTC	LTR	MaLR	1	81	-340	5
778	1909	213	0	11	chr3	25406844	25407200	-134192583	+	MTC	LTR	MaLR	70	421	0	5
778	293	214	99	14	chr3	25409580	25409651	-134190132	+	RMER15	LTR	ERVL	400	476	-99	5
778	967	301	47	78	chr3	25413251	25413633	-134186150	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	2	5
778	918	301	94	3	chr3	25420667	25420964	-134178819	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	324	-55	5
779	2238	195	100	51	chr3	25434722	25435332	-134164451	+	RLTR26	LTR	ERVK	3	642	0	5
779	1851	226	27	7	chr3	25437958	25438364	-134161419	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	1	5
779	416	314	191	60	chr3	25441848	25442183	-134157600	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	5
779	1153	283	61	3	chr3	25449595	25449925	-134149858	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	365	17	6
779	263	273	76	68	chr3	25450071	25450189	-134149594	+	ORR1E	LTR	MaLR	79	197	-162	6
779	584	328	234	9	chr3	25450929	25451271	-134148512	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
779	2084	179	58	10	chr3	25464681	25464861	-134134922	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	240	6
779	2084	179	58	10	chr3	25464894	25465113	-134134670	-	MTC	LTR	MaLR	-182	239	3	6
779	2252	159	44	24	chr3	25469996	25470409	-134129374	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
779	1043	308	33	21	chr3	25475741	25476073	-134123710	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	340	-39	6
779	1585	216	102	0	chr3	25484070	25484404	-134115379	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	368	-10	6
779	390	222	59	67	chr3	25492146	25492281	-134107502	+	MTD	LTR	MaLR	240	373	-46	6
779	1321	254	30	69	chr3	25493383	25493819	-134105964	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	6
779	607	252	19	19	chr3	25495537	25495695	-134104088	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	454	6
779	257	305	64	64	chr3	25497374	25497450	-134102333	-	RMER12	LTR	ERVK	-474	848	771	6
779	257	305	64	64	chr3	25497485	25497548	-134102235	-	RMER12	LTR	ERVK	-552	770	710	6
779	537	345	108	50	chr3	25498159	25498336	-134101447	+	MER57E1	LTR	ERV1	22	198	-174	6
779	537	345	108	50	chr3	25498481	25498626	-134101157	+	MER57E1	LTR	ERV1	199	363	-9	6
779	4271	19	0	0	chr3	25499507	25499989	-134099794	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	6
779	1995	266	51	29	chr3	25500053	25500351	-134099432	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-626	744	441	1
779	1995	266	51	29	chr3	25500396	25500719	-134099064	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-930	440	109	1
779	307	250	90	0	chr3	25500968	25501068	-134098715	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-474	629	521	5
779	3542	193	59	50	chr3	25501016	25501830	-134097953	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1142	821	1	6
779	1665	163	66	0	chr3	25501834	25502135	-134097648	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	6
779	639	316	53	25	chr3	25502191	25502434	-134097349	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-96	278	29	1
779	1229	213	82	7	chr3	25531884	25532154	-134067629	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-62	332	43	5
779	1928	137	18	50	chr3	25535588	25535926	-134063857	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
779	1433	233	99	60	chr3	25536939	25537436	-134062347	+	RLTR20A	LTR	ERVK	11	526	-15	5
779	1895	202	87	75	chr3	25539244	25539821	-134059962	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	1	6
779	1447	214	51	69	chr3	25549735	25550126	-134049657	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	8
779	1604	194	138	9	chr3	25550329	25550678	-134049105	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	8
780	689	253	27	0	chr3	25581420	25581570	-134018213	+	ORR1D1	LTR	MaLR	35	188	-186	1
780	401	290	191	46	chr3	25588735	25589064	-134010719	+	MTEb	LTR	MaLR	4	380	-4	1
780	1206	271	43	43	chr3	25591639	25592013	-134007770	+	MTEb	LTR	MaLR	3	376	-3	1
780	320	369	93	7	chr3	25595900	25596050	-134003733	-	LTR88c	LTR	Genie?	-461	401	239	1
780	1146	288	58	36	chr3	25597121	25597485	-134002298	-	MTE2b	LTR	MaLR	-7	372	1	1
780	225	370	54	23	chr3	25597497	25597627	-134002156	+	MLT1A	LTR	MaLR	119	252	-122	1
780	367	316	114	61	chr3	25610262	25610508	-133989275	+	MLT1A	LTR	MaLR	116	374	0	1
780	4437	127	65	9	chr3	25610833	25611599	-133988184	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	1
780	531	272	86	29	chr3	25611837	25612011	-133987772	+	RMER13B	LTR	ERVK	5	188	-720	1
780	961	261	28	64	chr3	25612011	25612368	-133987415	+	RLTR26	LTR	ERVK	299	642	0	1
780	600	312	43	75	chr3	25613705	25614051	-133985732	-	MLT1B	LTR	MaLR	-14	376	42	1
780	786	284	160	21	chr3	25617688	25618019	-133981764	+	MTEa	LTR	MaLR	3	379	0	1
780	323	352	41	68	chr3	25631564	25631924	-133967859	-	MLT1C	LTR	MaLR	-27	363	24	2
780	546	298	152	14	chr3	25632500	25632711	-133967072	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	240	-130	2
780	3495	198	28	6	chr3	25637137	25637814	-133961969	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	2
780	2205	206	84	12	chr3	25670801	25671054	-133928729	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	503	2
780	2205	206	84	12	chr3	25671131	25671388	-133928395	-	RMER6A	LTR	ERVK	-254	502	210	2
780	406	310	103	6	chr3	25678968	25679124	-133920659	-	MLT1I	LTR	MaLR	-236	175	5	2
780	1055	251	86	107	chr3	25683088	25683472	-133916311	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	1	2
780	390	322	27	20	chr3	25685302	25685451	-133914332	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	218	2
780	515	323	35	5	chr3	25685624	25685826	-133913957	-	MTEa	LTR	MaLR	-156	223	16	2
780	860	301	70	93	chr3	25685826	25686211	-133913572	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	2	2
780	1892	194	37	42	chr3	25686750	25687280	-133912503	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	2
780	1789	238	2	44	chr3	25687938	25688390	-133911393	+	RMER10A	LTR	ERVL	3	435	-7	2
780	1647	203	14	26	chr3	25688839	25689026	-133910757	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	187	-223	2
780	1647	203	14	26	chr3	25689176	25689403	-133910380	+	RMER17C	LTR	ERVK	188	410	0	2
781	1022	279	101	6	chr3	25692245	25692591	-133907192	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	2
781	493	271	42	94	chr3	25694276	25694488	-133905295	+	RMER20B	LTR	ERVK	398	598	-29	2
781	307	246	104	90	chr3	25695357	25695491	-133904292	-	RMER20B	LTR	ERVK	-259	368	233	2
781	254	316	20	20	chr3	25722222	25722322	-133877461	+	MLT1E2	LTR	MaLR	1	100	-527	3
781	486	144	11	22	chr3	25736456	25736548	-133863235	+	RMER16	LTR	ERVK	318	408	-125	3
781	574	156	0	76	chr3	25744155	25744273	-133855510	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	109	-298	3
781	2194	157	85	3	chr3	25744366	25744755	-133855028	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
781	4124	106	2	2	chr3	25787157	25787741	-133812042	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	4
781	655	306	54	9	chr3	25791366	25791587	-133808196	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1349	231	1	4
781	487	332	75	52	chr3	25791591	25791940	-133807843	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	4
781	393	244	50	8	chr3	25793189	25793309	-133806474	+	MLT2B2	LTR	ERVL	24	148	-367	4
781	252	361	74	15	chr3	25793833	25793968	-133805815	+	MLT2B2	LTR	ERVL	326	468	-87	4
781	4552	165	107	38	chr3	25797382	25798339	-133801444	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	4
781	275	286	26	13	chr3	25801062	25801140	-133798643	+	ORR1E	LTR	MaLR	281	359	0	4
781	1842	216	11	3	chr3	25817083	25817450	-133782333	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	370	-8	4
782	1435	269	86	46	chr3	25827803	25828348	-133771435	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	4
782	445	266	12	163	chr3	25830219	25830385	-133769398	+	RMER19C	LTR	ERVK	329	469	-142	4
782	345	152	0	0	chr3	25830389	25830448	-133769335	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	59	-469	4
782	1749	213	38	15	chr3	25830466	25830862	-133768921	+	RLTR11A	LTR	ERVK	107	511	-17	4
782	600	147	122	15	chr3	25830884	25831015	-133768768	+	RMER19B	LTR	ERVK	758	902	0	4
782	917	324	26	38	chr3	25836746	25837089	-133762694	+	MTE2b	LTR	MaLR	28	366	-13	4
782	361	274	50	33	chr3	25842137	25842258	-133757525	+	MTD	LTR	MaLR	5	127	-292	4
782	1447	185	142	13	chr3	25842470	25842788	-133756995	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	4
782	652	143	8	60	chr3	25845530	25845664	-133754119	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	127	-484	4
782	1103	255	54	115	chr3	25851082	25851472	-133748311	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	366	-13	5
782	442	284	207	10	chr3	25856148	25856443	-133743340	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	5	5
782	1633	218	63	8	chr3	25861258	25861655	-133738128	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
782	463	358	21	5	chr3	25861736	25861930	-133737853	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	197	-162	5
782	261	295	113	63	chr3	25870157	25870316	-133729467	+	RLTR21	LTR	ERVK	1087	1253	-319	5
782	486	251	99	12	chr3	25879214	25879375	-133720408	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	201	5
782	1666	253	49	21	chr3	25885081	25885601	-133714182	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	5
782	266	254	0	0	chr3	25889990	25890049	-133709734	+	RMER15	LTR	ERVL	1	59	-516	5
782	1892	269	44	17	chr3	25890102	25890627	-133709156	+	RMER15	LTR	ERVL	37	575	0	5
782	771	338	45	7	chr3	25899570	25899856	-133699927	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	297	-82	5
782	1664	195	35	83	chr3	25919526	25919900	-133679883	+	ORR1B1	LTR	MaLR	39	394	0	6
782	323	385	64	92	chr3	25922736	25923160	-133676623	-	MLT1D	LTR	MaLR	-24	481	70	6
782	770	257	58	31	chr3	25924855	25925080	-133674703	+	MTE2b	LTR	MaLR	138	368	-11	6
782	5036	134	42	61	chr3	25930410	25931387	-133668396	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	6
782	265	357	31	8	chr3	25934499	25934626	-133665157	+	MTE2b	LTR	MaLR	12	141	-280	6
782	2202	225	79	17	chr3	25934629	25935159	-133664624	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	563	-5	6
782	467	320	28	28	chr3	25935265	25935445	-133664338	+	MTE2b	LTR	MaLR	195	374	-5	6
782	495	275	68	27	chr3	25941614	25941760	-133658023	-	MTC	LTR	MaLR	-13	394	243	6
782	577	313	67	47	chr3	25941770	25942068	-133657715	-	MTC	LTR	MaLR	-113	308	5	6
782	1065	251	48	108	chr3	25942178	25942575	-133657208	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	377	-2	6
782	248	257	34	38	chr3	25951180	25951280	-133648503	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	276	6
783	3300	33	2	34	chr3	25953090	25953499	-133646284	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
783	4194	136	10	96	chr3	25954659	25955544	-133644239	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	6
783	641	340	50	97	chr3	25958380	25958576	-133641207	+	MLT1C	LTR	MaLR	2	183	-284	6
783	641	340	50	97	chr3	25958666	25958695	-133641088	+	MLT1C	LTR	MaLR	184	203	-264	6
783	641	340	50	97	chr3	25958720	25958978	-133640805	+	MLT1C	LTR	MaLR	204	463	-4	6
783	1637	178	79	3	chr3	25963184	25963499	-133636284	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-55	339	1	6
783	630	262	91	58	chr3	25965275	25965641	-133634142	+	MTD	LTR	MaLR	11	379	0	6
783	498	288	166	51	chr3	25967049	25967518	-133632265	+	MT2A	LTR	ERVL	1	523	-10	6
783	369	380	8	0	chr3	25975726	25975855	-133623928	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-414	141	12	6
783	285	376	98	6	chr3	26022761	26022935	-133576848	+	MLT1C	LTR	MaLR	3	192	-275	2
783	242	309	93	80	chr3	26023127	26023289	-133576494	+	MLT1C	LTR	MaLR	163	326	-64	2
783	260	375	110	52	chr3	26023386	26023676	-133576107	+	MLT1C	LTR	MaLR	88	394	-73	3
783	1643	267	111	64	chr3	26035858	26036170	-133563613	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	350	-467	4
783	1643	267	111	64	chr3	26036317	26036781	-133563002	+	RLTR40	LTR	ERVK	351	813	-4	4
783	1041	265	127	15	chr3	26036837	26037167	-133562616	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	367	-3	4
783	1875	169	110	48	chr3	26042309	26042625	-133557158	+	RMER4A	LTR	ERVK	4	346	-120	5
783	1875	169	110	48	chr3	26042692	26042811	-133556972	+	RMER4A	LTR	ERVK	347	465	-1	5
783	1345	172	146	67	chr3	26046787	26047192	-133552591	-	RMER10A	LTR	ERVL	-5	437	1	6
783	401	328	69	32	chr3	26063427	26063853	-133535930	+	MLT1D	LTR	MaLR	20	502	-3	8
783	3359	142	132	5	chr3	26064102	26064716	-133535067	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	9
784	231	350	79	65	chr3	26095745	26095959	-133503824	-	RMER12	LTR	ERVK	-467	855	639	1
784	2951	66	5	12	chr3	26097119	26097518	-133502265	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
784	874	340	43	5	chr3	26097825	26098200	-133501583	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2929	3317	-2397	1
784	419	353	78	70	chr3	26116111	26116470	-133483313	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	365	0	1
784	1726	177	68	113	chr3	26123010	26123125	-133476658	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	336	1
784	1726	177	68	113	chr3	26123739	26124049	-133475734	-	MTC	LTR	MaLR	-86	335	10	1
784	340	319	92	103	chr3	26159397	26159455	-133440328	+	MLT1C	LTR	MaLR	35	92	-298	2
784	2123	178	10	13	chr3	26159455	26159847	-133439936	+	ORR1B1	LTR	MaLR	4	394	0	2
784	398	303	171	44	chr3	26159847	26160148	-133439635	+	MLT1C	LTR	MaLR	93	467	0	2
784	967	266	111	92	chr3	26162603	26162645	-133437138	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	494	2
784	967	266	111	92	chr3	26162671	26162704	-133437079	-	MT2A	LTR	ERVL	-40	493	467	2
784	967	266	111	92	chr3	26162859	26163116	-133436667	-	MT2A	LTR	ERVL	-67	466	175	2
784	2918	70	19	12	chr3	26163116	26163534	-133436249	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	2
784	967	266	111	92	chr3	26163534	26163719	-133436064	-	MT2A	LTR	ERVL	-359	174	5	2
784	1091	261	40	26	chr3	26168966	26169269	-133430514	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	71	2
784	894	242	207	53	chr3	26177879	26178198	-133421585	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	368	-2	2
784	1071	234	34	31	chr3	26179816	26180138	-133419645	+	RMER6A	LTR	ERVK	292	614	-142	2
784	1433	114	60	28	chr3	26182269	26182521	-133417262	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	260	-69	2
784	444	37	0	0	chr3	26182794	26182848	-133416935	+	ORR1A4	LTR	MaLR	268	321	-8	2
784	257	200	33	0	chr3	26204709	26204769	-133395014	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	338	2
784	649	198	8	0	chr3	26204776	26204902	-133394881	-	RLTR15	LTR	ERVK	-232	127	1	2
785	1023	283	61	33	chr3	26219141	26219505	-133380278	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	20	3
785	261	247	98	12	chr3	26234344	26234426	-133365357	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	89	-290	3
785	787	278	85	4	chr3	26234674	26234909	-133364874	+	MTE2a	LTR	MaLR	126	379	0	3
785	816	266	60	38	chr3	26242139	26242506	-133357277	+	MTEb	LTR	MaLR	1	375	-4	3
785	490	310	8	85	chr3	26243292	26243517	-133356266	+	MLT2B4	LTR	ERVL	2	207	-313	3
785	2728	19	5	121	chr3	26245779	26246194	-133353589	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
785	52444	31	9	2	chr3	26246194	26252624	-133347159	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	3
785	2714	22	5	121	chr3	26252624	26253039	-133346744	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
785	370	221	78	26	chr3	26260710	26260826	-133338957	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	285	3
785	747	324	73	47	chr3	26262878	26263260	-133336523	-	MT2A	LTR	ERVL	-141	392	1	3
785	1385	195	10	40	chr3	26275271	26275567	-133324216	+	RMER10B	LTR	ERVL	2	288	-110	3
785	510	238	0	39	chr3	26275567	26275694	-133324089	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	122	-412	3
785	929	254	44	111	chr3	26275883	26276388	-133323395	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2627	3097	-141	3
785	3157	118	18	16	chr3	26285260	26286148	-133313635	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	3
785	2021	179	14	19	chr3	26289043	26289413	-133310370	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-1	377	10	3
785	3156	199	206	6	chr3	26289417	26290199	-133309584	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-484	1025	88	3
785	324	256	133	0	chr3	26296565	26296655	-133303128	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1268	102	1	3
785	1598	204	63	3	chr3	26296655	26297005	-133302778	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	8	3
785	2852	167	14	32	chr3	26301192	26301755	-133298028	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	1	3
785	439	369	50	50	chr3	26313392	26313654	-133286129	+	LTR33	LTR	ERVL	1	262	-253	4
785	241	276	94	31	chr3	26330430	26330557	-133269226	+	RMER12	LTR	ERVK	695	829	-493	4
785	793	273	117	25	chr3	26332002	26332276	-133267507	-	RMER13A	LTR	ERVK	-466	394	96	4
785	681	199	21	7	chr3	26334331	26334482	-133265301	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	146	-760	4
785	885	251	69	119	chr3	26335633	26335995	-133263788	-	MTE2a	LTR	MaLR	-35	344	1	4
785	3338	35	2	2	chr3	26337954	26338350	-133261433	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
785	504	304	106	50	chr3	26342414	26342594	-133257189	-	MTE2a	LTR	MaLR	-5	374	177	4
785	504	313	112	51	chr3	26342655	26342839	-133256944	-	MTE2a	LTR	MaLR	-198	221	25	4
786	314	245	73	65	chr3	26358397	26358590	-133241193	-	LTR41	LTR	ERVL	-2	766	569	4
786	376	295	63	0	chr3	26358833	26358928	-133240855	-	LTR41	LTR	ERVL	-151	617	517	4
786	382	323	74	60	chr3	26358928	26359211	-133240572	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	242	4
786	783	237	124	52	chr3	26359232	26359295	-133240488	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-254	314	246	4
786	783	226	113	51	chr3	26359397	26359610	-133240173	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-323	245	11	4
786	477	360	121	16	chr3	26359622	26359879	-133239904	-	LTR41	LTR	ERVL	-249	519	236	4
786	414	308	42	47	chr3	26362269	26362460	-133237323	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	3	4
786	969	265	166	19	chr3	26367039	26367382	-133232401	+	MTD	LTR	MaLR	5	413	-6	5
786	1381	229	88	75	chr3	26368890	26369483	-133230300	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	39	534	-19	5
786	307	343	130	11	chr3	26379066	26379243	-133220540	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	200	-305	5
786	410	301	115	70	chr3	26379271	26379471	-133220312	+	MLT1D	LTR	MaLR	278	486	-19	5
786	456	373	63	68	chr3	26384510	26384924	-133214859	+	MLT1D-int	LTR	MaLR	8	419	-968	5
786	1425	238	10	7	chr3	26385692	26385997	-133213786	+	RLTR11A	LTR	ERVK	220	525	-3	5
786	3303	34	13	0	chr3	26387533	26387916	-133211867	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-4	392	5	5
786	553	182	71	28	chr3	26401593	26401734	-133198049	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	147	-406	5
786	781	213	32	114	chr3	26401720	26402001	-133197782	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	292	549	-4	5
786	3399	23	8	0	chr3	26403327	26403720	-133196063	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
786	848	258	188	4	chr3	26410194	26410466	-133189317	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	58	5
786	254	216	154	51	chr3	26413960	26414077	-133185706	-	MLT1B	LTR	MaLR	-215	175	47	5
786	2917	94	7	15	chr3	26414754	26415164	-133184619	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	5
786	2148	81	84	43	chr3	26415196	26415543	-133184240	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	5	5
786	281	28	0	0	chr3	26415542	26415578	-133184205	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-256	36	1	5
786	3680	214	62	80	chr3	26421082	26422016	-133177767	+	RMER13B	LTR	ERVK	2	908	0	5
786	766	299	118	69	chr3	26422217	26422565	-133177218	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	6	5
786	235	375	18	46	chr3	26422906	26423015	-133176768	+	RMER12	LTR	ERVK	746	851	-471	5
786	253	330	99	44	chr3	26432200	26432381	-133167402	+	MER21B	LTR	ERV1	55	245	-618	6
786	377	288	126	0	chr3	26432602	26432713	-133167070	+	MER21B	LTR	ERV1	544	668	-195	6
786	323	316	191	54	chr3	26432930	26433228	-133166555	+	MLT1A	LTR	MaLR	35	373	-1	6
786	664	330	155	49	chr3	26433295	26433945	-133165838	+	MLT-int	LTR	MaLR	78	796	-939	6
786	846	291	32	48	chr3	26451956	26452270	-133147513	+	MTE-int	LTR	MaLR	1204	1512	-68	6
786	677	269	121	56	chr3	26459993	26460326	-133139457	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	5	6
786	510	330	29	32	chr3	26464858	26465202	-133134581	+	MER31-int	LTR	ERV1	594	936	-4000	6
786	1560	268	43	62	chr3	26465363	26466040	-133133743	+	MER31-int	LTR	ERV1	3545	4208	-728	6
786	685	368	103	10	chr3	26466283	26466670	-133133113	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-71	444	22	6
786	743	196	15	0	chr3	26468287	26468420	-133131363	+	ORR1B2	LTR	MaLR	9	143	-224	6
786	2938	32	12	0	chr3	26468423	26468765	-133131018	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	6
786	5998	46	14	1	chr3	26468765	26469529	-133130254	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1019	6
786	1116	48	0	0	chr3	26469518	26469663	-133130120	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	-1647	145	1	6
786	2779	33	0	9	chr3	26469667	26470008	-133129775	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-8	338	1	6
786	1090	204	26	13	chr3	26470008	26470231	-133129552	+	ORR1B2	LTR	MaLR	142	367	0	6
786	2492	181	16	33	chr3	26470231	26470741	-133129042	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	501	-1008	6
786	2083	109	3	70	chr3	26470737	26471093	-133128690	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-5	332	1	6
98	55178	14	2	0	chr3	26471093	26477527	-133122256	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	35	6
787	2103	106	3	70	chr3	26477539	26477895	-133121888	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-5	332	1	6
787	2373	232	107	18	chr3	26477895	26478523	-133121260	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	490	1181	-328	6
787	2373	232	107	18	chr3	26478611	26478665	-133121118	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1182	1233	-276	6
787	491	344	86	0	chr3	26479250	26479413	-133120370	+	ORR1B2	LTR	MaLR	10	186	-173	6
787	1824	173	56	3	chr3	26479511	26479848	-133119935	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-12	355	1	6
787	331	200	0	0	chr3	26479854	26479914	-133119869	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-6	1364	1305	6
787	297	275	0	42	chr3	26484677	26484772	-133115011	+	MLT1A1	LTR	MaLR	300	390	-18	6
787	1800	195	70	16	chr3	26485753	26486139	-133113644	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	6
787	333	294	46	0	chr3	26486941	26487050	-133112733	-	ORR1E	LTR	MaLR	-242	117	4	6
787	544	247	111	5	chr3	26487050	26487239	-133112544	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-50	1530	1343	6
787	1755	308	65	86	chr3	26489701	26490597	-133109186	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-432	938	62	6
787	779	308	92	12	chr3	26490660	26490986	-133108797	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	356	5	6
787	245	229	99	14	chr3	26493048	26493119	-133106664	+	MTD	LTR	MaLR	18	94	-327	6
787	547	244	127	6	chr3	26493122	26493287	-133106496	+	MTD	LTR	MaLR	235	419	0	6
787	864	265	111	25	chr3	26503866	26504209	-133095574	-	MTC	LTR	MaLR	-31	390	22	7
787	294	303	128	25	chr3	26504309	26504474	-133095309	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	181	-189	8
787	504	285	109	104	chr3	26505217	26505620	-133094163	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	368	9	1
787	247	253	120	54	chr3	26505730	26505822	-133093961	+	MTEa	LTR	MaLR	22	119	-302	1
787	384	289	50	97	chr3	26507658	26507935	-133091848	+	MTEa	LTR	MaLR	88	379	0	1
787	1010	47	16	2	chr3	26513510	26513646	-133086137	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	236	2
787	2318	48	3	0	chr3	26514840	26515129	-133084654	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-106	290	1	2
787	9147	39	0	1	chr3	26515129	26516228	-133083555	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
787	3459	20	5	0	chr3	26516228	26516622	-133083161	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
787	453	289	72	95	chr3	26517021	26517368	-133082415	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-120	440	21	3
787	1646	250	148	33	chr3	26523195	26523683	-133076100	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	359	4
787	700	248	146	55	chr3	26526469	26526810	-133072973	+	MLT2B4	LTR	ERVL	223	680	-37	4
787	1485	252	13	54	chr3	26533384	26533529	-133066254	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	143	-227	5
787	1498	199	57	19	chr3	26533529	26533897	-133065886	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	5
787	1485	242	6	117	chr3	26533897	26534145	-133065638	+	ORR1D2	LTR	MaLR	144	379	0	5
787	230	333	35	0	chr3	26543979	26544066	-133055717	+	RMER15	LTR	ERVL	381	470	-105	6
787	394	296	139	22	chr3	26545814	26545994	-133053789	-	LTR50	LTR	ERVL	-594	201	1	7
787	1417	210	163	0	chr3	26551446	26551784	-133047999	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	27	8
787	229	262	58	109	chr3	26551667	26551791	-133047992	-	MT2A	LTR	ERVL	-395	138	21	8
787	229	262	58	109	chr3	26551868	26551880	-133047903	-	MT2A	LTR	ERVL	-513	20	9	8
787	2109	179	10	21	chr3	26558769	26559158	-133040625	-	MTC	LTR	MaLR	-33	388	4	9
787	588	134	16	89	chr3	26569679	26569802	-133029981	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	114	-280	1
787	1282	152	159	9	chr3	26569860	26570093	-133029690	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	111	1
787	2081	199	20	5	chr3	26571887	26572292	-133027491	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	1
787	342	341	192	19	chr3	26593925	26594248	-133005535	-	MLT1D	LTR	MaLR	-4	501	123	1
787	414	314	114	59	chr3	26594423	26594677	-133005106	-	LTR40b	LTR	ERVL	-29	433	166	1
787	665	254	293	10	chr3	26594689	26595000	-133004783	+	MTD	LTR	MaLR	19	417	-2	1
787	240	331	68	38	chr3	26595006	26595138	-133004645	-	LTR40b	LTR	ERVL	-295	167	32	1
787	3506	159	29	43	chr3	26596431	26597082	-133002701	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	1
788	839	236	199	4	chr3	26620804	26621055	-132978728	+	ORR1D1	LTR	MaLR	75	374	0	1
788	1335	207	83	48	chr3	26622466	26622817	-132976966	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	1	1
788	1806	126	89	0	chr3	26623345	26623647	-132976136	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
788	275	303	93	19	chr3	26625088	26625260	-132974523	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	8	1
788	538	294	20	0	chr3	26631055	26631208	-132968575	+	LTR90B	LTR	LTR	641	796	0	1
788	237	357	38	53	chr3	26641982	26642115	-132957668	+	RLTR26	LTR	ERVK	482	612	-30	1
788	6092	83	104	51	chr3	26643559	26644068	-132955715	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-4	1019	430	2
788	6092	83	104	51	chr3	26644187	26644644	-132955139	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-594	429	1	2
788	836	239	45	160	chr3	26645384	26645600	-132954183	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	174	-196	2
788	836	239	45	160	chr3	26645663	26645864	-132953919	+	ORR1D2	LTR	MaLR	175	370	0	2
788	3436	15	5	12	chr3	26651694	26652093	-132947690	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
788	1052	255	47	4	chr3	26652690	26652946	-132946837	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	267	-103	2
788	1776	153	60	0	chr3	26656931	26657245	-132942538	+	ORR1B2	LTR	MaLR	27	359	-8	2
788	886	283	44	91	chr3	26658176	26658561	-132941222	-	MTE2a	LTR	MaLR	-10	369	3	2
788	267	324	8	67	chr3	26659734	26659853	-132939930	+	LTR40b	LTR	ERVL	346	457	-5	2
788	3711	74	71	2	chr3	26660381	26660905	-132938878	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	872	-242	2
788	1830	102	31	41	chr3	26667116	26667433	-132932350	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	495	808	0	2
788	405	242	22	101	chr3	26679505	26679643	-132920140	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	152	2
788	3113	29	3	0	chr3	26680418	26680759	-132919024	+	ORR1A0	LTR	MaLR	5	346	0	2
788	2392	84	15	61	chr3	26689227	26689570	-132910213	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
788	1087	163	64	0	chr3	26701468	26701670	-132898113	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	205	2
788	659	267	117	14	chr3	26702530	26702733	-132897050	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	5	2
788	401	352	50	16	chr3	26705266	26705448	-132894335	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-219	189	2	2
788	1375	339	69	42	chr3	26705448	26706237	-132893546	-	MLT1A1-int	LTR	MaLR	-13	1722	856	2
788	756	226	106	26	chr3	26706265	26706529	-132893254	-	MLT1A1-int	LTR	MaLR	-1448	287	3	2
788	265	356	10	0	chr3	26706534	26706635	-132893148	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	362	261	2
788	509	277	96	6	chr3	26706911	26707067	-132892716	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-238	170	1	2
788	3402	64	0	17	chr3	26719039	26719453	-132880330	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	3
788	6253	136	96	25	chr3	26719456	26720626	-132879157	+	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	6	1258	0	3
788	3212	72	15	17	chr3	26720626	26721034	-132878749	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	3
788	3597	162	96	4	chr3	26723583	26724314	-132875469	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	798	-110	3
788	722	255	36	20	chr3	26728768	26728964	-132870819	+	MTEb	LTR	MaLR	5	203	-176	3
788	484	291	5	18	chr3	26729460	26729619	-132870164	+	MTEb	LTR	MaLR	243	405	-14	3
789	836	284	54	71	chr3	26747727	26747899	-132851884	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	364	192	3
789	836	284	54	71	chr3	26747940	26748135	-132851648	-	MTE2a	LTR	MaLR	-188	191	3	3
789	2915	160	199	47	chr3	26765305	26766077	-132833706	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	3
789	430	284	69	29	chr3	26774074	26774248	-132825535	+	MLT1B	LTR	MaLR	5	185	-205	3
789	577	295	28	24	chr3	26774338	26774550	-132825233	+	MLT1B	LTR	MaLR	165	377	-13	3
789	516	313	30	85	chr3	26778081	26778409	-132821374	-	ORR1E	LTR	MaLR	-49	310	1	3
789	667	189	18	36	chr3	26780639	26780804	-132818979	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-15	438	277	3
789	3388	38	2	10	chr3	26783796	26784195	-132815588	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
789	544	231	0	53	chr3	26786836	26786987	-132812796	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-305	148	6	3
789	1960	242	71	43	chr3	26790211	26790763	-132809020	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	7	3
789	269	260	20	50	chr3	26793747	26793848	-132805935	+	MLT1A1	LTR	MaLR	311	408	0	4
789	675	282	56	103	chr3	26798633	26798973	-132800810	+	ORR1E	LTR	MaLR	36	359	0	4
789	1597	239	61	8	chr3	26806959	26807355	-132792428	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	4
789	1128	207	117	34	chr3	26807355	26807694	-132792089	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	1	4
789	1259	236	86	30	chr3	26814847	26815288	-132784495	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-39	489	24	4
789	339	327	46	51	chr3	26815296	26815512	-132784271	-	MLT1A	LTR	MaLR	-22	352	138	4
789	646	204	78	0	chr3	26815537	26815679	-132784104	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	253	4
789	513	301	50	20	chr3	26815844	26816044	-132783739	-	MTD	LTR	MaLR	-213	206	1	4
789	342	307	8	16	chr3	26816044	26816172	-132783611	-	MLT1A	LTR	MaLR	-244	130	4	4
789	2946	52	52	0	chr3	26816691	26817060	-132782723	+	RLTR10	LTR	ERVK	2	389	-1	4
789	3646	145	9	59	chr3	26821462	26822123	-132777660	-	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	0	628	1	4
789	2983	121	32	26	chr3	26822182	26822265	-132777518	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-3	538	448	4
789	2983	121	32	26	chr3	26822335	26822784	-132776999	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-94	447	5	4
789	1257	224	101	21	chr3	26827981	26828318	-132771465	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-10	364	1	4
789	1055	216	132	14	chr3	26828318	26828482	-132771301	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-49	325	126	4
789	1049	215	324	59	chr3	26828482	26828913	-132770870	+	MT2B	LTR	ERVL	1	543	-58	4
789	1049	215	324	59	chr3	26829006	26829049	-132770734	+	MT2B	LTR	ERVL	544	600	-1	4
789	1055	216	132	14	chr3	26829049	26829171	-132770612	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-249	125	4	4
789	341	261	152	9	chr3	26830171	26830283	-132769500	-	LTR50	LTR	ERVL	-635	160	33	4
789	300	289	94	75	chr3	26831268	26831481	-132768302	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-5	574	358	4
789	919	211	92	15	chr3	26833250	26833484	-132766299	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	125	4
789	919	211	92	15	chr3	26833524	26833549	-132766234	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-250	124	96	4
789	898	287	103	7	chr3	26833657	26833959	-132765824	-	MTEa	LTR	MaLR	-46	333	3	4
789	273	338	65	44	chr3	26836850	26837079	-132762704	-	ORR1E	LTR	MaLR	-117	242	9	4
789	454	299	50	63	chr3	26840768	26840989	-132758794	-	RMER12	LTR	ERVK	-4	1318	1101	4
789	4834	114	10	8	chr3	26841188	26841989	-132757794	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1045	803	1	4
789	806	281	125	77	chr3	26855573	26856012	-132743771	+	MT2A	LTR	ERVL	67	526	-7	4
789	1165	192	94	34	chr3	26856499	26856796	-132742987	-	RLTR46	LTR	ERVK	-5	315	1	4
789	1890	148	40	11	chr3	26857051	26857400	-132742383	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	4
789	437	373	72	0	chr3	26864804	26864882	-132734901	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-87	278	192	5
789	437	373	72	0	chr3	26865007	26865121	-132734662	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-174	191	73	5
789	623	318	62	19	chr3	26866551	26866859	-132732924	-	MLT1C	LTR	MaLR	-3	464	144	5
789	589	209	111	71	chr3	26866862	26867030	-132732753	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	222	5
789	589	209	111	71	chr3	26867085	26867142	-132732641	-	RMER17C	LTR	ERVK	-189	221	176	5
789	6153	145	60	61	chr3	26867157	26867378	-132732405	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-437	2801	2589	5
789	6153	145	60	61	chr3	26867423	26868651	-132731132	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-437	2588	1400	5
789	2234	196	28	28	chr3	26868656	26869308	-132730475	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	1	5
789	454	201	85	128	chr3	26869314	26869679	-132730104	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1838	1400	1100	5
790	2074	201	83	134	chr3	26869925	26870107	-132729676	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2496	742	595	5
790	2074	201	83	134	chr3	26870145	26870743	-132729040	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2644	594	2	5
790	1205	172	21	176	chr3	26870765	26871196	-132728587	-	RMER17C	LTR	ERVK	-46	364	1	5
790	2005	162	18	24	chr3	26871490	26871848	-132727935	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	22	5
790	2005	162	18	24	chr3	26872168	26872189	-132727594	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-357	21	1	5
790	767	270	95	31	chr3	26881453	26881778	-132718005	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	9	5
790	2307	181	17	33	chr3	26883049	26883570	-132716213	-	RLTR28	LTR	ERVL	-11	513	1	5
790	238	357	0	0	chr3	26884169	26884239	-132715544	+	RMER10B	LTR	ERVL	272	341	-57	5
790	1559	181	165	27	chr3	26884510	26884880	-132714903	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
790	2246	88	82	0	chr3	26885068	26885398	-132714385	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	5
790	527	272	270	9	chr3	26887458	26887777	-132712006	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	5
790	1265	243	157	100	chr3	26890418	26890896	-132708887	+	MT2A	LTR	ERVL	1	517	-16	5
790	1265	243	157	100	chr3	26891101	26891124	-132708659	+	MT2A	LTR	ERVL	518	531	-2	5
790	298	282	45	78	chr3	26891205	26891359	-132708424	-	MT2B	LTR	ERVL	-341	260	112	5
790	540	335	111	33	chr3	26891634	26891967	-132707816	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	5
790	939	108	1	33	chr3	26892848	26893015	-132706768	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-732	157	1	5
790	584	297	238	24	chr3	26893483	26893824	-132705959	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	-2	5
790	1352	285	18	34	chr3	26894316	26894701	-132705082	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	5
790	728	302	62	31	chr3	26895852	26896177	-132703606	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	29	5
790	2810	136	60	43	chr3	26899824	26900339	-132699444	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	524	0	5
790	1203	208	45	19	chr3	26901870	26902230	-132697553	+	RMER15	LTR	ERVL	28	431	-144	5
790	1298	193	206	46	chr3	26902242	26902698	-132697085	-	RMER4B	LTR	ERVK	-11	574	46	5
790	631	226	47	14	chr3	26902738	26902886	-132696897	+	RMER15	LTR	ERVL	423	575	0	5
790	2087	96	14	0	chr3	26906135	26906417	-132693366	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	286	-41	5
790	388	43	0	0	chr3	26907772	26907819	-132691964	+	ORR1A2	LTR	MaLR	272	318	-8	5
790	3443	173	50	136	chr3	26907823	26908767	-132691016	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	863	-929	5
790	6112	102	34	11	chr3	26910409	26911314	-132688469	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1038	1963	0	5
790	984	162	0	0	chr3	26911314	26911468	-132688315	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	154	-173	5
790	602	111	0	0	chr3	26911465	26911555	-132688228	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1221	1310	-653	5
790	766	156	0	0	chr3	26911563	26911685	-132688098	+	ORR1A2	LTR	MaLR	164	285	-41	5
790	465	36	0	0	chr3	26913438	26913493	-132686290	+	ORR1A3	LTR	MaLR	272	326	0	5
790	473	240	107	0	chr3	26914143	26914264	-132685519	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	246	5
790	2304	105	237	46	chr3	26914264	26914724	-132685059	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	37	5
790	237	228	196	56	chr3	26914726	26914833	-132684950	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-532	122	1	5
790	68823	16	15	2	chr3	26914833	26922516	-132677267	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	1	5
790	2456	104	227	44	chr3	26922516	26922997	-132676786	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-49	605	37	5
790	237	228	196	56	chr3	26922999	26923106	-132676677	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-532	122	1	5
790	635	275	105	36	chr3	26923180	26923399	-132676384	-	MTE2b	LTR	MaLR	-145	234	1	5
790	902	268	22	51	chr3	26923562	26923759	-132676024	+	MTEb	LTR	MaLR	1	194	-185	5
790	902	268	22	51	chr3	26923850	26923926	-132675857	+	MTEb	LTR	MaLR	195	266	-113	5
790	448	209	50	81	chr3	26924108	26924269	-132675514	+	MTE2b	LTR	MaLR	201	356	-23	6
790	335	323	53	15	chr3	26924775	26924907	-132674876	-	MTEa	LTR	MaLR	-224	155	19	6
790	1965	195	37	10	chr3	26926635	26927045	-132672738	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
790	294	289	78	99	chr3	26927387	26927579	-132672204	+	MLT1D	LTR	MaLR	7	194	-311	6
790	1925	114	65	90	chr3	26928344	26928699	-132671084	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	6
790	733	309	4	63	chr3	26929771	26930023	-132669760	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	239	-120	6
790	4091	146	88	70	chr3	26930260	26931190	-132668593	-	RMER17B	LTR	ERVK	-10	948	2	6
790	1405	251	153	32	chr3	26932181	26932679	-132667104	+	RMER13A	LTR	ERVK	14	571	-289	6
790	1830	168	231	14	chr3	26934869	26935297	-132664486	+	RLTR17	LTR	ERVK	172	692	0	6
790	1012	207	118	85	chr3	26935297	26935769	-132664014	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1	843	-1999	6
790	8169	175	61	47	chr3	26935862	26937866	-132661917	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	485	2837	-5	6
790	2034	143	66	17	chr3	26937867	26938216	-132661567	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	366	-326	6
790	1715	128	80	10	chr3	26939276	26939576	-132660207	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	6
790	1356	223	91	43	chr3	26941663	26942038	-132657745	+	MTD	LTR	MaLR	18	410	-9	6
790	364	266	97	0	chr3	26942761	26942874	-132656909	+	RMER5	LTR	ERV1	144	267	-267	6
790	1579	233	83	43	chr3	26942964	26943437	-132656346	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	481	0	6
790	2073	146	55	71	chr3	26948536	26948971	-132650812	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-5	476	49	6
790	1017	255	71	100	chr3	26949276	26949542	-132650241	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-12	516	270	6
790	1017	255	71	100	chr3	26949715	26949928	-132649855	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-259	269	52	6
790	898	229	168	20	chr3	26951222	26951520	-132648263	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	342	-17	6
790	1653	166	107	49	chr3	26951520	26951952	-132647831	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	6
790	1926	132	473	12	chr3	26952850	26953264	-132646519	+	RLTR1D	LTR	ERV1	1	605	0	6
790	352	217	0	0	chr3	26953279	26953371	-132646412	+	RLTR21	LTR	ERVK	1171	1262	-310	6
790	1814	167	47	183	chr3	26956418	26956975	-132642808	-	RMER6D	LTR	ERVK	-209	481	1	6
790	249	298	102	21	chr3	26960099	26960243	-132639540	+	MLT1F1	LTR	MaLR	21	167	-402	6
790	362	322	102	13	chr3	26961776	26961974	-132637809	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-40	527	310	6
790	305	324	86	26	chr3	26962027	26962179	-132637604	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-393	163	3	6
790	566	236	140	22	chr3	26962340	26962518	-132637265	+	MTE2b	LTR	MaLR	181	379	0	6
790	1861	159	25	3	chr3	26962561	26962921	-132636862	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	9	6
790	3193	53	2	8	chr3	26964605	26965003	-132634780	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
790	269	304	10	19	chr3	26966552	26966656	-132633127	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	365	263	6
790	1044	250	35	113	chr3	26967379	26967785	-132631998	+	MTEb	LTR	MaLR	6	379	0	6
790	949	219	92	18	chr3	26971803	26972099	-132627684	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
790	297	227	39	26	chr3	26973048	26973125	-132626658	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-154	254	177	7
790	2621	84	131	19	chr3	26975008	26975307	-132624476	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	324	-151	7
790	2621	84	131	19	chr3	26975505	26975632	-132624151	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	325	474	-1	7
790	336	205	90	120	chr3	26976734	26976867	-132622916	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	129	-241	7
790	1837	161	71	14	chr3	26976887	26977252	-132622531	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	7
790	1476	253	130	51	chr3	26977256	26977959	-132621824	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	153	909	-461	7
790	757	229	121	68	chr3	26977987	26978268	-132621515	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-9	361	66	7
790	1084	98	0	0	chr3	26982775	26982928	-132616855	+	ORR1A3	LTR	MaLR	171	323	-3	7
790	236	294	81	32	chr3	26985589	26985712	-132614071	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	349	477	-1012	7
790	970	296	74	28	chr3	26985839	26986263	-132613520	+	MLT2B1	LTR	ERVL	8	405	-9	7
790	487	275	15	8	chr3	26986269	26986401	-132613382	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1	133	-5581	7
790	321	346	0	29	chr3	26986527	26986664	-132613119	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	296	428	-5286	7
791	359	318	34	34	chr3	27002196	27002372	-132597411	+	RMER4A	LTR	ERVK	12	187	-279	5
791	532	260	101	63	chr3	27011171	27011409	-132588374	+	MTE2a	LTR	MaLR	51	297	-82	1
791	2215	149	77	10	chr3	27018619	27019011	-132580772	+	MTC	LTR	MaLR	3	420	-1	3
791	1843	174	70	40	chr3	27019803	27020204	-132579579	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	3
791	3628	25	5	0	chr3	27034179	27034573	-132565210	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
791	735	280	130	13	chr3	27038175	27038414	-132561369	-	MTEa	LTR	MaLR	-62	317	51	6
791	3513	41	5	0	chr3	27039590	27039984	-132559799	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
791	1542	243	68	80	chr3	27040875	27041510	-132558273	+	RMER13A	LTR	ERVK	40	666	-194	7
791	384	251	172	134	chr3	27046927	27047299	-132552484	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	387	-3	9
791	1671	170	21	42	chr3	27055609	27055989	-132543794	+	RMER10B	LTR	ERVL	27	398	0	1
791	3139	49	201	2	chr3	27058367	27058794	-132540989	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	1
791	2543	163	69	30	chr3	27061152	27061659	-132538124	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	1
791	691	265	58	33	chr3	27062580	27062822	-132536961	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4174	1348	1101	1
791	4867	145	56	40	chr3	27063142	27064012	-132535771	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	884	-18	1
791	668	249	130	14	chr3	27064213	27064421	-132535362	-	MTC-int	LTR	MaLR	-279	979	748	1
791	923	234	208	13	chr3	27064411	27064719	-132535064	-	MTC-int	LTR	MaLR	-715	543	176	1
791	391	179	95	0	chr3	27067641	27067725	-132532058	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	867	1
791	491	181	58	33	chr3	27067703	27067823	-132531960	-	RMER17B	LTR	ERVK	-269	689	567	1
791	1365	75	9	54	chr3	27067881	27068105	-132531678	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1803	2016	-4121	1
791	6510	141	97	15	chr3	27069651	27070923	-132528860	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-587	1376	1	1
791	2332	82	3	42	chr3	27070927	27071258	-132528525	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	2	1
791	1510	180	174	3	chr3	27075122	27075450	-132524333	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
791	249	268	55	27	chr3	27075860	27075933	-132523850	+	MT2B2	LTR	ERVL	180	254	-330	1
791	1226	222	256	69	chr3	27076262	27076299	-132523484	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	499	1
791	1226	222	256	69	chr3	27076332	27076743	-132523040	-	MT2A	LTR	ERVL	-35	498	1	1
791	240	125	104	0	chr3	27077223	27077271	-132522512	-	RMER19B	LTR	ERVK	-849	53	1	1
791	470	278	143	134	chr3	27078585	27079047	-132520736	+	RLTR40	LTR	ERVK	73	538	-279	1
791	485	158	146	24	chr3	27087605	27087728	-132512055	-	MTEa	LTR	MaLR	-53	326	189	1
791	2108	127	31	40	chr3	27089941	27090295	-132509488	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	352	-15	2
791	303	307	90	67	chr3	27090275	27090453	-132509330	-	RMER15	LTR	ERVL	-42	533	352	2
791	2012	87	44	88	chr3	27091689	27092031	-132507752	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
791	445	248	8	23	chr3	27096895	27097023	-132502760	-	MER57E1	LTR	ERV1	-191	181	56	2
791	1363	181	180	8	chr3	27104467	27104823	-132494960	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	2
791	1000	259	80	72	chr3	27113306	27113680	-132486103	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	1	2
791	1612	177	196	8	chr3	27114162	27114515	-132485268	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	2
791	2669	220	104	39	chr3	27115358	27116081	-132483702	+	RMER13A	LTR	ERVK	14	783	-77	2
791	465	232	137	27	chr3	27123072	27123119	-132476664	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	326	2
791	465	232	137	27	chr3	27123358	27123455	-132476328	-	MTEa	LTR	MaLR	-54	325	221	2
791	472	304	95	0	chr3	27123493	27123651	-132476132	-	MTEa	LTR	MaLR	-206	173	1	2
791	569	127	7	106	chr3	27129789	27129930	-132469853	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	405	3
792	1391	128	145	24	chr3	27135878	27136192	-132463591	+	MTC	LTR	MaLR	3	411	-8	3
792	2574	178	34	20	chr3	27137268	27137767	-132462016	+	RLTR18B	LTR	ERVK	4	509	-3	3
792	1234	270	45	19	chr3	27137842	27138201	-132461582	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	52	3
792	548	176	41	4	chr3	27144237	27144353	-132455430	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	394	265	3
792	4717	224	69	74	chr3	27144358	27145856	-132453927	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1509	19	3
792	1587	193	104	3	chr3	27145859	27146034	-132453749	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-12	372	191	3
792	1587	193	104	3	chr3	27146085	27146237	-132453546	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-194	190	12	3
792	1900	133	159	3	chr3	27146297	27146503	-132453280	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	260	-134	3
792	1900	133	159	3	chr3	27146544	27146677	-132453106	+	ORR1B1	LTR	MaLR	261	393	-1	3
792	4332	95	0	30	chr3	27152259	27152864	-132446919	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	3
792	605	77	99	0	chr3	27152864	27152955	-132446828	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	0	4690	4591	3
792	4618	122	9	23	chr3	27152976	27153664	-132446119	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-73	4617	3940	3
792	3339	163	22	8	chr3	27155949	27156842	-132442941	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-1021	3669	2176	3
792	5126	154	36	139	chr3	27156830	27158094	-132441689	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-2838	1852	719	3
792	1962	142	38	22	chr3	27158204	27158576	-132441207	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-4684	379	3	3
792	4400	88	7	28	chr3	27158577	27159177	-132440606	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	3
792	985	236	154	69	chr3	27159621	27159639	-132440144	+	MTD	LTR	MaLR	3	21	-398	3
792	985	236	154	69	chr3	27159685	27159782	-132440001	+	MTD	LTR	MaLR	22	120	-299	3
792	985	236	154	69	chr3	27159928	27160130	-132439653	+	MTD	LTR	MaLR	121	347	-72	3
792	1150	274	49	12	chr3	27160120	27160449	-132439334	+	MTEa	LTR	MaLR	6	346	-33	3
792	520	88	37	3	chr3	27161732	27161811	-132437972	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	421	296	3
792	1074	186	96	43	chr3	27162940	27163285	-132436498	+	RLTR26	LTR	ERVK	5	403	-239	3
792	372	94	0	19	chr3	27167175	27167229	-132432554	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-22	356	304	3
792	1804	153	36	52	chr3	27167398	27167744	-132432039	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-24	355	1	3
792	434	331	202	20	chr3	27167744	27168046	-132431737	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-338	4661	4305	3
792	3099	139	31	6	chr3	27169914	27170429	-132429354	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	3
792	3141	179	94	97	chr3	27172076	27172874	-132426909	-	RLTR40	LTR	ERVK	-21	796	1	4
792	2061	200	22	0	chr3	27174380	27174740	-132425043	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	7	4
792	305	275	62	103	chr3	27175412	27175558	-132424225	-	MTE2a	LTR	MaLR	-239	140	1	4
792	1917	113	12	59	chr3	27179022	27179360	-132420423	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	4
792	440	284	88	88	chr3	27188851	27189223	-132410560	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	362	-8	4
792	359	349	70	48	chr3	27189471	27189742	-132410041	-	LTR82A	LTR	ERVL	-339	533	257	4
792	729	106	0	9	chr3	27190017	27190131	-132409652	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-186	208	96	4
792	2240	112	66	71	chr3	27190404	27190798	-132408985	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	4
792	372	241	49	7	chr3	27197408	27197504	-132402279	-	MTE2a	LTR	MaLR	-319	102	1	4
792	294	316	50	10	chr3	27198469	27198568	-132401215	+	MTE2a	LTR	MaLR	19	121	-258	4
792	3181	40	42	0	chr3	27203231	27203611	-132396172	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
792	8053	74	25	2	chr3	27203611	27204684	-132395099	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
792	3323	33	15	15	chr3	27204684	27205080	-132394703	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
792	3339	46	2	2	chr3	27207712	27208108	-132391675	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
792	9170	39	8	0	chr3	27208108	27209197	-132390586	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
792	3447	25	5	2	chr3	27209197	27209592	-132390191	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
792	354	295	79	70	chr3	27211833	27212048	-132387735	+	LTR82A	LTR	ERVL	95	311	-561	4
792	1121	259	176	22	chr3	27213936	27214295	-132385488	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	4
792	1276	155	259	108	chr3	27215012	27215410	-132384373	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	458	-3	4
792	3298	24	39	0	chr3	27216816	27217197	-132382586	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
792	9585	25	1	1	chr3	27217197	27218295	-132381488	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
792	3298	24	39	0	chr3	27218295	27218676	-132381107	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
792	975	166	268	48	chr3	27219029	27219174	-132380609	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	217	5
792	975	166	268	48	chr3	27219324	27219514	-132380269	-	RMER17C	LTR	ERVK	-194	216	1	5
792	298	216	0	162	chr3	27222288	27222393	-132377390	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	153	5
792	3408	33	2	2	chr3	27226009	27226405	-132373378	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
792	2032	97	36	0	chr3	27229009	27229317	-132370466	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	5
792	377	273	141	20	chr3	27235200	27235398	-132364385	+	MTE-int	LTR	MaLR	1078	1299	-281	5
792	837	245	167	39	chr3	27239007	27239343	-132360440	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	5
792	527	335	43	0	chr3	27241591	27241800	-132357983	-	MTEb	LTR	MaLR	-161	218	1	5
792	248	315	81	40	chr3	27243797	27243946	-132355837	-	MLT1L	LTR	MaLR	-361	249	95	5
792	409	333	106	73	chr3	27250913	27251253	-132348530	-	MLT2F	LTR	ERVL	-110	553	203	5
792	423	249	373	18	chr3	27251817	27251994	-132347789	+	MLT1A	LTR	MaLR	133	372	-2	5
792	1981	174	90	10	chr3	27252115	27252505	-132347278	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
792	572	266	50	77	chr3	27253526	27253707	-132346076	+	MTEa	LTR	MaLR	3	183	-196	5
792	3315	26	39	0	chr3	27253707	27254088	-132345695	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
792	9339	38	0	1	chr3	27254088	27255187	-132344596	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
792	3364	11	42	0	chr3	27255187	27255567	-132344216	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
792	572	266	50	77	chr3	27255567	27255603	-132344180	+	MTEa	LTR	MaLR	184	214	-165	5
792	365	309	32	37	chr3	27256610	27256798	-132342985	-	RMER15	LTR	ERVL	-48	527	341	5
792	2597	154	46	164	chr3	27261196	27261889	-132337894	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	5
793	5358	120	58	13	chr3	27265850	27266802	-132332981	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-261	997	3	6
793	3418	30	5	0	chr3	27266802	27267196	-132332587	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
793	2017	210	30	70	chr3	27279144	27279703	-132320080	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-16	537	1	6
793	1872	208	105	3	chr3	27280669	27281050	-132318733	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	6
793	2222	113	3	41	chr3	27284091	27284431	-132315352	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
793	569	239	7	21	chr3	27286532	27286673	-132313110	-	MT2A	LTR	ERVL	-394	139	1	6
793	274	233	109	22	chr3	27289959	27290051	-132309732	+	MLT1A	LTR	MaLR	39	138	-236	6
793	243	335	70	41	chr3	27290322	27290493	-132309290	+	MLT1A	LTR	MaLR	213	388	-2	6
793	1661	163	159	22	chr3	27290795	27291165	-132308618	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
793	3449	28	5	0	chr3	27298583	27298977	-132300806	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
793	1156	259	70	34	chr3	27308716	27309072	-132290711	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	11	6
793	334	353	51	16	chr3	27309276	27309515	-132290268	-	MLT1G	LTR	MaLR	-333	258	57	6
793	526	269	85	81	chr3	27310375	27310477	-132289306	+	MTEb	LTR	MaLR	51	151	-228	6
793	526	269	85	81	chr3	27310537	27310681	-132289102	+	MTEb	LTR	MaLR	152	297	-82	6
793	1354	244	15	65	chr3	27312506	27312905	-132286878	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	6
793	624	165	120	0	chr3	27320267	27320400	-132279383	+	MTC	LTR	MaLR	1	149	-272	6
793	945	156	0	34	chr3	27320411	27320590	-132279193	+	MTC	LTR	MaLR	243	415	-6	6
793	252	286	51	80	chr3	27354569	27354706	-132245077	+	MTEb	LTR	MaLR	91	223	-156	7
793	2522	74	5	49	chr3	27372157	27372290	-132227493	+	MTB	LTR	MaLR	1	125	-275	7
793	2522	74	5	49	chr3	27372314	27372548	-132227235	+	MTB	LTR	MaLR	126	352	-48	7
793	1900	149	37	112	chr3	27379412	27379821	-132219962	+	MTC	LTR	MaLR	1	378	-43	7
793	420	342	86	62	chr3	27380141	27380465	-132219318	-	ORR1E	LTR	MaLR	-22	337	6	7
793	1060	192	235	153	chr3	27391284	27391586	-132208197	+	MTD	LTR	MaLR	1	331	-88	7
793	1060	192	22	190	chr3	27391702	27391809	-132207974	+	MTD	LTR	MaLR	332	418	-1	7
794	517	260	27	7	chr3	27401875	27402022	-132197761	+	MTEb	LTR	MaLR	230	379	0	7
794	3311	172	82	15	chr3	27405946	27406595	-132193188	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	7
794	227	268	119	40	chr3	27411167	27411268	-132188515	+	MLT1A0	LTR	MaLR	113	221	-144	7
794	847	255	127	83	chr3	27415716	27416054	-132183729	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	354	-5	8
794	438	315	99	93	chr3	27424255	27424752	-132175031	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	500	-5	8
794	229	111	0	27	chr3	27425107	27425144	-132174639	+	LTR9	LTR	ERV1	94	129	-483	8
794	2005	142	72	24	chr3	27434677	27435052	-132164731	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	393	-1	8
794	331	286	114	40	chr3	27444897	27445072	-132154711	+	MLT1B	LTR	MaLR	202	389	-1	8
794	563	282	143	51	chr3	27448699	27449035	-132150748	+	MTE2b	LTR	MaLR	13	379	0	8
794	2336	150	44	15	chr3	27452209	27452615	-132147168	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	8
794	609	279	54	29	chr3	27454595	27454835	-132144948	+	MTD	LTR	MaLR	50	295	-124	8
794	1918	156	83	22	chr3	27459031	27459391	-132140392	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	8
794	667	132	0	0	chr3	27459648	27459754	-132140029	+	MTC	LTR	MaLR	223	328	-93	8
794	1581	168	55	37	chr3	27460155	27460557	-132139226	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	2	8
794	424	179	11	0	chr3	27460656	27460751	-132139032	+	RLTR15	LTR	ERVK	264	359	0	8
794	1794	171	92	0	chr3	27488518	27488864	-132110919	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	9
794	345	239	11	11	chr3	27497452	27497541	-132102242	+	ORR1E	LTR	MaLR	47	135	-224	9
794	856	188	16	16	chr3	27512009	27512193	-132087590	+	RLTR15	LTR	ERVK	5	188	-171	2
794	3397	33	8	0	chr3	27513810	27514203	-132085580	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
794	235	330	94	0	chr3	27518777	27518883	-132080900	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	1317	1432	-57	2
794	313	293	106	33	chr3	27519067	27519247	-132080536	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	444	636	-44	3
794	3564	18	2	0	chr3	27522583	27522978	-132076805	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
795	515	236	49	28	chr3	27534143	27534287	-132065496	+	MTE2b	LTR	MaLR	230	376	-3	5
795	483	224	144	7	chr3	27538581	27538734	-132061049	+	MTE2b	LTR	MaLR	186	359	-20	6
795	1872	157	76	14	chr3	27542643	27543012	-132056771	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	7
795	233	315	21	43	chr3	27561114	27561207	-132038576	+	MT2B	LTR	ERVL	169	259	-342	1
795	498	325	66	43	chr3	27568647	27568904	-132030879	+	LTR40c	LTR	ERVL	151	413	-52	1
795	310	187	120	86	chr3	27573421	27573538	-132026245	-	MT2B2	LTR	ERVL	-327	257	137	1
795	300	269	17	3	chr3	27587212	27587316	-132012467	-	MLT1A	LTR	MaLR	-17	391	285	1
795	860	246	123	133	chr3	27600690	27601009	-131998774	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	85	1
795	860	246	123	133	chr3	27601157	27601244	-131998539	-	MTD	LTR	MaLR	-335	84	3	1
795	869	248	5	27	chr3	27614839	27615059	-131984724	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	217	-162	1
795	553	245	142	0	chr3	27615286	27615441	-131984342	+	MTE2b	LTR	MaLR	201	377	-2	1
795	231	283	120	19	chr3	27615803	27615911	-131983872	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	256	1
795	228	208	236	36	chr3	27616001	27616111	-131983672	-	MLT1A	LTR	MaLR	-224	141	10	1
795	605	239	103	30	chr3	27620317	27620521	-131979262	-	MLT2D	LTR	ERVL	-105	309	93	1
795	449	281	162	12	chr3	27620937	27621110	-131978673	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-4836	921	723	1
795	319	263	32	0	chr3	27621523	27621618	-131978165	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-410	146	49	1
795	316	221	113	17	chr3	27623548	27623663	-131976120	+	RMER15	LTR	ERVL	435	560	-15	1
795	1197	221	88	38	chr3	27624368	27624711	-131975072	+	ORR1D2	LTR	MaLR	11	370	0	2
795	1515	244	42	77	chr3	27630588	27631111	-131968672	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	1	2
795	397	322	5	103	chr3	27636792	27636986	-131962797	-	MTEa	LTR	MaLR	-202	177	3	2
795	1204	258	64	3	chr3	27638349	27638706	-131961077	-	MTD	LTR	MaLR	-40	379	1	2
795	321	246	45	141	chr3	27638826	27638867	-131960916	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	386	2
795	432	244	57	205	chr3	27639066	27639406	-131960377	-	MTE2a	LTR	MaLR	-34	385	65	2
795	1794	123	91	23	chr3	27643906	27644290	-131955493	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
795	995	275	50	85	chr3	27646857	27647234	-131952549	+	MTE2b	LTR	MaLR	16	379	0	2
795	471	316	193	22	chr3	27650633	27651047	-131948736	-	MLT1F	LTR	MaLR	-3	545	61	2
795	2146	166	41	24	chr3	27652126	27652539	-131947244	+	MTC	LTR	MaLR	2	421	0	2
795	2199	151	37	12	chr3	27653129	27653532	-131946251	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	2
795	955	209	242	50	chr3	27655104	27655301	-131944482	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	167	2
795	955	209	242	50	chr3	27655342	27655466	-131944317	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-218	166	1	2
795	316	305	13	65	chr3	27656053	27656187	-131943596	+	MLT-int	LTR	MaLR	11	146	-1589	2
796	298	233	219	29	chr3	27661207	27661344	-131938439	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-202	163	1	2
796	248	282	38	38	chr3	27662260	27662347	-131937436	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	92	-287	2
796	838	272	46	21	chr3	27662353	27662638	-131937145	+	MTE2a	LTR	MaLR	58	349	-30	2
796	413	303	94	81	chr3	27665950	27666259	-131933524	+	ORR1E	LTR	MaLR	46	358	-1	3
796	1999	300	127	104	chr3	27666288	27666816	-131932967	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	22	515	-1065	3
796	1999	300	127	104	chr3	27666971	27667920	-131931863	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	516	1532	-48	3
796	453	296	99	81	chr3	27667933	27668267	-131931516	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	358	-1	3
796	620	250	57	62	chr3	27673055	27673264	-131926519	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	172	3
796	383	314	57	31	chr3	27674256	27674450	-131925333	-	MTE2a	LTR	MaLR	-220	199	1	3
796	825	286	51	62	chr3	27674478	27674850	-131924933	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	370	0	3
796	587	279	53	77	chr3	27679796	27680095	-131919688	+	MLT1C	LTR	MaLR	35	326	-141	3
796	273	360	0	51	chr3	27680144	27680261	-131919522	+	MLT1B	LTR	MaLR	272	382	-8	3
796	2141	179	88	38	chr3	27684427	27684685	-131915098	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	264	3
796	2141	179	88	38	chr3	27684815	27685057	-131914726	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-265	263	5	3
796	2713	166	14	14	chr3	27687942	27688444	-131911339	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-75	502	1	3
796	668	259	141	26	chr3	27688703	27688972	-131910811	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	302	-72	3
796	1479	234	46	22	chr3	27692682	27693049	-131906734	+	MTEa	LTR	MaLR	1	376	-3	3
796	313	321	6	72	chr3	27693449	27693630	-131906153	+	MTEb	LTR	MaLR	23	191	-188	3
796	1798	167	78	17	chr3	27694342	27694689	-131905094	+	MTC	LTR	MaLR	1	368	-53	3
796	2320	148	35	5	chr3	27696224	27696625	-131903158	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	3
796	914	293	97	20	chr3	27697860	27698212	-131901571	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	3
796	588	217	149	63	chr3	27699314	27699535	-131900248	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	166	3
796	1206	222	45	59	chr3	27701464	27701815	-131897968	+	MTEa	LTR	MaLR	34	379	0	3
796	1408	139	89	0	chr3	27706161	27706420	-131893363	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	97	3
796	517	224	93	0	chr3	27707369	27707476	-131892307	-	MTEb	LTR	MaLR	-256	123	7	4
796	695	281	85	27	chr3	27711058	27711318	-131888465	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-47	318	44	4
796	512	208	43	2	chr3	27715718	27715854	-131883929	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	223	4
796	4419	16	0	24	chr3	27718238	27718743	-131881040	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
796	674	235	115	54	chr3	27721554	27721833	-131877950	-	RMER13A	LTR	ERVK	-470	390	95	4
796	330	215	0	0	chr3	27724776	27724841	-131874942	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	406	4
796	649	123	169	0	chr3	27730030	27730160	-131869623	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	152	-242	4
796	1438	111	42	65	chr3	27730266	27730344	-131869439	+	ORR1B1	LTR	MaLR	140	211	-183	4
796	1438	111	42	65	chr3	27730534	27730716	-131869067	+	ORR1B1	LTR	MaLR	212	393	-1	4
796	1288	166	158	29	chr3	27731561	27731872	-131867911	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-16	351	1	4
796	359	91	18	0	chr3	27737104	27737159	-131862624	+	MTD	LTR	MaLR	364	419	0	4
796	283	322	64	46	chr3	27737412	27737630	-131862153	+	MT2A	LTR	ERVL	10	231	-302	4
796	2268	95	38	0	chr3	27737650	27737965	-131861818	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
796	1087	196	64	13	chr3	27744510	27744743	-131855040	+	MTD	LTR	MaLR	20	264	-155	4
796	697	253	52	81	chr3	27745271	27745542	-131854241	+	RLTR41	LTR	ERV1	184	446	0	4
796	1771	187	6	29	chr3	27745542	27745878	-131853905	+	ORR1B2	LTR	MaLR	32	359	-8	4
796	1927	134	14	67	chr3	27752738	27753171	-131846612	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	4
796	1946	142	48	6	chr3	27754333	27754667	-131845116	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-5	389	42	5
796	521	327	19	9	chr3	27754947	27755157	-131844626	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-3	552	341	5
796	1037	252	68	81	chr3	27756219	27756603	-131843180	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	5
796	1868	181	30	16	chr3	27770953	27771323	-131828460	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	4	5
796	1226	249	74	0	chr3	27771928	27772281	-131827502	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	5
796	355	331	8	8	chr3	27772622	27772747	-131827036	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	125	-429	5
796	296	353	0	75	chr3	27772747	27772809	-131826974	+	MTEb	LTR	MaLR	1	173	-206	5
796	674	97	0	137	chr3	27772900	27773031	-131826752	-	RMER21B	LTR	ERV1	-729	113	1	5
796	990	251	75	89	chr3	27785764	27786048	-131813735	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	300	-59	5
796	990	251	75	89	chr3	27786223	27786286	-131813497	+	ORR1E	LTR	MaLR	301	348	-11	5
797	1158	306	25	68	chr3	27788531	27788899	-131810884	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	6	5
797	229	312	38	156	chr3	27791770	27791799	-131807984	+	MER31A	LTR	ERV1	63	88	-397	5
797	229	312	38	156	chr3	27791952	27792108	-131807675	+	MER31A	LTR	ERV1	89	226	-259	5
797	866	284	135	41	chr3	27801946	27802265	-131797518	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	9	6
797	841	337	51	25	chr3	27804489	27804842	-131794941	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	18	6
797	4032	148	62	25	chr3	27806891	27807627	-131792156	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	764	-264	6
797	910	211	167	33	chr3	27807882	27808122	-131791661	+	RLTR25B	LTR	ERVK	757	1028	0	6
797	2209	84	17	67	chr3	27809624	27809969	-131789814	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	2	6
797	10469	146	24	95	chr3	27809970	27812081	-131787702	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	2	6
797	2269	93	22	9	chr3	27812083	27812407	-131787376	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-1	328	1	6
797	2863	55	9	0	chr3	27814008	27814351	-131785432	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
797	2093	129	79	6	chr3	27816135	27816477	-131783306	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
797	740	229	98	10	chr3	27820494	27820688	-131779095	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	209	6
797	1734	144	35	110	chr3	27820697	27821071	-131778712	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	6
797	635	250	34	94	chr3	27821065	27821238	-131778545	-	MTD	LTR	MaLR	-196	223	48	6
797	635	250	34	94	chr3	27821375	27821435	-131778348	-	MTD	LTR	MaLR	-372	47	4	6
797	490	314	81	33	chr3	27823875	27824230	-131775553	+	MLT2B2	LTR	ERVL	35	505	-62	6
797	2004	130	55	99	chr3	27825125	27825509	-131774274	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
797	348	285	26	42	chr3	27827151	27827370	-131772413	+	RLTR15	LTR	ERVK	48	228	-131	6
797	1488	201	83	83	chr3	27828786	27829117	-131770666	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	337	-37	6
797	2692	58	3	0	chr3	27829117	27829443	-131770340	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
797	1488	201	83	83	chr3	27829443	27829485	-131770298	+	ORR1D1	LTR	MaLR	338	374	0	6
797	1441	200	129	6	chr3	27834761	27835093	-131764690	+	ORR1C1	LTR	MaLR	5	377	-1	6
797	533	224	62	7	chr3	27835447	27835591	-131764192	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	228	6
797	1012	191	178	0	chr3	27842552	27842777	-131757006	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	96	7
797	1113	83	0	0	chr3	27842825	27842981	-131756802	+	ORR1A3	LTR	MaLR	171	326	0	7
797	2604	129	14	0	chr3	27842981	27843398	-131756385	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1	423	-1540	7
797	1052	127	16	44	chr3	27843382	27843564	-131756219	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-150	177	1	7
797	2077	90	23	0	chr3	27844476	27844786	-131754997	+	ORR1A2	LTR	MaLR	11	327	0	7
797	1788	137	151	37	chr3	27848727	27849105	-131750678	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
797	330	266	82	101	chr3	27852278	27852437	-131747346	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	156	-209	7
797	3919	159	21	36	chr3	27852663	27852694	-131747089	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	667	7
797	3919	159	21	36	chr3	27852841	27853511	-131746272	-	RLTR17	LTR	ERVK	-26	666	1	7
797	812	282	81	76	chr3	27855734	27856103	-131743680	-	MTE2b	LTR	MaLR	-7	372	2	7
797	306	285	147	8	chr3	27859562	27859759	-131740024	+	LTR16E2	LTR	ERVL	239	460	-78	7
797	253	364	23	8	chr3	27865064	27865197	-131734586	-	MLT2F	LTR	ERVL	-517	146	12	7
797	526	169	127	30	chr3	27868546	27868680	-131731103	-	MTD	LTR	MaLR	-70	349	203	7
797	1353	232	46	6	chr3	27868994	27869323	-131730460	-	ORR1E	LTR	MaLR	-17	342	1	7
797	334	234	87	87	chr3	27874604	27874754	-131725029	+	MTD	LTR	MaLR	256	421	0	7
797	1504	185	112	0	chr3	27875761	27876097	-131723686	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	419	0	7
797	3362	28	5	5	chr3	27895653	27896049	-131703734	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
797	1498	178	139	0	chr3	27900003	27900335	-131699448	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	378	-6	8
797	305	47	23	0	chr3	27902530	27902573	-131697210	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	359	316	8
797	574	180	141	0	chr3	27902574	27902702	-131697081	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-248	146	1	8
797	1660	198	35	32	chr3	27913613	27913983	-131685800	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	374	0	8
797	1568	138	12	114	chr3	27916340	27916683	-131683100	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-59	308	1	8
797	469	236	118	0	chr3	27916684	27916794	-131682989	-	MTE2b	LTR	MaLR	-244	135	13	8
798	2122	126	78	20	chr3	27919464	27919821	-131679962	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	8
798	1584	157	108	68	chr3	27924943	27925367	-131674416	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	441	-1	8
798	769	255	161	17	chr3	27929656	27929947	-131669836	+	MTE2b	LTR	MaLR	46	378	-1	9
798	383	216	144	69	chr3	27936779	27936920	-131662863	-	RMER20B	LTR	ERVK	-207	420	261	9
798	608	230	180	58	chr3	27936920	27937248	-131662535	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	9
798	383	216	144	69	chr3	27937248	27937280	-131662503	-	RMER20B	LTR	ERVK	-367	260	234	9
798	2617	113	58	22	chr3	27937648	27938093	-131661690	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	9
798	785	208	87	21	chr3	27940423	27940664	-131659119	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-6	522	266	9
798	911	250	34	44	chr3	27940679	27940976	-131658807	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-188	340	47	9
798	3919	101	43	7	chr3	27953285	27954080	-131645703	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	855	1	9
798	2365	57	181	9	chr3	27957415	27957753	-131642030	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
798	569	144	9	9	chr3	27958128	27958233	-131641550	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-1622	186	82	9
798	1858	121	3	86	chr3	27961666	27962028	-131637755	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	-5	332	1	9
798	58636	13	4	8	chr3	27962028	27968527	-131631256	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	9	9
798	2016	134	41	41	chr3	27968527	27968892	-131630891	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	-2	365	1	9
798	2943	165	113	21	chr3	27972481	27973100	-131626683	-	RLTR17	LTR	ERVK	-16	676	1	9
798	1057	202	155	29	chr3	27976234	27976550	-131623233	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	2	9
798	340	340	0	0	chr3	27985102	27985202	-131614581	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	371	1
798	1444	240	74	43	chr3	27989297	27989381	-131610402	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	560	465	1
798	1444	227	62	24	chr3	27989420	27989863	-131609920	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-95	482	22	1
798	568	268	106	75	chr3	27994282	27994508	-131605275	-	MTD	LTR	MaLR	-145	274	42	1
798	1420	215	70	89	chr3	27994856	27995270	-131604513	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	1	1
798	1554	238	20	6	chr3	27996313	27996668	-131603115	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	16	1
798	637	268	44	31	chr3	27999773	28000000	-131599783	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	148	1
798	316	324	28	14	chr3	28000002	28000146	-131599637	-	MTEa	LTR	MaLR	-233	146	1	1
798	777	298	65	85	chr3	28003224	28003370	-131596413	+	ORR1E	LTR	MaLR	13	138	-221	9
798	777	298	65	85	chr3	28003592	28003797	-131595986	+	ORR1E	LTR	MaLR	139	357	-2	9
798	287	296	80	60	chr3	28011259	28011410	-131588373	-	MTEa	LTR	MaLR	-161	218	65	2
798	1092	259	63	25	chr3	28019013	28019378	-131580405	+	MTD	LTR	MaLR	26	404	-15	4
798	384	311	22	63	chr3	28023222	28023445	-131576338	-	MLT1L	LTR	MaLR	-370	240	27	5
798	1122	273	57	61	chr3	28024608	28025206	-131574577	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-47	569	1	5
798	2497	98	8	8	chr3	28033757	28034116	-131565667	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
798	265	180	78	20	chr3	28034906	28035008	-131564775	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6411	6518	-2441	6
798	6795	239	45	60	chr3	28035455	28035658	-131564125	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	6	206	-2120	7
798	6795	239	45	60	chr3	28035708	28037580	-131562203	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	207	2053	-273	7
798	6795	239	45	60	chr3	28037726	28037920	-131561863	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	2054	2240	-86	7
798	1019	108	22	17	chr3	28037957	28038135	-131561648	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	179	-180	7
798	522	140	0	11	chr3	28038145	28038239	-131561544	-	RLTR15	LTR	ERVK	-49	310	218	7
798	258	318	75	91	chr3	28038847	28039012	-131560771	-	MLT1A	LTR	MaLR	-93	315	165	8
798	1910	153	3	10	chr3	28039012	28039322	-131560461	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	308	-3	8
798	254	281	120	18	chr3	28039322	28039464	-131560319	-	MLT1A	LTR	MaLR	-244	164	13	8
798	2344	82	3	109	chr3	28041942	28042310	-131557473	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	8
798	1259	259	28	22	chr3	28044877	28045232	-131554551	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	359	0	9
798	1310	221	50	7	chr3	28045341	28045642	-131554141	+	MT2A	LTR	ERVL	5	318	-215	9
798	578	148	21	0	chr3	28046860	28046981	-131552802	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	331	466	-111	9
798	592	227	7	43	chr3	28047184	28047322	-131552461	-	MLT1F	LTR	MaLR	-285	263	131	9
798	2513	186	29	38	chr3	28048185	28048653	-131551130	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	471	-92	9
798	2513	186	29	38	chr3	28048702	28048786	-131550997	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	472	548	-15	9
799	336	328	38	8	chr3	28051112	28051244	-131548539	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-6	532	397	1
799	3204	132	115	54	chr3	28055673	28056249	-131543534	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
799	258	302	64	36	chr3	28057195	28057305	-131542478	-	RMER20B	LTR	ERVK	-38	589	477	1
799	689	242	86	14	chr3	28057349	28057571	-131542212	-	RMER20B	LTR	ERVK	-263	364	127	1
799	2406	197	37	12	chr3	28057749	28058232	-131541551	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-28	6891	6397	1
799	320	198	0	110	chr3	28058224	28058315	-131541468	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1764	4786	4706	1
799	1272	272	79	40	chr3	28058300	28058872	-131540911	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1930	4620	4124	1
799	2268	199	57	29	chr3	28059543	28059635	-131540148	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	563	472	1
799	2268	199	57	29	chr3	28059669	28060124	-131539659	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-92	471	2	1
799	405	191	11	56	chr3	28060720	28060809	-131538974	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-702	2536	2452	1
799	2421	93	6	3	chr3	28063465	28063790	-131535993	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	2	1
799	852	199	34	17	chr3	28068023	28068202	-131531581	-	RMER10A	LTR	ERVL	-260	182	1	1
799	463	274	114	53	chr3	28077710	28077898	-131521885	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	192	-250	1
799	463	271	19	119	chr3	28077919	28078058	-131521725	+	RMER10A	LTR	ERVL	176	298	-144	1
799	348	238	164	0	chr3	28079484	28079606	-131520177	-	MTE2b	LTR	MaLR	-37	342	201	1
799	359	313	15	37	chr3	28079636	28079772	-131520011	-	MTE-int	LTR	MaLR	-606	974	842	1
799	383	266	27	9	chr3	28080431	28080541	-131519242	+	ORR1E	LTR	MaLR	96	207	-152	1
799	238	100	0	0	chr3	28080605	28080645	-131519138	+	ORR1E	LTR	MaLR	331	370	0	1
799	950	254	35	35	chr3	28082020	28082305	-131517478	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-47	323	39	1
799	1848	159	50	32	chr3	28083064	28083441	-131516342	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
799	1437	179	142	29	chr3	28087126	28087247	-131512536	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	131	-253	1
799	1437	179	142	29	chr3	28087289	28087512	-131512271	+	ORR1C2	LTR	MaLR	132	383	-1	1
799	306	295	173	44	chr3	28088376	28088741	-131511042	+	LTR16A1	LTR	ERVL	43	454	-2	1
799	280	241	33	44	chr3	28088814	28088905	-131510878	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2674	2763	-2904	1
799	1640	309	87	12	chr3	28090593	28091384	-131508399	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2794	3700	-2057	1
799	3917	138	14	23	chr3	28091384	28092090	-131507693	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	57	2
799	516	202	24	80	chr3	28092142	28092311	-131507472	+	MTE2a	LTR	MaLR	204	377	-2	2
799	416	322	33	0	chr3	28092558	28092710	-131507073	+	MLT2B5	LTR	ERVL	24	180	-537	2
799	357	310	115	0	chr3	28092744	28092857	-131506926	+	MLT2B5	LTR	ERVL	295	420	-134	2
799	334	273	97	26	chr3	28093966	28094120	-131505663	+	RMER10A	LTR	ERVL	253	417	-25	2
799	288	294	11	11	chr3	28094615	28094708	-131505075	+	MER21B	LTR	ERV1	511	603	-260	2
799	2161	107	12	16	chr3	28096753	28097076	-131502707	+	ORR1A4	LTR	MaLR	4	325	-4	2
799	3057	29	10	70	chr3	28097123	28097538	-131502245	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
799	7862	41	7	28	chr3	28097548	28098526	-131501257	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	998	-989	2
799	390	237	76	38	chr3	28098571	28098720	-131501063	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1462	1594	-5987	2
799	8960	18	1	0	chr3	28098802	28099796	-131499987	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	990	1984	-3	2
799	3057	29	10	70	chr3	28099798	28100213	-131499570	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
799	852	265	61	54	chr3	28102007	28102398	-131497385	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-29	412	19	2
799	865	295	57	5	chr3	28102747	28103030	-131496753	+	MTEa	LTR	MaLR	6	300	-79	2
799	719	215	51	6	chr3	28104097	28104275	-131495508	+	MTE2a	LTR	MaLR	194	379	0	2
799	506	313	55	43	chr3	28110840	28111181	-131488602	+	MTEa	LTR	MaLR	9	375	-4	2
799	2097	136	81	3	chr3	28111704	28112087	-131487696	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	2
799	1166	246	77	41	chr3	28114809	28115174	-131484609	+	MTEb	LTR	MaLR	1	378	-1	2
799	1759	307	117	64	chr3	28115181	28116096	-131483687	+	MTEb-int	LTR	MaLR	7	979	-601	2
799	1065	217	249	7	chr3	28116096	28116397	-131483386	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
799	1759	307	117	64	chr3	28116397	28116466	-131483317	+	MTEb-int	LTR	MaLR	980	1043	-537	2
799	254	329	23	12	chr3	28116978	28117064	-131482719	+	MTE-int	LTR	MaLR	897	983	-597	2
799	914	258	62	53	chr3	28117298	28117618	-131482165	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	57	2
799	279	313	91	31	chr3	28118464	28118718	-131481065	+	MLT1C	LTR	MaLR	42	310	-157	2
799	894	272	17	99	chr3	28120746	28121159	-131478624	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	2
799	509	299	27	21	chr3	28123141	28123329	-131476454	+	MLT1H2	LTR	MaLR	2	190	-299	2
799	740	275	59	13	chr3	28129371	28129607	-131470176	+	RMER5	LTR	ERV1	75	321	-213	2
799	1858	205	21	45	chr3	28129613	28130032	-131469751	-	MTD	LTR	MaLR	-10	409	1	2
799	421	282	23	8	chr3	28130618	28130750	-131469033	+	RMER5	LTR	ERV1	359	492	-42	2
799	1286	308	87	57	chr3	28133471	28134170	-131465613	+	MTE-int	LTR	MaLR	641	1360	-220	2
799	302	303	74	0	chr3	28134259	28134381	-131465402	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	131	-228	2
799	590	253	239	19	chr3	28135103	28135413	-131464370	+	MTEb	LTR	MaLR	1	378	-1	2
799	383	316	76	86	chr3	28138937	28139238	-131460545	+	ORR1E	LTR	MaLR	61	358	-1	2
799	1301	159	241	3	chr3	28142629	28142919	-131456864	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	2
799	859	200	35	10	chr3	28143428	28143621	-131456162	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	180	2
799	384	171	0	28	chr3	28143758	28143830	-131455953	-	MTEa	LTR	MaLR	-289	90	21	2
799	651	301	82	36	chr3	28145193	28145524	-131454259	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-13	352	7	3
799	327	367	139	18	chr3	28150508	28150788	-131448995	+	MLT1G1	LTR	MaLR	88	401	-178	3
799	678	297	136	25	chr3	28150874	28151154	-131448629	+	MTEa	LTR	MaLR	7	317	-62	3
799	649	268	56	23	chr3	28151660	28151874	-131447909	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	155	3
799	352	334	124	25	chr3	28151875	28152231	-131447552	-	MLT1D	LTR	MaLR	-83	422	32	3
799	485	306	79	16	chr3	28153127	28153379	-131446404	-	MLT1F	LTR	MaLR	-2	546	279	3
799	682	288	59	79	chr3	28154370	28154484	-131445299	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	268	3
799	682	288	59	79	chr3	28154956	28155131	-131444652	-	MTE2a	LTR	MaLR	-112	267	96	3
799	716	247	194	42	chr3	28155449	28155797	-131443986	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	3
799	412	275	109	16	chr3	28156976	28157168	-131442615	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	197	3
799	2285	146	29	13	chr3	28159389	28159763	-131440020	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	3	3
799	1324	206	119	48	chr3	28170432	28170810	-131428973	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	3
799	450	305	63	5	chr3	28170868	28171059	-131428724	-	MLT1F	LTR	MaLR	-346	202	1	3
799	358	111	0	0	chr3	28172778	28172832	-131426951	+	ORR1B2	LTR	MaLR	5	58	-309	3
799	869	215	35	15	chr3	28172873	28173071	-131426712	+	ORR1B2	LTR	MaLR	157	358	-9	3
799	833	248	178	44	chr3	28173324	28173662	-131426121	+	MTD	LTR	MaLR	1	383	-36	3
799	3109	159	183	75	chr3	28174912	28175715	-131424068	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	3
799	4393	121	74	20	chr3	28176124	28176559	-131423224	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	466	-343	3
799	4393	121	74	20	chr3	28176599	28176930	-131422853	+	RMER17D2	LTR	ERVK	467	809	0	3
800	885	266	51	93	chr3	28182396	28182612	-131417171	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	200	-179	3
800	885	266	51	93	chr3	28182674	28182813	-131416970	+	MTE2a	LTR	MaLR	201	341	-38	3
800	2150	137	22	0	chr3	28184361	28184683	-131415100	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
800	2267	154	74	0	chr3	28185390	28185780	-131414003	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	3
800	904	263	56	116	chr3	28188703	28188989	-131410794	+	MTE2a	LTR	MaLR	8	261	-118	3
800	904	263	56	116	chr3	28189031	28189140	-131410643	+	MTE2a	LTR	MaLR	262	378	-1	3
800	1516	197	148	3	chr3	28194839	28195205	-131404578	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
800	1318	237	90	21	chr3	28204827	28205206	-131394577	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	4
800	229	325	65	41	chr3	28206812	28206982	-131392801	+	MLT1A0	LTR	MaLR	126	299	-66	4
800	572	259	32	8	chr3	28211440	28211607	-131388176	-	MTEb	LTR	MaLR	-23	356	163	4
800	788	208	6	6	chr3	28211807	28211986	-131387797	-	MTEb	LTR	MaLR	-200	179	1	4
800	1610	231	15	68	chr3	28215124	28215583	-131384200	-	RMER10A	LTR	ERVL	-7	435	1	4
800	1769	118	70	15	chr3	28218444	28218772	-131381011	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	4
800	723	283	57	116	chr3	28226399	28226787	-131372996	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	6	4
800	609	237	268	93	chr3	28232009	28232330	-131367453	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	379	0	4
800	811	310	88	14	chr3	28233359	28233784	-131365999	-	MER34A	LTR	ERV1	-125	462	6	4
800	1074	240	75	82	chr3	28235189	28235579	-131364204	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	370	1	4
800	1173	245	38	16	chr3	28241036	28241351	-131358432	-	MTD	LTR	MaLR	-88	331	10	4
800	1113	288	84	18	chr3	28241662	28242055	-131357728	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
800	252	253	103	0	chr3	28243063	28243150	-131356633	-	MLT1I	LTR	MaLR	-232	179	84	4
800	357	330	71	59	chr3	28243580	28243818	-131355965	-	MLT1J	LTR	MaLR	-33	479	239	4
800	517	253	119	8	chr3	28243907	28244110	-131355673	+	MTE2b	LTR	MaLR	21	234	-145	4
800	374	262	13	7	chr3	28247370	28247503	-131352280	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2429	3708	3621	4
800	347	262	74	93	chr3	28254095	28254352	-131345431	-	RMER15	LTR	ERVL	-9	566	315	5
800	468	279	121	101	chr3	28255047	28255453	-131344330	+	RMER10A	LTR	ERVL	12	425	-17	5
800	1392	208	136	6	chr3	28256770	28257123	-131342660	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	1	5
800	1236	252	12	31	chr3	28259425	28259748	-131340035	+	MTEa	LTR	MaLR	20	336	-43	5
800	482	256	254	45	chr3	28261677	28261964	-131337819	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	24	5
800	326	183	11	109	chr3	28262244	28262336	-131337447	+	MTE2b	LTR	MaLR	10	92	-287	5
800	914	234	72	26	chr3	28262517	28262781	-131337002	+	MTE2b	LTR	MaLR	100	375	-4	5
800	1166	229	45	31	chr3	28264525	28264881	-131334902	+	ORR1D2	LTR	MaLR	6	366	-4	5
800	3207	190	66	79	chr3	28267466	28268418	-131331365	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	5
800	230	235	32	105	chr3	28274645	28274740	-131325043	+	RMER12	LTR	ERVK	750	837	-485	5
800	420	232	72	0	chr3	28278698	28278823	-131320960	+	MLT1A1	LTR	MaLR	275	408	0	5
800	357	161	0	0	chr3	28287967	28288029	-131311754	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	62	-305	5
800	372	123	0	0	chr3	28288020	28288077	-131311706	+	ORR1B2	LTR	MaLR	311	367	0	5
800	294	321	119	0	chr3	28297023	28297157	-131302626	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-325	4674	4525	5
800	1682	164	50	16	chr3	28297629	28297946	-131301837	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-7	387	60	5
800	387	155	0	23	chr3	28297943	28298029	-131301754	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-245	84	1	5
800	341	250	216	5	chr3	28301825	28302010	-131297773	-	MLT1A	LTR	MaLR	-12	362	139	5
800	1059	242	117	43	chr3	28302499	28302875	-131296908	+	MTD	LTR	MaLR	13	416	-3	5
800	650	267	41	140	chr3	28305376	28305768	-131294015	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	3	5
801	817	192	104	33	chr3	28312364	28312614	-131287169	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	142	6
801	491	322	134	15	chr3	28313912	28314240	-131285543	+	MLT1C	LTR	MaLR	53	419	-48	6
801	267	185	77	0	chr3	28314714	28314779	-131285004	-	MTEb	LTR	MaLR	-9	370	301	6
801	3377	50	0	0	chr3	28322337	28322733	-131277050	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
801	2260	169	10	19	chr3	28323187	28323598	-131276185	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
801	743	279	66	82	chr3	28325593	28325783	-131274000	+	MTE2a	LTR	MaLR	7	183	-196	6
801	743	279	66	82	chr3	28325807	28325995	-131273788	+	MTE2a	LTR	MaLR	184	379	0	6
801	1171	271	67	16	chr3	28329020	28329395	-131270388	+	MTD	LTR	MaLR	11	404	-15	6
801	468	214	10	0	chr3	28330277	28330375	-131269408	+	MTE2b	LTR	MaLR	10	108	-313	6
801	315	143	0	0	chr3	28330395	28330444	-131269339	+	MTE2b	LTR	MaLR	75	123	-298	6
801	602	267	46	20	chr3	28331049	28331244	-131268539	+	MTE2b	LTR	MaLR	171	370	-9	6
801	248	353	50	45	chr3	28331287	28331486	-131268297	+	MLT1J2	LTR	MaLR	22	221	-227	6
801	707	250	114	27	chr3	28333130	28333393	-131266390	+	ORR1D2	LTR	MaLR	85	370	0	6
801	819	228	135	55	chr3	28342489	28342794	-131256989	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	356	-38	6
801	378	186	58	0	chr3	28348217	28348303	-131251480	-	MTE2a	LTR	MaLR	-29	350	260	6
801	446	290	121	5	chr3	28353518	28353733	-131246050	-	MER31B	LTR	ERV1	-214	252	13	6
801	1099	254	41	44	chr3	28358081	28358444	-131241339	-	RLTR17	LTR	ERVK	-226	466	105	6
801	251	298	45	160	chr3	28362740	28362896	-131236887	-	MTE2b	LTR	MaLR	-240	139	2	6
801	507	260	189	134	chr3	28363306	28363665	-131236118	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	6
801	2169	98	127	12	chr3	28373031	28373432	-131226351	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-85	447	1	6
801	461	323	17	30	chr3	28373505	28373792	-131225991	-	MuLV-int	LTR	ERV1	-80	7526	7263	6
801	559	290	52	34	chr3	28374254	28374634	-131225149	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-6798	808	428	6
801	492	143	144	1	chr3	28375082	28375219	-131224564	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	311	6
801	960	298	37	12	chr3	28379250	28379576	-131220207	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	26	7
801	433	234	97	74	chr3	28383091	28383308	-131216475	+	RMER5	LTR	ERV1	293	514	-20	7
801	810	180	68	0	chr3	28385268	28385429	-131214354	-	MTD	LTR	MaLR	-247	172	1	7
801	1303	241	73	14	chr3	28394305	28394659	-131205124	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	375	-4	7
801	2413	148	55	11	chr3	28419610	28420047	-131179736	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	351	806	0	7
801	1776	165	54	9	chr3	28424659	28424995	-131174788	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	351	-8	7
801	258	267	0	0	chr3	28424997	28425057	-131174726	+	MTE2b	LTR	MaLR	27	86	-293	7
801	1029	299	16	0	chr3	28425063	28425314	-131174469	+	MTE2b	LTR	MaLR	52	306	-73	7
801	854	228	111	13	chr3	28438995	28439015	-131160768	-	MTE2a	LTR	MaLR	-17	362	330	8
801	854	238	88	30	chr3	28439057	28439325	-131160458	-	MTE2a	LTR	MaLR	-50	329	91	8
801	1926	211	22	18	chr3	28440367	28440776	-131159007	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	5	8
801	279	224	0	17	chr3	28441390	28441449	-131158334	-	MTD	LTR	MaLR	-73	346	289	8
802	953	269	71	46	chr3	28457871	28458238	-131141545	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	1	8
802	1667	274	105	11	chr3	28458241	28458812	-131140971	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-3	1577	953	8
802	668	175	37	55	chr3	28458851	28459014	-131140769	-	MTD	LTR	MaLR	-259	160	1	8
802	980	193	123	43	chr3	28470808	28471153	-131128630	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	6	8
802	2668	175	44	12	chr3	28474452	28474950	-131124833	+	RMER20A	LTR	ERVK	3	516	0	8
802	941	258	34	127	chr3	28482748	28483166	-131116617	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	8
802	1732	112	35	151	chr3	28486117	28486580	-131113203	+	RMER17C	LTR	ERVK	2	410	0	8
802	1228	181	122	37	chr3	28486625	28486823	-131112960	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	198	8
802	1228	181	122	37	chr3	28486891	28487070	-131112713	-	RMER17C	LTR	ERVK	-213	197	2	8
802	640	193	181	60	chr3	28488287	28488469	-131111314	+	MTEa	LTR	MaLR	16	219	-160	8
802	288	219	16	0	chr3	28488484	28488548	-131111235	+	MTEa	LTR	MaLR	315	379	0	8
802	796	241	77	98	chr3	28489120	28489497	-131110286	-	MTE2a	LTR	MaLR	-4	375	7	8
802	979	266	36	70	chr3	28496670	28497058	-131102725	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	3	8
802	3239	31	31	3	chr3	28507687	28508072	-131091711	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
802	9879	13	0	0	chr3	28508072	28509170	-131090613	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
802	1152	64	0	6	chr3	28509170	28509328	-131090455	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	400	244	1
802	306	300	148	52	chr3	28522574	28522940	-131076843	-	RMER10A	LTR	ERVL	-24	418	18	2
802	435	261	102	37	chr3	28540772	28540959	-131058824	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-355	201	3	6
802	742	293	101	49	chr3	28543252	28543384	-131056399	-	MTEa	LTR	MaLR	-34	345	219	6
802	742	293	101	49	chr3	28543449	28543643	-131056140	-	MTEa	LTR	MaLR	-161	218	2	6
802	787	271	226	19	chr3	28555725	28556136	-131043647	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-58	498	3	7
803	1337	231	107	28	chr3	28575723	28576191	-131023592	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	1	8
803	825	114	29	29	chr3	28576813	28576949	-131022834	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	384	9
803	455	281	35	30	chr3	28577146	28577315	-131022468	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	390	9
803	236	342	38	31	chr3	28577413	28577573	-131022210	-	RMER15	LTR	ERVL	-414	161	1	9
803	2129	228	42	101	chr3	28582885	28583530	-131016253	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	607	-4	9
803	2243	188	20	4	chr3	28584723	28585177	-131014606	-	RLTR28	LTR	ERVL	-63	461	1	9
803	1846	160	87	30	chr3	28589080	28589518	-131010265	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	5	467	-110	1
803	375	240	104	0	chr3	28589749	28589845	-131009938	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	459	564	-13	1
803	2117	108	13	3	chr3	28590201	28590507	-131009276	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	1
803	4187	96	128	9	chr3	28592093	28592476	-131007307	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	312	1
803	4187	96	128	9	chr3	28592649	28592936	-131006847	-	RMER17A	LTR	ERVK	-440	311	2	1
803	381	325	93	15	chr3	28600576	28600883	-130998900	+	MLT1D	LTR	MaLR	270	504	-120	1
803	300	239	0	0	chr3	28609012	28609079	-130990704	-	RMER15	LTR	ERVL	-104	471	405	1
803	639	313	26	4	chr3	28609454	28609685	-130990098	-	MLT1D	LTR	MaLR	-11	494	259	1
803	1378	184	23	69	chr3	28609680	28610030	-130989753	-	MTC-int	LTR	MaLR	-122	1136	803	1
803	322	243	0	0	chr3	28610181	28610251	-130989532	+	RMER15	LTR	ERVL	402	471	-104	1
803	3653	184	49	11	chr3	28610280	28611037	-130988746	-	MTC-int	LTR	MaLR	-472	786	1	1
803	558	160	23	24	chr3	28611037	28611224	-130988559	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	297	1
803	306	301	188	5	chr3	28611240	28611447	-130988336	-	MLT1D	LTR	MaLR	-260	245	1	1
803	900	210	88	109	chr3	28631985	28632339	-130967444	+	MT2A	LTR	ERVL	1	476	-125	1
803	259	116	0	44	chr3	28632438	28632483	-130967300	+	MT2A	LTR	ERVL	535	577	-7	1
803	246	143	20	0	chr3	28632960	28633009	-130966774	-	MLT2D	LTR	ERVL	0	560	511	1
803	361	357	25	39	chr3	28633042	28633246	-130966537	-	MT2A	LTR	ERVL	-270	263	63	1
803	1012	233	89	80	chr3	28638398	28638860	-130960923	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	2
803	1386	239	89	38	chr3	28640304	28640382	-130959401	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	442	2
803	1386	239	89	38	chr3	28640411	28640828	-130958955	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-86	441	7	2
803	3836	122	138	64	chr3	28647531	28648468	-130951315	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1028	0	2
803	469	323	162	21	chr3	28649845	28650085	-130949698	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-183	332	59	2
803	930	240	56	15	chr3	28652851	28653118	-130946665	+	MTD	LTR	MaLR	1	278	-141	2
803	1084	163	54	33	chr3	28653216	28653457	-130946326	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-77	330	85	2
803	1736	178	79	17	chr3	28658833	28659215	-130940568	-	MTD	LTR	MaLR	-23	396	9	2
803	324	343	104	56	chr3	28660403	28660690	-130939093	+	MER68	LTR	ERVL	157	457	-106	2
803	1944	148	17	139	chr3	28666612	28667028	-130932755	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	365	-537	2
803	3443	60	0	5	chr3	28669345	28669747	-130930036	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
803	804	245	265	3	chr3	28674213	28674496	-130925287	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	357	-13	2
803	1759	213	95	5	chr3	28674567	28674935	-130924848	+	MTD	LTR	MaLR	1	401	-18	2
803	3277	204	213	50	chr3	28674935	28675723	-130924060	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	928	-330	2
803	3277	204	213	50	chr3	28675764	28676055	-130923728	+	MTD-int	LTR	MaLR	929	1256	-2	2
803	1891	185	69	71	chr3	28676056	28676117	-130923666	+	MTD	LTR	MaLR	1	50	-369	2
803	1891	185	69	71	chr3	28676265	28676623	-130923160	+	MTD	LTR	MaLR	51	419	0	2
803	687	306	80	40	chr3	28677266	28677593	-130922190	-	ORR1E	LTR	MaLR	-12	347	8	2
803	291	274	72	5	chr3	28684674	28684835	-130914948	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-964	4521	4344	2
803	352	319	72	14	chr3	28685315	28685522	-130914261	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2134	3533	3315	2
803	524	143	71	0	chr3	28688746	28688844	-130910939	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	87	191	-362	2
803	5619	199	126	31	chr3	28688844	28690268	-130909515	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1283	2841	-1	2
803	1761	138	68	12	chr3	28690269	28690593	-130909190	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	342	-211	2
803	269	269	15	0	chr3	28691622	28691689	-130908094	+	RMER15	LTR	ERVL	404	471	-104	3
803	1675	171	113	32	chr3	28702046	28702390	-130897393	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	3
804	858	303	168	15	chr3	28709369	28709412	-130890371	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	490	3
804	858	303	168	15	chr3	28709462	28709817	-130889966	-	MT2A	LTR	ERVL	-44	489	76	3
804	325	328	97	36	chr3	28710148	28710395	-130889388	-	MER90	LTR	ERV1	-313	262	1	3
804	1948	126	28	22	chr3	28714996	28715313	-130884470	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
804	768	273	84	68	chr3	28717197	28717507	-130882276	-	MTEa	LTR	MaLR	-64	315	1	3
804	1417	342	111	66	chr3	28717727	28718050	-130881733	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-26	1554	1201	3
804	3649	28	2	0	chr3	28718050	28718444	-130881339	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	3
804	1417	342	111	66	chr3	28718444	28719084	-130880699	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-380	1200	548	3
804	566	337	117	35	chr3	28719354	28719815	-130879968	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1081	499	1	3
804	539	303	106	75	chr3	28719834	28720183	-130879600	-	MTEa	LTR	MaLR	-19	360	1	3
804	1693	252	29	36	chr3	28722300	28722777	-130877006	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	138	3
804	997	266	32	69	chr3	28723910	28724304	-130875479	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	410	25	3
804	1688	132	7	2	chr3	28726900	28727208	-130872575	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	338	36	3
804	3970	68	0	66	chr3	28733901	28734449	-130865334	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	3
804	991	139	171	37	chr3	28735008	28735225	-130864558	-	RMER6B	LTR	ERVK	-8	453	208	3
804	884	241	145	43	chr3	28735627	28736000	-130863783	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	7	3
804	2986	83	10	12	chr3	28736002	28736406	-130863377	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	3
804	1013	238	209	14	chr3	28738825	28739170	-130860613	+	MTD	LTR	MaLR	6	417	-2	3
804	228	330	156	38	chr3	28741156	28741367	-130858416	-	MER74A	LTR	ERVL	-77	481	246	4
804	3712	131	25	27	chr3	28741778	28742407	-130857376	+	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	1	628	0	4
804	1087	261	114	26	chr3	28742499	28742841	-130856942	+	MTEa	LTR	MaLR	2	373	-6	4
804	7450	62	7	6	chr3	28748937	28749894	-130849889	-	RLTR13A2	LTR	ERVK	0	958	1	4
804	3083	211	40	53	chr3	28750023	28750868	-130848915	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-31	2811	1978	4
804	4574	50	9	14	chr3	28750870	28751436	-130848347	-	LTRIS2	LTR	ERV1	-1	563	1	4
804	825	242	31	4	chr3	28751437	28751665	-130848118	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-42	5021	4788	4
804	8166	154	49	41	chr3	28751656	28754841	-130844942	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-792	4271	760	4
804	4796	136	36	24	chr3	28754832	28755738	-130844045	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-3962	1444	141	4
804	4186	66	38	13	chr3	28756398	28756948	-130842835	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	4
804	3864	188	38	16	chr3	28757021	28757951	-130841832	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-987	1855	404	4
804	383	211	0	59	chr3	28758009	28758110	-130841673	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2116	726	632	4
804	295	301	63	31	chr3	28758541	28758668	-130841115	+	RLTR41	LTR	ERV1	268	398	-48	4
804	495	242	116	63	chr3	28758710	28758917	-130840866	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2599	243	26	4
804	244	125	0	0	chr3	28758944	28758984	-130840799	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	545	4
804	1867	198	20	11	chr3	28759115	28759567	-130840216	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-101	460	5	4
804	1961	92	108	7	chr3	28774260	28774556	-130825227	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	326	0	4
804	33540	90	14	7	chr3	28774556	28782094	-130817689	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	1	7240	-273	4
804	2297	86	3	33	chr3	28782094	28782430	-130817353	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	326	0	4
804	4079	35	14	2	chr3	28782612	28783099	-130816684	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
804	44136	25	9	0	chr3	28783099	28788425	-130811358	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5371	-114	4
804	371	111	26	53	chr3	28788425	28788501	-130811282	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	4
804	291	26	0	0	chr3	28788501	28788539	-130811244	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	4
804	4127	33	12	2	chr3	28788539	28789027	-130810756	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
804	235	258	97	0	chr3	28793501	28793563	-130806220	-	RMER10A	LTR	ERVL	-54	388	321	4
804	1609	204	22	16	chr3	28798373	28798696	-130801087	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-65	503	179	4
804	246	188	0	59	chr3	28800538	28800589	-130799194	-	MT2B	LTR	ERVL	0	584	537	4
804	1925	120	64	13	chr3	28800590	28800903	-130798880	-	MT2B	LTR	ERVL	-255	346	18	4
804	458	311	26	72	chr3	28818834	28819028	-130780755	-	MTEa	LTR	MaLR	-132	247	63	4
804	1074	284	86	27	chr3	28823356	28823693	-130776090	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	46	4
804	904	322	44	52	chr3	28823706	28824073	-130775710	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	3	4
804	522	370	51	78	chr3	28825974	28826346	-130773437	-	MTE2b	LTR	MaLR	-15	364	3	4
804	2099	108	10	22	chr3	28829831	28830144	-130769639	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	4
804	1394	161	0	26	chr3	28830144	28830412	-130769371	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	7321	4
804	326	297	25	25	chr3	28830546	28830708	-130769075	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-512	7069	6908	4
804	2790	297	39	34	chr3	28830927	28832795	-130766988	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2104	5477	3267	4
804	610	233	45	45	chr3	28833150	28833348	-130766435	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1135	852	655	5
804	362	45	7	0	chr3	28833380	28833433	-130766350	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7314	267	163	5
804	2100	111	10	22	chr3	28833457	28833770	-130766013	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	5
805	1916	177	75	22	chr3	28837927	28838342	-130761441	-	RMER10A	LTR	ERVL	-3	439	3	5
805	2001	226	29	95	chr3	28838350	28839004	-130760779	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	5
805	327	179	30	0	chr3	28840087	28840154	-130759629	+	RMER19B	LTR	ERVK	692	760	-142	5
805	834	224	93	0	chr3	28843335	28843518	-130756265	+	ORR1D1	LTR	MaLR	15	214	-160	5
805	4426	158	30	23	chr3	28844926	28845766	-130754017	+	RLTR13A	LTR	ERVK	10	855	0	5
805	2278	227	86	72	chr3	28848870	28849743	-130750040	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-8	894	10	5
805	786	307	115	20	chr3	28858634	28858930	-130740853	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	324	-46	5
805	1702	182	55	101	chr3	28860429	28860523	-130739260	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	93	-468	5
805	1702	182	55	101	chr3	28860590	28861081	-130738702	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	94	559	-2	5
805	428	336	40	57	chr3	28861930	28862157	-130737626	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	350	5
805	2604	135	16	52	chr3	28862738	28863184	-130736599	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	5
805	3243	21	42	0	chr3	28863951	28864331	-130735452	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
805	1676	202	58	75	chr3	28876011	28876516	-130723267	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	5
805	1328	232	116	9	chr3	28876516	28876850	-130722933	-	MTD	LTR	MaLR	-32	387	18	5
805	1041	163	11	26	chr3	28877806	28878040	-130721743	+	MT2B	LTR	ERVL	353	601	0	5
805	1357	157	170	11	chr3	28883929	28884199	-130715584	+	ORR1A4	LTR	MaLR	2	314	-15	5
805	573	262	114	50	chr3	28886539	28886661	-130713122	-	MTD	LTR	MaLR	-149	270	132	5
805	573	262	114	50	chr3	28886694	28886772	-130713011	-	MTD	LTR	MaLR	-288	131	57	5
805	1168	273	143	49	chr3	28886774	28887306	-130712477	-	RLTR26	LTR	ERVK	-60	582	1	5
805	272	271	70	12	chr3	28896502	28896588	-130703195	-	MTEb	LTR	MaLR	-8	371	281	5
805	780	216	29	35	chr3	28896588	28896760	-130703023	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	457	5
805	1152	255	35	22	chr3	28896760	28897077	-130702706	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	5
805	2239	160	19	84	chr3	28897084	28897561	-130702222	-	RMER20B	LTR	ERVK	-168	459	14	5
805	678	280	177	0	chr3	28897566	28897809	-130701974	-	MTEb	LTR	MaLR	-93	286	1	5
805	1120	243	160	63	chr3	28900372	28900754	-130699029	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
805	238	359	131	75	chr3	28903291	28903490	-130696293	+	MER77	LTR	ERVL	147	356	-251	5
805	1590	225	90	14	chr3	28905901	28906266	-130693517	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	12	6
805	228	172	14	86	chr3	28913567	28913637	-130686146	-	RMER17D	LTR	ERVK	-283	606	542	6
805	609	287	84	76	chr3	28920149	28920518	-130679265	-	RMER13A	LTR	ERVK	-467	393	22	6
805	1818	209	16	61	chr3	28922322	28922765	-130677018	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	205	6
805	3921	144	34	67	chr3	28923500	28924503	-130675280	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	983	1	6
805	3580	26	13	0	chr3	28932937	28933328	-130666455	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
805	3100	156	203	27	chr3	28939713	28940340	-130659443	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	6
805	619	276	90	95	chr3	28944222	28944421	-130655362	-	MTD	LTR	MaLR	-33	386	172	6
805	2029	142	3	6	chr3	28944421	28944733	-130655050	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	6
805	619	276	90	95	chr3	28944733	28944921	-130654862	-	MTD	LTR	MaLR	-248	171	1	6
805	3813	35	5	0	chr3	28951818	28952252	-130647531	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	6
805	4643	164	55	24	chr3	28953306	28954187	-130645596	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	6
805	3441	28	5	0	chr3	28955003	28955397	-130644386	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
805	479	330	27	16	chr3	28956960	28957145	-130642638	-	MTD	LTR	MaLR	-232	187	1	6
805	853	274	45	84	chr3	28957493	28957848	-130641935	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	15	6
805	355	253	188	108	chr3	28958525	28958866	-130640917	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	6
805	3945	109	16	39	chr3	28964630	28965243	-130634540	-	MT2B	LTR	ERVL	-2	599	1	6
806	2364	110	80	11	chr3	28970420	28970796	-130628987	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	4	6
806	447	290	87	73	chr3	28974062	28974337	-130625446	+	RLTR19	LTR	ERVK	228	506	0	7
806	2051	144	63	20	chr3	28994194	28994590	-130605193	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	7
806	435	289	87	70	chr3	28998404	28998776	-130601007	-	LTR40a	LTR	ERVL	-1	518	91	7
806	2894	160	112	22	chr3	29003430	29003725	-130596058	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	359	6
806	2894	160	112	22	chr3	29003917	29004254	-130595529	-	RMER6C	LTR	ERVK	-332	358	2	6
806	640	216	204	0	chr3	29005421	29005583	-130594200	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-179	195	1	9
806	902	288	86	110	chr3	29006468	29006797	-130592986	-	RLTR16	LTR	ERVK	-76	452	1	1
806	561	278	152	77	chr3	29019465	29019801	-130579982	+	MTE2a	LTR	MaLR	19	379	0	3
806	292	341	0	54	chr3	29020740	29020870	-130578913	-	RMER12	LTR	ERVK	-466	856	734	3
806	613	273	154	0	chr3	29020875	29021102	-130578681	+	MTEb	LTR	MaLR	117	378	-1	3
806	234	167	24	0	chr3	29022587	29022629	-130577154	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	43	-336	3
806	2966	63	5	12	chr3	29032257	29032656	-130567127	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
806	1504	173	113	30	chr3	29032996	29033423	-130566360	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	1	5
806	669	216	99	38	chr3	29038481	29038575	-130561208	+	ORR1C2	LTR	MaLR	144	234	-150	5
806	669	216	99	38	chr3	29038609	29038726	-130561057	+	ORR1C2	LTR	MaLR	235	368	-16	5
806	383	269	8	42	chr3	29057004	29057124	-130542659	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	116	-351	8
806	306	333	102	24	chr3	29057142	29057348	-130542435	+	MLT1C	LTR	MaLR	179	400	-67	8
806	260	243	56	14	chr3	29058730	29058801	-130540982	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-276	89	16	8
806	1104	237	154	37	chr3	29061913	29062264	-130537519	-	RMER15	LTR	ERVL	-154	421	30	9
806	248	292	0	44	chr3	29062313	29062381	-130537402	-	RMER15	LTR	ERVL	-510	65	1	9
806	363	348	190	35	chr3	29063223	29063595	-130536188	+	MER77	LTR	ERVL	175	604	-3	9
806	1805	183	148	6	chr3	29071816	29072174	-130527609	+	MTC	LTR	MaLR	13	421	0	1
806	248	361	16	63	chr3	29075901	29076028	-130523755	+	MLT1A	LTR	MaLR	218	338	-36	1
806	934	258	171	60	chr3	29079334	29079668	-130520115	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	371	-8	1
806	1769	132	5	138	chr3	29079810	29080180	-130519603	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	1
806	1131	254	109	19	chr3	29086541	29086862	-130512921	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	353	-6	1
806	1490	247	69	16	chr3	29086972	29087351	-130512432	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	18	1
807	506	237	8	48	chr3	29102544	29102668	-130497115	+	MTC	LTR	MaLR	2	120	-301	1
807	1281	196	65	8	chr3	29102925	29103169	-130496614	+	MTC	LTR	MaLR	114	374	-47	1
807	1281	196	65	8	chr3	29103235	29103251	-130496532	+	MTC	LTR	MaLR	375	388	-33	1
807	328	106	0	28	chr3	29103685	29103742	-130496041	+	MTD	LTR	MaLR	312	411	-8	1
807	2156	197	17	17	chr3	29106291	29106704	-130493079	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	1
807	2245	158	23	5	chr3	29106899	29107286	-130492497	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
807	910	269	116	90	chr3	29109233	29109551	-130490232	+	MTD	LTR	MaLR	1	315	-104	1
807	910	269	116	90	chr3	29109769	29109838	-130489945	+	MTD	LTR	MaLR	316	398	-21	1
807	435	350	138	17	chr3	29111075	29111430	-130488353	+	MLT1C	LTR	MaLR	60	457	-10	1
807	249	257	73	37	chr3	29112148	29112257	-130487526	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1307	1419	-429	1
807	980	206	113	181	chr3	29117989	29118165	-130481618	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	183	1
807	980	206	113	181	chr3	29118210	29118274	-130481509	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-192	182	163	1
807	980	206	113	181	chr3	29118364	29118519	-130481264	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-212	162	1	1
807	1632	146	73	73	chr3	29120876	29121230	-130478553	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	1
807	652	289	125	20	chr3	29127071	29127375	-130472408	-	MLT1B	LTR	MaLR	-9	381	46	1
807	1072	247	113	3	chr3	29130584	29130893	-130468890	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	343	-31	1
807	433	275	47	88	chr3	29140303	29140598	-130459185	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	2	2
807	264	368	48	14	chr3	29148894	29149040	-130450743	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	410	2
807	791	182	90	64	chr3	29151197	29151385	-130448398	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	192	2
807	574	275	131	0	chr3	29151593	29151753	-130448030	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-193	181	1	2
807	1552	221	20	56	chr3	29158098	29158237	-130441546	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	244	2
807	1552	221	20	56	chr3	29158275	29158305	-130441478	-	RLTR14	LTR	ERV1	-139	243	228	2
807	1552	221	20	56	chr3	29158338	29158560	-130441223	-	RLTR14	LTR	ERV1	-155	227	5	2
807	356	345	27	7	chr3	29158681	29158830	-130440953	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-272	5045	4894	2
807	469	352	56	43	chr3	29162993	29163296	-130436487	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-58	307	1	2
807	849	234	21	23	chr3	29168416	29168788	-130430995	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	108	542	-5219	2
807	1613	214	70	0	chr3	29168795	29169154	-130430629	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2480	2863	-2898	2
807	427	260	22	27	chr3	29169180	29169319	-130430464	+	MTD	LTR	MaLR	239	405	-14	2
807	312	263	165	58	chr3	29170238	29170359	-130429424	+	MLT1A0	LTR	MaLR	124	257	-108	2
807	1230	279	21	34	chr3	29173094	29173169	-130426614	+	MTEb	LTR	MaLR	6	78	-301	2
807	1144	238	78	67	chr3	29173169	29173543	-130426240	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	2
807	1230	279	21	34	chr3	29173543	29173846	-130425937	+	MTEb	LTR	MaLR	79	379	0	2
807	371	309	143	10	chr3	29176385	29176571	-130423212	+	MLT1A-int	LTR	MaLR	302	507	-864	2
807	371	309	143	10	chr3	29176736	29176856	-130422927	+	MLT1A-int	LTR	MaLR	508	648	-723	2
807	874	292	110	35	chr3	29176919	29177292	-130422491	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	2
807	756	295	87	45	chr3	29177536	29177845	-130421938	-	RMER5	LTR	ERV1	-180	354	33	2
807	467	345	91	5	chr3	29178086	29178307	-130421476	+	MLT-int	LTR	MaLR	1356	1595	-140	2
807	589	293	84	62	chr3	29184607	29184916	-130414867	+	MLT1A	LTR	MaLR	39	354	-20	2
807	225	293	52	42	chr3	29200442	29200538	-130399245	-	MT2B2	LTR	ERVL	-283	301	205	2
807	254	119	0	45	chr3	29224337	29224381	-130375402	+	MT2A	LTR	ERVL	1	42	-491	3
807	297	339	92	60	chr3	29225112	29225429	-130374354	-	ORR1E	LTR	MaLR	-26	333	7	3
808	243	184	78	13	chr3	29230712	29230789	-130368994	-	LTR37A	LTR	ERV1	-81	345	264	3
808	737	316	86	38	chr3	29231453	29231766	-130368017	-	ORR1E	LTR	MaLR	-30	329	2	3
808	511	334	137	61	chr3	29243549	29243893	-130355890	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-209	370	1	3
808	805	305	67	42	chr3	29245444	29245713	-130354070	-	ORR1E	LTR	MaLR	-77	302	1	3
808	564	287	104	18	chr3	29277463	29277800	-130321983	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-514	5243	4838	4
808	3063	26	0	0	chr3	29291880	29292226	-130307557	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	4
808	251	300	70	0	chr3	29296974	29296986	-130302797	-	LTR81C	LTR	ERV1?	-167	986	880	4
808	266	273	57	0	chr3	29296986	29297074	-130302709	-	MamGypLTR2	LTR	Gypsy	-203	986	894	4
808	1405	259	64	10	chr3	29297569	29297959	-130301824	+	MT2A	LTR	ERVL	13	423	-110	4
808	287	247	106	50	chr3	29299019	29299198	-130300585	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-396	1452	1264	4
808	984	324	58	50	chr3	29308640	29309104	-130290679	+	MLT1D	LTR	MaLR	36	503	-2	4
808	448	359	85	52	chr3	29309942	29310212	-130289571	-	MLT1H	LTR	MaLR	-229	320	42	4
808	549	294	33	6	chr3	29317646	29317819	-130281964	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-3	405	204	4
808	423	261	33	16	chr3	29325375	29325496	-130274287	-	RMER15	LTR	ERVL	-48	527	405	4
808	629	236	160	45	chr3	29326464	29326664	-130273119	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	144	4
808	260	154	0	0	chr3	29327506	29327545	-130272238	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-229	155	117	4
808	1342	200	65	35	chr3	29327545	29327835	-130271948	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	299	-609	4
808	2231	216	70	39	chr3	29327919	29328491	-130271292	+	RMER13B	LTR	ERVK	310	899	-9	4
808	293	263	125	10	chr3	29328505	29328601	-130271182	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-259	111	5	4
808	4246	168	89	44	chr3	29334544	29335410	-130264373	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1028	136	4
808	4246	172	89	45	chr3	29335439	29335576	-130264207	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-892	136	1	4
808	4030	81	20	7	chr3	29336641	29337198	-130262585	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	4
808	966	323	45	87	chr3	29339127	29339643	-130260140	+	MLT2B2	LTR	ERVL	22	515	0	4
808	1959	189	74	28	chr3	29342306	29342808	-130256975	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-2	525	1	4
808	1388	249	82	18	chr3	29359221	29359564	-130240219	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	54	5
809	588	274	55	51	chr3	29367498	29367594	-130232189	-	RMER15	LTR	ERVL	-46	529	431	5
809	588	274	55	51	chr3	29367744	29367882	-130231901	-	RMER15	LTR	ERVL	-145	430	294	5
809	422	195	111	70	chr3	29370960	29371159	-130228624	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	207	-152	5
809	1716	174	16	88	chr3	29373249	29373622	-130226161	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	5
809	309	182	133	22	chr3	29376060	29376150	-130223633	+	LTR37B	LTR	ERV1	364	463	-5	5
809	557	236	24	16	chr3	29376547	29376672	-130223111	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-979	391	266	5
809	385	152	30	0	chr3	29376750	29376816	-130222967	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	370	303	5
809	938	256	54	54	chr3	29376822	29377153	-130222630	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-148	333	3	5
809	387	295	68	99	chr3	29379221	29379443	-130220340	+	LTR48B	LTR	ERV1	372	688	-99	5
809	1529	248	56	19	chr3	29385254	29385611	-130214172	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	17	5
809	1529	248	56	19	chr3	29385659	29385675	-130214108	-	MTD	LTR	MaLR	-403	16	1	5
809	3110	37	42	0	chr3	29392930	29393310	-130206473	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
809	401	308	83	42	chr3	29394980	29395197	-130204586	+	RMER15	LTR	ERVL	347	572	-3	5
809	263	336	69	0	chr3	29399935	29400051	-130199732	+	MLT1F1	LTR	MaLR	428	551	-18	5
809	706	200	189	19	chr3	29401712	29401962	-130197821	-	RMER13B	LTR	ERVK	-314	328	6	5
809	2614	119	29	25	chr3	29405858	29406307	-130193476	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	3	5
809	421	330	129	85	chr3	29408164	29408621	-130191162	+	MLT1H1	LTR	MaLR	60	536	-19	5
809	1324	181	80	45	chr3	29408874	29409163	-130190620	+	ORR1C2	LTR	MaLR	86	384	0	5
809	438	259	64	58	chr3	29415076	29415231	-130184552	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	364	5
809	1005	235	61	49	chr3	29415231	29415699	-130184084	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	551	0	5
809	286	175	15	45	chr3	29415761	29415827	-130183956	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-387	164	101	5
809	1624	191	52	20	chr3	29424318	29424666	-130175117	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
809	255	372	97	89	chr3	29429753	29430248	-130169535	-	LTR41	LTR	ERVL	-80	688	190	6
809	274	324	124	73	chr3	29430279	29430552	-130169231	-	LTR41	LTR	ERVL	-452	316	30	6
809	1591	222	50	14	chr3	29433726	29434083	-130165700	+	MTD	LTR	MaLR	13	382	-37	6
809	255	271	0	17	chr3	29435309	29435369	-130164414	+	LTR85b	LTR	Gypsy?	726	784	0	6
809	524	251	42	72	chr3	29438023	29438216	-130161567	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	244	6
809	1966	198	131	14	chr3	29438557	29439070	-130160713	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	3	6
809	1762	206	193	9	chr3	29464913	29465343	-130134440	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	509	-19	6
809	1495	226	174	20	chr3	29465569	29465971	-130133812	-	MT2A	LTR	ERVL	-69	464	1	6
809	3393	28	2	2	chr3	29467182	29467578	-130132205	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
809	1712	212	30	3	chr3	29467710	29468079	-130131704	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	379	0	6
809	270	243	100	0	chr3	29468393	29468463	-130131320	-	MTC	LTR	MaLR	-327	94	18	6
809	1857	146	3	73	chr3	29470764	29471118	-130128665	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
809	1791	194	63	8	chr3	29472511	29472875	-130126908	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	6
809	302	349	19	13	chr3	29489120	29489274	-130110509	+	MLT1A0	LTR	MaLR	2	156	-209	6
810	318	296	154	34	chr3	29493968	29494143	-130105640	-	MER74C	LTR	ERVL	-4	456	261	7
810	1682	222	27	5	chr3	29497695	29497754	-130102029	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	322	7
810	1682	222	27	5	chr3	29497788	29497880	-130101903	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-63	321	227	7
810	1682	222	27	5	chr3	29497911	29498134	-130101649	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-158	226	2	7
810	396	360	111	17	chr3	29506024	29506383	-130093400	-	LTR16A	LTR	ERVL	-1	450	58	1
810	271	309	15	68	chr3	29516912	29517176	-130082607	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	250	-160	2
810	310	282	99	9	chr3	29520896	29521007	-130078776	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	245	3
810	227	150	24	48	chr3	29522549	29522633	-130077150	-	MT2A	LTR	ERVL	-4	529	448	3
810	431	336	32	84	chr3	29522750	29523000	-130076783	-	MT2A	LTR	ERVL	-142	391	155	3
810	280	316	171	0	chr3	29523033	29523150	-130076633	-	MTE2a	LTR	MaLR	-242	137	1	3
810	1216	216	125	38	chr3	29529330	29529643	-130070140	+	MTD	LTR	MaLR	80	419	0	4
810	429	272	56	86	chr3	29537590	29537634	-130062149	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-4	1959	1924	5
810	1024	145	350	14	chr3	29537634	29537914	-130061869	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
810	1481	174	42	7	chr3	29537914	29538199	-130061584	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1	1369	1076	5
810	1432	215	89	41	chr3	29538202	29538240	-130061543	-	MT2B	LTR	ERVL	-2	599	562	5
810	1432	214	191	178	chr3	29538284	29538712	-130061071	-	MT2B	LTR	ERVL	-40	561	1	5
810	2998	235	68	37	chr3	29538712	29539464	-130060319	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-290	1080	306	5
810	992	176	16	11	chr3	29541715	29541899	-130057884	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1044	326	142	5
810	578	207	8	0	chr3	29542033	29542154	-130057629	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1248	122	1	5
810	712	249	179	9	chr3	29542154	29542456	-130057327	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	370	9	5
810	286	257	0	0	chr3	29543268	29543342	-130056441	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-6	549	476	6
810	1502	234	22	42	chr3	29543897	29544304	-130055479	-	MT2A	LTR	ERVL	-58	543	5	6
810	243	265	45	66	chr3	29546768	29546966	-130052817	-	RMER17C	LTR	ERVK	-136	274	81	7
810	614	253	96	30	chr3	29551399	29551663	-130048120	+	MTC	LTR	MaLR	2	298	-109	8
810	1925	122	82	3	chr3	29559195	29559498	-130040285	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
810	2789	157	35	38	chr3	29563024	29563599	-130036184	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	1	1
810	1563	129	4	0	chr3	29567429	29567662	-130032121	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	93	1
810	709	117	2	0	chr3	29567823	29567929	-130031854	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-221	108	1	1
810	1915	174	43	6	chr3	29580692	29581044	-130018739	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	365	-2	1
810	1369	231	52	11	chr3	29581983	29582351	-130017432	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	384	0	1
810	248	258	140	0	chr3	29583452	29583545	-130016238	+	RMER20B	LTR	ERVK	287	392	-235	1
810	502	191	138	14	chr3	29583949	29584087	-130015696	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-15	438	284	1
810	1025	227	19	54	chr3	29584144	29584461	-130015322	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-220	307	1	1
810	262	244	92	11	chr3	29586324	29586411	-130013372	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	272	1
810	329	319	88	63	chr3	29587432	29587776	-130012007	-	MLT1C	LTR	MaLR	-26	441	24	1
810	415	343	167	35	chr3	29592357	29592819	-130006964	-	MLT1H	LTR	MaLR	-9	540	16	1
810	684	288	184	28	chr3	29596666	29597154	-130002629	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-90	1490	972	1
810	466	182	21	29	chr3	29598108	29598214	-130001569	+	RMER10A	LTR	ERVL	50	156	-286	1
810	1501	224	69	12	chr3	29599394	29599728	-130000055	-	MTD	LTR	MaLR	-66	353	1	1
810	322	154	70	93	chr3	29599886	29599972	-129999811	+	RLTR25B	LTR	ERVK	426	509	-519	1
810	473	332	45	10	chr3	29611018	29611216	-129988567	-	MLT1H	LTR	MaLR	-339	210	6	1
811	487	314	48	26	chr3	29627578	29627807	-129971976	-	MTEa	LTR	MaLR	-43	336	103	1
811	275	194	27	14	chr3	29627872	29627945	-129971838	-	MTEa	LTR	MaLR	-300	79	6	1
811	420	324	35	21	chr3	29652844	29652989	-129946794	+	MLT1D	LTR	MaLR	13	159	-346	2
811	1855	181	13	74	chr3	29662260	29662637	-129937146	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	2
811	1118	294	34	67	chr3	29664224	29664610	-129935173	-	MTE2b	LTR	MaLR	-6	373	1	2
811	565	339	33	27	chr3	29667759	29668018	-129931765	-	ORR1E	LTR	MaLR	-105	269	1	2
811	2170	138	3	0	chr3	29668184	29668510	-129931273	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
811	764	239	56	33	chr3	29669636	29669875	-129929908	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	105	2
811	2138	122	20	6	chr3	29677451	29677805	-129921978	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	2
811	2560	203	96	69	chr3	29678029	29679120	-129920663	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-173	8786	7816	2
811	249	226	56	133	chr3	29679120	29679245	-129920538	-	RMER4B	LTR	ERVK	-49	536	309	2
811	1027	260	42	79	chr3	29679270	29679470	-129920313	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1429	897	706	2
811	1027	260	42	79	chr3	29679744	29680039	-129919744	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1621	705	420	2
811	252	207	0	0	chr3	29680049	29680107	-129919676	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1488	1354	1297	2
811	3229	44	5	0	chr3	29682290	29682673	-129917110	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	2
811	479	286	132	63	chr3	29696697	29697023	-129902760	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	377	-2	2
811	236	314	37	61	chr3	29697391	29697554	-129902229	+	MER34A	LTR	ERV1	402	560	-11	2
811	1908	174	52	3	chr3	29697821	29698167	-129901616	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	5	2
811	1177	177	57	56	chr3	29704899	29705205	-129894578	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	267	-111	3
811	1028	281	42	58	chr3	29715910	29716269	-129883514	+	MTD	LTR	MaLR	23	375	-44	3
811	2115	119	22	0	chr3	29722963	29723283	-129876500	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	3	3
811	316	244	134	0	chr3	29730785	29730867	-129868916	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	93	-286	3
811	235	276	0	0	chr3	29730873	29730931	-129868852	+	MTE2b	LTR	MaLR	240	297	-82	3
811	233	200	0	22	chr3	29730916	29730962	-129868821	+	MTE2b	LTR	MaLR	253	297	-82	3
811	479	205	0	35	chr3	29730954	29731070	-129868713	+	MTE2b	LTR	MaLR	260	371	-8	3
811	312	194	47	131	chr3	29736255	29736362	-129863421	+	MT2B	LTR	ERVL	167	264	-337	3
812	241	280	0	0	chr3	29753961	29754011	-129845772	+	MTD	LTR	MaLR	138	187	-232	3
812	804	311	75	12	chr3	29762623	29762945	-129836838	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-12	353	12	3
812	3392	28	8	0	chr3	29775643	29776035	-129823748	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	2	4
812	345	274	53	9	chr3	29779805	29779919	-129819864	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	120	-254	4
812	876	193	37	56	chr3	29779888	29780102	-129819681	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	22	231	-346	4
812	983	215	54	38	chr3	29781578	29781839	-129817944	+	RMER19C	LTR	ERVK	347	611	0	4
812	1975	158	68	32	chr3	29783318	29783698	-129816085	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
812	227	333	24	12	chr3	29787124	29787209	-129812574	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	86	-322	4
812	236	289	16	90	chr3	29787268	29787469	-129812314	+	MTE2a	LTR	MaLR	197	373	-6	4
812	250	281	98	33	chr3	29807730	29807822	-129791961	+	LTR16A	LTR	ERVL	190	287	-164	4
812	313	336	35	14	chr3	29808228	29808370	-129791413	+	MLT1F	LTR	MaLR	105	249	-299	4
812	266	400	32	32	chr3	29819212	29819496	-129780287	+	ORR1E	LTR	MaLR	24	307	-52	4
812	2325	88	22	3	chr3	29819634	29819955	-129779828	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	4
812	264	383	9	0	chr3	29821673	29821788	-129777995	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4145	4260	-1454	4
812	250	379	39	0	chr3	29823058	29823161	-129776622	+	LTR16A	LTR	ERVL	345	451	0	4
812	289	216	64	51	chr3	29827758	29827836	-129771947	+	RLTR25B	LTR	ERVK	431	509	-519	4
812	1267	265	35	58	chr3	29830228	29830453	-129769330	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	191	4
812	1267	265	35	58	chr3	29831016	29831219	-129768564	-	MTC	LTR	MaLR	-231	190	3	4
812	2066	241	41	28	chr3	29831882	29832519	-129767264	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	3777	4421	-2129	4
812	710	310	25	13	chr3	29832714	29832949	-129766834	+	MTE2a	LTR	MaLR	7	244	-135	4
812	5157	86	72	99	chr3	29835433	29836351	-129763432	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	4
812	2915	58	45	0	chr3	29844925	29845304	-129754479	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
813	241	256	10	122	chr3	29932554	29932652	-129667131	-	MT2B2	LTR	ERVL	-346	238	152	6
813	845	318	95	9	chr3	29939014	29939363	-129660420	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	6
813	2004	284	83	26	chr3	29939344	29940669	-129659114	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1	1580	0	6
813	1105	291	86	15	chr3	29940669	29941007	-129658776	+	MTEb	LTR	MaLR	1	362	-17	6
813	3178	86	0	0	chr3	29960860	29961267	-129638516	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
813	587	193	108	47	chr3	29976883	29977138	-129622645	+	MTD	LTR	MaLR	1	420	-1	6
813	3242	29	29	0	chr3	29986736	29987119	-129612664	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	3	396	0	6
813	262	286	132	51	chr3	30010812	30011036	-129588747	+	MLT1C	LTR	MaLR	3	241	-149	1
814	1418	204	31	28	chr3	30025880	30026206	-129573577	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	374	0	4
814	446	314	59	96	chr3	30028586	30028910	-129570873	+	ORR1D2	LTR	MaLR	57	368	-2	4
814	231	348	89	75	chr3	30031918	30032210	-129567573	+	MLT1J	LTR	MaLR	102	397	-115	5
814	922	182	137	38	chr3	30036466	30036771	-129563012	+	MT2A	LTR	ERVL	1	461	-140	5
814	2274	130	16	3	chr3	30094159	30094482	-129505301	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	1
815	480	282	45	131	chr3	30178075	30178248	-129421535	+	MLT1B	LTR	MaLR	164	319	-71	2
815	480	282	45	131	chr3	30178442	30178513	-129421270	+	MLT1B	LTR	MaLR	320	387	-3	2
815	1196	282	13	3	chr3	30236518	30236817	-129362966	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	304	-75	2
815	292	246	102	34	chr3	30243587	30243705	-129356078	+	MLT1N2	LTR	MaLR	429	554	-8	3
815	291	339	86	47	chr3	30247244	30247476	-129352307	+	ORR1E	LTR	MaLR	67	307	-52	3
815	834	244	79	0	chr3	30250627	30250862	-129348921	+	MTEa	LTR	MaLR	1	261	-118	3
815	396	292	19	65	chr3	30250984	30251138	-129348645	+	MTEa	LTR	MaLR	231	377	-2	3
815	434	259	115	74	chr3	30265339	30265556	-129334227	+	MLT1K	LTR	MaLR	20	245	-350	3
816	1201	270	34	53	chr3	30288877	30289148	-129310635	+	MTEa	LTR	MaLR	3	264	-115	3
816	1201	270	34	53	chr3	30289194	30289301	-129310482	+	MTEa	LTR	MaLR	265	373	-6	3
816	297	301	88	27	chr3	30296918	30297065	-129302718	-	MLT1B	LTR	MaLR	-24	350	195	3
816	508	250	0	8	chr3	30297120	30297245	-129302538	-	MLT1B	LTR	MaLR	-252	138	15	3
816	368	327	111	13	chr3	30297300	30297526	-129302257	+	MLT1J1	LTR	MaLR	120	367	-77	3
816	1047	228	126	14	chr3	30332276	30332625	-129267158	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	18	4
816	1674	205	62	14	chr3	30339019	30339376	-129260407	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
816	1934	171	30	27	chr3	30342388	30342761	-129257022	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
816	342	357	39	60	chr3	30349530	30349712	-129250071	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-13	435	258	4
816	1243	230	86	112	chr3	30353278	30353708	-129246075	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
816	259	349	49	68	chr3	30383471	30383634	-129216149	+	MLT1J2	LTR	MaLR	288	447	-1	5
816	262	246	31	0	chr3	30384012	30384077	-129215706	-	MLT1I	LTR	MaLR	-4	407	341	5
817	1713	102	41	0	chr3	30425069	30425335	-129174448	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	43	5
817	654	119	0	10	chr3	30425332	30425434	-129174349	+	ORR1A2	LTR	MaLR	158	258	-69	5
817	417	100	0	0	chr3	30425432	30425492	-129174291	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-267	60	1	5
817	2028	115	17	111	chr3	30430290	30430651	-129169132	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
817	2135	133	33	66	chr3	30430958	30431351	-129168432	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-4	380	1	5
817	2464	138	193	4	chr3	30433426	30433907	-129165876	+	RMER15	LTR	ERVL	1	572	-3	5
817	749	195	78	160	chr3	30439286	30439496	-129160287	+	MT2A	LTR	ERVL	1	191	-342	6
817	749	195	78	160	chr3	30439567	30439600	-129160183	+	MT2A	LTR	ERVL	192	224	-309	6
817	543	214	73	7	chr3	30440111	30440258	-129159525	+	MT2A	LTR	ERVL	348	584	0	6
817	435	178	190	25	chr3	30440853	30440974	-129158809	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-224	141	1	6
817	1343	250	26	9	chr3	30441356	30441703	-129158080	+	MTEb	LTR	MaLR	20	372	-7	6
817	432	239	107	105	chr3	30443371	30443592	-129156191	+	LTR16C	LTR	ERVL	296	535	-3	6
817	289	322	52	78	chr3	30444235	30444427	-129155356	+	MLT1N2	LTR	MaLR	8	194	-368	6
817	450	260	40	14	chr3	30447350	30447498	-129152285	-	MLT1E3	LTR	MaLR	0	624	473	6
817	471	301	19	0	chr3	30448126	30448279	-129151504	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	156	-209	6
817	276	303	60	40	chr3	30448391	30448542	-129151241	+	MLT1A0	LTR	MaLR	215	368	-40	6
817	435	141	0	11	chr3	30449515	30449617	-129150166	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-276	98	1	6
817	1315	212	64	0	chr3	30451947	30452244	-129147539	-	MTC	LTR	MaLR	-105	316	1	6
817	371	292	202	51	chr3	30454137	30454442	-129145341	-	MTD	LTR	MaLR	-48	371	21	6
817	1593	138	120	67	chr3	30458759	30459100	-129140683	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
817	2409	43	52	0	chr3	30462653	30462977	-129136806	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	341	-55	6
817	4519	10	2	0	chr3	30462977	30463469	-129136314	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	6
817	321	0	0	0	chr3	30463469	30463507	-129136276	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	6
817	344	179	46	35	chr3	30463507	30463594	-129136189	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	6
817	9179	27	1	0	chr3	30463594	30464627	-129135156	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	4327	6
817	505	111	0	0	chr3	30464621	30464693	-129135090	+	RMER16-int	LTR	ERVK	4105	4176	-1230	6
817	596	234	55	47	chr3	30464701	30465075	-129134708	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6097	6422	-984	6
817	335	155	40	40	chr3	30465291	30465365	-129134418	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7404	-2	6
817	1981	162	22	95	chr3	30465366	30465698	-129134085	+	RLTR9B	LTR	ERVK	1	316	-121	6
817	1981	162	22	95	chr3	30465845	30465976	-129133807	+	RLTR9B	LTR	ERVK	317	430	-7	6
817	373	141	16	0	chr3	30465977	30466041	-129133742	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-106	240	176	6
817	4519	10	2	0	chr3	30466041	30466533	-129133250	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	6
817	471	33	0	0	chr3	30466533	30466593	-129133190	+	MTB	LTR	MaLR	341	400	0	6
817	2027	130	12	58	chr3	30467781	30468123	-129131660	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	6
817	712	234	83	5	chr3	30470799	30470992	-129128791	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1426	1633	-4504	6
817	1655	192	24	45	chr3	30471309	30471691	-129128092	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1631	2004	-4133	6
817	2060	144	19	19	chr3	30472428	30472796	-129126987	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	6
817	225	292	0	53	chr3	30473514	30473590	-129126193	+	MTEb	LTR	MaLR	254	325	-54	6
817	1732	155	92	37	chr3	30474336	30474684	-129125099	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
817	3788	20	55	13	chr3	30477901	30478357	-129121426	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	6
817	335	293	66	73	chr3	30479449	30479600	-129120183	-	MER77	LTR	ERVL	-248	359	210	6
817	474	275	6	48	chr3	30481014	30481182	-129118601	-	RMER4A	LTR	ERVK	-280	186	26	7
817	500	281	55	18	chr3	30486532	30486695	-129113088	+	MTEa	LTR	MaLR	9	177	-202	7
817	1531	107	163	13	chr3	30486978	30487149	-129112634	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	221	-189	7
817	1531	107	163	13	chr3	30487241	30487379	-129112404	+	RMER17C	LTR	ERVK	222	357	-53	7
817	1656	215	64	58	chr3	30487906	30488374	-129111409	+	RMER19C	LTR	ERVK	141	611	0	7
817	4261	202	12	40	chr3	30488671	30489616	-129110167	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1924	2841	-1	7
817	665	153	46	7	chr3	30489616	30489767	-129110016	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	157	-396	7
817	1493	243	19	62	chr3	30489857	30490403	-129109380	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	62	549	-4	7
817	633	221	323	77	chr3	30490527	30490909	-129108874	+	MT2A	LTR	ERVL	1	557	-44	7
817	534	234	103	34	chr3	30490958	30490994	-129108789	+	MT2A	LTR	ERVL	558	601	0	7
817	280	268	239	6	chr3	30508182	30508362	-129091421	+	MTE-int	LTR	MaLR	1204	1425	-155	1
817	291	235	95	87	chr3	30508393	30508519	-129091264	-	MT2B	LTR	ERVL	-320	281	155	2
817	244	294	139	52	chr3	30508896	30509068	-129090715	-	MTE-int	LTR	MaLR	-764	816	630	2
817	479	345	106	7	chr3	30509343	30509626	-129090157	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1070	510	200	2
817	325	293	142	7	chr3	30509732	30509873	-129089910	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1380	200	41	2
817	2826	12	61	12	chr3	30513149	30513479	-129086304	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
817	1062	198	92	8	chr3	30521843	30522092	-129077691	-	MT2A	LTR	ERVL	-243	290	21	4
817	342	133	228	21	chr3	30535975	30536116	-129063667	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	193	421	0	7
818	510	275	136	9	chr3	30539982	30540195	-129059588	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-79	1501	1262	8
818	568	299	67	33	chr3	30540409	30540564	-129059219	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1375	205	41	8
818	568	299	67	33	chr3	30540607	30540631	-129059152	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1540	40	20	8
818	386	285	10	82	chr3	30540642	30540837	-129058946	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	199	8
818	848	268	36	101	chr3	30542961	30543318	-129056465	-	MTE2a	LTR	MaLR	-43	336	3	9
818	1668	173	107	6	chr3	30543346	30543712	-129056071	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	5	9
818	906	237	122	50	chr3	30551124	30551502	-129048281	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	1
818	2355	140	77	3	chr3	30555090	30555478	-129044305	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	3	1
818	2123	98	6	16	chr3	30556106	30556428	-129043355	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	1
818	452	275	7	58	chr3	30557187	30557326	-129042457	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	248	1
818	1073	91	60	5	chr3	30557417	30557616	-129042167	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-65	346	137	1
818	1963	275	83	68	chr3	30564341	30565383	-129034400	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1427	5123	4066	1
818	1642	229	42	46	chr3	30565391	30565909	-129033874	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	26	1
818	7137	121	27	30	chr3	30565924	30567182	-129032601	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-6	2320	1067	1
818	4849	170	47	45	chr3	30567190	30568261	-129031522	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1487	1355	1	1
818	1480	248	22	36	chr3	30570326	30570773	-129029010	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	94	1
818	571	160	9	0	chr3	30570789	30570895	-129028888	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-3112	3438	3332	1
818	2003	118	13	0	chr3	30575248	30575561	-129024222	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	3	1
818	2063	185	30	223	chr3	30575918	30575985	-129023798	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	67	-544	1
818	2063	185	30	223	chr3	30576139	30576828	-129022955	+	RMER19C	LTR	ERVK	68	611	0	1
818	2379	104	3	0	chr3	30578906	30579232	-129020551	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
818	1774	162	77	29	chr3	30580422	30580771	-129019012	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	370	-4	1
818	1227	281	44	79	chr3	30582541	30583113	-129016670	+	MER68	LTR	ERVL	5	556	-7	1
818	1306	237	60	58	chr3	30584337	30584785	-129014998	-	RMER4A	LTR	ERVK	-17	449	1	1
818	3418	30	0	8	chr3	30587297	30587696	-129012087	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
818	1045	199	73	67	chr3	30588363	30588707	-129011076	+	RLTR15	LTR	ERVK	6	351	-8	1
818	486	240	8	30	chr3	30591711	30591844	-129007939	+	ORR1D2	LTR	MaLR	16	145	-225	1
818	272	322	0	22	chr3	30591991	30592080	-129007703	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	87	-321	1
818	853	262	83	18	chr3	30592363	30592633	-129007150	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	288	-82	1
818	4412	48	3	5	chr3	30592633	30593216	-129006567	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	582	-5	1
818	374	256	11	11	chr3	30593203	30593294	-129006489	+	ORR1D2	LTR	MaLR	277	367	-3	1
818	264	308	86	59	chr3	30593294	30593437	-129006346	+	MLT1A1	LTR	MaLR	147	293	-81	1
818	5265	141	25	51	chr3	30601131	30602064	-128997719	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	1
818	225	272	127	42	chr3	30602262	30602404	-128997379	-	MLT1B	LTR	MaLR	-215	175	22	1
818	663	287	237	24	chr3	30603492	30603591	-128996192	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	563	467	1
818	921	212	78	67	chr3	30603644	30604008	-128995775	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-97	466	1	1
818	17603	131	39	13	chr3	30604333	30607094	-128992689	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1810	3951	1119	1
818	664	268	85	51	chr3	30607143	30607438	-128992345	-	MTEa	LTR	MaLR	-74	305	1	1
818	295	293	127	89	chr3	30608770	30609050	-128990733	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	322	-68	2
818	295	254	97	100	chr3	30609187	30609253	-128990530	+	MLT1B	LTR	MaLR	308	371	-3	2
818	330	319	17	8	chr3	30609664	30609781	-128990002	-	LTR84b	LTR	ERVL	-590	171	54	2
818	239	273	15	0	chr3	30610542	30610608	-128989175	+	RMER15	LTR	ERVL	405	471	-104	2
818	1518	129	19	131	chr3	30611149	30611216	-128988567	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	338	2
818	1518	129	19	131	chr3	30611403	30611655	-128988128	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-57	337	111	2
818	235	304	53	71	chr3	30613143	30613313	-128986470	+	RLTR25A	LTR	ERVK	937	1103	0	2
818	476	90	0	24	chr3	30613313	30613390	-128986393	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-297	97	1	2
818	1704	225	53	15	chr3	30613459	30613856	-128985927	+	MTD	LTR	MaLR	3	414	-5	2
818	880	193	15	98	chr3	30616722	30616986	-128982797	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	242	-211	2
818	246	291	0	0	chr3	30616976	30617062	-128982721	+	RLTR11B	LTR	ERVK	201	286	-167	2
818	267	307	31	88	chr3	30617066	30617259	-128982524	+	RLTR11B	LTR	ERVK	246	427	-26	2
818	295	340	0	20	chr3	30618016	30618118	-128981665	-	MLT1I	LTR	MaLR	-200	211	112	2
818	2441	104	3	3	chr3	30618174	30618501	-128981282	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
818	1086	173	99	133	chr3	30618934	30619341	-128980442	+	MT2A	LTR	ERVL	1	527	-57	2
818	1529	122	36	22	chr3	30620918	30621194	-128978589	-	RLTR17	LTR	ERVK	-412	280	1	2
818	439	294	134	22	chr3	30627053	30627321	-128972462	-	MLT1C	LTR	MaLR	-16	451	154	2
818	752	229	44	83	chr3	30627344	30627598	-128972185	-	MTE2a	LTR	MaLR	-5	416	135	2
818	323	216	319	0	chr3	30627609	30627725	-128972058	-	RLTR18B	LTR	ERVK	0	512	360	2
818	502	273	35	41	chr3	30627741	30627913	-128971870	-	MTE2a	LTR	MaLR	-248	171	1	2
818	1148	172	160	0	chr3	30629273	30629529	-128970254	-	RLTR18	LTR	ERVK	-315	301	5	2
818	450	286	26	37	chr3	30629706	30629814	-128969969	+	MTEa	LTR	MaLR	193	303	-76	2
818	450	286	26	37	chr3	30630667	30630747	-128969036	+	MTEa	LTR	MaLR	304	379	0	2
818	2993	91	7	5	chr3	30633711	30634131	-128965652	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	2
818	1997	114	15	47	chr3	30634741	30635081	-128964702	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
818	3129	129	89	13	chr3	30643880	30644552	-128955231	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	2
818	477	332	24	15	chr3	30650345	30650414	-128949369	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	324	2
818	477	332	24	15	chr3	30650818	30650953	-128948830	-	MLT1B	LTR	MaLR	-67	323	184	2
818	227	181	43	108	chr3	30656436	30656529	-128943254	-	MTD	LTR	MaLR	-5	365	279	2
818	515	282	69	6	chr3	30656656	30656831	-128942952	-	MTD	LTR	MaLR	-216	203	18	2
818	2016	171	44	14	chr3	30666852	30667219	-128932564	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	3
818	1375	262	78	51	chr3	30669907	30670394	-128929389	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	500	-28	3
819	365	345	71	54	chr3	30673082	30673321	-128926462	+	LTR33	LTR	ERVL	20	262	-253	3
819	285	320	62	93	chr3	30675439	30675632	-128924151	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	4	3
819	389	254	54	27	chr3	30676419	30676564	-128923219	-	MER57D	LTR	ERV1	-37	374	226	3
819	924	200	92	36	chr3	30678753	30678947	-128920836	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	906	3
819	924	200	92	36	chr3	30678987	30679041	-128920742	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-198	905	842	3
819	289	135	200	63	chr3	30679061	30679156	-128920627	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-186	842	735	3
819	1472	157	49	87	chr3	30679351	30679777	-128920006	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	3
819	3530	177	125	35	chr3	30679788	30680571	-128919212	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-174	854	1	3
819	295	307	58	14	chr3	30683606	30683745	-128916038	+	LTR33B	LTR	ERVL	357	501	-2	3
819	1126	230	44	55	chr3	30684791	30684981	-128914802	-	MTD	LTR	MaLR	-18	401	211	3
819	1126	227	46	57	chr3	30685152	30685222	-128914561	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	143	3
819	694	321	93	45	chr3	30685432	30685830	-128913953	-	MER34A	LTR	ERV1	-153	418	2	3
819	1516	269	56	31	chr3	30688344	30688793	-128910990	+	MT2A	LTR	ERVL	2	461	-72	3
819	10937	99	46	52	chr3	30689204	30691043	-128908740	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-5	1843	17	3
819	262	318	101	67	chr3	30709623	30709832	-128889951	-	MLT1J	LTR	MaLR	-6	506	291	4
819	287	330	8	42	chr3	30709905	30710025	-128889758	-	MLT1J	LTR	MaLR	-395	117	2	4
819	238	270	14	113	chr3	30716235	30716275	-128883508	+	MT2B2	LTR	ERVL	130	155	-429	4
819	658	210	177	0	chr3	30722535	30722716	-128877067	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	203	4
819	325	363	57	46	chr3	30724193	30724476	-128875307	+	MLT1K	LTR	MaLR	295	580	-15	4
819	283	288	66	52	chr3	30727978	30728162	-128871621	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	194	-185	4
819	326	221	82	48	chr3	30729529	30729654	-128870129	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	983	1072	-42	4
819	2385	88	19	0	chr3	30729691	30730008	-128869775	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-4	323	1	4
819	370	279	68	82	chr3	30731135	30731342	-128868441	-	RLTR16	LTR	ERVK	-271	234	31	4
819	1060	238	51	70	chr3	30733601	30733971	-128865812	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	365	-14	4
819	1208	224	82	20	chr3	30735754	30736110	-128863673	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	2	4
819	1845	229	4	204	chr3	30736301	30737064	-128862719	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	2	4
819	672	249	109	34	chr3	30739580	30739815	-128859968	-	RLTR15	LTR	ERVK	-15	344	107	4
819	672	249	109	34	chr3	30739887	30739971	-128859812	-	RLTR15	LTR	ERVK	-253	106	2	4
819	2170	254	32	6	chr3	30742803	30743338	-128856445	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-3038	3881	3333	4
819	3385	245	39	14	chr3	30744588	30745387	-128854396	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-3576	3343	2525	4
819	2358	299	58	17	chr3	30745425	30746516	-128853267	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-4558	2361	1226	4
819	283	161	52	35	chr3	30746829	30746887	-128852896	+	MTEa	LTR	MaLR	7	65	-314	4
819	444	228	166	41	chr3	30746951	30747120	-128852663	+	MTEa	LTR	MaLR	182	371	-8	4
819	491	207	93	59	chr3	30747835	30748071	-128851712	-	RLTR15	LTR	ERVK	-17	342	99	4
819	424	247	41	0	chr3	30748389	30748486	-128851297	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	108	-251	4
819	2469	144	44	7	chr3	30750807	30751213	-128848570	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
819	307	284	70	111	chr3	30751617	30752033	-128847750	+	RMER10A	LTR	ERVL	18	416	-26	4
819	297	241	13	0	chr3	30753056	30753135	-128846648	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	296	4
819	795	243	60	9	chr3	30753165	30753381	-128846402	-	MTEb	LTR	MaLR	-152	227	1	4
819	1154	230	32	19	chr3	30757162	30757472	-128842311	-	RMER5	LTR	ERV1	-23	511	198	4
819	1442	211	148	3	chr3	30763019	30763385	-128836398	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
819	1419	147	184	3	chr3	30764501	30764735	-128835048	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	155	5
819	1419	164	150	9	chr3	30764849	30764923	-128834860	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-240	154	48	5
819	3306	159	78	100	chr3	30764938	30765865	-128833918	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	5
819	884	243	126	53	chr3	30766369	30766809	-128832974	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	63	5
819	244	258	52	88	chr3	30767680	30767816	-128831967	+	MTEa	LTR	MaLR	1	131	-248	5
819	1703	200	25	8	chr3	30771500	30771868	-128827915	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
819	1312	164	133	52	chr3	30774546	30774719	-128825064	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-9	375	181	5
819	1312	164	133	52	chr3	30774757	30774930	-128824853	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-204	180	2	5
819	282	317	35	28	chr3	30775485	30775628	-128824155	-	ORR1E	LTR	MaLR	-162	197	54	5
819	1891	201	26	44	chr3	30777686	30778071	-128821712	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	5
819	375	266	109	124	chr3	30779697	30780027	-128819756	-	ORR1E	LTR	MaLR	-34	325	1	5
819	522	292	180	94	chr3	30780027	30780156	-128819627	-	MTE-int	LTR	MaLR	-53	1527	1366	5
819	522	292	180	94	chr3	30780308	30780758	-128819025	-	MTE-int	LTR	MaLR	-215	1365	898	5
819	280	296	140	94	chr3	30780881	30781116	-128818667	+	MTE-int	LTR	MaLR	770	1015	-565	5
819	233	348	43	0	chr3	30781590	30781682	-128818101	-	MLT1C	LTR	MaLR	-361	106	11	5
819	407	255	178	37	chr3	30786962	30787153	-128812630	-	MLT1I	LTR	MaLR	0	411	194	5
819	551	214	30	10	chr3	30787829	30787981	-128811802	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-3	525	374	5
819	621	187	75	46	chr3	30787976	30788150	-128811633	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-378	199	21	5
820	1087	43	29	0	chr3	30809546	30809686	-128790097	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	144	-263	5
820	6199	84	33	80	chr3	30809677	30810714	-128789069	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	111	1098	0	5
820	3509	41	5	0	chr3	30810714	30811108	-128788675	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
820	3204	90	91	7	chr3	30812139	30812577	-128787206	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	5
820	853	62	0	0	chr3	30817661	30817773	-128782010	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-295	112	1	5
820	2341	132	39	113	chr3	30818482	30818995	-128780788	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	5
820	1956	145	108	51	chr3	30820187	30820622	-128779161	+	RMER6B	LTR	ERVK	2	461	0	6
820	344	154	0	0	chr3	30820683	30820735	-128779048	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6911	6962	-1997	6
820	292	240	59	57	chr3	30838879	30839000	-128760783	+	MLT1A1	LTR	MaLR	15	136	-238	6
820	426	277	182	32	chr3	30853266	30853486	-128746297	-	MLT1A	LTR	MaLR	-121	253	1	6
820	292	303	51	64	chr3	30857543	30857779	-128742004	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1156	1388	-4134	6
820	1977	197	50	7	chr3	30858644	30859088	-128740695	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	65	527	0	6
820	1019	133	71	15	chr3	30868742	30868940	-128730843	+	MTC	LTR	MaLR	180	388	-33	6
820	1820	152	141	3	chr3	30869630	30869993	-128729790	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	6
820	3709	173	50	14	chr3	30869993	30870767	-128729016	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	457	6
820	928	204	87	118	chr3	30870783	30871204	-128728579	-	MT2A	LTR	ERVL	-55	546	2	6
820	272	275	43	60	chr3	30872400	30872516	-128727267	+	MTD	LTR	MaLR	45	158	-261	6
820	228	180	32	32	chr3	30872693	30872756	-128727027	+	MLT1A1	LTR	MaLR	342	404	-4	7
820	249	250	74	82	chr3	30877527	30877662	-128722121	+	RLTR25A	LTR	ERVK	439	572	-531	7
820	2449	152	162	40	chr3	30881655	30882160	-128717623	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	7
820	950	295	25	66	chr3	30883115	30883510	-128716273	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	7
820	369	125	0	0	chr3	30883610	30883666	-128716117	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	339	7
820	566	86	86	0	chr3	30883667	30883760	-128716023	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	878	7
820	16074	60	57	23	chr3	30883760	30886125	-128713658	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-3174	2634	2	7
820	611	54	21	11	chr3	30886127	30886221	-128713562	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	884	7
820	826	59	17	0	chr3	30886204	30886323	-128713460	+	RLTR13A3	LTR	ERVK	858	978	0	7
820	1443	144	171	0	chr3	30886323	30886617	-128713166	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-49	345	1	7
820	912	259	4	26	chr3	30889355	30889581	-128710202	-	MTEb	LTR	MaLR	-154	225	5	7
820	1547	189	28	50	chr3	30892114	30892476	-128707307	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	7
820	307	326	80	89	chr3	30900062	30900412	-128699371	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	8	7
820	244	203	125	0	chr3	30901827	30901891	-128697892	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	72	-322	7
820	545	58	93	0	chr3	30901889	30901975	-128697808	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1415	94	1	7
820	1220	121	62	9	chr3	30901980	30902277	-128697506	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-36	358	1	7
820	930	152	119	35	chr3	30902339	30902625	-128697158	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	1	312	-222	7
820	791	204	6	24	chr3	30902617	30902783	-128697000	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	416	578	0	7
820	1499	156	51	4	chr3	30902783	30903058	-128696725	+	ORR1C1	LTR	MaLR	91	378	0	7
820	1859	198	127	16	chr3	30905849	30906346	-128693437	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	552	-16	7
820	1300	126	156	123	chr3	30908692	30909089	-128690694	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	8
820	256	251	221	74	chr3	30913666	30913937	-128685846	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	316	-49	8
820	266	331	123	8	chr3	30914147	30914269	-128685514	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-74	334	199	8
820	1612	246	25	20	chr3	30915724	30916213	-128683570	+	RMER5	LTR	ERV1	33	523	-11	8
820	306	300	0	0	chr3	30916450	30916530	-128683253	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	300	8
820	3782	204	139	39	chr3	30918911	30920147	-128679636	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	11	1370	0	8
820	588	179	28	28	chr3	30922836	30922980	-128676803	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	287	8
820	409	115	74	84	chr3	30923163	30923258	-128676525	-	RLTR23	LTR	ERV1	-336	94	1	8
820	544	248	135	10	chr3	30930538	30930746	-128669037	-	MTD	LTR	MaLR	-36	383	150	8
820	354	287	94	89	chr3	30931028	30931388	-128668395	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	367	-12	8
821	293	202	20	92	chr3	30933265	30933280	-128666503	-	MT2B	LTR	ERVL	-359	240	152	8
821	3242	133	155	20	chr3	30941607	30942214	-128657569	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	4	8
821	282	279	45	23	chr3	30951925	30952013	-128647770	+	RLTR25A	LTR	ERVK	522	611	-492	8
821	245	186	117	17	chr3	30961397	30961457	-128638326	+	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	244	309	-504	9
821	2533	83	3	3	chr3	30964026	30964353	-128635430	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	9
821	277	304	0	12	chr3	30965171	30965251	-128634532	+	MLT1A1	LTR	MaLR	297	375	-33	9
821	724	317	120	47	chr3	30965307	30965510	-128634273	+	MER21B	LTR	ERV1	242	475	-388	9
821	724	317	120	47	chr3	30965764	30966049	-128633734	+	MER21B	LTR	ERV1	476	769	-94	9
821	3448	52	30	16	chr3	30966452	30966882	-128632901	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	9
821	242	299	58	45	chr3	30966972	30967126	-128632657	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-424	604	449	9
821	292	148	112	56	chr3	30968958	30969065	-128630718	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	397	9
821	619	225	162	0	chr3	30972371	30972513	-128627270	+	MTEa	LTR	MaLR	1	165	-214	9
821	225	232	163	47	chr3	30974595	30974681	-128625102	-	LTR86B1	LTR	ERVL	-107	386	291	9
821	246	250	13	65	chr3	30977246	30977323	-128622460	-	RMER21B	LTR	ERV1	-113	834	762	9
821	718	226	233	23	chr3	30977331	30977580	-128622203	-	RMER21B	LTR	ERV1	-277	565	263	9
821	2610	112	80	9	chr3	30988160	30988583	-128611200	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	1
821	1445	184	90	15	chr3	30990519	30990828	-128608955	+	ORR1C2	LTR	MaLR	51	384	0	1
821	953	211	186	42	chr3	31003032	31003393	-128596390	+	MTD	LTR	MaLR	6	418	-1	1
821	539	264	263	27	chr3	31006838	31007176	-128592607	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	2
821	230	288	25	88	chr3	31011012	31011092	-128588691	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	167	3
821	253	322	44	11	chr3	31022295	31022386	-128577397	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-453	107	14	4
821	1191	274	35	9	chr3	31023249	31023591	-128576192	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	21	5
821	982	215	77	55	chr3	31025647	31026062	-128573721	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-18	506	9	5
821	573	156	47	15	chr3	31030348	31030496	-128569287	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	186	-188	6
821	285	259	74	0	chr3	31030613	31030694	-128569089	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	252	-122	6
821	730	283	114	9	chr3	31030842	31031167	-128568616	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	7
821	260	171	36	24	chr3	31054217	31054301	-128545482	-	RMER17B	LTR	ERVK	-499	459	375	1
822	960	207	29	10	chr3	31067345	31067557	-128532226	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-103	438	230	1
822	637	212	115	143	chr3	31070178	31070464	-128529319	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	102	1
822	1797	192	42	105	chr3	31072052	31072277	-128527506	+	MTC	LTR	MaLR	1	212	-209	1
822	1797	192	42	105	chr3	31072532	31072610	-128527173	+	MTC	LTR	MaLR	213	287	-134	1
822	4940	103	25	23	chr3	31072610	31072752	-128527031	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	597	1
822	4940	103	25	23	chr3	31072788	31073381	-128526402	-	RMER19A	LTR	ERVK	-141	596	1	1
822	1797	192	42	105	chr3	31073381	31073525	-128526258	+	MTC	LTR	MaLR	288	421	0	1
822	964	221	176	4	chr3	31075003	31075248	-128524535	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	860	574	1
822	3284	26	39	0	chr3	31075248	31075629	-128524154	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
822	9168	38	5	2	chr3	31075629	31076724	-128523059	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
822	3284	26	39	0	chr3	31076724	31077105	-128522678	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
822	4945	28	2	2	chr3	31077105	31077706	-128522077	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	498	1
822	3627	12	2	2	chr3	31077696	31078115	-128521668	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	75	493	0	1
822	2742	173	69	94	chr3	31078115	31078751	-128521032	-	RMER13B	LTR	ERVK	-294	614	1	1
822	3027	18	3	0	chr3	31080668	31081004	-128518779	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
822	56700	21	17	6	chr3	31081004	31087409	-128512374	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	1
822	3027	18	3	0	chr3	31087409	31087745	-128512038	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
822	2820	99	23	0	chr3	31093149	31093534	-128506249	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
822	2880	142	20	44	chr3	31094057	31094597	-128505186	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	1
822	506	214	62	0	chr3	31095759	31095871	-128503912	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	252	2
822	276	267	93	0	chr3	31096406	31096481	-128503302	+	ORR1D2	LTR	MaLR	243	324	-46	2
822	229	418	15	0	chr3	31100519	31100653	-128499130	+	MamGypLTR2	LTR	Gypsy	424	559	-630	2
822	427	385	67	4	chr3	31100651	31100904	-128498879	+	LTR81C	LTR	ERV1?	597	865	-288	2
822	443	244	28	71	chr3	31104545	31104686	-128495097	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	144	2
822	1580	11	5	0	chr3	31104831	31105016	-128494767	+	MTB	LTR	MaLR	215	400	0	2
822	1194	190	14	0	chr3	31109161	31109377	-128490406	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	219	-159	2
822	3813	148	11	2	chr3	31109377	31109951	-128489832	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3944	4522	-1239	2
822	458	196	41	102	chr3	31124570	31124814	-128474969	-	RMER17A	LTR	ERVK	-304	447	219	2
822	892	258	225	12	chr3	31138580	31138913	-128460870	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	5	2
822	236	332	74	102	chr3	31140067	31140282	-128459501	-	ORR1E	LTR	MaLR	-150	209	1	2
822	1558	225	119	13	chr3	31140588	31140967	-128458816	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
822	2251	166	22	17	chr3	31141217	31141622	-128458161	+	MTD	LTR	MaLR	1	407	-12	2
822	762	237	76	102	chr3	31145652	31146140	-128453643	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	455	-11	3
822	750	226	110	59	chr3	31146560	31146832	-128452951	+	RLTR14	LTR	ERV1	48	333	-49	3
822	810	270	88	104	chr3	31154002	31154376	-128445407	+	MTE2a	LTR	MaLR	40	419	0	3
822	1006	254	22	92	chr3	31155391	31155852	-128443931	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	8	441	-120	3
822	1233	242	36	82	chr3	31157218	31157547	-128442236	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	5	3
822	446	228	33	0	chr3	31158089	31158181	-128441602	+	MTD	LTR	MaLR	1	95	-324	3
822	439	229	20	239	chr3	31158369	31158477	-128441306	+	MTD	LTR	MaLR	83	157	-264	3
822	356	309	66	136	chr3	31159019	31159446	-128440337	+	RMER10A	LTR	ERVL	18	414	-28	3
822	245	342	129	50	chr3	31165529	31165769	-128434014	+	LTR33	LTR	ERVL	87	345	-170	3
822	409	230	135	26	chr3	31166609	31166763	-128433020	-	MLT1D	LTR	MaLR	-312	193	23	3
822	1928	163	37	8	chr3	31170813	31171165	-128428618	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	362	-5	3
822	3247	36	36	5	chr3	31172409	31172797	-128426986	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
822	632	303	35	115	chr3	31177657	31178001	-128421782	-	MT2A	LTR	ERVL	-166	367	55	3
822	632	303	35	115	chr3	31178149	31178203	-128421580	-	MT2A	LTR	ERVL	-479	54	1	3
822	1240	217	163	101	chr3	31181376	31181811	-128417972	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	1	3
822	251	276	154	46	chr3	31186094	31186269	-128413514	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4947	5140	-574	3
822	498	294	30	70	chr3	31191592	31191861	-128407922	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	242	-137	3
102	1059	282	57	8	chr3	31194790	31195144	-128404639	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	373	-6	4
823	1838	151	47	152	chr3	31200436	31200685	-128399098	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	194	-190	4
823	1838	151	47	152	chr3	31200864	31201043	-128398740	+	ORR1C2	LTR	MaLR	195	384	0	4
823	3254	46	5	5	chr3	31211374	31211770	-128388013	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
823	430	376	65	12	chr3	31215648	31215893	-128383890	+	RMER15	LTR	ERVL	291	548	-27	4
823	1885	158	47	73	chr3	31216340	31216781	-128383002	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	9	4
823	966	226	141	36	chr3	31216779	31216916	-128382867	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-69	305	162	4
823	966	226	141	36	chr3	31216942	31217080	-128382703	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-213	161	1	4
823	1063	91	67	22	chr3	31224264	31224443	-128375340	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	187	-140	4
823	1772	72	8	4	chr3	31224399	31224650	-128375133	+	MT2B2	LTR	ERVL	328	579	-5	4
823	1271	240	150	11	chr3	31225114	31225480	-128374303	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	4
823	298	338	27	20	chr3	31226474	31226622	-128373161	+	MLT1J	LTR	MaLR	307	455	-57	4
823	953	294	28	85	chr3	31228647	31228746	-128371037	+	MTEb	LTR	MaLR	1	96	-283	4
823	953	294	28	85	chr3	31228883	31229181	-128370602	+	MTEb	LTR	MaLR	97	375	-4	4
823	1265	247	5	118	chr3	31229190	31229425	-128370358	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	197	-162	4
823	1265	247	5	118	chr3	31229500	31229654	-128370129	+	ORR1E	LTR	MaLR	198	350	-9	4
823	401	381	13	49	chr3	31233231	31233457	-128366326	+	LTR16C	LTR	ERVL	74	291	-198	4
823	359	278	29	22	chr3	31239190	31239326	-128360457	+	RMER15	LTR	ERVL	426	562	-13	4
823	3506	20	5	0	chr3	31239733	31240127	-128359656	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
823	9775	16	1	0	chr3	31240127	31241224	-128358559	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
823	3506	20	5	0	chr3	31241224	31241618	-128358165	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
823	803	276	123	21	chr3	31242601	31242927	-128356856	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	4
823	802	308	60	49	chr3	31243336	31243722	-128356061	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	390	0	4
823	1724	188	93	14	chr3	31269960	31270316	-128329467	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
823	245	267	26	13	chr3	31273416	31273480	-128326303	-	MTE2a	LTR	MaLR	-226	153	88	5
823	245	267	26	13	chr3	31274254	31274265	-128325518	-	MTE2a	LTR	MaLR	-292	87	77	5
823	378	186	0	41	chr3	31274266	31274339	-128325444	-	RMER10A	LTR	ERVL	-372	70	1	5
823	329	302	55	8	chr3	31278195	31278326	-128321457	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	225	5
823	298	320	51	39	chr3	31278438	31278594	-128321189	-	MLT1C	LTR	MaLR	-286	181	24	5
823	783	218	124	31	chr3	31278924	31279194	-128320589	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	104	5
823	2193	188	197	23	chr3	31280904	31281421	-128318362	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	5	5
823	2365	67	45	0	chr3	31282931	31283244	-128316539	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	5
823	1308	194	43	7	chr3	31285146	31285422	-128314361	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-13	381	79	5
823	562	191	61	0	chr3	31285548	31285663	-128314120	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-272	122	1	5
823	607	191	0	9	chr3	31288511	31288617	-128311166	+	ORR1D2	LTR	MaLR	8	112	-247	5
823	686	241	197	8	chr3	31288981	31289220	-128310563	+	ORR1D2	LTR	MaLR	87	370	0	5
823	1090	256	112	6	chr3	31290673	31290995	-128308788	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	359	0	5
823	1464	172	183	3	chr3	31293923	31294267	-128305516	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	14	5
823	452	254	24	24	chr3	31295493	31295618	-128304165	-	MTEa	LTR	MaLR	-49	330	206	5
823	236	200	15	44	chr3	31296273	31296341	-128303442	-	MLT1I	LTR	MaLR	-6	405	340	5
823	322	325	44	19	chr3	31296728	31296888	-128302895	+	MLT2B1	LTR	ERVL	3	166	-354	5
823	1369	218	65	23	chr3	31297165	31297517	-128302266	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	1	5
823	5436	223	53	18	chr3	31297517	31298840	-128300943	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	2	5
823	253	109	22	0	chr3	31298983	31299029	-128300754	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	47	-458	5
823	2382	217	44	35	chr3	31299030	31299627	-128300156	+	RLTR1D	LTR	ERV1	4	605	0	5
823	1590	216	47	38	chr3	31299627	31300074	-128299709	+	RLTR16	LTR	ERVK	43	493	-12	5
823	394	160	27	0	chr3	31300188	31300263	-128299520	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-6	368	292	5
823	1761	184	6	3	chr3	31300261	31300583	-128299200	-	MTD	LTR	MaLR	-33	386	64	5
823	267	253	13	0	chr3	31300569	31300644	-128299139	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1181	77	2	5
823	872	294	46	29	chr3	31300875	31301155	-128298628	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-83	287	3	5
823	2066	126	7	108	chr3	31303980	31304408	-128295375	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	385	-9	5
823	1045	208	169	40	chr3	31305486	31305782	-128294001	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	46	5
823	421	322	142	20	chr3	31306269	31306627	-128293156	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	104	5
823	898	305	106	33	chr3	31306797	31307248	-128292535	-	RMER5	LTR	ERV1	-2	532	49	5
823	329	279	121	90	chr3	31308981	31309237	-128290546	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-103	492	229	5
823	3178	164	70	11	chr3	31310441	31311094	-128288689	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	5
823	1468	175	46	104	chr3	31313339	31313734	-128286049	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	372	-12	5
823	959	183	18	18	chr3	31313742	31313959	-128285824	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	1	217	-1292	5
823	3737	166	33	6	chr3	31313944	31314731	-128285052	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	570	1509	0	5
823	794	195	15	80	chr3	31314732	31314933	-128284850	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	189	-185	5
823	838	207	114	0	chr3	31315023	31315216	-128284567	+	ORR1C2	LTR	MaLR	164	378	0	5
823	510	179	11	0	chr3	31316109	31316204	-128283579	+	MTC	LTR	MaLR	1	96	-325	5
823	3922	158	24	7	chr3	31319605	31320312	-128279471	+	RMER12B	LTR	ERVK	1	719	-685	5
823	3708	92	19	74	chr3	31320311	31320984	-128278799	-	RMER17A	LTR	ERVK	-115	636	1	5
823	498	107	113	28	chr3	31320984	31321090	-128278693	+	RMER12B	LTR	ERVK	1046	1160	-244	5
823	539	271	76	16	chr3	31321074	31321258	-128278525	-	MTE2b	LTR	MaLR	-172	207	13	5
823	1609	221	36	3	chr3	31321444	31321807	-128277976	+	MTD	LTR	MaLR	1	375	-44	5
823	313	351	57	36	chr3	31321819	31322011	-128277772	+	LTR16C	LTR	ERVL	17	212	-277	5
823	421	323	70	58	chr3	31322518	31322761	-128277022	+	LTR16C	LTR	ERVL	217	462	-27	5
823	772	229	40	36	chr3	31325781	31326034	-128273749	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-267	260	7	6
824	1056	222	81	120	chr3	31326806	31327215	-128272568	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	6
824	2748	28	138	0	chr3	31332465	31332826	-128266957	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	6
824	723	266	101	11	chr3	31334264	31334541	-128265242	+	RMER15	LTR	ERVL	274	575	0	6
824	1772	214	47	0	chr3	31338054	31338441	-128261342	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	6
824	542	101	0	0	chr3	31340880	31340959	-128258824	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	983	905	6
824	455	237	87	113	chr3	31340964	31341230	-128258553	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-63	259	1	6
824	4323	48	27	22	chr3	31341230	31341824	-128257959	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	215	811	-172	6
824	764	138	74	19	chr3	31341819	31341981	-128257802	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	152	322	0	6
824	1539	95	0	5	chr3	31341981	31342202	-128257581	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	-763	220	1	6
824	3951	68	26	2	chr3	31346140	31346640	-128253143	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
824	16223	85	15	50	chr3	31346640	31349045	-128250738	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1	4006	-684	6
824	2702	29	0	0	chr3	31349055	31349361	-128250422	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	2917	3222	-77	6
824	463	14	132	92	chr3	31349435	31349449	-128250334	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3221	3234	-65	6
824	2868	127	14	5	chr3	31349449	31349878	-128249905	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-3	433	1	6
824	463	14	132	92	chr3	31349878	31349939	-128249844	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3235	3299	0	6
824	4045	62	22	2	chr3	31349939	31350441	-128249342	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
824	493	286	0	16	chr3	31350441	31350569	-128249214	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	136	-223	6
824	417	221	180	44	chr3	31350842	31351048	-128248735	+	ORR1E	LTR	MaLR	147	363	-7	6
824	456	279	165	29	chr3	31352067	31352237	-128247546	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-363	193	1	6
824	1018	122	23	23	chr3	31352304	31352480	-128247303	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	223	6
824	372	273	35	21	chr3	31352633	31352775	-128247008	+	LTR37A	LTR	ERV1	278	421	-5	6
824	3873	62	58	0	chr3	31353622	31354106	-128245677	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
824	266	263	13	13	chr3	31355326	31355392	-128244391	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	295	6
824	1351	216	116	31	chr3	31355392	31355779	-128244004	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	114	6
824	927	228	92	18	chr3	31355801	31356082	-128243701	-	MTD	LTR	MaLR	-117	302	1	6
824	745	210	180	100	chr3	31357274	31357613	-128242170	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	599	-28	6
824	1018	310	42	58	chr3	31357858	31358238	-128241545	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	374	-5	6
824	730	225	146	50	chr3	31359398	31359618	-128240165	+	MTEb	LTR	MaLR	70	310	-69	6
824	2108	135	94	13	chr3	31361545	31361927	-128237856	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	6
824	2169	163	74	0	chr3	31365511	31365903	-128233880	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
824	427	292	84	114	chr3	31368270	31368664	-128231119	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	382	-8	6
824	526	318	34	27	chr3	31376120	31376382	-128223401	-	MTD	LTR	MaLR	-145	274	11	6
824	2230	193	74	12	chr3	31377235	31377738	-128222045	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	1	6
824	904	265	149	19	chr3	31378103	31378275	-128221508	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	157	6
824	904	265	149	19	chr3	31378497	31378647	-128221136	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-214	156	7	6
824	468	248	23	8	chr3	31381187	31381317	-128218466	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	403	6
824	351	292	157	32	chr3	31382277	31382493	-128217290	-	RMER5	LTR	ERV1	-252	282	40	6
824	3388	33	2	20	chr3	31384070	31384473	-128215310	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
824	9101	43	4	1	chr3	31384473	31385567	-128214216	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1097	-1	7
824	3469	20	2	20	chr3	31385568	31385971	-128213812	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
824	492	296	40	17	chr3	31387672	31387847	-128211936	+	MT2A	LTR	ERVL	293	471	-62	7
824	2888	80	143	139	chr3	31389653	31390163	-128209620	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	7
824	6117	108	114	15	chr3	31390282	31391173	-128208610	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	980	-3	7
824	2070	130	34	28	chr3	31391910	31392235	-128207548	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	7
824	3768	121	46	4	chr3	31395519	31396040	-128203743	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	21	7
824	3768	121	46	4	chr3	31396063	31396082	-128203701	-	LTRIS2	LTR	ERV1	-544	20	2	7
824	1778	135	64	47	chr3	31399292	31399634	-128200149	+	ORR1B1	LTR	MaLR	47	394	0	7
824	357	341	30	118	chr3	31403670	31403966	-128195817	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	89	7
824	1330	152	105	34	chr3	31406118	31406384	-128193399	+	ORR1C2	LTR	MaLR	99	383	-1	7
824	360	302	45	112	chr3	31406970	31407194	-128192589	+	MLT1B	LTR	MaLR	126	334	-56	7
824	1526	302	53	2	chr3	31407231	31407794	-128191989	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	2	593	-778	7
824	453	285	122	6	chr3	31407809	31407989	-128191794	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	684	884	-487	7
824	4824	123	209	56	chr3	31413241	31414137	-128185646	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	1033	0	7
824	909	210	36	144	chr3	31415582	31415943	-128183840	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	7
824	1026	317	89	47	chr3	31417511	31417984	-128181799	+	MTC-int	LTR	MaLR	520	1012	-246	7
824	1372	190	86	118	chr3	31430965	31431371	-128168412	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	7
824	561	222	80	28	chr3	31431371	31431547	-128168236	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	4660	7
824	551	191	31	1	chr3	31431550	31431681	-128168102	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-526	277	142	7
824	6581	169	28	24	chr3	31431681	31434303	-128165480	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-203	7203	2493	7
824	590	162	72	0	chr3	31440256	31440367	-128159416	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3846	3560	3442	7
824	841	135	7	20	chr3	31440910	31441061	-128158722	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-156	650	502	7
824	1802	191	10	34	chr3	31441061	31441446	-128158337	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4403	3003	2628	7
824	6861	111	15	74	chr3	31441469	31442668	-128157115	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3714	1130	3	7
824	1181	193	99	128	chr3	31442672	31443077	-128156706	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	7
824	2121	111	10	3	chr3	31451342	31451650	-128148133	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	48	7
824	3372	145	27	7	chr3	31453840	31454403	-128145380	+	MT2B	LTR	ERVL	18	591	-10	7
825	1841	18	0	0	chr3	31466403	31466621	-128133162	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	218	-128	7
825	2304	53	67	0	chr3	31467418	31467717	-128132066	+	ORR1A1	LTR	MaLR	28	346	0	8
825	1205	348	36	26	chr3	31469043	31469982	-128129801	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-455	7762	6814	8
825	292	271	34	54	chr3	31470409	31470557	-128129226	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1880	6337	6193	8
825	6853	170	66	30	chr3	31470659	31473032	-128126751	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1779	5465	1715	8
825	459	163	35	0	chr3	31474584	31474670	-128125113	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4229	1177	1089	8
825	2044	160	138	37	chr3	31474675	31475188	-128124595	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4587	819	255	8
825	971	193	181	13	chr3	31476928	31477154	-128122629	-	MTD	LTR	MaLR	-135	284	21	8
825	554	261	92	18	chr3	31481529	31481693	-128118090	-	MTE2a	LTR	MaLR	-30	349	174	8
825	1899	174	72	32	chr3	31484938	31485342	-128114441	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	8
825	2204	48	82	0	chr3	31486788	31487081	-128112702	+	ORR1A1	LTR	MaLR	28	344	-2	8
825	659	341	48	54	chr3	31487133	31487465	-128112318	-	MER68	LTR	ERVL	-8	555	226	8
825	1107	266	49	90	chr3	31490400	31490887	-128108896	+	RLTR12B	LTR	ERVK	42	508	-20	8
825	590	241	13	27	chr3	31491154	31491303	-128108480	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	233	8
825	2575	64	3	3	chr3	31491657	31491984	-128107799	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
825	14380	102	25	27	chr3	31492069	31494419	-128105364	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4404	7748	-469	8
825	3950	131	107	5	chr3	31494474	31495111	-128104672	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6494	7195	-211	8
825	425	140	711	14	chr3	31495264	31495406	-128104377	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5540	5780	-28	8
825	1795	172	54	24	chr3	31495416	31495886	-128103897	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	537	-365	8
825	446	29	27	80	chr3	31495886	31495961	-128103822	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7329	7399	-7	8
825	1386	169	125	57	chr3	31495967	31496350	-128103433	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	8
825	297	336	28	18	chr3	31497748	31497857	-128101926	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-2	510	401	8
825	2856	172	31	14	chr3	31498444	31498919	-128100864	-	RLTR18	LTR	ERVK	-95	521	43	8
825	3053	132	132	0	chr3	31498919	31499435	-128100348	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	8
825	2856	172	31	14	chr3	31499435	31499471	-128100312	-	RLTR18	LTR	ERVK	-574	42	2	8
825	234	186	119	0	chr3	31501183	31501242	-128098541	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-983	404	339	6
825	351	336	98	29	chr3	31503821	31504066	-128095717	+	MER90	LTR	ERV1	1	262	-313	1
825	1796	186	32	84	chr3	31508312	31508809	-128090974	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	95	1
825	1796	186	32	84	chr3	31508864	31508958	-128090825	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-467	94	2	1
825	818	304	115	20	chr3	31510462	31510758	-128089025	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-46	324	1	2
825	2367	212	131	89	chr3	31519667	31520525	-128079258	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	894	-8	3
825	4400	157	31	24	chr3	31523637	31524477	-128075306	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	10	3
825	827	229	93	0	chr3	31525883	31526066	-128073717	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-160	214	15	4
825	324	179	30	0	chr3	31529275	31529342	-128070441	-	RMER19B	LTR	ERVK	-142	760	692	5
825	2034	226	28	95	chr3	31530425	31531080	-128068703	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	5
825	1954	194	60	10	chr3	31531089	31531505	-128068278	+	RMER10A	LTR	ERVL	3	439	-3	5
825	2021	119	19	19	chr3	31535621	31535930	-128063853	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	6
825	362	45	7	0	chr3	31535954	31536007	-128063776	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	163	267	-7314	6
825	624	225	56	51	chr3	31536039	31536236	-128063547	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	655	852	-1135	6
825	2625	293	46	43	chr3	31536591	31538463	-128061320	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3267	5477	-2104	6
825	274	310	25	25	chr3	31538682	31538844	-128060939	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6908	7069	-512	6
825	1348	172	0	26	chr3	31538967	31539235	-128060548	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7321	7581	0	6
825	2065	111	10	22	chr3	31539235	31539548	-128060235	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	6
825	522	367	51	73	chr3	31543019	31543389	-128056394	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	364	-15	7
825	874	327	41	49	chr3	31545291	31545658	-128054125	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	366	-4	8
825	1061	284	86	27	chr3	31545671	31546008	-128053775	+	MTD	LTR	MaLR	46	402	-17	8
825	4346	22	0	0	chr3	31550035	31550528	-128049255	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	9
825	45679	16	1	0	chr3	31550528	31555895	-128043888	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5371	-114	9
825	343	139	26	53	chr3	31555895	31555971	-128043812	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	9
825	302	0	0	0	chr3	31555971	31556009	-128043774	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	9
825	4327	24	0	0	chr3	31556009	31556502	-128043281	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	9
825	1887	123	64	13	chr3	31573977	31574290	-128025493	+	MT2B	LTR	ERVL	18	346	-255	1
825	275	146	0	59	chr3	31574291	31574342	-128025441	+	MT2B	LTR	ERVL	537	584	0	1
825	1552	214	25	12	chr3	31582396	31582717	-128017066	+	RLTR20D	LTR	ERVK	179	503	-65	1
826	1927	222	27	93	chr3	31606671	31607296	-127992487	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	584	0	1
826	413	242	116	63	chr3	31607323	31607530	-127992253	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	26	243	-2599	1
826	359	318	46	8	chr3	31607572	31607702	-127992081	-	RLTR41	LTR	ERV1	-48	398	264	1
826	306	259	35	70	chr3	31608544	31608772	-127991011	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	632	851	-1991	1
826	3538	184	34	12	chr3	31608794	31609642	-127990141	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1015	1855	-987	1
826	3934	92	21	14	chr3	31609706	31610266	-127989517	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	1
826	771	152	108	12	chr3	31610926	31611092	-127988691	+	RMER16-int	LTR	ERVK	145	326	-5080	1
826	4873	135	23	15	chr3	31611082	31611835	-127987948	+	RMER16-int	LTR	ERVK	686	1444	-3962	1
826	7938	147	37	24	chr3	31611826	31614999	-127984784	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	760	4266	-797	1
826	963	215	27	0	chr3	31615004	31615223	-127984560	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4797	5021	-42	1
826	4651	69	3	14	chr3	31615224	31615794	-127983989	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	1
826	2812	209	50	78	chr3	31615795	31616537	-127983246	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1978	2703	-139	1
826	2812	209	50	78	chr3	31616685	31616800	-127982983	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2704	2811	-31	1
826	1497	176	164	64	chr3	31618466	31618886	-127980897	+	RMER16-int	LTR	ERVK	358	819	-4587	1
826	973	129	145	6	chr3	31618889	31619068	-127980715	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1078	1281	-4125	1
826	7976	233	17	28	chr3	31620277	31621202	-127978581	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4083	4988	-2418	1
826	7976	233	17	28	chr3	31621231	31621412	-127978371	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4989	5173	-2233	1
826	7976	233	17	28	chr3	31622124	31622746	-127977037	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5174	5792	-1614	1
826	1004	157	76	0	chr3	31622794	31622966	-127976817	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3791	3975	-1431	1
826	994	294	14	7	chr3	31623194	31623570	-127976213	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7040	7664	-114	1
826	396	276	37	53	chr3	31623694	31623850	-127975933	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6374	6510	-32	1
826	459	288	141	79	chr3	31623985	31624325	-127975458	+	RLTR9A	LTR	ERVK	8	368	0	1
826	2378	126	3	0	chr3	31626812	31627138	-127972645	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
826	2934	52	6	14	chr3	31628125	31628474	-127971309	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
826	547	280	84	71	chr3	31631580	31631956	-127967827	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	381	-60	1
826	1617	161	117	31	chr3	31632837	31633163	-127966620	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	1
826	6853	174	38	90	chr3	31633163	31634741	-127965042	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1496	-467	1
826	1802	157	8	1	chr3	31636299	31636663	-127963120	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8613	8905	-54	1
826	8493	84	12	2	chr3	31636762	31637997	-127961786	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-642	1321	1	1
826	2981	44	6	31	chr3	31637997	31638352	-127961431	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
826	546	272	94	14	chr3	31639121	31639433	-127960350	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
826	299	176	0	19	chr3	31644356	31644408	-127955375	-	RLTR28	LTR	ERVL	-28	496	446	1
826	633	249	125	12	chr3	31644458	31644698	-127955085	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-3245	2892	2626	1
826	3048	152	75	35	chr3	31645032	31645605	-127954178	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	6	1
826	521	221	87	43	chr3	31645917	31646012	-127953771	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	568	477	1
826	849	222	106	72	chr3	31646042	31646374	-127953409	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-92	476	1	1
826	1844	159	232	18	chr3	31646780	31647232	-127952551	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-76	2250	1702	1
826	1973	180	74	10	chr3	31647212	31647604	-127952179	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1694	632	216	1
826	331	266	53	11	chr3	31649430	31649525	-127950258	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-2103	223	125	1
826	819	250	0	50	chr3	31649498	31649759	-127950024	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1461	1381	1134	1
826	430	265	104	22	chr3	31650851	31650921	-127948862	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-20	514	446	1
826	740	244	405	14	chr3	31650984	31651297	-127948486	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-89	445	3	1
826	1986	148	14	64	chr3	31651514	31651860	-127947923	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
826	457	304	7	7	chr3	31653378	31653524	-127946259	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	6470	6615	-304	1
826	4570	156	30	76	chr3	31654063	31654995	-127944788	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	14	902	0	1
826	431	266	71	174	chr3	31655032	31655314	-127944469	-	RLTR23	LTR	ERV1	-170	260	8	1
826	2403	225	31	82	chr3	31658729	31659372	-127940411	+	RMER19C	LTR	ERVK	2	611	0	1
826	2781	39	10	218	chr3	31661066	31661556	-127938227	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	2
826	17011	31	1	1	chr3	31661558	31663505	-127936278	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	39	2
826	2397	44	10	224	chr3	31663514	31664010	-127935773	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	2
826	387	289	128	10	chr3	31667340	31667536	-127932247	+	MLT1B	LTR	MaLR	17	235	-155	2
826	947	274	54	121	chr3	31671515	31671921	-127927862	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	2
826	1597	198	79	36	chr3	31678736	31679128	-127920655	+	MTD	LTR	MaLR	3	411	-8	2
826	263	211	0	0	chr3	31680799	31680856	-127918927	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	57	-458	2
826	917	309	34	21	chr3	31680884	31681211	-127918572	+	MLT2B3	LTR	ERVL	121	451	-103	2
826	907	259	76	73	chr3	31684775	31685166	-127914617	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	18	2
826	3392	99	15	17	chr3	31685798	31686340	-127913443	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	541	-417	2
826	632	204	7	14	chr3	31686885	31687024	-127912759	+	RMER17B	LTR	ERVK	524	661	-297	2
826	1208	248	43	54	chr3	31691513	31691863	-127907920	+	MTEa	LTR	MaLR	34	379	0	2
826	432	246	54	93	chr3	31693733	31694097	-127905686	+	MTEb	LTR	MaLR	17	379	0	2
826	743	302	20	107	chr3	31694583	31694976	-127904807	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	2
826	265	270	79	10	chr3	31699443	31699544	-127900239	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	263	2
826	482	238	34	155	chr3	31699708	31699947	-127899836	-	MTE2b	LTR	MaLR	-152	227	18	2
826	286	338	93	31	chr3	31700254	31700480	-127899303	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-227	335	96	2
826	314	206	16	0	chr3	31700496	31700559	-127899224	-	MTE2b	LTR	MaLR	-306	64	1	2
826	1211	262	55	11	chr3	31701903	31702250	-127897533	+	MTEb	LTR	MaLR	1	362	-17	2
826	269	203	15	45	chr3	31705741	31705808	-127893975	+	MTE2a	LTR	MaLR	78	142	-237	2
826	609	247	73	39	chr3	31705795	31706027	-127893756	+	MT2A	LTR	ERVL	142	381	-152	2
826	2052	97	139	74	chr3	31708145	31708525	-127891258	+	RLTR44A	LTR	ERVK	1	405	0	2
826	2098	154	41	11	chr3	31708674	31709041	-127890742	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
826	4402	156	119	64	chr3	31714957	31715927	-127883856	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	2
827	1256	246	129	40	chr3	31729098	31729619	-127870164	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	2
827	312	246	209	134	chr3	31735053	31735373	-127864410	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1541	1884	-3638	2
827	627	162	80	126	chr3	31735617	31735879	-127863904	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1870	2119	-3403	2
827	289	210	48	0	chr3	31735902	31735964	-127863819	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7249	7313	-1646	2
827	284	187	53	0	chr3	31735967	31736042	-127863741	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2041	2119	-3403	2
827	950	238	93	34	chr3	31736051	31736423	-127863360	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2532	2891	-3246	2
827	591	204	88	82	chr3	31736486	31736668	-127863115	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2896	3078	-3059	2
827	1559	200	70	137	chr3	31736904	31737559	-127862224	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3421	4031	-2106	2
827	3555	25	0	0	chr3	31738382	31738778	-127861005	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
827	2097	191	81	20	chr3	31742717	31743214	-127856569	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	2
827	385	264	18	9	chr3	31743354	31743465	-127856318	-	RMER13B	LTR	ERVK	-35	873	762	3
827	3485	154	13	58	chr3	31743466	31744141	-127855642	-	RMER13B	LTR	ERVK	-249	659	15	3
827	1586	167	118	12	chr3	31744678	31744999	-127854784	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	5	3
827	229	196	0	51	chr3	31749486	31749545	-127850238	+	MLT1C	LTR	MaLR	12	67	-400	3
827	3149	17	0	0	chr3	31751347	31751693	-127848090	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
827	2035	98	6	55	chr3	31753897	31754180	-127845603	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	272	-55	3
827	2035	98	6	55	chr3	31754470	31754530	-127845253	+	ORR1A2	LTR	MaLR	273	327	0	3
827	499	269	122	86	chr3	31754744	31755081	-127844702	-	MLT1B	LTR	MaLR	-36	354	6	3
827	348	318	126	39	chr3	31755311	31755596	-127844187	-	MLT1D	LTR	MaLR	-115	390	81	3
827	1926	235	12	93	chr3	31756434	31757025	-127842758	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	69	3
827	1714	228	42	158	chr3	31757064	31757752	-127842031	-	RMER19C	LTR	ERVK	-3	608	1	3
827	1053	270	21	65	chr3	31760099	31760436	-127839347	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	58	3
827	299	221	15	0	chr3	31760436	31760504	-127839279	-	MTE2a	LTR	MaLR	-281	98	30	3
827	657	241	0	8	chr3	31761934	31762068	-127837715	+	MTE2b	LTR	MaLR	173	305	-74	3
827	1089	276	25	45	chr3	31773742	31774095	-127825688	+	MTEa	LTR	MaLR	34	379	0	3
827	1909	238	7	2	chr3	31777905	31778322	-127821461	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
827	2554	65	80	3	chr3	31780958	31781297	-127818486	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	3
827	1016	282	56	0	chr3	31788710	31788994	-127810789	-	MTE2b	LTR	MaLR	-79	300	1	3
827	320	322	71	16	chr3	31794872	31795181	-127804602	-	RLTR15	LTR	ERVK	-33	326	1	3
827	334	266	18	18	chr3	31795819	31795930	-127803853	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	298	3
827	1668	233	54	31	chr3	31799402	31799924	-127799859	+	RMER5	LTR	ERV1	1	534	0	3
827	231	291	51	0	chr3	31819928	31820007	-127779776	-	ORR1E	LTR	MaLR	-274	85	3	4
827	3980	122	34	40	chr3	31826485	31826940	-127772843	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	450	-306	4
827	3980	122	34	40	chr3	31827561	31827865	-127771918	+	RMER6A	LTR	ERVK	451	756	0	4
827	1022	212	56	91	chr3	31834136	31834560	-127765223	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	1	4
827	519	291	64	88	chr3	31834916	31835213	-127764570	-	ORR1E	LTR	MaLR	-69	290	1	4
827	1477	242	42	47	chr3	31836859	31837240	-127762543	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	4
827	1243	243	70	39	chr3	31842218	31842713	-127757070	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	561	-24	4
827	3407	33	5	0	chr3	31845316	31845710	-127754073	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
828	4434	119	66	34	chr3	31866530	31867474	-127732309	+	RMER17B	LTR	ERVK	8	958	0	4
828	508	286	80	105	chr3	31875156	31875231	-127724552	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	84	-275	4
828	1352	200	66	35	chr3	31875231	31875578	-127724205	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	359	0	4
828	508	286	80	105	chr3	31875578	31875865	-127723918	+	ORR1E	LTR	MaLR	85	353	-6	4
828	590	294	36	155	chr3	31877040	31877454	-127722329	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	4
828	6293	218	40	83	chr3	31879005	31880962	-127718821	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-220	2957	1	4
828	3428	130	8	8	chr3	31881932	31882459	-127717324	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	4
828	918	307	60	4	chr3	31886408	31886689	-127713094	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	83	4
828	234	218	70	35	chr3	31886709	31886766	-127713017	-	MTE2b	LTR	MaLR	-276	103	45	4
828	350	242	20	29	chr3	31886748	31886850	-127712933	-	MTE2b	LTR	MaLR	-278	101	1	4
828	1898	117	17	0	chr3	31887880	31888180	-127711603	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-24	305	1	4
828	3787	37	80	2	chr3	31902153	31902664	-127697119	+	LTRIS2	LTR	ERV1	14	564	0	5
828	581	300	30	26	chr3	31914697	31914964	-127684819	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7460	7727	-51	5
828	2384	68	122	12	chr3	31915058	31915080	-127684703	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	22	-510	5
828	4597	145	12	44	chr3	31915080	31915915	-127683868	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	5
828	2384	68	122	12	chr3	31915915	31916295	-127683488	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	23	447	-85	5
828	2470	136	21	24	chr3	31916852	31917274	-127682509	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
828	1284	198	195	14	chr3	31920715	31921059	-127678724	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	12	5
828	389	252	111	19	chr3	31922344	31922537	-127677246	-	MLT1H	LTR	MaLR	0	579	387	5
828	428	296	8	0	chr3	31926367	31926499	-127673284	+	MLT1B	LTR	MaLR	21	153	-237	5
828	276	312	0	20	chr3	31926851	31926949	-127672834	+	MLT1B	LTR	MaLR	313	408	0	5
828	279	305	22	72	chr3	31926974	31927112	-127672671	+	MLT1B	LTR	MaLR	251	381	-9	5
828	1002	246	125	0	chr3	31932918	31933199	-127666584	+	MTE2b	LTR	MaLR	63	378	-1	5
828	832	247	166	47	chr3	31940114	31940475	-127659308	+	MTD	LTR	MaLR	2	405	-14	5
828	922	258	47	22	chr3	31941922	31942199	-127657584	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	76	5
828	227	295	0	114	chr3	31947392	31947406	-127652377	+	MT2B2	LTR	ERVL	156	233	-351	6
828	3381	159	90	41	chr3	31948657	31949314	-127650469	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	689	-3	6
828	3217	47	29	0	chr3	31953941	31954326	-127645457	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
828	225	341	55	71	chr3	31957485	31957668	-127642115	-	ORR1E	LTR	MaLR	-176	183	4	6
828	402	326	52	6	chr3	31957963	31958136	-127641647	+	MER57E2	LTR	ERV1	28	208	-194	6
828	303	352	0	0	chr3	31958148	31958253	-127641530	+	MER57E2	LTR	ERV1	255	359	-43	6
828	524	253	11	75	chr3	31963895	31964083	-127635700	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	384	6
828	784	298	60	15	chr3	31967463	31967732	-127632051	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	253	6
828	279	203	42	28	chr3	31967796	31967867	-127631916	-	MTE2b	LTR	MaLR	-307	72	1	6
828	2306	120	85	83	chr3	31975274	31975755	-127624028	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	6
828	3988	46	60	8	chr3	31976473	31976960	-127622823	+	LTRIS3	LTR	ERV1	1	512	0	6
829	1798	201	94	5	chr3	31982517	31982898	-127616885	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	6
829	623	293	55	29	chr3	31984126	31984400	-127615383	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	281	-224	6
829	459	182	32	40	chr3	31986299	31986425	-127613358	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	255	6
829	380	267	117	0	chr3	31986490	31986610	-127613173	-	MTEa	LTR	MaLR	-237	142	9	6
829	1532	254	41	3	chr3	31995950	31996313	-127603470	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	1	6
829	735	272	194	46	chr3	31998629	31998953	-127600830	-	MTE2a	LTR	MaLR	-7	372	1	6
829	908	192	58	49	chr3	32001547	32001771	-127598012	+	MTEa	LTR	MaLR	154	379	0	1
829	2068	104	112	9	chr3	32005528	32005859	-127593924	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-2	365	1	1
829	921	228	74	0	chr3	32015046	32015248	-127584535	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	217	-162	2
829	838	224	80	62	chr3	32016748	32017072	-127582711	+	RLTR40	LTR	ERVK	19	348	-469	2
829	265	283	144	24	chr3	32020749	32021060	-127578723	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-5	374	1	2
829	1202	201	88	0	chr3	32023078	32023361	-127576422	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1201	308	1	2
829	2015	166	43	16	chr3	32023361	32023729	-127576054	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
829	668	279	86	89	chr3	32026465	32026745	-127573038	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	101	3
829	566	310	106	9	chr3	32029438	32029656	-127570127	-	MTE2b	LTR	MaLR	-41	338	100	4
829	2731	224	76	35	chr3	32036841	32037642	-127562141	-	RMER13A	LTR	ERVK	-26	834	1	5
829	3588	13	2	0	chr3	32038545	32038940	-127560843	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
829	9020	42	6	2	chr3	32038940	32040034	-127559749	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
829	3545	13	5	0	chr3	32040034	32040428	-127559355	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
829	1437	248	14	6	chr3	32040663	32041012	-127558771	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	15	5
829	1280	164	55	206	chr3	32044625	32045077	-127554706	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	6
829	339	320	0	0	chr3	32045388	32045488	-127554295	+	RMER15	LTR	ERVL	371	470	-105	7
829	1932	216	40	2	chr3	32045525	32045929	-127553854	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
829	956	245	70	4	chr3	32055149	32055407	-127544376	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	103	9
829	435	223	21	0	chr3	32055408	32055502	-127544281	+	MTD	LTR	MaLR	1	96	-323	9
829	405	229	74	0	chr3	32057885	32058007	-127541776	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	249	9
829	526	250	129	125	chr3	32058128	32058384	-127541399	-	MTEb	LTR	MaLR	-122	257	1	9
829	2306	169	32	0	chr3	32071039	32071441	-127528342	+	MTC	LTR	MaLR	7	421	0	1
829	4369	92	2	7	chr3	32072013	32072596	-127527187	+	MT2B2	LTR	ERVL	2	581	-3	1
829	1101	247	134	15	chr3	32081503	32081832	-127517951	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	1	1
829	2060	149	142	13	chr3	32082015	32082388	-127517395	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
829	904	253	96	37	chr3	32086656	32087078	-127512705	+	RLTR26	LTR	ERVK	4	493	-149	1
829	1320	267	18	32	chr3	32090816	32091227	-127508556	+	MTEa	LTR	MaLR	1	377	-2	1
829	791	267	172	9	chr3	32096281	32096606	-127503177	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	2	1
829	1987	154	3	34	chr3	32099177	32099534	-127500249	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
830	1147	244	38	57	chr3	32113852	32113868	-127485915	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	395	1
830	1147	244	38	57	chr3	32113968	32114172	-127485611	-	RMER17C	LTR	ERVK	-16	394	206	1
830	1147	244	38	57	chr3	32114233	32114429	-127485354	-	RMER17C	LTR	ERVK	-205	205	1	1
830	409	197	157	33	chr3	32120780	32120901	-127478882	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	136	-491	1
830	266	324	77	7	chr3	32121075	32121218	-127478565	+	RMER20A	LTR	ERVK	364	516	0	1
830	921	283	133	0	chr3	32122639	32122961	-127476822	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	3	1
830	3859	129	80	11	chr3	32123160	32123794	-127475989	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	1	1
830	608	191	6	26	chr3	32126799	32126955	-127472828	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	155	-255	1
830	547	270	136	19	chr3	32127300	32127557	-127472226	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4037	4323	-1344	1
830	1269	311	30	15	chr3	32127941	32128405	-127471378	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4831	5301	-413	1
830	426	272	57	17	chr3	32128899	32129075	-127470708	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5257	5439	-228	1
830	639	87	0	0	chr3	32131424	32131516	-127468267	-	MT2B2	LTR	ERVL	-242	342	251	2
830	453	160	329	7	chr3	32132629	32132784	-127466999	+	MTD	LTR	MaLR	215	419	0	2
830	380	328	28	62	chr3	32132878	32133089	-127466694	+	MLT1D	LTR	MaLR	302	505	0	2
830	1641	212	39	14	chr3	32133454	32133927	-127465856	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	516	0	2
830	593	236	63	6	chr3	32134217	32134392	-127465391	+	MLT1D	LTR	MaLR	258	442	-63	2
830	380	102	17	0	chr3	32135297	32135356	-127464427	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-269	60	1	2
830	1089	142	51	51	chr3	32135356	32135559	-127464224	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-325	203	1	2
830	1689	205	72	5	chr3	32135640	32136013	-127463770	+	MTD	LTR	MaLR	22	419	0	2
830	500	208	28	47	chr3	32147140	32147312	-127452471	+	MT2A	LTR	ERVL	348	546	-38	2
830	293	132	47	24	chr3	32147305	32147390	-127452393	+	MT2A	LTR	ERVL	447	533	0	2
830	1840	183	80	30	chr3	32148214	32148613	-127451170	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
830	2371	159	17	5	chr3	32151488	32151904	-127447879	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
830	501	174	114	0	chr3	32154451	32154570	-127445213	+	MTD	LTR	MaLR	16	151	-268	2
830	653	147	213	0	chr3	32154594	32154730	-127445053	+	MTD	LTR	MaLR	248	412	-7	2
830	1366	219	136	66	chr3	32155973	32156516	-127443267	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	581	-4	2
830	2766	146	15	25	chr3	32158047	32158518	-127441265	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	2
830	1032	244	29	73	chr3	32158735	32159091	-127440692	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	372	7	2
830	497	209	9	0	chr3	32159102	32159212	-127440571	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-6	1364	1254	2
830	1608	256	35	65	chr3	32160082	32160604	-127439179	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-112	1258	753	2
830	838	193	93	5	chr3	32160609	32160802	-127438981	+	MTD	LTR	MaLR	1	210	-209	2
830	1773	133	108	9	chr3	32160891	32161233	-127438550	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	7	2
830	656	263	83	66	chr3	32161261	32161489	-127438294	-	ORR1E	LTR	MaLR	-127	232	1	2
830	352	235	24	0	chr3	32161489	32161564	-127438219	+	MTD	LTR	MaLR	21	97	-282	2
830	450	258	16	8	chr3	32162925	32163054	-127436729	+	MTD	LTR	MaLR	228	357	-62	2
830	348	309	0	0	chr3	32163629	32163723	-127436060	+	MTD	LTR	MaLR	1	94	-285	2
830	303	261	132	54	chr3	32163723	32163795	-127435988	+	MT2A	LTR	ERVL	1	179	-354	2
830	764	264	24	42	chr3	32166142	32166474	-127433309	-	RLTR15	LTR	ERVK	-33	326	1	2
830	935	194	47	0	chr3	32166994	32167164	-127432619	+	MTD	LTR	MaLR	91	268	-151	2
830	1577	228	27	25	chr3	32167396	32167764	-127432019	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	369	-1	2
830	2020	210	86	49	chr3	32168490	32168980	-127430803	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-3	509	2	2
830	1815	174	68	8	chr3	32169816	32170169	-127429614	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
830	1303	197	114	6	chr3	32171965	32172297	-127427486	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	3	2
830	362	316	126	43	chr3	32175596	32175874	-127423909	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	301	-58	2
830	1515	247	75	5	chr3	32177789	32178176	-127421607	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	2
830	823	279	92	27	chr3	32180265	32180600	-127419183	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	2
830	1532	232	54	20	chr3	32186017	32186422	-127413361	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
830	265	314	138	76	chr3	32186693	32186903	-127412880	-	MLT2B1	LTR	ERVL	0	567	345	3
830	341	256	90	0	chr3	32186957	32187090	-127412693	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-345	175	31	3
830	1337	219	91	30	chr3	32194073	32194403	-127405380	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	29	3
830	244	246	0	0	chr3	32194964	32195025	-127404758	-	MLT1C	LTR	MaLR	-6	499	439	3
830	751	303	59	59	chr3	32195483	32195820	-127403963	-	MLT1C	LTR	MaLR	-74	393	57	3
830	319	158	35	0	chr3	32198913	32198970	-127400813	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	59	-311	3
830	1344	220	51	43	chr3	32198970	32199341	-127400442	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
830	1086	252	105	26	chr3	32199341	32199631	-127400152	+	ORR1D2	LTR	MaLR	57	370	0	3
830	2034	156	176	15	chr3	32199705	32200102	-127399681	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	3
830	295	294	136	29	chr3	32200467	32200709	-127399074	+	LTR48	LTR	ERV1	475	742	-45	3
830	2809	101	8	120	chr3	32200980	32201464	-127398319	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	3
830	399	299	59	39	chr3	32202167	32202320	-127397463	+	RMER15	LTR	ERVL	1	156	-419	3
830	1153	221	67	112	chr3	32204258	32204660	-127395123	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
830	518	346	58	28	chr3	32204660	32205097	-127394686	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1130	3933	3164	3
830	305	381	5	16	chr3	32205556	32205748	-127394035	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2635	2682	2493	3
830	278	300	22	30	chr3	32206038	32206172	-127393611	-	MURVY-int	LTR	ERV1	-3689	3763	3631	3
830	595	203	26	20	chr3	32219677	32219828	-127379955	-	RMER15	LTR	ERVL	-128	447	296	3
830	733	278	35	22	chr3	32220292	32220524	-127379259	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	338	3
830	3184	150	29	34	chr3	32220856	32220945	-127378838	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	491	3
830	3184	150	29	34	chr3	32220989	32221480	-127378303	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-88	490	2	3
830	6513	148	52	14	chr3	32221482	32222258	-127377525	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-2	2840	1498	3
830	6513	178	45	35	chr3	32222302	32223776	-127376007	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-741	2101	1	3
830	2902	38	3	14	chr3	32223793	32224141	-127375642	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-2	344	1	3
830	284	131	15	90	chr3	32224703	32224770	-127375013	+	BGLII	LTR	ERVK	1	62	-359	3
830	1965	90	67	0	chr3	32226967	32227266	-127372517	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
830	2370	132	36	26	chr3	32227873	32228263	-127371520	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
830	4441	134	6	98	chr3	32229324	32230136	-127369647	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	3
830	4682	120	144	11	chr3	32230281	32231126	-127368657	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	3
831	959	281	90	11	chr3	32244654	32245010	-127354773	-	MTD	LTR	MaLR	-18	401	18	4
831	1145	211	145	82	chr3	32250071	32250463	-127349320	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	4
831	294	258	32	11	chr3	32253312	32253406	-127346377	+	MTC	LTR	MaLR	1	96	-325	4
831	420	92	0	0	chr3	32253941	32254006	-127345777	+	RLTR15	LTR	ERVK	294	358	-1	4
831	1043	140	33	36	chr3	32258443	32258672	-127341111	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1	1962	1754	4
831	1474	139	71	68	chr3	32258671	32258994	-127340789	+	ORR1A4	LTR	MaLR	6	329	0	4
831	1364	204	76	82	chr3	32261899	32262267	-127337516	+	MTE2b	LTR	MaLR	13	378	-1	4
831	656	208	188	4	chr3	32265542	32265773	-127334010	-	MTE2b	LTR	MaLR	-28	351	69	4
831	2818	100	50	2	chr3	32269689	32270111	-127329672	+	BGLII_A	LTR	ERVK	3	444	-1	4
831	286	220	95	48	chr3	32271194	32271299	-127328484	+	MLT1A1	LTR	MaLR	299	408	0	4
831	268	306	40	24	chr3	32273018	32273142	-127326641	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-4138	858	733	4
831	384	293	91	32	chr3	32273234	32273421	-127326362	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-4422	574	377	4
831	273	274	162	0	chr3	32273651	32273768	-127326015	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	233	4
831	2271	166	57	8	chr3	32273870	32274271	-127325512	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
831	3425	45	28	14	chr3	32274319	32274745	-127325038	+	RLTR10C	LTR	ERVK	5	436	0	4
831	2204	131	98	3	chr3	32274822	32275181	-127324602	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	1	4
831	395	265	16	49	chr3	32275219	32275342	-127324441	-	MTE2b	LTR	MaLR	-260	119	1	4
831	2194	92	6	0	chr3	32276819	32277133	-127322650	+	ORR1A2	LTR	MaLR	4	319	-8	4
831	377	169	0	0	chr3	32283635	32283700	-127316083	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	65	-257	5
831	599	138	37	1	chr3	32286040	32286155	-127313628	+	MTC	LTR	MaLR	88	211	-208	5
831	1256	153	18	5	chr3	32287574	32287797	-127311986	+	MTC	LTR	MaLR	196	421	0	5
831	430	209	18	79	chr3	32289656	32289770	-127310013	+	MT2B	LTR	ERVL	152	258	-343	5
831	901	210	30	20	chr3	32289885	32290084	-127309699	-	MTEb	LTR	MaLR	-13	366	166	5
831	843	243	11	0	chr3	32290171	32290352	-127309431	-	MTEb	LTR	MaLR	-196	183	1	5
831	836	242	38	4	chr3	32291248	32291484	-127308299	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	135	5
831	254	283	78	17	chr3	32291659	32291772	-127308011	-	MTE-int	LTR	MaLR	-92	1278	1159	5
831	451	256	23	31	chr3	32291760	32291889	-127307894	-	MTE-int	LTR	MaLR	-848	732	605	5
831	1840	197	72	51	chr3	32292118	32292605	-127307178	+	RMER15	LTR	ERVL	79	575	0	5
831	256	302	17	86	chr3	32293825	32293941	-127305842	-	MTEa	LTR	MaLR	-270	109	2	5
831	1499	236	81	25	chr3	32305688	32306158	-127293625	-	RLTR16	LTR	ERVK	-9	496	1	5
831	293	283	44	38	chr3	32307341	32307499	-127292284	-	RMER5	LTR	ERV1	-46	488	330	5
831	2848	133	149	12	chr3	32307572	32308076	-127291707	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	1	5
831	425	286	124	33	chr3	32315780	32315902	-127283881	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1227	353	227	5
831	1775	201	102	8	chr3	32315902	32316283	-127283500	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	5
831	425	286	124	33	chr3	32316283	32316402	-127283381	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1354	226	90	5
831	2952	129	66	66	chr3	32316418	32316990	-127282793	+	RMER15	LTR	ERVL	1	572	-3	5
831	354	214	11	11	chr3	32317044	32317134	-127282649	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1	5756	5667	5
831	934	269	55	35	chr3	32319154	32319354	-127280429	-	MTE2b	LTR	MaLR	-59	320	123	5
831	934	269	55	35	chr3	32319547	32319658	-127280125	-	MTE2b	LTR	MaLR	-257	122	3	5
831	575	206	276	52	chr3	32326580	32326869	-127272914	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	5
831	2296	115	51	22	chr3	32332301	32332656	-127267127	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	367	0	6
831	277	194	72	29	chr3	32353817	32353886	-127245897	-	MER34A	LTR	ERV1	-22	549	478	6
831	774	153	19	3	chr3	32355696	32355855	-127243928	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-216	162	1	6
831	1316	184	122	18	chr3	32355856	32356193	-127243590	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1	1369	998	6
831	2219	94	35	3	chr3	32357628	32357947	-127241836	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	6
831	746	83	9	0	chr3	32358257	32358366	-127241417	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-21	308	199	6
831	1017	264	82	7	chr3	32373333	32373615	-127226168	+	ORR1D2	LTR	MaLR	63	365	-5	6
831	402	202	141	16	chr3	32373874	32373995	-127225788	+	MTEb	LTR	MaLR	44	179	-200	6
832	616	103	0	0	chr3	32380918	32381015	-127218768	+	RLTR11B	LTR	ERVK	357	453	0	6
832	279	221	21	75	chr3	32381733	32381754	-127218029	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1232	1252	-4270	6
832	279	221	21	75	chr3	32381791	32381862	-127217921	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1253	1319	-4203	6
832	922	192	45	32	chr3	32391706	32391926	-127207857	+	MTC	LTR	MaLR	178	400	-21	7
832	571	202	50	24	chr3	32392292	32392455	-127207328	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	371	201	7
832	1779	198	153	11	chr3	32393374	32393761	-127206022	+	MT2A	LTR	ERVL	1	427	-106	7
832	2832	191	6	6	chr3	32393761	32394267	-127205516	+	RLTR18B	LTR	ERVK	3	508	-4	7
832	1779	198	153	11	chr3	32394267	32394343	-127205440	+	MT2A	LTR	ERVL	428	530	-3	7
832	258	279	25	0	chr3	32396305	32396384	-127203399	+	RMER15	LTR	ERVL	403	483	-92	7
832	254	250	30	128	chr3	32397586	32397719	-127202064	+	ORR1C1	LTR	MaLR	194	313	-66	7
832	248	256	74	37	chr3	32398590	32398671	-127201112	+	ORR1C2	LTR	MaLR	44	127	-247	7
832	2505	95	0	3	chr3	32398734	32399062	-127200721	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
832	1204	197	29	47	chr3	32399396	32399673	-127200110	+	ORR1C2	LTR	MaLR	111	382	-2	7
832	2260	11	114	0	chr3	32400174	32400436	-127199347	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	292	0	7
832	414	247	0	10	chr3	32400526	32400624	-127199159	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-1	406	310	7
832	310	160	0	0	chr3	32400617	32400667	-127199116	+	ORR1C1	LTR	MaLR	329	378	0	7
832	2789	147	119	29	chr3	32402364	32402616	-127197167	+	RLTR33	LTR	ERVK	39	326	-352	7
832	2789	147	119	29	chr3	32402764	32403098	-127196685	+	RLTR33	LTR	ERVK	327	678	0	7
832	2307	113	25	43	chr3	32403774	32404170	-127195613	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	87	475	0	7
832	2075	98	11	100	chr3	32404913	32405274	-127194509	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	7
832	1826	100	0	7	chr3	32405904	32406176	-127193607	+	RMER19B	LTR	ERVK	617	886	-16	7
832	1295	204	329	4	chr3	32406286	32406731	-127193052	+	MT2B	LTR	ERVL	12	601	0	7
832	3481	23	5	0	chr3	32407061	32407455	-127192328	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
832	397	229	8	99	chr3	32411069	32411190	-127188593	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	155	7
832	230	284	27	0	chr3	32421212	32421286	-127178497	-	MLT1C	LTR	MaLR	-382	85	10	7
832	822	240	234	50	chr3	32422519	32422883	-127176900	-	RMER15	LTR	ERVL	-112	463	33	7
832	245	277	24	104	chr3	32423140	32423170	-127176613	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	193	8
832	245	277	24	104	chr3	32423249	32423265	-127176518	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	192	149	8
832	3490	97	11	63	chr3	32424800	32425340	-127174443	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	8
832	1353	211	99	64	chr3	32425927	32426015	-127173768	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	331	8
832	1353	211	99	64	chr3	32426036	32426322	-127173461	-	MTD	LTR	MaLR	-89	330	18	8
832	275	314	23	0	chr3	32435436	32435522	-127164261	+	MER21B	LTR	ERV1	24	111	-752	8
832	441	305	172	19	chr3	32436419	32436876	-127162907	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-19	560	1	8
832	515	152	71	0	chr3	32438379	32438478	-127161305	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-268	106	1	8
832	1155	234	144	0	chr3	32452684	32452975	-127146808	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-37	333	1	8
832	1340	207	144	22	chr3	32453799	32454159	-127145624	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	8
832	899	202	58	19	chr3	32455172	32455379	-127144404	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	196	9
832	255	207	30	121	chr3	32455429	32455528	-127144255	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	169	9
832	268	262	12	23	chr3	32456383	32456469	-127143314	-	MT2B2	LTR	ERVL	-346	238	154	9
832	2045	215	69	15	chr3	32470577	32471111	-127128672	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	563	1	9
832	1962	140	45	6	chr3	32471831	32472273	-127127510	-	RLTR33	LTR	ERVK	-167	511	1	9
832	600	199	72	36	chr3	32474204	32474397	-127125386	+	RMER13A	LTR	ERVK	14	213	-647	9
832	1885	138	180	2	chr3	32484570	32484992	-127114791	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	260	9
832	1196	157	38	111	chr3	32499589	32499933	-127099850	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	319	-10	9
832	4409	12	0	0	chr3	32501401	32501883	-127097900	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	4
832	547	281	79	105	chr3	32502469	32502887	-127096896	+	RMER10A	LTR	ERVL	12	418	-24	7
832	1775	188	33	38	chr3	32503230	32503595	-127096188	+	ORR1D1	LTR	MaLR	12	374	0	9
832	2205	138	108	8	chr3	32503940	32504321	-127095462	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	1
832	412	364	71	22	chr3	32505406	32505729	-127094054	+	MTE-int	LTR	MaLR	769	1107	-473	1
833	256	271	130	96	chr3	32508931	32509139	-127090644	+	RLTR12B	LTR	ERVK	119	333	-195	2
833	236	150	143	48	chr3	32509915	32509978	-127089805	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	69	-310	2
833	987	252	46	62	chr3	32510172	32510475	-127089308	+	MTE2b	LTR	MaLR	73	370	-9	2
833	1417	171	191	9	chr3	32511547	32511872	-127087911	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
833	747	225	293	15	chr3	32512465	32512788	-127086995	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	7	3
833	576	338	139	23	chr3	32519226	32519571	-127080212	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-55	524	140	5
833	2091	130	76	157	chr3	32519910	32520395	-127079388	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	5
833	1157	209	75	19	chr3	32520477	32520745	-127079038	+	MTD	LTR	MaLR	5	287	-132	5
833	1113	207	205	27	chr3	32520739	32521031	-127078752	+	MTD	LTR	MaLR	24	381	-38	5
833	1342	209	117	35	chr3	32521031	32521373	-127078410	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
833	1113	207	205	27	chr3	32521373	32521412	-127078371	+	MTD	LTR	MaLR	382	414	-5	5
833	1117	127	15	86	chr3	32525458	32525690	-127074093	+	RLTR16	LTR	ERVK	34	296	-267	6
833	2374	142	47	12	chr3	32525962	32526368	-127073415	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	6
833	599	293	223	25	chr3	32526556	32526794	-127072989	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	69	6
833	601	222	149	23	chr3	32528084	32528259	-127071524	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	197	-162	6
833	3251	160	30	2	chr3	32530131	32530688	-127069095	+	RMER15	LTR	ERVL	3	575	0	7
833	2708	43	12	0	chr3	32534751	32535079	-127064704	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	54	385	0	8
833	302	239	33	33	chr3	32535322	32535413	-127064370	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	289	8
833	300	264	17	117	chr3	32536715	32536835	-127062948	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	150	9
833	1662	202	52	41	chr3	32538718	32539014	-127060769	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	302	-72	9
833	3366	43	2	0	chr3	32539014	32539409	-127060374	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	9
833	1662	202	52	41	chr3	32539409	32539474	-127060309	+	ORR1D1	LTR	MaLR	303	366	-8	9
833	607	267	62	62	chr3	32539507	32539715	-127060068	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	346	9
833	726	310	86	56	chr3	32539690	32540071	-127059712	-	RLTR17	LTR	ERVK	-207	485	60	9
833	1258	217	15	30	chr3	32541586	32541857	-127057926	+	MTD	LTR	MaLR	18	284	-135	1
833	704	199	60	0	chr3	32542308	32542459	-127057324	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	260	1
833	538	290	115	17	chr3	32543719	32543954	-127055829	-	RMER15	LTR	ERVL	-43	532	275	1
833	2308	181	34	60	chr3	32544218	32544683	-127055100	+	MT2A	LTR	ERVL	6	458	-75	1
833	1612	169	139	35	chr3	32544724	32544888	-127054895	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	190	-184	1
833	3163	62	7	7	chr3	32544888	32545309	-127054474	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
833	1612	169	139	35	chr3	32545372	32545544	-127054239	+	ORR1D1	LTR	MaLR	191	373	-1	1
833	290	109	0	18	chr3	32545842	32545898	-127053885	+	MT2A	LTR	ERVL	479	533	0	1
833	2639	148	22	26	chr3	32548081	32548533	-127051250	+	RLTR11B	LTR	ERVK	4	453	0	1
833	2303	122	91	6	chr3	32550988	32551351	-127048432	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
833	2098	138	76	0	chr3	32558412	32558753	-127041030	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	1
833	234	224	64	96	chr3	32558778	32558872	-127040911	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	167	1
833	531	249	195	35	chr3	32559786	32560073	-127039710	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	379	0	1
833	282	206	161	44	chr3	32560106	32560243	-127039540	+	ORR1D1	LTR	MaLR	25	177	-197	1
833	2293	153	0	18	chr3	32560878	32561278	-127038505	+	MTC	LTR	MaLR	1	393	-28	1
833	301	316	14	68	chr3	32566667	32566813	-127032970	+	MLT1B	LTR	MaLR	248	385	-5	1
833	526	315	91	0	chr3	32569434	32569653	-127030130	+	MLT1A0	LTR	MaLR	127	365	0	1
833	403	38	0	0	chr3	32569900	32569953	-127029830	+	MT2A	LTR	ERVL	6	58	-475	1
833	749	204	93	6	chr3	32571136	32571437	-127028346	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	1
833	1694	220	158	72	chr3	32571443	32572125	-127027658	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	518	1
833	1623	167	34	124	chr3	32572170	32572607	-127027176	+	MTC-int	LTR	MaLR	859	1256	-2	1
833	816	208	257	30	chr3	32572678	32572741	-127027042	+	MTD	LTR	MaLR	48	109	-310	1
833	816	208	257	30	chr3	32572763	32572989	-127026794	+	MTD	LTR	MaLR	110	405	-14	1
833	816	208	257	30	chr3	32573621	32573633	-127026150	+	MTD	LTR	MaLR	406	417	-2	1
833	807	263	57	60	chr3	32573635	32574061	-127025722	-	MTD-int	LTR	MaLR	-746	512	1	1
833	2701	66	26	3	chr3	32576244	32576593	-127023190	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	2
833	2682	28	2	116	chr3	32581529	32581969	-127017814	-	RLTR10	LTR	ERVK	-7	383	1	2
833	1419	234	58	80	chr3	32582733	32582823	-127016960	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	413	2
833	1419	234	58	80	chr3	32582856	32583281	-127016502	-	RLTR16	LTR	ERVK	-93	412	1	2
833	278	305	101	65	chr3	32585161	32585378	-127014405	+	MLT1B	LTR	MaLR	3	227	-163	2
833	2011	142	19	68	chr3	32585378	32585807	-127013976	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	408	-2	2
833	1281	192	55	93	chr3	32585819	32586204	-127013579	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	24	2
833	292	335	17	80	chr3	32588195	32588370	-127011413	-	RMER4A	LTR	ERVK	-278	188	25	2
833	426	183	54	0	chr3	32591540	32591633	-127008150	+	MTC	LTR	MaLR	324	421	0	2
833	545	245	121	29	chr3	32594294	32594500	-127005283	+	MLT1B	LTR	MaLR	32	256	-134	2
833	1190	209	46	132	chr3	32594581	32594951	-127004832	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	338	-46	2
833	1321	208	11	116	chr3	32594941	32595171	-127004612	-	MTD	LTR	MaLR	-80	339	122	2
833	1321	208	11	116	chr3	32595309	32595431	-127004352	-	MTD	LTR	MaLR	-298	121	24	2
833	2035	142	67	32	chr3	32596523	32596894	-127002889	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	2
833	2510	136	7	19	chr3	32598720	32599134	-127000649	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
833	523	109	8	12	chr3	32599134	32599220	-127000563	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1	7405	7331	2
833	18800	94	21	31	chr3	32599422	32601870	-126997913	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-981	6425	4071	2
833	18800	104	25	48	chr3	32602017	32602934	-126996849	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2648	4596	3636	2
833	726	245	0	37	chr3	32602929	32603090	-126996693	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4798	2608	2454	2
833	610	157	29	0	chr3	32603330	32603432	-126996351	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4213	1193	1089	2
833	285	186	67	17	chr3	32603437	32603497	-126996286	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4587	819	757	2
833	323	83	0	0	chr3	32603507	32603555	-126996228	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5218	188	141	2
833	370	169	0	15	chr3	32603997	32604063	-126995720	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5089	2155	2091	2
833	920	200	15	89	chr3	32604298	32604567	-126995216	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4594	250	2	2
833	2418	128	30	25	chr3	32604569	32604976	-126994807	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
833	1458	187	58	63	chr3	32608898	32609263	-126990520	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	8	2
833	349	257	37	65	chr3	32610657	32610765	-126989018	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	153	2
833	446	280	92	15	chr3	32612100	32612296	-126987487	-	MER68	LTR	ERVL	-183	380	170	2
833	310	240	35	96	chr3	32623984	32624099	-126975684	-	MT2B	LTR	ERVL	-341	260	153	2
834	1835	115	98	13	chr3	32641163	32641479	-126958304	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-12	355	13	3
834	2152	150	104	10	chr3	32641563	32641948	-126957835	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
834	1614	152	139	51	chr3	32645815	32646168	-126953615	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
834	266	284	198	13	chr3	32651346	32651503	-126948280	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	419	-208	3
834	366	242	65	11	chr3	32651795	32651887	-126947896	+	RMER20B	LTR	ERVK	504	600	-27	3
834	949	221	99	131	chr3	32654695	32655069	-126944714	+	RLTR18B	LTR	ERVK	151	512	0	3
834	538	161	42	35	chr3	32655548	32655690	-126944093	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1706	1848	0	3
834	2314	117	3	3	chr3	32656875	32657202	-126942581	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
834	2596	145	39	9	chr3	32657316	32657755	-126942028	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	2	3
834	421	285	140	41	chr3	32661732	32662175	-126937608	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-41	487	1	3
834	1110	169	118	185	chr3	32663233	32663442	-126936341	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2403	2591	-647	3
834	1110	169	118	185	chr3	32663497	32663673	-126936110	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2592	2751	-487	3
834	2915	74	48	0	chr3	32663673	32664065	-126935718	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	3
834	1110	211	352	60	chr3	32664065	32664446	-126935337	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2752	3238	0	3
834	337	245	58	120	chr3	32664592	32664833	-126934950	+	RMER17C	LTR	ERVK	130	355	-55	3
834	1353	193	77	8	chr3	32669571	32669832	-126929951	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1855	2133	-2858	3
834	7292	121	17	17	chr3	32670592	32671826	-126927957	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5525	7329	-351	3
834	1991	74	30	23	chr3	32671826	32672131	-126927652	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	307	-20	3
834	2852	195	27	42	chr3	32672474	32673064	-126926719	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	2105	2685	-2306	3
834	1028	165	96	20	chr3	32673441	32673639	-126926144	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1105	1317	-4205	3
834	256	179	0	116	chr3	32673866	32673961	-126925822	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3461	3544	-2593	3
834	6872	176	96	8	chr3	32673954	32675284	-126924499	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3226	4673	-318	3
834	1007	175	11	5	chr3	32678377	32678561	-126921222	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4641	4825	-166	3
834	345	252	50	0	chr3	32678563	32678662	-126921121	+	RMER4B	LTR	ERVK	346	449	-136	3
834	460	249	200	26	chr3	32678810	32679000	-126920783	+	RMER21B	LTR	ERV1	345	567	-275	3
834	1248	188	147	32	chr3	32679111	32679485	-126920298	-	RMER21B	LTR	ERV1	-356	486	70	3
834	2256	171	115	113	chr3	32681645	32682056	-126917727	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	375	-527	3
834	2384	109	34	32	chr3	32682056	32682464	-126917319	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	3
834	2256	171	115	113	chr3	32682464	32682595	-126917188	+	RMER19B	LTR	ERVK	376	496	-406	3
834	2256	171	115	113	chr3	32682655	32682739	-126917044	+	RMER19B	LTR	ERVK	497	629	-273	3
834	1017	202	206	13	chr3	32689628	32689934	-126909849	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-7	367	3	3
834	5474	209	51	39	chr3	32689941	32691282	-126908501	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-13	1357	1	3
834	881	233	155	42	chr3	32691282	32691473	-126908310	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	152	3
834	881	233	155	42	chr3	32691826	32691970	-126907813	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-223	151	1	3
834	1949	257	144	30	chr3	32692089	32692860	-126906923	+	RMER13A	LTR	ERVK	2	860	0	3
834	231	321	40	74	chr3	32694146	32694294	-126905489	-	MLT1I	LTR	MaLR	-26	385	243	3
834	1705	197	109	3	chr3	32694546	32694922	-126904861	+	MTD	LTR	MaLR	1	416	-3	3
834	579	152	29	0	chr3	32695462	32695567	-126904216	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	267	4
834	686	189	8	0	chr3	32695576	32695708	-126904075	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-241	133	1	4
834	226	167	56	0	chr3	32696353	32696407	-126903376	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	446	4
834	1686	120	12	58	chr3	32697134	32697461	-126902322	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	11	322	0	4
834	914	153	6	6	chr3	32699354	32699512	-126900271	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	158	-735	4
834	2327	101	29	72	chr3	32699512	32699886	-126899897	+	RLTR10D	LTR	ERVK	2	359	0	4
834	5784	50	36	3	chr3	32699886	32700609	-126899174	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	1	747	-5795	4
834	23021	52	12	16	chr3	32700668	32703514	-126896269	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	3188	6021	-521	4
834	3576	53	0	0	chr3	32703517	32703932	-126895851	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6128	6542	0	4
834	2216	109	32	80	chr3	32703932	32704309	-126895474	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	4
834	2372	153	184	32	chr3	32704309	32705080	-126894703	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	151	1023	0	4
834	3484	133	28	20	chr3	32705292	32705898	-126893885	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	142	4
834	4884	91	50	9	chr3	32705898	32706585	-126893198	-	RLTR19B	LTR	ERVK	0	715	1	4
834	3484	151	59	7	chr3	32706585	32706689	-126893094	-	RMER6A	LTR	ERVK	-615	141	1	4
834	561	297	82	88	chr3	32707736	32708065	-126891718	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	51	4
834	1192	168	5	14	chr3	32708888	32709111	-126890672	+	MTD	LTR	MaLR	1	221	-198	4
834	1339	203	33	13	chr3	32709120	32709419	-126890364	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	257	4
834	579	207	25	0	chr3	32710054	32710175	-126889608	-	RMER15	LTR	ERVL	-287	288	165	4
834	1916	142	103	15	chr3	32710176	32710650	-126889133	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	4
834	710	209	57	0	chr3	32710651	32710809	-126888974	-	RMER15	LTR	ERVL	-408	167	1	4
834	318	185	0	0	chr3	32710812	32710866	-126888917	+	MTD	LTR	MaLR	221	274	-145	4
834	3340	43	5	2	chr3	32718326	32718721	-126881062	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
834	249	256	49	37	chr3	32719614	32719695	-126880088	-	ORR1E	LTR	MaLR	-221	138	57	4
834	717	260	147	60	chr3	32721278	32721626	-126878157	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	2	4
834	2081	130	38	57	chr3	32726037	32726405	-126873378	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	18	4
834	251	33	0	0	chr3	32726558	32726588	-126873195	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-353	31	2	4
834	277	236	140	43	chr3	32732226	32732319	-126867464	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1156	102	1	4
834	1987	209	39	15	chr3	32732319	32732618	-126867165	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	125	4
834	1987	209	39	15	chr3	32732684	32732793	-126866990	-	MTD	LTR	MaLR	-295	124	2	4
834	1237	171	66	73	chr3	32733850	32734284	-126865499	-	MT2B	LTR	ERVL	-43	541	1	4
834	381	223	87	96	chr3	32735412	32735470	-126864313	-	MTEb	LTR	MaLR	-18	361	303	4
834	3409	146	0	11	chr3	32735470	32735751	-126864032	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	253	4
834	3409	146	0	11	chr3	32735925	32736177	-126863606	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-276	252	1	4
834	381	252	106	159	chr3	32736177	32736347	-126863436	-	MTEb	LTR	MaLR	-58	321	171	4
834	381	252	106	159	chr3	32736374	32736477	-126863306	-	MTEb	LTR	MaLR	-209	170	59	4
834	564	204	95	65	chr3	32741775	32741818	-126857965	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-195	179	138	4
834	564	204	95	65	chr3	32741900	32742024	-126857759	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-237	137	7	4
834	269	238	152	38	chr3	32742926	32743031	-126856752	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-6	402	286	4
834	2525	112	49	32	chr3	32758999	32759438	-126840345	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	1	5
834	2016	171	9	18	chr3	32762679	32763018	-126836765	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	84	5
834	612	156	21	8	chr3	32763529	32763651	-126836132	-	MTD	LTR	MaLR	-276	131	2	5
834	247	279	15	0	chr3	32763784	32763852	-126835931	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	402	5
834	1094	249	79	42	chr3	32766707	32767060	-126832723	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	370	0	5
834	2570	164	2	12	chr3	32767113	32767538	-126832245	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
104	763	250	81	207	chr3	32767578	32768012	-126831771	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	5
835	354	69	0	0	chr3	32781820	32781873	-126817910	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	369	5
835	1946	164	44	6	chr3	32782208	32782569	-126817214	-	MTC	LTR	MaLR	-46	375	1	5
835	962	266	90	44	chr3	32782839	32783338	-126816445	-	RMER5	LTR	ERV1	-12	522	1	5
835	286	269	32	0	chr3	32784327	32784420	-126815363	-	MER31B	LTR	ERV1	-104	362	267	5
835	259	326	0	30	chr3	32785619	32785720	-126814063	-	RMER15	LTR	ERVL	-45	530	433	5
835	437	346	115	11	chr3	32786181	32786450	-126813333	-	RMER15	LTR	ERVL	-4	571	275	5
835	1864	221	12	22	chr3	32789568	32789984	-126809799	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	3	6
835	530	279	22	42	chr3	32794038	32794327	-126805456	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-24	504	241	6
835	750	236	76	42	chr3	32794296	32794584	-126805199	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-155	298	1	6
835	2841	188	29	9	chr3	32794584	32795231	-126804552	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-54	8905	8330	6
835	1389	192	44	63	chr3	32795233	32795729	-126804054	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-795	8164	7813	6
835	243	247	90	13	chr3	32795729	32795807	-126803976	-	RMER4B	LTR	ERVK	-53	532	449	6
835	1010	305	35	56	chr3	32795815	32796301	-126803482	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1341	5209	4734	6
835	6285	133	13	31	chr3	32796304	32797434	-126802349	-	RLTR21	LTR	ERVK	-4	1568	459	6
835	3389	93	0	2	chr3	32797902	32798378	-126801405	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1097	475	1	6
835	414	236	168	68	chr3	32798378	32798569	-126801214	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1890	436	319	6
835	833	211	77	21	chr3	32798616	32798849	-126800934	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2107	4443	4198	6
835	508	272	116	95	chr3	32799698	32800129	-126799654	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-13	440	1	6
835	556	265	415	63	chr3	32801782	32802069	-126797714	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-96	438	51	6
835	857	274	58	124	chr3	32802324	32802670	-126797113	-	MTE2b	LTR	MaLR	-54	325	3	6
835	231	290	102	24	chr3	32819781	32819908	-126779875	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-280	248	112	6
835	565	279	93	13	chr3	32821078	32821314	-126778469	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	321	6
835	245	316	71	7	chr3	32824564	32824704	-126775079	-	LTR37B	LTR	ERV1	-1	467	319	6
835	4506	112	79	11	chr3	32825307	32826015	-126773768	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	6
835	1532	218	96	8	chr3	32826755	32827129	-126772654	+	MTD	LTR	MaLR	10	416	-3	6
835	1617	202	58	19	chr3	32830994	32831448	-126768335	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-6	435	22	6
835	1383	213	155	3	chr3	32835675	32836037	-126763746	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	6
835	358	246	82	0	chr3	32837621	32837731	-126762052	-	MLT1D	LTR	MaLR	-279	226	108	6
835	3401	28	5	10	chr3	32840771	32841169	-126758614	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
835	1857	168	78	9	chr3	32860922	32861270	-126738513	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	373	-1	7
835	1442	214	69	21	chr3	32870480	32870815	-126728968	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	351	-23	7
835	967	277	40	3	chr3	32872403	32872700	-126727083	+	MTEb	LTR	MaLR	72	379	0	7
835	4056	138	46	162	chr3	32882538	32883606	-126716177	+	RMER21A	LTR	ERV1	4	947	0	7
835	297	179	0	18	chr3	32883607	32883664	-126716119	+	RMER21B	LTR	ERV1	766	821	-21	7
835	537	235	22	15	chr3	32883667	32883801	-126715982	+	RMER21B	LTR	ERV1	700	834	-8	7
835	848	309	113	12	chr3	32885572	32885988	-126713795	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-40	529	72	7
835	922	230	104	123	chr3	32887856	32888277	-126711506	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	7	7
835	397	313	14	40	chr3	32892614	32892791	-126706992	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	467	251	7
835	1622	206	96	0	chr3	32893795	32894149	-126705634	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	32	7
835	916	293	53	88	chr3	32896304	32896351	-126703432	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	43	-376	7
835	1592	233	78	23	chr3	32896351	32896747	-126703036	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	7
835	1027	252	35	88	chr3	32896747	32897133	-126702650	+	MTE2a	LTR	MaLR	44	419	0	7
836	1520	179	11	6	chr3	32902017	32902300	-126697483	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	260	-303	7
836	1720	164	28	31	chr3	32902324	32902671	-126697112	+	RLTR11A	LTR	ERVK	200	528	0	7
836	928	230	34	26	chr3	32903698	32904049	-126695734	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	7
836	275	260	39	0	chr3	32909128	32909205	-126690578	+	MLT1D	LTR	MaLR	149	228	-277	7
836	228	319	20	41	chr3	32909309	32909407	-126690376	+	MLT1D	LTR	MaLR	410	505	0	7
836	502	266	107	63	chr3	32911613	32911866	-126687917	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	264	-203	7
836	864	297	89	25	chr3	32919628	32920022	-126679761	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	8
836	977	254	148	19	chr3	32934606	32934923	-126664860	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	359	0	8
836	237	263	126	44	chr3	32937480	32937663	-126662120	+	LTR85a	LTR	Gypsy?	494	691	-11	8
836	965	190	0	32	chr3	32949949	32950134	-126649649	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	220	8
836	2970	79	12	25	chr3	32950361	32950762	-126649021	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
836	851	266	60	39	chr3	32964140	32964509	-126635274	+	MTE2a	LTR	MaLR	4	375	-44	8
836	387	283	0	0	chr3	32992215	32992321	-126607462	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	106	-264	8
836	508	225	35	7	chr3	32992310	32992453	-126607330	+	ORR1D2	LTR	MaLR	222	368	-2	8
836	821	234	122	81	chr3	32995965	32996300	-126603483	-	MTE2a	LTR	MaLR	-30	349	1	9
836	340	275	111	42	chr3	33001547	33001763	-126598020	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-134	236	6	4
836	1525	209	71	3	chr3	33005838	33005968	-126593815	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	244	1
836	1525	209	71	3	chr3	33005995	33006214	-126593569	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-131	243	2	1
836	226	237	34	0	chr3	33010486	33010545	-126589238	+	RMER15	LTR	ERVL	2	62	-513	2
836	1505	208	222	7	chr3	33010838	33011288	-126588495	+	RMER15	LTR	ERVL	29	575	0	2
836	2008	175	67	44	chr3	33013117	33013553	-126586230	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	2
836	268	253	11	33	chr3	33026724	33026814	-126572969	+	MTE2a	LTR	MaLR	278	365	-14	3
836	349	241	24	0	chr3	33027065	33027148	-126572635	+	MTE2a	LTR	MaLR	11	95	-284	3
836	1082	265	50	35	chr3	33027152	33027469	-126572314	+	MTE2a	LTR	MaLR	58	379	0	3
104	1688	128	130	41	chr3	33029804	33030172	-126569611	+	MTC	LTR	MaLR	13	413	-8	4
837	2322	207	33	28	chr3	33035392	33035990	-126563793	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	601	-216	5
837	452	178	112	37	chr3	33043470	33043604	-126556179	+	MTD	LTR	MaLR	244	387	-32	5
837	1486	221	26	69	chr3	33043643	33044135	-126555648	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	71	5
837	2278	31	14	308	chr3	33044876	33045428	-126554355	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	6
837	302	272	0	32	chr3	33058482	33058577	-126541206	+	ORR1E	LTR	MaLR	104	195	-164	8
837	250	318	0	22	chr3	33058687	33058777	-126541006	+	ORR1E	LTR	MaLR	278	365	-14	8
837	297	298	62	29	chr3	33060702	33060867	-126538916	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	174	-196	8
837	1723	232	111	29	chr3	33061669	33062145	-126537638	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	61	9
837	599	196	152	28	chr3	33076103	33076281	-126523502	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	171	1
837	594	261	83	0	chr3	33076429	33076586	-126523197	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-194	176	7	1
837	2961	218	58	35	chr3	33076588	33077277	-126522506	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	666	1
837	379	322	0	40	chr3	33077296	33077417	-126522366	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-940	640	525	1
837	525	270	122	45	chr3	33077417	33077830	-126521953	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	3	1
837	2209	213	56	17	chr3	33077832	33078314	-126521469	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-869	501	1	1
837	1138	249	57	6	chr3	33078314	33078666	-126521117	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
837	2778	176	66	18	chr3	33079290	33079835	-126519948	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	5	1
837	1135	272	32	100	chr3	33082505	33082946	-126516837	+	MTD	LTR	MaLR	9	419	0	1
837	499	320	142	46	chr3	33088138	33088462	-126511321	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	5	1
837	683	249	171	12	chr3	33108720	33109047	-126490736	+	MTD	LTR	MaLR	27	405	-14	1
837	382	354	105	58	chr3	33111354	33111612	-126488171	+	MLT1K	LTR	MaLR	5	274	-321	1
837	1557	247	46	8	chr3	33114311	33114662	-126485121	+	MTE2a	LTR	MaLR	16	379	0	1
837	531	250	71	38	chr3	33114673	33114856	-126484927	-	ORR1E	LTR	MaLR	-170	189	1	1
837	442	109	0	0	chr3	33115078	33115142	-126484641	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-463	64	1	1
837	1351	210	40	11	chr3	33115142	33115417	-126484366	+	ORR1D1	LTR	MaLR	92	374	0	1
837	429	276	90	90	chr3	33116396	33116619	-126483164	+	LTR33A_	LTR	ERVL	7	245	-286	1
837	314	351	96	32	chr3	33118648	33118898	-126480885	+	LTR84b	LTR	ERVL	1	266	-495	1
837	299	163	20	0	chr3	33125164	33125213	-126474570	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-976	52	3	1
837	3100	174	6	6	chr3	33125593	33126124	-126473659	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	531	-32	1
837	525	259	51	15	chr3	33128020	33128157	-126471626	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	142	-228	1
837	1363	195	114	6	chr3	33129749	33130099	-126469684	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	54	1
837	1235	258	33	81	chr3	33134568	33134965	-126464818	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	2	1
837	271	231	115	44	chr3	33134989	33135102	-126464681	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	288	1
837	303	256	94	137	chr3	33152901	33153137	-126446646	-	MTEb	LTR	MaLR	-6	373	125	1
837	237	283	142	20	chr3	33153361	33153509	-126446274	+	MLT1A	LTR	MaLR	23	188	-186	1
837	1796	251	21	8	chr3	33155648	33156034	-126443749	+	MTD	LTR	MaLR	18	408	-11	2
837	1870	149	50	3	chr3	33160263	33160565	-126439218	+	ORR1B1	LTR	MaLR	79	394	0	2
838	1620	259	24	46	chr3	33163737	33163873	-126435910	+	MTD	LTR	MaLR	1	134	-285	2
838	1620	259	24	46	chr3	33164062	33164338	-126435445	+	MTD	LTR	MaLR	135	404	-15	2
838	1706	274	67	35	chr3	33164351	33164883	-126434900	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	880	-700	2
838	911	285	23	15	chr3	33165256	33165516	-126434267	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	262	-108	2
838	403	281	174	82	chr3	33171478	33171772	-126428011	-	ORR1E	LTR	MaLR	-38	321	1	2
838	2875	81	10	13	chr3	33175333	33175722	-126424061	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
838	2913	22	28	0	chr3	33176924	33177242	-126422541	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	2
838	2489	114	159	5	chr3	33181370	33181759	-126418024	+	RLTR44B	LTR	ERVK	1	449	0	2
838	1080	171	36	0	chr3	33181759	33181952	-126417831	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	1	200	-2612	2
838	6639	177	22	42	chr3	33181955	33184624	-126415159	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	659	2812	0	2
838	2402	113	181	5	chr3	33184624	33185006	-126414777	+	RLTR44B	LTR	ERVK	1	449	0	2
838	490	272	172	68	chr3	33186281	33186502	-126413281	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	247	-127	2
838	621	227	4	125	chr3	33186490	33186722	-126413061	+	ORR1D2	LTR	MaLR	158	361	-9	2
838	338	337	123	48	chr3	33188078	33188436	-126411347	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-204	391	7	2
838	330	283	50	0	chr3	33189482	33189602	-126410181	-	RMER15	LTR	ERVL	-42	533	408	2
838	258	296	73	45	chr3	33198955	33199132	-126400651	+	LTR37B	LTR	ERV1	198	379	-89	2
838	2752	199	10	8	chr3	33199536	33200027	-126399756	+	RMER19C	LTR	ERVK	120	611	0	2
838	739	319	77	52	chr3	33203778	33204218	-126395565	+	MLT1C	LTR	MaLR	8	458	-9	2
838	2049	224	51	157	chr3	33205918	33206601	-126393182	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
838	437	320	82	44	chr3	33209446	33209629	-126390154	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	190	-200	2
838	313	289	13	0	chr3	33209658	33209734	-126390049	+	MLT1B	LTR	MaLR	298	374	-16	2
838	252	312	104	37	chr3	33210160	33210323	-126389460	+	MLT2B4	LTR	ERVL	13	186	-370	2
838	289	315	61	19	chr3	33210369	33210540	-126389243	+	MLT2B4	LTR	ERVL	213	520	-36	2
838	327	337	26	56	chr3	33217716	33217911	-126381872	+	RMER4A	LTR	ERVK	4	192	-274	2
838	463	373	165	33	chr3	33218191	33218524	-126381259	-	MER21B	LTR	ERV1	-425	438	62	2
838	2060	165	26	59	chr3	33218529	33218634	-126381149	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	273	2
838	2060	165	26	59	chr3	33218676	33218957	-126380826	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-106	272	6	2
838	4856	209	53	50	chr3	33218958	33219136	-126380647	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-16	1354	1192	2
838	4856	209	53	50	chr3	33219552	33220554	-126379229	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-179	1191	170	2
838	3868	30	4	122	chr3	33220554	33221093	-126378690	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
838	6578	51	13	12	chr3	33221095	33221923	-126377860	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5651	2
838	2697	70	0	3	chr3	33221916	33222259	-126377524	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4781	1700	1359	2
838	3683	55	1	16	chr3	33222259	33222837	-126376946	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	2
838	228	321	0	0	chr3	33222837	33222890	-126376893	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	223	2
838	239	302	0	0	chr3	33222918	33222971	-126376812	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	223	2
838	1023	99	99	0	chr3	33222971	33223133	-126376650	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6286	195	18	2
838	581	239	109	35	chr3	33223133	33223173	-126376610	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1769	194	152	2
838	3855	30	4	122	chr3	33223173	33223712	-126376071	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
838	581	206	105	40	chr3	33223712	33223851	-126375932	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1357	152	1	2
838	2036	172	31	66	chr3	33223851	33224243	-126375540	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
838	549	281	209	13	chr3	33231118	33231352	-126368431	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	294	2
838	287	302	151	71	chr3	33233552	33233916	-126365867	-	MLT1D	LTR	MaLR	-9	496	104	3
838	4643	123	33	29	chr3	33245144	33245895	-126353888	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	3	3
838	930	237	217	50	chr3	33248628	33249171	-126350612	-	MT2B	LTR	ERVL	-47	554	6	3
838	308	313	38	45	chr3	33254314	33254471	-126345312	-	RMER4B	LTR	ERVK	-405	180	25	3
838	526	222	18	78	chr3	33256890	33257050	-126342733	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-30	340	191	3
838	1079	185	24	52	chr3	33257050	33257301	-126342482	-	LTRIS5	LTR	ERV1	0	447	204	3
838	340	143	48	0	chr3	33257284	33257347	-126342436	-	LTRIS5	LTR	ERV1	-381	66	1	3
838	878	235	15	20	chr3	33257347	33257539	-126342244	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-179	191	1	3
838	1331	251	85	10	chr3	33258226	33258539	-126341244	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	85	3
838	1331	251	85	10	chr3	33258574	33258650	-126341133	-	MTD	LTR	MaLR	-335	84	1	3
838	348	274	65	19	chr3	33259963	33260071	-126339712	-	LTR40a	LTR	ERVL	-8	454	342	3
838	366	234	59	59	chr3	33260206	33260342	-126339441	-	LTR40a	LTR	ERVL	-367	152	17	3
838	586	271	354	19	chr3	33261074	33261487	-126338296	+	RMER15	LTR	ERVL	23	574	-1	3
838	1398	152	70	0	chr3	33263772	33264016	-126335767	+	ORR1B2	LTR	MaLR	107	367	0	3
838	2016	181	87	20	chr3	33270651	33271052	-126328731	+	RMER15	LTR	ERVL	1	428	-147	3
838	2358	159	27	12	chr3	33271053	33271454	-126328329	+	MTC	LTR	MaLR	1	407	-14	3
838	495	211	0	22	chr3	33271456	33271548	-126328235	+	RMER15	LTR	ERVL	486	575	0	3
838	368	287	79	29	chr3	33274636	33274776	-126325007	+	RMER20B	LTR	ERVK	131	277	-350	3
838	324	285	69	97	chr3	33274787	33274835	-126324948	+	RMER20B	LTR	ERVK	463	513	-114	3
838	2417	137	24	78	chr3	33274835	33275248	-126324535	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	4	3
838	324	285	69	97	chr3	33275248	33275343	-126324440	+	RMER20B	LTR	ERVK	514	602	-25	3
838	1475	240	10	39	chr3	33284521	33284941	-126314842	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	153	3
838	396	220	55	55	chr3	33284962	33285145	-126314638	+	RMER17C	LTR	ERVK	93	275	-135	3
838	941	203	38	97	chr3	33285166	33285433	-126314350	-	RMER19C	LTR	ERVK	-360	251	1	3
839	1845	188	65	15	chr3	33292360	33292759	-126307024	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
839	1879	233	13	56	chr3	33292806	33293343	-126306440	+	RMER5	LTR	ERV1	21	534	0	4
839	975	207	287	67	chr3	33295589	33296043	-126303740	+	MT2B	LTR	ERVL	1	561	-40	4
839	975	207	287	67	chr3	33296080	33296116	-126303667	+	MT2B	LTR	ERVL	562	599	-2	4
839	327	268	122	19	chr3	33297394	33297550	-126302233	+	RMER15	LTR	ERVL	360	531	-44	4
839	330	284	62	16	chr3	33298871	33299000	-126300783	+	LTR16C	LTR	ERVL	350	484	-5	4
839	4980	162	45	11	chr3	33302825	33303698	-126296085	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	4
839	364	276	122	144	chr3	33310198	33310574	-126289209	+	MTEb	LTR	MaLR	1	368	-11	4
839	1204	268	43	92	chr3	33311375	33311843	-126287940	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-5	507	63	4
839	768	286	64	78	chr3	33315186	33315639	-126284144	-	MT2B	LTR	ERVL	-61	540	1	4
839	2408	79	81	40	chr3	33325266	33325661	-126274122	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	4
839	6357	31	3	19	chr3	33325661	33326419	-126273364	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5736	4
839	2349	50	0	0	chr3	33326418	33326696	-126273087	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	4
839	3616	67	4	16	chr3	33326696	33327274	-126272509	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	4
839	226	244	0	0	chr3	33327274	33327319	-126272464	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	231	4
839	998	136	15	98	chr3	33327327	33327531	-126272252	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6286	195	9	4
839	2339	114	103	18	chr3	33327532	33327970	-126271813	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	475	1	4
839	1298	233	151	78	chr3	33333115	33333651	-126266132	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	575	-10	4
839	5008	219	52	72	chr3	33333662	33335071	-126264712	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	1	1381	-3879	4
839	366	306	0	113	chr3	33336451	33336602	-126263181	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	246	4
839	1269	240	137	57	chr3	33338447	33338835	-126260948	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
839	436	328	65	91	chr3	33343049	33343435	-126256348	-	MER77	LTR	ERVL	-227	380	5	4
839	814	245	56	37	chr3	33343700	33343916	-126255867	+	RLTR18	LTR	ERVK	15	234	-382	4
839	1114	261	56	32	chr3	33345445	33345931	-126253852	+	RLTR18B	LTR	ERVK	143	512	0	4
839	1258	290	61	15	chr3	33346172	33346568	-126253215	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	4
839	2745	39	0	0	chr3	33348859	33349197	-126250586	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	1	4
839	3135	55	5	12	chr3	33350259	33350662	-126249121	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
839	6988	82	39	75	chr3	33350662	33351801	-126247982	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
839	863	65	16	8	chr3	33351801	33351926	-126247857	-	MTB	LTR	MaLR	0	396	271	4
839	1524	37	5	5	chr3	33351907	33352099	-126247684	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	205	396	0	4
839	305	335	124	10	chr3	33352188	33352381	-126247402	+	LTR80B	LTR	ERVL	135	349	-235	4
839	1610	219	236	41	chr3	33369661	33370152	-126229631	-	RMER19B	LTR	ERVK	-7	895	309	4
839	994	155	160	5	chr3	33372173	33372367	-126227416	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	196	4
839	1203	145	14	33	chr3	33373086	33373300	-126226483	-	MTC	LTR	MaLR	-211	210	1	4
839	2750	77	21	13	chr3	33378374	33378756	-126221027	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	4
839	316	319	70	9	chr3	33381984	33382098	-126217685	-	ORR1E	LTR	MaLR	-230	129	9	5
839	284	212	15	0	chr3	33382737	33382803	-126216980	-	ORR1E	LTR	MaLR	-221	138	72	5
839	2182	140	47	56	chr3	33382981	33383390	-126216393	+	RLTR44A	LTR	ERVK	1	405	0	5
839	2015	164	17	25	chr3	33383589	33383946	-126215837	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	5
839	2781	30	3	0	chr3	33386276	33386615	-126213168	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-6	340	1	5
839	2689	157	171	95	chr3	33390665	33391284	-126208499	+	RMER19A	LTR	ERVK	3	668	-69	5
839	1818	258	40	19	chr3	33391284	33391755	-126208028	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	25	5
839	423	169	13	0	chr3	33391761	33391838	-126207945	+	RMER19A	LTR	ERVK	660	737	0	5
839	4012	103	25	0	chr3	33393806	33394376	-126205407	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	5
839	2847	148	38	22	chr3	33394812	33395317	-126204466	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	513	-11	5
839	716	178	150	72	chr3	33396397	33396646	-126203137	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-43	324	1	5
839	488	327	111	36	chr3	33396671	33397004	-126202779	-	MLT1C	LTR	MaLR	-52	415	58	5
839	2844	73	21	5	chr3	33397120	33397507	-126202276	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-3	393	1	5
839	994	256	51	29	chr3	33403401	33403692	-126196091	-	MTD	LTR	MaLR	-120	280	1	5
839	908	205	64	16	chr3	33403692	33403879	-126195904	+	MTD	LTR	MaLR	211	406	-13	5
839	3150	239	118	48	chr3	33403898	33405068	-126194715	+	MTD-int	LTR	MaLR	4	1255	-3	5
839	550	288	0	0	chr3	33405072	33405218	-126194565	+	MTD	LTR	MaLR	2	147	-272	5
839	1804	238	67	11	chr3	33405344	33405420	-126194363	-	RLTR16	LTR	ERVK	-13	492	414	5
839	1804	238	67	11	chr3	33405465	33405852	-126193931	-	RLTR16	LTR	ERVK	-92	413	3	5
839	809	248	128	12	chr3	33405854	33406103	-126193680	+	MTD	LTR	MaLR	142	419	0	5
839	4465	170	23	34	chr3	33407160	33408329	-126191454	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1179	6227	5407	5
839	857	112	15	0	chr3	33409763	33409897	-126189886	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2513	4731	4596	5
839	7694	134	40	6	chr3	33409872	33411293	-126188490	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3308	4098	2630	5
839	530	277	23	33	chr3	33416017	33416183	-126183600	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	366	563	0	5
839	3934	101	54	7	chr3	33416441	33416999	-126182784	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	5
839	1706	211	29	63	chr3	33419147	33419526	-126180257	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	6	5
839	6021	206	33	41	chr3	33419530	33420911	-126178872	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	53	5
839	250	308	20	90	chr3	33420929	33421029	-126178754	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-281	98	6	5
840	2189	189	47	51	chr3	33424062	33424530	-126175253	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	21	487	-90	5
840	2189	189	47	51	chr3	33424625	33424686	-126175097	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	488	547	-30	5
840	2284	120	3	0	chr3	33434193	33434519	-126165264	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
840	959	274	146	59	chr3	33443162	33443635	-126156148	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	514	-6	5
840	377	294	41	20	chr3	33443672	33443818	-126155965	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	64	212	-5502	5
840	253	241	51	0	chr3	33444134	33444213	-126155570	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	3661	3743	-1971	5
840	483	261	69	14	chr3	33451281	33451425	-126148358	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	212	5
840	1961	206	15	20	chr3	33452089	33452495	-126147288	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	15	5
840	1246	274	30	3	chr3	33456882	33457182	-126142601	-	MTD	LTR	MaLR	-107	312	5	6
840	629	326	89	49	chr3	33458861	33459209	-126140574	+	MTEa	LTR	MaLR	1	362	-17	6
840	2277	85	30	59	chr3	33459998	33460335	-126139448	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
840	645	282	130	46	chr3	33460345	33460668	-126139115	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	355	-4	6
840	241	295	51	13	chr3	33463058	33463137	-126136646	+	MLT1K	LTR	MaLR	156	237	-358	6
840	387	202	0	37	chr3	33464579	33464661	-126135122	+	ORR1D2	LTR	MaLR	292	370	0	6
840	296	311	64	51	chr3	33464661	33464815	-126134968	-	ORR1E	LTR	MaLR	-107	252	97	6
840	4177	60	6	2	chr3	33469536	33470084	-126129699	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	550	-37	6
840	766	158	26	52	chr3	33470082	33470236	-126129547	-	RMER16	LTR	ERVK	-383	150	1	6
840	2334	108	189	0	chr3	33470677	33471122	-126128661	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-2	530	2	6
840	6691	119	37	17	chr3	33472450	33473591	-126126192	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1573	3833	2670	6
840	1359	268	123	34	chr3	33473591	33474045	-126125738	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	6
840	664	145	8	0	chr3	33474046	33474163	-126125620	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-2732	2674	2557	6
840	1664	195	20	84	chr3	33474245	33474649	-126125134	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	512	0	6
840	3328	212	63	82	chr3	33474656	33476072	-126123711	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3654	3590	1454	6
840	302	278	18	18	chr3	33476097	33476207	-126123576	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2132	1182	1073	6
840	1059	176	53	98	chr3	33478607	33478852	-126120931	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	301	6
840	2497	107	126	0	chr3	33479593	33479966	-126119817	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	1	420	0	6
840	1215	204	107	55	chr3	33485211	33485538	-126114245	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-23	344	1	6
840	467	262	59	75	chr3	33487371	33487557	-126112226	+	MTEa	LTR	MaLR	1	183	-196	6
840	412	303	96	48	chr3	33487968	33488155	-126111628	+	MLT1C	LTR	MaLR	167	362	-105	6
840	699	271	40	65	chr3	33488167	33488519	-126111264	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	343	-16	6
840	1182	272	48	41	chr3	33492775	33493189	-126106594	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	6
840	268	95	71	0	chr3	33508398	33508440	-126091343	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	45	-314	4
840	3374	210	39	98	chr3	33509285	33510303	-126089480	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	7
840	393	314	77	50	chr3	33510349	33510440	-126089343	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-8	554	463	8
840	437	321	84	35	chr3	33510509	33510754	-126089029	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-100	462	107	8
840	290	326	85	60	chr3	33531967	33532166	-126067617	+	LTR33	LTR	ERVL	130	333	-182	3
840	2397	193	182	55	chr3	33538754	33539408	-126060375	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	4
840	1139	260	145	52	chr3	33548147	33548519	-126051264	+	MTD	LTR	MaLR	1	407	-12	6
841	2782	181	69	80	chr3	33554826	33555540	-126044243	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	706	-14	7
841	3477	180	74	19	chr3	33556200	33556969	-126042814	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	811	-6	7
841	1218	199	76	98	chr3	33559023	33559146	-126040637	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	492	7
841	3146	53	8	5	chr3	33559146	33559541	-126040242	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
841	1218	213	76	102	chr3	33559541	33559818	-126039965	-	MT2B	LTR	ERVL	-110	491	111	7
841	265	333	40	48	chr3	33560563	33560689	-126039094	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-555	147	23	8
841	255	341	22	0	chr3	33561258	33561349	-126038434	+	RMER15	LTR	ERVL	373	465	-110	8
841	714	260	17	17	chr3	33567394	33567574	-126032209	-	MTC	LTR	MaLR	-52	369	190	9
841	284	214	0	67	chr3	33584886	33584946	-126014837	-	RMER12B	LTR	ERVK	-8	1396	1341	1
841	6976	155	44	45	chr3	33584989	33586446	-126013337	-	RLTR21	LTR	ERVK	-44	1528	1	1
841	376	255	99	9	chr3	33587784	33587895	-126011888	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	234	1
841	2374	167	48	0	chr3	33587891	33588286	-126011497	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	1
841	1852	219	96	19	chr3	33588286	33588756	-126011027	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	506	-752	1
841	275	226	0	16	chr3	33588759	33588822	-126010961	+	MTD-int	LTR	MaLR	1194	1255	-708	1
841	2190	143	63	26	chr3	33589496	33589876	-126009907	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
841	1254	257	58	123	chr3	33590405	33591200	-126008583	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3058	3079	2337	1
841	845	169	21	10	chr3	33591193	33591385	-126008398	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3395	2127	1934	1
841	362	250	9	27	chr3	33591382	33591493	-126008290	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3544	1978	1870	1
841	685	202	95	110	chr3	33592466	33592666	-126007117	+	MTC-int	LTR	MaLR	626	822	-436	1
841	321	358	132	6	chr3	33592674	33592840	-126006943	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-194	486	300	1
841	737	310	61	20	chr3	33593206	33593453	-126006330	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	103	1
841	273	235	186	12	chr3	33593808	33593894	-126005889	-	ORR1E	LTR	MaLR	-257	102	2	1
841	2348	168	136	21	chr3	33603170	33603705	-125996078	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	94	1
841	3615	76	2	10	chr3	33609626	33610105	-125989678	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
841	553	188	7	105	chr3	33611044	33611184	-125988599	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	126	-268	1
841	994	219	82	17	chr3	33611184	33611416	-125988367	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	247	-559	1
841	3357	112	15	27	chr3	33611396	33611918	-125987865	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	508	1023	0	1
841	1361	110	15	5	chr3	33611945	33612146	-125987637	+	ORR1B1	LTR	MaLR	192	394	0	1
841	1958	206	44	12	chr3	33620926	33621334	-125978449	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
841	297	295	92	23	chr3	33623441	33623604	-125976179	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-17	391	170	1
841	2074	224	68	42	chr3	33625848	33626288	-125973495	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	439	-102	1
841	2074	224	68	42	chr3	33626334	33626420	-125973363	+	RLTR20A	LTR	ERVK	440	540	-1	1
841	1622	211	72	30	chr3	33628899	33629299	-125970484	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	1
841	2637	96	71	0	chr3	33630725	33631119	-125968664	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	1
841	427	323	119	37	chr3	33632940	33633183	-125966600	-	LTR83	LTR	ERVL	0	780	518	1
841	1839	206	30	64	chr3	33633240	33633676	-125966107	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
841	690	251	54	134	chr3	33641624	33641863	-125957920	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	220	-159	1
841	901	260	124	32	chr3	33643452	33643798	-125955985	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	2	1
841	1360	274	87	68	chr3	33643812	33644523	-125955260	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-6	4993	4269	1
841	2900	309	57	17	chr3	33644916	33646173	-125953610	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3202	1797	490	1
841	4234	107	7	5	chr3	33646492	33647092	-125952691	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	1
841	2355	102	239	26	chr3	33652068	33652520	-125947263	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	37	1
841	789	205	26	109	chr3	33658392	33658622	-125941161	-	LTRIS3	LTR	ERV1	0	512	302	2
841	404	104	60	0	chr3	33658661	33658728	-125941055	-	LTRIS5	LTR	ERV1	-376	71	1	2
841	520	132	36	0	chr3	33658954	33659037	-125940746	+	ORR1B2	LTR	MaLR	247	332	-35	2
841	7798	169	34	8	chr3	33659036	33660489	-125939294	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	19	1509	0	2
841	2214	163	6	0	chr3	33660490	33660846	-125938937	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	359	-8	2
841	1385	146	43	4	chr3	33661419	33661653	-125938130	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	117	2
841	1536	201	95	26	chr3	33663412	33663760	-125936023	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	2
841	1413	84	0	0	chr3	33664957	33665148	-125934635	-	MTB	LTR	MaLR	-1	399	209	2
841	4462	142	113	21	chr3	33665147	33666011	-125933772	+	MTB-int	LTR	MaLR	315	1258	0	2
841	2810	94	18	2	chr3	33666011	33666405	-125933378	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
841	389	248	95	0	chr3	33666888	33666993	-125932790	-	MTB	LTR	MaLR	-244	115	1	2
841	1200	218	169	82	chr3	33674543	33674962	-125924821	+	MT2A	LTR	ERVL	4	461	-72	2
841	1200	218	169	82	chr3	33675049	33675114	-125924669	+	MT2A	LTR	ERVL	462	530	-3	2
841	1875	192	22	16	chr3	33675312	33675682	-125924101	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	2
841	4901	44	3	5	chr3	33675682	33676268	-125923515	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	2
841	3567	192	34	11	chr3	33676276	33676966	-125922817	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	679	2
841	2566	208	61	17	chr3	33677779	33678371	-125921412	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-643	727	110	2
841	700	186	34	7	chr3	33678638	33678784	-125920999	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1220	150	1	2
841	1288	232	18	92	chr3	33678797	33679190	-125920593	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-14	364	1	2
841	752	259	67	70	chr3	33679534	33679810	-125919973	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	70	2
105	874	297	73	28	chr3	33685148	33685505	-125914278	+	MLT2D	LTR	ERVL	35	407	-7	2
842	3204	36	8	8	chr3	33687719	33688115	-125911668	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
842	496	291	164	88	chr3	33690478	33690795	-125908988	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-19	501	161	2
842	3116	136	39	23	chr3	33692526	33693085	-125906698	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	568	0	2
842	270	323	54	0	chr3	33695329	33695422	-125904361	+	LTR86A2	LTR	ERVL	347	444	-64	2
842	256	254	111	0	chr3	33715464	33715527	-125884256	+	MLT1C	LTR	MaLR	34	103	-364	2
842	421	300	68	37	chr3	33716179	33716347	-125883436	-	LTR40a	LTR	ERVL	-9	510	297	2
842	2803	84	5	3	chr3	33720705	33721087	-125878696	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	383	-640	2
842	3460	52	0	2	chr3	33721093	33721554	-125878229	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-1167	625	166	2
842	4418	66	43	7	chr3	33721561	33722169	-125877614	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	394	1023	0	2
842	806	242	47	97	chr3	33726770	33726906	-125872877	-	RLTR15	LTR	ERVK	-15	344	214	2
842	806	242	47	97	chr3	33727050	33727275	-125872508	-	RLTR15	LTR	ERVK	-146	213	1	2
842	395	226	287	11	chr3	33737538	33737726	-125862057	+	MTD	LTR	MaLR	179	418	-3	2
842	473	325	114	13	chr3	33740170	33740398	-125859385	-	MLT1A	LTR	MaLR	-5	369	119	2
842	1337	180	146	3	chr3	33740398	33740721	-125859062	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	369	-5	2
842	266	263	182	13	chr3	33740731	33740808	-125858975	-	MLT1A	LTR	MaLR	-280	94	5	2
842	1462	206	78	52	chr3	33741003	33741387	-125858396	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	14	2
842	575	273	11	22	chr3	33743532	33743712	-125856071	-	RMER5	LTR	ERV1	-48	486	309	3
842	231	202	88	77	chr3	33744145	33744236	-125855547	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-381	125	34	3
842	694	212	173	46	chr3	33744271	33744508	-125855275	-	RMER5	LTR	ERV1	-225	309	43	3
842	246	214	0	54	chr3	33747322	33747396	-125852387	-	MTEb	LTR	MaLR	-6	373	304	3
842	1696	165	36	121	chr3	33749066	33749195	-125850588	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	134	-250	3
842	1696	165	36	121	chr3	33749366	33749655	-125850128	+	ORR1C2	LTR	MaLR	135	383	-1	3
842	5513	151	51	28	chr3	33750650	33751728	-125848055	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	1	3
842	2543	144	29	7	chr3	33753632	33754044	-125845739	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
842	480	214	135	92	chr3	33757857	33758042	-125841741	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	174	3
842	2156	70	3	52	chr3	33762424	33762754	-125837029	+	ORR1A2	LTR	MaLR	6	319	-8	3
842	866	251	106	62	chr3	33765357	33765697	-125834086	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	359	0	3
842	443	292	88	47	chr3	33766598	33766867	-125832916	-	RMER20B	LTR	ERVK	-181	461	187	3
842	424	259	15	55	chr3	33769600	33769800	-125829983	-	RMER15	LTR	ERVL	-110	465	274	3
842	3099	71	5	2	chr3	33778256	33778651	-125821132	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
842	573	261	124	31	chr3	33779640	33779930	-125819853	+	ORR1E	LTR	MaLR	24	373	-6	3
842	2003	158	60	51	chr3	33787498	33787911	-125811872	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	3
842	323	333	134	5	chr3	33793299	33793516	-125806267	+	MLT1J	LTR	MaLR	57	301	-211	3
842	1855	215	34	19	chr3	33794005	33794418	-125805365	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
842	3216	161	33	27	chr3	33799440	33800108	-125799675	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	85	3
842	2851	53	3	0	chr3	33809503	33809845	-125789938	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	4	4
842	1015	257	90	20	chr3	33812541	33812887	-125786896	-	MTEb	LTR	MaLR	-9	370	1	4
842	408	214	8	51	chr3	33815086	33815204	-125784579	+	MTD	LTR	MaLR	299	411	-8	4
842	816	242	166	16	chr3	33815281	33815588	-125784195	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	6	4
843	1228	231	68	15	chr3	33819289	33819628	-125780155	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	4
843	615	306	144	39	chr3	33820945	33821410	-125778373	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-14	514	1	4
843	3036	74	5	5	chr3	33823668	33824064	-125775719	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
843	1870	124	90	3	chr3	33828258	33828558	-125771225	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	4
843	4479	14	2	0	chr3	33841295	33841787	-125757996	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
843	48320	16	6	0	chr3	33841787	33847113	-125752670	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	4
843	362	167	46	35	chr3	33847113	33847200	-125752583	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	4
843	321	0	0	0	chr3	33847200	33847238	-125752545	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	4
843	4479	14	2	0	chr3	33847238	33847730	-125752053	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
843	3952	73	19	31	chr3	33851916	33852456	-125747327	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	4
843	702	177	14	21	chr3	33861745	33861889	-125737894	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-231	143	1	4
843	1810	162	56	43	chr3	33864056	33864429	-125735354	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
843	421	273	36	9	chr3	33873179	33873290	-125726493	+	MTE2b	LTR	MaLR	174	287	-92	5
843	1515	35	0	5	chr3	33875951	33876152	-125723631	+	MTB	LTR	MaLR	201	400	0	5
843	3755	91	63	167	chr3	33879627	33879861	-125719922	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	198	-480	5
843	3755	91	63	167	chr3	33880007	33880319	-125719464	+	RLTR33	LTR	ERVK	199	526	-152	5
843	3755	91	63	167	chr3	33880468	33880676	-125719107	+	RLTR33	LTR	ERVK	527	678	0	5
843	4210	33	0	2	chr3	33880798	33881281	-125718502	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	5
843	1973	144	31	28	chr3	33884886	33885244	-125714539	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	5
843	283	277	158	69	chr3	33889492	33889694	-125710089	+	RLTR9A	LTR	ERVK	2	221	-147	5
843	310	309	85	35	chr3	33889975	33890116	-125709667	-	LTR78	LTR	ERV1	-375	929	782	5
843	1408	162	147	75	chr3	33891010	33891357	-125708426	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	5
843	620	221	90	22	chr3	33899057	33899257	-125700526	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	208	-214	5
843	2543	142	13	3	chr3	33905234	33905609	-125694174	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	379	0	5
843	959	106	96	42	chr3	33905945	33906112	-125693671	+	RLTR14	LTR	ERV1	7	182	-200	5
843	463	202	0	101	chr3	33906111	33906210	-125693573	+	RLTR14	LTR	ERV1	294	382	0	5
843	236	215	185	0	chr3	33906775	33906840	-125692943	+	RLTR9E	LTR	ERVK	252	328	-81	5
843	2003	175	39	26	chr3	33910402	33910783	-125689000	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	6
843	1008	199	36	40	chr3	33910804	33911029	-125688754	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	151	6
843	1055	193	48	93	chr3	33911030	33911321	-125688462	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	278	-96	6
843	1767	152	27	98	chr3	33911331	33911416	-125688367	+	RLTR18B	LTR	ERVK	201	265	-247	6
843	3285	62	26	3	chr3	33911416	33911807	-125687976	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
843	1767	152	27	98	chr3	33911807	33912056	-125687727	+	RLTR18B	LTR	ERVK	266	511	-1	6
843	589	176	0	19	chr3	33912060	33912164	-125687619	+	ORR1D1	LTR	MaLR	273	374	0	6
843	926	165	2	7	chr3	33912164	33912316	-125687467	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-215	155	4	6
843	3564	194	78	9	chr3	33912316	33912845	-125686938	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	805	6
843	3564	194	78	9	chr3	33913270	33913480	-125686303	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-566	804	580	6
843	1238	200	13	186	chr3	33913478	33913524	-125686259	+	RLTR11B	LTR	ERVK	7	47	-406	6
843	2216	216	48	92	chr3	33913524	33914163	-125685620	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	6
843	1238	200	13	186	chr3	33914163	33914638	-125685145	+	RLTR11B	LTR	ERVK	48	438	-15	6
843	2407	220	76	28	chr3	33914654	33915219	-125684564	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-778	592	1	6
843	1919	157	58	30	chr3	33915221	33915583	-125684200	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	6
843	1054	229	64	147	chr3	33922952	33923361	-125676422	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	4	6
843	280	278	30	91	chr3	33934883	33934896	-125664887	+	MT2B	LTR	ERVL	153	243	-356	6
843	1232	177	85	45	chr3	33934981	33935293	-125664490	+	RLTR20C	LTR	ERVK	206	541	0	6
843	1156	201	132	4	chr3	33936368	33936673	-125663110	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	313	-2013	6
843	1088	225	186	3	chr3	33941503	33941815	-125657968	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	1	6
843	1467	201	79	65	chr3	33941998	33942366	-125657417	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	374	0	6
843	240	220	61	81	chr3	33945798	33945897	-125653886	+	MER57E2	LTR	ERV1	15	111	-291	6
844	364	331	0	55	chr3	33982451	33982579	-125617204	-	MLT1B	LTR	MaLR	-7	383	263	7
844	2262	110	6	0	chr3	33984076	33984395	-125615388	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	321	-6	7
844	3272	41	5	2	chr3	33986045	33986440	-125613343	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
844	1463	239	94	0	chr3	33988053	33988384	-125611399	+	ORR1D2	LTR	MaLR	6	367	-3	7
844	665	230	5	89	chr3	33991811	33991885	-125607898	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	66	-313	7
844	1934	184	34	29	chr3	33991885	33992300	-125607483	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	7
844	665	230	5	89	chr3	33992300	33992416	-125607367	+	MTE2b	LTR	MaLR	67	175	-204	7
844	388	341	84	0	chr3	33993824	33994003	-125605780	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3568	1431	1238	7
844	517	327	105	62	chr3	33994039	33994159	-125605624	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4232	767	641	7
844	2081	141	91	0	chr3	33994159	33994520	-125605263	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
844	517	327	105	62	chr3	33994520	33994980	-125604803	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4359	640	162	7
844	332	254	41	8	chr3	33995420	33995543	-125604240	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4872	127	1	7
844	2252	217	104	6	chr3	33995543	33996062	-125603721	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	6	7
844	264	258	0	16	chr3	33996087	33996150	-125603633	-	RMER15	LTR	ERVL	-513	62	1	7
844	1224	183	132	25	chr3	34000366	34000691	-125599092	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	360	-14	3
844	2102	141	30	3	chr3	34012374	34012736	-125587047	+	ORR1B1	LTR	MaLR	11	382	-12	2
844	733	255	75	28	chr3	34013822	34014101	-125585682	+	MTEa	LTR	MaLR	3	300	-79	2
844	1852	164	88	3	chr3	34016178	34016551	-125583232	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	3
844	2746	147	127	19	chr3	34019545	34020064	-125579719	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	3
844	487	253	84	91	chr3	34023747	34023842	-125575941	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-102	272	174	4
844	487	253	84	91	chr3	34023899	34024077	-125575706	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-201	173	2	4
844	595	269	97	21	chr3	34027701	34027887	-125571896	+	MTD	LTR	MaLR	1	200	-219	5
844	1826	165	64	17	chr3	34036405	34036762	-125563021	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
844	1601	220	11	41	chr3	34041476	34041845	-125557938	+	ORR1D1	LTR	MaLR	17	374	0	8
844	285	262	83	53	chr3	34041845	34041937	-125557846	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-303	105	10	8
844	961	287	39	45	chr3	34043475	34043807	-125555976	-	MTE2a	LTR	MaLR	-43	336	7	9
844	2376	147	44	0	chr3	34046278	34046687	-125553096	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-136	427	1	9
844	2309	132	18	10	chr3	34047044	34047433	-125552350	+	MTC	LTR	MaLR	1	392	-29	9
844	251	254	237	37	chr3	34052029	34052164	-125547619	+	MLT1A0	LTR	MaLR	144	305	-60	1
844	249	154	0	0	chr3	34055932	34055971	-125543812	-	RMER15	LTR	ERVL	-113	462	424	1
844	2292	191	46	6	chr3	34057009	34057489	-125542294	-	RMER20A	LTR	ERVK	-7	509	11	1
844	1363	209	113	14	chr3	34057610	34057974	-125541809	+	MTD	LTR	MaLR	18	417	-2	1
844	1392	208	56	69	chr3	34065106	34065483	-125534300	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	1
844	3670	121	18	16	chr3	34067013	34067633	-125532150	-	RMER6A	LTR	ERVK	-6	750	130	1
844	236	178	22	0	chr3	34067644	34067689	-125532094	-	RMER6A	LTR	ERVK	-415	46	1	1
844	1504	235	81	18	chr3	34068040	34068372	-125531411	+	MTD	LTR	MaLR	1	352	-67	1
844	1504	235	81	18	chr3	34068400	34068461	-125531322	+	MTD	LTR	MaLR	353	419	0	1
844	4145	229	60	49	chr3	34068465	34069702	-125530081	+	MTD-int	LTR	MaLR	8	1257	-1	1
844	470	168	73	18	chr3	34069734	34069843	-125529940	+	MTD	LTR	MaLR	307	421	0	1
844	889	309	58	18	chr3	34070832	34071158	-125528625	-	ORR1E	LTR	MaLR	-12	347	9	1
844	376	279	150	60	chr3	34074602	34074983	-125524800	+	MLT1D	LTR	MaLR	54	452	-53	1
844	272	373	54	18	chr3	34076310	34076534	-125523249	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-86	279	48	1
844	1681	216	55	42	chr3	34078202	34078603	-125521180	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	16	1
105	564	198	9	0	chr3	34078605	34078721	-125521062	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-257	117	1	1
845	993	251	58	90	chr3	34079058	34079434	-125520349	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	16	1
845	1422	224	88	44	chr3	34093205	34093593	-125506190	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	1
845	671	244	176	120	chr3	34099252	34099611	-125500172	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	1
845	344	230	69	20	chr3	34103297	34103399	-125496384	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	324	1
845	230	306	38	67	chr3	34104442	34104547	-125495236	-	MER88	LTR	ERVL	-247	217	116	1
845	2489	71	9	6	chr3	34109040	34109366	-125490417	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
845	550	211	12	87	chr3	34109625	34109643	-125490140	-	MTE2a	LTR	MaLR	-23	356	346	2
845	550	211	12	87	chr3	34109679	34109821	-125489962	-	MTE2a	LTR	MaLR	-34	345	208	2
845	1940	164	76	6	chr3	34110116	34110472	-125489311	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	4	2
845	1802	112	101	40	chr3	34112412	34112738	-125487045	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	2
845	1827	206	108	42	chr3	34121268	34121350	-125478433	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	434	2
845	1827	206	108	42	chr3	34121396	34121814	-125477969	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-101	433	2	2
845	401	183	0	119	chr3	34122091	34122209	-125477574	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	154	2
845	1187	268	49	29	chr3	34122334	34122564	-125477219	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	233	-126	2
845	1187	268	49	29	chr3	34122608	34122726	-125477057	+	ORR1E	LTR	MaLR	234	359	0	2
845	3163	282	83	42	chr3	34122728	34123055	-125476728	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	335	-1035	2
845	3163	282	83	42	chr3	34123241	34124203	-125475580	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	336	1342	-28	2
845	446	252	9	9	chr3	34124213	34124329	-125475454	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	116	-243	2
845	406	320	91	83	chr3	34128422	34128664	-125471119	-	MLT1A	LTR	MaLR	-19	355	112	2
845	3453	165	114	77	chr3	34129321	34130179	-125469604	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	2
845	329	356	53	35	chr3	34143236	34143405	-125456378	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	21	2
845	561	277	66	58	chr3	34143982	34144386	-125455397	+	MLT1C	LTR	MaLR	2	390	0	2
845	565	302	90	37	chr3	34144626	34145096	-125454687	+	MLT2B2	LTR	ERVL	19	509	-6	2
845	667	290	127	25	chr3	34156974	34157296	-125442487	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	1	2
845	261	296	29	48	chr3	34169755	34169858	-125429925	+	MTEb	LTR	MaLR	278	378	-1	2
845	1103	211	61	101	chr3	34171332	34171759	-125428024	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
845	259	247	0	69	chr3	34177740	34177827	-125421956	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	81	-309	3
845	626	277	91	56	chr3	34178183	34178470	-125421313	+	MLT1B	LTR	MaLR	92	388	-2	3
845	240	284	10	31	chr3	34179118	34179216	-125420567	-	RLTR15	LTR	ERVK	-213	146	51	3
845	2377	89	6	55	chr3	34180133	34180477	-125419306	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
845	1398	219	173	96	chr3	34184381	34184423	-125415360	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	494	3
845	1398	219	173	96	chr3	34184471	34184502	-125415281	-	MT2A	LTR	ERVL	-40	493	452	3
845	1398	219	173	96	chr3	34184557	34184973	-125414810	-	MT2A	LTR	ERVL	-82	451	5	3
845	1470	195	62	89	chr3	34189574	34189669	-125410114	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	334	3
845	1470	195	62	89	chr3	34189711	34190021	-125409762	-	MTD	LTR	MaLR	-86	333	13	3
845	252	219	123	0	chr3	34193868	34193941	-125405842	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	82	-283	3
845	312	352	55	0	chr3	34194009	34194191	-125405592	+	MLT1A0	LTR	MaLR	172	363	-2	3
845	395	278	0	0	chr3	34194242	34194332	-125405451	+	MLT1B	LTR	MaLR	289	378	-12	3
845	1237	183	147	75	chr3	34195361	34195516	-125404267	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	194	3
845	1237	183	147	75	chr3	34195560	34195752	-125404031	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-181	193	1	3
845	297	238	128	53	chr3	34197047	34197180	-125402603	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	387	3
846	291	338	27	7	chr3	34238671	34238817	-125360966	+	MLT1E2	LTR	MaLR	39	187	-440	3
846	470	324	67	83	chr3	34254179	34254539	-125345244	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	4
846	236	296	45	90	chr3	34282153	34282309	-125317474	+	MLT1H2	LTR	MaLR	36	184	-305	4
846	2429	119	42	5	chr3	34299166	34299546	-125300237	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
846	237	216	0	0	chr3	34319929	34319980	-125279803	-	MTD	LTR	MaLR	-201	218	168	5
846	647	229	38	0	chr3	34329369	34329526	-125270257	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	217	5
846	668	221	137	72	chr3	34330024	34330273	-125269510	-	MTE2b	LTR	MaLR	-114	265	1	5
846	1039	245	94	35	chr3	34331530	34331869	-125267914	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	5
847	1055	263	40	25	chr3	34347868	34348192	-125251591	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	91	5
847	310	307	79	69	chr3	34350188	34350377	-125249406	-	MER21B	LTR	ERV1	-610	253	63	5
847	2294	144	22	22	chr3	34367694	34368106	-125231677	+	MTC	LTR	MaLR	2	413	-8	5
847	1102	154	149	0	chr3	34368256	34368477	-125231306	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	106	5
847	2920	183	3	31	chr3	34368532	34369119	-125230664	-	RLTR17	LTR	ERVK	-121	571	1	5
847	619	108	36	0	chr3	34369119	34369227	-125230556	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-255	112	1	5
847	1323	229	100	42	chr3	34374273	34374652	-125225131	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	5	6
847	1735	176	14	101	chr3	34375608	34375661	-125224122	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-3	381	345	6
847	1735	176	14	101	chr3	34375804	34376166	-125223617	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-40	344	2	6
847	1676	171	48	107	chr3	34386911	34387305	-125212478	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	1	6
847	679	214	26	13	chr3	34390931	34391087	-125208696	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	262	6
847	356	197	42	0	chr3	34391088	34391159	-125208624	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4556	4629	-1132	6
847	360	288	27	9	chr3	34391259	34391371	-125208412	-	MTD	LTR	MaLR	-264	115	2	6
847	543	319	118	0	chr3	34398035	34398383	-125201400	+	MER74B	LTR	ERVL	91	479	-143	6
847	2464	150	34	10	chr3	34400379	34400790	-125198993	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
847	1742	185	82	5	chr3	34406587	34406967	-125192816	+	MTD	LTR	MaLR	1	409	-10	6
847	273	294	0	0	chr3	34412356	34412424	-125187359	+	RMER15	LTR	ERVL	404	471	-104	6
847	1889	188	17	40	chr3	34413832	34414253	-125185530	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	6
847	3563	13	2	2	chr3	34415333	34415729	-125184054	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
847	9794	19	0	0	chr3	34415729	34416827	-125182956	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
847	3563	13	2	2	chr3	34416827	34417223	-125182560	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
847	583	75	0	0	chr3	34420292	34420372	-125179411	-	RLTR1B	LTR	ERV1	-76	436	357	6
847	1648	206	72	9	chr3	34424477	34424825	-125174958	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	7
847	1212	233	55	45	chr3	34432393	34432770	-125167013	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	417	27	7
847	1788	203	88	18	chr3	34434262	34434509	-125165274	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	140	7
847	2307	128	39	6	chr3	34434509	34434864	-125164919	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	7
847	1788	203	88	18	chr3	34434864	34435003	-125164780	-	MTD	LTR	MaLR	-280	139	6	7
847	493	263	114	34	chr3	34438997	34439261	-125160522	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	79	7
847	2266	154	55	2	chr3	34440884	34441330	-125158453	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	493	-6	7
847	1758	142	14	102	chr3	34452727	34453088	-125146695	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	7
847	3287	166	232	15	chr3	34454040	34454786	-125144997	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	7
847	1310	208	164	6	chr3	34455320	34455668	-125144115	-	MTC	LTR	MaLR	-6	415	13	7
847	1161	177	102	20	chr3	34455701	34455955	-125143828	+	MTD	LTR	MaLR	80	354	-65	7
847	3092	72	10	12	chr3	34456202	34456610	-125143173	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	7
848	1535	169	74	55	chr3	34484644	34485007	-125114776	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	8
848	371	255	65	39	chr3	34490892	34491047	-125108736	+	MLT1C	LTR	MaLR	156	314	-153	8
848	514	292	49	64	chr3	34491573	34491840	-125107943	-	MLT1C	LTR	MaLR	-194	273	11	8
848	1840	158	90	12	chr3	34502742	34503075	-125096708	+	ORR1D1	LTR	MaLR	7	365	-9	1
848	585	237	50	29	chr3	34508087	34508226	-125091557	-	MTD	LTR	MaLR	-232	187	46	2
848	393	136	0	57	chr3	34508380	34508450	-125091333	-	MTD	LTR	MaLR	-355	66	1	2
848	859	159	78	24	chr3	34511919	34512086	-125087697	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	176	-198	3
848	241	250	90	26	chr3	34513878	34513956	-125085827	+	RLTR25A	LTR	ERVK	537	619	-484	4
848	1846	95	0	29	chr3	34524260	34524532	-125075251	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-143	264	1	7
848	2486	148	8	8	chr3	34524708	34525102	-125074681	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
848	2023	168	24	35	chr3	34527051	34527427	-125072356	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	7
848	398	236	8	98	chr3	34535557	34535570	-125064213	+	MT2B	LTR	ERVL	184	294	-307	9
848	567	243	98	38	chr3	34586876	34587060	-125012723	+	MTD	LTR	MaLR	12	206	-213	1
848	1004	210	48	34	chr3	34587257	34587464	-125012319	+	MTD	LTR	MaLR	201	410	-9	1
848	225	299	154	66	chr3	34592556	34592692	-125007091	-	MLT1H	LTR	MaLR	-15	534	387	2
848	280	302	74	19	chr3	34592881	34592989	-125006794	-	MLT1H	LTR	MaLR	-328	221	108	2
848	250	365	0	0	chr3	34601973	34602069	-124997714	+	RMER15	LTR	ERVL	371	466	-109	2
848	2119	142	83	18	chr3	34602376	34602763	-124997020	+	MTC	LTR	MaLR	2	413	-8	2
849	569	310	75	77	chr3	34612284	34612752	-124987031	+	RLTR12A	LTR	ERVK	42	508	-60	2
849	414	214	50	135	chr3	34613092	34613216	-124986567	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	162	2
849	414	214	50	135	chr3	34613236	34613311	-124986472	-	MT2B	LTR	ERVL	-440	161	82	2
849	3196	67	2	12	chr3	34615397	34615808	-124983975	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
849	833	192	61	11	chr3	34620024	34620297	-124979486	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-14	360	12	2
849	241	232	129	12	chr3	34621865	34622035	-124977748	+	RMER17D2	LTR	ERVK	239	428	-381	3
849	2135	144	14	14	chr3	34624465	34624811	-124974972	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	3
849	389	193	15	156	chr3	34633701	34633836	-124965947	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	149	3
849	3397	55	0	0	chr3	34639900	34640300	-124959483	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
849	1378	151	139	45	chr3	34642692	34642847	-124956936	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	176	-198	3
849	1378	151	139	45	chr3	34642884	34643060	-124956723	+	ORR1D1	LTR	MaLR	177	363	-11	3
849	2389	266	66	35	chr3	34643719	34644460	-124955323	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3353	1646	883	4
849	251	264	34	132	chr3	34655125	34655161	-124944622	-	MT2B	LTR	ERVL	-300	284	224	4
849	251	264	34	132	chr3	34655260	34655326	-124944457	-	MT2B	LTR	ERVL	-300	223	107	4
849	496	271	104	43	chr3	34664208	34664439	-124935344	-	MTE2b	LTR	MaLR	-117	262	18	4
849	468	271	52	17	chr3	34666061	34666209	-124933574	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	245	4
849	300	154	138	0	chr3	34666277	34666342	-124933441	-	MTE2a	LTR	MaLR	-295	84	11	4
849	1155	201	136	15	chr3	34668678	34668951	-124930832	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	65	4
849	1473	239	58	56	chr3	34669282	34669761	-124930022	+	RLTR28B	LTR	ERVL	2	481	0	5
849	267	173	0	55	chr3	34676110	34676165	-124923618	+	MT2A	LTR	ERVL	1	52	-481	5
849	592	303	110	45	chr3	34676471	34676806	-124922977	+	MT2A	LTR	ERVL	101	457	-76	5
849	1291	262	74	0	chr3	34680056	34680380	-124919403	-	MTEb	LTR	MaLR	-30	349	2	5
849	308	283	106	38	chr3	34682547	34682679	-124917104	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-207	388	248	5
849	855	263	71	20	chr3	34685074	34685349	-124914434	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	348	-31	5
849	355	317	5	127	chr3	34696649	34696862	-124902921	-	MT2B	LTR	ERVL	-347	254	68	5
849	4153	34	0	4	chr3	34711173	34711713	-124888070	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1224	1902	-3859	6
849	2603	57	96	0	chr3	34717398	34717752	-124882031	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	6
849	229	283	18	92	chr3	34726095	34726204	-124873579	-	MT2B	LTR	ERVL	-346	255	155	6
849	1657	189	93	18	chr3	34726790	34727177	-124872606	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	3	6
850	1028	238	74	77	chr3	34739422	34739786	-124859997	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	1	7
850	1192	195	125	27	chr3	34742606	34742943	-124856840	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	7
850	406	169	17	2	chr3	34743584	34743665	-124856118	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	376	295	7
850	3066	20	43	0	chr3	34745351	34745703	-124854080	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	7
850	56934	22	15	3	chr3	34745703	34752100	-124847683	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	7
850	3087	17	43	0	chr3	34752100	34752452	-124847331	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	7
850	253	250	81	23	chr3	34752726	34752812	-124846971	-	MLT1A	LTR	MaLR	-11	363	273	7
850	496	316	6	0	chr3	34753091	34753249	-124846534	-	MLT1A	LTR	MaLR	-213	161	3	7
850	274	296	57	0	chr3	34753267	34753355	-124846428	+	MLT1B	LTR	MaLR	253	345	-45	7
850	317	280	16	78	chr3	34754982	34755110	-124844673	+	LTR16A1	LTR	ERVL	247	366	-90	7
850	549	170	0	0	chr3	34755585	34755679	-124844104	+	RLTR24	LTR	ERV1	2	95	-434	7
850	863	159	54	97	chr3	34755976	34756325	-124843458	+	RLTR24	LTR	ERV1	81	529	0	7
850	419	276	56	72	chr3	34762891	34763071	-124836712	+	RMER15	LTR	ERVL	399	575	0	7
850	1735	168	32	112	chr3	34763236	34763480	-124836303	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	162	7
850	1735	168	32	112	chr3	34763539	34763697	-124836086	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-213	161	3	7
850	1279	239	174	14	chr3	34764987	34765348	-124834435	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	7
850	3166	42	5	0	chr3	34776903	34777285	-124822498	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	13	7
850	332	221	58	0	chr3	34778530	34778616	-124821167	-	MTD	LTR	MaLR	-319	100	10	7
850	2251	123	76	5	chr3	34778765	34779133	-124820650	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
850	1563	170	91	55	chr3	34780756	34781117	-124818666	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	7
850	227	288	0	0	chr3	34795003	34795069	-124804714	-	MTD	LTR	MaLR	-36	343	278	7
850	1730	197	3	35	chr3	34795094	34795436	-124804347	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-36	331	1	7
850	525	238	73	32	chr3	34795532	34795741	-124804042	-	MTD	LTR	MaLR	-183	196	18	7
850	2552	162	87	35	chr3	34798345	34798451	-124801332	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	490	7
850	2552	162	87	35	chr3	34798492	34798934	-124800849	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-89	489	2	7
850	2221	139	24	3	chr3	34810063	34810402	-124789381	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	8
850	361	267	238	11	chr3	34812517	34812706	-124787077	-	MTE2b	LTR	MaLR	-146	233	2	8
850	502	307	138	16	chr3	34812979	34813297	-124786486	-	MLT1F	LTR	MaLR	-3	545	189	8
850	2473	118	105	19	chr3	34813673	34814148	-124785635	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	8
850	639	186	287	26	chr3	34824404	34824669	-124775114	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-50	334	1	8
850	1886	170	80	23	chr3	34828754	34828926	-124770857	+	MTC	LTR	MaLR	1	182	-239	8
850	1886	170	80	23	chr3	34829075	34829300	-124770483	+	MTC	LTR	MaLR	183	420	-1	8
850	1905	181	88	8	chr3	34830478	34830863	-124768920	+	MTD	LTR	MaLR	4	419	0	8
850	2984	227	141	70	chr3	34830892	34832027	-124767756	+	MTD-int	LTR	MaLR	28	1243	-15	8
850	1071	222	155	55	chr3	34832027	34832408	-124767375	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	8
850	1701	182	119	2	chr3	34839003	34839380	-124760403	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-909	461	40	8
850	1701	182	119	2	chr3	34839405	34839440	-124760343	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1331	39	2	8
850	1425	202	91	15	chr3	34839440	34839782	-124760001	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	7	8
850	1780	210	34	50	chr3	34843317	34843698	-124756085	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	4	8
850	359	315	13	20	chr3	34852684	34852833	-124746950	+	MLT1A0	LTR	MaLR	74	221	-144	8
850	881	265	100	11	chr3	34855996	34856267	-124743516	+	MTE2b	LTR	MaLR	49	343	-36	8
850	360	180	173	39	chr3	34856583	34856618	-124743165	-	MTEa	LTR	MaLR	-11	368	329	8
850	360	180	173	39	chr3	34856654	34856722	-124743061	-	MTEa	LTR	MaLR	-51	328	251	8
850	429	211	53	0	chr3	34856792	34856904	-124742879	-	MTEa	LTR	MaLR	-246	133	1	8
850	888	160	65	78	chr3	34858780	34859011	-124740772	-	MTD	LTR	MaLR	-147	272	45	8
850	746	179	0	27	chr3	34859756	34859905	-124739878	+	MTD	LTR	MaLR	51	195	-224	8
850	452	246	150	9	chr3	34863595	34863808	-124735975	+	MLT1D	LTR	MaLR	254	496	-9	8
850	619	365	59	52	chr3	34864126	34864585	-124735198	+	MLT2B3	LTR	ERVL	30	491	-63	8
851	674	224	149	48	chr3	34865816	34866205	-124733578	+	MT2A	LTR	ERVL	1	469	-132	8
851	269	122	0	0	chr3	34866262	34866303	-124733480	+	MT2A	LTR	ERVL	491	531	-2	8
851	477	300	109	109	chr3	34867684	34868069	-124731714	+	MLT1B	LTR	MaLR	5	389	-1	8
851	1293	230	118	3	chr3	34879046	34879378	-124720405	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	8
851	481	330	56	71	chr3	34880864	34881187	-124718596	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	40	9
851	2920	52	0	0	chr3	34881502	34881848	-124717935	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	9
851	12336	62	12	17	chr3	34881848	34882712	-124717071	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	871	-921	9
851	12336	62	12	17	chr3	34883430	34884366	-124715417	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	872	1792	0	9
851	2824	64	0	0	chr3	34884366	34884708	-124715075	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	342	-4	9
851	1042	245	7	43	chr3	34900788	34900946	-124698837	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-73	301	149	9
851	1812	181	72	19	chr3	34900946	34901306	-124698477	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	1	9
851	1042	245	7	43	chr3	34901306	34901428	-124698355	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-226	148	31	9
851	1882	136	87	6	chr3	34913469	34913803	-124685980	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	61	9
851	1340	195	156	15	chr3	34913961	34914212	-124685571	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	299	-75	9
851	3126	61	0	12	chr3	34914212	34914613	-124685170	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	9
851	1340	195	156	15	chr3	34914613	34914689	-124685094	+	ORR1D1	LTR	MaLR	300	374	0	9
851	1427	179	45	38	chr3	34925903	34926217	-124673566	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	52	9
851	1401	156	106	57	chr3	34926896	34927273	-124672510	+	MTD	LTR	MaLR	24	388	-31	9
851	1644	134	44	10	chr3	34936715	34937009	-124662774	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	64	9
851	753	149	155	0	chr3	34937048	34937299	-124662484	-	MTC	LTR	MaLR	-131	290	1	9
851	244	345	92	0	chr3	34941536	34941655	-124658128	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-15	350	221	9
851	4835	152	57	42	chr3	34944006	34944901	-124654882	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	9
851	696	260	31	57	chr3	34947432	34947624	-124652159	+	MT2A	LTR	ERVL	1	187	-346	9
851	828	284	110	13	chr3	34950661	34950978	-124648805	+	MTEa	LTR	MaLR	3	350	-29	9
851	801	149	43	0	chr3	34954114	34954255	-124645528	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	261	407	0	1
851	1309	215	111	12	chr3	34960605	34960949	-124638834	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	2	1
851	259	250	15	45	chr3	34961103	34961170	-124638613	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	628	1
851	2121	160	26	40	chr3	34961285	34961708	-124638075	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-165	419	3	1
851	314	315	80	80	chr3	34967803	34968017	-124631766	-	MLT1A	LTR	MaLR	-1	373	162	1
851	314	315	80	80	chr3	34968096	34968254	-124631529	-	MLT1A	LTR	MaLR	-213	161	1	1
851	301	338	65	31	chr3	34975643	34975872	-124623911	-	MLT1D	LTR	MaLR	-22	483	247	1
852	276	297	124	82	chr3	35005775	35006057	-124593726	-	MTE2a	LTR	MaLR	-84	295	2	5
852	452	281	42	21	chr3	35033421	35033563	-124566220	-	RMER15	LTR	ERVL	-155	420	276	2
852	2125	73	21	65	chr3	35035734	35036071	-124563712	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	6	3
852	255	297	131	70	chr3	35039165	35039364	-124560419	+	MLT1K	LTR	MaLR	324	534	-61	3
852	934	271	124	40	chr3	35043298	35043346	-124556437	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	328	4
852	934	271	124	40	chr3	35043389	35043686	-124556097	-	MTEb	LTR	MaLR	-52	327	3	4
852	944	181	151	11	chr3	35056607	35056835	-124542948	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	243	-284	5
852	595	215	27	0	chr3	35056846	35056995	-124542788	-	RLTR15	LTR	ERVK	-131	228	76	5
852	1049	229	8	0	chr3	35056999	35057248	-124542535	+	RLTR11A	LTR	ERVK	278	528	0	5
852	1789	165	17	9	chr3	35057283	35057632	-124542151	-	RLTR15	LTR	ERVK	-7	352	1	5
852	2278	117	71	5	chr3	35059905	35060273	-124539510	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	392	-2	6
852	3230	39	18	0	chr3	35065491	35065880	-124533903	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
852	1730	142	12	54	chr3	35066847	35067183	-124532600	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	8
852	2694	124	4	72	chr3	35069462	35069923	-124529860	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	8
852	3440	39	0	130	chr3	35070440	35070941	-124528842	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	9
852	1931	182	115	8	chr3	35074926	35075396	-124524387	+	RMER5	LTR	ERV1	1	520	-14	9
852	2571	117	40	76	chr3	35075881	35076327	-124523456	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	1
852	1007	197	196	84	chr3	35080280	35080408	-124519375	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	431	1
852	3272	48	8	0	chr3	35080408	35080801	-124518982	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
852	7142	89	29	71	chr3	35080801	35081947	-124517836	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
852	3443	40	2	0	chr3	35081947	35082342	-124517441	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
852	1007	211	221	56	chr3	35082342	35082763	-124517020	-	MT2A	LTR	ERVL	-103	430	1	1
852	504	351	11	11	chr3	35083033	35083223	-124516560	-	MTD	LTR	MaLR	-160	199	10	1
852	2627	251	56	45	chr3	35083231	35084058	-124515725	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1370	535	1
852	1713	269	22	41	chr3	35084333	35084875	-124514908	-	MTD-int	LTR	MaLR	-837	533	2	1
852	592	160	158	49	chr3	35084876	35085060	-124514723	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	216	1
852	1822	148	25	82	chr3	35085039	35085406	-124514377	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	1
852	624	305	51	18	chr3	35085430	35085647	-124514136	-	MTD	LTR	MaLR	-190	229	6	1
852	330	261	165	0	chr3	35086494	35086641	-124513142	-	MTD	LTR	MaLR	-13	408	234	1
852	1182	198	69	31	chr3	35087303	35087621	-124512162	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1111	1440	-4321	1
852	2092	211	63	15	chr3	35092707	35093165	-124506618	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1433	1912	-3849	1
852	9940	199	78	12	chr3	35093211	35095276	-124504507	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2011	4211	-1550	1
852	226	135	0	0	chr3	35100482	35100519	-124499264	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	497	1
852	989	283	91	12	chr3	35106504	35106844	-124492939	+	MTEa	LTR	MaLR	9	375	-4	1
852	640	204	92	70	chr3	35107781	35108140	-124491643	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	367	-43	1
852	4024	165	8	184	chr3	35113588	35114682	-124485101	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	1
852	926	264	137	9	chr3	35118690	35119026	-124480757	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	1
853	308	333	38	82	chr3	35132681	35132864	-124466919	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	177	-182	1
853	1564	229	72	16	chr3	35157502	35157928	-124441855	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	13	483	-94	2
853	1564	232	79	22	chr3	35157965	35158058	-124441725	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	457	562	-1	2
853	514	271	78	12	chr3	35164564	35164795	-124434988	+	MLT1C	LTR	MaLR	5	235	-155	2
853	569	276	135	40	chr3	35167775	35168100	-124431683	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	2	2
853	1862	175	36	0	chr3	35173837	35174197	-124425586	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-16	378	6	2
853	5120	171	103	165	chr3	35174202	35175810	-124423973	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	1	2
853	2391	127	62	0	chr3	35175810	35176181	-124423602	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	2
853	672	255	161	80	chr3	35176563	35176930	-124422853	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2654	3050	-2664	2
853	608	304	72	40	chr3	35177327	35177635	-124422148	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	1	2
853	2413	162	169	8	chr3	35196533	35197037	-124402746	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	2
853	984	221	144	4	chr3	35198679	35198929	-124400854	+	MT2A	LTR	ERVL	1	285	-248	2
853	236	174	0	0	chr3	35199130	35199176	-124400607	+	MT2A	LTR	ERVL	488	533	0	2
853	1077	240	112	47	chr3	35202214	35202699	-124397084	-	RMER4B	LTR	ERVK	-10	575	17	2
853	2406	141	60	10	chr3	35205421	35205822	-124393961	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
853	286	325	63	48	chr3	35207414	35207540	-124392243	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-473	154	27	2
853	1843	229	49	18	chr3	35226978	35227468	-124372315	+	RMER19C	LTR	ERVK	107	611	0	2
853	1770	214	40	16	chr3	35248822	35249250	-124350533	+	RMER5	LTR	ERV1	89	526	-8	3
854	606	256	50	0	chr3	35262871	35263031	-124336752	-	MTD	LTR	MaLR	-57	362	195	3
854	753	257	6	28	chr3	35263842	35264022	-124335761	-	MTD	LTR	MaLR	-243	176	1	3
854	2134	222	130	92	chr3	35268560	35269388	-124330395	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	1	3
854	2038	108	13	16	chr3	35269808	35270162	-124329621	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	369	-16	3
854	412	311	59	41	chr3	35285712	35285933	-124313850	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-85	395	171	3
854	660	298	134	36	chr3	35287792	35288062	-124311721	+	MTEa	LTR	MaLR	54	343	-36	3
854	641	195	151	12	chr3	35297095	35297261	-124302522	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	231	3
854	479	229	18	27	chr3	35297532	35297644	-124302139	+	ORR1D1	LTR	MaLR	260	370	-4	3
854	347	188	0	0	chr3	35310553	35310617	-124289166	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-6	402	339	3
854	2158	113	6	6	chr3	35311810	35312131	-124287652	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	3
854	2154	87	31	16	chr3	35312495	35312812	-124286971	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
854	25789	34	11	11	chr3	35312812	35317720	-124282063	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	4
854	2154	87	31	16	chr3	35317720	35318037	-124281746	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
854	4636	14	2	12	chr3	35324867	35325365	-124274418	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
854	322	0	0	0	chr3	35325365	35325403	-124274380	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	4
854	367	167	46	35	chr3	35325403	35325490	-124274293	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	4
854	41273	16	14	0	chr3	35325490	35330777	-124269006	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	4
854	4636	14	2	12	chr3	35330777	35331275	-124268508	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
854	1810	214	41	19	chr3	35331448	35331814	-124267969	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
854	1248	193	31	34	chr3	35331999	35332321	-124267462	-	RMER17C	LTR	ERVK	-89	321	1	4
854	3213	56	5	2	chr3	35353139	35353534	-124246249	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
854	1546	147	98	0	chr3	35358026	35358311	-124241472	-	RLTR28	LTR	ERVL	-176	348	36	4
854	279	193	46	51	chr3	35358433	35358545	-124241238	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	257	4
854	246	312	43	26	chr3	35358649	35358764	-124241019	-	MTEa	LTR	MaLR	-242	117	1	4
854	2714	183	50	20	chr3	35359624	35359864	-124239919	+	RMER15	LTR	ERVL	1	231	-344	4
854	3254	56	2	2	chr3	35359864	35360260	-124239523	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
854	2714	183	50	20	chr3	35360260	35360427	-124239356	+	RMER15	LTR	ERVL	232	414	-161	4
854	1981	157	106	3	chr3	35360427	35360784	-124238999	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
854	2714	183	50	20	chr3	35360784	35360933	-124238850	+	RMER15	LTR	ERVL	415	573	-2	4
854	345	343	105	43	chr3	35361406	35361616	-124238167	+	RMER15	LTR	ERVL	353	575	0	4
854	856	218	203	20	chr3	35371930	35372225	-124227558	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	29	4
854	608	229	109	26	chr3	35383599	35383792	-124215991	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	374	0	4
854	234	181	52	98	chr3	35384385	35384538	-124215245	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-750	759	614	4
854	432	208	128	60	chr3	35387403	35387536	-124212247	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	393	4
854	3510	28	4	128	chr3	35387705	35388203	-124211580	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
854	1310	226	60	55	chr3	35388333	35388768	-124211015	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-133	445	9	4
855	225	386	36	23	chr3	35389804	35390024	-124209759	+	MLT1J	LTR	MaLR	6	228	-284	4
855	579	257	154	101	chr3	35390462	35390748	-124209035	+	MTEa	LTR	MaLR	2	302	-77	4
855	371	214	122	25	chr3	35390854	35390995	-124208788	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-7	460	280	4
855	248	319	0	21	chr3	35391084	35391180	-124208603	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-288	120	27	4
855	816	134	0	0	chr3	35397496	35397623	-124202160	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	127	-199	5
855	692	111	19	0	chr3	35397611	35397719	-124202064	-	MT2B	LTR	ERVL	-491	110	1	5
855	8312	25	0	3	chr3	35403347	35404279	-124195504	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	5
855	893	237	54	171	chr3	35411769	35412197	-124187586	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	2	5
855	302	271	58	29	chr3	35413846	35413983	-124185800	+	ORR1E	LTR	MaLR	216	356	-3	5
855	1370	226	136	5	chr3	35414566	35414935	-124184848	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	5
855	2480	113	48	13	chr3	35415568	35415946	-124183837	+	ORR1B1	LTR	MaLR	4	394	0	5
855	2442	203	54	19	chr3	35421523	35422061	-124177722	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	16	5
855	2338	162	48	5	chr3	35425005	35425142	-124174641	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	325	5
855	2338	162	48	5	chr3	35425162	35425439	-124174344	-	RMER4A	LTR	ERVK	-142	324	35	5
855	444	174	54	0	chr3	35426922	35427014	-124172769	+	MTE2b	LTR	MaLR	283	379	0	5
855	412	277	66	70	chr3	35434749	35434990	-124164793	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-5	360	121	5
855	1979	149	3	8	chr3	35435124	35435477	-124164306	-	RLTR15	LTR	ERVK	-8	351	1	5
855	523	279	36	44	chr3	35442411	35442738	-124157045	+	RLTR12B	LTR	ERVK	11	230	-298	5
855	244	85	21	0	chr3	35442879	35442926	-124156857	-	MT2A	LTR	ERVL	-5	528	481	5
855	2669	173	13	25	chr3	35442927	35443449	-124156334	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	1	5
855	1544	202	183	5	chr3	35443451	35443844	-124155939	-	MT2A	LTR	ERVL	-69	464	2	5
855	2356	194	7	0	chr3	35443864	35444281	-124155502	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	5
855	3453	40	0	0	chr3	35449618	35450014	-124149769	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
855	2234	185	82	25	chr3	35466308	35466817	-124132966	+	RMER15	LTR	ERVL	1	538	-37	6
855	3100	73	2	2	chr3	35468010	35468406	-124131377	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
855	387	198	142	0	chr3	35469609	35469740	-124130043	+	MLT1B	LTR	MaLR	231	462	-5	6
855	4601	89	39	24	chr3	35470383	35471051	-124128732	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	6
855	1116	286	80	19	chr3	35474959	35475333	-124124450	+	MTD	LTR	MaLR	1	397	-22	6
855	2297	149	41	19	chr3	35479145	35479602	-124120181	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	289	6
855	2872	43	40	6	chr3	35479602	35479955	-124119828	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	6
855	4353	136	13	3	chr3	35479962	35480634	-124119149	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-7	7673	6995	6
855	1574	96	100	0	chr3	35480638	35480867	-124118916	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5004	6
855	500	315	43	43	chr3	35480879	35481274	-124118509	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-6015	1566	1172	6
855	2872	50	124	0	chr3	35481299	35481679	-124118104	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-995	992	566	6
855	1277	85	6	22	chr3	35481893	35482074	-124117709	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7403	178	1	6
855	2831	43	40	8	chr3	35482074	35482428	-124117355	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	6
855	1600	142	29	0	chr3	35482428	35482656	-124117127	-	RMER6A	LTR	ERVK	-467	289	62	6
855	1600	142	29	0	chr3	35482682	35482734	-124117049	-	RMER6A	LTR	ERVK	-695	61	2	6
855	523	240	174	28	chr3	35485888	35486280	-124113503	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-39	320	7	6
855	2346	145	164	70	chr3	35487416	35488046	-124111737	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	2	6
855	1491	228	119	31	chr3	35488047	35488491	-124111292	+	RMER15	LTR	ERVL	50	532	-43	6
855	3496	35	0	0	chr3	35489238	35489634	-124110149	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
855	1164	184	297	3	chr3	35496338	35496681	-124103102	-	MT2B	LTR	ERVL	-157	444	1	6
855	3249	35	2	37	chr3	35515470	35515810	-124083973	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	340	-56	1
855	3249	35	2	37	chr3	35516003	35516072	-124083711	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	341	396	0	1
855	321	379	79	22	chr3	35516935	35517202	-124082581	+	MTE2a	LTR	MaLR	83	364	-15	1
855	843	329	35	43	chr3	35520114	35520483	-124079300	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	1
106	1131	279	74	34	chr3	35520476	35520855	-124078928	+	MTD	LTR	MaLR	26	419	0	2
856	1269	151	4	26	chr3	35523692	35523924	-124075859	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1377	5867	5641	3
856	594	186	54	17	chr3	35523933	35524104	-124075679	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	900	1114	0	3
856	2754	101	10	15	chr3	35528703	35529114	-124070669	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	3
856	475	110	26	23	chr3	35529114	35529202	-124070581	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	0	7406	7331	3
856	19777	174	81	69	chr3	35529399	35531672	-124068111	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	4213	3
856	3738	52	21	2	chr3	35531672	35532138	-124067645	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	3
856	19777	176	83	71	chr3	35532138	35534901	-124064882	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3194	4212	1356	3
856	3075	24	82	0	chr3	35534901	35535281	-124064502	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	4
856	19777	176	83	71	chr3	35535281	35535536	-124064247	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-6051	1355	1071	3
856	1379	215	45	50	chr3	35535552	35535934	-124063849	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2933	381	2	3
856	2565	109	39	8	chr3	35535947	35536335	-124063448	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-4	405	6	3
856	465	302	42	69	chr3	35536972	35537189	-124062594	+	MTEb	LTR	MaLR	22	232	-147	4
856	239	222	0	0	chr3	35547116	35547170	-124052613	+	RMER4A	LTR	ERVK	25	78	-388	4
856	3160	154	46	16	chr3	35556246	35556812	-124042971	+	MT2B	LTR	ERVL	18	600	-1	5
856	2602	187	24	8	chr3	35558299	35558794	-124040989	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	503	-65	5
856	3710	20	2	0	chr3	35562872	35563267	-124036516	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
856	730	291	29	26	chr3	35570708	35571018	-124028765	-	RLTR15	LTR	ERVK	-32	327	17	7
856	2011	183	79	35	chr3	35572088	35572279	-124027504	+	MT2B	LTR	ERVL	1	339	-262	7
856	2011	154	61	25	chr3	35572399	35572594	-124027189	+	MT2B	LTR	ERVL	340	545	-56	7
856	2011	154	61	25	chr3	35572641	35572698	-124027085	+	MT2B	LTR	ERVL	546	600	-1	7
856	1951	197	11	19	chr3	35576507	35576880	-124022903	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-8	370	1	8
856	457	331	24	43	chr3	35577345	35577646	-124022137	+	RMER15	LTR	ERVL	6	421	-154	8
856	1401	220	136	21	chr3	35578511	35578850	-124020933	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	8
856	1112	138	48	5	chr3	35580612	35580801	-124018982	+	MTD	LTR	MaLR	1	197	-222	9
856	479	189	61	76	chr3	35589387	35589519	-124010264	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	36	165	-4826	1
856	519	326	74	37	chr3	35593260	35593502	-124006281	+	MER34A	LTR	ERV1	24	274	-297	1
856	1207	242	218	49	chr3	35597335	35597731	-124002052	+	RMER15	LTR	ERVL	3	460	-115	1
856	2140	127	44	6	chr3	35597731	35598047	-124001736	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	2	1
856	1207	242	218	49	chr3	35598047	35598140	-124001643	+	RMER15	LTR	ERVL	461	575	0	1
856	1024	255	37	4	chr3	35598920	35599190	-124000593	+	ORR1D1	LTR	MaLR	11	259	-115	1
856	3545	36	8	0	chr3	35599191	35599584	-124000199	+	MTB	LTR	MaLR	2	397	-3	1
856	673	225	50	0	chr3	35599764	35599924	-123999859	+	ORR1D1	LTR	MaLR	215	382	-2	1
856	4577	89	5	28	chr3	35604827	35605428	-123994355	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	1
856	4698	12	2	0	chr3	35605946	35606438	-123993345	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	1
856	48240	16	6	1	chr3	35606438	35611769	-123988014	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	1
856	362	167	46	35	chr3	35611769	35611856	-123987927	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	1
856	321	0	0	0	chr3	35611856	35611894	-123987889	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	1
856	4492	12	2	0	chr3	35611894	35612386	-123987397	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	1
856	2778	92	22	32	chr3	35614334	35614738	-123985045	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
856	2029	125	6	71	chr3	35614985	35615337	-123984446	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
856	1857	100	106	7	chr3	35616511	35616804	-123982979	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
856	1935	112	132	12	chr3	35622454	35622781	-123977002	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	3	1
856	2938	131	16	70	chr3	35625071	35625157	-123974626	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-13	538	449	1
856	2938	131	16	70	chr3	35625308	35625328	-123974455	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-103	448	448	1
856	2938	131	16	70	chr3	35625365	35625817	-123973966	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-103	448	9	1
856	1965	123	41	41	chr3	35625933	35626271	-123973512	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	349	-45	1
856	1965	123	41	41	chr3	35626352	35626402	-123973381	+	ORR1B1	LTR	MaLR	350	389	-5	1
856	1705	153	3	101	chr3	35628551	35628908	-123970875	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
856	1748	131	23	75	chr3	35629063	35629410	-123970373	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
856	438	299	35	7	chr3	35630122	35630182	-123969601	-	MT2A	LTR	ERVL	-384	149	85	1
856	438	299	35	7	chr3	35630326	35630407	-123969376	-	MT2A	LTR	ERVL	-449	84	4	1
856	4391	142	85	62	chr3	35633185	35634067	-123965716	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	1
856	3000	60	39	3	chr3	35634564	35634946	-123964837	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
856	272	284	172	117	chr3	35637120	35637309	-123962474	-	MLT2D	LTR	ERVL	-50	364	166	1
856	3734	113	55	27	chr3	35637309	35637892	-123961891	+	MT2B	LTR	ERVL	3	601	0	1
856	272	284	172	117	chr3	35637892	35637993	-123961790	-	MLT2D	LTR	ERVL	-249	165	58	1
856	286	224	0	0	chr3	35638824	35638891	-123960892	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-135	235	169	1
856	279	176	25	86	chr3	35639128	35639209	-123960574	+	RLTR9A	LTR	ERVK	11	86	-282	1
856	1056	258	73	17	chr3	35640025	35640325	-123959458	+	MTD	LTR	MaLR	1	317	-102	1
856	3077	166	59	0	chr3	35647323	35647864	-123951919	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	3	2
856	273	226	16	0	chr3	35650874	35650936	-123948847	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-409	97	35	2
857	273	160	0	0	chr3	35661716	35661766	-123938017	+	ORR1C2	LTR	MaLR	335	384	0	2
857	1133	262	67	42	chr3	35662679	35663037	-123936746	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	8	2
857	339	275	98	15	chr3	35666781	35666914	-123932869	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-53	354	211	2
857	494	237	48	54	chr3	35675173	35675320	-123924463	-	RMER10B	LTR	ERVL	-48	350	205	2
857	1087	242	99	23	chr3	35675659	35675963	-123923820	+	ORR1D1	LTR	MaLR	48	374	0	2
857	852	206	110	23	chr3	35675999	35676334	-123923449	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
857	373	209	12	32	chr3	35689587	35689695	-123910088	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	274	2
857	736	198	116	11	chr3	35692677	35692866	-123906917	-	MTD	LTR	MaLR	-208	211	3	2
857	3088	142	78	9	chr3	35703490	35704025	-123895758	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	4	3
857	769	279	109	10	chr3	35723766	35724019	-123875764	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-64	295	1	3
857	471	167	219	0	chr3	35724019	35724133	-123875650	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	1232	3
857	714	217	38	0	chr3	35724536	35724693	-123875090	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1155	215	53	3
857	249	294	0	0	chr3	35724743	35724811	-123874972	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1301	69	2	3
857	595	273	29	54	chr3	35724812	35724957	-123874826	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	224	3
857	595	273	29	54	chr3	35725103	35725162	-123874621	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-147	223	171	3
857	728	232	93	6	chr3	35732314	35732496	-123867287	-	MTC	LTR	MaLR	-177	244	47	3
857	854	159	19	52	chr3	35748838	35749050	-123850733	-	RMER17C	LTR	ERVK	-205	205	1	3
857	607	206	191	88	chr3	35750386	35750727	-123849056	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	3	3
857	3399	150	67	50	chr3	35755857	35756557	-123843226	-	RMER13B	LTR	ERVK	-184	724	13	4
857	609	167	12	55	chr3	35760884	35761049	-123838734	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1084	1241	-1601	4
857	3030	157	25	117	chr3	35765106	35765784	-123833999	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	1	4
857	3273	30	100	23	chr3	35769811	35770252	-123829531	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
857	991	110	25	81	chr3	35770253	35770451	-123829332	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	4
857	226	321	0	0	chr3	35770451	35770504	-123829279	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	4
857	3686	59	0	20	chr3	35770504	35771009	-123828774	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	4
857	862	52	26	0	chr3	35771009	35771125	-123828658	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1477	-5004	4
857	1801	91	8	0	chr3	35771120	35771372	-123828411	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2244	2497	-5183	4
857	13565	61	8	0	chr3	35771393	35773181	-123826602	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4678	6479	-2	4
857	3134	35	42	20	chr3	35773183	35773585	-123826198	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	4
858	1724	192	29	8	chr3	35797934	35798285	-123801498	+	ORR1C1	LTR	MaLR	21	378	0	4
858	2394	87	18	15	chr3	35798526	35798852	-123800931	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
858	4106	129	83	50	chr3	35802883	35803631	-123796152	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	773	-255	4
858	2518	69	119	11	chr3	35807301	35807653	-123792130	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	4
858	252	280	206	12	chr3	35816608	35816778	-123783005	+	LTR50	LTR	ERVL	9	211	-584	4
858	2060	181	143	15	chr3	35841045	35841515	-123758268	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	2	5
858	1296	152	59	12	chr3	35841516	35841769	-123758014	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	0	5761	5497	5
858	9111	180	43	6	chr3	35841809	35843453	-123756330	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-421	5340	3636	5
858	5325	147	75	16	chr3	35843845	35845060	-123754723	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-208	2118	724	5
858	3512	198	76	45	chr3	35845347	35846180	-123753603	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1449	1393	1	5
858	735	200	6	55	chr3	35847137	35847301	-123752482	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	578	423	5
858	1049	168	108	51	chr3	35847299	35847594	-123752189	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-222	312	1	5
858	1403	172	76	0	chr3	35847711	35847949	-123751834	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2190	3571	3316	5
858	688	168	1	17	chr3	35847960	35848097	-123751686	+	MT2A	LTR	ERVL	347	540	-61	5
858	373	337	62	6	chr3	35848209	35848256	-123751527	-	MTE2b	LTR	MaLR	-188	191	6	5
858	643	172	16	8	chr3	35848256	35848385	-123751398	-	MT2A	LTR	ERVL	-398	135	6	5
858	334	140	0	0	chr3	35850526	35850583	-123749200	+	MTC	LTR	MaLR	1	57	-364	5
858	415	220	58	0	chr3	35850990	35851101	-123748682	+	MTC	LTR	MaLR	49	168	-251	5
858	348	181	0	0	chr3	35851658	35851730	-123748053	+	MTE2a	LTR	MaLR	308	379	0	5
858	1490	209	16	48	chr3	35852256	35852632	-123747151	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	365	-9	5
858	3079	131	30	81	chr3	35853663	35854242	-123745541	+	RMER15	LTR	ERVL	1	551	-24	5
858	2622	96	12	42	chr3	35854242	35854666	-123745117	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-4	411	1	5
858	3079	131	30	81	chr3	35854666	35854692	-123745091	+	RMER15	LTR	ERVL	552	575	0	5
858	1975	148	46	54	chr3	35856021	35856392	-123743391	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	11	5
858	1863	233	75	24	chr3	35857238	35857332	-123742451	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	563	456	5
858	1863	233	75	24	chr3	35857422	35857863	-123741920	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-108	455	1	5
858	498	284	180	35	chr3	35860898	35861215	-123738568	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	363	-2	5
858	499	15	0	15	chr3	35879136	35879202	-123720581	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-331	65	1	5
858	1111	202	208	3	chr3	35881298	35881610	-123718173	-	MTD	LTR	MaLR	-39	380	5	6
858	543	274	215	13	chr3	35886284	35886517	-123713266	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-5	360	81	6
858	2293	137	15	28	chr3	35893680	35894079	-123705704	-	RLTR26	LTR	ERVK	-148	494	101	6
858	1982	93	76	13	chr3	35901884	35902188	-123697595	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	325	-2	6
858	1734	150	42	3	chr3	35903884	35904191	-123695592	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	319	-1529	6
858	359	135	130	39	chr3	35904400	35904477	-123695306	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-281	89	6	6
858	2341	110	0	0	chr3	35904666	35904992	-123694791	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	6
858	3186	104	10	42	chr3	35906108	35906611	-123693172	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-16	487	1	6
858	1862	175	11	62	chr3	35907104	35907475	-123692308	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	70	6
858	551	314	33	28	chr3	35907477	35907657	-123692126	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1142	6
858	4721	201	88	36	chr3	35907749	35908157	-123691626	-	RMER12	LTR	ERVK	-85	1237	769	6
858	4721	201	88	36	chr3	35908236	35908686	-123691097	-	RMER12	LTR	ERVK	-554	768	319	6
858	4721	201	88	36	chr3	35909061	35909376	-123690407	-	RMER12	LTR	ERVK	-1004	318	2	6
858	376	205	84	59	chr3	35909376	35909444	-123690339	-	MTC	LTR	MaLR	-350	71	1	6
858	4517	162	26	26	chr3	35911735	35912590	-123687193	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	6
858	1137	229	30	4	chr3	35913305	35913537	-123686246	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	238	-132	6
859	287	297	227	0	chr3	35919696	35919824	-123679959	+	MLT1G	LTR	MaLR	254	410	-181	6
859	418	270	205	20	chr3	35920525	35920676	-123679107	-	MTE-int	LTR	MaLR	-32	1548	1370	6
859	384	239	292	21	chr3	35920881	35921073	-123678710	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1332	248	5	6
859	262	245	0	0	chr3	35922445	35922494	-123677289	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	49	-1523	6
859	2144	176	81	66	chr3	35922498	35923027	-123676756	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	537	-16	6
859	3943	186	72	75	chr3	35923074	35924083	-123675700	+	RLTR21	LTR	ERVK	52	1057	-515	6
859	439	250	81	113	chr3	35925229	35925414	-123674369	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	199	6
859	744	241	0	0	chr3	35925708	35925853	-123673930	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1435	145	1	6
859	432	306	143	77	chr3	35925854	35926190	-123673593	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	1	6
859	953	215	236	10	chr3	35929736	35929839	-123669944	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	139	-235	7
859	953	215	236	10	chr3	35929884	35930085	-123669698	+	ORR1D1	LTR	MaLR	140	374	0	7
859	759	271	35	21	chr3	35934890	35935180	-123664603	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1101	1394	-4128	7
859	3254	33	5	27	chr3	35936078	35936483	-123663300	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
859	1716	176	36	95	chr3	35937853	35938243	-123661540	+	ORR1B1	LTR	MaLR	28	394	0	7
859	3625	156	29	10	chr3	35938243	35938871	-123660912	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	640	-1323	7
859	265	56	0	0	chr3	35938871	35938907	-123660876	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5719	5754	-7	7
859	1267	190	70	49	chr3	35938931	35939258	-123660525	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1173	1506	-3	7
859	283	125	0	0	chr3	35939279	35939319	-123660464	+	ORR1B1	LTR	MaLR	347	386	-8	7
859	337	333	28	51	chr3	35942913	35943090	-123656693	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-1407	173	1	7
859	937	297	117	24	chr3	35943090	35943388	-123656395	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	50	7
859	1518	245	42	11	chr3	35943388	35943747	-123656036	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	370	-9	7
859	1609	281	101	58	chr3	35943948	35944423	-123655360	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	14	490	-1090	7
859	1609	281	101	58	chr3	35944457	35944772	-123655011	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	491	838	-742	7
859	398	281	33	8	chr3	35944843	35944965	-123654818	+	MTE-int	LTR	MaLR	150	274	-1306	7
859	601	257	174	16	chr3	35944970	35945288	-123654495	+	RMER5	LTR	ERV1	165	532	-2	7
859	4870	43	5	20	chr3	35947091	35947686	-123652097	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	2	587	0	7
859	1438	223	55	50	chr3	35953603	35954004	-123645779	+	MTD	LTR	MaLR	6	408	-11	7
859	948	201	14	48	chr3	35959147	35959356	-123640427	-	RLTR30	LTR	ERV1	-177	202	1	7
859	915	209	54	82	chr3	35959458	35959812	-123639971	+	RLTR40	LTR	ERVK	469	812	-5	7
859	602	228	44	6	chr3	35959905	35960064	-123639719	+	MTD	LTR	MaLR	5	169	-250	7
859	422	236	64	16	chr3	35960072	35960197	-123639586	+	MTD	LTR	MaLR	287	417	-2	7
859	354	172	0	0	chr3	35963036	35963100	-123636683	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-4	380	317	7
859	884	206	103	145	chr3	35963474	35963854	-123635929	+	RLTR14	LTR	ERV1	15	378	-4	7
859	783	278	109	31	chr3	35970187	35970507	-123629276	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	30	7
859	1111	240	43	74	chr3	35979221	35979612	-123620171	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	7
859	398	169	110	22	chr3	35993155	35993246	-123606537	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-756	272	174	7
859	465	187	21	10	chr3	35994433	35994540	-123605243	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	101	-293	8
859	772	170	7	13	chr3	35994540	35994689	-123605094	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	386	8
859	16399	106	41	22	chr3	35994707	35996344	-123603439	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-83	5323	3674	8
859	16399	106	41	22	chr3	35996364	35997239	-123602544	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1733	3673	2764	8
859	270	145	26	104	chr3	35997301	35997349	-123602434	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-61	1053	1010	8
859	7477	11	2	5	chr3	35997349	35998173	-123601610	+	RLTR13B2	LTR	ERVK	1	822	0	8
859	270	145	26	104	chr3	35998173	35998201	-123601582	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-105	1009	983	8
859	5333	108	45	14	chr3	35999183	35999998	-123599785	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-2634	2772	1932	8
859	1709	106	8	0	chr3	36000000	36000246	-123599537	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-3477	1929	1682	1
859	2617	183	86	10	chr3	36000247	36000749	-123599034	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4831	575	36	1
859	1661	81	5	5	chr3	36000890	36001152	-123598631	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	327	74	2
859	3359	54	0	2	chr3	36002581	36002986	-123596797	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	4	7
859	1178	148	47	13	chr3	36004861	36005093	-123594690	+	ORR1B2	LTR	MaLR	120	359	-8	1
859	488	227	8	16	chr3	36005231	36005352	-123594431	+	MTC	LTR	MaLR	1	120	-301	1
859	1433	192	45	17	chr3	36008119	36008411	-123591372	+	MTC	LTR	MaLR	113	412	-9	1
859	2519	187	21	52	chr3	36008665	36009223	-123590560	-	RMER15	LTR	ERVL	-34	541	1	1
859	2400	173	87	20	chr3	36010632	36011127	-123588656	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	2
859	629	182	16	24	chr3	36014576	36014700	-123585083	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-252	5065	4943	2
859	1110	211	0	209	chr3	36014928	36015330	-123584453	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	294	2
859	369	154	0	0	chr3	36017350	36017415	-123582368	-	RMER19C	LTR	ERVK	-546	65	1	2
859	7252	160	25	42	chr3	36017415	36017888	-123581895	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-833	4484	4020	2
859	3006	76	30	2	chr3	36017888	36018295	-123581488	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	4	2
859	7252	160	25	42	chr3	36018295	36019159	-123580624	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-1298	4019	3170	2
859	551	231	15	44	chr3	36019168	36019304	-123580479	-	RMER10B	LTR	ERVL	-10	388	257	3
859	5995	132	26	3	chr3	36019850	36020732	-123579051	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	3
859	1998	123	77	21	chr3	36021479	36021819	-123577964	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
859	2253	99	9	18	chr3	36022170	36022500	-123577283	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
859	1131	103	57	0	chr3	36022500	36022675	-123577108	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	185	-1778	3
859	486	265	104	60	chr3	36023014	36023361	-123576422	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-1	408	9	3
859	319	269	28	84	chr3	36023503	36023645	-123576138	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-32	6510	6377	3
859	4254	31	0	0	chr3	36023792	36024274	-123575509	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	3
859	24546	125	25	31	chr3	36024274	36029532	-123570251	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1	5555	-2001	3
859	4286	27	0	0	chr3	36029533	36030015	-123569768	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	3
859	390	281	23	23	chr3	36030016	36030187	-123569596	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-139	7639	7469	3
859	1200	259	13	29	chr3	36030462	36030776	-123569007	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1205	6201	5893	3
859	8328	239	45	19	chr3	36030773	36033106	-123566677	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1810	5596	2441	3
859	2806	310	24	48	chr3	36033159	36034299	-123565484	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5074	2332	585	3
859	452	254	73	116	chr3	36034885	36035117	-123564666	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	437	199	4
859	5371	132	20	7	chr3	36035294	36036270	-123563513	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	844	1963	0	4
859	2238	103	19	3	chr3	36036270	36036592	-123563191	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
859	292	222	0	0	chr3	36036671	36036725	-123563058	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-4100	891	838	4
859	472	274	40	0	chr3	36037254	36037378	-123562405	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	270	4
859	2221	169	37	72	chr3	36037654	36038114	-123561669	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-2141	3176	2733	4
859	2934	176	14	124	chr3	36038154	36038347	-123561436	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-2588	2729	2549	4
859	2934	176	14	124	chr3	36038408	36038948	-123560835	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-2769	2548	2077	4
859	662	216	122	108	chr3	36039893	36040329	-123559454	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	4
859	2796	28	0	0	chr3	36043980	36044302	-123555481	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
860	279	329	98	65	chr3	36047853	36048159	-123551624	+	MLT1H	LTR	MaLR	3	318	-231	5
860	3414	40	2	0	chr3	36049198	36049593	-123550190	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
860	590	263	102	72	chr3	36052084	36052988	-123546795	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3385	2752	1870	6
860	1444	235	73	160	chr3	36053249	36053998	-123545785	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3734	1788	1105	6
860	478	266	37	25	chr3	36056928	36057090	-123542693	+	MER67A	LTR	ERV1	21	184	-359	6
860	2426	64	45	0	chr3	36058626	36058939	-123540844	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
860	10729	130	76	10	chr3	36058940	36060780	-123539003	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	2	1963	0	6
860	2329	101	3	12	chr3	36060780	36061110	-123538673	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
860	386	275	167	59	chr3	36067280	36067585	-123532198	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	40	7
860	246	338	12	54	chr3	36069575	36069741	-123530042	+	MLT1C	LTR	MaLR	290	448	-19	7
860	467	313	108	60	chr3	36070189	36070505	-123529278	+	MTEb	LTR	MaLR	49	379	0	8
860	233	306	153	0	chr3	36101262	36101347	-123498436	-	MLT1D	LTR	MaLR	-132	373	276	1
860	299	356	0	9	chr3	36101706	36101811	-123497972	-	MLT1D	LTR	MaLR	-388	117	14	1
860	346	260	134	51	chr3	36104363	36104639	-123495144	+	RMER17C	LTR	ERVK	84	382	-28	1
860	252	186	229	0	chr3	36104895	36104965	-123494818	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1272	1357	-13	1
860	378	288	30	53	chr3	36104972	36105025	-123494758	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	51	-323	1
860	579	283	24	62	chr3	36105025	36105398	-123494385	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	1
860	378	288	30	53	chr3	36105398	36105464	-123494319	+	ORR1D1	LTR	MaLR	52	117	-257	1
860	713	201	99	16	chr3	36105637	36105829	-123493954	+	ORR1D1	LTR	MaLR	167	374	0	1
860	247	273	22	11	chr3	36110511	36110600	-123489183	-	LTR75	LTR	ERVL	-453	109	20	1
860	978	170	25	40	chr3	36116716	36116918	-123482865	+	ORR1D1	LTR	MaLR	176	374	0	1
860	765	274	52	15	chr3	36117083	36117400	-123482383	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	353	-6	1
860	1657	183	82	72	chr3	36125835	36125988	-123473795	+	ORR1C2	LTR	MaLR	4	171	-213	1
860	1657	183	82	72	chr3	36126123	36126346	-123473437	+	ORR1C2	LTR	MaLR	172	384	0	1
860	268	305	50	72	chr3	36128431	36128611	-123471172	+	MLT1B	LTR	MaLR	211	386	-4	1
860	2102	154	58	10	chr3	36129241	36129635	-123470148	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	1
860	536	301	50	5	chr3	36129655	36129855	-123469928	+	RMER5	LTR	ERV1	40	248	-286	1
860	302	314	63	14	chr3	36138507	36138649	-123461134	+	RMER5	LTR	ERV1	40	188	-346	1
860	332	293	57	8	chr3	36139132	36139256	-123460527	+	RMER5	LTR	ERV1	202	331	-203	1
860	241	315	40	86	chr3	36139429	36139614	-123460169	+	RMER5	LTR	ERV1	325	500	-34	1
860	2923	9	0	0	chr3	36142467	36142789	-123456994	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
860	285	306	96	74	chr3	36145484	36145713	-123454070	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	334	1
860	275	45	45	0	chr3	36146052	36146096	-123453687	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	46	-400	1
860	2159	144	49	44	chr3	36147517	36147925	-123451858	+	RLTR41	LTR	ERV1	37	446	0	1
860	3260	44	3	0	chr3	36154741	36155130	-123444653	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	1
860	15078	37	36	59	chr3	36155140	36157131	-123442652	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	1986	-1	1
860	3248	46	3	0	chr3	36157131	36157520	-123442263	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	1
860	447	165	0	0	chr3	36158293	36158372	-123441411	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	79	-295	2
860	741	274	112	21	chr3	36158426	36158699	-123441084	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1307	273	1	2
860	517	259	41	20	chr3	36158699	36158845	-123440938	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	231	2
860	1812	144	67	0	chr3	36158892	36159219	-123440564	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-11	367	19	2
860	403	195	26	0	chr3	36161204	36161281	-123438502	+	RMER5	LTR	ERV1	99	177	-357	2
860	310	141	94	0	chr3	36161282	36161346	-123438437	+	RMER5	LTR	ERV1	465	534	0	2
860	1390	218	111	37	chr3	36163506	36163883	-123435900	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	14	2
860	2374	183	50	31	chr3	36169736	36170254	-123429529	+	RLTR24	LTR	ERV1	2	529	0	2
860	2358	89	3	24	chr3	36171125	36171459	-123428324	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
860	512	171	9	0	chr3	36171542	36171647	-123428136	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1110	1215	-4307	2
860	1181	219	5	0	chr3	36171908	36172132	-123427651	+	RLTR14	LTR	ERV1	47	271	-111	2
860	1165	239	90	57	chr3	36172190	36172912	-123426871	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1862	2875	-3262	2
860	388	231	76	70	chr3	36173007	36173179	-123426604	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2907	3079	-3058	2
860	489	249	81	41	chr3	36173454	36173626	-123426157	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	268	2
860	565	207	118	30	chr3	36174043	36174294	-123425489	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3737	3969	-2168	2
860	2189	95	122	131	chr3	36174533	36174967	-123424816	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	2
861	407	153	14	14	chr3	36176128	36176201	-123423582	-	RMER5	LTR	ERV1	-461	73	1	2
861	284	286	33	0	chr3	36177418	36177509	-123422274	-	LTR37A	LTR	ERV1	-243	183	90	2
861	566	325	72	43	chr3	36180405	36180682	-123419101	+	RMER5	LTR	ERV1	22	306	-228	2
861	1411	167	30	4	chr3	36180976	36181211	-123418572	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	241	-288	2
861	958	148	25	0	chr3	36181213	36181375	-123418408	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	167	-200	2
861	296	198	46	11	chr3	36181302	36181389	-123418394	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-199	168	79	2
861	1072	122	22	11	chr3	36182710	36182892	-123416891	-	LTRIS3	LTR	ERV1	0	512	329	2
861	4614	100	8	12	chr3	36183609	36184279	-123415504	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	667	-316	2
861	2022	116	22	12	chr3	36190713	36191037	-123408746	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	653	979	-4	2
861	1205	219	102	20	chr3	36191189	36191482	-123408301	+	RMER5	LTR	ERV1	5	321	-213	2
861	2238	109	12	0	chr3	36192420	36192740	-123407043	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	4	2
861	909	143	132	0	chr3	36193004	36193186	-123406597	+	RMER5	LTR	ERV1	320	525	-9	2
861	2115	158	43	6	chr3	36196606	36196955	-123402828	+	ORR1B2	LTR	MaLR	5	366	-1	2
861	3531	25	0	0	chr3	36201710	36202106	-123397677	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
861	528	284	62	65	chr3	36205910	36206515	-123393268	+	MER34B-int	LTR	ERV1	2546	3163	-2193	2
861	2358	160	115	11	chr3	36206552	36207013	-123392770	-	RMER4B	LTR	ERVK	-44	541	33	2
861	352	303	41	45	chr3	36207106	36207372	-123392411	+	MER34B-int	LTR	ERV1	3343	3607	-1749	2
861	2094	242	53	22	chr3	36207373	36207918	-123391865	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	2	563	0	2
861	493	306	138	66	chr3	36208333	36208875	-123390908	+	MER34B-int	LTR	ERV1	3944	4524	-1663	2
861	390	244	22	0	chr3	36208897	36208987	-123390796	+	MER57C2	LTR	ERV1	343	434	0	2
861	443	262	42	45	chr3	36209186	36209348	-123390435	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	222	2
861	557	296	92	42	chr3	36209352	36209592	-123390191	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	128	2
861	644	288	43	16	chr3	36210477	36210664	-123389119	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	1	2
861	3375	30	5	0	chr3	36214404	36214798	-123384985	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
861	2004	136	28	3	chr3	36231637	36231954	-123367829	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	43	3
861	283	234	16	0	chr3	36231987	36232051	-123367732	+	RLTR19C	LTR	ERVK	33	97	-409	3
861	485	285	74	31	chr3	36232262	36232425	-123367358	+	RLTR33	LTR	ERVK	448	617	-61	3
861	512	312	74	29	chr3	36232780	36233024	-123366759	+	MLT1C	LTR	MaLR	38	292	-175	3
861	236	263	18	0	chr3	36233056	36233113	-123366670	+	MLT1C	LTR	MaLR	269	326	-64	3
861	2762	73	53	0	chr3	36237836	36238177	-123361606	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	3
861	266	287	72	27	chr3	36239065	36239176	-123360607	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	304	3
861	1303	268	48	23	chr3	36239578	36239935	-123359848	+	MTE-int	LTR	MaLR	79	445	-1135	3
861	1303	268	48	23	chr3	36240094	36240130	-123359653	+	MTE-int	LTR	MaLR	446	482	-1098	3
861	468	327	82	49	chr3	36240145	36240412	-123359371	+	MTE-int	LTR	MaLR	543	818	-762	3
861	391	236	99	86	chr3	36241166	36241328	-123358455	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	951	1114	0	3
861	2298	261	48	59	chr3	36241328	36241978	-123357805	+	MTE-int	LTR	MaLR	807	1449	-131	3
861	712	274	11	0	chr3	36242078	36242253	-123357530	+	MTEb	LTR	MaLR	200	376	-3	3
861	1414	187	178	59	chr3	36242254	36242328	-123357455	-	RLTR16	LTR	ERVK	-15	490	413	3
861	1414	187	178	59	chr3	36242361	36242547	-123357236	-	RLTR16	LTR	ERVK	-93	412	211	3
861	1414	187	178	59	chr3	36242729	36242905	-123356878	-	RLTR16	LTR	ERVK	-295	210	1	3
861	241	246	16	16	chr3	36247133	36247195	-123352588	-	MTE2b	LTR	MaLR	-38	341	280	3
861	255	328	16	0	chr3	36247512	36247576	-123352207	-	ORR1E	LTR	MaLR	-294	65	1	3
861	240	293	37	0	chr3	36249267	36249349	-123350434	-	MLT1K	LTR	MaLR	-26	569	485	3
861	2200	222	47	60	chr3	36249745	36250219	-123349564	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	471	-106	3
861	2200	222	47	60	chr3	36250265	36250361	-123349422	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	472	564	-13	3
861	253	414	19	0	chr3	36251892	36251996	-123347787	+	LTR89	LTR	ERVL?	542	647	-232	3
861	846	209	55	32	chr3	36253024	36253242	-123346541	-	LTRIS4	LTR	ERV1	0	507	285	3
861	1412	221	25	19	chr3	36258122	36258436	-123341347	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	64	3
861	1310	167	4	13	chr3	36264123	36264354	-123335429	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	179	3
861	1018	179	100	0	chr3	36266328	36266518	-123333265	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-210	211	3	3
861	284	323	114	80	chr3	36273008	36273183	-123326600	-	MLT1D	LTR	MaLR	-309	196	16	3
861	385	200	0	26	chr3	36276368	36276445	-123323338	+	MT2A	LTR	ERVL	2	76	-457	3
861	1924	223	30	62	chr3	36276467	36276979	-123322804	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-32	519	23	3
861	1924	223	30	62	chr3	36277203	36277225	-123322558	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-529	22	2	3
861	411	228	0	89	chr3	36277225	36277324	-123322459	+	MT2A	LTR	ERVL	69	158	-375	3
861	341	118	20	0	chr3	36277321	36277372	-123322411	+	MT2A	LTR	ERVL	349	400	-133	3
861	4675	181	56	87	chr3	36277423	36278673	-123321110	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7744	8955	-4	3
861	1329	207	157	64	chr3	36278682	36278818	-123320965	+	RMER4B	LTR	ERVK	13	157	-428	3
861	1329	207	157	64	chr3	36278872	36279251	-123320532	+	RMER4B	LTR	ERVK	158	576	-9	3
861	575	254	159	80	chr3	36283145	36283496	-123316287	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	4
861	1874	169	67	20	chr3	36284692	36285049	-123314734	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
861	2162	133	9	3	chr3	36285263	36285587	-123314196	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	4
861	232	279	11	55	chr3	36289869	36289960	-123309823	-	RMER4A	LTR	ERVK	-358	108	22	4
861	425	250	15	23	chr3	36291029	36291160	-123308623	+	MLT1A0	LTR	MaLR	199	340	-50	4
861	1625	225	14	11	chr3	36291638	36292007	-123307776	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	4
861	310	305	33	78	chr3	36293368	36293521	-123306262	-	MLT2D	LTR	ERVL	-106	358	213	4
861	589	194	17	96	chr3	36294161	36294338	-123305445	-	MLT2D	LTR	ERVL	-251	163	1	4
861	2212	197	62	38	chr3	36297167	36297695	-123302088	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	1	4
861	477	266	140	49	chr3	36300214	36300479	-123299304	-	RLTR40	LTR	ERVK	-13	804	516	4
861	412	271	84	47	chr3	36300681	36300871	-123298912	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	250	4
861	654	302	53	37	chr3	36301286	36301527	-123298256	-	MER88	LTR	ERVL	0	464	220	4
861	366	77	19	0	chr3	36301527	36301579	-123298204	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	53	-463	4
861	520	241	17	25	chr3	36301581	36301700	-123298083	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	6800	6917	-2	4
861	2668	171	7	56	chr3	36301705	36302243	-123297540	+	RMER20A	LTR	ERVK	3	514	-2	4
861	491	290	74	6	chr3	36302269	36302432	-123297351	-	MER88	LTR	ERVL	-290	174	1	4
861	2573	136	44	66	chr3	36302442	36302898	-123296885	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	4
861	941	281	123	15	chr3	36303286	36303766	-123296017	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1586	4081	3550	4
861	2219	131	27	3	chr3	36304368	36304737	-123295046	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	378	-138	4
861	435	171	0	0	chr3	36304755	36304825	-123294958	+	RMER20A	LTR	ERVK	447	516	0	4
861	303	311	77	86	chr3	36305938	36306251	-123293532	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-54	316	7	4
862	2170	104	3	3	chr3	36313383	36313701	-123286082	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	318	-9	4
862	2655	147	6	72	chr3	36313706	36313943	-123285840	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	208	-1755	4
862	2655	147	6	72	chr3	36314132	36314435	-123285348	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	209	505	-1458	4
862	2355	64	51	0	chr3	36314435	36314746	-123285037	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	4
862	18699	70	65	62	chr3	36314747	36317504	-123282279	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	2774	-3707	4
862	3171	19	0	0	chr3	36317502	36317862	-123281921	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4001	4360	-2121	4
862	5617	56	14	13	chr3	36317862	36318568	-123281215	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5775	6481	0	4
862	2333	68	51	0	chr3	36318568	36318879	-123280904	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	4
862	271	267	0	0	chr3	36318880	36318940	-123280843	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	535	594	-915	4
862	433	245	66	137	chr3	36318893	36318934	-123280849	+	RLTR25A	LTR	ERVK	460	525	-578	4
862	586	170	0	0	chr3	36318934	36319034	-123280749	+	MT2B	LTR	ERVL	157	256	-345	4
862	433	245	66	137	chr3	36319034	36319120	-123280663	+	RLTR25A	LTR	ERVK	526	670	-433	4
862	4782	131	6	16	chr3	36319040	36320501	-123279282	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	718	1963	0	4
862	594	264	122	45	chr3	36322507	36322729	-123277054	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	133	4
862	1097	168	4	36	chr3	36323518	36323762	-123276021	-	RMER10A	LTR	ERVL	-177	221	1	4
862	703	323	61	27	chr3	36324281	36324609	-123275174	-	LTR40c	LTR	ERVL	-29	436	98	4
862	1689	227	101	22	chr3	36324925	36325421	-123274362	-	RMER15	LTR	ERVL	-19	556	22	4
862	274	235	15	0	chr3	36325444	36325512	-123274271	-	RMER15	LTR	ERVL	-506	69	1	4
862	369	266	194	17	chr3	36327149	36327329	-123272454	+	RMER15	LTR	ERVL	294	505	-70	4
862	1610	163	11	23	chr3	36327588	36327917	-123271866	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	384	69	4
862	1382	201	20	77	chr3	36328055	36328075	-123271708	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-316	68	52	4
862	1382	201	20	77	chr3	36328125	36328150	-123271633	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-333	51	29	4
862	1382	201	20	77	chr3	36328273	36328297	-123271486	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-356	28	6	4
862	792	276	75	38	chr3	36328409	36328676	-123271107	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	94	4
862	2180	105	38	189	chr3	36328730	36329237	-123270546	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	4
862	494	220	57	41	chr3	36329314	36329437	-123270346	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	125	-502	4
862	282	284	209	23	chr3	36329576	36329861	-123269922	+	RMER20B	LTR	ERVK	126	472	-44	4
862	5090	110	12	65	chr3	36332306	36333154	-123266629	+	RLTR13B4	LTR	ERVK	1	803	0	4
862	3124	139	15	46	chr3	36337599	36338143	-123261640	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	527	-1	4
862	354	325	94	50	chr3	36338889	36339090	-123260693	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-65	300	91	4
862	2518	145	13	0	chr3	36339786	36340172	-123259611	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	391	-3	4
862	646	312	86	59	chr3	36342195	36342635	-123257148	+	MLT1D	LTR	MaLR	22	473	-32	5
862	487	192	33	8	chr3	36343099	36343220	-123256563	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	124	-235	5
862	299	272	50	35	chr3	36343306	36343447	-123256336	+	ORR1E	LTR	MaLR	50	192	-167	5
862	576	132	0	0	chr3	36347195	36347286	-123252497	+	RLTR15	LTR	ERVK	154	244	-115	5
862	2700	148	14	0	chr3	36365833	36366246	-123233537	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	5
862	2064	149	13	26	chr3	36367985	36368365	-123231418	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	33	407	0	5
862	752	286	77	10	chr3	36376181	36376478	-123223305	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-26	339	23	5
862	389	258	53	11	chr3	36377279	36377373	-123222410	-	ORR1E	LTR	MaLR	-258	101	4	5
862	740	327	142	14	chr3	36378098	36378529	-123221254	+	MLT2B1	LTR	ERVL	14	499	-21	5
862	450	315	67	141	chr3	36378586	36378792	-123220991	-	MER21B	LTR	ERV1	-82	781	600	5
862	450	315	67	141	chr3	36378993	36379189	-123220594	-	MER21B	LTR	ERV1	-264	599	409	5
862	226	281	33	22	chr3	36379496	36379587	-123220196	+	MLT1F2	LTR	MaLR	398	489	-71	5
862	2174	227	23	94	chr3	36385556	36386202	-123213581	-	RMER19C	LTR	ERVK	-11	600	1	5
862	2173	166	5	11	chr3	36386720	36387097	-123212686	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	8	5
862	1097	173	14	29	chr3	36387822	36388139	-123211644	-	RLTR33	LTR	ERVK	-130	548	197	5
862	538	277	239	44	chr3	36388172	36388603	-123211180	+	MT2A	LTR	ERVL	19	533	0	5
862	1813	167	59	72	chr3	36390777	36391164	-123208619	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	3	5
862	486	248	140	98	chr3	36394710	36394996	-123204787	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	298	-144	5
862	330	228	72	20	chr3	36395056	36395208	-123204575	+	RMER10A	LTR	ERVL	257	416	-26	5
862	593	262	139	48	chr3	36398930	36399239	-123200544	+	MTD	LTR	MaLR	83	419	0	6
862	3370	49	5	0	chr3	36405531	36405936	-123193847	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	6
862	2152	92	108	137	chr3	36406987	36407088	-123192695	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	73	-402	6
862	3562	18	2	0	chr3	36407166	36407561	-123192222	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
862	9359	34	4	1	chr3	36407561	36408656	-123191127	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
862	3562	18	2	0	chr3	36408656	36409051	-123190732	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
862	2152	92	108	137	chr3	36409497	36409884	-123189899	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	74	475	0	6
862	262	289	34	34	chr3	36421630	36421729	-123178054	-	MLT1F	LTR	MaLR	-18	530	432	6
862	281	331	151	27	chr3	36421940	36422272	-123177511	-	MLT1F	LTR	MaLR	-174	374	2	6
862	944	108	0	7	chr3	36423211	36423351	-123176432	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	283	6
862	2500	18	0	0	chr3	36424840	36425120	-123174663	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1362	4123	3844	6
862	2092	178	34	32	chr3	36428097	36428509	-123171274	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	6
862	2816	52	0	14	chr3	36428511	36428862	-123170921	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	6
862	257	349	22	28	chr3	36433820	36434000	-123165783	+	RMER15	LTR	ERVL	380	558	-17	6
863	2223	183	2	52	chr3	36441949	36442392	-123157391	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
863	5012	105	14	20	chr3	36442480	36443238	-123156545	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	3	6
863	1911	113	35	0	chr3	36443469	36443779	-123156004	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	6
863	611	272	141	100	chr3	36444521	36445109	-123154674	-	RLTR18	LTR	ERVK	-4	612	1	6
863	810	302	59	28	chr3	36445283	36445607	-123154176	+	MLT1A0	LTR	MaLR	32	365	0	6
863	441	338	44	18	chr3	36445764	36445993	-123153790	-	MLT1D	LTR	MaLR	-267	238	4	6
863	1803	134	24	200	chr3	36446039	36446505	-123153278	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	6
863	2007	175	74	18	chr3	36448401	36448791	-123150992	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	2	6
863	2125	110	3	0	chr3	36456368	36456686	-123143097	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	7
863	10525	129	88	17	chr3	36456686	36458519	-123141264	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	1	7
863	1676	112	225	0	chr3	36458519	36458786	-123140997	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
863	484	252	154	25	chr3	36460589	36460829	-123138954	-	MTD	LTR	MaLR	-139	280	10	7
863	2449	54	27	48	chr3	36483387	36483719	-123116064	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	325	-2	7
863	4411	103	4	4	chr3	36483756	36484437	-123115346	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	967	1647	-316	7
863	404	133	0	0	chr3	36484439	36484499	-123115284	+	ORR1A2	LTR	MaLR	259	318	-8	7
863	1772	125	143	15	chr3	36484809	36485151	-123114632	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	7
863	248	268	171	0	chr3	36485324	36485447	-123114336	+	MTEa	LTR	MaLR	209	352	-27	7
863	3126	14	0	3	chr3	36486414	36486761	-123113022	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	7
863	14421	53	6	1	chr3	36486761	36488544	-123111239	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	7
863	3135	17	0	0	chr3	36488544	36488890	-123110893	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	7
863	2275	126	47	49	chr3	36494473	36494642	-123105141	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	290	7
863	2275	126	47	49	chr3	36494673	36494696	-123105087	-	RMER4A	LTR	ERVK	-177	289	268	7
863	2878	33	27	0	chr3	36494696	36495033	-123104750	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	7
863	2275	126	47	49	chr3	36495033	36495306	-123104477	-	RMER4A	LTR	ERVK	-199	267	1	7
863	3105	71	2	5	chr3	36495532	36495929	-123103854	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
863	669	239	154	49	chr3	36516431	36516775	-123083008	+	RMER5	LTR	ERV1	81	460	-74	3
863	1560	153	79	13	chr3	36518629	36518947	-123080836	+	ORR1C2	LTR	MaLR	37	375	-9	3
863	2376	81	15	6	chr3	36518949	36519273	-123080510	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
863	1990	244	42	15	chr3	36527896	36528416	-123071367	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	534	0	6
863	254	275	42	42	chr3	36529690	36529785	-123069998	+	MT2B	LTR	ERVL	163	257	-344	6
863	1626	110	136	67	chr3	36535139	36535470	-123064313	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	7
863	238	333	0	0	chr3	36538781	36538844	-123060939	+	MTEb	LTR	MaLR	1	63	-316	8
863	302	231	103	7	chr3	36538869	36539022	-123060761	+	MTEb	LTR	MaLR	159	379	0	8
863	482	339	56	22	chr3	36554714	36555037	-123044746	+	MLT1A0	LTR	MaLR	20	353	-12	1
863	348	233	327	6	chr3	36556269	36556444	-123043339	+	MLT1A1	LTR	MaLR	177	407	-1	1
863	1475	167	134	56	chr3	36556617	36556991	-123042792	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	9	1
864	1630	159	46	102	chr3	36573906	36574231	-123025552	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	314	-60	1
864	1630	159	46	102	chr3	36574378	36574444	-123025339	+	ORR1D1	LTR	MaLR	315	370	-4	1
864	2090	47	7	0	chr3	36590682	36590957	-123008826	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	43	1
864	1078	260	35	56	chr3	36591493	36591888	-123007895	-	MLT1B	LTR	MaLR	-1	389	3	1
864	972	141	0	19	chr3	36594001	36594160	-123005623	+	MTC	LTR	MaLR	258	413	-8	1
864	2139	149	64	10	chr3	36609378	36609770	-122990013	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	1
864	243	317	30	119	chr3	36612598	36612834	-122986949	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-7	555	341	1
864	408	298	30	0	chr3	36612864	36612995	-122986788	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-312	208	74	1
864	3711	69	123	15	chr3	36617379	36617646	-122982137	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	280	2
864	3711	69	123	15	chr3	36617710	36617969	-122981814	-	MT2B2	LTR	ERVL	-305	279	2	2
864	778	319	129	12	chr3	36622969	36623388	-122976395	-	MLT1H	LTR	MaLR	0	549	82	2
864	251	221	115	13	chr3	36629636	36629714	-122970069	+	MLT1L	LTR	MaLR	285	370	-240	2
864	376	303	78	32	chr3	36638264	36638482	-122961301	+	LTR16E2	LTR	ERVL	341	568	0	2
864	237	292	89	11	chr3	36641127	36641217	-122958566	+	MLT1J2	LTR	MaLR	59	155	-293	2
864	2024	97	6	56	chr3	36645586	36645924	-122953859	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	2
864	1690	228	10	26	chr3	36645924	36646307	-122953476	-	MTD	LTR	MaLR	-38	381	5	2
864	500	172	78	172	chr3	36646311	36646543	-122953240	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	1049	2
864	617	243	63	167	chr3	36646619	36646906	-122952877	-	MTE2a	LTR	MaLR	-122	257	1	2
864	2422	189	28	169	chr3	36648745	36649453	-122950330	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	610	3	2
864	1782	204	96	10	chr3	36650267	36650653	-122949130	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
864	251	254	30	0	chr3	36652779	36652846	-122946937	-	MLT1B	LTR	MaLR	-16	374	306	2
864	531	261	578	36	chr3	36656635	36656823	-122942960	+	MTEb	LTR	MaLR	3	292	-87	2
864	3280	34	37	0	chr3	36656823	36657205	-122942578	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
864	8957	46	7	1	chr3	36657205	36658296	-122941487	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
864	3293	31	37	0	chr3	36658296	36658678	-122941105	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
864	372	262	12	110	chr3	36658678	36658768	-122941015	+	MTEb	LTR	MaLR	293	373	-6	2
864	2024	122	35	35	chr3	36660722	36661063	-122938720	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	342	-25	2
864	2367	134	38	0	chr3	36666456	36666852	-122932931	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	11	2
864	1294	235	81	7	chr3	36675415	36675761	-122924022	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	379	0	3
864	1440	233	85	22	chr3	36676065	36676109	-122923674	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-53	524	473	3
864	1440	233	85	22	chr3	36676150	36676565	-122923218	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-105	472	37	3
864	715	280	52	5	chr3	36678137	36678387	-122921396	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	56	3
864	2384	174	32	2	chr3	36678387	36678796	-122920987	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
864	271	287	71	41	chr3	36678796	36678848	-122920935	-	MTEb	LTR	MaLR	-324	55	3	3
864	427	243	91	49	chr3	36688438	36688570	-122911213	+	MTEb	LTR	MaLR	1	138	-241	3
864	2467	40	6	6	chr3	36688570	36688897	-122910886	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	31	3
864	687	237	87	69	chr3	36688915	36689146	-122910637	+	MTEb	LTR	MaLR	141	375	-4	3
865	457	276	55	43	chr3	36708789	36708952	-122890831	-	MTD	LTR	MaLR	-254	165	1	3
865	1433	143	91	108	chr3	36713957	36714318	-122885465	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	30	3
865	696	259	100	66	chr3	36715804	36716292	-122883491	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	505	0	3
865	1154	182	87	22	chr3	36720372	36720693	-122879090	-	RLTR15	LTR	ERVK	-17	342	1	3
865	1595	161	121	70	chr3	36727524	36727640	-122872143	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	158	-236	3
865	1976	192	33	174	chr3	36727640	36728250	-122871533	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	4	527	0	3
865	1595	161	121	70	chr3	36728250	36728506	-122871277	+	ORR1B1	LTR	MaLR	159	394	0	3
865	585	273	144	32	chr3	36730843	36731246	-122868537	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	472	-44	3
865	507	198	167	28	chr3	36732283	36732441	-122867342	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	239	3
865	755	288	104	30	chr3	36735533	36735830	-122863953	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	35	4
865	1512	187	164	3	chr3	36735949	36736297	-122863486	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	18	4
865	1219	184	156	44	chr3	36737882	36738163	-122861620	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-3	565	251	4
865	1219	184	156	44	chr3	36738339	36738352	-122861431	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-318	250	238	4
865	1260	170	4	6	chr3	36738364	36738595	-122861188	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-230	298	65	4
865	1410	253	114	46	chr3	36738601	36738759	-122861024	+	RLTR20D	LTR	ERVK	6	148	-420	4
865	1410	253	114	46	chr3	36738816	36739183	-122860600	+	RLTR20D	LTR	ERVK	149	567	-1	4
865	225	151	321	0	chr3	36739184	36739237	-122860546	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-498	70	1	4
865	229	171	0	0	chr3	36741876	36741917	-122857866	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-1	562	522	4
865	593	305	98	9	chr3	36742106	36742331	-122857452	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-51	346	102	4
865	781	312	110	45	chr3	36743324	36743420	-122856363	+	MTD	LTR	MaLR	20	116	-303	4
865	1568	184	45	63	chr3	36743420	36743798	-122855985	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	371	-3	4
865	781	312	110	45	chr3	36743798	36744010	-122855773	+	MTD	LTR	MaLR	117	348	-71	4
865	290	229	0	0	chr3	36753692	36753740	-122846043	-	RMER19B	LTR	ERVK	-354	548	501	4
865	1088	225	102	27	chr3	36753751	36754050	-122845733	-	RMER19B	LTR	ERVK	-471	431	177	4
865	1742	177	47	70	chr3	36756643	36757026	-122842757	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
865	1842	161	10	80	chr3	36757414	36757800	-122841983	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-225	359	1	4
865	2511	126	22	29	chr3	36759530	36759641	-122840142	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	308	4
865	3413	56	2	2	chr3	36759641	36760037	-122839746	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
865	2511	126	22	29	chr3	36760037	36760341	-122839442	-	MTC	LTR	MaLR	-114	307	1	4
865	1305	199	110	0	chr3	36764236	36764537	-122835246	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	41	4
865	6011	195	70	39	chr3	36764544	36765871	-122833912	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	3	4
865	1518	214	52	20	chr3	36765873	36766221	-122833562	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	16	4
865	1644	184	50	33	chr3	36767910	36768269	-122831514	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-17	367	3	4
865	1803	170	52	11	chr3	36778680	36779043	-122820740	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
865	2065	195	171	45	chr3	36780635	36781162	-122818621	-	RMER19B	LTR	ERVK	-2	900	308	4
865	1028	139	60	27	chr3	36789300	36789485	-122810298	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-216	191	1	4
865	405	301	50	31	chr3	36790461	36790622	-122809161	-	MLT1C	LTR	MaLR	-1	466	303	5
865	236	314	47	0	chr3	36790649	36790735	-122809048	-	MLT1C	LTR	MaLR	-300	90	1	5
865	1967	113	9	30	chr3	36791521	36791857	-122807926	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	5
865	488	291	110	36	chr3	36796107	36796414	-122803369	-	MTD	LTR	MaLR	-53	366	13	5
865	1913	155	3	22	chr3	36797854	36798177	-122801606	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	105	5
865	626	118	11	0	chr3	36804358	36804451	-122795332	-	MTC	LTR	MaLR	-323	98	5	5
865	3590	50	35	14	chr3	36812804	36813290	-122786493	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	69	5
865	335	273	128	32	chr3	36822776	36822901	-122776882	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	425	5
865	472	289	96	0	chr3	36823259	36823394	-122776389	-	MTEb	LTR	MaLR	-231	148	1	5
866	354	257	83	56	chr3	36833961	36834105	-122765678	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	241	5
866	615	332	88	4	chr3	36834095	36834367	-122765416	-	MLT1C	LTR	MaLR	-164	303	9	5
866	2428	90	81	18	chr3	36842451	36842847	-122756936	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	5
866	1289	150	13	14	chr3	36856331	36856610	-122743173	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	21	5
866	298	218	23	103	chr3	36865804	36865891	-122733892	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-280	94	15	6
866	2951	77	14	9	chr3	36866707	36867126	-122732657	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	6
866	1003	204	25	46	chr3	36867130	36867406	-122732377	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	0	557	327	6
866	753	253	12	31	chr3	36869485	36869648	-122730135	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	416	6
866	259	95	0	23	chr3	36869632	36869675	-122730108	-	RMER15	LTR	ERVL	-531	44	3	6
866	1672	190	55	28	chr3	36869965	36870328	-122729455	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	2	6
866	494	288	153	30	chr3	36870672	36871002	-122728781	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	10	6
866	250	275	0	28	chr3	36876981	36877040	-122722743	+	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	474	530	-27	6
866	250	275	0	28	chr3	36877060	36877071	-122722712	+	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	531	541	-16	6
866	2368	177	29	36	chr3	36878006	36878500	-122721283	-	RLTR1D	LTR	ERV1	0	605	115	6
866	637	281	142	56	chr3	36905194	36905533	-122694250	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	1	6
866	3664	153	28	20	chr3	36915845	36916480	-122683303	-	RLTR26	LTR	ERVK	-2	640	1	6
866	451	373	145	0	chr3	36930088	36930370	-122669413	-	MLT1F	LTR	MaLR	-135	413	91	7
866	612	250	27	43	chr3	36946615	36946799	-122652984	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-272	181	1	7
866	1018	246	99	36	chr3	36949898	36950231	-122649552	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	7
866	1812	252	147	19	chr3	36950231	36950739	-122649044	-	MTE-int	LTR	MaLR	-53	1527	953	7
866	719	233	41	67	chr3	36950800	36951067	-122648716	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-191	262	3	7
866	4811	126	80	6	chr3	36953456	36954299	-122645484	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2313	2947	2043	7
866	2070	193	112	14	chr3	36954392	36954911	-122644872	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-3753	1507	938	7
866	1976	138	68	122	chr3	36954911	36955355	-122644428	-	RLTR23	LTR	ERV1	-1	429	10	7
866	1204	301	73	77	chr3	36955359	36956238	-122643545	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-4904	876	2	7
866	392	184	69	39	chr3	36956246	36956348	-122643435	-	RMER4B	LTR	ERVK	-16	569	465	7
866	2319	64	22	0	chr3	36956351	36956663	-122643120	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	7
866	1066	195	235	25	chr3	36956663	36957016	-122642767	-	RMER4B	LTR	ERVK	-158	427	1	7
866	3205	166	128	114	chr3	36957820	36958651	-122641132	+	RMER21B	LTR	ERV1	1	842	0	7
866	391	275	42	42	chr3	36959349	36959493	-122640290	+	RLTR14	LTR	ERV1	225	368	-14	7
866	2193	111	13	0	chr3	36959565	36959880	-122639903	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	7
866	932	229	70	100	chr3	36960078	36960437	-122639346	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	373	7
866	2617	83	99	3	chr3	36960979	36961364	-122638419	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	7
867	1215	219	138	31	chr3	36967028	36967433	-122632350	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	7
867	1806	154	102	9	chr3	36983076	36983391	-122616392	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	43	7
867	406	246	14	106	chr3	36983467	36983608	-122616175	-	MT2B	LTR	ERVL	-327	274	147	7
867	506	239	162	101	chr3	36984208	36984677	-122615106	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	457	1	7
867	1956	120	67	22	chr3	37002463	37002778	-122597005	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
867	355	310	188	35	chr3	37003919	37004256	-122595527	-	MLT1H	LTR	MaLR	-15	474	114	9
867	3417	58	2	0	chr3	37014311	37014706	-122585077	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
867	229	266	89	0	chr3	37019193	37019272	-122580511	+	MLT1A1	LTR	MaLR	323	408	0	2
867	1723	124	6	4	chr3	37029450	37029520	-122570263	+	RLTR20A	LTR	ERVK	91	146	-395	4
867	1723	163	102	77	chr3	37029543	37029831	-122569952	+	RLTR20A	LTR	ERVK	147	448	-93	4
867	1723	163	102	77	chr3	37029856	37029944	-122569839	+	RLTR20A	LTR	ERVK	449	540	-1	4
867	306	203	58	0	chr3	37034657	37034726	-122565057	+	MLT1J	LTR	MaLR	401	473	-39	5
867	1548	140	152	21	chr3	37038388	37038717	-122561066	-	RMER6A	LTR	ERVK	-124	632	261	6
867	674	264	10	97	chr3	37039760	37039799	-122559984	-	MTE2b	LTR	MaLR	-10	369	337	6
867	5682	99	48	38	chr3	37039799	37040695	-122559088	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	905	-1	6
867	674	264	10	97	chr3	37040695	37040861	-122558922	-	MTE2b	LTR	MaLR	-43	336	182	6
867	418	220	139	51	chr3	37040954	37041112	-122558671	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	11	182	-395	6
867	1264	240	47	82	chr3	37041174	37041624	-122558159	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-124	453	20	6
867	630	212	42	162	chr3	37041632	37041823	-122557960	-	MTE2b	LTR	MaLR	-194	185	18	6
867	785	246	50	132	chr3	37041893	37042453	-122557330	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-2	566	1	7
867	5174	186	46	49	chr3	37042453	37043760	-122556023	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	0	8959	7813	7
867	312	265	58	58	chr3	37043762	37043918	-122555865	-	RMER4A	LTR	ERVK	-58	408	253	7
867	540	82	82	0	chr3	37045139	37045215	-122554568	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	83	-668	7
867	1228	177	60	92	chr3	37045308	37045656	-122554127	+	RMER17A	LTR	ERVK	415	751	0	7
867	329	264	14	0	chr3	37045982	37046054	-122553729	+	RMER10B	LTR	ERVL	269	341	-57	7
867	530	326	120	18	chr3	37049962	37050246	-122549537	+	MER34A1	LTR	ERV1	18	330	-257	8
867	238	231	0	97	chr3	37053319	37053391	-122546392	+	RLTR9C	LTR	ERVK	45	109	-284	8
867	413	270	30	95	chr3	37057879	37058047	-122541736	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	251	9
867	2127	150	241	47	chr3	37058338	37058827	-122540956	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	9
867	654	199	0	151	chr3	37062839	37063011	-122536772	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-262	1247	1102	1
867	733	184	0	7	chr3	37063516	37063658	-122536125	+	ORR1A1	LTR	MaLR	3	143	-203	1
867	1739	147	22	101	chr3	37063648	37064004	-122535779	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1636	1963	0	1
867	2085	111	33	60	chr3	37064004	37064340	-122535443	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
867	1815	166	23	69	chr3	37065719	37066069	-122533714	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	334	-33	1
867	447	71	0	0	chr3	37066672	37066728	-122533055	+	ORR1B2	LTR	MaLR	312	367	0	1
867	263	389	29	23	chr3	37069072	37069243	-122530540	+	LTR80A	LTR	ERVL	396	567	-16	1
867	1460	173	22	26	chr3	37075926	37076193	-122523590	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	266	-108	1
867	1938	206	76	34	chr3	37076267	37076346	-122523437	-	RLTR16	LTR	ERVK	-12	493	413	1
867	1938	206	76	34	chr3	37076440	37076832	-122522951	-	RLTR16	LTR	ERVK	-93	412	2	1
867	329	247	96	11	chr3	37076846	37076940	-122522843	+	ORR1D1	LTR	MaLR	283	384	0	1
867	414	282	52	52	chr3	37079108	37079299	-122520484	+	ORR1E	LTR	MaLR	50	240	-119	1
867	920	193	175	56	chr3	37079862	37080257	-122519526	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	1
867	310	309	21	21	chr3	37083252	37083348	-122516435	+	MTEa	LTR	MaLR	2	97	-282	1
867	1264	221	67	0	chr3	37083691	37083945	-122515838	+	MTEa	LTR	MaLR	109	379	0	1
867	417	314	84	118	chr3	37085379	37085762	-122514021	+	MLT1B	LTR	MaLR	21	390	0	1
867	255	306	106	18	chr3	37086787	37086900	-122512883	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	141	-218	1
868	2016	115	55	96	chr3	37093788	37094172	-122505611	+	ORR1B1	LTR	MaLR	27	394	0	1
868	4474	122	30	14	chr3	37094646	37095355	-122504428	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	239	1
868	833	204	45	58	chr3	37095601	37095825	-122503958	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	221	-737	1
868	382	124	19	93	chr3	37098557	37098664	-122501119	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	312	1
868	914	166	29	24	chr3	37098661	37098871	-122500912	-	RMER17C	LTR	ERVK	-562	396	186	1
868	2293	133	170	28	chr3	37098877	37099496	-122500287	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2532	1
868	714	143	170	58	chr3	37099484	37099655	-122500128	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-879	2359	2170	1
868	874	193	231	32	chr3	37099660	37100080	-122499703	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1250	1988	1485	1
868	1071	176	210	39	chr3	37100764	37101222	-122498561	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2642	596	61	1
868	1722	146	28	39	chr3	37101223	37101587	-122498196	-	RMER17C	LTR	ERVK	-49	361	2	1
868	260	192	19	0	chr3	37109327	37109379	-122490404	-	MER34A	LTR	ERV1	-518	53	1	1
868	313	311	93	114	chr3	37111507	37111743	-122488040	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	34	1
868	2809	55	2	115	chr3	37113555	37113990	-122485793	-	RLTR10	LTR	ERVK	-4	386	1	1
868	16886	25	17	1	chr3	37113990	37115906	-122483877	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1	1986	41	1
868	2809	55	2	115	chr3	37115922	37116357	-122483426	-	RLTR10	LTR	ERVK	-4	386	1	1
868	2461	157	90	26	chr3	37119395	37119495	-122480288	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	483	1
868	2461	157	90	26	chr3	37119554	37119995	-122479788	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-95	482	1	1
868	546	102	177	15	chr3	37137122	37137216	-122462567	+	RMER17B	LTR	ERVK	310	424	-534	2
868	546	102	177	15	chr3	37137292	37137327	-122462456	+	RMER17B	LTR	ERVK	425	460	-498	2
868	2415	49	3	3	chr3	37144152	37144478	-122455305	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	32	357	0	2
868	810	139	51	38	chr3	37144478	37144635	-122455148	+	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	22	180	-1290	2
868	9216	125	17	53	chr3	37144634	37146148	-122453635	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	524	1982	-5698	2
868	747	136	18	0	chr3	37146125	37146235	-122453548	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	2238	2349	-5331	2
868	3528	72	56	0	chr3	37146235	37146968	-122452815	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6907	7680	0	2
868	2412	56	3	3	chr3	37146979	37147304	-122452479	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	33	357	0	2
868	3448	33	2	0	chr3	37152534	37152929	-122446854	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
868	9481	34	2	0	chr3	37152929	37154025	-122445758	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
868	3248	29	28	8	chr3	37154025	37154413	-122445370	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
868	542	270	47	16	chr3	37155507	37155635	-122444148	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7201	-205	2
868	2153	169	110	5	chr3	37161858	37162239	-122437544	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
868	307	259	142	22	chr3	37163048	37163182	-122436601	+	MTEa	LTR	MaLR	16	165	-214	2
868	522	317	74	0	chr3	37163277	37163507	-122436276	+	MT2A	LTR	ERVL	287	533	0	2
868	889	292	91	42	chr3	37163822	37164183	-122435600	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	2
868	12738	96	62	29	chr3	37176552	37178217	-122421566	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1097	2899	-339	2
868	12738	96	64	29	chr3	37178276	37178606	-122421177	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2900	3238	0	2
868	1492	173	100	51	chr3	37178606	37178692	-122421091	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	92	-318	2
868	1492	173	100	51	chr3	37178771	37179072	-122420711	+	RMER17C	LTR	ERVK	93	407	-3	2
868	501	313	29	109	chr3	37186133	37186434	-122413349	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1223	357	82	2
868	435	293	0	57	chr3	37186434	37186557	-122413226	+	RMER2	LTR	ERV1	1	116	-451	2
868	345	217	196	119	chr3	37186622	37186857	-122412926	+	RMER2	LTR	ERV1	288	540	-27	2
868	247	200	18	18	chr3	37187628	37187684	-122412099	-	MTEa	LTR	MaLR	-46	333	278	2
868	294	314	77	19	chr3	37188530	37188686	-122411097	+	MLT1H	LTR	MaLR	373	537	-12	2
868	836	189	4	132	chr3	37188992	37189242	-122410541	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	307	2
868	1565	167	71	3	chr3	37190192	37190516	-122409267	+	MTC	LTR	MaLR	68	413	-8	2
868	554	301	193	22	chr3	37190741	37191144	-122408639	+	MER70A	LTR	ERVL	1	472	0	2
868	863	215	183	120	chr3	37194904	37195379	-122404404	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	505	-122	3
868	505	296	37	5	chr3	37197186	37197373	-122402410	-	ORR1E	LTR	MaLR	-166	193	1	3
868	235	0	297	0	chr3	37200395	37200432	-122399351	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	274	3
868	1800	121	64	78	chr3	37200606	37200966	-122398817	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-39	355	1	3
868	1271	262	80	31	chr3	37203218	37203376	-122396407	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-19	509	335	3
868	1271	262	80	31	chr3	37203408	37203734	-122396049	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-194	334	2	3
868	1430	198	129	12	chr3	37205298	37205630	-122394153	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	4	3
868	2331	132	105	14	chr3	37209766	37210251	-122389532	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	470	-115	3
868	581	225	153	14	chr3	37215244	37215492	-122384291	+	MLT1C	LTR	MaLR	61	370	-135	3
868	421	354	105	16	chr3	37220392	37220774	-122379009	-	LTR40c	LTR	ERVL	-13	452	37	3
868	505	232	249	59	chr3	37220778	37221062	-122378721	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	37	3
869	375	322	94	43	chr3	37226640	37226896	-122372887	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	87	3
869	910	256	118	78	chr3	37226898	37227404	-122372379	+	RMER4B	LTR	ERVK	3	604	-7	3
869	2258	106	77	31	chr3	37230750	37231141	-122368642	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	3
869	327	195	65	54	chr3	37232960	37233052	-122366731	+	MLT1A1	LTR	MaLR	316	408	0	3
869	306	304	96	32	chr3	37236486	37236673	-122363110	-	RMER20B	LTR	ERVK	-1	515	317	3
869	495	248	34	0	chr3	37236836	37236953	-122362830	-	RMER20B	LTR	ERVK	-506	121	1	3
869	1057	250	120	18	chr3	37238920	37239246	-122360537	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	3
869	237	282	150	53	chr3	37246426	37246613	-122353170	+	MER34A	LTR	ERV1	350	554	-17	3
869	381	219	51	20	chr3	37251888	37251983	-122347800	+	MTC	LTR	MaLR	2	99	-322	3
869	2033	153	12	9	chr3	37252145	37252475	-122347308	+	MTC	LTR	MaLR	91	421	0	3
869	983	263	117	19	chr3	37258226	37258554	-122341229	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	405	46	4
869	316	263	30	40	chr3	37262689	37262788	-122336995	-	ORR1E	LTR	MaLR	-17	362	265	4
869	597	263	26	10	chr3	37263373	37263517	-122336266	-	ORR1E	LTR	MaLR	-229	141	4	4
869	2552	287	198	52	chr3	37263562	37264687	-122335096	-	MTE-int	LTR	MaLR	-277	1303	14	4
869	394	256	138	13	chr3	37264985	37265120	-122334663	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	233	4
869	1269	239	62	68	chr3	37265342	37265679	-122334104	+	MTE2a	LTR	MaLR	39	373	-6	4
869	253	289	135	50	chr3	37269250	37269472	-122330311	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-3	394	154	4
869	1679	120	8	179	chr3	37270822	37271218	-122328565	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	328	-1	4
869	1731	194	30	14	chr3	37276103	37276469	-122323314	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	4
869	1475	233	79	38	chr3	37276551	37277123	-122322660	+	RLTR26	LTR	ERVK	2	642	0	4
869	263	267	85	71	chr3	37277164	37277305	-122322478	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-5	555	413	4
869	978	238	48	61	chr3	37278068	37278363	-122321420	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	28	4
869	1381	189	109	33	chr3	37281831	37282160	-122317623	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	4	4
869	411	265	325	7	chr3	37286257	37286540	-122313243	+	MTD	LTR	MaLR	1	372	-47	4
869	1587	144	136	12	chr3	37286531	37286854	-122312929	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-15	363	1	4
869	249	179	35	18	chr3	37286854	37286911	-122312872	+	MTD	LTR	MaLR	362	419	0	4
869	1906	81	84	39	chr3	37289512	37289845	-122309938	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	18	4
869	239	86	0	0	chr3	37289866	37289901	-122309882	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-249	43	9	4
869	296	48	0	0	chr3	37289909	37289951	-122309832	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-250	42	1	4
869	610	118	11	0	chr3	37289951	37290044	-122309739	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	7488	4
869	7213	48	0	30	chr3	37290277	37291172	-122308611	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-63	7518	6651	4
869	13147	42	2	0	chr3	37291163	37292687	-122307096	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	4284	4
869	4478	115	23	0	chr3	37292685	37293337	-122306446	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-3820	3761	3095	4
869	2550	69	0	0	chr3	37293609	37293926	-122305857	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7264	317	1	4
869	1927	78	84	39	chr3	37293926	37294259	-122305524	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	18	4
869	234	88	0	0	chr3	37294281	37294315	-122305468	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-250	42	9	4
869	296	48	0	0	chr3	37294323	37294365	-122305418	-	RLTR10B	LTR	ERVK	-250	42	1	4
869	498	217	72	104	chr3	37298487	37298708	-122301075	-	RMER10A	LTR	ERVL	-24	418	205	4
869	475	290	45	84	chr3	37298693	37298979	-122300804	-	RMER10A	LTR	ERVL	-156	286	12	4
869	272	152	0	0	chr3	37302517	37302563	-122297220	+	ORR1C2	LTR	MaLR	337	382	-2	4
869	455	286	129	9	chr3	37311862	37312095	-122287688	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-70	295	35	4
869	861	208	44	19	chr3	37322243	37322449	-122277334	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	169	4
869	753	121	40	0	chr3	37327664	37327788	-122271995	+	ORR1D1	LTR	MaLR	37	165	-209	5
869	310	122	0	0	chr3	37328005	37328054	-122271729	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-294	80	32	5
869	980	271	35	102	chr3	37333424	37333826	-122265957	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	5	5
869	2153	173	34	5	chr3	37343144	37343522	-122256261	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-5	389	1	5
870	717	307	168	3	chr3	37363708	37364041	-122235742	-	MER70B	LTR	ERVL	-182	396	9	5
870	1399	190	58	2	chr3	37364688	37364945	-122234838	+	MTC	LTR	MaLR	154	417	-4	5
870	369	75	0	36	chr3	37382730	37382785	-122216998	+	ORR1A4	LTR	MaLR	269	321	-8	6
870	1006	301	88	20	chr3	37384270	37384701	-122215082	+	MTE-int	LTR	MaLR	28	461	-909	6
870	953	304	67	51	chr3	37386615	37387045	-122212738	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	98	6
870	1017	257	84	84	chr3	37397717	37398087	-122201696	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
870	408	308	77	84	chr3	37403620	37403907	-122195876	-	MLT1D	LTR	MaLR	-103	402	118	6
870	3558	164	154	75	chr3	37408855	37409691	-122190092	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	6
870	752	147	62	0	chr3	37410619	37410748	-122189035	+	MTC	LTR	MaLR	227	363	-58	6
870	1690	195	48	17	chr3	37418065	37418419	-122181364	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	366	-8	6
870	2919	53	42	10	chr3	37418716	37419100	-122180683	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
870	543	193	31	109	chr3	37423105	37423233	-122176550	+	MTE2b	LTR	MaLR	6	123	-256	6
870	702	250	68	31	chr3	37423269	37423595	-122176188	-	RLTR15	LTR	ERVK	-21	338	1	6
870	227	189	125	42	chr3	37423595	37423646	-122176137	+	MTE2b	LTR	MaLR	209	265	-114	6
870	324	217	42	32	chr3	37425657	37425752	-122174031	-	RMER4B	LTR	ERVK	-482	103	8	6
870	2104	132	93	0	chr3	37432947	37433281	-122166502	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	3	6
870	2002	230	29	126	chr3	37442849	37443461	-122156322	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	818	1370	0	6
870	1162	238	106	34	chr3	37443484	37443776	-122156007	+	ORR1D2	LTR	MaLR	56	368	-2	6
870	1206	250	134	6	chr3	37445139	37445453	-122154330	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	18	6
870	352	335	29	62	chr3	37450241	37450415	-122149368	-	MLT1D	LTR	MaLR	-8	497	328	7
870	352	325	26	62	chr3	37450437	37450685	-122149098	-	MLT1D	LTR	MaLR	-178	327	40	7
870	236	267	174	0	chr3	37452013	37452099	-122147684	+	ORR1E	LTR	MaLR	97	197	-162	7
870	468	280	57	127	chr3	37458642	37459136	-122140647	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-41	487	1	7
870	431	333	42	16	chr3	37473183	37473375	-122126408	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-155	210	14	7
870	2784	192	156	93	chr3	37476093	37476902	-122122881	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	1	7
870	3460	3	12	37	chr3	37481265	37481671	-122118112	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
870	254	207	171	79	chr3	37483438	37483590	-122116193	+	MLT1D	LTR	MaLR	340	505	0	7
871	369	316	25	25	chr3	37488482	37488644	-122111139	-	MLT1B	LTR	MaLR	-228	162	1	7
871	372	212	253	13	chr3	37490804	37490962	-122108821	+	RMER21B	LTR	ERV1	348	543	-299	7
871	962	210	143	50	chr3	37492189	37492510	-122107273	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	20	7
871	1050	158	47	22	chr3	37496182	37496521	-122103262	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	438	-4	7
871	439	255	127	24	chr3	37497178	37497343	-122102440	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	9	7
871	257	149	0	0	chr3	37503389	37503436	-122096347	-	MER4B-int	LTR	ERV1	-5567	1191	1145	3
871	906	317	48	14	chr3	37505347	37505789	-122093994	+	MLT2B1	LTR	ERVL	12	564	-3	5
871	1847	188	33	22	chr3	37505867	37506226	-122093557	+	ORR1D1	LTR	MaLR	10	372	-2	6
871	1738	142	41	226	chr3	37508991	37509474	-122090309	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
871	694	286	94	13	chr3	37511405	37511639	-122088144	-	MLT1D	LTR	MaLR	-1	504	252	2
871	1021	217	44	70	chr3	37512543	37512908	-122086875	+	MTEb	LTR	MaLR	1	317	-62	2
871	334	268	34	192	chr3	37516669	37516747	-122083036	+	MTEa	LTR	MaLR	1	81	-298	3
871	334	268	34	192	chr3	37516850	37516979	-122082804	+	MTEa	LTR	MaLR	82	175	-204	3
871	533	304	133	8	chr3	37518508	37518763	-122081020	-	ORR1E	LTR	MaLR	-51	308	22	3
871	370	255	24	103	chr3	37524018	37524189	-122075594	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	205	4
871	286	318	111	9	chr3	37526244	37526352	-122073431	-	MTEb	LTR	MaLR	-237	122	4	4
871	473	310	123	40	chr3	37527957	37528118	-122071665	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	182	-177	4
871	2053	101	0	114	chr3	37528118	37528486	-122071297	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	4	5
871	473	310	123	40	chr3	37528486	37528650	-122071133	+	ORR1E	LTR	MaLR	183	353	-6	4
871	1134	221	220	6	chr3	37533047	37533388	-122066395	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	5	6
871	1147	216	152	9	chr3	37548879	37549202	-122050581	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	370	0	8
871	1265	194	29	4	chr3	37550730	37550973	-122048810	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	171	8
871	375	288	76	85	chr3	37564454	37564678	-122035105	+	RLTR14	LTR	ERV1	158	379	-3	1
871	389	262	55	80	chr3	37564745	37564944	-122034839	+	RMER17C	LTR	ERVK	167	360	-50	1
871	507	184	30	3	chr3	37570319	37570424	-122029359	+	MTD	LTR	MaLR	274	419	0	1
871	270	289	58	117	chr3	37570809	37570850	-122028933	-	MT2B	LTR	ERVL	-441	160	128	1
871	666	321	40	86	chr3	37581464	37581835	-122017948	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	355	-4	1
871	435	255	105	40	chr3	37585125	37585325	-122014458	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1164	1376	-4146	1
871	1276	219	139	19	chr3	37587514	37587884	-122011899	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	1
871	1546	179	133	27	chr3	37594197	37594535	-122005248	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
871	937	203	348	14	chr3	37596803	37597091	-122002692	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	1	1
871	232	268	99	0	chr3	37599937	37600008	-121999775	-	MER34	LTR	ERV1	-80	462	385	1
871	1840	161	84	38	chr3	37600438	37600805	-121998978	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
871	1485	201	54	59	chr3	37602013	37602384	-121997399	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	370	0	1
871	2257	121	14	69	chr3	37602462	37602881	-121996902	-	RMER10B	LTR	ERVL	-1	397	2	1
871	947	276	69	77	chr3	37606944	37607392	-121992391	+	RLTR26	LTR	ERVK	5	476	-166	1
871	1850	146	15	53	chr3	37609303	37609644	-121990139	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-1	328	1	1
871	577	296	92	28	chr3	37610382	37610650	-121989133	-	MTE2b	LTR	MaLR	-6	373	1	2
871	288	256	38	107	chr3	37613209	37613340	-121986443	+	MT2B	LTR	ERVL	139	260	-341	2
872	351	314	92	82	chr3	37625277	37625593	-121974190	-	MLT1J	LTR	MaLR	-46	466	148	2
872	2255	169	58	17	chr3	37632716	37633131	-121966652	-	RMER5	LTR	ERV1	-102	432	1	2
872	1954	173	31	41	chr3	37634078	37634470	-121965313	+	RMER6B	LTR	ERVK	54	441	-20	2
872	280	241	0	0	chr3	37636607	37636665	-121963118	+	RMER10B	LTR	ERVL	3	60	-338	2
872	278	314	92	49	chr3	37641297	37641461	-121958322	-	LTR16C	LTR	ERVL	-22	467	297	2
872	753	251	88	28	chr3	37643035	37643252	-121956531	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	230	-129	2
872	324	286	31	81	chr3	37648479	37648639	-121951144	-	RMER15	LTR	ERVL	-77	498	347	2
872	1722	169	82	67	chr3	37653594	37653950	-121945833	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	18	2
872	490	229	54	60	chr3	37655170	37655319	-121944464	+	RLTR14	LTR	ERV1	224	371	-11	2
872	1528	164	0	34	chr3	37655479	37655770	-121944013	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	281	-117	2
872	359	120	0	0	chr3	37655782	37655832	-121943951	+	RMER10B	LTR	ERVL	338	387	-11	2
872	247	297	11	32	chr3	37659130	37659224	-121940559	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-187	181	90	2
872	1310	165	190	18	chr3	37659284	37659568	-121940215	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	42	2
872	846	268	66	104	chr3	37661631	37661997	-121937786	+	MTE2a	LTR	MaLR	27	378	-1	2
872	340	253	231	23	chr3	37662282	37662497	-121937286	+	ORR1E	LTR	MaLR	88	347	-32	2
872	573	356	39	63	chr3	37662682	37662895	-121936888	+	MTD	LTR	MaLR	1	213	-206	2
872	573	356	39	63	chr3	37663111	37663230	-121936553	+	MTD	LTR	MaLR	214	325	-94	2
872	332	304	36	22	chr3	37663924	37664062	-121935721	-	MLT1I	LTR	MaLR	-8	403	264	2
872	828	267	65	102	chr3	37664927	37665311	-121934472	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	1	2
872	970	88	9	188	chr3	37669933	37670157	-121929626	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-141	188	5	3
872	1823	156	97	6	chr3	37670159	37670501	-121929282	-	RLTR14	LTR	ERV1	-9	373	1	3
872	231	222	19	0	chr3	37672494	37672548	-121927235	-	MTEa	LTR	MaLR	-75	304	250	3
872	1016	128	89	46	chr3	37677627	37677864	-121921919	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-280	247	1	3
872	2568	80	3	0	chr3	37682851	37683177	-121916606	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
872	599	218	178	36	chr3	37685791	37686034	-121913749	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	291	-68	3
872	599	162	14	29	chr3	37686211	37686281	-121913502	+	ORR1E	LTR	MaLR	292	379	0	3
872	626	285	92	53	chr3	37692964	37693431	-121906352	+	RLTR12B	LTR	ERVK	2	486	-42	3
872	341	301	89	35	chr3	37693469	37693672	-121906111	-	MER110-int	LTR	ERV1	-1858	2789	2576	3
872	270	312	36	9	chr3	37696867	37696977	-121902806	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-280	128	16	3
872	1158	297	129	21	chr3	37697012	37697525	-121902258	-	MLT-int	LTR	MaLR	-39	1696	1129	3
872	231	405	62	33	chr3	37698050	37698290	-121901493	-	MLT-int	LTR	MaLR	-640	1095	849	3
872	588	234	294	4	chr3	37699198	37699426	-121900357	-	MTEa	LTR	MaLR	-85	294	1	3
872	535	231	105	85	chr3	37707503	37707815	-121891968	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	405	-14	3
872	992	264	52	77	chr3	37708000	37708037	-121891746	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	38	-321	3
872	2525	204	25	129	chr3	37708037	37708719	-121891064	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	3
872	992	264	52	77	chr3	37708719	37708784	-121890999	+	ORR1E	LTR	MaLR	39	101	-258	3
872	992	264	52	77	chr3	37708989	37709250	-121890533	+	ORR1E	LTR	MaLR	102	359	0	3
872	1256	167	151	13	chr3	37719294	37719592	-121880191	+	RLTR24	LTR	ERV1	191	529	0	3
872	1223	212	33	93	chr3	37722661	37722994	-121876789	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	313	-66	4
872	1296	260	60	3	chr3	37723427	37723763	-121876020	+	MTEb	LTR	MaLR	12	366	-13	4
872	2439	57	3	0	chr3	37729907	37730225	-121869558	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	4
872	239	263	103	21	chr3	37730349	37730446	-121869337	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	86	4
872	253	329	161	8	chr3	37734103	37734339	-121865444	+	MER68	LTR	ERVL	274	545	-18	4
872	1362	181	48	70	chr3	37736881	37737297	-121862486	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	2	4
872	1384	161	236	10	chr3	37739058	37739371	-121860412	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
872	323	236	76	74	chr3	37739394	37739517	-121860266	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	378	254	4
872	1089	272	43	0	chr3	37739512	37739836	-121859947	+	MTE2b	LTR	MaLR	31	368	-11	4
872	586	256	220	5	chr3	37739851	37740051	-121859732	-	ORR1E	LTR	MaLR	-115	244	2	4
873	3147	20	0	0	chr3	37751421	37751767	-121848016	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	4
873	1548	192	134	36	chr3	37755106	37755463	-121844320	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	4
873	5334	192	58	14	chr3	37755463	37755683	-121844100	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	1292	4
873	5334	192	58	14	chr3	37755703	37756735	-121843048	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-218	1291	202	4
873	2256	158	22	0	chr3	37766851	37767219	-121832564	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	3	4
873	803	252	61	55	chr3	37769271	37769374	-121830409	+	ORR1E	LTR	MaLR	42	148	-211	4
873	803	252	61	55	chr3	37769433	37769640	-121830143	+	ORR1E	LTR	MaLR	149	353	-6	4
873	1624	238	129	37	chr3	37770915	37771403	-121828380	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	4
873	807	279	27	111	chr3	37780008	37780410	-121819373	+	MTD	LTR	MaLR	19	389	-30	4
873	3326	46	5	0	chr3	37780574	37780968	-121818815	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
873	609	229	186	53	chr3	37785331	37785650	-121814133	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	4
873	1898	202	80	19	chr3	37788789	37789313	-121810470	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	556	-4	5
873	320	221	22	44	chr3	37789833	37789923	-121809860	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1028	1115	-1727	5
873	2276	177	73	39	chr3	37790273	37790957	-121808826	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	932	-1394	5
873	6407	151	29	44	chr3	37790962	37792241	-121807542	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1067	2326	0	5
873	572	184	312	6	chr3	37792241	37792411	-121807372	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	4	225	-335	5
873	937	223	124	50	chr3	37792821	37793119	-121806664	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	320	-39	5
873	1255	187	52	99	chr3	37797289	37797447	-121802336	-	RMER17C	LTR	ERVK	-8	402	232	5
873	1255	187	52	99	chr3	37797469	37797732	-121802051	-	RMER17C	LTR	ERVK	-179	231	1	5
873	648	239	169	41	chr3	37802795	37803061	-121796722	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	275	5
873	1087	271	84	51	chr3	37808370	37808763	-121791020	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	1	5
873	2830	47	6	3	chr3	37809385	37809729	-121790054	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	2	5
873	298	168	27	169	chr3	37817299	37817409	-121782374	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	325	5
873	670	268	41	12	chr3	37817407	37817577	-121782206	-	MTD	LTR	MaLR	-224	195	21	5
873	978	227	162	7	chr3	37818680	37818982	-121780801	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	7	5
873	563	259	25	15	chr3	37819126	37819247	-121780536	-	RMER10B	LTR	ERVL	-1	397	276	5
873	563	259	25	15	chr3	37819340	37819418	-121780365	-	RMER10B	LTR	ERVL	-123	275	196	5
873	1257	199	21	7	chr3	37819682	37819970	-121779813	-	RMER10A	LTR	ERVL	-145	297	6	5
873	371	350	39	43	chr3	37820495	37820752	-121779031	+	MLT1D	LTR	MaLR	198	453	-52	5
873	375	310	31	0	chr3	37821369	37821498	-121778285	+	MLT1A0	LTR	MaLR	233	365	0	5
873	1361	252	11	45	chr3	37825748	37826130	-121773653	+	MTD	LTR	MaLR	51	419	0	5
873	442	276	24	16	chr3	37833146	37833271	-121766512	+	MTEa	LTR	MaLR	1	126	-253	5
873	457	298	8	0	chr3	37833344	37833468	-121766315	+	MT2A	LTR	ERVL	245	369	-164	5
873	229	234	91	0	chr3	37833481	37833558	-121766225	+	MLT2B2	LTR	ERVL	476	559	-3	5
873	3230	53	2	5	chr3	37841129	37841526	-121758257	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
873	608	216	78	24	chr3	37841579	37841745	-121758038	-	MTD	LTR	MaLR	-21	398	224	5
873	358	190	142	33	chr3	37841767	37841887	-121757896	-	MTD	LTR	MaLR	-284	135	3	5
873	1021	265	58	61	chr3	37849900	37850246	-121749537	-	ORR1E	LTR	MaLR	-9	350	6	5
873	351	325	111	64	chr3	37851164	37851592	-121748191	+	MLT1H	LTR	MaLR	59	485	-4	5
873	580	310	122	30	chr3	37852416	37852745	-121747038	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	5
873	3075	314	131	15	chr3	37852745	37854110	-121745673	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-53	1527	2	5
873	511	352	55	55	chr3	37854115	37854461	-121745322	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	8	5
873	1712	222	28	3	chr3	37854595	37854951	-121744832	-	MTC	LTR	MaLR	-56	365	1	5
873	294	385	80	42	chr3	37856348	37856660	-121743123	-	ORR1E	LTR	MaLR	-35	324	1	5
873	232	204	82	0	chr3	37856892	37856941	-121742842	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	367	5
873	1025	200	18	18	chr3	37856933	37857152	-121742631	-	MTC	LTR	MaLR	-202	219	1	5
873	725	216	68	0	chr3	37868212	37868374	-121731409	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	198	6
873	1862	195	61	21	chr3	37869115	37869540	-121730243	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	442	-74	6
873	450	351	12	0	chr3	37872232	37872400	-121727383	+	MLT1A0	LTR	MaLR	139	308	-57	6
874	1299	161	24	12	chr3	37880896	37881148	-121718635	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	255	-313	6
874	350	329	124	9	chr3	37883563	37883796	-121715987	+	MLT1D	LTR	MaLR	211	470	-35	6
874	619	284	31	89	chr3	37884385	37884799	-121714984	-	RMER10A	LTR	ERVL	-26	416	27	6
874	721	221	179	22	chr3	37889970	37890238	-121709545	+	MTE2a	LTR	MaLR	70	379	0	6
874	1542	239	116	8	chr3	37897844	37897881	-121701902	-	MT2A	LTR	ERVL	-9	524	488	6
874	1542	239	116	8	chr3	37897958	37898393	-121701390	-	MT2A	LTR	ERVL	-46	487	2	6
874	2423	96	9	3	chr3	37900488	37900813	-121698970	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
874	276	292	211	107	chr3	37906326	37906390	-121693393	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	52	-322	6
874	369	292	211	107	chr3	37906588	37906803	-121692980	+	MLT1A0	LTR	MaLR	53	309	-65	6
874	367	291	264	68	chr3	37907043	37907374	-121692409	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	405	10	6
874	610	249	97	138	chr3	37911116	37911414	-121688369	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-167	286	1	6
874	693	211	287	0	chr3	37912494	37912705	-121687078	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	271	-108	6
874	620	221	13	25	chr3	37916046	37916204	-121683579	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-218	156	1	6
874	874	232	14	9	chr3	37916948	37917170	-121682613	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	305	527	0	6
874	5138	129	0	5	chr3	37917869	37918610	-121681173	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	6
874	3500	25	2	0	chr3	37920213	37920608	-121679175	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
874	9180	40	3	1	chr3	37920608	37921704	-121678079	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
874	3487	28	2	0	chr3	37921704	37922099	-121677684	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
874	1218	232	6	51	chr3	37930691	37931045	-121668738	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-215	338	1	6
874	881	198	0	49	chr3	37931049	37931272	-121668511	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-5	2837	2626	6
874	2200	162	33	53	chr3	37936107	37936653	-121663130	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	3	537	-24	7
874	599	256	9	83	chr3	37936651	37936868	-121662915	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	361	561	0	7
874	427	211	22	76	chr3	37939630	37939789	-121659994	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	125	7
874	427	211	22	76	chr3	37939835	37939860	-121659923	-	RMER17C	LTR	ERVK	-286	124	101	7
874	306	292	56	43	chr3	37943311	37943472	-121656311	+	MLT1B	LTR	MaLR	37	199	-191	7
874	225	280	31	171	chr3	37943846	37943975	-121655808	+	MLT1B	LTR	MaLR	271	381	-9	7
874	1324	253	102	3	chr3	37950022	37950375	-121649408	+	MTD	LTR	MaLR	1	388	-31	7
874	302	312	36	9	chr3	37954200	37954310	-121645473	+	MTD	LTR	MaLR	1	113	-306	7
874	1630	154	58	100	chr3	37955870	37956231	-121643552	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	7
874	1035	144	17	0	chr3	37956235	37956255	-121643528	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	20	-1943	7
874	1035	144	17	0	chr3	37956287	37956439	-121643344	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	21	174	-1789	7
874	3617	245	60	76	chr3	37957568	37957603	-121642180	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	3775	3808	-2742	7
874	3617	245	60	76	chr3	37957653	37958812	-121640971	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	3809	4952	-1598	7
874	3617	245	60	76	chr3	37959582	37959757	-121640026	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4953	5123	-1427	7
874	481	276	43	65	chr3	37959758	37959990	-121639793	+	RMER4A	LTR	ERVK	248	583	-2	7
874	5048	218	33	35	chr3	37961520	37961695	-121638088	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5275	5453	-1097	7
874	3105	30	0	110	chr3	37961695	37962105	-121637678	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	7
874	5048	218	33	35	chr3	37962105	37963204	-121636579	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5454	6546	-4	7
874	684	252	46	14	chr3	37963207	37963424	-121636359	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	224	-135	7
874	1733	142	84	181	chr3	37964931	37965457	-121634326	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	7
874	2014	221	20	28	chr3	37968130	37968571	-121631212	+	MT2A	LTR	ERVL	1	558	-43	7
874	379	260	72	192	chr3	37968656	37968701	-121631082	+	MT2A	LTR	ERVL	559	601	0	7
874	1290	231	190	81	chr3	37968988	37969472	-121630311	+	MT2B	LTR	ERVL	1	554	-47	7
874	2041	178	69	3	chr3	37969778	37970138	-121629645	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	7
874	264	358	83	8	chr3	37970175	37970296	-121629487	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-64	498	369	7
874	654	271	81	5	chr3	37970320	37970531	-121629252	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-283	232	6	7
874	318	330	136	20	chr3	37972167	37972365	-121627418	-	MLT1D	LTR	MaLR	-272	233	13	7
874	425	336	62	25	chr3	37973899	37974143	-121625640	+	LTR81A	LTR	ERV1?	4	256	-1094	7
874	1495	280	72	15	chr3	37977728	37977777	-121622006	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	488	7
874	2488	160	34	3	chr3	37977777	37978159	-121621624	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
874	1495	280	72	15	chr3	37978159	37978584	-121621199	-	RMER5	LTR	ERV1	-47	487	33	7
874	3660	74	23	6	chr3	37981104	37981582	-121618201	-	RLTR44D	LTR	ERVK	0	486	1	7
874	1039	315	48	18	chr3	37981927	37982263	-121617520	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	34	7
874	2964	155	103	147	chr3	37984879	37985143	-121614640	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	241	-665	7
874	2964	155	103	147	chr3	37985393	37985469	-121614314	+	RMER17A2	LTR	ERVK	242	247	-659	7
874	2964	155	103	147	chr3	37986422	37987027	-121612756	+	RMER17A2	LTR	ERVK	248	906	0	7
874	817	249	87	60	chr3	37989106	37989528	-121610255	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	30	7
874	805	304	48	98	chr3	37989900	37990298	-121609485	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	378	-1	7
874	315	338	41	37	chr3	38003346	38003564	-121596219	-	RMER15	LTR	ERVL	-4	571	353	6
874	1341	183	90	155	chr3	38007927	38008425	-121591358	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	466	0	1
874	227	232	35	47	chr3	38008440	38008526	-121591257	-	MER77	LTR	ERVL	-20	587	503	1
874	3967	128	135	34	chr3	38008607	38009353	-121590430	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	1
875	711	271	56	50	chr3	38016392	38016695	-121583088	+	MTE2a	LTR	MaLR	75	379	0	2
875	625	299	72	8	chr3	38028131	38028367	-121571416	-	ORR1E	LTR	MaLR	-108	251	1	2
875	975	243	201	3	chr3	38039211	38039500	-121560283	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	74	3
875	717	333	82	45	chr3	38043491	38043846	-121555937	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	10	4
875	246	241	132	49	chr3	38046012	38046156	-121553627	+	RMER2	LTR	ERV1	385	540	-27	4
875	425	250	72	8	chr3	38047349	38047474	-121552309	+	MTEb	LTR	MaLR	65	197	-182	4
875	377	304	19	68	chr3	38055393	38055568	-121544215	+	MTEb	LTR	MaLR	1	144	-235	5
875	455	263	29	0	chr3	38056436	38056573	-121543210	+	MTEb	LTR	MaLR	123	263	-116	5
875	2870	55	0	0	chr3	38069025	38069371	-121530412	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	7
875	814	330	92	16	chr3	38070458	38070948	-121528835	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	7	7
875	276	262	8	0	chr3	38075910	38076036	-121523747	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	628	8
875	3579	20	2	0	chr3	38087186	38087581	-121512202	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
875	829	263	198	26	chr3	38089085	38089410	-121510373	+	RLTR40	LTR	ERVK	307	661	-156	1
875	829	263	198	26	chr3	38089433	38089532	-121510251	+	RLTR40	LTR	ERVK	662	803	-14	1
875	828	270	132	21	chr3	38104584	38104963	-121494820	-	MER54A	LTR	ERVL	-7	894	474	1
875	975	292	86	15	chr3	38109084	38109421	-121490362	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	364	-15	1
875	278	200	106	39	chr3	38129972	38130076	-121469707	-	ORR1E	LTR	MaLR	-209	150	40	1
109	4099	154	112	65	chr3	38141416	38142393	-121457390	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	-1	1022	1	1
876	2797	116	11	38	chr3	38148695	38149169	-121450614	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-14	461	1	1
876	245	237	132	0	chr3	38149776	38149852	-121449931	+	MTE2a	LTR	MaLR	149	234	-145	1
876	703	237	56	56	chr3	38150337	38150587	-121449196	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4126	1396	1147	1
876	1870	216	10	20	chr3	38151312	38151719	-121448064	+	MTD	LTR	MaLR	16	418	-1	1
876	473	301	120	13	chr3	38156182	38156453	-121443330	-	ORR1E	LTR	MaLR	-12	367	27	1
876	291	319	79	21	chr3	38157590	38157779	-121442004	+	MLT1D	LTR	MaLR	247	446	-59	2
876	1087	278	128	42	chr3	38163949	38164429	-121435354	-	MTE-int	LTR	MaLR	-303	1277	882	2
876	365	265	196	7	chr3	38164771	38164919	-121434864	-	RMER15	LTR	ERVL	-43	532	357	2
876	318	233	54	77	chr3	38165023	38165153	-121434630	-	RMER15	LTR	ERVL	-448	127	1	2
876	268	138	86	71	chr3	38166745	38166815	-121432968	+	RLTR25B	LTR	ERVK	439	509	-519	2
876	1880	192	74	10	chr3	38170820	38171214	-121428569	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
876	813	266	143	24	chr3	38172660	38172995	-121426788	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	1	2
876	1770	190	105	3	chr3	38177606	38177986	-121421797	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
876	406	309	126	16	chr3	38182984	38183175	-121416608	-	MLT1C	LTR	MaLR	-5	462	251	2
876	1877	94	38	38	chr3	38183738	38184057	-121415726	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	2
876	273	196	0	0	chr3	38189172	38189223	-121410560	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	51	-316	2
876	252	313	36	0	chr3	38189582	38189665	-121410118	-	RMER4B	LTR	ERVK	-155	430	345	2
876	3189	327	77	46	chr3	38189670	38191677	-121408106	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-163	4828	2760	2
876	284	286	45	45	chr3	38192589	38192721	-121407062	-	MER34-int	LTR	ERV1	-3372	4835	4704	2
876	1704	224	41	52	chr3	38192784	38193340	-121406443	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-29	555	6	2
876	278	274	73	36	chr3	38194829	38194939	-121404844	-	RMER20B	LTR	ERVK	-10	617	504	2
876	784	252	128	86	chr3	38194985	38195475	-121404308	-	RMER20B	LTR	ERVK	-15	612	30	2
876	7371	227	47	70	chr3	38195533	38196802	-121402981	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2273	2718	1446	2
876	7371	227	47	70	chr3	38196919	38197033	-121402750	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3546	1445	1354	2
876	7371	227	47	70	chr3	38197134	38197432	-121402351	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3638	1353	1083	2
876	7371	227	47	70	chr3	38197514	38197848	-121401935	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3909	1082	749	2
876	447	122	36	12	chr3	38197848	38197931	-121401852	+	ORR1B1	LTR	MaLR	310	394	0	2
876	1824	186	125	11	chr3	38200932	38201308	-121398475	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
876	551	274	94	76	chr3	38202645	38202921	-121396862	+	MTE2a	LTR	MaLR	7	287	-92	2
876	415	230	20	10	chr3	38203426	38203527	-121396256	+	MTE2a	LTR	MaLR	278	379	0	2
876	557	272	97	40	chr3	38213714	38214041	-121385742	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	366	-4	2
876	1727	239	9	57	chr3	38214529	38214650	-121385133	+	MTC	LTR	MaLR	1	119	-302	3
876	1727	239	9	57	chr3	38214835	38215145	-121384638	+	MTC	LTR	MaLR	120	418	-3	3
876	804	134	0	0	chr3	38218262	38218404	-121381379	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	142	-236	3
876	522	175	10	0	chr3	38218402	38218499	-121381284	+	ORR1C1	LTR	MaLR	281	378	0	3
876	1010	256	74	22	chr3	38219611	38219934	-121379849	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	20	3
876	1688	139	165	12	chr3	38219957	38220285	-121379498	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	3
876	402	271	261	23	chr3	38228780	38228822	-121370961	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	528	3
876	402	271	261	23	chr3	38228909	38229123	-121370660	-	RMER15	LTR	ERVL	-48	527	258	3
876	1135	239	29	59	chr3	38229137	38229444	-121370339	+	ORR1E	LTR	MaLR	55	352	-7	3
876	305	288	58	138	chr3	38231371	38231560	-121368223	+	MT2B	LTR	ERVL	87	260	-341	3
876	1008	261	59	85	chr3	38231780	38232169	-121367614	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	3
876	981	251	86	45	chr3	38234044	38234215	-121365568	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	190	3
876	981	284	80	35	chr3	38234281	38234497	-121365286	-	MTE2a	LTR	MaLR	-192	227	3	3
876	714	297	52	75	chr3	38240531	38240877	-121358906	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	339	-20	3
876	909	250	76	66	chr3	38240902	38241219	-121358564	-	ORR1E	LTR	MaLR	-39	320	1	3
876	1043	200	82	85	chr3	38241219	38241525	-121358258	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	0	1370	1066	3
876	1981	132	6	100	chr3	38241630	38241742	-121358041	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	92	-235	3
876	1981	132	6	100	chr3	38242528	38242776	-121357007	+	ORR1A2	LTR	MaLR	93	327	0	3
876	1015	315	50	65	chr3	38243879	38244419	-121355364	-	RMER5	LTR	ERV1	-2	532	1	3
876	1778	176	65	4	chr3	38251787	38252273	-121347510	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	1	3
876	6337	147	62	16	chr3	38252273	38252310	-121347473	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	2298	3
876	6337	147	62	16	chr3	38252341	38253516	-121346267	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-29	2297	1058	3
876	2929	47	21	0	chr3	38254071	38254410	-121345373	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
876	618	237	72	17	chr3	38255602	38255914	-121343869	-	MTEb	LTR	MaLR	-8	371	8	3
876	455	321	115	52	chr3	38267427	38267696	-121332087	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-6	359	74	3
876	1608	178	140	15	chr3	38267930	38268272	-121331511	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-9	385	1	3
876	290	282	112	8	chr3	38268554	38268679	-121331104	-	LTR50	LTR	ERVL	-12	783	646	3
876	268	309	112	141	chr3	38268667	38269115	-121330668	-	LTR50	LTR	ERVL	-322	473	39	3
877	854	196	60	5	chr3	38280169	38280369	-121319414	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	209	4
877	1327	159	134	15	chr3	38283509	38283777	-121316006	+	MT2A	LTR	ERVL	1	300	-233	4
877	3073	147	66	112	chr3	38284161	38284797	-121314986	-	RMER19C	LTR	ERVK	-4	607	1	4
877	255	261	111	22	chr3	38285125	38285215	-121314568	-	MTEa	LTR	MaLR	-239	140	43	4
877	274	246	14	0	chr3	38285229	38285298	-121314485	-	MTEa	LTR	MaLR	-24	355	286	4
877	226	164	18	18	chr3	38285754	38285810	-121313973	+	MER74A	LTR	ERVL	301	356	-202	4
877	1486	236	150	30	chr3	38286312	38286771	-121313012	+	RMER15	LTR	ERVL	47	560	-15	4
877	2128	171	38	0	chr3	38288940	38289308	-121310475	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	4
877	1581	252	35	18	chr3	38291926	38292093	-121307690	+	MTD	LTR	MaLR	1	169	-250	4
877	1284	220	177	73	chr3	38292093	38292574	-121307209	+	MT2A	LTR	ERVL	1	531	-2	4
877	1581	252	35	18	chr3	38292574	38292805	-121306978	+	MTD	LTR	MaLR	170	406	-13	4
877	861	265	86	11	chr3	38293219	38293534	-121306249	+	MTD	LTR	MaLR	71	405	-14	4
877	300	268	108	16	chr3	38293675	38293804	-121305979	+	MLT1C	LTR	MaLR	68	208	-259	4
877	343	164	248	46	chr3	38300008	38300117	-121299666	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1028	898	4
877	508	176	46	149	chr3	38300096	38300270	-121299513	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-253	775	620	4
877	1155	168	76	239	chr3	38300227	38300451	-121299332	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-999	964	650	4
877	1289	139	60	56	chr3	38300451	38300703	-121299080	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	35	4
877	1155	168	76	239	chr3	38300703	38300808	-121298975	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-999	649	499	4
877	2392	198	36	14	chr3	38300731	38301237	-121298546	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-580	523	7	4
877	1178	194	132	80	chr3	38305606	38305971	-121293812	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
877	753	226	216	5	chr3	38306365	38306583	-121293200	+	MTEa	LTR	MaLR	21	284	-95	4
877	241	224	132	75	chr3	38306637	38306743	-121293040	+	MTEa	LTR	MaLR	259	370	-9	4
877	1640	211	128	46	chr3	38306921	38307462	-121292321	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	1	4
877	481	256	50	131	chr3	38308357	38308694	-121291089	-	RLTR15	LTR	ERVK	-15	344	35	4
877	1189	201	35	18	chr3	38310266	38310549	-121289234	+	ORR1D1	LTR	MaLR	87	374	0	4
877	1096	289	49	46	chr3	38310977	38311343	-121288440	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	4	4
877	951	271	66	32	chr3	38317526	38317873	-121281910	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	4
877	863	139	0	38	chr3	38317929	38318086	-121281697	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1698	1848	0	4
877	291	284	121	50	chr3	38318199	38318340	-121281443	+	MLT1A0	LTR	MaLR	21	171	-194	4
877	813	155	20	0	chr3	38319093	38319241	-121280542	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-347	1979	1829	4
877	1690	214	68	11	chr3	38319970	38320352	-121279431	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	1	4
877	659	36	0	0	chr3	38325025	38325109	-121274674	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	84	-312	5
877	4548	52	7	2	chr3	38325085	38325728	-121274055	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	482	1154	-638	5
877	3449	28	5	2	chr3	38325728	38326123	-121273660	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
877	637	280	73	39	chr3	38326527	38326761	-121273022	+	MTD	LTR	MaLR	23	264	-155	5
877	256	356	59	14	chr3	38331049	38331126	-121268657	+	RMER5	LTR	ERV1	49	132	-402	5
877	256	356	59	14	chr3	38331148	38331292	-121268491	+	RMER5	LTR	ERV1	133	279	-255	5
877	294	347	69	6	chr3	38331320	38331494	-121268289	+	RMER5	LTR	ERV1	350	534	0	5
877	1241	169	226	7	chr3	38334042	38334339	-121265444	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	362	-12	5
877	3847	136	90	42	chr3	38334701	38335212	-121264571	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	192	5
877	3847	144	81	38	chr3	38335357	38335531	-121264252	-	RMER19A	LTR	ERVK	-546	191	38	5
877	443	129	10	0	chr3	38335502	38335579	-121264204	-	RMER19A	LTR	ERVK	-765	137	38	5
877	247	255	175	61	chr3	38335517	38335797	-121263986	+	MER31B	LTR	ERV1	103	414	-52	5
877	2522	137	50	5	chr3	38336172	38336575	-121263208	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
877	1564	185	109	26	chr3	38336725	38337074	-121262709	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	5
877	1314	196	161	3	chr3	38337227	38337513	-121262270	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	91	5
877	1718	145	148	33	chr3	38337519	38337883	-121261900	-	RMER6A	LTR	ERVK	-1	755	350	5
877	2016	124	3	26	chr3	38338805	38339112	-121260671	-	RMER6A	LTR	ERVK	-456	300	1	5
877	309	185	0	30	chr3	38339112	38339171	-121260612	-	MTC	LTR	MaLR	-332	89	33	5
877	252	103	26	0	chr3	38339388	38339427	-121260356	-	MTC	LTR	MaLR	-381	40	1	5
877	455	176	18	81	chr3	38341137	38341152	-121258631	+	MT2B2	LTR	ERVL	154	161	-423	5
877	446	341	131	63	chr3	38343275	38343704	-121256079	+	LTR40b	LTR	ERVL	3	460	-2	5
877	698	188	148	100	chr3	38360338	38360568	-121239215	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	179	5
877	1684	197	101	0	chr3	38362411	38362787	-121236996	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	5
877	3198	214	89	73	chr3	38362792	38363531	-121236252	+	MTD-int	LTR	MaLR	286	1043	-215	5
877	2108	163	87	8	chr3	38363531	38363921	-121235862	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
877	3198	214	89	73	chr3	38363921	38363957	-121235826	+	MTD-int	LTR	MaLR	1044	1068	-190	5
877	2043	162	111	8	chr3	38363957	38364336	-121235447	+	MTC	LTR	MaLR	4	421	0	5
877	3198	214	89	73	chr3	38364336	38364511	-121235272	+	MTD-int	LTR	MaLR	1069	1252	-6	5
877	1181	206	249	12	chr3	38364522	38364857	-121234926	+	MTD	LTR	MaLR	3	404	-15	5
877	340	290	98	44	chr3	38366741	38367094	-121232689	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	506	-50	5
877	2026	165	82	8	chr3	38367934	38368326	-121231457	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
877	3417	35	2	0	chr3	38371524	38371919	-121227864	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
877	2608	110	26	31	chr3	38378617	38379038	-121220745	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
877	338	235	58	42	chr3	38379193	38379313	-121220470	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	287	5
877	896	246	191	3	chr3	38380024	38380315	-121219468	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	4	5
877	236	193	18	0	chr3	38389044	38389101	-121210682	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	320	5
877	341	306	62	7	chr3	38389120	38389265	-121210518	+	MTE2a	LTR	MaLR	39	191	-188	5
877	682	223	149	5	chr3	38389959	38390153	-121209630	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	198	5
877	660	282	81	5	chr3	38390324	38390534	-121209249	-	MTD	LTR	MaLR	-193	226	1	5
877	292	340	157	24	chr3	38390664	38390996	-121208787	+	MLT1E2	LTR	MaLR	250	625	-2	5
877	322	250	87	40	chr3	38391768	38391918	-121207865	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	931	1087	-402	5
877	411	334	85	3	chr3	38393005	38393299	-121206484	+	MLT1B	LTR	MaLR	73	390	0	5
877	1177	197	184	0	chr3	38393635	38393944	-121205839	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	1	5
877	582	340	68	61	chr3	38396477	38396906	-121202877	+	MLT2B3	LTR	ERVL	46	477	-77	6
877	318	311	25	124	chr3	38400183	38400458	-121199325	+	MTEa	LTR	MaLR	75	322	-57	6
877	847	230	253	48	chr3	38401780	38402257	-121197526	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	576	-9	6
878	3449	23	5	10	chr3	38404486	38404884	-121194899	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
878	2252	150	51	3	chr3	38405922	38406296	-121193487	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	6
878	430	303	129	37	chr3	38407698	38407993	-121191790	-	MLT1A	LTR	MaLR	-52	322	1	6
878	284	151	0	36	chr3	38408320	38408375	-121191408	-	MT2B	LTR	ERVL	-1	600	548	6
878	1269	191	24	72	chr3	38408472	38408625	-121191158	-	MT2B	LTR	ERVL	-66	535	320	6
878	3059	29	0	0	chr3	38408625	38408971	-121190812	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	6
878	1269	235	61	79	chr3	38408971	38409279	-121190504	-	MT2B	LTR	ERVL	-199	402	1	6
878	318	179	0	0	chr3	38409279	38409335	-121190448	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	0	5761	5706	6
878	272	209	42	52	chr3	38409335	38409431	-121190352	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1324	639	545	6
878	3377	169	76	15	chr3	38409454	38409718	-121190065	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-82	5679	5235	6
878	12321	166	63	5	chr3	38409745	38412797	-121186986	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-405	5356	1965	6
878	1870	155	52	44	chr3	38412802	38413166	-121186617	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
878	556	218	0	16	chr3	38413460	38413586	-121186197	-	ORR1E	LTR	MaLR	-221	138	15	6
878	1861	205	129	20	chr3	38413870	38413952	-121185831	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	455	6
878	1861	205	129	20	chr3	38414008	38414413	-121185370	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-87	454	3	6
878	1024	206	173	102	chr3	38416283	38416393	-121183390	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	462	6
878	1024	206	173	102	chr3	38416500	38416777	-121183006	-	MT2A	LTR	ERVL	-72	461	114	6
878	1608	179	92	57	chr3	38416777	38417145	-121182638	+	ORR1C2	LTR	MaLR	4	384	0	6
878	1024	206	173	102	chr3	38417145	38417177	-121182606	-	MT2A	LTR	ERVL	-420	113	83	6
878	476	209	8	94	chr3	38417865	38417992	-121181791	-	MT2A	LTR	ERVL	-417	116	1	6
878	1801	157	102	3	chr3	38417992	38418363	-121181420	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	0	5761	5354	6
878	1943	169	49	20	chr3	38418354	38418704	-121181079	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-603	5158	4799	6
878	1452	247	108	15	chr3	38418704	38419168	-121180615	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	10	6
878	3125	142	86	4	chr3	38419174	38419675	-121180108	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-953	4808	4267	6
878	1001	200	60	24	chr3	38419675	38419924	-121179859	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1552	4209	3815	6
878	1248	270	13	43	chr3	38426806	38427197	-121172586	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	6
878	2052	155	13	60	chr3	38427875	38428260	-121171523	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
878	698	236	139	14	chr3	38428978	38429193	-121170590	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-127	243	2	6
878	3259	164	128	73	chr3	38430053	38430892	-121168891	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	127	6
878	4319	40	2	2	chr3	38435884	38436387	-121163396	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	1	6
878	439	338	102	27	chr3	38436627	38436852	-121162931	+	LTR53	LTR	ERVL	59	300	-219	6
878	1816	162	116	31	chr3	38439406	38439468	-121160315	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	367	6
878	1978	174	30	30	chr3	38439468	38439835	-121159948	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
878	1816	162	116	31	chr3	38439835	38440160	-121159623	-	MTC	LTR	MaLR	-55	366	1	6
878	822	146	50	6	chr3	38448063	38448222	-121151561	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	256	6
878	1346	163	11	60	chr3	38448298	38448579	-121151204	-	MTC	LTR	MaLR	-154	267	1	6
878	1774	152	118	70	chr3	38449098	38449472	-121150311	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	6
878	1833	151	31	3	chr3	38451289	38451607	-121148176	+	ORR1B2	LTR	MaLR	30	356	-11	6
878	1463	225	61	48	chr3	38455386	38455782	-121144001	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	19	6
878	692	276	31	117	chr3	38456514	38456805	-121142978	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	266	-113	6
878	299	212	15	0	chr3	38457785	38457851	-121141932	+	MTE2a	LTR	MaLR	313	379	0	6
878	2184	210	16	100	chr3	38459247	38459790	-121139993	+	MT2A	LTR	ERVL	1	493	-40	7
878	2184	210	16	100	chr3	38459908	38459946	-121139837	+	MT2A	LTR	ERVL	494	533	0	7
878	573	305	99	41	chr3	38460457	38460700	-121139083	+	MTD	LTR	MaLR	1	257	-162	7
878	1984	203	7	17	chr3	38461832	38462248	-121137535	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	9	7
878	294	314	160	9	chr3	38464731	38464956	-121134827	-	MER34A1	LTR	ERV1	-71	516	258	7
878	1569	35	5	0	chr3	38465056	38465257	-121134526	+	ORR1A1	LTR	MaLR	145	346	0	7
878	803	247	62	55	chr3	38468632	38468941	-121130842	-	RMER5	LTR	ERV1	-22	512	202	7
878	372	323	174	8	chr3	38469697	38469962	-121129821	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1257	323	15	7
878	2230	176	5	0	chr3	38470048	38470428	-121129355	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	7
878	366	281	45	45	chr3	38470527	38470706	-121129077	-	ORR1E	LTR	MaLR	-173	186	8	7
878	2619	118	29	0	chr3	38473946	38474329	-121125454	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
878	906	262	21	97	chr3	38475286	38475666	-121124117	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	353	-6	7
878	1676	183	57	3	chr3	38486631	38486949	-121112834	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	165	7
878	1023	131	34	22	chr3	38487117	38487296	-121112487	-	RLTR19	LTR	ERVK	-318	181	1	7
878	892	260	123	18	chr3	38489882	38490239	-121109544	-	MTE2b	LTR	MaLR	-22	397	27	7
878	235	262	189	8	chr3	38491916	38492043	-121107740	+	LTR16A	LTR	ERVL	243	392	-59	7
878	817	199	75	15	chr3	38493398	38493597	-121106186	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	174	7
878	852	156	13	7	chr3	38493982	38494137	-121105646	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-218	156	1	7
878	1809	202	46	37	chr3	38495218	38495655	-121104128	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	441	0	7
878	2038	45	0	8	chr3	38499732	38500000	-121099783	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	238	7
878	1809	55	0	0	chr3	38500000	38500237	-121099546	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-266	237	1	1
878	258	239	55	33	chr3	38501704	38501795	-121097988	-	RMER5	LTR	ERV1	-30	504	412	4
878	4709	123	45	3	chr3	38507200	38507907	-121091876	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	8
878	4894	116	105	39	chr3	38510750	38511195	-121088588	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	482	1
878	4894	116	105	39	chr3	38511318	38511722	-121088061	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-425	481	3	1
878	835	305	85	14	chr3	38514186	38514539	-121085244	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	379	0	1
878	465	208	23	28	chr3	38514926	38515045	-121084738	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	410	1
878	463	274	29	98	chr3	38515084	38515138	-121084645	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-108	460	407	1
878	673	199	74	22	chr3	38515127	38515364	-121084419	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-285	283	11	1
878	982	250	21	12	chr3	38515974	38516217	-121083566	+	MTEa	LTR	MaLR	1	245	-134	2
878	674	307	104	57	chr3	38517823	38518189	-121081594	+	MLT1B	LTR	MaLR	8	390	0	2
878	510	236	97	191	chr3	38519388	38519781	-121080002	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	4	2
879	2862	120	38	7	chr3	38539195	38539638	-121060145	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	5	4
879	1672	185	140	65	chr3	38541496	38542023	-121057760	-	RMER4B	LTR	ERVK	-6	579	13	4
879	1832	149	54	46	chr3	38542326	38542698	-121057085	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-3	375	1	4
879	2407	108	56	3	chr3	38543502	38543892	-121055891	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	5
879	259	301	24	0	chr3	38547579	38547662	-121052121	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	85	-274	5
879	1611	191	19	79	chr3	38547996	38548313	-121051470	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-147	406	109	5
879	1611	191	19	79	chr3	38548373	38548486	-121051297	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-445	108	2	5
879	349	275	135	31	chr3	38549274	38549554	-121050229	+	MLT1B	LTR	MaLR	68	390	0	6
879	3521	18	5	0	chr3	38551229	38551623	-121048160	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
879	912	235	156	16	chr3	38553848	38554134	-121045649	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-23	347	1	6
879	632	273	184	0	chr3	38557503	38557770	-121042013	+	MTE2b	LTR	MaLR	56	371	-8	7
879	1593	147	172	67	chr3	38571014	38571444	-121028339	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	9
879	481	317	66	0	chr3	38576170	38576337	-121023446	-	MTD	LTR	MaLR	-237	182	5	9
879	1400	166	260	0	chr3	38578592	38578888	-121020895	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	1	1
879	361	259	100	112	chr3	38581030	38581439	-121018344	-	RMER10A	LTR	ERVL	-27	415	12	1
879	1858	196	80	14	chr3	38587688	38588101	-121011682	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	89	1
879	540	239	82	27	chr3	38588092	38588238	-121011545	-	MTE2b	LTR	MaLR	-187	192	39	1
879	289	294	65	0	chr3	38588216	38588308	-121011475	-	MTE2b	LTR	MaLR	-281	98	1	1
879	476	73	0	0	chr3	38589129	38589197	-121010586	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-438	90	23	1
879	1003	191	109	71	chr3	38593558	38593880	-121005903	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-38	336	3	1
879	2508	162	68	8	chr3	38599108	38599605	-121000178	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	1
879	2322	146	11	6	chr3	38599636	38600001	-120999782	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	1
879	945	172	80	5	chr3	38600106	38600293	-120999490	+	MTC	LTR	MaLR	213	413	-8	1
879	462	196	0	40	chr3	38600296	38600397	-120999386	+	ORR1D1	LTR	MaLR	263	359	-15	1
879	2960	168	9	13	chr3	38602497	38603023	-120996760	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	524	0	1
879	298	156	0	45	chr3	38603326	38603393	-120996390	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	3174	3237	-1	1
879	1132	208	87	43	chr3	38603394	38603787	-120995996	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
879	2175	132	3	6	chr3	38606456	38606784	-120992999	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
879	1889	102	150	6	chr3	38609186	38609520	-120990263	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	5	1
879	1865	157	74	48	chr3	38609521	38609915	-120989868	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	1106	1
879	1032	212	10	5	chr3	38613576	38613780	-120986003	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1131	1335	-4187	1
879	331	206	102	10	chr3	38613835	38613933	-120985850	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7020	7126	-1833	1
879	1494	222	79	52	chr3	38616155	38616559	-120983224	-	RLTR41	LTR	ERV1	-29	417	3	1
879	1258	244	96	82	chr3	38616589	38617223	-120982560	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2183	2825	-3312	1
879	981	233	9	97	chr3	38617243	38617585	-120982198	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	312	-98	1
879	1204	270	97	111	chr3	38617904	38618056	-120981727	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3524	3661	-2476	1
879	1204	270	97	111	chr3	38618136	38618946	-120980837	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3662	4471	-1666	1
879	319	320	63	24	chr3	38619513	38619718	-120980065	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7304	7516	-262	1
879	441	288	40	8	chr3	38620350	38620476	-120979307	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	269	1
879	2436	196	53	80	chr3	38620788	38621376	-120978407	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	3	1
879	782	255	0	12	chr3	38621377	38621544	-120978239	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-25	4974	4810	1
879	1972	226	15	15	chr3	38621589	38621989	-120977794	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-292	4707	4308	1
879	2328	172	10	18	chr3	38623604	38624001	-120975782	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
879	1045	231	40	0	chr3	38624576	38624801	-120974982	+	MTD	LTR	MaLR	186	419	0	1
879	2800	148	41	0	chr3	38632647	38633087	-120966696	-	RMER6B	LTR	ERVK	-3	458	1	1
879	2073	86	4	0	chr3	38633525	38633803	-120965980	+	ORR1A2	LTR	MaLR	49	327	0	1
879	2127	151	29	6	chr3	38636346	38636692	-120963091	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	14	1
879	1008	187	134	24	chr3	38637437	38637727	-120962056	-	RLTR15	LTR	ERVK	-37	322	1	1
879	860	276	139	8	chr3	38638597	38638932	-120960851	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	349	-10	1
879	3146	43	52	0	chr3	38645787	38646156	-120953627	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	1
879	1715	167	82	36	chr3	38652450	38652842	-120946941	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
879	2702	131	5	8	chr3	38655986	38656378	-120943405	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-3	391	1	2
880	1374	239	15	30	chr3	38668162	38668499	-120931284	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-42	332	1	2
880	1015	284	47	18	chr3	38673375	38673716	-120926067	+	MTEb	LTR	MaLR	16	366	-13	2
880	1384	260	161	7	chr3	38677757	38678155	-120921628	+	MT2A	LTR	ERVL	3	468	-65	2
880	1384	260	161	7	chr3	38678178	38678239	-120921544	+	MT2A	LTR	ERVL	469	532	-1	2
880	744	244	149	48	chr3	38678411	38678700	-120921083	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	60	2
880	1656	182	118	37	chr3	38680440	38680822	-120918961	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	2
880	574	259	63	41	chr3	38685674	38685944	-120913839	-	RMER15	LTR	ERVL	-19	556	281	2
880	5820	143	45	23	chr3	38685995	38687065	-120912718	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6474	7566	-1393	2
880	1451	150	197	8	chr3	38687103	38687459	-120912324	+	RMER6A	LTR	ERVK	334	756	0	2
880	450	195	57	33	chr3	38687459	38687581	-120912202	-	RMER15	LTR	ERVL	-450	125	1	2
880	1923	141	10	13	chr3	38691550	38691860	-120907923	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	2
880	240	379	42	37	chr3	38692775	38692964	-120906819	-	LTR40a	LTR	ERVL	-324	195	6	2
880	832	243	24	19	chr3	38695887	38696097	-120903686	+	ORR1E	LTR	MaLR	39	249	-110	2
880	262	284	126	10	chr3	38696656	38696759	-120903024	+	LTR16C	LTR	ERVL	374	488	-1	2
880	2009	179	27	17	chr3	38696953	38697356	-120902427	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
880	963	262	101	18	chr3	38698834	38699160	-120900623	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	27	2
880	346	309	9	18	chr3	38700084	38700196	-120899587	+	MTEa	LTR	MaLR	21	131	-248	2
880	601	301	14	73	chr3	38701895	38702114	-120897669	+	MTE-int	LTR	MaLR	248	453	-1127	2
880	1419	190	43	37	chr3	38702199	38702274	-120897509	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	378	2
880	2866	33	62	0	chr3	38702274	38702610	-120897173	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	2
880	1419	190	43	37	chr3	38702610	38702834	-120896949	-	RLTR41	LTR	ERV1	-69	377	145	2
880	845	138	35	75	chr3	38702870	38703043	-120896740	-	RLTR41	LTR	ERV1	-280	166	1	2
880	443	215	87	106	chr3	38704383	38704591	-120895192	+	ORR1E	LTR	MaLR	18	221	-138	2
880	1192	228	10	20	chr3	38707853	38708153	-120891630	+	MTE2b	LTR	MaLR	70	366	-13	2
880	294	242	29	108	chr3	38708924	38709026	-120890757	+	MTEa	LTR	MaLR	220	313	-66	2
880	658	268	126	55	chr3	38710176	38710524	-120889259	+	RMER13A	LTR	ERVK	81	453	-407	2
880	688	282	51	20	chr3	38715053	38715306	-120884477	-	MTD	LTR	MaLR	-150	269	9	2
880	3245	32	24	29	chr3	38715457	38715870	-120883913	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	2
880	455	194	256	17	chr3	38717628	38717809	-120881974	-	RMER4B	LTR	ERVK	-18	567	343	2
880	1485	145	30	49	chr3	38717991	38718296	-120881487	-	RMER4B	LTR	ERVK	-286	299	1	2
880	427	283	91	0	chr3	38721940	38722170	-120877613	-	LTR37B	LTR	ERV1	-11	457	207	2
880	4889	123	34	6	chr3	38726200	38726917	-120872866	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	2
880	376	358	20	20	chr3	38727358	38727606	-120872177	+	RMER15	LTR	ERVL	274	521	-54	2
880	2218	150	45	91	chr3	38730113	38730554	-120869229	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
880	2171	196	136	116	chr3	38730554	38730739	-120869044	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1098	943	2
880	2171	196	136	116	chr3	38730879	38730919	-120868864	-	MTC-int	LTR	MaLR	-156	942	940	2
880	2244	179	101	69	chr3	38731109	38731599	-120868184	-	MTC-int	LTR	MaLR	-159	939	382	2
880	2244	162	66	21	chr3	38731650	38731886	-120867897	-	MTC-int	LTR	MaLR	-874	384	123	2
880	1582	189	72	0	chr3	38731875	38732193	-120867590	-	MTC	LTR	MaLR	-80	341	1	2
880	1450	213	76	25	chr3	38741393	38741749	-120858034	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
880	965	291	52	16	chr3	38742852	38743168	-120856615	-	MTE2a	LTR	MaLR	-17	362	53	3
880	1092	221	84	137	chr3	38744534	38744928	-120854855	+	MTEa	LTR	MaLR	1	373	-6	3
880	3014	223	46	51	chr3	38749691	38750499	-120849284	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2390	3193	-2944	3
880	1907	202	65	59	chr3	38750656	38751161	-120848622	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3524	4031	-2106	3
880	1683	156	43	51	chr3	38751210	38751561	-120848222	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4034	4381	-1756	3
880	1172	281	12	31	chr3	38755677	38756004	-120843779	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	321	-58	3
880	1724	137	0	10	chr3	38756298	38756594	-120843189	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	293	-66	3
880	1218	253	53	23	chr3	38757796	38758167	-120841616	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	3
880	919	314	62	3	chr3	38758966	38759286	-120840497	-	MTEa	LTR	MaLR	-14	365	27	3
880	3469	34	56	2	chr3	38760537	38760951	-120838832	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	3
880	1535	138	17	55	chr3	38762848	38763193	-120836590	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	122	3
880	631	156	55	0	chr3	38764565	38764693	-120835090	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-318	135	1	3
880	3569	13	5	0	chr3	38764930	38765324	-120834459	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
880	8526	49	2	69	chr3	38765324	38766501	-120833282	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
880	3557	13	5	0	chr3	38766501	38766895	-120832888	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
880	738	180	87	35	chr3	38770113	38770276	-120829507	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	213	3
880	2369	119	6	3	chr3	38770276	38770638	-120829145	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	1	363	-751	3
880	1427	177	85	25	chr3	38770633	38770952	-120828831	+	ORR1B2	LTR	MaLR	29	366	-1	3
880	2163	183	14	30	chr3	38775691	38776119	-120823664	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
880	1210	244	22	110	chr3	38777132	38777533	-120822250	+	MTE2a	LTR	MaLR	14	379	0	3
880	960	275	82	12	chr3	38778493	38778824	-120820959	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	359	0	3
880	552	298	105	18	chr3	38780188	38780407	-120819376	-	ORR1E	LTR	MaLR	-116	243	6	3
880	928	291	67	26	chr3	38780484	38780830	-120818953	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	18	3
880	804	280	111	14	chr3	38781189	38781486	-120818297	-	MTD	LTR	MaLR	-91	328	3	3
880	810	238	246	10	chr3	38794362	38794651	-120805132	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	3
880	2940	45	55	16	chr3	38795338	38795719	-120804064	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
881	522	264	109	11	chr3	38802998	38803182	-120796601	+	MTD	LTR	MaLR	1	202	-217	4
881	907	267	72	46	chr3	38804984	38805331	-120794452	+	MTD	LTR	MaLR	46	379	0	4
881	1711	165	91	18	chr3	38814018	38814358	-120785425	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	3	4
881	968	210	43	35	chr3	38819467	38819699	-120780084	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-69	305	72	4
881	232	130	17	85	chr3	38842312	38842371	-120757412	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	-652	170	116	4
881	815	268	63	102	chr3	38859116	38859510	-120740273	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	4
881	1536	228	65	19	chr3	38859724	38860095	-120739688	+	MTD	LTR	MaLR	18	405	-14	4
881	2190	161	172	69	chr3	38862340	38862757	-120737026	-	MT2B	LTR	ERVL	-8	593	122	4
881	2190	161	172	69	chr3	38862791	38862907	-120736876	-	MT2B	LTR	ERVL	-480	121	5	4
881	315	276	47	5	chr3	38863563	38863756	-120736027	-	RMER17C	LTR	ERVK	-133	277	77	4
881	331	300	53	91	chr3	38871124	38871493	-120728290	-	ORR1E	LTR	MaLR	-20	359	24	5
881	597	238	49	7	chr3	38884661	38884805	-120714978	-	MTEb	LTR	MaLR	-113	266	117	5
881	774	243	215	4	chr3	38889446	38889706	-120710077	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	63	5
881	2260	207	164	30	chr3	38915785	38916322	-120683461	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	609	-2	5
881	443	286	34	45	chr3	38916373	38916609	-120683174	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
881	876	215	69	41	chr3	38920279	38920497	-120679286	+	MTE2a	LTR	MaLR	152	375	-4	5
881	1403	140	9	0	chr3	38923047	38923269	-120676514	+	BGLII	LTR	ERVK	194	417	-4	5
881	1700	81	12	8	chr3	38923265	38923515	-120676268	-	BGLII	LTR	ERVK	-170	251	1	5
882	517	299	109	92	chr3	38934097	38934533	-120665250	-	RMER20B	LTR	ERVK	-89	427	3	5
882	827	324	47	83	chr3	38940223	38940473	-120659310	-	MLT1D	LTR	MaLR	-1	504	276	5
882	827	324	47	83	chr3	38940688	38940905	-120658878	-	MLT1D	LTR	MaLR	-230	275	54	5
882	385	338	62	98	chr3	38943303	38943641	-120656142	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	328	-31	5
882	450	261	155	42	chr3	38953783	38953951	-120645832	+	MLT1A	LTR	MaLR	5	191	-174	5
882	3064	27	117	0	chr3	38963095	38963463	-120636320	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	6
882	3445	21	36	16	chr3	38963580	38963968	-120635815	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
882	424	287	35	14	chr3	38969231	38969376	-120630407	-	RMER5	LTR	ERV1	-18	516	369	6
882	2325	239	80	108	chr3	38971256	38972107	-120627676	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	827	-131	6
882	3226	66	5	25	chr3	38974903	38975307	-120624476	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
882	255	355	119	76	chr3	38975985	38976287	-120623496	-	ORR1E	LTR	MaLR	-42	317	3	6
882	225	286	119	0	chr3	38976793	38976877	-120622906	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	95	-372	6
882	471	340	74	42	chr3	38977501	38977811	-120621972	+	MLT1B	LTR	MaLR	64	383	-7	6
882	1221	300	18	31	chr3	38980869	38981251	-120618532	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	6
882	1196	293	63	13	chr3	38981254	38981634	-120618149	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	3	401	-1179	6
882	2304	277	155	16	chr3	38981702	38982516	-120617267	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	654	1580	0	6
882	354	260	60	0	chr3	38982786	38982886	-120616897	+	MTE2b	LTR	MaLR	9	114	-265	6
882	1654	168	77	71	chr3	38982897	38983262	-120616521	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
882	916	323	70	21	chr3	38983740	38984123	-120615660	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	6
882	573	298	131	67	chr3	38991293	38991670	-120608113	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	453	-75	6
882	2426	114	3	18	chr3	38991670	38992001	-120607782	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	326	-1	6
882	573	298	131	67	chr3	38992001	38992044	-120607739	+	RLTR12B	LTR	ERVK	454	494	-34	6
882	508	185	0	11	chr3	38995338	38995431	-120604352	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	330	6
882	989	220	38	33	chr3	38995444	38995684	-120604099	-	MTC	LTR	MaLR	-180	241	1	6
882	2271	132	0	3	chr3	38999148	38999460	-120600323	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	6
882	893	293	83	13	chr3	39004526	39004843	-120594940	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	421	22	6
882	3059	73	8	0	chr3	39014443	39014840	-120584943	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
882	1725	166	104	18	chr3	39014840	39015168	-120584615	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-7	387	29	2
882	2064	184	24	8	chr3	39015807	39016185	-120583598	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	2
882	3430	23	5	0	chr3	39022272	39022666	-120577117	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
882	1461	233	86	78	chr3	39024676	39024697	-120575086	+	RMER19C	LTR	ERVK	2	22	-589	4
882	1461	233	86	78	chr3	39024732	39025315	-120574468	+	RMER19C	LTR	ERVK	23	611	0	4
882	772	254	26	52	chr3	39025833	39026024	-120573759	+	RMER19C	LTR	ERVK	152	337	-274	4
882	730	286	173	13	chr3	39029352	39029653	-120570130	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	352	-7	5
882	340	152	17	0	chr3	39032391	39032450	-120567333	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	360	5
882	1468	212	141	62	chr3	39038478	39038966	-120560817	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	6
882	266	297	100	40	chr3	39041862	39042075	-120557708	+	RMER4A	LTR	ERVK	7	224	-361	7
882	488	353	53	64	chr3	39045699	39046074	-120553709	-	LTR16A	LTR	ERVL	-80	371	1	8
882	275	242	59	29	chr3	39047709	39047811	-120551972	+	MMETn-int	LTR	ERVK	4366	4470	-374	8
882	1302	245	118	0	chr3	39050867	39051214	-120548569	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	9
883	2993	90	25	15	chr3	39072899	39073306	-120526477	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	1
883	1598	108	24	28	chr3	39073308	39073555	-120526228	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	304	549	-1438	1
883	356	345	31	25	chr3	39073597	39073918	-120525865	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	203	525	-6017	1
883	1080	128	21	38	chr3	39074012	39074198	-120525585	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	810	992	-995	1
883	5151	312	48	38	chr3	39074338	39077574	-120522209	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	822	4088	-2454	1
883	2040	231	37	48	chr3	39077693	39078688	-120521095	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	983	1277	-710	1
883	4739	103	45	19	chr3	39078796	39079491	-120520292	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	1274	1986	-1	1
883	2982	86	40	5	chr3	39079491	39079888	-120519895	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	1
883	290	252	75	0	chr3	39080950	39081057	-120518726	+	MER57D	LTR	ERV1	293	407	-4	1
883	768	309	84	42	chr3	39091951	39092285	-120507498	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	355	-4	1
883	2220	203	19	75	chr3	39093492	39094029	-120505754	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-56	521	15	1
883	399	288	121	36	chr3	39094841	39095133	-120504650	+	MLT1B	LTR	MaLR	8	355	-35	1
883	480	257	90	69	chr3	39106010	39106198	-120493585	-	MTE2a	LTR	MaLR	-39	340	149	1
883	1685	244	37	32	chr3	39112220	39112232	-120487551	+	MTD	LTR	MaLR	2	13	-406	1
883	1685	244	37	32	chr3	39112259	39112648	-120487135	+	MTD	LTR	MaLR	14	405	-14	1
883	566	325	90	78	chr3	39113523	39113585	-120486198	+	MTE2a	LTR	MaLR	13	72	-349	1
883	1781	174	40	23	chr3	39113585	39113938	-120485845	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	1
883	610	296	83	68	chr3	39113938	39114275	-120485508	+	MTE2a	LTR	MaLR	60	404	-17	1
883	2518	207	59	48	chr3	39114738	39115398	-120484385	-	RMER6C	LTR	ERVK	-15	675	9	1
883	1536	224	66	36	chr3	39124438	39124803	-120474980	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	376	-8	1
883	1130	112	22	22	chr3	39131952	39132135	-120467648	+	ORR1B1	LTR	MaLR	210	392	-2	1
883	240	186	47	0	chr3	39144737	39144780	-120455003	+	MLT2B2	LTR	ERVL	395	439	-123	1
883	1708	251	79	20	chr3	39155872	39156322	-120443461	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	470	-107	2
883	1708	251	79	20	chr3	39156368	39156462	-120443321	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	471	576	-1	2
883	3064	226	85	80	chr3	39157502	39158082	-120441701	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	433	2
883	3064	226	85	80	chr3	39158144	39158243	-120441540	-	RMER17B	LTR	ERVK	-526	432	307	2
883	3064	226	85	80	chr3	39158312	39158584	-120441199	-	RMER17B	LTR	ERVK	-652	306	2	2
883	280	347	31	10	chr3	39159583	39159679	-120440104	+	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	347	444	-369	2
883	1818	180	16	80	chr3	39160813	39161198	-120438585	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
883	1782	119	27	126	chr3	39161351	39161716	-120438067	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
883	1848	186	93	0	chr3	39161984	39162338	-120437445	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	8	2
883	6198	194	47	12	chr3	39162345	39163666	-120436117	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	143	2
883	760	299	47	23	chr3	39167271	39167572	-120432211	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	227	2
883	532	333	67	45	chr3	39167579	39167846	-120431937	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	300	2
883	2506	153	208	4	chr3	39168246	39168798	-120430985	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	665	-25	2
883	1467	172	75	39	chr3	39172310	39172643	-120427140	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	23	2
883	7180	172	26	104	chr3	39183993	39185101	-120414682	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1064	-508	2
883	7180	172	26	104	chr3	39185150	39185325	-120414458	+	RLTR21	LTR	ERVK	1065	1204	-368	2
883	7180	172	26	104	chr3	39185389	39185809	-120413974	+	RLTR21	LTR	ERVK	1205	1572	0	2
884	954	328	38	18	chr3	39196478	39196872	-120402911	-	RMER5	LTR	ERV1	-7	527	126	2
884	281	262	78	135	chr3	39201134	39201275	-120398508	+	MTEa	LTR	MaLR	52	184	-195	2
884	1783	346	37	28	chr3	39202231	39203498	-120396285	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	124	1402	-4312	2
884	453	279	145	22	chr3	39203592	39203615	-120396168	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2040	3717	3694	2
884	453	296	153	16	chr3	39203648	39203928	-120395855	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2064	3693	3259	2
884	353	181	93	2	chr3	39204062	39204171	-120395612	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5594	5740	-17	2
884	226	285	80	58	chr3	39204256	39204394	-120395389	+	MLT2B3	LTR	ERVL	73	213	-341	2
884	375	346	20	50	chr3	39205588	39205786	-120393997	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	192	-167	2
884	2198	158	29	3	chr3	39210033	39210415	-120389368	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	2
884	1141	174	27	89	chr3	39210561	39210820	-120388963	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	144	2
884	560	310	90	123	chr3	39222090	39222480	-120377303	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	3	2
884	227	378	55	40	chr3	39224030	39224231	-120375552	+	MLT1C	LTR	MaLR	259	462	-5	2
884	286	299	17	93	chr3	39237043	39237161	-120362622	+	MT2B	LTR	ERVL	163	271	-330	3
884	241	385	108	15	chr3	39242452	39242721	-120357062	+	MLT1D	LTR	MaLR	89	382	-123	3
884	281	198	0	129	chr3	39251738	39251831	-120347952	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-501	602	522	3
884	421	232	0	97	chr3	39251750	39251874	-120347909	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	167	3
884	473	312	96	52	chr3	39255652	39256017	-120343766	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-13	384	4	3
884	256	301	79	67	chr3	39272381	39272545	-120327238	+	MLT1A1	LTR	MaLR	155	320	-88	3
884	1331	255	30	40	chr3	39277744	39278148	-120321635	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	20	3
884	2963	252	93	63	chr3	39278159	39279142	-120320641	-	MTD-int	LTR	MaLR	-3	1255	244	3
884	443	297	89	26	chr3	39279300	39279490	-120320293	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-244	1143	942	3
884	2696	214	31	11	chr3	39280489	39281043	-120318740	+	RMER15	LTR	ERVL	6	570	-5	3
884	432	344	103	66	chr3	39283887	39284189	-120315594	+	RMER20B	LTR	ERVK	90	402	-225	3
884	2004	180	33	23	chr3	39286256	39286653	-120313130	+	MTC	LTR	MaLR	1	401	-20	3
884	393	305	67	17	chr3	39292673	39292853	-120306930	-	RMER12	LTR	ERVK	-355	967	779	3
884	252	317	56	48	chr3	39312062	39312188	-120287595	+	LTR40b	LTR	ERVL	133	259	-203	4
884	1096	298	41	14	chr3	39312419	39312763	-120287020	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	19	4
884	1182	254	103	6	chr3	39315556	39315877	-120283906	+	MT2A	LTR	ERVL	20	371	-162	4
884	356	263	188	0	chr3	39319858	39319991	-120279792	+	MT2A	LTR	ERVL	376	533	0	4
884	268	336	31	15	chr3	39320424	39320554	-120279229	+	MLT1A1	LTR	MaLR	277	408	0	4
884	2823	40	108	0	chr3	39321060	39321431	-120278352	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	4
885	353	301	211	32	chr3	39322827	39323155	-120276628	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	365	24	4
885	301	75	13	141	chr3	39329628	39329706	-120270077	+	MT2B2	LTR	ERVL	517	584	0	4
885	461	285	16	31	chr3	39334259	39334386	-120265397	-	RMER20B	LTR	ERVK	-502	125	1	4
885	1498	164	216	3	chr3	39335428	39335747	-120264036	+	ORR1B1	LTR	MaLR	6	392	-2	4
885	2511	196	125	15	chr3	39337642	39338244	-120261539	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2830	2931	2264	4
885	2299	67	26	6	chr3	39344938	39345255	-120254528	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-17	310	1	4
885	7419	231	19	25	chr3	39345255	39347162	-120252621	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-20	6801	4906	4
885	1790	75	4	0	chr3	39347159	39347398	-120252385	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2258	4
885	3938	108	65	19	chr3	39347460	39348295	-120251488	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-288	1182	1	4
885	2222	83	25	9	chr3	39348302	39348617	-120251166	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-7	320	1	4
885	443	317	28	42	chr3	39354407	39354621	-120245162	-	RMER15	LTR	ERVL	-65	510	300	4
885	246	221	59	96	chr3	39355347	39355477	-120244306	-	LTR37B	LTR	ERV1	-5	463	296	4
885	274	196	18	0	chr3	39356395	39356451	-120243332	-	LTR37B	LTR	ERV1	-213	255	199	4
885	3020	115	10	27	chr3	39356898	39357380	-120242403	+	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	3	476	-81	4
885	1075	297	62	3	chr3	39360891	39361198	-120238585	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-30	340	16	4
885	225	316	143	50	chr3	39361215	39361355	-120238428	+	MLT1A	LTR	MaLR	186	338	-36	4
885	1175	274	61	33	chr3	39363326	39363685	-120236098	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	3	4
885	784	312	108	19	chr3	39367251	39367623	-120232160	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	4
885	2102	135	3	3	chr3	39368588	39368899	-120230884	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	4
885	26491	91	5	3	chr3	39368899	39372997	-120226786	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7680	3552	4
885	1586	68	307	4	chr3	39372993	39373251	-120226532	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4515	3066	2730	4
885	4109	82	0	7	chr3	39373249	39373814	-120225969	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5136	2445	1885	4
885	376	185	123	0	chr3	39373805	39373886	-120225897	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5109	1028	938	4
885	2118	164	74	40	chr3	39373891	39374722	-120225061	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6709	872	313	4
885	1290	119	5	0	chr3	39374819	39375020	-120224763	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7155	426	225	4
885	256	259	0	18	chr3	39375020	39375075	-120224708	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	222	4
885	660	97	0	0	chr3	39375075	39375168	-120224615	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7488	93	1	4
885	2001	142	3	6	chr3	39375168	39375480	-120224303	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	4
885	231	336	9	35	chr3	39376794	39376908	-120222875	+	MTEa	LTR	MaLR	192	302	-77	4
885	258	238	16	0	chr3	39377190	39377253	-120222530	-	RMER15	LTR	ERVL	-154	421	358	5
885	1585	194	102	0	chr3	39380208	39380341	-120219442	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	970	5
885	1585	194	102	0	chr3	39380460	39380547	-120219236	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-134	969	850	5
885	1585	194	102	0	chr3	39380583	39380732	-120219051	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-254	849	697	5
885	236	289	30	92	chr3	39391795	39391959	-120207824	-	RMER12	LTR	ERVK	-472	850	697	5
885	2059	177	51	0	chr3	39399878	39400251	-120199532	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	5
885	1859	176	194	96	chr3	39404311	39404939	-120194844	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	5
885	226	285	187	30	chr3	39405316	39405450	-120194333	+	MLT2B3	LTR	ERVL	115	269	-285	5
885	842	239	74	13	chr3	39413864	39414245	-120185538	+	MT2A	LTR	ERVL	82	533	0	5
885	743	151	35	106	chr3	39415398	39415568	-120184215	-	RMER19B	LTR	ERVK	-6	896	739	5
885	805	64	102	16	chr3	39415593	39415720	-120184063	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	614	5
885	3022	57	34	0	chr3	39415721	39416104	-120183679	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
885	8739	55	3	1	chr3	39416104	39417200	-120182583	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
885	2544	77	9	0	chr3	39417200	39417539	-120182244	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	342	-54	5
885	479	117	4	14	chr3	39417564	39417651	-120182132	-	RMER19B	LTR	ERVK	-132	770	711	5
885	379	225	14	0	chr3	39417645	39417716	-120182067	+	RLTR20D	LTR	ERVK	497	568	0	5
885	503	280	63	34	chr3	39432757	39433036	-120166747	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	376	6	5
885	2431	268	95	38	chr3	39440599	39441356	-120158427	-	RMER13A	LTR	ERVK	-45	815	16	5
885	4403	16	2	0	chr3	39445388	39445880	-120153903	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
885	302	0	0	0	chr3	39445880	39445918	-120153865	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
885	379	179	46	35	chr3	39445918	39446005	-120153778	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	5
885	45306	15	6	0	chr3	39446005	39451330	-120148453	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	2	5
885	4403	16	2	0	chr3	39451331	39451823	-120147960	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
886	273	330	124	35	chr3	39459224	39459450	-120140333	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-93	272	27	5
886	2192	225	5	66	chr3	39464760	39465349	-120134434	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	553	0	5
886	248	250	76	43	chr3	39466592	39466684	-120133099	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	265	5
886	6294	127	47	18	chr3	39467516	39468070	-120131713	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	515	-508	6
886	2228	161	10	24	chr3	39468070	39468485	-120131298	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	6
886	6294	116	45	18	chr3	39468555	39469007	-120130776	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	516	1006	-17	6
886	963	246	118	104	chr3	39479392	39479812	-120119971	-	MT2A	LTR	ERVL	-34	567	1	6
886	473	309	84	6	chr3	39481336	39481502	-120118281	+	MTD	LTR	MaLR	18	196	-223	6
886	407	187	68	41	chr3	39481704	39481822	-120117961	+	MTD	LTR	MaLR	300	421	0	6
886	666	319	39	19	chr3	39487634	39487890	-120111893	-	MTD	LTR	MaLR	-135	284	24	6
886	444	319	71	63	chr3	39493323	39493734	-120106049	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	414	-27	6
886	288	287	17	85	chr3	39499677	39499795	-120099988	-	MTEb	LTR	MaLR	-269	110	1	6
886	522	343	106	51	chr3	39520071	39520363	-120079420	+	MTD	LTR	MaLR	18	325	-94	2
886	272	325	5	0	chr3	39523600	39523685	-120076098	+	MTD	LTR	MaLR	290	407	-14	2
886	384	293	93	44	chr3	39539581	39539931	-120059852	+	MLT2B2	LTR	ERVL	3	430	-90	5
886	533	289	14	14	chr3	39544411	39544567	-120055216	+	MLT1A0	LTR	MaLR	208	406	-2	6
886	496	284	156	106	chr3	39549965	39550324	-120049459	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	7
886	2927	246	61	111	chr3	39551785	39552946	-120046837	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	1	8
886	2541	155	17	20	chr3	39554689	39555149	-120044634	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	459	-2	8
886	2050	172	81	15	chr3	39568657	39569052	-120030731	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
886	1127	267	94	14	chr3	39572830	39573180	-120026603	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	42	1
886	886	263	71	20	chr3	39574128	39574380	-120025403	+	ORR1E	LTR	MaLR	89	353	-6	1
886	1798	258	56	8	chr3	39576316	39576797	-120022986	+	RMER20A	LTR	ERVK	13	516	0	1
886	2822	176	161	14	chr3	39580225	39580882	-120018901	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	754	-2	1
887	1616	238	9	9	chr3	39586006	39586333	-120013450	+	MT2A	LTR	ERVL	1	327	-206	1
887	728	243	52	6	chr3	39610189	39610363	-119989420	+	MTD	LTR	MaLR	224	405	-14	1
887	429	212	19	116	chr3	39616520	39616563	-119983220	+	MT2B2	LTR	ERVL	125	152	-432	1
887	518	332	45	119	chr3	39617149	39617621	-119982162	-	MER67D	LTR	ERV1	-77	437	1	1
887	1909	145	65	68	chr3	39620353	39620708	-119979075	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	1
887	694	134	39	0	chr3	39626826	39626953	-119972830	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1115	1246	-1080	1
887	3160	204	65	49	chr3	39641235	39641796	-119957987	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	567	-250	2
887	3160	204	65	49	chr3	39641860	39642098	-119957685	+	RLTR40	LTR	ERVK	568	813	-4	2
887	1207	226	88	12	chr3	39645128	39645469	-119954314	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	368	-2	2
887	365	304	47	20	chr3	39658408	39658556	-119941227	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	161	-204	2
887	1958	120	174	36	chr3	39669585	39669941	-119929842	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	2
887	918	205	82	10	chr3	39676096	39676303	-119923480	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	222	-137	2
887	245	331	177	61	chr3	39676560	39676888	-119922895	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	9	2
887	524	335	40	0	chr3	39681322	39681495	-119918288	+	MT2A	LTR	ERVL	282	461	-72	2
887	1993	173	6	0	chr3	39681521	39681850	-119917933	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	331	-63	2
887	3188	50	25	0	chr3	39686438	39686839	-119912944	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	2
887	4282	84	63	15	chr3	39686839	39687506	-119912277	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1	1986	1288	2
887	1591	57	0	0	chr3	39687507	39687718	-119912065	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-658	5884	5674	2
887	3423	64	78	12	chr3	39687730	39688219	-119911564	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1015	5527	5007	2
887	325	161	0	0	chr3	39688220	39688276	-119911507	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6040	502	447	2
887	429	308	24	24	chr3	39688295	39688548	-119911235	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-5481	1061	847	2
887	4886	67	24	9	chr3	39688713	39689392	-119910391	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-995	992	304	2
887	3086	60	28	0	chr3	39689394	39689794	-119909989	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	2
887	3329	174	36	32	chr3	39690101	39690250	-119909533	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	155	-535	2
887	3628	55	4	108	chr3	39690972	39691526	-119908257	+	RLTR44C	LTR	ERVK	3	498	-4	2
887	3329	174	36	32	chr3	39691850	39692387	-119907396	+	RMER6C	LTR	ERVK	156	690	0	2
887	269	388	6	30	chr3	39694416	39694581	-119905202	+	LTR16E1	LTR	ERVL	338	498	-40	2
887	452	184	20	10	chr3	39698938	39699037	-119900746	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	146	-382	2
888	2936	156	25	67	chr3	39727036	39727587	-119872196	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	3
888	1056	233	97	50	chr3	39729594	39729956	-119869827	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	3
888	771	84	0	9	chr3	39740550	39740658	-119859125	+	LTRIS2	LTR	ERV1	379	485	-79	3
888	3798	45	20	12	chr3	39742738	39743230	-119856553	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	69	3
888	798	253	76	41	chr3	39744916	39745233	-119854550	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	328	-31	3
888	293	280	40	13	chr3	39745404	39745480	-119854303	-	MLT1D	LTR	MaLR	-125	380	303	3
888	555	301	118	88	chr3	39745983	39746383	-119853400	+	RMER13A	LTR	ERVK	55	466	-394	3
888	316	346	73	49	chr3	39754671	39754800	-119844983	+	MLT-int	LTR	MaLR	1484	1622	-113	3
888	316	346	73	49	chr3	39755181	39755297	-119844486	+	MLT-int	LTR	MaLR	1623	1734	-1	3
888	250	302	45	34	chr3	39755528	39755617	-119844166	+	MLT1A0	LTR	MaLR	268	357	-8	3
888	5642	118	68	30	chr3	39764678	39766085	-119833698	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-1409	1890	1159	3
888	3602	28	5	0	chr3	39774704	39775098	-119824685	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
888	4685	12	0	12	chr3	39776038	39776537	-119823246	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
888	47703	13	0	0	chr3	39776537	39781908	-119817875	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5371	-114	3
888	397	123	13	40	chr3	39781908	39781984	-119817799	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	3
888	322	0	0	0	chr3	39781984	39782022	-119817761	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
888	4730	8	0	12	chr3	39782022	39782521	-119817262	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
888	1981	129	12	56	chr3	39782682	39783019	-119816764	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
888	1335	259	6	52	chr3	39790563	39790925	-119808858	+	MTEa	LTR	MaLR	22	366	-13	3
888	292	264	28	0	chr3	39797366	39797438	-119802345	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-546	81	8	4
888	484	321	122	28	chr3	39799525	39799852	-119799931	+	LTR52	LTR	ERVL	5	362	-59	4
888	1250	251	74	33	chr3	39799905	39800271	-119799512	+	MTD	LTR	MaLR	10	390	-29	4
888	269	261	161	11	chr3	39805280	39805373	-119794410	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-63	493	387	4
888	6221	143	29	4	chr3	39806129	39807064	-119792719	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	4
888	2156	114	98	28	chr3	39809860	39810248	-119789535	-	RLTR9F	LTR	ERVK	0	415	1	4
888	236	287	138	62	chr3	39811640	39811785	-119787998	+	LTR16C	LTR	ERVL	135	290	-199	4
888	3900	120	62	18	chr3	39820949	39821656	-119778127	-	RMER17A	LTR	ERVK	-13	738	1	4
888	3943	174	63	1	chr3	39827578	39828230	-119771553	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	4
888	3241	203	25	34	chr3	39828257	39829016	-119770767	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-30	2812	2061	4
888	837	231	58	9	chr3	39829034	39829257	-119770526	-	LTRIS4	LTR	ERV1	0	507	274	4
888	2764	226	65	63	chr3	39829549	39830604	-119769179	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-788	2054	997	4
888	1294	144	45	9	chr3	39832695	39832919	-119766864	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	232	-127	4
888	1951	177	28	18	chr3	39833290	39833682	-119766101	+	RLTR16	LTR	ERVK	110	505	0	4
888	2375	132	17	27	chr3	39834969	39835382	-119764401	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	4
888	2015	95	25	19	chr3	39836133	39836455	-119763328	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	6	4
888	867	220	270	109	chr3	39837655	39838114	-119761669	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	4
888	543	200	97	32	chr3	39841577	39841732	-119758051	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	369	4
889	1947	220	8	176	chr3	39854442	39855176	-119744607	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
889	1066	197	38	0	chr3	39855176	39855389	-119744394	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	1	221	-5559	4
889	3283	158	11	31	chr3	39856060	39856864	-119742919	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	658	1554	-4226	4
889	6139	134	32	13	chr3	39857207	39858276	-119741507	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	1643	2731	-3049	4
889	1366	150	29	0	chr3	39858416	39858656	-119741127	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	2713	2959	-2821	4
889	574	198	24	47	chr3	39858656	39858783	-119741000	+	RMER19B	LTR	ERVK	776	899	-3	4
889	243	169	50	17	chr3	39867667	39867727	-119732056	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	358	4
889	1043	261	71	45	chr3	39873071	39873424	-119726359	-	MTD	LTR	MaLR	-57	362	1	4
889	1195	245	14	112	chr3	39874359	39874576	-119725207	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	192	-218	5
889	1195	245	14	112	chr3	39874636	39874837	-119724946	+	RMER17C	LTR	ERVK	193	378	-32	5
889	1337	209	50	83	chr3	39874991	39875384	-119724399	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	225	601	-2637	5
889	1337	209	50	83	chr3	39875420	39875448	-119724335	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	602	631	-2607	5
889	3645	164	15	56	chr3	39875980	39876731	-119723052	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1096	1815	-1423	5
889	305	267	88	11	chr3	39877450	39877541	-119722242	-	RMER10A	LTR	ERVL	-27	415	318	5
889	612	300	32	40	chr3	39878744	39878997	-119720786	-	RMER15	LTR	ERVL	-13	562	312	5
889	915	295	65	30	chr3	39879051	39879404	-119720379	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-138	343	3	5
889	1795	160	205	19	chr3	39879638	39880014	-119719769	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	5
889	1072	253	32	100	chr3	39880242	39880327	-119719456	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	85	-325	5
889	1072	253	32	100	chr3	39880362	39880685	-119719098	+	RMER17C	LTR	ERVK	86	381	-29	5
889	1366	157	48	28	chr3	39886119	39886531	-119713252	-	RMER17C	LTR	ERVK	-519	439	16	5
889	1536	248	70	46	chr3	39890750	39891291	-119708492	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	24	5
889	1440	217	80	104	chr3	39900840	39901242	-119698541	+	RMER15	LTR	ERVL	1	392	-183	5
889	1565	188	176	0	chr3	39902156	39902491	-119697292	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
889	2119	165	31	5	chr3	39903141	39903525	-119696258	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
889	233	328	82	53	chr3	39903732	39904051	-119695732	+	ORR1E	LTR	MaLR	32	359	0	5
889	462	273	14	121	chr3	39904808	39905023	-119694760	-	RMER21A	LTR	ERV1	-369	578	268	5
889	284	231	15	0	chr3	39904991	39905056	-119694727	-	RMER21A	LTR	ERV1	-482	465	400	5
889	1609	221	62	10	chr3	39906222	39906607	-119693176	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	13	5
889	1458	198	86	33	chr3	39910341	39910377	-119689406	-	RLTR14	LTR	ERV1	-2	380	329	5
889	1458	198	86	33	chr3	39910441	39910765	-119689018	-	RLTR14	LTR	ERV1	-54	328	1	5
889	481	342	53	64	chr3	39912468	39912827	-119686956	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	1	5
889	501	307	196	13	chr3	39913891	39914208	-119685575	+	MTEa	LTR	MaLR	5	379	0	5
889	502	292	103	58	chr3	39917953	39918313	-119681470	+	MTEa	LTR	MaLR	4	379	0	5
889	1537	210	64	22	chr3	39918495	39918855	-119680928	+	MTD	LTR	MaLR	1	375	-44	5
889	361	200	63	21	chr3	39919732	39919875	-119679908	-	RLTR21	LTR	ERVK	-264	1308	1160	5
889	492	213	57	0	chr3	39927188	39927310	-119672473	+	MLT1C	LTR	MaLR	8	136	-331	5
889	332	270	82	64	chr3	39930126	39930382	-119669401	+	ORR1E	LTR	MaLR	96	371	-8	5
889	1423	236	25	3	chr3	39933719	39934033	-119665750	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	255	5
889	453	278	42	56	chr3	39940928	39941162	-119658621	+	MLT1A	LTR	MaLR	57	374	0	6
889	1080	254	55	11	chr3	39945478	39945749	-119654034	+	RMER19B	LTR	ERVK	348	630	-272	6
889	478	259	39	9	chr3	39946246	39946405	-119653378	+	MLT1J2	LTR	MaLR	32	197	-247	6
889	1866	216	75	84	chr3	39959245	39959322	-119640461	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	485	6
889	1866	216	75	84	chr3	39959369	39959853	-119639930	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-93	484	23	6
889	521	365	93	59	chr3	39963033	39963476	-119636307	-	LTR16B2	LTR	ERVL	-2	460	3	6
889	368	277	171	70	chr3	39965822	39966191	-119633592	-	MER57D	LTR	ERV1	0	411	6	6
889	676	288	89	8	chr3	39970097	39970355	-119629428	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	241	6
890	1749	193	49	189	chr3	39997440	39998150	-119601633	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	6
890	2081	202	90	38	chr3	39998250	39998717	-119601066	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	470	-107	6
890	2081	202	90	38	chr3	39998765	39998831	-119600952	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	471	561	-16	6
890	1009	234	214	3	chr3	40002617	40002930	-119596853	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
890	3330	33	8	0	chr3	40016571	40016964	-119582819	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
890	365	376	112	35	chr3	40017936	40018195	-119581588	+	LTR16A	LTR	ERVL	12	290	-161	2
890	840	290	26	47	chr3	40020172	40020556	-119579227	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	376	-3	3
890	254	304	77	43	chr3	40025763	40025880	-119573903	+	RMER15	LTR	ERVL	369	489	-86	3
890	755	255	97	109	chr3	40032442	40032772	-119567011	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	291	5
890	259	231	0	0	chr3	40032770	40032822	-119566961	-	RLTR18	LTR	ERVK	-562	54	3	5
890	243	265	12	35	chr3	40043214	40043300	-119556483	+	MTE2a	LTR	MaLR	282	365	-14	6
890	3001	80	10	5	chr3	40060361	40060763	-119539020	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	404	-3	9
890	1047	245	85	65	chr3	40068115	40068455	-119531328	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	365	19	1
890	601	283	121	32	chr3	40068806	40068996	-119530787	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	207	-172	1
890	328	295	53	0	chr3	40069038	40069133	-119530650	+	MLT1B	LTR	MaLR	251	350	-40	1
890	831	172	23	105	chr3	40071718	40071937	-119527846	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	209	-201	1
890	831	224	32	51	chr3	40072117	40072358	-119527425	+	RMER17C	LTR	ERVK	82	313	-97	1
890	3158	28	8	0	chr3	40072846	40073233	-119526550	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-6	390	1	1
890	2159	121	12	3	chr3	40083041	40083364	-119516419	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
890	315	236	58	79	chr3	40093282	40093401	-119506382	+	MTEa	LTR	MaLR	256	376	-3	1
890	249	330	114	25	chr3	40098086	40098288	-119501495	-	LTR82A	LTR	ERVL	-328	544	325	1
890	345	280	110	0	chr3	40098631	40098749	-119501034	+	MTEa	LTR	MaLR	3	133	-246	1
890	289	358	0	31	chr3	40101749	40101847	-119497936	-	RMER20B	LTR	ERVK	-22	605	511	1
890	736	261	71	123	chr3	40101923	40102377	-119497406	-	RMER20B	LTR	ERVK	-129	498	18	1
890	342	316	40	11	chr3	40102970	40103146	-119496637	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3284	3464	-2203	1
890	447	257	107	37	chr3	40104439	40104686	-119495097	-	ORR1E	LTR	MaLR	-19	360	48	1
890	1054	275	119	6	chr3	40106332	40106669	-119493114	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	379	0	1
890	320	333	22	73	chr3	40107387	40107565	-119492218	+	LTR79	LTR	ERVL	261	429	-98	1
891	265	306	178	27	chr3	40112633	40112818	-119486965	+	MER77	LTR	ERVL	306	518	-89	1
891	3027	34	17	0	chr3	40118935	40119286	-119480497	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	1
891	1858	26	9	0	chr3	40119294	40119520	-119480263	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-8	7672	7445	1
891	980	222	92	105	chr3	40120844	40121226	-119478557	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	379	0	1
891	1468	206	77	33	chr3	40124841	40125177	-119474606	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	351	-33	1
891	2239	110	0	58	chr3	40135317	40135663	-119464120	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
891	1853	239	11	0	chr3	40141191	40141550	-119458233	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	363	-7	2
891	746	169	23	0	chr3	40141550	40141680	-119458103	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	133	-237	2
891	957	294	38	9	chr3	40144292	40144601	-119455182	+	MER34A1	LTR	ERV1	1	318	-269	2
891	306	302	82	70	chr3	40144601	40144772	-119455011	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	207	2
891	655	213	47	40	chr3	40144804	40144965	-119454818	+	ORR1D2	LTR	MaLR	8	260	-110	2
891	1822	202	70	15	chr3	40144965	40145362	-119454421	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	2
891	655	189	49	59	chr3	40145362	40145475	-119454308	+	ORR1D2	LTR	MaLR	226	361	-9	2
891	296	360	44	44	chr3	40145455	40145635	-119454148	-	MTEa	LTR	MaLR	-179	180	1	2
891	479	256	48	36	chr3	40145646	40145812	-119453971	+	MER34A1	LTR	ERV1	326	493	-94	2
891	785	330	64	4	chr3	40146329	40146594	-119453189	-	MTEa	LTR	MaLR	-98	281	1	2
891	402	275	83	11	chr3	40147266	40147446	-119452337	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1821	3936	3744	2
891	269	253	0	48	chr3	40149054	40149137	-119450646	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	2698	2776	-2891	2
891	1085	257	125	29	chr3	40154027	40154372	-119445411	+	MTEa	LTR	MaLR	1	378	-1	2
891	1944	221	55	40	chr3	40154383	40154931	-119444852	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-15	562	7	2
891	702	294	96	55	chr3	40156989	40157334	-119442449	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	2
891	269	349	54	14	chr3	40158230	40158378	-119441405	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	408	2
891	259	334	92	37	chr3	40159049	40159235	-119440548	+	MLT1F1	LTR	MaLR	37	236	-343	2
891	366	278	72	59	chr3	40159432	40159585	-119440198	+	MLT1F1	LTR	MaLR	415	569	0	2
891	2473	162	2	28	chr3	40160261	40160693	-119439090	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
891	338	307	137	12	chr3	40169727	40169895	-119429888	-	MLT1G	LTR	MaLR	-392	199	11	2
891	473	229	27	1	chr3	40171642	40171770	-119428013	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	244	2
891	748	279	73	31	chr3	40172143	40172402	-119427381	-	MTD	LTR	MaLR	-149	270	1	2
891	502	228	55	31	chr3	40177805	40177896	-119421887	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	282	2
891	842	234	427	6	chr3	40177920	40178119	-119421664	-	MTE2b	LTR	MaLR	-98	281	1	2
891	487	244	63	11	chr3	40178556	40178709	-119421074	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	190	2
891	2307	214	12	107	chr3	40184169	40184844	-119414939	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
891	1967	146	9	102	chr3	40188851	40189302	-119410481	-	RMER17C	LTR	ERVK	-1	409	1	2
891	577	268	54	5	chr3	40189476	40189629	-119410154	+	MTE2b	LTR	MaLR	224	379	0	3
891	5808	44	1	8	chr3	40193017	40193768	-119406015	-	MT-int	LTR	MaLR	-75	1023	193	3
891	4432	52	2	33	chr3	40193826	40194404	-119405379	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	3
891	2863	174	124	37	chr3	40194992	40195901	-119403882	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	11	1023	0	3
891	2586	82	15	3	chr3	40201999	40202341	-119397442	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
891	1196	259	24	52	chr3	40205048	40205123	-119394660	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	297	3
891	1196	259	24	52	chr3	40205205	40205459	-119394324	-	MTEa	LTR	MaLR	-83	296	51	3
891	1111	284	27	30	chr3	40208513	40208850	-119390933	-	MTE2b	LTR	MaLR	-25	354	19	3
891	1032	223	18	55	chr3	40210182	40210414	-119389369	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	223	-161	3
891	1032	223	18	55	chr3	40210594	40210636	-119389147	+	ORR1C2	LTR	MaLR	224	264	-120	3
891	1005	198	61	0	chr3	40210697	40210894	-119388889	+	ORR1C2	LTR	MaLR	176	384	0	3
891	310	278	120	0	chr3	40226040	40226148	-119373635	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	121	-269	3
891	237	383	77	15	chr3	40231137	40231267	-119368516	+	LTR16B2	LTR	ERVL	320	457	-5	3
891	588	267	42	47	chr3	40232851	40233063	-119366720	-	MLT1F1	LTR	MaLR	0	569	359	3
891	310	232	79	12	chr3	40235317	40235439	-119364344	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	419	277	3
892	1773	197	32	30	chr3	40243078	40243449	-119356334	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	3
892	592	277	210	38	chr3	40243652	40243956	-119355827	+	MTE2a	LTR	MaLR	19	342	-37	3
892	374	319	41	71	chr3	40256658	40256827	-119342956	-	MER57C2	LTR	ERV1	-25	409	246	3
892	528	257	37	37	chr3	40263157	40263364	-119336419	+	MTE2b	LTR	MaLR	28	239	-180	4
892	2100	216	82	19	chr3	40265822	40266356	-119333427	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	568	0	4
892	557	324	83	77	chr3	40267301	40267775	-119332008	+	MLT1G1	LTR	MaLR	60	487	-2	4
892	228	242	46	46	chr3	40271522	40271587	-119328196	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	70	-289	4
892	895	324	68	55	chr3	40278326	40278858	-119320925	+	MLT1F	LTR	MaLR	10	548	0	4
892	230	270	93	13	chr3	40282803	40282878	-119316905	-	MLT1H	LTR	MaLR	-149	400	320	4
892	1150	290	104	16	chr3	40283037	40283422	-119316361	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
892	252	160	59	118	chr3	40284949	40285034	-119314749	+	RLTR25B	LTR	ERVK	430	509	-519	4
892	989	315	60	14	chr3	40290776	40291124	-119308659	-	MTEa	LTR	MaLR	-15	364	1	4
892	794	266	159	49	chr3	40291635	40292040	-119307743	+	MLT2B1	LTR	ERVL	5	412	-2	4
892	604	158	74	16	chr3	40294949	40295071	-119304712	-	MTC	LTR	MaLR	-290	131	3	4
892	279	328	80	30	chr3	40295266	40295530	-119304253	-	LTR33	LTR	ERVL	-204	311	35	4
892	1909	217	49	20	chr3	40296422	40296831	-119302952	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
892	1281	228	104	16	chr3	40305526	40305901	-119293882	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	1	4
892	359	43	22	0	chr3	40314456	40314502	-119285281	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	338	292	4
892	1908	142	7	0	chr3	40316042	40316330	-119283453	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-37	290	1	4
892	996	242	35	41	chr3	40318292	40318637	-119281146	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	1	4
892	748	276	105	21	chr3	40319358	40319643	-119280140	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	309	-247	4
892	1323	152	26	35	chr3	40319711	40319937	-119279846	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	197	-173	4
892	459	267	81	54	chr3	40319937	40320030	-119279753	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	86	-324	4
892	459	267	81	54	chr3	40320135	40320263	-119279520	+	RMER17C	LTR	ERVK	87	228	-182	4
892	1089	147	19	10	chr3	40320245	40320466	-119279317	+	ORR1B1	LTR	MaLR	152	394	0	4
892	506	272	0	0	chr3	40321372	40321486	-119278297	+	MLT1A0	LTR	MaLR	251	364	-1	4
892	239	327	86	37	chr3	40321797	40321959	-119277824	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	173	-186	4
892	244	323	147	57	chr3	40322361	40322640	-119277143	+	LTR79	LTR	ERVL	151	454	-73	4
892	3141	43	52	0	chr3	40324335	40324704	-119275079	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	4
892	274	278	41	10	chr3	40343124	40343222	-119256561	+	RMER15	LTR	ERVL	432	532	-43	5
892	896	283	40	109	chr3	40344815	40345220	-119254563	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	5
892	260	244	12	25	chr3	40349382	40349462	-119250321	+	MLT1A1	LTR	MaLR	318	396	-12	5
892	423	256	105	111	chr3	40354019	40354362	-119245421	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	3	5
892	1316	224	62	31	chr3	40354360	40354714	-119245069	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	365	-5	5
892	2673	130	63	21	chr3	40355158	40355637	-119244146	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	499	-193	5
892	348	213	53	0	chr3	40355656	40355731	-119244052	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	483	561	0	5
892	4825	160	17	42	chr3	40358958	40359889	-119239894	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	5
892	1696	173	93	33	chr3	40360737	40361156	-119238627	+	RLTR40	LTR	ERVK	26	469	-348	5
892	2338	145	114	13	chr3	40361133	40361607	-119238176	+	RLTR11A	LTR	ERVK	7	528	0	5
892	1461	204	101	0	chr3	40361607	40361799	-119237984	+	RLTR40	LTR	ERVK	435	643	-174	5
892	1461	204	101	0	chr3	40361823	40361978	-119237805	+	RLTR40	LTR	ERVK	644	816	-1	5
892	861	215	20	0	chr3	40365024	40365224	-119234559	+	RMER10B	LTR	ERVL	194	397	-1	5
892	744	318	57	49	chr3	40366578	40366944	-119232839	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	374	-45	5
892	1316	214	58	91	chr3	40367149	40367580	-119232203	+	MTD	LTR	MaLR	2	418	-1	5
892	1696	179	70	62	chr3	40369779	40369971	-119229812	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-1	377	165	5
111	1696	179	70	62	chr3	40370031	40370212	-119229571	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-214	164	2	5
893	1153	236	67	59	chr3	40370882	40371256	-119228527	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	377	-2	5
893	1658	211	81	120	chr3	40376943	40377181	-119222602	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-1	511	271	5
893	1658	211	81	120	chr3	40377327	40377369	-119222414	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-242	270	249	5
893	1658	211	81	120	chr3	40378240	40378490	-119221293	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-264	248	1	5
893	285	340	29	0	chr3	40378493	40378596	-119221187	-	MER34	LTR	ERV1	-429	113	8	5
893	2302	98	3	36	chr3	40380856	40381193	-119218590	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	5
893	2520	182	13	36	chr3	40384231	40384760	-119215023	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	517	-11	5
893	888	236	120	21	chr3	40385184	40385549	-119214234	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	5
893	1677	135	87	13	chr3	40386289	40386589	-119213194	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-43	324	3	5
893	415	284	244	24	chr3	40387087	40387300	-119212483	-	MTE-int	LTR	MaLR	-611	969	710	5
893	1256	176	156	15	chr3	40387326	40387654	-119212129	+	ORR1C2	LTR	MaLR	11	384	0	5
893	427	316	45	41	chr3	40387675	40387896	-119211887	-	MTE-int	LTR	MaLR	-896	684	463	5
893	401	300	49	12	chr3	40388036	40388198	-119211585	-	MTEa	LTR	MaLR	-30	349	182	5
893	1766	126	87	23	chr3	40389604	40389913	-119209870	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
893	297	315	0	11	chr3	40390990	40391081	-119208702	-	MER34A	LTR	ERV1	-481	90	1	6
893	1187	278	33	86	chr3	40391403	40391950	-119207833	-	RMER5	LTR	ERV1	-16	518	1	6
893	2935	70	39	0	chr3	40393085	40393470	-119206313	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
893	1652	179	62	17	chr3	40393923	40394276	-119205507	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	6	6
893	1249	182	87	10	chr3	40394779	40395068	-119204715	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-48	330	20	6
893	1663	117	65	44	chr3	40399478	40399799	-119199984	+	ORR1B1	LTR	MaLR	33	360	-34	6
893	1635	188	32	15	chr3	40400482	40400822	-119198961	+	MTC	LTR	MaLR	3	348	-73	6
893	600	147	9	0	chr3	40402563	40402672	-119197111	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	110	-268	6
893	313	265	24	0	chr3	40406854	40406937	-119192846	-	LTR37B	LTR	ERV1	-185	283	199	6
893	693	259	215	6	chr3	40413187	40413517	-119186266	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	5	6
893	769	242	53	47	chr3	40414092	40414413	-119185370	-	RLTR15	LTR	ERVK	-27	332	10	6
893	1477	221	65	34	chr3	40423762	40424146	-119175637	-	MTD	LTR	MaLR	-23	396	1	6
893	272	358	58	19	chr3	40426323	40426477	-119173306	+	LTR16A	LTR	ERVL	201	360	-91	6
893	332	318	117	31	chr3	40426902	40427173	-119172610	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-114	566	316	6
893	284	364	39	7	chr3	40427883	40428064	-119171719	-	MLT1C	LTR	MaLR	-24	443	256	6
893	244	305	103	65	chr3	40428477	40428534	-119171249	-	MLT1C	LTR	MaLR	-155	235	182	6
893	296	291	101	1	chr3	40428745	40428905	-119170878	-	MLT1C	LTR	MaLR	-285	182	9	6
893	1207	283	27	8	chr3	40428953	40429324	-119170459	+	MTEb	LTR	MaLR	2	379	0	6
893	949	284	91	79	chr3	40438187	40438683	-119161100	+	MER21B	LTR	ERV1	321	822	-41	7
893	262	179	303	40	chr3	40440974	40441073	-119158710	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	275	7
893	366	53	105	0	chr3	40444382	40444439	-119155344	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	560	622	-887	7
893	3675	111	109	1	chr3	40444588	40445237	-119154546	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	791	1509	0	7
893	640	132	243	0	chr3	40445237	40445389	-119154394	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	189	-205	7
893	571	133	210	0	chr3	40445713	40445894	-119153889	+	ORR1B1	LTR	MaLR	176	394	0	7
893	1221	259	73	0	chr3	40446181	40446482	-119153301	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	52	7
893	278	222	16	0	chr3	40446524	40446578	-119153205	-	MTE2b	LTR	MaLR	-292	87	33	7
893	1148	239	38	54	chr3	40446578	40446892	-119152891	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	309	-50	7
893	472	254	174	14	chr3	40456715	40456927	-119142856	-	RMER15	LTR	ERVL	-35	540	295	7
893	1390	168	83	48	chr3	40460765	40461102	-119138681	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	253	7
893	6634	159	44	7	chr3	40461110	40462185	-119137598	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1044	4717	3603	7
893	1002	198	33	18	chr3	40462185	40462424	-119137359	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1315	265	2	7
893	1340	177	173	24	chr3	40462428	40462769	-119137014	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	25	7
893	473	286	48	0	chr3	40466268	40466415	-119133368	-	LTR40a	LTR	ERVL	-351	168	15	7
893	2029	116	75	0	chr3	40466764	40467110	-119132673	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-3	391	20	7
893	589	317	73	57	chr3	40467210	40467564	-119132219	+	RMER5	LTR	ERV1	175	534	0	7
893	2624	124	21	3	chr3	40468954	40469341	-119130442	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
893	309	213	20	36	chr3	40469472	40469573	-119130210	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	365	246	7
893	1988	334	124	43	chr3	40469885	40471295	-119128488	-	MTE-int	LTR	MaLR	-46	1534	10	7
893	440	251	80	90	chr3	40474299	40474588	-119125195	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	94	7
893	752	65	152	8	chr3	40480506	40480631	-119119152	-	RMER16	LTR	ERVK	-83	450	308	7
893	2042	153	92	24	chr3	40489080	40489502	-119110281	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	3	7
893	795	269	123	38	chr3	40492204	40492544	-119107239	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	11	7
893	303	306	41	7	chr3	40498538	40498683	-119101100	+	LTR16A	LTR	ERVL	201	350	-101	7
893	300	336	71	77	chr3	40500531	40500686	-119099097	+	RMER4A	LTR	ERVK	8	161	-305	1
894	3410	25	5	0	chr3	40506573	40506967	-119092816	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
894	488	217	25	117	chr3	40518576	40518738	-119081045	-	RLTR23	LTR	ERV1	-276	154	8	3
894	275	220	20	90	chr3	40518951	40519051	-119080732	+	MT2B	LTR	ERVL	172	264	-337	3
894	409	201	20	92	chr3	40524639	40524784	-119074999	-	MT2B	LTR	ERVL	-327	257	119	4
894	1327	209	178	58	chr3	40535069	40535591	-119064192	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	1	6
894	2384	118	31	10	chr3	40538198	40538585	-119061198	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	362	6
894	296	309	50	30	chr3	40540119	40540219	-119059564	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-224	184	83	7
894	2076	132	93	56	chr3	40542431	40542880	-119056903	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	7
894	641	191	180	27	chr3	40543148	40543362	-119056421	-	MT2A	LTR	ERVL	0	601	245	7
894	243	260	0	0	chr3	40545611	40545661	-119054122	+	LTR79	LTR	ERVL	220	269	-258	8
894	822	227	112	12	chr3	40545913	40546252	-119053531	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	8
894	1848	178	48	7	chr3	40546746	40547090	-119052693	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	411	-8	8
894	263	256	31	113	chr3	40551816	40551913	-119047870	-	MT2B2	LTR	ERVL	-343	241	153	9
894	229	319	67	125	chr3	40553547	40553787	-119045996	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-120	245	20	9
894	1486	208	116	11	chr3	40557329	40557708	-119042075	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
894	276	230	12	119	chr3	40563659	40563743	-119036040	-	MT2B2	LTR	ERVL	-349	235	161	1
894	274	320	25	45	chr3	40565394	40565551	-119034232	-	RMER15	LTR	ERVL	-143	432	279	1
894	1196	206	103	116	chr3	40566710	40567089	-119032694	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
894	9525	136	53	40	chr3	40567111	40568933	-119030850	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	3	1
894	5095	187	70	127	chr3	40568934	40570367	-119029416	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	18	1369	-1	1
894	1307	200	162	0	chr3	40570368	40570688	-119029095	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	1
894	361	136	0	43	chr3	40572966	40573035	-119026748	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	57	122	-299	1
894	707	174	0	8	chr3	40573369	40573491	-119026292	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	287	407	0	1
894	322	287	108	47	chr3	40575381	40575612	-119024171	-	MLT1C	LTR	MaLR	-16	451	149	1
894	3620	183	127	27	chr3	40580290	40580886	-119018897	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	242	1
894	3620	183	127	27	chr3	40580925	40581148	-119018635	-	RMER19B	LTR	ERVK	-661	241	1	1
894	2801	87	8	22	chr3	40591213	40591247	-119008536	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	364	1
894	2801	87	8	22	chr3	40591621	40591988	-119007795	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-33	363	1	1
894	287	246	0	14	chr3	40592619	40592693	-119007090	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	451	1
894	1929	165	48	27	chr3	40597382	40597756	-119002027	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	3	1
894	278	235	78	10	chr3	40603004	40603107	-118996676	+	MER87	LTR	ERV1	424	533	-8	1
895	1654	181	91	12	chr3	40655067	40655408	-118944375	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	3	3
895	363	344	71	85	chr3	40657428	40657711	-118942072	+	MLT1E2	LTR	MaLR	293	571	-109	3
895	3468	43	5	0	chr3	40662171	40662564	-118937219	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	3
895	8898	67	7	3	chr3	40662564	40663657	-118936126	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
895	3127	69	12	37	chr3	40663657	40664063	-118935720	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
895	3495	37	25	2	chr3	40664321	40664723	-118935060	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	3
895	5390	65	13	7	chr3	40664725	40665409	-118934374	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5792	3
895	4193	39	16	0	chr3	40665407	40665900	-118933883	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-1086	5395	4895	3
895	1101	103	32	0	chr3	40665898	40666054	-118933729	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2737	4943	4783	3
895	1877	102	0	0	chr3	40666049	40666295	-118933488	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2252	3
895	9273	56	69	38	chr3	40666296	40667566	-118932217	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5004	1477	168	3
895	228	321	0	0	chr3	40667566	40667619	-118932164	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	223	3
895	808	83	121	76	chr3	40667619	40667776	-118932007	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6286	195	32	3
895	2925	34	0	27	chr3	40667812	40668148	-118931635	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	3
895	1153	209	132	40	chr3	40673527	40673831	-118925952	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	3
895	5356	133	26	11	chr3	40674009	40674851	-118924932	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	3
895	245	300	126	9	chr3	40675420	40675531	-118924252	-	RLTR33	LTR	ERVK	-85	593	470	3
895	382	162	0	75	chr3	40675585	40675665	-118924118	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-400	106	33	3
895	490	232	36	0	chr3	40675703	40675815	-118923968	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1127	4358	4243	3
895	994	152	250	17	chr3	40675813	40676053	-118923730	+	ERVL-int	LTR	ERVL	4451	4746	-1011	3
895	1821	122	88	13	chr3	40682289	40682609	-118917174	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	46	3
895	61130	56	14	12	chr3	40682617	40685643	-118914140	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	4640	3
895	3554	50	0	0	chr3	40685643	40686039	-118913744	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
895	61130	56	14	12	chr3	40686039	40690579	-118909204	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2942	4639	1	3
895	2431	90	60	73	chr3	40690579	40690949	-118908834	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	3
895	1842	133	215	13	chr3	40694673	40695068	-118904715	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
895	1630	179	94	12	chr3	40702401	40702741	-118897042	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	3	4
895	354	341	63	81	chr3	40704640	40704924	-118894859	+	MLT1E2	LTR	MaLR	284	571	-109	4
895	259	245	86	29	chr3	40707050	40707155	-118892628	-	MER65D	LTR	ERV1	-135	338	228	4
895	308	259	54	76	chr3	40719419	40719488	-118880295	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	186	4
895	308	259	54	76	chr3	40719669	40719691	-118880092	-	MT2B	LTR	ERVL	-416	185	168	4
895	263	291	126	9	chr3	40723631	40723742	-118876041	-	RLTR33	LTR	ERVK	-85	593	470	4
895	403	149	0	75	chr3	40723796	40723876	-118875907	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-400	106	33	4
895	498	223	36	0	chr3	40723914	40724026	-118875757	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1127	4358	4243	4
895	1034	154	233	0	chr3	40724024	40724264	-118875519	+	ERVL-int	LTR	ERVL	4451	4746	-1011	4
895	2480	128	48	14	chr3	40730301	40730720	-118869063	-	RLTR44B	LTR	ERVK	-16	433	1	5
895	7690	39	40	1	chr3	40730720	40732334	-118867449	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	0	2812	1136	5
895	2125	55	9	38	chr3	40732330	40732650	-118867133	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-1834	978	612	5
895	883	153	57	0	chr3	40732646	40732803	-118866980	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-2646	166	1	5
895	2492	135	59	12	chr3	40732814	40733235	-118866548	-	RLTR44B	LTR	ERVK	-8	441	1	5
895	295	216	27	0	chr3	40733422	40733496	-118866287	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-2567	245	170	5
895	404	286	226	15	chr3	40734200	40734252	-118865531	-	MER68	LTR	ERVL	-7	556	504	5
895	404	286	226	15	chr3	40734281	40734423	-118865360	-	MER68	LTR	ERVL	-60	503	321	5
895	308	322	117	63	chr3	40734483	40734705	-118865078	-	MER68	LTR	ERVL	-320	243	10	5
895	352	250	20	20	chr3	40735146	40735244	-118864539	-	RLTR14	LTR	ERV1	-282	100	3	5
895	278	264	50	117	chr3	40735952	40735966	-118863817	+	MT2B	LTR	ERVL	152	157	-444	5
895	510	190	163	19	chr3	40741459	40741598	-118858185	+	RMER10A	LTR	ERVL	5	152	-246	5
895	231	250	75	100	chr3	40742944	40743064	-118856719	+	LTR48	LTR	ERV1	108	224	-563	5
895	1896	100	53	11	chr3	40746398	40746680	-118853103	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-33	294	1	5
895	2135	77	62	13	chr3	40748032	40748336	-118851447	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	5
895	273	301	111	24	chr3	40749084	40749210	-118850573	-	LTR33	LTR	ERVL	-4	511	375	5
895	1422	187	171	26	chr3	40751910	40752295	-118847488	+	RMER10A	LTR	ERVL	2	442	0	5
896	558	237	118	7	chr3	40763878	40764031	-118835752	+	MTD	LTR	MaLR	222	391	-28	6
896	693	307	154	12	chr3	40769766	40770096	-118829687	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	3	6
896	413	245	49	98	chr3	40778651	40778814	-118820969	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	103	6
896	1149	259	64	42	chr3	40779098	40779593	-118820190	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-15	562	7	6
896	2597	265	177	51	chr3	40782068	40783391	-118816392	+	MTEb-int	LTR	MaLR	2	1576	-4	6
896	1415	153	237	7	chr3	40783395	40783700	-118816083	+	MTEb	LTR	MaLR	1	376	-3	6
896	235	189	100	75	chr3	40790534	40790614	-118809169	+	MT2B	LTR	ERVL	169	250	-351	6
896	1765	136	220	56	chr3	40799803	40800199	-118799584	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	7
896	1242	174	201	6	chr3	40804316	40804629	-118795154	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
896	656	269	76	76	chr3	40805491	40805781	-118794002	+	MTE2a	LTR	MaLR	70	359	-20	7
896	2394	134	13	40	chr3	40807877	40808048	-118791735	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	228	7
896	2394	134	13	40	chr3	40808231	40808456	-118791327	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-167	227	1	7
896	246	250	70	80	chr3	40812329	40812429	-118787354	-	MT2B	LTR	ERVL	-247	354	256	7
896	1769	142	26	73	chr3	40815533	40815875	-118783908	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-1	328	3	7
896	1140	221	63	54	chr3	40823284	40823715	-118776068	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-269	423	1	7
896	260	238	133	95	chr3	40831119	40831277	-118768506	-	ORR1E	LTR	MaLR	-160	199	36	7
896	358	293	113	75	chr3	40833797	40834063	-118765720	+	MLT1B	LTR	MaLR	6	281	-109	8
896	649	250	230	21	chr3	40834292	40834632	-118765151	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	9	8
896	281	270	11	13	chr3	40834641	40834740	-118765043	+	MLT1B	LTR	MaLR	257	370	-20	8
896	378	336	114	43	chr3	40838281	40838536	-118761247	-	MLT1F	LTR	MaLR	-250	298	26	8
896	378	280	105	112	chr3	40852381	40852667	-118747116	-	ORR1E	LTR	MaLR	-51	308	25	8
896	4308	124	28	38	chr3	40854561	40855324	-118744459	-	RMER6A	LTR	ERVK	-1	755	1	8
896	603	267	165	11	chr3	40856645	40856918	-118742865	+	RMER15	LTR	ERVL	259	573	-2	8
896	441	239	161	37	chr3	40858030	40858191	-118741592	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	181	-193	8
896	618	140	230	6	chr3	40858268	40858433	-118741350	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	367	-7	8
896	598	284	14	62	chr3	40858434	40858644	-118741139	+	MTE2b	LTR	MaLR	10	209	-170	8
896	763	208	14	71	chr3	40858881	40859066	-118740717	+	MTE2b	LTR	MaLR	204	370	0	8
896	970	206	127	0	chr3	40860203	40860455	-118739328	+	MTD	LTR	MaLR	1	284	-135	8
896	1324	186	99	6	chr3	40860470	40860784	-118738999	+	RMER10A	LTR	ERVL	100	442	0	8
896	3073	27	85	0	chr3	40861329	40861694	-118738089	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
896	407	272	21	60	chr3	40862787	40862939	-118736844	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-19	448	264	8
896	3306	51	2	2	chr3	40863416	40863812	-118735971	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
896	2251	160	36	12	chr3	40865237	40865648	-118734135	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	8
896	379	276	123	108	chr3	40865760	40866101	-118733682	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-48	349	4	8
896	995	267	40	25	chr3	40866575	40866901	-118732882	-	MTE2a	LTR	MaLR	-6	373	43	8
896	2679	86	66	5	chr3	40868335	40868746	-118731037	-	MT2B2	LTR	ERVL	-148	436	1	8
896	376	328	44	15	chr3	40890481	40890617	-118709166	+	MLT1I	LTR	MaLR	227	366	-45	9
896	1061	226	125	12	chr3	40892042	40892171	-118707612	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	228	9
896	1061	226	125	12	chr3	40892205	40892411	-118707372	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-147	227	2	9
896	429	204	95	8	chr3	40893116	40893238	-118706545	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	262	9
896	336	235	242	8	chr3	40893246	40893366	-118706417	-	MTD	LTR	MaLR	-270	151	4	9
897	837	295	35	77	chr3	40895715	40896053	-118703730	+	ORR1E	LTR	MaLR	33	356	-3	9
897	340	290	133	22	chr3	40897889	40898069	-118701714	+	MTD	LTR	MaLR	8	207	-212	9
897	508	268	50	25	chr3	40901248	40901447	-118698336	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	195	9
897	978	174	117	17	chr3	40901508	40901747	-118698036	-	RMER10B	LTR	ERVL	-134	264	2	9
897	2752	102	31	3	chr3	40906518	40906900	-118692883	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	1	9
897	228	290	35	127	chr3	40910371	40910513	-118689270	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	129	-230	9
897	1075	238	42	113	chr3	40911049	40911475	-118688308	+	MTD	LTR	MaLR	8	403	-16	9
897	1055	236	91	82	chr3	40926487	40926851	-118672932	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	1	9
897	695	251	70	103	chr3	40927690	40928221	-118671562	+	RMER17B	LTR	ERVK	366	958	0	9
897	410	335	42	24	chr3	40933166	40933331	-118666452	+	LTR16E2	LTR	ERVL	148	315	-253	9
897	3334	58	0	0	chr3	40939153	40939549	-118660234	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
897	2117	134	33	3	chr3	40946546	40946913	-118652870	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
897	2036	176	5	8	chr3	40956390	40956763	-118643020	-	RLTR14	LTR	ERV1	-8	374	3	1
897	259	277	128	0	chr3	40957460	40957554	-118642229	+	MLT1J1	LTR	MaLR	329	434	-10	1
897	378	227	4	64	chr3	40960798	40960937	-118638846	+	MLT1E2	LTR	MaLR	2	125	-380	1
897	355	198	16	124	chr3	40965394	40965515	-118634268	+	MT2B	LTR	ERVL	157	264	-337	1
897	1992	253	18	92	chr3	40966469	40966580	-118633203	-	RLTR18	LTR	ERVK	-3	613	510	1
897	2267	151	8	3	chr3	40966580	40966945	-118632838	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	1
897	1992	253	18	92	chr3	40966945	40966982	-118632801	-	RLTR18	LTR	ERVK	-107	509	488	1
897	1992	253	18	92	chr3	40967127	40967639	-118632144	-	RLTR18	LTR	ERVK	-129	487	1	1
897	515	301	100	43	chr3	40967750	40968101	-118631682	+	MLT1D	LTR	MaLR	2	372	-133	1
897	357	313	163	33	chr3	40969534	40969841	-118629942	-	MLT1A	LTR	MaLR	-8	366	20	1
897	388	332	69	32	chr3	40971101	40971319	-118628464	+	ORR1E	LTR	MaLR	14	239	-120	1
897	523	266	151	40	chr3	40971441	40971792	-118627991	-	MLT1C	LTR	MaLR	-10	495	114	1
897	1335	214	152	8	chr3	40974082	40974096	-118625687	+	MTD	LTR	MaLR	1	14	-405	1
897	1335	214	152	8	chr3	40974151	40974321	-118625462	+	MTD	LTR	MaLR	15	228	-191	1
897	1335	214	152	8	chr3	40974402	40974569	-118625214	+	MTD	LTR	MaLR	229	403	-16	1
897	1847	196	68	13	chr3	40977476	40977873	-118621910	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
897	1956	134	3	0	chr3	40979198	40979512	-118620271	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	315	-31	1
897	1077	242	96	32	chr3	40979679	40980024	-118619759	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	13	1
897	231	227	14	43	chr3	40980273	40980342	-118619441	+	ORR1A0	LTR	MaLR	313	379	0	1
897	1337	208	95	0	chr3	40982912	40983258	-118616525	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	41	1
897	1294	276	16	19	chr3	40989605	40989978	-118609805	+	MTEa	LTR	MaLR	8	379	0	1
897	1199	295	76	19	chr3	41004763	41005237	-118594546	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	34	6
897	351	181	169	0	chr3	41005369	41005452	-118594331	+	MTD	LTR	MaLR	1	97	-322	7
897	961	228	46	94	chr3	41005516	41005859	-118593924	+	MTD	LTR	MaLR	47	405	-14	8
897	3545	180	125	83	chr3	41011979	41012850	-118586933	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	2
897	467	354	77	60	chr3	41013233	41013569	-118586214	-	ORR1E	LTR	MaLR	-10	349	8	2
897	387	271	32	24	chr3	41016229	41016354	-118583429	+	MER90	LTR	ERV1	441	566	-9	3
897	284	333	0	11	chr3	41017395	41017489	-118582294	+	MTEb	LTR	MaLR	258	350	-29	3
897	492	291	121	23	chr3	41018485	41018700	-118581083	+	LTR41	LTR	ERVL	11	246	-522	3
897	465	175	141	21	chr3	41020228	41020390	-118579393	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	179	-205	4
897	331	219	191	0	chr3	41025400	41025505	-118574278	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	680	556	5
112	614	262	147	73	chr3	41025512	41025866	-118573917	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-175	385	6	5
898	1487	162	157	29	chr3	41026206	41026556	-118573227	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	343	5
898	1396	164	188	0	chr3	41027671	41027975	-118571808	-	RMER19A	LTR	ERVK	-376	361	1	5
898	2438	147	50	5	chr3	41028191	41028594	-118571189	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
898	296	272	84	42	chr3	41036208	41036327	-118563456	-	MLT1I	LTR	MaLR	-253	158	35	7
898	226	312	147	29	chr3	41044231	41044469	-118555314	-	RMER12	LTR	ERVK	-287	1035	770	8
898	1782	195	78	3	chr3	41046889	41047279	-118552504	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	8
898	1888	195	27	17	chr3	41048535	41048948	-118550835	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	9
898	848	246	103	49	chr3	41050337	41050666	-118549117	-	RMER13A	LTR	ERVK	-416	444	98	9
898	301	248	39	67	chr3	41069052	41069156	-118530627	-	LTR90B	LTR	LTR	0	796	696	1
898	411	362	86	42	chr3	41070330	41070783	-118529000	-	MER21B	LTR	ERV1	-112	751	279	1
898	327	274	185	0	chr3	41072683	41072829	-118526954	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	202	1
898	272	247	26	52	chr3	41073101	41073178	-118526605	-	MTEa	LTR	MaLR	-170	209	135	1
898	412	378	14	14	chr3	41074383	41074595	-118525188	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-7	548	337	1
898	384	135	112	0	chr3	41074890	41074979	-118524804	+	MTEa	LTR	MaLR	30	128	-251	1
898	2598	73	73	0	chr3	41076704	41077114	-118522669	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-92	440	1	1
898	441	310	39	39	chr3	41077194	41077449	-118522334	-	MuLV-int	LTR	ERV1	-80	7526	7272	1
898	1830	311	62	67	chr3	41078005	41079500	-118520283	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2009	5547	2854	1
898	4760	125	52	86	chr3	41079500	41080438	-118519345	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	1
898	1830	303	70	80	chr3	41080438	41080533	-118519250	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2210	2853	2757	1
898	1713	316	94	41	chr3	41080601	41081816	-118517967	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5216	2562	1284	1
898	317	259	138	30	chr3	41082305	41082472	-118517311	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-6858	698	514	1
898	718	122	150	0	chr3	41082896	41083043	-118516740	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-7	525	357	1
898	855	249	126	17	chr3	41083161	41083509	-118516274	+	MLT1B	LTR	MaLR	5	390	0	1
898	1221	266	16	42	chr3	41087924	41088313	-118511470	-	MTE2a	LTR	MaLR	-22	397	18	1
898	285	282	74	40	chr3	41089928	41090076	-118509707	-	LTR81B	LTR	ERV1?	-14	1379	1227	1
898	282	263	234	39	chr3	41090076	41090185	-118509598	-	MamGypLTR2	LTR	Gypsy	-14	1175	869	1
898	1151	264	90	0	chr3	41095825	41096159	-118503624	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	56	1
898	1415	221	98	0	chr3	41102198	41102564	-118497219	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	1
898	260	338	155	31	chr3	41104737	41104963	-118494820	-	MLT1D	LTR	MaLR	-134	371	118	1
898	365	292	69	129	chr3	41105972	41106322	-118493461	+	RLTR18	LTR	ERVK	149	477	-139	1
898	400	284	125	31	chr3	41108374	41108534	-118491249	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	191	1
898	240	250	15	30	chr3	41108529	41108595	-118491188	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-297	68	4	1
898	392	288	37	29	chr3	41115639	41115775	-118484008	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	243	2
898	392	233	272	37	chr3	41116443	41116686	-118483097	+	RMER15	LTR	ERVL	275	575	0	2
898	1492	86	9	0	chr3	41118653	41118863	-118480920	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-115	212	1	2
898	11699	128	53	7	chr3	41118863	41120739	-118479044	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	2	2
898	1440	66	0	10	chr3	41120744	41120944	-118478839	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	122	2
898	1270	275	80	24	chr3	41121200	41121662	-118478121	-	MLT1D	LTR	MaLR	-8	497	10	2
898	2312	97	99	32	chr3	41127687	41128090	-118471693	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	2
898	816	226	117	53	chr3	41129045	41129386	-118470397	+	RMER13A	LTR	ERVK	98	460	-400	2
898	1764	205	65	57	chr3	41132621	41132718	-118467065	-	RLTR16	LTR	ERVK	-26	479	401	2
898	1764	205	65	57	chr3	41132747	41133124	-118466659	-	RLTR16	LTR	ERVK	-105	400	1	2
898	324	297	91	52	chr3	41133985	41134216	-118465567	+	LTR81A	LTR	ERV1?	6	245	-1105	2
898	315	183	97	97	chr3	41134537	41134640	-118465143	+	MER31B	LTR	ERV1	1	103	-363	2
898	1471	214	67	21	chr3	41134944	41135331	-118464452	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	2
898	466	297	7	0	chr3	41135350	41135488	-118464295	+	MER31B	LTR	ERV1	326	464	-2	2
898	286	311	168	36	chr3	41136891	41137111	-118462672	-	MLT1D	LTR	MaLR	-252	253	5	2
898	891	235	117	117	chr3	41137689	41138065	-118461718	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-8	376	1	2
898	420	167	211	9	chr3	41138234	41138343	-118461440	-	RMER6C	LTR	ERVK	-46	644	514	2
898	1254	144	205	46	chr3	41138314	41138641	-118461142	-	RMER6C	LTR	ERVK	-311	379	1	2
898	1225	198	194	9	chr3	41151476	41151812	-118447971	+	MTD	LTR	MaLR	20	417	-2	2
898	502	302	99	68	chr3	41155787	41156202	-118443581	+	MT2A	LTR	ERVL	1	428	-105	2
899	241	278	174	26	chr3	41165511	41165666	-118434117	-	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	-54	1014	837	3
899	1621	154	42	10	chr3	41166409	41166698	-118433085	+	MTC	LTR	MaLR	113	410	-11	3
899	634	268	5	32	chr3	41166698	41166883	-118432900	+	RMER5	LTR	ERV1	289	468	-66	3
899	576	192	1	41	chr3	41166874	41167001	-118432782	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-270	126	1	3
899	541	270	65	41	chr3	41167006	41167176	-118432607	-	RMER5	LTR	ERV1	-249	285	112	3
899	310	265	12	12	chr3	41171141	41171225	-118428558	+	MLT1A1	LTR	MaLR	317	400	-8	3
899	231	268	56	44	chr3	41172679	41172769	-118427014	-	MLT1L	LTR	MaLR	-2	608	518	3
899	398	245	21	21	chr3	41172806	41172902	-118426881	-	MLT1L	LTR	MaLR	-172	438	343	3
899	377	318	105	59	chr3	41172930	41173149	-118426634	-	MLT1D	LTR	MaLR	-13	492	227	3
899	231	304	33	86	chr3	41173210	41173361	-118426422	-	MLT1D	LTR	MaLR	-335	170	28	3
899	1842	210	71	31	chr3	41173372	41173783	-118426000	+	RLTR26	LTR	ERVK	2	431	-211	3
899	1842	210	71	31	chr3	41173817	41173857	-118425926	+	RLTR26	LTR	ERVK	432	471	-171	3
899	750	217	37	51	chr3	41173871	41174085	-118425698	+	RLTR26	LTR	ERVK	431	641	-1	3
899	228	300	21	32	chr3	41175587	41175680	-118424103	+	RMER6B	LTR	ERVK	303	394	-67	3
899	2127	109	81	9	chr3	41175933	41176256	-118423527	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
899	484	304	14	7	chr3	41180550	41180689	-118419094	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	422	3
899	2281	66	23	3	chr3	41183204	41183506	-118416277	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	308	-19	3
899	1523	116	51	137	chr3	41185519	41185870	-118413913	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	3
899	620	261	25	32	chr3	41187339	41187554	-118412229	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	367	-3	3
899	1349	230	133	15	chr3	41187657	41187988	-118411795	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	2	3
899	750	250	280	27	chr3	41190080	41190380	-118409403	+	MTEa	LTR	MaLR	1	376	-3	3
899	1907	120	8	107	chr3	41202727	41203091	-118396692	+	ORR1A4	LTR	MaLR	2	329	0	3
899	1390	248	53	17	chr3	41204644	41205001	-118394782	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	10	3
899	814	260	86	53	chr3	41214252	41214613	-118385170	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	375	-4	4
899	230	324	64	37	chr3	41215693	41215802	-118383981	-	MTEa	LTR	MaLR	-28	351	240	4
899	714	239	93	33	chr3	41216042	41216224	-118383559	-	MTEa	LTR	MaLR	-173	206	14	4
899	2030	133	48	151	chr3	41216944	41217422	-118382361	+	RLTR23	LTR	ERV1	2	430	0	4
899	389	252	100	10	chr3	41218172	41218272	-118381511	+	MLT1C	LTR	MaLR	357	465	-2	4
899	258	292	15	0	chr3	41219741	41219806	-118379977	+	MTEa	LTR	MaLR	1	66	-313	4
899	242	250	0	68	chr3	41219786	41219859	-118379924	+	MTEa	LTR	MaLR	296	363	-16	4
899	1790	181	125	21	chr3	41234973	41235267	-118364516	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	94	4
899	1790	181	125	21	chr3	41235287	41235369	-118364414	-	MTD	LTR	MaLR	-326	93	5	4
899	360	329	157	44	chr3	41236193	41236556	-118363227	-	MLT1D	LTR	MaLR	-10	495	92	4
899	304	185	185	0	chr3	41236626	41236707	-118363076	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	284	4
899	459	291	75	100	chr3	41236932	41237211	-118362572	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-29	460	189	4
899	412	286	187	32	chr3	41238832	41239175	-118360608	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	1	4
899	822	287	144	9	chr3	41240589	41240923	-118358860	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	4
899	825	309	60	38	chr3	41244432	41244850	-118354933	-	MT2A	LTR	ERVL	-106	427	1	4
899	1429	188	187	22	chr3	41246095	41246454	-118353329	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	1	4
899	1660	137	152	76	chr3	41252527	41252868	-118346915	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
899	254	311	109	6	chr3	41256027	41256192	-118343591	-	LTR37B	LTR	ERV1	-240	228	47	4
899	1479	156	19	145	chr3	41257805	41258164	-118341619	+	ORR1B1	LTR	MaLR	81	394	0	5
899	253	253	108	0	chr3	41259433	41259516	-118340267	-	LTR50	LTR	ERVL	-611	184	93	5
899	1353	181	54	47	chr3	41262178	41262571	-118337212	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	367	19	5
899	2882	82	31	5	chr3	41262732	41263122	-118336661	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
899	724	293	103	36	chr3	41264138	41264622	-118335161	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	548	43	5
899	1068	252	60	83	chr3	41264648	41265046	-118334737	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-19	389	1	5
899	385	209	96	78	chr3	41269058	41269224	-118330559	+	MER110A	LTR	ERV1	2	170	-298	5
899	2028	110	3	130	chr3	41269554	41269738	-118330045	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	164	5
899	2028	110	3	130	chr3	41269885	41270077	-118329706	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-166	163	1	5
899	338	295	55	39	chr3	41273559	41273686	-118326097	+	MTE2a	LTR	MaLR	26	154	-225	5
899	266	268	16	89	chr3	41274201	41274324	-118325459	-	MER34	LTR	ERV1	-388	154	41	5
900	2362	93	12	3	chr3	41291548	41291872	-118307911	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
900	834	261	149	50	chr3	41293656	41294079	-118305704	-	MER31B	LTR	ERV1	0	466	2	5
900	428	245	41	14	chr3	41294174	41294319	-118305464	-	MER31-int	LTR	ERV1	-729	4207	4059	5
900	856	296	51	51	chr3	41294929	41295285	-118304498	-	MER31-int	LTR	ERV1	-1186	3750	3395	5
900	339	237	0	0	chr3	41295641	41295717	-118304066	-	MER31-int	LTR	ERV1	-1706	3230	3155	5
900	2545	138	82	10	chr3	41296802	41297300	-118302483	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	1	5
900	567	318	58	51	chr3	41297448	41297740	-118302043	+	MTE2b	LTR	MaLR	66	359	-20	5
900	262	299	15	30	chr3	41298326	41298457	-118301326	-	MER31-int	LTR	ERV1	-2728	2628	2500	5
900	2110	290	65	74	chr3	41299033	41299095	-118300688	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3116	1820	1759	5
900	2151	133	3	27	chr3	41299095	41299428	-118300355	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	325	-2	5
900	2110	290	65	74	chr3	41299428	41299889	-118299894	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3178	1758	1302	5
900	2505	76	165	3	chr3	41299889	41300259	-118299524	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	5
900	2110	290	65	74	chr3	41300259	41301065	-118298718	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3635	1301	505	5
900	370	307	359	62	chr3	41302236	41302520	-118297263	-	MER31B	LTR	ERV1	-98	368	1	5
900	1646	128	66	20	chr3	41303610	41303914	-118295869	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-36	358	41	5
900	891	272	40	0	chr3	41305455	41305705	-118294078	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	260	-119	6
900	296	289	67	131	chr3	41306287	41306476	-118293307	-	MT2A	LTR	ERVL	-184	349	168	6
900	296	289	67	131	chr3	41306817	41306899	-118292884	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	85	6
900	420	256	79	16	chr3	41306846	41306973	-118292810	-	MTE2a	LTR	MaLR	-242	137	3	6
900	2228	96	38	6	chr3	41311082	41311396	-118288387	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-3	324	1	6
900	229	284	84	66	chr3	41318956	41319122	-118280661	+	MLT1A0	LTR	MaLR	32	200	-165	6
900	1311	131	29	67	chr3	41323575	41323813	-118275970	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	229	-631	6
900	1466	130	141	50	chr3	41323812	41324152	-118275631	+	RMER13A	LTR	ERVK	369	739	-121	6
900	1065	226	55	16	chr3	41329033	41329289	-118270494	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	114	6
900	1895	158	29	53	chr3	41329282	41329657	-118270126	+	ORR1C1	LTR	MaLR	12	377	-1	6
900	285	202	185	46	chr3	41329657	41329743	-118270040	-	MTE2a	LTR	MaLR	-275	104	1	6
900	298	223	7	148	chr3	41331906	41331919	-118267864	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	375	367	6
900	3447	93	35	48	chr3	41331919	41332483	-118267300	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	0	557	1	6
900	1342	203	83	39	chr3	41332483	41332822	-118266961	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-13	366	6	6
900	775	231	143	19	chr3	41333322	41333538	-118266245	-	MTEb	LTR	MaLR	-9	370	128	6
900	888	258	119	75	chr3	41339027	41339388	-118260395	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	3	6
900	2482	101	0	0	chr3	41339877	41340204	-118259579	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
900	462	322	63	68	chr3	41342643	41343061	-118256722	-	MLT1F	LTR	MaLR	-4	544	94	7
900	255	209	164	0	chr3	41349834	41349901	-118249882	+	RMER15	LTR	ERVL	57	134	-441	7
900	490	248	92	28	chr3	41350185	41350326	-118249457	-	RMER15	LTR	ERVL	-425	150	1	7
900	325	317	15	82	chr3	41350888	41351022	-118248761	+	MT2B	LTR	ERVL	133	257	-344	7
900	940	224	86	140	chr3	41358882	41359267	-118240516	+	MTB	LTR	MaLR	1	364	-36	7
900	292	199	12	60	chr3	41365364	41365378	-118234405	+	MT2B	LTR	ERVL	157	217	-367	7
900	229	311	106	75	chr3	41372761	41373081	-118226702	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-29	499	170	7
900	342	292	82	37	chr3	41380931	41381066	-118218717	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	268	7
900	254	154	0	0	chr3	41383903	41383942	-118215841	-	MER34A1	LTR	ERV1	-523	64	26	7
900	243	299	181	0	chr3	41401057	41401278	-118198505	-	MLT1C	LTR	MaLR	-153	314	54	8
901	1307	173	19	42	chr3	41424443	41424708	-118175075	+	MTC	LTR	MaLR	2	260	-161	8
901	537	279	229	10	chr3	41425819	41426116	-118173667	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	362	-8	8
901	1510	171	150	18	chr3	41435871	41436198	-118163585	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	8
901	2135	193	38	82	chr3	41437694	41438219	-118161564	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-4	508	7	8
901	1918	131	65	12	chr3	41445497	41445838	-118153945	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	8
901	2211	204	89	17	chr3	41447533	41448058	-118151725	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	563	0	8
901	1279	219	115	23	chr3	41469119	41469503	-118130280	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	9
901	864	316	28	4	chr3	41489552	41489800	-118109983	+	MLT1A0	LTR	MaLR	54	307	-58	9
901	1989	133	117	51	chr3	41494103	41494555	-118105228	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	9
901	1918	144	45	14	chr3	41499646	41499999	-118099784	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	364	-39	9
901	225	100	0	0	chr3	41500000	41500030	-118099753	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	391	420	0	1
901	2225	83	9	69	chr3	41504472	41504820	-118094963	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
901	1538	226	73	13	chr3	41506532	41506543	-118093240	+	MTD	LTR	MaLR	1	11	-408	9
901	1538	226	73	13	chr3	41506563	41506932	-118092851	+	MTD	LTR	MaLR	12	403	-16	9
901	237	288	0	15	chr3	41506953	41507020	-118092763	+	LTR16C	LTR	ERVL	360	425	-64	1
901	1933	228	52	10	chr3	41508718	41509202	-118090581	-	RMER20A	LTR	ERVK	-2	514	11	1
901	978	248	95	40	chr3	41516411	41516738	-118083045	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	349	-21	3
901	853	267	82	84	chr3	41522844	41523212	-118076571	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	8	4
901	299	270	97	60	chr3	41524111	41524245	-118075538	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	406	-2	4
901	647	233	194	72	chr3	41527152	41527299	-118072484	+	MTD	LTR	MaLR	15	196	-223	5
901	647	233	194	72	chr3	41527921	41527995	-118071788	+	MTD	LTR	MaLR	197	263	-156	5
901	401	365	107	12	chr3	41541226	41541470	-118058313	-	ORR1E	LTR	MaLR	-89	270	4	7
901	1250	153	282	10	chr3	41541992	41542283	-118057500	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	372	-2	8
902	807	319	83	45	chr3	41558225	41558599	-118041184	-	LTR87	LTR	ERVL?	-69	555	168	1
902	998	302	39	3	chr3	41560863	41561225	-118038558	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	1	1
902	356	141	93	53	chr3	41565801	41565876	-118033907	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-306	78	1	1
902	961	313	112	39	chr3	41565974	41566410	-118033373	-	MER70A	LTR	ERVL	-4	468	1	1
902	280	270	122	160	chr3	41566554	41566841	-118032942	-	MTEb	LTR	MaLR	-7	372	84	1
902	694	300	97	15	chr3	41575928	41576195	-118023588	-	LTR80B	LTR	ERVL	-266	318	30	1
902	3116	31	31	3	chr3	41580098	41580483	-118019300	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
902	255	149	0	0	chr3	41586839	41586886	-118012897	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	142	188	-5218	1
902	281	213	52	26	chr3	41586879	41586956	-118012827	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	741	819	-4587	1
902	634	182	25	0	chr3	41586960	41587081	-118012702	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	938	1061	-5076	1
902	18336	124	26	13	chr3	41587093	41590299	-118009484	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2555	5781	-1625	1
902	3340	62	7	15	chr3	41605923	41606381	-117993402	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5772	6225	-1181	1
902	1060	127	46	0	chr3	41606431	41606604	-117993179	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6222	6402	-1004	1
902	383	104	0	43	chr3	41606854	41606924	-117992859	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7337	7403	-3	1
902	2269	138	14	77	chr3	41606926	41607357	-117992426	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	404	-5	1
902	2018	175	60	10	chr3	41630513	41630912	-117968871	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	1
902	1915	140	16	3	chr3	41637276	41637592	-117962191	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	1	1
902	23768	94	8	23	chr3	41637592	41641102	-117958681	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	4125	1
902	7715	81	19	7	chr3	41641101	41642195	-117957588	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-3662	3919	2813	1
902	3272	86	97	10	chr3	41642217	41642733	-117957050	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5136	2445	1885	1
902	348	138	0	0	chr3	41642735	41642793	-117956990	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4260	1146	1089	1
902	1377	181	257	26	chr3	41642798	41643303	-117956480	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4587	819	198	1
902	297	216	9	64	chr3	41643868	41643977	-117955806	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-5884	937	835	1
902	1968	139	13	3	chr3	41644089	41644406	-117955377	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	1	1
902	1651	181	38	82	chr3	41644921	41645289	-117954494	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	43	1
902	3450	23	5	0	chr3	41654329	41654723	-117945060	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
902	9188	31	5	1	chr3	41654723	41655817	-117943966	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
902	3475	25	2	0	chr3	41655817	41656212	-117943571	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
902	2034	155	87	13	chr3	41667192	41667584	-117932199	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
902	2175	139	41	56	chr3	41668392	41668782	-117931001	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	2
902	1800	123	20	102	chr3	41671770	41672123	-117927660	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	107	2
902	233	194	319	0	chr3	41672521	41672593	-117927190	-	RLTR23	LTR	ERV1	-317	113	19	2
903	1584	228	97	17	chr3	41683870	41684232	-117915551	+	MTD	LTR	MaLR	1	391	-28	2
903	607	117	0	0	chr3	41684251	41684345	-117915438	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-298	286	193	2
903	601	69	11	0	chr3	41684392	41684479	-117915304	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-496	88	1	2
903	251	116	22	44	chr3	41685145	41685190	-117914593	+	ORR1A4	LTR	MaLR	286	329	0	2
903	1768	215	18	13	chr3	41686081	41686463	-117913320	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	144	2
903	2895	27	24	0	chr3	41692883	41693221	-117906562	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
903	13750	55	15	1	chr3	41693221	41694987	-117904796	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	2
903	2930	21	24	0	chr3	41694987	41695325	-117904458	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
903	485	183	12	0	chr3	41700550	41700632	-117899151	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-1020	83	1	2
903	1771	196	132	52	chr3	41703050	41703527	-117896256	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
903	376	385	74	35	chr3	41707019	41707248	-117892535	+	LTR41B	LTR	ERVL	31	268	-490	2
903	236	304	107	113	chr3	41709124	41709424	-117890359	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	64	2
903	804	294	177	32	chr3	41709491	41709993	-117889790	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	2
903	1316	194	165	9	chr3	41716336	41716663	-117883120	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
903	4035	143	38	49	chr3	41717115	41717513	-117882270	-	RMER6A	LTR	ERVK	-6	750	338	2
903	4035	143	38	49	chr3	41717717	41718074	-117881709	-	RMER6A	LTR	ERVK	-419	337	3	2
903	685	331	80	11	chr3	41718305	41718580	-117881203	+	MLT1D	LTR	MaLR	191	484	-21	2
903	4950	120	70	44	chr3	41726690	41726991	-117872792	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	287	-619	2
903	4950	120	70	44	chr3	41727135	41727166	-117872617	+	RMER17A2	LTR	ERVK	288	306	-600	2
903	4950	120	70	44	chr3	41727310	41727859	-117871924	+	RMER17A2	LTR	ERVK	307	906	0	2
903	860	285	118	32	chr3	41732861	41733176	-117866607	+	RLTR26	LTR	ERVK	51	392	-250	2
903	962	246	71	57	chr3	41742639	41743002	-117856781	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	421	43	2
903	552	275	83	16	chr3	41752050	41752345	-117847438	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	366	-13	3
903	3500	20	2	0	chr3	41755493	41755888	-117843895	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
903	1189	269	98	30	chr3	41760560	41761028	-117838755	-	RMER5	LTR	ERV1	-2	532	33	3
903	2361	194	2	5	chr3	41765558	41765978	-117833805	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	3
903	1993	194	97	3	chr3	41770013	41770396	-117829387	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
903	419	315	88	95	chr3	41771035	41771298	-117828485	+	MER77	LTR	ERVL	12	272	-335	3
903	1679	203	24	29	chr3	41772492	41772868	-117826915	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
903	233	250	61	111	chr3	41781045	41781144	-117818639	-	LTR32	LTR	ERVL	-251	220	127	3
903	981	256	105	31	chr3	41785774	41786125	-117813658	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	1	3
903	264	285	14	110	chr3	41796529	41796675	-117803108	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-15	375	244	3
903	497	262	26	40	chr3	41796914	41797065	-117802718	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-205	160	12	3
903	248	132	0	0	chr3	41808255	41808293	-117791490	-	RMER6D	LTR	ERVK	-680	40	3	3
904	332	85	0	0	chr3	41818730	41818777	-117781006	-	MTC	LTR	MaLR	-12	409	343	3
904	1313	225	196	87	chr3	41818780	41819184	-117780599	-	MT2A	LTR	ERVL	-85	448	1	3
904	328	203	0	0	chr3	41824627	41824686	-117775097	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	64	-315	3
904	888	232	50	63	chr3	41825446	41825745	-117774038	+	MTE2a	LTR	MaLR	70	364	-15	3
904	644	234	21	7	chr3	41835122	41835264	-117764519	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	236	3
904	692	255	121	60	chr3	41835615	41835980	-117763803	+	RMER2	LTR	ERV1	27	556	-11	3
904	2610	191	66	11	chr3	41841306	41841918	-117757865	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	906	-2	4
904	606	264	62	31	chr3	41845125	41845320	-117754463	+	RMER5	LTR	ERV1	235	435	-99	4
904	2917	249	1	1	chr3	41847886	41848586	-117751197	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	4332	5031	-3186	4
904	552	263	7	7	chr3	41848582	41848735	-117751048	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7662	7814	-403	4
904	1101	218	115	37	chr3	41876426	41876722	-117723061	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	14	332	0	4
904	374	308	39	46	chr3	41883562	41883715	-117716068	+	MLT1A0	LTR	MaLR	214	365	0	4
904	3233	58	2	0	chr3	41893905	41894300	-117705483	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
904	3776	144	42	9	chr3	41904622	41905261	-117694522	+	RLTR25A	LTR	ERVK	6	665	-438	4
904	1109	91	0	19	chr3	41913133	41913290	-117686493	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-75	332	179	4
904	484	333	69	26	chr3	41918037	41918278	-117681505	-	MLT1J	LTR	MaLR	-108	336	104	4
904	801	256	155	60	chr3	41932430	41932766	-117667017	+	MTEa	LTR	MaLR	3	370	-9	5
904	589	285	185	19	chr3	41934335	41934499	-117665284	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	210	5
904	589	285	185	19	chr3	41934670	41934830	-117664953	-	MTEa	LTR	MaLR	-170	209	2	5
904	282	289	22	97	chr3	41935298	41935432	-117664351	+	MLT1A	LTR	MaLR	226	349	-25	5
904	1208	309	8	22	chr3	41940414	41940781	-117659002	+	MTE2b	LTR	MaLR	13	374	-5	5
904	286	298	86	31	chr3	41942416	41942601	-117657182	+	MTEa	LTR	MaLR	19	215	-144	5
904	307	132	36	36	chr3	41942793	41942848	-117656935	+	MTEa	LTR	MaLR	311	365	-14	5
905	226	271	86	0	chr3	41948777	41948847	-117650936	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-1058	329	254	5
905	504	330	49	6	chr3	41950413	41950596	-117649187	+	MLT1A0	LTR	MaLR	175	365	0	5
905	879	263	23	5	chr3	41953675	41953889	-117645894	+	ORR1D1	LTR	MaLR	39	256	-118	5
905	970	204	62	79	chr3	41953889	41954254	-117645529	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	403	1	5
905	485	243	90	0	chr3	41954254	41954359	-117645424	+	ORR1D1	LTR	MaLR	253	367	-3	5
905	856	316	14	44	chr3	41954364	41954639	-117645144	-	ORR1E	LTR	MaLR	-64	295	29	5
905	276	313	41	47	chr3	41968854	41969025	-117630758	+	LTR81A	LTR	ERV1?	18	187	-1163	5
905	464	223	41	8	chr3	41971321	41971443	-117628340	+	RLTR25A	LTR	ERVK	389	514	-589	5
905	1914	201	23	3	chr3	41972228	41972613	-117627170	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	1	5
905	1665	152	40	3	chr3	41972613	41972896	-117626887	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	1220	5
905	1665	152	40	3	chr3	41972956	41972976	-117626807	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-290	1219	1197	5
905	1489	211	81	10	chr3	41984199	41984508	-117615275	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-385	1124	796	5
905	487	222	33	41	chr3	41984652	41984676	-117615107	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1097	866	847	5
905	299	140	0	109	chr3	41984948	41985012	-117614771	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1249	714	658	5
905	537	226	22	17	chr3	41984965	41985104	-117614679	-	MT2B	LTR	ERVL	-312	163	17	5
905	1336	112	26	83	chr3	41985347	41985703	-117614080	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-141	842	493	5
905	3225	55	3	0	chr3	41986770	41987154	-117612629	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	5
905	4983	185	35	4	chr3	41987154	41988172	-117611611	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1	1050	-6630	5
905	20739	46	4	6	chr3	41988172	41990886	-117608897	+	IAPEy-int	LTR	ERVK	4804	7513	0	5
905	3143	47	2	50	chr3	41990886	41991290	-117608493	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	5
905	319	242	38	134	chr3	41992887	41992916	-117606867	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	688	713	-142	5
905	768	191	39	26	chr3	41993898	41994054	-117605729	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	866	1023	0	5
905	494	380	80	48	chr3	41994369	41994720	-117605063	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-197	398	37	5
905	612	255	84	36	chr3	42001868	42002035	-117597748	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	379	6
905	430	264	32	65	chr3	42002145	42002331	-117597452	-	RLTR17	LTR	ERVK	-397	295	116	7
905	1093	308	53	49	chr3	42004293	42004701	-117595082	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	406	-13	9
905	814	290	128	63	chr3	42004817	42005295	-117594488	+	MER67D	LTR	ERV1	1	509	-5	1
905	251	241	19	108	chr3	42017688	42017846	-117581937	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-523	383	240	2
905	247	348	93	68	chr3	42027961	42028346	-117571437	-	LTR85b	LTR	Gypsy?	-133	651	257	3
905	2452	91	102	0	chr3	42033448	42033821	-117565962	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	3
905	5922	32	3	20	chr3	42033823	42034580	-117565203	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5736	3
905	2155	54	0	0	chr3	42034579	42034857	-117564926	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	3
905	3359	58	0	20	chr3	42034857	42035316	-117564467	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	213	3
905	1041	105	0	0	chr3	42035284	42035436	-117564347	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6162	319	168	3
905	248	309	0	0	chr3	42035436	42035491	-117564292	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	221	3
905	871	128	25	109	chr3	42035491	42035693	-117564090	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6288	193	9	3
905	2393	97	102	0	chr3	42035695	42036067	-117563716	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	-1	410	1	3
905	230	294	14	29	chr3	42037073	42037143	-117562640	-	MLT1B	LTR	MaLR	-31	359	291	3
905	1162	247	63	22	chr3	42039813	42040177	-117559606	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	3
905	499	348	132	20	chr3	42041462	42041764	-117558019	-	LTR16E2	LTR	ERVL	-222	346	11	4
905	3678	28	12	2	chr3	42042173	42042605	-117557178	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
905	6930	64	16	5	chr3	42066172	42067055	-117532728	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	8
905	1839	179	45	26	chr3	42070267	42070481	-117529302	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	207	-187	8
905	1839	179	45	26	chr3	42070665	42070829	-117528954	+	ORR1B1	LTR	MaLR	208	385	-9	8
905	527	275	88	17	chr3	42073874	42074055	-117525728	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	194	-362	8
906	637	366	73	17	chr3	42085151	42085509	-117514274	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-25	554	177	1
906	1317	200	107	8	chr3	42085488	42085791	-117513992	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-114	293	1	1
906	830	294	90	25	chr3	42091326	42091682	-117508101	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	1
906	811	252	118	33	chr3	42092433	42092816	-117506967	-	MT2A	LTR	ERVL	-70	463	1	1
906	465	352	34	17	chr3	42103084	42103437	-117496346	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	1
906	1679	209	84	54	chr3	42110041	42110285	-117489498	-	RMER13B	LTR	ERVK	-183	725	449	1
906	1679	209	84	54	chr3	42110514	42110710	-117489073	-	RMER13B	LTR	ERVK	-460	448	272	1
906	1720	202	20	44	chr3	42110729	42111179	-117488604	-	RMER17B	LTR	ERVK	-519	439	1	1
906	1045	329	84	11	chr3	42114830	42115199	-117484584	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	396	-124	1
906	365	345	63	80	chr3	42129995	42130282	-117469501	+	ORR1E	LTR	MaLR	32	313	-46	1
906	228	290	95	21	chr3	42139247	42139342	-117460441	-	MTEb	LTR	MaLR	-28	351	250	2
906	2816	207	43	65	chr3	42146784	42147441	-117452342	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	2
906	650	202	77	77	chr3	42147937	42148119	-117451664	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	182	-429	2
906	1352	278	63	45	chr3	42148399	42149011	-117450772	+	RMER19B	LTR	ERVK	138	902	0	2
906	1608	177	36	51	chr3	42182696	42183030	-117416753	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
906	401	326	77	43	chr3	42183277	42183626	-117416157	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	5	2
906	516	382	93	26	chr3	42184927	42185239	-117414544	+	MLT1A0	LTR	MaLR	21	353	-12	2
906	1462	256	71	13	chr3	42187494	42187890	-117411893	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
906	559	274	116	33	chr3	42188470	42188745	-117411038	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	298	-214	2
906	774	295	71	74	chr3	42188738	42189152	-117410631	+	RLTR18B	LTR	ERVK	192	612	-4	2
906	725	291	131	55	chr3	42189227	42189678	-117410105	+	MER31A	LTR	ERV1	1	485	0	2
906	902	320	80	6	chr3	42189697	42190046	-117409737	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	5	2
906	1918	170	11	58	chr3	42190641	42190695	-117409088	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	315	2
906	1918	170	11	58	chr3	42190859	42191184	-117408599	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-53	314	6	2
906	2059	170	42	3	chr3	42191471	42191848	-117407935	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	2
906	2271	236	178	22	chr3	42193264	42194038	-117405745	-	RMER19B	LTR	ERVK	-7	895	1	2
906	1257	281	145	8	chr3	42199206	42199251	-117400532	+	MTD	LTR	MaLR	12	86	-333	2
906	1257	281	145	8	chr3	42199983	42200296	-117399487	+	MTD	LTR	MaLR	87	419	0	2
906	1308	295	58	46	chr3	42200298	42200795	-117398988	+	MTD-int	LTR	MaLR	3	505	-753	2
907	3473	45	17	100	chr3	42210732	42211250	-117388533	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
907	1464	171	91	14	chr3	42215416	42215713	-117384070	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	320	-12	3
907	624	145	9	43	chr3	42219690	42219805	-117379978	+	MTC	LTR	MaLR	2	112	-309	3
907	1162	200	4	39	chr3	42220575	42220726	-117379057	+	MTC	LTR	MaLR	196	346	-75	3
907	2615	51	39	0	chr3	42220726	42221058	-117378725	+	IAPLTR4	LTR	ERVK	1	345	0	3
907	1162	200	4	39	chr3	42221058	42221140	-117378643	+	MTC	LTR	MaLR	347	421	0	3
907	953	222	234	81	chr3	42228196	42228589	-117371194	-	MT2A	LTR	ERVL	-78	455	3	3
907	1100	245	40	104	chr3	42230250	42230596	-117369187	+	MTEa	LTR	MaLR	1	324	-55	3
907	2461	207	79	0	chr3	42238073	42238605	-117361178	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	1	3
907	236	319	175	42	chr3	42248501	42248878	-117350905	+	MER31B	LTR	ERV1	9	435	-31	3
907	263	281	113	10	chr3	42250655	42250689	-117349094	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	168	201	-479	3
907	263	281	113	10	chr3	42250852	42250914	-117348869	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	202	272	-408	3
907	301	342	50	25	chr3	42253168	42253288	-117346495	+	MTE-int	LTR	MaLR	741	863	-717	3
907	986	220	18	72	chr3	42262749	42263028	-117336755	+	MER67D	LTR	ERV1	3	266	-248	3
907	554	318	73	107	chr3	42266889	42267245	-117332538	-	MTEa	LTR	MaLR	-33	346	3	3
907	243	195	0	0	chr3	42269375	42269416	-117330367	-	RMER12B	LTR	ERVK	0	1404	1364	3
907	371	345	92	65	chr3	42270273	42270611	-117329172	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-11	363	17	3
907	1080	282	84	9	chr3	42275735	42276078	-117323705	+	MTEa	LTR	MaLR	8	376	-3	4
907	1768	193	56	5	chr3	42276691	42277066	-117322717	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
907	556	361	94	25	chr3	42296194	42296586	-117303197	+	RMER5	LTR	ERV1	116	534	0	4
907	280	295	0	0	chr3	42298050	42298128	-117301655	+	MTC	LTR	MaLR	313	390	-31	4
907	521	307	104	62	chr3	42303606	42304009	-117295774	+	MTE-int	LTR	MaLR	893	1470	-110	4
907	464	301	72	29	chr3	42305381	42305590	-117294193	-	RLTR16	LTR	ERVK	-255	250	33	4
907	477	375	41	37	chr3	42305860	42306131	-117293652	+	MLT1A0	LTR	MaLR	63	334	-31	4
907	3075	26	2	89	chr3	42306575	42307002	-117292781	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	4
907	8351	22	0	1	chr3	42307004	42307998	-117291785	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	992	4
907	322	258	39	15	chr3	42308081	42308211	-117291572	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-5987	1594	1462	4
907	4223	38	1	11	chr3	42308275	42309171	-117290612	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-989	998	41	4
907	3054	26	2	89	chr3	42309183	42309608	-117290175	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	4
907	231	329	75	63	chr3	42312426	42312585	-117287198	+	RMER15	LTR	ERVL	319	479	-96	4
907	1327	283	34	9	chr3	42322537	42322862	-117276921	-	MTEb	LTR	MaLR	-42	337	5	4
907	4190	177	20	72	chr3	42323393	42323819	-117275964	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	414	-494	4
907	4190	177	20	72	chr3	42324110	42324608	-117275175	+	RMER13B	LTR	ERVK	415	877	-31	4
907	552	375	78	12	chr3	42324756	42325091	-117274692	+	MLT1A	LTR	MaLR	18	374	0	4
907	1388	308	25	83	chr3	42326444	42326996	-117272787	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	92	4
907	249	400	0	0	chr3	42327173	42327239	-117272544	-	RMER19C	LTR	ERVK	-430	181	116	4
907	4525	141	128	57	chr3	42327239	42328187	-117271596	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1015	-8	4
907	717	131	7	44	chr3	42328211	42328347	-117271436	-	RMER19C	LTR	ERVK	-480	131	1	4
907	752	313	51	60	chr3	42335334	42335650	-117264133	-	LTR16C	LTR	ERVL	-149	340	28	4
908	433	329	130	9	chr3	42338290	42338520	-117261263	+	RMER15	LTR	ERVL	299	556	-19	4
908	226	368	123	0	chr3	42343667	42343773	-117256010	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	375	257	4
908	344	263	52	10	chr3	42344623	42344719	-117255064	-	ORR1E	LTR	MaLR	-257	102	3	4
908	250	341	37	37	chr3	42344851	42344985	-117254798	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-3	535	402	4
908	700	327	127	67	chr3	42359451	42359977	-117239806	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	555	1	5
908	1063	268	70	8	chr3	42366800	42367157	-117232626	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
908	535	361	90	4	chr3	42370141	42370419	-117229364	-	MER21B	LTR	ERV1	-88	775	474	5
908	265	314	14	0	chr3	42370586	42370656	-117229127	-	MER21B	LTR	ERV1	-605	258	188	5
908	275	281	74	66	chr3	42371362	42371484	-117228299	+	RMER15	LTR	ERVL	1	123	-452	5
908	298	261	102	0	chr3	42371584	42371672	-117228111	+	RMER15	LTR	ERVL	479	575	0	5
908	281	304	0	12	chr3	42372249	42372329	-117227454	-	ORR1E	LTR	MaLR	-243	116	38	5
908	230	354	30	10	chr3	42377073	42377173	-117222610	-	MTEb	LTR	MaLR	-12	358	257	5
908	1600	183	46	7	chr3	42377170	42377594	-117222189	+	RMER17C	LTR	ERVK	19	439	-519	5
908	670	273	43	0	chr3	42377689	42377850	-117221933	-	MTEb	LTR	MaLR	-207	172	5	5
908	362	299	60	60	chr3	42381705	42381922	-117217861	+	MTEa	LTR	MaLR	1	217	-162	5
908	1913	204	47	6	chr3	42384464	42384829	-117214954	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	189	5
908	2722	59	2	128	chr3	42385170	42385614	-117214169	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	5
908	2421	148	5	18	chr3	42392681	42393080	-117206703	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
908	555	355	52	25	chr3	42409077	42409381	-117190402	-	MLT2D	LTR	ERVL	-113	351	55	5
908	788	302	89	49	chr3	42412029	42412377	-117187406	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	4543	4876	-384	5
908	788	302	89	49	chr3	42412409	42412554	-117187229	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	4877	4951	-309	5
908	491	282	81	46	chr3	42412571	42412768	-117187015	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	4954	5157	-1393	5
908	425	266	81	61	chr3	42412771	42412919	-117186864	+	RMER4A	LTR	ERVK	289	439	-27	5
908	3826	225	64	30	chr3	42412919	42414033	-117185750	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7763	8914	-45	5
908	252	236	0	0	chr3	42414062	42414117	-117185666	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8904	8958	-1	5
908	1056	241	66	33	chr3	42414118	42414453	-117185330	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	346	-13	5
908	2143	266	63	77	chr3	42415300	42416405	-117183378	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	899	-9	5
908	987	306	58	45	chr3	42418441	42418681	-117181102	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	139	5
908	3047	69	5	2	chr3	42418681	42419076	-117180707	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
908	8739	50	4	3	chr3	42419076	42420173	-117179610	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
908	3175	51	5	2	chr3	42420173	42420568	-117179215	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
908	987	306	58	45	chr3	42420568	42420702	-117179081	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-246	138	3	5
908	372	303	92	75	chr3	42427247	42427640	-117172143	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-130	438	47	6
908	1004	279	68	20	chr3	42435986	42436337	-117163446	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	368	-2	6
908	3409	25	5	0	chr3	42442510	42442904	-117156879	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
908	9358	23	3	2	chr3	42442904	42444001	-117155782	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	6
908	3460	18	5	0	chr3	42444001	42444395	-117155388	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
908	761	244	11	39	chr3	42449726	42449905	-117149878	+	ORR1D1	LTR	MaLR	9	182	-192	6
908	687	263	68	59	chr3	42449934	42450156	-117149627	+	ORR1D1	LTR	MaLR	151	374	0	6
908	422	261	26	9	chr3	42459016	42459132	-117140651	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	400	6
908	689	324	69	80	chr3	42462873	42463148	-117136635	+	MTEb	LTR	MaLR	6	277	-102	6
909	694	301	135	61	chr3	42471355	42471681	-117128102	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	18	6
909	2433	126	105	7	chr3	42475051	42475460	-117124323	-	RLTR44B	LTR	ERVK	0	449	1	6
909	305	319	129	44	chr3	42480599	42480871	-117118912	+	RMER15	LTR	ERVL	229	523	-52	6
909	2219	202	25	55	chr3	42482914	42483444	-117116339	-	RLTR28	LTR	ERVL	-10	514	1	6
909	2019	208	40	25	chr3	42493924	42494398	-117105385	+	RMER6A	LTR	ERVK	261	741	-15	6
909	1908	131	103	57	chr3	42497126	42497580	-117102203	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
909	251	326	70	70	chr3	42500160	42500345	-117099438	+	MER67C	LTR	ERV1	22	206	-505	2
909	645	283	16	37	chr3	42502938	42503129	-117096654	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	191	-183	1
909	249	167	46	77	chr3	42508327	42508392	-117091391	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	2
909	852	302	28	59	chr3	42513807	42514198	-117085585	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	2
909	1455	185	127	3	chr3	42519144	42519466	-117080317	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-23	351	1	4
909	252	297	18	26	chr3	42519466	42519565	-117080218	-	LTR37A	LTR	ERV1	-88	338	241	4
909	1018	174	40	40	chr3	42520142	42520390	-117079393	-	RLTR45	LTR	ERVK	-126	356	61	4
909	860	173	6	67	chr3	42529800	42529969	-117069814	-	MTB	LTR	MaLR	-51	349	192	5
909	315	361	122	15	chr3	42530810	42531007	-117068776	+	MER21B	LTR	ERV1	588	805	-58	5
909	1840	244	16	0	chr3	42548735	42549121	-117050662	+	MTC	LTR	MaLR	3	394	-27	7
909	341	343	0	20	chr3	42558165	42558266	-117041517	-	MT2A	LTR	ERVL	-121	412	314	8
909	240	226	16	16	chr3	42560771	42560834	-117038949	+	MTEb	LTR	MaLR	317	379	0	9
909	242	352	110	49	chr3	42563086	42563331	-117036452	+	MLT1I	LTR	MaLR	106	365	-46	9
909	727	267	130	26	chr3	42566189	42566460	-117033323	-	MTE2a	LTR	MaLR	-62	357	53	1
909	287	282	13	13	chr3	42567380	42567459	-117032324	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-477	79	1	1
909	2171	187	13	38	chr3	42572032	42572510	-117027273	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	466	-95	1
909	995	222	195	30	chr3	42573856	42574084	-117025699	+	MT2A	LTR	ERVL	70	349	-184	1
909	995	222	195	30	chr3	42574269	42574373	-117025410	+	MT2A	LTR	ERVL	350	457	-76	1
909	796	319	65	54	chr3	42594296	42594702	-117005081	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	405	-14	1
910	406	324	168	39	chr3	42598633	42599015	-117000768	+	MLT1D	LTR	MaLR	72	502	-3	1
910	447	312	67	46	chr3	42616472	42616667	-116983116	-	MER21B	LTR	ERV1	-504	359	161	1
910	597	322	89	15	chr3	42619933	42620218	-116979565	+	MTE-int	LTR	MaLR	69	407	-1173	1
910	1399	247	71	39	chr3	42620297	42620833	-116978950	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	1	1
910	1087	216	5	0	chr3	42620944	42621148	-116978635	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	174	1
910	399	273	80	49	chr3	42622180	42622342	-116977441	-	MTE-int	LTR	MaLR	-627	953	787	1
910	362	291	21	27	chr3	42622442	42622558	-116977225	-	MTEb	LTR	MaLR	-39	380	256	1
910	244	367	53	26	chr3	42623088	42623239	-116976544	-	MTEb	LTR	MaLR	-164	195	41	1
910	1086	360	145	22	chr3	42623256	42624154	-116975629	+	MTE-int	LTR	MaLR	389	1396	-184	1
910	1991	123	46	44	chr3	42624154	42624520	-116975263	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	1
910	56898	16	7	4	chr3	42624520	42630971	-116968812	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	1
910	1991	123	46	44	chr3	42630971	42631337	-116968446	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	1
910	408	230	40	10	chr3	42631337	42631438	-116968345	+	MTE-int	LTR	MaLR	1391	1494	-86	1
910	250	200	0	0	chr3	42631518	42631568	-116968215	-	MT2A	LTR	ERVL	-483	50	1	1
910	615	251	56	46	chr3	42635679	42635875	-116963908	+	MTEb	LTR	MaLR	6	203	-176	1
910	686	280	37	19	chr3	42635851	42636066	-116963717	-	RMER5	LTR	ERV1	-4	530	312	2
910	914	269	137	32	chr3	42636071	42636443	-116963340	+	MTD	LTR	MaLR	9	419	0	2
910	492	214	19	0	chr3	42636904	42637007	-116962776	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	105	-407	2
910	323	172	17	0	chr3	42637026	42637084	-116962699	+	RLTR18B	LTR	ERVK	220	278	-234	2
910	1025	180	38	5	chr3	42640175	42640387	-116959396	-	RMER6D	LTR	ERVK	-139	581	363	2
910	341	145	43	14	chr3	42640467	42640537	-116959246	-	RMER6D	LTR	ERVK	-369	351	280	2
910	1511	170	0	23	chr3	42640921	42641186	-116958597	-	RMER6D	LTR	ERVK	-461	259	1	2
910	883	294	163	62	chr3	42645314	42645640	-116954143	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	373	18	2
910	2677	155	198	3	chr3	42645793	42646092	-116953691	-	RMER6C	LTR	ERVK	-1	689	357	2
910	2677	155	198	3	chr3	42646117	42646393	-116953390	-	RMER6C	LTR	ERVK	-334	356	2	2
910	1638	203	11	64	chr3	42656678	42657036	-116942747	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	379	-15	2
910	263	320	99	57	chr3	42662310	42662522	-116937261	-	MER21B	LTR	ERV1	-268	595	375	2
910	398	364	53	21	chr3	42662336	42662524	-116937259	-	MER68	LTR	ERVL	-6	557	364	2
910	1109	295	31	83	chr3	42665921	42666305	-116933478	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	1	2
910	350	246	24	81	chr3	42666306	42666381	-116933402	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1	1369	1298	2
910	1810	186	101	3	chr3	42666381	42666736	-116933047	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	390	-4	2
910	350	246	24	81	chr3	42666736	42666784	-116932999	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-73	1297	1253	2
910	2638	41	22	66	chr3	42668947	42669309	-116930474	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	2
910	534	206	14	81	chr3	42673953	42674101	-116925682	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-2	1101	964	2
910	4316	165	8	33	chr3	42674070	42674859	-116924924	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-253	775	7	2
910	2567	166	69	51	chr3	42682290	42682856	-116916927	+	RMER6-int	LTR	ERVK	10	585	-2592	2
910	2499	206	61	52	chr3	42682846	42683516	-116916267	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2502	3177	0	2
910	2589	202	142	3	chr3	42683516	42684062	-116915721	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	618	-102	2
910	2589	202	142	3	chr3	42684094	42684176	-116915607	+	RMER6D	LTR	ERVK	619	715	-5	2
910	350	179	92	31	chr3	42684308	42684435	-116915348	-	RMER6C	LTR	ERVK	-9	747	606	2
910	1988	218	107	67	chr3	42684470	42685304	-116914479	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	720	1	2
910	946	226	98	33	chr3	42687252	42687559	-116912224	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	327	-32	2
910	230	344	65	50	chr3	42690034	42690233	-116909550	+	LTR78	LTR	ERV1	176	377	-927	2
910	931	238	129	32	chr3	42690694	42691057	-116908726	+	MTD	LTR	MaLR	20	405	-14	2
910	304	295	93	110	chr3	42691059	42691131	-116908652	+	MTD-int	LTR	MaLR	3	63	-1195	2
910	304	295	93	110	chr3	42691254	42691417	-116908366	+	MTD-int	LTR	MaLR	64	234	-1024	2
910	2011	179	50	3	chr3	42695481	42695857	-116903926	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	3
910	1665	197	73	30	chr3	42703180	42703552	-116896231	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	7	3
910	677	195	8	0	chr3	42710852	42710975	-116888808	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	124	-250	3
910	1629	185	116	57	chr3	42713897	42714356	-116885427	-	RMER2	LTR	ERV1	-8	559	74	3
910	525	152	38	40	chr3	42716547	42716687	-116883096	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-251	127	3	3
910	974	204	55	55	chr3	42717270	42717597	-116882186	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	84	3
910	1786	185	95	29	chr3	42719156	42719568	-116880215	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	4	3
910	1217	262	97	0	chr3	42724513	42724852	-116874931	+	MTD	LTR	MaLR	45	416	-3	3
911	2954	71	10	18	chr3	42729816	42730023	-116869760	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	196	3
911	2954	71	10	18	chr3	42730263	42730454	-116869329	-	MTB	LTR	MaLR	-205	195	3	3
911	339	282	24	0	chr3	42733878	42733963	-116865820	-	MTE2b	LTR	MaLR	-292	87	1	3
911	1565	195	26	7	chr3	42735861	42736171	-116863612	+	MTC	LTR	MaLR	104	419	-2	3
911	579	322	132	10	chr3	42736175	42736479	-116863304	+	MT2A	LTR	ERVL	193	533	0	3
911	2316	143	26	16	chr3	42737732	42738435	-116861348	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	3
911	692	326	84	48	chr3	42740906	42741344	-116858439	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	3	456	-1124	3
911	228	268	67	44	chr3	42741332	42741422	-116858361	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	983	1074	-506	3
911	640	278	115	31	chr3	42741425	42741754	-116858029	+	RMER13A	LTR	ERVK	184	558	-350	3
911	230	281	10	92	chr3	42741897	42741995	-116857788	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	1491	1580	0	3
911	305	303	5	171	chr3	42741997	42742184	-116857599	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	158	-221	3
911	493	276	75	25	chr3	42742288	42742448	-116857335	+	MTE2a	LTR	MaLR	207	374	-5	3
911	646	216	10	1	chr3	42744310	42744459	-116855324	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-228	166	5	3
911	910	188	93	9	chr3	42744622	42744837	-116854946	+	ORR1B2	LTR	MaLR	127	359	-8	3
911	1699	203	29	148	chr3	42749338	42749824	-116849959	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	428	-2	3
911	1987	122	9	67	chr3	42757739	42758083	-116841700	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	3	3
911	824	271	98	81	chr3	42759422	42759791	-116839992	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	379	0	3
911	733	203	157	101	chr3	42760762	42760934	-116838849	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	188	3
911	733	203	157	101	chr3	42760988	42761203	-116838580	-	RMER17C	LTR	ERVK	-223	187	1	3
911	569	159	104	17	chr3	42791957	42792072	-116807711	+	MTC	LTR	MaLR	295	419	-2	4
911	6337	91	31	0	chr3	42799014	42799880	-116799903	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	4
911	500	160	703	5	chr3	42802827	42803021	-116796762	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	336	-384	4
911	1257	216	25	28	chr3	42803676	42804041	-116795742	+	RMER6D	LTR	ERVK	330	683	-7	4
911	3462	23	2	0	chr3	42807497	42807892	-116791891	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
911	1747	174	0	89	chr3	42828311	42828378	-116771405	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	273	4
911	1747	174	0	89	chr3	42828778	42829069	-116770714	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-55	272	1	4
911	860	266	175	36	chr3	42836642	42836687	-116763096	+	MTD	LTR	MaLR	43	89	-330	4
911	1836	163	3	7	chr3	42836687	42836996	-116762787	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	308	-3	4
911	860	266	175	36	chr3	42836996	42837281	-116762502	+	MTD	LTR	MaLR	90	419	0	4
911	510	337	48	51	chr3	42842566	42842919	-116756864	+	RLTR16	LTR	ERVK	23	427	-265	4
911	2562	48	7	2	chr3	42853580	42853914	-116745869	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	4
912	1011	257	62	45	chr3	42863518	42863873	-116735910	-	RMER5	LTR	ERV1	-18	516	156	5
912	734	280	182	7	chr3	42865186	42865480	-116734303	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	32	5
912	255	312	161	67	chr3	42869496	42869750	-116730033	-	MLT1K	LTR	MaLR	-165	430	153	5
912	693	337	69	19	chr3	42872099	42872459	-116727324	+	MER31A	LTR	ERV1	1	378	-107	5
912	1063	282	50	84	chr3	42877104	42877128	-116722655	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	344	5
912	1063	282	50	84	chr3	42877185	42877539	-116722244	-	MTE2b	LTR	MaLR	-36	343	3	5
912	2985	71	5	2	chr3	42879818	42880213	-116719570	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
912	1382	254	90	0	chr3	42880308	42880651	-116719132	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	46	5
912	334	328	99	26	chr3	42880710	42880901	-116718882	+	MLT1A1	LTR	MaLR	21	225	-183	5
912	3041	49	3	3	chr3	42886393	42886758	-116713025	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	5
912	4098	123	8	0	chr3	42886758	42887439	-116712344	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6965	5
912	1275	95	200	0	chr3	42887439	42887649	-116712134	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5004	5
912	447	296	90	15	chr3	42887662	42887920	-116711863	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5481	1061	822	5
912	2772	45	15	0	chr3	42888060	42888396	-116711387	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-995	992	652	5
912	300	111	0	0	chr3	42888399	42888444	-116711339	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-6405	137	93	5
912	371	87	0	0	chr3	42888625	42888671	-116711112	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	222	5
912	235	195	0	0	chr3	42888671	42888712	-116711071	-	RLTR27	LTR	ERVK	-37	272	232	5
912	748	87	10	0	chr3	42888712	42888815	-116710968	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7477	104	1	5
912	2881	47	0	67	chr3	42888815	42889206	-116710577	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	5
912	550	310	200	21	chr3	42891975	42892508	-116707275	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	197	961	-528	5
912	2615	61	0	20	chr3	42894460	42894798	-116704985	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	332	-14	5
912	2804	53	69	0	chr3	42894798	42895158	-116704625	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	5
912	2615	61	0	20	chr3	42895158	42895172	-116704611	+	ORR1A1	LTR	MaLR	333	346	0	5
912	424	326	27	0	chr3	42895768	42895915	-116703868	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	389	5
912	260	373	7	22	chr3	42901240	42901377	-116698406	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	135	-230	5
912	313	243	59	59	chr3	42901875	42901993	-116697790	+	MLT2C1	LTR	ERVL	111	228	-169	5
912	7111	196	37	58	chr3	42904891	42905141	-116694642	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1301	5
912	7111	196	37	58	chr3	42905170	42905217	-116694566	-	RLTR21	LTR	ERVK	-272	1300	1245	5
912	7111	196	37	58	chr3	42905260	42905344	-116694439	-	RLTR21	LTR	ERVK	-328	1244	1174	5
912	7111	196	37	58	chr3	42905412	42905797	-116693986	-	RLTR21	LTR	ERVK	-399	1173	837	5
912	7111	196	37	58	chr3	42906501	42907331	-116692452	-	RLTR21	LTR	ERVK	-736	836	8	5
912	714	333	47	33	chr3	42907556	42907919	-116691864	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	12	5
912	1067	276	75	107	chr3	42910593	42910814	-116688969	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	902	691	5
912	1248	250	68	38	chr3	42911210	42911624	-116688159	-	RMER19C	LTR	ERVK	-212	690	1	5
912	3862	183	111	121	chr3	42919193	42920307	-116679476	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1103	0	5
912	755	158	15	8	chr3	42923580	42923714	-116676069	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-979	135	1	6
912	1716	231	86	36	chr3	42930122	42930678	-116669105	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	584	0	6
912	592	283	56	48	chr3	42937324	42937680	-116662103	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	6
912	2457	23	2	298	chr3	42950965	42951519	-116648264	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	6
912	14594	25	42	31	chr3	42951521	42953443	-116646340	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	41	6
912	2468	20	2	298	chr3	42953453	42954007	-116645776	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	6
912	1762	88	0	8	chr3	42955072	42955314	-116644469	+	LTRIS4	LTR	ERV1	1	240	-267	6
912	1357	112	90	12	chr3	42955752	42955997	-116643786	+	LTRIS4	LTR	ERV1	244	507	0	6
912	2325	197	37	17	chr3	42970129	42970665	-116629118	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8297	8843	-116	6
912	707	262	34	69	chr3	42970727	42971076	-116628707	+	RLTR15	LTR	ERVK	8	344	-15	6
912	1269	245	51	12	chr3	42973238	42973572	-116626211	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-29	498	152	6
912	870	258	52	113	chr3	42974033	42974378	-116625405	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	107	6
912	432	198	65	11	chr3	42974517	42974609	-116625174	-	RLTR23	LTR	ERV1	-326	104	8	6
912	1639	223	107	24	chr3	42983141	42983523	-116616260	-	MTC	LTR	MaLR	-7	414	1	6
912	1487	156	53	38	chr3	42983528	42983848	-116615935	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	366	6
912	1112	183	89	0	chr3	42983839	42984052	-116615731	-	RMER6C	LTR	ERVK	-488	232	1	6
912	318	181	163	41	chr3	42985171	42985269	-116614514	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	110	-258	6
912	257	279	21	41	chr3	42985346	42985443	-116614340	+	RLTR9B	LTR	ERVK	343	437	0	6
912	225	206	68	81	chr3	42985569	42985643	-116614140	+	MLT1F1	LTR	MaLR	264	336	-233	6
912	2058	154	90	15	chr3	42987674	42988064	-116611719	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	419	-80	6
913	368	355	50	11	chr3	43006246	43006428	-116593355	+	MLT1D	LTR	MaLR	10	198	-167	8
913	476	350	16	5	chr3	43007524	43007711	-116592072	+	MLT1D	LTR	MaLR	317	505	0	8
913	280	181	13	77	chr3	43016437	43016515	-116583268	-	RMER19C	LTR	ERVK	-501	110	38	2
913	314	365	0	0	chr3	43019991	43020087	-116579696	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2013	5588	5493	2
913	1143	276	76	23	chr3	43020283	43020819	-116578964	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1087	3976	3470	2
913	3044	133	66	2	chr3	43020854	43021013	-116578770	+	RLTR1	LTR	ERV1	1	160	-464	2
913	3044	133	66	2	chr3	43021092	43021430	-116578353	+	RLTR1	LTR	ERV1	161	528	-96	2
913	697	113	0	9	chr3	43022407	43022514	-116577269	-	RLTR23	LTR	ERV1	-324	106	1	3
913	381	205	60	43	chr3	43022991	43023069	-116576714	+	RMER4B	LTR	ERVK	458	532	-53	3
913	381	205	60	43	chr3	43023238	43023276	-116576507	+	RMER4B	LTR	ERVK	533	575	-10	3
913	4051	237	46	9	chr3	43023276	43024371	-116575412	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5386	6520	-30	3
913	3519	13	2	0	chr3	43025066	43025461	-116574322	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
913	336	315	74	57	chr3	43029443	43029618	-116570165	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	181	-184	4
913	3661	119	22	40	chr3	43035877	43036470	-116563313	-	MT2B2	LTR	ERVL	-2	582	1	4
913	260	289	62	0	chr3	43038078	43038175	-116561608	-	RLTR40	LTR	ERVK	-34	783	681	5
913	1546	193	30	7	chr3	43039245	43039542	-116560241	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	23	5
913	301	281	6	9	chr3	43044072	43044162	-116555621	+	MLT1A0	LTR	MaLR	78	166	-242	6
913	283	289	50	63	chr3	43044788	43044947	-116554836	+	MT2B2	LTR	ERVL	108	264	-320	6
913	283	285	97	88	chr3	43048876	43049103	-116550680	-	LTR40c	LTR	ERVL	-33	432	204	7
913	1318	257	20	71	chr3	43059082	43059476	-116540307	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	8
913	677	271	98	64	chr3	43063197	43063643	-116536140	-	MT2B	LTR	ERVL	-2	599	1	9
913	3678	244	81	17	chr3	43065839	43066925	-116532858	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-330	1179	24	9
913	755	278	31	16	chr3	43066929	43067185	-116532598	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-9	358	99	9
913	533	226	1	24	chr3	43067711	43067842	-116531941	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-211	116	1	9
913	328	331	86	7	chr3	43068312	43068452	-116531331	+	RMER5	LTR	ERV1	191	341	-193	1
913	336	297	52	149	chr3	43083277	43083472	-116516311	-	RLTR18	LTR	ERVK	-144	472	192	1
913	371	377	9	70	chr3	43083494	43083708	-116516075	-	RLTR18	LTR	ERVK	-300	316	116	1
913	251	341	28	64	chr3	43085591	43085732	-116514051	-	MTE-int	LTR	MaLR	-44	1536	1401	1
914	1050	127	220	19	chr3	43130811	43131020	-116468763	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-77	252	2	1
914	395	360	95	37	chr3	43131218	43131460	-116468323	-	MTE2b	LTR	MaLR	-123	256	1	1
914	1943	228	60	12	chr3	43135083	43135562	-116464221	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	26	1
914	2230	208	39	12	chr3	43137328	43137839	-116461944	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	3	2
914	4839	152	74	9	chr3	43142519	43143412	-116456371	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	951	-7	2
914	858	285	81	40	chr3	43154546	43154893	-116444890	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	362	-8	2
914	306	361	52	57	chr3	43158100	43158329	-116441454	+	RMER15	LTR	ERVL	347	574	-1	2
914	3499	150	41	47	chr3	43161611	43162382	-116437401	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	2
914	2880	195	76	21	chr3	43166249	43166905	-116432878	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	2
914	473	292	38	147	chr3	43186469	43186551	-116413232	-	MTD-int	LTR	MaLR	-927	331	247	2
914	589	328	72	30	chr3	43186588	43186869	-116412914	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1285	295	3	2
914	712	344	34	114	chr3	43186870	43187316	-116412467	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	2
914	306	263	61	74	chr3	43200938	43201086	-116398697	-	RMER15	LTR	ERVL	-157	418	273	2
914	667	82	98	17	chr3	43201376	43201549	-116398234	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-400	506	320	2
914	610	306	143	17	chr3	43226536	43226892	-116372891	-	RMER5	LTR	ERV1	-13	521	121	3
914	2544	80	20	3	chr3	43232893	43233244	-116366539	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	3
914	390	322	95	72	chr3	43237428	43237652	-116362131	-	MER67C	LTR	ERV1	-215	496	278	3
914	390	322	95	72	chr3	43237922	43238045	-116361738	-	MER67C	LTR	ERV1	-434	277	141	3
914	1469	189	58	13	chr3	43240094	43240404	-116359379	-	RMER6C	LTR	ERVK	-366	324	1	3
914	464	343	37	47	chr3	43240525	43240739	-116359044	+	RMER15	LTR	ERVL	273	484	-91	3
914	2930	26	3	3	chr3	43240994	43241340	-116358443	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
914	785	269	78	9	chr3	43241347	43241579	-116358204	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	170	3
914	350	245	31	21	chr3	43241839	43241935	-116357848	-	MTD	LTR	MaLR	-318	101	5	3
914	873	314	178	6	chr3	43246554	43247038	-116352745	-	MER67C	LTR	ERV1	-128	583	17	3
914	2299	228	74	2	chr3	43247545	43248042	-116351741	-	RMER19A	LTR	ERVK	-204	533	1	3
914	1359	281	157	42	chr3	43248112	43248655	-116351128	-	RMER20B	LTR	ERVK	-22	605	1	3
914	482	317	155	24	chr3	43250173	43250412	-116349371	+	RMER15	LTR	ERVL	27	298	-277	3
914	536	264	130	78	chr3	43250412	43250757	-116349026	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-2	366	4	3
914	469	272	7	14	chr3	43250790	43250928	-116348855	+	RMER15	LTR	ERVL	275	411	-164	3
914	226	279	63	0	chr3	43252178	43252257	-116347526	+	RMER15	LTR	ERVL	492	575	0	3
915	913	204	138	17	chr3	43254769	43255008	-116344775	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	268	-1580	3
915	1810	202	91	48	chr3	43259301	43259826	-116339957	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	262	809	-1039	3
915	231	158	0	0	chr3	43260040	43260078	-116339705	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1590	1627	-221	3
915	313	338	33	26	chr3	43266554	43266706	-116333077	+	MLT1D	LTR	MaLR	353	505	0	3
915	614	245	82	34	chr3	43284804	43285011	-116314772	+	ORR1D2	LTR	MaLR	152	368	-2	4
915	1689	219	5	53	chr3	43312465	43312860	-116286923	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	1	4
915	4256	162	24	25	chr3	43316389	43317199	-116282584	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	4
915	226	379	17	17	chr3	43317202	43317320	-116282463	+	MLT2D	LTR	ERVL	442	559	-1	4
915	604	350	68	34	chr3	43318405	43319424	-116280359	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	3644	4771	-990	4
915	1109	273	30	11	chr3	43326655	43327022	-116272761	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
915	480	316	112	67	chr3	43341388	43341673	-116258110	-	MTE2b	LTR	MaLR	-76	303	6	4
915	911	120	38	0	chr3	43342722	43342880	-116256903	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	227	4
915	2481	41	0	6	chr3	43342938	43343258	-116256525	-	RLTR10	LTR	ERVK	-72	318	1	4
915	17028	23	4	13	chr3	43343260	43345262	-116254521	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	1	4
915	893	122	39	0	chr3	43345264	43345420	-116254363	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	227	4
915	2502	38	0	6	chr3	43345478	43345798	-116253985	-	RLTR10	LTR	ERVK	-72	318	1	4
915	3515	23	0	0	chr3	43350893	43351289	-116248494	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
915	9207	35	2	1	chr3	43351289	43352386	-116247397	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
915	3515	23	0	0	chr3	43352386	43352782	-116247001	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
915	367	313	103	12	chr3	43363434	43363599	-116236184	-	ORR1E	LTR	MaLR	-179	180	1	4
915	588	302	61	91	chr3	43368246	43368588	-116231195	-	MTEb	LTR	MaLR	-17	362	31	4
915	298	350	89	42	chr3	43382282	43382518	-116217265	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-78	434	188	5
915	294	335	128	32	chr3	43382788	43382976	-116216807	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-235	277	72	5
915	1459	272	54	84	chr3	43383450	43384080	-116215703	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	5
915	286	307	69	10	chr3	43384153	43384255	-116215528	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	270	5
916	270	353	65	50	chr3	43385396	43385596	-116214187	+	MLT1A0	LTR	MaLR	126	328	-37	5
916	1344	211	43	93	chr3	43390412	43390584	-116209199	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	189	-501	5
916	1344	211	43	93	chr3	43391625	43391827	-116207956	+	RMER6C	LTR	ERVK	190	358	-332	5
916	553	279	84	41	chr3	43393282	43393656	-116206127	+	RLTR45	LTR	ERVK	42	482	0	5
916	1249	346	48	17	chr3	43402414	43402934	-116196849	+	RMER15	LTR	ERVL	22	557	-18	5
916	250	291	74	53	chr3	43403721	43403910	-116195873	-	RLTR15	LTR	ERVK	-141	218	26	5
916	3860	223	39	56	chr3	43403997	43404731	-116195052	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-54	8905	8183	5
916	3860	223	39	56	chr3	43404964	43405341	-116194442	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-777	8182	7813	5
916	393	304	51	72	chr3	43405420	43405657	-116194126	-	RMER4A	LTR	ERVK	-20	565	225	5
916	391	320	33	0	chr3	43405760	43405913	-116193870	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1573	753	596	5
916	1950	289	58	39	chr3	43405975	43406814	-116192969	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1921	4629	3775	5
916	726	279	32	63	chr3	43409585	43409933	-116189850	-	RLTR15	LTR	ERVK	-22	337	1	5
916	1818	128	6	56	chr3	43410403	43410742	-116189041	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
916	907	343	38	16	chr3	43427314	43427741	-116172042	+	RMER5	LTR	ERV1	81	516	-18	5
916	2405	178	169	12	chr3	43436268	43436864	-116162919	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	6
916	5408	111	28	30	chr3	43439035	43439930	-116159853	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	6
916	1128	284	16	7	chr3	43446851	43447156	-116152627	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	308	-59	6
916	597	198	47	0	chr3	43451022	43451179	-116148604	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	180	-204	6
916	457	271	8	0	chr3	43451333	43451462	-116148321	+	ORR1D1	LTR	MaLR	255	384	0	6
916	9421	9	0	0	chr3	43461744	43462781	-116137002	+	MERVL-int	LTR	ERVL	2568	3604	-1881	6
916	3038	41	0	0	chr3	43462786	43463202	-116136581	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3865	1896	1340	6
916	800	248	4	76	chr3	43469842	43470078	-116129705	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	242	460	-117	6
916	248	331	71	75	chr3	43472677	43472972	-116126811	+	MTEa	LTR	MaLR	24	337	-42	6
916	329	189	99	11	chr3	43476347	43476438	-116123345	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1269	101	3	6
916	1307	219	63	60	chr3	43476438	43476801	-116122982	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-13	365	2	6
916	2946	82	10	0	chr3	43483558	43483950	-116115833	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
916	2593	108	8	5	chr3	43483950	43484350	-116115433	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	401	-697	6
916	644	265	43	63	chr3	43490840	43491094	-116108689	-	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	0	628	380	6
916	4893	80	31	3	chr3	43491753	43492455	-116107328	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	377	1098	0	6
916	864	37	0	0	chr3	43492455	43492562	-116107221	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	107	-289	6
916	906	289	115	23	chr3	43496199	43496546	-116103237	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	27	6
916	988	300	96	20	chr3	43513759	43514113	-116085670	+	MTC	LTR	MaLR	41	421	0	2
916	756	349	38	19	chr3	43515043	43515361	-116084422	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	56	2
916	3485	18	2	0	chr3	43515393	43515788	-116083995	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
917	618	220	75	45	chr3	43527053	43527253	-116072530	-	RLTR12A	LTR	ERVK	0	568	363	4
917	1314	182	67	13	chr3	43530719	43531031	-116068752	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
917	1800	221	52	54	chr3	43533713	43534045	-116065738	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	344	-346	5
917	1800	221	52	54	chr3	43534118	43534287	-116065496	+	RMER6C	LTR	ERVK	345	500	-190	5
917	1325	169	91	0	chr3	43536053	43536295	-116063488	+	ORR1A4	LTR	MaLR	65	328	-1	6
917	1510	232	12	16	chr3	43539262	43539581	-116060202	+	RLTR12B	LTR	ERVK	5	322	-206	6
917	2107	226	53	67	chr3	43541781	43542265	-116057518	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	230	7
917	2107	226	53	67	chr3	43542315	43542507	-116057276	-	RMER6C	LTR	ERVK	-461	229	22	7
917	232	208	38	25	chr3	43542692	43542771	-116057012	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-4	551	472	7
917	426	288	44	10	chr3	43542844	43543013	-116056770	-	MT2A	LTR	ERVL	-30	571	347	7
917	374	305	30	30	chr3	43543057	43543194	-116056589	-	MT2A	LTR	ERVL	-164	329	100	7
917	1451	201	89	9	chr3	43543208	43543535	-116056248	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	42	7
917	517	196	9	36	chr3	43543554	43543665	-116056118	-	MT2A	LTR	ERVL	-423	110	3	7
917	1388	214	4	4	chr3	43546647	43546909	-116052874	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	60	8
917	1902	172	64	68	chr3	43546897	43547352	-116052431	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-7	1502	1050	8
917	255	273	58	43	chr3	43547354	43547423	-116052360	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-146	183	114	8
917	512	175	84	29	chr3	43547985	43548164	-116051619	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-158	236	2	8
917	1602	187	7	3	chr3	43552455	43552761	-116047022	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1656	307	1	8
917	1051	227	115	25	chr3	43552769	43552979	-116046804	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	204	-190	8
917	1051	225	124	17	chr3	43553442	43553597	-116046186	+	ORR1A4	LTR	MaLR	142	321	-8	8
917	1459	88	5	0	chr3	43557600	43557794	-116041989	+	MTB	LTR	MaLR	3	197	-203	9
917	2361	114	124	14	chr3	43557804	43558232	-116041551	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	9
917	946	134	25	25	chr3	43558783	43558912	-116040871	+	MTB	LTR	MaLR	182	310	-90	9
917	533	278	74	55	chr3	43558912	43558992	-116040791	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	692	611	9
917	2835	76	63	0	chr3	43558992	43559388	-116040395	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	9
917	1936	216	66	40	chr3	43559388	43559805	-116039978	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-82	610	98	9
917	1936	214	66	40	chr3	43559874	43559969	-116039814	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-464	97	3	9
917	625	116	11	0	chr3	43559972	43560067	-116039716	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	312	407	0	1
917	1522	253	48	10	chr3	43574067	43574463	-116025320	+	RMER19A	LTR	ERVK	327	737	0	1
917	1685	192	79	77	chr3	43578102	43578531	-116021252	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	1
917	1493	228	25	87	chr3	43578822	43579225	-116020558	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	512	0	1
917	925	254	29	145	chr3	43601084	43601498	-115998285	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	366	-12	1
917	3588	175	42	16	chr3	43608560	43609297	-115990486	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	1
917	3024	52	34	0	chr3	43609634	43610017	-115989766	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
917	1183	208	36	68	chr3	43626316	43626765	-115973018	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	441	-517	1
917	2670	70	3	0	chr3	43636628	43636969	-115962814	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	342	-4	2
917	2793	229	73	89	chr3	43640821	43641599	-115958184	-	RMER13A	LTR	ERVK	-94	766	1	2
917	276	321	92	50	chr3	43641788	43641929	-115957854	-	MLT1D	LTR	MaLR	-75	430	284	2
917	337	332	102	20	chr3	43646497	43646694	-115953089	+	MLT1D	LTR	MaLR	269	481	-24	2
918	481	225	0	43	chr3	43650203	43650319	-115949464	+	RMER6C	LTR	ERVK	535	645	-45	2
918	299	249	70	140	chr3	43655807	43655894	-115943889	-	RMER17C	LTR	ERVK	-158	252	183	2
918	299	249	70	140	chr3	43656068	43656251	-115943532	-	RMER17C	LTR	ERVK	-228	182	2	2
918	2037	188	70	21	chr3	43656251	43656680	-115943103	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2789	2
918	2865	15	0	43	chr3	43658248	43658600	-115941183	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
918	55199	20	20	6	chr3	43658600	43664987	-115934796	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	2
918	2865	15	0	43	chr3	43664987	43665339	-115934444	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
918	1193	153	10	5	chr3	43670141	43670344	-115929439	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-440	2798	2595	2
918	1582	257	80	48	chr3	43670351	43670928	-115928855	+	RLTR1	LTR	ERV1	30	624	0	2
918	498	186	86	76	chr3	43670931	43671023	-115928760	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-644	2594	2506	2
918	498	186	86	76	chr3	43671064	43671169	-115928614	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-733	2505	2397	2
918	581	170	46	78	chr3	43671192	43671345	-115928438	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1895	1343	1196	2
918	319	207	17	0	chr3	43671758	43671816	-115927967	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2081	1157	1099	2
918	309	208	49	59	chr3	43672283	43672385	-115927398	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2635	603	503	2
918	1078	224	36	79	chr3	43672422	43672727	-115927056	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2723	515	224	2
918	438	239	70	121	chr3	43672905	43673062	-115926721	-	RMER17C	LTR	ERVK	-20	390	242	2
918	624	323	22	49	chr3	43675531	43675798	-115923985	+	MTD	LTR	MaLR	1	260	-159	2
918	2464	204	91	42	chr3	43676046	43676695	-115923088	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	684	-6	2
918	1119	217	18	161	chr3	43678108	43678230	-115921553	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	249	2
918	1119	217	18	161	chr3	43678324	43678585	-115921198	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-81	248	1	2
918	3714	34	0	96	chr3	43696389	43696912	-115902871	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7109	7581	0	2
918	3697	35	7	0	chr3	43696912	43697345	-115902438	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	2
918	676	336	91	36	chr3	43700775	43701105	-115898678	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	6	2
918	3058	32	82	0	chr3	43705485	43705865	-115893918	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	411	0	2
918	1073	99	25	81	chr3	43705866	43706064	-115893719	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	2
918	244	302	0	0	chr3	43706064	43706117	-115893666	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	2
918	3504	66	4	16	chr3	43706117	43706695	-115893088	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	2
918	2695	61	0	3	chr3	43706695	43707038	-115892745	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	2
918	5964	63	45	11	chr3	43707031	43707833	-115891950	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5651	6479	-2	2
918	3485	28	97	2	chr3	43707835	43708268	-115891515	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	474	-1	2
918	252	250	31	0	chr3	43710652	43710716	-115889067	+	MTD	LTR	MaLR	354	419	0	2
918	2517	200	83	26	chr3	43713682	43714335	-115885448	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	2
918	1965	157	9	3	chr3	43714484	43714816	-115884967	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	334	-25	2
918	335	360	75	0	chr3	43715909	43716056	-115883727	+	MTE-int	LTR	MaLR	770	927	-653	3
918	229	343	100	43	chr3	43716420	43716630	-115883153	+	MTE-int	LTR	MaLR	1273	1494	-86	3
918	724	294	122	43	chr3	43717745	43718210	-115881573	-	RMER2	LTR	ERV1	-26	541	1	3
918	459	250	0	9	chr3	43722170	43722278	-115877505	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	650	3
918	3978	138	43	9	chr3	43722278	43722929	-115876854	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	6	3
918	3250	174	25	23	chr3	43723104	43723750	-115876033	-	RMER6A	LTR	ERVK	-109	647	1	3
918	536	364	62	45	chr3	43727149	43727569	-115872214	-	LTR80A	LTR	ERVL	-19	564	138	3
918	1572	249	122	36	chr3	43728914	43729465	-115870318	-	RMER19C	LTR	ERVK	-13	598	1	3
918	300	311	37	15	chr3	43730271	43730405	-115869378	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-307	157	21	3
918	448	325	131	38	chr3	43739474	43739765	-115860018	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	37	3
918	563	267	44	35	chr3	43756874	43757073	-115842710	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	209	3
918	277	234	76	25	chr3	43757050	43757129	-115842654	-	MT2B	LTR	ERVL	-346	255	173	3
918	654	126	48	0	chr3	43757106	43757209	-115842574	-	RMER6C	LTR	ERVK	-579	111	4	3
918	233	292	19	86	chr3	43766576	43766681	-115833102	-	LTR68	LTR	ERV1	-148	592	495	3
918	890	278	126	25	chr3	43774100	43774458	-115825325	+	MTD	LTR	MaLR	1	394	-25	3
919	1689	169	11	3	chr3	43779210	43779495	-115820288	-	RLTR27	LTR	ERVK	-22	287	1	4
919	1243	158	19	97	chr3	43780114	43780373	-115819410	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-86	241	3	4
919	3542	197	44	44	chr3	43789766	43790337	-115809446	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	521	4
919	3542	197	44	44	chr3	43790371	43790396	-115809387	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-583	520	504	4
919	3542	197	44	44	chr3	43790463	43790681	-115809102	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-600	503	288	4
919	435	222	40	0	chr3	43791257	43791356	-115808427	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-1000	103	1	4
919	336	326	52	1	chr3	43792029	43792180	-115807603	-	MLT2D	LTR	ERVL	-358	157	1	4
919	251	372	59	46	chr3	43798266	43798503	-115801280	-	MTD	LTR	MaLR	-179	240	1	4
919	1616	277	44	18	chr3	43798860	43799357	-115800426	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	510	-17	4
919	845	333	51	18	chr3	43806552	43806888	-115792895	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	349	-10	4
919	270	228	39	205	chr3	43816019	43816044	-115783739	-	RMER20B	LTR	ERVK	-392	235	216	4
919	270	228	39	205	chr3	43816186	43816287	-115783496	-	RMER20B	LTR	ERVK	-412	215	130	4
919	480	245	43	87	chr3	43816428	43816589	-115783194	-	RMER20B	LTR	ERVK	-473	154	1	4
919	672	325	120	6	chr3	43837150	43837484	-115762299	-	MTE2b	LTR	MaLR	-7	372	1	4
919	2091	218	75	78	chr3	43838641	43839218	-115760565	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	4
919	2446	75	45	12	chr3	43840771	43841106	-115758677	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
919	1031	183	101	22	chr3	43841356	43841624	-115758159	-	RMER6C	LTR	ERVK	-8	682	394	4
919	1024	238	98	0	chr3	43841629	43841936	-115757847	+	RMER6-int	LTR	ERVK	1847	2183	-994	4
919	3105	171	119	75	chr3	43841949	43842193	-115757590	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2275	2547	-630	4
919	3105	171	119	75	chr3	43842255	43842814	-115756969	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2548	3177	0	4
919	867	238	35	48	chr3	43842816	43843046	-115756737	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	229	-461	4
919	1658	183	68	87	chr3	43843166	43843662	-115756121	+	RMER6C	LTR	ERVK	204	690	0	4
919	345	214	70	23	chr3	43855484	43855570	-115744213	+	MT2B	LTR	ERVL	175	264	-337	5
919	3067	74	5	0	chr3	43863129	43863523	-115736260	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
919	232	368	17	8	chr3	43867611	43867729	-115732054	+	MLT1F	LTR	MaLR	359	477	-71	5
919	2085	190	12	5	chr3	43868017	43868429	-115731354	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	5	5
919	928	246	40	52	chr3	43871535	43871882	-115727901	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	1	5
919	718	347	58	18	chr3	43872572	43872965	-115726818	-	RMER5	LTR	ERV1	-14	520	112	5
919	990	294	5	124	chr3	43877443	43877854	-115721929	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	362	-8	5
919	993	334	30	30	chr3	43878252	43878609	-115721174	+	MTEa	LTR	MaLR	18	359	-11	5
919	590	342	46	114	chr3	43879812	43880206	-115719577	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	370	4	5
919	4815	22	0	0	chr3	43891911	43892457	-115707326	+	MERVL-int	LTR	ERVL	3901	4446	-1039	5
919	1021	315	53	20	chr3	43895348	43895704	-115704079	-	MTD	LTR	MaLR	-24	395	28	5
919	493	323	53	67	chr3	43901455	43901737	-115698046	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	102	5
920	496	345	81	58	chr3	43910290	43910637	-115689146	+	MLT1B	LTR	MaLR	24	378	-12	5
920	1655	151	120	32	chr3	43916922	43917298	-115682485	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	6
920	3973	54	20	12	chr3	43917473	43917981	-115681802	-	LTRIS3	LTR	ERV1	0	512	1	6
920	546	327	40	48	chr3	43931957	43932341	-115667442	+	MER67C	LTR	ERV1	4	411	-300	6
920	1264	103	0	0	chr3	43937560	43937745	-115662038	-	MTB	LTR	MaLR	-54	346	162	6
920	1608	236	65	28	chr3	43937934	43938331	-115661452	+	MTC	LTR	MaLR	6	417	-4	6
920	1516	204	80	3	chr3	43940213	43940527	-115659256	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	30	6
920	247	319	54	33	chr3	43963798	43964132	-115635651	+	RMER17D2	LTR	ERVK	301	641	-168	6
920	770	297	79	30	chr3	43965111	43965378	-115634405	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	666	945	-425	6
920	395	256	91	36	chr3	43976602	43976757	-115623026	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-172	187	13	6
920	2604	314	53	66	chr3	43976759	43977294	-115622489	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-4	1366	822	6
920	2604	314	53	66	chr3	43978316	43979097	-115620686	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-549	821	54	6
920	2604	314	53	66	chr3	43979150	43979212	-115620571	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1317	53	1	6
920	1339	233	35	30	chr3	43979212	43979579	-115620204	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	2	6
920	1271	245	23	20	chr3	43980017	43980321	-115619462	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-6	506	202	6
920	318	218	101	22	chr3	43980371	43980460	-115619323	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-281	231	136	6
920	2080	88	33	17	chr3	43998645	43998947	-115600836	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	307	-20	6
920	1952	132	9	24	chr3	43998963	43999357	-115600426	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	21	578	-5903	6
920	3053	100	5	0	chr3	43999354	43999765	-115600018	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1570	1982	-5698	6
920	1934	79	8	0	chr3	43999745	43999999	-115599784	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	2242	2497	-5183	6
920	7895	226	20	24	chr3	44000019	44001901	-115597882	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	4929	6801	-20	1
920	1977	114	26	16	chr3	44001901	44002205	-115597578	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	307	-20	1
920	312	182	18	0	chr3	44010971	44011026	-115588757	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	56	-255	1
920	468	273	60	33	chr3	44013301	44013510	-115586273	+	MER90a	LTR	ERV1	37	234	-380	2
920	249	309	74	11	chr3	44016042	44016137	-115583646	-	MLT1D	LTR	MaLR	-402	103	3	2
920	757	284	16	45	chr3	44017425	44017733	-115582050	+	RLTR12B	LTR	ERVK	18	316	-252	2
920	443	294	42	31	chr3	44017748	44017941	-115581842	+	RLTR12B	LTR	ERVK	291	485	-43	2
920	1000	205	37	25	chr3	44019431	44019769	-115580014	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8641	8902	-57	2
920	810	279	41	131	chr3	44019792	44020223	-115579560	+	RLTR12B	LTR	ERVK	42	424	-103	2
920	432	169	31	47	chr3	44020800	44021008	-115578775	-	RMER17B	LTR	ERVK	-393	513	310	3
920	2884	67	33	138	chr3	44021638	44022125	-115577658	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	3
920	584	273	62	19	chr3	44031231	44031440	-115568343	+	RLTR45	LTR	ERVK	265	482	0	4
920	743	375	60	24	chr3	44034401	44034783	-115565000	+	MTD	LTR	MaLR	24	419	0	5
920	443	211	63	83	chr3	44035030	44035168	-115564615	+	MLT1D	LTR	MaLR	231	505	0	5
920	1817	82	31	0	chr3	44037712	44037967	-115561816	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	76	5
920	525	118	15	17	chr3	44038193	44038292	-115561491	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-282	112	2	5
921	652	305	48	70	chr3	44040232	44040588	-115559195	+	RLTR11B	LTR	ERVK	4	351	-102	5
921	1261	200	54	40	chr3	44041572	44041926	-115557857	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	6
921	291	397	48	34	chr3	44054540	44054686	-115545097	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-103	524	377	7
921	2948	26	218	0	chr3	44070731	44071121	-115528662	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	8
921	370	320	124	45	chr3	44073169	44073434	-115526349	+	MER67B	LTR	ERV1	306	591	-70	9
921	2675	92	5	42	chr3	44074201	44074610	-115525173	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	3	396	0	9
921	591	244	39	0	chr3	44078113	44078240	-115521543	-	RMER10B	LTR	ERVL	-11	387	256	1
921	1237	229	47	88	chr3	44099788	44100152	-115499631	+	RMER19B	LTR	ERVK	316	664	-238	1
921	1836	266	38	34	chr3	44100378	44100841	-115498942	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	67	1
921	3012	23	3	0	chr3	44100841	44101186	-115498597	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	1
921	1836	266	38	34	chr3	44101186	44101252	-115498531	-	MT2A	LTR	ERVL	-467	66	2	1
921	265	326	11	11	chr3	44101468	44101558	-115498225	+	MT2A	LTR	ERVL	284	373	-160	1
921	1831	144	98	26	chr3	44101953	44102330	-115497453	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	6	1
921	1193	299	43	60	chr3	44102553	44103084	-115496699	-	RLTR40	LTR	ERVK	-275	542	21	1
921	565	315	83	45	chr3	44103135	44103463	-115496320	-	ORR1E	LTR	MaLR	-9	350	14	1
921	229	277	88	10	chr3	44109845	44109878	-115489905	+	RMER12	LTR	ERVK	727	760	-562	1
921	229	277	88	10	chr3	44109920	44109988	-115489795	+	RMER12	LTR	ERVK	761	835	-487	1
921	4188	52	0	8	chr3	44110130	44110653	-115489130	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	1
921	612	338	66	29	chr3	44130152	44130426	-115469357	+	MTEa	LTR	MaLR	1	284	-95	1
921	763	299	87	76	chr3	44144499	44145142	-115454641	+	MTC-int	LTR	MaLR	314	1058	-200	1
921	884	310	77	11	chr3	44147808	44148186	-115451597	+	MTD	LTR	MaLR	1	403	-16	2
921	360	246	66	3	chr3	44154723	44154840	-115444943	+	MTD	LTR	MaLR	213	342	-79	2
921	3303	94	207	65	chr3	44160252	44160910	-115438873	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	2
921	752	313	32	58	chr3	44165946	44166255	-115433528	-	MER57F	LTR	ERV1	-135	301	1	2
921	1470	224	99	67	chr3	44167825	44168494	-115431289	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	2
921	487	355	105	75	chr3	44169243	44169307	-115430476	+	LTR68	LTR	ERV1	162	229	-511	2
921	487	355	105	75	chr3	44169331	44169705	-115430078	+	LTR68	LTR	ERV1	230	613	-127	2
922	2695	60	0	0	chr3	44183614	44183946	-115415837	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	2
922	2997	72	10	5	chr3	44184451	44184845	-115414938	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
922	640	174	17	17	chr3	44204071	44204188	-115395595	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4550	4666	-325	2
922	1200	197	89	114	chr3	44204229	44204624	-115395159	+	RMER21B	LTR	ERV1	1	385	-457	2
922	2417	96	107	30	chr3	44209263	44209704	-115390079	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
922	225	183	46	77	chr3	44209743	44209808	-115389975	-	RMER20A	LTR	ERVK	-268	248	186	2
922	883	211	24	77	chr3	44210410	44210462	-115389321	+	RMER21B	LTR	ERV1	499	537	-410	2
922	883	211	24	77	chr3	44211457	44211650	-115388133	+	RMER21B	LTR	ERV1	538	731	-216	2
922	680	277	54	84	chr3	44212378	44212819	-115386964	+	RLTR40	LTR	ERVK	116	543	-274	2
922	579	307	83	106	chr3	44220590	44221060	-115378723	-	RLTR26	LTR	ERVK	-182	460	2	2
922	757	339	49	49	chr3	44221613	44221960	-115377823	-	ORR1E	LTR	MaLR	-10	349	3	2
922	7054	170	75	6	chr3	44226239	44227672	-115372111	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	432	1963	0	2
922	1608	143	85	7	chr3	44227672	44227967	-115371816	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	2
922	388	265	220	14	chr3	44228587	44228805	-115370978	-	MTD	LTR	MaLR	-58	361	99	2
922	649	287	45	5	chr3	44231469	44231693	-115368090	+	MER89-int	LTR	ERV1	5556	5788	-1013	3
922	1762	291	52	62	chr3	44232496	44233243	-115366540	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	631	3
922	680	321	104	70	chr3	44233353	44233694	-115366089	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-970	400	43	3
922	680	321	104	70	chr3	44233731	44233774	-115366009	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1328	42	3	3
922	1268	299	13	47	chr3	44233775	44233977	-115365806	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	175	3
922	2083	108	106	19	chr3	44233977	44234353	-115365430	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	3
922	1268	299	13	47	chr3	44234353	44234533	-115365250	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-196	174	1	3
922	412	366	136	24	chr3	44235935	44236265	-115363518	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	1	3
922	393	342	116	34	chr3	44243551	44243784	-115355999	-	LTR80A	LTR	ERVL	-26	557	306	3
922	643	317	152	33	chr3	44248657	44248846	-115350937	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	183	3
922	643	317	152	33	chr3	44248973	44249113	-115350670	-	MTEb	LTR	MaLR	-197	182	12	3
922	908	317	65	38	chr3	44256410	44256751	-115343032	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	6	3
922	1354	271	56	13	chr3	44269052	44269423	-115330360	+	MTD	LTR	MaLR	19	406	-13	3
922	520	248	103	78	chr3	44269430	44269662	-115330121	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	238	-1020	3
922	1403	291	54	51	chr3	44270029	44270562	-115329221	+	MTD-int	LTR	MaLR	261	1268	-524	3
922	245	274	116	0	chr3	44271233	44271328	-115328455	+	MTD-int	LTR	MaLR	1153	1258	0	3
922	1704	246	17	15	chr3	44271363	44271768	-115328015	+	MTD	LTR	MaLR	14	419	0	3
922	379	71	18	0	chr3	44272282	44272338	-115327445	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	366	3
922	1332	137	5	41	chr3	44272352	44272382	-115327401	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-209	213	188	3
922	1332	137	5	41	chr3	44272479	44272669	-115327114	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-235	187	1	3
922	328	332	93	56	chr3	44280520	44280734	-115319049	+	MLT1L	LTR	MaLR	366	587	-23	3
922	903	155	9	138	chr3	44282025	44282235	-115317548	+	RLTR10D	LTR	ERVK	177	359	0	3
922	307	287	144	40	chr3	44286208	44286466	-115313317	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	372	1	3
922	3061	59	5	10	chr3	44286984	44287380	-115312403	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	3
922	1488	232	160	35	chr3	44294524	44295079	-115304704	+	RMER12	LTR	ERVK	14	583	-1265	4
922	616	244	120	38	chr3	44295094	44295303	-115304480	+	RMER12	LTR	ERVK	991	1216	-106	4
922	283	237	78	13	chr3	44295300	44295377	-115304406	+	RLTR21	LTR	ERVK	1491	1572	0	4
923	2483	232	72	39	chr3	44317767	44317912	-115281871	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	151	-569	4
923	2483	232	72	39	chr3	44318305	44318830	-115280953	+	RMER6D	LTR	ERVK	152	693	-27	4
923	1829	191	8	22	chr3	44323786	44324150	-115275633	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	4
923	1647	149	89	3	chr3	44331915	44332231	-115267552	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	343	-132	4
923	3400	61	23	16	chr3	44332231	44332777	-115267006	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	188	662	-5819	4
923	2219	61	0	0	chr3	44332777	44333055	-115266728	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	4
923	6245	31	4	8	chr3	44333054	44333801	-115265982	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6479	-2	4
923	788	131	39	0	chr3	44333803	44333933	-115265850	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	135	-192	4
923	1047	282	87	26	chr3	44351213	44351671	-115248112	-	RMER5	LTR	ERV1	-48	486	1	4
923	406	319	133	42	chr3	44352411	44352794	-115246989	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	4
923	519	262	88	0	chr3	44352844	44353004	-115246779	+	MTD	LTR	MaLR	1	174	-245	4
923	231	288	13	27	chr3	44354857	44354932	-115244851	+	RMER15	LTR	ERVL	344	417	-158	4
923	573	250	45	107	chr3	44361803	44362027	-115237756	+	RLTR25B	LTR	ERVK	814	1023	-5	5
923	701	161	103	20	chr3	44373556	44373702	-115226081	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-393	158	1	5
923	3400	136	154	44	chr3	44374141	44374529	-115225254	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	394	-415	5
923	3400	136	154	44	chr3	44374683	44375023	-115224760	+	RMER17D2	LTR	ERVK	395	808	-1	5
923	1582	226	114	199	chr3	44378710	44379493	-115220290	-	RMER6C	LTR	ERVK	-25	731	5	5
923	365	373	91	59	chr3	44388025	44388498	-115211285	-	MLT1D	LTR	MaLR	-6	499	12	5
923	1038	244	93	11	chr3	44392855	44393133	-115206650	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-66	301	1	5
923	945	309	62	0	chr3	44395920	44396273	-115203510	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	375	-4	5
923	1781	159	16	9	chr3	44400027	44400344	-115199439	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
923	253	280	57	45	chr3	44400461	44400618	-115199165	-	RMER17D	LTR	ERVK	-492	397	239	5
923	256	274	71	0	chr3	44407284	44407368	-115192415	-	MER67D	LTR	ERV1	-417	97	8	5
924	2956	216	39	39	chr3	44439382	44439493	-115160290	+	RLTR17	LTR	ERVK	18	126	-566	6
924	2956	202	31	49	chr3	44439674	44440210	-115159573	+	RLTR17	LTR	ERVK	127	671	-21	6
924	664	249	64	50	chr3	44444449	44444820	-115154963	+	MT2B	LTR	ERVL	1	448	-153	6
924	2336	66	119	11	chr3	44450552	44450904	-115148879	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	6
924	2167	20	0	0	chr3	44450904	44451153	-115148630	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	302	550	-1437	6
924	4652	21	55	3	chr3	44451152	44451718	-115148065	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	404	998	-989	6
924	330	240	62	39	chr3	44451782	44451912	-115147871	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1462	1594	-5987	6
924	1154	35	0	0	chr3	44451994	44452135	-115147648	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	990	1130	-857	6
924	1864	99	31	22	chr3	44452135	44452454	-115147329	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
924	29051	20	4	3	chr3	44452454	44455762	-115144021	+	ETnERV-int	LTR	ERVK	1	3312	-2	6
924	1765	100	35	22	chr3	44455764	44456082	-115143701	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
924	7448	30	0	1	chr3	44456082	44456943	-115142840	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1125	1984	-3	6
924	3281	188	44	49	chr3	44463097	44463952	-115135831	-	RLTR13A	LTR	ERVK	-4	851	1	6
924	1139	62	0	0	chr3	44468188	44468332	-115131451	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-42	304	161	6
924	963	162	0	30	chr3	44468387	44468407	-115131376	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-185	141	125	6
924	3045	64	18	2	chr3	44478604	44478998	-115120785	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
924	2516	195	24	12	chr3	44484807	44485300	-115114483	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	499	-29	6
924	2412	146	24	5	chr3	44488910	44489324	-115110459	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	6
924	287	197	0	116	chr3	44489665	44489734	-115110049	-	RLTR23	LTR	ERV1	-4	426	366	6
924	421	214	12	0	chr3	44490053	44490137	-115109646	-	RLTR23	LTR	ERV1	-340	90	6	6
924	229	260	93	74	chr3	44490919	44491027	-115108756	+	RLTR30	LTR	ERV1	188	297	-82	6
924	308	373	60	39	chr3	44492429	44492663	-115107120	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-338	241	3	6
924	227	378	22	0	chr3	44493153	44493243	-115106540	-	MTE2a	LTR	MaLR	-228	151	60	6
924	267	197	16	32	chr3	44493277	44493340	-115106443	-	MTE2a	LTR	MaLR	-317	62	1	6
924	460	212	75	7	chr3	44495140	44495287	-115104496	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5605	5761	0	6
924	538	268	120	52	chr3	44495287	44495691	-115104092	+	MT2B	LTR	ERVL	1	488	-113	6
924	275	292	0	92	chr3	44495743	44495766	-115104017	+	MT2B	LTR	ERVL	401	422	-111	6
924	742	262	106	14	chr3	44496118	44496335	-115103448	+	MTD	LTR	MaLR	1	237	-182	6
924	616	346	45	35	chr3	44512053	44512367	-115087416	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	61	1
924	362	371	56	49	chr3	44514024	44514310	-115085473	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	274	2
924	327	405	66	18	chr3	44517119	44517345	-115082438	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	241	-118	2
924	4678	127	38	19	chr3	44517399	44517750	-115082033	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	456	2
924	4678	127	38	19	chr3	44517780	44518222	-115081561	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-354	455	1	2
924	1524	194	14	69	chr3	44520194	44520554	-115079229	+	ORR1B1	LTR	MaLR	47	386	-8	3
924	1282	211	110	11	chr3	44524417	44524699	-115075084	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-84	310	1	4
924	553	322	34	65	chr3	44524699	44524960	-115074823	-	MT2B	LTR	ERVL	-88	513	261	4
924	369	340	68	74	chr3	44528318	44528629	-115071154	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	47	4
924	5313	104	18	32	chr3	44533428	44534245	-115065538	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	3	5
924	1215	251	94	92	chr3	44534911	44535381	-115064402	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	5
924	399	242	96	122	chr3	44551854	44552068	-115047715	-	RMER12	LTR	ERVK	-103	1219	1010	7
924	399	242	96	122	chr3	44552162	44552177	-115047606	-	RMER12	LTR	ERVK	-313	1009	996	7
924	1266	279	83	86	chr3	44552500	44553336	-115046447	-	RMER12	LTR	ERVK	-1006	802	1	7
924	2924	48	0	0	chr3	44557008	44557360	-115042423	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-3003	3539	3188	8
924	5136	69	23	67	chr3	44557419	44558200	-115041583	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-5795	747	1	8
924	2371	109	3	68	chr3	44558200	44558584	-115041199	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	8
924	19076	62	15	3	chr3	44561699	44564135	-115035648	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	3557	6021	-521	8
115	3398	58	0	0	chr3	44564138	44564553	-115035230	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6128	6542	0	8
925	2152	140	3	75	chr3	44564553	44564940	-115034843	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	8
925	355	224	0	274	chr3	44573803	44573938	-115025845	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	578	481	9
925	1163	190	230	55	chr3	44573971	44574347	-115025436	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-90	444	3	9
925	236	355	45	9	chr3	44583528	44583639	-115016144	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-293	115	1	1
925	519	378	45	32	chr3	44588936	44589313	-115010470	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	18	1
925	2965	173	119	19	chr3	44590751	44591380	-115008403	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	1
925	726	190	25	126	chr3	44591397	44591596	-115008187	+	RLTR17	LTR	ERVK	514	692	0	1
925	380	150	0	0	chr3	44591596	44591656	-115008127	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1	60	-2782	1
925	232	191	0	45	chr3	44591699	44591743	-115008040	+	RLTR17	LTR	ERVK	651	692	0	1
925	947	294	98	23	chr3	44601920	44602348	-114997435	+	RMER5	LTR	ERV1	59	518	-16	1
925	1057	341	91	70	chr3	44603650	44604420	-114995363	-	MER54A	LTR	ERVL	-115	786	1	1
925	277	305	0	24	chr3	44619945	44620029	-114979754	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	176	1
925	2658	103	34	0	chr3	44620602	44621010	-114978773	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	422	0	1
925	1639	158	24	69	chr3	44639777	44640111	-114959672	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	1
925	1273	251	87	0	chr3	44642678	44643024	-114956759	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	1	1
925	2859	252	66	22	chr3	44643029	44644224	-114955559	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-2	1368	13	1
925	1231	247	34	65	chr3	44644246	44644632	-114955151	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	3	1
925	1877	113	46	0	chr3	44645130	44645413	-114954370	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3236	2249	1954	1
925	305	233	56	46	chr3	44646543	44646651	-114953132	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	300	1
925	1141	201	61	84	chr3	44647402	44647949	-114951834	-	RMER6A	LTR	ERVK	-40	716	297	1
925	323	252	19	45	chr3	44647943	44648097	-114951686	-	RMER6C	LTR	ERVK	-314	376	227	1
925	3770	172	86	39	chr3	44653333	44654198	-114945585	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	905	-53	2
925	468	273	9	0	chr3	44655829	44655939	-114943844	-	RMER6A	LTR	ERVK	-517	203	93	1
925	1982	138	91	67	chr3	44659541	44659959	-114939824	+	RLTR23	LTR	ERV1	3	430	0	2
925	895	305	9	87	chr3	44672701	44673128	-114926655	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	140	2
925	2188	206	41	19	chr3	44678846	44679362	-114920421	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	2
925	583	233	0	54	chr3	44682170	44682338	-114917445	+	RLTR9A	LTR	ERVK	210	368	0	2
925	262	333	12	0	chr3	44684794	44684878	-114914905	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-279	95	11	2
926	1699	191	255	53	chr3	44712455	44713180	-114886603	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	717	-3	2
926	337	250	83	41	chr3	44713348	44713469	-114886314	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1277	1402	-3597	2
926	256	174	0	0	chr3	44726680	44726726	-114873057	+	MLT1C	LTR	MaLR	74	119	-348	2
926	439	303	32	149	chr3	44737733	44738136	-114861647	+	RLTR15	LTR	ERVK	4	359	0	3
926	999	157	48	21	chr3	44762963	44763152	-114836631	-	RMER6C	LTR	ERVK	-496	194	1	3
926	1139	262	71	21	chr3	44763152	44763284	-114836499	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-18	356	210	3
926	1139	262	71	21	chr3	44763468	44763674	-114836109	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-165	209	2	3
926	234	200	0	0	chr3	44768920	44768965	-114830818	+	RMER15	LTR	ERVL	15	59	-516	3
926	335	230	69	0	chr3	44773255	44773342	-114826441	-	MTEa	LTR	MaLR	-285	94	2	3
926	422	286	42	20	chr3	44789974	44790186	-114809597	-	MTD	LTR	MaLR	-31	390	181	3
926	876	205	285	4	chr3	44803263	44803498	-114796285	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	301	-66	4
926	418	360	82	27	chr3	44804473	44804767	-114795016	-	MTEa	LTR	MaLR	-14	365	56	4
926	1971	161	12	0	chr3	44820419	44820742	-114779041	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
927	3220	41	13	3	chr3	44836509	44836901	-114762882	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
927	2906	46	0	0	chr3	44840098	44840444	-114759339	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
927	635	203	87	5	chr3	44848189	44848391	-114751392	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-128	201	1	4
927	539	226	9	0	chr3	44848391	44848506	-114751277	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1370	1255	4
927	1013	205	10	173	chr3	44848542	44848849	-114750934	+	MT2B	LTR	ERVL	2	258	-343	4
927	1643	261	63	39	chr3	44848722	44849289	-114750494	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	624	1204	-305	4
927	542	194	78	0	chr3	44849401	44849504	-114750279	-	MT2B	LTR	ERVL	-489	112	2	4
927	382	353	64	6	chr3	44849550	44849707	-114750076	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	205	4
927	3675	96	7	5	chr3	44850006	44850551	-114749232	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	68	587	0	4
927	1529	269	28	46	chr3	44850709	44851142	-114748641	-	RMER19C	LTR	ERVK	-13	598	174	4
927	314	113	0	36	chr3	44851130	44851185	-114748598	-	RMER19C	LTR	ERVK	-558	53	1	4
927	423	343	14	0	chr3	44851227	44851370	-114748413	-	MTE2b	LTR	MaLR	-163	216	72	4
927	448	239	0	11	chr3	44851597	44851686	-114748097	-	MTE2b	LTR	MaLR	-281	98	11	4
927	1079	196	5	57	chr3	44860879	44861090	-114738693	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-129	200	1	5
927	233	196	0	0	chr3	44871001	44871047	-114728736	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1304	1349	-499	5
927	809	318	37	66	chr3	44871797	44872174	-114727609	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	5
927	927	305	69	33	chr3	44872187	44872554	-114727229	+	MTD	LTR	MaLR	46	421	0	5
927	387	290	42	112	chr3	44881877	44881955	-114717828	+	MTEb	LTR	MaLR	18	90	-289	5
927	1752	139	57	92	chr3	44881955	44882358	-114717425	-	RLTR9C	LTR	ERVK	-4	389	1	5
927	387	290	42	112	chr3	44882358	44882520	-114717263	+	MTEb	LTR	MaLR	91	241	-138	5
927	3449	145	8	30	chr3	44898710	44899309	-114700474	+	MT2B	LTR	ERVL	16	601	0	5
927	1809	161	159	31	chr3	44900431	44900790	-114698993	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	5
927	5429	52	6	5	chr3	44900790	44901460	-114698323	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	0	2812	2142	5
927	4052	311	44	47	chr3	44901680	44906501	-114693282	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-1436	5106	659	5
927	627	167	0	0	chr3	44906681	44906789	-114692994	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-1831	981	874	5
927	288	214	0	18	chr3	44906799	44906856	-114692927	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-2756	56	1	5
927	1792	149	142	31	chr3	44906859	44907219	-114692564	-	RLTR44A	LTR	ERVK	-5	400	1	5
927	2438	201	33	8	chr3	44907667	44908158	-114691625	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	503	-65	5
927	2354	127	56	10	chr3	44908473	44908864	-114690919	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	5
927	1417	214	47	47	chr3	44908867	44909250	-114690533	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4	386	-2928	5
927	3742	137	78	32	chr3	44909265	44910018	-114689765	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1071	1858	-5548	5
927	3505	59	21	15	chr3	44910031	44910510	-114689273	+	LTRIS2	LTR	ERV1	69	550	-14	5
927	5126	181	30	29	chr3	44910510	44911690	-114688093	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1217	3423	-3983	5
927	381	211	0	84	chr3	44917589	44917708	-114682075	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2082	2190	-2654	5
927	15976	108	22	3	chr3	44917960	44920238	-114679545	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3441	5762	-1644	5
927	2934	183	100	100	chr3	44920230	44921266	-114678517	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2356	3141	-1703	5
927	1231	164	31	27	chr3	44921235	44921590	-114678193	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6127	6429	-977	5
927	512	92	10	34	chr3	44921791	44921880	-114677903	+	MMETn-int	LTR	ERVK	7331	7406	0	5
927	2416	106	58	23	chr3	44921880	44922275	-114677508	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	5
927	2418	86	107	6	chr3	44929948	44930311	-114669472	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
927	1164	222	65	62	chr3	44945423	44945779	-114654004	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	357	-2	5
927	619	378	24	12	chr3	44945896	44946145	-114653638	-	MTD	LTR	MaLR	-143	276	25	5
928	869	46	0	0	chr3	44989335	44989444	-114610339	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	299	6
928	1569	122	8	0	chr3	44989432	44989686	-114610097	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1703	260	5	6
928	2016	133	9	27	chr3	44989690	44990023	-114609760	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
928	3096	62	3	0	chr3	44994188	44994572	-114605211	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	6
928	433	302	78	27	chr3	45001464	45001835	-114597948	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	390	0	4
928	252	301	86	0	chr3	45008566	45008659	-114591124	+	MER76	LTR	ERVL	513	613	-78	1
928	525	294	28	7	chr3	45012187	45012331	-114587452	+	ORR1C2	LTR	MaLR	238	384	0	2
928	3126	51	8	8	chr3	45015756	45016150	-114583633	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	3	396	0	2
928	707	175	21	35	chr3	45017685	45017824	-114581959	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	137	-765	3
928	2181	133	79	0	chr3	45017824	45018191	-114581592	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	628	3
928	829	261	88	38	chr3	45018191	45018533	-114581250	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	3
928	529	220	17	0	chr3	45018580	45018698	-114581085	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	22	141	-6401	3
928	5283	295	27	19	chr3	45018722	45020787	-114578996	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	3148	5229	-1313	3
928	1407	246	6	11	chr3	45020862	45021215	-114578568	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6190	6540	-2	3
928	597	270	48	26	chr3	45021217	45021445	-114578338	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	233	-126	3
928	2401	106	8	29	chr3	45021423	45021909	-114577874	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-374	429	1	3
928	3373	209	100	16	chr3	45021909	45022646	-114577137	+	RMER19B	LTR	ERVK	101	902	0	3
928	1810	96	11	11	chr3	45023698	45023973	-114575810	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	728	1002	-21	4
928	707	98	10	0	chr3	45024059	45024161	-114575622	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	-920	103	1	4
928	760	260	48	103	chr3	45034199	45034692	-114565091	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-45	482	1	5
928	1820	194	34	131	chr3	45042243	45042718	-114557065	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-83	429	1	6
928	372	276	20	0	chr3	45043491	45043589	-114556194	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	100	-279	6
928	503	358	81	18	chr3	45043567	45043789	-114555994	+	MTE2b	LTR	MaLR	30	265	-114	6
928	933	185	19	93	chr3	45047901	45048141	-114551642	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	884	6
928	933	185	19	93	chr3	45048197	45048224	-114551559	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-220	883	857	6
928	1490	171	92	10	chr3	45049331	45049626	-114550157	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-248	855	537	6
928	850	262	54	120	chr3	45050481	45050832	-114548951	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	49	7
928	1023	220	95	18	chr3	45054863	45055085	-114544698	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-289	239	1	7
928	2111	218	57	71	chr3	45056543	45057106	-114542677	+	RMER20B	LTR	ERVK	73	627	0	8
928	1047	268	56	65	chr3	45073442	45073905	-114525878	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	3	1
928	377	384	46	78	chr3	45078586	45078931	-114520852	-	MLT1J	LTR	MaLR	-20	492	159	1
928	1209	252	109	9	chr3	45084306	45084646	-114515137	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
929	3081	47	5	0	chr3	45090992	45091378	-114508405	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	388	-8	1
929	720	331	28	45	chr3	45091890	45092181	-114507602	+	MTE2b	LTR	MaLR	80	365	-14	1
929	1302	162	277	0	chr3	45094707	45095003	-114504780	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
929	461	318	112	39	chr3	45095353	45095710	-114504073	+	MER57F	LTR	ERV1	6	388	-48	1
929	349	213	33	2	chr3	45101194	45101270	-114498513	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	306	1
929	686	316	63	55	chr3	45103484	45103832	-114495951	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	25	1
929	435	144	206	0	chr3	45104709	45104806	-114494977	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	268	1
929	272	318	78	33	chr3	45104868	45105021	-114494762	+	MT2A	LTR	ERVL	230	389	-144	1
929	850	242	286	23	chr3	45105833	45106207	-114493576	+	MT2A	LTR	ERVL	1	462	-71	1
929	942	244	10	0	chr3	45119526	45119731	-114480052	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-163	211	5	1
929	430	256	175	0	chr3	45119768	45119859	-114479924	+	ORR1D1	LTR	MaLR	214	309	-65	1
929	430	256	175	0	chr3	45119891	45119936	-114479847	+	ORR1D1	LTR	MaLR	310	373	-1	1
929	640	300	95	81	chr3	45121123	45121367	-114478416	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	266	-104	1
929	640	300	95	81	chr3	45121540	45121643	-114478140	+	ORR1D2	LTR	MaLR	267	355	-15	1
929	2414	178	75	10	chr3	45132264	45132757	-114467026	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-3	525	1	2
929	565	271	92	15	chr3	45137129	45137335	-114462448	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	149	2
929	3141	164	23	117	chr3	45141446	45142218	-114457565	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	57	2
929	470	338	55	72	chr3	45144788	45145031	-114454752	-	ORR1E	LTR	MaLR	-141	233	1	2
929	1054	331	98	17	chr3	45145031	45145425	-114454358	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-53	1527	1100	2
929	804	265	124	69	chr3	45160415	45160560	-114439223	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	183	-187	2
929	804	265	124	69	chr3	45160959	45161161	-114438622	+	ORR1D2	LTR	MaLR	184	369	-1	2
929	1579	195	19	90	chr3	45161711	45162093	-114437690	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	353	-45	2
929	1579	195	19	90	chr3	45162182	45162221	-114437562	+	RMER10B	LTR	ERVL	354	392	-6	2
929	360	356	113	28	chr3	45163367	45163766	-114436017	-	MLT1J	LTR	MaLR	-12	500	68	2
929	241	242	89	99	chr3	45172566	45172667	-114427116	+	MT2B	LTR	ERVL	157	256	-345	2
930	549	271	25	108	chr3	45230787	45231027	-114368756	-	RMER15	LTR	ERVL	-329	246	27	3
930	259	316	32	0	chr3	45232106	45232201	-114367582	-	HERVL74-int	LTR	ERVL	-2428	3257	3160	3
930	802	282	122	24	chr3	45233036	45233330	-114366453	-	MTD	LTR	MaLR	-77	342	20	3
930	583	274	73	28	chr3	45236427	45236675	-114363108	+	MLT1F2	LTR	MaLR	302	560	0	3
930	400	333	44	0	chr3	45240843	45240978	-114358805	+	RMER15	LTR	ERVL	422	562	-13	3
930	481	264	86	166	chr3	45242782	45243072	-114356711	+	MTE2a	LTR	MaLR	20	286	-93	3
930	2644	237	37	117	chr3	45243072	45244079	-114355704	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	926	-32	3
930	830	306	39	22	chr3	45249252	45249563	-114350220	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	61	3
930	1755	135	101	0	chr3	45254246	45254542	-114345241	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	3
930	374	350	14	7	chr3	45256073	45256211	-114343572	+	RMER15	LTR	ERVL	421	559	-16	3
930	381	328	47	91	chr3	45256520	45256795	-114342988	+	MT2A	LTR	ERVL	231	493	-40	3
930	1413	221	83	126	chr3	45259474	45259910	-114339873	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	3
930	5280	199	45	42	chr3	45259909	45261012	-114338771	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	1099	-159	3
930	5280	199	45	42	chr3	45261200	45261343	-114338440	+	MTC-int	LTR	MaLR	1100	1252	-6	3
930	1658	236	75	21	chr3	45261348	45261734	-114338049	+	MTC	LTR	MaLR	1	407	-14	3
930	3651	134	194	11	chr3	45266115	45266531	-114333252	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	445	-461	3
930	3651	134	194	11	chr3	45266581	45266920	-114332863	+	RMER17A2	LTR	ERVK	446	894	-12	3
930	1398	227	170	89	chr3	45272116	45272342	-114327441	+	RMER6D	LTR	ERVK	41	350	-370	3
930	1398	227	170	89	chr3	45272401	45272802	-114326981	+	RMER6D	LTR	ERVK	351	719	-1	3
930	261	314	45	34	chr3	45283718	45283807	-114315976	-	ORR1E	LTR	MaLR	-243	116	27	3
930	359	353	51	65	chr3	45286293	45286430	-114313353	+	MTEa	LTR	MaLR	168	309	-70	3
930	359	353	51	65	chr3	45286485	45286562	-114313221	+	MTEa	LTR	MaLR	310	379	0	3
930	232	211	35	0	chr3	45295842	45295899	-114303884	+	MTEb	LTR	MaLR	290	348	-31	4
930	467	314	55	30	chr3	45297975	45298175	-114301608	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	371	4
930	328	304	33	42	chr3	45300252	45300372	-114299411	-	RMER12	LTR	ERVK	-471	851	733	4
930	2217	110	40	60	chr3	45301524	45301922	-114297861	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	4
930	425	141	34	34	chr3	45308403	45308491	-114291292	+	MTC	LTR	MaLR	9	96	-325	4
930	761	255	75	0	chr3	45311459	45311647	-114288136	+	MTC	LTR	MaLR	175	376	-45	4
930	3309	46	0	0	chr3	45313509	45313901	-114285882	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-4	392	1	4
930	6861	72	74	51	chr3	45313902	45314975	-114284808	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-1	1097	1	4
930	3401	23	10	0	chr3	45314975	45315367	-114284416	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
930	468	238	109	41	chr3	45315726	45315983	-114283800	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	279	-298	4
930	1367	256	40	50	chr3	45316066	45316498	-114283285	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	126	577	0	4
930	234	340	83	7	chr3	45317118	45317263	-114282520	+	RMER12	LTR	ERVK	701	856	-466	4
930	3279	48	2	0	chr3	45321645	45322040	-114277743	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
930	284	336	110	49	chr3	45325070	45325303	-114274480	+	RMER12	LTR	ERVK	707	958	-364	4
930	284	336	110	49	chr3	45325332	45325361	-114274422	+	RMER12	LTR	ERVK	959	984	-338	4
930	1207	133	55	43	chr3	45326551	45326786	-114272997	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-2	451	214	4
930	1529	170	20	7	chr3	45326791	45327087	-114272696	+	RLTR11A	LTR	ERVK	229	528	0	4
930	879	315	84	0	chr3	45327196	45327504	-114272279	+	RMER15	LTR	ERVL	229	562	-13	4
930	1072	194	49	14	chr3	45334679	45334927	-114264856	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-5	379	140	4
930	884	301	112	35	chr3	45334892	45335240	-114264543	+	MTD	LTR	MaLR	24	398	-21	4
930	1235	286	91	63	chr3	45335255	45335807	-114263976	-	RMER15	LTR	ERVL	-8	567	1	4
116	920	268	41	117	chr3	45350371	45350983	-114248800	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	495	-116	4
931	3778	190	51	48	chr3	45351000	45351883	-114247900	-	RMER13B	LTR	ERVK	-22	886	1	4
931	543	178	67	8	chr3	45351883	45352002	-114247781	+	RMER19B	LTR	ERVK	777	902	0	4
931	6551	78	29	7	chr3	45363109	45364018	-114235765	-	RLTR13B3	LTR	ERVK	0	929	1	5
931	569	331	122	34	chr3	45397802	45398180	-114201603	+	MLT1D	LTR	MaLR	51	461	-44	5
931	421	318	183	40	chr3	45402360	45402737	-114197046	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-138	431	1	5
931	2147	194	52	133	chr3	45419952	45420703	-114179080	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	5
931	1797	151	15	46	chr3	45421220	45421547	-114178236	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	5	5
931	1718	174	59	89	chr3	45426669	45427060	-114172723	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	16	5
931	1968	137	12	37	chr3	45437959	45438286	-114161497	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	6
931	9197	150	43	16	chr3	45438288	45440031	-114159752	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-2	1790	1	6
931	2022	133	8	82	chr3	45440031	45440103	-114159680	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	270	6
931	2022	133	8	82	chr3	45440450	45440730	-114159053	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-58	269	1	6
931	2652	191	35	16	chr3	45440941	45441505	-114158278	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	6
931	2373	96	193	0	chr3	45443411	45443774	-114156009	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	433	-3	6
931	719	189	41	17	chr3	45445722	45445889	-114153894	+	MTE2b	LTR	MaLR	233	405	-14	6
931	1076	287	37	52	chr3	45449177	45449581	-114150202	-	MTD	LTR	MaLR	-18	401	4	6
931	252	268	82	61	chr3	45464694	45464841	-114134942	+	MLT1E1	LTR	MaLR	125	274	-380	6
931	280	363	16	24	chr3	45464876	45465003	-114134780	-	MLT1J	LTR	MaLR	-261	251	126	6
931	2078	205	88	32	chr3	45465649	45465952	-114133831	+	RMER6A	LTR	ERVK	9	355	-365	6
931	2078	197	80	34	chr3	45466029	45466345	-114133438	+	RMER6A	LTR	ERVK	332	690	0	6
931	797	262	58	89	chr3	45471283	45471750	-114128033	-	RMER2	LTR	ERV1	-18	549	1	6
931	769	303	21	42	chr3	45481063	45481346	-114118437	+	MTEb	LTR	MaLR	101	377	-2	6
932	261	292	33	11	chr3	45482305	45482395	-114117388	+	ORR1D2	LTR	MaLR	123	214	-156	6
932	734	278	42	19	chr3	45486032	45486292	-114113491	-	RMER5	LTR	ERV1	-156	378	113	6
932	948	274	121	42	chr3	45487570	45487901	-114111882	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	15	6
932	1281	216	35	95	chr3	45487911	45488259	-114111524	+	ORR1C2	LTR	MaLR	30	356	-28	6
932	2999	176	37	4	chr3	45488310	45488853	-114110930	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	6
932	226	333	71	48	chr3	45493504	45493520	-114106263	+	LTR81B	LTR	ERV1?	203	287	-1106	6
932	356	308	29	0	chr3	45493520	45493624	-114106159	+	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	1	107	-961	7
932	566	220	34	41	chr3	45499853	45500000	-114099783	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	271	7
932	772	222	20	56	chr3	45500000	45500196	-114099587	-	MTC	LTR	MaLR	-151	270	82	1
932	878	252	59	88	chr3	45500642	45500982	-114098801	-	MER67D	LTR	ERV1	-183	331	2	3
932	1107	284	24	74	chr3	45509710	45510426	-114089357	-	RMER19B	LTR	ERVK	-13	889	4	1
932	330	264	127	58	chr3	45514161	45514334	-114085449	+	RMER15	LTR	ERVL	3	187	-388	2
932	460	310	96	40	chr3	45514321	45514570	-114085213	+	RMER15	LTR	ERVL	299	561	-14	2
932	1935	138	9	16	chr3	45522280	45522603	-114077180	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	3
932	924	217	13	35	chr3	45526252	45526481	-114073302	+	MTD	LTR	MaLR	194	417	-2	4
932	895	277	123	12	chr3	45527087	45527420	-114072363	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	4
932	3424	23	5	0	chr3	45528187	45528581	-114071202	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
932	333	327	17	50	chr3	45529929	45530048	-114069735	+	LTR83	LTR	ERVL	23	137	-643	5
932	2758	47	68	5	chr3	45541169	45541537	-114058246	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	5	395	-1	7
932	1287	275	29	23	chr3	45542403	45542749	-114057034	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	21	7
932	548	241	84	39	chr3	45542765	45542968	-114056815	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	1159	7
932	1163	294	74	8	chr3	45550361	45550738	-114049045	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	8
932	298	306	4	25	chr3	45552490	45552584	-114047199	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-16	562	460	8
932	1958	219	48	26	chr3	45554066	45554525	-114045258	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-99	469	1	8
932	1425	208	3	106	chr3	45560706	45561035	-114038748	-	MT2A	LTR	ERVL	-236	297	3	9
932	379	284	44	92	chr3	45568005	45568234	-114031549	-	RMER12	LTR	ERVK	-334	988	771	1
932	448	366	10	0	chr3	45569961	45570155	-114029628	-	MLT1D	LTR	MaLR	-8	497	302	1
932	559	296	230	58	chr3	45582082	45582477	-114017306	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	463	-42	1
932	2097	140	16	0	chr3	45585170	45585492	-114014291	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
932	1921	116	6	56	chr3	45585518	45585857	-114013926	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
932	227	247	18	118	chr3	45588018	45588128	-114011655	-	MT2B	LTR	ERVL	-354	247	149	1
932	321	247	11	33	chr3	45588571	45588663	-114011120	+	RMER20B	LTR	ERVK	128	217	-410	1
932	1774	184	13	0	chr3	45591535	45591839	-114007944	+	ORR1A2	LTR	MaLR	12	319	-8	1
932	385	293	73	0	chr3	45595312	45595435	-114004348	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	140	-219	1
932	275	253	82	42	chr3	45598766	45598920	-114000863	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-296	168	1	1
932	811	322	64	47	chr3	45599695	45600037	-113999746	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	350	-9	1
932	395	132	29	0	chr3	45604796	45604864	-113994919	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	326	257	1
932	1608	185	7	7	chr3	45606364	45606652	-113993131	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-39	288	1	1
932	2218	216	56	14	chr3	45608755	45609239	-113990544	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-24	504	1	1
932	710	312	148	41	chr3	45609513	45609974	-113989809	+	MER34A1	LTR	ERV1	16	525	-62	1
933	1736	298	58	4	chr3	45621125	45621611	-113978172	-	RLTR18B	LTR	ERVK	0	512	1	2
933	900	252	109	132	chr3	45630953	45631401	-113968382	+	RMER15	LTR	ERVL	65	502	-73	2
933	861	313	116	22	chr3	45637828	45638361	-113961422	+	MTD-int	LTR	MaLR	676	1258	0	2
933	597	339	38	30	chr3	45638363	45638770	-113961013	+	MTD	LTR	MaLR	3	384	-35	2
933	383	375	99	17	chr3	45656792	45657126	-113942657	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	364	-15	2
933	868	312	76	12	chr3	45659013	45659357	-113940426	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	2
933	810	327	77	47	chr3	45659370	45659733	-113940050	+	MTD	LTR	MaLR	46	419	0	2
933	3386	25	5	0	chr3	45665345	45665739	-113934044	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
933	9108	36	2	4	chr3	45665739	45666839	-113932944	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
933	3386	25	5	0	chr3	45666839	45667233	-113932550	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
933	346	314	53	80	chr3	45669440	45669627	-113930156	+	MTEb	LTR	MaLR	18	199	-180	2
933	1582	180	12	20	chr3	45678372	45678685	-113921098	-	RLTR10E	LTR	ERVK	-7	404	1	2
933	4112	128	32	6	chr3	45678685	45679343	-113920440	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	7006	2
933	1453	111	111	0	chr3	45679362	45679587	-113920196	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1286	5256	5007	2
933	343	175	0	0	chr3	45679587	45679644	-113920139	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6039	503	447	2
933	2390	266	59	35	chr3	45679661	45680604	-113919179	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6015	1566	535	2
933	343	237	40	88	chr3	45680657	45680805	-113918978	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-7539	141	1	2
933	1608	183	11	22	chr3	45680805	45681124	-113918659	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	475	1	2
933	564	282	80	22	chr3	45712239	45712616	-113887167	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	5	3
933	534	348	123	85	chr3	45727057	45727374	-113872409	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-8	366	38	3
933	349	335	79	38	chr3	45727422	45727689	-113872094	-	MLT1C	LTR	MaLR	-189	278	1	3
933	232	192	18	71	chr3	45739346	45739402	-113860381	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-453	62	10	3
933	987	286	53	43	chr3	45742321	45742621	-113857162	+	ORR1D2	LTR	MaLR	10	312	-58	3
934	1057	250	48	4	chr3	45758767	45759036	-113840747	-	MTD	LTR	MaLR	-133	286	6	3
934	1808	178	0	60	chr3	45770343	45770690	-113829093	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
934	662	324	63	119	chr3	45773080	45773507	-113826276	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	17	4
934	522	227	163	56	chr3	45777059	45777255	-113822528	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	168	4
934	387	316	13	7	chr3	45777461	45777632	-113822151	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-191	183	4	4
934	697	307	94	13	chr3	45778553	45778926	-113820857	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3932	1067	665	4
934	332	375	37	0	chr3	45779369	45779505	-113820278	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4773	226	86	4
934	230	416	72	6	chr3	45779621	45779788	-113819995	-	RMER15	LTR	ERVL	-48	527	350	4
934	510	345	36	76	chr3	45789121	45789204	-113810579	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	79	-291	4
934	510	345	36	76	chr3	45789374	45789593	-113810190	+	ORR1D2	LTR	MaLR	80	294	-76	4
934	258	150	46	77	chr3	45791481	45791546	-113808237	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	4
934	449	292	128	51	chr3	45798545	45798819	-113800964	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	117	4
934	2301	203	107	27	chr3	45801803	45802432	-113797351	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	679	-11	4
934	3388	91	19	2	chr3	45808916	45809381	-113790402	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	3	4
934	527	332	57	9	chr3	45810550	45810778	-113789005	+	MER90	LTR	ERV1	3	241	-334	4
934	1452	159	14	87	chr3	45812209	45812554	-113787229	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	3	322	0	4
934	547	359	106	45	chr3	45813660	45813820	-113785963	+	MLT1E2	LTR	MaLR	22	183	-444	4
934	547	362	98	47	chr3	45813887	45814294	-113785489	+	MLT1E2	LTR	MaLR	184	618	-6	4
934	855	288	52	13	chr3	45817523	45817757	-113782026	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	177	4
934	4319	166	72	80	chr3	45817917	45818819	-113780964	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	895	-7	4
934	380	335	43	37	chr3	45818907	45819071	-113780712	-	MTD	LTR	MaLR	-243	176	12	4
934	228	350	50	20	chr3	45820698	45820797	-113778986	-	MLT1J	LTR	MaLR	-335	177	76	4
934	1805	219	37	2	chr3	45823151	45823558	-113776225	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
934	352	306	97	0	chr3	45832831	45832975	-113766808	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	4	161	-1419	4
934	400	307	168	10	chr3	45832978	45833232	-113766551	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1017	1344	-236	4
934	1026	281	73	21	chr3	45833962	45834289	-113765494	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	352	-7	4
934	1464	209	39	52	chr3	45839233	45839616	-113760167	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	5
934	3176	123	29	170	chr3	45846892	45847767	-113752016	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	5
934	2316	78	6	27	chr3	45853121	45853450	-113746333	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	322	-24	5
935	2527	121	44	3	chr3	45879435	45879824	-113719959	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	5
935	1564	187	12	102	chr3	45879935	45880269	-113719514	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-51	343	40	5
935	597	284	111	20	chr3	45880720	45880964	-113718819	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	310	5
935	241	301	28	70	chr3	45907829	45907972	-113691811	+	LTR32	LTR	ERVL	34	170	-301	5
935	3398	25	5	0	chr3	45921759	45922153	-113677630	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
935	317	403	32	16	chr3	45930042	45930231	-113669552	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	1	6
935	5166	105	19	29	chr3	45933324	45934120	-113665663	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	788	-20	6
935	453	291	101	32	chr3	45935723	45935940	-113663843	+	MER76	LTR	ERVL	460	691	0	6
935	2448	202	58	20	chr3	45937605	45938160	-113661623	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	576	-1	6
935	424	330	83	68	chr3	45954284	45954609	-113645174	+	MER31A	LTR	ERV1	15	344	-122	6
935	297	262	0	121	chr3	45961630	45961721	-113638062	-	MT2B	LTR	ERVL	-345	256	177	6
935	1825	160	115	23	chr3	45969131	45969566	-113630217	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
935	297	268	38	20	chr3	45984875	45985014	-113614769	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	143	-231	6
935	283	360	53	69	chr3	45986032	45986351	-113613432	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-789	314	1	6
935	477	338	135	63	chr3	45991558	45991937	-113607846	-	MTE-int	LTR	MaLR	-69	1511	1106	7
935	505	321	88	31	chr3	45992616	45992844	-113606939	+	MTD	LTR	MaLR	49	289	-130	7
935	235	250	54	0	chr3	45992884	45992940	-113606843	+	MTD	LTR	MaLR	295	353	-6	7
935	262	353	73	53	chr3	46000231	46000644	-113599139	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-1135	4579	4159	1
936	2186	122	219	26	chr3	46011992	46012453	-113587330	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-68	586	37	9
936	1869	132	9	51	chr3	46023330	46023666	-113576117	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	2
936	4115	64	3	50	chr3	46023667	46024261	-113575522	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2	567	-4277	2
936	927	177	221	69	chr3	46039716	46040160	-113559623	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-16	431	1	4
936	346	360	123	9	chr3	46040694	46040921	-113558862	-	LTR50	LTR	ERVL	-537	258	6	4
936	6951	29	1	23	chr3	46051650	46052490	-113547293	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	5
936	654	273	201	9	chr3	46054527	46054845	-113544938	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	5
936	2852	88	23	3	chr3	46055431	46055817	-113543966	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	3	396	0	5
936	601	280	14	64	chr3	46056340	46056553	-113543230	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	198	5
936	4209	111	15	81	chr3	46067147	46067935	-113531848	-	RMER17A	LTR	ERVK	-15	736	1	7
936	318	301	77	37	chr3	46087358	46087546	-113512237	+	RMER15	LTR	ERVL	96	352	-223	1
936	240	346	112	8	chr3	46087560	46087694	-113512089	+	RMER15	LTR	ERVL	392	539	-36	1
936	2120	189	64	91	chr3	46091216	46091744	-113508039	+	RMER16	LTR	ERVK	1	514	-19	1
936	227	290	14	14	chr3	46119986	46120056	-113479727	-	RMER15	LTR	ERVL	-79	496	427	1
936	311	266	119	0	chr3	46123977	46124086	-113475697	+	RLTR23	LTR	ERV1	3	124	-306	1
936	406	250	87	92	chr3	46124823	46125030	-113474753	+	RLTR23	LTR	ERV1	225	430	0	1
936	1426	187	77	31	chr3	46136091	46136501	-113463282	+	RMER6A	LTR	ERVK	277	680	-76	1
14	1642	229	53	44	chr3	46136967	46137492	-113462291	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	28	557	-3	1
937	3424	23	2	2	chr3	46142214	46142610	-113457173	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
937	9546	18	2	0	chr3	46142610	46143706	-113456077	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
937	3424	23	2	2	chr3	46143706	46144102	-113455681	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
937	624	280	141	4	chr3	46149935	46150197	-113449586	-	RMER20B	LTR	ERVK	-217	410	113	1
937	1048	151	6	6	chr3	46157211	46157391	-113442392	+	MTB	LTR	MaLR	221	400	0	1
937	232	345	0	44	chr3	46157669	46157760	-113442023	-	RMER20B	LTR	ERVK	-519	108	22	1
937	1261	238	137	98	chr3	46158161	46158599	-113441184	+	MT2A	LTR	ERVL	1	455	-78	2
937	287	364	39	13	chr3	46159649	46159802	-113439981	+	RMER15	LTR	ERVL	406	562	-13	2
937	696	336	46	43	chr3	46160691	46161042	-113438741	-	MLT1B	LTR	MaLR	-38	352	1	2
937	260	197	0	57	chr3	46172645	46172715	-113427068	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	331	2
937	230	342	40	86	chr3	46174583	46174781	-113425002	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-821	207	19	2
937	3280	56	69	11	chr3	46177519	46177566	-113422217	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	431	2
937	7926	32	1	8	chr3	46177566	46178502	-113421281	-	RLTR13B3	LTR	ERVK	0	929	1	2
937	3280	56	69	11	chr3	46178502	46178902	-113420881	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-45	430	2	2
937	242	348	11	11	chr3	46194060	46194153	-113405630	-	MTC	LTR	MaLR	-14	407	315	2
937	420	171	66	0	chr3	46203949	46204025	-113395758	+	MTC	LTR	MaLR	1	81	-340	2
937	1224	225	114	0	chr3	46204366	46204664	-113395119	+	MTC	LTR	MaLR	82	413	-8	2
937	226	234	0	45	chr3	46218818	46218885	-113380898	-	LTR37B	LTR	ERV1	-71	397	334	3
937	1464	177	109	20	chr3	46219377	46219630	-113380153	+	ORR1A2	LTR	MaLR	6	290	-37	3
937	2861	46	0	0	chr3	46219630	46219976	-113379807	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
937	1464	177	109	20	chr3	46219976	46220016	-113379767	+	ORR1A2	LTR	MaLR	291	325	-2	3
937	1414	266	42	126	chr3	46222355	46223082	-113376701	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	736	47	3
937	406	175	40	30	chr3	46225321	46225421	-113374362	-	RMER19C	LTR	ERVK	-510	101	1	3
937	536	372	89	28	chr3	46227519	46227878	-113371905	-	LTR16C	LTR	ERVL	-14	475	95	3
937	396	256	0	0	chr3	46229143	46229237	-113370546	+	MTC	LTR	MaLR	265	365	-56	3
937	263	254	0	16	chr3	46229317	46229381	-113370402	+	MTC	LTR	MaLR	316	378	0	3
937	1963	172	22	33	chr3	46233149	46233510	-113366273	+	MTC	LTR	MaLR	63	419	-2	3
937	1124	186	73	168	chr3	46243676	46244129	-113355654	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	3
937	253	308	139	46	chr3	46253259	46253272	-113346511	+	MER34A1	LTR	ERV1	307	316	-271	3
937	253	308	139	46	chr3	46253295	46253475	-113346308	+	MER34A1	LTR	ERV1	317	518	-69	3
937	1021	215	273	26	chr3	46258016	46258701	-113341082	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	720	0	3
937	883	176	0	83	chr3	46262735	46263001	-113336782	-	RMER17C	LTR	ERVK	-166	244	1	3
937	3272	25	20	7	chr3	46265078	46265484	-113334299	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	3
937	13865	68	8	5	chr3	46265486	46267283	-113332500	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	4678	3
937	1854	99	8	0	chr3	46267301	46267553	-113332230	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2244	3
117	8862	78	55	85	chr3	46267548	46269144	-113330639	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5004	1477	9	3
938	3098	34	59	5	chr3	46269145	46269535	-113330248	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	3
938	294	280	108	31	chr3	46279409	46279538	-113320245	+	MT2A	LTR	ERVL	95	233	-300	3
938	308	309	144	0	chr3	46279523	46279620	-113320163	+	MT2A	LTR	ERVL	347	457	-76	3
938	229	256	45	34	chr3	46281168	46281257	-113318526	-	RMER15	LTR	ERVL	-485	90	1	3
938	2019	123	15	33	chr3	46282268	46282603	-113317180	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
938	1692	159	102	29	chr3	46290122	46290503	-113309280	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	3
938	1475	278	32	7	chr3	46296565	46296974	-113302809	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
938	1743	243	40	106	chr3	46297920	46298574	-113301209	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	4
938	458	410	6	11	chr3	46308741	46308921	-113290862	+	MT2A	LTR	ERVL	245	423	-110	4
938	322	234	120	74	chr3	46309390	46309565	-113290218	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	197	4
938	3099	74	10	2	chr3	46309664	46310082	-113289701	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	4
938	536	360	40	9	chr3	46310131	46310358	-113289425	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1295	285	52	4
938	4043	170	25	97	chr3	46316628	46317599	-113282184	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	2	902	0	4
938	650	319	109	46	chr3	46323867	46324215	-113275568	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	10	4
938	1694	239	86	138	chr3	46327067	46327684	-113272099	-	RMER17B	LTR	ERVK	-48	812	273	4
938	1694	228	96	138	chr3	46327778	46328143	-113271640	-	RMER17B	LTR	ERVK	-556	402	1	4
938	439	266	18	0	chr3	46330830	46330943	-113268840	+	ORR1C1	LTR	MaLR	4	118	-260	4
938	1331	200	48	11	chr3	46331350	46331618	-113268165	+	ORR1C1	LTR	MaLR	93	370	-8	4
938	2070	187	91	88	chr3	46338052	46338633	-113261150	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	3	4
938	3317	35	0	2	chr3	46343968	46344365	-113255418	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
938	347	314	52	62	chr3	46360254	46360429	-113239354	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	187	-172	4
938	581	328	61	25	chr3	46360595	46360873	-113238910	+	MTE-int	LTR	MaLR	1	288	-1292	4
938	1665	133	30	67	chr3	46382261	46382591	-113217192	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	5
938	878	279	20	29	chr3	46394113	46394375	-113205408	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-345	279	1	5
938	866	251	113	29	chr3	46397342	46397687	-113202096	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
938	260	410	21	27	chr3	46398126	46398314	-113201469	-	MTD	LTR	MaLR	-140	260	74	5
938	271	265	0	14	chr3	46398378	46398447	-113201336	-	MTD	LTR	MaLR	-351	68	1	5
939	531	296	48	24	chr3	46412416	46412582	-113187201	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	171	-188	5
939	383	329	177	76	chr3	46412710	46413026	-113186757	+	MTE2b	LTR	MaLR	15	362	-17	5
939	1477	229	38	84	chr3	46417587	46418082	-113181701	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	5
939	2892	206	59	17	chr3	46423055	46423633	-113176150	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	602	-25	5
939	1624	200	199	5	chr3	46427099	46427546	-113172237	+	RMER6C	LTR	ERVK	157	690	0	5
939	279	293	0	0	chr3	46431554	46431629	-113168154	+	RLTR12B	LTR	ERVK	20	94	-434	5
939	587	223	55	187	chr3	46433507	46433887	-113165896	+	RLTR12B	LTR	ERVK	122	451	-77	5
939	262	286	29	0	chr3	46437049	46437119	-113162664	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4572	4643	-356	6
939	2071	253	82	26	chr3	46440748	46441333	-113158450	-	RLTR17	LTR	ERVK	-74	618	1	6
939	789	192	89	0	chr3	46445090	46445236	-113154547	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	159	-483	6
939	1443	186	22	99	chr3	46445950	46446273	-113153510	+	RLTR26	LTR	ERVK	345	642	0	6
939	1253	252	137	27	chr3	46449755	46450165	-113149618	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	23	480	-97	6
939	1253	252	137	27	chr3	46450198	46450231	-113149552	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	481	514	-63	6
939	2162	99	15	45	chr3	46454330	46454667	-113145116	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	6
939	1004	161	0	70	chr3	46454668	46454869	-113144914	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	6
939	227	321	0	0	chr3	46454869	46454922	-113144861	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	6
939	20091	58	19	18	chr3	46454922	46457528	-113142255	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	2774	-3707	6
939	3123	17	0	0	chr3	46457526	46457883	-113141900	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4001	4357	-2124	6
939	5867	59	13	18	chr3	46457874	46458649	-113141134	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5709	6479	-2	6
939	2175	96	15	45	chr3	46458651	46458988	-113140795	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	6
939	993	307	56	19	chr3	46460896	46461255	-113138528	+	MTD	LTR	MaLR	35	406	-13	6
939	251	314	124	25	chr3	46461684	46461805	-113137978	+	LTR69	LTR	ERVL	17	149	-439	6
939	454	311	167	5	chr3	46461942	46462152	-113137631	+	LTR69	LTR	ERVL	325	568	-20	6
939	387	241	194	0	chr3	46465579	46465687	-113134096	-	MTC	LTR	MaLR	-83	296	168	6
939	402	222	40	20	chr3	46466244	46466345	-113133438	-	MTC	LTR	MaLR	-306	115	13	6
939	367	279	56	14	chr3	46468059	46468201	-113131582	+	MER92B	LTR	ERV1	74	221	-415	6
939	795	296	60	29	chr3	46473192	46473526	-113126257	-	MTD	LTR	MaLR	-71	348	3	6
939	529	232	6	112	chr3	46478091	46478261	-113121522	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-344	224	73	6
939	305	203	0	0	chr3	46478441	46478500	-113121283	-	RLTR16	LTR	ERVK	-446	59	1	6
939	2452	158	10	2	chr3	46481171	46481583	-113118200	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-146	415	1	6
939	838	285	70	54	chr3	46482436	46482807	-113116976	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	6
939	352	367	31	0	chr3	46483021	46483149	-113116634	+	MER54B	LTR	ERVL	67	198	-595	6
939	1053	256	68	25	chr3	46483189	46483557	-113116226	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	6
939	231	345	0	54	chr3	46484534	46484626	-113115157	-	RLTR18	LTR	ERVK	-527	89	3	6
939	2302	217	19	28	chr3	46484814	46485346	-113114437	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	6
939	2488	111	29	27	chr3	46486735	46487143	-113112640	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	6
939	3931	122	96	148	chr3	46491498	46492478	-113107305	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	6
939	385	189	289	26	chr3	46497367	46497530	-113102253	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-32	996	783	7
939	385	189	289	26	chr3	46497555	46497581	-113102202	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-246	782	757	7
939	490	274	16	33	chr3	46511013	46511154	-113088629	-	RMER20B	LTR	ERVK	-383	133	1	1
939	257	202	130	37	chr3	46511306	46511369	-113088414	+	MER54A	LTR	ERVL	473	547	-354	1
939	257	202	130	37	chr3	46511442	46511486	-113088297	+	MER54A	LTR	ERVL	548	590	-311	1
939	1116	252	17	27	chr3	46515915	46516216	-113083567	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-41	536	239	2
939	325	152	17	0	chr3	46516460	46516519	-113083264	+	RMER15	LTR	ERVL	302	361	-214	3
939	1257	262	178	37	chr3	46517513	46518076	-113081707	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	3
939	3403	23	5	5	chr3	46518194	46518590	-113081193	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
939	2749	103	28	0	chr3	46520739	46521135	-113078648	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
939	1202	255	106	32	chr3	46522222	46522613	-113077170	+	RLTR28	LTR	ERVL	8	428	-96	4
939	1202	255	106	32	chr3	46522654	46522695	-113077088	+	RLTR28	LTR	ERVL	429	472	-52	4
939	559	259	40	0	chr3	46522667	46522841	-113076942	+	RLTR28	LTR	ERVL	344	524	0	4
939	313	204	80	45	chr3	46523677	46523791	-113075992	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-23	396	232	4
939	226	213	112	90	chr3	46523847	46523866	-113075917	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-135	284	260	4
939	348	239	42	42	chr3	46526556	46526652	-113073131	+	RLTR23	LTR	ERV1	314	409	-21	5
940	3776	208	45	30	chr3	46537293	46538141	-113061642	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	861	-167	8
940	1815	161	164	12	chr3	46538458	46538874	-113060909	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	54	8
940	653	70	52	17	chr3	46545847	46545963	-113053820	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-412	120	1	8
940	3033	76	177	2	chr3	46547688	46548124	-113051659	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	8
940	1336	222	136	188	chr3	46553715	46554178	-113045605	-	RMER6A	LTR	ERVK	-4	716	352	9
940	1336	222	136	188	chr3	46554212	46554503	-113045280	-	RMER6A	LTR	ERVK	-367	353	1	9
940	1006	258	26	33	chr3	46563100	46563373	-113036410	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	271	-103	1
940	1011	180	31	51	chr3	46573781	46574037	-113025746	+	ORR1B1	LTR	MaLR	27	352	-42	1
940	986	196	81	146	chr3	46574183	46574261	-113025522	+	ORR1B1	LTR	MaLR	283	327	0	1
940	2521	206	117	25	chr3	46585365	46585914	-113013869	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	599	-12	1
940	1943	136	27	0	chr3	46596098	46596399	-113003384	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	1
940	387	224	130	9	chr3	46604183	46604291	-112995492	+	RMER15	LTR	ERVL	346	466	-109	1
940	235	191	44	73	chr3	46607911	46607979	-112991804	-	RMER20A	LTR	ERVK	-265	251	186	1
940	1267	51	0	0	chr3	46618513	46618670	-112981113	+	BGLII	LTR	ERVK	1	157	-264	1
940	1626	177	4	0	chr3	46624017	46624282	-112975501	-	RMER6A	LTR	ERVK	-487	269	4	2
940	2913	79	2	20	chr3	46645886	46646287	-112953496	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	2
940	584	261	70	27	chr3	46655119	46655304	-112944479	-	RMER5	LTR	ERV1	-341	193	1	2
940	471	341	65	101	chr3	46655593	46656099	-112943684	+	MER54A	LTR	ERVL	412	899	-2	2
940	526	363	31	8	chr3	46657773	46658031	-112941752	-	RMER15	LTR	ERVL	-22	553	290	2
940	351	273	48	24	chr3	46658052	46658176	-112941607	-	RMER15	LTR	ERVL	-446	129	3	2
941	2991	61	13	5	chr3	46663120	46663513	-112936270	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
941	1995	154	64	18	chr3	46673427	46673818	-112925965	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
941	306	127	0	35	chr3	46673830	46673887	-112925896	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-14	7392	7338	2
941	1841	190	151	11	chr3	46673891	46674366	-112925417	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-360	542	1	2
941	1540	155	4	4	chr3	46674373	46674626	-112925157	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-27	5781	5529	2
941	361	137	0	49	chr3	46674626	46674707	-112925076	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-1172	6072	6009	2
941	1286	194	19	17	chr3	46674802	46675157	-112924626	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	6127	2
941	3959	168	39	68	chr3	46675126	46676747	-112923036	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1153	4655	2371	2
941	2685	169	51	24	chr3	46676763	46677308	-112922475	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4419	2987	2428	2
941	1795	163	46	11	chr3	46687165	46687512	-112912271	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	359	-331	2
941	4030	179	41	49	chr3	46687643	46688541	-112911242	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-46	856	2	2
941	1550	143	23	0	chr3	46688549	46688808	-112910975	+	RMER6C	LTR	ERVK	424	688	-2	2
941	532	288	100	13	chr3	46700806	46701105	-112898678	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-368	5346	5022	3
941	570	346	110	26	chr3	46701371	46702033	-112897750	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-4970	744	27	3
941	451	295	64	125	chr3	46704406	46704735	-112895048	+	RLTR26	LTR	ERVK	168	476	-166	3
941	249	250	50	50	chr3	46707083	46707163	-112892620	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	287	3
941	1188	198	9	13	chr3	46709886	46710111	-112889672	+	ORR1A4	LTR	MaLR	98	321	-8	3
941	4040	186	36	31	chr3	46710561	46710705	-112889078	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	142	-886	3
941	4040	191	39	33	chr3	46710754	46711527	-112888256	+	RLTR25B	LTR	ERVK	143	1028	0	3
941	1583	204	7	0	chr3	46712210	46712499	-112887284	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	37	3
941	8591	182	73	21	chr3	46712500	46714363	-112885420	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-2	1961	1	3
941	363	96	0	0	chr3	46714366	46714418	-112885365	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-3	323	272	3
941	1089	240	96	11	chr3	46720622	46720904	-112878879	-	MTC-int	LTR	MaLR	-952	306	1	3
941	1546	212	64	67	chr3	46720906	46721151	-112878632	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	195	3
941	1546	212	64	67	chr3	46721510	46721684	-112878099	-	MTC	LTR	MaLR	-227	194	1	3
941	389	309	82	16	chr3	46733656	46733840	-112865943	+	RMER5	LTR	ERV1	330	525	-9	3
941	1894	155	71	45	chr3	46741296	46741750	-112858033	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	426	-15	3
941	369	301	7	47	chr3	46742410	46742560	-112857223	-	RLTR33	LTR	ERVK	-360	318	175	3
941	336	368	62	42	chr3	46750302	46750543	-112849240	+	LTR82A	LTR	ERVL	431	676	-196	3
941	707	320	55	22	chr3	46770222	46770589	-112829194	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	4
941	440	353	66	63	chr3	46772906	46773193	-112826590	+	MTEa	LTR	MaLR	78	365	-14	4
941	289	330	0	0	chr3	46773690	46773778	-112826005	-	MER77	LTR	ERVL	-516	91	4	4
941	419	347	121	66	chr3	46773778	46774238	-112825545	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-22	538	53	4
941	2110	223	229	13	chr3	46774669	46775412	-112824371	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	5	4
941	2591	56	6	3	chr3	46777681	46778023	-112821760	+	MT-int	LTR	MaLR	683	1025	-73	4
941	245	352	34	0	chr3	46785582	46785670	-112814113	-	LTR16C	LTR	ERVL	-147	342	252	4
942	1911	188	14	27	chr3	46797093	46797460	-112802323	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	33	4
942	244	344	88	101	chr3	46812226	46812543	-112787240	+	MER67D	LTR	ERV1	83	395	-119	4
942	15289	273	16	10	chr3	46817407	46818226	-112781557	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-2102	4440	3625	4
942	15289	273	16	10	chr3	46818795	46822366	-112777417	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-2918	3624	22	4
942	1164	222	47	58	chr3	46822393	46822756	-112777027	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	4
942	1522	235	15	82	chr3	46826829	46827191	-112772592	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	338	-40	4
942	1167	217	95	54	chr3	46827191	46827400	-112772383	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	212	-198	4
942	1167	217	95	54	chr3	46827488	46827667	-112772116	+	RMER17C	LTR	ERVK	213	406	-4	4
942	1522	235	15	82	chr3	46827667	46827707	-112772076	+	ORR1C1	LTR	MaLR	339	376	-2	4
942	394	338	81	0	chr3	46827870	46828006	-112771777	+	MTEa	LTR	MaLR	1	147	-232	4
942	290	333	112	11	chr3	46828006	46828058	-112771725	+	MT2A	LTR	ERVL	1	207	-326	4
942	1450	190	43	50	chr3	46844292	46844672	-112755111	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	386	-8	5
942	425	326	114	23	chr3	46845821	46846085	-112753698	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	288	-86	5
942	236	377	13	76	chr3	46846340	46846443	-112753340	+	MTEb	LTR	MaLR	121	213	-166	5
942	236	377	13	76	chr3	46846474	46846528	-112753255	+	MTEb	LTR	MaLR	214	267	-112	5
942	437	347	49	57	chr3	46846590	46846853	-112752930	+	MTE-int	LTR	MaLR	1	261	-1319	5
942	259	217	63	45	chr3	46847264	46847375	-112752408	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1092	1204	-1638	5
942	1439	213	16	6	chr3	46847444	46847756	-112752027	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	315	-2011	5
942	990	176	34	0	chr3	46847748	46847952	-112751831	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	2041	2251	-75	5
942	702	271	79	39	chr3	46856774	46857176	-112742607	-	MT2A	LTR	ERVL	-80	453	6	5
942	360	314	0	28	chr3	46859432	46859540	-112740243	+	LTR16B2	LTR	ERVL	139	243	-219	5
942	803	285	85	8	chr3	46859678	46859926	-112739857	-	MT2A	LTR	ERVL	-97	436	170	5
942	414	297	58	17	chr3	46860741	46860861	-112738922	-	MT2A	LTR	ERVL	-357	176	52	5
942	3580	145	15	88	chr3	46867370	46868180	-112731603	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	5
942	325	339	152	0	chr3	46883244	46883480	-112716303	-	MER110A	LTR	ERV1	-96	372	101	5
942	2041	151	6	11	chr3	46891214	46891575	-112708208	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	5
942	1150	236	140	70	chr3	46891818	46892342	-112707441	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-13	564	20	5
942	709	130	0	36	chr3	46898744	46898856	-112700927	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	252	5
942	234	276	92	0	chr3	46898853	46898929	-112700854	-	RLTR15	LTR	ERVK	-274	85	3	5
942	246	209	2	0	chr3	46902731	46902786	-112696997	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-159	235	128	5
942	239	354	62	23	chr3	46905464	46905594	-112694189	+	MER77	LTR	ERVL	82	216	-391	5
942	231	351	121	38	chr3	46905665	46905822	-112693961	+	MER77	LTR	ERVL	167	336	-271	5
942	2269	210	28	47	chr3	46909724	46909784	-112689999	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-35	499	445	5
942	2269	210	28	47	chr3	46909844	46910292	-112689491	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-90	444	1	5
942	1926	145	28	3	chr3	46910667	46910985	-112688798	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	327	0	5
942	620	310	203	40	chr3	46912685	46913065	-112686718	+	RMER15	LTR	ERVL	29	470	-105	6
942	512	376	29	10	chr3	46915094	46915298	-112684485	+	MTE2b	LTR	MaLR	97	304	-75	6
943	2177	225	28	108	chr3	46933321	46933968	-112665815	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	96	6
943	477	285	19	50	chr3	46933952	46934111	-112665672	-	RMER6C	LTR	ERVK	-534	156	3	6
943	253	210	48	0	chr3	46941354	46941416	-112658367	+	LTR82A	LTR	ERVL	230	294	-578	6
943	3147	35	38	0	chr3	46942593	46942989	-112656794	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	6
943	343	311	106	59	chr3	46946787	46947043	-112652740	+	RMER2	LTR	ERV1	300	567	0	6
943	1048	235	75	35	chr3	46971159	46971441	-112628342	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	293	-77	6
943	320	325	65	20	chr3	46979749	46979950	-112619833	-	MER67C	LTR	ERV1	-501	210	1	6
943	489	365	40	44	chr3	46984190	46984488	-112615295	-	MER21B	LTR	ERV1	-69	794	498	7
943	1846	220	127	55	chr3	46994184	46994728	-112605055	+	RMER4B	LTR	ERVK	3	585	0	7
943	1334	231	81	81	chr3	46995083	46995493	-112604290	+	MTC	LTR	MaLR	2	411	-10	7
943	358	157	39	70	chr3	46997307	46997400	-112602383	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	378	281	7
943	3382	211	30	46	chr3	46997400	46998159	-112601624	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	763	7
943	1636	129	136	112	chr3	46998184	46998648	-112601135	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	7
943	907	162	126	6	chr3	46998656	46998830	-112600953	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-172	195	1	7
943	948	152	24	30	chr3	47009238	47009407	-112590376	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	434	1
943	1110	213	17	13	chr3	47009370	47009608	-112590175	-	RLTR27	LTR	ERVK	-70	239	1	1
943	1655	197	88	6	chr3	47013217	47013570	-112586213	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	339	2
943	560	159	109	50	chr3	47013624	47013862	-112585921	-	RMER17D	LTR	ERVK	-394	495	244	2
943	1713	200	48	0	chr3	47013833	47014148	-112585635	-	RMER6D	LTR	ERVK	-390	330	1	2
943	2500	218	113	54	chr3	47014515	47015142	-112584641	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	664	-14	2
943	636	326	58	83	chr3	47016341	47016666	-112583117	+	MLT1B	LTR	MaLR	51	367	-23	3
943	4405	206	32	26	chr3	47016776	47017631	-112582152	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	41	3
943	2208	46	364	3	chr3	47017631	47017980	-112581803	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	3
943	4405	206	32	26	chr3	47017980	47018020	-112581763	-	RMER19B	LTR	ERVK	-862	40	1	3
943	281	366	85	82	chr3	47018397	47018751	-112581032	+	MTEa	LTR	MaLR	22	376	-3	3
943	392	346	28	14	chr3	47033867	47034084	-112565699	-	LTR68	LTR	ERV1	0	740	521	5
943	803	386	38	47	chr3	47041136	47041710	-112558073	+	MTE-int	LTR	MaLR	857	1425	-155	6
943	253	409	62	11	chr3	47041762	47041940	-112557843	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	187	-172	6
943	948	277	32	16	chr3	47047184	47047430	-112552353	-	MTD	LTR	MaLR	-56	363	114	7
943	258	269	0	71	chr3	47047757	47047841	-112551942	-	MTD	LTR	MaLR	-299	120	43	7
943	2180	190	0	58	chr3	47049904	47050385	-112549398	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	7
943	1179	240	132	54	chr3	47051827	47052600	-112547183	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	720	1	8
944	1836	151	25	0	chr3	47059629	47059948	-112539835	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	9
944	1130	317	75	13	chr3	47079100	47079567	-112520216	+	RMER5	LTR	ERV1	37	532	-2	1
944	392	279	33	61	chr3	47098089	47098314	-112501469	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	561	304	1
944	1426	196	58	18	chr3	47101967	47102295	-112497488	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-243	341	1	1
944	280	370	51	28	chr3	47120461	47120675	-112479108	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2626	3041	2823	1
944	1296	165	153	76	chr3	47122754	47123055	-112476728	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	324	-2	1
944	2822	201	130	27	chr3	47130225	47130881	-112468902	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	180	1
944	432	180	0	101	chr3	47140933	47141032	-112458751	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	1015	2
944	253	347	8	53	chr3	47148775	47148906	-112450877	+	MLT1B	LTR	MaLR	216	340	-50	2
944	863	262	36	29	chr3	47158120	47158399	-112441384	+	MER34	LTR	ERV1	3	283	-259	2
944	1267	272	104	39	chr3	47171434	47171923	-112427860	+	RMER19C	LTR	ERVK	88	608	-3	2
944	1535	209	168	88	chr3	47172667	47173233	-112426550	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
945	3167	35	30	5	chr3	47187921	47188322	-112411461	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	26	2
945	2679	126	23	5	chr3	47191172	47191604	-112408179	+	RLTR44E	LTR	ERVK	1	440	-12	2
945	777	269	104	47	chr3	47199128	47199425	-112400358	+	MTD-int	LTR	MaLR	6	319	-939	2
945	1239	291	111	50	chr3	47201043	47201708	-112398075	+	MTD-int	LTR	MaLR	418	1123	-135	2
945	370	262	89	8	chr3	47201830	47201953	-112397830	+	MTD-int	LTR	MaLR	1124	1256	-2	2
945	1218	290	40	59	chr3	47201958	47202383	-112397400	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	2
945	1201	248	39	48	chr3	47224903	47225118	-112374665	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	192	3
945	1201	248	39	48	chr3	47225147	47225262	-112374521	-	MTD	LTR	MaLR	-228	191	87	3
945	298	366	26	52	chr3	47229899	47230092	-112369691	+	LTR69	LTR	ERVL	345	532	-56	3
945	1720	204	51	28	chr3	47235738	47236167	-112363616	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	439	-519	3
945	2410	225	52	20	chr3	47236186	47236798	-112362985	+	RMER13B	LTR	ERVK	272	903	-5	3
945	673	257	33	122	chr3	47246673	47247041	-112352742	-	RLTR15	LTR	ERVK	-19	340	6	3
945	834	237	12	24	chr3	47247047	47247298	-112352485	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-5	6545	6298	3
945	942	199	5	0	chr3	47247299	47247510	-112352273	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-923	8036	7825	3
945	333	157	148	55	chr3	47247484	47247612	-112352171	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1057	7902	7763	3
945	392	274	74	84	chr3	47247612	47247815	-112351968	-	RMER4A	LTR	ERVK	-27	439	239	3
945	1035	288	59	65	chr3	47247815	47248501	-112351282	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1575	751	151	3
945	1011	276	65	65	chr3	47248554	47249166	-112350617	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7075	1884	1273	3
945	687	269	50	47	chr3	47249318	47249595	-112350188	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1824	1353	1076	3
945	388	292	54	33	chr3	47249895	47250079	-112349704	-	RLTR15	LTR	ERVK	-171	188	1	3
945	491	169	32	48	chr3	47254197	47254321	-112345462	+	RLTR9A	LTR	ERVK	247	368	0	3
945	1640	115	18	22	chr3	47255257	47255532	-112344251	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	274	-201	3
945	724	117	42	0	chr3	47255530	47255650	-112344133	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-202	125	1	3
945	1003	133	12	12	chr3	47255654	47255814	-112343969	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-24	6797	6638	3
945	2908	26	2	148	chr3	47255829	47256283	-112343500	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	3
945	299	308	77	0	chr3	47259545	47259688	-112340095	-	MLT1B	LTR	MaLR	-229	161	8	3
945	625	245	106	21	chr3	47272038	47272226	-112327557	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	167	3
945	433	360	7	13	chr3	47272451	47272603	-112327180	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-219	155	5	3
945	1066	193	315	24	chr3	47285208	47285675	-112314108	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	1	603	-51	4
945	996	209	61	51	chr3	47285679	47286011	-112313772	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	25	347	-7105	4
945	4837	119	29	13	chr3	47286028	47286812	-112312971	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	672	1468	-2230	4
945	8499	85	47	37	chr3	47286887	47289186	-112310597	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	960	3698	0	4
945	836	142	6	99	chr3	47289186	47289358	-112310425	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	1	156	-498	4
945	511	203	213	45	chr3	47289371	47289639	-112310144	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	276	588	-66	4
945	2867	55	0	0	chr3	47292367	47292713	-112307070	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	4
945	5195	198	58	71	chr3	47301054	47301931	-112297852	+	RMER12	LTR	ERVK	1	898	-424	4
945	5195	198	58	71	chr3	47301997	47302459	-112297324	+	RMER12	LTR	ERVK	899	1322	0	4
945	2738	94	42	0	chr3	47313623	47314007	-112285776	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
946	2722	38	24	3	chr3	47323201	47323540	-112276243	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	4
946	1048	204	263	20	chr3	47324287	47324686	-112275097	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-7	570	75	4
946	2416	192	40	0	chr3	47324725	47325250	-112274533	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-5	2321	1776	4
946	3777	182	18	18	chr3	47325388	47326128	-112273655	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1586	740	1	4
946	844	297	32	43	chr3	47332588	47332958	-112266825	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	4
946	966	306	81	33	chr3	47332971	47333330	-112266453	+	MTC	LTR	MaLR	46	421	0	4
946	2478	99	20	67	chr3	47346998	47347400	-112252383	-	RLTR9A2	LTR	ERVK	0	383	1	4
946	442	326	34	90	chr3	47348645	47348911	-112250872	+	MTEb	LTR	MaLR	1	251	-128	4
946	3628	182	16	9	chr3	47353022	47353708	-112246075	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	691	-1	4
946	273	335	73	84	chr3	47378218	47378459	-112221324	-	MLT1B	LTR	MaLR	-21	369	129	5
946	273	335	73	84	chr3	47378502	47378547	-112221236	-	MLT1B	LTR	MaLR	-262	128	86	5
946	1688	221	62	25	chr3	47379185	47379589	-112220194	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	5
946	2874	236	111	27	chr3	47379612	47379674	-112220109	-	MTC-int	LTR	MaLR	-368	890	823	5
946	2874	236	111	27	chr3	47379722	47380111	-112219672	-	MTC-int	LTR	MaLR	-436	822	367	5
946	2874	236	111	27	chr3	47380555	47380919	-112218864	-	MTC-int	LTR	MaLR	-892	366	6	5
946	1860	209	46	13	chr3	47380921	47381314	-112218469	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	16	5
946	3306	46	5	0	chr3	47385101	47385495	-112214288	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
946	8980	40	2	2	chr3	47385495	47386593	-112213190	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
946	3282	41	8	0	chr3	47386593	47386986	-112212797	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
946	463	208	19	19	chr3	47389896	47389999	-112209784	+	RLTR17	LTR	ERVK	263	365	-327	5
946	1649	196	39	21	chr3	47392322	47392655	-112207128	+	RLTR17	LTR	ERVK	354	692	0	5
946	3679	163	84	5	chr3	47392656	47393302	-112206481	-	RMER19A	LTR	ERVK	-40	697	1	5
946	229	297	31	0	chr3	47393754	47393818	-112205965	+	RLTR21	LTR	ERVK	230	295	-1277	5
946	665	293	42	24	chr3	47402906	47403074	-112196709	-	RMER20B	LTR	ERVK	-456	171	1	5
946	504	323	93	31	chr3	47411501	47411760	-112188023	+	RLTR12B	LTR	ERVK	46	320	-208	5
946	393	338	46	21	chr3	47411733	47411972	-112187811	+	RLTR12B	LTR	ERVK	242	486	-42	5
946	2160	145	6	17	chr3	47426131	47426489	-112173294	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	56	5
946	411	157	48	41	chr3	47430364	47430506	-112169277	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-289	131	1	5
946	260	220	0	0	chr3	47433560	47433610	-112166173	-	MT2B2	LTR	ERVL	-2	582	533	5
946	635	294	17	90	chr3	47433851	47434150	-112165633	-	MT2B2	LTR	ERVL	-55	529	253	5
946	344	250	87	48	chr3	47434176	47434302	-112165481	-	MT2B2	LTR	ERVL	-401	132	2	5
946	482	340	66	25	chr3	47436991	47437187	-112162596	+	MTEb	LTR	MaLR	169	372	-7	5
946	237	250	138	21	chr3	47441290	47441384	-112158399	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	109	-310	5
946	445	289	9	0	chr3	47441503	47441617	-112158166	+	MTE2a	LTR	MaLR	265	379	0	5
946	3728	35	5	0	chr3	47443022	47443456	-112156327	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	6
947	312	289	31	10	chr3	47450200	47450298	-112149485	-	RMER15	LTR	ERVL	-475	100	1	6
947	1999	148	85	24	chr3	47450316	47450460	-112149323	+	MTB	LTR	MaLR	3	143	-257	6
947	2460	78	16	48	chr3	47450460	47450837	-112148946	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	6
947	1999	148	85	24	chr3	47450837	47451067	-112148716	+	MTB	LTR	MaLR	144	400	0	6
947	1933	136	63	0	chr3	47451067	47451399	-112148384	+	MTB-int	LTR	MaLR	1	353	-745	6
947	2594	87	3	13	chr3	47453363	47453736	-112146047	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	28	396	0	6
947	2103	100	53	24	chr3	47459750	47460137	-112139646	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	55	6
947	3412	35	0	0	chr3	47460137	47460533	-112139250	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
947	9108	35	5	0	chr3	47460533	47461626	-112138157	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	6
947	3244	28	2	62	chr3	47461626	47462047	-112137736	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
947	827	32	91	68	chr3	47462047	47462089	-112137694	-	RLTR1B	LTR	ERV1	-458	54	3	6
947	2744	214	122	35	chr3	47464526	47465388	-112134395	+	RMER13A	LTR	ERVK	5	908	0	6
947	227	196	0	21	chr3	47474224	47474271	-112125512	-	MTE2b	LTR	MaLR	-332	47	2	6
947	1627	127	124	0	chr3	47476002	47476293	-112123490	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	327	-5	6
947	1557	256	89	37	chr3	47476679	47477141	-112122642	+	RMER19C	LTR	ERVK	126	611	0	6
947	2728	79	10	27	chr3	47479882	47480169	-112119614	+	MTB	LTR	MaLR	1	286	-114	6
947	1889	175	9	75	chr3	47480169	47480607	-112119176	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	6
947	2728	79	10	27	chr3	47480607	47480723	-112119060	+	MTB	LTR	MaLR	287	397	-3	6
947	2154	93	51	3	chr3	47482281	47482593	-112117190	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
947	313	93	0	53	chr3	47484236	47484293	-112115490	+	ORR1A1	LTR	MaLR	293	346	0	6
947	242	328	60	15	chr3	47484666	47484799	-112114984	+	MLT1A0	LTR	MaLR	227	365	0	6
947	2272	228	48	57	chr3	47488493	47489103	-112110680	-	RLTR18	LTR	ERVK	-12	604	1	6
947	805	288	78	35	chr3	47490555	47490912	-112108871	-	MTD	LTR	MaLR	-14	386	1	6
947	690	285	87	49	chr3	47490914	47490970	-112108813	-	MTD-int	LTR	MaLR	-2	1256	1210	6
947	855	295	131	42	chr3	47491150	47492086	-112107697	-	MTD-int	LTR	MaLR	-49	1209	12	6
947	860	282	184	17	chr3	47492099	47492453	-112107330	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	3	6
947	3365	35	2	0	chr3	47496821	47497216	-112102567	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
947	459	0	0	0	chr3	47497216	47497270	-112102513	-	RLTR1B	LTR	ERV1	-458	54	1	6
947	852	331	75	40	chr3	47503853	47504253	-112095530	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	8
947	432	283	87	5	chr3	47506651	47506836	-112092947	-	RMER5	LTR	ERV1	-9	525	326	1
947	463	346	105	57	chr3	47525026	47525483	-112074300	-	MLT1E1	LTR	MaLR	0	654	176	3
947	313	310	0	12	chr3	47527526	47527611	-112072172	-	RMER15	LTR	ERVL	-154	421	338	3
947	347	268	44	18	chr3	47529411	47529525	-112070258	+	MER67C	LTR	ERV1	465	581	-130	4
947	867	282	97	45	chr3	47534494	47534802	-112064981	+	ORR1D2	LTR	MaLR	35	358	-12	4
947	1306	266	18	18	chr3	47535069	47535406	-112064377	-	MTC	LTR	MaLR	-84	337	1	4
947	4227	104	0	0	chr3	47551132	47551716	-112048067	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	7
947	2349	188	73	82	chr3	47552672	47553368	-112046415	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	8
947	396	297	124	72	chr3	47554309	47554640	-112045143	-	MLT1B	LTR	MaLR	-42	348	1	8
947	235	275	43	11	chr3	47564405	47564497	-112035286	-	MLT1E2	LTR	MaLR	0	505	411	9
947	292	365	50	46	chr3	47564690	47564908	-112034875	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-390	237	19	9
948	399	281	51	15	chr3	47591278	47591423	-112008360	-	MT2B2	LTR	ERVL	-70	531	380	1
948	2547	34	6	6	chr3	47593810	47594135	-112005648	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	33	1
948	3438	111	16	28	chr3	47594146	47594877	-112004906	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7581	6908	1
948	1285	120	5	0	chr3	47594879	47595063	-112004720	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4395	3285	3101	1
948	3803	44	2	0	chr3	47595058	47595515	-112004268	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2438	5242	4785	1
948	13147	113	19	28	chr3	47595512	47597504	-112002279	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5183	2497	524	1
948	702	141	51	45	chr3	47597503	47597659	-112002124	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-1290	180	24	1
948	2386	44	28	6	chr3	47597661	47597979	-112001804	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	33	1
948	3422	20	5	0	chr3	47601652	47602046	-111997737	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
948	9479	18	2	0	chr3	47602046	47603142	-111996641	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
948	3453	15	5	0	chr3	47603142	47603536	-111996247	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
948	1475	178	59	53	chr3	47615503	47615860	-111983923	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	1
948	1527	130	208	79	chr3	47616658	47616976	-111982807	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	1
948	1120	71	6	13	chr3	47616976	47617132	-111982651	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	1	155	-6387	1
948	736	174	44	17	chr3	47617132	47617360	-111982423	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	106	503	-6039	1
948	7723	61	32	1	chr3	47617360	47618344	-111981439	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5007	6021	-521	1
948	3014	74	56	0	chr3	47618347	47618740	-111981043	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6128	6542	0	1
948	2306	117	3	65	chr3	47618740	47619123	-111980660	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	1
948	941	324	50	9	chr3	47620331	47620652	-111979131	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	36	1
948	1808	231	107	31	chr3	47624048	47624571	-111975212	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-13	564	2	1
948	737	299	54	9	chr3	47626348	47626571	-111973212	+	MTEb	LTR	MaLR	147	379	0	1
948	264	333	113	40	chr3	47627230	47627380	-111972403	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-72	466	306	1
948	442	381	31	44	chr3	47627391	47627616	-111972167	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-309	229	8	1
948	1245	189	24	16	chr3	47629472	47629720	-111970063	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	250	-79	1
948	1055	151	5	5	chr3	47629719	47629905	-111969878	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1777	186	1	1
948	1766	156	44	12	chr3	47629905	47630224	-111969559	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
948	847	284	65	14	chr3	47630225	47630593	-111969190	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	5066	5452	-70	1
948	1908	192	34	34	chr3	47631916	47632298	-111967485	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	40	1
948	3418	157	128	40	chr3	47640580	47641409	-111958374	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	1
948	543	337	63	82	chr3	47642873	47643300	-111956483	+	MER67D	LTR	ERV1	12	430	-84	1
948	324	325	67	0	chr3	47643973	47644093	-111955690	-	RMER10B	LTR	ERVL	-2	396	269	1
948	1090	182	28	0	chr3	47645250	47645431	-111954352	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	186	-374	1
948	400	212	80	10	chr3	47646323	47646423	-111953360	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	171	277	-283	1
948	268	253	35	46	chr3	47647476	47647563	-111952220	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-14	394	309	1
948	934	248	47	39	chr3	47648765	47649021	-111950762	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	311	2
948	236	348	85	43	chr3	47649261	47649402	-111950381	-	MER90a	LTR	ERV1	-396	218	72	2
948	693	292	62	127	chr3	47651459	47651891	-111947892	+	RLTR23	LTR	ERV1	27	430	0	2
948	1549	171	41	66	chr3	47652280	47652599	-111947184	+	ORR1A3	LTR	MaLR	8	318	-8	2
948	2037	230	73	8	chr3	47666444	47666926	-111932857	-	RMER5	LTR	ERV1	-21	513	1	2
948	304	269	94	70	chr3	47686230	47686358	-111913425	+	RMER15	LTR	ERVL	9	139	-436	2
948	485	314	55	98	chr3	47686362	47686669	-111913114	+	RMER15	LTR	ERVL	265	558	-17	2
948	313	301	155	70	chr3	47695416	47695901	-111903882	-	LTR73	LTR	ERV1	-17	555	30	2
948	1028	273	23	63	chr3	47696083	47696478	-111903305	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	381	-1	2
948	1515	211	207	5	chr3	47696753	47697192	-111902591	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	2
948	1211	229	225	6	chr3	47702216	47702545	-111897238	+	MTC	LTR	MaLR	3	403	-18	2
949	2608	49	6	44	chr3	47715085	47715425	-111884358	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	2
949	772	299	97	33	chr3	47738905	47739377	-111860406	+	RMER12	LTR	ERVK	32	540	-1308	3
949	1103	82	51	29	chr3	47739366	47739541	-111860242	-	MTB	LTR	MaLR	-221	179	1	3
949	5314	155	66	16	chr3	47739565	47740559	-111859224	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-214	1044	1	3
949	2126	135	3	6	chr3	47740559	47740887	-111858896	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
949	695	307	31	16	chr3	47740990	47741248	-111858535	+	MTE-int	LTR	MaLR	165	426	-1154	3
949	1953	128	20	3	chr3	47747200	47747506	-111852277	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	3
949	2985	69	3	3	chr3	47747983	47748374	-111851409	+	MTB	LTR	MaLR	1	391	-9	3
949	239	308	22	11	chr3	47751632	47751724	-111848059	+	MLT1A	LTR	MaLR	278	370	-4	3
949	324	320	75	37	chr3	47752415	47752629	-111847154	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	284	3
949	863	323	38	19	chr3	47752986	47753342	-111846441	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	365	-5	3
949	396	338	83	31	chr3	47756133	47756423	-111843360	+	LTR40b	LTR	ERVL	156	460	-2	3
949	566	325	26	5	chr3	47758967	47759162	-111840621	-	MTEb	LTR	MaLR	-180	199	1	3
949	835	294	36	118	chr3	47762808	47763274	-111836509	+	RLTR23	LTR	ERV1	3	430	0	3
949	2496	114	42	2	chr3	47782413	47782818	-111816965	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	3
949	341	311	118	7	chr3	47787238	47787390	-111812393	-	MLT-int	LTR	MaLR	-20	1715	1547	3
949	280	363	88	104	chr3	47788093	47788474	-111811309	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1023	712	328	3
949	280	363	88	104	chr3	47788855	47789123	-111810660	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1408	327	63	3
949	2465	139	35	19	chr3	47791824	47792249	-111807534	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	10	3
949	823	341	60	20	chr3	47799695	47799875	-111799908	+	MTEa	LTR	MaLR	16	207	-172	3
949	1836	133	61	13	chr3	47799875	47800187	-111799596	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
949	823	341	60	20	chr3	47800187	47800356	-111799427	+	MTEa	LTR	MaLR	208	379	0	3
949	2499	38	95	0	chr3	47806033	47806349	-111793434	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
949	230	264	111	94	chr3	47816754	47816871	-111782912	+	MLT1A0	LTR	MaLR	3	121	-253	4
949	285	299	82	27	chr3	47816888	47816998	-111782785	+	MLT1A0	LTR	MaLR	182	297	-68	4
949	1091	271	117	47	chr3	47820332	47820890	-111778893	-	MER67C	LTR	ERV1	-6	705	109	4
949	644	252	47	39	chr3	47824026	47824388	-111775395	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	4
949	1817	78	27	0	chr3	47827799	47828055	-111771728	+	MTB	LTR	MaLR	1	263	-137	4
949	1066	73	20	7	chr3	47829104	47829255	-111770528	+	MTB	LTR	MaLR	248	400	0	4
949	1488	221	78	9	chr3	47836933	47837267	-111762516	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	3	4
949	782	323	78	28	chr3	47838073	47838393	-111761390	+	MTD	LTR	MaLR	60	398	-23	4
949	3706	48	35	0	chr3	47840281	47840739	-111759044	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	2	475	0	4
118	1388	28	73	0	chr3	47841121	47841300	-111758483	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	205	396	0	4
950	1460	216	96	6	chr3	47855876	47856230	-111743553	+	MTD	LTR	MaLR	1	386	-33	4
950	1282	158	191	68	chr3	47861806	47862099	-111737684	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
950	3165	196	181	54	chr3	47868132	47869032	-111730751	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-7	1021	8	4
950	800	316	87	49	chr3	47881584	47881930	-111717853	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	7	4
950	623	281	32	73	chr3	47886584	47886830	-111712953	+	MLT1B	LTR	MaLR	10	245	-145	5
950	308	285	34	74	chr3	47886871	47887019	-111712764	+	MTE2a	LTR	MaLR	238	379	0	5
950	2237	261	71	36	chr3	47892925	47893671	-111706112	-	RLTR40	LTR	ERVK	-45	772	1	5
950	773	297	81	32	chr3	47894969	47895279	-111704504	+	MTD	LTR	MaLR	1	325	-94	5
950	1512	239	85	29	chr3	47921619	47922242	-111677541	-	RMER17B	LTR	ERVK	-63	845	1	5
950	405	155	0	14	chr3	47924859	47924931	-111674852	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	308	5
950	574	273	8	8	chr3	47924935	47925068	-111674715	+	RMER6D	LTR	ERVK	575	707	-13	5
950	332	181	19	0	chr3	47925188	47925263	-111674520	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-58	320	230	5
950	267	154	75	19	chr3	47926455	47926508	-111673275	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-42	486	431	5
950	376	314	56	15	chr3	47926611	47926808	-111672975	+	MTEb	LTR	MaLR	167	371	-8	5
950	3093	58	182	2	chr3	47927145	47927579	-111672204	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	5
950	2155	144	76	44	chr3	47928132	47928539	-111671244	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	0	420	1	5
950	484	306	49	148	chr3	47929313	47929854	-111669929	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-20	548	42	5
950	621	329	33	19	chr3	47934903	47935114	-111664669	-	MTE2b	LTR	MaLR	-164	215	2	5
950	292	333	11	0	chr3	47939503	47939596	-111660187	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	286	5
950	225	293	206	7	chr3	47939978	47940119	-111659664	-	MTEa	LTR	MaLR	-132	247	79	5
950	3193	135	129	12	chr3	47947922	47948257	-111651526	-	RMER17A	LTR	ERVK	-16	735	370	5
950	3193	135	129	12	chr3	47948433	47948755	-111651028	-	RMER17A	LTR	ERVK	-382	369	1	5
950	641	300	53	116	chr3	47954023	47954472	-111645311	+	RLTR23	LTR	ERV1	10	430	0	6
950	1046	239	23	60	chr3	47955838	47956173	-111643610	+	RLTR15	LTR	ERVK	8	330	-29	6
950	1046	239	23	60	chr3	47956359	47956370	-111643413	+	RLTR15	LTR	ERVK	331	341	-18	6
951	2804	213	100	83	chr3	47977692	47978579	-111621204	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	6
951	2010	168	3	6	chr3	47980103	47980426	-111619357	-	RMER13B	LTR	ERVK	-586	322	1	6
951	1610	237	106	27	chr3	47980896	47981347	-111618436	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	13	6
951	1528	196	6	31	chr3	47981345	47981667	-111618116	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-97	430	117	6
951	547	190	16	65	chr3	47981689	47981813	-111617970	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-409	118	1	6
951	2909	207	52	19	chr3	47984724	47985066	-111614717	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	369	-351	6
951	2909	207	52	19	chr3	47985249	47985598	-111614185	+	RMER6D	LTR	ERVK	370	714	-6	6
951	286	331	128	33	chr3	47986392	47986698	-111613085	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-1033	338	4	6
951	980	215	154	126	chr3	47991898	47992280	-111607503	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	307	6
951	980	215	154	126	chr3	47992428	47992714	-111607069	-	RMER6C	LTR	ERVK	-384	306	1	6
951	1623	170	88	6	chr3	47999110	47999430	-111600353	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-14	380	35	6
951	596	328	77	81	chr3	47999615	47999966	-111599817	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	1	6
951	227	364	91	48	chr3	48000585	48000793	-111598990	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-32	547	331	1
951	1818	227	145	75	chr3	48054412	48055189	-111544594	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	720	45	5
951	1818	219	149	70	chr3	48055687	48055731	-111544052	-	RMER6C	LTR	ERVK	-646	44	1	5
951	2016	196	51	32	chr3	48056528	48056825	-111542958	+	MTC	LTR	MaLR	1	309	-112	5
951	2016	196	51	32	chr3	48056875	48056987	-111542796	+	MTC	LTR	MaLR	310	418	-3	5
951	1581	161	80	6	chr3	48058021	48058346	-111541437	+	RMER16	LTR	ERVK	57	405	-128	5
951	273	44	133	0	chr3	48058375	48058420	-111541363	+	RMER16	LTR	ERVK	467	517	-16	5
951	258	323	59	37	chr3	48073045	48073072	-111526711	-	ORR1E	LTR	MaLR	-216	143	113	7
951	258	323	59	37	chr3	48073928	48074035	-111525748	-	ORR1E	LTR	MaLR	-247	112	6	7
951	356	409	74	50	chr3	48074172	48074457	-111525326	+	MER21B	LTR	ERV1	313	604	-259	7
951	1426	233	31	14	chr3	48074457	48074809	-111524974	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	358	-1	7
951	356	409	74	50	chr3	48074809	48074927	-111524856	+	MER21B	LTR	ERV1	605	726	-137	7
951	305	298	73	16	chr3	48076293	48076416	-111523367	+	MLT2C1	LTR	ERVL	99	228	-169	8
951	2507	178	78	36	chr3	48077138	48077662	-111522121	+	MT2B	LTR	ERVL	1	546	-55	8
951	233	103	51	0	chr3	48078114	48078153	-111521630	+	MT2B	LTR	ERVL	532	572	-29	8
951	238	265	70	77	chr3	48078209	48078285	-111521498	+	MLT2C1	LTR	ERVL	417	496	-64	8
951	515	31	0	0	chr3	48078446	48078511	-111521272	+	MT2B	LTR	ERVL	535	599	-2	8
951	408	259	36	54	chr3	48078850	48079017	-111520766	+	RNLTR23	LTR	ERVK	479	642	0	8
951	454	355	75	43	chr3	48084189	48084488	-111515295	+	MTEb	LTR	MaLR	1	329	-50	9
951	454	342	34	51	chr3	48084750	48084795	-111514988	+	MTEb	LTR	MaLR	330	375	-4	9
952	349	307	104	47	chr3	48103638	48103850	-111495933	+	MLT1A	LTR	MaLR	24	247	-127	1
952	869	315	44	28	chr3	48113721	48114083	-111485700	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	370	-4	1
952	441	350	99	47	chr3	48117185	48117550	-111482233	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-742	629	246	1
952	2003	117	27	59	chr3	48118160	48118497	-111481286	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	1
952	2241	209	45	10	chr3	48130150	48130638	-111469145	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	505	-19	1
952	651	255	101	34	chr3	48139829	48140036	-111459747	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	500	1
952	1917	270	79	31	chr3	48140051	48140669	-111459114	-	RMER6C	LTR	ERVK	-42	648	1	1
952	628	154	48	16	chr3	48140669	48140794	-111458989	-	RMER6-int	LTR	ERVK	0	3177	3049	1
952	783	254	0	23	chr3	48140926	48141099	-111458684	-	RLTR21	LTR	ERVK	-52	1520	1352	1
952	6364	168	46	61	chr3	48142819	48142870	-111456913	-	RLTR21	LTR	ERVK	-220	1352	1291	1
952	6364	168	46	61	chr3	48142942	48143350	-111456433	-	RLTR21	LTR	ERVK	-282	1290	916	1
952	6364	168	46	61	chr3	48143596	48144501	-111455282	-	RLTR21	LTR	ERVK	-657	915	6	1
952	399	169	0	0	chr3	48144506	48144577	-111455206	-	RMER6-int	LTR	ERVK	-118	3059	2989	1
952	226	305	149	20	chr3	48145089	48145290	-111454493	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1028	802	1
952	330	313	57	88	chr3	48146968	48147186	-111452597	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-822	206	1	1
952	868	236	0	22	chr3	48158721	48158903	-111440880	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-216	178	1	2
952	3615	239	60	13	chr3	48158903	48160193	-111439590	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	1	2
952	1561	222	66	6	chr3	48160197	48160559	-111439224	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	3	2
952	1275	199	124	67	chr3	48163426	48163782	-111436001	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	376	-314	2
952	427	229	8	85	chr3	48180551	48180680	-111419103	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	979	1097	-5040	2
952	599	146	30	40	chr3	48182816	48182958	-111416825	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2220	2325	-3812	2
952	1456	222	52	23	chr3	48182958	48183388	-111416395	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2817	3190	-2947	2
952	1834	150	10	19	chr3	48188178	48188490	-111411293	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	2
952	835	174	0	0	chr3	48188952	48189090	-111410693	+	RMER6D	LTR	ERVK	3	140	-580	2
952	412	233	11	32	chr3	48189114	48189207	-111410576	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	371	224	0	0	chr3	48189218	48189285	-111410498	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	393	244	11	32	chr3	48189270	48189363	-111410420	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	400	233	11	32	chr3	48189387	48189480	-111410303	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	348	239	0	0	chr3	48189491	48189558	-111410225	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	275	231	0	0	chr3	48189530	48189582	-111410201	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	125	-595	2
952	408	233	11	32	chr3	48189582	48189675	-111410108	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	388	244	11	32	chr3	48189660	48189753	-111410030	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	412	229	12	36	chr3	48189777	48189894	-111409889	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	408	233	11	32	chr3	48189894	48189987	-111409796	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	396	209	0	0	chr3	48189998	48190065	-111409718	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	371	224	0	0	chr3	48190076	48190143	-111409640	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	277	231	0	0	chr3	48190115	48190167	-111409616	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	125	-595	2
952	408	233	11	32	chr3	48190167	48190260	-111409523	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	371	224	0	0	chr3	48190271	48190338	-111409445	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	330	254	0	0	chr3	48190310	48190377	-111409406	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	245	250	0	0	chr3	48190349	48190401	-111409382	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	125	-595	2
952	408	233	11	32	chr3	48190401	48190494	-111409289	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	294	211	0	0	chr3	48190505	48190557	-111409226	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	125	-595	2
952	408	233	11	32	chr3	48190557	48190650	-111409133	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	371	224	0	0	chr3	48190661	48190728	-111409055	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	330	254	0	0	chr3	48190700	48190767	-111409016	+	RMER6D	LTR	ERVK	74	140	-580	2
952	408	233	11	32	chr3	48190791	48190884	-111408899	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	388	244	11	32	chr3	48190908	48191001	-111408782	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	140	-580	2
952	1166	229	29	11	chr3	48190986	48191264	-111408519	+	RMER6D	LTR	ERVK	50	332	-388	2
952	3056	167	68	23	chr3	48191614	48192214	-111407569	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	16	2
952	254	340	44	111	chr3	48196928	48197153	-111402630	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-244	220	11	2
952	554	348	77	4	chr3	48198251	48198511	-111401272	+	MLT2B4	LTR	ERVL	51	329	-227	2
952	435	294	49	43	chr3	48201277	48201462	-111398321	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2596	2781	-2933	2
952	1871	137	11	83	chr3	48208868	48209065	-111390718	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	180	-146	2
952	1543	178	56	93	chr3	48209065	48209473	-111390310	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	2
952	1871	137	11	83	chr3	48209473	48209626	-111390157	+	ORR1A3	LTR	MaLR	181	326	0	2
952	1469	272	13	11	chr3	48211863	48212235	-111387548	-	RLTR14	LTR	ERV1	-5	377	5	2
952	261	368	94	20	chr3	48213921	48214165	-111385618	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-63	493	232	2
952	1412	336	75	76	chr3	48214820	48215081	-111384702	-	MTE-int	LTR	MaLR	-580	1000	745	2
952	1691	205	15	33	chr3	48215081	48215470	-111384313	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	2
952	1412	336	75	76	chr3	48215470	48216209	-111383574	-	MTE-int	LTR	MaLR	-836	744	1	2
952	256	350	129	44	chr3	48216281	48216529	-111383254	-	ORR1E	LTR	MaLR	-52	307	39	2
952	898	259	28	0	chr3	48222387	48222603	-111377180	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-152	222	1	3
952	249	356	10	10	chr3	48223689	48223791	-111375992	+	MLT1A1	LTR	MaLR	29	130	-278	3
952	433	278	113	80	chr3	48225370	48225660	-111374123	-	MT2A	LTR	ERVL	-124	477	92	3
952	445	167	13	0	chr3	48226508	48226586	-111373197	-	MT2A	LTR	ERVL	-452	81	3	3
952	385	362	47	26	chr3	48229542	48229735	-111370048	-	MLT1E	LTR	MaLR	-11	642	446	3
953	396	362	68	23	chr3	48245778	48245931	-111353852	+	MLT1D	LTR	MaLR	227	386	-119	3
953	2456	101	54	10	chr3	48245931	48246321	-111353462	+	RLTR9E	LTR	ERVK	3	409	0	3
953	396	362	68	23	chr3	48246321	48246430	-111353353	+	MLT1D	LTR	MaLR	387	501	-4	3
953	1186	206	128	4	chr3	48246603	48246876	-111352907	+	ORR1C1	LTR	MaLR	72	378	0	3
953	3531	188	62	100	chr3	48257960	48258898	-111340885	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	3
953	1286	312	21	3	chr3	48269670	48270008	-111329775	+	MTE2b	LTR	MaLR	18	361	-18	3
953	1914	214	66	52	chr3	48276584	48277102	-111322681	+	RMER5	LTR	ERV1	1	525	-9	3
953	3062	69	179	2	chr3	48283606	48284041	-111315742	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	3
953	1945	220	51	39	chr3	48286855	48287342	-111312441	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-860	510	18	3
953	790	300	75	11	chr3	48287352	48287713	-111312070	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
953	1648	141	134	23	chr3	48290253	48290797	-111308986	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	605	0	3
953	3341	68	50	2	chr3	48293524	48293984	-111305799	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	3
953	278	258	29	49	chr3	48297595	48297697	-111302086	+	RMER15	LTR	ERVL	61	160	-415	4
953	332	339	87	0	chr3	48298077	48298260	-111301523	+	RMER15	LTR	ERVL	377	575	0	4
953	4558	81	16	3	chr3	48298718	48299676	-111300107	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	1792	0	4
953	2710	42	26	9	chr3	48299676	48300016	-111299767	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
953	280	272	85	12	chr3	48302550	48302632	-111297151	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-2	532	445	4
953	515	287	50	69	chr3	48314943	48315145	-111284638	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	206	4
953	654	341	19	5	chr3	48316237	48316452	-111283331	-	MTD	LTR	MaLR	-197	222	5	4
953	888	318	84	45	chr3	48317287	48317643	-111282140	+	MTD	LTR	MaLR	1	370	-49	4
953	887	276	65	52	chr3	48317672	48318108	-111281675	+	MTC-int	LTR	MaLR	10	451	-647	4
953	401	416	55	12	chr3	48321553	48321898	-111277885	+	MER21B	LTR	ERV1	19	378	-485	4
953	432	309	115	54	chr3	48321935	48322195	-111277588	+	MER21B	LTR	ERV1	460	735	-128	4
953	3363	88	15	2	chr3	48323988	48324455	-111275328	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	473	-2	4
953	1892	228	143	2	chr3	48324723	48325212	-111274571	+	RMER15	LTR	ERVL	2	559	-16	4
953	2447	179	85	15	chr3	48329263	48329790	-111269993	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	564	-4	4
953	890	277	20	12	chr3	48330501	48330753	-111269030	+	RMER15	LTR	ERVL	280	533	-42	4
953	1022	172	195	52	chr3	48334855	48335198	-111264585	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	392	-17	4
953	5738	109	24	30	chr3	48343940	48344847	-111254936	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	4
953	1758	278	56	81	chr3	48347491	48348169	-111251614	+	MER67B	LTR	ERV1	1	661	0	4
953	391	330	61	48	chr3	48363155	48363384	-111236399	-	MTEa	LTR	MaLR	-147	232	1	4
954	2191	175	58	17	chr3	48369665	48370077	-111229706	+	RLTR12A	LTR	ERVK	4	432	-136	4
954	3062	115	0	0	chr3	48370430	48370866	-111228917	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	5
954	305	250	24	0	chr3	48373333	48373417	-111226366	+	RLTR12A	LTR	ERVK	419	504	-64	4
954	1915	195	149	22	chr3	48386509	48386998	-111212785	+	RMER20B	LTR	ERVK	77	627	0	5
954	471	204	10	0	chr3	48388903	48389001	-111210782	+	RLTR25B	LTR	ERVK	2	100	-928	5
954	531	188	6	200	chr3	48390093	48390273	-111209510	+	RLTR25B	LTR	ERVK	636	780	-248	5
954	423	210	56	16	chr3	48390240	48390366	-111209417	+	RLTR25B	LTR	ERVK	898	1028	0	5
954	344	200	31	0	chr3	48392556	48392621	-111207162	+	ORR1C2	LTR	MaLR	307	373	-11	5
954	278	329	12	0	chr3	48395975	48396057	-111203726	+	MTEa	LTR	MaLR	88	170	-209	5
954	430	304	47	13	chr3	48396074	48396224	-111203559	+	MTEa	LTR	MaLR	222	376	-3	5
954	335	259	58	67	chr3	48396231	48396351	-111203432	+	MTEa-int	LTR	MaLR	8	126	-1454	5
954	1263	348	79	49	chr3	48396356	48397112	-111202671	+	MTEa-int	LTR	MaLR	232	1010	-570	5
954	348	333	23	16	chr3	48397284	48397412	-111202371	-	MTE2b	LTR	MaLR	-250	129	1	5
954	341	261	99	56	chr3	48407763	48407925	-111191858	-	RMER15	LTR	ERVL	-111	464	296	5
954	1261	236	65	88	chr3	48416074	48416283	-111183500	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	225	-153	5
954	1261	236	65	88	chr3	48416551	48416727	-111183056	+	ORR1C1	LTR	MaLR	226	377	-1	5
954	793	279	102	18	chr3	48416732	48417016	-111182767	-	MTE2a	LTR	MaLR	-66	313	6	5
954	285	286	13	0	chr3	48417072	48417149	-111182634	+	MTE2a	LTR	MaLR	288	365	-14	5
954	375	310	116	56	chr3	48424551	48424749	-111175034	+	MLT2B4	LTR	ERVL	16	225	-331	5
954	609	301	0	6	chr3	48427902	48428059	-111171724	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-216	158	3	5
954	745	305	89	43	chr3	48428873	48429222	-111170561	+	MTD	LTR	MaLR	55	419	0	5
954	773	355	18	54	chr3	48429278	48429611	-111170172	-	MTE2b	LTR	MaLR	-58	321	1	5
954	747	268	209	9	chr3	48431867	48432183	-111167600	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	5
954	261	277	109	3	chr3	48445897	48446025	-111153758	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-225	149	3	6
954	286	204	0	0	chr3	48448349	48448398	-111151385	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1320	50	2	6
954	459	206	247	66	chr3	48448400	48448566	-111151217	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	223	6
954	251	338	0	0	chr3	48451324	48451398	-111148385	-	MTD	LTR	MaLR	-288	91	18	6
954	306	367	42	97	chr3	48462064	48462375	-111137408	+	MLT1H	LTR	MaLR	11	304	-245	6
954	825	302	68	43	chr3	48463870	48464265	-111135518	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	6
954	1826	142	46	10	chr3	48470293	48470600	-111129183	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	4	6
954	305	320	43	43	chr3	48473531	48473694	-111126089	-	MT2A	LTR	ERVL	-81	452	290	6
954	1128	214	113	62	chr3	48481467	48481821	-111117962	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	6
954	457	318	70	74	chr3	48482390	48482689	-111117094	+	RLTR17	LTR	ERVK	127	424	-268	6
954	817	211	47	23	chr3	48490159	48490417	-111109366	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	304	-63	6
954	595	331	59	53	chr3	48491665	48492120	-111107663	+	MER34	LTR	ERV1	38	494	-48	6
954	428	342	83	72	chr3	48495581	48495871	-111103912	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	73	6
955	4225	194	51	28	chr3	48501539	48502421	-111097362	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	4
955	1112	254	80	14	chr3	48503023	48503374	-111096409	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
955	343	332	43	100	chr3	48504449	48504680	-111095103	-	MTEa	LTR	MaLR	-161	218	1	1
955	298	268	61	20	chr3	48505404	48505503	-111094280	-	MTE2b	LTR	MaLR	-276	103	1	1
955	2251	215	59	62	chr3	48508993	48509607	-111090176	-	RLTR18	LTR	ERVK	-2	614	3	1
955	551	207	72	46	chr3	48510064	48510170	-111089613	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	115	-259	1
955	2334	117	20	3	chr3	48510170	48510521	-111089262	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	1
955	551	218	72	47	chr3	48510521	48510573	-111089210	+	ORR1D1	LTR	MaLR	116	163	-215	1
955	424	288	115	32	chr3	48510671	48510750	-111089033	+	ORR1D1	LTR	MaLR	164	186	-192	1
955	241	288	116	31	chr3	48510974	48511025	-111088758	+	ORR1D1	LTR	MaLR	331	384	0	1
955	323	297	77	77	chr3	48511877	48512045	-111087738	-	MLT1A	LTR	MaLR	-206	168	1	2
955	283	210	0	16	chr3	48515325	48515388	-111084395	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-42	582	521	2
955	252	233	0	48	chr3	48516456	48516519	-111083264	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-594	60	1	2
955	258	231	6	0	chr3	48522843	48522925	-111076858	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-72	336	254	3
955	1857	158	13	0	chr3	48524415	48524718	-111075065	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	307	-601	4
955	641	308	142	18	chr3	48528542	48528823	-111070960	+	MTEa	LTR	MaLR	64	379	0	4
955	2773	44	2	119	chr3	48537659	48538096	-111061687	-	RLTR10	LTR	ERVK	-4	386	1	5
955	8658	26	0	1	chr3	48538098	48539094	-111060689	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	990	5
955	301	256	62	39	chr3	48539176	48539306	-111060477	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-5987	1594	1462	5
955	8000	44	1	2	chr3	48539370	48540329	-111059454	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-989	998	41	5
955	2786	42	2	119	chr3	48540345	48540782	-111059001	-	RLTR10	LTR	ERVK	-4	386	1	5
955	1956	164	37	74	chr3	48540967	48541374	-111058409	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	5
955	668	271	39	50	chr3	48541598	48541883	-111057900	+	MTEb	LTR	MaLR	66	375	-4	6
955	834	222	15	36	chr3	48543327	48543456	-111056327	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	132	-252	6
955	3388	35	2	0	chr3	48543456	48543851	-111055932	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
955	834	243	35	72	chr3	48543851	48543957	-111055826	+	ORR1C2	LTR	MaLR	113	223	-144	6
955	683	221	69	37	chr3	48544045	48544193	-111055590	+	ORR1C2	LTR	MaLR	174	324	-60	6
955	683	221	69	37	chr3	48544802	48544841	-111054942	+	ORR1C2	LTR	MaLR	325	365	-19	6
955	930	316	123	43	chr3	48561545	48562097	-111037686	-	MER77	LTR	ERVL	-9	598	3	7
955	328	298	11	0	chr3	48566088	48566182	-111033601	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	356	450	-959	8
955	374	281	40	32	chr3	48570159	48570282	-111029501	-	MLT1D	LTR	MaLR	-381	124	1	9
955	1372	244	50	3	chr3	48572615	48572819	-111026964	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	166	9
955	1372	244	50	3	chr3	48572995	48573147	-111026636	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-209	165	1	9
955	3193	53	0	8	chr3	48580924	48581320	-111018463	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	4	1
955	242	414	14	38	chr3	48589136	48589347	-111010436	+	LTR85c	LTR	Gypsy?	408	613	-210	1
955	304	291	67	79	chr3	48594616	48594870	-111004913	-	RLTR15	LTR	ERVK	-37	322	72	1
955	301	265	23	31	chr3	48594914	48595042	-111004741	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-404	124	1	1
955	755	241	34	11	chr3	48596926	48597102	-111002681	-	RLTR17	LTR	ERVK	-73	619	440	1
955	4897	176	42	45	chr3	48597104	48598245	-111001538	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1705	2842	0	1
955	1054	186	5	44	chr3	48598245	48598448	-111001335	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	195	-497	1
955	1835	253	73	14	chr3	48601202	48601684	-110998099	+	RLTR17	LTR	ERVK	183	692	0	1
955	3298	33	5	8	chr3	48606871	48607268	-110992515	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
955	554	255	99	23	chr3	48613411	48613632	-110986151	-	MLT1C	LTR	MaLR	-47	420	183	1
955	2336	235	59	43	chr3	48613854	48614464	-110985319	+	RLTR26	LTR	ERVK	23	642	0	1
955	647	325	117	37	chr3	48615509	48615972	-110983811	+	RMER5	LTR	ERV1	15	514	-20	1
955	1396	265	113	69	chr3	48621326	48621890	-110977893	-	RLTR18	LTR	ERVK	-3	613	25	1
955	234	329	28	129	chr3	48622233	48622488	-110977295	-	RLTR21	LTR	ERVK	-312	1260	1032	1
955	265	294	167	96	chr3	48625655	48625800	-110973983	-	MER57F	LTR	ERV1	0	436	305	1
955	265	294	167	96	chr3	48626044	48626282	-110973501	-	MER57F	LTR	ERV1	-132	304	26	1
956	1315	224	39	120	chr3	48628371	48628828	-110970955	-	RLTR23	LTR	ERV1	-8	422	3	1
956	3307	28	23	0	chr3	48633556	48633943	-110965840	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
956	2102	171	32	5	chr3	48635798	48636174	-110963609	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	1
956	570	325	56	53	chr3	48639110	48639432	-110960351	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	57	2
956	2306	166	64	108	chr3	48643774	48643865	-110955918	+	RLTR12A	LTR	ERVK	42	131	-437	2
956	2306	166	64	108	chr3	48644011	48644466	-110955317	+	RLTR12A	LTR	ERVK	132	564	-4	2
956	828	296	36	69	chr3	48647263	48647597	-110952186	+	MTE2a	LTR	MaLR	57	379	0	2
956	438	143	24	12	chr3	48647727	48647812	-110951971	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	86	-288	2
956	565	171	9	19	chr3	48647978	48648085	-110951698	+	MT2A	LTR	ERVL	107	212	-321	2
956	695	207	127	6	chr3	48648087	48648289	-110951494	+	ORR1C2	LTR	MaLR	96	380	-4	2
956	312	301	88	9	chr3	48660368	48660482	-110939301	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	283	2
956	1423	65	0	0	chr3	48661074	48661260	-110938523	+	MTB	LTR	MaLR	1	186	-214	2
956	1429	99	40	0	chr3	48664152	48664353	-110935430	+	MTB	LTR	MaLR	192	400	0	2
956	657	284	57	147	chr3	48665515	48665849	-110933934	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-9	365	62	2
956	2703	21	0	66	chr3	48668918	48669268	-110930515	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	2
956	2663	37	0	47	chr3	48699771	48700114	-110899669	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	2
956	3480	84	19	20	chr3	48700137	48700912	-110898871	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	10	662	-5819	2
956	2724	58	0	3	chr3	48700912	48701255	-110898528	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	2
956	6044	59	36	17	chr3	48701248	48702062	-110897721	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5651	6479	-2	2
956	2219	46	19	55	chr3	48702064	48702389	-110897394	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	313	-14	2
956	1995	114	40	0	chr3	48707702	48707999	-110891784	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	18	2
956	1711	203	42	46	chr3	48711421	48711854	-110887929	-	RMER6C	LTR	ERVK	-26	664	234	2
956	1103	132	20	236	chr3	48713905	48714252	-110885531	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	272	-158	2
956	426	173	93	50	chr3	48720890	48721072	-110878711	+	RMER17C	LTR	ERVK	88	277	-133	3
956	1403	143	14	0	chr3	48726761	48726984	-110872799	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-33	1815	1590	3
956	4386	134	46	17	chr3	48727242	48728025	-110871758	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1040	808	3	3
956	289	365	89	13	chr3	48728862	48729020	-110870763	+	MTD	LTR	MaLR	2	171	-248	3
956	2203	99	6	64	chr3	48729911	48730257	-110869526	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	3
956	2475	185	56	4	chr3	48732970	48733454	-110866329	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	509	-51	3
956	343	286	50	33	chr3	48744449	48744630	-110855153	+	RLTR10D	LTR	ERVK	176	359	0	3
956	486	237	22	7	chr3	48744675	48744811	-110854972	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	22	159	-6383	3
956	8492	275	19	30	chr3	48744813	48748131	-110851652	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	3148	6542	0	3
956	547	282	62	53	chr3	48748131	48748487	-110851296	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	3
956	1831	228	32	5	chr3	48753094	48753504	-110846279	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
956	457	323	25	84	chr3	48756547	48756750	-110843033	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	191	-188	3
957	2871	29	2	142	chr3	48761047	48761496	-110838287	-	RLTR10	LTR	ERVK	-4	386	1	3
957	14985	26	35	70	chr3	48761498	48763514	-110836269	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	41	3
957	2833	31	2	142	chr3	48763530	48763979	-110835804	-	RLTR10	LTR	ERVK	-4	386	1	3
957	383	345	50	33	chr3	48767980	48768160	-110831623	-	MT2A	LTR	ERVL	-69	464	282	3
957	347	253	38	103	chr3	48770571	48770713	-110829070	+	ORR1D2	LTR	MaLR	239	368	-11	3
957	1952	215	24	54	chr3	48771004	48771427	-110828356	-	RMER15	LTR	ERVL	-40	535	126	3
957	234	256	67	34	chr3	48775854	48775943	-110823840	-	MLT1A	LTR	MaLR	-272	102	11	3
957	1406	200	34	113	chr3	48776951	48777368	-110822415	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
957	951	256	169	97	chr3	48786569	48787040	-110812743	-	MT2A	LTR	ERVL	0	601	1	3
957	449	146	126	89	chr3	48787042	48787177	-110812606	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2	5759	5620	3
957	829	235	27	9	chr3	48787178	48787397	-110812386	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-73	5688	5466	3
957	2337	207	68	22	chr3	48795638	48796181	-110803602	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	3	570	-7	4
957	2285	109	5	89	chr3	48815952	48816344	-110783439	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	4
957	3352	40	2	0	chr3	48819083	48819478	-110780305	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
957	9126	40	0	1	chr3	48819478	48820577	-110779206	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
957	3367	40	2	0	chr3	48820577	48820972	-110778811	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
957	428	328	49	64	chr3	48838686	48838950	-110760833	-	ORR1E	LTR	MaLR	-50	309	50	4
957	1767	209	36	63	chr3	48841224	48841759	-110758024	+	RMER19B	LTR	ERVK	79	664	-238	4
957	642	337	58	18	chr3	48841761	48842036	-110757747	-	MTEa	LTR	MaLR	-93	286	1	4
957	300	400	24	8	chr3	48843442	48843568	-110756215	+	MLT1H1	LTR	MaLR	1	128	-427	4
957	428	373	61	48	chr3	48862967	48863297	-110736486	-	MTEa	LTR	MaLR	-45	334	1	4
957	625	249	69	61	chr3	48866154	48866422	-110733361	+	RLTR20D	LTR	ERVK	52	291	-277	4
957	358	232	55	218	chr3	48866400	48866461	-110733322	+	RLTR20D	LTR	ERVK	406	460	-108	4
957	358	232	55	218	chr3	48866585	48866688	-110733095	+	RLTR20D	LTR	ERVK	461	543	-25	4
957	251	250	66	0	chr3	48866869	48866945	-110732838	+	MLT1A0	LTR	MaLR	262	342	-23	5
957	633	297	64	41	chr3	48873340	48873635	-110726148	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	271	5
957	3777	220	77	22	chr3	48883744	48884716	-110715067	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-2	1026	1	5
957	241	286	35	79	chr3	48884716	48884809	-110714974	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-1015	88	1	5
957	1501	230	201	10	chr3	48887599	48888112	-110711671	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	5
958	2590	197	47	28	chr3	48892047	48892647	-110707136	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	5
958	2307	173	20	11	chr3	48895005	48895460	-110704323	+	RMER6B	LTR	ERVK	3	461	0	5
958	339	259	56	0	chr3	48896722	48896830	-110702953	+	MLT2C2	LTR	ERVL	1	114	-350	5
958	512	365	60	71	chr3	48905291	48905659	-110694124	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	364	-15	5
958	764	331	39	47	chr3	48908577	48908909	-110690874	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	329	-41	5
958	1093	272	91	40	chr3	48908909	48909307	-110690476	+	MTD	LTR	MaLR	2	419	0	5
958	1358	177	22	40	chr3	48912073	48912347	-110687436	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	634	5
958	2863	131	11	62	chr3	48912347	48912876	-110686907	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	477	5
958	373	314	45	75	chr3	48917172	48917372	-110682411	+	MTEb	LTR	MaLR	22	215	-164	5
958	573	208	0	0	chr3	48935844	48935945	-110663838	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7095	7195	-211	5
958	296	323	22	8	chr3	48936503	48936637	-110663146	+	RMER16-int	LTR	ERVK	169	304	-6940	5
958	1307	199	169	54	chr3	48936682	48937107	-110662676	+	RMER16-int	LTR	ERVK	346	819	-4587	5
958	549	180	63	0	chr3	48937112	48937223	-110662560	+	RMER16-int	LTR	ERVK	938	1055	-5082	5
958	10205	151	37	25	chr3	48937243	48939259	-110660524	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2935	4679	-2727	5
958	3059	70	0	0	chr3	48939257	48939656	-110660127	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5356	5754	-1652	5
958	5875	151	76	94	chr3	48939654	48941075	-110658708	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	4676	6071	-1173	5
958	940	264	29	12	chr3	48941077	48941449	-110658334	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	7506	7849	-368	5
958	4946	128	13	0	chr3	48941466	48942160	-110657623	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6494	7196	-210	5
958	3148	145	53	16	chr3	48950775	48951336	-110648447	+	MT2B	LTR	ERVL	18	599	-2	5
958	2275	207	47	16	chr3	48953012	48953498	-110646285	+	RLTR20D	LTR	ERVK	3	503	-65	6
958	230	286	95	0	chr3	48958495	48958558	-110641225	+	RMER10A	LTR	ERVL	320	388	-54	6
958	300	239	16	80	chr3	48958880	48959001	-110640782	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	451	584	0	6
958	1939	124	33	3	chr3	48964300	48964607	-110635176	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	316	-11	6
958	16678	116	47	28	chr3	48964618	48967354	-110632429	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	21	2982	-3499	6
958	3697	28	0	0	chr3	48967341	48967767	-110632016	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3145	3570	-2911	6
958	3649	75	33	0	chr3	48967771	48968252	-110631531	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4928	5424	-1057	6
958	4590	85	30	23	chr3	48968250	48968914	-110630869	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5813	6481	0	6
958	2105	105	3	9	chr3	48968914	48969232	-110630551	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	316	-11	6
958	1632	249	168	25	chr3	48972654	48973173	-110626610	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	10	6
958	484	288	144	0	chr3	48994989	48995149	-110604634	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	195	6
958	530	274	49	27	chr3	48995268	48995452	-110604331	-	MTE2b	LTR	MaLR	-191	188	1	6
958	1151	241	72	42	chr3	49003087	49003123	-110596660	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	39	-335	8
958	1151	241	72	42	chr3	49003420	49003742	-110596041	+	ORR1D1	LTR	MaLR	40	372	-2	8
958	1051	301	42	25	chr3	49003747	49004105	-110595678	+	ORR1D2	LTR	MaLR	7	370	0	1
958	1618	211	5	128	chr3	49013036	49013465	-110586318	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	19	2
958	280	106	64	0	chr3	49014881	49014928	-110584855	-	MLT1B	LTR	MaLR	-24	366	317	2
958	345	286	41	92	chr3	49014989	49015059	-110584724	-	MLT1B	LTR	MaLR	-180	210	153	2
958	1462	234	55	165	chr3	49015059	49015745	-110584038	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
958	345	286	41	92	chr3	49015745	49015870	-110583913	-	MLT1B	LTR	MaLR	-238	152	26	2
959	1297	269	47	11	chr3	49022619	49022980	-110576803	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
959	3248	21	39	0	chr3	49028528	49028909	-110570874	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
959	9026	27	11	7	chr3	49028911	49030003	-110569780	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-2	1096	1	4
959	3200	29	39	0	chr3	49030003	49030384	-110569399	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
959	801	228	75	33	chr3	49032246	49032459	-110567324	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	149	4
959	632	267	28	6	chr3	49032561	49032738	-110567045	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-193	181	1	4
959	781	313	77	46	chr3	49036985	49037310	-110562473	+	MTD	LTR	MaLR	49	383	-36	5
959	232	118	0	0	chr3	49037336	49037370	-110562413	-	RMER5	LTR	ERV1	-275	259	226	5
959	2008	95	52	30	chr3	49037375	49037736	-110562047	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	983	447	5
959	3211	88	24	9	chr3	49037917	49038377	-110561406	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	467	-341	6
959	477	202	99	31	chr3	49039836	49039998	-110559785	+	ORR1A4	LTR	MaLR	2	221	-163	6
959	925	191	85	0	chr3	49040640	49040829	-110558954	+	ORR1A4	LTR	MaLR	125	329	0	6
959	1811	203	34	78	chr3	49044424	49045011	-110554772	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	7
959	338	346	70	0	chr3	49048737	49048893	-110550890	-	MLT1A	LTR	MaLR	-183	191	25	7
959	334	310	173	23	chr3	49048964	49049261	-110550522	-	MLT1A-int	LTR	MaLR	-814	595	254	7
959	306	321	97	0	chr3	49051232	49051366	-110548417	-	MLT1A	LTR	MaLR	-12	615	469	7
959	287	363	50	19	chr3	49051897	49052057	-110547726	-	MLT1A	LTR	MaLR	-443	184	20	7
959	1962	199	44	15	chr3	49058058	49058465	-110541318	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	9
959	2449	113	8	8	chr3	49058674	49059041	-110540742	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-1	367	1	9
959	539	336	101	8	chr3	49078299	49078557	-110521226	+	MLT1L	LTR	MaLR	37	318	-292	1
959	267	346	134	43	chr3	49080325	49080512	-110519271	+	MLT1G1	LTR	MaLR	93	296	-283	1
959	512	324	143	45	chr3	49093238	49093461	-110506322	+	MTEa	LTR	MaLR	6	250	-129	1
959	2676	49	17	0	chr3	49095957	49096185	-110503598	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	2	229	-128	1
959	2676	49	17	0	chr3	49096838	49096956	-110502827	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	230	352	-5	1
959	7913	134	60	54	chr3	49096956	49097433	-110502350	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	17	618	-7062	1
959	7913	134	60	54	chr3	49097488	49098565	-110501218	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	619	1982	-5698	1
959	3449	74	9	0	chr3	49098545	49098989	-110500794	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	2242	2689	-4991	1
959	4812	63	74	1	chr3	49099118	49099766	-110500017	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6984	7678	-2	1
959	2735	56	32	0	chr3	49099768	49099796	-110499987	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	28	-329	1
959	2735	56	32	0	chr3	49099833	49100146	-110499637	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	29	352	-5	1
959	2385	89	14	44	chr3	49111126	49111491	-110488292	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	1
959	282	345	40	13	chr3	49119126	49119276	-110480507	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-47	514	361	1
959	648	153	16	14	chr3	49121090	49121234	-110478549	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-246	338	175	1
959	3302	41	5	0	chr3	49129862	49130256	-110469527	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
959	8054	49	48	4	chr3	49130256	49131307	-110468476	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
959	3339	38	5	0	chr3	49131307	49131701	-110468082	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
959	2602	186	14	8	chr3	49138091	49138580	-110461203	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-75	493	2	2
959	255	298	35	35	chr3	49138646	49138714	-110461069	-	RMER12	LTR	ERVK	-486	836	768	2
959	255	298	35	35	chr3	49138757	49138775	-110461008	-	RMER12	LTR	ERVK	-555	767	750	2
959	3171	149	46	16	chr3	49140155	49140721	-110459062	-	MT2B	LTR	ERVL	-1	600	18	2
960	2643	53	12	14	chr3	49152617	49152962	-110446821	+	ORR1A1	LTR	MaLR	3	346	0	2
960	424	317	42	69	chr3	49158043	49158260	-110441523	-	MTEb	LTR	MaLR	-147	232	22	2
960	561	254	53	42	chr3	49163530	49163719	-110436064	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	712	2
960	2524	212	2	9	chr3	49163719	49164251	-110435532	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	4862	5389	-419	2
960	1583	142	8	0	chr3	49164251	49164498	-110435285	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5529	5777	-31	2
960	4739	146	20	60	chr3	49164516	49165455	-110434328	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	2
960	1186	268	75	33	chr3	49168121	49168480	-110431303	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	46	2
960	609	320	36	30	chr3	49168493	49168857	-110430926	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	1	2
960	460	361	54	68	chr3	49177629	49177997	-110421786	-	MTE2b	LTR	MaLR	-15	364	2	2
960	2107	125	9	0	chr3	49180982	49181309	-110418474	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	0	1033	704	2
960	494	268	46	23	chr3	49181769	49181899	-110417884	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7202	-204	2
960	2686	170	99	30	chr3	49186755	49187331	-110412452	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	-367	616	1	2
960	2850	47	6	0	chr3	49198951	49199295	-110400488	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	2
960	472	191	36	28	chr3	49200731	49200854	-110398929	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	128	-778	2
960	4744	120	43	6	chr3	49200854	49201673	-110398110	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	874	1722	-6	2
960	3934	148	55	35	chr3	49201679	49202169	-110397614	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	477	-332	2
960	3934	148	55	35	chr3	49202280	49202582	-110397201	+	RMER17D2	LTR	ERVK	478	809	0	2
960	390	393	84	29	chr3	49204054	49204400	-110395383	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	365	-14	2
960	228	321	66	82	chr3	49204470	49204592	-110395191	+	MTE-int	LTR	MaLR	55	174	-1406	2
960	742	320	52	41	chr3	49208062	49208424	-110391359	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	2
960	1068	287	60	35	chr3	49208417	49208580	-110391203	+	MTD	LTR	MaLR	26	194	-225	2
960	1068	255	65	30	chr3	49208623	49208840	-110390943	+	MTD	LTR	MaLR	195	401	-18	2
960	2328	72	119	11	chr3	49214870	49215222	-110384561	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
960	2059	114	3	9	chr3	49234560	49234878	-110364905	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-11	316	1	3
960	4312	94	51	16	chr3	49234878	49235524	-110364259	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5813	3
960	11749	49	3	0	chr3	49235522	49236941	-110362842	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-1057	5424	4001	3
960	13912	119	37	27	chr3	49236939	49239377	-110360406	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3707	2774	1	3
960	1973	103	12	43	chr3	49239389	49239715	-110360068	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-11	316	1	3
960	3364	149	26	16	chr3	49246625	49247205	-110352578	+	MT2B	LTR	ERVL	16	601	0	3
960	2588	198	26	6	chr3	49255117	49255610	-110344173	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	503	-65	3
960	1257	203	197	16	chr3	49257502	49257955	-110341828	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-3	538	4	3
960	3586	49	20	0	chr3	49257966	49258414	-110341369	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	457	-18	3
960	814	179	8	91	chr3	49273413	49273656	-110326127	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-336	225	1	3
960	4090	153	47	8	chr3	49275115	49275825	-110323958	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	3
960	2526	46	30	0	chr3	49277768	49278096	-110321687	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-8	338	1	3
961	278	360	86	25	chr3	49289928	49290207	-110309576	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-41	356	61	3
961	568	325	114	80	chr3	49290221	49290336	-110309447	+	MTE2a	LTR	MaLR	14	130	-289	3
961	568	336	60	57	chr3	49290559	49290767	-110309016	+	MTE2a	LTR	MaLR	97	308	-71	3
961	395	359	95	50	chr3	49300958	49301336	-110298447	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-58	462	68	3
961	1743	214	67	3	chr3	49304205	49304576	-110295207	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	16	3
961	371	235	101	10	chr3	49315092	49315191	-110284592	-	ORR1E	LTR	MaLR	-250	109	2	3
961	1363	193	90	10	chr3	49315422	49315710	-110284073	-	MTC	LTR	MaLR	-101	320	10	4
961	457	296	102	7	chr3	49317114	49317369	-110282414	-	ORR1E	LTR	MaLR	-12	358	2	4
961	915	175	56	41	chr3	49326799	49326996	-110272787	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	179	4
961	746	243	11	16	chr3	49327219	49327407	-110272376	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-191	187	1	4
961	682	206	0	0	chr3	49328652	49328788	-110270995	+	MTC	LTR	MaLR	207	342	-79	4
961	337	253	0	0	chr3	49328976	49329051	-110270732	+	MTC	LTR	MaLR	337	411	-10	4
961	313	301	42	75	chr3	49331423	49331635	-110268148	+	LTR37A	LTR	ERV1	87	291	-135	4
961	277	357	42	21	chr3	49335883	49336026	-110263757	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	234	4
961	2296	64	109	0	chr3	49342235	49342547	-110257236	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
961	4161	69	21	16	chr3	49360507	49361068	-110238715	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	4
961	857	309	77	82	chr3	49364975	49365328	-110234455	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	353	-6	4
961	875	244	116	10	chr3	49366579	49366873	-110232910	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	50	4
961	1207	240	32	16	chr3	49367146	49367455	-110232328	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	1057	1370	0	4
961	273	241	0	0	chr3	49367457	49367515	-110232268	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	60	-324	4
961	430	369	0	44	chr3	49391420	49391624	-110208159	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	268	5
961	1160	219	82	52	chr3	49394157	49394523	-110205260	+	ORR1C2	LTR	MaLR	8	384	0	5
961	1865	140	9	31	chr3	49404674	49404992	-110194791	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	5
961	17804	87	30	19	chr3	49404992	49407481	-110192302	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	5065	5
961	3092	101	0	0	chr3	49407740	49408156	-110191627	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2543	5038	4623	5
961	766	110	39	8	chr3	49408941	49409069	-110190714	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2920	4661	4530	5
961	545	186	62	30	chr3	49409040	49409207	-110190576	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2376	2468	2356	5
961	3482	136	126	5	chr3	49409211	49409840	-110189943	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3135	4271	3567	5
961	1165	231	72	23	chr3	49409848	49410154	-110189629	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4632	2774	2454	5
961	546	195	88	0	chr3	49410167	49410280	-110189503	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5077	1060	938	5
961	1474	172	116	37	chr3	49410285	49410716	-110189067	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4750	656	317	5
961	1406	138	0	0	chr3	49410826	49411066	-110188717	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6629	952	713	5
961	1212	122	17	32	chr3	49411077	49411359	-110188424	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7212	369	41	5
961	1915	158	0	10	chr3	49411370	49411684	-110188099	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	5
962	3593	60	38	78	chr3	49419166	49419690	-110180093	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	1	5
962	835	234	53	12	chr3	49425015	49425301	-110174482	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-4	437	127	5
962	4249	167	48	30	chr3	49425419	49426556	-110173227	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-83	2759	1037	5
962	232	178	141	64	chr3	49426557	49426635	-110173148	-	RMER4B	LTR	ERVK	-51	534	451	5
962	421	210	69	21	chr3	49426636	49426786	-110172997	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1375	951	824	5
962	3642	70	70	4	chr3	49426994	49427481	-110172302	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	5
962	921	217	24	75	chr3	49428487	49428842	-110170941	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	70	5
962	288	321	9	18	chr3	49434758	49434869	-110164914	+	MLT2D	LTR	ERVL	84	193	-221	5
962	2413	96	8	73	chr3	49449564	49449948	-110149835	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	5
962	1856	191	135	23	chr3	49457301	49457773	-110142010	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	4	6
962	885	231	56	10	chr3	49458322	49458616	-110141167	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	372	-2	6
962	226	261	154	33	chr3	49459364	49459455	-110140328	+	LTR40b	LTR	ERVL	343	444	-18	6
962	285	294	35	12	chr3	49461456	49461542	-110138241	-	RMER5	LTR	ERV1	-19	515	428	6
962	289	337	51	72	chr3	49464404	49464599	-110135184	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	191	-168	6
962	330	328	160	8	chr3	49467481	49467779	-110132004	-	ORR1E	LTR	MaLR	-8	371	1	6
962	227	224	17	0	chr3	49469669	49469727	-110130056	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	362	6
962	1698	212	65	48	chr3	49470048	49470136	-110129647	-	MTC	LTR	MaLR	-15	392	306	6
962	1698	189	77	40	chr3	49470184	49470488	-110129295	-	MTC	LTR	MaLR	-101	320	4	6
962	427	350	35	40	chr3	49470488	49470697	-110129086	-	ORR1E	LTR	MaLR	-151	208	1	6
962	442	383	25	21	chr3	49476603	49477024	-110122759	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2853	3333	-2381	6
962	586	300	143	24	chr3	49478928	49479215	-110120568	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	57	6
962	269	324	63	98	chr3	49481276	49481481	-110118302	+	RMER15	LTR	ERVL	336	533	-42	6
962	266	299	0	30	chr3	49486236	49486336	-110113447	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4195	1327	1231	6
962	487	237	140	6	chr3	49491498	49491676	-110108107	+	RMER20B	LTR	ERVK	210	411	-216	6
962	1307	267	10	3	chr3	49498695	49498996	-110100787	+	MTD	LTR	MaLR	21	323	-96	6
962	663	285	47	44	chr3	49499202	49499499	-110100284	-	RLTR15	LTR	ERVK	-39	320	23	6
962	400	281	106	18	chr3	49500003	49500173	-110099610	+	MTD-int	LTR	MaLR	1072	1256	-2	1
962	748	224	400	4	chr3	49500175	49500419	-110099364	+	MTD	LTR	MaLR	1	341	-78	1
962	282	298	45	90	chr3	49507292	49507425	-110092358	-	MLT1D	LTR	MaLR	-292	213	87	7
962	2374	192	61	50	chr3	49511550	49512011	-110087772	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	465	-95	1
962	2374	192	61	50	chr3	49512058	49512150	-110087633	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	466	559	-1	1
962	356	314	104	7	chr3	49512327	49512481	-110087302	+	RMER15	LTR	ERVL	407	575	0	1
962	368	325	82	73	chr3	49513249	49513455	-110086328	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-338	231	24	1
962	304	316	61	114	chr3	49515475	49515739	-110084044	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-204	316	67	2
962	1548	251	49	24	chr3	49525255	49525664	-110074119	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
962	1994	186	47	44	chr3	49525991	49526405	-110073378	+	MTC	LTR	MaLR	2	406	-15	4
962	440	250	19	0	chr3	49527033	49527137	-110072646	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	314	4
962	421	209	143	54	chr3	49527525	49527672	-110072111	+	MT2A	LTR	ERVL	1	160	-373	4
962	17491	181	41	12	chr3	49527677	49531191	-110068592	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	236	3851	-1910	4
962	3743	37	5	0	chr3	49531206	49531640	-110068143	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	4
962	7653	36	2	0	chr3	49531640	49532574	-110067209	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	6646	4
962	40122	38	1	1	chr3	49532560	49537497	-110062286	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	870	4
962	2524	90	53	3	chr3	49537495	49537875	-110061908	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7182	399	1	4
962	3769	32	5	0	chr3	49537875	49538309	-110061474	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	4
962	5720	195	58	8	chr3	49538312	49538594	-110061189	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3863	4157	-1604	4
962	2852	64	53	5	chr3	49538594	49538972	-110060811	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
962	5720	195	58	8	chr3	49538972	49539860	-110059923	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4158	5091	-670	4
962	3065	172	18	10	chr3	49540550	49541159	-110058624	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5077	5690	-71	4
962	2015	148	0	12	chr3	49541193	49541515	-110058268	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	104	4
962	532	188	0	0	chr3	49541866	49541962	-110057821	-	MTC	LTR	MaLR	-323	98	3	4
962	494	131	45	36	chr3	49541962	49542073	-110057710	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5650	5761	0	4
962	753	253	246	79	chr3	49542075	49542469	-110057314	+	MT2A	LTR	ERVL	3	463	-70	4
962	753	253	246	79	chr3	49542492	49542552	-110057231	+	MT2A	LTR	ERVL	464	533	0	4
962	807	263	13	66	chr3	49542631	49542859	-110056924	-	MTD	LTR	MaLR	-203	216	1	5
963	1426	80	30	0	chr3	49551953	49552154	-110047629	+	MTB	LTR	MaLR	1	207	-193	6
963	2232	113	3	6	chr3	49552161	49552489	-110047294	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
963	581	320	125	45	chr3	49578182	49578470	-110021313	-	MTEa	LTR	MaLR	-60	319	9	9
963	3092	56	2	10	chr3	49586301	49586700	-110013083	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
963	273	305	32	89	chr3	49587245	49587361	-110012422	+	MT2B2	LTR	ERVL	53	160	-441	1
963	1233	232	51	88	chr3	49593609	49594043	-110005740	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	1
963	2068	193	42	7	chr3	49599579	49599986	-109999797	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
963	4240	187	55	61	chr3	49613032	49613287	-109986496	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	810	1
963	4240	187	55	61	chr3	49613352	49614130	-109985653	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-219	809	1	1
963	423	302	24	59	chr3	49616521	49616690	-109983093	+	MTEa	LTR	MaLR	4	166	-213	1
963	792	256	96	32	chr3	49620365	49620786	-109978997	+	RMER15	LTR	ERVL	7	514	-61	1
963	1876	223	19	14	chr3	49637637	49638056	-109961727	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
963	1611	156	24	20	chr3	49650952	49651246	-109948537	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-51	295	1	1
963	280	205	229	0	chr3	49655238	49655321	-109944462	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	278	1
963	617	295	28	24	chr3	49659494	49659734	-109940049	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	248	-122	2
963	601	322	68	42	chr3	49664263	49664663	-109935120	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	408	0	2
964	504	349	81	36	chr3	49678128	49678461	-109921322	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	353	-6	2
964	937	282	58	29	chr3	49678464	49678555	-109921228	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	2	105	-1475	2
964	937	282	58	29	chr3	49678611	49678862	-109920921	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	106	354	-1226	2
964	1590	172	190	25	chr3	49682961	49683355	-109916428	+	RMER6B	LTR	ERVK	3	461	0	2
964	986	251	122	21	chr3	49686209	49686546	-109913237	+	MTEb	LTR	MaLR	1	371	-8	2
964	256	260	45	107	chr3	49687025	49687137	-109912646	-	ORR1E	LTR	MaLR	-157	202	98	2
964	1207	261	67	56	chr3	49693053	49693340	-109906443	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	299	-80	2
964	1207	261	67	56	chr3	49693968	49694053	-109905730	+	MTE2b	LTR	MaLR	300	377	-2	2
964	593	296	293	28	chr3	49695263	49695777	-109904006	+	MLT1E1	LTR	MaLR	4	653	-1	2
964	1956	161	41	240	chr3	49696387	49697094	-109902689	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	570	-41	2
964	1956	161	41	240	chr3	49697129	49697183	-109902600	+	RMER19C	LTR	ERVK	571	610	-1	2
964	1925	182	233	50	chr3	49700885	49701612	-109898171	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	720	0	2
964	2297	98	3	58	chr3	49704230	49704576	-109895207	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
964	960	266	12	31	chr3	49709906	49710162	-109889621	+	MTD	LTR	MaLR	4	254	-165	2
964	300	231	25	13	chr3	49710177	49710256	-109889527	+	MTD	LTR	MaLR	340	419	0	2
964	725	287	85	25	chr3	49711692	49712046	-109887737	+	MTEa	LTR	MaLR	5	379	0	2
964	2061	135	0	0	chr3	49720715	49721033	-109878750	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	2
964	760	295	62	36	chr3	49721523	49721818	-109877965	-	RLTR16	LTR	ERVK	-339	353	15	2
964	231	306	58	96	chr3	49733594	49733782	-109866001	+	MLT1D	LTR	MaLR	54	234	-271	3
964	2212	165	53	75	chr3	49738218	49738252	-109861531	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	30	-504	3
964	2212	165	53	75	chr3	49738397	49738814	-109860969	+	RLTR20C	LTR	ERVK	31	442	-92	3
964	380	344	153	9	chr3	49746482	49746711	-109853072	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	296	3
964	893	234	53	80	chr3	49746827	49746866	-109852917	-	MT2B	LTR	ERVL	-89	512	468	3
964	893	247	75	69	chr3	49746944	49747360	-109852423	-	MT2B	LTR	ERVL	-134	467	1	3
964	338	326	76	15	chr3	49749968	49750099	-109849684	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	406	-2	3
964	3388	77	0	17	chr3	49755464	49755926	-109843857	-	LTRIS2	LTR	ERV1	-79	485	32	3
964	612	122	10	0	chr3	49755928	49756026	-109843757	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-158	4905	4807	3
964	1411	279	51	19	chr3	49758066	49758494	-109841289	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-917	4146	3705	3
964	2185	67	0	11	chr3	49758504	49758790	-109840993	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1559	3504	3222	3
964	2036	88	81	0	chr3	49773198	49773493	-109826290	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
964	1054	223	188	110	chr3	49778825	49779266	-109820517	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	1	3
964	575	289	16	16	chr3	49780353	49780558	-109819225	+	MLT1B	LTR	MaLR	13	213	-254	3
964	268	304	83	62	chr3	49780934	49781078	-109818705	+	MLT1B	LTR	MaLR	241	387	-3	3
964	4815	176	36	33	chr3	49781177	49782082	-109817701	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	3
964	1572	203	102	23	chr3	49785097	49785254	-109814529	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	165	-213	3
964	1572	203	102	23	chr3	49785325	49785399	-109814384	+	ORR1C1	LTR	MaLR	166	267	-111	3
964	7719	80	15	1	chr3	49785399	49786408	-109813375	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	3
964	1572	203	102	23	chr3	49786408	49786518	-109813265	+	ORR1C1	LTR	MaLR	268	371	-7	3
964	610	270	19	23	chr3	49788275	49788454	-109811329	+	MTD	LTR	MaLR	1	203	-216	3
964	1790	135	46	28	chr3	49790767	49791045	-109808738	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	293	-613	3
964	1790	159	34	44	chr3	49791180	49791456	-109808327	+	RMER17A2	LTR	ERVK	294	809	0	3
964	275	200	0	0	chr3	49791907	49791957	-109807826	+	RMER17A2	LTR	ERVK	74	123	-783	3
120	2935	78	5	5	chr3	49807143	49807542	-109792241	+	MTB	LTR	MaLR	2	400	0	4
965	475	238	198	38	chr3	49811384	49811541	-109788242	-	MTD	LTR	MaLR	-191	228	47	4
965	2353	88	3	0	chr3	49811701	49812009	-109787774	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	4
965	225	224	51	17	chr3	49812193	49812252	-109787531	-	MTD	LTR	MaLR	-358	61	1	4
965	2009	121	101	61	chr3	49813262	49813719	-109786064	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
965	258	257	7	169	chr3	49817413	49817549	-109782234	+	MLT1A	LTR	MaLR	4	117	-257	4
965	3140	51	8	8	chr3	49821307	49821703	-109778080	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
965	2185	82	94	0	chr3	49825110	49825429	-109774354	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	9	4
965	5969	128	22	19	chr3	49827685	49828665	-109771118	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	983	1	4
965	1034	39	8	0	chr3	49829523	49829652	-109770131	-	RLTR1B	LTR	ERV1	-382	130	1	4
965	1979	98	87	162	chr3	49829769	49829853	-109769930	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	295	4
965	1979	98	87	162	chr3	49829907	49830247	-109769536	-	RLTR9C	LTR	ERVK	-99	294	1	4
965	500	262	52	93	chr3	49831849	49832228	-109767555	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	371	-8	4
965	1467	232	57	39	chr3	49836523	49836980	-109762803	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-62	465	1	4
965	1045	212	128	36	chr3	49843314	49843618	-109756165	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	4
965	1095	266	95	0	chr3	49844796	49845142	-109754641	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	4
965	1153	114	35	22	chr3	49856058	49856311	-109743472	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	117	4
965	264	322	119	50	chr3	49867100	49867319	-109732464	-	RMER5	LTR	ERV1	-235	299	66	4
965	1811	165	22	28	chr3	49870454	49870815	-109728968	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	5
965	552	332	101	16	chr3	49871576	49871833	-109727950	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-264	292	14	5
965	2500	176	181	4	chr3	49876528	49877047	-109722736	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	5
965	488	86	0	0	chr3	49879079	49879149	-109720634	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	70	-458	5
965	3171	92	19	9	chr3	49879146	49879609	-109720174	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-7	468	1	5
965	2848	157	2	23	chr3	49879609	49880080	-109719703	+	RLTR12B	LTR	ERVK	68	528	0	5
965	1750	248	137	6	chr3	49883355	49883895	-109715888	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	5
965	311	313	52	22	chr3	49893338	49893472	-109706311	-	MLT1D	LTR	MaLR	-108	397	260	5
965	561	202	10	0	chr3	49899817	49899921	-109699862	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	105	-254	5
965	243	266	53	86	chr3	49900378	49900530	-109699253	+	LTR37A	LTR	ERV1	62	208	-218	5
965	529	327	65	25	chr3	49901482	49901758	-109698025	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	275	5
965	1339	266	38	9	chr3	49902412	49902757	-109697026	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	357	-22	5
965	1295	261	49	10	chr3	49920379	49920685	-109679098	+	MTD	LTR	MaLR	6	323	-96	5
965	1562	176	38	17	chr3	49920688	49920977	-109678806	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	125	5
965	546	99	32	21	chr3	49920963	49921056	-109678727	-	RMER6A	LTR	ERVK	-325	431	338	5
965	1459	347	4	14	chr3	49921194	49921680	-109678103	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	853	1333	-247	5
965	292	286	30	10	chr3	49921784	49921883	-109677900	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-31	497	397	5
965	262	272	2	29	chr3	49921934	49922032	-109677751	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-220	307	212	5
965	406	235	50	91	chr3	49922148	49922332	-109677451	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	1409	1701	-91	5
965	268	224	0	0	chr3	49922336	49922385	-109677398	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	49	-330	5
965	903	306	30	36	chr3	49922444	49922746	-109677037	-	MTE2b	LTR	MaLR	-79	300	1	5
965	705	319	98	11	chr3	49922746	49923031	-109676752	+	MTE2b	LTR	MaLR	66	375	-4	5
965	334	221	51	31	chr3	49926501	49926599	-109673184	-	RMER12	LTR	ERVK	-481	841	742	5
965	405	173	111	0	chr3	49928084	49928165	-109671618	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	311	5
965	1292	124	5	0	chr3	49928140	49928342	-109671441	-	MTB	LTR	MaLR	-197	203	1	5
965	1800	179	66	9	chr3	49932071	49932404	-109667379	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-15	352	1	5
965	313	316	10	30	chr3	49935897	49935998	-109663785	-	MER70B	LTR	ERVL	-230	348	250	5
965	267	330	0	52	chr3	49936011	49936107	-109663676	-	MER70B	LTR	ERVL	-398	180	90	5
966	250	345	14	61	chr3	49943044	49943192	-109656591	+	RMER12	LTR	ERVK	708	848	-474	6
966	527	318	6	6	chr3	49944700	49944877	-109654906	-	MLT1B	LTR	MaLR	-134	256	80	6
966	278	241	24	48	chr3	49945093	49945176	-109654607	-	MLT1B	LTR	MaLR	-380	87	7	6
966	3195	156	55	68	chr3	49945176	49945795	-109653988	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
966	3382	219	114	19	chr3	49946803	49947599	-109652184	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	872	-156	6
966	404	244	202	87	chr3	49948469	49948711	-109651072	+	RLTR25B	LTR	ERVK	834	1103	0	6
966	683	244	15	0	chr3	49957538	49957669	-109642114	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	6
966	367	354	80	49	chr3	49962944	49963232	-109636551	+	MER76	LTR	ERVL	1	297	-394	6
966	946	286	111	35	chr3	49966125	49966280	-109633503	+	RMER5	LTR	ERV1	40	205	-329	6
966	946	286	111	35	chr3	49966398	49966702	-109633081	+	RMER5	LTR	ERV1	206	534	0	6
966	2590	76	64	8	chr3	49971534	49971907	-109627876	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	6
966	466	303	106	6	chr3	49971971	49972150	-109627633	-	ORR1E	LTR	MaLR	-162	197	1	6
966	1873	158	13	3	chr3	49973475	49973786	-109625997	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	13	6
966	1839	174	43	62	chr3	49974554	49974927	-109624856	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-12	366	1	6
966	299	281	20	30	chr3	49980509	49980608	-109619175	+	MLT1A1	LTR	MaLR	293	390	-18	6
966	1366	180	53	45	chr3	49985418	49985755	-109614028	-	RMER6C	LTR	ERVK	-4	686	347	6
966	476	174	0	156	chr3	49985767	49985876	-109613907	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	196	6
966	644	264	151	63	chr3	49986377	49986648	-109613135	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	85	6
966	261	246	16	0	chr3	49999652	49999713	-109600070	-	RMER5	LTR	ERV1	-1	533	472	6
966	3036	86	0	28	chr3	50003398	50003831	-109595952	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	3
966	584	317	81	25	chr3	50005468	50005788	-109593995	+	MLT1B	LTR	MaLR	9	346	-44	4
966	1369	176	25	0	chr3	50011856	50012094	-109587689	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	244	-284	1
966	1511	135	33	66	chr3	50021685	50022018	-109577765	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
966	1063	197	128	41	chr3	50037920	50038264	-109561519	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
966	749	294	134	89	chr3	50041224	50041583	-109558200	-	MTE2a	LTR	MaLR	-4	375	1	5
966	972	282	63	111	chr3	50044383	50044778	-109555005	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	2	5
966	3358	35	2	0	chr3	50044880	50045275	-109554508	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
966	1001	251	56	80	chr3	50046709	50046893	-109552890	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	196	6
966	1001	251	56	80	chr3	50047030	50047221	-109552562	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-175	195	4	6
966	500	344	77	56	chr3	50048351	50048674	-109551109	+	MLT1G	LTR	MaLR	39	368	-223	6
966	2843	83	3	3	chr3	50054860	50055248	-109544535	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	388	-8	7
966	915	256	52	40	chr3	50055926	50056178	-109543605	-	MTE2a	LTR	MaLR	-122	257	3	7
966	370	320	66	7	chr3	50058548	50058699	-109541084	-	LTR52	LTR	ERVL	-250	171	12	7
966	1165	239	51	91	chr3	50059366	50059896	-109539887	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2709	529	21	7
966	1244	138	174	88	chr3	50060359	50060710	-109539073	-	RMER17C	LTR	ERVK	-29	381	1	7
966	225	184	0	0	chr3	50062470	50062508	-109537275	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-668	821	784	8
966	601	385	68	33	chr3	50067458	50067882	-109531901	-	MLT2F	LTR	ERVL	-23	640	202	8
967	290	337	0	0	chr3	50069760	50069843	-109529940	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2353	3314	3232	8
967	670	336	73	8	chr3	50070102	50070501	-109529282	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2517	3197	2773	8
967	1985	152	74	76	chr3	50070673	50071093	-109528690	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	9
967	283	339	18	12	chr3	50073490	50073657	-109526126	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-5436	231	64	1
967	335	272	58	14	chr3	50073806	50073944	-109525839	-	MLT2F	LTR	ERVL	-517	146	3	1
967	263	277	61	26	chr3	50086223	50086338	-109513445	-	LTR33B	LTR	ERVL	0	503	385	1
967	1335	290	61	84	chr3	50089557	50090178	-109509605	-	RLTR18	LTR	ERVK	-1	615	9	1
967	301	360	118	46	chr3	50093329	50093609	-109506174	+	MLT1E2	LTR	MaLR	298	597	-83	1
967	475	311	79	20	chr3	50094692	50094895	-109504888	-	MLT1K	LTR	MaLR	-15	580	366	1
967	737	344	56	25	chr3	50098772	50099094	-109500689	+	MTEa	LTR	MaLR	3	334	-45	1
967	293	395	88	30	chr3	50108888	50109193	-109490590	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	45	1
967	469	301	256	77	chr3	50119073	50119537	-109480246	+	MLT2B1	LTR	ERVL	5	551	-5	1
967	263	248	27	29	chr3	50120552	50120631	-109479152	+	MTE2a	LTR	MaLR	279	356	-23	1
967	292	237	0	0	chr3	50125770	50125829	-109473954	-	MER34	LTR	ERV1	-481	61	3	1
967	276	335	80	46	chr3	50127096	50127271	-109472512	+	MER34A1	LTR	ERV1	395	575	-12	1
967	1635	147	153	64	chr3	50138953	50139359	-109460424	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	442	0	2
967	1753	179	47	57	chr3	50141120	50141506	-109458277	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	1	2
967	251	330	30	83	chr3	50144090	50144222	-109455561	+	RLTR43A	LTR	ERVK	240	364	0	2
967	945	245	103	51	chr3	50145310	50145890	-109453893	-	RLTR18	LTR	ERVK	-26	590	1	2
967	1384	244	84	34	chr3	50145890	50146272	-109453511	-	MTD	LTR	MaLR	-18	401	1	2
967	2090	148	110	5	chr3	50147644	50148018	-109451765	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	2
967	820	272	176	45	chr3	50148283	50148726	-109451057	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	503	-2	2
967	619	311	30	25	chr3	50151646	50151847	-109447936	+	MTEb	LTR	MaLR	3	204	-175	2
967	651	177	133	6	chr3	50151848	50152013	-109447770	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-171	5590	5405	2
967	9210	104	8	1	chr3	50152004	50153345	-109446438	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1998	3347	-2138	2
967	977	118	155	25	chr3	50153347	50153547	-109446236	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	824	1049	-914	2
967	225	183	46	77	chr3	50153957	50154022	-109445761	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	2
967	2017	132	23	11	chr3	50154323	50154656	-109445127	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1381	1690	-273	2
967	2149	100	17	0	chr3	50154676	50154965	-109444818	-	MT2B	LTR	ERVL	-307	294	1	2
967	620	301	12	6	chr3	50154965	50155129	-109444654	+	MTEb	LTR	MaLR	215	379	0	2
967	2580	153	102	31	chr3	50156117	50156637	-109443146	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	21	2
967	768	284	55	48	chr3	50158072	50158361	-109441422	+	RMER15	LTR	ERVL	251	541	-34	2
967	613	188	187	55	chr3	50160112	50160331	-109439452	-	RMER20B	LTR	ERVK	-251	376	129	2
967	2897	34	7	88	chr3	50165759	50166180	-109433603	-	RLTR10	LTR	ERVK	-3	387	1	2
967	585	276	98	67	chr3	50177255	50177601	-109422182	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	359	0	2
967	314	149	65	39	chr3	50196291	50196368	-109403415	+	RMER15	LTR	ERVL	22	100	-475	2
967	1227	225	134	0	chr3	50196408	50196706	-109403077	+	RMER15	LTR	ERVL	238	575	0	2
967	711	292	25	25	chr3	50200006	50200203	-109399580	+	MTD	LTR	MaLR	4	200	-219	2
968	936	210	72	6	chr3	50202468	50202677	-109397106	+	MTD	LTR	MaLR	196	407	-12	2
968	363	336	0	0	chr3	50215732	50215836	-109383947	+	RMER12	LTR	ERVK	771	874	-448	2
968	618	307	30	13	chr3	50254170	50254404	-109345379	+	RMER15	LTR	ERVL	324	561	-14	3
968	875	309	82	39	chr3	50257417	50257747	-109342036	-	MTEa	LTR	MaLR	-22	357	14	3
968	252	200	217	36	chr3	50263275	50263358	-109336425	-	MLT1D	LTR	MaLR	-4	404	307	3
968	551	312	60	87	chr3	50266620	50266989	-109332794	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	3
968	396	303	7	60	chr3	50267025	50267176	-109332607	+	MLT1A0	LTR	MaLR	213	355	-10	3
968	364	300	37	37	chr3	50268155	50268289	-109331494	-	MLT1D	LTR	MaLR	-284	221	88	3
968	255	359	0	57	chr3	50268575	50268699	-109331084	-	MLT1D	LTR	MaLR	-388	117	1	3
968	567	376	102	30	chr3	50276003	50276376	-109323407	+	MLT-int	LTR	MaLR	1258	1664	-71	3
968	3414	33	2	0	chr3	50276376	50276771	-109323012	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
968	9192	32	4	1	chr3	50276772	50277866	-109321917	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-1	1097	1	3
968	3472	25	2	0	chr3	50277866	50278261	-109321522	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
968	237	214	27	41	chr3	50281117	50281190	-109318593	-	MTE2b	LTR	MaLR	-30	349	278	3
968	236	276	48	72	chr3	50282011	50282136	-109317647	+	RMER15	LTR	ERVL	8	129	-446	3
968	539	338	69	40	chr3	50282146	50282423	-109317360	+	RMER15	LTR	ERVL	291	575	0	3
968	2333	149	18	10	chr3	50288468	50288855	-109310928	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	394	0	3
968	754	263	47	47	chr3	50290609	50291010	-109308773	-	MT2A	LTR	ERVL	-11	590	89	3
968	288	300	0	0	chr3	50291050	50291073	-109308710	-	MT2A	LTR	ERVL	-445	88	66	3
968	275	287	34	11	chr3	50293013	50293101	-109306682	+	MLT1A1	LTR	MaLR	19	108	-300	3
968	579	314	102	18	chr3	50293338	50293623	-109306160	+	MLT1A	LTR	MaLR	53	361	-13	3
968	2682	169	52	2	chr3	50294820	50295323	-109304460	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	3
968	791	268	88	127	chr3	50295609	50296001	-109303782	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	171	3
968	3520	176	12	16	chr3	50296413	50297084	-109302699	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-252	5509	4842	3
968	2157	178	127	89	chr3	50298779	50299440	-109300343	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	5	3
968	3159	56	2	8	chr3	50302041	50302439	-109297344	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
968	230	324	66	88	chr3	50302664	50302891	-109296892	+	LTR85c	LTR	Gypsy?	585	806	-17	3
968	2946	70	31	3	chr3	50303847	50304232	-109295551	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
968	2327	72	15	9	chr3	50309730	50310055	-109289728	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
968	1601	162	63	31	chr3	50313618	50313937	-109285846	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
968	229	268	92	11	chr3	50315876	50315963	-109283820	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	105	198	-1311	4
968	466	344	52	22	chr3	50318552	50318784	-109280999	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	322	4
968	230	254	104	0	chr3	50318788	50318855	-109280928	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-473	87	14	4
968	756	292	55	40	chr3	50321853	50322178	-109277605	-	MLT1B	LTR	MaLR	-1	389	60	4
968	359	296	213	22	chr3	50322469	50322652	-109277131	-	MLT1A	LTR	MaLR	-21	353	136	4
968	270	323	216	39	chr3	50328485	50328778	-109271005	+	MLT1A1	LTR	MaLR	19	363	-45	4
968	302	212	9	69	chr3	50329010	50329228	-109270555	+	RMER17D	LTR	ERVK	236	440	-449	4
968	384	280	8	63	chr3	50329228	50329354	-109270429	+	RMER15	LTR	ERVL	349	467	-108	4
969	3545	72	100	19	chr3	50339243	50339765	-109260018	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	4
969	1388	201	116	48	chr3	50340548	50340903	-109258880	+	RMER16	LTR	ERVK	72	450	-83	4
969	411	340	104	93	chr3	50343272	50343626	-109256157	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	2	4
969	495	301	54	121	chr3	50357416	50357714	-109242069	+	ORR1E	LTR	MaLR	77	354	-5	4
969	1272	228	80	22	chr3	50360011	50360374	-109239409	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	4
969	849	277	136	49	chr3	50369097	50369545	-109230238	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	487	-18	4
969	400	298	8	15	chr3	50372582	50372715	-109227068	+	RMER15	LTR	ERVL	403	534	-41	4
969	2807	25	25	94	chr3	50375503	50375895	-109223888	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	4
969	230	213	21	0	chr3	50375906	50375953	-109223830	-	MLT1D	LTR	MaLR	-4	386	339	4
969	350	280	38	101	chr3	50375959	50376118	-109223665	-	MLT1D	LTR	MaLR	-120	385	237	4
969	251	320	134	39	chr3	50381816	50381943	-109217840	-	ORR1E	LTR	MaLR	-214	145	7	4
969	414	307	45	72	chr3	50384256	50384477	-109215306	+	MLT2C1	LTR	ERVL	18	232	-165	4
969	908	291	67	14	chr3	50398341	50398669	-109201114	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	372	8	5
969	4503	142	142	10	chr3	50399214	50400051	-109199732	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	948	-155	5
969	673	177	88	135	chr3	50400337	50400552	-109199231	+	RLTR25B	LTR	ERVK	742	946	-82	5
969	695	211	28	14	chr3	50400544	50400688	-109199095	-	MTEa	LTR	MaLR	-23	356	211	5
969	1193	231	78	28	chr3	50401339	50401508	-109198275	+	MTEa	LTR	MaLR	1	188	-191	5
969	1193	231	78	28	chr3	50401571	50401761	-109198022	+	MTEa	LTR	MaLR	189	378	-1	5
969	411	268	127	54	chr3	50402826	50402992	-109196791	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-85	484	307	5
969	345	311	105	29	chr3	50403047	50403219	-109196564	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-363	185	1	5
969	419	319	50	0	chr3	50403369	50403510	-109196273	+	MLT1D	LTR	MaLR	14	161	-344	5
969	533	268	113	49	chr3	50404327	50404531	-109195252	+	MLT1D	LTR	MaLR	246	462	-43	5
969	416	298	90	18	chr3	50409654	50409876	-109189907	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	238	-127	5
969	4254	134	83	6	chr3	50415376	50416060	-109183723	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	5
969	316	368	135	23	chr3	50420181	50420440	-109179343	+	LTR78	LTR	ERV1	999	1286	-18	5
969	264	214	4	0	chr3	50423328	50423394	-109176389	+	MTEb	LTR	MaLR	287	353	-26	5
969	2333	155	16	21	chr3	50424537	50424816	-109174967	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	284	-110	5
969	5280	108	153	2	chr3	50424816	50425670	-109174113	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	5
969	2333	155	16	21	chr3	50425670	50425778	-109174005	+	ORR1B1	LTR	MaLR	285	386	-8	5
969	1105	245	150	18	chr3	50429060	50429393	-109170390	+	MTEb	LTR	MaLR	3	379	0	5
969	228	342	57	82	chr3	50430781	50430940	-109168843	+	MT-int	LTR	MaLR	537	691	-407	5
969	927	246	119	6	chr3	50434178	50434512	-109165271	+	MTEa	LTR	MaLR	8	379	0	5
969	1223	209	232	15	chr3	50435348	50435688	-109164095	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	5
969	823	234	124	35	chr3	50440307	50440789	-109158994	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	10	534	0	5
969	360	323	205	21	chr3	50442418	50442608	-109157175	+	MLT1A0	LTR	MaLR	141	365	0	5
969	491	256	25	8	chr3	50446962	50447084	-109152699	+	RMER20B	LTR	ERVK	2	125	-502	5
969	638	304	37	70	chr3	50458720	50458992	-109140791	-	MTE2a	LTR	MaLR	-98	281	19	6
969	990	251	60	151	chr3	50459380	50459797	-109139986	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	6
970	1944	195	22	30	chr3	50463759	50464129	-109135654	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
970	249	338	87	91	chr3	50464870	50465134	-109134649	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	263	-96	6
970	494	282	62	28	chr3	50470362	50470600	-109129183	+	MTEa	LTR	MaLR	108	379	0	6
970	371	288	59	29	chr3	50479530	50479666	-109120117	+	MTE-int	LTR	MaLR	308	447	-1133	6
970	2016	321	70	49	chr3	50480302	50481143	-109118640	+	MTE-int	LTR	MaLR	669	1527	-53	6
970	271	395	0	7	chr3	50481143	50481278	-109118505	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	134	-225	6
970	1063	273	73	36	chr3	50487277	50487638	-109112145	-	MTE2b	LTR	MaLR	-10	369	3	6
970	615	180	0	0	chr3	50489002	50489102	-109110681	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-294	100	1	6
970	243	320	88	37	chr3	50489113	50489297	-109110486	+	MLT2C1	LTR	ERVL	347	553	-10	6
970	2651	143	134	89	chr3	50497094	50497654	-109102129	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	1	6
970	611	308	97	54	chr3	50506749	50507067	-109092716	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	370	31	3
970	2094	182	17	11	chr3	50507955	50508317	-109091466	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	4	5
970	242	180	48	32	chr3	50509831	50509894	-109089889	-	MLT1I	LTR	MaLR	-16	395	332	7
970	677	292	142	42	chr3	50516650	50517050	-109082733	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	486	-42	1
970	231	105	0	26	chr3	50518560	50518599	-109081184	+	BGLII_A	LTR	ERVK	20	57	-388	2
970	1226	213	27	27	chr3	50518620	50518919	-109080864	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	235	533	-44	2
970	414	314	156	22	chr3	50519597	50519867	-109079916	+	MLT1J	LTR	MaLR	1	306	-206	2
970	414	296	96	26	chr3	50525758	50525914	-109073869	+	RMER15	LTR	ERVL	359	525	-50	2
970	342	276	29	110	chr3	50529746	50529885	-109069898	+	MLT1A	LTR	MaLR	8	147	-227	3
970	1464	242	58	23	chr3	50533065	50533412	-109066371	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	7	4
970	818	284	175	32	chr3	50534932	50535394	-109064389	+	MT2A	LTR	ERVL	6	533	0	4
970	2842	91	123	0	chr3	50535521	50535904	-109063879	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	4
970	341	301	19	0	chr3	50541800	50541903	-109057880	+	ORR1D2	LTR	MaLR	213	317	-53	5
970	414	200	0	0	chr3	50544455	50544525	-109055258	+	MTEb	LTR	MaLR	1	70	-309	5
970	937	274	124	9	chr3	50544525	50544856	-109054927	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	51	5
970	422	263	0	20	chr3	50544949	50545050	-109054733	-	MTD	LTR	MaLR	-319	100	2	5
970	741	288	152	47	chr3	50545052	50545329	-109054454	+	MTEb	LTR	MaLR	67	372	-7	5
970	668	253	103	44	chr3	50545693	50545896	-109053887	-	RMER21B	LTR	ERV1	-280	562	348	5
970	4236	162	124	19	chr3	50546482	50547257	-109052526	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	5	5
970	435	194	66	28	chr3	50547307	50547413	-109052370	+	MTEa	LTR	MaLR	268	377	-2	6
970	915	267	215	16	chr3	50554640	50554956	-109044827	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	7
970	478	256	83	0	chr3	50557471	50557592	-109042191	+	MLT1B	LTR	MaLR	3	133	-257	7
970	306	305	11	21	chr3	50557639	50557765	-109042018	+	MLT1B	LTR	MaLR	256	387	-21	7
970	1049	240	122	24	chr3	50558618	50558955	-109040828	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	6	7
970	667	350	81	30	chr3	50562062	50562395	-109037388	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	355	-4	8
970	261	282	87	75	chr3	50563530	50563687	-109036096	+	ORR1E	LTR	MaLR	209	367	-12	8
970	838	198	32	43	chr3	50563687	50563872	-109035911	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	183	-1397	8
970	315	280	54	0	chr3	50563851	50563920	-109035863	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1454	1527	-53	8
970	288	333	16	48	chr3	50563920	50564046	-109035737	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	122	-237	8
971	467	320	116	17	chr3	50618878	50619180	-108980603	-	MLT1D	LTR	MaLR	-92	413	82	9
971	321	282	66	61	chr3	50626789	50626970	-108972813	+	LTR33	LTR	ERVL	334	515	0	1
971	238	241	0	35	chr3	50628616	50628702	-108971081	+	MTEb	LTR	MaLR	272	354	-25	1
971	1729	158	128	18	chr3	50632784	50633120	-108966663	+	ORR1C1	LTR	MaLR	5	377	-1	1
971	1433	228	58	30	chr3	50637101	50637463	-108962320	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	1
971	397	271	82	14	chr3	50643251	50643397	-108956386	+	MTC	LTR	MaLR	7	162	-259	1
971	258	295	46	37	chr3	50643607	50643716	-108956067	-	MTEa	LTR	MaLR	-262	117	8	1
971	3576	15	0	2	chr3	50647109	50647506	-108952277	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
971	2342	191	7	10	chr3	50650118	50650536	-108949247	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	5	1
971	260	321	92	29	chr3	50656231	50656404	-108943379	+	MLT1E2	LTR	MaLR	1	184	-443	1
971	287	128	0	167	chr3	50656607	50656691	-108943092	+	MLT1D	LTR	MaLR	436	505	0	1
971	3250	56	5	2	chr3	50658153	50658548	-108941235	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
971	1100	203	35	0	chr3	50659710	50659937	-108939846	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	183	1
971	495	317	36	64	chr3	50661195	50661508	-108938275	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	321	-98	1
971	2840	81	44	3	chr3	50661508	50661892	-108937891	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
971	385	255	19	19	chr3	50663493	50663601	-108936182	+	RMER15	LTR	ERVL	357	464	-111	1
971	275	242	17	241	chr3	50664194	50664368	-108935415	+	RMER15	LTR	ERVL	1	135	-440	1
971	838	297	43	47	chr3	50664381	50664572	-108935211	+	RMER15	LTR	ERVL	274	466	-109	1
971	838	297	43	47	chr3	50664842	50664950	-108934833	+	RMER15	LTR	ERVL	467	572	-3	1
971	1258	50	6	6	chr3	50667336	50667497	-108932286	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	236	396	0	1
971	7136	53	84	74	chr3	50667497	50668585	-108931198	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
971	3250	58	2	2	chr3	50668585	50668981	-108930802	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
971	734	268	233	7	chr3	50671847	50672118	-108927665	+	MTEb	LTR	MaLR	42	374	-5	1
971	294	311	103	26	chr3	50675394	50675549	-108924234	+	RMER15	LTR	ERVL	408	574	-1	1
971	565	343	135	18	chr3	50679039	50679440	-108920343	-	MER31B	LTR	ERV1	0	466	19	1
971	234	339	144	41	chr3	50681291	50681534	-108918249	-	MLT1L	LTR	MaLR	-30	580	313	1
971	603	339	72	63	chr3	50692794	50693254	-108906529	+	MLT1G1	LTR	MaLR	93	556	-23	2
971	326	375	99	58	chr3	50693468	50693813	-108905970	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	2
971	902	251	80	93	chr3	50695381	50695760	-108904023	-	MLT1B	LTR	MaLR	-8	357	7	2
971	2019	194	132	25	chr3	50699289	50699766	-108900017	+	MT2A	LTR	ERVL	6	533	0	2
971	288	200	91	0	chr3	50699780	50699835	-108899948	-	MT2A	LTR	ERVL	-249	284	225	2
971	396	320	40	114	chr3	50700288	50700489	-108899294	+	LTR85c	LTR	Gypsy?	13	198	-625	2
971	850	251	101	0	chr3	50704800	50705007	-108894776	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	228	-131	2
971	335	261	244	0	chr3	50706044	50706159	-108893624	+	MTEa	LTR	MaLR	1	143	-236	2
971	399	262	78	26	chr3	50706084	50706295	-108893488	+	MT2A	LTR	ERVL	374	584	0	2
971	396	289	108	67	chr3	50712531	50712828	-108886955	+	MLT1D	LTR	MaLR	21	329	-176	2
971	1167	224	86	21	chr3	50722665	50722956	-108876827	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	110	2
971	307	214	29	0	chr3	50723170	50723240	-108876543	-	MTD	LTR	MaLR	-349	72	1	2
971	774	294	92	10	chr3	50723240	50723535	-108876248	+	MLT1A0	LTR	MaLR	24	342	-23	2
972	902	291	99	82	chr3	50725491	50725683	-108874100	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	329	2
972	902	291	99	82	chr3	50725820	50726102	-108873681	-	MLT1D	LTR	MaLR	-177	328	23	2
972	1374	296	39	27	chr3	50728851	50729362	-108870421	+	LTR82A	LTR	ERVL	12	528	-344	2
972	307	308	0	0	chr3	50729614	50729692	-108870091	+	MTE2a	LTR	MaLR	43	120	-259	2
972	581	204	191	0	chr3	50729718	50729870	-108869913	+	MTE2a	LTR	MaLR	199	379	0	2
972	1103	235	55	4	chr3	50732922	50733193	-108866590	+	ORR1C1	LTR	MaLR	13	297	-81	2
972	429	223	18	9	chr3	50733334	50733358	-108866425	+	ORR1C1	LTR	MaLR	265	287	-91	2
972	429	223	18	9	chr3	50733420	50733508	-108866275	+	ORR1C1	LTR	MaLR	288	377	-1	2
972	328	366	94	44	chr3	50734377	50734740	-108865043	+	LTR33	LTR	ERVL	135	515	0	2
972	282	328	84	46	chr3	50735254	50735599	-108864184	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	379	8	2
972	474	245	40	7	chr3	50738303	50738427	-108861356	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	240	2
972	575	270	167	33	chr3	50738628	50738873	-108860910	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-88	282	5	2
972	855	269	109	55	chr3	50739129	50739514	-108860269	-	MLT1D	LTR	MaLR	-15	490	85	2
972	252	353	23	105	chr3	50741635	50741806	-108857977	+	MER21B	LTR	ERV1	14	170	-693	2
972	255	346	73	95	chr3	50746153	50746565	-108853218	-	MLT2B3	LTR	ERVL	0	554	152	3
972	243	323	15	75	chr3	50746464	50746598	-108853185	-	MTEa	LTR	MaLR	-165	214	89	3
972	3094	146	81	19	chr3	50746910	50747441	-108852342	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-4	564	1	3
972	258	243	14	32	chr3	50747557	50747640	-108852143	+	MTE2a	LTR	MaLR	289	396	-12	3
972	3996	200	106	18	chr3	50750282	50751011	-108848772	+	RMER12	LTR	ERVK	1	767	-555	3
972	3996	200	106	18	chr3	50751070	50751417	-108848366	+	RMER12	LTR	ERVK	768	1171	-151	3
972	413	214	139	28	chr3	50751409	50751553	-108848230	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1689	1848	0	3
972	463	295	136	57	chr3	50752005	50752336	-108847447	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	3
972	796	296	103	22	chr3	50757900	50758211	-108841572	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	340	-19	3
972	318	340	69	6	chr3	50759416	50759576	-108840207	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-20	388	219	3
972	268	264	236	16	chr3	50759771	50759898	-108839885	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-248	160	6	3
972	1143	228	15	19	chr3	50778344	50778612	-108821171	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	309	3
972	366	219	203	0	chr3	50779564	50779687	-108820096	+	MLT1A	LTR	MaLR	227	374	0	3
972	1137	285	21	46	chr3	50790031	50790447	-108809336	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	419	0	3
972	391	353	44	15	chr3	50792936	50793140	-108806643	+	MLT1I	LTR	MaLR	9	218	-193	3
972	354	267	268	29	chr3	50801043	50801323	-108798460	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-34	374	28	3
972	1256	231	38	84	chr3	50803239	50803632	-108796151	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	5	3
972	4605	103	38	36	chr3	50803974	50804781	-108795002	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	3
972	338	309	109	29	chr3	50806518	50806728	-108793055	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-567	270	44	3
972	968	255	85	36	chr3	50809930	50809967	-108789816	-	MTEa	LTR	MaLR	-30	349	314	4
972	968	255	85	36	chr3	50810033	50810325	-108789458	-	MTEa	LTR	MaLR	-66	313	4	4
972	2782	29	0	0	chr3	50811807	50812158	-108787625	+	MT-int	LTR	MaLR	672	1022	-76	4
972	2356	14	0	0	chr3	50812157	50812446	-108787337	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	-204	289	1	4
972	309	26	0	0	chr3	50812446	50812484	-108787299	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	4
972	311	118	28	56	chr3	50812484	50812556	-108787227	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	571	4
972	1042	38	8	0	chr3	50812556	50812687	-108787096	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-111	5374	5243	4
972	4379	173	117	8	chr3	50813620	50814393	-108785390	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	817	-211	4
972	4379	173	117	8	chr3	50814435	50814587	-108785196	+	RLTR25B	LTR	ERVK	818	1026	-2	4
972	3519	77	108	21	chr3	50816011	50816530	-108783253	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	4
972	4159	154	63	70	chr3	50820537	50821398	-108778385	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	855	-47	4
972	507	308	19	5	chr3	50823532	50823741	-108776042	+	MLT1F1	LTR	MaLR	354	565	-4	4
972	795	248	206	6	chr3	50825262	50825578	-108774205	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	4
972	802	327	6	41	chr3	50826994	50827335	-108772448	+	MTEb	LTR	MaLR	51	379	0	4
972	248	326	139	15	chr3	50828009	50828146	-108771637	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-196	399	246	4
972	1820	128	27	46	chr3	50829863	50830231	-108769552	+	ORR1B2	LTR	MaLR	7	367	0	4
972	1225	247	35	7	chr3	50832040	50832350	-108767433	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	60	4
972	302	235	118	0	chr3	50832355	50832440	-108767343	-	MTE2a	LTR	MaLR	-284	95	1	4
972	730	309	91	19	chr3	50838385	50838705	-108761078	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	36	4
972	235	206	91	71	chr3	50853221	50853320	-108746463	+	MLT1A1	LTR	MaLR	24	124	-284	4
972	303	252	46	46	chr3	50853426	50853534	-108746249	+	MLT1A1	LTR	MaLR	299	406	-2	4
972	254	309	40	20	chr3	50854964	50855063	-108744720	+	MLT1A1	LTR	MaLR	13	113	-261	4
972	271	261	0	0	chr3	50855457	50855522	-108744261	+	MLT1A1	LTR	MaLR	283	347	-61	4
973	1625	170	113	15	chr3	50860261	50860596	-108739187	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	3	5
973	1163	262	183	0	chr3	50861112	50861554	-108738229	+	MLT1F	LTR	MaLR	1	523	-25	5
973	896	269	25	56	chr3	50864305	50864663	-108735120	-	MT2A	LTR	ERVL	-98	435	89	5
973	307	267	186	61	chr3	50864481	50864728	-108735055	-	MTE2a	LTR	MaLR	-97	282	5	5
973	240	276	50	30	chr3	50874515	50874616	-108725167	-	MLT1D	LTR	MaLR	-16	489	387	5
973	1010	274	86	19	chr3	50881264	50881685	-108718098	-	RMER5	LTR	ERV1	-10	524	76	5
973	835	251	40	90	chr3	50888600	50888976	-108710807	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	5
973	3347	39	3	0	chr3	50904975	50905359	-108694424	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	5
973	2917	157	14	24	chr3	50905359	50906038	-108693745	+	IAPEy-int	LTR	ERVK	1	1058	-6455	5
973	22478	44	3	6	chr3	50906038	50908757	-108691026	+	IAPEy-int	LTR	ERVK	4804	7513	0	5
973	3347	39	3	0	chr3	50908757	50909141	-108690642	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	5
973	929	142	22	10	chr3	50909955	50910122	-108689661	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-185	142	1	5
973	1758	146	92	47	chr3	50913739	50913910	-108685873	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	192	-206	6
973	1758	146	92	47	chr3	50913983	50914191	-108685592	+	RMER10B	LTR	ERVL	193	397	-1	6
973	317	360	0	0	chr3	50914564	50914664	-108685119	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	371	6
973	586	307	12	109	chr3	50919168	50919424	-108680359	-	MTEa	LTR	MaLR	-23	356	126	6
973	581	208	114	8	chr3	50919635	50919756	-108680027	-	MTEa	LTR	MaLR	-236	143	9	6
973	242	283	166	31	chr3	50926833	50927026	-108672757	+	ORR1E	LTR	MaLR	42	260	-99	6
973	517	291	35	76	chr3	50932421	50932592	-108667191	+	MTEa	LTR	MaLR	1	164	-215	6
973	407	258	30	20	chr3	50932589	50932688	-108667095	+	MTEa	LTR	MaLR	276	375	-4	6
973	590	204	258	22	chr3	50932776	50933059	-108666724	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	352	-7	6
973	1600	242	88	8	chr3	50933640	50934028	-108665755	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
973	760	284	70	25	chr3	50934923	50935309	-108664474	+	MLT1D	LTR	MaLR	9	501	-4	6
973	289	263	0	0	chr3	50935452	50935509	-108664274	+	MTC	LTR	MaLR	1	57	-302	6
973	1760	183	108	8	chr3	50935487	50935857	-108663926	+	MTC	LTR	MaLR	15	421	0	6
973	494	251	58	48	chr3	50935859	50936047	-108663736	+	MTEa	LTR	MaLR	182	371	-8	6
973	333	257	292	0	chr3	50937687	50937784	-108661999	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	245	6
973	915	201	18	0	chr3	50937784	50937953	-108661830	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	206	6
973	502	286	131	0	chr3	50938506	50938674	-108661109	-	MTE2b	LTR	MaLR	-189	190	1	6
973	687	232	213	24	chr3	50945081	50945255	-108654528	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	159	6
973	687	232	213	24	chr3	50945326	50945447	-108654336	-	ORR1E	LTR	MaLR	-201	158	3	6
973	294	143	62	31	chr3	50946973	50947038	-108652745	+	MT2B	LTR	ERVL	191	257	-344	6
973	230	284	43	64	chr3	50947328	50947422	-108652361	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-24	525	434	6
973	1610	170	75	20	chr3	50947790	50948178	-108651605	-	MT2A	LTR	ERVL	-61	540	1	6
973	2374	95	0	60	chr3	50948851	50949199	-108650584	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
973	357	278	0	11	chr3	50949602	50949693	-108650090	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-48	360	271	6
973	238	280	67	120	chr3	50949729	50949879	-108649904	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-266	142	1	6
973	600	236	126	6	chr3	50955362	50955537	-108644246	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	181	7
973	340	235	0	0	chr3	50955587	50955655	-108644128	-	MTEb	LTR	MaLR	-306	73	6	7
973	612	348	34	94	chr3	50958363	50958832	-108640951	-	MT2A	LTR	ERVL	-74	459	19	7
973	6731	113	67	78	chr3	50964727	50966021	-108633762	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	684	1963	0	7
973	2009	121	65	3	chr3	50966021	50966329	-108633454	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	327	-2	7
973	939	270	141	55	chr3	50967115	50967650	-108632133	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-4	597	1	7
973	841	197	117	19	chr3	50969100	50969317	-108630466	-	MT2A	LTR	ERVL	-186	398	3	7
973	387	299	50	88	chr3	50969834	50970072	-108629711	+	MLT1F2-int	LTR	MaLR	436	664	-707	7
973	259	294	52	67	chr3	50970324	50970459	-108629324	+	MLT1F2	LTR	MaLR	185	317	-243	7
973	892	280	53	32	chr3	50970749	50971033	-108628750	-	MLT1A-int	LTR	MaLR	-1286	449	160	7
973	272	260	0	0	chr3	50971067	50971132	-108628651	-	MLT1A-int	LTR	MaLR	-1669	66	2	7
973	262	274	47	12	chr3	50971523	50971608	-108628175	-	MLT1A	LTR	MaLR	-27	347	260	7
973	2044	133	39	95	chr3	50971666	50972052	-108627731	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	15	7
973	644	165	55	8	chr3	50972052	50972180	-108627603	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	0	1370	1237	7
973	249	248	134	79	chr3	50973012	50973139	-108626644	-	MLT1A	LTR	MaLR	-274	134	1	7
973	227	291	59	68	chr3	50973044	50973162	-108626621	-	RMER19B	LTR	ERVK	-124	778	662	7
973	251	294	0	105	chr3	50981152	50981247	-108618536	+	MT2B2	LTR	ERVL	160	244	-340	7
973	1225	202	217	27	chr3	50984454	50984790	-108614993	+	MTD	LTR	MaLR	6	405	-14	7
121	251	260	90	40	chr3	50986978	50987078	-108612705	+	MT2B	LTR	ERVL	160	264	-337	7
974	484	296	198	31	chr3	50988762	50989055	-108610728	-	MLT2C1	LTR	ERVL	0	397	56	7
974	349	259	65	0	chr3	50991109	50991217	-108608566	+	MLT1A	LTR	MaLR	61	175	-269	8
974	484	273	158	0	chr3	50992095	50992278	-108607505	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	208	8
974	437	250	80	40	chr3	50992293	50992418	-108607365	-	MTD	LTR	MaLR	-277	142	13	8
974	538	250	50	56	chr3	50994411	50994572	-108605211	+	MLT1A	LTR	MaLR	209	368	-6	8
974	359	324	20	0	chr3	50997287	50997389	-108602394	-	MTD	LTR	MaLR	-309	110	7	8
974	397	256	89	16	chr3	50999207	50999330	-108600453	-	MLT1J	LTR	MaLR	-303	209	78	8
974	818	170	77	89	chr3	50999739	50999985	-108599798	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	6	248	-329	8
974	708	168	77	42	chr3	51000000	51000193	-108599590	+	RLTR11A	LTR	ERVK	240	447	-80	1
974	400	266	9	35	chr3	51000480	51000593	-108599190	+	RLTR11A	LTR	ERVK	419	528	0	1
974	237	348	22	22	chr3	51002716	51002807	-108596976	+	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	948	1038	-30	9
974	463	289	30	30	chr3	51006877	51007041	-108592742	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-8	559	396	2
974	483	188	42	111	chr3	51009830	51009974	-108589809	+	MT2B	LTR	ERVL	145	278	-323	3
974	1284	169	90	4	chr3	51012720	51013031	-108586752	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	342	-80	4
974	2312	108	19	3	chr3	51014121	51014445	-108585338	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
974	2375	122	14	69	chr3	51014565	51014988	-108584795	+	RLTR9F	LTR	ERVK	16	415	0	4
974	303	339	8	78	chr3	51016703	51016831	-108582952	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-239	241	123	5
974	368	294	45	104	chr3	51017201	51017421	-108582362	+	RLTR25A	LTR	ERVK	2	208	-895	5
974	277	264	185	22	chr3	51018900	51019070	-108580713	+	MLT1A	LTR	MaLR	13	213	-254	6
974	293	202	32	160	chr3	51019177	51019271	-108580512	+	MLT1A	LTR	MaLR	230	311	-63	6
974	442	268	0	9	chr3	51019539	51019652	-108580131	+	RMER5	LTR	ERV1	382	493	-41	6
974	3622	74	19	4	chr3	51019919	51020394	-108579389	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	6
974	3306	196	113	52	chr3	51021581	51021934	-108577849	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	398	-504	6
974	4129	41	16	0	chr3	51021934	51022419	-108577364	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	7
974	3306	196	113	52	chr3	51022419	51022915	-108576868	+	RMER19B	LTR	ERVK	399	902	0	6
974	326	243	16	116	chr3	51024457	51024578	-108575205	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	156	7
974	1430	237	91	82	chr3	51024595	51025110	-108574673	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	15	7
974	231	204	74	0	chr3	51031289	51031343	-108568440	+	MT2B	LTR	ERVL	211	268	-333	9
974	287	260	22	115	chr3	51039076	51039215	-108560568	+	MT2B	LTR	ERVL	132	257	-344	1
974	1636	171	177	33	chr3	51039415	51039717	-108560066	+	MTC	LTR	MaLR	1	350	-71	1
974	3460	26	13	0	chr3	51039717	51040108	-108559675	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
974	1636	171	177	33	chr3	51040108	51040173	-108559610	+	MTC	LTR	MaLR	351	421	0	1
974	1199	237	116	12	chr3	51042236	51042421	-108557362	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	153	1
974	1199	237	116	12	chr3	51042497	51042640	-108557143	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-222	152	8	1
974	2819	22	5	129	chr3	51043889	51044308	-108555475	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
974	7345	102	86	20	chr3	51044308	51045534	-108554249	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	1
974	28022	21	1	1	chr3	51045532	51048804	-108550979	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3209	6481	0	1
974	2819	22	5	129	chr3	51048804	51049223	-108550560	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
974	365	195	20	152	chr3	51049875	51050026	-108549757	-	MT2B	LTR	ERVL	-326	275	145	1
974	375	275	246	6	chr3	51061877	51062060	-108537723	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	227	-152	1
974	694	78	8	23	chr3	51064729	51064860	-108534923	+	RMER17B	LTR	ERVK	332	460	-498	1
974	248	178	93	27	chr3	51068612	51068687	-108531096	+	RLTR25B	LTR	ERVK	430	509	-519	1
974	284	246	227	36	chr3	51083784	51083978	-108515805	+	MLT1F1	LTR	MaLR	307	537	-32	2
974	1273	171	175	23	chr3	51089169	51089523	-108510260	+	MTD	LTR	MaLR	1	408	-11	2
974	1109	193	70	29	chr3	51098131	51098403	-108501380	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-81	293	11	2
974	626	335	109	32	chr3	51115863	51116202	-108483581	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	365	-25	3
974	851	71	50	0	chr3	51116582	51116766	-108483017	-	RMER6A	LTR	ERVK	-516	240	1	3
975	235	294	79	93	chr3	51119161	51119300	-108480483	+	MLT1A1	LTR	MaLR	264	400	-8	3
975	270	187	44	176	chr3	51119412	51119503	-108480280	-	MT2B	LTR	ERVL	-370	231	153	3
975	429	144	0	143	chr3	51120531	51120560	-108479223	-	MT2B	LTR	ERVL	-365	236	147	3
975	2071	152	81	13	chr3	51130656	51131050	-108468733	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
975	236	302	108	45	chr3	51131105	51131176	-108468607	+	MT2B2	LTR	ERVL	175	255	-329	3
975	236	302	108	45	chr3	51131210	51131249	-108468534	+	MT2B2	LTR	ERVL	256	292	-292	3
975	349	276	10	48	chr3	51138641	51138744	-108461039	+	MTD	LTR	MaLR	193	291	-128	3
975	247	188	111	65	chr3	51140083	51140128	-108459655	+	RLTR25B	LTR	ERVK	397	445	-583	3
975	247	188	111	65	chr3	51140324	51140386	-108459397	+	RLTR25B	LTR	ERVK	446	509	-519	3
975	374	316	8	104	chr3	51147154	51147394	-108452389	+	MLT1H	LTR	MaLR	105	321	-228	4
975	3109	172	28	16	chr3	51147412	51147980	-108451803	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	4
975	2265	154	88	17	chr3	51154073	51154482	-108445301	-	RMER15	LTR	ERVL	-78	497	60	4
975	534	304	35	53	chr3	51154578	51154804	-108444979	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	351	4
975	2605	37	74	3	chr3	51155798	51156121	-108443662	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
975	614	230	52	73	chr3	51156199	51156391	-108443392	-	RMER5	LTR	ERV1	-7	527	340	4
975	1357	237	58	15	chr3	51156838	51157164	-108442619	-	RMER5	LTR	ERV1	-180	354	15	4
975	1425	149	54	96	chr3	51164630	51164963	-108434820	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	80	4
975	373	211	13	13	chr3	51165045	51165122	-108434661	+	RMER15-int	LTR	ERVL	655	731	-4268	4
975	812	245	250	11	chr3	51165221	51165489	-108434294	+	ORR1E	LTR	MaLR	26	357	-2	4
975	1946	116	137	58	chr3	51165734	51165966	-108433817	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	163	4
975	1946	116	137	58	chr3	51166114	51166246	-108433537	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-232	162	1	4
975	2081	165	63	42	chr3	51166455	51166623	-108433160	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	245	4
975	1865	131	112	9	chr3	51166623	51166954	-108432829	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	3	4
975	2081	165	63	42	chr3	51166954	51167093	-108432690	-	MTC	LTR	MaLR	-177	244	107	4
975	2081	165	63	42	chr3	51167502	51167598	-108432185	-	MTC	LTR	MaLR	-315	106	4	4
975	338	242	49	24	chr3	51168640	51168763	-108431020	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2379	2504	-2495	4
975	2414	267	96	60	chr3	51168874	51169850	-108429933	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2751	3761	-1238	4
975	3226	133	69	94	chr3	51169937	51170275	-108429508	-	RMER6A	LTR	ERVK	-34	722	345	4
975	2202	101	6	66	chr3	51170275	51170625	-108429158	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
975	3226	133	69	94	chr3	51170625	51170964	-108428819	-	RMER6A	LTR	ERVK	-412	344	62	4
975	1771	285	67	6	chr3	51172013	51172331	-108427452	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4161	4503	-496	4
975	1249	199	280	9	chr3	51172331	51172660	-108427123	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	4
975	1771	285	67	6	chr3	51172660	51172877	-108426906	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4504	4728	-271	4
975	2698	139	28	5	chr3	51172926	51173063	-108426720	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	140	-376	4
975	2698	139	28	5	chr3	51173084	51173378	-108426405	+	RMER20A	LTR	ERVK	141	441	-75	4
975	508	242	32	132	chr3	51173400	51173619	-108426164	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4777	4973	-26	4
975	314	239	188	69	chr3	51173619	51173763	-108426020	+	RMER15	LTR	ERVL	1	161	-414	4
975	401	231	69	97	chr3	51176436	51176580	-108423203	-	MLT1B	LTR	MaLR	-240	150	11	5
975	576	265	0	8	chr3	51178786	51178919	-108420864	+	MTD	LTR	MaLR	53	184	-235	5
975	232	275	49	107	chr3	51179574	51179696	-108420087	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	143	5
975	769	239	108	62	chr3	51179975	51180234	-108419549	+	RLTR18B	LTR	ERVK	24	294	-218	5
975	1237	112	28	0	chr3	51181404	51181582	-108418201	+	ORR1A3	LTR	MaLR	136	318	-8	5
975	489	317	86	6	chr3	51183578	51183740	-108416043	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	182	-177	5
975	413	237	61	20	chr3	51183978	51184077	-108415706	+	ORR1E	LTR	MaLR	277	379	0	5
975	301	242	64	86	chr3	51184780	51184920	-108414863	-	MT2B2	LTR	ERVL	-321	263	127	5
975	436	52	0	33	chr3	51187894	51187954	-108411829	+	RMER10B	LTR	ERVL	2	59	-339	5
975	690	201	68	68	chr3	51187959	51188178	-108411605	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	201	5
975	450	252	34	54	chr3	51188428	51188575	-108411208	-	MTD	LTR	MaLR	-205	216	73	5
975	289	264	176	0	chr3	51189309	51189400	-108410383	+	ORR1E	LTR	MaLR	41	147	-212	5
975	260	250	24	84	chr3	51195309	51195327	-108404456	+	MT2B2	LTR	ERVL	150	224	-357	5
975	1765	172	65	90	chr3	51203034	51203480	-108396303	+	RMER10A	LTR	ERVL	7	441	-1	6
975	250	257	133	13	chr3	51207295	51207370	-108392413	-	MLT1D	LTR	MaLR	-6	674	591	6
975	341	252	54	130	chr3	51207535	51207694	-108392089	-	MLT1D	LTR	MaLR	-423	204	59	6
975	474	175	0	12	chr3	51207729	51207810	-108391973	+	RLTR23	LTR	ERV1	5	84	-346	6
975	380	231	274	7	chr3	51208214	51208280	-108391503	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	473	6
975	380	231	274	7	chr3	51208342	51208410	-108391373	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-69	472	373	6
975	892	102	100	20	chr3	51208573	51208723	-108391060	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-370	164	3	6
975	465	243	118	26	chr3	51208729	51208881	-108390902	+	RLTR23	LTR	ERV1	265	430	0	6
975	411	185	16	122	chr3	51225105	51225228	-108374555	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	155	6
975	579	131	3	5	chr3	51226120	51226226	-108373557	+	MTD	LTR	MaLR	267	419	0	6
975	630	184	50	35	chr3	51226226	51226365	-108373418	+	MTE2a	LTR	MaLR	239	379	0	6
975	643	301	80	5	chr3	51242580	51242780	-108357003	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	215	-150	7
975	242	262	60	48	chr3	51242811	51242895	-108356888	+	MLT1A0	LTR	MaLR	324	408	0	7
975	2189	67	44	0	chr3	51245201	51245498	-108354285	-	MTB	LTR	MaLR	-90	310	1	7
976	1187	272	84	10	chr3	51256680	51257063	-108342720	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	8
976	1089	190	179	19	chr3	51264642	51264910	-108334873	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-73	311	1	8
976	1448	143	61	4	chr3	51285661	51285906	-108313877	+	RLTR15	LTR	ERVK	63	321	-38	8
976	812	144	26	17	chr3	51286198	51286342	-108313441	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	241	8
976	349	359	91	31	chr3	51286568	51286887	-108312896	+	LTR40a	LTR	ERVL	4	341	-178	8
976	299	237	144	0	chr3	51286911	51287008	-108312775	+	LTR40a	LTR	ERVL	345	455	-7	8
976	1761	127	80	19	chr3	51290351	51290663	-108309120	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-76	331	1	8
976	372	242	100	57	chr3	51290772	51290912	-108308871	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	146	-219	8
976	2232	239	69	82	chr3	51301041	51301585	-108298198	-	RLTR40	LTR	ERVK	-45	772	241	9
976	2232	239	69	82	chr3	51301948	51302185	-108297598	-	RLTR40	LTR	ERVK	-577	240	1	9
976	316	279	90	40	chr3	51304542	51304731	-108295052	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-9	586	392	9
976	2213	191	63	25	chr3	51305533	51305581	-108294202	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-53	507	455	9
976	2596	147	48	7	chr3	51305633	51306072	-108293711	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-107	456	1	9
976	543	216	204	30	chr3	51307999	51308166	-108291617	+	MTD	LTR	MaLR	204	399	-20	9
976	309	322	188	1	chr3	51315303	51315602	-108284181	+	MER74A	LTR	ERVL	215	615	-7	9
976	3484	24	63	5	chr3	51316464	51316876	-108282907	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	9
976	256	231	51	51	chr3	51325036	51325173	-108274610	-	RMER17D	LTR	ERVK	-522	367	231	9
976	241	321	171	29	chr3	51326440	51326610	-108273173	+	RMER12	LTR	ERVK	746	939	-383	9
976	1022	271	19	140	chr3	51326797	51327282	-108272501	+	RLTR11B	LTR	ERVK	2	427	-26	9
976	1420	136	229	3	chr3	51327336	51327624	-108272159	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	353	-14	9
976	410	273	104	121	chr3	51329496	51329932	-108269851	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	18	456	-72	1
976	410	297	52	126	chr3	51330135	51330207	-108269576	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	436	506	-21	1
976	293	295	53	8	chr3	51337923	51338056	-108261727	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-3	528	390	1
976	612	220	0	36	chr3	51338186	51338323	-108261460	+	MT2A	LTR	ERVL	1	132	-401	1
976	268	218	0	18	chr3	51338311	51338367	-108261416	+	MT2A	LTR	ERVL	87	141	-392	1
976	284	187	61	61	chr3	51349516	51349630	-108250153	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-518	510	397	1
976	1457	170	94	97	chr3	51359836	51360239	-108239544	+	RMER16	LTR	ERVK	132	533	0	1
976	325	288	54	25	chr3	51374168	51374331	-108225452	+	MTE2a	LTR	MaLR	159	340	-39	1
976	1020	233	57	70	chr3	51379462	51379762	-108220021	+	ORR1E	LTR	MaLR	64	359	0	1
977	278	212	30	0	chr3	51383354	51383420	-108216363	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-24	366	299	1
977	287	280	0	26	chr3	51383536	51383613	-108216170	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-281	84	10	1
977	2066	216	95	7	chr3	51384172	51384633	-108215150	+	RMER20A	LTR	ERVK	15	516	0	1
977	478	274	189	0	chr3	51388208	51388361	-108211422	+	ORR1D2	LTR	MaLR	178	359	-11	1
977	434	193	24	102	chr3	51392608	51392735	-108207048	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	141	1
977	303	301	17	156	chr3	51392775	51392811	-108206972	+	MLT1G3	LTR	MaLR	134	156	-439	1
977	2710	128	30	53	chr3	51392811	51393280	-108206503	+	RMER6B	LTR	ERVK	2	459	-2	1
977	303	301	17	156	chr3	51393280	51393416	-108206367	+	MLT1G3	LTR	MaLR	157	282	-313	1
977	1045	248	168	27	chr3	51393576	51393904	-108205879	+	MTEb	LTR	MaLR	4	377	-2	1
977	244	186	0	0	chr3	51393904	51393946	-108205837	-	MER68	LTR	ERVL	-227	336	295	1
977	233	312	129	0	chr3	51394043	51394136	-108205647	-	MER68	LTR	ERVL	-456	107	3	1
977	1999	151	35	71	chr3	51395262	51395684	-108204099	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
977	1932	128	51	9	chr3	51397632	51397948	-108201835	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
977	10920	119	41	110	chr3	51397948	51400056	-108199727	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	1963	0	1
977	2378	110	3	6	chr3	51400056	51400386	-108199397	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
977	3275	55	5	2	chr3	51401984	51402383	-108197400	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
977	1378	158	148	3	chr3	51403424	51403722	-108196061	+	ORR1C1	LTR	MaLR	38	378	0	1
977	688	125	0	139	chr3	51405448	51405606	-108194177	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	176	-218	1
977	1228	126	51	9	chr3	51405674	51405891	-108193892	+	ORR1A4	LTR	MaLR	104	329	0	1
977	1931	154	82	8	chr3	51412225	51412263	-108187520	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-15	379	342	1
977	1931	154	82	8	chr3	51412982	51413296	-108186487	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-53	341	2	1
977	462	307	57	139	chr3	51413296	51413626	-108186157	+	MLT1A	LTR	MaLR	58	358	-16	1
977	343	286	72	36	chr3	51414212	51414350	-108185433	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	149	-210	1
977	452	370	94	28	chr3	51417120	51417406	-108182377	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	55	1
977	238	235	198	0	chr3	51418222	51418303	-108181480	+	RMER21B	LTR	ERV1	480	576	-266	1
977	4478	137	18	94	chr3	51418459	51419439	-108180344	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	1
977	546	203	16	47	chr3	51419659	51419788	-108179995	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	125	-502	1
977	3023	3	5	123	chr3	51420104	51420520	-108179263	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
977	56123	28	14	4	chr3	51420522	51427060	-108172723	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	6478	-3	1
977	3023	3	5	123	chr3	51427064	51427480	-108172303	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
977	489	272	114	67	chr3	51431756	51432040	-108167743	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	405	72	1
977	697	302	83	89	chr3	51433947	51434274	-108165509	+	MTEa	LTR	MaLR	16	340	-39	1
977	269	298	48	0	chr3	51434649	51434733	-108165050	+	MLT1L	LTR	MaLR	119	206	-404	1
977	2537	131	138	24	chr3	51434865	51435685	-108164098	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	1028	0	1
977	1205	253	130	10	chr3	51437012	51437319	-108162464	+	MTEa	LTR	MaLR	36	379	0	1
977	1743	186	53	34	chr3	51437356	51437712	-108162071	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	8	1
977	606	273	25	155	chr3	51438912	51439151	-108160632	-	MTEb	LTR	MaLR	-8	371	176	1
977	2153	198	114	19	chr3	51439151	51439634	-108160149	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	1
977	606	241	23	87	chr3	51439634	51439752	-108160031	-	MTEb	LTR	MaLR	-204	175	63	1
977	300	269	213	0	chr3	51439752	51439775	-108160008	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-395	322	152	1
977	301	296	74	0	chr3	51442352	51442460	-108157323	+	RMER5	LTR	ERV1	45	160	-374	1
977	448	283	149	20	chr3	51442476	51442671	-108157112	+	RMER5	LTR	ERV1	312	531	-3	1
977	365	276	104	42	chr3	51443704	51443897	-108155886	-	MLT1B	LTR	MaLR	-8	382	178	1
977	399	291	172	64	chr3	51443992	51444430	-108155353	-	RLTR21	LTR	ERVK	-189	1215	715	1
977	1937	158	0	95	chr3	51444596	51444987	-108154796	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	1
977	663	398	53	33	chr3	51445105	51445614	-108154169	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1053	519	1	1
977	1996	108	67	3	chr3	51448519	51448816	-108150967	+	ORR1A3	LTR	MaLR	3	318	-8	1
977	354	259	69	113	chr3	51449591	51450002	-108149781	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-219	358	19	1
977	929	307	121	9	chr3	51450778	51451100	-108148683	-	MTEa	LTR	MaLR	-11	368	11	1
977	574	205	43	64	chr3	51451393	51451534	-108148249	+	MTE2a	LTR	MaLR	2	139	-240	1
977	512	213	9	18	chr3	51451528	51451638	-108148145	+	MTE2a	LTR	MaLR	271	379	0	1
977	330	250	103	70	chr3	51454111	51454386	-108145397	-	MLT1G	LTR	MaLR	-1	594	214	1
977	341	358	61	74	chr3	51454586	51454882	-108144901	+	LTR16D	LTR	ERVL	331	622	-29	1
977	245	257	42	28	chr3	51460841	51460913	-108138870	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	365	293	1
977	232	270	27	13	chr3	51470347	51470422	-108129361	-	MTE2a	LTR	MaLR	-17	362	287	1
977	250	262	97	53	chr3	51473677	51473790	-108125993	-	RLTR26	LTR	ERVK	-357	285	168	1
977	3025	118	53	33	chr3	51474071	51474581	-108125202	-	RLTR28	LTR	ERVL	-4	520	1	1
977	607	186	18	0	chr3	51475179	51475292	-108124491	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	260	1
977	2315	84	10	0	chr3	51475297	51475605	-108124178	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-16	311	1	1
977	1240	199	37	26	chr3	51475605	51475849	-108123934	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-107	267	20	1
977	1240	199	37	26	chr3	51475878	51475897	-108123886	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-355	19	1	1
977	230	118	0	0	chr3	51477014	51477048	-108122735	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-41	403	370	1
977	865	194	128	39	chr3	51478490	51478694	-108121089	+	MTEa	LTR	MaLR	4	225	-154	1
977	1953	136	88	0	chr3	51479189	51479497	-108120286	+	MTC	LTR	MaLR	1	335	-86	1
977	499	324	97	16	chr3	51490256	51490513	-108109270	-	LTR16A1	LTR	ERVL	0	456	179	1
977	2647	121	8	15	chr3	51500898	51501293	-108098490	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	1
122	996	268	59	121	chr3	51511284	51511351	-108088432	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	320	2
978	996	268	59	121	chr3	51511521	51511544	-108088239	-	MTEa	LTR	MaLR	-60	319	319	2
978	1128	219	123	60	chr3	51511709	51512058	-108087725	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	3	3
978	996	268	59	121	chr3	51512058	51512281	-108087502	-	MTEa	LTR	MaLR	-60	319	90	2
978	996	268	59	121	chr3	51512304	51512391	-108087392	-	MTEa	LTR	MaLR	-290	89	2	2
978	388	310	28	34	chr3	51513271	51513448	-108086335	+	RMER15	LTR	ERVL	388	563	-12	3
978	291	211	109	84	chr3	51515211	51515330	-108084453	+	MT2B2	LTR	ERVL	118	239	-345	3
978	2668	156	247	17	chr3	51524169	51524768	-108075015	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	5
978	2381	153	33	15	chr3	51530263	51530661	-108069122	+	RMER20B	LTR	ERVK	12	416	-211	6
978	305	200	15	30	chr3	51530699	51530766	-108069017	+	RMER20B	LTR	ERVK	562	627	0	6
978	230	413	101	23	chr3	51534365	51534623	-108065160	+	ORR1D2	LTR	MaLR	79	356	-14	7
978	983	293	46	46	chr3	51538995	51539345	-108060438	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	8	8
978	376	280	102	102	chr3	51545810	51546199	-108053584	+	MTD	LTR	MaLR	1	374	-45	9
978	765	235	231	42	chr3	51547255	51547566	-108052217	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	9
978	505	337	93	44	chr3	51551231	51551575	-108048208	+	ORR1D2	LTR	MaLR	10	370	0	1
978	328	279	111	56	chr3	51552090	51552234	-108047549	+	MLT1A1	LTR	MaLR	257	408	0	1
978	760	275	39	31	chr3	51555894	51556123	-108043660	+	MLT1B	LTR	MaLR	136	366	-24	1
978	360	342	136	56	chr3	51559181	51559519	-108040264	+	MLT1J	LTR	MaLR	101	465	-47	1
978	277	350	48	37	chr3	51572714	51572901	-108026882	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	191	-168	1
978	262	291	0	23	chr3	51573025	51573113	-108026670	+	ORR1E	LTR	MaLR	294	379	0	1
978	1878	191	16	5	chr3	51573848	51574217	-108025566	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	374	0	1
978	1325	196	18	18	chr3	51574420	51574696	-108025087	+	ORR1D1	LTR	MaLR	73	348	-26	1
978	2293	75	55	52	chr3	51576719	51577045	-108022738	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
978	1312	269	23	3	chr3	51580015	51580365	-108019418	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	1
978	363	293	63	59	chr3	51583712	51583933	-108015850	-	RMER12	LTR	ERVK	-331	991	770	1
978	316	232	29	0	chr3	51584664	51584733	-108015050	+	MLT1J1	LTR	MaLR	70	140	-304	1
978	2122	148	26	3	chr3	51585154	51585499	-108014284	-	MTC	LTR	MaLR	-68	353	1	1
978	286	297	35	18	chr3	51585595	51585708	-108014075	+	MTEa	LTR	MaLR	45	159	-220	1
978	698	286	190	10	chr3	51585624	51586013	-108013770	+	MT2A	LTR	ERVL	75	533	0	1
978	231	243	51	51	chr3	51598488	51598566	-108001217	+	RMER5	LTR	ERV1	431	508	-26	2
978	288	276	82	0	chr3	51625943	51626041	-107973742	-	ORR1E	LTR	MaLR	-253	106	1	2
979	533	279	65	45	chr3	51644252	51644520	-107955263	+	MLT1F1	LTR	MaLR	12	290	-265	2
979	871	144	150	0	chr3	51648746	51648919	-107950864	+	MTC	LTR	MaLR	11	209	-212	2
979	1127	194	33	5	chr3	51649984	51650196	-107949587	+	MTC	LTR	MaLR	196	413	-8	2
979	963	212	103	32	chr3	51651268	51651521	-107948262	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	271	-103	2
979	602	291	69	144	chr3	51652366	51652803	-107946980	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	1	2
979	2232	88	3	42	chr3	51664544	51664875	-107934908	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	319	-8	3
979	256	231	231	0	chr3	51674803	51674894	-107924889	+	MLT1B	LTR	MaLR	111	222	-168	3
979	874	259	103	42	chr3	51674908	51675267	-107924516	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-5	403	23	3
979	490	293	35	7	chr3	51675271	51675412	-107924371	+	MLT1B	LTR	MaLR	239	383	-7	3
979	454	291	154	83	chr3	51675696	51675962	-107923821	-	MLT1B	LTR	MaLR	-100	290	6	3
979	300	326	0	20	chr3	51681211	51681311	-107918472	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	98	-276	3
979	266	293	48	19	chr3	51681388	51681492	-107918291	+	MLT1A	LTR	MaLR	288	422	-22	3
979	460	283	120	91	chr3	51682002	51682453	-107917330	+	MLT1C	LTR	MaLR	4	467	0	3
979	257	259	118	25	chr3	51686817	51686936	-107912847	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	133	-226	3
979	1433	180	103	42	chr3	51691078	51691408	-107908375	+	MTD	LTR	MaLR	18	367	-52	3
979	1060	271	117	9	chr3	51695466	51695808	-107903975	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	3
979	4550	74	3	2	chr3	51696941	51697524	-107902259	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	3
979	1476	206	129	0	chr3	51703061	51703386	-107896397	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-7	367	1	3
979	294	283	121	32	chr3	51709380	51709504	-107890279	+	RMER15	LTR	ERVL	441	575	0	4
979	1718	173	56	48	chr3	51712968	51713362	-107886421	+	RMER10B	LTR	ERVL	2	398	0	4
979	557	310	35	110	chr3	51718459	51718713	-107881070	+	MLT2D	LTR	ERVL	129	363	-51	4
979	288	141	118	59	chr3	51723486	51723554	-107876229	+	MTEb	LTR	MaLR	294	365	-14	4
979	1807	206	16	19	chr3	51723801	51724167	-107875616	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-9	365	1	4
979	2399	79	31	12	chr3	51733388	51733709	-107866074	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
979	2228	109	18	6	chr3	51734026	51734357	-107865426	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	335	-2	4
979	11383	98	91	27	chr3	51734382	51736975	-107862808	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	17	2774	-3707	4
979	3148	20	0	0	chr3	51736973	51737330	-107862453	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4001	4357	-2124	4
979	5696	71	33	12	chr3	51737321	51738076	-107861707	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5709	6479	-2	4
979	2228	109	18	6	chr3	51738078	51738409	-107861374	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	335	-2	4
979	248	275	47	62	chr3	51740580	51740708	-107859075	+	MT2B	LTR	ERVL	132	257	-344	4
979	236	266	41	81	chr3	51741269	51741392	-107858391	+	RLTR25B	LTR	ERVK	404	521	-507	4
979	1945	144	31	15	chr3	51744200	51744524	-107855259	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
979	858	244	83	36	chr3	51750378	51750654	-107849129	+	MLT1A0	LTR	MaLR	76	364	-1	4
979	937	256	81	90	chr3	51752411	51752778	-107847005	+	MTE2a	LTR	MaLR	47	419	0	4
979	1470	212	121	11	chr3	51759190	51759561	-107840222	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	8	4
979	291	323	113	113	chr3	51770690	51771025	-107828758	+	ORR1D1	LTR	MaLR	28	362	-12	5
980	3215	53	8	2	chr3	51780966	51781360	-107818423	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
980	978	219	259	6	chr3	51794170	51794226	-107805557	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	352	5
980	978	219	259	6	chr3	51794258	51794522	-107805261	-	MTD	LTR	MaLR	-68	351	18	5
980	288	243	143	80	chr3	51796383	51796495	-107803288	+	MT2B	LTR	ERVL	146	264	-337	5
980	259	303	20	126	chr3	51802196	51802347	-107797436	+	RLTR25A	LTR	ERVK	442	576	-527	5
980	229	340	60	0	chr3	51823986	51824086	-107775697	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	106	-253	6
980	1172	173	29	55	chr3	51830288	51830469	-107769314	+	ORR1A2	LTR	MaLR	62	236	-91	6
980	442	66	81	126	chr3	51830469	51830556	-107769227	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	244	6
980	1893	141	56	33	chr3	51854305	51854664	-107745119	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
980	1972	136	18	51	chr3	51855306	51855639	-107744144	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	322	-4	6
980	1813	263	118	47	chr3	51857155	51858043	-107741740	-	MTD-int	LTR	MaLR	-157	941	1	6
980	1277	234	181	11	chr3	51858043	51858397	-107741386	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	6
980	832	288	146	6	chr3	51858663	51859005	-107740778	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	1	6
980	1460	211	50	16	chr3	51900292	51900615	-107699168	-	MTD	LTR	MaLR	-73	346	13	7
981	3086	131	5	119	chr3	51910469	51911059	-107688724	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	51	7
981	252	252	0	28	chr3	51912737	51912759	-107687024	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	630	732	-777	7
981	4396	114	126	82	chr3	51912843	51913711	-107686072	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	7
981	416	225	143	67	chr3	51918205	51918360	-107681423	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	179	-211	7
981	366	292	65	95	chr3	51918543	51918776	-107681007	+	MLT1A	LTR	MaLR	180	361	-29	7
981	225	285	51	127	chr3	51921399	51921556	-107678227	+	MT2B2	LTR	ERVL	143	287	-297	7
981	744	250	30	71	chr3	51922015	51922213	-107677570	-	MTE2b	LTR	MaLR	-186	193	4	7
981	1806	213	44	34	chr3	51923081	51923494	-107676289	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	7
981	442	149	0	146	chr3	51923888	51923998	-107675785	+	MT2B	LTR	ERVL	171	264	-337	8
981	1228	242	84	68	chr3	51925814	51926182	-107673601	+	MTEb	LTR	MaLR	4	377	-2	8
981	673	268	42	46	chr3	51931970	51932255	-107667528	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	284	-75	8
981	501	274	33	176	chr3	51932597	51932841	-107666942	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	213	-166	8
981	1934	163	49	46	chr3	51933075	51933545	-107666238	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	439	-519	8
981	1781	226	93	74	chr3	51933547	51934086	-107665697	+	RMER13B	LTR	ERVK	356	904	-4	8
981	233	287	154	29	chr3	51934105	51934209	-107665574	+	MTE2a	LTR	MaLR	287	403	-16	8
981	635	250	42	15	chr3	51939692	51940009	-107659774	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	384	0	8
981	1489	190	113	52	chr3	51940071	51940433	-107659350	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	8
981	232	314	45	90	chr3	51943609	51943899	-107655884	-	RMER12	LTR	ERVK	-270	1052	776	8
981	235	357	90	14	chr3	51951104	51951249	-107648534	+	LTR33	LTR	ERVL	94	249	-266	8
981	1268	303	70	67	chr3	51951209	51952199	-107647584	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-423	1086	1	8
981	589	333	62	28	chr3	51952199	51952551	-107647232	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	7	8
981	657	327	154	19	chr3	51953998	51954316	-107645467	+	MLT1A0	LTR	MaLR	11	371	-3	8
981	736	310	102	23	chr3	51956305	51956609	-107643174	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-37	328	1	8
981	1339	262	52	14	chr3	51959010	51959355	-107640428	+	ORR1D2	LTR	MaLR	7	364	-6	8
981	329	174	0	68	chr3	51960208	51960282	-107639501	+	MTEb	LTR	MaLR	278	346	-33	8
981	1715	287	99	84	chr3	51962432	51963025	-107636758	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-10	670	43	8
981	255	286	95	0	chr3	51963077	51963161	-107636622	-	LTR16B	LTR	ERVL	-371	92	1	8
981	349	263	12	8	chr3	51964894	51964993	-107634790	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	100	-319	9
981	606	291	24	48	chr3	51965213	51965419	-107634364	+	MTE2a	LTR	MaLR	165	365	-14	9
981	282	333	101	27	chr3	51975889	51976077	-107623706	+	LTR50	LTR	ERVL	479	680	-115	9
981	1063	312	42	97	chr3	51976287	51976791	-107622992	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-43	477	2	9
981	243	229	69	46	chr3	51976802	51976889	-107622894	+	LTR50	LTR	ERVL	707	795	0	9
981	243	301	100	58	chr3	51976977	51977097	-107622686	+	MLT1K	LTR	MaLR	106	230	-365	9
981	449	273	89	22	chr3	51977167	51977302	-107622481	+	MLT2B1	LTR	ERVL	42	185	-335	9
981	398	290	189	18	chr3	51991263	51991544	-107608239	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-14	356	28	9
981	1384	319	82	12	chr3	51998103	51998612	-107601171	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	595	1	9
981	1841	136	7	114	chr3	52008688	52009144	-107590639	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	4	1
981	316	283	55	55	chr3	52018007	52018153	-107581630	-	MLT1B	LTR	MaLR	-4	386	241	2
981	268	274	38	12	chr3	52018191	52018300	-107581483	-	MLT1B	LTR	MaLR	-248	117	5	2
981	619	318	52	82	chr3	52019392	52019758	-107580025	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	3	2
981	404	252	17	17	chr3	52021679	52021796	-107577987	-	MTEa	LTR	MaLR	-54	325	209	3
981	364	287	18	9	chr3	52021972	52022081	-107577702	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-2	553	444	3
981	363	270	0	60	chr3	52022084	52022218	-107577565	-	MTEa	LTR	MaLR	-253	126	1	3
981	226	225	47	59	chr3	52022434	52022519	-107577264	+	MLT1H1	LTR	MaLR	239	322	-233	3
981	407	339	62	6	chr3	52022542	52022720	-107577063	+	MLT1H1	LTR	MaLR	368	555	0	3
981	742	321	40	32	chr3	52023968	52024315	-107575468	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2090	2439	-2560	4
981	1411	124	131	38	chr3	52024790	52025115	-107574668	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	46	4
981	530	284	104	59	chr3	52025083	52025529	-107574254	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-184	344	1	4
981	801	111	0	0	chr3	52025529	52025654	-107574129	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-269	125	1	4
981	8881	157	50	129	chr3	52025654	52027786	-107571997	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1963	1	4
981	1850	189	56	19	chr3	52027786	52028163	-107571620	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	4	4
981	269	282	28	0	chr3	52028686	52028757	-107571026	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1554	1626	-3373	4
981	255	188	0	20	chr3	52029081	52029126	-107570657	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	394	351	4
981	1992	160	34	0	chr3	52029419	52029776	-107570007	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-38	369	1	4
981	2184	303	67	67	chr3	52030067	52031216	-107568567	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1987	3124	-1875	4
981	2943	164	50	4	chr3	52032820	52033358	-107566425	+	RMER15	LTR	ERVL	13	575	0	4
981	2612	111	120	0	chr3	52033862	52034286	-107565497	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
981	365	94	0	0	chr3	52034288	52034341	-107565442	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	55	-1932	5
981	1553	127	38	62	chr3	52034326	52034920	-107564863	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	10	429	-6052	5
981	3638	58	0	17	chr3	52034920	52035456	-107564327	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	211	662	-5819	5
122	2568	94	3	3	chr3	52035456	52035798	-107563985	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	5
982	6958	34	5	17	chr3	52035791	52036630	-107563153	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5651	6479	-2	5
982	2564	108	142	0	chr3	52036632	52037048	-107562735	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
982	2067	157	8	37	chr3	52037468	52037846	-107561937	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
982	2371	144	40	8	chr3	52039065	52039465	-107560318	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	6
982	1341	187	67	188	chr3	52039583	52040183	-107559600	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	2	6
982	804	311	27	27	chr3	52042040	52042087	-107557696	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-78	7700	7659	6
982	3204	46	10	5	chr3	52042087	52042481	-107557302	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
982	874	307	37	25	chr3	52042481	52042979	-107556804	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-120	7658	6909	6
982	297	225	49	24	chr3	52044211	52044293	-107555490	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-2008	5598	5515	6
982	2214	330	74	77	chr3	52044494	52047690	-107552093	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-2321	5235	1940	6
982	577	320	69	66	chr3	52047841	52048490	-107551293	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-5712	1844	1194	6
982	2028	187	133	92	chr3	52049887	52050487	-107549296	-	RMER20B	LTR	ERVK	-2	625	1	6
982	3468	108	4	18	chr3	52052562	52053118	-107546665	+	RLTR19B	LTR	ERVK	168	715	0	6
982	309	115	0	14	chr3	52054771	52054836	-107544947	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	61	-266	7
982	1831	125	22	117	chr3	52056587	52056805	-107542978	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	193	8
982	1831	125	22	117	chr3	52056882	52057116	-107542667	-	RMER17C	LTR	ERVK	-218	192	1	8
982	2046	154	72	8	chr3	52058503	52058877	-107540906	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	8
982	747	259	93	49	chr3	52059716	52060014	-107539769	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	406	80	9
982	2296	115	16	0	chr3	52060994	52061316	-107538467	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	9
982	389	304	85	37	chr3	52064080	52064326	-107535457	+	RLTR12B	LTR	ERVK	269	526	-2	1
982	2007	158	49	54	chr3	52066727	52067136	-107532647	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	1
982	260	324	43	98	chr3	52079628	52079671	-107520112	-	MT2B	LTR	ERVL	-443	158	125	1
982	268	235	15	0	chr3	52080910	52080978	-107518805	+	MTD	LTR	MaLR	247	315	-104	1
982	1119	226	92	20	chr3	52081536	52081829	-107517954	+	MTD	LTR	MaLR	2	315	-104	1
982	623	274	82	61	chr3	52081837	52082148	-107517635	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	370	56	1
982	532	180	85	158	chr3	52082221	52082386	-107517397	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-231	153	1	1
982	333	230	42	113	chr3	52090380	52090522	-107509261	-	MT2B	LTR	ERVL	-274	327	196	1
982	258	246	27	80	chr3	52092049	52092060	-107507723	-	MT2B	LTR	ERVL	-367	234	164	1
982	304	226	7	212	chr3	52094837	52094983	-107504800	-	MT2B	LTR	ERVL	-325	276	161	1
982	383	263	169	34	chr3	52098100	52098277	-107501506	-	MTE2b	LTR	MaLR	-65	314	114	1
982	1122	198	232	31	chr3	52113707	52114056	-107485727	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	1
982	494	237	23	15	chr3	52122051	52122184	-107477599	+	MTE2a	LTR	MaLR	245	378	-1	2
982	2893	95	14	2	chr3	52163506	52163926	-107435857	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-50	425	1	2
122	3145	47	39	3	chr3	52166309	52166691	-107433092	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
983	1485	212	127	6	chr3	52167596	52167942	-107431841	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	142	2
983	989	233	44	101	chr3	52167944	52168570	-107431213	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3278	2244	1870	2
983	1317	237	7	0	chr3	52168789	52169059	-107430724	-	RLTR14	LTR	ERV1	-64	318	47	2
983	270	182	25	25	chr3	52169087	52169166	-107430617	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-5160	977	899	2
983	513	204	28	0	chr3	52169376	52169484	-107430299	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4307	1215	1105	2
983	3144	52	33	13	chr3	52169627	52170017	-107429766	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	3	2
983	2246	116	3	58	chr3	52170098	52170446	-107429337	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
983	243	73	0	128	chr3	52170999	52171046	-107428737	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	600	640	-1323	2
983	676	237	108	21	chr3	52171092	52171286	-107428497	+	MT2B	LTR	ERVL	14	224	-377	2
983	3261	165	90	27	chr3	52171282	52172188	-107427595	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	328	1378	-585	2
983	1811	161	21	27	chr3	52172188	52172519	-107427264	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
983	268	181	35	172	chr3	52172519	52172540	-107427243	+	ORR1B1	LTR	MaLR	71	84	-310	2
983	271	155	32	116	chr3	52177003	52177098	-107422685	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-514	514	428	2
983	2926	38	3	11	chr3	52184513	52184862	-107414921	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	3
983	367	196	83	64	chr3	52192325	52192434	-107407349	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	154	3
983	998	292	48	62	chr3	52194288	52194646	-107405137	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	3
983	1352	174	126	43	chr3	52194646	52194995	-107404788	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-3	381	4	3
983	2470	135	73	10	chr3	52199219	52199615	-107400168	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
983	2982	100	26	7	chr3	52202765	52203187	-107396596	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	3
983	292	261	161	40	chr3	52206811	52206935	-107392848	-	RLTR14	LTR	ERV1	-19	363	225	3
983	1360	228	101	6	chr3	52212521	52212878	-107386905	+	MER31A	LTR	ERV1	1	391	-94	3
983	1591	118	24	151	chr3	52216036	52216505	-107383278	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	2	3
983	234	319	135	21	chr3	52217695	52217836	-107381947	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1310	1466	-382	3
983	649	264	12	18	chr3	52219161	52219327	-107380456	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-353	167	3	3
983	1717	132	170	25	chr3	52219947	52220121	-107379662	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	181	3
983	1717	132	170	25	chr3	52220237	52220420	-107379363	-	RMER17C	LTR	ERVK	-230	180	2	3
983	921	293	129	36	chr3	52221082	52221590	-107378193	-	LTR48B	LTR	ERV1	-48	596	4	3
983	406	296	79	83	chr3	52223032	52223297	-107376486	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	202	3
983	328	138	227	11	chr3	52223407	52223495	-107376288	-	MLT1D	LTR	MaLR	-364	141	35	3
983	1465	233	98	3	chr3	52223689	52224067	-107375716	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	3
983	335	258	113	0	chr3	52224542	52224639	-107375144	-	ORR1E	LTR	MaLR	-248	111	4	3
983	2098	158	53	81	chr3	52225330	52225527	-107374256	+	MTC	LTR	MaLR	1	210	-211	3
983	2098	158	53	81	chr3	52225674	52225909	-107373874	+	MTC	LTR	MaLR	211	421	0	3
983	453	134	0	171	chr3	52227693	52227810	-107371973	+	MTC	LTR	MaLR	1	97	-324	4
983	841	172	141	67	chr3	52228406	52228705	-107371078	+	MTC-int	LTR	MaLR	938	1258	0	4
983	1540	135	8	15	chr3	52228705	52228968	-107370815	+	MTC	LTR	MaLR	1	261	-160	4
983	361	188	14	0	chr3	52229155	52229224	-107370559	+	RMER15	LTR	ERVL	1	70	-505	4
983	2102	200	95	29	chr3	52229914	52230273	-107369510	+	RMER15	LTR	ERVL	68	461	-114	4
983	4380	18	8	0	chr3	52230273	52230762	-107369021	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
983	2102	200	95	29	chr3	52230762	52230877	-107368906	+	RMER15	LTR	ERVL	462	574	-1	4
983	342	189	8	152	chr3	52241514	52241639	-107358144	+	MT2B	LTR	ERVL	151	257	-344	4
983	343	104	0	0	chr3	52243958	52244006	-107355777	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	274	4
983	1843	109	7	11	chr3	52244146	52244433	-107355350	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-43	286	1	4
983	291	298	114	11	chr3	52246974	52247137	-107352646	-	MLT1C	LTR	MaLR	-287	180	5	4
983	2403	187	69	8	chr3	52250155	52250678	-107349105	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	336	4
983	844	190	24	6	chr3	52250702	52250866	-107348917	-	RMER19B	LTR	ERVK	-681	221	55	4
983	642	185	62	0	chr3	52250842	52250972	-107348811	-	RMER19B	LTR	ERVK	-764	138	1	4
983	304	158	65	65	chr3	52258314	52258422	-107341361	+	RLTR25B	LTR	ERVK	397	504	-524	4
983	284	130	68	55	chr3	52260747	52260814	-107338969	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	441	4
983	1462	238	70	3	chr3	52261985	52262356	-107337427	+	MTD	LTR	MaLR	1	396	-23	4
983	2253	129	28	8	chr3	52269341	52269700	-107330083	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	4
983	616	309	98	11	chr3	52274464	52274729	-107325054	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	286	4
983	1277	228	111	35	chr3	52284004	52284270	-107315513	-	MTD	LTR	MaLR	-23	396	110	5
983	1277	228	111	35	chr3	52284453	52284554	-107315229	-	MTD	LTR	MaLR	-310	109	1	5
983	396	224	0	144	chr3	52287011	52287031	-107312752	+	MT2B	LTR	ERVL	151	152	-449	5
983	1847	128	46	99	chr3	52291042	52291229	-107308554	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	184	-226	5
983	1847	128	46	99	chr3	52291407	52291652	-107308131	+	RMER17C	LTR	ERVK	185	410	0	5
983	242	338	12	83	chr3	52295936	52296104	-107303679	-	RMER4A	LTR	ERVK	-286	180	25	5
984	2885	136	30	24	chr3	52298025	52298366	-107301417	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	190	5
984	2885	136	30	24	chr3	52298416	52298572	-107301211	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-339	189	29	5
984	536	269	27	7	chr3	52298976	52299126	-107300657	+	MLT2C2	LTR	ERVL	1	153	-311	5
984	467	337	75	39	chr3	52299202	52299235	-107300548	+	MLT2C2	LTR	ERVL	133	164	-300	5
984	467	337	75	39	chr3	52299353	52299600	-107300183	+	MLT2C2	LTR	ERVL	165	423	-41	5
984	258	306	30	30	chr3	52300158	52300259	-107299524	+	MTEa	LTR	MaLR	278	378	-1	5
984	1073	293	92	40	chr3	52301919	52302267	-107297516	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	1	5
984	226	268	49	0	chr3	52302316	52302398	-107297385	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	618	703	-1105	5
984	2207	178	43	32	chr3	52311645	52312086	-107287697	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	5
984	3492	25	5	0	chr3	52318219	52318613	-107281170	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
984	1754	152	137	24	chr3	52319678	52319826	-107279957	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	176	-198	5
984	1754	152	137	24	chr3	52319880	52320067	-107279716	+	ORR1D1	LTR	MaLR	177	374	0	5
984	306	296	0	204	chr3	52326655	52326812	-107272971	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-270	138	14	5
984	2083	107	24	30	chr3	52336855	52337092	-107262691	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	92	6
984	2083	107	24	30	chr3	52337625	52337716	-107262067	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-236	91	1	6
984	1888	243	23	8	chr3	52342086	52342567	-107257216	+	MT2A	LTR	ERVL	1	488	-45	6
984	802	279	125	3	chr3	52348623	52348911	-107250872	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	50	6
984	2445	116	104	0	chr3	52357220	52357575	-107242208	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	392	-2	6
984	247	286	91	0	chr3	52357585	52357662	-107242121	+	MLT1B	LTR	MaLR	236	319	-71	6
984	573	292	103	37	chr3	52361352	52361732	-107238051	-	MLT2D	LTR	ERVL	-8	406	2	6
984	1284	225	93	23	chr3	52365603	52366045	-107233738	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	473	-54	6
984	399	257	151	100	chr3	52366696	52367046	-107232737	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	6
984	1032	254	37	61	chr3	52376300	52376677	-107223106	+	RLTR14	LTR	ERV1	15	382	0	6
984	311	266	0	12	chr3	52376734	52376814	-107222969	-	MTEb	LTR	MaLR	-38	341	263	6
984	839	293	70	46	chr3	52380039	52380408	-107219375	+	MTD	LTR	MaLR	3	380	-39	6
984	1635	169	171	60	chr3	52387192	52387589	-107212194	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	441	0	7
984	1534	239	50	18	chr3	52391314	52391714	-107208069	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	5	7
984	284	262	62	47	chr3	52392217	52392345	-107207438	+	MER67D	LTR	ERV1	69	198	-316	7
984	312	268	186	9	chr3	52392534	52392647	-107207136	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-231	134	2	7
984	338	295	50	68	chr3	52395265	52395487	-107204296	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	165	7
984	1011	238	128	3	chr3	52396438	52396720	-107203063	-	MT2A	LTR	ERVL	-216	317	1	7
984	1179	165	5	0	chr3	52397024	52397224	-107202559	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	178	7
984	454	290	144	65	chr3	52397228	52397567	-107202216	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-1	367	2	7
984	896	149	25	0	chr3	52397660	52397821	-107201962	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-213	165	1	7
984	1422	134	321	3	chr3	52399797	52400096	-107199687	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
984	923	280	58	97	chr3	52401613	52402147	-107197636	+	MLT2B1	LTR	ERVL	5	517	-3	7
984	3112	146	35	63	chr3	52412119	52412710	-107187073	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	7
984	370	320	72	54	chr3	52418955	52419106	-107180677	-	MLT1D	LTR	MaLR	-427	200	38	7
984	370	317	69	63	chr3	52419314	52419362	-107180421	-	MLT1D	LTR	MaLR	-461	44	2	7
984	2596	155	35	44	chr3	52419659	52420225	-107179558	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	7
984	583	279	21	81	chr3	52420686	52420861	-107178922	+	MLT1D	LTR	MaLR	275	439	-66	7
984	583	279	21	81	chr3	52420999	52421057	-107178726	+	MLT1D	LTR	MaLR	440	494	-11	7
985	329	294	224	29	chr3	52429524	52429734	-107170049	+	MLT1J1	LTR	MaLR	55	305	-139	7
985	5074	192	69	49	chr3	52432078	52433119	-107166664	+	RMER12	LTR	ERVK	1	1057	-265	7
985	5074	192	69	49	chr3	52433158	52433177	-107166606	+	RMER12	LTR	ERVK	1058	1071	-251	7
985	5074	192	69	49	chr3	52433212	52433446	-107166337	+	RMER12	LTR	ERVK	1072	1322	0	7
985	818	305	90	25	chr3	52453739	52454093	-107145690	+	MLT1A0	LTR	MaLR	5	361	-4	8
985	564	285	162	57	chr3	52454847	52455188	-107144595	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	377	1	8
985	384	235	105	40	chr3	52457976	52458100	-107141683	+	MLT1B	LTR	MaLR	259	390	0	8
985	320	250	34	43	chr3	52460454	52460571	-107139212	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	244	8
985	230	135	0	0	chr3	52462601	52462638	-107137145	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	37	-373	8
985	2209	121	112	8	chr3	52462863	52463220	-107136563	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	8
985	2378	166	58	48	chr3	52468232	52468751	-107131032	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	524	0	8
985	2479	173	72	42	chr3	52469626	52470170	-107129613	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	1	8
985	264	203	17	17	chr3	52470171	52470231	-107129552	-	MTEb	LTR	MaLR	-10	369	310	8
985	1094	261	59	39	chr3	52470272	52470403	-107129380	-	MTEb	LTR	MaLR	-66	313	178	8
985	1094	261	59	39	chr3	52470660	52470834	-107128949	-	MTEb	LTR	MaLR	-202	177	2	8
985	1067	328	82	29	chr3	52474754	52475206	-107124577	-	MTE-int	LTR	MaLR	-993	587	112	8
985	326	316	154	6	chr3	52478435	52478591	-107121192	-	MLT1B	LTR	MaLR	-210	180	2	8
985	571	291	92	30	chr3	52481723	52482084	-107117699	+	MLT1G	LTR	MaLR	2	394	-201	8
985	649	269	72	53	chr3	52482225	52482433	-107117350	+	MLT1G	LTR	MaLR	357	568	-23	8
985	497	265	89	58	chr3	52483321	52483545	-107116238	+	RLTR14	LTR	ERV1	152	382	0	8
985	1829	166	108	3	chr3	52485677	52485805	-107113978	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	153	-214	8
985	1829	166	108	3	chr3	52485860	52486063	-107113720	+	ORR1B2	LTR	MaLR	154	367	0	8
985	601	298	169	20	chr3	52486469	52486764	-107113019	+	MLT1A	LTR	MaLR	18	356	-18	8
985	424	347	90	63	chr3	52488354	52488689	-107111094	+	MLT1E2	LTR	MaLR	198	541	-86	8
985	422	367	26	84	chr3	52495982	52496363	-107103420	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	8
985	1232	79	42	0	chr3	52502337	52502527	-107097256	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	331	4
985	1673	199	172	95	chr3	52503526	52503571	-107096212	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	489	6
985	1673	199	172	95	chr3	52503613	52504062	-107095721	-	MT2A	LTR	ERVL	-45	488	2	6
985	1132	289	83	0	chr3	52507361	52507710	-107092073	+	MTEb	LTR	MaLR	1	378	-1	1
985	400	264	117	70	chr3	52508135	52508306	-107091477	-	MTEa	LTR	MaLR	-200	179	1	1
985	510	298	168	58	chr3	52510706	52511152	-107088631	+	MLT1H	LTR	MaLR	53	547	-2	1
985	230	303	110	29	chr3	52511742	52511878	-107087905	-	ORR1E	LTR	MaLR	-212	147	1	1
985	3431	137	29	15	chr3	52523562	52524156	-107075627	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	602	-426	3
985	3028	34	5	0	chr3	52524170	52524554	-107075229	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	11	396	0	3
985	486	336	56	26	chr3	52528288	52528591	-107071192	-	MLT1M	LTR	MaLR	-231	441	130	3
985	1633	124	16	140	chr3	52535811	52536175	-107063608	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	319	1	4
985	233	236	11	53	chr3	52537307	52537401	-107062382	+	MLT1A	LTR	MaLR	74	163	-211	4
985	245	297	0	39	chr3	52537908	52537985	-107061798	-	MTEa	LTR	MaLR	-57	322	249	4
985	1062	240	14	78	chr3	52540235	52540529	-107059254	+	MTEb	LTR	MaLR	49	323	-56	5
985	269	219	31	0	chr3	52540642	52540706	-107059077	+	MTEb	LTR	MaLR	314	379	0	5
985	372	71	54	0	chr3	52549793	52549849	-107049934	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	271	6
985	1740	123	7	10	chr3	52549898	52550186	-107049597	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-42	287	1	6
985	2270	110	26	0	chr3	52551170	52551515	-107048268	-	MTC	LTR	MaLR	-67	354	1	7
986	1605	136	66	158	chr3	52561387	52561825	-107037958	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	8
986	902	300	51	19	chr3	52565445	52565758	-107034025	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-37	371	49	9
986	1230	281	57	25	chr3	52569326	52569728	-107030055	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	1
986	2472	89	9	0	chr3	52576145	52576469	-107023314	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
986	321	329	0	31	chr3	52578821	52578964	-107020819	-	MLT1J	LTR	MaLR	-312	200	31	1
986	719	156	0	0	chr3	52580951	52581073	-107018710	+	ORR1C2	LTR	MaLR	263	384	0	1
986	2422	81	9	0	chr3	52590013	52590335	-107009448	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	1
986	390	289	92	104	chr3	52590605	52590946	-107008837	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	372	-18	1
986	236	311	100	8	chr3	52598000	52598120	-107001663	-	LTR40b	LTR	ERVL	-30	432	302	1
986	2162	104	0	109	chr3	52599889	52600255	-106999528	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	1
986	1342	158	45	4	chr3	52605862	52606129	-106993654	+	RMER15	LTR	ERVL	1	278	-297	1
986	1470	151	38	8	chr3	52606221	52606488	-106993295	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	298	1
986	228	301	12	35	chr3	52619979	52620065	-106979718	-	MLT1I	LTR	MaLR	-10	401	318	1
986	292	270	65	8	chr3	52622273	52622393	-106977390	+	MLT1E2	LTR	MaLR	513	625	-2	1
986	753	302	93	63	chr3	52637365	52637741	-106962042	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	172	1
986	1672	167	111	12	chr3	52637741	52638075	-106961708	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	1
986	753	302	93	63	chr3	52638075	52638108	-106961675	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-389	171	139	1
986	1843	195	78	5	chr3	52638121	52638507	-106961276	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	1	1
986	310	264	141	23	chr3	52638507	52638632	-106961151	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-420	140	1	1
986	3334	51	2	0	chr3	52649833	52650228	-106949555	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
986	8057	62	9	69	chr3	52650228	52651396	-106948387	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
986	3480	18	10	0	chr3	52651396	52651788	-106947995	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
986	2335	125	3	8	chr3	52658310	52658688	-106941095	+	RLTR14	LTR	ERV1	7	382	0	2
986	1566	138	59	92	chr3	52661607	52662031	-106937752	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	2
986	499	212	152	52	chr3	52665801	52666070	-106933713	-	RMER20B	LTR	ERVK	-235	392	97	2
986	331	260	123	103	chr3	52671841	52671945	-106927838	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	479	2
986	331	260	123	103	chr3	52672006	52672047	-106927736	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-90	478	420	2
986	751	168	138	66	chr3	52672046	52672261	-106927522	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-315	253	5	2
986	507	275	43	54	chr3	52675926	52676276	-106923507	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	346	-13	2
986	1803	136	21	0	chr3	52678404	52678691	-106921092	-	MTC	LTR	MaLR	-128	293	1	2
986	533	259	164	80	chr3	52680416	52680880	-106918903	+	MER34	LTR	ERV1	1	544	-43	2
986	1046	239	82	79	chr3	52681278	52681656	-106918127	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	2
987	2644	147	52	12	chr3	52692237	52692733	-106907050	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	1	2
987	226	352	164	6	chr3	52701630	52701807	-106897976	-	LTR88c	LTR	Genie?	-562	300	96	2
987	439	352	85	18	chr3	52706140	52706481	-106893302	-	MLT1L	LTR	MaLR	-29	581	218	2
987	388	266	152	25	chr3	52712218	52712415	-106887368	-	RMER15	LTR	ERVL	-13	562	341	2
987	226	200	0	156	chr3	52712934	52713011	-106886772	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	312	2
987	759	209	120	123	chr3	52713062	52713229	-106886554	+	MTE2a	LTR	MaLR	13	181	-198	2
987	759	209	120	123	chr3	52713303	52713468	-106886315	+	MTE2a	LTR	MaLR	182	343	-36	2
987	3212	164	76	19	chr3	52713476	52714054	-106885729	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	3
987	236	214	13	103	chr3	52726278	52726356	-106873427	+	MTE2a	LTR	MaLR	289	359	-20	3
987	943	228	167	9	chr3	52727284	52727620	-106872163	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	31	3
987	359	311	70	79	chr3	52735790	52736132	-106863651	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	21	3
987	442	353	24	24	chr3	52739127	52739336	-106860447	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	209	-296	3
987	577	156	108	15	chr3	52743225	52743355	-106856428	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	280	3
987	788	104	75	100	chr3	52743357	52743517	-106856266	-	MTC	LTR	MaLR	-265	156	1	3
987	1125	238	129	23	chr3	52748699	52749095	-106850688	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-96	438	1	3
987	413	353	17	90	chr3	52753747	52754046	-106845737	+	MLT1A	LTR	MaLR	98	374	0	3
987	917	316	208	34	chr3	52761549	52762654	-106837129	-	MTE-int	LTR	MaLR	-106	1474	178	3
987	752	194	75	37	chr3	52764676	52764890	-106834893	-	RMER10A	LTR	ERVL	-6	436	215	3
987	285	227	38	51	chr3	52771173	52771252	-106828531	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-285	85	8	3
987	1561	198	118	65	chr3	52772430	52772949	-106826834	+	RMER4B	LTR	ERVK	20	529	-56	3
987	588	260	233	91	chr3	52791367	52791697	-106808086	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	3
987	2794	32	266	3	chr3	52798217	52798593	-106801190	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
987	281	232	132	61	chr3	52801393	52801590	-106798193	+	RLTR15	LTR	ERVK	69	279	-80	4
987	1394	208	58	0	chr3	52803750	52804058	-106795725	+	MTD	LTR	MaLR	2	327	-92	4
987	407	271	115	43	chr3	52805571	52805779	-106794004	+	MTEa	LTR	MaLR	25	247	-132	4
987	350	189	33	11	chr3	52805765	52805856	-106793927	+	MTEb	LTR	MaLR	186	278	-101	4
987	402	265	152	78	chr3	52808243	52808351	-106791432	-	MTD	LTR	MaLR	-21	398	264	4
987	402	265	152	78	chr3	52808410	52808649	-106791134	-	MTD	LTR	MaLR	-156	263	27	4
987	381	355	91	25	chr3	52811999	52812360	-106787423	+	MLT1E2	LTR	MaLR	6	390	-237	4
987	960	240	62	84	chr3	52815218	52815735	-106784048	+	MT2B	LTR	ERVL	1	593	-8	4
988	777	319	67	20	chr3	52822339	52822684	-106777099	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	1	4
988	340	329	43	7	chr3	52823152	52823290	-106776493	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-494	5173	5031	4
988	441	274	28	115	chr3	52825684	52826006	-106773777	+	RMER17C	LTR	ERVK	85	378	-32	4
988	1024	244	49	25	chr3	52826395	52826681	-106773102	+	MT2A	LTR	ERVL	1	293	-240	4
988	1648	265	26	26	chr3	52827944	52828401	-106771382	+	MT2A	LTR	ERVL	3	459	-74	4
988	1578	190	279	2	chr3	52829554	52829970	-106769813	+	MT2A	LTR	ERVL	3	533	0	4
988	2003	165	49	30	chr3	52832052	52832375	-106767408	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	75	4
988	2003	165	49	30	chr3	52832558	52832639	-106767144	-	MTC	LTR	MaLR	-347	74	1	4
988	529	288	112	48	chr3	52835755	52836069	-106763714	+	RMER15	LTR	ERVL	207	540	-35	4
988	301	326	56	35	chr3	52836201	52836344	-106763439	+	MLT1A0	LTR	MaLR	49	194	-171	4
988	234	303	95	74	chr3	52836474	52836663	-106763120	+	MLT1A0	LTR	MaLR	167	359	-15	4
988	2051	178	10	29	chr3	52861017	52861429	-106738354	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	4	5
988	323	304	224	61	chr3	52870684	52870752	-106729031	+	MTEa	LTR	MaLR	1	82	-297	5
988	323	304	224	61	chr3	52870807	52871064	-106728719	+	MTEa	LTR	MaLR	83	379	0	5
988	563	288	39	0	chr3	52875134	52875287	-106724496	-	ORR1E	LTR	MaLR	-198	161	3	5
988	491	336	143	11	chr3	52881594	52881943	-106717840	-	LTR16B	LTR	ERVL	-68	395	1	5
988	403	316	15	0	chr3	52883146	52883282	-106716501	+	MLT1B	LTR	MaLR	40	177	-213	5
988	442	318	54	49	chr3	52884314	52884621	-106715162	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	49	5
988	2170	80	19	0	chr3	52885339	52885652	-106714131	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
988	273	308	143	0	chr3	52885673	52885764	-106714019	+	ORR1E	LTR	MaLR	32	135	-224	5
988	289	268	59	75	chr3	52896563	52896922	-106702861	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	323	-36	5
988	2368	120	7	70	chr3	52898785	52899197	-106700586	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	5
988	246	321	12	12	chr3	52900321	52900403	-106699380	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	365	284	5
988	452	287	100	18	chr3	52914515	52914735	-106685048	+	MLT1B	LTR	MaLR	120	357	-33	5
988	2838	16	3	0	chr3	52917340	52917661	-106682122	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
988	41293	28	8	7	chr3	52917661	52922499	-106677284	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	1	5
988	2838	16	3	0	chr3	52922499	52922820	-106676963	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
988	306	271	98	0	chr3	52925105	52925227	-106674556	-	MLT1K	LTR	MaLR	0	595	462	6
988	1702	19	0	5	chr3	52925243	52925458	-106674325	+	ORR1A0	LTR	MaLR	133	346	0	6
988	7298	68	28	12	chr3	52925458	52926926	-106672857	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1154	-638	6
988	275	271	104	0	chr3	52930232	52930328	-106669455	+	MLT1A0	LTR	MaLR	216	321	-44	6
988	1736	208	11	74	chr3	52942602	52942666	-106657117	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	355	6
988	1736	208	11	74	chr3	52942688	52943069	-106656714	-	MTD	LTR	MaLR	-65	354	2	6
988	768	265	131	19	chr3	52943850	52944170	-106655613	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	15	6
988	266	373	57	0	chr3	52945766	52945943	-106653840	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-55	310	124	6
988	408	245	51	115	chr3	52950938	52951065	-106648718	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-76	491	375	6
988	2308	83	9	61	chr3	52951065	52951410	-106648373	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
988	408	245	51	115	chr3	52951410	52951439	-106648344	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-193	374	345	6
988	377	271	104	16	chr3	52951508	52951650	-106648133	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-345	175	20	6
988	1741	217	63	3	chr3	52952397	52952776	-106647007	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	6
989	523	219	11	26	chr3	52955559	52955692	-106644091	-	MTEb	LTR	MaLR	-27	352	212	6
989	743	213	188	35	chr3	52955818	52956047	-106643736	-	MTEb	LTR	MaLR	-115	264	1	6
989	3647	112	118	45	chr3	52956710	52957353	-106642430	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	6
989	2225	73	16	0	chr3	52966478	52966792	-106632991	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	6
989	2270	140	6	8	chr3	52967367	52967727	-106632056	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	6
989	1960	127	57	86	chr3	52971698	52972095	-106627688	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	387	-7	6
989	1836	131	22	103	chr3	52972095	52972453	-106627330	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	6
989	2323	75	120	3	chr3	52975380	52975729	-106624054	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	6
989	1236	204	48	48	chr3	52979401	52979558	-106620225	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-53	321	163	6
989	1325	124	262	14	chr3	52979558	52979852	-106619931	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
989	1236	204	48	48	chr3	52979852	52980008	-106619775	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-212	162	8	6
989	3024	77	43	3	chr3	52984921	52985312	-106614471	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
989	1939	182	119	27	chr3	52986466	52986946	-106612837	-	RMER15	LTR	ERVL	-25	550	27	6
989	382	330	117	33	chr3	52997225	52997677	-106602106	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1203	4554	4065	6
989	263	296	85	25	chr3	52998024	52998142	-106601641	+	MLT2B4	LTR	ERVL	18	142	-414	6
989	637	300	68	145	chr3	53016527	53017294	-106582489	-	LTR82A	LTR	ERVL	-141	731	24	1
989	231	238	125	0	chr3	53021073	53021153	-106578630	-	MLT1C	LTR	MaLR	-297	170	81	2
989	358	334	164	33	chr3	53032280	53032639	-106567144	-	LTR33B	LTR	ERVL	-32	471	66	3
989	479	230	168	55	chr3	53036680	53036882	-106562901	+	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	397	621	-7	4
989	832	271	54	98	chr3	53039650	53039986	-106559797	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	321	-58	4
989	3949	107	49	40	chr3	53042938	53043534	-106556249	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	4
989	1152	225	130	25	chr3	53046729	53047053	-106552730	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	359	0	5
989	357	291	73	13	chr3	53047107	53047257	-106552526	+	LTR82A	LTR	ERVL	233	391	-481	5
989	324	300	91	40	chr3	53048059	53048086	-106551697	+	LTR82A	LTR	ERVL	650	676	-196	5
989	324	300	91	40	chr3	53048126	53048275	-106551508	+	LTR82A	LTR	ERVL	677	836	-36	5
989	324	300	91	40	chr3	53048459	53048479	-106551304	+	LTR82A	LTR	ERVL	837	855	-17	5
989	2145	213	38	32	chr3	53050006	53050534	-106549249	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	4	5
989	313	315	55	41	chr3	53051384	53051717	-106548066	+	MTEb	LTR	MaLR	29	379	0	6
989	3466	25	5	0	chr3	53054761	53055155	-106544628	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
989	1237	259	83	22	chr3	53055247	53055693	-106544090	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	45	6
989	2723	59	101	0	chr3	53058212	53058569	-106541214	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	4	7
989	2408	135	24	20	chr3	53061416	53061825	-106537958	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	8
989	303	302	58	78	chr3	53074601	53074996	-106524787	+	RLTR12B	LTR	ERVK	112	498	-30	1
990	2423	160	40	5	chr3	53086888	53087291	-106512492	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	1
990	320	284	18	81	chr3	53088351	53088462	-106511321	+	MLT1A0	LTR	MaLR	17	120	-245	1
990	868	247	137	39	chr3	53091376	53091713	-106508070	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
990	452	254	44	0	chr3	53091760	53091873	-106507910	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	118	-292	1
990	4104	162	60	11	chr3	53091873	53092653	-106507130	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	818	-42	1
990	766	196	171	27	chr3	53092638	53092895	-106506888	+	RMER17C	LTR	ERVK	117	410	0	1
990	721	232	187	15	chr3	53098566	53098839	-106500944	-	MTEb	LTR	MaLR	-38	341	22	1
990	1918	199	29	21	chr3	53100026	53100401	-106499382	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
990	1570	151	138	84	chr3	53100538	53100930	-106498853	+	RMER4A	LTR	ERVK	54	466	0	1
990	477	205	106	11	chr3	53102015	53102185	-106497598	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	199	1
990	3866	117	56	32	chr3	53107329	53108020	-106491763	+	RLTR19B	LTR	ERVK	3	710	-5	1
990	4494	164	32	24	chr3	53109853	53110746	-106489037	+	RLTR25A	LTR	ERVK	7	907	-196	1
990	4714	161	57	69	chr3	53110800	53111635	-106488148	+	RLTR25A	LTR	ERVK	21	882	-221	1
990	4714	161	57	69	chr3	53111675	53111753	-106488030	+	RLTR25A	LTR	ERVK	883	939	-164	1
990	4714	161	57	69	chr3	53111788	53111970	-106487813	+	RLTR25A	LTR	ERVK	940	1102	-1	1
990	845	226	118	52	chr3	53112474	53112763	-106487020	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	62	1
990	474	325	25	0	chr3	53113784	53113944	-106485839	-	LTR40a	LTR	ERVL	-355	164	1	1
990	2442	161	44	12	chr3	53116721	53117129	-106482654	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
990	403	296	13	0	chr3	53117689	53117827	-106481956	+	MER74A	LTR	ERVL	16	194	-428	1
990	2319	134	58	39	chr3	53118762	53119174	-106480609	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	1
990	271	318	53	20	chr3	53120127	53120278	-106479505	-	MLT1C	LTR	MaLR	-33	434	279	1
990	863	197	129	14	chr3	53123039	53123431	-106476352	-	MT2A	LTR	ERVL	0	601	1	1
990	842	298	73	13	chr3	53125163	53125466	-106474317	+	MLT1B	LTR	MaLR	3	323	-67	1
990	301	306	86	76	chr3	53127586	53127784	-106471999	+	MTEb	LTR	MaLR	64	263	-116	1
990	407	119	60	0	chr3	53130011	53130078	-106469705	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	308	1
990	1638	181	47	68	chr3	53130253	53130595	-106469188	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-44	334	1	1
990	428	340	72	104	chr3	53141400	53141661	-106458122	-	MLT2D	LTR	ERVL	-52	362	93	2
990	428	340	72	104	chr3	53141807	53141919	-106457864	-	MLT2D	LTR	ERVL	-322	92	1	2
990	226	256	12	47	chr3	53142649	53142735	-106457048	-	MLT1I	LTR	MaLR	-90	321	239	2
990	266	339	42	0	chr3	53142786	53142904	-106456879	-	MLT1I	LTR	MaLR	-288	123	1	2
990	2705	138	22	8	chr3	53144235	53144730	-106455053	-	RLTR28	LTR	ERVL	-21	503	2	2
990	2408	245	91	33	chr3	53146943	53147822	-106451961	+	RMER13A	LTR	ERVK	14	848	-12	2
990	278	256	133	50	chr3	53147987	53148168	-106451615	-	RMER2	LTR	ERV1	-5	562	367	2
990	730	223	122	46	chr3	53148189	53148405	-106451378	-	RMER2	LTR	ERV1	-299	268	1	2
990	275	318	54	23	chr3	53148916	53149045	-106450738	-	RMER15	LTR	ERVL	-19	556	424	2
990	4148	75	5	0	chr3	53150538	53151111	-106448672	-	MT2B2	LTR	ERVL	-8	576	1	2
990	1033	171	55	9	chr3	53161460	53161555	-106438228	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	413	2
990	1033	171	55	9	chr3	53161610	53161733	-106438050	-	RLTR16	LTR	ERVK	-93	412	279	2
990	1384	203	3	42	chr3	53161787	53162126	-106437657	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	318	2
990	2856	92	19	24	chr3	53162346	53162768	-106437015	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-2	420	1	2
990	2637	216	22	42	chr3	53163209	53163832	-106435951	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
990	1436	238	23	136	chr3	53164891	53165047	-106434736	+	RMER19C	LTR	ERVK	142	283	-328	2
990	1436	238	23	136	chr3	53165194	53165567	-106434216	+	RMER19C	LTR	ERVK	284	611	0	2
990	279	333	50	57	chr3	53166588	53166728	-106433055	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-329	240	102	2
990	276	306	35	0	chr3	53166804	53166889	-106432894	+	HERV16-int	LTR	ERVL	361	448	-4548	2
990	4366	17	0	0	chr3	53167598	53168080	-106431703	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	2
990	38124	37	13	15	chr3	53168080	53172859	-106426924	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	0	4690	1	2
990	4229	21	2	4	chr3	53172859	53173342	-106426441	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	2
990	315	285	141	63	chr3	53179208	53179414	-106420369	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	127	348	-1039	2
990	262	281	44	11	chr3	53179550	53179640	-106420143	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	850	942	-445	2
990	304	262	24	0	chr3	53180285	53180369	-106419414	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	374	289	2
990	264	348	73	6	chr3	53182543	53182708	-106417075	-	MLT1D	LTR	MaLR	-308	197	22	2
990	347	280	87	40	chr3	53182883	53183032	-106416751	-	ORR1E	LTR	MaLR	-179	180	25	2
990	2285	91	31	12	chr3	53186907	53187228	-106412555	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
990	493	32	0	0	chr3	53188065	53188127	-106411656	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	258	2
990	1994	67	0	22	chr3	53188287	53188562	-106411221	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-58	269	1	2
990	488	275	40	28	chr3	53189434	53189610	-106410173	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	213	2
990	1843	159	17	82	chr3	53189696	53190100	-106409683	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	512	0	2
990	269	319	213	5	chr3	53190100	53190277	-106409506	-	MLT1B	LTR	MaLR	-172	218	3	2
990	1406	231	57	8	chr3	53190450	53190803	-106408980	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	5	2
990	1182	131	208	23	chr3	53192618	53192883	-106406900	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	117	2
990	468	223	239	32	chr3	53192930	53193148	-106406635	-	RLTR23	LTR	ERV1	-167	263	1	2
990	495	284	213	36	chr3	53194285	53194700	-106405083	+	RMER5	LTR	ERV1	46	534	0	2
990	1791	172	63	6	chr3	53198561	53198923	-106400860	-	MTD	LTR	MaLR	-25	394	12	3
990	1578	182	48	56	chr3	53200088	53200501	-106399282	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	3
990	2422	117	32	18	chr3	53200501	53200924	-106398859	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2764	3
990	2258	134	113	12	chr3	53201304	53201728	-106398055	-	RMER19C	LTR	ERVK	-144	467	1	3
990	370	241	8	87	chr3	53201820	53201947	-106397836	-	RLTR23	LTR	ERV1	-3	427	311	3
990	758	286	112	32	chr3	53209321	53209668	-106390115	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	375	-39	3
990	277	319	82	14	chr3	53209899	53210045	-106389738	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	243	3
990	2309	174	38	26	chr3	53212333	53212829	-106386954	+	RLTR16	LTR	ERVK	4	505	0	3
990	2835	150	22	6	chr3	53213449	53213939	-106385844	+	RLTR16	LTR	ERVK	4	501	-4	3
991	1481	208	175	63	chr3	53215362	53215871	-106383912	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	2	3
991	431	239	103	26	chr3	53217190	53217345	-106382438	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	167	-314	3
991	325	284	86	20	chr3	53217521	53217672	-106382111	+	RLTR28B	LTR	ERVL	183	343	-138	3
991	792	295	24	48	chr3	53226795	53227090	-106372693	+	MTD	LTR	MaLR	2	289	-130	3
991	503	273	18	89	chr3	53227121	53227290	-106372493	+	MTD	LTR	MaLR	263	419	0	3
991	239	310	128	45	chr3	53237867	53238046	-106361737	-	ORR1E	LTR	MaLR	-165	194	1	3
991	2040	162	53	19	chr3	53240414	53240791	-106358992	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	32	3
991	321	256	12	49	chr3	53240796	53240878	-106358905	-	MTC	LTR	MaLR	-340	81	3	3
991	4481	170	106	107	chr3	53240884	53242143	-106357640	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1	3
991	1582	149	62	32	chr3	53242143	53242444	-106357339	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	84	3
991	1346	279	47	16	chr3	53242848	53243274	-106356509	+	MER54B	LTR	ERVL	340	778	-15	3
991	612	268	65	0	chr3	53243567	53243720	-106356063	-	MTEa	LTR	MaLR	-216	163	1	3
991	500	230	8	90	chr3	53245827	53245961	-106353822	+	MTC-int	LTR	MaLR	230	352	-906	3
991	1616	98	260	0	chr3	53248457	53248742	-106351041	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	3
991	980	203	171	11	chr3	53250236	53250500	-106349283	+	ORR1D1	LTR	MaLR	16	321	-53	3
991	2552	198	60	76	chr3	53250589	53251331	-106348452	+	MTC-int	LTR	MaLR	387	1258	0	3
991	1128	151	85	24	chr3	53251338	53251549	-106348234	+	MTC	LTR	MaLR	8	231	-190	3
991	348	264	50	94	chr3	53260979	53261138	-106338645	+	MLT1C	LTR	MaLR	282	433	-34	3
991	1615	226	118	6	chr3	53261805	53262278	-106337505	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	2	527	0	3
991	2296	194	89	116	chr3	53271461	53272090	-106327693	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	612	-416	4
991	377	155	14	40	chr3	53272072	53272146	-106327637	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1032	1103	0	4
991	225	275	100	0	chr3	53276397	53276477	-106323306	-	MLT1F	LTR	MaLR	-3	545	458	4
991	609	295	242	8	chr3	53276624	53276996	-106322787	-	MLT1F	LTR	MaLR	-82	466	8	4
991	2196	112	12	18	chr3	53286585	53286913	-106312870	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
991	929	219	101	40	chr3	53287444	53287768	-106312015	-	RLTR15	LTR	ERVK	-73	286	9	4
991	1018	233	180	20	chr3	53291185	53291535	-106308248	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	14	4
991	265	192	39	0	chr3	53293769	53293820	-106305963	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	482	4
991	5499	120	150	7	chr3	53293820	53294785	-106304998	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1103	0	4
991	355	333	35	79	chr3	53294978	53295180	-106304603	-	RMER5	LTR	ERV1	-308	226	34	4
991	376	333	66	6	chr3	53298685	53298851	-106300932	+	MER89	LTR	ERV1	1	176	-383	4
991	995	212	21	43	chr3	53310923	53311143	-106288640	-	MTD	LTR	MaLR	-162	257	6	4
991	1206	162	21	10	chr3	53312452	53312598	-106287185	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	242	-168	4
991	1206	159	13	21	chr3	53312750	53312919	-106286864	+	RMER17C	LTR	ERVK	243	410	0	4
991	471	314	6	60	chr3	53314393	53314559	-106285224	-	MTEa	LTR	MaLR	-218	161	5	5
991	2737	174	45	12	chr3	53314559	53315065	-106284718	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	523	-54	5
992	269	294	54	0	chr3	53348425	53348517	-106251266	+	LTR79	LTR	ERVL	1	97	-430	5
992	226	241	52	0	chr3	53352280	53352338	-106247445	+	RMER15	LTR	ERVL	3	63	-512	5
992	1457	186	166	5	chr3	53352383	53352793	-106246990	+	RMER15	LTR	ERVL	27	502	-73	5
992	308	290	152	78	chr3	53353149	53353418	-106246365	+	MLT1B	LTR	MaLR	94	382	-8	5
992	1771	179	37	29	chr3	53358418	53358759	-106241024	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	347	-31	5
992	2141	148	101	0	chr3	53358759	53359117	-106240666	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
992	1771	179	37	29	chr3	53359117	53359149	-106240634	+	ORR1C1	LTR	MaLR	348	377	-1	5
992	1179	229	119	16	chr3	53360303	53360681	-106239102	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	5
992	815	289	130	13	chr3	53360776	53361091	-106238692	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	2	5
992	794	236	0	11	chr3	53366887	53367071	-106232712	+	MTD	LTR	MaLR	55	236	-183	5
992	3716	64	13	6	chr3	53374061	53374533	-106225250	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	5
992	1728	184	78	16	chr3	53380688	53381075	-106218708	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	6
992	591	248	182	14	chr3	53381116	53381438	-106218345	-	MER89	LTR	ERV1	-85	474	2	6
992	376	267	10	80	chr3	53382815	53382972	-106216811	+	MLT1A0	LTR	MaLR	253	408	0	6
992	2036	101	28	81	chr3	53400563	53400994	-106198789	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	408	-2	6
992	832	228	95	10	chr3	53407782	53408066	-106191717	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	378	-1	6
992	367	161	103	21	chr3	53409255	53409357	-106190426	-	MTEb	LTR	MaLR	-18	361	226	6
992	2490	181	2	2	chr3	53409582	53410003	-106189780	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
992	3449	33	5	0	chr3	53417636	53418030	-106181753	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
992	3676	84	2	6	chr3	53422905	53423382	-106176401	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	6
992	2418	64	39	0	chr3	53423382	53423694	-106176089	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-3	324	1	6
992	278	333	40	10	chr3	53425300	53425400	-106174383	+	MER74A	LTR	ERVL	21	123	-435	6
992	429	309	117	6	chr3	53425408	53425640	-106174143	+	MER74A	LTR	ERVL	215	501	-121	6
992	377	288	20	54	chr3	53426192	53426269	-106173514	-	MTE-int	LTR	MaLR	-54	1526	1456	6
992	4610	161	47	38	chr3	53426269	53427169	-106172614	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	6
992	377	288	20	54	chr3	53427169	53427238	-106172545	-	MTE-int	LTR	MaLR	-125	1455	1385	6
992	334	344	8	102	chr3	53428989	53429225	-106170558	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	216	-289	6
992	301	308	192	0	chr3	53429901	53430047	-106169736	+	MLT1D	LTR	MaLR	330	503	-2	6
992	2150	210	192	13	chr3	53467082	53467690	-106132093	-	RMER19A	LTR	ERVK	-20	717	1	7
992	3250	128	29	10	chr3	53468736	53469250	-106130533	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	524	0	7
992	423	250	50	44	chr3	53470130	53470289	-106129494	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2066	3648	3489	7
993	2937	91	13	2	chr3	53483873	53484269	-106115514	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	7
993	375	280	92	13	chr3	53484269	53484421	-106115362	-	MTE2a	LTR	MaLR	-207	172	9	7
993	265	213	26	26	chr3	53484866	53484943	-106114840	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	330	7
993	239	299	90	60	chr3	53492697	53492864	-106106919	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	203	7
993	2435	92	46	11	chr3	53492865	53493237	-106106546	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	23	7
993	468	247	93	35	chr3	53493298	53493470	-106106313	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-192	182	1	7
993	853	134	120	17	chr3	53497125	53497300	-106102483	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	193	-174	7
993	297	236	0	0	chr3	53497449	53497504	-106102279	+	ORR1B2	LTR	MaLR	324	378	0	7
993	1259	237	17	92	chr3	53497504	53497853	-106101930	+	ORR1E	LTR	MaLR	13	335	-24	7
993	665	304	5	5	chr3	53500640	53500832	-106098951	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	193	-186	2
993	2255	156	44	15	chr3	53501754	53501782	-106098001	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	394	6
993	3422	40	2	0	chr3	53501782	53502177	-106097606	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
993	2255	156	44	15	chr3	53502177	53502557	-106097226	-	MTC	LTR	MaLR	-28	393	1	6
993	1654	185	214	18	chr3	53502726	53503183	-106096600	+	RMER15	LTR	ERVL	29	575	0	8
993	3565	23	0	132	chr3	53526870	53527371	-106072412	+	RLTR10C	LTR	ERVK	2	436	0	3
993	438	210	20	10	chr3	53533382	53533483	-106066300	+	MLT1D	LTR	MaLR	400	501	-4	4
993	2057	175	20	15	chr3	53536633	53537038	-106062745	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
993	1997	173	259	17	chr3	53537344	53537827	-106061956	+	MT2B	LTR	ERVL	2	601	0	4
993	294	354	59	28	chr3	53538022	53538344	-106061439	-	MER57C2	LTR	ERV1	-65	369	25	4
993	1452	182	196	6	chr3	53544216	53544558	-106055225	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	1	5
993	768	111	16	114	chr3	53546343	53546536	-106053247	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	174	-236	6
993	6270	53	38	2	chr3	53546539	53547408	-106052375	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	30	929	0	6
993	1107	132	8	93	chr3	53547408	53547673	-106052110	+	RMER17C	LTR	ERVK	169	410	0	6
993	1134	236	135	13	chr3	53552359	53552722	-106047061	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	6	7
993	1604	217	211	7	chr3	53558689	53559130	-106040653	+	MT2A	LTR	ERVL	3	533	0	8
993	1107	207	132	35	chr3	53561058	53561398	-106038385	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	5	9
993	358	279	77	8	chr3	53565540	53565670	-106034113	+	MLT1N2	LTR	MaLR	352	490	-72	9
993	228	180	43	116	chr3	53568516	53568585	-106031198	+	RMER13A	LTR	ERVK	205	268	-592	1
993	325	355	74	35	chr3	53568531	53568814	-106030969	-	MLT1H	LTR	MaLR	-219	330	37	1
993	360	287	0	29	chr3	53569727	53569831	-106029952	-	MTEa	LTR	MaLR	-276	103	3	1
993	425	346	57	6	chr3	53573983	53574160	-106025623	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-15	580	395	1
993	235	320	98	56	chr3	53574393	53574727	-106025056	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-14	365	19	1
993	672	299	52	80	chr3	53574985	53575371	-106024412	+	MTEa	LTR	MaLR	1	375	-4	1
993	1153	233	70	63	chr3	53578518	53578833	-106020950	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	48	1
993	1814	178	70	117	chr3	53578833	53579087	-106020696	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	256	-272	1
993	3369	53	8	2	chr3	53579087	53579485	-106020298	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
993	1814	178	70	117	chr3	53579528	53579823	-106019960	+	RLTR11A	LTR	ERVK	257	528	0	1
993	305	130	18	36	chr3	53579823	53579876	-106019907	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-317	53	2	1
993	1035	275	49	125	chr3	53592545	53592952	-106006831	+	MTE2a	LTR	MaLR	4	379	0	1
993	672	270	73	71	chr3	53592952	53593247	-106006536	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	1	280	-978	1
993	464	304	70	91	chr3	53593274	53593307	-106006476	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	281	321	-937	1
993	766	315	100	38	chr3	53593319	53593639	-106006144	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	747	1086	-494	1
993	227	211	0	34	chr3	53596253	53596312	-106003471	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	352	1
993	2047	142	115	0	chr3	53602429	53602768	-105997015	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
993	257	130	87	0	chr3	53604837	53604883	-105994900	+	MTEa	LTR	MaLR	1	50	-329	1
993	258	352	80	58	chr3	53606099	53606325	-105993458	+	LTR16D2	LTR	ERVL	237	467	-105	1
994	276	221	12	83	chr3	53616866	53616950	-105982833	-	RLTR18	LTR	ERVK	-343	273	196	1
994	681	273	80	42	chr3	53616988	53617225	-105982558	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-245	267	22	1
994	2328	158	7	40	chr3	53618154	53618386	-105981397	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	227	-180	1
994	2324	133	14	3	chr3	53618386	53618740	-105981043	+	RLTR15	LTR	ERVK	2	359	0	1
994	2328	158	7	40	chr3	53618740	53618928	-105980855	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	228	407	0	1
994	254	330	37	0	chr3	53619132	53619250	-105980533	-	MER90	LTR	ERV1	-97	517	356	1
994	3315	68	5	0	chr3	53619278	53619672	-105980111	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
994	3274	89	16	71	chr3	53619672	53619755	-105980028	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1047	1
994	3274	89	16	71	chr3	53619900	53620362	-105979421	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-52	1046	583	1
994	596	346	31	27	chr3	53620421	53620682	-105979101	+	MER90a	LTR	ERV1	81	342	-272	1
994	5062	96	27	59	chr3	53620876	53621652	-105978131	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	1
994	250	326	20	0	chr3	53621670	53621768	-105978015	+	MLT1A0	LTR	MaLR	11	110	-255	1
994	410	326	177	20	chr3	53631947	53632297	-105967486	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2039	2443	-3271	2
994	262	333	116	22	chr3	53632785	53632923	-105966860	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2951	3101	-2613	2
994	258	257	14	41	chr3	53633358	53633431	-105966352	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4619	4689	-978	2
994	262	187	98	108	chr3	53635005	53635107	-105964676	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-186	842	742	2
994	4189	166	65	96	chr3	53635184	53635604	-105964179	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-156	947	506	2
994	4189	166	65	96	chr3	53635748	53635790	-105963993	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-598	505	505	2
994	4189	166	65	96	chr3	53635981	53636489	-105963294	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-598	505	6	2
994	3194	183	65	6	chr3	53639452	53640127	-105959656	+	RLTR40	LTR	ERVK	39	753	-64	2
994	361	206	15	0	chr3	53646533	53646601	-105953182	+	RLTR40	LTR	ERVK	746	814	-3	2
994	2148	123	33	45	chr3	53650289	53650620	-105949163	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
994	449	355	108	50	chr3	53654013	53654336	-105945447	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	18	2
994	1551	162	107	66	chr3	53657761	53658125	-105941658	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	6	2
994	630	276	76	79	chr3	53669239	53669476	-105930307	-	RMER21B	LTR	ERV1	-275	567	325	2
994	630	276	76	79	chr3	53669499	53669552	-105930231	-	RMER21B	LTR	ERV1	-518	324	279	2
994	254	203	28	99	chr3	53669604	53669675	-105930108	-	RMER21B	LTR	ERV1	-776	66	1	2
994	508	232	62	72	chr3	53670009	53670204	-105929579	+	RMER10A	LTR	ERVL	234	426	-16	2
994	375	323	6	37	chr3	53674897	53675061	-105924722	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-329	7449	7291	2
994	2168	129	162	32	chr3	53675487	53675888	-105923895	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	2
994	317	219	118	45	chr3	53676364	53676474	-105923309	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2159	3978	3861	2
994	520	243	5	91	chr3	53676709	53676895	-105922888	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2456	3681	3512	2
994	338	245	121	100	chr3	53676905	53677145	-105922638	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2947	3190	2946	2
994	641	227	59	108	chr3	53677372	53677716	-105922067	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3557	2580	2026	2
994	1012	242	99	43	chr3	53678112	53678505	-105921278	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4003	1519	1105	2
994	269	349	47	23	chr3	53680202	53680331	-105919452	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	251	2
994	2216	52	3	33	chr3	53682105	53682405	-105917378	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-74	291	1	2
994	534	252	18	83	chr3	53684356	53684525	-105915258	+	RLTR20A	LTR	ERVK	384	541	0	2
994	2515	182	52	37	chr3	53685279	53685798	-105913985	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	2
994	3912	66	21	110	chr3	53691703	53692265	-105907518	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	2
994	2511	114	204	46	chr3	53692643	53693103	-105906680	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	2
994	332	264	54	11	chr3	53703904	53703996	-105895787	-	MT2A	LTR	ERVL	-401	132	37	3
994	354	155	17	0	chr3	53707273	53707331	-105892452	+	MTC	LTR	MaLR	60	118	-303	3
994	2320	177	47	7	chr3	53708533	53708938	-105890845	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
994	1523	195	46	59	chr3	53708942	53708962	-105890821	+	MTC-int	LTR	MaLR	5	24	-1234	3
994	1592	163	10	205	chr3	53708962	53709371	-105890412	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
994	1523	201	56	65	chr3	53709371	53709799	-105889984	+	MTC-int	LTR	MaLR	25	523	-575	3
994	3387	191	139	29	chr3	53710240	53710813	-105888970	+	MTC-int	LTR	MaLR	350	1001	-257	3
994	3387	191	139	29	chr3	53710841	53711086	-105888697	+	MTC-int	LTR	MaLR	1002	1257	-1	3
994	816	211	44	29	chr3	53711092	53711297	-105888486	+	MTC	LTR	MaLR	7	214	-207	3
994	1949	132	13	108	chr3	53711305	53711695	-105888088	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	393	-1	3
994	933	209	19	28	chr3	53711695	53711896	-105887887	+	MTC	LTR	MaLR	214	412	-9	3
994	2338	132	85	3	chr3	53712209	53712573	-105887210	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	3
994	3249	58	15	2	chr3	53713139	53713534	-105886249	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
994	2004	119	6	59	chr3	53718189	53718527	-105881256	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	2	3
994	335	268	114	18	chr3	53727494	53727608	-105872175	-	RMER15	LTR	ERVL	-152	423	299	3
994	933	254	121	66	chr3	53728369	53728748	-105871035	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	5	3
994	854	298	95	40	chr3	53729147	53729570	-105870213	+	MLT1D	LTR	MaLR	44	489	-16	3
994	5032	156	159	78	chr3	53730293	53731516	-105868267	+	RMER12	LTR	ERVK	1	1322	0	3
994	3213	48	0	3	chr3	53733702	53734060	-105865723	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	3
994	291	352	228	27	chr3	53737022	53737276	-105862507	-	MLT1H	LTR	MaLR	-46	503	199	3
995	1742	128	86	13	chr3	53746975	53747277	-105852506	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	-21	324	1	3
995	2520	74	6	63	chr3	53747818	53748165	-105851618	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
995	1980	175	38	14	chr3	53749161	53749526	-105850257	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
995	7878	178	73	32	chr3	53754607	53755104	-105844679	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-2	1846	1349	3
995	7878	178	73	32	chr3	53755141	53756254	-105843529	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-500	1348	160	3
995	7878	178	73	32	chr3	53756310	53756470	-105843313	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1689	159	4	3
995	849	279	46	115	chr3	53760734	53761107	-105838676	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	347	-12	4
995	527	328	78	32	chr3	53763499	53763998	-105835785	+	MLT1E2	LTR	MaLR	105	639	-15	4
995	928	305	26	55	chr3	53774195	53774606	-105825177	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	405	-14	4
995	244	341	33	0	chr3	53781378	53781469	-105818314	+	MTEa	LTR	MaLR	15	108	-271	4
995	280	369	62	49	chr3	53782504	53782729	-105817054	+	MLT1J2	LTR	MaLR	9	236	-212	4
995	244	393	83	45	chr3	53783029	53783317	-105816466	+	MLT1J2-int	LTR	MaLR	79	377	-1010	4
995	233	211	36	55	chr3	53785460	53785515	-105814268	+	MLT2C2	LTR	ERVL	217	270	-194	4
995	1875	131	24	56	chr3	53786321	53786662	-105813121	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-24	370	41	4
995	1570	180	26	15	chr3	53787366	53787687	-105812096	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	61	4
995	1233	179	49	199	chr3	53796493	53796945	-105802838	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	4
995	1747	141	18	75	chr3	53797976	53798361	-105801422	+	RLTR11B	LTR	ERVK	91	453	0	4
995	317	320	61	130	chr3	53810151	53810413	-105789370	-	ORR1E	LTR	MaLR	-17	342	99	4
995	570	368	54	30	chr3	53811397	53811769	-105788014	-	LTR40a	LTR	ERVL	0	519	139	4
995	2982	119	25	2	chr3	53817104	53817552	-105782231	-	RMER6B	LTR	ERVK	-3	458	1	4
995	270	346	84	13	chr3	53818088	53818243	-105781540	+	LTR16E1	LTR	ERVL	347	512	-26	4
995	1164	245	42	71	chr3	53818519	53819005	-105780778	+	MT2B	LTR	ERVL	1	568	-33	4
995	3074	85	0	2	chr3	53826098	53826499	-105773284	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
995	305	333	28	51	chr3	53827291	53827468	-105772315	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-118	1690	1518	5
995	3158	162	65	31	chr3	53827470	53828195	-105771588	-	RMER12	LTR	ERVK	-476	846	1	5
995	989	235	5	138	chr3	53828923	53829230	-105770553	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	152	5
995	1753	248	22	15	chr3	53836670	53837072	-105762711	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	5
995	538	152	179	0	chr3	53837430	53837542	-105762241	-	RLTR15	LTR	ERVK	-227	132	1	5
995	1779	242	37	7	chr3	53840002	53840406	-105759377	+	MTD	LTR	MaLR	1	416	-3	5
995	1300	200	61	129	chr3	53845930	53846464	-105753319	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	5
995	1972	125	14	22	chr3	53851775	53852180	-105747603	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	394	1	5
995	472	282	73	6	chr3	53855780	53855944	-105743839	+	MT2A	LTR	ERVL	2	176	-357	5
995	320	202	84	75	chr3	53856084	53856191	-105743592	+	MT2A	LTR	ERVL	332	439	-94	5
995	333	360	40	54	chr3	53868753	53869050	-105730733	+	ORR1E	LTR	MaLR	51	343	-16	5
996	376	325	130	30	chr3	53871232	53871432	-105728351	+	LTR33C	LTR	ERVL	62	281	-348	5
996	468	299	75	79	chr3	53871452	53871714	-105728069	+	ORR1E	LTR	MaLR	33	306	-53	5
996	460	190	31	0	chr3	53875692	53875791	-105723992	-	RMER19A	LTR	ERVK	-508	229	136	5
996	390	190	87	79	chr3	53875912	53876038	-105723745	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	611	5
996	1766	238	33	179	chr3	53876055	53876880	-105722903	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	34	5
996	1956	148	132	27	chr3	53879692	53880209	-105719574	-	RMER6A	LTR	ERVK	-4	752	220	5
996	1863	137	31	25	chr3	53880349	53880672	-105719111	-	RMER6A	LTR	ERVK	-431	325	1	5
996	238	314	116	39	chr3	53881327	53881418	-105718365	+	MLT2B3	LTR	ERVL	413	514	-40	5
996	238	314	116	39	chr3	53881472	53881509	-105718274	+	MLT2B3	LTR	ERVL	515	551	-3	5
996	3720	15	5	0	chr3	53891709	53892103	-105707680	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
996	3359	62	10	2	chr3	53894617	53895019	-105704764	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-2	405	1	6
996	628	318	110	12	chr3	53896835	53897163	-105702620	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	365	0	6
996	700	250	41	15	chr3	53899137	53899332	-105700451	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	176	6
996	1225	279	59	33	chr3	53902853	53903243	-105696540	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	20	6
996	1720	126	87	186	chr3	53904811	53905338	-105694445	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
996	1299	258	91	6	chr3	53905859	53906221	-105693562	+	MTD	LTR	MaLR	5	397	-22	6
996	1561	187	107	0	chr3	53906213	53906512	-105693271	-	MTC	LTR	MaLR	-89	332	2	6
996	260	194	38	41	chr3	53906512	53906567	-105693216	+	MTD	LTR	MaLR	339	405	-14	6
996	1098	254	129	22	chr3	53908916	53909279	-105690504	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	6
996	308	298	149	0	chr3	53915741	53915902	-105683881	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-223	185	1	6
996	1213	254	39	20	chr3	53916378	53916726	-105683057	+	MTD	LTR	MaLR	41	379	0	6
996	3412	58	2	2	chr3	53917482	53917878	-105681905	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
996	281	291	108	82	chr3	53920002	53920241	-105679542	+	MTEb	LTR	MaLR	94	359	-20	6
996	861	267	61	102	chr3	53932997	53933053	-105666730	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	317	6
996	861	267	61	102	chr3	53933091	53933426	-105666357	-	MTE2b	LTR	MaLR	-63	316	2	6
996	1675	217	65	18	chr3	53935257	53935655	-105664128	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	6
996	1351	264	23	66	chr3	53938429	53938823	-105660960	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	379	0	6
996	3213	207	75	28	chr3	53939307	53940096	-105659687	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1819	4318	3493	6
996	1762	176	12	12	chr3	53940252	53940575	-105659208	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2948	3189	2867	6
996	238	249	21	63	chr3	53940765	53940875	-105658908	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-390	178	76	6
996	1981	224	68	36	chr3	53941078	53941490	-105658293	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3261	2876	2449	6
996	1981	224	68	36	chr3	53941523	53941637	-105658146	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3689	2448	2333	6
996	273	233	0	0	chr3	53941709	53941769	-105658014	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3808	2329	2270	6
996	1064	206	94	7	chr3	53941827	53942115	-105657668	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4755	1382	1070	6
996	348	253	12	0	chr3	53942259	53942342	-105657441	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5164	973	890	6
996	475	291	113	25	chr3	53948609	53948813	-105650970	+	MLT1A1	LTR	MaLR	120	341	-67	7
996	933	166	61	25	chr3	53952259	53952457	-105647326	+	BGLII_B	LTR	ERVK	2	206	-235	7
996	1170	188	65	21	chr3	53952439	53952719	-105647064	+	MTD	LTR	MaLR	123	400	-19	7
996	326	244	94	70	chr3	53952764	53952892	-105646891	+	MTEb	LTR	MaLR	162	292	-87	7
996	1902	195	69	8	chr3	53970713	53971105	-105628678	+	MTD	LTR	MaLR	4	419	0	7
996	242	342	140	103	chr3	53971377	53971648	-105628135	-	ORR1E	LTR	MaLR	-55	304	24	7
996	3647	14	0	2	chr3	53972943	53973376	-105626407	+	MERVL-int	LTR	ERVL	239	670	-4815	7
996	884	279	42	42	chr3	53976063	53976347	-105623436	+	MTEa	LTR	MaLR	6	289	-90	7
996	241	292	19	68	chr3	53977897	53978000	-105621783	-	LTR16A	LTR	ERVL	-313	138	41	7
996	1075	196	39	18	chr3	53979729	53979958	-105619825	+	MTD	LTR	MaLR	172	405	-14	7
996	298	345	56	92	chr3	53980428	53980734	-105619049	+	ORR1E	LTR	MaLR	20	314	-56	7
996	254	220	31	62	chr3	53989905	53990002	-105609781	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-507	521	428	7
996	1348	194	112	14	chr3	53991424	53991711	-105608072	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	102	7
996	367	229	48	0	chr3	53991925	53992008	-105607775	-	MTD	LTR	MaLR	-322	99	13	7
997	233	356	112	9	chr3	54009028	54009144	-105590639	+	ORR1E	LTR	MaLR	15	142	-217	7
997	2141	93	18	12	chr3	54009391	54009718	-105590065	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	8
997	675	210	0	7	chr3	54019381	54019525	-105580258	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-203	143	1	2
997	314	367	7	20	chr3	54020996	54021149	-105578634	-	RLTR17	LTR	ERVK	-266	426	276	2
997	240	346	101	32	chr3	54021140	54021328	-105578455	-	RLTR16	LTR	ERVK	-271	234	34	2
997	435	221	20	25	chr3	54024249	54024363	-105575420	+	MTEb	LTR	MaLR	216	325	-54	2
997	236	319	32	108	chr3	54037000	54037158	-105562625	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	148	-211	4
997	979	299	50	11	chr3	54043651	54044013	-105555770	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	4	5
997	1894	127	36	62	chr3	54049432	54049768	-105550015	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
997	1151	69	0	139	chr3	54051231	54051433	-105548350	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-153	174	1	6
997	1052	201	212	32	chr3	54054649	54054989	-105544794	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	5	7
997	1182	223	16	144	chr3	54055979	54056403	-105543380	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	7
997	456	340	118	24	chr3	54057547	54057927	-105541856	+	MLT1C	LTR	MaLR	52	467	0	7
997	1172	273	93	67	chr3	54058819	54059057	-105540726	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	275	7
997	1172	273	93	67	chr3	54059244	54059467	-105540316	-	MT2A	LTR	ERVL	-259	274	60	7
997	280	238	28	34	chr3	54059414	54059558	-105540225	-	MTE2a	LTR	MaLR	-277	142	2	8
997	325	202	0	200	chr3	54059579	54059684	-105540099	+	MT2B	LTR	ERVL	157	240	-361	8
997	1039	253	150	15	chr3	54069264	54069605	-105530178	+	MTD	LTR	MaLR	13	399	-20	9
997	3224	28	2	17	chr3	54079696	54080037	-105519746	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	341	-55	1
997	3599	30	2	5	chr3	54080037	54080434	-105519349	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
997	3224	28	2	17	chr3	54080434	54080494	-105519289	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	342	396	0	1
997	1534	233	65	23	chr3	54088105	54088504	-105511279	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	4	1
997	3372	65	2	2	chr3	54089156	54089555	-105510228	+	MTB	LTR	MaLR	1	399	-1	1
997	315	279	43	79	chr3	54089618	54089758	-105510025	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	245	1
997	2112	185	11	13	chr3	54092581	54092959	-105506824	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	2	1
997	298	325	65	41	chr3	54093791	54093961	-105505822	-	LTR40a	LTR	ERVL	-154	365	192	1
997	1077	168	92	0	chr3	54100486	54100682	-105499101	-	RMER4B	LTR	ERVK	-371	214	1	1
997	1638	209	15	84	chr3	54107087	54107479	-105492304	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-13	365	1	1
997	5361	217	79	26	chr3	54107479	54108780	-105491003	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	0	1370	1	1
997	316	180	16	0	chr3	54108790	54108851	-105490932	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-316	62	1	1
997	1231	241	181	35	chr3	54115575	54116056	-105483727	-	RMER4B	LTR	ERVK	-15	570	20	1
997	450	303	82	14	chr3	54120937	54121084	-105478699	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	223	1
997	225	244	149	11	chr3	54121082	54121095	-105478688	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-416	99	1	1
997	225	236	54	27	chr3	54121095	54121169	-105478614	-	MTEa	LTR	MaLR	-303	76	1	1
997	288	236	0	114	chr3	54131933	54132038	-105467745	+	RMER15	LTR	ERVL	336	428	-147	1
998	1886	179	48	37	chr3	54133634	54133844	-105465939	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	175	1
998	1886	179	48	37	chr3	54133901	54134068	-105465715	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-210	174	5	1
998	1840	180	96	0	chr3	54134443	54134777	-105465006	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	2	1
998	1350	263	55	48	chr3	54136725	54137220	-105462563	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	5	502	-25	1
998	956	305	104	65	chr3	54148898	54149160	-105450623	+	MT2A	LTR	ERVL	1	244	-289	2
998	3666	30	0	0	chr3	54149607	54150002	-105449781	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	2
998	9766	27	13	0	chr3	54150002	54150400	-105449383	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	700	2
998	9766	27	13	0	chr3	54150420	54151105	-105448678	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-399	699	2	2
998	3689	28	0	0	chr3	54151105	54151501	-105448282	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
998	956	305	104	65	chr3	54151969	54152217	-105447566	+	MT2A	LTR	ERVL	245	530	-3	2
998	331	286	66	57	chr3	54153120	54153331	-105446452	+	LTR52	LTR	ERVL	203	415	-6	2
998	709	274	69	102	chr3	54155812	54156174	-105443609	-	MTE2a	LTR	MaLR	-19	360	11	2
998	230	270	65	43	chr3	54161710	54161803	-105437980	-	LTR33A	LTR	ERVL	-296	224	130	2
998	403	296	179	48	chr3	54204235	54204487	-105395296	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	289	-85	2
998	239	283	32	48	chr3	54206163	54206289	-105393494	-	RMER12	LTR	ERVK	-472	850	727	2
998	297	333	95	0	chr3	54206380	54206506	-105393277	+	MLT1A0	LTR	MaLR	9	146	-219	2
998	272	273	18	108	chr3	54208512	54208623	-105391160	+	MT2B	LTR	ERVL	169	269	-332	2
998	262	335	12	88	chr3	54223899	54224069	-105375714	+	RMER4B	LTR	ERVK	7	163	-422	3
998	979	249	47	150	chr3	54239513	54239985	-105359798	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	8	3
998	293	266	102	80	chr3	54241421	54241552	-105358231	-	MTEb	LTR	MaLR	-57	322	164	3
998	683	324	111	75	chr3	54241759	54242383	-105357400	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	646	-214	3
998	685	217	0	51	chr3	54245241	54245416	-105354367	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	462	3
998	2267	132	44	68	chr3	54252125	54252508	-105347275	+	ORR1C1	LTR	MaLR	5	378	0	3
998	5086	232	63	36	chr3	54252508	54252690	-105347093	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	15	221	-1149	3
998	1909	147	5	126	chr3	54252690	54253064	-105346719	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	3
998	5086	232	63	36	chr3	54253064	54253939	-105345844	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	222	1127	-243	3
998	3753	20	2	0	chr3	54253939	54254334	-105345449	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
998	5086	232	63	36	chr3	54254334	54254592	-105345191	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1128	1370	0	3
998	1769	179	77	11	chr3	54254597	54254947	-105344836	+	ORR1C1	LTR	MaLR	6	378	0	3
998	234	268	60	24	chr3	54255408	54255492	-105344291	+	MLT1J	LTR	MaLR	71	157	-355	3
998	277	284	52	10	chr3	54256296	54256392	-105343391	+	MLT1J	LTR	MaLR	71	170	-342	3
998	2710	160	40	31	chr3	54258166	54258426	-105341357	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	272	3
998	2180	122	41	49	chr3	54258426	54258771	-105341012	+	ORR1A1	LTR	MaLR	5	346	0	3
998	2710	160	40	31	chr3	54258771	54259032	-105340751	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-256	271	1	3
998	746	261	88	95	chr3	54262701	54263211	-105336572	+	RLTR12B	LTR	ERVK	42	500	-27	3
999	916	231	142	94	chr3	54267698	54268037	-105331746	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	1	3
999	260	234	94	0	chr3	54274634	54274698	-105325085	-	MTD	LTR	MaLR	-308	111	42	3
999	420	152	46	29	chr3	54274732	54274830	-105324953	+	MTD	LTR	MaLR	278	419	0	3
999	287	361	21	53	chr3	54278413	54278603	-105321180	-	LTR86C	LTR	ERVL	-27	594	411	4
999	2814	120	10	280	chr3	54278711	54279487	-105320296	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	4
999	4182	78	5	24	chr3	54286248	54286842	-105312941	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1430	2012	-4125	4
999	4638	16	0	12	chr3	54287157	54287656	-105312127	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
999	2216	164	5	11	chr3	54292744	54293121	-105306662	+	RLTR14	LTR	ERV1	7	381	-1	4
999	463	372	60	53	chr3	54295349	54295667	-105304116	+	MLT1I	LTR	MaLR	48	367	-44	4
999	317	222	46	13	chr3	54295716	54295815	-105303968	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	280	4
999	281	210	16	16	chr3	54295980	54296043	-105303740	-	MTD	LTR	MaLR	-89	330	268	4
999	260	207	0	79	chr3	54296067	54296130	-105303653	-	MTC	LTR	MaLR	-363	58	1	4
999	424	252	53	20	chr3	54301730	54301880	-105297903	-	LTR55	LTR	ERV	-362	186	32	4
999	354	266	147	8	chr3	54304632	54304763	-105295020	+	MLT1A0	LTR	MaLR	30	183	-225	4
999	2661	162	47	137	chr3	54304768	54305000	-105294783	-	RMER20B	LTR	ERVK	-2	625	416	4
999	2661	162	47	137	chr3	54305259	54305713	-105294070	-	RMER20B	LTR	ERVK	-212	415	1	4
999	354	275	56	104	chr3	54309246	54309514	-105290269	+	RMER15	LTR	ERVL	319	573	-2	4
999	237	318	115	19	chr3	54312330	54312487	-105287296	-	RMER15	LTR	ERVL	-52	523	352	4
999	232	232	36	0	chr3	54313169	54313225	-105286558	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-310	60	3	4
999	1020	261	140	3	chr3	54315248	54315541	-105284242	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	44	4
999	793	281	46	0	chr3	54316193	54316389	-105283394	+	MTE2b	LTR	MaLR	140	344	-35	4
999	1894	179	59	59	chr3	54321862	54322271	-105277512	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	8	4
999	668	184	17	116	chr3	54323612	54323780	-105276003	+	MTD	LTR	MaLR	8	158	-261	4
999	1723	161	157	27	chr3	54324306	54324644	-105275139	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	4
999	291	262	26	97	chr3	54324923	54325037	-105274746	+	RMER15	LTR	ERVL	368	473	-102	4
999	327	261	150	18	chr3	54325144	54325257	-105274526	+	MER70B	LTR	ERVL	263	390	-188	4
999	241	342	48	72	chr3	54325950	54326117	-105273666	-	MLT1B	LTR	MaLR	-24	366	204	4
999	655	337	51	37	chr3	54335209	54335641	-105264142	+	MLT2B3	LTR	ERVL	71	508	-46	5
999	252	333	114	13	chr3	54338809	54338958	-105260825	-	MER67C	LTR	ERV1	-401	310	147	5
999	1301	261	85	3	chr3	54340294	54340636	-105259147	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	5
999	1899	108	105	23	chr3	54342509	54342813	-105256970	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
999	1164	261	60	15	chr3	54343200	54343535	-105256248	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	355	-4	5
999	2178	117	28	0	chr3	54344152	54344469	-105255314	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	5
999	1419	199	147	24	chr3	54344714	54345054	-105254729	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	5
999	542	276	165	9	chr3	54353940	54354152	-105245631	+	MTD	LTR	MaLR	175	419	0	5
999	1445	209	15	43	chr3	54354563	54354954	-105244829	-	RMER17C	LTR	ERVK	-30	380	1	5
999	976	249	48	63	chr3	54360006	54360357	-105239426	+	ORR1E	LTR	MaLR	14	359	0	5
999	1568	211	85	11	chr3	54360656	54361020	-105238763	+	MTD	LTR	MaLR	1	391	-28	5
999	2261	148	54	0	chr3	54364853	54365244	-105234539	-	MTC	LTR	MaLR	-7	414	3	5
999	2297	185	108	94	chr3	54365512	54366115	-105233668	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	5
999	539	321	48	63	chr3	54368539	54368888	-105230895	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-1	566	223	5
999	3895	57	45	0	chr3	54373183	54373673	-105226110	+	LTRIS3	LTR	ERV1	1	512	0	5
999	1131	255	78	18	chr3	54374048	54374432	-105225351	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	13	5
999	308	200	71	0	chr3	54375113	54375198	-105224585	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	94	-276	5
999	462	261	113	18	chr3	54375227	54375395	-105224388	+	ORR1D2	LTR	MaLR	169	352	-18	5
999	1772	153	79	0	chr3	54383296	54383636	-105216147	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	12	5
999	1921	113	9	59	chr3	54389596	54389935	-105209848	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
999	445	325	65	0	chr3	54392566	54392734	-105207049	+	MLT1A0	LTR	MaLR	115	293	-72	6
1000	1801	110	72	0	chr3	54400990	54401280	-105198503	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	111	6
1000	339	340	159	41	chr3	54402137	54402622	-105197161	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-9	551	10	6
1000	1924	198	99	39	chr3	54402921	54403436	-105196347	-	RLTR40	LTR	ERVK	-1	816	271	6
1000	1602	152	3	3	chr3	54403859	54404143	-105195640	-	RLTR40	LTR	ERVK	-533	284	1	6
1000	2858	109	16	34	chr3	54405966	54406460	-105193323	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	487	-269	6
1000	2727	84	43	12	chr3	54409173	54409572	-105190211	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	6
1000	1526	155	78	97	chr3	54410446	54410518	-105189265	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	296	6
1000	1746	178	94	0	chr3	54410518	54410790	-105188993	+	ORR1B2	LTR	MaLR	5	302	-65	6
1000	1746	178	94	0	chr3	54410813	54410871	-105188912	+	ORR1B2	LTR	MaLR	303	365	-2	6
1000	1526	155	78	97	chr3	54410871	54411170	-105188613	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-72	295	3	6
1000	2037	153	20	14	chr3	54412270	54412622	-105187161	+	ORR1B2	LTR	MaLR	6	359	-8	6
1000	1029	208	10	5	chr3	54421201	54421399	-105178384	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-450	1059	861	6
1000	4527	125	45	8	chr3	54421505	54422214	-105177569	+	RMER19A	LTR	ERVK	3	737	0	6
1000	1236	151	238	7	chr3	54422220	54422527	-105177256	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	6
1000	1936	128	89	53	chr3	54424421	54424801	-105174982	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1000	2016	113	46	43	chr3	54425031	54425356	-105174427	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	6
1000	828	243	127	39	chr3	54425762	54426045	-105173738	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-61	309	2	6
1000	2758	75	66	13	chr3	54426841	54427205	-105172578	+	MTB	LTR	MaLR	3	390	-10	6
1000	2758	75	66	13	chr3	54427376	54427389	-105172394	+	MTB	LTR	MaLR	391	400	0	6
1000	4169	92	37	5	chr3	54427855	54428421	-105171362	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	6
1000	1536	118	18	73	chr3	54428520	54428794	-105170989	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-52	277	19	6
1000	1938	150	31	17	chr3	54428884	54429237	-105170546	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	358	-9	6
1000	485	179	118	17	chr3	54429357	54429476	-105170307	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	247	6
1000	461	264	36	134	chr3	54444173	54444396	-105155387	+	MTE2a	LTR	MaLR	16	216	-163	7
1000	783	277	116	7	chr3	54444893	54445196	-105154587	+	MTE2b	LTR	MaLR	34	379	0	7
1000	2828	78	54	0	chr3	54445421	54445830	-105153953	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	154	7
1000	243	86	0	0	chr3	54446412	54446447	-105153336	-	MT2B2	LTR	ERVL	-416	168	134	7
1000	384	319	50	0	chr3	54449017	54449136	-105150647	+	MLT1C	LTR	MaLR	343	467	0	7
1000	2881	185	38	9	chr3	54453492	54454049	-105145734	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	3	7
1000	1702	158	82	14	chr3	54454740	54455094	-105144689	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	7
1000	3147	70	18	0	chr3	54457228	54457628	-105142155	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	7
1000	337	342	63	16	chr3	54457710	54457900	-105141883	+	MLT2D	LTR	ERVL	162	360	-54	7
1000	687	286	68	27	chr3	54458718	54459013	-105140770	-	MTE2b	LTR	MaLR	-72	307	1	7
1000	244	264	44	44	chr3	54462953	54463044	-105136739	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-23	385	295	7
1000	4497	92	0	0	chr3	54464364	54464948	-105134835	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	7
1000	1819	160	44	65	chr3	54472404	54472791	-105126992	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	6	7
1000	999	284	51	35	chr3	54485472	54485844	-105113939	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	378	-1	7
1000	431	213	0	11	chr3	54486101	54486196	-105113587	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-295	186	93	7
1000	396	222	24	57	chr3	54486221	54486345	-105113438	+	RLTR11B	LTR	ERVK	32	151	-302	7
1000	270	240	93	0	chr3	54486432	54486507	-105113276	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-383	98	17	7
1000	415	323	87	35	chr3	54487799	54488030	-105111753	+	MLT1K	LTR	MaLR	350	592	-3	7
1000	1044	258	110	15	chr3	54490258	54490601	-105109182	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	368	2	8
1000	237	175	0	52	chr3	54493038	54493104	-105106679	+	MT2B2	LTR	ERVL	505	584	0	8
1000	1570	145	142	3	chr3	54493777	54494102	-105105681	+	RLTR14	LTR	ERV1	13	382	0	8
1000	2708	127	28	6	chr3	54507891	54508054	-105091729	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	983	821	2
1000	3232	110	10	8	chr3	54508200	54508918	-105090865	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	-163	820	1	2
1001	653	279	109	61	chr3	54545495	54545789	-105053994	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	364	57	8
1001	3939	172	36	13	chr3	54554052	54554917	-105044866	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	625	1509	0	9
1001	2210	120	51	8	chr3	54554917	54555287	-105044496	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	9
1001	288	277	24	12	chr3	54556565	54556649	-105043134	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	85	-274	9
1001	1760	194	92	24	chr3	54556676	54557056	-105042727	+	MTD	LTR	MaLR	12	417	-2	9
1001	2357	67	37	19	chr3	54567553	54567874	-105031909	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1001	557	229	16	0	chr3	54576642	54576764	-105023019	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	124	-246	1
1001	670	310	84	70	chr3	54576981	54577338	-105022445	-	MTEa	LTR	MaLR	-14	365	4	1
1001	1853	158	98	64	chr3	54580943	54581349	-105018434	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	1
1001	415	246	13	128	chr3	54582285	54582308	-105017475	+	MT2B	LTR	ERVL	145	275	-325	1
1001	559	179	66	0	chr3	54582429	54582535	-105017248	-	RLTR30	LTR	ERV1	-264	115	3	1
1001	264	209	22	99	chr3	54586912	54587093	-105012690	-	RMER17A	LTR	ERVK	-276	475	309	1
1001	2453	135	113	11	chr3	54591241	54591699	-105008084	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	1
1001	330	339	83	0	chr3	54605556	54605677	-104994106	-	MLT1H	LTR	MaLR	-75	430	300	2
1001	644	254	158	30	chr3	54606021	54606318	-104993465	-	RLTR15	LTR	ERVK	-17	342	8	2
1001	411	319	83	18	chr3	54606376	54606545	-104993238	-	MLT1H	LTR	MaLR	-365	184	5	2
1001	874	157	85	89	chr3	54613132	54613356	-104986427	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-106	223	1	2
1001	261	215	73	7	chr3	54617864	54617950	-104981833	+	MLT1A0	LTR	MaLR	27	116	-292	2
1001	471	324	36	41	chr3	54618297	54618493	-104981290	+	MLT1A0	LTR	MaLR	165	359	-6	2
1001	317	349	18	35	chr3	54619556	54619669	-104980114	-	MTE2b	LTR	MaLR	-174	205	95	2
1001	412	206	155	0	chr3	54619949	54620046	-104979737	-	MTE2b	LTR	MaLR	-267	112	1	2
1001	2155	289	142	14	chr3	54620047	54620903	-104978880	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-1	1579	614	2
1001	779	232	25	84	chr3	54620992	54621349	-104978434	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	336	-23	2
1001	1155	255	61	38	chr3	54623379	54623770	-104976013	+	MTD	LTR	MaLR	1	400	-19	2
1001	818	186	232	4	chr3	54627770	54628007	-104971776	+	RMER2	LTR	ERV1	27	317	-250	2
1001	2549	48	30	72	chr3	54628009	54628414	-104971369	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	2
1001	17024	28	8	14	chr3	54628416	54630410	-104969373	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	3	2
1001	2549	48	30	72	chr3	54630414	54630819	-104968964	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	2
1001	530	241	117	52	chr3	54630819	54631059	-104968724	+	RMER2	LTR	ERV1	312	567	0	2
1001	3322	40	0	36	chr3	54632953	54633364	-104966419	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1001	297	286	0	21	chr3	54634861	54634954	-104964829	-	MLT1E2	LTR	MaLR	0	627	537	2
1001	285	262	75	88	chr3	54635038	54635197	-104964586	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-261	244	88	2
1001	651	247	53	11	chr3	54636026	54636214	-104963569	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	175	2
1001	1668	134	9	66	chr3	54636745	54637065	-104962718	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	302	-27	2
1001	2376	90	19	0	chr3	54638860	54639181	-104960602	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1001	3475	28	2	2	chr3	54643503	54643899	-104955884	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1001	722	354	115	10	chr3	54650244	54650627	-104949156	-	LTR16D	LTR	ERVL	-203	448	26	2
1001	278	260	203	0	chr3	54651657	54651780	-104948003	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1408	4353	4206	2
1001	417	254	132	42	chr3	54652108	54652297	-104947486	+	LTR16B2	LTR	ERVL	105	310	-152	2
1001	2234	84	60	17	chr3	54653101	54653453	-104946330	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
125	56312	28	8	5	chr3	54653453	54659901	-104939882	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6479	-2	2
1002	2234	84	60	17	chr3	54659903	54660255	-104939528	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
1002	3202	65	20	0	chr3	54660415	54660814	-104938969	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
1002	632	281	46	5	chr3	54669699	54670038	-104929745	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	17	2
1002	231	286	0	0	chr3	54674647	54674710	-104925073	+	RMER4A	LTR	ERVK	5	67	-399	3
1002	2544	101	59	3	chr3	54675756	54676145	-104923638	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	3
1002	1051	121	25	81	chr3	54676146	54676344	-104923439	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	3
1002	236	244	0	0	chr3	54676352	54676397	-104923386	+	RLTR27	LTR	ERVK	231	275	-34	3
1002	3593	73	33	18	chr3	54676397	54676885	-104922898	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	3
1002	2289	61	0	0	chr3	54676885	54677163	-104922620	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	3
1002	6162	42	13	12	chr3	54677162	54677907	-104921876	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6481	0	3
1002	2561	89	81	3	chr3	54677907	54678288	-104921495	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	3
1002	613	278	174	12	chr3	54680511	54680769	-104919014	+	MTEb	LTR	MaLR	80	379	0	3
1002	503	215	14	58	chr3	54683246	54683384	-104916399	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	393	3
1002	393	139	0	0	chr3	54683404	54683476	-104916307	-	RLTR28	LTR	ERVL	-327	154	83	3
1002	540	106	0	23	chr3	54685068	54685155	-104914628	-	RLTR28	LTR	ERVL	-437	87	3	3
1002	1478	127	12	12	chr3	54687740	54687995	-104911788	+	RLTR1	LTR	ERV1	370	624	0	3
1002	2799	114	44	9	chr3	54690536	54690971	-104908812	+	RLTR11B	LTR	ERVK	4	453	0	3
1002	610	277	60	111	chr3	54693108	54693441	-104906342	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	316	-63	3
1002	626	305	67	58	chr3	54693977	54694353	-104905430	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	3
1002	1401	256	39	8	chr3	54721318	54721676	-104878107	+	MTD	LTR	MaLR	1	369	-50	3
1002	229	290	190	28	chr3	54722293	54722435	-104877348	-	MLT1C	LTR	MaLR	-101	366	202	3
1002	481	159	9	0	chr3	54727133	54727240	-104872543	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	108	-238	3
1002	240	143	0	0	chr3	54727240	54727296	-104872487	+	ORR1A1	LTR	MaLR	82	137	-257	3
1002	2031	94	3	7	chr3	54727318	54727618	-104872165	+	ORR1A2	LTR	MaLR	29	327	0	3
1002	1851	171	45	29	chr3	54732039	54732413	-104867370	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	380	-27	3
1002	595	252	165	52	chr3	54732544	54732908	-104866875	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	3
1002	1072	214	199	13	chr3	54733090	54733402	-104866381	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1002	857	155	42	0	chr3	54736791	54736959	-104862824	-	RMER13A	LTR	ERVK	-98	762	588	3
1002	2814	155	63	72	chr3	54737627	54738211	-104861572	-	RMER13A	LTR	ERVK	-280	580	2	3
1002	436	250	109	26	chr3	54740295	54740451	-104859332	-	MTEb	LTR	MaLR	-8	371	203	3
1002	399	235	83	8	chr3	54740451	54740571	-104859212	+	MTD	LTR	MaLR	277	405	-14	3
1002	425	291	16	8	chr3	54740592	54740720	-104859063	-	MTEb	LTR	MaLR	-226	153	25	3
1002	2476	289	92	10	chr3	54740759	54741538	-104858245	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-16	1564	722	3
1002	239	314	35	11	chr3	54741630	54741717	-104858066	+	LTR33B	LTR	ERVL	1	89	-414	3
1002	1119	236	90	85	chr3	54743769	54744181	-104855602	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	4
1002	1382	231	62	11	chr3	54747383	54747737	-104852046	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	3	4
1002	1015	185	252	108	chr3	54748356	54748756	-104851027	+	MT2A	LTR	ERVL	2	459	-74	4
1002	572	249	144	67	chr3	54748779	54748818	-104850965	+	MT2A	LTR	ERVL	524	583	-1	4
1002	1082	241	134	9	chr3	54754808	54755152	-104844631	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	33	4
1002	236	273	112	11	chr3	54756675	54756764	-104843019	+	MER74B	LTR	ERVL	76	173	-449	4
1002	404	139	69	0	chr3	54766163	54766235	-104833548	-	RMER6C	LTR	ERVK	-613	77	1	4
1002	1624	187	100	17	chr3	54767857	54768206	-104831577	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
1002	328	284	36	29	chr3	54777786	54777924	-104821859	+	MLT2B4	LTR	ERVL	11	149	-407	4
1002	6835	154	18	31	chr3	54779159	54780202	-104819581	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	1046	-212	4
1002	6835	154	18	31	chr3	54780347	54780576	-104819207	+	MTC-int	LTR	MaLR	1047	1258	0	4
1002	562	122	22	0	chr3	54780580	54780670	-104819113	+	MTC	LTR	MaLR	5	96	-325	4
1002	2242	156	42	3	chr3	54781069	54781448	-104818335	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1002	562	301	69	87	chr3	54783918	54784297	-104815486	-	RMER5	LTR	ERV1	-162	372	1	4
1002	706	87	43	0	chr3	54785314	54785429	-104814354	+	ORR1C2	LTR	MaLR	5	124	-260	4
1002	1689	174	13	62	chr3	54785569	54785955	-104813828	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1003	1170	266	72	84	chr3	54796630	54797238	-104802545	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	4
1003	279	266	21	21	chr3	54797583	54797679	-104802104	-	LTR81B	LTR	ERV1?	-1176	217	122	4
1003	722	266	116	40	chr3	54799370	54799672	-104800111	-	MTD	LTR	MaLR	-75	344	20	4
1003	880	39	16	16	chr3	54800747	54800876	-104798907	-	RLTR10	LTR	ERVK	-3	387	259	4
1003	251	183	0	0	chr3	54800882	54800942	-104798841	-	RLTR10	LTR	ERVK	-72	318	259	4
1003	1963	96	22	6	chr3	54800963	54801276	-104798507	-	RLTR10	LTR	ERVK	-72	318	1	4
1003	1303	91	416	0	chr3	54803619	54803850	-104795933	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1003	952	240	109	32	chr3	54805326	54805610	-104794173	+	MTE2b	LTR	MaLR	74	379	0	5
1003	732	288	136	30	chr3	54807328	54807658	-104792125	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	365	0	5
1003	312	237	10	40	chr3	54808823	54808924	-104790859	+	MLT1A1	LTR	MaLR	311	408	0	5
1003	603	320	54	67	chr3	54809527	54809989	-104789794	+	MT2A	LTR	ERVL	14	469	-64	5
1003	4056	118	79	11	chr3	54813965	54814600	-104785183	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	5
1003	549	280	47	37	chr3	54815428	54815643	-104784140	+	MLT1A0	LTR	MaLR	78	294	-71	5
1003	1947	184	88	8	chr3	54818759	54819147	-104780636	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
1003	1466	221	68	8	chr3	54823876	54824063	-104775720	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	178	5
1003	1466	221	68	8	chr3	54824111	54824275	-104775508	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-197	177	3	5
1003	1857	167	87	22	chr3	54827411	54827573	-104772210	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	178	-200	5
1003	1857	167	87	22	chr3	54827601	54827793	-104771990	+	ORR1C1	LTR	MaLR	179	378	0	5
1003	2210	183	151	16	chr3	54828891	54829441	-104770342	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	624	-3	5
1003	1731	173	23	18	chr3	54833651	54833993	-104765790	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	344	-122	5
1003	889	210	25	5	chr3	54834144	54834340	-104765443	+	ORR1C2	LTR	MaLR	185	384	0	5
1003	744	315	51	86	chr3	54837076	54837448	-104762335	+	MTE-int	LTR	MaLR	118	476	-1104	5
1003	1542	310	131	22	chr3	54837958	54838677	-104761106	+	MTE-int	LTR	MaLR	750	1546	-34	5
1003	2317	117	6	0	chr3	54842879	54843204	-104756579	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1003	1728	157	125	0	chr3	54844876	54845213	-104754570	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	379	-5	5
1003	553	268	77	12	chr3	54865071	54865241	-104734542	+	MTD	LTR	MaLR	1	181	-238	5
1003	873	184	160	17	chr3	54865398	54865635	-104734148	+	MTD	LTR	MaLR	149	419	0	5
1003	1313	287	88	98	chr3	54865638	54865918	-104733865	+	MTD-int	LTR	MaLR	2	297	-801	5
1003	1313	287	88	98	chr3	54866531	54867353	-104732430	+	MTD-int	LTR	MaLR	298	1093	-5	5
1003	660	264	51	0	chr3	54867539	54867755	-104732028	-	MTE2b	LTR	MaLR	-152	227	1	5
1003	566	192	257	14	chr3	54871562	54871820	-104727963	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	4	312	-222	5
1003	489	180	8	75	chr3	54871812	54871932	-104727851	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	416	527	-51	5
1003	1222	138	71	31	chr3	54873046	54873300	-104726483	+	RMER12	LTR	ERVK	623	886	-436	6
1003	849	188	78	82	chr3	54873354	54873563	-104726220	+	RMER12	LTR	ERVK	976	1175	-147	6
1003	849	204	101	55	chr3	54873588	54873655	-104726128	+	RMER12	LTR	ERVK	1176	1302	-20	6
1003	1558	224	44	87	chr3	54881625	54882152	-104717631	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-6	506	3	6
1003	403	333	23	17	chr3	54885051	54885225	-104714558	-	LTR75	LTR	ERVL	-18	544	370	6
1003	1373	219	49	32	chr3	54885674	54886022	-104713761	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	357	-2	6
1003	1005	188	35	0	chr3	54891917	54892119	-104707664	-	RLTR42	LTR	ERVK	-30	209	1	6
1003	12428	150	40	31	chr3	54892119	54894003	-104705780	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	0	5522	3617	6
1003	2129	146	88	8	chr3	54894003	54894368	-104705415	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1003	12428	150	40	31	chr3	54894368	54894797	-104704986	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1906	3616	3188	6
1003	5224	142	67	84	chr3	54894786	54895733	-104704050	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2581	2941	2016	6
1003	2822	67	78	0	chr3	54895733	54896104	-104703679	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
1003	5224	142	67	84	chr3	54896104	54896249	-104703534	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3507	2015	1868	6
1003	1867	119	35	0	chr3	54896381	54896691	-104703092	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	6
1003	7297	196	81	78	chr3	54896777	54896854	-104702929	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3658	1864	1786	6
1003	2250	89	6	66	chr3	54896854	54897202	-104702581	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1003	7297	196	81	78	chr3	54897202	54898260	-104701523	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3737	1785	754	6
1003	7297	196	81	78	chr3	54898408	54898829	-104700954	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4769	753	338	6
1003	7297	196	81	78	chr3	54899492	54899791	-104699992	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-5185	337	1	6
1003	424	176	0	0	chr3	54899920	54899994	-104699789	-	RLTR42	LTR	ERVK	-159	80	7	6
1003	2964	119	81	82	chr3	54904888	54905667	-104694116	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-55	968	1	6
1003	3036	56	48	0	chr3	54906061	54906453	-104693330	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	6
1003	233	228	58	134	chr3	54909513	54909685	-104690098	-	RLTR26	LTR	ERVK	-243	399	241	6
1003	4720	36	11	2	chr3	54910562	54911117	-104688666	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	6
1003	647	267	70	129	chr3	54914833	54915191	-104684592	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	24	6
1004	1474	157	283	14	chr3	54921863	54922230	-104677553	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	6
1004	1782	178	72	37	chr3	54922650	54923052	-104676731	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	1	6
1004	596	251	127	13	chr3	54927385	54927665	-104672118	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	6	6
1004	520	243	104	50	chr3	54933276	54933536	-104666247	-	MER73	LTR	ERVL	-281	363	90	6
1004	2049	119	80	48	chr3	54936581	54936979	-104662804	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	11	6
1004	316	341	71	104	chr3	54941732	54942040	-104657743	-	MER21B	LTR	ERV1	-554	309	12	7
1004	1366	240	83	8	chr3	54947071	54947445	-104652338	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	7
1004	430	306	158	19	chr3	54952632	54952949	-104646834	+	RMER5	LTR	ERV1	174	534	0	7
1004	473	295	90	39	chr3	54959378	54959710	-104640073	+	LTR16B2	LTR	ERVL	105	453	-9	7
1004	4329	23	12	0	chr3	54966122	54966609	-104633174	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	7
1004	509	335	42	8	chr3	54968129	54968367	-104631416	-	MER68	LTR	ERVL	0	563	318	7
1004	735	276	184	20	chr3	54978033	54978380	-104621403	+	MTD	LTR	MaLR	15	418	-1	7
1004	295	216	13	13	chr3	54979036	54979111	-104620672	+	MTD	LTR	MaLR	345	419	0	7
1004	291	386	32	7	chr3	54979760	54979914	-104619869	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-312	1075	918	7
1004	957	291	12	36	chr3	54981873	54982208	-104617575	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-15	350	24	7
1004	632	333	98	10	chr3	54990655	54990952	-104608831	+	MLT1A0	LTR	MaLR	43	365	0	7
1004	1175	210	189	9	chr3	55010844	55011194	-104588589	-	MTD	LTR	MaLR	-6	413	1	7
1004	283	314	82	19	chr3	55014367	55014526	-104585257	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	407	1
1004	5893	75	10	5	chr3	55023620	55024483	-104575300	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	111	2
1004	310	319	29	29	chr3	55027367	55027506	-104572277	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	423	2
1004	302	229	26	103	chr3	55034019	55034136	-104565647	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	151	4
1004	1572	211	39	6	chr3	55034457	55034815	-104564968	+	MTD	LTR	MaLR	33	402	-17	4
1004	1875	149	69	103	chr3	55041126	55041591	-104558192	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-29	452	4	5
1004	492	243	109	38	chr3	55041878	55042062	-104557721	+	MTD	LTR	MaLR	7	203	-216	5
1004	2401	167	144	10	chr3	55043345	55043852	-104555931	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	5
1004	285	338	21	76	chr3	55044544	55044688	-104555095	+	RLTR33	LTR	ERVK	458	593	-85	5
1005	237	363	100	12	chr3	55057200	55057370	-104542413	+	MLT1A	LTR	MaLR	154	338	-36	6
1005	1742	177	84	5	chr3	55057681	55058051	-104541732	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	21	6
1005	2007	199	27	12	chr3	55063425	55063838	-104535945	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1005	249	292	30	30	chr3	55067446	55067545	-104532238	+	MTEa	LTR	MaLR	278	376	-3	7
1005	1496	186	83	50	chr3	55067552	55067754	-104532029	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	157	7
1005	1496	186	83	50	chr3	55067926	55068085	-104531698	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-218	156	1	7
1005	1169	249	133	11	chr3	55068402	55068764	-104531019	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	14	8
1005	1756	134	0	11	chr3	55068968	55069254	-104530529	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	44	8
1005	2164	129	45	17	chr3	55069799	55070154	-104529629	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	3	8
1005	866	230	70	75	chr3	55074561	55074933	-104524850	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	8
1005	1571	218	28	46	chr3	55076845	55077234	-104522549	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	18	8
1005	3219	50	5	8	chr3	55081341	55081742	-104518041	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	9
1005	241	236	65	65	chr3	55082969	55083046	-104516737	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	366	290	9
1005	968	290	126	16	chr3	55093312	55093677	-104506106	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	1
1005	1931	159	61	50	chr3	55093729	55093941	-104505842	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-3	381	172	1
1005	1931	159	61	50	chr3	55094105	55094268	-104505515	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-213	171	2	1
1005	1254	255	41	28	chr3	55098073	55098436	-104501347	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	1	1
1005	1086	151	29	34	chr3	55104871	55105077	-104494706	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-5	379	175	1
1005	1199	97	0	11	chr3	55105186	55105374	-104494409	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-196	188	3	1
1005	430	349	45	77	chr3	55105703	55106079	-104493704	-	LTR40b	LTR	ERVL	-18	444	81	1
1005	628	284	56	10	chr3	55118564	55118760	-104481023	+	MTD	LTR	MaLR	1	205	-214	1
1005	1708	203	55	50	chr3	55127383	55127787	-104471996	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	6	1
1005	256	234	242	65	chr3	55138642	55138857	-104460926	+	RLTR24	LTR	ERV1	277	529	0	1
1005	554	332	60	31	chr3	55142167	55142518	-104457265	-	MLT2D	LTR	ERVL	-9	405	45	1
1005	4473	158	115	6	chr3	55148335	55149154	-104450629	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	1
1005	1876	77	156	17	chr3	55159063	55159352	-104440431	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
1005	398	306	85	77	chr3	55162213	55162472	-104437311	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-102	263	3	2
1005	551	188	120	43	chr3	55163202	55163386	-104436397	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1016	242	45	2
1005	1777	169	123	13	chr3	55163401	55163774	-104436009	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	1	2
1005	496	324	49	48	chr3	55166424	55166768	-104433015	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	75	2
1005	2409	89	85	16	chr3	55167734	55168100	-104431683	+	ORR1B1	LTR	MaLR	4	394	0	2
1005	1394	156	65	29	chr3	55173767	55174045	-104425738	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-81	313	26	2
1005	659	303	61	12	chr3	55174798	55175045	-104424738	+	MLT1A0	LTR	MaLR	105	363	-2	2
1005	715	168	44	0	chr3	55178617	55178754	-104421029	+	MTC	LTR	MaLR	47	189	-232	2
1005	227	224	20	0	chr3	55178750	55178799	-104420984	+	MTD	LTR	MaLR	136	185	-234	2
1005	1300	185	64	18	chr3	55178787	55179068	-104420715	+	MTC	LTR	MaLR	128	421	0	2
1005	1240	225	110	32	chr3	55179370	55179742	-104420041	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	5	2
1006	675	259	36	26	chr3	55183163	55183357	-104416426	+	MTD	LTR	MaLR	87	282	-137	2
1006	514	315	59	16	chr3	55196203	55196458	-104403325	-	MER57E1	LTR	ERV1	-2	370	105	2
1006	431	308	173	56	chr3	55198756	55199200	-104400583	-	MER21B	LTR	ERV1	-156	707	212	2
1006	1547	144	60	98	chr3	55199225	55199593	-104400190	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	2
1006	2479	124	84	2	chr3	55202550	55202955	-104396828	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-665	438	1	2
1006	1003	251	142	24	chr3	55203260	55203591	-104396192	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	2	2
1006	2011	128	0	56	chr3	55203727	55204065	-104395718	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	2
1006	5165	114	99	15	chr3	55210575	55211455	-104388328	-	RMER17B	LTR	ERVK	-4	954	1	2
1006	2403	120	164	0	chr3	55212219	55212676	-104387107	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	2
1006	1407	214	90	0	chr3	55214041	55214364	-104385419	-	MTD	LTR	MaLR	-67	352	1	2
1006	2176	103	54	6	chr3	55214530	55214843	-104384940	+	ORR1A4	LTR	MaLR	2	329	0	2
1006	1609	133	43	140	chr3	55216033	55216425	-104383358	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	3
1006	1089	219	137	33	chr3	55218031	55218052	-104381731	+	MTD	LTR	MaLR	6	24	-395	3
1006	1089	219	137	33	chr3	55218082	55218395	-104381388	+	MTD	LTR	MaLR	25	374	-45	3
1006	528	153	0	0	chr3	55218477	55218562	-104381221	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-214	170	86	3
1006	1974	122	0	154	chr3	55233932	55234321	-104365462	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
1006	1203	267	82	66	chr3	55244342	55244888	-104354895	-	MER89	LTR	ERV1	-1	558	4	3
1006	1600	214	96	25	chr3	55248614	55249096	-104350687	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	457	17	3
1006	1327	222	90	3	chr3	55249600	55249921	-104349862	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	19	3
1006	1704	218	32	29	chr3	55253642	55254054	-104345729	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	2	3
1006	833	245	279	52	chr3	55257269	55257732	-104342051	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	568	1	3
1006	1544	248	19	13	chr3	55263981	55264353	-104335430	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1006	722	125	22	0	chr3	55277744	55277880	-104321903	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-107	346	208	3
1006	1483	147	7	26	chr3	55277955	55278238	-104321545	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-174	271	1	3
1006	2527	174	42	40	chr3	55286338	55286860	-104312923	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-2	525	3	3
1007	819	219	52	25	chr3	55348841	55349121	-104250662	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	405	-14	4
1007	680	290	79	46	chr3	55349173	55349477	-104250306	-	ORR1E	LTR	MaLR	-45	314	1	4
1007	771	256	148	33	chr3	55349663	55349985	-104249798	-	MTD	LTR	MaLR	-16	384	8	4
1007	1297	297	41	85	chr3	55350342	55350908	-104248875	-	MER89	LTR	ERV1	-1	558	18	4
1007	487	264	62	41	chr3	55353569	55353715	-104246068	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	230	4
1007	366	267	84	33	chr3	55354340	55354480	-104245303	+	LTR48	LTR	ERV1	2	141	-401	4
1007	314	274	37	9	chr3	55354619	55354726	-104245057	+	LTR48	LTR	ERV1	368	477	-65	4
1007	655	254	227	8	chr3	55355010	55355248	-104244535	-	MLT1H	LTR	MaLR	-258	291	2	4
1007	706	304	63	55	chr3	55357594	55357942	-104241841	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	7	4
1007	1217	310	47	40	chr3	55358016	55358158	-104241625	+	MER21B	LTR	ERV1	423	569	-294	4
1007	1217	310	47	40	chr3	55358459	55358740	-104241043	+	MER21B	LTR	ERV1	570	849	-14	4
1007	274	256	46	58	chr3	55360167	55360254	-104239529	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	294	4
1007	243	227	31	93	chr3	55361629	55361726	-104238057	-	MLT1B	LTR	MaLR	-230	160	70	4
1007	1486	172	169	0	chr3	55367142	55367462	-104232321	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1007	746	132	107	34	chr3	55368824	55368973	-104230810	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1649	1808	0	4
1007	911	247	57	162	chr3	55371246	55371647	-104228136	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	4
1007	261	258	61	20	chr3	55377278	55377377	-104222406	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1167	4355	4253	5
1007	517	242	105	218	chr3	55379843	55380270	-104219513	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1007	558	284	16	49	chr3	55380502	55380687	-104219096	+	RMER15	LTR	ERVL	343	521	-54	5
1007	319	313	28	129	chr3	55381402	55381669	-104218114	+	ORR1D2	LTR	MaLR	96	374	0	5
1007	2964	66	200	9	chr3	55381917	55382347	-104217436	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	5
1007	63031	20	2	1	chr3	55382347	55389890	-104209893	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	0	7556	1	5
1007	2964	66	200	9	chr3	55389890	55390320	-104209463	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	5
1007	305	312	111	65	chr3	55392292	55392491	-104207292	-	LTR88c	LTR	Genie?	-478	384	177	5
1007	1426	153	212	27	chr3	55396357	55396687	-104203096	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-3	391	1	5
1007	472	336	69	47	chr3	55398797	55399035	-104200748	+	MLT1A0	LTR	MaLR	75	321	-44	5
1007	3432	71	60	9	chr3	55399035	55399487	-104200296	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	5
1007	472	336	69	47	chr3	55399487	55399523	-104200260	+	MLT1A0	LTR	MaLR	322	355	-10	5
1007	810	255	59	13	chr3	55400510	55400748	-104199035	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	257	5
1007	235	254	60	0	chr3	55401150	55401217	-104198566	+	MTEa	LTR	MaLR	289	359	-20	5
1007	1578	208	104	18	chr3	55401466	55401849	-104197934	+	MTD	LTR	MaLR	3	418	-1	5
1007	607	308	70	48	chr3	55402108	55402422	-104197361	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-233	323	3	5
1007	705	115	0	0	chr3	55406078	55406174	-104193609	-	MTD	LTR	MaLR	-323	96	1	5
1007	935	204	97	16	chr3	55415155	55415464	-104184319	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	77	5
1007	882	196	12	16	chr3	55415489	55415743	-104184040	-	RMER17C	LTR	ERVK	-157	253	1	5
1007	597	270	61	12	chr3	55418093	55418258	-104181525	-	RMER15	LTR	ERVL	-51	524	352	5
1007	241	332	100	56	chr3	55418453	55418702	-104181081	+	ORR1E	LTR	MaLR	79	338	-21	5
1007	388	293	65	65	chr3	55421379	55421565	-104178218	+	RMER15	LTR	ERVL	383	568	-7	5
1007	1890	149	119	3	chr3	55423151	55423495	-104176288	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
1007	366	295	55	41	chr3	55423614	55423759	-104176024	-	LTR48	LTR	ERV1	-640	147	1	5
1007	539	309	89	49	chr3	55424716	55425037	-104174746	+	MLT1A0	LTR	MaLR	14	404	-4	5
1007	401	331	39	13	chr3	55425445	55425598	-104174185	-	MTD	LTR	MaLR	-258	161	5	5
1007	327	281	329	36	chr3	55427535	55427877	-104171906	+	LTR82A	LTR	ERVL	264	704	-168	5
1007	935	213	166	18	chr3	55433527	55433841	-104165942	+	MTD	LTR	MaLR	1	397	-22	5
1008	853	254	88	15	chr3	55449523	55449838	-104149945	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	351	-19	5
1008	693	235	192	8	chr3	55456977	55457217	-104142566	+	RMER21B	LTR	ERV1	284	567	-275	5
1008	3423	23	8	0	chr3	55458939	55459332	-104140451	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1008	359	212	38	106	chr3	55481290	55481422	-104118361	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	135	6
1008	264	269	127	7	chr3	55488783	55488933	-104110850	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	806	973	-436	6
1008	430	288	79	77	chr3	55493456	55493897	-104105886	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-85	442	1	6
1008	735	241	90	41	chr3	55495213	55495503	-104104280	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	304	-177	6
1008	270	263	41	111	chr3	55501610	55501781	-104098002	-	RMER10A	LTR	ERVL	-25	417	259	5
1008	343	305	133	33	chr3	55501807	55502078	-104097705	-	RMER10A	LTR	ERVL	-144	298	1	5
1008	1530	215	120	8	chr3	55507906	55508281	-104091502	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	1
1008	1559	220	79	72	chr3	55512718	55512776	-104087007	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	369	2
1008	1559	220	79	72	chr3	55512823	55513180	-104086603	-	MTD	LTR	MaLR	-51	368	1	2
1008	249	336	53	8	chr3	55522738	55522870	-104076913	+	MLT1A1	LTR	MaLR	271	408	0	4
1008	1690	135	29	66	chr3	55524487	55524836	-104074947	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	336	-62	4
1008	283	311	86	26	chr3	55532676	55532828	-104066955	+	LTR41	LTR	ERVL	14	174	-584	6
1008	483	331	155	18	chr3	55532901	55533289	-104066494	+	LTR41	LTR	ERVL	320	760	-8	6
1008	1576	185	287	81	chr3	55538833	55539275	-104060508	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	7
1008	278	311	22	22	chr3	55549456	55549548	-104050235	+	MLT1A1	LTR	MaLR	202	293	-115	8
1008	534	309	87	115	chr3	55558071	55558670	-104041113	+	RLTR18	LTR	ERVK	25	606	-10	9
1008	1810	255	0	19	chr3	55562268	55562695	-104037088	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	9
1008	1655	171	108	0	chr3	55564859	55565192	-104034591	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	369	-15	1
1008	2491	146	25	17	chr3	55570433	55570837	-104028946	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
1008	911	223	25	21	chr3	55571336	55571574	-104028209	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	240	-134	1
1008	306	221	39	0	chr3	55572105	55572182	-104027601	+	ORR1D1	LTR	MaLR	132	211	-163	1
1009	600	285	198	22	chr3	55593711	55594116	-104005667	-	MER90a	LTR	ERV1	-87	527	52	1
1009	1816	188	92	6	chr3	55604895	55605233	-103994550	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	1
1009	1156	195	95	0	chr3	55624499	55624740	-103975043	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-5	379	116	1
1009	3264	209	95	27	chr3	55624737	55625960	-103973823	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-57	1313	1	1
1009	680	124	9	26	chr3	55625960	55626076	-103973707	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	271	1
1009	294	316	25	25	chr3	55656459	55656579	-103943204	+	RMER15	LTR	ERVL	420	539	-36	2
1009	434	316	84	67	chr3	55671779	55672111	-103927672	+	MLT1A1	LTR	MaLR	31	408	0	2
1009	532	266	110	18	chr3	55687433	55687777	-103912006	+	MTD	LTR	MaLR	1	386	-35	2
1009	1204	205	92	82	chr3	55690539	55690965	-103908818	+	RMER10A	LTR	ERVL	7	436	-6	2
1010	3375	174	88	3	chr3	55708924	55709255	-103890528	+	RMER6D	LTR	ERVK	6	358	-362	3
1010	3375	174	88	3	chr3	55709292	55709619	-103890164	+	RMER6D	LTR	ERVK	359	720	0	3
1010	3780	194	59	47	chr3	55712830	55713591	-103886192	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	770	-132	3
1010	683	180	70	0	chr3	55715154	55715282	-103884501	+	RMER19B	LTR	ERVK	759	895	-7	3
1010	645	288	209	14	chr3	55719692	55719970	-103879813	-	MTC	LTR	MaLR	-52	369	38	3
1010	488	350	69	76	chr3	55747733	55748181	-103851602	+	MLT1E2	LTR	MaLR	22	466	-161	3
1010	1700	175	148	16	chr3	55764942	55765314	-103834469	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1010	271	193	0	81	chr3	55765358	55765420	-103834363	+	ORR1C1	LTR	MaLR	310	366	-12	3
1010	1249	176	21	16	chr3	55765429	55765671	-103834112	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	2	244	-1014	3
1010	861	157	38	6	chr3	55774876	55775036	-103824747	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	196	3
1010	384	365	116	60	chr3	55782648	55782983	-103816800	+	MLT1D	LTR	MaLR	41	394	-111	4
1010	2313	187	28	39	chr3	55784192	55784686	-103815097	+	RLTR16	LTR	ERVK	5	493	-12	4
1010	285	257	13	13	chr3	55788535	55788610	-103811173	+	RMER4A	LTR	ERVK	26	100	-366	4
1010	350	290	6	119	chr3	55808158	55808334	-103791449	+	RMER12	LTR	ERVK	696	851	-471	4
1010	2232	127	61	3	chr3	55810651	55811014	-103788769	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1010	1485	215	49	21	chr3	55816540	55816868	-103782915	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	338	-36	4
1010	779	186	78	31	chr3	55821566	55821887	-103777896	+	ORR1C2	LTR	MaLR	19	384	0	4
1010	1391	209	136	16	chr3	55822248	55822448	-103777335	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	188	4
1010	2717	150	104	22	chr3	55822448	55822987	-103776796	-	RMER4B	LTR	ERVK	-2	583	1	4
1010	1391	209	136	16	chr3	55822987	55823160	-103776623	-	MTD	LTR	MaLR	-232	187	1	4
1010	357	314	39	0	chr3	55823951	55824053	-103775730	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	106	-253	4
1010	259	234	0	138	chr3	55835815	55835909	-103763874	+	MT2B	LTR	ERVL	156	236	-365	4
1011	1643	213	44	0	chr3	55850438	55850800	-103748983	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
1011	582	275	206	51	chr3	55870618	55870929	-103728854	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	5
1011	323	288	65	97	chr3	55885845	55885999	-103713784	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	109	5
1011	971	224	185	29	chr3	55894026	55894334	-103705449	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	361	-13	5
1011	867	120	86	2	chr3	55895791	55895952	-103703831	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	187	-207	5
1011	1420	163	43	43	chr3	55896043	55896105	-103703678	+	ORR1C1	LTR	MaLR	78	129	-249	5
1011	1420	163	43	43	chr3	55896131	55896369	-103703414	+	ORR1C1	LTR	MaLR	130	378	0	5
1011	581	354	51	68	chr3	55899277	55899571	-103700212	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	289	-76	5
1011	1718	192	38	103	chr3	55900088	55900536	-103699247	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	5
1011	1910	174	70	13	chr3	55902084	55902457	-103697326	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1011	2209	146	63	0	chr3	55902797	55903160	-103696623	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	5
1011	1698	215	81	83	chr3	55903859	55904413	-103695370	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	553	0	5
1011	1035	295	77	16	chr3	55907233	55907535	-103692248	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	59	5
1011	2091	251	94	14	chr3	55907535	55908098	-103691685	-	MTE-int	LTR	MaLR	-2	1578	971	5
1011	819	275	41	41	chr3	55910272	55910617	-103689166	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	345	-14	5
1011	368	329	181	32	chr3	55912130	55912378	-103687405	+	RMER15	LTR	ERVL	272	556	-19	5
1011	4037	188	102	69	chr3	55915264	55916378	-103683405	+	RMER12	LTR	ERVK	172	1828	-20	5
1011	397	204	0	31	chr3	55918923	55919019	-103680764	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1870	1962	-3560	5
1011	1820	260	122	59	chr3	55919080	55919861	-103679922	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2364	3193	-2944	5
1011	625	210	70	98	chr3	55919962	55920247	-103679536	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3405	3681	-2456	5
1011	1864	193	22	79	chr3	55920256	55920661	-103679122	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	382	-12	5
1011	7807	162	89	84	chr3	55920667	55922620	-103677163	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1963	0	5
1011	1845	179	81	6	chr3	55922620	55922979	-103676804	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	5
1011	387	204	83	31	chr3	55922983	55923079	-103676704	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3701	3801	-2336	5
1011	507	205	48	96	chr3	55925153	55925320	-103674463	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3873	4031	-2106	5
1011	1244	244	51	40	chr3	55925349	55925721	-103674062	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4006	4381	-1756	5
1011	616	100	11	0	chr3	55926210	55926300	-103673483	+	ORR1B1	LTR	MaLR	288	378	0	5
1011	6162	197	89	10	chr3	55926300	55927699	-103672084	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1509	0	5
1011	1731	193	23	57	chr3	55927725	55928077	-103671706	+	ORR1B1	LTR	MaLR	55	394	0	5
1011	4456	170	141	20	chr3	55928435	55929215	-103670568	+	RLTR25A	LTR	ERVK	3	865	-238	5
1011	4456	170	141	20	chr3	55929265	55929465	-103670318	+	RLTR25A	LTR	ERVK	866	1100	-3	5
1011	505	136	49	0	chr3	55929801	55929882	-103669901	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	275	6
1011	645	81	152	9	chr3	55929871	55929983	-103669800	-	RMER19B	LTR	ERVK	-4	898	771	6
1011	4857	139	38	79	chr3	55930128	55931068	-103668715	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	6
1011	2353	99	6	0	chr3	55931853	55932175	-103667608	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	4	6
1011	284	297	132	85	chr3	55933157	55933235	-103666548	+	MTEa	LTR	MaLR	70	158	-201	6
1011	323	263	100	56	chr3	55933326	55933519	-103666264	+	MTEa	LTR	MaLR	159	359	-20	6
1011	8365	150	49	149	chr3	55947861	55950020	-103649763	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-21	1942	1	6
1011	2000	158	20	11	chr3	55950020	55950371	-103649412	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	6
1011	1317	218	80	87	chr3	55954730	55955318	-103644465	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-1	905	322	6
1011	1110	145	134	74	chr3	55955312	55955595	-103644188	-	RLTR24	LTR	ERV1	-220	309	10	6
1011	2878	208	129	63	chr3	55959677	55960473	-103639310	-	RMER19B	LTR	ERVK	-53	849	1	6
1011	518	83	182	70	chr3	55960473	55960616	-103639167	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	0	5780	5622	6
1011	2612	140	36	11	chr3	55960616	55960868	-103638915	+	RLTR19	LTR	ERVK	49	307	-192	6
1011	2612	140	36	11	chr3	55960890	55961077	-103638706	+	RLTR19	LTR	ERVK	308	499	0	6
1011	231	286	0	14	chr3	55966715	55966786	-103632997	-	MLT1J	LTR	MaLR	-3	509	440	6
1012	593	331	123	25	chr3	55971179	55971569	-103628214	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	482	-74	6
1012	258	349	104	31	chr3	55971595	55971640	-103628143	+	MLT2B4	LTR	ERVL	483	530	-26	6
1012	313	357	36	0	chr3	55979766	55979906	-103619877	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-611	776	632	6
1012	586	162	102	8	chr3	55980639	55980757	-103619026	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	291	6
1012	1262	126	18	31	chr3	55980757	55980959	-103618824	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	219	6
1012	1262	126	18	31	chr3	55981076	55981095	-103618688	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-204	218	204	6
1012	424	51	68	0	chr3	55981086	55981145	-103618638	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-359	63	1	6
1012	421	293	218	37	chr3	55981372	55981588	-103618195	-	MTD	LTR	MaLR	-164	255	1	6
1012	514	326	88	97	chr3	55991031	55991462	-103608321	+	MLT1C	LTR	MaLR	36	462	-5	6
1012	726	263	179	40	chr3	55995214	55995539	-103604244	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	6
1012	249	423	90	0	chr3	56000878	56001067	-103598716	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	989	1194	-193	3
1012	986	266	5	0	chr3	56002822	56003029	-103596754	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	167	8
1012	558	221	105	52	chr3	56003113	56003285	-103596498	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-193	181	1	8
1012	277	326	38	23	chr3	56006976	56007108	-103592675	-	MTE-int	LTR	MaLR	-285	1295	1162	1
1012	762	326	179	27	chr3	56007643	56008302	-103591481	-	MLT-int	LTR	MaLR	-975	760	2	1
1012	252	261	80	80	chr3	56009343	56009468	-103590315	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	125	-240	1
1012	372	278	35	9	chr3	56009553	56009669	-103590114	+	MLT1A1	LTR	MaLR	290	408	0	1
1012	734	287	108	19	chr3	56011490	56011883	-103587900	+	MLT2B4	LTR	ERVL	4	423	-41	2
1012	747	316	88	36	chr3	56012072	56012460	-103587323	+	MLT1A1-int	LTR	MaLR	250	657	-714	1
1012	1950	141	10	94	chr3	56012472	56012856	-103586927	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	392	-2	2
1012	259	388	39	0	chr3	56013093	56013196	-103586587	+	MLT1A-int	LTR	MaLR	1276	1382	-353	2
1012	563	299	204	42	chr3	56019825	56020090	-103579693	+	ORR1E	LTR	MaLR	50	357	-2	2
1012	865	311	74	3	chr3	56020090	56020400	-103579383	+	MLT1A-int	LTR	MaLR	1404	1735	0	2
1012	391	295	234	45	chr3	56020400	56020728	-103579055	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	390	0	2
1012	338	277	0	47	chr3	56022652	56022758	-103577025	+	MT2A	LTR	ERVL	138	238	-295	3
1012	345	376	7	14	chr3	56022826	56022969	-103576814	+	MT2A	LTR	ERVL	226	367	-166	3
1012	501	233	78	0	chr3	56023618	56023721	-103576062	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	112	-258	3
1012	327	350	74	12	chr3	56025111	56025273	-103574510	-	LTR53	LTR	ERVL	-27	492	321	4
1012	869	304	36	101	chr3	56027189	56027547	-103572236	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	26	4
1012	1246	242	34	116	chr3	56030785	56031173	-103568610	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	366	11	5
1012	452	319	108	0	chr3	56033138	56033304	-103566479	-	MER77	LTR	ERVL	-9	598	415	5
1012	1762	230	36	3	chr3	56034356	56034714	-103565069	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	6
1012	494	256	33	33	chr3	56034877	56034998	-103564785	+	MT2B	LTR	ERVL	35	155	-378	6
1012	552	257	22	0	chr3	56034973	56035109	-103564674	+	MT2B	LTR	ERVL	92	230	-303	6
1012	776	233	57	75	chr3	56035280	56035458	-103564325	+	MT2B	LTR	ERVL	379	559	-42	6
1012	776	233	57	75	chr3	56035605	56035648	-103564135	+	MT2B	LTR	ERVL	560	601	0	6
1012	2097	158	47	8	chr3	56035651	56036015	-103563768	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	6
1012	294	125	0	14	chr3	56036968	56037016	-103562767	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	486	6
1012	294	125	0	14	chr3	56037054	56037078	-103562705	-	MT2A	LTR	ERVL	-48	485	462	6
1012	1211	260	105	6	chr3	56037655	56037988	-103561795	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	1	7
1012	989	221	267	24	chr3	56038848	56039109	-103560674	+	MTC	LTR	MaLR	12	358	-63	7
1012	989	221	267	24	chr3	56039501	56039569	-103560214	+	MTC	LTR	MaLR	359	421	0	7
1012	236	139	0	0	chr3	56041345	56041388	-103558395	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	352	7
1012	1636	143	164	3	chr3	56041382	56041705	-103558078	+	ORR1B1	LTR	MaLR	20	394	0	7
1012	1551	231	132	0	chr3	56042121	56042484	-103557299	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	9	8
1012	251	340	82	0	chr3	56043547	56043644	-103556139	-	MLT1K	LTR	MaLR	0	595	491	8
1012	2959	52	3	14	chr3	56045042	56045392	-103554391	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	8
1012	1903	168	52	70	chr3	56047387	56047621	-103552162	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	230	-148	9
1012	2667	86	3	0	chr3	56047621	56047947	-103551836	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	9
1012	1903	168	52	70	chr3	56047947	56048097	-103551686	+	ORR1C1	LTR	MaLR	231	378	0	9
1012	1329	206	125	6	chr3	56057158	56057470	-103542313	+	ORR1D2	LTR	MaLR	22	370	0	9
1012	1076	161	59	13	chr3	56059698	56059937	-103539846	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	161	1
1012	226	321	54	0	chr3	56061193	56061305	-103538478	-	MER34	LTR	ERV1	-16	526	409	1
1012	1230	225	83	64	chr3	56061403	56061610	-103538173	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	211	1
1012	1230	225	83	64	chr3	56061755	56061938	-103537845	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	22	1
1012	1230	225	83	64	chr3	56061987	56062004	-103537779	-	MTD	LTR	MaLR	-398	21	1	1
1012	259	314	12	12	chr3	56062909	56063021	-103536762	-	MER34	LTR	ERV1	-459	112	1	1
1012	939	277	13	0	chr3	56064722	56064953	-103534830	+	MTEa	LTR	MaLR	144	377	-2	1
1012	421	306	43	73	chr3	56065346	56065689	-103534094	+	RLTR12B	LTR	ERVK	19	332	-196	1
1012	618	268	43	110	chr3	56067929	56068053	-103531730	-	MT2A	LTR	ERVL	0	601	483	1
1012	1080	222	120	68	chr3	56068129	56068479	-103531304	-	MT2A	LTR	ERVL	-119	482	1	1
1012	1073	240	80	118	chr3	56068913	56069353	-103530430	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	8	1
1012	280	317	85	0	chr3	56070085	56070167	-103529616	-	MLT1L	LTR	MaLR	-375	235	147	1
1012	422	305	23	8	chr3	56070381	56070510	-103529273	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	249	1
1012	232	284	27	0	chr3	56071706	56071780	-103528003	+	RMER15	LTR	ERVL	408	483	-92	1
1012	4466	12	0	0	chr3	56072679	56073172	-103526611	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	1
1012	293	326	90	38	chr3	56074156	56074524	-103525259	+	MER31A	LTR	ERV1	39	482	-3	1
1012	4258	156	81	70	chr3	56075139	56076032	-103523751	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	1
1012	754	301	51	34	chr3	56083010	56083306	-103516477	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	273	1
1012	251	326	51	0	chr3	56085597	56085695	-103514088	+	LTR16B	LTR	ERVL	205	307	-156	1
1012	2118	39	0	0	chr3	56086224	56086480	-103513303	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	141	1
1012	7793	39	2	36	chr3	56086473	56087119	-103512664	-	MT-int	LTR	MaLR	-94	1004	394	1
1012	7793	39	2	36	chr3	56087225	56087618	-103512165	-	MT-int	LTR	MaLR	-705	393	1	1
1012	4474	10	0	0	chr3	56087620	56088113	-103511670	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1012	2705	158	28	49	chr3	56089081	56089654	-103510129	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	1
1012	3506	23	0	0	chr3	56093403	56093799	-103505984	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1012	280	185	10	18	chr3	56096321	56096387	-103503396	+	MTEb	LTR	MaLR	291	360	-19	1
1012	1599	321	88	41	chr3	56096391	56096808	-103502975	+	MTEb-int	LTR	MaLR	14	454	-1126	1
1012	1599	321	88	41	chr3	56097024	56097415	-103502368	+	MTEb-int	LTR	MaLR	455	860	-720	1
1013	1874	209	15	118	chr3	56102042	56102629	-103497154	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-15	538	12	1
1013	243	345	115	70	chr3	56103250	56103493	-103496290	-	ORR1E	LTR	MaLR	-105	254	1	1
1013	345	281	42	16	chr3	56104897	56105037	-103494746	+	MLT1A1	LTR	MaLR	215	407	-1	1
1013	1281	194	233	30	chr3	56108820	56109229	-103490554	+	RMER19B	LTR	ERVK	88	664	-238	1
1013	375	253	0	0	chr3	56109735	56109818	-103489965	-	RMER19B	LTR	ERVK	-287	615	533	1
1013	464	204	106	10	chr3	56110635	56110739	-103489044	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	114	-440	1
1013	234	294	43	96	chr3	56110810	56110904	-103488879	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-228	292	204	1
1013	410	241	5	51	chr3	56111835	56112052	-103487731	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3497	1439	1310	2
1013	236	231	0	19	chr3	56113766	56113819	-103485964	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-38	370	319	2
1013	1303	250	63	60	chr3	56114941	56115306	-103484477	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	379	0	2
1013	484	283	110	10	chr3	56115848	56116136	-103483647	-	MER31B	LTR	ERV1	-107	359	1	2
1013	227	157	0	19	chr3	56116185	56116237	-103483546	+	LTR37A	LTR	ERV1	371	421	-5	2
1013	809	255	116	43	chr3	56119829	56120195	-103479588	-	MER31A	LTR	ERV1	-51	415	1	2
1013	2135	190	19	54	chr3	56120703	56120915	-103478868	+	MTC	LTR	MaLR	1	210	-211	2
1013	2135	190	19	54	chr3	56121311	56121521	-103478262	+	MTC	LTR	MaLR	211	413	-8	2
1013	860	255	127	8	chr3	56124110	56124355	-103475428	+	MTD	LTR	MaLR	1	274	-145	2
1013	1569	183	69	63	chr3	56124362	56124583	-103475200	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	213	-171	2
1013	4408	119	98	40	chr3	56124583	56125424	-103474359	-	RMER17D	LTR	ERVK	0	889	1	2
1013	1569	183	69	63	chr3	56125424	56125581	-103474202	+	ORR1C2	LTR	MaLR	214	381	-3	2
1013	403	208	112	9	chr3	56125582	56125689	-103474094	+	MTE2a	LTR	MaLR	262	379	0	2
1013	1304	286	108	76	chr3	56125689	56126479	-103473304	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	1	1289	-291	2
1013	1304	266	109	98	chr3	56126692	56126951	-103472832	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	989	1251	-7	2
1013	1454	256	55	22	chr3	56126994	56127358	-103472425	+	MTD	LTR	MaLR	44	419	0	2
1013	2534	53	0	0	chr3	56128036	56128359	-103471424	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	7234	7556	0	2
1013	3143	60	176	5	chr3	56128359	56128796	-103470987	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	2
1013	3432	33	0	2	chr3	56129640	56130037	-103469746	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1013	360	327	99	18	chr3	56132925	56133096	-103466687	+	MER34A1	LTR	ERV1	48	232	-355	2
1013	497	248	15	8	chr3	56134183	56134313	-103465470	+	MER34A1	LTR	ERV1	385	515	-72	2
1013	1831	196	58	16	chr3	56143044	56143408	-103456375	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-5	379	1	2
1013	1827	100	116	64	chr3	56147877	56148188	-103451595	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1013	1627	140	37	189	chr3	56150294	56150727	-103449056	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	2
1013	419	288	63	73	chr3	56150753	56151049	-103448734	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	370	71	2
1013	290	266	109	50	chr3	56151081	56151200	-103448583	-	MTEb	LTR	MaLR	-251	128	3	2
1013	342	383	15	39	chr3	56151601	56151805	-103447978	-	MLT1J	LTR	MaLR	-211	301	103	2
1013	236	271	69	40	chr3	56156656	56156751	-103443032	+	RMER17A	LTR	ERVK	347	444	-307	2
1013	236	271	69	40	chr3	56156922	56156999	-103442784	+	RMER17A	LTR	ERVK	445	524	-227	2
1013	342	296	45	63	chr3	56158464	56158780	-103441003	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	56	2
1013	335	264	73	121	chr3	56158831	56158967	-103440816	-	RMER10A	LTR	ERVL	-19	423	275	2
1013	335	264	73	121	chr3	56158999	56159176	-103440607	-	RMER10A	LTR	ERVL	-168	274	125	2
1013	351	338	92	92	chr3	56165037	56165383	-103434400	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	363	18	2
1013	250	200	0	0	chr3	56165637	56165687	-103434096	+	MT2B	LTR	ERVL	548	597	-4	2
1013	2651	234	16	7	chr3	56165692	56166354	-103433429	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-195	1314	513	2
1013	3499	23	0	0	chr3	56168653	56169049	-103430734	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1013	454	254	66	66	chr3	56171114	56171266	-103428517	+	MLT1A1	LTR	MaLR	257	408	0	3
1013	1387	204	50	44	chr3	56171816	56172286	-103427497	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-53	459	38	3
1013	3748	150	69	26	chr3	56172352	56173015	-103426768	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	3
1013	381	266	106	38	chr3	56182466	56182626	-103417157	-	MTEa	LTR	MaLR	-11	368	198	3
1013	298	182	36	0	chr3	56185433	56185488	-103414295	+	ORR1B1	LTR	MaLR	15	71	-323	3
1013	2289	197	7	45	chr3	56196583	56197029	-103402754	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-99	429	1	3
1013	759	157	87	13	chr3	56198069	56198218	-103401565	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	208	3
1013	3266	51	2	10	chr3	56201041	56201440	-103398343	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1013	992	235	155	39	chr3	56201561	56201897	-103397886	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	375	-4	3
1013	1191	246	82	71	chr3	56204062	56204424	-103395359	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	5	3
1013	1390	233	202	25	chr3	56205625	56206114	-103393669	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	576	1	3
1013	1148	265	92	39	chr3	56207725	56208003	-103391780	+	MTD	LTR	MaLR	5	290	-129	3
1013	2928	101	5	0	chr3	56208003	56208401	-103391382	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
1013	1148	272	85	36	chr3	56208401	56208515	-103391268	+	MTD	LTR	MaLR	284	405	-14	3
1013	2056	215	77	46	chr3	56218023	56218474	-103381309	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	470	-93	3
1013	2056	215	77	46	chr3	56218538	56218632	-103381151	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	471	562	-1	3
1014	707	353	71	44	chr3	56231194	56231532	-103368251	+	MLT1F2	LTR	MaLR	193	539	-21	3
1014	1712	265	78	75	chr3	56231555	56232183	-103367600	+	RLTR26	LTR	ERVK	2	631	-11	3
1014	1433	240	47	0	chr3	56234163	56234484	-103365299	+	MTD	LTR	MaLR	3	338	-81	3
1014	1584	249	52	12	chr3	56234849	56235252	-103364531	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1014	715	191	380	30	chr3	56236527	56236813	-103362970	+	MTD	LTR	MaLR	20	405	-14	3
1014	627	277	129	22	chr3	56236996	56237361	-103362422	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-1084	405	2	4
1014	1135	315	104	32	chr3	56237372	56237874	-103361909	-	MLT1F	LTR	MaLR	-9	539	2	4
1014	567	313	112	94	chr3	56244339	56244731	-103355052	-	LTR16A1	LTR	ERVL	-55	401	3	4
1014	687	317	74	43	chr3	56246995	56247321	-103352462	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	336	-29	4
1014	438	374	57	27	chr3	56250176	56250509	-103349274	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	343	-16	4
1014	2561	204	31	29	chr3	56251438	56251786	-103347997	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	394	4
1014	2334	207	81	33	chr3	56251786	56252295	-103347488	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	4
1014	2561	212	32	27	chr3	56252295	56252517	-103347266	-	RMER19A	LTR	ERVK	-344	393	178	4
1014	1559	224	83	3	chr3	56253734	56254070	-103345713	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	365	-5	4
1014	547	237	0	51	chr3	56256253	56256391	-103343392	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	131	-239	4
1014	1292	232	122	14	chr3	56256396	56256750	-103343033	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	23	4
1014	734	202	123	3	chr3	56256787	56257001	-103342782	+	ORR1D2	LTR	MaLR	127	370	-4	4
1014	296	282	63	16	chr3	56261649	56261775	-103338008	+	MLT1N2	LTR	MaLR	431	562	0	4
1014	1654	286	33	27	chr3	56265043	56265593	-103334190	+	MER89	LTR	ERV1	5	557	-2	4
1014	3018	54	52	0	chr3	56265708	56266077	-103333706	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	4
1014	255	259	17	0	chr3	56267199	56267257	-103332526	+	RMER15	LTR	ERVL	11	69	-506	4
1014	1499	257	134	15	chr3	56267273	56267727	-103332056	+	RMER15	LTR	ERVL	31	538	-37	4
1014	237	164	53	35	chr3	56268619	56268676	-103331107	+	MLT1A1	LTR	MaLR	81	138	-270	4
1014	235	272	96	24	chr3	56278129	56278212	-103321571	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-319	89	1	4
1014	917	275	70	73	chr3	56278643	56278733	-103321050	+	MTD	LTR	MaLR	1	91	-328	4
1014	917	270	116	70	chr3	56278756	56279035	-103320748	+	MTD	LTR	MaLR	92	386	-35	4
1014	349	339	64	29	chr3	56281561	56281734	-103318049	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-25	340	162	4
1014	648	350	44	20	chr3	56282309	56282604	-103317179	+	MLT1F	LTR	MaLR	244	545	-3	4
1014	555	255	56	32	chr3	56286935	56287220	-103312563	+	MTD	LTR	MaLR	7	381	-38	4
1014	1679	225	68	13	chr3	56287963	56288351	-103311432	+	MTD	LTR	MaLR	7	405	-14	4
1014	4764	147	97	60	chr3	56292852	56293722	-103306061	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	4
1014	1644	238	26	24	chr3	56305130	56305509	-103294274	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	5	4
1014	1906	150	181	12	chr3	56307117	56307454	-103292329	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1014	425	322	19	37	chr3	56309808	56310024	-103289759	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1189	1400	-4122	5
1014	1349	246	29	72	chr3	56312279	56312655	-103287128	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	11	5
1014	1026	306	59	37	chr3	56313836	56314243	-103285540	-	MLT1C	LTR	MaLR	-17	450	35	5
1014	319	316	17	17	chr3	56315289	56315405	-103284378	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	116	-292	5
1014	1904	165	55	37	chr3	56327523	56327926	-103271857	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	5
1014	397	200	59	0	chr3	56328479	56328564	-103271219	+	MTD	LTR	MaLR	307	396	-23	5
1014	459	310	63	126	chr3	56329881	56330294	-103269489	+	MLT1A1	LTR	MaLR	21	407	-1	5
1014	411	333	49	0	chr3	56331200	56331362	-103268421	-	MLT1D	LTR	MaLR	-58	447	278	5
1014	1846	161	26	7	chr3	56333670	56333977	-103265806	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	313	-54	5
1014	2141	78	49	61	chr3	56341021	56341348	-103258435	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	5
1014	869	170	26	35	chr3	56358911	56359103	-103240680	+	ORR1D1	LTR	MaLR	8	170	-159	5
1015	480	266	152	31	chr3	56362067	56362330	-103237453	-	MLT1D	LTR	MaLR	-33	472	192	5
1015	3541	167	16	12	chr3	56362731	56363375	-103236408	-	RMER6A	LTR	ERVK	-2	754	109	5
1015	490	353	98	60	chr3	56374070	56374507	-103225276	+	MTE-int	LTR	MaLR	133	586	-994	5
1015	565	266	154	37	chr3	56375181	56375427	-103224356	-	RMER15	LTR	ERVL	-24	551	277	5
1015	333	323	119	26	chr3	56375732	56375926	-103223857	+	MTE-int	LTR	MaLR	1075	1286	-294	5
1015	241	324	111	76	chr3	56378930	56379271	-103220512	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-13	357	5	5
1015	825	181	67	0	chr3	56381391	56381540	-103218243	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-942	161	3	5
1015	3340	169	150	140	chr3	56383089	56384105	-103215678	+	RLTR25B	LTR	ERVK	3	1028	0	5
1015	299	175	186	49	chr3	56384724	56384826	-103214957	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1188	1303	-206	5
1015	742	203	159	15	chr3	56384958	56384983	-103214800	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1287	1316	-193	5
1015	4746	104	6	10	chr3	56384983	56385664	-103214119	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	5
1015	742	203	159	15	chr3	56385664	56385833	-103213950	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1317	1509	0	5
1015	1688	178	70	37	chr3	56385833	56386188	-103213595	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1015	977	234	61	83	chr3	56392819	56392871	-103206912	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	561	6
1015	977	220	81	131	chr3	56392927	56393297	-103206486	-	MT2B	LTR	ERVL	-41	560	64	6
1015	873	319	109	31	chr3	56398863	56399311	-103200472	-	MER74B	LTR	ERVL	-67	555	73	6
1015	292	341	63	107	chr3	56399895	56400213	-103199570	+	MLT1A	LTR	MaLR	63	366	-8	6
1015	226	316	59	59	chr3	56407540	56407641	-103192142	-	RLTR45	LTR	ERVK	-378	104	4	6
1015	1601	218	42	24	chr3	56409585	56409918	-103189865	+	MTC	LTR	MaLR	1	339	-82	6
1015	320	272	11	21	chr3	56409920	56410014	-103189769	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	93	-436	6
1015	343	162	24	108	chr3	56410305	56410388	-103189395	+	MTC	LTR	MaLR	338	413	-8	6
1015	3855	196	64	10	chr3	56410388	56411158	-103188625	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	811	-447	6
1015	757	240	7	14	chr3	56417421	56417569	-103182214	+	MTC-int	LTR	MaLR	797	943	-315	6
1015	421	297	73	69	chr3	56418362	56418608	-103181175	-	RMER2	LTR	ERV1	-13	554	308	6
1015	1117	122	6	6	chr3	56421278	56421451	-103178332	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	149	6
1015	890	130	6	90	chr3	56422666	56422843	-103176940	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-167	162	1	6
1015	3072	58	8	10	chr3	56424808	56425205	-103174578	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1015	404	290	153	139	chr3	56426021	56426510	-103173273	-	RLTR18	LTR	ERVK	-120	496	1	6
1015	1597	191	101	25	chr3	56428274	56428629	-103171154	-	MTC	LTR	MaLR	-39	382	1	6
1015	2665	162	30	45	chr3	56428629	56429160	-103170623	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	736	6
1015	1764	194	26	34	chr3	56429186	56429541	-103170242	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	68	6
1015	1764	194	26	34	chr3	56430343	56430365	-103169418	-	MTC	LTR	MaLR	-354	67	47	6
1015	493	125	12	12	chr3	56430737	56430818	-103168965	-	MTC	LTR	MaLR	-340	81	1	6
1015	270	233	137	0	chr3	56431627	56431700	-103168083	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	294	6
1015	628	179	0	0	chr3	56435736	56435841	-103163942	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	105	-262	6
1015	934	212	65	49	chr3	56435841	56436222	-103163561	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	393	1	6
1015	1426	201	50	67	chr3	56436222	56436480	-103163303	+	ORR1B2	LTR	MaLR	116	367	0	6
1015	2211	164	35	8	chr3	56437698	56438073	-103161710	-	MTC	LTR	MaLR	-7	414	30	6
1015	1458	77	58	0	chr3	56438073	56438281	-103161502	+	MT2B	LTR	ERVL	1	220	-381	6
1015	924	152	77	24	chr3	56438268	56438437	-103161346	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-189	178	1	6
1015	1128	214	49	37	chr3	56439265	56439689	-103160094	-	MT2A	LTR	ERVL	0	601	14	6
1015	1708	207	67	0	chr3	56440568	56440925	-103158858	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	4	6
1015	663	282	59	115	chr3	56442203	56442717	-103157066	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-24	504	1	6
1015	1591	218	11	26	chr3	56443551	56443900	-103155883	+	RLTR14	LTR	ERV1	35	378	-4	6
1015	384	136	0	17	chr3	56443942	56444002	-103155781	+	RMER13B	LTR	ERVK	329	387	-521	6
1015	1480	234	50	8	chr3	56448673	56449073	-103150710	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	6
1015	537	198	57	52	chr3	56453343	56453575	-103146208	+	MT2A	LTR	ERVL	16	251	-224	6
1015	300	95	0	0	chr3	56453640	56453682	-103146101	+	MT2B2	LTR	ERVL	543	584	0	6
1015	1462	191	30	50	chr3	56457588	56457951	-103141832	+	RMER17C	LTR	ERVK	42	397	-13	7
1015	539	356	11	65	chr3	56460714	56460975	-103138808	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	314	7
1015	1444	250	92	52	chr3	56463090	56463491	-103136292	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	7
1015	241	319	111	63	chr3	56466317	56466588	-103133195	+	ORR1E	LTR	MaLR	59	342	-17	7
1015	651	283	107	57	chr3	56468964	56469245	-103130538	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	313	-46	7
1015	1698	99	134	14	chr3	56470356	56470632	-103129151	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	7
1015	598	287	121	48	chr3	56478309	56478558	-103121225	+	MER21B	LTR	ERV1	549	815	-48	7
1015	533	249	32	103	chr3	56480557	56480759	-103119024	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	419	175	7
1015	323	289	89	73	chr3	56481243	56481366	-103118417	-	ORR1E	LTR	MaLR	-245	125	1	7
1015	1190	233	212	0	chr3	56483831	56484175	-103115608	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	7
1015	312	354	25	67	chr3	56485426	56485500	-103114283	+	MLT1G	LTR	MaLR	3	69	-510	7
1015	323	360	22	62	chr3	56485688	56485878	-103113905	+	MLT1G	LTR	MaLR	35	231	-348	7
1015	232	319	58	153	chr3	56485998	56486130	-103113653	+	MLT1G	LTR	MaLR	371	484	-64	7
1015	242	215	63	34	chr3	56486275	56486339	-103113444	+	MLT1G	LTR	MaLR	485	578	-1	7
1015	322	341	17	35	chr3	56486340	56486513	-103113270	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	2722	2891	-2776	7
1015	694	311	86	34	chr3	56488930	56489262	-103110521	+	MLT2C1	LTR	ERVL	39	380	-17	7
1015	466	163	103	11	chr3	56489352	56489439	-103110344	+	ORR1C2	LTR	MaLR	28	122	-252	7
1015	2498	187	124	38	chr3	56489440	56489995	-103109788	+	RLTR18	LTR	ERVK	9	611	-5	7
1015	1068	235	52	12	chr3	56490000	56490250	-103109533	+	ORR1C2	LTR	MaLR	125	384	0	7
1016	1652	157	48	66	chr3	56492604	56492939	-103106844	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	7
1016	276	230	22	33	chr3	56495595	56495685	-103104098	+	MER57A-int	LTR	ERV1	5804	5892	-295	7
1016	367	355	93	10	chr3	56496090	56496295	-103103488	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	240	-119	7
1016	1950	244	16	62	chr3	56497315	56497814	-103101969	+	RMER15	LTR	ERVL	13	488	-87	7
1016	272	272	83	75	chr3	56498195	56498383	-103101400	-	LTRIS4	LTR	ERV1	-32	532	283	7
1016	256	283	0	16	chr3	56499280	56499341	-103100442	-	MER34A1	LTR	ERV1	0	587	528	7
1016	1883	169	21	99	chr3	56499343	56499858	-103099925	+	RMER4B	LTR	ERVK	2	466	0	7
1016	298	264	34	102	chr3	56499870	56499988	-103099795	-	MER34A1	LTR	ERV1	-56	531	422	7
1016	1880	180	111	32	chr3	56500053	56500495	-103099288	+	RLTR28	LTR	ERVL	48	524	0	1
1016	1026	284	64	80	chr3	56500952	56501480	-103098303	-	LTR73	LTR	ERV1	-35	537	18	2
1016	387	351	6	25	chr3	56501789	56501947	-103097836	+	MLT1C	LTR	MaLR	313	467	0	3
1016	246	204	19	0	chr3	56503565	56503619	-103096164	+	RLTR28B	LTR	ERVL	11	65	-459	4
1016	1425	170	27	107	chr3	56503791	56504192	-103095591	-	RMER17C	LTR	ERVK	-41	369	1	7
1016	691	277	129	60	chr3	56504192	56504541	-103095242	+	RLTR28B	LTR	ERVL	71	443	-38	4
1016	548	297	42	0	chr3	56505200	56505365	-103094418	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-370	4629	4458	9
1016	569	342	112	8	chr3	56506415	56506530	-103093253	+	MLT1F	LTR	MaLR	26	185	-363	1
1016	569	298	99	30	chr3	56506656	56506852	-103092931	+	MLT1F	LTR	MaLR	186	399	-149	1
1016	437	357	83	71	chr3	56513813	56514220	-103085563	+	LTR16B1	LTR	ERVL	36	447	-33	1
1016	639	277	69	0	chr3	56514856	56515015	-103084768	+	MTD	LTR	MaLR	34	203	-216	2
1016	1637	192	99	0	chr3	56516749	56516946	-103082837	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	150	2
1016	1637	192	99	0	chr3	56517001	56517137	-103082646	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-225	149	4	2
1016	1757	200	63	45	chr3	56519373	56519771	-103080012	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	2
1016	281	305	105	73	chr3	56519817	56520160	-103079623	+	MLT1A	LTR	MaLR	35	370	-4	2
1016	382	265	28	47	chr3	56520302	56520409	-103079374	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-599	772	668	2
1016	969	217	112	89	chr3	56525201	56525780	-103074003	+	MT2B	LTR	ERVL	1	540	-61	3
1016	4781	140	183	32	chr3	56527819	56528637	-103071146	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	142	3
1016	4781	140	183	32	chr3	56528687	56528836	-103070947	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-973	141	1	3
1016	981	151	24	0	chr3	56528857	56529023	-103070760	+	MTC	LTR	MaLR	1	170	-251	4
1016	1930	168	38	68	chr3	56529048	56529445	-103070338	+	RLTR41	LTR	ERV1	62	446	0	4
1016	1495	191	28	4	chr3	56529445	56529693	-103070090	+	MTC	LTR	MaLR	167	420	-1	4
1016	4697	195	115	13	chr3	56529693	56530834	-103068949	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	1258	0	4
1016	2582	151	24	0	chr3	56530834	56531245	-103068538	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1016	257	275	29	14	chr3	56531685	56531755	-103068028	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-267	181	111	4
1016	584	72	48	0	chr3	56532320	56532403	-103067380	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	314	4
1016	3345	33	13	0	chr3	56532461	56532852	-103066931	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1016	259	299	105	31	chr3	56535915	56536077	-103063706	+	RLTR21	LTR	ERVK	1080	1253	-319	4
1016	4932	110	98	13	chr3	56536882	56537209	-103062574	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	367	-522	5
1016	4932	110	98	13	chr3	56537325	56537815	-103061968	+	RMER17D	LTR	ERVK	368	887	-2	5
1016	1927	217	50	15	chr3	56537951	56538354	-103061429	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	5
1016	476	180	154	39	chr3	56541440	56541544	-103058239	+	MTD	LTR	MaLR	194	309	-110	5
1016	1098	303	58	74	chr3	56542509	56543025	-103056758	-	LTR40a	LTR	ERVL	-2	517	10	6
1016	1148	224	168	26	chr3	56553870	56554210	-103045573	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	7
1016	334	276	76	30	chr3	56556668	56556799	-103042984	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	404	-4	8
1016	881	308	111	22	chr3	56557078	56557393	-103042390	-	ORR1E	LTR	MaLR	-15	344	2	8
1016	475	214	14	143	chr3	56561761	56561833	-103037950	+	MTD	LTR	MaLR	13	79	-340	8
1016	475	214	14	143	chr3	56562026	56562099	-103037684	+	MTD	LTR	MaLR	80	139	-280	8
1016	799	236	148	7	chr3	56566081	56566334	-103033449	+	MTD	LTR	MaLR	130	419	0	8
1016	1418	219	144	24	chr3	56571693	56572067	-103027716	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	9
1016	920	312	75	36	chr3	56578538	56578752	-103021031	+	MT2A	LTR	ERVL	15	229	-304	1
1016	920	280	128	100	chr3	56578817	56579152	-103020631	+	MT2A	LTR	ERVL	230	593	-8	1
1016	266	309	113	0	chr3	56582803	56582900	-103016883	-	ORR1E	LTR	MaLR	-229	130	23	1
1016	1950	191	80	0	chr3	56586930	56587276	-103012507	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	370	-37	1
1016	1950	191	80	0	chr3	56587314	56587344	-103012439	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	371	406	-1	1
1016	454	349	97	54	chr3	56587933	56588378	-103011405	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-65	490	21	1
1016	438	227	20	10	chr3	56596607	56596705	-103003078	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	321	1
1016	1522	231	60	81	chr3	56596736	56597183	-103002600	+	RLTR28B	LTR	ERVL	17	454	-27	1
1016	999	217	104	21	chr3	56597191	56597431	-103002352	-	MTD	LTR	MaLR	-92	327	68	1
1016	3874	47	19	0	chr3	56598558	56599024	-103000759	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1016	323	286	12	0	chr3	56599467	56599551	-103000232	-	MTD	LTR	MaLR	-334	85	1	1
1016	1133	288	24	29	chr3	56599555	56599931	-102999852	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	5	1
1016	1302	140	43	13	chr3	56602005	56602237	-102997546	+	RMER19B	LTR	ERVK	664	902	0	1
1016	3980	29	11	69	chr3	56602961	56603484	-102996299	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1016	1168	218	73	46	chr3	56604470	56604844	-102994939	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	1
1016	842	251	169	25	chr3	56606523	56606842	-102992941	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	365	0	1
1016	1326	265	39	50	chr3	56608241	56608602	-102991181	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	1
1016	353	118	78	24	chr3	56609221	56609288	-102990495	+	MT2B	LTR	ERVL	12	83	-518	1
1016	5555	169	21	28	chr3	56609288	56610083	-102989700	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	790	-238	1
1016	5555	169	21	28	chr3	56610258	56610497	-102989286	+	RLTR25B	LTR	ERVK	791	1027	-1	1
1016	993	205	151	46	chr3	56610541	56610911	-102988872	+	MT2B	LTR	ERVL	62	601	0	1
1016	1035	186	118	5	chr3	56611132	56611343	-102988440	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	235	-132	1
1016	2778	174	123	12	chr3	56611338	56611609	-102988174	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	156	434	-1075	1
1016	2778	174	123	12	chr3	56611634	56612020	-102987763	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	435	886	-623	1
1016	557	184	18	9	chr3	56612988	56613007	-102986776	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1258	1277	-93	1
1016	557	184	18	9	chr3	56613109	56613199	-102986584	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1278	1367	-3	1
1016	1983	139	67	3	chr3	56613201	56613546	-102986237	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	1
1016	1198	225	88	57	chr3	56621314	56621668	-102978115	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	48	1
1017	924	257	83	39	chr3	56625604	56625973	-102973810	+	RMER20B	LTR	ERVK	151	514	-2	1
1017	269	336	39	23	chr3	56626457	56626585	-102973198	+	MLT1L	LTR	MaLR	121	250	-360	1
1017	6297	59	15	1	chr3	56631047	56631844	-102967939	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	1
1017	320	347	181	47	chr3	56634284	56634538	-102965245	+	MLT1G1	LTR	MaLR	209	496	-83	1
1017	246	290	102	49	chr3	56636555	56636780	-102963003	+	RMER17C	LTR	ERVK	69	305	-105	2
1017	308	195	45	68	chr3	56640600	56640688	-102959095	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-21	387	302	2
1017	1271	141	37	33	chr3	56641920	56642162	-102957621	+	RLTR11A	LTR	ERVK	286	528	0	2
1017	4346	17	0	0	chr3	56644286	56644768	-102955015	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
1017	263	291	133	25	chr3	56644912	56645032	-102954751	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	133	-246	2
1017	1949	125	94	3	chr3	56645761	56646090	-102953693	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	2
1017	2938	188	111	20	chr3	56646090	56646528	-102953255	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	663	2
1017	3293	175	21	13	chr3	56646673	56647297	-102952486	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-880	629	1	2
1017	1670	178	66	55	chr3	56647297	56647660	-102952123	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1017	458	343	102	90	chr3	56647752	56648165	-102951618	+	MLT1D	LTR	MaLR	22	439	-66	2
1017	1998	104	97	0	chr3	56650393	56650691	-102949092	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1017	352	240	70	119	chr3	56651523	56651751	-102948032	+	ORR1E	LTR	MaLR	25	255	-104	2
1017	1156	179	31	4	chr3	56651815	56652040	-102947743	+	MT2A	LTR	ERVL	1	231	-302	2
1017	242	154	0	0	chr3	56658166	56658205	-102941578	+	MT2A	LTR	ERVL	218	256	-277	2
1017	575	199	7	90	chr3	56659789	56659933	-102939850	+	MT2A	LTR	ERVL	1	132	-401	2
1017	318	236	0	27	chr3	56659919	56659993	-102939790	+	MT2A	LTR	ERVL	86	157	-376	2
1017	230	163	20	0	chr3	56660110	56660159	-102939624	+	MT2A	LTR	ERVL	484	533	0	2
1017	971	194	146	4	chr3	56662731	56662964	-102936819	+	MTD	LTR	MaLR	154	419	0	2
1017	2384	200	26	4	chr3	56663959	56664049	-102935734	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	483	2
1017	2384	200	26	4	chr3	56664122	56664493	-102935290	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-96	482	108	2
1017	585	135	0	96	chr3	56666419	56666534	-102933249	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-430	104	1	2
1017	583	265	153	46	chr3	56666829	56666927	-102932856	-	MTC	LTR	MaLR	-129	292	174	2
1017	583	265	153	46	chr3	56667011	56667173	-102932610	-	MTC	LTR	MaLR	-248	173	5	2
1017	357	282	146	73	chr3	56667929	56668189	-102931594	-	MLT1H	LTR	MaLR	-1	548	270	2
1017	1220	210	0	13	chr3	56670197	56670424	-102929359	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	196	2
1017	1280	109	5	30	chr3	56670899	56671098	-102928685	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-213	194	1	2
1017	616	266	65	87	chr3	56671116	56671425	-102928358	-	MLT1B	LTR	MaLR	-33	357	56	2
1017	1516	285	58	22	chr3	56679217	56679242	-102920541	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	84	108	-455	2
1017	1516	285	58	22	chr3	56679275	56679712	-102920071	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	109	563	0	2
1017	2646	183	15	25	chr3	56679714	56680241	-102919542	+	RLTR11A	LTR	ERVK	7	528	0	2
1017	2162	88	29	78	chr3	56680840	56681184	-102918599	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1017	3897	161	63	101	chr3	56682396	56682639	-102917144	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	245	-657	2
1017	3897	161	63	101	chr3	56682666	56682966	-102916817	+	RMER19B	LTR	ERVK	246	543	-359	2
1017	3897	161	63	101	chr3	56683141	56683166	-102916617	+	RMER19B	LTR	ERVK	544	544	-358	2
1017	3897	161	63	101	chr3	56683896	56684194	-102915589	+	RMER19B	LTR	ERVK	544	836	-66	2
1017	471	265	28	70	chr3	56685491	56685633	-102914150	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	136	-234	2
1017	331	308	23	86	chr3	56685832	56685863	-102913920	+	ORR1D2	LTR	MaLR	136	163	-211	2
1017	1575	185	118	39	chr3	56686168	56686500	-102913283	+	ORR1B1	LTR	MaLR	29	386	-8	2
1017	6282	205	120	1	chr3	56686505	56687853	-102911930	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	2	1509	0	2
1017	2090	166	23	30	chr3	56687853	56688250	-102911533	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1017	308	317	144	29	chr3	56692670	56692878	-102906905	+	MLT1D	LTR	MaLR	208	439	-66	2
1017	1501	232	44	30	chr3	56692886	56693307	-102906476	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	272	3
1017	357	283	87	75	chr3	56693370	56693391	-102906392	-	RMER19C	LTR	ERVK	-572	330	310	3
1017	662	320	123	7	chr3	56695442	56695719	-102904064	-	MER70A	LTR	ERVL	0	472	164	3
1017	928	233	34	34	chr3	56699555	56699652	-102900131	+	MTD	LTR	MaLR	42	143	-276	3
1017	6170	121	30	18	chr3	56699652	56700599	-102899184	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	3
1017	928	239	84	46	chr3	56700599	56700843	-102898940	+	MTD	LTR	MaLR	111	379	0	3
1017	3217	27	24	20	chr3	56718255	56718664	-102881119	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	3
1017	621	274	47	24	chr3	56724133	56724346	-102875437	+	RLTR45	LTR	ERVK	265	482	0	3
1017	236	220	83	92	chr3	56731374	56731494	-102868289	+	RMER12	LTR	ERVK	698	816	-506	3
1017	621	274	47	24	chr3	56737756	56737969	-102861814	+	RLTR45	LTR	ERVK	265	482	0	3
1017	236	220	83	92	chr3	56744997	56745117	-102854666	+	RMER12	LTR	ERVK	698	816	-506	3
1017	1127	234	170	6	chr3	56753518	56753836	-102845947	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1018	253	319	85	45	chr3	56763038	56763215	-102836568	+	LTR37A	LTR	ERV1	18	201	-225	3
1018	356	335	147	40	chr3	56764071	56764370	-102835413	+	LTR16A	LTR	ERVL	101	431	-20	3
1018	251	324	71	18	chr3	56765916	56766029	-102833754	-	ORR1E	LTR	MaLR	-222	137	19	3
1018	495	397	39	14	chr3	56774724	56775005	-102824778	-	LTR33A	LTR	ERVL	-226	294	7	3
1018	3368	169	36	10	chr3	56775176	56775756	-102824027	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	98	3
1018	611	236	44	27	chr3	56783145	56783328	-102816455	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-295	186	1	4
1018	4209	169	101	46	chr3	56785362	56785431	-102814352	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	70	-1033	4
1018	4497	174	64	10	chr3	56785431	56786247	-102813536	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	860	0	4
1018	4209	169	101	46	chr3	56786247	56787019	-102812764	+	RLTR25A	LTR	ERVK	71	873	-230	4
1018	4209	169	101	46	chr3	56787068	56787130	-102812653	+	RLTR25A	LTR	ERVK	874	952	-151	4
1018	1019	205	60	84	chr3	56787454	56787752	-102812031	+	RLTR25A	LTR	ERVK	813	1103	0	4
1018	904	308	133	43	chr3	56787949	56788172	-102811611	-	MLT1C	LTR	MaLR	-8	459	195	4
1018	904	308	133	43	chr3	56788199	56788396	-102811387	-	MLT1C	LTR	MaLR	-273	194	1	4
1018	958	326	124	14	chr3	56794050	56794542	-102805241	-	MER89	LTR	ERV1	-12	547	2	4
1018	337	317	48	8	chr3	56797100	56797224	-102802559	+	MER57C2	LTR	ERV1	67	195	-239	4
1018	297	159	59	33	chr3	56800011	56800116	-102799667	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	275	4
1018	861	262	30	40	chr3	56800133	56800332	-102799451	+	ORR1D2	LTR	MaLR	25	221	-149	4
1018	1250	230	81	26	chr3	56800473	56800817	-102798966	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	8	4
1018	653	315	84	50	chr3	56808854	56809175	-102790608	+	MLT1F2	LTR	MaLR	229	560	0	4
1018	227	387	17	0	chr3	56809990	56810109	-102789674	+	MLT2F	LTR	ERVL	490	610	-53	4
1018	3151	74	0	12	chr3	56810598	56811010	-102788773	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	4
1018	831	242	87	42	chr3	56814436	56814677	-102785106	+	RMER19B	LTR	ERVK	310	561	-341	4
1018	5449	126	19	52	chr3	56817175	56818107	-102781676	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	902	-4	4
1018	608	318	16	11	chr3	56818450	56818662	-102781121	-	MER57E2	LTR	ERV1	-45	357	108	4
1018	332	262	0	12	chr3	56820142	56820223	-102779560	-	LTR68	LTR	ERV1	-304	436	357	4
1018	2996	22	0	116	chr3	56824515	56824928	-102774855	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	4
1018	3933	119	8	6	chr3	56824928	56825616	-102774167	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6965	4
1018	1439	100	100	0	chr3	56825616	56825845	-102773938	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5004	4
1018	439	308	21	16	chr3	56825859	56826136	-102773647	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5530	1012	822	4
1018	2716	47	0	3	chr3	56826276	56826618	-102773165	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-995	992	652	4
1018	335	67	0	0	chr3	56826621	56826666	-102773117	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-6405	137	93	4
1018	1278	68	6	6	chr3	56826921	56827099	-102772684	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7403	178	1	4
1018	2940	36	3	64	chr3	56827100	56827488	-102772295	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-1	364	1	4
1018	2092	177	31	0	chr3	56832149	56832505	-102767278	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1018	1588	223	20	3	chr3	56832719	56833025	-102766758	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	69	4
1018	2074	109	9	67	chr3	56833652	56833997	-102765786	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	5	4
1018	298	326	76	136	chr3	56842679	56843112	-102756671	-	RMER10A	LTR	ERVL	-24	418	12	5
1018	884	271	135	6	chr3	56846408	56846735	-102753048	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	370	0	5
1018	487	271	7	41	chr3	56848552	56848698	-102751085	+	MLT2B2	LTR	ERVL	422	562	0	5
1018	577	309	43	39	chr3	56852593	56852849	-102746934	-	MLT1B	LTR	MaLR	-21	369	113	5
1018	344	300	10	0	chr3	56853055	56853155	-102746628	-	MTE-int	LTR	MaLR	-878	702	602	5
1018	286	258	0	119	chr3	56853379	56853480	-102746303	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1196	384	296	5
1018	733	297	28	14	chr3	56853458	56853670	-102746113	-	ORR1E	LTR	MaLR	-121	238	24	5
1018	4202	174	67	70	chr3	56854017	56854978	-102744805	+	RLTR21	LTR	ERVK	29	986	-586	5
1018	239	258	0	16	chr3	56854969	56855022	-102744761	+	RMER12B	LTR	ERVK	1202	1253	-151	5
1018	473	285	113	38	chr3	56855083	56855118	-102744665	+	RLTR21	LTR	ERVK	1255	1289	-283	5
1018	473	278	62	16	chr3	56855162	56855362	-102744421	+	RLTR21	LTR	ERVK	1285	1454	-118	5
1018	3829	151	26	19	chr3	56855626	56856356	-102743427	-	RMER17A	LTR	ERVK	-16	735	1	5
1018	819	270	62	47	chr3	56861494	56861865	-102737918	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	6	5
1018	829	305	90	53	chr3	56862093	56862450	-102737333	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	5
1018	366	209	0	117	chr3	56876218	56876321	-102723462	+	MT2B	LTR	ERVL	43	133	-468	5
1018	1392	221	109	22	chr3	56876313	56876677	-102723106	+	MT2B	LTR	ERVL	72	601	0	5
1018	316	348	23	63	chr3	56879546	56879721	-102720062	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	241	5
1018	1336	205	32	0	chr3	56881661	56881910	-102717873	-	MTC	LTR	MaLR	-58	363	107	5
1019	444	356	57	45	chr3	56893909	56894165	-102705618	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-153	258	1	5
1019	513	233	159	2	chr3	56894218	56894378	-102705405	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	218	5
1019	1111	224	65	102	chr3	56895960	56896360	-102703423	+	MT2A	LTR	ERVL	1	517	-84	5
1019	3344	239	60	37	chr3	56896381	56897270	-102702513	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	462	1370	0	5
1019	1505	183	140	88	chr3	56897270	56897635	-102702148	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
1019	1470	253	40	29	chr3	56899158	56899533	-102700250	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	6
1019	231	323	20	20	chr3	56902982	56903080	-102696703	+	MLT1H	LTR	MaLR	26	123	-426	6
1019	2596	133	246	9	chr3	56903758	56904310	-102695473	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	683	-7	6
1019	1895	201	58	20	chr3	56904390	56904786	-102694997	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	6
1019	1121	201	143	37	chr3	56907168	56907468	-102692315	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	6
1019	454	252	41	27	chr3	56909657	56909804	-102689979	+	ORR1D2	LTR	MaLR	221	369	-1	6
1019	412	169	0	0	chr3	56910481	56910546	-102689237	+	ORR1C1	LTR	MaLR	302	366	-12	6
1019	2041	189	5	11	chr3	56910736	56911116	-102688667	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	6
1019	271	322	22	11	chr3	56922501	56922592	-102677191	-	MLT1C	LTR	MaLR	-38	429	338	6
1019	332	252	48	19	chr3	56931032	56931137	-102668646	+	MTEa	LTR	MaLR	272	379	0	6
1019	822	214	162	22	chr3	56933035	56933264	-102666519	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	119	6
1019	1492	202	52	76	chr3	56938757	56939138	-102660645	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	374	-10	6
1019	1298	158	73	52	chr3	56949381	56949668	-102650115	+	MTE2b	LTR	MaLR	85	377	-2	6
1019	792	258	74	62	chr3	56950211	56950550	-102649233	+	RLTR28B	LTR	ERVL	110	452	-29	6
1019	405	301	125	14	chr3	56954904	56955200	-102644583	+	RMER20B	LTR	ERVK	147	469	-47	6
1019	226	171	49	0	chr3	56956492	56956533	-102643250	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-250	304	262	6
1019	2160	128	38	6	chr3	56960015	56960354	-102639429	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	351	-16	6
1019	1004	161	24	0	chr3	56960344	56960512	-102639271	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-194	173	2	6
1019	960	198	146	0	chr3	56960671	56960872	-102638911	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	413	649	-860	6
1019	230	233	0	0	chr3	56961831	56961874	-102637909	+	RMER20B	LTR	ERVK	16	58	-569	6
1019	260	202	149	35	chr3	56962770	56962857	-102636926	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3857	3953	-2184	6
1019	2659	253	26	9	chr3	56963250	56963933	-102635850	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	6223	6917	-2	7
1019	1595	139	0	16	chr3	56963936	56964191	-102635592	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	251	-376	7
1019	1198	226	12	43	chr3	56964202	56964456	-102635327	+	RMER20B	LTR	ERVK	377	622	-5	7
1019	294	272	101	50	chr3	56965069	56965228	-102634555	-	RMER15	LTR	ERVL	-4	571	405	7
1019	1775	215	63	46	chr3	56966317	56966843	-102632940	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2704	7
1019	1433	138	117	36	chr3	56966843	56967152	-102632631	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	76	7
1019	448	158	26	122	chr3	56967165	56967335	-102632448	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-528	2710	2607	7
1019	510	177	0	74	chr3	56967457	56967579	-102632204	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-707	2531	2419	7
1019	400	127	0	102	chr3	56967618	56967706	-102632077	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-3839	2298	2220	7
1019	322	239	45	0	chr3	56967910	56967998	-102631785	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-5059	1078	987	7
1019	897	236	128	62	chr3	56970317	56970738	-102629045	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-4169	822	374	7
1019	570	285	39	35	chr3	56970734	56970963	-102628820	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-4745	246	17	7
1019	695	226	97	0	chr3	56970996	56971151	-102628632	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	523	7
1019	428	161	25	0	chr3	56971157	56971238	-102628545	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-445	1881	1799	7
1019	2882	145	80	6	chr3	56971238	56971725	-102628058	-	RLTR17	LTR	ERVK	-169	523	1	7
1019	1986	224	29	32	chr3	56971725	56972320	-102627463	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	0	2842	2250	7
1019	434	322	118	26	chr3	56972321	56972627	-102627156	-	RMER17C	LTR	ERVK	-62	348	15	7
1019	1642	138	56	66	chr3	56974828	56975223	-102624560	+	RMER17C	LTR	ERVK	17	407	-3	7
1019	1559	179	27	82	chr3	56975890	56976291	-102623492	-	RMER17C	LTR	ERVK	-31	379	1	7
1019	226	268	80	30	chr3	56981888	56981988	-102617795	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	327	431	-223	7
1019	2222	129	0	9	chr3	56982127	56982456	-102617327	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	7
1019	2223	150	0	11	chr3	56984234	56984592	-102615191	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	7
1019	1525	153	8	19	chr3	56998328	56998588	-102601195	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-150	257	1	7
1019	3982	275	66	34	chr3	57008289	57010376	-102589407	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	530	2915	-2345	7
1019	2077	241	59	10	chr3	57010387	57011000	-102588783	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	3100	3742	-1518	7
1020	3365	248	67	80	chr3	57017147	57018357	-102581426	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	3182	4364	-4595	1
1020	3365	248	67	80	chr3	57018569	57018784	-102580999	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	4365	4588	-4371	1
1020	2138	163	10	29	chr3	57022209	57022626	-102577157	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	1
1020	1311	191	8	0	chr3	57023906	57024141	-102575642	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-76	291	55	1
1020	473	117	13	0	chr3	57024308	57024385	-102575398	+	ORR1B1	LTR	MaLR	309	386	-8	2
1020	277	211	0	17	chr3	57024575	57024633	-102575150	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-310	57	1	1
1020	359	234	36	10	chr3	57026926	57027090	-102572693	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2361	5220	5125	2
1020	1961	170	53	0	chr3	57027201	57027542	-102572241	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	2
1020	1254	178	34	211	chr3	57032883	57033361	-102566422	+	ORR1B1	LTR	MaLR	2	394	0	3
1020	939	201	53	135	chr3	57036361	57036717	-102563066	-	MTD-int	LTR	MaLR	-931	327	1	3
1020	823	243	28	26	chr3	57036721	57036963	-102562820	-	MTD	LTR	MaLR	-8	413	154	3
1020	258	297	11	32	chr3	57039360	57039454	-102560329	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	288	4
1020	2698	28	6	50	chr3	57040487	57040829	-102558954	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	4
1020	6024	54	12	18	chr3	57040831	57041663	-102558120	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5653	4
1020	10751	71	35	82	chr3	57041658	57043433	-102556350	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4781	1700	9	4
1020	2677	31	6	50	chr3	57043434	57043774	-102556009	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	3	5
1020	1526	241	109	132	chr3	57044291	57044820	-102554963	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2105	4032	3572	5
1020	7151	100	11	12	chr3	57044820	57045844	-102553939	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	5
1020	1526	254	127	134	chr3	57045844	57046901	-102552882	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2566	3571	2520	5
1020	1526	254	127	134	chr3	57047486	57047763	-102552020	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3618	2519	2222	5
1020	319	214	20	10	chr3	57047757	57047856	-102551927	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3553	1969	1870	5
1020	282	120	40	0	chr3	57048310	57048360	-102551423	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3905	1617	1566	5
1020	3317	43	5	0	chr3	57048360	57048754	-102551029	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1020	260	180	105	63	chr3	57048836	57048931	-102550852	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5160	977	879	5
1020	352	255	42	84	chr3	57049170	57049384	-102550399	-	RMER10A	LTR	ERVL	-116	326	122	5
1020	480	264	8	23	chr3	57050133	57050265	-102549518	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-1236	134	5	5
1020	1723	236	3	45	chr3	57050470	57050851	-102548932	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	365	-9	5
1020	5253	215	41	58	chr3	57050853	57052088	-102547695	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	156	1370	0	5
1020	1543	216	24	7	chr3	57052092	57052386	-102547397	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	304	-70	5
1020	783	301	69	72	chr3	57052805	57053181	-102546602	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	375	-15	6
1020	810	195	318	44	chr3	57054888	57055106	-102544677	+	ORR1B1	LTR	MaLR	6	283	-84	6
1020	3128	73	2	0	chr3	57055106	57055501	-102544282	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1020	577	192	31	55	chr3	57055501	57055586	-102544197	+	ORR1B1	LTR	MaLR	284	367	0	6
1020	1635	178	7	7	chr3	57057510	57057793	-102541990	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1226	283	1	6
1020	2038	161	76	8	chr3	57057793	57058162	-102541621	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1020	511	136	0	4	chr3	57058595	57058686	-102541097	+	MT2B	LTR	ERVL	4	92	-441	6
1020	503	220	71	40	chr3	57058727	57058892	-102540891	+	MT2B	LTR	ERVL	94	325	-168	6
1020	1708	50	8	70	chr3	57058896	57059153	-102540630	+	RLTR10	LTR	ERVK	148	388	-2	6
1020	6076	80	99	50	chr3	57059155	57060100	-102539683	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1	992	-995	6
1020	593	310	30	27	chr3	57060156	57060548	-102539235	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1309	1594	-5987	6
1020	8449	30	18	2	chr3	57060630	57060988	-102538795	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	990	1346	-641	7
1020	8449	30	18	2	chr3	57061033	57061655	-102538128	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1347	1984	-3	7
1020	3085	49	2	98	chr3	57061655	57062084	-102537699	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	7
1020	937	198	7	79	chr3	57062087	57062333	-102537450	+	MT2B	LTR	ERVL	252	601	0	6
1020	260	242	121	0	chr3	57071621	57071687	-102528096	-	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	-211	628	555	8
1020	501	306	35	17	chr3	57072258	57072431	-102527352	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	188	8
1020	243	217	137	56	chr3	57075273	57075434	-102524349	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-20	548	375	9
1020	3073	48	75	0	chr3	57076564	57076922	-102522861	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	9
1020	1396	184	129	15	chr3	57078375	57078707	-102521076	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	9
1020	442	322	59	42	chr3	57080572	57080891	-102518892	-	ORR1E	LTR	MaLR	-10	369	28	1
1020	1812	150	121	15	chr3	57082873	57083204	-102516579	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	367	0	1
1020	6593	177	124	30	chr3	57083204	57084584	-102515199	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	1509	0	1
1020	1752	207	36	22	chr3	57084584	57084945	-102514838	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	1
1020	409	272	141	42	chr3	57090061	57090253	-102509530	+	ORR1E	LTR	MaLR	39	249	-110	1
1020	450	272	6	174	chr3	57111469	57111574	-102488209	+	MT2A	LTR	ERVL	3	85	-448	1
1020	462	272	6	174	chr3	57112021	57112093	-102487690	+	MT2A	LTR	ERVL	86	150	-383	1
1020	1148	223	93	64	chr3	57112099	57112263	-102487520	+	MT2A	LTR	ERVL	106	268	-265	1
1020	2156	89	30	60	chr3	57112263	57112596	-102487187	+	ORR1A2	LTR	MaLR	5	327	0	1
1020	1148	223	93	64	chr3	57112596	57112776	-102487007	+	MT2A	LTR	ERVL	269	460	-73	1
1020	484	240	94	57	chr3	57112871	57113030	-102486753	+	MTC-int	LTR	MaLR	64	228	-1030	1
1020	2111	107	5	81	chr3	57113032	57113585	-102486198	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	694	-208	1
1020	989	215	9	37	chr3	57113804	57114021	-102485762	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	813	1023	0	1
1020	1959	264	198	22	chr3	57114025	57114803	-102484980	+	MTC-int	LTR	MaLR	225	1139	-119	1
1020	553	199	259	28	chr3	57115575	57115787	-102483996	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	261	-324	1
1020	377	317	75	33	chr3	57115805	57116017	-102483766	+	RMER19C	LTR	ERVK	335	555	-56	1
1020	228	183	46	77	chr3	57127451	57127516	-102472267	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	1
1020	2720	53	24	3	chr3	57137964	57138303	-102461480	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
1020	3182	48	5	8	chr3	57142475	57142872	-102456911	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1020	1866	206	14	0	chr3	57143067	57143416	-102456367	+	MTC	LTR	MaLR	5	358	-63	1
1020	5506	184	51	41	chr3	57143436	57143683	-102456100	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	228	-1030	1
1020	5506	184	51	41	chr3	57143828	57144826	-102454957	+	MTC-int	LTR	MaLR	229	1258	0	1
1020	1352	197	86	152	chr3	57144826	57145268	-102454515	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	1
1021	489	304	7	35	chr3	57148570	57148713	-102451070	-	LTR40b	LTR	ERVL	-5	457	319	1
1021	291	293	45	68	chr3	57157905	57157986	-102441797	+	ORR1D2	LTR	MaLR	127	205	-165	2
1021	236	229	8	173	chr3	57158001	57158128	-102441655	+	MT2B	LTR	ERVL	181	286	-315	2
1021	300	298	26	9	chr3	57158150	57158265	-102441518	+	ORR1D2	LTR	MaLR	195	311	-59	2
1021	2564	76	65	17	chr3	57168942	57169344	-102430439	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	2
1021	1103	255	111	27	chr3	57171011	57171345	-102428438	+	MTD	LTR	MaLR	20	381	-38	2
1021	703	222	83	97	chr3	57172936	57173190	-102426593	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	276	-118	2
1021	1111	201	25	0	chr3	57173230	57173434	-102426349	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	374	0	2
1021	444	293	67	91	chr3	57173478	57173688	-102426095	+	MLT1C	LTR	MaLR	20	224	-243	2
1021	1209	264	63	82	chr3	57173726	57174138	-102425645	+	MTE-int	LTR	MaLR	1149	1552	-28	2
1021	1138	204	155	24	chr3	57174854	57175190	-102424593	+	RLTR25B	LTR	ERVK	474	853	-175	2
1021	374	241	43	155	chr3	57175544	57175731	-102424052	+	RLTR25B	LTR	ERVK	757	922	-106	2
1021	4314	22	2	0	chr3	57175858	57176350	-102423433	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1021	302	0	0	0	chr3	57176350	57176388	-102423395	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	2
1021	399	123	13	40	chr3	57176388	57176464	-102423319	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	2
1021	38845	16	14	0	chr3	57176464	57181760	-102418023	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-114	5371	3	2
1021	3463	25	2	0	chr3	57181760	57182155	-102417628	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1021	5395	11	3	0	chr3	57182157	57182797	-102416986	-	MT-int	LTR	MaLR	-456	642	1	2
1021	4314	22	2	0	chr3	57182799	57183291	-102416492	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1021	754	153	8	24	chr3	57183295	57183422	-102416361	+	RLTR25B	LTR	ERVK	979	1103	0	2
1021	3194	101	97	21	chr3	57184827	57185351	-102414432	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	2
1021	1092	155	314	10	chr3	57185978	57186107	-102413676	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	850	2
1021	1092	155	314	10	chr3	57186256	57186419	-102413364	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-179	849	648	2
1021	496	198	0	65	chr3	57186392	57186500	-102413283	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-1000	103	3	2
1021	4276	47	2	8	chr3	57186988	57187503	-102412280	+	LTRIS3	LTR	ERV1	1	512	0	2
1021	574	213	88	63	chr3	57188833	57189014	-102410769	+	MTC	LTR	MaLR	1	169	-227	2
1021	1041	223	32	32	chr3	57188994	57189240	-102410543	+	RMER4A	LTR	ERVK	6	251	-215	2
1021	2936	72	10	36	chr3	57195677	57196095	-102403688	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
1021	746	249	39	34	chr3	57198581	57198785	-102400998	+	MLT1F2	LTR	MaLR	355	559	-1	2
1021	3886	92	7	41	chr3	57199264	57199850	-102399933	+	RMER2	LTR	ERV1	1	566	-1	2
1021	3190	158	23	25	chr3	57199873	57200433	-102399350	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	2	2
1021	268	306	138	56	chr3	57200571	57200803	-102398980	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-251	328	78	2
1021	260	401	73	33	chr3	57202950	57203252	-102396531	-	MER90	LTR	ERV1	-3	572	259	2
1021	1163	282	73	9	chr3	57203232	57203547	-102396236	-	MTE2b	LTR	MaLR	-44	335	1	2
1021	1424	246	59	102	chr3	57203638	57203801	-102395982	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	237	2
1021	1424	246	59	102	chr3	57204196	57204453	-102395330	-	MTD	LTR	MaLR	-183	236	3	2
1021	4758	291	64	12	chr3	57204474	57205811	-102393972	-	MTE-int	LTR	MaLR	-82	1498	93	2
1021	1148	298	36	21	chr3	57207015	57207348	-102392435	-	MTE2b	LTR	MaLR	-41	338	1	2
1021	1861	168	0	7	chr3	57209752	57210045	-102389738	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	131	2
1021	778	121	81	0	chr3	57211280	57211404	-102388379	-	MTC	LTR	MaLR	-287	134	1	2
1021	287	182	0	35	chr3	57212981	57213038	-102386745	+	MLT1H	LTR	MaLR	495	549	0	3
1021	267	263	39	29	chr3	57215365	57215467	-102384316	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	377	275	3
1021	839	199	54	54	chr3	57215855	57216041	-102383742	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-26	341	156	3
1021	695	246	82	42	chr3	57216064	57216297	-102383486	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-108	262	30	3
1021	695	219	84	0	chr3	57216654	57216682	-102383101	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-349	29	2	3
1021	232	234	78	7	chr3	57221488	57221630	-102378153	+	RMER17D2	LTR	ERVK	238	389	-420	3
1021	514	174	22	0	chr3	57222760	57222852	-102376931	-	RMER13A	LTR	ERVK	-613	247	154	3
1021	696	199	96	30	chr3	57222859	57223073	-102376710	-	RMER13B	LTR	ERVK	-372	270	5	3
1021	1768	106	109	64	chr3	57223699	57224011	-102375772	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	3
1021	1998	152	73	0	chr3	57224639	57224994	-102374789	+	ORR1C2	LTR	MaLR	4	384	0	3
1021	1673	209	69	0	chr3	57247571	57247921	-102351862	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1021	375	328	91	109	chr3	57250096	57250248	-102349535	-	MLT2F	LTR	ERVL	-59	604	458	3
1021	375	328	91	109	chr3	57250378	57250394	-102349389	-	MLT2F	LTR	ERVL	-206	457	446	3
1021	375	328	91	109	chr3	57250518	57250799	-102348984	-	MLT2F	LTR	ERVL	-218	445	162	3
1021	372	343	120	39	chr3	57251244	57251502	-102348281	-	MTE-int	LTR	MaLR	-425	1155	877	3
1021	1812	117	107	9	chr3	57253169	57253496	-102346287	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	3
1021	1597	189	30	100	chr3	57253883	57254282	-102345501	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	371	-3	3
1021	956	201	38	11	chr3	57255380	57255604	-102344179	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	243	-320	3
1021	510	213	296	38	chr3	57255861	57256098	-102343685	+	ORR1D2	LTR	MaLR	73	370	0	3
1021	2420	182	10	28	chr3	57268649	57269158	-102330625	+	RLTR16	LTR	ERVK	6	505	0	4
1021	802	204	136	44	chr3	57271848	57272093	-102327690	+	MTD	LTR	MaLR	13	281	-138	4
1021	802	168	74	16	chr3	57272116	57272220	-102327563	+	MTD	LTR	MaLR	282	421	0	4
1021	551	187	407	23	chr3	57272485	57272784	-102326999	+	MTD	LTR	MaLR	1	414	-5	4
1021	312	250	0	0	chr3	57272940	57273008	-102326775	+	BGLII_B	LTR	ERVK	347	414	-27	4
1022	360	311	51	64	chr3	57280789	57281023	-102318760	+	MLT1H	LTR	MaLR	314	544	-5	4
1022	1761	146	74	20	chr3	57294659	57295009	-102304774	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	371	-13	4
1022	636	247	119	39	chr3	57303334	57303620	-102296163	+	RMER20B	LTR	ERVK	128	436	-191	4
1022	381	272	39	124	chr3	57305271	57305602	-102294181	+	RMER10A	LTR	ERVL	116	418	-24	4
1022	361	326	73	42	chr3	57318062	57318254	-102281529	+	MER21B	LTR	ERV1	509	706	-157	5
1022	3248	58	2	2	chr3	57322269	57322665	-102277118	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1022	1246	166	85	98	chr3	57325148	57325476	-102274307	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	324	-43	5
1022	939	257	101	10	chr3	57327056	57327363	-102272420	+	ORR1D1	LTR	MaLR	35	369	-5	5
1022	5370	192	56	39	chr3	57327373	57327554	-102272229	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	6	205	-1165	5
1022	2849	30	62	3	chr3	57327554	57327891	-102271892	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	5
1022	5370	190	54	36	chr3	57327891	57328994	-102270789	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	206	1370	0	5
1022	934	229	38	11	chr3	57329004	57329263	-102270520	+	ORR1D1	LTR	MaLR	22	280	-90	5
1022	359	252	77	23	chr3	57329253	57329383	-102270400	-	MTD	LTR	MaLR	-278	141	5	5
1022	2597	133	19	44	chr3	57329516	57329948	-102269835	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1022	1375	151	260	63	chr3	57330367	57330686	-102269097	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	5
1022	362	363	8	8	chr3	57336210	57336334	-102263449	+	MLT1G1	LTR	MaLR	214	337	-242	5
1022	2749	217	137	38	chr3	57336602	57337412	-102262371	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	5
1022	266	191	222	28	chr3	57341099	57341222	-102258561	+	MLT1A	LTR	MaLR	256	374	0	5
1022	1478	109	47	131	chr3	57342411	57342771	-102257012	-	RMER10B	LTR	ERVL	-31	367	38	5
1022	923	257	94	39	chr3	57343067	57343412	-102256371	-	MTD	LTR	MaLR	-15	364	3	5
1022	2175	131	87	19	chr3	57368441	57368808	-102230975	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	6
1022	609	257	290	16	chr3	57383215	57383470	-102216313	+	MTD	LTR	MaLR	92	416	-3	6
1022	417	189	26	86	chr3	57390883	57390999	-102208784	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	149	6
1022	3823	177	13	56	chr3	57392456	57393313	-102206470	+	RMER13B	LTR	ERVK	2	821	-87	6
1022	959	273	116	8	chr3	57394214	57394528	-102205255	+	MTEa	LTR	MaLR	18	341	-18	6
1022	376	164	0	15	chr3	57394882	57394950	-102204833	+	ORR1E	LTR	MaLR	282	348	-11	6
1022	2062	167	68	0	chr3	57394964	57395318	-102204465	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	6
1022	2470	123	25	151	chr3	57400569	57401094	-102198689	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	1	6
1022	477	250	58	0	chr3	57401197	57401317	-102198466	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-337	144	18	6
1022	1953	138	98	50	chr3	57402984	57403192	-102196591	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	191	7
1022	530	300	57	141	chr3	57403192	57403864	-102195919	+	RLTR18	LTR	ERVK	2	616	0	7
1022	1953	138	98	50	chr3	57403864	57404051	-102195732	-	MTC	LTR	MaLR	-231	190	2	7
1022	1596	174	29	125	chr3	57407531	57407978	-102191805	-	RMER10A	LTR	ERVL	-7	435	32	7
1023	342	231	29	235	chr3	57409883	57410160	-102189623	+	RLTR42	LTR	ERVK	1	220	-19	7
1023	3205	31	39	3	chr3	57413512	57413894	-102185889	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1023	1794	167	193	64	chr3	57414737	57415204	-102184579	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	7
1023	454	309	17	56	chr3	57423693	57423871	-102175912	+	MTC	LTR	MaLR	10	180	-241	7
1023	321	177	278	23	chr3	57423887	57424020	-102175763	+	MTC	LTR	MaLR	239	405	-14	7
1023	670	249	156	29	chr3	57424847	57425140	-102174643	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-29	341	1	7
1023	993	261	119	9	chr3	57426799	57427136	-102172647	+	MTD	LTR	MaLR	42	415	-4	7
1023	518	189	184	27	chr3	57433730	57433877	-102165906	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	236	7
1023	806	189	24	6	chr3	57433904	57434069	-102165714	-	MTD	LTR	MaLR	-247	172	5	7
1023	1687	228	47	54	chr3	57434164	57434701	-102165082	-	RMER5	LTR	ERV1	-1	533	1	7
1023	3095	49	15	10	chr3	57436679	57437073	-102162710	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1023	1956	104	88	60	chr3	57438310	57438628	-102161155	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1023	445	248	79	21	chr3	57440863	57441003	-102158780	-	MT2A	LTR	ERVL	-385	148	1	7
1023	978	252	130	3	chr3	57446346	57446668	-102153115	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	364	-6	8
1023	3482	18	8	0	chr3	57452379	57452772	-102147011	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
1023	338	261	0	11	chr3	57460054	57460143	-102139640	+	MT2A	LTR	ERVL	3	90	-443	8
1023	285	343	0	20	chr3	57460143	57460155	-102139628	+	MTEa	LTR	MaLR	3	101	-278	8
1023	248	221	87	14	chr3	57460486	57460555	-102139228	+	MT2A	LTR	ERVL	76	149	-384	8
1023	1263	163	122	20	chr3	57460558	57460881	-102138902	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	33	8
1023	614	282	98	44	chr3	57460881	57461215	-102138568	+	MT2A	LTR	ERVL	131	533	0	8
1023	1301	242	91	36	chr3	57478588	57478627	-102121156	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-56	521	477	8
1023	1301	242	91	36	chr3	57478683	57479118	-102120665	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-101	476	22	8
1023	1806	215	74	83	chr3	57480030	57480502	-102119281	+	RLTR18B	LTR	ERVK	2	469	-43	8
1023	1745	130	97	16	chr3	57480935	57481255	-102118528	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	8
1023	2880	124	12	5	chr3	57482690	57483120	-102116663	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-3	433	1	8
1023	5284	117	92	18	chr3	57483158	57484049	-102115734	+	RMER17B	LTR	ERVK	2	958	0	8
1023	468	331	17	11	chr3	57485748	57485925	-102113858	+	MLT1N2	LTR	MaLR	372	549	-13	9
1023	2936	6	0	0	chr3	57486130	57486452	-102113331	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	9
1023	43085	18	1	3	chr3	57486452	57491306	-102108477	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	9
1023	2906	9	0	0	chr3	57491306	57491628	-102108155	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	9
1023	500	206	0	0	chr3	57493008	57493100	-102106683	-	MTD	LTR	MaLR	-327	92	1	9
1023	3166	120	89	6	chr3	57499309	57499839	-102099944	+	MT2B	LTR	ERVL	28	601	0	9
1023	1696	261	23	17	chr3	57501119	57501598	-102098185	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-45	482	1	1
1023	1868	175	23	54	chr3	57503928	57504279	-102095504	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	340	-38	8
1023	1154	241	43	31	chr3	57516098	57516423	-102083360	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	477	805	-1043	3
1023	2610	61	0	15	chr3	57524457	57524791	-102074992	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	4	4
1023	273	308	0	0	chr3	57535207	57535311	-102064472	+	MMTV-int	LTR	ERVK	6596	6699	-554	5
1023	3029	29	0	0	chr3	57535560	57535904	-102063879	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-2	344	1	5
1023	2310	201	128	85	chr3	57536249	57537175	-102062608	+	RLTR25B	LTR	ERVK	18	899	-204	5
1023	1511	237	148	155	chr3	57537236	57537403	-102062380	+	RLTR25B	LTR	ERVK	900	1103	0	5
1023	944	212	239	96	chr3	57537572	57538094	-102061689	+	MT2B	LTR	ERVL	3	599	-2	6
1023	320	193	169	0	chr3	57538094	57538177	-102061606	+	ORR1D1	LTR	MaLR	278	374	0	6
1024	350	288	177	14	chr3	57550882	57551023	-102048760	-	MTE-int	LTR	MaLR	-50	1530	1367	9
1024	1785	161	76	84	chr3	57565189	57565595	-102034188	-	MTC	LTR	MaLR	-18	403	1	1
1024	229	311	57	19	chr3	57574421	57574526	-102025257	-	MT2B2	LTR	ERVL	-324	260	152	1
1024	531	255	331	6	chr3	57576098	57576325	-102023458	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	109	1
1024	337	303	104	14	chr3	57576351	57576441	-102023342	-	MTD	LTR	MaLR	-271	108	10	1
1024	274	255	0	138	chr3	57579498	57579607	-102020176	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	147	1
1024	338	352	51	90	chr3	57584289	57584545	-102015238	-	MER57C2	LTR	ERV1	-15	419	151	1
1024	302	264	0	121	chr3	57588236	57588335	-102011448	-	MT2B	LTR	ERVL	-362	239	153	1
1024	2137	120	6	18	chr3	57589971	57590301	-102009482	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	1
1024	249	306	50	36	chr3	57592799	57592938	-102006845	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-239	145	5	1
1024	627	221	87	127	chr3	57594241	57594610	-102005173	-	RLTR15	LTR	ERVK	-5	354	1	1
1024	4075	196	35	26	chr3	57598355	57599298	-102000485	-	RLTR13A2	LTR	ERVK	0	958	8	1
1024	2048	162	36	8	chr3	57604685	57605046	-101994737	-	RLTR14	LTR	ERV1	-2	380	10	2
1024	1924	181	121	0	chr3	57607855	57608226	-101991557	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	1	2
1024	467	180	11	33	chr3	57618456	57618548	-101981235	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	568	479	2
1024	728	260	69	21	chr3	57619242	57619533	-101980250	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-96	482	178	2
1024	1416	266	54	33	chr3	57626629	57627056	-101972727	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-417	4582	4147	2
1024	263	191	0	0	chr3	57627103	57627150	-101972633	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2613	2386	2340	2
1024	944	279	57	4	chr3	57627766	57628047	-101971736	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3399	1600	1305	2
1024	795	296	54	0	chr3	57628459	57628719	-101971064	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3773	1226	953	2
1024	760	315	91	43	chr3	57628781	57629176	-101970607	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4292	707	294	2
1024	380	335	110	13	chr3	57629192	57629428	-101970355	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4740	259	1	2
1024	540	284	207	41	chr3	57629429	57629671	-101970112	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	293	2
1024	394	160	263	44	chr3	57629884	57630021	-101969762	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	204	2
1024	1996	209	28	114	chr3	57633405	57634073	-101965710	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
1024	238	216	108	0	chr3	57635416	57635490	-101964293	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	422	2
1024	1847	163	81	1	chr3	57652880	57652930	-101946853	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	421	340	2
1024	1847	164	55	49	chr3	57653063	57653384	-101946399	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-39	339	1	2
1024	3428	33	2	10	chr3	57653918	57654321	-101945462	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1024	2392	213	56	4	chr3	57654596	57655058	-101944725	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-25	487	2	2
1024	239	234	125	96	chr3	57656665	57656769	-101943014	+	MT2B	LTR	ERVL	175	281	-320	2
1025	839	268	84	18	chr3	57677163	57677437	-101922346	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	270	3
1025	908	247	51	74	chr3	57678250	57678635	-101921148	+	ORR1D2	LTR	MaLR	8	370	0	3
1025	1107	269	120	9	chr3	57679716	57679782	-101920001	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	69	-301	3
1025	1107	269	120	9	chr3	57679828	57680087	-101919696	+	ORR1D2	LTR	MaLR	70	360	-10	3
1025	2211	163	38	38	chr3	57680161	57680582	-101919201	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1025	2477	80	3	30	chr3	57680886	57681222	-101918561	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1025	397	298	79	63	chr3	57684099	57684289	-101915494	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	227	3
1025	465	291	15	7	chr3	57684828	57684963	-101914820	-	MLT1B	LTR	MaLR	-254	136	1	3
1025	1056	313	38	40	chr3	57687351	57687771	-101912012	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1025	7444	77	8	39	chr3	57687880	57687921	-101911862	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1001	3
1025	7444	77	8	39	chr3	57688435	57689449	-101910334	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-23	1000	1	3
1025	522	279	42	14	chr3	57689450	57689592	-101910191	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	223	3
1025	1164	188	182	117	chr3	57689593	57690021	-101909762	+	MT2A	LTR	ERVL	3	458	-75	3
1025	559	303	91	15	chr3	57690126	57690357	-101909426	-	MTE2b	LTR	MaLR	-128	251	7	3
1025	355	229	22	139	chr3	57690645	57690782	-101909001	-	MTEa	LTR	MaLR	-254	125	5	3
1025	575	203	66	33	chr3	57696789	57696911	-101902872	+	MT2B	LTR	ERVL	1	126	-407	3
1025	689	262	154	85	chr3	57696906	57697189	-101902594	+	MT2B	LTR	ERVL	249	537	-64	3
1025	689	262	154	85	chr3	57697232	57697278	-101902505	+	MT2B	LTR	ERVL	538	600	-1	3
1025	1962	201	3	13	chr3	57697439	57697823	-101901960	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	382	0	3
1025	749	121	105	0	chr3	57698077	57698201	-101901582	-	MTC	LTR	MaLR	-284	137	1	3
1025	375	305	30	38	chr3	57700075	57700208	-101899575	-	MTEb	LTR	MaLR	-105	274	143	3
1025	436	263	26	0	chr3	57700212	57700326	-101899457	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-8	362	246	3
1025	3339	125	211	119	chr3	57706481	57707336	-101892447	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-42	1921	989	3
1025	641	123	0	88	chr3	57707322	57707447	-101892336	-	MT2B	LTR	ERVL	-478	123	10	3
1025	4036	140	38	4	chr3	57707355	57708037	-101891746	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1258	705	1	3
1025	1447	96	15	0	chr3	57708037	57708236	-101891547	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	128	3
1025	1352	265	102	22	chr3	57708412	57708874	-101890909	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	21	3
1025	425	315	34	20	chr3	57713996	57714142	-101885641	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	261	3
1025	5151	108	12	8	chr3	57717974	57718708	-101881075	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	3
1025	512	287	71	67	chr3	57718784	57719038	-101880745	+	RMER2	LTR	ERV1	290	544	-23	3
1025	3150	53	5	10	chr3	57719921	57720319	-101879464	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1025	991	230	102	48	chr3	57727423	57727757	-101872026	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	8	4
1025	914	286	45	64	chr3	57727859	57728330	-101871453	+	LTR37B	LTR	ERV1	6	467	-1	4
1025	422	196	0	30	chr3	57729143	57729243	-101870540	-	MTD	LTR	MaLR	-322	97	1	4
1025	2561	217	32	132	chr3	57729267	57730307	-101869476	-	MTD-int	LTR	MaLR	-451	807	19	4
1025	1608	213	72	8	chr3	57730314	57730674	-101869109	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	35	4
1025	1045	169	63	55	chr3	57730696	57730934	-101868849	+	RMER19B	LTR	ERVK	310	549	-353	4
1025	679	291	90	39	chr3	57735292	57735571	-101864212	-	MT2A	LTR	ERVL	-84	449	157	4
1025	436	182	0	22	chr3	57738146	57738236	-101861547	-	RLTR14	LTR	ERV1	-3	379	292	4
1025	263	75	0	24	chr3	57738315	57738356	-101861427	-	RLTR14	LTR	ERV1	-104	278	239	4
1025	1921	151	70	0	chr3	57738773	57739118	-101860665	-	MTC	LTR	MaLR	-21	400	32	4
1025	914	272	73	62	chr3	57740380	57740737	-101859046	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	10	4
1025	1728	200	52	25	chr3	57742101	57742501	-101857282	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	4
1025	600	81	11	0	chr3	57744791	57744871	-101854912	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	81	-326	4
1025	4486	168	49	19	chr3	57744871	57745732	-101854051	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	896	-12	4
1025	2946	36	0	0	chr3	57745732	57746064	-101853719	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	4
1025	4486	168	49	19	chr3	57746064	57746084	-101853699	+	RMER13B	LTR	ERVK	897	908	0	4
1025	2352	64	6	15	chr3	57746087	57746421	-101853362	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	77	407	0	4
1025	1558	109	53	23	chr3	57746485	57746748	-101853035	+	MTC	LTR	MaLR	15	285	-136	4
1025	262	173	77	0	chr3	57746740	57746792	-101852991	-	RLTR18	LTR	ERVK	-6	610	555	4
1025	1255	178	16	20	chr3	57747394	57747640	-101852143	-	RLTR18	LTR	ERVK	-65	551	307	4
1025	891	147	91	14	chr3	57747639	57747860	-101851923	+	MTC-int	LTR	MaLR	1021	1258	0	4
1025	811	190	358	3	chr3	57747860	57748171	-101851612	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1025	330	242	74	0	chr3	57748235	57748330	-101851453	+	MT2A	LTR	ERVL	94	195	-338	4
1025	241	188	250	0	chr3	57748314	57748394	-101851389	+	MT2A	LTR	ERVL	356	455	-78	4
1025	660	118	50	8	chr3	57750402	57750522	-101849261	+	MTD	LTR	MaLR	7	131	-288	4
1025	954	185	26	22	chr3	57750594	57750826	-101848957	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	2605	2837	-5	4
1025	2150	200	119	51	chr3	57750831	57751479	-101848304	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	4
1025	1365	201	40	7	chr3	57751482	57751757	-101848026	+	MTD	LTR	MaLR	129	412	-7	4
1025	1637	232	75	73	chr3	57753506	57754012	-101845771	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	507	-5	4
1025	1448	173	37	1	chr3	57758122	57758426	-101841357	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-178	375	1	4
1025	1969	120	170	57	chr3	57762263	57762686	-101837097	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-86	471	1	4
1025	2233	98	6	0	chr3	57762687	57763005	-101836778	+	ORR1A2	LTR	MaLR	8	327	0	4
1025	305	250	82	52	chr3	57774081	57774178	-101825605	+	MLT1H2	LTR	MaLR	370	469	-20	4
1025	278	252	71	88	chr3	57781305	57781418	-101818365	+	MTEb	LTR	MaLR	256	366	-13	4
1025	529	182	20	108	chr3	57785125	57785218	-101814565	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	80	-304	4
1025	3123	146	74	2	chr3	57785218	57785748	-101814035	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	568	0	4
1025	1245	171	84	62	chr3	57785748	57786021	-101813762	+	ORR1C2	LTR	MaLR	99	377	-7	4
1025	284	196	73	42	chr3	57786512	57786608	-101813175	-	LTR33	LTR	ERVL	-51	464	366	4
1025	1800	122	108	45	chr3	57787866	57788200	-101811583	+	ORR1B2	LTR	MaLR	5	359	-8	4
1025	1971	153	73	14	chr3	57789275	57789633	-101810150	+	MTC	LTR	MaLR	3	381	-40	4
1025	1462	181	41	55	chr3	57790317	57790450	-101809333	-	RMER17C	LTR	ERVK	-52	358	212	5
1025	1462	181	41	55	chr3	57790511	57790740	-101809043	-	RMER17C	LTR	ERVK	-199	211	2	5
1025	2345	103	9	6	chr3	57790740	57791073	-101808710	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2905	5
1025	1584	103	146	147	chr3	57791068	57791203	-101808580	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-511	2727	2603	5
1025	1584	103	146	147	chr3	57791257	57791553	-101808230	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-511	2602	2327	5
1025	1632	76	0	9	chr3	57791551	57791764	-101808019	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1259	1979	1769	5
1025	284	29	0	0	chr3	57791813	57791847	-101807936	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1867	1371	1338	5
1025	2788	194	89	89	chr3	57792249	57793200	-101806583	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2287	951	1	5
1025	633	238	104	46	chr3	57793639	57793899	-101805884	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2964	5
1025	285	239	143	27	chr3	57793912	57794024	-101805759	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-363	2875	2751	5
1025	884	215	103	106	chr3	57794114	57794520	-101805263	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2171	3966	3562	5
1025	304	225	62	12	chr3	57794620	57794701	-101805082	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2864	3273	3189	5
1025	2246	144	60	23	chr3	57794853	57795076	-101804707	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	227	-171	5
1025	2246	144	60	23	chr3	57795139	57795299	-101804484	+	RMER10B	LTR	ERVL	228	398	0	5
1025	787	198	130	77	chr3	57795393	57795678	-101804105	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2708	3007	-3130	5
1025	347	145	143	14	chr3	57795688	57795758	-101804025	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3199	3277	-2860	5
1025	1165	225	62	46	chr3	57796035	57796342	-101803441	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-4669	322	11	5
1025	564	317	56	17	chr3	57797693	57797927	-101801856	+	MLT1A1	LTR	MaLR	3	245	-163	5
1025	456	360	1	7	chr3	57798730	57798931	-101800852	+	MLT1A1	LTR	MaLR	167	408	0	5
1025	1780	149	254	11	chr3	57798989	57799348	-101800435	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	5
1026	493	270	32	58	chr3	57804025	57804214	-101795569	+	RLTR23	LTR	ERV1	247	430	0	5
1026	1196	214	174	9	chr3	57823663	57824007	-101775776	+	MTD	LTR	MaLR	19	419	0	5
1026	1358	237	43	31	chr3	57824169	57824518	-101775265	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-824	546	194	5
1026	1447	249	52	104	chr3	57824498	57825179	-101774604	+	RMER13B	LTR	ERVK	320	898	-10	5
1026	232	237	16	33	chr3	57825229	57825290	-101774493	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	-48	539	480	5
1026	1082	267	215	9	chr3	57826241	57826585	-101773198	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	1	5
1026	562	254	91	95	chr3	57834759	57835011	-101764772	+	RLTR18	LTR	ERVK	31	281	-335	5
1026	541	281	78	58	chr3	57836426	57836683	-101763100	+	RLTR18	LTR	ERVK	251	512	0	5
1026	2575	262	118	20	chr3	57836894	57837178	-101762605	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	703	1009	-571	5
1026	2674	137	83	28	chr3	57837213	57837639	-101762144	-	RMER6B	LTR	ERVK	-9	452	1	5
1026	2575	262	118	20	chr3	57837639	57838148	-101761635	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	1010	1574	-6	5
1026	631	277	94	43	chr3	57838157	57838391	-101761392	+	MTE2a	LTR	MaLR	19	264	-115	5
1026	2696	48	3	3	chr3	57838480	57838814	-101760969	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	52	385	0	5
1026	312	189	40	26	chr3	57838926	57839002	-101760781	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	79	-295	5
1026	540	315	119	35	chr3	57841211	57841530	-101758253	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	85	5
1026	467	228	29	10	chr3	57841622	57841724	-101758059	-	RLTR23	LTR	ERV1	-317	113	10	5
1026	854	178	56	56	chr3	57843139	57843318	-101756465	-	RLTR14	LTR	ERV1	-39	343	165	5
1026	2498	221	68	31	chr3	57843323	57843912	-101755871	+	RLTR18	LTR	ERVK	4	614	-2	5
1026	1015	171	0	92	chr3	57843912	57844118	-101755665	-	RLTR14	LTR	ERV1	-195	187	1	5
1026	2323	166	53	2	chr3	57844235	57844628	-101755155	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	5
1026	2278	109	16	0	chr3	57845429	57845749	-101754034	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	5
1026	803	244	98	44	chr3	57849017	57849339	-101750444	-	RMER20B	LTR	ERVK	-206	421	98	5
1026	1785	179	76	9	chr3	57851380	57851724	-101748059	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1026	1348	272	40	40	chr3	57852794	57852848	-101746935	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	329	6
1026	1348	272	40	40	chr3	57852917	57853241	-101746542	-	MTE2a	LTR	MaLR	-51	328	1	6
1026	3638	20	5	0	chr3	57855039	57855433	-101744350	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1026	10116	21	2	0	chr3	57855433	57856529	-101743254	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	6
1026	3493	21	29	0	chr3	57856529	57856914	-101742869	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1026	1653	154	119	28	chr3	57857084	57857411	-101742372	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-4	374	18	6
1026	1483	167	341	41	chr3	57859329	57859748	-101740035	+	MT2B	LTR	ERVL	1	545	-56	6
1026	240	108	0	0	chr3	57859868	57859905	-101739878	+	MT2B	LTR	ERVL	548	584	-17	6
1026	2101	168	11	8	chr3	57865868	57866222	-101733561	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-12	355	1	6
1026	259	258	65	101	chr3	57867103	57867241	-101732542	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	132	6
1026	1091	207	102	62	chr3	57868625	57868929	-101730854	+	MTD	LTR	MaLR	104	419	0	6
1026	1692	203	98	45	chr3	57869148	57869546	-101730237	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1026	3631	25	5	0	chr3	57870149	57870543	-101729240	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1026	9685	30	8	1	chr3	57870543	57871633	-101728150	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
1026	3631	25	5	0	chr3	57871633	57872027	-101727756	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1026	2524	157	49	12	chr3	57872874	57873280	-101726503	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1026	1974	152	13	72	chr3	57874823	57875199	-101724584	+	ORR1C1	LTR	MaLR	18	371	-7	6
1026	1668	228	47	17	chr3	57875206	57875613	-101724170	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	5	423	-947	6
1026	676	248	97	13	chr3	57875598	57875835	-101723948	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	638	894	-364	6
1026	271	312	72	18	chr3	57875863	57875974	-101723809	-	RMER17C	LTR	ERVK	-62	348	232	6
1026	1121	212	12	118	chr3	57875974	57876397	-101723386	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	378	-32	6
1026	1808	172	21	87	chr3	57876648	57877075	-101722708	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	860	1258	0	6
1026	313	303	47	53	chr3	57878712	57878862	-101720921	+	RLTR14	LTR	ERV1	234	382	0	6
1026	1533	176	138	50	chr3	57878883	57879260	-101720523	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	6
1026	1264	260	93	56	chr3	57879437	57879921	-101719862	+	RMER5	LTR	ERV1	33	534	0	6
1026	313	211	14	27	chr3	57881789	57881862	-101717921	+	MER52-int	LTR	ERV1	7017	7088	-3	6
1026	2846	132	43	69	chr3	57882497	57883034	-101716749	-	RLTR24	LTR	ERV1	-6	523	1	6
1026	1652	135	33	72	chr3	57885378	57885713	-101714070	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	6
1026	3246	95	8	51	chr3	57885713	57886222	-101713561	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	4358	6
1026	1830	231	14	43	chr3	57886300	57886744	-101713039	+	RMER19C	LTR	ERVK	181	611	0	6
1026	513	247	86	25	chr3	57887462	57887624	-101712159	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-194	176	5	6
1026	1033	281	96	6	chr3	57891355	57891491	-101708292	+	MTEa	LTR	MaLR	17	163	-216	6
1026	1033	281	96	6	chr3	57891551	57891747	-101708036	+	MTEa	LTR	MaLR	164	378	-1	6
1026	1624	186	100	0	chr3	57895241	57895590	-101704193	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	6
1026	465	241	18	9	chr3	57897149	57897262	-101702521	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	265	6
1026	2306	119	42	3	chr3	57897617	57897970	-101701813	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1026	3115	147	60	68	chr3	57899006	57899627	-101700156	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	1	6
1026	435	252	356	0	chr3	57900608	57900878	-101698905	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	7
1026	1325	238	58	43	chr3	57917295	57917779	-101682004	+	RMER5	LTR	ERV1	33	523	-11	7
1026	1581	223	59	27	chr3	57918132	57918538	-101681245	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1026	2418	202	51	15	chr3	57919093	57919542	-101680241	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	458	-105	7
1026	2418	202	51	15	chr3	57919582	57919659	-101680124	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	459	545	-18	7
1026	295	340	38	0	chr3	57920226	57920332	-101679451	-	LTR16A	LTR	ERVL	-328	123	14	7
1026	690	334	111	38	chr3	57921786	57922256	-101677527	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	504	-50	7
1026	539	325	36	62	chr3	57922394	57922751	-101677032	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	6	7
1026	2379	161	88	30	chr3	57924111	57924610	-101675173	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	7
1026	2225	190	24	10	chr3	57929096	57929511	-101670272	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	7
1026	439	335	92	32	chr3	57931879	57932160	-101667623	+	MT2A	LTR	ERVL	135	432	-101	7
1027	3706	92	4	9	chr3	57934688	57935235	-101664548	+	RLTR1D	LTR	ERV1	62	605	0	7
1027	331	252	121	76	chr3	57936724	57936968	-101662815	+	MER34	LTR	ERV1	304	571	0	7
1027	705	328	92	26	chr3	57937291	57937639	-101662144	+	MLT1H1	LTR	MaLR	185	555	0	7
1027	260	301	31	81	chr3	57938224	57938410	-101661373	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-230	282	74	7
1027	471	257	9	9	chr3	57941658	57941772	-101658011	-	MTE2b	LTR	MaLR	-207	172	59	7
1027	1891	147	134	9	chr3	57941900	57942250	-101657533	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
1027	1794	180	91	5	chr3	57943796	57944171	-101655612	-	MTC	LTR	MaLR	-13	408	2	7
1027	262	135	0	0	chr3	57946615	57946652	-101653131	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1756	4381	4345	7
1027	2692	219	16	78	chr3	57946736	57947489	-101652294	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2008	4129	3424	7
1027	815	37	28	0	chr3	57947594	57947701	-101652082	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	287	396	0	7
1027	447	50	0	0	chr3	57947701	57947761	-101652022	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	60	-1038	7
1027	1737	192	39	17	chr3	57947763	57948123	-101651660	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2987	3150	2783	7
1027	721	218	75	30	chr3	57948119	57948374	-101651409	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3552	2585	2433	7
1027	756	211	65	28	chr3	57948420	57948635	-101651148	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3430	2092	1870	7
1027	499	242	74	108	chr3	57949048	57949372	-101650411	-	MTC-int	LTR	MaLR	-36	1222	910	7
1027	786	236	9	38	chr3	57949372	57949583	-101650200	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4909	1228	1024	7
1027	485	105	113	0	chr3	57949756	57949848	-101649935	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5161	976	888	7
1027	279	151	51	122	chr3	57949874	57949951	-101649832	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4264	1258	1187	7
1027	2756	109	11	76	chr3	57949951	57950409	-101649374	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	428	-2	7
1027	279	151	51	122	chr3	57950409	57950429	-101649354	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4336	1186	1168	7
1027	342	228	0	114	chr3	57950485	57950599	-101649184	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5245	892	792	7
1027	959	194	15	64	chr3	57950695	57950959	-101648824	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	283	7
1027	2184	139	87	16	chr3	57953576	57953956	-101645827	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	7
1027	552	309	125	28	chr3	57954080	57954439	-101645344	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-1	679	286	7
1027	230	266	42	105	chr3	57954478	57954621	-101645162	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-520	160	27	7
1027	386	218	23	11	chr3	57955473	57955561	-101644222	+	MTC	LTR	MaLR	6	94	-327	7
1027	1726	155	129	0	chr3	57956615	57956957	-101642826	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	7
1027	3022	129	99	15	chr3	57959715	57960313	-101639470	+	RMER6A	LTR	ERVK	109	756	0	7
1027	411	251	100	173	chr3	57960314	57960574	-101639209	+	MLT1F2	LTR	MaLR	176	416	-153	7
1027	883	188	146	119	chr3	57964229	57964647	-101635136	+	MT2B	LTR	ERVL	4	546	-55	8
1027	883	170	148	112	chr3	57964695	57964758	-101635025	+	MT2B	LTR	ERVL	547	599	-2	8
1027	328	294	16	40	chr3	57964817	57964941	-101634842	+	LTR16E1	LTR	ERVL	418	538	0	8
1027	831	337	54	96	chr3	57967731	57968512	-101631271	+	LTR41B	LTR	ERVL	1	748	-10	8
1027	341	269	92	49	chr3	57970309	57970493	-101629290	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	1	8
1027	2072	158	16	55	chr3	57971609	57971991	-101627792	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	8
1027	2036	132	11	3	chr3	57978718	57979074	-101620709	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	8
1027	1656	145	82	51	chr3	57982475	57982537	-101617246	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	58	-309	8
1027	1656	145	82	51	chr3	57983185	57983478	-101616305	+	ORR1B2	LTR	MaLR	59	367	0	8
1027	509	178	113	43	chr3	57984758	57984899	-101614884	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	151	-291	8
1027	261	219	82	0	chr3	57987190	57987263	-101612520	-	MTEb	LTR	MaLR	-18	361	283	8
1027	245	302	0	0	chr3	57987741	57987804	-101611979	-	MTEb	LTR	MaLR	-99	280	218	8
1027	1846	192	65	13	chr3	57999236	57999633	-101600150	+	MTD	LTR	MaLR	2	404	-15	8
1027	2053	183	65	0	chr3	58000957	58001312	-101598471	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	6
1027	3344	145	21	118	chr3	58001335	58002082	-101597701	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-57	1452	778	6
1027	2969	64	3	8	chr3	58002082	58002473	-101597310	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	389	-7	7
1027	3169	154	83	2	chr3	58002621	58003188	-101596595	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-887	622	10	6
1027	1587	193	40	6	chr3	58003184	58003512	-101596271	+	ORR1B1	LTR	MaLR	6	344	-50	9
1027	881	222	68	36	chr3	58003512	58003732	-101596051	+	ORR1D2	LTR	MaLR	144	370	0	1
1027	930	321	92	43	chr3	58004352	58004840	-101594943	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	22	1
1027	563	246	76	51	chr3	58009639	58009836	-101589947	-	LTR33	LTR	ERVL	-169	346	145	1
1027	1731	171	132	3	chr3	58013023	58013363	-101586420	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	2
1027	2017	140	6	27	chr3	58015660	58015990	-101583793	+	MTC	LTR	MaLR	91	413	-8	3
1027	332	242	7	31	chr3	58015975	58016129	-101583654	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-209	165	5	3
1027	309	345	37	43	chr3	58016680	58016868	-101582915	-	LTR33B	LTR	ERVL	-290	213	27	3
1027	1650	82	20	21	chr3	58018508	58018917	-101580866	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-133	491	1	4
1027	231	274	83	0	chr3	58026424	58026508	-101573275	+	RMER15	LTR	ERVL	371	461	-114	5
1027	5957	105	31	18	chr3	58026680	58027556	-101572227	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	887	-2	5
1027	807	186	238	13	chr3	58027944	58028259	-101571524	+	MTD	LTR	MaLR	34	419	0	5
1027	488	289	84	66	chr3	58040758	58041077	-101558706	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	38	7
1027	838	287	97	100	chr3	58042633	58043013	-101556770	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	7
1027	1517	258	42	22	chr3	58043063	58043424	-101556359	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	368	-2	8
1027	392	250	283	9	chr3	58043728	58043954	-101555829	+	RMER15	LTR	ERVL	273	560	-15	8
1027	229	300	36	91	chr3	58048243	58048270	-101551513	+	MT2B2	LTR	ERVL	138	158	-426	9
1027	2842	94	43	8	chr3	58053057	58053454	-101546329	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	1
1027	1424	236	28	8	chr3	58062475	58062838	-101536945	+	MT2A	LTR	ERVL	3	372	-161	1
1027	1551	151	16	21	chr3	58064053	58064592	-101535191	-	RLTR1D	LTR	ERV1	0	605	1	1
1028	658	249	100	5	chr3	58082504	58082694	-101517089	+	MTD	LTR	MaLR	3	210	-209	1
1028	351	288	122	42	chr3	58083238	58083452	-101516331	+	RLTR12B	LTR	ERVK	19	249	-279	1
1028	263	211	18	0	chr3	58084460	58084517	-101515266	+	MTD	LTR	MaLR	348	405	-14	1
1028	3263	63	2	0	chr3	58088496	58088895	-101510888	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1028	410	277	99	50	chr3	58089746	58090008	-101509775	-	RLTR16	LTR	ERVK	-207	298	24	1
1028	2962	134	10	43	chr3	58102399	58102890	-101496893	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1028	1973	198	39	19	chr3	58103378	58103791	-101495992	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1028	276	307	114	91	chr3	58114537	58114791	-101484992	+	ORR1E	LTR	MaLR	96	355	-4	2
1028	2887	72	31	8	chr3	58116023	58116414	-101483369	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1028	838	328	97	26	chr3	58117456	58117879	-101481904	+	LTR33A	LTR	ERVL	54	506	-14	2
1028	280	315	0	119	chr3	58118199	58118300	-101481483	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	153	2
1028	284	296	60	71	chr3	58126184	58126366	-101473417	+	MLT1J	LTR	MaLR	16	195	-317	2
1028	238	284	208	40	chr3	58126378	58126580	-101473203	+	MLT1J	LTR	MaLR	227	462	-50	2
1028	408	263	86	124	chr3	58128072	58128407	-101471376	-	MLT1C	LTR	MaLR	-71	396	1	2
1028	959	250	58	4	chr3	58129953	58130178	-101469605	-	MT2A	LTR	ERVL	-295	238	2	2
1028	1844	89	86	0	chr3	58131172	58131452	-101468331	+	ORR1A2	LTR	MaLR	16	319	-8	2
1028	809	324	107	29	chr3	58131486	58131905	-101467878	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-8	472	21	2
1028	1061	253	144	58	chr3	58134088	58134470	-101465313	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-2	567	153	2
1028	1772	137	133	84	chr3	58134938	58135175	-101464608	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	278	-251	2
1028	1772	137	133	84	chr3	58135322	58135513	-101464270	+	RLTR24	LTR	ERV1	279	450	-79	2
1028	1654	48	5	0	chr3	58135684	58135893	-101463890	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	187	2
1028	2544	43	9	47	chr3	58135883	58136226	-101463557	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-145	330	1	2
1028	252	61	0	0	chr3	58136226	58136257	-101463526	+	RLTR24	LTR	ERV1	497	527	-2	2
1028	2020	180	84	58	chr3	58147509	58148023	-101451760	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	2
1028	3764	79	12	4	chr3	58149739	58150237	-101449546	+	MT2B2	LTR	ERVL	83	584	0	3
1028	521	341	65	42	chr3	58150347	58150702	-101449081	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	1	3
1028	1179	233	96	68	chr3	58156023	58156461	-101443322	+	RLTR12B	LTR	ERVK	42	491	-37	3
1028	403	83	0	16	chr3	58158740	58158801	-101440982	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	61	-323	3
1028	4342	78	12	0	chr3	58162404	58162979	-101436804	+	MT2B2	LTR	ERVL	3	584	0	3
1028	588	133	38	0	chr3	58164880	58164985	-101434798	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	367	475	0	3
1028	1389	294	82	14	chr3	58170722	58171208	-101428575	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-6	563	45	3
1028	330	245	102	54	chr3	58173322	58173469	-101426314	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-24	545	392	3
1028	328	352	24	0	chr3	58173538	58173663	-101426120	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-166	403	276	3
1028	4692	65	3	3	chr3	58183157	58183741	-101416042	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	3
1028	246	281	0	0	chr3	58184919	58184983	-101414800	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	316	3
1028	610	210	128	11	chr3	58185028	58185264	-101414519	+	MTD	LTR	MaLR	21	299	-122	3
1028	541	319	91	14	chr3	58187353	58187639	-101412144	-	ORR1E	LTR	MaLR	-51	308	1	3
1028	366	241	11	0	chr3	58189927	58190014	-101409769	+	MT2B	LTR	ERVL	2	89	-444	3
1028	246	229	0	0	chr3	58190049	58190097	-101409686	+	MT2B	LTR	ERVL	82	129	-404	3
1028	1149	243	24	84	chr3	58190113	58190495	-101409288	+	MT2B	LTR	ERVL	241	599	-2	3
1029	2235	109	15	15	chr3	58206788	58207115	-101392668	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1029	5957	115	40	141	chr3	58207115	58208500	-101391283	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	718	4
1029	557	162	0	132	chr3	58208459	58208580	-101391203	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	183	4
1029	385	141	0	27	chr3	58209150	58209223	-101390560	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1201	591	521	4
1029	530	147	11	0	chr3	58209217	58209312	-101390471	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-231	96	1	4
1029	231	219	118	40	chr3	58212637	58212713	-101387070	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	298	4
1029	747	191	93	28	chr3	58212731	58212946	-101386837	-	MTEa	LTR	MaLR	-150	229	1	4
1029	376	315	60	103	chr3	58245360	58245693	-101354090	-	MTEb	LTR	MaLR	-10	369	51	4
1029	1887	322	65	8	chr3	58245705	58246325	-101353458	-	MTE-int	LTR	MaLR	-31	1549	895	4
1029	1391	218	45	56	chr3	58273052	58273426	-101326357	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
1029	268	190	248	48	chr3	58282451	58282483	-101317300	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	43	-316	5
1029	268	190	248	48	chr3	58282519	58282591	-101317192	+	RLTR15	LTR	ERVK	44	126	-233	5
1029	493	280	25	0	chr3	58298362	58298480	-101301303	+	MTEa	LTR	MaLR	59	179	-200	5
1029	2111	155	48	30	chr3	58306743	58306844	-101292939	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	308	5
1029	2226	102	14	83	chr3	58306844	58306898	-101292885	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	275	5
1029	2226	102	14	83	chr3	58307093	58307389	-101292394	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-53	274	1	5
1029	2111	155	48	30	chr3	58307389	58307687	-101292096	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-100	307	1	5
1029	465	59	44	0	chr3	58308763	58308831	-101290952	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	71	-370	5
1029	3552	48	0	2	chr3	58309045	58309442	-101290341	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1029	1334	133	58	4	chr3	58309908	58310150	-101289633	+	BGLII_B	LTR	ERVK	187	441	0	5
1029	439	274	16	24	chr3	58310508	58310635	-101289148	-	MT2A	LTR	ERVL	-70	514	389	5
1029	580	221	88	50	chr3	58310631	58310831	-101288952	-	MT2A	LTR	ERVL	-287	206	5	5
1029	1414	233	153	11	chr3	58315796	58316161	-101283622	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	5
1029	627	278	22	51	chr3	58324352	58324530	-101275253	+	MTE2a	LTR	MaLR	194	366	-13	6
1029	2140	167	57	16	chr3	58325245	58325629	-101274154	+	MTC	LTR	MaLR	14	413	-8	6
1030	271	309	23	58	chr3	58332209	58332295	-101267488	-	MLT1K	LTR	MaLR	-255	340	258	6
1030	226	233	80	27	chr3	58336826	58336875	-101262908	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-331	105	53	6
1030	2080	138	117	87	chr3	58339046	58339305	-101260478	-	RLTR19	LTR	ERVK	-48	451	199	6
1030	2080	138	117	87	chr3	58339493	58339669	-101260114	-	RLTR19	LTR	ERVK	-301	198	3	6
1030	2015	168	43	11	chr3	58340740	58341090	-101258693	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-8	370	10	6
1030	296	220	24	128	chr3	58342420	58342545	-101257238	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	153	6
1030	312	254	33	91	chr3	58346226	58346347	-101253436	-	MT2B	LTR	ERVL	-336	265	152	6
1030	740	228	320	0	chr3	58348046	58348309	-101251474	-	MTC	LTR	MaLR	-67	352	10	6
1030	842	204	267	67	chr3	58354621	58354813	-101244970	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	124	6
1030	842	204	267	67	chr3	58354957	58354982	-101244801	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-255	123	96	6
1030	842	204	267	67	chr3	58355175	58355271	-101244512	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-283	95	1	6
1030	406	287	57	35	chr3	58358172	58358313	-101241470	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	218	7
1030	758	254	20	56	chr3	58358636	58358886	-101240897	-	RMER15	LTR	ERVL	-7	568	328	7
1030	2954	75	14	5	chr3	58362546	58362962	-101236821	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	2	7
1030	684	200	68	4	chr3	58363855	58364081	-101235702	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	50	7
1030	304	344	68	68	chr3	58364552	58364714	-101235069	+	MLT1I	LTR	MaLR	19	180	-231	7
1030	1879	255	121	92	chr3	58365447	58366679	-101233104	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1	7
1030	3880	106	11	9	chr3	58367456	58368019	-101231764	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	7
1030	2173	116	92	0	chr3	58368953	58369290	-101230493	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	7
1030	8091	184	111	69	chr3	58369715	58370364	-101229419	+	RMER16-int	LTR	ERVK	320	1082	-4324	7
1030	8091	184	111	69	chr3	58370509	58370778	-101229005	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1083	1299	-4107	7
1030	8091	184	111	69	chr3	58370906	58372098	-101227685	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1300	2553	-2853	7
1030	8091	184	111	69	chr3	58372245	58372582	-101227201	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2554	2870	-2536	7
1030	1613	215	25	87	chr3	58372890	58373293	-101226490	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	512	0	7
1030	4035	119	52	38	chr3	58373343	58374038	-101225745	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2865	3583	-1823	7
1030	4035	187	45	70	chr3	58374232	58374340	-101225443	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3584	3614	-1792	7
1030	2291	232	41	92	chr3	58374482	58374900	-101224883	+	RMER16-int	LTR	ERVK	5830	6211	-1195	7
1030	304	269	11	0	chr3	58375054	58375147	-101224636	+	RMER16-int	LTR	ERVK	6332	6425	-981	7
1030	2331	109	25	19	chr3	58375416	58375782	-101224001	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	7
1030	253	242	42	139	chr3	58377027	58377171	-101222612	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	133	-275	7
1030	2153	192	45	62	chr3	58377952	58378481	-101221302	-	RLTR17	LTR	ERVK	-77	615	96	7
1030	225	356	40	63	chr3	58378471	58378494	-101221289	+	MT2B2	LTR	ERVL	142	161	-423	7
1030	1859	81	97	45	chr3	58382739	58382789	-101216994	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	282	7
1030	1859	81	97	45	chr3	58382940	58383199	-101216584	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-46	281	1	7
1030	358	231	65	21	chr3	58398356	58398449	-101201334	-	RMER10A	LTR	ERVL	-28	414	318	7
1030	3043	238	128	75	chr3	58398712	58398871	-101200912	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-63	1745	1555	7
1030	3043	238	128	75	chr3	58399050	58400428	-101199355	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-254	1554	126	7
1030	293	294	75	8	chr3	58400581	58400701	-101199082	-	RMER12	LTR	ERVK	-1194	128	1	7
1030	709	236	219	30	chr3	58403607	58403850	-101195933	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	93	7
1030	709	241	70	48	chr3	58404071	58404158	-101195625	-	MTE2b	LTR	MaLR	-287	92	1	7
1030	3458	139	18	54	chr3	58411488	58412174	-101187609	+	RMER6A	LTR	ERVK	11	671	-85	8
1030	2057	153	45	24	chr3	58413242	58413616	-101186167	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	8
1030	273	288	50	0	chr3	58413618	58413698	-101186085	+	MLT1A0	LTR	MaLR	61	144	-221	8
1030	234	231	34	126	chr3	58413709	58413828	-101185955	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	150	8
1030	2682	81	45	18	chr3	58416498	58416898	-101182885	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	8
1030	1982	141	64	6	chr3	58416953	58417311	-101182472	+	ORR1B1	LTR	MaLR	16	394	0	8
1030	436	289	125	12	chr3	58419290	58419449	-101180334	-	RMER21B	LTR	ERV1	-275	567	390	8
1030	1227	242	95	66	chr3	58419449	58419910	-101179873	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	469	-108	8
1030	1227	242	95	66	chr3	58419942	58419983	-101179800	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	470	517	-60	8
1030	795	123	179	0	chr3	58429508	58429670	-101170113	+	RLTR24	LTR	ERV1	5	195	-334	8
1030	928	264	35	92	chr3	58431042	58431380	-101168403	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	36	8
1030	502	292	79	5	chr3	58432664	58432867	-101166916	+	MLT1B	LTR	MaLR	8	225	-165	8
1030	1708	160	68	108	chr3	58436238	58436638	-101163145	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	8
1030	505	220	59	22	chr3	58447446	58447581	-101152202	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	140	-720	8
1030	265	288	75	0	chr3	58449153	58449232	-101150551	+	MLT1C	LTR	MaLR	357	441	-26	8
1030	501	267	83	8	chr3	58449232	58449459	-101150324	-	RMER13A	LTR	ERVK	-2	858	576	8
1030	302	318	83	79	chr3	58450657	58450934	-101148849	+	MLT1H	LTR	MaLR	260	537	-12	8
1030	2067	168	45	3	chr3	58452113	58452465	-101147318	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	8
1030	433	82	0	16	chr3	58452466	58452528	-101147255	+	ORR1D2	LTR	MaLR	307	367	-3	8
1030	248	259	24	36	chr3	58453509	58453593	-101146190	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	292	8
1030	3219	39	39	0	chr3	58457231	58457612	-101142171	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
128	320	73	0	0	chr3	58458091	58458132	-101141651	+	ORR1D1	LTR	MaLR	323	363	-11	9
1031	1119	203	91	88	chr3	58461394	58461724	-101138059	+	ORR1D2	LTR	MaLR	40	370	0	9
1031	793	171	100	12	chr3	58468218	58468378	-101131405	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	211	9
1031	227	222	0	18	chr3	58470562	58470617	-101129166	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-154	220	167	9
1031	1059	168	0	56	chr3	58470713	58470909	-101128874	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-199	185	1	9
1031	1250	209	214	6	chr3	58473033	58473217	-101126566	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	199	9
1031	1250	209	214	6	chr3	58473251	58473384	-101126399	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-186	198	1	9
1031	2582	183	59	6	chr3	58473384	58473873	-101125910	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1370	856	9
1031	1152	206	140	28	chr3	58478036	58478321	-101121462	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	102	9
1031	1790	144	55	26	chr3	58490179	58490522	-101109261	-	RLTR15	LTR	ERVK	-6	353	1	9
1031	301	229	111	48	chr3	58501439	58501614	-101098169	-	RMER21A	LTR	ERV1	-348	494	298	3
1031	232	311	134	57	chr3	58501805	58501962	-101097821	+	MLT1F2	LTR	MaLR	1	169	-391	4
1031	249	153	32	20	chr3	58502013	58502085	-101097698	-	MLT1A	LTR	MaLR	-75	299	218	5
1031	385	268	154	38	chr3	58502239	58502454	-101097329	+	MLT1F2	LTR	MaLR	197	443	-126	4
1031	3358	21	26	0	chr3	58504250	58504635	-101095148	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	1
1031	1763	125	20	142	chr3	58505434	58505835	-101093948	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	352	-42	1
1031	2146	98	3	97	chr3	58505969	58506201	-101093582	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	99	1
1031	2146	98	3	97	chr3	58506413	58506540	-101093243	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-228	98	1	1
1031	343	239	0	64	chr3	58507229	58507304	-101092479	+	MLT1A1	LTR	MaLR	305	374	-34	2
1031	343	239	0	64	chr3	58507636	58507654	-101092129	+	MLT1A1	LTR	MaLR	375	392	-16	2
1031	822	300	72	22	chr3	58508503	58508864	-101090919	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	2
1031	244	290	78	20	chr3	58509432	58509534	-101090249	+	MLT1A1	LTR	MaLR	396	503	-92	2
1031	324	318	65	45	chr3	58509863	58510064	-101089719	+	LTR40c	LTR	ERVL	165	369	-96	2
1031	309	339	8	16	chr3	58511715	58511844	-101087939	+	MER90a	LTR	ERV1	63	190	-424	3
1031	577	271	131	7	chr3	58512747	58513022	-101086761	-	MLT1C	LTR	MaLR	-156	311	3	3
1031	556	266	114	5	chr3	58513164	58513357	-101086426	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	359	3
1031	240	328	81	65	chr3	58513656	58513917	-101085866	-	LTR82A	LTR	ERVL	-178	694	430	3
1031	442	291	87	78	chr3	58514250	58514559	-101085224	-	LTR82A	LTR	ERVL	-550	322	11	3
1031	465	220	11	0	chr3	58515272	58515363	-101084420	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	92	-267	3
1031	601	308	101	67	chr3	58515434	58516069	-101083714	-	RMER13A	LTR	ERVK	-199	709	30	3
1031	1026	223	42	15	chr3	58516112	58516372	-101083411	+	ORR1E	LTR	MaLR	87	353	-6	3
1031	785	259	71	39	chr3	58517217	58517498	-101082285	+	RMER15	LTR	ERVL	272	561	-14	4
1031	343	264	88	47	chr3	58525623	58525794	-101073989	-	RMER21B	LTR	ERV1	-342	500	323	5
1031	372	306	67	87	chr3	58526080	58526527	-101073256	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	698	1135	-3856	5
1031	422	270	91	17	chr3	58533894	58534092	-101065691	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	208	-419	5
1031	233	257	26	39	chr3	58534268	58534345	-101065438	+	MLT1D	LTR	MaLR	424	499	-128	5
1031	243	247	86	0	chr3	58534736	58534817	-101064966	+	MLT1D	LTR	MaLR	517	604	-6	5
1031	629	257	159	4	chr3	58537255	58537482	-101062301	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	160	6
1031	548	257	14	21	chr3	58537668	58537811	-101061972	+	RMER10B	LTR	ERVL	246	387	-11	6
1031	336	250	271	29	chr3	58537839	58537979	-101061804	-	MTC	LTR	MaLR	-233	186	13	6
1031	279	235	27	81	chr3	58538993	58539141	-101060642	-	RLTR15	LTR	ERVK	-63	296	157	7
1031	360	225	43	87	chr3	58539144	58539329	-101060454	-	RLTR15	LTR	ERVK	-150	209	33	7
1031	1445	198	84	69	chr3	58541688	58542106	-101057677	+	RLTR24	LTR	ERV1	106	529	0	7
1031	3176	108	54	143	chr3	58545205	58546015	-101053768	-	RMER17A	LTR	ERVK	-13	738	1	8
1031	575	277	109	34	chr3	58549764	58550029	-101049754	-	LTR82A	LTR	ERVL	-577	295	11	8
1031	259	280	13	0	chr3	58552006	58552081	-101047702	+	MLT2F	LTR	ERVL	5	80	-583	9
1031	325	302	140	58	chr3	58552132	58552339	-101047444	+	MLT2F	LTR	ERVL	185	408	-255	9
1031	375	335	58	6	chr3	58560882	58561038	-101038745	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-41	324	161	1
1031	1274	149	321	31	chr3	58563922	58564212	-101035571	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1031	384	273	109	0	chr3	58566510	58566620	-101033163	-	ORR1E	LTR	MaLR	-237	122	1	1
1031	263	216	126	58	chr3	58573639	58573742	-101026041	+	MTEb	LTR	MaLR	259	368	-11	1
1031	337	416	26	34	chr3	58577154	58577388	-101022395	+	LTR16E2	LTR	ERVL	49	280	-288	1
1031	464	287	68	20	chr3	58581490	58581739	-101018044	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	268	1
1031	264	296	36	29	chr3	58581807	58581946	-101017837	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-219	309	170	1
1031	958	212	39	70	chr3	58581971	58582229	-101017554	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4130	4379	-1758	1
1031	633	275	29	50	chr3	58582450	58582691	-101017092	+	RMER5	LTR	ERV1	143	378	-156	1
1031	2116	142	65	28	chr3	58582756	58583110	-101016673	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	1
1031	1808	145	20	97	chr3	58587527	58587971	-101011812	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	1
1032	359	298	55	34	chr3	58590357	58590503	-101009280	+	ORR1E	LTR	MaLR	18	166	-193	1
1032	1761	204	27	39	chr3	58591015	58591427	-101008356	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	5	1
1032	2743	21	0	0	chr3	58597596	58597934	-101001849	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	338	-8	1
1032	2696	96	91	0	chr3	58599561	58599947	-100999836	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1032	244	284	80	27	chr3	58611448	58611560	-100988223	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	388	1
1032	576	332	65	37	chr3	58612039	58612440	-100987343	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	56	1
1032	1811	203	129	15	chr3	58618468	58618933	-100980850	+	RLTR24	LTR	ERV1	12	529	0	1
1032	1892	118	10	0	chr3	58619589	58619893	-100979890	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	15	1
1032	225	320	42	88	chr3	58620371	58620611	-100979172	+	RLTR14	LTR	ERV1	154	382	0	1
1032	513	340	141	56	chr3	58630812	58631279	-100968504	+	MER21B	LTR	ERV1	22	528	-335	1
1032	525	283	63	134	chr3	58631421	58631801	-100967982	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	7	1
1032	384	291	122	26	chr3	58634478	58634707	-100965076	-	MLT1J	LTR	MaLR	-230	282	32	1
1032	673	281	59	84	chr3	58638214	58638666	-100961117	+	MT2B	LTR	ERVL	1	535	-66	1
1032	19975	158	50	14	chr3	58638752	58642591	-100957192	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	39	4015	-1746	2
1032	1882	166	29	6	chr3	58642602	58642953	-100956830	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	2
1032	4706	183	71	12	chr3	58642953	58643999	-100955784	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	403	2
1032	9010	158	55	2	chr3	58643999	58645430	-100954353	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4089	5595	-166	2
1032	241	190	0	49	chr3	58645448	58645509	-100954274	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	624	-1339	2
1032	287	164	0	52	chr3	58645517	58645594	-100954189	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	639	-1324	2
1032	406	89	0	0	chr3	58645594	58645650	-100954133	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5706	5761	0	2
1032	1753	193	161	62	chr3	58645650	58646135	-100953648	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	2
1032	1835	177	120	68	chr3	58649353	58649777	-100950006	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	2
1032	715	249	43	29	chr3	58662917	58663198	-100936585	-	RLTR15	LTR	ERVK	-7	352	68	2
1032	238	313	122	0	chr3	58667016	58667131	-100932652	+	LTR50	LTR	ERVL	8	136	-659	2
1032	342	248	108	18	chr3	58672537	58672648	-100927135	-	RMER10A	LTR	ERVL	-4	438	318	2
1032	564	292	93	58	chr3	58673228	58673636	-100926147	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	414	-27	2
1032	3005	52	0	3	chr3	58680722	58681069	-100918714	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
1032	426	258	102	59	chr3	58694419	58694738	-100905045	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	3	2
1032	1133	200	86	9	chr3	58694876	58695108	-100904675	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	172	2
1032	267	312	111	30	chr3	58695520	58695619	-100904164	-	LTR33	LTR	ERVL	-300	215	109	2
1032	1190	289	102	50	chr3	58697261	58697760	-100902023	-	MT2A	LTR	ERVL	-6	527	3	2
1032	231	347	102	132	chr3	58701277	58701858	-100897925	-	MLT1K	LTR	MaLR	-6	589	27	2
1032	1705	194	80	9	chr3	58704344	58704693	-100895090	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1032	267	401	60	16	chr3	58710466	58710651	-100889132	+	LTR33	LTR	ERVL	247	439	-76	3
1032	249	239	57	132	chr3	58711763	58711869	-100887914	+	MER68	LTR	ERVL	82	179	-384	3
1	522	263	36	21	chr3	58720176	58720316	-100879467	+	MER68	LTR	ERVL	164	305	-258	3
1033	834	169	39	22	chr3	58720403	58720584	-100879199	-	RMER10A	LTR	ERVL	-2	440	257	3
1033	341	259	134	64	chr3	58720595	58720752	-100879031	+	MER68	LTR	ERVL	396	563	0	3
1033	953	253	174	0	chr3	58720812	58721065	-100878718	-	MTE2b	LTR	MaLR	-82	297	1	3
1033	1852	133	185	18	chr3	58723174	58723503	-100876280	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1033	1666	205	68	66	chr3	58728658	58728958	-100870825	+	RMER10A	LTR	ERVL	2	318	-124	3
1033	1583	149	152	22	chr3	58728958	58729321	-100870462	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	3
1033	1666	205	68	66	chr3	58729321	58729459	-100870324	+	RMER10A	LTR	ERVL	319	441	-1	3
1033	386	258	92	93	chr3	58729867	58730338	-100869445	-	RMER10A	LTR	ERVL	-16	426	12	3
1033	357	384	101	29	chr3	58730786	58731062	-100868721	+	LTR33	LTR	ERVL	103	398	-117	3
1033	253	250	18	0	chr3	58740460	58740516	-100859267	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	334	3
1033	268	243	70	14	chr3	58748245	58748316	-100851467	+	MLT1J1	LTR	MaLR	93	167	-277	3
1033	1162	270	28	80	chr3	58750366	58750764	-100849019	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	379	0	3
1033	603	257	269	42	chr3	58751365	58751674	-100848109	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	3
1033	261	282	144	62	chr3	58761119	58761255	-100838528	+	MLT1E2	LTR	MaLR	126	278	-349	4
1033	1442	85	20	0	chr3	58761255	58761455	-100838328	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	204	-685	4
1033	326	240	75	65	chr3	58761516	58761577	-100838206	+	MLT1E2	LTR	MaLR	355	422	-205	4
1033	2240	136	162	11	chr3	58761577	58761941	-100837842	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	4
1033	326	296	119	85	chr3	58761941	58762108	-100837675	+	MLT1E2	LTR	MaLR	423	651	-29	4
1033	480	343	57	60	chr3	58762360	58762676	-100837107	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	325	-34	4
1033	312	329	55	14	chr3	58766630	58766775	-100833008	+	RMER15	LTR	ERVL	385	535	-40	4
1033	262	241	70	18	chr3	58768125	58768239	-100831544	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	635	4
1033	2424	64	112	3	chr3	58774213	58774525	-100825258	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
1033	2060	315	70	11	chr3	58776134	58776789	-100822994	-	MTE-int	LTR	MaLR	-43	1537	844	4
1033	1063	233	88	93	chr3	58777220	58777687	-100822096	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	4
1033	1421	156	158	59	chr3	58778101	58778455	-100821328	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	6	4
1033	2301	89	32	0	chr3	58779154	58779467	-100820316	+	ORR1A2	LTR	MaLR	5	327	0	4
1033	406	196	87	0	chr3	58786876	58786968	-100812815	+	LTR41B	LTR	ERVL	108	207	-551	4
1033	315	160	63	11	chr3	58787506	58787601	-100812182	+	LTR41B	LTR	ERVL	636	735	-23	4
1033	362	206	15	15	chr3	58788372	58788505	-100811278	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	39	195	-246	4
1033	476	275	183	40	chr3	58788996	58789318	-100810465	-	LTR16A1	LTR	ERVL	-54	402	35	4
1033	522	374	90	21	chr3	58789901	58790466	-100809317	-	MLT2F	LTR	ERVL	-59	604	1	4
1033	415	238	157	28	chr3	58792209	58792378	-100807405	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-329	225	38	4
1033	3215	24	59	0	chr3	58792921	58793295	-100806488	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1033	757	317	126	41	chr3	58798465	58798972	-100800811	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-10	550	1	4
1033	907	268	85	16	chr3	58800398	58800716	-100799067	+	MLT1A0	LTR	MaLR	24	363	-2	4
1033	255	317	12	0	chr3	58804740	58804822	-100794961	+	RMER15	LTR	ERVL	380	462	-113	4
1033	1293	201	19	178	chr3	58807744	58808155	-100791628	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	346	-38	4
1033	283	245	37	130	chr3	58821398	58821506	-100778277	-	MLT1A	LTR	MaLR	-16	358	261	5
1033	275	305	138	5	chr3	58828233	58828421	-100771362	-	MLT1C	LTR	MaLR	-4	463	251	5
1033	289	331	36	0	chr3	58828469	58828608	-100771175	-	MLT1C	LTR	MaLR	-288	179	36	5
1033	1121	238	53	19	chr3	58834891	58835251	-100764532	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	8	5
1033	1620	172	29	177	chr3	58839952	58840398	-100759385	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-4	380	1	5
1033	1305	201	159	65	chr3	58848483	58848866	-100750917	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1033	404	95	16	0	chr3	58849923	58849986	-100749797	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	310	5
1033	793	150	19	25	chr3	58850688	58850845	-100748938	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-218	156	1	5
1034	3582	159	113	68	chr3	58851908	58852760	-100747023	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	5
1034	791	266	38	94	chr3	58853765	58854001	-100745782	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	172	5
1034	791	266	38	94	chr3	58854033	58854190	-100745593	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-213	171	13	5
1034	1030	243	124	26	chr3	58854921	58855118	-100744665	+	MTD	LTR	MaLR	3	195	-224	5
1034	1030	243	124	26	chr3	58855146	58855328	-100744455	+	MTD	LTR	MaLR	196	418	-1	5
1034	549	221	142	82	chr3	58855465	58855805	-100743978	+	MTD	LTR	MaLR	10	413	-6	5
1034	532	278	116	64	chr3	58856721	58857062	-100742721	+	MTD	LTR	MaLR	1	361	-18	5
1034	1591	166	123	25	chr3	58864706	58865071	-100734712	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	175	5
1034	385	91	0	0	chr3	58865366	58865421	-100734362	-	RMER15	LTR	ERVL	-508	67	13	5
1034	2078	153	31	60	chr3	58867590	58868006	-100731777	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	4	5
1034	1033	251	53	72	chr3	58882927	58883287	-100716496	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	3	6
1034	241	265	59	0	chr3	58891950	58892018	-100707765	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	307	6
1034	461	255	56	14	chr3	58892103	58892246	-100707537	-	MTE2b	LTR	MaLR	-230	149	1	6
1034	1456	182	225	24	chr3	58893042	58893380	-100706403	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	2	6
1034	5572	154	130	18	chr3	58893380	58894508	-100705275	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1258	2	6
1034	1978	166	22	53	chr3	58894730	58895144	-100704639	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-6	401	1	6
1034	2447	114	67	89	chr3	58911651	58911779	-100688004	-	RLTR19	LTR	ERVK	-39	460	323	6
1034	2447	114	67	89	chr3	58911969	58912302	-100687481	-	RLTR19	LTR	ERVK	-177	322	9	6
1034	236	302	174	30	chr3	58912893	58913060	-100686723	-	RMER17B	LTR	ERVK	-2	956	766	6
1034	1600	246	22	52	chr3	58913095	58913474	-100686309	-	RMER17B	LTR	ERVK	-174	784	429	6
1034	1600	246	22	52	chr3	58913545	58913663	-100686120	-	RMER17B	LTR	ERVK	-530	428	302	6
1034	1818	167	58	39	chr3	58913692	58914123	-100685660	-	RMER17B	LTR	ERVK	-519	439	1	6
1034	355	234	67	75	chr3	58915298	58915418	-100684365	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	139	6
1034	3538	38	5	0	chr3	58945129	58945523	-100654260	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1034	432	111	340	0	chr3	58950421	58950531	-100649252	+	ORR1D2	LTR	MaLR	220	368	-2	6
1034	439	279	85	32	chr3	58963836	58964025	-100635758	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	377	7
1034	801	276	34	108	chr3	58964877	58965202	-100634581	+	MTE2a	LTR	MaLR	74	374	-5	7
1034	1940	223	49	39	chr3	58966615	58967105	-100632678	-	RMER5	LTR	ERV1	-36	498	4	7
1034	262	321	71	9	chr3	58974900	58975013	-100624770	+	MLT1A0	LTR	MaLR	243	362	-3	7
1034	3118	70	35	20	chr3	58975162	58975556	-100624227	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1034	7480	105	10	62	chr3	58975556	58976711	-100623072	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	3	7
1034	1446	105	100	30	chr3	58976715	58976997	-100622786	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	65	7
1034	486	265	30	0	chr3	58978482	58978614	-100621169	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	137	-233	7
1034	329	212	0	0	chr3	58978613	58978679	-100621104	+	ORR1D2	LTR	MaLR	304	369	-1	7
1035	555	296	173	5	chr3	59040493	59040690	-100559093	-	MTD	LTR	MaLR	-72	347	118	5
1035	240	266	9	105	chr3	59046527	59046632	-100553151	-	RMER12	LTR	ERVK	-507	815	721	6
1035	393	248	47	19	chr3	59072675	59072782	-100527001	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1904	4233	4124	9
1035	279	253	81	0	chr3	59072831	59072918	-100526865	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2007	4130	4037	9
1035	939	256	100	97	chr3	59073019	59073365	-100526418	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2168	3969	3707	9
1035	3595	35	2	0	chr3	59073365	59073760	-100526023	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1035	939	255	112	109	chr3	59073760	59073778	-100526005	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2431	3706	3691	9
1035	939	255	112	109	chr3	59073829	59074342	-100525441	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2447	3690	3162	9
1035	579	249	79	138	chr3	59074627	59075046	-100524737	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3115	3022	2629	9
1035	2415	138	18	18	chr3	59078557	59078955	-100520828	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	1
1035	1254	195	226	50	chr3	59082428	59082747	-100517036	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	4	1
1035	1222	209	170	25	chr3	59111126	59111449	-100488334	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	5	1
1035	3134	36	5	5	chr3	59112370	59112761	-100487022	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-5	391	1	1
1036	467	323	121	0	chr3	59113730	59113962	-100485821	-	MLT1C	LTR	MaLR	-64	403	144	1
1036	1072	288	91	13	chr3	59126110	59126483	-100473300	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	1
1036	401	272	29	0	chr3	59127304	59127407	-100472376	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	110	-269	1
1036	890	304	123	13	chr3	59127403	59127826	-100471957	+	MT2A	LTR	ERVL	57	563	0	1
1036	2286	173	34	19	chr3	59143977	59144390	-100455393	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	1
1036	282	150	233	0	chr3	59153425	59153485	-100446298	+	MT2A	LTR	ERVL	10	83	-450	1
1036	392	274	0	21	chr3	59153598	59153695	-100446088	+	RMER15	LTR	ERVL	286	380	-195	1
1036	1248	272	91	10	chr3	59156026	59156412	-100443371	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	1
1036	760	228	31	11	chr3	59158903	59159094	-100440689	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	329	1
1036	5455	103	11	10	chr3	59159579	59160384	-100439399	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	806	1	1
1036	734	136	8	53	chr3	59161623	59161755	-100438028	-	RMER15	LTR	ERVL	-423	152	27	1
1036	825	251	143	4	chr3	59161904	59162156	-100437627	+	ORR1D1	LTR	MaLR	86	372	-2	1
1036	4270	143	156	76	chr3	59170783	59171730	-100428053	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	2
1036	252	261	23	159	chr3	59172232	59172364	-100427419	+	MT2B	LTR	ERVL	160	273	-328	2
1036	1282	214	0	16	chr3	59172753	59173009	-100426774	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-1257	252	1	2
1036	1866	193	33	44	chr3	59173013	59173376	-100426407	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	2
1036	2949	21	3	0	chr3	59174730	59175066	-100424717	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	2
1036	53225	21	15	4	chr3	59175066	59181474	-100418309	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	2
1036	2949	21	3	0	chr3	59181474	59181810	-100417973	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	2
1036	366	305	63	0	chr3	59187863	59187958	-100411825	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	180	280	-127	2
1036	235	268	28	0	chr3	59191478	59191549	-100408234	+	MLT1D	LTR	MaLR	26	98	-407	2
1036	2825	55	0	0	chr3	59192879	59193225	-100406558	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
1036	4112	156	99	18	chr3	59195736	59195879	-100403904	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	145	-715	2
1036	4112	156	99	18	chr3	59195913	59196546	-100403237	+	RMER13A	LTR	ERVK	146	839	-21	2
1036	624	356	58	20	chr3	59205294	59205746	-100394037	+	MLT1G3	LTR	MaLR	13	467	-128	2
1036	1908	191	34	37	chr3	59207308	59207716	-100392067	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	2
1036	242	333	78	0	chr3	59208967	59209057	-100390726	+	LTR88b	LTR	Gypsy?	741	837	0	2
1036	265	348	68	55	chr3	59224939	59225158	-100374625	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1101	2
1036	5388	88	26	10	chr3	59225416	59226212	-100373571	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-997	811	3	2
1036	236	275	24	59	chr3	59228092	59228177	-100371606	-	RMER15	LTR	ERVL	-108	467	386	2
1036	1132	226	177	26	chr3	59233941	59234316	-100365467	+	RMER17B	LTR	ERVK	449	957	-1	2
1036	848	195	24	0	chr3	59234317	59234481	-100365302	+	ORR1B1	LTR	MaLR	186	353	-41	2
1036	2835	19	0	0	chr3	59242610	59242932	-100356851	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
1037	475	308	53	122	chr3	59275090	59275418	-100324365	+	RMER10A	LTR	ERVL	12	322	-120	3
1037	3203	46	10	0	chr3	59275418	59275810	-100323973	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1037	475	308	53	122	chr3	59275810	59275917	-100323866	+	RMER10A	LTR	ERVL	323	417	-25	3
1037	2111	103	89	98	chr3	59278375	59278825	-100320958	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-86	446	1	3
1037	3447	165	76	26	chr3	59281689	59282348	-100317435	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	3
1037	587	170	18	9	chr3	59289787	59289900	-100309883	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	695	3
1037	1921	174	3	0	chr3	59289900	59290261	-100309522	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-486	5322	4961	3
1037	1443	236	43	87	chr3	59299523	59300039	-100299744	+	RLTR40	LTR	ERVK	316	808	-9	3
1037	888	251	51	46	chr3	59310975	59311326	-100288457	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	353	-6	3
1037	371	271	70	47	chr3	59312908	59313036	-100286747	+	MTEb	LTR	MaLR	249	379	0	3
1037	1573	114	86	11	chr3	59328519	59328786	-100270997	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	287	-1521	3
1037	2333	75	6	0	chr3	59334973	59335292	-100264491	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	283	603	-1205	3
1037	408	322	35	61	chr3	59335369	59335597	-100264186	+	RMER12	LTR	ERVK	1101	1322	0	3
1037	1257	301	57	27	chr3	59340807	59341474	-100258309	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	2864	3550	-4667	3
1037	14924	123	14	15	chr3	59341685	59344246	-100255537	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1660	6223	-1183	3
1037	527	67	13	0	chr3	59344464	59344539	-100255244	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7406	0	3
1037	2967	96	2	12	chr3	59344539	59344952	-100254831	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	3
1037	607	359	65	52	chr3	59345299	59345746	-100254037	+	MLT1E3	LTR	MaLR	1	453	-171	3
1037	3416	18	2	34	chr3	59350713	59351122	-100248661	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1037	357	250	0	48	chr3	59355595	59355679	-100244104	-	RMER13A	LTR	ERVK	-617	243	164	4
1037	707	226	57	0	chr3	59355669	59355828	-100243955	-	RMER20A	LTR	ERVK	-346	170	3	4
1037	1417	251	39	85	chr3	59365596	59366111	-100233672	+	RLTR40	LTR	ERVK	318	808	-9	4
1037	230	229	0	0	chr3	59366593	59366641	-100233142	-	MLT1A	LTR	MaLR	-313	61	14	4
1037	2522	111	5	16	chr3	59367380	59367765	-100232018	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-22	381	1	4
1037	2707	31	2	201	chr3	59369211	59369694	-100230089	-	RLTR10	LTR	ERVK	-3	387	1	4
1037	16031	20	13	0	chr3	59369696	59371615	-100228168	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	41	4
1037	2446	37	2	207	chr3	59371625	59372103	-100227680	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	11	4
1037	3046	36	2	89	chr3	59372120	59372547	-100227236	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	4
1037	14307	29	8	2	chr3	59372549	59374307	-100225476	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	216	4
1037	2401	25	129	0	chr3	59374312	59374630	-100225153	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6115	366	8	4
1037	2915	27	0	3	chr3	59374630	59374968	-100224815	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	4
1037	1851	159	95	70	chr3	59375309	59375585	-100224198	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	125	4
1038	1851	159	95	70	chr3	59376066	59376201	-100223582	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-298	124	1	4
1038	1035	279	116	21	chr3	59378337	59378674	-100221109	-	MTE2b	LTR	MaLR	-10	369	1	4
1038	306	306	73	98	chr3	59381935	59382058	-100217725	+	RMER20B	LTR	ERVK	6	125	-502	4
1038	249	273	70	10	chr3	59382362	59382462	-100217321	+	RMER20B	LTR	ERVK	364	469	-47	4
1038	5372	121	53	15	chr3	59384011	59384884	-100214899	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	4
1038	226	361	48	0	chr3	59387004	59387087	-100212696	+	MLT2D	LTR	ERVL	408	494	-66	4
1038	1075	130	0	0	chr3	59387179	59387340	-100212443	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-23	371	211	4
1038	3149	118	7	8	chr3	59388925	59389436	-100210347	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	605	1	4
1038	3296	57	38	0	chr3	59394343	59394763	-100205020	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	4
1038	1142	204	14	0	chr3	59398892	59399103	-100200680	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-169	225	12	4
1038	3125	39	36	5	chr3	59401451	59401835	-100197948	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1038	992	36	22	0	chr3	59401835	59401972	-100197811	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	959	4
1038	5530	60	26	7	chr3	59401982	59402722	-100197061	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	55	808	0	4
1038	280	140	0	57	chr3	59403638	59403691	-100196092	-	MT2B	LTR	ERVL	0	584	535	4
1038	1058	220	119	91	chr3	59403789	59404242	-100195541	-	MT2B	LTR	ERVL	-63	538	1	4
1038	246	291	156	12	chr3	59404402	59404562	-100195221	-	MT2A	LTR	ERVL	-204	329	147	4
1038	680	269	49	87	chr3	59407837	59408204	-100191579	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	353	-6	4
1038	454	257	37	81	chr3	59409753	59409914	-100189869	+	MTEa	LTR	MaLR	226	379	0	4
1038	2247	148	12	36	chr3	59420419	59420838	-100178945	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	4
1038	688	321	43	36	chr3	59441212	59441516	-100158267	+	MLT1E3	LTR	MaLR	1	306	-318	4
1038	370	288	224	0	chr3	59443965	59444191	-100155592	+	MTD	LTR	MaLR	10	285	-134	4
1038	935	258	172	55	chr3	59444386	59444973	-100154810	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	1056	-524	5
1038	1435	175	94	3	chr3	59446896	59447197	-100152586	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	467	-8	5
1038	964	265	26	23	chr3	59451546	59451812	-100147971	+	MTD	LTR	MaLR	8	274	-145	5
1038	2116	185	21	40	chr3	59452385	59452778	-100147005	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-111	457	71	5
1038	2116	185	21	40	chr3	59453365	59453398	-100146385	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-498	70	39	5
1038	7279	79	23	8	chr3	59453474	59454482	-100145301	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	5
1038	298	303	61	0	chr3	59456574	59456673	-100143110	+	RMER20A	LTR	ERVK	3	107	-409	5
1038	629	337	134	25	chr3	59469526	59470277	-100129506	-	MER70-int	LTR	ERVL	-799	4224	3392	5
1038	410	333	121	18	chr3	59480432	59480655	-100119128	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	258	5
1038	346	353	37	15	chr3	59502820	59502955	-100096828	-	MTE2b	LTR	MaLR	-182	197	60	5
1038	369	271	0	0	chr3	59502958	59503043	-100096740	-	MTE2b	LTR	MaLR	-292	87	3	5
1038	1017	323	80	13	chr3	59503071	59503598	-100096185	+	MER70-int	LTR	ERVL	4413	4974	-49	6
1038	505	345	80	34	chr3	59503816	59503991	-100095792	+	MER70A	LTR	ERVL	153	340	-132	6
1038	4156	56	0	41	chr3	59503991	59504532	-100095251	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	7
1038	505	345	80	34	chr3	59504532	59504620	-100095163	+	MER70A	LTR	ERVL	341	428	-44	6
1039	1551	163	48	65	chr3	59507171	59507390	-100092393	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	221	-161	1
1039	1763	252	75	11	chr3	59507390	59507963	-100091820	+	RMER19C	LTR	ERVK	2	611	0	1
1039	1551	163	48	65	chr3	59507963	59508049	-100091734	+	RLTR14	LTR	ERV1	222	301	-81	1
1039	1314	164	244	33	chr3	59508049	59508381	-100091402	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	412	-546	1
1039	1314	164	61	109	chr3	59508576	59508643	-100091140	+	RMER17B	LTR	ERVK	413	435	-523	1
1039	281	188	31	0	chr3	59509100	59509164	-100090619	+	RMER17B	LTR	ERVK	893	958	0	1
1039	456	240	40	0	chr3	59509164	59509251	-100090532	+	RLTR14	LTR	ERV1	292	382	0	1
1039	3385	43	0	0	chr3	59510018	59510414	-100089369	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1039	7343	82	32	24	chr3	59510414	59511503	-100088280	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1039	3070	69	10	0	chr3	59511503	59511895	-100087888	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1039	674	245	7	0	chr3	59512178	59512317	-100087466	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-1300	209	70	2
1039	808	189	183	10	chr3	59512317	59512525	-100087258	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-123	244	1	2
1039	4952	135	54	35	chr3	59514039	59514924	-100084859	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	2
1039	388	345	52	4	chr3	59516071	59516237	-100083546	-	MTEb	LTR	MaLR	-208	171	1	2
1039	570	152	40	0	chr3	59519498	59519597	-100080186	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	276	3
1039	3789	209	122	16	chr3	59519597	59519693	-100080090	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-294	1215	1124	3
1039	3789	209	122	16	chr3	59519834	59520566	-100079217	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-386	1123	311	3
1039	3789	209	122	16	chr3	59520732	59520863	-100078920	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1199	310	153	3
1039	1372	225	66	53	chr3	59525333	59525901	-100073882	+	RMER12	LTR	ERVK	1	583	-1265	4
1039	352	298	17	17	chr3	59525957	59526073	-100073710	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	587	702	-1146	4
1039	2523	174	87	27	chr3	59527852	59528402	-100071381	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	583	-2	4
1039	340	248	84	35	chr3	59528769	59528911	-100070872	+	RLTR40	LTR	ERVK	19	167	-650	4
1039	319	233	33	11	chr3	59529255	59529346	-100070437	+	RLTR40	LTR	ERVK	187	279	-538	4
1039	348	322	49	81	chr3	59529467	59529688	-100070095	+	RLTR40	LTR	ERVK	293	506	-311	4
1039	475	284	34	7	chr3	59530774	59530923	-100068860	-	RMER15	LTR	ERVL	-59	516	364	5
1039	689	252	40	72	chr3	59531605	59531827	-100067956	+	MTE2a	LTR	MaLR	152	366	-13	6
1039	651	309	45	83	chr3	59535136	59535329	-100064454	-	MTE2a	LTR	MaLR	-101	278	81	6
1039	651	309	45	83	chr3	59535354	59535449	-100064334	-	MTE2a	LTR	MaLR	-299	80	1	6
1039	3763	174	12	6	chr3	59539986	59540666	-100059117	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-24	1824	1141	7
1039	268	163	0	0	chr3	59541244	59541287	-100058496	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-700	1148	1106	7
1039	3155	171	38	26	chr3	59541288	59541942	-100057841	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1183	665	4	7
1039	3192	234	56	79	chr3	59543540	59544571	-100055212	-	RMER17B	LTR	ERVK	-10	948	2	7
1039	302	321	145	41	chr3	59553726	59553898	-100045885	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1133	9
1039	4313	158	48	69	chr3	59553923	59554870	-100044913	-	RMER12	LTR	ERVK	-395	927	1	9
1039	2930	233	104	20	chr3	59564316	59565099	-100034684	+	RMER12	LTR	ERVK	9	836	-486	1
1039	2930	224	97	50	chr3	59565151	59565609	-100034174	+	RMER12	LTR	ERVK	837	1037	-285	1
1039	2778	61	0	11	chr3	59567055	59567405	-100032378	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
1039	3184	36	61	0	chr3	59567405	59567848	-100031935	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	470	-1322	1
1039	9445	63	4	2	chr3	59575678	59577031	-100022752	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	437	1792	0	1
1039	2711	54	39	3	chr3	59577031	59577365	-100022418	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
1039	2749	58	12	9	chr3	59578559	59578904	-100020879	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
1039	3399	169	39	11	chr3	59580267	59580890	-100018893	-	RLTR26	LTR	ERVK	-2	640	1	1
1039	45144	78	27	5	chr3	59580891	59586438	-100013345	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	0	6919	1259	1
1039	45144	78	27	5	chr3	59586465	59586775	-100013008	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-5661	1258	934	1
1039	2273	78	57	3	chr3	59586774	59587070	-100012713	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6293	626	315	1
1039	2006	121	15	4	chr3	59587624	59587898	-100011885	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6628	291	15	1
1039	722	125	0	0	chr3	59587904	59588016	-100011767	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	531	1
1039	1802	147	148	8	chr3	59588027	59588411	-100011372	-	RLTR26	LTR	ERVK	-204	438	1	1
1039	340	102	68	0	chr3	59590547	59590606	-100009177	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-229	1734	1672	1
1039	5363	117	28	22	chr3	59590619	59590999	-100008784	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	377	-512	1
1039	5363	117	28	22	chr3	59591182	59591680	-100008103	+	RMER17D	LTR	ERVK	378	885	-4	1
1039	441	196	22	105	chr3	59591807	59591895	-100007888	-	MT2B	LTR	ERVL	-393	191	154	1
1039	899	158	39	6	chr3	59591884	59592062	-100007721	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1219	573	390	1
1039	775	127	0	0	chr3	59592059	59592193	-100007590	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1658	134	1	1
1039	2301	100	19	0	chr3	59592193	59592514	-100007269	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1039	267	328	23	15	chr3	59592788	59592918	-100006865	-	MER70-int	LTR	ERVL	-799	4224	4094	1
1039	527	334	98	41	chr3	59593168	59593586	-100006197	-	MER70-int	LTR	ERVL	-1224	3799	3358	1
1039	3003	21	0	0	chr3	59600950	59601287	-99998496	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1039	57219	21	11	5	chr3	59601287	59607721	-99992062	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	1
1039	3003	21	0	0	chr3	59607721	59608058	-99991725	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1039	6283	102	28	6	chr3	59612730	59613668	-99986115	+	RLTR13A2	LTR	ERVK	1	958	0	1
1039	1280	256	68	115	chr3	59617137	59617988	-99981795	+	RMER12	LTR	ERVK	1	805	-1003	1
1039	369	205	24	48	chr3	59618045	59618171	-99981612	+	RMER12	LTR	ERVK	1051	1246	-158	1
1039	2437	177	89	22	chr3	59619454	59620002	-99979781	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	1
1039	311	300	62	41	chr3	59620360	59620506	-99979277	+	RLTR40	LTR	ERVK	19	167	-650	1
1039	954	254	48	197	chr3	59625000	59625104	-99974679	+	RLTR40	LTR	ERVK	198	283	-534	1
1039	954	254	48	197	chr3	59625139	59625315	-99974468	+	RLTR40	LTR	ERVK	284	429	-388	1
1039	954	254	48	197	chr3	59625484	59625568	-99974215	+	RLTR40	LTR	ERVK	430	492	-325	1
1039	954	254	48	197	chr3	59625710	59626008	-99973775	+	RLTR40	LTR	ERVK	493	763	-54	1
1039	677	259	39	73	chr3	59627522	59627755	-99972028	+	MTE2a	LTR	MaLR	142	366	-13	1
1040	1660	186	37	12	chr3	59637968	59638289	-99961494	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
1040	6041	177	8	49	chr3	59638289	59639493	-99960290	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	809	1
1040	3512	15	2	0	chr3	59656273	59656668	-99943115	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1040	285	286	97	9	chr3	59660729	59660842	-99938941	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-247	123	1	2
1040	424	336	55	28	chr3	59661677	59661894	-99937889	+	ORR1E	LTR	MaLR	135	357	-2	2
1040	2002	309	36	73	chr3	59661898	59662741	-99937042	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	811	-559	2
1040	431	291	9	9	chr3	59666212	59666323	-99933460	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	260	2
1040	2555	201	87	22	chr3	59668438	59669039	-99930744	-	RLTR26	LTR	ERVK	-1	641	2	2
1040	320	289	84	55	chr3	59673453	59673658	-99926125	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	173	2
1040	371	258	595	68	chr3	59673648	59673821	-99925962	-	MTD	LTR	MaLR	-155	264	1	2
1040	895	265	47	7	chr3	59673821	59674098	-99925685	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	971	2
1040	246	212	54	140	chr3	59674092	59674185	-99925598	-	MTD-int	LTR	MaLR	-968	290	206	2
1040	886	287	55	0	chr3	59674201	59674438	-99925345	-	MTD	LTR	MaLR	-169	250	1	2
1040	1025	150	67	0	chr3	59681491	59681671	-99918112	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2053	2244	-5162	2
1040	5542	120	35	9	chr3	59681662	59682571	-99917212	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2494	3426	-3980	2
1040	351	173	0	26	chr3	59682571	59682648	-99917135	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3279	3353	-2053	2
1040	4682	125	38	13	chr3	59682648	59683837	-99915946	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5209	6071	-1173	2
1040	4301	177	71	8	chr3	59683851	59684700	-99915083	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	2
1040	337	346	121	85	chr3	59695598	59695625	-99904158	+	RMER21A	LTR	ERV1	368	396	-551	2
1040	337	346	121	85	chr3	59695656	59695934	-99903849	+	RMER21A	LTR	ERV1	397	684	-263	2
1040	2641	191	21	52	chr3	59696956	59697536	-99902247	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	14	2
1040	430	256	152	48	chr3	59698510	59698740	-99901043	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1004	254	1	2
1040	1294	266	63	37	chr3	59698784	59699163	-99900620	-	MTD	LTR	MaLR	-30	389	1	2
1040	547	287	66	101	chr3	59700487	59700805	-99898978	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-317	307	1	2
1040	1706	199	97	42	chr3	59706694	59707167	-99892616	-	RLTR16	LTR	ERVK	-3	502	4	2
1040	3353	87	6	37	chr3	59709403	59709891	-99889892	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-2	473	1	2
1040	1011	212	19	170	chr3	59716887	59717211	-99882572	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	275	-104	2
1040	2120	147	22	42	chr3	59717421	59717825	-99881958	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	3	2
1040	474	336	54	100	chr3	59721696	59722066	-99877717	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	7	3
1040	1374	168	163	30	chr3	59722325	59722505	-99877278	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	183	3
1040	1374	168	163	30	chr3	59722586	59722767	-99877016	-	RMER17C	LTR	ERVK	-228	182	1	3
1040	1775	206	53	8	chr3	59722938	59723315	-99876468	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1040	381	236	108	32	chr3	59723355	59723496	-99876287	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-208	157	3	3
1040	457	323	42	42	chr3	59727841	59728006	-99871777	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-106	409	245	3
1040	400	316	91	82	chr3	59728465	59728696	-99871087	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-283	237	5	3
1040	467	337	57	112	chr3	59737242	59737643	-99862140	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	3
1040	4042	116	28	31	chr3	59738440	59739125	-99860658	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1089	759	77	3
1040	311	365	9	0	chr3	59745322	59745437	-99854346	-	RMER15	LTR	ERVL	-41	534	419	3
1040	393	333	99	7	chr3	59745935	59746077	-99853706	+	MER70-int	LTR	ERVL	3232	3386	-1637	3
1040	752	327	98	23	chr3	59746309	59746878	-99852905	+	MER70-int	LTR	ERVL	3678	4289	-734	3
1040	330	351	101	29	chr3	59747760	59747968	-99851815	+	MER70B	LTR	ERVL	99	321	-257	3
1040	1037	184	20	45	chr3	59749652	59750193	-99849590	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	410	0	3
1040	1813	216	116	100	chr3	59750193	59750944	-99848839	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	763	-2475	3
1040	8902	142	85	82	chr3	59751915	59753189	-99846594	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1276	2521	-717	3
1040	8902	142	85	82	chr3	59753267	59753558	-99846225	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2533	2874	-364	3
1040	8902	142	85	82	chr3	59753613	59753928	-99845855	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2875	3215	-23	3
1040	859	205	12	48	chr3	59754117	59754434	-99845349	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	253	-157	3
1040	859	231	15	39	chr3	59754463	59754667	-99845116	+	RMER17C	LTR	ERVK	211	410	0	3
1040	340	368	85	6	chr3	59755016	59755180	-99844603	-	MER54A	LTR	ERVL	-380	521	345	3
1040	313	328	144	35	chr3	59755428	59755630	-99844153	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-277	238	15	3
1040	533	326	48	117	chr3	59765406	59765799	-99833984	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	1	3
1040	4176	127	107	8	chr3	59767746	59768482	-99831301	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	3
1041	21908	161	30	21	chr3	59770009	59774230	-99825553	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-213	7193	2164	3
1041	393	331	8	0	chr3	59780747	59780868	-99818915	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	418	3
1041	281	248	140	9	chr3	59781220	59781334	-99818449	+	MER70-int	LTR	ERVL	3014	3142	-1881	3
1041	3345	40	0	0	chr3	59781335	59781731	-99818052	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1041	1317	338	46	15	chr3	59782298	59782967	-99816816	+	MER70-int	LTR	ERVL	4296	4985	-38	3
1041	581	375	155	11	chr3	59783169	59783545	-99816238	+	MER70B	LTR	ERVL	40	470	-2	3
1041	545	231	51	0	chr3	59786718	59786835	-99812948	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7192	-214	3
1041	6842	65	7	0	chr3	59787015	59787756	-99812027	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	745	-148	3
1041	6842	65	7	0	chr3	59788224	59788369	-99811414	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	746	891	-2	3
1041	367	293	44	33	chr3	59788777	59788957	-99810826	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	185	366	-6878	3
1041	2167	168	150	37	chr3	59789110	59789618	-99810165	+	RMER16-int	LTR	ERVK	255	819	-4587	3
1041	443	125	268	10	chr3	59789623	59789720	-99810063	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1089	1210	-4196	3
1041	592	275	101	30	chr3	59789734	59789933	-99809850	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2455	2667	-4739	3
1041	8409	148	75	49	chr3	59789920	59791094	-99808689	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2979	4233	-3173	3
1041	8409	148	75	49	chr3	59791162	59791577	-99808206	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4234	4679	-2727	3
1041	1785	61	4	0	chr3	59791575	59791806	-99807977	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5356	5587	-1819	3
1041	1405	81	0	0	chr3	59797890	59798076	-99801707	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5577	5762	-1644	3
1041	5561	172	68	59	chr3	59798065	59799514	-99800269	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3903	5910	-1334	3
1041	905	267	15	12	chr3	59799503	59799858	-99799925	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	7506	7826	-391	3
1041	4519	143	23	19	chr3	59799889	59800585	-99799198	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6494	7192	-214	3
1041	317	282	56	7	chr3	59810074	59810228	-99789555	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-335	221	54	3
1041	1052	259	92	6	chr3	59818060	59818334	-99781449	-	MTD	LTR	MaLR	-18	401	120	4
1041	479	139	11	34	chr3	59820074	59820163	-99779620	-	MTC	LTR	MaLR	-334	87	1	4
1041	1264	308	59	46	chr3	59824788	59825333	-99774450	+	MTE-int	LTR	MaLR	102	653	-927	4
1041	380	349	64	35	chr3	59825669	59825841	-99773942	+	MTE-int	LTR	MaLR	745	921	-659	4
1041	2744	197	46	38	chr3	59826535	59827212	-99772571	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1028	350	4
1041	449	251	20	91	chr3	59829320	59829440	-99770343	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	234	4
1041	2885	73	49	24	chr3	59829440	59829849	-99769934	+	BGLII	LTR	ERVK	3	421	0	4
1041	449	251	20	91	chr3	59829849	59829925	-99769858	-	RLTR15	LTR	ERVK	-126	233	161	4
1041	887	191	74	57	chr3	59830969	59831266	-99768517	-	MTC	LTR	MaLR	0	396	15	4
1041	562	270	145	100	chr3	59831250	59831367	-99768416	-	MTC-int	LTR	MaLR	-10	1248	1135	4
1041	2981	219	16	51	chr3	59831488	59832232	-99767551	-	MTC-int	LTR	MaLR	-122	1136	461	4
1041	420	379	101	55	chr3	59832241	59832548	-99767235	+	MLT2B3	LTR	ERVL	343	663	-54	4
1041	915	219	22	38	chr3	59842513	59842698	-99757085	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	182	-846	4
1041	1810	241	47	8	chr3	59844426	59844933	-99754850	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	4
1041	1981	196	162	13	chr3	59845926	59846458	-99753325	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	4
1041	763	142	31	52	chr3	59846475	59846668	-99753115	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-8	5772	5584	4
1041	1589	205	141	15	chr3	59846776	59847236	-99752547	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-336	5444	4927	4
1041	385	171	128	22	chr3	59847261	59847365	-99752418	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	120	-346	4
1041	543	263	31	45	chr3	59847421	59847675	-99752108	+	RMER4B	LTR	ERVK	291	576	-9	4
1041	1348	283	69	26	chr3	59857311	59857772	-99742011	-	RMER15	LTR	ERVL	-5	570	90	4
1041	233	286	48	0	chr3	59857872	59857935	-99741848	-	RMER15	LTR	ERVL	-509	66	1	4
1041	1079	286	139	9	chr3	59862107	59862552	-99737231	+	RMER5	LTR	ERV1	32	534	0	4
1041	376	222	23	86	chr3	59870305	59870334	-99729449	+	MT2B	LTR	ERVL	139	159	-442	4
1041	248	381	0	23	chr3	59871245	59871331	-99728452	-	RMER15	LTR	ERVL	-156	419	336	4
1041	1895	167	57	14	chr3	59871393	59871746	-99728037	+	MTC	LTR	MaLR	1	368	-53	4
1041	1531	224	61	200	chr3	59873398	59873829	-99725954	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	378	-233	4
1041	1531	224	61	200	chr3	59873852	59874130	-99725653	+	RMER19C	LTR	ERVK	379	611	0	4
1041	2096	154	105	185	chr3	59874319	59874635	-99725148	-	RMER6C	LTR	ERVK	-9	681	407	5
1041	2096	154	105	185	chr3	59875461	59875884	-99723899	-	RMER6C	LTR	ERVK	-284	406	1	5
1041	1914	184	74	0	chr3	59876987	59877352	-99722431	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	5
1041	384	278	44	23	chr3	59878898	59879099	-99720684	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-388	4675	4493	5
1041	875	277	56	26	chr3	59888135	59888402	-99711381	+	MTE2a	LTR	MaLR	84	358	-21	5
1041	1515	121	12	77	chr3	59899580	59899839	-99699944	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	242	-85	5
1042	1902	188	62	18	chr3	59899910	59900311	-99699472	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	5
1042	1812	232	78	6	chr3	59900474	59900960	-99698823	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	7	5
1042	226	308	0	0	chr3	59907182	59907234	-99692549	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-117	331	280	5
1042	264	296	110	58	chr3	59908278	59908432	-99691351	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	36	197	-836	5
1042	329	247	109	68	chr3	59909032	59909197	-99690586	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	983	1114	0	5
1042	2220	218	119	69	chr3	59910199	59911054	-99688729	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	1033	0	5
1042	485	310	156	38	chr3	59917978	59918156	-99681627	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	167	5
1042	485	310	156	38	chr3	59918186	59918346	-99681437	-	MTEa	LTR	MaLR	-213	166	1	5
1042	1174	266	107	87	chr3	59920281	59920877	-99678906	+	RLTR18	LTR	ERVK	9	616	0	5
1042	419	310	82	24	chr3	59921449	59921657	-99678126	-	MLT1D	LTR	MaLR	-1	504	285	5
1042	312	310	93	25	chr3	59922133	59922295	-99677488	-	MLT1D	LTR	MaLR	-324	181	9	5
1042	2108	135	6	12	chr3	59924398	59924727	-99675056	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1042	623	265	73	65	chr3	59931297	59931633	-99668150	+	RLTR28B	LTR	ERVL	9	333	-191	5
1042	247	266	0	15	chr3	59932034	59932099	-99667684	+	RLTR28B	LTR	ERVL	437	500	-24	5
1042	346	179	0	50	chr3	59934450	59934550	-99665233	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1973	2067	-3455	6
1042	619	227	41	85	chr3	59934639	59934885	-99664898	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7248	7482	-1477	6
1042	358	194	42	100	chr3	59935077	59935197	-99664586	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2914	3026	-3111	6
1042	402	162	147	93	chr3	59936892	59937042	-99662741	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3556	3713	-2424	6
1042	541	260	42	51	chr3	59937146	59937361	-99662422	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2627	2839	-399	6
1042	260	246	81	16	chr3	59937539	59937663	-99662120	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	3024	3155	-83	6
1042	978	239	85	72	chr3	59937725	59938032	-99661751	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	311	-170	6
1042	1452	197	61	20	chr3	59946482	59946876	-99652907	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	6
1042	238	192	81	93	chr3	59948693	59948779	-99651004	-	LTR65	LTR	ERV1	-251	418	334	6
1042	2133	192	19	15	chr3	59949272	59949684	-99650099	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	6
1042	575	235	17	0	chr3	59949762	59949881	-99649902	+	MTC	LTR	MaLR	1	121	-300	6
1042	1213	215	53	43	chr3	59952267	59952568	-99647215	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	250	6
1042	1991	265	67	35	chr3	59963184	59963271	-99636512	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1090	1165	-3834	6
1042	1991	265	67	35	chr3	59963313	59963902	-99635881	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1166	1786	-3213	6
1042	1593	262	49	22	chr3	59963910	59964398	-99635385	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1889	2389	-2610	6
1042	364	360	90	65	chr3	59968341	59968697	-99631086	-	LTR16A	LTR	ERVL	-84	367	3	6
1042	275	328	133	33	chr3	59975321	59975501	-99624282	-	MTD	LTR	MaLR	-204	215	18	6
1042	456	296	0	17	chr3	59989253	59989370	-99610413	+	MTEa	LTR	MaLR	252	366	-13	6
1042	592	354	123	9	chr3	59991628	59991945	-99607838	+	LTR33A_	LTR	ERVL	179	531	0	6
1042	296	326	41	0	chr3	59999902	60000000	-99599783	+	MLT1D	LTR	MaLR	10	111	-394	7
1042	348	322	104	10	chr3	60000737	60000938	-99598845	-	MER34	LTR	ERV1	-5	537	318	4
1042	3581	139	23	3	chr3	60001035	60001604	-99598179	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	580	-4	5
1042	362	290	61	0	chr3	60001610	60001741	-99598042	-	MER34	LTR	ERV1	-386	156	18	4
1042	408	296	79	16	chr3	60002186	60002313	-99597470	+	MLT1B	LTR	MaLR	37	171	-219	6
1042	675	224	69	6	chr3	60002817	60002831	-99596952	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-573	530	517	8
1042	675	224	69	6	chr3	60002852	60003012	-99596771	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-587	516	346	8
1042	365	312	11	0	chr3	60004750	60004843	-99594940	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-934	94	1	1
1042	1037	231	159	10	chr3	60005037	60005329	-99594454	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	563	0	1
1042	238	385	55	22	chr3	60005329	60005483	-99594300	+	MLT1J1	LTR	MaLR	90	249	-195	1
1042	1140	242	166	9	chr3	60010210	60010560	-99589223	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	2
1043	1185	253	51	100	chr3	60049531	60050062	-99549721	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	1	5
1043	3504	23	0	0	chr3	60050578	60050974	-99548809	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1043	3333	170	65	18	chr3	60051478	60052136	-99547647	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	689	-1	5
1043	303	274	48	82	chr3	60058980	60059127	-99540656	+	LTR40a	LTR	ERVL	1	142	-377	7
1043	634	331	35	60	chr3	60059263	60059578	-99540205	-	ORR1E	LTR	MaLR	-52	307	1	7
1043	298	260	0	14	chr3	60060353	60060427	-99539356	+	MTEb	LTR	MaLR	294	366	-13	7
1043	280	306	55	18	chr3	60061263	60061373	-99538410	+	LTR88b	LTR	Gypsy?	716	829	-8	7
1043	1858	240	24	17	chr3	60061735	60062151	-99537632	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	7
1043	431	161	0	65	chr3	60062370	60062463	-99537320	+	MTC	LTR	MaLR	1	87	-334	8
1043	2055	172	5	33	chr3	60063384	60063805	-99535978	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	8
1043	487	96	0	14	chr3	60063807	60063881	-99535902	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3	7403	7331	8
1043	4185	130	12	26	chr3	60064096	60064791	-99534992	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1184	6222	5772	8
1043	4185	84	0	7	chr3	60064817	60064924	-99534859	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1635	5771	5665	8
1043	263	352	37	0	chr3	60065413	60065521	-99534262	+	MLT1G1	LTR	MaLR	21	132	-447	8
1043	4395	73	0	12	chr3	60067566	60068137	-99531646	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	9
1043	517	301	150	16	chr3	60075177	60075430	-99524353	+	MLT1A0	LTR	MaLR	35	321	-44	9
1043	3174	51	2	5	chr3	60076869	60077266	-99522517	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1043	1104	256	153	6	chr3	60078930	60079295	-99520488	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1043	1066	215	145	78	chr3	60084163	60084192	-99515591	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	31	-353	1
1043	1066	215	145	78	chr3	60084324	60084466	-99515317	+	ORR1C2	LTR	MaLR	32	174	-210	1
1043	1066	215	145	78	chr3	60084518	60084703	-99515080	+	ORR1C2	LTR	MaLR	175	383	-1	1
1043	2391	180	28	38	chr3	60091355	60091885	-99507898	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	3	1
1043	3008	151	56	42	chr3	60091893	60092481	-99507302	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	1100	1695	-33	1
1043	1953	172	35	39	chr3	60092508	60093155	-99506628	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	813	-145	1
1043	486	310	76	6	chr3	60096423	60096595	-99503188	-	MLT1C	LTR	MaLR	-3	464	281	1
1043	707	255	130	0	chr3	60096777	60096977	-99502806	-	MLT1C	LTR	MaLR	-228	239	14	1
1043	574	283	33	50	chr3	60100959	60101039	-99498744	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	303	1
1043	5919	143	104	5	chr3	60101039	60102053	-99497730	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	1	1114	0	1
1043	574	283	33	50	chr3	60102053	60102154	-99497629	-	MTE2a	LTR	MaLR	-77	302	201	1
1043	1012	215	79	47	chr3	60102178	60102432	-99497351	-	MT2B	LTR	ERVL	-11	590	329	1
1043	3520	171	42	69	chr3	60111728	60112439	-99487344	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	1
1043	359	295	146	10	chr3	60114419	60114611	-99485172	+	MLT1C	LTR	MaLR	67	284	-183	1
1043	440	299	40	40	chr3	60114761	60114935	-99484848	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	217	1
1043	260	263	201	45	chr3	60115343	60115522	-99484261	+	MLT1C	LTR	MaLR	362	568	-27	1
1043	2012	178	17	70	chr3	60124053	60124469	-99475314	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1043	1028	296	53	9	chr3	60129018	60129359	-99470424	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	4	1
1043	2568	202	63	22	chr3	60131321	60131908	-99467875	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	1
1043	484	172	0	0	chr3	60138036	60138123	-99461660	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	293	1
1043	609	277	93	22	chr3	60147047	60147343	-99452440	-	MTE2a	LTR	MaLR	-60	319	1	1
1043	1646	307	142	14	chr3	60147343	60148040	-99451743	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	0	1580	795	1
1043	489	321	0	15	chr3	60148078	60148214	-99451569	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-962	618	485	1
1043	1028	299	21	71	chr3	60148200	60148578	-99451205	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-1207	373	15	1
1043	778	327	62	53	chr3	60149172	60149492	-99450291	-	MTE2a	LTR	MaLR	-54	325	3	1
1043	2763	189	22	36	chr3	60150215	60150249	-99449534	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	542	1
1043	2763	189	22	36	chr3	60150289	60150837	-99448946	-	RMER15	LTR	ERVL	-34	541	3	1
1043	1860	170	82	11	chr3	60151144	60151512	-99448271	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
1043	413	268	34	118	chr3	60155881	60156118	-99443665	+	MLT1C-int	LTR	MaLR	1128	1344	-27	2
1043	405	286	132	55	chr3	60156178	60156582	-99443201	+	MLT1C	LTR	MaLR	29	463	-4	2
1043	265	224	35	0	chr3	60157155	60157213	-99442570	+	MLT1J	LTR	MaLR	73	132	-380	2
1043	1017	251	309	5	chr3	60157723	60158090	-99441693	+	RMER15	LTR	ERVL	27	512	-63	2
1043	1017	251	309	5	chr3	60158119	60158155	-99441628	+	RMER15	LTR	ERVL	513	552	-23	2
130	714	343	95	54	chr3	60161675	60162140	-99437643	-	MER77	LTR	ERVL	-3	604	121	2
1044	281	344	40	58	chr3	60162988	60163161	-99436622	-	MER21-int	LTR	ERV1	-362	3829	3660	2
1044	788	321	104	27	chr3	60163816	60164190	-99435593	-	MER21-int	LTR	ERV1	-1102	3089	2687	2
1044	546	326	136	30	chr3	60164363	60164701	-99435082	+	MTEa	LTR	MaLR	5	378	-1	2
1044	1381	251	30	79	chr3	60164999	60165537	-99434246	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-109	468	7	2
1044	1932	193	11	14	chr3	60170294	60170662	-99429121	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1044	564	311	57	0	chr3	60181830	60182007	-99417776	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-28	1552	1366	2
1044	800	284	12	48	chr3	60184724	60184972	-99414811	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1341	239	1	2
1044	477	221	72	85	chr3	60184972	60185125	-99414658	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	227	2
1044	253	260	13	25	chr3	60185214	60185293	-99414490	-	MTEa	LTR	MaLR	-292	82	5	2
1044	1180	276	145	12	chr3	60194194	60194612	-99405171	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	5	478	-100	2
1044	1180	276	145	12	chr3	60194683	60194760	-99405023	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	479	565	-13	2
1044	751	250	10	39	chr3	60196780	60196984	-99402799	+	MTD	LTR	MaLR	19	216	-203	2
1044	722	227	31	77	chr3	60197364	60197595	-99402188	+	MTD	LTR	MaLR	181	419	0	2
1044	379	327	60	56	chr3	60198400	60198685	-99401098	+	LTR81B	LTR	ERV1?	118	403	-990	2
1044	282	266	0	48	chr3	60198693	60198776	-99401007	+	MTD	LTR	MaLR	2	80	-341	2
1044	957	287	24	4	chr3	60199361	60199613	-99400170	+	MTD	LTR	MaLR	108	364	-55	2
1044	301	120	58	0	chr3	60199682	60199743	-99400040	+	MTD	LTR	MaLR	294	403	-16	2
1044	709	307	141	19	chr3	60224486	60224755	-99375028	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	302	-112	3
1044	238	280	179	53	chr3	60231678	60231829	-99367954	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	21	3
1044	1372	226	109	11	chr3	60244660	60245026	-99354757	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	3
1044	281	348	42	30	chr3	60249272	60249438	-99350345	-	MLT2B3	LTR	ERVL	0	554	387	3
1044	299	284	164	0	chr3	60261170	60261286	-99338497	+	MLT1E3	LTR	MaLR	7	141	-483	3
1044	2155	195	92	121	chr3	60261923	60262313	-99337470	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	331	-280	3
1044	2155	195	92	121	chr3	60262930	60263168	-99336615	+	RMER19C	LTR	ERVK	332	610	-1	3
1044	2393	108	67	16	chr3	60274564	60274939	-99324844	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1045	2024	76	116	21	chr3	60293794	60294129	-99305654	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	4
1045	27516	22	1	1	chr3	60294133	60297401	-99302382	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3	6478	3209	4
1045	6796	85	98	71	chr3	60297399	60298671	-99301112	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5168	1313	8	4
1045	2024	76	116	21	chr3	60298671	60299006	-99300777	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	4
1045	534	237	49	208	chr3	60299309	60299757	-99300026	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	4
1045	248	333	11	45	chr3	60329221	60329309	-99270474	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	179	4
1045	309	283	138	57	chr3	60383917	60384164	-99215619	+	RMER10A	LTR	ERVL	152	418	-24	5
1045	272	203	31	0	chr3	60385319	60385383	-99214400	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1542	1607	-3915	5
1045	284	133	0	0	chr3	60385511	60385556	-99214227	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1751	1795	-3727	5
1045	444	231	46	9	chr3	60394655	60394788	-99204995	+	MLT1B	LTR	MaLR	236	388	-2	5
1046	3850	181	21	15	chr3	60450011	60450762	-99149021	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	5
1046	431	350	53	29	chr3	60451102	60451308	-99148475	+	MTD	LTR	MaLR	11	221	-198	5
1046	624	240	112	65	chr3	60451335	60451549	-99148234	+	MTE2b	LTR	MaLR	154	377	-2	5
1046	269	340	46	70	chr3	60453057	60453265	-99146518	-	LTR16B2	LTR	ERVL	-87	375	187	5
1046	440	342	20	20	chr3	60454858	60455007	-99144776	+	MTD	LTR	MaLR	11	159	-260	5
1046	579	300	52	150	chr3	60456383	60456783	-99143000	-	MTD	LTR	MaLR	-57	362	2	5
1046	859	223	36	5	chr3	60459212	60459406	-99140377	+	MTD	LTR	MaLR	206	405	-14	6
1046	1358	269	104	33	chr3	60459896	60460387	-99139396	+	RMER5	LTR	ERV1	9	534	0	6
1046	1034	306	55	3	chr3	60463578	60463926	-99135857	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	368	-2	6
1046	976	298	45	47	chr3	60466032	60466391	-99133392	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	61	6
1046	425	369	79	38	chr3	60474816	60475081	-99124702	+	LTR52	LTR	ERVL	9	284	-137	6
1046	722	292	108	73	chr3	60475393	60475736	-99124047	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	179	6
1046	346	237	53	0	chr3	60475840	60475916	-99123867	-	MT2A	LTR	ERVL	-442	91	12	6
1046	4373	116	33	51	chr3	60476210	60477034	-99122749	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	6
1046	392	302	92	92	chr3	60478887	60479204	-99120579	+	MLT1A	LTR	MaLR	50	366	-8	6
1046	1026	343	86	12	chr3	60479364	60479508	-99120275	+	MLT2B3	LTR	ERVL	161	308	-362	6
1046	1026	292	120	47	chr3	60479589	60479948	-99119835	+	MLT2B3	LTR	ERVL	309	698	-19	6
1046	2866	43	3	0	chr3	60481991	60482343	-99117440	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-43	353	1	6
1046	713	199	78	13	chr3	60482343	60482494	-99117289	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-280	161	1	6
1046	3231	21	2	40	chr3	60485592	60485995	-99113788	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	6
1046	1022	129	10	79	chr3	60485995	60486197	-99113586	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	6	193	-6288	6
1046	226	327	0	0	chr3	60486197	60486252	-99113531	+	RLTR27	LTR	ERVK	221	275	-34	6
1046	3358	65	1	16	chr3	60486252	60486830	-99112953	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	6
1046	2082	75	0	0	chr3	60486830	60487108	-99112675	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	6
1046	5680	46	4	19	chr3	60487107	60487864	-99111919	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6481	0	6
1046	2300	96	126	0	chr3	60487864	60488229	-99111554	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	411	0	6
1046	2633	46	12	0	chr3	60489532	60489859	-99109924	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	55	6
1046	3107	81	0	14	chr3	60491874	60492287	-99107496	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	6
1046	3605	182	38	22	chr3	60493741	60494439	-99105344	-	RLTR33	LTR	ERVK	-19	659	1	6
1046	3453	35	0	0	chr3	60494476	60494872	-99104911	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1046	8034	61	3	70	chr3	60494874	60496049	-99103734	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	3	1098	0	6
1046	3342	38	2	8	chr3	60496049	60496447	-99103336	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1046	225	319	75	32	chr3	60496472	60496566	-99103217	+	MER90a	LTR	ERV1	35	132	-482	6
1046	269	318	83	121	chr3	60503698	60503938	-99095845	-	MLT1J	LTR	MaLR	-194	318	88	4
1046	635	309	21	30	chr3	60506284	60506529	-99093254	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	220	-159	7
1046	3146	135	10	20	chr3	60507003	60507503	-99092280	-	RLTR19	LTR	ERVK	-4	495	1	8
1046	569	173	22	38	chr3	60509242	60509411	-99090372	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	139	-418	1
1046	580	290	67	11	chr3	60509913	60510091	-99089692	+	MLT1D	LTR	MaLR	275	462	-43	1
1046	6931	78	49	34	chr3	60513578	60514586	-99085197	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	1023	0	1
1046	420	325	32	5	chr3	60515003	60515192	-99084591	+	LTR55	LTR	ERV	28	221	-327	1
1046	1106	284	15	58	chr3	60515197	60515593	-99084190	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	1
1046	237	308	50	17	chr3	60515758	60515877	-99083906	+	LTR55	LTR	ERV	418	540	-8	1
1046	1382	256	44	22	chr3	60517792	60518155	-99081628	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	1	2
1046	516	311	80	19	chr3	60519426	60519639	-99080144	-	MLT1E	LTR	MaLR	-153	500	275	2
1046	1703	260	67	38	chr3	60525857	60526353	-99073430	-	RMER15	LTR	ERVL	-17	558	49	4
1046	272	220	17	0	chr3	60526429	60526488	-99073295	-	RMER15	LTR	ERVL	-515	60	1	4
1046	1774	174	88	32	chr3	60527439	60527812	-99071971	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
1046	226	291	119	8	chr3	60528746	60528864	-99070919	+	MTEa	LTR	MaLR	226	356	-23	4
1046	823	324	93	33	chr3	60529331	60529816	-99069967	-	MT2A	LTR	ERVL	-3	530	17	4
1046	4418	154	18	15	chr3	60535716	60536509	-99063274	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	19	813	-1035	6
1046	531	264	72	67	chr3	60536795	60536990	-99062793	+	RMER12	LTR	ERVK	1127	1322	0	6
1046	331	231	108	27	chr3	60542040	60542151	-99057632	+	RLTR23	LTR	ERV1	311	430	0	7
1046	480	308	46	40	chr3	60545400	60545684	-99054099	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-14	376	72	8
1046	458	294	109	100	chr3	60546374	60546832	-99052951	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-25	503	42	8
1046	2128	208	69	40	chr3	60547364	60547872	-99051911	-	RLTR21	LTR	ERVK	-3	1569	1065	8
1046	261	138	261	0	chr3	60547849	60547914	-99051869	-	RLTR21	LTR	ERVK	-426	1146	1065	8
1046	244	286	11	56	chr3	60547883	60547972	-99051811	-	RMER12B	LTR	ERVK	-144	1260	1176	9
1046	6691	161	41	18	chr3	60548034	60548980	-99050803	-	RLTR21	LTR	ERVK	-317	1255	281	9
1046	2350	88	25	0	chr3	60548980	60549299	-99050484	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	9
1046	6691	161	41	18	chr3	60549299	60549579	-99050204	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1292	280	1	9
1046	315	272	123	45	chr3	60551082	60551236	-99048547	+	RLTR23	LTR	ERV1	265	430	0	9
1046	2533	199	83	170	chr3	60551242	60551371	-99048412	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-111	992	889	9
1046	2533	199	83	170	chr3	60551480	60552437	-99047346	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-215	888	1	9
1046	2322	121	57	44	chr3	60553005	60553412	-99046371	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	64	9
1046	2730	160	58	19	chr3	60553891	60554610	-99045173	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	681	-11	1
1046	1948	201	50	3	chr3	60554744	60555123	-99044660	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-8	399	3	1
1047	401	256	191	87	chr3	60556198	60556429	-99043354	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1537	1791	-3731	1
1047	666	282	86	16	chr3	60561216	60561461	-99038322	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	273	1
1047	359	289	79	0	chr3	60561551	60561665	-99038118	-	RMER5	LTR	ERV1	-397	137	15	1
1047	2630	185	34	41	chr3	60564592	60565248	-99034535	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	3	1
1047	1676	244	96	30	chr3	60570175	60570800	-99028983	-	RMER13A	LTR	ERVK	-25	835	130	1
1047	2730	185	72	2	chr3	60570840	60571397	-99028386	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	3454	4049	-2870	1
1047	912	311	88	15	chr3	60583029	60583371	-99016412	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	1	1
1047	1728	228	42	13	chr3	60590899	60591282	-99008501	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	12	1
1047	306	330	30	20	chr3	60594784	60594883	-99004900	-	MT2A	LTR	ERVL	-137	396	297	1
1047	1870	216	39	20	chr3	60598722	60599129	-99000654	+	MTC	LTR	MaLR	7	421	0	1
1047	430	280	73	47	chr3	60599379	60599640	-99000143	+	MTEb	LTR	MaLR	101	372	-7	1
1047	468	315	68	59	chr3	60605537	60605891	-98993892	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	3	1
1047	6812	69	6	0	chr3	60617949	60618831	-98980952	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-6	887	1	1
1047	2598	196	45	48	chr3	60620877	60621457	-98978326	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	578	0	1
1047	991	224	157	21	chr3	60625559	60625834	-98973949	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	106	2
1047	5725	65	26	11	chr3	60625834	60626621	-98973162	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	953	-5	2
1047	379	288	0	43	chr3	60626628	60626744	-98973039	-	MTD	LTR	MaLR	-307	112	2	2
1047	368	197	28	0	chr3	60632109	60632180	-98967603	+	MTC	LTR	MaLR	7	79	-342	2
1047	2407	126	86	2	chr3	60632188	60632585	-98967198	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	2
1047	1464	183	64	72	chr3	60632593	60632640	-98967143	-	RMER10B	LTR	ERVL	-10	388	347	2
1047	1464	183	64	72	chr3	60633296	60633395	-98966388	-	RMER10B	LTR	ERVL	-52	346	258	2
1047	1464	183	64	72	chr3	60633625	60633863	-98965920	-	RMER10B	LTR	ERVL	-141	257	7	2
1047	1245	216	91	56	chr3	60633861	60634200	-98965583	+	MTC	LTR	MaLR	71	421	0	2
1047	1334	122	292	0	chr3	60634709	60634962	-98964821	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1047	245	411	35	21	chr3	60635371	60635515	-98964268	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	146	-213	2
1047	1715	176	156	25	chr3	60636258	60636694	-98963089	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	493	-12	2
1047	2654	89	39	13	chr3	60640805	60641191	-98958592	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1047	283	263	133	3	chr3	60641989	60642091	-98957692	-	MTE2a	LTR	MaLR	-51	370	240	2
1047	759	320	76	48	chr3	60645409	60645763	-98954020	-	MTD	LTR	MaLR	-54	365	2	2
1047	2723	47	0	0	chr3	60647245	60647583	-98952200	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	2
1047	792	293	101	79	chr3	60651031	60651079	-98948704	+	MLT1B	LTR	MaLR	11	45	-345	2
1047	792	293	101	79	chr3	60651260	60651578	-98948205	+	MLT1B	LTR	MaLR	46	385	-5	2
1047	1824	199	66	8	chr3	60653696	60654092	-98945691	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
1047	3878	40	0	2	chr3	60654763	60655240	-98944543	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	18	2
1047	1668	251	15	20	chr3	60661217	60661615	-98938168	-	MTD	LTR	MaLR	-23	396	1	2
1047	408	331	68	50	chr3	60662499	60662851	-98936932	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	375	3	2
1047	1522	134	66	8	chr3	60663388	60663644	-98936139	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	97	2
1047	2230	186	7	48	chr3	60663644	60664166	-98935617	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	440	-144	2
1047	253	254	85	0	chr3	60664970	60665029	-98934754	+	RLTR17	LTR	ERVK	629	692	0	2
1047	375	191	71	0	chr3	60665029	60665103	-98934680	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-282	85	6	2
1047	762	240	35	17	chr3	60668335	60668509	-98931274	+	MTD	LTR	MaLR	241	417	-2	2
1047	1815	153	36	0	chr3	60671335	60671642	-98928141	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	2
1047	2291	113	0	6	chr3	60678399	60678728	-98921055	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	2
1047	301	355	96	86	chr3	60679898	60680178	-98919605	-	MER74A	LTR	ERVL	0	558	276	2
1047	465	350	54	79	chr3	60682948	60683302	-98916481	+	MLT1A	LTR	MaLR	10	354	-20	2
1048	2753	165	120	6	chr3	60692651	60693176	-98906607	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	3
1048	282	351	134	22	chr3	60693453	60693730	-98906053	+	MLT1D	LTR	MaLR	192	499	-6	3
1048	3239	177	9	31	chr3	60695449	60696033	-98903750	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	7	3
1048	302	355	25	76	chr3	60697829	60698027	-98901756	-	ORR1E	LTR	MaLR	-171	188	1	3
1048	2717	87	10	10	chr3	60699496	60699731	-98900052	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	159	3
1048	2717	87	10	10	chr3	60699967	60700125	-98899658	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-238	158	2	3
1048	427	323	29	40	chr3	60700221	60700395	-98899388	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	190	3
1048	408	363	50	58	chr3	60700448	60700688	-98899095	+	MTD	LTR	MaLR	6	243	-176	3
1048	2381	138	217	8	chr3	60702520	60703003	-98896780	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	584	-1	3
1048	2522	133	67	7	chr3	60704062	60704510	-98895273	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
1048	265	241	125	11	chr3	60710444	60710532	-98889251	+	RMER16	LTR	ERVK	387	484	-49	3
1048	394	134	30	0	chr3	60711636	60711703	-98888080	+	RMER16	LTR	ERVK	463	531	-2	3
1048	2485	210	47	93	chr3	60715240	60715897	-98883886	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	1	3
1048	249	274	82	138	chr3	60719111	60719306	-98880477	-	RMER15	LTR	ERVL	-390	185	2	3
1048	399	343	78	43	chr3	60731726	60732073	-98867710	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	3
1048	607	284	113	98	chr3	60742143	60742850	-98856933	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1731	2448	-5108	3
1048	1718	320	35	35	chr3	60743009	60744506	-98855277	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3533	5558	-1998	3
1048	469	345	44	11	chr3	60745032	60745050	-98854733	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4663	4728	-335	3
1048	474	315	60	10	chr3	60745050	60745249	-98854534	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7541	7749	-468	3
1048	469	345	44	11	chr3	60745249	60745302	-98854481	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4729	4941	-122	3
1048	2163	98	167	0	chr3	60745400	60745778	-98854005	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	441	-91	3
1048	958	228	129	66	chr3	60749855	60750203	-98849580	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	5	3
1048	357	322	100	105	chr3	60751415	60751776	-98848007	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	4
1048	985	292	138	5	chr3	60757971	60758356	-98841427	-	MER34	LTR	ERV1	-79	463	28	4
1048	3808	223	63	78	chr3	60765686	60766483	-98833300	+	MTC-int	LTR	MaLR	177	998	-260	4
1048	3808	223	63	78	chr3	60766541	60766702	-98833081	+	MTC-int	LTR	MaLR	999	1119	-139	4
1048	3808	223	63	78	chr3	60767016	60767152	-98832631	+	MTC-int	LTR	MaLR	1120	1256	-2	4
1048	741	255	27	66	chr3	60767402	60767632	-98832151	+	MTD	LTR	MaLR	68	247	-160	4
1048	626	242	88	28	chr3	60768629	60768823	-98830960	+	MTD	LTR	MaLR	220	419	0	4
1048	356	340	0	20	chr3	60770539	60770638	-98829145	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	506	4
1048	339	327	92	130	chr3	60770633	60770742	-98829041	-	RMER20B	LTR	ERVK	-31	596	484	4
1048	339	327	92	130	chr3	60770792	60770974	-98828809	-	RMER20B	LTR	ERVK	-144	483	316	4
1048	1157	180	45	34	chr3	60771043	60771410	-98828373	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-36	386	4	4
1048	243	257	53	13	chr3	60771410	60771483	-98828300	-	RMER20B	LTR	ERVK	-222	294	219	4
1048	4344	14	2	12	chr3	60772274	60772772	-98827011	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
1048	47348	14	8	0	chr3	60772772	60778092	-98821691	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	4
1048	380	179	46	35	chr3	60778092	60778179	-98821604	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	4
1048	302	0	0	0	chr3	60778179	60778217	-98821566	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	4
1048	4362	14	2	12	chr3	60778217	60778715	-98821068	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
1048	405	331	109	53	chr3	60779917	60780009	-98819774	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	87	-418	4
1048	405	331	109	53	chr3	60780056	60780432	-98819351	+	MLT1D	LTR	MaLR	88	497	-8	4
1048	552	314	79	88	chr3	60781518	60781871	-98817912	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	358	-1	4
1048	437	295	50	25	chr3	60783412	60783612	-98816171	-	MTD	LTR	MaLR	-197	182	6	4
1048	1960	130	12	58	chr3	60786954	60787297	-98812486	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1048	1670	235	35	5	chr3	60790161	60790538	-98809245	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	388	-117	4
1048	1614	115	139	3	chr3	60790832	60791120	-98808663	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	327	-5	4
1048	538	220	51	0	chr3	60793346	60793464	-98806319	+	ORR1D2	LTR	MaLR	247	370	0	4
1048	230	193	16	66	chr3	60797116	60797177	-98802606	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	322	4
1048	659	297	33	78	chr3	60797731	60798126	-98801657	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	3	4
1049	1847	140	131	131	chr3	60817875	60818319	-98781464	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	444	-2	4
1049	248	423	6	24	chr3	60818725	60818892	-98780891	+	MLT1G	LTR	MaLR	428	591	0	4
1049	299	279	70	81	chr3	60819080	60819252	-98780531	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-48	471	302	4
1049	714	254	106	121	chr3	60819552	60819874	-98779909	-	MTE2a	LTR	MaLR	-62	317	1	4
1049	963	326	86	18	chr3	60819880	60820274	-98779509	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-7	1573	1153	4
1049	1280	273	32	3	chr3	60820274	60820586	-98779197	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-40	330	10	4
1049	1886	186	21	40	chr3	60820605	60820985	-98778798	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-5	373	1	5
1049	1031	283	93	30	chr3	60820989	60821291	-98778492	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-428	1152	832	4
1049	429	198	20	40	chr3	60821305	60821405	-98778378	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-1480	100	3	4
1049	949	291	71	95	chr3	60821405	60821784	-98777999	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	1	4
1049	238	353	70	12	chr3	60843403	60843489	-98756294	-	LTR78	LTR	ERV1	-363	941	851	5
1049	2548	63	147	3	chr3	60846102	60846470	-98753313	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	5
1049	380	287	135	77	chr3	60849371	60849541	-98750242	-	MTEb	LTR	MaLR	-57	322	143	5
1049	231	263	53	0	chr3	60851492	60851549	-98748234	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-338	151	92	5
1049	2812	120	34	32	chr3	60855233	60855706	-98744077	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	2	475	0	5
1049	795	216	18	6	chr3	60855767	60855935	-98743848	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	205	5
1049	1235	205	139	23	chr3	60871373	60871861	-98727922	+	RMER19C	LTR	ERVK	11	611	0	5
1049	781	309	82	39	chr3	60876994	60877367	-98722416	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-38	370	1	5
1049	632	325	109	22	chr3	60878625	60878937	-98720846	+	MLT1C	LTR	MaLR	125	463	-4	5
1049	1344	248	24	112	chr3	60879364	60879773	-98720010	-	MTE2b	LTR	MaLR	-6	373	1	5
1049	1670	121	4	0	chr3	60881404	60881643	-98718140	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	88	5
1049	1387	108	39	0	chr3	60881647	60881851	-98717932	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-115	212	1	5
1049	2207	135	0	0	chr3	60917533	60917860	-98681923	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1049	1001	273	46	10	chr3	60919732	60920028	-98679755	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	902	481	6
1049	1415	191	44	42	chr3	60924248	60924691	-98675092	-	RMER17C	LTR	ERVK	-519	439	19	6
1049	1090	247	96	16	chr3	60930964	60931277	-98668506	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	41	6
1049	383	195	102	11	chr3	60941120	60941208	-98658575	+	MTC	LTR	MaLR	1	96	-300	6
1049	1224	214	162	0	chr3	60941780	60942139	-98657644	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	6
1049	252	269	15	0	chr3	60942897	60942964	-98656819	+	MER21B	LTR	ERV1	648	715	-148	6
1049	305	221	30	59	chr3	60943364	60943465	-98656318	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	262	6
1049	684	374	43	53	chr3	60943621	60944014	-98655769	-	MT2A	LTR	ERVL	-144	389	1	6
1049	2979	74	5	8	chr3	60944167	60944562	-98655221	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	6
1049	380	327	139	13	chr3	60944875	60945033	-98654750	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	1311	1488	-1	6
1049	533	175	52	17	chr3	60945348	60945464	-98654319	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	287	6
1049	564	300	64	118	chr3	60945464	60945778	-98654005	-	MTD	LTR	MaLR	-83	317	19	6
1049	238	274	54	89	chr3	60947029	60947141	-98652642	+	RLTR25B	LTR	ERVK	402	509	-519	6
1050	3095	75	0	2	chr3	60970880	60971281	-98628502	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1050	1499	265	77	3	chr3	60982338	60982713	-98617070	+	MTC	LTR	MaLR	1	403	-18	7
1050	1157	350	54	54	chr3	60989158	60989675	-98610108	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-16	538	22	7
1050	258	306	12	0	chr3	60992084	60992169	-98607614	+	MTEa	LTR	MaLR	1	86	-293	7
1050	751	289	98	26	chr3	60992233	60992539	-98607244	+	MT2A	LTR	ERVL	206	533	0	7
1050	394	287	278	14	chr3	61008280	61008640	-98591143	+	RMER5	LTR	ERV1	41	495	-39	1
1050	859	197	101	2	chr3	61010269	61010477	-98589306	+	MTD	LTR	MaLR	1	211	-208	1
1050	628	220	186	0	chr3	61018466	61018643	-98581140	+	MTD	LTR	MaLR	196	405	-14	1
1050	564	301	141	62	chr3	61020089	61020379	-98579404	+	MLT1A	LTR	MaLR	32	344	-30	2
1050	250	300	33	79	chr3	61026054	61026074	-98573709	+	RMER19C	LTR	ERVK	110	124	-613	2
1050	1954	244	19	46	chr3	61026121	61026614	-98573169	+	RMER19C	LTR	ERVK	125	611	0	2
1050	2778	217	66	118	chr3	61027382	61027987	-98571796	-	RMER19B	LTR	ERVK	-105	797	228	3
1050	2778	222	66	103	chr3	61028135	61028341	-98571442	-	RMER19B	LTR	ERVK	-675	227	49	3
1050	3607	157	70	68	chr3	61040871	61041776	-98558007	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	4
1050	3454	30	2	0	chr3	61042410	61042805	-98556978	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1050	9053	40	4	0	chr3	61042805	61043899	-98555884	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
1050	3464	25	2	0	chr3	61043899	61044294	-98555489	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1050	315	239	130	63	chr3	61046339	61046536	-98553247	+	MTEa	LTR	MaLR	153	378	-1	4
1050	1148	302	89	8	chr3	61049912	61050273	-98549510	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1190	390	1	5
1050	793	280	160	19	chr3	61050276	61050589	-98549194	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	5
1050	672	193	162	45	chr3	61053827	61054006	-98545777	+	ORR1C2	LTR	MaLR	174	373	-11	5
1050	409	242	105	3	chr3	61054072	61054190	-98545593	-	MTC	LTR	MaLR	-7	412	295	6
1050	1952	164	68	30	chr3	61054190	61054619	-98545164	-	BGLII_A	LTR	ERVK	0	445	1	6
1050	2346	214	79	45	chr3	61054624	61055334	-98544449	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-5	2837	2104	6
1050	3443	89	6	11	chr3	61058057	61058534	-98541249	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	6
1050	1000	291	79	38	chr3	61063643	61064036	-98535747	+	MTE-int	LTR	MaLR	141	549	-1031	7
1050	1955	281	78	5	chr3	61064026	61064580	-98535203	+	MTE-int	LTR	MaLR	983	1576	-4	7
1050	846	309	68	43	chr3	61071282	61071563	-98528220	+	MTEb	LTR	MaLR	84	371	-8	8
1050	2889	6	5	149	chr3	61073316	61073745	-98526038	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	8
1050	27811	17	1	1	chr3	61073745	61077019	-98522764	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3210	8
1050	6437	87	128	36	chr3	61077018	61078210	-98521573	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5168	1313	67	8
1050	916	86	167	0	chr3	61078181	61078343	-98521440	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6285	196	8	8
1050	2889	6	5	149	chr3	61078343	61078772	-98521011	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	8
1051	677	247	232	26	chr3	61081098	61081446	-98518337	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	8
1051	700	279	78	38	chr3	61081525	61081845	-98517938	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	333	-26	8
1051	753	230	206	47	chr3	61088444	61088491	-98511292	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	327	1
1051	753	230	206	47	chr3	61088777	61089039	-98510744	-	MTEa	LTR	MaLR	-59	320	9	1
1051	843	291	144	9	chr3	61090699	61091018	-98508765	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	362	-8	1
1051	1822	188	33	14	chr3	61092218	61092585	-98507198	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1051	226	328	21	50	chr3	61100771	61100912	-98498871	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	137	-228	1
1051	463	294	86	97	chr3	61100936	61101215	-98498568	+	ORR1E	LTR	MaLR	64	339	-20	1
1051	294	325	6	83	chr3	61103771	61103952	-98495831	+	RMER10A	LTR	ERVL	128	294	-148	1
1051	949	261	173	48	chr3	61113982	61114502	-98485281	-	LTR82A	LTR	ERVL	-162	710	126	1
1051	304	311	99	54	chr3	61115623	61115844	-98483939	-	MER21B	LTR	ERV1	-210	653	423	1
1051	395	260	64	70	chr3	61116387	61116544	-98483239	+	MLT1B	LTR	MaLR	22	177	-213	1
1051	988	210	247	17	chr3	61116620	61116920	-98482863	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	4	1
1051	226	295	77	62	chr3	61116920	61117047	-98482736	+	MLT1B	LTR	MaLR	258	386	-4	1
1051	835	323	62	25	chr3	61121613	61121987	-98477796	-	MLT2D	LTR	ERVL	-20	539	6	1
1051	235	259	30	141	chr3	61124319	61124517	-98475266	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	204	1
1051	1530	184	91	13	chr3	61127651	61127949	-98471834	+	MTC	LTR	MaLR	1	321	-100	1
1051	457	234	77	26	chr3	61127950	61128144	-98471639	+	MT2B	LTR	ERVL	1	206	-327	1
1051	8346	179	95	12	chr3	61128147	61131026	-98468757	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1977	5095	-666	1
1051	3370	186	123	39	chr3	61131338	61131673	-98468110	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5096	5457	-304	1
1051	2121	178	58	2	chr3	61135669	61136063	-98463720	+	MTC	LTR	MaLR	1	416	-5	1
1051	1646	187	84	180	chr3	61140169	61140730	-98459053	+	RLTR18B	LTR	ERVK	2	508	-4	1
1051	591	286	159	31	chr3	61142003	61142335	-98457448	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	555	167	2
1051	428	331	127	35	chr3	61142491	61142751	-98457032	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-97	1392	1109	2
1051	768	287	36	51	chr3	61150881	61151156	-98448627	-	MTE2a	LTR	MaLR	-24	355	85	2
1051	986	80	100	0	chr3	61154402	61154552	-98445231	-	RLTR28	LTR	ERVL	-359	165	1	2
1051	2548	179	103	12	chr3	61154564	61155049	-98444734	-	RMER15	LTR	ERVL	-44	531	3	2
1051	344	291	46	40	chr3	61156117	61156263	-98443520	-	MLT1F	LTR	MaLR	-25	544	391	2
1051	448	338	78	15	chr3	61156319	61156565	-98443218	-	MLT1F	LTR	MaLR	-301	268	1	2
1051	677	345	87	18	chr3	61190140	61190473	-98409310	+	MLT1B	LTR	MaLR	28	383	-7	2
1051	452	76	12	25	chr3	61195210	61195291	-98404492	+	RMER17C	LTR	ERVK	331	410	0	2
1051	454	290	28	83	chr3	61196925	61197143	-98402640	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	368	2
1051	2806	184	48	79	chr3	61199607	61200238	-98399545	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
1051	2655	71	43	55	chr3	61202895	61203311	-98396472	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	3
1051	3425	152	99	94	chr3	61206661	61207447	-98392336	+	RLTR25A	LTR	ERVK	7	860	-243	3
1051	775	168	115	50	chr3	61207493	61207533	-98392250	+	RLTR25A	LTR	ERVK	861	906	-197	3
1051	893	258	72	20	chr3	61207830	61208079	-98391704	+	RLTR25B	LTR	ERVK	766	1027	-1	3
1051	1539	190	84	9	chr3	61208153	61208488	-98391295	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	48	3
1051	240	198	25	62	chr3	61209959	61210041	-98389742	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	298	3
1051	991	263	157	7	chr3	61210167	61210454	-98389329	-	MTD	LTR	MaLR	-85	334	5	3
1052	852	291	73	64	chr3	61217954	61218312	-98381471	-	MTEb	LTR	MaLR	-24	355	3	3
1052	1927	284	127	10	chr3	61218316	61218916	-98380867	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-2	1578	909	3
1052	856	261	115	37	chr3	61222896	61223270	-98376513	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	3
1052	2149	153	49	8	chr3	61228290	61228660	-98371123	-	RLTR17	LTR	ERVK	-307	385	1	3
1052	1694	188	7	3	chr3	61233069	61233357	-98366426	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	106	3
1052	588	292	52	78	chr3	61239449	61239794	-98359989	-	MLT1B	LTR	MaLR	-13	377	42	3
1052	2079	178	63	12	chr3	61242215	61242614	-98357169	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	3
1052	356	290	54	24	chr3	61243798	61243964	-98355819	+	MLT1B	LTR	MaLR	79	249	-141	3
1052	228	363	24	8	chr3	61243989	61244114	-98355669	+	MLT1B	LTR	MaLR	304	430	-37	3
1052	833	387	44	28	chr3	61244513	61244949	-98354834	-	LTR16B	LTR	ERVL	0	463	21	3
1052	2786	77	50	0	chr3	61246731	61247108	-98352675	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1052	928	188	84	26	chr3	61248056	61248274	-98351509	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	234	-95	3
1052	1421	111	5	0	chr3	61248271	61248488	-98351295	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	404	621	-888	3
1052	1276	139	125	21	chr3	61255177	61255457	-98344326	+	RMER16-int	LTR	ERVK	314	622	-4784	3
1052	3368	196	49	71	chr3	61255457	61255635	-98344148	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	613	797	-712	3
1052	3368	196	49	71	chr3	61255788	61256466	-98343317	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	798	1450	-59	3
1052	1759	181	60	82	chr3	61256477	61256546	-98343237	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	64	-303	3
1052	1759	181	60	82	chr3	61256714	61257011	-98342772	+	ORR1B2	LTR	MaLR	65	359	-8	3
1052	2669	93	63	5	chr3	61263149	61263547	-98336236	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	4
1052	1560	193	94	3	chr3	61265251	61265579	-98334204	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	218	4
1052	1056	191	19	91	chr3	61266812	61267077	-98332706	-	RMER15	LTR	ERVL	-329	246	1	4
1052	247	375	74	41	chr3	61267626	61267868	-98331915	+	MLT2B4	LTR	ERVL	114	363	-193	4
1052	2944	54	8	3	chr3	61270193	61270580	-98329203	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-7	389	1	4
1052	1058	158	3	88	chr3	61280875	61281159	-98318624	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	262	-148	4
1052	3002	77	12	2	chr3	61283202	61283619	-98316164	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	4
1052	256	291	128	85	chr3	61291862	61292050	-98307733	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	361	-13	4
1052	656	297	70	26	chr3	61292403	61292673	-98307110	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	294	4
1052	496	261	104	57	chr3	61293178	61293389	-98306394	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-151	4848	4628	4
1052	1115	358	70	23	chr3	61294653	61295477	-98304306	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2908	2091	1229	4
1052	1140	341	66	27	chr3	61295471	61296183	-98303600	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4258	741	2	4
1052	579	342	55	4	chr3	61296184	61296419	-98303364	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	329	4
1052	2772	146	8	59	chr3	61307131	61307642	-98292141	-	RLTR28	LTR	ERVL	-38	486	2	4
1052	394	206	266	18	chr3	61308283	61308392	-98291391	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	440	4
1052	322	138	185	0	chr3	61328034	61328099	-98271684	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-297	77	1	4
1052	270	338	73	7	chr3	61329537	61329674	-98270109	-	LTR16A	LTR	ERVL	0	451	306	4
1052	1512	174	52	41	chr3	61329802	61330167	-98269616	+	RMER17C	LTR	ERVK	40	408	-2	4
1052	641	169	137	43	chr3	61330718	61330879	-98268904	-	RLTR23	LTR	ERV1	-166	264	89	4
1052	426	106	176	0	chr3	61337095	61337180	-98262603	-	RLTR23	LTR	ERV1	-325	105	6	4
1052	980	302	24	88	chr3	61337436	61337769	-98262014	+	RMER5	LTR	ERV1	15	329	-205	4
1052	980	302	24	88	chr3	61337916	61338000	-98261783	+	RMER5	LTR	ERV1	330	405	-129	4
1052	263	269	27	55	chr3	61339000	61339110	-98260673	+	RMER5	LTR	ERV1	387	493	-41	4
1052	293	344	21	0	chr3	61340032	61340128	-98259655	+	MER21B	LTR	ERV1	1	98	-765	4
1052	1202	364	58	48	chr3	61340120	61340899	-98258884	+	MER21B	LTR	ERV1	20	806	-57	4
1053	239	364	49	83	chr3	61346647	61346851	-98252932	+	LTR16A1	LTR	ERVL	161	357	-99	5
1053	253	336	47	103	chr3	61350849	61350973	-98248810	-	RMER12	LTR	ERVK	-251	1071	969	5
1053	253	336	47	103	chr3	61351247	61351292	-98248491	-	RMER12	LTR	ERVK	-354	968	926	5
1053	253	336	47	103	chr3	61351322	61351470	-98248313	-	RMER12	LTR	ERVK	-397	925	771	5
1053	2455	209	27	44	chr3	61363594	61363990	-98235793	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	389	-188	5
1053	2455	209	27	44	chr3	61364030	61364220	-98235563	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	390	577	0	5
1053	552	340	20	10	chr3	61384756	61384955	-98214828	+	MTEb	LTR	MaLR	15	215	-164	5
1053	427	340	98	12	chr3	61384992	61385156	-98214627	+	MTEb	LTR	MaLR	202	379	0	5
1053	2927	319	109	44	chr3	61385155	61385306	-98214477	+	MTEb-int	LTR	MaLR	2	150	-1430	5
1053	2927	319	109	44	chr3	61385348	61386563	-98213220	+	MTEb-int	LTR	MaLR	151	1460	-120	5
1053	2927	319	109	44	chr3	61386596	61386708	-98213075	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1461	1578	-2	5
1053	423	154	275	0	chr3	61386712	61386803	-98212980	+	MTEb	LTR	MaLR	3	118	-261	5
1053	394	320	115	49	chr3	61386967	61387253	-98212530	-	MER89	LTR	ERV1	-75	484	180	5
1053	2518	72	127	11	chr3	61387816	61387991	-98211792	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	216	-206	5
1053	2518	72	127	11	chr3	61388060	61388262	-98211521	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	217	421	-1	5
1053	464	187	22	0	chr3	61389300	61389391	-98210392	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	436	5
1053	328	111	273	107	chr3	61392654	61392775	-98207008	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-386	141	1	5
1053	454	294	54	27	chr3	61397673	61397820	-98201963	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	151	-709	5
1053	309	288	263	0	chr3	61427417	61427569	-98172214	+	ORR1D1	LTR	MaLR	36	234	-144	6
1053	720	223	85	35	chr3	61427998	61428198	-98171585	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	175	6
1053	1271	246	68	46	chr3	61429625	61430035	-98169748	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
1053	2611	114	2	22	chr3	61432690	61433094	-98166689	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1053	8003	80	6	4	chr3	61433095	61434186	-98165597	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	2	1095	-3	6
1053	2687	104	2	20	chr3	61434189	61434592	-98165191	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1053	1166	245	108	30	chr3	61458730	61459163	-98140620	+	RMER5	LTR	ERV1	2	468	-66	6
1053	393	308	107	27	chr3	61461899	61461980	-98137803	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-4	574	492	6
1053	393	308	107	27	chr3	61462022	61462090	-98137693	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-87	491	413	6
1053	633	221	28	26	chr3	61462076	61462299	-98137484	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-299	269	1	6
1053	2778	181	95	40	chr3	61465136	61465790	-98133993	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	6
1054	2042	161	19	3	chr3	61474758	61475119	-98124664	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1054	337	394	22	17	chr3	61483570	61483748	-98116035	+	MLT1J	LTR	MaLR	105	283	-229	6
1054	733	223	405	0	chr3	61493908	61494128	-98105655	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	6
1054	374	302	107	21	chr3	61494977	61495325	-98104458	+	MLT2B4	LTR	ERVL	48	446	-110	6
1054	714	258	93	19	chr3	61495945	61496318	-98103465	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-124	391	3	6
1054	238	290	63	36	chr3	61505438	61505549	-98094234	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	1235	1348	-141	5
1054	2990	18	0	0	chr3	61511505	61511842	-98087941	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1054	29204	10	2	0	chr3	61511842	61515074	-98084709	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3244	1
1054	22478	30	19	18	chr3	61515066	61517808	-98081975	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3730	2751	8	1
1054	2990	18	0	0	chr3	61517808	61518145	-98081638	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1054	804	329	37	24	chr3	61519373	61519619	-98080164	-	MTEa	LTR	MaLR	-117	262	14	1
1054	441	315	66	17	chr3	61519679	61519860	-98079923	+	MER67B	LTR	ERV1	1	190	-471	1
1054	2001	173	135	42	chr3	61520125	61520549	-98079234	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	439	-102	1
1054	2001	173	135	42	chr3	61520581	61520651	-98079132	+	RLTR20A	LTR	ERVK	440	540	-1	1
1054	368	311	262	19	chr3	61520874	61521130	-98078653	+	MER67B	LTR	ERV1	339	656	-5	1
1054	2254	151	22	68	chr3	61521382	61521793	-98077990	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	2
1054	397	288	56	43	chr3	61530689	61530815	-98068968	+	ORR1D1	LTR	MaLR	47	187	-197	2
1054	342	288	50	50	chr3	61530865	61530896	-98068887	+	ORR1D1	LTR	MaLR	188	214	-170	2
1054	1584	217	57	19	chr3	61531869	61532058	-98067725	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	419	193	3
1054	1584	209	57	14	chr3	61532113	61532292	-98067491	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-192	192	2	3
1054	4271	28	0	0	chr3	61538452	61538945	-98060838	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1054	559	249	227	0	chr3	61539217	61539402	-98060381	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-167	227	1	4
1054	1625	247	19	120	chr3	61541483	61542049	-98057734	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-3	509	1	4
1054	1667	220	79	3	chr3	61545055	61545424	-98054359	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	16	5
1054	346	185	124	52	chr3	61550621	61550815	-98048968	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	68	5
1054	318	293	114	0	chr3	61550994	61551117	-98048666	+	MER57C2	LTR	ERV1	59	195	-239	5
1054	1757	203	113	3	chr3	61551373	61551743	-98048040	+	MTC	LTR	MaLR	1	411	-10	5
1054	1248	208	99	18	chr3	61563488	61563772	-98036011	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-6	361	55	7
1054	487	165	62	0	chr3	61564930	61565027	-98034756	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-263	104	2	7
1054	305	225	52	126	chr3	61565792	61565950	-98033833	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-221	144	1	7
1054	2685	160	129	50	chr3	61571431	61571997	-98027786	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	8
1054	3198	207	122	14	chr3	61599592	61600370	-97999413	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	862	-166	1
1054	839	211	94	38	chr3	61601026	61601238	-97998545	+	RLTR25B	LTR	ERVK	880	1103	0	1
1054	3012	68	13	8	chr3	61601478	61601876	-97997907	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1055	2638	160	53	20	chr3	61606303	61606814	-97992969	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	1	1
1055	1471	219	100	13	chr3	61614398	61614787	-97984996	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	536	1
1055	1827	217	13	8	chr3	61615730	61616106	-97983677	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
1055	2738	209	32	10	chr3	61616115	61616699	-97983084	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-7	1502	906	1
1055	1020	215	10	5	chr3	61616699	61616900	-97982883	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1289	4472	4271	1
1055	1183	232	8	30	chr3	61616923	61617190	-97982593	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	261	-1248	1
1055	1574	185	125	3	chr3	61617236	61617573	-97982210	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
1055	1029	267	136	3	chr3	61625333	61625641	-97974142	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	9	1
1055	268	355	32	16	chr3	61626392	61626518	-97973265	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-122	438	311	1
1055	242	343	161	42	chr3	61627523	61627876	-97971907	+	MLT1A1	LTR	MaLR	3	397	-11	1
1055	323	400	5	37	chr3	61628711	61628898	-97970885	+	MLT1A	LTR	MaLR	177	357	-17	1
1055	662	197	91	7	chr3	61629089	61629232	-97970551	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-2	439	285	1
1055	3524	33	28	5	chr3	61629376	61629802	-97969981	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
1055	1447	56	0	0	chr3	61629802	61629980	-97969803	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1	178	-7403	1
1055	370	115	0	0	chr3	61630163	61630215	-97969568	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	93	144	-6398	1
1055	1956	9	9	4	chr3	61630213	61630444	-97969339	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	654	885	-1102	1
1055	19100	45	0	0	chr3	61630413	61632713	-97967070	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3512	5810	-1771	1
1055	7471	51	0	51	chr3	61632699	61633685	-97966098	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6646	7581	0	1
1055	3423	43	31	5	chr3	61633685	61634110	-97965673	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
1055	372	143	0	0	chr3	61635707	61635763	-97964020	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3936	908	853	1
1055	15770	94	29	25	chr3	61635760	61638007	-97961776	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4183	6437	-969	1
1055	426	147	0	0	chr3	61638210	61638285	-97961498	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7405	-1	1
1055	2485	137	8	10	chr3	61638298	61638697	-97961086	+	RLTR9E	LTR	ERVK	6	403	-6	1
1055	1373	292	43	0	chr3	61653006	61653376	-97946407	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	18	1
1055	612	127	70	0	chr3	61654034	61654176	-97945607	-	RMER17B	LTR	ERVK	-495	463	312	1
1055	614	306	134	79	chr3	61664370	61664839	-97934944	-	MLT1D	LTR	MaLR	-10	495	1	1
1055	280	253	78	69	chr3	61665656	61665758	-97934025	+	MLT2B4	LTR	ERVL	117	219	-337	1
1055	262	269	45	0	chr3	61665758	61665825	-97933958	+	MLT2B4	LTR	ERVL	358	427	-129	1
1055	953	292	76	18	chr3	61674785	61675113	-97924670	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	354	-5	1
1055	1400	180	32	121	chr3	61675285	61675632	-97924151	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-712	316	1	1
1055	241	399	40	49	chr3	61676842	61677066	-97922717	+	MLT2F	LTR	ERVL	274	495	-168	1
1055	5442	130	63	15	chr3	61677893	61678807	-97920976	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	2
1055	1958	232	52	12	chr3	61683511	61683544	-97916239	-	MT2A	LTR	ERVL	-12	521	488	2
1055	1958	232	52	12	chr3	61683571	61684038	-97915745	-	MT2A	LTR	ERVL	-46	487	2	2
1055	2640	100	70	64	chr3	61693398	61693876	-97905907	-	RLTR44C	LTR	ERVK	-25	477	9	2
1055	973	174	30	155	chr3	61716730	61717098	-97882685	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
1055	503	93	0	26	chr3	61717100	61717177	-97882606	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3	7403	7329	2
1055	657	206	113	47	chr3	61717177	61717520	-97882263	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-365	537	118	2
1055	3611	107	15	0	chr3	61717520	61717997	-97881786	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-236	7170	6687	2
1055	3602	123	22	5	chr3	61717993	61718572	-97881211	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3376	4030	3442	2
1055	1594	166	33	30	chr3	61718811	61719204	-97880579	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3958	3448	3122	2
1055	3673	167	24	117	chr3	61719232	61720214	-97879569	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3953	891	1	2
1055	1004	184	58	72	chr3	61720215	61720570	-97879213	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	409	7	2
1055	445	300	90	34	chr3	61731628	61731949	-97867834	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	373	-6	2
1055	2119	86	201	0	chr3	61734317	61734691	-97865092	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	449	-83	2
1056	242	246	61	15	chr3	61735031	61735097	-97864686	-	LTR84b	LTR	ERVL	-366	395	327	2
1056	2113	123	9	35	chr3	61739420	61739758	-97860025	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
1056	288	304	112	46	chr3	61740814	61740966	-97858817	+	MLT1L	LTR	MaLR	423	584	-26	2
1056	391	229	94	0	chr3	61741628	61741724	-97858059	-	ORR1E	LTR	MaLR	-254	105	1	2
1056	2868	328	108	66	chr3	61741724	61741834	-97857949	-	MTE-int	LTR	MaLR	-53	1527	1411	2
1056	2868	328	108	66	chr3	61742142	61743493	-97856290	-	MTE-int	LTR	MaLR	-170	1410	3	2
1056	1872	106	51	44	chr3	61746947	61747263	-97852520	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	2
1056	273	261	53	60	chr3	61750052	61750203	-97849580	+	RMER10A	LTR	ERVL	223	372	-70	3
1056	930	296	22	53	chr3	61750958	61751372	-97848411	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8275	8675	-284	3
1056	293	205	108	0	chr3	61751602	61751685	-97848098	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3190	3281	-2856	3
1056	859	219	104	135	chr3	61751661	61752247	-97847536	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3457	4024	-2113	3
1056	875	274	28	0	chr3	61752789	61753001	-97846782	+	MTE-int	LTR	MaLR	1361	1578	-2	3
1056	593	346	48	62	chr3	61756965	61757319	-97842464	+	MLT1B	LTR	MaLR	40	388	-2	3
1056	769	335	19	52	chr3	61760616	61760981	-97838802	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-1883	3108	2756	3
1056	2727	252	73	34	chr3	61762750	61763595	-97836188	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2735	2256	1379	3
1056	700	327	149	40	chr3	61772416	61772865	-97826918	+	MT2A	LTR	ERVL	36	533	0	3
1056	2146	222	7	5	chr3	61773067	61773479	-97826304	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	3
1056	1129	258	89	18	chr3	61786099	61786490	-97813293	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1056	619	364	42	37	chr3	61786983	61787337	-97812446	+	MER74A	LTR	ERVL	1	356	-202	3
1056	1194	203	78	22	chr3	61796114	61796581	-97803202	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-13	564	6	3
1056	2337	197	43	37	chr3	61801254	61801770	-97798013	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	10	3
1056	324	348	41	41	chr3	61801829	61801976	-97797807	-	MLT2F	LTR	ERVL	-233	430	284	3
1056	2112	132	3	9	chr3	61802036	61802365	-97797418	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1056	2877	200	45	35	chr3	61806423	61806943	-97792840	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	522	-94	3
1056	2877	200	45	35	chr3	61807342	61807427	-97792356	+	RLTR18	LTR	ERVK	523	612	-4	3
1056	3094	167	113	17	chr3	61808992	61809336	-97790447	+	RMER6D	LTR	ERVK	2	368	-352	3
1056	3094	167	113	17	chr3	61809377	61809688	-97790095	+	RMER6D	LTR	ERVK	369	720	0	3
1056	2229	181	76	120	chr3	61811289	61811524	-97788259	+	MTC-int	LTR	MaLR	26	258	-1000	3
1056	2229	181	76	120	chr3	61811669	61812074	-97787709	+	MTC-int	LTR	MaLR	259	638	-620	3
1056	2169	135	3	12	chr3	61815195	61815525	-97784258	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1056	1632	227	105	3	chr3	61817015	61817395	-97782388	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1056	323	248	240	40	chr3	61819357	61819582	-97780201	+	MLT1C	LTR	MaLR	204	505	0	3
1056	282	333	15	8	chr3	61821169	61821299	-97778484	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	3748	3878	-1439	3
1056	1184	91	107	39	chr3	61821840	61822046	-97777737	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	220	-210	3
1056	254	154	0	0	chr3	61822062	61822101	-97777682	+	RLTR23	LTR	ERV1	392	430	0	3
1056	2201	208	30	49	chr3	61833350	61834159	-97765624	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	752	-4	4
1056	236	167	46	77	chr3	61837759	61837824	-97761959	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	4
1056	232	185	54	36	chr3	61844002	61844058	-97755725	+	MER77	LTR	ERVL	78	134	-473	4
1056	227	281	48	12	chr3	61847098	61847181	-97752602	-	ORR1E	LTR	MaLR	-14	365	280	4
1056	392	288	76	31	chr3	61847263	61847434	-97752349	-	ORR1E	LTR	MaLR	-192	178	4	4
1056	344	340	27	139	chr3	61847578	61847872	-97751911	+	MLT1A0	LTR	MaLR	30	290	-75	4
1056	2165	138	3	0	chr3	61854968	61855294	-97744489	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1057	760	214	112	12	chr3	61866736	61866906	-97732877	+	RMER21B	LTR	ERV1	1	187	-655	4
1057	252	274	126	24	chr3	61867048	61867175	-97732608	+	RMER21B	LTR	ERV1	426	565	-277	4
1057	772	319	113	62	chr3	61867489	61867957	-97731826	+	MLT1D	LTR	MaLR	5	496	-9	4
1057	2982	198	5	9	chr3	61868169	61868746	-97731037	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	4
1057	1691	127	119	10	chr3	61872731	61873042	-97726741	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	0	345	1	4
1057	881	268	148	9	chr3	61873818	61874149	-97725634	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	3	4
1057	902	241	112	98	chr3	61874460	61874879	-97724904	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-55	426	2	4
1057	237	306	25	100	chr3	61874879	61874942	-97724841	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	979	1032	-355	4
1057	1218	216	177	89	chr3	61876703	61877183	-97722600	+	RLTR11A	LTR	ERVK	7	528	0	4
1057	441	331	168	8	chr3	61879076	61879326	-97720457	+	MTE-int	LTR	MaLR	833	1122	-458	4
1057	550	231	242	8	chr3	61879412	61879656	-97720127	+	MTC-int	LTR	MaLR	955	1255	-3	4
1057	987	277	131	16	chr3	61879663	61880037	-97719746	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	4
1057	341	311	68	98	chr3	61880566	61880904	-97718879	+	MLT1A	LTR	MaLR	32	359	-15	4
1057	388	362	35	80	chr3	61893967	61894255	-97705528	+	MER57E1	LTR	ERV1	39	313	-59	5
1057	1414	169	84	4	chr3	61894435	61894696	-97705087	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-64	282	1	5
1057	295	215	30	15	chr3	61900903	61900969	-97698814	+	MLT1A1	LTR	MaLR	305	371	-37	5
1057	564	317	79	31	chr3	61906148	61906376	-97693407	+	MER89	LTR	ERV1	297	535	-24	5
1057	478	338	20	120	chr3	61911419	61911819	-97687964	-	MLT2D	LTR	ERVL	-54	360	1	5
1057	257	246	182	76	chr3	61938580	61938712	-97661071	+	LTR50	LTR	ERVL	21	166	-629	5
1057	385	96	53	40	chr3	61941266	61941342	-97658441	+	ORR1A1	LTR	MaLR	270	346	0	5
1057	3462	156	102	14	chr3	61944000	61944636	-97655147	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	5
1057	1826	153	39	3	chr3	61961926	61962235	-97637548	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	320	0	5
1057	1242	196	214	25	chr3	61963422	61963829	-97635954	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	336	819	-4587	5
1057	282	241	0	0	chr3	61963834	61963892	-97635891	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	938	995	-5142	5
1057	3408	94	74	15	chr3	61963894	61964424	-97635359	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1885	2445	-5136	5
1057	7765	83	19	0	chr3	61964445	61965531	-97634252	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	2813	3919	-3662	5
1057	15207	80	5	1	chr3	61965530	61967580	-97632203	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4125	6183	-1398	5
1057	6084	122	9	11	chr3	61967576	61968911	-97630872	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6322	7680	0	5
1057	2006	139	9	3	chr3	61968911	61969229	-97630554	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	320	0	5
1057	3288	36	18	0	chr3	61973315	61973704	-97626079	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1057	3381	23	8	2	chr3	61985013	61985407	-97614376	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1057	783	234	46	32	chr3	61987732	61987948	-97611835	-	RMER5	LTR	ERV1	-10	524	306	5
1057	838	147	133	0	chr3	61990310	61990460	-97609323	+	ORR1B1	LTR	MaLR	225	394	0	5
1057	1105	176	63	27	chr3	61990460	61990682	-97609101	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	230	-1733	5
1057	4222	138	66	142	chr3	61990680	61991648	-97608135	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1050	1944	-19	5
1058	373	180	33	22	chr3	62002735	62002826	-97596957	-	RMER17D	LTR	ERVK	0	889	798	5
1058	1050	279	52	146	chr3	62005409	62006160	-97593623	-	MTD-int	LTR	MaLR	-530	1433	1	1
1058	689	204	119	67	chr3	62006165	62006359	-97593424	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	211	1
1058	3180	53	3	0	chr3	62007134	62007514	-97592269	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	5	385	0	1
1058	291	364	15	52	chr3	62008001	62008137	-97591646	-	MLT1B-int	LTR	MaLR	-1236	151	21	2
1058	358	315	102	74	chr3	62008371	62008587	-97591196	-	RMER2	LTR	ERV1	-12	555	334	2
1058	428	269	32	79	chr3	62009332	62009522	-97590261	-	MLT1B	LTR	MaLR	-168	222	42	2
1058	4891	159	22	28	chr3	62017393	62018311	-97581472	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3506	4417	-1344	2
1058	1033	215	32	8	chr3	62018354	62018775	-97581008	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-4705	555	1	2
1058	2334	179	104	28	chr3	62018775	62019304	-97580479	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	17	2
1058	2305	169	32	5	chr3	62024745	62025155	-97574628	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1058	388	301	160	46	chr3	62027552	62028027	-97571756	+	MLT1E1	LTR	MaLR	3	560	-94	4
1058	1722	228	57	59	chr3	62029416	62029887	-97569896	+	RMER19C	LTR	ERVK	79	548	-63	4
1058	312	296	37	0	chr3	62030437	62030545	-97569238	+	RMER15	LTR	ERVL	421	532	-43	4
1058	1394	280	36	17	chr3	62048046	62048461	-97551322	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	7
1058	356	276	248	27	chr3	62049024	62049173	-97550610	+	RMER15	LTR	ERVL	352	533	-42	7
1058	1090	256	19	97	chr3	62049559	62049970	-97549813	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	7
1058	253	240	78	20	chr3	62051012	62051114	-97548669	+	MamGypLTR1b	LTR	Gypsy	3	110	-672	8
1058	983	283	99	6	chr3	62053680	62054025	-97545758	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	379	0	8
1058	234	310	127	66	chr3	62059967	62060133	-97539650	+	MLT1G3	LTR	MaLR	215	390	-205	9
1058	1470	204	59	218	chr3	62069017	62069608	-97530175	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	497	-114	1
1058	1906	174	8	84	chr3	62070914	62071297	-97528486	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	1
1058	5941	135	110	14	chr3	62077334	62078440	-97521343	-	RMER12	LTR	ERVK	-109	1213	1	1
1058	562	148	118	14	chr3	62080193	62080307	-97519476	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	352	1
1058	562	148	118	14	chr3	62080374	62080403	-97519380	-	RMER4A	LTR	ERVK	-115	351	309	1
1058	490	132	36	0	chr3	62080406	62080489	-97519294	-	RMER4A	LTR	ERVK	-1	465	380	1
1058	999	226	114	24	chr3	62080623	62080913	-97518870	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-19	515	200	1
1058	1067	188	70	16	chr3	62080916	62081068	-97518715	+	RLTR20A	LTR	ERVK	286	450	-91	1
1058	1067	188	70	16	chr3	62081104	62081194	-97518589	+	RLTR20A	LTR	ERVK	451	540	-1	1
1058	1458	170	47	4	chr3	62081194	62081469	-97518314	-	RMER4A	LTR	ERVK	-179	287	1	1
1058	318	348	70	0	chr3	62084386	62084501	-97515282	+	MTEa	LTR	MaLR	1	123	-256	1
1058	230	288	142	18	chr3	62084594	62084707	-97515076	+	MTEa	LTR	MaLR	253	379	0	1
1058	773	263	184	25	chr3	62100062	62100344	-97499439	+	MT2A	LTR	ERVL	160	531	-70	1
1058	2231	191	10	15	chr3	62102269	62102678	-97497105	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
1058	946	259	24	24	chr3	62103469	62103718	-97496065	+	MTD	LTR	MaLR	1	249	-170	1
1058	1193	219	21	4	chr3	62103719	62103953	-97495830	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	180	1
1058	1096	172	27	0	chr3	62107066	62107252	-97492531	-	MTC	LTR	MaLR	-230	191	1	1
1058	732	193	78	6	chr3	62107252	62107404	-97492379	+	MTD	LTR	MaLR	242	405	-14	1
1058	915	325	43	31	chr3	62117670	62118020	-97481763	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	357	-2	1
1058	322	206	94	85	chr3	62119570	62119609	-97480174	+	RLTR25B	LTR	ERVK	403	443	-585	1
1058	322	206	94	85	chr3	62119780	62119846	-97479937	+	RLTR25B	LTR	ERVK	444	508	-520	1
1058	1462	150	0	9	chr3	62120099	62120328	-97479455	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	346	1
1058	3130	61	71	2	chr3	62120663	62121057	-97478726	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
1058	2857	40	9	3	chr3	62121231	62121556	-97478227	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	1
1058	394	309	94	59	chr3	62123904	62124107	-97475676	+	MTD	LTR	MaLR	58	267	-152	1
1058	5526	172	35	13	chr3	62124087	62125155	-97474628	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-418	1091	1	1
1058	1113	158	14	42	chr3	62125155	62125367	-97474416	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	162	1
1058	469	248	74	8	chr3	62125364	62125486	-97474297	+	MTD	LTR	MaLR	290	419	0	1
1059	1079	253	106	17	chr3	62128863	62129156	-97470627	+	MTE2b	LTR	MaLR	52	370	-9	1
1059	755	165	8	0	chr3	62132957	62133078	-97466705	+	MT2A	LTR	ERVL	338	459	-74	2
1059	358	45	15	0	chr3	62133140	62133207	-97466576	+	MT2A	LTR	ERVL	466	533	0	2
1059	277	213	0	32	chr3	62133866	62133929	-97465854	+	RMER15	LTR	ERVL	408	468	-107	2
1059	1028	293	104	15	chr3	62135530	62135856	-97463927	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	51	2
1059	1950	117	78	134	chr3	62138127	62138514	-97461269	-	RLTR8	LTR	ERVK	0	365	1	2
1059	1461	216	137	38	chr3	62140771	62141137	-97458646	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-5	402	1	2
1059	2115	164	89	52	chr3	62160365	62160771	-97439012	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1059	4749	12	0	0	chr3	62160820	62161313	-97438470	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1059	322	0	0	0	chr3	62161313	62161351	-97438432	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	2
1059	387	167	46	35	chr3	62161351	62161438	-97438345	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	2
1059	48898	14	0	0	chr3	62161438	62166797	-97432986	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	2
1059	4749	12	0	0	chr3	62166797	62167290	-97432493	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1059	4638	14	2	12	chr3	62167801	62168299	-97431484	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1059	6472	16	26	0	chr3	62168299	62169545	-97430238	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	1279	-4206	2
1059	12963	26	1	0	chr3	62169525	62170984	-97428799	+	MERVL-int	LTR	ERVL	3901	5360	-125	2
1059	387	167	46	35	chr3	62170984	62171071	-97428712	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	2
1059	322	0	0	0	chr3	62171071	62171109	-97428674	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	2
1059	4620	16	2	12	chr3	62171109	62171607	-97428176	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1059	888	316	36	75	chr3	62175842	62176057	-97423726	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-10	355	142	2
1059	888	316	36	75	chr3	62176204	62176350	-97423433	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-224	141	8	2
1059	1265	174	226	6	chr3	62195796	62196114	-97403669	+	MTD	LTR	MaLR	32	419	0	2
1059	958	231	73	105	chr3	62201827	62202142	-97397641	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	74	3
1059	259	333	23	31	chr3	62202031	62202161	-97397622	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-392	209	81	3
1059	274	289	123	8	chr3	62211252	62211374	-97388409	-	ORR1E	LTR	MaLR	-223	136	1	3
1059	809	292	100	34	chr3	62211688	62212039	-97387744	-	MLT1D	LTR	MaLR	-13	492	119	3
1059	979	331	91	41	chr3	62221813	62222352	-97377431	-	MER21B	LTR	ERV1	-259	604	39	3
1059	269	200	0	0	chr3	62237203	62237243	-97362540	-	MTD	LTR	MaLR	-223	196	157	3
1059	1863	129	120	66	chr3	62238536	62238847	-97360936	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	351	-43	3
1059	1863	129	120	66	chr3	62238994	62239048	-97360735	+	ORR1B1	LTR	MaLR	352	386	-8	3
1059	1503	129	25	4	chr3	62239698	62239940	-97359843	-	RMER21A	LTR	ERV1	-231	716	470	3
1059	274	277	24	198	chr3	62239936	62240062	-97359721	-	RMER21A	LTR	ERV1	-843	104	1	3
1059	1369	165	120	69	chr3	62240062	62240385	-97359398	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-38	340	1	3
1059	2354	106	16	9	chr3	62242988	62243311	-97356472	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	5	3
1059	3012	45	5	0	chr3	62248149	62248524	-97351259	+	MTB	LTR	MaLR	1	377	-23	3
1059	226	395	88	7	chr3	62256803	62256951	-97342832	-	RMER13A	LTR	ERVK	-116	744	585	3
1059	705	215	0	30	chr3	62257089	62257223	-97342560	-	RMER13A	LTR	ERVK	-567	293	164	3
1060	304	259	52	69	chr3	62266289	62266405	-97333378	-	MLT1E3	LTR	MaLR	0	624	511	3
1060	315	322	11	11	chr3	62267534	62267622	-97332161	-	LTR16A	LTR	ERVL	-256	195	108	3
1060	1910	186	82	26	chr3	62270078	62270469	-97329314	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	3
1060	2048	157	205	8	chr3	62284112	62284581	-97315202	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	4
1060	977	253	86	93	chr3	62286211	62286608	-97313175	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	174	4
1060	3539	77	15	2	chr3	62321535	62322004	-97277779	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	4
1060	225	183	46	77	chr3	62323922	62323987	-97275796	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	4
1060	301	215	92	0	chr3	62328741	62328806	-97270977	+	MER34A	LTR	ERV1	498	568	-3	4
1060	638	182	0	0	chr3	62329645	62329755	-97270028	+	MTD	LTR	MaLR	1	110	-309	4
1060	307	314	201	62	chr3	62330413	62330736	-97269047	-	MER77	LTR	ERVL	-98	509	142	4
1060	2915	85	5	10	chr3	62338874	62339279	-97260504	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	4
1060	2347	233	57	93	chr3	62345037	62345874	-97253909	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	807	-10	5
1060	1746	231	6	18	chr3	62353175	62353518	-97246265	+	MTC	LTR	MaLR	1	339	-82	5
1060	2110	157	25	67	chr3	62355939	62356342	-97243441	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	5
1060	514	377	83	14	chr3	62358589	62358912	-97240871	+	MLT2E	LTR	ERVL	3	353	-275	5
1060	580	187	37	0	chr3	62359323	62359430	-97240353	+	ORR1D2	LTR	MaLR	260	370	0	5
1060	267	301	60	0	chr3	62359457	62359540	-97240243	-	MTEa	LTR	MaLR	-291	88	1	5
1060	709	345	89	18	chr3	62363332	62363731	-97236052	+	MLT2B3	LTR	ERVL	5	411	-104	5
1060	705	369	70	56	chr3	62363764	62363846	-97235937	+	MLT2B3	LTR	ERVL	412	493	-22	5
1060	357	267	23	0	chr3	62365452	62365538	-97234245	+	ORR1D2	LTR	MaLR	283	370	0	5
1060	2589	192	12	33	chr3	62368374	62368890	-97230893	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	5
1060	876	201	74	83	chr3	62370600	62370926	-97228857	-	RMER17C	LTR	ERVK	-8	402	80	5
1060	871	224	45	102	chr3	62370930	62370971	-97228812	-	RMER17B	LTR	ERVK	-519	439	400	5
1060	871	224	45	102	chr3	62371154	62371445	-97228338	-	RMER17B	LTR	ERVK	-559	399	126	5
1060	581	294	92	97	chr3	62375656	62376037	-97223746	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
1061	1643	240	14	17	chr3	62392181	62392597	-97207186	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	1	5
1061	847	213	192	31	chr3	62393838	62394187	-97205596	+	RLTR9E	LTR	ERVK	5	409	0	5
1061	761	329	108	62	chr3	62397137	62397506	-97202277	-	MTD	LTR	MaLR	-14	386	1	5
1061	717	258	216	20	chr3	62409340	62409376	-97190407	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	542	5
1061	717	279	363	24	chr3	62409429	62409818	-97189965	-	RMER15	LTR	ERVL	-34	541	13	5
1061	927	207	53	66	chr3	62409851	62410094	-97189689	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-118	4881	4642	5
1061	1388	287	91	14	chr3	62410113	62410541	-97189242	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-430	4569	4109	5
1061	664	311	32	60	chr3	62411167	62411451	-97188332	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-895	4104	3829	5
1061	1501	254	88	30	chr3	62411534	62412168	-97187615	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2246	2753	2083	5
1061	308	331	34	20	chr3	62413206	62413354	-97186429	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4816	183	34	5
1061	1054	282	41	82	chr3	62413378	62413883	-97185900	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	5
1061	896	341	78	8	chr3	62419125	62419613	-97180170	+	MT2A	LTR	ERVL	1	522	-11	6
1061	348	196	58	67	chr3	62420404	62420508	-97179275	-	RMER5	LTR	ERV1	-111	423	321	6
1061	477	219	44	0	chr3	62420506	62420620	-97179163	+	RMER5	LTR	ERV1	237	355	-179	6
1061	1643	152	117	19	chr3	62420597	62420913	-97178870	-	RLTR26	LTR	ERVK	-295	347	1	6
1061	578	287	22	54	chr3	62428795	62428979	-97170804	+	MTEb	LTR	MaLR	3	180	-199	6
1061	594	286	61	0	chr3	62429492	62429639	-97170144	+	MTEb	LTR	MaLR	60	215	-164	6
1061	737	330	72	18	chr3	62430163	62430441	-97169342	-	LTR40a	LTR	ERVL	-222	297	5	6
1061	225	217	100	0	chr3	62435773	62435833	-97163950	-	MLT1L	LTR	MaLR	-391	219	154	6
1061	342	278	157	45	chr3	62437288	62437637	-97162146	-	MLT1D	LTR	MaLR	-27	440	16	6
1061	3443	30	0	0	chr3	62439589	62439985	-97159798	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1061	1839	110	32	48	chr3	62442605	62442919	-97156864	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	6
1061	657	308	110	36	chr3	62446141	62446422	-97153361	+	MLT1F2	LTR	MaLR	2	397	-257	6
1061	1555	198	68	26	chr3	62452689	62453041	-97146742	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1061	1958	129	46	88	chr3	62455106	62455197	-97144586	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	62	-297	6
1061	1958	129	46	88	chr3	62455710	62455991	-97143792	+	RLTR15	LTR	ERVK	63	357	-2	6
1061	359	296	116	34	chr3	62463635	62463782	-97136001	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	224	6
1061	3029	76	10	2	chr3	62464580	62464977	-97134806	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	7
1061	1907	154	72	32	chr3	62466100	62466462	-97133321	+	ORR1C1	LTR	MaLR	6	376	-2	7
1061	1468	165	197	7	chr3	62468728	62469033	-97130750	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	365	-13	7
1061	425	233	84	25	chr3	62470125	62470244	-97129539	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-279	129	4	7
1061	1418	267	48	86	chr3	62473560	62474218	-97125565	+	RLTR18B	LTR	ERVK	25	512	0	7
1061	538	286	58	68	chr3	62480570	62480630	-97119153	+	RMER15	LTR	ERVL	296	355	-220	7
1061	1929	186	34	13	chr3	62480630	62481016	-97118767	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	7
1061	538	286	58	68	chr3	62481016	62481146	-97118637	+	RMER15	LTR	ERVL	356	484	-91	7
1061	504	211	23	68	chr3	62481177	62481309	-97118474	+	MLT1A0	LTR	MaLR	240	365	0	7
1061	1505	218	123	81	chr3	62481660	62482340	-97117443	-	RMER17B	LTR	ERVK	-11	947	300	7
1061	1636	176	33	21	chr3	62483523	62483854	-97115929	-	RMER17B	LTR	ERVK	-623	335	1	7
1061	1153	201	5	5	chr3	62485175	62485375	-97114408	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	222	7
1061	1658	224	59	45	chr3	62485359	62485601	-97114182	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1076	433	181	7
1061	6267	127	23	17	chr3	62485601	62486616	-97113167	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	3	7
1061	1658	224	59	45	chr3	62486616	62486799	-97112984	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1329	180	2	7
1061	1802	174	25	91	chr3	62486800	62487205	-97112578	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	7
1061	1272	228	129	27	chr3	62488534	62488659	-97111124	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	252	7
1061	1272	228	129	27	chr3	62488686	62488741	-97111042	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-123	251	172	7
1061	1272	228	129	27	chr3	62488798	62488950	-97110833	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-203	171	9	7
1061	1327	232	122	22	chr3	62490752	62491114	-97108669	+	MTD	LTR	MaLR	20	417	-2	7
1061	20740	85	7	5	chr3	62497083	62500000	-97099783	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	898	3822	-2659	7
1061	13088	45	13	0	chr3	62500000	62501582	-97098201	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3823	5424	-1057	1
1061	4521	92	30	23	chr3	62501580	62502244	-97097539	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5813	6481	0	1
1061	2117	102	6	9	chr3	62502244	62502561	-97097222	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	316	-11	1
1061	225	319	162	27	chr3	62505261	62505409	-97094374	+	LTR41	LTR	ERVL	479	646	-122	7
1061	841	303	114	107	chr3	62512242	62512488	-97087295	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	286	-531	2
1061	841	303	114	107	chr3	62512533	62512720	-97087063	+	RLTR40	LTR	ERVK	287	445	-372	2
1061	841	303	114	107	chr3	62513071	62513243	-97086540	+	RLTR40	LTR	ERVK	446	610	-207	2
1062	409	343	254	18	chr3	62523106	62523329	-97076454	-	LTR33	LTR	ERVL	-105	410	113	3
1062	1810	186	51	19	chr3	62523329	62523701	-97076082	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1062	409	343	254	18	chr3	62523701	62523804	-97075979	-	LTR33	LTR	ERVL	-403	112	7	3
1062	3242	42	3	0	chr3	62528401	62528785	-97070998	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	4
1062	929	247	65	28	chr3	62528785	62529118	-97070665	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	377	38	4
1062	245	330	37	19	chr3	62533738	62533846	-97065937	-	MER34	LTR	ERV1	-87	455	346	5
1062	1956	166	125	5	chr3	62538071	62538447	-97061336	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
1062	2154	151	18	34	chr3	62538619	62539003	-97060780	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	5
1062	496	273	304	13	chr3	62539443	62539685	-97060098	-	MLT1A	LTR	MaLR	-18	356	45	5
1062	520	296	58	13	chr3	62553822	62553976	-97045807	+	MTE2a	LTR	MaLR	42	202	-177	6
1062	264	368	0	86	chr3	62563680	62563808	-97035975	-	MLT1D	LTR	MaLR	-388	117	1	7
1062	240	224	20	0	chr3	62574711	62574760	-97025023	-	ORR1E	LTR	MaLR	-209	150	101	7
1062	1627	177	153	0	chr3	62578584	62578917	-97020866	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	8
1062	2878	96	8	2	chr3	62579542	62579940	-97019843	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	8
1062	2722	105	48	5	chr3	62580238	62580650	-97019133	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	9
1062	749	285	111	19	chr3	62584728	62585053	-97014730	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	359	0	9
1062	1474	214	66	13	chr3	62588248	62588551	-97011232	+	ORR1B2	LTR	MaLR	6	324	-43	9
1062	351	167	0	0	chr3	62588729	62588783	-97011000	+	ORR1B2	LTR	MaLR	321	374	-4	9
1062	2737	168	20	20	chr3	62593010	62593432	-97006351	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	3	430	-97	1
1062	7108	103	22	3	chr3	62593432	62594436	-97005347	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	1
1062	2737	168	20	20	chr3	62594436	62594523	-97005260	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	431	512	-15	1
1062	683	242	71	89	chr3	62595233	62595514	-97004269	-	RMER12	LTR	ERVK	-101	1221	946	1
1062	4311	172	15	36	chr3	62595488	62596303	-97003480	-	RMER12	LTR	ERVK	-524	798	1	1
1062	570	297	112	95	chr3	62603908	62604257	-96995526	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	355	-4	1
1062	1637	206	89	42	chr3	62605092	62605720	-96994063	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-24	537	1	1
1062	335	280	98	8	chr3	62607014	62607188	-96992595	-	MT2A	LTR	ERVL	-67	534	340	1
1062	533	259	67	162	chr3	62607175	62607540	-96992243	-	RLTR18	LTR	ERVK	-199	417	121	1
1062	602	196	89	20	chr3	62608070	62608236	-96991547	-	MT2A	LTR	ERVL	-162	313	94	1
1062	452	227	70	35	chr3	62608247	62608361	-96991422	-	MT2A	LTR	ERVL	-412	121	4	1
1062	854	301	34	22	chr3	62614092	62614415	-96985368	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	327	-32	1
1062	901	265	12	56	chr3	62616583	62616835	-96982948	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1318	262	22	1
1062	845	300	119	0	chr3	62616890	62617133	-96982650	-	MTE2b	LTR	MaLR	-105	274	3	1
1062	736	305	102	105	chr3	62617233	62617643	-96982140	-	MLT2D	LTR	ERVL	0	414	6	1
1062	2467	82	68	11	chr3	62621019	62621388	-96978395	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	1
1062	2061	249	39	16	chr3	62627398	62627911	-96971872	-	MT2A	LTR	ERVL	-8	525	1	1
1062	325	345	9	0	chr3	62631952	62632062	-96967721	+	ORR1E	LTR	MaLR	43	153	-206	1
1062	410	320	87	53	chr3	62641728	62641992	-96957791	-	MER65D	LTR	ERV1	-17	456	184	1
1062	978	272	60	33	chr3	62643534	62643928	-96955855	+	MLT2B4	LTR	ERVL	3	401	-13	1
1062	1903	214	2	71	chr3	62644703	62645155	-96954628	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1062	446	346	126	59	chr3	62650780	62651201	-96948582	-	MT2A	LTR	ERVL	-78	455	7	1
1062	444	293	22	16	chr3	62651201	62651385	-96948398	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-10	5747	5563	1
1062	349	326	10	0	chr3	62651423	62651521	-96948262	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1075	4682	4584	1
1062	325	306	30	54	chr3	62651534	62651700	-96948083	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-307	5454	5293	1
1062	1712	266	159	9	chr3	62651694	62652274	-96947509	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-1959	3802	3136	1
132	640	299	57	0	chr3	62652285	62652496	-96947287	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2808	2953	2731	1
1063	2571	305	62	33	chr3	62652499	62653407	-96946376	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3131	2583	1636	1
1063	1430	222	116	12	chr3	62653407	62653744	-96946039	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	1
1063	2571	305	62	33	chr3	62653744	62653919	-96945864	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-4079	1635	1469	1
1063	273	298	26	17	chr3	62655243	62655359	-96944424	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-5186	575	459	1
1063	2317	280	138	43	chr3	62655365	62656377	-96943406	-	MTC-int	LTR	MaLR	-74	1184	77	1
1063	260	258	0	64	chr3	62658400	62658433	-96941350	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-863	646	623	1
1063	282	322	79	20	chr3	62662727	62662879	-96936904	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4863	5023	-691	2
1063	943	297	110	42	chr3	62664254	62664609	-96935174	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	2
1063	1269	215	116	42	chr3	62674478	62674813	-96924970	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	360	-14	2
1063	938	264	32	64	chr3	62674906	62675310	-96924473	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	391	-19	2
1063	1479	179	129	18	chr3	62684697	62685038	-96914745	+	RMER12	LTR	ERVK	526	904	-418	2
1063	1437	138	116	47	chr3	62686679	62686884	-96912899	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	218	-192	2
1063	1437	138	116	47	chr3	62686944	62687119	-96912664	+	RMER17C	LTR	ERVK	219	407	-3	2
1063	647	301	76	46	chr3	62687279	62687577	-96912206	-	MLT1C	LTR	MaLR	-157	310	1	2
1063	1756	281	45	4	chr3	62689495	62689981	-96909802	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	516	0	2
1063	2915	41	120	0	chr3	62692839	62693206	-96906577	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	2
1063	1751	256	30	5	chr3	62694975	62695380	-96904403	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	3	2
1063	1223	255	60	25	chr3	62695625	62695991	-96903792	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	2
1063	6768	65	38	3	chr3	62700415	62701313	-96898470	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	2
1063	3022	69	10	2	chr3	62702168	62702561	-96897222	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1063	5277	84	8	142	chr3	62702561	62703554	-96896229	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	239	2
1063	2697	46	3	31	chr3	62719725	62720081	-96879702	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1063	456	316	88	28	chr3	62723689	62723940	-96875843	+	ORR1D2	LTR	MaLR	103	368	-2	2
1063	877	282	177	25	chr3	62723942	62724516	-96875267	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1	686	-894	2
1063	1416	219	95	32	chr3	62737299	62737647	-96862136	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	1	2
1063	2425	228	69	68	chr3	62745141	62745848	-96853935	-	MTD-int	LTR	MaLR	-448	810	1	2
1063	1745	233	83	0	chr3	62745844	62746230	-96853553	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	1	2
1063	3010	163	29	143	chr3	62747369	62748316	-96851467	-	RMER17D	LTR	ERVK	-50	839	1	2
1063	257	179	12	93	chr3	62748616	62748702	-96851081	+	MLT1A1	LTR	MaLR	329	407	-1	2
1063	1170	273	110	21	chr3	62750222	62750559	-96849224	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	1	2
1063	229	327	35	93	chr3	62752313	62752485	-96847298	+	MT2B	LTR	ERVL	191	352	-249	2
1063	2844	153	102	48	chr3	62752916	62753269	-96846514	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	375	-315	3
1063	2844	176	78	68	chr3	62753330	62753821	-96845962	+	RMER6C	LTR	ERVK	345	721	-35	3
1063	535	332	38	65	chr3	62753776	62754146	-96845637	-	LTR48	LTR	ERV1	-20	767	408	3
1063	251	333	108	54	chr3	62754440	62754570	-96845213	-	LTR48	LTR	ERV1	-643	144	8	3
1063	1014	144	33	22	chr3	62755154	62755338	-96844445	+	ORR1A1	LTR	MaLR	87	272	-74	3
1063	1824	186	134	5	chr3	62757123	62757496	-96842287	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1063	2017	242	30	36	chr3	62757651	62758175	-96841608	+	RMER19C	LTR	ERVK	90	610	-1	3
1063	2123	199	31	19	chr3	62767614	62768030	-96831753	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1063	991	306	78	36	chr3	62768094	62768541	-96831242	-	RMER5	LTR	ERV1	-25	509	44	3
1063	1026	291	137	13	chr3	62772402	62772476	-96827307	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	345	3
1063	2930	183	61	28	chr3	62772476	62773144	-96826639	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	3
1063	1026	291	137	13	chr3	62773144	62773442	-96826341	-	MTD	LTR	MaLR	-75	344	1	3
1063	356	328	139	46	chr3	62773916	62774197	-96825586	+	MLT1F1	LTR	MaLR	2	319	-250	3
1063	3302	38	8	2	chr3	62774424	62774818	-96824965	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1063	259	343	49	69	chr3	62774825	62774969	-96824814	+	MLT1F1	LTR	MaLR	351	491	-69	3
1064	276	252	33	123	chr3	62783897	62784019	-96815764	+	MT2B	LTR	ERVL	154	264	-337	3
1064	2649	52	0	169	chr3	62796556	62796995	-96802788	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	3
1064	1379	239	74	37	chr3	62798872	62799333	-96800450	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-3	478	1	3
1064	284	357	72	48	chr3	62799341	62799550	-96800233	+	MLT1J2	LTR	MaLR	36	249	-199	3
1064	3090	139	8	4	chr3	62801870	62802355	-96797428	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	487	-16	3
1064	2169	171	42	12	chr3	62802884	62803293	-96796490	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1064	595	240	323	7	chr3	62803938	62804223	-96795560	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	5	3
1064	1981	254	51	77	chr3	62806857	62807599	-96792184	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	717	-20	3
1064	385	322	150	12	chr3	62809732	62809905	-96789878	-	MTEa	LTR	MaLR	-178	201	5	3
1064	2016	211	35	0	chr3	62821500	62821894	-96777889	+	MTC	LTR	MaLR	14	421	0	3
1064	495	208	22	40	chr3	62822132	62822314	-96777469	-	MT2B	LTR	ERVL	-297	178	1	3
1064	2972	93	0	2	chr3	62826737	62827134	-96772649	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1064	389	278	69	56	chr3	62828313	62828473	-96771310	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	162	-367	3
1064	305	281	170	42	chr3	62828495	62828707	-96771076	+	RLTR24	LTR	ERV1	291	529	0	3
1064	513	239	32	26	chr3	62834002	62834157	-96765626	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1198	1353	-4169	4
1064	294	254	55	71	chr3	62834697	62834879	-96764904	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2532	2710	-3427	4
1064	271	48	48	0	chr3	62834932	62834974	-96764809	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2796	2839	-3298	4
1064	338	240	48	91	chr3	62835026	62835191	-96764592	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2866	3023	-3114	4
1064	1484	210	122	0	chr3	62836275	62836594	-96763189	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	2	4
1064	5785	211	73	8	chr3	62836596	62838012	-96761771	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-1	1508	1	4
1064	1182	193	104	173	chr3	62838012	62838406	-96761377	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1064	327	324	33	33	chr3	62839108	62839258	-96760525	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	4879	5028	-289	4
1064	355	207	112	79	chr3	62839598	62839750	-96760033	+	RLTR24	LTR	ERV1	6	162	-367	4
1064	299	243	198	72	chr3	62839762	62839984	-96759799	+	RLTR24	LTR	ERV1	280	529	0	4
1064	4086	105	91	42	chr3	62845430	62845835	-96753948	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	347	4
1064	4086	105	91	42	chr3	62846006	62846316	-96753467	-	RMER17A	LTR	ERVK	-405	346	1	4
1064	577	323	158	21	chr3	62847082	62847373	-96752410	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-5	360	30	4
1064	403	254	41	25	chr3	62851399	62851520	-96748263	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	282	4
1064	5567	156	16	13	chr3	62855197	62856213	-96743570	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1019	-4	4
1064	1162	218	265	18	chr3	62864327	62864663	-96735120	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
1064	1691	198	9	104	chr3	62867657	62868097	-96731686	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	4
1064	249	231	84	42	chr3	62870719	62870814	-96728969	+	MTC-int	LTR	MaLR	910	1008	-250	4
1064	1268	202	95	91	chr3	62870878	62871460	-96728323	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2451	3004	-3133	4
1064	305	211	112	25	chr3	62871834	62871976	-96727807	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3871	3962	-2175	4
1064	1253	266	131	88	chr3	62871982	62872587	-96727196	-	RLTR26	LTR	ERVK	-11	631	1	4
1064	284	264	74	8	chr3	62872870	62872992	-96726791	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3032	3161	-77	4
1064	1089	208	102	136	chr3	62873121	62873533	-96726250	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	4
1064	2172	161	49	56	chr3	62877370	62877861	-96721922	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	417	-24	4
1064	1801	156	75	113	chr3	62878346	62878788	-96720995	+	RLTR23	LTR	ERV1	2	426	-4	4
1064	2986	40	0	3	chr3	62885360	62885715	-96714068	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	4
1064	1742	187	27	92	chr3	62885968	62886380	-96713403	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	62	4
1064	1763	181	21	58	chr3	62887317	62887699	-96712084	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	368	-6	4
1064	1649	216	52	3	chr3	62893331	62893697	-96706086	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	4
1064	1515	233	67	163	chr3	62894007	62894683	-96705100	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	4
1064	2900	66	31	19	chr3	62894802	62895218	-96704565	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	4
1064	2676	110	36	3	chr3	62904493	62904884	-96694899	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-3	404	1	4
1064	2077	240	39	14	chr3	62905208	62905702	-96694081	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	516	0	5
1064	551	254	78	57	chr3	62910580	62910772	-96689011	+	RMER13A	LTR	ERVK	98	293	-567	5
1064	303	293	222	0	chr3	62911333	62911500	-96688283	-	MTE-int	LTR	MaLR	-27	1553	1350	5
1064	272	337	29	10	chr3	62911554	62911656	-96688127	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1466	114	11	5
1065	227	395	5	73	chr3	62917619	62917824	-96681959	+	RMER4B	LTR	ERVK	35	225	-360	5
1065	425	287	19	0	chr3	62917949	62918057	-96681726	-	MTE2b	LTR	MaLR	-267	112	3	5
1065	574	347	51	27	chr3	62918728	62919063	-96680720	+	MLT1A0	LTR	MaLR	23	365	0	5
1065	778	297	21	94	chr3	62919902	62919934	-96679849	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	395	5
1065	1629	199	27	19	chr3	62919934	62920302	-96679481	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	1	5
1065	778	297	21	94	chr3	62920302	62920382	-96679401	-	MTD	LTR	MaLR	-25	394	329	5
1065	778	297	21	94	chr3	62920405	62920621	-96679162	-	MTD	LTR	MaLR	-91	328	114	5
1065	760	285	42	47	chr3	62920621	62920982	-96678801	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	5
1065	557	233	8	8	chr3	62920982	62921101	-96678682	-	MTD	LTR	MaLR	-300	119	1	5
1065	1303	227	137	44	chr3	62923218	62923586	-96676197	+	RLTR20A	LTR	ERVK	58	436	-105	5
1065	1303	222	148	44	chr3	62923652	62923748	-96676035	+	RLTR20A	LTR	ERVK	437	541	0	5
1065	246	298	29	78	chr3	62930232	62930334	-96669449	+	RLTR25A	LTR	ERVK	523	619	-484	5
1065	1348	254	123	62	chr3	62935598	62936310	-96663473	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	900	-2	5
1065	1303	278	23	39	chr3	62947802	62948187	-96651596	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	5
1065	272	300	83	91	chr3	62949108	62949229	-96650554	-	LTR88a	LTR	Gypsy	0	816	697	5
1065	821	309	138	35	chr3	62955750	62956068	-96643715	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	20	5
1065	1372	74	0	16	chr3	62958178	62958370	-96641413	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	208	5
1065	3223	70	142	7	chr3	62958373	62958830	-96640953	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	5
1065	4359	279	55	51	chr3	62958830	62961482	-96638301	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3	2813	-4743	5
1065	6855	281	15	13	chr3	62961482	62963599	-96636184	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	2152	4272	-791	5
1065	1808	64	203	17	chr3	62963888	62964189	-96635594	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	3	359	-160	5
1065	696	55	0	11	chr3	62964189	62964280	-96635503	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-306	90	1	5
1065	446	307	75	154	chr3	62964350	62964505	-96635278	-	MLT1H	LTR	MaLR	-205	344	221	5
1065	446	307	75	154	chr3	62964533	62964643	-96635140	-	MLT1H	LTR	MaLR	-329	220	100	5
1065	308	359	78	62	chr3	62964945	62965292	-96634491	-	MTD	LTR	MaLR	-48	371	1	5
1065	419	219	46	37	chr3	62968367	62968476	-96631307	+	MTEb	LTR	MaLR	262	371	-8	5
1065	2089	152	32	11	chr3	62970905	62971278	-96628505	-	RLTR14	LTR	ERV1	-1	381	1	6
1065	8014	166	66	32	chr3	62971278	62972990	-96626793	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	0	5317	3548	6
1065	2309	174	79	19	chr3	62973001	62973522	-96626261	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-2746	2571	2020	6
1065	1420	177	16	0	chr3	62973920	62974174	-96625609	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3315	2002	1745	6
1065	4677	187	59	79	chr3	62977976	62979137	-96620646	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3611	1706	570	6
1065	328	170	95	11	chr3	62979210	62979305	-96620478	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4768	549	447	6
1065	1633	257	44	35	chr3	62980310	62980762	-96619021	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4861	456	1	6
1065	2179	153	8	23	chr3	62980762	62981150	-96618633	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	6
1065	1764	224	59	106	chr3	62987368	62987943	-96611840	+	RMER20B	LTR	ERVK	14	561	-66	6
1065	1744	186	5	110	chr3	62988136	62988307	-96611476	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	211	6
1065	1744	186	5	110	chr3	62988443	62988681	-96611102	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-157	210	1	6
1065	2749	183	74	86	chr3	62988681	62989109	-96610674	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	1100	6
1065	4675	59	14	0	chr3	62989109	62989688	-96610095	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	6
1065	2749	183	74	86	chr3	62989688	62989965	-96609818	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-410	1099	813	6
1065	3165	195	61	24	chr3	62990141	62990924	-96608859	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-696	813	2	6
1065	1747	208	11	11	chr3	62990929	62991288	-96608495	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	6
1065	2705	196	45	14	chr3	62994557	62995112	-96604671	+	RMER15	LTR	ERVL	4	575	0	6
1065	2538	84	84	5	chr3	62996526	62996897	-96602886	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
1065	2616	123	80	26	chr3	62996897	62997447	-96602336	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1258	618	6
1065	422	344	56	15	chr3	63001868	63002063	-96597720	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	188	3
1065	353	169	221	0	chr3	63011917	63011994	-96587789	+	MTC	LTR	MaLR	1	94	-327	1
1065	1370	177	173	4	chr3	63012715	63012987	-96586796	+	MTC	LTR	MaLR	104	421	0	1
1065	274	289	11	57	chr3	63014487	63014575	-96585208	-	MLT1G	LTR	MaLR	-305	286	203	1
1065	7030	144	35	8	chr3	63023629	63024873	-96574910	+	RMER12B	LTR	ERVK	1	1223	-181	2
1065	366	176	10	124	chr3	63024970	63025025	-96574758	+	RMER12B	LTR	ERVK	1176	1219	-185	2
1065	366	136	8	265	chr3	63025067	63025205	-96574578	+	RMER12B	LTR	ERVK	1172	1269	-135	2
1065	887	306	156	51	chr3	63026368	63026881	-96572902	+	MER21B	LTR	ERV1	286	852	-11	2
1065	352	291	147	63	chr3	63029753	63030072	-96569711	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	29	3
1065	1844	204	60	5	chr3	63030551	63030950	-96568833	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1065	1007	263	117	3	chr3	63031463	63031761	-96568022	+	MTE2b	LTR	MaLR	6	337	-42	4
1065	897	200	204	98	chr3	63031767	63032105	-96567678	+	MTEb	LTR	MaLR	6	379	0	4
1065	269	271	46	23	chr3	63032672	63032759	-96567024	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-202	163	75	4
1065	1744	169	58	86	chr3	63045120	63045502	-96554281	+	RLTR41	LTR	ERV1	62	432	-14	6
1066	2471	183	44	123	chr3	63046906	63047310	-96552473	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	282	7
1066	3380	30	5	0	chr3	63047310	63047704	-96552079	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1066	2471	183	44	123	chr3	63047704	63047980	-96551803	-	RMER20B	LTR	ERVK	-346	281	2	7
1066	1480	109	683	36	chr3	63048120	63048235	-96551548	+	BGLII_B	LTR	ERVK	3	190	-251	7
1066	1480	212	45	83	chr3	63048304	63048821	-96550962	+	BGLII_B	LTR	ERVK	96	553	0	7
1066	1841	170	16	89	chr3	63050561	63050704	-96549079	+	ORR1B1	LTR	MaLR	42	174	-220	8
1066	3835	57	4	76	chr3	63050704	63051256	-96548527	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	8
1066	1841	170	16	89	chr3	63051256	63051493	-96548290	+	ORR1B1	LTR	MaLR	175	394	0	8
1066	2404	92	3	0	chr3	63067693	63068019	-96531764	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	9
1066	672	317	65	25	chr3	63068572	63068847	-96530936	+	RMER15	LTR	ERVL	274	559	-16	9
1066	913	139	42	6	chr3	63069082	63069248	-96530535	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1337	172	1	1
1066	1813	115	16	150	chr3	63069248	63069323	-96530460	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	288	1
1066	1813	115	16	150	chr3	63069470	63069774	-96530009	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-42	287	1	1
1066	271	314	20	74	chr3	63072668	63072816	-96526967	-	MLT1A	LTR	MaLR	-8	366	227	1
1066	570	278	26	26	chr3	63072828	63072983	-96526800	-	MLT1A	LTR	MaLR	-206	168	14	1
1066	2970	88	7	9	chr3	63074178	63074600	-96525183	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
1066	638	262	97	15	chr3	63077220	63077543	-96522240	+	MTD	LTR	MaLR	14	407	-12	1
1066	726	353	56	12	chr3	63078798	63079122	-96520661	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	28	1
1066	488	318	108	36	chr3	63081136	63081443	-96518340	-	MLT1C	LTR	MaLR	-130	337	9	1
1066	653	164	78	0	chr3	63083433	63083561	-96516222	+	MTD	LTR	MaLR	1	138	-281	1
1066	1658	239	27	18	chr3	63083586	63083987	-96515796	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	1
1066	1572	185	68	0	chr3	63094766	63095074	-96504709	+	MTC	LTR	MaLR	36	364	-57	1
1066	252	302	153	114	chr3	63108403	63108534	-96491249	+	MLT1D	LTR	MaLR	62	197	-308	1
1066	334	252	36	64	chr3	63109019	63109159	-96490624	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	273	1
1066	1313	221	128	11	chr3	63111607	63111959	-96487824	+	MTD	LTR	MaLR	25	417	-2	1
1066	648	268	85	60	chr3	63122788	63123153	-96476630	+	MTEa	LTR	MaLR	5	378	-1	1
1066	1203	199	98	34	chr3	63143240	63143536	-96456247	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	315	-5	2
1066	405	289	60	60	chr3	63155162	63155346	-96444437	-	RLTR26	LTR	ERVK	-458	184	1	2
1067	1740	188	72	158	chr3	63181868	63182154	-96417629	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	109	2
1067	1740	188	72	158	chr3	63182377	63182544	-96417239	-	MTC	LTR	MaLR	-313	108	1	2
1067	2757	77	42	58	chr3	63190563	63190992	-96408791	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	2
1067	5699	177	62	58	chr3	63190992	63192444	-96407339	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	0	2842	1385	2
1067	1994	92	193	79	chr3	63192447	63192594	-96407189	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	195	-227	2
1067	1994	92	193	79	chr3	63192649	63192880	-96406903	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	196	421	-1	2
1067	497	277	207	78	chr3	63194093	63194373	-96405410	+	MLT1D	LTR	MaLR	17	325	-180	2
1067	497	277	207	78	chr3	63194407	63194552	-96405231	+	MLT1D	LTR	MaLR	326	496	-9	2
1067	1143	253	91	40	chr3	63195678	63196028	-96403755	+	MTEa	LTR	MaLR	8	375	-4	2
1067	350	314	152	34	chr3	63196267	63196531	-96403252	+	MLT1A0	LTR	MaLR	63	357	-8	2
1067	265	309	53	141	chr3	63198218	63198538	-96401245	-	MTC-int	LTR	MaLR	-266	992	701	2
1067	1294	289	18	47	chr3	63200397	63200782	-96399001	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	375	-4	2
1067	545	267	60	12	chr3	63205579	63205746	-96394037	+	MLT1C	LTR	MaLR	10	184	-206	2
1067	1344	219	63	189	chr3	63205979	63206677	-96393106	+	RMER19C	LTR	ERVK	2	611	0	2
1067	679	266	159	9	chr3	63206756	63206976	-96392807	+	MLT1C	LTR	MaLR	210	462	-5	2
1067	334	344	136	31	chr3	63209478	63209706	-96390077	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-450	252	1	2
1067	301	390	85	5	chr3	63210860	63211061	-96388722	-	MER110	LTR	ERV1	-87	404	188	2
1067	810	182	52	147	chr3	63213867	63214099	-96385684	+	ORR1C2	LTR	MaLR	175	384	0	2
1067	700	293	151	9	chr3	63215679	63215996	-96383787	+	MLT1B	LTR	MaLR	29	390	0	2
1067	920	200	62	30	chr3	63220519	63220753	-96379030	+	BGLII_B	LTR	ERVK	8	244	-178	3
1067	2976	69	20	0	chr3	63220753	63221143	-96378640	+	MTB	LTR	MaLR	3	400	0	3
1067	426	335	53	39	chr3	63221143	63221191	-96378592	+	BGLII_B	LTR	ERVK	245	294	-128	3
1067	1116	255	25	34	chr3	63225613	63225938	-96373845	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1	322	-4669	3
1067	754	292	15	49	chr3	63226195	63226461	-96373322	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	688	944	-4047	3
1067	825	189	53	16	chr3	63230768	63231015	-96368768	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1870	2125	-3397	3
1067	1214	266	50	54	chr3	63231015	63231724	-96368059	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8093	8683	-276	3
1067	577	238	76	122	chr3	63232071	63232440	-96367343	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3437	3788	-2349	3
1067	506	226	68	76	chr3	63232505	63232754	-96367029	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2618	2864	-374	3
1067	305	317	66	8	chr3	63232919	63233040	-96366743	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4963	5090	-1460	3
1067	455	270	37	58	chr3	63233476	63233665	-96366118	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	246	3
1067	1317	235	22	79	chr3	63233992	63234348	-96365435	-	ORR1E	LTR	MaLR	-23	336	1	3
1067	1673	197	54	24	chr3	63236719	63237088	-96362695	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	3	3
1067	244	290	167	43	chr3	63237158	63237320	-96362463	-	MLT1G3	LTR	MaLR	0	610	429	3
1067	305	315	178	12	chr3	63238270	63238460	-96361323	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-328	267	3	3
1067	1156	268	98	6	chr3	63240190	63240546	-96359237	+	MLT1D	LTR	MaLR	77	465	-40	3
1067	259	344	137	65	chr3	63241894	63242230	-96357553	+	MLT1G3	LTR	MaLR	199	558	-37	3
1067	1940	154	6	0	chr3	63245808	63246132	-96353651	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	3
1067	2200	168	8	29	chr3	63247734	63247990	-96351793	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	253	-114	3
1067	2206	102	3	58	chr3	63247990	63248334	-96351449	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	3
1067	2200	168	8	29	chr3	63248334	63248452	-96351331	+	ORR1B2	LTR	MaLR	254	367	0	3
1067	919	341	38	114	chr3	63249064	63249660	-96350123	+	MLT2B3	LTR	ERVL	6	552	-2	3
1067	1918	113	40	61	chr3	63249890	63250191	-96349592	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	36	3
1067	268	158	66	66	chr3	63250191	63250252	-96349531	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-2	1961	1904	3
1067	986	305	82	58	chr3	63250262	63251015	-96348768	+	ERVL-int	LTR	ERVL	87	857	-4857	3
1067	360	143	45	19	chr3	63251022	63251115	-96348668	-	MTE2a	LTR	MaLR	-277	102	1	3
1067	684	327	70	8	chr3	63257459	63257860	-96341923	+	ERVL-int	LTR	ERVL	930	1355	-4359	3
1067	856	250	35	38	chr3	63257863	63258150	-96341633	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	286	-73	3
1067	992	314	121	16	chr3	63258230	63258842	-96340941	+	ERVL-int	LTR	ERVL	1416	2091	-3666	3
1067	979	109	37	43	chr3	63258847	63259010	-96340773	+	RMER6C	LTR	ERVK	7	168	-522	3
1067	894	331	68	39	chr3	63259967	63260427	-96339356	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	486	-68	3
1067	797	248	70	47	chr3	63261880	63262138	-96337645	+	RMER13A	LTR	ERVK	115	378	-482	3
1067	3690	143	99	17	chr3	63268348	63269045	-96330738	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	756	0	3
1067	3268	192	131	56	chr3	63279503	63280340	-96319443	+	RMER13B	LTR	ERVK	5	904	-4	3
1067	1688	199	59	6	chr3	63282900	63283224	-96316559	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	341	-37	3
1067	330	74	69	69	chr3	63284426	63284484	-96315299	+	ORR1C2	LTR	MaLR	327	384	0	4
1067	9748	185	41	27	chr3	63288273	63289705	-96310078	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3602	5058	-703	4
1067	9748	185	41	27	chr3	63290257	63290836	-96308947	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5059	5642	-119	4
1067	252	268	0	14	chr3	63290849	63290921	-96308862	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	569	639	-1324	4
1067	335	125	0	0	chr3	63290921	63290977	-96308806	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5706	5761	0	4
1067	621	272	129	40	chr3	63290977	63291368	-96308415	+	MT2A	LTR	ERVL	1	457	-144	4
1067	1141	205	8	45	chr3	63291309	63291554	-96308229	+	MTC	LTR	MaLR	176	411	-10	4
1067	3714	37	5	0	chr3	63295884	63296318	-96303465	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
1067	1413	298	48	36	chr3	63297847	63298351	-96301432	+	RMER5	LTR	ERV1	10	519	-15	4
1068	1559	160	150	3	chr3	63312036	63312356	-96287427	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1068	281	254	114	38	chr3	63314975	63315106	-96284677	+	LTR37B	LTR	ERV1	325	465	-3	4
1068	384	405	87	55	chr3	63322770	63322923	-96276860	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-89	359	198	4
1068	384	405	87	55	chr3	63323747	63323938	-96275845	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-251	197	4	4
1068	278	287	34	34	chr3	63326519	63326638	-96273145	+	RLTR33	LTR	ERVK	525	643	-35	4
1068	637	307	52	48	chr3	63334620	63334893	-96264890	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	273	-101	4
1068	226	336	23	78	chr3	63344946	63345075	-96254708	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-256	272	151	4
1068	1053	285	121	3	chr3	63346699	63347037	-96252746	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	378	-1	4
1068	1209	200	59	35	chr3	63348286	63348540	-96251243	+	MTD	LTR	MaLR	18	277	-142	4
1068	331	322	25	56	chr3	63351992	63352153	-96247630	-	LTR48B	LTR	ERV1	-30	757	602	4
1068	279	277	87	99	chr3	63352174	63352346	-96247437	+	RMER15	LTR	ERVL	14	183	-392	4
1068	285	237	96	119	chr3	63352419	63352596	-96247187	+	RMER15	LTR	ERVL	403	575	0	4
1068	708	319	73	42	chr3	63352631	63352988	-96246795	-	LTR48B	LTR	ERV1	-273	371	4	4
1068	400	324	90	45	chr3	63353103	63353371	-96246412	-	MER21B	LTR	ERV1	-136	727	448	4
1068	639	282	130	20	chr3	63354243	63354496	-96245287	+	MLT1C	LTR	MaLR	34	314	-153	4
1068	486	311	162	29	chr3	63356652	63356930	-96242853	-	LTR82A	LTR	ERVL	-296	576	262	5
1068	1548	204	78	28	chr3	63359068	63359427	-96240356	-	RLTR14	LTR	ERV1	-5	377	1	5
1068	4512	161	69	30	chr3	63359427	63359790	-96239993	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	0	5317	4937	5
1068	3293	77	5	2	chr3	63359790	63360196	-96239587	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	5
1068	4512	161	69	30	chr3	63360196	63360701	-96239082	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-381	4936	4415	5
1068	1809	180	87	59	chr3	63360699	63360969	-96238814	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-2862	2455	2184	5
1068	1809	180	87	59	chr3	63361051	63361170	-96238613	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3134	2183	2056	5
1068	7263	214	62	109	chr3	63361313	63362597	-96237186	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3252	2065	808	5
1068	7263	214	62	109	chr3	63362661	63362911	-96236872	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3252	807	562	5
1068	7263	214	62	109	chr3	63362944	63363511	-96236272	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4756	561	1	5
1068	1846	210	64	3	chr3	63363511	63363869	-96235914	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	3	5
1068	1897	310	38	82	chr3	63364943	63365776	-96234007	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	755	1551	-29	5
1068	227	291	101	65	chr3	63365760	63365929	-96233854	+	ORR1D2	LTR	MaLR	9	183	-187	5
1068	333	252	210	34	chr3	63366688	63366807	-96232976	+	MER21B	LTR	ERV1	98	237	-626	5
1068	261	373	82	12	chr3	63366885	63367056	-96232727	+	MER21B	LTR	ERV1	409	591	-272	5
1068	249	228	64	73	chr3	63367535	63367644	-96232139	+	RLTR23	LTR	ERV1	286	393	-37	5
1068	296	343	19	0	chr3	63371795	63371900	-96227883	+	MER21B	LTR	ERV1	612	718	-145	5
1068	282	297	116	25	chr3	63372138	63372259	-96227524	+	MLT1A1	LTR	MaLR	232	395	-13	5
1068	1100	200	71	52	chr3	63372882	63373236	-96226547	-	MTC-int	LTR	MaLR	-884	374	123	5
1068	2210	122	18	15	chr3	63375144	63375470	-96224313	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1068	1009	178	83	10	chr3	63378688	63378892	-96220891	-	MTC	LTR	MaLR	-201	220	2	5
1068	1610	252	26	24	chr3	63379279	63379511	-96220272	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	233	-146	5
1068	1610	252	26	24	chr3	63379778	63379923	-96219860	+	MTE2b	LTR	MaLR	234	379	0	5
1068	1939	101	63	10	chr3	63381258	63381557	-96218226	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	4	5
1068	1262	165	75	18	chr3	63382585	63382749	-96217034	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	164	-210	5
1068	1262	165	75	18	chr3	63382806	63382869	-96216914	+	ORR1D1	LTR	MaLR	165	243	-131	5
1068	860	289	68	88	chr3	63385370	63385825	-96213958	-	MER31A	LTR	ERV1	-2	483	38	5
1068	1274	174	279	3	chr3	63396835	63397147	-96202636	+	MTC	LTR	MaLR	24	421	0	5
1068	3091	83	8	2	chr3	63400108	63400506	-96199277	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1068	1390	245	6	70	chr3	63407015	63407422	-96192361	-	MTE2a	LTR	MaLR	-11	368	8	5
1068	293	287	67	48	chr3	63409307	63409472	-96190311	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	223	5
1068	902	308	62	0	chr3	63410145	63410453	-96189330	+	MER21B	LTR	ERV1	452	778	-85	5
1068	876	306	87	16	chr3	63411802	63412307	-96187476	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	1	663	-708	5
1068	572	320	103	25	chr3	63412948	63413328	-96186455	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	1438	1721	-14	5
1068	743	255	91	53	chr3	63413576	63413970	-96185813	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	5
1068	372	278	18	9	chr3	63414018	63414127	-96185656	+	MLT1B	LTR	MaLR	281	390	0	5
1068	280	275	53	100	chr3	63416895	63417065	-96182718	+	LTR48	LTR	ERV1	620	781	-6	6
1068	2359	179	30	42	chr3	63421363	63421789	-96177994	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
1068	4113	57	4	69	chr3	63421835	63422383	-96177400	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
1068	260	306	210	56	chr3	63422390	63422657	-96177126	+	LTR48	LTR	ERV1	1	308	-479	6
1068	835	215	28	42	chr3	63422715	63422929	-96176854	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	164	6
1068	732	227	94	44	chr3	63423060	63423240	-96176543	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-185	189	1	6
1068	590	296	39	34	chr3	63423382	63423588	-96176195	+	LTR48	LTR	ERV1	404	610	-177	6
1068	926	254	24	155	chr3	63423699	63424035	-96175748	+	MTE2a	LTR	MaLR	10	301	-78	6
1068	232	297	151	59	chr3	63429093	63429211	-96170572	+	MTE2a	LTR	MaLR	202	337	-82	6
1068	388	219	24	0	chr3	63430216	63430298	-96169485	+	MTE2a	LTR	MaLR	296	379	0	6
1068	382	210	83	128	chr3	63431396	63431576	-96168207	+	LTR48	LTR	ERV1	605	776	-11	6
1068	523	263	43	48	chr3	63433341	63433529	-96166254	+	MER89	LTR	ERV1	366	552	-7	6
1068	374	340	94	43	chr3	63433785	63434062	-96165721	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-53	317	27	6
1068	980	286	15	11	chr3	63434090	63434355	-96165428	-	MTE-int	LTR	MaLR	-57	1523	1258	6
1068	1675	202	94	19	chr3	63434435	63434808	-96164975	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	13	6
1068	654	312	191	33	chr3	63434840	63435175	-96164608	-	MTE-int	LTR	MaLR	-455	1125	738	6
1068	568	245	87	51	chr3	63435980	63436208	-96163575	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1072	508	245	6
133	6235	166	17	64	chr3	63438769	63439301	-96160482	+	RLTR21	LTR	ERVK	2	543	-1029	6
1069	6235	166	17	64	chr3	63439548	63440100	-96159683	+	RLTR21	LTR	ERVK	544	1072	-500	6
1069	6235	166	17	64	chr3	63440156	63440246	-96159537	+	RLTR21	LTR	ERVK	1073	1128	-444	6
1069	6235	179	22	93	chr3	63440302	63440411	-96159372	+	RLTR21	LTR	ERVK	1129	1253	-151	6
1069	489	219	38	183	chr3	63440456	63440636	-96159147	+	RLTR21	LTR	ERVK	1254	1404	0	6
1069	748	238	6	41	chr3	63441405	63441576	-96158207	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1415	165	1	6
1069	904	268	79	105	chr3	63445490	63445920	-96153863	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	426	-4	6
1069	1271	276	32	45	chr3	63450187	63450563	-96149220	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	374	-5	6
1069	3035	47	0	85	chr3	63451453	63451851	-96147932	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	364	-1	6
1069	2313	68	161	0	chr3	63451880	63452264	-96147519	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-86	446	1	6
1069	1623	175	34	21	chr3	63452765	63453092	-96146691	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	331	-230	6
1069	1820	297	71	67	chr3	63453119	63454489	-96145294	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2036	5520	2952	6
1069	1765	157	81	6	chr3	63455391	63455711	-96144072	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-10	384	41	6
1069	1158	194	65	211	chr3	63458457	63458889	-96140894	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	374	0	6
1069	1491	273	41	0	chr3	63458889	63459252	-96140531	+	MTEa	LTR	MaLR	2	379	0	6
1069	426	217	50	109	chr3	63459427	63459546	-96140237	-	MLT1C	LTR	MaLR	-56	411	300	6
1069	248	293	27	0	chr3	63459887	63459962	-96139821	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	481	6
1069	538	198	0	0	chr3	63459962	63460058	-96139725	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	283	6
1069	276	105	0	0	chr3	63460059	63460097	-96139686	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	38	-995	6
1069	908	206	22	27	chr3	63461507	63461692	-96138091	-	RMER15	LTR	ERVL	-89	486	303	6
1069	485	277	29	46	chr3	63461757	63461931	-96137852	-	RMER15	LTR	ERVL	-383	192	22	6
1069	250	151	55	36	chr3	63461940	63461995	-96137788	-	RMER15	LTR	ERVL	-506	69	14	6
1069	286	364	46	52	chr3	63462340	63462514	-96137269	-	ORR1E	LTR	MaLR	-186	173	1	6
1069	508	272	51	28	chr3	63465145	63465323	-96134460	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1088	4434	4253	6
1069	423	250	24	24	chr3	63465647	63465770	-96134013	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1296	4226	4104	6
1069	1957	109	72	3	chr3	63465933	63466264	-96133519	-	RLTR15	LTR	ERVK	-5	354	1	6
1069	1245	303	57	3	chr3	63482496	63482847	-96116936	+	MTEa	LTR	MaLR	10	379	0	6
1069	346	300	71	26	chr3	63483028	63483182	-96116601	-	LTR48	LTR	ERV1	-625	162	2	6
1069	1987	176	0	78	chr3	63484069	63484452	-96115331	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	42	6
1069	233	154	0	0	chr3	63485021	63485060	-96114723	-	RMER21B	LTR	ERV1	0	842	804	6
1069	712	215	386	58	chr3	63485116	63485283	-96114500	-	RMER21B	LTR	ERV1	-289	553	433	6
1069	712	237	320	13	chr3	63486157	63486366	-96113417	-	RMER21B	LTR	ERV1	-410	432	147	6
1069	1564	181	58	3	chr3	63487179	63487472	-96112311	+	ORR1B1	LTR	MaLR	86	394	0	7
1069	1751	173	15	31	chr3	63488580	63488918	-96110865	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-36	334	1	7
1069	1258	221	82	68	chr3	63488917	63489282	-96110501	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	370	-14	7
1069	322	323	212	10	chr3	63489383	63489586	-96110197	+	MLT2B1	LTR	ERVL	144	387	-133	7
1069	713	314	34	24	chr3	63489739	63490033	-96109750	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	117	413	-5301	7
1069	1949	172	58	11	chr3	63493042	63493401	-96106382	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	3	7
1069	2318	160	70	5	chr3	63495101	63495471	-96104312	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
1069	426	319	29	25	chr3	63495481	63495723	-96104060	+	MERVL-int	LTR	ERVL	2347	2657	-2828	7
1069	278	341	33	22	chr3	63496281	63496371	-96103412	-	ORR1E	LTR	MaLR	-248	111	21	7
1069	251	287	19	29	chr3	63497379	63497483	-96102300	+	LTR16D	LTR	ERVL	472	574	-77	7
1069	4045	132	14	42	chr3	63514011	63514637	-96085146	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	609	-2	7
1069	300	296	31	0	chr3	63515414	63515512	-96084271	-	MER57C2	LTR	ERV1	-56	378	278	9
1069	617	261	75	35	chr3	63528128	63528515	-96071268	+	RLTR12B	LTR	ERVK	12	499	-29	2
1069	1130	166	80	14	chr3	63535082	63535303	-96064480	+	ORR1B2	LTR	MaLR	114	328	-39	4
1069	239	266	112	41	chr3	63536929	63537027	-96062756	+	MLT1A	LTR	MaLR	261	365	-9	4
1069	256	184	48	84	chr3	63538464	63538547	-96061236	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-54	508	429	5
1069	485	340	83	86	chr3	63538563	63538772	-96061011	+	MLT1F2	LTR	MaLR	1	202	-358	5
1069	485	340	83	86	chr3	63538798	63538835	-96060948	+	MLT1F2	LTR	MaLR	203	243	-317	5
1069	485	333	152	84	chr3	63538874	63539154	-96060629	+	MLT1F2	LTR	MaLR	244	680	0	5
1069	3008	49	5	5	chr3	63546439	63546826	-96052957	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-9	387	1	7
1069	307	313	25	42	chr3	63548933	63549053	-96050730	+	MLT2D	LTR	ERVL	223	340	-74	7
1069	1284	206	34	56	chr3	63551876	63552200	-96047583	+	ORR1D1	LTR	MaLR	26	342	-32	7
1069	508	251	31	140	chr3	63553975	63554197	-96045586	+	MTEa	LTR	MaLR	182	379	0	8
1069	3019	296	130	59	chr3	63554197	63554697	-96045086	+	MTEa-int	LTR	MaLR	14	575	-1005	8
1069	3019	296	130	59	chr3	63554766	63555650	-96044133	+	MTEa-int	LTR	MaLR	576	1496	-84	8
1069	385	351	147	43	chr3	63555659	63555692	-96044091	+	MTEb	LTR	MaLR	89	118	-261	8
1069	2288	222	50	33	chr3	63555692	63556266	-96043517	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	584	0	8
1069	385	351	147	43	chr3	63556266	63556443	-96043340	+	MTEb	LTR	MaLR	119	321	-58	8
1069	594	293	129	8	chr3	63563512	63563753	-96036030	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	198	9
1069	339	317	111	43	chr3	63565195	63565429	-96034354	-	MER31B	LTR	ERV1	-201	265	16	9
1069	473	351	124	45	chr3	63565451	63565943	-96033840	-	MER21B	LTR	ERV1	-309	554	24	9
1069	1147	199	212	29	chr3	63566809	63567125	-96032658	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	9
1069	2063	179	27	75	chr3	63568631	63568963	-96030820	+	MTC	LTR	MaLR	1	322	-99	1
1069	2063	179	27	75	chr3	63569044	63569090	-96030693	+	MTC	LTR	MaLR	323	365	-56	1
1069	2465	145	59	38	chr3	63569090	63569562	-96030221	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1069	2063	179	27	75	chr3	63569562	63569624	-96030159	+	MTC	LTR	MaLR	366	421	0	1
1070	298	200	0	18	chr3	63583404	63583460	-96016323	+	MLT1L	LTR	MaLR	449	503	-107	1
1070	1217	302	81	52	chr3	63586963	63587484	-96012299	+	MLT2B3	LTR	ERVL	19	554	0	1
1070	255	274	40	14	chr3	63591534	63591608	-96008175	+	MLT1A	LTR	MaLR	49	124	-250	1
1070	232	273	115	26	chr3	63591889	63592002	-96007781	+	RMER15	LTR	ERVL	299	421	-154	1
1070	263	266	31	0	chr3	63592034	63592098	-96007685	+	RMER15	LTR	ERVL	496	561	-14	1
1070	409	231	29	24	chr3	63592058	63592210	-96007573	+	MLT1A	LTR	MaLR	243	444	-23	1
1070	282	275	49	42	chr3	63594140	63594284	-96005499	+	RLTR23	LTR	ERV1	286	430	0	1
1070	1442	218	102	23	chr3	63600788	63601131	-95998652	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
1070	1488	183	80	63	chr3	63601673	63601829	-95997954	+	ORR1C1	LTR	MaLR	11	181	-197	1
1070	1488	183	80	63	chr3	63601863	63602068	-95997715	+	ORR1C1	LTR	MaLR	182	378	0	1
1070	6202	176	30	20	chr3	63602068	63603290	-95996493	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1	1234	-275	1
1070	263	321	13	108	chr3	63604585	63604742	-95995041	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	142	-217	1
1070	229	367	83	21	chr3	63609899	63610091	-95989692	+	RMER4B	LTR	ERVK	10	213	-372	1
1070	362	330	8	74	chr3	63613283	63613404	-95986379	-	MTEa	LTR	MaLR	-266	113	1	1
1070	1503	228	169	24	chr3	63615894	63616400	-95983383	-	RMER4B	LTR	ERVK	-5	580	1	1
1070	650	279	94	26	chr3	63622496	63622864	-95976919	+	MLT2B1	LTR	ERVL	5	528	-34	2
1070	270	333	0	11	chr3	63625308	63625396	-95974387	-	MER74B	LTR	ERVL	-418	204	118	2
1070	1881	163	8	93	chr3	63625389	63625767	-95974016	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	2
1070	368	284	98	0	chr3	63626677	63626779	-95973004	+	MLT1F1	LTR	MaLR	5	116	-453	2
1070	875	226	250	31	chr3	63642097	63642385	-95957398	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	24	2
1070	1208	259	57	10	chr3	63642871	63643167	-95956616	+	ORR1E	LTR	MaLR	45	354	-5	2
1070	1125	229	76	86	chr3	63645004	63645387	-95954396	+	ORR1C2	LTR	MaLR	6	384	0	2
1070	2415	189	7	14	chr3	63651136	63651559	-95948224	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	2
1070	1344	150	67	35	chr3	63659044	63659216	-95940567	+	RLTR20C	LTR	ERVK	272	442	-92	2
1070	1344	150	67	35	chr3	63659321	63659403	-95940380	+	RLTR20C	LTR	ERVK	443	534	0	2
1070	1134	239	146	20	chr3	63671085	63671435	-95928348	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	25	3
1070	1099	232	93	108	chr3	63673002	63673326	-95926457	+	MTEa	LTR	MaLR	2	320	-59	3
1070	624	232	149	51	chr3	63678067	63678262	-95921521	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	206	3
1070	326	304	68	17	chr3	63678394	63678511	-95921272	-	MTD	LTR	MaLR	-243	176	54	3
1070	245	279	114	0	chr3	63678652	63678731	-95921052	+	MLT1A0	LTR	MaLR	3	90	-275	3
1070	654	199	142	6	chr3	63678741	63678903	-95920880	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	184	-297	3
1070	262	292	66	22	chr3	63679073	63679164	-95920619	+	RLTR28	LTR	ERVL	417	511	-13	3
1070	537	273	87	19	chr3	63679198	63679413	-95920370	+	MLT1A0	LTR	MaLR	127	400	-8	3
1070	226	244	114	92	chr3	63680581	63680712	-95919071	+	MLT1A0	LTR	MaLR	459	592	-3	3
1070	684	161	15	30	chr3	63681204	63681338	-95918445	+	RLTR15	LTR	ERVK	6	137	-222	3
1070	549	218	18	55	chr3	63681352	63681517	-95918266	+	RLTR15	LTR	ERVK	197	355	-4	3
1070	3882	157	43	19	chr3	63688948	63689622	-95910161	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	3
1070	1920	156	130	13	chr3	63691350	63691727	-95908056	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1070	2234	148	6	14	chr3	63692417	63692774	-95907009	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	354	-13	3
1070	1825	146	82	37	chr3	63694549	63694904	-95904879	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-13	371	1	3
1070	248	336	6	149	chr3	63696870	63697038	-95902745	+	MT2B2	LTR	ERVL	119	262	-322	3
1071	2429	160	75	73	chr3	63705330	63705849	-95893934	+	RMER15	LTR	ERVL	1	520	-55	3
1071	1825	116	57	44	chr3	63706789	63707106	-95892677	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	3
1071	1135	218	81	62	chr3	63707248	63707264	-95892519	-	MT2B	LTR	ERVL	-7	594	579	3
1071	1135	218	81	62	chr3	63707306	63707612	-95892171	-	MT2B	LTR	ERVL	-23	578	266	3
1071	246	286	134	0	chr3	63707654	63707766	-95892017	-	MT2B	LTR	ERVL	-405	128	2	3
1071	3433	38	5	10	chr3	63715876	63716274	-95883509	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1071	2105	153	9	6	chr3	63716545	63716893	-95882890	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	349	-25	3
1071	2794	128	45	53	chr3	63716901	63717373	-95882410	+	RLTR19	LTR	ERVK	31	498	-1	4
1071	242	342	77	77	chr3	63717785	63717994	-95881789	-	RMER4A	LTR	ERVK	-370	215	7	4
1071	363	264	97	35	chr3	63718306	63718451	-95881332	-	MLT1L	LTR	MaLR	-40	570	417	4
1071	4688	123	55	12	chr3	63721029	63721753	-95878030	-	RMER6A	LTR	ERVK	-1	755	1	4
1071	280	211	28	112	chr3	63724455	63724562	-95875221	+	MT2B	LTR	ERVL	172	269	-332	4
1071	585	168	42	72	chr3	63724967	63725060	-95874723	+	ORR1E	LTR	MaLR	85	141	-218	4
1071	653	248	47	48	chr3	63725208	63725427	-95874356	+	ORR1E	LTR	MaLR	129	366	-4	4
1071	228	206	0	150	chr3	63732631	63732711	-95867072	+	MT2B	LTR	ERVL	197	264	-337	4
1071	329	242	266	32	chr3	63733901	63734059	-95865724	+	MER77	LTR	ERVL	54	248	-359	4
1071	310	272	68	0	chr3	63734074	63734177	-95865606	+	MER77	LTR	ERVL	304	413	-194	4
1071	4384	122	29	32	chr3	63735231	63735390	-95864393	-	RLTR19B	LTR	ERVK	0	715	569	4
1071	4384	122	29	32	chr3	63735578	63736135	-95863648	-	RLTR19B	LTR	ERVK	-147	568	1	4
1071	1082	191	127	46	chr3	63736170	63736477	-95863306	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	4
1071	2304	190	19	27	chr3	63741638	63742125	-95857658	-	RLTR16	LTR	ERVK	-22	483	1	4
1071	3022	151	8	8	chr3	63742979	63743473	-95856310	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	494	-609	4
1071	314	358	105	21	chr3	63743480	63743671	-95856112	-	RMER13A	LTR	ERVK	-66	794	588	4
1071	796	295	78	51	chr3	63743705	63744076	-95855707	-	RMER13A	LTR	ERVK	-467	393	13	4
1071	1823	172	215	43	chr3	63744070	63744448	-95855335	+	RLTR25B	LTR	ERVK	436	853	-175	4
1071	1823	171	243	33	chr3	63744571	63744729	-95855054	+	RLTR25B	LTR	ERVK	854	1028	0	4
1071	828	266	102	48	chr3	63744873	63745223	-95854560	+	MLT1B	LTR	MaLR	7	375	-15	4
1071	529	339	68	60	chr3	63745223	63745574	-95854209	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	4
1071	236	268	11	99	chr3	63750269	63750360	-95849423	-	MT2B	LTR	ERVL	-366	235	153	4
1071	1728	159	78	17	chr3	63753873	63754219	-95845564	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1071	1056	168	21	122	chr3	63770366	63770603	-95829180	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	213	-165	5
1071	349	172	46	15	chr3	63772121	63772186	-95827597	+	RLTR30	LTR	ERV1	2	68	-311	5
1071	557	212	108	14	chr3	63772246	63772385	-95827398	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-202	163	12	5
1071	491	147	179	8	chr3	63772400	63772517	-95827266	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-20	1715	1579	5
1071	1105	258	72	43	chr3	63772519	63772867	-95826916	+	MTE2b	LTR	MaLR	6	363	-16	5
1071	269	320	68	38	chr3	63772888	63773021	-95826762	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-147	1588	1452	5
1071	489	318	85	104	chr3	63773076	63773205	-95826578	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-239	1496	1356	5
1071	1607	174	57	85	chr3	63773205	63773308	-95826475	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	285	5
1071	1607	174	57	85	chr3	63773504	63773623	-95826160	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-94	284	182	5
1071	1607	174	57	85	chr3	63773768	63773932	-95825851	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-197	181	3	5
1071	489	318	85	104	chr3	63773932	63774072	-95825711	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-380	1355	1232	5
1071	431	309	128	19	chr3	63774193	63774404	-95825379	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-1333	402	169	5
1071	2544	67	0	55	chr3	63775283	63775629	-95824154	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1071	235	335	156	85	chr3	63777867	63778079	-95821704	+	MLT1G1	LTR	MaLR	204	430	-165	5
1071	245	342	25	50	chr3	63778091	63778171	-95821612	+	MLT1G1	LTR	MaLR	417	494	-85	5
1071	378	289	31	63	chr3	63782222	63782381	-95817402	+	MTD	LTR	MaLR	41	194	-225	5
1071	430	309	104	50	chr3	63782889	63783272	-95816511	-	MTC	LTR	MaLR	0	419	13	5
1071	975	193	201	76	chr3	63784867	63785260	-95814523	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	5
1071	242	342	0	27	chr3	63786158	63786269	-95813514	+	RMER12	LTR	ERVK	748	855	-467	6
1071	901	272	100	14	chr3	63787406	63787448	-95812335	-	MT2B	LTR	ERVL	-2	599	551	6
1071	901	243	136	115	chr3	63787487	63787881	-95811902	-	MT2B	LTR	ERVL	-51	550	16	6
1071	2136	176	60	15	chr3	63791111	63791514	-95808269	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
1071	2548	174	117	10	chr3	63793079	63793590	-95806193	-	RMER15	LTR	ERVL	-5	570	5	6
1071	1601	246	48	2	chr3	63816275	63816674	-95783109	+	MTC	LTR	MaLR	3	419	-2	6
1071	259	277	44	0	chr3	63826695	63826724	-95773059	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-863	646	612	6
1071	823	228	83	143	chr3	63827669	63828053	-95771730	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-9	361	1	6
1072	4540	155	14	19	chr3	63834480	63835182	-95764601	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-214	7192	6494	6
1072	1286	331	9	4	chr3	63835227	63835790	-95763993	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-463	7754	7246	6
1072	341	275	36	73	chr3	63835995	63836242	-95763541	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-5609	1635	1398	6
1072	424	227	36	57	chr3	63836642	63836782	-95763001	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1886	6331	6195	6
1072	530	292	58	33	chr3	63837976	63838314	-95761469	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-781	5386	5077	6
1072	4134	321	61	46	chr3	63839956	63843039	-95756744	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2791	5426	2298	6
1072	353	318	20	29	chr3	63845196	63845400	-95754383	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6862	382	181	6
1072	2099	106	9	13	chr3	63850159	63850474	-95749309	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-11	316	3	7
1072	4633	89	30	23	chr3	63850476	63851140	-95748643	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5813	7
1072	37497	73	29	12	chr3	63851138	63856078	-95743705	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-1057	5424	403	7
1072	689	295	88	0	chr3	63880910	63881103	-95718680	-	ORR1E	LTR	MaLR	-142	217	8	7
1072	3265	71	2	5	chr3	63883342	63883739	-95716044	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1072	317	348	62	0	chr3	63894674	63894786	-95704997	-	MLT1J	LTR	MaLR	-304	208	90	7
1072	1185	148	6	0	chr3	63897153	63897336	-95702447	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-130	197	14	7
1072	2348	181	78	17	chr3	63903658	63904182	-95695601	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	3	558	-3	7
1072	2652	148	84	107	chr3	63904257	63904339	-95695444	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	479	7
1072	2652	148	84	107	chr3	63904404	63904901	-95694882	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-90	478	2	7
1072	713	227	13	20	chr3	63915650	63915785	-95683998	-	RMER21A	LTR	ERV1	-7	835	702	7
1072	2205	158	37	0	chr3	63915785	63916163	-95683620	-	RMER21A	LTR	ERV1	0	947	556	7
1072	974	112	0	0	chr3	63916163	63916297	-95683486	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	134	-772	7
1072	583	99	0	0	chr3	63916298	63916379	-95683404	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-5555	1364	1284	7
1072	7784	103	65	22	chr3	63916476	63917710	-95682073	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-5621	1298	12	7
1072	4893	112	81	14	chr3	63917711	63918551	-95681232	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-10	896	1	7
1072	317	192	192	0	chr3	63918551	63918629	-95681154	-	RMER21A	LTR	ERV1	-386	561	469	7
1072	1471	255	46	63	chr3	63918624	63919038	-95680745	+	MTD	LTR	MaLR	11	417	-2	8
1072	5994	73	20	0	chr3	63925450	63926240	-95673543	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	806	1	8
1072	2039	186	114	70	chr3	63932205	63932256	-95667527	+	RMER15	LTR	ERVL	3	56	-519	8
1072	2039	186	114	70	chr3	63932614	63933105	-95666678	+	RMER15	LTR	ERVL	57	569	-6	8
1072	1757	154	14	58	chr3	63933198	63933542	-95666241	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	8
1072	948	279	120	23	chr3	63935092	63935459	-95664324	-	MTD	LTR	MaLR	-36	383	3	8
1072	888	314	121	11	chr3	63948164	63948537	-95651246	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	8
1072	2462	53	88	0	chr3	63954519	63954837	-95644946	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	8
1072	387	266	104	97	chr3	63957249	63957528	-95642255	+	RLTR20D	LTR	ERVK	5	285	-283	8
1072	379	286	14	101	chr3	63957516	63957664	-95642119	+	RLTR20D	LTR	ERVK	423	557	-21	8
1072	250	274	14	0	chr3	63958018	63958091	-95641692	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	604	677	-2165	8
1072	905	206	200	21	chr3	63958662	63959209	-95640574	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	486	-1840	8
1072	1314	199	34	49	chr3	63959233	63959560	-95640223	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	612	933	-1393	8
1072	906	150	53	0	chr3	63959572	63959759	-95640024	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1111	1307	-1019	8
1072	3239	171	68	14	chr3	63959749	63960533	-95639250	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1493	2318	-8	8
1072	751	324	34	57	chr3	63960541	63960839	-95638944	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	291	-277	8
1073	11445	158	8	23	chr3	63969779	63970052	-95629731	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1179	6227	6001	8
1073	11445	138	6	5	chr3	63970097	63971675	-95628108	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1406	6000	4420	8
1073	9086	138	34	12	chr3	63971672	63973469	-95626314	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3312	4094	1565	8
1073	1960	123	0	0	chr3	63973460	63973761	-95626022	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5162	2244	1944	8
1073	2929	114	86	6	chr3	63973756	63974293	-95625490	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5756	1650	1071	8
1073	911	264	35	60	chr3	63974303	63974673	-95625110	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2927	387	27	8
1073	2927	88	10	8	chr3	63974691	63975091	-95624692	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	3	8
1073	2102	128	27	27	chr3	63985601	63985969	-95613814	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	8
1073	3775	168	62	56	chr3	63986371	63987627	-95612156	+	RMER16-int	LTR	ERVK	309	2247	-5159	8
1073	11175	158	64	49	chr3	63987628	63990459	-95609324	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1653	4176	-1230	8
1073	364	266	15	53	chr3	63990456	63990587	-95609196	+	RMER16-int	LTR	ERVK	6086	6211	-1195	8
1073	389	259	168	17	chr3	63990653	63990826	-95608957	+	RMER16-int	LTR	ERVK	6223	6421	-985	8
1073	351	93	0	36	chr3	63991041	63991097	-95608686	+	RMER16-int	LTR	ERVK	7331	7384	-22	8
1073	2093	127	39	11	chr3	63991120	63991478	-95608305	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	8
1073	2719	72	0	0	chr3	63992436	63992782	-95607001	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	8
1073	3520	160	35	27	chr3	63995056	63995505	-95604278	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	194	8
1073	6175	79	6	22	chr3	63995505	63996374	-95603409	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	8
1073	3520	160	35	27	chr3	63996374	63996561	-95603222	-	RLTR26	LTR	ERVK	-449	193	1	8
1073	2856	44	6	0	chr3	63999611	63999955	-95599828	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	8
1073	1950	238	51	49	chr3	64000767	64001336	-95598447	+	RMER15	LTR	ERVL	1	570	-5	2
1073	2504	138	103	20	chr3	64001533	64001978	-95597805	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	3
1073	3160	155	9	22	chr3	64004900	64005434	-95594349	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-17	588	62	6
1073	2213	129	62	34	chr3	64006708	64007094	-95592689	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-6	397	1	7
1073	3445	64	55	4	chr3	64008927	64009399	-95590384	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	69	1
1073	2093	135	54	88	chr3	64010056	64010463	-95589320	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	1
1073	3562	46	2	0	chr3	64011296	64011691	-95588092	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1073	753	309	136	11	chr3	64022568	64022937	-95576846	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	3
1073	2273	143	22	37	chr3	64032376	64032783	-95567000	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1447	401	1	5
1073	3009	9	3	0	chr3	64037371	64037692	-95562091	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	6
1073	479	294	19	45	chr3	64038115	64038382	-95561401	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	181	440	-6804	6
1073	1297	318	57	62	chr3	64039095	64039362	-95560421	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	1412	1826	-6391	6
1073	3209	107	27	39	chr3	64039362	64039850	-95559933	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	7
1073	1603	314	57	54	chr3	64039850	64041398	-95558385	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	1532	3484	-4733	6
1073	2270	312	72	71	chr3	64050194	64052419	-95547364	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	3475	5702	-2515	6
1073	265	341	14	14	chr3	64052807	64052947	-95546836	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	5921	6060	-1496	7
1073	1507	306	50	50	chr3	64053404	64053727	-95546056	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	6810	7129	-1088	6
1073	1507	306	50	50	chr3	64053920	64054261	-95545522	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7130	7479	-738	6
1073	2948	130	29	25	chr3	64054261	64054741	-95545042	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	7
1073	1507	306	50	50	chr3	64054741	64055028	-95544755	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7480	7762	-455	6
1073	2029	54	0	0	chr3	64057771	64058031	-95541752	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-131	677	418	8
1073	3306	65	5	0	chr3	64059764	64060194	-95539589	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-376	432	1	8
1073	635	232	31	52	chr3	64060277	64060468	-95539315	+	MTD	LTR	MaLR	229	415	-4	8
1073	2590	102	55	0	chr3	64060580	64060980	-95538803	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	422	0	8
1073	2267	138	22	29	chr3	64068916	64069328	-95530455	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	9
1073	1121	134	29	0	chr3	64069532	64069704	-95530079	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-981	6425	6249	9
1073	779	179	19	30	chr3	64069699	64069910	-95529873	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6106	6222	-1184	9
1073	1747	228	78	57	chr3	64076056	64076619	-95523164	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	1
1074	594	352	127	9	chr3	64095591	64095921	-95503862	+	MTD	LTR	MaLR	51	419	0	1
1074	507	95	14	0	chr3	64118399	64118473	-95481310	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-857	1106	1032	1
1074	5223	124	58	12	chr3	64125557	64126419	-95473364	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	1
1074	2344	201	58	74	chr3	64131663	64131766	-95468017	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	466	1
1074	2344	201	58	74	chr3	64131805	64132269	-95467514	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-103	465	11	1
1074	2496	188	37	6	chr3	64139237	64139822	-95459961	-	RMER21A	LTR	ERV1	0	947	470	1
1074	1387	265	50	11	chr3	64139828	64140139	-95459644	+	MTD	LTR	MaLR	21	345	-74	1
1074	1387	265	50	11	chr3	64140174	64140244	-95459539	+	MTD	LTR	MaLR	346	417	-2	1
1074	1778	226	54	59	chr3	64150228	64150806	-95448977	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	2
1074	1433	207	19	1	chr3	64150893	64151210	-95448573	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	394	43	2
1074	868	297	139	47	chr3	64152829	64153211	-95446572	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	2
1074	2896	98	5	0	chr3	64164546	64164944	-95434839	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1074	778	267	126	37	chr3	64165734	64166115	-95433668	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	2
1074	312	262	85	52	chr3	64167607	64167760	-95432023	+	MTD	LTR	MaLR	256	413	-6	2
1074	1085	185	5	10	chr3	64183850	64184047	-95415736	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1652	196	1	2
1074	251	385	39	0	chr3	64185797	64185901	-95413882	-	MTE2a	LTR	MaLR	-196	183	76	2
1074	227	206	270	0	chr3	64186341	64186404	-95413379	-	MTE2a	LTR	MaLR	-297	82	3	2
1074	7736	117	25	59	chr3	64186405	64187751	-95412032	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	549	2
1074	2876	100	5	12	chr3	64190399	64190823	-95408960	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	2
1074	2089	226	70	56	chr3	64207393	64207951	-95391832	+	RMER15	LTR	ERVL	1	566	-9	2
134	1029	280	99	30	chr3	64225019	64225295	-95374488	+	MTD	LTR	MaLR	22	323	-96	2
1075	1029	280	99	30	chr3	64225559	64225654	-95374129	+	MTD	LTR	MaLR	324	419	0	2
1075	480	334	120	19	chr3	64230326	64230574	-95369209	-	MTE2b	LTR	MaLR	-110	269	1	2
1075	1499	224	90	3	chr3	64232006	64232373	-95367410	+	MTD	LTR	MaLR	19	417	-2	2
1075	1694	196	9	0	chr3	64232427	64232744	-95367039	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	1	2
1075	19938	125	27	10	chr3	64232744	64236149	-95363634	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-353	7228	4125	2
1075	2501	95	0	3	chr3	64236148	64236517	-95363266	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-3662	3919	3552	2
1075	1598	75	304	0	chr3	64236513	64236771	-95363012	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4515	3066	2730	2
1075	4169	75	0	7	chr3	64236769	64237334	-95362449	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5136	2445	1885	2
1075	341	188	138	0	chr3	64237325	64237405	-95362378	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5109	1028	938	2
1075	1476	178	197	32	chr3	64237410	64237846	-95361937	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4587	819	312	2
1075	608	185	69	8	chr3	64237835	64237966	-95361817	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6906	675	537	2
1075	2066	260	19	36	chr3	64237961	64238648	-95361135	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6760	920	246	3
1075	1336	207	8	0	chr3	64243727	64243978	-95355805	-	RLTR46	LTR	ERVK	-67	253	1	3
1075	1577	249	48	2	chr3	64255251	64255650	-95344133	+	MTC	LTR	MaLR	3	419	-2	3
1075	2417	203	43	3	chr3	64290492	64291010	-95308773	-	RMER21A	LTR	ERV1	-7	940	470	3
1075	1351	252	50	48	chr3	64291016	64291333	-95308450	+	MTD	LTR	MaLR	21	347	-72	3
1075	1351	252	50	48	chr3	64291379	64291457	-95308326	+	MTD	LTR	MaLR	348	417	-2	3
1075	1549	251	56	56	chr3	64301477	64302052	-95297731	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	3
1075	1209	240	12	61	chr3	64302139	64302485	-95297298	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
1075	949	294	98	50	chr3	64304057	64304455	-95295328	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	3
1075	3052	85	2	0	chr3	64316548	64316947	-95282836	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
1075	919	279	127	32	chr3	64317743	64317999	-95281784	+	MTD	LTR	MaLR	1	288	-131	3
1075	919	260	48	40	chr3	64318573	64318701	-95281082	+	MTD	LTR	MaLR	287	405	-14	3
1075	1029	182	21	10	chr3	64332398	64332592	-95267191	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1652	196	1	4
1075	275	375	39	0	chr3	64334312	64334416	-95265367	-	MTE2a	LTR	MaLR	-196	183	76	4
1075	7670	111	36	61	chr3	64335367	64336705	-95263078	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	545	4
1075	2819	110	5	12	chr3	64339344	64339768	-95260015	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	4
1076	984	286	102	37	chr3	64375068	64375346	-95224437	+	MTD	LTR	MaLR	22	323	-96	4
1076	984	286	102	37	chr3	64375610	64375705	-95224078	+	MTD	LTR	MaLR	324	419	0	4
1076	491	336	117	19	chr3	64387100	64387377	-95212406	-	MTE2b	LTR	MaLR	-79	300	1	4
1076	1483	220	100	5	chr3	64388506	64388886	-95210897	+	MTD	LTR	MaLR	2	417	-2	4
1076	1490	211	9	16	chr3	64388940	64389262	-95210521	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	1	4
1076	2703	195	24	19	chr3	64389262	64390049	-95209734	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-353	7228	6244	4
1076	1915	100	0	0	chr3	64390046	64390327	-95209456	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5416	2165	1885	4
1076	338	175	138	0	chr3	64390318	64390398	-95209385	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4227	1179	1089	4
1076	1334	169	122	44	chr3	64390448	64390844	-95208939	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4747	659	312	4
1076	609	192	69	0	chr3	64390828	64390958	-95208825	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6906	675	537	4
1076	2465	254	49	51	chr3	64390953	64391873	-95207910	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6760	920	3	4
1076	1659	195	6	42	chr3	64391875	64391954	-95207829	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	254	4
1076	1659	195	6	42	chr3	64392631	64392883	-95206900	-	RLTR46	LTR	ERVK	-67	253	1	4
1076	1615	246	48	2	chr3	64407079	64407478	-95192305	+	MTC	LTR	MaLR	3	419	-2	5
1076	2499	185	43	4	chr3	64432279	64432794	-95166989	-	RMER21A	LTR	ERV1	-7	940	474	5
1076	1371	255	52	26	chr3	64432809	64433123	-95166660	+	MTD	LTR	MaLR	21	347	-72	5
1076	1371	255	52	26	chr3	64433159	64433231	-95166552	+	MTD	LTR	MaLR	348	416	-3	5
1076	1576	249	56	56	chr3	64449417	64449992	-95149791	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	5
1076	1167	246	12	61	chr3	64450079	64450425	-95149358	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	5
1076	941	296	98	48	chr3	64451997	64452394	-95147389	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	5
1076	3237	16	0	5	chr3	64461479	64461848	-95137935	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	5
1076	23817	31	35	3	chr3	64461848	64464823	-95134960	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	3076	-3405	5
1076	7013	26	3	0	chr3	64464809	64465658	-95134125	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5630	6481	0	5
1076	3237	16	0	5	chr3	64465658	64466027	-95133756	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	5
1076	2991	93	2	0	chr3	64469076	64469475	-95130308	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1076	916	277	130	32	chr3	64470271	64470528	-95129255	+	MTD	LTR	MaLR	1	289	-130	5
1076	916	253	58	32	chr3	64471087	64471213	-95128570	+	MTD	LTR	MaLR	287	405	-14	5
1076	1017	182	21	10	chr3	64485412	64485606	-95114177	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1652	196	1	6
1076	3167	38	128	0	chr3	64485651	64486072	-95113711	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
1077	275	375	39	0	chr3	64487744	64487848	-95111935	-	MTE2a	LTR	MaLR	-196	183	76	6
1077	7631	112	38	60	chr3	64488487	64489821	-95109962	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	545	6
1077	2596	117	5	8	chr3	64492465	64492861	-95106922	-	BGLII	LTR	ERVK	-26	395	1	6
1077	855	293	92	45	chr3	64534409	64534663	-95065120	+	MTD	LTR	MaLR	46	323	-96	3
1077	855	293	92	45	chr3	64534927	64535029	-95064754	+	MTD	LTR	MaLR	324	419	0	3
1077	398	293	148	14	chr3	64542970	64543112	-95056671	-	MTE2b	LTR	MaLR	-218	161	1	5
1077	2710	60	40	6	chr3	64544095	64544448	-95055335	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	5
1077	1124	99	0	0	chr3	64544458	64544620	-95055163	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	202	-1785	5
1077	253	260	0	0	chr3	64544620	64544670	-95055113	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	272	-37	5
1077	311	24	95	0	chr3	64544670	64544712	-95055071	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	222	267	-7314	5
1077	2760	52	106	0	chr3	64544885	64545271	-95054512	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	566	992	-995	5
1077	414	304	35	35	chr3	64545327	64545689	-95054094	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	738	1012	-5530	5
1077	1418	96	104	0	chr3	64545701	64545931	-95053852	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5002	5255	-1287	5
1077	3823	118	22	7	chr3	64545931	64546614	-95053169	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6965	7680	0	5
1077	2611	64	10	91	chr3	64546614	64547011	-95052772	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	5
1077	1441	221	101	14	chr3	64547448	64547815	-95051968	+	MTD	LTR	MaLR	19	417	-2	5
1077	1532	173	198	30	chr3	64561414	64561848	-95037935	+	RMER16-int	LTR	ERVK	313	819	-4587	6
1077	340	195	130	0	chr3	64561853	64561930	-95037853	+	RMER16-int	LTR	ERVK	938	1024	-5113	6
1077	804	242	75	5	chr3	64561933	64562145	-95037638	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2522	2748	-4658	7
1077	9509	143	32	6	chr3	64562177	64563877	-95035906	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2935	4679	-2727	7
1077	3060	48	0	0	chr3	64563875	64564269	-95035514	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5356	5749	-1657	7
1077	268	233	80	27	chr3	64564609	64564684	-95035099	+	RLTR25B	LTR	ERVK	431	509	-519	7
1077	5794	144	71	94	chr3	64564795	64566230	-95033553	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	4670	6071	-1173	7
1077	784	279	18	12	chr3	64566232	64566586	-95033197	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	7506	7826	-391	7
1077	4480	141	22	1	chr3	64566617	64567306	-95032477	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6494	7196	-210	7
1077	796	267	126	47	chr3	64578142	64578523	-95021260	+	MTD	LTR	MaLR	5	415	-4	8
1077	351	370	48	11	chr3	64579372	64579558	-95020225	+	MLT1D	LTR	MaLR	273	465	-40	8
1077	267	303	53	39	chr3	64586693	64586899	-95012884	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2495	5086	4878	9
1077	257	352	0	0	chr3	64587320	64587408	-95012375	+	ORR1E	LTR	MaLR	75	162	-197	9
1077	849	311	126	98	chr3	64587522	64588116	-95011667	-	RLTR18	LTR	ERVK	-3	613	3	9
1077	6254	42	1	0	chr3	64593216	64593987	-95005796	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6473	7244	0	1
1077	2714	134	40	19	chr3	64593987	64594459	-95005324	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1077	1471	204	45	27	chr3	64594459	64594820	-95004963	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	152	547	-30	1
1077	3056	89	43	21	chr3	64606889	64607052	-94992731	+	RLTR44D	LTR	ERVK	3	165	-321	1
1077	3056	89	43	21	chr3	64607097	64607401	-94992382	+	RLTR44D	LTR	ERVK	166	479	-7	1
1077	556	88	91	73	chr3	64607422	64607532	-94992251	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	1	112	-2700	1
1077	4124	77	133	1	chr3	64607532	64608193	-94991590	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	40	787	-2025	1
1077	3787	57	2	2	chr3	64608498	64608990	-94990793	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	2321	2812	0	1
1077	3162	106	2	40	chr3	64608990	64609492	-94990291	+	RLTR44D	LTR	ERVK	1	483	-3	1
1077	3148	46	0	5	chr3	64615574	64615988	-94983795	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5661	6072	-1172	1
1077	2050	100	10	3	chr3	64616010	64616310	-94983473	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	207	508	-385	1
1077	7020	46	1	1	chr3	64616311	64617184	-94982599	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6334	7206	-38	1
1077	2482	99	82	91	chr3	64617196	64617682	-94982101	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1078	783	271	75	136	chr3	64630463	64630809	-94968974	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	81	1
1078	2404	169	53	18	chr3	64634860	64635366	-94964417	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	524	0	1
1078	801	247	23	6	chr3	64635545	64635720	-94964063	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	180	-179	1
1078	295	323	10	0	chr3	64635866	64635962	-94963821	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-3	486	390	1
1078	4467	164	54	72	chr3	64646943	64647675	-94952108	+	RMER21A	LTR	ERV1	1	703	-244	1
1078	4467	164	54	72	chr3	64647738	64647967	-94951816	+	RMER21A	LTR	ERV1	704	945	-2	1
1078	373	241	0	0	chr3	64647967	64648039	-94951744	+	RMER21B	LTR	ERV1	763	834	-8	1
1078	502	260	151	93	chr3	64648462	64648839	-94950944	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-9	399	1	1
1078	435	222	101	17	chr3	64651786	64651905	-94947878	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-279	129	1	1
1078	983	260	172	80	chr3	64654971	64655510	-94944273	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	589	-27	1
1078	1641	282	60	110	chr3	64658898	64659746	-94940037	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	806	-1042	1
1078	631	257	155	103	chr3	64659735	64659949	-94939834	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1128	1379	-469	1
1078	631	257	155	103	chr3	64660002	64660037	-94939746	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1380	1434	-414	1
1078	631	257	155	103	chr3	64660064	64660151	-94939632	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1435	1503	-345	1
1078	631	257	155	103	chr3	64660520	64660666	-94939117	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1504	1635	-213	1
1078	324	235	156	35	chr3	64660701	64660842	-94938941	+	RLTR21	LTR	ERVK	1342	1499	-73	1
1078	243	205	214	12	chr3	64661275	64661359	-94938424	+	MT2A	LTR	ERVL	427	527	-6	1
1078	1637	216	93	5	chr3	64661888	64662275	-94937508	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1078	645	353	5	0	chr3	64663219	64663406	-94936377	-	ORR1E	LTR	MaLR	-159	200	13	1
1078	2542	317	74	27	chr3	64663418	64664170	-94935613	-	MTE-int	LTR	MaLR	-49	1531	746	1
1078	2542	317	74	27	chr3	64664396	64664537	-94935246	-	MTE-int	LTR	MaLR	-835	745	596	1
1078	395	257	97	9	chr3	64666177	64666291	-94933492	-	MTE-int	LTR	MaLR	-857	723	600	1
1078	925	272	140	24	chr3	64668623	64668957	-94930826	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	36	1
1078	958	162	55	10	chr3	64670616	64670815	-94928968	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	240	447	-85	1
1078	1073	237	129	15	chr3	64677397	64677537	-94922246	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	166	-208	1
1078	1073	237	129	15	chr3	64677696	64677889	-94921894	+	ORR1D1	LTR	MaLR	167	373	-1	1
1078	381	276	114	0	chr3	64682339	64682462	-94917321	-	ORR1E	LTR	MaLR	-221	138	2	1
1078	1946	206	36	48	chr3	64685197	64685489	-94914294	+	MTC	LTR	MaLR	6	300	-121	2
1078	7071	59	10	2	chr3	64685489	64686375	-94913408	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	2
1078	1946	206	36	48	chr3	64686375	64686495	-94913288	+	MTC	LTR	MaLR	301	413	-8	2
1078	227	250	118	12	chr3	64694680	64694765	-94905018	+	RMER4B	LTR	ERVK	429	522	-63	2
1078	410	284	68	68	chr3	64696424	64696643	-94903140	+	RLTR15	LTR	ERVK	49	267	-92	2
1078	958	256	128	14	chr3	64704230	64704511	-94895272	+	MTD	LTR	MaLR	93	405	-14	2
1078	243	361	82	0	chr3	64705192	64705314	-94894469	+	LTR33	LTR	ERVL	47	178	-337	2
1078	361	158	0	0	chr3	64707265	64707322	-94892461	-	MTC	LTR	MaLR	-346	75	19	2
1078	3116	196	38	77	chr3	64709872	64710754	-94889029	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8093	8895	-64	2
1078	320	211	13	0	chr3	64713748	64713824	-94885959	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	6451	6527	-23	2
1078	759	243	82	45	chr3	64713834	64714235	-94885548	+	RMER4B	LTR	ERVK	6	418	-48	2
1078	762	270	75	39	chr3	64718301	64718404	-94881379	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	114	-245	2
1078	762	270	75	39	chr3	64718537	64718768	-94881015	+	RLTR15	LTR	ERVK	115	346	-13	2
1078	1030	261	50	112	chr3	64734305	64734706	-94865077	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	377	-2	2
1078	620	234	117	0	chr3	64734708	64734862	-94864921	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	2	173	-1407	2
1078	2414	177	7	26	chr3	64747445	64747641	-94852142	+	MTC	LTR	MaLR	1	196	-225	2
1078	2414	177	7	26	chr3	64748031	64748263	-94851520	+	MTC	LTR	MaLR	197	421	0	2
1079	469	360	159	21	chr3	64750665	64751130	-94848653	-	MLT1H1	LTR	MaLR	0	555	27	2
1079	1714	249	24	38	chr3	64756813	64757234	-94842549	+	MTD	LTR	MaLR	3	417	-2	2
1079	1588	178	126	6	chr3	64765126	64765460	-94834323	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1079	2833	44	9	0	chr3	64765538	64765881	-94833902	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
1079	1564	215	98	5	chr3	64765993	64766362	-94833421	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	3	3
1079	544	315	81	5	chr3	64769038	64769236	-94830547	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-231	213	1	3
1079	238	222	12	111	chr3	64776530	64776611	-94823172	+	MT2B	LTR	ERVL	154	226	-375	3
1079	2223	189	15	12	chr3	64779239	64779651	-94820132	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	3
1079	965	270	84	73	chr3	64790220	64790591	-94809192	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	5	3
1079	1436	237	89	11	chr3	64790913	64791293	-94808490	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	3
1079	699	310	89	39	chr3	64792704	64793100	-94806683	+	MLT2B4	LTR	ERVL	33	565	-2	3
1079	1110	336	93	16	chr3	64794812	64795305	-94804478	-	MER77	LTR	ERVL	-23	584	54	3
1079	1046	294	56	59	chr3	64795486	64795841	-94803942	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	3
1079	1087	276	118	9	chr3	64803649	64803989	-94795794	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	1	3
1079	391	219	12	24	chr3	64804909	64804993	-94794790	-	MTEb	LTR	MaLR	-19	360	278	3
1079	991	307	105	39	chr3	64807696	64808121	-94791662	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	502	-54	3
1079	1014	289	27	27	chr3	64809097	64809464	-94790319	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	3	3
1079	1014	297	34	20	chr3	64811497	64811847	-94787936	-	MLT1B	LTR	MaLR	-35	355	1	3
1079	2558	58	65	0	chr3	64820509	64820834	-94778949	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	3
1079	1264	236	139	19	chr3	64823301	64823405	-94776378	+	MTD	LTR	MaLR	10	121	-298	3
1079	1264	236	139	19	chr3	64823575	64823829	-94775954	+	MTD	LTR	MaLR	122	411	-8	3
1079	319	376	124	35	chr3	64839075	64839301	-94760482	+	MLT1K	LTR	MaLR	22	267	-328	4
1079	2011	166	44	8	chr3	64841129	64841494	-94758289	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1079	785	363	104	50	chr3	64846888	64847549	-94752234	+	MER21B	LTR	ERV1	44	740	-123	4
1079	938	253	93	71	chr3	64848523	64848598	-94751185	+	MTE-int	LTR	MaLR	1171	1250	-330	4
1079	938	253	93	71	chr3	64848626	64848902	-94750881	+	MTE-int	LTR	MaLR	1251	1529	-51	4
1079	1274	281	19	13	chr3	64848902	64849216	-94750567	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	319	-40	4
1079	1576	193	77	28	chr3	64849643	64850005	-94749778	+	ORR1C2	LTR	MaLR	5	384	0	4
1079	262	378	69	7	chr3	64854165	64854309	-94745474	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	364	4
1079	701	201	15	35	chr3	64854455	64854618	-94745165	-	RMER20B	LTR	ERVK	-359	157	1	4
1079	2178	124	9	3	chr3	64862567	64862890	-94736893	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	4
1079	4580	150	122	71	chr3	64867198	64867572	-94732211	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	325	-703	4
1079	4580	150	122	71	chr3	64867803	64868402	-94731381	+	RLTR25B	LTR	ERVK	326	1027	-1	4
1079	2779	67	6	0	chr3	64869931	64870275	-94729508	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	4
1079	2906	142	52	10	chr3	64871194	64871267	-94728516	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	448	4
1079	2906	142	52	10	chr3	64871303	64871727	-94728056	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-81	447	11	4
1079	658	328	69	16	chr3	64873788	64874033	-94725750	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	258	-310	4
1079	297	261	100	14	chr3	64874043	64874113	-94725670	+	RLTR20D	LTR	ERVK	480	555	-23	4
1079	591	380	65	24	chr3	64874295	64874665	-94725118	-	LTR16C	LTR	ERVL	-37	452	68	4
1079	396	311	125	58	chr3	64879023	64879383	-94720400	-	MLT1H	LTR	MaLR	-5	484	138	4
1080	4361	121	17	65	chr3	64883795	64884627	-94715156	+	RMER17D2	LTR	ERVK	18	809	0	4
1080	1945	81	56	66	chr3	64885134	64885439	-94714344	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	26	4
1080	911	163	24	6	chr3	64887566	64887733	-94712050	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	170	-176	4
1080	3365	146	11	16	chr3	64887732	64888288	-94711495	+	RLTR1D	LTR	ERV1	37	589	-16	4
1080	1303	120	10	0	chr3	64888296	64888488	-94711295	+	ORR1A2	LTR	MaLR	126	319	-8	4
1080	393	314	73	30	chr3	64888772	64889063	-94710720	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	33	4
1080	859	329	60	34	chr3	64889091	64889262	-94710521	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-39	1541	1364	4
1080	859	329	60	34	chr3	64889408	64889474	-94710309	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-217	1363	1300	4
1080	859	329	60	34	chr3	64889501	64889677	-94710106	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-281	1299	1117	4
1080	443	328	114	95	chr3	64889962	64890434	-94709349	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-883	697	217	4
1080	732	292	5	0	chr3	64890585	64890777	-94709006	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1387	193	1	4
1080	527	331	105	63	chr3	64890794	64891126	-94708657	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	3	4
1080	287	419	16	0	chr3	64892053	64892182	-94707601	-	MLT1K	LTR	MaLR	-359	236	106	4
1080	866	298	67	54	chr3	64896812	64897110	-94702673	-	ORR1E	LTR	MaLR	-57	302	1	4
1080	590	312	137	50	chr3	64897631	64898012	-94701771	+	MT2A	LTR	ERVL	15	428	-105	4
1080	1848	287	81	31	chr3	64898268	64898402	-94701381	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-546	1034	892	4
1080	1848	292	91	63	chr3	64898474	64899258	-94700525	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-689	891	3	4
1080	985	302	70	73	chr3	64899291	64899634	-94700149	-	ORR1E	LTR	MaLR	-17	342	1	4
1080	260	250	12	62	chr3	64899915	64899996	-94699787	+	ORR1E	LTR	MaLR	20	96	-263	4
1080	492	302	76	84	chr3	64901886	64902230	-94697553	+	MLT1B	LTR	MaLR	48	388	-2	4
1080	1091	258	96	23	chr3	64909944	64910297	-94689486	-	MLT1B	LTR	MaLR	-10	380	2	5
1080	571	260	47	0	chr3	64916919	64917046	-94682737	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	5
1080	360	265	84	49	chr3	64923554	64923697	-94676086	-	MLT1D	LTR	MaLR	-183	322	175	5
1080	1038	293	55	50	chr3	64924832	64925234	-94674549	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	5
1080	1729	197	60	22	chr3	64935617	64935981	-94663802	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	5
1080	3341	68	8	0	chr3	64936082	64936479	-94663304	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1080	606	322	103	50	chr3	64937770	64938166	-94661617	+	MLT1D	LTR	MaLR	86	502	-3	5
1080	239	258	204	51	chr3	64940535	64940731	-94659052	-	LTR33	LTR	ERVL	-3	512	287	5
1080	1127	257	89	31	chr3	64946682	64947031	-94652752	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	371	-8	5
1080	507	298	44	29	chr3	64952977	64953181	-94646602	-	RLTR15	LTR	ERVK	-93	266	60	5
1080	526	290	134	45	chr3	64954569	64954850	-94644933	-	LTR40c	LTR	ERVL	-64	401	92	5
1080	526	290	134	45	chr3	64954929	64954983	-94644800	-	LTR40c	LTR	ERVL	-374	91	37	5
1080	1922	284	160	29	chr3	64961696	64962465	-94637318	-	MTE-int	LTR	MaLR	-660	920	51	5
1080	1032	308	67	17	chr3	64962491	64962851	-94636932	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	2	5
1080	365	301	64	80	chr3	64964954	64965142	-94634641	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	195	5
1080	755	161	126	0	chr3	64965173	64965316	-94634467	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	210	5
1080	607	260	126	39	chr3	64969434	64969755	-94630028	+	MTEa	LTR	MaLR	3	369	-10	5
1080	2302	132	5	53	chr3	64971037	64971414	-94628369	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	5
1080	1801	183	12	79	chr3	64973261	64973648	-94626135	+	ORR1B1	LTR	MaLR	31	387	-7	6
1080	980	210	237	0	chr3	64976483	64976740	-94623043	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	53	6
1080	1476	253	97	3	chr3	64980055	64980427	-94619356	+	MTD	LTR	MaLR	3	409	-10	6
1080	647	325	130	44	chr3	64980738	64981211	-94618572	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	5	6
1080	1655	209	59	17	chr3	64985043	64985399	-94614384	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	1	6
1080	290	322	99	29	chr3	64987786	64988029	-94611754	-	LTR48	LTR	ERV1	0	787	528	6
1080	695	247	64	61	chr3	64990378	64990708	-94609075	-	RMER15	LTR	ERVL	-153	422	1	6
1080	278	252	98	105	chr3	64991349	64991482	-94608301	+	MLT1A1	LTR	MaLR	248	379	-29	6
1080	1329	197	97	31	chr3	65002776	65003127	-94596656	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1080	1850	184	68	100	chr3	65003130	65003176	-94596607	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	488	6
1080	1850	184	68	100	chr3	65003245	65003728	-94596055	-	MT2A	LTR	ERVL	-46	487	21	6
1080	2106	149	67	3	chr3	65006105	65006448	-94593335	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	367	0	1
1081	1897	125	85	7	chr3	65014447	65014752	-94585031	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
1081	1182	235	97	29	chr3	65015963	65016313	-94583470	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1081	261	139	233	14	chr3	65029965	65030038	-94569745	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-38	332	244	4
1081	386	227	0	22	chr3	65030291	65030381	-94569402	-	MTD	LTR	MaLR	-106	313	226	4
1081	747	270	61	13	chr3	65030926	65031155	-94568628	-	MTD	LTR	MaLR	-179	240	1	4
1081	3246	125	17	58	chr3	65033988	65034589	-94565194	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	576	-9	5
1081	227	360	86	17	chr3	65037946	65038062	-94561721	-	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	-694	374	251	5
1081	337	278	66	46	chr3	65039215	65039366	-94560417	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	229	6
1081	458	289	85	54	chr3	65054123	65054383	-94545400	-	MER21B	LTR	ERV1	-125	738	471	8
1081	513	265	239	15	chr3	65064445	65064713	-94535070	-	MER57C2	LTR	ERV1	-9	425	98	9
1081	518	254	22	36	chr3	65070928	65071067	-94528716	+	MTE2b	LTR	MaLR	40	176	-203	9
1081	264	242	0	16	chr3	65071120	65071183	-94528600	-	MTEa	LTR	MaLR	-131	248	187	1
1081	564	217	35	0	chr3	65071777	65071892	-94527891	-	MTEa	LTR	MaLR	-247	132	14	1
1081	1147	253	50	50	chr3	65071894	65072252	-94527531	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-11	1569	1212	1
1081	2352	291	77	32	chr3	65072726	65073557	-94526226	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-371	1209	342	1
1081	803	302	44	121	chr3	65073791	65074179	-94525604	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1212	368	11	1
1081	803	288	101	45	chr3	65074188	65074544	-94525239	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	4	1
1081	367	286	20	0	chr3	65078387	65078485	-94521298	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	102	-277	1
1081	665	212	44	9	chr3	65078607	65078764	-94521019	+	MTE2b	LTR	MaLR	198	366	-4	1
1081	1847	150	120	57	chr3	65082956	65083323	-94516460	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	5	1
1081	7883	40	33	8	chr3	65084297	65085231	-94514552	-	RLTR13A2	LTR	ERVK	0	958	1	1
1081	1762	175	45	22	chr3	65086695	65087045	-94512738	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	378	26	1
1081	343	303	149	52	chr3	65089678	65089946	-94509837	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	64	1
1081	271	294	82	25	chr3	65089971	65090093	-94509690	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-384	131	3	1
1081	297	279	108	145	chr3	65094448	65094800	-94504983	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-68	340	2	1
1081	313	353	147	19	chr3	65099361	65099517	-94500266	-	LTR16A	LTR	ERVL	-261	190	15	1
1081	310	339	88	8	chr3	65100221	65100346	-94499437	-	ORR1E	LTR	MaLR	-224	135	1	1
1081	2126	147	15	3	chr3	65109020	65109354	-94490429	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	1
1081	489	90	51	0	chr3	65112429	65112501	-94487282	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	384	309	1
1081	1610	112	95	33	chr3	65112659	65112798	-94486985	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-55	323	165	1
1081	1610	112	95	33	chr3	65112845	65113009	-94486774	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-214	164	2	1
1081	1545	105	106	199	chr3	65117192	65117282	-94482501	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	90	-320	1
1081	1545	105	106	199	chr3	65117339	65117700	-94482083	+	RMER17C	LTR	ERVK	91	410	0	1
1081	4133	39	12	2	chr3	65127234	65127722	-94472061	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1081	442	339	48	66	chr3	65128571	65128843	-94470940	-	ORR1E	LTR	MaLR	-81	278	12	2
1081	2556	296	64	75	chr3	65128839	65129391	-94470392	-	MTE-int	LTR	MaLR	-52	1528	955	2
1081	2556	296	64	75	chr3	65129430	65130092	-94469691	-	MTE-int	LTR	MaLR	-626	954	327	2
1081	301	337	0	56	chr3	65135704	65135811	-94463972	+	LTR78	LTR	ERV1	338	438	-866	2
1081	3001	193	38	39	chr3	65140201	65141015	-94458768	-	RMER13A	LTR	ERVK	-68	840	58	2
1081	262	182	14	108	chr3	65141423	65141497	-94458286	-	ORR1E	LTR	MaLR	-285	74	8	2
1081	1877	281	120	58	chr3	65141479	65142396	-94457387	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-28	1552	579	2
1082	305	314	124	35	chr3	65143669	65143870	-94455913	-	ORR1E	LTR	MaLR	-44	315	97	2
1082	277	227	15	0	chr3	65143910	65143976	-94455807	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-274	134	68	2
1082	789	269	61	41	chr3	65145111	65145406	-94454377	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	275	2
1082	3450	35	2	0	chr3	65145960	65146355	-94453428	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1082	3241	53	13	2	chr3	65147290	65147686	-94452097	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1082	636	302	118	25	chr3	65148305	65148628	-94451155	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	2
1082	670	228	0	7	chr3	65149076	65149222	-94450561	-	MTD	LTR	MaLR	-263	156	12	2
1082	1538	199	114	26	chr3	65149475	65149854	-94449929	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	2
1082	2695	55	3	0	chr3	65174142	65174467	-94425316	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	2	2
1082	3119	142	88	20	chr3	65205325	65205871	-94393912	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	3	3
1082	777	263	142	59	chr3	65209707	65210079	-94389704	+	MLT2B2	LTR	ERVL	98	500	-15	3
1082	1826	150	44	57	chr3	65211769	65212152	-94387631	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	3
1082	4269	164	11	30	chr3	65212190	65212999	-94386784	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	794	-114	3
1082	337	82	0	0	chr3	65215183	65215232	-94384551	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	336	3
1082	4348	158	53	36	chr3	65215239	65216119	-94383664	-	RMER19B	LTR	ERVK	-7	895	1	3
1082	1828	128	75	3	chr3	65216440	65216760	-94383023	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-41	343	1	3
1082	1696	197	8	56	chr3	65217301	65217678	-94382105	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	3
1082	2164	155	29	49	chr3	65220546	65220932	-94378851	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	3
1082	639	136	88	0	chr3	65237085	65237210	-94362573	+	ORR1C2	LTR	MaLR	69	204	-170	3
1082	688	223	62	11	chr3	65238426	65238603	-94361180	+	ORR1C2	LTR	MaLR	199	384	0	3
1082	823	260	129	8	chr3	65240590	65240840	-94358943	+	MTD	LTR	MaLR	1	281	-138	3
1082	2204	189	5	5	chr3	65240840	65241259	-94358524	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	3
1082	347	237	93	0	chr3	65241263	65241381	-94358402	+	MTD	LTR	MaLR	279	407	-12	3
1082	270	272	74	0	chr3	65254779	65254860	-94344923	+	ORR1E	LTR	MaLR	20	106	-253	4
1082	285	237	105	0	chr3	65256037	65256113	-94343670	+	LTR53	LTR	ERVL	193	276	-243	4
1082	2507	222	16	31	chr3	65256131	65256749	-94343034	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	2234	2842	0	4
1082	3603	128	141	10	chr3	65256751	65257359	-94342424	+	RLTR17	LTR	ERVK	3	690	-2	4
1082	389	330	70	53	chr3	65257361	65257588	-94342195	+	LTR53	LTR	ERVL	288	518	-1	4
1082	3064	138	158	6	chr3	65258173	65258703	-94341080	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	4
1082	660	212	126	93	chr3	65262250	65262552	-94337231	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	312	-78	4
1082	2093	172	26	8	chr3	65273328	65273710	-94326073	+	MTD	LTR	MaLR	21	409	-10	4
1083	612	238	211	10	chr3	65277177	65277385	-94322398	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	117	4
1083	3391	121	29	0	chr3	65277576	65278089	-94321694	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	4
1083	953	130	21	21	chr3	65278422	65278611	-94321172	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	222	4
1083	479	191	38	0	chr3	65278583	65278688	-94321095	-	RMER17C	LTR	ERVK	-301	109	1	4
1083	3184	53	8	2	chr3	65282494	65282888	-94316895	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1083	1270	232	125	34	chr3	65282920	65283304	-94316479	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
1083	1689	153	204	61	chr3	65286798	65287343	-94312440	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	5	4
1083	3302	119	176	10	chr3	65289050	65289345	-94310438	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	332	-358	4
1083	3302	119	176	10	chr3	65289385	65289681	-94310102	+	RMER6C	LTR	ERVK	333	689	-1	4
1083	366	220	44	32	chr3	65290498	65290618	-94309165	+	MT2A	LTR	ERVL	1	122	-462	5
1083	1796	154	78	6	chr3	65293509	65293843	-94305940	-	MTC	LTR	MaLR	-63	358	1	5
1083	765	272	81	69	chr3	65295299	65295705	-94304078	+	RMER5	LTR	ERV1	114	524	-10	5
1083	1266	191	4	13	chr3	65296517	65296756	-94303027	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	185	5
1083	776	119	90	0	chr3	65297053	65297187	-94302596	-	MTC	LTR	MaLR	-269	152	7	5
1083	1981	139	36	61	chr3	65299819	65300211	-94299572	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	13	5
1083	626	336	58	31	chr3	65302510	65302734	-94297049	+	MLT1I	LTR	MaLR	147	376	-35	5
1083	923	258	98	69	chr3	65303749	65303868	-94295915	+	ORR1D2	LTR	MaLR	15	116	-254	5
1083	2333	108	3	6	chr3	65303868	65304193	-94295590	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	4	5
1083	923	258	98	69	chr3	65304193	65304419	-94295364	+	ORR1D2	LTR	MaLR	117	370	0	5
1083	827	247	234	35	chr3	65313243	65313711	-94286072	+	MT2A	LTR	ERVL	3	513	-88	5
1083	317	104	12	7	chr3	65313845	65313926	-94285857	+	MT2A	LTR	ERVL	467	555	0	5
1083	354	165	25	12	chr3	65318030	65318110	-94281673	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	81	-289	5
1083	1320	187	170	27	chr3	65321876	65322206	-94277577	+	RMER15	LTR	ERVL	194	570	-5	5
1083	3404	33	5	0	chr3	65323237	65323631	-94276152	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1083	9339	35	5	0	chr3	65323631	65324724	-94275059	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
1083	3492	35	0	0	chr3	65324724	65325120	-94274663	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1083	263	292	48	102	chr3	65328822	65329009	-94270774	-	MLT1J	LTR	MaLR	-109	403	227	5
1083	276	270	0	0	chr3	65330273	65330336	-94269447	+	MLT1G3	LTR	MaLR	69	131	-358	5
1083	376	341	81	75	chr3	65330360	65330471	-94269312	+	MLT1G3	LTR	MaLR	223	327	-268	5
1083	376	341	81	75	chr3	65330619	65330878	-94268905	+	MLT1G3	LTR	MaLR	328	594	-1	5
1083	919	221	64	30	chr3	65353947	65354180	-94245603	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	139	6
1083	261	257	95	1	chr3	65361822	65361911	-94237872	+	MLT1D	LTR	MaLR	6	106	-399	6
1083	310	316	56	107	chr3	65363800	65364052	-94235731	-	ORR1E	LTR	MaLR	-80	314	76	6
1083	307	333	79	14	chr3	65374345	65374485	-94225298	+	MLT1F	LTR	MaLR	374	522	-26	6
1083	5027	151	37	5	chr3	65377451	65378285	-94221498	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	195	1055	-4205	6
1083	2402	65	3	50	chr3	65378289	65378627	-94221156	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-5	322	1	6
1083	3078	160	94	48	chr3	65378627	65379139	-94220644	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	1412	6
1083	2986	52	102	3	chr3	65379139	65379503	-94220280	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
1083	3078	150	100	44	chr3	65379503	65379740	-94220043	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-552	1411	1215	6
1083	1760	117	0	0	chr3	65379740	65379979	-94219804	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	5022	5260	0	6
1083	2387	151	31	118	chr3	65379979	65380029	-94219754	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	47	-419	6
1083	2387	151	31	118	chr3	65380207	65380666	-94219117	+	RMER4A	LTR	ERVK	48	466	0	6
1083	2313	240	52	92	chr3	65380844	65381912	-94217871	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	908	1	6
1083	2577	80	6	50	chr3	65387459	65387801	-94211982	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1083	248	194	29	43	chr3	65394044	65394114	-94205669	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	339	6
1083	230	383	23	23	chr3	65394161	65394292	-94205491	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-181	193	63	6
1083	628	217	196	22	chr3	65397834	65398142	-94201641	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-1	364	3	6
1083	1534	159	97	56	chr3	65398235	65398627	-94201156	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	3	6
1083	393	214	66	28	chr3	65399868	65399974	-94199809	+	MLT1A1	LTR	MaLR	299	408	0	6
1083	2371	70	33	51	chr3	65400361	65400694	-94199089	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1083	2333	92	21	0	chr3	65403816	65404151	-94195632	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	53	7
135	1508	176	55	7	chr3	65404677	65404969	-94194814	+	MTD	LTR	MaLR	12	317	-102	7
1084	267	310	49	31	chr3	65416170	65416333	-94183450	-	LTR50	LTR	ERVL	-155	640	475	7
1084	303	209	21	95	chr3	65420946	65421041	-94178742	+	MT2B	LTR	ERVL	152	239	-362	7
1084	1816	161	55	25	chr3	65421972	65422334	-94177449	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	374	0	7
1084	403	331	24	6	chr3	65423885	65424052	-94175731	+	MLT1A0	LTR	MaLR	2	171	-194	7
1084	2921	55	55	0	chr3	65426077	65426456	-94173327	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1084	446	335	35	12	chr3	65426479	65426648	-94173135	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-73	481	309	7
1084	960	253	214	3	chr3	65443781	65444094	-94155689	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	7
1084	2409	95	13	33	chr3	65447128	65447520	-94152263	+	RLTR11B	LTR	ERVK	70	453	0	7
1084	1073	236	266	17	chr3	65447607	65447900	-94151883	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	7
1084	2003	137	44	63	chr3	65449322	65449735	-94150048	+	RMER15	LTR	ERVL	2	406	-169	7
1084	639	147	205	14	chr3	65450898	65451083	-94148700	+	RMER21A	LTR	ERV1	299	611	-336	7
1084	605	255	39	29	chr3	65454022	65454322	-94145461	+	MLT1A0	LTR	MaLR	18	408	0	7
1084	1298	179	120	7	chr3	65456523	65456799	-94142984	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	66	8
1084	260	310	96	72	chr3	65457273	65457398	-94142385	-	LTR79	LTR	ERVL	-329	198	71	8
1084	445	55	0	0	chr3	65474931	65474986	-94124797	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-352	55	1	8
1084	1695	65	0	0	chr3	65478706	65478921	-94120862	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	182	8
1084	3169	52	26	7	chr3	65478892	65479322	-94120461	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	-1354	438	1	8
1084	3263	26	0	0	chr3	65479322	65479668	-94120115	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	8
1084	1593	210	65	8	chr3	65490651	65491007	-94108776	+	MTD	LTR	MaLR	43	418	-1	8
1084	1843	163	139	5	chr3	65493845	65494234	-94105549	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	2	8
1084	468	301	160	10	chr3	65494840	65495188	-94104595	+	MLT2B3	LTR	ERVL	8	407	-113	8
1084	295	94	38	0	chr3	65495422	65495475	-94104308	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	325	8
1084	997	283	9	17	chr3	65495508	65495738	-94104045	-	MTE2a	LTR	MaLR	-126	253	26	8
1084	1860	198	91	0	chr3	65497384	65497723	-94102060	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	8
1084	1178	230	158	3	chr3	65498441	65498751	-94101032	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	17	8
1084	1824	122	122	0	chr3	65498751	65499062	-94100721	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	349	-371	8
1084	1999	178	52	0	chr3	65499380	65499763	-94100020	+	RMER6D	LTR	ERVK	312	714	-6	8
1084	1690	206	84	16	chr3	65501846	65502226	-94097557	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	1	3
1084	3122	50	5	17	chr3	65504574	65504977	-94094806	+	MTB	LTR	MaLR	3	400	0	7
1084	1045	142	71	0	chr3	65510743	65510940	-94088843	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	174	1
1084	707	196	50	127	chr3	65510964	65511232	-94088551	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-119	265	1	1
1084	792	249	127	0	chr3	65516542	65516779	-94083004	+	MLT1A0	LTR	MaLR	99	365	0	3
1084	323	287	190	63	chr3	65519476	65519807	-94079976	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	373	-35	3
1084	514	345	152	76	chr3	65519855	65520653	-94079130	+	MLT-int	LTR	MaLR	74	931	-804	3
1084	260	323	93	53	chr3	65520774	65520995	-94078788	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-114	245	11	3
1084	392	318	8	8	chr3	65521135	65521265	-94078518	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	137	-222	3
1084	651	305	117	94	chr3	65521390	65521927	-94077856	+	MLT-int	LTR	MaLR	1023	1545	-190	3
1084	788	274	41	16	chr3	65528280	65528525	-94071258	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	115	5
1084	415	218	127	5	chr3	65534626	65534780	-94065003	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	249	6
1084	466	273	39	0	chr3	65534788	65534916	-94064867	+	RMER15	LTR	ERVL	443	575	0	6
1085	1594	208	58	15	chr3	65539315	65539715	-94060068	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	7
1085	229	266	50	60	chr3	65542384	65542484	-94057299	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-488	540	442	8
1085	327	217	0	0	chr3	65547431	65547491	-94052292	-	MTE-int	LTR	MaLR	-125	1455	1396	9
1085	423	252	16	102	chr3	65547476	65547530	-94052253	+	MTE2a	LTR	MaLR	263	318	-61	9
1085	423	252	16	102	chr3	65547690	65547762	-94052021	+	MTE2a	LTR	MaLR	319	378	-1	9
1085	570	244	279	41	chr3	65547764	65548080	-94051703	-	MTE-int	LTR	MaLR	-808	772	382	9
1085	528	321	135	27	chr3	65548083	65548342	-94051441	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	275	9
1085	441	233	62	89	chr3	65553505	65553651	-94046132	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-49	513	372	1
1085	1970	144	30	15	chr3	65559401	65559739	-94040044	+	ORR1B1	LTR	MaLR	7	349	-45	1
1085	329	106	0	0	chr3	65566118	65566165	-94033618	+	ORR1B1	LTR	MaLR	340	386	-8	1
1085	2310	144	73	5	chr3	65566328	65566675	-94033108	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	27	1
1085	2310	144	73	5	chr3	65566711	65566732	-94033051	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-368	26	2	1
1085	979	248	98	40	chr3	65576487	65576576	-94023207	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	446	1
1085	979	248	98	40	chr3	65576604	65576841	-94022942	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-89	445	191	1
1085	839	204	20	82	chr3	65580562	65580806	-94018977	-	MT2B	LTR	ERVL	-131	470	238	1
1085	570	167	64	24	chr3	65580803	65580935	-94018848	-	MT2B	LTR	ERVL	-471	130	5	1
1085	663	170	51	32	chr3	65580945	65581103	-94018680	-	RMER15	LTR	ERVL	-382	193	33	1
1085	246	259	17	0	chr3	65581127	65581185	-94018598	-	RMER15	LTR	ERVL	-516	59	1	1
1085	1673	174	84	56	chr3	65583145	65583504	-94016279	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	2	1
1085	320	192	54	14	chr3	65583845	65583919	-94015864	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	77	-297	1
1085	1681	172	144	0	chr3	65584240	65584588	-94015195	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	18	1
1085	364	212	230	33	chr3	65585529	65585705	-94014078	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	161	1
1085	293	223	403	0	chr3	65585842	65585981	-94013802	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-1	1579	1385	1
1085	1358	284	180	20	chr3	65586002	65587064	-94012719	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-277	1303	1	1
1085	295	291	23	86	chr3	65587080	65587208	-94012575	-	MTE-int	LTR	MaLR	-252	1328	1209	1
1085	1188	282	37	62	chr3	65587215	65587570	-94012213	-	MTEb	LTR	MaLR	-33	346	1	1
1085	243	256	21	43	chr3	65593002	65593096	-94006687	-	MLT1D	LTR	MaLR	-13	492	401	1
1085	1896	141	119	30	chr3	65597150	65597487	-94002296	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	367	1	1
1085	7987	159	59	14	chr3	65597487	65598931	-94000852	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	2	1
1085	2133	148	119	3	chr3	65598931	65599283	-94000500	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1085	336	222	14	14	chr3	65604141	65604214	-93995569	+	MTC	LTR	MaLR	1	73	-348	2
1085	259	274	0	0	chr3	65604240	65604291	-93995492	+	MTC	LTR	MaLR	70	120	-299	2
1085	886	286	9	5	chr3	65605042	65605260	-93994523	+	MTC	LTR	MaLR	189	407	-14	2
1085	1602	195	35	40	chr3	65612612	65612986	-93986797	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	372	-12	2
1085	3303	30	8	8	chr3	65620495	65620891	-93978892	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1085	836	286	110	75	chr3	65626737	65627198	-93972585	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-82	478	11	2
1085	376	245	46	28	chr3	65627227	65627336	-93972447	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-12	358	248	2
1085	303	276	83	74	chr3	65627366	65627703	-93972080	-	RLTR15	LTR	ERVK	-19	340	1	2
1085	849	172	40	110	chr3	65627703	65627931	-93971852	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-133	241	30	2
1085	513	294	28	133	chr3	65660952	65661349	-93938434	-	MLT1B	LTR	MaLR	-35	355	1	2
1086	1465	210	5	133	chr3	65669361	65669491	-93930292	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	248	2
1086	1465	210	5	133	chr3	65669671	65669736	-93930047	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-127	247	223	2
1086	1465	210	5	133	chr3	65669814	65670046	-93929737	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-152	222	1	2
1086	1437	191	60	89	chr3	65670268	65670618	-93929165	-	MTD	LTR	MaLR	-46	373	34	2
1086	430	309	203	9	chr3	65672285	65672497	-93927286	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	308	2
1086	2143	125	18	87	chr3	65678323	65678716	-93921067	+	ORR1B1	LTR	MaLR	29	394	0	3
1086	1902	214	108	45	chr3	65680836	65681292	-93918491	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	470	-93	3
1086	1902	214	108	45	chr3	65681317	65681389	-93918394	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	471	561	-2	3
1086	709	204	77	0	chr3	65686146	65686327	-93913456	+	ORR1D1	LTR	MaLR	180	374	0	3
1086	2280	163	37	7	chr3	65686920	65687329	-93912454	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1086	621	237	177	74	chr3	65690354	65690637	-93909146	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	2	313	-180	3
1086	748	225	179	44	chr3	65691138	65691370	-93908413	+	MT2B2	LTR	ERVL	176	584	0	3
1086	1130	286	92	48	chr3	65691491	65691688	-93908095	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	202	-265	3
1086	1130	268	94	28	chr3	65691810	65692061	-93907722	+	MLT1C	LTR	MaLR	203	453	-14	3
1086	377	218	39	0	chr3	65695993	65696071	-93903712	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	299	3
1086	2498	142	5	0	chr3	65696468	65696842	-93902941	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	3
1086	1005	287	109	3	chr3	65697406	65697700	-93902083	-	MTEa	LTR	MaLR	-54	325	1	3
1086	299	308	37	0	chr3	65703639	65703746	-93896037	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-303	186	76	3
1086	226	342	60	72	chr3	65712560	65712571	-93887212	+	MT2B	LTR	ERVL	153	182	-419	3
1086	226	342	60	72	chr3	65712683	65712727	-93887056	+	MT2B	LTR	ERVL	183	317	-284	3
1086	3254	48	10	5	chr3	65712994	65713388	-93886395	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1086	337	179	0	0	chr3	65715440	65715496	-93884287	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	312	3
1086	1700	184	16	43	chr3	65715960	65716329	-93883454	+	RMER17B	LTR	ERVK	600	958	0	3
1086	325	177	16	31	chr3	65716330	65716394	-93883389	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	2	64	-1664	3
1086	1145	54	14	0	chr3	65716394	65716541	-93883242	-	RMER17B	LTR	ERVK	-809	149	1	3
1086	300	294	35	44	chr3	65716733	65716847	-93882936	+	RLTR26	LTR	ERVK	305	417	-225	3
1086	788	299	22	4	chr3	65717282	65717506	-93882277	+	RLTR11A	LTR	ERVK	221	448	-80	3
1086	336	265	0	24	chr3	65717853	65717938	-93881845	+	RLTR11A	LTR	ERVK	429	511	-17	3
1086	1775	239	54	12	chr3	65717996	65718204	-93881579	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-10	431	211	3
1086	1775	239	54	12	chr3	65718290	65718491	-93881292	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-231	210	5	3
1086	3394	162	15	36	chr3	65720474	65721087	-93878696	-	RMER20B	LTR	ERVK	-24	603	4	3
1086	4949	228	51	26	chr3	65721092	65722211	-93877572	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-2	6917	5771	3
1086	1660	140	92	0	chr3	65722301	65722594	-93877189	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	320	-12	4
1086	440	234	121	36	chr3	65722598	65722776	-93877007	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-348	212	2	4
1086	768	209	52	0	chr3	65722776	65722948	-93876835	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-1903	5016	4836	3
1086	299	138	0	94	chr3	65722987	65723051	-93876732	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-2073	4846	4789	3
1086	3430	38	2	0	chr3	65723644	65724039	-93875744	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1086	1633	189	48	22	chr3	65724932	65725289	-93874494	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	367	-7	4
1086	1005	271	84	3	chr3	65725664	65725997	-93873786	-	MTEb	LTR	MaLR	-13	366	7	4
1086	503	323	164	17	chr3	65727036	65727389	-93872394	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	405	1	4
1086	710	265	26	118	chr3	65730426	65730611	-93869172	+	MTEa	LTR	MaLR	99	261	-118	4
1086	710	265	26	118	chr3	65730740	65730858	-93868925	+	MTEa	LTR	MaLR	262	374	-5	4
1086	2549	143	51	18	chr3	65734998	65735491	-93864292	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	19	4
1086	358	311	94	51	chr3	65743578	65743679	-93856104	+	MER34A1	LTR	ERV1	1	116	-471	4
1086	358	311	94	51	chr3	65743824	65743956	-93855827	+	MER34A1	LTR	ERV1	117	243	-344	4
1086	234	228	99	25	chr3	65744952	65744999	-93854784	+	MTEb	LTR	MaLR	319	371	-8	4
1086	710	142	25	0	chr3	65762723	65762843	-93836940	+	RMER5	LTR	ERV1	401	523	-11	4
1086	943	107	160	6	chr3	65763916	65764085	-93835698	-	RMER15	LTR	ERVL	-8	567	373	4
1086	1693	148	19	91	chr3	65764091	65764455	-93835328	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-130	382	45	4
1086	302	138	17	17	chr3	65764601	65764660	-93835123	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-453	59	1	4
1086	1681	194	43	27	chr3	65767611	65767690	-93832093	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	341	4
1086	3226	53	8	13	chr3	65767690	65768088	-93831695	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1086	1681	194	43	27	chr3	65768088	65768383	-93831400	-	MTC	LTR	MaLR	-81	340	42	4
1086	1529	133	294	25	chr3	65768589	65768950	-93830833	-	RMER6B	LTR	ERVK	-3	458	1	4
1086	1140	153	30	0	chr3	65770341	65770544	-93829239	+	MTC	LTR	MaLR	2	210	-211	5
1086	1852	142	36	12	chr3	65770557	65770893	-93828890	+	ORR1B1	LTR	MaLR	51	394	0	5
1086	1026	150	113	5	chr3	65770893	65771087	-93828696	+	MTC	LTR	MaLR	207	421	0	5
1086	306	194	226	71	chr3	65772074	65772159	-93827624	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	456	5
1086	2129	170	47	5	chr3	65772159	65772561	-93827222	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
1086	306	194	226	71	chr3	65772561	65772630	-93827153	-	RMER5	LTR	ERV1	-79	455	356	5
1086	295	287	69	44	chr3	65773132	65773336	-93826447	-	RMER5	LTR	ERV1	-192	342	134	5
1086	2382	148	17	2	chr3	65773330	65773735	-93826048	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	3	5
1086	250	238	37	24	chr3	65773738	65773820	-93825963	+	RMER5	LTR	ERV1	452	534	0	5
1086	408	274	20	0	chr3	65773886	65773988	-93825795	-	RLTR19A	LTR	ERVK	-62	437	334	5
1086	930	211	0	174	chr3	65774034	65774160	-93825623	-	RLTR19A	LTR	ERVK	-165	331	223	5
1086	930	197	0	131	chr3	65774310	65774523	-93825260	-	RLTR19A	LTR	ERVK	-274	222	4	5
1086	2324	176	32	30	chr3	65775397	65775890	-93823893	+	RLTR19A	LTR	ERVK	1	494	-2	5
1086	719	215	149	17	chr3	65776407	65776582	-93823201	+	RLTR42	LTR	ERVK	1	198	-41	5
1086	1471	138	87	75	chr3	65776936	65777281	-93822502	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3270	3618	-1904	5
1086	3566	35	28	9	chr3	65783877	65784305	-93815478	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	5
1086	335	316	99	6	chr3	65784469	65784641	-93815142	-	MLT1C	LTR	MaLR	-270	197	10	5
1086	1286	206	62	156	chr3	65785664	65785818	-93813965	+	MTD	LTR	MaLR	14	110	-309	5
1086	1286	206	62	156	chr3	65785965	65786160	-93813623	+	MTD	LTR	MaLR	111	314	-105	5
1086	2145	84	43	10	chr3	65786160	65786459	-93813324	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	5
1086	1286	206	62	156	chr3	65786459	65786556	-93813227	+	MTD	LTR	MaLR	315	419	0	5
1086	4170	84	11	21	chr3	65786744	65787316	-93812467	+	RMER2	LTR	ERV1	1	566	-1	5
1086	3950	129	47	91	chr3	65787510	65787594	-93812189	-	RMER6A	LTR	ERVK	-1	755	680	5
1086	3950	129	47	91	chr3	65787618	65788323	-93811460	-	RMER6A	LTR	ERVK	-77	679	1	5
1086	1036	177	129	0	chr3	65790235	65790467	-93809316	+	RMER6C	LTR	ERVK	12	273	-417	5
1086	637	89	196	0	chr3	65790463	65790575	-93809208	+	RMER6C	LTR	ERVK	557	690	0	5
1087	3949	89	41	11	chr3	65800718	65801028	-93798755	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	311	-367	5
1087	2288	108	12	12	chr3	65801028	65801355	-93798428	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1087	3949	89	41	11	chr3	65801355	65801654	-93798129	+	RLTR33	LTR	ERVK	312	628	-50	5
1087	963	237	83	32	chr3	65801662	65802013	-93797770	+	RLTR26	LTR	ERVK	5	409	-233	5
1087	306	111	0	53	chr3	65803079	65803136	-93796647	+	RLTR33	LTR	ERVK	625	678	0	5
1087	3459	35	0	0	chr3	65805495	65805891	-93793892	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1087	9382	33	3	0	chr3	65805891	65806986	-93792797	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
1087	3401	38	5	0	chr3	65806986	65807380	-93792403	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1087	2060	201	47	5	chr3	65810864	65811268	-93788515	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1087	1507	236	88	40	chr3	65814637	65814748	-93785035	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	563	468	6
1087	1507	223	104	24	chr3	65814785	65815225	-93784558	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-107	470	1	6
1087	320	202	180	0	chr3	65815840	65815929	-93783854	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	105	-269	6
1087	1061	194	69	25	chr3	65816180	65816455	-93783328	+	ORR1C2	LTR	MaLR	98	384	0	6
1087	826	209	104	9	chr3	65818933	65819145	-93780638	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	143	6
1087	2809	15	95	0	chr3	65819328	65819654	-93780129	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	6
1087	1290	233	116	18	chr3	65821026	65821363	-93778420	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
1087	961	282	84	67	chr3	65823368	65823819	-93775964	+	MLT2B3	LTR	ERVL	193	671	-46	6
1087	2257	178	27	7	chr3	65823964	65824377	-93775406	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
1087	724	233	27	38	chr3	65827888	65828134	-93771649	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-140	227	1	6
1087	260	339	94	135	chr3	65829840	65830106	-93769677	+	ORR1E	LTR	MaLR	82	336	-23	6
1087	1635	129	65	27	chr3	65830136	65830342	-93769441	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	181	6
1087	1635	179	58	62	chr3	65830402	65830603	-93769180	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-198	196	3	6
1087	4798	145	53	14	chr3	65838075	65838928	-93760855	-	RMER19B	LTR	ERVK	-16	886	1	6
1087	1824	121	43	92	chr3	65852763	65853109	-93746674	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1087	2738	80	3	8	chr3	65855398	65855789	-93743994	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	389	-7	6
1087	1795	197	21	32	chr3	65857429	65857806	-93741977	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	1	6
1087	341	284	104	20	chr3	65858792	65858993	-93740790	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-19	635	418	6
1087	272	295	138	41	chr3	65859150	65859295	-93740488	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-396	164	6	6
1087	1003	267	41	55	chr3	65859662	65860007	-93739776	+	ORR1E	LTR	MaLR	20	359	0	6
1087	758	216	89	0	chr3	65864173	65864363	-93735420	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	207	-308	6
1087	1063	242	181	3	chr3	65866116	65866467	-93733316	-	MTD	LTR	MaLR	-21	398	1	6
1087	231	258	31	31	chr3	65869437	65869533	-93730250	-	LTR33	LTR	ERVL	-9	506	411	7
1087	249	265	56	56	chr3	65874150	65874294	-93725489	+	RMER15	LTR	ERVL	2	145	-430	7
1087	396	252	126	26	chr3	65874343	65874494	-93725289	+	RMER15	LTR	ERVL	276	441	-134	7
1087	2452	97	18	33	chr3	65888359	65888691	-93711092	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1087	10212	132	85	35	chr3	65888691	65889593	-93710190	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1792	908	7
1087	10212	132	85	35	chr3	65889782	65890586	-93709197	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-885	907	1	7
1087	2375	95	36	60	chr3	65890586	65890921	-93708862	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1087	1321	260	67	28	chr3	65892870	65893296	-93706487	+	RLTR20C	LTR	ERVK	77	518	-16	7
1087	227	147	0	0	chr3	65894949	65894983	-93704800	+	MLT1E1	LTR	MaLR	305	338	-316	7
1087	251	222	47	151	chr3	65896688	65896794	-93702989	-	MT2B2	LTR	ERVL	-328	256	162	7
1087	457	306	47	24	chr3	65898255	65898466	-93701317	+	RMER15	LTR	ERVL	343	558	-17	7
1087	2053	164	69	3	chr3	65906922	65907271	-93692512	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	7
1087	2707	186	24	57	chr3	65910887	65911434	-93688349	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	529	0	7
1087	717	187	0	29	chr3	65913302	65913440	-93686343	+	MTD	LTR	MaLR	60	193	-226	7
1087	967	243	27	5	chr3	65913666	65913885	-93685898	+	MTD	LTR	MaLR	196	419	0	7
1087	2223	97	3	59	chr3	65915075	65915415	-93684368	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	7
1087	1298	286	20	3	chr3	65918877	65919221	-93680562	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	353	-6	7
1087	946	160	206	20	chr3	65919880	65919905	-93679878	+	ORR1D1	LTR	MaLR	133	157	-217	7
1087	946	160	206	20	chr3	65919973	65920151	-93679632	+	ORR1D1	LTR	MaLR	158	373	-1	7
1087	429	333	71	88	chr3	65923310	65923605	-93676178	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-25	383	89	7
1087	429	333	71	88	chr3	65924215	65924284	-93675499	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-320	88	27	7
1088	917	283	196	14	chr3	65931601	65931999	-93667784	-	MTE-int	LTR	MaLR	-896	474	38	8
1088	352	260	81	117	chr3	65932002	65932200	-93667583	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	187	8
1088	265	246	29	6	chr3	65932213	65932293	-93667490	+	MTEb	LTR	MaLR	7	85	-294	8
1088	1156	233	72	8	chr3	65933711	65933975	-93665808	+	MTEb	LTR	MaLR	96	376	-3	8
1088	343	298	22	58	chr3	65933982	65934121	-93665662	-	MTEa	LTR	MaLR	-222	137	4	8
1088	854	251	64	148	chr3	65942436	65942829	-93656954	+	MTC	LTR	MaLR	1	360	-61	8
1088	2071	150	112	53	chr3	65951334	65951728	-93648055	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	5	8
1088	2384	227	125	63	chr3	65953690	65954673	-93645110	+	RMER17B	LTR	ERVK	3	899	-9	8
1088	1875	198	110	3	chr3	65955877	65956251	-93643532	+	MTD	LTR	MaLR	3	416	-3	8
1088	988	265	105	10	chr3	65968344	65968638	-93631145	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	32	8
1088	567	282	177	0	chr3	65979434	65979643	-93620140	-	ORR1E	LTR	MaLR	-14	345	100	8
1088	19615	167	30	16	chr3	65979643	65982953	-93616830	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-425	5336	1979	8
1088	2115	181	2	46	chr3	65982973	65983367	-93616416	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	379	-3	8
1088	10485	161	62	22	chr3	65983368	65984459	-93615324	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3779	1982	832	8
1088	10485	161	62	22	chr3	65984630	65985436	-93614347	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4930	831	10	8
1088	631	282	17	153	chr3	65985443	65985895	-93613888	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	123	8
1088	579	185	93	0	chr3	65986176	65986284	-93613499	-	MT2B	LTR	ERVL	-415	118	1	8
1088	348	247	26	0	chr3	65986284	65986343	-93613440	-	ORR1E	LTR	MaLR	-298	61	1	8
1088	276	347	88	74	chr3	65988139	65988435	-93611348	-	ORR1E	LTR	MaLR	-57	302	3	8
1088	296	280	0	0	chr3	65996673	65996748	-93603035	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	75	-440	8
1088	315	235	12	0	chr3	66000000	66000085	-93599698	+	MLT1A1	LTR	MaLR	307	392	-16	1
1088	1072	255	49	18	chr3	66000069	66000410	-93599373	-	MTE2b	LTR	MaLR	-12	367	22	2
1088	1164	189	62	117	chr3	66001432	66001792	-93597991	+	MT2A	LTR	ERVL	2	468	-133	3
1088	775	247	99	68	chr3	66004429	66004778	-93595005	+	MTD	LTR	MaLR	48	404	-15	6
1088	248	289	78	0	chr3	66007363	66007453	-93592330	+	MLT1J	LTR	MaLR	229	325	-187	8
1088	232	306	16	0	chr3	66014219	66014281	-93585502	-	ORR1E	LTR	MaLR	-269	90	28	2
1088	315	260	94	39	chr3	66016437	66016565	-93583218	+	MLT1D	LTR	MaLR	113	247	-258	2
1088	322	235	23	34	chr3	66016591	66016679	-93583104	+	MLT1D	LTR	MaLR	302	388	-117	2
1088	349	354	72	19	chr3	66051461	66051726	-93548057	+	MLT1J	LTR	MaLR	44	322	-190	5
1088	257	197	88	112	chr3	66055008	66055088	-93544695	-	MT2B	LTR	ERVL	-365	236	159	6
1089	1383	237	14	166	chr3	66064774	66064868	-93534915	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	285	8
1089	1383	237	14	166	chr3	66065007	66065357	-93534426	-	MTE2b	LTR	MaLR	-95	284	3	8
1089	3487	55	2	0	chr3	66069554	66069953	-93529830	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	8
1089	588	208	8	24	chr3	66072552	66072675	-93527108	+	MT2A	LTR	ERVL	1	121	-412	8
1089	230	309	13	57	chr3	66072711	66072798	-93526985	+	MT2A	LTR	ERVL	100	180	-353	8
1089	342	267	80	99	chr3	66079039	66079251	-93520532	+	MT2A	LTR	ERVL	321	528	-56	8
1089	240	150	0	0	chr3	66085579	66085619	-93514164	+	MT2A	LTR	ERVL	544	583	-1	8
1089	1471	251	10	10	chr3	66094174	66094495	-93505288	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	313	-57	1
1089	454	314	109	15	chr3	66103451	66103684	-93496099	+	MLT1E2	LTR	MaLR	294	533	-121	1
1089	3391	60	2	12	chr3	66110086	66110490	-93489293	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1089	738	251	79	18	chr3	66114223	66114450	-93485333	+	ORR1D2	LTR	MaLR	126	366	-4	1
1089	2388	89	76	33	chr3	66115512	66115906	-93483877	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	1
1089	432	132	77	185	chr3	66115907	66116037	-93483746	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	124	-6357	1
1089	230	273	0	0	chr3	66116037	66116081	-93483702	+	RLTR27	LTR	ERVK	232	275	-34	1
1089	225	321	0	0	chr3	66116109	66116162	-93483621	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	1
1089	3264	58	22	16	chr3	66116162	66116728	-93483055	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	1
1089	2159	58	0	0	chr3	66116728	66117006	-93482777	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	1
1089	5634	50	5	12	chr3	66117005	66117754	-93482029	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6479	-2	1
1089	2378	92	76	33	chr3	66117756	66118150	-93481633	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	1
1089	2102	163	24	16	chr3	66118567	66118942	-93480841	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
1089	1170	260	74	20	chr3	66123171	66123524	-93476259	+	MTEa	LTR	MaLR	1	372	-7	1
1089	242	359	185	35	chr3	66123769	66123942	-93475841	+	RMER5	LTR	ERV1	10	208	-326	1
1089	705	289	36	26	chr3	66133509	66133759	-93466024	-	ORR1E	LTR	MaLR	-141	243	1	1
1089	1904	102	19	125	chr3	66133829	66134197	-93465586	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1089	476	346	136	19	chr3	66139749	66140176	-93459607	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-8	587	46	1
1089	2213	166	3	5	chr3	66141971	66142346	-93457437	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1089	415	351	88	56	chr3	66145543	66145863	-93453920	-	MLT1D	LTR	MaLR	-114	391	62	1
1089	1876	204	66	40	chr3	66147550	66148103	-93451680	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	6	1
1089	2743	122	30	0	chr3	66151065	66151491	-93448292	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	3	2
1089	6759	162	52	9	chr3	66151493	66152896	-93446887	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	863	2
1089	1437	188	147	6	chr3	66166319	66166491	-93433292	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	171	2
1089	1437	188	147	6	chr3	66166551	66166705	-93433078	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-204	170	2	2
1089	567	315	88	55	chr3	66166922	66167265	-93432518	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	355	-4	2
1089	1073	270	42	26	chr3	66168119	66168431	-93431352	+	ORR1E	LTR	MaLR	43	359	0	2
1089	534	277	152	69	chr3	66183632	66183935	-93415848	+	MLT1B	LTR	MaLR	61	388	-2	2
1089	858	254	39	109	chr3	66184254	66184679	-93415104	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	405	1	2
1089	307	333	109	15	chr3	66185952	66186153	-93413630	-	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	0	803	584	2
1090	1422	262	28	3	chr3	66191914	66192266	-93407517	+	MT2A	LTR	ERVL	1	361	-172	2
1090	278	134	0	0	chr3	66192284	66192361	-93407422	+	MT2A	LTR	ERVL	468	551	-4	2
1090	2008	94	32	19	chr3	66193853	66194168	-93405615	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	2
1090	9440	154	46	11	chr3	66194172	66196010	-93403773	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1902	-61	2
1090	1581	217	51	8	chr3	66205833	66206186	-93393597	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	1	2
1090	606	203	8	16	chr3	66207852	66207977	-93391806	+	MTD	LTR	MaLR	1	124	-295	2
1090	326	182	112	11	chr3	66207973	66208062	-93391721	+	MTD	LTR	MaLR	320	417	-2	2
1090	309	300	18	0	chr3	66210795	66210905	-93388878	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	296	2
1090	694	292	107	34	chr3	66211127	66211453	-93388330	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	5	2
1090	583	331	101	28	chr3	66220009	66220435	-93379348	+	MLT1C	LTR	MaLR	8	464	-3	2
1090	3382	46	73	52	chr3	66221544	66222007	-93377776	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	3	475	0	3
1090	818	270	87	84	chr3	66223506	66223770	-93376013	+	MTD	LTR	MaLR	13	274	-126	3
1090	784	266	73	74	chr3	66227784	66228134	-93371649	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	369	-5	3
1090	251	258	48	90	chr3	66228757	66228902	-93370881	+	MLT1A0	LTR	MaLR	227	365	0	3
1090	244	323	19	94	chr3	66240081	66240103	-93359680	+	MT2B	LTR	ERVL	143	156	-445	3
1090	684	277	150	91	chr3	66240530	66240871	-93358912	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	19	3
1090	467	262	85	43	chr3	66243902	66244129	-93355654	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	384	157	3
1090	945	284	17	17	chr3	66244439	66244675	-93355108	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-134	236	1	3
1090	4577	8	0	57	chr3	66254408	66254931	-93344852	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	3
1090	322	0	0	0	chr3	66254931	66254969	-93344814	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	3
1090	390	167	46	35	chr3	66254969	66255056	-93344727	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	3
1090	48406	16	0	7	chr3	66255056	66260453	-93339330	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	3
1090	4707	10	0	12	chr3	66260453	66260952	-93338831	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	3
1090	723	312	94	25	chr3	66266037	66266323	-93333460	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	60	3
1090	509	322	58	31	chr3	66267342	66267677	-93332106	-	MER57E1	LTR	ERV1	-9	402	20	3
1090	320	284	10	19	chr3	66268350	66268454	-93331329	+	MLT1C	LTR	MaLR	39	141	-326	3
1090	254	353	12	12	chr3	66268561	66268647	-93331136	+	MLT1C	LTR	MaLR	293	378	-12	3
1090	528	221	126	155	chr3	66273059	66273108	-93326675	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	49	-562	3
1090	528	229	124	148	chr3	66273472	66273724	-93326059	+	RMER19C	LTR	ERVK	50	287	-450	3
1090	380	315	266	9	chr3	66275203	66275541	-93324242	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	488	-66	3
1090	411	305	313	0	chr3	66276581	66276869	-93322914	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	3
1090	993	297	52	19	chr3	66276871	66277235	-93322548	-	RMER5	LTR	ERV1	-81	453	78	3
1090	278	372	94	19	chr3	66286127	66286286	-93313497	+	MLT1J	LTR	MaLR	114	284	-228	3
1090	401	328	20	65	chr3	66303098	66303297	-93296486	+	MLT1J1	LTR	MaLR	21	210	-234	4
1090	749	350	78	49	chr3	66307435	66307907	-93291876	+	MLT1F2	LTR	MaLR	73	558	-2	4
1090	1321	197	109	47	chr3	66316907	66317227	-93282556	-	RMER15	LTR	ERVL	-235	340	1	4
1090	823	243	73	9	chr3	66318394	66318614	-93281169	+	MLT1D	LTR	MaLR	270	503	-2	4
1091	1272	179	151	21	chr3	66327538	66327817	-93271966	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	315	-52	4
1091	231	388	0	10	chr3	66328762	66328866	-93270917	-	RMER12	LTR	ERVK	-471	851	749	4
1091	417	223	25	74	chr3	66335625	66335746	-93264037	-	RMER15	LTR	ERVL	-29	546	432	4
1091	554	224	47	53	chr3	66335774	66335944	-93263839	-	RMER15	LTR	ERVL	-355	220	52	4
1091	289	374	102	73	chr3	66336696	66336941	-93262842	+	LTR16A1	LTR	ERVL	48	299	-157	4
1091	610	335	91	54	chr3	66336947	66337297	-93262486	+	LTR40a	LTR	ERVL	19	381	-138	4
1091	1581	211	63	48	chr3	66338611	66339010	-93260773	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	4
1091	560	281	97	88	chr3	66345761	66346069	-93253714	+	MTEa	LTR	MaLR	55	365	-14	4
1091	1306	307	53	55	chr3	66348362	66348925	-93250858	+	MLT1E2	LTR	MaLR	69	627	0	4
1091	410	328	45	85	chr3	66350254	66350454	-93249329	+	MLT2C1	LTR	ERVL	199	390	-7	4
1091	374	276	0	10	chr3	66363587	66363686	-93236097	+	MTEb	LTR	MaLR	3	100	-259	5
1091	512	237	77	28	chr3	66363747	66363890	-93235893	+	MTEb	LTR	MaLR	230	379	0	5
1091	621	315	66	91	chr3	66369454	66369817	-93229966	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	6	5
1091	3926	280	67	77	chr3	66369796	66370744	-93229039	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-27	1553	579	5
1091	3926	280	67	77	chr3	66370898	66371176	-93228607	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1002	578	345	5
1091	3926	280	67	77	chr3	66371252	66371446	-93228337	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1236	344	147	5
1091	318	257	43	0	chr3	66371450	66371520	-93228263	-	ORR1E	LTR	MaLR	-278	81	9	5
1091	307	282	162	0	chr3	66375491	66375608	-93224175	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	367	5
1091	348	259	42	56	chr3	66376080	66376223	-93223560	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	408	268	5
1091	444	289	0	72	chr3	66376462	66376615	-93223168	-	MLT1A	LTR	MaLR	-211	163	22	5
1091	721	269	120	5	chr3	66383640	66383857	-93215926	-	MLT1C	LTR	MaLR	-1	466	225	5
1091	234	247	71	36	chr3	66384089	66384173	-93215610	-	MLT1C	LTR	MaLR	-336	169	83	5
1091	2383	65	17	111	chr3	66391655	66392016	-93207767	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1091	2705	112	19	80	chr3	66393492	66393966	-93205817	+	BGLII_A	LTR	ERVK	1	445	0	5
1091	607	278	0	19	chr3	66394621	66394775	-93205008	+	RMER15	LTR	ERVL	359	509	-66	5
1091	400	339	78	74	chr3	66411159	66411417	-93188366	+	MLT2B3	LTR	ERVL	280	538	-16	5
1091	925	254	81	19	chr3	66411664	66411774	-93188009	+	MTE2a	LTR	MaLR	80	195	-184	5
1091	925	254	81	19	chr3	66411818	66411968	-93187815	+	MTE2a	LTR	MaLR	196	355	-24	5
1091	3252	80	2	2	chr3	66420176	66420576	-93179207	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
1091	2609	141	83	15	chr3	66420847	66421315	-93178468	+	RLTR16	LTR	ERVK	6	505	0	6
1091	881	166	160	0	chr3	66426930	66427105	-93172678	-	RMER15	LTR	ERVL	-106	469	267	6
1091	1760	188	92	16	chr3	66428944	66429312	-93170471	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	26	6
1091	688	251	78	133	chr3	66440218	66440617	-93159166	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	379	0	6
1091	503	303	89	13	chr3	66450299	66450523	-93149260	+	RMER15	LTR	ERVL	299	539	-36	6
1091	916	278	81	64	chr3	66451332	66451509	-93148274	+	ORR1D2	LTR	MaLR	6	185	-185	6
1091	916	278	81	64	chr3	66451565	66451744	-93148039	+	ORR1D2	LTR	MaLR	186	368	-2	6
1091	2245	180	37	5	chr3	66452712	66453120	-93146663	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1092	292	185	0	0	chr3	66459257	66459311	-93140472	+	MER31A	LTR	ERV1	5	58	-408	6
1092	664	291	92	18	chr3	66459356	66459639	-93140144	+	MER31A	LTR	ERV1	182	485	0	6
1092	532	229	37	50	chr3	66460072	66460233	-93139550	+	RLTR14	LTR	ERV1	224	382	0	6
1092	518	256	274	24	chr3	66472260	66472640	-93127143	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	128	6
1092	3497	25	2	2	chr3	66484279	66484675	-93115108	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1092	1856	165	108	3	chr3	66492267	66492601	-93107182	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	370	-4	6
1092	300	362	122	5	chr3	66503021	66503210	-93096573	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-378	1009	799	4
1092	412	397	81	42	chr3	66517583	66517964	-93081819	+	MLT1N2	LTR	MaLR	62	457	-105	1
1092	1307	238	162	3	chr3	66524324	66524670	-93075113	+	MTD	LTR	MaLR	19	419	0	2
1092	288	286	14	0	chr3	66525148	66525218	-93074565	-	LTR33B	LTR	ERVL	-3	500	430	2
1092	496	345	68	8	chr3	66525242	66525490	-93074293	-	LTR33B	LTR	ERVL	-148	355	93	2
1092	1750	174	51	3	chr3	66530111	66530446	-93069337	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	351	-43	3
1092	298	98	98	0	chr3	66532639	66532690	-93067093	+	ORR1A4	LTR	MaLR	274	329	0	3
1092	334	356	94	22	chr3	66536256	66536480	-93063303	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-177	402	163	4
1092	282	309	113	65	chr3	66542148	66542488	-93057295	+	MLT1I	LTR	MaLR	50	411	0	5
1092	322	242	67	95	chr3	66544887	66544992	-93054791	+	MLT1J	LTR	MaLR	72	173	-339	6
1092	2049	176	8	8	chr3	66557480	66557847	-93041936	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	7
1092	989	206	169	75	chr3	66563085	66563424	-93036359	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	40	8
1092	764	288	12	33	chr3	66574398	66574639	-93025144	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-1114	236	1	1
1092	3259	40	5	17	chr3	66575728	66576133	-93023650	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1092	244	244	81	11	chr3	66578817	66578904	-93020879	-	LTR40b	LTR	ERVL	-24	438	346	1
1093	2768	101	8	10	chr3	66587893	66588294	-93011489	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1093	695	328	81	46	chr3	66590536	66590907	-93008876	-	LTR40b	LTR	ERVL	0	462	79	1
1093	1561	143	66	38	chr3	66598547	66598867	-93000916	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1093	335	164	0	0	chr3	66598867	66598922	-93000861	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	55	-1454	1
1093	3306	156	87	2	chr3	66599051	66599637	-93000146	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	69	704	-1259	1
1093	276	273	52	0	chr3	66599580	66599657	-93000126	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	35	115	-378	1
1093	2775	128	30	0	chr3	66603865	66604293	-92995490	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	1	1
1093	2424	145	44	4	chr3	66604293	66604771	-92995012	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	1830	1
1093	1958	201	27	14	chr3	66607542	66607931	-92991852	+	MTD	LTR	MaLR	1	376	-43	1
1093	284	310	0	14	chr3	66609342	66609414	-92990369	-	MLT1K	LTR	MaLR	-331	264	194	1
1093	225	288	143	55	chr3	66622976	66623193	-92976590	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	332	1
1093	295	293	12	24	chr3	66626898	66626982	-92972801	-	MTD	LTR	MaLR	-276	143	61	1
1093	1140	189	204	42	chr3	66626915	66627000	-92972783	+	MTD	LTR	MaLR	61	142	-277	1
1093	4289	94	24	2	chr3	66627000	66627584	-92972199	+	MT2B	LTR	ERVL	1	597	-4	1
1093	1140	189	204	42	chr3	66627584	66627807	-92971976	+	MTD	LTR	MaLR	143	419	0	1
1093	498	365	134	23	chr3	66627980	66628270	-92971513	+	LTR33	LTR	ERVL	24	315	-205	1
1093	264	263	102	167	chr3	66628839	66629269	-92970514	-	RMER10A	LTR	ERVL	-23	419	18	1
1093	289	286	36	0	chr3	66634407	66634491	-92965292	-	MTD	LTR	MaLR	-132	268	182	2
1093	733	233	78	16	chr3	66636044	66636236	-92963547	-	MTD	LTR	MaLR	-215	204	1	2
1093	656	332	28	14	chr3	66636625	66636842	-92962941	+	MLT1C	LTR	MaLR	204	423	-44	2
1093	225	118	20	0	chr3	66636926	66636977	-92962806	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	480	2
1093	427	216	32	65	chr3	66637045	66637169	-92962614	+	MTC-int	LTR	MaLR	676	795	-463	2
1093	551	68	0	0	chr3	66637162	66637235	-92962548	-	MTC-int	LTR	MaLR	-521	737	665	2
1093	1401	153	34	55	chr3	66637228	66637519	-92962264	-	MTC-int	LTR	MaLR	-969	289	5	2
1093	2295	144	60	12	chr3	66637521	66637923	-92961860	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1093	528	344	94	70	chr3	66638808	66638987	-92960796	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-6	621	442	2
1093	528	344	94	70	chr3	66639300	66639461	-92960322	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-186	441	273	2
1093	1598	174	40	0	chr3	66647622	66647898	-92951885	-	MTC	LTR	MaLR	-88	333	47	2
1093	3317	30	2	12	chr3	66655299	66655699	-92944084	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1093	4355	14	2	12	chr3	66659247	66659745	-92940038	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1093	38775	16	14	0	chr3	66659745	66665032	-92934751	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	2
1093	390	167	46	35	chr3	66665032	66665119	-92934664	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	2
1093	302	0	0	0	chr3	66665119	66665157	-92934626	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	2
1093	4355	14	2	12	chr3	66665157	66665655	-92934128	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1093	641	256	43	0	chr3	66668759	66668923	-92930860	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	335	2
1093	365	320	101	53	chr3	66670358	66670566	-92929217	-	MLT1D	LTR	MaLR	-287	218	1	2
1093	434	349	59	20	chr3	66674884	66675086	-92924697	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-13	689	480	2
1093	3446	164	38	7	chr3	66675706	66676283	-92923500	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	98	2
1093	1291	217	129	12	chr3	66684168	66684579	-92915204	+	MT2A	LTR	ERVL	1	459	-74	2
1093	7078	49	2	28	chr3	66690072	66690716	-92909067	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	194	2
1093	7078	49	2	28	chr3	66690863	66691062	-92908721	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	-629	193	1	2
1093	330	335	40	20	chr3	66692251	66692382	-92907401	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-37	525	392	2
1093	656	296	62	45	chr3	66705237	66705510	-92894273	-	RLTR26	LTR	ERVK	-79	548	208	3
1093	3500	175	7	8	chr3	66705576	66706175	-92893608	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	95	3
1093	594	131	30	0	chr3	66714370	66714469	-92885314	-	RLTR17	LTR	ERVK	-590	102	1	3
1094	270	222	0	0	chr3	66725455	66725509	-92874274	+	MTEa	LTR	MaLR	326	379	0	3
1094	670	249	63	11	chr3	66728264	66728455	-92871328	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	201	-355	3
1094	4020	52	26	2	chr3	66729056	66729556	-92870227	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	3
1094	244	242	14	83	chr3	66729787	66729843	-92869940	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	329	3
1094	3090	145	174	2	chr3	66732275	66732862	-92866921	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	690	0	3
1094	776	278	65	148	chr3	66733748	66734161	-92865622	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	3
1094	1360	228	59	12	chr3	66734472	66734796	-92864987	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	32	3
1094	1513	234	41	3	chr3	66753003	66753368	-92846415	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	3
1094	1770	193	63	16	chr3	66754108	66754471	-92845312	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	382	-2	3
1094	4897	220	93	30	chr3	66754473	66755761	-92844022	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	1	1370	0	3
1094	1657	188	56	86	chr3	66755761	66756157	-92843626	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1094	460	331	79	54	chr3	66759132	66759448	-92840335	+	ORR1E	LTR	MaLR	22	345	-14	3
1094	226	354	10	30	chr3	66769950	66770049	-92829734	-	MLT1D	LTR	MaLR	-53	452	356	3
1094	249	299	109	29	chr3	66800832	66800970	-92798813	+	MLT1B	LTR	MaLR	4	152	-222	4
1094	615	276	80	65	chr3	66801110	66801326	-92798457	+	MLT1B	LTR	MaLR	155	389	-1	4
1094	1821	148	88	6	chr3	66810050	66810389	-92789394	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1094	277	139	0	0	chr3	66811616	66811659	-92788124	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	336	4
1094	359	225	12	0	chr3	66815419	66815499	-92784284	-	RMER12	LTR	ERVK	-474	848	768	4
1094	1026	212	70	32	chr3	66816435	66816740	-92783043	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	4
1094	2850	14	54	8	chr3	66831864	66832215	-92767568	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	4
1094	936	125	74	0	chr3	66832215	66832391	-92767392	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	196	-6285	4
1094	994	154	16	21	chr3	66832365	66832557	-92767226	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	70	260	-7321	4
1094	10324	25	2	5	chr3	66832558	66833752	-92766031	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5292	6481	0	4
1094	2820	14	54	8	chr3	66833752	66834103	-92765680	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	4
1095	1818	189	106	18	chr3	66858862	66859249	-92740534	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1095	263	267	65	92	chr3	66866298	66866417	-92733366	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-35	335	207	5
1095	308	173	5	126	chr3	66868228	66868426	-92731357	-	RMER17C	LTR	ERVK	-148	262	89	5
1095	1726	141	39	13	chr3	66869270	66869631	-92730152	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-54	391	3	5
1095	2370	69	85	0	chr3	66882674	66882993	-92716790	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	5
1095	1172	240	158	31	chr3	66884212	66884291	-92715492	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	415	5
1095	1172	240	158	31	chr3	66884337	66884705	-92715078	-	RLTR16	LTR	ERVK	-91	414	1	5
1095	544	301	88	37	chr3	66891279	66891576	-92708207	-	LTR37A	LTR	ERV1	-27	399	88	5
1095	1744	204	54	32	chr3	66892131	66892540	-92707243	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	5
1095	6611	15	1	1	chr3	66899999	66900741	-92699042	+	RLTR4_Mm	LTR	ERV1	1	742	0	6
1095	22340	12	1	0	chr3	66900742	66903374	-92696409	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	1	2634	-4967	6
1095	24328	21	13	0	chr3	66903369	66906328	-92693455	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	3841	6838	-763	6
1095	5551	15	0	0	chr3	66906325	66906974	-92692809	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	6953	7601	0	6
1095	6611	15	1	1	chr3	66906974	66907716	-92692067	+	RLTR4_Mm	LTR	ERV1	1	742	0	6
1095	2141	158	124	43	chr3	66907903	66908243	-92691540	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	352	-233	6
1095	6856	45	39	7	chr3	66908243	66909108	-92690675	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	6
1095	2141	161	126	40	chr3	66909108	66909274	-92690509	+	RMER4B	LTR	ERVK	328	530	-55	6
1095	497	229	47	39	chr3	66911096	66911223	-92688560	-	MTE2b	LTR	MaLR	-251	128	1	6
1095	293	312	80	88	chr3	66912658	66912957	-92686826	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	41	6
1095	1545	164	36	25	chr3	66914797	66915078	-92684705	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	286	-108	6
1095	779	308	66	43	chr3	66925187	66925489	-92674294	-	MTD	LTR	MaLR	-110	309	1	6
1095	328	261	21	42	chr3	66925601	66925697	-92674086	+	MLT1A1	LTR	MaLR	2	95	-313	6
1095	261	343	93	67	chr3	66935924	66936074	-92663709	-	LTR50	LTR	ERVL	-252	543	390	6
1095	277	133	0	0	chr3	66937368	66937413	-92662370	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	366	6
1095	1130	217	9	0	chr3	66976507	66976728	-92623055	+	MTD	LTR	MaLR	1	223	-196	6
1096	589	171	232	14	chr3	66981059	66981220	-92618563	+	MTD	LTR	MaLR	219	405	-14	6
1096	356	293	119	73	chr3	67027224	67027556	-92572227	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	457	-10	3
1096	265	369	56	7	chr3	67030883	67031025	-92568758	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-190	218	70	4
1096	2772	116	35	26	chr3	67045939	67046398	-92553385	+	MMETn-int	LTR	ERVK	4382	4844	0	7
1096	1546	150	24	57	chr3	67046398	67046731	-92553052	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
1096	260	278	179	17	chr3	67049114	67049231	-92550552	-	MTC	LTR	MaLR	-12	409	274	7
1096	837	297	47	9	chr3	67052809	67053152	-92546631	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	357	-2	8
1096	2379	153	37	10	chr3	67084749	67085157	-92514626	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	1
1097	1721	211	126	147	chr3	67119924	67120542	-92479241	-	RMER19C	LTR	ERVK	-6	605	1	1
1097	1612	270	114	18	chr3	67134833	67135334	-92464449	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	27	1
1097	608	205	219	7	chr3	67137013	67137178	-92462605	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	383	186	2
1097	253	339	96	53	chr3	67137211	67137235	-92462548	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-173	186	163	2
1097	758	195	71	0	chr3	67137309	67137478	-92462305	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-193	181	1	2
1097	3151	66	0	8	chr3	67141528	67141927	-92457856	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1097	249	255	70	46	chr3	67160975	67161059	-92438724	-	MTEa	LTR	MaLR	-18	361	278	2
1097	294	219	108	54	chr3	67163881	67163918	-92435865	+	MT2B	LTR	ERVL	121	164	-437	2
1097	603	267	123	101	chr3	67164332	67164530	-92435253	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	171	2
1097	603	267	123	101	chr3	67164693	67164860	-92434923	-	MTEa	LTR	MaLR	-209	170	6	2
1097	609	325	60	53	chr3	67166943	67167236	-92432547	+	RMER5	LTR	ERV1	60	357	-177	2
1097	1140	210	107	35	chr3	67167236	67167581	-92432202	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	2
1097	609	325	60	53	chr3	67167581	67167667	-92432116	+	RMER5	LTR	ERV1	358	441	-93	2
1097	468	199	130	85	chr3	67168857	67169064	-92430719	+	MLT1G3	LTR	MaLR	372	584	-11	2
1097	1372	164	10	261	chr3	67169134	67169437	-92430346	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	180	-198	2
1097	1372	164	10	261	chr3	67169520	67169721	-92430062	+	ORR1C1	LTR	MaLR	181	378	0	2
1097	322	303	131	67	chr3	67173940	67174223	-92425560	-	RMER5	LTR	ERV1	-151	383	83	2
1097	1515	233	26	35	chr3	67174786	67175209	-92424574	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1097	270	257	92	26	chr3	67181519	67181595	-92418188	+	MLT1D	LTR	MaLR	5	85	-420	2
1097	562	342	210	21	chr3	67181657	67182131	-92417652	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	569	1	2
1097	819	283	97	45	chr3	67182984	67183314	-92416469	+	MTEa	LTR	MaLR	1	347	-32	2
1097	2837	176	34	4	chr3	67185034	67185535	-92414248	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	2
1097	1720	158	51	107	chr3	67189044	67189419	-92410364	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	2
1097	9632	137	47	123	chr3	67189426	67191550	-92408233	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1963	1	2
1097	1055	139	280	55	chr3	67191552	67191832	-92407951	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-6	323	2	2
1097	310	224	117	87	chr3	67192908	67193082	-92406701	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-13	361	195	2
1097	431	236	55	79	chr3	67193261	67193463	-92406320	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2627	2823	-415	2
1097	440	235	80	51	chr3	67193511	67193686	-92406097	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2918	3097	-141	2
1097	2215	149	23	18	chr3	67193987	67194174	-92405609	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	205	2
1097	2215	149	23	18	chr3	67194275	67194483	-92405300	-	RMER10B	LTR	ERVL	-194	204	2	2
1097	464	321	22	18	chr3	67198234	67198459	-92401324	+	RLTR15	LTR	ERVK	117	342	-17	2
1097	1680	212	72	77	chr3	67204112	67204632	-92395151	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-1	577	3	3
1097	339	109	0	0	chr3	67211869	67211915	-92387868	+	ORR1A4	LTR	MaLR	276	321	-8	3
1097	771	251	44	109	chr3	67213173	67213521	-92386262	-	RMER10A	LTR	ERVL	-25	417	65	3
1097	4222	120	51	43	chr3	67219684	67220427	-92379356	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	8	3
1097	2042	117	259	27	chr3	67220528	67220975	-92378808	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-67	587	37	3
1097	234	238	200	38	chr3	67220977	67221082	-92378701	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-532	122	1	3
1097	60832	34	13	0	chr3	67221082	67228667	-92371116	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	1	3
1097	1929	110	276	45	chr3	67228667	67229116	-92370667	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-65	589	37	3
1097	245	209	209	0	chr3	67229156	67229223	-92370560	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-573	81	1	3
1097	3683	166	150	10	chr3	67229324	67229812	-92369971	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	552	-308	3
1097	3683	174	59	11	chr3	67229833	67230115	-92369668	+	RMER13A	LTR	ERVK	553	853	-7	3
1097	1873	191	120	4	chr3	67236283	67236750	-92363033	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	14	3
1097	645	215	197	69	chr3	67237776	67238066	-92361717	+	MTD	LTR	MaLR	79	405	-14	3
1097	1404	206	60	30	chr3	67238100	67238465	-92361318	+	MTD-int	LTR	MaLR	28	403	-855	3
1097	726	235	114	45	chr3	67238477	67238767	-92361016	+	MTD-int	LTR	MaLR	922	1231	-27	3
1097	848	260	115	13	chr3	67238971	67239345	-92360438	+	MTD	LTR	MaLR	1	412	-7	3
1098	4553	126	42	7	chr3	67240999	67241729	-92358054	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	3
1098	316	300	207	24	chr3	67246124	67246288	-92353495	-	MER68	LTR	ERVL	-279	284	91	3
1098	369	236	99	139	chr3	67246710	67246912	-92352871	-	MTEa	LTR	MaLR	-185	194	1	3
1098	578	192	224	18	chr3	67250065	67250288	-92349495	+	MTC	LTR	MaLR	8	276	-145	3
1098	296	256	51	36	chr3	67250672	67250810	-92348973	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	421	3
1098	1429	229	70	22	chr3	67255800	67256157	-92343626	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1098	360	214	0	12	chr3	67258938	67259023	-92340760	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-10	617	534	3
1098	230	164	113	16	chr3	67274748	67274810	-92324973	+	LTR85a	LTR	Gypsy?	360	427	-275	3
1098	1554	145	71	17	chr3	67275657	67275951	-92323832	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-84	310	1	3
1098	1988	159	62	3	chr3	67280884	67281238	-92318545	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	4	4
1098	4161	158	67	51	chr3	67286167	67287015	-92312768	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	862	-40	4
1098	286	282	0	0	chr3	67295184	67295255	-92304528	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	76	-303	4
1098	472	211	318	22	chr3	67295281	67295460	-92304323	+	MTE2a	LTR	MaLR	148	379	0	4
1098	311	287	61	133	chr3	67299719	67299802	-92299981	+	MT2B	LTR	ERVL	85	155	-446	4
1098	235	389	77	49	chr3	67300715	67301064	-92298719	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	4
1098	1298	219	146	31	chr3	67307299	67307718	-92292065	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	1	4
1098	751	191	13	164	chr3	67308474	67308630	-92291153	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-30	344	213	4
1098	751	191	13	164	chr3	67308950	67309023	-92290760	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-162	212	143	4
1098	1725	202	47	12	chr3	67309023	67309543	-92290240	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5037	724	121	4
1098	3024	154	58	29	chr3	67309543	67310123	-92289660	+	RLTR1D	LTR	ERV1	1	605	0	4
1098	259	150	0	0	chr3	67310123	67310163	-92289620	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5655	106	67	4
1098	1915	177	118	80	chr3	67310319	67310767	-92289016	-	MT2A	LTR	ERVL	-68	465	1	4
1098	338	302	177	22	chr3	67311293	67311543	-92288240	+	MLT2B1	LTR	ERVL	273	567	0	4
1098	721	284	64	25	chr3	67314108	67314343	-92285440	+	MLT1D	LTR	MaLR	255	498	-7	4
1098	1070	191	216	63	chr3	67315751	67316098	-92283685	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	6	4
1098	305	266	142	87	chr3	67329016	67329234	-92270549	-	RMER21B	LTR	ERV1	-277	565	336	4
1098	349	158	50	50	chr3	67329315	67329395	-92270388	-	RMER4B	LTR	ERVK	-135	450	371	4
1098	1330	210	24	24	chr3	67329395	67329688	-92270095	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-162	4829	4537	4
1098	469	209	9	26	chr3	67333897	67334010	-92265773	-	MT2A	LTR	ERVL	-320	213	103	4
1098	899	215	149	177	chr3	67334361	67334482	-92265301	+	MT2A	LTR	ERVL	1	117	-416	4
1098	899	217	141	177	chr3	67334677	67335067	-92264716	+	MT2A	LTR	ERVL	118	599	-2	4
1098	3794	166	34	32	chr3	67335071	67335350	-92264433	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4	273	-5488	4
1098	3794	166	34	32	chr3	67335531	67335992	-92263791	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	274	745	-5016	4
1098	12703	158	42	8	chr3	67335995	67338139	-92261644	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	847	3064	-2697	4
1098	2913	116	36	0	chr3	67338131	67338552	-92261231	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3830	4265	-1496	4
1098	638	270	131	29	chr3	67338886	67339130	-92260653	+	MTE2a	LTR	MaLR	105	373	-6	4
1098	714	188	6	55	chr3	67348121	67348284	-92251499	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	155	-191	4
1098	500	193	275	22	chr3	67348303	67348526	-92251257	-	MT2A	LTR	ERVL	-95	489	193	4
1098	2395	144	10	5	chr3	67348639	67349044	-92250739	-	MTC	LTR	MaLR	-14	407	1	4
1098	514	306	94	17	chr3	67349853	67350086	-92249697	+	MLT1A0	LTR	MaLR	97	347	-18	4
1098	1826	144	6	30	chr3	67352269	67352324	-92247459	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	274	5
1098	1826	144	6	30	chr3	67352669	67352950	-92246833	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-56	273	1	5
1098	2336	179	58	45	chr3	67354527	67355042	-92244741	-	RLTR28	LTR	ERVL	-2	522	1	5
1098	278	139	0	0	chr3	67357403	67357446	-92242337	-	RLTR42	LTR	ERVK	-193	46	4	5
1098	286	346	141	51	chr3	67363277	67363533	-92236250	-	MLT1L	LTR	MaLR	-128	482	204	5
1098	622	314	110	8	chr3	67365571	67365944	-92233839	-	MER68	LTR	ERVL	-152	411	1	5
1099	452	221	54	16	chr3	67371705	67371832	-92227951	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	356	223	5
1099	315	244	24	0	chr3	67372361	67372443	-92227340	-	LTR41	LTR	ERVL	-594	174	91	5
1099	577	272	60	34	chr3	67373198	67373533	-92226250	+	MTEb	LTR	MaLR	12	378	-1	5
1099	3094	72	157	4	chr3	67375436	67376135	-92223648	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	806	1	5
1099	2462	124	90	0	chr3	67379376	67379778	-92220005	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	4	5
1099	2023	116	51	6	chr3	67381543	67381856	-92217927	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1099	2656	126	57	15	chr3	67385174	67385578	-92214205	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1099	524	279	173	12	chr3	67391423	67391677	-92208106	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	85	5
1099	346	339	108	11	chr3	67393509	67393694	-92206089	-	MLT1G	LTR	MaLR	-348	243	41	5
1099	768	214	113	73	chr3	67395806	67396051	-92203732	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	120	5
1099	838	229	35	58	chr3	67396051	67396311	-92203472	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	348	5
1099	393	224	0	84	chr3	67402434	67402541	-92197242	-	MT2B	LTR	ERVL	-4	580	483	5
1099	1269	120	289	4	chr3	67402543	67402823	-92196960	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-7	360	1	5
1099	758	234	124	52	chr3	67402823	67403169	-92196614	-	MT2B	LTR	ERVL	-98	503	7	5
1099	450	269	41	28	chr3	67403177	67403322	-92196461	-	MTEa	LTR	MaLR	-206	173	27	5
1099	229	196	74	56	chr3	67403580	67403634	-92196149	+	MT2B2	LTR	ERVL	233	287	-297	5
1099	576	271	198	16	chr3	67405677	67405996	-92193787	-	MTD	LTR	MaLR	-22	399	16	5
1099	2119	131	16	85	chr3	67408207	67408656	-92191127	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4831	2575	2064	5
1099	4723	138	29	14	chr3	67408682	67409455	-92190328	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-6336	1070	284	5
1099	1453	199	57	7	chr3	67411777	67412056	-92187727	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-7113	293	1	5
1099	3568	96	6	15	chr3	67412071	67412608	-92187175	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	277	5
1099	3610	123	14	31	chr3	67412610	67413162	-92186621	+	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	1	542	-86	5
1099	3610	123	14	31	chr3	67413751	67413837	-92185946	+	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	543	628	0	5
1099	1641	105	39	53	chr3	67413837	67414119	-92185664	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-530	278	1	5
1099	423	264	0	0	chr3	67414604	67414710	-92185073	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	454	5
1099	1056	235	31	15	chr3	67416281	67416540	-92183243	-	MTD	LTR	MaLR	-156	263	1	5
1099	453	270	91	80	chr3	67418749	67419035	-92180748	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	290	-69	6
1099	892	291	75	12	chr3	67426784	67427168	-92172615	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	407	-108	6
1099	3630	28	5	0	chr3	67457679	67458073	-92141710	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1099	1128	282	31	120	chr3	67468613	67469004	-92130779	-	MTE2a	LTR	MaLR	-5	374	19	6
1099	1383	229	143	22	chr3	67469068	67469425	-92130358	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	20	6
1099	328	347	87	54	chr3	67471423	67471847	-92127936	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-365	5302	4865	6
1099	1595	172	78	7	chr3	67471986	67472279	-92127504	-	MTC	LTR	MaLR	-105	316	3	6
1099	4889	130	97	3	chr3	67472293	67473143	-92126640	-	RMER17B	LTR	ERVK	-3	955	27	6
1099	551	351	51	54	chr3	67474390	67474706	-92125077	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3553	2161	1847	6
1099	997	266	11	53	chr3	67475278	67475560	-92124223	+	MTD	LTR	MaLR	1	270	-149	6
1099	626	229	28	7	chr3	67475612	67475753	-92124030	+	MTD	LTR	MaLR	262	405	-14	6
1099	899	208	190	98	chr3	67479752	67480099	-92119684	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	6
1099	838	238	42	118	chr3	67480263	67480501	-92119282	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-4	380	149	7
1099	814	184	9	148	chr3	67480576	67480786	-92118997	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-193	181	1	7
1099	563	272	96	16	chr3	67481054	67481241	-92118542	-	MLT1K	LTR	MaLR	-2	593	392	7
1099	371	309	50	0	chr3	67481613	67481752	-92118031	-	ORR1E	LTR	MaLR	-213	146	1	7
1099	2129	167	72	168	chr3	67500297	67500546	-92099237	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	244	-284	1
1099	2129	167	72	168	chr3	67500725	67501057	-92098726	+	RLTR12B	LTR	ERVK	245	526	-2	1
1099	1856	198	21	47	chr3	67501628	67502009	-92097774	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	4	4
1100	1082	277	48	69	chr3	67502593	67502995	-92096788	+	MTE2a	LTR	MaLR	20	419	0	6
1100	486	289	92	26	chr3	67502995	67503177	-92096606	+	MLT1I	LTR	MaLR	99	293	-118	7
1100	1553	237	118	19	chr3	67510677	67510997	-92088786	-	RMER5	LTR	ERV1	-4	530	187	2
1100	1553	237	118	19	chr3	67511039	67511200	-92088583	-	RMER5	LTR	ERV1	-348	186	1	2
1100	625	351	104	15	chr3	67512680	67513015	-92086768	-	MTE-int	LTR	MaLR	-127	1453	1089	3
1100	570	68	0	0	chr3	67514717	67514790	-92084993	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	73	-678	3
1100	2432	74	52	27	chr3	67514786	67515189	-92084594	-	RMER17A	LTR	ERVK	-261	490	78	3
1100	629	326	33	95	chr3	67517564	67517869	-92081914	+	MTE2a	LTR	MaLR	14	299	-80	3
1100	501	229	25	29	chr3	67517889	67518061	-92081722	+	MTE2a	LTR	MaLR	214	379	0	3
1100	2150	163	3	3	chr3	67518097	67518442	-92081341	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	2	4
1100	314	247	44	22	chr3	67518585	67518676	-92081107	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	316	4
1100	269	305	99	22	chr3	67521161	67521342	-92078441	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-164	303	109	4
1100	408	328	39	17	chr3	67535777	67535957	-92063826	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	376	6
1100	306	267	33	11	chr3	67537789	67537880	-92061903	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	287	6
1100	775	238	212	89	chr3	67540907	67541313	-92058470	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	38	7
1100	243	324	44	71	chr3	67546263	67546376	-92053407	-	LTR78	LTR	ERV1	-344	960	851	8
1100	551	147	55	4	chr3	67547218	67547322	-92052461	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-87	297	136	8
1100	387	291	176	68	chr3	67550076	67550400	-92049383	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	9
1100	1832	107	14	104	chr3	67559271	67559625	-92040158	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	9
1100	2004	159	10	77	chr3	67560157	67560558	-92039225	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	21	9
1100	1170	249	118	24	chr3	67565903	67566241	-92033542	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
1100	1454	193	108	15	chr3	67567906	67568248	-92031535	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1100	729	300	77	59	chr3	67572401	67572776	-92027007	-	MLT1C	LTR	MaLR	-80	387	6	1
1100	2218	139	49	12	chr3	67576316	67576724	-92023059	+	RLTR26	LTR	ERVK	220	642	0	1
1100	799	97	24	0	chr3	67578768	67578892	-92020891	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	127	-402	1
1100	2869	41	0	101	chr3	67578893	67579299	-92020484	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	1
1100	1315	73	11	6	chr3	67579299	67579478	-92020305	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	180	-7401	1
1100	245	200	0	0	chr3	67579478	67579523	-92020260	+	RLTR27	LTR	ERVK	231	275	-34	1
1100	383	23	0	0	chr3	67579523	67579566	-92020217	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	225	267	-7314	1
1100	339	111	0	0	chr3	67579787	67579832	-92019951	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	93	137	-6405	1
1100	2860	56	0	0	chr3	67579836	67580176	-92019607	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	653	992	-995	1
1100	505	311	39	28	chr3	67580201	67580593	-92019190	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	822	1566	-6015	1
1100	1649	74	100	0	chr3	67580605	67580834	-92018949	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	5004	5255	-1287	1
1100	4444	132	13	3	chr3	67580838	67581517	-92018266	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6995	7680	0	1
1100	2668	49	0	178	chr3	67581517	67581961	-92017822	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	1
1100	1628	163	13	32	chr3	67582032	67582348	-92017435	+	RLTR24	LTR	ERV1	167	476	-53	1
1100	333	111	0	18	chr3	67582531	67582586	-92017197	+	RLTR24	LTR	ERV1	476	529	0	1
1100	327	342	51	66	chr3	67585120	67585377	-92014406	+	RLTR26	LTR	ERVK	165	417	-225	1
1100	1313	284	76	0	chr3	67588515	67588896	-92010887	+	MTD	LTR	MaLR	5	414	-5	1
1100	546	144	57	19	chr3	67597851	67597957	-92001826	+	MT2A	LTR	ERVL	4	113	-420	1
1100	666	249	73	32	chr3	67599856	67600153	-91999630	+	MT2A	LTR	ERVL	96	545	-56	1
1100	6152	202	21	25	chr3	67600392	67601653	-91998130	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	8	1264	-4497	1
1100	2141	47	58	81	chr3	67601653	67601832	-91997951	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-7	339	187	1
1100	2141	47	58	81	chr3	67602354	67602521	-91997262	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-160	186	1	1
1100	2610	166	23	12	chr3	67602521	67602953	-91996830	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1257	1693	-4068	1
1100	6121	166	39	13	chr3	67602954	67604024	-91995759	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4661	5758	-3	1
1100	1242	196	118	193	chr3	67604027	67604603	-91995180	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	1
1100	237	206	123	0	chr3	67607805	67607878	-91991905	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-484	95	14	1
1100	1193	253	139	6	chr3	67609977	67610343	-91989440	+	MTD	LTR	MaLR	1	415	-4	1
1100	770	316	50	53	chr3	67613048	67613389	-91986394	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	340	-25	1
1100	3028	55	0	6	chr3	67615136	67615483	-91984300	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-1	345	1	1
1100	454	288	163	37	chr3	67617239	67617484	-91982299	+	ORR1E	LTR	MaLR	18	293	-66	1
1100	721	277	179	23	chr3	67620262	67620732	-91979051	+	MER34A1	LTR	ERV1	5	563	-24	1
1100	273	370	74	39	chr3	67620914	67621251	-91978532	-	MLT1K	LTR	MaLR	-110	485	137	1
1100	879	213	11	0	chr3	67623246	67623420	-91976363	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-852	176	1	1
1100	438	211	3	2	chr3	67623733	67623838	-91975945	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5162	975	889	1
1100	373	222	0	0	chr3	67624037	67624109	-91975674	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5277	860	789	1
1100	2934	114	5	12	chr3	67628693	67629101	-91970682	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	3	407	0	1
1100	502	347	79	57	chr3	67632071	67632389	-91967394	-	MamGypLTR2b	LTR	Gypsy	-189	733	409	2
1101	239	385	51	34	chr3	67635962	67636137	-91963646	+	ORR1D2	LTR	MaLR	6	183	-187	2
1101	262	319	0	0	chr3	67638853	67638925	-91960858	+	RMER15	LTR	ERVL	3	74	-501	2
1101	1518	266	12	62	chr3	67639480	67640066	-91959717	+	RMER15	LTR	ERVL	27	561	-14	2
1101	342	370	31	13	chr3	67642704	67642863	-91956920	-	LTR40a	LTR	ERVL	-54	465	304	2
1101	541	298	121	8	chr3	67645529	67645769	-91954014	-	LTR55	LTR	ERV	-270	278	12	2
1101	1631	103	306	0	chr3	67647859	67648140	-91951643	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1101	404	306	99	84	chr3	67658625	67658828	-91940955	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	206	-168	2
1101	228	291	37	37	chr3	67662395	67662477	-91937306	-	MER34	LTR	ERV1	-65	477	396	2
1101	274	239	150	92	chr3	67662868	67662988	-91936795	-	LTR48	LTR	ERV1	-643	144	18	2
1101	2709	164	121	34	chr3	67665960	67666498	-91933285	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	2
1101	426	294	200	44	chr3	67669461	67669842	-91929941	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-27	535	2	2
1101	708	281	107	69	chr3	67675524	67675841	-91923942	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	31	2
1101	1387	323	53	63	chr3	67675841	67676545	-91923238	-	MTE-int	LTR	MaLR	-784	796	100	2
1101	944	311	54	58	chr3	67681342	67681843	-91917940	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	7	2
1101	786	340	111	17	chr3	67683665	67684081	-91915702	-	RMER5	LTR	ERV1	-40	494	40	2
1101	258	179	216	64	chr3	67684296	67684421	-91915362	+	MLT1J1	LTR	MaLR	14	157	-287	2
1101	1171	197	102	134	chr3	67708127	67708560	-91891223	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1101	314	294	50	72	chr3	67710416	67710629	-91889154	-	MTE2a	LTR	MaLR	-7	412	204	3
1101	236	307	56	22	chr3	67710618	67710708	-91889075	-	MTE2a	LTR	MaLR	-281	93	1	3
1101	307	300	94	55	chr3	67711409	67711441	-91888342	-	MLT1L	LTR	MaLR	-308	302	277	3
1101	307	300	94	55	chr3	67712265	67712359	-91887424	-	MLT1L	LTR	MaLR	-334	276	171	3
1101	494	260	24	160	chr3	67718116	67718322	-91881461	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	178	-201	3
1101	1382	274	29	52	chr3	67720571	67720952	-91878831	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	6	3
1101	1200	266	26	31	chr3	67721713	67722094	-91877689	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	3
1101	1192	228	140	8	chr3	67724755	67725113	-91874670	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	3
1101	1320	249	31	50	chr3	67731879	67732053	-91867730	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	179	-195	3
1101	1320	249	31	50	chr3	67732097	67732303	-91867480	+	ORR1D1	LTR	MaLR	180	374	0	3
1101	241	316	51	34	chr3	67735945	67736063	-91863720	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-14	434	315	3
1101	263	200	234	1	chr3	67736934	67737029	-91862754	-	MTC	LTR	MaLR	-9	410	278	3
1101	254	296	51	51	chr3	67742467	67742663	-91857120	-	RMER17C	LTR	ERVK	-51	359	164	3
1101	256	329	74	49	chr3	67744037	67744200	-91855583	+	LTR33	LTR	ERVL	12	178	-337	3
1101	727	266	40	160	chr3	67744814	67745213	-91854570	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-29	499	149	3
1101	1137	185	118	40	chr3	67745352	67745654	-91854129	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-2	388	1	3
1101	546	94	11	45	chr3	67747166	67747255	-91852528	-	MTD	LTR	MaLR	-331	88	3	3
1101	241	256	35	47	chr3	67747431	67747517	-91852266	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	476	3
1101	471	351	34	95	chr3	67749930	67750257	-91849526	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-82	598	292	3
1101	313	363	29	0	chr3	67750309	67750411	-91849372	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-422	138	34	3
1101	461	292	116	7	chr3	67752556	67752711	-91847072	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-107	258	87	3
1101	709	288	92	43	chr3	67757154	67757524	-91842259	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	405	18	3
1101	916	252	74	134	chr3	67760049	67760534	-91839249	+	RLTR12B	LTR	ERVK	42	497	-31	4
1102	1815	132	67	29	chr3	67775580	67775893	-91823890	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	4
1102	374	282	33	25	chr3	67781899	67782019	-91817764	+	MTE2b	LTR	MaLR	256	376	-3	4
1102	874	323	59	7	chr3	67786452	67786739	-91813044	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-265	304	3	4
1102	628	348	69	43	chr3	67791463	67791809	-91807974	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	355	-4	4
1102	440	383	73	50	chr3	67793759	67794061	-91805722	-	LTR16A	LTR	ERVL	-106	345	37	4
1102	614	338	22	32	chr3	67795298	67795576	-91804207	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1337	4330	4056	4
1102	395	254	50	8	chr3	67795705	67795824	-91803959	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3127	1869	1746	4
1102	259	294	92	46	chr3	67796892	67797088	-91802695	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-4377	619	415	4
1102	400	403	42	38	chr3	67797694	67797934	-91801849	-	LTR16A	LTR	ERVL	-210	241	1	4
1102	265	266	87	4	chr3	67800967	67801052	-91798731	+	MLT1J1	LTR	MaLR	25	110	-338	4
1102	915	145	6	62	chr3	67802214	67802391	-91797392	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-200	167	1	4
1102	1109	276	24	100	chr3	67804830	67805240	-91794543	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	4
1102	386	336	128	50	chr3	67807956	67808117	-91791666	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-319	236	68	4
1102	386	336	128	50	chr3	67808175	67808232	-91791551	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-488	67	1	4
1102	299	108	22	14	chr3	67809490	67809548	-91790235	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	322	4
1102	743	326	75	55	chr3	67809548	67810027	-91789756	+	MT2A	LTR	ERVL	1	491	-42	4
1102	743	326	75	55	chr3	67810075	67810118	-91789665	+	MT2A	LTR	ERVL	492	533	0	4
1102	659	303	59	63	chr3	67810161	67810415	-91789368	-	MTD	LTR	MaLR	-166	253	1	4
1102	1359	298	36	10	chr3	67816247	67816664	-91783119	-	RMER20A	LTR	ERVK	-38	478	51	4
1102	2424	174	32	78	chr3	67816810	67817334	-91782449	+	RLTR16	LTR	ERVK	6	505	0	4
1102	728	305	30	30	chr3	67818923	67819187	-91780596	-	LTR37A	LTR	ERV1	-162	264	1	4
1102	675	272	105	30	chr3	67820942	67821276	-91778507	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	4
1102	540	308	234	3	chr3	67822262	67822574	-91777209	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	120	4
1102	607	311	92	51	chr3	67823696	67823988	-91775795	+	MLT1B	LTR	MaLR	46	349	-41	4
1102	803	304	116	70	chr3	67829813	67830298	-91769485	-	MER21B	LTR	ERV1	-109	754	248	5
1102	308	333	111	48	chr3	67830313	67830392	-91769391	-	MER21B	LTR	ERV1	-706	157	76	5
1102	2755	75	28	23	chr3	67830392	67830790	-91768993	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1102	308	333	111	48	chr3	67830790	67830836	-91768947	-	MER21B	LTR	ERV1	-788	75	24	5
1102	987	206	86	78	chr3	67850324	67850593	-91749190	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	148	5
1102	1481	218	106	3	chr3	67854762	67855130	-91744653	+	MTD	LTR	MaLR	1	406	-13	5
1102	331	376	39	45	chr3	67874616	67874928	-91724855	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-99	345	36	5
1102	3039	51	8	20	chr3	67883243	67883643	-91716140	+	MTB	LTR	MaLR	1	395	-5	5
1102	487	350	92	56	chr3	67884496	67884853	-91714930	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
1102	809	305	70	12	chr3	67884930	67885189	-91714594	+	MLT1C	LTR	MaLR	190	463	-4	5
1102	2650	199	45	12	chr3	67890548	67891107	-91708676	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	1	5
1102	1268	213	255	19	chr3	67892554	67892985	-91706798	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	5
1103	418	338	191	34	chr3	67898240	67898623	-91701160	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-2	446	4	5
1103	231	318	44	22	chr3	67898730	67898820	-91700963	-	MLT1J2-int	LTR	MaLR	-198	1211	1120	5
1103	1010	268	30	41	chr3	67901241	67901580	-91698203	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	340	-25	5
1103	270	103	0	0	chr3	67901828	67901867	-91697916	+	MLT1A0	LTR	MaLR	323	361	-4	5
1103	1273	192	95	34	chr3	67903331	67903627	-91696156	-	RLTR46	LTR	ERVK	-6	314	1	5
1103	828	273	186	19	chr3	67905135	67905613	-91694170	-	MER89	LTR	ERV1	0	559	2	6
1103	2746	15	95	6	chr3	67918378	67918715	-91681068	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1103	6040	97	143	45	chr3	67918715	67919905	-91679878	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	6
1103	27405	23	1	2	chr3	67919904	67923181	-91676602	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3210	6481	0	6
1103	2746	15	95	6	chr3	67923181	67923518	-91676265	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1103	2426	175	37	0	chr3	67923994	67924400	-91675383	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1103	2098	193	38	29	chr3	67940959	67941267	-91658516	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	107	6
1103	2098	193	38	29	chr3	67941442	67941546	-91658237	-	MTC	LTR	MaLR	-315	106	1	6
1103	2363	69	0	72	chr3	67947432	67947778	-91652005	+	ORR1A2	LTR	MaLR	5	325	-2	6
1103	415	338	63	40	chr3	67953209	67953431	-91646352	+	ORR1E	LTR	MaLR	12	238	-121	6
1103	369	278	65	40	chr3	67953634	67953780	-91646003	+	ORR1E	LTR	MaLR	206	376	-3	6
1103	486	360	20	0	chr3	67957104	67957257	-91642526	+	MLT2B2	LTR	ERVL	168	323	-192	6
1103	1686	185	88	0	chr3	67965180	67965510	-91634273	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-35	359	1	6
1103	341	255	209	37	chr3	67980733	67980924	-91618859	-	MTEa	LTR	MaLR	-152	227	4	6
1103	361	310	78	69	chr3	67984782	67985014	-91614769	-	ORR1E	LTR	MaLR	-69	290	57	7
1103	1879	114	88	63	chr3	67985181	67985499	-91614284	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	7
1103	708	312	149	19	chr3	67991343	67991808	-91607975	-	MLT1F	LTR	MaLR	-8	547	10	7
1103	263	352	68	42	chr3	67993425	67993615	-91606168	-	MLT1L	LTR	MaLR	-221	389	195	7
1103	1134	271	58	18	chr3	67997746	67998035	-91601748	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	85	7
1103	1134	271	58	18	chr3	67998091	67998128	-91601655	-	MTE2b	LTR	MaLR	-295	84	42	7
1103	239	333	125	6	chr3	68014251	68014411	-91585372	+	MLT1B	LTR	MaLR	39	217	-173	1
1103	333	311	94	0	chr3	68015326	68015432	-91584351	-	MT2A	LTR	ERVL	-74	459	344	2
1103	547	348	5	5	chr3	68015435	68015620	-91584163	-	MT2A	LTR	ERVL	-106	427	243	2
1103	412	267	84	26	chr3	68015861	68016015	-91583768	-	MT2A	LTR	ERVL	-368	165	3	2
1103	225	286	16	0	chr3	68021037	68021100	-91578683	+	RLTR19C	LTR	ERVK	34	97	-409	3
1103	1291	166	92	55	chr3	68022507	68023048	-91576735	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	3
1104	1997	167	75	30	chr3	68031150	68031551	-91568232	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
1104	1661	177	79	8	chr3	68034654	68035007	-91564776	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	6
1104	636	201	359	0	chr3	68058855	68059039	-91540744	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	170	9
1104	1243	231	90	3	chr3	68066576	68066876	-91532907	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	41	1
1104	1841	141	54	3	chr3	68066996	68067310	-91532473	+	RLTR15	LTR	ERVK	30	359	0	1
1104	297	239	42	32	chr3	68069826	68069921	-91529862	+	MT2A	LTR	ERVL	1	96	-437	1
1104	237	369	51	28	chr3	68077145	68077321	-91522462	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-155	289	110	1
1104	2099	153	26	3	chr3	68078845	68079192	-91520591	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-3	375	21	1
1104	233	321	82	47	chr3	68079235	68079405	-91520378	-	LTR89	LTR	ERVL?	-600	279	104	1
1104	1997	167	48	65	chr3	68083852	68084269	-91515514	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	57	1
1104	237	301	23	0	chr3	68085341	68085474	-91514309	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-755	754	619	1
1104	2137	140	28	64	chr3	68093546	68093935	-91505848	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	2	1
1104	373	340	105	89	chr3	68097605	68097957	-91501826	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	379	-11	1
1104	1857	155	105	26	chr3	68104005	68104357	-91495426	-	MTC	LTR	MaLR	-41	380	1	1
1104	2830	159	29	13	chr3	68107928	68108449	-91491334	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	1
1104	885	185	17	146	chr3	68115050	68115290	-91484493	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	188	1
1104	689	212	14	7	chr3	68115977	68116124	-91483659	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	251	1
1104	251	289	37	37	chr3	68120230	68120338	-91479445	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	275	1
1104	344	261	0	0	chr3	68121724	68121816	-91477967	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	414	1
1104	284	323	45	8	chr3	68122048	68122182	-91477601	-	MLT1D	LTR	MaLR	-260	245	107	1
1104	879	259	114	76	chr3	68123445	68123700	-91476083	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	356	98	1
1104	879	259	114	76	chr3	68123850	68123937	-91475846	-	ORR1E	LTR	MaLR	-262	97	2	1
1104	438	298	84	6	chr3	68127467	68127646	-91472137	-	MT2A	LTR	ERVL	-7	526	334	2
1104	271	225	42	0	chr3	68128233	68128304	-91471479	-	MT2A	LTR	ERVL	-454	79	6	2
1104	4190	219	141	35	chr3	68130138	68131823	-91467960	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-15	1355	31	2
1104	1147	202	159	58	chr3	68131824	68132150	-91467633	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-11	363	5	2
1104	881	247	5	5	chr3	68132163	68132362	-91467421	-	MTD	LTR	MaLR	-217	202	4	2
1104	1723	215	66	5	chr3	68134154	68134547	-91465236	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	2
1104	496	285	93	51	chr3	68139339	68139676	-91460107	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	375	1	2
1104	2902	12	0	0	chr3	68140504	68140826	-91458957	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
1104	1791	169	3	0	chr3	68141107	68141427	-91458356	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	2
1104	241	311	49	56	chr3	68145403	68145546	-91454237	-	LTR33	LTR	ERVL	-48	467	326	2
1104	277	307	39	8	chr3	68148317	68148445	-91451338	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	134	-225	2
1104	1372	233	32	94	chr3	68151676	68152079	-91447704	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	378	-1	2
1104	2023	186	27	0	chr3	68153861	68154231	-91445552	-	RLTR14	LTR	ERV1	-2	380	1	2
1105	2853	161	95	40	chr3	68158401	68159054	-91440729	+	RMER6C	LTR	ERVK	2	690	0	2
1105	286	300	180	0	chr3	68160774	68160924	-91438859	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4119	1403	1227	2
1105	1982	168	34	55	chr3	68167736	68168120	-91431663	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	1	2
1105	685	212	30	8	chr3	68170707	68170942	-91428841	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	48	2
1105	303	277	362	4	chr3	68173591	68173861	-91425922	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	3	2
1105	1694	195	14	89	chr3	68175359	68175786	-91423997	+	MTC	LTR	MaLR	19	413	-8	2
1105	2491	166	69	26	chr3	68177272	68177810	-91421973	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	2
1105	2402	122	55	8	chr3	68177884	68178281	-91421502	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	6	2
1105	658	244	122	8	chr3	68180567	68180884	-91418899	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	3	2
1105	1674	209	46	46	chr3	68182644	68183060	-91416723	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	4	2
1105	376	268	30	29	chr3	68190617	68190774	-91409009	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	222	3
1105	368	278	22	0	chr3	68190863	68190953	-91408830	-	MTEb	LTR	MaLR	-287	92	1	3
1105	264	167	0	36	chr3	68192376	68192432	-91407351	-	MTD	LTR	MaLR	-365	54	1	3
1105	543	347	61	22	chr3	68193629	68193906	-91405877	+	LTR16B1	LTR	ERVL	100	387	-93	3
1105	4293	299	59	45	chr3	68197682	68197832	-91401951	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-1305	3694	3530	3
1105	4293	302	58	42	chr3	68197902	68199613	-91400170	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-1470	3529	1998	3
1105	264	241	35	46	chr3	68199701	68199788	-91399995	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3272	1727	1642	3
1105	530	180	0	10	chr3	68200426	68200527	-91399256	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	320	3
1105	640	166	7	54	chr3	68200531	68200678	-91399105	-	MTD	LTR	MaLR	-270	149	10	3
1105	3240	287	53	27	chr3	68200691	68201350	-91398433	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3560	1439	752	3
1105	3240	287	53	27	chr3	68201527	68201927	-91397856	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4248	751	353	3
1105	751	241	48	11	chr3	68213751	68213940	-91385843	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	181	3
1105	326	267	11	43	chr3	68213969	68214063	-91385720	-	MTEa	LTR	MaLR	-280	99	9	3
1105	699	243	151	48	chr3	68216480	68216507	-91383276	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-138	343	317	3
1105	699	243	151	48	chr3	68216574	68216857	-91382926	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-165	316	3	3
1105	820	264	168	42	chr3	68224869	68225178	-91374605	+	MTEa	LTR	MaLR	20	367	-12	3
1105	1927	117	39	0	chr3	68233034	68233343	-91366440	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	3
1105	325	287	68	68	chr3	68233508	68233669	-91366114	+	MER74B	LTR	ERVL	164	324	-298	3
1105	1063	268	82	37	chr3	68233911	68234298	-91365485	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	3
1105	388	262	126	1	chr3	68236669	68236808	-91362975	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	404	219	3
1105	1896	167	80	30	chr3	68249996	68250360	-91349423	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	1	3
1105	281	387	40	66	chr3	68251840	68252219	-91347564	-	LTR33	LTR	ERVL	-113	402	34	3
1105	1186	227	104	0	chr3	68252452	68252730	-91347053	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	307	-52	3
1105	1700	236	57	41	chr3	68254676	68255060	-91344723	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	113	3
1105	1700	236	57	41	chr3	68255253	68255285	-91344498	-	RLTR19	LTR	ERVK	-387	112	80	3
1105	1700	236	57	41	chr3	68255330	68255403	-91344380	-	RLTR19	LTR	ERVK	-420	79	2	3
1105	327	211	100	55	chr3	68258095	68258205	-91341578	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	294	4
1105	274	288	86	43	chr3	68258340	68258456	-91341327	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-286	122	2	4
1105	1692	129	53	20	chr3	68259574	68259875	-91339908	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	11	4
1105	2772	60	30	93	chr3	68263622	68264061	-91335722	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	4
1105	475	303	36	89	chr3	68265758	68266128	-91333655	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	3	4
1105	1385	252	133	5	chr3	68266128	68266269	-91333514	-	MTE-int	LTR	MaLR	-51	1529	1362	4
1105	1385	252	133	5	chr3	68266311	68266600	-91333183	-	MTE-int	LTR	MaLR	-219	1361	1044	4
1105	391	321	8	15	chr3	68268433	68268566	-91331217	-	ORR1E	LTR	MaLR	-227	132	1	4
1105	1470	186	169	33	chr3	68269616	68269982	-91329801	+	MTC	LTR	MaLR	6	421	0	4
1105	1736	153	43	20	chr3	68277114	68277460	-91322323	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	4
1105	229	282	213	41	chr3	68279752	68279874	-91319909	+	LTR90B	LTR	LTR	103	245	-551	4
1105	1423	172	246	15	chr3	68282094	68282436	-91317347	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1106	503	133	150	20	chr3	68302142	68302242	-91297541	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	370	258	5
1106	569	271	41	29	chr3	68302258	68302429	-91297354	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-193	181	9	5
1106	577	259	108	14	chr3	68314372	68314561	-91285222	+	MTD	LTR	MaLR	1	215	-204	5
1106	508	188	101	8	chr3	68314780	68314910	-91284873	+	MTD	LTR	MaLR	253	405	-14	5
1106	636	290	87	24	chr3	68321902	68322156	-91277627	-	MLT2D	LTR	ERVL	-143	271	2	5
1106	367	302	95	57	chr3	68330327	68330538	-91269245	-	LTR33A	LTR	ERVL	0	520	302	5
1106	395	262	123	34	chr3	68332721	68332867	-91266916	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	344	5
1106	478	324	60	60	chr3	68332926	68333159	-91266624	-	MLT1D	LTR	MaLR	-264	241	9	5
1106	1698	143	96	25	chr3	68336152	68336475	-91263308	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	230	5
1106	275	136	174	43	chr3	68336487	68336556	-91263227	-	RMER15	LTR	ERVL	-471	104	27	5
1106	3412	142	79	72	chr3	68340612	68341297	-91258486	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1106	1644	223	55	22	chr3	68342712	68343115	-91256668	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	1	5
1106	264	253	13	26	chr3	68343788	68343865	-91255918	-	MLT1J	LTR	MaLR	-169	343	268	5
1106	1327	201	154	36	chr3	68353072	68353429	-91246354	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	13	6
1106	1366	230	138	3	chr3	68353626	68353997	-91245786	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
1106	700	319	112	19	chr3	68354222	68354535	-91245248	+	LTR16A	LTR	ERVL	11	352	-99	6
1106	558	306	105	81	chr3	68354885	68355219	-91244564	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	35	6
1106	558	306	105	81	chr3	68355418	68355453	-91244330	-	MTE2a	LTR	MaLR	-345	34	1	6
1106	393	328	21	82	chr3	68355453	68355757	-91244026	+	MTEa	LTR	MaLR	84	379	0	6
1106	358	215	276	48	chr3	68357955	68358165	-91241618	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-5	564	307	6
1106	1390	270	30	35	chr3	68361135	68361504	-91238279	+	MTEa	LTR	MaLR	1	367	-12	6
1106	1510	201	87	6	chr3	68362123	68362469	-91237314	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1106	322	334	85	95	chr3	68364653	68364970	-91234813	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	45	6
1106	474	287	40	58	chr3	68370599	68370773	-91229010	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	332	6
1106	756	244	162	7	chr3	68372631	68372903	-91226880	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	52	6
1106	2531	131	5	56	chr3	68402287	68402716	-91197067	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	7
1106	3223	46	18	3	chr3	68411805	68412197	-91187586	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	3	7
1107	890	263	106	60	chr3	68425402	68425799	-91173984	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	7
1107	3352	40	0	5	chr3	68432707	68433105	-91166678	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1107	250	215	30	15	chr3	68434783	68434849	-91164934	+	MLT1J2	LTR	MaLR	252	318	-130	7
1107	2473	146	42	2	chr3	68447305	68447710	-91152073	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	7
1107	499	247	86	6	chr3	68453679	68453842	-91145941	+	RLTR28B	LTR	ERVL	11	186	-295	7
1107	273	385	23	12	chr3	68454602	68454773	-91145010	+	ORR1E	LTR	MaLR	25	197	-162	7
1107	250	167	83	0	chr3	68460147	68460207	-91139576	-	RMER5	LTR	ERV1	-128	406	342	7
1107	488	221	58	58	chr3	68460966	68461120	-91138663	-	RMER5	LTR	ERV1	-368	166	13	7
1107	707	203	16	53	chr3	68462347	68462534	-91137249	-	RMER5	LTR	ERV1	-1	533	354	7
1107	499	156	0	0	chr3	68463298	68463406	-91136377	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	108	-238	7
1107	246	94	0	36	chr3	68463407	68463446	-91136337	+	ORR1A2	LTR	MaLR	44	80	-287	7
1107	1886	100	13	20	chr3	68463446	68463784	-91135999	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1107	637	309	140	29	chr3	68467734	68468041	-91131742	-	MTE2b	LTR	MaLR	-28	351	11	7
1107	611	284	98	62	chr3	68468242	68468467	-91131316	+	MLT2B1	LTR	ERVL	56	288	-232	7
1107	558	333	12	74	chr3	68469827	68470083	-91129700	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-61	454	215	8
1107	3178	186	75	45	chr3	68471326	68472104	-91127679	-	RLTR40	LTR	ERVK	-16	801	1	8
1107	3900	175	144	25	chr3	68472253	68472849	-91126934	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-117	1141	447	8
1107	3900	175	144	25	chr3	68472939	68473362	-91126421	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-812	446	3	8
1107	1619	193	85	0	chr3	68473376	68473729	-91126054	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	1	8
1107	1822	100	4	4	chr3	68473729	68473999	-91125784	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	144	8
1107	245	322	72	17	chr3	68476295	68476475	-91123308	+	LTR73	LTR	ERV1	281	470	-102	8
1107	3203	56	2	5	chr3	68477332	68477729	-91122054	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1107	3010	41	7	81	chr3	68483993	68484414	-91115369	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	8
1107	16940	29	6	3	chr3	68484424	68486362	-91113421	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	1984	-3	8
1107	3010	41	7	81	chr3	68486364	68486785	-91112998	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	8
1107	349	242	10	20	chr3	68490133	68490234	-91109549	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	280	8
1107	331	323	15	30	chr3	68490658	68490789	-91108994	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-425	129	1	8
1107	1138	203	181	23	chr3	68500689	68501037	-91098746	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1107	1703	198	88	33	chr3	68502674	68503071	-91096712	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1107	624	343	50	26	chr3	68510202	68510543	-91089240	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	349	-10	2
1107	765	252	102	92	chr3	68512564	68512931	-91086852	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	7	2
1107	729	184	49	14	chr3	68514690	68514828	-91084955	+	RLTR11A	LTR	ERVK	6	148	-380	3
1107	753	236	24	44	chr3	68514828	68515058	-91084725	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	323	3
1107	366	123	215	0	chr3	68515062	68515127	-91084656	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-455	79	1	3
1107	1851	177	72	6	chr3	68515127	68515489	-91084294	+	RLTR11A	LTR	ERVK	143	528	0	3
1107	633	124	10	0	chr3	68516304	68516401	-91083382	+	MTC	LTR	MaLR	1	98	-323	3
1107	1151	139	6	0	chr3	68516434	68516600	-91083183	-	RLTR17	LTR	ERVK	-326	366	200	3
1107	1242	225	72	7	chr3	68516599	68516890	-91082893	+	MTC	LTR	MaLR	104	413	-8	3
1107	411	303	80	35	chr3	68523328	68523651	-91076132	-	MTEb	LTR	MaLR	-11	348	12	4
1107	403	184	13	13	chr3	68525306	68525383	-91074400	+	MLT1A1	LTR	MaLR	299	375	-33	5
1107	820	246	105	35	chr3	68525613	68525899	-91073884	+	MTEb	LTR	MaLR	34	339	-40	5
1107	2452	86	3	15	chr3	68527766	68528097	-91071686	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1107	2742	33	92	3	chr3	68536469	68536806	-91062977	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1107	56579	23	15	6	chr3	68536806	68543221	-91056562	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	6
1107	2937	31	45	3	chr3	68543221	68543573	-91056210	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1107	419	325	68	56	chr3	68544673	68545028	-91054755	+	MER52-int	LTR	ERV1	3637	3995	-3096	6
1107	846	227	57	53	chr3	68546345	68546573	-91053210	+	MTE2a	LTR	MaLR	151	379	0	6
1107	2894	116	25	2	chr3	68549307	68549740	-91050043	+	RMER15	LTR	ERVL	1	443	-132	7
1108	2463	89	78	10	chr3	68556923	68557308	-91042475	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	7
1108	569	215	22	15	chr3	68558587	68558724	-91041059	+	RMER15	LTR	ERVL	433	570	-5	7
1108	959	244	170	0	chr3	68558727	68558957	-91040826	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1	269	-4730	7
1108	1706	187	55	76	chr3	68560478	68560860	-91038923	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	8
1108	234	289	95	95	chr3	68562900	68563068	-91036715	-	LTR48	LTR	ERV1	-619	168	1	9
1108	319	96	0	19	chr3	68563786	68563839	-91035944	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	52	-332	9
1108	870	178	51	32	chr3	68564016	68564269	-91035514	+	ORR1D1	LTR	MaLR	52	384	0	9
1108	422	267	74	6	chr3	68565490	68565652	-91034131	+	MER92B	LTR	ERV1	56	228	-408	9
1108	3595	15	2	0	chr3	68567937	68568332	-91031451	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1108	578	178	28	9	chr3	68571761	68571869	-91027914	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-24	488	379	1
1108	912	234	141	34	chr3	68579875	68580202	-91019581	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-3	362	1	1
1108	320	248	53	46	chr3	68581455	68581586	-91018197	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	812	943	-40	1
1108	1469	52	18	18	chr3	68581624	68581841	-91017942	-	MTB	LTR	MaLR	-183	217	1	1
1108	2213	144	34	137	chr3	68584216	68584713	-91015070	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	1
1108	310	246	148	35	chr3	68586885	68587087	-91012696	-	RMER20B	LTR	ERVK	-91	425	199	1
1108	2052	143	9	54	chr3	68589563	68589992	-91009791	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	1
1108	286	309	64	0	chr3	68593547	68593657	-91006126	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-429	126	10	1
1108	2300	102	15	3	chr3	68594512	68594837	-91004946	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1108	2195	92	13	6	chr3	68599225	68599542	-91000241	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	1
1108	3469	47	126	0	chr3	68602435	68602881	-90996902	+	RLTR44C	LTR	ERVK	1	502	0	1
1108	1518	115	23	42	chr3	68602881	68603145	-90996638	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	1	259	-2553	1
1108	4306	55	30	54	chr3	68603383	68603979	-90995804	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	813	1394	-1418	1
1108	10809	30	6	2	chr3	68603970	68605219	-90994564	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	1559	2812	0	1
1108	3303	60	145	0	chr3	68605219	68605654	-90994129	+	RLTR44C	LTR	ERVK	1	498	-4	1
1108	381	223	173	73	chr3	68609669	68609819	-90989964	+	RMER10A	LTR	ERVL	12	176	-266	1
1108	1609	164	62	9	chr3	68609828	68610149	-90989634	+	ORR1B1	LTR	MaLR	49	386	-8	1
1108	532	261	116	23	chr3	68610161	68610377	-90989406	+	RMER10A	LTR	ERVL	182	417	-25	1
1108	298	361	75	75	chr3	68612228	68612536	-90987247	+	LTR81C	LTR	ERV1?	613	920	-233	1
1108	787	344	82	26	chr3	68612569	68613035	-90986748	+	MER74A	LTR	ERVL	13	504	-54	1
1108	1631	189	82	15	chr3	68613355	68613438	-90986345	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	473	1
1108	1631	189	82	15	chr3	68613477	68613785	-90985998	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-105	472	161	1
1108	2350	190	63	26	chr3	68613786	68614326	-90985457	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	1	1
1108	638	290	82	49	chr3	68622480	68622846	-90976937	+	LTR55	LTR	ERV	49	426	-122	1
1108	772	245	262	16	chr3	68625192	68625504	-90974279	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	35	1
1108	1203	196	92	25	chr3	68635955	68636269	-90963514	-	MTC	LTR	MaLR	-36	385	51	2
1108	3674	8	0	0	chr3	68636269	68636665	-90963118	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1108	9218	37	5	1	chr3	68636665	68637759	-90962024	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
1108	3385	21	23	0	chr3	68637759	68638146	-90961637	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1108	226	348	121	14	chr3	68639652	68639792	-90959991	+	MLT1G	LTR	MaLR	217	371	-220	2
1108	343	241	64	163	chr3	68647181	68647384	-90952399	+	RMER10A	LTR	ERVL	244	426	-16	2
1108	2371	146	138	84	chr3	68648666	68649310	-90950473	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	679	-11	2
1108	964	322	58	32	chr3	68653958	68654368	-90945415	+	MT2A	LTR	ERVL	2	422	-111	2
1108	4413	142	26	33	chr3	68654369	68654857	-90944926	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	496	-397	2
1108	3276	56	2	2	chr3	68654857	68655253	-90944530	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1108	4413	63	9	21	chr3	68655253	68655643	-90944140	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	408	879	-14	2
1108	375	247	570	16	chr3	68656067	68656309	-90943474	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	379	0	2
1108	2179	146	58	15	chr3	68656798	68657194	-90942589	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	2
1108	250	326	20	10	chr3	68657426	68657525	-90942258	+	MLT1J1	LTR	MaLR	3	102	-342	2
1108	245	268	41	27	chr3	68659105	68659178	-90940605	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-371	198	125	2
1108	612	309	58	29	chr3	68661975	68662318	-90937465	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	1	2
1108	1545	224	74	6	chr3	68664349	68664700	-90935083	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	375	-4	2
1108	745	234	99	139	chr3	68665576	68666008	-90933775	-	RLTR23	LTR	ERV1	-8	422	8	2
1108	2513	62	6	58	chr3	68666066	68666411	-90933372	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1108	323	331	16	24	chr3	68666914	68667038	-90932745	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	126	-233	2
1108	1686	196	66	16	chr3	68679025	68679411	-90920372	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	13	2
1108	281	93	23	0	chr3	68680408	68680451	-90919332	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	44	-323	2
1108	326	270	25	34	chr3	68681184	68681303	-90918480	+	RMER15	LTR	ERVL	6	123	-452	2
1108	501	238	265	0	chr3	68681464	68681633	-90918150	+	RMER15	LTR	ERVL	275	491	-84	2
138	1996	153	56	13	chr3	68681633	68681970	-90917813	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	352	-42	2
1109	1996	153	56	13	chr3	68682143	68682183	-90917600	+	ORR1B1	LTR	MaLR	353	393	-1	2
1109	4092	246	53	66	chr3	68682183	68682851	-90916932	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	651	-719	2
1109	4092	246	53	66	chr3	68683549	68684267	-90915516	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	652	1369	-1	2
1109	2067	157	103	6	chr3	68684267	68684626	-90915157	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1109	233	286	65	0	chr3	68684633	68684710	-90915073	+	RMER15	LTR	ERVL	492	573	-2	2
1109	239	204	211	22	chr3	68685438	68685528	-90914255	+	MT2B	LTR	ERVL	151	257	-344	2
1109	2343	132	79	31	chr3	68689217	68689662	-90910121	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	466	0	3
1109	277	317	64	35	chr3	68690713	68690886	-90908897	+	MER21B	LTR	ERV1	141	318	-545	3
1109	2466	140	45	30	chr3	68691431	68691522	-90908261	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	402	3
1109	2466	140	45	30	chr3	68691582	68691982	-90907801	-	RLTR16	LTR	ERVK	-104	401	7	3
1109	477	319	303	55	chr3	68692296	68692663	-90907120	+	MER4B-int	LTR	ERV1	3142	3599	-3159	3
1109	438	351	79	31	chr3	68692872	68693163	-90906620	+	MER21-int	LTR	ERV1	674	978	-3213	3
1109	667	271	144	67	chr3	68693836	68694212	-90905571	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	3
1109	381	296	72	0	chr3	68694224	68694349	-90905434	+	MER21-int	LTR	ERV1	3492	3625	-566	3
1109	497	244	69	0	chr3	68694558	68694696	-90905087	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-215	150	1	3
1109	415	194	153	0	chr3	68694767	68694865	-90904918	+	MER21-int	LTR	ERV1	3720	3832	-359	3
1109	490	262	54	0	chr3	68694877	68695026	-90904757	+	MER21-int	LTR	ERV1	3859	4015	-176	3
1109	287	192	75	25	chr3	68695491	68695571	-90904212	+	MTC	LTR	MaLR	5	88	-331	3
1109	676	204	13	32	chr3	68695649	68695806	-90903977	+	MTC	LTR	MaLR	268	421	0	3
1109	474	305	95	62	chr3	68696064	68696389	-90903394	+	MER21B	LTR	ERV1	383	718	-145	3
1109	227	227	14	96	chr3	68701153	68701189	-90898594	-	RMER21A	LTR	ERV1	-630	317	288	3
1109	435	40	0	0	chr3	68704040	68704090	-90895693	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4450	1035	986	3
1109	2852	10	56	0	chr3	68704376	68704970	-90894813	+	MERVL-int	LTR	ERVL	406	1032	-4453	3
1109	482	17	0	0	chr3	68704970	68705029	-90894754	+	ORR1C1	LTR	MaLR	288	346	0	3
1109	2425	46	0	0	chr3	68705029	68705358	-90894425	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1	329	-1463	3
1109	3091	5	0	0	chr3	68705360	68705732	-90894051	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	-121	372	1	3
1109	710	32	21	0	chr3	68706067	68706160	-90893623	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	390	484	-9	3
1109	7504	13	39	0	chr3	68706831	68707676	-90892107	+	MERVL-int	LTR	ERVL	187	1064	-4421	3
1109	2834	28	0	0	chr3	68708079	68708398	-90891385	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-438	5047	4729	3
1109	2826	8	83	0	chr3	68708399	68708797	-90890986	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4429	1056	626	3
1109	1828	146	17	54	chr3	68708901	68709255	-90890528	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	343	-35	3
1109	769	266	72	98	chr3	68712510	68712906	-90886877	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	400	-19	3
1109	2519	74	3	69	chr3	68728340	68728690	-90871093	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1109	284	281	43	97	chr3	68732661	68732846	-90866937	+	MTEa	LTR	MaLR	171	345	-34	3
1109	431	331	45	7	chr3	68745724	68745879	-90853904	+	MLT1A0	LTR	MaLR	156	316	-49	3
1109	1932	196	124	74	chr3	68746203	68746501	-90853282	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	322	-262	3
1109	1932	196	124	74	chr3	68746645	68746902	-90852881	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	323	584	0	3
1109	1100	237	92	19	chr3	68750269	68750540	-90849243	-	MTE2b	LTR	MaLR	-22	357	67	4
1109	270	224	26	0	chr3	68750885	68750961	-90848822	+	MTEa	LTR	MaLR	202	279	-100	4
1109	556	344	107	20	chr3	68751149	68751449	-90848334	+	MLT1K	LTR	MaLR	224	549	-46	4
1109	234	283	17	94	chr3	68752054	68752171	-90847612	+	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	311	418	-650	4
1109	371	174	34	162	chr3	68755866	68755933	-90843850	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	209	4
1109	3292	76	13	132	chr3	68755933	68756480	-90843303	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	4
1109	371	174	34	162	chr3	68756509	68756529	-90843254	-	MT2B	LTR	ERVL	-393	208	163	4
1109	495	225	30	37	chr3	68760902	68761036	-90838747	+	RMER15	LTR	ERVL	423	555	-20	4
1109	291	330	75	78	chr3	68764701	68765007	-90834776	+	ORR1E	LTR	MaLR	55	359	0	4
1109	887	224	167	56	chr3	68767198	68767539	-90832244	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	4
1109	541	202	9	28	chr3	68768360	68768467	-90831316	+	MTC	LTR	MaLR	3	107	-314	4
1109	1822	173	194	4	chr3	68769638	68770196	-90829587	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	707	1370	0	4
1109	1398	166	125	11	chr3	68770196	68770388	-90829395	+	ORR1D1	LTR	MaLR	15	228	-146	4
1109	1398	166	125	11	chr3	68770417	68770495	-90829288	+	ORR1D1	LTR	MaLR	229	317	-57	4
1109	360	123	0	0	chr3	68770885	68770942	-90828841	+	ORR1D1	LTR	MaLR	318	374	0	4
1109	290	294	84	101	chr3	68772105	68772117	-90827666	+	MT2B2	LTR	ERVL	163	183	-401	4
1109	290	294	84	101	chr3	68772204	68772283	-90827500	+	MT2B2	LTR	ERVL	184	337	-247	4
1109	244	295	184	20	chr3	68773252	68773404	-90826379	+	MTEa	LTR	MaLR	184	360	-19	4
1109	448	292	16	8	chr3	68774457	68774578	-90825205	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	277	4
1109	2642	140	24	19	chr3	68775703	68776118	-90823665	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	4
1109	614	311	68	38	chr3	68780272	68780666	-90819117	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	4017	4422	-3134	4
1109	1184	277	48	31	chr3	68781057	68781538	-90818245	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	4799	5287	-2314	4
1109	261	319	6	6	chr3	68781687	68781837	-90817946	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	5486	5563	-2038	4
1109	1124	231	97	80	chr3	68782481	68782537	-90817246	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	60	-370	4
1109	1124	231	97	80	chr3	68783181	68783546	-90816237	+	RLTR23	LTR	ERV1	61	429	-1	4
1109	236	200	14	122	chr3	68783760	68783834	-90815949	+	RLTR14	LTR	ERV1	317	382	0	4
1109	832	238	119	45	chr3	68785065	68785351	-90814432	-	RLTR14	LTR	ERV1	-75	307	1	4
1109	1051	286	102	35	chr3	68790328	68790839	-90808944	+	MLT1F1	LTR	MaLR	14	548	0	5
1109	750	244	78	93	chr3	68791262	68791647	-90808136	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
1109	1788	164	75	60	chr3	68795771	68796185	-90803598	+	MTC	LTR	MaLR	2	421	0	5
1109	3104	73	0	0	chr3	68796959	68797355	-90802428	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1109	1999	186	124	27	chr3	68799915	68800397	-90799386	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	5
1109	555	277	101	72	chr3	68800964	68801201	-90798582	+	MTEa	LTR	MaLR	6	249	-130	5
1109	249	154	134	126	chr3	68802379	68802410	-90797373	+	MT2B	LTR	ERVL	131	247	-351	5
1109	805	190	6	47	chr3	68802580	68802751	-90797032	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-206	164	1	5
1109	459	196	173	47	chr3	68803169	68803319	-90796464	+	ORR1D2	LTR	MaLR	168	336	-34	5
1110	246	214	139	28	chr3	68832664	68832736	-90767047	-	MT2B	LTR	ERVL	-355	246	167	6
1110	1268	169	171	28	chr3	68844079	68844401	-90755382	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	1	6
1110	334	381	87	50	chr3	68850260	68850661	-90749122	-	MER34A	LTR	ERV1	-137	434	19	6
1110	1346	201	63	99	chr3	68855472	68855854	-90743929	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	369	-10	6
1110	1650	214	77	71	chr3	68862738	68863086	-90736697	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-14	513	160	7
1110	1650	214	77	71	chr3	68863256	68863416	-90736367	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-368	159	2	7
1110	1412	168	91	15	chr3	68864733	68865049	-90734734	+	ORR1B1	LTR	MaLR	24	330	-37	7
1110	412	123	0	0	chr3	68865083	68865148	-90734635	+	ORR1B1	LTR	MaLR	322	386	-8	7
1110	3426	206	66	7	chr3	68865152	68865980	-90733803	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	877	-632	7
1110	252	276	21	84	chr3	68867590	68867609	-90732174	+	MT2B	LTR	ERVL	150	162	-439	7
1110	234	270	86	48	chr3	68872495	68872600	-90727183	+	RMER21A	LTR	ERV1	596	704	-243	7
1110	669	270	213	39	chr3	68874449	68874904	-90724879	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	44	631	-23	7
1110	1938	147	25	12	chr3	68894781	68895104	-90704679	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1110	1084	298	114	71	chr3	68920204	68920756	-90679027	+	MER21B	LTR	ERV1	185	760	-103	8
1110	272	250	109	0	chr3	68921527	68921591	-90678192	-	MTEa	LTR	MaLR	-54	325	255	8
1111	924	114	38	108	chr3	68952458	68952512	-90647271	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	347	9
1111	924	114	38	108	chr3	68953074	68953205	-90646578	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-48	346	222	9
1111	588	183	43	17	chr3	68961631	68961748	-90638035	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	300	9
1111	581	235	38	0	chr3	68961794	68961926	-90637857	-	MTD	LTR	MaLR	-281	138	2	9
1111	385	252	39	10	chr3	68962519	68962623	-90637160	+	MLT1A0	LTR	MaLR	32	138	-227	9
1111	2967	42	15	2	chr3	68962868	68963272	-90636511	-	BGLII	LTR	ERVK	-12	409	1	9
1111	384	329	7	0	chr3	68967096	68967239	-90632544	+	ERVL-int	LTR	ERVL	5215	5358	-399	9
1111	1174	225	135	7	chr3	68967627	68967931	-90631852	+	MTD	LTR	MaLR	23	365	-54	9
1111	1347	159	215	14	chr3	68968653	68968997	-90630786	+	MTD	LTR	MaLR	5	417	-2	9
1111	1324	194	50	21	chr3	68969512	68969791	-90629992	+	MTC	LTR	MaLR	4	290	-131	9
1111	1590	220	46	97	chr3	68969793	68970317	-90629466	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-5	507	11	9
1111	578	239	0	0	chr3	68970328	68970462	-90629321	+	MTC	LTR	MaLR	283	416	-5	9
1111	1836	147	51	9	chr3	68971229	68971545	-90628238	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	9
1111	986	110	6	24	chr3	68971545	68971713	-90628070	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	1799	9
1111	274	175	0	127	chr3	68971775	68971893	-90627890	-	RMER17A	LTR	ERVK	-287	464	362	9
1111	226	321	48	88	chr3	68972878	68973025	-90626758	+	MLT1J1	LTR	MaLR	157	297	-147	9
1111	395	344	128	50	chr3	68982580	68983058	-90616725	-	MLT2B2	LTR	ERVL	0	515	1	1
1111	1743	122	11	106	chr3	68983354	68983712	-90616071	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	324	-5	1
1111	1478	210	70	9	chr3	68984354	68984695	-90615088	-	MTD	LTR	MaLR	-56	363	2	1
1111	1285	245	94	16	chr3	68985316	68985689	-90614094	+	MTD	LTR	MaLR	8	409	-10	1
1111	742	304	71	33	chr3	68994200	68994514	-90605269	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	345	-14	1
1111	394	284	142	137	chr3	68995801	68996173	-90603610	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	6	1
1111	607	308	189	0	chr3	68996300	68996527	-90603256	-	MTEa	LTR	MaLR	-47	332	63	1
1111	580	231	75	75	chr3	68999744	68999997	-90599786	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	101	353	-327	1
1111	338	264	184	63	chr3	69000003	69000177	-90599606	+	MLT1E	LTR	MaLR	383	577	-76	1
1111	3419	43	0	0	chr3	69001128	69001524	-90598259	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1111	2477	22	0	0	chr3	69001524	69001837	-90597946	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	313	-785	6
1111	403	299	73	0	chr3	69001904	69002041	-90597742	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	244	7
1111	537	309	0	18	chr3	69002066	69002234	-90597549	+	MTEa	LTR	MaLR	1	165	-214	8
1111	380	297	80	20	chr3	69003299	69003450	-90596333	-	MTD	LTR	MaLR	-158	261	102	1
1111	4639	109	26	4	chr3	69004803	69005537	-90594246	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1214	1963	0	1
1111	2323	112	16	0	chr3	69005537	69005858	-90593925	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	326	-1	1
1111	317	275	27	81	chr3	69005953	69006064	-90593719	-	RMER12	LTR	ERVK	-471	851	747	1
1111	1072	263	10	28	chr3	69006189	69006478	-90593305	-	MTD	LTR	MaLR	-135	284	1	1
1111	803	258	55	72	chr3	69006871	69007218	-90592565	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	359	0	2
1111	348	375	66	41	chr3	69007585	69007977	-90591806	-	MLT1I	LTR	MaLR	-3	408	7	2
1111	3019	50	55	0	chr3	69014784	69015163	-90584620	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1111	4887	45	5	2	chr3	69016760	69017345	-90582438	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	4
1111	772	154	117	28	chr3	69020331	69020511	-90579272	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	196	-494	5
1111	1315	160	266	3	chr3	69021933	69022302	-90577481	+	RMER6C	LTR	ERVK	183	648	-42	5
1111	3266	157	118	12	chr3	69024495	69024798	-90574985	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	385	6
1111	3266	157	118	12	chr3	69024835	69025182	-90574601	-	RMER6D	LTR	ERVK	-336	384	2	6
1111	244	233	0	72	chr3	69025341	69025438	-90574345	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-492	611	522	6
1111	3329	18	39	0	chr3	69032562	69032943	-90566840	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1111	9275	34	3	2	chr3	69032945	69034039	-90565744	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-2	1096	2	7
1111	3329	18	39	0	chr3	69034040	69034421	-90565362	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1111	2900	41	9	0	chr3	69037336	69037679	-90562104	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	8
1111	552	186	12	52	chr3	69043861	69044051	-90555732	+	RMER6A	LTR	ERVK	58	202	-488	1
1111	1715	151	49	6	chr3	69044077	69044423	-90555360	+	RMER6A	LTR	ERVK	396	756	0	1
1111	245	276	154	15	chr3	69045515	69045651	-90554132	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	155	-472	1
1111	269	303	40	0	chr3	69045899	69045998	-90553785	+	MLT1D	LTR	MaLR	277	379	-126	1
1111	1480	198	116	39	chr3	69046334	69046723	-90553060	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1111	1785	205	110	30	chr3	69051094	69051602	-90548181	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	27	1
1111	2460	130	27	12	chr3	69052393	69052451	-90547332	+	MTC	LTR	MaLR	4	66	-355	1
1111	2460	130	27	12	chr3	69052930	69053283	-90546500	+	MTC	LTR	MaLR	67	421	0	1
1111	2347	88	62	171	chr3	69059736	69060269	-90539514	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1111	2202	170	45	41	chr3	69062426	69062624	-90537159	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	210	1
1111	2202	170	45	41	chr3	69062770	69062989	-90536794	-	MTC	LTR	MaLR	-212	209	2	1
1111	409	281	162	15	chr3	69063628	69063906	-90535877	-	LTR37B	LTR	ERV1	-16	452	134	1
1111	282	303	52	72	chr3	69064343	69064496	-90535287	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	241	1
1111	1634	200	134	76	chr3	69064714	69065266	-90534517	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	584	0	1
1111	2106	86	72	15	chr3	69065306	69065578	-90534205	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	282	-125	1
1111	2106	86	72	15	chr3	69065628	69065687	-90534096	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	283	349	-58	1
1111	4525	116	60	21	chr3	69065701	69066562	-90533221	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-11	895	1	1
1111	472	48	0	0	chr3	69066562	69066624	-90533159	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	346	407	0	1
1111	1180	214	163	111	chr3	69067461	69067965	-90531818	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	2	1
1111	1509	179	90	35	chr3	69068861	69069180	-90530603	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	56	1
1111	4212	87	39	3	chr3	69069180	69069747	-90530036	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	1
1111	1509	179	90	35	chr3	69069747	69069804	-90529979	-	RMER10B	LTR	ERVL	-343	55	1	1
1112	820	218	17	6	chr3	69080355	69080535	-90519248	+	MTE2a	LTR	MaLR	197	378	-1	2
1112	1494	146	94	88	chr3	69083696	69084048	-90515735	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	2
1112	1355	138	179	20	chr3	69088471	69088767	-90511016	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	42	2
1112	406	320	109	54	chr3	69094102	69094452	-90505331	-	LTR16B2	LTR	ERVL	-47	415	47	2
1112	2633	156	43	47	chr3	69096554	69097106	-90502677	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	550	-77	2
1112	894	99	132	30	chr3	69103617	69103784	-90495999	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	200	2
1112	2208	259	66	20	chr3	69103783	69104425	-90495358	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	258	931	-439	2
1112	1915	144	32	78	chr3	69104425	69104658	-90495125	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	155	2
1112	3180	58	10	0	chr3	69104658	69105054	-90494729	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1112	1915	144	32	78	chr3	69105054	69105220	-90494563	-	RLTR14	LTR	ERV1	-228	154	1	2
1112	410	265	8	25	chr3	69105336	69105456	-90494327	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-239	5078	4961	2
1112	1770	171	121	36	chr3	69105640	69106003	-90493780	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1112	7286	171	68	4	chr3	69106003	69106665	-90493118	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	687	-822	2
1112	7286	171	68	4	chr3	69106690	69107444	-90492339	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	688	1506	-3	2
1112	1687	159	22	5	chr3	69107444	69107766	-90492017	+	ORR1B1	LTR	MaLR	6	384	-10	2
1112	260	274	0	27	chr3	69108020	69108095	-90491688	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-492	4825	4753	2
1112	793	158	235	31	chr3	69109102	69109298	-90490485	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-1669	3648	3413	2
1112	1949	166	11	17	chr3	69109307	69109662	-90490121	+	ORR1B1	LTR	MaLR	42	394	0	2
1112	4630	165	69	69	chr3	69109662	69110656	-90489127	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-1901	3416	2423	2
1112	539	191	114	0	chr3	69110716	69110821	-90488962	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4400	917	801	2
1112	560	241	69	39	chr3	69110928	69111131	-90488652	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4660	657	449	2
1112	1553	190	93	3	chr3	69111374	69111727	-90488056	-	MTC	LTR	MaLR	-36	385	1	2
1112	4330	25	0	0	chr3	69113638	69114120	-90485663	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
1112	602	143	16	56	chr3	69114429	69114555	-90485228	+	ORR1B2	LTR	MaLR	5	125	-242	2
1112	1091	186	8	91	chr3	69114648	69114891	-90484892	+	ORR1B2	LTR	MaLR	119	341	-26	2
1112	1714	156	61	9	chr3	69117648	69117797	-90481986	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	151	-216	2
1112	1714	156	61	9	chr3	69117859	69118039	-90481744	+	ORR1B2	LTR	MaLR	152	345	-22	2
1112	242	29	59	0	chr3	69134058	69134092	-90465691	+	ORR1D2	LTR	MaLR	322	357	-13	3
1112	1487	182	124	84	chr3	69135376	69135779	-90464004	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1112	1091	228	167	13	chr3	69163546	69163905	-90435878	+	MTD	LTR	MaLR	6	402	-17	3
1112	413	299	128	20	chr3	69177951	69178200	-90421583	+	MLT1A0	LTR	MaLR	88	363	-2	3
1112	2842	85	25	5	chr3	69188174	69188566	-90411217	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1112	775	343	56	86	chr3	69195436	69195934	-90403849	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-68	486	4	4
1112	393	325	91	11	chr3	69197088	69197374	-90402409	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	310	-49	4
1112	1227	261	39	14	chr3	69197964	69198321	-90401462	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	6	4
1112	262	299	157	9	chr3	69200564	69200672	-90399111	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-320	128	5	4
1112	2072	125	94	6	chr3	69203207	69203569	-90396214	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1113	423	276	136	11	chr3	69209386	69209562	-90390221	-	MER21B	LTR	ERV1	-86	777	580	4
1113	246	275	178	53	chr3	69209591	69209760	-90390023	-	MER21B	LTR	ERV1	-423	440	251	4
1113	421	290	151	87	chr3	69209769	69210113	-90389670	+	MTE2a	LTR	MaLR	9	374	-5	4
1113	717	264	13	56	chr3	69210124	69210357	-90389426	-	MER21B	LTR	ERV1	-618	245	23	4
1113	2398	146	60	62	chr3	69211799	69212316	-90387467	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	4
1113	329	304	0	25	chr3	69213360	69213478	-90386305	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	391	4
1113	459	253	165	30	chr3	69217742	69217942	-90381841	-	MLT1D	LTR	MaLR	-7	498	272	4
1113	255	250	152	62	chr3	69218278	69218423	-90381360	-	MLT1D	LTR	MaLR	-343	162	5	4
1113	1424	249	58	20	chr3	69221050	69221447	-90378336	+	MTD	LTR	MaLR	8	419	0	4
1113	4387	106	67	17	chr3	69225142	69225860	-90373923	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	756	0	4
1113	1842	157	16	0	chr3	69225932	69226251	-90373532	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	98	4
1113	1775	145	43	57	chr3	69226255	69226606	-90373177	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	4
1113	385	196	152	0	chr3	69226609	69226701	-90373082	-	MTC	LTR	MaLR	-315	106	1	4
1113	311	290	179	10	chr3	69232810	69233005	-90366778	+	MLT1G1	LTR	MaLR	13	240	-339	5
1113	2118	143	33	3	chr3	69233059	69233395	-90366388	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	5
1113	485	289	93	58	chr3	69233943	69234200	-90365583	+	MLT1G1	LTR	MaLR	290	555	-24	5
1113	3158	128	48	17	chr3	69238673	69239214	-90360569	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	558	-10	5
1113	225	287	103	17	chr3	69239657	69239774	-90360009	-	MLT1A	LTR	MaLR	-220	154	28	5
1113	1030	219	195	62	chr3	69240571	69240941	-90358842	+	MT2A	LTR	ERVL	3	421	-112	5
1113	471	170	100	36	chr3	69248572	69248712	-90351071	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	4091	4239	-1283	5
1113	476	316	170	55	chr3	69256654	69256928	-90342855	-	LTR33	LTR	ERVL	-79	436	136	5
1113	476	316	170	55	chr3	69256948	69257055	-90342728	-	LTR33	LTR	ERVL	-380	135	11	5
1113	270	253	50	12	chr3	69260300	69260380	-90339403	-	ORR1E	LTR	MaLR	-276	83	1	5
1113	1677	148	27	62	chr3	69265689	69266140	-90333643	-	RMER17C	LTR	ERVK	-517	441	16	5
1113	2285	158	32	5	chr3	69269251	69269653	-90330130	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	5
1113	485	293	158	37	chr3	69275001	69275280	-90324503	+	MLT1A0	LTR	MaLR	3	321	-44	5
1113	2025	149	114	5	chr3	69275280	69275658	-90324125	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	5
1113	485	293	158	37	chr3	69275658	69275701	-90324082	+	MLT1A0	LTR	MaLR	322	364	-1	5
1113	315	318	0	98	chr3	69275886	69276029	-90323754	-	LTR78	LTR	ERV1	-15	1289	1161	5
1113	248	315	63	0	chr3	69276567	69276710	-90323073	-	LTR78	LTR	ERV1	-712	592	441	5
1113	1367	202	112	14	chr3	69278212	69278564	-90321219	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	378	0	5
1113	454	212	124	152	chr3	69292490	69292646	-90307137	-	MTD	LTR	MaLR	-57	362	195	6
1113	454	212	124	152	chr3	69292856	69292916	-90306867	-	MTD	LTR	MaLR	-225	194	152	6
1113	844	144	54	5	chr3	69295054	69295257	-90304526	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	312	6
1113	606	199	212	28	chr3	69302511	69302723	-90297060	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	169	6
1113	322	339	0	17	chr3	69304243	69304363	-90295420	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-171	194	77	6
1113	2786	145	45	54	chr3	69310163	69310696	-90289087	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	2	6
1113	440	247	40	10	chr3	69315503	69315673	-90284110	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-354	225	1	6
1113	1372	229	72	3	chr3	69326049	69326339	-90273444	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	61	6
1113	2166	149	15	63	chr3	69326339	69326734	-90273049	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	378	0	6
1113	1372	229	72	3	chr3	69326734	69326789	-90272994	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-310	60	2	6
1113	330	294	215	50	chr3	69328242	69328521	-90271262	+	MLT1E1	LTR	MaLR	314	638	-16	6
1113	337	173	0	0	chr3	69333728	69333780	-90266003	+	MTE2b	LTR	MaLR	325	376	-3	6
1113	392	259	69	35	chr3	69336040	69336156	-90263627	+	MLT1F2	LTR	MaLR	5	124	-445	6
1113	567	295	149	36	chr3	69336467	69336776	-90263007	+	MLT1F2	LTR	MaLR	184	527	-33	6
139	2891	55	43	33	chr3	69336882	69337278	-90262505	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
1114	4752	91	36	72	chr3	69337330	69338169	-90261614	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	6
1114	3270	53	2	5	chr3	69348468	69348869	-90250914	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
1114	1823	141	52	0	chr3	69350648	69350939	-90248844	+	MTC	LTR	MaLR	1	306	-115	6
1114	508	209	19	38	chr3	69350985	69351144	-90248639	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	120	6
1114	991	253	43	31	chr3	69354511	69354893	-90244890	-	MT2A	LTR	ERVL	-47	554	1	6
1114	2383	98	3	15	chr3	69366758	69367091	-90232692	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	7
1114	225	35	0	0	chr3	69372456	69372485	-90227298	-	MTEb	LTR	MaLR	-25	394	366	7
1114	346	320	65	13	chr3	69373339	69373453	-90226330	-	MTEb	LTR	MaLR	-15	364	248	7
1114	4975	95	78	0	chr3	69373453	69374137	-90225646	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	7
1114	346	320	65	13	chr3	69374137	69374177	-90225606	-	MTEb	LTR	MaLR	-132	247	203	7
1114	4606	96	79	8	chr3	69374382	69375052	-90224731	+	RMER19A	LTR	ERVK	20	737	0	7
1114	375	269	41	25	chr3	69375052	69375166	-90224617	+	MTEb	LTR	MaLR	249	364	-15	7
1114	225	35	0	0	chr3	69376021	69376050	-90223733	+	MTEb	LTR	MaLR	366	394	-25	7
1114	226	338	89	38	chr3	69376619	69376776	-90223007	+	MLT1I	LTR	MaLR	227	391	-20	7
1114	2209	103	18	50	chr3	69386098	69386155	-90213628	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	272	7
1114	2209	103	18	50	chr3	69386331	69386611	-90213172	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-56	271	1	7
1114	6345	89	27	6	chr3	69386623	69387536	-90212247	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-32	1931	999	7
1114	1941	90	0	15	chr3	69387547	69387817	-90211966	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-61	266	1	7
1114	4363	42	0	8	chr3	69388907	69389414	-90210369	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	7
1114	1349	167	169	103	chr3	69389804	69390164	-90209619	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	7
1114	2125	171	44	17	chr3	69390610	69391020	-90208763	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	7
1114	275	211	190	17	chr3	69391656	69391772	-90208011	-	MT2A	LTR	ERVL	-3	530	395	7
1114	519	181	21	0	chr3	69393482	69393599	-90206184	+	ORR1D1	LTR	MaLR	52	178	-206	7
1114	305	259	0	0	chr3	69393573	69393654	-90206129	+	ORR1D1	LTR	MaLR	294	374	0	7
1114	2567	178	22	8	chr3	69393665	69394178	-90205605	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	12	558	-812	7
1114	1968	255	64	20	chr3	69394227	69394657	-90205126	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	556	1008	-362	7
1114	2257	89	41	3	chr3	69400012	69400329	-90199454	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	7
1114	1906	175	121	83	chr3	69406003	69406557	-90193226	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	7
1114	1528	180	48	95	chr3	69406741	69407153	-90192630	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	7
1114	3410	28	2	22	chr3	69409173	69409577	-90190206	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1114	542	340	57	46	chr3	69409831	69410112	-90189671	-	RMER15	LTR	ERVL	-17	558	275	7
1114	275	133	0	48	chr3	69412563	69412626	-90187157	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	899	958	-5179	7
1114	281	111	0	0	chr3	69415187	69415223	-90184560	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1750	1785	-3737	7
1114	355	236	19	81	chr3	69415239	69415400	-90184383	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1018	1168	-4969	7
1114	655	212	42	0	chr3	69416808	69416926	-90182857	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-214	7192	7070	7
1114	1159	233	99	91	chr3	69416976	69417919	-90181864	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1870	3026	-3111	7
1114	258	184	7	127	chr3	69417971	69418080	-90181703	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3123	3193	-2944	7
1114	1673	173	118	8	chr3	69418217	69418573	-90181210	+	MTC	LTR	MaLR	27	421	0	7
1114	770	234	90	83	chr3	69418584	69418896	-90180887	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3648	3961	-2176	7
1114	2705	91	154	0	chr3	69420765	69421226	-90178557	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	7
1114	598	291	12	35	chr3	69421509	69421735	-90178048	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-1	615	290	7
1114	250	197	0	145	chr3	69421811	69421894	-90177889	+	MT2B	LTR	ERVL	155	225	-376	7
1114	1634	112	15	22	chr3	69421895	69422168	-90177615	-	RLTR13B4	LTR	ERVK	-3	800	530	7
1114	2864	36	0	3	chr3	69422168	69422506	-90177277	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	7
1114	7339	32	2	7	chr3	69422506	69423363	-90176420	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5629	7
1114	26401	24	17	9	chr3	69423348	69426391	-90173392	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3405	3076	8	7
1114	2864	36	0	3	chr3	69426391	69426729	-90173054	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	7
1114	1576	67	0	0	chr3	69426729	69426939	-90172844	-	RLTR13B4	LTR	ERVK	-268	535	326	7
1114	568	103	0	11	chr3	69427771	69427859	-90171924	+	RLTR13A	LTR	ERVK	769	855	0	7
1114	2283	118	17	123	chr3	69427859	69428306	-90171477	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-405	398	1	7
1114	281	325	86	57	chr3	69428306	69428511	-90171272	-	RLTR18	LTR	ERVK	-405	211	1	7
1114	1784	200	162	32	chr3	69430512	69430787	-90168996	-	RMER19A	LTR	ERVK	-11	726	445	8
1114	1917	141	36	181	chr3	69430787	69431307	-90168476	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	2	8
1114	1784	204	155	31	chr3	69431307	69431601	-90168182	-	RMER19A	LTR	ERVK	-293	444	58	8
1114	260	253	0	88	chr3	69431866	69431904	-90167879	+	MTEb	LTR	MaLR	294	324	-55	8
1114	260	253	0	88	chr3	69432093	69432145	-90167638	+	MTEb	LTR	MaLR	325	376	-3	8
1114	349	209	178	19	chr3	69432247	69432301	-90167482	-	RMER12B	LTR	ERVK	-132	1272	1201	8
1114	1500	156	71	91	chr3	69432395	69432584	-90167199	-	RLTR21	LTR	ERVK	-478	1094	926	8
1114	1500	156	71	91	chr3	69432615	69432833	-90166950	-	RLTR21	LTR	ERVK	-647	925	695	8
1114	2852	155	135	55	chr3	69433223	69433896	-90165887	-	RLTR21	LTR	ERVK	-841	731	5	8
1114	379	301	56	81	chr3	69434531	69434888	-90164895	+	ORR1E	LTR	MaLR	17	365	-5	8
1114	239	244	58	0	chr3	69435373	69435459	-90164324	-	MTE2b	LTR	MaLR	-12	367	277	8
1114	2498	80	9	0	chr3	69436408	69436732	-90163051	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	8
1114	3314	11	0	5	chr3	69441861	69442230	-90157553	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	8
1114	53297	20	10	2	chr3	69442230	69448628	-90151155	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	8
1114	3328	8	0	5	chr3	69448628	69448997	-90150786	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	8
1114	365	308	80	37	chr3	69450407	69450493	-90149290	+	RLTR18B	LTR	ERVK	9	96	-416	8
1114	365	308	80	37	chr3	69450520	69450595	-90149188	+	RLTR18B	LTR	ERVK	97	177	-335	8
1114	709	291	86	47	chr3	69450605	69450974	-90148809	+	RLTR18	LTR	ERVK	111	607	-9	8
1114	294	299	50	30	chr3	69455034	69455134	-90144649	-	MT2A	LTR	ERVL	-355	178	77	8
1114	248	335	144	7	chr3	69455042	69455195	-90144588	-	MTE2a	LTR	MaLR	-201	178	5	8
1114	3362	87	2	4	chr3	69455659	69456147	-90143636	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-16	487	1	8
1114	17099	52	37	4	chr3	69456147	69458276	-90141507	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	0	3698	1501	8
1114	532	156	114	165	chr3	69458538	69458792	-90140991	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2099	1200	960	8
1114	2526	131	20	8	chr3	69458879	69459270	-90140513	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-2245	1453	1058	8
1114	457	308	0	27	chr3	69459592	69459739	-90140044	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-7023	533	391	8
1114	2671	132	5	30	chr3	69459743	69460172	-90139611	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-7138	418	1	8
1114	269	51	0	0	chr3	69460173	69460212	-90139571	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-566	39	1	8
1114	2637	121	29	72	chr3	69462024	69462471	-90137312	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	1	8
1114	258	102	143	0	chr3	69464135	69464184	-90135599	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	343	8
1114	1229	191	174	116	chr3	69465031	69465446	-90134337	+	MT2A	LTR	ERVL	1	439	-94	8
1114	1968	218	81	43	chr3	69466130	69466638	-90133145	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	8
1115	268	267	0	0	chr3	69468228	69468288	-90131495	+	MT2A	LTR	ERVL	93	152	-381	8
1115	239	245	0	0	chr3	69468281	69468330	-90131453	+	MT2A	LTR	ERVL	301	349	-184	8
1115	617	233	78	16	chr3	69469350	69469542	-90130241	+	RMER5	LTR	ERV1	331	534	0	8
1115	244	217	0	0	chr3	69470577	69470623	-90129160	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	496	8
1115	1869	137	6	38	chr3	69470628	69470969	-90128814	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-211	330	1	8
1115	225	247	147	21	chr3	69471463	69471558	-90128225	-	MLT1J	LTR	MaLR	-304	208	102	8
1115	231	282	220	8	chr3	69472685	69472803	-90126980	+	RMER15	LTR	ERVL	433	575	0	8
1115	623	282	60	81	chr3	69474164	69474596	-90125187	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	423	-18	8
1115	958	251	63	60	chr3	69476322	69476687	-90123096	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	370	0	8
1115	441	215	43	65	chr3	69478976	69479115	-90120668	-	MLT1B	LTR	MaLR	-38	370	228	9
1115	4421	97	42	64	chr3	69479328	69480096	-90119687	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	9
1115	700	280	47	143	chr3	69480885	69481352	-90118431	-	RLTR23	LTR	ERV1	-3	427	6	9
1115	1751	189	30	63	chr3	69481918	69482313	-90117470	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	9
1115	629	281	27	18	chr3	69482527	69482752	-90117031	+	RLTR41	LTR	ERV1	199	425	-21	9
1115	1043	285	45	16	chr3	69482770	69483084	-90116699	+	ORR1E	LTR	MaLR	37	359	0	9
1115	3925	32	4	0	chr3	69483913	69484409	-90115374	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	6	9
1115	1500	157	259	22	chr3	69485480	69485851	-90113932	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	1	9
1115	1813	151	81	6	chr3	69487187	69487534	-90112249	+	MTC	LTR	MaLR	47	419	-2	9
1115	3087	180	110	44	chr3	69488198	69488954	-90110829	-	RLTR40	LTR	ERVK	-11	806	1	9
1115	305	249	10	63	chr3	69490337	69490443	-90109340	+	MER57A-int	LTR	ERV1	5804	5893	-294	9
1115	2135	187	68	18	chr3	69491952	69492454	-90107329	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	9
1115	553	299	126	62	chr3	69493312	69493702	-90106081	+	MLT1B	LTR	MaLR	22	459	-8	9
1115	1581	197	19	48	chr3	69494637	69495016	-90104767	+	ORR1B1	LTR	MaLR	2	369	-9	9
1115	3150	46	5	69	chr3	69495121	69495544	-90104239	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1115	6630	117	57	89	chr3	69495546	69497292	-90102491	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	8	1963	0	9
1115	2551	108	47	15	chr3	69497370	69497776	-90102007	-	BGLII	LTR	ERVK	-2	419	1	9
1115	234	264	14	27	chr3	69498168	69498242	-90101541	+	MLT1A1	LTR	MaLR	320	392	-16	9
1115	3701	44	2	14	chr3	69499515	69500000	-90099783	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	479	-24	9
1115	2324	170	5	92	chr3	69500024	69500608	-90099175	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1	533	-7023	1
1115	2753	82	62	8	chr3	69500936	69501598	-90098185	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	772	1469	-2229	1
1115	534	140	49	19	chr3	69501747	69501938	-90097845	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1020	1184	-2115	3
1115	350	88	0	0	chr3	69502275	69502332	-90097451	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1501	1557	-2141	3
1115	1966	53	0	8	chr3	69502332	69502581	-90097202	+	RLTR1C	LTR	ERV1	257	503	0	6
1115	978	176	31	86	chr3	69502581	69502824	-90096959	-	RMER10A	LTR	ERVL	-37	405	178	7
1115	978	176	31	86	chr3	69503011	69503022	-90096761	-	RMER10A	LTR	ERVL	-265	177	165	7
1115	396	312	64	13	chr3	69504180	69504336	-90095447	-	LTR48	LTR	ERV1	-141	646	483	1
1115	303	320	64	53	chr3	69504375	69504563	-90095220	-	LTR48	LTR	ERV1	-454	190	1	1
1115	3044	53	2	64	chr3	69509869	69510291	-90089492	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1115	7968	80	11	2	chr3	69510291	69511379	-90088404	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
1115	3062	67	13	3	chr3	69511379	69511769	-90088014	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	3	2
1115	229	378	104	55	chr3	69513887	69514069	-90085714	+	MLT1N2	LTR	MaLR	162	352	-210	2
1115	453	341	12	18	chr3	69514093	69514263	-90085520	+	MLT1N2	LTR	MaLR	394	562	0	2
1115	1081	128	321	71	chr3	69515865	69516245	-90083538	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	475	-215	3
1115	1334	114	38	0	chr3	69518317	69518528	-90081255	+	RMER6C	LTR	ERVK	472	690	0	3
1115	1544	174	95	23	chr3	69518863	69519211	-90080572	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	374	0	4
1115	4256	21	0	0	chr3	69519213	69519695	-90080088	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	4
1115	2630	51	45	0	chr3	69520105	69520436	-90079347	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	4
1115	253	279	11	75	chr3	69533615	69533708	-90066075	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	154	7
1115	1031	182	153	35	chr3	69537948	69538176	-90061607	-	RMER15	LTR	ERVL	-83	492	238	8
1115	720	250	133	125	chr3	69539437	69539812	-90059971	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	2	8
1115	3035	198	235	40	chr3	69540413	69540984	-90058799	-	RMER12B	LTR	ERVK	0	1404	720	8
1115	2311	78	15	58	chr3	69540984	69541326	-90058457	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	8
1115	3035	224	51	33	chr3	69541326	69542034	-90057749	-	RMER12B	LTR	ERVK	-685	719	2	8
1115	372	192	40	139	chr3	69549007	69549043	-90050740	-	MT2B	LTR	ERVL	-452	149	129	1
1115	284	309	112	1	chr3	69559249	69559395	-90040388	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	362	647	-33	1
1115	1796	164	50	3	chr3	69566128	69566488	-90033295	-	RLTR14	LTR	ERV1	-5	377	1	1
1115	1843	160	79	30	chr3	69570453	69570821	-90028962	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	1
1115	1491	158	63	58	chr3	69584226	69584341	-90015442	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-12	407	244	1
1115	1491	177	61	72	chr3	69584364	69584618	-90015165	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-131	243	3	1
1115	1071	278	102	8	chr3	69584764	69585127	-90014656	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	11	1
1115	2264	114	12	0	chr3	69585509	69585834	-90013949	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
1115	529	228	24	36	chr3	69587201	69587369	-90012414	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	265	1
1115	309	145	0	16	chr3	69588022	69588085	-90011698	-	MLT1D	LTR	MaLR	-9	496	435	1
1115	473	272	13	16	chr3	69588482	69588637	-90011146	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-5	462	241	1
1115	2438	201	27	104	chr3	69589779	69590441	-90009342	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
1115	1318	227	105	50	chr3	69595910	69596101	-90003682	+	MTD	LTR	MaLR	19	210	-209	2
1115	1318	227	105	50	chr3	69596301	69596489	-90003294	+	MTD	LTR	MaLR	211	419	0	2
1115	822	278	73	47	chr3	69597471	69597889	-90001894	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	39	2
1116	514	213	27	81	chr3	69609015	69609163	-89990620	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	423	562	-16	2
1116	818	146	50	55	chr3	69611055	69611236	-89988547	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	180	-194	2
1116	793	192	35	11	chr3	69611419	69611593	-89988190	+	ORR1D1	LTR	MaLR	197	374	0	2
1116	2266	168	44	12	chr3	69611976	69612381	-89987402	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	4	2
1116	3390	25	8	5	chr3	69617691	69618086	-89981697	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1116	1249	271	92	30	chr3	69620293	69620791	-89978992	+	RMER5	LTR	ERV1	1	529	-5	2
1116	667	293	36	62	chr3	69622134	69622440	-89977343	+	RLTR26	LTR	ERVK	120	417	-225	2
1116	287	154	58	0	chr3	69622654	69622706	-89977077	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-2806	4113	4059	2
1116	1293	302	11	0	chr3	69622990	69623341	-89976442	+	MTEb	LTR	MaLR	15	369	-10	2
1116	333	380	53	10	chr3	69627746	69627953	-89971830	+	MER68	LTR	ERVL	348	563	0	2
1116	466	258	81	38	chr3	69627986	69628171	-89971612	+	MLT1A1	LTR	MaLR	213	405	-3	2
1116	259	289	40	0	chr3	69629366	69629442	-89970341	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-329	79	1	2
1116	619	277	123	4	chr3	69632598	69632834	-89966949	+	MLT1A0	LTR	MaLR	88	351	-14	2
1116	1503	192	119	42	chr3	69646302	69646688	-89953095	+	MTD	LTR	MaLR	1	416	-3	3
1116	4485	8	2	12	chr3	69652301	69652799	-89946984	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1116	41386	16	14	0	chr3	69652799	69658086	-89941697	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	3
1116	344	179	46	35	chr3	69658086	69658173	-89941610	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	3
1116	321	0	0	0	chr3	69658173	69658211	-89941572	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
1116	4485	8	2	12	chr3	69658211	69658709	-89941074	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1116	3235	53	2	12	chr3	69662598	69662998	-89936785	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1116	2254	138	60	6	chr3	69670623	69670987	-89928796	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1116	585	204	78	67	chr3	69672265	69672444	-89927339	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1449	1629	-3370	3
1116	366	176	42	100	chr3	69676196	69676316	-89923467	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	151	3
1116	693	177	49	53	chr3	69676596	69676780	-89923003	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-199	195	5	3
1116	3886	169	178	6	chr3	69676781	69677697	-89922086	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	0	1509	436	3
1116	1269	232	82	73	chr3	69680164	69680698	-89919085	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	5	3
1116	2454	163	89	17	chr3	69681002	69681465	-89918318	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	496	-3	3
1116	418	278	77	142	chr3	69690838	69690888	-89908895	+	RMER10A	LTR	ERVL	18	57	-385	3
1116	418	278	77	142	chr3	69691073	69691450	-89908333	+	RMER10A	LTR	ERVL	58	417	-25	3
1116	1890	169	63	40	chr3	69691481	69691911	-89907872	-	RMER10A	LTR	ERVL	-2	440	1	3
1116	253	316	17	26	chr3	69695631	69695748	-89904035	+	MER57A-int	LTR	ERV1	5795	5910	-277	3
1116	442	293	111	5	chr3	69696906	69697105	-89902678	+	MLT1A1	LTR	MaLR	2	221	-187	3
1116	557	267	40	12	chr3	69697333	69697527	-89902256	+	MLT1A1	LTR	MaLR	161	405	-3	3
1116	2293	93	21	9	chr3	69713585	69713910	-89885873	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
1116	1987	218	59	62	chr3	69714506	69715199	-89884584	+	RLTR40	LTR	ERVK	114	804	-13	4
1116	3855	41	33	0	chr3	69717937	69718397	-89881386	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	4
1116	7232	120	15	10	chr3	69723476	69724963	-89874820	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	56	2028	-3733	4
1116	5200	58	22	0	chr3	69724958	69725597	-89874186	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2141	2793	-2692	4
1116	4060	64	2	2	chr3	69725597	69726100	-89873683	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	4
1116	4366	185	23	88	chr3	69726100	69727071	-89872712	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1	908	-6648	4
1116	5321	201	4	0	chr3	69727071	69728019	-89871764	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1057	2008	-5548	4
1116	7996	140	68	62	chr3	69728028	69729699	-89870084	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1940	3621	-77	4
1116	631	126	9	59	chr3	69729690	69729832	-89869951	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3221	3299	0	4
139	4252	52	2	0	chr3	69729832	69730334	-89869449	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	4
1117	14817	169	42	4	chr3	69730335	69732837	-89866946	+	ERVL-int	LTR	ERVL	2830	5425	-332	4
1117	354	123	62	0	chr3	69732864	69732929	-89866854	+	ERVL-int	LTR	ERVL	5561	5629	-132	4
1117	294	181	26	53	chr3	69732929	69733005	-89866778	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	4
1117	321	0	0	0	chr3	69733005	69733043	-89866740	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	4
1117	3640	27	82	0	chr3	69733043	69733482	-89866301	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	4
1117	2132	143	48	11	chr3	69736821	69737175	-89862608	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1117	1152	124	12	25	chr3	69737175	69737430	-89862353	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	358	-1151	4
1117	961	147	178	37	chr3	69738162	69738431	-89861352	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	348	654	-855	4
1117	3189	45	2	27	chr3	69738504	69738910	-89860873	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1117	1270	163	8	23	chr3	69739599	69739862	-89859921	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1212	1470	-39	4
1117	362	150	0	0	chr3	69739939	69739999	-89859784	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1311	1370	0	4
1117	2068	138	73	6	chr3	69739999	69740342	-89859441	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	4
1117	241	231	0	44	chr3	69743151	69743219	-89856564	+	RMER15	LTR	ERVL	1	65	-510	4
1117	4005	143	191	18	chr3	69743312	69744066	-89855717	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-7	1021	138	4
1117	4005	143	191	18	chr3	69744149	69744265	-89855518	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-891	137	3	4
1117	454	248	42	21	chr3	69744265	69744425	-89855358	+	RMER15	LTR	ERVL	92	315	-260	4
1117	1466	149	11	19	chr3	69745227	69745493	-89854290	-	RLTR24	LTR	ERV1	-101	428	165	4
1117	4496	10	0	12	chr3	69745496	69745995	-89853788	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
1117	2767	80	0	3	chr3	69746000	69746389	-89853394	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	9	4
1117	865	106	35	7	chr3	69746401	69746544	-89853239	-	RLTR24	LTR	ERV1	-365	164	18	4
1117	782	152	14	0	chr3	69746588	69746726	-89853057	+	RMER15	LTR	ERVL	431	570	-5	4
1117	1413	192	287	3	chr3	69747327	69747651	-89852132	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	4	4
1117	1464	180	41	17	chr3	69760162	69760456	-89839327	-	MTC	LTR	MaLR	-64	357	57	4
1117	1588	241	38	52	chr3	69760434	69760645	-89839138	-	MTC-int	LTR	MaLR	-626	632	436	4
1117	1588	241	38	52	chr3	69760871	69761154	-89838629	-	MTC-int	LTR	MaLR	-823	435	145	4
1117	3138	12	3	0	chr3	69763874	69764219	-89835564	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	4
1117	2505	133	44	44	chr3	69765129	69765270	-89834513	-	RMER6B	LTR	ERVK	-4	457	321	4
1117	2505	133	44	44	chr3	69765332	69765647	-89834136	-	RMER6B	LTR	ERVK	-141	320	1	4
1117	851	321	119	31	chr3	69771650	69772203	-89827580	+	MLT1E1	LTR	MaLR	1	602	-52	4
1117	271	269	39	0	chr3	69775809	69775887	-89823896	-	MER57-int	LTR	ERV1	-293	7244	7164	4
1117	3427	179	43	11	chr3	69780802	69781451	-89818332	+	RMER6C	LTR	ERVK	20	689	-1	5
1117	745	255	45	5	chr3	69782050	69782251	-89817532	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	209	-150	5
1117	3468	137	105	37	chr3	69783602	69784248	-89815535	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1117	654	267	11	75	chr3	69784348	69784522	-89815261	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-211	163	1	5
1117	1801	218	60	0	chr3	69785035	69785388	-89814395	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1117	1992	150	15	59	chr3	69785402	69785742	-89814041	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	327	0	5
1117	273	163	20	0	chr3	69785793	69785842	-89813941	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	50	-334	5
1117	1436	130	21	21	chr3	69789224	69789460	-89810323	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	143	5
1117	2438	140	111	0	chr3	69791333	69791711	-89808072	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	1	5
1117	3398	63	2	0	chr3	69792569	69792964	-89806819	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1117	246	283	149	8	chr3	69793741	69793862	-89805921	+	MLT-int	LTR	MaLR	645	782	-953	5
1117	300	297	57	47	chr3	69794340	69794446	-89805337	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	107	-301	5
1117	302	201	280	73	chr3	69794570	69794720	-89805063	-	RMER15	LTR	ERVL	-59	516	336	5
1117	1351	282	70	13	chr3	69797781	69798241	-89801542	-	LTR40a	LTR	ERVL	-2	517	32	5
1117	521	181	9	79	chr3	69799809	69799923	-89799860	+	RLTR28	LTR	ERVL	419	524	0	5
1117	510	304	77	108	chr3	69799960	69800211	-89799572	-	MLT1A1-int	LTR	MaLR	-1394	341	108	5
1117	510	304	77	108	chr3	69800472	69800570	-89799213	-	MLT1A1-int	LTR	MaLR	-1628	107	3	5
1117	286	282	139	44	chr3	69800572	69800709	-89799074	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	258	5
1117	1171	0	0	0	chr3	69803669	69803801	-89795982	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	265	396	0	5
1117	9647	36	4	8	chr3	69803801	69804904	-89794879	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
1117	3727	18	2	0	chr3	69804904	69805299	-89794484	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1117	254	358	39	51	chr3	69807422	69807578	-89792205	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-186	179	26	5
1117	247	286	29	0	chr3	69818186	69818256	-89781527	+	MLT1H1	LTR	MaLR	482	553	-2	5
1117	412	323	99	67	chr3	69818338	69818650	-89781133	-	MLT1H	LTR	MaLR	-195	354	33	5
1117	282	295	22	11	chr3	69825503	69825592	-89774191	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-575	127	38	5
1117	1198	208	30	30	chr3	69825866	69826129	-89773654	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	263	-111	5
1117	1142	197	213	43	chr3	69832352	69832680	-89767103	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
1117	2735	123	2	2	chr3	69833677	69834084	-89765699	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	5
1117	245	73	24	0	chr3	69839269	69839310	-89760473	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	42	-916	6
1117	268	348	78	28	chr3	69842036	69842178	-89757605	+	LTR16A	LTR	ERVL	70	218	-233	6
1117	292	321	24	12	chr3	69848324	69848406	-89751377	-	MLT1I	LTR	MaLR	-124	287	205	6
1117	227	234	21	0	chr3	69850063	69850110	-89749673	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	47	94	-434	6
1117	2366	66	108	0	chr3	69850121	69850453	-89749330	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-43	368	1	6
1117	1394	231	35	121	chr3	69856847	69857335	-89742448	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	82	527	0	6
1117	1319	259	75	14	chr3	69857341	69857690	-89742093	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
1118	1144	128	65	30	chr3	69863188	69863409	-89736374	+	RMER17A2	LTR	ERVK	2	236	-406	6
1118	233	366	109	101	chr3	69872993	69873379	-89726404	-	MLT1H	LTR	MaLR	-160	389	1	6
1118	1801	189	47	53	chr3	69886062	69886418	-89713365	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	352	-26	6
1118	1801	189	47	53	chr3	69886475	69886498	-89713285	+	ORR1C1	LTR	MaLR	353	378	0	6
1118	228	319	204	16	chr3	69886823	69887014	-89712769	+	RMER15	LTR	ERVL	276	502	-73	6
1118	1102	221	0	0	chr3	69891060	69891255	-89708528	-	MTD	LTR	MaLR	-222	197	3	6
1118	934	307	57	72	chr3	69894710	69895237	-89704546	-	MT2A	LTR	ERVL	-5	528	10	6
1118	251	271	14	0	chr3	69900239	69900309	-89699474	+	MamGypLTR2b	LTR	Gypsy	823	893	-29	6
1118	1261	230	147	62	chr3	69927808	69927893	-89671890	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	16	101	-476	7
1118	1261	230	147	62	chr3	69927918	69928350	-89671433	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	102	576	-1	7
1118	382	370	94	18	chr3	69929036	69929259	-89670524	-	MLT1I	LTR	MaLR	-160	251	12	7
1118	2053	130	93	89	chr3	69935513	69935986	-89663797	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	7
1118	2012	124	9	19	chr3	69936697	69937018	-89662765	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	7
1118	635	337	105	43	chr3	69945984	69946449	-89653334	-	MLT1D	LTR	MaLR	-9	496	3	7
1118	934	328	42	16	chr3	69952432	69952816	-89646967	-	RMER5	LTR	ERV1	-8	526	133	7
1118	2642	74	39	34	chr3	69954925	69955332	-89644451	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	7
1118	281	345	44	21	chr3	69967288	69967452	-89632331	+	MER92B	LTR	ERV1	17	188	-366	7
1118	345	374	5	70	chr3	69979353	69979540	-89620243	-	MER34A	LTR	ERV1	-385	186	12	7
1118	1456	138	9	13	chr3	69987246	69987473	-89612310	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	196	7
1118	1944	154	36	6	chr3	69988587	69988919	-89610864	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-25	342	1	8
1119	403	388	88	30	chr3	69997196	69997491	-89602292	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-8	672	361	8
1119	416	301	75	19	chr3	69998522	69998681	-89601102	+	MLT1I	LTR	MaLR	244	411	0	8
1119	1273	193	48	102	chr3	70000185	70000578	-89599205	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	2
1119	1242	267	96	0	chr3	70006670	70006992	-89592791	-	MTEb	LTR	MaLR	-12	367	15	1
1119	349	317	97	100	chr3	70008986	70009305	-89590478	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-13	361	44	2
1119	293	364	118	42	chr3	70012571	70012858	-89586925	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	309	-50	2
1119	838	244	39	23	chr3	70015070	70015299	-89584484	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	238	-156	3
1119	255	307	174	32	chr3	70028734	70028889	-89570894	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-4	444	268	5
1119	279	342	96	10	chr3	70028935	70029124	-89570659	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-248	200	1	5
1119	235	333	76	0	chr3	70029622	70029688	-89570095	+	MER21B	LTR	ERV1	22	92	-771	5
1119	857	334	104	21	chr3	70029693	70030029	-89569754	+	MER21B	LTR	ERV1	48	411	-452	5
1119	741	311	48	0	chr3	70032821	70033049	-89566734	+	MER21B	LTR	ERV1	468	706	-157	5
1119	574	335	78	29	chr3	70033430	70033737	-89566046	-	MLT1J1-int	LTR	MaLR	-219	1168	847	5
1119	654	221	128	5	chr3	70033899	70034086	-89565697	-	MER110	LTR	ERV1	-240	251	42	5
1119	267	224	0	0	chr3	70034161	70034219	-89565564	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	684	741	-646	5
1119	327	285	88	56	chr3	70034893	70035040	-89564743	-	MLT1J1-int	LTR	MaLR	-1051	336	182	5
1119	327	285	88	56	chr3	70035071	70035083	-89564700	-	MLT1J1-int	LTR	MaLR	-1206	181	172	5
1119	523	339	44	40	chr3	70035314	70035583	-89564200	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-166	282	1	5
1119	2034	147	22	0	chr3	70037993	70038313	-89561470	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1119	2221	172	53	5	chr3	70040560	70040957	-89558826	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	6	7
1119	231	214	34	51	chr3	70041456	70041515	-89558268	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1292	1349	-499	7
1119	647	258	60	24	chr3	70041720	70042066	-89557717	-	MLT1B	LTR	MaLR	-1	389	3	7
1119	761	273	31	119	chr3	70043274	70043594	-89556189	-	MTE2b	LTR	MaLR	-87	292	1	7
1119	681	266	136	4	chr3	70049124	70049307	-89550476	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	204	8
1119	681	266	136	4	chr3	70049765	70049823	-89549960	-	MTD	LTR	MaLR	-216	203	147	8
1119	1546	183	16	62	chr3	70049875	70050183	-89549600	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-29	345	52	9
1119	3462	222	34	6	chr3	70051291	70052024	-89547759	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-45	1325	572	9
1119	680	297	78	66	chr3	70062349	70062684	-89537099	-	MLT1A	LTR	MaLR	-13	361	23	1
1119	598	287	118	9	chr3	70063440	70063651	-89536132	+	LTR16C	LTR	ERVL	256	489	0	1
1119	232	326	56	0	chr3	70065425	70065514	-89534269	-	LTR78	LTR	ERV1	-230	1074	981	1
1119	1603	274	25	11	chr3	70072206	70072649	-89527134	-	RMER20A	LTR	ERVK	-2	514	66	1
1119	467	300	150	31	chr3	70077067	70077608	-89522175	-	MLT2F	LTR	ERVL	0	663	2	1
1119	511	313	88	50	chr3	70084785	70085047	-89514736	-	ORR1E	LTR	MaLR	-82	277	6	1
1119	354	331	89	11	chr3	70090557	70090737	-89509046	-	MLT1F	LTR	MaLR	-227	321	128	1
1119	1260	134	91	54	chr3	70091362	70091638	-89508145	+	RMER4B	LTR	ERVK	9	294	-291	1
1119	1454	205	42	19	chr3	70091666	70091979	-89507804	+	RMER4B	LTR	ERVK	253	572	-13	1
1119	367	273	11	64	chr3	70091985	70092267	-89507516	+	RMER17D	LTR	ERVK	285	551	-338	1
1119	527	342	145	10	chr3	70094381	70094685	-89505098	+	MLT2B3	LTR	ERVL	8	352	-202	1
1119	1641	224	238	4	chr3	70103222	70103702	-89496081	+	RMER19B	LTR	ERVK	309	900	-2	1
1119	841	326	114	12	chr3	70104358	70104699	-89495084	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-404	1176	801	1
1119	1818	328	76	27	chr3	70105038	70105810	-89493973	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-770	810	1	1
1119	489	269	67	0	chr3	70105815	70105934	-89493849	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	248	1
1119	3677	160	217	7	chr3	70106078	70106820	-89492963	-	RMER19B	LTR	ERVK	-4	898	1	1
1119	1327	248	92	20	chr3	70110404	70110795	-89488988	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1119	712	336	70	55	chr3	70111443	70112057	-89487726	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-942	4543	3921	2
1119	579	326	58	31	chr3	70112050	70112341	-89487442	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1853	3814	3516	2
1119	606	323	105	40	chr3	70113198	70113521	-89486262	+	MLT1G3	LTR	MaLR	71	414	-181	2
1119	395	237	149	56	chr3	70114497	70114643	-89485140	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2648	2749	-489	2
1119	395	299	71	79	chr3	70114837	70114968	-89484815	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2750	2885	-353	2
1119	264	136	0	0	chr3	70114939	70114983	-89484800	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	4037	4080	-2057	2
1119	537	280	78	110	chr3	70115349	70115758	-89484025	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	396	-46	2
1119	377	423	68	25	chr3	70117045	70117440	-89482343	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-58	504	93	2
1119	469	314	44	71	chr3	70118890	70119116	-89480667	+	MTE2a	LTR	MaLR	80	299	-80	2
1120	242	269	73	31	chr3	70124061	70124157	-89475626	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-9	439	340	2
1120	531	298	57	16	chr3	70126753	70126947	-89472836	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	202	-352	2
1120	569	353	29	74	chr3	70127176	70127412	-89472371	+	MLT2B1	LTR	ERVL	224	459	-61	2
1120	569	353	29	74	chr3	70127459	70127531	-89472252	+	MLT2B1	LTR	ERVL	460	518	-2	2
1120	230	294	46	23	chr3	70132611	70132698	-89467085	-	MER34A	LTR	ERV1	-477	94	6	2
1120	364	294	135	18	chr3	70132753	70132916	-89466867	+	MER34A	LTR	ERV1	67	248	-323	2
1120	251	343	161	13	chr3	70137351	70137554	-89462229	-	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	-2	780	574	2
1120	392	337	144	16	chr3	70146263	70146561	-89453222	-	ORR1E	LTR	MaLR	-8	371	4	2
1120	373	375	105	32	chr3	70149182	70149372	-89450411	-	MER21B	LTR	ERV1	-186	677	474	2
1120	559	368	57	40	chr3	70149444	70149795	-89449988	-	MER21B	LTR	ERV1	-505	358	2	2
1120	282	326	0	0	chr3	70152685	70152774	-89447009	+	ORR1D1	LTR	MaLR	53	141	-233	2
1120	255	193	122	22	chr3	70152819	70152909	-89446874	+	ORR1D1	LTR	MaLR	267	365	-9	2
1120	366	313	126	46	chr3	70152964	70153312	-89446471	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	3	2
1120	318	305	21	0	chr3	70153317	70153412	-89446371	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-23	1557	1461	2
1120	802	344	26	15	chr3	70153628	70153894	-89445889	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-231	1349	1081	2
1120	247	377	38	8	chr3	70155166	70155297	-89444486	+	ORR1C2	LTR	MaLR	24	158	-226	2
1120	334	313	23	38	chr3	70164564	70164646	-89435137	+	MTEb	LTR	MaLR	241	319	-60	2
1120	334	313	23	38	chr3	70165260	70165310	-89434473	+	MTEb	LTR	MaLR	320	371	-8	2
1120	781	286	23	160	chr3	70170406	70170543	-89429240	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-3	391	236	2
1120	781	283	23	163	chr3	70170671	70170702	-89429081	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-132	235	226	2
1120	781	292	24	154	chr3	70170746	70171008	-89428775	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-142	252	6	2
1120	2108	305	80	27	chr3	70172909	70172970	-89426813	-	MER21B	LTR	ERV1	-5	858	803	2
1120	2108	305	80	27	chr3	70172995	70173708	-89426075	-	MER21B	LTR	ERV1	-61	802	44	2
1120	259	254	17	0	chr3	70173736	70173795	-89425988	-	MER21B	LTR	ERV1	-799	64	5	2
1120	225	326	33	11	chr3	70173780	70173870	-89425913	-	MER21B	LTR	ERV1	-757	106	15	2
1120	1872	184	124	27	chr3	70176042	70176556	-89423227	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	564	-4	2
1120	423	283	239	83	chr3	70189504	70189831	-89409952	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	1	2
1120	232	148	0	103	chr3	70190833	70190901	-89408882	+	LTR59	LTR	ERV1	251	311	-286	3
1120	2912	79	8	2	chr3	70193955	70194349	-89405434	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1120	338	338	77	81	chr3	70194398	70194659	-89405124	-	ORR1E	LTR	MaLR	-50	309	50	3
1120	2310	283	52	45	chr3	70194668	70194929	-89404854	-	MTE-int	LTR	MaLR	-34	1546	1285	3
1120	2310	283	52	45	chr3	70195142	70195612	-89404171	-	MTE-int	LTR	MaLR	-296	1284	810	3
1120	1422	302	64	122	chr3	70195771	70196571	-89403212	-	MTE-int	LTR	MaLR	-765	815	63	3
1120	1163	262	67	43	chr3	70196576	70196967	-89402816	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	13	3
1120	458	265	23	62	chr3	70197045	70197222	-89402561	-	MTEb	LTR	MaLR	-9	370	201	3
1120	1905	169	72	21	chr3	70197384	70197770	-89402013	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	2	3
1120	2190	102	19	0	chr3	70200357	70200670	-89399113	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	3
1120	348	330	153	15	chr3	70204764	70204967	-89394816	-	MER21B	LTR	ERV1	-632	231	1	3
1120	1438	221	62	117	chr3	70207128	70207855	-89391928	-	RMER6C	LTR	ERVK	-3	687	1	3
1120	3773	258	75	36	chr3	70209155	70211224	-89388559	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2051	5555	1516	3
1120	330	105	0	0	chr3	70211612	70211669	-89388114	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2187	1511	1455	3
1120	251	100	0	0	chr3	70211810	70211850	-89387933	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2269	1030	991	3
1120	538	173	9	9	chr3	70212057	70212162	-89387621	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2245	1453	1349	3
1120	253	350	71	99	chr3	70215879	70216231	-89383552	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	7	3
1120	240	218	48	60	chr3	70217589	70217672	-89382111	+	MER72B	LTR	ERV1	426	507	-261	3
1120	363	289	58	26	chr3	70221074	70221230	-89378553	-	MLT1E	LTR	MaLR	-417	236	76	3
1120	2195	278	67	121	chr3	70223049	70223359	-89376424	-	MTD-int	LTR	MaLR	-224	1034	771	3
1120	2195	278	67	121	chr3	70223782	70224564	-89375219	-	MTD-int	LTR	MaLR	-488	770	2	3
1120	1242	222	123	70	chr3	70224564	70224962	-89374821	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1120	2087	160	26	3	chr3	70228704	70229049	-89370734	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	353	-41	3
1120	243	375	76	72	chr3	70229639	70229903	-89369880	+	ORR1D2	LTR	MaLR	103	367	-3	3
1120	1281	221	86	7	chr3	70230489	70230780	-89369003	+	ORR1B1	LTR	MaLR	80	393	-1	3
1120	292	242	60	10	chr3	70239075	70239175	-89360608	+	MER110A	LTR	ERV1	4	108	-360	3
1120	390	313	87	60	chr3	70239186	70239451	-89360332	+	MER110A	LTR	ERV1	157	428	-40	3
1120	1871	201	40	18	chr3	70244549	70244948	-89354835	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	6	3
1120	3217	39	7	17	chr3	70249491	70249904	-89349879	+	RLTR10A	LTR	ERVK	3	411	0	3
1120	3366	28	5	0	chr3	70250823	70251217	-89348566	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1121	568	273	34	39	chr3	70255218	70255397	-89344386	+	RLTR24	LTR	ERV1	352	529	0	3
1121	572	349	43	14	chr3	70257704	70257983	-89341800	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	275	4
1121	270	271	92	23	chr3	70259088	70259175	-89340608	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-12	539	447	4
1121	1144	290	75	71	chr3	70259142	70259279	-89340504	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-24	554	416	4
1121	1144	290	75	71	chr3	70260035	70260443	-89339340	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-163	415	7	4
1121	257	300	144	0	chr3	70264424	70264514	-89335269	-	MLT1L	LTR	MaLR	-507	103	1	4
1121	1106	174	150	57	chr3	70265497	70265777	-89334006	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	69	4
1121	326	125	216	27	chr3	70265778	70265852	-89333931	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	359	4
1121	1249	160	62	104	chr3	70267067	70267374	-89332409	-	RLTR41	LTR	ERV1	-72	374	81	4
1121	243	286	122	114	chr3	70267501	70267738	-89332045	-	RMER2	LTR	ERV1	-27	540	302	4
1121	2053	103	45	60	chr3	70267942	70268273	-89331510	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
1121	1351	265	27	32	chr3	70269181	70269586	-89330197	+	RMER19C	LTR	ERVK	208	610	-1	4
1121	2261	106	16	0	chr3	70273574	70273896	-89325887	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1121	412	175	12	24	chr3	70274145	70274227	-89325556	+	ORR1A1	LTR	MaLR	166	246	-100	4
1121	2891	146	51	12	chr3	70282686	70283192	-89316591	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	526	-3	4
1121	273	316	77	65	chr3	70283218	70283387	-89316396	+	MLT1L	LTR	MaLR	432	602	-8	4
1121	928	262	37	144	chr3	70284713	70285039	-89314744	+	MTD	LTR	MaLR	129	419	0	4
1121	244	299	167	6	chr3	70290202	70290370	-89309413	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	276	4
1121	283	316	147	24	chr3	70292466	70292677	-89307106	-	MLT1B	LTR	MaLR	-153	237	1	4
1121	967	277	82	25	chr3	70293968	70294323	-89305460	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	377	-2	4
1121	841	280	27	34	chr3	70294346	70294609	-89305174	+	MLT1A0	LTR	MaLR	105	365	0	4
1121	453	284	41	76	chr3	70309305	70309450	-89290333	+	MTEa	LTR	MaLR	1	140	-239	5
1121	407	314	9	0	chr3	70317171	70317276	-89282507	+	MLT1K	LTR	MaLR	1	106	-489	5
1121	239	370	126	57	chr3	70317285	70317635	-89282148	+	MLT1K	LTR	MaLR	209	582	-13	5
1121	2598	164	94	86	chr3	70318372	70318687	-89281096	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	368	-352	5
1121	2598	164	94	86	chr3	70318733	70318934	-89280849	+	RMER6D	LTR	ERVK	369	535	-185	5
1121	2598	164	94	86	chr3	70318954	70319064	-89280719	+	RMER6D	LTR	ERVK	536	632	-88	5
1121	715	325	98	53	chr3	70321190	70321586	-89278197	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	5
1121	230	299	124	22	chr3	70326591	70326728	-89273055	+	LTR40b	LTR	ERVL	15	165	-354	5
1121	308	250	34	11	chr3	70327443	70327532	-89272251	+	LTR40b	LTR	ERVL	372	462	0	5
1121	2303	66	119	11	chr3	70329119	70329471	-89270312	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	5
1121	1089	264	72	39	chr3	70334850	70335181	-89264602	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	342	-37	5
1121	3165	290	181	32	chr3	70335186	70336542	-89263241	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	23	1580	0	5
1121	1269	256	38	8	chr3	70336544	70336910	-89262873	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	379	0	5
1121	883	218	119	50	chr3	70338144	70338488	-89261295	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	447	-104	5
1121	637	230	5	134	chr3	70338667	70338795	-89260988	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	448	551	0	5
1121	1128	172	31	36	chr3	70345455	70345678	-89254105	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	196	5
1121	910	251	33	0	chr3	70346815	70347026	-89252757	-	MTC	LTR	MaLR	-199	222	5	5
1121	2048	90	33	20	chr3	70350020	70350325	-89249458	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	5
1121	2951	175	39	0	chr3	70355951	70355997	-89243786	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-45	533	481	5
1121	2951	175	39	0	chr3	70356051	70356517	-89243266	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-98	480	2	5
1121	1619	127	79	3	chr3	70356517	70356833	-89242950	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-2	2324	1985	5
1121	457	314	96	45	chr3	70357079	70357423	-89242360	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-34	433	13	5
1121	258	179	98	49	chr3	70360051	70360133	-89239650	+	LTR40c	LTR	ERVL	145	230	-235	5
1121	1970	192	37	7	chr3	70368667	70369076	-89230707	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
1121	440	310	103	0	chr3	70373011	70373185	-89226598	+	MER76	LTR	ERVL	500	691	0	6
1121	3206	37	8	0	chr3	70375637	70376019	-89223764	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	6
1121	2823	157	14	30	chr3	70376019	70376698	-89223085	+	IAPEy-int	LTR	ERVK	1	1058	-6455	6
1121	21860	45	3	5	chr3	70376698	70379414	-89220369	+	IAPEy-int	LTR	ERVK	4804	7513	0	6
1121	3228	34	8	0	chr3	70379414	70379796	-89219987	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	6
1121	1442	173	14	64	chr3	70383214	70383560	-89216223	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	329	-30	6
1121	255	155	198	77	chr3	70384220	70384258	-89215525	+	RMER10A	LTR	ERVL	314	356	-86	6
1121	255	155	198	77	chr3	70384394	70384445	-89215338	+	RMER10A	LTR	ERVL	357	414	-28	6
1122	2469	182	43	18	chr3	70386866	70387354	-89212429	+	RLTR16	LTR	ERVK	6	505	0	6
1122	1097	301	41	43	chr3	70388924	70389292	-89210491	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	10	6
1122	1262	204	183	31	chr3	70401850	70401948	-89197835	+	RLTR40	LTR	ERVK	3	102	-715	6
1122	1262	204	183	31	chr3	70402767	70403083	-89196700	+	RLTR40	LTR	ERVK	103	480	-337	6
1122	2506	214	47	35	chr3	70403091	70403750	-89196033	-	RMER6C	LTR	ERVK	-21	669	3	6
1122	240	243	42	28	chr3	70403783	70403855	-89195928	+	RLTR40	LTR	ERVK	514	586	-231	6
1122	537	227	163	104	chr3	70403876	70404097	-89195686	+	RLTR40	LTR	ERVK	570	803	-14	6
1122	371	301	19	44	chr3	70405173	70405333	-89194450	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	166	6
1122	1717	172	14	45	chr3	70405227	70405586	-89194197	-	RMER10B	LTR	ERVL	-50	348	1	6
1122	1185	220	72	11	chr3	70410233	70410509	-89189274	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-42	352	60	6
1122	492	199	43	87	chr3	70410506	70410644	-89189139	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	572	703	-1260	6
1122	995	250	58	12	chr3	70410556	70410799	-89188984	+	MT2B	LTR	ERVL	6	259	-342	6
1122	1043	234	14	17	chr3	70410803	70411094	-89188689	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	720	1009	-954	6
1122	4588	153	32	123	chr3	70414554	70415582	-89184201	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1030	1963	0	6
1122	1801	158	9	53	chr3	70415582	70415922	-89183861	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	325	-4	6
1122	322	255	61	0	chr3	70419357	70419455	-89180328	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	104	-275	6
1122	738	294	16	21	chr3	70419569	70419760	-89180023	+	MTE2b	LTR	MaLR	120	309	-70	6
1122	285	284	15	2	chr3	70419857	70419949	-89179834	+	MTE2b	LTR	MaLR	287	379	0	6
1122	491	302	69	86	chr3	70422259	70422567	-89177216	-	MTE2a	LTR	MaLR	-52	327	35	6
1122	1758	188	21	85	chr3	70428122	70428500	-89171283	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	6
1122	344	298	147	16	chr3	70431009	70431193	-89168590	-	MER74B	LTR	ERVL	-339	283	76	7
1122	3419	191	55	13	chr3	70434254	70434939	-89164844	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	791	1504	-5	7
1122	1755	196	46	0	chr3	70434944	70435270	-89164513	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	341	-26	7
1122	337	289	141	64	chr3	70443719	70444006	-89155777	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	376	32	7
1122	2362	214	99	13	chr3	70458816	70459141	-89140642	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	334	-356	7
1122	2362	214	99	13	chr3	70459174	70459483	-89140300	+	RMER6C	LTR	ERVK	335	689	-1	7
1122	313	281	107	30	chr3	70464949	70465118	-89134665	-	MTE-int	LTR	MaLR	-204	1376	1195	7
1122	393	390	27	11	chr3	70465586	70465770	-89134013	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1144	436	250	7
1122	669	244	27	49	chr3	70467649	70467834	-89131949	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	371	551	0	7
1122	2141	194	74	38	chr3	70468582	70469196	-89130587	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	525	-1801	7
1122	5107	130	47	17	chr3	70469196	70470073	-89129710	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	903	-3	7
1122	5594	155	49	35	chr3	70470073	70471495	-89128288	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	526	2664	-178	7
1122	1897	247	66	41	chr3	70471546	70472108	-89127675	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	3	578	0	7
1122	2485	132	31	19	chr3	70474891	70475307	-89124476	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1122	670	354	39	66	chr3	70487633	70487996	-89111787	-	MER31A	LTR	ERV1	-122	363	9	7
1122	1031	284	121	39	chr3	70488799	70489286	-89110497	+	RMER5	LTR	ERV1	1	527	-7	7
1122	225	273	11	54	chr3	70490781	70490874	-89108909	-	RMER4A	LTR	ERVK	-356	110	22	7
1122	312	292	174	0	chr3	70499335	70499496	-89100287	-	MER68	LTR	ERVL	-312	251	63	7
1122	563	307	135	14	chr3	70501930	70502211	-89097572	-	RMER5	LTR	ERV1	-41	493	179	6
1122	440	218	22	44	chr3	70503318	70503500	-89096283	+	RMER17C	LTR	ERVK	96	273	-137	9
1122	689	302	93	32	chr3	70508629	70509000	-89090783	-	RLTR18	LTR	ERVK	-1	615	112	1
1122	631	282	27	32	chr3	70509142	70509329	-89090454	-	RLTR18	LTR	ERVK	-430	186	1	1
1122	230	293	11	68	chr3	70509951	70509964	-89089819	-	MT2A	LTR	ERVL	-129	472	462	1
1122	1070	224	50	119	chr3	70509988	70510118	-89089665	-	MT2A	LTR	ERVL	-231	302	191	1
1122	1070	199	64	138	chr3	70510143	70510373	-89089410	-	MT2A	LTR	ERVL	-343	190	1	1
1122	2945	35	0	0	chr3	70510404	70510750	-89089033	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	2
1122	2792	96	22	19	chr3	70512891	70513299	-89086484	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-65	519	1	2
1122	260	26	0	26	chr3	70513299	70513338	-89086445	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	2
1122	374	111	26	53	chr3	70513338	70513414	-89086369	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	2
1122	946	169	0	12	chr3	70513510	70513672	-89086111	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-276	5485	5326	2
1122	1688	233	22	11	chr3	70515293	70515657	-89084126	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	368	-11	2
1123	3485	25	0	0	chr3	70517432	70517828	-89081955	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1123	9466	19	4	0	chr3	70517828	70518922	-89080861	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
1123	3371	38	0	0	chr3	70518922	70519314	-89080469	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	5	3
1123	1818	167	53	55	chr3	70521574	70521616	-89078167	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	41	-357	4
1123	1818	167	53	55	chr3	70521735	70522090	-89077693	+	RMER10B	LTR	ERVL	42	397	-1	4
1123	398	296	33	0	chr3	70544422	70544553	-89055230	+	MTD	LTR	MaLR	180	323	-98	7
1123	226	355	71	18	chr3	70546571	70546683	-89053100	-	MLT1C	LTR	MaLR	-142	325	208	7
1123	455	293	144	0	chr3	70547008	70547182	-89052601	+	MTD	LTR	MaLR	216	414	-5	7
1123	2632	47	6	169	chr3	70548196	70548662	-89051121	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	7
1123	681	36	0	0	chr3	70548672	70548755	-89051028	+	RLTR10	LTR	ERVK	308	390	0	7
1123	8339	39	1	6	chr3	70548756	70549764	-89050019	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	9	988	-999	7
1123	8764	18	0	1	chr3	70549844	70550840	-89048943	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	992	1986	-1	7
1123	2665	47	6	197	chr3	70550840	70551322	-89048461	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	7
1123	264	279	29	0	chr3	70555386	70555454	-89044329	-	RMER15	LTR	ERVL	-505	70	1	8
1123	1482	196	119	56	chr3	70555601	70555995	-89043788	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	8
1123	515	232	65	26	chr3	70557224	70557379	-89042404	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	259	8
1123	869	213	93	93	chr3	70561526	70561806	-89037977	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	282	9
1123	967	282	75	27	chr3	70566447	70566632	-89033151	+	RLTR12B	LTR	ERVK	42	245	-283	1
1123	967	282	75	27	chr3	70566749	70567000	-89032783	+	RLTR12B	LTR	ERVK	246	503	-25	1
1123	514	259	15	0	chr3	70578293	70578424	-89021359	+	RMER19B	LTR	ERVK	768	900	-2	1
1123	3471	25	0	0	chr3	70585147	70585543	-89014240	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1123	2427	207	77	65	chr3	70587250	70587884	-89011899	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	1
1123	1677	247	44	22	chr3	70590118	70590528	-89009255	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	442	1
1123	1719	275	21	41	chr3	70590732	70591267	-89008516	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	88	1
1123	1672	170	6	64	chr3	70597471	70597817	-89001966	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
1123	268	327	0	96	chr3	70600585	70600700	-88999083	+	MT2B	LTR	ERVL	155	258	-343	1
1123	502	336	84	4	chr3	70603887	70604138	-88995645	-	MLT1C	LTR	MaLR	-196	271	1	1
1123	380	302	131	41	chr3	70611690	70611987	-88987796	-	MTE-int	LTR	MaLR	-22	1558	1078	1
1123	314	335	90	90	chr3	70612187	70612364	-88987419	-	MTEa	LTR	MaLR	-194	185	9	1
1123	607	392	63	58	chr3	70612610	70613005	-88986778	-	MTE-int	LTR	MaLR	-448	1132	736	1
1123	809	74	40	7	chr3	70615347	70615497	-88984286	-	RMER17B	LTR	ERVK	-498	460	306	1
1123	1052	275	90	52	chr3	70617710	70618222	-88981561	+	MT2B	LTR	ERVL	3	601	0	1
1123	4290	10	21	0	chr3	70640442	70640925	-88958858	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1123	314	0	0	0	chr3	70640925	70640963	-88958820	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	2
1123	400	137	13	40	chr3	70640963	70641039	-88958744	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	2
1123	12288	44	25	0	chr3	70641039	70643194	-88956589	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-114	5371	2937	2
1123	24865	12	4	0	chr3	70643191	70645975	-88953808	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-2690	2795	1	2
1123	3733	11	121	0	chr3	70645975	70646415	-88953368	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1124	756	245	93	47	chr3	70659371	70659649	-88940134	-	RMER15	LTR	ERVL	-39	536	246	2
1124	2773	86	32	2	chr3	70663753	70664162	-88935621	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	2
1124	701	283	58	41	chr3	70673884	70674179	-88925604	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	274	2
1124	841	265	133	21	chr3	70679791	70680076	-88919707	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	103	2
1124	236	312	82	20	chr3	70681217	70681315	-88918468	-	MTD	LTR	MaLR	-300	107	4	2
1124	273	347	32	0	chr3	70693999	70694123	-88905660	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	251	2
1124	408	288	16	21	chr3	70695205	70695326	-88904457	-	MTD	LTR	MaLR	-15	406	291	2
1124	496	328	55	17	chr3	70695376	70695612	-88904171	-	MTD	LTR	MaLR	-122	297	53	2
1124	254	355	59	34	chr3	70699707	70699946	-88899837	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	245	-120	2
1124	833	325	108	11	chr3	70701613	70701958	-88897825	-	MER70B	LTR	ERVL	-148	430	56	2
1124	833	325	108	11	chr3	70702005	70702039	-88897744	-	MER70B	LTR	ERVL	-523	55	15	2
1124	319	348	74	35	chr3	70703016	70703245	-88896538	-	MER70-int	LTR	ERVL	-657	4366	4129	2
1124	2246	122	165	5	chr3	70703641	70704028	-88895755	+	RLTR44B	LTR	ERVK	1	449	0	2
1124	478	328	32	16	chr3	70704878	70705067	-88894716	-	MER70-int	LTR	ERVL	-1689	3334	3143	2
1124	255	281	58	10	chr3	70705187	70705291	-88894492	-	MER70-int	LTR	ERVL	-2064	2959	2851	2
1124	342	336	0	14	chr3	70707570	70707709	-88892074	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4031	4167	-4792	2
1124	1266	131	4	129	chr3	70707817	70708072	-88891711	+	ORR1A2	LTR	MaLR	7	229	-98	2
1124	984	87	34	0	chr3	70708063	70708212	-88891571	+	MT2B2	LTR	ERVL	431	584	0	2
1124	892	318	59	111	chr3	70708259	70708348	-88891435	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4064	4151	-2399	2
1124	892	318	59	111	chr3	70708878	70709906	-88889877	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4152	5123	-1427	2
1124	313	221	100	105	chr3	70709937	70710115	-88889668	+	RMER4A	LTR	ERVK	276	557	-28	3
1124	1518	245	75	36	chr3	70710178	70710588	-88889195	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7813	8226	-733	3
1124	1518	245	75	36	chr3	70710737	70710931	-88888852	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8227	8442	-517	3
1124	1216	222	34	20	chr3	70711020	70711368	-88888415	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	6036	6352	-198	3
1124	523	251	5	76	chr3	70711548	70711746	-88888037	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	6358	6541	-9	3
1124	646	308	61	30	chr3	70711760	70712158	-88887625	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	5	414	-27	3
1124	281	240	40	0	chr3	70712258	70712333	-88887450	-	MER70-int	LTR	ERVL	-2384	2639	2562	3
1124	306	304	0	0	chr3	70712501	70712580	-88887203	-	MER70-int	LTR	ERVL	-3097	1926	1848	3
1124	685	335	37	80	chr3	70713730	70714106	-88885677	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	20	3
1124	1253	218	189	3	chr3	70714111	70714428	-88885355	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	3
1124	1174	347	73	56	chr3	70714497	70714692	-88885091	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-39	1541	1342	3
1124	1174	347	73	56	chr3	70714735	70715195	-88884588	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-239	1341	875	3
1124	411	369	109	6	chr3	70715201	70715512	-88884271	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-858	722	380	3
1124	561	311	111	10	chr3	70717902	70718110	-88881673	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1334	246	18	3
1124	227	246	0	34	chr3	70718122	70718181	-88881602	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	316	3
1124	618	298	158	50	chr3	70718812	70719109	-88880674	+	MTD	LTR	MaLR	74	402	-17	3
1124	347	328	67	62	chr3	70719149	70719344	-88880439	-	MTEa	LTR	MaLR	-183	196	1	3
1124	2825	81	36	0	chr3	70727723	70728107	-88871676	+	MTB	LTR	MaLR	3	400	0	3
1124	438	337	60	75	chr3	70730036	70730434	-88869349	+	RMER5	LTR	ERV1	112	503	-31	3
1124	847	336	39	24	chr3	70732135	70732470	-88867313	+	MTD	LTR	MaLR	76	415	-4	3
1124	2241	98	6	58	chr3	70734023	70734368	-88865415	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1124	1359	230	110	33	chr3	70735626	70736017	-88863766	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1124	391	282	144	23	chr3	70736578	70736752	-88863031	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	370	176	3
1124	256	316	104	10	chr3	70736918	70737014	-88862769	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-258	112	8	3
1124	898	212	48	5	chr3	70737020	70737228	-88862555	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	0	1370	1154	3
1124	2773	286	32	85	chr3	70743401	70744377	-88855406	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-210	1160	237	3
1124	1034	261	107	9	chr3	70744360	70744677	-88855106	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-30	348	1	3
1124	438	314	36	36	chr3	70744685	70744848	-88854935	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1162	208	46	3
1124	438	314	36	36	chr3	70744887	70744918	-88854865	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1325	45	15	3
1124	954	309	65	31	chr3	70744933	70745287	-88854496	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	368	3	3
1124	4319	136	21	45	chr3	70749779	70750679	-88849104	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	874	-15	3
1124	395	230	11	22	chr3	70752963	70753052	-88846731	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	596	683	-1165	3
1124	418	314	29	140	chr3	70760039	70760346	-88839437	+	MLT1B	LTR	MaLR	117	389	-1	3
1124	900	233	206	74	chr3	70762518	70763019	-88836764	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	3
1124	303	314	48	56	chr3	70763036	70763161	-88836622	+	RMER12	LTR	ERVK	736	859	-463	3
1124	1148	265	152	50	chr3	70775914	70776414	-88823369	+	RMER2	LTR	ERV1	1	551	-16	4
1124	1636	259	26	142	chr3	70776423	70777085	-88822698	-	RMER19C	LTR	ERVK	-25	586	2	4
1125	1115	282	42	50	chr3	70792174	70792232	-88807551	-	MTD	LTR	MaLR	-45	374	312	4
1125	1115	282	42	50	chr3	70792846	70793150	-88806633	-	MTD	LTR	MaLR	-108	311	15	4
1125	1115	282	42	50	chr3	70793214	70793227	-88806556	-	MTD	LTR	MaLR	-405	14	2	4
1125	613	319	88	34	chr3	70802029	70802401	-88797382	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	491	-76	4
1125	297	351	37	68	chr3	70802459	70802500	-88797283	+	MLT2B3	LTR	ERVL	492	530	-37	4
1125	457	264	86	53	chr3	70805991	70806023	-88793760	+	MT2B	LTR	ERVL	123	202	-399	4
1125	457	264	86	53	chr3	70806115	70806143	-88793640	+	MT2B	LTR	ERVL	203	279	-322	4
1125	251	315	0	14	chr3	70806420	70806494	-88793289	+	MTEb	LTR	MaLR	287	359	-20	4
1125	255	324	134	21	chr3	70807468	70807610	-88792173	-	MLT1B	LTR	MaLR	-18	372	215	4
1125	4051	148	70	0	chr3	70808516	70809205	-88790578	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	4
1125	2453	175	236	38	chr3	70809854	70810484	-88789299	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	2	4
1125	728	282	88	54	chr3	70815816	70816239	-88783544	-	LTR37B	LTR	ERV1	-25	443	7	4
1125	2814	74	42	5	chr3	70832703	70833085	-88766698	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1125	7311	92	9	68	chr3	70833085	70834253	-88765530	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
1125	2186	78	137	28	chr3	70834253	70834386	-88765397	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	269	4
1125	4516	115	10	68	chr3	70834386	70835180	-88764603	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	748	-3	4
1125	2186	78	137	28	chr3	70835180	70835403	-88764380	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-128	268	1	4
1125	671	308	160	34	chr3	70841720	70842076	-88757707	+	MTD	LTR	MaLR	8	370	0	4
1125	2721	88	8	3	chr3	70844069	70844455	-88755328	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	4
1125	2252	230	50	35	chr3	70848883	70849477	-88750306	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	603	-89	5
1125	881	271	57	59	chr3	70853026	70853525	-88746258	-	RMER2	LTR	ERV1	-5	562	1	5
1125	457	167	12	60	chr3	70859108	70859191	-88740592	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7148	-258	5
1125	231	308	95	34	chr3	70870692	70870840	-88728943	-	RMER4B	LTR	ERVK	-187	398	242	5
1125	723	219	148	19	chr3	70870929	70871138	-88728645	-	RMER4B	LTR	ERVK	-329	256	21	5
1125	267	286	28	28	chr3	70876620	70876728	-88723055	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	272	5
1125	935	260	80	11	chr3	70882164	70882514	-88717269	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1125	388	215	12	12	chr3	70883909	70883989	-88715794	+	MTEb	LTR	MaLR	60	139	-240	5
1125	1454	247	27	3	chr3	70886271	70886640	-88713143	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	5
1125	729	335	49	25	chr3	70887970	70888297	-88711486	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	337	-42	5
1125	539	193	45	18	chr3	70890609	70890720	-88709063	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	305	5
1125	295	263	39	13	chr3	70891865	70891942	-88707841	-	MTC-int	LTR	MaLR	-800	458	380	5
1125	1322	219	0	52	chr3	70893878	70894186	-88705597	-	MTC-int	LTR	MaLR	-867	391	100	5
1125	1405	179	5	181	chr3	70899536	70899912	-88699871	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	310	-592	5
1125	304	388	27	13	chr3	70901761	70901910	-88697873	+	LTR69	LTR	ERVL	381	531	-57	5
1125	278	346	37	12	chr3	70901924	70902088	-88697695	+	LTR33A	LTR	ERVL	318	485	-35	5
1126	367	130	58	0	chr3	70916303	70916372	-88683411	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	322	5
1126	913	195	11	22	chr3	70916379	70916557	-88683226	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-218	176	1	5
1126	452	391	76	27	chr3	70916822	70917085	-88682698	+	MER70B	LTR	ERVL	10	285	-293	5
1126	1627	182	93	120	chr3	70917302	70917810	-88681973	+	RMER6C	LTR	ERVK	121	614	-76	5
1126	542	331	35	29	chr3	70927911	70928082	-88671701	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-198	172	1	5
1126	1079	294	36	19	chr3	70928424	70928788	-88670995	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
1126	347	337	74	17	chr3	70932950	70933125	-88666658	-	MER70A	LTR	ERVL	-35	437	253	6
1126	864	270	164	27	chr3	70934556	70934891	-88664892	-	LTR53	LTR	ERVL	-110	409	29	6
1126	926	261	153	3	chr3	70947779	70948079	-88651704	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	345	-29	6
1126	346	356	127	51	chr3	70954117	70954771	-88645012	+	MLT-int	LTR	MaLR	4	723	-1012	6
1126	297	311	112	31	chr3	70971584	70971780	-88628003	-	MLT1C	LTR	MaLR	-5	462	251	6
1126	1373	167	33	122	chr3	70971825	70972186	-88627597	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	6
1126	886	358	24	12	chr3	70973288	70973616	-88626167	+	MTD	LTR	MaLR	3	334	-85	6
1126	679	361	61	47	chr3	70986402	70986875	-88612908	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4410	4889	-110	6
1126	326	338	49	21	chr3	70987107	70987249	-88612534	+	RMER15	LTR	ERVL	276	421	-154	6
1126	296	204	41	89	chr3	70992935	70993051	-88606732	-	MLT1A	LTR	MaLR	-258	116	1	6
1126	622	216	9	0	chr3	71003840	71003956	-88595827	+	MTC	LTR	MaLR	1	117	-304	8
1126	1567	208	6	37	chr3	71004571	71004896	-88594887	+	MTC	LTR	MaLR	107	421	0	8
1126	1015	345	92	14	chr3	71005123	71005860	-88593923	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3318	1681	887	1
1126	468	386	56	7	chr3	71006015	71006302	-88593481	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4317	682	382	1
1126	676	325	145	25	chr3	71007713	71008189	-88591594	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	41	1
1126	401	330	63	6	chr3	71009076	71009250	-88590533	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-440	184	1	1
1126	1051	88	7	7	chr3	71013775	71013924	-88585859	-	MTB	LTR	MaLR	-1	399	251	2
1126	594	111	0	3	chr3	71013950	71014045	-88585738	+	MTB	LTR	MaLR	175	266	-141	2
1126	317	253	0	78	chr3	71013965	71014068	-88585715	-	MTB	LTR	MaLR	-312	95	1	2
1126	1062	257	76	41	chr3	71019915	71020245	-88579538	+	RMER19B	LTR	ERVK	142	662	-240	3
1126	417	326	29	7	chr3	71020924	71021060	-88578723	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-191	179	41	3
1126	1779	198	220	28	chr3	71021707	71022284	-88577499	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	3	3
1126	293	257	92	71	chr3	71023774	71023958	-88575825	-	MER57F	LTR	ERV1	-228	208	21	4
1126	1633	199	63	42	chr3	71029074	71029297	-88570486	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	156	5
1126	3523	33	28	5	chr3	71029334	71029760	-88570023	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	5
1126	1633	199	63	42	chr3	71029901	71030055	-88569728	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-239	155	1	5
1126	3104	70	17	0	chr3	71039147	71039561	-88560222	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	7
1127	665	281	16	204	chr3	71041176	71041690	-88558093	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	14	7
1127	4195	103	244	78	chr3	71043771	71044657	-88555126	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	1033	0	8
1127	386	111	0	0	chr3	71048050	71048104	-88551679	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	346	293	8
1127	1597	166	34	13	chr3	71048246	71048551	-88551232	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-21	308	1	8
1127	470	348	29	5	chr3	71049119	71049324	-88550459	+	MLT1A1	LTR	MaLR	195	404	-4	8
1127	834	178	71	11	chr3	71051364	71051546	-88548237	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	202	9
1127	384	294	90	43	chr3	71059345	71059533	-88540250	-	RMER12	LTR	ERVK	-26	1296	1100	1
1127	2064	205	40	24	chr3	71059828	71060528	-88539255	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1035	813	1	1
1127	2470	176	130	33	chr3	71061949	71062695	-88537088	-	RMER6C	LTR	ERVK	-4	716	1	1
1127	2476	197	52	16	chr3	71063499	71063994	-88535789	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	513	-15	1
1127	1416	258	17	17	chr3	71066724	71067079	-88532704	+	ORR1D1	LTR	MaLR	9	363	-11	1
1127	2099	212	117	2	chr3	71078155	71078173	-88521610	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	542	1
1127	2099	212	117	2	chr3	71078241	71078709	-88521074	-	RMER15	LTR	ERVL	-34	541	18	1
1127	460	330	38	30	chr3	71078711	71078973	-88520810	-	RLTR19	LTR	ERVK	-7	499	240	1
1127	2082	189	115	22	chr3	71085229	71085732	-88514051	+	RMER6C	LTR	ERVK	141	690	0	1
1127	2965	85	12	2	chr3	71089896	71090308	-88509475	-	BGLII	LTR	ERVK	-2	419	4	1
1127	700	277	166	16	chr3	71090453	71090706	-88509077	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-32	480	190	1
1127	2138	115	0	61	chr3	71095271	71095615	-88504168	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	1
1127	1509	148	27	157	chr3	71098827	71099196	-88500587	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	1
1127	3620	207	78	34	chr3	71099200	71100260	-88499523	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	1751	-212	1
1127	3620	206	62	109	chr3	71100298	71100636	-88499147	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1217	1769	-194	1
1127	923	187	0	6	chr3	71100636	71100808	-88498975	+	ORR1A4	LTR	MaLR	224	394	0	1
1127	265	333	43	74	chr3	71105155	71105317	-88494466	-	ORR1E	LTR	MaLR	-139	220	64	1
1127	2393	181	149	28	chr3	71126654	71127199	-88472584	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
1127	563	266	0	38	chr3	71134970	71135103	-88464680	-	RMER10A	LTR	ERVL	-314	128	1	2
1127	291	287	122	27	chr3	71139172	71139319	-88460464	+	MER110	LTR	ERV1	283	443	-48	2
1127	243	271	0	0	chr3	71140630	71140700	-88459083	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	310	2
1127	234	337	46	96	chr3	71141435	71141632	-88458151	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	389	2
1127	2735	81	66	0	chr3	71141839	71142234	-88457549	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	2
1127	876	293	59	54	chr3	71142307	71142679	-88457104	-	RMER5	LTR	ERV1	-160	374	1	2
1127	319	184	51	26	chr3	71148320	71148398	-88451385	+	RLTR25B	LTR	ERVK	430	509	-519	2
1127	1286	244	65	50	chr3	71154883	71155332	-88444451	-	RMER19B	LTR	ERVK	-261	641	76	2
1127	1372	243	102	3	chr3	71161281	71161664	-88438119	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1127	1679	181	23	17	chr3	71162860	71163214	-88436569	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	4	2
1127	486	195	0	0	chr3	71163290	71163377	-88436406	+	RLTR15	LTR	ERVK	268	354	-5	2
1128	2662	209	21	38	chr3	71184248	71184824	-88414959	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	566	-126	3
1128	418	336	174	50	chr3	71209550	71209791	-88389992	+	ORR1D2	LTR	MaLR	42	312	-58	3
1128	3344	40	2	0	chr3	71213475	71213870	-88385913	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1128	2459	141	10	14	chr3	71216225	71216641	-88383142	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-143	414	1	3
1128	251	237	70	85	chr3	71223081	71223161	-88376622	-	RLTR15	LTR	ERVK	-198	161	77	3
1128	4480	150	45	59	chr3	71223161	71224080	-88375703	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	3
1128	251	237	70	85	chr3	71224080	71224128	-88375655	-	RLTR15	LTR	ERVK	-283	76	35	3
1128	4060	193	35	48	chr3	71224175	71225123	-88374660	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-17	8942	8008	3
1128	650	240	19	10	chr3	71225255	71225461	-88374322	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1009	5541	5334	3
1128	1978	301	53	39	chr3	71225469	71226456	-88373327	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-98	5162	4199	3
1128	633	244	42	33	chr3	71226452	71226664	-88373119	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2509	4041	3828	3
1128	285	140	0	107	chr3	71227319	71227375	-88372408	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2606	6353	6304	3
1128	770	306	82	19	chr3	71231800	71232057	-88367726	+	ORR1D2	LTR	MaLR	43	315	-55	3
1128	255	271	0	0	chr3	71236599	71236658	-88363125	+	ORR1D2	LTR	MaLR	348	406	-13	3
1128	1086	280	92	38	chr3	71238305	71238673	-88361110	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	10	397	-10	3
1128	513	335	61	107	chr3	71253465	71253856	-88345927	+	MTEa	LTR	MaLR	1	373	-6	3
1128	301	365	108	23	chr3	71265958	71266216	-88333567	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-71	294	15	3
1128	876	248	31	140	chr3	71266659	71266810	-88332973	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	134	-244	3
1128	876	248	31	140	chr3	71266965	71267235	-88332548	+	ORR1C1	LTR	MaLR	135	378	0	3
1128	1765	198	41	3	chr3	71274838	71275178	-88324605	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-14	353	1	4
1128	307	260	136	26	chr3	71276729	71276883	-88322900	+	RMER5	LTR	ERV1	298	468	-66	4
1128	426	348	35	28	chr3	71281535	71281960	-88317823	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-4902	765	338	4
1128	1486	224	15	77	chr3	71284783	71285184	-88314599	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	4
1128	529	270	222	16	chr3	71286449	71286777	-88313006	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	20	4
1128	1457	243	98	24	chr3	71292239	71292743	-88307040	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1001	1963	0	4
1128	249	186	32	63	chr3	71292748	71292811	-88306972	+	ORR1A4	LTR	MaLR	6	66	-263	4
1128	1245	266	39	17	chr3	71293025	71293381	-88306402	+	ORR1D1	LTR	MaLR	8	371	-3	4
1128	446	329	43	7	chr3	71296927	71297065	-88302718	-	MTD	LTR	MaLR	-108	311	169	4
1128	2510	128	28	5	chr3	71301296	71301690	-88298093	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	4
1129	254	305	89	70	chr3	71312846	71313103	-88286680	+	MTEb	LTR	MaLR	118	379	0	4
1129	265	330	121	73	chr3	71313328	71313642	-88286141	-	MLT1B	LTR	MaLR	-35	355	27	4
1129	1364	179	101	63	chr3	71315215	71315532	-88284251	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
1129	838	400	60	23	chr3	71318350	71318829	-88280954	+	MTE-int	LTR	MaLR	777	1273	-307	4
1129	343	331	21	0	chr3	71318813	71318955	-88280828	+	MTE-int	LTR	MaLR	1409	1553	-27	4
1129	2359	109	21	67	chr3	71319176	71319607	-88280176	+	RLTR9F	LTR	ERVK	1	411	-4	4
1129	321	314	68	68	chr3	71319609	71319756	-88280027	+	MTEa	LTR	MaLR	228	374	-5	4
1129	3893	55	15	0	chr3	71337089	71337564	-88262219	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	5
1129	495	250	59	22	chr3	71351422	71351557	-88248226	-	RMER6C	LTR	ERVK	-550	140	1	5
1129	2703	218	37	58	chr3	71352968	71353699	-88246084	-	RMER6D	LTR	ERVK	-4	716	1	5
1129	2895	98	2	2	chr3	71361032	71361432	-88238351	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1129	946	126	0	7	chr3	71367401	71367545	-88232238	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	319	5
1129	1427	174	15	8	chr3	71367581	71367848	-88231935	-	RMER6B	LTR	ERVK	-135	326	58	5
1129	2074	200	29	32	chr3	71371512	71372039	-88227744	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-3	525	1	5
1129	257	327	73	50	chr3	71381192	71381411	-88218372	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	65	288	-6631	5
1129	3343	323	33	25	chr3	71383188	71384572	-88215211	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	1539	2934	-3985	5
1129	268	255	185	19	chr3	71384795	71384903	-88214880	+	RMER13A	LTR	ERVK	340	465	-395	5
1129	311	382	51	43	chr3	71384963	71385198	-88214585	+	RMER13A	LTR	ERVK	585	821	-39	5
1129	857	242	5	26	chr3	71385225	71385420	-88214363	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	6413	6603	-316	5
1129	293	262	46	18	chr3	71385322	71385431	-88214352	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4430	4541	-450	5
1129	1622	202	23	6	chr3	71396202	71396555	-88203228	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	5
1129	3151	246	51	73	chr3	71396572	71398507	-88201276	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-17	8942	7821	5
1129	2454	267	75	59	chr3	71398547	71399079	-88200704	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1871	455	3	5
1129	1919	167	134	70	chr3	71400653	71401405	-88198378	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1023	1	5
1129	366	252	9	78	chr3	71401918	71402034	-88197749	-	RLTR18-int	LTR	ERVK	-510	4851	4744	5
1129	1020	179	131	32	chr3	71402067	71402349	-88197434	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2244	6715	6406	5
1129	2968	86	0	5	chr3	71403084	71403482	-88196301	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1129	2259	160	17	65	chr3	71404845	71405550	-88194233	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	922	-61	5
1129	1075	234	160	6	chr3	71410491	71410809	-88188974	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1129	629	132	0	0	chr3	71414384	71414475	-88185308	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	91	-867	6
1129	462	273	9	0	chr3	71414477	71414587	-88185196	+	RMER17B	LTR	ERVK	848	958	0	6
1129	233	203	74	148	chr3	71416275	71416356	-88183427	-	LTR41	LTR	ERVL	-566	202	128	6
1129	277	240	12	36	chr3	71416952	71417060	-88182723	+	RMER21B	LTR	ERV1	347	535	-412	6
1129	932	282	18	0	chr3	71421045	71421268	-88178515	+	RMER15	LTR	ERVL	212	438	-137	6
1129	898	167	134	0	chr3	71423006	71423192	-88176591	+	RLTR40	LTR	ERVK	18	228	-589	6
1129	440	273	97	7	chr3	71423246	71423390	-88176393	+	RMER15	LTR	ERVL	419	575	0	6
1129	606	257	28	0	chr3	71423398	71423542	-88176241	-	MTEb	LTR	MaLR	-226	153	6	6
1129	3015	26	14	0	chr3	71424797	71425149	-88174634	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	6
1129	4162	52	4	0	chr3	71426614	71427115	-88172668	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	6
1130	2743	49	2	76	chr3	71435449	71435845	-88163938	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	6
1130	282	292	53	176	chr3	71449944	71450098	-88149685	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	135	-249	6
1130	282	292	53	176	chr3	71450237	71450327	-88149456	+	ORR1C2	LTR	MaLR	136	215	-169	6
1130	539	273	89	19	chr3	71450336	71450513	-88149270	+	ORR1C2	LTR	MaLR	89	330	-54	6
1130	281	319	33	11	chr3	71456283	71456375	-88143408	-	MLT1G1-int	LTR	MaLR	-545	864	771	6
1130	254	325	64	13	chr3	71457116	71457194	-88142589	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-42	537	456	6
1130	293	326	33	0	chr3	71458131	71458223	-88141560	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-38	336	242	6
1130	304	354	52	26	chr3	71458238	71458354	-88141429	-	RMER10B	LTR	ERVL	-11	387	269	6
1130	744	333	17	8	chr3	71458589	71458828	-88140955	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-125	249	9	6
1130	410	292	68	51	chr3	71463282	71463459	-88136324	-	RMER21A	LTR	ERV1	-335	612	433	6
1130	1510	179	69	87	chr3	71467348	71467740	-88132043	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-9	385	1	7
1130	641	126	102	0	chr3	71473418	71473545	-88126238	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-83	449	310	7
1130	2235	128	24	86	chr3	71479221	71479640	-88120143	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	7
1130	509	338	106	29	chr3	71506132	71506510	-88093273	+	MTC	LTR	MaLR	1	407	-14	6
1130	1474	205	171	59	chr3	71507186	71507742	-88092041	-	RMER6C	LTR	ERVK	-72	618	1	9
1130	3429	171	112	21	chr3	71508423	71509204	-88090579	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	829	-194	1
1130	248	178	22	0	chr3	71509199	71509244	-88090539	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	978	1023	0	1
1130	318	303	159	57	chr3	71509323	71509656	-88090127	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	370	0	1
1130	3810	47	11	0	chr3	71510846	71511314	-88088469	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-2	473	1	1
1130	1260	245	104	58	chr3	71521629	71522176	-88077607	+	RMER15	LTR	ERVL	4	575	0	3
1130	3172	113	40	29	chr3	71525068	71525633	-88074150	+	RMER17D	LTR	ERVK	6	552	-337	3
1130	1734	189	24	29	chr3	71525690	71526076	-88073707	+	RMER17D	LTR	ERVK	488	888	-18	3
1130	346	347	111	64	chr3	71531968	71532244	-88067539	+	MT2A	LTR	ERVL	12	301	-232	4
1130	3094	61	5	10	chr3	71532244	71532642	-88067141	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1130	346	347	111	64	chr3	71532642	71532707	-88067076	+	MT2A	LTR	ERVL	302	369	-164	4
1130	264	324	169	13	chr3	71544693	71544918	-88054865	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	262	-97	6
1130	228	318	121	48	chr3	71545072	71545237	-88054546	-	LTR68	LTR	ERV1	-402	338	162	6
1130	681	274	31	16	chr3	71558038	71558231	-88041552	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	179	8
1130	1118	158	0	0	chr3	71562259	71562442	-88037341	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	145	8
1130	2785	154	10	8	chr3	71562433	71562685	-88037098	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1477	486	235	8
1130	2785	154	10	8	chr3	71562718	71562950	-88036833	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1729	234	2	8
1130	1972	151	19	0	chr3	71562954	71563265	-88036518	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	3	8
1130	231	324	46	72	chr3	71563643	71563796	-88035987	+	RMER4B	LTR	ERVK	39	187	-398	9
1131	1878	236	54	30	chr3	71565674	71565716	-88034067	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-53	524	483	9
1131	1878	236	54	30	chr3	71565747	71566206	-88033577	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-95	482	13	9
1131	688	266	92	21	chr3	71568060	71568287	-88031496	+	MTD	LTR	MaLR	4	230	-170	9
1131	1832	47	0	0	chr3	71570205	71570440	-88029343	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	236	-160	1
1131	2284	172	161	40	chr3	71583916	71584461	-88015322	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	1
1131	943	282	88	104	chr3	71593046	71593070	-88006713	+	MTC-int	LTR	MaLR	246	272	-826	1
1131	1073	268	80	82	chr3	71593120	71593823	-88005960	+	MTC-int	LTR	MaLR	273	1098	-160	1
1131	695	202	31	42	chr3	71594559	71594750	-88005033	+	MTC-int	LTR	MaLR	1068	1256	-2	1
1131	1530	260	60	18	chr3	71594756	71595155	-88004628	+	MTC	LTR	MaLR	6	421	0	1
1131	934	288	164	21	chr3	71596497	71596923	-88002860	+	RMER15	LTR	ERVL	45	531	-44	1
1131	801	155	139	21	chr3	71618933	71619218	-87980565	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	359	-331	1
1131	449	201	97	32	chr3	71625253	71625365	-87974418	+	RLTR43A	LTR	ERVK	201	314	-50	1
1131	449	201	97	32	chr3	71625432	71625473	-87974310	+	RLTR43A	LTR	ERVK	315	363	-1	1
1131	455	339	110	49	chr3	71634410	71634674	-87965109	+	MTEb	LTR	MaLR	1	280	-99	2
1131	1397	192	45	75	chr3	71638442	71638774	-87961009	+	ORR1A3	LTR	MaLR	5	326	0	2
1131	497	355	80	46	chr3	71640128	71640541	-87959242	+	LTR40a	LTR	ERVL	91	517	-2	2
1131	1509	192	37	31	chr3	71648717	71649044	-87950739	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
1131	276	357	129	30	chr3	71669965	71670268	-87929515	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	364	32	2
1131	691	205	33	17	chr3	71691862	71692014	-87907769	+	ORR1C2	LTR	MaLR	191	360	-24	2
1131	1916	209	42	0	chr3	71692256	71692633	-87907150	+	MTC	LTR	MaLR	11	403	-18	2
1132	250	403	88	0	chr3	71702076	71702257	-87897526	-	LTR41	LTR	ERVL	-531	237	41	2
1132	398	314	116	55	chr3	71716943	71717236	-87882547	+	RMER13A	LTR	ERVK	183	493	-367	3
1132	1242	304	32	9	chr3	71721993	71722338	-87877445	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	556	3
1132	383	225	0	0	chr3	71735225	71735314	-87864469	+	ORR1D1	LTR	MaLR	31	119	-255	3
1132	277	313	0	32	chr3	71735419	71735530	-87864253	+	ORR1D1	LTR	MaLR	167	267	-100	3
1132	3283	284	88	22	chr3	71735538	71735622	-87864161	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	5	87	-1283	3
1132	3283	284	88	22	chr3	71735663	71736800	-87862983	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	88	1306	-64	3
1132	347	260	13	0	chr3	71736800	71736877	-87862906	+	ORR1D1	LTR	MaLR	56	133	-241	3
1132	3337	175	28	14	chr3	71736875	71737593	-87862190	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-516	1447	720	3
1132	1156	185	85	60	chr3	71737554	71737802	-87861981	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	34	3
1132	3345	189	70	47	chr3	71737621	71738409	-87861374	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1157	806	1	3
1132	1594	169	40	61	chr3	71738413	71738741	-87861042	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	3
1132	243	293	204	31	chr3	71740485	71740647	-87859136	+	RMER15	LTR	ERVL	336	525	-50	3
1132	1099	176	168	287	chr3	71745475	71746027	-87853756	+	RMER6A	LTR	ERVK	6	455	-301	3
1132	1099	183	19	18	chr3	71746763	71746977	-87852806	+	RMER6A	LTR	ERVK	456	687	-3	3
1132	2773	214	23	18	chr3	71746980	71747584	-87852199	+	RMER6-int	LTR	ERVK	1	607	-2570	3
1132	3418	110	27	195	chr3	71751097	71752070	-87847713	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	3
1132	500	208	57	0	chr3	71752296	71752402	-87847381	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-5	1098	987	3
1132	3524	212	46	51	chr3	71752648	71753512	-87846271	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-166	862	3	3
1132	3551	183	20	3	chr3	71753692	71754355	-87845428	+	RMER6-int	LTR	ERVK	600	1273	-1904	3
1132	1100	259	91	117	chr3	71758570	71759152	-87840631	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	2	3
1132	339	128	20	131	chr3	71762205	71762304	-87837479	-	BGLII	LTR	ERVK	-2	419	332	3
1132	904	287	22	16	chr3	71766155	71766474	-87833309	-	RLTR33	LTR	ERVK	-85	593	188	3
1132	664	118	69	191	chr3	71767220	71767408	-87832375	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	165	-525	3
1132	378	229	0	86	chr3	71767478	71767583	-87832200	+	RMER6C	LTR	ERVK	491	586	-104	3
1132	940	179	68	40	chr3	71769409	71769769	-87830014	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	720	475	4
1132	846	152	49	25	chr3	71769906	71770068	-87829715	-	RMER6A	LTR	ERVK	-524	166	1	4
1132	1164	88	0	17	chr3	71775202	71775376	-87824407	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-220	176	6	4
1132	574	304	70	39	chr3	71775926	71776210	-87823573	+	RMER10A	LTR	ERVL	125	417	-25	4
1132	737	290	118	61	chr3	71776410	71776773	-87823010	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1132	370	211	0	0	chr3	71776788	71776864	-87822919	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	15	90	-1280	4
1132	2119	88	20	67	chr3	71776872	71777215	-87822568	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	4
1132	6007	49	4	12	chr3	71777217	71777967	-87821816	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5736	4
1132	2165	75	0	0	chr3	71777966	71778244	-87821539	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	4
1132	3374	66	20	36	chr3	71778244	71778987	-87820796	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	9	4
1132	2195	78	20	67	chr3	71778988	71779331	-87820452	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	4
1132	2172	222	68	29	chr3	71789342	71789930	-87809853	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	4
1132	1140	194	68	89	chr3	71797723	71798124	-87801659	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	1	4
1132	3156	227	40	5	chr3	71805288	71806044	-87793739	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	728	4
1132	992	296	14	10	chr3	71810023	71810313	-87789470	+	MTD	LTR	MaLR	1	291	-128	4
1132	2023	167	162	40	chr3	71810338	71810843	-87788940	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	4
1132	290	210	0	51	chr3	71815602	71815677	-87784106	+	ORR1D1	LTR	MaLR	303	374	0	4
1132	909	239	88	44	chr3	71816119	71816423	-87783360	-	MT2A	LTR	ERVL	-213	320	1	4
1132	552	325	47	6	chr3	71821305	71821475	-87778308	-	MTE2b	LTR	MaLR	-201	178	2	4
1133	324	250	65	0	chr3	71841780	71841872	-87757911	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-1271	99	2	5
1133	786	257	90	5	chr3	71841874	71842085	-87757698	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-13	371	143	5
1133	368	399	69	9	chr3	71848865	71849146	-87750637	+	MLT1E3	LTR	MaLR	352	650	-3	5
1133	2140	198	157	59	chr3	71849294	71849918	-87749865	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	688	-2	5
1133	605	325	40	94	chr3	71849934	71850308	-87749475	+	MT2A	LTR	ERVL	180	533	0	5
1133	674	235	34	34	chr3	71857656	71857832	-87741951	-	MLT1K	LTR	MaLR	-61	534	359	5
1133	365	355	116	54	chr3	71857881	71858140	-87741643	-	MLT1K	LTR	MaLR	-307	288	14	5
1133	463	277	40	69	chr3	71860475	71860491	-87739292	+	ORR1A4	LTR	MaLR	162	177	-193	5
1133	1235	128	1	2	chr3	71860792	71860983	-87738800	+	ORR1A4	LTR	MaLR	136	357	-13	5
1133	1049	319	17	23	chr3	71862231	71862577	-87737206	+	MTE2b	LTR	MaLR	23	366	-13	5
1133	541	194	65	37	chr3	71866715	71866897	-87732886	-	RMER6A	LTR	ERVK	-188	502	325	5
1133	487	157	0	0	chr3	71866975	71867058	-87732725	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	181	5
1133	246	154	0	0	chr3	71867070	71867107	-87732676	-	RMER6A	LTR	ERVK	-683	37	1	5
1133	232	298	47	23	chr3	71872262	71872348	-87727435	+	MLT-int	LTR	MaLR	1	88	-1647	5
1133	1112	372	92	52	chr3	71872672	71873797	-87725986	+	MLT-int	LTR	MaLR	151	1320	-415	5
1133	484	351	77	36	chr3	71873823	71874071	-87725712	+	MLT-int	LTR	MaLR	1416	1673	-62	5
1133	2417	117	47	10	chr3	71880695	71881102	-87718681	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	5
1133	251	262	0	0	chr3	71882749	71882810	-87716973	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	617	677	-3	5
1133	3572	129	35	88	chr3	71884773	71885566	-87714217	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	5
1133	2308	226	75	51	chr3	71891760	71892347	-87707436	-	RMER20B	LTR	ERVK	-23	604	4	5
1133	268	370	37	0	chr3	71892727	71892835	-87706948	-	ORR1E	LTR	MaLR	-235	124	13	5
1133	2603	81	31	17	chr3	71897271	71897623	-87702160	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	6
1133	1805	197	18	25	chr3	71900314	71900715	-87699068	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	6
1133	406	317	148	106	chr3	71900762	71901119	-87698664	-	MTEb	LTR	MaLR	-7	372	1	6
1133	776	333	78	3	chr3	71913093	71913388	-87686395	+	MTEa	LTR	MaLR	2	318	-61	6
1133	278	219	39	52	chr3	71913388	71913465	-87686318	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	76	-294	6
1133	825	258	57	31	chr3	71913688	71914077	-87685706	+	RMER15	LTR	ERVL	29	549	-26	6
1133	1835	135	63	171	chr3	71914549	71914648	-87685135	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	99	-331	6
1133	1835	135	63	171	chr3	71914684	71915058	-87684725	+	RLTR23	LTR	ERV1	100	430	0	6
1133	2634	190	46	138	chr3	71927875	71928613	-87671170	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	670	-50	6
1133	1200	164	9	32	chr3	71942970	71943191	-87656592	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-4	323	108	6
1133	396	239	121	0	chr3	71949108	71949221	-87650562	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-194	132	1	6
1133	1025	293	73	24	chr3	71949750	71950131	-87649652	-	MTC	LTR	MaLR	-21	400	1	6
1134	639	342	69	102	chr3	71962008	71962229	-87637554	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	190	6
1134	639	342	69	102	chr3	71962375	71962544	-87637239	-	MTD	LTR	MaLR	-230	189	37	6
1134	310	337	75	37	chr3	71962704	71962892	-87636891	-	ORR1E	LTR	MaLR	-164	195	1	6
1134	984	293	66	5	chr3	71963120	71963515	-87636268	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1134	3065	70	5	0	chr3	71965692	71966090	-87633693	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
1134	1235	249	56	6	chr3	71973098	71973421	-87626362	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-28	346	8	6
1134	1666	232	35	0	chr3	71974015	71974386	-87625397	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	6
1134	1435	246	44	37	chr3	71974386	71974795	-87624988	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1509	1098	6
1134	839	264	104	39	chr3	71978445	71978825	-87620958	+	RMER13A	LTR	ERVK	67	512	-396	7
1134	563	314	75	72	chr3	71980389	71980667	-87619116	-	MER73	LTR	ERVL	-2	642	364	7
1134	935	296	63	31	chr3	71982623	71982941	-87616842	-	MT2A	LTR	ERVL	-203	330	3	7
1134	829	280	101	23	chr3	71983908	71984255	-87615528	-	RMER13A	LTR	ERVK	-388	472	99	7
1134	235	229	177	71	chr3	71985736	71985849	-87613934	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-9	361	237	7
1134	1271	165	4	30	chr3	71985902	71986125	-87613658	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	201	7
1134	904	251	37	32	chr3	71987363	71987700	-87612083	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-72	347	2	7
1134	524	320	47	0	chr3	71987701	71987851	-87611932	-	MTC	LTR	MaLR	-192	167	11	7
1134	1609	181	16	58	chr3	71991158	71991586	-87608197	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	7
1134	714	320	51	64	chr3	71995576	71995950	-87603833	+	MTEa	LTR	MaLR	7	375	-4	7
1134	1379	340	92	44	chr3	71995977	71996630	-87603153	+	MTEa-int	LTR	MaLR	29	726	-854	7
1134	890	214	25	121	chr3	71996630	71996986	-87602797	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	7
1134	1379	340	92	44	chr3	71996986	71997102	-87602681	+	MTEa-int	LTR	MaLR	727	835	-745	7
1134	482	290	27	56	chr3	71997861	71998047	-87601736	+	ORR1D2	LTR	MaLR	142	366	-4	7
1134	2027	135	3	3	chr3	72006095	72006406	-87593377	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	6
1134	7215	12	9	0	chr3	72009086	72009901	-87589882	+	RLTR13B2	LTR	ERVK	1	822	0	1
1134	424	317	168	9	chr3	72010919	72011145	-87588638	-	MLT-int	LTR	MaLR	-7	1728	1467	1
1134	241	319	31	41	chr3	72011531	72011629	-87588154	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1611	124	28	1
1134	308	363	6	19	chr3	72015677	72015837	-87583946	-	LTR40a	LTR	ERVL	-44	475	318	1
1134	506	270	153	27	chr3	72020223	72020406	-87579377	+	RLTR18	LTR	ERVK	3	208	-304	2
1134	695	302	53	24	chr3	72020691	72020898	-87578885	+	RLTR18	LTR	ERVK	404	616	0	2
1134	1497	214	94	12	chr3	72027670	72028010	-87571773	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	17	4
1134	645	211	113	0	chr3	72029639	72029781	-87570002	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	254	4
1134	2028	216	77	32	chr3	72029790	72030320	-87569463	+	RLTR12A	LTR	ERVK	3	556	-12	4
1134	414	294	9	9	chr3	72030328	72030438	-87569345	-	MTD	LTR	MaLR	-161	258	149	4
1134	1079	286	89	40	chr3	72033224	72033596	-87566187	-	MTD	LTR	MaLR	-26	393	4	5
1134	404	264	252	33	chr3	72035477	72035779	-87564004	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	6
1134	566	259	0	0	chr3	72040119	72040227	-87559556	+	RMER6A	LTR	ERVK	634	741	-15	6
1134	1163	262	25	22	chr3	72046127	72046443	-87553340	+	MTD	LTR	MaLR	103	419	0	7
1134	1304	216	193	55	chr3	72046867	72047473	-87552310	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	7
1134	1355	191	8	19	chr3	72050623	72050879	-87548904	+	RMER12	LTR	ERVK	1	253	-1069	8
1134	770	192	11	102	chr3	72050880	72051066	-87548717	+	RMER12	LTR	ERVK	722	890	-432	8
1134	683	209	43	97	chr3	72051163	72051370	-87548413	+	RMER12	LTR	ERVK	976	1171	-151	8
1134	1769	166	52	83	chr3	72051993	72052400	-87547383	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	8
1134	1370	215	21	38	chr3	72057204	72057494	-87542289	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-9	358	74	9
1134	263	303	65	100	chr3	72069817	72070048	-87529735	+	RMER10A	LTR	ERVL	215	437	-5	1
1135	823	357	110	18	chr3	72104399	72104898	-87494885	-	MER54B	LTR	ERVL	-113	680	136	1
1135	1948	117	29	10	chr3	72110711	72111021	-87488762	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	316	-11	1
1135	1112	293	28	80	chr3	72118162	72118601	-87481182	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	1
1135	324	412	18	0	chr3	72122217	72122382	-87477401	+	RMER15-int	LTR	ERVL	332	499	-4500	1
1135	2882	155	97	51	chr3	72122471	72122948	-87476835	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	504	-252	1
1135	2882	155	97	51	chr3	72123035	72123183	-87476600	+	RMER6A	LTR	ERVK	505	655	-101	1
1135	3378	40	0	0	chr3	72125776	72126172	-87473611	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1135	1202	234	97	18	chr3	72130148	72130487	-87469296	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	366	-8	1
1135	243	406	23	54	chr3	72131474	72131604	-87468179	+	MLT1N2	LTR	MaLR	127	252	-310	1
1135	2650	48	0	9	chr3	72150762	72151102	-87448681	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	-8	337	1	1
1135	5682	191	54	3	chr3	72151102	72152187	-87447596	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-351	7329	5758	1
1135	654	263	50	53	chr3	72152439	72152720	-87447063	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-797	5745	5466	1
1135	2156	204	11	14	chr3	72153003	72153570	-87446213	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1076	5745	5098	1
1135	792	88	35	56	chr3	72153679	72153823	-87445960	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4530	1
1135	436	196	23	4	chr3	72153838	72153959	-87445824	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2380	2464	2362	1
1135	6692	115	57	6	chr3	72153964	72155344	-87444439	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-3135	4271	2735	1
1135	294	267	0	65	chr3	72155356	72155448	-87444335	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-4867	2539	2454	1
1135	460	220	93	0	chr3	72155459	72155577	-87444206	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-5557	1849	1721	1
1135	1315	197	100	82	chr3	72155578	72156067	-87443716	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-4783	623	251	1
1135	400	119	7	151	chr3	72156179	72156318	-87443465	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-6629	952	834	2
1135	437	164	9	52	chr3	72156297	72156413	-87443370	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-5877	944	834	2
1135	482	217	17	34	chr3	72156413	72156532	-87443251	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-6704	117	1	2
1135	2509	57	9	6	chr3	72156538	72156874	-87442909	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	-8	337	1	2
1135	458	401	115	31	chr3	72166053	72166697	-87433086	-	MTE-int	LTR	MaLR	-27	1553	856	2
1135	1301	251	51	13	chr3	72167253	72167564	-87432219	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	323	-44	2
1135	580	262	97	55	chr3	72174686	72175045	-87424738	-	MTEa	LTR	MaLR	-24	355	47	2
1135	277	307	40	0	chr3	72175020	72175095	-87424688	-	ORR1E	LTR	MaLR	-260	99	22	2
1135	600	181	50	21	chr3	72176543	72176684	-87423099	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1220	1364	-6	2
1135	764	277	114	26	chr3	72176684	72177025	-87422758	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	372	-2	2
1135	247	287	63	84	chr3	72179763	72179858	-87419925	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	275	2
1135	1174	198	60	1	chr3	72180171	72180419	-87419364	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-1104	266	4	2
1135	968	116	20	7	chr3	72180422	72180570	-87419213	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	218	2
1135	762	293	87	73	chr3	72180954	72181241	-87418542	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	292	-92	2
1135	2561	231	28	67	chr3	72181246	72181951	-87417832	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	823	1500	-9	2
1135	991	255	140	134	chr3	72181987	72182517	-87417266	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	2
1135	273	193	0	50	chr3	72182573	72182633	-87417150	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1324	639	583	2
1135	510	232	7	44	chr3	72182671	72182806	-87416977	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-90	5671	5542	2
1135	1480	257	41	28	chr3	72183121	72183275	-87416508	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-226	5535	5383	2
1135	2167	94	37	0	chr3	72183275	72183573	-87416210	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	2
1135	1480	257	41	28	chr3	72183573	72183882	-87415901	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-379	5382	5066	2
1135	1568	167	51	10	chr3	72188656	72188952	-87410831	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-59	308	1	2
1135	422	276	16	31	chr3	72189433	72189560	-87410223	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	125	-502	2
1135	1208	206	157	12	chr3	72190262	72190581	-87409202	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	3	2
1135	625	349	32	32	chr3	72191273	72191614	-87408169	-	MT2A	LTR	ERVL	-108	425	85	2
1135	293	294	123	36	chr3	72195173	72195404	-87404379	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-109	261	19	2
1135	320	342	130	6	chr3	72197457	72197619	-87402164	+	MTEa	LTR	MaLR	65	246	-133	2
1135	445	374	49	21	chr3	72205833	72206120	-87393663	-	MER77	LTR	ERVL	0	607	313	2
1135	3429	232	27	65	chr3	72217355	72218176	-87381607	+	RMER13B	LTR	ERVK	119	908	0	2
1136	409	363	35	45	chr3	72228379	72228581	-87371202	-	MTEb	LTR	MaLR	-7	372	173	3
1136	1813	223	41	8	chr3	72228677	72229043	-87370740	+	MTC	LTR	MaLR	39	416	-5	3
1136	3293	186	40	10	chr3	72239539	72240162	-87359621	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	3
1136	1790	204	84	69	chr3	72246367	72247064	-87352719	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	885	-218	3
1136	1790	229	47	60	chr3	72247127	72247356	-87352427	+	RLTR25A	LTR	ERVK	886	1103	0	3
1136	1665	170	27	59	chr3	72247870	72248207	-87351576	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	3
1136	3247	44	3	0	chr3	72256051	72256435	-87343348	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	3
1136	273	362	11	0	chr3	72262871	72262965	-87336818	-	ORR1E	LTR	MaLR	-202	157	63	3
1136	1413	317	100	37	chr3	72263006	72263658	-87336125	-	MTE-int	LTR	MaLR	-55	1525	833	3
1136	666	128	436	0	chr3	72266125	72266281	-87333502	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	224	-466	3
1136	289	254	0	0	chr3	72266280	72266343	-87333440	+	RMER6D	LTR	ERVK	658	720	0	3
1136	270	345	119	80	chr3	72268643	72268955	-87330828	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	188	538	-142	3
1136	1380	226	49	10	chr3	72274742	72275050	-87324733	+	MTC	LTR	MaLR	102	421	0	3
1136	349	276	0	19	chr3	72275550	72275657	-87324126	+	MTEb	LTR	MaLR	275	379	0	3
1136	811	279	147	22	chr3	72276160	72276411	-87323372	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	119	3
1136	811	276	151	22	chr3	72276881	72276946	-87322837	-	MTD	LTR	MaLR	-306	113	50	3
1136	1244	280	35	38	chr3	72281783	72282236	-87317547	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	82	3
1136	298	232	110	0	chr3	72282320	72282402	-87317381	-	MT2A	LTR	ERVL	-442	91	1	3
1136	252	379	87	43	chr3	72284751	72285005	-87314778	-	LTR53	LTR	ERVL	-181	338	74	3
1136	638	217	0	8	chr3	72287545	72287675	-87312108	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1381	1509	0	4
1136	2036	189	8	8	chr3	72287675	72288069	-87311714	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
1136	1132	254	93	38	chr3	72290041	72290484	-87309299	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-21	5740	5274	4
1136	2661	37	28	0	chr3	72290539	72290861	-87308922	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-1	331	1	4
1136	5240	246	62	22	chr3	72291431	72292148	-87307635	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-489	5272	4518	4
1136	3265	100	6	11	chr3	72292148	72292623	-87307160	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-2	473	1	4
1136	5240	246	62	22	chr3	72292623	72293215	-87306568	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1244	4517	3911	4
1136	656	189	8	0	chr3	72293213	72293340	-87306443	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2909	2852	2725	4
1136	2310	259	24	10	chr3	72293895	72294483	-87305300	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3046	2715	2120	4
1136	3464	279	48	21	chr3	72294483	72295241	-87304542	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4127	1634	888	4
1136	3464	279	48	21	chr3	72295426	72295801	-87303982	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4874	887	471	4
1136	400	322	88	93	chr3	72295812	72296219	-87303564	-	RMER10A	LTR	ERVL	-25	417	13	4
1136	517	229	97	32	chr3	72296236	72296421	-87303362	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5288	473	277	4
1136	300	245	65	5	chr3	72296971	72297083	-87302700	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-36	343	226	4
1136	340	320	110	26	chr3	72298465	72298619	-87301164	+	MLT1A0	LTR	MaLR	198	364	-1	4
1136	673	318	106	75	chr3	72302172	72302492	-87297291	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	330	-49	4
1136	2456	184	30	18	chr3	72305664	72306169	-87293614	-	RMER19C	LTR	ERVK	-27	584	3	4
1136	3331	138	11	5	chr3	72306476	72307036	-87292747	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	251	813	-1035	4
1136	1436	163	4	41	chr3	72307319	72307587	-87292196	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1591	1848	0	4
1136	1276	206	77	60	chr3	72308052	72308455	-87291328	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	4
1136	1367	168	35	51	chr3	72320274	72320588	-87279195	+	RMER16-int	LTR	ERVK	27	335	-5071	4
1136	287	95	0	0	chr3	72320588	72320630	-87279153	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1677	1718	-3688	4
1136	3483	125	87	19	chr3	72320630	72321225	-87278558	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2007	2642	-2764	4
1136	1987	192	86	24	chr3	72321225	72321585	-87278198	+	RMER17B	LTR	ERVK	509	899	-59	4
1136	3973	76	34	29	chr3	72321585	72322142	-87277641	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	4
1136	1987	192	86	24	chr3	72322142	72322202	-87277581	+	RMER17B	LTR	ERVK	900	955	-3	4
1136	15870	131	26	20	chr3	72322228	72324886	-87274897	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2733	5406	0	4
1136	1115	231	7	62	chr3	72325032	72325341	-87274442	+	RMER16	LTR	ERVK	242	533	0	4
1136	710	236	82	33	chr3	72325516	72325770	-87274013	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	759	4
1136	3026	189	105	15	chr3	72325863	72326590	-87273193	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-166	862	147	4
1136	2933	29	0	6	chr3	72327838	72328182	-87271601	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-4	342	1	4
1136	13983	59	2	1	chr3	72328182	72329973	-87269810	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1	4
1136	2937	38	0	0	chr3	72329973	72330319	-87269464	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	4
1136	2397	187	132	34	chr3	72338118	72338672	-87261111	+	RMER19C	LTR	ERVK	4	611	0	4
1136	269	204	0	0	chr3	72340587	72340636	-87259147	+	MTEa	LTR	MaLR	331	379	0	4
1136	341	352	105	25	chr3	72342157	72342518	-87257265	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1224	1613	-3386	4
1136	297	306	45	18	chr3	72342551	72342661	-87257122	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4421	4533	-466	4
1136	552	390	59	5	chr3	72342829	72343048	-87256735	-	ORR1E	LTR	MaLR	-114	245	15	4
1136	2055	203	15	17	chr3	72343559	72343970	-87255813	+	MTC	LTR	MaLR	3	412	-9	4
1136	456	301	167	25	chr3	72351106	72351430	-87248353	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
1137	7686	168	31	2	chr3	72354879	72356281	-87243502	+	RMER6-int	LTR	ERVK	25	1467	-1710	4
1137	1468	202	7	7	chr3	72362494	72362778	-87237005	+	RMER6-int	LTR	ERVK	1454	1737	-1440	4
1137	1056	178	73	13	chr3	72362896	72363129	-87236654	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2585	2831	-346	4
1137	1068	159	11	5	chr3	72363132	72363321	-87236462	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2981	3170	-7	4
1137	1506	244	96	41	chr3	72363326	72363980	-87235803	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	4
1137	2698	82	8	8	chr3	72365678	72366061	-87233722	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	383	-13	5
1137	2132	100	40	0	chr3	72377026	72377325	-87222458	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	5
1137	454	312	88	29	chr3	72383022	72383306	-87216477	+	MER34	LTR	ERV1	3	301	-270	5
1137	1062	209	151	15	chr3	72395357	72395682	-87204101	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	3	5
1137	274	284	104	20	chr3	72405489	72405616	-87194167	+	MLT1B	LTR	MaLR	261	449	-18	5
1137	490	364	100	28	chr3	72420505	72420754	-87179029	-	MTC	LTR	MaLR	-14	407	141	5
1137	453	202	96	0	chr3	72422061	72422165	-87177618	+	MTD	LTR	MaLR	293	406	-13	5
1137	1267	262	90	68	chr3	72422262	72422950	-87176833	-	RMER13A	LTR	ERVK	-131	777	1	5
1137	235	258	150	8	chr3	72427105	72427238	-87172545	+	MER67C	LTR	ERV1	45	196	-515	6
1137	273	363	81	7	chr3	72427254	72427390	-87172393	+	MER67C	LTR	ERV1	231	376	-335	6
1137	3456	180	34	27	chr3	72429705	72430414	-87169369	+	RMER6D	LTR	ERVK	3	716	-4	6
1137	2649	115	29	10	chr3	72457336	72457750	-87142033	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	422	0	6
1137	536	238	301	20	chr3	72470836	72471128	-87128655	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	6
1137	3039	272	75	9	chr3	72471160	72472000	-87127783	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-45	1325	431	6
1137	2902	70	26	5	chr3	72472021	72472408	-87127375	-	MTB	LTR	MaLR	-5	395	1	6
1137	1543	272	70	3	chr3	72472469	72472887	-87126896	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-943	427	3	6
1137	1835	158	34	25	chr3	72475813	72475912	-87123871	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	96	-231	6
1137	1835	158	34	25	chr3	72476136	72476360	-87123423	+	ORR1A2	LTR	MaLR	97	327	0	6
1137	5010	147	24	21	chr3	72476360	72477232	-87122551	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1089	1963	0	6
1137	2133	136	12	3	chr3	72477232	72477556	-87122227	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1137	1917	226	39	18	chr3	72482215	72482728	-87117055	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	4	6
1138	710	144	0	0	chr3	72483839	72483957	-87115826	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-335	118	1	6
1138	614	307	30	110	chr3	72484393	72484598	-87115185	+	MT2A	LTR	ERVL	1	180	-353	6
1138	614	307	30	110	chr3	72484776	72484870	-87114913	+	MT2A	LTR	ERVL	181	276	-257	6
1138	927	257	34	48	chr3	72484913	72485265	-87114518	+	MTD-int	LTR	MaLR	912	1258	0	6
1138	252	228	239	0	chr3	72485265	72485357	-87114426	+	MTD	LTR	MaLR	1	114	-307	6
1138	287	210	0	88	chr3	72485875	72485943	-87113840	+	MTD	LTR	MaLR	179	240	-179	6
1138	1466	103	54	5	chr3	72495469	72495693	-87104090	-	RLTR27	LTR	ERVK	-74	235	1	7
1138	231	284	158	12	chr3	72496727	72496809	-87102974	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-29	379	286	7
1138	2207	175	132	107	chr3	72510142	72510815	-87088968	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	6
1138	2055	211	42	3	chr3	72511824	72512205	-87087578	+	MTC	LTR	MaLR	1	396	-25	9
1138	464	369	92	13	chr3	72515494	72515733	-87084050	-	MER77	LTR	ERVL	-97	510	253	1
1138	265	340	97	46	chr3	72515793	72516080	-87083703	+	MTEa	LTR	MaLR	1	334	-45	1
1138	466	302	73	133	chr3	72517211	72517462	-87082321	+	MTE-int	LTR	MaLR	249	467	-1113	1
1138	1222	357	61	51	chr3	72517489	72518304	-87081479	+	MTE-int	LTR	MaLR	468	1571	-9	1
1138	247	188	0	0	chr3	72521001	72521049	-87078734	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	347	2
1138	1034	281	37	58	chr3	72525440	72525822	-87073961	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	2
1138	3023	26	0	0	chr3	72528430	72528776	-87071007	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
1138	2269	195	203	51	chr3	72530243	72530865	-87068918	-	RMER6D	LTR	ERVK	-4	716	1	3
1138	237	214	135	54	chr3	72533001	72533075	-87066708	+	LTR87	LTR	ERVL?	44	123	-501	4
1138	247	275	21	62	chr3	72534380	72534477	-87065306	-	LTR16E2	LTR	ERVL	-161	407	315	4
1138	918	307	23	69	chr3	72541063	72541409	-87058374	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	48	5
1138	700	301	135	12	chr3	72543499	72543751	-87056032	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1266	314	32	6
1138	268	338	73	121	chr3	72544392	72544665	-87055118	-	ORR1E	LTR	MaLR	-55	304	45	6
1138	3456	21	118	0	chr3	72553884	72554309	-87045474	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	7
1138	1761	137	80	0	chr3	72555955	72556254	-87043529	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	35	8
1138	27075	112	19	4	chr3	72556262	72560238	-87039545	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	3647	8
1138	2238	117	6	12	chr3	72560230	72560558	-87039225	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5738	1942	1617	8
1138	10022	108	6	22	chr3	72560541	72562044	-87037739	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6201	1479	1	8
1138	1727	144	80	0	chr3	72562044	72562343	-87037440	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	35	8
1138	5550	156	19	7	chr3	72562563	72563508	-87036275	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	956	-2	8
1138	1274	250	82	26	chr3	72567144	72567484	-87032299	-	MTC	LTR	MaLR	-14	407	47	9
1138	1980	215	46	5	chr3	72567484	72567585	-87032198	+	MTC	LTR	MaLR	1	113	-308	9
1138	1980	215	46	5	chr3	72568193	72568479	-87031304	+	MTC	LTR	MaLR	114	403	-18	9
1138	229	262	47	37	chr3	72579039	72579146	-87020637	+	MER72B	LTR	ERV1	280	387	-381	1
1138	1829	211	13	10	chr3	72584841	72585234	-87014549	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1138	4124	237	80	14	chr3	72585234	72585399	-87014384	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	1327	1
1138	4124	237	80	14	chr3	72585425	72585469	-87014314	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-183	1326	1288	1
1138	4124	242	83	29	chr3	72585518	72586587	-87013196	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-222	1287	101	1
1138	393	226	12	0	chr3	72587721	72587805	-87011978	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1424	85	1	1
1138	1676	202	31	18	chr3	72587807	72588191	-87011592	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-3	391	3	1
1138	857	316	107	20	chr3	72592441	72592786	-87006997	+	MTEa	LTR	MaLR	3	377	-2	1
1138	508	265	64	85	chr3	72597547	72597711	-87002072	+	RMER15	LTR	ERVL	346	508	-67	1
1138	508	265	64	85	chr3	72598423	72598493	-87001290	+	RMER15	LTR	ERVL	509	575	0	1
1138	1422	99	25	2	chr3	72600804	72601038	-86998745	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1139	2854	76	8	10	chr3	72615968	72616365	-86983418	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1139	1604	232	52	5	chr3	72624080	72624466	-86975317	-	MTC	LTR	MaLR	-17	404	1	1
1139	580	318	49	81	chr3	72627039	72627347	-86972436	-	MLT1D	LTR	MaLR	-114	391	94	1
1139	2804	73	5	3	chr3	72627435	72627822	-86971961	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	1
1139	968	288	65	21	chr3	72628676	72629013	-86970770	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	221	1
1139	1044	232	67	22	chr3	72629584	72629853	-86969930	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	628	1
1139	2577	158	32	18	chr3	72629853	72630291	-86969492	-	RMER13B	LTR	ERVK	-464	444	1	1
1139	2276	62	6	50	chr3	72634444	72634781	-86965002	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
1139	6658	82	7	3	chr3	72637397	72638287	-86961496	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	1	1
1139	2305	186	42	56	chr3	72646858	72647075	-86952708	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	355	2
1139	2305	186	42	56	chr3	72647286	72647637	-86952146	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-207	354	2	2
1139	483	366	78	40	chr3	72652770	72653066	-86946717	+	MTD	LTR	MaLR	113	419	0	2
1139	435	322	114	39	chr3	72654145	72654185	-86945598	+	MTC	LTR	MaLR	22	73	-306	2
1139	1317	209	89	0	chr3	72654332	72654624	-86945159	+	MTC	LTR	MaLR	104	421	0	2
1139	595	302	92	30	chr3	72660859	72661163	-86938620	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	201	2
1139	226	239	44	15	chr3	72662336	72662404	-86937379	+	MLT1E3	LTR	MaLR	554	623	-1	2
1139	292	251	33	0	chr3	72663643	72663734	-86936049	+	MLT2C1	LTR	ERVL	37	130	-267	2
1139	310	357	58	18	chr3	72663913	72664084	-86935699	+	MLT2C1	LTR	ERVL	121	298	-99	2
1139	1340	227	55	29	chr3	72664808	72665153	-86934630	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-19	355	2	2
1139	1563	217	57	59	chr3	72665672	72666112	-86933671	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	747	1185	-1141	2
1139	883	79	7	28	chr3	72666619	72666762	-86933021	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1177	1316	-1010	2
1139	746	144	8	0	chr3	72667271	72667403	-86932380	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	2038	2170	-156	2
1139	4086	157	70	29	chr3	72671824	72672666	-86927117	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	26	902	0	2
1139	2740	74	48	0	chr3	72680103	72680496	-86919287	-	BGLII	LTR	ERVK	-9	412	1	2
1139	530	133	0	12	chr3	72680496	72680580	-86919203	-	RMER6D	LTR	ERVK	-149	541	459	2
1139	3309	145	18	9	chr3	72680596	72681160	-86918623	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-16	589	21	2
1139	751	268	138	48	chr3	72681113	72681571	-86918212	-	RMER6D	LTR	ERVK	-219	501	3	2
1139	335	321	17	26	chr3	72685857	72685972	-86913811	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	114	-265	2
1139	597	299	35	56	chr3	72693152	72693439	-86906344	-	MTE2a	LTR	MaLR	-63	316	36	2
1139	362	311	56	53	chr3	72704039	72704297	-86895486	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-305	263	8	2
1139	1743	143	20	7	chr3	72708636	72708932	-86890851	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2931	3230	-8	2
1139	1105	186	0	43	chr3	72708934	72709215	-86890568	+	RMER17C	LTR	ERVK	7	275	-135	2
1139	225	305	71	40	chr3	72714529	72714628	-86885155	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	157	3
1139	760	280	73	37	chr3	72720452	72720843	-86878940	-	RMER10A	LTR	ERVL	-2	440	1	3
1139	1593	217	128	18	chr3	72728237	72728692	-86871091	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	1	3
1139	2122	201	79	11	chr3	72733576	72734184	-86865599	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	717	-3	3
1139	1831	197	62	17	chr3	72737105	72737508	-86862275	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1140	1196	128	22	22	chr3	72777854	72778069	-86821714	-	MT2B2	LTR	ERVL	-29	555	233	3
1140	356	111	0	0	chr3	72778065	72778119	-86821664	+	MT2B	LTR	ERVL	548	601	0	3
1140	282	240	0	186	chr3	72778173	72778291	-86821492	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-359	105	10	3
1140	292	350	40	104	chr3	72778387	72778741	-86821042	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	24	3
1140	2710	193	211	28	chr3	72780027	72780789	-86818994	+	RMER12	LTR	ERVK	421	1322	0	3
1140	720	285	59	55	chr3	72780793	72781049	-86818734	+	MTD	LTR	MaLR	149	405	-14	3
1140	234	111	0	0	chr3	72823608	72823644	-86776139	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	36	-338	4
1140	977	199	53	38	chr3	72823641	72823938	-86775845	-	RMER6D	LTR	ERVK	-388	332	83	4
1140	405	228	92	50	chr3	72823938	72824058	-86775725	-	RMER6C	LTR	ERVK	-501	189	65	4
1140	769	99	16	8	chr3	72830285	72830407	-86769376	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-38	437	315	4
1140	356	238	38	0	chr3	72830415	72830495	-86769288	-	RMER6C	LTR	ERVK	-607	83	1	4
1140	1197	248	81	23	chr3	72842257	72842448	-86757335	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	170	4
1140	1197	248	81	23	chr3	72842562	72842708	-86757075	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-213	161	4	4
1140	480	345	19	53	chr3	72867173	72867436	-86732347	+	MLT1E2	LTR	MaLR	374	627	0	5
1141	3093	165	49	41	chr3	72916452	72917089	-86682694	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	5
1141	380	321	95	40	chr3	72937596	72937943	-86661840	-	MLT1A	LTR	MaLR	-2	406	4	6
1141	1260	219	90	71	chr3	72940662	72940755	-86659028	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	441	6
1141	1260	224	94	67	chr3	72940805	72941238	-86658545	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-102	476	24	6
1141	255	301	27	27	chr3	72941477	72941552	-86658231	+	MTD	LTR	MaLR	199	273	-146	6
1141	1302	282	17	39	chr3	72941754	72942202	-86657581	-	MTD	LTR	MaLR	-14	407	1	6
1141	678	291	80	114	chr3	72943337	72943636	-86656147	+	MTE2b	LTR	MaLR	27	315	-64	6
1141	512	246	283	38	chr3	72948678	72948915	-86650868	+	MTD	LTR	MaLR	104	398	-21	6
1141	335	271	105	73	chr3	72949944	72950163	-86649620	+	MTE2a	LTR	MaLR	154	379	0	6
1141	1686	147	0	18	chr3	72951438	72951715	-86648068	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	419	6
1141	375	202	69	147	chr3	72951809	72951925	-86647858	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	181	6
1141	467	215	44	14	chr3	72951839	72951983	-86647800	-	RMER6C	LTR	ERVK	-539	181	35	6
1141	2312	171	139	58	chr3	72959754	72960392	-86639391	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	6
1141	248	180	27	91	chr3	72973343	72973453	-86626330	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-543	363	261	6
1141	1139	304	10	10	chr3	72976510	72976809	-86622974	+	MTE2a	LTR	MaLR	73	371	-8	6
1141	1053	263	219	7	chr3	72977072	72977497	-86622286	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	61	6
1141	677	329	39	60	chr3	72977694	72978108	-86621675	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	6
1141	231	193	18	0	chr3	72985374	72985431	-86614352	+	RMER6A	LTR	ERVK	105	162	-528	6
1141	1391	194	192	48	chr3	72985886	72986037	-86613746	+	RMER6A	LTR	ERVK	153	336	-420	6
1141	1391	206	147	80	chr3	72986105	72986534	-86613249	+	RMER6A	LTR	ERVK	307	675	-45	6
1141	2974	137	30	41	chr3	72986534	72987099	-86612684	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	3	561	0	6
1141	1218	232	40	156	chr3	72987099	72987139	-86612644	+	RMER6A	LTR	ERVK	676	709	-11	6
1141	2396	183	164	13	chr3	72989193	72989724	-86610059	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1141	758	313	25	74	chr3	72993243	72993567	-86606216	+	ORR1D2	LTR	MaLR	8	315	-55	7
1141	3108	48	27	0	chr3	72993629	72994004	-86605779	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	7
1141	576	375	61	33	chr3	72995667	72996061	-86603722	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	7
1142	986	284	80	109	chr3	73007516	73007994	-86591789	-	MT2A	LTR	ERVL	-68	465	2	1
1142	352	327	17	46	chr3	73009165	73009345	-86590438	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-167	198	28	1
1142	1043	203	32	6	chr3	73016566	73016849	-86582934	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	336	-38	2
1142	609	244	63	103	chr3	73021479	73021898	-86577885	+	RMER2	LTR	ERV1	1	507	-60	3
1142	254	290	137	77	chr3	73024775	73024958	-86574825	+	RMER2	LTR	ERV1	346	539	-28	3
1142	519	254	135	36	chr3	73039046	73039238	-86560545	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	195	6
1142	400	363	54	19	chr3	73039385	73039590	-86560193	-	MTD	LTR	MaLR	-197	222	11	6
1142	303	353	58	14	chr3	73041449	73041587	-86558196	-	LTR16A	LTR	ERVL	-86	365	222	6
1142	4376	16	2	0	chr3	73055644	73056136	-86543647	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	8
1142	40488	16	14	0	chr3	73056136	73061423	-86538360	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	8
1142	392	167	46	35	chr3	73061423	73061510	-86538273	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	8
1142	314	0	0	0	chr3	73061510	73061548	-86538235	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	8
1142	4376	16	2	0	chr3	73061548	73062040	-86537743	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	8
1142	12530	67	11	65	chr3	73065483	73065833	-86533950	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-4	1804	1533	8
1142	2341	85	87	15	chr3	73065833	73066168	-86533615	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	9
1142	12530	67	11	65	chr3	73066168	73066395	-86533388	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-276	1532	1311	8
1142	12530	67	11	65	chr3	73066451	73067123	-86532660	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-498	1310	649	8
1142	3245	21	39	0	chr3	73067123	73067504	-86532279	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1142	8640	34	34	2	chr3	73067506	73068568	-86531215	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-2	1096	1	9
1142	3245	21	39	0	chr3	73068568	73068949	-86530834	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1142	12530	67	11	65	chr3	73068949	73069598	-86530185	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-1160	648	2	8
1142	557	259	100	41	chr3	73074158	73074453	-86525330	-	MLT1A	LTR	MaLR	-29	361	28	1
1142	305	385	33	28	chr3	73077423	73077637	-86522146	-	MLT1D	LTR	MaLR	-24	481	267	1
1142	241	303	98	0	chr3	73081021	73081143	-86518640	-	MLT1D	LTR	MaLR	-343	162	29	1
1142	743	304	48	65	chr3	73090249	73090594	-86509189	-	MTE2a	LTR	MaLR	-28	391	46	1
1142	3973	65	77	2	chr3	73102755	73103276	-86496507	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	1
1142	1605	205	11	114	chr3	73105477	73105950	-86493833	+	RLTR23	LTR	ERV1	7	430	0	1
1142	1060	222	53	4	chr3	73113001	73113272	-86486511	+	MTC	LTR	MaLR	1	273	-127	1
1142	920	247	18	18	chr3	73113238	73113465	-86486318	+	ORR1C2	LTR	MaLR	156	382	-2	1
1142	1820	215	39	17	chr3	73117691	73118103	-86481680	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1142	1123	226	72	83	chr3	73118829	73119109	-86480674	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	264	-120	1
1142	1123	226	72	83	chr3	73119153	73119258	-86480525	+	ORR1C2	LTR	MaLR	265	384	0	1
1142	3070	239	55	24	chr3	73119258	73120123	-86479660	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	1	892	-478	1
1142	529	301	66	58	chr3	73124641	73124867	-86474916	-	MER34A1	LTR	ERV1	-357	230	3	1
1142	2132	232	73	71	chr3	73136151	73137124	-86462659	+	MTC-int	LTR	MaLR	108	1210	-48	1
1143	2312	192	79	10	chr3	73142560	73143054	-86456729	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	1
1143	243	392	53	32	chr3	73151650	73151837	-86447946	-	LTR16A1	LTR	ERVL	-8	448	258	2
1143	428	301	35	35	chr3	73151982	73152154	-86447629	+	MLT2B4	LTR	ERVL	48	219	-337	2
1143	379	345	46	27	chr3	73152168	73152430	-86447353	-	RLTR15	LTR	ERVK	-17	342	76	2
1143	427	238	107	47	chr3	73155229	73155379	-86444404	-	RLTR15	LTR	ERVK	-200	159	1	2
1143	352	328	73	29	chr3	73155398	73155602	-86444181	+	MLT2B4	LTR	ERVL	266	478	-78	2
1143	1011	258	37	31	chr3	73155602	73155921	-86443862	+	MT2A	LTR	ERVL	3	474	-127	2
1143	1183	245	121	0	chr3	73156157	73156528	-86443255	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	1	2
1143	3532	186	84	46	chr3	73162530	73163386	-86436397	-	RMER19B	LTR	ERVK	-13	889	1	2
1143	2391	100	141	0	chr3	73163561	73163741	-86436042	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	243	2
1143	2391	100	141	0	chr3	73163807	73163996	-86435787	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-180	242	2	2
1143	276	222	0	0	chr3	73165957	73166011	-86433772	-	MTE2b	LTR	MaLR	-325	54	1	2
1143	1073	215	63	137	chr3	73166557	73166967	-86432816	+	ORR1C2	LTR	MaLR	5	384	0	2
1143	3088	211	56	34	chr3	73170518	73171235	-86428548	-	RMER13A	LTR	ERVK	-125	735	3	2
1143	790	365	80	11	chr3	73180329	73180780	-86419003	+	MLT2B4	LTR	ERVL	6	487	-69	2
1143	1114	230	74	28	chr3	73181777	73182185	-86417598	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	6	428	-106	2
1143	1045	259	124	40	chr3	73182222	73182263	-86417520	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	429	481	-53	2
1143	2690	107	38	48	chr3	73183379	73183859	-86415924	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
1143	1465	218	41	56	chr3	73202017	73202215	-86397568	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	198	-180	2
1143	1465	218	41	56	chr3	73202408	73202549	-86397234	+	ORR1C1	LTR	MaLR	199	337	-41	2
1143	538	348	45	24	chr3	73204486	73204816	-86394967	+	MER110	LTR	ERV1	1	337	-154	2
1143	625	250	133	33	chr3	73205857	73206068	-86393715	+	MTD	LTR	MaLR	186	417	-2	2
1143	344	312	51	88	chr3	73206087	73206377	-86393406	+	ORR1E	LTR	MaLR	106	366	-4	3
1143	231	325	102	31	chr3	73212442	73212569	-86387214	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-234	136	1	3
1143	467	322	28	28	chr3	73225884	73226060	-86373723	+	MLT1E1	LTR	MaLR	1	176	-478	3
1143	348	315	38	135	chr3	73227247	73227669	-86372114	+	MER110	LTR	ERV1	87	467	-24	3
1143	575	254	42	0	chr3	73229495	73229637	-86370146	+	MTD	LTR	MaLR	1	148	-271	3
1143	800	319	115	6	chr3	73229981	73230312	-86369471	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	370	-9	3
1143	480	288	112	70	chr3	73230704	73230962	-86368821	+	MLT-int	LTR	MaLR	1428	1696	-39	3
1143	575	350	86	42	chr3	73231103	73231485	-86368298	+	MLT1C	LTR	MaLR	64	462	-5	3
1143	225	307	67	0	chr3	73238664	73238739	-86361044	-	MLT1B	LTR	MaLR	-29	379	300	3
1143	306	329	62	19	chr3	73238782	73238943	-86360840	-	MLT1B	LTR	MaLR	-219	171	4	3
1143	1229	205	62	167	chr3	73239228	73239708	-86360075	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	3
1143	1976	226	26	63	chr3	73240086	73240592	-86359191	+	RLTR25A	LTR	ERVK	35	521	-582	3
1143	694	171	177	132	chr3	73240518	73240767	-86359016	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	499	758	-1205	3
1143	1112	160	89	61	chr3	73240621	73240837	-86358946	+	MT2B	LTR	ERVL	35	257	-344	3
1143	1898	299	24	41	chr3	73260845	73261763	-86338020	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-437	4969	4068	3
1143	558	141	0	21	chr3	73262837	73262931	-86336852	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1335	4071	3980	3
1143	1807	279	29	36	chr3	73263167	73263921	-86335862	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1427	3979	3231	3
1144	307	351	84	7	chr3	73274570	73274725	-86325058	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-372	188	22	3
1144	239	284	61	95	chr3	73279459	73279607	-86320176	-	RMER17C	LTR	ERVK	-78	332	190	3
1144	246	301	54	11	chr3	73283537	73283722	-86316061	+	RMER17C	LTR	ERVK	48	240	-170	3
1144	498	369	87	31	chr3	73288213	73288602	-86311181	+	MLT1C	LTR	MaLR	39	449	-18	4
1144	3469	15	5	0	chr3	73290569	73290963	-86308820	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1144	9082	36	4	1	chr3	73290963	73292058	-86307725	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
1144	3554	10	2	0	chr3	73292058	73292453	-86307330	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1144	2929	61	26	3	chr3	73294422	73294802	-86304981	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	4	392	-4	4
1144	2848	83	0	2	chr3	73294806	73295206	-86304577	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	399	-699	4
1144	685	250	103	34	chr3	73295229	73295445	-86304338	-	MT2A	LTR	ERVL	-153	448	94	4
1144	533	214	35	9	chr3	73295657	73295770	-86304013	-	MT2A	LTR	ERVL	-415	118	3	4
1144	447	245	124	100	chr3	73300160	73300419	-86299364	-	LTR40b	LTR	ERVL	-11	451	187	4
1144	777	321	94	28	chr3	73302425	73302713	-86297070	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	307	-52	4
1144	2775	172	30	28	chr3	73303343	73303871	-86295912	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	529	-574	4
1144	235	406	23	0	chr3	73309412	73309540	-86290243	+	MLT1J	LTR	MaLR	72	202	-310	4
1144	3516	13	2	0	chr3	73310370	73310765	-86289018	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1144	9425	24	0	1	chr3	73310765	73311864	-86287919	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
1144	3375	30	2	0	chr3	73311864	73312259	-86287524	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1144	752	293	254	45	chr3	73315884	73316265	-86283518	-	RMER15	LTR	ERVL	-92	483	23	4
1144	637	362	86	58	chr3	73316784	73317282	-86282501	+	MLT1F2	LTR	MaLR	49	560	0	4
1144	229	279	46	46	chr3	73325064	73325173	-86274610	+	MER49	LTR	ERV1	269	377	-546	4
1144	642	271	105	5	chr3	73329251	73329451	-86270332	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-129	236	17	4
1144	256	303	79	0	chr3	73329556	73329645	-86270138	-	MTEb	LTR	MaLR	-23	356	261	4
1144	314	256	24	0	chr3	73329669	73329751	-86270032	+	MTD	LTR	MaLR	334	417	-2	4
1144	1465	231	3	30	chr3	73336003	73336337	-86263446	+	RLTR14	LTR	ERV1	7	331	-51	4
1144	1507	219	162	8	chr3	73340491	73340886	-86258897	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	130	4
1144	1493	213	82	3	chr3	73340862	73341177	-86258606	+	ORR1B1	LTR	MaLR	47	386	-8	4
1144	252	312	28	118	chr3	73360437	73360648	-86239135	+	LTR48	LTR	ERV1	583	774	-13	5
1144	695	351	56	14	chr3	73361347	73361633	-86238150	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	275	5
1144	961	217	29	5	chr3	73362083	73362287	-86237496	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	482	5
1144	4275	17	0	0	chr3	73363489	73363971	-86235812	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	5
1144	3017	75	5	2	chr3	73364083	73364482	-86235301	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1144	271	310	29	29	chr3	73367071	73367174	-86232609	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	357	255	5
1144	226	327	73	26	chr3	73370046	73370197	-86229586	+	MLT2F	LTR	ERVL	457	614	-49	5
1144	651	314	75	33	chr3	73370560	73370922	-86228861	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	1	5
1144	4376	66	12	12	chr3	73375655	73376219	-86223564	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	5
1144	577	256	218	31	chr3	73376469	73376763	-86223020	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	755	5
1144	2527	220	40	117	chr3	73377154	73377974	-86221809	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-339	764	8	5
1144	1820	226	35	2	chr3	73378014	73378409	-86221374	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	14	5
1144	275	300	56	14	chr3	73384451	73384522	-86215261	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-223	346	273	5
1144	7292	16	1	4	chr3	73385122	73385946	-86213837	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	5
1144	416	329	105	23	chr3	73388096	73388438	-86211345	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	5
1144	389	309	101	68	chr3	73389236	73389455	-86210328	-	MTEb	LTR	MaLR	-40	339	114	5
1144	363	276	68	8	chr3	73389490	73389607	-86210176	-	MTEb	LTR	MaLR	-255	124	1	5
1144	616	267	120	41	chr3	73391871	73392124	-86207659	-	MT2A	LTR	ERVL	-60	524	104	5
1144	231	250	73	0	chr3	73394544	73394612	-86205171	+	MLT1E3	LTR	MaLR	547	619	-5	5
1145	306	293	80	39	chr3	73401496	73401654	-86198129	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-227	1144	1012	5
1145	251	279	11	34	chr3	73402920	73403009	-86196774	+	MTEa	LTR	MaLR	272	358	-21	5
1145	784	174	77	12	chr3	73414721	73414890	-86184893	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	195	6
1145	564	224	88	0	chr3	73415157	73415305	-86184478	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-121	249	84	6
1145	1742	165	6	42	chr3	73429463	73429798	-86169985	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	323	-4	6
1145	2510	184	120	112	chr3	73430404	73431154	-86168629	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	6
1145	721	309	9	9	chr3	73432886	73433098	-86166685	-	MTD	LTR	MaLR	-199	220	9	6
1145	2020	99	84	43	chr3	73437620	73437967	-86161816	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	5	6
1145	324	48	0	0	chr3	73437988	73438030	-86161753	-	RLTR10B	LTR	ERVK	-250	42	1	6
1145	272	301	62	41	chr3	73438152	73438249	-86161534	-	MER67C	LTR	ERV1	-440	271	173	6
1145	2035	230	141	25	chr3	73438344	73438897	-86160886	+	RMER19A	LTR	ERVK	3	619	-118	6
1145	554	223	42	35	chr3	73439048	73439062	-86160721	+	RMER19A	LTR	ERVK	593	602	-135	6
1145	554	223	42	35	chr3	73439239	73439368	-86160415	+	RMER19A	LTR	ERVK	603	737	0	6
1145	1452	239	55	26	chr3	73439687	73440035	-86159748	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-8	362	5	6
1145	631	361	4	0	chr3	73440042	73440286	-86159497	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	715	959	-4802	6
1145	2466	268	101	40	chr3	73440280	73441318	-86158465	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	918	1980	-3734	6
1145	568	269	78	33	chr3	73441394	73441748	-86158035	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5374	5761	0	6
1145	1812	284	29	8	chr3	73441748	73442262	-86157521	+	MT2A	LTR	ERVL	1	525	-8	6
1145	309	384	82	66	chr3	73447802	73447960	-86151823	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-56	309	144	6
1145	309	384	82	66	chr3	73447987	73448132	-86151651	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-222	143	1	6
1145	488	368	59	17	chr3	73464227	73464465	-86135318	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	114	6
1145	474	332	20	49	chr3	73470048	73470295	-86129488	+	MER57D	LTR	ERV1	155	394	-17	6
1145	513	312	52	92	chr3	73472351	73472676	-86127107	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	312	-716	6
1145	300	317	67	62	chr3	73473757	73473935	-86125848	+	RLTR25B	LTR	ERVK	850	1028	0	6
1145	467	221	34	81	chr3	73478585	73478733	-86121050	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	138	7
1145	246	303	91	76	chr3	73483503	73483635	-86116148	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	271	7
1145	804	283	62	17	chr3	73489308	73489596	-86110187	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	301	-58	7
1145	1469	220	39	39	chr3	73492466	73492826	-86106957	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	360	-14	7
1145	449	300	57	9	chr3	73492961	73493157	-86106626	-	MTEa	LTR	MaLR	-162	217	3	7
1145	1363	232	47	12	chr3	73514773	73515092	-86084691	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	330	-37	1
1145	399	192	27	27	chr3	73515907	73516057	-86083726	+	RMER17C	LTR	ERVK	123	272	-138	2
1145	1465	99	33	0	chr3	73516557	73516769	-86083014	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	101	2
1145	652	265	225	19	chr3	73516767	73517081	-86082702	-	RMER20B	LTR	ERVK	-185	442	64	2
1145	706	259	31	31	chr3	73517955	73518089	-86081694	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	281	3
1145	706	259	31	31	chr3	73518124	73518184	-86081599	-	MTC	LTR	MaLR	-141	280	220	3
1145	1534	192	52	3	chr3	73518159	73518486	-86081297	-	MTC	LTR	MaLR	-73	346	1	3
1145	563	308	105	73	chr3	73522475	73522961	-86076822	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	480	-40	4
1145	422	206	33	0	chr3	73527901	73527993	-86071790	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	2747	2841	-1	5
1145	2340	232	39	37	chr3	73527996	73528607	-86071176	+	RLTR17	LTR	ERVK	14	596	-96	5
1146	2839	23	54	3	chr3	73537105	73537454	-86062329	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1146	8057	81	68	49	chr3	73537454	73538736	-86061047	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	6
1146	28787	21	1	2	chr3	73538734	73542011	-86057772	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3209	6481	0	6
1146	2839	23	54	3	chr3	73542011	73542360	-86057423	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1146	1337	208	78	59	chr3	73544612	73544970	-86054813	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-15	369	5	7
1146	470	335	54	67	chr3	73547631	73547945	-86051838	-	MLT2D	LTR	ERVL	-84	330	21	8
1146	627	274	37	16	chr3	73548827	73549016	-86050767	-	RMER5	LTR	ERV1	-37	497	305	8
1146	235	224	28	69	chr3	73549039	73549111	-86050672	-	RMER5	LTR	ERV1	-456	78	10	8
1146	288	359	64	61	chr3	73551125	73551389	-86048394	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-73	607	343	9
1146	1579	153	93	18	chr3	73552466	73552798	-86046985	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	3	9
1146	418	320	45	153	chr3	73553734	73553872	-86045911	+	MLT1E2	LTR	MaLR	298	418	-209	9
1146	418	320	45	153	chr3	73554333	73554503	-86045280	+	MLT1E2	LTR	MaLR	419	575	-52	9
1146	2580	199	24	86	chr3	73558056	73558338	-86041445	-	RMER6D	LTR	ERVK	-4	716	458	1
1146	2580	199	24	86	chr3	73558392	73558873	-86040910	-	RMER6D	LTR	ERVK	-263	457	1	1
1146	417	237	17	21	chr3	73568317	73568445	-86031338	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	621	413	1
1146	1311	238	71	3	chr3	73569691	73569986	-86029797	+	MTC	LTR	MaLR	1	315	-106	1
1146	1916	91	181	6	chr3	73576978	73577310	-86022473	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
1146	2812	47	6	0	chr3	73580681	73581025	-86018758	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
1146	487	351	54	41	chr3	73587395	73587689	-86012094	+	MLT2B1	LTR	ERVL	221	518	-2	1
1146	840	327	117	24	chr3	73601049	73601509	-85998274	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	503	-2	1
1146	230	284	59	140	chr3	73602751	73602972	-85996811	+	MTC-int	LTR	MaLR	207	409	-849	1
1146	3141	111	15	6	chr3	73614764	73615235	-85984548	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1146	448	171	24	0	chr3	73622901	73622983	-85976800	+	RMER6C	LTR	ERVK	104	187	-569	1
1146	1130	142	5	5	chr3	73623114	73623305	-85976478	+	RMER6C	LTR	ERVK	500	690	0	1
1146	333	319	37	63	chr3	73623957	73624184	-85975599	+	MTE2a	LTR	MaLR	7	242	-179	2
1146	1121	227	70	90	chr3	73625186	73625574	-85974209	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	5	2
1146	2880	252	62	125	chr3	73625575	73627032	-85972751	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1370	5	2
1146	455	189	0	86	chr3	73627036	73627152	-85972631	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	279	2
1146	803	169	19	120	chr3	73627345	73627553	-85972230	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-190	194	8	2
1146	845	256	98	4	chr3	73629991	73630226	-85969557	+	MTD	LTR	MaLR	12	268	-151	2
1146	1648	158	28	70	chr3	73637903	73638230	-85961553	+	ORR1A4	LTR	MaLR	17	329	0	2
1146	512	285	230	19	chr3	73649178	73649443	-85950340	-	MTC	LTR	MaLR	-52	369	49	2
1146	229	324	15	0	chr3	73656680	73656748	-85943035	-	MTEb	LTR	MaLR	-307	72	4	2
1146	1039	313	84	9	chr3	73656964	73657299	-85942484	+	ORR1D2	LTR	MaLR	11	370	0	2
1147	412	278	0	0	chr3	73690089	73690179	-85909604	+	RMER12	LTR	ERVK	1	90	-1232	2
1147	1616	203	95	11	chr3	73701081	73701439	-85898344	+	ORR1B1	LTR	MaLR	7	394	0	3
1147	270	263	118	0	chr3	73702149	73702225	-85897558	-	MLT1B	LTR	MaLR	-45	422	338	3
1147	355	286	117	49	chr3	73702451	73702731	-85897052	-	MLT1B	LTR	MaLR	-129	338	29	3
1147	330	335	68	51	chr3	73703642	73703878	-85895905	-	RLTR15	LTR	ERVK	-37	322	83	3
1147	367	279	24	54	chr3	73704019	73704186	-85895597	-	RLTR43A	LTR	ERVK	-2	362	201	3
1147	343	367	101	52	chr3	73705327	73705655	-85894128	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	351	-8	3
1147	878	274	44	58	chr3	73708379	73708743	-85891040	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1147	1370	253	126	57	chr3	73709515	73709906	-85889877	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	394	-296	3
1147	1370	229	192	111	chr3	73709951	73710278	-85889505	+	RMER6C	LTR	ERVK	363	697	-59	3
1147	670	239	56	12	chr3	73710270	73710431	-85889352	+	RMER6D	LTR	ERVK	553	720	0	3
1147	1242	223	170	27	chr3	73711598	73711934	-85887849	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1147	3533	18	0	0	chr3	73712595	73712991	-85886792	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1147	244	273	54	62	chr3	73714901	73715030	-85884753	-	MLT1D	LTR	MaLR	-1	504	377	3
1147	2270	208	60	12	chr3	73717762	73718244	-85881539	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	3
1147	1900	228	9	7	chr3	73725141	73725561	-85874222	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1147	2331	214	59	31	chr3	73725561	73725934	-85873849	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	876	3
1147	1992	152	3	3	chr3	73725934	73726245	-85873538	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	3
1147	2331	214	59	31	chr3	73726245	73726479	-85873304	-	MTC-int	LTR	MaLR	-383	875	634	3
1147	724	280	175	27	chr3	73727348	73727645	-85872138	-	MTC-int	LTR	MaLR	-864	394	54	3
1147	376	340	13	40	chr3	73729243	73729393	-85870390	-	MTEb	LTR	MaLR	-225	154	9	3
1147	293	267	76	17	chr3	73730014	73730132	-85869651	+	MLT1A1	LTR	MaLR	3	127	-281	3
1147	1024	307	12	31	chr3	73732329	73732655	-85867128	+	RLTR17	LTR	ERVK	105	424	-268	3
1147	536	309	15	55	chr3	73735767	73735842	-85863941	-	RMER15	LTR	ERVL	-86	489	419	3
1147	3233	48	5	0	chr3	73735842	73736236	-85863547	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1147	536	309	15	55	chr3	73736236	73736359	-85863424	-	RMER15	LTR	ERVL	-157	418	299	3
1147	3239	144	17	14	chr3	73737834	73738419	-85861364	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1430	2016	-4121	3
1147	451	304	127	0	chr3	73738535	73738716	-85861067	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	302	3
1147	1440	214	115	20	chr3	73744227	73744403	-85855380	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-1	440	248	3
1147	1440	214	115	20	chr3	73744490	73744713	-85855070	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-194	247	4	3
1147	1076	248	77	32	chr3	73746781	73747190	-85852593	-	MT2A	LTR	ERVL	-34	567	3	3
1147	1445	184	0	69	chr3	73753141	73753432	-85846351	+	ORR1A3	LTR	MaLR	2	272	-54	3
1147	741	236	81	15	chr3	73753593	73753791	-85845992	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4901	5111	-650	3
1147	1151	275	32	3	chr3	73753901	73754248	-85845535	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5124	5480	-281	3
1147	628	293	155	78	chr3	73754800	73755069	-85844714	+	MT2A	LTR	ERVL	7	271	-262	3
1147	628	293	155	78	chr3	73756015	73756142	-85843641	+	MT2A	LTR	ERVL	272	431	-102	3
1147	538	300	112	7	chr3	73760912	73761191	-85838592	-	ORR1E	LTR	MaLR	-43	336	1	4
1147	2514	114	17	40	chr3	73762732	73763153	-85836630	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	4
1147	530	329	32	72	chr3	73764909	73765158	-85834625	+	MTE2a	LTR	MaLR	133	371	-8	4
1147	555	265	29	0	chr3	73769164	73769300	-85830483	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	140	-234	4
1147	1955	158	9	0	chr3	73782802	73783124	-85816659	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	327	0	4
1148	1875	216	100	43	chr3	73796312	73796844	-85802939	+	RMER2	LTR	ERV1	1	562	-5	4
1148	1117	173	162	44	chr3	73797289	73797585	-85802198	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	331	-237	4
1148	1040	201	16	63	chr3	73800171	73800426	-85799357	+	RLTR12A	LTR	ERVK	288	530	-38	4
1148	738	127	4	14	chr3	73803252	73803388	-85796395	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	134	-772	4
1148	314	271	129	34	chr3	73803360	73803541	-85796242	+	MTD	LTR	MaLR	168	405	-14	4
1148	1493	222	79	3	chr3	73806260	73806576	-85793207	+	ORR1B2	LTR	MaLR	28	367	0	4
1148	1333	259	19	11	chr3	73810965	73811336	-85788447	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1148	2579	173	21	32	chr3	73813282	73813774	-85786009	-	RLTR33	LTR	ERVK	-223	455	1	5
1148	660	235	291	48	chr3	73814284	73814641	-85785142	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	18	5
1148	307	241	61	37	chr3	73814630	73814712	-85785071	-	RMER6A	LTR	ERVK	-664	92	9	5
1148	6928	166	84	46	chr3	73814748	73815502	-85784281	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-271	8688	7969	5
1148	6928	166	84	46	chr3	73816377	73817142	-85782641	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-991	7968	7110	5
1148	6928	166	84	46	chr3	73817183	73817219	-85782564	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1850	7109	7073	5
1148	404	181	0	0	chr3	73817391	73817463	-85782320	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1922	7037	6966	5
1148	420	171	0	0	chr3	73817454	73817524	-85782259	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2141	6818	6749	5
1148	321	125	0	0	chr3	73817524	73817572	-85782211	+	RMER2	LTR	ERV1	2	49	-518	5
1148	482	285	95	18	chr3	73817558	73817726	-85782057	+	RMER2	LTR	ERV1	387	567	0	5
1148	1168	145	156	34	chr3	73817726	73818093	-85781690	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2206	6753	6342	5
1148	542	222	63	197	chr3	73818149	73818401	-85781382	-	RMER6B	LTR	ERVK	-245	216	1	5
1148	1288	235	99	30	chr3	73819023	73819387	-85780396	+	MTD	LTR	MaLR	24	412	-7	5
1148	2768	88	34	0	chr3	73820277	73820664	-85779119	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1148	4666	121	45	86	chr3	73820664	73821569	-85778214	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	231	5
1148	1881	150	3	0	chr3	73821568	73821868	-85777915	-	MTB	LTR	MaLR	-99	301	1	5
1148	579	310	15	100	chr3	73821882	73822151	-85777632	+	RLTR11B	LTR	ERVK	68	313	-140	5
1148	1966	242	38	9	chr3	73824380	73824830	-85774953	+	RMER5	LTR	ERV1	21	483	-51	5
1148	2992	32	0	0	chr3	73829257	73829603	-85770180	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1148	1854	220	34	29	chr3	73831354	73831771	-85768012	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	5
1148	2143	176	190	42	chr3	73833363	73833963	-85765820	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	689	-1	5
1148	747	293	95	0	chr3	73839438	73839660	-85760123	+	MER70A	LTR	ERVL	230	472	0	5
1148	1006	271	77	26	chr3	73840260	73840609	-85759174	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	367	-3	5
1148	1169	370	100	44	chr3	73844000	73844847	-85754936	+	MTEa-int	LTR	MaLR	684	1578	-2	5
1148	651	369	78	30	chr3	73844854	73845044	-85754739	+	MTEa	LTR	MaLR	7	196	-183	5
1148	651	369	78	30	chr3	73845098	73845242	-85754541	+	MTEa	LTR	MaLR	197	357	-22	5
1148	1892	173	10	0	chr3	73847239	73847545	-85752238	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	5
1148	929	273	127	3	chr3	73851969	73852292	-85747491	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	43	5
1148	481	341	101	28	chr3	73852667	73852993	-85746790	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	81	5
1148	448	250	0	11	chr3	73853068	73853161	-85746622	-	RLTR23	LTR	ERV1	-331	99	8	5
1148	2150	142	59	48	chr3	73853344	73853765	-85746018	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	426	-4	5
1148	1215	161	37	205	chr3	73859902	73860253	-85739530	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	292	-154	5
1148	3268	196	49	56	chr3	73868361	73869197	-85730586	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	104	933	-1393	5
1148	5901	158	46	21	chr3	73869202	73870431	-85729352	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1067	2326	0	5
1148	2454	186	38	38	chr3	73870439	73870970	-85728813	+	RLTR20A	LTR	ERVK	11	541	0	5
1148	2267	254	45	75	chr3	73879403	73880378	-85719405	-	RMER17B	LTR	ERVK	-43	915	1	6
1148	758	238	66	14	chr3	73881881	73882085	-85717698	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	113	6
1148	3667	58	20	10	chr3	73884845	73885336	-85714447	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	69	6
1148	1094	239	136	3	chr3	73892330	73892653	-85707130	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	366	-8	6
1148	337	338	72	50	chr3	73897777	73897998	-85701785	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	226	-164	6
1148	2446	207	29	18	chr3	73903693	73904202	-85695581	+	RLTR20D	LTR	ERVK	7	568	0	6
1148	257	241	0	126	chr3	73910384	73910479	-85689304	+	MT2B2	LTR	ERVL	152	234	-350	6
1148	388	311	16	16	chr3	73911727	73911848	-85687935	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	121	-258	6
1148	290	356	119	10	chr3	73911848	73911920	-85687863	+	MT2A	LTR	ERVL	1	214	-319	6
1148	231	225	28	0	chr3	73912113	73912184	-85687599	+	MLT2B5	LTR	ERVL	477	549	-6	6
1148	321	272	28	140	chr3	73913956	73914170	-85685613	+	RMER12	LTR	ERVK	676	865	-457	6
1148	1327	195	46	23	chr3	73923451	73923802	-85675981	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
1149	1085	210	5	18	chr3	73928025	73928243	-85671540	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	215	-475	6
1149	2082	256	56	58	chr3	73929824	73930620	-85669163	-	RMER17B	LTR	ERVK	-168	790	1	7
1149	1700	182	132	16	chr3	73930988	73931419	-85668364	+	RMER6C	LTR	ERVK	198	678	-12	6
1149	1002	294	108	21	chr3	73934515	73934887	-85664896	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	13	7
1149	235	306	20	95	chr3	73939818	73939966	-85659817	+	LTR83	LTR	ERVL	610	746	-34	7
1149	823	246	26	13	chr3	73943261	73943492	-85656291	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	234	-294	7
1149	1914	152	7	3	chr3	73971002	73971312	-85628471	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	7
1149	1714	114	68	0	chr3	73973411	73973692	-85626091	+	BGLII	LTR	ERVK	1	300	-121	7
1149	1150	216	45	52	chr3	73976563	73976898	-85622885	+	RLTR45	LTR	ERVK	172	482	0	7
1149	571	364	126	37	chr3	73977223	73977793	-85621990	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-671	716	96	7
1149	978	318	80	40	chr3	73979427	73979800	-85619983	+	MTD	LTR	MaLR	32	419	0	7
1149	2229	116	232	43	chr3	73990440	73990901	-85608882	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	37	584	-70	8
1149	419	205	242	8	chr3	73997534	73997625	-85602158	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	362	8
1149	419	205	242	8	chr3	73997685	73997721	-85602062	-	RMER4A	LTR	ERVK	-105	361	311	8
1149	1988	214	42	22	chr3	73997728	73998181	-85601602	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	5	8
1149	328	335	41	53	chr3	74000218	74000388	-85599395	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	513	680	0	1
1149	1042	308	52	26	chr3	74006602	74007110	-85592673	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	27	1
1149	2841	204	38	79	chr3	74025215	74025467	-85574316	+	RLTR19B	LTR	ERVK	3	249	-466	3
1149	2841	204	38	79	chr3	74026059	74026550	-85573233	+	RLTR19B	LTR	ERVK	250	715	0	3
1149	1322	235	78	21	chr3	74028447	74028905	-85570878	+	RMER19B	LTR	ERVK	87	616	-286	4
1149	1037	313	33	10	chr3	74031347	74031650	-85568133	+	MTD	LTR	MaLR	110	419	0	4
1149	901	248	74	14	chr3	74033146	74033229	-85566554	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-2	539	456	5
1149	901	248	74	14	chr3	74033317	74033447	-85566336	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-86	455	313	5
1149	229	264	108	83	chr3	74047974	74048094	-85551689	+	MT2B	LTR	ERVL	1	123	-410	6
1149	1111	254	69	62	chr3	74048112	74048505	-85551278	+	MT2B	LTR	ERVL	176	601	0	6
1149	643	226	27	16	chr3	74048506	74048690	-85551093	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2	187	-5574	6
1149	1247	256	84	58	chr3	74048695	74049453	-85550330	+	RMER6C	LTR	ERVK	20	720	0	6
1149	4247	218	36	17	chr3	74049459	74050424	-85549359	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	182	1165	-4596	6
1149	1084	237	28	18	chr3	74052070	74052354	-85547429	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1178	1464	-4297	6
1149	2433	246	42	6	chr3	74052346	74052969	-85546814	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3747	4391	-1370	6
1150	1271	222	56	31	chr3	74061792	74062113	-85537670	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	8
1150	301	200	51	5	chr3	74063174	74063250	-85536533	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-74	304	222	8
1150	269	374	20	7	chr3	74069701	74069849	-85529934	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1429	151	2	8
1150	3228	66	31	5	chr3	74070565	74070990	-85528793	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	9
1150	877	29	0	0	chr3	74070990	74071094	-85528689	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	104	-7477	9
1150	781	133	0	0	chr3	74071096	74071216	-85528567	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	224	343	-7238	9
1150	736	204	5	11	chr3	74071214	74071402	-85528381	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	729	915	-6666	9
1150	442	128	13	0	chr3	74071426	74071504	-85528279	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	874	952	-6629	9
1150	672	255	140	90	chr3	74071594	74071962	-85527821	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	2079	2424	-4820	9
1150	399	101	6	60	chr3	74071970	74072091	-85527692	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1727	1946	-5635	9
1150	26485	53	3	1	chr3	74072098	74075349	-85524434	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	2552	5810	-1771	9
1150	7275	57	2	51	chr3	74075335	74076319	-85523464	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6646	7581	0	9
1150	3254	66	28	5	chr3	74076319	74076745	-85523038	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	9
1150	353	207	0	0	chr3	74080070	74080128	-85519655	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	60	-314	1
1150	1516	197	37	2	chr3	74080142	74080587	-85519196	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-12	515	1	1
1150	899	292	105	17	chr3	74080587	74080883	-85518900	+	ORR1D1	LTR	MaLR	53	374	0	1
1150	478	321	116	18	chr3	74082736	74083117	-85516666	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	1	1
1150	1901	201	56	18	chr3	74084679	74085074	-85514709	+	MTC	LTR	MaLR	10	419	-2	1
1150	2018	249	82	23	chr3	74085076	74085166	-85514617	+	MTC-int	LTR	MaLR	15	129	-1129	1
1150	2494	132	44	40	chr3	74085166	74085646	-85514137	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
1150	2018	249	82	23	chr3	74085646	74086127	-85513656	+	MTC-int	LTR	MaLR	130	620	-638	1
1150	1319	265	11	38	chr3	74086105	74086478	-85513305	+	MTC-int	LTR	MaLR	771	1133	-125	1
1150	975	241	53	69	chr3	74086767	74087146	-85512637	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-2	439	67	1
1150	353	222	53	24	chr3	74094116	74094219	-85505564	+	MTC-int	LTR	MaLR	1171	1252	-6	1
1150	1524	258	100	3	chr3	74094235	74094605	-85505178	+	MTC	LTR	MaLR	11	416	-5	1
1150	368	376	11	0	chr3	74099968	74100146	-85499637	+	ERVL-int	LTR	ERVL	472	651	-5106	1
1150	634	215	69	117	chr3	74100880	74101098	-85498685	+	MTD	LTR	MaLR	1	206	-194	1
1150	672	288	118	6	chr3	74101678	74101856	-85497927	+	MTD	LTR	MaLR	219	416	-3	1
1150	1410	328	42	28	chr3	74102350	74103059	-85496724	+	ERVL-int	LTR	ERVL	2164	2882	-2875	1
1150	2993	54	0	0	chr3	74104065	74104419	-85495364	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	354	-3	1
1150	9211	129	16	26	chr3	74104423	74106051	-85493732	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	21	1982	-5698	1
1150	3515	53	5	0	chr3	74106046	74106476	-85493307	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	2258	2689	-4991	1
1150	465	34	0	17	chr3	74106469	74106529	-85493254	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	4852	4910	-2770	1
1150	4955	83	86	0	chr3	74106533	74107234	-85492549	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6920	7680	0	1
1150	2976	56	0	0	chr3	74107234	74107591	-85492192	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	1
1150	408	305	30	32	chr3	74107875	74108057	-85491726	+	ERVL-int	LTR	ERVL	3368	3575	-2182	1
1150	4952	122	37	64	chr3	74108223	74109148	-85490635	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	1023	0	1
1150	452	303	91	0	chr3	74110587	74110655	-85489128	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-19	559	492	1
1150	452	307	370	36	chr3	74110739	74111008	-85488775	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-87	491	127	1
1150	421	305	95	12	chr3	74115331	74115500	-85484283	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	393	1
1150	1123	262	77	72	chr3	74133597	74134041	-85465742	-	RMER13B	LTR	ERVK	-4	904	459	1
1150	532	295	14	21	chr3	74134049	74134191	-85465592	+	RMER13B	LTR	ERVK	705	845	-63	1
1150	832	252	49	82	chr3	74134186	74134693	-85465090	-	RMER17B	LTR	ERVK	-454	504	2	1
1150	456	304	56	43	chr3	74137727	74138178	-85461605	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	2966	3532	-3289	1
1150	326	293	110	63	chr3	74139427	74139744	-85460039	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4938	5269	-1552	1
1150	2127	213	65	28	chr3	74139966	74140507	-85459276	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	1
1150	787	179	7	104	chr3	74143214	74143407	-85456376	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	201	-145	1
1150	448	187	0	0	chr3	74143402	74143477	-85456306	-	MT2B	LTR	ERVL	-350	251	177	1
1150	3160	149	41	6	chr3	74143481	74144021	-85455762	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1403	560	2	1
1150	1640	143	109	61	chr3	74144022	74144334	-85455449	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1150	9443	200	21	27	chr3	74144335	74146240	-85453543	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-3885	1895	1	1
1150	2334	209	128	13	chr3	74146240	74146788	-85452995	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
1150	927	251	166	85	chr3	74161286	74161779	-85438004	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	2
1150	3159	223	94	14	chr3	74161779	74162596	-85437187	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1	883	-4878	2
1150	1354	237	54	3	chr3	74175727	74176023	-85423760	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	107	2
1150	270	206	141	64	chr3	74176339	74176417	-85423366	-	MTC	LTR	MaLR	-337	84	1	2
1150	828	278	83	40	chr3	74181244	74181570	-85418213	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-199	342	3	2
1150	1813	125	36	30	chr3	74182700	74183029	-85416754	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	55	2
1150	1137	251	108	33	chr3	74184364	74184726	-85415057	-	MTC	LTR	MaLR	-30	391	3	2
1151	1534	112	70	52	chr3	74187553	74187850	-85411933	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	60	2
1151	371	289	205	0	chr3	74188329	74188485	-85411298	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	183	2
1151	793	292	133	16	chr3	74196162	74196485	-85403298	+	MTD	LTR	MaLR	45	405	-14	2
1151	833	181	306	7	chr3	74221295	74221565	-85378218	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	351	-16	2
1151	377	311	86	25	chr3	74221965	74222163	-85377620	-	RMER20B	LTR	ERVK	-289	338	129	2
1151	2904	188	63	21	chr3	74225071	74225768	-85374015	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	2
1151	1008	287	54	113	chr3	74226792	74227252	-85372531	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-9	503	71	2
1151	253	309	0	134	chr3	74227796	74227809	-85371974	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-394	118	110	2
1151	253	309	0	134	chr3	74228172	74228255	-85371528	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-403	109	35	2
1151	347	154	31	0	chr3	74228505	74228570	-85371213	+	MTD	LTR	MaLR	1	67	-352	2
1151	1355	254	45	57	chr3	74228605	74229006	-85370777	+	MTC-int	LTR	MaLR	321	716	-542	2
1151	277	203	47	0	chr3	74228997	74229061	-85370722	+	MTD	LTR	MaLR	346	412	-7	2
1151	1066	302	61	31	chr3	74234086	74234530	-85365253	-	RMER5	LTR	ERV1	-45	489	33	3
1151	3016	191	90	103	chr3	74238449	74239061	-85360722	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	617	-411	3
1151	3016	191	90	103	chr3	74239487	74239738	-85360045	+	RLTR25B	LTR	ERVK	618	853	-175	3
1151	609	228	83	77	chr3	74239874	74239929	-85359854	+	RLTR25B	LTR	ERVK	912	973	-130	3
1151	609	228	83	77	chr3	74240038	74240162	-85359621	+	RLTR25B	LTR	ERVK	974	1092	-11	3
1151	545	287	89	36	chr3	74247808	74248032	-85351751	+	RMER15	LTR	ERVL	336	571	-4	3
1151	405	259	83	0	chr3	74249972	74250080	-85349703	-	ORR1E	LTR	MaLR	-213	146	30	3
1151	438	350	67	5	chr3	74251623	74251818	-85347965	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	297	3
1151	958	312	58	39	chr3	74268395	74268758	-85331025	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1151	2286	131	3	45	chr3	74281598	74281973	-85317810	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	3
1151	993	214	73	52	chr3	74282991	74283277	-85316506	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-20	354	63	3
1151	1620	165	30	62	chr3	74290870	74291255	-85308528	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	421	-132	3
1151	249	267	37	73	chr3	74291232	74291341	-85308442	+	RLTR17	LTR	ERVK	588	692	0	3
1151	996	219	29	20	chr3	74309066	74309348	-85290435	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	197	-445	4
1151	1874	167	22	0	chr3	74310778	74311095	-85288688	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-2	324	1	4
1151	3846	189	78	36	chr3	74314542	74315458	-85284325	+	RMER17B	LTR	ERVK	5	958	0	4
1152	801	254	16	11	chr3	74325441	74325624	-85274159	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	201	4
1152	2526	147	5	20	chr3	74325938	74326340	-85273443	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	396	-1176	4
1152	732	227	35	0	chr3	74326402	74326574	-85273209	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-197	181	4	4
1152	3257	282	67	34	chr3	74326577	74327827	-85271956	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1963	1	4
1152	1905	225	21	5	chr3	74327930	74328359	-85271424	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	7	4
1152	501	384	23	57	chr3	74328985	74329250	-85270533	-	MTE2a	LTR	MaLR	-31	348	93	4
1152	234	267	32	32	chr3	74330850	74330912	-85268871	-	MTE2a	LTR	MaLR	-317	62	1	4
1152	841	294	124	45	chr3	74336731	74337216	-85262567	-	RLTR40	LTR	ERVK	-12	805	283	4
1152	349	280	7	64	chr3	74339597	74339738	-85260045	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	3998	4130	-4829	4
1152	392	141	28	0	chr3	74340318	74340389	-85259394	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	455	4
1152	573	373	64	31	chr3	74343832	74344255	-85255528	+	MLT1D	LTR	MaLR	6	442	-63	4
1152	226	350	65	65	chr3	74344703	74344978	-85254805	-	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	-8	1060	786	4
1152	1893	157	60	80	chr3	74349522	74349924	-85249859	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1152	1061	307	53	20	chr3	74351719	74352118	-85247665	+	RMER20A	LTR	ERVK	103	514	-2	4
1152	1535	221	35	209	chr3	74379284	74380024	-85219759	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
1152	343	272	0	52	chr3	74384911	74385033	-85214750	-	RMER20B	LTR	ERVK	-355	161	47	4
1152	1562	224	26	20	chr3	74393166	74393516	-85206267	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	70	5
1152	5730	160	96	18	chr3	74393645	74394796	-85204987	-	MTC-int	LTR	MaLR	-13	1245	6	5
1152	3219	8	0	39	chr3	74395047	74395429	-85204354	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	5
1152	52813	24	17	2	chr3	74395429	74401810	-85197973	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	5
1152	3219	8	0	39	chr3	74401810	74402192	-85197591	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	5
1152	569	173	19	153	chr3	74405403	74405560	-85194223	+	RLTR25B	LTR	ERVK	636	771	-257	5
1152	500	250	34	48	chr3	74405542	74405689	-85194094	+	RLTR25B	LTR	ERVK	884	1028	0	5
1152	1606	264	48	0	chr3	74410931	74411347	-85188436	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-1073	436	1	5
1152	1013	281	78	21	chr3	74411347	74411678	-85188105	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	35	5
1152	3392	182	44	65	chr3	74413533	74414239	-85185544	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	2	5
1152	437	134	15	0	chr3	74417035	74417102	-85182681	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	68	-316	5
1152	1041	244	98	15	chr3	74417986	74418252	-85181531	+	ORR1C2	LTR	MaLR	65	352	-32	5
1152	2204	257	83	32	chr3	74419178	74419934	-85179849	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	2	1509	0	5
1152	1175	225	115	66	chr3	74419934	74420300	-85179483	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
1152	2390	95	87	5	chr3	74422807	74423187	-85176596	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	5
1152	5564	37	3	21	chr3	74423189	74423908	-85175875	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5774	5
1152	3024	14	0	0	chr3	74423908	74424267	-85175516	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2122	4359	4001	5
1152	6447	50	0	0	chr3	74424265	74425072	-85174711	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3707	2774	1968	5
1152	11563	84	34	75	chr3	74425074	74427012	-85172771	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4616	1865	9	5
1152	2326	103	87	5	chr3	74427013	74427393	-85172390	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	5
1152	1217	230	88	120	chr3	74427628	74428103	-85171680	+	RLTR28B	LTR	ERVL	4	463	-18	5
1152	573	231	0	24	chr3	74435503	74435627	-85164156	-	RLTR14	LTR	ERV1	-192	190	70	5
1152	1395	208	43	26	chr3	74435805	74436107	-85163676	+	MTC	LTR	MaLR	107	413	-8	5
1152	229	296	147	127	chr3	74436200	74436252	-85163531	+	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	36	148	-655	5
1152	374	262	79	71	chr3	74436252	74436392	-85163391	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	399	5
1152	229	296	147	127	chr3	74436392	74436459	-85163324	+	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	149	299	-504	5
1152	1890	199	22	12	chr3	74437246	74437662	-85162121	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1097	751	332	5
1152	2721	108	37	0	chr3	74438679	74439086	-85160697	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	5
1152	1861	238	55	24	chr3	74439236	74439731	-85160052	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-20	548	39	5
1153	976	281	139	9	chr3	74458303	74458634	-85141149	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1153	244	284	141	39	chr3	74462908	74463036	-85136747	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	372	232	6
1153	534	302	100	6	chr3	74463579	74463749	-85136034	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-184	186	1	6
1153	1281	165	198	0	chr3	74468915	74469188	-85130595	-	RMER6C	LTR	ERVK	-360	330	4	6
1153	4236	154	82	28	chr3	74470751	74471606	-85128177	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-1	901	1	6
1153	468	216	16	21	chr3	74474384	74474573	-85125210	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	88	6
1153	927	313	29	98	chr3	74478854	74479240	-85120543	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	20	6
1153	276	385	75	19	chr3	74479738	74479897	-85119886	-	MER77	LTR	ERVL	-315	292	125	6
1153	1227	293	89	10	chr3	74481148	74481361	-85118422	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	172	6
1153	1227	290	92	11	chr3	74481668	74481842	-85117941	-	MTD	LTR	MaLR	-248	171	2	6
1153	301	205	162	25	chr3	74484802	74484882	-85114901	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-55	352	262	6
1153	2171	235	21	10	chr3	74486643	74487155	-85112628	-	MTC-int	LTR	MaLR	-739	519	2	6
1153	707	241	97	0	chr3	74489907	74490092	-85109691	+	MTC	LTR	MaLR	18	228	-191	6
1153	1599	217	45	28	chr3	74493954	74494052	-85105731	-	RMER6C	LTR	ERVK	-243	477	370	6
1153	1913	154	27	16	chr3	74494232	74494602	-85105181	-	RMER6C	LTR	ERVK	-317	373	1	6
1153	1590	220	41	85	chr3	74499018	74499507	-85100276	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
1153	1583	212	174	5	chr3	74502268	74502681	-85097102	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	208	3
1153	1496	263	172	21	chr3	74502696	74502942	-85096841	-	RMER20B	LTR	ERVK	-15	612	354	4
1153	1496	263	172	21	chr3	74502990	74503089	-85096694	-	RMER20B	LTR	ERVK	-274	353	190	4
1153	1496	263	172	21	chr3	74503416	74503593	-85096190	-	RMER20B	LTR	ERVK	-438	189	13	4
1153	563	190	58	33	chr3	74503610	74503730	-85096053	-	RMER6C	LTR	ERVK	-567	123	1	3
1153	12914	197	46	72	chr3	74503732	74504466	-85095317	-	RMER6-int	LTR	ERVK	-2	3175	2449	3
1153	12914	197	46	72	chr3	74504523	74506991	-85092792	-	RMER6-int	LTR	ERVK	-2	2448	1	3
1153	1519	227	32	139	chr3	74506997	74507564	-85092219	-	RMER6C	LTR	ERVK	-3	687	151	3
1153	691	376	101	36	chr3	74511309	74511866	-85087917	+	MER21B	LTR	ERV1	1	593	-270	1
1153	740	221	15	0	chr3	74514082	74514213	-85085570	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	1
1153	2071	143	3	20	chr3	74518736	74519078	-85080705	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	3	2
1153	3822	144	64	109	chr3	74521624	74522572	-85077211	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	2
1153	823	210	45	60	chr3	74533149	74533531	-85066252	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	394	3
1153	427	330	52	48	chr3	74533547	74533851	-85065932	+	RLTR11B	LTR	ERVK	16	335	-192	3
1153	291	281	41	71	chr3	74533830	74534050	-85065733	+	RLTR11B	LTR	ERVK	210	491	-37	3
1153	2362	176	66	4	chr3	74534093	74534565	-85065218	-	RMER6D	LTR	ERVK	-218	502	2	3
1153	239	328	84	25	chr3	74544862	74544981	-85054802	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	126	-428	5
1153	434	306	97	48	chr3	74559342	74559507	-85040276	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	177	-202	7
1153	954	138	122	5	chr3	74559512	74559701	-85040082	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	174	7
1153	639	199	80	0	chr3	74563223	74563374	-85036409	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-76	405	243	8
1154	4611	91	7	93	chr3	74580424	74581245	-85018538	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	1
1154	296	271	20	40	chr3	74584739	74584839	-85014944	-	MER34A	LTR	ERV1	-418	153	56	1
1154	3257	163	55	19	chr3	74588204	74588824	-85010959	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	1
1154	464	342	113	33	chr3	74598393	74598729	-85001054	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	1	1
1154	434	188	0	106	chr3	74600043	74600204	-84999579	+	RMER17C	LTR	ERVK	132	275	-135	1
1154	725	212	95	128	chr3	74600902	74601145	-84998638	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	275	-119	1
1154	524	293	47	0	chr3	74601869	74602019	-84997764	+	LTR50	LTR	ERVL	3	159	-636	1
1154	519	289	216	14	chr3	74609632	74609923	-84989860	-	MTD	LTR	MaLR	-39	380	51	1
1154	1048	259	62	14	chr3	74612310	74612469	-84987314	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	174	-200	1
1154	1048	259	62	14	chr3	74612493	74612623	-84987160	+	ORR1D1	LTR	MaLR	175	304	-70	1
1154	1775	223	62	13	chr3	74614865	74615255	-84984528	+	MTC	LTR	MaLR	1	409	-12	1
1154	311	265	83	12	chr3	74621876	74621960	-84977823	-	MLT1B	LTR	MaLR	-5	385	296	1
1154	437	289	65	56	chr3	74623942	74624197	-84975586	-	MLT1A	LTR	MaLR	-4	623	118	1
1154	1949	220	38	8	chr3	74624379	74624778	-84975005	-	MTC	LTR	MaLR	-10	411	1	1
1154	338	345	43	65	chr3	74624795	74624981	-84974802	+	MTC	LTR	MaLR	222	403	-18	1
1154	2854	38	0	118	chr3	74626488	74626902	-84972881	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	1
1154	1635	247	77	33	chr3	74629956	74630468	-84969315	-	RMER13A	LTR	ERVK	-323	635	1	1
1154	371	155	0	0	chr3	74634401	74634459	-84965324	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-267	60	3	1
1154	7748	178	57	14	chr3	74634617	74636219	-84963564	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	293	1963	0	1
1154	1707	174	34	56	chr3	74636223	74636501	-84963282	+	ORR1A2	LTR	MaLR	5	276	-51	1
1154	1707	174	34	56	chr3	74637172	74637215	-84962568	+	ORR1A2	LTR	MaLR	277	319	-8	1
1154	2967	18	0	0	chr3	74638255	74638592	-84961191	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
1154	22051	41	18	14	chr3	74638592	74641327	-84958456	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	2751	-3730	1
1154	29267	10	1	0	chr3	74641319	74644554	-84955229	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3244	6481	0	1
1154	2957	21	0	0	chr3	74644554	74644891	-84954892	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
1154	305	343	40	40	chr3	74646715	74646940	-84952843	+	HERVL40-int	LTR	ERVL	708	932	-4598	1
1154	248	217	50	0	chr3	74647992	74648052	-84951731	+	MTEb	LTR	MaLR	2	64	-315	1
1154	882	272	13	113	chr3	74648208	74648510	-84951273	+	MTEb	LTR	MaLR	106	377	-2	1
1154	252	257	20	85	chr3	74648549	74648702	-84951081	+	RMER10B	LTR	ERVL	194	336	-62	2
1154	330	321	78	7	chr3	74650368	74650509	-84949274	+	LTR80A	LTR	ERVL	139	289	-294	2
1154	295	403	28	33	chr3	74652377	74652559	-84947224	-	LTR16A	LTR	ERVL	-254	197	17	2
1154	798	198	357	9	chr3	74663514	74663832	-84935951	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-13	428	1	2
1154	313	213	130	68	chr3	74666406	74666567	-84933216	+	RMER10A	LTR	ERVL	272	442	0	2
1154	2837	46	3	0	chr3	74675245	74675590	-84924193	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1154	889	297	50	33	chr3	74705637	74705743	-84894040	+	MTC	LTR	MaLR	106	210	-211	2
1154	889	297	50	33	chr3	74705890	74705909	-84893874	+	MTC	LTR	MaLR	211	228	-193	2
1154	889	297	50	33	chr3	74706001	74706177	-84893606	+	MTC	LTR	MaLR	229	413	-8	2
1154	3511	151	135	53	chr3	74706679	74707433	-84892350	+	RMER21B	LTR	ERV1	1	816	-26	2
1154	451	193	60	0	chr3	74707435	74707518	-84892265	+	RMER21B	LTR	ERV1	753	840	-2	2
1154	3178	195	29	8	chr3	74707736	74707881	-84891902	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	454	2
1154	3178	195	29	8	chr3	74707956	74708400	-84891383	-	RMER20B	LTR	ERVK	-174	453	1	2
1154	4174	275	38	20	chr3	74708401	74708499	-84891284	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6	6913	6816	2
1154	4174	262	69	15	chr3	74708530	74710324	-84889459	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-104	6815	4922	2
1154	454	200	12	0	chr3	74710466	74710546	-84889237	-	RMER20B	LTR	ERVK	-546	81	1	2
1155	1806	224	16	6	chr3	74711082	74711445	-84888338	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1155	808	252	119	20	chr3	74711480	74711682	-84888101	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	457	2
1155	649	188	8	30	chr3	74711662	74711794	-84887989	-	RLTR33	LTR	ERVK	-549	129	1	2
1155	673	201	22	36	chr3	74711888	74712023	-84887760	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	133	-435	2
1155	1536	209	112	45	chr3	74718898	74719000	-84880783	+	RLTR12A	LTR	ERVK	117	211	-357	2
1155	3016	32	0	0	chr3	74719000	74719346	-84880437	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1155	1536	209	112	45	chr3	74719346	74719663	-84880120	+	RLTR12A	LTR	ERVK	212	564	-4	2
1155	2461	203	39	31	chr3	74719702	74720247	-84879536	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-16	1493	945	2
1155	2012	172	125	2	chr3	74720305	74720712	-84879071	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-889	620	164	2
1155	254	245	0	0	chr3	74720733	74720786	-84878997	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-1456	53	1	2
1155	1800	161	70	26	chr3	74720790	74721134	-84878649	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	2
1155	233	220	52	52	chr3	74722900	74722996	-84876787	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	1190	1285	-85	2
1155	2533	163	82	53	chr3	74725970	74726521	-84873262	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	2
1155	624	269	76	16	chr3	74738107	74738292	-84861491	+	MTD	LTR	MaLR	3	198	-221	2
1155	419	278	158	12	chr3	74738306	74738470	-84861313	+	MTD	LTR	MaLR	232	419	0	2
1155	2933	130	14	0	chr3	74739972	74740410	-84859373	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1128	444	1	2
1155	496	304	64	109	chr3	74741472	74741536	-84858247	+	BGLII_B	LTR	ERVK	86	133	-308	2
1155	496	304	64	109	chr3	74741683	74741925	-84857858	+	BGLII_B	LTR	ERVK	134	377	-64	2
1155	2725	60	0	0	chr3	74741925	74742257	-84857526	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	3
1155	496	304	64	109	chr3	74742257	74742307	-84857476	+	BGLII_B	LTR	ERVK	378	427	-14	2
1155	729	291	38	38	chr3	74742320	74742544	-84857239	-	MTD	LTR	MaLR	-183	236	17	3
1155	729	291	38	38	chr3	74742571	74742582	-84857201	-	MTD	LTR	MaLR	-403	16	2	3
1155	857	172	17	17	chr3	74742849	74743073	-84856710	+	RMER10B	LTR	ERVL	11	398	0	3
1155	757	214	0	61	chr3	74760830	74760994	-84838789	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	308	3
1155	8984	161	15	22	chr3	74761003	74762651	-84837132	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7321	1638	3	3
1155	2135	187	32	47	chr3	74762652	74763118	-84836665	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	3	3
1155	315	339	173	29	chr3	74779538	74779856	-84819927	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	372	-7	3
1155	746	251	42	12	chr3	74783624	74783913	-84815870	+	MT2A	LTR	ERVL	183	533	0	3
1155	529	311	43	39	chr3	74784968	74785175	-84814608	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	172	3
1155	453	297	62	0	chr3	74785455	74785583	-84814200	-	MTE2a	LTR	MaLR	-242	137	2	3
1155	1850	288	22	12	chr3	74786830	74787333	-84812450	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-2	6917	6410	3
1155	1180	331	31	9	chr3	74787384	74787832	-84811951	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-619	6300	5843	3
1155	1563	132	69	90	chr3	74791733	74792066	-84807717	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	3
1155	239	308	0	15	chr3	74796004	74796070	-84803713	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	403	3
1155	339	281	211	77	chr3	74799597	74799844	-84799939	-	MLT1C	LTR	MaLR	-128	339	60	3
1155	841	308	151	11	chr3	74804224	74804588	-84795195	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	3
1155	351	259	40	61	chr3	74815916	74816064	-84783719	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-337	191	47	4
1155	854	286	56	136	chr3	74823156	74823338	-84776445	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	162	-217	4
1155	854	286	56	136	chr3	74823683	74823912	-84775871	+	MTE2a	LTR	MaLR	163	379	0	4
1155	1101	254	75	37	chr3	74825068	74825416	-84774367	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	362	-8	4
1155	370	246	31	78	chr3	74826125	74826253	-84773530	+	MTEb	LTR	MaLR	256	377	-2	4
1155	242	294	19	56	chr3	74826908	74827016	-84772767	+	RMER15	LTR	ERVL	459	562	-13	4
1155	1951	239	87	59	chr3	74832513	74833090	-84766693	-	RMER19C	LTR	ERVK	-18	593	1	4
1155	1310	233	107	0	chr3	74837171	74837497	-84762286	+	RMER6D	LTR	ERVK	339	699	-21	4
1155	295	154	62	0	chr3	74837497	74837562	-84762221	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	960	4
1155	615	299	142	8	chr3	74841107	74841353	-84758430	-	MLT2D	LTR	ERVL	-124	290	12	4
1156	954	229	223	22	chr3	74851925	74852292	-84747491	+	MT2A	LTR	ERVL	3	443	-90	4
1156	1053	101	0	25	chr3	74853395	74853558	-84746225	-	MT2B	LTR	ERVL	-440	161	3	4
1156	731	279	140	29	chr3	74854014	74854457	-84745326	+	RLTR12B	LTR	ERVK	12	503	-25	4
1156	1326	251	144	0	chr3	74866028	74866362	-84733421	+	MTD	LTR	MaLR	10	391	-28	4
1156	246	348	24	55	chr3	74870910	74871074	-84728709	+	MLT1E1	LTR	MaLR	216	374	-280	4
1156	2135	191	19	30	chr3	74876628	74876950	-84722833	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	108	4
1156	2135	191	19	30	chr3	74877032	74877135	-84722648	-	MTC	LTR	MaLR	-314	107	2	4
1156	263	339	139	88	chr3	74879616	74880004	-84719779	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	1	4
1156	879	288	62	54	chr3	74883890	74884242	-84715541	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	355	-4	4
1156	2392	203	126	34	chr3	74898363	74898792	-84700991	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1501	1944	-382	5
1156	2392	203	126	34	chr3	74899342	74899667	-84700116	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1945	2324	-2	5
1156	523	310	72	34	chr3	74899687	74899924	-84699859	+	RLTR16	LTR	ERVK	32	277	-228	5
1156	492	209	54	18	chr3	74907265	74907377	-84692406	+	MTC	LTR	MaLR	298	413	-8	5
1156	1501	293	24	52	chr3	74908165	74908382	-84691401	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	192	5
1156	1501	293	24	52	chr3	74908435	74908642	-84691141	-	MTC	LTR	MaLR	-230	191	2	5
1156	541	260	80	115	chr3	74908819	74909158	-84690625	+	ORR1E	LTR	MaLR	32	358	-1	5
1156	2377	113	117	7	chr3	74913770	74914196	-84685587	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	-2	473	1	5
1156	961	308	24	50	chr3	74944179	74944559	-84655224	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	8	5
1156	279	226	32	0	chr3	74972627	74972645	-84627138	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	627	648	-861	6
1156	783	219	47	73	chr3	74972874	74973106	-84626677	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	196	6
1157	825	211	39	17	chr3	74977449	74977627	-84622156	-	MTC	LTR	MaLR	-171	250	69	6
1157	869	231	145	95	chr3	74984537	74984895	-84614888	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	1	6
1157	2232	241	25	92	chr3	74987109	74987759	-84612024	-	RMER19C	LTR	ERVK	-5	606	1	6
1157	329	279	23	23	chr3	74989020	74989108	-84610675	+	MTEa	LTR	MaLR	1	88	-291	6
1157	3820	136	61	32	chr3	74991189	74991919	-84607864	-	RMER17A	LTR	ERVK	-13	738	3	6
1157	626	333	79	20	chr3	75005005	75005308	-84594475	-	MTE-int	LTR	MaLR	-2	1578	1258	1
1157	2624	82	53	8	chr3	75006012	75006391	-84593392	+	MTB	LTR	MaLR	5	400	0	1
1157	4730	215	72	7	chr3	75008113	75009198	-84590585	+	RMER12B	LTR	ERVK	19	1173	-231	1
1157	338	257	54	54	chr3	75009307	75009479	-84590304	+	RLTR21	LTR	ERVK	1408	1572	0	2
1157	759	305	64	10	chr3	75012461	75012756	-84587027	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	313	-66	2
1157	1813	135	114	72	chr3	75018526	75018982	-84580801	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
1157	1888	231	55	118	chr3	75027229	75027455	-84572328	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	397	5
1157	2970	80	25	0	chr3	75027455	75027856	-84571927	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	5
1157	1888	231	55	118	chr3	75027856	75028281	-84571502	-	RMER19C	LTR	ERVK	-215	396	1	5
1157	2164	228	28	31	chr3	75029319	75029827	-84569956	-	RMER15	LTR	ERVL	-21	554	49	5
1157	246	300	0	0	chr3	75029922	75029982	-84569801	-	RMER15	LTR	ERVL	-515	60	1	5
1157	289	333	53	91	chr3	75031817	75032081	-84567702	-	ORR1E	LTR	MaLR	-102	257	4	5
1157	1471	163	47	88	chr3	75032288	75032631	-84567152	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	6
1157	1428	183	133	3	chr3	75034328	75034629	-84565154	+	ORR1B1	LTR	MaLR	47	386	-8	6
1157	1294	209	107	56	chr3	75036856	75037231	-84562552	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	6
1157	796	301	108	13	chr3	75037277	75037657	-84562126	+	MER95	LTR	ERV	14	429	-2	6
1157	798	319	78	26	chr3	75039966	75040275	-84559508	+	MTEb	LTR	MaLR	53	377	-2	7
1157	1676	163	43	61	chr3	75040713	75041040	-84558743	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	7
1157	232	309	95	52	chr3	75041812	75041928	-84557855	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-1199	188	68	7
1157	837	337	101	26	chr3	75044801	75045307	-84554476	+	MER34A1	LTR	ERV1	44	587	0	8
1157	520	306	140	20	chr3	75045695	75045912	-84553871	+	MTD	LTR	MaLR	5	220	-159	8
1157	240	270	16	16	chr3	75055153	75055217	-84544566	+	MTE2b	LTR	MaLR	278	341	-38	9
1157	1932	151	115	52	chr3	75057243	75057475	-84542308	+	RLTR11B	LTR	ERVK	2	257	-196	9
1157	1932	151	115	52	chr3	75057658	75057850	-84541933	+	RLTR11B	LTR	ERVK	258	453	0	9
1157	3092	38	0	14	chr3	75064943	75065313	-84534470	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	1
1157	2744	148	86	40	chr3	75066834	75067390	-84532393	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	4	1
1157	464	292	149	52	chr3	75083662	75083976	-84515807	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	5	1
1157	228	180	48	32	chr3	75091629	75091692	-84508091	+	LTR37A	LTR	ERV1	166	229	-197	1
1157	469	330	44	24	chr3	75092080	75092285	-84507498	+	MER92C	LTR	ERV1	1	209	-345	1
1157	349	345	23	41	chr3	75093458	75093630	-84506153	+	RMER4A	LTR	ERVK	22	190	-276	1
1157	2955	230	60	3	chr3	75094246	75094878	-84504905	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1771	2438	-2553	1
1157	5941	216	40	21	chr3	75097598	75098694	-84501089	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3502	4623	-368	1
1157	5941	216	40	21	chr3	75098949	75099153	-84500630	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4624	4826	-165	1
1157	505	196	31	10	chr3	75099154	75099252	-84500531	+	RMER4B	LTR	ERVK	346	445	-140	1
1157	1550	248	89	69	chr3	75099293	75099818	-84499965	+	RMER21B	LTR	ERV1	18	553	-289	1
1157	1487	206	14	129	chr3	75103515	75103636	-84496147	+	ORR1B1	LTR	MaLR	32	137	-257	1
1157	1487	196	8	140	chr3	75103815	75104039	-84495744	+	ORR1B1	LTR	MaLR	138	350	-44	1
1158	1487	196	8	140	chr3	75104388	75104453	-84495330	+	ORR1B1	LTR	MaLR	351	386	-8	1
1158	773	273	5	54	chr3	75105055	75105276	-84494507	+	MTEb	LTR	MaLR	7	216	-163	1
1158	2077	231	33	0	chr3	75106335	75106757	-84493026	+	MT2A	LTR	ERVL	25	568	-33	1
1158	396	253	61	180	chr3	75106817	75106852	-84492931	+	MT2A	LTR	ERVL	569	601	0	1
1158	1911	142	14	61	chr3	75112827	75113171	-84486612	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	2	1
1158	327	259	65	130	chr3	75113518	75113687	-84486096	-	RMER2	LTR	ERV1	-122	445	288	1
1158	423	295	0	18	chr3	75113744	75113858	-84485925	-	RMER2	LTR	ERV1	-451	116	5	1
1158	819	227	21	11	chr3	75114316	75114503	-84485280	+	MTC	LTR	MaLR	229	417	-4	1
1158	1182	251	76	68	chr3	75114622	75114989	-84484794	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
1158	748	312	25	33	chr3	75125146	75125388	-84474395	+	RMER15	LTR	ERVL	336	575	0	1
1158	853	156	124	12	chr3	75128320	75128489	-84471294	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	234	2
1158	1680	239	44	33	chr3	75133524	75134004	-84465779	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-1	576	92	2
1158	751	296	65	38	chr3	75140336	75140645	-84459138	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	358	-12	2
1158	288	297	64	93	chr3	75144398	75144602	-84455181	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1146	1343	-4179	2
1158	3219	11	0	3	chr3	75152373	75152740	-84447043	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	-1	366	1	2
1158	25739	18	11	2	chr3	75152740	75155671	-84444112	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3525	2
1158	914	81	24	0	chr3	75155671	75155794	-84443989	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4785	2
1158	1763	123	4	15	chr3	75155791	75156056	-84443727	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2236	2
1158	442	66	0	32	chr3	75156045	75156108	-84443675	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5062	1419	1359	2
1158	3402	81	32	14	chr3	75156108	75156822	-84442961	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	8	2
1158	3230	11	0	3	chr3	75156822	75157190	-84442593	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	2
1158	2432	151	79	7	chr3	75157741	75158196	-84441587	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	490	-200	2
1158	1327	140	31	0	chr3	75158691	75158913	-84440870	+	RMER6C	LTR	ERVK	462	690	0	2
1158	285	310	0	33	chr3	75161820	75161910	-84437873	+	MTE-int	LTR	MaLR	9	95	-1485	2
1158	1002	259	75	57	chr3	75162493	75162865	-84436918	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	2
1158	750	319	55	77	chr3	75162865	75163053	-84436730	+	MTEa-int	LTR	MaLR	2	192	-1388	2
1158	750	319	55	77	chr3	75163201	75163378	-84436405	+	MTEa-int	LTR	MaLR	193	359	-1221	2
1158	533	348	37	67	chr3	75163661	75163892	-84435891	+	MTEa-int	LTR	MaLR	384	621	-959	2
1158	533	348	37	67	chr3	75164093	75164159	-84435624	+	MTEa-int	LTR	MaLR	622	672	-908	2
1158	240	259	0	18	chr3	75172104	75172159	-84427624	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1461	1514	-66	2
1158	1790	179	53	6	chr3	75172167	75172505	-84427278	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	2
1158	629	306	158	0	chr3	75173118	75173155	-84426628	+	MTEa	LTR	MaLR	28	64	-315	2
1158	629	297	171	22	chr3	75173205	75173393	-84426390	+	MTEa	LTR	MaLR	65	283	-96	2
1158	225	289	184	43	chr3	75173615	75173682	-84426101	+	MTEa	LTR	MaLR	278	355	-29	2
1158	875	354	50	21	chr3	75175832	75176253	-84423530	+	MER21B	LTR	ERV1	147	579	-284	2
1158	465	347	29	53	chr3	75182711	75182918	-84416865	+	MER21B	LTR	ERV1	590	791	-72	2
1158	1712	241	64	18	chr3	75187490	75187744	-84412039	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	142	2
1158	1190	229	109	36	chr3	75187744	75187933	-84411850	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	180	2
1158	1190	229	109	36	chr3	75187978	75188146	-84411637	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-205	179	3	2
1158	1712	241	64	18	chr3	75188146	75188284	-84411499	-	MTD	LTR	MaLR	-278	141	1	2
1158	414	339	8	0	chr3	75201257	75201384	-84398399	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	128	-377	2
1158	453	259	123	71	chr3	75203957	75204127	-84395656	+	MLT1D	LTR	MaLR	248	426	-79	2
1158	1109	244	148	19	chr3	75206625	75206742	-84393041	+	MTD	LTR	MaLR	1	119	-300	3
1158	1109	244	148	19	chr3	75206805	75207058	-84392725	+	MTD	LTR	MaLR	120	419	0	3
1158	1999	206	9	14	chr3	75211424	75211852	-84387931	-	RMER20A	LTR	ERVK	-90	426	1	3
1158	2078	194	12	22	chr3	75219926	75220337	-84379446	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	3
1158	2967	46	7	25	chr3	75220852	75221255	-84378528	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	583	3
1158	3129	11	0	52	chr3	75222596	75222983	-84376800	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1158	8576	56	78	70	chr3	75222983	75224278	-84375505	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	3
1158	28918	19	1	1	chr3	75224277	75227551	-84372232	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3210	6481	0	3
1158	3139	11	0	47	chr3	75227551	75227936	-84371847	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1158	4200	71	10	35	chr3	75227939	75228541	-84371242	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	-391	587	1	3
1159	528	301	19	7	chr3	75236068	75236222	-84363561	+	LTR40a	LTR	ERVL	3	158	-361	3
1159	562	318	74	20	chr3	75236749	75237051	-84362732	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	349	-41	3
1159	274	160	0	20	chr3	75248253	75248304	-84351479	+	MLT2B4	LTR	ERVL	505	554	-2	3
1159	616	218	131	11	chr3	75256014	75256190	-84343593	+	MLT1D	LTR	MaLR	309	505	0	3
1159	554	282	101	61	chr3	75270897	75271225	-84328558	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	341	-18	3
1159	277	318	103	0	chr3	75275363	75275470	-84324313	+	ORR1E	LTR	MaLR	77	194	-165	3
1159	249	350	20	20	chr3	75275553	75275655	-84324128	+	ORR1E	LTR	MaLR	268	369	-10	3
1159	267	366	20	0	chr3	75295410	75295511	-84304272	+	MTEa	LTR	MaLR	3	105	-274	4
1159	255	283	48	19	chr3	75302024	75302233	-84297550	+	RMER17A2	LTR	ERVK	295	509	-397	4
1159	737	250	17	23	chr3	75304596	75304772	-84295011	+	MTEb	LTR	MaLR	1	175	-204	4
1159	1199	221	90	28	chr3	75304962	75305384	-84294399	+	MT2A	LTR	ERVL	1	531	-70	4
1159	363	278	141	20	chr3	75305382	75305481	-84294302	+	MTEb	LTR	MaLR	217	327	-52	4
1159	790	184	186	36	chr3	75307160	75307357	-84292426	-	MTD	LTR	MaLR	-130	289	32	4
1159	323	290	110	48	chr3	75307533	75307777	-84292006	+	RLTR41	LTR	ERV1	191	486	-21	4
1159	255	258	48	114	chr3	75307794	75307899	-84291884	-	MTD	LTR	MaLR	-321	98	1	4
1159	364	279	92	80	chr3	75307931	75308332	-84291451	+	MLT2B4	LTR	ERVL	71	545	-9	4
1159	230	212	102	91	chr3	75312893	75312981	-84286802	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	152	4
1159	1144	204	92	108	chr3	75316184	75316563	-84283220	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	374	0	4
1159	1012	186	255	30	chr3	75330401	75330738	-84269045	+	MTD	LTR	MaLR	7	419	0	4
1159	924	135	399	31	chr3	75331017	75331305	-84268478	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1159	240	350	48	10	chr3	75343699	75343803	-84255980	+	MLT1J2	LTR	MaLR	40	147	-301	4
1159	241	176	154	77	chr3	75351301	75351418	-84248365	+	MLT1-int	LTR	MaLR	541	666	-705	4
1160	2136	148	69	7	chr3	75368379	75368801	-84230982	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	0	557	1	5
1160	1314	249	41	60	chr3	75379721	75380089	-84219694	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	365	-14	5
1160	1457	236	104	5	chr3	75381850	75382225	-84217558	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	6	5
1160	2476	229	84	25	chr3	75391910	75392520	-84207263	+	RMER13A	LTR	ERVK	163	808	-52	5
1160	975	244	9	5	chr3	75393342	75393552	-84206231	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	196	5
1160	720	254	72	0	chr3	75395129	75395322	-84204461	-	MTD	LTR	MaLR	-208	211	5	5
1160	1756	162	87	89	chr3	75398979	75399252	-84200531	-	RMER16	LTR	ERVK	-87	446	153	5
1160	1756	162	87	89	chr3	75399399	75399572	-84200211	-	RMER16	LTR	ERVK	-381	152	1	5
1160	7777	90	21	2	chr3	75399572	75400658	-84199125	-	RMER16-int	LTR	ERVK	0	5406	4300	5
1160	646	324	65	44	chr3	75404995	75405289	-84194494	+	MER31B	LTR	ERV1	4	303	-163	5
1160	237	164	117	52	chr3	75405470	75405547	-84194236	+	MER31B	LTR	ERV1	365	446	-20	5
1160	283	248	84	50	chr3	75408304	75408423	-84191360	-	LTR37A	LTR	ERV1	-41	385	263	5
1160	379	305	94	58	chr3	75408509	75408732	-84191051	-	LTR37A	LTR	ERV1	-189	237	7	5
1160	445	236	115	24	chr3	75409068	75409233	-84190550	-	LTR48	LTR	ERV1	-60	727	548	5
1160	269	354	92	12	chr3	75409240	75409403	-84190380	-	LTR29	LTR	ERV1	-306	316	141	5
1160	1471	225	183	32	chr3	75414187	75414596	-84185187	-	RLTR33	LTR	ERVK	-33	645	175	5
1160	379	317	36	42	chr3	75416006	75416174	-84183609	+	MTD	LTR	MaLR	36	202	-217	5
1160	332	208	42	0	chr3	75416598	75416670	-84183113	+	MTD	LTR	MaLR	345	419	0	5
1160	2637	67	6	14	chr3	75431816	75432165	-84167618	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	6
1160	332	247	26	0	chr3	75440474	75440551	-84159232	-	MLT1B	LTR	MaLR	-104	286	208	6
1160	573	316	55	39	chr3	75440780	75441037	-84158746	-	MLT2D	LTR	ERVL	-153	261	1	6
1160	254	350	159	0	chr3	75441043	75441206	-84158577	-	MLT1B	LTR	MaLR	-187	203	15	6
1160	401	260	56	31	chr3	75450431	75450619	-84149164	-	LTR40b	LTR	ERVL	0	519	332	6
1160	391	275	72	77	chr3	75450845	75450865	-84148918	-	LTR40b	LTR	ERVL	-188	331	312	6
1160	1837	138	116	27	chr3	75451314	75451649	-84148134	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	3	6
1160	826	109	14	28	chr3	75454165	75454306	-84145477	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	255	6
1160	1622	131	119	22	chr3	75454321	75454641	-84145142	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-58	351	1	6
1160	461	42	26	66	chr3	75454643	75454719	-84145064	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3	7403	7331	6
1160	1899	182	183	7	chr3	75454719	75455177	-84144606	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-363	539	1	6
1160	1494	151	4	4	chr3	75455184	75455437	-84144346	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-27	5781	5529	6
1160	282	154	0	58	chr3	75455450	75455519	-84144264	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1172	6072	6008	6
1160	1249	171	31	16	chr3	75455613	75455955	-84143828	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	6136	6
1160	3948	178	42	39	chr3	75455933	75457628	-84142155	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3321	4085	2358	6
1160	1637	174	206	29	chr3	75457644	75458120	-84141663	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4419	2987	2428	6
1160	2895	166	94	106	chr3	75458125	75459423	-84140360	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5329	2077	2	6
1160	1966	119	99	36	chr3	75459426	75459810	-84139973	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-1	408	1	6
1160	518	276	82	82	chr3	75460987	75461366	-84138417	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	6
1160	1937	155	15	6	chr3	75463490	75463814	-84135969	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1160	3535	20	0	0	chr3	75466627	75467023	-84132760	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1160	9101	34	5	1	chr3	75467023	75468117	-84131666	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
1160	3515	20	0	0	chr3	75468117	75468511	-84131272	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	394	-2	6
1160	1018	265	67	100	chr3	75477148	75477307	-84122476	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	202	6
1160	1018	265	67	100	chr3	75477328	75477558	-84122225	-	MTE2a	LTR	MaLR	-178	201	1	6
1160	347	312	180	34	chr3	75479710	75479949	-84119834	+	MLT1A0	LTR	MaLR	19	292	-73	6
1160	281	271	29	0	chr3	75480783	75480853	-84118930	-	MT2A	LTR	ERVL	-74	459	388	6
1160	4296	220	78	33	chr3	75483449	75484750	-84115033	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1848	1	7
1160	318	144	36	0	chr3	75486337	75486403	-84113380	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	286	7
1160	654	263	268	7	chr3	75486866	75487142	-84112641	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	74	7
1160	260	336	63	57	chr3	75487200	75487358	-84112425	-	MLT1L	LTR	MaLR	-408	202	44	7
1161	2706	176	69	62	chr3	75498762	75499374	-84100409	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	616	0	7
1161	274	218	49	49	chr3	75504480	75504562	-84095221	-	MER34A	LTR	ERV1	-489	82	1	9
1161	1250	121	64	102	chr3	75505943	75506209	-84093574	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	256	-71	1
1161	1119	244	27	33	chr3	75512893	75513229	-84086554	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-62	554	135	2
1161	642	256	56	60	chr3	75513204	75513470	-84086313	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-309	307	1	2
1161	665	303	17	34	chr3	75513560	75513796	-84085987	+	RLTR17	LTR	ERVK	125	356	-336	2
1161	643	299	33	47	chr3	75513855	75514066	-84085717	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	346	553	0	2
1161	277	56	0	0	chr3	75518868	75518904	-84080879	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	36	-256	3
1161	2047	49	0	93	chr3	75518904	75519217	-84080566	+	RLTR10B	LTR	ERVK	9	292	0	3
1161	21260	83	14	0	chr3	75519465	75522415	-84077368	+	MERVL-int	LTR	ERVL	2365	5356	-129	3
1161	301	164	90	0	chr3	75522532	75522599	-84077184	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	568	640	-1323	3
1161	264	53	0	0	chr3	75522599	75522637	-84077146	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
1161	3229	90	19	31	chr3	75522637	75523118	-84076665	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	3
1161	1393	216	43	17	chr3	75525507	75525856	-84073927	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	2	4
1161	2039	125	168	21	chr3	75537018	75537393	-84062390	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	5
1161	1110	260	94	3	chr3	75556309	75556648	-84043135	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	7
1161	876	188	332	22	chr3	75561395	75561672	-84038111	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-15	363	1	8
1161	468	303	65	84	chr3	75562138	75562489	-84037294	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-10	552	118	8
1161	533	358	21	21	chr3	75562507	75562741	-84037042	+	MLT2B2	LTR	ERVL	10	243	-272	8
1161	284	141	121	30	chr3	75575453	75575519	-84024264	+	RLTR25B	LTR	ERVK	438	509	-519	1
1161	664	316	73	30	chr3	75577461	75577804	-84021979	+	MTD	LTR	MaLR	18	405	-14	1
1161	1415	238	48	27	chr3	75592700	75593075	-84006708	-	RMER19C	LTR	ERVK	-2	609	227	1
1161	949	224	66	33	chr3	75593182	75593514	-84006269	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	1	1
1161	1305	248	72	80	chr3	75593720	75593913	-84005870	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	184	-186	1
1161	1305	248	72	80	chr3	75594234	75594413	-84005370	+	ORR1D2	LTR	MaLR	185	370	0	1
1161	340	322	102	63	chr3	75604565	75604948	-83994835	-	MLT2D	LTR	ERVL	0	414	1	1
1161	1106	233	43	36	chr3	75607331	75607607	-83992176	-	RMER20B	LTR	ERVK	-14	613	336	1
1161	3817	107	3	8	chr3	75618394	75618987	-83980796	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	864	1453	-2245	1
1161	387	173	86	71	chr3	75619052	75619304	-83980479	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	960	1184	-2115	1
1161	4906	95	31	16	chr3	75619565	75620348	-83979435	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	1501	2231	-1467	1
1161	625	74	5	47	chr3	75620446	75620558	-83979225	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3221	3299	0	1
1161	3947	51	24	2	chr3	75620558	75621050	-83978733	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	1
1161	377	390	64	6	chr3	75624363	75624536	-83975247	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-44	363	181	1
1161	1520	227	134	14	chr3	75625450	75625884	-83973899	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	126	1
1162	1541	137	33	4	chr3	75634586	75634857	-83964926	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	279	-196	1
1162	509	142	121	57	chr3	75634895	75635118	-83964665	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	213	475	0	1
1162	889	265	133	25	chr3	75642717	75643160	-83956623	-	RLTR16	LTR	ERVK	-14	491	1	1
1162	362	207	0	94	chr3	75652789	75652859	-83946924	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	200	1
1162	362	207	0	94	chr3	75653466	75653491	-83946292	-	MT2B	LTR	ERVL	-402	199	178	1
1162	244	235	34	21	chr3	75657746	75657845	-83941938	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	421	289	2
1162	1321	219	142	3	chr3	75658311	75658485	-83941298	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	173	2
1162	1321	219	142	3	chr3	75658578	75658733	-83941050	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-212	172	10	2
1162	1077	303	62	26	chr3	75663594	75664062	-83935721	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	33	2
1162	338	295	99	15	chr3	75664104	75664235	-83935548	+	ORR1D2	LTR	MaLR	34	175	-195	2
1162	283	320	40	16	chr3	75664251	75664375	-83935408	+	ORR1D2	LTR	MaLR	253	379	0	2
1162	351	252	104	0	chr3	75668824	75668939	-83930844	+	MLT1C	LTR	MaLR	6	132	-335	2
1162	244	312	78	26	chr3	75669020	75669135	-83930648	+	MLT1C	LTR	MaLR	340	460	-7	2
1162	1023	150	75	20	chr3	75671721	75672049	-83927734	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	390	-13	2
1162	444	319	179	39	chr3	75676377	75676762	-83923021	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-130	439	1	2
1162	229	196	210	59	chr3	75678358	75678477	-83921306	-	LTR40a	LTR	ERVL	-380	139	3	2
1162	2509	128	5	76	chr3	75679227	75679650	-83920133	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	2
1162	227	402	0	0	chr3	75682878	75682970	-83916813	+	RMER15	LTR	ERVL	371	462	-113	2
1162	1808	182	40	51	chr3	75688328	75688699	-83911084	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	2
1162	3306	177	69	33	chr3	75689166	75689832	-83909951	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	2
1162	295	274	69	82	chr3	75693428	75693587	-83906196	+	RLTR18	LTR	ERVK	35	191	-425	2
1162	1507	238	17	54	chr3	75693642	75693869	-83905914	+	RMER10B	LTR	ERVL	9	222	-176	2
1162	1507	238	17	54	chr3	75694044	75694221	-83905562	+	RMER10B	LTR	ERVL	223	398	0	2
1162	348	350	47	89	chr3	75704195	75704430	-83895353	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	234	-131	2
1162	973	321	46	15	chr3	75708942	75709322	-83890461	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	404	18	2
1162	807	259	152	19	chr3	75720606	75720921	-83878862	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	3
1162	376	327	20	26	chr3	75722030	75722181	-83877602	+	RMER15	LTR	ERVL	298	447	-128	3
1162	739	157	16	8	chr3	75725427	75725555	-83874228	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1103	975	3
1162	4592	135	41	21	chr3	75725531	75726341	-83873442	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-202	826	1	3
1162	1489	218	91	34	chr3	75727536	75727888	-83871895	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	3
1162	1384	329	85	52	chr3	75730064	75730902	-83868881	+	MLT1A1-int	LTR	MaLR	786	1718	-17	3
1162	305	392	23	28	chr3	75730896	75731072	-83868711	+	MLT1A1	LTR	MaLR	16	190	-218	3
1162	411	247	56	9	chr3	75731197	75731317	-83868466	+	MLT1A1	LTR	MaLR	281	490	-15	3
1162	360	347	45	75	chr3	75733791	75734059	-83865724	+	RMER15	LTR	ERVL	188	447	-128	3
1162	615	206	23	64	chr3	75734148	75734319	-83865464	+	RMER15	LTR	ERVL	407	570	-5	3
1162	923	252	68	75	chr3	75735217	75735285	-83864498	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	310	3
1162	923	252	68	75	chr3	75735675	75735927	-83863856	-	MTEa	LTR	MaLR	-70	309	61	3
1162	2110	224	91	13	chr3	75736354	75736825	-83862958	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-4	508	1	3
1162	1473	134	49	20	chr3	75737069	75737332	-83862451	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	383	3
1162	1473	173	149	87	chr3	75737369	75737683	-83862100	-	RMER6C	LTR	ERVK	-308	382	10	3
1162	2161	139	12	6	chr3	75740190	75740515	-83859268	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1162	498	310	68	68	chr3	75749851	75750100	-83849683	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	262	510	-979	3
1162	1013	291	136	39	chr3	75751015	75751523	-83848260	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	833	1389	-100	3
1162	445	297	181	47	chr3	75755179	75755500	-83844283	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	5	3
1163	731	283	157	38	chr3	75764961	75765306	-83834477	+	MTD	LTR	MaLR	9	394	-25	3
1163	2470	119	149	10	chr3	75772396	75772813	-83826970	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
1163	6247	43	4	12	chr3	75772813	75773565	-83826218	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5736	3
1163	2233	72	0	0	chr3	75773564	75773842	-83825941	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	3
1163	4961	58	3	56	chr3	75773842	75774533	-83825250	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	9	3
1163	2473	116	149	10	chr3	75774534	75774951	-83824832	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
1163	3360	56	15	0	chr3	75777390	75777784	-83821999	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
1163	6334	127	19	71	chr3	75777784	75778942	-83820841	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
1163	3041	68	10	0	chr3	75778942	75779337	-83820446	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	2	3
1163	391	321	75	49	chr3	75784734	75785066	-83814717	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	12	3
1163	311	243	80	45	chr3	75786799	75786911	-83812872	+	MLT1A1	LTR	MaLR	293	408	0	4
1163	821	300	33	107	chr3	75787470	75787525	-83812258	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	326	4
1163	821	300	33	107	chr3	75787719	75788055	-83811728	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-40	325	3	4
1163	354	327	19	32	chr3	75788091	75788249	-83811534	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-14	553	398	4
1163	1531	268	68	25	chr3	75788249	75788495	-83811288	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	249	-279	4
1163	1531	268	68	25	chr3	75788606	75788841	-83810942	+	RLTR12B	LTR	ERVK	250	503	-25	4
1163	704	271	50	58	chr3	75789115	75789641	-83810142	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	506	-22	4
1163	236	228	283	47	chr3	75789816	75789922	-83809861	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-425	131	1	4
1163	1624	197	80	22	chr3	75790738	75791101	-83808682	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1163	1750	208	93	5	chr3	75792586	75792963	-83806820	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	1	4
1163	1699	237	52	10	chr3	75804302	75804702	-83795081	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	4
1163	2244	172	53	157	chr3	75807282	75807964	-83791819	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	4
1163	730	158	48	48	chr3	75807964	75808170	-83791613	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	0	5780	5575	4
1163	1215	254	91	24	chr3	75809523	75809862	-83789921	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	3	4
1163	471	335	68	17	chr3	75810485	75810722	-83789061	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-1	568	320	4
1163	325	343	12	24	chr3	75812017	75812187	-83787596	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2634	2429	2262	4
1163	6092	149	54	112	chr3	75812884	75814032	-83785751	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-683	1280	227	4
1163	1912	157	12	15	chr3	75814032	75814362	-83785421	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
1163	6092	149	54	112	chr3	75814362	75814573	-83785210	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1737	226	1	4
1163	1651	166	9	71	chr3	75814573	75814910	-83784873	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	14	4
1163	2855	90	22	12	chr3	75818205	75818608	-83781175	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1163	1530	179	55	0	chr3	75820180	75820469	-83779314	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	306	-61	4
1163	287	178	27	140	chr3	75820469	75820563	-83779220	+	RMER16	LTR	ERVK	1	131	-402	4
1163	2613	230	57	24	chr3	75823718	75824310	-83775473	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	5	4
1163	279	335	112	48	chr3	75829176	75829427	-83770356	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	285	-74	4
1163	494	252	94	70	chr3	75834390	75834561	-83765222	+	MTEb	LTR	MaLR	197	371	-8	4
1163	1735	267	49	62	chr3	75835902	75836469	-83763314	-	MTD-int	LTR	MaLR	-698	560	1	4
1163	1511	257	49	31	chr3	75836469	75836854	-83762929	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	28	4
1163	302	239	42	42	chr3	75842864	75842960	-83756823	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-4	374	279	4
1163	260	284	54	43	chr3	75852223	75852315	-83747468	+	MER57C2	LTR	ERV1	300	392	-42	5
1163	6667	88	36	86	chr3	75856952	75858040	-83741743	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	1033	0	5
1163	2854	91	5	2	chr3	75861066	75861461	-83738322	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1163	308	273	0	0	chr3	75867009	75867075	-83732708	+	MTEa	LTR	MaLR	20	85	-294	5
1163	413	250	10	77	chr3	75869382	75869486	-83730297	+	MTEa	LTR	MaLR	104	200	-179	5
1163	544	288	25	18	chr3	75869675	75869838	-83729945	+	MTEa	LTR	MaLR	216	379	0	5
1163	1019	276	43	42	chr3	75875261	75875628	-83724155	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	16	5
1163	623	300	115	52	chr3	75875674	75875689	-83724094	-	MTD	LTR	MaLR	-392	15	1	5
1163	1147	313	99	76	chr3	75887006	75887743	-83712040	+	MTE-int	LTR	MaLR	37	790	-790	5
1163	528	389	35	25	chr3	75887727	75888012	-83711771	+	MTE-int	LTR	MaLR	1075	1362	-218	5
1163	225	311	67	19	chr3	75889837	75889942	-83709841	+	MTE-int	LTR	MaLR	1416	1525	-55	5
1164	2786	84	23	5	chr3	75905925	75906318	-83693465	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1164	2387	109	38	86	chr3	75922758	75922960	-83676823	+	MTB	LTR	MaLR	1	188	-212	5
1164	2387	109	38	86	chr3	75923676	75923882	-83675901	+	MTB	LTR	MaLR	189	399	-1	5
1164	578	283	80	16	chr3	75926425	75926612	-83673171	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	321	5
1164	1407	249	80	34	chr3	75926886	75927013	-83672770	-	RMER5	LTR	ERV1	-8	526	392	5
1164	1407	249	80	34	chr3	75927099	75927419	-83672364	-	RMER5	LTR	ERV1	-143	391	58	5
1164	1719	219	16	56	chr3	75941656	75941942	-83657841	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	1574	6
1164	1719	219	16	56	chr3	75942005	75942144	-83657639	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-275	1573	1440	6
1164	566	201	16	172	chr3	75944375	75944561	-83655222	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	223	6
1164	525	314	189	4	chr3	75944566	75944836	-83654947	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1250	330	11	6
1164	227	260	48	29	chr3	75945068	75945171	-83654612	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	315	6
1164	268	349	25	121	chr3	75947764	75947963	-83651820	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	381	6
1164	716	259	111	0	chr3	75950383	75950572	-83649211	+	MTD	LTR	MaLR	196	405	-14	6
1164	243	288	154	99	chr3	75961369	75961531	-83638252	-	RMER5	LTR	ERV1	-350	184	14	6
1164	3461	28	0	0	chr3	75967141	75967537	-83632246	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1164	270	253	128	32	chr3	75970240	75970334	-83629449	-	MTEb	LTR	MaLR	-113	266	164	6
1164	242	262	47	37	chr3	75971996	75972103	-83627680	+	MER72B	LTR	ERV1	280	387	-381	6
1164	1006	273	96	40	chr3	75977828	75978129	-83621654	+	MTD	LTR	MaLR	9	326	-93	6
1164	350	299	70	79	chr3	75989303	75989532	-83610251	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-56	472	246	6
1164	672	272	173	58	chr3	75989550	75989795	-83609988	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-235	293	1	6
1164	1592	162	136	23	chr3	75989939	75990293	-83609490	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	6
1164	1238	240	113	24	chr3	75990999	75991336	-83608447	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	8	6
1164	1259	271	83	18	chr3	75992211	75992666	-83607117	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	33	6
1164	496	286	82	134	chr3	75996023	75996426	-83603357	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	383	-1	6
1164	267	346	76	6	chr3	75998679	75998836	-83600947	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-173	383	216	6
1164	300	198	115	77	chr3	75999342	75999446	-83600337	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-420	136	29	6
1164	1713	190	80	14	chr3	76012260	76012622	-83587161	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	2
1164	1011	258	127	71	chr3	76021633	76021745	-83578038	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	421	4
1165	1011	258	127	71	chr3	76021905	76022297	-83577486	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-114	420	2	4
1165	915	328	75	3	chr3	76031430	76031763	-83568020	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	21	5
1165	343	295	91	1	chr3	76034182	76034317	-83565466	+	MTEa	LTR	MaLR	3	146	-233	6
1165	861	301	125	25	chr3	76034878	76035317	-83564466	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	52	6
1165	737	267	117	106	chr3	76035401	76035769	-83564014	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	374	-5	6
1165	1293	274	67	69	chr3	76050058	76050478	-83549305	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	8
1165	398	330	146	5	chr3	76078618	76078831	-83520952	-	RLTR40	LTR	ERVK	-51	766	524	1
1165	1424	250	9	87	chr3	76092714	76093152	-83506631	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	4	1
1165	807	264	97	11	chr3	76104461	76104729	-83495054	+	MTD	LTR	MaLR	3	293	-126	1
1165	1746	185	37	99	chr3	76113928	76114331	-83485452	-	RLTR14	LTR	ERV1	-2	380	3	1
1165	361	177	76	0	chr3	76122496	76122575	-83477208	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-376	4468	4384	1
1165	421	258	62	60	chr3	76122961	76123143	-83476640	-	MER57C2	LTR	ERV1	-199	235	60	2
1165	469	312	42	16	chr3	76135851	76136043	-83463740	-	RMER15	LTR	ERVL	-33	542	346	2
1165	311	302	70	0	chr3	76136133	76136262	-83463521	-	RMER15	LTR	ERVL	-437	138	1	2
1165	470	288	89	90	chr3	76142352	76142697	-83457086	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	377	-17	2
1165	1585	150	15	0	chr3	76147578	76147845	-83451938	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-56	273	3	2
1165	1563	153	249	17	chr3	76147847	76148260	-83451523	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1509	1001	2
1165	234	350	146	7	chr3	76149496	76149640	-83450143	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-240	204	41	2
1166	999	323	77	24	chr3	76155693	76156200	-83443583	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	1	2
1166	923	155	8	50	chr3	76166456	76166789	-83432994	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-13	390	1	2
1166	363	277	10	21	chr3	76175920	76176016	-83423767	-	MTD	LTR	MaLR	-218	201	107	2
1166	275	232	0	95	chr3	76184902	76184997	-83414786	+	MT2B2	LTR	ERVL	155	240	-344	2
1166	1224	238	134	64	chr3	76186494	76187016	-83412767	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	2
1166	2050	227	17	47	chr3	76187017	76187594	-83412189	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1	2841	2282	2
1166	751	172	21	67	chr3	76187591	76187784	-83411999	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-734	2108	1925	2
1166	923	166	19	28	chr3	76187799	76188010	-83411773	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-978	1864	1656	2
1166	1223	191	26	108	chr3	76189227	76189609	-83410174	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1175	1667	1382	2
1166	1744	179	39	19	chr3	76189604	76189968	-83409815	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1458	1384	1014	2
1166	1483	225	77	57	chr3	76189989	76190767	-83409016	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1780	1062	8	2
1166	890	304	107	9	chr3	76196669	76197014	-83402769	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	3
1166	311	315	11	0	chr3	76222554	76222646	-83377137	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	97	-282	3
1166	283	338	20	61	chr3	76222660	76222808	-83376975	+	MTE2b	LTR	MaLR	73	214	-165	3
1166	3147	65	7	5	chr3	76225079	76225499	-83374284	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	3
1166	329	291	0	0	chr3	76228912	76228998	-83370785	+	MTD	LTR	MaLR	18	103	-316	3
1166	4543	187	28	27	chr3	76228990	76229847	-83369936	-	RMER13B	LTR	ERVK	-50	858	1	3
1166	723	343	67	25	chr3	76239660	76240059	-83359724	-	MTD	LTR	MaLR	-5	416	1	3
1166	1768	156	41	38	chr3	76249591	76249958	-83349825	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	3
1166	887	151	183	36	chr3	76261583	76261884	-83337899	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	345	-14	3
1166	280	244	33	44	chr3	76262465	76262555	-83337228	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-441	127	39	3
1166	1813	143	11	86	chr3	76266307	76266688	-83333095	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-33	361	39	4
1166	902	323	95	22	chr3	76266707	76267077	-83332706	+	MTD	LTR	MaLR	21	417	-2	4
1166	2818	196	54	28	chr3	76267414	76268085	-83331698	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	1	4
1166	2650	192	36	40	chr3	76268202	76268808	-83330975	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6478	2481	1878	4
1166	325	308	28	107	chr3	76270250	76270428	-83329355	-	MER67D	LTR	ERV1	-185	329	166	4
1166	1446	130	89	239	chr3	76270432	76270938	-83328845	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	4
1166	262	270	144	59	chr3	76271100	76271218	-83328565	-	MER67D	LTR	ERV1	-386	128	1	4
1166	454	264	29	72	chr3	76272949	76273088	-83326695	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	243	4
1166	2948	184	6	4	chr3	76282057	76282581	-83317202	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	4	4
1167	3288	207	21	141	chr3	76288186	76289017	-83310766	+	RLTR25A	LTR	ERVK	2	735	-368	4
1167	3288	207	21	141	chr3	76289096	76289264	-83310519	+	RLTR25A	LTR	ERVK	736	880	-223	4
1167	747	224	106	76	chr3	76289402	76289481	-83310302	+	RLTR25B	LTR	ERVK	746	824	-204	4
1167	747	224	106	76	chr3	76289504	76289699	-83310084	+	RLTR25B	LTR	ERVK	825	1028	0	4
1167	1866	164	57	50	chr3	76292997	76293401	-83306382	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	4
1167	1186	206	17	44	chr3	76294853	76295148	-83304635	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	6264	6550	0	4
1167	811	252	103	53	chr3	76295287	76295530	-83304253	+	RLTR12B	LTR	ERVK	248	502	-26	4
1167	350	378	118	25	chr3	76298006	76298372	-83301411	-	MER76	LTR	ERVL	-26	665	266	4
1167	375	358	39	17	chr3	76298402	76298581	-83301202	-	MER76	LTR	ERVL	-508	183	1	4
1167	672	108	0	0	chr3	76304364	76304457	-83295326	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-314	93	1	4
1167	2637	208	58	49	chr3	76305171	76306010	-83293773	-	RMER17D	LTR	ERVK	-15	874	28	4
1167	1446	166	80	14	chr3	76308267	76308555	-83291228	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-12	320	14	4
1167	4633	110	13	23	chr3	76308563	76309459	-83290324	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7581	6743	4
1167	3327	98	0	2	chr3	76309455	76309904	-83289879	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-1373	6208	5761	4
1167	3273	91	5	16	chr3	76309895	76310340	-83289443	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-1939	5642	5203	4
1167	836	81	35	49	chr3	76310595	76310738	-83289045	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4530	4
1167	441	193	22	38	chr3	76310747	76310876	-83288907	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2380	2464	2357	4
1167	2669	174	96	74	chr3	76310879	76311569	-83288214	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3135	4271	3567	4
1167	659	202	0	0	chr3	76311595	76311714	-83288069	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4653	2753	2635	4
1167	280	279	0	55	chr3	76311726	76311817	-83287966	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4867	2539	2454	4
1167	427	229	93	0	chr3	76311828	76311946	-83287837	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5557	1849	1721	4
1167	1416	206	108	43	chr3	76311948	76312428	-83287355	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4750	656	251	4
1167	370	139	23	108	chr3	76312540	76312636	-83287147	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6629	952	868	4
1167	11288	53	18	4	chr3	76312636	76314065	-83285718	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	0	1470	22	4
1167	1516	150	83	20	chr3	76314065	76314365	-83285418	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	14	4
1167	2386	223	35	53	chr3	76316307	76317005	-83282778	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	4
1167	1268	181	65	99	chr3	76319864	76320188	-83279595	+	ORR1B1	LTR	MaLR	82	394	0	4
1167	1228	165	14	114	chr3	76320697	76320978	-83278805	-	RMER15	LTR	ERVL	-322	253	1	4
1167	261	326	100	8	chr3	76321132	76321262	-83278521	+	LTR40a	LTR	ERVL	300	441	-78	4
1167	608	41	0	0	chr3	76322127	76322200	-83277583	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-411	5074	5002	4
1167	2880	77	26	3	chr3	76329809	76330200	-83269583	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1167	1736	187	96	23	chr3	76332485	76332912	-83266871	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-1848	4289	3832	4
1167	1689	195	85	182	chr3	76332911	76333165	-83266618	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3370	2767	2521	4
1167	1689	195	85	182	chr3	76333217	76333605	-83266178	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3370	2520	2141	4
1167	225	183	46	77	chr3	76335381	76335446	-83264337	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	4
1167	357	173	13	0	chr3	76336659	76336734	-83263049	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4213	1924	1849	4
1167	1930	184	201	16	chr3	76336743	76337405	-83262378	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4498	1639	807	4
1167	240	176	0	19	chr3	76343307	76343359	-83256424	+	MTE2a	LTR	MaLR	305	355	-24	5
1167	1343	231	24	153	chr3	76349391	76349856	-83249927	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	15	5
1167	2671	23	2	248	chr3	76358719	76359236	-83240547	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	5
1167	17089	25	4	0	chr3	76359238	76361214	-83238569	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	1	5
1167	2674	20	2	251	chr3	76361214	76361733	-83238050	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	5
1167	2146	199	139	36	chr3	76372922	76373146	-83226637	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	386	5
1167	2146	199	139	36	chr3	76373251	76373578	-83226205	-	RMER19C	LTR	ERVK	-226	385	1	5
1167	337	370	44	99	chr3	76375072	76375456	-83224327	+	MTEa	LTR	MaLR	17	379	0	5
1167	1311	279	29	41	chr3	76375613	76375896	-83223887	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	121	5
1167	1311	279	29	41	chr3	76376489	76376616	-83223167	-	MTD	LTR	MaLR	-299	120	1	5
1167	1905	161	31	0	chr3	76378385	76378702	-83221081	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1167	1735	202	72	13	chr3	76379580	76379971	-83219812	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	5	5
1167	424	326	62	55	chr3	76382807	76383080	-83216703	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-69	290	16	5
1167	2941	55	31	5	chr3	76383225	76383611	-83216172	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1167	1517	295	93	45	chr3	76383839	76384054	-83215729	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-11	1569	1186	5
1167	1517	298	83	34	chr3	76384079	76384570	-83215213	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-185	1185	681	5
1167	527	244	119	5	chr3	76386429	76386623	-83213160	-	RMER17C	LTR	ERVK	-194	216	1	5
1167	292	306	112	151	chr3	76386624	76386713	-83213070	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-961	619	537	5
1167	547	267	108	63	chr3	76386860	76387203	-83212580	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1044	536	180	5
1167	366	368	28	52	chr3	76388395	76388607	-83211176	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-159	410	204	5
1167	282	277	24	12	chr3	76389034	76389118	-83210665	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-464	105	21	5
1167	826	289	80	15	chr3	76389863	76390127	-83209656	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	88	5
1167	746	312	59	3	chr3	76395917	76396254	-83203529	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	4	5
1167	1474	238	122	54	chr3	76412567	76413365	-83186418	+	RMER6C	LTR	ERVK	7	720	0	6
1168	381	408	29	0	chr3	76419788	76419994	-83179789	+	MLT1F	LTR	MaLR	156	367	-181	6
1168	284	306	116	71	chr3	76434024	76434249	-83165534	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-68	396	162	6
1168	776	254	138	5	chr3	76447815	76448025	-83151758	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	238	-274	6
1168	1390	230	34	52	chr3	76448026	76448352	-83151431	+	RLTR18B	LTR	ERVK	186	505	-7	6
1168	390	302	115	11	chr3	76462802	76462993	-83136790	-	RMER5	LTR	ERV1	-67	467	257	6
1168	251	257	0	75	chr3	76463952	76464032	-83135751	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-13	395	322	6
1168	363	238	71	0	chr3	76472178	76472262	-83127521	+	MTEa	LTR	MaLR	1	90	-289	6
1168	279	305	132	70	chr3	76474646	76475048	-83124735	-	MER57F	LTR	ERV1	-9	427	1	6
1168	352	290	55	116	chr3	76486293	76486492	-83113291	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-12	544	358	6
1168	338	351	46	20	chr3	76486685	76486880	-83112903	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-401	5313	5114	6
1168	735	279	97	112	chr3	76487375	76487758	-83112025	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	7
1168	283	65	0	80	chr3	76487778	76487828	-83111955	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-786	4928	4883	6
1168	1678	236	45	5	chr3	76488770	76489171	-83110612	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	7
1168	273	238	227	41	chr3	76489939	76490179	-83109604	+	MLT1A1	LTR	MaLR	84	408	0	7
1168	3961	104	13	142	chr3	76496384	76497247	-83102536	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	7
1168	231	316	10	31	chr3	76506169	76506267	-83093516	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	301	5
1168	424	244	16	63	chr3	76514114	76514241	-83085542	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	262	1
1168	876	219	24	121	chr3	76527739	76527988	-83071795	+	RLTR14	LTR	ERV1	101	325	-57	3
1168	233	286	87	56	chr3	76528368	76528494	-83071289	+	RLTR12B	LTR	ERVK	356	485	-43	3
1168	1685	229	105	56	chr3	76542987	76543791	-83055992	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	803	0	5
1169	756	326	44	28	chr3	76550954	76551273	-83048510	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	107	6
1169	461	226	0	11	chr3	76551382	76551476	-83048307	-	RLTR23	LTR	ERV1	-330	100	8	6
1169	376	168	158	63	chr3	76558549	76558571	-83041212	+	ORR1C2	LTR	MaLR	208	231	-115	7
1169	535	106	153	7	chr3	76558627	76558731	-83041052	+	ORR1C2	LTR	MaLR	232	384	0	7
1169	2490	94	71	37	chr3	76570648	76571055	-83028728	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	9
1169	583	80	0	0	chr3	76571456	76571544	-83028239	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	489	564	-2278	9
1169	630	202	72	52	chr3	76571559	76571687	-83028096	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	652	786	-2056	9
1169	3086	17	0	0	chr3	76571687	76572032	-83027751	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-1	345	1	9
1169	630	202	72	52	chr3	76572032	76572096	-83027687	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	787	848	-1994	9
1169	609	202	37	27	chr3	76572129	76572420	-83027363	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	354	838	-2004	9
1169	2372	189	35	37	chr3	76572426	76572966	-83026817	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1156	1694	-1148	9
1169	1348	155	16	68	chr3	76572967	76573278	-83026505	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1925	2219	-623	9
1169	259	106	43	0	chr3	76573315	76573362	-83026421	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	2277	2325	-1	9
1169	2907	96	10	5	chr3	76573363	76573781	-83026002	+	BGLII	LTR	ERVK	1	420	-1	9
1169	1184	316	42	25	chr3	76579693	76580218	-83019565	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	45	1
1169	1640	222	42	30	chr3	76581385	76581785	-83017998	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	3	1
1169	631	233	132	53	chr3	76581787	76582090	-83017693	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	772	1
1169	1506	234	89	51	chr3	76583778	76584228	-83015555	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-791	467	1	1
1169	1459	178	163	17	chr3	76584228	76584572	-83015211	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	394	1	1
1169	1138	311	34	0	chr3	76592357	76592685	-83007098	-	MTE2b	LTR	MaLR	-30	349	11	1
1169	1617	141	124	0	chr3	76596566	76596856	-83002927	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	326	-6	1
1169	815	131	26	46	chr3	76596860	76597012	-83002771	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1	149	-7531	1
1169	787	152	89	38	chr3	76597021	76597318	-83002465	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	558	952	-6629	1
1169	1669	197	115	24	chr3	76597430	76597933	-83001850	+	RMER16-int	LTR	ERVK	192	662	-5475	1
1169	317	154	58	0	chr3	76597925	76597977	-83001806	+	RMER16-int	LTR	ERVK	950	1004	-983	1
1169	276	313	36	35	chr3	76597993	76598227	-83001556	+	RMER16-int	LTR	ERVK	822	940	-5602	1
1169	319	193	0	0	chr3	76598373	76598430	-83001353	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	447	503	-6039	1
1169	1438	103	112	0	chr3	76598430	76598653	-83001130	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5007	5254	-1288	1
1169	1645	135	13	0	chr3	76598654	76598967	-83000816	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6965	7307	-373	1
1169	1339	210	55	15	chr3	76599002	76599345	-83000438	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6125	6481	0	1
1169	1540	145	128	0	chr3	76599345	76599635	-83000148	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	327	-5	1
1169	253	286	45	45	chr3	76600540	76600650	-82999133	+	MLT1A1	LTR	MaLR	299	408	0	1
1169	1070	291	115	21	chr3	76602087	76602470	-82997313	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1169	4488	98	19	78	chr3	76611498	76612296	-82987487	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	1
1169	721	249	38	75	chr3	76615944	76616157	-82983626	+	ORR1D1	LTR	MaLR	170	374	0	1
1169	2515	185	139	20	chr3	76628326	76628871	-82970912	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	610	-1	1
1169	702	302	67	31	chr3	76631651	76632037	-82967746	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3490	3889	-1872	1
1169	1397	259	101	13	chr3	76632041	76632417	-82967366	+	MTD	LTR	MaLR	2	410	-9	1
1169	2073	193	17	0	chr3	76640661	76641023	-82958760	+	MTC	LTR	MaLR	5	372	-49	1
1169	581	221	0	0	chr3	76641031	76641144	-82958639	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-265	113	1	1
1169	1132	261	68	3	chr3	76642670	76642978	-82956805	-	RMER15	LTR	ERVL	-50	525	198	1
1169	360	285	69	8	chr3	76652919	76653050	-82946733	+	MLT2E	LTR	ERVL	486	624	-4	2
1169	1156	204	50	161	chr3	76653424	76653845	-82945938	+	ORR1C1	LTR	MaLR	5	378	0	2
1169	3035	16	19	84	chr3	76654215	76654630	-82945153	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
1169	13078	26	4	1	chr3	76654632	76656508	-82943275	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1	1984	-3	2
1169	3045	16	19	80	chr3	76656510	76656923	-82942860	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
1169	1494	245	30	0	chr3	76661028	76661396	-82938387	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	1	2
1169	1789	224	20	16	chr3	76662361	76662809	-82936974	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	450	-270	2
1169	1457	171	27	10	chr3	76662973	76663268	-82936515	+	RMER6C	LTR	ERVK	391	690	0	2
1169	365	304	149	51	chr3	76670581	76670896	-82928887	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	346	-19	2
1169	789	302	67	19	chr3	76676274	76676588	-82923195	-	RMER5	LTR	ERV1	-173	361	33	2
1170	4409	16	0	0	chr3	76690471	76690964	-82908819	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1170	46955	18	8	0	chr3	76690970	76696281	-82903502	+	MERVL-int	LTR	ERVL	7	5360	-125	2
1170	392	167	46	35	chr3	76696281	76696368	-82903415	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	2
1170	314	0	0	0	chr3	76696368	76696406	-82903377	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	2
1170	4385	18	0	0	chr3	76696406	76696899	-82902884	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1170	387	165	187	0	chr3	76701928	76702019	-82897764	+	ORR1A4	LTR	MaLR	214	321	-8	2
1170	294	236	0	0	chr3	76707444	76707499	-82892284	-	RLTR26	LTR	ERVK	-1	641	587	2
1170	3992	133	20	40	chr3	76709605	76710372	-82889411	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	2
1170	2658	89	39	3	chr3	76722364	76722746	-82877037	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1170	1566	345	110	49	chr3	76722819	76723815	-82875968	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-521	1059	3	2
1170	1114	261	41	90	chr3	76723829	76724195	-82875588	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	1	2
1170	852	325	64	45	chr3	76727562	76728046	-82871737	+	RMER5	LTR	ERV1	42	534	0	2
1170	3059	60	8	0	chr3	76729777	76730174	-82869609	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
1170	706	313	73	27	chr3	76732194	76732562	-82867221	-	RMER5	LTR	ERV1	-38	496	112	3
1170	1663	256	8	19	chr3	76738721	76739099	-82860684	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1170	1275	242	40	97	chr3	76741218	76741662	-82858121	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	3
1170	1184	305	41	10	chr3	76744450	76744844	-82854939	+	MTD	LTR	MaLR	1	406	-13	3
1170	269	314	31	71	chr3	76746657	76746784	-82852999	+	MLT1A	LTR	MaLR	13	134	-274	3
1170	479	333	100	19	chr3	76746924	76747285	-82852498	+	MLT1A-int	LTR	MaLR	203	592	-779	3
1170	2013	143	16	0	chr3	76752785	76753099	-82846684	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	3
1170	1674	238	6	0	chr3	76762093	76762442	-82837341	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-1157	352	2	3
1170	1508	225	22	11	chr3	76762443	76762802	-82836981	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	5	3
1170	248	388	17	0	chr3	76779030	76779146	-82820637	+	RMER15	LTR	ERVL	432	549	-26	3
1170	2378	201	52	30	chr3	76781875	76782399	-82817384	-	RMER13A	LTR	ERVK	-180	680	146	3
1170	232	264	0	0	chr3	76782399	76782452	-82817331	-	RLTR26	LTR	ERVK	-372	270	218	3
1170	642	350	76	60	chr3	76786124	76786571	-82813212	+	MTE-int	LTR	MaLR	311	764	-816	3
1170	741	286	112	18	chr3	76789774	76790112	-82809671	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1170	1648	71	85	12	chr3	76800373	76800631	-82799152	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	277	-198	4
1170	1361	243	170	87	chr3	76803184	76803510	-82796273	+	MTC-int	LTR	MaLR	410	832	-426	4
1170	1361	226	184	66	chr3	76803551	76803900	-82795883	+	MTC-int	LTR	MaLR	833	1258	0	4
1170	1606	239	41	24	chr3	76803900	76804311	-82795472	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	4
1170	904	187	60	11	chr3	76807847	76808031	-82791752	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	193	-527	4
146	1064	143	17	0	chr3	76808043	76808218	-82791565	+	RMER6C	LTR	ERVK	513	690	0	4
1171	2103	161	27	25	chr3	76811361	76811769	-82788014	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	4
1171	683	309	71	53	chr3	76813697	76813963	-82785820	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	109	4
1171	341	320	74	37	chr3	76814061	76814304	-82785479	-	MT2A	LTR	ERVL	-138	395	144	4
1171	1132	211	104	36	chr3	76818568	76818877	-82780906	+	MTD	LTR	MaLR	44	373	-46	4
1171	2930	36	7	112	chr3	76826861	76827297	-82772486	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	4
1171	2136	203	9	33	chr3	76828668	76829096	-82770687	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	4
1171	1775	146	8	30	chr3	76836570	76836930	-82762853	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	324	-5	4
1171	1172	268	109	17	chr3	76838520	76838877	-82760906	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	30	4
1171	257	379	43	8	chr3	76841151	76841268	-82758515	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-2	558	438	4
1171	490	345	66	47	chr3	76848299	76848741	-82751042	+	MER73	LTR	ERVL	136	636	-8	4
1171	1059	232	61	4	chr3	76851462	76851709	-82748074	-	MTC	LTR	MaLR	-14	407	147	4
1171	255	390	21	21	chr3	76853958	76854102	-82745681	+	RMER15	LTR	ERVL	276	419	-156	4
1171	1177	203	79	0	chr3	76863708	76863949	-82735834	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	262	-122	4
1171	1524	169	36	84	chr3	76873645	76873980	-82725803	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	3	5
1171	674	110	37	0	chr3	76873982	76874091	-82725692	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	1851	5
1171	4507	174	43	6	chr3	76878245	76879167	-82720616	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-193	1770	930	5
1171	1647	196	136	5	chr3	76880004	76880373	-82719410	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	5
1171	2190	212	148	10	chr3	76887189	76887795	-82711988	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1171	1000	189	0	0	chr3	76887796	76887971	-82711812	+	RMER6D	LTR	ERVK	535	709	-11	5
1171	749	239	75	26	chr3	76888137	76888365	-82711418	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	255	-330	5
1171	371	260	50	41	chr3	76888497	76888666	-82711117	+	RMER4B	LTR	ERVK	343	549	-36	5
1171	2868	162	48	2	chr3	76888855	76889374	-82710409	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	543	-135	5
1171	807	135	0	36	chr3	76889811	76889949	-82709834	+	RLTR33	LTR	ERVK	540	672	-6	5
1171	4081	259	57	34	chr3	76890243	76891849	-82707934	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	179	1733	-3527	5
1171	6830	174	54	17	chr3	76891847	76893243	-82706540	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	2390	3836	-1424	5
1171	1301	229	7	18	chr3	76893245	76893521	-82706262	+	RMER19C	LTR	ERVK	337	609	-2	5
1171	2965	205	66	22	chr3	76893523	76894250	-82705533	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	4393	5151	-109	5
1171	474	246	23	0	chr3	76894272	76894402	-82705381	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4523	4655	-1895	5
1171	748	306	4	38	chr3	76894703	76894941	-82704842	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4905	5134	-1416	5
1171	352	249	34	127	chr3	76894942	76895136	-82704647	+	RMER4A	LTR	ERVK	256	553	-32	5
1171	2786	229	35	137	chr3	76895197	76895773	-82704010	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7877	8362	-597	5
1171	2786	229	35	137	chr3	76895796	76896363	-82703420	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8363	8903	-56	5
1171	637	226	171	17	chr3	76896439	76896678	-82703105	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	276	-309	5
1171	414	236	54	19	chr3	76896872	76897043	-82702740	+	RMER4B	LTR	ERVK	368	579	-6	5
1171	2612	101	6	0	chr3	76904895	76905261	-82694522	+	MTB	LTR	MaLR	32	399	-1	5
1171	1518	176	192	34	chr3	76907967	76908407	-82691376	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-7	434	1	5
1171	225	359	32	11	chr3	76910087	76910180	-82689603	-	LTR69	LTR	ERVL	-121	467	373	5
1171	310	307	54	90	chr3	76916891	76917113	-82682670	+	MTD	LTR	MaLR	36	249	-170	5
1171	451	282	105	52	chr3	76918909	76919100	-82680683	+	MTE2a	LTR	MaLR	179	379	0	5
1171	433	332	44	119	chr3	76920196	76920606	-82679177	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	5
1171	1892	256	55	45	chr3	76924372	76924989	-82674794	-	RLTR1	LTR	ERV1	0	624	2	5
1171	428	206	0	108	chr3	76925088	76925105	-82674678	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	254	152	5
1171	532	304	59	52	chr3	76929094	76929517	-82670266	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2966	3444	-4137	5
1172	341	176	7	67	chr3	76945794	76945902	-82653881	+	ORR1C2	LTR	MaLR	273	384	0	6
1172	1341	214	128	3	chr3	76952785	76953104	-82646679	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	6
1172	797	300	101	13	chr3	76964464	76964849	-82634934	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
1172	1570	198	98	3	chr3	76970031	76970356	-82629427	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	356	-11	6
1172	3367	25	8	0	chr3	76984283	76984676	-82615107	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1172	2385	180	62	71	chr3	76997800	76998380	-82601403	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	6
1172	2280	87	6	6	chr3	77003483	77003794	-82595989	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	4
1172	1569	223	14	6	chr3	77003889	77004241	-82595542	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-280	7400	7046	5
1172	378	139	139	0	chr3	77004245	77004331	-82595452	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-600	1387	1290	4
1172	1478	110	101	0	chr3	77004332	77004550	-82595233	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1299	5243	5004	6
1172	516	295	38	30	chr3	77004562	77004841	-82594942	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-5481	1061	822	6
1172	3292	68	14	28	chr3	77004981	77005441	-82594342	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-995	992	93	7
1172	359	48	0	0	chr3	77005841	77005883	-82593900	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	226	1
1172	319	242	0	16	chr3	77005921	77005984	-82593799	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	248	1
1172	612	88	33	0	chr3	77005986	77006077	-82593706	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7487	94	1	1
1172	2062	86	48	0	chr3	77006077	77006368	-82593415	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	7	1
1172	314	257	116	68	chr3	77006870	77007016	-82592767	-	RLTR17	LTR	ERVK	-328	364	212	1
1172	3907	203	15	33	chr3	77007095	77008026	-82591757	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1928	2841	-1	1
1172	1313	252	58	40	chr3	77008035	77008415	-82591368	+	RLTR17	LTR	ERVK	106	492	-200	1
1172	271	361	6	6	chr3	77010169	77010325	-82589458	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	297	452	-7765	1
1172	2163	186	118	21	chr3	77010844	77011359	-82588424	+	RMER16-int	LTR	ERVK	255	819	-4587	2
1172	1103	186	15	5	chr3	77011364	77011564	-82588219	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1089	1290	-4116	2
1172	1556	226	44	41	chr3	77011573	77011984	-82587799	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2339	2750	-4656	2
1172	2765	167	24	30	chr3	77011977	77012570	-82587213	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2313	2839	-2567	2
1172	2072	246	60	19	chr3	77012592	77013286	-82586497	+	RMER16-int	LTR	ERVK	4083	4534	-2872	2
1172	1400	264	7	10	chr3	77013347	77013755	-82586028	+	RMER16-int	LTR	ERVK	4846	5516	-1890	2
1172	807	232	7	7	chr3	77014099	77014251	-82585532	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-185	7221	7070	2
1172	639	300	41	45	chr3	77014263	77014748	-82585035	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3351	3833	-1573	2
1172	753	316	35	35	chr3	77019333	77019589	-82580194	-	RMER15	LTR	ERVL	-134	441	186	2
1172	514	242	13	51	chr3	77019727	77019884	-82579899	-	RMER15	LTR	ERVL	-397	178	28	2
1172	1642	10	0	0	chr3	77030929	77031122	-82568661	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	204	4
1172	807	11	0	0	chr3	77031117	77031210	-82568573	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	-400	93	1	4
1172	2112	225	58	91	chr3	77031700	77032341	-82567442	-	RMER20B	LTR	ERVK	-2	625	6	4
1172	1716	215	72	27	chr3	77034328	77034833	-82564950	+	RLTR19B	LTR	ERVK	1	715	0	5
1172	341	273	48	48	chr3	77050308	77050454	-82549329	+	RMER15	LTR	ERVL	380	525	-50	6
1172	1602	195	102	6	chr3	77050775	77051090	-82548693	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	342	-25	6
1172	1602	195	102	6	chr3	77051195	77051214	-82548569	+	ORR1B2	LTR	MaLR	343	365	-2	6
1172	1492	185	97	19	chr3	77051524	77051844	-82547939	-	RMER20A	LTR	ERVK	-171	345	1	6
1172	2067	247	71	10	chr3	77052946	77053466	-82546317	+	RMER15	LTR	ERVL	24	575	0	7
1172	825	212	22	32	chr3	77068782	77068967	-82530816	+	ORR1D1	LTR	MaLR	7	189	-185	7
1172	1003	212	51	24	chr3	77069022	77069279	-82530504	+	ORR1D1	LTR	MaLR	69	374	0	8
1173	694	264	287	3	chr3	77079608	77079901	-82519882	-	MTC	LTR	MaLR	-44	377	2	9
1173	4800	190	62	57	chr3	77080074	77081171	-82518612	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1103	0	9
1173	1106	252	110	25	chr3	77096802	77097156	-82502627	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	1
1173	2740	112	12	17	chr3	77102780	77103189	-82496594	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
1173	286	326	12	0	chr3	77104943	77105029	-82494754	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	87	-292	1
1173	874	314	4	17	chr3	77105016	77105249	-82494534	+	MTE2b	LTR	MaLR	48	277	-102	1
1173	697	350	65	16	chr3	77107444	77107766	-82492017	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	338	-32	1
1173	3344	74	9	2	chr3	77107767	77108212	-82491571	+	RLTR1C	LTR	ERV1	56	503	0	1
1173	2223	195	105	43	chr3	77114238	77114886	-82484897	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	1	1
1173	3743	121	5	12	chr3	77120139	77120709	-82479074	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	2	1
1173	783	68	8	63	chr3	77121404	77121559	-82478224	+	MTB	LTR	MaLR	200	344	-56	1
1173	730	292	40	45	chr3	77122190	77122437	-82477346	-	RMER15	LTR	ERVL	-127	448	203	1
1173	5237	153	49	10	chr3	77122576	77123498	-82476285	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	1
1173	574	321	52	39	chr3	77126212	77126453	-82473330	+	MTD	LTR	MaLR	5	270	-151	1
1173	617	318	57	111	chr3	77131963	77132349	-82467434	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	365	-14	1
1173	362	241	60	0	chr3	77136088	77136171	-82463612	+	MTEa	LTR	MaLR	1	88	-291	1
1173	730	299	19	107	chr3	77136388	77136648	-82463135	+	MTEa	LTR	MaLR	86	335	-44	1
1173	730	299	19	107	chr3	77136975	77137032	-82462751	+	MTEa	LTR	MaLR	336	375	-4	1
1173	1134	290	92	45	chr3	77137036	77137483	-82462300	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1	468	-1112	1
1173	523	284	12	128	chr3	77137601	77137715	-82462068	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1353	1452	-128	1
1173	523	284	12	128	chr3	77137902	77138034	-82461749	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1458	1580	0	1
1173	312	343	0	0	chr3	77138035	77138134	-82461649	+	MTEa	LTR	MaLR	2	100	-279	1
1173	254	184	0	20	chr3	77143188	77143231	-82456552	+	MT2B	LTR	ERVL	76	117	-416	1
1173	627	286	45	48	chr3	77143246	77143524	-82456259	+	MT2B	LTR	ERVL	99	524	-77	1
1173	1983	199	56	0	chr3	77143722	77144099	-82455684	-	MTC	LTR	MaLR	-23	398	1	2
1173	392	192	157	30	chr3	77144099	77144233	-82455550	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1108	2
1173	3054	88	5	0	chr3	77148405	77148824	-82450959	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	2
1173	3541	234	85	27	chr3	77148882	77149773	-82450010	-	MTC-int	LTR	MaLR	-159	1099	157	2
1173	1337	262	55	10	chr3	77151998	77152399	-82447384	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	2
1173	993	250	220	27	chr3	77152806	77153218	-82446565	+	RMER19A	LTR	ERVK	60	580	-157	2
1173	2333	93	71	3	chr3	77161159	77161495	-82438288	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	2
1173	2845	85	19	31	chr3	77169223	77169648	-82430135	-	BGLII	LTR	ERVK	-1	420	1	2
1173	443	376	67	9	chr3	77171044	77171373	-82428410	+	MLT1A0	LTR	MaLR	19	365	0	2
1173	3843	101	34	97	chr3	77171596	77172398	-82427385	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	2
1173	269	333	0	79	chr3	77174323	77174450	-82425333	+	MTE-int	LTR	MaLR	449	565	-805	2
1173	2744	47	2	89	chr3	77174783	77175208	-82424575	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	2
1173	1657	348	26	15	chr3	77177751	77178413	-82421370	+	MTE-int	LTR	MaLR	793	1461	-119	2
1173	2024	231	65	30	chr3	77179054	77179700	-82420083	+	RMER19A	LTR	ERVK	7	737	0	2
1173	1611	197	12	24	chr3	77180098	77180431	-82419352	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
1173	1055	217	18	9	chr3	77180431	77180659	-82419124	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	230	-1733	2
1173	1989	142	28	3	chr3	77180659	77180978	-82418805	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1173	5348	158	19	6	chr3	77180978	77181878	-82417905	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-19	1944	1033	2
1173	4408	198	61	5	chr3	77187430	77188434	-82411349	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-923	1040	2	2
1173	1898	105	34	115	chr3	77188435	77188791	-82410992	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1173	872	180	66	0	chr3	77188791	77188958	-82410825	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	226	403	-1560	2
1173	793	185	6	9	chr3	77193402	77193577	-82406206	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1817	1963	0	2
1173	1647	172	21	56	chr3	77193579	77193918	-82405865	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	2
1173	360	255	51	76	chr3	77201065	77201222	-82398561	+	ORR1E	LTR	MaLR	43	195	-164	2
1173	248	333	21	31	chr3	77201299	77201395	-82398388	+	ORR1E	LTR	MaLR	272	366	-13	2
1174	2170	221	163	11	chr3	77208042	77208681	-82391102	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	736	-1	2
1174	882	298	102	18	chr3	77219529	77219871	-82379912	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	6	2
1174	1172	220	19	11	chr3	77228803	77229070	-82370713	+	RLTR24	LTR	ERV1	11	279	-250	3
1174	356	98	32	32	chr3	77229169	77229232	-82370551	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	63	-296	3
1174	1362	183	35	51	chr3	77231888	77232199	-82367584	+	RLTR15	LTR	ERVK	48	353	-6	3
1174	1190	271	59	32	chr3	77233881	77234254	-82365529	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	6	3
1174	310	348	65	35	chr3	77235375	77235607	-82364176	-	MER89	LTR	ERV1	-57	502	264	3
1174	1092	300	40	9	chr3	77236733	77237079	-82362704	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	15	3
1174	873	225	51	21	chr3	77238495	77238731	-82361052	+	MTD	LTR	MaLR	177	419	0	3
1174	267	313	60	18	chr3	77239804	77239970	-82359813	-	RMER5	LTR	ERV1	-319	215	43	3
1174	475	229	0	79	chr3	77240749	77240863	-82358920	+	MT2B	LTR	ERVL	153	257	-344	3
1174	351	260	10	0	chr3	77245727	77245823	-82353960	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2126	4424	4328	3
1174	1415	81	5	5	chr3	77245841	77246040	-82353743	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	202	3
1174	1226	72	43	16	chr3	77248316	77248500	-82351283	-	MTB	LTR	MaLR	-207	189	1	3
1174	6865	91	28	71	chr3	77248500	77249648	-82350135	+	MTB-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
1174	2540	86	14	88	chr3	77249648	77249840	-82349943	+	MTB	LTR	MaLR	1	181	-219	3
1174	2540	86	14	88	chr3	77250824	77250912	-82348871	+	MTB	LTR	MaLR	182	260	-140	3
1174	2540	86	14	88	chr3	77251104	77251254	-82348529	+	MTB	LTR	MaLR	261	400	0	3
1174	356	240	28	28	chr3	77251258	77251365	-82348418	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4413	4546	4440	3
1174	445	165	101	16	chr3	77251368	77251497	-82348286	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6179	2780	2641	3
1174	376	302	100	42	chr3	77252022	77252212	-82347571	-	RMER20B	LTR	ERVK	-271	356	156	3
1174	1555	256	52	12	chr3	77256648	77257051	-82342732	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1174	299	192	50	88	chr3	77257777	77257857	-82341926	+	RLTR25A	LTR	ERVK	507	583	-520	3
1174	674	334	134	46	chr3	77258282	77258907	-82340876	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-147	4852	4173	3
1174	866	345	97	44	chr3	77259476	77260025	-82339758	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3165	1834	1257	3
1174	843	302	26	35	chr3	77260200	77260546	-82339237	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3778	1221	879	3
1174	447	410	0	0	chr3	77260630	77260874	-82338909	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4149	850	607	3
1174	374	279	64	46	chr3	77261703	77261876	-82337907	-	RMER15	LTR	ERVL	-22	553	378	3
1174	1272	219	26	103	chr3	77266830	77267207	-82332576	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	348	-560	3
1174	976	207	42	5	chr3	77273357	77273546	-82326237	+	RMER13A	LTR	ERVK	290	485	-375	3
1174	727	221	42	12	chr3	77273548	77273713	-82326070	+	RMER13A	LTR	ERVK	739	908	0	3
1174	2440	204	63	80	chr3	77274670	77275292	-82324491	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	3
1174	277	294	11	11	chr3	77278395	77278488	-82321295	+	MLT1A0	LTR	MaLR	229	364	-44	3
1174	2561	172	143	65	chr3	77290164	77290804	-82308979	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	4
1174	1764	208	122	99	chr3	77293022	77293726	-82306057	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	4
1174	367	366	45	23	chr3	77295789	77295965	-82303818	-	MT2A	LTR	ERVL	-75	458	279	4
1174	276	325	83	0	chr3	77296091	77296211	-82303572	-	MTEb	LTR	MaLR	-244	135	6	4
1174	839	263	131	27	chr3	77296393	77296711	-82303072	-	MTD	LTR	MaLR	-1	420	71	4
1174	700	301	132	47	chr3	77296972	77297036	-82302747	-	MTD	LTR	MaLR	-351	70	4	4
1174	2779	198	119	0	chr3	77298189	77298795	-82300988	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	1	4
1174	340	183	28	0	chr3	77303258	77303329	-82296454	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5654	107	35	4
1174	1463	234	114	83	chr3	77303544	77303992	-82295791	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	1	4
1174	998	150	47	21	chr3	77310255	77310446	-82289337	+	ORR1B1	LTR	MaLR	47	242	-152	4
1174	781	197	5	18	chr3	77310440	77310596	-82289187	-	MT2B	LTR	ERVL	-387	146	1	4
1174	344	189	0	39	chr3	77310634	77310711	-82289072	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	4
1174	406	212	24	0	chr3	77310711	77310796	-82288987	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-133	5628	5542	4
1174	2659	221	48	0	chr3	77310784	77311326	-82288457	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-671	5090	4523	4
1174	1199	187	71	8	chr3	77311326	77311579	-82288204	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-85	309	41	4
1174	691	356	108	61	chr3	77316800	77317460	-82282323	-	MER76	LTR	ERVL	0	691	1	4
1174	1184	324	27	65	chr3	77319329	77319805	-82279978	+	MT2A	LTR	ERVL	1	458	-75	4
1174	1895	300	99	82	chr3	77320131	77321388	-82278395	+	RMER12	LTR	ERVK	1	1278	-44	4
1174	535	256	8	0	chr3	77326268	77326375	-82273408	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	108	-266	4
1174	2235	192	36	25	chr3	77326375	77326428	-82273355	+	RMER6B	LTR	ERVK	2	51	-410	4
1174	2235	192	36	25	chr3	77326454	77326844	-82272939	+	RMER6B	LTR	ERVK	52	449	-12	4
1174	948	194	66	10	chr3	77327256	77327454	-82272329	+	ORR1C2	LTR	MaLR	176	384	0	4
1174	1540	189	120	20	chr3	77328813	77329170	-82270613	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	4
1174	1585	276	8	5	chr3	77329398	77329766	-82270017	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	1	4
1174	1664	229	25	25	chr3	77331059	77331454	-82268329	+	RLTR12A	LTR	ERVK	170	564	-4	4
146	879	242	102	17	chr3	77332276	77332570	-82267213	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6406	6724	-2235	4
1175	973	229	294	30	chr3	77335896	77336384	-82263399	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	5	548	-1778	4
1175	827	229	121	52	chr3	77336574	77336758	-82263025	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	549	739	-1587	4
1175	3060	262	86	44	chr3	77336932	77338390	-82261393	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	858	2303	-23	4
1175	1182	280	149	36	chr3	77349369	77349566	-82250217	+	RMER15	LTR	ERVL	33	257	-318	5
1175	1182	280	149	36	chr3	77350326	77350596	-82249187	+	RMER15	LTR	ERVL	258	549	-26	5
1175	3300	95	16	62	chr3	77353580	77354097	-82245686	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1175	3149	53	2	10	chr3	77355527	77355926	-82243857	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1175	6850	103	14	69	chr3	77355928	77357088	-82242695	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	3	1098	0	5
1175	2788	79	15	5	chr3	77357088	77357484	-82242299	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	400	0	5
1175	291	345	31	100	chr3	77358558	77358787	-82240996	+	MLT1D	LTR	MaLR	81	293	-212	5
1175	4429	60	2	14	chr3	77365330	77365901	-82233882	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	5
1175	270	293	37	82	chr3	77370036	77370050	-82229733	+	MT2B2	LTR	ERVL	151	158	-426	5
1175	1182	276	65	3	chr3	77384495	77384819	-82214964	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	232	5
1175	226	192	115	0	chr3	77385304	77385356	-82214427	+	RMER10A	LTR	ERVL	321	378	-64	5
1175	1828	195	38	8	chr3	77385371	77385743	-82214040	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	2	5
1175	514	276	100	87	chr3	77387410	77387640	-82212143	+	MTD	LTR	MaLR	152	384	-35	5
1175	577	236	108	57	chr3	77387796	77388114	-82211669	-	MT2A	LTR	ERVL	-61	540	1	5
1175	452	185	0	131	chr3	77393231	77393368	-82206415	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	146	5
1175	2153	78	59	23	chr3	77401296	77401650	-82198133	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	5
1175	55074	28	6	5	chr3	77401660	77408101	-82191682	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	34	6481	0	5
1175	1399	260	66	20	chr3	77410326	77410596	-82189187	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	126	5
1175	1399	260	66	20	chr3	77410745	77410866	-82188917	-	MTD	LTR	MaLR	-294	125	3	5
1175	314	206	13	52	chr3	77416161	77416238	-82183545	+	MT2A	LTR	ERVL	5	78	-523	6
1175	476	277	43	129	chr3	77416225	77416408	-82183375	+	MT2A	LTR	ERVL	322	491	-42	6
1175	476	277	43	129	chr3	77416442	77416490	-82183293	+	MT2A	LTR	ERVL	492	533	0	6
1175	302	350	10	20	chr3	77416698	77416800	-82182983	+	MT2A	LTR	ERVL	279	379	-154	6
1175	495	30	15	0	chr3	77434783	77434850	-82164933	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	290	6
1175	1511	110	175	11	chr3	77435160	77435441	-82164342	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-57	300	1	6
1175	329	239	0	0	chr3	77449652	77449723	-82150060	+	MTC-int	LTR	MaLR	373	443	-815	6
1175	2296	233	151	19	chr3	77450085	77450806	-82148977	+	MTC-int	LTR	MaLR	443	1258	0	6
1175	1740	234	42	17	chr3	77450806	77451166	-82148617	+	MTC	LTR	MaLR	1	369	-52	6
1175	258	317	18	90	chr3	77459256	77459367	-82140416	+	MT2B	LTR	ERVL	155	257	-344	6
1175	1291	254	35	106	chr3	77460548	77460945	-82138838	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	374	0	6
1175	267	369	66	44	chr3	77462824	77463051	-82136732	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-60	305	74	6
1176	1853	197	64	52	chr3	77465014	77465453	-82134330	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	444	-2	6
1176	285	368	73	7	chr3	77477983	77478120	-82121663	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-219	146	1	6
1176	294	70	0	23	chr3	77479993	77480037	-82119746	-	MTB	LTR	MaLR	-149	251	209	6
1176	1025	119	0	0	chr3	77480022	77480165	-82119618	+	ORR1A2	LTR	MaLR	258	400	0	6
1176	6109	132	39	11	chr3	77480164	77481453	-82118330	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	2	1963	0	6
1176	2248	75	72	0	chr3	77481453	77481758	-82118025	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1176	2042	112	0	62	chr3	77492999	77493323	-82106460	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	24	6
1176	1045	313	43	34	chr3	77497194	77497591	-82102192	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	421	12	7
1176	803	345	40	17	chr3	77498546	77498897	-82100886	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	7
1176	1173	206	152	111	chr3	77499513	77500000	-82099783	+	RMER6C	LTR	ERVK	9	515	-175	7
1176	976	183	0	0	chr3	77500000	77500175	-82099608	+	RMER6C	LTR	ERVK	516	690	0	1
1176	718	130	0	9	chr3	77516615	77516724	-82083059	+	ORR1A4	LTR	MaLR	222	329	0	1
1176	925	225	134	35	chr3	77516724	77516994	-82082789	+	MTEb	LTR	MaLR	69	367	-12	1
1176	245	119	0	67	chr3	77517688	77517733	-82082050	+	MTEb	LTR	MaLR	333	374	-5	1
1176	668	313	71	83	chr3	77522860	77523268	-82076515	-	MT2A	LTR	ERVL	-120	413	11	3
1176	2751	199	70	54	chr3	77526355	77527041	-82072742	-	RLTR40	LTR	ERVK	-120	697	1	4
1176	687	237	106	11	chr3	77539285	77539464	-82060319	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	224	6
1176	335	241	0	79	chr3	77539518	77539644	-82060139	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	998	1113	-735	6
1176	899	347	29	23	chr3	77544948	77545299	-82054484	+	MTE2a	LTR	MaLR	27	379	0	6
1176	1219	297	33	12	chr3	77548922	77549259	-82050524	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	68	7
1176	2790	204	112	75	chr3	77552225	77552607	-82047176	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	366	-536	7
1176	2790	204	112	75	chr3	77552639	77552977	-82046806	+	RMER19B	LTR	ERVK	367	747	-155	7
1176	318	49	0	0	chr3	77552982	77553023	-82046760	-	RMER17C	LTR	ERVK	-369	41	1	8
1176	989	206	40	27	chr3	77553061	77553525	-82046258	-	RMER17C	LTR	ERVK	-33	377	1	8
1176	2050	176	48	5	chr3	77556576	77556954	-82042829	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	8
1176	414	53	35	0	chr3	77557414	77557471	-82042312	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	349	8
1176	5551	169	96	20	chr3	77557454	77558531	-82041252	+	MTB-int	LTR	MaLR	10	1163	-95	8
1176	2989	78	2	2	chr3	77558531	77558927	-82040856	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
1176	5551	169	96	20	chr3	77558927	77559008	-82040775	+	MTB-int	LTR	MaLR	1164	1255	-3	8
1176	2891	93	2	10	chr3	77559009	77559034	-82040749	+	MTB	LTR	MaLR	1	22	-378	8
1176	2891	93	2	10	chr3	77559071	77559448	-82040335	+	MTB	LTR	MaLR	23	400	0	8
1176	740	180	0	0	chr3	77559525	77559647	-82040136	+	RLTR26	LTR	ERVK	521	642	0	9
1176	2049	178	239	12	chr3	77560604	77561094	-82038689	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	9
1176	1430	262	69	40	chr3	77561995	77562499	-82037284	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	16	9
1176	1038	204	34	98	chr3	77562904	77563242	-82036541	+	MER67C	LTR	ERV1	40	385	-326	9
1176	1238	251	76	47	chr3	77570939	77571348	-82028435	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	9
1176	543	323	78	81	chr3	77572917	77573200	-82026583	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	73	1
1176	255	154	0	0	chr3	77580102	77580141	-82019642	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	39	-681	1
1176	1341	164	83	25	chr3	77580213	77580538	-82019245	+	RMER6C	LTR	ERVK	347	690	0	1
1176	836	139	52	0	chr3	77586107	77586280	-82013503	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1116	1297	-1029	1
1176	1171	292	83	19	chr3	77587741	77588213	-82011570	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	33	1
1176	466	257	21	42	chr3	77591365	77591507	-82008276	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	142	-228	1
1176	2764	151	147	0	chr3	77591520	77592030	-82007753	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	1	1
1176	456	243	8	17	chr3	77592170	77592308	-82007475	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	379	245	1
18	1150	272	146	7	chr3	77594542	77594994	-82004789	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	21	535	-42	1
1177	1307	226	107	0	chr3	77596256	77596601	-82003182	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	1
1177	440	283	180	6	chr3	77613239	77613406	-81986377	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-484	196	1	1
1177	586	324	83	44	chr3	77631580	77631942	-81967841	+	MTEb	LTR	MaLR	2	377	-2	1
1177	398	290	165	21	chr3	77632041	77632251	-81967532	+	MLT1D	LTR	MaLR	256	622	-2	1
1177	2038	216	55	9	chr3	77652163	77652621	-81947162	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	9	487	-90	1
1177	452	204	10	31	chr3	77652744	77652840	-81946943	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	484	577	0	1
1177	6618	175	42	43	chr3	77654113	77654582	-81945201	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	459	-1867	2
1177	6618	175	42	43	chr3	77654925	77655843	-81943940	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	460	1387	-939	2
1177	1924	181	87	5	chr3	77662002	77662391	-81937392	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1177	747	194	28	83	chr3	77668872	77669052	-81930731	-	MTD	LTR	MaLR	-55	364	195	2
1177	331	329	20	60	chr3	77674076	77674225	-81925558	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-40	988	846	2
1177	436	216	62	0	chr3	77674230	77674327	-81925456	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-306	722	620	2
1177	1621	210	52	37	chr3	77674300	77674765	-81925018	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-996	967	496	2
1177	2068	217	75	67	chr3	77674681	77675200	-81924583	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-580	523	1	2
1177	281	297	58	19	chr3	77678236	77678339	-81921444	+	MLT1A0	LTR	MaLR	259	365	0	2
1177	1211	287	80	8	chr3	77681156	77681542	-81918241	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	1	2
1177	797	332	68	7	chr3	77681829	77682238	-81917545	+	RMER15-int	LTR	ERVL	783	1216	-3783	2
1177	645	304	59	47	chr3	77682346	77682750	-81917033	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1359	1767	-3232	2
1177	1332	314	99	23	chr3	77683254	77683811	-81915972	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4136	4734	-265	2
1177	267	311	95	15	chr3	77690673	77690810	-81908973	+	RMER15	LTR	ERVL	378	525	-50	2
1177	1519	247	55	5	chr3	77711452	77711851	-81887932	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	2
1177	358	354	95	6	chr3	77718168	77718347	-81881436	-	MTE2b	LTR	MaLR	-182	197	3	2
1177	241	321	226	14	chr3	77718349	77718570	-81881213	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-2	1578	1311	2
1177	335	369	65	26	chr3	77723955	77724342	-81875441	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	2638	3039	-2628	2
1177	262	242	45	0	chr3	77724524	77724590	-81875193	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3224	3292	-2375	2
1178	409	345	19	39	chr3	77737187	77737341	-81862442	-	ORR1E	LTR	MaLR	-208	151	1	2
1178	656	362	82	11	chr3	77737341	77737677	-81862106	-	MTE-int	LTR	MaLR	-53	1527	1167	2
1178	465	312	64	10	chr3	77737806	77738010	-81861773	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1362	218	4	2
1178	3990	158	19	65	chr3	77741472	77742409	-81857374	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	902	7	3
1178	767	306	178	7	chr3	77742713	77743022	-81856761	+	ORR1D2	LTR	MaLR	9	370	0	3
1178	317	359	65	81	chr3	77751044	77751441	-81848342	-	MT2A	LTR	ERVL	-141	392	2	3
1178	3435	20	2	0	chr3	77755536	77755929	-81843854	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	3	3
1178	9009	37	4	4	chr3	77755931	77757029	-81842754	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
1178	3467	18	2	0	chr3	77757029	77757424	-81842359	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1178	2423	113	16	8	chr3	77759737	77760119	-81839664	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-18	385	1	3
1178	1611	341	79	40	chr3	77763256	77764911	-81834872	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2361	4122	-1635	3
1178	576	275	155	62	chr3	77769136	77769477	-81830306	+	MTEa	LTR	MaLR	3	375	-4	3
1178	3487	28	0	0	chr3	77771510	77771906	-81827877	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1178	8991	42	2	1	chr3	77771906	77773001	-81826782	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1096	-2	3
1178	3478	23	0	0	chr3	77773003	77773399	-81826384	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1178	9082	35	2	4	chr3	77773399	77774497	-81825286	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1096	-2	3
1178	3501	25	0	0	chr3	77774499	77774895	-81824888	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1178	530	343	18	44	chr3	77776344	77776731	-81823052	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	3	3
1178	1885	321	112	32	chr3	77776767	77777854	-81821929	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-16	1564	329	3
1178	6269	68	19	1	chr3	77779641	77780435	-81819348	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	3
1178	1416	248	61	6	chr3	77791558	77791903	-81807880	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	364	-10	3
1178	2356	203	24	20	chr3	77804587	77805085	-81794698	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	6	3
1178	2862	208	23	45	chr3	77807033	77807388	-81792395	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	348	-342	3
1178	2862	208	23	45	chr3	77807530	77807880	-81791903	+	RMER6C	LTR	ERVK	349	690	0	3
1178	898	289	93	66	chr3	77809714	77810080	-81789703	+	MTEa	LTR	MaLR	3	378	-1	3
1178	387	276	0	11	chr3	77813112	77813200	-81786583	-	MTD	LTR	MaLR	-116	303	217	3
1178	638	200	17	0	chr3	77815862	77815982	-81783801	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	122	-252	3
1178	974	231	29	29	chr3	77816233	77816474	-81783309	+	ORR1D1	LTR	MaLR	126	366	-8	3
1178	2795	52	0	6	chr3	77818052	77818400	-81781383	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
1178	4474	159	31	95	chr3	77820632	77821568	-81778215	-	RMER19B	LTR	ERVK	-26	876	1	3
1178	560	227	68	0	chr3	77821871	77822003	-81777780	-	MTC	LTR	MaLR	-12	407	267	3
1178	777	247	0	18	chr3	77822018	77822187	-81777596	-	MTC	LTR	MaLR	-226	195	30	3
1178	236	307	53	0	chr3	77839583	77839658	-81760125	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1501	79	1	4
1178	2047	221	67	21	chr3	77840332	77840408	-81759375	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-23	505	433	4
1178	2047	221	67	21	chr3	77840831	77841235	-81758548	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-96	432	3	4
1178	2521	223	59	20	chr3	77844528	77845192	-81754591	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	4
1178	1665	155	49	10	chr3	77846017	77846323	-81753460	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	4
1179	2322	66	119	11	chr3	77857028	77857380	-81742403	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	4
1179	1364	246	64	12	chr3	77859749	77860095	-81739688	+	ORR1D1	LTR	MaLR	11	374	0	4
1179	642	414	58	74	chr3	77861148	77861863	-81737920	+	MLT-int	LTR	MaLR	651	1367	-368	4
1179	642	414	58	74	chr3	77862010	77862089	-81737694	+	MLT-int	LTR	MaLR	1368	1432	-303	4
1179	445	320	45	37	chr3	77862338	77862581	-81737202	+	MLT-int	LTR	MaLR	1442	1686	-49	4
1179	556	302	84	116	chr3	77865784	77866155	-81733628	-	MTEa	LTR	MaLR	-14	365	7	4
1179	1385	216	52	145	chr3	77866518	77866994	-81732789	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	432	-14	4
1179	1523	258	75	13	chr3	77878789	77879174	-81720609	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	8	4
1179	379	240	95	9	chr3	77879476	77879581	-81720202	+	MTEb	LTR	MaLR	266	379	0	4
1179	511	309	66	53	chr3	77904564	77904882	-81694901	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	202	5
1179	1937	132	9	66	chr3	77915973	77916322	-81683461	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	5
1179	2985	68	2	37	chr3	77922839	77923249	-81676534	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1179	8152	65	26	2	chr3	77923249	77924321	-81675462	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
1179	3434	35	0	0	chr3	77924321	77924717	-81675066	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1179	330	291	68	29	chr3	77931110	77931282	-81668501	-	RMER21B	LTR	ERV1	-383	564	266	5
1179	3641	182	17	15	chr3	77936464	77937179	-81662604	+	RMER6D	LTR	ERVK	5	720	0	5
1179	2602	186	16	2	chr3	77937414	77937899	-81661884	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	492	-13	5
1179	1802	137	6	47	chr3	77940158	77940479	-81659304	-	RLTR28	LTR	ERVL	-216	308	1	5
1179	1202	213	13	0	chr3	77940513	77940743	-81659040	+	RMER15	LTR	ERVL	343	575	0	5
1179	1958	156	9	0	chr3	77940852	77941178	-81658605	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1179	1071	237	0	0	chr3	77950435	77950642	-81649141	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-4137	2782	2576	5
1179	3101	242	46	1	chr3	77950760	77951452	-81648331	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-4972	1947	1225	5
1179	1327	274	57	10	chr3	77966311	77966694	-81633089	+	MTD	LTR	MaLR	18	418	-1	5
1179	289	393	18	6	chr3	77973128	77973292	-81626491	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-98	1391	1226	6
1179	2545	170	11	17	chr3	77977573	77978035	-81621748	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	1	6
1179	3927	148	32	1	chr3	77978659	77979317	-81620466	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	6
1179	1434	198	126	31	chr3	77981900	77982250	-81617533	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	384	0	6
1179	390	335	38	12	chr3	77985004	77985164	-81614619	+	MTD	LTR	MaLR	3	166	-253	6
1180	2024	139	26	3	chr3	77999651	77999997	-81599786	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	4854	5207	-601	6
1180	1004	118	12	24	chr3	78000000	78000165	-81599618	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5909	6071	-1173	1
1180	1656	126	12	0	chr3	78000179	78000425	-81599358	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	5529	5777	-31	2
1180	4963	94	109	20	chr3	78000443	78001268	-81598515	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	875	-27	2
1180	258	314	35	42	chr3	78001666	78001809	-81597974	+	MLT1D	LTR	MaLR	61	202	-303	5
1180	412	272	69	29	chr3	78001868	78002042	-81597741	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	354	6
1180	1999	212	65	42	chr3	78015760	78016281	-81583502	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-44	533	1	2
1180	2370	226	10	12	chr3	78016288	78016772	-81583011	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-27	485	3	2
1180	1031	307	16	50	chr3	78018220	78018601	-81581182	-	MTEb	LTR	MaLR	-11	368	1	2
1180	1165	316	75	1	chr3	78029776	78029966	-81569817	-	RLTR40	LTR	ERVK	-243	574	307	4
1180	1165	238	25	16	chr3	78030085	78030386	-81569397	-	RLTR40	LTR	ERVK	-511	306	5	4
1180	377	294	20	105	chr3	78034758	78034910	-81564873	+	MLT1D	LTR	MaLR	334	472	-33	5
1180	254	286	28	101	chr3	78036615	78036724	-81563059	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-305	103	3	5
1180	1876	93	30	4	chr3	78042005	78042274	-81557509	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-51	276	1	6
1180	846	94	8	0	chr3	78043691	78043819	-81555964	+	ORR1A4	LTR	MaLR	198	326	-3	6
1180	2612	100	260	15	chr3	78045214	78045683	-81554100	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	7
1180	5225	189	54	75	chr3	78058314	78059863	-81539920	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1963	8	8
1180	686	220	227	9	chr3	78059930	78059988	-81539795	-	MT2B	LTR	ERVL	-331	270	200	8
1180	686	220	227	9	chr3	78060050	78060211	-81539572	-	MT2B	LTR	ERVL	-402	199	4	8
1180	2652	167	80	12	chr3	78061905	78062420	-81537363	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	4	553	0	8
1180	2090	112	15	58	chr3	78062660	78063002	-81536781	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	9
1180	1414	206	128	25	chr3	78065335	78065694	-81534089	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	401	-557	9
1180	1414	247	80	50	chr3	78065719	78065835	-81533948	+	RMER17B	LTR	ERVK	361	481	-328	9
1180	428	272	34	108	chr3	78066235	78066246	-81533537	+	RMER13B	LTR	ERVK	395	405	-503	9
1180	428	277	43	111	chr3	78066316	78066709	-81533074	+	RMER13B	LTR	ERVK	406	894	-14	9
1180	1470	180	17	24	chr3	78068698	78069026	-81530757	+	ORR1B2	LTR	MaLR	4	367	0	1
1180	405	314	207	46	chr3	78070982	78071308	-81528475	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	1	1
1180	1025	317	69	14	chr3	78071308	78071647	-81528136	-	MTE-int	LTR	MaLR	-53	1527	1170	1
1180	1378	233	88	36	chr3	78085724	78085844	-81513939	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	128	-256	1
1180	3514	13	2	0	chr3	78085844	78086239	-81513544	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1180	9630	16	0	1	chr3	78086239	78087338	-81512445	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1180	3514	13	2	0	chr3	78087338	78087733	-81512050	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1180	1378	233	88	36	chr3	78087733	78087975	-81511808	+	ORR1C2	LTR	MaLR	129	382	-2	1
1180	627	311	96	73	chr3	78089765	78090119	-81509664	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	18	1
1180	252	328	123	29	chr3	78090719	78090857	-81508926	-	MLT1K	LTR	MaLR	-176	419	269	1
1180	650	236	16	12	chr3	78094384	78094557	-81505226	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	212	1
1180	499	312	139	61	chr3	78094736	78095095	-81504688	+	MLT2D	LTR	ERVL	7	410	-4	1
1180	2527	141	60	48	chr3	78097753	78098186	-81501597	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	98	1
1180	2527	141	60	48	chr3	78098320	78098406	-81501377	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-430	97	2	1
1180	748	233	133	10	chr3	78099504	78099699	-81500084	-	MT2A	LTR	ERVL	-153	448	103	1
1180	334	295	35	2	chr3	78102523	78102647	-81497136	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-51	509	414	1
1180	3601	72	4	15	chr3	78106143	78106623	-81493160	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1180	845	296	42	57	chr3	78107932	78108265	-81491518	+	MTE2a	LTR	MaLR	52	379	0	1
1180	1305	248	149	11	chr3	78108809	78109164	-81490619	+	MTD	LTR	MaLR	2	405	-14	1
1180	2091	137	58	30	chr3	78111354	78111752	-81488031	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	1
1180	664	24	48	0	chr3	78111872	78111956	-81487827	-	RLTR10B	LTR	ERVK	-203	89	2	1
1180	332	24	0	0	chr3	78111961	78112003	-81487780	-	RLTR10B	LTR	ERVK	-250	42	1	1
147	3100	186	33	77	chr3	78118399	78119071	-81480712	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	1
1181	303	357	20	105	chr3	78119438	78119732	-81480051	+	MLT1B	LTR	MaLR	51	324	-66	1
1181	1633	211	8	3	chr3	78129831	78130188	-81469595	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	2
1181	1998	115	258	33	chr3	78152024	78152473	-81447310	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-68	586	37	2
1181	259	228	200	38	chr3	78152475	78152580	-81447203	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-532	122	1	2
1181	490	75	0	0	chr3	78152580	78152647	-81447136	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	7712	2
1181	3370	34	0	0	chr3	78152631	78153040	-81446743	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-619	7159	6751	2
1181	328	236	79	0	chr3	78154328	78154417	-81445366	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-22	386	291	2
1181	1747	210	90	13	chr3	78157791	78158228	-81441555	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	2
1181	511	280	113	118	chr3	78159110	78159613	-81440170	+	RMER20B	LTR	ERVK	30	579	-48	2
1181	298	271	71	0	chr3	78165029	78165114	-81434669	-	LTR78	LTR	ERV1	-1010	294	204	2
1181	591	308	43	35	chr3	78170436	78170668	-81429115	-	MER67C	LTR	ERV1	-101	610	377	2
1181	4282	28	0	27	chr3	78179043	78179474	-81420309	+	MT-int	LTR	MaLR	490	920	-178	2
1181	4282	28	0	27	chr3	78180083	78180198	-81419585	+	MT-int	LTR	MaLR	921	1021	-77	2
1181	1267	248	132	21	chr3	78184187	78184487	-81415296	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	187	2
1181	1267	248	132	21	chr3	78184541	78184664	-81415119	-	MT2A	LTR	ERVL	-347	186	64	2
1181	599	284	44	30	chr3	78184544	78184747	-81415036	-	MTD	LTR	MaLR	-203	216	11	2
1181	3207	52	3	0	chr3	78185781	78186165	-81413618	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	2
1181	370	91	14	96	chr3	78189660	78189691	-81410092	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-493	67	42	2
1181	4085	27	23	0	chr3	78189691	78190173	-81409610	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1181	370	91	14	96	chr3	78190173	78190214	-81409569	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-519	41	1	2
1181	842	248	135	108	chr3	78190616	78191135	-81408648	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	2
1181	347	125	0	0	chr3	78191135	78191191	-81408592	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-29	5732	5677	2
1181	878	311	94	51	chr3	78192453	78192982	-81406801	+	MLT1E2	LTR	MaLR	76	627	0	2
1181	1088	231	43	12	chr3	78194344	78194598	-81405185	-	MTD	LTR	MaLR	-157	262	1	2
1181	3338	129	4	2	chr3	78195892	78196390	-81403393	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	499	0	2
1181	867	286	80	38	chr3	78218979	78219292	-81380491	-	RMER15	LTR	ERVL	-156	419	94	3
1181	297	358	61	103	chr3	78223081	78223210	-81376573	+	ORR1E	LTR	MaLR	51	171	-188	3
1181	297	358	61	103	chr3	78223352	78223369	-81376414	+	ORR1E	LTR	MaLR	172	180	-179	3
1181	297	358	61	103	chr3	78223516	78223679	-81376104	+	ORR1E	LTR	MaLR	181	348	-11	3
1181	1567	218	11	89	chr3	78224678	78225060	-81374723	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	392	-2	3
1181	258	208	0	40	chr3	78229432	78229482	-81370301	+	ORR1A4	LTR	MaLR	274	321	-8	3
1181	1421	235	35	99	chr3	78234598	78234835	-81364948	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	207	3
1181	1421	235	35	99	chr3	78235017	78235181	-81364602	-	MTD	LTR	MaLR	-213	206	44	3
1181	358	348	50	11	chr3	78238761	78238941	-81360842	+	MLT1A0	LTR	MaLR	176	362	-3	3
1181	2642	56	0	0	chr3	78241030	78241368	-81358415	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	1	3
1181	13488	64	7	3	chr3	78241368	78243154	-81356629	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	0	1792	1	3
1181	2905	43	0	0	chr3	78243154	78243500	-81356283	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	3
1181	1726	208	5	98	chr3	78243757	78244174	-81355609	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	3
1182	242	331	148	31	chr3	78253986	78254148	-81345635	+	MLT1A	LTR	MaLR	140	320	-54	3
1182	266	243	39	139	chr3	78264434	78264563	-81335220	+	LTR81A	LTR	ERV1?	48	163	-1187	3
1182	1056	227	66	71	chr3	78265523	78265924	-81333859	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	3
1182	1600	220	69	14	chr3	78266234	78266584	-81333199	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	1	3
1182	2969	29	6	0	chr3	78266632	78266976	-81332807	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1182	881	186	12	0	chr3	78269081	78269242	-81330541	-	RMER15	LTR	ERVL	-412	163	1	3
1182	385	269	80	33	chr3	78275994	78276144	-81323639	+	MLT1J1	LTR	MaLR	149	305	-139	3
1182	1261	285	24	3	chr3	78278956	78279287	-81320496	+	MTEb	LTR	MaLR	1	338	-41	3
1182	1082	213	169	36	chr3	78281107	78281414	-81318369	+	ORR1C2	LTR	MaLR	37	384	0	3
1182	264	156	14	72	chr3	78283691	78283760	-81316023	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	346	3
1182	365	259	0	24	chr3	78285064	78285147	-81314636	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	81	-535	3
1182	3264	53	0	2	chr3	78287858	78288255	-81311528	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1182	1002	202	331	6	chr3	78290288	78290627	-81309156	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-1207	4053	3604	4
1182	1117	273	143	20	chr3	78309234	78309673	-81290110	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	493	-12	4
1182	321	305	242	18	chr3	78314414	78314691	-81285092	+	LTR50	LTR	ERVL	335	673	-122	4
1182	1580	173	22	141	chr3	78318968	78319345	-81280438	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	334	-64	4
1182	1580	173	22	141	chr3	78319432	78319458	-81280325	+	RMER10B	LTR	ERVL	335	356	-42	4
1182	877	230	143	42	chr3	78324526	78324862	-81274921	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	4
1182	323	367	86	13	chr3	78335537	78335689	-81264094	-	MLT1A	LTR	MaLR	-44	330	168	4
1182	1008	250	101	41	chr3	78341717	78342034	-81257749	+	MTEb	LTR	MaLR	1	336	-43	4
1182	1815	112	31	22	chr3	78356232	78356551	-81243232	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	4
1182	17599	146	26	18	chr3	78356551	78363385	-81236398	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-172	7234	1	4
1182	1818	112	31	22	chr3	78363385	78363704	-81236079	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	4
1182	2632	61	11	45	chr3	78367217	78367575	-81232208	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
1182	11416	66	122	4	chr3	78367575	78369179	-81230604	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	0	1792	1	4
1182	5141	121	58	26	chr3	78376835	78377711	-81222072	+	RMER17A2	LTR	ERVK	3	906	0	4
1182	1778	169	12	58	chr3	78377867	78378212	-81221571	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
1183	2841	62	8	5	chr3	78383556	78383930	-81215853	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-21	375	1	4
1183	232	302	66	49	chr3	78389541	78389663	-81210120	-	MLT1A	LTR	MaLR	-18	356	233	5
1183	289	331	7	14	chr3	78392786	78392924	-81206859	-	MER34	LTR	ERV1	-56	486	350	5
1183	225	245	108	39	chr3	78393217	78393319	-81206464	-	MER34	LTR	ERV1	-390	152	44	5
1183	529	284	97	11	chr3	78419232	78419417	-81180366	+	MER57C2	LTR	ERV1	13	213	-221	5
1183	329	287	55	132	chr3	78419828	78420000	-81179783	-	ORR1E	LTR	MaLR	-42	317	161	5
1183	2770	121	26	0	chr3	78420000	78420430	-81179353	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	1	5
1183	329	287	55	132	chr3	78420430	78420514	-81179269	-	ORR1E	LTR	MaLR	-199	160	82	5
1183	335	320	0	10	chr3	78425743	78425847	-81173936	+	MLT1A1	LTR	MaLR	306	408	0	5
1183	284	297	89	52	chr3	78425847	78425974	-81173809	+	MER68	LTR	ERVL	37	168	-395	5
1183	1196	288	72	14	chr3	78431247	78431592	-81168191	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	1	5
1183	911	248	63	82	chr3	78432835	78433138	-81166645	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	83	5
1183	3441	94	37	0	chr3	78440947	78441436	-81158347	-	LTRIS4	LTR	ERV1	0	507	1	5
1183	4556	150	39	71	chr3	78441874	78442806	-81156977	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	5
1183	2997	74	5	8	chr3	78445252	78445649	-81154134	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1183	466	333	117	18	chr3	78451402	78451625	-81148158	+	ORR1E	LTR	MaLR	115	359	0	5
1183	292	304	96	90	chr3	78452814	78453136	-81146647	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	324	-35	5
1183	496	224	9	9	chr3	78461599	78461707	-81138076	+	MLT1E2	LTR	MaLR	9	116	-511	6
1183	289	331	97	0	chr3	78466354	78466478	-81133305	+	MLT1E2	LTR	MaLR	110	245	-382	6
1183	227	300	116	18	chr3	78467035	78467147	-81132636	+	MLT1E2	LTR	MaLR	501	623	-1	6
1183	262	350	25	41	chr3	78467998	78468120	-81131663	+	MTEb	LTR	MaLR	23	142	-242	6
1183	265	260	147	37	chr3	78469061	78469197	-81130586	+	MTEb	LTR	MaLR	226	376	-3	6
1183	233	263	28	66	chr3	78469492	78469598	-81130185	+	RMER15	LTR	ERVL	406	507	-68	6
1183	837	280	38	0	chr3	78469597	78469783	-81130000	+	ORR1D2	LTR	MaLR	10	202	-168	6
1183	264	264	20	121	chr3	78470390	78470489	-81129294	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-9	618	530	6
1183	226	356	80	55	chr3	78471328	78471527	-81128256	-	MLT1D	LTR	MaLR	-301	204	1	6
1183	640	110	5	0	chr3	78477088	78477194	-81122589	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-219	110	1	6
1183	910	260	53	161	chr3	78484322	78484739	-81115044	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	8	6
1183	2125	144	26	101	chr3	78484958	78485375	-81114408	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	6
1183	339	374	63	17	chr3	78487855	78488029	-81111754	-	LTR16A	LTR	ERVL	-1	450	269	6
1183	387	385	31	6	chr3	78488044	78488206	-81111577	-	LTR16A	LTR	ERVL	-239	212	47	6
1183	509	321	162	61	chr3	78488234	78488579	-81111204	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	380	-10	6
1183	2316	189	11	36	chr3	78491831	78492280	-81107503	+	RMER5	LTR	ERV1	97	534	0	6
1183	306	242	200	0	chr3	78492994	78493089	-81106694	+	MLT2B3	LTR	ERVL	3	116	-438	6
1183	616	325	98	59	chr3	78494118	78494505	-81105278	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	1	6
1183	1468	207	37	10	chr3	78498050	78498348	-81101435	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	270	6
1183	893	126	0	0	chr3	78499110	78499245	-81100538	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	135	-673	6
1183	2298	114	16	45	chr3	78499219	78499597	-81100186	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	442	808	0	6
1183	449	136	0	0	chr3	78500582	78500648	-81099135	-	RMER15	LTR	ERVL	-287	288	223	4
1183	387	279	9	26	chr3	78500645	78500759	-81099024	-	MT2A	LTR	ERVL	-337	196	85	5
1183	406	221	148	8	chr3	78501019	78501147	-81098636	-	MT2A	LTR	ERVL	-387	146	1	8
1183	2448	166	12	19	chr3	78504294	78504718	-81095065	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1183	580	347	41	48	chr3	78510109	78510400	-81089383	-	MER21B	LTR	ERV1	-558	305	17	2
147	490	290	163	25	chr3	78511892	78512168	-81087615	+	LTR48B	LTR	ERV1	143	456	-188	2
1184	306	304	167	82	chr3	78512338	78512623	-81087160	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	49	2
1184	1371	184	78	101	chr3	78512623	78512805	-81086978	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	168	-210	2
1184	1371	184	78	101	chr3	78512871	78513075	-81086708	+	ORR1C1	LTR	MaLR	169	378	0	2
1184	306	304	167	82	chr3	78513075	78513119	-81086664	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-322	48	6	2
1184	1544	160	155	7	chr3	78535091	78535381	-81064402	+	ORR1B1	LTR	MaLR	62	394	0	5
1184	2059	138	22	0	chr3	78536308	78536628	-81063155	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1184	401	314	84	42	chr3	78540167	78540333	-81059450	+	MLT1F1	LTR	MaLR	193	365	-204	6
1184	325	319	42	35	chr3	78542078	78542221	-81057562	+	MLT1F1	LTR	MaLR	406	549	0	6
1184	664	275	98	26	chr3	78542250	78542444	-81057339	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	208	-171	7
1184	2122	113	30	21	chr3	78545302	78545636	-81054147	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	7
1184	12724	39	93	17	chr3	78545636	78548487	-81051296	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	3076	-3405	7
1184	6266	60	13	11	chr3	78548473	78549321	-81050462	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5630	6479	-2	7
1184	2122	113	30	21	chr3	78549323	78549657	-81050126	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	7
1184	2045	147	66	28	chr3	78557916	78558280	-81041503	+	ORR1C2	LTR	MaLR	5	382	-2	8
1184	445	208	10	10	chr3	78558567	78558664	-81041119	+	RMER13B	LTR	ERVK	812	908	0	8
1184	1720	222	31	0	chr3	78558803	78559154	-81040629	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	5	8
1184	439	278	193	69	chr3	78569795	78570317	-81029466	-	MER67C	LTR	ERV1	-4	510	4	1
1184	360	334	38	35	chr3	78570560	78570762	-81029021	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	177	1
1184	1689	226	86	43	chr3	78570798	78571195	-81028588	+	MTD	LTR	MaLR	4	417	-2	1
1184	317	316	80	14	chr3	78571195	78571326	-81028457	-	MLT1B	LTR	MaLR	-200	174	35	1
1184	1178	133	83	28	chr3	78571782	78571998	-81027785	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	228	-233	1
1184	262	302	61	69	chr3	78572115	78572346	-81027437	+	RMER17C	LTR	ERVK	150	378	-32	1
1184	1048	166	0	72	chr3	78572350	78572571	-81027212	+	RMER6B	LTR	ERVK	257	461	0	1
1184	551	327	36	49	chr3	78582886	78583111	-81016672	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1101	1
1184	4636	116	16	88	chr3	78584563	78585430	-81014353	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1043	805	1	1
1184	348	355	80	83	chr3	78590221	78590571	-81009212	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	359	0	1
1184	860	278	187	7	chr3	78591562	78591968	-81007815	-	MER31A	LTR	ERV1	-1	484	6	1
1184	230	330	172	21	chr3	78594794	78594986	-81004797	-	MLT1K	LTR	MaLR	-218	377	157	1
1184	903	221	14	104	chr3	78597279	78597491	-81002292	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	181	1
1184	903	294	56	1752	chr3	78597524	78597598	-81002185	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-194	180	49	1
1184	1071	177	16	0	chr3	78597743	78597929	-81001854	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-185	189	1	1
1184	386	311	128	26	chr3	78598731	78598957	-81000826	-	LTR73	LTR	ERV1	-293	279	30	1
1184	285	312	21	0	chr3	78599406	78599502	-81000281	-	MER34A	LTR	ERV1	-65	477	380	1
1184	2507	149	153	44	chr3	78599921	78600387	-80999396	-	RMER19C	LTR	ERVK	-2	609	142	1
1184	2932	79	15	2	chr3	78600387	78600782	-80999001	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
1184	2507	149	153	44	chr3	78600849	78600921	-80998862	-	RMER19C	LTR	ERVK	-513	98	2	1
1184	286	325	50	17	chr3	78601304	78601423	-80998360	-	MER34A	LTR	ERV1	-329	242	120	1
1184	1186	217	203	14	chr3	78603690	78604040	-80995743	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	2	1
1184	2948	77	39	2	chr3	78606004	78606410	-80993373	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	1
1184	276	281	10	136	chr3	78610493	78610594	-80989189	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	93	-272	1
1184	1452	251	57	15	chr3	78610594	78610983	-80988800	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	15	1
1184	323	268	41	0	chr3	78611094	78611191	-80988592	+	MLT1A0	LTR	MaLR	265	365	0	1
1184	351	323	128	15	chr3	78611518	78611713	-80988070	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	217	-142	1
1184	3372	43	8	8	chr3	78614080	78614476	-80985307	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1184	546	231	20	33	chr3	78634529	78634681	-80965102	+	RMER5	LTR	ERV1	369	518	-16	1
1185	975	239	96	8	chr3	78644479	78644719	-80955064	-	ORR1E	LTR	MaLR	-96	263	3	2
1185	385	149	149	0	chr3	78650824	78650898	-80948885	+	MT2A	LTR	ERVL	4	88	-445	2
1185	941	238	14	24	chr3	78651889	78652100	-80947683	+	MT2A	LTR	ERVL	257	465	-68	2
1185	1851	231	57	93	chr3	78665605	78666129	-80933654	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-7	505	1	2
1185	257	343	65	18	chr3	78666930	78667099	-80932684	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4248	4424	-1337	2
1185	836	280	51	8	chr3	78673140	78673374	-80926409	+	MTD	LTR	MaLR	29	272	-147	2
1185	230	231	103	0	chr3	78676294	78676372	-80923411	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	285	2
1185	1106	262	79	40	chr3	78677840	78678097	-80921686	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	269	-101	2
1185	1691	169	11	199	chr3	78678097	78678570	-80921213	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	2
1185	1106	262	79	40	chr3	78678570	78678666	-80921117	+	ORR1D2	LTR	MaLR	270	368	-2	2
1185	651	118	0	10	chr3	78680341	78680444	-80919339	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	208	2
1185	3415	20	13	0	chr3	78682972	78683363	-80916420	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1185	238	306	35	0	chr3	78686925	78687010	-80912773	+	MLT1I	LTR	MaLR	90	177	-234	2
1185	491	300	88	1	chr3	78691899	78692071	-80907712	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	194	-190	2
1185	279	358	108	20	chr3	78692720	78692971	-80906812	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	968	1240	-249	2
1185	335	288	86	23	chr3	78693351	78693525	-80906258	+	MLT1F1	LTR	MaLR	379	563	-6	2
1185	379	204	22	22	chr3	78699213	78699303	-80900480	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	513	2
1185	789	255	104	38	chr3	78699396	78699742	-80900041	+	RMER13A	LTR	ERVK	98	466	-394	2
1185	861	283	13	77	chr3	78700207	78700286	-80899497	-	RMER20B	LTR	ERVK	-154	473	415	2
1185	861	283	13	77	chr3	78700705	78700935	-80898848	-	RMER20B	LTR	ERVK	-213	414	184	2
1185	2987	86	0	10	chr3	78701007	78701407	-80898376	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1185	7611	83	3	77	chr3	78701407	78702592	-80897191	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
1185	3905	57	11	0	chr3	78702594	78703064	-80896719	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	2
1185	819	274	42	75	chr3	78708169	78708477	-80891306	-	MTE2b	LTR	MaLR	-65	314	17	2
1185	384	385	6	0	chr3	78718676	78718842	-80880941	-	MLT1D	LTR	MaLR	-51	454	288	3
1185	381	295	8	8	chr3	78728997	78729126	-80870657	+	MLT1A0	LTR	MaLR	45	173	-192	3
1185	1885	232	39	92	chr3	78729126	78729399	-80870384	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	303	-308	3
1185	1885	211	40	85	chr3	78729449	78729750	-80870033	+	RMER19C	LTR	ERVK	304	611	0	3
1185	343	236	48	108	chr3	78729752	78729918	-80869865	+	MLT1A0	LTR	MaLR	181	336	-38	3
1185	1358	235	68	19	chr3	78730128	78730497	-80869286	-	MTD	LTR	MaLR	-32	387	1	3
1185	294	327	37	43	chr3	78731211	78731374	-80868409	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-405	164	3	3
1185	257	216	0	0	chr3	78732946	78732997	-80866786	-	MTE2a	LTR	MaLR	-39	340	290	3
1185	456	292	69	56	chr3	78733368	78733600	-80866183	-	RMER2	LTR	ERV1	-4	563	329	3
1185	445	302	176	22	chr3	78735350	78735577	-80864206	+	RMER15	LTR	ERVL	314	575	0	3
1185	1254	205	169	139	chr3	78736509	78737025	-80862758	+	MT2A	LTR	ERVL	3	533	0	3
1185	1812	149	56	12	chr3	78738629	78738968	-80860815	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	3
1185	2560	192	173	8	chr3	78742488	78743119	-80856664	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	735	-2	3
1185	1370	146	0	9	chr3	78749390	78749618	-80850165	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	193	3
1185	244	210	16	0	chr3	78749829	78749891	-80849892	-	MTC	LTR	MaLR	-211	210	148	3
1185	619	178	87	20	chr3	78750682	78750831	-80848952	-	MTC	LTR	MaLR	-262	159	1	3
1185	988	249	139	27	chr3	78752691	78752713	-80847070	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	25	-345	3
1185	988	249	139	27	chr3	78752736	78753044	-80846739	+	ORR1D2	LTR	MaLR	26	370	0	3
1185	1554	216	35	73	chr3	78754043	78754442	-80845341	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1185	415	235	67	0	chr3	78754892	78755013	-80844770	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	286	3
1185	1899	139	30	69	chr3	78755774	78756167	-80843616	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	3
1185	4315	230	105	42	chr3	78756167	78757456	-80842327	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1	1370	0	3
1185	1569	142	183	68	chr3	78757456	78757795	-80841988	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	3
1185	1794	197	20	80	chr3	78758582	78758984	-80840799	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	3
1185	1212	177	129	31	chr3	78760163	78760486	-80839297	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	32	3
1185	2068	114	3	0	chr3	78761732	78762049	-80837734	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	3
1185	266	250	0	0	chr3	78763510	78763570	-80836213	+	RMER15	LTR	ERVL	1	60	-515	3
1185	1644	233	186	7	chr3	78763589	78764047	-80835736	+	RMER15	LTR	ERVL	22	561	-14	3
1185	295	261	16	65	chr3	78766414	78766537	-80833246	+	MLT1E2	LTR	MaLR	347	463	-164	4
1185	1417	215	165	79	chr3	78767161	78767652	-80832131	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	4
1185	1023	225	154	17	chr3	78767761	78768118	-80831665	+	MTD	LTR	MaLR	1	406	-13	4
1186	2041	132	113	3	chr3	78779063	78779435	-80820348	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	4
1186	384	83	0	0	chr3	78783477	78783525	-80816258	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1748	1795	-3727	4
1186	352	164	0	151	chr3	78783570	78783656	-80816127	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1797	1869	-3653	4
1186	5133	167	40	80	chr3	78786448	78787542	-80812241	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1861	2911	-2611	4
1186	522	199	21	161	chr3	78787559	78787751	-80812032	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3108	3272	-2250	4
1186	391	266	76	140	chr3	78787799	78787952	-80811831	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-76	492	347	4
1186	2217	123	49	77	chr3	78787952	78788357	-80811426	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
1186	688	240	46	87	chr3	78788357	78788718	-80811065	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-222	346	11	4
1186	7987	138	64	26	chr3	78788726	78790236	-80809547	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3270	4836	-686	4
1186	2003	195	93	24	chr3	78790255	78790750	-80809033	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	4939	5467	-55	4
1186	943	179	35	123	chr3	78790769	78790910	-80808873	+	RLTR42	LTR	ERVK	2	141	-98	4
1186	943	179	35	123	chr3	78791057	78791176	-80808607	+	RLTR42	LTR	ERVK	142	239	0	4
1186	291	243	44	26	chr3	78792616	78792730	-80807053	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	264	4
1186	250	326	30	59	chr3	78792903	78793004	-80806779	-	MTEb	LTR	MaLR	-281	98	1	4
1186	1497	141	35	12	chr3	78793784	78794042	-80805741	+	RLTR14	LTR	ERV1	112	375	-7	4
1186	2806	53	18	0	chr3	78794053	78794393	-80805390	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
1186	1313	66	0	21	chr3	78797196	78797382	-80802401	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	204	385	0	4
1186	976	324	73	15	chr3	78797649	78798116	-80801667	+	RMER5	LTR	ERV1	33	526	-8	4
1186	414	211	87	0	chr3	78800434	78800538	-80799245	+	MTEb	LTR	MaLR	267	379	0	4
1186	920	257	121	36	chr3	78800547	78800603	-80799180	+	MTEa	LTR	MaLR	20	85	-294	4
1186	1802	185	111	3	chr3	78800603	78800944	-80798839	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1186	920	257	121	36	chr3	78800944	78801218	-80798565	+	MTEa	LTR	MaLR	86	378	-1	4
1186	456	342	109	18	chr3	78801781	78802055	-80797728	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-221	1166	868	4
1186	250	246	54	85	chr3	78803671	78803800	-80795983	+	RLTR12B	LTR	ERVK	397	521	-7	4
1186	769	209	108	120	chr3	78803807	78804123	-80795660	-	MTE2b	LTR	MaLR	-65	314	3	4
1186	340	298	77	0	chr3	78804123	78804227	-80795556	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-833	554	443	4
1186	252	359	89	47	chr3	78804241	78804431	-80795352	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-985	402	205	4
1186	656	187	31	43	chr3	78804769	78804931	-80794852	+	MER34A1	LTR	ERV1	4	163	-424	4
1186	786	194	248	11	chr3	78804943	78805272	-80794511	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	1	4
1186	527	271	129	110	chr3	78805272	78805683	-80794100	+	MER34A1	LTR	ERV1	160	578	-9	4
1186	463	298	43	73	chr3	78807404	78807636	-80792147	-	ORR1E	LTR	MaLR	-126	233	9	4
1186	1671	163	11	71	chr3	78809532	78809882	-80789901	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
1186	626	157	17	0	chr3	78813839	78813954	-80785829	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	117	-410	4
1186	982	150	0	27	chr3	78813956	78814141	-80785642	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	348	527	0	4
1186	486	278	153	16	chr3	78821186	78821435	-80778348	+	RMER15	LTR	ERVL	277	559	-16	4
1186	1153	328	93	59	chr3	78821446	78822153	-80777630	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1	731	-4268	4
1186	708	278	52	104	chr3	78822153	78822240	-80777543	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	77	-302	4
1186	708	278	52	104	chr3	78822288	78822489	-80777294	+	MTE2b	LTR	MaLR	78	274	-105	4
1186	287	316	35	41	chr3	78822959	78823104	-80776679	+	MTE2b	LTR	MaLR	236	379	0	4
1186	1907	261	103	20	chr3	78823196	78823829	-80775954	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4148	4832	-167	4
1186	363	292	38	8	chr3	78824020	78824151	-80775632	+	RMER15	LTR	ERVL	426	560	-15	4
1186	1265	218	25	76	chr3	78825293	78825720	-80774063	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	3	4
1186	229	213	51	39	chr3	78825844	78825922	-80773861	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-48	479	401	4
1186	364	280	28	9	chr3	78828990	78829098	-80770685	+	ORR1E	LTR	MaLR	31	140	-219	4
1186	315	209	105	0	chr3	78830495	78830581	-80769202	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	411	4
1186	386	340	54	36	chr3	78830908	78831131	-80768652	-	MLT1D	LTR	MaLR	-258	247	21	4
1186	253	302	113	69	chr3	78831403	78831606	-80768177	-	MLT1K	LTR	MaLR	0	595	384	4
1186	783	251	101	37	chr3	78832544	78832892	-80766891	+	RMER13A	LTR	ERVK	95	464	-396	4
1186	283	379	27	7	chr3	78834781	78834927	-80764856	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	149	-210	4
1186	3634	66	92	50	chr3	78835613	78836154	-80763629	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	4
1186	2298	86	15	79	chr3	78836444	78836848	-80762935	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	512	0	4
1186	1976	125	82	0	chr3	78837167	78837471	-80762312	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
1186	2074	211	88	2	chr3	78839020	78839486	-80760297	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	506	-6	5
1186	238	213	0	0	chr3	78841944	78841991	-80757792	+	MT2B	LTR	ERVL	82	128	-405	5
1186	516	212	7	77	chr3	78842017	78842028	-80757755	+	MT2B	LTR	ERVL	84	93	-440	5
1186	905	263	26	44	chr3	78842186	78842532	-80757251	+	MT2B	LTR	ERVL	94	600	-1	5
1186	2617	134	66	13	chr3	78844150	78844620	-80755163	-	RLTR19B	LTR	ERVK	-6	709	215	5
1186	263	246	14	0	chr3	78844622	78844691	-80755092	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	361	5
1186	368	194	70	20	chr3	78844691	78844791	-80754992	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	324	5
1186	4975	44	2	2	chr3	78844957	78845544	-80754239	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	5
1186	1528	158	53	32	chr3	78845798	78846139	-80753644	-	RMER6C	LTR	ERVK	-3	687	340	5
1186	557	168	8	123	chr3	78846280	78846375	-80753408	-	MT2B	LTR	ERVL	-414	187	154	5
1186	304	51	0	0	chr3	78846385	78846424	-80753359	-	RMER6D	LTR	ERVK	-681	39	1	5
1186	252	214	138	16	chr3	78846847	78846953	-80752830	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	418	281	5
1186	2451	150	28	34	chr3	78847556	78848054	-80751729	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	3	497	-64	5
1186	2435	112	141	25	chr3	78848702	78849134	-80750649	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	5
1186	298	45	0	43	chr3	78850104	78850150	-80749633	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1114	1157	-4365	5
1186	4379	22	0	12	chr3	78850150	78850649	-80749134	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1186	321	0	0	0	chr3	78850649	78850687	-80749096	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
1186	354	167	46	35	chr3	78850687	78850774	-80749009	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	5
1186	49156	13	0	0	chr3	78850774	78856134	-80743649	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	5
1186	4404	20	0	12	chr3	78856134	78856633	-80743150	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1186	1007	231	66	187	chr3	78856886	78857269	-80742514	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1199	1534	-3988	5
1186	1007	231	66	187	chr3	78857296	78857670	-80742113	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1535	1864	-3658	5
1186	775	217	49	116	chr3	78858019	78858200	-80741583	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	1869	2035	-3487	5
1186	1291	237	45	113	chr3	78858385	78858770	-80741013	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2036	2648	-3489	5
1186	2434	136	10	149	chr3	78858770	78859288	-80740495	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	5
1186	1291	273	39	108	chr3	78859288	78859771	-80740012	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2649	3079	-3058	5
1186	331	261	78	44	chr3	78859952	78860250	-80739533	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3186	3631	-2506	5
1186	1288	109	86	0	chr3	78862200	78862421	-80737362	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	80	5
1186	444	198	11	0	chr3	78863022	78863113	-80736670	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-235	92	1	5
1186	1037	188	166	39	chr3	78868925	78869257	-80730526	+	MTD	LTR	MaLR	46	419	0	5
1186	2324	88	6	3	chr3	78888934	78889252	-80710531	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
1187	243	259	91	106	chr3	78905418	78905617	-80694166	+	RMER15	LTR	ERVL	23	218	-357	6
1187	529	201	140	15	chr3	78905661	78905797	-80693986	+	RMER15	LTR	ERVL	423	575	0	6
1187	442	190	138	0	chr3	78906535	78906651	-80693132	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1124	134	3	6
1187	522	238	103	20	chr3	78906662	78906808	-80692975	-	MTD	LTR	MaLR	-63	356	199	6
1187	675	285	10	10	chr3	78907010	78907205	-80692578	-	MTD	LTR	MaLR	-212	207	13	6
1187	670	248	84	44	chr3	78912217	78912466	-80687317	+	RMER5	LTR	ERV1	1	259	-275	6
1187	2185	146	43	39	chr3	78912481	78912895	-80686888	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	1	6
1187	815	224	89	28	chr3	78912895	78913133	-80686650	+	RMER5	LTR	ERV1	282	534	0	6
1187	930	258	192	32	chr3	78913448	78913796	-80685987	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	1	6
1187	255	233	82	16	chr3	78915679	78915740	-80684043	+	RMER5	LTR	ERV1	430	494	-40	6
1187	353	321	86	56	chr3	78925928	78926126	-80673657	+	MLT1J2	LTR	MaLR	9	212	-236	6
1187	1776	96	93	64	chr3	78935595	78935907	-80663876	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	6
1187	269	275	90	15	chr3	78936273	78936406	-80663377	-	RMER12	LTR	ERVK	-466	856	714	6
1187	255	260	38	49	chr3	78936443	78936565	-80663218	-	ORR1E	LTR	MaLR	-189	181	71	6
1187	279	263	30	50	chr3	78936607	78936707	-80663076	-	ORR1E	LTR	MaLR	-261	98	1	6
1187	1019	114	112	6	chr3	78954412	78954669	-80645114	+	RMER6D	LTR	ERVK	3	327	-393	7
1187	936	175	69	43	chr3	78955015	78955248	-80644535	+	RMER6D	LTR	ERVK	473	711	-45	7
1187	907	161	52	81	chr3	78955224	78955434	-80644349	+	RMER6D	LTR	ERVK	517	720	0	7
1187	3776	18	0	0	chr3	78955449	78955845	-80643938	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1187	595	78	10	0	chr3	78970374	78970477	-80629306	+	RMER17B	LTR	ERVK	314	417	-541	7
1187	3415	43	5	8	chr3	78975315	78975712	-80624071	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1187	2092	166	135	110	chr3	78990463	78990983	-80608800	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	7
1187	249	206	0	150	chr3	78994910	78994990	-80604793	-	MT2B2	LTR	ERVL	-350	234	167	7
1187	2281	156	71	13	chr3	79004300	79004696	-80595087	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	6
1187	915	264	32	78	chr3	79010336	79010710	-80589073	+	MTE2a	LTR	MaLR	4	360	-19	1
1187	925	208	134	52	chr3	79019607	79019759	-80580024	+	RMER17C	LTR	ERVK	16	165	-245	2
1187	925	208	134	52	chr3	79019797	79020009	-80579774	+	RMER17C	LTR	ERVK	166	409	-1	2
1187	3299	48	5	0	chr3	79023639	79024033	-80575750	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1187	4221	80	42	11	chr3	79034000	79034566	-80565217	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	4
1187	2665	82	102	111	chr3	79035606	79036085	-80563698	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	4
1188	1636	168	39	45	chr3	79041524	79041854	-80557929	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	2	5
1188	268	214	56	14	chr3	79043501	79043572	-80556211	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	344	5
1188	249	282	0	53	chr3	79044105	79044180	-80555603	-	MTD	LTR	MaLR	-68	351	281	5
1188	352	241	11	0	chr3	79048272	79048359	-80551424	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4344	4431	-568	6
1188	245	211	0	101	chr3	79049052	79049131	-80550652	+	RMER15	LTR	ERVL	397	467	-108	6
1188	1450	212	86	17	chr3	79054750	79054905	-80544878	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	177	-207	8
1188	1450	212	86	17	chr3	79054935	79055138	-80544645	+	ORR1C2	LTR	MaLR	178	384	0	8
1188	2107	125	3	3	chr3	79058074	79058412	-80541371	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	9
1188	338	320	33	22	chr3	79059649	79059831	-80539952	+	MLT1A	LTR	MaLR	191	374	0	9
1188	2267	102	9	3	chr3	79060283	79060606	-80539177	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	327	0	9
1188	3061	73	2	22	chr3	79065081	79065485	-80534298	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1188	1082	240	93	31	chr3	79067810	79068197	-80531586	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	1
1188	1829	135	32	65	chr3	79069486	79069763	-80530020	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	271	-58	1
1188	1829	135	32	65	chr3	79069910	79069972	-80529811	+	ORR1A4	LTR	MaLR	272	329	0	1
1188	1803	77	98	26	chr3	79080315	79080622	-80519161	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1188	861	246	57	131	chr3	79097427	79097833	-80501950	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	4	1
1188	626	251	9	3	chr3	79102097	79102248	-80497535	-	MTC	LTR	MaLR	-207	200	60	1
1188	2077	91	32	0	chr3	79102252	79102560	-80497223	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	1
1188	370	154	0	0	chr3	79102560	79102624	-80497159	-	MTC	LTR	MaLR	-357	64	1	1
1188	2222	190	79	17	chr3	79107990	79108461	-80491322	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-12	500	1	1
1188	2877	106	17	35	chr3	79108692	79109153	-80490630	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	1
1188	2016	160	34	64	chr3	79111924	79112312	-80487471	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	2
1188	1109	151	61	38	chr3	79122833	79123113	-80476670	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	87	2
1188	2043	175	49	98	chr3	79125961	79126551	-80473232	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	2
1188	354	331	16	16	chr3	79131896	79132080	-80467703	-	RMER15	LTR	ERVL	-54	521	338	2
1188	1166	245	39	106	chr3	79145149	79145555	-80454228	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	2
1188	294	259	123	50	chr3	79147293	79147472	-80452311	+	ORR1E	LTR	MaLR	79	270	-89	2
1188	1725	175	65	6	chr3	79154409	79154765	-80445018	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	41	2
1189	363	297	49	41	chr3	79168921	79169044	-80430739	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-31	536	413	3
1189	716	290	58	22	chr3	79169025	79169300	-80430483	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-235	285	1	3
1189	621	227	8	8	chr3	79172477	79172610	-80427173	+	MT2A	LTR	ERVL	1	133	-400	3
1189	637	242	27	19	chr3	79172626	79172897	-80426886	+	MT2A	LTR	ERVL	279	530	-54	3
1189	583	302	82	55	chr3	79176516	79176895	-80422888	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	389	-1	3
1189	746	242	112	64	chr3	79177589	79177958	-80421825	+	MTE2a	LTR	MaLR	26	404	-15	3
1189	1205	284	266	65	chr3	79177969	79178846	-80420937	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	11	1401	-179	3
1189	927	273	134	45	chr3	79178951	79179308	-80420475	+	MTE2a	LTR	MaLR	31	419	0	3
1189	3404	35	5	2	chr3	79193991	79194386	-80405397	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1189	9040	49	4	1	chr3	79194386	79195481	-80404302	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
1189	3411	35	5	0	chr3	79195481	79195875	-80403908	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1189	983	155	6	12	chr3	79196665	79196835	-80402948	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	253	3
1189	2796	140	25	95	chr3	79198005	79198574	-80401209	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	3
1189	249	333	38	38	chr3	79198609	79198793	-80400990	-	MLT1L	LTR	MaLR	-310	300	117	3
1189	1081	157	30	5	chr3	79200233	79200431	-80399352	+	MTC	LTR	MaLR	1	203	-218	3
1189	396	239	309	35	chr3	79208086	79208360	-80391423	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	375	27	3
1189	409	288	168	44	chr3	79219515	79219798	-80379985	-	MLT1E3	LTR	MaLR	0	680	284	4
1189	346	305	56	49	chr3	79220196	79220358	-80379425	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-461	163	1	4
1189	325	258	21	21	chr3	79228422	79228517	-80371266	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	271	4
1189	827	271	67	74	chr3	79237173	79237563	-80362220	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	2	4
1189	1708	146	41	101	chr3	79238716	79239104	-80360679	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-2	365	1	4
1189	2400	96	16	0	chr3	79241066	79241388	-80358395	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1189	292	204	19	0	chr3	79243383	79243437	-80356346	+	MLT1C	LTR	MaLR	407	461	-6	4
1189	2143	101	6	0	chr3	79258035	79258352	-80341431	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	4
1189	649	265	156	36	chr3	79258631	79258933	-80340850	-	MLT2D	LTR	ERVL	-57	357	20	4
1189	1721	150	119	31	chr3	79264667	79265019	-80334764	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	384	0	4
1189	1217	248	66	5	chr3	79270895	79271230	-80328553	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	4
1189	3148	134	135	20	chr3	79272191	79272739	-80327044	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
1189	240	199	116	143	chr3	79283002	79283149	-80316634	+	LTR33	LTR	ERVL	32	174	-341	5
1190	1061	219	84	72	chr3	79304958	79305427	-80294356	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	466	0	5
1190	268	300	48	91	chr3	79314713	79314922	-80284861	-	RMER10A	LTR	ERVL	-24	418	219	5
1190	1082	227	153	34	chr3	79316852	79317172	-80282611	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	358	-12	5
1190	247	274	0	136	chr3	79324787	79324905	-80274878	+	MT2B	LTR	ERVL	156	257	-344	6
1190	231	305	76	8	chr3	79326689	79326808	-80272975	+	MLT1C	LTR	MaLR	71	197	-270	6
1190	345	244	53	92	chr3	79337206	79337337	-80262446	+	MT2B	LTR	ERVL	153	278	-323	6
1190	3260	29	42	0	chr3	79344193	79344573	-80255210	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1190	7573	64	50	72	chr3	79344573	79345696	-80254087	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
1190	3443	28	5	0	chr3	79345698	79346090	-80253693	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	3	396	0	6
1190	225	350	62	0	chr3	79349940	79350020	-80249763	+	MER21B	LTR	ERV1	273	357	-506	6
1190	711	276	129	54	chr3	79350055	79350334	-80249449	+	MER21B	LTR	ERV1	501	800	-63	6
1190	3409	28	15	3	chr3	79350895	79351286	-80248497	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1190	7854	72	33	7	chr3	79351290	79352360	-80247423	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	6
1190	1072	222	97	46	chr3	79352367	79352723	-80247060	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-17	383	7	6
1190	295	322	79	39	chr3	79353273	79353451	-80246332	+	ORR1E	LTR	MaLR	175	359	0	6
1190	598	274	159	18	chr3	79356101	79356328	-80243455	+	RMER15	LTR	ERVL	317	575	0	6
1190	1702	178	52	6	chr3	79361518	79361862	-80237921	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	6189	6548	-2	6
1190	1312	157	61	8	chr3	79361863	79362323	-80237460	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	519	-8	6
1190	472	219	39	70	chr3	79366809	79366937	-80232846	+	MT2B	LTR	ERVL	168	291	-310	7
1190	1050	167	59	48	chr3	79379850	79380034	-80219749	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	226	7
1190	1050	175	32	46	chr3	79380132	79380361	-80219422	-	RMER17C	LTR	ERVK	-421	330	6	7
1190	253	259	0	96	chr3	79386215	79386229	-80213554	+	MT2B	LTR	ERVL	157	161	-440	7
1190	1205	91	45	0	chr3	79387612	79387788	-80211995	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	345	7
1190	340	190	37	25	chr3	79387880	79387961	-80211822	+	RLTR11A	LTR	ERVK	216	297	-231	7
1190	484	200	0	0	chr3	79393477	79393567	-80206216	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	281	8
1190	1398	192	173	16	chr3	79416897	79417220	-80182563	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	8
1190	1726	183	144	45	chr3	79420244	79420639	-80179144	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	442	-92	8
1190	1726	183	144	45	chr3	79420718	79420808	-80178975	+	RLTR20C	LTR	ERVK	443	533	-1	8
1190	299	289	19	19	chr3	79422930	79423036	-80176747	+	MER67C	LTR	ERV1	55	160	-551	8
1190	2620	95	0	0	chr3	79424533	79424860	-80174923	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1190	6842	78	6	138	chr3	79424862	79426000	-80173783	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	981	-117	8
1190	6842	78	6	138	chr3	79426179	79426304	-80173479	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	982	1097	-1	8
1190	227	269	76	13	chr3	79428740	79428819	-80170964	+	MLT1F2	LTR	MaLR	49	132	-428	8
1191	242	167	46	77	chr3	79442998	79443063	-80156720	-	RMER20A	LTR	ERVK	-268	248	186	9
1191	639	318	82	80	chr3	79446123	79446714	-80153069	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	592	-24	9
1191	726	231	107	34	chr3	79458967	79459173	-80140610	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	145	9
1191	509	232	40	40	chr3	79459904	79460052	-80139731	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-214	151	4	9
1191	734	205	144	12	chr3	79460745	79461012	-80138771	+	MTD	LTR	MaLR	18	400	-19	9
1191	276	226	131	20	chr3	79462058	79462165	-80137618	+	MLT1A1	LTR	MaLR	239	403	-5	9
1191	2007	112	12	68	chr3	79465771	79466107	-80133676	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-9	317	1	9
1191	1040	266	22	47	chr3	79466107	79466383	-80133400	+	MTE2a	LTR	MaLR	90	358	-21	9
1191	1336	169	262	3	chr3	79471076	79471385	-80128398	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	393	-1	9
1191	3200	26	0	0	chr3	79473353	79473699	-80126084	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	9
1191	902	268	110	18	chr3	79478560	79478887	-80120896	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	2	9
1191	2314	120	76	8	chr3	79480392	79480746	-80119037	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	9
1191	3910	108	160	7	chr3	79481456	79482019	-80117764	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	25	9
1191	3910	108	160	7	chr3	79482058	79482082	-80117701	-	RLTR33	LTR	ERVK	-654	24	1	9
1191	1282	176	106	103	chr3	79491220	79491588	-80108195	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	369	-15	1
1191	4574	58	22	7	chr3	79491778	79492330	-80107453	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	1
1191	1498	310	84	2	chr3	79492372	79492837	-80106946	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	1076	1578	-2	1
1191	683	332	14	19	chr3	79492843	79493055	-80106728	+	MTE2b	LTR	MaLR	6	216	-163	1
1191	481	306	93	6	chr3	79493110	79493271	-80106512	+	MTE2b	LTR	MaLR	190	364	-15	1
1191	701	282	153	41	chr3	79494385	79494725	-80105058	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	2	1
1191	407	247	165	35	chr3	79504857	79505083	-80094700	-	MLT1C	LTR	MaLR	-18	487	154	5
1191	229	283	0	16	chr3	79505169	79505230	-80094553	+	MLT1B	LTR	MaLR	51	110	-280	6
1191	1434	276	27	13	chr3	79506152	79506526	-80093257	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	8
1191	4494	250	88	91	chr3	79506528	79508110	-80091673	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-2	1578	1	8
1191	743	291	56	151	chr3	79508287	79508704	-80091079	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	3	8
1191	2454	72	3	12	chr3	79510091	79510413	-80089370	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	1
1191	1616	154	0	48	chr3	79513530	79513802	-80085981	+	RLTR41	LTR	ERV1	188	446	0	1
1191	231	260	12	38	chr3	79515457	79515537	-80084246	+	MER34A	LTR	ERV1	53	130	-441	2
1191	886	86	50	14	chr3	79515655	79515796	-80083987	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	148	-230	2
1191	778	274	35	22	chr3	79519388	79519619	-80080164	+	MT2A	LTR	ERVL	155	388	-145	3
1191	442	165	0	169	chr3	79519675	79519799	-80079984	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	162	3
1191	351	234	242	61	chr3	79519772	79519904	-80079879	+	MT2A	LTR	ERVL	378	533	0	3
1191	305	286	164	40	chr3	79520238	79520464	-80079319	-	ORR1E	LTR	MaLR	-105	254	1	3
1191	1983	131	6	56	chr3	79521989	79522328	-80077455	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
1191	225	330	26	17	chr3	79528198	79528315	-80071468	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	120	-299	5
1191	1149	241	44	27	chr3	79528438	79528736	-80071047	+	MTE2b	LTR	MaLR	77	379	0	5
1191	951	169	111	59	chr3	79529193	79529314	-80070469	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	125	-249	5
1191	1415	204	52	131	chr3	79529314	79529720	-80070063	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1191	951	185	133	52	chr3	79529720	79529912	-80069871	+	ORR1D1	LTR	MaLR	126	379	0	5
1191	605	282	72	81	chr3	79531650	79532009	-80067774	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	358	-1	5
1191	372	171	91	13	chr3	79532104	79532164	-80067619	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	66	-308	6
1191	4274	185	32	32	chr3	79532164	79533028	-80066755	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	864	-44	6
1191	290	128	0	0	chr3	79533036	79533083	-80066700	+	ORR1D1	LTR	MaLR	55	101	-273	6
1191	250	182	0	0	chr3	79533160	79533204	-80066579	+	ORR1D1	LTR	MaLR	87	130	-244	6
1191	226	309	74	67	chr3	79541892	79541971	-80057812	+	RMER4B	LTR	ERVK	422	503	-82	7
1191	226	309	74	67	chr3	79542011	79542066	-80057717	+	RMER4B	LTR	ERVK	504	557	-28	7
1191	237	250	19	0	chr3	79545470	79545522	-80054261	-	RMER15	LTR	ERVL	-520	55	3	8
1191	604	333	38	95	chr3	79545917	79546285	-80053498	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	357	-2	8
1191	3254	289	104	30	chr3	79546403	79547437	-80052346	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	2	1107	-473	8
1191	3254	289	104	30	chr3	79547575	79547725	-80052058	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1108	1274	-306	8
1191	899	310	91	36	chr3	79549804	79550279	-80049504	-	RMER5	LTR	ERV1	-1	533	33	8
1191	634	252	20	43	chr3	79559023	79559273	-80040510	+	MTEa	LTR	MaLR	133	379	0	1
1191	1310	269	99	40	chr3	79559273	79559746	-80040037	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1	501	-1079	1
1191	701	316	44	20	chr3	79559762	79560011	-80039772	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1096	1350	-230	1
1191	1104	204	122	26	chr3	79560027	79560143	-80039640	+	ORR1D1	LTR	MaLR	42	167	-207	1
1191	1104	204	122	26	chr3	79560226	79560410	-80039373	+	ORR1D1	LTR	MaLR	168	371	-3	1
1192	4009	185	36	53	chr3	79563763	79564631	-80035152	-	RMER13B	LTR	ERVK	-55	853	1	1
1192	447	266	78	59	chr3	79565134	79565420	-80034363	+	MT2B	LTR	ERVL	15	420	-181	1
1192	245	100	0	48	chr3	79565584	79565626	-80034157	+	MT2B	LTR	ERVL	535	574	-10	1
1192	914	289	93	28	chr3	79565916	79566237	-80033546	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	18	1
1192	2975	71	24	7	chr3	79566248	79566673	-80033110	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-43	432	1	1
1192	809	192	9	118	chr3	79574816	79574905	-80024878	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-25	1345	1289	1
1192	809	172	0	119	chr3	79575153	79575312	-80024471	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-82	1288	1154	1
1192	1174	294	102	42	chr3	79575360	79575888	-80023895	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-723	647	88	1
1192	347	260	24	121	chr3	79575914	79575926	-80023857	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	368	1
1192	1958	172	50	3	chr3	79575926	79576287	-80023496	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
1192	4835	219	65	48	chr3	79576292	79577639	-80022144	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	0	1370	1	1
1192	2028	175	35	5	chr3	79577639	79578006	-80021777	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
1192	948	239	77	88	chr3	79578006	79578359	-80021424	-	ORR1E	LTR	MaLR	-12	367	4	1
1192	237	333	18	64	chr3	79580970	79581079	-80018704	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	104	-255	1
1192	1805	158	206	3	chr3	79581926	79582276	-80017507	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1192	598	159	53	41	chr3	79582276	79582446	-80017337	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1087	1
1192	2325	160	38	11	chr3	79584023	79584472	-80015311	-	MTC-int	LTR	MaLR	-145	1113	653	1
1192	995	175	36	10	chr3	79584486	79584682	-80015101	-	MTC	LTR	MaLR	-220	201	1	1
1192	739	184	30	101	chr3	79588487	79588686	-80011097	-	RMER10B	LTR	ERVL	-6	392	208	1
1192	904	182	85	17	chr3	79588705	79588940	-80010843	-	RMER10B	LTR	ERVL	-147	251	1	1
1192	392	213	69	0	chr3	79590104	79590239	-80009544	+	ORR1E	LTR	MaLR	32	188	-186	1
1192	1416	226	31	91	chr3	79598177	79598595	-80001188	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	27	1
1192	582	214	33	164	chr3	79600439	79600774	-79999009	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3455	3745	-2392	1
1192	410	275	174	50	chr3	79601032	79601250	-79998533	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3865	4109	-2028	1
1192	371	277	8	70	chr3	79602159	79602287	-79997496	+	MTEa	LTR	MaLR	230	349	-30	1
1192	1880	154	97	11	chr3	79602463	79602812	-79996971	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	1	1
1192	1445	180	11	7	chr3	79618263	79618543	-79981240	+	ORR1B2	LTR	MaLR	86	366	-1	1
1192	1674	224	52	44	chr3	79641273	79641796	-79957987	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	2
1192	2513	138	9	80	chr3	79655732	79656195	-79943588	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	2
1192	471	281	149	14	chr3	79656608	79656890	-79942893	-	MLT1F	LTR	MaLR	-225	323	4	2
1192	433	291	112	34	chr3	79658144	79658350	-79941433	-	LTR65	LTR	ERV1	-231	438	217	2
1192	2272	179	17	7	chr3	79663884	79664301	-79935482	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1192	393	245	20	80	chr3	79673261	79673412	-79926371	-	MLT1B	LTR	MaLR	-8	382	241	2
1192	2481	156	37	5	chr3	79673677	79674083	-79925700	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	2
1192	265	248	0	23	chr3	79676715	79676843	-79922940	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	630	2
1192	1836	132	77	12	chr3	79678168	79678505	-79921278	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	2
1192	1906	190	60	12	chr3	79679304	79679704	-79920079	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1192	1111	224	160	3	chr3	79682282	79682626	-79917157	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	22	2
1192	548	223	189	31	chr3	79682803	79683062	-79916721	+	RLTR28B	LTR	ERVL	17	316	-165	2
1192	361	191	11	45	chr3	79683156	79683244	-79916539	+	RLTR28B	LTR	ERVL	435	519	-5	2
1192	307	384	56	36	chr3	79683261	79683564	-79916219	-	LTR88a	LTR	Gypsy	-27	789	481	3
1192	256	379	68	37	chr3	79683288	79683611	-79916172	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-54	783	451	3
1193	3469	28	2	0	chr3	79696362	79696757	-79903026	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1193	9751	19	0	0	chr3	79696757	79697855	-79901928	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
1193	3487	25	2	0	chr3	79697855	79698250	-79901533	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1193	241	379	70	30	chr3	79713351	79713650	-79886133	-	LTR40b	LTR	ERVL	-32	430	120	3
1193	716	254	73	33	chr3	79715487	79715589	-79884194	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	113	-246	3
1193	716	254	73	33	chr3	79715628	79715855	-79883928	+	RLTR15	LTR	ERVK	114	343	-16	3
1193	295	271	108	43	chr3	79716564	79716703	-79883080	-	RMER15	LTR	ERVL	-92	483	336	3
1193	653	324	44	8	chr3	79716808	79717060	-79882723	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	299	3
1193	769	230	84	50	chr3	79717350	79717611	-79882172	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-130	4869	4600	3
1193	444	310	18	37	chr3	79717661	79717825	-79881958	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-479	4520	4360	3
1193	593	264	228	4	chr3	79718454	79718709	-79881074	+	MTD	LTR	MaLR	88	399	-20	3
1193	945	309	107	72	chr3	79718904	79719333	-79880450	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2776	2223	1755	3
1193	2318	115	0	0	chr3	79719333	79719655	-79880128	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-3	326	5	3
1193	945	309	107	72	chr3	79719655	79719906	-79879877	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3245	1754	1519	3
1193	618	306	18	0	chr3	79720047	79720217	-79879566	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3692	1307	1135	3
1193	944	302	56	58	chr3	79720233	79720732	-79879051	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3933	1066	569	3
1193	528	348	43	25	chr3	79720760	79721040	-79878743	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4484	515	231	3
1193	472	331	172	16	chr3	79722330	79722585	-79877198	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	279	3
1193	1376	170	50	85	chr3	79726162	79726566	-79873217	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	21	3
1193	1376	170	50	85	chr3	79726592	79726611	-79873172	-	RMER17C	LTR	ERVK	-390	20	2	3
1193	257	291	96	90	chr3	79743876	79744042	-79855741	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-184	186	20	3
1193	586	219	258	53	chr3	79752998	79753330	-79846453	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	1	3
1193	244	267	107	0	chr3	79754392	79754467	-79845316	-	MLT1I	LTR	MaLR	-28	383	301	4
1193	395	270	71	21	chr3	79771631	79771771	-79828012	-	ORR1E	LTR	MaLR	-212	147	1	4
1193	661	324	76	76	chr3	79772734	79773078	-79826705	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	347	-12	4
1193	705	312	15	0	chr3	79777079	79777278	-79822505	+	RMER15	LTR	ERVL	369	570	-5	4
1193	305	328	67	40	chr3	79779003	79779210	-79820573	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	214	-413	4
1193	744	282	70	5	chr3	79779295	79779509	-79820274	+	MLT1D	LTR	MaLR	268	495	-10	4
1193	411	185	0	98	chr3	79784607	79784709	-79815074	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	92	-302	4
1193	400	239	21	11	chr3	79786973	79787066	-79812717	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	94	-265	4
1193	1011	257	115	45	chr3	79788498	79788828	-79810955	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	357	-2	4
1193	283	341	88	58	chr3	79796377	79796572	-79803211	-	MLT1G	LTR	MaLR	-346	249	44	4
1193	553	246	22	41	chr3	79799590	79799756	-79800027	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	161	-355	4
1193	258	332	66	86	chr3	79800762	79801006	-79798777	-	LTR52	LTR	ERVL	-40	381	143	4
1193	2209	185	27	7	chr3	79805784	79806197	-79793586	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1194	728	288	36	40	chr3	79825588	79825866	-79773917	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	282	-83	4
1194	232	259	35	0	chr3	79825814	79825872	-79773911	-	MLT1D	LTR	MaLR	-185	320	261	4
1194	329	329	107	53	chr3	79834939	79835288	-79764495	+	MTEa	LTR	MaLR	11	365	-14	5
1194	696	305	159	9	chr3	79835302	79835636	-79764147	+	MTEa-int	LTR	MaLR	2	385	-1195	5
1194	608	319	46	70	chr3	79835863	79836122	-79763661	+	ORR1E	LTR	MaLR	101	353	-6	5
1194	1852	204	8	50	chr3	79840503	79840879	-79758904	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-13	361	2	5
1194	8050	25	4	3	chr3	79841005	79841933	-79757850	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	5
1194	246	288	137	0	chr3	79848459	79848532	-79751251	-	MLT1A	LTR	MaLR	-284	90	8	5
1194	382	304	91	33	chr3	79849070	79849319	-79750464	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	97	5
1194	2624	68	9	147	chr3	79849320	79849784	-79749999	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1194	369	370	97	56	chr3	79851295	79851636	-79748147	+	MLT2F	LTR	ERVL	302	656	-7	5
1194	614	284	40	0	chr3	79857410	79857586	-79742197	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	352	5
1194	904	237	69	42	chr3	79857611	79857871	-79741912	-	RMER5	LTR	ERV1	-251	283	17	5
1194	682	283	135	4	chr3	79858173	79858432	-79741351	+	MER90a	LTR	ERV1	1	293	-321	5
1194	1716	207	161	74	chr3	79858554	79858601	-79741182	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	562	5
1194	1716	207	161	74	chr3	79858664	79859169	-79740614	-	MT2B	LTR	ERVL	-40	561	1	5
1194	1965	176	56	13	chr3	79859169	79859561	-79740222	-	MTC	LTR	MaLR	-11	410	2	5
1194	354	296	68	19	chr3	79870184	79870346	-79729437	-	RLTR21	LTR	ERVK	-239	1333	1164	5
1194	291	315	98	0	chr3	79872363	79872506	-79727277	-	LTR78	LTR	ERV1	-5	1299	1143	5
1194	317	250	161	0	chr3	79872755	79872867	-79726916	+	MTEa	LTR	MaLR	8	137	-242	5
1194	1565	206	53	66	chr3	79872867	79872894	-79726889	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	27	-347	5
1194	1310	211	128	34	chr3	79872894	79872950	-79726833	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	369	5
1194	1310	211	128	34	chr3	79872986	79873312	-79726471	-	MTC	LTR	MaLR	-53	368	3	5
1194	1565	206	53	66	chr3	79873312	79873663	-79726120	+	ORR1D1	LTR	MaLR	28	374	0	5
1194	586	280	18	132	chr3	79873663	79873939	-79725844	+	MTEa	LTR	MaLR	136	379	0	5
1194	226	385	75	20	chr3	79875325	79875471	-79724312	-	MLT1A	LTR	MaLR	-201	173	20	5
1194	1256	230	101	17	chr3	79877809	79878154	-79721629	+	MTEa	LTR	MaLR	6	379	0	5
1194	257	156	0	22	chr3	79879529	79879575	-79720208	-	MTE2b	LTR	MaLR	-46	333	289	5
1194	502	291	32	19	chr3	79879559	79879713	-79720070	-	MTE2b	LTR	MaLR	-223	156	1	5
1194	344	410	98	7	chr3	79881615	79881912	-79717871	+	LTR81A	LTR	ERV1?	677	1000	-350	5
1194	1878	164	47	30	chr3	79882059	79882424	-79717359	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	372	-2	5
1194	329	320	14	72	chr3	79889855	79889993	-79709790	+	RMER10B	LTR	ERVL	269	398	0	5
1194	241	313	222	60	chr3	79891135	79891437	-79708346	-	MLT1F	LTR	MaLR	-187	361	11	5
1194	4167	25	2	0	chr3	79894727	79895236	-79704547	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	-1281	511	2	5
1194	2909	15	0	0	chr3	79895241	79895579	-79704204	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-8	338	1	5
1194	1300	210	121	63	chr3	79897938	79897977	-79701806	+	MTD	LTR	MaLR	1	47	-372	6
1194	1300	210	121	63	chr3	79898023	79898168	-79701615	+	MTD	LTR	MaLR	48	201	-218	6
1194	1300	210	121	63	chr3	79898617	79898827	-79700956	+	MTD	LTR	MaLR	202	417	-2	6
1194	474	324	101	55	chr3	79903985	79904204	-79695579	+	MLT1J	LTR	MaLR	76	304	-208	6
1194	362	225	24	59	chr3	79904393	79904478	-79695305	+	MTEb	LTR	MaLR	9	90	-289	6
1194	969	275	13	81	chr3	79904527	79904836	-79694947	+	MTEb	LTR	MaLR	92	379	0	6
1194	696	160	39	66	chr3	79913762	79914005	-79685778	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-98	269	33	6
1194	1708	173	93	26	chr3	79915301	79915645	-79684138	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1194	1658	202	68	107	chr3	79915861	79916299	-79683484	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
1194	282	318	89	44	chr3	79918239	79918374	-79681409	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	141	-233	6
1194	451	315	148	27	chr3	79923478	79923775	-79676008	-	LTR53	LTR	ERVL	-174	345	13	6
1194	4276	14	2	8	chr3	79929263	79929748	-79670035	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	6
1194	1021	297	80	9	chr3	79930521	79930847	-79668936	+	MTEa	LTR	MaLR	1	349	-30	6
1194	1453	140	208	3	chr3	79930864	79931157	-79668626	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-14	353	1	6
1194	427	317	42	48	chr3	79932026	79932215	-79667568	-	MTD	LTR	MaLR	-189	230	43	6
1194	2490	99	3	56	chr3	79933312	79933686	-79666097	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	6
1194	2676	122	17	33	chr3	79933686	79934342	-79665441	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7581	6984	6
1194	3398	65	9	0	chr3	79934471	79934919	-79664864	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4991	2689	2238	6
1194	8894	128	21	23	chr3	79934896	79936507	-79663276	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5698	1982	17	6
1194	2376	87	0	9	chr3	79936507	79936833	-79662950	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	32	6
1194	2027	194	58	5	chr3	79938500	79938900	-79660883	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1194	666	328	17	21	chr3	79939682	79939922	-79659861	+	RMER15	LTR	ERVL	324	562	-13	6
1194	426	326	126	29	chr3	79941004	79941250	-79658533	-	RMER5	LTR	ERV1	-73	461	192	6
1194	966	271	120	3	chr3	79941373	79941706	-79658077	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	6
1194	486	156	56	0	chr3	79941988	79942062	-79657721	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	243	6
1194	2851	152	23	15	chr3	79942062	79942537	-79657246	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	479	-99	6
1194	9030	131	48	119	chr3	79942591	79944507	-79655276	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	185	1963	0	6
1194	1719	142	62	40	chr3	79944507	79944829	-79654954	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1194	367	277	110	25	chr3	79945830	79945993	-79653790	+	LTR37A	LTR	ERV1	126	302	-124	6
1195	3019	153	31	11	chr3	79954653	79955203	-79644580	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	6
1195	2715	173	64	14	chr3	79965458	79965973	-79633810	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	541	0	7
1195	3391	38	2	0	chr3	79972282	79972677	-79627106	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1195	1123	210	134	22	chr3	79979151	79979472	-79620311	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	63	7
1195	1862	285	107	63	chr3	79979515	79980256	-79619527	-	MTC-int	LTR	MaLR	-4	1254	465	7
1195	1862	285	107	63	chr3	79980328	79980489	-79619294	-	MTC-int	LTR	MaLR	-794	464	312	7
1195	528	267	142	24	chr3	79980477	79980646	-79619137	-	MTD	LTR	MaLR	-10	397	209	7
1195	553	266	80	9	chr3	79980759	79980941	-79618842	-	MTD	LTR	MaLR	-219	200	1	7
1195	378	298	53	8	chr3	80002909	80003041	-79596742	-	RMER5	LTR	ERV1	-347	187	50	6
1195	564	329	97	90	chr3	80013702	80014146	-79585637	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	21	1
1195	649	222	84	26	chr3	80016793	80017071	-79582712	-	MT2A	LTR	ERVL	-165	328	2	2
1195	745	198	97	67	chr3	80019315	80019510	-79580273	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-176	202	2	2
1195	6156	122	26	4	chr3	80023868	80024802	-79574981	-	RMER17B	LTR	ERVK	-1	957	4	3
1195	494	319	157	35	chr3	80037766	80038143	-79561640	+	RMER5	LTR	ERV1	92	514	-20	5
1195	410	357	60	41	chr3	80039690	80039956	-79559827	+	MLT1E2	LTR	MaLR	40	310	-317	5
1195	303	318	132	89	chr3	80040009	80040358	-79559425	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	371	8	5
1195	259	297	85	24	chr3	80040735	80040949	-79558834	+	MLT1E2	LTR	MaLR	431	680	0	5
1195	352	204	69	138	chr3	80050712	80050871	-79548912	-	MER57C2	LTR	ERV1	-199	235	88	6
1195	502	202	10	20	chr3	80051239	80051340	-79548443	-	MER57C2	LTR	ERV1	-332	102	3	6
1195	325	180	17	43	chr3	80053479	80053548	-79546235	+	RMER17A	LTR	ERVK	345	412	-339	6
1195	325	180	17	43	chr3	80053683	80053729	-79546054	+	RMER17A	LTR	ERVK	413	456	-295	6
1195	890	241	58	78	chr3	80055628	80055879	-79543904	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	141	7
1195	890	241	58	78	chr3	80055921	80056051	-79543732	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-234	140	1	7
1195	724	255	68	99	chr3	80062123	80062445	-79537338	+	ORR1D2	LTR	MaLR	53	373	-6	7
1195	2836	67	5	5	chr3	80062441	80062818	-79536965	+	MTB	LTR	MaLR	24	400	0	8
1195	6655	101	30	77	chr3	80062820	80063970	-79535813	+	MTB-int	LTR	MaLR	3	1098	0	8
1195	2984	81	10	0	chr3	80063970	80064366	-79535417	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	8
1195	1608	219	86	11	chr3	80064610	80064983	-79534800	+	MTD	LTR	MaLR	1	401	-18	8
1195	360	314	110	52	chr3	80066115	80066481	-79533302	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	69	8
1195	1749	139	7	19	chr3	80074097	80074579	-79525204	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	220	9
1195	474	49	0	0	chr3	80074574	80074635	-79525148	-	RMER19A	LTR	ERVK	-674	63	3	9
1196	1926	229	51	36	chr3	80086772	80087297	-79512486	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	79	1
1196	656	313	116	49	chr3	80093021	80093350	-79506433	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	353	-21	1
1196	478	356	43	0	chr3	80094163	80094351	-79505432	+	RMER15	LTR	ERVL	378	573	-2	1
1196	800	251	24	47	chr3	80095132	80095345	-79504438	+	MTE2b	LTR	MaLR	172	379	0	1
1196	573	200	0	0	chr3	80110834	80110939	-79488844	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	107	-275	1
1196	281	406	88	32	chr3	80124765	80125073	-79474710	-	LTR33	LTR	ERVL	-173	342	18	1
1196	268	226	12	81	chr3	80130323	80130444	-79469339	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-327	482	368	1
1196	268	226	12	81	chr3	80130475	80130599	-79469184	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-442	367	255	1
1196	309	294	30	141	chr3	80130903	80131137	-79468646	-	RMER4A	LTR	ERVK	-251	215	8	1
1196	498	236	90	23	chr3	80133345	80133529	-79466254	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-155	239	8	1
1196	318	167	30	0	chr3	80133501	80133567	-79466216	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-326	68	1	1
1196	334	242	164	0	chr3	80134351	80134479	-79465304	-	RMER20A	LTR	ERVK	-236	280	132	1
1196	900	268	141	27	chr3	80138246	80138580	-79461203	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	1	1
1196	1702	125	19	4	chr3	80171391	80171656	-79428127	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	269	-633	2
1196	4155	171	61	46	chr3	80174712	80175652	-79424131	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	5	2
1196	1367	186	39	4	chr3	80176202	80176461	-79423322	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	260	527	0	2
1196	3277	172	112	5	chr3	80178973	80179623	-79420160	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	2
1196	2024	156	100	30	chr3	80179628	80180057	-79419726	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	459	-2	2
1196	400	354	81	71	chr3	80190078	80190388	-79409395	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	43	2
1196	896	293	41	17	chr3	80193715	80194007	-79405776	+	RMER15	LTR	ERVL	276	574	-1	2
1196	3664	178	42	9	chr3	80194924	80195270	-79404513	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	363	-357	2
1196	3664	178	42	9	chr3	80195345	80195695	-79404088	+	RMER6D	LTR	ERVK	364	719	-1	2
1196	1524	164	57	72	chr3	80195948	80196282	-79403501	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
1196	235	154	19	19	chr3	80203606	80203659	-79396124	+	RLTR30	LTR	ERV1	322	374	-5	2
1196	560	171	0	0	chr3	80203861	80203967	-79395816	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-14	380	273	2
1196	812	301	53	46	chr3	80203967	80204378	-79395405	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	414	-27	2
1196	1348	178	105	8	chr3	80204405	80204671	-79395112	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-102	292	1	2
1196	295	333	10	0	chr3	80205076	80205175	-79394608	-	MLT1H	LTR	MaLR	0	549	450	2
1197	325	279	222	11	chr3	80228744	80228929	-79370854	+	RMER15	LTR	ERVL	349	572	-3	2
1197	3496	23	0	0	chr3	80238167	80238563	-79361220	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1197	2494	206	41	29	chr3	80257763	80258322	-79341461	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-12	566	1	3
1197	260	180	0	20	chr3	80260723	80260774	-79339009	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	528	3
1197	2069	208	69	41	chr3	80260802	80260865	-79338918	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-36	541	485	3
1197	2069	208	69	41	chr3	80260907	80261350	-79338433	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-93	484	23	3
1197	2092	86	53	0	chr3	80263489	80263792	-79335991	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	3
1197	3397	146	24	2	chr3	80263796	80264344	-79335439	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	560	-1403	3
1197	739	169	31	97	chr3	80264305	80264543	-79335240	+	MT2B	LTR	ERVL	127	294	-307	3
1197	394	230	61	0	chr3	80264443	80264608	-79335175	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	718	892	-1071	3
1197	761	134	62	21	chr3	80265471	80265616	-79334167	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	862	1012	-951	3
1197	702	233	49	49	chr3	80265625	80265828	-79333955	-	RLTR17	LTR	ERVK	-121	571	369	3
1197	288	150	16	32	chr3	80265818	80265880	-79333903	+	RLTR17	LTR	ERVK	313	373	-319	3
1197	932	274	0	49	chr3	80265884	80266149	-79333634	-	RLTR17	LTR	ERVK	-336	356	105	3
1197	1485	117	187	0	chr3	80266155	80266412	-79333371	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1485	1789	-174	3
1197	642	265	123	69	chr3	80284707	80285056	-79314727	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	3
1197	474	316	22	69	chr3	80286276	80286540	-79313243	-	MTE2a	LTR	MaLR	-151	228	8	3
1197	1641	185	77	0	chr3	80293625	80293938	-79305845	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	337	-57	3
1197	641	286	140	127	chr3	80296001	80296379	-79303404	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	3
1197	1619	308	117	25	chr3	80300747	80301352	-79298431	+	MTEa-int	LTR	MaLR	918	1578	-2	3
1197	1158	283	41	27	chr3	80301357	80301724	-79298059	+	MTEa	LTR	MaLR	3	374	-5	3
1197	413	405	31	31	chr3	80323697	80323919	-79275864	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-5	555	334	4
1197	3484	18	2	0	chr3	80325462	80325857	-79273926	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1197	9068	36	4	1	chr3	80325857	80326952	-79272831	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
1197	3484	18	2	0	chr3	80326952	80327347	-79272436	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1197	290	328	32	95	chr3	80338245	80338434	-79261349	-	MLT1J	LTR	MaLR	0	512	336	4
1197	1074	145	17	6	chr3	80341142	80341322	-79258461	-	RLTR15	LTR	ERVK	-177	182	1	4
1197	475	192	254	0	chr3	80341519	80341649	-79258134	+	RLTR15	LTR	ERVK	196	358	-1	4
1198	2704	221	84	104	chr3	80352881	80353746	-79246037	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	848	-12	4
1198	267	275	101	0	chr3	80354031	80354100	-79245683	+	MTEa	LTR	MaLR	256	331	-48	4
1198	1642	173	91	24	chr3	80354280	80354611	-79245172	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	42	4
1198	230	228	69	17	chr3	80355099	80355157	-79244626	-	MTEb	LTR	MaLR	-24	355	295	4
1198	612	270	74	12	chr3	80357650	80357983	-79241800	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	382	-8	4
1198	228	341	52	29	chr3	80359494	80359666	-79240117	-	LTR80A	LTR	ERVL	0	583	408	4
1198	672	304	139	9	chr3	80359739	80360098	-79239685	+	MLT2B4	LTR	ERVL	3	414	0	4
1198	694	321	25	90	chr3	80363897	80364298	-79235485	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	1	4
1198	641	377	49	81	chr3	80365926	80366394	-79233389	-	MER74C	LTR	ERVL	-3	457	5	4
1198	271	235	0	0	chr3	80367473	80367524	-79232259	+	ORR1C2	LTR	MaLR	46	96	-278	4
1198	917	204	61	52	chr3	80367643	80367855	-79231928	+	ORR1C2	LTR	MaLR	171	384	0	4
1198	391	202	66	19	chr3	80368222	80368328	-79231455	-	MER74C	LTR	ERVL	0	460	350	4
1198	518	229	454	43	chr3	80371470	80371733	-79228050	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
1198	231	266	63	0	chr3	80373039	80373118	-79226665	+	MT2B	LTR	ERVL	152	235	-366	4
1198	231	263	33	17	chr3	80373500	80373620	-79226163	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-756	753	632	4
1198	922	192	126	96	chr3	80381113	80381406	-79218377	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	228	5
1198	536	205	56	93	chr3	80382828	80382989	-79216794	-	RLTR24	LTR	ERV1	-276	253	99	5
1198	1218	242	117	54	chr3	80386313	80386759	-79213024	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	111	5
1198	645	111	10	0	chr3	80387736	80387835	-79211948	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-484	100	1	5
1198	1698	176	169	27	chr3	80388698	80389066	-79210717	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	1	5
1198	406	309	19	68	chr3	80389171	80389479	-79210304	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	375	-4	5
1198	1375	251	71	10	chr3	80391915	80392310	-79207473	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
1198	2739	244	36	129	chr3	80392310	80392700	-79207083	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	364	-734	5
1198	2739	244	36	129	chr3	80393209	80394021	-79205762	+	MTC-int	LTR	MaLR	365	1091	-7	5
1198	1724	191	96	10	chr3	80394029	80394416	-79205367	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	5
1198	518	334	83	48	chr3	80394878	80395334	-79204449	+	MER70A	LTR	ERVL	1	472	0	5
1198	595	304	109	39	chr3	80404366	80404725	-79195058	-	MER31B	LTR	ERV1	0	466	83	5
1198	295	339	28	0	chr3	80407594	80407703	-79192080	-	RMER15	LTR	ERVL	-33	542	431	5
1198	507	285	179	24	chr3	80407789	80408001	-79191782	-	RMER15	LTR	ERVL	-5	570	326	5
1198	796	251	145	15	chr3	80408584	80408923	-79190860	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	5
1198	364	280	59	136	chr3	80413413	80413686	-79186097	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	125	5
1198	1306	178	215	19	chr3	80419730	80419968	-79179815	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	145	5
1198	1306	178	215	19	chr3	80420435	80420512	-79179271	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-234	144	2	5
1198	302	200	145	13	chr3	80423707	80423783	-79176000	+	MTEb	LTR	MaLR	292	377	-2	5
1198	845	318	177	50	chr3	80423796	80424470	-79175313	+	MTEb-int	LTR	MaLR	9	794	-786	5
1198	854	306	67	10	chr3	80424468	80424768	-79175015	+	MTEa	LTR	MaLR	63	379	0	5
1198	1407	140	57	49	chr3	80432755	80433018	-79166765	+	RLTR15	LTR	ERVK	91	355	-4	5
1198	3431	123	51	0	chr3	80435568	80436098	-79163685	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	28	5
1198	1558	188	6	19	chr3	80454899	80455214	-79144569	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	6
1198	345	328	31	31	chr3	80456926	80457055	-79142728	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	129	-425	6
1198	422	328	260	16	chr3	80457662	80457976	-79141807	+	MLT1A1	LTR	MaLR	15	404	-4	6
1198	455	351	38	136	chr3	80458005	80458374	-79141409	+	MLT-int	LTR	MaLR	550	882	-853	6
1198	580	299	92	4	chr3	80458549	80458777	-79141006	+	MLT-int	LTR	MaLR	1437	1684	-51	6
1198	436	289	67	34	chr3	80458989	80459168	-79140615	+	MLT1A1	LTR	MaLR	216	400	-8	6
1198	1212	229	28	133	chr3	80464927	80465325	-79134458	+	MTD	LTR	MaLR	59	414	-5	6
1198	831	271	35	56	chr3	80465327	80465558	-79134225	+	MT2A	LTR	ERVL	1	226	-307	6
1199	1908	234	28	16	chr3	80482600	80483034	-79116749	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6644	7082	-324	6
1199	319	232	95	101	chr3	80483183	80483351	-79116432	+	RLTR43A	LTR	ERVK	198	364	0	6
1199	665	262	29	0	chr3	80496948	80497120	-79102663	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-192	182	6	6
1199	1300	194	144	15	chr3	80535196	80535536	-79064247	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1199	744	326	60	76	chr3	80555708	80556090	-79043693	-	MTE-int	LTR	MaLR	-48	1532	1157	5
1199	388	398	47	30	chr3	80556527	80556866	-79042917	-	MTE-int	LTR	MaLR	-691	889	545	5
1199	278	324	10	0	chr3	80556915	80557017	-79042766	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1115	465	363	5
1199	834	281	49	72	chr3	80557075	80557520	-79042263	+	RLTR20D	LTR	ERVK	46	564	-4	6
1199	534	345	86	22	chr3	80557529	80557796	-79041987	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1296	284	1	5
1199	2496	159	43	4	chr3	80566568	80567028	-79032755	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	84	6
1199	249	398	45	8	chr3	80568489	80568735	-79031048	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	74	328	-1081	7
1199	1403	204	141	11	chr3	80571061	80571430	-79028353	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	7
1199	1595	176	95	29	chr3	80587918	80588264	-79011519	+	MTC	LTR	MaLR	9	377	-44	9
1200	1018	282	127	6	chr3	80610770	80611102	-78988681	+	MTD	LTR	MaLR	48	419	0	1
1200	1051	331	26	12	chr3	80612295	80612640	-78987143	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	352	-27	1
1200	291	381	35	35	chr3	80615175	80615463	-78984320	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2144	3613	3326	1
1200	231	283	101	50	chr3	80621815	80621934	-78977849	+	MamGypLTR1b	LTR	Gypsy	611	735	-47	1
1200	557	318	101	21	chr3	80628691	80629108	-78970675	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1130	450	1	1
1200	252	273	56	11	chr3	80629129	80629218	-78970565	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	256	1
1200	1689	205	17	51	chr3	80630353	80630765	-78969018	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	1
1200	253	171	0	0	chr3	80631375	80631416	-78968367	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	344	1
1200	886	181	0	79	chr3	80631691	80631907	-78967876	-	RMER10B	LTR	ERVL	-1	397	199	1
1200	1120	185	14	82	chr3	80631913	80632195	-78967588	-	RMER10B	LTR	ERVL	-133	265	3	1
1200	798	269	47	9	chr3	80633356	80633570	-78966213	+	MTEa	LTR	MaLR	1	222	-157	1
1200	329	200	281	10	chr3	80633605	80633701	-78966082	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	122	-320	1
1200	1055	164	84	109	chr3	80634301	80634622	-78965161	+	RMER10A	LTR	ERVL	130	442	0	1
1200	321	250	53	0	chr3	80634625	80634701	-78965082	+	MTEa	LTR	MaLR	300	379	0	1
1200	1786	156	12	54	chr3	80636077	80636265	-78963518	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	138	1
1200	1786	156	12	54	chr3	80636483	80636626	-78963157	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-189	137	2	1
1200	475	252	166	81	chr3	80657137	80657469	-78942314	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	360	-8	2
1200	1458	205	109	50	chr3	80658948	80659369	-78940414	+	RLTR11B	LTR	ERVK	8	453	0	2
1200	227	132	113	0	chr3	80676311	80676364	-78923419	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-49	418	360	2
1200	437	307	71	38	chr3	80676352	80676562	-78923221	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-126	239	23	2
1200	446	348	131	28	chr3	80677182	80677640	-78922143	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	1	2
1200	805	199	98	6	chr3	80688787	80689087	-78910696	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	8	2
1200	2104	129	17	40	chr3	80692904	80693324	-78906459	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	2
1200	315	380	18	29	chr3	80694249	80694420	-78905363	-	MTEa	LTR	MaLR	-157	222	54	2
1200	2346	134	21	26	chr3	80700043	80700465	-78899318	+	BGLII	LTR	ERVK	2	421	0	2
1200	264	250	9	111	chr3	80708267	80708375	-78891408	-	MT2B	LTR	ERVL	-336	265	169	2
1200	1192	298	32	24	chr3	80722480	80722855	-78876928	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	1	2
1200	410	200	76	31	chr3	80729610	80729738	-78870045	+	MTEa	LTR	MaLR	246	379	0	2
1200	741	278	77	56	chr3	80729937	80730261	-78869522	+	MLT1A0	LTR	MaLR	12	342	-23	2
1200	2717	27	48	3	chr3	80730684	80731015	-78868768	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1200	13989	51	7	3	chr3	80731016	80732799	-78866984	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	2	1792	0	2
1200	2933	38	0	0	chr3	80732799	80733145	-78866638	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1200	477	313	87	16	chr3	80736079	80736264	-78863519	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	168	2
1200	247	266	36	60	chr3	80736299	80736383	-78863400	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-258	107	26	2
1200	232	271	0	0	chr3	80737567	80737649	-78862134	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	452	2
1200	1359	226	187	3	chr3	80738509	80738851	-78860932	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	405	-2	3
1201	490	268	101	6	chr3	80740496	80740654	-78859129	+	MTE2b	LTR	MaLR	207	379	0	3
1201	547	274	151	44	chr3	80740678	80740884	-78858899	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	228	-156	3
1201	4333	182	19	14	chr3	80741059	80741866	-78857917	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-292	811	1	3
1201	229	311	115	40	chr3	80743980	80744154	-78855629	-	ORR1E	LTR	MaLR	-165	194	8	3
1201	491	395	65	26	chr3	80752041	80752470	-78847313	+	MLT2F	LTR	ERVL	51	496	-167	3
1201	2136	214	11	16	chr3	80754376	80754812	-78844971	+	RMER15	LTR	ERVL	2	435	-140	3
1201	2004	112	48	13	chr3	80756271	80756587	-78843196	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1201	269	350	34	26	chr3	80757197	80757464	-78842319	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1726	3941	3673	3
1201	926	280	105	30	chr3	80757607	80757979	-78841804	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	5	3
1201	2346	182	0	12	chr3	80757981	80758393	-78841390	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	3
1201	234	307	0	62	chr3	80759545	80759625	-78840158	-	RMER6A	LTR	ERVK	-25	731	657	3
1201	411	403	89	17	chr3	80759655	80759892	-78839891	-	LTR16A	LTR	ERVL	0	451	198	3
1201	1348	201	195	146	chr3	80761394	80761860	-78837923	+	MT2A	LTR	ERVL	1	491	-42	3
1201	1348	201	195	146	chr3	80761934	80761975	-78837808	+	MT2A	LTR	ERVL	492	532	-1	3
1201	281	130	0	0	chr3	80762661	80762707	-78837076	-	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	-242	597	552	3
1201	225	295	32	32	chr3	80767268	80767331	-78832452	+	LTR75_1	LTR	ERV1	352	414	-132	3
1201	516	344	85	24	chr3	80767589	80767917	-78831866	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	7	3
1201	1798	149	21	60	chr3	80779269	80779605	-78820178	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	7	3
1201	262	359	9	19	chr3	80793269	80793374	-78806409	+	MTEb	LTR	MaLR	38	141	-218	3
1201	766	328	82	26	chr3	80793426	80793730	-78806053	-	ORR1E	LTR	MaLR	-38	321	1	3
1201	294	312	84	36	chr3	80793762	80793928	-78805855	+	MTEb	LTR	MaLR	204	377	-2	3
1201	2874	89	19	22	chr3	80795796	80796208	-78803575	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-4	411	1	3
1201	3800	165	45	12	chr3	80817558	80818225	-78781558	-	RLTR17	LTR	ERVK	-3	689	1	3
1201	769	309	34	37	chr3	80818491	80818787	-78780996	-	RMER5	LTR	ERV1	-9	525	231	3
1201	470	323	81	0	chr3	80819732	80819893	-78779890	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-196	174	1	3
1201	462	307	116	28	chr3	80821037	80821324	-78778459	-	RMER20B	LTR	ERVK	-12	504	182	4
1201	824	331	60	38	chr3	80823149	80823519	-78776264	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	2	4
1201	998	317	10	14	chr3	80825093	80825384	-78774399	-	MTD	LTR	MaLR	-129	290	1	4
1201	3427	174	176	68	chr3	80825788	80826160	-78773623	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	372	-731	4
1201	3427	176	52	80	chr3	80826329	80826754	-78773029	+	RLTR25B	LTR	ERVK	370	808	-220	4
1201	3427	174	176	68	chr3	80826800	80826898	-78772885	+	RLTR25B	LTR	ERVK	809	996	-107	4
1201	239	297	65	21	chr3	80835264	80835357	-78764426	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	421	4
1201	562	309	86	40	chr3	80860637	80860961	-78738822	-	MER34A	LTR	ERV1	-3	568	230	4
1201	1548	219	77	29	chr3	80860975	80861393	-78738390	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	5	4
1201	283	315	126	37	chr3	80861765	80861956	-78737827	-	MT2A	LTR	ERVL	-4	529	322	4
1201	330	291	86	79	chr3	80866001	80866362	-78733421	+	ORR1E	LTR	MaLR	12	360	-10	4
1201	2902	69	0	3	chr3	80868353	80868700	-78731083	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
1201	1093	181	50	0	chr3	80870101	80870300	-78729483	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	174	4
1201	1078	158	0	22	chr3	80870452	80870633	-78729150	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-202	182	6	4
1202	250	324	64	45	chr3	80891583	80891693	-78708090	-	RMER12	LTR	ERVK	-474	848	737	4
1202	245	203	51	63	chr3	80894458	80894537	-78705246	+	MTEa	LTR	MaLR	281	358	-21	4
1202	830	270	134	20	chr3	80895548	80895794	-78703989	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	274	-96	5
1202	245	128	40	60	chr3	80895891	80895941	-78703842	+	ORR1D2	LTR	MaLR	321	369	-1	5
1202	317	322	0	25	chr3	80898628	80898746	-78701037	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-381	134	20	5
1202	590	297	27	53	chr3	80899236	80899574	-78700209	-	RLTR15	LTR	ERVK	-3	356	28	5
1202	265	222	41	148	chr3	80902781	80902950	-78696833	+	RLTR25B	LTR	ERVK	371	521	-507	5
1202	235	318	179	34	chr3	80905014	80905193	-78694590	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-52	313	109	5
1202	1329	282	30	43	chr3	80916417	80916788	-78682995	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	1	5
1202	959	303	89	19	chr3	80919039	80919355	-78680428	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	365	28	5
1202	298	109	0	0	chr3	80948150	80948196	-78651587	-	MT2A	LTR	ERVL	-1	532	487	5
1202	445	304	0	9	chr3	80948323	80948439	-78651344	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	348	5
1202	660	251	45	128	chr3	80948453	80948718	-78651065	-	MT2A	LTR	ERVL	-289	244	2	5
1202	2835	93	2	12	chr3	80952249	80952653	-78647130	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1202	230	308	66	0	chr3	80953153	80953244	-78646539	-	MER110A	LTR	ERV1	0	468	372	5
1202	777	276	51	116	chr3	80953318	80953707	-78646076	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	364	1	5
1202	633	338	99	10	chr3	80956636	80956859	-78642924	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-18	347	95	5
1202	3229	46	5	5	chr3	80956859	80957255	-78642528	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1202	633	338	99	10	chr3	80957255	80957345	-78642438	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-271	94	7	5
1202	2099	146	13	26	chr3	80962389	80962770	-78637013	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	6
1202	1617	194	88	42	chr3	80966463	80966840	-78632943	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1202	2323	162	81	15	chr3	80971418	80971741	-78628042	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	177	6
1202	2323	162	81	15	chr3	80971787	80971932	-78627851	-	RLTR16	LTR	ERVK	-329	176	6	6
1203	237	261	46	115	chr3	81026584	81026714	-78573069	-	MT-int	LTR	MaLR	-834	264	144	3
1203	420	309	112	74	chr3	81050731	81051070	-78548713	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-20	534	183	6
1203	841	300	108	27	chr3	81053933	81054303	-78545480	+	MTE-int	LTR	MaLR	2	401	-1179	6
1203	495	331	24	0	chr3	81054308	81054477	-78545306	+	MTE-int	LTR	MaLR	542	714	-866	6
1203	452	333	91	65	chr3	81066721	81066980	-78532803	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	278	-81	7
1203	452	333	91	65	chr3	81067201	81067281	-78532502	+	ORR1E	LTR	MaLR	279	357	-2	7
1203	366	266	0	2	chr3	81069503	81069598	-78530185	+	MTD	LTR	MaLR	329	421	0	8
1203	273	232	0	0	chr3	81069598	81069654	-78530129	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	56	-1202	8
1203	272	330	23	0	chr3	81069713	81069801	-78529982	+	MTD-int	LTR	MaLR	53	142	-1116	8
1203	1490	240	35	35	chr3	81069804	81070175	-78529608	+	MTD-int	LTR	MaLR	733	1103	-155	8
1203	366	235	217	0	chr3	81071874	81071989	-78527794	+	MTD	LTR	MaLR	256	395	-24	8
1203	484	326	77	99	chr3	81073615	81073979	-78525804	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	35	8
1203	338	236	21	14	chr3	81081996	81082030	-78517753	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	612	646	-863	1
1203	341	305	170	5	chr3	81084429	81084617	-78515166	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	219	-248	1
1203	240	215	48	97	chr3	81087688	81087791	-78511992	+	LTR40c	LTR	ERVL	6	103	-362	1
1203	1028	290	83	24	chr3	81092402	81092741	-78507042	-	MTEb	LTR	MaLR	-20	359	1	1
1203	929	306	105	15	chr3	81100337	81100662	-78499121	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	1
1203	1643	222	50	6	chr3	81107936	81108294	-78491489	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1203	250	357	126	42	chr3	81120224	81120414	-78479369	+	LTR50	LTR	ERVL	2	207	-588	1
1203	320	316	21	70	chr3	81124026	81124169	-78475614	-	LTR40a	LTR	ERVL	-381	138	3	1
1203	439	271	65	65	chr3	81124950	81125104	-78474679	+	MER57C2	LTR	ERV1	61	214	-220	1
1203	3537	181	32	39	chr3	81128181	81128898	-78470885	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	712	-8	1
1204	1632	174	37	91	chr3	81135379	81135753	-78464030	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	1
1204	2453	200	139	6	chr3	81136888	81137427	-78462356	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
1204	770	233	60	64	chr3	81142197	81142503	-78457280	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	309	-20	1
1204	1033	288	61	37	chr3	81149483	81149890	-78449893	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	1	1
1204	1499	226	87	32	chr3	81153287	81153794	-78445989	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	585	0	2
1204	267	257	123	21	chr3	81155739	81155926	-78443857	+	RMER17B	LTR	ERVK	636	841	-117	2
1204	1049	85	0	113	chr3	81157282	81157467	-78442316	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-163	164	1	2
1204	8305	165	55	10	chr3	81157468	81159019	-78440764	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1	1962	341	2
1204	795	304	109	14	chr3	81161859	81162152	-78437631	+	MTE2b	LTR	MaLR	55	375	-4	2
1204	2689	187	102	14	chr3	81163350	81163984	-78435799	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	2
1204	535	315	56	74	chr3	81172680	81172896	-78426887	-	MLT1A	LTR	MaLR	-42	332	121	2
1204	1235	286	64	28	chr3	81175906	81176294	-78423489	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	2
1204	481	329	66	0	chr3	81178247	81178399	-78421384	-	RMER19C	LTR	ERVK	-307	304	143	2
1204	1968	214	47	70	chr3	81178393	81178954	-78420829	-	RMER19B	LTR	ERVK	-238	664	98	2
1204	1223	220	49	18	chr3	81178984	81179270	-78420513	-	RMER19A	LTR	ERVK	-307	304	2	2
1204	1131	102	51	6	chr3	81188686	81188863	-78410920	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	141	2
1204	523	302	61	119	chr3	81192519	81192812	-78406971	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	506	231	2
1204	225	339	65	41	chr3	81196913	81197011	-78402772	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	113	-246	2
1204	2354	204	64	64	chr3	81197011	81197586	-78402197	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	2
1204	225	339	65	41	chr3	81197586	81197610	-78402173	+	ORR1E	LTR	MaLR	114	134	-225	2
1204	730	263	28	142	chr3	81202779	81203244	-78396539	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-41	412	1	2
1204	874	299	89	19	chr3	81209803	81210117	-78389666	+	ORR1E	LTR	MaLR	22	357	-2	2
1204	307	369	16	0	chr3	81210571	81210693	-78389090	-	RMER12	LTR	ERVK	-472	850	727	2
1204	473	195	210	8	chr3	81214498	81214617	-78385166	-	RMER19B	LTR	ERVK	-451	451	309	2
1204	2211	187	11	100	chr3	81224685	81225213	-78374570	-	RMER15	LTR	ERVL	-94	481	1	3
1204	1359	239	199	21	chr3	81234882	81235091	-78364692	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	401	3
1204	1359	239	199	21	chr3	81235125	81235432	-78364351	-	RMER19C	LTR	ERVK	-211	400	5	3
1204	318	308	49	16	chr3	81241430	81241552	-78358231	-	ORR1E	LTR	MaLR	-212	147	22	3
1204	1091	174	11	126	chr3	81242163	81242426	-78357357	+	RLTR25B	LTR	ERVK	216	448	-580	3
1204	451	154	112	182	chr3	81242987	81243130	-78356653	+	RLTR25B	LTR	ERVK	620	752	-276	3
1204	291	245	160	20	chr3	81243194	81243294	-78356489	+	RLTR25B	LTR	ERVK	904	1017	-11	3
1204	259	304	43	17	chr3	81258247	81258364	-78341419	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1614	121	2	3
1204	240	319	121	40	chr3	81259425	81259598	-78340185	-	ORR1E	LTR	MaLR	-109	250	64	3
1204	441	316	22	43	chr3	81261400	81261585	-78338198	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-341	215	35	3
1204	3325	165	35	49	chr3	81263451	81264102	-78335681	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	3
1205	2566	90	77	0	chr3	81275251	81275640	-78324143	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	4	3
1205	2473	207	8	21	chr3	81279902	81280425	-78319358	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	1	3
1205	1008	301	29	20	chr3	81281110	81281459	-78318324	+	RMER15-int	LTR	ERVL	485	836	-4163	3
1205	574	255	88	58	chr3	81283251	81283429	-78316354	+	MTEb	LTR	MaLR	8	195	-184	3
1205	471	380	102	16	chr3	81285419	81285793	-78313990	-	MLT1D	LTR	MaLR	-66	439	34	3
1205	1368	289	39	107	chr3	81297584	81298126	-78301657	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-4	508	4	4
1205	251	356	89	9	chr3	81299110	81299351	-78300432	+	MT2A	LTR	ERVL	261	552	-10	4
1205	1560	116	104	7	chr3	81300718	81301005	-78298778	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	97	4
1205	2869	82	47	19	chr3	81301070	81301495	-78298288	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-248	1739	1303	4
1205	1280	90	72	99	chr3	81301583	81301805	-78297978	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-199	6343	6128	4
1205	983	69	295	0	chr3	81301808	81302005	-78297778	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-521	6021	5766	4
1205	3228	41	8	0	chr3	81302003	81302394	-78297389	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1142	5400	5007	4
1205	1230	125	11	40	chr3	81302394	81302794	-78296989	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1385	602	295	4
1205	1626	132	12	71	chr3	81302796	81303121	-78296662	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	106	4
1205	1811	172	33	59	chr3	81303789	81304178	-78295605	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	1	4
1205	1258	213	136	129	chr3	81305602	81306029	-78293754	+	MT2A	LTR	ERVL	2	458	-75	4
1205	1258	213	136	129	chr3	81306057	81306157	-78293626	+	MT2A	LTR	ERVL	459	533	0	4
1205	502	342	92	15	chr3	81307227	81307500	-78292283	+	RMER15	LTR	ERVL	282	575	0	4
1205	1346	353	50	46	chr3	81307500	81308010	-78291773	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1	520	-4479	4
1205	1612	201	123	24	chr3	81308010	81308393	-78291390	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1205	1346	353	50	46	chr3	81308393	81308648	-78291135	+	RMER15-int	LTR	ERVL	521	769	-4230	4
1205	2021	281	56	32	chr3	81308817	81309570	-78290213	+	RMER15-int	LTR	ERVL	860	1630	-3369	4
1205	1320	262	22	50	chr3	81309666	81309862	-78289921	+	MTD	LTR	MaLR	1	197	-222	4
1205	1320	262	22	50	chr3	81309888	81310053	-78289730	+	MTD	LTR	MaLR	198	352	-67	4
1205	732	308	75	58	chr3	81310057	81310471	-78289312	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4564	4984	-15	4
1205	353	246	76	42	chr3	81324899	81325018	-78274765	+	MTE2a	LTR	MaLR	145	267	-112	4
1205	4021	121	7	15	chr3	81329741	81330347	-78269436	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	4
1205	232	152	40	108	chr3	81333610	81333684	-78266099	+	LTR88b	LTR	Gypsy?	254	322	-515	4
1205	1674	175	26	63	chr3	81341052	81341478	-78258305	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	4
1205	431	283	35	26	chr3	81344223	81344339	-78255444	+	MTC	LTR	MaLR	295	411	-10	4
1205	259	294	54	20	chr3	81345945	81346094	-78253689	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1226	4441	4288	4
1205	466	291	2	48	chr3	81346118	81346271	-78253512	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2098	3387	3213	4
1205	2065	102	39	71	chr3	81371136	81371474	-78228309	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1205	390	254	43	9	chr3	81383395	81383510	-78216273	+	RMER15-int	LTR	ERVL	733	851	-4148	5
1205	2772	322	70	32	chr3	81383521	81384819	-78214964	+	RMER15-int	LTR	ERVL	757	2104	-2895	5
1205	737	256	132	57	chr3	81385388	81385773	-78214010	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4560	4973	-26	5
1205	332	258	50	165	chr3	81385789	81385989	-78213794	+	RMER15	LTR	ERVL	17	193	-382	5
1205	498	278	56	0	chr3	81386056	81386200	-78213583	+	RMER15	LTR	ERVL	424	575	0	5
1205	1850	121	60	32	chr3	81386791	81387107	-78212676	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	5
1205	1435	176	74	77	chr3	81390978	81391328	-78208455	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	389	-5	5
1205	1725	259	89	34	chr3	81391979	81392633	-78207150	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1205	776	265	114	56	chr3	81394975	81395440	-78204343	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	481	-211	5
1206	253	163	0	0	chr3	81411612	81411655	-78188128	+	MTC	LTR	MaLR	335	377	-44	5
1206	596	314	66	91	chr3	81412756	81413106	-78186677	+	MLT1A	LTR	MaLR	5	345	-29	5
1206	883	270	153	28	chr3	81416320	81416647	-78183136	+	MTE2b	LTR	MaLR	10	377	-2	5
1206	1736	132	128	3	chr3	81419169	81419322	-78180461	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	201	5
1206	1736	132	128	3	chr3	81419348	81419521	-78180262	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-168	200	3	5
1206	1657	189	9	135	chr3	81453281	81453704	-78146079	+	ORR1C1	LTR	MaLR	9	378	0	5
1206	260	311	75	59	chr3	81469093	81469217	-78130566	-	MLT1B	LTR	MaLR	-71	337	214	6
1206	228	289	51	26	chr3	81471744	81471822	-78127961	+	MLT1I	LTR	MaLR	61	140	-271	6
1206	661	341	82	22	chr3	81476606	81477070	-78122713	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-813	676	185	6
1206	346	350	64	23	chr3	81477235	81477454	-78122329	+	LTR80B	LTR	ERVL	109	336	-248	6
1206	490	243	162	65	chr3	81477455	81477717	-78122066	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	285	-80	6
1206	621	278	77	58	chr3	81479992	81480284	-78119499	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-31	328	6	6
1206	2253	97	78	3	chr3	81482685	81483017	-78116766	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	6
1206	2620	167	13	47	chr3	81483704	81484232	-78115551	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	510	-51	6
1206	366	235	38	98	chr3	81484243	81484447	-78115336	+	RLTR17	LTR	ERVK	349	614	-78	6
1206	239	351	70	70	chr3	81489770	81490012	-78109771	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-75	1296	1055	6
1206	371	304	100	17	chr3	81490038	81490269	-78109514	+	MLT1-int	LTR	MaLR	231	480	-891	6
1206	554	164	9	46	chr3	81501372	81501481	-78098302	-	RMER6D	LTR	ERVK	-16	704	600	4
1206	4286	132	43	18	chr3	81507255	81508044	-78091739	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	1
1206	3008	48	0	0	chr3	81521846	81522200	-78077583	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	2
1206	440	374	86	21	chr3	81525830	81526109	-78073674	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-259	301	5	2
1206	2317	169	74	45	chr3	81526152	81526665	-78073118	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	2
1207	2802	52	6	0	chr3	81527864	81528208	-78071575	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
1207	259	397	48	24	chr3	81533440	81533649	-78066134	+	LTR16B1	LTR	ERVL	6	219	-261	4
1207	388	316	51	25	chr3	81533639	81533821	-78065962	+	MLT1E1	LTR	MaLR	379	651	-3	4
1207	1633	201	46	15	chr3	81541848	81542176	-78057607	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-16	378	41	5
1207	1914	125	84	3	chr3	81543560	81543880	-78055903	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	5
1207	2041	237	59	52	chr3	81552358	81552914	-78046869	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	16	7
1207	2037	154	67	11	chr3	81570358	81570731	-78029052	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	8
1207	528	289	88	11	chr3	81573638	81573820	-78025963	+	MLT1A0	LTR	MaLR	162	357	-8	9
1207	453	285	94	15	chr3	81573821	81574024	-78025759	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	2	220	-1515	9
1207	988	300	56	52	chr3	81574556	81575064	-78024719	+	MLT-int	LTR	MaLR	99	699	-1036	9
1207	468	284	22	100	chr3	81575465	81575645	-78024138	+	MLT-int	LTR	MaLR	1323	1488	-247	9
1207	1738	150	56	48	chr3	81575649	81576027	-78023756	+	RMER6B	LTR	ERVK	2	382	-79	1
1207	920	193	11	22	chr3	81575997	81576182	-78023601	-	RMER6B	LTR	ERVK	-278	183	1	1
1207	451	286	15	15	chr3	81576399	81576534	-78023249	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	135	-230	1
1207	1257	322	55	90	chr3	81586696	81587375	-78012408	-	LTR41B	LTR	ERVL	0	758	104	1
1207	949	168	12	103	chr3	81590304	81590535	-78009248	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	275	-119	1
1207	274	75	0	48	chr3	81590514	81590556	-78009227	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-988	40	1	1
1207	1950	112	42	66	chr3	81591619	81591954	-78007829	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1207	1622	147	54	75	chr3	81604270	81604601	-77995182	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	3	1
1207	334	248	74	44	chr3	81608995	81609130	-77990653	+	LTR37B	LTR	ERV1	330	468	0	1
1207	305	290	141	45	chr3	81610915	81611011	-77988772	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1352	228	129	1
1207	305	290	141	45	chr3	81611222	81611302	-77988481	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1452	128	35	1
1207	930	194	38	0	chr3	81614481	81614641	-77985142	+	MTC	LTR	MaLR	180	345	-76	1
1207	3355	197	49	13	chr3	81628212	81628526	-77971257	+	RMER6D	LTR	ERVK	22	347	-373	1
1207	3355	197	49	13	chr3	81628564	81628924	-77970859	+	RMER6D	LTR	ERVK	348	720	0	1
1207	247	184	16	228	chr3	81631823	81631950	-77967833	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	12	111	-211	1
1207	3184	168	41	64	chr3	81639371	81640028	-77959755	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	1
1207	268	424	23	28	chr3	81641227	81641443	-77958340	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	215	-144	1
1207	2409	118	69	88	chr3	81641963	81642454	-77957329	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1207	1369	143	297	30	chr3	81642531	81642827	-77956956	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	377	-1	1
1207	1066	208	58	98	chr3	81643696	81643926	-77955857	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	205	-205	1
1207	1066	208	58	98	chr3	81643955	81644151	-77955632	+	RMER17C	LTR	ERVK	206	410	0	1
1207	1137	231	87	89	chr3	81644941	81645401	-77954382	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	1	1
1207	2770	88	20	23	chr3	81646347	81646744	-77953039	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1207	267	371	72	8	chr3	81651394	81651519	-77948264	+	ORR1E	LTR	MaLR	42	174	-185	2
1207	947	319	65	38	chr3	81651681	81652078	-77947705	+	MTE-int	LTR	MaLR	1	408	-1172	2
1208	1802	164	13	94	chr3	81660946	81661330	-77938453	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	393	-1	2
1208	2709	93	39	5	chr3	81662161	81662548	-77937235	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
1208	1921	278	65	45	chr3	81664654	81665150	-77934633	-	RLTR40	LTR	ERVK	-4	813	298	2
1208	1921	278	65	45	chr3	81665189	81665471	-77934312	-	RLTR40	LTR	ERVK	-520	297	19	2
1208	3549	20	0	0	chr3	81667917	81668313	-77931470	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1208	325	277	123	24	chr3	81668674	81668844	-77930939	+	LTR73	LTR	ERV1	166	352	-220	2
1208	271	268	44	44	chr3	81669507	81669597	-77930186	-	MER34A	LTR	ERV1	-478	93	4	2
1208	227	271	139	12	chr3	81673359	81673445	-77926338	+	LTR48B	LTR	ERV1	4	100	-544	2
1208	881	225	23	28	chr3	81677196	81677411	-77922372	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	109	2
1208	1637	258	28	6	chr3	81686878	81687286	-77912497	+	MTC	LTR	MaLR	1	404	-17	2
1208	1616	171	7	20	chr3	81696200	81696505	-77903278	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	301	-10	2
1208	404	363	83	78	chr3	81705097	81705470	-77894313	+	MTEa	LTR	MaLR	5	379	0	2
1208	717	288	103	9	chr3	81705778	81706002	-77893781	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	287	2
1208	351	233	77	11	chr3	81706048	81706139	-77893644	-	MTEa	LTR	MaLR	-264	115	19	2
1208	531	350	62	35	chr3	81727562	81728077	-77871706	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-12	544	1	2
1208	814	275	16	63	chr3	81731376	81731628	-77868155	+	MTE2b	LTR	MaLR	140	379	0	2
1208	1232	290	18	36	chr3	81737727	81738113	-77861670	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	2
1208	371	355	103	43	chr3	81754804	81755154	-77844629	+	MLT1J	LTR	MaLR	38	408	-104	3
1208	3510	20	2	0	chr3	81769976	81770371	-77829412	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1208	2394	176	49	30	chr3	81773967	81774363	-77825420	+	RLTR16	LTR	ERVK	6	400	-105	3
1208	2394	176	49	30	chr3	81774405	81774499	-77825284	+	RLTR16	LTR	ERVK	401	505	0	3
1208	251	224	99	66	chr3	81786443	81786534	-77813249	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	372	279	3
1208	477	354	44	39	chr3	81786637	81786840	-77812943	-	ORR1E	LTR	MaLR	-154	205	2	3
1209	1237	231	75	72	chr3	81789015	81789389	-77810394	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	379	0	3
1209	1148	262	52	55	chr3	81791032	81791359	-77808424	-	ORR1E	LTR	MaLR	-29	330	5	3
1209	283	95	0	0	chr3	81791917	81791959	-77807824	+	MTD	LTR	MaLR	356	397	-22	3
1209	1481	202	108	9	chr3	81792440	81792775	-77807008	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	372	-2	3
1209	3469	246	93	62	chr3	81792775	81793030	-77806753	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	4	235	-1135	3
1209	3469	246	93	62	chr3	81793068	81793829	-77805954	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	236	1052	-318	3
1209	290	314	116	62	chr3	81796321	81796596	-77803187	-	LTR48	LTR	ERV1	-83	704	415	3
1209	2298	44	3	101	chr3	81814398	81814754	-77785029	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	321	-69	3
1209	265	159	0	31	chr3	81814772	81814837	-77784946	+	RLTR10	LTR	ERVK	259	321	-69	3
1209	882	78	0	15	chr3	81814838	81814968	-77784815	+	RLTR10	LTR	ERVK	259	386	-4	3
1209	311	332	55	135	chr3	81816581	81816818	-77782965	-	MTE2b	LTR	MaLR	-10	369	152	4
1209	292	322	53	20	chr3	81817065	81817217	-77782566	-	MTE2b	LTR	MaLR	-257	162	6	4
1209	866	308	65	61	chr3	81825334	81825389	-77774394	+	MTD	LTR	MaLR	6	56	-363	4
1209	866	308	65	61	chr3	81825615	81825971	-77773812	+	MTD	LTR	MaLR	57	419	0	4
1209	528	306	7	14	chr3	81829379	81829525	-77770258	+	MTE2b	LTR	MaLR	168	312	-67	4
1209	2537	185	38	6	chr3	81829971	81830444	-77769339	-	MTC-int	LTR	MaLR	-329	929	442	4
1209	263	218	12	93	chr3	81843628	81843643	-77756140	-	MT2B	LTR	ERVL	-374	227	149	4
1209	2222	153	89	95	chr3	81853715	81854243	-77745540	-	RLTR24	LTR	ERV1	-2	527	3	4
1209	398	342	53	7	chr3	81856347	81856497	-77743286	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-359	196	40	4
1209	477	313	84	36	chr3	81858140	81858365	-77741418	+	RMER5	LTR	ERV1	33	268	-266	4
1209	372	267	56	28	chr3	81858347	81858455	-77741328	+	RMER5	LTR	ERV1	414	524	-10	4
1209	501	261	118	0	chr3	81879992	81880145	-77719638	+	RMER15	LTR	ERVL	405	575	0	4
1209	398	304	98	90	chr3	81881127	81881167	-77718616	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-27	500	451	4
1209	1712	196	12	0	chr3	81881167	81881489	-77718294	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	4
1209	428	275	55	99	chr3	81881489	81881942	-77717841	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-77	450	6	4
1209	545	324	56	32	chr3	81882726	81882978	-77716805	-	MTD	LTR	MaLR	-161	258	1	4
1209	506	291	82	5	chr3	81883128	81883335	-77716448	+	MER31A	LTR	ERV1	13	235	-250	4
1209	435	331	122	37	chr3	81884868	81885261	-77714522	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	490	-15	4
1209	297	347	66	7	chr3	81885314	81885465	-77714318	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	160	-214	4
1209	1182	278	101	12	chr3	81885519	81885857	-77713926	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	3	4
1209	391	269	84	14	chr3	81885863	81886006	-77713777	+	MLT1A0	LTR	MaLR	212	364	-1	4
1209	1574	162	102	22	chr3	81886489	81886804	-77712979	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	340	-350	5
1209	926	186	70	39	chr3	81888521	81888894	-77710889	+	RMER6C	LTR	ERVK	472	720	0	5
1209	254	327	19	19	chr3	81891418	81891524	-77708259	+	MLT-int	LTR	MaLR	181	286	-1449	5
1209	236	289	92	46	chr3	81900934	81901021	-77698762	+	MER21B	LTR	ERV1	375	465	-398	5
1209	559	348	127	15	chr3	81905117	81905599	-77694184	+	MLT1G	LTR	MaLR	1	575	-4	5
151	331	308	148	39	chr3	81919858	81920061	-77679722	+	RMER15	LTR	ERVL	332	556	-19	5
1210	531	308	56	68	chr3	81923476	81923728	-77676055	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-28	588	232	5
1210	422	329	163	45	chr3	81923863	81924075	-77675708	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-295	321	69	5
1210	2116	176	118	60	chr3	81925248	81925799	-77673984	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	583	-2	5
1210	2937	71	10	5	chr3	81926506	81926904	-77672879	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1210	404	297	106	63	chr3	81952744	81952999	-77646784	+	MLT1D	LTR	MaLR	149	414	-91	5
1210	488	339	143	19	chr3	81953053	81953570	-77646213	+	MLT1D-int	LTR	MaLR	2	582	-789	5
1210	356	317	87	92	chr3	81960977	81961072	-77638711	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	295	6
1210	356	317	87	92	chr3	81961265	81961398	-77638385	-	MTE2b	LTR	MaLR	-85	294	152	6
1210	1326	212	56	74	chr3	81962972	81963349	-77636434	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	371	-3	6
1210	279	251	66	76	chr3	81968335	81968544	-77631239	-	MLT1D	LTR	MaLR	-21	484	229	6
1210	302	206	14	42	chr3	81975443	81975514	-77624269	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-41	367	299	6
1210	2900	168	30	19	chr3	81976556	81976730	-77623053	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	172	-369	6
1210	2900	168	30	19	chr3	81976840	81977200	-77622583	+	RLTR20A	LTR	ERVK	173	540	-1	6
1210	1489	247	13	8	chr3	81982572	81982944	-77616839	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	6
1210	892	333	30	62	chr3	81983393	81983764	-77616019	+	MTEa	LTR	MaLR	21	379	0	6
1210	272	274	133	25	chr3	81986904	81987024	-77612759	-	ORR1E	LTR	MaLR	-226	133	1	6
1210	612	300	45	62	chr3	81994273	81994497	-77605286	+	ORR1E	LTR	MaLR	93	312	-47	6
1210	1214	198	146	7	chr3	82007311	82007591	-77592192	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-55	319	1	9
1210	1309	271	51	8	chr3	82008014	82008367	-77591416	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	3	1
1210	974	287	59	56	chr3	82008374	82008835	-77590948	+	MT2A	LTR	ERVL	1	462	-71	1
1210	921	260	54	47	chr3	82011184	82011535	-77588248	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	419	12	1
1210	737	275	0	60	chr3	82021365	82021566	-77578217	+	MTC-int	LTR	MaLR	380	568	-690	3
1210	572	261	86	67	chr3	82021742	82021951	-77577832	-	MTC-int	LTR	MaLR	-442	816	604	3
1210	640	107	197	0	chr3	82023746	82023868	-77575915	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	146	-248	3
1210	868	152	262	8	chr3	82023880	82023944	-77575839	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-93	1010	907	3
1210	3538	149	139	94	chr3	82024095	82024858	-77574925	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-218	885	9	3
1210	1369	157	4	46	chr3	82024863	82025103	-77574680	+	ORR1B1	LTR	MaLR	164	393	-1	3
1210	454	323	127	47	chr3	82025281	82025619	-77574164	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	365	0	3
1210	366	355	113	41	chr3	82027380	82027671	-77572112	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	312	-47	4
1210	796	261	202	12	chr3	82027948	82028289	-77571494	-	MER57D	LTR	ERV1	-5	406	1	4
1210	266	356	52	26	chr3	82028317	82028470	-77571313	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	428	4
1210	255	343	28	19	chr3	82028451	82028558	-77571225	-	MTEa	LTR	MaLR	-260	119	12	4
1210	420	288	52	135	chr3	82034856	82035145	-77564638	+	MLT1E	LTR	MaLR	387	651	-2	5
1210	3892	45	19	0	chr3	82035682	82036148	-77563635	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	5
1210	1734	231	45	163	chr3	82036622	82037315	-77562468	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	5
1210	1464	266	97	76	chr3	82037962	82038797	-77560986	+	MTD-int	LTR	MaLR	272	1258	0	5
1210	1268	277	47	3	chr3	82038797	82039117	-77560666	+	MTD	LTR	MaLR	10	343	-76	5
1210	393	293	29	29	chr3	82039168	82039305	-77560478	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1443	137	1	5
1210	980	295	67	15	chr3	82039309	82039636	-77560147	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	10	5
1210	2719	214	103	85	chr3	82044456	82045346	-77554437	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	6
1210	226	358	30	50	chr3	82048277	82048377	-77551406	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	102	-257	7
151	3883	123	29	19	chr3	82050888	82051517	-77548266	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1329	1963	0	7
1211	2005	144	3	58	chr3	82051517	82051863	-77547920	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1211	248	208	0	111	chr3	82051863	82051874	-77547909	+	ORR1D1	LTR	MaLR	69	77	-307	7
1211	337	294	233	0	chr3	82051897	82052060	-77547723	+	ORR1D1	LTR	MaLR	131	331	-43	7
1211	277	285	74	68	chr3	82055874	82055929	-77543854	+	MT2B2	LTR	ERVL	116	171	-413	7
1211	595	185	145	34	chr3	82060767	82060946	-77538837	+	MTC-int	LTR	MaLR	1060	1258	0	8
1211	2151	180	37	56	chr3	82060946	82061375	-77538408	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	8
1211	489	128	35	0	chr3	82061696	82061782	-77538001	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-238	89	1	8
1211	794	233	175	31	chr3	82063086	82063343	-77536440	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	527	-100	8
1211	1009	304	83	14	chr3	82064408	82064854	-77534929	+	RMER5	LTR	ERV1	58	534	0	8
1211	3160	72	26	3	chr3	82067416	82067807	-77531976	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	9
1211	6733	120	3	130	chr3	82067807	82069064	-77530719	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	1	9
1211	3062	90	26	3	chr3	82069064	82069454	-77530329	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	2	9
1211	1072	302	82	37	chr3	82069703	82070081	-77529702	+	MTD	LTR	MaLR	25	419	0	9
1211	963	254	88	83	chr3	82077056	82077443	-77522340	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	389	-471	1
1211	592	128	168	0	chr3	82078090	82078215	-77521568	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	146	-248	1
1211	842	145	7	21	chr3	82078216	82078357	-77521426	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	965	1
1211	349	336	84	54	chr3	82080526	82080674	-77519109	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	154	-205	1
1211	1057	267	198	27	chr3	82080674	82081124	-77518659	-	MT2A	LTR	ERVL	-3	530	4	1
1211	349	336	84	54	chr3	82081124	82081271	-77518512	+	ORR1E	LTR	MaLR	155	308	-51	1
1211	589	246	22	15	chr3	82081361	82081497	-77518286	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	283	1
1211	375	364	25	31	chr3	82081493	82081652	-77518131	-	MTD	LTR	MaLR	-256	163	6	1
1211	4657	14	4	0	chr3	82087287	82087778	-77512005	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1211	322	0	0	0	chr3	82087778	82087816	-77511967	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	1
1211	387	167	46	35	chr3	82087816	82087903	-77511880	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	1
1211	19044	21	1	0	chr3	82087903	82090023	-77509760	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	3240	1
1211	12225	10	35	0	chr3	82090016	82092084	-77507699	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3345	2140	1	1
1211	4657	14	4	0	chr3	82092084	82092575	-77507208	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1211	294	303	89	38	chr3	82095228	82095386	-77504397	-	MLT1C	LTR	MaLR	-194	273	108	1
1211	2018	167	40	8	chr3	82102864	82103215	-77496568	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-5	362	1	1
1211	258	247	44	56	chr3	82103957	82104047	-77495736	-	LTR45C	LTR	ERV1	-4	535	447	1
1211	334	250	109	18	chr3	82104354	82104464	-77495319	+	MTE2b	LTR	MaLR	56	175	-204	1
1211	1866	176	96	9	chr3	82107521	82107865	-77491918	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1211	298	340	42	51	chr3	82109171	82109427	-77490356	-	MTEb	LTR	MaLR	-23	356	86	1
1211	2268	92	18	59	chr3	82113776	82114113	-77485670	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	1
1211	1012	295	61	19	chr3	82118285	82118662	-77481121	-	MER95	LTR	ERV	-10	421	29	1
1211	2706	209	60	68	chr3	82127317	82128179	-77471604	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	1
1211	6206	103	57	8	chr3	82130351	82131288	-77468495	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	1
1211	4053	57	14	4	chr3	82132019	82132526	-77467257	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	1
1211	663	221	108	108	chr3	82140414	82140599	-77459184	+	RLTR42	LTR	ERVK	1	189	-50	1
1211	663	221	108	108	chr3	82140770	82140797	-77458986	+	RLTR42	LTR	ERVK	190	213	-26	1
1211	388	213	111	0	chr3	82141960	82142068	-77457715	-	ORR1E	LTR	MaLR	-239	120	1	1
1211	227	230	50	75	chr3	82142987	82143067	-77456716	-	LTR83	LTR	ERVL	-644	136	59	1
1211	268	375	37	6	chr3	82146410	82146571	-77453212	-	MLT1H	LTR	MaLR	-363	186	21	1
1211	365	305	32	19	chr3	82148236	82148393	-77451390	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3963	4121	-1546	1
1211	596	141	174	0	chr3	82149154	82149275	-77450508	-	RLTR14	LTR	ERV1	-9	373	232	1
1211	1256	141	10	14	chr3	82149440	82149648	-77450135	-	RLTR14	LTR	ERV1	-154	228	22	1
1211	2755	78	47	5	chr3	82149664	82150065	-77449718	+	BGLII	LTR	ERVK	4	421	0	1
1211	348	106	0	0	chr3	82150250	82150297	-77449486	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	466	1
1211	608	142	68	13	chr3	82150295	82150414	-77449369	+	RLTR1B	LTR	ERV1	368	590	-15	1
1211	517	68	14	0	chr3	82150414	82150488	-77449295	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	438	1
1211	770	152	57	44	chr3	82150505	82150663	-77449120	+	RLTR12B	LTR	ERVK	369	528	0	1
1211	1909	131	18	59	chr3	82153385	82153725	-77446058	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	2
1211	1770	183	70	39	chr3	82153825	82154184	-77445599	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	25	2
1211	319	280	204	47	chr3	82158482	82158654	-77441129	+	RMER15	LTR	ERVL	336	534	-41	2
1211	605	259	75	40	chr3	82164295	82164571	-77435212	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-14	405	1	2
1211	3432	243	66	60	chr3	82164574	82165631	-77434152	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-3	1367	305	2
1211	1590	230	65	10	chr3	82165641	82166027	-77433756	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	1	2
1211	789	236	199	15	chr3	82166027	82166288	-77433495	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1061	309	1	2
1211	1131	238	67	14	chr3	82166292	82166638	-77433145	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	3	2
1211	274	130	22	0	chr3	82170543	82170589	-77429194	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	359	2
1211	1039	164	23	33	chr3	82170589	82170803	-77428980	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	156	2
1211	604	219	0	58	chr3	82172864	82173019	-77426764	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-221	146	1	2
1211	683	231	138	19	chr3	82173063	82173323	-77426460	-	MTD	LTR	MaLR	-116	303	13	2
1211	1306	234	86	8	chr3	82178734	82179105	-77420678	+	MTD	LTR	MaLR	6	405	-14	2
1211	1892	141	102	17	chr3	82179701	82180062	-77419721	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	2
1212	3638	132	63	45	chr3	82190944	82191357	-77408426	-	RMER6A	LTR	ERVK	-2	754	318	2
1212	3638	132	63	45	chr3	82192011	82192337	-77407446	-	RMER6A	LTR	ERVK	-439	317	1	2
1212	379	305	65	85	chr3	82209179	82209473	-77390310	+	MLT1A	LTR	MaLR	62	349	-25	2
1212	242	327	20	10	chr3	82217266	82217368	-77382415	+	MER67D	LTR	ERV1	3	105	-409	2
1212	309	305	101	24	chr3	82217387	82217636	-77382147	+	MER67D	LTR	ERV1	180	436	-78	2
1212	362	268	158	19	chr3	82220518	82220727	-77379056	+	MLT1A0	LTR	MaLR	128	365	0	2
1212	558	345	60	11	chr3	82220727	82221008	-77378775	+	MLT2C1	LTR	ERVL	35	329	-68	2
1212	251	89	0	4	chr3	82221533	82221577	-77378206	+	MLT2C1	LTR	ERVL	518	560	0	2
1212	1026	250	14	50	chr3	82221944	82222226	-77377557	-	MTE2b	LTR	MaLR	-36	343	72	2
1212	1077	224	106	109	chr3	82222364	82222740	-77377043	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	375	-4	2
1212	352	373	48	0	chr3	82226228	82226354	-77373429	-	MLT1J	LTR	MaLR	-306	206	75	2
1212	1668	158	38	132	chr3	82231801	82232218	-77367565	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	2
1212	312	299	7	118	chr3	82233240	82233392	-77366391	+	RMER4B	LTR	ERVK	36	170	-415	3
1212	240	208	21	0	chr3	82235201	82235249	-77364534	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-656	1136	1088	3
1212	1260	249	41	75	chr3	82238659	82239046	-77360737	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1212	375	329	67	89	chr3	82240539	82240909	-77358874	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-106	461	1	3
1212	294	298	107	70	chr3	82241034	82241165	-77358618	+	MLT1C	LTR	MaLR	108	240	-150	3
1212	317	270	68	50	chr3	82241269	82241408	-77358375	+	MLT1C	LTR	MaLR	241	465	-2	3
1212	2397	104	139	41	chr3	82241518	82241957	-77357826	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	3
1212	1254	266	58	36	chr3	82243504	82243867	-77355916	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	1	3
1212	2469	96	30	77	chr3	82244776	82245207	-77354576	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-4	411	1	3
1212	350	164	14	0	chr3	82245208	82245281	-77354502	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2	7404	7331	3
1212	4782	156	16	21	chr3	82245495	82246528	-77353255	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1179	6227	5440	3
1212	747	320	50	65	chr3	82247577	82247854	-77351929	+	MTEb	LTR	MaLR	4	276	-103	3
1212	1956	190	62	5	chr3	82248184	82248571	-77351212	+	MTC	LTR	MaLR	13	421	0	3
1212	1408	262	59	8	chr3	82253261	82253650	-77346133	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	3	3
1212	941	283	75	41	chr3	82254007	82254449	-77345334	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-25	503	47	3
1212	4513	183	42	56	chr3	82254478	82255599	-77344184	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2	8957	7853	3
1212	339	192	79	88	chr3	82255651	82255765	-77344018	-	RMER4B	LTR	ERVK	-36	549	437	3
1212	11872	201	32	43	chr3	82256026	82259069	-77340714	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4864	4095	1085	3
1212	2587	265	57	17	chr3	82259368	82260109	-77339674	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7876	1083	311	3
1212	2587	265	57	17	chr3	82260139	82260326	-77339457	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8649	310	119	3
1212	339	318	82	44	chr3	82263663	82263821	-77335962	+	RMER5	LTR	ERV1	49	212	-322	3
1212	1092	272	126	6	chr3	82268535	82268861	-77330922	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	2	3
1212	2731	183	38	41	chr3	82269064	82269361	-77330422	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	218	3
1212	3477	18	5	0	chr3	82269361	82269755	-77330028	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1212	2731	183	38	41	chr3	82269755	82269988	-77329795	-	RLTR24	LTR	ERV1	-312	217	1	3
1212	3377	33	5	0	chr3	82270203	82270597	-77329186	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1212	3219	84	55	2	chr3	82273235	82273686	-77326097	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	3
1212	897	286	55	0	chr3	82274352	82274590	-77325193	-	MTE2b	LTR	MaLR	-128	251	1	3
1212	303	380	124	5	chr3	82276267	82276468	-77323315	-	MLT1I	LTR	MaLR	-145	266	42	3
1212	522	250	47	115	chr3	82276745	82276980	-77322803	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	357	3
1212	387	207	121	36	chr3	82277002	82277142	-77322641	-	RMER15	LTR	ERVL	-378	197	46	3
1212	490	310	48	87	chr3	82277411	82277774	-77322009	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	10	3
1212	2199	95	21	48	chr3	82284715	82285092	-77314691	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	3
1212	52413	30	8	6	chr3	82285096	82291549	-77308234	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3	6478	8	3
1212	2199	95	21	48	chr3	82291549	82291926	-77307857	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	3
1212	269	270	22	22	chr3	82294012	82294101	-77305682	+	MLT1C	LTR	MaLR	267	416	-51	3
1212	225	320	0	99	chr3	82296631	82296652	-77303131	+	MT2B2	LTR	ERVL	145	154	-430	3
1212	701	292	56	93	chr3	82301457	82301835	-77297948	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	364	-1	3
1212	239	346	12	0	chr3	82303045	82303126	-77296657	+	RMER15	LTR	ERVL	478	559	-16	3
1212	230	284	104	38	chr3	82307558	82307664	-77292119	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-28	380	268	4
1212	311	348	70	27	chr3	82309396	82309582	-77290201	-	MLT1L	LTR	MaLR	0	610	417	4
1213	483	360	77	60	chr3	82316408	82316760	-77283023	+	MT2A	LTR	ERVL	78	435	-98	4
1213	255	253	67	78	chr3	82321502	82321592	-77278191	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-321	381	293	4
1213	1491	222	78	3	chr3	82321965	82322312	-77277471	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	373	-1	4
1213	456	320	118	99	chr3	82331259	82331523	-77268260	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-14	394	81	4
1213	3028	73	5	22	chr3	82331523	82331929	-77267854	+	MTB	LTR	MaLR	1	399	-1	4
1213	288	319	123	113	chr3	82331929	82331992	-77267791	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-285	80	19	4
1213	368	198	22	34	chr3	82332113	82332202	-77267581	+	MTD	LTR	MaLR	7	94	-327	4
1213	970	207	133	24	chr3	82333163	82333411	-77266372	+	MTD	LTR	MaLR	84	358	-61	4
1213	349	219	14	0	chr3	82335392	82335465	-77264318	+	MTD	LTR	MaLR	344	417	-2	4
1213	623	268	83	55	chr3	82337197	82337450	-77262333	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	302	4
1213	1555	217	73	60	chr3	82337509	82337906	-77261877	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	4
1213	1202	335	23	12	chr3	82338103	82338589	-77261194	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-330	4669	4179	4
1213	992	317	7	3	chr3	82340102	82340387	-77259396	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3605	1394	1109	4
1213	663	313	121	94	chr3	82341116	82341603	-77258180	+	MLT2B3	LTR	ERVL	48	547	-7	4
1213	367	309	64	53	chr3	82348314	82348481	-77251302	+	LTR33A_	LTR	ERVL	3	171	-360	4
1213	496	215	6	89	chr3	82360647	82360710	-77239073	-	MT2A	LTR	ERVL	-1	532	470	4
1213	496	215	6	89	chr3	82360766	82360860	-77238923	-	MT2A	LTR	ERVL	-64	469	388	4
1213	226	314	123	51	chr3	82360877	82361112	-77238671	-	ORR1E	LTR	MaLR	-105	254	3	4
1213	367	310	122	69	chr3	82361843	82362299	-77237484	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-15	580	38	4
1213	256	262	72	36	chr3	82366555	82366595	-77233188	-	MER70B	LTR	ERVL	-88	490	447	4
1213	353	258	86	31	chr3	82366595	82366723	-77233060	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	245	4
1213	371	313	60	32	chr3	82367641	82367826	-77231957	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	3	4
1213	421	330	56	36	chr3	82373477	82373672	-77226111	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	199	-160	5
1213	263	250	65	87	chr3	82373742	82373834	-77225949	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	280	5
1213	2186	75	36	3	chr3	82377110	82377417	-77222366	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-10	317	1	5
1213	878	290	95	28	chr3	82382989	82383315	-77216468	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-17	348	1	5
1213	274	356	41	33	chr3	82386662	82386784	-77212999	+	MLT1K	LTR	MaLR	330	452	-143	5
1213	828	227	116	5	chr3	82388809	82389008	-77210775	-	RMER21B	LTR	ERV1	-275	567	347	5
1213	298	260	73	61	chr3	82389017	82389181	-77210602	-	RMER21B	LTR	ERV1	-611	231	66	5
1213	2023	218	37	7	chr3	82390326	82390729	-77209054	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	3	5
1213	3006	33	198	0	chr3	82393150	82393514	-77206269	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	5
1213	8343	27	2	0	chr3	82393514	82394448	-77205335	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	6646	5
1213	27870	40	0	0	chr3	82394434	82397653	-77202130	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	2591	5
1213	1017	25	0	0	chr3	82397648	82397768	-77202015	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1216	771	652	5
1213	413	22	0	0	chr3	82397936	82397982	-77201801	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	222	5
1213	248	191	0	0	chr3	82397982	82398024	-77201759	-	RLTR27	LTR	ERVK	-37	272	231	5
1213	1550	28	0	0	chr3	82398024	82398204	-77201579	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7401	180	1	5
1213	3050	33	192	0	chr3	82398204	82398569	-77201214	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	2	5
1213	2648	68	5	27	chr3	82401960	82402336	-77197447	+	MTB	LTR	MaLR	1	368	-32	5
1213	321	335	144	6	chr3	82403444	82403624	-77196159	+	MLT1E2	LTR	MaLR	206	410	-217	5
1213	537	157	0	0	chr3	82403674	82403757	-77196026	+	RMER15	LTR	ERVL	477	559	-16	5
1213	336	168	216	21	chr3	82404858	82404955	-77194828	+	RMER21B	LTR	ERV1	450	565	-277	5
1213	679	336	47	33	chr3	82405283	82405646	-77194137	+	MT2A	LTR	ERVL	1	368	-165	5
1213	475	326	0	29	chr3	82406784	82406920	-77192863	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	132	-227	5
1213	1894	198	117	23	chr3	82407479	82407956	-77191827	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-2	526	5	5
1213	591	278	101	94	chr3	82410912	82411068	-77188715	+	RMER21B	LTR	ERV1	268	406	-436	5
1213	591	278	101	94	chr3	82411095	82411236	-77188547	+	RMER21B	LTR	ERV1	407	567	-275	5
1213	251	295	10	50	chr3	82411348	82411448	-77188335	+	RMER21B	LTR	ERV1	752	847	-100	5
1213	2715	151	19	2	chr3	82412734	82413146	-77186637	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	5
1213	882	284	8	21	chr3	82413427	82413668	-77186115	+	MTEb	LTR	MaLR	131	368	-11	5
1213	3482	8	3	0	chr3	82413772	82414138	-77185645	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	5
1213	35939	27	20	3	chr3	82414162	82418265	-77181518	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	57	4229	-2252	5
1213	15157	24	2	0	chr3	82418260	82419955	-77179828	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4784	6481	0	5
1213	3482	8	3	0	chr3	82419955	82420321	-77179462	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	5
1213	3338	65	10	12	chr3	82425866	82426272	-77173511	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	3	407	0	5
1213	328	346	45	50	chr3	82433283	82433505	-77166278	+	MER110-int	LTR	ERV1	2594	2814	-1833	5
1213	252	288	94	78	chr3	82442320	82442448	-77157335	+	MT2B	LTR	ERVL	123	252	-349	6
1214	321	384	89	60	chr3	82445023	82445071	-77154712	-	LTR33A	LTR	ERVL	-1	519	470	6
1214	321	384	89	60	chr3	82445648	82445948	-77153835	-	LTR33A	LTR	ERVL	-51	469	161	6
1214	242	333	30	0	chr3	82446195	82446294	-77153489	-	LTR33A	LTR	ERVL	-392	111	10	6
1214	2239	108	12	9	chr3	82450201	82450527	-77149256	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1214	3479	25	2	0	chr3	82451826	82452221	-77147562	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1214	9198	32	5	1	chr3	82452221	82453315	-77146468	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	6
1214	3479	25	2	0	chr3	82453315	82453710	-77146073	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1214	959	204	32	128	chr3	82454898	82455179	-77144604	+	MT2A	LTR	ERVL	3	256	-277	6
1214	1700	240	45	3	chr3	82455212	82455588	-77144195	+	RMER19C	LTR	ERVK	220	611	0	6
1214	259	290	14	0	chr3	82455588	82455654	-77144129	+	MT2A	LTR	ERVL	356	422	-111	6
1214	390	307	68	22	chr3	82459353	82459603	-77140180	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	52	6
1214	290	296	105	50	chr3	82462461	82462642	-77137141	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	199	-160	6
1214	1119	170	32	23	chr3	82464051	82464268	-77135515	+	ORR1D1	LTR	MaLR	148	366	-8	6
1214	842	260	32	158	chr3	82467823	82468240	-77131543	-	RMER19A	LTR	ERVK	-191	420	31	6
1214	1911	199	118	0	chr3	82470078	82470484	-77129299	+	MT2A	LTR	ERVL	3	456	-77	6
1214	1258	298	49	0	chr3	82471414	82471763	-77128020	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	366	-13	6
1214	907	291	72	18	chr3	82471766	82472043	-77127740	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	2	293	-1287	6
1214	1013	342	37	23	chr3	82472063	82472416	-77127367	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	486	843	-737	6
1214	409	307	31	50	chr3	82472880	82473041	-77126742	-	MTE2b	LTR	MaLR	-219	160	3	6
1214	552	291	11	37	chr3	82473048	82473108	-77126675	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-5	1575	1516	6
1214	552	291	11	37	chr3	82473350	82473478	-77126305	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-65	1515	1392	6
1214	2154	102	9	66	chr3	82484574	82484921	-77114862	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-2	327	1	6
1214	2058	302	82	20	chr3	82490067	82491096	-77108687	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3370	4461	-1300	6
1214	836	166	7	13	chr3	82491117	82491270	-77108513	+	RMER17C	LTR	ERVK	259	410	0	6
1214	1620	279	37	64	chr3	82491271	82491333	-77108450	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4410	4471	-1286	6
1214	4379	63	31	27	chr3	82491333	82491918	-77107865	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	6
1214	1620	279	37	64	chr3	82491918	82492110	-77107673	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4472	4657	-1100	6
1214	1620	279	37	64	chr3	82492287	82492660	-77107123	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4658	5032	-725	6
1214	1995	147	138	21	chr3	82492660	82493036	-77106747	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	1	420	0	6
1214	1620	279	37	64	chr3	82493036	82493113	-77106670	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5033	5097	-660	6
1214	267	343	133	104	chr3	82493171	82493275	-77106508	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	132	-422	6
1214	1083	252	107	12	chr3	82493275	82493601	-77106182	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	6
1214	418	304	80	59	chr3	82493601	82493734	-77106049	+	MTC	LTR	MaLR	110	243	-136	6
1214	267	343	133	104	chr3	82493734	82493841	-77105942	+	MLT2B3	LTR	ERVL	133	354	-200	6
1214	2031	111	39	60	chr3	82494263	82494599	-77105184	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	6
1214	621	152	9	19	chr3	82494617	82494724	-77105059	+	MTC	LTR	MaLR	310	415	-6	6
1214	408	283	31	8	chr3	82496969	82497097	-77102686	+	RMER15	LTR	ERVL	1	131	-444	6
1214	306	380	115	0	chr3	82497328	82497520	-77102263	+	LTR85b	LTR	Gypsy?	408	621	-163	6
1214	364	308	115	91	chr3	82498046	82498289	-77101494	+	RMER4A	LTR	ERVK	8	256	-210	6
1214	1854	210	34	1	chr3	82499457	82499818	-77099965	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	421	0	6
1214	1514	196	106	12	chr3	82500717	82500781	-77099002	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	310	2
1214	1514	196	106	12	chr3	82500821	82501097	-77098686	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-69	309	6	2
1214	540	260	45	8	chr3	82505949	82506081	-77093702	-	MTEa	LTR	MaLR	-242	137	1	8
1214	800	327	53	46	chr3	82506324	82506718	-77093065	+	MLT1D	LTR	MaLR	109	505	0	9
1214	567	319	93	20	chr3	82507139	82507477	-77092306	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-24	545	147	1
1214	2825	167	6	19	chr3	82509381	82509901	-77089882	-	RLTR28	LTR	ERVL	-11	513	1	1
1214	643	192	46	7	chr3	82510324	82510476	-77089307	+	RLTR28	LTR	ERVL	327	484	-40	1
1214	298	345	92	12	chr3	82511071	82511244	-77088539	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	4	1
1214	2587	146	63	20	chr3	82512914	82513419	-77086364	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	1
1214	528	316	88	31	chr3	82516351	82516612	-77083171	-	LTR90B	LTR	LTR	-389	407	132	1
1214	256	341	39	31	chr3	82523972	82524099	-77075684	+	MLT1C	LTR	MaLR	334	461	-6	3
1214	2071	177	15	20	chr3	82525350	82525743	-77074040	+	RLTR25A	LTR	ERVK	350	740	-363	3
1214	728	196	14	14	chr3	82525716	82525856	-77073927	+	RLTR25A	LTR	ERVK	889	1028	0	3
1214	320	306	77	104	chr3	82532368	82532733	-77067050	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	356	2	4
1214	2484	154	72	17	chr3	82535379	82535849	-77063934	-	RLTR28	LTR	ERVL	-28	496	1	4
1214	1303	251	79	6	chr3	82537872	82538225	-77061558	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	5
1214	281	314	46	37	chr3	82541928	82542037	-77057746	+	MLT1A0	LTR	MaLR	21	130	-235	5
1214	669	293	51	34	chr3	82548073	82548348	-77051435	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	273	-97	6
1214	294	250	73	59	chr3	82550488	82550624	-77049159	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	271	7
1214	2369	162	31	14	chr3	82551456	82551870	-77047913	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1214	622	276	27	49	chr3	82553203	82553466	-77046317	-	RLTR15	LTR	ERVK	-102	257	1	7
1214	3180	69	17	12	chr3	82558043	82558452	-77041331	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	8
1214	407	373	88	46	chr3	82558933	82559172	-77040611	+	MLT-int	LTR	MaLR	861	1109	-626	8
1214	329	295	11	0	chr3	82559453	82559548	-77040235	-	ORR1E	LTR	MaLR	-220	139	44	8
1214	274	291	86	19	chr3	82562083	82562188	-77037595	+	MLT1F2	LTR	MaLR	56	167	-393	8
1214	656	271	42	5	chr3	82564357	82564550	-77035233	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5298	5497	-264	9
1214	236	228	0	50	chr3	82564721	82564781	-77035002	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	583	639	-1324	9
1214	435	280	40	8	chr3	82564877	82565003	-77034780	+	MTEa	LTR	MaLR	19	148	-231	9
1214	672	334	134	27	chr3	82564961	82565313	-77034470	+	MT2A	LTR	ERVL	107	517	-37	9
1214	278	314	202	35	chr3	82565350	82565368	-77034415	+	MT2A	LTR	ERVL	518	535	-19	9
1214	1977	127	9	35	chr3	82566518	82566786	-77032997	-	RLTR28	LTR	ERVL	-187	337	79	1
1214	1977	127	9	35	chr3	82566828	82566903	-77032880	-	RLTR28	LTR	ERVL	-446	78	3	1
1214	407	282	28	33	chr3	82567047	82567227	-77032556	-	RLTR15	LTR	ERVK	-3	356	178	1
1214	412	214	62	90	chr3	82567328	82567472	-77032311	-	RLTR15	LTR	ERVK	-187	172	33	1
1214	3694	20	5	0	chr3	82568374	82568768	-77031015	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1214	9163	47	2	66	chr3	82568768	82569941	-77029842	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
1214	3140	33	5	30	chr3	82569941	82570254	-77029529	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	303	-93	1
1214	3140	33	5	30	chr3	82570509	82570601	-77029182	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	304	395	-1	1
1214	382	259	123	18	chr3	82571222	82571336	-77028447	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	366	241	1
1215	363	399	84	36	chr3	82583745	82584101	-77015682	+	LTR82A	LTR	ERVL	346	718	-154	1
1215	7749	152	54	9	chr3	82584851	82586248	-77013535	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-332	1460	1	1
1215	2271	91	97	0	chr3	82586248	82586546	-77013237	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1215	2115	148	49	11	chr3	82594218	82594587	-77005196	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	384	0	1
1215	2325	146	46	36	chr3	82602697	82603087	-76996696	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
1215	256	329	168	44	chr3	82603094	82603409	-76996374	-	LTR16A	LTR	ERVL	-45	406	53	1
1215	2438	65	142	12	chr3	82606390	82606735	-76993048	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
1215	2672	104	74	0	chr3	82608633	82608999	-76990784	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	393	-1	1
1215	236	297	85	59	chr3	82622763	82622881	-76976902	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	254	1
1215	869	270	52	85	chr3	82626787	82627188	-76972595	+	MTD	LTR	MaLR	1	388	-31	1
1215	247	314	0	0	chr3	82632518	82632588	-76967195	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-147	409	340	2
1215	480	333	110	66	chr3	82632852	82633353	-76966430	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-631	756	234	2
1215	1596	207	80	35	chr3	82637631	82638031	-76961752	+	MTD	LTR	MaLR	2	419	0	2
1215	254	286	45	110	chr3	82638414	82638643	-76961140	+	MTEb	LTR	MaLR	178	367	-12	2
1215	5624	128	61	18	chr3	82651046	82652027	-76947756	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	1023	0	2
1215	1710	198	99	42	chr3	82654000	82654384	-76945399	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	13	2
1215	4893	243	39	58	chr3	82654805	82656201	-76943582	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	1	1370	0	2
1215	1722	193	30	82	chr3	82656201	82656302	-76943481	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	84	-300	2
1215	1722	193	30	82	chr3	82656805	82656818	-76942965	+	ORR1C2	LTR	MaLR	91	99	-285	2
1215	1722	193	30	82	chr3	82656893	82657170	-76942613	+	ORR1C2	LTR	MaLR	100	380	-4	2
1215	885	212	260	110	chr3	82661739	82662174	-76937609	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	500	-12	2
1215	1829	219	43	0	chr3	82666519	82666917	-76932866	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	2
1215	1013	307	86	35	chr3	82673831	82674260	-76925523	+	MT2A	LTR	ERVL	70	520	-13	2
1215	925	279	127	12	chr3	82675031	82675361	-76924422	+	MTE2a	LTR	MaLR	9	376	-3	2
1215	1003	286	91	24	chr3	82688472	82688812	-76910971	-	MTE2b	LTR	MaLR	-16	363	1	2
1215	722	175	7	14	chr3	82690783	82690928	-76908855	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	144	-240	2
1215	2109	212	86	8	chr3	82691006	82691495	-76908288	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	7	2
1215	1574	186	60	58	chr3	82691732	82692114	-76907669	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	1	2
1215	280	302	75	45	chr3	82695768	82695969	-76903814	-	LTR73	LTR	ERV1	-363	209	3	2
1215	2085	181	30	3	chr3	82704086	82704452	-76895331	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	378	0	3
1216	243	295	90	0	chr3	82713000	82713078	-76886705	+	MER90a	LTR	ERV1	21	105	-509	3
1216	344	254	25	50	chr3	82715026	82715146	-76884637	+	RLTR23	LTR	ERV1	314	430	0	3
1216	333	254	59	8	chr3	82715930	82716049	-76883734	-	RMER15	LTR	ERVL	-17	558	434	3
1216	2683	160	50	38	chr3	82716345	82716866	-76882917	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	3
1216	665	248	7	14	chr3	82719585	82719732	-76880051	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-224	146	1	3
1216	3360	39	39	0	chr3	82720771	82721152	-76878631	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1216	426	284	250	0	chr3	82721731	82721907	-76877876	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	149	3
1216	1710	184	46	43	chr3	82722099	82722450	-76877333	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	354	-40	3
1216	409	57	0	0	chr3	82723525	82723578	-76876205	+	ORR1B1	LTR	MaLR	340	392	-2	3
1216	601	247	27	27	chr3	82724008	82724158	-76875625	-	MTE2b	LTR	MaLR	-229	150	1	3
1216	232	286	70	26	chr3	82724565	82724680	-76875103	-	ORR1E	LTR	MaLR	-239	120	1	3
1216	1866	123	42	0	chr3	82733290	82733598	-76866185	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	3
1216	637	233	33	7	chr3	82734055	82734206	-76865577	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	216	3
1216	1491	200	98	34	chr3	82734317	82734548	-76865235	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	242	-140	3
1216	1491	200	98	34	chr3	82734730	82734855	-76864928	+	RLTR14	LTR	ERV1	243	382	0	3
1216	230	178	67	0	chr3	82738806	82738851	-76860932	+	MTE2a	LTR	MaLR	216	263	-116	3
1216	2423	135	16	0	chr3	82747143	82747514	-76852269	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	3	3
1216	819	289	51	75	chr3	82749255	82749746	-76850037	-	MT2A	LTR	ERVL	-54	479	1	3
1216	1168	237	31	54	chr3	82752474	82752826	-76846957	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	344	-15	3
1216	1249	215	133	6	chr3	82762702	82763025	-76836758	-	MTD	LTR	MaLR	-29	390	27	4
1216	2987	24	0	0	chr3	82776447	82776784	-76822999	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	4
1216	57457	20	8	8	chr3	82776784	82783261	-76816522	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	4
1216	2987	24	0	0	chr3	82783261	82783598	-76816185	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	4
1216	608	325	99	10	chr3	82784246	82784562	-76815221	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-15	344	1	4
1216	341	70	0	50	chr3	82792474	82792534	-76807249	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	57	-520	4
1216	1589	169	70	12	chr3	82794336	82794677	-76805106	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	361	-120	4
1216	342	280	21	0	chr3	82795205	82795298	-76804485	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	467	4
1216	250	200	20	0	chr3	82795444	82795494	-76804289	-	RMER15	LTR	ERVL	-524	51	1	4
1216	384	232	34	30	chr3	82797495	82797609	-76802174	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	248	4
1216	2070	130	0	7	chr3	82801730	82802040	-76797743	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	308	-3	4
1216	780	306	59	24	chr3	82802396	82802771	-76797012	-	LTR55	LTR	ERV	-112	436	49	4
1217	786	293	73	17	chr3	82841959	82842192	-76757591	+	MTE2a	LTR	MaLR	57	302	-77	5
1217	1607	189	7	124	chr3	82861026	82861444	-76738339	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	369	-5	5
1217	2337	79	28	0	chr3	82864278	82864596	-76735187	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1217	1240	143	156	18	chr3	82878131	82878412	-76721371	-	MTC	LTR	MaLR	-98	309	3	5
1217	273	314	81	0	chr3	82878921	82879045	-76720738	+	MTEa	LTR	MaLR	1	134	-245	5
1217	685	301	111	28	chr3	82879024	82879386	-76720397	+	MT2A	LTR	ERVL	130	521	-12	5
1217	2549	68	9	9	chr3	82880184	82880511	-76719272	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1217	2045	179	15	39	chr3	82882352	82882816	-76716967	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	5
1217	985	291	35	19	chr3	82885817	82886129	-76713654	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	60	5
1217	1693	113	62	65	chr3	82886185	82886507	-76713276	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	5
1217	430	292	7	52	chr3	82887355	82887436	-76712347	-	MTEa	LTR	MaLR	-228	151	71	5
1217	430	292	7	52	chr3	82887471	82887544	-76712239	-	MTEa	LTR	MaLR	-309	70	4	5
1217	2488	157	70	18	chr3	82889130	82889631	-76710152	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	6
1217	1939	143	9	0	chr3	82890299	82890627	-76709156	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	331	-48	6
1217	230	228	25	12	chr3	82891532	82891612	-76708171	+	RLTR12B	LTR	ERVK	371	451	-77	6
1217	651	318	92	41	chr3	82903183	82903671	-76696112	-	MER21B	LTR	ERV1	-61	802	290	6
1217	398	304	100	45	chr3	82903728	82903928	-76695855	-	MER21B	LTR	ERV1	-652	211	1	6
1217	1436	221	88	9	chr3	82906340	82906682	-76693101	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	370	0	6
1217	333	250	115	0	chr3	82907772	82907876	-76691907	-	MTEb	LTR	MaLR	-12	367	252	6
1217	585	249	78	52	chr3	82908377	82908568	-76691215	-	MTEb	LTR	MaLR	-172	207	12	6
1217	2695	65	140	14	chr3	82909181	82909616	-76690167	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-29	490	1	6
1217	536	323	48	4	chr3	82918936	82919166	-76680617	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	263	6
1217	235	299	0	0	chr3	82924672	82924749	-76675034	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-57	503	427	6
1217	511	239	112	21	chr3	82925098	82925286	-76674497	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-181	283	79	6
1217	2472	81	16	0	chr3	82935684	82936006	-76663777	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1217	227	256	141	22	chr3	82937241	82937333	-76662450	+	MTE2a	LTR	MaLR	256	358	-21	6
1217	1922	132	12	61	chr3	82938684	82939030	-76660753	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1217	776	310	29	46	chr3	82950712	82951060	-76648723	+	MLT1A	LTR	MaLR	33	374	0	6
1217	4948	82	12	75	chr3	82961129	82961930	-76637853	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	7
1217	440	292	67	24	chr3	82967742	82967907	-76631876	+	LTR40c	LTR	ERVL	35	206	-259	7
1218	231	200	0	110	chr3	82977154	82977227	-76622556	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	193	7
1218	1805	169	98	9	chr3	82977792	82978139	-76621644	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	7
1218	730	221	32	5	chr3	82981551	82981738	-76618045	+	RMER5	LTR	ERV1	328	519	-15	7
1218	437	284	136	5	chr3	82982083	82982281	-76617502	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-126	354	131	7
1218	1825	177	19	26	chr3	82985245	82985622	-76614161	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	7
1218	1943	304	101	58	chr3	82985639	82986271	-76613512	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1632	4125	3451	7
1218	1137	205	226	98	chr3	82986271	82986313	-76613470	-	MT2A	LTR	ERVL	-3	530	489	7
1218	1137	205	226	98	chr3	82986377	82986804	-76612979	-	MT2A	LTR	ERVL	-45	488	3	7
1218	1943	304	101	58	chr3	82986804	82986893	-76612890	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2307	3450	3356	7
1218	1943	304	101	58	chr3	82986984	82987279	-76612504	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2402	3355	3088	7
1218	1943	304	101	58	chr3	82987427	82987612	-76612171	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2670	3087	2871	7
1218	1184	241	96	12	chr3	82992704	82993049	-76606734	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	5	7
1218	246	336	41	35	chr3	83005371	83005516	-76594267	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-27	535	390	9
1218	2260	154	32	5	chr3	83007977	83008381	-76591402	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	7	1
1218	406	237	19	12	chr3	83010136	83010259	-76589524	+	MLT2B2	LTR	ERVL	437	565	-2	1
1218	234	311	84	70	chr3	83017261	83017403	-76582380	-	LTR33	LTR	ERVL	-350	165	22	2
1218	247	292	117	68	chr3	83024226	83024432	-76575351	-	ORR1E	LTR	MaLR	-143	216	1	3
1218	1294	196	117	45	chr3	83031440	83031798	-76567985	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1218	237	243	57	0	chr3	83047788	83047858	-76551925	-	ORR1E	LTR	MaLR	-268	91	18	6
1218	813	268	40	106	chr3	83061475	83061880	-76537903	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	1	7
1218	316	383	88	26	chr3	83063415	83063608	-76536175	+	LTR78	LTR	ERV1	314	518	-786	8
1218	258	316	54	48	chr3	83063828	83063994	-76535789	+	ORR1E	LTR	MaLR	25	191	-168	8
1218	3536	57	2	2	chr3	83064595	83065000	-76534783	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	3	8
1218	358	254	101	58	chr3	83065040	83065178	-76534605	+	LTR78	LTR	ERV1	1142	1285	-19	8
1218	407	244	109	0	chr3	83071008	83071127	-76528656	+	MTE2b	LTR	MaLR	169	300	-79	9
1218	376	333	31	67	chr3	83071209	83071402	-76528381	+	MLT1B	LTR	MaLR	205	390	0	1
1218	375	285	72	35	chr3	83071490	83071709	-76528074	-	ORR1E	LTR	MaLR	-110	249	30	1
1218	810	276	67	102	chr3	83072037	83072409	-76527374	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	359	1	1
1218	378	264	84	9	chr3	83072692	83072799	-76526984	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-1	562	448	1
1218	619	279	65	0	chr3	83072795	83072996	-76526787	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-342	214	1	1
1218	227	219	24	0	chr3	83087061	83087102	-76512681	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	534	1
1218	263	320	0	13	chr3	83095215	83095291	-76504492	-	LTR50	LTR	ERVL	-715	80	6	1
1219	1760	226	34	15	chr3	83105950	83106359	-76493424	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	1
1219	2216	133	124	12	chr3	83111331	83111758	-76488025	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1219	329	182	47	134	chr3	83114423	83114550	-76485233	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	149	1
1219	2588	184	63	6	chr3	83138327	83138820	-76460963	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	4	1
1219	3736	20	0	0	chr3	83139401	83139794	-76459989	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-3	393	1	1
1219	6006	17	1	1	chr3	83139794	83140516	-76459267	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	377	1
1219	3200	23	3	0	chr3	83147083	83147472	-76452311	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-708	390	1	1
1219	3767	20	0	0	chr3	83147472	83147868	-76451915	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1219	1667	230	56	23	chr3	83148001	83148429	-76451354	-	RMER4B	LTR	ERVK	-143	442	1	1
1219	1817	202	42	11	chr3	83153354	83153710	-76446073	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1219	7947	170	50	10	chr3	83153710	83155161	-76444622	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	1	2
1219	1720	149	141	15	chr3	83155161	83155487	-76444296	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1219	384	211	256	8	chr3	83173911	83174040	-76425743	+	MLT2B5	LTR	ERVL	10	170	-547	2
1219	250	351	46	7	chr3	83174134	83174286	-76425497	+	MLT2B2	LTR	ERVL	397	554	-8	2
1219	637	171	19	0	chr3	83174708	83174813	-76424970	+	MTC	LTR	MaLR	1	107	-314	2
1219	1734	172	51	9	chr3	83175356	83175672	-76424111	+	MTC	LTR	MaLR	93	421	0	2
1219	2649	150	57	6	chr3	83194005	83194500	-76405283	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	8	527	0	2
1219	744	167	32	0	chr3	83197172	83197298	-76402485	-	RLTR27	LTR	ERVK	-179	130	1	2
1219	1415	130	27	30	chr3	83197298	83197560	-76402223	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	7321	2
1219	580	330	7	3	chr3	83197990	83198273	-76401510	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-807	6774	6491	2
1219	5066	304	45	39	chr3	83198386	83202629	-76397154	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2104	5477	720	2
1219	274	237	0	0	chr3	83202821	83202897	-76396886	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6765	915	840	2
1219	569	241	98	57	chr3	83202959	83203205	-76396578	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1077	910	655	2
1219	362	45	7	0	chr3	83203236	83203289	-76396494	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	163	2
1219	1658	184	19	30	chr3	83203313	83203638	-76396145	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	2
1219	443	352	57	90	chr3	83206304	83206672	-76393111	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	4	2
1219	593	209	13	97	chr3	83209888	83210042	-76389741	+	MTD	LTR	MaLR	1	141	-278	2
1219	796	259	154	4	chr3	83211521	83211754	-76388029	+	MTD	LTR	MaLR	138	405	-14	2
1219	1819	111	15	62	chr3	83212167	83212505	-76387278	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	2
1219	1210	197	18	187	chr3	83219209	83219652	-76380131	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	368	-6	2
1219	3279	54	36	3	chr3	83223939	83224326	-76375457	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
152	488	263	144	106	chr3	83230476	83230740	-76369043	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-40	325	52	2
1220	4285	178	27	49	chr3	83231104	83231918	-76367865	-	RMER19B	LTR	ERVK	-106	796	1	2
1220	1144	197	96	136	chr3	83239359	83239764	-76360019	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	389	-5	2
1220	924	155	6	77	chr3	83244591	83244773	-76355010	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	169	-360	3
1220	846	169	128	0	chr3	83244772	83244944	-76354839	+	RLTR24	LTR	ERV1	336	529	0	3
1220	278	250	278	10	chr3	83249046	83249143	-76350640	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	257	3
1220	470	317	66	6	chr3	83250897	83251078	-76348705	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	174	3
1220	6859	191	53	48	chr3	83252053	83253660	-76346123	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-9	2833	1219	3
1220	1101	155	18	30	chr3	83253699	83253942	-76345841	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1614	1228	1020	3
1220	859	221	112	48	chr3	83253938	83254416	-76345367	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1763	1079	476	3
1220	225	273	75	15	chr3	83254422	83254489	-76345294	+	MLT-int	LTR	MaLR	1492	1562	-173	3
1220	293	214	13	79	chr3	83254490	83254566	-76345217	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2606	236	166	3
1220	527	227	0	35	chr3	83254577	83254691	-76345092	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2732	110	1	3
1220	2673	176	51	13	chr3	83254691	83255164	-76344619	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	202	3
1220	247	308	0	133	chr3	83259245	83259365	-76340418	+	MT2B2	LTR	ERVL	148	251	-333	3
1220	236	351	98	46	chr3	83267389	83267583	-76332200	+	MTE2a	LTR	MaLR	51	254	-105	3
1220	240	230	51	89	chr3	83267601	83267721	-76332062	+	MTE2a	LTR	MaLR	280	368	-11	3
1220	2846	64	6	17	chr3	83273152	83273501	-76326282	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	0	345	1	3
1220	313	318	69	53	chr3	83277398	83277605	-76322178	+	MER57C2	LTR	ERV1	182	403	-31	3
1220	2950	144	47	61	chr3	83281439	83282032	-76317751	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	3
1220	415	324	35	17	chr3	83284961	83285134	-76314649	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-66	299	124	3
1220	1739	197	101	95	chr3	83287936	83288441	-76311342	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	508	-4	3
1220	425	271	299	19	chr3	83288576	83288895	-76310888	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	1	3
1220	1099	220	136	16	chr3	83292578	83292901	-76306882	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	7	3
1220	4537	210	80	96	chr3	83292909	83294302	-76305481	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	1	3
1220	1151	230	131	27	chr3	83294302	83294637	-76305146	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	3
1220	1366	231	95	3	chr3	83296163	83296501	-76303282	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	369	-1	3
1220	712	327	75	49	chr3	83297256	83297681	-76302102	-	MLT1C	LTR	MaLR	-18	449	14	3
1220	824	296	43	79	chr3	83302228	83302621	-76297162	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	3
1220	1858	142	78	14	chr3	83302959	83303303	-76296480	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	1	3
1220	1965	162	29	3	chr3	83306507	83306853	-76292930	+	RLTR15	LTR	ERVK	5	359	0	3
1220	480	269	155	45	chr3	83307936	83308351	-76291432	+	MER90	LTR	ERV1	1	498	-116	3
1220	516	316	137	16	chr3	83314245	83314625	-76285158	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	426	-41	3
1220	589	235	0	22	chr3	83320617	83320756	-76279027	+	MER77	LTR	ERVL	462	597	-10	4
1220	559	327	137	75	chr3	83320764	83321230	-76278553	-	MLT1D	LTR	MaLR	-4	501	7	4
1220	1670	165	35	126	chr3	83323273	83323724	-76276059	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	4
1220	2284	82	0	0	chr3	83326487	83326804	-76272979	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	3	4
1220	596	329	176	60	chr3	83326894	83327501	-76272282	+	MER21B	LTR	ERV1	14	690	-173	4
1220	522	274	135	60	chr3	83331496	83331830	-76267953	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	16	4
1220	420	287	75	52	chr3	83332607	83332780	-76267003	-	MLT1D	LTR	MaLR	-287	218	42	4
1220	359	263	30	10	chr3	83337372	83337472	-76262311	+	MTD	LTR	MaLR	2	103	-316	4
1220	1427	207	34	0	chr3	83338350	83338645	-76261138	+	MTD	LTR	MaLR	115	419	0	4
1220	1021	228	161	9	chr3	83355450	83355767	-76244016	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	15	4
1221	794	177	14	7	chr3	83362416	83362564	-76237219	+	ORR1B1	LTR	MaLR	245	393	-1	4
1221	895	167	16	3	chr3	83362852	83363052	-76236731	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-160	234	5	4
1221	401	303	72	38	chr3	83367336	83367573	-76232210	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-268	288	44	4
1221	823	237	131	72	chr3	83372039	83372330	-76227453	-	ORR1E	LTR	MaLR	-42	317	10	4
1221	256	294	92	105	chr3	83372488	83372640	-76227143	+	ORR1D2	LTR	MaLR	38	187	-183	4
1221	420	319	0	0	chr3	83376703	83376816	-76222967	+	MTEa	LTR	MaLR	267	379	0	4
1221	881	334	118	13	chr3	83377026	83377148	-76222635	-	MER21B	LTR	ERV1	-158	705	565	4
1221	2863	49	95	11	chr3	83377148	83377517	-76222266	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1221	881	334	118	13	chr3	83377517	83377919	-76221864	-	MER21B	LTR	ERV1	-299	564	126	4
1221	243	318	0	54	chr3	83378005	83378098	-76221685	-	MER21B	LTR	ERV1	-775	88	1	4
1221	1189	239	135	3	chr3	83386120	83386447	-76213336	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	4
1221	916	280	81	38	chr3	83391222	83391567	-76208216	-	MTE2b	LTR	MaLR	-17	362	3	4
1221	514	336	46	83	chr3	83395430	83395803	-76203980	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	5
1221	3147	55	29	0	chr3	83399855	83400273	-76199510	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	430	-6	5
1221	547	149	21	0	chr3	83400650	83400744	-76199039	-	RLTR24	LTR	ERV1	-433	96	1	5
1221	925	266	62	47	chr3	83401460	83401799	-76197984	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	364	21	5
1221	520	296	123	19	chr3	83406813	83407130	-76192653	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	118	5
1221	1459	272	22	3	chr3	83426642	83427010	-76172773	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	1	5
1221	228	297	98	11	chr3	83427057	83427149	-76172634	-	ORR1E	LTR	MaLR	-259	100	1	5
1221	1996	197	45	5	chr3	83427867	83428270	-76171513	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
1221	1923	187	19	31	chr3	83428270	83428695	-76171088	+	MTC-int	LTR	MaLR	3	422	-1087	5
1221	1938	200	14	11	chr3	83430651	83431020	-76168763	+	MTC	LTR	MaLR	1	370	-4	5
1221	1121	179	258	27	chr3	83432525	83432823	-76166960	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1221	565	226	204	52	chr3	83433613	83434096	-76165687	+	RLTR18B	LTR	ERVK	3	541	-75	5
1221	2501	48	93	0	chr3	83435510	83435865	-76163918	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	5
1221	716	151	46	229	chr3	83439413	83439697	-76160086	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	114	345	-216	5
1221	2037	157	72	53	chr3	83445789	83446165	-76153618	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	383	-1	5
1221	2835	65	102	5	chr3	83448132	83448516	-76151267	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	5
1221	1096	282	16	34	chr3	83450478	83450801	-76148982	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	319	-51	5
1221	410	266	134	30	chr3	83455925	83456101	-76143682	-	MLT1A	LTR	MaLR	-18	390	188	5
1221	501	254	35	14	chr3	83457586	83457730	-76142053	-	MLT1A	LTR	MaLR	-219	155	9	5
1221	1001	289	56	51	chr3	83471275	83471650	-76128133	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	5
1221	1348	276	48	6	chr3	83473362	83473716	-76126067	-	MTD	LTR	MaLR	-47	372	4	5
1221	3769	70	11	17	chr3	83483194	83483672	-76116111	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	6
1221	229	344	31	10	chr3	83483963	83484060	-76115723	+	RMER12	LTR	ERVK	748	846	-476	6
1221	3373	46	5	5	chr3	83488978	83489374	-76110409	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1221	227	145	121	52	chr3	83490955	83491013	-76108770	+	RLTR25B	LTR	ERVK	448	509	-519	6
1222	1979	150	23	16	chr3	83501484	83501872	-76097911	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-30	377	1	3
1222	1182	292	89	11	chr3	83502860	83503334	-76096449	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-603	4882	4297	4
1222	887	356	51	10	chr3	83503328	83503819	-76095964	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1375	4339	3829	4
1222	226	370	32	19	chr3	83503976	83504133	-76095650	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-29	533	375	5
1222	444	240	52	75	chr3	83508636	83508848	-76090935	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-174	290	84	1
1222	251	338	56	28	chr3	83509209	83509352	-76090431	-	ORR1E	LTR	MaLR	-209	150	4	1
1222	253	282	153	0	chr3	83510869	83510993	-76088790	-	LTR50	LTR	ERVL	-567	228	86	1
1222	1195	137	113	17	chr3	83517930	83518168	-76081615	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	145	3
1222	1091	236	103	40	chr3	83518728	83519076	-76080707	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	3
1222	1335	144	98	70	chr3	83520104	83520491	-76079292	-	RMER17C	LTR	ERVK	-12	398	1	3
1222	630	153	0	0	chr3	83524599	83524710	-76075073	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	111	-263	4
1222	676	147	93	53	chr3	83524711	83524862	-76074921	+	ORR1D1	LTR	MaLR	218	374	0	4
1222	335	326	30	15	chr3	83525194	83525325	-76074458	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	247	4
1222	657	306	77	54	chr3	83525389	83526032	-76073751	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-890	690	1	4
1222	554	302	97	48	chr3	83526032	83526342	-76073441	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	55	4
1222	292	284	0	39	chr3	83527657	83527734	-76072049	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	74	-285	4
1222	1477	230	78	0	chr3	83528192	83528540	-76071243	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	3	4
1222	1673	188	136	0	chr3	83528641	83529002	-76070781	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	3	4
1222	697	266	98	124	chr3	83533357	83533735	-76066048	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	4	5
1222	438	290	160	61	chr3	83544730	83545024	-76054759	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-42	323	1	6
1222	1054	198	273	8	chr3	83545729	83546029	-76053754	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	416	-5	6
1222	234	282	13	0	chr3	83549680	83549758	-76050025	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	286	7
1222	1882	218	37	0	chr3	83549848	83550229	-76049554	+	MTD	LTR	MaLR	25	419	0	7
1222	870	226	154	4	chr3	83550229	83550481	-76049302	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-80	290	1	7
1222	2231	128	19	0	chr3	83550543	83550863	-76048920	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	7
1222	2383	138	5	37	chr3	83554631	83555038	-76044745	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	8
1222	686	262	35	12	chr3	83555278	83555448	-76044335	+	RLTR18	LTR	ERVK	5	178	-334	8
1222	808	240	56	97	chr3	83555610	83555929	-76043854	+	RLTR18	LTR	ERVK	286	591	-25	8
1222	300	280	304	33	chr3	83557342	83557622	-76042161	+	MLT1C	LTR	MaLR	35	390	0	8
1222	419	330	52	64	chr3	83558430	83558679	-76041104	+	MTEa	LTR	MaLR	3	248	-131	8
1222	253	357	76	7	chr3	83560178	83560322	-76039461	+	MLT1I	LTR	MaLR	16	169	-242	9
1222	1059	175	10	12	chr3	83560673	83560869	-76038914	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	172	-202	9
1222	638	207	213	0	chr3	83560972	83561160	-76038623	+	ORR1D1	LTR	MaLR	143	370	-4	9
1222	618	289	194	16	chr3	83578719	83579029	-76020754	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	1
1222	1484	252	70	62	chr3	83579990	83580489	-76019294	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-2	510	8	1
1222	392	307	122	25	chr3	83582458	83582697	-76017086	+	MTEa	LTR	MaLR	172	419	0	1
1222	225	118	58	19	chr3	83582697	83582745	-76017038	+	LTR55	LTR	ERV	246	295	-253	1
1222	226	215	55	110	chr3	83585717	83585790	-76013993	-	MLT1K	LTR	MaLR	-177	418	350	1
1222	314	260	37	46	chr3	83590571	83590680	-76009103	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	300	1
1222	1526	134	65	240	chr3	83590779	83591241	-76008542	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-3	381	1	1
1222	888	275	140	7	chr3	83595761	83596032	-76003751	+	MTE2a	LTR	MaLR	30	336	-43	1
1222	966	274	49	37	chr3	83599449	83599794	-75999989	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-31	339	1	1
1222	512	288	0	0	chr3	83602682	83602800	-75996983	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	387	270	1
1222	2966	65	44	3	chr3	83618294	83618678	-75981105	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1223	1997	108	39	0	chr3	83625389	83625696	-75974087	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	1
1223	2435	119	9	0	chr3	83626673	83627016	-75972767	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
1223	526	346	55	23	chr3	83631092	83631438	-75968345	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	3	1
1223	1521	256	25	16	chr3	83637216	83637581	-75962202	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	369	-1	1
1223	712	258	46	0	chr3	83637582	83637776	-75962007	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1377	203	1	1
1223	277	261	78	9	chr3	83647152	83647268	-75952515	-	LTR48	LTR	ERV1	-74	713	590	2
1223	262	221	69	11	chr3	83647365	83647452	-75952331	-	LTR48	LTR	ERV1	-432	212	121	2
1223	2234	236	47	62	chr3	83655866	83656662	-75943121	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	840	1547	-779	2
1223	1011	235	33	11	chr3	83656658	83656929	-75942854	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	6269	6545	-5	2
1223	2945	157	33	17	chr3	83656933	83657451	-75942332	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	526	-1	2
1223	1389	217	200	11	chr3	83659556	83660020	-75939763	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	551	1	2
1223	1746	179	89	42	chr3	83661894	83662320	-75937463	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	2
1223	657	243	132	40	chr3	83664579	83664875	-75934908	+	RMER20B	LTR	ERVK	90	412	-215	2
1223	4047	275	58	73	chr3	83667856	83668090	-75931693	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	231	-380	2
1223	4047	188	68	18	chr3	83668136	83668212	-75931571	+	RMER19B	LTR	ERVK	157	234	-668	2
1223	4853	148	62	17	chr3	83668212	83669081	-75930702	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	2
1223	4047	188	68	18	chr3	83669081	83669699	-75930084	+	RMER19B	LTR	ERVK	235	890	-12	2
1223	2716	232	96	26	chr3	83670774	83671528	-75928255	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	806	0	2
1223	647	292	103	32	chr3	83672027	83672412	-75927371	-	MLT1D	LTR	MaLR	-6	499	139	2
1223	903	276	146	23	chr3	83672425	83672489	-75927294	-	MT2A	LTR	ERVL	-6	527	457	2
1223	2886	22	0	0	chr3	83672489	83672811	-75926972	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	2
1223	903	276	146	23	chr3	83672811	83673047	-75926736	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	190	2
1223	1151	257	68	30	chr3	83673051	83673243	-75926540	+	MLT1A1	LTR	MaLR	25	222	-186	2
1223	1151	257	68	30	chr3	83673439	83673615	-75926168	+	MLT1A1	LTR	MaLR	223	407	-1	2
1223	263	260	40	40	chr3	83673616	83673692	-75926091	-	MLT1D	LTR	MaLR	-551	76	1	2
1223	2215	101	6	66	chr3	83673964	83674314	-75925469	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
1223	1679	154	123	27	chr3	83675461	83675834	-75923949	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
1223	507	53	25	62	chr3	83675834	83675914	-75923869	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1	7405	7329	2
1223	1790	183	170	9	chr3	83675914	83676376	-75923407	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-365	537	1	2
1223	1707	117	8	4	chr3	83676389	83676638	-75923145	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-30	5778	5529	2
1223	314	158	12	50	chr3	83676638	83676718	-75923065	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-1172	6072	6009	2
1223	4174	188	35	52	chr3	83676805	83678830	-75920953	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3321	4085	2342	2
1223	1738	181	197	23	chr3	83678846	83679323	-75920460	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4419	2987	2428	2
1223	1662	140	30	17	chr3	83679314	83679612	-75920171	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5311	2095	1794	2
1223	1381	178	97	113	chr3	83679684	83680064	-75919719	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
1223	2733	333	28	13	chr3	83680652	83681685	-75918098	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-102	4889	3841	2
1223	332	336	46	64	chr3	83681703	83681983	-75917800	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-1375	3616	3342	2
1223	553	217	0	56	chr3	83682620	83682781	-75917002	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2371	2620	2469	2
1223	445	342	81	30	chr3	83682854	83682994	-75916789	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-226	334	193	2
1223	5836	83	15	29	chr3	83682994	83683814	-75915969	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	2
1223	445	342	81	30	chr3	83683814	83683971	-75915812	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-368	192	22	2
1223	2636	19	109	3	chr3	83684134	83684447	-75915336	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1223	2708	54	15	95	chr3	83684491	83684881	-75914902	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	2
1223	1516	181	184	12	chr3	83685104	83685274	-75914509	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	200	2
1223	1516	181	184	12	chr3	83685301	83685472	-75914311	-	MTD	LTR	MaLR	-220	199	20	2
1223	370	241	144	27	chr3	83686238	83686349	-75913434	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	256	2
1223	642	307	63	23	chr3	83686548	83686837	-75912946	-	ORR1E	LTR	MaLR	-105	254	1	2
1223	1934	268	153	17	chr3	83686837	83687472	-75912311	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-51	1529	809	2
1223	4183	46	4	29	chr3	83687941	83688457	-75911326	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	1	2
1223	316	332	82	69	chr3	83690427	83690660	-75909123	+	MLT1F2	LTR	MaLR	130	365	-195	2
1223	586	179	8	33	chr3	83690747	83690868	-75908915	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	118	-249	2
1223	1199	252	47	94	chr3	83691760	83692290	-75907493	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	2
1223	376	292	105	57	chr3	83694762	83695092	-75904691	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	367	-138	2
1223	2319	135	38	3	chr3	83695156	83695527	-75904256	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	2
1223	1486	271	91	16	chr3	83696609	83697094	-75902689	-	MT2A	LTR	ERVL	0	554	1	2
1223	1973	203	75	51	chr3	83720418	83720910	-75878873	+	MT2A	LTR	ERVL	1	504	-29	3
1223	1527	212	91	10	chr3	83722318	83722723	-75877060	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	438	-3	3
1223	3635	144	98	8	chr3	83747247	83747882	-75851901	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	3
1224	877	227	127	49	chr3	83757248	83757493	-75842290	+	MTD	LTR	MaLR	13	276	-143	3
1224	1479	204	16	22	chr3	83760959	83761280	-75838503	+	MTD	LTR	MaLR	1	319	-100	3
1224	3033	73	10	2	chr3	83772525	83772922	-75826861	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1224	701	284	121	33	chr3	83775511	83775843	-75823940	+	MER21B	LTR	ERV1	457	817	-46	3
1224	234	343	73	9	chr3	83778422	83778531	-75821252	+	ORR1E	LTR	MaLR	34	149	-210	3
1224	1160	236	130	92	chr3	83779098	83779607	-75820176	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	3
1224	227	348	132	52	chr3	83779703	83779900	-75819883	+	MLT1N2	LTR	MaLR	9	220	-342	3
1224	393	274	560	37	chr3	83779962	83780169	-75819614	+	MLT1N2	LTR	MaLR	221	536	-26	3
1224	2614	104	39	0	chr3	83781062	83781445	-75818338	+	MTB	LTR	MaLR	1	398	-2	3
1224	847	245	140	27	chr3	83783270	83783606	-75816177	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1224	254	267	79	58	chr3	83789827	83789966	-75809817	+	MTEa	LTR	MaLR	234	375	-4	4
1224	678	259	78	82	chr3	83790419	83790844	-75808939	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	423	-19	4
1224	1362	186	210	3	chr3	83794521	83794850	-75804933	+	MTD	LTR	MaLR	8	404	-15	4
1224	2435	162	19	12	chr3	83795137	83795555	-75804228	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1224	2120	166	35	11	chr3	83803847	83804219	-75795564	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	381	-204	4
1224	238	213	16	32	chr3	83807156	83807219	-75792564	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-526	502	441	4
1224	295	225	28	0	chr3	83810888	83810959	-75788824	+	MLT1B	LTR	MaLR	27	99	-291	4
1224	376	271	66	78	chr3	83813805	83814049	-75785734	-	RLTR21	LTR	ERVK	-261	1311	1071	4
1224	1087	192	188	20	chr3	83815747	83816040	-75783743	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-28	342	1	4
1224	331	308	71	54	chr3	83820529	83820769	-75779014	-	RMER17A	LTR	ERVK	-341	410	167	4
1224	647	259	76	99	chr3	83822248	83822603	-75777180	+	ORR1D2	LTR	MaLR	11	357	-13	4
1224	540	299	121	30	chr3	83825489	83825720	-75774063	+	MLT1C	LTR	MaLR	215	466	-1	4
1224	299	345	69	55	chr3	83826195	83826413	-75773370	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-606	231	11	4
1224	393	263	42	8	chr3	83827133	83827252	-75772531	+	MLT1C	LTR	MaLR	474	596	-14	4
1224	422	252	87	22	chr3	83847297	83847435	-75752348	+	MLT1A1	LTR	MaLR	262	408	0	5
1224	842	286	90	0	chr3	83850034	83850272	-75749511	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	105	5
1224	248	306	0	0	chr3	83850272	83850334	-75749449	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	318	5
1224	400	233	107	0	chr3	83850328	83850431	-75749352	-	ORR1E	LTR	MaLR	-245	114	1	5
1224	282	221	93	48	chr3	83850431	83850510	-75749273	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-252	113	37	5
1224	317	250	102	66	chr3	83855499	83855666	-75744117	+	MTEa	LTR	MaLR	206	378	-1	5
1224	661	164	0	0	chr3	83855730	83855840	-75743943	+	RMER2	LTR	ERV1	1	110	-457	5
1224	2575	80	102	3	chr3	83855840	83856204	-75743579	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1224	7387	91	13	70	chr3	83856204	83857368	-75742415	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
1224	615	53	0	0	chr3	83857368	83857443	-75742340	-	MTB	LTR	MaLR	0	396	322	5
1224	2470	78	3	0	chr3	83857454	83857776	-75742007	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	35	357	0	5
1224	807	132	51	44	chr3	83857776	83857934	-75741849	+	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	22	180	-1290	5
1224	15470	108	13	25	chr3	83857933	83860160	-75739623	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	524	2723	-4957	5
1224	3366	45	91	0	chr3	83860127	83860723	-75739060	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	4852	5501	-2179	5
1224	2599	48	69	0	chr3	83860719	83861315	-75738468	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	7044	7680	0	5
1224	2511	80	3	0	chr3	83861325	83861650	-75738133	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	32	357	0	5
1224	624	103	0	40	chr3	83861650	83861739	-75738044	-	MTB	LTR	MaLR	-61	339	255	5
1224	1551	50	0	57	chr3	83861721	83861933	-75737850	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	208	407	0	5
1224	1123	208	69	121	chr3	83861934	83862339	-75737444	+	RMER2	LTR	ERV1	179	562	-5	5
1224	334	297	0	47	chr3	83862984	83863090	-75736693	-	RMER12	LTR	ERVK	-472	850	750	5
1224	1628	181	18	44	chr3	83867849	83868189	-75731594	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-43	331	1	5
1224	361	329	83	87	chr3	83874594	83874847	-75724936	-	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	-17	786	535	5
1224	877	234	90	35	chr3	83875154	83875451	-75724332	+	MTD	LTR	MaLR	66	357	-43	5
1224	4655	110	38	16	chr3	83882739	83883479	-75716304	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	5
1225	482	284	94	38	chr3	83892877	83893007	-75706776	+	MLT1B	LTR	MaLR	45	186	-204	5
1225	482	284	94	38	chr3	83893064	83893145	-75706638	+	MLT1B	LTR	MaLR	187	268	-122	5
1225	2659	124	37	5	chr3	83894194	83894574	-75705209	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	392	-2	5
1225	1009	239	109	27	chr3	83902292	83902619	-75697164	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	4	6
1225	955	274	101	49	chr3	83902958	83903284	-75696499	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	348	-11	6
1225	233	219	63	137	chr3	83907063	83907158	-75692625	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-433	595	508	6
1225	1330	178	65	71	chr3	83910902	83911211	-75688572	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	222	6
1225	4068	178	38	38	chr3	83911213	83912064	-75687719	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1400	2250	-76	6
1225	1422	147	300	49	chr3	83912111	83912447	-75687336	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	420	-108	6
1225	737	132	201	0	chr3	83912428	83912572	-75687211	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-355	173	1	6
1225	305	250	0	81	chr3	83916023	83916110	-75683673	-	MT2A	LTR	ERVL	-453	80	1	6
1225	723	117	8	16	chr3	83916110	83916232	-75683551	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	0	5761	5641	6
1225	227	260	49	49	chr3	83916264	83916345	-75683438	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1339	624	544	6
1225	5106	164	29	10	chr3	83916345	83917536	-75682247	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-153	5608	4310	6
1225	1847	189	24	3	chr3	83917535	83917865	-75681918	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3181	2580	2244	6
1225	3138	184	122	3	chr3	83917863	83918463	-75681320	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4646	1115	445	6
1225	2156	178	83	16	chr3	83918991	83919425	-75680358	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5295	466	4	6
1225	283	111	44	0	chr3	83919427	83919472	-75680311	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	487	6
1225	1707	175	155	102	chr3	83919589	83920028	-75679755	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	1	6
1225	1931	183	56	32	chr3	83920599	83920919	-75678864	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	92	6
1225	1931	183	56	32	chr3	83921124	83921214	-75678569	-	MTC	LTR	MaLR	-330	91	1	6
1225	228	294	123	38	chr3	83928210	83928316	-75671467	+	MLT1L	LTR	MaLR	3	117	-493	6
1225	233	159	23	0	chr3	83930079	83930123	-75669660	+	MTEa	LTR	MaLR	309	353	-26	6
1225	374	311	144	39	chr3	83934844	83935128	-75664655	+	MLT1F2	LTR	MaLR	245	558	-2	6
1225	306	305	8	71	chr3	83935841	83935968	-75663815	+	ORR1E	LTR	MaLR	79	197	-162	6
1225	239	291	0	0	chr3	83940167	83940222	-75659561	-	MLT1B	LTR	MaLR	-335	55	1	6
1225	318	315	47	66	chr3	83941111	83941196	-75658587	+	MLT1C	LTR	MaLR	261	347	-120	6
1225	2440	114	76	119	chr3	83941196	83941683	-75658100	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	6
1225	318	315	47	66	chr3	83941683	83941808	-75657975	+	MLT1C	LTR	MaLR	348	467	0	6
1225	2963	19	0	113	chr3	83946303	83946717	-75653066	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	7
1225	57008	21	15	2	chr3	83946717	83953113	-75646670	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	7
1225	2963	19	0	113	chr3	83953113	83953527	-75646256	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	7
1225	1804	209	82	29	chr3	83954749	83955270	-75644513	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	27	7
1225	273	207	35	0	chr3	83955531	83955589	-75644194	-	RMER15	LTR	ERVL	-515	60	1	7
1225	328	211	19	87	chr3	83960184	83960288	-75639495	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	161	7
1225	1580	132	143	13	chr3	83962010	83962318	-75637465	+	ORR1B1	LTR	MaLR	2	349	-45	7
1225	436	294	8	23	chr3	83962750	83962879	-75636904	-	RMER10B	LTR	ERVL	-2	396	270	7
1225	458	372	12	70	chr3	83969296	83969640	-75630143	+	MT2A	LTR	ERVL	3	326	-207	7
1225	237	263	41	41	chr3	83969843	83969966	-75629817	+	MT2A	LTR	ERVL	334	456	-77	7
1225	330	326	21	14	chr3	83973585	83973728	-75626055	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	144	-264	7
1225	296	259	12	12	chr3	83973878	83973964	-75625819	+	MTE2a	LTR	MaLR	280	365	-14	7
1225	2073	125	25	6	chr3	83974557	83974879	-75624904	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	328	-1	7
1225	2016	181	12	22	chr3	83984313	83984715	-75615068	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	7
1225	824	172	86	0	chr3	83987775	83987938	-75611845	+	RMER20A	LTR	ERVK	340	516	0	7
1225	326	329	38	139	chr3	83988276	83988376	-75611407	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	105	-254	7
1225	3119	54	33	15	chr3	83988376	83988774	-75611009	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	405	-2	7
1225	326	329	38	139	chr3	83988774	83989012	-75610771	+	ORR1E	LTR	MaLR	106	312	-47	7
1225	372	208	7	143	chr3	83990366	83990506	-75609277	-	MT2B	LTR	ERVL	-330	271	151	7
1225	2577	129	13	0	chr3	84001005	84001393	-75598390	+	ORR1B1	LTR	MaLR	2	394	0	5
1225	1879	161	17	103	chr3	84010632	84010912	-75588871	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	260	-114	3
1225	1879	161	17	103	chr3	84010959	84011087	-75588696	+	ORR1D1	LTR	MaLR	261	374	0	3
1225	271	256	139	13	chr3	84014657	84014736	-75585047	-	MER34A	LTR	ERV1	-115	456	368	4
1226	318	251	61	39	chr3	84019010	84019138	-75580645	+	MLT1A	LTR	MaLR	5	142	-232	5
1226	537	251	55	85	chr3	84019421	84019621	-75580162	+	MLT1A	LTR	MaLR	173	366	-8	5
1226	238	296	94	77	chr3	84027869	84027986	-75571797	+	ORR1E	LTR	MaLR	56	174	-185	7
1226	940	257	79	78	chr3	84028018	84028443	-75571340	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	423	-18	7
1226	1888	162	26	20	chr3	84029355	84029707	-75570076	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	7
1226	760	314	150	62	chr3	84030444	84030865	-75568918	-	MLT1C	LTR	MaLR	-9	458	1	7
1226	778	297	14	5	chr3	84034059	84034272	-75565511	+	MTD	LTR	MaLR	25	239	-180	8
1226	2287	148	16	5	chr3	84037371	84037751	-75562032	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	9
1226	227	286	73	80	chr3	84038528	84038665	-75561118	+	RMER21B	LTR	ERV1	679	814	-28	9
1226	1714	201	44	8	chr3	84041796	84042162	-75557621	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	1
1226	446	303	119	88	chr3	84048145	84048499	-75551284	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	365	0	1
1226	420	341	83	67	chr3	84049504	84049865	-75549918	+	MLT1A1	LTR	MaLR	42	408	0	1
1226	380	344	81	70	chr3	84051290	84051562	-75548221	+	MLT2B5	LTR	ERVL	174	448	-153	1
1226	416	218	322	6	chr3	84053223	84053394	-75546389	+	MLT1C	LTR	MaLR	115	339	-128	1
1226	1528	147	283	30	chr3	84053645	84053981	-75545802	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1226	1717	209	56	206	chr3	84058692	84059336	-75540447	+	RMER15	LTR	ERVL	29	575	0	1
1226	462	251	89	41	chr3	84064873	84065150	-75534633	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	390	97	1
1226	238	329	206	19	chr3	84065158	84065313	-75534470	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	176	1
1226	374	189	31	72	chr3	84065524	84065621	-75534162	-	MLT1C	LTR	MaLR	-372	95	3	1
1226	1734	169	17	17	chr3	84071508	84071863	-75527920	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	5	1
1226	852	361	117	29	chr3	84072376	84072887	-75526896	+	MER21B	LTR	ERV1	24	579	-284	1
1226	351	297	93	45	chr3	84076033	84076234	-75523549	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	134	1
1226	242	338	122	0	chr3	84076248	84076322	-75523461	-	MTEa	LTR	MaLR	-276	83	1	1
1226	1331	245	87	21	chr3	84076336	84076715	-75523068	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	1
1226	2554	147	10	7	chr3	84078140	84078552	-75521231	+	MTC	LTR	MaLR	9	421	0	1
1226	261	256	58	11	chr3	84081956	84082043	-75517740	-	MTEb	LTR	MaLR	-10	369	279	1
1226	429	221	126	53	chr3	84084622	84084815	-75514968	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	200	-208	1
1226	365	295	45	67	chr3	84084866	84085044	-75514739	+	MLT1A	LTR	MaLR	186	359	-31	1
1226	303	347	171	27	chr3	84087950	84088317	-75511466	+	MLT1J	LTR	MaLR	93	512	0	1
1226	2380	164	7	77	chr3	84092133	84092493	-75507290	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	78	1
1226	2380	164	7	77	chr3	84092627	84092708	-75507075	-	MTC	LTR	MaLR	-344	77	3	1
1226	1420	178	55	172	chr3	84103153	84103588	-75496195	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	2
1226	2014	170	42	6	chr3	84110492	84110853	-75488930	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
1226	339	338	77	50	chr3	84112613	84112834	-75486949	-	ORR1E	LTR	MaLR	-126	233	7	2
1226	2382	63	66	0	chr3	84113080	84113397	-75486386	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	1	2
1226	7539	108	25	10	chr3	84113397	84114501	-75485282	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	0	1963	844	2
1226	405	267	197	60	chr3	84114520	84114600	-75485183	-	RLTR21	LTR	ERVK	-197	1375	1275	2
1226	5549	115	17	57	chr3	84114646	84115571	-75484212	-	RMER12	LTR	ERVK	-434	888	1	2
1226	385	339	110	46	chr3	84120606	84120958	-75478825	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	407	-220	2
1226	2332	167	133	11	chr3	84120958	84121418	-75478365	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	516	-12	2
1226	826	259	75	110	chr3	84122538	84122797	-75476986	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-2	395	119	2
1226	826	246	60	114	chr3	84122880	84123011	-75476772	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-346	118	1	2
1226	401	280	102	54	chr3	84124656	84124822	-75474961	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	175	-184	2
1226	2114	201	17	17	chr3	84124827	84125232	-75474551	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	2	2
1226	420	171	34	0	chr3	84125354	84125442	-75474341	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	91	-276	2
1226	334	176	0	68	chr3	84125409	84125482	-75474301	+	ORR1B2	LTR	MaLR	259	326	0	2
1226	2141	272	61	140	chr3	84125544	84125706	-75474077	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	135	-1445	2
1226	2141	272	61	140	chr3	84125877	84126774	-75473009	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	136	977	-603	2
1226	241	250	0	0	chr3	84127085	84127133	-75472650	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	240	287	-281	2
1226	625	227	12	78	chr3	84127119	84127176	-75472607	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	423	479	-99	2
1226	625	227	12	78	chr3	84127274	84127383	-75472400	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	480	577	-1	2
1226	936	224	70	16	chr3	84128967	84129225	-75470558	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	272	-87	2
1226	392	308	118	68	chr3	84129502	84129739	-75470044	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	254	-105	2
1226	1551	173	122	3	chr3	84131272	84131574	-75468209	-	MTC	LTR	MaLR	-26	395	58	2
1226	228	297	0	26	chr3	84134410	84134486	-75465297	+	ORR1E	LTR	MaLR	280	353	-26	2
1226	266	306	87	24	chr3	84135464	84135591	-75464192	+	MLT1C	LTR	MaLR	18	152	-353	2
1226	339	291	133	14	chr3	84136272	84136415	-75463368	+	MLT1C	LTR	MaLR	304	463	-4	2
1226	1924	137	128	32	chr3	84136534	84136940	-75462843	+	RLTR28	LTR	ERVL	64	508	-16	2
1226	665	304	92	78	chr3	84137809	84138155	-75461628	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-13	352	2	2
1226	1969	180	52	15	chr3	84142807	84143213	-75456570	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1227	667	285	46	105	chr3	84152503	84152875	-75446908	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	350	-9	3
1227	244	316	50	30	chr3	84153329	84153430	-75446353	+	MLT1B	LTR	MaLR	111	213	-177	3
1227	249	341	76	41	chr3	84154841	84155012	-75444771	+	MLT1K	LTR	MaLR	39	215	-380	3
1227	3268	53	2	5	chr3	84158207	84158604	-75441179	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1227	258	293	0	109	chr3	84161714	84161806	-75437977	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	99	-280	3
1227	2256	87	60	17	chr3	84163083	84163435	-75436348	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	3
1227	39515	21	4	3	chr3	84163437	84169886	-75429897	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	8	3
1227	2232	87	60	17	chr3	84169886	84170238	-75429545	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	3
1227	1010	210	144	11	chr3	84171160	84171430	-75428353	-	ORR1E	LTR	MaLR	-53	306	1	3
1227	1611	146	28	0	chr3	84171511	84171765	-75428018	+	MT2A	LTR	ERVL	1	261	-272	3
1227	443	173	0	13	chr3	84171997	84172073	-75427710	+	MTC	LTR	MaLR	1	75	-346	3
1227	1663	107	4	0	chr3	84172137	84172379	-75427404	+	MTC	LTR	MaLR	104	346	-75	3
1227	301	262	73	18	chr3	84176167	84176276	-75423507	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	115	-244	3
1227	534	285	95	22	chr3	84177128	84177389	-75422394	+	MLT1B	LTR	MaLR	3	279	-95	3
1227	383	223	7	177	chr3	84178758	84178905	-75420878	+	RMER15	LTR	ERVL	1	122	-453	3
1227	892	252	112	8	chr3	84178954	84179194	-75420589	+	RMER15	LTR	ERVL	310	574	-1	3
1227	571	245	181	0	chr3	84179200	84179404	-75420379	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-223	241	1	3
1227	1235	224	50	112	chr3	84181153	84181555	-75418228	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	3
1227	225	351	56	78	chr3	84184042	84184221	-75415562	-	ORR1E	LTR	MaLR	-165	194	20	3
1227	653	211	30	182	chr3	84184253	84184456	-75415327	-	MLT1C	LTR	MaLR	-24	443	196	3
1227	3348	38	5	2	chr3	84186861	84187256	-75412527	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1227	1452	240	67	32	chr3	84188256	84188661	-75411122	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1227	1045	236	205	15	chr3	84190460	84190792	-75408991	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	21	3
1227	234	235	204	93	chr3	84190696	84190804	-75408979	-	MT2A	LTR	ERVL	-413	120	1	3
1227	1387	214	100	31	chr3	84193344	84193366	-75406417	+	MTD	LTR	MaLR	1	20	-399	3
1227	1387	214	100	31	chr3	84193386	84193754	-75406029	+	MTD	LTR	MaLR	21	418	-1	3
1227	364	262	73	84	chr3	84195157	84195336	-75404447	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	203	4
1227	1272	258	60	35	chr3	84202442	84202812	-75396971	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	4
1227	359	351	76	12	chr3	84205346	84205572	-75394211	-	MLT1A	LTR	MaLR	-54	320	74	4
1227	920	280	182	31	chr3	84205621	84205945	-75393838	-	MLT1A-int	LTR	MaLR	-8	1727	1408	4
1227	306	293	192	7	chr3	84206255	84206406	-75393377	-	MLT1A-int	LTR	MaLR	-1183	552	374	4
1227	479	226	21	50	chr3	84207992	84208132	-75391651	+	MTEa	LTR	MaLR	240	375	-4	4
1227	1429	176	76	110	chr3	84210110	84210315	-75389468	-	RMER10B	LTR	ERVL	-3	395	197	4
1227	1429	176	76	110	chr3	84210367	84210570	-75389213	-	RMER10B	LTR	ERVL	-202	196	1	4
1227	986	238	124	26	chr3	84215305	84215360	-75384423	-	MTE2b	LTR	MaLR	-41	338	283	4
1227	1926	120	128	6	chr3	84215360	84215687	-75384096	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1227	986	238	124	26	chr3	84215687	84215937	-75383846	-	MTE2b	LTR	MaLR	-97	282	3	4
1227	436	284	205	59	chr3	84218474	84218747	-75381036	+	MLT1D	LTR	MaLR	17	329	-176	4
1227	1073	187	28	214	chr3	84221587	84221798	-75377985	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	237	4
1227	1073	187	28	214	chr3	84221845	84222137	-75377646	-	RMER17C	LTR	ERVK	-174	236	1	4
1227	622	271	63	57	chr3	84222632	84222900	-75376883	+	MLT1G1	LTR	MaLR	257	579	0	4
1227	470	260	0	0	chr3	84225454	84225550	-75374233	-	MTD	LTR	MaLR	-229	190	95	4
1227	862	240	133	4	chr3	84227703	84227966	-75371817	-	MLT1C	LTR	MaLR	-105	362	66	4
1227	343	276	39	77	chr3	84230390	84230548	-75369235	-	MLT1C	LTR	MaLR	-7	460	216	4
1227	850	260	141	57	chr3	84244018	84244352	-75355431	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	4	4
1227	234	346	58	29	chr3	84268627	84268731	-75331052	+	RMER15	LTR	ERVL	360	466	-109	5
1227	357	294	77	93	chr3	84268786	84269045	-75330738	-	RLTR21	LTR	ERVK	-228	1344	1090	5
1228	243	171	11	126	chr3	84280481	84280568	-75319215	+	MT2B	LTR	ERVL	164	240	-361	5
1228	1275	188	157	9	chr3	84296601	84296944	-75302839	+	MTC	LTR	MaLR	1	394	-27	5
1228	2092	114	67	3	chr3	84297179	84297539	-75302244	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	383	-11	5
1228	237	362	16	63	chr3	84306018	84306207	-75293576	+	RMER4B	LTR	ERVK	7	186	-399	5
1228	960	178	68	9	chr3	84309583	84309804	-75289979	-	RMER10A	LTR	ERVL	-13	429	196	5
1228	2150	194	37	51	chr3	84315768	84316334	-75283449	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	4	561	0	5
1228	705	301	114	29	chr3	84337659	84338001	-75261782	+	MER68	LTR	ERVL	1	371	-192	6
1228	475	248	171	0	chr3	84342621	84342884	-75256899	+	MTE2b	LTR	MaLR	9	366	-13	6
1228	2648	74	71	36	chr3	84346643	84347036	-75252747	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
1228	1346	97	56	21	chr3	84348295	84348528	-75251255	-	RLTR15	LTR	ERVK	-4	355	115	6
1228	314	246	0	0	chr3	84350110	84350179	-75249604	+	MLT1A1	LTR	MaLR	340	408	0	6
1228	867	276	111	13	chr3	84351168	84351483	-75248300	+	ORR1D2	LTR	MaLR	13	358	-12	6
1228	290	184	51	112	chr3	84353151	84353167	-75246616	+	MT2B	LTR	ERVL	155	164	-437	6
1228	539	228	32	0	chr3	84354400	84354523	-75245260	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	258	6
1228	1846	144	44	7	chr3	84354524	84354851	-75244932	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-62	322	5	6
1228	402	284	242	9	chr3	84355177	84355439	-75244344	+	MTEb	LTR	MaLR	21	349	-30	6
1228	1418	184	50	88	chr3	84373565	84373964	-75225819	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	6
1228	1900	177	123	38	chr3	84381496	84381838	-75217945	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	18	399	-128	7
1228	2811	55	91	3	chr3	84381838	84382202	-75217581	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1228	1900	177	123	38	chr3	84382202	84382329	-75217454	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	400	527	0	7
1228	429	181	0	95	chr3	84389675	84389689	-75210094	+	MT2B	LTR	ERVL	153	155	-446	7
1228	532	311	140	19	chr3	84392456	84392764	-75207019	+	MLT1E2	LTR	MaLR	219	563	-64	7
1228	1353	201	104	45	chr3	84407667	84408043	-75191740	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	7
1228	613	306	95	49	chr3	84408151	84408523	-75191260	-	MTE2a	LTR	MaLR	-21	398	18	7
1228	1210	203	161	133	chr3	84409220	84409737	-75190046	+	MT2A	LTR	ERVL	3	533	0	7
1228	3002	123	117	4	chr3	84409742	84410297	-75189486	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	5	622	-887	7
1229	746	118	13	42	chr3	84410481	84410635	-75189148	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1369	1527	-53	7
1229	450	117	26	0	chr3	84410635	84410712	-75189071	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	79	-288	7
1229	2284	122	19	0	chr3	84413305	84413626	-75186157	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1229	1517	138	80	180	chr3	84414354	84414560	-75185223	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	189	-195	7
1229	1517	138	80	180	chr3	84414739	84414955	-75184828	+	ORR1C2	LTR	MaLR	190	382	-2	7
1229	294	286	81	81	chr3	84414993	84415179	-75184604	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	186	-319	7
1229	1364	249	25	70	chr3	84415980	84416224	-75183559	+	MTEa	LTR	MaLR	1	236	-143	7
1229	1536	172	123	0	chr3	84416224	84416556	-75183227	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	1	7
1229	1364	249	25	70	chr3	84416556	84416708	-75183075	+	MTEa	LTR	MaLR	237	379	0	7
1229	1096	259	102	27	chr3	84418895	84419268	-75180515	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	7
1229	5269	154	20	30	chr3	84423559	84424470	-75175313	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	7
1229	268	264	20	90	chr3	84427257	84427357	-75172426	-	MT2B2	LTR	ERVL	-340	244	152	7
1229	230	233	10	126	chr3	84427463	84427479	-75172304	+	MT2B	LTR	ERVL	191	261	-340	7
1229	1486	220	138	25	chr3	84433061	84433509	-75166274	-	RMER15	LTR	ERVL	-21	554	56	8
1229	246	170	0	19	chr3	84433566	84433620	-75166163	-	RMER15	LTR	ERVL	-522	53	1	8
1229	451	184	118	85	chr3	84435400	84435631	-75164152	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-278	256	1	8
1229	893	224	52	103	chr3	84438854	84439203	-75160580	-	MTEa	LTR	MaLR	-16	363	33	8
1229	867	126	39	15	chr3	84440311	84440509	-75159274	+	RMER19A	LTR	ERVK	542	711	-26	8
1229	306	231	75	25	chr3	84442543	84442663	-75157120	+	MER57D	LTR	ERV1	284	409	-2	8
1229	4298	125	193	38	chr3	84445055	84445836	-75153947	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	8
1229	875	135	61	160	chr3	84453391	84453603	-75146180	-	RMER2	LTR	ERV1	-376	191	1	8
1229	4571	167	67	14	chr3	84453861	84454718	-75145065	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	8
1229	238	336	118	7	chr3	84455683	84455827	-75143956	+	MLT1K	LTR	MaLR	408	567	-28	8
1229	2463	102	3	6	chr3	84465973	84466300	-75133483	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	9
1229	367	325	82	77	chr3	84475021	84475351	-75124432	-	ORR1E	LTR	MaLR	-27	352	1	9
1229	303	308	29	18	chr3	84480131	84480287	-75119496	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	374	215	9
1229	270	163	0	20	chr3	84486041	84486091	-75113692	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-285	80	32	9
1229	1318	264	71	23	chr3	84486483	84486836	-75112947	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	5	9
1229	235	324	56	97	chr3	84494026	84494221	-75105562	-	LTR58	LTR	ERV1	-481	198	12	9
1229	1042	215	107	42	chr3	84502383	84502795	-75096988	-	RMER15	LTR	ERVL	-41	534	9	7
1229	233	277	0	0	chr3	84502833	84502880	-75096903	-	RMER15	LTR	ERVL	-524	51	5	8
1229	3237	44	15	7	chr3	84502880	84503288	-75096495	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	9
1229	361	204	16	129	chr3	84512971	84513095	-75086688	+	MT2B	LTR	ERVL	155	264	-337	2
1229	276	282	112	75	chr3	84514025	84514186	-75085597	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-1	488	322	3
1229	629	275	45	96	chr3	84514215	84514520	-75085263	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-296	299	3	3
1229	228	339	29	73	chr3	84516347	84516484	-75083299	+	ORR1E	LTR	MaLR	44	174	-185	4
1229	1244	219	30	83	chr3	84519334	84519732	-75080051	+	MTEb	LTR	MaLR	3	379	0	4
1229	1303	151	0	98	chr3	84522360	84522647	-75077136	-	RMER10B	LTR	ERVL	-121	277	19	5
1229	694	283	124	18	chr3	84525683	84526021	-75073762	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	1	6
1229	498	350	53	38	chr3	84528286	84528550	-75071233	-	MLT1J	LTR	MaLR	-7	505	238	6
1229	590	276	109	71	chr3	84528567	84528913	-75070870	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	375	1	6
1229	2214	135	29	6	chr3	84529785	84530136	-75069647	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	6
1229	273	332	56	87	chr3	84533507	84533738	-75066045	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-138	240	17	7
1229	237	276	198	9	chr3	84533788	84533894	-75065889	-	MTE-int	LTR	MaLR	-119	1461	1336	7
1229	255	280	36	107	chr3	84533904	84534072	-75065711	-	MTE-int	LTR	MaLR	-523	1057	902	7
1229	232	326	43	0	chr3	84534198	84534290	-75065493	-	MTE-int	LTR	MaLR	-666	914	819	7
1229	604	265	0	0	chr3	84534293	84534425	-75065358	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-233	132	1	7
1229	499	320	57	136	chr3	84537489	84537894	-75061889	-	MLT1B	LTR	MaLR	-12	378	6	8
1229	405	312	49	81	chr3	84538285	84538587	-75061196	+	ORR1E	LTR	MaLR	51	340	-30	8
1229	465	289	76	93	chr3	84538927	84539228	-75060555	+	ORR1E	LTR	MaLR	58	353	-6	8
1230	287	345	126	20	chr3	84542732	84542930	-75056853	-	LTR33	LTR	ERVL	-66	449	231	9
1230	3565	20	0	2	chr3	84554630	84555027	-75044756	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1230	10029	7	0	0	chr3	84555027	84556125	-75043658	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1230	3556	15	2	2	chr3	84556125	84556521	-75043262	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1230	2280	151	94	29	chr3	84556962	84557439	-75042344	+	RMER2	LTR	ERV1	60	567	0	1
1230	265	196	0	0	chr3	84559228	84559279	-75040504	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-431	97	47	1
1230	2489	120	19	5	chr3	84560732	84561101	-75038682	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	374	-4	1
1230	308	280	11	2	chr3	84561829	84561932	-75037851	+	MTEa	LTR	MaLR	278	379	0	1
1230	1565	223	25	14	chr3	84571584	84571939	-75027844	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	1
1230	228	308	85	78	chr3	84580661	84580720	-75019063	+	MT2B	LTR	ERVL	103	162	-439	1
1230	2302	78	28	3	chr3	84584813	84585134	-75014649	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1230	522	286	135	22	chr3	84585688	84585917	-75013866	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-115	255	1	1
1230	498	252	41	0	chr3	84587174	84587297	-75012486	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	247	1
1230	3349	55	0	2	chr3	84589693	84590090	-75009693	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1230	5038	117	24	0	chr3	84591010	84591730	-75008053	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	2
1230	2464	92	33	39	chr3	84594830	84595191	-75004592	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	2
1230	1049	92	10	151	chr3	84595191	84595397	-75004386	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	1	177	-6365	2
1230	802	199	6	6	chr3	84595391	84595548	-75004235	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	347	503	-6039	2
1230	1917	189	62	6	chr3	84595548	84595904	-75003879	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5007	5382	-1160	2
1230	6501	89	3	24	chr3	84595891	84596779	-75003004	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5673	6542	0	2
1230	2570	80	28	39	chr3	84596779	84597141	-75002642	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	358	-1	2
1230	1421	179	71	43	chr3	84597610	84597961	-75001822	+	ORR1C2	LTR	MaLR	17	377	-7	2
1230	1118	188	13	129	chr3	84602751	84602832	-74996951	-	MT2B	LTR	ERVL	-4	597	541	2
1230	1118	188	13	129	chr3	84602884	84603119	-74996664	-	MT2B	LTR	ERVL	-61	540	318	2
1230	1131	264	109	3	chr3	84603543	84603893	-74995890	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	387	-3	2
1230	486	281	28	79	chr3	84608357	84608535	-74991248	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	175	-184	2
1230	268	244	66	11	chr3	84610369	84610460	-74989323	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-303	141	46	2
1230	1745	149	87	18	chr3	84613268	84613664	-74986119	-	RMER4B	LTR	ERVK	-2	464	71	2
1230	893	222	74	127	chr3	84614778	84615105	-74984678	+	MT2A	LTR	ERVL	45	483	-118	2
1230	1406	144	192	13	chr3	84624682	84624999	-74974784	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	2
1230	2051	138	76	22	chr3	84628076	84628456	-74971327	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	3	2
1230	450	287	97	44	chr3	84638293	84638541	-74961242	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-76	604	344	3
1230	558	228	45	38	chr3	84641087	84641219	-74958564	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	235	3
1230	1162	222	89	32	chr3	84641875	84642223	-74957560	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	3	3
1230	413	269	157	25	chr3	84646876	84647118	-74952665	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-250	278	5	3
1230	376	229	120	78	chr3	84652524	84652666	-74947117	+	MTEa	LTR	MaLR	5	152	-227	3
1230	235	290	10	70	chr3	84653413	84653513	-74946270	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-493	535	442	3
1230	346	299	109	51	chr3	84656800	84657168	-74942615	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	379	0	3
1230	258	322	137	64	chr3	84657356	84657575	-74942208	-	ORR1E	LTR	MaLR	-65	294	60	3
1230	2020	198	39	19	chr3	84661654	84662066	-74937717	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	3
1231	244	263	48	95	chr3	84673350	84673476	-74926307	+	MLT1-int	LTR	MaLR	187	306	-1065	3
1231	1479	210	47	14	chr3	84676711	84677073	-74922710	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1231	1758	202	146	6	chr3	84683080	84683444	-74916339	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	1	3
1231	388	166	58	70	chr3	84688047	84688157	-74911626	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	365	267	4
1231	516	274	21	77	chr3	84688185	84688379	-74911404	-	MTE2b	LTR	MaLR	-186	193	11	4
1231	3259	46	5	0	chr3	84690043	84690437	-74909346	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1231	774	257	245	7	chr3	84691884	84691985	-74907798	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	230	4
1231	774	257	245	7	chr3	84692009	84692205	-74907578	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-141	229	3	4
1231	1416	85	60	0	chr3	84692302	84692501	-74907282	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	136	4
1231	447	250	64	136	chr3	84692487	84692535	-74907248	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-426	677	539	4
1231	703	183	17	111	chr3	84692535	84692707	-74907076	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	132	4
1231	3170	132	40	11	chr3	84692673	84693217	-74906566	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-1403	560	1	4
1231	447	250	64	136	chr3	84692707	84692737	-74907046	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-426	538	446	4
1231	2168	123	12	3	chr3	84693221	84693556	-74906227	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	1	4
1231	5098	159	142	58	chr3	84694487	84695477	-74904306	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	158	4
1231	5098	159	142	58	chr3	84695672	84695822	-74903961	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1101	157	22	4
1231	2515	118	117	7	chr3	84695825	84696253	-74903530	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	4
1231	262	153	25	89	chr3	84696290	84696369	-74903414	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	4
1231	10675	84	21	0	chr3	84696489	84697972	-74901811	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-129	5356	3843	4
1231	2227	157	53	0	chr3	84697993	84698368	-74901415	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	19	4
1231	880	224	154	12	chr3	84700077	84700330	-74899453	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-85	289	1	4
1231	587	269	42	74	chr3	84702575	84702792	-74896991	-	MTEb	LTR	MaLR	-169	210	1	4
1231	1572	156	22	187	chr3	84702832	84703043	-74896740	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	180	4
1231	1572	156	22	187	chr3	84703073	84703311	-74896472	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-199	179	1	4
1231	1223	231	116	29	chr3	84713473	84713817	-74885966	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1231	1218	213	226	62	chr3	84714085	84714581	-74885202	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	577	-8	4
1231	350	42	0	41	chr3	84720237	84720286	-74879497	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	272	4
1231	239	379	15	75	chr3	84722220	84722354	-74877429	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-438	141	16	4
1231	2222	108	97	0	chr3	84765320	84765662	-74834121	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	20	5
1231	2113	156	51	25	chr3	84765676	84766071	-74833712	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	3	407	0	5
1231	2193	103	22	9	chr3	84783828	84784151	-74815632	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1231	1824	163	69	57	chr3	84788049	84788486	-74811297	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	5
1231	3442	25	5	8	chr3	84791350	84791747	-74808036	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1231	641	96	135	0	chr3	84791781	84791885	-74807898	+	ORR1C1	LTR	MaLR	259	376	-2	5
1231	421	250	52	26	chr3	84798828	84798943	-74800840	+	ORR1E	LTR	MaLR	10	127	-232	5
1231	522	263	25	44	chr3	84798984	84799143	-74800640	+	ORR1E	LTR	MaLR	116	271	-88	5
1231	314	267	22	22	chr3	84799422	84799514	-74800269	+	ORR1E	LTR	MaLR	288	379	0	5
1232	334	200	120	0	chr3	84806980	84807055	-74792728	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	84	-324	5
1232	761	274	158	11	chr3	84808137	84808422	-74791361	-	MTEb	LTR	MaLR	-52	327	1	5
1232	227	282	132	47	chr3	84809807	84809997	-74789786	-	LTR45C	LTR	ERV1	-320	219	14	5
1232	786	267	117	103	chr3	84817874	84818242	-74781541	-	MTE2a	LTR	MaLR	-4	375	3	5
1232	700	317	208	50	chr3	84820817	84821298	-74778485	-	MLT1K	LTR	MaLR	-5	590	34	6
1232	300	188	0	55	chr3	84821312	84821385	-74778398	-	RMER20A	LTR	ERVK	-8	508	440	6
1232	4413	123	84	30	chr3	84821477	84822466	-74777317	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	1102	-1	6
1232	2351	150	12	37	chr3	84822466	84822875	-74776908	-	RMER20A	LTR	ERVK	-117	399	1	6
1232	816	108	0	0	chr3	84822881	84822992	-74776791	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	794	904	-4876	6
1232	2761	158	193	9	chr3	84822992	84823558	-74776225	+	RMER19A	LTR	ERVK	28	723	-14	6
1232	472	237	144	0	chr3	84823562	84823680	-74776103	+	MTE2b	LTR	MaLR	18	152	-227	6
1232	238	281	71	24	chr3	84829238	84829322	-74770461	-	LTR78	LTR	ERV1	-346	958	871	6
1232	628	292	37	95	chr3	84829806	84830184	-74769599	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	359	-6	6
1232	229	322	11	32	chr3	84830735	84830828	-74768955	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	318	6
1232	2888	164	86	45	chr3	84832851	84833445	-74766338	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	10	6
1232	395	345	95	60	chr3	84834713	84835145	-74764638	-	MLT1L	LTR	MaLR	-163	447	1	6
1232	1191	254	61	95	chr3	84835321	84835700	-74764083	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	368	-11	6
1232	1195	291	17	20	chr3	84838420	84838774	-74761009	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	6
1232	585	243	83	32	chr3	84849329	84849546	-74750237	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	307	6
1232	1218	232	95	97	chr3	84850310	84850936	-74748847	-	RMER13A	LTR	ERVK	-265	643	1	6
1232	1507	233	13	44	chr3	84851766	84852152	-74747631	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	6
1232	1147	281	51	52	chr3	84852816	84853349	-74746434	+	RMER5	LTR	ERV1	3	534	0	6
1232	2058	199	19	14	chr3	84855587	84856006	-74743777	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1232	1050	222	112	10	chr3	84863346	84863642	-74736141	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	45	6
1232	672	310	36	52	chr3	84865092	84865347	-74734436	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	244	-115	6
1232	1874	171	75	38	chr3	84865347	84865747	-74734036	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	6
1232	672	310	36	52	chr3	84865747	84865855	-74733928	+	ORR1E	LTR	MaLR	245	358	-1	6
1232	1169	244	53	72	chr3	84869198	84869573	-74730210	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	1	6
1232	721	222	297	0	chr3	84871278	84871487	-74728296	-	MTE2a	LTR	MaLR	-26	353	83	6
1232	3356	140	46	19	chr3	84871490	84872115	-74727668	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	6
1232	287	282	100	4	chr3	84872120	84872226	-74727557	-	MTE2a	LTR	MaLR	-308	111	5	6
1232	455	316	38	19	chr3	84872606	84872764	-74727019	+	RMER15	LTR	ERVL	371	531	-44	6
1232	444	294	96	27	chr3	84874015	84874235	-74725548	+	RMER15	LTR	ERVL	336	570	-5	6
1232	347	156	12	94	chr3	84874786	84874871	-74724912	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	342	6
1232	1785	219	47	88	chr3	84875257	84875767	-74724016	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-13	499	11	6
1232	377	257	245	29	chr3	84875771	84875979	-74723804	-	MTD	LTR	MaLR	-166	253	1	6
1232	1942	172	199	65	chr3	84878013	84878282	-74721501	-	RMER6C	LTR	ERVK	-3	687	407	6
1232	1942	172	199	65	chr3	84878348	84878679	-74721104	-	RMER6C	LTR	ERVK	-284	406	4	6
1232	1379	216	72	41	chr3	84880646	84881009	-74718774	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1232	949	267	27	153	chr3	84894073	84894555	-74705228	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	10	7
1232	252	380	11	0	chr3	84895785	84895877	-74703906	-	MTE-int	LTR	MaLR	-42	1538	1446	7
1232	869	299	42	40	chr3	84898103	84898437	-74701346	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	421	56	7
1232	353	364	41	28	chr3	84901070	84901347	-74698436	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-266	325	47	7
1232	2160	98	3	76	chr3	84903940	84904295	-74695488	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	7
1232	480	289	7	0	chr3	84905290	84905432	-74694351	+	MLT2B1	LTR	ERVL	70	212	-308	7
1232	1740	176	121	12	chr3	84911647	84912078	-74687705	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	18	495	-32	7
1232	1795	151	65	6	chr3	84917365	84917704	-74682079	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	7
1232	1743	187	14	27	chr3	84921193	84921562	-74678221	+	MTD	LTR	MaLR	42	405	-14	7
1232	422	330	16	11	chr3	84922173	84922363	-74677420	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-262	202	12	7
1232	696	231	22	11	chr3	84923250	84923400	-74676383	+	MTEa	LTR	MaLR	194	344	-35	7
1232	696	231	22	11	chr3	84923443	84923476	-74676307	+	MTEa	LTR	MaLR	345	378	-1	7
1232	1043	144	158	5	chr3	84924024	84924220	-74675563	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	196	7
1232	1257	93	42	0	chr3	84924488	84924681	-74675102	-	MTC	LTR	MaLR	-210	211	11	7
1233	3400	35	5	0	chr3	84934924	84935318	-74664465	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1233	545	243	168	0	chr3	84935411	84935596	-74664187	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	150	7
1233	377	178	120	22	chr3	84935591	84935683	-74664100	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	368	-40	7
1233	539	191	8	42	chr3	84935697	84935817	-74663966	+	MER57A-int	LTR	ERV1	5805	5920	-267	7
1233	629	261	222	44	chr3	84935999	84936364	-74663419	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-244	436	7	7
1233	796	287	19	68	chr3	84939667	84939989	-74659794	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-7	358	53	7
1233	1743	134	98	6	chr3	84940036	84940352	-74659431	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-58	345	1	7
1233	960	294	30	35	chr3	84944741	84945080	-74654703	-	MLT1B	LTR	MaLR	-28	362	26	7
1233	1206	214	115	49	chr3	84952703	84953052	-74646731	-	MLT1B	LTR	MaLR	-17	373	2	7
1233	233	204	17	85	chr3	84954452	84954511	-74645272	-	LTR50	LTR	ERVL	-577	218	164	7
1233	1710	190	122	24	chr3	84955228	84955606	-74644177	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	7
1233	3230	53	2	8	chr3	84957968	84958366	-74641417	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1233	764	167	74	45	chr3	84959082	84959258	-74640525	+	ORR1A4	LTR	MaLR	28	208	-186	8
1233	2184	129	41	124	chr3	84959255	84959723	-74640060	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1081	1509	0	8
1233	2141	108	15	60	chr3	84959723	84960059	-74639724	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	8
1233	655	301	140	47	chr3	84969613	84969980	-74629803	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-173	375	2	8
1233	1716	198	65	53	chr3	84969992	84970201	-74629582	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	457	269	8
1233	1716	183	74	25	chr3	84970238	84970462	-74629321	-	RMER4B	LTR	ERVK	-305	280	36	8
1233	1716	183	74	25	chr3	84971099	84971132	-74628651	-	RMER4B	LTR	ERVK	-550	35	10	8
1233	879	223	81	11	chr3	84971351	84971592	-74628191	-	MTC	LTR	MaLR	-149	251	11	8
1233	243	293	6	157	chr3	84980799	84980814	-74618969	-	MT2B	LTR	ERVL	-304	297	242	8
1233	243	293	6	157	chr3	84980955	84980977	-74618806	-	MT2B	LTR	ERVL	-304	241	147	8
1233	455	280	14	94	chr3	84981436	84981639	-74618144	+	MLT2B2	LTR	ERVL	215	397	-118	8
1233	2530	129	37	32	chr3	84981639	84982072	-74617711	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	435	-150	8
1233	1292	180	28	20	chr3	84982109	84982358	-74617425	+	MTD	LTR	MaLR	142	392	-27	8
1233	3927	157	105	32	chr3	84983651	84984502	-74615281	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	1	1114	0	8
1233	2613	192	47	19	chr3	84996264	84996801	-74602982	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-25	552	1	8
1233	2022	210	54	0	chr3	84996835	84997225	-74602558	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	8
1233	240	234	90	13	chr3	84998594	84998672	-74601111	-	ORR1E	LTR	MaLR	-249	110	27	8
1233	2586	122	102	14	chr3	84998848	84999271	-74600512	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	460	-1	8
1233	1121	204	135	7	chr3	85001366	85001645	-74598138	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	105	5
1233	2395	174	74	58	chr3	85001696	85002197	-74597586	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-3	509	1	7
1233	4471	129	139	15	chr3	85002324	85002945	-74596838	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	243	8
1233	4471	129	139	15	chr3	85002998	85003168	-74596615	-	RMER19B	LTR	ERVK	-660	242	14	8
1233	360	198	42	26	chr3	85003164	85003256	-74596527	-	MTD	LTR	MaLR	-294	85	1	5
1233	485	313	134	72	chr3	85004959	85005279	-74594504	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	20	1
1233	1109	291	113	16	chr3	85007142	85007565	-74592218	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	4	1
1233	757	286	146	9	chr3	85008473	85008808	-74590975	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	387	7	1
1233	226	333	9	87	chr3	85011149	85011264	-74588519	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-425	1423	1318	2
1233	345	305	97	63	chr3	85013451	85013626	-74586157	+	MLT1L	LTR	MaLR	80	260	-350	2
1233	256	276	13	13	chr3	85013670	85013747	-74586036	+	MLT1L	LTR	MaLR	354	430	-180	2
1233	617	346	71	11	chr3	85014822	85015105	-74584678	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-65	300	1	2
1233	2236	92	49	0	chr3	85017704	85018008	-74581775	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1233	644	294	35	73	chr3	85021051	85021337	-74578446	+	ORR1E	LTR	MaLR	80	354	-5	4
1233	615	282	67	29	chr3	85024047	85024255	-74575528	+	MLT1I	LTR	MaLR	196	411	0	4
1233	479	359	57	63	chr3	85028352	85028685	-74571098	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	18	5
1233	1933	235	14	38	chr3	85031778	85032198	-74567585	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	3	5
1233	4273	214	110	50	chr3	85032203	85033386	-74566397	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	5	5
1233	1405	207	147	8	chr3	85033395	85033750	-74566033	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	1	5
1233	2189	151	64	11	chr3	85044169	85044543	-74555240	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	7
1233	508	290	67	36	chr3	85045364	85045557	-74554226	+	MLT2F	LTR	ERVL	352	550	-113	7
1233	362	250	100	117	chr3	85045874	85046173	-74553610	-	ORR1E	LTR	MaLR	-13	357	38	7
1233	244	311	0	16	chr3	85046172	85046234	-74553549	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-282	126	66	8
1233	263	308	0	0	chr3	85046519	85046571	-74553212	+	LTR16A	LTR	ERVL	175	226	-225	8
1233	2912	243	132	21	chr3	85046882	85047656	-74552127	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	860	0	8
1233	1903	160	57	8	chr3	85049732	85050085	-74549698	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	8
1233	400	261	73	15	chr3	85055575	85055711	-74544072	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	418	9
1233	1399	162	11	135	chr3	85057998	85058361	-74541422	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	4	1
1233	2718	41	4	202	chr3	85064365	85064851	-74534932	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
1234	3638	111	23	31	chr3	85073411	85074055	-74525728	+	RMER6A	LTR	ERVK	118	756	0	1
1234	1851	192	48	21	chr3	85075945	85076317	-74523466	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	1
1234	1621	102	112	7	chr3	85081834	85082111	-74517672	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	32	337	-20	1
1234	1618	152	23	11	chr3	85082111	85082473	-74517310	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	20	432	-7081	1
1234	769	73	9	0	chr3	85082876	85082986	-74516797	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	244	354	-3	1
1234	3908	141	132	1	chr3	85083163	85083815	-74515968	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	1
1234	2424	93	6	0	chr3	85088764	85089085	-74510698	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	1
1234	394	328	69	43	chr3	85089845	85090033	-74509750	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-5	439	247	1
1234	2172	115	48	48	chr3	85090045	85090410	-74509373	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	43	1
1234	247	98	0	0	chr3	85090410	85090451	-74509332	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1258	1218	1
1234	3335	41	2	2	chr3	85091286	85091681	-74508102	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	396	0	1
1234	1386	261	89	30	chr3	85093881	85094265	-74505518	+	MLT2B2	LTR	ERVL	64	460	-55	1
1234	1386	261	89	30	chr3	85094291	85094333	-74505450	+	MLT2B2	LTR	ERVL	461	514	-1	1
1234	424	333	152	4	chr3	85095914	85096158	-74503625	-	LTR33	LTR	ERVL	-1	514	235	1
1234	1046	198	60	41	chr3	85096951	85097220	-74502563	-	RLTR46	LTR	ERVK	-5	315	42	1
1234	967	330	43	53	chr3	85097265	85097751	-74502032	+	MTE-int	LTR	MaLR	50	530	-1050	1
1234	490	285	15	0	chr3	85097867	85098004	-74501779	+	MTE-int	LTR	MaLR	1147	1285	-295	1
1234	537	280	31	51	chr3	85098007	85098203	-74501580	-	MTE-int	LTR	MaLR	-93	1487	1296	1
1234	1197	259	59	10	chr3	85098217	85098626	-74501157	-	MLT1C	LTR	MaLR	-36	431	3	1
1234	766	230	137	54	chr3	85099367	85099680	-74500103	-	ORR1E	LTR	MaLR	-20	339	1	1
1234	1548	302	86	60	chr3	85099680	85100418	-74499365	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-53	1527	646	1
1234	1548	312	60	70	chr3	85100472	85100554	-74499229	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-935	645	565	1
1234	1464	247	105	11	chr3	85101283	85101729	-74498054	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1092	488	1	1
1234	227	319	60	88	chr3	85101727	85101909	-74497874	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	377	201	1
1234	780	242	34	0	chr3	85102023	85102201	-74497582	-	ORR1E	LTR	MaLR	-175	184	1	1
1234	245	329	83	42	chr3	85107088	85107329	-74492454	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	251	-108	1
1234	768	220	194	24	chr3	85107534	85107663	-74492120	+	MTEb	LTR	MaLR	1	148	-231	1
1234	2493	83	6	0	chr3	85107663	85107988	-74491795	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1234	768	220	194	24	chr3	85107988	85108147	-74491636	+	MTEb	LTR	MaLR	149	337	-42	1
1234	231	202	225	0	chr3	85108603	85108692	-74491091	-	LTR48	LTR	ERV1	-641	146	38	1
1234	2323	106	85	80	chr3	85109147	85109620	-74490163	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1234	6880	38	12	11	chr3	85109620	85110448	-74489335	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5653	1
1234	2743	70	0	3	chr3	85110443	85110786	-74488997	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4781	1700	1359	1
1234	3752	62	26	18	chr3	85110786	85111277	-74488506	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	1
1234	228	250	0	0	chr3	85111277	85111321	-74488462	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	232	1
1234	1154	124	10	80	chr3	85111330	85111531	-74488252	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6286	195	9	1
1234	2362	111	73	85	chr3	85111532	85112013	-74487770	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1234	1017	186	90	60	chr3	85120586	85120953	-74478830	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	76	1
1234	2922	110	4	49	chr3	85120953	85121403	-74478380	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	1
1234	621	269	18	36	chr3	85121403	85121478	-74478305	-	RMER17C	LTR	ERVK	-335	75	1	1
1234	507	306	153	80	chr3	85122558	85122846	-74476937	-	MLT1J	LTR	MaLR	-201	311	3	1
1234	269	215	15	30	chr3	85123616	85123683	-74476100	+	MTEa	LTR	MaLR	298	363	-16	1
1234	274	317	28	19	chr3	85125257	85125363	-74474420	+	ORR1E	LTR	MaLR	24	130	-229	2
1234	531	295	44	52	chr3	85125372	85125622	-74474161	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4122	1400	1153	2
1234	225	360	79	98	chr3	85126676	85126993	-74472790	+	MLT1A	LTR	MaLR	56	366	-8	2
1234	290	225	41	61	chr3	85127108	85127192	-74472591	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	81	-278	2
1234	901	81	102	9	chr3	85128987	85129139	-74470644	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-255	145	1	2
1234	9514	24	3	1	chr3	85129139	85130235	-74469548	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
1234	3566	18	2	0	chr3	85130235	85130630	-74469153	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1234	544	309	88	20	chr3	85131717	85132078	-74467705	+	MER74C	LTR	ERVL	12	482	-76	2
1234	284	350	19	0	chr3	85133727	85133830	-74465953	+	MLT2B2	LTR	ERVL	5	109	-406	2
1234	324	233	104	13	chr3	85134024	85134142	-74465641	+	ORR1E	LTR	MaLR	245	367	-3	2
1234	1952	175	65	14	chr3	85135629	85136000	-74463783	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	390	-4	2
1234	2015	133	0	72	chr3	85136259	85136606	-74463177	+	ORR1A3	LTR	MaLR	5	326	0	2
1234	1622	192	15	89	chr3	85137389	85137522	-74462261	+	MTC	LTR	MaLR	1	108	-313	2
1234	1622	192	15	89	chr3	85137695	85137899	-74461884	+	MTC	LTR	MaLR	109	313	-108	2
1234	1654	129	137	64	chr3	85137903	85138276	-74461507	+	RLTR9E	LTR	ERVK	10	409	0	2
1234	659	122	112	9	chr3	85138276	85138392	-74461391	+	MTC	LTR	MaLR	294	421	0	2
1234	1748	189	98	12	chr3	85141022	85141410	-74458373	+	MTC	LTR	MaLR	3	391	-30	2
1234	721	310	32	67	chr3	85144260	85144661	-74455122	+	MLT1B	LTR	MaLR	4	390	0	2
1234	4102	163	80	78	chr3	85149737	85150637	-74449146	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	2
1234	251	309	12	24	chr3	85151696	85151779	-74448004	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-115	329	248	2
1234	652	301	77	94	chr3	85157263	85157666	-74442117	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	1	2
1234	289	292	122	17	chr3	85165801	85165916	-74433867	-	ORR1E	LTR	MaLR	-222	137	11	2
1234	1333	186	252	9	chr3	85166283	85166620	-74433163	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1234	1407	183	34	93	chr3	85167839	85168017	-74431766	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-16	358	179	2
1234	1407	183	34	93	chr3	85168063	85168240	-74431543	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-196	178	25	2
1234	846	291	86	3	chr3	85175177	85175501	-74424282	+	MLT1B	LTR	MaLR	40	390	0	2
1234	544	275	21	39	chr3	85178104	85178316	-74421467	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-30	624	381	2
1234	392	347	33	104	chr3	85178320	85178619	-74421164	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-290	279	2	2
1234	1205	238	108	0	chr3	85179045	85179352	-74420431	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	347	-32	2
1234	368	296	258	14	chr3	85179660	85179869	-74419914	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	95	2
1234	403	204	54	0	chr3	85180073	85180166	-74419617	-	ORR1E	LTR	MaLR	-261	98	1	2
1234	361	333	25	6	chr3	85184786	85184943	-74414840	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	346	2
1234	439	194	102	119	chr3	85185187	85185363	-74414420	+	MTEa	LTR	MaLR	205	377	-2	2
1234	811	278	135	28	chr3	85187346	85187701	-74412082	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-3	677	285	2
1234	235	383	43	0	chr3	85188175	85188316	-74411467	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-506	147	1	2
1234	823	270	147	32	chr3	85192845	85193347	-74406436	+	RMER13A	LTR	ERVK	98	657	-203	2
154	501	345	45	62	chr3	85196547	85196905	-74402878	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	359	0	2
1235	350	208	0	158	chr3	85200337	85200571	-74399212	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	79	3
1235	1706	172	3	59	chr3	85201365	85201635	-74398148	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	54	3
1235	2169	97	80	34	chr3	85201635	85201986	-74397797	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-1	367	1	3
1235	1706	172	3	59	chr3	85201986	85202055	-74397728	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-276	53	1	3
1235	246	389	59	55	chr3	85202448	85202668	-74397115	+	LTR16E2	LTR	ERVL	47	267	-301	3
1235	982	262	86	20	chr3	85206548	85206852	-74392931	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	44	3
1235	2473	178	71	99	chr3	85211450	85212054	-74387729	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	587	-315	3
1235	612	158	0	0	chr3	85212057	85212158	-74387625	+	RMER19B	LTR	ERVK	802	902	0	3
1235	430	355	73	23	chr3	85212805	85213105	-74386678	+	ORR1E	LTR	MaLR	25	339	-20	3
1235	2409	161	15	0	chr3	85214997	85215408	-74384375	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	50	3
1235	1737	107	0	24	chr3	85215449	85215699	-74384084	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2672	2588	2345	3
1235	1579	163	78	66	chr3	85215698	85216046	-74383737	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-4875	385	34	3
1235	570	174	9	9	chr3	85216068	85216157	-74383626	-	RMER4A	LTR	ERVK	-8	458	369	3
1235	570	174	9	9	chr3	85216298	85216318	-74383465	-	RMER4A	LTR	ERVK	-98	368	349	3
1235	1974	174	21	10	chr3	85216377	85216760	-74383023	-	RMER4A	LTR	ERVK	-79	387	1	3
1235	1392	260	58	3	chr3	85217511	85217671	-74382112	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	165	-205	3
1235	1392	260	58	3	chr3	85217727	85217913	-74381870	+	ORR1D2	LTR	MaLR	166	369	-1	3
1235	2067	184	25	0	chr3	85224286	85224651	-74375132	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1235	774	220	232	32	chr3	85228343	85228657	-74371126	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	379	0	3
1235	5113	151	62	23	chr3	85229224	85230092	-74369691	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	3
1235	2214	187	42	78	chr3	85234261	85234347	-74365436	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	441	3
1235	2214	187	42	78	chr3	85234371	85234836	-74364947	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-101	440	11	3
1235	1059	250	40	37	chr3	85235793	85236122	-74363661	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	374	1	3
1235	246	245	19	0	chr3	85236992	85237045	-74362738	-	LTR33B	LTR	ERVL	-396	107	54	3
1235	237	322	72	32	chr3	85238672	85238797	-74360986	+	MLT1A1	LTR	MaLR	254	383	-25	3
1235	1097	242	73	41	chr3	85241248	85241562	-74358221	+	MTEa	LTR	MaLR	1	324	-55	3
1235	405	289	129	31	chr3	85244069	85244262	-74355521	+	MLT1H	LTR	MaLR	2	213	-336	3
1235	331	315	114	38	chr3	85244596	85244860	-74354923	+	MLT1H	LTR	MaLR	224	507	-42	3
1235	473	312	6	55	chr3	85247410	85247593	-74352190	-	MLT1J	LTR	MaLR	-102	410	237	3
1235	2295	227	46	52	chr3	85247739	85248329	-74351454	+	RLTR18	LTR	ERVK	28	613	-3	3
1235	226	288	0	48	chr3	85250100	85250184	-74349599	-	MLT1J	LTR	MaLR	-204	308	229	3
1235	626	324	124	46	chr3	85252240	85252586	-74347197	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	373	-1	3
1235	3750	120	34	20	chr3	85256702	85257289	-74342494	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	98	4
1235	1561	212	88	22	chr3	85257306	85257668	-74342115	-	MTD	LTR	MaLR	-33	386	1	4
1235	328	273	23	51	chr3	85259027	85259158	-74340625	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	229	4
1235	2265	125	27	3	chr3	85261049	85261387	-74338396	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
1235	735	262	161	35	chr3	85261710	85261995	-74337788	+	ORR1E	LTR	MaLR	33	353	-6	4
1235	4366	153	12	20	chr3	85262951	85263713	-74336070	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	4
1235	301	328	86	14	chr3	85265767	85265906	-74333877	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	1	4
1235	1906	201	28	0	chr3	85267020	85267384	-74332399	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1235	644	267	133	94	chr3	85268355	85268611	-74331172	+	MLT1B	LTR	MaLR	116	381	-9	4
1235	1966	159	17	0	chr3	85268849	85269195	-74330588	-	RLTR15	LTR	ERVK	-3	356	5	4
1235	372	376	178	10	chr3	85276421	85276735	-74323048	+	LTR78	LTR	ERV1	170	536	-768	4
1235	329	376	44	39	chr3	85277015	85277195	-74322588	+	LTR78	LTR	ERV1	874	1054	-250	4
1235	1039	241	52	137	chr3	85277644	85278009	-74321774	-	MTE2b	LTR	MaLR	-41	338	5	4
1235	1948	165	34	40	chr3	85278767	85279145	-74320638	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	1	4
1235	1422	119	102	18	chr3	85285403	85285686	-74314097	-	BGLII_A	LTR	ERVK	0	445	139	4
1235	424	304	60	82	chr3	85286469	85286923	-74312860	-	MLT1D	LTR	MaLR	-8	497	54	4
1235	246	293	29	39	chr3	85287611	85287714	-74312069	+	MTEa	LTR	MaLR	278	379	0	4
1235	419	263	8	17	chr3	85290427	85290547	-74309236	+	MTEa	LTR	MaLR	244	362	-17	4
1235	234	287	106	0	chr3	85290966	85291060	-74308723	+	MTEa	LTR	MaLR	262	365	-14	4
1235	704	289	82	67	chr3	85297384	85297714	-74302069	+	LTR16E1	LTR	ERVL	201	535	-3	4
1235	292	312	109	21	chr3	85300655	85300848	-74298935	-	MLT1K	LTR	MaLR	-33	562	353	4
1235	4330	123	126	55	chr3	85305726	85306555	-74293228	-	RMER17D	LTR	ERVK	-2	887	1	4
1235	285	281	30	52	chr3	85309533	85309668	-74290115	+	RLTR25A	LTR	ERVK	522	653	-450	4
1235	2208	211	54	39	chr3	85314858	85315429	-74284354	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	580	-4	5
1235	2229	163	68	0	chr3	85316244	85316613	-74283170	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1235	340	238	49	10	chr3	85316636	85316738	-74283045	-	ORR1E	LTR	MaLR	-235	124	19	5
1235	318	346	36	67	chr3	85318016	85318211	-74281572	-	MLT1H	LTR	MaLR	-271	278	90	5
1235	368	268	41	55	chr3	85323403	85323456	-74276327	-	MLT1C	LTR	MaLR	-122	345	295	5
1235	368	268	41	55	chr3	85323622	85323714	-74276069	-	MLT1C	LTR	MaLR	-173	294	202	5
1235	455	298	21	28	chr3	85323810	85323954	-74275829	-	MLT1C	LTR	MaLR	-288	179	37	5
1235	657	280	68	58	chr3	85324159	85324451	-74275332	+	MLT2B4	LTR	ERVL	73	387	-169	5
1235	535	316	49	37	chr3	85325034	85325280	-74274503	+	MLT1A	LTR	MaLR	7	255	-119	5
154	10944	121	80	23	chr3	85327071	85328926	-74270857	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	2	1963	0	5
1236	2181	99	48	3	chr3	85328926	85329239	-74270544	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1236	379	248	131	2	chr3	85329472	85329605	-74270178	+	MLT1A	LTR	MaLR	367	529	-20	5
1236	372	342	0	53	chr3	85329822	85329992	-74269791	+	MER74A	LTR	ERVL	143	303	-255	5
1236	323	331	24	8	chr3	85333949	85334074	-74265709	-	MLT1I	LTR	MaLR	-279	132	6	5
1236	1687	147	54	60	chr3	85337059	85337392	-74262391	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-53	331	1	5
1236	1865	143	227	0	chr3	85342243	85342586	-74257197	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
1236	5040	176	117	13	chr3	85342586	85343713	-74256070	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	1244	-14	5
1236	366	193	10	50	chr3	85343745	85343845	-74255938	+	MTC	LTR	MaLR	18	110	-286	5
1236	1402	170	66	4	chr3	85346688	85346959	-74252824	+	MTC	LTR	MaLR	68	355	-66	5
1236	457	238	112	32	chr3	85351143	85351330	-74248453	+	LTR81B	LTR	ERV1?	76	277	-1116	5
1236	562	219	92	59	chr3	85352495	85352733	-74247050	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	246	-221	5
1236	298	274	24	0	chr3	85353072	85353156	-74246627	+	MLT1C	LTR	MaLR	265	350	-117	5
1236	1113	180	268	33	chr3	85353189	85353488	-74246295	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	372	-2	5
1236	393	330	66	63	chr3	85356075	85356392	-74243391	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	323	-36	5
1236	240	29	0	28	chr3	85358171	85358207	-74241576	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	35	-339	5
1236	793	210	66	5	chr3	85358215	85358411	-74241372	+	ORR1C2	LTR	MaLR	177	384	0	5
1236	952	153	48	27	chr3	85358416	85358604	-74241179	-	MTC	LTR	MaLR	-227	194	3	5
1236	789	317	58	12	chr3	85359100	85359442	-74240341	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	358	-7	5
1236	3244	52	0	12	chr3	85360258	85360663	-74239120	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1236	1174	209	127	45	chr3	85362779	85363250	-74236533	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	457	17	5
1236	937	199	108	121	chr3	85366743	85367115	-74232668	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	372	-2	5
1236	1665	191	144	3	chr3	85384132	85384500	-74215283	+	MTC	LTR	MaLR	2	421	0	6
1236	473	280	58	96	chr3	85386582	85386894	-74212889	-	LTR83	LTR	ERVL	-477	303	4	6
1236	746	284	96	75	chr3	85391230	85391752	-74208031	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	6
1236	594	330	98	31	chr3	85400096	85400277	-74199506	+	LTR33A	LTR	ERVL	22	217	-303	6
1236	594	330	98	31	chr3	85400311	85400580	-74199203	+	LTR33A	LTR	ERVL	218	502	-18	6
1236	4134	15	51	0	chr3	85401137	85401606	-74198177	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	6
1236	377	340	14	28	chr3	85408553	85408768	-74191015	-	LTR79	LTR	ERVL	-29	498	287	6
1236	424	282	72	35	chr3	85415572	85415818	-74183965	-	MLT1H	LTR	MaLR	-244	305	16	6
1236	786	244	181	40	chr3	85417778	85418081	-74181702	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-24	346	1	6
1236	3432	33	5	0	chr3	85418120	85418514	-74181269	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1236	523	185	7	20	chr3	85418956	85419076	-74180707	+	RMER19B	LTR	ERVK	2	118	-493	6
1236	297	254	74	66	chr3	85419090	85419212	-74180571	+	MTEb	LTR	MaLR	256	378	-1	6
1236	2632	40	64	9	chr3	85421810	85422138	-74177645	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
1236	3184	6	37	0	chr3	85426203	85426557	-74173226	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	6
1236	56865	23	14	2	chr3	85426557	85432959	-74166824	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	6
1236	3184	6	37	0	chr3	85432959	85433313	-74166470	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	6
1236	478	304	106	59	chr3	85441660	85441915	-74157868	-	MLT1A	LTR	MaLR	-65	309	43	6
1236	799	145	49	17	chr3	85443046	85443253	-74156530	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	374	164	6
1236	283	281	103	26	chr3	85445382	85445499	-74154284	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-281	127	2	6
1236	875	314	99	3	chr3	85447497	85447820	-74151963	+	MLT1A0	LTR	MaLR	5	358	-7	6
1236	4232	106	78	38	chr3	85454074	85454822	-74144961	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	806	1	6
1237	496	254	49	83	chr3	85471997	85472267	-74127516	+	ORR1E	LTR	MaLR	33	292	-67	6
1237	374	292	157	38	chr3	85473823	85474058	-74125725	+	RMER15	LTR	ERVL	275	537	-38	6
1237	2449	120	49	0	chr3	85488454	85488822	-74110961	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	7
1237	725	245	96	90	chr3	85490286	85490362	-74109421	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	75	-304	7
1237	725	245	96	90	chr3	85490501	85490801	-74108982	+	MTE2a	LTR	MaLR	76	379	0	7
1237	458	297	179	44	chr3	85496368	85496671	-74103112	+	ORR1E	LTR	MaLR	13	353	-6	7
1237	277	309	18	18	chr3	85507737	85507849	-74091934	+	LTR79	LTR	ERVL	380	491	-36	1
1237	249	211	153	14	chr3	85508328	85508400	-74091383	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	85	-274	1
1237	1739	135	8	104	chr3	85513723	85514079	-74085704	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
1237	847	232	110	18	chr3	85514708	85514980	-74084803	-	MTE2a	LTR	MaLR	-25	354	58	1
1237	867	260	55	46	chr3	85515960	85516287	-74083496	+	MTE2b	LTR	MaLR	13	342	-37	2
1237	1645	144	90	0	chr3	85517986	85518298	-74081485	+	RMER19A	LTR	ERVK	398	737	0	2
1237	248	239	105	74	chr3	85520145	85520240	-74079543	+	MLT1I	LTR	MaLR	70	167	-244	2
1237	1657	212	65	3	chr3	85540423	85540792	-74058991	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	26	5
1237	1959	162	169	2	chr3	85549921	85550360	-74049423	-	RMER4B	LTR	ERVK	-57	528	17	6
1237	530	304	72	22	chr3	85552513	85552846	-74046937	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	379	0	6
1237	648	284	33	21	chr3	85552846	85553087	-74046696	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	244	-1336	6
1237	2799	281	137	16	chr3	85553086	85554128	-74045655	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	358	1528	-52	6
1237	543	294	10	63	chr3	85554128	85554335	-74045448	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	196	-163	6
1237	425	245	37	9	chr3	85554770	85554877	-74044906	+	ORR1E	LTR	MaLR	265	374	-5	6
1237	239	319	110	69	chr3	85561900	85562045	-74037738	+	LTR16A	LTR	ERVL	4	154	-297	8
1237	3828	43	19	39	chr3	85564768	85565253	-74034530	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	8
1237	1410	226	85	34	chr3	85565305	85565657	-74034126	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	8
1237	1195	263	20	39	chr3	85566371	85566727	-74033056	+	MTE2a	LTR	MaLR	19	367	-12	8
1237	1628	207	69	10	chr3	85567315	85567705	-74032078	+	MTD	LTR	MaLR	1	413	-6	8
1238	248	407	25	0	chr3	85595623	85595741	-74004042	-	MLT1K	LTR	MaLR	-326	269	149	1
1238	1363	196	165	32	chr3	85596222	85596592	-74003191	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1238	2214	149	24	31	chr3	85599187	85599568	-74000215	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
1238	827	260	63	73	chr3	85608197	85608512	-73991271	-	MER31B	LTR	ERV1	-150	316	5	1
1238	1628	190	171	110	chr3	85610776	85611278	-73988505	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	1
1238	292	262	45	27	chr3	85613996	85614106	-73985677	+	RLTR25B	LTR	ERVK	427	538	-490	1
1238	273	305	75	9	chr3	85614530	85614636	-73985147	+	MLT1J	LTR	MaLR	400	512	0	1
1238	276	371	69	0	chr3	85615123	85615282	-73984501	-	LTR84b	LTR	ERVL	-90	671	502	1
1238	2643	117	47	10	chr3	85615634	85616040	-73983743	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1238	1233	214	129	12	chr3	85620711	85621051	-73978732	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	38	1
1238	1486	217	43	27	chr3	85621828	85622197	-73977586	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	5	1
1238	1593	224	73	20	chr3	85627421	85627817	-73971966	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	1
1238	1849	167	60	8	chr3	85634912	85635292	-73964491	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	6	1
1238	961	281	39	75	chr3	85641086	85641475	-73958308	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	1	2
1238	285	75	0	0	chr3	85643206	85643246	-73956537	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	5024	5063	0	2
1238	1679	120	64	48	chr3	85643257	85643633	-73956150	+	LTRIS4	LTR	ERV1	126	507	0	2
1238	1076	209	59	140	chr3	85649867	85650273	-73949510	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	373	-6	2
1238	1115	258	100	16	chr3	85659773	85660143	-73939640	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	19	2
1238	1319	249	42	6	chr3	85664928	85665284	-73934499	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	1	2
1238	657	297	60	49	chr3	85667492	85667842	-73931941	+	RMER5	LTR	ERV1	155	508	-26	2
1238	1940	138	12	25	chr3	85672949	85673276	-73926507	-	LTRIS3	LTR	ERV1	0	512	190	2
1238	251	125	0	0	chr3	85673309	85673349	-73926434	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	0	5063	5024	2
1238	413	269	110	46	chr3	85681209	85681480	-73918303	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	72	2
1238	280	261	153	0	chr3	85683811	85683922	-73915861	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-56	500	373	2
1238	290	274	136	10	chr3	85684030	85684133	-73915650	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-375	181	66	2
1238	250	269	73	15	chr3	85693077	85693145	-73906638	+	MTE2b	LTR	MaLR	293	364	-15	3
1238	618	287	62	49	chr3	85694977	85695306	-73904477	-	RLTR16	LTR	ERVK	-280	412	32	3
1238	1603	172	32	24	chr3	85698075	85698414	-73901369	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-5	379	5	3
1238	3435	129	88	76	chr3	85698414	85699018	-73900765	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	3
1238	379	266	117	24	chr3	85699607	85699768	-73900015	-	MLT2D	LTR	ERVL	-183	281	92	3
1238	1248	227	52	120	chr3	85699775	85700176	-73899607	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	374	-5	3
1238	543	235	71	39	chr3	85706354	85706509	-73893274	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	248	3
1238	1177	241	67	30	chr3	85706530	85706829	-73892954	+	MTEa	LTR	MaLR	1	310	-69	3
1238	2532	126	84	10	chr3	85706833	85707225	-73892558	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1238	719	222	79	21	chr3	85707229	85707410	-73892373	-	ORR1E	LTR	MaLR	-184	175	6	3
1238	1453	122	249	17	chr3	85709129	85709422	-73890361	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	361	-6	3
1238	1284	202	139	41	chr3	85709890	85710235	-73889548	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	3
1238	610	234	130	25	chr3	85711013	85711339	-73888444	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	359	1	3
1238	799	221	158	106	chr3	85713480	85713829	-73885954	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	2	3
1238	2863	135	75	22	chr3	85713935	85714429	-73885354	-	RLTR28	LTR	ERVL	-4	520	1	3
1238	336	305	94	50	chr3	85714966	85715125	-73884658	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	170	-189	3
1238	607	116	28	19	chr3	85715523	85715639	-73884144	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	79	-331	3
1238	1128	267	117	6	chr3	85717964	85718281	-73881502	-	MTEb	LTR	MaLR	-25	354	3	3
1239	986	253	4	45	chr3	85722922	85723166	-73876617	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-385	5376	5143	4
1239	1391	266	57	0	chr3	85723159	85723512	-73876271	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1708	4053	3681	4
1239	377	289	18	145	chr3	85723682	85723848	-73875935	-	MT2A	LTR	ERVL	-190	343	199	4
1239	236	296	13	112	chr3	85729372	85729524	-73870259	+	MLT1K	LTR	MaLR	456	592	-3	4
1239	1070	261	111	12	chr3	85733760	85734167	-73865616	-	MLT1C	LTR	MaLR	-16	451	5	4
1239	5637	101	59	24	chr3	85739906	85741059	-73858724	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	845	1692	-271	4
1239	1930	98	41	38	chr3	85741059	85741334	-73858449	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	286	-43	4
1239	1930	98	41	38	chr3	85741490	85741534	-73858249	+	ORR1A4	LTR	MaLR	287	321	-8	4
1239	491	321	141	45	chr3	85750595	85750908	-73848875	-	MLT1J	LTR	MaLR	-31	481	139	4
1239	238	292	32	43	chr3	85752876	85752969	-73846814	-	MLT1J	LTR	MaLR	-273	92	1	4
1239	592	289	116	53	chr3	85753039	85753400	-73846383	+	MLT1B	LTR	MaLR	5	388	-2	4
1239	2013	124	91	29	chr3	85756106	85756481	-73843302	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	4
1239	323	329	59	62	chr3	85756779	85757084	-73842699	-	MLT1H	LTR	MaLR	-125	424	121	4
1239	1627	160	85	60	chr3	85758157	85758349	-73841434	+	ORR1B1	LTR	MaLR	21	221	-173	4
1239	1627	160	85	60	chr3	85758536	85758708	-73841075	+	ORR1B1	LTR	MaLR	222	394	0	4
1239	711	213	7	7	chr3	85758794	85758945	-73840838	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	151	-223	4
1239	378	261	71	45	chr3	85759158	85759466	-73840317	+	RLTR15	LTR	ERVK	65	332	-27	4
1239	622	244	54	36	chr3	85759503	85759562	-73840221	+	ORR1D1	LTR	MaLR	205	267	-107	4
1239	2035	140	34	42	chr3	85759562	85759943	-73839840	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1239	622	244	54	36	chr3	85759943	85760049	-73839734	+	ORR1D1	LTR	MaLR	268	373	-1	4
1239	1830	194	78	8	chr3	85760393	85760777	-73839006	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	4
1239	249	91	45	0	chr3	85761380	85761424	-73838359	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	488	5
1239	644	208	15	15	chr3	85761429	85761561	-73838222	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5280	481	350	5
1239	2119	173	35	5	chr3	85762209	85762529	-73837254	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5378	383	65	5
1239	2119	173	35	5	chr3	85762674	85762725	-73837058	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5697	64	2	5
1239	288	122	0	0	chr3	85762725	85762774	-73837009	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	485	5
1239	604	232	23	65	chr3	85764365	85764621	-73835162	-	MT2A	LTR	ERVL	-118	483	84	5
1239	684	189	0	23	chr3	85764606	85764736	-73835047	-	MT2A	LTR	ERVL	-401	132	6	5
1239	557	295	60	0	chr3	85764973	85765156	-73834627	-	ORR1E	LTR	MaLR	-165	194	1	5
1239	719	228	205	60	chr3	85765166	85765497	-73834286	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	5
1239	627	164	28	62	chr3	85766403	85766608	-73833175	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	898	5
1239	3521	155	33	53	chr3	85766795	85767278	-73832505	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-206	897	400	5
1239	3521	155	33	53	chr3	85767467	85767712	-73832071	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-704	399	184	5
1239	941	34	0	0	chr3	85767712	85767830	-73831953	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	118	-209	5
1239	3014	42	40	40	chr3	85767827	85768274	-73831509	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	29	475	0	5
1239	771	183	43	37	chr3	85768274	85768459	-73831324	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-840	188	3	5
1239	2256	94	3	0	chr3	85768543	85768861	-73830922	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
1239	3048	123	48	16	chr3	85770303	85770808	-73828975	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	521	-3	5
1239	436	292	68	36	chr3	85771710	85771930	-73827853	-	RMER15	LTR	ERVL	-13	562	336	5
1239	4346	68	52	0	chr3	85772288	85772843	-73826940	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	5
1239	256	205	62	37	chr3	85784801	85784882	-73814901	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	293	5
1239	1194	154	4	22	chr3	85785329	85785357	-73814426	+	ORR1A4	LTR	MaLR	46	68	-261	5
1239	1568	138	100	69	chr3	85785357	85785676	-73814107	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1239	1194	154	4	22	chr3	85785676	85785872	-73813911	+	ORR1A4	LTR	MaLR	69	265	-64	5
1239	272	130	3	57	chr3	85785868	85785938	-73813845	+	RMER16	LTR	ERVK	11	66	-467	5
1239	298	49	0	0	chr3	85786160	85786201	-73813582	+	ORR1A4	LTR	MaLR	281	321	-8	5
1239	588	171	170	7	chr3	85791439	85791592	-73808191	+	MTD	LTR	MaLR	203	380	-39	5
1239	3790	118	30	7	chr3	85792641	85793237	-73806546	-	RLTR17	LTR	ERVK	-82	610	1	5
1239	501	311	52	83	chr3	85793390	85793716	-73806067	-	MLT1D	LTR	MaLR	-187	318	3	5
1239	1396	181	130	17	chr3	85802783	85803137	-73796646	+	MTD	LTR	MaLR	13	406	-13	6
1239	403	319	100	16	chr3	85803792	85804034	-73795749	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-2	651	326	6
1239	4163	147	87	45	chr3	85811904	85812764	-73787019	-	RMER19B	LTR	ERVK	-6	896	1	6
1239	1539	186	83	14	chr3	85815024	85815253	-73784530	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	228	-146	6
1239	1539	186	83	14	chr3	85815276	85815396	-73784387	+	ORR1D1	LTR	MaLR	229	373	-1	6
1239	298	299	64	13	chr3	85815408	85815564	-73784219	+	MLT1F1	LTR	MaLR	73	236	-333	6
1239	248	259	134	25	chr3	85815669	85815788	-73783995	+	MLT1F1	LTR	MaLR	414	545	-24	6
1239	2390	74	48	3	chr3	85827356	85827669	-73772114	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1239	935	186	116	31	chr3	85828404	85828704	-73771079	+	ORR1D1	LTR	MaLR	24	373	-1	6
1239	733	254	32	0	chr3	85829354	85829543	-73770240	+	ORR1D2	LTR	MaLR	38	232	-138	6
1239	1723	237	41	41	chr3	85830008	85830540	-73769243	+	RMER5	LTR	ERV1	1	532	-2	6
1239	2201	112	12	6	chr3	85835813	85836138	-73763645	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1239	401	298	96	65	chr3	85836659	85836889	-73762894	+	MLT1D	LTR	MaLR	267	503	-2	6
1239	1703	148	50	12	chr3	85840779	85841094	-73758689	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	328	-46	6
1239	1986	127	6	9	chr3	85841094	85841413	-73758370	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	6
1239	252	139	47	0	chr3	85846531	85846574	-73753209	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	449	493	0	6
1239	826	256	75	66	chr3	85850214	85850601	-73749182	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	406	21	7
1239	916	229	142	8	chr3	85850600	85850860	-73748923	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-75	295	1	7
1240	253	59	0	0	chr3	85852507	85852541	-73747242	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	353	7
1240	1457	142	40	152	chr3	85852937	85853312	-73746471	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-27	367	35	7
1240	4783	144	92	5	chr3	85854258	85855088	-73744695	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	7
1240	234	273	52	0	chr3	85855945	85856022	-73743761	-	MER31A	LTR	ERV1	-38	447	367	7
1240	348	235	71	0	chr3	85860936	85861034	-73738749	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-290	107	3	7
1240	599	291	109	30	chr3	85867992	85868258	-73731525	+	MLT1A0	LTR	MaLR	75	361	-4	7
1240	1350	176	165	6	chr3	85878027	85878203	-73721580	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-19	365	172	7
1240	1350	176	165	6	chr3	85878226	85878364	-73721419	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-213	171	1	7
1240	1916	166	16	22	chr3	85893286	85893649	-73706134	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	14	7
1240	726	324	70	17	chr3	85898917	85899218	-73700565	-	MER68	LTR	ERVL	-11	552	236	8
1240	1956	133	16	0	chr3	85903855	85904171	-73695612	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	8
1240	3821	97	82	53	chr3	85912132	85912852	-73686931	+	RMER6A	LTR	ERVK	16	756	0	8
1240	3030	12	0	0	chr3	85921883	85922211	-73677572	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1931	3554	3227	8
1240	2311	114	110	13	chr3	85929128	85929510	-73670273	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	8
1240	265	278	11	54	chr3	85932862	85932949	-73666834	-	ORR1E	LTR	MaLR	-14	365	287	8
1240	2536	85	99	3	chr3	85935897	85936262	-73663521	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	8
1240	260	222	71	36	chr3	85936610	85936694	-73663089	+	MT2B	LTR	ERVL	154	240	-361	8
1240	821	230	128	61	chr3	85937494	85937642	-73662141	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	222	8
1240	821	230	128	61	chr3	85937788	85937982	-73661801	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-153	221	6	8
1240	306	270	53	142	chr3	85938283	85938325	-73661458	-	RMER15	LTR	ERVL	-122	453	412	8
1240	306	270	53	142	chr3	85938473	85938620	-73661163	-	RMER15	LTR	ERVL	-164	411	281	8
1240	307	210	135	56	chr3	85938646	85938772	-73661011	-	RMER15	LTR	ERVL	-418	157	22	8
1240	317	261	82	88	chr3	85939320	85939467	-73660316	-	LTR40c	LTR	ERVL	-312	153	8	8
1240	259	259	146	18	chr3	85939531	85939641	-73660142	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-79	5451	5328	8
1240	4436	8	0	0	chr3	85952241	85952723	-73647060	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	9
1240	1914	147	58	50	chr3	85952871	85953251	-73646532	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	2	9
1240	961	189	92	0	chr3	85965133	85965339	-73634444	-	RLTR42	LTR	ERVK	-14	225	1	9
1240	4072	164	76	24	chr3	85965339	85966142	-73633641	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	0	5522	4678	9
1240	8748	141	70	48	chr3	85966144	85966607	-73633176	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1046	4476	4005	9
1240	8748	141	70	48	chr3	85966755	85967220	-73632563	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1518	4004	3556	9
1240	8748	141	70	48	chr3	85967357	85968166	-73631617	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1967	3555	2699	9
1240	527	190	116	39	chr3	85968186	85968367	-73631416	+	RLTR15	LTR	ERVK	33	227	-132	9
1240	247	290	117	27	chr3	85968364	85968552	-73631231	+	RLTR15	LTR	ERVK	134	338	-21	9
1240	1498	133	129	0	chr3	85968581	85968836	-73630947	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2817	2705	2418	9
1240	270	314	177	46	chr3	85973559	85973926	-73625857	-	MER74B	LTR	ERVL	-137	485	71	9
1240	1977	150	77	18	chr3	85975728	85976019	-73623764	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	96	9
1240	1977	150	77	18	chr3	85976186	85976281	-73623502	-	MTC	LTR	MaLR	-326	95	4	9
1240	3035	100	48	71	chr3	85978090	85978652	-73621131	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	19	9
1241	1737	153	55	77	chr3	85988355	85988758	-73611025	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1241	416	230	44	50	chr3	85989018	85989178	-73610605	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	224	1
1241	2234	105	38	0	chr3	85989693	85990008	-73609775	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1241	309	260	148	49	chr3	85990915	85991077	-73608706	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	178	-181	1
1241	228	288	40	14	chr3	85991172	85991246	-73608537	+	ORR1E	LTR	MaLR	290	365	-14	1
1241	1342	183	16	4	chr3	85998785	85999037	-73600746	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	255	-139	1
1241	2918	285	73	149	chr3	86003274	86004012	-73595771	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-132	1448	742	1
1241	2918	285	73	149	chr3	86004215	86004366	-73595417	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-839	741	692	1
1241	2918	285	73	149	chr3	86004549	86005221	-73594562	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-889	691	1	1
1241	257	182	0	0	chr3	86005221	86005265	-73594518	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	379	336	1
1241	478	215	29	117	chr3	86005361	86005440	-73594343	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	69	-558	1
1241	478	250	25	107	chr3	86005625	86005719	-73594064	+	RMER20B	LTR	ERVK	70	161	-355	1
1241	423	212	8	117	chr3	86005994	86006019	-73593764	+	MT2B	LTR	ERVL	145	155	-446	1
1241	913	203	20	41	chr3	86006790	86006985	-73592798	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-181	193	3	1
1241	2830	52	0	3	chr3	86011535	86011882	-73587901	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1241	1737	221	112	105	chr3	86013925	86014058	-73585725	+	RLTR20C	LTR	ERVK	3	92	-459	4
1241	1821	172	94	45	chr3	86014206	86014617	-73585166	+	RLTR20C	LTR	ERVK	85	551	0	4
1241	283	298	61	117	chr3	86023382	86023633	-73576150	-	MLT1F	LTR	MaLR	-17	543	236	6
1241	2164	173	61	5	chr3	86033054	86033450	-73566333	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	1	8
1241	859	234	52	56	chr3	86034457	86034735	-73565048	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	329	8
1241	1425	177	91	94	chr3	86041671	86041955	-73557828	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	96	1
1241	1425	177	91	94	chr3	86042144	86042233	-73557550	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-279	95	1	1
1241	1199	201	165	63	chr3	86048118	86048452	-73551331	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	11	1
1241	2620	62	86	26	chr3	86052289	86052672	-73547111	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-1	406	1	1
1241	1439	217	56	34	chr3	86055190	86055600	-73544183	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1241	2226	137	27	120	chr3	86057878	86058482	-73541301	+	RLTR25B	LTR	ERVK	9	1103	0	1
1241	753	259	104	0	chr3	86060959	86061179	-73538604	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-239	1250	1008	1
1241	4888	140	67	12	chr3	86069201	86070053	-73529730	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	4	1
1241	228	273	66	117	chr3	86076123	86076161	-73523622	-	MT2B2	LTR	ERVL	-420	164	134	2
1241	2230	104	3	33	chr3	86083949	86084286	-73515497	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1241	3361	40	0	0	chr3	86097099	86097495	-73502288	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1241	1279	194	251	3	chr3	86100318	86100649	-73499134	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	2
1241	283	188	0	127	chr3	86102817	86102843	-73496940	-	MT2B2	LTR	ERVL	-428	156	145	2
1241	337	297	110	0	chr3	86104157	86104275	-73495508	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	131	-234	2
1241	253	67	0	43	chr3	86109879	86109926	-73489857	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1034	4372	4328	2
1241	1182	206	124	39	chr3	86110097	86110461	-73489322	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-1433	3973	3579	2
1241	2991	144	99	5	chr3	86110456	86111043	-73488740	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4847	1290	649	2
1242	269	319	96	41	chr3	86130514	86130816	-73468967	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-16	392	19	3
1242	518	273	178	15	chr3	86148479	86148597	-73451186	-	RMER21A	LTR	ERV1	-258	689	544	3
1242	518	273	178	15	chr3	86148654	86148732	-73451051	-	RMER21A	LTR	ERV1	-404	543	462	3
1242	236	356	23	58	chr3	86149694	86149867	-73449916	-	MER34A	LTR	ERV1	-404	167	1	3
1242	323	304	65	87	chr3	86161862	86162046	-73437737	-	MLT1G	LTR	MaLR	-3	588	409	3
1242	2044	146	66	26	chr3	86168892	86169271	-73430512	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1242	242	61	0	0	chr3	86169907	86169940	-73429843	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	362	3
1242	350	137	77	64	chr3	86173779	86173857	-73425926	-	MT2B2	LTR	ERVL	-325	259	181	3
1242	767	100	27	9	chr3	86173838	86173949	-73425834	-	RMER6C	LTR	ERVK	-577	113	1	3
1242	395	72	0	18	chr3	86177685	86177742	-73422041	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	339	4
1242	1536	122	54	23	chr3	86177940	86178201	-73421582	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-54	275	7	4
1242	1887	171	42	0	chr3	86210918	86211251	-73388532	+	MTC	LTR	MaLR	26	372	-49	4
1242	801	243	50	62	chr3	86219082	86219096	-73380687	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	979	992	-378	4
1242	801	243	50	62	chr3	86219159	86219385	-73380398	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	993	1215	-155	4
1242	802	279	169	54	chr3	86219393	86219707	-73380076	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	350	-20	4
1242	926	237	143	28	chr3	86220226	86220513	-73379270	-	MTE2b	LTR	MaLR	-59	320	1	4
1242	1301	95	294	3	chr3	86229346	86229672	-73370111	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	4
1242	370	218	18	98	chr3	86232353	86232465	-73367318	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	364	4
1242	2349	152	21	42	chr3	86232462	86232896	-73366887	-	RMER4B	LTR	ERVK	-156	429	5	4
1243	288	299	203	56	chr3	86259443	86259749	-73340034	+	RLTR15	LTR	ERVK	17	299	-229	5
1243	373	242	228	24	chr3	86261744	86261867	-73337916	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-216	149	2	5
1243	1986	187	50	7	chr3	86264198	86264602	-73335181	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1243	509	149	74	12	chr3	86266475	86266638	-73333145	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	103	5
1243	1681	248	49	32	chr3	86269230	86269696	-73330087	+	MER68	LTR	ERVL	1	474	-89	5
1243	2124	116	38	10	chr3	86271722	86272036	-73327747	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	5
1243	644	256	39	22	chr3	86287236	86287416	-73312367	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	197	5
1243	515	279	63	58	chr3	86287758	86287948	-73311835	+	MT2B	LTR	ERVL	74	264	-337	5
1243	314	348	104	48	chr3	86292226	86292495	-73307288	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-2	558	275	5
1243	4398	18	0	0	chr3	86296529	86297022	-73302761	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1243	47327	16	8	0	chr3	86297022	86302353	-73297430	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5371	-114	5
1243	412	120	13	39	chr3	86302353	86302431	-73297352	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	642	-1321	5
1243	298	0	0	0	chr3	86302431	86302467	-73297316	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5450	5485	0	5
1243	4374	20	0	0	chr3	86302467	86302960	-73296823	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1243	236	359	75	27	chr3	86313354	86313500	-73286283	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-270	174	22	6
1243	663	351	81	36	chr3	86316746	86317104	-73282679	-	MER76	LTR	ERVL	-302	389	16	6
1243	1201	266	106	3	chr3	86321044	86321394	-73278389	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	34	6
1243	786	253	262	10	chr3	86322710	86323004	-73276779	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	10	6
1243	306	326	42	10	chr3	86369942	86370038	-73229745	-	MLT1D	LTR	MaLR	-101	404	306	6
1244	234	375	88	7	chr3	86390219	86390356	-73209427	-	LTR33B	LTR	ERVL	-329	174	27	7
1244	2540	109	41	102	chr3	86396546	86397056	-73202727	-	RLTR44C	LTR	ERVK	-23	479	1	7
1244	485	254	65	7	chr3	86401293	86401432	-73198351	+	MTD	LTR	MaLR	1	147	-272	7
1244	455	244	177	32	chr3	86401452	86401638	-73198145	+	MTD	LTR	MaLR	207	419	0	7
1244	389	332	101	19	chr3	86413917	86414126	-73185657	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-244	335	110	7
1244	285	358	178	5	chr3	86415630	86415838	-73183945	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-3231	2299	2056	7
1244	1550	223	55	25	chr3	86416100	86416333	-73183450	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	136	7
1244	1550	223	55	25	chr3	86416550	86416679	-73183104	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-239	135	1	7
1244	434	278	93	112	chr3	86432377	86432689	-73167094	+	MLT1B	LTR	MaLR	85	390	0	7
1244	730	273	61	50	chr3	86434927	86435224	-73164559	+	ORR1E	LTR	MaLR	56	355	-4	7
1244	283	280	0	123	chr3	86438773	86438895	-73160888	-	MT2B	LTR	ERVL	-341	260	154	7
1244	2422	168	22	5	chr3	86449634	86450048	-73149735	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1244	1876	142	22	50	chr3	86452997	86453359	-73146424	+	RLTR21	LTR	ERVK	721	1072	-500	8
1244	1002	198	77	54	chr3	86453992	86454334	-73145449	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	8
1244	466	245	18	9	chr3	86459819	86459930	-73139853	-	MER57C2	LTR	ERV1	-25	409	298	8
1244	485	297	157	57	chr3	86474816	86475166	-73124617	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	387	3	8
1244	373	303	99	37	chr3	86476855	86477016	-73122767	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	387	217	8
1244	294	217	205	0	chr3	86477089	86477172	-73122611	-	MLT1B	LTR	MaLR	-366	139	40	8
1244	236	358	53	75	chr3	86479510	86479697	-73120086	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-187	183	1	8
1244	237	341	35	0	chr3	86480134	86480219	-73119564	-	MLT1B	LTR	MaLR	-1	389	302	8
1244	729	220	90	45	chr3	86480268	86480468	-73119315	-	MLT1B	LTR	MaLR	-174	216	8	8
1244	339	323	145	25	chr3	86482937	86483096	-73116687	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-27	527	350	8
1244	1146	249	104	30	chr3	86483106	86483434	-73116349	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	4	8
1244	1144	273	65	46	chr3	86483434	86483802	-73115981	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-139	376	2	8
1244	1231	210	138	27	chr3	86486948	86487281	-73112502	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	8
1244	737	247	188	4	chr3	86489771	86490027	-73109756	+	MLT-int	LTR	MaLR	1433	1735	0	8
1244	375	300	134	82	chr3	86490065	86490356	-73109427	+	MLT1A	LTR	MaLR	60	365	-9	8
1244	902	256	123	18	chr3	86493426	86493730	-73106053	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	364	-6	8
1244	259	104	0	0	chr3	86496835	86496883	-73102900	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-393	48	1	8
1244	336	282	296	10	chr3	86497139	86497348	-73102435	+	ORR1E	LTR	MaLR	50	338	-21	8
1244	1703	181	55	14	chr3	86497656	86498020	-73101763	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	1	8
1245	293	212	71	59	chr3	86575008	86575093	-73024690	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	424	1
1245	455	307	14	21	chr3	86601498	86601641	-72998142	+	MLT1A0	LTR	MaLR	20	161	-204	1
1245	651	271	71	38	chr3	86601727	86601938	-72997845	+	MLT1A0	LTR	MaLR	146	363	-2	1
1245	332	304	73	102	chr3	86608908	86609252	-72990531	+	ORR1E	LTR	MaLR	26	359	0	1
1245	253	299	153	47	chr3	86617045	86617280	-72982503	+	LTR40c	LTR	ERVL	126	385	-80	1
1245	245	284	121	48	chr3	86625199	86625406	-72974377	+	MLT1F	LTR	MaLR	67	288	-260	1
1245	374	303	84	26	chr3	86625716	86625943	-72973840	+	MLT1F	LTR	MaLR	278	517	-31	1
1245	3364	28	5	8	chr3	86631746	86632143	-72967640	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1245	1120	252	120	7	chr3	86638157	86638589	-72961194	+	RMER5	LTR	ERV1	47	527	-7	1
1246	643	219	78	11	chr3	86641514	86641833	-72957950	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	1
1246	758	195	139	28	chr3	86644975	86645182	-72954601	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	201	-193	1
1246	3590	58	20	2	chr3	86645182	86645669	-72954114	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	69	1
1246	1150	170	0	14	chr3	86645656	86645877	-72953906	+	ORR1B1	LTR	MaLR	177	394	0	1
1246	1745	150	63	182	chr3	86646782	86646918	-72952865	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	302	1
1246	1745	150	63	182	chr3	86647098	86647467	-72952316	-	RLTR41	LTR	ERV1	-145	301	1	1
1246	1285	180	105	120	chr3	86651569	86651960	-72947823	+	RLTR41	LTR	ERV1	62	446	0	1
1246	310	183	44	118	chr3	86657655	86657791	-72941992	-	MTEa	LTR	MaLR	-22	357	232	2
1246	2485	288	74	35	chr3	86657973	86658900	-72940883	-	MTE-int	LTR	MaLR	-34	1546	583	2
1246	309	269	50	75	chr3	86659361	86659562	-72940221	+	RMER2	LTR	ERV1	367	562	-5	2
1246	576	323	49	23	chr3	86660568	86660834	-72938949	+	MER57D	LTR	ERV1	26	298	-113	2
1246	2021	238	83	48	chr3	86666836	86667668	-72932115	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	906	0	2
1246	544	192	108	0	chr3	86668258	86668378	-72931405	+	RMER21B	LTR	ERV1	303	435	-407	2
1246	244	250	229	17	chr3	86669340	86669458	-72930325	+	RMER21B	LTR	ERV1	425	567	-275	2
1246	2784	115	34	45	chr3	86671521	86671987	-72927796	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	2
1246	258	321	46	121	chr3	86677794	86678099	-72921684	-	ORR1E	LTR	MaLR	-55	304	23	2
1246	1979	131	169	3	chr3	86678701	86679062	-72920721	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1246	1285	246	132	0	chr3	86686159	86686484	-72913299	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	368	-2	2
1246	1369	210	43	27	chr3	86688659	86689028	-72910755	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	2	2
1246	2560	66	97	19	chr3	86695848	86696219	-72903564	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1246	1800	163	53	8	chr3	86699190	86699548	-72900235	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	2
1246	1338	197	157	109	chr3	86705374	86705916	-72893867	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	611	1	2
1246	1221	240	79	6	chr3	86718681	86718996	-72880787	-	MTE2b	LTR	MaLR	-39	340	3	3
1246	240	367	46	26	chr3	86719057	86719208	-72880575	-	MLT1A	LTR	MaLR	-123	251	98	3
1246	269	299	28	118	chr3	86721451	86721595	-72878188	-	MT2B	LTR	ERVL	-296	305	175	3
1246	287	316	102	31	chr3	86729694	86729919	-72869864	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	241	-118	3
1246	1613	198	18	47	chr3	86731939	86732320	-72867463	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	3
1246	2158	162	31	10	chr3	86733206	86733598	-72866185	-	MTC	LTR	MaLR	-20	401	2	3
1246	636	310	25	45	chr3	86733874	86734246	-72865537	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	379	0	3
1246	1594	165	158	18	chr3	86736547	86736875	-72862908	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1246	2095	115	47	19	chr3	86738146	86738464	-72861319	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1246	2708	28	6	6	chr3	86738857	86739179	-72860604	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
1246	1964	119	22	0	chr3	86741075	86741387	-72858396	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1246	2801	152	87	33	chr3	86743142	86743719	-72856064	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	608	-8	3
1246	2880	36	0	3	chr3	86746074	86746412	-72853371	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	3
1246	25981	31	35	12	chr3	86746412	86749499	-72850284	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	3165	-3316	3
1246	10003	27	2	4	chr3	86749488	86750628	-72849155	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5345	6481	0	3
1246	2861	39	0	3	chr3	86750628	86750966	-72848817	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	3
1246	4795	137	35	65	chr3	86751124	86752035	-72847748	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	884	-18	3
1246	560	217	259	102	chr3	86754454	86754836	-72844947	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	3
1246	2035	153	55	10	chr3	86758391	86758808	-72840975	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	436	-6	3
1246	1574	161	46	15	chr3	86759664	86759703	-72840080	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	492	3
1246	1574	161	46	15	chr3	86759761	86760050	-72839733	-	RMER5	LTR	ERV1	-43	491	196	3
1246	619	266	54	11	chr3	86760102	86760288	-72839495	-	RMER5	LTR	ERV1	-335	199	6	3
1246	2038	168	50	5	chr3	86764991	86765393	-72834390	+	RMER4B	LTR	ERVK	16	435	-150	3
1246	275	168	110	12	chr3	86765379	86765479	-72834304	+	RMER4B	LTR	ERVK	352	529	-56	3
1247	347	293	61	85	chr3	86779610	86779774	-72820009	-	RLTR33	LTR	ERVK	-80	598	439	4
1247	2265	145	10	51	chr3	86782477	86782870	-72816913	+	ORR1C1	LTR	MaLR	2	378	0	4
1247	1531	247	68	93	chr3	86785026	86785647	-72814136	-	RMER19C	LTR	ERVK	-6	605	1	4
1247	315	240	0	0	chr3	86796216	86796291	-72803492	-	RLTR24	LTR	ERV1	-454	75	1	4
1247	2123	124	9	6	chr3	86797759	86798107	-72801676	-	RLTR15	LTR	ERVK	-10	349	1	4
1247	1665	150	373	71	chr3	86798107	86798268	-72801515	+	MT2A	LTR	ERVL	8	214	-319	4
1247	1951	163	106	21	chr3	86798268	86798656	-72801127	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1247	1665	185	57	21	chr3	86798656	86798960	-72800823	+	MT2A	LTR	ERVL	215	533	0	4
1247	801	94	107	0	chr3	86799453	86799602	-72800181	+	ORR1A4	LTR	MaLR	17	181	-148	4
1247	308	183	42	14	chr3	86805078	86805150	-72794633	+	MTD	LTR	MaLR	338	411	-8	4
1247	6726	121	48	42	chr3	86811634	86812742	-72787041	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	1	4
1247	372	271	209	62	chr3	86812950	86813304	-72786479	-	RMER10A	LTR	ERVL	-4	438	33	4
1247	2360	107	14	0	chr3	86813306	86813660	-72786123	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	4
1247	1982	108	3	71	chr3	86815966	86816248	-72783535	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-3	326	67	4
1247	5425	137	53	28	chr3	86816248	86817207	-72782576	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	4
1247	1982	108	3	71	chr3	86817207	86817274	-72782509	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-263	66	1	4
1247	882	144	84	22	chr3	86817918	86818096	-72781687	-	RMER4A	LTR	ERVK	-277	189	1	4
1247	2172	103	78	48	chr3	86819777	86820174	-72779609	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	4
1247	1718	186	131	26	chr3	86820855	86821236	-72778547	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1247	3434	137	146	16	chr3	86822655	86823292	-72776491	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	4
1247	340	363	63	46	chr3	86828336	86828573	-72771210	+	MER21B	LTR	ERV1	26	266	-597	4
1247	1472	63	10	0	chr3	86829366	86829571	-72770212	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	121	4
1247	2247	35	260	3	chr3	86830467	86830782	-72769001	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1247	877	272	151	29	chr3	86833075	86833435	-72766348	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	4
1247	2575	123	34	3	chr3	86834063	86834445	-72765338	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1247	389	333	101	71	chr3	86837978	86838141	-72761642	-	RMER13A	LTR	ERVK	-135	773	584	4
1247	628	331	92	67	chr3	86838169	86838293	-72761490	-	RMER13A	LTR	ERVK	-325	583	448	4
1247	7285	39	40	0	chr3	86838356	86839214	-72760569	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-1	892	1	4
1247	628	330	86	63	chr3	86839214	86839616	-72760167	-	RMER13A	LTR	ERVK	-413	447	31	4
1247	616	206	0	53	chr3	86841428	86841561	-72758222	+	MT2A	LTR	ERVL	16	141	-392	5
1247	2144	141	65	3	chr3	86848228	86848583	-72751200	+	ORR1C1	LTR	MaLR	2	378	0	5
1247	1249	234	106	46	chr3	86848960	86849063	-72750720	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	92	-278	5
1247	1249	234	106	46	chr3	86849250	86849495	-72750288	+	ORR1D2	LTR	MaLR	93	370	0	5
1247	3439	40	0	2	chr3	86850663	86851060	-72748723	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1247	1380	218	57	77	chr3	86851928	86852330	-72747453	+	MT2A	LTR	ERVL	140	533	0	5
1247	619	251	15	34	chr3	86853322	86853488	-72746295	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	161	-355	5
1247	254	268	103	48	chr3	86853593	86853738	-72746045	+	RMER20B	LTR	ERVK	317	469	-47	5
1247	716	176	161	54	chr3	86860786	86860954	-72738829	-	MTD	LTR	MaLR	-21	398	213	5
1247	935	224	24	5	chr3	86861893	86862099	-72737684	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	1	5
1247	2164	100	3	60	chr3	86863282	86863613	-72736170	+	ORR1A2	LTR	MaLR	16	327	0	5
1247	650	305	98	5	chr3	86864527	86864747	-72735036	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	130	5
1247	520	302	40	0	chr3	86864938	86865087	-72734696	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-204	155	1	5
1247	813	182	127	0	chr3	86865087	86865252	-72734531	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	1185	5
1247	1519	246	41	74	chr3	86866219	86866732	-72733051	+	RMER5	LTR	ERV1	4	499	-35	5
1247	1950	204	25	13	chr3	86866682	86867079	-72732704	-	RMER5	LTR	ERV1	-5	529	128	5
1247	326	236	85	11	chr3	86869003	86869097	-72730686	+	RMER5	LTR	ERV1	8	108	-426	5
1247	270	280	58	29	chr3	86869154	86869257	-72730526	+	RMER5	LTR	ERV1	238	343	-191	5
1247	478	271	83	77	chr3	86872725	86873049	-72726734	+	LTR37A	LTR	ERV1	101	426	0	5
1247	1567	234	128	11	chr3	86873327	86873798	-72725985	+	RMER5	LTR	ERV1	1	527	-7	5
1247	2255	113	52	81	chr3	86878319	86878725	-72721058	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1247	2300	280	66	55	chr3	86879708	86880558	-72719225	+	RMER13A	LTR	ERVK	2	860	0	5
1247	2396	84	9	6	chr3	86887900	86888222	-72711561	+	ORR1A2	LTR	MaLR	5	327	0	5
1248	230	295	77	0	chr3	86932195	86932273	-72667510	+	MER21B	LTR	ERV1	24	107	-756	6
1248	229	307	55	33	chr3	86932693	86932784	-72666999	+	MER21B	LTR	ERV1	487	579	-284	6
1248	393	274	117	94	chr3	86933118	86933468	-72666315	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	358	-1	6
1248	309	330	103	62	chr3	86941944	86942283	-72657500	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	358	-1	6
1248	1202	187	210	59	chr3	86949814	86950138	-72649645	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	373	-1	6
1248	229	281	82	66	chr3	86963180	86963302	-72636481	+	MLT1E1	LTR	MaLR	387	510	-144	7
1248	410	321	77	65	chr3	86983448	86983788	-72615995	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	349	-10	7
1248	2926	197	19	58	chr3	86987626	86988262	-72611521	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	7
1248	2346	104	3	12	chr3	86988676	86989006	-72610777	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1248	281	270	51	159	chr3	86995943	86996119	-72603664	+	RMER15	LTR	ERVL	3	159	-416	7
1248	551	287	117	29	chr3	86996122	86996395	-72603388	+	RMER15	LTR	ERVL	279	575	0	7
1248	1925	125	106	17	chr3	86998474	86998823	-72600960	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	5	7
1248	249	248	210	17	chr3	87002719	87002838	-72596945	-	MLT1B	LTR	MaLR	-164	226	85	5
1248	320	200	70	12	chr3	87003234	87003320	-72596463	-	MLT1B	LTR	MaLR	-297	93	3	5
1248	434	270	51	51	chr3	87004623	87004818	-72594965	+	RMER15	LTR	ERVL	337	531	-44	7
1248	295	242	61	0	chr3	87005271	87005337	-72594446	+	MTD	LTR	MaLR	2	71	-350	9
1248	2360	77	3	64	chr3	87005524	87005870	-72593913	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	1
1248	443	189	0	138	chr3	87005883	87006006	-72593777	+	MTD	LTR	MaLR	108	213	-206	9
1248	368	153	28	0	chr3	87006007	87006079	-72593704	+	MTD	LTR	MaLR	340	413	-6	9
1248	382	184	70	145	chr3	87007770	87007942	-72591841	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	159	317	-363	1
1248	421	208	10	50	chr3	87011115	87011216	-72588567	+	MTEa	LTR	MaLR	15	111	-268	2
1248	636	292	15	0	chr3	87011979	87012174	-72587609	+	MTEa	LTR	MaLR	182	379	0	2
1248	1884	254	118	20	chr3	87012164	87012413	-72587370	+	MTEa-int	LTR	MaLR	4	278	-1302	2
1248	1884	254	118	20	chr3	87012564	87012964	-72586819	+	MTEa-int	LTR	MaLR	279	717	-863	2
1248	508	143	46	31	chr3	87012964	87013094	-72586689	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	191	2
1248	584	233	15	15	chr3	87013569	87013700	-72586083	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-211	163	33	2
1248	1639	196	24	56	chr3	87014188	87014566	-72585217	+	ORR1D1	LTR	MaLR	9	374	0	2
1248	1158	279	87	12	chr3	87015078	87015422	-72584361	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	3
1248	2740	250	70	164	chr3	87015422	87016023	-72583760	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	856	3
1248	2740	250	70	164	chr3	87016349	87016778	-72583005	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-515	855	377	3
1248	2740	250	70	164	chr3	87016987	87017043	-72582740	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-994	376	367	3
1248	2740	250	70	164	chr3	87017189	87017238	-72582545	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1004	366	328	3
1248	2740	250	70	164	chr3	87017431	87017644	-72582139	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1043	327	137	3
1248	1507	221	33	16	chr3	87019069	87019432	-72580351	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	2	3
1248	1868	213	118	21	chr3	87022183	87022668	-72577115	-	MT2A	LTR	ERVL	-1	532	1	4
1248	2158	270	69	44	chr3	87027568	87028738	-72571045	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-102	1478	7	4
1248	245	213	16	16	chr3	87028740	87028802	-72570981	+	MTD	LTR	MaLR	318	379	0	4
1248	1580	306	64	71	chr3	87028809	87030401	-72569382	+	MTD	LTR	MaLR	1	1577	-3	4
1248	1302	283	14	36	chr3	87030599	87030990	-72568793	+	MTE2a	LTR	MaLR	25	419	0	5
1248	572	330	138	43	chr3	87031040	87031411	-72568372	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-837	743	338	4
1249	253	156	94	0	chr3	87035546	87035610	-72564173	+	RMER10A	LTR	ERVL	345	414	-28	5
1249	2370	117	19	24	chr3	87039695	87040064	-72559719	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1249	643	220	114	10	chr3	87042089	87042371	-72557412	+	MTEa	LTR	MaLR	41	378	-1	6
1249	1040	223	89	78	chr3	87042748	87043220	-72556563	+	MT2B	LTR	ERVL	1	539	-62	6
1249	1049	260	65	40	chr3	87044020	87044373	-72555410	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	362	-17	6
1249	868	233	103	29	chr3	87045532	87045853	-72553930	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	3	6
1249	338	294	110	112	chr3	87046198	87046554	-72553229	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	4	7
1249	2411	93	12	0	chr3	87052664	87052987	-72546796	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1249	309	370	113	20	chr3	87053456	87053757	-72546026	+	MLT2F	LTR	ERVL	31	359	-304	8
1249	2417	120	24	5	chr3	87053752	87054130	-72545653	+	RMER19B	LTR	ERVK	518	902	0	8
1249	227	278	64	43	chr3	87056765	87056859	-72542924	+	MT2A	LTR	ERVL	1	96	-437	9
1249	1096	237	87	12	chr3	87056836	87057157	-72542626	+	MTE2b	LTR	MaLR	35	379	0	9
1249	1543	239	77	5	chr3	87068153	87068544	-72531239	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1249	3502	248	42	32	chr3	87068715	87069655	-72530128	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	1
1249	232	336	0	53	chr3	87075765	87075878	-72523905	+	RMER12	LTR	ERVK	744	850	-472	1
1249	1839	216	23	10	chr3	87077541	87077934	-72521849	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	22	1
1249	3122	23	0	0	chr3	87082813	87083159	-72516624	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	1
1249	13972	49	23	1	chr3	87083159	87084912	-72514871	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1	1
1249	3015	38	0	0	chr3	87084912	87085258	-72514525	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	1
1249	5715	80	13	66	chr3	87089951	87090799	-72508984	-	RLTR13B4	LTR	ERVK	0	803	1	1
1249	849	273	157	7	chr3	87092365	87092671	-72507112	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	357	-2	1
1249	500	235	14	29	chr3	87092675	87092815	-72506968	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	138	-1442	1
1249	247	188	0	20	chr3	87093198	87093247	-72506536	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	109	156	-1214	1
1249	280	92	16	88	chr3	87093246	87093312	-72506471	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	386	316	1
1249	1694	143	76	22	chr3	87093505	87093816	-72505967	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-39	328	1	1
1249	2207	301	142	62	chr3	87094095	87094534	-72505249	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	248	680	-900	1
1249	2207	301	142	62	chr3	87094700	87095443	-72504340	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	681	1527	-53	1
1249	254	284	0	15	chr3	87095443	87095511	-72504272	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	67	-292	1
1249	2352	176	109	6	chr3	87095512	87096042	-72503741	+	RLTR40	LTR	ERVK	224	808	-9	1
1249	292	133	160	43	chr3	87096445	87096539	-72503244	-	RLTR40	LTR	ERVK	-136	681	577	1
1249	587	111	10	48	chr3	87096959	87097063	-72502720	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	100	-274	1
1249	1322	180	67	4	chr3	87098750	87099018	-72500765	+	ORR1D1	LTR	MaLR	87	371	-3	1
1249	1260	105	18	41	chr3	87101818	87102037	-72497746	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	181	1
1249	3688	128	25	9	chr3	87102042	87102680	-72497103	-	RMER6A	LTR	ERVK	-106	650	3	1
1249	1060	270	108	12	chr3	87105960	87106376	-72493407	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	62	1
1249	1242	231	108	26	chr3	87110030	87110333	-72489450	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	315	-55	1
1249	1242	231	108	26	chr3	87110389	87110427	-72489356	+	ORR1D2	LTR	MaLR	316	370	0	1
1249	940	229	31	64	chr3	87111101	87111460	-72488323	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	347	-12	1
1249	720	268	58	49	chr3	87111550	87111793	-72487990	+	MER21B	LTR	ERV1	65	309	-554	1
1249	759	325	89	29	chr3	87111841	87112155	-72487628	+	MER21B	LTR	ERV1	442	774	-89	1
1249	1100	296	38	14	chr3	87112618	87112984	-72486799	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	379	0	1
1249	2153	159	100	44	chr3	87126379	87126879	-72472904	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	1	1
1249	549	226	87	11	chr3	87131794	87131977	-72467806	+	RMER5	LTR	ERV1	40	236	-298	1
1249	1884	150	150	19	chr3	87134622	87134988	-72464795	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	4	2
1249	2385	205	48	70	chr3	87135564	87136189	-72463594	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
1249	257	275	0	0	chr3	87146210	87146341	-72453442	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	624	2
1249	2007	193	33	10	chr3	87156662	87157060	-72442723	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	2	2
1249	380	233	90	30	chr3	87159361	87159494	-72440289	-	RMER15	LTR	ERVL	-13	562	422	2
1250	300	297	10	10	chr3	87174679	87174781	-72425002	+	MLT1A1	LTR	MaLR	21	122	-286	2
1250	716	249	147	22	chr3	87178689	87179148	-72420635	-	RMER5	LTR	ERV1	-18	516	1	2
1250	964	107	20	0	chr3	87182889	87183038	-72416745	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	-881	152	1	2
1250	1332	168	243	0	chr3	87199595	87199904	-72399879	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	2
1250	535	292	140	37	chr3	87206784	87207133	-72392650	+	RMER13A	LTR	ERVK	273	657	-203	2
1250	3028	141	49	30	chr3	87208485	87209055	-72390728	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	322	3
1250	373	273	91	0	chr3	87211193	87211303	-72388480	+	MTEb	LTR	MaLR	1	120	-259	3
1250	406	294	0	23	chr3	87211300	87211429	-72388354	+	MTEb	LTR	MaLR	244	369	-10	3
1250	394	250	79	16	chr3	87216923	87216976	-72382807	-	MT2A	LTR	ERVL	-399	134	83	3
1250	394	250	79	16	chr3	87217020	87217092	-72382691	-	MT2A	LTR	ERVL	-451	82	2	3
1250	4754	101	57	16	chr3	87219105	87219812	-72379971	-	RMER19A	LTR	ERVK	-1	736	1	3
1250	257	309	36	29	chr3	87221874	87222014	-72377769	+	ORR1D2	LTR	MaLR	225	365	-5	3
1250	564	174	114	34	chr3	87222020	87222169	-72377614	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	390	550	-4767	3
1250	602	216	43	56	chr3	87222343	87222505	-72377278	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	548	707	-4610	3
1250	1142	146	50	23	chr3	87222505	87222723	-72377060	+	ORR1C1	LTR	MaLR	155	378	0	3
1250	3616	177	75	170	chr3	87222723	87223591	-72376192	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1443	2178	-3139	3
1250	3616	177	75	170	chr3	87223641	87223893	-72375890	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	2179	2455	-2862	3
1250	1609	176	34	10	chr3	87223888	87224181	-72375602	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	3488	3787	-1530	3
1250	1404	231	28	25	chr3	87224201	87224520	-72375263	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	3851	4170	-1147	3
1250	1032	144	40	6	chr3	87224517	87224692	-72375091	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	4861	5041	-276	3
1250	332	87	43	0	chr3	87224888	87224934	-72374849	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	5270	5317	0	3
1250	2113	166	35	3	chr3	87224954	87225322	-72374461	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	382	0	3
1250	245	306	74	8	chr3	87226456	87226578	-72373205	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-276	168	39	3
1250	383	225	96	52	chr3	87228921	87229031	-72370752	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	261	3
1250	383	225	96	52	chr3	87229140	87229165	-72370618	-	MTEa	LTR	MaLR	-119	260	238	3
1250	242	273	57	66	chr3	87230234	87230340	-72369443	+	MT2B	LTR	ERVL	153	257	-344	3
1250	3417	35	2	2	chr3	87232533	87232929	-72366854	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1250	2036	220	23	8	chr3	87234391	87234873	-72364910	-	RLTR16	LTR	ERVK	-12	493	5	3
1250	417	301	24	41	chr3	87235895	87236065	-72363718	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	167	-192	3
1250	2270	85	3	0	chr3	87237892	87238209	-72361574	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	319	-8	3
1250	487	333	75	34	chr3	87244715	87245035	-72354748	-	MT2A	LTR	ERVL	-101	432	100	3
1250	232	364	0	0	chr3	87244994	87245060	-72354723	-	MTE2a	LTR	MaLR	-239	140	75	3
1250	2375	166	36	22	chr3	87248547	87249045	-72350738	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	1	3
1250	432	277	59	125	chr3	87252936	87253241	-72346542	+	RMER10A	LTR	ERVL	10	294	-148	3
1250	418	173	40	0	chr3	87254093	87254168	-72345615	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3599	3676	-2461	3
1250	998	203	63	77	chr3	87254463	87254762	-72345021	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2595	2889	-349	3
1250	893	149	0	7	chr3	87256730	87256879	-72342904	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	236	3
1250	352	235	50	10	chr3	87261641	87261740	-72338043	-	MLT1A	LTR	MaLR	-11	363	261	3
1250	362	256	98	18	chr3	87261747	87261910	-72337873	-	RMER10A	LTR	ERVL	-15	427	252	3
1250	388	184	11	65	chr3	87261897	87261990	-72337793	-	RMER10A	LTR	ERVL	-354	88	1	3
1250	1297	227	140	137	chr3	87263097	87264330	-72335453	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2168	3969	2596	3
1250	1072	284	65	56	chr3	87264379	87264688	-72335095	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3263	2874	2554	3
1250	1980	158	14	35	chr3	87264688	87265055	-72334728	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	3
1250	1072	234	39	91	chr3	87265055	87265470	-72334313	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3584	2553	1936	3
1250	384	208	66	218	chr3	87265868	87266065	-72333718	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3667	1855	1689	3
1250	272	115	177	16	chr3	87266217	87266279	-72333504	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5170	967	896	3
1250	408	236	79	131	chr3	87267261	87267475	-72332308	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	430	632	-2606	3
1250	817	241	52	64	chr3	87267859	87268120	-72331663	-	RMER17C	LTR	ERVK	-68	342	85	3
1250	817	241	52	64	chr3	87268220	87268304	-72331479	-	RMER17C	LTR	ERVK	-326	84	2	3
1250	237	266	125	21	chr3	87268678	87268774	-72331009	+	RMER10A	LTR	ERVL	12	117	-325	3
1250	2324	83	0	0	chr3	87268794	87269119	-72330664	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-82	325	1	3
1250	4817	144	64	41	chr3	87269126	87270157	-72329626	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1334	3372	-2765	3
1250	4154	145	112	86	chr3	87270151	87270496	-72329287	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2215	2574	-664	3
1250	4154	145	112	86	chr3	87270533	87270818	-72328965	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2575	2874	-364	3
1250	4154	145	112	86	chr3	87270869	87271146	-72328637	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2875	3183	-55	3
1250	2920	93	2	17	chr3	87271147	87271562	-72328221	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	3
1250	948	169	48	71	chr3	87271563	87271773	-72328010	+	ETnERV-int	LTR	ERVK	2	206	-3108	3
1250	6004	134	15	23	chr3	87271836	87272862	-72326921	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1995	3448	-3958	3
1250	830	86	52	0	chr3	87273112	87273228	-72326555	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3441	3562	-3844	3
1250	16445	92	10	1	chr3	87278706	87280884	-72318899	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3566	5762	-1644	3
1250	2609	177	80	72	chr3	87280873	87282258	-72317525	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3452	5443	-1801	4
1250	520	90	17	12	chr3	87282458	87282543	-72317240	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7402	-4	4
1250	2753	87	51	13	chr3	87282548	87282942	-72316841	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	4
1250	2906	161	113	49	chr3	87282955	87283921	-72315862	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	1023	1	4
1250	292	122	0	39	chr3	87283922	87283973	-72315810	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	3190	3238	0	4
1250	444	188	12	24	chr3	87283973	87284055	-72315728	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	81	-329	4
1250	1902	127	7	71	chr3	87292357	87292573	-72307210	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	201	-209	4
1250	1902	127	7	71	chr3	87292649	87292855	-72306928	+	RMER17C	LTR	ERVK	202	396	-14	4
1251	306	170	0	0	chr3	87297760	87297813	-72301970	+	MT2A	LTR	ERVL	410	462	-71	4
1251	734	254	98	59	chr3	87298022	87298454	-72301329	+	RMER15	LTR	ERVL	1	542	-33	4
1251	389	217	159	48	chr3	87298728	87298936	-72300847	-	RLTR15	LTR	ERVK	-13	346	116	4
1251	409	184	25	87	chr3	87298935	87299096	-72300687	-	RLTR15	LTR	ERVK	-176	183	33	4
1251	970	291	62	21	chr3	87304232	87304569	-72295214	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	357	-2	4
1251	1967	279	55	61	chr3	87304620	87305379	-72294404	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	31	785	-585	4
1251	1013	256	135	9	chr3	87305850	87306169	-72293614	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	20	4
1251	400	319	0	53	chr3	87306042	87306194	-72293589	-	MT2A	LTR	ERVL	-387	146	3	4
1251	353	198	119	28	chr3	87306194	87306298	-72293485	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-234	131	18	4
1251	727	208	45	45	chr3	87309294	87309450	-72290333	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-218	156	1	4
1251	515	337	65	6	chr3	87318112	87318282	-72281501	-	MLT1H1	LTR	MaLR	0	555	376	4
1251	728	270	61	47	chr3	87320970	87321452	-72278331	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	464	2	4
1251	2200	78	24	3	chr3	87363637	87363932	-72235851	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	27	5
1251	2481	129	37	3	chr3	87367320	87367701	-72232082	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
1251	1103	204	156	97	chr3	87368703	87368897	-72230886	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	182	-202	5
1251	1103	204	156	97	chr3	87368986	87369107	-72230676	+	ORR1C2	LTR	MaLR	183	340	-44	5
1251	3348	33	8	2	chr3	87369107	87369505	-72230278	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1251	1103	204	156	97	chr3	87369505	87369540	-72230243	+	ORR1C2	LTR	MaLR	341	372	-12	5
1251	1919	168	107	27	chr3	87370577	87370951	-72228832	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	18	5
1251	374	323	71	92	chr3	87373069	87373352	-72226431	-	ORR1E	LTR	MaLR	-8	351	75	5
1251	319	287	10	21	chr3	87378249	87378345	-72221438	+	MTE2b	LTR	MaLR	230	324	-55	5
1251	303	220	0	0	chr3	87378378	87378437	-72221346	+	MTE2b	LTR	MaLR	316	374	-5	5
1251	1256	245	25	45	chr3	87378964	87379290	-72220493	-	RMER13B	LTR	ERVK	-34	874	556	5
1251	1005	184	47	22	chr3	87379291	87379573	-72220210	-	RMER17B	LTR	ERVK	-722	236	1	5
1251	3425	40	2	0	chr3	87382286	87382682	-72217101	+	MTB	LTR	MaLR	4	400	0	5
1251	3512	108	6	3	chr3	87384492	87384994	-72214789	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	519	0	5
1251	1794	170	22	16	chr3	87387315	87387626	-72212157	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	66	5
1251	2212	112	16	0	chr3	87398465	87398785	-72200998	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	325	-2	6
1251	2789	128	29	31	chr3	87398787	87399304	-72200479	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	516	-1447	6
1251	337	117	50	0	chr3	87399301	87399361	-72200422	+	MT2B2	LTR	ERVL	189	251	-333	6
1251	7705	108	6	4	chr3	87400155	87401399	-72198384	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	718	1963	0	6
1251	2002	100	51	63	chr3	87401399	87401730	-72198053	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1251	1515	154	97	3	chr3	87403818	87404117	-72195666	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	327	-5	6
1251	56149	94	14	4	chr3	87404122	87411719	-72188064	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	3	7680	0	6
1251	1704	149	92	10	chr3	87411719	87412025	-72187758	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	331	-1	6
1251	972	270	42	55	chr3	87412520	87412904	-72186879	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	6
1251	1272	256	60	37	chr3	87413136	87413432	-72186351	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	115	6
1251	1272	256	60	37	chr3	87413623	87413679	-72186104	-	MTD	LTR	MaLR	-305	114	58	6
1251	1002	206	119	4	chr3	87413667	87413726	-72186057	+	MT2A	LTR	ERVL	26	86	-447	6
1251	1002	234	74	40	chr3	87413779	87414106	-72185677	+	MT2A	LTR	ERVL	87	526	-75	6
1251	2496	162	55	2	chr3	87414331	87414764	-72185019	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1	456	-5305	6
1251	12659	145	38	30	chr3	87416069	87418243	-72181540	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	451	2642	-3119	6
1251	1007	111	103	21	chr3	87418372	87418566	-72181217	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5472	5681	-80	6
1251	858	118	7	34	chr3	87418567	87418716	-72181067	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5617	5761	0	6
1251	517	182	0	0	chr3	87418716	87418804	-72180979	+	MT2A	LTR	ERVL	1	88	-445	6
1251	1175	185	248	23	chr3	87419233	87419543	-72180240	+	MT2A	LTR	ERVL	85	464	-69	6
1251	1897	200	135	20	chr3	87419671	87420161	-72179622	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	27	6
1251	231	246	14	14	chr3	87420651	87420721	-72179062	+	RMER15	LTR	ERVL	352	421	-154	6
1252	2121	304	52	50	chr3	87433129	87433840	-72165943	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6950	2009	1292	6
1252	2121	304	52	50	chr3	87434017	87434315	-72165468	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7668	1291	999	6
1252	598	248	200	45	chr3	87435321	87435701	-72164082	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-43	485	47	6
1252	749	147	49	31	chr3	87438384	87438546	-72161237	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	6	170	-237	6
1252	3672	122	43	9	chr3	87443396	87443430	-72156353	+	RMER4B	LTR	ERVK	3	43	-542	6
1252	3672	122	43	9	chr3	87443468	87443997	-72155786	+	RMER4B	LTR	ERVK	44	584	-1	6
1252	1433	202	114	6	chr3	87445657	87445990	-72153793	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	49	6
1252	945	229	118	27	chr3	87449701	87450056	-72149727	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1252	1764	179	159	3	chr3	87450814	87451173	-72148610	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	6
1252	1133	207	210	39	chr3	87454897	87455123	-72144660	+	MTD	LTR	MaLR	2	252	-167	7
1252	1133	207	210	39	chr3	87455333	87455463	-72144320	+	MTD	LTR	MaLR	253	419	0	7
1252	640	164	16	0	chr3	87456087	87456209	-72143574	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	124	-250	7
1252	270	276	89	139	chr3	87456220	87456536	-72143247	+	RLTR12B	LTR	ERVK	200	509	-19	7
1252	869	209	55	18	chr3	87456567	87456784	-72142999	+	ORR1C2	LTR	MaLR	53	327	-57	7
1252	367	103	43	14	chr3	87457030	87457099	-72142684	+	ORR1C2	LTR	MaLR	308	378	0	7
1252	727	179	1	15	chr3	87458728	87458876	-72140907	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	419	252	7
1252	406	252	137	97	chr3	87458976	87459233	-72140550	-	MLT1A	LTR	MaLR	-14	360	83	7
1252	2291	160	94	108	chr3	87459233	87459816	-72139967	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	7
1252	406	252	137	97	chr3	87459816	87459857	-72139926	-	MLT1A	LTR	MaLR	-292	82	50	7
1252	2053	79	128	0	chr3	87463003	87463293	-72136490	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1252	4501	137	31	92	chr3	87469654	87470616	-72129167	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	4	7
1252	2019	107	62	3	chr3	87471974	87472282	-72127501	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	7
1252	2173	82	3	0	chr3	87474402	87474693	-72125090	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	36	7
1252	9671	128	65	111	chr3	87474693	87474832	-72124951	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-2	1961	1816	7
1252	9671	128	65	111	chr3	87475021	87476938	-72122845	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-148	1815	1	7
1252	2119	97	0	62	chr3	87476942	87477282	-72122501	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	7
1252	388	188	19	111	chr3	87479603	87479711	-72120072	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	167	7
1252	2451	80	117	32	chr3	87498070	87498445	-72101338	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	7
1252	1302	218	255	44	chr3	87503938	87504413	-72095370	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	9
1252	248	325	92	2	chr3	87522522	87522651	-72077132	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	237	2
1252	2321	127	88	11	chr3	87530508	87530881	-72068902	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	15	4
1252	226	183	161	73	chr3	87543369	87543493	-72056290	-	LTR81C	LTR	ERV1?	-851	302	168	5
1252	261	343	29	29	chr3	87547452	87547554	-72052229	+	MLT1F2	LTR	MaLR	1	102	-458	5
1252	343	266	528	28	chr3	87547714	87547951	-72051832	+	MLT1F2	LTR	MaLR	95	450	-110	5
1252	252	223	34	69	chr3	87551728	87551822	-72047961	+	MLT1K	LTR	MaLR	477	595	0	6
1253	234	307	67	89	chr3	87566126	87566220	-72033563	+	MT2B2	LTR	ERVL	66	155	-429	7
1253	232	390	50	0	chr3	87575164	87575264	-72024519	+	RMER15	LTR	ERVL	366	470	-105	9
1253	1174	216	89	64	chr3	87626388	87626818	-71972965	+	MT2A	LTR	ERVL	5	462	-71	1
1253	865	139	137	52	chr3	87629706	87629918	-71969865	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	230	-381	1
1253	2564	193	104	58	chr3	87629903	87630689	-71969094	+	RMER19C	LTR	ERVK	40	868	-34	1
1253	495	265	136	41	chr3	87632528	87632697	-71967086	-	MTEb	LTR	MaLR	-113	266	82	1
1253	291	219	139	28	chr3	87633052	87633160	-71966623	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-350	191	72	1
1253	515	190	80	32	chr3	87634655	87634780	-71965003	+	MT2A	LTR	ERVL	167	297	-236	2
1253	1089	175	85	47	chr3	87635132	87635404	-71964379	+	MT2A	LTR	ERVL	229	533	0	2
1253	2994	254	73	28	chr3	87635410	87636246	-71963537	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	8	987	-4774	2
1253	2663	185	216	0	chr3	87636246	87636852	-71962931	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	2
1253	2994	230	71	16	chr3	87636852	87637010	-71962773	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	988	1166	-4595	2
1253	2257	218	47	10	chr3	87637253	87637759	-71962024	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1189	1713	-4048	2
1253	643	226	170	83	chr3	87637759	87637809	-71961974	-	MT2B	LTR	ERVL	-1	600	549	2
1253	643	226	170	83	chr3	87637873	87638110	-71961673	-	MT2B	LTR	ERVL	-53	548	288	2
1253	552	122	44	0	chr3	87638185	87638275	-71961508	-	RLTR14	LTR	ERV1	-244	138	45	2
1253	853	96	8	8	chr3	87638277	87638403	-71961380	+	RLTR12A	LTR	ERVK	2	127	-441	2
1253	3626	21	97	5	chr3	87638782	87639217	-71960566	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
1253	728	174	83	51	chr3	87639610	87639767	-71960016	+	RLTR12A	LTR	ERVK	117	278	-290	2
1253	3118	57	10	0	chr3	87639772	87640156	-71959627	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
1253	2677	151	53	60	chr3	87640158	87640708	-71959075	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3261	3806	-1955	2
1253	5144	139	27	1	chr3	87640707	87641511	-71958272	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4055	4879	-882	2
1253	233	233	0	0	chr3	87641615	87641658	-71958125	+	MT2B	LTR	ERVL	62	104	-497	2
1253	428	170	138	35	chr3	87641734	87641850	-71957933	-	RLTR15	LTR	ERVK	-229	130	3	2
1253	575	278	132	6	chr3	87641853	87642027	-71957756	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1231	349	154	2
1253	225	221	99	78	chr3	87642026	87642168	-71957615	+	RLTR15	LTR	ERVK	215	359	0	2
1253	384	316	67	39	chr3	87642168	87642326	-71957457	+	MTE-int	LTR	MaLR	337	499	-1081	2
1253	1808	287	170	26	chr3	87642552	87643347	-71956436	+	MTE-int	LTR	MaLR	578	1486	-94	2
1253	748	281	153	42	chr3	87643407	87643715	-71956068	+	MTEa	LTR	MaLR	9	350	-29	2
1253	366	292	7	103	chr3	87647089	87647234	-71952549	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	134	2
1253	2502	83	3	21	chr3	87647674	87648006	-71951777	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
1253	3188	170	140	9	chr3	87648952	87649604	-71950179	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	2
1253	225	304	0	0	chr3	87649967	87650023	-71949760	+	LTR16D1	LTR	ERVL	236	291	-384	2
1253	782	103	0	0	chr3	87659667	87659774	-71940009	+	ORR1A3	LTR	MaLR	212	318	-8	2
1253	530	195	51	109	chr3	87659780	87659918	-71939865	+	MTE2b	LTR	MaLR	250	379	0	2
1253	384	335	165	16	chr3	87669290	87669539	-71930244	+	MLT1J	LTR	MaLR	194	479	-33	2
1253	1930	211	26	55	chr3	87669540	87669961	-71929822	+	MTD	LTR	MaLR	3	411	-8	2
1253	1316	222	95	29	chr3	87670877	87671224	-71928559	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	2
1253	272	230	53	84	chr3	87681086	87681181	-71918602	+	RMER15	LTR	ERVL	64	155	-420	3
1253	527	250	81	0	chr3	87681537	87681661	-71918122	+	RMER15	LTR	ERVL	442	575	0	3
1253	1389	176	101	95	chr3	87683858	87684151	-71915632	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	323	-44	3
1253	1389	176	101	95	chr3	87684298	87684361	-71915422	+	ORR1B2	LTR	MaLR	324	359	-8	3
1254	366	234	56	130	chr3	87687423	87687436	-71912347	+	MT2B	LTR	ERVL	153	275	-322	3
1254	366	234	56	130	chr3	87687595	87687618	-71912165	+	MT2B	LTR	ERVL	280	302	-299	3
1254	245	173	57	19	chr3	87692214	87692267	-71907516	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-204	1644	1590	3
1254	900	217	5	21	chr3	87692340	87692528	-71907255	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1039	809	625	3
1254	1901	240	45	34	chr3	87692530	87692722	-71907061	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	346	3
1254	1901	240	45	34	chr3	87692871	87692889	-71906894	-	RMER16	LTR	ERVK	-188	345	328	3
1254	1901	240	45	34	chr3	87693028	87693343	-71906440	-	RMER16	LTR	ERVK	-206	327	3	3
1254	440	253	0	0	chr3	87693343	87693438	-71906345	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1220	628	534	3
1254	240	208	101	25	chr3	87693501	87693580	-71906203	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	425	3
1254	6420	61	28	19	chr3	87693623	87694470	-71905313	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	3
1254	320	250	38	84	chr3	87694746	87694877	-71904906	+	RLTR23	LTR	ERV1	306	430	0	3
1254	363	274	36	9	chr3	87700062	87700193	-71899590	+	MLT1A1	LTR	MaLR	215	405	-3	4
1254	285	286	53	105	chr3	87702183	87702316	-71897467	+	MT2B	LTR	ERVL	153	278	-323	4
1254	244	217	159	0	chr3	87702912	87702981	-71896802	+	MT2B2	LTR	ERVL	162	241	-343	4
1254	2163	178	48	0	chr3	87703094	87703492	-71896291	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	4
1254	340	197	142	7	chr3	87708258	87708406	-71891377	+	RMER17C	LTR	ERVK	108	275	-135	4
1254	339	207	81	47	chr3	87715797	87715883	-71883900	-	MT2B	LTR	ERVL	-357	244	156	4
1254	724	225	78	45	chr3	87724660	87724902	-71874881	-	RMER17C	LTR	ERVK	-19	391	142	4
1254	271	253	148	11	chr3	87736354	87736442	-71863341	-	MTEa	LTR	MaLR	-262	117	18	5
1254	449	225	189	50	chr3	87736453	87736654	-71863129	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	1350	5
1254	1161	200	215	15	chr3	87737225	87737555	-71862228	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	19	5
1254	1171	223	75	28	chr3	87737566	87737926	-71861857	-	MTD-int	LTR	MaLR	-6	1252	876	5
1254	854	188	34	80	chr3	87737999	87738234	-71861549	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1034	224	1	5
1254	951	147	132	5	chr3	87738401	87738606	-71861177	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	181	5
1254	2010	288	147	33	chr3	87738617	87739122	-71860661	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-331	1249	646	5
1254	2010	297	147	49	chr3	87739269	87739787	-71859996	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-828	752	49	5
1254	1621	161	142	52	chr3	87746654	87746874	-71852909	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	211	5
1254	1621	161	142	52	chr3	87747014	87747179	-71852604	-	MTC	LTR	MaLR	-211	210	1	5
1254	1314	206	53	40	chr3	87767486	87767790	-71831993	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	112	5
1254	287	209	171	23	chr3	87768108	87768196	-71831587	-	MTD	LTR	MaLR	-302	119	19	5
1254	1914	96	58	19	chr3	87769502	87769811	-71829972	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	5
1254	4562	110	40	0	chr3	87771101	87771783	-71828000	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	29	6
1254	660	168	217	128	chr3	87773748	87773915	-71825868	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-98	276	80	6
1254	660	168	217	128	chr3	87774062	87774120	-71825663	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-295	79	31	6
1254	3364	48	5	0	chr3	87788604	87789002	-71810781	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
1254	1820	159	75	0	chr3	87808305	87808386	-71791397	-	RMER19B	LTR	ERVK	-24	878	798	6
1254	1820	159	75	0	chr3	87808767	87809017	-71790766	-	RMER19B	LTR	ERVK	-105	797	523	6
1254	250	226	155	9	chr3	87814273	87814389	-71785394	+	RMER15	LTR	ERVL	426	558	-17	6
1254	2529	182	32	36	chr3	87816890	87817354	-71782429	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	21	471	-106	6
1254	2529	182	32	36	chr3	87817404	87817498	-71782285	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	472	577	0	6
1255	4405	114	46	9	chr3	87818328	87819021	-71780762	-	RMER19A	LTR	ERVK	-17	720	1	6
1255	728	232	107	8	chr3	87821616	87821868	-71777915	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-9	519	243	6
1255	635	238	41	83	chr3	87821880	87822145	-71777638	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-230	298	55	6
1255	516	226	5	33	chr3	87822791	87823001	-71776782	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1914	2117	-3405	6
1255	437	256	37	46	chr3	87823140	87823306	-71776477	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2050	2221	-3301	6
1255	2843	181	71	54	chr3	87823344	87823461	-71776322	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2187	2305	-3217	6
1255	2843	181	71	54	chr3	87823648	87824175	-71775608	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2306	2849	-2673	6
1255	453	231	84	28	chr3	87836255	87836362	-71763421	+	MT2B2	LTR	ERVL	3	115	-418	7
1255	1081	211	35	16	chr3	87836788	87837114	-71762669	+	MT2B2	LTR	ERVL	92	584	0	7
1255	907	205	49	20	chr3	87837479	87837723	-71762060	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-55	5467	5217	7
1255	571	108	14	196	chr3	87837750	87837888	-71761895	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	113	-265	7
1255	281	280	0	13	chr3	87837888	87837964	-71761819	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	75	-454	7
1255	1708	108	7	66	chr3	87838267	87838554	-71761229	+	ORR1C1	LTR	MaLR	109	378	0	7
1255	1987	206	40	18	chr3	87838554	87838954	-71760829	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1	409	-1100	7
1255	2090	164	72	37	chr3	87838974	87839431	-71760352	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-343	5179	4707	7
1255	497	294	23	41	chr3	87839433	87839653	-71760130	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1089	4433	4218	7
1255	2135	160	8	38	chr3	87839922	87840081	-71759702	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2616	2906	2751	7
1255	3208	39	42	0	chr3	87840081	87840465	-71759318	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1255	2135	160	8	38	chr3	87840465	87840701	-71759082	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2772	2750	2523	7
1255	1231	162	61	20	chr3	87840727	87840786	-71758997	-	RLTR14	LTR	ERV1	-2	380	323	7
1255	1231	162	61	20	chr3	87841100	87841283	-71758500	-	RLTR14	LTR	ERV1	-60	322	126	7
1255	944	285	127	45	chr3	87841473	87842134	-71757649	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4640	882	168	7
1255	3141	107	12	94	chr3	87842202	87842767	-71757016	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	7
1255	1311	233	13	10	chr3	87843440	87843743	-71756040	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3184	1815	1512	7
1255	402	229	60	0	chr3	87843743	87843826	-71755957	-	RMER15	LTR	ERVL	-471	104	17	7
1255	1358	204	68	0	chr3	87845058	87845322	-71754461	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-92	282	1	7
1255	2072	125	63	91	chr3	87845377	87845773	-71754010	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	385	-9	7
1255	262	185	45	15	chr3	87849740	87849806	-71749977	-	MLT1E3	LTR	MaLR	0	624	565	7
1255	378	237	106	156	chr3	87853972	87854152	-71745631	-	MTE2b	LTR	MaLR	-204	175	5	7
1255	2479	126	193	12	chr3	87856638	87857120	-71742663	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	585	0	7
1255	279	307	116	40	chr3	87864416	87864589	-71735194	+	MLT1J	LTR	MaLR	1	186	-326	7
1255	1791	144	156	11	chr3	87864892	87865244	-71734539	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	19	7
1255	2377	108	72	28	chr3	87867479	87867869	-71731914	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	5	7
1255	5921	33	13	12	chr3	87867873	87868618	-71731165	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5736	7
1255	2096	83	0	0	chr3	87868617	87868895	-71730888	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	7
1255	3502	57	1	16	chr3	87868895	87869473	-71730310	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	7
1255	247	327	0	0	chr3	87869473	87869528	-71730255	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	221	7
1255	1052	97	0	155	chr3	87869528	87869747	-71730036	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6288	193	9	7
1255	2141	128	165	29	chr3	87869748	87870166	-71729617	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	475	1	7
1255	571	233	8	8	chr3	87884633	87884754	-71715029	+	MTE2b	LTR	MaLR	64	184	-195	8
1255	1614	166	133	146	chr3	87889224	87889263	-71710520	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	25	-441	8
1255	1614	166	133	146	chr3	87889420	87889852	-71709931	+	RMER4A	LTR	ERVK	26	466	0	8
1255	1662	197	94	11	chr3	87904683	87905072	-71694711	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	8
1255	1505	188	70	65	chr3	87907533	87907903	-71691880	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	8
1255	1551	188	74	96	chr3	87909542	87909765	-71690018	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	219	8
1255	1551	188	74	96	chr3	87909957	87910150	-71689633	-	MTD	LTR	MaLR	-201	218	12	8
1255	490	178	122	0	chr3	87928311	87928418	-71671365	-	MTD	LTR	MaLR	-299	120	1	9
1255	1513	157	21	156	chr3	87932714	87932938	-71666845	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	157	9
1255	1513	157	21	156	chr3	87933017	87933214	-71666569	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-218	156	2	9
1255	2342	68	58	3	chr3	87933560	87933870	-71665913	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	9
1255	1212	167	17	109	chr3	87938280	87938369	-71661414	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-100	274	187	9
1255	1212	167	17	109	chr3	87938431	87938643	-71661140	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-188	186	1	9
1256	352	186	0	110	chr3	87955382	87955491	-71644292	+	MT2B	LTR	ERVL	168	264	-337	9
1256	246	200	192	39	chr3	87961101	87961179	-71638604	+	MT2B	LTR	ERVL	169	258	-343	1
1256	327	232	33	44	chr3	87979588	87979678	-71620105	+	MTD	LTR	MaLR	1	89	-307	1
1256	753	258	10	50	chr3	87983929	87984129	-71615654	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	214	1
1256	231	213	0	0	chr3	87984752	87984799	-71614984	-	MTD	LTR	MaLR	-321	98	52	1
1256	1641	206	32	92	chr3	87985788	87986280	-71613503	-	RMER4A	LTR	ERVK	-3	463	1	1
1256	564	300	71	23	chr3	87988063	87988313	-71611470	+	MTD	LTR	MaLR	1	240	-179	1
1256	2106	170	22	37	chr3	87991284	87991687	-71608096	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	25	1
1256	1740	194	18	61	chr3	87992141	87992405	-71607378	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	131	1
1256	1965	107	14	114	chr3	87992405	87992710	-71607073	+	ORR1A3	LTR	MaLR	3	285	-41	1
1256	1965	107	14	114	chr3	87992894	87992945	-71606838	+	ORR1A3	LTR	MaLR	286	326	0	1
1256	1740	194	18	61	chr3	87992945	87993071	-71606712	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-244	130	4	1
1256	1713	174	148	9	chr3	87997265	87997602	-71602181	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
1256	1993	209	17	14	chr3	87997603	87998021	-71601762	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1256	1866	165	46	6	chr3	88001008	88001374	-71598409	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	33	5
1256	235	224	103	0	chr3	88050420	88050536	-71549247	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	627	6
1256	1713	186	7	75	chr3	88065552	88065964	-71533819	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
1256	2397	104	95	65	chr3	88067075	88067536	-71532247	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1256	562	260	173	5	chr3	88068012	88068209	-71531574	+	RMER21B	LTR	ERV1	338	567	-275	1
1256	2001	154	14	123	chr3	88068396	88068460	-71531323	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	340	1
1256	2001	154	14	123	chr3	88068606	88068963	-71530820	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-39	339	1	1
1256	335	141	30	30	chr3	88069985	88070039	-71529744	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	366	1
1256	1368	196	39	0	chr3	88070139	88070394	-71529389	-	MTD	LTR	MaLR	-46	373	109	1
1256	8061	43	40	4	chr3	88070612	88071664	-71528119	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-8	1090	1	1
1256	3466	11	37	0	chr3	88071664	88072046	-71527737	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1256	3159	124	30	2	chr3	88072625	88073125	-71526658	-	RLTR28	LTR	ERVL	-10	514	1	1
1256	1649	192	128	22	chr3	88073993	88074080	-71525703	+	RMER15	LTR	ERVL	1	87	-488	1
1256	1649	192	128	22	chr3	88074386	88074664	-71525119	+	RMER15	LTR	ERVL	88	405	-170	1
1256	1932	111	75	54	chr3	88074667	88075040	-71524743	-	RLTR28	LTR	ERVL	-28	496	116	1
1256	473	217	20	15	chr3	88076244	88076353	-71523430	+	MTD	LTR	MaLR	1	110	-311	1
1256	2327	123	51	81	chr3	88076353	88076580	-71523203	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	211	1
1256	2327	123	51	81	chr3	88076772	88076978	-71522805	-	MTC	LTR	MaLR	-211	210	1	1
1256	384	288	16	56	chr3	88076978	88076993	-71522790	+	MTD	LTR	MaLR	111	120	-301	1
1256	770	260	107	16	chr3	88077795	88078066	-71521717	+	MTD	LTR	MaLR	75	379	0	1
1257	1886	132	16	54	chr3	88082280	88082706	-71517077	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
1257	304	320	59	98	chr3	88082787	88082989	-71516794	+	MLT1E2	LTR	MaLR	1	190	-315	1
1257	245	328	71	142	chr3	88083181	88083203	-71516580	+	MLT1E2	LTR	MaLR	191	205	-300	1
1257	245	328	71	142	chr3	88083319	88083374	-71516409	+	MLT1E2	LTR	MaLR	206	261	-244	1
1257	449	205	51	114	chr3	88084548	88084724	-71515059	-	MT2B2	LTR	ERVL	-299	285	121	1
1257	549	311	56	37	chr3	88084941	88085211	-71514572	+	MT2A	LTR	ERVL	1	275	-258	1
1257	4952	113	57	27	chr3	88085213	88086051	-71513732	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	863	-39	1
1257	382	305	59	52	chr3	88086166	88086301	-71513482	+	MT2A	LTR	ERVL	290	425	-108	1
1257	228	186	58	145	chr3	88086293	88086328	-71513455	+	MLT2B3	LTR	ERVL	479	515	-39	1
1257	228	186	58	145	chr3	88086381	88086414	-71513369	+	MLT2B3	LTR	ERVL	516	541	-13	1
1257	3195	52	28	0	chr3	88088678	88089078	-71510705	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	1
1257	2243	88	135	11	chr3	88092448	88092795	-71506988	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
1257	314	250	62	91	chr3	88094121	88094297	-71505486	+	MLT1K	LTR	MaLR	395	565	-30	2
1257	2968	56	48	5	chr3	88094565	88094959	-71504824	+	RLTR10A	LTR	ERVK	1	411	0	2
1257	311	359	31	0	chr3	88105680	88105808	-71493975	-	MLT1C	LTR	MaLR	-323	144	13	2
1257	296	221	0	69	chr3	88105842	88105973	-71493810	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	638	759	-750	2
1257	824	221	78	108	chr3	88107550	88108068	-71491715	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	578	1	2
1257	307	179	375	0	chr3	88113742	88113853	-71485930	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	379	2
1257	1415	170	74	46	chr3	88114023	88114353	-71485430	-	MT2A	LTR	ERVL	-130	471	1	3
1257	1411	182	44	22	chr3	88121085	88121355	-71478428	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	46	3
1257	531	189	18	9	chr3	88121766	88121878	-71477905	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-281	113	1	3
1257	418	190	77	65	chr3	88127049	88127218	-71472565	+	RMER17C	LTR	ERVK	97	267	-143	3
1257	286	274	18	89	chr3	88142395	88142507	-71457276	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	155	3
1257	2543	98	0	84	chr3	88173516	88173908	-71425875	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	4
1257	13083	29	3	1	chr3	88173908	88175476	-71424307	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-2	6540	4970	4
1257	8679	38	2	0	chr3	88175474	88176528	-71423255	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-5486	1056	1	4
1257	2565	97	0	80	chr3	88176528	88176918	-71422865	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	4
1257	1309	151	151	0	chr3	88177426	88177685	-71422098	+	MTC	LTR	MaLR	1	298	-123	4
1257	235	190	16	65	chr3	88179448	88179510	-71420273	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	0	1808	1750	4
1257	1338	143	151	0	chr3	88183138	88183397	-71416386	+	MTC	LTR	MaLR	1	298	-123	4
1257	235	190	16	65	chr3	88185224	88185286	-71414497	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	0	1808	1750	4
1257	1283	154	151	0	chr3	88188899	88189158	-71410625	+	MTC	LTR	MaLR	1	298	-123	4
1257	11045	64	22	106	chr3	88190074	88190661	-71409122	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-25	1783	1319	4
1257	11045	64	22	106	chr3	88190848	88191087	-71408696	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-490	1318	1119	4
1257	11045	64	22	106	chr3	88191204	88191215	-71408568	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-690	1118	1118	4
1257	11045	64	22	106	chr3	88191354	88191859	-71407924	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-690	1118	600	4
1257	11045	64	22	106	chr3	88192043	88192454	-71407329	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-1209	599	190	4
1257	11045	64	22	106	chr3	88192644	88192833	-71406950	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-1619	189	1	4
1257	267	255	0	0	chr3	88193247	88193298	-71406485	+	SRV_MM-int	LTR	ERVK	510	560	-5607	4
1257	280	390	15	15	chr3	88193712	88193915	-71405868	+	MMTV-int	LTR	ERVK	2396	2598	-5619	4
1257	852	332	10	5	chr3	88194485	88194875	-71404908	+	MMTV-int	LTR	ERVK	2789	3180	-4073	4
1257	428	321	60	43	chr3	88194880	88195284	-71404499	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6086	2873	2507	4
1257	584	324	31	30	chr3	88195677	88196164	-71403619	+	MMTV-int	LTR	ERVK	5392	5733	-1673	4
1257	396	248	60	37	chr3	88196907	88197041	-71402742	-	MMTV-int	LTR	ERVK	-1975	5278	5142	4
1257	2110	148	120	32	chr3	88200427	88200860	-71398923	+	RMER4B	LTR	ERVK	114	584	-1	4
1257	259	169	0	92	chr3	88204110	88204127	-71395656	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	17	-357	4
1257	1869	162	79	28	chr3	88204127	88204483	-71395300	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1257	259	169	0	92	chr3	88204483	88204530	-71395253	+	ORR1D1	LTR	MaLR	18	59	-315	4
1257	276	207	120	71	chr3	88204530	88204687	-71395096	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	-19	1014	812	4
1257	916	206	189	29	chr3	88205663	88205943	-71393840	+	ORR1D1	LTR	MaLR	50	374	0	4
1258	488	297	59	115	chr3	88222304	88222643	-71377140	+	RLTR12B	LTR	ERVK	166	485	-43	5
1258	702	254	171	109	chr3	88229996	88230287	-71369496	+	MTD	LTR	MaLR	3	345	-74	5
1258	702	254	171	109	chr3	88230431	88230532	-71369251	+	MTD	LTR	MaLR	346	419	0	5
1258	1052	164	58	36	chr3	88230823	88231136	-71368647	+	RMER16	LTR	ERVK	198	533	0	5
1258	3530	168	45	62	chr3	88234028	88234668	-71365115	-	RLTR40	LTR	ERVK	-76	741	111	5
1258	3530	168	45	62	chr3	88234815	88234928	-71364855	-	RLTR40	LTR	ERVK	-707	110	1	5
1258	2957	56	25	8	chr3	88235045	88235438	-71364345	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1258	563	221	168	0	chr3	88235754	88235903	-71363880	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-196	198	25	5
1258	2964	106	6	62	chr3	88237428	88237542	-71362241	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-20	483	381	5
1258	2964	106	6	62	chr3	88237754	88238151	-71361632	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-123	380	1	5
1258	351	301	56	37	chr3	88248043	88248257	-71351526	-	RMER12	LTR	ERVK	-334	988	771	6
1258	1585	176	80	17	chr3	88249387	88249739	-71350044	+	ORR1C2	LTR	MaLR	11	384	0	6
1258	411	214	8	118	chr3	88260018	88260145	-71339638	+	MT2B	LTR	ERVL	152	264	-337	6
1258	278	233	42	127	chr3	88265776	88265894	-71333889	+	MT2B	LTR	ERVL	156	263	-338	6
1258	1172	212	223	27	chr3	88269207	88269615	-71330168	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	88	6
1258	290	211	70	0	chr3	88269670	88269741	-71330042	+	RMER15	LTR	ERVL	63	138	-437	6
1258	318	326	20	0	chr3	88270030	88270128	-71329655	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-6	4993	4894	6
1258	327	198	136	0	chr3	88270499	88270580	-71329203	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-100	4899	4808	6
1258	410	307	70	49	chr3	88272035	88272220	-71327563	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3370	1629	1441	6
1258	243	180	0	107	chr3	88273313	88273348	-71326435	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	29	-355	6
1258	4129	131	37	19	chr3	88273348	88274073	-71325710	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	738	-18	6
1258	1513	199	18	2	chr3	88274078	88274412	-71325371	+	ORR1B1	LTR	MaLR	24	394	0	6
1258	1847	141	132	6	chr3	88274487	88274836	-71324947	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	6
1258	1507	195	101	111	chr3	88274921	88275434	-71324349	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	508	-4	6
1258	325	298	26	17	chr3	88275904	88276020	-71323763	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	354	6
1258	250	261	0	129	chr3	88276614	88276715	-71323068	+	MT2B2	LTR	ERVL	194	281	-303	6
1258	232	325	75	25	chr3	88280399	88280519	-71319264	+	MTEa	LTR	MaLR	1	126	-253	7
1258	303	293	97	8	chr3	88280733	88280867	-71318916	+	MTEa	LTR	MaLR	161	306	-73	7
1258	1474	201	189	26	chr3	88283065	88283484	-71316299	+	RMER15	LTR	ERVL	45	531	-44	7
1258	1794	151	42	36	chr3	88283494	88283851	-71315932	+	RMER6B	LTR	ERVK	17	375	-86	7
1258	362	220	0	130	chr3	88301138	88301253	-71298530	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	165	7
1258	325	202	0	154	chr3	88302866	88302989	-71296794	+	MT2B	LTR	ERVL	155	258	-343	7
1258	2348	78	55	0	chr3	88323530	88323838	-71275945	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	325	-2	8
1258	317	271	0	142	chr3	88326583	88326738	-71273045	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	125	8
1259	378	268	94	35	chr3	88354152	88354322	-71245461	+	RLTR12B	LTR	ERVK	5	184	-344	8
1259	308	305	70	83	chr3	88354335	88354564	-71245219	+	RLTR12B	LTR	ERVK	261	486	-42	8
1259	1871	189	66	56	chr3	88361328	88361931	-71237852	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	585	33	9
1259	3468	143	82	22	chr3	88374018	88374690	-71225093	-	RMER19A	LTR	ERVK	-1	736	25	9
1259	235	271	65	76	chr3	88375113	88375136	-71224647	+	MT2B2	LTR	ERVL	163	250	-334	9
1259	539	286	47	144	chr3	88375635	88375995	-71223788	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-76	452	128	9
1259	2582	151	6	123	chr3	88376805	88377310	-71222473	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	9
1259	675	231	199	31	chr3	88377468	88377759	-71222024	+	RMER13A	LTR	ERVK	85	424	-436	9
1259	237	266	0	138	chr3	88379152	88379224	-71220559	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-307	220	157	9
1259	237	266	0	138	chr3	88379415	88379451	-71220332	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-371	156	127	9
1259	752	126	16	0	chr3	88379517	88379644	-71220139	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	129	-324	9
1259	2053	169	47	12	chr3	88379648	88380073	-71219710	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	10	449	-78	9
1259	231	203	127	28	chr3	88381109	88381180	-71218603	+	RLTR25B	LTR	ERVK	432	509	-519	9
1259	419	143	9	0	chr3	88381261	88381343	-71218440	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6212	2747	2676	9
1259	3078	23	0	3	chr3	88381573	88381920	-71217863	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	9
1259	270	273	8	106	chr3	88382304	88382335	-71217448	+	MT2B2	LTR	ERVL	137	168	-416	9
1259	2113	129	55	23	chr3	88382335	88382732	-71217051	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	9
1259	326	300	147	59	chr3	88386936	88387343	-71212440	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-44	484	42	9
1259	767	201	373	7	chr3	88399331	88399626	-71200157	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	9	1
1259	240	217	0	12	chr3	88399652	88399736	-71200047	-	RMER17C	LTR	ERVK	-149	261	179	1
1259	935	187	305	37	chr3	88407242	88407537	-71192246	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1259	264	214	35	133	chr3	88408481	88408594	-71191189	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	156	1
1259	1138	176	227	10	chr3	88445345	88445649	-71154134	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
1259	419	241	330	5	chr3	88459485	88459673	-71140110	-	RMER21B	LTR	ERV1	-275	567	319	1
1259	3032	167	63	2	chr3	88460023	88460544	-71139239	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	33	1
1259	1031	257	84	30	chr3	88460751	88461084	-71138699	-	ORR1E	LTR	MaLR	-8	351	1	1
1259	238	94	0	0	chr3	88462563	88462595	-71137188	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	380	1
1259	1933	217	88	24	chr3	88462595	88462869	-71136914	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	578	251	1
1259	1933	214	85	17	chr3	88462917	88463157	-71136626	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-313	250	2	1
1259	736	184	86	0	chr3	88463162	88463336	-71136447	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-5	2321	2133	1
1259	1728	262	93	60	chr3	88463336	88463849	-71135934	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	539	-103	1
1259	1728	262	93	60	chr3	88463873	88463980	-71135803	+	RLTR26	LTR	ERVK	540	642	0	1
1259	1548	135	94	4	chr3	88464237	88464504	-71135279	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	352	642	-1684	1
1259	4365	156	29	64	chr3	88464504	88464591	-71135192	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1380	1461	-865	1
1259	4365	156	29	64	chr3	88464747	88465241	-71134542	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1462	1944	-382	1
1259	4365	156	29	64	chr3	88465417	88465786	-71133997	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1945	2298	-28	1
1259	613	142	165	8	chr3	88465791	88465897	-71133886	+	RLTR20C	LTR	ERVK	2	126	-408	1
1259	765	215	19	84	chr3	88466152	88466365	-71133418	+	RLTR20C	LTR	ERVK	110	308	-226	1
1259	425	171	60	0	chr3	88466451	88466535	-71133248	+	RLTR20C	LTR	ERVK	461	566	-12	1
1259	5054	96	50	102	chr3	88468838	88469005	-71130778	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-1	905	749	1
1259	5054	96	50	102	chr3	88469028	88469813	-71129970	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-158	748	3	1
1259	3012	24	0	0	chr3	88470332	88470669	-71129114	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
157	56729	20	15	6	chr3	88470679	88477071	-71122712	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	34	6481	0	1
1260	3012	24	0	0	chr3	88477071	88477408	-71122375	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	1
1260	2704	134	11	38	chr3	88480001	88480473	-71119310	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	1	1
1260	5913	125	37	20	chr3	88480476	88481234	-71118549	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1195	7764	7001	1
1260	5913	125	37	20	chr3	88481264	88481457	-71118326	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1959	7000	6798	1
1260	3818	128	136	164	chr3	88481629	88482104	-71117679	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2160	6799	6257	1
1260	3818	128	136	164	chr3	88482162	88482258	-71117525	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2703	6256	6148	1
1260	3818	128	136	164	chr3	88482320	88482394	-71117389	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2160	6147	6060	1
1260	3818	128	136	164	chr3	88482540	88482943	-71116840	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2900	6059	5664	1
1260	2216	99	19	3	chr3	88483312	88483635	-71116148	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7544	1415	1088	1
1260	5925	139	40	53	chr3	88483906	88484117	-71115666	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7859	1100	909	1
1260	5925	139	40	53	chr3	88484225	88485124	-71114659	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8051	908	4	1
1260	2452	143	27	65	chr3	88485129	88485180	-71114603	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	420	1
1260	2452	143	27	65	chr3	88485370	88485795	-71113988	-	RMER6B	LTR	ERVK	-42	419	1	1
1260	2252	197	105	21	chr3	88487301	88487999	-71111784	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	1
1260	249	302	0	60	chr3	88488349	88488416	-71111367	+	MER66C	LTR	ERV1	453	515	-40	1
1260	591	244	151	12	chr3	88498783	88498949	-71100834	-	MTD	LTR	MaLR	-33	386	198	1
1260	363	326	0	11	chr3	88499907	88500000	-71099783	-	MTD	LTR	MaLR	-287	132	41	1
1260	2231	156	56	20	chr3	88500866	88501316	-71098467	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	3
1260	523	189	27	0	chr3	88503200	88503311	-71096472	+	MTC	LTR	MaLR	6	119	-302	1
1260	509	247	93	41	chr3	88506147	88506341	-71093442	+	RLTR18	LTR	ERVK	42	248	-264	2
1260	805	199	33	89	chr3	88507923	88508011	-71091772	+	RLTR18-int	LTR	ERVK	4114	4201	-1160	2
1260	805	199	33	89	chr3	88508154	88508335	-71091448	+	RLTR18-int	LTR	ERVK	4202	4368	-993	2
1260	920	276	60	51	chr3	88508390	88508911	-71090872	+	RLTR18	LTR	ERVK	84	528	-88	2
1260	528	173	125	0	chr3	88508920	88509024	-71090759	+	RLTR18-int	LTR	ERVK	4375	4491	-870	3
1260	451	149	0	39	chr3	88509934	88510011	-71089772	+	RLTR18-int	LTR	ERVK	4803	4876	-485	3
1260	377	149	95	0	chr3	88518361	88518435	-71081348	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	302	5
1260	1537	145	58	36	chr3	88518435	88518765	-71081018	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	130	5
1260	251	61	176	39	chr3	88518823	88518874	-71080909	-	RMER4A	LTR	ERVK	-343	123	66	5
1260	832	220	66	53	chr3	88527898	88528310	-71071473	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	377	-17	8
1260	1534	187	117	3	chr3	88536212	88536571	-71063212	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	400	-502	1
1260	2173	120	88	10	chr3	88536588	88536975	-71062808	+	RMER19B	LTR	ERVK	470	886	-16	1
1260	2951	21	9	0	chr3	88537908	88538242	-71061541	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1260	2904	30	58	10	chr3	88542050	88542450	-71057333	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	18	1
1260	270	28	0	0	chr3	88542464	88542500	-71057283	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-256	36	1	1
1260	1094	146	95	33	chr3	88543620	88543861	-71055922	+	RMER15	LTR	ERVL	316	571	-4	1
1260	267	93	0	0	chr3	88544654	88544697	-71055086	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	43	-859	1
1260	4513	141	14	45	chr3	88544697	88545601	-71054182	+	RLTR13A3	LTR	ERVK	1	978	0	1
1260	338	148	49	0	chr3	88545601	88545660	-71054123	+	RMER19B	LTR	ERVK	35	96	-806	1
1260	1754	169	93	82	chr3	88545667	88546309	-71053474	-	RMER19B	LTR	ERVK	-197	705	1	1
1260	2773	68	149	115	chr3	88548041	88548536	-71051247	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	1
1260	242	239	53	64	chr3	88586246	88586340	-71013443	-	MT2B2	LTR	ERVL	-337	247	155	2
1260	1379	189	81	84	chr3	88587195	88587576	-71012207	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	5	2
1260	1215	227	100	31	chr3	88591307	88591657	-71008126	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1260	464	262	134	0	chr3	88591946	88592110	-71007673	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	419	-208	3
1260	9657	257	65	61	chr3	88596230	88596477	-71003306	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-116	5144	4976	3
1260	9657	268	58	54	chr3	88597526	88598795	-71000988	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-285	4975	3722	3
1260	9657	268	58	54	chr3	88598941	88599688	-71000095	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-1539	3721	2962	3
1260	9657	268	58	54	chr3	88599710	88600477	-70999306	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2299	2961	2155	3
1260	307	130	0	0	chr3	88600477	88600533	-70999250	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-271	56	1	3
1260	9657	268	58	54	chr3	88600533	88600725	-70999058	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2299	2154	1951	3
1260	9657	268	58	54	chr3	88600876	88601379	-70998404	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-3310	1950	1456	3
1260	1388	284	48	74	chr3	88601667	88601768	-70998015	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-1899	1278	1213	3
1260	1388	284	48	74	chr3	88601908	88602411	-70997372	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-1965	1212	690	3
1260	386	299	63	63	chr3	88604106	88604295	-70995488	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1465	5085	4897	3
1260	738	226	50	79	chr3	88604367	88604645	-70995138	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-362	2876	2607	3
1261	915	175	50	132	chr3	88604836	88605212	-70994571	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3259	2878	2534	3
1261	2242	221	73	18	chr3	88609083	88609203	-70990580	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	442	3
1261	2242	221	73	18	chr3	88609385	88609809	-70989974	-	RMER15	LTR	ERVL	-134	441	1	3
1261	3379	35	5	2	chr3	88609911	88610306	-70989477	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1261	2823	148	68	4	chr3	88610905	88611394	-70988389	-	RLTR28	LTR	ERVL	-4	520	1	3
1261	1999	186	39	9	chr3	88627008	88627448	-70972335	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	3
1261	1246	189	82	82	chr3	88649276	88649656	-70950127	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	5	4
1261	648	92	27	34	chr3	88657858	88658005	-70941778	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-396	510	365	4
1261	243	200	127	114	chr3	88669136	88669215	-70930568	-	MT2B	LTR	ERVL	-347	254	175	5
1261	1215	227	100	31	chr3	88671704	88672054	-70927729	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1261	464	262	134	0	chr3	88672359	88672523	-70927260	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	419	-208	5
1261	9688	257	65	61	chr3	88676679	88676926	-70922857	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-116	5144	4976	5
1261	9688	267	58	54	chr3	88677974	88679236	-70920547	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-285	4975	3714	5
1261	9688	267	58	54	chr3	88679382	88680132	-70919651	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-1547	3713	2962	5
1261	9688	267	58	54	chr3	88680158	88680924	-70918859	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2299	2961	2153	5
1261	307	130	0	0	chr3	88680924	88680980	-70918803	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-271	56	1	5
1261	9688	267	58	54	chr3	88680980	88681182	-70918601	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2299	2152	1938	5
1261	9688	277	56	56	chr3	88681329	88681906	-70917877	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-3323	1937	1146	5
1261	1294	290	49	77	chr3	88682131	88682224	-70917559	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1908	1269	1213	5
1261	1324	291	49	75	chr3	88682364	88682885	-70916898	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1965	1212	484	5
1261	383	299	63	63	chr3	88684562	88684751	-70915032	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1465	5085	4897	5
1261	724	230	50	79	chr3	88684823	88685101	-70914682	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-362	2876	2607	5
1261	935	208	71	85	chr3	88685216	88685652	-70914131	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3259	2878	2534	5
1261	2161	218	68	11	chr3	88688050	88688166	-70911617	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	445	5
1261	2161	218	68	11	chr3	88688348	88688773	-70911010	-	RMER15	LTR	ERVL	-131	444	2	5
1261	3162	51	13	5	chr3	88688874	88689267	-70910516	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1261	2830	146	68	4	chr3	88689904	88690393	-70909390	-	RLTR28	LTR	ERVL	-4	520	1	5
1261	255	243	50	69	chr3	88692463	88692478	-70907305	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	599	617	-892	5
1261	255	243	50	69	chr3	88692675	88692818	-70906965	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	618	754	-755	5
1261	337	236	21	124	chr3	88701329	88701364	-70898419	+	MT2B	LTR	ERVL	136	264	-336	6
1261	1568	188	34	6	chr3	88701690	88702011	-70897772	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-123	330	1	6
1261	423	275	147	7	chr3	88720847	88720990	-70878793	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-211	163	1	6
1261	3431	180	57	63	chr3	88723118	88723978	-70875805	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	6
1261	875	195	69	33	chr3	88724316	88724692	-70875091	+	MT2A	LTR	ERVL	42	488	-45	6
1261	2367	185	171	21	chr3	88725146	88725798	-70873985	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	698	-204	6
1261	261	276	144	24	chr3	88728881	88729048	-70870735	+	ORR1E	LTR	MaLR	51	237	-122	6
1261	1184	194	224	20	chr3	88731345	88731693	-70868090	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
1262	2700	138	8	26	chr3	88739327	88739796	-70859987	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	7
1262	564	280	136	43	chr3	88747907	88748223	-70851560	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	7	7
1262	3745	137	233	3	chr3	88770975	88771713	-70828070	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	8
1262	1680	183	78	51	chr3	88779038	88779412	-70820371	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	8
1262	272	274	21	188	chr3	88791670	88791814	-70807969	+	MT2B	LTR	ERVL	175	294	-307	8
1262	230	222	0	18	chr3	88809408	88809463	-70790320	+	MLT2B3	LTR	ERVL	501	554	0	9
1262	361	257	119	0	chr3	88809746	88809855	-70789928	-	MTE-int	LTR	MaLR	-7	1573	1452	9
1262	1848	160	216	29	chr3	88813249	88813621	-70786162	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	464	-64	9
1262	1848	160	216	29	chr3	88813769	88813841	-70785942	+	RLTR11A	LTR	ERVK	465	527	-1	9
1262	1213	154	259	23	chr3	88818943	88819209	-70780574	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	9
1262	1446	158	9	165	chr3	88819422	88819714	-70780069	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	243	-659	9
1262	1446	254	174	60	chr3	88819898	88820111	-70779672	+	RMER19B	LTR	ERVK	244	595	-16	9
1262	2422	128	64	42	chr3	88823473	88823929	-70775854	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	9
1262	1040	239	73	28	chr3	88831478	88831766	-70768017	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	78	1
1262	387	295	107	27	chr3	88831817	88831967	-70767816	-	MTE-int	LTR	MaLR	0	1580	1419	1
1262	1822	305	102	119	chr3	88832279	88833132	-70766651	-	MTE-int	LTR	MaLR	-182	1398	583	1
1262	1378	307	103	119	chr3	88833307	88833868	-70765915	-	MTE-int	LTR	MaLR	-998	582	7	1
1262	668	188	48	18	chr3	88838245	88838413	-70761370	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	173	-186	1
1262	1849	192	11	97	chr3	88853465	88853814	-70745969	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	80	1
1262	1849	192	11	97	chr3	88854049	88854076	-70745707	-	MTC	LTR	MaLR	-342	79	79	1
1262	1849	192	11	97	chr3	88854185	88854262	-70745521	-	MTC	LTR	MaLR	-342	79	4	1
1263	1996	203	73	20	chr3	88867969	88868058	-70731725	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	446	1
1263	1996	203	73	20	chr3	88868091	88868508	-70731275	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-89	445	3	1
1263	658	227	75	32	chr3	88899882	88900128	-70699655	+	MTD	LTR	MaLR	1	262	-134	1
1263	314	266	41	123	chr3	88902924	88903070	-70696713	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	124	1
1263	320	220	17	0	chr3	88908734	88908793	-70690990	+	MER21B	LTR	ERV1	547	606	-257	1
1263	316	250	14	27	chr3	88909883	88909957	-70689826	-	MTEa	LTR	MaLR	-42	337	265	1
1263	1932	125	81	11	chr3	88910836	88911184	-70688599	+	RMER6B	LTR	ERVK	90	461	0	1
1263	400	335	62	57	chr3	88911767	88911976	-70687807	-	MER21B	LTR	ERV1	-163	700	491	1
1263	2289	181	63	57	chr3	88913462	88913556	-70686227	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	436	1
1263	2289	181	63	57	chr3	88913742	88914173	-70685610	-	RLTR24	LTR	ERV1	-94	435	2	1
1263	1141	54	7	13	chr3	88914288	88914438	-70685345	+	RLTR19B	LTR	ERVK	13	161	-554	1
1263	3573	119	11	2	chr3	88914625	88915146	-70684637	+	RLTR19B	LTR	ERVK	190	715	0	1
1263	817	264	58	12	chr3	88917745	88918002	-70681781	+	RMER5	LTR	ERV1	68	336	-198	1
1263	319	246	69	99	chr3	88918341	88918461	-70681322	+	RMER5	LTR	ERV1	340	457	-77	1
1263	344	179	88	25	chr3	88920228	88920308	-70679475	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	425	1
1263	2077	216	68	21	chr3	88923286	88923771	-70676012	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-17	546	6	1
1263	796	371	31	20	chr3	88924592	88925353	-70674430	+	MuLV-int	LTR	ERV1	2674	3443	-4163	1
1263	418	290	38	31	chr3	88925695	88925855	-70673928	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	3303	3463	-1854	1
1263	2171	101	25	12	chr3	88929597	88929918	-70669865	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	-2	325	1	1
1263	1639	209	40	30	chr3	88929952	88930322	-70669461	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1263	4126	156	117	37	chr3	88931226	88932031	-70667752	-	RMER19B	LTR	ERVK	-13	889	20	1
1263	324	364	15	8	chr3	88934380	88934513	-70665270	-	MT2A	LTR	ERVL	-170	363	230	1
1263	254	248	35	17	chr3	88934689	88934804	-70664979	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-770	739	623	1
1263	348	292	0	0	chr3	88957444	88957533	-70642250	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-23	418	330	1
1263	991	217	129	56	chr3	88959261	88959306	-70640477	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	54	-313	1
1263	1254	158	104	66	chr3	88959448	88959558	-70640225	+	ORR1C2	LTR	MaLR	55	182	-202	1
1263	1254	149	100	68	chr3	88959742	88959927	-70639856	+	ORR1C2	LTR	MaLR	183	384	0	1
1263	296	219	98	0	chr3	88995388	88995470	-70604313	+	RMER5	LTR	ERV1	1	90	-444	1
1263	394	304	132	6	chr3	88995508	88995667	-70604116	+	RMER5	LTR	ERV1	212	390	-144	1
1263	684	214	71	7	chr3	88995744	88995899	-70603884	+	RMER5	LTR	ERV1	329	493	-41	1
1264	361	55	18	18	chr3	88998778	88998833	-70600950	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	272	1
1264	1008	99	0	0	chr3	88998927	88999068	-70600715	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-41	285	145	1
1264	1115	81	6	0	chr3	88999218	88999379	-70600404	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-165	162	1	1
1264	618	242	151	57	chr3	89000853	89001206	-70598577	+	MTD	LTR	MaLR	1	384	-12	1
1264	588	296	41	67	chr3	89060049	89060317	-70539466	+	MLT2D	LTR	ERVL	153	413	-1	1
1264	2044	206	52	53	chr3	89061293	89061897	-70537886	+	RLTR18	LTR	ERVK	16	532	-84	1
1264	1302	157	11	36	chr3	89064103	89064380	-70535403	-	RLTR28	LTR	ERVL	-12	512	243	1
1264	1430	157	12	0	chr3	89064520	89064775	-70535008	-	RLTR28	LTR	ERVL	-266	258	1	1
1264	2103	133	38	43	chr3	89065656	89066050	-70533733	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	7	1
1264	287	202	0	125	chr3	89067217	89067235	-70532548	-	MT2B	LTR	ERVL	-366	235	152	1
1264	237	296	91	0	chr3	89068936	89069024	-70530759	+	LTR65	LTR	ERV1	274	369	-300	1
1264	542	274	12	31	chr3	89098753	89098915	-70500868	+	RLTR1D	LTR	ERV1	60	218	-387	2
1264	673	199	14	7	chr3	89104062	89104211	-70495572	+	LTR41	LTR	ERVL	617	795	0	2
1264	667	325	64	38	chr3	89112753	89113095	-70486688	+	MTD	LTR	MaLR	1	351	-68	2
1264	338	236	165	75	chr3	89113336	89113469	-70486314	+	MTE2a	LTR	MaLR	205	349	-30	2
1264	2094	183	46	0	chr3	89114909	89115276	-70484507	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	2
1264	2448	153	42	15	chr3	89115818	89116228	-70483555	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1264	295	179	0	35	chr3	89116257	89116315	-70483468	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	366	2
1264	2399	153	0	17	chr3	89116446	89116472	-70483311	-	MTC	LTR	MaLR	-22	399	375	2
1264	2399	153	0	17	chr3	89116499	89116878	-70482905	-	MTC	LTR	MaLR	-47	374	1	2
1265	243	336	53	0	chr3	89134381	89134494	-70465289	+	MLT1G3	LTR	MaLR	349	467	-128	3
1265	225	299	55	122	chr3	89156205	89156460	-70443323	+	LTRIS3	LTR	ERV1	79	316	-196	3
1265	245	285	113	78	chr3	89158570	89158622	-70441161	-	MT2B	LTR	ERVL	-364	224	92	3
1265	333	243	174	56	chr3	89164654	89164798	-70434985	+	MLT1L	LTR	MaLR	1	161	-449	3
1265	271	214	16	149	chr3	89178203	89178324	-70421459	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	153	3
1265	312	191	85	106	chr3	89181019	89181160	-70418623	+	MT2B2	LTR	ERVL	103	240	-344	4
1265	274	259	21	177	chr3	89203640	89203664	-70396119	+	MT2B2	LTR	ERVL	170	257	-327	4
1265	274	259	21	177	chr3	89203784	89203816	-70395967	+	MT2B2	LTR	ERVL	258	287	-297	4
1265	386	198	0	119	chr3	89214414	89214523	-70385260	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	163	4
1265	2622	127	10	5	chr3	89244351	89244762	-70355021	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	5
1265	356	213	8	122	chr3	89246093	89246216	-70353567	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	155	5
1266	404	306	148	58	chr3	89266520	89266884	-70332899	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	405	9	5
1266	258	276	36	109	chr3	89266881	89267019	-70332764	+	MT2B	LTR	ERVL	144	271	-330	5
1266	231	228	137	81	chr3	89292236	89292360	-70307423	+	MT2B	LTR	ERVL	127	257	-344	6
1266	1275	242	82	6	chr3	89294638	89294979	-70304804	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	1	6
1266	520	309	92	44	chr3	89297299	89297570	-70302213	-	MLT1K	LTR	MaLR	-17	578	295	6
1266	1840	110	110	0	chr3	89298974	89299292	-70300491	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	353	-41	6
1266	289	169	45	30	chr3	89299429	89299496	-70300287	+	ORR1B2	LTR	MaLR	292	359	-8	6
1266	502	249	89	11	chr3	89299652	89299830	-70299953	-	ORR1E	LTR	MaLR	-20	339	148	6
1266	1754	188	52	85	chr3	89299830	89300030	-70299753	+	MTD	LTR	MaLR	1	208	-211	6
1266	1754	188	52	85	chr3	89300242	89300466	-70299317	+	MTD	LTR	MaLR	209	411	-8	6
1266	409	192	0	0	chr3	89300469	89300547	-70299236	-	ORR1E	LTR	MaLR	-262	97	20	6
1266	1400	108	7	156	chr3	89301255	89301497	-70298286	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1358	6
1266	1400	108	7	156	chr3	89301643	89301703	-70298080	-	RLTR21	LTR	ERVK	-215	1357	1315	6
1266	5602	129	43	111	chr3	89301979	89302270	-70297513	-	RLTR21	LTR	ERVK	-498	1074	815	6
1266	5602	129	43	111	chr3	89302637	89302754	-70297029	-	RLTR21	LTR	ERVK	-758	814	758	6
1266	5602	129	43	111	chr3	89302899	89302910	-70296873	-	RLTR21	LTR	ERVK	-815	757	757	6
1266	5602	129	43	111	chr3	89303093	89303820	-70295963	-	RLTR21	LTR	ERVK	-815	757	3	6
1266	261	228	24	37	chr3	89303908	89303990	-70295793	+	ORR1A3	LTR	MaLR	17	97	-229	6
1266	456	292	158	67	chr3	89304636	89305144	-70294639	+	RMER13A	LTR	ERVK	95	700	-208	6
1266	242	200	0	57	chr3	89305875	89305918	-70293865	+	ORR1D2	LTR	MaLR	329	370	0	6
1266	1371	123	108	167	chr3	89372854	89373032	-70226751	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	169	8
1266	1371	123	108	167	chr3	89373078	89373307	-70226476	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-216	168	1	8
1266	1548	240	89	0	chr3	89375763	89376122	-70223661	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	13	8
1266	637	286	61	29	chr3	89379624	89379869	-70219914	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-561	4438	4186	8
1266	251	294	43	21	chr3	89383747	89383841	-70215942	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3728	1794	1699	8
1266	629	266	176	37	chr3	89386142	89386466	-70213317	-	MLT1D	LTR	MaLR	-45	460	92	8
1267	364	308	40	33	chr3	89397312	89397463	-70202320	+	MLT1D	LTR	MaLR	95	246	-259	8
1267	967	205	259	26	chr3	89407523	89407863	-70191920	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	8
1267	248	335	47	99	chr3	89408416	89408588	-70191195	+	MT2B2	LTR	ERVL	194	356	-228	8
1267	851	341	111	9	chr3	89411813	89412263	-70187520	-	MER21B	LTR	ERV1	-123	740	245	8
1267	250	333	70	76	chr3	89416774	89416889	-70182894	+	LTR16A	LTR	ERVL	114	224	-227	8
1267	250	333	70	76	chr3	89417091	89417160	-70182623	+	LTR16A	LTR	ERVL	225	297	-154	8
1267	359	299	88	18	chr3	89427517	89427687	-70172096	-	MLT1J	LTR	MaLR	-90	422	241	9
1267	292	298	83	21	chr3	89439437	89439533	-70160250	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-52	508	407	9
1267	255	385	9	9	chr3	89439731	89439836	-70159947	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-391	169	65	9
1267	269	324	19	47	chr3	89439833	89439940	-70159843	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-448	112	9	9
1267	1020	276	97	47	chr3	89440117	89440456	-70159327	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	24	9
1267	1821	208	11	19	chr3	89440699	89441076	-70158707	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	9
1267	2440	151	45	2	chr3	89441963	89442367	-70157416	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	9
1267	1320	217	107	26	chr3	89442679	89442798	-70156985	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	229	9
1267	1320	217	107	26	chr3	89442834	89442967	-70156816	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-146	228	94	9
1267	2734	137	5	14	chr3	89442967	89443390	-70156393	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	9
1267	1320	217	107	26	chr3	89443390	89443482	-70156301	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-281	93	2	9
1267	531	307	128	45	chr3	89447968	89448210	-70151573	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	405	144	9
1267	230	239	155	0	chr3	89448369	89448440	-70151343	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-273	135	54	9
1267	228	303	22	90	chr3	89465629	89465897	-70133886	-	RLTR21	LTR	ERVK	-257	1315	1066	9
1267	1999	141	13	82	chr3	89482426	89482805	-70116978	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	42	9
1267	1222	224	71	51	chr3	89483204	89483515	-70116268	-	MTEa	LTR	MaLR	-62	317	1	9
1267	384	341	31	8	chr3	89485229	89485356	-70114427	+	MER21B	LTR	ERV1	20	149	-714	9
1267	752	289	65	16	chr3	89490814	89491097	-70108686	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	326	-93	1
1267	468	232	51	90	chr3	89491112	89491268	-70108515	+	MTE2b	LTR	MaLR	190	339	-40	1
1267	917	215	104	179	chr3	89494171	89494272	-70105511	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	271	1
1267	917	215	104	179	chr3	89494419	89494719	-70105064	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-104	270	3	1
1267	239	207	206	54	chr3	89497471	89497563	-70102220	-	MER110A	LTR	ERV1	-168	300	195	1
1267	1173	139	28	19	chr3	89497616	89497829	-70101954	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	158	1
1267	1090	130	11	38	chr3	89497907	89498091	-70101692	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-193	181	3	1
1267	616	348	42	107	chr3	89498107	89498159	-70101624	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	484	1
1267	616	348	42	107	chr3	89498180	89498681	-70101102	-	MT2A	LTR	ERVL	-50	483	16	1
1267	2804	93	18	8	chr3	89503143	89503531	-70096252	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	9
1267	286	296	31	94	chr3	89507528	89507655	-70092128	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	421	2
1267	2265	42	267	9	chr3	89509999	89510314	-70089469	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1267	2482	127	65	8	chr3	89510316	89510714	-70089069	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1267	816	103	17	0	chr3	89511271	89511388	-70088395	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	619	3
1267	2456	104	0	0	chr3	89511395	89511722	-70088061	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1267	467	86	14	0	chr3	89511733	89511803	-70087980	-	RMER19A	LTR	ERVK	-666	71	1	3
1267	296	326	0	32	chr3	89514989	89515084	-70084699	+	LTR55	LTR	ERV	35	126	-422	4
1267	268	246	164	40	chr3	89516026	89516178	-70083605	+	LTR55	LTR	ERV	339	509	-39	4
1267	663	218	14	34	chr3	89517335	89517482	-70082301	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	429	4
1267	269	296	8	80	chr3	89517550	89517675	-70082108	-	RMER15	LTR	ERVL	-416	159	44	4
1267	2422	142	40	2	chr3	89521027	89521428	-70078355	+	MTC	LTR	MaLR	6	421	0	5
1267	348	266	100	111	chr3	89521985	89522175	-70077608	-	MLT1K	LTR	MaLR	-13	582	395	5
1268	958	272	46	122	chr3	89522597	89523007	-70076776	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
1268	2393	92	0	21	chr3	89526737	89527070	-70072713	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	7
1268	2329	82	9	19	chr3	89529670	89529991	-70069792	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	8
1268	236	315	34	51	chr3	89531186	89531303	-70068480	-	MLT1D	LTR	MaLR	-158	347	233	9
1268	2461	91	38	59	chr3	89538104	89538477	-70061306	+	RLTR8	LTR	ERVK	1	365	0	1
1268	254	229	270	32	chr3	89542292	89542525	-70057258	-	MT2A	LTR	ERVL	0	554	255	1
1268	353	294	93	29	chr3	89542493	89542633	-70057150	-	MT2A	LTR	ERVL	-256	277	129	1
1268	342	316	50	31	chr3	89542610	89542770	-70057013	-	MTD	LTR	MaLR	-256	163	1	1
1268	2564	86	132	0	chr3	89548050	89548422	-70051361	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
1268	691	265	101	23	chr3	89562754	89563071	-70036712	+	MTEa	LTR	MaLR	18	379	0	1
1268	272	219	291	30	chr3	89569162	89569327	-70030456	+	MLT1K	LTR	MaLR	384	591	-4	1
1268	2335	189	301	31	chr3	89573148	89573891	-70025892	-	RMER21A	LTR	ERV1	-3	944	1	1
1268	2566	167	24	58	chr3	89590522	89590609	-70009174	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	446	1
1268	2566	167	24	58	chr3	89590666	89590734	-70009049	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-89	445	400	1
1268	2566	167	24	58	chr3	89590882	89591278	-70008505	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-135	399	1	1
1268	3135	44	180	2	chr3	89593947	89594381	-70005402	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	511	-1	1
1268	1969	118	13	91	chr3	89596771	89597030	-70002753	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	275	-119	1
1268	1879	104	128	9	chr3	89597030	89597351	-70002432	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	1
1268	1969	118	13	91	chr3	89597351	89597475	-70002308	+	ORR1B1	LTR	MaLR	276	394	0	1
1268	1536	193	112	22	chr3	89602004	89602203	-69997580	+	MTD	LTR	MaLR	6	225	-194	1
1268	1880	152	47	19	chr3	89602203	89602566	-69997217	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	373	-1	1
1268	1536	193	112	22	chr3	89602566	89602732	-69997051	+	MTD	LTR	MaLR	226	404	-15	1
1268	4990	97	84	16	chr3	89602978	89603825	-69995958	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	904	-54	2
1268	2803	127	35	14	chr3	89603821	89604310	-69995473	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	45	543	-359	2
1268	3753	90	12	19	chr3	89604283	89604849	-69994934	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	227	788	-18	2
1268	726	192	224	29	chr3	89611180	89611446	-69988337	-	MTD	LTR	MaLR	-78	318	1	2
1268	14315	143	86	67	chr3	89613184	89614871	-69984912	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2573	3564	2010	2
1268	14315	143	86	67	chr3	89615064	89616554	-69983229	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4128	2009	329	2
1268	609	271	95	81	chr3	89616732	89617005	-69982778	-	RMER13A	LTR	ERVK	-583	277	1	2
1268	2844	133	61	16	chr3	89619108	89619717	-69980066	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	690	2	2
1268	1510	171	66	39	chr3	89620792	89621156	-69978627	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
1268	229	200	82	16	chr3	89622586	89622647	-69977136	-	RLTR21	LTR	ERVK	-733	839	775	2
1268	265	264	62	62	chr3	89624625	89624722	-69975061	+	MLT1D	LTR	MaLR	137	233	-272	2
1268	560	273	114	32	chr3	89625657	89625903	-69973880	+	MLT1D	LTR	MaLR	240	505	0	2
1268	2097	193	22	17	chr3	89626373	89626790	-69972993	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1268	2940	117	24	16	chr3	89627488	89627940	-69971843	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	456	-5	2
1268	2637	146	44	42	chr3	89629919	89630440	-69969343	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-4	523	2	2
1268	765	145	0	31	chr3	89630442	89630570	-69969213	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-329	124	1	2
1268	1462	171	211	10	chr3	89632092	89632275	-69967508	+	ORR1C2	LTR	MaLR	9	234	-150	2
1268	1462	171	211	10	chr3	89632295	89632424	-69967359	+	ORR1C2	LTR	MaLR	235	383	-1	2
1268	408	247	11	0	chr3	89633133	89633222	-69966561	+	MT2A	LTR	ERVL	2	91	-442	2
1268	303	354	35	0	chr3	89633222	89633246	-69966537	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	118	-261	2
1268	855	247	89	5	chr3	89633247	89633471	-69966312	+	MT2A	LTR	ERVL	174	416	-117	2
1268	225	281	22	89	chr3	89650951	89651041	-69948742	+	MT2B2	LTR	ERVL	155	238	-346	3
1268	317	244	31	94	chr3	89652029	89652156	-69947627	+	MT2B	LTR	ERVL	160	278	-323	3
1269	4097	55	70	9	chr3	89666890	89667418	-69932365	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	3
1269	3983	161	74	22	chr3	89669413	89670214	-69929569	+	RLTR25B	LTR	ERVK	12	853	-175	3
1269	595	160	67	0	chr3	89670648	89670767	-69929016	+	RLTR25B	LTR	ERVK	977	1103	0	3
1269	1712	102	221	9	chr3	89676963	89677280	-69922503	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1269	1130	219	88	58	chr3	89677969	89678332	-69921451	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1269	262	293	44	96	chr3	89687623	89687640	-69912143	+	MT2B	LTR	ERVL	169	235	-366	4
1269	262	293	44	96	chr3	89687746	89687759	-69912024	+	MT2B	LTR	ERVL	236	297	-304	4
1269	3165	46	5	0	chr3	89696040	89696434	-69903349	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1269	1049	197	42	78	chr3	89696668	89696976	-69902807	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	297	-77	4
1269	1061	194	4	118	chr3	89698322	89698513	-69901270	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-124	250	90	4
1269	1061	194	4	118	chr3	89698600	89698687	-69901096	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-285	89	4	4
1269	4272	137	121	40	chr3	89719023	89719853	-69879930	-	RMER19B	LTR	ERVK	-5	897	1	4
1269	2241	88	6	0	chr3	89721858	89722175	-69877608	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	5
1269	4260	16	0	0	chr3	89723528	89724021	-69875762	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1269	469	186	40	96	chr3	89724399	89724524	-69875259	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	147	5
1269	1890	97	121	19	chr3	89724541	89724855	-69874928	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	5
1269	1810	206	80	82	chr3	89725775	89725962	-69873821	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	512	5
1269	1810	206	80	82	chr3	89726108	89726612	-69873171	-	RMER6C	LTR	ERVK	-179	511	1	5
1269	1062	231	250	2	chr3	89727104	89727252	-69872531	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	184	-315	5
1269	1062	231	250	2	chr3	89727284	89727535	-69872248	+	RLTR19	LTR	ERVK	185	499	0	5
1269	901	249	126	55	chr3	89728639	89728808	-69870975	+	MTEa	LTR	MaLR	4	179	-200	5
1269	901	249	126	55	chr3	89728948	89729058	-69870725	+	MTEa	LTR	MaLR	180	312	-67	5
1269	901	249	126	55	chr3	89729263	89729329	-69870454	+	MTEa	LTR	MaLR	313	374	-5	5
1269	2586	40	0	0	chr3	89731472	89731798	-69867985	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	32	357	0	5
1269	515	184	162	0	chr3	89733944	89734106	-69865677	+	MTD	LTR	MaLR	217	415	-6	5
1269	717	318	139	5	chr3	89734660	89735071	-69864712	+	MLT2B4	LTR	ERVL	20	485	-71	5
1269	605	188	7	66	chr3	89736158	89736295	-69863488	-	MT2A	LTR	ERVL	-401	132	4	5
1269	1150	127	63	0	chr3	89736815	89737004	-69862779	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	194	5
1269	1012	174	25	15	chr3	89736992	89737190	-69862593	+	MTC	LTR	MaLR	222	421	0	5
1269	1573	161	40	95	chr3	89737796	89738060	-69861723	+	ORR1C2	LTR	MaLR	2	252	-132	5
1269	2129	117	3	44	chr3	89738060	89738401	-69861382	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1269	1573	161	40	95	chr3	89738401	89738485	-69861298	+	ORR1C2	LTR	MaLR	253	331	-53	5
1269	1149	218	45	26	chr3	89741306	89741575	-69858208	-	MTD	LTR	MaLR	-145	274	1	5
1269	390	395	40	43	chr3	89774398	89774591	-69825192	+	LTR16A	LTR	ERVL	29	220	-231	6
1269	390	395	40	43	chr3	89774636	89774765	-69825018	+	LTR16A	LTR	ERVL	221	349	-102	6
1269	952	281	7	76	chr3	89775272	89775316	-69824467	-	MTE2b	LTR	MaLR	-58	321	292	6
1269	952	281	7	76	chr3	89775502	89775746	-69824037	-	MTE2b	LTR	MaLR	-88	291	53	6
1269	266	267	147	0	chr3	89775747	89775822	-69823961	-	MTE2b	LTR	MaLR	-292	87	2	6
1269	1189	211	189	29	chr3	89777153	89777456	-69822327	+	MT2A	LTR	ERVL	92	459	-74	6
1269	1127	211	189	29	chr3	89777699	89777772	-69822011	+	MT2A	LTR	ERVL	460	530	-3	6
1269	352	248	44	44	chr3	89777814	89777949	-69821834	-	MER52-int	LTR	ERV1	-5	7086	6952	6
1269	249	204	75	123	chr3	89778897	89779003	-69820780	-	RLTR26	LTR	ERVK	-225	417	317	6
1269	2871	172	52	12	chr3	89780290	89780885	-69818898	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	890	1508	-1	6
1269	441	169	493	0	chr3	89780886	89781114	-69818669	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	370	-14	6
1269	2560	131	6	99	chr3	89781380	89781501	-69818282	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	120	-310	6
1269	2560	131	6	99	chr3	89781785	89782136	-69817647	+	RLTR23	LTR	ERV1	121	429	-1	6
1269	421	322	91	4	chr3	89783217	89783448	-69816335	-	MER52-int	LTR	ERV1	-1193	5898	5648	6
158	3233	136	19	58	chr3	89784102	89784686	-69815097	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	6
1270	628	277	16	83	chr3	89784792	89784985	-69814798	-	MER52-int	LTR	ERV1	-3345	3746	3567	6
1270	227	214	17	35	chr3	89787784	89787842	-69811941	+	RLTR23	LTR	ERV1	332	388	-42	6
1270	1617	179	40	3	chr3	89792392	89792690	-69807093	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	6
1270	374	200	0	86	chr3	89794368	89794461	-69805322	-	MT2B	LTR	ERVL	-362	239	155	7
1270	569	221	274	36	chr3	89812435	89812727	-69787056	+	ORR1E	LTR	MaLR	10	370	0	7
1270	458	152	141	0	chr3	89825588	89825680	-69774103	+	MTD	LTR	MaLR	18	122	-299	7
1270	658	227	201	0	chr3	89826109	89826303	-69773480	+	MTD	LTR	MaLR	187	419	0	7
1270	579	81	168	8	chr3	89826682	89826807	-69772976	-	RMER17B	LTR	ERVK	-498	460	316	7
1270	1191	187	75	0	chr3	89828557	89828825	-69770958	-	RMER4B	LTR	ERVK	-249	336	49	8
1270	373	66	135	20	chr3	89859946	89860025	-69739758	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-282	112	6	8
1270	264	272	26	97	chr3	89872437	89872551	-69727232	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	152	9
1270	273	276	105	0	chr3	89900384	89900408	-69699375	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	180	211	-264	9
1270	670	284	18	0	chr3	89913921	89914035	-69685748	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	117	-257	1
1270	1283	118	48	14	chr3	89914035	89914242	-69685541	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	116	1
1270	1252	116	0	75	chr3	89914429	89914605	-69685178	-	RMER6C	LTR	ERVK	-382	308	144	1
1270	1252	116	0	75	chr3	89914781	89914818	-69684965	-	RMER6C	LTR	ERVK	-547	143	111	1
1270	1004	264	175	11	chr3	89914892	89915240	-69684543	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	1
1271	427	257	65	59	chr3	89919287	89919473	-69680310	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	244	1
1271	343	247	61	51	chr3	89920021	89920178	-69679605	-	MT2B	LTR	ERVL	-327	257	105	1
1271	386	232	0	118	chr3	89921070	89921197	-69678586	-	MT2B	LTR	ERVL	-336	265	154	1
1271	324	253	0	117	chr3	89922071	89922089	-69677694	+	MT2B	LTR	ERVL	150	155	-446	1
1271	389	169	0	0	chr3	89926083	89926148	-69673635	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-1038	65	1	1
1271	2280	91	28	0	chr3	89929113	89929433	-69670350	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1271	1009	256	144	19	chr3	89933564	89933883	-69665900	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	5	1
1271	256	71	95	0	chr3	89933882	89933924	-69665859	+	ORR1D1	LTR	MaLR	329	374	0	1
1271	1907	149	77	44	chr3	89935297	89935662	-69664121	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-1	377	1	1
1271	3862	56	70	6	chr3	89937752	89938240	-69661543	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	1
1271	845	209	104	112	chr3	89939459	89939728	-69660055	+	MTD	LTR	MaLR	153	419	0	1
1271	1283	208	126	51	chr3	89942608	89942998	-69656785	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1271	2314	125	65	8	chr3	89944975	89945347	-69654436	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	1
1271	1494	210	138	3	chr3	89945465	89945819	-69653964	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	1
1271	2101	170	22	15	chr3	89947142	89947548	-69652235	+	MTC	LTR	MaLR	5	413	-8	1
1271	248	218	51	90	chr3	89949999	89950155	-69649628	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-58	395	246	1
1271	260	275	0	0	chr3	89950361	89950430	-69649353	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-458	69	1	1
1271	230	296	103	27	chr3	89950432	89950578	-69649205	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	411	1
1271	551	280	76	63	chr3	89950910	89951338	-69648445	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	7141	1
1271	356	301	31	31	chr3	89953411	89953538	-69646245	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2023	5578	5492	1
1271	1370	328	37	24	chr3	89953688	89954179	-69645604	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1037	4026	3530	1
1271	324	200	25	8	chr3	89954538	89954659	-69645124	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	632	1
1271	1836	139	65	0	chr3	89956873	89957197	-69642586	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	69	1
1271	379	184	40	0	chr3	89957558	89957634	-69642149	-	MTC	LTR	MaLR	-340	81	3	1
1271	324	264	164	27	chr3	89959886	89960099	-69639684	+	MTE2a	LTR	MaLR	143	378	-1	1
1271	533	237	29	15	chr3	89964057	89964194	-69635589	-	RMER20A	LTR	ERVK	-66	450	312	1
1271	1057	214	74	30	chr3	89964377	89964676	-69635107	-	RMER20A	LTR	ERVK	-204	312	1	1
1271	471	127	0	12	chr3	89965042	89965122	-69634661	-	MTC	LTR	MaLR	-339	82	4	1
1271	311	222	14	0	chr3	89965338	89965410	-69634373	+	MTEa	LTR	MaLR	18	90	-289	1
1271	830	172	65	11	chr3	89965465	89965650	-69634133	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-107	252	49	1
1271	850	125	0	65	chr3	89966814	89966968	-69632815	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	613	1
1271	990	70	245	31	chr3	89966964	89967156	-69632627	-	RMER6A	LTR	ERVK	-523	233	1	1
1271	2151	137	20	67	chr3	89968494	89968900	-69630883	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-7	387	1	1
1271	2499	131	56	0	chr3	89970261	89970634	-69629149	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1271	361	149	15	0	chr3	89972454	89972521	-69627262	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-385	68	1	1
1271	1421	165	267	31	chr3	89975046	89975461	-69624322	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	16	1
1271	1949	164	17	17	chr3	89975472	89975826	-69623957	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-38	356	3	1
1271	3328	31	23	0	chr3	89981258	89981642	-69618141	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-3	393	1	1
1271	2395	143	57	10	chr3	89991952	89992354	-69607429	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1271	1631	169	91	29	chr3	89999190	89999651	-69600132	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	463	-3	1
1271	496	223	43	0	chr3	90000403	90000497	-69599286	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	98	-426	4
1271	2209	122	61	81	chr3	90000514	90000958	-69598825	+	RLTR28	LTR	ERVL	78	512	-12	4
1271	2558	139	45	41	chr3	90004757	90005221	-69594562	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	2
1271	256	212	59	59	chr3	90014491	90014576	-69585207	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	425	6
1271	313	269	0	63	chr3	90019224	90019335	-69580448	+	MT2B	LTR	ERVL	154	257	-344	7
1271	325	272	174	72	chr3	90020851	90021212	-69578571	+	RMER10A	LTR	ERVL	18	415	-27	8
1271	558	260	196	31	chr3	90021290	90021549	-69578234	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	72	8
1271	354	248	143	27	chr3	90021868	90021980	-69577803	-	MTD	LTR	MaLR	-294	125	1	9
1271	1847	134	98	39	chr3	90022524	90022723	-69577060	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	224	-186	9
1271	1847	134	98	39	chr3	90022790	90022977	-69576806	+	RMER17C	LTR	ERVK	225	409	-1	9
1271	941	239	90	8	chr3	90023051	90023296	-69576487	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	265	-114	9
1271	1844	206	16	21	chr3	90031723	90031760	-69568023	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	342	1
1271	2341	134	239	11	chr3	90031760	90032236	-69567547	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	1
1271	1844	206	16	21	chr3	90032236	90032574	-69567209	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-33	341	1	1
1272	1336	142	101	5	chr3	90050654	90050873	-69548910	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4289	4528	-1233	1
1272	248	197	106	0	chr3	90073440	90073506	-69526277	+	LTR89	LTR	ERVL?	4	76	-803	2
1272	1767	116	207	111	chr3	90089819	90090062	-69509721	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	226	2
1272	1767	116	207	111	chr3	90090251	90090383	-69509400	-	RMER4A	LTR	ERVK	-241	225	111	2
1272	1767	116	207	111	chr3	90090571	90090619	-69509164	-	RMER4A	LTR	ERVK	-356	110	1	2
1272	693	206	20	7	chr3	90090620	90090767	-69509016	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2	5258	5110	2
1272	3997	181	83	41	chr3	90090736	90091529	-69508254	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-3135	2125	1273	2
1272	3997	181	83	41	chr3	90091679	90091858	-69507925	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-3988	1272	1113	2
1272	1623	138	22	0	chr3	90091851	90092119	-69507664	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	754	1027	-4233	2
1272	1107	134	121	4	chr3	90092123	90092355	-69507428	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-4663	597	339	2
1272	1087	157	71	5	chr3	90093492	90093690	-69506093	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-4943	317	107	2
1272	1917	154	0	59	chr3	90093948	90094287	-69505496	-	RMER4A	LTR	ERVK	-147	319	1	2
1272	434	200	43	95	chr3	90095510	90095626	-69504157	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	155	2
1272	262	331	41	102	chr3	90106461	90106474	-69493309	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	182	3
1272	262	331	41	102	chr3	90106761	90106875	-69492908	-	MT2B	LTR	ERVL	-420	181	29	3
1272	307	208	62	106	chr3	90117984	90118097	-69481686	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	156	3
1272	226	313	31	94	chr3	90122665	90122792	-69476991	-	MT2B	LTR	ERVL	-336	265	147	4
1272	384	259	165	15	chr3	90129031	90129164	-69470619	+	MTD	LTR	MaLR	252	404	-15	4
1272	2074	142	32	16	chr3	90133566	90133938	-69465845	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1272	2268	111	91	3	chr3	90142067	90142429	-69457354	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1272	387	308	101	20	chr3	90143594	90143793	-69455990	-	MLT1L	LTR	MaLR	-32	578	364	4
1272	618	284	19	13	chr3	90156595	90156752	-69443031	-	MTE2b	LTR	MaLR	-55	324	167	5
1272	253	244	32	137	chr3	90157795	90157890	-69441893	+	MT2B	LTR	ERVL	155	239	-362	5
1272	2517	40	65	0	chr3	90167595	90167920	-69431863	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	5
1272	1288	178	17	45	chr3	90176560	90176848	-69422935	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-94	280	1	5
1273	859	189	36	129	chr3	90182987	90183267	-69416516	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	254	-125	5
1273	1097	198	95	10	chr3	90211058	90211399	-69388384	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	6
1273	227	313	136	39	chr3	90227348	90227436	-69372347	+	RMER6A	LTR	ERVK	34	131	-625	6
1273	305	284	8	76	chr3	90227371	90227383	-69372400	+	MT2B	LTR	ERVL	154	157	-444	6
1273	375	255	0	117	chr3	90228753	90228873	-69370910	+	MT2B	LTR	ERVL	152	257	-344	6
1273	233	256	77	116	chr3	90235330	90235511	-69364272	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-527	576	403	7
1273	458	190	27	164	chr3	90241516	90241699	-69358084	+	MT2B	LTR	ERVL	107	264	-337	7
1273	4022	130	24	74	chr3	90242165	90242912	-69356871	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	47	7
1273	625	138	0	21	chr3	90243477	90243573	-69356210	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-275	99	6	7
1273	264	210	93	58	chr3	90243704	90243790	-69355993	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-527	576	488	7
1273	1683	178	90	22	chr3	90244597	90244954	-69354829	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-3	381	1	7
1273	249	290	36	108	chr3	90245202	90245341	-69354442	+	MT2B	LTR	ERVL	129	257	-344	7
1273	1960	168	29	47	chr3	90247799	90248181	-69351602	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	4	7
1273	283	287	115	62	chr3	90256530	90256660	-69343123	-	MT2B2	LTR	ERVL	-338	246	110	8
1273	381	230	8	137	chr3	90278235	90278366	-69321417	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	151	8
1273	346	238	0	36	chr3	90282130	90282213	-69317570	-	MT2B	LTR	ERVL	-355	246	167	8
1273	478	214	194	23	chr3	90288674	90288803	-69310980	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-12	566	416	9
1273	467	216	10	10	chr3	90288779	90288877	-69310906	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-277	291	194	9
1273	309	125	209	45	chr3	90288912	90288979	-69310804	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-456	78	1	9
1273	295	266	42	11	chr3	90292088	90292183	-69307600	+	MTEb	LTR	MaLR	110	207	-172	9
1273	282	299	64	64	chr3	90293581	90293599	-69306184	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-489	539	496	9
1273	282	299	64	64	chr3	90293676	90293706	-69306077	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-489	495	415	9
1273	352	271	134	38	chr3	90298133	90298290	-69301493	-	LTR41	LTR	ERVL	-120	648	477	9
1273	449	255	146	57	chr3	90298352	90298564	-69301219	-	LTR41	LTR	ERVL	-515	253	23	9
1274	513	223	8	59	chr3	90313920	90314039	-69285744	-	MT2A	LTR	ERVL	-361	172	60	9
1274	350	270	62	104	chr3	90315880	90315985	-69283798	+	MT2B	LTR	ERVL	183	384	-217	9
1274	458	263	114	0	chr3	90324172	90324286	-69275497	+	MER21B	LTR	ERV1	689	815	-48	1
1274	448	226	92	35	chr3	90324491	90324633	-69275150	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	385	1
1274	548	230	151	46	chr3	90325024	90325243	-69274540	-	RMER5	LTR	ERV1	-138	396	155	1
1274	2524	83	3	12	chr3	90325886	90326216	-69273567	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1274	770	251	88	105	chr3	90333307	90333726	-69266057	-	RMER10A	LTR	ERVL	-19	423	12	1
1274	808	246	86	125	chr3	90333729	90334335	-69265448	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-76	3162	2627	1
1274	291	182	9	170	chr3	90334534	90334640	-69265143	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	152	1
1274	312	165	10	115	chr3	90334669	90334765	-69265018	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2628	3509	3424	1
1274	285	239	11	43	chr3	90335567	90335659	-69264124	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2859	3278	3190	1
1274	629	213	53	106	chr3	90335880	90336106	-69263677	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3063	3074	2861	1
1274	1056	201	73	158	chr3	90336285	90336709	-69263074	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3440	2697	2065	1
1274	656	160	0	44	chr3	90336870	90337007	-69262776	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3462	2060	1930	1
1274	418	176	27	73	chr3	90337000	90337110	-69262673	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3548	1974	1870	1
1274	255	303	0	0	chr3	90337562	90337628	-69262155	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3658	1864	1799	1
1274	562	245	110	88	chr3	90337678	90337906	-69261877	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-3730	1792	1560	1
1274	440	55	0	0	chr3	90337926	90337981	-69261802	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	326	272	1
1274	1850	118	10	41	chr3	90338184	90338475	-69261308	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-46	283	2	1
1274	579	288	52	113	chr3	90340109	90340551	-69259232	-	RMER10A	LTR	ERVL	-8	434	20	1
1274	2821	170	55	32	chr3	90352784	90353313	-69246470	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	541	0	1
1274	1748	194	107	5	chr3	90355272	90355645	-69244138	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	1
1274	1272	165	198	26	chr3	90355686	90355880	-69243903	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	198	1
1274	1272	165	198	26	chr3	90356050	90356061	-69243722	-	RMER17C	LTR	ERVK	-213	197	172	1
1274	1272	165	198	26	chr3	90356104	90356245	-69243538	-	RMER17C	LTR	ERVK	-239	171	4	1
1274	235	192	36	131	chr3	90356895	90356979	-69242804	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	165	1
1274	567	183	43	0	chr3	90357079	90357194	-69242589	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	120	-258	1
1274	521	148	0	0	chr3	90357247	90357328	-69242455	+	ORR1C1	LTR	MaLR	242	322	-56	1
1274	375	109	0	0	chr3	90357572	90357627	-69242156	+	ORR1C1	LTR	MaLR	324	378	0	1
1274	4420	199	87	5	chr3	90358211	90359187	-69240596	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	8	1063	-446	1
1274	378	243	215	0	chr3	90361282	90361426	-69238357	+	MER70A	LTR	ERVL	296	470	-2	1
1274	1347	172	70	4	chr3	90361692	90361949	-69237834	+	RLTR14	LTR	ERV1	11	284	-98	1
1274	487	125	25	12	chr3	90362117	90362198	-69237585	+	RLTR14	LTR	ERV1	246	327	-55	1
1274	2973	184	92	64	chr3	90362196	90362856	-69236927	-	RMER19B	LTR	ERVK	-219	683	5	1
1274	227	341	23	54	chr3	90365600	90365730	-69234053	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	162	1
1274	2246	159	5	14	chr3	90369548	90369918	-69229865	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	1
1274	431	287	0	0	chr3	90372771	90372872	-69226911	+	MLT1K	LTR	MaLR	152	252	-343	1
1274	1982	56	127	20	chr3	90375596	90375888	-69223895	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-4	323	1	1
1274	667	324	75	25	chr3	90376400	90376682	-69223101	-	ORR1E	LTR	MaLR	-12	347	52	1
1274	4499	149	88	77	chr3	90376769	90377643	-69222140	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	884	-18	1
1274	575	319	67	64	chr3	90382141	90382499	-69217284	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	1
1274	850	245	33	29	chr3	90382505	90382715	-69217068	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	24	234	-1346	1
1274	3917	290	56	39	chr3	90382885	90384107	-69215676	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	223	1465	-115	1
1274	4619	98	11	199	chr3	90384149	90385002	-69214781	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	248	1
1274	4619	98	11	199	chr3	90385059	90385321	-69214462	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-659	247	1	1
1274	250	250	0	118	chr3	90385718	90385786	-69213997	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1448	1507	-73	1
1274	969	264	70	81	chr3	90385805	90386164	-69213619	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	355	-4	1
1274	257	130	295	48	chr3	90386392	90386497	-69213286	+	RMER15	LTR	ERVL	2	132	-443	1
1274	438	292	58	14	chr3	90386524	90386663	-69213120	+	RMER15	LTR	ERVL	275	419	-156	1
1274	2328	83	211	0	chr3	90391881	90392217	-69207566	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
1274	448	366	25	25	chr3	90396512	90396750	-69203033	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-1051	336	99	1
1274	462	294	114	22	chr3	90396975	90397190	-69202593	-	MLT1F	LTR	MaLR	-2	678	357	1
1274	2823	139	7	7	chr3	90397200	90397621	-69202162	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1274	288	304	33	74	chr3	90398368	90398489	-69201294	+	MLT1G3	LTR	MaLR	180	295	-300	1
1274	379	248	8	117	chr3	90401442	90401570	-69198213	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	150	1
1274	604	300	112	9	chr3	90421830	90422062	-69177721	-	MER21B	LTR	ERV1	-318	545	290	1
1274	607	261	179	5	chr3	90422245	90422374	-69177409	-	MER21B	LTR	ERV1	-605	258	96	1
1274	1879	149	24	42	chr3	90422378	90422715	-69177068	-	MTC	LTR	MaLR	-9	412	82	1
1274	332	356	97	35	chr3	90424028	90424287	-69175496	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	79	1
1274	1059	130	37	32	chr3	90426293	90426483	-69173300	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-215	192	2	1
1274	654	294	112	35	chr3	90431447	90431732	-69168051	-	RMER5	LTR	ERV1	-202	332	26	1
1274	238	262	16	32	chr3	90435175	90435238	-69164545	+	MLT1K	LTR	MaLR	191	252	-343	1
1274	483	216	160	51	chr3	90435686	90435842	-69163941	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	236	1
1275	287	316	98	68	chr3	90441680	90441843	-69157940	-	MLT1L	LTR	MaLR	-266	344	177	1
1275	2221	101	29	50	chr3	90446757	90447133	-69152650	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	1
1275	242	114	0	0	chr3	90450022	90450057	-69149726	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-339	35	1	1
1275	420	230	44	83	chr3	90461962	90462142	-69137641	+	MT2B	LTR	ERVL	85	257	-344	1
1275	2064	182	69	0	chr3	90466085	90466474	-69133309	+	MTD	LTR	MaLR	3	418	-1	1
1275	955	306	72	44	chr3	90471144	90471170	-69128613	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	353	1
1275	955	306	72	44	chr3	90471408	90471740	-69128043	-	MTEa	LTR	MaLR	-27	352	1	1
1275	1948	211	25	7	chr3	90475917	90476323	-69123460	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	2	1
1275	3861	226	93	73	chr3	90476324	90476905	-69122878	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	686	1
1275	3861	226	93	73	chr3	90477312	90477945	-69121838	-	MTD-int	LTR	MaLR	-573	685	20	1
1275	2109	192	29	10	chr3	90477950	90478361	-69121422	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1275	989	302	36	59	chr3	90478799	90479437	-69120346	+	RLTR18B	LTR	ERVK	13	614	-2	1
1275	928	303	54	18	chr3	90484748	90485081	-69114702	+	MER70-int	LTR	ERVL	4640	4984	-39	1
1275	462	290	182	30	chr3	90485106	90485369	-69114414	+	MER70B	LTR	ERVL	165	467	-111	1
1275	3638	29	60	4	chr3	90488620	90489070	-69110713	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1275	385	314	80	33	chr3	90492918	90493298	-69106485	-	MT2A	LTR	ERVL	-72	461	78	1
1275	2273	245	93	85	chr3	90510111	90511205	-69088578	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	1	1
1275	290	340	49	64	chr3	90533956	90534220	-69065563	+	LTR16E2	LTR	ERVL	276	535	-33	3
1275	909	277	108	21	chr3	90535516	90535848	-69063935	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	15	4
1275	304	164	16	0	chr3	90537895	90537956	-69061827	-	RMER15	LTR	ERVL	-109	466	405	4
1275	263	102	20	39	chr3	90538902	90538953	-69060830	-	RMER15	LTR	ERVL	-446	129	80	4
1275	3349	48	2	2	chr3	90546441	90546837	-69052946	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1275	1900	181	9	0	chr3	90547723	90548049	-69051734	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1275	1578	156	56	8	chr3	90556300	90556648	-69043135	-	RMER19A	LTR	ERVK	-19	718	313	7
1275	767	216	149	14	chr3	90561393	90561515	-69038268	-	RMER10B	LTR	ERVL	-22	376	195	7
1275	767	152	165	35	chr3	90561586	90561730	-69038053	-	RMER10B	LTR	ERVL	-204	194	23	7
1276	603	252	0	30	chr3	90577890	90578021	-69021762	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	734	8
1276	1796	148	107	70	chr3	90597180	90597638	-69002145	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	9
1276	274	200	0	0	chr3	90608391	90608451	-68991332	+	MER66-int	LTR	ERV1	6418	6477	-199	9
1276	282	309	78	78	chr3	90623338	90623542	-68976241	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-10	1018	815	1
1276	3274	43	2	12	chr3	90625812	90626212	-68973571	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1276	5153	68	24	6	chr3	90626212	90626937	-68972846	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	400	1
1276	2897	118	56	15	chr3	90626921	90627385	-68972398	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-20	483	1	1
1276	4745	121	39	28	chr3	90627385	90628316	-68971467	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-67	3631	2579	1
1276	594	291	31	27	chr3	90628583	90628844	-68970939	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-3215	4563	4100	1
1276	4275	138	40	26	chr3	90628847	90629751	-68970032	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2409	2654	1615	1
1276	641	86	63	209	chr3	90629725	90629916	-68969867	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2177	1122	960	1
1276	586	55	0	0	chr3	90630003	90630076	-68969707	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-2245	1453	1381	1
1276	1093	236	132	34	chr3	90630079	90630632	-68969151	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-6948	608	2	1
1276	2833	128	42	29	chr3	90630650	90631131	-68968652	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-16	487	1	1
1276	2827	77	31	0	chr3	90631131	90631522	-68968261	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-695	403	1	1
1276	3327	38	2	10	chr3	90631522	90631921	-68967862	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1276	2941	186	8	9	chr3	90643416	90643944	-68955839	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	432	1
1276	2120	124	6	18	chr3	90644004	90644310	-68955473	-	RMER17B	LTR	ERVK	-651	307	1	1
1276	3575	175	60	22	chr3	90644991	90645815	-68953968	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	1
1276	290	284	232	0	chr3	90648175	90648270	-68951513	+	MT2A	LTR	ERVL	171	287	-246	1
1276	538	276	0	30	chr3	90648285	90648416	-68951367	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	734	1
1276	1246	237	107	21	chr3	90661154	90661225	-68938558	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	348	1
1276	1710	178	269	30	chr3	90661225	90661782	-68938001	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	1
1276	1246	237	107	21	chr3	90661782	90662094	-68937689	-	MTC	LTR	MaLR	-74	347	3	1
1276	1665	230	25	14	chr3	90662934	90663287	-68936496	-	MTD	LTR	MaLR	-58	361	5	1
1276	3104	185	82	15	chr3	90677351	90677950	-68921833	-	RLTR26	LTR	ERVK	-3	639	1	1
1276	1245	216	32	19	chr3	90678676	90678992	-68920791	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	320	0	1
1276	2499	195	81	37	chr3	90679982	90680780	-68919003	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	1
1276	1435	209	64	0	chr3	90689175	90689458	-68910325	+	RLTR26	LTR	ERVK	342	642	0	1
1277	1881	126	103	65	chr3	90735842	90736300	-68863483	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
1277	278	245	21	11	chr3	90749299	90749394	-68850389	+	MER66-int	LTR	ERV1	6382	6477	-199	2
1277	5688	88	17	38	chr3	90765593	90766480	-68833303	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	111	2
1277	3900	97	29	26	chr3	90779378	90779963	-68819820	+	RLTR1D	LTR	ERV1	3	589	-16	2
1277	1694	135	82	14	chr3	90781131	90781499	-68818284	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	393	1	2
1277	532	84	0	0	chr3	90781500	90781571	-68818212	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5	7401	7331	2
1277	16420	115	9	10	chr3	90781784	90784223	-68815560	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1183	6223	1660	2
1277	371	312	50	50	chr3	90793904	90794083	-68805700	+	RMER13B	LTR	ERVK	5	183	-725	2
1277	504	219	41	94	chr3	90794088	90794259	-68805524	+	RLTR26	LTR	ERVK	269	430	-212	2
1277	3119	27	0	0	chr3	90795129	90795466	-68804317	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
1277	7928	31	2	6	chr3	90795472	90796388	-68803395	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6	6475	5563	2
1277	34213	23	31	10	chr3	90796381	90800347	-68799436	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2422	4059	8	2
1277	3119	27	0	0	chr3	90800347	90800684	-68799099	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
1277	7418	44	0	4	chr3	90803921	90804746	-68795037	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	2
1277	5147	132	20	10	chr3	90808755	90809697	-68790086	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	958	8	2
1277	904	270	98	53	chr3	90830534	90830890	-68768893	-	RMER13A	LTR	ERVK	-394	466	95	2
1278	249	220	34	0	chr3	90833198	90833257	-68766526	+	MTEa	LTR	MaLR	4	64	-315	2
1278	241	247	148	0	chr3	90833257	90833279	-68766504	+	MT2A	LTR	ERVL	4	96	-437	2
1278	432	355	71	0	chr3	90833283	90833480	-68766303	+	MTEa	LTR	MaLR	127	337	-42	2
1278	5384	125	24	48	chr3	90833796	90834720	-68765063	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	2
1278	867	75	0	8	chr3	90835048	90835169	-68764614	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	207	2
1278	2044	161	32	19	chr3	90836413	90836786	-68762997	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	2
1278	622	288	144	107	chr3	90841749	90842400	-68757383	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	681	-227	2
1278	552	226	0	0	chr3	90843129	90843231	-68756552	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-276	102	1	2
1278	2082	118	3	60	chr3	90843797	90844131	-68755652	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	13	2
1278	231	368	0	59	chr3	90847163	90847264	-68752519	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	508	3
1278	651	331	94	65	chr3	90847261	90847771	-68752012	-	RMER20B	LTR	ERVK	-44	583	1	3
1278	866	271	19	84	chr3	90849604	90849866	-68749917	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-133	245	1	3
1278	1391	192	35	3	chr3	90849867	90850155	-68749628	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1	1508	1212	3
1278	971	262	212	41	chr3	90850161	90850647	-68749136	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	585	0	3
1278	2025	273	61	46	chr3	90850647	90851290	-68748493	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-281	1089	437	3
1278	243	307	62	123	chr3	90851115	90851375	-68748408	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-597	506	263	3
1278	233	309	14	29	chr3	90858654	90858724	-68741059	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1741	1809	-39	3
1278	777	236	119	15	chr3	90858725	90858927	-68740856	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-155	223	1	3
1278	819	174	25	0	chr3	90862418	90862579	-68737204	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	168	3
1278	750	274	46	8	chr3	90863373	90863612	-68736171	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2150	4400	4153	3
1278	638	187	12	0	chr3	90867355	90867504	-68732279	+	ORR1A2	LTR	MaLR	219	374	-4	3
1278	2104	328	58	78	chr3	90867509	90868084	-68731699	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4198	2352	1828	3
1278	2153	328	58	78	chr3	90868220	90869800	-68729983	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6880	2079	240	3
1278	235	329	0	48	chr3	90882648	90882731	-68717052	-	LTR33	LTR	ERVL	-206	309	231	3
1278	1551	219	239	31	chr3	90888165	90888584	-68711199	-	RLTR19C	LTR	ERVK	0	506	1	3
1278	3951	225	40	30	chr3	90888589	90889561	-68710222	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6734	7715	-1244	3
1278	1575	201	17	61	chr3	90891387	90891731	-68708052	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	3
1278	412	174	11	23	chr3	90891731	90891819	-68707964	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	87	-1876	3
1278	1602	206	25	25	chr3	90895054	90895418	-68704365	-	RLTR19C	LTR	ERVK	0	506	143	3
1278	3502	243	75	13	chr3	90895465	90896122	-68703661	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6734	7410	-1549	3
1278	3502	243	75	13	chr3	90896153	90896420	-68703363	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7411	7714	-1245	3
1278	602	333	0	11	chr3	90897902	90898084	-68701699	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	277	3
1278	747	305	151	38	chr3	90898206	90898704	-68701079	+	RMER12	LTR	ERVK	769	1322	0	3
1278	363	283	28	0	chr3	90898704	90898810	-68700973	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	59	3
1278	1406	247	11	8	chr3	90910058	90910413	-68689370	+	RLTR15	LTR	ERVK	4	359	0	3
1278	577	261	36	42	chr3	90910791	90910983	-68688800	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	189	3
1278	712	206	45	11	chr3	90910984	90911161	-68688622	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4663	4296	4114	3
1278	2056	215	20	11	chr3	90911162	90911872	-68687911	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1001	1960	-3	3
1278	1159	198	0	160	chr3	90911870	90912183	-68687600	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	263	-66	3
1278	466	344	113	16	chr3	90914693	90914950	-68684833	-	MTE2b	LTR	MaLR	-71	308	27	3
1278	308	305	0	0	chr3	90920206	90920288	-68679495	+	MTE2b	LTR	MaLR	15	96	-283	3
1278	275	290	21	11	chr3	90920289	90920383	-68679400	-	RLTR15	LTR	ERVK	-264	95	1	3
1278	407	255	21	0	chr3	90920463	90920557	-68679226	+	MT2A	LTR	ERVL	57	152	-381	3
1278	659	264	123	82	chr3	90920570	90920888	-68678895	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	992	3
1278	2655	191	122	26	chr3	90921027	90921725	-68678058	-	RMER12	LTR	ERVK	-554	768	4	3
1278	1324	268	7	3	chr3	90921726	90922022	-68677761	+	MT2A	LTR	ERVL	160	456	-77	3
1278	225	183	46	77	chr3	90941644	90941709	-68658074	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	3
1278	5833	94	14	98	chr3	90947212	90948187	-68651596	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	3
1278	1685	220	0	32	chr3	90954301	90954676	-68645107	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7108	7470	-1489	3
1278	661	189	7	7	chr3	90954718	90954862	-68644921	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7569	7712	-1247	3
1278	1550	187	18	62	chr3	90956934	90957270	-68642513	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	4
1278	2693	234	65	13	chr3	90957274	90958041	-68641742	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	807	-1156	4
1278	773	323	47	13	chr3	90958057	90958355	-68641428	+	ORR1A4	LTR	MaLR	63	370	0	4
1278	1804	171	16	0	chr3	90958779	90959083	-68640700	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	4
1278	292	143	0	0	chr3	90959125	90959167	-68640616	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	226	267	-7314	4
1278	649	236	62	41	chr3	90959199	90959393	-68640390	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	655	852	-1135	4
1278	7596	302	33	46	chr3	90959767	90962531	-68637252	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1170	3880	-3701	4
1278	6417	59	34	2	chr3	90962531	90963360	-68636423	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	4
159	7596	302	33	46	chr3	90963360	90964960	-68634823	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3881	5478	-2103	4
1279	294	338	18	18	chr3	90964970	90965133	-68634650	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6907	7069	-512	4
1279	1453	153	27	27	chr3	90965267	90965528	-68634255	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7321	7581	0	4
1279	1867	162	20	0	chr3	90965528	90965831	-68633952	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	4
1279	575	311	29	10	chr3	90966663	90966871	-68632912	-	MT2A	LTR	ERVL	-45	488	277	4
1279	854	279	49	59	chr3	90967078	90967402	-68632381	+	RMER12	LTR	ERVK	1002	1322	0	4
1279	407	265	25	8	chr3	90967402	90967520	-68632263	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	48	4
1279	1404	227	16	28	chr3	90967587	90967950	-68631833	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	4
1279	553	306	29	42	chr3	90968328	90968352	-68631431	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	357	4
1279	594	336	33	30	chr3	90968594	90968864	-68630919	-	MTE2a	LTR	MaLR	-23	356	86	4
1279	4837	240	38	29	chr3	90984514	90985955	-68613828	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4344	4615	3162	4
1279	986	319	73	48	chr3	90989502	90990061	-68609722	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4997	1553	996	4
1279	1081	319	63	20	chr3	90990089	90990800	-68608983	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7687	1272	258	4
1279	1778	65	53	15	chr3	90990811	90991077	-68608706	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-51	276	1	4
1279	1228	222	20	72	chr3	90997677	90998022	-68601761	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	327	-2	4
1279	2828	215	41	28	chr3	90998032	90998741	-68601042	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	19	736	-1227	4
1279	580	208	191	62	chr3	90998822	90999063	-68600720	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	4
1279	1719	220	15	30	chr3	90999099	90999592	-68600191	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-202	7042	6529	4
1279	449	336	64	21	chr3	90999720	91000000	-68599783	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1335	5207	4916	4
1279	1431	332	56	43	chr3	91000034	91001631	-68598152	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1657	4885	3268	1
1279	745	284	63	49	chr3	91001692	91002118	-68597665	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-3870	2672	2241	1
1279	421	191	60	52	chr3	91002396	91002512	-68597271	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1553	434	318	2
1279	608	224	183	54	chr3	91002528	91002769	-68597014	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	2
1279	1715	219	15	32	chr3	91002805	91003299	-68596484	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-202	7042	6529	2
1279	1406	221	15	68	chr3	91004947	91005286	-68594497	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	3
1279	2832	229	54	14	chr3	91005290	91006066	-68593717	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	807	-1156	3
1279	774	354	36	20	chr3	91006082	91006385	-68593398	+	ORR1A4	LTR	MaLR	63	370	0	3
1279	3742	184	70	24	chr3	91007724	91008575	-68591208	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-48	854	1	7
1279	453	328	63	16	chr3	91008980	91009169	-68590614	+	RMER12	LTR	ERVK	1040	1237	-85	9
1279	400	292	28	0	chr3	91009249	91009355	-68590428	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	59	1
1279	895	251	25	0	chr3	91009436	91009675	-68590108	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	245	-114	1
1279	485	222	19	0	chr3	91009810	91009866	-68589917	+	RLTR15	LTR	ERVK	250	305	-54	1
1279	485	222	19	0	chr3	91009886	91009937	-68589846	+	RLTR15	LTR	ERVK	306	358	-1	1
1279	753	318	34	31	chr3	91010308	91010600	-68589183	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	83	1
1279	2388	216	64	66	chr3	91011618	91011662	-68588121	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2445	6514	6449	1
1279	2388	216	64	66	chr3	91011737	91012473	-68587310	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2511	6448	5734	1
1279	2402	135	24	29	chr3	91012474	91012887	-68586896	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-4	411	1	2
1279	435	119	26	12	chr3	91012889	91012972	-68586811	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4	7402	7331	2
1279	5819	151	14	41	chr3	91013170	91015097	-68584686	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	3441	2
1279	5341	135	36	12	chr3	91015430	91016368	-68583415	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3950	3456	2496	2
1279	517	156	36	9	chr3	91016383	91016493	-68583290	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5308	2098	1986	2
1279	2583	68	0	0	chr3	91016859	91017185	-68582598	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	326	0	2
1279	11380	53	35	0	chr3	91017185	91018607	-68581176	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	1	1472	-5349	2
1279	12788	34	1	7	chr3	91018605	91020113	-68579670	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	5304	6801	-20	2
1279	2634	43	12	15	chr3	91020113	91020440	-68579343	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	326	0	2
1279	350	299	77	103	chr3	91022625	91022897	-68576886	-	RMER20B	LTR	ERVK	-265	362	98	3
1279	308	255	89	34	chr3	91022915	91023061	-68576722	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	275	3
1279	651	298	124	25	chr3	91023100	91023423	-68576360	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	450	804	-1044	3
1279	4959	240	31	26	chr3	91027366	91028800	-68570983	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4370	4589	3148	4
1279	1666	230	239	19	chr3	91032764	91033179	-68566604	-	RLTR19C	LTR	ERVK	0	506	1	4
1279	3138	224	48	27	chr3	91033184	91033967	-68565816	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6748	7547	-1412	4
1279	497	171	19	0	chr3	91034295	91034400	-68565383	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7609	7715	-1244	4
1279	558	326	22	33	chr3	91035918	91036099	-68563684	-	MT2A	LTR	ERVL	-78	455	277	5
1279	355	254	34	82	chr3	91036232	91036378	-68563405	+	RMER12	LTR	ERVK	770	908	-414	5
1279	2202	241	47	27	chr3	91042693	91043289	-68556494	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7108	7715	-1244	5
1279	1103	244	26	62	chr3	91046946	91047287	-68552496	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1279	2946	222	42	18	chr3	91047287	91047998	-68551785	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	730	-1233	6
1279	710	323	57	30	chr3	91048091	91048391	-68551392	+	ORR1A4	LTR	MaLR	63	370	0	6
1279	538	274	73	28	chr3	91049469	91049511	-68550272	-	MT2A	LTR	ERVL	-11	522	481	6
1279	538	274	73	28	chr3	91049534	91049709	-68550074	-	MT2A	LTR	ERVL	-53	480	296	6
1279	6194	128	41	27	chr3	91049995	91050717	-68549066	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	623	1330	-398	6
1279	6194	128	41	27	chr3	91050768	91051133	-68548650	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	1331	1726	-2	6
1279	3923	153	16	37	chr3	91051135	91051900	-68547883	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	749	-2	6
1279	658	285	72	69	chr3	91052139	91052429	-68547354	+	RMER12	LTR	ERVK	1002	1292	-30	7
1279	346	248	78	52	chr3	91052460	91052575	-68547208	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	50	6
1279	1317	239	20	0	chr3	91052653	91053001	-68546782	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	357	-2	7
1279	857	306	30	27	chr3	91053380	91053676	-68546107	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	83	7
1279	2791	198	67	82	chr3	91054006	91054869	-68544914	-	RMER17D	LTR	ERVK	-15	874	25	7
1279	2652	244	87	53	chr3	91054967	91055927	-68543856	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2483	6476	5485	7
1279	2165	232	44	17	chr3	91056497	91057089	-68542694	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7108	7715	-1244	7
1279	4624	65	5	2	chr3	91057342	91057926	-68541857	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	586	-1	7
1279	3005	129	26	23	chr3	91057927	91058758	-68541025	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1	1109	-3581	7
1279	3941	111	5	3	chr3	91058880	91059467	-68540316	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1108	1695	-2995	7
1279	8915	65	3	10	chr3	91059477	91060710	-68539073	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1650	2874	-1816	7
1279	5357	122	17	16	chr3	91060709	91060872	-68538911	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	3829	3990	-700	7
1279	5357	122	17	16	chr3	91060913	91060932	-68538851	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	3991	4022	-668	7
1279	5357	122	17	16	chr3	91061299	91061976	-68537807	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	4023	4690	0	7
1279	4565	73	2	2	chr3	91061976	91062563	-68537220	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	7
1279	1288	223	29	62	chr3	91064523	91064863	-68534920	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	8
1279	2935	231	36	20	chr3	91064863	91065580	-68534203	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	730	-1233	8
1279	742	320	46	26	chr3	91065673	91065975	-68533808	+	ORR1A4	LTR	MaLR	63	370	0	8
1279	538	285	46	51	chr3	91067247	91067443	-68532340	-	MT2A	LTR	ERVL	-44	489	295	8
1279	373	256	78	99	chr3	91067489	91067732	-68532051	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	430	667	-1061	8
1279	5756	131	43	27	chr3	91067753	91068456	-68531327	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	623	1310	-418	8
1279	5756	131	43	27	chr3	91069004	91069384	-68530399	+	RMER17A-int	LTR	ERVK	1311	1723	-5	8
1279	4074	116	22	94	chr3	91069386	91070193	-68529590	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	749	-2	8
1279	441	331	0	23	chr3	91070292	91070425	-68529358	+	RMER12	LTR	ERVK	770	899	-423	9
1279	633	282	110	68	chr3	91070431	91070739	-68529044	+	RMER12	LTR	ERVK	1002	1322	0	9
1279	342	325	8	0	chr3	91070739	91070854	-68528929	-	MT2A	LTR	ERVL	-368	165	50	8
1279	1348	234	17	3	chr3	91070930	91071282	-68528501	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	357	-2	9
1279	679	316	41	34	chr3	91071661	91071953	-68527830	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	86	9
1279	3974	122	6	137	chr3	91072257	91073121	-68526662	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	9
1279	841	204	30	112	chr3	91073863	91074194	-68525589	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2588	6371	6068	9
1279	2121	219	101	19	chr3	91074303	91074591	-68525192	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-3359	5600	5293	9
1279	2121	219	101	19	chr3	91074671	91075016	-68524767	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-3667	5292	4915	9
1279	2465	218	67	63	chr3	91075031	91075932	-68523851	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-3943	5016	4113	9
1279	2368	226	26	139	chr3	91075932	91076622	-68523161	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1352	1963	0	9
1279	507	208	19	19	chr3	91076629	91076737	-68523046	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	148	-246	9
1279	2427	120	5	13	chr3	91076738	91077111	-68522672	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-26	370	1	1
1279	319	127	0	0	chr3	91077113	91077172	-68522611	+	ORR1B1	LTR	MaLR	214	331	-63	9
1279	2768	22	3	0	chr3	91082167	91082488	-68517295	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
1279	20414	20	4	3	chr3	91082488	91087235	-68512548	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	1
1279	2793	19	3	0	chr3	91087235	91087556	-68512227	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
1279	2771	49	0	3	chr3	91089480	91089808	-68509975	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	1
1279	4389	92	8	20	chr3	91089809	91090471	-68509312	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	662	-5819	1
1279	2500	76	0	3	chr3	91090471	91090814	-68508969	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	1
1279	5958	67	11	17	chr3	91090809	91091641	-68508142	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5653	6479	-2	1
1279	2726	52	0	3	chr3	91091643	91091971	-68507812	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	1
1279	277	331	58	109	chr3	91092952	91093227	-68506556	-	RMER20B	LTR	ERVK	-265	362	102	1
1279	688	282	22	9	chr3	91093533	91093755	-68506028	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	580	804	-1044	1
1280	720	259	26	90	chr3	91101996	91102229	-68497554	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	218	-111	1
1280	533	229	7	0	chr3	91102229	91102369	-68497414	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7575	7715	-1244	1
1280	271	256	35	35	chr3	91104909	91104994	-68494789	+	MTE2a	LTR	MaLR	12	96	-283	1
1280	239	337	11	0	chr3	91104997	91105089	-68494694	-	RLTR15	LTR	ERVK	-266	93	1	1
1280	253	330	10	62	chr3	91105145	91105242	-68494541	+	MTE2a	LTR	MaLR	38	129	-250	1
1280	495	211	11	0	chr3	91105169	91105264	-68494519	+	MT2A	LTR	ERVL	57	152	-381	1
1280	432	262	85	99	chr3	91105393	91105586	-68494197	-	RMER12	LTR	ERVK	-139	1183	991	1
1280	1499	204	41	35	chr3	91105696	91106093	-68493690	-	RMER12	LTR	ERVK	-524	798	447	1
1280	1421	201	22	69	chr3	91106102	91106422	-68493361	-	RMER12	LTR	ERVK	-1014	308	4	1
1280	1178	282	76	0	chr3	91106423	91106767	-68493016	+	MT2A	LTR	ERVL	160	529	-4	1
1280	1052	236	56	58	chr3	91120817	91121177	-68478606	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	1
1280	10564	254	34	10	chr3	91121181	91124205	-68475578	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	29	3127	-3415	1
1280	1198	301	3	0	chr3	91133234	91133530	-68466253	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	160	1
1280	2536	210	128	14	chr3	91133531	91134251	-68465532	+	RMER12	LTR	ERVK	4	805	-517	1
1280	480	292	107	97	chr3	91134314	91134614	-68465169	+	RMER12	LTR	ERVK	991	1296	-26	1
1280	438	271	83	0	chr3	91134632	91134765	-68465018	-	MT2A	LTR	ERVL	-358	175	32	1
1280	316	298	11	0	chr3	91134828	91134922	-68464861	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	95	-264	1
1280	286	341	0	0	chr3	91134923	91135008	-68464775	-	MTE2a	LTR	MaLR	-283	96	12	1
1280	1866	126	94	53	chr3	91138703	91139096	-68460687	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	1
1280	5057	192	83	73	chr3	91139098	91140894	-68458889	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2	2589	-4817	1
1280	3460	47	31	0	chr3	91141163	91141586	-68458197	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
1280	300	280	53	46	chr3	91142674	91142805	-68456978	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	30	161	-1687	1
1280	2628	252	29	93	chr3	91142903	91143183	-68456600	+	RMER12	LTR	ERVK	269	555	-767	1
1280	801	246	136	85	chr3	91143183	91143358	-68456425	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	225	1
1280	801	246	136	85	chr3	91143422	91143636	-68456147	-	RMER17C	LTR	ERVK	-186	224	2	1
1280	2628	253	39	89	chr3	91143636	91144376	-68455407	+	RMER12	LTR	ERVK	556	1717	-131	1
1280	692	249	123	28	chr3	91144899	91145110	-68454673	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-147	231	1	1
1280	5550	230	22	24	chr3	91147026	91147119	-68452664	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4661	4298	4212	1
1280	3498	160	168	30	chr3	91147119	91147898	-68451885	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	887	-2	1
1280	5550	230	22	24	chr3	91147898	91148236	-68451547	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4748	4211	3875	1
1280	5357	80	56	4	chr3	91148236	91149002	-68450781	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	806	0	1
1280	5550	230	22	24	chr3	91149002	91150153	-68449630	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5085	3874	2718	1
1280	1553	152	31	71	chr3	91150153	91150478	-68449305	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	11	1
1280	3620	56	83	2	chr3	91150530	91151014	-68448769	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	42	1
1280	3076	204	79	23	chr3	91151017	91152226	-68447557	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3216	1847	760	2
1280	4252	133	32	15	chr3	91152220	91152947	-68446836	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-3965	1441	703	2
1280	439	266	19	25	chr3	91152929	91153091	-68446692	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-7005	551	391	2
1280	3858	72	83	2	chr3	91153570	91154088	-68445695	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	2
1280	316	121	69	0	chr3	91154167	91154219	-68445564	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	56	-271	2
1280	1450	91	35	0	chr3	91154219	91154417	-68445366	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	205	-277	2
1280	1069	93	31	6	chr3	91154421	91154584	-68445199	+	RLTR45	LTR	ERVK	316	482	0	2
1280	1631	153	37	4	chr3	91154584	91154852	-68444931	+	ORR1A2	LTR	MaLR	47	323	-4	2
1280	1740	290	6	7	chr3	91154857	91155402	-68444381	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2079	3181	2638	2
1280	2010	322	62	43	chr3	91155624	91157274	-68442509	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6880	2079	458	2
1280	3386	38	2	0	chr3	91157931	91158326	-68441457	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1280	9364	26	3	0	chr3	91158326	91159419	-68440364	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	3	2
1280	3364	40	2	0	chr3	91159421	91159816	-68439967	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1280	1469	242	239	17	chr3	91172652	91173066	-68426717	-	RLTR19C	LTR	ERVK	0	506	1	2
1280	1009	278	7	0	chr3	91173071	91173341	-68426442	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6734	7005	-1954	2
1280	836	265	9	22	chr3	91180128	91180312	-68419471	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	163	2
1280	390	302	40	34	chr3	91180312	91180487	-68419296	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	176	-1672	2
1280	1346	190	52	3	chr3	91180511	91180801	-68418982	+	RMER12	LTR	ERVK	246	549	-773	2
1280	1011	240	143	28	chr3	91180815	91181179	-68418604	-	RMER17C	LTR	ERVK	-4	406	1	2
1280	1645	246	129	32	chr3	91181179	91181394	-68418389	+	RMER12	LTR	ERVK	556	764	-558	2
1280	1645	247	124	41	chr3	91181462	91181864	-68417919	+	RMER12	LTR	ERVK	765	1167	-155	2
1280	297	250	79	53	chr3	91182298	91182412	-68417371	+	RMER12	LTR	ERVK	1706	1822	-26	2
1280	724	228	25	1	chr3	91182426	91182598	-68417185	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-183	195	1	2
1280	2175	247	42	20	chr3	91193102	91193697	-68406086	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7108	7715	-1244	2
1280	1471	202	15	62	chr3	91195723	91196060	-68403723	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	2
1280	2794	213	61	17	chr3	91196064	91196770	-68403013	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	737	-1226	2
1280	410	331	40	46	chr3	91196667	91196841	-68402942	+	MT2B	LTR	ERVL	65	237	-364	2
1280	801	327	36	17	chr3	91196856	91197158	-68402625	+	ORR1A4	LTR	MaLR	63	370	0	2
1280	540	310	19	24	chr3	91198398	91198429	-68401354	-	MT2A	LTR	ERVL	-40	493	465	2
1280	540	310	19	24	chr3	91198585	91198761	-68401022	-	MT2A	LTR	ERVL	-69	464	287	2
1280	697	300	66	62	chr3	91198996	91199316	-68400467	+	RMER12	LTR	ERVK	1002	1322	0	2
1280	443	256	25	8	chr3	91199316	91199434	-68400349	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	48	2
1280	1324	234	14	25	chr3	91199501	91199864	-68399919	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	2
1280	677	338	24	27	chr3	91200247	91200271	-68399512	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	358	2
1280	677	338	24	27	chr3	91200516	91200786	-68398997	-	MTE2a	LTR	MaLR	-22	357	87	2
1280	6857	248	26	18	chr3	91220309	91222295	-68377488	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4344	4615	2407	2
1280	4440	307	50	56	chr3	91222319	91222387	-68377396	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4144	2406	2355	2
1280	2080	146	3	0	chr3	91222387	91222709	-68377074	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	323	-4	2
1280	1779	261	26	72	chr3	91222709	91223326	-68376457	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-6328	2631	2038	2
1280	279	207	43	54	chr3	91223597	91223689	-68376094	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4747	1803	1713	2
1280	453	297	33	13	chr3	91224596	91224746	-68375037	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-760	6646	6494	2
1280	317	299	0	0	chr3	91224855	91224962	-68374821	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-469	7748	7642	2
1280	256	280	50	0	chr3	91225090	91225190	-68374593	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1329	6888	6784	2
1280	1059	112	0	0	chr3	91225236	91225396	-68374387	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-573	450	291	2
19	5976	151	86	94	chr3	91225434	91226845	-68372938	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1173	6071	4672	2
1281	2899	82	12	7	chr3	91226833	91227238	-68372545	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1644	5762	5356	2
1281	9367	148	34	2	chr3	91227237	91228811	-68370972	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2728	4678	3055	2
1281	726	232	0	37	chr3	91228811	91228972	-68370811	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4798	2608	2454	2
1281	606	180	27	0	chr3	91228994	91229105	-68370678	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4204	1202	1089	2
1281	1825	176	164	64	chr3	91229110	91229627	-68370156	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4587	819	251	2
1281	319	344	16	5	chr3	91229770	91229954	-68369829	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6878	366	181	2
1281	2367	328	67	26	chr3	91230859	91232221	-68367562	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7060	1899	483	2
1281	1898	173	36	51	chr3	91257057	91257472	-68342311	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	2
1281	332	292	28	0	chr3	91258643	91258749	-68341034	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-5	373	265	2
1281	421	298	79	7	chr3	91258732	91258884	-68340899	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-204	163	1	2
1281	416	315	9	9	chr3	91263555	91263667	-68336116	-	MT2A	LTR	ERVL	-146	387	276	3
1281	956	301	119	43	chr3	91263736	91264250	-68335533	+	RMER12	LTR	ERVK	770	1322	0	3
1281	379	293	10	0	chr3	91264257	91264356	-68335427	-	MT2A	LTR	ERVL	-375	158	59	3
1281	1376	238	5	27	chr3	91264440	91264807	-68334976	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1281	508	306	26	26	chr3	91265188	91265379	-68334404	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	189	3
1281	742	192	39	11	chr3	91265380	91265559	-68334224	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4663	4296	4113	3
1281	1683	234	39	6	chr3	91265559	91266252	-68333531	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1001	1952	-11	3
1281	934	269	16	80	chr3	91266269	91266580	-68333203	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	331	-63	3
1281	436	377	70	5	chr3	91269617	91269891	-68329892	-	MTE2b	LTR	MaLR	-80	299	1	3
1281	260	333	75	92	chr3	91271997	91272225	-68327558	-	RMER20B	LTR	ERVK	-307	320	97	3
1281	341	270	22	93	chr3	91272236	91272375	-68327408	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	300	3
1281	770	302	56	24	chr3	91272397	91272774	-68327009	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	416	804	-1044	3
1281	839	251	1	2	chr3	91276002	91276189	-68323594	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	392	208	3
1281	2575	227	122	29	chr3	91276189	91276674	-68323109	+	RMER12	LTR	ERVK	3	555	-767	3
1281	732	241	258	42	chr3	91276674	91276836	-68322947	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	169	3
1281	732	241	258	42	chr3	91276954	91277128	-68322655	-	RMER17C	LTR	ERVK	-242	168	1	3
1281	2575	215	49	37	chr3	91277128	91277353	-68322430	+	RMER12	LTR	ERVK	556	768	-554	3
1281	2575	221	111	53	chr3	91277404	91277804	-68321979	+	RMER12	LTR	ERVK	769	1181	-141	3
1281	318	268	86	27	chr3	91278254	91278397	-68321386	+	RMER12	LTR	ERVK	1658	1810	-38	3
1281	258	230	236	22	chr3	91278437	91278526	-68321257	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-270	108	1	3
1281	250	211	86	62	chr3	91286030	91286111	-68313672	-	RLTR15	LTR	ERVK	-160	199	117	3
1281	2510	223	44	20	chr3	91286657	91287251	-68312532	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7108	7715	-1244	3
1281	1355	205	20	64	chr3	91289415	91289759	-68310024	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	3
1281	2964	220	61	19	chr3	91289759	91290513	-68309270	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	786	-1177	3
1281	458	287	40	58	chr3	91290361	91290535	-68309248	+	MT2B	LTR	ERVL	67	237	-364	3
1281	730	338	40	26	chr3	91290550	91290854	-68308929	+	ORR1A4	LTR	MaLR	63	370	0	3
1281	696	292	62	58	chr3	91291793	91292084	-68307699	+	RMER12	LTR	ERVK	1002	1293	-29	3
1281	416	248	24	49	chr3	91292113	91292236	-68307547	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	48	3
1281	1552	232	6	0	chr3	91292309	91292666	-68307117	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1281	718	330	30	37	chr3	91293044	91293067	-68306716	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	357	3
1281	718	330	30	37	chr3	91293312	91293587	-68306196	-	MTE2a	LTR	MaLR	-23	356	83	3
1281	3245	32	9	40	chr3	91296659	91297083	-68302700	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	3
1281	4757	247	32	21	chr3	91301663	91303013	-68296770	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4447	4512	3148	3
1281	1464	249	14	23	chr3	91312653	91313006	-68286777	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-6	500	151	3
1281	274	167	0	0	chr3	91314171	91314219	-68285564	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-458	48	1	3
1281	2537	229	53	26	chr3	91314224	91314886	-68284897	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6734	7413	-1546	3
1281	891	191	120	0	chr3	91315056	91315265	-68284518	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7421	7654	-1305	3
1281	361	183	0	0	chr3	91321419	91321490	-68278293	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7645	7715	-1244	3
1281	475	329	77	6	chr3	91323050	91323218	-68276565	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	277	3
1281	352	252	119	18	chr3	91323320	91323429	-68276354	+	RMER12	LTR	ERVK	769	888	-434	3
1281	865	236	72	69	chr3	91323450	91323741	-68276042	+	RMER12	LTR	ERVK	1002	1293	-29	3
1281	339	293	26	8	chr3	91323770	91323887	-68275896	-	MT2A	LTR	ERVL	-366	167	49	3
1281	1150	238	81	0	chr3	91323960	91324292	-68275491	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1281	525	299	21	26	chr3	91324672	91324864	-68274919	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	189	3
1281	688	247	34	0	chr3	91324865	91325043	-68274740	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4663	4296	4113	3
1281	1920	218	38	28	chr3	91325043	91325751	-68274032	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1002	1960	-3	3
1281	1149	181	21	184	chr3	91325749	91326080	-68273703	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	277	-52	3
1281	548	312	97	70	chr3	91328616	91328916	-68270867	-	MTE2b	LTR	MaLR	-71	308	1	3
1281	2449	86	3	6	chr3	91328979	91329317	-68270466	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	-8	337	1	3
1281	6164	254	48	36	chr3	91329317	91331832	-68267951	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-351	7329	3468	3
1281	813	96	35	49	chr3	91331941	91332084	-68267699	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4530	3
1281	438	206	9	36	chr3	91332110	91332221	-68267562	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-2380	2464	2357	3
1281	6603	116	56	11	chr3	91332226	91333611	-68266172	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-3135	4271	2735	3
1281	435	239	88	0	chr3	91333711	91333824	-68265959	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5077	1060	938	3
1281	278	305	105	15	chr3	91333827	91333960	-68265823	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5469	668	524	3
1281	1779	83	20	4	chr3	91335622	91335875	-68263908	+	RLTR1C	LTR	ERV1	247	503	0	3
1281	368	266	11	0	chr3	91335933	91336027	-68263756	-	RLTR15	LTR	ERVK	-264	95	1	3
1281	228	355	52	31	chr3	91336084	91336180	-68263603	+	MTE2a	LTR	MaLR	32	129	-250	3
1281	491	221	11	0	chr3	91336107	91336202	-68263581	+	MT2A	LTR	ERVL	57	152	-381	3
1281	258	320	86	24	chr3	91336215	91336376	-68263407	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1106	3
1281	225	344	66	104	chr3	91336499	91336605	-68263178	-	RMER12	LTR	ERVK	-217	1105	1009	3
1281	1559	195	158	44	chr3	91336823	91337527	-68262256	-	RMER12	LTR	ERVK	-535	787	4	3
1281	1349	258	69	0	chr3	91337528	91337862	-68261921	+	MT2A	LTR	ERVL	160	516	-17	3
1281	717	278	21	0	chr3	91339981	91340165	-68259618	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	191	3
1281	2930	231	120	85	chr3	91340165	91340656	-68259127	+	RMER12	LTR	ERVK	1	555	-767	3
1281	820	200	265	59	chr3	91340656	91340799	-68258984	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	214	3
1281	820	200	265	59	chr3	91340869	91341065	-68258718	-	RMER17C	LTR	ERVK	-197	213	2	3
1281	2930	229	46	108	chr3	91341065	91341275	-68258508	+	RMER12	LTR	ERVK	556	767	-555	3
1281	2930	229	46	108	chr3	91341322	91341521	-68258262	+	RMER12	LTR	ERVK	768	957	-365	3
1281	2930	231	64	103	chr3	91341701	91342014	-68257769	+	RMER12	LTR	ERVK	958	1161	-161	3
1281	313	271	55	18	chr3	91342442	91342551	-68257232	+	RMER12	LTR	ERVK	1698	1810	-38	3
1281	688	247	152	20	chr3	91342550	91342748	-68257035	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-154	224	1	3
1281	3177	251	40	16	chr3	91347882	91348775	-68251008	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4344	4615	3701	4
1281	3835	239	16	48	chr3	91349005	91350097	-68249686	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5276	3683	2626	4
1281	764	179	0	7	chr3	91350097	91350232	-68249551	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	134	-193	4
1281	4618	153	22	77	chr3	91350232	91351059	-68248724	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	788	-114	4
1281	4618	153	22	77	chr3	91351550	91351649	-68248134	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	789	876	-26	4
1281	1295	136	0	0	chr3	91351668	91351859	-68247924	+	ORR1A2	LTR	MaLR	133	323	-4	4
1281	4866	292	62	33	chr3	91351863	91353981	-68245802	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6329	2630	452	4
1282	286	331	100	19	chr3	91361498	91361658	-68238125	-	RMER12	LTR	ERVK	-146	1176	1004	4
1282	767	280	20	45	chr3	91361685	91361932	-68237851	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6625	294	54	4
1282	482	319	70	49	chr3	91362104	91362388	-68237395	-	RLTR26	LTR	ERVK	-233	409	120	4
1282	978	312	28	31	chr3	91363229	91363589	-68236194	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	4
1282	2453	97	3	0	chr3	91365992	91366323	-68233460	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	4
1282	3406	84	56	0	chr3	91366323	91367055	-68232728	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6908	4
1282	20839	124	7	4	chr3	91367038	91370085	-68229698	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4376	3304	251	4
1282	330	331	102	0	chr3	91392868	91393025	-68206758	-	RMER12	LTR	ERVK	-146	1176	1004	4
1282	241	256	60	120	chr3	91394141	91394274	-68205509	-	RMER12B	LTR	ERVK	-131	1273	1149	4
1282	1024	293	36	34	chr3	91394842	91395199	-68204584	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	527	-1	4
1282	845	272	8	40	chr3	91396246	91396495	-68203288	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6625	294	54	4
1282	424	302	96	18	chr3	91396814	91397033	-68202750	-	RLTR26	LTR	ERVK	-287	355	120	4
1282	233	259	146	53	chr3	91397238	91397389	-68202394	-	RMER12B	LTR	ERVK	-162	1242	1078	4
1282	252	357	0	43	chr3	91397874	91397991	-68201792	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	281	-247	4
1282	753	246	56	19	chr3	91398057	91398272	-68201511	+	RLTR11A	LTR	ERVK	306	528	0	4
1282	358	363	58	5	chr3	91403709	91403900	-68195883	-	MTE2b	LTR	MaLR	-26	353	153	4
1282	622	265	108	53	chr3	91404831	91405186	-68194597	-	RMER20B	LTR	ERVK	-186	441	82	4
1282	2453	93	0	6	chr3	91405794	91406128	-68193655	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	4
1282	5202	108	5	29	chr3	91406128	91406926	-68192857	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	0	7513	6735	4
1282	3508	77	0	2	chr3	91406916	91407371	-68192412	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-1367	6214	5761	4
1282	3190	96	2	18	chr3	91407362	91407809	-68191974	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-1939	5642	5203	4
1282	570	81	47	66	chr3	91408064	91408170	-68191613	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4567	4
1282	396	107	0	0	chr3	91408169	91408225	-68191558	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-3784	3622	3567	4
1282	659	193	0	0	chr3	91408251	91408370	-68191413	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-4653	2753	2635	4
1282	400	266	88	0	chr3	91408486	91408599	-68191184	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5077	1060	938	4
1282	1539	203	99	37	chr3	91408604	91409085	-68190698	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4750	656	251	4
1282	853	166	39	64	chr3	91409197	91409446	-68190337	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6629	952	619	4
1282	3492	21	4	116	chr3	91409446	91409937	-68189846	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
1282	853	116	32	13	chr3	91409937	91410106	-68189677	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-7062	618	409	4
1282	2111	163	30	32	chr3	91410514	91410947	-68188836	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-7059	454	1	4
1282	2462	96	0	3	chr3	91410947	91411280	-68188503	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	4
1282	369	299	75	0	chr3	91420950	91421084	-68178699	+	RLTR11A	LTR	ERVK	384	527	-1	4
1282	311	327	100	12	chr3	91422950	91423120	-68176663	-	MTE2a	LTR	MaLR	-10	369	185	4
1282	678	235	127	13	chr3	91424212	91424449	-68175334	-	RMER20B	LTR	ERVK	-234	393	130	4
1282	2832	57	52	0	chr3	91431202	91431571	-68168212	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	4
1282	1118	279	33	36	chr3	91440009	91440369	-68159414	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	4
1282	468	249	147	15	chr3	91441644	91441848	-68157935	+	RMER20B	LTR	ERVK	183	413	-214	4
1282	327	24	0	0	chr3	91443118	91443160	-68156623	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	42	-250	4
1282	1966	46	0	121	chr3	91443196	91443519	-68156264	+	RLTR10B	LTR	ERVK	9	292	0	4
1282	2475	76	0	0	chr3	91443519	91443836	-68155947	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	317	-7264	4
1282	21506	61	7	1	chr3	91444118	91446818	-68152965	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3095	5810	-1771	4
1282	288	143	0	0	chr3	91446804	91446853	-68152930	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6646	6694	-887	4
1282	7181	52	2	29	chr3	91446879	91447801	-68151982	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6685	7581	0	4
1282	327	24	0	0	chr3	91447801	91447843	-68151940	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	42	-250	4
1282	1965	96	83	46	chr3	91447878	91448226	-68151557	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	5	365	0	4
1282	1032	303	33	33	chr3	91448899	91449258	-68150525	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	170	4
1282	274	327	54	108	chr3	91449791	91450014	-68149769	+	RMER12B	LTR	ERVK	1122	1332	-72	4
1282	264	339	43	67	chr3	91450375	91450584	-68149199	+	RLTR26	LTR	ERVK	207	410	-232	4
1282	239	286	53	80	chr3	91469474	91469628	-68130155	-	RMER17A	LTR	ERVK	-333	418	264	5
1282	239	286	53	80	chr3	91469809	91469954	-68129829	-	RMER17A	LTR	ERVK	-488	263	127	5
1282	331	306	45	100	chr3	91476056	91476256	-68123527	-	RMER12B	LTR	ERVK	-131	1273	1085	5
1282	880	328	31	33	chr3	91476728	91477088	-68122695	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	5
1282	718	239	112	19	chr3	91481841	91482101	-68117682	+	RMER20B	LTR	ERVK	130	413	-214	5
1282	381	349	70	10	chr3	91483135	91483335	-68116448	+	MTE2a	LTR	MaLR	153	364	-15	5
1282	1113	292	28	31	chr3	91485204	91485561	-68114222	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-3	525	170	5
1282	255	300	51	108	chr3	91486099	91486256	-68113527	+	RMER12B	LTR	ERVK	1126	1273	-131	5
1283	1065	296	31	28	chr3	91497701	91498059	-68101724	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	170	5
1283	389	305	87	31	chr3	91498972	91499168	-68100615	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	359	153	5
1283	501	275	121	25	chr3	91500148	91500387	-68099396	-	RMER20B	LTR	ERVK	-216	411	150	1
1283	263	337	94	61	chr3	91516074	91516286	-68083497	-	RMER12	LTR	ERVK	-105	1217	999	1
1283	662	301	18	9	chr3	91516320	91516541	-68083242	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6631	288	66	1
1283	360	316	38	67	chr3	91516734	91516944	-68082839	-	RLTR26	LTR	ERVK	-232	410	207	1
1283	344	303	76	0	chr3	91529688	91529820	-68069963	+	RLTR11A	LTR	ERVK	384	525	-3	2
1283	342	325	83	24	chr3	91531684	91531889	-68067894	-	MTE2a	LTR	MaLR	-10	369	153	2
1283	590	269	119	27	chr3	91532926	91533186	-68066597	-	RMER20B	LTR	ERVK	-214	413	130	2
1283	1086	283	36	31	chr3	91549914	91550271	-68049512	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	3
1283	452	237	162	29	chr3	91551543	91551747	-68048036	+	RMER20B	LTR	ERVK	183	413	-214	4
1283	1173	284	30	36	chr3	91553699	91554060	-68045723	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	170	4
1283	251	301	29	102	chr3	91554592	91554729	-68045054	+	RMER12B	LTR	ERVK	1122	1248	-156	4
1283	302	319	56	71	chr3	91555210	91555406	-68044377	+	RLTR26	LTR	ERVK	207	399	-243	4
1283	241	352	93	54	chr3	91555869	91556073	-68043710	+	RMER12	LTR	ERVK	1004	1215	-107	4
1283	961	150	143	14	chr3	91566024	91566240	-68033543	+	RMER6A	LTR	ERVK	311	554	-202	5
1283	243	338	96	73	chr3	91566799	91567019	-68032764	+	RMER12	LTR	ERVK	999	1223	-99	5
1283	434	241	149	29	chr3	91583545	91583720	-68016063	+	RMER20B	LTR	ERVK	216	411	-216	6
1283	471	289	87	31	chr3	91584727	91584923	-68014860	+	MTE2a	LTR	MaLR	153	359	-20	7
1283	1043	302	31	31	chr3	91585835	91586194	-68013589	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	7
1283	301	312	25	83	chr3	91597617	91597774	-68002009	-	RMER12B	LTR	ERVK	-131	1273	1126	7
1283	1151	282	31	33	chr3	91598312	91598672	-68001111	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	8
1283	405	352	65	10	chr3	91600540	91600741	-67999042	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	364	153	8
1283	963	315	28	31	chr3	91603436	91603796	-67995987	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	170	8
1283	308	311	45	104	chr3	91604267	91604468	-67995315	+	RMER12B	LTR	ERVK	1085	1273	-131	8
1283	252	301	39	62	chr3	91610608	91610753	-67989030	+	RMER17D	LTR	ERVK	145	284	-605	9
1283	252	301	39	62	chr3	91610933	91611124	-67988659	+	RMER17D	LTR	ERVK	285	473	-416	9
1284	1037	301	28	31	chr3	91620534	91620894	-67978889	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	1
1284	401	320	66	20	chr3	91626345	91626543	-67973240	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	359	153	1
1284	612	243	116	55	chr3	91627470	91627762	-67972021	-	RMER20B	LTR	ERVK	-186	441	132	1
1284	2506	93	0	3	chr3	91628433	91628766	-67971017	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	1
1284	2585	120	10	3	chr3	91628766	91629151	-67970632	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	0	7513	7126	1
1284	584	152	55	9	chr3	91629151	91629261	-67970522	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	-236	149	1	1
1284	369	299	75	0	chr3	91638997	91639131	-67960652	+	RLTR11A	LTR	ERVK	384	527	-1	1
1284	275	349	94	6	chr3	91640996	91641166	-67958617	-	MTE2b	LTR	MaLR	-10	369	185	1
1284	692	239	127	13	chr3	91642257	91642494	-67957289	-	RMER20B	LTR	ERVK	-234	393	130	1
1284	1071	303	25	25	chr3	91652002	91652361	-67947422	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	170	1
1284	318	309	96	46	chr3	91653271	91653468	-67946315	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	359	153	1
1284	240	254	101	101	chr3	91660010	91660168	-67939615	-	RLTR26	LTR	ERVK	-232	410	253	1
1284	580	276	129	27	chr3	91667419	91667717	-67932066	+	RMER20B	LTR	ERVK	97	413	-214	1
1284	989	301	39	34	chr3	91670200	91670557	-67929226	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	170	1
1284	300	289	49	66	chr3	91671066	91671188	-67928595	+	RMER12B	LTR	ERVK	1122	1241	-163	1
1284	318	325	101	13	chr3	91696199	91696358	-67903425	-	RMER12	LTR	ERVK	-146	1176	1004	1
1284	746	252	28	53	chr3	91696385	91696632	-67903151	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6625	294	54	1
1284	474	316	78	62	chr3	91696804	91697177	-67902606	-	RLTR26	LTR	ERVK	-233	409	3	1
1284	293	282	115	94	chr3	91697256	91697448	-67902335	-	RMER12B	LTR	ERVK	-131	1273	1078	1
1284	1005	309	25	25	chr3	91697960	91698319	-67901464	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	1
1284	391	307	87	27	chr3	91707797	91707981	-67891802	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	359	165	1
1284	676	249	106	55	chr3	91708952	91709245	-67890538	-	RMER20B	LTR	ERVK	-186	441	134	1
1284	770	304	4	34	chr3	91716471	91716740	-67883043	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-98	430	170	1
1284	267	324	38	112	chr3	91734069	91734229	-67865554	-	RMER12B	LTR	ERVK	-131	1273	1126	1
1284	1072	288	33	36	chr3	91734770	91735130	-67864653	+	RLTR11A	LTR	ERVK	170	528	0	1
1284	258	341	37	22	chr3	91742588	91742723	-67857060	-	RMER12	LTR	ERVK	-146	1176	1040	2
1284	858	264	16	40	chr3	91742783	91743032	-67856751	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6631	288	46	2
1284	650	289	62	59	chr3	91743197	91743487	-67856296	-	RLTR26	LTR	ERVK	-232	410	120	2
1284	1114	297	44	22	chr3	91744317	91744679	-67855104	+	RLTR11A	LTR	ERVK	156	525	-3	2
1284	258	318	20	60	chr3	91745467	91745668	-67854115	-	RMER12	LTR	ERVK	-1082	766	574	2
1284	1272	257	47	51	chr3	91745706	91746282	-67853501	-	RMER12	LTR	ERVK	-1265	583	1	2
1284	1296	265	50	25	chr3	91748521	91748885	-67850898	+	RLTR11A	LTR	ERVK	156	528	0	2
1285	3407	23	5	0	chr3	91759140	91759534	-67840249	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1285	238	339	76	102	chr3	91760646	91760739	-67839044	-	RMER12	LTR	ERVK	-143	1179	1087	2
1285	238	339	76	102	chr3	91760890	91760993	-67838790	-	RMER12	LTR	ERVK	-236	1086	988	2
1285	955	238	13	40	chr3	91761086	91761314	-67838469	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6644	275	54	2
1285	619	319	74	65	chr3	91761434	91761773	-67838010	-	RLTR26	LTR	ERVK	-181	461	120	2
1285	394	238	153	91	chr3	91761944	91762120	-67837663	-	RMER12B	LTR	ERVK	-131	1273	1087	2
1285	334	236	22	0	chr3	91762440	91762529	-67837254	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-1227	581	491	2
1285	2728	94	20	12	chr3	91762584	91762984	-67836799	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	2
1285	1108	248	61	45	chr3	91762986	91763362	-67836421	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3	384	-2930	2
1285	3613	178	81	81	chr3	91763427	91764466	-67835317	+	MMETn-int	LTR	ERVK	293	1313	-3531	2
1285	3327	122	37	9	chr3	91764469	91765006	-67834777	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2494	3045	-4361	2
1285	3282	129	10	8	chr3	91765061	91765569	-67834214	+	RLTR1D	LTR	ERV1	81	589	-16	2
1285	5873	144	35	8	chr3	91765583	91766662	-67833121	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1979	4075	-3331	2
1285	4679	205	83	88	chr3	91766887	91768248	-67831535	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2063	3745	-1099	2
1285	457	95	27	13	chr3	91768458	91768533	-67831250	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7406	0	2
1285	1701	107	306	10	chr3	91768533	91768844	-67830939	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	2
1285	1181	253	14	36	chr3	91768923	91769273	-67830510	-	RMER12	LTR	ERVK	-1507	341	1	2
1285	1238	270	28	48	chr3	91771595	91771953	-67827830	+	RLTR11A	LTR	ERVK	175	525	-3	2
1285	702	318	85	17	chr3	91773943	91774264	-67825519	-	MTE2b	LTR	MaLR	-26	353	1	2
1285	764	274	98	38	chr3	91775089	91775419	-67824364	-	RMER20B	LTR	ERVK	-191	436	98	2
1285	432	247	0	0	chr3	91786928	91787001	-67812782	-	RLTR26	LTR	ERVK	-569	73	1	2
1285	3083	45	45	0	chr3	91793412	91793789	-67805994	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	3	2
1285	8235	65	9	3	chr3	91793791	91794882	-67804901	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
1285	3019	45	56	0	chr3	91794882	91795257	-67804526	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1285	1910	184	27	14	chr3	91798471	91798841	-67800942	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-3	375	1	2
1285	427	277	50	8	chr3	91798923	91799043	-67800740	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	251	2
1285	570	246	183	50	chr3	91799088	91799328	-67800455	+	RLTR10A	LTR	ERVK	140	411	0	2
1285	591	288	33	22	chr3	91799328	91799505	-67800278	-	MTE2b	LTR	MaLR	-117	262	84	2
1285	3238	130	49	25	chr3	91801500	91802107	-67797676	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-187	622	1	2
1285	700	227	200	5	chr3	91804052	91804247	-67795536	+	MT2A	LTR	ERVL	301	533	0	2
1285	1216	222	4	4	chr3	91804252	91804505	-67795278	+	RMER5	LTR	ERV1	282	534	0	2
1285	2123	210	42	43	chr3	91806779	91806950	-67792833	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	164	-1684	2
1285	2123	210	42	43	chr3	91806978	91806991	-67792792	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	165	169	-1679	2
1285	2123	210	42	43	chr3	91807055	91807446	-67792337	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	170	576	-1272	2
1285	770	230	15	91	chr3	91808118	91808381	-67791402	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	571	813	-1035	2
1285	259	340	18	27	chr3	91808737	91808849	-67790934	+	RMER12	LTR	ERVK	1072	1182	-140	2
1285	430	295	16	0	chr3	91808913	91809035	-67790748	+	RMER12	LTR	ERVK	1195	1318	-4	2
1285	955	141	13	29	chr3	91814306	91814488	-67785295	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-8	412	247	2
1285	455	259	53	9	chr3	91814488	91814601	-67785182	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7085	7202	-204	2
1285	1704	89	30	0	chr3	91814991	91815226	-67784557	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-162	247	6	2
1285	961	303	57	48	chr3	91818903	91819274	-67780509	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	6	2
1285	228	282	26	97	chr3	91830018	91830132	-67769651	-	LTR50	LTR	ERVL	-638	157	52	2
1285	248	312	73	31	chr3	91836424	91836520	-67763263	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	100	-308	3
1285	2350	218	151	28	chr3	91844504	91845159	-67754624	-	RMER19A	LTR	ERVK	-1	736	1	3
1285	2522	146	25	14	chr3	91846557	91847002	-67752781	+	RLTR11B	LTR	ERVK	4	453	0	3
1285	939	234	67	106	chr3	91852673	91853165	-67746618	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	473	-2765	3
1285	606	241	142	35	chr3	91853362	91853616	-67746167	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	464	744	-2494	3
1285	1937	115	19	13	chr3	91854004	91854322	-67745461	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1356	1675	-1563	3
1285	782	212	112	20	chr3	91854322	91854572	-67745211	+	RMER17C	LTR	ERVK	110	382	-28	3
1285	908	241	146	11	chr3	91858636	91858896	-67740887	+	ORR1C2	LTR	MaLR	89	383	-1	3
1285	721	232	107	96	chr3	91859379	91859670	-67740113	+	MTE2a	LTR	MaLR	86	379	0	3
1285	397	195	105	19	chr3	91860988	91861170	-67738613	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	983	1066	-48	3
1285	1167	314	45	36	chr3	91862578	91863130	-67736653	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3374	1625	1069	3
1285	529	308	110	8	chr3	91864182	91864418	-67735365	-	RMER15	LTR	ERVL	-40	535	276	3
1285	1005	220	19	14	chr3	91864908	91865120	-67734663	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	213	-161	3
1285	666	151	79	0	chr3	91865649	91865775	-67734008	+	ORR1D1	LTR	MaLR	239	374	0	3
1285	2355	236	95	77	chr3	91867560	91868226	-67731557	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	678	-182	3
1285	526	292	10	73	chr3	91868287	91868479	-67731304	+	RMER13A	LTR	ERVK	681	860	0	3
1285	2930	93	5	2	chr3	91868914	91869313	-67730470	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1285	2890	103	23	2	chr3	91872336	91872735	-67727048	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	3
1285	4023	179	48	26	chr3	91873659	91874549	-67725234	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	910	-1416	3
1285	1776	106	56	86	chr3	91874554	91874771	-67725012	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1085	1315	-1011	3
1285	1776	106	56	86	chr3	91875364	91875540	-67724243	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1316	1466	-860	3
1285	761	112	95	50	chr3	91880193	91880372	-67719411	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	2138	2324	-2	3
1285	1933	209	18	86	chr3	91880374	91880889	-67718894	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	431	-103	3
1285	1175	268	50	198	chr3	91880929	91881033	-67718750	+	RLTR20A	LTR	ERVK	432	528	-6	3
1286	348	191	45	211	chr3	91881485	91881684	-67718099	-	RLTR23	LTR	ERV1	-21	409	244	3
1286	1599	227	62	28	chr3	91917868	91918221	-67681562	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	4	4
1286	381	339	30	76	chr3	91918739	91918937	-67680846	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-53	317	129	4
1286	1719	170	21	54	chr3	91919648	91920072	-67679711	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	4
1286	340	297	101	7	chr3	91931040	91931179	-67668604	+	MLT1D	LTR	MaLR	249	400	-105	4
1286	1628	222	50	43	chr3	91931207	91931389	-67668394	+	MTD	LTR	MaLR	18	210	-209	4
1286	1628	222	50	43	chr3	91931703	91931919	-67667864	+	MTD	LTR	MaLR	211	419	0	4
1286	1650	187	191	8	chr3	91940485	91940862	-67658921	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	4
1286	714	283	82	112	chr3	91942089	91942546	-67657237	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1545	1998	-5780	4
1286	714	289	86	103	chr3	91942866	91943412	-67656371	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1895	2447	-5109	4
1286	1419	310	89	72	chr3	91943451	91944148	-67655635	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	2754	3448	-1615	4
1286	1419	310	89	72	chr3	91944248	91944790	-67654993	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3449	4015	-1048	4
1286	425	316	29	49	chr3	91945610	91945853	-67653930	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7447	7684	-94	4
1286	1943	152	223	24	chr3	91945945	91946317	-67653466	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	4
1286	456	158	9	159	chr3	91951124	91951237	-67648546	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	410	4
1286	376	194	38	67	chr3	91956052	91956157	-67643626	-	MLT1D	LTR	MaLR	-403	102	1	4
1286	1619	192	10	3	chr3	91960378	91960666	-67639117	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	240	4
1286	783	83	9	0	chr3	91960667	91960776	-67639007	+	ORR1A4	LTR	MaLR	216	325	-4	5
1286	506	299	43	31	chr3	91961231	91961524	-67638259	+	MLT2C1	LTR	ERVL	57	560	0	5
1286	272	284	117	33	chr3	91969015	91969135	-67630648	+	MLT1H1	LTR	MaLR	1	130	-425	5
1286	257	330	9	27	chr3	91975105	91975217	-67624566	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	299	5
1286	261	341	0	11	chr3	91982581	91982673	-67617110	+	RMER15	LTR	ERVL	372	462	-113	5
1286	2251	108	12	15	chr3	91989322	91989660	-67610123	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	5
1286	56050	27	9	8	chr3	91989660	91996130	-67603653	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6479	-2	5
1286	2251	108	12	15	chr3	91996132	91996470	-67603313	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	5
1286	1801	169	101	42	chr3	92003923	92004488	-67595295	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-375	653	1	7
1286	345	248	78	86	chr3	92005879	92006122	-67593661	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3395	2127	1887	9
1287	1409	276	87	45	chr3	92015301	92015872	-67583911	-	RLTR1	LTR	ERV1	0	624	1	1
1287	781	218	95	143	chr3	92019344	92019756	-67580027	+	RLTR9C	LTR	ERVK	2	393	0	2
1287	3579	115	147	1	chr3	92024790	92025437	-67574346	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	130	870	-978	2
1287	427	300	100	0	chr3	92027561	92027701	-67572082	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-49	325	172	3
1287	1758	181	170	11	chr3	92032620	92033185	-67566598	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-373	655	1	4
1287	332	218	132	14	chr3	92034339	92034483	-67565300	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3282	2240	2080	4
1287	519	213	79	152	chr3	92035187	92035581	-67564202	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3282	2240	1876	5
1287	270	189	0	0	chr3	92039907	92039960	-67559823	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3922	1600	1548	5
1287	6206	78	8	16	chr3	92040970	92041850	-67557933	+	RLTR13A3	LTR	ERVK	106	978	0	5
1287	1834	113	35	22	chr3	92043910	92044228	-67555555	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
1287	3067	37	98	5	chr3	92044228	92044666	-67555117	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	4366	5
1287	1733	145	35	22	chr3	92044668	92044986	-67554797	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
1287	263	202	138	46	chr3	92045025	92045134	-67554649	+	MT2B	LTR	ERVL	160	278	-323	6
1287	230	232	0	51	chr3	92047663	92047722	-67552061	+	MER34	LTR	ERV1	155	210	-332	6
1287	1409	276	87	45	chr3	92050011	92050582	-67549201	-	RLTR1	LTR	ERV1	0	624	1	6
1287	781	218	95	143	chr3	92054156	92054568	-67545215	+	RLTR9C	LTR	ERVK	2	393	0	7
1287	3599	116	147	1	chr3	92059603	92060250	-67539533	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	130	870	-978	7
1287	410	299	102	0	chr3	92062377	92062514	-67537269	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-52	322	172	8
1287	261	182	18	0	chr3	92064336	92064391	-67535392	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2187	2242	-3280	9
1287	1756	181	170	11	chr3	92067422	92067987	-67531796	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-373	655	1	9
1287	368	218	132	14	chr3	92069141	92069285	-67530498	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3282	2240	2080	9
1287	609	204	81	155	chr3	92069979	92070373	-67529410	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3282	2240	1876	9
1287	285	189	0	0	chr3	92074699	92074752	-67525031	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3922	1600	1548	9
1287	6196	78	8	16	chr3	92075762	92076642	-67523141	+	RLTR13A3	LTR	ERVK	106	978	0	1
1287	1813	113	35	22	chr3	92078702	92079020	-67520763	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
1287	3229	37	98	5	chr3	92079020	92079458	-67520325	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	4366	1
1287	1718	145	35	22	chr3	92079460	92079778	-67520005	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
1287	258	202	138	46	chr3	92079817	92079926	-67519857	+	MT2B	LTR	ERVL	160	278	-323	1
1287	233	232	0	51	chr3	92082455	92082514	-67517269	+	MER34	LTR	ERV1	155	210	-332	1
1287	1368	277	87	44	chr3	92084803	92085373	-67514410	-	RLTR1	LTR	ERV1	0	624	1	1
1287	776	218	95	143	chr3	92088841	92089253	-67510530	+	RLTR9C	LTR	ERVK	2	393	0	1
1287	3600	112	149	1	chr3	92094286	92094932	-67504851	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	130	870	-978	1
1287	407	299	104	0	chr3	92098080	92098214	-67501569	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-55	319	172	1
1287	1701	182	72	6	chr3	92101867	92101880	-67497903	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-375	653	641	1
1287	1701	194	111	37	chr3	92102021	92102564	-67497219	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-388	640	1	1
1287	630	225	55	118	chr3	92103680	92104078	-67495705	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3282	2240	1868	1
1287	3943	183	165	8	chr3	92123174	92124131	-67475652	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	138	1244	-564	1
1287	404	317	97	0	chr3	92127808	92127953	-67471830	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-52	322	164	1
1288	1343	244	37	37	chr3	92148954	92149282	-67450501	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	328	-1244	2
1288	3072	48	5	10	chr3	92150166	92150541	-67449242	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	375	-21	2
1288	3072	48	5	10	chr3	92150935	92150957	-67448826	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	376	396	0	2
1288	2252	226	13	51	chr3	92151078	92151688	-67448095	+	RLTR21	LTR	ERVK	361	947	-625	2
1288	4102	26	0	4	chr3	92151688	92152146	-67447637	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	458	-35	2
1288	4102	26	0	4	chr3	92152671	92152707	-67447076	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	459	493	0	2
1288	472	186	0	78	chr3	92152707	92152832	-67446951	+	RLTR21	LTR	ERVK	943	1057	-515	2
1288	2375	159	174	85	chr3	92163305	92163939	-67435844	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	2
1288	5109	228	48	62	chr3	92165195	92166469	-67433314	+	RMER12B	LTR	ERVK	1	1247	-157	2
1288	5109	228	48	62	chr3	92166646	92166795	-67432988	+	RMER12B	LTR	ERVK	1248	1404	0	2
1288	1563	238	29	7	chr3	92170512	92170922	-67428861	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	2
1288	608	155	0	0	chr3	92173426	92173523	-67426260	-	RLTR26	LTR	ERVK	-542	100	4	2
1288	750	269	104	65	chr3	92193167	92193447	-67406336	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	85	2
1288	750	269	104	65	chr3	92193745	92193818	-67405965	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-284	84	2	2
1288	627	214	0	53	chr3	92200765	92200898	-67398885	+	MTC	LTR	MaLR	291	416	-5	2
1288	1755	217	17	3	chr3	92205291	92205638	-67394145	-	MTC	LTR	MaLR	-69	352	1	2
1288	263	279	16	0	chr3	92213209	92213270	-67386513	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	62	-966	2
1288	1258	227	131	8	chr3	92214518	92214891	-67384892	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	2
1288	727	291	138	19	chr3	92237910	92238229	-67361554	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	3	3
1288	245	250	15	45	chr3	92246367	92246434	-67353349	+	RLTR28	LTR	ERVL	431	495	-29	3
1288	2152	197	59	61	chr3	92248469	92248778	-67351005	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	325	-202	3
1288	2152	197	59	61	chr3	92248960	92249142	-67350641	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	326	491	-36	3
1288	2063	164	77	0	chr3	92249677	92250043	-67349740	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	3
1288	2212	187	67	28	chr3	92252832	92253372	-67346411	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	561	0	3
1288	873	295	69	71	chr3	92253588	92253938	-67345845	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	9	3
1288	3732	166	72	6	chr3	92265025	92265734	-67334049	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	3
1288	835	319	109	70	chr3	92266478	92266890	-67332893	-	MER77	LTR	ERVL	-82	525	98	3
1288	331	207	11	22	chr3	92267488	92267577	-67332206	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-71	1438	1351	3
1288	282	384	64	43	chr3	92273044	92273278	-67326505	+	LTR16E2	LTR	ERVL	303	541	-27	3
1288	2332	92	89	6	chr3	92273981	92274318	-67325465	+	RLTR8	LTR	ERVK	1	365	0	3
1289	584	244	25	43	chr3	92298239	92298429	-67301354	-	MER34A	LTR	ERV1	-14	573	381	4
1289	417	254	93	60	chr3	92300121	92300272	-67299511	-	MER34A	LTR	ERV1	-348	223	68	4
1289	1089	272	53	23	chr3	92312084	92312426	-67287357	-	MER31A	LTR	ERV1	-8	477	126	4
1289	320	234	62	21	chr3	92312790	92312886	-67286897	-	MER31A	LTR	ERV1	-360	125	26	4
1289	964	188	0	21	chr3	92325993	92326183	-67273600	+	RLTR18-int	LTR	ERVK	5165	5350	-11	4
1289	1055	227	50	43	chr3	92326187	92326506	-67273277	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	281	-335	4
1289	818	279	21	46	chr3	92333729	92333969	-67265814	+	RLTR18B	LTR	ERVK	278	511	-1	4
1289	903	313	84	35	chr3	92385340	92385684	-67214099	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	361	-18	5
1289	294	277	49	10	chr3	92405313	92405415	-67194368	+	LTR41B	LTR	ERVL	643	748	-10	5
1290	1062	207	114	65	chr3	92407652	92408004	-67191779	-	RMER13A	LTR	ERVK	-394	466	98	5
1290	3217	231	86	33	chr3	92427046	92427870	-67171913	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	480	1347	-23	5
1290	1312	241	36	42	chr3	92427877	92428263	-67171520	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
1290	1974	176	36	0	chr3	92432499	92432862	-67166921	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	6
1290	488	237	76	0	chr3	92433833	92433964	-67165819	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	276	6
1290	918	277	155	19	chr3	92441366	92441559	-67158224	-	RMER5	LTR	ERV1	-76	458	215	6
1290	2236	121	59	82	chr3	92441559	92441999	-67157784	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	6
1290	918	277	155	19	chr3	92441999	92442180	-67157603	-	RMER5	LTR	ERV1	-320	214	33	6
1290	485	133	12	173	chr3	92443866	92444039	-67155744	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1011	1155	-6089	6
1290	665	113	10	176	chr3	92444207	92444400	-67155383	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1168	1328	-5916	6
1290	2229	213	43	41	chr3	92456368	92456724	-67143059	-	RMER20B	LTR	ERVK	-137	490	134	6
1290	2229	213	43	41	chr3	92456746	92456874	-67142909	-	RMER20B	LTR	ERVK	-494	133	6	6
1290	1462	230	127	24	chr3	92476083	92476461	-67123322	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	6
1290	2094	180	30	28	chr3	92486986	92487420	-67112363	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-258	770	336	6
1290	278	180	33	180	chr3	92494738	92494860	-67104923	+	MER34B-int	LTR	ERV1	1838	1941	-3415	6
1290	853	147	6	28	chr3	92494914	92495096	-67104687	+	MER34B-int	LTR	ERV1	1932	2109	-3247	6
1290	1244	207	95	106	chr3	92498750	92499128	-67100655	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1290	2469	220	72	29	chr3	92499129	92499713	-67100070	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	2	610	-760	6
1290	230	330	70	52	chr3	92520533	92520648	-67079135	-	RMER12	LTR	ERVK	-61	1261	1145	1
1290	3345	233	171	29	chr3	92520816	92521893	-67077890	-	RMER12	LTR	ERVK	-92	1230	1	2
1290	929	179	31	31	chr3	92530569	92530765	-67069018	+	MTB	LTR	MaLR	1	196	-204	2
1290	2399	121	142	19	chr3	92533704	92534133	-67065650	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	3
1290	3257	41	8	0	chr3	92534272	92534665	-67065118	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1291	3400	19	2	2	chr3	92549233	92549649	-67050134	-	MT-int	LTR	MaLR	-20	1078	663	5
1291	3373	43	2	0	chr3	92602953	92603348	-66996435	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1291	4920	133	20	71	chr3	92619621	92620570	-66979213	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	2	902	0	1
1291	644	252	32	6	chr3	92623393	92623549	-66976234	+	MTC	LTR	MaLR	1	160	-261	1
1291	402	350	102	0	chr3	92624185	92624371	-66975412	+	RMER15	LTR	ERVL	371	575	0	1
1291	717	302	66	4	chr3	92624589	92624832	-66974951	+	RMER15-int	LTR	ERVL	281	538	-4461	1
1291	344	320	0	54	chr3	92625115	92625244	-66974539	+	RMER15	LTR	ERVL	400	521	-54	1
1291	1229	279	71	5	chr3	92640214	92640606	-66959177	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	1
1291	976	267	109	17	chr3	92646939	92647286	-66952497	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	156	1
1291	324	250	65	11	chr3	92647301	92647394	-66952389	-	RMER5	LTR	ERV1	-433	101	4	1
1291	1839	208	50	47	chr3	92647468	92647852	-66951931	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	524	1
1291	466	149	0	0	chr3	92647854	92647921	-66951862	-	RMER13B	LTR	ERVK	-841	67	1	1
1291	231	297	69	10	chr3	92651025	92651127	-66948656	+	MTEb	LTR	MaLR	272	379	0	1
1291	717	250	97	0	chr3	92652913	92653089	-66946694	+	MTEb	LTR	MaLR	1	193	-186	1
1291	271	161	117	0	chr3	92656536	92656616	-66943167	-	MTE2a	LTR	MaLR	-4	375	284	1
1292	1060	240	196	25	chr3	92678050	92678371	-66921412	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	3	2
1292	1731	130	106	0	chr3	92679059	92679351	-66920432	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	35	2
1292	1026	224	130	41	chr3	92683973	92684266	-66915517	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-51	319	1	2
1292	2240	159	85	16	chr3	92688330	92688707	-66911076	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	3	405	-2	2
1292	710	335	55	30	chr3	92702996	92703362	-66896421	+	RMER5	LTR	ERV1	4	378	-156	2
1292	525	217	93	56	chr3	92703566	92703682	-66896101	+	RMER5	LTR	ERV1	368	488	-46	2
1292	525	217	93	56	chr3	92703728	92703772	-66896011	+	RMER5	LTR	ERV1	489	534	0	2
1292	1226	154	24	24	chr3	92709236	92709442	-66890341	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	206	-1366	2
1292	2623	127	54	52	chr3	92709440	92709974	-66889809	+	RLTR21	LTR	ERVK	560	1094	-478	2
1292	367	257	268	19	chr3	92710000	92710027	-66889756	+	RMER12B	LTR	ERVK	1201	1252	-152	2
1292	367	257	268	19	chr3	92710066	92710173	-66889610	+	RMER12B	LTR	ERVK	1253	1402	-2	2
1292	4861	86	16	97	chr3	92713300	92714114	-66885669	-	RMER17A	LTR	ERVK	-3	748	1	2
1292	1812	235	56	28	chr3	92716102	92716601	-66883182	+	RLTR11A	LTR	ERVK	16	528	0	2
1292	3762	18	0	0	chr3	92717892	92718288	-66881495	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1292	9915	28	2	1	chr3	92718288	92719385	-66880398	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
1292	3775	15	0	0	chr3	92719385	92719781	-66880002	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1292	229	204	0	20	chr3	92740790	92740840	-66858943	+	RLTR28B	LTR	ERVL	68	116	-365	2
1292	424	299	31	22	chr3	92754168	92754380	-66845403	-	RMER15	LTR	ERVL	-42	533	273	3
1292	2177	202	27	52	chr3	92754913	92755354	-66844429	+	RLTR28	LTR	ERVL	5	438	-86	3
1292	3213	76	2	10	chr3	92755354	92755753	-66844030	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1292	2177	202	27	52	chr3	92755753	92755827	-66843956	+	RLTR28	LTR	ERVL	439	507	-17	3
1292	335	289	284	24	chr3	92767168	92767371	-66832412	-	RMER15	LTR	ERVL	-47	528	273	3
1292	237	269	63	13	chr3	92769177	92769256	-66830527	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-315	93	11	3
1292	874	237	50	29	chr3	92791980	92792219	-66807564	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-126	244	1	3
1292	237	210	15	75	chr3	92793038	92793105	-66806678	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-354	174	112	3
1292	283	280	83	74	chr3	92795326	92795434	-66804349	+	RMER15	LTR	ERVL	356	464	-111	3
1293	1785	234	54	22	chr3	92799916	92800322	-66799461	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1293	247	211	58	0	chr3	92809153	92809205	-66790578	-	RMER20B	LTR	ERVK	-11	616	562	3
1293	1788	202	78	10	chr3	92809207	92809607	-66790176	-	RMER20B	LTR	ERVK	-200	427	1	3
1293	1861	187	18	95	chr3	92812158	92812559	-66787224	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	3
1293	1068	270	37	7	chr3	92827092	92827364	-66772419	+	MLT1D	LTR	MaLR	41	320	-185	4
1293	1469	254	60	70	chr3	92841040	92841145	-66758638	-	RMER5	LTR	ERV1	-8	526	429	4
1293	1469	254	60	70	chr3	92841571	92841964	-66757819	-	RMER5	LTR	ERV1	-106	428	33	4
1293	974	212	80	139	chr3	92842108	92842409	-66757374	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-2481	2836	2554	4
1293	2350	211	46	75	chr3	92842424	92842615	-66757168	-	RMER20B	LTR	ERVK	-47	580	420	4
1293	2350	211	46	75	chr3	92842792	92842867	-66756916	-	RMER20B	LTR	ERVK	-208	419	337	4
1293	2350	211	46	75	chr3	92842904	92843224	-66756559	-	RMER20B	LTR	ERVK	-291	336	12	4
1293	2364	172	110	21	chr3	92843230	92843563	-66756220	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-2760	2557	2184	4
1293	2364	227	54	26	chr3	92843606	92844069	-66755714	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3134	2183	1812	4
1293	343	109	17	52	chr3	92849799	92849857	-66749926	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3517	1800	1745	4
1293	1687	109	74	0	chr3	92849881	92850138	-66749645	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-51	276	1	4
1293	7461	125	11	2	chr3	92850138	92851296	-66748487	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	795	4
1293	2175	221	30	29	chr3	92851331	92851905	-66747878	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3606	1711	1295	4
1293	1617	217	136	85	chr3	92851931	92852460	-66747323	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4029	1288	733	4
1293	759	189	77	19	chr3	92852498	92852570	-66747213	+	MT2A	LTR	ERVL	13	84	-449	4
1293	759	231	77	21	chr3	92853225	92853367	-66746416	+	MT2A	LTR	ERVL	85	351	-124	4
1293	716	218	26	160	chr3	92854224	92854537	-66745246	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1112	1359	-1879	4
1293	283	108	148	57	chr3	92854603	92854691	-66745092	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1342	1437	-1801	4
1293	3350	203	106	136	chr3	92854707	92856197	-66743586	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1428	3057	-3080	4
1293	3350	203	106	136	chr3	92856243	92856540	-66743243	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	3058	3384	-2753	4
1293	808	242	35	13	chr3	92859125	92859351	-66740432	-	MTD	LTR	MaLR	-188	231	1	4
1293	2314	108	48	20	chr3	92859436	92859794	-66739989	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	4
1293	2078	169	23	65	chr3	92862164	92862563	-66737220	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	4
1293	296	261	7	173	chr3	92869062	92869201	-66730582	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	333	448	-105	4
1293	553	267	45	40	chr3	92869583	92869782	-66730001	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	4
1293	2988	170	120	16	chr3	92869784	92869909	-66729874	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	132	-624	4
1293	3923	64	11	0	chr3	92869909	92870379	-66729404	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	4
1293	2988	170	120	16	chr3	92870379	92870936	-66728847	+	RMER6A	LTR	ERVK	133	755	-1	4
1293	253	291	106	20	chr3	92871220	92871371	-66728412	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	414	577	-4740	4
1293	271	313	71	112	chr3	92872114	92872283	-66727500	+	MTEa	LTR	MaLR	56	217	-162	4
1293	945	244	208	63	chr3	92872470	92872994	-66726789	+	MT2B	LTR	ERVL	2	601	0	4
1293	580	243	6	91	chr3	92873251	92873560	-66726223	-	RMER17C	LTR	ERVK	-327	482	8	4
1293	4148	129	17	70	chr3	92873560	92873962	-66725821	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2	3236	2875	4
1293	4148	129	17	70	chr3	92873994	92874372	-66725411	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-364	2874	2499	4
1293	5652	219	85	102	chr3	92874414	92877049	-66722734	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-731	2507	1	4
1293	892	172	48	48	chr3	92877049	92877257	-66722526	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	203	4
1293	1807	174	49	23	chr3	92879130	92879476	-66720307	+	ORR1B1	LTR	MaLR	40	394	0	4
1293	722	165	0	8	chr3	92879632	92879759	-66720024	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	126	-220	4
1293	2167	82	138	39	chr3	92879759	92880165	-66719618	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	2	447	-85	4
1293	1442	123	32	0	chr3	92880186	92880406	-66719377	+	ORR1A2	LTR	MaLR	93	319	-8	4
1293	2202	154	80	24	chr3	92880494	92880944	-66718839	+	BGLII_B	LTR	ERVK	3	435	-6	4
1293	681	199	46	66	chr3	92882322	92882591	-66717192	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	81	4
1293	3873	46	5	2	chr3	92882591	92883026	-66716757	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
1293	676	187	68	62	chr3	92883026	92883045	-66716738	-	RMER10B	LTR	ERVL	-318	80	68	4
1293	2638	65	0	0	chr3	92883045	92883369	-66716414	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	20	343	-7238	4
1293	925	148	4	177	chr3	92883367	92883638	-66716145	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	729	952	-6629	4
1293	803	211	223	56	chr3	92883726	92884127	-66715656	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	314	611	-4795	4
1293	316	175	0	0	chr3	92884102	92884159	-66715624	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1089	1145	-4261	4
1293	388	95	0	0	chr3	92884164	92884227	-66715556	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1885	1947	-5634	4
1293	44534	19	4	16	chr3	92884233	92889248	-66710535	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	2552	7581	0	4
1293	442	258	19	34	chr3	92889248	92889282	-66710501	-	RMER10B	LTR	ERVL	-324	118	86	4
1293	3704	44	5	2	chr3	92889282	92889717	-66710066	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
1293	442	211	21	21	chr3	92889717	92889799	-66709984	-	RMER10B	LTR	ERVL	-313	85	5	4
1293	382	278	29	94	chr3	92891724	92891895	-66707888	+	ORR1B1	LTR	MaLR	49	208	-186	4
1293	327	234	0	25	chr3	92891869	92891948	-66707835	+	ORR1B1	LTR	MaLR	94	170	-159	4
1293	3263	50	2	15	chr3	92893016	92893421	-66706362	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1293	2302	201	93	15	chr3	92893584	92894110	-66705673	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	4
1293	256	265	82	0	chr3	92894615	92894713	-66705070	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-18	347	242	4
1293	473	175	39	0	chr3	92900164	92900267	-66699516	+	MTD	LTR	MaLR	13	119	-302	5
1293	803	232	209	11	chr3	92900517	92900775	-66699008	+	MTD	LTR	MaLR	106	419	0	5
1293	302	202	35	72	chr3	92911648	92911777	-66688006	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-42	1072	977	5
1293	264	235	148	0	chr3	92912426	92912507	-66687276	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-1021	93	1	5
1294	332	232	122	46	chr3	92941373	92941504	-66658279	+	MLT2D	LTR	ERVL	10	150	-264	5
1294	1565	265	26	11	chr3	92944901	92945252	-66654531	+	MTD	LTR	MaLR	16	371	-48	5
1294	642	345	99	24	chr3	92947104	92947558	-66652225	-	RMER5	LTR	ERV1	-39	495	8	5
1294	532	291	237	10	chr3	92954685	92955095	-66644688	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	505	0	5
1294	8732	202	66	23	chr3	92967933	92970159	-66629624	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1	2322	-4	5
1294	3127	140	29	12	chr3	92970162	92970681	-66629102	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	5
1294	2823	42	0	3	chr3	92972430	92972767	-66627016	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-1	336	1	6
1294	8922	25	2	5	chr3	92972767	92973849	-66625934	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5403	6
1294	20882	30	24	10	chr3	92973830	92976458	-66623325	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3811	2670	8	6
1294	2834	42	0	3	chr3	92976458	92976796	-66622987	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	6
1294	1048	286	102	70	chr3	92976814	92977344	-66622439	-	RMER13A	LTR	ERVK	-200	660	114	6
1294	244	313	118	30	chr3	92980295	92980430	-66619353	+	LTR33C	LTR	ERVL	477	623	-6	6
1294	329	250	30	10	chr3	92982608	92982709	-66617074	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	401	6
1294	870	288	158	12	chr3	92982818	92983141	-66616642	-	MLT1D	LTR	MaLR	-135	370	1	6
1294	1322	124	129	30	chr3	92986372	92986656	-66613127	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	279	-89	6
1294	914	244	161	16	chr3	93036096	93036215	-66563568	+	MTD	LTR	MaLR	1	134	-285	2
1294	914	244	161	16	chr3	93036247	93036443	-66563340	+	MTD	LTR	MaLR	135	361	-58	2
1294	865	258	237	39	chr3	93036427	93036887	-66562896	-	MTD-int	LTR	MaLR	-707	551	1	2
1294	1461	258	57	12	chr3	93036887	93037288	-66562495	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1294	1978	101	9	57	chr3	93041536	93041871	-66557912	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	4	322	0	3
1294	2019	201	69	18	chr3	93042088	93042581	-66557202	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	10	3
1294	352	318	86	113	chr3	93045993	93046319	-66553464	-	MER57F	LTR	ERV1	-119	317	1	4
1294	731	268	224	29	chr3	93049309	93049755	-66550028	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	549	-36	4
1294	294	251	22	15	chr3	93049806	93049936	-66549847	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	2	146	-5114	4
1294	393	278	26	9	chr3	93050156	93050241	-66549542	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	179	262	-4998	4
1294	393	278	26	9	chr3	93050611	93050641	-66549142	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	263	295	-4965	4
1294	2775	199	65	32	chr3	93050772	93050832	-66548951	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	61	-1787	5
1294	2775	199	65	32	chr3	93050853	93050948	-66548835	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	62	163	-1685	5
1294	2775	199	65	32	chr3	93050988	93051556	-66548227	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	164	748	-1100	5
1294	410	123	110	12	chr3	93052165	93052247	-66547536	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1593	1682	-166	5
1294	569	310	24	2	chr3	93052325	93052580	-66547203	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	279	532	-5248	4
1294	698	240	22	17	chr3	93052700	93052878	-66546905	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	1378	1556	-3704	4
1294	4026	226	26	47	chr3	93053126	93054229	-66545554	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5458	6537	-13	5
1294	358	192	105	9	chr3	93054248	93054353	-66545430	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	131	-454	5
1294	840	297	146	13	chr3	93059072	93059403	-66540380	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	359	0	6
1294	1744	229	39	36	chr3	93059868	93060361	-66539422	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-33	494	1	7
1295	1479	216	65	30	chr3	93061979	93062347	-66537436	+	RLTR25B	LTR	ERVK	482	862	-166	7
1295	873	187	44	66	chr3	93062556	93062813	-66536970	+	RLTR25A	LTR	ERVK	742	1103	0	7
1295	1183	202	185	20	chr3	93062858	93063156	-66536627	-	MTD	LTR	MaLR	-43	376	30	7
1295	722	279	17	35	chr3	93063173	93063403	-66536380	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	1066	1291	-5259	7
1295	1897	236	77	39	chr3	93063404	93064051	-66535732	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	1685	2356	-6603	7
1295	2051	221	169	32	chr3	93064034	93064697	-66535086	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4231	4984	-1566	7
1295	427	214	20	30	chr3	93064673	93064774	-66535009	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	2632	2731	-3049	7
1295	355	329	39	85	chr3	93064779	93064932	-66534851	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4981	5126	-1424	7
1295	541	279	43	38	chr3	93064932	93065118	-66534665	+	RMER4A	LTR	ERVK	251	437	-29	7
1295	5052	168	42	49	chr3	93065167	93066243	-66533540	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7892	8959	0	8
1295	340	218	0	25	chr3	93066251	93066331	-66533452	+	RLTR12B	LTR	ERVK	9	86	-442	8
1295	373	300	69	103	chr3	93066333	93066612	-66533171	+	RLTR15	LTR	ERVK	48	267	-92	8
1295	2450	83	0	58	chr3	93067348	93067693	-66532090	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	327	0	8
1295	225	213	64	0	chr3	93069185	93069232	-66530551	-	MT2B	LTR	ERVL	-309	292	243	8
1295	2328	188	79	28	chr3	93097971	93098063	-66501720	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	465	1
1295	2328	188	79	28	chr3	93098112	93098549	-66501234	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-96	464	4	1
1295	2286	142	36	9	chr3	93098549	93098969	-66500814	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	1896	1
1295	439	275	78	36	chr3	93099153	93099319	-66500464	+	RMER20B	LTR	ERVK	158	330	-297	1
1295	4784	169	36	29	chr3	93099319	93100173	-66499610	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	860	0	1
1295	638	277	98	61	chr3	93100461	93100757	-66499026	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	81	387	-6532	1
1295	634	281	30	0	chr3	93101553	93101717	-66498066	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1651	1819	-5100	1
1295	693	213	52	0	chr3	93102054	93102209	-66497574	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2791	2953	-6006	1
1295	503	292	46	51	chr3	93102305	93102586	-66497197	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	4752	4998	-782	1
1295	227	204	56	0	chr3	93102589	93102643	-66497140	+	RLTR12B	LTR	ERVK	9	65	-463	1
1295	3411	43	2	0	chr3	93104131	93104526	-66495257	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1295	270	247	0	64	chr3	93104818	93104896	-66494887	+	RLTR15	LTR	ERVK	38	110	-249	1
1295	1817	203	77	0	chr3	93105891	93106270	-66493513	+	MTD	LTR	MaLR	12	419	0	1
1295	4847	91	35	50	chr3	93107970	93108732	-66491051	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	1
1295	1997	239	118	73	chr3	93115062	93115748	-66484035	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	717	-20	1
1295	403	274	28	9	chr3	93116199	93116295	-66483488	+	MTEb	LTR	MaLR	1	97	-282	1
1295	260	301	47	81	chr3	93125799	93125947	-66473836	-	MT2B2	LTR	ERVL	-319	265	123	1
1295	312	329	53	30	chr3	93141430	93141599	-66458184	+	RLTR12B	LTR	ERVK	59	231	-297	1
1295	375	209	209	0	chr3	93141610	93141701	-66458082	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5972	2987	2878	1
1295	597	153	9	9	chr3	93141698	93141810	-66457973	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	4307	4418	-4541	1
1295	2149	141	23	35	chr3	93141803	93142200	-66457583	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	3024	3415	-5544	1
1295	340	283	209	47	chr3	93143144	93143359	-66456424	-	RMER12	LTR	ERVK	-105	1217	1102	1
1295	1536	261	86	20	chr3	93143884	93144433	-66455350	+	RMER19B	LTR	ERVK	164	902	0	1
1295	453	294	10	10	chr3	93144433	93144536	-66455247	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	5005	5107	-1443	1
1295	525	244	81	36	chr3	93144545	93144738	-66455045	+	RMER4A	LTR	ERVK	251	554	-31	1
1295	5680	157	34	55	chr3	93144738	93144996	-66454787	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7771	8040	-919	1
1295	5680	157	34	55	chr3	93145169	93145885	-66453898	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8041	8738	-221	1
1295	5680	157	34	55	chr3	93146025	93146208	-66453575	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8739	8904	-55	1
1295	356	281	96	89	chr3	93146284	93146715	-66453068	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	325	-203	1
1295	3519	13	39	3	chr3	93149564	93149946	-66449837	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1295	436	274	147	51	chr3	93164627	93164900	-66434883	+	MLT2D	LTR	ERVL	91	389	-25	2
1295	1927	144	27	61	chr3	93166501	93166916	-66432867	+	RMER10B	LTR	ERVL	4	398	0	2
1295	936	182	81	0	chr3	93167483	93167692	-66432091	+	RLTR28	LTR	ERVL	252	477	-47	2
1295	1944	182	40	64	chr3	93168403	93168856	-66430927	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	442	0	2
1295	1228	149	18	156	chr3	93168935	93169262	-66430521	+	RLTR24	LTR	ERV1	32	313	-216	2
1295	784	264	100	115	chr3	93169355	93169855	-66429928	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8249	8659	-300	2
1295	9886	103	21	7	chr3	93169904	93171243	-66428540	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-4463	2456	1099	2
1295	225	151	76	76	chr3	93172544	93172623	-66427160	+	RMER2	LTR	ERV1	461	539	-28	2
1295	1818	208	32	43	chr3	93180105	93180543	-66419240	-	RMER10A	LTR	ERVL	-9	433	1	2
1295	1632	241	45	2	chr3	93181240	93181640	-66418143	+	MTD	LTR	MaLR	2	418	-1	2
1295	1883	178	45	41	chr3	93184435	93184458	-66415325	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	419	2
1295	1883	178	45	41	chr3	93184518	93184934	-66414849	-	RMER10A	LTR	ERVL	-24	418	1	2
1296	273	240	92	20	chr3	93206341	93206439	-66393344	+	RLTR23	LTR	ERV1	325	429	-1	3
1296	1807	182	45	50	chr3	93214311	93214711	-66385072	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	3
1296	730	111	35	49	chr3	93214999	93215028	-66384755	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	23	-375	3
1296	730	111	35	49	chr3	93215050	93215162	-66384621	+	RMER10B	LTR	ERVL	24	140	-258	3
1296	822	132	19	44	chr3	93215255	93215414	-66384369	+	RMER10B	LTR	ERVL	244	398	0	3
1296	1845	172	29	34	chr3	93221164	93221574	-66378209	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	1	3
1296	523	267	8	8	chr3	93227038	93227170	-66372613	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-76	294	163	3
1296	353	162	15	0	chr3	93228959	93229027	-66370756	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-459	69	1	3
1296	281	269	0	0	chr3	93229027	93229105	-66370678	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-475	79	2	3
1296	258	277	12	35	chr3	93230841	93230927	-66368856	+	MLT1A1	LTR	MaLR	321	404	-4	3
1296	3150	61	2	25	chr3	93253586	93253991	-66345792	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1296	1116	298	27	19	chr3	93255433	93255799	-66343984	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	207	4
1296	660	260	91	71	chr3	93255951	93256303	-66343480	+	MLT1B	LTR	MaLR	32	390	0	4
1296	410	298	195	54	chr3	93265170	93265267	-66334516	+	MLT1A0	LTR	MaLR	5	112	-253	4
1296	2872	129	7	5	chr3	93265267	93265687	-66334096	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1296	410	298	195	54	chr3	93265687	93265806	-66333977	+	MLT1A0	LTR	MaLR	113	260	-105	4
1296	4136	64	60	8	chr3	93265806	93266338	-66333445	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	4
1296	410	315	120	88	chr3	93266338	93266442	-66333341	+	MLT1A0	LTR	MaLR	261	373	-17	4
1296	849	264	54	70	chr3	93281483	93281876	-66317907	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	417	-225	4
1296	1274	199	159	31	chr3	93284877	93285203	-66314580	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	3	4
1296	598	266	91	0	chr3	93287936	93288090	-66311693	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	203	4
1296	6783	178	46	50	chr3	93294731	93295240	-66304543	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1094	4
1296	6783	178	46	50	chr3	93295289	93296356	-66303427	-	RLTR21	LTR	ERVK	-479	1093	1	4
1296	1738	137	137	3	chr3	93301839	93302182	-66297601	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	389	-5	5
1296	1137	255	102	14	chr3	93305219	93305581	-66294202	+	MTD	LTR	MaLR	10	403	-16	5
1296	3055	45	55	0	chr3	93305661	93306040	-66293743	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1296	1907	154	92	76	chr3	93313899	93314335	-66285448	-	RLTR24	LTR	ERV1	-2	527	85	5
1296	289	252	35	106	chr3	93315339	93315481	-66284302	-	MTEb	LTR	MaLR	-15	364	233	5
1296	1284	220	139	28	chr3	93320314	93320674	-66279109	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	20	5
1296	457	309	128	25	chr3	93322058	93322300	-66277483	-	MLT1M	LTR	MaLR	-376	296	30	5
1297	340	77	39	0	chr3	93328327	93328379	-66271404	+	RMER6A	LTR	ERVK	57	110	-646	5
1297	2285	158	8	16	chr3	93328435	93328916	-66270867	+	RMER6A	LTR	ERVK	299	734	-22	5
1297	388	265	78	29	chr3	93331674	93331882	-66267901	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-26	501	301	5
1297	300	233	57	57	chr3	93331950	93332109	-66267674	-	RLTR15	LTR	ERVK	-68	291	133	5
1297	382	148	117	27	chr3	93332197	93332308	-66267475	-	RLTR15	LTR	ERVK	-238	121	1	5
1297	473	267	124	36	chr3	93332345	93332594	-66267189	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-216	312	42	5
1297	949	141	10	36	chr3	93335654	93335846	-66263937	+	MTC	LTR	MaLR	10	196	-211	5
1297	1814	122	63	13	chr3	93335846	93336146	-66263637	+	ORR1A2	LTR	MaLR	11	325	-2	5
1297	1186	128	27	10	chr3	93336146	93336361	-66263422	+	MTC	LTR	MaLR	185	406	-1	5
1297	1577	168	105	0	chr3	93336569	93336884	-66262899	+	RLTR1	LTR	ERV1	277	624	0	5
1297	757	288	120	30	chr3	93337160	93337461	-66262322	+	ORR1E	LTR	MaLR	30	357	-2	5
1297	4425	240	44	47	chr3	93337520	93338766	-66261017	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	10	1251	-119	5
1297	306	286	28	9	chr3	93339097	93339203	-66260580	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1261	1368	-2	5
1297	625	247	317	4	chr3	93339209	93339477	-66260306	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	356	-3	5
1297	1329	103	4	63	chr3	93341577	93341816	-66257967	+	RMER6B	LTR	ERVK	3	227	-234	5
1297	630	201	300	7	chr3	93343607	93343900	-66255883	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	5
1297	3240	232	38	45	chr3	93345026	93345853	-66253930	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	2	822	-4169	5
1297	2639	111	15	29	chr3	93346035	93346410	-66253373	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2791	3165	-2972	5
1297	6049	63	33	10	chr3	93346410	93347198	-66252585	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	806	1	5
1297	2639	111	15	29	chr3	93347198	93347231	-66252552	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3166	3193	-2944	5
1297	494	80	0	202	chr3	93347669	93347712	-66252071	-	MTB	LTR	MaLR	0	407	378	5
1297	494	80	0	202	chr3	93347886	93347951	-66251832	-	MTB	LTR	MaLR	-30	377	321	5
1297	1105	81	155	9	chr3	93347951	93348338	-66251445	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
1297	2297	83	3	33	chr3	93348338	93348658	-66251125	-	MTB	LTR	MaLR	-91	309	1	5
1297	1891	201	81	13	chr3	93353015	93353409	-66246374	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
1297	5795	33	5	0	chr3	93354630	93355297	-66244486	+	MERVL-int	LTR	ERVL	4678	5347	-138	6
1297	273	269	95	34	chr3	93356061	93356220	-66243563	-	MLT1J	LTR	MaLR	-344	168	25	6
1297	1508	164	100	9	chr3	93388615	93388935	-66210848	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	349	-25	6
1297	308	292	133	50	chr3	93389743	93389873	-66209910	-	LTR41	LTR	ERVL	0	768	627	6
1297	308	292	133	50	chr3	93389988	93390037	-66209746	-	LTR41	LTR	ERVL	-142	626	574	6
1297	475	308	145	39	chr3	93390072	93390410	-66209373	-	MER21B	LTR	ERV1	-22	841	468	6
1297	1582	32	384	0	chr3	93391365	93391615	-66208168	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	6
1297	2030	148	66	5	chr3	93392321	93392702	-66207081	+	RMER6B	LTR	ERVK	58	461	0	6
1297	1626	219	43	13	chr3	93394098	93394491	-66205292	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	6
1297	341	299	116	24	chr3	93395508	93395758	-66204025	+	MLT1E2	LTR	MaLR	17	289	-338	6
1297	2961	114	31	5	chr3	93399805	93400254	-66199529	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	7
1297	683	192	37	192	chr3	93402173	93402547	-66197236	-	RMER17C	LTR	ERVK	-94	316	1	7
1297	3869	60	83	39	chr3	93403001	93403541	-66196242	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	7
1297	1744	164	99	43	chr3	93408531	93408945	-66190838	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	6	7
1297	245	264	35	20	chr3	93409737	93409847	-66189936	+	MLT1D	LTR	MaLR	5	113	-514	7
1297	258	253	35	46	chr3	93409920	93410007	-66189776	+	MLT1D	LTR	MaLR	249	334	-171	7
1297	248	259	72	24	chr3	93410346	93410429	-66189354	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	279	7
1297	2456	187	91	23	chr3	93416746	93417276	-66182507	+	RMER2	LTR	ERV1	2	567	0	7
1297	3225	55	2	15	chr3	93417439	93417844	-66181939	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	7
1297	1112	205	76	0	chr3	93425236	93425485	-66174298	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-1	377	110	7
1297	437	250	23	167	chr3	93425574	93425790	-66173993	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-161	233	49	7
1297	1266	173	184	68	chr3	93427516	93427869	-66171914	+	RMER10B	LTR	ERVL	5	398	0	7
1297	2110	145	79	22	chr3	93429326	93429765	-66170018	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-6	435	3	7
1297	1193	168	32	0	chr3	93429854	93430074	-66169709	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	93	7
1297	1856	103	138	37	chr3	93430125	93430530	-66169253	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-85	447	2	7
1297	663	145	21	2	chr3	93430530	93430650	-66169133	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-241	153	1	7
1297	1621	178	45	42	chr3	93430784	93431071	-66168712	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	98	7
1297	4201	118	8	119	chr3	93431071	93431916	-66167867	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	7
1297	1621	178	45	42	chr3	93431916	93431981	-66167802	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-297	97	41	7
1297	812	203	29	29	chr3	93433863	93434071	-66165712	+	RMER17C	LTR	ERVK	203	410	0	7
1297	601	219	44	104	chr3	93434071	93434254	-66165529	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	172	-3066	7
1297	407	200	37	12	chr3	93434420	93434501	-66165282	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1618	1700	-1538	7
1297	292	209	15	15	chr3	93434907	93434975	-66164808	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1163	1230	-2008	7
1297	4868	160	130	60	chr3	93434990	93436357	-66163426	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1119	2502	-736	7
1297	4661	151	37	48	chr3	93436393	93436747	-66163036	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2501	2868	-370	7
1297	4661	151	37	48	chr3	93436796	93437191	-66162592	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2869	3238	0	7
1297	790	160	0	198	chr3	93437198	93437532	-66162251	+	RMER17C	LTR	ERVK	8	275	-135	7
1297	752	253	210	65	chr3	93437667	93438191	-66161592	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	2	7
1297	341	248	99	13	chr3	93439732	93439883	-66159900	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4740	577	414	7
1297	923	239	22	51	chr3	93440058	93440129	-66159654	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	201	7
1297	2938	171	91	32	chr3	93440129	93440638	-66159145	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	223	7
1297	2938	171	91	32	chr3	93440784	93440988	-66158795	-	RMER6A	LTR	ERVK	-534	222	1	7
1297	923	239	22	51	chr3	93440988	93441189	-66158594	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5117	200	1	7
1297	306	203	0	0	chr3	93441872	93441936	-66157847	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-169	384	321	7
1297	888	243	36	47	chr3	93442114	93442512	-66157271	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-7	434	1	7
1297	263	287	89	44	chr3	93446186	93446321	-66153462	+	RLTR41	LTR	ERV1	306	446	0	7
1297	3597	63	33	2	chr3	93446541	93447001	-66152782	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	474	-1	7
1297	1108	177	100	8	chr3	93447372	93447611	-66152172	-	MTC	LTR	MaLR	-158	263	3	7
1297	266	321	0	24	chr3	93449504	93449587	-66150196	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	245	325	-4992	8
1297	373	252	29	0	chr3	93449590	93449693	-66150090	+	RLTR14	LTR	ERV1	31	136	-246	8
1297	5406	92	14	52	chr3	93449722	93450555	-66149228	+	RLTR13B4	LTR	ERVK	2	803	0	8
1297	3248	97	40	17	chr3	93452252	93452723	-66147060	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	8
1298	647	183	91	59	chr3	93456719	93456940	-66142843	+	RMER17C	LTR	ERVK	181	408	-2	8
1298	1643	253	43	78	chr3	93456940	93457595	-66142188	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	632	-2606	8
1298	385	217	72	0	chr3	93457675	93457758	-66142025	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1618	1706	-1532	8
1298	379	208	110	92	chr3	93458148	93458312	-66141471	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1064	1230	-2008	8
1298	900	169	176	43	chr3	93458327	93458537	-66141246	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1119	1356	-1882	8
1298	1487	197	23	50	chr3	93458577	93458919	-66140864	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1475	1807	-1431	8
1298	3294	163	44	33	chr3	93460815	93461476	-66138307	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1807	2474	-764	8
1298	282	159	0	92	chr3	93461540	93461616	-66138167	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2392	2460	-778	8
1298	1062	107	16	33	chr3	93461814	93461997	-66137786	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2452	2631	-607	8
1298	846	267	12	102	chr3	93462138	93462311	-66137472	+	RMER17C	LTR	ERVK	17	180	-230	8
1298	846	267	12	102	chr3	93462423	93462533	-66137250	+	RMER17C	LTR	ERVK	181	269	-141	8
1298	846	267	12	102	chr3	93462677	93462792	-66136991	+	RMER17C	LTR	ERVK	270	380	-30	8
1298	746	199	152	78	chr3	93462880	93463232	-66136551	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	176	8
1298	1360	258	67	106	chr3	93464900	93465286	-66134497	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4754	563	201	8
1298	2950	177	83	50	chr3	93465286	93465816	-66133967	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	194	8
1298	2950	177	83	50	chr3	93466076	93466275	-66133508	-	RMER6A	LTR	ERVK	-563	193	1	8
1298	1360	258	67	106	chr3	93466275	93466474	-66133309	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5117	200	3	8
1298	1382	259	100	29	chr3	93466951	93467548	-66132235	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	11	8
1298	2591	85	46	27	chr3	93470641	93471053	-66128730	+	RMER16	LTR	ERVK	74	493	-40	8
1298	565	250	24	35	chr3	93471059	93471142	-66128641	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-16	378	295	8
1298	3234	58	2	2	chr3	93471142	93471538	-66128245	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1298	565	250	24	35	chr3	93471538	93471624	-66128159	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-100	294	211	8
1298	406	229	252	4	chr3	93471630	93471703	-66128080	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1001	962	793	8
1298	406	229	252	4	chr3	93471823	93471884	-66127899	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1001	792	646	8
1298	297	190	35	0	chr3	93471857	93471915	-66127868	-	MT2B2	LTR	ERVL	-523	61	2	8
1298	706	210	92	46	chr3	93475521	93475781	-66124002	+	RMER17C	LTR	ERVK	139	410	0	8
1298	1478	246	74	109	chr3	93475781	93476485	-66123298	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	679	-2559	8
1298	327	161	46	46	chr3	93476493	93476558	-66123225	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1618	1682	-1556	8
1298	398	192	25	0	chr3	93477077	93477164	-66122619	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1100	1230	-2008	8
1298	620	227	86	60	chr3	93477179	93477446	-66122337	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1119	1392	-1846	8
1298	3874	175	60	40	chr3	93477485	93478350	-66121433	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1579	2460	-778	8
1298	748	161	0	53	chr3	93478504	93478674	-66121109	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2358	2518	-720	8
1298	1704	125	13	33	chr3	93478742	93479041	-66120742	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2589	2881	-357	8
1298	1941	141	23	29	chr3	93479113	93479457	-66120326	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2897	3238	0	8
1298	970	211	36	166	chr3	93479457	93479928	-66119855	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	8
1298	709	190	119	114	chr3	93479988	93480367	-66119416	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	181	8
1298	265	337	42	88	chr3	93480706	93480898	-66118885	-	MTEa	LTR	MaLR	-162	217	35	8
1298	329	217	0	14	chr3	93481423	93481493	-66118290	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	8
1298	1484	212	62	41	chr3	93481495	93481933	-66117850	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	310	8
1298	1434	230	59	83	chr3	93484661	93485235	-66114548	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	41	553	0	8
1298	1023	254	128	46	chr3	93485552	93485754	-66114029	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	8
1298	3329	190	53	23	chr3	93485754	93486488	-66113295	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	8
1298	1023	254	128	46	chr3	93486488	93486653	-66113130	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	201	398	-4919	8
1298	1306	189	56	10	chr3	93486653	93486941	-66112842	+	ORR1B1	LTR	MaLR	90	390	-4	8
1298	788	237	82	22	chr3	93487032	93487451	-66112332	+	BGLII_B	LTR	ERVK	3	437	-4	8
1298	4429	154	99	40	chr3	93487646	93488178	-66111605	+	RMER16-int	LTR	ERVK	119	716	-4690	8
1298	4429	154	99	40	chr3	93488204	93488614	-66111169	+	RMER16-int	LTR	ERVK	717	1116	-4290	8
1298	1832	219	32	41	chr3	93488770	93489208	-66110575	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1111	1544	-3862	8
1298	1484	211	28	25	chr3	93489554	93489874	-66109909	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1542	1862	-3544	8
1298	3385	121	6	6	chr3	93490072	93490580	-66109203	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1848	2355	-3051	8
1298	885	198	16	5	chr3	93491073	93491261	-66108522	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-2	327	138	8
1298	488	232	199	0	chr3	93491274	93491339	-66108444	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1023	940	796	8
1298	375	229	350	48	chr3	93491455	93491553	-66108230	-	MT2B	LTR	ERVL	-440	161	2	8
1298	488	232	199	0	chr3	93491455	93491520	-66108263	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1023	795	646	8
1298	3465	61	19	82	chr3	93498268	93498782	-66101001	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	8
1298	10045	46	10	3	chr3	93498782	93500000	-66099783	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	0	7244	5980	8
1298	7446	37	26	9	chr3	93500000	93500900	-66098883	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1265	5979	5065	1
1298	4169	75	33	30	chr3	93500893	93501498	-66098285	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-3258	3986	3380	1
1298	11992	42	18	7	chr3	93501468	93503280	-66096503	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-4032	3212	1318	1
1298	260	218	54	54	chr3	93503570	93503662	-66096121	-	MMTV-int	LTR	ERVK	-4749	2504	2413	2
1298	1173	43	0	0	chr3	93504061	93504199	-66095584	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6426	818	681	1
1298	4213	72	102	62	chr3	93504499	93505164	-66094619	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6552	692	1	1
1298	3685	59	19	82	chr3	93505164	93505678	-66094105	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
1298	722	214	67	101	chr3	93505799	93506104	-66093679	-	MT2B	LTR	ERVL	-77	524	183	4
1298	938	162	40	0	chr3	93509308	93509481	-66090302	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	207	9
1298	361	255	0	11	chr3	93509500	93509560	-66090223	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1023	940	881	9
1298	361	255	0	11	chr3	93509683	93509717	-66090066	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1083	880	847	9
1298	377	183	0	0	chr3	93509721	93509781	-66090002	-	MT2B	LTR	ERVL	-540	61	2	4
1298	4159	175	55	22	chr3	93512564	93513426	-66086357	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-6	923	1	1
1298	432	220	11	0	chr3	93513684	93513775	-66086008	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-235	92	1	1
1298	3508	38	5	0	chr3	93514592	93514986	-66084797	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1298	3605	72	19	82	chr3	93515964	93516478	-66083305	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
1298	7838	45	3	2	chr3	93516478	93517389	-66082394	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	0	7244	6333	1
1298	1976	114	13	3	chr3	93517389	93517688	-66082095	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	-385	508	207	1
1298	8519	41	2	5	chr3	93517710	93518721	-66081062	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1172	6072	5065	1
1298	4042	83	30	31	chr3	93518714	93519322	-66080461	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-3258	3986	3380	1
1298	11826	44	48	6	chr3	93519292	93521107	-66078676	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-4032	3212	1322	1
1298	1173	43	0	0	chr3	93521869	93522007	-66077776	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6426	818	681	1
1298	4380	77	107	17	chr3	93522305	93522940	-66076843	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6552	692	1	1
1298	3621	68	19	82	chr3	93522940	93523454	-66076329	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
1298	238	325	47	93	chr3	93529030	93529046	-66070737	-	MT2B2	LTR	ERVL	-308	276	217	2
1298	238	325	47	93	chr3	93529145	93529159	-66070624	-	MT2B2	LTR	ERVL	-308	216	154	2
1298	674	228	35	109	chr3	93533516	93533789	-66065994	-	MT2A	LTR	ERVL	-133	468	100	3
1298	445	131	0	14	chr3	93534826	93534896	-66064887	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	3
1298	1186	184	22	0	chr3	93534974	93535197	-66064586	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1175	1402	-7557	3
1298	310	320	48	55	chr3	93535533	93535824	-66063959	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1928	2216	-2474	4
1298	5500	196	59	62	chr3	93536222	93537714	-66062069	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1352	2839	-3	3
1298	1685	127	17	3	chr3	93537726	93538019	-66061764	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	24	320	-241	3
1298	958	196	6	0	chr3	93538017	93538190	-66061593	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-95	283	110	4
1298	359	251	0	25	chr3	93538279	93538368	-66061415	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-157	189	94	4
1298	370	252	199	28	chr3	93538487	93538703	-66061080	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4864	453	201	4
1298	2482	197	58	11	chr3	93538705	93539274	-66060509	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	161	4
1298	1023	173	5	11	chr3	93539482	93539666	-66060117	-	RMER6A	LTR	ERVK	-573	183	1	4
1298	680	253	30	35	chr3	93539666	93539867	-66059916	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5117	200	1	4
1298	995	228	0	0	chr3	93541365	93541558	-66058225	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-7	400	208	5
1298	3475	106	39	42	chr3	93541558	93541865	-66057918	+	RMER2	LTR	ERV1	1	326	-241	5
1298	3475	106	39	42	chr3	93542482	93542743	-66057040	+	RMER2	LTR	ERV1	327	567	0	5
1298	282	340	0	0	chr3	93544314	93544408	-66055375	+	MURVY-int	LTR	ERV1	1309	1402	-3661	5
1298	281	300	125	36	chr3	93545364	93545571	-66054212	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	4040	4419	-3359	5
1298	4314	74	2	4	chr3	93545731	93546249	-66053534	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-2	517	1	5
1298	469	330	22	22	chr3	93546430	93546663	-66053120	+	MURVY-int	LTR	ERV1	4732	4873	-2579	5
1298	2041	197	57	20	chr3	93548740	93549144	-66050639	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	6
1298	3127	98	131	23	chr3	93552116	93552597	-66047186	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	1	7
1298	2748	43	0	0	chr3	93559377	93559699	-66040084	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	8
1298	40675	38	5	8	chr3	93559699	93564561	-66035222	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	1	8
1298	2797	25	0	9	chr3	93564561	93564886	-66034897	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	8
1298	1324	226	27	34	chr3	93565959	93566408	-66033375	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	12	437	-4	8
1298	1195	254	86	59	chr3	93567201	93567400	-66032383	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	8
1298	2537	199	60	93	chr3	93567400	93567639	-66032144	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	213	-543	8
1298	2537	199	60	93	chr3	93567715	93568257	-66031526	+	RMER6A	LTR	ERVK	214	756	0	8
1298	1195	254	86	59	chr3	93568257	93568501	-66031282	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	201	456	-4861	8
1298	426	277	11	48	chr3	93568478	93568664	-66031119	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	385	563	-4754	8
1298	761	195	152	79	chr3	93570396	93570743	-66029040	+	MT2B	LTR	ERVL	181	601	0	9
1298	954	252	40	109	chr3	93570804	93570946	-66028837	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	270	9
1298	954	252	40	109	chr3	93571094	93571374	-66028409	-	RMER17C	LTR	ERVK	-141	269	17	9
1298	1262	132	66	59	chr3	93571515	93571701	-66028082	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-607	2631	2454	9
1298	3282	166	44	37	chr3	93571907	93572628	-66027155	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-764	2474	1807	9
1298	1378	192	231	78	chr3	93574529	93575126	-66024657	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1431	1807	1119	9
1298	407	242	70	64	chr3	93575141	93575313	-66024470	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2008	1230	1058	1
1298	395	205	72	0	chr3	93575696	93575779	-66024004	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1532	1706	1618	1
1298	1021	275	55	74	chr3	93575859	93576389	-66023394	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2606	632	113	1
1298	582	209	90	28	chr3	93576541	93576718	-66023065	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	221	1
1298	2625	44	28	0	chr3	93578876	93579194	-66020589	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	1
1298	5325	92	12	58	chr3	93582791	93583631	-66016152	-	RLTR13B4	LTR	ERVK	0	803	3	1
1298	376	252	29	0	chr3	93583664	93583767	-66016016	-	RLTR14	LTR	ERV1	-246	136	31	1
1299	1106	181	101	4	chr3	93585747	93585985	-66013798	+	MTC	LTR	MaLR	3	263	-158	1
1299	3607	63	24	4	chr3	93586369	93586834	-66012949	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-1	474	1	1
1299	990	242	35	88	chr3	93590887	93591288	-66008495	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	434	-7	1
1299	990	238	2	106	chr3	93591503	93591571	-66008212	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	336	392	-161	1
1299	1042	278	103	38	chr3	93592232	93592433	-66007350	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	1
1299	2817	183	97	24	chr3	93592433	93592626	-66007157	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	207	-549	1
1299	2817	183	97	24	chr3	93592792	93593302	-66006481	+	RMER6A	LTR	ERVK	208	755	-1	1
1299	1042	278	103	38	chr3	93593302	93593526	-66006257	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	201	454	-4863	1
1299	339	266	91	0	chr3	93593560	93593703	-66006080	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	422	577	-4740	1
1299	752	253	118	68	chr3	93595253	93595776	-66004007	+	MT2B	LTR	ERVL	2	601	0	1
1299	597	245	72	57	chr3	93595953	93596022	-66003761	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	208	1
1299	597	245	72	57	chr3	93596101	93596295	-66003488	-	RMER17C	LTR	ERVK	-203	207	8	1
1299	4944	143	35	43	chr3	93596302	93596668	-66003115	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2894	1
1299	4944	143	35	43	chr3	93596707	93597085	-66002698	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-345	2893	2501	1
1299	4944	162	36	39	chr3	93597121	93598218	-66001565	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-736	2502	1498	1
1299	701	155	211	91	chr3	93598393	93598592	-66001191	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1873	1365	1143	1
1299	292	209	15	15	chr3	93599007	93599075	-66000708	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2008	1230	1163	1
1299	370	111	37	0	chr3	93599508	93599562	-66000221	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1565	1673	1618	1
1299	601	228	26	121	chr3	93599729	93599919	-65999864	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-3066	172	1	1
1299	841	167	48	48	chr3	93599919	93600127	-65999656	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	203	1
1299	1591	172	45	42	chr3	93602015	93602080	-65997703	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	103	-291	1
1299	4444	117	6	66	chr3	93602080	93602879	-65996904	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	1
1299	1591	172	45	42	chr3	93602879	93603166	-65996617	+	ORR1B1	LTR	MaLR	104	394	0	1
1299	655	146	43	121	chr3	93605228	93605368	-65994415	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	136	-242	1
1299	1785	108	138	37	chr3	93605368	93605773	-65994010	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	2	447	-85	1
1299	1218	164	32	0	chr3	93605811	93606031	-65993752	+	ORR1A2	LTR	MaLR	93	319	-8	1
1299	2098	148	79	22	chr3	93606120	93606559	-65993224	+	BGLII_B	LTR	ERVK	3	435	-6	1
1299	1309	167	185	63	chr3	93607972	93608323	-65991460	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	5	1
1299	414	244	23	167	chr3	93610084	93610300	-65989483	+	ORR1B1	LTR	MaLR	49	233	-161	1
1299	1122	201	76	0	chr3	93610389	93610638	-65989145	+	ORR1C1	LTR	MaLR	110	377	-1	1
1299	3380	55	2	15	chr3	93611623	93612028	-65987755	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
1299	2348	199	94	25	chr3	93612191	93612702	-65987081	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	22	1
1299	1514	217	60	3	chr3	93617941	93618255	-65981528	-	MTC	LTR	MaLR	-89	332	1	1
1299	658	247	23	12	chr3	93618572	93618744	-65981039	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-4530	461	288	1
1299	3577	174	26	6	chr3	93619952	93620600	-65979183	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7452	1507	847	1
1299	3202	76	2	5	chr3	93621688	93622085	-65977698	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1299	1685	215	53	30	chr3	93622883	93623320	-65976463	+	RMER6A	LTR	ERVK	310	756	0	1
1299	310	348	44	114	chr3	93623885	93624112	-65975671	+	MTEa	LTR	MaLR	7	217	-162	1
1299	764	207	110	106	chr3	93624684	93625082	-65974701	+	MT2B	LTR	ERVL	152	600	-1	2
1299	641	248	31	172	chr3	93625145	93625622	-65974161	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	2
1299	3825	153	73	110	chr3	93625622	93625979	-65973804	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2896	2
1299	3825	153	73	110	chr3	93626002	93626030	-65973753	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-343	2895	2880	2
1299	5437	170	59	94	chr3	93626112	93626404	-65973379	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-359	2879	2604	2
1299	5437	170	59	94	chr3	93626456	93628020	-65971763	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-359	2603	1119	2
1299	386	269	86	59	chr3	93628035	93628221	-65971562	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2008	1230	1040	2
1299	355	82	0	20	chr3	93628643	93628693	-65971090	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1556	1682	1634	2
1299	1637	239	71	96	chr3	93628785	93629432	-65970351	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2606	632	2	2
1299	493	229	81	59	chr3	93629451	93629637	-65970146	-	RMER17C	LTR	ERVK	-30	380	191	2
1299	2783	124	46	42	chr3	93634226	93634706	-65965077	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	2
1299	3697	106	28	17	chr3	93634706	93635244	-65964539	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1	544	-6700	2
1299	1733	129	36	112	chr3	93636031	93636423	-65963360	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	549	910	-6334	2
1299	707	143	0	0	chr3	93636546	93636665	-65963118	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	913	1031	-6213	2
1299	347	318	29	29	chr3	93637001	93637275	-65962508	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	2376	2841	-5376	2
1299	14538	217	16	12	chr3	93637313	93641955	-65957828	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	2920	7268	-412	2
1299	2975	49	3	3	chr3	93641955	93642300	-65957483	+	IAPLTR4	LTR	ERVK	1	345	0	2
1299	429	284	8	17	chr3	93642709	93642827	-65956956	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	212	328	-4989	2
1299	1197	268	15	9	chr3	93642827	93643159	-65956624	+	RLTR14	LTR	ERV1	31	364	-18	2
1299	6355	172	29	44	chr3	93643757	93644362	-65955421	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6775	2184	1567	2
1299	6355	172	29	44	chr3	93644385	93645089	-65954694	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7393	1566	895	2
1299	463	347	34	68	chr3	93645197	93645519	-65954264	+	RLTR23	LTR	ERV1	118	428	-2	2
1299	332	338	15	7	chr3	93646649	93646786	-65952997	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1163	1300	-6152	2
1299	2164	58	0	154	chr3	93648836	93649181	-65950602	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	292	0	2
1299	2246	87	13	8	chr3	93649181	93649657	-65950126	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	399	-7182	2
1299	39895	67	2	1	chr3	93649655	93654593	-65945190	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	870	5810	-1771	2
1299	4654	98	12	7	chr3	93654579	93655577	-65944206	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6646	7680	0	2
1299	2328	58	3	49	chr3	93655577	93655883	-65943900	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	292	0	2
1299	357	262	70	83	chr3	93655917	93656208	-65943575	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1247	1779	-5999	2
1299	3592	40	0	0	chr3	93657139	93657535	-65942248	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1299	1457	168	55	73	chr3	93658936	93659264	-65940519	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
1299	9190	149	27	32	chr3	93659278	93661001	-65938782	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-860	5307	3219	2
1299	1245	175	0	0	chr3	93661025	93661214	-65938569	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-2692	4714	4526	2
1299	285	219	95	24	chr3	93661214	93661298	-65938485	+	RLTR25B	LTR	ERVK	408	497	-531	2
1299	6669	153	26	19	chr3	93661354	93662863	-65936920	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3321	4085	2356	2
1299	3615	97	11	59	chr3	93663108	93663763	-65936020	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4730	2676	1654	2
1299	1158	136	17	0	chr3	93663756	93663932	-65935851	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-5162	2244	2066	2
1299	1450	105	26	17	chr3	93667420	93667652	-65932131	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3670	1174	941	2
1299	1334	128	188	10	chr3	93667657	93667950	-65931833	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	0	345	1	2
1299	6146	91	1	59	chr3	93667953	93668896	-65930887	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3902	942	55	2
1299	1379	168	55	73	chr3	93668950	93669278	-65930505	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
1299	850	199	23	0	chr3	93672594	93672770	-65927013	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	207	2
1299	348	188	0	2	chr3	93673002	93673069	-65926714	-	MT2B	LTR	ERVL	-408	67	2	2
1299	632	235	40	90	chr3	93679837	93680110	-65919673	-	MT2A	LTR	ERVL	-133	468	100	2
1299	429	145	0	14	chr3	93681151	93681221	-65918562	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	2
1299	3534	172	41	21	chr3	93681299	93682007	-65917776	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1175	1896	-7063	2
1299	702	286	9	0	chr3	93682062	93682282	-65917501	-	RLTR14	LTR	ERV1	-15	367	146	2
1299	3029	147	29	13	chr3	93682476	93683029	-65916754	+	RMER2	LTR	ERV1	6	567	0	2
1299	4245	29	0	0	chr3	93684372	93684854	-65914929	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
1299	837	194	114	0	chr3	93685433	93685634	-65914149	+	MTC	LTR	MaLR	3	226	-195	2
1299	3579	102	65	9	chr3	93685634	93686171	-65913612	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	2
1299	671	313	42	35	chr3	93686585	93686873	-65912910	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-1109	3954	3724	2
1299	3083	230	126	25	chr3	93686873	93687743	-65912040	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	2
1299	462	335	13	13	chr3	93694030	93694263	-65905520	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2579	4873	4732	2
1299	4071	76	2	4	chr3	93694444	93694962	-65904821	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	517	-2	2
1299	293	298	126	35	chr3	93695122	93695319	-65904464	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3359	4419	4049	2
1299	279	340	0	0	chr3	93696285	93696379	-65903404	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3661	1402	1309	2
1299	3235	110	39	42	chr3	93697952	93698213	-65901570	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	327	2
1299	3235	110	39	42	chr3	93698830	93699137	-65900646	-	RMER2	LTR	ERV1	-241	326	1	2
1299	929	228	0	0	chr3	93699137	93699330	-65900453	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	208	400	-7	2
1299	685	253	30	35	chr3	93700823	93701024	-65898759	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	2
1299	961	173	5	11	chr3	93701024	93701208	-65898575	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	183	-573	2
1299	2356	189	59	11	chr3	93701420	93701982	-65897801	+	RMER6A	LTR	ERVK	168	756	0	2
1299	333	251	0	25	chr3	93702319	93702408	-65897375	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	94	189	-157	2
1299	928	195	0	0	chr3	93702497	93702671	-65897112	+	ORR1C1	LTR	MaLR	110	283	-95	2
1299	1585	127	17	3	chr3	93702669	93702962	-65896821	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-241	320	24	2
1299	3394	201	40	47	chr3	93702974	93703852	-65895931	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-3	2839	1968	2
1299	823	249	22	403	chr3	93705365	93705416	-65894367	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	178	223	-196	2
1299	3540	110	39	40	chr3	93705416	93705984	-65893799	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	2
1299	823	246	5	20	chr3	93705984	93706180	-65893603	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	207	399	-8	2
1299	665	254	35	40	chr3	93707672	93707873	-65891910	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	2
1299	927	184	5	11	chr3	93707873	93708057	-65891726	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	183	-573	2
1299	4800	198	56	65	chr3	93708161	93709492	-65890291	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-160	2682	1365	3
1299	329	325	52	45	chr3	93709890	93710177	-65889606	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-2474	2216	1928	3
1299	1172	184	22	0	chr3	93710513	93710736	-65889047	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-7557	1402	1175	3
1299	444	131	0	14	chr3	93710814	93710884	-65888899	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	197	265	-5052	2
1299	614	228	61	92	chr3	93711921	93712194	-65887589	+	MT2A	LTR	ERVL	100	468	-133	3
1300	3431	68	19	82	chr3	93722258	93722772	-65877011	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	3
1300	4378	77	107	17	chr3	93722772	93723407	-65876376	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1	692	-6552	3
1300	1171	43	0	0	chr3	93723705	93723843	-65875940	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	681	818	-6426	3
1300	8000	40	65	7	chr3	93724605	93725941	-65873842	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1322	2735	-4509	3
1300	643	207	75	63	chr3	93733580	93733833	-65865950	-	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	0	628	373	3
1300	1814	124	88	0	chr3	93734666	93734993	-65864790	-	BGLII_A	LTR	ERVK	0	445	90	3
1300	1460	175	106	137	chr3	93734993	93735712	-65864071	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	893	196	3
1300	449	45	0	43	chr3	93735712	93735782	-65864001	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1371	5873	5807	3
1300	393	182	13	0	chr3	93738363	93738440	-65861343	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-23	371	294	3
1300	2924	57	3	3	chr3	93738443	93738831	-65860952	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	9	396	0	3
1300	395	226	28	28	chr3	93738831	93738938	-65860845	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-96	233	126	3
1300	322	218	13	13	chr3	93738923	93739002	-65860781	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-620	889	811	3
1300	282	240	139	6	chr3	93739116	93739177	-65860606	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1233	730	646	3
1300	297	190	35	0	chr3	93739150	93739208	-65860575	-	MT2B2	LTR	ERVL	-523	61	2	3
1300	681	217	71	49	chr3	93742817	93743083	-65856700	+	RMER17C	LTR	ERVK	139	410	0	3
1300	4283	240	96	112	chr3	93743083	93745583	-65854200	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	2460	-778	3
1300	3339	140	87	155	chr3	93745745	93745913	-65853870	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2358	2525	-713	3
1300	3339	140	87	155	chr3	93745981	93746691	-65853092	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2526	3238	0	3
1300	942	216	36	164	chr3	93746691	93747161	-65852622	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	3
1300	694	194	119	114	chr3	93747221	93747600	-65852183	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	181	3
1300	265	337	42	88	chr3	93747938	93748130	-65851653	-	MTEa	LTR	MaLR	-162	217	35	3
1300	329	217	0	14	chr3	93748653	93748723	-65851060	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	3
1300	1510	217	52	32	chr3	93748725	93749163	-65850620	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	310	3
1300	1456	227	69	80	chr3	93751879	93752479	-65847304	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	18	553	0	3
1300	1010	256	128	46	chr3	93752799	93753001	-65846782	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	3
1300	3283	194	53	20	chr3	93753001	93753733	-65846050	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	3
1300	1010	256	128	46	chr3	93753733	93753898	-65845885	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	201	398	-4919	3
1300	1306	189	56	10	chr3	93753898	93754186	-65845597	+	ORR1B1	LTR	MaLR	90	390	-4	3
1300	1711	175	161	5	chr3	93754277	93754657	-65845126	+	BGLII_B	LTR	ERVK	3	441	0	3
1300	4484	166	71	39	chr3	93754886	93755853	-65843930	+	RMER16-int	LTR	ERVK	119	1116	-4290	3
1300	1787	211	31	67	chr3	93756005	93756424	-65843359	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1111	1518	-3888	3
1300	8843	11	5	0	chr3	93756424	93757397	-65842386	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	1	3
1300	1787	211	31	67	chr3	93757397	93757428	-65842355	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1519	1545	-3861	3
1300	1435	219	25	19	chr3	93757776	93758093	-65841690	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1544	1862	-3544	3
1300	3312	129	6	6	chr3	93758290	93758798	-65840985	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1848	2355	-3051	3
1300	823	203	16	5	chr3	93759302	93759490	-65840293	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-2	327	138	3
1300	348	188	0	2	chr3	93759714	93759781	-65840002	-	MT2B	LTR	ERVL	-408	67	2	3
1300	608	218	31	110	chr3	93766836	93767143	-65832640	-	MT2B	LTR	ERVL	-77	507	181	3
1300	884	154	28	6	chr3	93770370	93770546	-65829237	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	207	3
1300	318	266	0	11	chr3	93770565	93770625	-65829158	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1023	940	881	3
1300	318	266	0	11	chr3	93770748	93770782	-65829001	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1083	880	847	3
1300	371	171	0	2	chr3	93770779	93770846	-65828937	-	MT2B	LTR	ERVL	-408	67	2	3
1300	3929	169	56	22	chr3	93773649	93774495	-65825288	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-28	874	1	3
1300	404	220	11	0	chr3	93774744	93774835	-65824948	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-235	92	1	3
1300	3174	58	5	0	chr3	93775668	93776062	-65823721	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1300	231	279	35	103	chr3	93782118	93782134	-65817649	-	MT2B2	LTR	ERVL	-308	276	170	3
1300	602	230	54	110	chr3	93786580	93786887	-65812896	-	MT2B	LTR	ERVL	-133	468	181	4
1300	429	145	0	14	chr3	93787925	93787995	-65811788	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	4
1300	1180	192	18	0	chr3	93788073	93788297	-65811486	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1175	1402	-7557	4
1300	320	331	49	42	chr3	93788633	93788920	-65810863	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1928	2216	-2474	4
1300	4841	200	55	60	chr3	93789318	93790625	-65809158	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1365	2664	-178	4
1300	971	173	5	11	chr3	93790754	93790938	-65808845	-	RMER6A	LTR	ERVK	-573	183	1	4
1300	684	258	30	35	chr3	93790938	93791139	-65808644	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5117	200	1	4
1300	842	241	5	20	chr3	93792634	93792830	-65806953	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-7	400	208	4
1300	3515	114	39	40	chr3	93792830	93793398	-65806385	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	4
1300	842	265	15	533	chr3	93793398	93793449	-65806334	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-196	223	178	4
1300	4549	10	0	0	chr3	93794494	93794987	-65804796	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
1300	41341	17	14	0	chr3	93794987	93800274	-65799509	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	4
1300	344	179	46	35	chr3	93800274	93800361	-65799422	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	4
1300	321	0	0	0	chr3	93800361	93800399	-65799384	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	4
1300	4549	10	0	0	chr3	93800399	93800892	-65798891	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
1300	4546	12	0	0	chr3	93801879	93802372	-65797411	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
1300	278	288	115	10	chr3	93802887	93803081	-65796702	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	4027	4227	-3374	4
1300	4139	66	4	4	chr3	93803283	93803800	-65795983	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-2	517	1	4
1300	921	329	30	45	chr3	93803981	93804243	-65795540	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3469	3729	-1334	4
1300	3282	226	124	25	chr3	93804243	93805115	-65794668	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	4
1300	921	321	26	39	chr3	93805115	93805403	-65794380	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3730	3953	-1110	4
1300	3605	96	65	9	chr3	93805818	93806353	-65793430	+	RMER2	LTR	ERV1	3	567	0	4
1300	837	194	114	0	chr3	93806353	93806554	-65793229	-	MTC	LTR	MaLR	-195	226	3	4
1300	4314	27	0	0	chr3	93807116	93807598	-65792185	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	4
1300	2995	152	29	13	chr3	93809142	93809695	-65790088	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	6	4
1300	702	286	9	0	chr3	93809894	93810114	-65789669	+	RLTR14	LTR	ERV1	146	367	-15	4
1300	3584	170	41	23	chr3	93810169	93810878	-65788905	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7063	1896	1175	4
1300	429	145	0	14	chr3	93810956	93811026	-65788757	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	197	265	-5052	4
1300	633	233	50	78	chr3	93812066	93812339	-65787444	+	MT2A	LTR	ERVL	100	468	-133	4
1300	335	200	0	0	chr3	93819027	93819087	-65780696	+	MT2B	LTR	ERVL	2	61	-540	4
1300	471	237	203	4	chr3	93819060	93819125	-65780658	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	646	790	-1173	4
1300	471	237	203	4	chr3	93819241	93819306	-65780477	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	791	940	-1023	4
1300	916	159	23	0	chr3	93819325	93819501	-65780282	+	ORR1B1	LTR	MaLR	207	386	-8	4
1300	2149	201	45	19	chr3	93823188	93823809	-65775974	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3724	4085	-3321	4
1300	6097	91	3	5	chr3	93823836	93824898	-65774885	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2379	3402	-2004	4
1300	9122	142	30	31	chr3	93824963	93826647	-65773136	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3219	5307	-860	4
1300	1539	168	21	73	chr3	93826674	93827014	-65772769	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
1300	3505	33	0	0	chr3	93828411	93828807	-65770976	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1300	259	254	0	0	chr3	93828893	93828956	-65770827	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3488	1829	1767	4
1300	378	269	54	66	chr3	93829739	93830029	-65769754	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5999	1779	1247	4
1300	1800	64	3	121	chr3	93830062	93830384	-65769399	-	RLTR10B	LTR	ERVK	0	292	9	4
1300	4628	98	13	11	chr3	93830406	93831401	-65768382	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7680	6651	4
1300	7292	63	3	7	chr3	93831392	93832300	-65767483	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	4906	4
1300	2775	100	42	24	chr3	93839419	93839871	-65759912	+	RMER16	LTR	ERVK	74	533	0	4
1300	1851	202	57	22	chr3	93842823	93843228	-65756555	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	4
1300	672	202	75	63	chr3	93845615	93845868	-65753915	-	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	0	628	373	4
1300	1805	124	88	0	chr3	93846701	93847028	-65752755	-	BGLII_A	LTR	ERVK	0	445	90	4
162	1449	173	106	137	chr3	93847028	93847747	-65752036	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	893	196	4
1301	449	45	0	43	chr3	93847747	93847817	-65751966	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1371	5873	5807	4
1301	393	182	13	0	chr3	93850419	93850496	-65749287	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-23	371	294	4
1301	1253	43	0	0	chr3	93850499	93850660	-65749123	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	9	169	-227	4
1301	681	217	71	49	chr3	93854165	93854431	-65745352	+	RMER17C	LTR	ERVK	139	410	0	4
1301	4267	241	95	112	chr3	93854431	93856933	-65742850	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	2460	-778	4
1301	3362	142	83	152	chr3	93857087	93857255	-65742528	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2358	2525	-713	4
1301	3362	142	83	152	chr3	93857323	93858033	-65741750	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2526	3238	0	4
1301	942	216	36	164	chr3	93858033	93858503	-65741280	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	4
1301	686	192	119	114	chr3	93858563	93858942	-65740841	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	181	4
1301	265	337	42	88	chr3	93859280	93859472	-65740311	-	MTEa	LTR	MaLR	-162	217	35	4
1301	329	217	0	14	chr3	93859997	93860067	-65739716	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	5
1301	1397	220	65	32	chr3	93860069	93860502	-65739281	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	310	5
1301	1462	219	60	84	chr3	93863239	93863813	-65735970	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	41	553	0	5
1301	1010	256	128	46	chr3	93864132	93864334	-65735449	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	200	-5117	5
1301	3270	192	53	23	chr3	93864334	93865068	-65734715	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	5
1301	1010	256	128	46	chr3	93865068	93865233	-65734550	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	201	398	-4919	5
1301	1306	189	56	10	chr3	93865233	93865521	-65734262	+	ORR1B1	LTR	MaLR	90	390	-4	5
1301	1706	177	161	5	chr3	93865612	93865992	-65733791	+	BGLII_B	LTR	ERVK	3	441	0	5
1301	4454	167	71	39	chr3	93866221	93867188	-65732595	+	RMER16-int	LTR	ERVK	119	1116	-4290	5
1301	1805	205	35	71	chr3	93867338	93867757	-65732026	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1111	1518	-3888	5
1301	8783	12	5	0	chr3	93867757	93868730	-65731053	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	1	5
1301	1805	205	35	71	chr3	93868730	93868761	-65731022	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1519	1545	-3861	5
1301	1423	223	29	19	chr3	93869109	93869425	-65730358	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1544	1862	-3544	5
1301	3321	129	6	6	chr3	93869622	93870130	-65729653	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1848	2355	-3051	5
1301	823	203	16	5	chr3	93870632	93870820	-65728963	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-2	327	138	5
1301	348	188	0	2	chr3	93871044	93871111	-65728672	-	MT2B	LTR	ERVL	-408	67	2	5
1301	631	212	31	110	chr3	93878170	93878477	-65721306	-	MT2B	LTR	ERVL	-77	507	181	5
1301	507	148	21	18	chr3	93881681	93881789	-65717994	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	419	289	5
1301	3926	168	56	23	chr3	93884427	93885268	-65714515	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-33	869	1	5
1301	404	220	11	0	chr3	93885526	93885617	-65714166	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-235	92	1	5
1301	3242	51	5	0	chr3	93886450	93886844	-65712939	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1301	264	302	47	94	chr3	93892891	93892906	-65706877	-	MT2B2	LTR	ERVL	-309	275	219	5
1301	264	302	47	94	chr3	93893005	93893019	-65706764	-	MT2B2	LTR	ERVL	-309	218	154	5
1301	663	271	171	67	chr3	93897352	93897680	-65702103	-	MT2B	LTR	ERVL	-77	524	163	5
1301	232	305	54	141	chr3	93898063	93898212	-65701571	-	MTEa	LTR	MaLR	-224	155	20	5
1301	445	131	0	14	chr3	93898698	93898768	-65701015	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	5
1301	229	278	14	14	chr3	93898770	93898843	-65700940	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	684	5
1301	1146	197	22	0	chr3	93898846	93899069	-65700714	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1175	1402	-7557	5
1301	350	324	48	48	chr3	93899400	93899689	-65700094	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1928	2216	-2474	5
1301	3386	233	63	67	chr3	93900087	93901410	-65698373	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1365	2682	-160	5
1301	1021	173	5	11	chr3	93901514	93901698	-65698085	-	RMER6A	LTR	ERVK	-573	183	1	5
1301	665	268	30	35	chr3	93901698	93901899	-65697884	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5117	200	1	5
1301	910	236	5	25	chr3	93903390	93903586	-65696197	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-7	400	208	5
1301	3841	108	39	29	chr3	93903586	93904146	-65695637	+	RMER2	LTR	ERV1	1	566	-1	5
1301	910	243	11	498	chr3	93904146	93904198	-65695585	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-199	222	178	5
1301	253	341	155	6	chr3	93906748	93906916	-65692867	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	4040	4232	-3369	5
1301	4344	61	18	0	chr3	93907115	93907623	-65692160	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-2	517	1	5
1301	916	331	34	64	chr3	93907801	93908070	-65691713	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3470	3729	-1334	5
1301	3590	224	123	24	chr3	93908070	93908942	-65690841	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	5
1301	916	332	31	57	chr3	93908942	93909230	-65690553	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3730	3953	-1110	5
1301	3778	102	65	9	chr3	93909638	93910175	-65689608	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	5
1301	886	200	120	0	chr3	93910175	93910375	-65689408	-	MTC	LTR	MaLR	-195	226	3	5
1301	4402	33	2	0	chr3	93910938	93911419	-65688364	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	5
1301	3642	73	38	11	chr3	93912635	93913104	-65686679	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	5
1301	4486	66	107	16	chr3	93913104	93913738	-65686045	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1	692	-6552	5
1301	11933	47	41	6	chr3	93914313	93916133	-65683650	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1329	3212	-4032	5
1301	4075	78	29	38	chr3	93916103	93916715	-65683068	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3380	3986	-3258	5
1301	8239	43	17	5	chr3	93916708	93917704	-65682079	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5065	6072	-1172	5
1301	2006	101	10	7	chr3	93917726	93918025	-65681758	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	207	506	-387	5
1301	7687	43	16	3	chr3	93918026	93918928	-65680855	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6332	7244	0	5
1301	298	345	49	49	chr3	93919023	93919145	-65680638	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	212	333	-4984	5
1301	3212	149	35	11	chr3	93919245	93919794	-65679989	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	6	5
1301	822	277	9	0	chr3	93919979	93920199	-65679584	+	RLTR14	LTR	ERV1	146	367	-15	5
1301	3567	179	32	24	chr3	93920254	93920970	-65678813	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7063	1896	1175	5
1301	406	159	0	14	chr3	93921048	93921118	-65678665	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	197	265	-5052	5
1301	676	248	33	72	chr3	93922117	93922383	-65677400	+	MT2B	LTR	ERVL	181	468	-133	5
1301	377	188	0	2	chr3	93929091	93929158	-65670625	+	MT2B	LTR	ERVL	2	67	-408	6
1301	299	298	0	11	chr3	93929155	93929189	-65670594	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	847	880	-1083	6
1301	299	298	0	11	chr3	93929310	93929370	-65670413	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	881	940	-1023	6
1301	920	182	23	0	chr3	93929389	93929565	-65670218	+	ORR1B1	LTR	MaLR	207	386	-8	6
1301	1438	194	12	57	chr3	93932845	93933178	-65666605	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	5	322	0	6
1301	8424	116	5	50	chr3	93933179	93934545	-65665238	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2	1306	-3538	6
1301	3883	98	6	78	chr3	93934559	93935214	-65664569	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1580	2187	-2657	6
1301	2178	204	45	19	chr3	93935445	93936066	-65663717	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3724	4085	-3321	6
1301	6337	82	4	5	chr3	93936093	93937153	-65662630	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2379	3402	-2004	6
1301	9272	147	20	33	chr3	93937217	93938922	-65660861	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3219	5307	-860	6
1301	1675	159	21	73	chr3	93938947	93939287	-65660496	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
1301	3606	40	0	0	chr3	93940686	93941082	-65658701	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1301	9661	36	5	2	chr3	93941082	93942177	-65657606	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	6
1301	3606	38	0	0	chr3	93942177	93942573	-65657210	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1301	257	254	0	0	chr3	93942659	93942722	-65657061	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3488	1829	1767	6
1301	402	268	52	64	chr3	93943504	93943793	-65655990	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-5999	1779	1247	6
1301	1800	64	3	121	chr3	93943826	93944148	-65655635	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	292	9	6
1301	4660	99	13	7	chr3	93944170	93945161	-65654622	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7680	6651	6
1301	40091	65	2	2	chr3	93945152	93950094	-65649689	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	870	6
1301	844	133	0	0	chr3	93950092	93950220	-65649563	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7182	399	272	6
1301	2155	71	11	7	chr3	93956420	93956704	-65643079	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7296	285	1	6
1301	1935	101	30	67	chr3	93956708	93957081	-65642702	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-6	359	1	6
1301	323	292	41	53	chr3	93957829	93957999	-65641784	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3823	1240	1073	6
1301	446	325	36	25	chr3	93959098	93959294	-65640489	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	231	6
1301	4854	165	26	49	chr3	93959527	93960545	-65639238	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	894	1888	-7071	6
1301	669	233	72	86	chr3	93963995	93964372	-65635411	-	MT2B	LTR	ERVL	-77	524	68	6
1301	838	193	23	6	chr3	93967766	93967943	-65631840	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	207	6
1301	432	246	109	56	chr3	93967949	93968070	-65631713	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1000	963	757	6
1301	432	246	109	56	chr3	93968188	93968251	-65631532	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1000	756	646	6
1301	343	183	0	0	chr3	93968224	93968284	-65631499	-	MT2B	LTR	ERVL	-523	61	2	6
1301	3895	168	61	11	chr3	93971053	93971895	-65627888	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-12	917	1	6
1301	398	209	11	0	chr3	93972153	93972244	-65627539	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-235	92	1	6
1301	3277	46	5	0	chr3	93973080	93973474	-65626309	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1302	616	226	35	109	chr3	93981979	93982252	-65617531	-	MT2A	LTR	ERVL	-133	468	100	6
1302	429	145	0	14	chr3	93983291	93983361	-65616422	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	197	6
1302	1182	192	18	0	chr3	93983439	93983663	-65616120	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1175	1402	-7557	6
1302	364	324	49	42	chr3	93984000	93984287	-65615496	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1928	2216	-2474	6
1302	4924	200	53	63	chr3	93984685	93986016	-65613767	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1365	2682	-160	6
1302	984	168	5	11	chr3	93986120	93986304	-65613479	-	RMER6A	LTR	ERVK	-573	183	1	6
1302	650	268	30	35	chr3	93986304	93986505	-65613278	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5117	200	1	6
1302	823	246	5	20	chr3	93987997	93988193	-65611590	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-7	400	208	6
1302	3516	114	39	40	chr3	93988193	93988761	-65611022	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	6
1302	823	255	18	537	chr3	93988761	93988812	-65610971	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-196	223	178	6
1302	278	288	115	10	chr3	93991335	93991529	-65608254	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	4027	4227	-3374	6
1302	4139	66	4	4	chr3	93991731	93992248	-65607535	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-2	517	1	6
1302	954	327	30	45	chr3	93992429	93992691	-65607092	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3469	3729	-1334	6
1302	3243	228	124	26	chr3	93992691	93993564	-65606219	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	6
1302	954	319	26	39	chr3	93993564	93993852	-65605931	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3730	3953	-1110	6
1302	3614	98	65	9	chr3	93994265	93994802	-65604981	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	6
1302	812	200	120	0	chr3	93994802	93995002	-65604781	-	MTC	LTR	MaLR	-195	226	3	6
1302	4306	25	0	0	chr3	93995558	93996040	-65603743	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	6
1302	3051	145	29	13	chr3	93997568	93998121	-65601662	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	6	6
1302	702	286	9	0	chr3	93998324	93998544	-65601239	+	RLTR14	LTR	ERV1	146	367	-15	6
1302	3563	172	41	24	chr3	93998599	93999309	-65600474	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7063	1896	1175	6
1302	429	145	0	14	chr3	93999387	93999457	-65600326	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	197	265	-5052	6
1302	686	231	102	78	chr3	94000497	94000770	-65599013	+	MT2A	LTR	ERVL	100	468	-133	1
1302	381	240	338	56	chr3	94007427	94007643	-65592140	+	MT2B2	LTR	ERVL	2	278	-306	1
1302	562	236	228	0	chr3	94007460	94007719	-65592064	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	646	963	-1000	1
1302	943	171	23	0	chr3	94007725	94007901	-65591882	+	ORR1B1	LTR	MaLR	207	386	-8	1
1302	2103	202	54	19	chr3	94011597	94012214	-65587569	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3724	4085	-3321	1
1302	6234	88	3	5	chr3	94012245	94013307	-65586476	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2379	3402	-2004	1
1302	9361	145	21	30	chr3	94013372	94015083	-65584700	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3219	5307	-860	1
1302	1639	168	21	73	chr3	94015094	94015434	-65584349	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
1302	3605	40	0	0	chr3	94016829	94017225	-65582558	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1302	257	254	0	0	chr3	94017311	94017374	-65582409	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3488	1829	1767	2
1302	379	305	66	69	chr3	94018156	94018445	-65581338	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5999	1779	1492	2
1302	2139	69	3	118	chr3	94018478	94018808	-65580975	-	RLTR10B	LTR	ERVK	0	292	1	2
1302	449	54	0	0	chr3	94018808	94018864	-65580919	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	7526	2
1302	35585	64	2	1	chr3	94018861	94023221	-65576562	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2347	5234	870	2
1302	3046	78	8	5	chr3	94023219	94023617	-65576166	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7182	399	1	2
1302	1921	74	0	121	chr3	94023617	94023940	-65575843	-	RLTR10B	LTR	ERVK	0	292	9	2
1302	308	256	26	0	chr3	94024704	94024782	-65575001	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3823	1240	1161	2
1302	439	328	37	80	chr3	94025963	94026288	-65573495	-	RLTR23	LTR	ERV1	-2	428	118	2
1302	6496	167	28	36	chr3	94026382	94027683	-65572100	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	894	2184	-6775	2
1302	537	359	25	36	chr3	94027934	94028290	-65571493	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4955	362	11	2
1302	1206	264	15	9	chr3	94028316	94028648	-65571135	-	RLTR14	LTR	ERV1	-18	364	31	2
1302	406	293	8	17	chr3	94028648	94028766	-65571017	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4989	328	212	2
1302	2916	61	3	3	chr3	94029175	94029519	-65570264	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	0	345	2	2
1302	14676	219	22	13	chr3	94029520	94034155	-65565628	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-351	7329	2920	2
1302	366	294	43	45	chr3	94034155	94034467	-65565316	-	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	-5376	2841	2324	2
1302	733	94	17	17	chr3	94034808	94034927	-65564856	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6213	1031	913	3
1302	885	55	360	0	chr3	94035050	94035211	-65564572	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6334	910	692	3
1302	1128	49	0	40	chr3	94035565	94035715	-65564068	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6552	692	549	3
1302	3572	120	32	11	chr3	94036503	94037036	-65562747	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-6700	544	1	3
1302	2790	134	40	37	chr3	94037036	94037517	-65562266	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	3
1302	566	223	81	54	chr3	94041911	94042096	-65557687	+	RMER17C	LTR	ERVK	191	380	-30	4
1302	1543	242	74	100	chr3	94042115	94042763	-65557020	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2	632	-2606	4
1302	358	93	36	18	chr3	94042850	94042905	-65556878	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1627	1682	-1556	4
1302	692	196	58	88	chr3	94043433	94043749	-65556034	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1100	1366	-1872	4
1302	2772	41	28	0	chr3	94045230	94045548	-65554235	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	4
1302	334	331	37	124	chr3	94047925	94048142	-65551641	-	MTEa	LTR	MaLR	-162	217	20	5
1302	1533	226	75	30	chr3	94048715	94049143	-65550640	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	310	5
1302	3342	58	2	5	chr3	94049941	94050338	-65549445	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1302	3615	170	28	6	chr3	94050940	94051587	-65548196	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	847	1507	-7452	5
1302	3679	36	0	5	chr3	94051745	94052190	-65547593	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	451	6
1302	2926	49	0	3	chr3	94052182	94052552	-65547231	-	RLTR13B3	LTR	ERVK	-308	621	253	6
1302	31835	54	37	42	chr3	94052553	94054110	-65545673	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1335	2913	-4331	6
1302	31835	54	37	42	chr3	94054391	94056236	-65543547	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	2914	4745	-2499	6
1302	31835	27	18	26	chr3	94056261	94058721	-65541062	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	4746	7240	-4	6
1302	3867	42	23	2	chr3	94058725	94059197	-65540586	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	6
1302	388	213	0	0	chr3	94059197	94059272	-65540511	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-194	184	110	6
1302	901	247	22	51	chr3	94059712	94059783	-65540000	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5052	265	201	6
1302	3449	178	48	14	chr3	94059783	94060514	-65539269	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	7
1302	901	247	22	51	chr3	94060514	94060715	-65539068	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-5117	200	1	6
1302	956	240	0	5	chr3	94063123	94063317	-65536466	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-7	400	208	7
1302	3540	112	39	27	chr3	94063317	94063877	-65535906	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	7
1302	956	256	4	507	chr3	94063877	94063928	-65535855	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-198	223	178	7
1302	1217	167	41	89	chr3	94066313	94066628	-65533155	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7485	1474	1175	7
1302	351	174	0	14	chr3	94066706	94066776	-65533007	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	197	265	-5052	7
1302	687	255	129	31	chr3	94067798	94068092	-65531691	+	MT2A	LTR	ERVL	100	468	-133	7
1302	248	265	59	22	chr3	94079007	94079043	-65520740	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	614	654	-855	8
1302	291	186	0	119	chr3	94081699	94081766	-65518017	+	MT2B2	LTR	ERVL	3	61	-523	9
1302	321	309	0	10	chr3	94081768	94081804	-65517979	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	845	880	-1083	8
1302	321	309	0	10	chr3	94081927	94081988	-65517795	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	881	941	-1022	8
1302	950	171	23	0	chr3	94081983	94082159	-65517624	+	ORR1B1	LTR	MaLR	207	386	-8	9
1302	1013	231	26	64	chr3	94094960	94095302	-65504481	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	294	622	-4369	9
1302	476	178	83	9	chr3	94095302	94095410	-65504373	+	MTD	LTR	MaLR	302	417	-2	1
1302	310	204	169	5	chr3	94095942	94096018	-65503765	-	MT2B	LTR	ERVL	-390	85	1	1
1302	477	299	157	22	chr3	94101748	94102022	-65497761	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	18	328	-4989	1
1302	1154	251	94	0	chr3	94102022	94102341	-65497442	+	RLTR14	LTR	ERV1	31	379	-3	1
1302	687	325	21	40	chr3	94102341	94102716	-65497067	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	368	-4949	1
1302	470	190	0	87	chr3	94102790	94102917	-65496866	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	431	546	-4771	1
1302	652	221	7	0	chr3	94102958	94103107	-65496676	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6776	2183	2034	1
1302	227	242	23	38	chr3	94103267	94103293	-65496490	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-863	646	623	1
1302	8946	143	26	7	chr3	94103293	94104881	-65494902	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6941	2018	401	1
1302	1178	137	174	0	chr3	94104893	94105134	-65494649	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8639	320	38	1
1302	340	301	55	67	chr3	94105852	94106016	-65493767	+	MTEb	LTR	MaLR	54	215	-164	1
1302	1032	147	12	0	chr3	94107143	94107299	-65492484	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	158	-226	1
1302	937	196	70	39	chr3	94107492	94107512	-65492271	+	ORR1C2	LTR	MaLR	147	166	-218	1
1302	2370	55	55	6	chr3	94107512	94107824	-65491959	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1302	937	196	70	39	chr3	94107824	94108032	-65491751	+	ORR1C2	LTR	MaLR	167	381	-3	1
1302	2229	147	8	55	chr3	94108732	94109129	-65490654	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
1303	1057	198	70	4	chr3	94117705	94117964	-65481819	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	99	1
1303	621	202	14	65	chr3	94121993	94122221	-65477562	+	RMER21B	LTR	ERV1	272	558	-389	1
1303	2589	147	32	2	chr3	94122551	94122960	-65476823	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1303	3005	78	27	15	chr3	94124247	94124649	-65475134	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
1303	1166	228	62	14	chr3	94124964	94125315	-65474468	-	MTD	LTR	MaLR	-14	386	6	1
1303	331	318	110	10	chr3	94128983	94129183	-65470600	-	LTR80A	LTR	ERVL	-192	391	172	1
1303	521	241	30	15	chr3	94134568	94134703	-65465080	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	283	2
1303	348	351	77	13	chr3	94136129	94136285	-65463498	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	300	2
1303	2162	112	9	69	chr3	94138718	94139064	-65460719	+	ORR1A4	LTR	MaLR	5	329	0	2
1303	2197	104	66	14	chr3	94140929	94141279	-65458504	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	2
1303	1168	246	58	67	chr3	94143117	94143488	-65456295	-	MTE-int	LTR	MaLR	-176	1559	1222	2
1303	228	211	17	34	chr3	94144900	94144959	-65454824	+	RLTR14	LTR	ERV1	267	324	-58	2
1303	1022	193	168	48	chr3	94155773	94156038	-65443745	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	303	-81	2
1303	2742	201	157	40	chr3	94156038	94156833	-65442950	+	RMER19B	LTR	ERVK	3	890	-12	2
1303	624	116	11	0	chr3	94156836	94156931	-65442852	+	ORR1C2	LTR	MaLR	289	384	0	2
1303	3240	104	39	54	chr3	94156953	94157473	-65442310	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	2
1303	364	264	28	9	chr3	94158208	94158315	-65441468	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	109	-299	2
1303	343	218	51	0	chr3	94159134	94159212	-65440571	+	RMER5	LTR	ERV1	5	86	-448	2
1303	582	250	27	0	chr3	94159205	94159353	-65440430	+	RMER5	LTR	ERV1	203	354	-180	2
1303	1916	99	31	22	chr3	94159606	94159925	-65439858	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
1303	239	196	0	0	chr3	94159927	94159973	-65439810	+	RMER21A	LTR	ERV1	639	684	-263	2
1303	1066	142	11	11	chr3	94160029	94160214	-65439569	+	RMER5	LTR	ERV1	350	534	0	2
1303	3222	120	24	48	chr3	94160349	94160972	-65438811	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	608	-148	2
1303	333	264	38	29	chr3	94161030	94161146	-65438637	+	MLT1A1	LTR	MaLR	249	408	0	2
1303	694	196	64	18	chr3	94168675	94168719	-65431064	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	336	2
1303	694	196	64	18	chr3	94168761	94168887	-65430896	-	MTE2a	LTR	MaLR	-44	335	201	2
1303	802	161	58	93	chr3	94169675	94169880	-65429903	-	MTE2a	LTR	MaLR	-181	198	1	2
1303	238	264	35	138	chr3	94220414	94220447	-65379336	+	MT2B2	LTR	ERVL	134	151	-433	3
1303	2203	133	57	138	chr3	94222693	94223200	-65376583	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	466	0	3
1304	1509	229	131	8	chr3	94241492	94241858	-65357925	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	4
1304	382	124	292	0	chr3	94252785	94252845	-65346938	+	MT2A	LTR	ERVL	403	467	-66	4
1304	382	124	292	0	chr3	94252880	94252908	-65346875	+	MT2A	LTR	ERVL	468	516	-17	4
1304	944	115	79	17	chr3	94254131	94254308	-65345475	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	106	293	-291	4
1304	365	207	115	8	chr3	94255974	94256102	-65343681	-	MTD	LTR	MaLR	-39	380	240	4
1304	233	200	41	215	chr3	94256017	94256138	-65343645	-	LTR64	LTR	ERV1	-323	205	106	4
1304	1123	176	152	20	chr3	94261065	94261371	-65338412	+	MTD	LTR	MaLR	1	375	-46	4
1304	1059	196	236	36	chr3	94261568	94261595	-65338188	+	MTD	LTR	MaLR	376	401	-20	4
1304	2355	136	20	0	chr3	94262546	94262898	-65336885	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	4
1304	2116	164	97	22	chr3	94266190	94266602	-65333181	+	MT2A	LTR	ERVL	6	448	-85	5
1304	277	81	0	0	chr3	94266656	94266693	-65333090	+	MT2A	LTR	ERVL	497	533	0	5
1304	390	196	30	89	chr3	94279499	94279600	-65320183	-	MT2B	LTR	ERVL	-345	256	162	5
1304	256	239	105	74	chr3	94291414	94291509	-65308274	-	MT2B	LTR	ERVL	-354	247	150	5
1304	297	236	167	11	chr3	94297276	94297366	-65302417	-	MTEa	LTR	MaLR	-200	179	76	5
1304	981	233	72	96	chr3	94308127	94308560	-65291223	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	401	-18	5
1304	3288	48	8	0	chr3	94309791	94310184	-65289599	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1304	610	234	398	23	chr3	94311829	94312085	-65287698	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	352	-27	5
1304	466	86	57	0	chr3	94318392	94318462	-65281321	+	MT2A	LTR	ERVL	1	74	-459	6
1304	495	261	29	35	chr3	94318462	94318633	-65281150	+	MT2A	LTR	ERVL	364	533	0	6
1304	567	194	351	19	chr3	94318817	94319073	-65280710	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	39	377	-5384	6
1304	7044	185	95	83	chr3	94319242	94320217	-65279566	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	449	1425	-4336	6
1304	7044	185	95	83	chr3	94320364	94320670	-65279113	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1426	1739	-4022	6
1304	7044	185	95	83	chr3	94320716	94320777	-65279006	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1740	1803	-3958	6
1304	7044	185	95	83	chr3	94320962	94321295	-65278488	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1804	2192	-3569	6
1304	811	301	112	42	chr3	94322317	94322719	-65277064	+	MER21B	LTR	ERV1	423	852	-11	6
1304	248	311	0	100	chr3	94332962	94333062	-65266721	+	MT2B2	LTR	ERVL	150	239	-345	6
1304	1564	200	49	80	chr3	94333801	94334187	-65265596	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1304	333	125	42	0	chr3	94336325	94336397	-65263386	-	MTC-int	LTR	MaLR	-64	1194	1120	6
1304	316	248	0	118	chr3	94338624	94338640	-65261143	+	MT2B	LTR	ERVL	153	154	-447	6
1304	603	256	95	109	chr3	94343418	94343830	-65255953	+	MTD	LTR	MaLR	14	419	0	6
1304	628	130	57	8	chr3	94343831	94343955	-65255828	+	MTD-int	LTR	MaLR	3	132	-1126	6
1304	599	267	46	33	chr3	94344086	94344326	-65255457	+	MTD-int	LTR	MaLR	967	1209	-49	6
1304	1362	220	131	8	chr3	94344589	94344955	-65254828	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	7
1304	2615	184	95	6	chr3	94347198	94347267	-65252516	+	RLTR17	LTR	ERVK	98	194	-498	7
1304	2615	184	95	6	chr3	94347336	94347812	-65251971	+	RLTR17	LTR	ERVK	195	691	-1	7
1304	513	161	105	35	chr3	94360480	94360612	-65239171	+	MT2A	LTR	ERVL	115	236	-297	7
1304	2028	165	44	8	chr3	94360698	94361064	-65238719	+	ORR1B1	LTR	MaLR	9	387	-7	7
1304	226	150	0	0	chr3	94361307	94361347	-65238436	+	MT2A	LTR	ERVL	492	531	-2	7
1304	3497	28	2	0	chr3	94361927	94362322	-65237461	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1304	809	246	153	79	chr3	94363957	94364297	-65235486	+	MTEb	LTR	MaLR	6	370	-9	7
20	292	228	0	124	chr3	94371831	94371936	-65227847	+	MT2B	LTR	ERVL	168	259	-342	7
1305	1175	228	103	20	chr3	94373969	94374318	-65225465	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	378	-6	7
1305	259	231	0	125	chr3	94380672	94380776	-65219007	-	MT2B	LTR	ERVL	-347	254	164	8
1305	546	299	104	38	chr3	94387449	94387841	-65211942	-	LTR40c	LTR	ERVL	-24	495	24	8
1305	590	310	119	44	chr3	94392032	94392538	-65207245	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	41	680	0	8
1305	392	360	71	33	chr3	94392841	94393051	-65206732	-	MLT1L	LTR	MaLR	-351	259	42	8
1305	322	267	18	9	chr3	94393126	94393353	-65206430	-	RMER17D	LTR	ERVK	-410	479	251	8
1305	3113	37	39	5	chr3	94393668	94394051	-65205732	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1305	2197	182	10	204	chr3	94394991	94395688	-65204095	+	RMER19C	LTR	ERVK	3	564	-47	8
1305	411	245	39	0	chr3	94396957	94397050	-65202733	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	97	-277	8
1305	740	186	52	69	chr3	94397050	94397223	-65202560	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	416	8
1305	2740	106	44	3	chr3	94397223	94397612	-65202171	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	8
1305	5140	24	24	0	chr3	94397612	94398197	-65201586	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	0	2812	2214	8
1305	829	65	0	9	chr3	94398681	94398828	-65200955	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-1831	981	778	8
1305	426	115	0	0	chr3	94399621	94399682	-65200101	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-2509	303	243	8
1305	2649	105	60	3	chr3	94399707	94400090	-65199693	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	8
1305	2349	152	49	12	chr3	94400091	94400496	-65199287	-	RMER4B	LTR	ERVK	-165	420	1	8
1305	1258	172	120	0	chr3	94400499	94400749	-65199034	+	ORR1D1	LTR	MaLR	95	374	0	8
1305	2047	177	133	38	chr3	94402647	94403205	-65196578	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	8
1305	2934	60	38	23	chr3	94404518	94404663	-65195120	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	254	8
1305	2934	60	38	23	chr3	94404797	94405045	-65194738	-	MTB	LTR	MaLR	-147	253	1	8
1305	895	94	38	0	chr3	94407180	94407339	-65192444	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1082	1244	1080	8
1305	879	141	16	110	chr3	94407519	94407710	-65192073	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1444	882	710	8
1305	1321	161	55	12	chr3	94407805	94408062	-65191721	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1782	544	277	8
1305	509	237	23	118	chr3	94408062	94408282	-65191501	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1456	1386	1188	8
1305	724	333	41	6	chr3	94409136	94409474	-65190309	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8158	801	452	8
1305	2642	113	33	64	chr3	94409800	94409844	-65189939	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	400	8
1305	2642	113	33	64	chr3	94409880	94409942	-65189841	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-42	399	361	8
1305	2642	113	33	64	chr3	94410114	94410461	-65189322	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-81	360	1	8
1305	2347	119	64	55	chr3	94410845	94410887	-65188896	+	RMER4A	LTR	ERVK	21	59	-407	8
1305	2347	119	64	55	chr3	94411080	94411472	-65188311	+	RMER4A	LTR	ERVK	60	459	-7	8
1305	242	250	15	15	chr3	94414900	94414935	-65184848	+	MT2B2	LTR	ERVL	223	257	-327	9
1305	606	168	88	0	chr3	94421897	94422010	-65177773	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7192	-214	9
1305	519	305	150	61	chr3	94423320	94423666	-65176117	+	MER21B	LTR	ERV1	384	760	-103	9
1305	332	262	0	176	chr3	94424868	94425016	-65174767	-	MT2B	LTR	ERVL	-310	291	170	9
1305	1811	160	75	10	chr3	94425395	94425780	-65174003	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	9
1305	368	204	8	142	chr3	94429175	94429295	-65170488	+	MT2B	LTR	ERVL	161	264	-337	9
1305	984	180	107	0	chr3	94429651	94429820	-65169963	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	398	9
1305	2909	130	103	8	chr3	94429820	94430268	-65169515	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	479	-99	9
1305	2909	130	103	8	chr3	94430322	94430370	-65169413	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	480	543	-35	9
1305	2357	130	10	47	chr3	94430366	94430771	-65169012	-	RMER4B	LTR	ERVK	-195	390	1	9
1305	312	279	29	35	chr3	94441022	94441193	-65158590	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	585	754	-755	9
1305	254	299	66	66	chr3	94445689	94445825	-65153958	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-443	585	450	9
1305	336	250	143	0	chr3	94445934	94446018	-65153765	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	96	-283	9
1305	279	230	98	18	chr3	94456958	94457122	-65142661	+	RMER17C	LTR	ERVK	97	273	-137	1
1305	1095	246	122	24	chr3	94463753	94464090	-65135693	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
1305	229	304	125	19	chr3	94467887	94467991	-65131792	+	MTE2b	LTR	MaLR	191	305	-74	1
1305	761	279	106	8	chr3	94467991	94468226	-65131557	+	MTE-int	LTR	MaLR	958	1215	-365	1
1305	572	220	175	51	chr3	94468230	94468407	-65131376	+	MTE-int	LTR	MaLR	1367	1565	-15	1
1305	1118	178	17	134	chr3	94474978	94475270	-65124513	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	258	-64	1
1305	14108	84	9	49	chr3	94475270	94475672	-65124111	+	MMETn-int	LTR	ERVK	136	482	-4362	1
1305	14108	84	9	49	chr3	94475819	94477552	-65122231	+	MMETn-int	LTR	ERVK	483	2187	-2657	1
1305	2135	125	12	0	chr3	94477797	94478118	-65121665	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3724	4048	-3358	1
1305	4576	133	11	3	chr3	94478111	94478745	-65121038	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6548	7186	-220	1
1305	484	251	178	12	chr3	94478746	94478988	-65120795	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	159	440	-462	1
1305	626	177	41	34	chr3	94478988	94479134	-65120649	+	MMETn-int	LTR	ERVK	4698	4844	0	1
1305	1664	148	11	104	chr3	94479134	94479489	-65120294	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
1305	3289	120	4	10	chr3	94480455	94480945	-65118838	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	487	-16	1
1305	35083	227	18	31	chr3	94480961	94488624	-65111159	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	1	7556	0	1
1305	3257	120	6	10	chr3	94488624	94489113	-65110670	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	487	-16	1
1305	2067	170	88	5	chr3	94490878	94491262	-65108521	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	6	1
1305	277	215	62	0	chr3	94492175	94492240	-65107543	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	311	1
1305	319	289	50	0	chr3	94493525	94493646	-65106137	-	MTEb	LTR	MaLR	-102	277	151	1
1305	387	191	64	45	chr3	94493649	94493759	-65106024	-	MT2A	LTR	ERVL	-328	205	94	1
1305	649	211	2	49	chr3	94493738	94493890	-65105893	-	MT2A	LTR	ERVL	-340	135	3	1
1306	235	281	73	96	chr3	94505112	94505289	-65094494	+	MT2B2	LTR	ERVL	104	276	-308	1
1306	480	273	6	49	chr3	94505332	94505447	-65094336	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	411	1
1306	480	273	6	49	chr3	94505578	94505624	-65094159	-	RLTR28	LTR	ERVL	-114	410	370	1
1306	2407	147	56	5	chr3	94505639	94506070	-65093713	-	RLTR28	LTR	ERVL	-71	453	1	2
1306	756	215	147	14	chr3	94506849	94507146	-65092637	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	42	2
1306	1434	157	52	0	chr3	94508616	94508845	-65090938	+	ORR1B1	LTR	MaLR	113	353	-41	2
1306	346	336	37	22	chr3	94509674	94509808	-65089975	-	RMER15	LTR	ERVL	-93	482	347	3
1306	4544	65	2	31	chr3	94511048	94511653	-65088130	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	3
1306	257	224	52	0	chr3	94512116	94512174	-65087609	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3647	1875	1815	3
1306	269	286	60	0	chr3	94512387	94512471	-65087312	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3725	1797	1709	3
1306	667	157	114	0	chr3	94512974	94513114	-65086669	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-9	365	210	3
1306	1961	263	43	69	chr3	94513133	94513602	-65086181	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-973	607	149	3
1306	1961	263	43	69	chr3	94513649	94513800	-65085983	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1432	148	3	3
1306	517	292	199	26	chr3	94513801	94514072	-65085711	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	60	3
1306	718	204	146	7	chr3	94516302	94516501	-65083282	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	182	5
1306	4556	68	0	31	chr3	94518676	94519282	-65080501	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	5
1306	251	167	62	0	chr3	94519743	94519791	-65079992	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3647	1875	1825	6
1306	269	286	60	0	chr3	94520014	94520098	-65079685	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3725	1797	1709	6
1306	670	157	114	0	chr3	94520650	94520790	-65078993	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-9	365	210	6
1306	1961	263	43	69	chr3	94520809	94521278	-65078505	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-973	607	149	6
1306	1961	263	43	69	chr3	94521329	94521480	-65078303	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1432	148	3	6
1306	535	288	199	26	chr3	94521481	94521752	-65078031	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	60	6
1306	242	266	100	15	chr3	94528461	94528591	-65071192	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	614	754	-755	9
1306	246	315	65	65	chr3	94539931	94540070	-65059713	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-444	659	521	1
1306	338	250	143	0	chr3	94540176	94540260	-65059523	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	96	-283	1
1306	2041	118	10	22	chr3	94549271	94549528	-65050255	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	59	1
1306	2158	91	39	0	chr3	94549528	94549836	-65049947	-	RLTR46	LTR	ERVK	0	320	1	1
1306	2041	118	10	22	chr3	94549836	94549891	-65049892	-	RLTR27	LTR	ERVK	-251	58	1	1
1306	1326	130	123	25	chr3	94549891	94550127	-65049656	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2	7579	7321	1
1306	357	325	29	17	chr3	94550252	94550424	-65049359	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-501	7080	6907	1
1306	7851	299	33	41	chr3	94550430	94554397	-65045386	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2099	5482	1545	1
1306	229	321	71	43	chr3	94554403	94554543	-65045240	-	MER54B	LTR	ERVL	-117	676	533	1
1306	445	311	47	35	chr3	94554565	94554824	-65044959	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5622	920	704	1
1306	266	263	0	0	chr3	94554958	94555034	-65044749	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-530	940	865	1
1306	1447	169	131	4	chr3	94555221	94555495	-65044288	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	1
1306	245	286	38	54	chr3	94555686	94555871	-65043912	+	RMER17C	LTR	ERVK	97	278	-132	1
1306	1156	218	162	31	chr3	94563263	94563590	-65036193	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
1306	228	304	125	19	chr3	94567339	94567443	-65032340	+	MTE2b	LTR	MaLR	191	305	-74	1
1306	802	270	106	8	chr3	94567443	94567678	-65032105	+	MTE-int	LTR	MaLR	958	1215	-365	1
1306	568	220	175	51	chr3	94567682	94567859	-65031924	+	MTE-int	LTR	MaLR	1367	1565	-15	1
1306	266	362	78	8	chr3	94580405	94580533	-65019250	+	MLT1F1	LTR	MaLR	433	569	0	2
1306	233	263	47	104	chr3	94581695	94581801	-65017982	+	MT2B2	LTR	ERVL	154	253	-331	2
1306	2221	86	79	0	chr3	94593239	94593542	-65006241	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1306	2680	148	22	128	chr3	94593751	94593837	-65005946	-	RLTR24	LTR	ERV1	-2	527	451	2
1306	2680	148	22	128	chr3	94593987	94594488	-65005295	-	RLTR24	LTR	ERV1	-79	450	2	2
1306	1759	177	91	3	chr3	94594964	94595304	-65004479	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	2
1306	315	363	83	65	chr3	94596945	94597292	-65002491	+	LTR16B1	LTR	ERVL	93	476	-4	2
1306	497	278	27	59	chr3	94597846	94598033	-65001750	+	HERV16-int	LTR	ERVL	268	448	-4548	2
1306	288	321	9	19	chr3	94598248	94598356	-65001427	+	HERV16-int	LTR	ERVL	754	860	-4136	2
1306	489	223	149	131	chr3	94598447	94598844	-65000939	+	RMER10A	LTR	ERVL	15	418	-24	2
1306	313	370	68	6	chr3	94603277	94603440	-64996343	+	LTR16B1	LTR	ERVL	99	271	-209	2
1306	588	265	198	9	chr3	94604302	94604519	-64995264	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	248	2
1306	1153	204	151	31	chr3	94604524	94604849	-64994934	+	MER57D	LTR	ERV1	1	387	-24	2
1306	398	279	9	0	chr3	94605168	94605279	-64994504	-	MLT1D	LTR	MaLR	-385	120	9	2
1306	2702	148	158	84	chr3	94614717	94614773	-64985010	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	571	3
1306	2702	148	158	84	chr3	94614963	94615475	-64984308	-	RMER19C	LTR	ERVK	-41	570	1	3
1306	537	195	41	12	chr3	94621168	94621309	-64978474	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-233	141	1	3
1306	1567	168	75	12	chr3	94621309	94621640	-64978143	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	1019	3
1306	740	245	35	5	chr3	94621963	94621995	-64977788	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-319	1051	1018	3
1306	740	245	35	5	chr3	94622033	94622197	-64977586	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-353	1017	850	3
1306	776	84	0	0	chr3	94622188	94622295	-64977488	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	212	3
1306	277	98	0	0	chr3	94622295	94622336	-64977447	+	ORR1C2	LTR	MaLR	344	384	0	3
1306	232	319	13	49	chr3	94631604	94631769	-64968014	-	MLT1I	LTR	MaLR	-9	435	283	3
1306	1552	175	128	56	chr3	94631786	94632083	-64967700	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	341	-43	3
1306	1552	175	128	56	chr3	94632256	94632313	-64967470	+	ORR1C2	LTR	MaLR	342	384	0	3
1306	1655	239	8	13	chr3	94632567	94632965	-64966818	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	10	3
1307	493	110	0	0	chr3	94637719	94637792	-64961991	-	RMER10B	LTR	ERVL	-325	73	1	4
1307	237	336	154	8	chr3	94639459	94639582	-64960201	+	MLT1H2	LTR	MaLR	232	372	-223	4
1307	238	313	23	46	chr3	94639616	94639703	-64960080	+	MLT1H2	LTR	MaLR	382	466	-23	4
1307	911	174	23	17	chr3	94647842	94648017	-64951766	+	RMER6D	LTR	ERVK	545	720	0	4
1307	4215	125	38	60	chr3	94650957	94651730	-64948053	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	4
1307	1448	184	246	35	chr3	94653612	94653661	-64946122	-	RMER4B	LTR	ERVK	-17	568	503	4
1307	1448	184	246	35	chr3	94653683	94654089	-64945694	-	RMER4B	LTR	ERVK	-83	502	17	4
1307	571	237	30	38	chr3	94654512	94654651	-64945132	-	MTE2a	LTR	MaLR	-42	377	201	4
1307	497	306	15	131	chr3	94654832	94654901	-64944882	-	MTE2a	LTR	MaLR	-164	255	198	4
1307	497	252	97	124	chr3	94655076	94655148	-64944635	-	MTE2a	LTR	MaLR	-222	197	87	4
1307	1185	239	36	57	chr3	94659391	94659777	-64940006	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	378	-1	4
1307	397	245	19	19	chr3	94663920	94664028	-64935755	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-266	108	1	4
1307	1000	168	0	15	chr3	94691914	94692113	-64907670	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	196	-202	5
1307	683	271	60	114	chr3	94692904	94693237	-64906546	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	317	-62	5
1307	235	183	27	40	chr3	94693298	94693372	-64906411	-	RLTR15	LTR	ERVK	-52	307	235	5
1307	4458	139	57	64	chr3	94694807	94695684	-64904099	+	RMER19B	LTR	ERVK	3	873	-29	5
1307	263	120	120	0	chr3	94696109	94696159	-64903624	-	RMER15	LTR	ERVL	-113	462	407	5
1307	918	165	66	28	chr3	94696219	94696431	-64903352	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	155	5
1307	904	224	39	45	chr3	94697320	94697656	-64902127	-	RLTR15	LTR	ERVK	-18	341	8	5
1307	4043	168	58	67	chr3	94697660	94698542	-64901241	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1	8958	8085	5
1307	1120	251	90	53	chr3	94699718	94700185	-64899598	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1811	4739	4256	5
1307	979	189	28	6	chr3	94700434	94700615	-64899168	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7502	1457	1273	5
1307	528	234	0	65	chr3	94700772	94700927	-64898856	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1784	1393	1249	5
1307	1200	271	47	64	chr3	94704485	94704522	-64895261	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7911	1048	1018	5
1307	4146	165	120	15	chr3	94704522	94705338	-64894445	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	5
1307	1200	271	47	64	chr3	94705338	94705784	-64893999	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7942	1017	571	5
1307	1200	271	47	64	chr3	94705972	94706000	-64893783	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8389	570	545	5
1307	1533	194	35	60	chr3	94708150	94708550	-64891233	+	MTC	LTR	MaLR	1	390	-31	5
1307	2090	168	32	60	chr3	94708572	94708769	-64891014	+	MTC	LTR	MaLR	2	210	-211	5
1307	2090	168	32	60	chr3	94708961	94709195	-64890588	+	MTC	LTR	MaLR	211	421	0	5
1307	749	207	40	149	chr3	94709279	94709346	-64890437	+	RMER16	LTR	ERVK	266	314	-219	5
1307	749	207	40	149	chr3	94709487	94709720	-64890063	+	RMER16	LTR	ERVK	315	533	0	5
1307	13987	138	19	3	chr3	94709720	94711809	-64887974	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2360	3401	1280	6
1307	4394	157	38	66	chr3	94711965	94712186	-64887597	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4467	1294	1069	6
1307	4394	157	38	66	chr3	94712361	94713005	-64886778	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4693	1068	453	6
1307	1856	131	91	3	chr3	94713005	94713335	-64886448	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	6
1307	2312	139	77	41	chr3	94713336	94713777	-64886006	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5303	458	2	6
1307	742	84	104	93	chr3	94713778	94713961	-64885822	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	349	6
1307	353	77	0	0	chr3	94713963	94714020	-64885763	-	MT2A	LTR	ERVL	-476	57	1	6
1307	1417	180	139	48	chr3	94718691	94719065	-64880718	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	12	6
1307	1245	172	232	3	chr3	94719605	94719932	-64879851	+	MTD	LTR	MaLR	13	414	-5	6
1307	266	327	42	47	chr3	94719956	94720168	-64879615	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1247	4420	4210	6
1307	246	287	17	167	chr3	94724950	94725052	-64874731	-	MT2B2	LTR	ERVL	-423	161	87	6
1307	359	272	68	68	chr3	94725117	94725338	-64874445	-	MLT1C	LTR	MaLR	-55	412	192	6
1307	2083	160	88	8	chr3	94730964	94731349	-64868434	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	6	6
1307	289	188	77	15	chr3	94732282	94732347	-64867436	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	311	6
1307	319	289	50	0	chr3	94733564	94733685	-64866098	-	MTEb	LTR	MaLR	-102	277	151	6
1307	717	179	30	155	chr3	94733688	94733841	-64865942	-	MT2A	LTR	ERVL	-328	205	79	6
1307	717	179	30	155	chr3	94733881	94733959	-64865824	-	MT2A	LTR	ERVL	-455	78	3	6
1307	270	286	100	74	chr3	94745204	94745434	-64854349	+	MT2B2	LTR	ERVL	41	276	-308	7
1307	456	298	0	60	chr3	94745478	94745593	-64854190	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	411	7
1307	456	298	0	60	chr3	94745725	94745777	-64854006	-	RLTR28	LTR	ERVL	-114	410	367	7
1307	2371	145	58	5	chr3	94745784	94746214	-64853569	-	RLTR28	LTR	ERVL	-71	453	1	7
1307	1292	220	67	43	chr3	94746994	94747047	-64852736	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	331	7
1307	1292	220	67	43	chr3	94747239	94747513	-64852270	-	MTEb	LTR	MaLR	-49	330	42	7
1307	1482	148	52	0	chr3	94748961	94749190	-64850593	+	ORR1B1	LTR	MaLR	113	353	-41	7
1307	345	336	38	15	chr3	94749793	94749926	-64849857	-	RMER15	LTR	ERVL	-93	482	347	7
1307	270	222	153	57	chr3	94754725	94754849	-64844934	+	RMER5	LTR	ERV1	124	259	-275	7
1307	553	216	39	31	chr3	94755082	94755211	-64844572	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	290	7
1307	2559	179	77	32	chr3	94755212	94755742	-64844041	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	349	7
1307	1239	122	0	193	chr3	94755760	94756035	-64843748	-	RMER19B	LTR	ERVK	-680	222	1	7
1307	351	295	9	9	chr3	94756042	94756148	-64843635	-	MTD	LTR	MaLR	-150	257	152	7
1307	301	344	38	15	chr3	94763546	94763679	-64836104	-	MLT1K	LTR	MaLR	-7	588	453	7
1307	365	335	99	63	chr3	94763732	94763955	-64835828	-	MLT1K	LTR	MaLR	-241	354	124	7
1308	602	56	97	43	chr3	94766546	94766639	-64833144	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	324	7
1308	1020	114	59	24	chr3	94766642	94766812	-64832971	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-246	176	1	7
1308	1524	232	72	11	chr3	94783022	94783371	-64816412	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	10	8
1308	266	282	89	128	chr3	94787111	94787173	-64812610	+	MT2B2	LTR	ERVL	115	281	-298	8
1308	532	125	56	11	chr3	94821801	94821890	-64777893	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	278	8
1308	895	223	83	0	chr3	94822232	94822425	-64777358	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-161	209	1	8
1308	359	216	97	105	chr3	94826901	94826951	-64772832	-	MT2B2	LTR	ERVL	-351	233	111	9
1308	3971	151	99	90	chr3	94828169	94828771	-64771012	-	RMER19B	LTR	ERVK	-16	886	234	9
1308	3786	112	196	86	chr3	94828771	94829584	-64770199	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-4	902	1	9
1308	3971	151	99	90	chr3	94829584	94829859	-64769924	-	RMER19B	LTR	ERVK	-669	233	1	9
1308	828	186	100	18	chr3	94849642	94849812	-64749971	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	196	9
1308	376	237	0	50	chr3	94850013	94850093	-64749690	-	MTE2a	LTR	MaLR	-291	88	13	9
1308	359	225	70	70	chr3	94850205	94850334	-64749449	+	MT2B	LTR	ERVL	129	257	-344	1
1308	252	270	50	217	chr3	94850705	94850808	-64748975	-	MTE-int	LTR	MaLR	0	1580	1487	1
1308	324	200	53	34	chr3	94850956	94851045	-64748738	-	MTE-int	LTR	MaLR	-39	1331	1253	1
1308	933	268	45	32	chr3	94851676	94851994	-64747789	-	MTE-int	LTR	MaLR	-454	1509	954	1
1308	247	353	23	46	chr3	94852079	94852156	-64747627	-	MTE-int	LTR	MaLR	-813	767	697	1
1308	247	353	23	46	chr3	94852309	94852406	-64747377	-	MTE-int	LTR	MaLR	-884	696	598	1
1308	421	288	125	5	chr3	94852431	94852623	-64747160	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1179	401	187	1
1308	710	309	26	22	chr3	94852854	94853122	-64746661	+	MTE-int	LTR	MaLR	68	336	-1244	1
1308	290	164	164	0	chr3	94853212	94853279	-64746504	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	302	1
1308	2306	144	79	8	chr3	94853599	94853978	-64745805	+	MTC	LTR	MaLR	16	421	0	1
1308	669	295	138	8	chr3	94854200	94854236	-64745547	+	MTE-int	LTR	MaLR	856	892	-688	1
1308	669	295	138	8	chr3	94854592	94854783	-64745000	+	MTE-int	LTR	MaLR	905	1124	-456	1
1308	1350	181	152	47	chr3	94854991	94855333	-64744450	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
1308	1692	194	98	10	chr3	94855577	94855739	-64744044	+	MTC	LTR	MaLR	2	180	-241	1
1308	1692	194	98	10	chr3	94855884	94856107	-64743676	+	MTC	LTR	MaLR	181	421	0	1
1308	436	288	70	64	chr3	94858625	94858670	-64741113	+	RLTR18B	LTR	ERVK	28	70	-442	1
1308	436	288	70	64	chr3	94858817	94858942	-64740841	+	RLTR18B	LTR	ERVK	71	199	-313	1
1308	707	331	114	36	chr3	94858943	94859303	-64740480	+	RLTR18B	LTR	ERVK	123	510	-2	1
1308	580	278	52	17	chr3	94859333	94859505	-64740278	+	RLTR18-int	LTR	ERVK	4	181	-5180	1
1308	3507	25	2	2	chr3	94861272	94861668	-64738115	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1308	479	284	67	8	chr3	94866504	94866657	-64733126	+	MLT1F2	LTR	MaLR	397	560	-9	1
1308	597	364	38	52	chr3	94867026	94867313	-64732470	+	MLT1F2	LTR	MaLR	228	510	-50	1
1308	370	269	12	98	chr3	94870767	94870825	-64728958	+	MT2B	LTR	ERVL	115	243	-358	1
1308	370	269	12	98	chr3	94870929	94870940	-64728843	+	MT2B	LTR	ERVL	244	272	-329	1
1308	248	297	65	125	chr3	94874735	94874935	-64724848	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	41	228	-94	1
1308	2297	172	79	25	chr3	94881255	94881697	-64718086	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	466	0	1
1309	2794	58	84	11	chr3	94927235	94927604	-64672179	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1309	3733	103	35	22	chr3	94935030	94935607	-64664176	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	1
1309	417	223	0	112	chr3	94946806	94946922	-64652861	+	MT2B	LTR	ERVL	162	264	-337	1
1309	884	228	247	8	chr3	94947672	94947915	-64651868	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	113	1
1309	1274	181	161	11	chr3	94949999	94950433	-64649350	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	538	-47	1
1309	2250	127	250	21	chr3	94956713	94957181	-64642602	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	1
1309	2537	137	166	14	chr3	94969518	94970007	-64629776	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	13	1
1309	386	248	18	82	chr3	94980726	94980836	-64618947	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	155	1
1309	940	215	0	6	chr3	94983013	94983186	-64616597	-	MTE2b	LTR	MaLR	-207	172	1	1
1309	305	239	43	59	chr3	94992090	94992116	-64607667	-	MT2B2	LTR	ERVL	-389	195	153	1
1309	414	289	38	69	chr3	94993864	94994024	-64605759	-	MLT1B	LTR	MaLR	-11	379	225	1
1309	687	168	29	89	chr3	94996575	94996865	-64602918	-	RMER4A	LTR	ERVK	-123	343	1	1
1309	268	186	34	0	chr3	94997184	94997243	-64602540	+	RMER4A	LTR	ERVK	18	78	-388	1
1309	555	275	105	87	chr3	94997256	94997626	-64602157	+	RMER4A	LTR	ERVK	54	430	-36	1
1309	351	268	53	18	chr3	94999749	94999863	-64599920	+	LTR41	LTR	ERVL	1	118	-650	1
1309	250	256	52	136	chr3	95003299	95003311	-64596472	-	MT2B2	LTR	ERVL	-292	292	242	1
1309	250	256	52	136	chr3	95003435	95003453	-64596330	-	MT2B2	LTR	ERVL	-292	241	152	1
1309	262	235	29	14	chr3	95007370	95007439	-64592344	+	MT2B2	LTR	ERVL	156	225	-359	3
1309	225	222	250	53	chr3	95009821	95009897	-64589886	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	167	4
1309	372	248	48	36	chr3	95011914	95011960	-64587823	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	586	5
1309	225	230	51	112	chr3	95024800	95024898	-64574885	-	MT2B2	LTR	ERVL	-308	276	185	1
1310	333	250	16	136	chr3	95029935	95030060	-64569723	+	MT2B	LTR	ERVL	150	259	-342	1
1310	2695	148	26	32	chr3	95062389	95062857	-64536926	-	RMER4A	LTR	ERVK	-1	465	1	2
1310	2364	161	24	87	chr3	95064975	95065017	-64534766	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	46	-420	2
1310	2364	161	24	87	chr3	95065393	95065433	-64534350	+	RMER4A	LTR	ERVK	47	62	-404	2
1310	2364	161	24	87	chr3	95065581	95065989	-64533794	+	RMER4A	LTR	ERVK	63	466	0	2
1310	1878	141	28	37	chr3	95070813	95071137	-64528646	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	321	-57	2
1310	414	71	0	0	chr3	95071277	95071333	-64528450	+	ORR1C2	LTR	MaLR	315	370	-14	2
1310	1001	162	99	25	chr3	95073265	95073467	-64526316	+	MTC	LTR	MaLR	2	218	-203	2
1310	298	147	107	107	chr3	95073454	95073538	-64526245	+	RLTR17	LTR	ERVK	609	692	0	2
1310	242	255	156	21	chr3	95079656	95079752	-64520031	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	170	2
1310	440	178	15	139	chr3	95090300	95090333	-64509450	+	MT2B	LTR	ERVL	138	153	-448	3
1310	539	305	124	69	chr3	95092502	95092939	-64506844	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-32	495	71	3
1310	1845	174	129	24	chr3	95094089	95094506	-64505277	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	3
1310	528	349	36	6	chr3	95097757	95097924	-64501859	-	MLT1I	LTR	MaLR	0	411	240	3
1310	320	239	21	64	chr3	95098182	95098276	-64501507	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	152	3
1310	251	302	32	65	chr3	95100506	95100630	-64499153	-	RMER13A	LTR	ERVK	-102	758	639	3
1310	2926	114	110	16	chr3	95103520	95104037	-64495746	+	RMER4B	LTR	ERVK	16	581	-4	3
1310	1590	173	110	18	chr3	95114298	95114634	-64485149	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	3
1310	839	175	160	75	chr3	95136530	95136847	-64462936	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-30	354	3	4
1310	238	298	26	149	chr3	95137469	95137515	-64462268	-	MT2B2	LTR	ERVL	-297	287	190	4
1310	238	298	26	149	chr3	95137608	95137623	-64462160	-	MT2B2	LTR	ERVL	-297	189	153	4
1310	5800	87	42	73	chr3	95147453	95148412	-64451371	-	RLTR13B3	LTR	ERVK	0	929	1	4
1310	1214	284	43	20	chr3	95157858	95158210	-64441573	+	MTE2a	LTR	MaLR	20	379	0	4
1311	3877	186	31	57	chr3	95162706	95162932	-64436851	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	2877	3030	-668	5
1311	3877	151	25	57	chr3	95163171	95163751	-64436032	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	3032	3605	-93	5
1311	365	229	147	40	chr3	95163737	95163887	-64435896	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7613	7778	0	5
1311	3223	43	10	5	chr3	95163916	95164310	-64435473	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1311	263	308	52	65	chr3	95164714	95164867	-64434916	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	378	528	-59	5
1311	299	303	39	58	chr3	95164997	95165210	-64434573	-	MT2B	LTR	ERVL	-328	256	40	5
1311	925	145	63	12	chr3	95165255	95165531	-64434252	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	5
1311	964	256	103	67	chr3	95166695	95167131	-64432652	+	RLTR12B	LTR	ERVK	46	497	-31	5
1311	281	164	16	0	chr3	95167330	95167391	-64432392	-	RMER4A	LTR	ERVK	-1	465	404	5
1311	4618	4	0	0	chr3	95167501	95167994	-64431789	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1311	48889	16	0	0	chr3	95167994	95173366	-64426417	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5371	-114	5
1311	332	164	13	40	chr3	95173366	95173442	-64426341	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	5
1311	321	0	0	0	chr3	95173442	95173480	-64426303	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	5
1311	824	0	0	0	chr3	95173480	95173578	-64426205	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	98	-395	5
1311	559	26	13	0	chr3	95173601	95173677	-64426106	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	417	493	0	5
1311	1885	191	62	60	chr3	95173685	95173907	-64425876	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1460	866	663	5
1311	647	275	119	47	chr3	95173907	95174250	-64425533	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	5
1311	1885	191	62	60	chr3	95174250	95174462	-64425321	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1664	662	431	5
1311	629	98	0	29	chr3	95175092	95175197	-64424586	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1912	414	313	5
1311	536	174	10	0	chr3	95175382	95175480	-64424303	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-5161	99	1	5
1311	2261	177	17	36	chr3	95175480	95175950	-64423833	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	6	5
1311	431	233	10	0	chr3	95176128	95176231	-64423552	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	316	5
1311	248	242	76	61	chr3	95176231	95176363	-64423420	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	313	5
1311	2527	161	10	55	chr3	95176371	95176412	-64423371	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-356	3342	3312	5
1311	2527	161	10	55	chr3	95176601	95177047	-64422736	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-387	3311	2877	5
1311	292	210	0	227	chr3	95177424	95177504	-64422279	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2736	962	895	5
1311	292	210	0	227	chr3	95177681	95177752	-64422031	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2804	894	844	5
1311	260	259	193	32	chr3	95178421	95178658	-64421125	-	RLTR41	LTR	ERV1	-80	452	240	5
1311	1250	216	103	0	chr3	95178977	95179259	-64420524	-	MTD	LTR	MaLR	-108	311	1	5
1311	1835	146	80	18	chr3	95179493	95179861	-64419922	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	5
1311	749	242	8	0	chr3	95180023	95180155	-64419628	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7202	-204	5
1311	340	284	38	25	chr3	95180569	95180728	-64419055	+	RMER16-int	LTR	ERVK	169	329	-6915	5
1311	1927	189	165	43	chr3	95181077	95181586	-64418197	+	RMER16-int	LTR	ERVK	251	821	-4585	5
1311	628	208	25	0	chr3	95181589	95181709	-64418074	+	RMER16-int	LTR	ERVK	938	1060	-5077	5
1311	1017	261	86	23	chr3	95181722	95182024	-64417759	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2454	2774	-4632	5
1311	4890	167	130	137	chr3	95182039	95183222	-64416561	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	4296	5435	-1809	5
1311	4890	167	130	137	chr3	95183341	95183881	-64415902	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5443	6070	-1174	5
1311	979	252	51	21	chr3	95183883	95184249	-64415534	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	7506	7848	-369	5
1311	4812	146	26	3	chr3	95184262	95184957	-64414826	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6492	7202	-204	5
1311	457	312	56	7	chr3	95186550	95186692	-64413091	+	MTE2a	LTR	MaLR	79	227	-152	5
1311	649	204	39	26	chr3	95186755	95186911	-64412872	+	MTE2a	LTR	MaLR	222	379	0	5
1311	269	281	0	0	chr3	95187781	95187845	-64411938	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	3707	3770	-3831	5
1311	1770	169	64	8	chr3	95194986	95195343	-64404440	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	29	5
1311	252	229	8	41	chr3	95199353	95199388	-64400395	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-864	645	615	6
1311	2838	16	3	0	chr3	95199955	95200276	-64399507	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
1311	42228	28	0	6	chr3	95200276	95205147	-64394636	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	6
1311	2812	22	3	0	chr3	95205147	95205468	-64394315	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
1311	245	273	99	20	chr3	95207790	95207891	-64391892	-	RMER10A	LTR	ERVL	-15	427	319	6
1311	1567	149	151	3	chr3	95209543	95209860	-64389923	+	ORR1C2	LTR	MaLR	21	384	0	6
1311	732	303	0	58	chr3	95210314	95210556	-64389227	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-1896	3095	2868	6
1311	2085	67	27	3	chr3	95210608	95210909	-64388874	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	308	-19	6
1311	359	304	40	52	chr3	95211067	95211443	-64388340	-	MuLV-int	LTR	ERV1	-2657	4949	4890	6
1311	252	264	32	21	chr3	95212437	95212530	-64387253	+	MLT1B	LTR	MaLR	295	388	-2	6
1311	316	164	59	15	chr3	95213140	95213208	-64386575	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-280	94	24	6
1311	704	185	96	79	chr3	95216918	95217174	-64382609	-	RMER12	LTR	ERVK	-32	1290	980	6
1311	593	153	45	0	chr3	95217180	95217291	-64382492	+	RMER19B	LTR	ERVK	8	123	-779	6
1311	2228	115	35	5	chr3	95217320	95217695	-64382088	+	RMER16	LTR	ERVK	148	533	0	6
1311	2731	164	142	25	chr3	95217695	95218311	-64381472	+	RMER19B	LTR	ERVK	120	808	-94	6
1311	1209	236	61	39	chr3	95218298	95218857	-64380926	-	RMER12	LTR	ERVK	-607	797	39	6
1311	253	173	39	0	chr3	95219387	95219439	-64380344	-	RMER12	LTR	ERVK	-1268	54	1	6
1311	3442	41	0	128	chr3	95219689	95220189	-64379594	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	6
1311	2764	64	147	142	chr3	95220511	95221020	-64378763	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
1311	2931	39	0	0	chr3	95221130	95221462	-64378321	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	6
1311	45485	79	7	5	chr3	95221476	95227248	-64372535	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	62	5850	-1830	6
1311	1287	34	0	0	chr3	95227245	95227394	-64372389	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	5596	5744	-1936	6
1311	12295	51	34	1	chr3	95227397	95229162	-64370621	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	5857	7680	0	6
1311	2944	36	0	0	chr3	95229162	95229494	-64370289	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	6
1311	1778	138	141	102	chr3	95230173	95230326	-64369457	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	0	420	276	6
1311	1778	138	141	102	chr3	95230473	95230723	-64369060	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	-145	275	1	6
1311	1911	173	24	125	chr3	95230993	95231489	-64368294	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	6
1311	769	280	42	26	chr3	95234613	95234877	-64364906	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	112	6
1311	4556	6	2	0	chr3	95235286	95235778	-64364005	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	6
1311	319	191	22	2	chr3	95236078	95236155	-64363628	+	MTC	LTR	MaLR	18	97	-322	6
1311	227	299	0	112	chr3	95240256	95240354	-64359429	-	MT2B	LTR	ERVL	-362	239	153	7
1311	487	232	40	0	chr3	95241962	95242087	-64357696	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	240	7
1311	552	149	0	10	chr3	95242095	95242197	-64357586	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-265	109	9	7
1311	1808	172	46	36	chr3	95248549	95248960	-64350823	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	7	7
1311	3137	35	70	0	chr3	95253274	95253644	-64346139	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1311	229	352	60	53	chr3	95257863	95258013	-64341770	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-305	184	34	7
1311	399	188	29	10	chr3	95258164	95258266	-64341517	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	106	-268	7
1311	793	206	74	6	chr3	95258289	95258465	-64341318	-	MTD	LTR	MaLR	-231	188	1	7
1311	2077	158	70	8	chr3	95258699	95259057	-64340726	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	3	7
1311	1073	190	79	34	chr3	95277660	95278042	-64321741	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	5	8
1311	3183	36	26	3	chr3	95286526	95286912	-64312871	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	2	8
1312	259	194	13	107	chr3	95290314	95290389	-64309394	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	173	8
1312	446	108	68	0	chr3	95302251	95302323	-64297460	+	MTC	LTR	MaLR	105	181	-240	8
1312	269	148	112	56	chr3	95311466	95311573	-64288210	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	397	9
1312	966	228	164	36	chr3	95312080	95312416	-64287367	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	9
1312	1360	178	101	0	chr3	95316134	95316432	-64283351	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	245	9
1312	410	163	0	263	chr3	95317379	95317554	-64282229	-	RMER15	LTR	ERVL	-444	131	3	9
1312	3385	133	41	94	chr3	95318205	95318953	-64280830	+	RMER6A	LTR	ERVK	48	756	0	9
1312	936	294	77	45	chr3	95320648	95321140	-64278643	+	RLTR18B	LTR	ERVK	5	512	0	9
1312	1476	159	131	19	chr3	95326929	95327288	-64272495	+	MTD	LTR	MaLR	12	410	-9	9
1312	1133	224	180	36	chr3	95336803	95337293	-64262490	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-8	543	2	9
1312	2645	134	39	15	chr3	95341443	95341852	-64257931	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	1
1312	625	291	84	58	chr3	95343042	95343414	-64256369	-	RLTR26	LTR	ERVK	-207	435	1	1
1312	1094	137	130	25	chr3	95348779	95349018	-64250765	-	RMER10A	LTR	ERVL	-157	285	22	1
1312	271	279	22	90	chr3	95350319	95350453	-64249330	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-505	523	399	1
1312	801	181	372	28	chr3	95352244	95352279	-64247504	-	MTD	LTR	MaLR	-29	390	356	1
1312	3765	15	2	0	chr3	95352279	95352674	-64247109	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1312	801	181	372	28	chr3	95352674	95352928	-64246855	-	MTD	LTR	MaLR	-64	355	1	1
1312	1583	178	176	33	chr3	95354234	95354570	-64245213	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	1
1312	296	260	63	112	chr3	95354665	95354808	-64244975	-	MT2B	LTR	ERVL	-327	274	139	1
1312	1711	211	16	45	chr3	95355605	95355986	-64243797	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
1312	237	363	18	9	chr3	95356479	95356593	-64243190	-	MLT1C	LTR	MaLR	-40	427	313	1
1312	496	255	170	79	chr3	95357795	95358072	-64241711	-	MLT1C	LTR	MaLR	-159	308	7	1
1312	2408	102	116	0	chr3	95367701	95368054	-64231729	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1312	1953	176	94	8	chr3	95369018	95369390	-64230393	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	18	1
1312	264	277	66	74	chr3	95382486	95382607	-64217176	-	MT2B2	LTR	ERVL	-332	252	133	1
1312	5105	105	22	36	chr3	95385768	95386589	-64213194	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	1	1
1312	366	139	118	70	chr3	95394313	95394499	-64205284	+	RMER17C	LTR	ERVK	80	274	-136	1
1312	305	138	35	0	chr3	95403600	95403658	-64196125	-	MTE2a	LTR	MaLR	-4	375	316	1
1312	469	254	284	54	chr3	95404024	95404293	-64195490	-	MTE2a	LTR	MaLR	-44	335	5	1
1312	629	238	66	34	chr3	95417761	95418018	-64181765	-	MTEb	LTR	MaLR	-55	324	40	1
1313	1993	107	12	15	chr3	95425080	95425404	-64174379	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-261	323	1	1
1313	1695	156	37	43	chr3	95427353	95427718	-64172065	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	357	-53	1
1313	1803	146	11	142	chr3	95427718	95427994	-64171789	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	226	-184	1
1313	1803	146	11	142	chr3	95428152	95428346	-64171437	+	RMER17C	LTR	ERVK	227	409	-1	1
1313	1695	155	37	44	chr3	95428346	95428392	-64171391	+	RMER17C	LTR	ERVK	358	402	-8	1
1313	227	218	42	94	chr3	95438419	95438434	-64161349	+	MT2B2	LTR	ERVL	151	160	-424	1
1313	1376	149	53	16	chr3	95461147	95461392	-64138391	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	168	1
1313	315	116	43	0	chr3	95474840	95474909	-64124874	-	RMER17C	LTR	ERVK	-137	273	202	1
1313	380	249	63	111	chr3	95475152	95475342	-64124441	-	MT2B	LTR	ERVL	-345	256	76	1
1313	1600	164	148	13	chr3	95478685	95479062	-64120721	-	RMER10A	LTR	ERVL	-2	440	13	1
1313	242	143	36	167	chr3	95492558	95492642	-64107141	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	168	1
1313	517	91	148	0	chr3	95494683	95494771	-64105012	+	ORR1A4	LTR	MaLR	187	287	-42	1
1313	383	74	0	0	chr3	95495073	95495127	-64104656	+	ORR1A4	LTR	MaLR	274	327	-2	1
1313	332	227	0	102	chr3	95495643	95495660	-64104123	+	MT2B	LTR	ERVL	155	251	-350	1
1313	1585	186	121	21	chr3	95501353	95501368	-64098415	+	MTD	LTR	MaLR	2	15	-404	3
1313	1585	186	121	21	chr3	95501391	95501755	-64098028	+	MTD	LTR	MaLR	16	419	0	3
1313	2233	254	77	118	chr3	95501755	95502137	-64097646	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	335	-923	3
1313	2233	254	77	118	chr3	95502162	95502841	-64096942	+	MTD-int	LTR	MaLR	336	1019	-239	3
1313	226	296	91	91	chr3	95506583	95506791	-64092992	+	RLTR42	LTR	ERVK	32	239	0	1
1313	619	201	120	18	chr3	95507231	95507398	-64092385	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	236	1
1313	310	68	322	0	chr3	95509698	95509757	-64090026	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	451	2
1313	1319	164	61	23	chr3	95509763	95510025	-64089758	+	RLTR11A	LTR	ERVK	257	528	0	2
1313	347	328	40	99	chr3	95512486	95512709	-64087074	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-1744	3247	3038	3
1313	309	268	114	6	chr3	95512875	95513033	-64086750	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3369	4838	4664	3
1313	333	300	41	103	chr3	95513683	95513723	-64086060	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3114	3977	3945	3
1313	333	300	41	103	chr3	95513910	95514256	-64085527	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3147	3944	3615	3
1313	510	217	16	40	chr3	95514269	95514394	-64085389	-	RMER20B	LTR	ERVK	-22	605	484	3
1313	1953	212	97	12	chr3	95514538	95514962	-64084821	-	RMER20B	LTR	ERVK	-167	460	1	3
1313	822	240	16	24	chr3	95515099	95515351	-64084432	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2273	2718	2469	3
1313	293	206	27	93	chr3	95515352	95515389	-64084394	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	615	749	-755	4
1313	436	198	0	111	chr3	95515389	95515497	-64084286	+	MT2B	LTR	ERVL	162	257	-344	4
1313	2404	206	137	22	chr3	95515544	95516346	-64083437	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-2535	2456	1563	3
1313	4418	139	82	76	chr3	95516563	95517078	-64082705	-	RMER19B	LTR	ERVK	-16	886	328	4
1313	6122	112	82	17	chr3	95517078	95518038	-64081745	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	1	4
1313	4418	139	82	76	chr3	95518038	95518403	-64081380	-	RMER19B	LTR	ERVK	-575	327	2	4
1313	1896	234	47	58	chr3	95518403	95519017	-64080766	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-3423	1568	962	3
1313	1896	296	192	38	chr3	95519087	95519437	-64080346	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-4030	961	558	3
1313	269	327	13	82	chr3	95519414	95519505	-64080278	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2905	333	117	4
1313	724	210	0	28	chr3	95519505	95519647	-64080136	-	RodERV21-int	LTR	ERV1	-4674	317	180	3
1313	732	204	114	17	chr3	95523667	95523842	-64075941	-	MTC	LTR	MaLR	-34	387	196	6
1313	606	201	55	24	chr3	95524051	95524210	-64075573	-	MTC	LTR	MaLR	-210	211	55	6
1313	249	254	14	56	chr3	95525240	95525311	-64074472	-	RMER10A	LTR	ERVL	-363	79	12	6
1313	231	106	66	132	chr3	95526585	95526661	-64073122	+	MTE2a	LTR	MaLR	309	379	0	7
1313	1360	228	133	8	chr3	95528575	95528942	-64070841	+	MTD	LTR	MaLR	4	416	-3	8
1313	1120	149	66	20	chr3	95529755	95529953	-64069830	+	ORR1C2	LTR	MaLR	174	380	-4	9
1313	312	283	124	8	chr3	95532862	95532983	-64066800	-	MLT1F	LTR	MaLR	-3	545	411	1
1313	907	241	128	58	chr3	95534463	95534806	-64064977	+	MTD	LTR	MaLR	3	369	-50	1
1313	303	229	33	125	chr3	95541233	95541353	-64058430	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	156	1
1313	2306	244	117	95	chr3	95547281	95548465	-64051318	+	RMER12	LTR	ERVK	5	1213	-109	1
1313	650	239	303	17	chr3	95548691	95548985	-64050798	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	378	-1	1
1313	421	264	9	125	chr3	95549511	95549538	-64050245	-	MT2B	LTR	ERVL	-328	256	180	1
1313	421	264	9	125	chr3	95549619	95549633	-64050150	-	MT2B	LTR	ERVL	-257	179	156	1
1314	3349	38	2	8	chr3	95583837	95584235	-64015548	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1314	1472	171	76	79	chr3	95597100	95597455	-64002328	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	354	-30	2
1314	283	224	53	61	chr3	95601815	95601858	-63997925	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-588	440	387	2
1314	684	244	110	35	chr3	95603873	95604128	-63995655	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	320	-208	2
1314	833	133	40	0	chr3	95606461	95606611	-63993172	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	160	-169	3
1314	1008	117	17	45	chr3	95606772	95606951	-63992832	+	ORR1B1	LTR	MaLR	213	386	-8	3
1314	3395	146	118	47	chr3	95607042	95607313	-63992470	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	317	-439	3
1314	3395	146	118	47	chr3	95607336	95607446	-63992337	+	RMER6A	LTR	ERVK	318	441	-315	3
1314	3395	146	118	47	chr3	95607624	95607947	-63991836	+	RMER6A	LTR	ERVK	442	756	0	3
1314	267	230	66	26	chr3	95628286	95628362	-63971421	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	431	3
1314	783	264	107	34	chr3	95629075	95629373	-63970410	-	MTEa	LTR	MaLR	-59	320	1	3
1314	2722	183	171	16	chr3	95630419	95631120	-63968663	-	RLTR40	LTR	ERVK	-7	810	1	3
1314	948	259	99	52	chr3	95633234	95633577	-63966206	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	4
1314	282	307	9	47	chr3	95638657	95638763	-63961020	-	MT2B	LTR	ERVL	-348	253	152	4
1314	3216	101	42	2	chr3	95660510	95660967	-63938816	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	4
1315	259	194	12	122	chr3	95687714	95687796	-63911987	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-530	498	426	5
1315	323	188	112	45	chr3	95689462	95689551	-63910232	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	163	5
1315	295	216	20	120	chr3	95690321	95690343	-63909440	+	MT2B	LTR	ERVL	143	162	-439	5
1315	295	216	20	120	chr3	95690494	95690571	-63909212	+	MT2B	LTR	ERVL	163	232	-369	5
1315	1431	208	138	6	chr3	95691596	95691921	-63907862	+	MTD	LTR	MaLR	45	412	-7	5
1315	289	268	107	58	chr3	95704594	95704697	-63895086	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	157	6
1315	392	194	162	77	chr3	95704859	95704976	-63894807	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	131	6
1315	271	230	95	0	chr3	95714872	95714946	-63884837	+	RMER21B	LTR	ERV1	489	569	-273	6
1315	852	115	35	179	chr3	95724203	95724269	-63875514	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	287	6
1315	852	115	35	179	chr3	95724415	95724549	-63875234	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-41	286	148	6
1315	4268	128	81	47	chr3	95724554	95725359	-63874424	+	RMER17A2	LTR	ERVK	75	906	0	6
1315	2236	144	69	23	chr3	95725554	95725946	-63873837	+	MTC	LTR	MaLR	4	413	-8	6
1315	323	231	96	0	chr3	95727100	95727191	-63872592	-	MTEb	LTR	MaLR	-264	115	1	6
1315	1126	219	36	63	chr3	95729064	95729438	-63870345	-	RLTR33	LTR	ERVK	-85	593	145	6
1315	351	324	42	104	chr3	95729535	95729674	-63870109	-	LTR16A	LTR	ERVL	-270	181	46	6
1315	351	324	42	104	chr3	95729864	95729917	-63869866	-	LTR16A	LTR	ERVL	-406	45	1	6
1315	684	188	14	35	chr3	95730118	95730261	-63869522	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-10	374	235	6
1315	341	250	52	35	chr3	95730320	95730436	-63869347	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-126	248	131	6
1315	387	193	10	93	chr3	95730543	95730640	-63869143	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	169	6
1315	318	308	53	106	chr3	95731704	95731776	-63868007	+	MT2B2	LTR	ERVL	176	354	-230	6
1315	245	224	98	73	chr3	95735003	95735085	-63864698	+	MT2B	LTR	ERVL	155	238	-363	7
1315	282	183	105	47	chr3	95738278	95738364	-63861419	+	MT2B	LTR	ERVL	174	264	-337	7
1315	1711	123	170	6	chr3	95746573	95746885	-63852898	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	32	7
1315	345	272	0	112	chr3	95751407	95751523	-63848260	+	MT2B	LTR	ERVL	135	237	-364	7
1315	426	211	28	140	chr3	95755870	95755910	-63843873	-	MT2B	LTR	ERVL	-447	154	131	7
1315	239	305	0	8	chr3	95758412	95758428	-63841355	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	632	646	-863	7
1315	2823	58	3	19	chr3	95758543	95758913	-63840870	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	364	-1	7
1315	1003	251	22	68	chr3	95758974	95759295	-63840488	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4755	767	462	7
1315	389	220	72	106	chr3	95759440	95759648	-63840135	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-5319	203	3	7
1315	1416	176	40	170	chr3	95762695	95763125	-63836658	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	7
1315	2318	155	48	8	chr3	95763286	95763683	-63836100	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	7
1315	958	281	44	71	chr3	95764905	95765311	-63834472	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	2911	3305	-1686	8
1315	869	271	112	66	chr3	95767139	95767566	-63832217	-	MLT1D	LTR	MaLR	-11	494	48	8
1315	1871	157	56	51	chr3	95778667	95778711	-63821072	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-9	358	327	8
1315	1871	157	56	51	chr3	95778855	95779009	-63820774	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-41	326	166	8
1315	1871	157	56	51	chr3	95779032	95779188	-63820595	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-202	165	3	8
1315	225	219	163	47	chr3	95782722	95782808	-63816975	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	168	8
1315	791	312	88	13	chr3	95785933	95786306	-63813477	-	MLT1H-int	LTR	MaLR	-1008	401	1	8
1315	240	260	12	61	chr3	95786350	95786432	-63813351	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-503	600	523	8
1315	286	315	90	99	chr3	95808025	95808226	-63791557	+	MT2B	LTR	ERVL	194	392	-209	8
1316	239	184	0	75	chr3	95813637	95813690	-63786093	+	MLT1E1	LTR	MaLR	412	460	-194	9
1316	1469	217	66	39	chr3	95814891	95815255	-63784528	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	9
1316	515	304	276	13	chr3	95821142	95821719	-63778064	+	MER21B	LTR	ERV1	1	731	-132	9
1316	1191	153	20	5	chr3	95830543	95830746	-63769037	+	RMER6A	LTR	ERVK	121	326	-430	9
1316	303	289	7	110	chr3	95831233	95831369	-63768414	+	MT2B	LTR	ERVL	142	263	-338	9
1316	414	301	187	26	chr3	95834616	95834889	-63764894	-	MLT1E	LTR	MaLR	-57	596	280	9
1316	515	261	9	0	chr3	95835900	95836011	-63763772	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	129	-250	9
1316	911	264	85	51	chr3	95864820	95865195	-63734588	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	3	1
1316	1693	202	73	3	chr3	95870702	95871070	-63728713	+	MTD	LTR	MaLR	12	405	-14	1
1316	4671	102	46	106	chr3	95872381	95873172	-63726611	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	169	1
1316	4142	151	36	113	chr3	95873172	95873404	-63726379	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	668	1
1316	4142	151	36	113	chr3	95873549	95874293	-63725490	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-235	667	1	1
1316	4671	102	46	106	chr3	95874293	95874465	-63725318	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-738	168	1	1
1316	1627	164	44	18	chr3	95874465	95874906	-63724877	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	48	527	0	1
1316	3434	35	2	0	chr3	95885272	95885667	-63714116	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1316	1852	129	75	12	chr3	95888203	95888549	-63711234	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	1
1316	2569	202	19	44	chr3	95891910	95892505	-63707278	-	RLTR18	LTR	ERVK	-24	592	13	1
1316	755	245	80	110	chr3	95895368	95895804	-63703979	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	430	0	1
1316	554	237	98	6	chr3	95903794	95903968	-63695815	-	MLT1L	LTR	MaLR	-3	607	418	1
1316	336	287	127	67	chr3	95903983	95904282	-63695501	-	MLT1L	LTR	MaLR	-272	338	22	1
1316	1054	221	98	52	chr3	95904283	95904608	-63695175	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	79	1
1316	239	203	145	0	chr3	95904790	95904859	-63694924	-	MTD	LTR	MaLR	-323	96	18	1
1316	5779	231	43	49	chr3	95924418	95925817	-63673966	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2113	2886	1497	1
1316	1333	167	167	18	chr3	95933745	95934074	-63665709	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	5	1
1317	244	220	33	17	chr3	95951490	95951550	-63648233	-	MER66B	LTR	ERV1	-376	110	50	1
1317	1497	204	157	6	chr3	95958193	95958557	-63641226	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1317	2740	95	107	21	chr3	95971218	95971323	-63628460	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	347	1
1317	2740	95	107	21	chr3	95971349	95971672	-63628111	-	RMER4A	LTR	ERVK	-120	346	2	1
1317	2906	12	0	0	chr3	96002404	96002726	-63597057	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	5
1317	388	300	160	56	chr3	96002726	96002860	-63596923	-	RMER10A	LTR	ERVL	-29	413	258	6
1317	388	300	160	56	chr3	96002965	96003204	-63596579	-	RMER10A	LTR	ERVL	-185	257	1	6
1317	320	253	138	108	chr3	96003704	96004035	-63595748	+	RMER10A	LTR	ERVL	18	367	-75	9
1317	320	253	138	108	chr3	96004075	96004142	-63595641	+	RMER10A	LTR	ERVL	368	428	-14	9
1317	4451	14	2	2	chr3	96004167	96004660	-63595123	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1317	319	0	0	0	chr3	96004660	96004698	-63595085	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	1
1317	395	167	46	35	chr3	96004698	96004785	-63594998	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	1
1317	48496	15	6	0	chr3	96004785	96010111	-63589672	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	1
1317	4451	14	2	2	chr3	96010111	96010604	-63589179	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1317	2308	157	130	51	chr3	96010604	96011324	-63588459	-	RMER19B	LTR	ERVK	-38	864	1	1
1317	699	269	129	44	chr3	96012864	96013159	-63586624	+	MLT1A0	LTR	MaLR	19	338	-27	2
1317	361	204	62	80	chr3	96015411	96015523	-63584260	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	169	2
1317	2274	124	48	108	chr3	96015905	96016340	-63583443	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	13	3
1317	1458	154	77	0	chr3	96016418	96016678	-63583105	-	RLTR28	LTR	ERVL	-16	508	229	3
1317	560	236	0	0	chr3	96017027	96017137	-63582646	-	RMER15	LTR	ERVL	-21	554	445	3
1317	1198	158	37	0	chr3	96017869	96018059	-63581724	-	RMER15	LTR	ERVL	-154	421	225	3
1317	330	311	67	88	chr3	96018319	96018559	-63581224	+	RLTR23	LTR	ERV1	196	430	0	3
1317	856	188	12	12	chr3	96018559	96018721	-63581062	-	RMER15	LTR	ERVL	-413	162	1	3
1317	4536	111	83	101	chr3	96019510	96019920	-63579863	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	564	3
1317	4536	111	83	101	chr3	96020113	96020342	-63579441	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-343	563	294	3
1317	4536	111	83	101	chr3	96020373	96020654	-63579129	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-613	293	1	3
1317	800	189	92	85	chr3	96026710	96027057	-63572726	+	MT2A	LTR	ERVL	51	483	-118	4
1317	852	251	60	90	chr3	96030646	96031116	-63568667	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-55	473	1	5
1317	624	209	233	10	chr3	96031136	96031329	-63568454	+	ORR1C2	LTR	MaLR	5	240	-144	5
1317	865	273	50	147	chr3	96031348	96032030	-63567753	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	616	0	5
1317	1670	140	144	32	chr3	96032842	96033182	-63566601	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	6
1317	286	348	54	87	chr3	96035978	96036220	-63563563	+	MLT1C	LTR	MaLR	77	310	-157	7
1317	2518	135	34	32	chr3	96036293	96036705	-63563078	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	7
1317	444	247	97	26	chr3	96037180	96037334	-63562449	-	MLT1D	LTR	MaLR	-16	489	325	7
1317	638	293	23	51	chr3	96037406	96037622	-63562161	-	MLT1D	LTR	MaLR	-295	210	1	7
1317	2267	191	83	14	chr3	96038489	96038984	-63560799	+	RMER5	LTR	ERV1	1	529	-5	7
1317	1526	178	70	29	chr3	96046229	96046588	-63553195	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	385	-15	8
1317	239	311	0	63	chr3	96046713	96046792	-63552991	+	MLT1D	LTR	MaLR	125	198	-307	8
1317	502	195	177	0	chr3	96046818	96046931	-63552852	-	MT2A	LTR	ERVL	-400	133	1	8
1317	3702	76	2	4	chr3	96053878	96054366	-63545417	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-16	487	1	9
1317	868	212	188	9	chr3	96054566	96054790	-63544993	-	MTEa	LTR	MaLR	-103	276	13	9
1317	4250	120	46	1	chr3	96056945	96057594	-63542189	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	1
1317	499	271	212	5	chr3	96057613	96057835	-63541948	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	357	90	1
1317	1711	226	52	37	chr3	96057837	96058241	-63541542	+	MTD	LTR	MaLR	2	411	-8	1
1317	331	93	73	18	chr3	96058899	96058954	-63540829	-	MTC	LTR	MaLR	-18	401	344	1
1317	1301	117	15	0	chr3	96058950	96059146	-63540637	-	MTC	LTR	MaLR	-220	201	3	1
1317	2941	131	50	4	chr3	96061980	96062455	-63537328	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	3	1
1317	4160	120	91	14	chr3	96062838	96063540	-63536243	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	1
1317	4713	94	85	0	chr3	96063993	96064255	-63535528	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	263	-474	1
1317	4713	94	85	0	chr3	96064284	96064700	-63535083	+	RMER19A	LTR	ERVK	264	736	-1	1
1317	227	159	215	31	chr3	96068767	96068832	-63530951	+	MER34A	LTR	ERV1	1	77	-494	1
1317	376	289	134	54	chr3	96069055	96069278	-63530505	+	MER34A1	LTR	ERV1	327	567	-20	1
1317	297	173	99	174	chr3	96071555	96071582	-63528201	+	MT2B	LTR	ERVL	139	219	-382	1
1317	297	173	99	174	chr3	96071696	96071716	-63528067	+	MT2B	LTR	ERVL	220	287	-314	1
1317	1711	25	0	0	chr3	96074238	96074440	-63525343	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-194	202	1	1
1317	9139	36	7	4	chr3	96074440	96075534	-63524249	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
164	3507	28	2	0	chr3	96075534	96075929	-63523854	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1318	9139	36	7	4	chr3	96075929	96077023	-63522760	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1318	3507	28	2	0	chr3	96077023	96077418	-63522365	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1318	1781	148	71	0	chr3	96085322	96085619	-63514164	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	318	-9	1
1318	337	321	29	64	chr3	96085597	96085662	-63514121	+	RMER5	LTR	ERV1	153	210	-324	1
1318	4212	91	26	0	chr3	96085662	96086231	-63513552	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	1
1318	598	293	328	28	chr3	96086231	96086469	-63513314	+	RMER5	LTR	ERV1	211	524	-10	1
1318	1184	157	9	64	chr3	96086615	96086833	-63512950	+	ORR1D1	LTR	MaLR	13	218	-156	1
1318	283	298	65	24	chr3	96087184	96087308	-63512475	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-617	4868	4740	1
1318	2543	125	51	2	chr3	96088843	96088938	-63510845	+	MTC	LTR	MaLR	1	97	-324	1
1318	2543	125	51	2	chr3	96089149	96089447	-63510336	+	MTC	LTR	MaLR	98	412	-9	1
1318	540	276	125	36	chr3	96091800	96091992	-63507791	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	288	496	-184	1
1318	2417	160	16	44	chr3	96093203	96093635	-63506148	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	1	420	0	1
1318	1513	69	0	19	chr3	96099215	96099423	-63500360	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	204	-381	1
1318	705	279	193	42	chr3	96099533	96099977	-63499806	+	MT2A	LTR	ERVL	2	600	-1	1
1318	273	248	88	88	chr3	96101259	96101396	-63498387	-	MT2B	LTR	ERVL	-262	339	203	1
1318	1678	167	149	3	chr3	96105474	96105588	-63494195	+	MTD	LTR	MaLR	5	124	-295	2
1318	1678	167	149	3	chr3	96105648	96105882	-63493901	+	MTD	LTR	MaLR	125	403	-16	2
1318	2082	122	58	0	chr3	96107567	96107878	-63491905	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
1318	1486	150	23	81	chr3	96108253	96108627	-63491156	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	305	-79	2
1318	479	271	7	85	chr3	96110983	96111124	-63488659	+	LTR87	LTR	ERVL?	14	143	-481	2
1318	2664	128	84	55	chr3	96111323	96111836	-63487947	+	RLTR24	LTR	ERV1	2	529	0	2
1318	2375	110	94	23	chr3	96112810	96112902	-63486881	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	313	2
1318	2375	110	94	23	chr3	96113024	96113323	-63486460	-	MTC	LTR	MaLR	-109	312	1	2
1318	364	287	104	107	chr3	96113364	96113711	-63486072	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	9	2
1318	2988	41	57	0	chr3	96114248	96114615	-63485168	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
1318	3079	119	67	6	chr3	96116733	96117225	-63482558	+	RLTR28	LTR	ERVL	3	524	0	2
1318	3747	46	5	0	chr3	96117385	96117819	-63481964	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	2
1318	7949	57	0	0	chr3	96117819	96118750	-63481033	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	6651	2
1318	41693	51	0	1	chr3	96118741	96123686	-63476097	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	870	2
1318	2668	103	53	3	chr3	96123684	96124064	-63475719	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7182	399	1	2
1318	3628	58	5	2	chr3	96124064	96124499	-63475284	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	2
1318	438	259	127	17	chr3	96127748	96127866	-63471917	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-343	213	83	2
1318	334	270	28	83	chr3	96128431	96128540	-63471243	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	155	2
1318	2393	121	60	3	chr3	96129893	96130258	-63469525	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	2
1318	264	303	0	82	chr3	96130542	96130639	-63469144	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	152	2
1318	269	352	79	45	chr3	96131654	96132032	-63467751	-	RMER5	LTR	ERV1	-65	469	79	2
1318	2345	89	114	6	chr3	96135072	96135424	-63464359	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	2
1318	258	304	123	71	chr3	96136768	96136938	-63462845	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	188	-177	2
1318	2162	104	70	18	chr3	96140477	96140818	-63458965	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	36	2
1318	361	171	0	41	chr3	96147363	96147436	-63452347	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	492	561	-2	2
1318	1917	155	142	29	chr3	96148490	96148876	-63450907	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	430	-99	2
1318	377	287	122	59	chr3	96149019	96149256	-63450527	-	MER67B	LTR	ERV1	0	661	410	2
1318	1049	284	81	52	chr3	96151575	96151921	-63447862	+	MTEb	LTR	MaLR	1	356	-23	3
1318	385	174	112	34	chr3	96157654	96157743	-63442040	-	RMER15	LTR	ERVL	-61	514	419	3
1318	2226	93	29	0	chr3	96158556	96158866	-63440917	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	3
1318	2195	112	19	3	chr3	96165283	96165605	-63434178	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1318	267	200	128	98	chr3	96165841	96165974	-63433809	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	315	451	-4540	3
1318	2641	201	53	30	chr3	96166189	96166605	-63433178	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3504	3938	-1053	3
1318	1627	136	14	81	chr3	96166605	96166950	-63432833	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
1318	2641	201	53	30	chr3	96166950	96167102	-63432681	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	3939	4085	-906	3
1318	3483	68	49	0	chr3	96167301	96167770	-63432013	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	73	3
1318	1657	68	9	5	chr3	96167770	96167991	-63431792	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	282	3
1318	1779	174	182	86	chr3	96167990	96168524	-63431259	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-69	585	1	3
1318	63585	31	13	0	chr3	96168524	96176221	-63423562	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	0	7778	1	3
1318	2142	163	108	70	chr3	96176221	96177106	-63422677	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-65	589	1	3
1318	507	70	70	0	chr3	96177115	96177186	-63422597	-	LTRIS2	LTR	ERV1	-488	76	1	3
1318	2230	93	29	0	chr3	96183127	96183437	-63416346	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1318	387	174	112	34	chr3	96184250	96184339	-63415444	+	RMER15	LTR	ERVL	419	514	-61	3
1318	1045	284	81	52	chr3	96190075	96190421	-63409362	-	MTEb	LTR	MaLR	-23	356	1	3
1318	357	276	159	51	chr3	96192782	96192977	-63406806	+	MER67B	LTR	ERV1	446	661	0	3
1318	1690	167	173	29	chr3	96193158	96193534	-63406249	-	RLTR24	LTR	ERV1	-99	430	1	3
1318	378	162	0	14	chr3	96194587	96194656	-63405127	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	563	496	3
1318	231	294	49	98	chr3	96197401	96197503	-63402280	+	MTEa	LTR	MaLR	1	97	-282	4
1318	412	200	91	4	chr3	96198011	96198110	-63401673	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-737	633	499	4
1318	1999	168	50	91	chr3	96198041	96198589	-63401194	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-462	566	1	4
1318	1433	111	0	24	chr3	96198699	96198911	-63400872	+	RLTR19B	LTR	ERVK	1	207	-508	4
1318	2039	117	32	98	chr3	96199099	96199468	-63400315	+	RLTR19B	LTR	ERVK	364	708	-7	4
1318	761	248	226	52	chr3	96200222	96200550	-63399233	-	RMER15	LTR	ERVL	-48	527	143	4
1318	574	107	94	43	chr3	96200838	96200955	-63398828	-	RMER15	LTR	ERVL	-431	144	22	4
1318	3204	86	59	2	chr3	96201337	96201814	-63397969	+	RMER2	LTR	ERV1	1	504	-63	4
1318	523	114	22	22	chr3	96202076	96202166	-63397617	+	RMER2	LTR	ERV1	478	567	0	4
1318	2474	165	88	36	chr3	96203528	96204031	-63395752	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	4
1318	5746	177	124	20	chr3	96204307	96205579	-63394204	+	RMER12B	LTR	ERVK	1	1404	0	4
1319	998	184	143	54	chr3	96207908	96208167	-63391616	+	RLTR24	LTR	ERV1	248	529	0	4
1319	1600	186	29	22	chr3	96211000	96211313	-63388470	-	MTC	LTR	MaLR	-60	361	47	4
1319	3826	37	5	0	chr3	96211811	96212245	-63387538	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
1319	366	181	42	0	chr3	96213370	96213442	-63386341	-	MTC	LTR	MaLR	-321	100	26	4
1319	254	212	0	149	chr3	96214241	96214253	-63385530	+	MT2B2	LTR	ERVL	185	264	-320	4
1319	1316	190	99	139	chr3	96215989	96216673	-63383110	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1670	2326	0	4
1319	769	130	45	80	chr3	96216673	96216849	-63382934	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	170	-383	4
1319	3237	128	177	9	chr3	96220444	96220880	-63378903	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	219	4
1319	3237	128	177	9	chr3	96221019	96221157	-63378626	-	RLTR33	LTR	ERVK	-460	218	9	4
1319	2508	94	190	0	chr3	96221889	96222325	-63377458	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-13	519	1	4
1319	4053	47	53	0	chr3	96222410	96222903	-63376880	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	4
1319	2510	123	28	7	chr3	96222917	96223343	-63376440	+	BGLII_B	LTR	ERVK	7	441	0	4
1319	533	237	358	51	chr3	96235005	96235241	-63364542	+	MT2A	LTR	ERVL	3	342	-259	5
1319	485	199	139	75	chr3	96235269	96235400	-63364383	+	MT2A	LTR	ERVL	287	431	-44	5
1319	289	238	16	0	chr3	96236277	96236340	-63363443	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	74	-285	5
1319	1554	145	10	27	chr3	96236346	96236644	-63363139	-	RLTR28	LTR	ERVL	-26	498	206	5
1319	1962	223	64	35	chr3	96236766	96237222	-63362561	-	RMER19C	LTR	ERVK	-5	606	138	5
1319	349	232	63	132	chr3	96237519	96237678	-63362105	-	RLTR23	LTR	ERV1	-18	412	265	5
1319	2376	176	38	5	chr3	96241032	96241459	-63358324	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	1	5
1319	1408	137	64	14	chr3	96241459	96241741	-63358042	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1	2325	2030	5
1319	4570	189	142	101	chr3	96241733	96243360	-63356423	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-535	1791	99	5
1319	908	346	2	12	chr3	96243355	96243779	-63356004	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8088	871	452	5
1319	854	228	78	19	chr3	96245135	96245365	-63354418	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	167	5
1319	574	260	84	51	chr3	96248131	96248346	-63351437	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	149	5
1319	481	303	103	0	chr3	96248394	96248539	-63351244	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-169	190	31	5
1319	2700	155	62	8	chr3	96249240	96249758	-63350025	+	RMER19C	LTR	ERVK	6	611	0	5
1319	349	284	27	60	chr3	96253669	96253819	-63345964	-	RMER5	LTR	ERV1	-65	469	325	5
1319	2309	192	160	18	chr3	96257300	96257862	-63341921	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	5
1319	364	192	171	9	chr3	96258026	96258131	-63341652	-	RMER12B	LTR	ERVK	-31	1373	1252	5
1319	364	192	171	9	chr3	96260350	96260455	-63339328	+	RMER12B	LTR	ERVK	1252	1373	-31	5
1319	2309	192	160	18	chr3	96260619	96261181	-63338602	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	5
1319	349	284	27	60	chr3	96264661	96264811	-63334972	+	RMER5	LTR	ERV1	325	469	-65	5
1319	1033	275	58	71	chr3	96269392	96269842	-63329941	+	MT2A	LTR	ERVL	1	444	-89	5
1319	2919	186	47	32	chr3	96269835	96270428	-63329355	-	RLTR18	LTR	ERVK	-10	606	5	5
1319	263	179	86	37	chr3	96270854	96270935	-63328848	-	RMER5	LTR	ERV1	-132	402	318	5
1319	2383	98	38	158	chr3	96271091	96271461	-63328322	-	RLTR44D	LTR	ERVK	-17	469	175	5
1319	2383	98	38	158	chr3	96271496	96271658	-63328125	-	RLTR44D	LTR	ERVK	-312	174	3	5
1319	1873	154	111	69	chr3	96271870	96271899	-63327884	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	384	5
1319	2161	111	151	6	chr3	96271899	96272243	-63327540	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
1319	1873	154	111	69	chr3	96272243	96272494	-63327289	-	MTC	LTR	MaLR	-38	383	121	5
1319	1873	154	111	69	chr3	96272714	96272831	-63326952	-	MTC	LTR	MaLR	-301	120	1	5
1319	3298	112	120	25	chr3	96274952	96275185	-63324598	+	MT2B	LTR	ERVL	1	279	-322	5
1319	5092	109	14	60	chr3	96275185	96276026	-63323757	+	RLTR13B4	LTR	ERVK	1	803	0	5
1319	3298	112	120	25	chr3	96276026	96276341	-63323442	+	MT2B	LTR	ERVL	280	601	0	5
1319	1599	121	292	3	chr3	96276464	96276762	-63323021	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	5
1319	248	317	147	33	chr3	96277340	96277390	-63322393	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-621	482	416	5
1319	1205	267	44	19	chr3	96280047	96280368	-63319415	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	43	6
1319	809	167	80	40	chr3	96280362	96280537	-63319246	+	RMER5	LTR	ERV1	249	430	-104	6
1319	2900	9	0	9	chr3	96280740	96281065	-63318718	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	6
1319	269	246	0	80	chr3	96281921	96281996	-63317787	-	MT2B	LTR	ERVL	-367	234	166	6
1319	2292	171	33	40	chr3	96283727	96284178	-63315605	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-1	604	157	6
1319	960	203	145	69	chr3	96284841	96285239	-63314544	+	RMER15	LTR	ERVL	22	538	-37	6
1319	308	324	9	36	chr3	96285964	96286076	-63313707	+	RMER10B	LTR	ERVL	283	391	-7	6
1319	301	164	0	35	chr3	96286843	96286900	-63312883	-	RLTR26	LTR	ERVK	-578	64	10	6
1319	819	238	23	69	chr3	96291704	96291799	-63307984	-	RMER19B	LTR	ERVK	-54	848	754	6
1319	819	252	10	52	chr3	96291822	96292053	-63307730	-	RMER19B	LTR	ERVK	-149	753	642	6
1319	330	209	135	87	chr3	96292101	96292227	-63307556	-	RMER5	LTR	ERV1	-345	189	58	6
1319	2795	15	95	6	chr3	96293170	96293507	-63306276	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	6
1319	29036	29	1	1	chr3	96293507	96296778	-63303005	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3210	6
1319	7788	93	95	11	chr3	96296777	96297978	-63301805	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5168	1313	67	6
1319	1044	125	74	0	chr3	96297949	96298125	-63301658	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6285	196	8	6
1319	2795	15	95	6	chr3	96298125	96298462	-63301321	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	6
1319	2724	58	12	3	chr3	96299288	96299631	-63300152	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
1319	246	336	79	21	chr3	96306887	96307027	-63292756	+	RMER15	LTR	ERVL	424	571	-4	6
1319	2379	125	5	35	chr3	96310263	96310635	-63289148	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-2	365	5	6
1319	3668	46	5	0	chr3	96312129	96312563	-63287220	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	6
1319	46218	13	1	1	chr3	96312563	96317662	-63282121	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	1885	6
1319	309	175	0	0	chr3	96317667	96317724	-63282059	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4261	1145	1089	6
1319	670	242	153	72	chr3	96317711	96318097	-63281686	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4819	2425	2079	6
1319	910	152	4	177	chr3	96318187	96318458	-63281325	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6629	952	729	6
1319	2868	55	0	0	chr3	96318456	96318799	-63280984	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7238	343	1	6
1319	3668	46	5	0	chr3	96318799	96319233	-63280550	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	6
1319	252	311	0	131	chr3	96321982	96322119	-63277664	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-464	639	521	6
1319	432	238	0	87	chr3	96322061	96322176	-63277607	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	153	6
1319	1510	205	60	52	chr3	96322181	96322562	-63277221	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	6
1319	2749	203	91	99	chr3	96324102	96325024	-63274759	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	915	-43	7
1319	3199	48	5	12	chr3	96327331	96327734	-63272049	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1319	1092	250	157	53	chr3	96333636	96334112	-63265671	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-12	556	1	7
1319	311	270	28	57	chr3	96335756	96335862	-63263921	-	RMER15	LTR	ERVL	-70	505	403	7
1319	1476	160	113	21	chr3	96337778	96337795	-63261988	+	MTD	LTR	MaLR	1	21	-398	7
164	1476	160	113	21	chr3	96337821	96338129	-63261654	+	MTD	LTR	MaLR	22	356	-63	7
1320	2006	161	143	0	chr3	96338477	96338862	-63260921	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-1	440	1	7
1320	4656	131	41	72	chr3	96338862	96339029	-63260754	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-2	2324	2152	7
1320	4656	131	41	72	chr3	96339222	96339448	-63260335	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-175	2151	1937	7
1320	4656	131	41	72	chr3	96339598	96340125	-63259658	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-390	1936	1431	7
1320	3796	222	121	55	chr3	96340318	96341603	-63258180	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-882	1444	74	7
1320	3063	196	41	2	chr3	96342093	96342702	-63257081	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4368	4591	3959	7
1320	5672	264	66	38	chr3	96342698	96344549	-63255234	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6397	2562	661	7
1320	1665	144	245	6	chr3	96345968	96346011	-63253772	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-1	440	397	7
1320	1665	144	245	6	chr3	96346036	96346347	-63253436	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-45	396	1	7
1320	366	332	108	80	chr3	96347495	96347763	-63252020	-	RMER15	LTR	ERVL	-60	515	113	7
1320	366	332	108	80	chr3	96347923	96347996	-63251787	-	RMER15	LTR	ERVL	-60	112	1	7
1320	313	200	0	16	chr3	96348134	96348195	-63251588	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-13	395	336	7
1320	251	246	46	0	chr3	96350574	96350639	-63249144	-	MT2B	LTR	ERVL	-376	225	158	7
1320	1865	169	124	0	chr3	96350882	96351254	-63248529	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	7
1320	248	206	29	115	chr3	96351757	96351861	-63247922	-	MT2B	LTR	ERVL	-350	251	157	7
1320	228	215	67	106	chr3	96369109	96369213	-63230570	+	MT2B	LTR	ERVL	154	253	-348	8
1320	2092	156	88	5	chr3	96370551	96370925	-63228858	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	8
1320	419	176	30	129	chr3	96372456	96372685	-63227098	-	RMER17B	LTR	ERVK	-392	514	68	8
1320	1386	167	114	23	chr3	96391170	96391513	-63208270	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	9
1320	2375	182	66	122	chr3	96392627	96393578	-63206205	+	RMER6C	LTR	ERVK	57	755	-1	9
1320	1747	179	71	39	chr3	96393975	96394381	-63205402	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	9
1320	327	295	22	122	chr3	96408710	96408849	-63190934	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	341	9
1320	370	264	157	0	chr3	96409059	96409199	-63190584	-	MLT1D	LTR	MaLR	-67	438	277	9
1320	237	308	87	11	chr3	96409448	96409540	-63190243	-	MLT1D	LTR	MaLR	-400	105	7	9
1320	408	293	97	8	chr3	96412650	96412784	-63186999	-	LTR40c	LTR	ERVL	-159	306	161	9
1320	409	237	141	26	chr3	96412939	96413095	-63186688	-	LTR40c	LTR	ERVL	-289	176	3	9
1320	594	135	180	0	chr3	96413999	96414096	-63185687	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	295	9
1320	606	244	121	59	chr3	96414096	96414158	-63185625	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	540	9
1320	606	244	121	59	chr3	96414238	96414413	-63185370	-	MT2B	LTR	ERVL	-62	539	349	9
1320	369	154	76	13	chr3	96414599	96414678	-63185105	-	MT2A	LTR	ERVL	-449	84	1	9
1320	1186	224	92	14	chr3	96414678	96414957	-63184826	-	MTD	LTR	MaLR	-118	301	1	9
1320	280	194	149	96	chr3	96420452	96420556	-63179227	-	MT2B	LTR	ERVL	-292	292	156	9
1320	335	222	27	100	chr3	96421336	96421446	-63178337	+	MT2B2	LTR	ERVL	156	257	-327	1
1320	1606	216	209	11	chr3	96425596	96426040	-63173743	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	2	1
1320	7330	131	14	46	chr3	96430225	96431013	-63168770	+	MERVL-int	LTR	ERVL	247	1012	-4473	1
1320	7330	131	14	46	chr3	96431204	96431251	-63168532	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1013	1042	-4443	1
1320	7330	131	14	46	chr3	96431442	96431830	-63167953	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1043	1432	-4053	1
1320	1315	109	81	0	chr3	96431830	96432041	-63167742	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1735	228	1	1
1320	484	88	0	0	chr3	96432041	96432109	-63167674	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	260	1
1320	450	263	59	72	chr3	96432715	96432920	-63166863	+	MT2B	LTR	ERVL	1	203	-330	1
1320	1103	216	109	38	chr3	96433028	96433321	-63166462	+	MT2B	LTR	ERVL	248	561	-40	1
1320	309	292	9	62	chr3	96436354	96436467	-63163316	+	MT2B	LTR	ERVL	158	264	-337	1
1320	499	229	38	83	chr3	96437745	96437878	-63161905	+	MT2B	LTR	ERVL	150	276	-325	1
1320	1238	154	59	13	chr3	96443053	96443289	-63156494	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	148	1
1320	272	312	15	67	chr3	96459912	96460046	-63139737	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	138	1
1320	2091	120	6	28	chr3	96462651	96462977	-63136806	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	1
1320	796	194	153	51	chr3	96465291	96465580	-63134203	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-253	315	11	1
1320	1849	214	86	114	chr3	96468500	96468833	-63130950	+	RMER6C	LTR	ERVK	10	370	-320	1
1321	1849	214	86	114	chr3	96469013	96469192	-63130591	+	RMER6C	LTR	ERVK	371	534	-156	1
1321	1849	214	86	114	chr3	96469339	96469525	-63130258	+	RMER6C	LTR	ERVK	535	689	-1	1
1321	295	252	87	175	chr3	96472877	96473060	-63126723	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	112	1
1321	306	261	41	116	chr3	96497711	96497747	-63102036	-	MT2B	LTR	ERVL	-448	153	129	1
1321	1582	110	219	114	chr3	96502223	96502512	-63097271	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	335	-63	3
1321	1582	110	219	114	chr3	96502659	96502729	-63097054	+	RMER10B	LTR	ERVL	336	398	0	3
1321	430	117	142	113	chr3	96507098	96507204	-63092579	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	156	1
1321	462	191	73	22	chr3	96514154	96514269	-63085514	+	ORR1D2	LTR	MaLR	9	134	-236	2
1321	2445	94	122	2	chr3	96514300	96514700	-63085083	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	2
1321	341	205	103	0	chr3	96514700	96514775	-63085008	+	ORR1D2	LTR	MaLR	280	362	-8	2
1321	2211	154	78	97	chr3	96528793	96529219	-63070564	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	48	7
1321	2211	154	78	97	chr3	96529365	96529413	-63070370	-	RMER4A	LTR	ERVK	-419	47	1	7
1321	4526	87	7	12	chr3	96545188	96545792	-63053991	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	1
1321	1518	207	31	55	chr3	96551080	96551463	-63048320	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1321	1847	134	68	106	chr3	96554439	96554489	-63045294	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	354	1
1321	1847	134	68	106	chr3	96554680	96554997	-63044786	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-41	353	41	1
1321	1097	200	108	0	chr3	96556498	96556758	-63043025	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	288	-86	1
1321	2081	138	13	0	chr3	96556905	96557209	-63042574	-	MTC	LTR	MaLR	-113	308	1	1
1321	1902	120	6	27	chr3	96567032	96567366	-63032417	+	RLTR11B	LTR	ERVK	127	453	0	1
1321	958	242	248	0	chr3	96569403	96569705	-63030078	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	1	1
1321	1871	184	30	3	chr3	96569798	96570131	-63029652	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	342	-32	1
1321	6187	186	80	35	chr3	96570142	96571447	-63028336	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	5	1367	-3	1
1321	1606	151	195	19	chr3	96571450	96571768	-63028015	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1321	289	222	114	114	chr3	96574930	96574963	-63024820	-	MT2B2	LTR	ERVL	-429	155	123	2
1321	483	273	45	40	chr3	96578459	96578661	-63021122	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	168	2
1321	889	227	141	31	chr3	96580538	96580793	-63018990	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-51	323	41	2
1321	3068	22	11	0	chr3	96582367	96582732	-63017051	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	28	2
1321	456	51	0	0	chr3	96583105	96583164	-63016619	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	59	-416	2
1321	5598	97	28	15	chr3	96583176	96583961	-63015822	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1688	2482	-3003	2
1321	409	196	51	10	chr3	96584188	96584286	-63015497	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5564	5665	-96	2
1321	353	204	50	87	chr3	96584286	96584355	-63015428	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	551	613	-1350	2
1321	1602	67	0	0	chr3	96584355	96584564	-63015219	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	209	-266	2
1321	849	320	75	34	chr3	96586539	96586942	-63012841	-	MLT1F	LTR	MaLR	-65	483	65	2
1321	669	282	174	26	chr3	96596273	96596689	-63003094	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-16	551	6	2
1321	398	294	162	38	chr3	96596993	96597333	-63002450	-	MTD	LTR	MaLR	-4	375	18	2
1321	1698	217	46	0	chr3	96597610	96597960	-63001823	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	9	2
1321	1850	156	41	74	chr3	96599263	96599629	-63000154	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	2
1322	795	211	217	21	chr3	96601470	96601802	-62997981	+	MT2B	LTR	ERVL	1	540	-61	2
1322	235	162	0	0	chr3	96601897	96601934	-62997849	+	MT2B	LTR	ERVL	497	533	0	2
1322	1023	222	179	12	chr3	96610008	96610327	-62989456	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	2
1322	246	160	0	57	chr3	96610629	96610682	-62989101	-	RMER4B	LTR	ERVK	-143	442	393	2
1322	2146	139	68	16	chr3	96610688	96611053	-62988730	-	RMER4B	LTR	ERVK	-170	415	32	2
1322	310	58	154	0	chr3	96611203	96611255	-62988528	-	RMER4B	LTR	ERVK	-525	60	1	2
1322	447	36	0	0	chr3	96611401	96611456	-62988327	+	ORR1A3	LTR	MaLR	272	326	0	2
1322	637	247	186	21	chr3	96612221	96612457	-62987326	+	RMER21B	LTR	ERV1	293	567	-275	2
1322	418	281	215	63	chr3	96615210	96615480	-62984303	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	44	2
1322	457	223	45	30	chr3	96618811	96618945	-62980838	-	RMER5	LTR	ERV1	-281	253	118	2
1322	253	259	51	85	chr3	96620668	96620698	-62979085	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	238	128	3
1322	2964	75	42	0	chr3	96622644	96623028	-62976755	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1322	4018	161	132	58	chr3	96625177	96626015	-62973768	-	RMER19B	LTR	ERVK	-2	900	1	3
1322	1910	158	112	8	chr3	96626963	96627320	-62972463	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1322	771	307	65	55	chr3	96640952	96641316	-62958467	-	MLT1B	LTR	MaLR	-10	380	4	3
1322	1410	232	143	28	chr3	96661871	96662305	-62937478	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	51	3
1322	772	208	261	58	chr3	96682204	96682598	-62917185	-	RLTR40	LTR	ERVK	-89	728	255	4
1322	399	260	167	37	chr3	96693307	96693523	-62906260	+	RMER15	LTR	ERVL	280	523	-52	4
1322	3072	85	2	2	chr3	96695300	96695700	-62904083	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1322	2231	161	60	15	chr3	96710197	96710373	-62889410	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	241	4
1322	2231	161	60	15	chr3	96710415	96710641	-62889142	-	MTC	LTR	MaLR	-181	240	2	4
1322	703	316	69	23	chr3	96714082	96714423	-62885360	+	MLT1F	LTR	MaLR	58	411	-137	4
1322	735	215	151	43	chr3	96714666	96715005	-62884778	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	6	322	0	4
1322	243	228	102	65	chr3	96717063	96717171	-62882612	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-259	115	2	4
1322	2402	149	44	19	chr3	96720752	96721162	-62878621	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	4
1323	1597	193	77	6	chr3	96744760	96745109	-62854674	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1323	2566	130	60	44	chr3	96745464	96745716	-62854067	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	182	5
1323	2566	130	60	44	chr3	96745909	96746090	-62853693	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-260	181	1	5
1323	299	267	13	0	chr3	96746838	96746913	-62852870	-	RMER15	LTR	ERVL	-108	467	392	5
1323	330	322	134	25	chr3	96750666	96750905	-62848878	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-22	533	269	5
1323	688	233	81	129	chr3	96751009	96751280	-62848503	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-238	277	20	5
1323	616	209	149	19	chr3	96754590	96754751	-62845032	+	MT2A	LTR	ERVL	3	184	-349	5
1323	839	180	78	51	chr3	96754739	96754956	-62844827	+	MT2A	LTR	ERVL	311	533	0	5
1323	226	289	92	46	chr3	96758445	96758532	-62841251	+	MER21B	LTR	ERV1	11	101	-762	5
1323	581	346	63	30	chr3	96758714	96759048	-62840735	-	MT2A	LTR	ERVL	-144	389	45	5
1323	330	307	97	0	chr3	96758955	96759069	-62840714	-	MTE2a	LTR	MaLR	-242	137	13	5
1323	541	303	165	35	chr3	96759223	96759538	-62840245	+	MER21B	LTR	ERV1	290	645	-218	5
1323	595	316	88	13	chr3	96763940	96764168	-62835615	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	316	5
1323	591	277	51	6	chr3	96769394	96769572	-62830211	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	937	1122	-367	5
1323	1425	260	70	6	chr3	96769572	96769928	-62829855	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	5
1323	474	281	167	26	chr3	96769933	96770160	-62829623	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	1124	1382	-107	5
1323	712	360	61	35	chr3	96770379	96770886	-62828897	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	12	5
1323	321	296	60	17	chr3	96770917	96771034	-62828749	-	MLT1A	LTR	MaLR	-6	368	247	5
1323	230	247	10	133	chr3	96771103	96771201	-62828582	-	MLT1A	LTR	MaLR	-230	160	75	5
1323	2526	128	36	24	chr3	96771928	96772344	-62827439	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1323	247	234	0	99	chr3	96772701	96772772	-62827011	+	MLT1E	LTR	MaLR	4	67	-613	6
1323	722	318	58	19	chr3	96772815	96773123	-62826660	+	MLT1E	LTR	MaLR	287	606	-47	6
1323	269	290	73	18	chr3	96776013	96776122	-62823661	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	446	6
1323	1545	185	184	6	chr3	96784560	96784914	-62814869	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	6
1323	408	315	161	5	chr3	96785085	96785302	-62814481	+	MLT1A0	LTR	MaLR	112	362	-3	6
1323	336	255	238	0	chr3	96787413	96787573	-62812210	-	MTD	LTR	MaLR	-1	420	223	6
1323	878	216	62	26	chr3	96792415	96792599	-62807184	-	MTD	LTR	MaLR	-208	211	21	6
1323	444	300	66	40	chr3	96795277	96795342	-62804441	-	MER34A1	LTR	ERV1	0	587	523	6
1323	3146	45	204	2	chr3	96795342	96795768	-62804015	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	6
1323	444	300	66	40	chr3	96795768	96795900	-62803883	-	MER34A1	LTR	ERV1	-65	522	386	6
1323	1415	212	43	102	chr3	96795910	96796118	-62803665	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	197	-182	6
1323	1415	212	43	102	chr3	96796158	96796343	-62803440	+	MTE2a	LTR	MaLR	198	371	-8	6
1323	2204	164	39	24	chr3	96797527	96797940	-62801843	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1323	291	371	149	24	chr3	96798431	96798696	-62801087	+	LTR85a	LTR	Gypsy?	209	502	-282	6
1323	491	288	153	17	chr3	96798752	96798996	-62800787	+	LTR85a	LTR	Gypsy?	480	782	-2	6
1323	232	320	9	91	chr3	96799207	96799317	-62800466	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	141	6
1323	253	222	0	0	chr3	96801193	96801247	-62798536	+	MLT1I	LTR	MaLR	330	383	-28	6
1323	621	244	16	0	chr3	96801645	96801772	-62798011	-	MTEa	LTR	MaLR	-250	129	1	6
1323	2097	197	42	22	chr3	96805954	96806359	-62793424	+	MTD	LTR	MaLR	7	419	0	6
1323	353	273	30	21	chr3	96810030	96810151	-62789632	+	MLT1A1	LTR	MaLR	225	396	-12	6
1323	309	276	42	118	chr3	96812511	96812530	-62787253	+	MT2B	LTR	ERVL	150	157	-444	6
1323	1028	212	204	52	chr3	96816207	96816516	-62783267	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-13	357	2	6
1323	474	278	12	56	chr3	96817860	96818020	-62781763	-	LTR79	LTR	ERVL	-15	512	360	6
1323	3085	132	97	24	chr3	96819588	96820126	-62779657	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	577	-8	6
1323	265	291	54	75	chr3	96820439	96820532	-62779251	-	MT2B2	LTR	ERVL	-343	241	151	6
1323	437	252	0	34	chr3	96821221	96821340	-62778443	-	MTD	LTR	MaLR	-306	113	3	6
1323	2238	45	185	0	chr3	96821927	96822219	-62777564	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
1323	1495	218	99	16	chr3	96830819	96831202	-62768581	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	1	7
1323	584	312	39	93	chr3	96844483	96844600	-62755183	-	MTEb	LTR	MaLR	-21	358	238	7
1323	1316	221	157	14	chr3	96844600	96844963	-62754820	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	1	7
1323	584	312	39	93	chr3	96844963	96845124	-62754659	-	MTEb	LTR	MaLR	-142	237	95	7
1323	423	250	8	122	chr3	96845617	96845738	-62754045	-	MTEb	LTR	MaLR	-272	107	1	7
1323	291	216	33	87	chr3	96846752	96846848	-62752935	-	ORR1E	LTR	MaLR	-282	92	9	7
1323	2437	226	31	24	chr3	96846857	96847402	-62752381	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	27	7
1323	248	206	29	73	chr3	96847417	96847485	-62752298	-	RMER15	LTR	ERVL	-510	65	1	7
1323	1648	176	120	45	chr3	96851131	96851325	-62748458	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	173	7
1323	1648	176	120	45	chr3	96851407	96851569	-62748214	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-212	172	2	7
1323	261	265	83	117	chr3	96853922	96854016	-62745767	-	RLTR40	LTR	ERVK	-148	669	504	7
1323	261	265	83	117	chr3	96854138	96854187	-62745596	-	RLTR40	LTR	ERVK	-148	503	414	7
1324	1344	230	57	7	chr3	96869287	96869562	-62730221	+	MT2A	LTR	ERVL	5	294	-239	7
1324	1120	171	105	53	chr3	96869562	96869809	-62729974	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	610	351	7
1324	1227	180	156	33	chr3	96870105	96870380	-62729403	-	RMER19B	LTR	ERVK	-291	611	303	7
1324	1002	206	77	20	chr3	96870377	96870561	-62729222	+	MT2A	LTR	ERVL	272	458	-75	7
1324	1002	206	77	20	chr3	96870608	96870671	-62729112	+	MT2A	LTR	ERVL	459	532	-1	7
1324	284	347	102	0	chr3	96871518	96871665	-62728118	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-4151	1516	1355	7
1324	353	327	76	9	chr3	96871714	96871924	-62727859	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3600	3823	-1844	7
1324	325	337	69	35	chr3	96872142	96872459	-62727324	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4154	4481	-1004	7
1324	251	333	12	23	chr3	96872499	96872585	-62727198	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-811	576	492	7
1324	621	267	209	16	chr3	96875383	96875699	-62724084	+	MTEa	LTR	MaLR	3	379	0	7
1324	2444	145	2	31	chr3	96876716	96877135	-62722648	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	7
1324	2170	122	6	0	chr3	96878786	96879105	-62720678	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	7
1324	3125	131	22	39	chr3	96882562	96883095	-62716688	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	524	0	8
1324	1656	234	63	5	chr3	96885292	96885675	-62714108	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	8
1324	1100	171	37	130	chr3	96888467	96888822	-62710961	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	8
1324	7533	110	18	87	chr3	96888824	96889877	-62709906	+	MMETn-int	LTR	ERVK	3	992	-3852	8
1324	7533	110	18	87	chr3	96890071	96890386	-62709397	+	MMETn-int	LTR	ERVK	993	1276	-3568	8
1324	3766	61	90	0	chr3	96890386	96890862	-62708921	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	8
1324	11685	289	43	54	chr3	96890862	96896357	-62703426	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	3	5652	-2126	8
1324	306	71	0	0	chr3	96896586	96896628	-62703155	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7737	7778	0	8
1324	3985	53	57	0	chr3	96896628	96897119	-62702664	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	8
1324	350	161	0	0	chr3	96897120	96897176	-62702607	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2189	2244	-5162	8
1324	7779	174	75	93	chr3	96897169	96900297	-62699486	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1737	4453	-391	8
1324	327	254	324	38	chr3	96900309	96900624	-62699159	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	127	531	-371	8
1324	476	113	23	70	chr3	96900624	96900710	-62699073	+	MMETn-int	LTR	ERVK	7324	7405	-1	8
1324	1014	189	44	105	chr3	96900710	96901003	-62698780	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	278	-44	8
1324	3527	25	2	0	chr3	96901003	96901398	-62698385	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1324	1014	189	44	105	chr3	96901398	96901447	-62698336	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	279	322	0	8
1324	1245	161	131	26	chr3	96902519	96902832	-62696951	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	8
1324	614	306	143	15	chr3	96905226	96905568	-62694215	+	MLT1F	LTR	MaLR	163	548	0	8
1324	596	271	115	11	chr3	96906722	96906983	-62692800	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	272	8
1324	2435	99	70	35	chr3	96907626	96908023	-62691760	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	8
1324	1530	166	89	21	chr3	96910274	96910595	-62689188	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	344	-30	8
1324	746	149	279	10	chr3	96910595	96910799	-62688984	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	1590	8
1324	4880	147	34	27	chr3	96910975	96911945	-62687838	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-871	977	1	8
1324	1528	128	116	4	chr3	96912176	96912451	-62687332	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	89	8
1324	664	158	17	2	chr3	96914376	96914517	-62685266	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-274	120	1	8
1324	960	310	46	3	chr3	96916489	96916813	-62682970	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	338	-41	8
1324	3255	58	2	0	chr3	96919780	96920179	-62679604	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	8
1324	1882	139	16	64	chr3	96923790	96924167	-62675616	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	8
1324	1604	227	19	14	chr3	96926989	96927355	-62672428	+	MTD	LTR	MaLR	52	419	0	8
1324	328	266	28	0	chr3	96928549	96928658	-62671125	+	LTR78	LTR	ERV1	1008	1119	-185	8
1324	1855	145	96	34	chr3	96933460	96933845	-62665938	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	8
1324	1281	169	127	65	chr3	96937526	96937739	-62662044	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	244	-165	8
1324	2663	107	123	27	chr3	96937739	96938179	-62661604	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	8
1324	1281	169	127	65	chr3	96938179	96938350	-62661433	+	RLTR9E	LTR	ERVK	245	408	-1	8
1324	7004	232	90	131	chr3	96938351	96943009	-62656774	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4468	-376	8
1324	657	165	248	5	chr3	96943009	96943304	-62656479	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	157	537	-365	8
1324	512	53	25	62	chr3	96943304	96943384	-62656399	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7329	7405	-1	8
1324	1369	156	148	64	chr3	96943384	96943761	-62656022	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	8
1324	2204	131	76	8	chr3	96944926	96945295	-62654488	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	8
1324	267	252	118	118	chr3	96945990	96946020	-62653763	+	MLT1K	LTR	MaLR	13	39	-369	8
1324	267	252	118	118	chr3	96946234	96946347	-62653436	+	MLT1K	LTR	MaLR	40	156	-252	8
1324	250	284	126	0	chr3	96946408	96946503	-62653280	+	MLT1K	LTR	MaLR	291	397	-11	8
1324	583	325	61	96	chr3	96946614	96946781	-62653002	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	164	-201	8
1324	583	325	61	96	chr3	96946808	96946967	-62652816	+	MLT1A0	LTR	MaLR	165	323	-42	8
1324	583	290	67	137	chr3	96947154	96947218	-62652565	+	MLT1A0	LTR	MaLR	319	370	-4	8
1324	1865	229	19	53	chr3	96954078	96954549	-62645234	-	RMER19C	LTR	ERVK	-19	592	138	9
1324	297	342	71	52	chr3	96955600	96955810	-62643973	+	MLT1K	LTR	MaLR	379	592	-3	8
1324	571	260	19	32	chr3	96956162	96956317	-62643466	+	MLT1A1	LTR	MaLR	247	399	-9	9
1324	418	314	70	87	chr3	96956950	96957236	-62642547	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	79	9
1324	1009	219	92	31	chr3	96957555	96957880	-62641903	-	RLTR15	LTR	ERVK	-14	345	1	9
1324	297	289	72	72	chr3	96958742	96958895	-62640888	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	88	9
1324	270	300	0	26	chr3	96960127	96960281	-62639502	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-755	754	605	9
1324	368	279	44	122	chr3	96960311	96960515	-62639268	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	77	9
1324	341	235	15	125	chr3	96961412	96961548	-62638235	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	144	9
1324	367	270	95	98	chr3	96971093	96971358	-62628425	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	98	9
1324	359	314	136	40	chr3	96973664	96973863	-62625920	-	RMER12	LTR	ERVK	-334	988	771	9
1324	3592	162	30	44	chr3	96973953	96974731	-62625052	-	RMER13B	LTR	ERVK	-4	904	1	9
1324	1441	232	104	23	chr3	96981570	96981954	-62617829	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	9
1324	1021	192	228	44	chr3	96982940	96983256	-62616527	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	9
1324	749	312	120	6	chr3	96986114	96986430	-62613353	+	MLT1A1	LTR	MaLR	39	390	-18	9
1324	701	278	101	12	chr3	96986859	96987117	-62612666	+	MLT1B	LTR	MaLR	96	376	-14	9
1325	1559	205	64	78	chr3	96996340	96996763	-62603020	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	9
1325	587	149	39	10	chr3	96998376	96998478	-62601305	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	303	9
1325	4473	98	55	15	chr3	96998478	96999129	-62600654	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	2	9
1325	1643	117	62	31	chr3	96999285	96999575	-62600208	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-100	307	9	9
1325	1923	119	34	97	chr3	97000200	97000582	-62599201	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-9	358	1	1
1325	2583	134	42	2	chr3	97033273	97033676	-62566107	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	3
1325	225	186	0	92	chr3	97042117	97042146	-62557637	-	LTR33A	LTR	ERVL	-321	199	173	5
1325	225	186	0	92	chr3	97042313	97042348	-62557435	-	LTR33A	LTR	ERVL	-348	172	141	5
1325	4474	8	2	12	chr3	97049073	97049571	-62550212	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	6
1325	41455	16	14	0	chr3	97049571	97054858	-62544925	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	6
1325	364	191	46	35	chr3	97054858	97054945	-62544838	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	6
1325	319	0	0	0	chr3	97054945	97054983	-62544800	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	6
1325	4474	8	2	12	chr3	97054983	97055481	-62544302	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	6
1325	1598	242	118	19	chr3	97061171	97061639	-62538144	+	MT2A	LTR	ERVL	20	533	0	7
1325	4261	124	77	87	chr3	97062694	97063593	-62536190	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	7
1325	3133	52	34	0	chr3	97067574	97067961	-62531822	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	9
1325	583	317	70	14	chr3	97076923	97077155	-62522628	+	MTEa	LTR	MaLR	3	240	-139	1
1325	424	240	129	32	chr3	97077250	97077405	-62522378	+	MTEa	LTR	MaLR	207	376	-3	1
1325	1609	173	125	6	chr3	97089666	97090027	-62509756	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	2	1
1325	269	182	74	49	chr3	97107941	97108022	-62491761	+	RLTR25B	LTR	ERVK	427	509	-519	1
1325	1889	136	16	3	chr3	97110138	97110451	-62489332	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	105	1
1325	409	190	0	12	chr3	97110651	97110736	-62489047	-	MTC	LTR	MaLR	-290	106	23	1
1325	1150	222	47	73	chr3	97114719	97115038	-62484745	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	107	1
1325	1150	222	47	73	chr3	97115174	97115194	-62484589	-	MTD	LTR	MaLR	-313	106	86	1
1325	293	375	75	39	chr3	97120619	97120874	-62478909	+	LTR16A1	LTR	ERVL	83	346	-110	2
1325	615	218	53	20	chr3	97123971	97124121	-62475662	-	LTR37A	LTR	ERV1	-271	155	1	2
1326	236	287	28	73	chr3	97127476	97127488	-62472295	+	MT2B	LTR	ERVL	155	161	-440	2
1326	341	268	14	81	chr3	97132771	97132982	-62466801	+	RMER17C	LTR	ERVK	70	266	-144	2
1326	1541	152	139	22	chr3	97134743	97134956	-62464827	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	231	-143	2
1326	1541	152	139	22	chr3	97134988	97135090	-62464693	+	ORR1D1	LTR	MaLR	232	354	-20	2
1326	1741	240	86	5	chr3	97146235	97146653	-62453130	+	MT2A	LTR	ERVL	5	456	-77	2
1326	328	363	57	47	chr3	97146748	97146959	-62452824	-	ORR1E	LTR	MaLR	-127	232	20	2
1326	655	213	47	109	chr3	97147068	97147279	-62452504	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	173	2
1326	551	237	150	42	chr3	97147515	97147682	-62452101	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-185	185	1	2
1326	2003	241	35	10	chr3	97149200	97149711	-62450072	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-3	524	1	2
1326	226	327	110	18	chr3	97153467	97153576	-62446207	+	LTR16A	LTR	ERVL	101	219	-232	2
1326	311	146	0	38	chr3	97153640	97153697	-62446086	+	LTR16A	LTR	ERVL	397	456	0	2
1326	401	226	0	173	chr3	97154574	97154724	-62445059	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	141	2
1326	4746	96	84	65	chr3	97157185	97158074	-62441709	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	3
1326	1261	152	0	5	chr3	97159685	97159883	-62439900	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	225	3
1326	1239	155	27	18	chr3	97160744	97160967	-62438816	-	MTC	LTR	MaLR	-196	225	1	3
1326	253	174	0	0	chr3	97161951	97161997	-62437786	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	488	3
1326	456	304	7	29	chr3	97165989	97166128	-62433655	-	ORR1E	LTR	MaLR	-223	136	1	3
1326	2745	214	58	30	chr3	97167368	97168037	-62431746	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4281	4968	-31	3
1326	279	255	83	19	chr3	97168377	97168485	-62431298	+	RMER15	LTR	ERVL	424	538	-37	3
1326	4147	131	62	83	chr3	97168643	97169461	-62430322	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	801	-101	3
1326	920	165	51	6	chr3	97171939	97172116	-62427667	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	185	-392	3
1326	448	278	191	11	chr3	97173732	97173994	-62425789	+	MLT1D	LTR	MaLR	192	500	-5	3
1326	1919	183	20	3	chr3	97175112	97175469	-62424314	-	MTD	LTR	MaLR	-42	377	15	3
1326	4976	128	55	27	chr3	97176256	97177135	-62422648	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	903	-3	3
1326	370	285	69	116	chr3	97177729	97178047	-62421736	+	ORR1E	LTR	MaLR	16	318	-41	3
1326	383	229	189	101	chr3	97179983	97180221	-62419562	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-13	398	140	3
1326	1939	202	17	29	chr3	97180257	97180753	-62419030	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-202	7042	6522	3
1326	2060	319	51	48	chr3	97180854	97182741	-62417042	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1462	5080	3224	3
1326	375	278	41	41	chr3	97182744	97182913	-62416870	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-4149	2393	2225	3
1326	488	237	183	50	chr3	97183265	97183505	-62416278	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	3
1326	2305	212	26	95	chr3	97184373	97185014	-62414769	+	RMER19C	LTR	ERVK	12	608	-3	3
1326	2887	46	0	0	chr3	97185668	97186014	-62413769	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	3
1326	2847	96	14	23	chr3	97187499	97187938	-62411845	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	435	-26	3
1326	236	325	0	49	chr3	97189943	97190024	-62409759	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	526	3
1326	1097	233	269	4	chr3	97190027	97190500	-62409283	-	RMER20B	LTR	ERVK	-29	598	1	3
1326	1607	280	106	29	chr3	97191010	97191565	-62408218	+	MTE-int	LTR	MaLR	914	1511	-69	3
1326	461	325	85	82	chr3	97191561	97191903	-62407880	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	351	-8	3
1326	1991	89	45	19	chr3	97192228	97192537	-62407246	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	317	-9	3
1326	1269	246	87	3	chr3	97193954	97194288	-62405495	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	2	3
1326	1256	202	184	33	chr3	97197355	97197719	-62402064	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1326	1072	267	109	35	chr3	97199221	97199679	-62400104	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2518	3196	2705	3
1326	856	175	96	15	chr3	97199679	97199876	-62399907	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	172	3
1326	723	188	71	0	chr3	97199968	97200122	-62399661	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-193	181	17	3
1326	519	271	54	51	chr3	97203687	97203983	-62395800	+	RLTR15	LTR	ERVK	49	345	-14	4
1326	2184	280	49	13	chr3	97204001	97204674	-62395109	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3619	2095	1399	3
1326	791	220	34	0	chr3	97204747	97204924	-62394859	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-4428	1286	1104	3
1326	845	224	94	76	chr3	97204939	97205215	-62394568	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	88	4
1326	419	282	105	37	chr3	97205329	97205491	-62394292	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2173	3494	3322	4
1326	273	324	19	38	chr3	97206127	97206233	-62393550	+	RMER15	LTR	ERVL	380	483	-92	4
1326	269	273	60	10	chr3	97208332	97208432	-62391351	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	275	4
1326	1193	98	16	0	chr3	97209374	97209567	-62390216	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	333	4
1326	3520	107	168	159	chr3	97210524	97211422	-62388361	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	4
1326	1966	149	90	0	chr3	97212157	97212513	-62387270	+	RMER19B	LTR	ERVK	2	389	-513	4
1326	305	321	6	53	chr3	97213574	97213745	-62386038	+	RMER4A	LTR	ERVK	25	187	-279	4
1326	2531	96	28	19	chr3	97216944	97217306	-62382477	+	RLTR8	LTR	ERVK	1	365	0	4
1326	1112	126	38	91	chr3	97217306	97217516	-62382267	+	SRV_MM-int	LTR	ERVK	1	199	-5968	4
1326	331	65	22	0	chr3	97217525	97217571	-62382212	-	RLTR8	LTR	ERVK	-318	47	1	4
1326	858	184	20	0	chr3	97226556	97226703	-62373080	+	MTEa	LTR	MaLR	1	150	-229	4
1326	942	208	21	68	chr3	97226725	97226959	-62372824	-	RMER15	LTR	ERVL	-68	507	285	4
1326	1446	219	145	21	chr3	97226959	97226976	-62372807	+	MTD	LTR	MaLR	1	15	-404	4
1326	1446	219	145	21	chr3	97227053	97227408	-62372375	+	MTD	LTR	MaLR	16	419	0	4
1326	772	227	125	46	chr3	97227408	97227634	-62372149	-	RMER15	LTR	ERVL	-291	284	40	4
1326	228	235	59	0	chr3	97227664	97227715	-62372068	-	RMER15	LTR	ERVL	-521	54	1	4
1326	857	231	29	34	chr3	97227718	97227924	-62371859	+	MTEa	LTR	MaLR	151	355	-24	4
1326	1389	234	96	6	chr3	97231622	97231957	-62367826	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	6	4
1326	270	294	163	23	chr3	97231959	97232088	-62367695	+	MLT1E2	LTR	MaLR	149	295	-332	4
1326	2603	94	155	15	chr3	97232792	97233257	-62366526	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	530	-2	4
1326	1406	152	150	8	chr3	97233592	97233858	-62365925	-	RMER4B	LTR	ERVK	-12	573	270	4
1326	3320	158	91	28	chr3	97233864	97234501	-62365282	-	RLTR33	LTR	ERVK	-1	677	1	4
1326	1545	138	0	0	chr3	97234688	97234919	-62364864	-	RMER4B	LTR	ERVK	-338	247	17	4
1326	1197	162	50	14	chr3	97234943	97235162	-62364621	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	181	4
1326	944	200	99	5	chr3	97237258	97237357	-62362426	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-201	220	120	4
1326	944	200	99	5	chr3	97237859	97237960	-62361823	-	MTC	LTR	MaLR	-302	119	1	4
1326	2598	265	14	12	chr3	97241412	97242102	-62357681	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2802	2959	2268	4
1326	568	290	24	0	chr3	97242097	97242266	-62357517	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3595	2162	1990	4
1326	657	266	38	34	chr3	97242292	97242529	-62357254	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3846	1868	1631	4
1326	2002	173	22	39	chr3	97242536	97242896	-62356887	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	4
1326	2129	310	52	24	chr3	97242896	97243497	-62356286	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4077	1680	1053	4
1326	2129	317	61	48	chr3	97243675	97244324	-62355459	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4705	1052	305	4
1326	1017	236	60	86	chr3	97244334	97244703	-62355080	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	7	4
1326	408	94	0	0	chr3	97251577	97251641	-62348142	-	RMER12	LTR	ERVK	-638	684	621	4
1326	977	309	95	38	chr3	97252095	97252590	-62347193	-	MT2A	LTR	ERVL	-1	532	10	4
1326	1771	177	62	124	chr3	97252720	97253237	-62346546	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	485	-473	4
1327	328	229	50	40	chr3	97255932	97256032	-62343751	+	MTE2b	LTR	MaLR	278	378	-1	4
1327	937	253	91	8	chr3	97260729	97260972	-62338811	+	MTD	LTR	MaLR	145	407	-12	4
1327	1423	262	71	6	chr3	97264586	97264950	-62334833	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	32	4
1327	868	247	51	40	chr3	97266582	97266835	-62332948	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	111	4
1327	622	241	56	111	chr3	97266847	97267188	-62332595	-	RMER10A	LTR	ERVL	-25	417	96	4
1327	3736	204	84	107	chr3	97267263	97268552	-62331231	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	5	1292	-78	4
1327	947	188	0	40	chr3	97268552	97268729	-62331054	+	RLTR18	LTR	ERVK	3	172	-444	4
1327	1310	139	5	5	chr3	97268729	97268931	-62330852	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	202	-165	4
1327	1185	205	60	20	chr3	97268937	97269168	-62330615	+	ORR1C1	LTR	MaLR	120	365	-13	4
1327	2575	97	169	2	chr3	97269168	97269624	-62330159	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	1	4
1327	1185	205	60	20	chr3	97269624	97269641	-62330142	+	ORR1C1	LTR	MaLR	366	378	0	4
1327	2678	176	4	8	chr3	97269658	97270127	-62329656	+	RLTR18	LTR	ERVK	150	616	0	4
1327	458	95	149	0	chr3	97270127	97270201	-62329582	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1286	1370	0	4
1327	661	165	9	9	chr3	97270201	97270317	-62329466	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	116	-258	4
1327	382	259	25	0	chr3	97270340	97270421	-62329362	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-287	83	1	4
1327	702	339	122	58	chr3	97275556	97276041	-62323742	+	MER21B	LTR	ERV1	297	812	-51	5
1327	2129	153	85	5	chr3	97279466	97279854	-62319929	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	5
1327	1781	155	167	126	chr3	97282891	97283423	-62316360	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	554	-348	5
1327	1983	181	86	27	chr3	97287108	97287597	-62312186	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	518	-10	5
1327	2025	96	16	6	chr3	97292262	97292578	-62307205	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
1327	1513	214	29	136	chr3	97292773	97292879	-62306904	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	104	-473	5
1327	4021	132	129	89	chr3	97292879	97293748	-62306035	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	904	-2	5
1327	1513	213	34	90	chr3	97293748	97294259	-62305524	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	105	528	0	5
1327	279	255	199	7	chr3	97297050	97297196	-62302587	+	MT2A	LTR	ERVL	360	533	0	5
1327	2248	157	17	24	chr3	97304494	97304906	-62294877	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	5
1327	1406	212	40	23	chr3	97313031	97313384	-62286399	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	5
1327	1385	203	37	124	chr3	97315890	97316300	-62283483	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1327	401	302	56	0	chr3	97317589	97317715	-62282068	-	MTE2a	LTR	MaLR	-246	133	1	5
1327	3426	33	5	0	chr3	97318093	97318487	-62281296	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1327	2620	93	80	3	chr3	97319756	97320132	-62279651	+	RLTR44A	LTR	ERVK	1	405	0	5
1327	690	157	58	0	chr3	97320132	97320253	-62279530	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	1	128	-2684	5
1327	499	72	0	55	chr3	97320256	97320329	-62279454	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	877	945	-1867	5
1327	6734	180	26	32	chr3	97320350	97322922	-62276861	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	659	2812	0	5
1327	2215	101	167	3	chr3	97322922	97323270	-62276513	+	RLTR44A	LTR	ERVK	1	405	0	5
1327	1517	225	98	5	chr3	97327374	97327750	-62272033	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	5
1327	2340	194	14	46	chr3	97333265	97333784	-62265999	+	RLTR16	LTR	ERVK	4	505	0	5
1327	310	295	8	51	chr3	97334409	97334527	-62265256	-	MTEa	LTR	MaLR	-266	113	1	5
1327	2026	273	76	31	chr3	97334538	97335249	-62264534	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	836	5
1327	305	277	122	32	chr3	97336257	97336380	-62263403	+	MTE-int	LTR	MaLR	919	1052	-528	5
1327	2098	161	40	3	chr3	97340153	97340507	-62259276	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1327	846	175	12	6	chr3	97340626	97340793	-62258990	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	215	6
1327	291	336	9	0	chr3	97340793	97340900	-62258883	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-316	5001	4894	6
1327	342	219	73	0	chr3	97341275	97341357	-62258426	+	RLTR14	LTR	ERV1	293	380	-2	6
1327	1001	201	127	46	chr3	97341408	97341715	-62258068	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	6
1327	344	219	73	0	chr3	97341822	97341904	-62257879	+	RLTR14	LTR	ERV1	293	380	-2	6
1327	236	327	77	34	chr3	97343507	97343564	-62256219	-	MER21B	LTR	ERV1	-233	630	509	6
1327	236	305	0	17	chr3	97343564	97343624	-62256159	-	MER77	LTR	ERVL	-6	601	543	6
1327	809	320	91	20	chr3	97343920	97344370	-62255413	-	MER21B	LTR	ERV1	-358	505	24	6
1327	273	296	0	12	chr3	97346032	97346114	-62253669	-	MTE-int	LTR	MaLR	-355	1225	1145	6
1327	672	237	9	11	chr3	97346090	97346249	-62253534	-	MTD	LTR	MaLR	-246	161	3	6
1327	1296	251	327	4	chr3	97346249	97346798	-62252985	-	MTE-int	LTR	MaLR	-852	728	2	6
1327	946	296	31	3	chr3	97346947	97347238	-62252545	-	MTEa	LTR	MaLR	-80	299	1	6
1327	641	259	95	13	chr3	97347811	97348042	-62251741	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	250	-132	6
1327	1476	156	116	29	chr3	97350040	97350384	-62249399	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	6
1327	3469	133	149	112	chr3	97353200	97354074	-62245709	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	6
1327	323	260	0	0	chr3	97354427	97354500	-62245283	-	RLTR24	LTR	ERV1	-456	73	1	6
1327	3413	36	8	0	chr3	97356280	97356671	-62243112	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	394	-2	6
1327	2272	165	31	24	chr3	97359049	97359503	-62240280	+	RLTR26	LTR	ERVK	2	458	-184	6
1327	672	170	0	0	chr3	97359541	97359653	-62240130	+	RLTR26	LTR	ERVK	531	642	0	6
1327	1116	263	94	12	chr3	97359754	97360085	-62239698	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	358	-12	6
1327	273	218	208	8	chr3	97360536	97360661	-62239122	+	RMER15	LTR	ERVL	410	559	-16	6
1327	298	269	241	0	chr3	97362201	97362309	-62237474	+	MLT1C	LTR	MaLR	334	467	0	6
1327	499	148	214	69	chr3	97363685	97363816	-62235967	+	RLTR24	LTR	ERV1	380	529	0	6
1327	673	238	119	0	chr3	97366762	97366947	-62232836	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	207	-152	6
1327	283	106	0	0	chr3	97366950	97366997	-62232786	+	RLTR15	LTR	ERVK	313	359	0	6
1327	235	274	78	17	chr3	97369212	97369327	-62230456	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	122	-268	6
1327	324	194	39	106	chr3	97383912	97384016	-62215767	-	MT2B	LTR	ERVL	-350	251	155	7
1327	4284	44	6	0	chr3	97384264	97384764	-62215019	+	RLTR1C	LTR	ERV1	1	503	0	7
1327	760	280	92	3	chr3	97385980	97386263	-62213520	+	MTE2b	LTR	MaLR	72	379	0	7
1328	441	223	190	30	chr3	97400187	97400431	-62199352	+	MLT1A1	LTR	MaLR	84	404	-4	7
1328	894	218	107	8	chr3	97403894	97404231	-62195552	+	MTD	LTR	MaLR	18	418	-1	7
1328	1616	136	201	15	chr3	97404382	97404710	-62195073	+	ORR1B1	LTR	MaLR	4	392	-2	7
1328	1493	203	138	24	chr3	97406232	97406610	-62193173	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1328	578	318	75	78	chr3	97409489	97409820	-62189963	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	337	-22	7
1328	542	282	120	14	chr3	97409821	97410030	-62189753	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	231	-1349	7
1328	246	325	0	13	chr3	97410575	97410653	-62189130	-	LTR33B	LTR	ERVL	-39	464	388	7
1328	5877	123	90	6	chr3	97416765	97417863	-62181920	+	RMER12B	LTR	ERVK	90	1260	-144	7
1328	576	245	228	2	chr3	97418323	97418601	-62181182	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	9	7
1328	296	278	0	0	chr3	97425337	97425409	-62174374	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3915	1607	1536	7
1328	1204	158	181	67	chr3	97426006	97426152	-62173631	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	165	7
1328	1204	158	181	67	chr3	97426182	97426366	-62173417	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-210	164	1	7
1328	567	229	13	65	chr3	97431387	97431541	-62168242	+	MTEa	LTR	MaLR	7	152	-227	7
1328	386	381	42	80	chr3	97460507	97460682	-62139101	-	MLT1J	LTR	MaLR	-3	509	339	8
1328	386	381	42	80	chr3	97460818	97460930	-62138853	-	MLT1J	LTR	MaLR	-174	338	233	8
1328	1150	272	86	20	chr3	97473230	97473583	-62126200	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	420	-1	8
1328	2226	102	19	0	chr3	97478198	97478511	-62121272	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	8
1328	2400	198	127	55	chr3	97478599	97478928	-62120855	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	362	8
1328	2400	198	127	55	chr3	97479115	97479421	-62120362	-	RMER19A	LTR	ERVK	-376	361	57	8
1328	1744	210	102	20	chr3	97480933	97481375	-62118408	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	5	482	-45	8
1328	229	245	20	0	chr3	97483617	97483666	-62116117	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	269	8
1328	288	264	11	144	chr3	97483721	97483902	-62115881	-	ORR1E	LTR	MaLR	-107	252	96	8
1328	229	222	0	0	chr3	97486857	97486902	-62112881	-	MTD	LTR	MaLR	-1	378	334	8
1328	917	261	142	34	chr3	97487234	97487559	-62112224	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	1	8
1328	1058	170	258	27	chr3	97488024	97488357	-62111426	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	8
1328	715	127	91	46	chr3	97490026	97490247	-62109536	+	RMER6A	LTR	ERVK	206	465	-225	9
1328	749	335	27	27	chr3	97499255	97499553	-62100230	+	MTE2a	LTR	MaLR	82	379	0	9
1328	3262	46	2	10	chr3	97512631	97513030	-62086753	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
20	3186	41	10	18	chr3	97517358	97517757	-62082026	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1329	261	297	43	32	chr3	97518057	97518151	-62081632	+	MLT1H2	LTR	MaLR	1	95	-484	2
1329	266	262	212	0	chr3	97518465	97518545	-62081238	+	MLT1H2	LTR	MaLR	380	476	-13	2
1329	4566	167	50	17	chr3	97525580	97526446	-62073337	+	RLTR25A	LTR	ERVK	3	896	-207	3
1329	778	233	136	57	chr3	97526500	97526764	-62073019	+	RLTR25B	LTR	ERVK	742	1026	-2	3
1329	305	333	37	9	chr3	97526928	97527037	-62072746	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-147	1701	1590	3
1329	1619	221	26	23	chr3	97527114	97527504	-62072279	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1043	805	415	3
1329	346	246	41	66	chr3	97527537	97527659	-62072124	+	RLTR23	LTR	ERV1	306	424	-6	3
1329	2374	157	68	5	chr3	97531611	97532026	-62067757	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	1	4
1329	666	120	19	0	chr3	97574638	97574746	-62025037	+	MTC	LTR	MaLR	1	110	-311	9
1329	1316	136	132	57	chr3	97574949	97575028	-62024755	+	MTC	LTR	MaLR	104	190	-231	9
1329	1316	136	132	57	chr3	97575476	97575692	-62024091	+	MTC	LTR	MaLR	191	420	-1	9
1329	1539	187	7	16	chr3	97576505	97576815	-62022968	+	RMER12	LTR	ERVK	2	308	-1014	9
1329	1278	118	149	59	chr3	97577325	97577613	-62022170	+	RMER12	LTR	ERVK	456	769	-553	9
1329	260	200	101	58	chr3	97577691	97577760	-62022023	+	RLTR21	LTR	ERVK	1341	1412	-160	1
1329	312	211	33	0	chr3	97579380	97579470	-62020313	+	MLT1A1	LTR	MaLR	316	408	0	1
1329	357	284	66	22	chr3	97581415	97581552	-62018231	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1258	1400	-4122	1
1329	1509	193	102	6	chr3	97582002	97582335	-62017448	+	MTD	LTR	MaLR	21	385	-34	1
1329	504	307	67	60	chr3	97583399	97583666	-62016117	-	ORR1E	LTR	MaLR	-40	319	51	1
1329	266	292	13	40	chr3	97585250	97585325	-62014458	-	ORR1E	LTR	MaLR	-190	180	108	1
1329	482	223	26	0	chr3	97585789	97585898	-62013885	-	ORR1E	LTR	MaLR	-245	125	3	1
1329	1670	144	51	63	chr3	97589577	97589992	-62009791	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
1329	4083	125	61	4	chr3	97594590	97595345	-62004438	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	12	1
1329	345	283	6	91	chr3	97595935	97596036	-62003747	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	106	205	-475	1
1329	345	283	6	91	chr3	97596238	97596311	-62003472	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	206	265	-415	1
1329	409	288	65	31	chr3	97596363	97596583	-62003200	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	391	666	-14	1
1329	889	270	184	3	chr3	97599597	97599917	-61999866	+	MTD	LTR	MaLR	42	419	0	1
1329	3093	23	0	0	chr3	97610753	97611098	-61988685	+	ORR1A0	LTR	MaLR	2	346	0	1
1329	393	299	111	0	chr3	97611881	97612025	-61987758	+	MLT1E1	LTR	MaLR	389	548	-106	1
1329	269	233	31	69	chr3	97612051	97612171	-61987612	+	MLT1A1	LTR	MaLR	257	392	-16	1
1329	468	270	143	69	chr3	97614961	97615339	-61984444	-	RMER10A	LTR	ERVL	-25	417	12	1
1329	3297	43	5	0	chr3	97617640	97618034	-61981749	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1329	4547	133	42	11	chr3	97622980	97623314	-61976469	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	343	-466	1
1329	4547	133	42	11	chr3	97623417	97623864	-61975919	+	RMER17D2	LTR	ERVK	344	805	-4	1
1329	738	267	155	29	chr3	97634577	97634886	-61964897	+	MTEa	LTR	MaLR	32	379	0	2
1329	552	279	54	61	chr3	97638802	97639081	-61960702	+	MER57F	LTR	ERV1	1	277	-159	2
1329	2375	113	10	28	chr3	97641332	97641725	-61958058	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	2
1329	385	239	25	41	chr3	97641916	97642038	-61957745	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1288	1407	-4115	2
1329	1993	158	90	11	chr3	97642695	97643072	-61956711	+	MTC	LTR	MaLR	1	407	-14	2
1329	1647	168	29	93	chr3	97644759	97645167	-61954616	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	5	2
1329	1198	212	128	35	chr3	97648067	97648433	-61951350	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	6	2
1330	384	264	96	121	chr3	97649294	97649699	-61950084	-	RMER10A	LTR	ERVL	-19	423	29	2
1330	305	297	89	115	chr3	97651234	97651538	-61948245	+	ORR1E	LTR	MaLR	60	355	-4	2
1330	527	313	56	43	chr3	97655041	97655345	-61944438	+	MTE-int	LTR	MaLR	212	519	-1061	2
1330	3862	114	77	4	chr3	97655580	97656222	-61943561	-	RMER6A	LTR	ERVK	-7	749	60	2
1330	3862	114	77	4	chr3	97656250	97656305	-61943478	-	RMER6A	LTR	ERVK	-697	59	2	2
1330	1679	139	108	0	chr3	97656370	97656693	-61943090	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-8	370	13	2
1330	954	273	148	23	chr3	97666000	97666438	-61933345	+	MLT1D	LTR	MaLR	13	505	0	2
1330	1404	254	63	15	chr3	97667853	97668248	-61931535	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	2
1330	501	325	76	5	chr3	97675098	97675296	-61924487	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	212	-196	2
1330	272	343	95	41	chr3	97677957	97678325	-61921458	+	MLT1A1-int	LTR	MaLR	555	942	-547	2
1330	607	232	8	0	chr3	97684029	97684154	-61915629	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-244	126	1	3
1330	866	209	88	52	chr3	97684371	97684679	-61915104	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	319	-55	3
1330	2201	131	49	79	chr3	97687216	97687545	-61912238	+	MTC	LTR	MaLR	1	346	-75	3
1330	2201	131	49	79	chr3	97688056	97688158	-61911625	+	MTC	LTR	MaLR	347	419	-2	3
1330	419	222	10	0	chr3	97689434	97689533	-61910250	+	MLT1A1	LTR	MaLR	290	389	-19	3
1330	1330	213	124	6	chr3	97697115	97697446	-61902337	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1330	518	246	145	79	chr3	97703099	97703417	-61896366	-	RLTR15	LTR	ERVK	-20	339	1	3
1330	499	281	194	17	chr3	97710102	97710334	-61889449	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-37	328	56	3
1330	565	281	219	29	chr3	97712696	97713007	-61886776	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	1	3
1330	262	195	56	28	chr3	97721942	97722044	-61877739	-	MTEb	LTR	MaLR	-21	358	252	3
1330	262	303	40	20	chr3	97722118	97722219	-61877564	-	MTEb	LTR	MaLR	-272	122	20	3
1330	2335	163	96	19	chr3	97723303	97723772	-61876011	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	1	3
1330	1504	185	38	32	chr3	97739816	97740156	-61859627	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	33	4
1330	2264	150	68	5	chr3	97747594	97747990	-61851793	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1330	1967	160	47	19	chr3	97757743	97758107	-61841676	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1330	1606	178	141	3	chr3	97758778	97759105	-61840678	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	4
1330	251	290	115	39	chr3	97760197	97760301	-61839482	-	LTR16C	LTR	ERVL	-222	267	156	4
1330	304	284	43	0	chr3	97763470	97763586	-61836197	+	ORR1E	LTR	MaLR	20	140	-219	4
1330	2027	133	99	41	chr3	97771395	97771570	-61828213	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	191	5
1330	2027	133	99	41	chr3	97771672	97771858	-61827925	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-194	190	3	5
166	1159	210	175	19	chr3	97779423	97779743	-61820040	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	5
1331	640	262	20	96	chr3	97781849	97782098	-61817685	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	230	-223	5
1331	429	285	147	97	chr3	97782351	97782876	-61816907	-	MLT1M	LTR	MaLR	-121	551	1	5
1331	2835	134	5	0	chr3	97785497	97785916	-61813867	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1331	4106	118	126	8	chr3	97786825	97787484	-61812299	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	5
1331	418	359	77	14	chr3	97799269	97799478	-61800305	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	284	5
1331	281	265	65	111	chr3	97799993	97800146	-61799637	+	MT2B	LTR	ERVL	119	264	-337	5
1331	504	282	136	34	chr3	97801283	97801518	-61798265	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-259	261	3	5
1331	2455	124	71	22	chr3	97805760	97806171	-61793612	-	RMER15	LTR	ERVL	-144	431	1	5
1331	2841	107	203	2	chr3	97807947	97808434	-61791349	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	5
1331	804	286	107	50	chr3	97814083	97814524	-61785259	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	466	-61	5
1331	269	162	49	86	chr3	97827733	97827814	-61771969	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	164	6
1331	236	216	142	38	chr3	97853425	97853531	-61746252	-	RMER15	LTR	ERVL	-154	421	305	6
1331	360	285	49	93	chr3	97875124	97875329	-61724454	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	175	6
1331	246	246	203	0	chr3	97875375	97875444	-61724339	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-287	83	1	6
1331	646	237	120	11	chr3	97883789	97883964	-61715819	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	228	7
1331	293	306	58	77	chr3	97886641	97886797	-61712986	+	MT2B	LTR	ERVL	124	276	-325	7
1331	518	266	157	30	chr3	97904925	97905233	-61694550	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	1	7
1332	2051	138	89	22	chr3	97917888	97918257	-61681526	-	MTC	LTR	MaLR	-27	394	1	7
1332	374	305	14	71	chr3	97919538	97919679	-61680104	+	RMER15	LTR	ERVL	305	437	-138	7
1332	949	149	133	0	chr3	97922358	97922546	-61677237	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	207	7
1332	565	200	174	15	chr3	97923482	97923614	-61676169	-	MTD	LTR	MaLR	-206	213	61	7
1332	280	331	68	79	chr3	97926535	97926725	-61673058	-	ORR1E	LTR	MaLR	-168	191	4	7
1332	538	314	73	92	chr3	97928926	97929295	-61670488	+	LTR55	LTR	ERV	13	374	-174	7
1332	235	271	57	162	chr3	97943288	97943517	-61656266	+	LTR75	LTR	ERVL	16	220	-342	7
1332	232	167	0	0	chr3	97946253	97946295	-61653488	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	384	343	7
1332	964	130	6	56	chr3	97946281	97946297	-61653486	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-208	170	163	7
1332	964	130	6	56	chr3	97946343	97946505	-61653278	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-216	162	1	7
1332	978	244	78	42	chr3	97947179	97947513	-61652270	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-24	346	1	7
1332	800	236	236	33	chr3	97956364	97956711	-61643072	-	MTD	LTR	MaLR	-17	404	23	7
1332	270	287	120	0	chr3	97959686	97959794	-61639989	+	LTR41	LTR	ERVL	63	183	-585	8
1332	225	227	39	26	chr3	97961498	97961575	-61638208	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	368	291	8
1332	249	245	123	38	chr3	97961651	97961757	-61638026	-	ORR1E	LTR	MaLR	-157	202	88	8
1332	1361	40	0	0	chr3	97961897	97962073	-61637710	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-1449	359	184	8
1332	282	336	112	37	chr3	97967334	97967575	-61632208	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-250	278	20	8
1332	1731	197	82	18	chr3	97968634	97969022	-61630761	+	MTD	LTR	MaLR	7	419	0	8
1332	822	225	21	58	chr3	97977235	97977476	-61622307	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	24	255	-272	8
1332	474	210	181	7	chr3	97977658	97977802	-61621981	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	268	436	-91	8
1332	815	342	124	53	chr3	97982308	97983434	-61616349	+	MTE-int	LTR	MaLR	333	1538	-42	8
1332	1868	209	85	143	chr3	97983477	97984126	-61615657	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	8
1332	285	281	20	30	chr3	97984326	97984425	-61615358	+	MLT1A1	LTR	MaLR	307	404	-4	8
1332	2866	142	225	12	chr3	97986379	97986943	-61612840	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	5	8
1332	1976	186	10	57	chr3	97990594	97990982	-61608801	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	5	8
1332	1493	272	71	46	chr3	97991743	97992347	-61607436	+	MER21B	LTR	ERV1	228	846	-17	8
1332	996	78	14	0	chr3	97995068	97995210	-61604573	-	MT2B2	LTR	ERVL	-80	504	361	8
1332	1918	202	87	65	chr3	98000399	98000906	-61598877	+	RLTR28	LTR	ERVL	3	520	-4	1
1332	230	222	56	0	chr3	98001513	98001567	-61598216	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	195	251	-373	3
1332	705	333	32	86	chr3	98001578	98001637	-61598146	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	352	400	-254	3
1332	736	314	28	40	chr3	98001677	98001932	-61597851	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	401	675	-5	3
1332	226	308	74	43	chr3	98012855	98013018	-61586765	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	168	-197	2
1332	1571	205	34	77	chr3	98013768	98014211	-61585572	+	RMER10A	LTR	ERVL	3	426	-16	2
1332	234	328	88	9	chr3	98017653	98017767	-61582016	-	LTR85b	LTR	Gypsy?	0	784	662	3
1332	320	149	43	29	chr3	98020208	98020277	-61579506	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7335	7404	-2	4
1332	1610	106	93	11	chr3	98020278	98020546	-61579237	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	290	-78	4
1332	1090	222	135	41	chr3	98020656	98020706	-61579077	+	RLTR9A	LTR	ERVK	306	348	-35	4
1332	1855	141	3	101	chr3	98022963	98023319	-61576464	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	5
1332	877	294	12	37	chr3	98031495	98031739	-61568044	+	MTEb	LTR	MaLR	141	378	-1	6
1332	657	281	127	13	chr3	98032921	98033220	-61566563	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3555	2159	1827	7
1332	269	281	56	0	chr3	98033544	98033633	-61566150	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3869	1888	1795	7
1332	455	146	0	58	chr3	98039075	98039134	-61560649	-	MTC	LTR	MaLR	-331	90	35	8
1332	455	146	0	58	chr3	98039340	98039367	-61560416	-	MTC	LTR	MaLR	-387	34	9	8
1332	955	237	48	72	chr3	98039831	98040122	-61559661	-	MLT2D	LTR	ERVL	-128	286	3	8
1333	2235	127	51	23	chr3	98048481	98048875	-61550908	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	352	1
1333	1269	80	0	0	chr3	98048873	98049036	-61550747	+	RLTR23	LTR	ERV1	268	430	0	1
1333	414	223	101	87	chr3	98049466	98049675	-61550108	+	MTEb	LTR	MaLR	19	221	-158	1
1333	3647	31	28	9	chr3	98051684	98052112	-61547671	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
1333	601	255	197	74	chr3	98053279	98053299	-61546484	-	MLT1E	LTR	MaLR	0	653	634	1
1333	601	255	197	74	chr3	98053362	98053650	-61546133	-	MLT1E	LTR	MaLR	-20	633	307	1
1333	536	314	81	46	chr3	98053892	98054152	-61545631	-	LTR16C	LTR	ERVL	-7	482	214	1
1333	250	369	4	34	chr3	98055286	98055519	-61544264	+	MuLV-int	LTR	ERV1	3493	3718	-3888	1
1333	248	287	152	24	chr3	98056344	98056469	-61543314	+	RMER4B	LTR	ERVK	346	486	-99	1
1333	5144	124	29	27	chr3	98057029	98057882	-61541901	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	1
1333	1009	240	102	36	chr3	98060011	98060244	-61539539	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	234	478	-99	1
1333	3855	41	15	15	chr3	98060244	98060719	-61539064	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1333	1009	240	102	36	chr3	98060719	98060788	-61538995	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	479	556	-21	1
1333	1018	279	144	26	chr3	98064462	98064956	-61534827	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-4	552	1	1
1333	3303	53	5	0	chr3	98066736	98067134	-61532649	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
1333	912	225	60	236	chr3	98068011	98068465	-61531318	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1333	528	235	214	12	chr3	98072946	98073114	-61526669	-	RMER15	LTR	ERVL	-50	525	324	1
1333	1412	197	250	3	chr3	98073648	98073984	-61525799	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1333	378	221	45	71	chr3	98074371	98074483	-61525300	-	RMER5	LTR	ERV1	-48	486	378	1
1333	257	359	27	27	chr3	98074855	98075001	-61524782	-	RMER5	LTR	ERV1	-136	398	253	1
1333	353	293	41	35	chr3	98075372	98075517	-61524266	-	RMER5	LTR	ERV1	-277	257	112	1
1333	4733	111	100	32	chr3	98078014	98078884	-61520899	-	RMER17B	LTR	ERVK	-29	929	1	1
1333	1165	247	85	48	chr3	98079308	98079708	-61520075	-	RMER5	LTR	ERV1	-8	526	112	1
1333	599	236	77	59	chr3	98079919	98080140	-61519643	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5619	5843	-707	1
1333	2324	185	36	38	chr3	98080807	98081330	-61518453	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	7	1
1333	296	244	26	201	chr3	98085866	98086020	-61513763	-	MT2B	LTR	ERVL	-341	260	134	1
1333	2174	159	28	0	chr3	98093579	98093938	-61505845	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-8	370	2	1
1333	1180	263	70	118	chr3	98094131	98094514	-61505269	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	2	1
1333	659	258	195	3	chr3	98095545	98095853	-61503930	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	9	1
1333	2412	153	125	2	chr3	98103699	98104132	-61495651	-	RMER4B	LTR	ERVK	-10	575	90	2
1333	631	254	141	62	chr3	98105838	98106144	-61493639	+	RMER20B	LTR	ERVK	70	399	-228	2
1333	2900	36	0	3	chr3	98107671	98108009	-61491774	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
1333	21324	17	1	2	chr3	98108009	98110370	-61489413	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	4123	2
1333	951	80	24	0	chr3	98110372	98110497	-61489286	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4783	2
1333	1828	123	4	4	chr3	98110492	98110754	-61489029	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2236	2
1333	460	66	0	32	chr3	98110743	98110806	-61488977	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5062	1419	1359	2
1333	4626	57	71	16	chr3	98110806	98111427	-61488356	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	8	2
1333	2906	39	0	3	chr3	98111427	98111765	-61488018	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	2
1333	385	363	37	80	chr3	98115248	98115574	-61484209	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	312	-716	2
1333	265	298	72	78	chr3	98116505	98116658	-61483125	+	RLTR25B	LTR	ERVK	877	1028	0	2
1333	1681	131	63	42	chr3	98127538	98127873	-61471910	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	342	-17	2
1333	349	231	28	28	chr3	98128884	98128991	-61470792	+	MTD	LTR	MaLR	20	126	-295	2
1333	1167	202	190	7	chr3	98129076	98129360	-61470423	+	MTD	LTR	MaLR	84	419	0	2
1333	2472	82	31	0	chr3	98134553	98134870	-61464913	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1333	10156	127	45	57	chr3	98134870	98136684	-61463099	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1792	0	2
1333	1856	95	125	14	chr3	98136684	98136971	-61462812	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	2
1333	407	242	30	78	chr3	98148733	98148899	-61450884	+	RLTR9B	LTR	ERVK	280	437	0	2
1333	1752	160	185	6	chr3	98149087	98149433	-61450350	+	MTC	LTR	MaLR	1	408	-13	2
1333	6467	166	34	28	chr3	98149435	98150684	-61449099	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	1258	0	2
1333	2658	153	5	19	chr3	98150686	98151113	-61448670	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1333	326	213	9	161	chr3	98151115	98151227	-61448556	-	MTD	LTR	MaLR	-219	200	106	2
1333	379	258	72	8	chr3	98151229	98151354	-61448429	+	MLT1D	LTR	MaLR	56	188	-317	2
1333	2860	41	18	3	chr3	98151449	98151790	-61447993	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	2
1333	494	309	157	21	chr3	98152165	98152446	-61447337	+	MLT1D	LTR	MaLR	186	504	-1	2
1333	277	325	48	16	chr3	98152952	98153077	-61446706	+	RMER5	LTR	ERV1	128	256	-278	2
1333	838	258	132	113	chr3	98155038	98155195	-61444588	+	MTEa	LTR	MaLR	1	155	-224	2
1333	838	258	132	113	chr3	98155382	98155596	-61444187	+	MTEa	LTR	MaLR	156	379	0	2
1333	2677	68	59	0	chr3	98158934	98159273	-61440510	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	3
1333	664	293	84	47	chr3	98160033	98160330	-61439453	+	MTE-int	LTR	MaLR	1030	1337	-243	3
1333	499	306	65	0	chr3	98160943	98161142	-61438641	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4329	670	459	3
1333	3879	155	64	8	chr3	98161636	98162291	-61437492	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	3
1333	3306	48	8	0	chr3	98163206	98163599	-61436184	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1333	2618	214	137	122	chr3	98169279	98169758	-61430025	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	383	3
1333	2618	214	137	122	chr3	98169905	98170272	-61429511	-	RMER13A	LTR	ERVK	-478	382	1	3
1334	2554	144	130	48	chr3	98175427	98175967	-61423816	-	RMER4B	LTR	ERVK	-1	584	1	3
1334	236	279	71	80	chr3	98193384	98193497	-61406286	-	MLT1J	LTR	MaLR	-342	170	59	3
1334	12484	154	70	41	chr3	98193522	98195764	-61404019	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-141	5381	3062	3
1334	12484	154	70	41	chr3	98195951	98196193	-61403590	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2461	3061	2826	3
1334	1038	212	53	4	chr3	98196198	98196425	-61403358	-	RLTR42	LTR	ERVK	0	239	2	3
1334	296	354	102	0	chr3	98206418	98206565	-61393218	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-4151	1516	1355	4
1334	401	321	84	19	chr3	98206611	98206824	-61392959	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3597	3823	-1844	4
1334	345	317	84	49	chr3	98207051	98207359	-61392424	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4163	4481	-1004	4
1334	250	333	12	23	chr3	98207399	98207485	-61392298	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-811	576	492	4
1334	591	264	209	19	chr3	98210284	98210600	-61389183	+	MTEa	LTR	MaLR	3	378	-1	4
1334	2471	148	2	19	chr3	98211565	98211979	-61387804	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1334	2159	122	6	0	chr3	98213630	98213949	-61385834	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	4
1334	287	319	21	0	chr3	98219046	98219140	-61380643	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	96	-460	4
1334	732	263	148	41	chr3	98219391	98219681	-61380102	+	MLT2D	LTR	ERVL	94	414	0	4
1334	3552	97	2	6	chr3	98227804	98228281	-61371502	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	4
1334	240	174	40	68	chr3	98236366	98236440	-61363343	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	348	4
1334	1411	237	61	23	chr3	98236814	98237207	-61362576	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	12	4
1334	416	278	191	35	chr3	98237251	98237534	-61362249	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	932	4
1334	612	244	69	54	chr3	98239419	98239623	-61360160	-	MTE2a	LTR	MaLR	-5	374	168	4
1334	239	287	57	47	chr3	98239672	98239778	-61360005	-	MTE2a	LTR	MaLR	-312	107	1	4
1334	233	282	0	105	chr3	98246773	98246804	-61352979	-	MT2B	LTR	ERVL	-385	211	132	4
1334	803	255	154	46	chr3	98251182	98251552	-61348231	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	4
1334	1489	161	132	6	chr3	98255772	98256098	-61343685	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	28	4
1334	1088	204	141	52	chr3	98256692	98257039	-61342744	+	MTC	LTR	MaLR	44	421	0	4
1334	1793	221	58	85	chr3	98257408	98257926	-61341857	+	RLTR18B	LTR	ERVK	5	508	-4	4
1334	1401	239	54	6	chr3	98258974	98259327	-61340456	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	4
1334	296	365	140	11	chr3	98260759	98261044	-61338739	-	MER21B	LTR	ERV1	-212	651	330	4
1334	269	308	135	23	chr3	98261050	98261183	-61338600	-	MTC	LTR	MaLR	-272	149	2	4
1334	321	308	25	25	chr3	98261884	98262004	-61337779	+	RMER5	LTR	ERV1	93	212	-322	4
1334	1358	249	14	6	chr3	98261994	98262341	-61337442	+	RMER5	LTR	ERV1	167	516	-18	4
1334	386	319	81	55	chr3	98262625	98262897	-61336886	+	MTE-int	LTR	MaLR	103	381	-1199	5
1334	238	300	0	0	chr3	98263035	98263102	-61336681	+	MTE-int	LTR	MaLR	778	844	-736	5
1334	2818	190	27	49	chr3	98263102	98263800	-61335983	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	74	5
1334	517	374	50	48	chr3	98263813	98264068	-61335715	+	MTE-int	LTR	MaLR	795	1048	-532	5
1334	4396	131	18	70	chr3	98264068	98264922	-61334861	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	5
1334	517	374	50	48	chr3	98264922	98265045	-61334738	+	MTE-int	LTR	MaLR	1049	1174	-406	5
1334	1350	269	56	22	chr3	98265206	98265669	-61334114	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1722	2200	-3967	5
1334	15014	193	30	25	chr3	98266696	98270166	-61329617	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2215	6425	-981	5
1334	326	118	82	68	chr3	98270380	98270453	-61329330	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7404	-2	5
1334	2442	156	20	13	chr3	98270454	98270851	-61328932	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	400	-3	5
1334	584	260	49	65	chr3	98270864	98271049	-61328734	+	RMER20B	LTR	ERVK	422	603	-24	5
1334	928	243	129	7	chr3	98274950	98275252	-61324531	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	68	5
1334	1119	238	85	40	chr3	98275746	98276245	-61323538	+	BGLII_B	LTR	ERVK	21	434	-7	5
1334	1391	217	110	3	chr3	98278228	98278584	-61321199	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
1334	1446	247	8	24	chr3	98279141	98279523	-61320260	+	MTC	LTR	MaLR	45	420	-1	5
1334	1224	237	17	10	chr3	98279962	98280256	-61319527	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	296	-216	5
1334	3071	32	0	0	chr3	98289490	98289836	-61309947	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1334	14555	51	1	1	chr3	98289836	98291628	-61308155	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	5
1334	3096	26	0	0	chr3	98291628	98291974	-61307809	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1334	14555	51	1	1	chr3	98291974	98293766	-61306017	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	5
1334	3096	26	0	0	chr3	98293766	98294112	-61305671	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1334	14570	50	1	1	chr3	98294112	98295904	-61303879	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	5
1334	3060	29	0	0	chr3	98295904	98296250	-61303533	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1334	1455	229	51	39	chr3	98296909	98297306	-61302477	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	13	5
1334	1455	229	51	39	chr3	98297337	98297353	-61302430	-	MTD	LTR	MaLR	-407	12	1	5
1334	369	262	265	19	chr3	98297353	98297542	-61302241	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	1010	5
1334	369	262	265	19	chr3	98297577	98297644	-61302139	-	MTD-int	LTR	MaLR	-249	1009	940	5
1334	527	271	45	47	chr3	98299393	98299617	-61300166	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	405	195	5
1335	808	255	154	46	chr3	98304579	98304949	-61294834	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	5
1335	1506	161	132	6	chr3	98309147	98309473	-61290310	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	28	5
1335	1088	204	141	52	chr3	98310132	98310479	-61289304	+	MTC	LTR	MaLR	44	421	0	5
1335	1783	229	56	83	chr3	98310848	98311366	-61288417	+	RLTR18B	LTR	ERVK	5	508	-4	5
1335	1401	239	54	6	chr3	98312414	98312767	-61287016	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	5
1335	314	362	140	14	chr3	98314199	98314485	-61285298	-	MER21B	LTR	ERV1	-212	651	330	5
1335	282	300	135	23	chr3	98314491	98314624	-61285159	-	MTC	LTR	MaLR	-272	149	2	5
1335	330	299	25	25	chr3	98315325	98315445	-61284338	+	RMER5	LTR	ERV1	93	212	-322	5
1335	1358	249	14	6	chr3	98315435	98315782	-61284001	+	RMER5	LTR	ERV1	167	516	-18	5
1335	399	319	81	55	chr3	98316066	98316338	-61283445	+	MTE-int	LTR	MaLR	103	381	-1199	5
1335	238	300	0	0	chr3	98316476	98316543	-61283240	+	MTE-int	LTR	MaLR	778	844	-736	5
1335	2856	197	26	45	chr3	98316543	98317239	-61282544	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	74	5
1335	517	374	50	48	chr3	98317252	98317507	-61282276	+	MTE-int	LTR	MaLR	795	1048	-532	5
1335	4396	131	18	70	chr3	98317507	98318361	-61281422	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	5
1335	517	374	50	48	chr3	98318361	98318484	-61281299	+	MTE-int	LTR	MaLR	1049	1174	-406	5
1335	1325	274	56	22	chr3	98318645	98319108	-61280675	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1722	2200	-3967	5
1335	15014	193	30	25	chr3	98320135	98323607	-61276176	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2215	6425	-981	5
1335	326	118	82	68	chr3	98323821	98323894	-61275889	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7404	-2	5
1335	2442	156	20	13	chr3	98323895	98324292	-61275491	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	400	-3	5
1335	584	260	49	65	chr3	98324305	98324490	-61275293	+	RMER20B	LTR	ERVK	422	603	-24	5
1335	928	243	129	7	chr3	98328427	98328729	-61271054	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	68	5
1335	1119	238	85	40	chr3	98329223	98329722	-61270061	+	BGLII_B	LTR	ERVK	21	434	-7	5
1335	1391	217	110	3	chr3	98331705	98332061	-61267722	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
1335	1446	247	8	24	chr3	98332618	98333000	-61266783	+	MTC	LTR	MaLR	45	420	-1	5
1335	1224	237	17	10	chr3	98333439	98333733	-61266050	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	296	-216	5
1335	3071	32	0	0	chr3	98342951	98343297	-61256486	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1335	14555	51	1	1	chr3	98343297	98345089	-61254694	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	5
1335	3096	26	0	0	chr3	98345089	98345435	-61254348	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1335	14555	51	1	1	chr3	98345435	98347227	-61252556	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	5
1335	3096	26	0	0	chr3	98347227	98347573	-61252210	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1335	14570	50	1	1	chr3	98347573	98349365	-61250418	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	5
1335	3060	29	0	0	chr3	98349365	98349711	-61250072	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1335	1455	229	51	39	chr3	98350370	98350767	-61249016	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	13	5
1335	1455	229	51	39	chr3	98350798	98350814	-61248969	-	MTD	LTR	MaLR	-407	12	1	5
1335	369	262	265	19	chr3	98350814	98351003	-61248780	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	1010	5
1335	369	262	265	19	chr3	98351038	98351105	-61248678	-	MTD-int	LTR	MaLR	-249	1009	940	5
1335	527	271	45	47	chr3	98352858	98353082	-61246701	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	405	195	5
1335	808	255	154	46	chr3	98358050	98358420	-61241363	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	6
1335	1506	161	132	6	chr3	98362618	98362944	-61236839	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	28	6
1335	1088	204	141	52	chr3	98363603	98363950	-61235833	+	MTC	LTR	MaLR	44	421	0	6
1335	1783	229	56	83	chr3	98364319	98364837	-61234946	+	RLTR18B	LTR	ERVK	5	508	-4	6
1335	1401	239	54	6	chr3	98365885	98366238	-61233545	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	6
1335	314	362	140	14	chr3	98367670	98367956	-61231827	-	MER21B	LTR	ERV1	-212	651	330	6
1335	282	300	135	23	chr3	98367962	98368095	-61231688	-	MTC	LTR	MaLR	-272	149	2	6
1335	330	299	25	25	chr3	98368796	98368916	-61230867	+	RMER5	LTR	ERV1	93	212	-322	6
1335	1358	249	14	6	chr3	98368906	98369253	-61230530	+	RMER5	LTR	ERV1	167	516	-18	6
1335	399	319	81	55	chr3	98369537	98369809	-61229974	+	MTE-int	LTR	MaLR	103	381	-1199	6
1335	238	300	0	0	chr3	98369947	98370014	-61229769	+	MTE-int	LTR	MaLR	778	844	-736	6
1335	2856	197	26	45	chr3	98370014	98370710	-61229073	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	74	6
1335	536	391	31	39	chr3	98370723	98370982	-61228801	+	MTE-int	LTR	MaLR	795	1054	-526	6
1335	4418	139	13	55	chr3	98370982	98371826	-61227957	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	809	0	6
1335	536	391	31	39	chr3	98371826	98371949	-61227834	+	MTE-int	LTR	MaLR	1055	1173	-407	6
1335	1300	276	56	22	chr3	98372110	98372573	-61227210	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1722	2200	-3967	6
1335	15014	193	30	25	chr3	98373600	98377070	-61222713	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2215	6425	-981	6
1335	326	118	82	68	chr3	98377284	98377357	-61222426	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7331	7404	-2	6
1335	2442	156	20	13	chr3	98377358	98377755	-61222028	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	400	-3	6
1335	584	260	49	65	chr3	98377768	98377953	-61221830	+	RMER20B	LTR	ERVK	422	603	-24	6
1335	928	243	129	7	chr3	98386072	98386374	-61213409	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	68	6
1335	1126	235	85	40	chr3	98386868	98387367	-61212416	+	BGLII_B	LTR	ERVK	21	434	-7	6
1335	1566	209	110	3	chr3	98389360	98389716	-61210067	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1335	1603	247	0	23	chr3	98390271	98390656	-61209127	+	MTC	LTR	MaLR	45	420	-1	6
1335	1373	220	17	14	chr3	98391099	98391394	-61208389	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	296	-216	6
1335	297	359	164	54	chr3	98392371	98392798	-61206985	-	MER21B	LTR	ERV1	-60	803	330	6
1335	353	303	127	15	chr3	98392804	98392938	-61206845	-	MTC	LTR	MaLR	-272	149	1	6
1335	351	204	72	27	chr3	98396950	98397061	-61202722	+	RMER5	LTR	ERV1	81	196	-338	6
1335	1406	257	12	6	chr3	98397073	98397418	-61202365	+	RMER5	LTR	ERV1	170	516	-18	6
1335	268	289	86	91	chr3	98397701	98397876	-61201907	+	MTE-int	LTR	MaLR	103	276	-1304	6
1335	2709	40	0	0	chr3	98397915	98398238	-61201545	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	32	354	-3	6
1335	9713	122	12	21	chr3	98398243	98399872	-61199911	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	1	1982	-5698	6
1335	3646	67	9	0	chr3	98399849	98400300	-61199483	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	2238	2692	-4988	6
1335	494	51	0	0	chr3	98400290	98400349	-61199434	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	4852	4910	-2770	6
1335	3366	77	56	0	chr3	98400349	98401082	-61198701	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	6907	7680	0	6
1335	2707	46	0	0	chr3	98401092	98401418	-61198365	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	32	357	0	6
1335	3047	187	36	46	chr3	98401692	98402382	-61197401	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	74	6
1335	694	390	34	21	chr3	98402388	98402773	-61197010	+	MTE-int	LTR	MaLR	787	1176	-404	6
1335	237	227	89	51	chr3	98403570	98403649	-61196134	+	LTRIS4	LTR	ERV1	376	457	-50	6
1335	480	56	0	27	chr3	98404151	98404224	-61195559	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	772	842	-2856	6
1335	349	327	21	80	chr3	98404300	98404539	-61195244	+	MMVL30-int	LTR	ERV1	844	1068	-2630	6
1335	3204	32	0	0	chr3	98414916	98415262	-61184521	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	6
1335	1509	235	64	32	chr3	98416312	98416702	-61183081	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	18	6
1335	1509	235	64	32	chr3	98416749	98416766	-61183017	-	MTC	LTR	MaLR	-404	17	2	6
1335	376	277	66	50	chr3	98416858	98417040	-61182743	-	MTC-int	LTR	MaLR	-142	1116	932	6
1335	614	266	46	68	chr3	98418881	98419127	-61180656	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	417	174	6
1335	582	272	177	9	chr3	98424112	98424468	-61175315	-	MTD	LTR	MaLR	0	421	7	6
1335	1441	196	130	6	chr3	98427414	98427739	-61172044	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	417	28	6
1335	1200	207	141	52	chr3	98428314	98428661	-61171122	+	MTC	LTR	MaLR	44	421	0	6
1335	1369	233	22	10	chr3	98429344	98429656	-61170127	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	316	-196	6
1335	712	254	32	16	chr3	98429678	98429866	-61169917	+	RLTR18B	LTR	ERVK	297	487	-25	6
1335	3023	96	2	20	chr3	98430038	98430441	-61169342	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1335	942	85	140	11	chr3	98430441	98430620	-61169163	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	897	6
1335	5001	93	15	1	chr3	98430611	98431324	-61168459	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-375	723	1	6
1335	2935	94	2	27	chr3	98431324	98431730	-61168053	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1335	1573	242	54	6	chr3	98432637	98432990	-61166793	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	6
1335	413	355	178	22	chr3	98434349	98434715	-61165068	-	MER21B	LTR	ERV1	-111	752	330	6
1336	344	234	53	11	chr3	98439094	98439189	-61160594	+	RMER5	LTR	ERV1	98	196	-338	7
1336	1243	264	23	9	chr3	98439202	98439549	-61160234	+	RMER5	LTR	ERV1	171	522	-12	7
1336	411	298	101	56	chr3	98439826	98440093	-61159690	+	MTE-int	LTR	MaLR	103	381	-1199	7
1336	240	292	15	0	chr3	98440230	98440295	-61159488	+	MTE-int	LTR	MaLR	778	843	-737	7
1336	1679	231	46	18	chr3	98440298	98440753	-61159030	-	RMER6A	LTR	ERVK	-2	754	287	7
1336	987	186	10	15	chr3	98447499	98447701	-61152082	-	RMER6C	LTR	ERVK	-350	340	140	7
1336	588	403	39	16	chr3	98447720	98448101	-61151682	+	MTE-int	LTR	MaLR	787	1176	-404	7
1336	794	223	223	13	chr3	98449316	98449622	-61150161	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	369	3	7
1336	1467	250	51	41	chr3	98453872	98454450	-61145333	+	RMER12	LTR	ERVK	1	583	-1265	7
1336	2080	268	91	8	chr3	98456533	98457127	-61142656	-	RMER13A	LTR	ERVK	-217	643	1	7
1336	3226	37	12	0	chr3	98464446	98464851	-61134932	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-688	410	1	7
1336	3590	40	2	0	chr3	98464851	98465246	-61134537	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1336	944	254	134	10	chr3	98474257	98474555	-61125228	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	68	7
1336	298	253	102	29	chr3	98475049	98475240	-61124543	+	BGLII_B	LTR	ERVK	21	255	-186	7
1336	230	290	19	65	chr3	98475238	98475345	-61124438	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	340	441	-120	7
1336	1288	242	122	3	chr3	98478939	98479291	-61120492	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
1336	1604	239	8	21	chr3	98479843	98480223	-61119560	+	MTC	LTR	MaLR	45	419	-2	7
1336	1249	232	24	14	chr3	98481142	98481435	-61118348	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	296	-216	7
1336	1166	108	14	37	chr3	98482970	98483167	-61116616	+	LTRIS2	LTR	ERV1	321	564	0	7
1336	234	192	19	19	chr3	98483167	98483193	-61116590	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	586	611	-43	7
1336	292	335	173	36	chr3	98483594	98483842	-61115941	+	MER21B	LTR	ERV1	354	635	-228	7
1336	933	254	134	10	chr3	98485906	98486204	-61113579	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	68	7
1336	1223	237	90	43	chr3	98486697	98487186	-61112597	+	BGLII_B	LTR	ERVK	21	434	-7	7
1336	1338	224	118	8	chr3	98489248	98489603	-61110180	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
1336	1653	231	8	24	chr3	98490178	98490560	-61109223	+	MTC	LTR	MaLR	45	420	-1	7
1336	1234	241	20	14	chr3	98491067	98491361	-61108422	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	296	-216	7
1336	233	322	157	25	chr3	98492474	98492595	-61107188	-	MER21B	LTR	ERV1	-398	465	329	7
1336	370	250	31	0	chr3	98492642	98492738	-61107045	+	RMER5	LTR	ERV1	98	196	-338	7
1336	1321	255	18	6	chr3	98492750	98493089	-61106694	+	RMER5	LTR	ERV1	170	512	-22	7
1336	390	329	88	62	chr3	98493357	98493629	-61106154	+	MTE-int	LTR	MaLR	103	381	-1199	7
1336	708	163	0	8	chr3	98499870	98500000	-61099783	-	RMER6C	LTR	ERVK	-359	331	203	7
1336	563	227	0	0	chr3	98500000	98500119	-61099664	-	RMER6A	LTR	ERVK	-556	200	82	1
1336	420	318	57	57	chr3	98500128	98500358	-61099425	+	MTE-int	LTR	MaLR	787	1016	-564	2
1336	623	277	217	27	chr3	98501576	98501880	-61097903	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	369	8	3
1336	341	299	51	41	chr3	98503358	98503553	-61096230	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-312	256	60	5
1336	2095	133	0	0	chr3	98510002	98510326	-61089457	-	MT2B2	LTR	ERVL	-260	324	1	7
1336	647	257	104	92	chr3	98510328	98510577	-61089206	+	RMER20B	LTR	ERVK	334	585	-42	8
1336	427	396	63	26	chr3	98520803	98521153	-61078630	-	MER21B	LTR	ERV1	-163	700	338	2
1336	777	303	58	33	chr3	98521626	98521991	-61077792	-	MER21-int	LTR	ERV1	-168	4023	3650	2
1336	259	250	85	21	chr3	98522725	98522819	-61076964	-	MER21-int	LTR	ERV1	-3516	675	576	2
1336	448	339	36	65	chr3	98523533	98523717	-61076066	-	MT2A	LTR	ERVL	-107	426	245	2
1336	448	339	36	65	chr3	98523811	98523935	-61075848	-	MT2A	LTR	ERVL	-289	244	127	2
1336	1087	268	78	19	chr3	98526112	98526485	-61073298	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1039	809	415	2
1336	301	266	42	21	chr3	98526533	98526629	-61073154	+	RLTR23	LTR	ERV1	317	414	-16	2
1336	716	297	27	5	chr3	98526635	98526858	-61072925	+	RMER5	LTR	ERV1	206	433	-101	2
1336	259	307	47	41	chr3	98527415	98527585	-61072198	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1230	1400	-4122	3
1336	723	261	109	9	chr3	98527683	98527971	-61071812	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-6	353	24	3
1336	275	298	37	37	chr3	98528316	98528424	-61071359	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	267	3
1336	378	252	67	55	chr3	98528796	98528960	-61070823	+	RNLTR23	LTR	ERVK	477	642	0	3
1336	489	290	7	7	chr3	98529164	98529310	-61070473	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	190	335	-7882	3
1336	1247	286	8	8	chr3	98530087	98530446	-61069337	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	2516	2874	-5343	3
1336	1153	192	5	5	chr3	98530453	98530668	-61069115	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	215	-687	3
1336	1202	207	98	63	chr3	98536968	98537686	-61062097	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	200	893	0	3
1336	7744	267	29	14	chr3	98537757	98538351	-61061432	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	2982	3593	-4624	4
1336	2597	118	15	34	chr3	98538351	98538762	-61061021	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	4
1336	7744	267	29	14	chr3	98538762	98540212	-61059571	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	3594	5057	-3160	4
1336	278	391	113	52	chr3	98557607	98557766	-61042017	-	MER21B	LTR	ERV1	-225	638	486	6
1336	278	391	113	52	chr3	98557789	98557974	-61041809	-	MER21B	LTR	ERV1	-378	485	273	6
1336	391	303	68	42	chr3	98558395	98558660	-61041123	-	MER21-int	LTR	ERV1	-173	4018	3747	6
1336	268	301	70	35	chr3	98558853	98559025	-61040758	-	MER21-int	LTR	ERV1	-3438	753	576	6
1336	467	345	31	77	chr3	98559839	98560037	-61039746	-	MT2A	LTR	ERVL	-96	437	243	6
1336	467	345	31	77	chr3	98560069	98560196	-61039587	-	MT2A	LTR	ERVL	-291	242	127	6
1336	1206	265	25	25	chr3	98562197	98562592	-61037191	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1039	809	415	7
1336	273	250	86	111	chr3	98562613	98562730	-61037053	+	RLTR23	LTR	ERV1	301	414	-16	7
1336	1077	284	28	16	chr3	98562736	98563054	-61036729	+	RMER5	LTR	ERV1	204	525	-9	7
1336	409	322	44	61	chr3	98563417	98563645	-61036138	+	MTE-int	LTR	MaLR	158	381	-1199	7
1336	2684	211	24	51	chr3	98563854	98564524	-61035259	-	RMER6A	LTR	ERVK	-3	753	102	7
1336	987	350	44	21	chr3	98564569	98564954	-61034829	+	MTE-int	LTR	MaLR	783	1176	-404	7
1337	945	241	185	0	chr3	98566144	98566447	-61033336	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	8	7
1337	875	255	185	0	chr3	98566866	98567164	-61032619	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-14	360	8	8
1337	379	261	40	36	chr3	98567599	98567758	-61032025	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	163	8
1337	1748	213	48	14	chr3	98568058	98568458	-61031325	+	RMER19A	LTR	ERVK	216	725	-12	8
1337	1521	177	31	28	chr3	98568514	98568839	-61030944	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	8
1337	326	158	25	62	chr3	98568839	98568920	-61030863	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1	78	-1431	8
1337	4560	205	50	41	chr3	98568933	98570151	-61029632	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	86	1314	-1012	8
1337	4068	167	57	9	chr3	98574153	98575130	-61024653	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1303	2326	0	8
1337	2942	187	16	23	chr3	98575130	98575694	-61024089	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	560	0	8
1337	1727	211	3	32	chr3	98575694	98576060	-61023723	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1519	444	90	8
1337	1818	181	13	0	chr3	98576060	98576375	-61023408	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	9
1337	2885	196	18	4	chr3	98576379	98576931	-61022852	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	560	-1403	9
1337	670	243	15	106	chr3	98576868	98577066	-61022717	+	MT2B	LTR	ERVL	104	283	-318	9
1337	5678	175	10	102	chr3	98583299	98584646	-61015137	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	742	1963	0	9
1337	1707	159	28	15	chr3	98584646	98584971	-61014812	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	329	0	9
1337	1709	154	171	3	chr3	98586065	98586450	-61013333	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-82	450	1	9
1337	783	324	5	8	chr3	98586545	98586921	-61012862	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-74	7704	7330	9
1337	323	271	37	0	chr3	98587579	98587686	-61012097	-	MURVY-int	LTR	ERV1	-2309	5143	5033	9
1337	503	313	9	9	chr3	98589447	98589663	-61010120	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-3541	1522	1307	1
1337	521	192	226	0	chr3	98591113	98591259	-61008524	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	0	532	354	1
1337	3900	181	42	25	chr3	98604267	98605108	-60994675	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	1
1337	9884	91	33	24	chr3	98605122	98606688	-60993095	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-28	5780	4202	1
1337	8470	91	16	14	chr3	98606679	98607967	-60991816	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4675	2731	1441	1
1337	338	412	51	10	chr3	98615182	98615496	-60984287	-	MER21B	LTR	ERV1	-204	659	333	1
1337	774	300	65	32	chr3	98615966	98616335	-60983448	-	MER21-int	LTR	ERV1	-168	4023	3643	1
1337	369	283	83	44	chr3	98617091	98617272	-60982511	-	MER21-int	LTR	ERV1	-3413	778	591	1
1337	460	332	63	42	chr3	98618056	98618241	-60981542	-	MT2A	LTR	ERVL	-109	424	244	1
1337	460	332	63	42	chr3	98618318	98618465	-60981318	-	MT2A	LTR	ERVL	-290	243	85	1
1337	1791	218	47	17	chr3	98620928	98621335	-60978448	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1337	2096	81	166	12	chr3	98626598	98626936	-60972847	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
1337	644	181	57	13	chr3	98627692	98627849	-60971934	+	MTC	LTR	MaLR	250	413	-8	1
1337	2035	135	16	0	chr3	98628698	98629002	-60970781	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	1
1337	1663	73	31	186	chr3	98629078	98629432	-60970351	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	554	852	-1135	1
1337	748	147	51	60	chr3	98629501	98629771	-60970012	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	78	496	-6046	1
1337	2076	74	160	0	chr3	98629770	98630107	-60969676	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5010	5400	-1142	1
1337	994	84	18	0	chr3	98630105	98630319	-60969464	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5766	6021	-521	1
1337	1465	112	5	0	chr3	98630322	98630518	-60969265	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6128	6324	-218	1
1337	1190	108	48	0	chr3	98630595	98630781	-60969002	+	RLTR27	LTR	ERVK	115	309	0	1
1337	814	206	42	5	chr3	98637424	98637614	-60962169	-	RLTR26	LTR	ERVK	-352	290	94	1
1337	444	182	80	0	chr3	98642068	98642156	-60957627	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	95	-417	1
1337	1592	151	20	109	chr3	98642160	98642510	-60957273	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	1
1337	1411	170	87	0	chr3	98642511	98642776	-60957007	+	RLTR18B	LTR	ERVK	92	379	-133	1
1337	2488	62	0	3	chr3	98644414	98644753	-60955030	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	1
1337	1498	231	19	11	chr3	98645542	98645901	-60953882	+	RLTR14	LTR	ERV1	2	363	-19	1
1337	1512	196	70	46	chr3	98652702	98652792	-60946991	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	90	-422	1
1337	2025	137	32	3	chr3	98652792	98653106	-60946677	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-4	323	1	1
1337	1512	196	70	46	chr3	98653106	98653385	-60946398	+	RLTR18B	LTR	ERVK	91	379	-133	1
1337	1707	227	16	5	chr3	98655592	98655969	-60943814	+	RLTR14	LTR	ERV1	2	382	0	1
1337	1155	210	5	14	chr3	98667040	98667262	-60932521	+	MTC	LTR	MaLR	193	412	-9	1
1337	834	340	108	83	chr3	98671827	98672346	-60927437	+	MLT1F2	LTR	MaLR	29	560	0	1
1337	273	302	84	9	chr3	98672933	98673040	-60926743	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	294	1
1337	1379	246	73	36	chr3	98674447	98674805	-60924978	+	MTD	LTR	MaLR	27	397	-22	1
1337	493	240	24	8	chr3	98674811	98674937	-60924846	-	RMER5	LTR	ERV1	-42	492	365	1
1337	267	213	0	0	chr3	98674939	98674986	-60924797	-	RMER5	LTR	ERV1	-271	263	217	1
1337	772	275	22	48	chr3	98677921	98678150	-60921633	-	MTD	LTR	MaLR	-196	223	1	1
1337	675	291	270	48	chr3	98690260	98690692	-60909091	+	MER68	LTR	ERVL	1	528	-35	2
1337	3885	48	122	0	chr3	98693108	98693607	-60906176	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	2
1338	659	267	38	27	chr3	98698037	98698222	-60901561	+	MTEa	LTR	MaLR	1	187	-192	2
1338	504	291	94	94	chr3	98698440	98698664	-60901119	+	MTEa	LTR	MaLR	156	379	0	2
1338	2788	141	53	35	chr3	98698715	98699222	-60900561	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	2
1338	1625	225	39	33	chr3	98699922	98700285	-60899498	-	MTD	LTR	MaLR	-54	365	1	2
1338	2314	127	60	15	chr3	98713954	98714354	-60885429	-	RMER6B	LTR	ERVK	-43	418	1	2
1338	1111	226	146	60	chr3	98727455	98727804	-60871979	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	2
1338	237	213	33	0	chr3	98727890	98727951	-60871832	+	MTE2b	LTR	MaLR	294	356	-23	2
1338	3197	61	5	8	chr3	98728060	98728457	-60871326	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1338	275	371	73	31	chr3	98729375	98729567	-60870216	-	MLT1H	LTR	MaLR	-325	224	25	2
1338	259	328	47	42	chr3	98731855	98732046	-60867737	-	MamGypLTR2b	LTR	Gypsy	-43	879	688	2
1338	983	305	35	35	chr3	98732350	98732727	-60867056	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	2
1338	330	319	68	12	chr3	98753467	98753629	-60846154	+	MLT2B4	LTR	ERVL	117	287	-269	3
1338	280	331	96	42	chr3	98756293	98756460	-60843323	-	MLT1I	LTR	MaLR	-6	405	230	3
1338	2232	135	32	0	chr3	98763305	98763653	-60836130	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	3
1338	1261	172	47	16	chr3	98764455	98764709	-60835074	+	MTD	LTR	MaLR	158	419	0	3
1338	1793	228	104	18	chr3	98764736	98765246	-60834537	+	RMER15	LTR	ERVL	22	575	0	3
1338	4861	100	92	95	chr3	98768356	98769252	-60830531	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	3
1338	246	264	45	54	chr3	98770617	98770729	-60829054	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-6	483	373	3
1338	392	312	85	23	chr3	98772769	98772946	-60826837	-	LTR16D	LTR	ERVL	-241	410	223	3
1338	2616	169	100	8	chr3	98776512	98776550	-60823233	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	489	3
1338	2616	169	100	8	chr3	98776583	98777032	-60822751	-	MT2A	LTR	ERVL	-45	488	2	3
1338	298	307	163	28	chr3	98780612	98780753	-60819030	-	MLT1A	LTR	MaLR	-34	340	181	3
1338	328	220	35	0	chr3	98780787	98780872	-60818911	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	97	-282	3
1338	557	335	97	26	chr3	98780929	98781156	-60818627	+	MTE2b	LTR	MaLR	100	342	-37	3
1338	4222	28	0	2	chr3	98789898	98790392	-60809391	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1338	8069	14	2	0	chr3	98790410	98791363	-60808420	+	MERVL-int	LTR	ERVL	19	973	-4512	3
1338	2295	112	14	28	chr3	98799619	98799978	-60799805	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	354	-3	3
1338	1693	207	31	14	chr3	98800772	98801125	-60798658	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	3
1338	1486	240	27	19	chr3	98801138	98801511	-60798272	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	1	3
1338	1136	317	66	39	chr3	98801511	98801918	-60797865	-	MTEa-int	LTR	MaLR	0	1580	1163	3
1338	920	303	23	67	chr3	98801936	98802279	-60797504	+	MTEa	LTR	MaLR	50	377	-2	3
1338	433	338	50	0	chr3	98802279	98802415	-60797368	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-423	1157	1015	3
1338	2264	158	42	10	chr3	98802450	98802858	-60796925	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1338	363	168	30	13	chr3	98802885	98802961	-60796822	+	ORR1E	LTR	MaLR	288	405	-14	3
1338	1319	277	47	12	chr3	98802969	98803312	-60796471	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1225	355	1	3
1338	344	145	0	61	chr3	98803317	98803383	-60796400	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	315	3
1338	242	329	12	25	chr3	98803711	98803792	-60795991	-	MTEa	LTR	MaLR	-104	255	176	3
1338	307	330	28	126	chr3	98825889	98826104	-60773679	+	MLT1E2	LTR	MaLR	1	194	-311	4
1339	3368	33	8	0	chr3	98831711	98832104	-60767679	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1339	1359	249	50	28	chr3	98832738	98833097	-60766686	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	1	4
1339	3748	23	0	0	chr3	98833561	98833957	-60765826	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1339	595	315	57	66	chr3	98841608	98841941	-60757842	+	MLT1B	LTR	MaLR	61	390	0	4
1339	395	301	29	41	chr3	98841941	98842111	-60757672	-	MLT1D	LTR	MaLR	-21	484	317	4
1339	720	346	49	45	chr3	98842978	98843404	-60756379	-	MT2A	LTR	ERVL	-101	432	5	4
1339	390	319	87	40	chr3	98844966	98845116	-60754667	-	MLT1D	LTR	MaLR	-470	157	1	4
1339	602	295	24	102	chr3	98845165	98845459	-60754324	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	96	4
1339	466	323	88	71	chr3	98852321	98852661	-60747122	+	MTEa	LTR	MaLR	46	391	-28	4
1339	1417	256	17	20	chr3	98863661	98864008	-60735775	-	MTD	LTR	MaLR	-68	351	6	4
1339	3435	40	25	0	chr3	98866397	98866798	-60732985	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	4
1339	3635	56	0	20	chr3	98866818	98867322	-60732461	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	211	662	-5819	4
1339	2209	72	0	0	chr3	98867322	98867600	-60732183	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	4
1339	6014	53	3	19	chr3	98867599	98868355	-60731428	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6479	-2	4
1339	3843	36	63	0	chr3	98868357	98868804	-60730979	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
1339	1585	197	19	165	chr3	98869539	98869970	-60729813	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	368	-6	4
1339	1028	242	23	19	chr3	98883459	98883716	-60716067	+	RMER6B	LTR	ERVK	204	461	0	4
1339	2193	160	67	32	chr3	98885563	98885964	-60713819	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	7	4
1339	4670	175	56	69	chr3	98885964	98886038	-60713745	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	54	-848	4
1339	4670	175	56	69	chr3	98886087	98886926	-60712857	+	RMER19B	LTR	ERVK	55	902	0	4
1339	1070	205	107	27	chr3	98898679	98898940	-60700843	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	243	5
1339	342	224	48	58	chr3	98906858	98906962	-60692821	+	MTD	LTR	MaLR	7	109	-310	5
1339	731	231	59	0	chr3	98907533	98907719	-60692064	+	MTD	LTR	MaLR	223	419	0	5
1339	477	316	72	21	chr3	98908848	98909042	-60690741	-	RMER20B	LTR	ERVK	-317	310	107	5
1339	2117	129	37	16	chr3	98909357	98909679	-60690104	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1339	2733	156	53	23	chr3	98922236	98922710	-60677073	+	RLTR20C	LTR	ERVK	47	534	0	5
1339	3449	65	19	4	chr3	98924725	98925188	-60674595	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	64	5
1339	9479	91	10	17	chr3	98925208	98926534	-60673249	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4	5402	4087	5
1339	653	283	153	23	chr3	98929158	98929502	-60670281	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	3	5
1339	2972	166	45	26	chr3	98936971	98937546	-60662237	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	323	5
1339	2353	182	127	98	chr3	98942372	98943146	-60656637	-	RLTR40	LTR	ERVK	-21	796	1	5
1339	669	284	28	14	chr3	98955377	98955590	-60644193	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	408	186	5
1339	1891	106	53	3	chr3	98957212	98957515	-60642268	+	BGLII_B	LTR	ERVK	120	437	-4	6
167	2365	112	19	0	chr3	98959291	98959611	-60640172	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	6
1340	4563	120	181	17	chr3	98964105	98964988	-60634795	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	1103	0	6
1340	2017	191	69	0	chr3	98965101	98965493	-60634290	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
1340	281	333	102	8	chr3	98977631	98977749	-60622034	-	MLT1C	LTR	MaLR	-326	141	13	6
1340	469	259	179	31	chr3	98981753	98982069	-60617714	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	44	6
1340	409	297	51	64	chr3	98985501	98985796	-60613987	-	RLTR15	LTR	ERVK	-20	339	49	6
1340	271	157	39	0	chr3	98985965	98986016	-60613767	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-500	68	16	6
1340	1270	192	90	7	chr3	98989808	98990107	-60609676	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	42	6
1340	3048	43	3	3	chr3	98995023	98995369	-60604414	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
1340	416	313	42	30	chr3	98999383	98999551	-60600232	+	MTEb	LTR	MaLR	90	259	-120	6
1340	2045	118	19	26	chr3	98999656	99000000	-60599783	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	855	467	6
1340	3738	37	15	17	chr3	99000001	99000473	-60599310	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-337	471	1	1
1340	471	204	226	8	chr3	99000475	99000608	-60599175	+	MTEb	LTR	MaLR	213	374	-5	2
1340	225	382	43	35	chr3	99001808	99001949	-60597834	+	MLT1I	LTR	MaLR	147	288	-123	9
1340	1026	285	27	85	chr3	99004157	99004266	-60595517	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	277	1
1340	3408	71	38	11	chr3	99004266	99004735	-60595048	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	1
1340	1026	285	27	85	chr3	99004735	99005027	-60594756	-	MTEa	LTR	MaLR	-103	276	1	1
1340	1162	191	143	12	chr3	99005253	99005553	-60594230	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	1
1340	311	308	93	76	chr3	99014252	99014477	-60585306	-	ORR1E	LTR	MaLR	-112	247	19	3
1340	227	228	88	0	chr3	99023291	99023348	-60576435	-	MLT2B3	LTR	ERVL	0	556	495	5
1340	788	292	91	126	chr3	99023746	99024197	-60575586	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-64	490	22	5
1340	303	228	25	25	chr3	99024327	99024408	-60575375	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	160	5
1340	255	308	50	71	chr3	99030044	99030184	-60569599	+	MLT1B	LTR	MaLR	7	143	-369	6
1340	677	218	214	39	chr3	99030177	99030436	-60569347	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	6	285	-190	6
1340	980	98	35	0	chr3	99030427	99030570	-60569213	-	MTC	LTR	MaLR	-204	217	70	7
1340	507	130	29	107	chr3	99031534	99031637	-60568146	-	MTD	LTR	MaLR	-321	98	4	7
1340	358	327	50	70	chr3	99033001	99033362	-60566421	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	367	-12	7
1340	543	276	96	78	chr3	99034994	99035265	-60564518	+	MLT1B	LTR	MaLR	113	388	-2	6
1340	338	291	73	93	chr3	99072563	99072809	-60526974	+	ORR1E	LTR	MaLR	73	313	-46	1
1340	467	315	33	65	chr3	99086949	99087224	-60512559	+	MLT1A	LTR	MaLR	76	341	-33	1
1340	317	327	11	122	chr3	99087220	99087408	-60512375	-	MLT1A	LTR	MaLR	-127	247	81	1
1341	1074	269	28	36	chr3	99144803	99145165	-60454618	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	2
1341	1452	204	116	47	chr3	99146231	99146611	-60453172	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	14	2
1341	276	247	89	11	chr3	99147314	99147404	-60452379	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-457	97	1	2
1341	476	330	149	71	chr3	99150329	99150763	-60449020	-	MLT1K	LTR	MaLR	0	610	126	2
1341	1960	161	53	17	chr3	99178680	99179040	-60420743	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	2	2
1341	605	340	72	25	chr3	99186480	99186758	-60413025	+	RMER15	LTR	ERVL	271	561	-14	2
1341	403	335	82	53	chr3	99189794	99189964	-60409819	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-229	219	45	2
1341	812	350	87	22	chr3	99192111	99192523	-60407260	+	LTR16B2	LTR	ERVL	1	439	-23	2
1341	4014	55	12	62	chr3	99202006	99202525	-60397258	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1341	698	301	91	74	chr3	99202567	99202727	-60397056	+	MLT1C	LTR	MaLR	4	179	-288	2
1341	698	301	91	74	chr3	99202914	99203172	-60396611	+	MLT1C	LTR	MaLR	180	429	-38	2
1341	3197	18	0	0	chr3	99219301	99219638	-60380145	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	3
167	43297	17	9	3	chr3	99219638	99226038	-60373745	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	3
1342	2996	15	9	0	chr3	99226038	99226372	-60373411	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	3
1342	251	149	0	0	chr3	99226615	99226662	-60373121	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-347	47	1	3
1342	590	250	16	55	chr3	99229171	99229353	-60370430	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-64	499	325	3
1342	1404	203	94	17	chr3	99239904	99240264	-60359519	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-174	389	2	3
1342	269	269	78	78	chr3	99243550	99243691	-60356092	+	MLT1A	LTR	MaLR	217	357	-17	3
1342	2397	166	14	12	chr3	99256758	99257174	-60342609	+	MTC	LTR	MaLR	3	419	-2	3
1342	1163	262	75	29	chr3	99258848	99259076	-60340707	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	147	3
1342	2531	147	8	0	chr3	99259076	99259463	-60340320	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	394	0	3
1342	1163	262	75	29	chr3	99259463	99259580	-60340203	-	MTEa	LTR	MaLR	-233	146	18	3
1342	546	335	143	21	chr3	99264017	99264491	-60335292	+	MLT1F	LTR	MaLR	1	532	-16	3
1342	2181	208	24	20	chr3	99265520	99266031	-60333752	-	RMER5	LTR	ERV1	-9	525	13	3
1342	666	228	35	0	chr3	99267783	99267928	-60331855	-	MTE2b	LTR	MaLR	-26	353	204	3
1342	286	211	0	0	chr3	99276364	99276421	-60323362	+	MTC	LTR	MaLR	1	57	-364	3
1342	238	167	46	77	chr3	99278416	99278481	-60321302	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	3
1342	832	75	83	0	chr3	99282973	99283093	-60316690	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	278	3
1342	756	259	31	16	chr3	99283739	99283956	-60315827	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	1380	1578	-2	3
1342	650	276	454	17	chr3	99283958	99284178	-60315605	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	316	-63	3
1342	412	274	19	9	chr3	99284881	99284988	-60314795	-	RMER19C	LTR	ERVK	-34	577	470	3
1342	814	270	124	47	chr3	99286231	99286550	-60313233	-	RMER19C	LTR	ERVK	-127	484	99	3
1342	260	61	158	188	chr3	99286588	99286689	-60313094	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	0	5780	5683	3
1342	766	181	67	12	chr3	99302155	99302334	-60297449	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-199	175	1	4
1342	2187	105	227	0	chr3	99303142	99303486	-60296297	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	1	4
1342	542	201	99	19	chr3	99303486	99303629	-60296154	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2842	2686	4
1342	542	201	99	19	chr3	99303942	99303960	-60295823	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-157	2685	2668	4
1342	3962	192	98	35	chr3	99306560	99308277	-60291506	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-181	2145	286	4
1342	1243	240	60	16	chr3	99308353	99308671	-60291112	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2131	4419	4088	4
1342	9513	192	14	17	chr3	99308810	99310612	-60289171	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4670	4289	2493	4
1342	1410	120	33	4	chr3	99310612	99310855	-60288928	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-82	340	91	4
1342	2995	77	51	8	chr3	99311095	99311489	-60288294	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	4
1342	5554	63	4	14	chr3	99311489	99312209	-60287574	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1	1986	1274	4
1342	2043	92	21	21	chr3	99312364	99312654	-60287129	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-710	1277	988	4
1342	338	158	0	0	chr3	99312637	99312694	-60287089	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-6039	503	447	4
1342	566	334	30	30	chr3	99312711	99313106	-60286677	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6015	1566	1172	4
1342	1097	134	21	38	chr3	99313131	99313317	-60286466	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-995	992	810	4
1342	1370	63	6	17	chr3	99313766	99313943	-60285840	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1511	476	302	4
1342	816	111	62	0	chr3	99313943	99314087	-60285696	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	259	4
1342	2007	68	38	0	chr3	99315293	99315557	-60284226	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-137	274	1	4
1342	608	229	99	12	chr3	99319049	99319221	-60280562	-	RMER5	LTR	ERV1	-300	234	48	4
1342	226	323	16	0	chr3	99320711	99320773	-60279010	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-346	143	81	4
1342	2071	199	11	16	chr3	99322883	99323256	-60276527	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	371	-3	4
1342	692	298	77	55	chr3	99323837	99324086	-60275697	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-9	399	98	4
1342	2698	101	92	31	chr3	99324086	99324534	-60275249	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
1342	692	293	79	56	chr3	99324534	99324603	-60275180	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-268	97	31	4
1342	1626	178	72	7	chr3	99327277	99327582	-60272201	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-58	326	2	4
1342	449	283	31	42	chr3	99327606	99327798	-60271985	+	RMER15-int	LTR	ERVL	599	788	-4211	4
1342	1910	147	10	0	chr3	99327917	99328231	-60271552	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-9	317	1	4
1342	249	362	35	28	chr3	99331742	99331887	-60267896	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	263	4
1342	1490	237	22	8	chr3	99332627	99332989	-60266794	+	RMER20A	LTR	ERVK	150	516	0	4
1342	291	233	32	53	chr3	99333009	99333104	-60266679	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-313	95	3	4
1342	848	127	6	46	chr3	99338663	99338837	-60260946	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	167	-243	4
1342	1347	189	104	83	chr3	99338853	99339263	-60260520	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	421	-537	4
1342	1347	189	104	83	chr3	99339306	99339327	-60260456	+	RMER17B	LTR	ERVK	422	441	-517	4
1342	1672	248	111	42	chr3	99339336	99339832	-60259951	+	RMER13B	LTR	ERVK	272	801	-107	4
1342	1090	188	8	65	chr3	99339894	99340246	-60259537	+	RMER17C	LTR	ERVK	79	410	0	4
1342	241	221	118	20	chr3	99341902	99342054	-60257729	-	RMER10A	LTR	ERVL	-16	426	260	4
1342	402	295	89	37	chr3	99342260	99342531	-60257252	-	RMER10A	LTR	ERVL	-144	298	14	4
1342	898	352	99	57	chr3	99342559	99343317	-60256466	-	MTE-int	LTR	MaLR	-307	1273	477	4
1342	898	352	99	57	chr3	99343482	99343518	-60256265	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1104	476	445	4
1342	2078	169	12	75	chr3	99343796	99344212	-60255571	+	RMER10B	LTR	ERVL	9	398	0	4
1342	1933	111	156	36	chr3	99344375	99344740	-60255043	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	22	4
1342	1829	127	229	6	chr3	99345589	99345938	-60253845	-	RLTR23	LTR	ERV1	-3	427	1	4
1342	3105	308	44	45	chr3	99346935	99347998	-60251785	+	MTE-int	LTR	MaLR	116	1177	-403	4
1342	335	266	104	49	chr3	99348073	99348302	-60251481	+	MTEa	LTR	MaLR	133	377	-2	4
1342	1991	145	15	6	chr3	99349004	99349330	-60250453	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
1343	1333	245	56	9	chr3	99354103	99354412	-60245371	+	MTE2b	LTR	MaLR	18	336	-43	5
1343	1333	245	56	9	chr3	99354453	99354485	-60245298	+	MTE2b	LTR	MaLR	337	375	-4	5
1343	273	297	143	8	chr3	99355415	99355534	-60244249	+	LTR16C	LTR	ERVL	347	481	-8	5
1343	839	293	64	81	chr3	99355580	99355937	-60243846	-	MTD	LTR	MaLR	-68	351	1	5
1343	1433	186	97	63	chr3	99356496	99356858	-60242925	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1343	1847	88	127	4	chr3	99358213	99358488	-60241295	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	5
1343	976	225	126	11	chr3	99361169	99361480	-60238303	+	MTD	LTR	MaLR	3	365	-35	5
1343	1595	143	124	27	chr3	99361483	99361814	-60237969	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-4	363	1	5
1343	1604	320	36	26	chr3	99365181	99365797	-60233986	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3294	1705	1084	5
1343	252	382	0	0	chr3	99389738	99389814	-60209969	+	MTEa	LTR	MaLR	19	94	-285	5
1343	515	255	79	92	chr3	99389872	99390036	-60209747	+	MTEa	LTR	MaLR	206	367	-12	5
1343	420	296	34	27	chr3	99394771	99394920	-60204863	-	MER90	LTR	ERV1	-178	397	248	5
1343	1439	227	82	15	chr3	99395037	99395377	-60204406	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	8	5
1343	258	236	153	0	chr3	99395456	99395528	-60204255	-	MLT1A	LTR	MaLR	-261	113	31	5
1343	283	289	12	134	chr3	99395526	99395690	-60204093	-	MER90	LTR	ERV1	-353	222	79	5
1343	309	354	30	23	chr3	99399311	99399444	-60200339	+	RMER15	LTR	ERVL	352	485	-90	5
1343	3079	55	8	5	chr3	99404117	99404504	-60195279	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	5
1343	1226	56	6	0	chr3	99404506	99404667	-60195116	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	162	-7419	5
1343	539	159	54	102	chr3	99404667	99404814	-60194969	+	RLTR10A	LTR	ERVK	272	411	0	5
1343	346	340	91	26	chr3	99424265	99424419	-60175364	+	MLT1G1	LTR	MaLR	100	263	-316	6
1343	990	281	164	22	chr3	99428948	99429350	-60170433	+	RLTR16	LTR	ERVK	5	463	-42	6
1343	1112	279	99	28	chr3	99429462	99429816	-60169967	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	6
1343	1945	242	27	68	chr3	99430035	99430672	-60169111	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1343	498	370	15	0	chr3	99430958	99431158	-60168625	+	MLT2B1	LTR	ERVL	3	205	-315	6
1343	826	287	14	0	chr3	99433448	99433657	-60166126	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	168	6
1343	251	205	29	59	chr3	99434018	99434118	-60165665	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-8	619	524	6
1343	513	294	54	87	chr3	99434119	99434361	-60165422	-	MLT1D	LTR	MaLR	-271	234	1	6
1343	323	331	69	98	chr3	99437100	99437304	-60162479	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-23	537	340	6
1343	313	172	125	19	chr3	99440827	99440925	-60158858	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	320	6
1343	976	266	139	3	chr3	99443386	99443703	-60156080	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	6	6
1343	246	271	200	7	chr3	99460897	99461042	-60138741	+	MTEb	LTR	MaLR	202	374	-5	6
1343	425	111	297	20	chr3	99482301	99482332	-60117451	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-62	515	471	6
1343	425	111	297	20	chr3	99482434	99482502	-60117281	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-107	470	388	6
1343	1765	64	41	8	chr3	99482503	99482769	-60117014	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-976	1350	1076	6
1343	425	264	73	55	chr3	99482770	99482975	-60116808	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-204	237	20	6
1344	1685	185	40	17	chr3	99484448	99484795	-60114988	-	MT2B	LTR	ERVL	-17	584	230	6
1344	497	136	0	74	chr3	99484771	99484866	-60114917	-	MT2B	LTR	ERVL	-513	88	1	6
1344	621	263	29	140	chr3	99486221	99486516	-60113267	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-30	349	52	7
1344	333	305	25	70	chr3	99489593	99489823	-60109960	-	MLT1H	LTR	MaLR	-24	525	327	7
1344	398	230	63	56	chr3	99489914	99490057	-60109726	-	MLT1H	LTR	MaLR	-383	166	23	7
1344	1946	199	76	13	chr3	99492736	99493132	-60106651	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1344	2159	175	110	25	chr3	99502692	99503209	-60096574	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	1
1344	810	98	107	0	chr3	99503692	99503814	-60095969	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	556	1
1344	263	201	0	54	chr3	99504387	99504464	-60095319	-	MTD	LTR	MaLR	-3	418	294	1
1344	1754	222	53	3	chr3	99505559	99505915	-60093868	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	34	2
1344	656	297	57	25	chr3	99515376	99515708	-60084075	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	2
1344	1821	302	13	56	chr3	99515719	99516259	-60083524	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-9	1571	1055	2
1344	818	308	168	3	chr3	99516245	99516548	-60083235	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1225	355	3	2
1344	408	311	55	11	chr3	99516666	99516941	-60082842	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	6	2
1344	1644	171	104	23	chr3	99520913	99521297	-60078486	-	RMER10A	LTR	ERVL	-27	415	1	3
1344	2089	112	9	59	chr3	99523865	99524205	-60075578	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	323	-4	3
1344	2536	164	111	28	chr3	99525842	99526374	-60073409	+	RMER4B	LTR	ERVK	10	585	0	4
1344	366	260	104	65	chr3	99526832	99527156	-60072627	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	5	4
1344	738	249	26	52	chr3	99536062	99536253	-60063530	-	MLT1B	LTR	MaLR	-4	386	201	5
1344	2345	187	59	15	chr3	99540613	99541086	-60058697	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	12	6
1344	869	163	102	30	chr3	99541094	99541359	-60058424	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-2	2324	2041	6
1344	1752	161	29	113	chr3	99545573	99545654	-60054129	+	RMER17C	LTR	ERVK	6	86	-324	6
1344	1752	161	29	113	chr3	99545707	99545874	-60053909	+	RMER17C	LTR	ERVK	87	233	-177	6
1344	1752	161	29	113	chr3	99545895	99546087	-60053696	+	RMER17C	LTR	ERVK	234	409	-1	6
1344	1622	129	44	7	chr3	99558352	99558657	-60041126	-	RMER12B	LTR	ERVK	-233	1171	653	7
1344	404	367	120	25	chr3	99560733	99561057	-60038726	+	MLT1I	LTR	MaLR	57	411	0	8
1344	2234	157	13	51	chr3	99566770	99567160	-60032623	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	4	9
1344	527	371	55	4	chr3	99575380	99575618	-60024165	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-11	354	105	1
1344	262	315	89	32	chr3	99579575	99579765	-60020018	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-1099	251	51	1
1344	350	326	134	59	chr3	99579949	99580203	-60019580	+	LTR33	LTR	ERVL	240	512	-3	1
1344	4241	133	50	77	chr3	99584584	99585341	-60014442	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	1
1344	1965	138	35	6	chr3	99588281	99588623	-60011160	+	RLTR28	LTR	ERVL	173	524	0	1
1344	386	338	58	7	chr3	99591134	99591289	-60008494	+	MLT2D	LTR	ERVL	379	541	-19	1
1344	365	336	39	141	chr3	99596861	99597241	-60002542	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	341	-33	1
1344	1954	146	163	30	chr3	99605821	99606286	-59993497	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	1
1344	240	318	47	0	chr3	99607310	99607395	-59992388	+	RMER15	LTR	ERVL	486	574	-1	1
1344	980	193	36	27	chr3	99607800	99608024	-59991759	-	RMER15	LTR	ERVL	-328	247	22	1
1345	367	214	79	0	chr3	99630337	99630426	-59969357	-	MTD	LTR	MaLR	-60	359	264	1
1345	1211	226	85	21	chr3	99630415	99630745	-59969038	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	10	1
1345	732	310	55	112	chr3	99632406	99632845	-59966938	-	MLT2B1	LTR	ERVL	0	414	1	1
1345	1594	236	88	69	chr3	99633429	99633952	-59965831	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	29	1
1345	564	257	122	50	chr3	99634023	99634244	-59965539	+	MLT1D	LTR	MaLR	269	505	0	1
1345	2652	142	4	30	chr3	99636735	99637198	-59962585	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	451	-2	1
1345	910	300	58	29	chr3	99641739	99642086	-59957697	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	1
1345	544	332	99	12	chr3	99645103	99645435	-59954348	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	5	1
1345	2544	166	75	18	chr3	99649405	99649451	-59950332	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	488	2
1345	2544	166	75	18	chr3	99649497	99649531	-59950252	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-54	487	441	2
1345	2544	166	75	18	chr3	99649569	99649819	-59949964	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-101	440	196	2
1345	2544	166	75	18	chr3	99649864	99650039	-59949744	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-346	195	6	2
1345	950	258	58	4	chr3	99657412	99657669	-59942114	+	ORR1D2	LTR	MaLR	21	291	-79	2
1345	4364	154	51	55	chr3	99666295	99666644	-59933139	+	RMER13B	LTR	ERVK	34	388	-520	2
1345	4364	154	51	55	chr3	99666790	99667318	-59932465	+	RMER13B	LTR	ERVK	389	908	0	2
1345	566	293	79	5	chr3	99667413	99667629	-59932154	-	MLT1B	LTR	MaLR	-158	232	1	2
1345	925	229	4	106	chr3	99671232	99671451	-59928332	+	MTE2a	LTR	MaLR	15	218	-161	2
1345	925	229	4	106	chr3	99671662	99671716	-59928067	+	MTE2a	LTR	MaLR	219	260	-119	2
1345	237	253	0	62	chr3	99680738	99680818	-59918965	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	322	2
1345	811	263	81	86	chr3	99684394	99684805	-59914978	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	405	-14	2
1345	235	325	42	65	chr3	99684998	99685166	-59914617	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-263	181	18	2
1345	517	262	123	28	chr3	99690120	99690371	-59909412	-	MTD	LTR	MaLR	-144	275	1	2
1345	887	40	73	0	chr3	99695077	99695201	-59904582	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	227	2
1345	1505	72	72	0	chr3	99695393	99695614	-59904169	-	RLTR10D	LTR	ERVK	-122	237	1	2
1345	2699	184	30	24	chr3	99695614	99696244	-59903539	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	0	6542	5645	2
1345	29776	177	6	19	chr3	99696287	99701412	-59898371	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-358	6184	1125	2
1345	843	211	0	12	chr3	99701398	99701571	-59898212	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6072	470	300	2
1345	1692	166	50	18	chr3	99722616	99722959	-59876824	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	68	2
1345	386	185	12	0	chr3	99724305	99724386	-59875397	-	MTC	LTR	MaLR	-339	82	1	2
1345	2144	140	9	0	chr3	99725775	99726097	-59873686	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	2	2
1345	794	271	48	105	chr3	99726451	99726851	-59872932	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	2
1345	1072	257	48	42	chr3	99730256	99730609	-59869174	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	18	3
1346	1920	229	35	159	chr3	99750378	99751070	-59848713	-	RMER19C	LTR	ERVK	-5	606	1	3
1346	1285	231	167	0	chr3	99762762	99763121	-59836662	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1346	236	200	50	0	chr3	99765918	99765978	-59833805	+	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	114	176	-627	3
1346	683	187	79	61	chr3	99778528	99778624	-59821159	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	481	3
1346	1102	206	99	50	chr3	99778680	99779030	-59820753	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-98	480	1	3
1346	1644	212	117	70	chr3	99782577	99783123	-59816660	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	3
1346	812	201	18	18	chr3	99785882	99786049	-59813734	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	241	3
1346	1924	123	50	3	chr3	99805306	99805608	-59794175	-	RLTR14	LTR	ERV1	-49	333	18	3
1346	2500	147	34	12	chr3	99814999	99815411	-59784372	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1346	734	247	90	11	chr3	99815648	99815836	-59783947	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	216	3
1346	812	238	48	26	chr3	99815829	99816162	-59783621	+	MTD-int	LTR	MaLR	866	1241	-17	3
1346	1560	203	131	9	chr3	99816212	99816578	-59783205	+	MTD	LTR	MaLR	14	406	-13	3
1346	1717	201	68	40	chr3	99817587	99817982	-59781801	+	MTD	LTR	MaLR	2	407	-12	4
1346	1114	249	96	74	chr3	99823985	99824480	-59775303	+	RMER13A	LTR	ERVK	30	558	-350	4
1346	461	340	34	60	chr3	99841404	99841485	-59758298	-	MLT1A	LTR	MaLR	-3	371	292	4
1346	3306	73	2	2	chr3	99841485	99841881	-59757902	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1346	461	340	34	60	chr3	99841881	99842068	-59757715	-	MLT1A	LTR	MaLR	-83	291	111	4
1346	344	205	12	37	chr3	99847828	99847909	-59751874	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-10	368	290	4
1346	4035	225	94	18	chr3	99847907	99848179	-59751604	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-65	1305	1000	4
1346	4035	225	94	18	chr3	99848214	99849021	-59750762	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-371	999	143	4
1346	1064	304	65	49	chr3	99855239	99855609	-59744174	-	MER21B	LTR	ERV1	-487	376	1	4
1346	692	314	75	32	chr3	99865152	99865500	-59734283	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	3	4
1347	601	276	64	6	chr3	99877861	99878032	-59721751	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-166	199	19	4
1347	621	301	99	60	chr3	99878575	99878939	-59720844	+	MTEa	LTR	MaLR	1	378	-1	4
1347	1691	169	91	3	chr3	99882009	99882318	-59717465	+	ORR1B2	LTR	MaLR	32	367	0	4
1347	1959	176	21	38	chr3	99884186	99884559	-59715224	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1347	799	295	89	14	chr3	99891054	99891412	-59708371	+	MTD	LTR	MaLR	1	385	-34	5
1347	287	258	0	110	chr3	99891475	99891575	-59708208	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	152	5
1347	756	252	178	31	chr3	99892884	99893293	-59706490	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	803	5
1347	688	219	130	110	chr3	99893326	99893479	-59706304	-	RMER12	LTR	ERVK	-540	1308	1165	5
1347	1102	249	79	134	chr3	99893623	99893871	-59705912	-	RMER12	LTR	ERVK	-1110	738	561	5
1347	3838	146	57	84	chr3	99894561	99895490	-59704293	+	RMER17A2	LTR	ERVK	3	906	0	5
1347	1182	232	61	66	chr3	99895914	99896446	-59703337	-	RMER12	LTR	ERVK	-1288	560	1	5
1347	257	346	75	21	chr3	99900282	99900468	-59699315	-	MER34A	LTR	ERV1	0	571	376	5
1347	1965	114	61	61	chr3	99904548	99904875	-59694908	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1347	235	303	103	90	chr3	99911344	99911500	-59688283	-	RLTR42	LTR	ERVK	-19	220	63	5
1347	1721	184	113	11	chr3	99913759	99914139	-59685644	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1347	379	267	64	70	chr3	99916427	99916584	-59683199	+	MTEb	LTR	MaLR	224	379	0	5
1347	1834	252	57	11	chr3	99917195	99917720	-59682063	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	27	5
1347	3098	128	6	15	chr3	99919643	99920165	-59679618	+	RLTR28	LTR	ERVL	3	519	-5	5
1347	1023	216	201	27	chr3	99928595	99928928	-59670855	-	RMER17B	LTR	ERVK	-1	957	567	5
1347	435	277	23	0	chr3	99936740	99936870	-59662913	-	ORR1E	LTR	MaLR	-226	133	1	5
1347	1844	181	69	11	chr3	99947861	99948208	-59651575	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1347	249	211	17	34	chr3	99949126	99949185	-59650598	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-531	572	515	5
1347	1420	187	146	151	chr3	99959516	99960052	-59639731	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	5
1347	237	220	0	0	chr3	99975184	99975234	-59624549	+	MTC	LTR	MaLR	33	82	-339	6
1347	911	157	17	39	chr3	99975526	99975705	-59624078	+	MTC	LTR	MaLR	65	239	-182	6
1347	226	280	84	46	chr3	99980503	99980634	-59619149	-	MLT1A	LTR	MaLR	-4	386	251	6
1347	275	325	68	57	chr3	99980650	99980826	-59618957	-	MLT1A	LTR	MaLR	-196	178	1	6
1347	276	351	26	32	chr3	99987402	99987558	-59612225	-	MER74B	LTR	ERVL	-408	214	60	6
1348	685	255	46	20	chr3	100015545	100015741	-59584042	-	MTE2a	LTR	MaLR	-12	367	167	1
1348	461	309	73	55	chr3	100018179	100018453	-59581330	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-97	351	73	1
1348	3249	47	7	33	chr3	100019006	100019428	-59580355	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	2
1348	1131	238	185	32	chr3	100020483	100020590	-59579193	-	RLTR26	LTR	ERVK	-5	637	523	2
1348	1131	238	185	32	chr3	100020640	100021062	-59578721	-	RLTR26	LTR	ERVK	-120	522	27	2
1348	307	282	15	46	chr3	100023896	100024026	-59575757	+	RMER5	LTR	ERV1	402	527	-7	3
1348	1040	174	51	5	chr3	100034035	100034232	-59565551	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	216	5
1348	3497	20	8	0	chr3	100036387	100036780	-59563003	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1348	9409	31	4	10	chr3	100036780	100037885	-59561898	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
1348	3566	18	2	0	chr3	100037885	100038280	-59561503	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1348	359	397	37	47	chr3	100039773	100040095	-59559688	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-176	355	37	5
1348	378	249	386	0	chr3	100040332	100040514	-59559269	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	128	5
1348	275	284	53	0	chr3	100041078	100041173	-59558610	-	MTE2b	LTR	MaLR	-277	102	3	5
1348	1055	135	16	5	chr3	100041587	100041773	-59558010	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	503	6
1348	706	288	127	46	chr3	100044983	100045307	-59554476	-	ORR1E	LTR	MaLR	-9	350	1	6
1348	467	285	101	55	chr3	100045561	100045780	-59554003	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	229	-136	6
1348	2607	173	0	9	chr3	100047080	100047505	-59552278	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1348	283	423	62	7	chr3	100047829	100048105	-59551678	-	LTR16A	LTR	ERVL	-113	338	48	7
1348	238	293	53	73	chr3	100073682	100073833	-59525950	+	MLT1L	LTR	MaLR	455	602	-8	1
1348	313	301	353	31	chr3	100075472	100075699	-59524084	-	ORR1E	LTR	MaLR	-52	327	28	1
1348	967	258	58	75	chr3	100082137	100082498	-59517285	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	357	-22	1
1348	3874	143	75	7	chr3	100083081	100083752	-59516031	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	672	-6	1
1348	5227	116	41	45	chr3	100084003	100084912	-59514871	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	2	1
1348	1468	196	49	85	chr3	100084916	100085331	-59514452	-	MT2B	LTR	ERVL	-64	537	1	1
1348	1078	221	12	111	chr3	100085811	100086217	-59513566	+	MT2A	LTR	ERVL	1	529	-72	1
1348	507	170	196	9	chr3	100086257	100086364	-59513419	-	MT2A	LTR	ERVL	-245	288	162	1
1348	1228	259	96	0	chr3	100086595	100086939	-59512844	+	MTEa	LTR	MaLR	1	377	-2	1
1348	1500	306	96	61	chr3	100088217	100088937	-59510846	-	MTE-int	LTR	MaLR	-489	1091	347	1
1348	609	280	115	82	chr3	100089076	100089379	-59510404	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1229	351	39	1
1348	947	206	78	100	chr3	100091013	100091294	-59508489	+	MTEb	LTR	MaLR	87	361	-18	1
1348	3585	254	159	16	chr3	100091313	100092468	-59507315	+	MTEb-int	LTR	MaLR	6	1364	-216	1
1348	235	275	72	36	chr3	100092676	100092759	-59507024	-	RMER15	LTR	ERVL	-118	457	372	1
1348	2717	73	25	87	chr3	100098012	100098461	-59501322	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
1348	2723	210	73	45	chr3	100098468	100099354	-59500429	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-7	2835	1925	1
1348	2397	179	85	74	chr3	100099373	100100032	-59499751	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1163	1679	1014	1
1348	487	143	16	0	chr3	100100141	100100254	-59499529	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2259	583	489	1
1348	3014	70	19	0	chr3	100100661	100100870	-59498913	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	210	1
1348	3014	70	19	0	chr3	100100913	100101116	-59498667	-	BGLII	LTR	ERVK	-212	209	2	1
1348	453	157	235	0	chr3	100102095	100102197	-59497586	-	MTD	LTR	MaLR	-293	126	1	1
1348	1312	165	172	4	chr3	100106666	100106922	-59492861	+	MTC	LTR	MaLR	123	421	0	1
1348	3113	203	72	136	chr3	100106922	100107434	-59492349	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	506	-752	1
1348	3113	203	72	136	chr3	100107469	100108296	-59491487	+	MTC-int	LTR	MaLR	507	1255	-3	1
1348	2286	189	23	2	chr3	100108299	100108698	-59491085	+	MTC	LTR	MaLR	1	407	-14	1
1348	2336	155	49	0	chr3	100110260	100110648	-59489135	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	496	1
1348	1353	42	0	0	chr3	100113295	100113463	-59486320	+	LTRIS3	LTR	ERV1	345	512	0	1
1348	1048	158	73	14	chr3	100113616	100113834	-59485949	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	63	293	-3006	1
1348	1015	129	66	17	chr3	100114179	100114360	-59485423	+	RMER16-int	LTR	ERVK	142	331	-5075	1
1348	4424	149	50	22	chr3	100114341	100115080	-59484703	+	RMER16-int	LTR	ERVK	685	1444	-3962	1
1348	3582	181	86	30	chr3	100115071	100116353	-59483430	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	760	1847	-3216	1
1348	1883	63	126	0	chr3	100116333	100116603	-59483180	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1619	1922	-1377	1
1348	311	248	19	38	chr3	100116596	100116701	-59483082	+	MURVY-int	LTR	ERV1	5097	5199	-2253	1
1348	987	228	26	0	chr3	100116902	100117130	-59482653	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4788	5021	-42	1
1348	3144	88	55	7	chr3	100117131	100117546	-59482237	+	LTRIS3	LTR	ERV1	1	430	-82	1
1348	3144	88	55	7	chr3	100117595	100117635	-59482148	+	LTRIS3	LTR	ERV1	431	478	-34	1
1348	3301	181	30	3	chr3	100121883	100122546	-59477237	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1046	1726	-600	1
1348	949	270	98	59	chr3	100124992	100125344	-59474439	+	MTE2a	LTR	MaLR	46	406	-13	1
1348	398	299	160	22	chr3	100137548	100137729	-59462054	+	RMER15	LTR	ERVL	299	504	-71	2
1348	3526	174	41	41	chr3	100138095	100138785	-59460998	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	2
1349	2102	147	0	0	chr3	100140936	100141255	-59458528	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	8	2
1349	1328	253	68	3	chr3	100141964	100142301	-59457482	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	2
1349	339	273	277	6	chr3	100142765	100142931	-59456852	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	165	2
1349	358	331	60	12	chr3	100143443	100143611	-59456172	-	MTE2b	LTR	MaLR	-200	179	4	2
1349	292	281	99	14	chr3	100148173	100148314	-59451469	+	MLT-int	LTR	MaLR	46	198	-1537	2
1349	346	358	90	21	chr3	100148311	100148545	-59451238	+	MTE-int	LTR	MaLR	224	473	-1107	2
1349	545	298	88	57	chr3	100148983	100149314	-59450469	+	MTE-int	LTR	MaLR	1201	1541	-39	2
1349	348	283	62	67	chr3	100149490	100149668	-59450115	-	RMER20B	LTR	ERVK	-2	514	338	2
1349	607	244	18	37	chr3	100149782	100149948	-59449835	-	RMER20B	LTR	ERVK	-355	161	1	2
1349	1288	186	17	29	chr3	100153160	100153398	-59446385	+	MTC	LTR	MaLR	1	235	-186	2
1349	1267	135	5	5	chr3	100153507	100153701	-59446082	+	MTC	LTR	MaLR	224	417	-4	2
1349	598	312	93	77	chr3	100156318	100156880	-59442903	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-12	705	124	2
1349	1407	264	40	19	chr3	100159912	100160282	-59439501	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	1	2
1349	234	225	60	48	chr3	100160361	100160445	-59439338	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	366	282	2
1349	509	252	52	122	chr3	100171038	100171268	-59428515	-	MTE2b	LTR	MaLR	-26	353	140	2
1349	529	296	161	5	chr3	100171844	100172068	-59427715	-	MT2A	LTR	ERVL	-11	522	264	2
1349	264	185	12	36	chr3	100178151	100178235	-59421548	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-5	550	469	2
1349	1256	201	19	35	chr3	100178308	100178731	-59421052	-	MT2A	LTR	ERVL	-68	465	3	2
1349	287	321	59	59	chr3	100180629	100180798	-59418985	+	MTEb	LTR	MaLR	1	169	-210	2
1349	378	309	76	20	chr3	100180918	100181116	-59418667	-	RMER15	LTR	ERVL	-4	571	363	2
1349	820	179	61	41	chr3	100181142	100181451	-59418332	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	6	2
1349	1850	228	37	7	chr3	100184653	100185060	-59414723	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
1349	530	149	17	50	chr3	100193102	100193222	-59406561	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-94	232	117	3
1349	436	244	44	7	chr3	100193282	100193418	-59406365	+	MTC	LTR	MaLR	281	421	0	3
1349	225	286	22	56	chr3	100194387	100194476	-59405307	-	LTR33	LTR	ERVL	-366	149	64	3
1349	4504	6	6	0	chr3	100194891	100195381	-59404402	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1349	621	293	87	64	chr3	100199686	100200076	-59399707	-	MER74A	LTR	ERVL	-147	411	13	3
1349	2645	40	71	0	chr3	100209608	100209931	-59389852	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
1349	563	177	131	68	chr3	100210892	100211068	-59388715	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	341	3
1349	752	271	44	47	chr3	100211083	100211358	-59388425	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-235	292	19	3
1349	3919	145	107	63	chr3	100213532	100214385	-59385398	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	3
1349	4255	147	71	70	chr3	100218805	100219706	-59380077	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	3
1349	998	197	138	4	chr3	100220396	100220671	-59379112	+	RMER21B	LTR	ERV1	254	565	-277	3
1349	595	291	48	36	chr3	100220730	100221065	-59378718	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	341	-18	3
1349	1283	267	74	9	chr3	100236985	100237321	-59362462	-	MTD	LTR	MaLR	-44	375	18	3
1349	801	249	345	24	chr3	100237601	100237888	-59361895	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	3
1349	1583	157	27	63	chr3	100246025	100246359	-59353424	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
1349	1074	312	33	53	chr3	100249299	100249658	-59350125	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	357	-2	3
1349	367	319	162	62	chr3	100250848	100251299	-59348484	+	MLT1F2	LTR	MaLR	1	496	-64	3
1349	3896	109	99	52	chr3	100257444	100258161	-59341622	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	3
1349	340	328	102	66	chr3	100261177	100261517	-59338266	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-6	402	1	4
1349	256	341	149	74	chr3	100261593	100261606	-59338177	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	20	-339	4
1349	2612	125	23	3	chr3	100261606	100261992	-59337791	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1349	256	341	149	74	chr3	100261992	100262301	-59337482	+	ORR1E	LTR	MaLR	21	354	-5	4
1349	715	266	148	40	chr3	100265040	100265364	-59334419	-	MTE2b	LTR	MaLR	-3	376	18	4
1350	985	264	68	39	chr3	100285691	100285998	-59313785	+	MTEa	LTR	MaLR	2	317	-62	4
1350	1945	145	84	20	chr3	100297331	100297676	-59302107	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1350	495	308	223	58	chr3	100298524	100298986	-59300797	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-2	560	23	4
1350	1070	263	28	11	chr3	100300705	100300989	-59298794	-	MTE2b	LTR	MaLR	-17	362	74	4
1350	296	320	85	31	chr3	100300999	100301128	-59298655	-	LTR33	LTR	ERVL	-115	400	265	4
1350	1731	167	80	39	chr3	100301299	100301636	-59298147	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-16	351	1	4
1350	273	299	65	50	chr3	100301943	100302075	-59297708	+	MLT1A1	LTR	MaLR	11	142	-223	4
1350	690	311	125	8	chr3	100303868	100304124	-59295659	+	RMER15	LTR	ERVL	276	561	-14	4
1350	1892	139	40	6	chr3	100304317	100304638	-59295145	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	26	4
1350	2694	118	0	141	chr3	100304731	100305236	-59294547	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	434	-2	4
1350	1867	155	17	67	chr3	100308890	100309236	-59290547	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
1350	812	289	165	31	chr3	100310586	100310943	-59288840	-	MER57C2	LTR	ERV1	-18	416	12	4
1350	2074	127	136	0	chr3	100311987	100312318	-59287465	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	3	4
1350	1217	216	240	12	chr3	100312512	100312929	-59286854	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-1	514	3	4
1350	373	323	124	56	chr3	100313871	100314209	-59285574	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	1	4
1350	267	379	91	58	chr3	100316628	100316936	-59282847	-	MLT1I	LTR	MaLR	-31	380	63	4
1350	3238	139	17	28	chr3	100317802	100318335	-59281448	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	5
1350	1396	201	114	31	chr3	100327429	100327779	-59272004	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	5
1350	2360	154	31	38	chr3	100327961	100328385	-59271398	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1350	394	241	96	15	chr3	100334957	100335092	-59264691	-	MER57C2	LTR	ERV1	-59	375	230	5
1350	1984	156	39	8	chr3	100335940	100336301	-59263482	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	50	5
1350	2766	113	10	3	chr3	100341413	100341804	-59257979	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
1350	697	281	73	22	chr3	100343392	100343665	-59256118	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	327	613	-67	5
1350	246	305	31	31	chr3	100344174	100344272	-59255511	-	LTR16D1	LTR	ERVL	-2	673	576	5
1350	378	234	171	8	chr3	100349951	100350080	-59249703	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	259	5
1350	1409	211	105	99	chr3	100355646	100356279	-59243504	+	RLTR18	LTR	ERVK	7	504	-8	5
1350	726	282	160	23	chr3	100360948	100361296	-59238487	+	MTD	LTR	MaLR	1	359	-20	5
1350	900	147	13	7	chr3	100379455	100379606	-59220177	+	RLTR26	LTR	ERVK	10	161	-481	5
1350	5237	88	79	98	chr3	100382799	100383709	-59216074	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	6
1350	2476	160	115	9	chr3	100388549	100389079	-59210704	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-630	1333	748	6
1350	978	238	64	135	chr3	100389921	100390329	-59209454	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	6
1350	377	293	209	53	chr3	100391896	100392217	-59207566	+	MTE2a	LTR	MaLR	9	379	0	6
1351	278	213	5	0	chr3	100401255	100401319	-59198464	+	MLT1F	LTR	MaLR	482	547	-2	6
1351	343	282	102	24	chr3	100401852	100402019	-59197764	+	MTEa	LTR	MaLR	191	370	-9	6
1351	516	331	87	46	chr3	100405908	100406320	-59193463	-	RMER10A	LTR	ERVL	-13	429	1	6
1351	255	256	0	104	chr3	100407437	100407533	-59192250	+	RLTR25A	LTR	ERVK	522	607	-496	6
1351	1455	211	127	14	chr3	100412780	100413141	-59186642	+	RMER15	LTR	ERVL	174	575	0	6
1351	388	258	90	41	chr3	100416597	100416765	-59183018	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-7	401	201	6
1351	1011	316	79	36	chr3	100422975	100423444	-59176339	+	RMER5	LTR	ERV1	46	534	0	6
1351	1727	214	28	51	chr3	100427073	100427166	-59172617	+	MTD	LTR	MaLR	1	86	-333	6
1351	1727	214	28	51	chr3	100427359	100427694	-59172089	+	MTD	LTR	MaLR	87	419	0	6
1351	998	223	120	22	chr3	100427699	100428055	-59171728	+	MTD-int	LTR	MaLR	6	487	-771	6
1351	1626	126	171	16	chr3	100429502	100429824	-59169959	-	RMER6A	LTR	ERVK	-384	372	1	6
1351	1261	274	104	49	chr3	100438558	100439154	-59160629	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-2	614	3	6
1351	1650	177	158	14	chr3	100440316	100440682	-59159101	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	7
1351	1394	207	129	19	chr3	100441647	100442011	-59157772	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	7
1351	2037	189	271	22	chr3	100445361	100445752	-59154031	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	497	-240	7
1351	2037	189	271	22	chr3	100445787	100445985	-59153798	+	RMER19A	LTR	ERVK	498	737	0	7
1351	932	293	70	12	chr3	100450532	100450860	-59148923	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-18	347	1	7
1351	2507	140	48	8	chr3	100456724	100457121	-59142662	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	7
1351	659	273	28	65	chr3	100458865	100459112	-59140671	+	MTEa	LTR	MaLR	22	259	-120	7
1351	409	125	31	0	chr3	100464300	100464364	-59135419	+	ORR1A3	LTR	MaLR	206	271	-55	7
1351	2096	83	39	54	chr3	100464687	100464744	-59135039	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	279	7
1351	2096	83	39	54	chr3	100465006	100465280	-59134503	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-49	278	1	7
1351	335	362	14	41	chr3	100469618	100469765	-59130018	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	143	-216	7
1351	242	245	35	70	chr3	100469780	100469894	-59129889	+	ORR1E	LTR	MaLR	212	321	-49	7
1351	2647	54	15	0	chr3	100470455	100470790	-59128993	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	7	7
1351	590	231	192	4	chr3	100472822	100472997	-59126786	-	MTD	LTR	MaLR	-232	187	2	7
1351	226	222	25	111	chr3	100473344	100473425	-59126358	-	RLTR43B	LTR	ERVK	-91	284	211	7
1351	440	328	169	27	chr3	100478793	100479125	-59120658	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	7
1351	378	242	45	68	chr3	100479125	100479243	-59120540	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1	115	-1465	7
1351	1822	276	36	5	chr3	100480383	100480823	-59118960	+	MTEa-int	LTR	MaLR	117	570	-1010	7
1351	246	310	0	14	chr3	100481044	100481116	-59118667	+	MTEa-int	LTR	MaLR	563	633	-947	7
1351	3868	248	40	43	chr3	100481469	100482413	-59117370	+	MTEa-int	LTR	MaLR	614	1554	-26	7
1351	314	303	95	34	chr3	100482615	100482762	-59117021	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	156	-398	7
1351	791	298	120	18	chr3	100483108	100483410	-59116373	+	MTEa	LTR	MaLR	44	378	-1	7
1351	779	319	189	46	chr3	100492837	100493175	-59106608	+	MTE-int	LTR	MaLR	706	1092	-488	7
1351	779	319	189	46	chr3	100493387	100493635	-59106148	+	MTE-int	LTR	MaLR	1093	1382	-198	7
1351	2990	70	5	20	chr3	100493635	100494041	-59105742	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	7
1351	779	319	189	46	chr3	100494041	100494132	-59105651	+	MTE-int	LTR	MaLR	1383	1481	-99	7
1351	545	265	90	124	chr3	100500198	100500684	-59099099	+	RLTR12B	LTR	ERVK	32	486	-42	1
1351	720	260	95	38	chr3	100511239	100511555	-59088228	+	RMER15	LTR	ERVL	238	571	-4	2
1351	951	205	203	25	chr3	100513534	100513889	-59085894	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	2
1351	910	172	128	12	chr3	100520676	100520989	-59078794	+	RLTR33	LTR	ERVK	197	593	-85	4
1351	822	266	32	6	chr3	100522548	100522852	-59076931	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	358	-21	5
1351	662	199	36	175	chr3	100524799	100525073	-59074710	+	RLTR23	LTR	ERV1	2	237	-193	5
1351	997	129	0	48	chr3	100525293	100525377	-59074406	+	RLTR23	LTR	ERV1	253	328	-102	5
1351	3241	76	0	0	chr3	100525377	100525796	-59073987	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	3	5
1351	997	129	0	48	chr3	100525796	100525898	-59073885	+	RLTR23	LTR	ERV1	329	430	0	5
1351	1133	281	47	17	chr3	100526023	100526275	-59073508	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	127	6
1351	2223	121	108	124	chr3	100526275	100526728	-59073055	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	6
1351	1133	281	47	17	chr3	100526728	100526837	-59072946	-	MTEa	LTR	MaLR	-253	126	7	6
1351	2221	151	34	14	chr3	100527085	100527538	-59072245	+	RLTR1	LTR	ERV1	138	624	0	6
1351	1543	200	101	39	chr3	100528856	100529250	-59070533	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	1	6
1351	725	157	113	0	chr3	100531172	100531331	-59068452	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	177	-269	7
1352	793	257	90	26	chr3	100535805	100536073	-59063710	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	86	7
1352	467	228	8	50	chr3	100536268	100536368	-59063415	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-264	95	1	7
1352	1991	127	14	58	chr3	100543793	100544137	-59055646	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	9
1352	1571	165	93	73	chr3	100545956	100546282	-59053501	+	RMER10B	LTR	ERVL	3	347	-51	9
1352	1571	165	93	73	chr3	100546465	100546523	-59053260	+	RMER10B	LTR	ERVL	348	395	-3	9
1352	602	231	38	77	chr3	100547431	100547666	-59052117	+	RLTR12B	LTR	ERVK	46	271	-257	1
1352	1769	123	26	84	chr3	100547764	100547859	-59051924	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	74	-252	1
1352	1228	133	109	178	chr3	100547859	100548094	-59051689	-	RMER17C	LTR	ERVK	-1	409	185	1
1352	1228	133	109	178	chr3	100548249	100548452	-59051331	-	RMER17C	LTR	ERVK	-226	184	1	1
1352	1769	123	26	84	chr3	100548452	100548702	-59051081	+	ORR1A3	LTR	MaLR	75	326	0	1
1352	323	266	47	37	chr3	100548702	100548898	-59050885	+	RLTR12B	LTR	ERVK	312	501	-26	1
1352	342	263	100	42	chr3	100549651	100549908	-59049875	+	ORR1D2	LTR	MaLR	37	324	-55	1
1352	983	238	327	28	chr3	100553439	100554056	-59045727	+	MTC-int	LTR	MaLR	123	924	-334	1
1352	1028	260	70	61	chr3	100554343	100554828	-59044955	-	MT2B	LTR	ERVL	-52	549	1	1
1352	396	278	79	0	chr3	100555106	100555232	-59044551	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	136	-243	1
1352	940	313	3	19	chr3	100555171	100555533	-59044250	+	MT2A	LTR	ERVL	76	431	-102	1
1352	233	213	0	0	chr3	100555531	100555578	-59044205	+	MT2A	LTR	ERVL	343	389	-144	1
1352	2243	176	14	65	chr3	100556890	100557334	-59042449	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1352	942	211	217	49	chr3	100558547	100559036	-59040747	-	RMER4B	LTR	ERVK	-14	571	1	1
1352	260	216	65	102	chr3	100559395	100559503	-59040280	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	154	1
1352	1685	165	77	74	chr3	100561580	100561730	-59038053	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	162	-205	1
1352	1685	165	77	74	chr3	100561810	100562024	-59037759	+	ORR1B2	LTR	MaLR	163	366	-1	1
1352	747	249	154	65	chr3	100562241	100562520	-59037263	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	104	1
1352	478	286	95	39	chr3	100562560	100562844	-59036939	-	MLT1D	LTR	MaLR	-190	315	16	1
1352	594	286	136	17	chr3	100565793	100566128	-59033655	+	MTD	LTR	MaLR	9	401	-18	1
1352	3509	25	2	0	chr3	100566373	100566768	-59033015	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1352	973	269	137	23	chr3	100575636	100576052	-59023731	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	465	-55	1
1352	973	269	137	23	chr3	100576264	100576277	-59023506	+	MLT2B1	LTR	ERVL	466	478	-42	1
1352	296	262	84	101	chr3	100577484	100577662	-59022121	-	MER67C	LTR	ERV1	-44	667	493	1
1352	830	191	98	5	chr3	100582603	100582795	-59016988	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	208	1
1352	830	191	98	5	chr3	100582819	100582831	-59016952	-	MTD	LTR	MaLR	-212	207	196	1
1352	707	224	88	59	chr3	100583090	100583294	-59016489	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	1	1
1352	263	308	127	8	chr3	100585525	100585643	-59014140	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	136	-223	1
1352	368	343	51	87	chr3	100585686	100586056	-59013727	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	3	1
1352	1825	171	99	0	chr3	100587887	100588220	-59011563	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	1
1352	563	295	96	14	chr3	100589170	100589264	-59010519	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	568	477	1
1352	871	251	75	16	chr3	100589311	100589667	-59010116	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-92	476	1	1
1352	2291	125	102	12	chr3	100589802	100590423	-59009360	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	1
1352	826	122	33	104	chr3	100592087	100592270	-59007513	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	170	-156	2
1352	4267	159	80	55	chr3	100592270	100593107	-59006676	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4627	858	1	2
1352	2324	106	16	0	chr3	100593107	100593428	-59006355	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
1352	510	286	109	6	chr3	100594855	100595038	-59004745	+	RMER21A	LTR	ERV1	483	684	-263	2
1352	276	235	0	56	chr3	100595054	100595126	-59004657	+	RMER21A	LTR	ERV1	651	718	-124	2
1352	1058	136	136	5	chr3	100595318	100595532	-59004251	+	MTD	LTR	MaLR	174	415	-4	2
1352	1611	180	49	140	chr3	100601429	100601900	-58997883	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	428	-2	2
1352	502	252	109	36	chr3	100603033	100603312	-58996471	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	590	-37	2
1352	423	196	11	32	chr3	100609029	100609124	-58990659	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	318	2
1352	531	344	110	28	chr3	100612582	100612872	-58986911	-	LTR16A	LTR	ERVL	-137	314	1	2
1352	298	333	12	0	chr3	100615442	100615526	-58984257	-	MTEa	LTR	MaLR	-14	365	281	2
1352	410	237	109	42	chr3	100615751	100615870	-58983913	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-279	129	3	2
1352	396	304	115	31	chr3	100616135	100616408	-58983375	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	199	2
1352	1566	156	166	0	chr3	100617976	100618284	-58981499	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	2
1352	2336	78	0	72	chr3	100619620	100619965	-58979818	+	ORR1A2	LTR	MaLR	8	327	0	2
1352	236	246	43	0	chr3	100620548	100620617	-58979166	-	MLT1I	LTR	MaLR	-13	398	327	2
1352	361	272	149	39	chr3	100620908	100621135	-58978648	-	MLT1A	LTR	MaLR	-7	460	116	2
1352	438	299	63	106	chr3	100621319	100621622	-58978161	+	MLT1B	LTR	MaLR	21	310	-80	2
1352	1425	213	94	9	chr3	100622522	100622863	-58976920	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	2
1352	330	316	40	153	chr3	100622981	100623328	-58976455	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	308	-51	2
1352	305	289	111	82	chr3	100623661	100623868	-58975915	-	MLT1H2	LTR	MaLR	0	489	277	2
1352	633	343	123	9	chr3	100626099	100626322	-58973461	+	MLT1B	LTR	MaLR	11	261	-129	2
1352	633	343	123	9	chr3	100626351	100626468	-58973315	+	MLT1B	LTR	MaLR	262	389	-1	2
1352	287	284	49	86	chr3	100626849	100627011	-58972772	+	LTR48B	LTR	ERV1	489	644	0	2
1352	1683	213	88	5	chr3	100633788	100634165	-58965618	+	MTD	LTR	MaLR	12	419	0	2
1352	452	280	18	18	chr3	100640444	100640553	-58959230	-	MTEb	LTR	MaLR	-11	368	260	2
1352	805	203	142	79	chr3	100640673	100640940	-58958843	-	MTEb	LTR	MaLR	-95	284	1	2
1352	330	287	0	11	chr3	100642628	100642716	-58957067	-	ORR1E	LTR	MaLR	-270	89	3	2
1352	1670	132	119	14	chr3	100649743	100650036	-58949747	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	6	3
1352	2114	133	9	0	chr3	100651401	100651717	-58948066	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-10	319	1	3
1352	324	377	70	31	chr3	100652809	100653036	-58946747	-	LTR78	LTR	ERV1	-1068	236	1	3
1352	2142	142	110	5	chr3	100655079	100655460	-58944323	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1353	1108	301	37	9	chr3	100664831	100665156	-58934627	-	MTE2b	LTR	MaLR	-40	339	6	3
1353	1931	139	108	32	chr3	100668130	100668508	-58931275	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	3
1353	3256	53	8	2	chr3	100668822	100669220	-58930563	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1353	1072	267	123	14	chr3	100669254	100669603	-58930180	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	18	3
1353	295	288	27	58	chr3	100670050	100670215	-58929568	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	225	3
1353	348	192	260	0	chr3	100670471	100670575	-58929208	-	MLT1C	LTR	MaLR	-283	184	54	3
1353	4593	108	191	4	chr3	100671505	100672311	-58927472	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	2	3
1353	3005	176	45	5	chr3	100674269	100674867	-58924916	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-887	622	1	3
1353	384	106	0	15	chr3	100674869	100674936	-58924847	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	311	3
1353	1028	162	11	0	chr3	100674928	100675113	-58924670	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-191	187	1	3
1353	479	267	70	41	chr3	100683433	100683605	-58916178	+	MTD	LTR	MaLR	18	196	-204	3
1353	526	262	28	0	chr3	100684310	100684455	-58915328	+	MTD	LTR	MaLR	241	389	-30	3
1353	1080	203	63	225	chr3	100690624	100691082	-58908701	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
1353	2114	141	11	14	chr3	100694808	100695168	-58904615	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1353	391	269	48	14	chr3	100707026	100707088	-58892695	-	MLT1B	LTR	MaLR	-219	171	109	4
1353	391	269	48	14	chr3	100707304	100707388	-58892395	-	MLT1B	LTR	MaLR	-282	108	21	4
1353	228	237	34	0	chr3	100721463	100721518	-58878265	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	419	363	4
1353	628	234	53	61	chr3	100721765	100722078	-58877705	-	ORR1E	LTR	MaLR	-75	309	4	4
1353	266	291	25	12	chr3	100732811	100732891	-58866892	-	MTE2b	LTR	MaLR	-17	362	282	4
1353	1016	169	301	19	chr3	100739463	100739788	-58859995	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	4
1353	739	307	136	12	chr3	100761083	100761406	-58838377	+	MER68	LTR	ERVL	146	508	-55	5
1353	2181	126	129	15	chr3	100775101	100775152	-58824631	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	60	-525	5
1353	2181	141	119	39	chr3	100775175	100775610	-58824173	+	RMER4B	LTR	ERVK	60	456	-10	5
1353	271	238	244	8	chr3	100784325	100784448	-58815335	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	152	-222	5
1353	449	272	101	48	chr3	100784962	100785151	-58814632	+	MLT1A0	LTR	MaLR	167	365	0	5
1353	779	285	52	163	chr3	100786691	100786834	-58812949	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	148	-367	5
1353	779	285	52	163	chr3	100787045	100787479	-58812304	+	MLT2B2	LTR	ERVL	149	514	-1	5
1353	945	251	87	56	chr3	100788653	100789008	-58810775	-	RLTR14	LTR	ERV1	-3	379	14	5
1353	289	358	59	47	chr3	100792624	100792794	-58806989	+	LTR88b	LTR	Gypsy?	666	837	0	5
1353	338	221	14	14	chr3	100793868	100793894	-58805889	-	MTD	LTR	MaLR	-3	356	331	5
1353	1367	253	110	21	chr3	100793927	100794280	-58805503	-	MTD	LTR	MaLR	-32	387	1	5
1354	225	283	10	71	chr3	100795515	100795528	-58804255	+	RLTR25A	LTR	ERVK	522	612	-491	5
1354	348	259	146	80	chr3	100796605	100796756	-58803027	-	MT2B	LTR	ERVL	-262	339	179	5
1354	376	314	42	21	chr3	100800661	100800804	-58798979	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	149	-210	5
1354	1658	212	31	14	chr3	100801147	100801505	-58798278	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	367	-3	6
1354	1004	287	86	4	chr3	100804950	100805219	-58794564	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	291	-88	6
1354	229	305	100	120	chr3	100806588	100806897	-58792886	+	ORR1D1	LTR	MaLR	25	327	-47	6
1354	246	230	65	54	chr3	100808968	100809060	-58790723	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	283	6
1354	383	278	162	22	chr3	100809054	100809190	-58790593	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-674	906	752	6
1354	1430	303	132	51	chr3	100809395	100810041	-58789742	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-882	698	1	6
1354	598	343	31	92	chr3	100810035	100810051	-58789732	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	355	6
1354	598	343	31	92	chr3	100810089	100810454	-58789329	-	MTEa	LTR	MaLR	-25	354	12	6
1354	225	323	29	29	chr3	100810851	100810953	-58788830	+	LTR50	LTR	ERVL	148	249	-546	6
1354	2327	104	82	11	chr3	100814799	100815171	-58784612	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	6
1354	1481	246	72	25	chr3	100829044	100829444	-58770339	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1354	448	298	476	9	chr3	100830427	100830654	-58769129	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-75	333	1	6
1354	272	270	33	33	chr3	100836026	100836118	-58763665	-	MLT1H	LTR	MaLR	0	549	458	6
1354	468	195	29	79	chr3	100836239	100836378	-58763405	+	RMER15	LTR	ERVL	28	159	-416	6
1354	957	210	79	56	chr3	100836377	100836568	-58763215	+	RMER15	LTR	ERVL	275	475	-100	6
1354	957	210	79	56	chr3	100836737	100836796	-58762987	+	RMER15	LTR	ERVL	476	531	-44	6
1354	1380	189	269	3	chr3	100837642	100837965	-58761818	+	MTD	LTR	MaLR	1	409	-10	6
1354	912	223	140	102	chr3	100842483	100842895	-58756888	+	MT2B	LTR	ERVL	1	544	-57	6
1354	912	261	95	27	chr3	100842927	100842964	-58756819	+	MT2B	LTR	ERVL	545	593	-8	6
1354	3126	40	50	5	chr3	100843350	100843729	-58756054	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1354	309	255	139	69	chr3	100848457	100848558	-58751225	+	RMER15	LTR	ERVL	454	561	-14	6
1354	2233	165	39	24	chr3	100853488	100853903	-58745880	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1354	1149	270	106	17	chr3	100885472	100885879	-58713904	+	MLT1C	LTR	MaLR	16	458	-9	7
1354	2930	12	0	0	chr3	100889062	100889384	-58710399	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
1354	292	325	38	50	chr3	100892210	100892369	-58707414	+	RMER4B	LTR	ERVK	14	170	-415	7
1354	379	316	150	59	chr3	100897395	100897715	-58702068	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	349	-10	7
1354	613	311	74	37	chr3	100898904	100899201	-58700582	+	LTR33C	LTR	ERVL	17	324	-305	7
1354	515	303	116	17	chr3	100899240	100899421	-58700362	+	LTR33C	LTR	ERVL	424	622	-7	7
1354	502	290	121	59	chr3	100910374	100910736	-58689047	+	MLT1J1	LTR	MaLR	27	399	-49	7
1354	1285	194	10	165	chr3	100922183	100922584	-58677199	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	339	-39	7
1354	371	127	0	0	chr3	100925131	100925186	-58674597	+	ORR1C1	LTR	MaLR	330	384	0	7
1355	2924	60	68	0	chr3	100926859	100927240	-58672543	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	7
1355	413	318	21	77	chr3	100927341	100927535	-58672248	+	MLT1L	LTR	MaLR	99	281	-329	7
1355	473	318	50	41	chr3	100930177	100930397	-58669386	+	RMER15	LTR	ERVL	347	568	-7	8
1355	2367	153	5	5	chr3	100931560	100931927	-58667856	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	8
1355	651	328	61	20	chr3	100936935	100937231	-58662552	-	ORR1E	LTR	MaLR	-51	308	1	8
1355	931	262	104	48	chr3	100943177	100943513	-58656270	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	358	-1	8
1355	540	260	51	33	chr3	100944143	100944358	-58655425	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-355	224	6	8
1355	228	167	111	0	chr3	100951589	100951643	-58648140	+	MLT1J	LTR	MaLR	391	450	-62	8
1355	768	367	40	25	chr3	100952023	100952470	-58647313	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	480	933	-454	8
1355	350	184	92	0	chr3	100952669	100952748	-58647035	+	MLT1A0	LTR	MaLR	2	88	-320	8
1355	252	312	88	27	chr3	100953007	100953155	-58646628	-	MLT1F	LTR	MaLR	-51	497	341	8
1355	439	306	7	27	chr3	100953180	100953328	-58646455	+	MLT1A0	LTR	MaLR	218	362	-3	8
1355	246	296	10	39	chr3	100953736	100953838	-58645945	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	1288	1386	-1	8
1355	2952	124	29	2	chr3	100955774	100956227	-58643556	-	RMER4A	LTR	ERVK	-1	465	1	8
1355	1047	218	161	33	chr3	100956844	100956988	-58642795	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	210	8
1355	1047	218	161	33	chr3	100957117	100957308	-58642475	-	MTEa	LTR	MaLR	-170	209	1	8
1355	1127	214	68	17	chr3	100957308	100957603	-58642180	-	MTEa-int	LTR	MaLR	0	1580	1271	8
1355	2012	294	74	41	chr3	100957809	100958596	-58641187	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-308	1272	460	8
1355	1082	219	83	0	chr3	100958690	100958955	-58640828	+	MTD	LTR	MaLR	130	416	-3	8
1355	1714	155	209	3	chr3	100958977	100959326	-58640457	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	8
1355	600	322	70	37	chr3	100959850	100960253	-58639530	-	RMER5	LTR	ERV1	-71	463	48	8
1355	2063	148	123	5	chr3	100964009	100964382	-58635401	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	1	8
1355	322	323	23	30	chr3	100966279	100966410	-58633373	+	MLT1N2	LTR	MaLR	433	562	0	8
1355	350	280	184	0	chr3	100969111	100969236	-58630547	-	MTD	LTR	MaLR	-36	383	236	8
1355	337	301	121	6	chr3	100969369	100969526	-58630257	+	LTR16A	LTR	ERVL	210	384	-67	8
1355	277	298	43	74	chr3	100969862	100970025	-58629758	+	LTR48	LTR	ERV1	2	159	-628	8
1355	2346	166	57	84	chr3	100971742	100972340	-58627443	-	RLTR18	LTR	ERVK	-2	614	33	8
1355	1099	231	43	143	chr3	100976505	100976760	-58623023	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	157	8
1355	1099	231	43	143	chr3	100976902	100977045	-58622738	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-214	156	8	8
1355	1664	179	197	111	chr3	100981392	100981810	-58617973	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	343	8
1355	1664	179	197	111	chr3	100981871	100982112	-58617671	-	RMER6D	LTR	ERVK	-378	342	4	8
1355	1153	257	68	40	chr3	100986575	100986683	-58613100	+	MTEa	LTR	MaLR	18	120	-259	9
1355	2130	118	38	0	chr3	100986683	100986998	-58612785	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	9
1355	1153	257	68	40	chr3	100986998	100987241	-58612542	+	MTEa	LTR	MaLR	121	379	0	9
1355	1186	269	39	9	chr3	100987250	100987584	-58612199	+	MTEa-int	LTR	MaLR	10	353	-1227	9
1355	980	251	99	23	chr3	100987575	100987917	-58611866	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1209	1576	-4	9
1355	346	286	0	0	chr3	100987924	100988001	-58611782	+	MTEa	LTR	MaLR	4	80	-299	9
1355	1432	156	29	18	chr3	100988087	100988270	-58611513	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	183	-191	9
1355	1432	156	29	18	chr3	100988332	100988421	-58611362	+	ORR1D1	LTR	MaLR	184	276	-98	9
1355	2132	178	26	21	chr3	100988421	100988639	-58611144	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	205	9
1355	3237	152	68	54	chr3	100988639	100989320	-58610463	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	9
1355	2132	178	26	21	chr3	100989320	100989520	-58610263	-	MTC	LTR	MaLR	-217	204	1	9
1355	412	231	9	9	chr3	100989520	100989621	-58610162	+	ORR1D1	LTR	MaLR	272	372	-2	9
1355	244	295	159	33	chr3	100989978	100990160	-58609623	-	LTR41B	LTR	ERVL	-553	205	1	9
1355	331	325	95	35	chr3	100990703	100991050	-58608733	+	MLT1F	LTR	MaLR	5	375	-220	9
1355	342	326	81	18	chr3	100991020	100991242	-58608541	+	MLT1F	LTR	MaLR	288	523	-25	9
1355	1536	221	88	8	chr3	100991733	100992117	-58607666	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	9
1355	1494	240	27	5	chr3	100992970	100993339	-58606444	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	1	9
1355	313	286	33	77	chr3	100994428	100994609	-58605174	-	LTR48	LTR	ERV1	-62	725	553	9
1355	630	224	22	7	chr3	100994609	100994744	-58605039	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	137	-222	9
1355	354	291	170	5	chr3	100994790	100995014	-58604769	-	LTR48	LTR	ERV1	-510	277	17	9
1355	312	339	109	76	chr3	100995032	100995389	-58604394	+	MLT1J2	LTR	MaLR	67	435	-13	9
1355	711	282	109	13	chr3	100995767	100996080	-58603703	+	MER34A1	LTR	ERV1	1	343	-244	9
1355	252	308	34	8	chr3	100997695	100997813	-58601970	+	MLT1A1	LTR	MaLR	286	406	-2	9
1355	682	234	67	10	chr3	100997813	100998002	-58601781	+	MER34A1	LTR	ERV1	388	587	0	9
1355	1622	142	119	62	chr3	101000455	101000638	-58599145	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	188	-186	3
1355	1622	142	119	62	chr3	101000694	101000862	-58598921	+	ORR1D1	LTR	MaLR	189	374	0	3
1355	456	284	94	102	chr3	101002763	101003124	-58596659	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	358	-7	1
1355	282	316	10	20	chr3	101007330	101007430	-58592353	-	ORR1E	LTR	MaLR	-42	317	219	2
1355	7663	66	23	8	chr3	101009172	101009823	-58589960	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	661	-362	2
1355	7663	66	23	8	chr3	101009857	101010206	-58589577	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	662	1014	-9	2
1355	227	254	0	69	chr3	101010271	101010343	-58589440	+	LTR33A	LTR	ERVL	62	128	-392	3
1355	397	197	26	0	chr3	101010280	101010356	-58589427	+	MLT1J	LTR	MaLR	100	177	-335	3
1355	344	299	83	72	chr3	101012584	101012836	-58586947	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	122	3
1355	603	329	109	37	chr3	101014074	101014396	-58585387	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	11	4
1355	293	224	17	0	chr3	101015458	101015516	-58584267	-	MTEb	LTR	MaLR	-315	64	6	3
1355	1188	226	84	42	chr3	101018921	101019276	-58580507	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
1355	249	293	78	26	chr3	101019329	101019406	-58580377	+	MT2B2	LTR	ERVL	161	241	-343	5
1355	405	279	20	9	chr3	101021403	101021528	-58578255	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-215	150	25	5
1355	2186	148	20	8	chr3	101021528	101021882	-58577901	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	359	-8	6
1355	334	288	57	9	chr3	101022493	101022598	-58577185	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	110	-255	6
1355	795	285	61	25	chr3	101022767	101023044	-58576739	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	75	6
1355	1349	160	87	142	chr3	101024815	101025173	-58574610	+	ORR1C2	LTR	MaLR	33	370	-14	6
1355	1914	150	59	0	chr3	101027154	101027474	-58572309	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	83	7
1355	358	214	95	0	chr3	101027521	101027605	-58572178	-	MTC	LTR	MaLR	-324	97	6	7
1355	1961	109	38	88	chr3	101028131	101028504	-58571279	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	7
1355	1036	200	184	49	chr3	101029976	101030302	-58569481	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	8
1355	2571	168	13	108	chr3	101041790	101042153	-58557630	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	327	-185	1
1355	2571	168	13	108	chr3	101042341	101042523	-58557260	+	RLTR18B	LTR	ERVK	328	494	-18	1
1355	631	359	87	62	chr3	101043251	101043667	-58556116	+	LTR16D1	LTR	ERVL	12	437	-238	1
1355	267	345	97	66	chr3	101044664	101045045	-58554738	+	LTR79	LTR	ERVL	84	476	-51	1
1355	600	245	29	0	chr3	101047003	101047142	-58552641	+	MLT1N2	LTR	MaLR	419	561	-1	1
1355	6527	62	5	26	chr3	101047750	101048590	-58551193	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	1
1355	384	289	118	52	chr3	101050561	101050773	-58549010	+	MER34	LTR	ERV1	334	571	0	1
1355	232	221	76	119	chr3	101050810	101050928	-58548855	-	MER34A1	LTR	ERV1	-396	191	79	1
1355	2094	156	8	6	chr3	101054788	101055142	-58544641	+	RLTR15	LTR	ERVK	5	359	0	1
1355	1006	219	186	18	chr3	101056112	101056391	-58543392	+	MTD	LTR	MaLR	1	326	-93	1
1356	1246	221	103	10	chr3	101057339	101057696	-58542087	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	1
1356	447	297	59	26	chr3	101057738	101057890	-58541893	+	MLT1B	LTR	MaLR	234	390	0	1
1356	365	224	184	72	chr3	101058531	101058656	-58541127	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	270	1
1356	2355	87	15	58	chr3	101058698	101059040	-58540743	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1356	1309	213	11	37	chr3	101061023	101061467	-58538316	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	16	1
1356	1029	245	156	25	chr3	101062907	101063233	-58536550	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	376	-3	1
1356	699	307	82	7	chr3	101063732	101064047	-58535736	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	359	0	1
1356	384	233	18	80	chr3	101071250	101071362	-58528421	+	MT2B	LTR	ERVL	153	257	-344	1
1356	1491	101	332	28	chr3	101072208	101072350	-58527433	-	RLTR44E	LTR	ERVK	-28	424	237	1
1356	1491	101	332	28	chr3	101072377	101072559	-58527224	-	RLTR44E	LTR	ERVK	-216	236	3	1
1356	246	235	57	29	chr3	101074225	101074295	-58525488	-	MT2B2	LTR	ERVL	-352	232	161	1
1356	1894	171	76	3	chr3	101074459	101074800	-58524983	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	366	-8	1
1356	1106	163	34	15	chr3	101075813	101076018	-58523765	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-4	380	172	1
1356	987	144	40	0	chr3	101076170	101076343	-58523440	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-194	180	1	1
1356	699	336	35	12	chr3	101076343	101076686	-58523097	+	RMER15-int	LTR	ERVL	311	661	-4338	1
1356	713	272	45	31	chr3	101077638	101077862	-58521921	+	RMER15	LTR	ERVL	336	562	-13	1
1356	343	262	100	60	chr3	101085929	101086079	-58513704	+	MLT1F2	LTR	MaLR	130	285	-275	2
1356	876	197	84	74	chr3	101092253	101092580	-58507203	+	ORR1D1	LTR	MaLR	87	384	0	2
1356	362	252	79	43	chr3	101094473	101094660	-58505123	-	RMER4B	LTR	ERVK	-35	550	319	2
1356	515	30	0	15	chr3	101094660	101094728	-58505055	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	67	-323	2
1356	395	42	0	0	chr3	101094719	101094767	-58505016	+	RLTR10	LTR	ERVK	343	390	0	2
1356	915	201	162	18	chr3	101094767	101094816	-58504967	-	RMER4B	LTR	ERVK	-261	324	268	2
1356	915	201	162	18	chr3	101094875	101095108	-58504675	-	RMER4B	LTR	ERVK	-318	267	3	2
1356	388	294	15	118	chr3	101095305	101095509	-58504274	-	MER34A1	LTR	ERV1	-404	183	1	2
1356	326	319	152	61	chr3	101101247	101101577	-58498206	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-168	387	28	2
1356	998	311	112	26	chr3	101105957	101106254	-58493529	+	RMER5	LTR	ERV1	41	364	-170	2
1356	998	311	112	26	chr3	101106274	101106431	-58493352	+	RMER5	LTR	ERV1	365	533	-1	2
1356	552	282	84	115	chr3	101108140	101108497	-58491286	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	347	-12	2
1356	1191	251	101	11	chr3	101109650	101109997	-58489786	+	MTEb	LTR	MaLR	1	378	-1	2
1356	279	266	31	0	chr3	101113494	101113558	-58486225	-	MLT1J	LTR	MaLR	-3	559	494	2
1356	616	267	78	70	chr3	101115712	101115970	-58483813	-	MLT1J	LTR	MaLR	-23	489	230	2
1356	1480	156	70	11	chr3	101117909	101118182	-58481601	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	245	2
1356	2524	176	146	50	chr3	101118196	101118751	-58481032	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	608	-3	2
1356	1054	176	26	5	chr3	101118751	101118922	-58480861	-	MT2A	LTR	ERVL	-358	175	1	2
1356	3025	76	15	0	chr3	101119446	101119840	-58479943	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1356	231	325	24	48	chr3	101120039	101120123	-58479660	+	MTEa	LTR	MaLR	11	92	-287	2
1356	227	310	125	46	chr3	101123909	101124061	-58475722	-	MLT1I	LTR	MaLR	-39	372	209	2
1356	901	219	82	58	chr3	101127722	101128013	-58471770	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	298	-144	2
1356	243	195	122	92	chr3	101128085	101128249	-58471534	+	RMER10A	LTR	ERVL	257	425	-17	2
1356	2394	81	3	58	chr3	101129200	101129543	-58470240	+	ORR1A2	LTR	MaLR	4	327	0	2
1356	254	319	106	46	chr3	101131068	101131219	-58468564	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-125	245	86	2
1356	2402	117	34	3	chr3	101131521	101131873	-58467910	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-4	363	1	2
1356	1427	179	125	32	chr3	101132697	101133118	-58466665	+	MT2A	LTR	ERVL	1	553	-48	2
1356	2455	148	19	37	chr3	101133429	101133858	-58465925	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1356	4877	121	88	18	chr3	101136211	101137043	-58462740	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	2
1356	357	269	86	86	chr3	101137492	101137655	-58462128	+	MLT1A1	LTR	MaLR	6	168	-240	3
1356	1819	196	30	68	chr3	101139913	101140340	-58459443	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	5	3
1356	375	305	132	54	chr3	101146151	101146484	-58453299	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	3
1356	263	319	95	15	chr3	101147032	101147169	-58452614	+	MLT1M	LTR	MaLR	37	184	-488	3
1356	234	298	19	160	chr3	101150214	101150370	-58449413	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	137	-222	3
1356	271	304	94	37	chr3	101152073	101152264	-58447519	+	MLT1L	LTR	MaLR	396	597	-13	3
1356	1303	213	84	60	chr3	101152453	101152823	-58446960	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	3
1356	2127	158	14	17	chr3	101157459	101157819	-58441964	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	3
1356	252	226	32	0	chr3	101159705	101159767	-58440016	+	MER57A-int	LTR	ERV1	5805	5868	-319	3
1356	321	372	128	20	chr3	101162412	101162599	-58437184	-	MLT1L	LTR	MaLR	-340	270	63	3
1356	1852	160	46	59	chr3	101162599	101162970	-58436813	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	366	-8	3
1356	1520	243	60	8	chr3	101164712	101165065	-58434718	-	MTEb	LTR	MaLR	-8	371	1	3
1356	1996	130	108	3	chr3	101165772	101166104	-58433679	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	3
1356	1545	137	4	4	chr3	101166788	101167016	-58432767	-	RMER19B	LTR	ERVK	-674	228	1	3
1356	764	267	154	9	chr3	101167403	101167728	-58432055	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	6	3
1356	492	292	134	71	chr3	101168423	101168692	-58431091	+	LTR48	LTR	ERV1	16	301	-486	3
1356	502	282	21	42	chr3	101168792	101168981	-58430802	+	LTR48	LTR	ERV1	603	787	0	3
1356	1053	240	86	53	chr3	101169004	101169296	-58430487	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	78	3
1356	249	143	232	0	chr3	101169468	101169524	-58430259	-	MTE2b	LTR	MaLR	-298	81	13	3
1356	3121	46	5	8	chr3	101173850	101174247	-58425536	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1356	2225	108	186	119	chr3	101174490	101175038	-58424745	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	3
1356	266	301	71	58	chr3	101175308	101175463	-58424320	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-209	199	43	3
1356	271	339	71	54	chr3	101185896	101186080	-58413703	-	ORR1E	LTR	MaLR	-172	187	1	4
1356	702	276	128	62	chr3	101186364	101186716	-58413067	-	MLT1J	LTR	MaLR	-137	375	1	4
1357	364	340	151	44	chr3	101197546	101197817	-58401966	+	MLT1L	LTR	MaLR	6	305	-305	4
1357	346	293	82	15	chr3	101211329	101211493	-58388290	-	MLT1G	LTR	MaLR	-316	275	103	4
1357	1377	149	8	16	chr3	101215235	101215487	-58384296	-	RLTR28	LTR	ERVL	-204	320	71	4
1357	1702	91	108	69	chr3	101215491	101215797	-58383986	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	4
1357	269	73	24	0	chr3	101215810	101215851	-58383932	-	RLTR28	LTR	ERVL	-439	42	1	4
1357	583	300	81	111	chr3	101219154	101219732	-58380051	-	RLTR18	LTR	ERVK	-25	591	31	4
1357	268	228	18	0	chr3	101222756	101222813	-58376970	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	579	522	4
1357	501	312	74	48	chr3	101225438	101225707	-58374076	-	MLT1F	LTR	MaLR	-49	499	224	4
1357	402	278	15	22	chr3	101226107	101226243	-58373540	-	MER21B	LTR	ERV1	-554	309	175	4
1357	386	258	215	46	chr3	101230240	101230500	-58369283	-	LTR48B	LTR	ERV1	-103	541	238	4
1357	332	105	35	0	chr3	101232438	101232495	-58367288	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-1	527	469	4
1357	326	248	74	8	chr3	101240070	101240192	-58359591	-	LTR33	LTR	ERVL	-58	457	328	5
1357	1966	138	33	33	chr3	101258198	101258399	-58341384	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	161	5
1357	1966	138	33	33	chr3	101258451	101258615	-58341168	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-214	160	2	5
1357	883	205	241	41	chr3	101259484	101259800	-58339983	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	5
1357	279	340	19	0	chr3	101270139	101270242	-58329541	-	RMER20B	LTR	ERVK	-263	364	260	5
1357	389	319	74	12	chr3	101270374	101270536	-58329247	-	RMER15	LTR	ERVL	-39	536	365	5
1357	369	262	39	47	chr3	101271525	101271653	-58328130	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4122	1400	1274	5
1357	439	280	40	8	chr3	101272477	101272603	-58327180	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	269	5
1357	247	188	114	38	chr3	101273362	101273467	-58326316	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	397	5
1357	1688	256	99	23	chr3	101275335	101275900	-58323883	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4163	4770	-229	5
1357	2182	124	13	3	chr3	101277913	101278229	-58321554	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	5
1357	10951	104	117	30	chr3	101278233	101278933	-58320850	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	866	-1097	5
1357	10951	104	117	30	chr3	101279092	101280196	-58319587	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	867	1962	-1	5
1357	2144	116	55	0	chr3	101280196	101280506	-58319277	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1357	2415	139	27	3	chr3	101281783	101282152	-58317631	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	5
1357	851	286	45	66	chr3	101283174	101283512	-58316271	-	MTEa	LTR	MaLR	-44	375	44	5
1357	429	335	62	96	chr3	101283698	101283746	-58316037	-	MTEa	LTR	MaLR	-376	43	3	5
1357	3574	141	190	80	chr3	101286136	101286948	-58312835	+	RMER19B	LTR	ERVK	2	902	0	5
1357	499	90	0	0	chr3	101286961	101287028	-58312755	+	MTC	LTR	MaLR	355	421	0	5
1357	1267	238	75	36	chr3	101287205	101287341	-58312442	+	MTEa	LTR	MaLR	4	155	-224	5
1357	1267	238	75	36	chr3	101287385	101287610	-58312173	+	MTEa	LTR	MaLR	156	379	0	5
1357	1539	227	12	63	chr3	101292453	101292657	-58307126	+	MTEa	LTR	MaLR	1	200	-179	6
1357	1539	227	12	63	chr3	101292804	101292998	-58306785	+	MTEa	LTR	MaLR	201	379	0	6
1357	2660	137	27	2	chr3	101298491	101298901	-58300882	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	6
1357	1040	198	67	105	chr3	101299891	101300264	-58299519	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
1357	476	315	65	15	chr3	101307732	101307932	-58291851	+	MLT1J	LTR	MaLR	247	456	-56	6
1357	230	212	158	24	chr3	101308337	101308357	-58291426	+	MT2B2	LTR	ERVL	148	178	-406	6
1357	3200	77	71	11	chr3	101309134	101309582	-58290201	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	6
1357	416	286	70	48	chr3	101315093	101315280	-58284503	+	ORR1E	LTR	MaLR	24	214	-145	6
1358	383	263	113	35	chr3	101319099	101319241	-58280542	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	38	6
1358	226	250	115	0	chr3	101320898	101320950	-58278833	-	MER68	LTR	ERVL	-475	88	31	6
1358	2177	112	13	3	chr3	101325735	101326049	-58273734	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-7	319	3	6
1358	493	237	28	82	chr3	101327727	101327914	-58271869	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	210	6
1358	1309	192	4	22	chr3	101336757	101337029	-58262754	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	267	-131	7
1358	558	287	129	43	chr3	101337713	101337946	-58261837	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	255	-104	7
1358	1163	278	77	13	chr3	101338437	101338750	-58261033	+	MTEa	LTR	MaLR	2	334	-45	7
1358	1687	174	204	50	chr3	101339832	101340273	-58259510	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	509	-75	7
1358	372	172	0	0	chr3	101346166	101346224	-58253559	+	ORR1D1	LTR	MaLR	317	374	0	7
1358	944	159	0	137	chr3	101346964	101347183	-58252600	+	MTC	LTR	MaLR	1	189	-218	7
1358	1410	173	0	13	chr3	101347471	101347700	-58252083	+	MTC	LTR	MaLR	196	421	0	7
1358	582	131	26	53	chr3	101347699	101347812	-58251971	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	111	-1147	7
1358	1339	227	55	76	chr3	101349067	101349449	-58250334	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	4	7
1358	1378	235	120	40	chr3	101349589	101349939	-58249844	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	378	-1	7
1358	1272	228	48	0	chr3	101358256	101358550	-58241233	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-991	4723	4416	7
1358	590	235	28	56	chr3	101359474	101359654	-58240129	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4411	1350	1176	7
1358	765	266	13	18	chr3	101359911	101360137	-58239646	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4574	1187	963	7
1358	1270	138	10	10	chr3	101360342	101360540	-58239243	+	RLTR17	LTR	ERVK	90	287	-405	7
1358	931	349	45	75	chr3	101363272	101363650	-58236133	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	145	7
1358	3481	30	5	0	chr3	101363650	101364044	-58235739	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1358	931	349	45	75	chr3	101364044	101364182	-58235601	-	MLT1D	LTR	MaLR	-361	144	3	7
1358	2532	65	6	47	chr3	101369317	101369599	-58230184	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	270	-57	7
1358	2532	65	6	47	chr3	101369794	101369852	-58229931	+	ORR1A2	LTR	MaLR	271	327	0	7
1358	546	264	68	148	chr3	101370233	101370584	-58229199	+	MTEa	LTR	MaLR	1	323	-56	7
1358	3737	130	194	5	chr3	101371429	101372049	-58227734	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	7
1358	715	138	46	0	chr3	101374181	101374290	-58225493	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	253	7
1358	1453	154	73	119	chr3	101374292	101374661	-58225122	+	RLTR9A	LTR	ERVK	17	368	0	7
1358	1283	118	14	51	chr3	101374739	101374953	-58224830	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-155	212	7	7
1358	227	345	92	0	chr3	101375003	101375122	-58224661	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-309	135	6	8
1358	262	292	45	106	chr3	101409463	101409662	-58190121	-	LTR90B	LTR	LTR	-4	792	606	8
1358	460	214	99	76	chr3	101410537	101410709	-58189074	+	MT2B	LTR	ERVL	89	264	-337	8
1358	2528	142	146	51	chr3	101412213	101412747	-58187036	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	8
1358	874	221	243	32	chr3	101421841	101422154	-58177629	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	8
1358	362	258	98	16	chr3	101424446	101424568	-58175215	+	RMER15	LTR	ERVL	374	505	-70	8
1358	1921	185	8	54	chr3	101424642	101425031	-58174752	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	372	-2	8
1358	1111	277	58	25	chr3	101426503	101426866	-58172917	+	MTD	LTR	MaLR	45	419	0	8
1358	512	242	8	45	chr3	101428980	101429114	-58170669	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	239	8
1358	327	246	0	0	chr3	101429099	101429168	-58170615	+	MTEb	LTR	MaLR	181	249	-130	8
1358	2268	106	44	90	chr3	101429653	101430066	-58169717	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	8
1358	621	249	129	137	chr3	101430256	101430759	-58169024	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	501	-4	8
1358	1560	241	51	25	chr3	101431303	101431695	-58168088	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	3	8
1358	287	235	44	131	chr3	101431778	101431915	-58167868	-	MT2B2	LTR	ERVL	-308	276	152	8
1358	1833	206	11	13	chr3	101433225	101433599	-58166184	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	1	8
1358	424	290	16	29	chr3	101434688	101434825	-58164958	+	MTE2b	LTR	MaLR	217	351	-28	8
1358	729	337	129	38	chr3	101439172	101439598	-58160185	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-102	522	58	8
1358	315	312	100	14	chr3	101439651	101439791	-58159992	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-5	360	209	8
1358	448	236	0	11	chr3	101439805	101439895	-58159888	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-260	105	17	8
1358	723	324	126	13	chr3	101441651	101442011	-58157772	+	MLT1F1	LTR	MaLR	147	563	-6	8
1358	529	346	54	31	chr3	101444108	101444332	-58155451	+	MLT1D	LTR	MaLR	208	436	-69	9
1358	417	361	39	5	chr3	101446327	101446530	-58153253	-	LTR16A	LTR	ERVL	-185	266	57	9
1358	2156	203	134	18	chr3	101448301	101448793	-58150990	+	RMER15	LTR	ERVL	27	575	0	9
1358	1748	210	83	21	chr3	101448969	101449344	-58150439	+	MTD	LTR	MaLR	6	403	-16	9
1359	2126	155	17	31	chr3	101461642	101462002	-58137781	+	ORR1C1	LTR	MaLR	7	361	-17	9
1359	265	295	79	88	chr3	101465052	101465279	-58134504	+	MLT1K	LTR	MaLR	371	595	0	9
1359	968	161	169	10	chr3	101465866	101466066	-58133717	+	MTC	LTR	MaLR	2	233	-188	9
1359	446	37	0	0	chr3	101466066	101466120	-58133663	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	354	9
1359	227	347	0	47	chr3	101466118	101466224	-58133559	+	MLT1A1	LTR	MaLR	62	162	-212	9
1359	304	209	15	0	chr3	101466722	101466789	-58132994	+	MLT1A1	LTR	MaLR	341	408	0	9
1359	1135	134	188	47	chr3	101468331	101468565	-58131218	+	MT2A	LTR	ERVL	1	267	-266	9
1359	1988	191	12	87	chr3	101468892	101469316	-58130467	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	9
1359	400	309	102	93	chr3	101474625	101474968	-58124815	-	MLT1M	LTR	MaLR	-161	511	166	9
1359	1491	231	80	12	chr3	101475986	101476324	-58123459	+	ORR1D2	LTR	MaLR	8	368	-2	9
1359	2074	101	40	0	chr3	101479850	101480147	-58119636	+	ORR1A2	LTR	MaLR	11	319	-8	9
1359	1953	181	36	14	chr3	101480253	101480511	-58119272	-	MTD	LTR	MaLR	-35	384	115	9
1359	1953	181	36	14	chr3	101480554	101480653	-58119130	-	MTD	LTR	MaLR	-305	114	20	9
1359	978	219	127	56	chr3	101484205	101484654	-58115129	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	457	16	9
1359	354	276	87	72	chr3	101488443	101488638	-58111145	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1188	1385	-4137	9
1359	1243	131	67	13	chr3	101490060	101490284	-58109499	+	MTC	LTR	MaLR	1	236	-185	1
1359	2620	125	35	5	chr3	101494750	101495153	-58104630	+	MTC	LTR	MaLR	5	419	-2	1
1359	2140	120	3	61	chr3	101496587	101496933	-58102850	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	1
1359	256	366	68	6	chr3	101502220	101502396	-58097387	+	MLT1K	LTR	MaLR	66	252	-343	7
1359	2243	72	35	65	chr3	101519726	101520065	-58079718	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
1359	421	230	40	10	chr3	101522090	101522191	-58077592	+	MLT1L	LTR	MaLR	153	256	-354	5
1359	374	294	232	30	chr3	101522258	101522521	-58077262	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	44	5
1359	252	254	175	52	chr3	101522544	101522698	-58077085	+	MLT1L	LTR	MaLR	383	555	-55	5
1359	2751	285	77	32	chr3	101525080	101525973	-58073810	+	MTE-int	LTR	MaLR	648	1580	0	6
1359	947	238	41	18	chr3	101526059	101526277	-58073506	+	MTEa	LTR	MaLR	157	379	0	6
1359	417	239	26	76	chr3	101527318	101527622	-58072161	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-327	482	194	6
1359	423	329	40	20	chr3	101527503	101527652	-58072131	+	MLT1D	LTR	MaLR	353	504	-1	6
1359	373	264	90	30	chr3	101528999	101529132	-58070651	+	MLT1D	LTR	MaLR	2	142	-363	7
1359	1747	196	101	3	chr3	101529144	101529522	-58070261	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	7
1359	1087	258	18	51	chr3	101533922	101534196	-58065587	-	MTEb	LTR	MaLR	-110	269	5	8
1359	271	309	83	79	chr3	101534413	101534641	-58065142	+	MLT1D	LTR	MaLR	37	265	-240	8
1359	542	310	179	61	chr3	101535842	101536282	-58063501	-	MLT1K	LTR	MaLR	-4	591	100	9
1359	250	330	147	0	chr3	101537073	101537263	-58062520	-	MLT1J	LTR	MaLR	-33	479	204	9
1359	308	306	129	0	chr3	101538176	101538300	-58061483	-	MLT1J	LTR	MaLR	-368	144	5	9
1359	1987	160	66	14	chr3	101540273	101540622	-58059161	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	1
1359	514	107	0	0	chr3	101541118	101541193	-58058590	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	310	1
1359	1066	145	1	33	chr3	101541192	101541406	-58058377	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-34	1546	1323	1
1359	1790	82	92	101	chr3	101541406	101541774	-58058009	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	1
1359	4864	219	82	14	chr3	101541774	101542890	-58056893	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-178	1192	1	1
1359	1676	182	57	57	chr3	101542890	101543090	-58056693	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	384	180	1
1359	1676	182	57	57	chr3	101543273	101543456	-58056327	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-205	179	1	1
1359	225	314	126	42	chr3	101543797	101543940	-58055843	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	155	-399	1
1359	367	326	91	120	chr3	101543948	101544223	-58055560	+	ORR1E	LTR	MaLR	80	346	-13	1
1359	590	244	16	8	chr3	101545246	101545374	-58054409	+	MTD	LTR	MaLR	276	404	-15	1
1359	2451	81	16	0	chr3	101546032	101546354	-58053429	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1359	320	273	0	38	chr3	101547876	101547956	-58051827	-	MTEa	LTR	MaLR	-300	79	3	1
1359	529	224	53	7	chr3	101551134	101551294	-58048489	-	MLT1A	LTR	MaLR	-33	341	155	1
1359	1436	192	123	18	chr3	101552842	101553182	-58046601	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	4	1
1359	1100	174	78	10	chr3	101554413	101554806	-58044977	-	MT2A	LTR	ERVL	-69	464	3	1
1359	309	188	87	0	chr3	101557201	101557259	-58042524	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-10	384	321	1
1359	1403	165	21	153	chr3	101557380	101557752	-58042031	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-51	323	1	1
1359	3088	20	0	20	chr3	101560272	101560625	-58039158	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	1
1359	1828	220	44	37	chr3	101561291	101561368	-58038415	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	343	1
1359	1828	220	44	37	chr3	101561563	101561890	-58037893	-	MTD	LTR	MaLR	-77	342	4	1
1359	1459	163	40	8	chr3	101564957	101565205	-58034578	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	256	-604	1
1359	1223	254	90	20	chr3	101565272	101565617	-58034166	-	MTD	LTR	MaLR	-50	369	1	1
1359	526	371	56	18	chr3	101567151	101567436	-58032347	+	MLT1L	LTR	MaLR	110	405	-205	1
1359	2100	170	31	0	chr3	101569093	101569446	-58030337	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	4	1
1359	2772	163	1	128	chr3	101572198	101572897	-58026886	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	689	-1	1
1359	3261	46	18	0	chr3	101578386	101578777	-58021006	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	3	1
1359	1782	182	90	78	chr3	101579595	101579994	-58019789	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	1
1360	1406	235	47	8	chr3	101582481	101582846	-58016937	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	2
1360	1149	241	21	31	chr3	101582863	101583150	-58016633	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-86	284	1	2
1360	802	260	243	0	chr3	101589379	101589683	-58010100	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	2	2
1360	1637	203	93	19	chr3	101589758	101590135	-58009648	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	4	2
1360	1412	260	81	40	chr3	101590429	101590854	-58008929	+	RMER5	LTR	ERV1	43	492	-42	2
1360	5065	103	58	91	chr3	101590854	101591791	-58007992	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	2
1360	1412	260	81	40	chr3	101591791	101591834	-58007949	+	RMER5	LTR	ERV1	493	530	-4	2
1360	241	277	31	0	chr3	101593199	101593264	-58006519	-	RMER5	LTR	ERV1	-356	178	112	2
1360	2730	138	138	19	chr3	101596550	101597073	-58002710	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	2
1360	970	305	66	38	chr3	101597308	101597655	-58002128	+	MLT1H1	LTR	MaLR	198	554	-1	2
1360	377	239	53	55	chr3	101601833	101601987	-57997796	+	MTD	LTR	MaLR	134	295	-112	2
1360	562	206	30	42	chr3	101601976	101602139	-57997644	+	MTD	LTR	MaLR	210	397	-22	2
1360	455	309	41	45	chr3	101605313	101605531	-57994252	-	MTE2a	LTR	MaLR	-199	220	8	2
1360	514	232	91	63	chr3	101605553	101605730	-57994053	+	MTE2a	LTR	MaLR	226	379	0	2
1360	908	256	148	21	chr3	101607331	101607662	-57992121	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	1	2
1360	1756	172	46	43	chr3	101614858	101615228	-57984555	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	1	2
1360	485	250	113	74	chr3	101615754	101615983	-57983800	-	MLT1B	LTR	MaLR	-59	331	94	2
1360	289	217	0	0	chr3	101617475	101617535	-57982248	+	RMER15	LTR	ERVL	408	467	-108	2
1360	1960	88	110	0	chr3	101621140	101621458	-57978325	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	70	422	0	2
1360	710	246	200	55	chr3	101629147	101629422	-57970361	+	ORR1D2	LTR	MaLR	48	362	-8	2
1360	1022	220	110	34	chr3	101633384	101633676	-57966107	-	MTD	LTR	MaLR	-73	346	33	2
1360	1399	146	119	21	chr3	101642085	101642382	-57957401	+	RMER6A	LTR	ERVK	466	756	0	3
1360	474	343	37	74	chr3	101646223	101646519	-57953264	-	LTR89	LTR	ERVL?	-44	835	551	3
1360	3375	40	2	0	chr3	101650657	101651054	-57948729	+	MTB	LTR	MaLR	1	398	-2	3
1360	391	172	35	147	chr3	101651258	101651374	-57948409	+	MT2B	LTR	ERVL	153	255	-346	3
1360	295	241	64	136	chr3	101653481	101653531	-57946252	+	MT2B	LTR	ERVL	167	282	-319	3
1360	273	332	95	26	chr3	101656980	101657169	-57942614	+	MLT1D	LTR	MaLR	14	215	-290	3
1360	1104	222	105	64	chr3	101662306	101662774	-57937009	+	RLTR11A	LTR	ERVK	21	525	-3	3
1360	449	95	218	1	chr3	101668195	101668282	-57931501	+	ORR1C2	LTR	MaLR	286	384	0	3
1360	3096	69	20	0	chr3	101669149	101669539	-57930244	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	3	3
1360	605	338	73	35	chr3	101670413	101670756	-57929027	+	RMER5	LTR	ERV1	155	510	-24	3
1360	479	162	34	81	chr3	101672157	101672305	-57927478	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	135	3
1360	981	271	43	58	chr3	101689620	101689996	-57909787	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	1	3
1360	1397	233	123	5	chr3	101699618	101699993	-57899790	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1361	1790	185	49	6	chr3	101712220	101712568	-57887215	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	12	4
1361	612	257	149	34	chr3	101713536	101713858	-57885925	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	4
1361	370	362	68	21	chr3	101715022	101715214	-57884569	+	LTR82A	LTR	ERVL	596	796	-76	4
1361	2314	190	33	80	chr3	101717305	101717946	-57881837	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
1361	404	312	138	31	chr3	101725924	101726185	-57873598	+	MLT2F	LTR	ERVL	68	356	-307	4
1361	739	247	40	89	chr3	101729028	101729353	-57870430	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	57	4
1361	1471	132	61	8	chr3	101731075	101731435	-57868348	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	288	-71	4
1361	436	100	0	14	chr3	101731410	101731481	-57868302	-	RLTR15	LTR	ERVK	-289	70	1	4
1361	474	229	141	49	chr3	101732212	101732396	-57867387	+	MTEa	LTR	MaLR	18	218	-161	4
1361	5145	106	102	4	chr3	101735025	101735350	-57864433	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	394	-495	4
1361	5145	106	102	4	chr3	101735455	101735937	-57863846	+	RMER17D	LTR	ERVK	395	887	-2	4
1361	2129	141	90	14	chr3	101737848	101738214	-57861569	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
1361	431	211	0	0	chr3	101743081	101743171	-57856612	+	MTC	LTR	MaLR	332	421	0	4
1361	241	253	67	0	chr3	101745728	101745803	-57853980	+	MTE-int	LTR	MaLR	1100	1179	-401	4
1361	657	275	58	58	chr3	101746243	101746552	-57853231	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	309	-50	4
1361	2140	164	95	3	chr3	101746578	101746958	-57852825	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	5	4
1361	1294	225	101	17	chr3	101749777	101750125	-57849658	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	4
1361	868	250	90	32	chr3	101750515	101750792	-57848991	+	MTEa	LTR	MaLR	3	295	-84	4
1361	413	281	21	14	chr3	101750793	101750934	-57848849	+	MTEa	LTR	MaLR	236	377	-2	4
1361	1067	210	127	7	chr3	101753899	101754191	-57845592	+	ORR1D1	LTR	MaLR	14	340	-34	4
1361	823	276	31	72	chr3	101759466	101759826	-57839957	-	MLT1A	LTR	MaLR	-26	348	4	5
1361	3120	49	28	3	chr3	101760872	101761262	-57838521	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1361	1497	270	47	5	chr3	101761309	101761711	-57838072	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1361	515	268	7	0	chr3	101774638	101774776	-57825007	+	MLT1A0	LTR	MaLR	226	364	-1	5
1361	1176	193	249	123	chr3	101776386	101776815	-57822968	+	MT2A	LTR	ERVL	1	465	-68	5
1361	1176	193	249	123	chr3	101776868	101776911	-57822872	+	MT2A	LTR	ERVL	466	532	-1	5
1361	2234	191	7	0	chr3	101776915	101777339	-57822444	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	5	431	-1078	5
1361	1192	113	25	10	chr3	101777324	101777521	-57822262	+	MTC	LTR	MaLR	222	421	0	5
1361	618	254	77	52	chr3	101778378	101778683	-57821100	+	RLTR15	LTR	ERVK	45	332	-27	5
1361	242	339	42	95	chr3	101780221	101780485	-57819298	+	ORR1D2	LTR	MaLR	119	368	-2	5
1361	923	246	132	60	chr3	101781399	101781801	-57817982	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-23	458	28	5
1361	269	266	50	50	chr3	101784345	101784464	-57815319	-	MT2B	LTR	ERVL	-345	256	138	5
1361	2070	220	54	12	chr3	101792188	101792672	-57807111	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	24	527	0	5
1361	556	314	203	27	chr3	101796072	101796496	-57803287	-	MLT1D	LTR	MaLR	-4	463	1	5
1361	284	312	214	44	chr3	101800343	101800591	-57799192	+	MTEa	LTR	MaLR	87	376	-3	5
1361	331	366	9	0	chr3	101801764	101801876	-57797907	-	LTR33	LTR	ERVL	-78	437	325	5
1361	307	298	92	7	chr3	101801877	101802029	-57797754	-	LTR33	LTR	ERVL	-350	165	1	5
1361	766	192	140	6	chr3	101803544	101803722	-57796061	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	169	5
1361	532	256	110	13	chr3	101805976	101806130	-57793653	+	MTD	LTR	MaLR	1	169	-250	6
1361	1690	186	110	6	chr3	101806134	101806469	-57793314	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	1	6
1361	966	184	52	24	chr3	101806489	101806701	-57793082	+	MTD	LTR	MaLR	202	419	0	6
1361	251	242	44	29	chr3	101839190	101839258	-57760525	+	RMER20B	LTR	ERVK	541	609	-18	6
1361	3249	29	3	0	chr3	101839406	101839786	-57759997	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	381	-15	6
1361	418	335	31	12	chr3	101839788	101839948	-57759835	-	MT2A	LTR	ERVL	-105	428	266	6
1361	644	298	53	31	chr3	101839968	101840193	-57759590	-	MTEa	LTR	MaLR	-144	235	6	6
1361	2514	138	39	5	chr3	101841626	101842033	-57757750	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1362	427	308	280	19	chr3	101844202	101844616	-57755167	+	MER77	LTR	ERVL	86	607	0	6
1362	1277	221	55	150	chr3	101844688	101844948	-57754835	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	211	6
1362	1277	221	55	150	chr3	101845078	101845270	-57754513	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	5	6
1362	887	230	243	29	chr3	101845571	101845920	-57753863	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	1	6
1362	1351	229	42	57	chr3	101846148	101846437	-57753346	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	96	6
1362	1351	229	42	57	chr3	101846467	101846561	-57753222	-	MTEa	LTR	MaLR	-284	95	2	6
1362	1272	273	68	19	chr3	101847291	101847612	-57752171	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	337	-33	6
1362	321	102	0	0	chr3	101847756	101847807	-57751976	+	ORR1D2	LTR	MaLR	311	370	0	6
1362	348	250	0	40	chr3	101854458	101854558	-57745225	+	MER57-int	LTR	ERV1	7149	7244	-293	7
1362	351	346	160	19	chr3	101855139	101855345	-57744438	-	MER21B	LTR	ERV1	-531	332	98	7
1362	2216	190	38	8	chr3	101855711	101856108	-57743675	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	10	7
1362	2414	26	2	313	chr3	101856497	101857063	-57742720	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	7
1362	1876	191	44	30	chr3	101861924	101862329	-57737454	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	7
1362	2449	123	242	12	chr3	101871092	101871620	-57728163	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-34	994	414	7
1362	566	264	8	8	chr3	101874813	101874935	-57724848	+	MTEa	LTR	MaLR	28	149	-230	7
1362	605	211	39	39	chr3	101874998	101875151	-57724632	+	MTEa	LTR	MaLR	158	310	-69	7
1362	255	316	13	0	chr3	101875420	101875499	-57724284	+	MTEa	LTR	MaLR	300	379	0	7
1362	1383	213	71	23	chr3	101875967	101876318	-57723465	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	370	0	7
1362	1021	296	50	59	chr3	101876492	101876812	-57722971	+	MLT1A0	LTR	MaLR	48	364	-1	7
1362	761	219	56	52	chr3	101877017	101877287	-57722496	-	RLTR15	LTR	ERVK	-39	320	50	7
1362	895	189	81	5	chr3	101881195	101881330	-57718453	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	384	247	7
1362	895	179	71	75	chr3	101881358	101881434	-57718349	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-138	246	166	7
1362	991	141	49	38	chr3	101881529	101881713	-57718070	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-184	190	5	7
1362	700	309	75	25	chr3	101882326	101882662	-57717121	+	RLTR26	LTR	ERVK	21	412	-215	7
1362	303	282	62	26	chr3	101883541	101883654	-57716129	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	389	7
1362	419	294	48	48	chr3	101883723	101883912	-57715871	-	MLT1D	LTR	MaLR	-296	209	21	7
1362	2146	182	19	29	chr3	101884662	101885076	-57714707	+	MTC	LTR	MaLR	4	413	-8	7
1362	2014	132	12	59	chr3	101894477	101894815	-57704968	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	322	-4	7
1362	1720	206	21	45	chr3	101894922	101895303	-57704480	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	7
1362	2411	117	48	0	chr3	101897726	101898084	-57701699	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	4	7
1362	2063	159	38	0	chr3	101902265	101902611	-57697172	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	8
1362	1144	15	0	0	chr3	101909480	101909612	-57690171	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	132	-264	8
1362	639	63	0	0	chr3	101909607	101909686	-57690097	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	318	396	0	8
1362	9036	39	18	1	chr3	101909686	101910766	-57689017	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	8
1362	3307	31	5	0	chr3	101910766	101911158	-57688625	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	394	-2	8
1362	2356	149	64	3	chr3	101918533	101918922	-57680861	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	8
1362	277	301	24	12	chr3	101919292	101919376	-57680407	-	MTEb	LTR	MaLR	-16	363	279	8
1362	259	290	79	10	chr3	101919572	101919673	-57680110	-	MTEb	LTR	MaLR	-248	111	4	8
1362	233	329	45	71	chr3	101920535	101920689	-57679094	-	RMER12	LTR	ERVK	-471	851	702	8
1362	801	287	90	54	chr3	101922975	101923307	-57676476	-	RLTR26	LTR	ERVK	-251	391	48	8
1362	2542	71	16	0	chr3	101925070	101925392	-57674391	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1362	3358	38	2	8	chr3	101932844	101933242	-57666541	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
1362	233	320	27	0	chr3	101934148	101934223	-57665560	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	77	-297	8
1362	277	198	95	95	chr3	101934478	101934573	-57665210	+	MLT1A0	LTR	MaLR	236	330	-35	8
1362	225	138	147	44	chr3	101944773	101944841	-57654942	-	MamGypLTR2b	LTR	Gypsy	-17	905	831	8
1362	364	288	51	111	chr3	101951107	101951341	-57648442	-	ORR1E	LTR	MaLR	-22	337	118	8
1362	429	211	37	37	chr3	101951401	101951509	-57648274	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-300	108	1	8
1362	261	384	64	57	chr3	101951509	101951639	-57648144	-	MLT1B	LTR	MaLR	-29	361	224	8
1362	261	384	64	57	chr3	101951659	101951814	-57647969	-	MLT1B	LTR	MaLR	-167	223	74	8
1362	2470	160	22	2	chr3	101958297	101958704	-57641079	+	MTC	LTR	MaLR	1	415	-6	8
1362	471	255	63	34	chr3	101959118	101959310	-57640473	+	RMER4B	LTR	ERVK	316	574	-11	8
1362	6668	45	11	4	chr3	101965861	101966663	-57633120	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	9
1363	378	348	59	69	chr3	101975678	101976063	-57623720	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	370	0	9
1363	1935	176	11	0	chr3	101977248	101977601	-57622182	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	357	-2	9
1363	337	246	0	0	chr3	101977603	101977672	-57622111	+	MTEb	LTR	MaLR	311	379	0	9
1363	635	300	84	60	chr3	101980578	101980911	-57618872	-	MLT1A	LTR	MaLR	-20	354	14	9
1363	1562	213	131	21	chr3	101981168	101981206	-57618577	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	51	-476	9
1363	1562	213	131	21	chr3	101981226	101981662	-57618121	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	52	526	-1	9
1363	1437	281	90	29	chr3	101982100	101982758	-57617025	+	MTE2b	LTR	MaLR	58	537	-12	9
1363	1586	173	88	51	chr3	101985511	101985864	-57613919	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	1	9
1363	354	252	27	103	chr3	101986596	101986740	-57613043	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	146	9
1363	265	316	47	87	chr3	102010354	102010503	-57589280	+	LTR79	LTR	ERVL	385	527	0	1
1363	3058	134	92	61	chr3	102010625	102011182	-57588601	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	1	1
1363	1872	207	63	26	chr3	102015047	102015460	-57584323	+	MTD	LTR	MaLR	7	393	-26	2
1363	893	269	119	4	chr3	102016737	102017033	-57582750	-	MTEb	LTR	MaLR	-54	325	3	3
1363	603	276	68	63	chr3	102018328	102018533	-57581250	+	MER74A	LTR	ERVL	176	381	-177	4
1363	351	314	118	82	chr3	102020404	102020744	-57579039	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	359	0	4
1363	364	287	155	63	chr3	102022106	102022405	-57577378	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	377	27	5
1363	543	223	194	48	chr3	102023017	102023397	-57576386	+	RLTR12B	LTR	ERVK	11	464	-104	5
1363	620	329	88	43	chr3	102024830	102025135	-57574648	-	MER70B	LTR	ERVL	-146	432	114	6
1363	509	248	9	0	chr3	102025775	102025880	-57573903	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	106	-253	6
1363	2283	189	98	13	chr3	102027188	102027665	-57572118	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	10	6
1363	813	330	52	83	chr3	102029870	102030055	-57569728	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	189	-326	6
1363	813	330	52	83	chr3	102030170	102030503	-57569280	+	MLT2B2	LTR	ERVL	190	503	-12	6
1363	1621	157	179	19	chr3	102034813	102035138	-57564645	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	377	-1	7
1363	618	148	0	19	chr3	102036805	102036908	-57562875	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-253	141	41	7
1363	1863	135	19	35	chr3	102038676	102038990	-57560793	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	8
1363	1684	211	50	20	chr3	102038990	102039547	-57560236	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	6907	8
1363	1054	259	36	45	chr3	102039760	102040116	-57559667	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2099	5482	5130	8
1363	8321	68	0	6	chr3	102040126	102041178	-57558605	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-3704	3877	2832	8
1363	569	55	0	0	chr3	102041176	102041249	-57558534	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4957	2624	2552	8
1363	449	94	47	12	chr3	102041232	102041318	-57558465	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5608	1973	1885	8
1363	382	185	123	0	chr3	102041309	102041390	-57558393	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-5109	1028	938	8
1363	1201	186	138	56	chr3	102041377	102041792	-57557991	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4795	611	312	8
1363	1326	124	206	6	chr3	102041880	102042211	-57557572	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-6629	952	566	8
1363	403	130	72	0	chr3	102042402	102042471	-57557312	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7300	281	208	8
1363	1840	157	13	29	chr3	102042494	102042808	-57556975	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	8
1363	1074	231	8	58	chr3	102045735	102045978	-57553805	+	MTD	LTR	MaLR	12	242	-177	9
1363	432	329	66	0	chr3	102048753	102048905	-57550878	-	LTR16D2	LTR	ERVL	-249	323	162	9
1363	237	238	84	36	chr3	102052912	102052995	-57546788	+	MLT2B1	LTR	ERVL	481	567	0	1
1363	1285	163	184	44	chr3	102053919	102054240	-57545543	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	370	0	1
1363	328	292	70	17	chr3	102055142	102055257	-57544526	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	276	1
1363	491	244	166	41	chr3	102055850	102056143	-57543640	-	MTEa	LTR	MaLR	-24	355	1	1
1363	834	271	143	9	chr3	102060136	102060359	-57539424	-	ORR1E	LTR	MaLR	-52	307	55	1
1363	250	309	30	82	chr3	102061241	102061375	-57538408	+	RMER15	LTR	ERVL	1	127	-448	1
1363	341	316	46	6	chr3	102061421	102061597	-57538186	+	RMER15	LTR	ERVL	352	562	-13	1
1363	281	241	65	54	chr3	102062818	102062910	-57536873	-	RMER15	LTR	ERVL	-51	524	432	1
1363	361	363	54	56	chr3	102063307	102063674	-57536109	-	MER70B	LTR	ERVL	-111	467	34	1
1363	373	152	45	0	chr3	102064510	102064576	-57535207	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	69	-651	1
1363	342	264	137	69	chr3	102065589	102065764	-57534019	+	MLT1H2	LTR	MaLR	295	481	-8	1
1363	1643	154	132	31	chr3	102068308	102068471	-57531312	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	171	-213	1
1363	1643	154	132	31	chr3	102068525	102068577	-57531206	+	ORR1C2	LTR	MaLR	172	233	-151	1
1363	1643	154	132	31	chr3	102068601	102068733	-57531050	+	ORR1C2	LTR	MaLR	234	382	-2	1
1363	277	357	97	7	chr3	102073226	102073381	-57526402	+	MLT1F	LTR	MaLR	1	169	-379	1
1363	371	252	98	65	chr3	102073491	102073644	-57526139	+	MLT1F1	LTR	MaLR	403	569	0	1
1363	736	249	68	19	chr3	102073719	102073924	-57525859	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-37	328	114	1
1363	237	369	44	92	chr3	102073931	102074137	-57525646	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	196	-212	1
1363	276	247	69	23	chr3	102074201	102074288	-57525495	+	MLT1A1	LTR	MaLR	302	392	-16	1
1363	913	314	77	19	chr3	102075358	102075683	-57524100	+	MLT1J	LTR	MaLR	8	351	-161	1
1363	476	230	93	29	chr3	102076365	102076504	-57523279	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	261	1
1363	386	274	204	19	chr3	102077677	102077893	-57521890	+	MLT1A1-int	LTR	MaLR	1466	1721	-14	1
1363	545	292	102	94	chr3	102077904	102078297	-57521486	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	396	-12	1
1363	1418	243	86	34	chr3	102078330	102078713	-57521070	+	MTD	LTR	MaLR	3	405	-14	1
1363	393	221	11	11	chr3	102083895	102083982	-57515801	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	271	1
1363	504	284	89	123	chr3	102083992	102084471	-57515312	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-159	409	1	1
1363	1511	225	9	36	chr3	102084475	102084807	-57514976	-	MTD	LTR	MaLR	-95	324	2	1
1363	367	314	56	12	chr3	102085442	102085606	-57514177	+	LTR48	LTR	ERV1	469	615	-172	1
1363	1578	216	117	0	chr3	102085971	102086346	-57513437	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1363	289	258	41	41	chr3	102089365	102089462	-57510321	+	ORR1D2	LTR	MaLR	273	369	-1	1
1363	2001	147	18	87	chr3	102089694	102090074	-57509709	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	1
1363	4739	122	45	108	chr3	102090081	102090977	-57508806	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1963	1125	1
1363	3578	184	64	35	chr3	102090975	102091771	-57508012	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1143	820	2	1
1363	1945	145	40	86	chr3	102091772	102092143	-57507640	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	1
1363	836	288	65	31	chr3	102092809	102093164	-57506619	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	150	1
1363	459	225	34	59	chr3	102093320	102093438	-57506345	-	RMER20A	LTR	ERVK	-502	125	11	1
1363	2463	30	0	150	chr3	102093489	102093883	-57505900	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-30	335	1	1
1363	493	315	0	33	chr3	102094057	102094241	-57505542	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1509	1686	-3313	1
1363	656	131	32	21	chr3	102094249	102094382	-57505401	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	236	-722	1
1363	1336	136	8	134	chr3	102094489	102094855	-57504928	+	RMER17C	LTR	ERVK	73	392	-18	1
1363	1809	297	89	43	chr3	102095501	102096285	-57503498	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4148	4967	-32	1
1363	399	221	30	83	chr3	102096290	102096423	-57503360	+	RMER15	LTR	ERVL	1	126	-449	1
1363	601	291	177	13	chr3	102096450	102096687	-57503096	+	RMER15	LTR	ERVL	286	561	-14	1
1363	276	333	86	66	chr3	102096945	102097398	-57502385	-	LTR37B	LTR	ERV1	-4	464	3	2
1363	703	324	125	25	chr3	102097504	102097865	-57501918	+	MLT2C1	LTR	ERVL	1	397	0	2
1363	1717	171	28	3	chr3	102099206	102099494	-57500289	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-72	295	1	2
1363	715	316	56	15	chr3	102099678	102099948	-57499835	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-21	499	219	2
1363	1645	164	137	60	chr3	102100061	102100412	-57499371	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	2
1363	603	246	89	28	chr3	102100547	102100727	-57499056	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-329	191	1	2
1363	448	296	52	40	chr3	102101885	102102207	-57497576	-	RLTR15	LTR	ERVK	-19	340	43	2
1363	420	288	108	25	chr3	102103106	102103168	-57496615	-	LTR48	LTR	ERV1	-91	696	633	2
1363	4061	105	5	11	chr3	102103168	102103738	-57496045	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	2
1363	420	304	239	27	chr3	102103738	102104095	-57495688	-	LTR48	LTR	ERV1	-155	632	1	2
1364	773	176	186	6	chr3	102105341	102105524	-57494259	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	200	2
1364	604	218	26	31	chr3	102107744	102107897	-57491886	-	MTD	LTR	MaLR	-183	238	76	2
1364	594	270	18	36	chr3	102107904	102108069	-57491714	-	MTD	LTR	MaLR	-246	173	12	2
1364	563	332	58	37	chr3	102108150	102108391	-57491392	+	MLT1H	LTR	MaLR	79	324	-225	2
1364	267	237	17	0	chr3	102108554	102108613	-57491170	+	MTD	LTR	MaLR	1	60	-361	2
1364	1279	224	86	0	chr3	102109107	102109212	-57490571	+	MTD	LTR	MaLR	105	213	-206	2
1364	1279	224	86	0	chr3	102109262	102109446	-57490337	+	MTD	LTR	MaLR	214	418	-1	2
1364	565	337	23	23	chr3	102116696	102116957	-57482826	+	MLT1C	LTR	MaLR	199	459	-8	2
1364	1499	192	67	6	chr3	102117489	102117834	-57481949	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	366	-8	2
1364	491	171	11	0	chr3	102126059	102126147	-57473636	+	MTEa	LTR	MaLR	3	91	-288	2
1364	1247	249	100	12	chr3	102126855	102127196	-57472587	+	MTEa	LTR	MaLR	9	379	0	2
1364	628	281	117	64	chr3	102128332	102128690	-57471093	+	MTE2a	LTR	MaLR	14	390	-29	2
1364	238	247	62	82	chr3	102140933	102141030	-57458753	-	RMER10A	LTR	ERVL	-27	415	321	2
1364	336	267	40	75	chr3	102146175	102146349	-57453434	-	MTEb	LTR	MaLR	-15	364	197	2
1364	243	214	62	100	chr3	102148068	102148198	-57451585	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-6	556	432	2
1364	246	294	95	14	chr3	102148458	102148606	-57451177	+	MLT1A0	LTR	MaLR	206	365	0	2
1364	971	322	72	83	chr3	102151858	102152458	-57447325	-	MLT1G	LTR	MaLR	0	595	3	2
1364	354	292	104	78	chr3	102156687	102156917	-57442866	-	MLT1K	LTR	MaLR	-6	589	354	2
1364	265	319	68	20	chr3	102158882	102159029	-57440754	+	MLT1G1	LTR	MaLR	424	577	-2	3
1364	339	234	0	69	chr3	102166041	102166142	-57433641	-	MTEb	LTR	MaLR	-285	94	1	3
1364	958	321	33	12	chr3	102166786	102167123	-57432660	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	344	-21	3
1364	233	217	56	28	chr3	102167447	102167518	-57432265	+	MLT1A0	LTR	MaLR	364	436	-174	3
1364	2377	169	111	57	chr3	102170617	102171138	-57428645	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	39	3
1364	2377	169	111	57	chr3	102171159	102171177	-57428606	-	RMER4B	LTR	ERVK	-547	38	17	3
1364	3106	32	6	0	chr3	102177502	102177846	-57421937	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1364	1527	246	79	8	chr3	102179254	102179607	-57420176	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	3
1364	782	324	86	18	chr3	102182846	102183230	-57416553	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-125	435	26	3
1364	494	291	173	73	chr3	102186332	102186632	-57413151	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	330	-29	3
1364	844	283	61	64	chr3	102192927	102193222	-57406561	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	72	3
1364	298	359	101	43	chr3	102195802	102196128	-57403655	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	348	-11	3
1364	1158	229	123	30	chr3	102196695	102197028	-57402755	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	42	3
1364	506	290	137	9	chr3	102204916	102205128	-57394655	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	295	3
1364	911	244	166	99	chr3	102205354	102205709	-57394074	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	3
1364	1008	301	69	79	chr3	102206508	102207015	-57392768	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-9	506	7	3
1364	1285	294	80	2	chr3	102207068	102207531	-57392252	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-65	5649	5151	3
1364	270	85	237	0	chr3	102207625	102207684	-57392099	+	ORR1C1	LTR	MaLR	306	378	0	3
1364	346	325	44	0	chr3	102208282	102208396	-57391387	+	MLT1G1	LTR	MaLR	13	131	-448	3
1364	1534	223	19	42	chr3	102209526	102209887	-57389896	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	1	3
1364	504	248	8	47	chr3	102213728	102213855	-57385928	-	MLT1B	LTR	MaLR	-9	381	260	3
1364	2584	121	38	0	chr3	102218809	102219174	-57380609	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	379	0	3
1364	337	314	0	25	chr3	102219175	102219296	-57380487	+	MLT1A1	LTR	MaLR	291	408	0	3
1364	2534	187	57	33	chr3	102220313	102220855	-57378928	+	RLTR12A	LTR	ERVK	2	556	-12	3
1364	775	174	0	7	chr3	102227288	102227419	-57372364	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	132	-252	4
1364	1720	126	81	52	chr3	102227419	102227763	-57372020	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	4
1364	1183	147	21	107	chr3	102227768	102228049	-57371734	+	ORR1C2	LTR	MaLR	126	382	-2	4
1364	1738	239	43	3	chr3	102230456	102230847	-57368936	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	1	4
1364	291	210	23	80	chr3	102233329	102233417	-57366366	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	83	-296	4
1365	2351	177	61	14	chr3	102240700	102241194	-57358589	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	41	4
1365	227	286	0	16	chr3	102241244	102241308	-57358475	-	RMER15	LTR	ERVL	-512	63	1	4
1365	627	263	43	10	chr3	102241543	102241823	-57357960	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	325	-34	4
1365	2331	154	5	50	chr3	102251716	102252112	-57347671	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1365	435	309	89	87	chr3	102256586	102256990	-57342793	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	396	-12	4
1365	845	260	90	18	chr3	102259047	102259423	-57340360	+	MT2A	LTR	ERVL	13	462	-71	4
1365	910	272	57	60	chr3	102268474	102268842	-57330941	+	LTR81A	LTR	ERV1?	41	407	-943	4
1365	1298	252	97	6	chr3	102280259	102280590	-57319193	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	10	4
1365	2235	137	87	0	chr3	102280675	102281032	-57318751	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-6	388	1	4
1365	705	134	0	11	chr3	102281032	102281156	-57318627	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1509	1401	4
1365	258	196	20	0	chr3	102281145	102281196	-57318587	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-342	52	1	4
1365	1634	102	49	4	chr3	102297069	102297314	-57302469	-	MTC	LTR	MaLR	-165	256	1	4
1365	277	319	2	34	chr3	102298958	102299055	-57300728	-	MTEb	LTR	MaLR	-17	362	260	4
1365	509	226	28	63	chr3	102299477	102299619	-57300164	+	MTD	LTR	MaLR	228	364	-55	4
1365	1040	271	65	48	chr3	102308074	102308384	-57291399	-	MTE2b	LTR	MaLR	-33	346	32	4
1365	330	300	137	118	chr3	102314257	102314696	-57285087	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-2	513	67	5
1365	354	301	93	75	chr3	102314501	102314727	-57285056	-	MTEa	LTR	MaLR	-121	258	29	5
1365	4422	160	66	29	chr3	102315422	102316253	-57283530	-	RMER13B	LTR	ERVK	-36	872	11	5
1365	547	155	10	0	chr3	102341211	102341308	-57258475	+	ORR1B2	LTR	MaLR	6	103	-264	5
1365	360	373	80	59	chr3	102345989	102346277	-57253506	-	RMER13A	LTR	ERVK	-3	857	564	5
1365	1054	205	90	87	chr3	102346381	102346760	-57253023	-	RMER13A	LTR	ERVK	-480	380	1	5
1365	2143	162	51	29	chr3	102348339	102348451	-57251332	+	MTC	LTR	MaLR	1	103	-318	5
1365	2143	162	51	29	chr3	102348670	102348969	-57250814	+	MTC	LTR	MaLR	104	421	0	5
1365	793	197	49	2	chr3	102349358	102349608	-57250175	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	207	-695	5
1365	4278	141	94	11	chr3	102349635	102350457	-57249326	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	5
1365	505	255	78	44	chr3	102352282	102352487	-57247296	+	MLT1B	LTR	MaLR	91	302	-88	5
1365	1682	137	97	61	chr3	102353121	102353463	-57246320	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	5
1365	928	225	36	32	chr3	102354113	102354361	-57245422	-	RLTR16	LTR	ERVK	-256	249	1	5
1365	2274	139	43	5	chr3	102354707	102355104	-57244679	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	10	5
1365	370	308	29	29	chr3	102355944	102356081	-57243702	+	MLT1B	LTR	MaLR	421	557	-53	5
1365	416	258	68	44	chr3	102356230	102356539	-57243244	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	372	5	5
1365	704	310	136	2	chr3	102357774	102358069	-57241714	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-19	346	21	5
1365	649	300	97	35	chr3	102360052	102360394	-57239389	+	LTR79	LTR	ERVL	33	395	-132	5
1365	889	256	56	27	chr3	102362313	102362603	-57237180	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	278	-163	5
1365	1004	194	74	68	chr3	102362681	102362991	-57236792	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	216	527	0	5
1365	426	233	51	17	chr3	102366422	102366540	-57233243	+	HERV16-int	LTR	ERVL	1310	1431	-3565	5
1366	1089	267	136	11	chr3	102372289	102372649	-57227134	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	5
1366	1819	166	102	3	chr3	102374226	102374558	-57225225	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	365	-2	5
1366	1892	178	55	3	chr3	102387064	102387425	-57212358	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	3	5
1366	1261	216	102	54	chr3	102389567	102389920	-57209863	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
1366	2428	151	7	26	chr3	102390973	102391040	-57208743	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	362	5
1366	2427	182	238	10	chr3	102391040	102391640	-57208143	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	5
1366	2428	151	7	26	chr3	102391640	102392001	-57207782	-	MTC	LTR	MaLR	-60	361	1	5
1366	331	211	43	32	chr3	102399599	102399692	-57200091	-	MTE2a	LTR	MaLR	-7	372	279	6
1366	1895	121	16	118	chr3	102402014	102402380	-57197403	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1366	348	380	7	26	chr3	102403909	102404063	-57195720	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	151	-208	6
1366	273	293	10	29	chr3	102404162	102404264	-57195519	+	ORR1E	LTR	MaLR	258	357	-22	6
1366	1180	244	15	93	chr3	102409331	102409805	-57189978	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	437	-16	6
1366	250	242	61	0	chr3	102412860	102412926	-57186857	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-369	120	51	6
1366	1954	173	21	24	chr3	102419491	102419870	-57179913	+	MTC	LTR	MaLR	36	413	-8	6
1366	3165	73	0	8	chr3	102423459	102423858	-57175925	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1366	1729	147	114	11	chr3	102432470	102432821	-57166962	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	19	6
1366	454	327	0	13	chr3	102434819	102434971	-57164812	-	MT2A	LTR	ERVL	-137	396	247	6
1366	397	250	40	111	chr3	102435039	102435165	-57164618	-	MTEa	LTR	MaLR	-262	117	1	6
1366	373	255	45	9	chr3	102435168	102435279	-57164504	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1	5666	5552	6
1366	325	148	88	33	chr3	102435354	102435445	-57164338	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-850	4907	4812	6
1366	843	220	113	127	chr3	102435445	102435506	-57164277	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	558	6
1366	843	222	104	120	chr3	102435592	102435997	-57163786	-	MT2B	LTR	ERVL	-44	557	7	6
1366	518	311	7	0	chr3	102436020	102436171	-57163612	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-948	4766	4615	6
1366	7279	278	77	47	chr3	102436161	102438782	-57161001	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1370	4391	1693	6
1366	2152	155	50	10	chr3	102439096	102439493	-57160290	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	6
1366	2244	160	48	45	chr3	102441940	102442358	-57157425	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	6
1366	362	330	61	91	chr3	102458848	102459178	-57140605	-	MTEa	LTR	MaLR	-59	320	1	7
1366	243	269	43	27	chr3	102471289	102471476	-57128307	+	RMER17A	LTR	ERVK	280	469	-282	7
1366	232	313	61	85	chr3	102471488	102471652	-57128131	+	MLT1E1	LTR	MaLR	389	548	-106	7
1366	1643	202	75	36	chr3	102472853	102472982	-57126801	+	MTD	LTR	MaLR	2	144	-275	7
1366	2130	146	84	14	chr3	102472982	102473350	-57126433	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	7
1366	1643	202	75	36	chr3	102473350	102473605	-57126178	+	MTD	LTR	MaLR	145	401	-18	7
1366	644	298	116	42	chr3	102476599	102476935	-57122848	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	2	362	-1127	7
1366	251	279	78	103	chr3	102477033	102477237	-57122546	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	548	746	-743	7
1366	1218	314	134	16	chr3	102477282	102477790	-57121993	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	904	1471	-18	7
1366	309	383	69	32	chr3	102477810	102478026	-57121757	+	MLT1F	LTR	MaLR	3	226	-322	7
1366	523	360	5	23	chr3	102483181	102483400	-57116383	+	LTR33	LTR	ERVL	301	515	0	7
1366	702	152	6	105	chr3	102487919	102488081	-57111702	+	ORR1D1	LTR	MaLR	16	161	-213	7
1366	333	139	26	77	chr3	102488086	102488164	-57111619	+	ORR1D1	LTR	MaLR	310	394	0	7
1366	4978	211	86	43	chr3	102488165	102488558	-57111225	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	2	391	-979	7
1366	4978	212	87	42	chr3	102488947	102489722	-57110061	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	392	1550	-185	7
1366	940	184	43	32	chr3	102490807	102490992	-57108791	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1183	1369	-1	7
1366	1385	196	83	20	chr3	102490996	102491344	-57108439	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	7
1366	365	265	113	61	chr3	102496165	102496378	-57103405	+	RMER12	LTR	ERVK	770	993	-329	7
1367	496	247	176	0	chr3	102500160	102500330	-57099453	+	MTEb	LTR	MaLR	168	367	-12	1
1367	327	310	104	37	chr3	102500352	102500486	-57099297	-	MLT1M	LTR	MaLR	-374	298	156	2
1367	391	327	68	22	chr3	102508647	102508862	-57090921	+	MLT1G3	LTR	MaLR	1	274	-305	1
1367	976	281	81	55	chr3	102508936	102509283	-57090500	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	19	1
1367	894	285	53	113	chr3	102514337	102514773	-57085010	+	MTE2a	LTR	MaLR	8	406	-13	2
1367	4208	58	46	11	chr3	102521312	102521853	-57077930	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	3
1367	760	323	44	53	chr3	102521926	102522004	-57077779	+	MLT1A0	LTR	MaLR	2	79	-329	3
1367	2957	85	6	82	chr3	102522004	102522493	-57077290	+	RLTR11B	LTR	ERVK	2	453	0	3
1367	760	312	42	55	chr3	102522493	102522694	-57077089	+	MLT1A0	LTR	MaLR	79	281	-84	3
1367	760	312	42	55	chr3	102522904	102522963	-57076820	+	MLT1A0	LTR	MaLR	282	337	-28	3
1367	429	294	123	24	chr3	102527293	102527507	-57072276	+	MLT2B4	LTR	ERVL	303	515	-41	4
1367	2095	107	12	51	chr3	102529486	102529821	-57069962	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	5
1367	3331	156	21	12	chr3	102530338	102530897	-57068886	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-4	564	1	5
1367	1324	242	52	68	chr3	102530983	102531368	-57068415	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	5
1367	824	237	295	3	chr3	102536513	102536801	-57062982	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	376	-3	6
1367	269	286	30	30	chr3	102555024	102555125	-57044658	+	MLT1K	LTR	MaLR	493	593	-2	9
1367	2250	91	32	59	chr3	102563624	102563962	-57035821	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
1367	2347	124	77	6	chr3	102570234	102570600	-57029183	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	1
1367	2493	126	80	0	chr3	102571001	102571389	-57028394	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	1
1367	257	290	53	88	chr3	102578644	102578814	-57020969	-	MLT1K	LTR	MaLR	-114	481	318	1
1367	420	304	177	18	chr3	102588819	102589147	-57010636	-	MER57C2	LTR	ERV1	-11	423	44	1
1367	289	289	235	7	chr3	102592669	102592805	-57006978	+	MLT1C	LTR	MaLR	106	272	-195	1
1367	936	232	9	22	chr3	102594380	102594605	-57005178	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	222	-157	1
1367	1892	113	48	51	chr3	102594600	102594935	-57004848	+	MT2B	LTR	ERVL	49	382	-219	1
1367	250	156	30	45	chr3	102600154	102600221	-56999562	-	ORR1E	LTR	MaLR	-8	371	306	1
1367	973	239	47	70	chr3	102600246	102600547	-56999236	-	ORR1E	LTR	MaLR	-65	294	1	1
1367	3492	25	5	0	chr3	102602869	102603263	-56996520	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1367	1180	240	137	9	chr3	102606938	102607266	-56992517	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
1367	1282	220	139	50	chr3	102608439	102608841	-56990942	-	RMER10A	LTR	ERVL	-4	438	1	1
1367	3352	160	65	27	chr3	102610793	102611766	-56988017	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	1013	-10	1
1367	1394	120	41	14	chr3	102613144	102613364	-56986419	+	ORR1A2	LTR	MaLR	102	327	0	1
1367	1189	197	0	14	chr3	102613372	102613583	-56986200	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	772	979	-391	1
1367	427	167	83	0	chr3	102613585	102613669	-56986114	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	3	93	-314	1
1367	321	145	19	2	chr3	102613668	102613725	-56986058	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	194	265	-154	1
1367	1081	249	77	19	chr3	102613727	102614114	-56985669	-	MT2A	LTR	ERVL	-26	575	1	1
1367	1613	215	68	90	chr3	102614644	102614770	-56985013	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	285	1
1367	1613	215	68	90	chr3	102614957	102615116	-56984667	-	MTD	LTR	MaLR	-135	284	116	1
1367	1613	215	68	90	chr3	102615409	102615546	-56984237	-	MTD	LTR	MaLR	-304	115	5	1
1368	328	417	49	6	chr3	102644004	102644168	-56955615	+	LTR16A	LTR	ERVL	234	404	-47	2
1368	793	217	96	45	chr3	102649612	102649749	-56950034	+	MTD	LTR	MaLR	3	156	-263	2
1368	2582	133	35	57	chr3	102649749	102650242	-56949541	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	2
1368	793	217	96	45	chr3	102650242	102650302	-56949481	+	MTD	LTR	MaLR	157	210	-209	2
1368	662	207	177	25	chr3	102651624	102651811	-56947972	+	MTD	LTR	MaLR	203	421	0	2
1368	236	128	26	0	chr3	102652657	102652696	-56947087	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	40	-328	2
1368	501	119	60	0	chr3	102652855	102652939	-56946844	+	RLTR9A	LTR	ERVK	280	368	0	2
1368	3129	56	5	10	chr3	102653209	102653607	-56946176	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1368	232	278	79	28	chr3	102678762	102678940	-56920843	+	RMER17C	LTR	ERVK	88	274	-136	2
1368	1707	201	48	104	chr3	102681462	102682001	-56917782	+	RLTR11A	LTR	ERVK	20	528	0	2
1368	1310	249	95	15	chr3	102697661	102698021	-56901762	+	MTD	LTR	MaLR	1	352	-67	2
1368	588	226	66	40	chr3	102698039	102698237	-56901546	-	RMER20B	LTR	ERVK	-191	436	234	2
1368	3537	15	0	0	chr3	102699315	102699711	-56900072	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1368	3512	8	5	0	chr3	102708509	102708903	-56890880	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1368	9332	21	7	0	chr3	102708903	102709993	-56889790	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
1368	3512	8	5	0	chr3	102709993	102710387	-56889396	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1368	304	316	21	0	chr3	102712981	102713076	-56886707	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4604	4700	-299	3
1368	551	257	90	127	chr3	102722221	102722405	-56877378	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	162	3
1368	776	150	176	18	chr3	102722489	102722659	-56877124	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-177	197	1	3
1368	961	269	127	35	chr3	102723738	102724084	-56875699	+	MTD	LTR	MaLR	42	419	0	3
1368	1426	183	108	10	chr3	102733594	102733908	-56865875	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	75	3
1368	2182	259	97	65	chr3	102741024	102741822	-56857961	-	MTE-int	LTR	MaLR	-463	1117	295	3
1368	1389	210	59	54	chr3	102742795	102743167	-56856616	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1368	1733	232	169	36	chr3	102759330	102759903	-56839880	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	615	-77	4
21	849	226	16	6	chr3	102760346	102760528	-56839255	+	RMER16	LTR	ERVK	1	184	-349	4
1369	3987	139	53	21	chr3	102769636	102770351	-56829432	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	738	-18	4
1369	1226	191	104	82	chr3	102772240	102772645	-56827138	-	RMER10A	LTR	ERVL	-18	424	11	4
1369	4656	166	51	7	chr3	102774499	102775343	-56824440	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-576	5185	4305	4
1369	15746	129	29	2	chr3	102775343	102776451	-56823332	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1585	4176	3048	4
1369	15746	129	29	2	chr3	102776473	102777868	-56821915	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2714	3047	1608	4
1369	232	229	188	68	chr3	102778695	102778812	-56820971	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	678	808	0	4
1369	3079	166	65	13	chr3	102778819	102779577	-56820206	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4176	1538	720	4
1369	328	113	567	0	chr3	102782108	102782205	-56817578	-	MTD	LTR	MaLR	-39	380	214	4
1369	845	222	3	12	chr3	102782232	102782417	-56817366	-	MTD	LTR	MaLR	-194	213	13	4
1369	271	231	16	32	chr3	102785692	102785817	-56813966	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	632	4
1369	757	243	102	181	chr3	102786023	102786233	-56813550	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	173	4
1369	757	243	102	181	chr3	102786431	102786612	-56813171	-	MTE2a	LTR	MaLR	-207	172	19	4
1369	255	250	60	126	chr3	102809286	102809437	-56790346	+	MLT1N2	LTR	MaLR	1	141	-421	5
1369	1300	114	66	50	chr3	102812858	102813117	-56786666	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-20	433	171	5
1369	993	108	0	135	chr3	102813293	102813508	-56786275	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-267	186	1	5
1369	381	161	28	131	chr3	102813511	102813618	-56786165	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-3	6547	6452	5
1369	2883	63	44	10	chr3	102813909	102814292	-56785491	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1369	980	179	10	39	chr3	102815515	102815718	-56784065	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	180	5
1369	271	300	19	39	chr3	102819483	102819587	-56780196	-	RMER10B	LTR	ERVL	-30	368	267	5
1369	405	158	0	13	chr3	102822713	102822790	-56776993	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-291	76	1	5
1369	496	128	2	14	chr3	102822790	102822870	-56776913	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-52	1528	1431	5
1369	880	123	375	0	chr3	102822994	102823213	-56776570	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-97	1866	1566	5
1369	277	269	0	141	chr3	102841226	102841347	-56758436	-	MT2B	LTR	ERVL	-345	256	153	6
1369	3322	46	88	69	chr3	102851214	102851680	-56748103	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	6
1369	1892	128	134	15	chr3	102871852	102872194	-56727589	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-9	385	3	7
1369	305	344	39	76	chr3	102874099	102874461	-56725322	+	LTR16B1	LTR	ERVL	55	458	-5	7
1369	5051	144	124	61	chr3	102875556	102876519	-56723264	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1023	0	7
1369	327	245	20	69	chr3	102884139	102884240	-56715543	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	279	7
1370	1325	226	89	5	chr3	102916074	102916456	-56683327	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	8
1370	292	196	18	0	chr3	102920619	102920675	-56679108	-	MT2B	LTR	ERVL	-364	237	181	8
1370	1728	124	42	32	chr3	102921220	102921529	-56678254	+	RMER4A	LTR	ERVK	155	466	0	8
1370	1812	167	66	16	chr3	102927588	102927965	-56671818	+	MTD	LTR	MaLR	10	405	-14	8
1370	292	222	120	10	chr3	102945285	102945385	-56654398	-	ORR1E	LTR	MaLR	-248	111	1	9
1370	346	165	8	192	chr3	102962830	102962950	-56636833	+	MT2B	LTR	ERVL	167	264	-337	9
1370	2241	184	105	0	chr3	102963438	102963915	-56635868	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	9
1370	274	204	17	104	chr3	102967735	102967763	-56632020	+	MT2B	LTR	ERVL	144	161	-440	9
1370	1491	167	199	0	chr3	102969202	102969508	-56630275	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	9
1370	1858	85	92	3	chr3	102969969	102970263	-56629520	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-7	320	1	9
1370	338	276	157	18	chr3	102971393	102971559	-56628224	-	ORR1E	LTR	MaLR	-162	197	9	9
1370	439	204	427	19	chr3	102973707	102973971	-56625812	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	9
1370	2065	129	139	45	chr3	102982834	102982898	-56616885	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	64	-402	1
1370	2065	129	139	45	chr3	102983089	102983447	-56616336	+	RMER4A	LTR	ERVK	65	463	-3	1
1370	304	285	104	37	chr3	102984957	102985121	-56614662	+	MTE-int	LTR	MaLR	329	503	-1077	1
1370	554	319	101	50	chr3	102985324	102985720	-56614063	+	MTE-int	LTR	MaLR	1126	1541	-39	1
1370	5298	154	24	32	chr3	102985865	102986765	-56613018	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-643	5118	4226	1
1370	2386	142	105	63	chr3	102986766	102987271	-56612512	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	117	1
1370	8889	225	44	30	chr3	102987274	102988497	-56611286	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1722	4828	3575	1
1370	8889	206	36	25	chr3	102988689	102988768	-56611015	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5161	3798	3720	1
1370	8889	206	36	25	chr3	102988801	102989926	-56609857	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-5240	3719	2587	1
1370	574	258	49	0	chr3	102990138	102990301	-56609482	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8071	888	718	1
1370	253	226	19	0	chr3	102990957	102991010	-56608773	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-8788	171	118	1
1370	1942	193	72	26	chr3	102991361	102991727	-56608056	+	RLTR16	LTR	ERVK	27	400	-105	1
1370	1942	193	72	26	chr3	102991771	102991862	-56607921	+	RLTR16	LTR	ERVK	401	504	-1	1
1370	461	288	70	50	chr3	102993123	102993446	-56606337	-	RLTR15	LTR	ERVK	-56	303	59	1
1370	291	197	0	0	chr3	102993686	102993752	-56606031	-	RLTR15	LTR	ERVK	-458	70	5	1
1370	721	279	57	20	chr3	102994363	102994663	-56605120	-	RMER5	LTR	ERV1	-4	530	220	1
1370	1663	223	107	225	chr3	102995229	102996046	-56603737	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	720	0	1
1370	2610	97	166	2	chr3	102996212	102996669	-56603114	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	532	0	1
1370	276	203	15	59	chr3	102996906	102996974	-56602809	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	65	-377	1
1370	1030	126	48	7	chr3	102996974	102997254	-56602529	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	144	1
1370	995	218	138	15	chr3	102997251	102997581	-56602202	+	RMER10A	LTR	ERVL	59	431	-11	1
1370	555	261	166	41	chr3	102998687	102999016	-56600767	+	MLT1D	LTR	MaLR	115	505	0	1
1370	228	232	236	79	chr3	103001388	103001466	-56598317	+	MLT1A1	LTR	MaLR	255	357	-51	4
1370	848	110	102	0	chr3	103002152	103002279	-56597504	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	140	-580	9
1370	393	219	0	0	chr3	103002288	103002361	-56597422	+	RMER6D	LTR	ERVK	72	144	-576	1
1370	408	184	0	73	chr3	103002405	103002487	-56597296	+	RMER6D	LTR	ERVK	72	147	-573	1
1370	243	179	0	0	chr3	103002483	103002522	-56597261	+	RMER6D	LTR	ERVK	72	110	-610	1
1370	393	199	0	0	chr3	103002522	103002600	-56597183	+	RMER6D	LTR	ERVK	72	144	-576	1
1370	453	178	0	0	chr3	103002600	103002673	-56597110	+	RMER6D	LTR	ERVK	72	144	-576	1
1370	253	175	0	0	chr3	103002677	103002717	-56597066	+	RMER6D	LTR	ERVK	71	110	-610	1
1370	419	174	0	0	chr3	103002717	103002786	-56596997	+	RMER6D	LTR	ERVK	72	140	-580	1
1370	449	171	0	0	chr3	103002794	103002864	-56596919	+	RMER6D	LTR	ERVK	71	140	-580	1
1370	3444	141	99	26	chr3	103002873	103003152	-56596631	+	RMER6D	LTR	ERVK	72	349	-371	1
1370	3444	141	99	26	chr3	103003186	103003250	-56596533	+	RMER6D	LTR	ERVK	350	421	-299	1
1370	3873	120	3	21	chr3	103003250	103003827	-56595956	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	1
1370	3444	141	99	26	chr3	103003827	103004087	-56595696	+	RMER6D	LTR	ERVK	422	720	0	1
1370	2389	97	112	8	chr3	103005042	103005407	-56594376	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	2
1370	439	141	14	0	chr3	103005772	103005843	-56593940	+	MTC	LTR	MaLR	10	81	-340	2
1370	676	181	53	0	chr3	103006133	103006266	-56593517	+	MTC	LTR	MaLR	28	167	-254	2
1370	294	228	89	89	chr3	103008229	103008240	-56591543	+	MT2B	LTR	ERVL	139	181	-420	3
1370	294	228	89	89	chr3	103008318	103008330	-56591453	+	MT2B	LTR	ERVL	182	239	-362	3
1370	2106	110	65	132	chr3	103008359	103008471	-56591312	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	100	-330	3
1370	2106	110	65	132	chr3	103008513	103008861	-56590922	+	RLTR23	LTR	ERV1	101	430	0	3
1370	300	311	147	53	chr3	103011053	103011243	-56588540	-	LTR16A	LTR	ERVL	-13	438	231	4
1370	1003	183	131	37	chr3	103011207	103011277	-56588506	+	RMER10B	LTR	ERVL	132	200	-198	5
1370	1003	183	131	37	chr3	103011338	103011511	-56588272	+	RMER10B	LTR	ERVL	201	397	-1	5
1370	230	183	267	0	chr3	103011929	103011989	-56587794	-	RLTR18	LTR	ERVK	-339	277	202	5
1370	393	241	201	40	chr3	103011984	103012183	-56587600	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-257	255	25	5
1370	1994	142	115	39	chr3	103013798	103014215	-56585568	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	6
1370	244	135	27	0	chr3	103014391	103014428	-56585355	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	38	-346	6
1370	1265	119	45	5	chr3	103014456	103014658	-56585125	+	ORR1B2	LTR	MaLR	150	359	-8	6
1370	816	138	46	0	chr3	103014691	103014821	-56584962	-	RLTR41	LTR	ERV1	-102	344	209	6
1370	851	223	6	39	chr3	103015035	103015217	-56584566	-	RLTR41	LTR	ERV1	-218	228	53	6
1370	589	189	134	145	chr3	103015197	103015376	-56584407	-	RLTR41	LTR	ERV1	-269	177	1	6
1370	433	231	28	19	chr3	103016447	103016553	-56583230	+	RLTR23	LTR	ERV1	324	430	0	6
1370	1217	207	130	95	chr3	103017372	103017893	-56581890	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	611	1	7
1370	1539	223	151	27	chr3	103018583	103018993	-56580790	-	RMER20A	LTR	ERVK	-55	461	1	7
1370	2846	102	115	5	chr3	103019370	103019804	-56579979	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	7
1371	2092	153	54	34	chr3	103023047	103023552	-56576231	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	0	584	3	8
1371	297	254	0	0	chr3	103024018	103024089	-56575694	+	MER57-int	LTR	ERV1	7149	7219	-318	8
1371	2041	140	9	104	chr3	103024259	103024667	-56575116	+	ORR1B1	LTR	MaLR	28	392	-2	8
1371	268	282	28	0	chr3	103025330	103025401	-56574382	-	MER77	LTR	ERVL	-233	374	302	9
1371	3016	63	50	0	chr3	103025767	103026148	-56573635	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	9
1371	2470	191	110	42	chr3	103029004	103029577	-56570206	+	RLTR18	LTR	ERVK	5	616	0	1
1371	294	237	41	51	chr3	103030935	103031033	-56568750	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	467	563	-4754	1
1371	3865	121	274	102	chr3	103031238	103031401	-56568382	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	253	-850	1
1371	3865	124	186	23	chr3	103031546	103032259	-56567524	+	RLTR25A	LTR	ERVK	254	1103	0	1
1371	354	312	18	60	chr3	103032260	103032427	-56567356	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	750	909	-4408	1
1371	3148	91	24	49	chr3	103032498	103032992	-56566791	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1371	592	297	15	71	chr3	103033392	103033660	-56566123	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	5065	5317	0	1
1371	1037	214	238	36	chr3	103033712	103034158	-56565625	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	536	-154	1
1371	1088	124	0	0	chr3	103034575	103034736	-56565047	+	RMER6C	LTR	ERVK	530	690	0	1
1371	407	259	133	42	chr3	103034946	103035111	-56564672	+	RLTR14	LTR	ERV1	203	382	0	1
1371	559	254	207	21	chr3	103038714	103038951	-56560832	-	RMER20B	LTR	ERVK	-235	392	112	1
1371	880	299	109	25	chr3	103039621	103039978	-56559805	+	MTD	LTR	MaLR	18	404	-15	1
1371	709	261	65	121	chr3	103039982	103040077	-56559706	+	MTD-int	LTR	MaLR	3	69	-1511	1
1371	868	252	152	88	chr3	103040224	103040961	-56558822	+	MTD-int	LTR	MaLR	51	950	-308	1
1371	3546	25	0	0	chr3	103041672	103042068	-56557715	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1371	2719	41	77	0	chr3	103042476	103042815	-56556968	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	1
1371	2333	131	71	47	chr3	103042905	103043369	-56556414	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1371	2050	174	17	62	chr3	103043403	103043807	-56555976	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	1
1371	1799	120	7	213	chr3	103044496	103044799	-56554984	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	286	-43	1
1371	1799	120	7	213	chr3	103044946	103045056	-56554727	+	ORR1A4	LTR	MaLR	287	329	0	1
1371	468	250	37	0	chr3	103045662	103045798	-56553985	+	RMER15	LTR	ERVL	422	562	-13	1
1371	2670	166	62	6	chr3	103046726	103047229	-56552554	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	3	1
1371	4181	62	36	18	chr3	103047795	103048352	-56551431	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	1
1371	733	213	96	20	chr3	103049549	103049851	-56549932	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	84	1
1371	839	268	42	15	chr3	103051670	103051935	-56547848	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	272	-98	1
1371	1597	198	105	16	chr3	103052744	103053171	-56546612	+	RMER15	LTR	ERVL	27	557	-18	1
1371	1263	107	34	216	chr3	103053724	103053753	-56546030	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	384	1
1371	1263	107	34	216	chr3	103053850	103054237	-56545546	-	RMER17C	LTR	ERVK	-27	383	70	1
1371	430	110	123	0	chr3	103054616	103054689	-56545094	-	RMER17C	LTR	ERVK	-328	82	1	1
1371	250	192	75	88	chr3	103057666	103057746	-56542037	+	RLTR25A	LTR	ERVK	504	582	-521	1
1371	729	240	67	10	chr3	103060111	103060305	-56539478	-	MER77	LTR	ERVL	-364	243	39	2
1371	1926	170	251	7	chr3	103063560	103064022	-56535761	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	2
1371	1202	222	77	27	chr3	103064148	103064514	-56535269	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	2
1371	364	254	101	8	chr3	103064827	103064946	-56534837	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	248	2
1371	357	246	50	129	chr3	103064953	103065035	-56534748	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	312	2
1371	357	246	50	129	chr3	103065234	103065291	-56534492	-	RMER10B	LTR	ERVL	-87	311	270	2
1371	388	336	83	43	chr3	103065392	103065694	-56534089	-	MTC	LTR	MaLR	-107	314	1	2
1371	2192	108	13	3	chr3	103065699	103066014	-56533769	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	2	2
1371	2000	163	26	9	chr3	103066069	103066410	-56533373	+	ORR1B1	LTR	MaLR	48	394	0	2
1371	407	226	471	63	chr3	103066573	103066811	-56532972	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	568	-59	2
1371	2734	179	13	45	chr3	103066824	103067387	-56532396	+	RMER19C	LTR	ERVK	2	611	0	2
1371	989	219	120	36	chr3	103069068	103069343	-56530440	-	RMER20B	LTR	ERVK	-22	605	308	2
1371	272	249	71	42	chr3	103069669	103069731	-56530052	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-861	648	582	2
1371	2551	121	147	2	chr3	103070022	103070443	-56529340	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	2
1371	1170	236	35	59	chr3	103071957	103072295	-56527488	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-42	332	3	2
1371	988	266	42	59	chr3	103072352	103072701	-56527082	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	430	-181	2
1371	8425	98	17	10	chr3	103072701	103073923	-56525860	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-1582	4198	2968	2
1371	1005	136	7	0	chr3	103073911	103074065	-56525718	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-787	4993	4839	2
1371	1551	97	4	81	chr3	103074308	103074355	-56525428	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-954	4826	4791	2
1371	1551	97	4	81	chr3	103074547	103074749	-56525034	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-990	4790	4588	2
1371	426	301	50	39	chr3	103076177	103076357	-56523426	-	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	-1	838	657	2
1371	1838	136	80	10	chr3	103076838	103077151	-56522632	-	RMER20A	LTR	ERVK	-181	335	1	2
1371	838	114	15	0	chr3	103079163	103079294	-56520489	-	RMER6D	LTR	ERVK	-381	339	207	2
1371	922	115	301	0	chr3	103079539	103079708	-56520075	-	RMER6D	LTR	ERVK	-494	226	3	2
1371	758	292	83	14	chr3	103079820	103080179	-56519604	+	MER77	LTR	ERVL	1	475	-132	2
1371	298	295	13	13	chr3	103080207	103080286	-56519497	+	MER77	LTR	ERVL	529	607	0	2
1371	383	179	188	10	chr3	103081860	103081956	-56517827	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-250	128	16	2
1371	317	259	17	61	chr3	103089543	103089658	-56510125	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	155	3
1371	413	195	12	0	chr3	103092413	103092495	-56507288	-	ORR1E	LTR	MaLR	-276	83	1	3
1371	363	333	212	4	chr3	103092863	103093113	-56506670	-	MLT1F	LTR	MaLR	-116	432	131	3
1371	1943	138	70	0	chr3	103095579	103095920	-56503863	+	RMER6B	LTR	ERVK	83	447	-14	3
1371	1722	159	24	20	chr3	103095924	103096219	-56503564	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2	297	-8662	3
1371	1026	109	131	6	chr3	103096223	103096398	-56503385	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	977	1173	-7786	3
1371	1045	130	59	49	chr3	103096642	103096845	-56502938	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1160	1364	-7595	3
1371	9520	102	43	14	chr3	103096827	103098269	-56501514	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1561	3044	-5915	3
1371	7738	90	36	20	chr3	103098267	103099432	-56500351	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	3845	5028	-3931	3
1371	6801	97	81	53	chr3	103099444	103100586	-56499197	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	4937	6109	-2850	3
1371	729	45	45	0	chr3	103101172	103101261	-56498522	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	5058	5150	-3809	3
1371	1733	130	121	22	chr3	103105564	103105878	-56493905	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-37	357	13	3
1371	300	276	482	13	chr3	103117947	103118179	-56481604	-	MER21B	LTR	ERV1	-124	739	400	3
1371	297	375	76	32	chr3	103118193	103118350	-56481433	-	MER21B	LTR	ERV1	-510	353	190	3
1371	301	327	28	107	chr3	103119347	103119525	-56480258	-	MER21-int	LTR	ERV1	-2085	2106	1943	3
1371	461	298	89	76	chr3	103141642	103141878	-56457905	-	MLT2D	LTR	ERVL	-63	351	113	4
1371	2103	150	116	25	chr3	103147231	103147700	-56452083	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	457	17	4
171	484	182	95	40	chr3	103153541	103153667	-56446116	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-84	448	316	4
1372	510	280	157	24	chr3	103165133	103165482	-56434301	-	MTD	LTR	MaLR	-4	417	1	4
1372	788	195	189	5	chr3	103165766	103165962	-56433821	-	MTD	LTR	MaLR	-181	238	7	4
1372	348	229	24	12	chr3	103166666	103166750	-56433033	-	MTC	LTR	MaLR	-331	90	6	5
1372	1133	133	65	30	chr3	103167554	103167755	-56432028	+	ORR1A2	LTR	MaLR	79	286	-41	5
1372	331	225	56	0	chr3	103167948	103168019	-56431764	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	75	-304	5
1372	310	228	152	68	chr3	103168054	103168186	-56431597	+	MTE2b	LTR	MaLR	164	313	-66	5
1372	2087	118	21	12	chr3	103171905	103172231	-56427552	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	5
1372	7247	136	166	149	chr3	103172231	103174161	-56425622	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	1	5
1372	998	83	80	0	chr3	103174161	103174336	-56425447	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	111	5
1372	448	237	74	124	chr3	103176347	103176564	-56423219	+	RMER2	LTR	ERV1	334	539	-28	5
1372	1166	168	48	5	chr3	103180514	103180724	-56419059	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	201	5
1372	1722	62	175	114	chr3	103181596	103181655	-56418128	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	277	5
1372	1722	62	175	114	chr3	103181802	103182050	-56417733	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-51	276	1	5
1372	283	200	163	78	chr3	103182074	103182215	-56417568	-	MER57D	LTR	ERV1	-121	313	161	5
1372	320	264	25	91	chr3	103182413	103182534	-56417249	+	RMER12	LTR	ERVK	749	861	-461	5
1372	2589	93	29	36	chr3	103186275	103186689	-56413094	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	5
1372	287	295	40	24	chr3	103189193	103189318	-56410465	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-14	548	422	5
1372	384	154	15	0	chr3	103192357	103192422	-56407361	+	MT2A	LTR	ERVL	1	66	-467	5
1372	724	211	224	10	chr3	103193007	103193320	-56406463	+	MT2A	LTR	ERVL	75	455	-78	5
1372	621	264	65	33	chr3	103193341	103193525	-56406258	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-325	195	6	5
1372	3006	154	126	25	chr3	103193734	103194669	-56405114	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	1023	2	5
1372	3206	54	13	5	chr3	103195789	103196182	-56403601	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1372	1313	160	49	0	chr3	103198718	103198943	-56400840	+	ORR1B1	LTR	MaLR	151	386	-8	5
1372	515	293	30	0	chr3	103200405	103200538	-56399245	+	MTEa	LTR	MaLR	1	137	-242	5
1372	759	303	90	19	chr3	103200570	103200880	-56398903	+	MT2A	LTR	ERVL	190	521	-12	5
1372	3370	33	2	22	chr3	103201912	103202316	-56397467	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1372	3046	105	15	18	chr3	103209048	103209505	-56390278	-	RMER6B	LTR	ERVK	-3	458	3	6
1372	241	286	18	0	chr3	103211347	103211403	-56388380	-	MT2B2	LTR	ERVL	-343	241	185	6
1372	448	213	139	0	chr3	103218509	103218617	-56381166	+	RMER15	LTR	ERVL	239	361	-214	6
1372	730	305	93	47	chr3	103221586	103222011	-56377772	-	MLT1G1	LTR	MaLR	0	489	75	6
1372	442	356	25	12	chr3	103225901	103226063	-56373720	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-352	204	41	6
1372	4129	121	141	35	chr3	103227990	103228854	-56370929	-	RMER17B	LTR	ERVK	-1	957	2	6
1372	3180	14	0	0	chr3	103234657	103235003	-56364780	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	6
1372	262	291	101	69	chr3	103236990	103237178	-56362605	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	180	6
1372	963	173	17	34	chr3	103238628	103238807	-56360976	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-193	181	6	6
1372	1982	210	43	4	chr3	103239669	103240072	-56359711	+	MTD	LTR	MaLR	2	403	-16	6
1372	3242	53	5	5	chr3	103241834	103242230	-56357553	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1372	242	265	19	75	chr3	103242536	103242642	-56357141	+	MT2B2	LTR	ERVL	159	258	-326	6
1372	605	321	32	27	chr3	103247693	103247914	-56351869	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	354	7
1372	1967	97	6	124	chr3	103251040	103251404	-56348379	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	7
1372	1570	189	161	75	chr3	103257316	103257807	-56341976	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	7
1372	253	247	37	49	chr3	103261299	103261380	-56338403	+	LTR86A1	LTR	ERVL	7	86	-427	7
1372	385	333	154	6	chr3	103261629	103261798	-56337985	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-345	234	41	7
1372	790	224	46	17	chr3	103262539	103262712	-56337071	+	MTEb	LTR	MaLR	2	179	-200	7
1372	2277	160	46	138	chr3	103262715	103263302	-56336481	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	7
1372	649	218	37	110	chr3	103263464	103263655	-56336128	+	MTEa	LTR	MaLR	201	377	-2	7
1372	2080	248	125	35	chr3	103263657	103264662	-56335121	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1	1578	-2	7
1372	659	270	20	106	chr3	103264664	103264863	-56334920	+	MTEa	LTR	MaLR	198	379	0	7
1372	259	305	50	8	chr3	103264867	103264986	-56334797	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	213	336	-5331	7
1372	651	315	73	11	chr3	103265499	103265759	-56334024	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	491	766	-4901	7
1372	2106	98	4	181	chr3	103267235	103267733	-56332050	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	7
1372	492	296	68	6	chr3	103276252	103276415	-56323368	+	MLT2B4	LTR	ERVL	69	241	-315	7
1372	1998	180	77	0	chr3	103281243	103281609	-56318174	+	MTD	LTR	MaLR	12	405	-14	7
1372	246	254	119	0	chr3	103282983	103283042	-56316741	+	MLT1H	LTR	MaLR	484	549	0	7
1373	1278	206	136	73	chr3	103288359	103288742	-56311041	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	7
1373	244	244	58	47	chr3	103289837	103289923	-56309860	-	RLTR28	LTR	ERVL	-20	504	418	7
1373	537	356	71	51	chr3	103291723	103292075	-56307708	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	7
1373	2174	107	9	58	chr3	103295347	103295693	-56304090	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	8
1373	841	173	40	35	chr3	103297227	103297319	-56302464	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	434	8
1373	841	173	40	35	chr3	103297472	103297553	-56302230	-	RLTR24	LTR	ERV1	-96	433	355	8
1373	1823	149	64	12	chr3	103298018	103298364	-56301419	-	RLTR24	LTR	ERV1	-165	364	1	8
1373	821	299	75	52	chr3	103298718	103299064	-56300719	-	MTD	LTR	MaLR	-65	354	1	8
1373	480	294	48	74	chr3	103302342	103302704	-56297079	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	15	8
1373	1049	196	25	37	chr3	103305831	103306075	-56293708	+	RMER13B	LTR	ERVK	325	565	-343	8
1373	230	196	98	49	chr3	103306063	103306165	-56293618	+	RMER13B	LTR	ERVK	798	904	-4	8
1373	545	274	172	42	chr3	103306387	103306625	-56293158	+	MTD	LTR	MaLR	151	419	0	8
1373	950	294	55	46	chr3	103315736	103316061	-56283722	-	MT2A	LTR	ERVL	-16	517	190	8
1373	239	308	209	47	chr3	103324549	103324740	-56275043	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-48	514	293	8
1373	2319	94	3	81	chr3	103325291	103325648	-56274135	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	8
1373	491	316	96	73	chr3	103326215	103326529	-56273254	+	MLT1J1	LTR	MaLR	4	324	-120	8
1373	1158	287	73	13	chr3	103327940	103328254	-56271529	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	22	8
1373	257	316	10	59	chr3	103329268	103329369	-56270414	-	MLT1K	LTR	MaLR	-15	580	485	8
1373	260	259	85	81	chr3	103329371	103329578	-56270205	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	191	-199	8
1373	234	259	43	77	chr3	103330056	103330173	-56269610	+	MTE2a	LTR	MaLR	267	379	0	8
1373	995	184	44	48	chr3	103330766	103331070	-56268713	-	RMER17B	LTR	ERVK	-517	441	16	8
1373	733	293	72	54	chr3	103331514	103331792	-56267991	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	283	-285	8
1373	397	144	254	26	chr3	103331782	103331837	-56267946	+	RLTR20D	LTR	ERVK	423	479	-99	8
1373	397	144	254	26	chr3	103331933	103331991	-56267792	+	RLTR20D	LTR	ERVK	480	561	-17	8
1373	2875	62	69	3	chr3	103333539	103333914	-56265869	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	8
1373	6620	116	20	81	chr3	103333914	103335082	-56264701	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	1	8
1373	3157	62	0	31	chr3	103335082	103335495	-56264288	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	8
1373	470	164	43	69	chr3	103338872	103338984	-56260799	-	MTD	LTR	MaLR	-308	113	1	8
1373	1990	171	106	3	chr3	103340744	103341113	-56258670	+	MTD	LTR	MaLR	5	411	-8	8
1373	536	254	197	14	chr3	103341112	103341320	-56258463	+	MT2A	LTR	ERVL	288	533	0	8
1373	1572	265	21	21	chr3	103343868	103344254	-56255529	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	3	9
1373	2331	82	27	59	chr3	103345848	103346185	-56253598	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	9
1373	2378	119	68	0	chr3	103348656	103349010	-56250773	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	9
1373	855	232	81	111	chr3	103349708	103350105	-56249678	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	386	-4	9
1373	247	312	50	0	chr3	103351840	103351920	-56247863	-	MLT1C	LTR	MaLR	-8	459	376	9
1373	298	235	69	121	chr3	103353752	103353868	-56245915	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	155	9
1373	759	327	80	15	chr3	103358896	103358943	-56240840	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-18	347	301	9
1373	3449	38	2	0	chr3	103358943	103359338	-56240445	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1373	9319	32	4	2	chr3	103359338	103360434	-56239349	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	9
1373	3437	38	2	0	chr3	103360434	103360829	-56238954	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1373	759	327	80	15	chr3	103360829	103361105	-56238678	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-65	300	3	9
1373	2347	110	152	5	chr3	103362076	103362478	-56237305	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-150	1359	899	9
1373	576	105	53	0	chr3	103362472	103362567	-56237216	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-267	100	1	9
1373	1471	163	110	7	chr3	103362567	103362624	-56237159	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-74	300	239	9
1373	1471	163	110	7	chr3	103362650	103362864	-56236919	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-136	238	2	9
1373	267	233	14	89	chr3	103363491	103363637	-56236146	-	MER4B-int	LTR	ERV1	-4573	2185	2051	9
1373	2194	112	12	36	chr3	103364508	103364842	-56234941	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	9
1373	235	312	46	42	chr3	103374587	103374804	-56224979	+	RMER17A	LTR	ERVK	288	505	-246	9
1373	323	226	7	163	chr3	103383151	103383204	-56216579	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-459	569	524	9
1373	323	226	7	163	chr3	103383231	103383330	-56216453	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-505	523	441	9
1373	917	330	50	25	chr3	103392130	103392490	-56207293	-	MLT1I	LTR	MaLR	0	411	43	9
1373	1609	182	102	16	chr3	103394646	103394969	-56204814	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	69	1
1373	362	289	33	0	chr3	103395436	103395526	-56204257	-	MTD	LTR	MaLR	-326	93	1	1
1373	631	258	196	79	chr3	103414723	103415039	-56184744	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	1	1
1374	1267	238	58	23	chr3	103417645	103417954	-56181829	+	MTE2a	LTR	MaLR	58	377	-2	1
1374	254	265	170	50	chr3	103435001	103435160	-56164623	+	LTR80A	LTR	ERVL	389	566	-17	1
1374	633	338	73	11	chr3	103439764	103440036	-56159747	-	MLT1I	LTR	MaLR	-3	408	120	1
1374	781	276	222	23	chr3	103442890	103443287	-56156496	-	RMER20B	LTR	ERVK	-23	604	129	1
1374	426	287	75	27	chr3	103445047	103445194	-56154589	+	MLT1A0	LTR	MaLR	210	363	-2	1
1374	228	321	37	28	chr3	103452750	103452859	-56146924	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	110	-298	1
1374	263	278	99	38	chr3	103452922	103453053	-56146730	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	406	-2	1
1374	4517	52	9	7	chr3	103454857	103455416	-56144367	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	1
1374	1579	174	150	140	chr3	103458634	103459162	-56140621	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	1
1374	269	389	47	16	chr3	103459493	103459621	-56140162	-	MLT1M	LTR	MaLR	-405	267	136	1
1374	3554	38	86	0	chr3	103460808	103461252	-56138531	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1374	246	317	0	56	chr3	103462420	103462527	-56137256	+	MER21B	LTR	ERV1	1	101	-762	1
1374	870	306	77	39	chr3	103462981	103463302	-56136481	+	MER21B	LTR	ERV1	273	608	-255	1
1374	870	306	77	39	chr3	103463918	103463932	-56135851	+	MER21B	LTR	ERV1	609	621	-242	1
1374	616	313	20	15	chr3	103463999	103464200	-56135583	+	MER21B	LTR	ERV1	612	813	-50	1
1374	298	384	56	6	chr3	103465715	103465893	-56133890	+	LTR78	LTR	ERV1	1078	1264	-40	1
1374	2285	161	71	0	chr3	103467827	103468219	-56131564	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	1
1374	666	245	35	40	chr3	103469327	103469527	-56130256	+	LTR81B	LTR	ERV1?	1	199	-1194	1
1374	573	249	286	26	chr3	103470132	103470363	-56129420	+	MTE2b	LTR	MaLR	87	377	-2	1
1374	1384	263	67	86	chr3	103472508	103473044	-56126739	+	MT2A	LTR	ERVL	8	533	0	1
1374	733	290	84	78	chr3	103474508	103474841	-56124942	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	19	1
1374	2178	196	27	7	chr3	103475132	103475543	-56124240	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1374	245	279	54	71	chr3	103477086	103477198	-56122585	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-189	349	240	1
1374	276	301	147	22	chr3	103477420	103477556	-56122227	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	153	-255	1
1374	2845	198	26	12	chr3	103477980	103478480	-56121303	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-5	507	1	1
1374	273	342	67	36	chr3	103478480	103478644	-56121139	+	MLT1A1	LTR	MaLR	188	357	-315	1
1374	399	353	66	35	chr3	103480082	103480279	-56119504	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-343	226	24	1
1374	241	292	77	0	chr3	103482799	103482864	-56116919	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	310	1
1374	337	328	92	24	chr3	103484474	103484680	-56115103	-	RMER5	LTR	ERV1	-247	287	68	1
1374	1775	181	70	22	chr3	103485219	103485575	-56114208	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	1	1
1374	1673	230	48	3	chr3	103485597	103485954	-56113829	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	4	1
1374	887	327	143	26	chr3	103488260	103488728	-56111055	-	MER74A	LTR	ERVL	0	558	36	1
1374	483	293	0	61	chr3	103490303	103490434	-56109349	+	MLT1C	LTR	MaLR	46	168	-299	1
1374	1012	275	84	36	chr3	103490556	103490914	-56108869	+	MTEa	LTR	MaLR	3	377	-2	1
1374	307	330	18	42	chr3	103491106	103491251	-56108532	+	MLT1C	LTR	MaLR	247	463	-4	1
1374	1997	152	11	183	chr3	103492760	103493236	-56106547	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1374	627	286	46	0	chr3	103494547	103494722	-56105061	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	189	-170	1
1374	587	223	8	8	chr3	103495389	103495511	-56104272	+	ORR1E	LTR	MaLR	250	371	-8	1
1374	3140	49	23	23	chr3	103496326	103496722	-56103061	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1374	2332	95	13	3	chr3	103497759	103498077	-56101706	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	323	-4	1
1374	327	226	0	77	chr3	103500224	103500315	-56099468	+	MT2B	LTR	ERVL	181	264	-337	1
1374	1240	197	96	44	chr3	103500851	103501121	-56098662	-	MTE2b	LTR	MaLR	-45	334	60	3
1374	1493	250	153	25	chr3	103501418	103501985	-56097798	-	RLTR40	LTR	ERVK	-51	766	127	6
1374	339	302	43	80	chr3	103508413	103508575	-56091208	-	RLTR40	LTR	ERVK	-661	156	1	6
1374	1124	242	154	12	chr3	103508590	103508928	-56090855	+	MTD	LTR	MaLR	20	405	-14	1
1374	435	328	134	42	chr3	103509647	103510045	-56089738	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	1
1374	240	354	51	83	chr3	103510259	103510288	-56089495	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-135	1445	1416	1
1374	584	280	57	75	chr3	103510286	103510514	-56089269	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1356	224	1	1
1374	284	298	110	53	chr3	103510516	103510747	-56089036	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	377	133	1
1374	285	286	100	50	chr3	103510766	103510843	-56088940	-	ORR1E	LTR	MaLR	-212	147	74	1
1374	285	286	100	50	chr3	103510866	103510928	-56088855	-	ORR1E	LTR	MaLR	-286	73	1	1
1374	3100	155	55	20	chr3	103511910	103512602	-56087181	+	RLTR40	LTR	ERVK	3	807	-10	1
1374	1947	224	72	33	chr3	103513559	103514100	-56085683	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-12	566	5	2
1374	1747	155	209	3	chr3	103514406	103514755	-56085028	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1374	234	323	31	46	chr3	103515013	103515143	-56084640	-	RMER21A	LTR	ERV1	-203	744	617	2
1374	242	186	67	17	chr3	103515659	103515719	-56084064	+	MLT1F	LTR	MaLR	459	521	-27	2
1374	675	314	0	28	chr3	103516234	103516411	-56083372	-	MLT1F	LTR	MaLR	-218	330	159	3
1374	394	318	27	9	chr3	103516584	103516695	-56083088	-	MLT1F	LTR	MaLR	-409	139	27	3
1374	792	283	99	26	chr3	103521770	103522122	-56077661	+	MTEa	LTR	MaLR	1	378	-1	4
1374	1777	182	36	105	chr3	103524172	103524310	-56075473	+	MTD	LTR	MaLR	4	128	-291	5
1374	1777	182	36	105	chr3	103524454	103524762	-56075021	+	MTD	LTR	MaLR	129	419	0	5
1374	2045	215	54	3	chr3	103524990	103525381	-56074402	+	MTD	LTR	MaLR	9	419	0	5
1374	467	209	204	23	chr3	103526280	103526412	-56073371	+	MTE2a	LTR	MaLR	32	187	-192	5
1374	371	173	27	21	chr3	103532305	103532398	-56067385	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	262	6
1375	1014	260	58	69	chr3	103552378	103552741	-56047042	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	9
1375	1434	153	107	0	chr3	103560978	103561259	-56038524	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	311	-16	9
1375	2119	145	129	5	chr3	103566615	103567017	-56032766	+	RLTR11B	LTR	ERVK	2	453	0	1
1375	833	182	174	18	chr3	103567052	103567276	-56032507	+	RLTR23	LTR	ERV1	10	268	-162	1
1375	660	133	58	0	chr3	103567270	103567390	-56032393	+	RLTR23	LTR	ERV1	177	303	-127	1
1375	3615	111	44	145	chr3	103587228	103588069	-56011714	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	1
1375	2557	89	3	0	chr3	103602569	103602895	-55996888	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1375	1461	235	56	11	chr3	103620787	103621144	-55978639	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	3	2
1375	1131	164	62	33	chr3	103623206	103623547	-55976236	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	5	365	-195	2
1375	228	128	26	0	chr3	103628616	103628655	-55971128	+	MT2A	LTR	ERVL	3	42	-491	2
1375	342	261	165	43	chr3	103629616	103629780	-55970003	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	1067	1250	-159	2
1375	804	173	19	0	chr3	103633171	103633327	-55966456	+	MTD	LTR	MaLR	1	159	-260	2
1375	3996	163	138	78	chr3	103634389	103635354	-55964429	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	1	2
1375	244	264	18	66	chr3	103641690	103641856	-55957927	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	597	2
1375	291	170	0	0	chr3	103643107	103643160	-55956623	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	53	-329	2
1375	242	177	145	0	chr3	103643148	103643210	-55956573	+	RLTR14	LTR	ERV1	175	245	-137	2
1375	844	147	7	14	chr3	103643253	103643398	-55956385	+	RLTR14	LTR	ERV1	236	379	-3	2
1375	1159	254	52	26	chr3	103643398	103643705	-55956078	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1	315	-5002	2
1375	321	130	0	0	chr3	103643735	103643789	-55955994	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	414	467	-4850	2
1375	4432	118	54	46	chr3	103643789	103644439	-55955344	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	677	-225	2
1375	4432	119	55	48	chr3	103644620	103644821	-55954962	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	578	855	-47	2
1375	2872	105	49	28	chr3	103644821	103645293	-55954490	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	2
1375	827	152	71	138	chr3	103645293	103645340	-55954443	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	768	806	-2	2
1375	621	211	176	0	chr3	103645342	103645484	-55954299	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1310	1476	-3841	2
1375	5249	194	55	144	chr3	103645600	103647083	-55952700	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1448	2798	-2519	2
1375	431	327	38	33	chr3	103647083	103647295	-55952488	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1110	2
1375	4109	123	63	21	chr3	103647508	103648014	-55951769	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1053	795	262	2
1375	2411	121	139	19	chr3	103648014	103648444	-55951339	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	2
1375	4109	123	63	21	chr3	103648444	103648700	-55951083	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1587	261	1	2
1375	7615	132	58	51	chr3	103648700	103649810	-55949973	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	2793	3916	-1401	2
1375	4359	19	0	0	chr3	103649810	103650292	-55949491	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
1375	7615	132	58	51	chr3	103650292	103650565	-55949218	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	3917	4187	-1130	2
1375	11276	60	8	154	chr3	103651448	103653565	-55946218	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	1807	-1	2
1375	264	108	66	145	chr3	103661768	103661844	-55937939	-	MT2B	LTR	ERVL	-362	239	170	3
1375	1464	226	126	26	chr3	103668090	103668471	-55931312	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1375	307	292	107	73	chr3	103674349	103674632	-55925151	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	86	3
1375	2805	112	39	12	chr3	103675252	103675659	-55924124	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	4	3
1376	1939	134	429	102	chr3	103695678	103696245	-55903538	-	RMER6A	LTR	ERVK	-4	752	1	4
1376	773	268	47	90	chr3	103696760	103697039	-55902744	-	MTEa	LTR	MaLR	-17	362	96	4
1376	4724	93	82	0	chr3	103697174	103697800	-55901983	+	RLTR33	LTR	ERVK	2	678	0	4
1376	314	258	82	10	chr3	103697802	103697900	-55901883	-	MTEa	LTR	MaLR	-274	105	1	4
1376	3117	255	69	121	chr3	103697902	103698731	-55901052	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	750	4
1376	3117	255	69	121	chr3	103698762	103698775	-55901008	-	MTE-int	LTR	MaLR	-831	749	749	4
1376	3117	255	69	121	chr3	103698913	103699119	-55900664	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-831	749	584	4
1376	1658	304	73	7	chr3	103699365	103699918	-55899865	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-990	590	1	4
1376	663	254	113	147	chr3	103699920	103700018	-55899765	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	289	4
1376	2094	143	92	3	chr3	103700018	103700355	-55899428	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1376	663	254	113	147	chr3	103700355	103700583	-55899200	-	MTEa	LTR	MaLR	-91	288	58	4
1376	5248	36	2	17	chr3	103701219	103701815	-55897968	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	4
1376	1239	161	123	138	chr3	103703352	103703735	-55896048	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	8	4
1376	1074	231	72	93	chr3	103705528	103705915	-55893868	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	4
1376	234	264	93	102	chr3	103714918	103714934	-55884849	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	165	4
1376	1161	243	156	8	chr3	103723711	103724076	-55875707	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1376	2196	98	28	6	chr3	103735613	103735933	-55863850	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1376	1353	273	96	33	chr3	103742901	103743295	-55856488	-	MER54B	LTR	ERVL	0	793	375	5
1376	1742	142	14	100	chr3	103743374	103743734	-55856049	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1376	385	248	67	17	chr3	103745738	103745857	-55853926	-	MLT1D	LTR	MaLR	-380	125	1	5
1376	267	295	11	11	chr3	103748156	103748245	-55851538	-	MLT1J	LTR	MaLR	-2	406	318	5
1376	370	296	269	0	chr3	103748892	103749078	-55850705	-	MLT1J	LTR	MaLR	-268	244	9	5
1376	2081	231	26	69	chr3	103751241	103751775	-55848008	+	RMER19C	LTR	ERVK	101	611	0	5
1376	1018	174	68	0	chr3	103752499	103752689	-55847094	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	176	5
1376	305	266	0	12	chr3	103752770	103752850	-55846933	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-295	83	5	5
1376	335	352	54	54	chr3	103762443	103762665	-55837118	-	MLT1L	LTR	MaLR	-44	566	345	5
1376	654	199	173	84	chr3	103762934	103763148	-55836635	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-151	233	1	5
1376	5131	17	0	0	chr3	103776143	103776721	-55823062	+	MERVL-int	LTR	ERVL	3349	3926	-1559	5
1376	248	255	78	39	chr3	103777576	103777678	-55822105	+	MLT1A	LTR	MaLR	76	181	-193	5
1376	364	324	56	52	chr3	103780482	103780752	-55819031	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	352	82	5
1376	342	280	32	95	chr3	103780835	103780993	-55818790	-	LTR84b	LTR	ERVL	-6	755	608	5
1376	1550	145	226	3	chr3	103781788	103782085	-55817698	+	ORR1B2	LTR	MaLR	5	367	0	5
1376	1199	200	74	39	chr3	103785941	103786253	-55813530	+	MTD	LTR	MaLR	21	343	-76	5
1376	2199	149	64	5	chr3	103787181	103787571	-55812212	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	5
1376	1270	233	121	27	chr3	103796884	103796931	-55802852	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	491	6
1376	1270	233	121	27	chr3	103797003	103797325	-55802458	-	MT2A	LTR	ERVL	-43	490	129	6
1376	262	257	13	13	chr3	103797339	103797414	-55802369	-	MT2A	LTR	ERVL	-458	75	1	6
1376	898	235	192	12	chr3	103797851	103798195	-55801588	+	MTD	LTR	MaLR	1	406	-13	6
1376	1685	144	95	25	chr3	103800744	103801071	-55798712	+	MTC	LTR	MaLR	72	421	0	6
1377	375	198	61	30	chr3	103814329	103814428	-55785355	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	102	-268	6
1377	374	257	18	27	chr3	103823120	103823232	-55776551	+	MLT1A1	LTR	MaLR	298	408	0	6
1377	1246	190	139	32	chr3	103831351	103831689	-55768094	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1377	253	192	164	0	chr3	103832235	103832308	-55767475	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	425	6
1377	262	247	24	0	chr3	103840385	103840470	-55759313	-	LTR68	LTR	ERV1	-646	94	8	6
1377	994	238	162	0	chr3	103846547	103846862	-55752921	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	370	0	6
1377	2377	166	9	49	chr3	103864127	103864576	-55735207	-	RMER6B	LTR	ERVK	-11	450	20	7
1377	231	305	0	0	chr3	103870280	103870339	-55729444	+	MT2A	LTR	ERVL	298	356	-177	7
1377	2606	108	35	23	chr3	103871510	103871937	-55727846	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	432	-324	7
1377	893	221	139	52	chr3	103872885	103873172	-55726611	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	62	7
1377	2596	59	112	0	chr3	103891999	103892355	-55707428	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1377	391	309	143	24	chr3	103900005	103900214	-55699569	+	MLT1H2	LTR	MaLR	343	576	-3	8
1377	529	321	41	99	chr3	103905061	103905355	-55694428	-	LTR41B	LTR	ERVL	-5	753	477	8
1377	373	296	123	63	chr3	103905661	103905964	-55693819	-	LTR41B	LTR	ERVL	-436	332	17	8
1377	1298	187	84	68	chr3	103908231	103908599	-55691184	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	8
1377	876	236	159	48	chr3	103916280	103916570	-55683213	+	MTEa	LTR	MaLR	1	322	-57	8
1377	250	149	21	0	chr3	103916939	103916986	-55682797	+	MTEa	LTR	MaLR	307	354	-25	8
1377	1979	142	155	18	chr3	103928056	103928495	-55671288	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	466	0	8
1377	966	237	84	43	chr3	103928584	103928894	-55670889	-	ORR1E	LTR	MaLR	-67	312	2	8
1377	690	281	164	1	chr3	103936925	103937293	-55662490	+	MER68	LTR	ERVL	1	483	-124	8
1378	2190	15	114	0	chr3	103940579	103940841	-55658942	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	292	0	8
1378	1034	127	14	0	chr3	103952699	103952860	-55646923	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	-324	203	5	8
1378	330	336	61	106	chr3	103953590	103953883	-55645900	+	MLT1J2	LTR	MaLR	102	381	-67	8
1378	2379	145	55	5	chr3	103957718	103958120	-55641663	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	422	-315	9
1378	699	118	18	0	chr3	103960549	103960659	-55639124	+	RMER15	LTR	ERVL	42	153	-422	9
1378	1649	158	144	26	chr3	103964661	103965090	-55634693	+	RMER6A	LTR	ERVK	180	690	0	9
1378	329	288	136	58	chr3	103970673	103970931	-55628852	+	RLTR12A	LTR	ERVK	118	395	-133	9
1378	2092	153	152	17	chr3	103977295	103977729	-55622054	+	MT2A	LTR	ERVL	5	576	-8	9
1378	987	185	354	4	chr3	103979448	103979719	-55620064	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	5	9
1378	798	263	198	49	chr3	103987953	103988123	-55611660	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	190	-315	9
1378	798	263	198	49	chr3	103988257	103988285	-55611498	+	MLT1D	LTR	MaLR	191	233	-272	9
1378	798	263	198	49	chr3	103988506	103988634	-55611149	+	MLT1D	LTR	MaLR	234	376	-129	9
1378	310	204	129	0	chr3	103988792	103988885	-55610898	+	MLT1D	LTR	MaLR	401	505	0	9
1378	672	78	10	19	chr3	103989542	103989646	-55610137	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	425	9
1378	339	82	20	0	chr3	103989647	103989696	-55610087	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	478	527	0	9
1378	3288	48	5	0	chr3	104011477	104011871	-55587912	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1378	2003	123	205	6	chr3	104012390	104012741	-55587042	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1378	1994	156	72	35	chr3	104014799	104015203	-55584580	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1378	341	209	15	0	chr3	104015325	104015392	-55584391	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	403	2
1378	2005	145	127	36	chr3	104018864	104019250	-55580533	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1378	384	366	81	14	chr3	104026061	104026344	-55573439	-	MLT1L	LTR	MaLR	0	610	309	3
1378	313	239	28	0	chr3	104026508	104026579	-55573204	-	MLT1L	LTR	MaLR	-534	76	4	3
1378	360	243	105	19	chr3	104031510	104031615	-55568168	+	MER21B	LTR	ERV1	273	386	-477	5
1378	712	223	119	56	chr3	104031668	104031920	-55567863	+	MER21B	LTR	ERV1	546	813	-50	5
1378	2117	175	85	5	chr3	104033223	104033613	-55566170	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
1378	293	291	38	0	chr3	104033817	104033896	-55565887	+	MLT1B	LTR	MaLR	282	363	-27	5
1378	1964	159	92	13	chr3	104034289	104034671	-55565112	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	2	5
1378	4158	116	92	28	chr3	104035474	104035767	-55564016	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	327	-429	6
1378	4158	116	92	28	chr3	104035825	104036240	-55563543	+	RMER6A	LTR	ERVK	328	753	-3	6
1378	1369	253	18	51	chr3	104039396	104039788	-55559995	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	6
1378	308	335	76	20	chr3	104039881	104040079	-55559704	+	MLT1A0	LTR	MaLR	87	295	-70	7
1378	1462	139	124	7	chr3	104040130	104040405	-55559378	+	ORR1B2	LTR	MaLR	61	367	0	7
1378	1529	193	58	92	chr3	104042397	104042831	-55556952	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1378	313	311	83	6	chr3	104044398	104044579	-55555204	+	LTR33	LTR	ERVL	19	213	-302	7
1378	3355	81	41	11	chr3	104045088	104045549	-55554234	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	7
1378	651	244	6	19	chr3	104053864	104054023	-55545760	+	MTD	LTR	MaLR	3	159	-260	1
1378	271	281	16	0	chr3	104054027	104054091	-55545692	+	MTD	LTR	MaLR	265	329	-90	1
1378	2444	169	102	18	chr3	104058479	104058967	-55540816	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	1
1378	708	255	51	143	chr3	104059576	104060065	-55539718	+	RLTR12B	LTR	ERVK	54	497	-31	1
1378	1919	216	17	3	chr3	104062329	104062691	-55537092	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	4	1
1379	361	233	40	72	chr3	104078320	104078380	-55521403	+	MTEb	LTR	MaLR	257	309	-70	1
1379	361	233	40	72	chr3	104078575	104078639	-55521144	+	MTEb	LTR	MaLR	310	377	-2	1
1379	461	212	120	12	chr3	104080948	104081115	-55518668	-	MER89	LTR	ERV1	-23	536	352	1
1379	2663	141	69	6	chr3	104081396	104081873	-55517910	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	494	-66	1
1379	273	321	115	9	chr3	104081992	104082209	-55517574	-	MER89	LTR	ERV1	-319	240	1	1
1379	302	197	0	40	chr3	104084350	104084424	-55515359	+	RMER15	LTR	ERVL	2	72	-503	1
1379	1959	219	75	30	chr3	104084558	104085066	-55514717	+	RMER15	LTR	ERVL	27	557	-18	1
1379	678	276	98	20	chr3	104086679	104086934	-55512849	-	MT2A	LTR	ERVL	-10	523	249	1
1379	244	228	85	37	chr3	104086944	104087026	-55512757	-	MTEa	LTR	MaLR	-290	89	4	1
1379	391	213	0	0	chr3	104090107	104090182	-55509601	+	MTD	LTR	MaLR	345	419	0	1
1379	265	389	39	54	chr3	104090182	104090438	-55509345	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-304	258	7	1
1379	906	238	114	61	chr3	104093949	104094325	-55505458	+	MTD	LTR	MaLR	10	405	-14	1
1379	242	232	25	96	chr3	104102451	104102599	-55497184	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-343	267	27	2
1379	458	311	153	46	chr3	104106682	104107062	-55492721	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-3	557	134	2
1379	458	311	153	46	chr3	104107111	104107168	-55492615	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-427	133	74	2
1379	1204	189	143	7	chr3	104109215	104109508	-55490275	+	RMER5	LTR	ERV1	1	333	-201	2
1379	1063	175	17	29	chr3	104109740	104109981	-55489802	+	RMER5	LTR	ERV1	297	534	0	2
1379	279	292	149	0	chr3	104117274	104117435	-55482348	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-18	471	287	2
1379	705	322	56	86	chr3	104122760	104123262	-55476521	+	MLT1H2	LTR	MaLR	1	487	-2	2
1379	335	295	73	8	chr3	104124632	104124755	-55475028	+	MLT1K	LTR	MaLR	451	581	-14	2
1379	2327	88	21	59	chr3	104133400	104133740	-55466043	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1379	286	260	8	48	chr3	104143707	104143814	-55455969	+	MLT1A1	LTR	MaLR	258	402	-6	2
1379	360	383	71	42	chr3	104143814	104144054	-55455729	+	LTR78	LTR	ERV1	348	594	-710	2
1379	300	291	150	61	chr3	104144305	104144631	-55455152	+	LTR78	LTR	ERV1	743	1097	-207	2
1379	1784	147	6	52	chr3	104148580	104148924	-55450859	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	328	-1	3
1379	775	249	97	69	chr3	104149022	104149384	-55450399	+	RMER13A	LTR	ERVK	95	466	-394	3
1379	583	276	0	0	chr3	104151944	104152089	-55447694	+	MTEa	LTR	MaLR	1	145	-234	3
1379	376	273	60	89	chr3	104157591	104157872	-55441911	-	ORR1E	LTR	MaLR	-33	326	54	3
1379	1708	134	66	21	chr3	104159018	104159451	-55440332	-	RMER17C	LTR	ERVK	-519	439	16	3
1379	950	113	144	11	chr3	104161307	104161495	-55438288	+	MTC	LTR	MaLR	201	413	-8	3
1379	349	359	40	25	chr3	104165542	104165842	-55433941	-	MLT2D	LTR	ERVL	-73	324	10	3
1379	397	287	56	49	chr3	104167946	104168089	-55431694	+	MLT1G3	LTR	MaLR	1	144	-451	3
1379	557	353	135	13	chr3	104168140	104168444	-55431339	+	MLT1G3	LTR	MaLR	247	587	-8	3
1379	361	321	141	84	chr3	104171129	104171568	-55428215	+	MLT1M	LTR	MaLR	2	465	-207	3
1379	384	293	24	24	chr3	104171856	104171982	-55427801	+	LTR90A	LTR	LTR	448	573	-403	3
1379	225	232	130	0	chr3	104172298	104172367	-55427416	+	LTR90A	LTR	LTR	881	958	-18	3
1379	2945	99	5	15	chr3	104173429	104173840	-55425943	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	3
1379	6132	132	114	30	chr3	104173840	104175000	-55424783	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1258	2	3
1379	2917	94	5	31	chr3	104175000	104175417	-55424366	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	3
1379	343	283	181	47	chr3	104176528	104176721	-55423062	-	RMER15	LTR	ERVL	-10	565	347	3
1379	255	308	7	145	chr3	104182525	104182677	-55417106	-	LTR90A	LTR	LTR	-47	929	799	3
1379	1116	253	47	78	chr3	104184861	104185182	-55414601	+	MTEb	LTR	MaLR	13	323	-56	3
1379	320	203	31	0	chr3	104185202	104185266	-55414517	+	MTEb	LTR	MaLR	314	379	0	3
1379	496	194	29	19	chr3	104192967	104193072	-55406711	+	ERVL-int	LTR	ERVL	5055	5160	-597	3
1379	1537	210	143	116	chr3	104195633	104196103	-55403680	+	MT2A	LTR	ERVL	1	487	-46	3
1379	1537	210	143	116	chr3	104196228	104196275	-55403508	+	MT2A	LTR	ERVL	488	532	-1	3
1379	520	254	8	54	chr3	104196498	104196627	-55403156	+	MTEa	LTR	MaLR	1	123	-256	3
1379	1506	246	37	3	chr3	104196827	104197181	-55402602	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	4
1379	4340	265	90	77	chr3	104198126	104199507	-55400276	+	MTEb-int	LTR	MaLR	143	1542	-38	4
1379	4340	265	90	77	chr3	104199694	104199729	-55400054	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1543	1577	-3	4
1379	731	226	178	10	chr3	104199729	104199926	-55399857	+	MTEb	LTR	MaLR	4	233	-146	4
1380	371	306	57	61	chr3	104202334	104202519	-55397264	+	ORR1D2	LTR	MaLR	28	205	-165	4
1380	1427	224	69	31	chr3	104203609	104203959	-55395824	+	MLT1B	LTR	MaLR	28	390	0	4
1380	255	253	139	0	chr3	104207804	104207883	-55391900	+	MLT1J	LTR	MaLR	32	121	-391	4
1380	801	216	6	13	chr3	104208930	104209112	-55390671	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	154	4
1380	252	353	26	8	chr3	104209106	104209223	-55390560	-	MT2A	LTR	ERVL	-403	130	12	4
1380	3787	14	121	0	chr3	104210226	104210666	-55389117	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
1380	1490	229	90	28	chr3	104210681	104211036	-55388747	+	MTEa	LTR	MaLR	1	377	-2	4
1380	3271	55	8	0	chr3	104217113	104217510	-55382273	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1380	1819	215	119	35	chr3	104217512	104218033	-55381750	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-1	576	12	4
1380	1408	253	65	15	chr3	104218108	104218433	-55381350	-	MER70B	LTR	ERVL	-146	432	92	4
1380	1482	229	56	64	chr3	104218522	104218895	-55380888	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	1	4
1380	3124	247	43	44	chr3	104218900	104219131	-55380652	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-5	1575	1352	4
1380	3124	247	43	44	chr3	104219298	104219859	-55379924	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-229	1351	784	4
1380	2713	166	15	46	chr3	104220020	104220563	-55379220	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	5	537	-16	4
1380	330	292	191	72	chr3	104223310	104223561	-55376222	-	RMER15	LTR	ERVL	-22	553	273	4
1380	332	323	340	11	chr3	104225191	104225456	-55374327	-	MLT1F	LTR	MaLR	-196	352	1	4
1380	3275	29	39	0	chr3	104226073	104226454	-55373329	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1380	7702	59	42	71	chr3	104226454	104227584	-55372199	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
1380	3447	35	5	0	chr3	104227584	104227978	-55371805	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1380	928	284	119	25	chr3	104229337	104229691	-55370092	+	MLT1C	LTR	MaLR	69	455	-12	4
1380	704	279	49	56	chr3	104230980	104231284	-55368499	-	RMER10A	LTR	ERVL	-18	424	123	4
1380	381	236	35	129	chr3	104231294	104231464	-55368319	-	RMER10A	LTR	ERVL	-288	154	1	4
1380	1463	215	89	82	chr3	104240201	104240617	-55359166	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1380	307	296	29	131	chr3	104243585	104243760	-55356023	+	MT2B2	LTR	ERVL	122	278	-306	5
1380	334	220	30	126	chr3	104250522	104250546	-55349237	+	MT2B	LTR	ERVL	143	153	-448	5
1380	553	143	55	0	chr3	104262396	104262487	-55337296	+	MTC	LTR	MaLR	1	96	-325	5
1380	1824	164	66	0	chr3	104263259	104263577	-55336206	+	MTC	LTR	MaLR	83	421	0	5
1380	423	265	21	91	chr3	104276022	104276209	-55323574	+	MLT1J1	LTR	MaLR	9	182	-262	5
1380	283	169	131	12	chr3	104277161	104277245	-55322538	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3498	1858	1765	5
1380	294	266	125	0	chr3	104277280	104277408	-55322375	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3643	1713	1570	5
1380	688	301	102	58	chr3	104279709	104280090	-55319693	-	MER31-int	LTR	ERV1	-4529	407	10	5
1380	1270	275	84	30	chr3	104280134	104280509	-55319274	-	MER31A	LTR	ERV1	0	485	109	5
1380	1270	275	84	30	chr3	104280643	104280706	-55319077	-	MER31A	LTR	ERV1	-377	108	24	5
1380	293	235	31	133	chr3	104287215	104287232	-55312551	+	MT2B	LTR	ERVL	148	235	-366	6
1380	1641	188	93	21	chr3	104287341	104287673	-55312110	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	360	-14	6
1380	2642	204	65	17	chr3	104287677	104288182	-55311601	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	532	-838	6
1380	2642	204	65	17	chr3	104288223	104288306	-55311477	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	533	617	-753	6
1380	382	293	98	69	chr3	104288306	104288720	-55311063	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	332	-196	6
1380	3235	189	70	36	chr3	104288804	104289495	-55310288	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	641	1355	-15	6
1380	6222	176	65	24	chr3	104289495	104290329	-55309454	+	RMER12	LTR	ERVK	1	832	-490	6
1380	6222	176	65	24	chr3	104290374	104290810	-55308973	+	RMER12	LTR	ERVK	833	1321	-1	6
1380	1586	188	67	40	chr3	104290831	104291202	-55308581	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	381	-3	6
1380	532	294	116	102	chr3	104305677	104305960	-55293823	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	287	-72	6
1380	239	236	0	132	chr3	104306103	104306186	-55293597	+	ORR1E	LTR	MaLR	300	371	-8	6
1380	453	264	153	68	chr3	104306595	104306843	-55292940	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	10	6
1380	1321	195	253	32	chr3	104307169	104307545	-55292238	+	MT2A	LTR	ERVL	1	459	-74	6
1380	424	278	65	36	chr3	104313073	104313211	-55286572	+	MTEb	LTR	MaLR	231	372	-7	6
1380	1201	276	71	9	chr3	104313390	104313715	-55286068	+	MTEb-int	LTR	MaLR	11	355	-1225	6
1380	278	255	131	94	chr3	104318370	104318401	-55281382	+	MT2B2	LTR	ERVL	175	339	-245	7
1380	377	200	53	105	chr3	104320608	104320703	-55279080	+	MT2B	LTR	ERVL	149	238	-363	7
1380	234	254	0	63	chr3	104324539	104324602	-55275181	+	MLT2B2	LTR	ERVL	186	244	-271	7
1380	235	326	79	30	chr3	104326323	104326424	-55273359	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	158	7
1380	1310	90	16	11	chr3	104330928	104331119	-55268664	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-215	192	1	7
1380	1860	153	125	9	chr3	104332403	104332732	-55267051	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	7
1381	1803	133	12	43	chr3	104335777	104336122	-55263661	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-73	334	1	7
1381	1475	157	83	23	chr3	104337486	104337786	-55261997	+	RMER5	LTR	ERV1	173	490	-44	7
1381	1337	46	0	0	chr3	104338786	104338961	-55260822	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	-318	175	1	8
1381	321	0	0	0	chr3	104338961	104338999	-55260784	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	8
1381	301	153	26	53	chr3	104338999	104339075	-55260708	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	8
1381	2592	38	45	0	chr3	104339075	104339389	-55260394	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-114	5371	5044	8
1381	1383	146	0	9	chr3	104342882	104343110	-55256673	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	196	8
1381	1053	114	26	122	chr3	104343591	104343727	-55256056	-	MTC	LTR	MaLR	-214	207	99	8
1381	1053	114	26	122	chr3	104343873	104343965	-55255818	-	MTC	LTR	MaLR	-323	98	1	8
1381	273	228	27	163	chr3	104349482	104349629	-55250154	+	MER57-int	LTR	ERV1	7138	7264	-273	8
1381	739	277	82	49	chr3	104352202	104352631	-55247152	-	RMER5	LTR	ERV1	-58	476	34	8
1381	2546	155	80	6	chr3	104363365	104363852	-55235931	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	2	8
1381	256	248	0	250	chr3	104370863	104371003	-55228780	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	153	9
1381	590	239	144	31	chr3	104378824	104379018	-55220765	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	157	9
1381	296	176	0	0	chr3	104379056	104379092	-55220691	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-316	58	23	9
1381	625	147	29	19	chr3	104379092	104379225	-55220558	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	1256	9
1381	839	161	86	0	chr3	104379324	104379498	-55220285	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1179	191	3	9
1381	1712	182	27	104	chr3	104379500	104379905	-55219878	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	9
1381	2068	90	94	0	chr3	104380607	104380906	-55218877	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	9
1381	3198	57	75	22	chr3	104385144	104385595	-55214188	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	9
1381	3822	107	73	0	chr3	104387740	104388300	-55211483	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	9
1381	547	338	76	50	chr3	104389439	104389941	-55209842	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-3	551	37	9
1381	1538	194	86	67	chr3	104390013	104390445	-55209338	+	RMER10A	LTR	ERVL	3	442	0	9
1381	236	236	12	100	chr3	104391691	104391771	-55208012	+	MT2B2	LTR	ERVL	159	231	-353	9
1381	2854	19	5	97	chr3	104392112	104392516	-55207267	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	9
1381	54891	31	17	6	chr3	104392516	104398916	-55200867	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	9
1381	2854	19	5	97	chr3	104398916	104399320	-55200463	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	9
1381	1686	184	98	13	chr3	104401826	104402205	-55197578	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	1
1381	682	82	0	0	chr3	104406420	104406513	-55193270	+	MT2B	LTR	ERVL	3	95	-506	1
1381	8197	129	103	113	chr3	104406513	104407741	-55192042	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	1412	-551	1
1381	3190	6	0	3	chr3	104407741	104408088	-55191695	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	1
1381	8197	129	103	113	chr3	104408088	104408840	-55190943	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1413	1963	0	1
1381	1761	128	24	60	chr3	104408840	104409173	-55190610	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	1
1381	256	187	104	26	chr3	104410360	104410437	-55189346	-	RMER15	LTR	ERVL	-471	104	22	1
1381	2429	98	3	3	chr3	104412963	104413290	-55186493	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1381	608	288	141	46	chr3	104414896	104415180	-55184603	+	MLT1A1	LTR	MaLR	73	383	-25	1
1381	2092	284	124	106	chr3	104415901	104416330	-55183453	+	MLT1A1-int	LTR	MaLR	3	422	-1313	1
1381	2092	284	124	106	chr3	104416380	104417652	-55182131	+	MLT1A1-int	LTR	MaLR	423	1735	0	1
1381	638	239	118	36	chr3	104417652	104417966	-55181817	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	330	-35	1
1381	615	282	89	72	chr3	104418082	104418126	-55181657	+	MLT1A1	LTR	MaLR	331	365	0	1
1381	236	241	60	48	chr3	104418227	104418310	-55181473	-	MLT1J	LTR	MaLR	-314	198	115	1
1381	361	325	83	12	chr3	104419230	104419398	-55180385	+	MLT-int	LTR	MaLR	1107	1286	-449	1
1381	2561	171	49	12	chr3	104423730	104424239	-55175544	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	1
1381	1408	201	307	8	chr3	104424828	104425223	-55174560	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	61	1
1381	256	77	0	71	chr3	104425310	104425352	-55174431	-	RMER15	LTR	ERVL	-510	65	27	1
1381	264	192	59	82	chr3	104426299	104426384	-55173399	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	427	1
1381	3605	13	2	0	chr3	104428855	104429250	-55170533	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1381	9543	25	2	1	chr3	104429250	104430347	-55169436	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
1381	3605	13	2	0	chr3	104430347	104430742	-55169041	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1381	919	189	218	58	chr3	104431626	104431952	-55167831	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	2	1
1381	1023	260	108	30	chr3	104447668	104448001	-55151782	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	1
1381	341	336	64	45	chr3	104454300	104454456	-55145327	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-177	188	30	1
1381	286	236	40	27	chr3	104455220	104455294	-55144489	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-521	507	433	1
1381	3488	30	2	0	chr3	104455295	104455690	-55144093	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1382	228	314	100	44	chr3	104467675	104467765	-55132018	-	MER21B	LTR	ERV1	-4	859	765	1
1382	334	256	0	0	chr3	104469008	104469098	-55130685	+	MER34B-int	LTR	ERV1	1979	2068	-3288	1
1382	386	292	63	31	chr3	104483149	104483340	-55116443	-	MLT1F1	LTR	MaLR	0	569	373	1
1382	2321	81	71	6	chr3	104483326	104483663	-55116120	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	1
1382	2529	33	0	252	chr3	104484497	104484985	-55114798	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	1
1382	273	298	60	0	chr3	104486516	104486600	-55113183	+	LTR55	LTR	ERV	103	191	-357	1
1382	911	259	131	95	chr3	104486619	104486977	-55112806	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	1	1
1382	569	283	89	46	chr3	104487161	104487398	-55112385	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-306	263	17	1
1382	4025	152	69	202	chr3	104488210	104488774	-55111009	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	409	-624	1
1382	4509	87	19	5	chr3	104488811	104489438	-55110345	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	388	1023	0	1
1382	3424	200	63	100	chr3	104489983	104490422	-55109361	-	MTC-int	LTR	MaLR	-310	948	508	1
1382	3424	200	63	100	chr3	104490442	104490985	-55108798	-	MTC-int	LTR	MaLR	-751	507	2	1
1382	1869	150	140	11	chr3	104490988	104491346	-55108437	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	10	1
1382	3361	174	192	42	chr3	104492196	104492940	-55106843	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	856	-4	1
1382	3375	31	13	0	chr3	104498235	104498626	-55101157	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1382	9710	15	3	3	chr3	104498626	104499724	-55100059	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1382	2214	40	18	0	chr3	104499724	104500000	-55099783	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	116	1
1382	1014	9	0	0	chr3	104500000	104500115	-55099668	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-281	115	1	1
1382	237	287	107	98	chr3	104500132	104500244	-55099539	-	LTR33B	LTR	ERVL	-3	500	388	2
1382	290	266	59	42	chr3	104502718	104502836	-55096947	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1158	1277	-4245	1
1382	2071	182	67	3	chr3	104507289	104507675	-55092108	+	MTC	LTR	MaLR	3	413	-8	3
1382	233	184	0	0	chr3	104508588	104508626	-55091157	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	1	38	-1076	3
1382	398	206	112	67	chr3	104509359	104509508	-55090275	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	983	1114	0	3
1382	258	232	69	42	chr3	104512309	104512381	-55087402	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	436	5
1382	2713	100	124	32	chr3	104513296	104513771	-55086012	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	5
1382	2615	136	39	2	chr3	104515710	104516116	-55083667	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1382	395	270	54	84	chr3	104517218	104517384	-55082399	+	MTE2a	LTR	MaLR	205	365	-14	6
1382	516	311	54	81	chr3	104519263	104519634	-55080149	+	MLT1A1	LTR	MaLR	36	396	-12	6
1382	2481	141	10	49	chr3	104522088	104522498	-55077285	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
1382	314	296	87	0	chr3	104524096	104524211	-55075572	-	LTR50	LTR	ERVL	-633	162	38	8
1382	1682	125	181	84	chr3	104527471	104527830	-55071953	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	8
1382	332	302	52	39	chr3	104528700	104528855	-55070928	+	RMER15	LTR	ERVL	414	570	-5	9
1382	1360	213	132	21	chr3	104528900	104529226	-55070557	+	ORR1D2	LTR	MaLR	9	370	0	9
1382	1993	128	6	67	chr3	104529292	104529635	-55070148	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	8	9
1382	394	311	87	70	chr3	104531083	104531325	-55068458	-	RMER15	LTR	ERVL	-11	564	319	1
1382	893	263	87	19	chr3	104532483	104532747	-55067036	+	RMER5	LTR	ERV1	33	314	-220	1
1382	1871	90	20	45	chr3	104532722	104533014	-55066769	+	ORR1A4	LTR	MaLR	45	329	0	1
1382	969	208	135	16	chr3	104532960	104533204	-55066579	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	147	1
1382	279	246	14	0	chr3	104533197	104533266	-55066517	-	RLTR14	LTR	ERV1	-312	70	1	1
1382	278	298	60	17	chr3	104533507	104533623	-55066160	+	RMER5	LTR	ERV1	1	121	-413	1
1382	1512	208	77	17	chr3	104533831	104533989	-55065794	+	ORR1C2	LTR	MaLR	12	171	-213	1
1382	1512	208	77	17	chr3	104534035	104534228	-55065555	+	ORR1C2	LTR	MaLR	172	383	-1	1
1382	271	323	0	0	chr3	104534467	104534532	-55065251	+	MER57E1	LTR	ERV1	22	86	-316	1
1382	591	229	80	29	chr3	104534598	104534766	-55065017	+	MER57E1	LTR	ERV1	187	365	-7	1
1382	979	213	233	80	chr3	104536226	104536555	-55063228	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	1	1
1382	355	256	35	11	chr3	104536555	104536642	-55063141	+	ORR1E	LTR	MaLR	266	354	-5	1
1382	560	170	191	43	chr3	104537226	104537367	-55062416	+	MTEb	LTR	MaLR	98	259	-120	1
1382	268	266	102	66	chr3	104539388	104539493	-55060290	+	LTR16C	LTR	ERVL	348	458	-31	1
1382	268	266	102	66	chr3	104539545	104539576	-55060207	+	LTR16C	LTR	ERVL	459	489	0	1
1382	302	309	0	0	chr3	104539650	104539718	-55060065	+	MTD	LTR	MaLR	75	142	-277	1
1382	276	159	123	55	chr3	104540998	104541028	-55058755	-	MT2B	LTR	ERVL	-297	293	227	1
1382	1235	186	43	83	chr3	104541057	104541436	-55058347	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	1	1
1382	1475	214	114	15	chr3	104541539	104541880	-55057903	+	MTD	LTR	MaLR	43	417	-2	1
1382	3535	23	2	0	chr3	104542300	104542695	-55057088	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1382	9142	40	4	1	chr3	104542695	104543790	-55055993	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1382	3562	18	2	0	chr3	104543790	104544185	-55055598	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1382	2343	109	6	0	chr3	104545041	104545363	-55054420	+	ORR1A2	LTR	MaLR	4	327	0	1
1382	423	224	0	23	chr3	104545363	104545450	-55054333	+	MTEa	LTR	MaLR	2	86	-293	1
1382	1017	227	172	30	chr3	104545758	104546026	-55053757	+	MTEa	LTR	MaLR	74	379	0	1
1382	3259	60	2	0	chr3	104548494	104548893	-55050890	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1382	561	330	43	69	chr3	104549431	104549779	-55050004	+	ORR1E	LTR	MaLR	21	359	0	1
1382	523	238	61	8	chr3	104549781	104549912	-55049871	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	138	-1442	1
1382	650	276	105	54	chr3	104549925	104550201	-55049582	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	383	672	-908	1
1382	4316	120	41	42	chr3	104551546	104552303	-55047480	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	1
1382	272	286	14	0	chr3	104558418	104558488	-55041295	+	LTR52	LTR	ERVL	7	77	-344	1
1382	1937	170	82	47	chr3	104559080	104559505	-55040278	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	440	-2	1
1382	428	267	0	38	chr3	104560795	104560900	-55038883	+	MTE2a	LTR	MaLR	10	110	-269	1
1382	350	339	60	49	chr3	104566159	104566342	-55033441	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1911	3756	3572	2
1382	271	279	44	0	chr3	104567543	104567611	-55032172	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-3116	2551	2481	2
1382	226	254	0	33	chr3	104567830	104567891	-55031892	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-81	284	226	2
1382	404	170	16	138	chr3	104568896	104569019	-55030764	+	MT2B	LTR	ERVL	157	264	-337	2
1383	3549	23	0	0	chr3	104611900	104612296	-54987487	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1383	9343	34	2	1	chr3	104612296	104613393	-54986390	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
1383	3573	20	0	0	chr3	104613394	104613789	-54985994	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	396	0	2
1383	304	265	254	23	chr3	104619451	104619671	-54980112	+	MER31B	LTR	ERV1	117	387	-79	3
1383	687	289	118	74	chr3	104626616	104627173	-54972610	-	RLTR18	LTR	ERVK	-4	612	31	3
1383	1065	234	43	16	chr3	104633231	104633487	-54966296	+	ORR1D2	LTR	MaLR	108	370	0	3
1383	2012	166	52	106	chr3	104638341	104638495	-54961288	+	MTC	LTR	MaLR	1	126	-295	3
1383	2012	166	52	106	chr3	104638642	104638932	-54960851	+	MTC	LTR	MaLR	127	421	0	3
1383	292	217	14	0	chr3	104649095	104649164	-54950619	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	791	3
1383	2251	185	167	18	chr3	104649218	104649312	-54950471	-	RMER13A	LTR	ERVK	-220	640	543	3
1383	2251	185	167	18	chr3	104649337	104649799	-54949984	-	RMER13A	LTR	ERVK	-318	542	3	3
1383	1597	185	64	25	chr3	104651144	104651512	-54948271	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	3
1383	401	276	78	29	chr3	104653623	104653802	-54945981	+	MER31B	LTR	ERV1	204	390	-76	4
1383	766	55	60	40	chr3	104658488	104658638	-54941145	+	RMER17B	LTR	ERVK	312	464	-494	4
1383	1277	145	148	1	chr3	104659106	104659405	-54940378	+	ORR1B2	LTR	MaLR	9	375	-3	4
1383	2546	53	6	0	chr3	104660287	104660626	-54939157	+	ORR1A1	LTR	MaLR	6	346	0	4
1383	388	189	0	144	chr3	104672854	104672965	-54926818	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	163	4
1383	954	277	78	21	chr3	104674042	104674285	-54925498	+	MLT1A0	LTR	MaLR	54	310	-55	4
1383	344	387	24	66	chr3	104674342	104674428	-54925355	-	MLT1J	LTR	MaLR	-107	405	327	4
1383	344	387	24	66	chr3	104674574	104674653	-54925130	-	MLT1J	LTR	MaLR	-186	326	248	4
1383	358	227	0	120	chr3	104677251	104677351	-54922432	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	153	4
1383	1549	223	63	8	chr3	104708345	104708742	-54891041	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1383	521	316	90	93	chr3	104711848	104712193	-54887590	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	344	-15	5
1383	4678	254	89	62	chr3	104712205	104712532	-54887251	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	341	-1239	5
1383	4678	254	89	62	chr3	104712769	104713099	-54886684	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	342	665	-915	5
1383	4678	254	89	62	chr3	104713233	104714080	-54885703	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	666	1546	-34	5
1383	670	285	118	57	chr3	104714068	104714404	-54885379	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	419	0	5
1383	233	268	0	102	chr3	104714842	104714950	-54884833	+	MT2B	LTR	ERVL	155	251	-350	5
1383	1597	233	63	13	chr3	104723126	104723521	-54876262	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	5	5
1384	3861	121	5	14	chr3	104773138	104773707	-54826076	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	564	-4	6
1384	8875	244	44	46	chr3	104775243	104776510	-54823273	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	480	1802	-7157	6
1384	8875	244	44	46	chr3	104776700	104776824	-54822959	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1803	1913	-7046	6
1384	8875	244	44	46	chr3	104776854	104777246	-54822537	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1914	2277	-6682	6
1384	8875	244	44	46	chr3	104777440	104777604	-54822179	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2278	2427	-6532	6
1384	5805	211	18	51	chr3	104777669	104777925	-54821858	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2428	2677	-6282	6
1384	5805	211	18	51	chr3	104777971	104778455	-54821328	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2678	3167	-5792	6
1384	2240	117	45	8	chr3	104778469	104778823	-54820960	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	7
1384	8194	55	11	15	chr3	104778825	104779854	-54819929	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5455	7
1384	14398	42	117	18	chr3	104779854	104781953	-54817830	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4168	2313	8	7
1384	2240	117	45	8	chr3	104781953	104782307	-54817476	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	7
1384	7168	184	27	21	chr3	104782307	104783817	-54815966	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2672	4615	-4344	6
1384	658	146	71	93	chr3	104783945	104784083	-54815700	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	319	448	-1878	6
1384	658	146	71	93	chr3	104784129	104784167	-54815616	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	449	496	-1830	6
1384	3268	201	78	83	chr3	104784182	104784402	-54815381	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5592	5782	-768	7
1384	3268	201	78	83	chr3	104784714	104785433	-54814350	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	5786	6536	-14	7
1384	3361	133	25	15	chr3	104785434	104785960	-54813823	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	531	-37	7
1384	1788	219	104	19	chr3	104789914	104790290	-54809493	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	12	7
1384	321	213	66	109	chr3	104791990	104792127	-54807656	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	379	7
1384	278	245	0	0	chr3	104798968	104799021	-54800762	-	LTR16A	LTR	ERVL	-183	268	216	7
1384	2999	133	77	10	chr3	104809844	104810339	-54789444	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	7
1384	404	295	64	14	chr3	104816533	104816674	-54783109	-	MLT1F1	LTR	MaLR	0	569	422	7
1384	1662	147	71	95	chr3	104827187	104827287	-54772496	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	454	8
1384	1662	147	71	95	chr3	104827430	104827697	-54772086	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-75	453	170	8
1384	959	155	0	37	chr3	104827917	104828078	-54771705	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-371	157	3	8
1384	246	256	12	47	chr3	104833320	104833406	-54766377	+	RLTR25B	LTR	ERVK	427	509	-519	8
1384	398	305	15	66	chr3	104835345	104835482	-54764301	-	MT2B	LTR	ERVL	-319	282	153	8
1384	353	207	40	216	chr3	104845632	104845739	-54754044	+	MLT1B	LTR	MaLR	5	89	-301	8
1384	353	207	40	216	chr3	104845821	104845861	-54753922	+	MLT1B	LTR	MaLR	90	126	-264	8
1384	278	191	119	19	chr3	104846438	104846541	-54753242	+	MLT1B	LTR	MaLR	106	225	-242	8
1384	1813	189	37	16	chr3	104852739	104853120	-54746663	-	MTD	LTR	MaLR	-30	389	1	8
1385	794	252	60	40	chr3	104858691	104858993	-54740790	-	MLT1C	LTR	MaLR	-18	449	142	8
1385	323	197	30	0	chr3	104859098	104859164	-54740619	-	MLT1C	LTR	MaLR	-348	119	52	8
1385	543	319	41	27	chr3	104864618	104864837	-54734946	-	MLT1K	LTR	MaLR	-5	590	369	9
1385	921	282	91	19	chr3	104865795	104865918	-54733865	-	MTEa	LTR	MaLR	-37	342	208	9
1385	1808	135	124	12	chr3	104865918	104866248	-54733535	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	9
1385	921	282	91	19	chr3	104866248	104866442	-54733341	-	MTEa	LTR	MaLR	-172	207	3	9
1385	3088	274	91	57	chr3	104866449	104866581	-54733202	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-24	1556	1421	9
1385	5166	102	16	25	chr3	104866581	104866608	-54733175	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	721	9
1385	5166	102	16	25	chr3	104866790	104867506	-54732277	-	RMER19A	LTR	ERVK	-17	720	1	9
1385	3088	274	91	57	chr3	104867506	104868428	-54731355	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-160	1420	466	9
1385	2757	156	119	23	chr3	104868669	104869188	-54730595	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	17	9
1385	1790	265	23	25	chr3	104869274	104869751	-54730032	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1104	476	1	9
1385	613	241	105	35	chr3	104870060	104870225	-54729558	-	MTEa	LTR	MaLR	-200	179	3	9
1385	1599	222	55	6	chr3	104871919	104872281	-54727502	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	5	9
1385	1392	194	258	9	chr3	104873653	104874079	-54725704	+	RMER21A	LTR	ERV1	153	684	-263	9
1385	259	340	63	79	chr3	104877849	104878101	-54721682	-	MLT1I	LTR	MaLR	-124	287	40	9
1385	362	236	52	89	chr3	104878912	104879047	-54720736	+	LTR41	LTR	ERVL	59	188	-570	9
1385	3483	23	8	0	chr3	104882557	104882950	-54716833	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1385	1161	148	35	53	chr3	104884840	104885068	-54714715	+	RMER13A	LTR	ERVK	635	858	-2	9
1385	315	191	32	0	chr3	104885893	104885956	-54713827	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-745	1218	1154	9
1385	702	317	43	101	chr3	104888717	104889093	-54710690	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	9
1385	904	294	27	50	chr3	104890315	104890661	-54709122	-	ORR1E	LTR	MaLR	-47	327	1	9
1385	1910	183	62	20	chr3	104894781	104895182	-54704601	+	MTD	LTR	MaLR	2	419	0	9
1385	317	338	148	64	chr3	104898949	104899047	-54700736	+	LTR81A	LTR	ERV1?	198	332	-1018	9
1385	317	338	148	64	chr3	104899125	104899306	-54700477	+	LTR81A	LTR	ERV1?	333	584	-766	9
1385	337	371	189	21	chr3	104899304	104899556	-54700227	+	LTR81A	LTR	ERV1?	687	970	-380	9
1385	857	314	164	3	chr3	104900427	104900817	-54698966	+	MLT1F1	LTR	MaLR	23	475	-94	9
1385	474	129	14	0	chr3	104901307	104901377	-54698406	-	MTC	LTR	MaLR	-350	71	1	9
1385	618	269	151	36	chr3	104906358	104906583	-54693200	+	MLT1G1	LTR	MaLR	1	251	-328	1
1385	263	327	160	59	chr3	104906983	104907152	-54692631	+	MLT1G1	LTR	MaLR	378	563	-6	1
1385	525	303	93	33	chr3	104916789	104917119	-54682664	+	MLT1J2	LTR	MaLR	75	438	-10	1
1385	1876	242	102	22	chr3	104921049	104921559	-54678224	+	RMER15	LTR	ERVL	25	575	0	1
1385	404	282	191	59	chr3	104922411	104922667	-54677116	+	ORR1E	LTR	MaLR	65	354	-5	1
1385	288	310	45	102	chr3	104924581	104924757	-54675026	-	LTR48	LTR	ERV1	-13	774	609	1
1385	278	274	35	12	chr3	104926907	104926992	-54672791	-	MER87	LTR	ERV1	-23	518	432	1
1385	1183	237	76	38	chr3	104927402	104927770	-54672013	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	1
1385	968	224	195	21	chr3	104929372	104929689	-54670094	+	MTEb	LTR	MaLR	8	379	0	1
1385	2124	131	60	16	chr3	104931575	104931939	-54667844	-	RLTR28	LTR	ERVL	-143	381	2	1
1385	3195	28	3	3	chr3	104934872	104935237	-54664546	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	1
1385	2041	183	33	3	chr3	104936721	104937082	-54662701	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	1
1385	1890	166	88	45	chr3	104938587	104939009	-54660774	+	RMER10A	LTR	ERVL	3	442	0	1
1385	1801	164	9	33	chr3	104942253	104942582	-54657201	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	1
1385	236	200	88	44	chr3	104942584	104942652	-54657131	-	RMER10A	LTR	ERVL	-54	388	318	1
1385	1493	180	8	72	chr3	104951119	104951555	-54648228	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-2056	270	1	1
1385	3402	43	2	0	chr3	104951688	104952083	-54647700	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1385	2037	215	84	27	chr3	104952573	104953085	-54646698	-	RLTR20A	LTR	ERVK	0	541	1	1
1385	2961	148	12	92	chr3	104955855	104956430	-54643353	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	1
1385	2221	154	181	0	chr3	104961575	104962033	-54637750	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	45	1
1385	2221	154	181	0	chr3	104962116	104962138	-54637645	-	RMER4B	LTR	ERVK	-541	44	20	1
1385	1652	125	239	3	chr3	104963317	104963614	-54636169	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	1
1385	1220	170	191	10	chr3	104973432	104973741	-54626042	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-9	365	1	1
1385	588	336	70	45	chr3	104978610	104979080	-54620703	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-4305	1362	881	1
1385	437	292	146	70	chr3	104979268	104979596	-54620187	+	MTEa	LTR	MaLR	11	363	-16	1
1385	1954	304	95	50	chr3	104979617	104979851	-54619932	+	MTEa-int	LTR	MaLR	25	261	-1319	1
1385	1954	304	95	50	chr3	104979901	104980686	-54619097	+	MTEa-int	LTR	MaLR	262	1090	-490	1
1385	1218	290	55	76	chr3	104981256	104981767	-54618016	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1078	1577	-3	1
1385	357	286	144	27	chr3	104981770	104981957	-54617826	+	MTEa	LTR	MaLR	1	209	-170	1
1385	330	264	39	28	chr3	104982053	104982229	-54617554	+	MTEa	LTR	MaLR	197	379	0	1
1385	314	256	0	82	chr3	104983620	104983718	-54616065	+	MTEb	LTR	MaLR	288	377	-2	1
1385	486	330	97	50	chr3	104984916	104985359	-54614424	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	464	-3	1
1385	572	277	24	10	chr3	104986443	104986629	-54613154	+	MLT1A0	LTR	MaLR	173	371	-3	1
1385	3207	63	0	8	chr3	104987544	104987943	-54611840	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1386	1019	254	44	11	chr3	104989308	104989583	-54610200	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	292	1
1386	290	259	27	75	chr3	104989623	104989769	-54610014	-	RMER15	LTR	ERVL	-436	139	1	1
1386	243	314	103	95	chr3	104990193	104990446	-54609337	-	MLT1J	LTR	MaLR	-174	338	84	1
1386	2058	201	37	2	chr3	104990783	104991186	-54608597	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	1
1386	236	267	43	22	chr3	104999778	104999870	-54599913	+	MTE2a	LTR	MaLR	281	374	-5	1
1386	2075	110	90	3	chr3	105001718	105002073	-54597710	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	1
1386	671	353	86	82	chr3	105003918	105003944	-54595839	-	LTR33A_	LTR	ERVL	0	531	507	5
1386	671	353	86	82	chr3	105004050	105004506	-54595277	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-25	506	48	5
1386	671	353	86	82	chr3	105004539	105004580	-54595203	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-484	47	6	5
1386	2825	134	0	12	chr3	105010320	105010744	-54589039	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	3	1
1386	3322	53	2	0	chr3	105011011	105011409	-54588374	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	2	1
1386	978	228	59	123	chr3	105016943	105017348	-54582435	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	2
1386	873	184	264	13	chr3	105027679	105027982	-54571801	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	4
1386	1697	216	70	21	chr3	105037932	105038319	-54561464	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	1	7
1386	1562	148	45	79	chr3	105039589	105039721	-54560062	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-63	321	176	7
1386	1562	148	45	79	chr3	105039778	105039975	-54559808	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-209	175	4	7
1386	262	304	43	9	chr3	105043708	105043824	-54555959	+	LTR52	LTR	ERVL	1	120	-301	8
1386	323	242	0	87	chr3	105043926	105044030	-54555753	+	LTR52	LTR	ERVL	322	416	-5	8
1386	276	379	88	8	chr3	105056695	105056820	-54542963	-	LTR16A	LTR	ERVL	-190	261	127	9
1386	1206	202	65	64	chr3	105058929	105059306	-54540477	+	RLTR26	LTR	ERVK	5	417	-225	1
1386	525	315	76	45	chr3	105065679	105066035	-54533748	-	MLT1B	LTR	MaLR	-16	374	8	1
1386	2187	73	13	0	chr3	105066047	105066362	-54533421	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	1
1386	547	322	34	72	chr3	105072455	105072746	-54527037	-	MT2A	LTR	ERVL	-149	384	105	1
1386	549	297	12	6	chr3	105072824	105072990	-54526793	-	RMER15	LTR	ERVL	-57	518	352	1
1386	831	275	75	41	chr3	105076350	105076695	-54523088	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	1
1386	603	265	131	70	chr3	105081687	105082102	-54517681	-	RMER13A	LTR	ERVK	-41	586	96	1
1386	2112	164	76	8	chr3	105085509	105085903	-54513880	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1386	266	196	18	0	chr3	105085903	105085959	-54513824	+	MTEa	LTR	MaLR	321	377	-2	1
1386	2776	45	30	0	chr3	105086027	105086363	-54513420	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
1386	936	249	61	127	chr3	105087748	105088143	-54511640	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	371	-8	1
1386	349	364	59	23	chr3	105088710	105088966	-54510817	-	LTR78	LTR	ERV1	-174	1130	866	1
1386	305	225	66	22	chr3	105113550	105113641	-54486142	+	MTEa	LTR	MaLR	277	371	-8	1
1386	414	261	214	0	chr3	105113654	105113829	-54485954	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	154	1
1386	414	374	39	19	chr3	105115915	105116174	-54483609	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-27	453	190	1
1387	245	344	41	8	chr3	105121152	105121275	-54478508	+	MLT2B3	LTR	ERVL	3	129	-425	2
1387	521	353	59	65	chr3	105121537	105122013	-54477770	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-40	480	8	2
1387	581	309	70	23	chr3	105122715	105122973	-54476810	-	LTR16E2	LTR	ERVL	0	568	299	2
1387	1993	147	69	0	chr3	105124061	105124422	-54475361	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	2
1387	300	278	30	53	chr3	105124653	105124786	-54474997	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1553	4114	3985	2
1387	1473	253	52	8	chr3	105125792	105126159	-54473624	+	MTD	LTR	MaLR	15	397	-22	2
1387	591	350	82	40	chr3	105126672	105127124	-54472659	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-2765	2231	1761	2
1387	522	396	68	49	chr3	105130744	105131211	-54468572	-	LTR16E2	LTR	ERVL	-92	476	1	2
1387	3571	10	5	0	chr3	105135007	105135401	-54464382	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1387	575	292	77	45	chr3	105152485	105152772	-54447011	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	64	2
1387	744	290	18	77	chr3	105154488	105154761	-54445022	+	MER73	LTR	ERVL	1	257	-387	2
1387	233	204	111	0	chr3	105154841	105154895	-54444888	+	MER73	LTR	ERVL	252	311	-333	2
1387	693	252	107	99	chr3	105163549	105163583	-54436200	-	RMER4B	LTR	ERVK	-134	451	420	2
1387	3440	30	5	0	chr3	105163583	105163977	-54435806	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1387	693	252	107	99	chr3	105163977	105164307	-54435476	-	RMER4B	LTR	ERVK	-166	419	84	2
1387	1476	221	83	6	chr3	105171466	105171803	-54427980	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	363	-7	2
1387	1712	229	21	26	chr3	105181452	105181833	-54417950	+	MTC	LTR	MaLR	43	421	0	2
1387	651	323	86	74	chr3	105182586	105183118	-54416665	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	14	666	-14	2
1387	341	279	242	44	chr3	105183411	105183659	-54416124	-	MLT1H2	LTR	MaLR	0	489	193	2
1387	285	234	94	94	chr3	105184986	105185146	-54414637	+	RMER15	LTR	ERVL	2	161	-414	2
1387	321	265	155	22	chr3	105185165	105185378	-54414405	+	RMER15	LTR	ERVL	300	561	-14	2
1387	255	378	20	74	chr3	105196348	105196551	-54403232	+	LTR16A	LTR	ERVL	260	451	0	2
1387	367	349	32	90	chr3	105204995	105205328	-54394455	+	MLT2B1	LTR	ERVL	122	539	-15	3
1387	341	370	90	85	chr3	105212880	105213234	-54386549	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	357	-2	3
1387	230	200	73	62	chr3	105216845	105216941	-54382842	+	RMER17A	LTR	ERVK	369	465	-286	3
1387	1243	239	14	83	chr3	105219551	105219912	-54379871	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	336	-43	3
1387	1310	228	70	107	chr3	105219920	105220429	-54379354	+	MT2B	LTR	ERVL	1	549	-52	3
1387	1310	219	29	106	chr3	105220463	105220518	-54379265	+	MT2B	LTR	ERVL	550	600	-1	3
1387	1501	188	132	9	chr3	105221489	105221822	-54377961	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1387	3612	143	20	44	chr3	105222123	105222862	-54376921	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	3
1387	920	256	131	15	chr3	105222862	105223133	-54376650	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-51	314	12	3
1387	639	152	38	9	chr3	105223641	105223747	-54376036	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	109	-518	3
1387	1707	172	52	158	chr3	105223747	105224127	-54375656	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	101	3
1387	1707	172	52	158	chr3	105224152	105224247	-54375536	-	RLTR23	LTR	ERV1	-330	100	5	3
1387	1616	196	139	108	chr3	105224218	105224744	-54375039	+	RMER20B	LTR	ERVK	86	627	0	3
1387	389	327	147	18	chr3	105229814	105230038	-54369745	+	RMER15	LTR	ERVL	280	532	-43	3
1387	226	256	21	72	chr3	105230311	105230408	-54369375	+	MLT1D	LTR	MaLR	395	486	-19	3
1387	2589	83	6	0	chr3	105232878	105233203	-54366580	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1387	1492	196	161	97	chr3	105243545	105243979	-54355804	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	1	3
1387	562	327	192	27	chr3	105245862	105246236	-54353547	-	MLT1J2	LTR	MaLR	0	448	13	3
1387	2192	190	25	25	chr3	105246361	105246761	-54353022	+	MTD	LTR	MaLR	18	417	-2	4
1387	389	36	8	17	chr3	105247889	105247947	-54351836	+	MTB	LTR	MaLR	312	400	0	4
173	1874	144	30	171	chr3	105250723	105251157	-54348626	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	373	-1	4
1388	242	258	19	76	chr3	105260929	105261034	-54338749	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-140	187	89	4
1388	1401	241	49	54	chr3	105279933	105280302	-54319481	+	MTEa	LTR	MaLR	1	367	-12	4
1388	254	289	32	129	chr3	105280785	105281017	-54318766	-	MLT1H	LTR	MaLR	-4	591	378	4
1388	292	304	90	65	chr3	105281177	105281332	-54318451	-	MLT1H	LTR	MaLR	-379	170	12	4
1388	328	278	140	91	chr3	105287602	105287788	-54311995	-	LTR78	LTR	ERV1	-14	1290	1096	4
1388	789	242	192	68	chr3	105302321	105302644	-54297139	+	MTEa	LTR	MaLR	13	375	-4	4
1388	417	299	8	0	chr3	105306793	105306910	-54292873	+	MLT1D	LTR	MaLR	381	498	-7	4
1388	427	297	109	76	chr3	105310553	105310856	-54288927	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	19	4
1388	268	274	40	14	chr3	105310878	105310952	-54288831	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-415	100	25	4
1388	1004	257	178	3	chr3	105312071	105312391	-54287392	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	4	4
1388	245	333	40	0	chr3	105322262	105322337	-54277446	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-350	181	104	5
1388	1183	223	213	18	chr3	105330749	105331087	-54268696	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	9	5
1388	599	262	76	37	chr3	105336007	105336238	-54263545	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-6	648	372	5
1388	1124	268	101	39	chr3	105347511	105347868	-54251915	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	5
1388	768	246	34	102	chr3	105353118	105353353	-54246430	-	MTEa	LTR	MaLR	-160	219	1	5
1388	245	262	70	119	chr3	105354177	105354320	-54245463	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-197	318	183	5
1388	2157	147	104	8	chr3	105356409	105356793	-54242990	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
1388	1900	174	104	16	chr3	105365374	105365759	-54234024	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1388	390	343	43	134	chr3	105366216	105366291	-54233492	-	MLT2B4	LTR	ERVL	0	763	694	5
1388	1240	264	133	48	chr3	105366474	105366822	-54232961	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-70	693	370	5
1388	1657	224	51	27	chr3	105366822	105367231	-54232552	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1388	1240	251	160	32	chr3	105367231	105367451	-54232332	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-333	385	163	5
1388	535	350	86	62	chr3	105376243	105376663	-54223120	-	LTR33A	LTR	ERVL	-6	514	85	6
1389	340	217	73	73	chr3	105391850	105391974	-54207809	-	MTEb	LTR	MaLR	-230	149	26	6
1389	651	209	28	40	chr3	105396027	105396277	-54203506	+	MTEa	LTR	MaLR	9	374	-5	6
1389	2278	129	61	17	chr3	105401818	105402180	-54197603	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	6
1389	265	204	93	0	chr3	105407251	105407305	-54192478	+	MLT1A0	LTR	MaLR	28	86	-322	6
1389	470	271	41	8	chr3	105407383	105407506	-54192277	+	MLT1A0	LTR	MaLR	232	358	-7	6
1389	396	269	168	120	chr3	105410333	105410667	-54189116	-	ORR1E	LTR	MaLR	-9	350	1	6
1389	2405	87	16	0	chr3	105418621	105418943	-54180840	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1389	728	311	79	38	chr3	105419939	105420280	-54179503	+	MLT1A	LTR	MaLR	18	372	-2	6
1389	888	297	100	51	chr3	105425454	105425883	-54173900	-	MLT1C	LTR	MaLR	-6	461	12	6
1389	300	265	69	19	chr3	105429217	105429479	-54170304	+	RMER17D	LTR	ERVK	275	549	-340	6
1389	777	266	128	49	chr3	105429879	105430234	-54169549	-	MER31B	LTR	ERV1	-48	418	35	6
1389	885	298	33	66	chr3	105430234	105430600	-54169183	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	6
1389	2717	74	112	0	chr3	105431786	105432152	-54167631	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	6
1389	433	302	14	35	chr3	105454811	105454955	-54144828	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4124	1398	1258	7
1389	2162	194	40	10	chr3	105459056	105459452	-54140331	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	1	7
1389	423	276	160	84	chr3	105462436	105462780	-54137003	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	10	7
1389	229	352	75	19	chr3	105468292	105468399	-54131384	-	MER76	LTR	ERVL	-98	593	481	7
1389	248	272	22	137	chr3	105476144	105476327	-54123456	+	LTR48B	LTR	ERV1	138	299	-345	7
1389	292	257	9	90	chr3	105483056	105483167	-54116616	+	MT2B	LTR	ERVL	156	257	-344	7
1389	589	153	171	0	chr3	105491463	105491574	-54108209	+	ORR1A4	LTR	MaLR	200	329	0	7
1389	1035	240	102	96	chr3	105492023	105492397	-54107386	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	2	7
1389	312	292	11	33	chr3	105495659	105495751	-54104032	-	MLT1J	LTR	MaLR	-196	316	227	7
1389	339	296	53	53	chr3	105495967	105496081	-54103702	-	MLT1J	LTR	MaLR	-293	219	106	7
1389	238	266	122	83	chr3	105497022	105497178	-54102605	+	RMER19B	LTR	ERVK	396	557	-345	7
1389	1448	243	82	10	chr3	105500284	105500675	-54099108	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1389	475	297	0	8	chr3	105503346	105503475	-54096308	+	MTEa	LTR	MaLR	206	333	-46	6
1390	1305	196	72	39	chr3	105545552	105546107	-54053676	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	585	0	7
1390	238	267	34	103	chr3	105546349	105546466	-54053317	-	MT2B2	LTR	ERVL	-312	272	164	7
1390	302	239	32	10	chr3	105560263	105560364	-54039419	-	MTD	LTR	MaLR	-311	108	8	1
1390	1417	216	75	36	chr3	105565466	105565803	-54033980	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	352	-22	1
1390	1417	216	75	36	chr3	105565830	105565852	-54033931	+	ORR1D1	LTR	MaLR	353	374	0	1
1390	639	187	2	17	chr3	105570296	105570442	-54029341	+	ORR1C2	LTR	MaLR	189	384	0	1
1390	741	233	62	31	chr3	105576873	105577068	-54022715	+	MLT2C1	LTR	ERVL	19	219	-178	1
1390	3027	55	31	3	chr3	105578513	105578898	-54020885	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1390	833	223	84	11	chr3	105589415	105589745	-54010038	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	1
1390	919	235	112	27	chr3	105589754	105590012	-54009771	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	280	-978	1
1390	2122	236	92	78	chr3	105591866	105592692	-54007091	+	MTD-int	LTR	MaLR	240	1138	-120	1
1390	1422	209	120	46	chr3	105592669	105593036	-54006747	+	MTD	LTR	MaLR	6	399	-20	1
1390	818	225	37	63	chr3	105619481	105619733	-53980050	+	RLTR11A	LTR	ERVK	173	436	-124	2
1390	818	211	28	68	chr3	105619758	105619796	-53979987	+	RLTR11A	LTR	ERVK	429	464	-64	2
1390	442	314	56	30	chr3	105621254	105621514	-53978269	-	LTR81B	LTR	ERV1?	0	1393	885	2
1390	890	245	73	136	chr3	105622474	105622857	-53976926	+	MTEb	LTR	MaLR	1	359	-20	2
1390	673	273	92	144	chr3	105623956	105624114	-53975669	+	MLT1A0	LTR	MaLR	2	162	-212	2
1390	673	273	90	154	chr3	105624246	105624481	-53975302	+	MLT1A0	LTR	MaLR	152	365	0	2
1390	1056	271	82	16	chr3	105625239	105625554	-53974229	+	MTEa	LTR	MaLR	10	345	-34	2
1390	2382	136	19	6	chr3	105637001	105637363	-53962420	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1390	1982	153	7	121	chr3	105642262	105642693	-53957090	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	3
1391	1952	119	26	0	chr3	105647396	105647707	-53952076	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1391	306	263	97	55	chr3	105650723	105650868	-53948915	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	240	3
1391	285	266	45	27	chr3	105653789	105653901	-53945882	-	MLT1B	LTR	MaLR	-218	172	59	3
1391	338	319	16	57	chr3	105653922	105654045	-53945738	-	MTEa	LTR	MaLR	-187	192	75	3
1391	265	179	19	184	chr3	105654235	105654338	-53945445	-	MTEa	LTR	MaLR	-293	86	1	3
1391	352	238	38	53	chr3	105654603	105654736	-53945047	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-39	414	284	3
1391	780	264	23	38	chr3	105654847	105655149	-53944634	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-153	292	2	3
1391	1181	238	66	13	chr3	105655255	105655618	-53944165	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	3
1391	1693	128	63	16	chr3	105656038	105656341	-53943442	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	11	3
1391	3903	98	109	26	chr3	105661687	105662359	-53937424	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	8	3
1391	927	231	4	115	chr3	105669057	105669301	-53930482	-	MTEa	LTR	MaLR	-161	218	2	3
1391	2686	235	104	52	chr3	105672167	105672983	-53926800	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	2	3
1391	1049	190	15	10	chr3	105674352	105674554	-53925229	-	MTD	LTR	MaLR	-211	208	6	3
1391	867	46	18	0	chr3	105680641	105680750	-53919033	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	288	3
1391	300	384	11	11	chr3	105681234	105681413	-53918370	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1350	1528	-3463	3
1391	2123	149	28	13	chr3	105682109	105682497	-53917286	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	5	3
1391	602	193	302	123	chr3	105683358	105683666	-53916117	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	16	3
1391	371	326	150	23	chr3	105694183	105694489	-53905294	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	6	4
1391	1595	129	145	11	chr3	105700145	105700427	-53899356	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	320	-47	4
1391	382	58	77	0	chr3	105700764	105700816	-53898967	+	ORR1B2	LTR	MaLR	312	367	0	4
1391	258	193	17	17	chr3	105701732	105701790	-53897993	+	MTEb	LTR	MaLR	322	379	0	4
1391	2515	77	12	0	chr3	105705058	105705381	-53894402	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1391	277	169	13	133	chr3	105706642	105706717	-53893066	-	MT2B	LTR	ERVL	-367	234	169	4
1391	1252	219	48	66	chr3	105711797	105712174	-53887609	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	4
1391	369	283	10	0	chr3	105712899	105712998	-53886785	-	MTEa	LTR	MaLR	-68	311	212	4
1391	560	59	0	0	chr3	105715766	105715834	-53883949	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	262	4
1391	330	162	29	29	chr3	105715831	105715901	-53883882	+	MTD	LTR	MaLR	350	419	0	4
1391	556	304	12	54	chr3	105718507	105718674	-53881109	-	MTEa	LTR	MaLR	-219	160	1	4
1391	346	271	172	7	chr3	105718683	105718828	-53880955	-	MLT1B	LTR	MaLR	-99	291	123	4
1391	302	273	87	48	chr3	105719010	105719114	-53880669	-	MLT1B	LTR	MaLR	-282	108	1	4
1391	3134	49	18	8	chr3	105719159	105719551	-53880232	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1391	5814	113	30	79	chr3	105723035	105723589	-53876194	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	400	4
1391	5814	113	30	79	chr3	105723735	105723764	-53876019	-	RMER17B	LTR	ERVK	-559	399	399	4
1391	5814	113	30	79	chr3	105723797	105724145	-53875638	-	RMER17B	LTR	ERVK	-559	399	77	4
1391	5814	113	30	79	chr3	105724334	105724408	-53875375	-	RMER17B	LTR	ERVK	-882	76	1	4
1391	1508	203	25	76	chr3	105740144	105740361	-53859422	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	172	5
1391	1508	203	25	76	chr3	105740384	105740560	-53859223	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-203	171	1	5
1391	935	257	101	54	chr3	105751932	105752176	-53847607	+	RMER5	LTR	ERV1	87	336	-198	5
1391	935	257	101	54	chr3	105752372	105752555	-53847228	+	RMER5	LTR	ERV1	337	534	0	5
1391	236	254	0	60	chr3	105754191	105754258	-53845525	+	RLTR20C	LTR	ERVK	98	160	-374	5
1391	1294	200	109	26	chr3	105765190	105765529	-53834254	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	8	5
1391	379	198	28	94	chr3	105768554	105768660	-53831123	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	142	5
1392	5822	117	35	23	chr3	105784380	105785276	-53814507	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	5
1392	4411	152	97	20	chr3	105792276	105793114	-53806669	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	5
1392	2101	181	165	7	chr3	105793340	105793777	-53806006	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	516	0	5
1392	3428	29	42	0	chr3	105798752	105799132	-53800651	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1392	2162	126	46	44	chr3	105806519	105806885	-53792898	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1392	1340	213	138	27	chr3	105813363	105813696	-53786087	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
1392	351	77	5	3	chr3	105834062	105834111	-53765672	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	322	6
1392	252	191	56	42	chr3	105835563	105835582	-53764201	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-53	321	303	6
1392	4086	132	93	30	chr3	105842980	105843740	-53756043	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	6
1392	2160	80	7	0	chr3	105863577	105863865	-53735918	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	290	-668	6
1392	3533	164	7	48	chr3	105863849	105864577	-53735206	+	RLTR21	LTR	ERVK	466	1163	-409	6
1392	584	216	81	69	chr3	105864625	105864799	-53734984	+	RLTR21	LTR	ERVK	1397	1572	0	6
1392	1476	143	17	12	chr3	105890621	105890861	-53708922	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	241	-85	6
1392	225	333	112	69	chr3	105904027	105904304	-53695479	+	LTR41	LTR	ERVL	449	737	-31	7
1392	371	292	174	7	chr3	105905557	105905712	-53694071	-	RMER12	LTR	ERVK	-132	1190	1010	7
21	3487	189	30	43	chr3	105905859	105906725	-53693058	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	7
1393	301	250	94	59	chr3	105909264	105909434	-53690349	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-1030	778	603	7
1393	1781	191	38	6	chr3	105930260	105930603	-53669180	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-40	354	1	7
1393	534	337	45	55	chr3	105959999	105960310	-53639473	+	RLTR18	LTR	ERVK	6	313	-303	7
1393	476	361	29	30	chr3	105960384	105960675	-53639108	+	RLTR18B	LTR	ERVK	217	608	-8	7
1393	1963	206	29	23	chr3	105960808	105961310	-53638473	+	RMER12	LTR	ERVK	352	1051	-271	7
1393	540	256	85	54	chr3	105962046	105962269	-53637514	+	RMER12	LTR	ERVK	1039	1268	-54	7
1393	744	186	49	43	chr3	105962272	105962457	-53637326	+	RMER12	LTR	ERVK	1123	1308	-14	7
1393	239	323	137	21	chr3	105967105	105967200	-53632583	+	RLTR1D	LTR	ERV1	182	287	-318	7
1393	824	244	13	30	chr3	105968553	105968850	-53630933	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	7
1393	4053	235	22	10	chr3	105973651	105974546	-53625237	+	RMER13B	LTR	ERVK	3	908	0	7
1393	3078	42	0	0	chr3	105987001	105987355	-53612428	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	7
1393	2696	117	17	37	chr3	105987355	105988013	-53611770	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7581	6984	7
1393	3332	70	7	0	chr3	105988142	105988587	-53611196	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4991	2689	2242	7
1393	8470	130	22	37	chr3	105988567	105990048	-53609735	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5698	1982	524	7
1393	730	154	49	37	chr3	105990047	105990209	-53609574	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-1290	180	17	7
1393	3074	42	0	0	chr3	105990209	105990563	-53609220	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	7
1393	1906	136	0	17	chr3	105999504	106000000	-53599783	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-1705	3358	2453	8
1393	5044	96	27	32	chr3	106000005	106000751	-53599032	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2365	2698	1957	1
1393	4192	202	14	21	chr3	106000753	106001618	-53598165	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3405	4263	-800	2
1393	738	215	139	14	chr3	106001791	106001999	-53597784	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4788	5021	-42	2
1393	2767	100	102	24	chr3	106002000	106002450	-53597333	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	485	-79	4
1393	456	357	34	61	chr3	106010138	106010466	-53589317	+	RLTR18	LTR	ERVK	5	323	-293	1
1393	250	349	29	52	chr3	106010546	106010682	-53589101	+	RLTR18	LTR	ERVK	350	482	-134	1
1393	1753	215	30	23	chr3	106010951	106011384	-53588399	+	RMER12	LTR	ERVK	352	787	-535	1
1393	269	290	10	106	chr3	106011351	106011455	-53588328	+	RMER12	LTR	ERVK	958	1051	-271	1
1393	656	264	70	16	chr3	106012151	106012383	-53587400	+	RMER12	LTR	ERVK	1039	1267	-55	1
1393	725	166	47	47	chr3	106012386	106012557	-53587226	+	RMER12	LTR	ERVK	1123	1293	-29	1
1393	254	256	201	72	chr3	106017290	106017429	-53582354	+	RLTR1D	LTR	ERV1	182	338	-267	1
1393	540	229	7	14	chr3	106020644	106020786	-53578997	+	RLTR15	LTR	ERVK	219	359	0	2
1393	369	234	98	110	chr3	106026746	106026919	-53572864	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	944	1114	0	2
1393	3639	230	35	12	chr3	106028168	106029056	-53570727	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	3
1393	1433	183	61	20	chr3	106030997	106031342	-53568441	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1394	2952	133	44	18	chr3	106050694	106051245	-53548538	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1531	2095	-5311	5
1394	483	291	5	69	chr3	106051241	106051429	-53548354	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2433	2608	-4798	5
1394	2079	140	35	25	chr3	106051429	106051885	-53547898	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3055	3448	-3958	5
1394	4588	160	16	39	chr3	106051920	106053639	-53546144	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2356	4085	-3321	5
1394	9576	108	19	38	chr3	106053648	106055088	-53544695	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5757	7168	-238	5
1394	737	227	213	10	chr3	106055090	106055441	-53544342	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	118	537	-365	5
1394	282	125	164	45	chr3	106055441	106055461	-53544322	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7329	7348	-58	5
1394	282	125	164	45	chr3	106055499	106055545	-53544238	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7349	7402	-4	5
1394	877	177	30	148	chr3	106055547	106055912	-53543871	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	5
1394	4026	162	98	70	chr3	106055912	106056892	-53542891	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1562	5682	4676	5
1394	3108	59	5	2	chr3	106056884	106057290	-53542493	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1644	5762	5356	5
1394	9095	132	32	2	chr3	106057288	106058700	-53541083	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-2727	4679	3226	5
1394	503	136	38	19	chr3	106058768	106058873	-53540910	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4253	3153	3047	5
1394	686	227	6	38	chr3	106058865	106059025	-53540758	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4798	2608	2454	5
1394	687	167	25	0	chr3	106059038	106059158	-53540625	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5077	1060	938	5
1394	2128	164	152	38	chr3	106059163	106059670	-53540113	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4587	819	255	5
1394	2626	212	86	4	chr3	106062092	106062789	-53536994	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8152	8905	-54	6
1394	717	270	27	66	chr3	106062830	106063163	-53536620	+	RLTR15	LTR	ERVK	4	323	-36	6
1394	2776	165	214	4	chr3	106064016	106064576	-53535207	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	6
1394	295	395	58	32	chr3	106067669	106068012	-53531771	+	MTD	LTR	MaLR	26	377	-42	7
1394	1338	254	14	41	chr3	106068584	106068953	-53530830	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	7
1394	631	222	86	23	chr3	106084725	106084900	-53514883	-	RMER12	LTR	ERVK	-14	1308	1123	7
1394	506	253	159	15	chr3	106084904	106085105	-53514678	-	RMER12	LTR	ERVK	-55	1267	1038	8
1394	1971	208	28	25	chr3	106085824	106086323	-53513460	-	RMER12	LTR	ERVK	-271	1051	352	8
1394	481	337	27	31	chr3	106086485	106086745	-53513038	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-37	475	217	8
1394	429	376	35	45	chr3	106086819	106087131	-53512652	-	RLTR18	LTR	ERVK	-303	313	5	8
1394	2902	141	76	17	chr3	106113466	106114252	-53485531	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	860	-163	1
1394	686	262	29	29	chr3	106114247	106114455	-53485328	-	RLTR15	LTR	ERVK	-151	208	1	1
1394	1221	203	39	49	chr3	106119921	106120271	-53479512	-	RMER16	LTR	ERVK	-228	305	1	1
1394	731	276	52	45	chr3	106122719	106123027	-53476756	+	RLTR15	LTR	ERVK	14	323	-36	1
1394	3234	155	130	0	chr3	106123914	106124514	-53475269	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	1
1394	850	206	11	43	chr3	106127362	106127550	-53472233	+	RLTR9A	LTR	ERVK	185	366	-2	1
1394	3139	14	5	8	chr3	106127572	106127940	-53471843	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	1
1394	3885	213	43	18	chr3	106135741	106136627	-53463156	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	1
1394	2829	52	23	0	chr3	106137259	106137578	-53462205	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	36	1
1394	2829	52	23	0	chr3	106137627	106137653	-53462130	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-322	35	2	1
1394	3332	125	7	7	chr3	106137653	106138193	-53461590	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	0	7513	6974	1
1394	1981	52	4	0	chr3	106138323	106138575	-53461208	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4991	2689	2437	1
1394	473	81	0	0	chr3	106138560	106138622	-53461161	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2226	5454	5393	1
1394	1779	137	12	9	chr3	106138641	106139023	-53460760	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5907	574	17	1
1394	3041	45	0	0	chr3	106139023	106139377	-53460406	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	1
1394	245	388	63	30	chr3	106144243	106144575	-53455208	+	MTD	LTR	MaLR	26	368	-51	1
1394	1263	257	20	20	chr3	106150603	106150948	-53448835	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	345	-14	1
1394	991	132	63	6	chr3	106158734	106158946	-53440837	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	241	-126	1
1394	1799	132	9	59	chr3	106159637	106159976	-53439807	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
1394	31638	87	7	29	chr3	106159977	106164928	-53434855	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2	4844	0	1
1394	1705	141	9	62	chr3	106164928	106165268	-53434515	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	1
1395	700	45	0	1	chr3	106186575	106186673	-53413110	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	394	260	1
1395	2139	186	26	24	chr3	106190786	106191204	-53408579	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	1
1395	885	286	97	9	chr3	106194957	106195296	-53404487	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	369	-1	1
1395	404	312	14	0	chr3	106211460	106211601	-53388182	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4409	4551	-440	2
1395	878	279	51	29	chr3	106212767	106213118	-53386665	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	2
1395	875	254	149	25	chr3	106213171	106213446	-53386337	+	MTE-int	LTR	MaLR	1221	1529	-51	2
1395	1351	310	22	2	chr3	106227017	106227463	-53372320	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-3467	2294	1840	2
1395	1525	250	21	66	chr3	106229360	106229784	-53369999	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	170	2
1395	5413	121	14	27	chr3	106233490	106233757	-53366026	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	273	-616	2
1395	5255	134	25	72	chr3	106234043	106235069	-53364714	+	RLTR13A3	LTR	ERVK	1	978	0	2
1395	5413	121	14	27	chr3	106235095	106235725	-53364058	+	RMER17D	LTR	ERVK	274	887	-2	2
1395	2123	172	28	3	chr3	106237701	106238062	-53361721	-	MTC	LTR	MaLR	-44	377	8	2
1395	603	194	119	18	chr3	106238065	106238233	-53361550	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1074	2
1395	1602	97	143	39	chr3	106239390	106239670	-53360113	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	2
1395	355	51	9	0	chr3	106239695	106239748	-53360035	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	163	267	-7314	2
1395	594	249	45	50	chr3	106239780	106239979	-53359804	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	655	852	-1135	2
1395	840	295	47	51	chr3	106240425	106241135	-53358648	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3653	4359	-3222	2
1395	2039	295	29	31	chr3	106241637	106242656	-53357127	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4462	5477	-2104	2
1395	344	300	18	24	chr3	106242873	106243037	-53356746	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6907	7069	-512	2
1395	1803	216	24	41	chr3	106243103	106243514	-53356269	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-18	587	184	2
1395	851	233	10	21	chr3	106243519	106243712	-53356071	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-363	242	52	2
1395	1327	160	0	0	chr3	106243814	106244051	-53355732	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7345	7581	0	2
1395	2054	125	13	13	chr3	106244051	106244360	-53355423	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	2
1395	2426	212	53	25	chr3	106250128	106250690	-53349093	-	MTC-int	LTR	MaLR	-198	1060	483	2
1395	379	261	62	50	chr3	106258863	106259024	-53340759	-	LTR73	LTR	ERV1	-234	338	176	2
1395	262	367	62	35	chr3	106259355	106259468	-53340315	-	LTR16A	LTR	ERVL	-196	255	140	2
1395	1038	289	89	35	chr3	106260148	106260610	-53339173	+	RMER5	LTR	ERV1	33	519	-15	2
1395	541	269	142	53	chr3	106261508	106261810	-53337973	-	ORR1E	LTR	MaLR	-25	334	6	2
1395	256	345	146	35	chr3	106262698	106263041	-53336742	-	RMER5	LTR	ERV1	-28	506	126	2
1395	1709	227	73	58	chr3	106268728	106269220	-53330563	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	499	-318	2
1395	2276	182	45	0	chr3	106269220	106269622	-53330161	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	2
1395	1170	206	60	57	chr3	106269624	106269938	-53329845	+	RLTR40	LTR	ERVK	496	810	-7	2
1395	2978	35	0	0	chr3	106270276	106270622	-53329161	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1395	327	281	101	77	chr3	106275878	106276249	-53323534	+	RLTR12B	LTR	ERVK	17	278	-250	3
1395	409	230	98	86	chr3	106281475	106281664	-53318119	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	940	1114	0	3
1395	278	333	0	0	chr3	106281855	106281933	-53317850	+	MTE-int	LTR	MaLR	1469	1546	-34	3
1396	278	259	0	133	chr3	106302973	106303071	-53296712	+	RMER19B	LTR	ERVK	816	900	-2	3
1396	1624	195	109	8	chr3	106328346	106328703	-53271080	+	MTD	LTR	MaLR	13	405	-14	3
1396	1372	220	13	63	chr3	106339115	106339430	-53260353	+	MTEb	LTR	MaLR	1	299	-80	4
1396	245	300	125	110	chr3	106358758	106359039	-53240744	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	85	4
1396	527	163	9	5	chr3	106362678	106362774	-53237009	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	527	625	-745	4
1396	3239	36	0	0	chr3	106362795	106363185	-53236598	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	390	-6	4
1396	3482	187	99	3	chr3	106363194	106363939	-53235844	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	693	1509	0	4
1396	1272	148	298	3	chr3	106363939	106364231	-53235552	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
1396	636	292	42	59	chr3	106369691	106370054	-53229729	-	MER31A	LTR	ERV1	-13	472	1	4
1396	2025	128	40	9	chr3	106374985	106375333	-53224450	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	4
1396	1285	208	11	60	chr3	106383215	106383496	-53216287	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	128	5
1396	827	271	96	58	chr3	106383892	106384256	-53215527	-	RMER4A	LTR	ERVK	-23	443	66	5
1396	3171	44	21	3	chr3	106386081	106386470	-53213313	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1396	3883	47	19	0	chr3	106389814	106390280	-53209503	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	5
1396	302	0	0	0	chr3	106390280	106390318	-53209465	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
1396	258	203	25	63	chr3	106390318	106390397	-53209386	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	565	5
1396	12074	56	8	4	chr3	106390535	106392100	-53207683	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-129	5356	3786	5
1396	1299	82	70	42	chr3	106392100	106392524	-53207259	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	37	5
1396	7616	44	3	0	chr3	106392632	106393580	-53206203	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1695	3790	2840	5
1396	4413	8	2	12	chr3	106393580	106394078	-53205705	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1396	302	0	0	0	chr3	106394078	106394116	-53205667	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
1396	390	167	46	35	chr3	106394116	106394203	-53205580	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	5
1396	5570	24	1	0	chr3	106394203	106394875	-53204908	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	4688	5
1396	4413	8	2	12	chr3	106395092	106395590	-53204193	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1396	18701	53	22	11	chr3	106395590	106398061	-53201722	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-2641	2844	345	5
1396	738	292	69	32	chr3	106404118	106404464	-53195319	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	5
1396	2759	227	38	13	chr3	106405414	106406051	-53193732	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-804	4957	4305	5
1396	517	177	41	17	chr3	106406080	106406245	-53193538	+	ORR1A1	LTR	MaLR	66	231	-163	5
1396	1019	83	2	5	chr3	106406239	106406391	-53193392	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-250	144	4	5
1396	425	269	0	11	chr3	106419540	106419634	-53180149	+	MTE-int	LTR	MaLR	1432	1524	-56	5
1396	1869	91	15	130	chr3	106428004	106428473	-53171310	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-106	703	289	5
1396	235	342	0	27	chr3	106428540	106428615	-53171168	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-373	161	89	5
1397	342	182	0	0	chr3	106430683	106430738	-53169045	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	324	5
1397	260	259	19	0	chr3	106431781	106431850	-53167933	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	969	5
1397	3165	209	39	118	chr3	106431848	106431924	-53167859	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-203	825	747	5
1397	3711	206	28	21	chr3	106432104	106432918	-53166865	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-338	765	3	5
1397	402	231	34	5	chr3	106463229	106463335	-53136448	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	394	287	5
1397	3223	43	10	2	chr3	106465219	106465612	-53134171	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1397	7379	87	42	3	chr3	106465612	106466669	-53133114	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
1397	3148	53	8	2	chr3	106466669	106467063	-53132720	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1397	413	183	13	39	chr3	106470363	106470474	-53129309	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1423	1540	-40	5
1397	1898	187	55	6	chr3	106470466	106470811	-53128972	+	ORR1B2	LTR	MaLR	6	367	0	5
1397	305	127	24	37	chr3	106470838	106470920	-53128863	+	MTC-int	LTR	MaLR	1060	1140	-118	5
1397	279	292	97	52	chr3	106474491	106474646	-53125137	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-5	1098	937	6
1397	1989	245	51	42	chr3	106490327	106490873	-53108910	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	22	6
1397	235	317	0	0	chr3	106490937	106490997	-53108786	-	RMER15	LTR	ERVL	-515	60	1	6
1397	316	275	0	0	chr3	106491240	106491320	-53108463	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	80	-285	6
1397	423	259	40	7	chr3	106492408	106492556	-53107227	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1762	3995	3843	6
1397	263	250	16	8	chr3	106519103	106519119	-53080664	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-756	753	632	1
1397	3154	213	63	7	chr3	106520342	106521107	-53078676	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1111	852	45	1
1397	429	401	48	42	chr3	106522755	106523091	-53076692	+	LTR16A	LTR	ERVL	7	344	-107	1
1397	355	307	114	102	chr3	106556927	106557242	-53042541	-	MER67B	LTR	ERV1	-382	329	11	4
174	3542	75	143	14	chr3	106561190	106561707	-53038076	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	6
1398	268	344	67	26	chr3	106562162	106562323	-53037460	+	MLT1F2	LTR	MaLR	3	178	-370	6
1398	314	388	29	12	chr3	106562413	106562585	-53037198	+	MLT1F2	LTR	MaLR	329	503	-57	6
1398	280	310	50	25	chr3	106571020	106571139	-53028644	+	MTD	LTR	MaLR	74	195	-224	7
1398	371	317	20	84	chr3	106576411	106576614	-53023169	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	191	-168	8
1398	2058	135	28	6	chr3	106597987	106598307	-53001476	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1398	414	221	101	89	chr3	106598629	106598798	-53000985	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	944	1
1398	1586	230	93	35	chr3	106599826	106600222	-52999561	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1398	1228	259	46	54	chr3	106600223	106600594	-52999189	+	MTD-int	LTR	MaLR	2	369	-889	1
1398	2680	246	65	73	chr3	106600920	106601546	-52998237	+	MTD-int	LTR	MaLR	380	1009	-249	1
1398	2680	246	65	73	chr3	106602197	106602445	-52997338	+	MTD-int	LTR	MaLR	1014	1258	0	1
1398	1717	219	58	20	chr3	106602445	106602841	-52996942	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	1
1398	483	240	13	36	chr3	106604969	106605126	-52994657	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	265	1
1398	1248	216	99	0	chr3	106611180	106611453	-52988330	-	MTC	LTR	MaLR	-119	302	3	1
1398	902	272	52	81	chr3	106615494	106615842	-52983941	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-34	340	3	1
1398	1658	238	22	22	chr3	106616398	106616768	-52983015	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
1398	3979	113	27	5	chr3	106619046	106619634	-52980149	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	1
1398	1696	202	33	16	chr3	106619739	106620107	-52979676	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1398	3196	154	113	77	chr3	106632225	106632811	-52966972	-	RMER6-int	LTR	ERVK	0	3177	2525	1
1398	3196	154	113	77	chr3	106632874	106633097	-52966686	-	RMER6-int	LTR	ERVK	0	2524	2274	1
1398	1300	251	82	91	chr3	106633105	106633534	-52966249	+	RLTR23	LTR	ERV1	6	430	0	1
1398	289	103	0	0	chr3	106634511	106634550	-52965233	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-2	324	286	1
1398	539	207	0	0	chr3	106634549	106634660	-52965123	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-235	111	1	1
1398	344	364	42	12	chr3	106634714	106635048	-52964735	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	1312	1655	-6123	1
1398	275	194	40	27	chr3	106635053	106635127	-52964656	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	5483	5557	-2044	1
1398	591	308	39	39	chr3	106636585	106636973	-52962810	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7325	7712	-66	1
1398	1361	203	94	106	chr3	106637028	106637090	-52962693	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	57	-373	1
1398	1361	203	94	106	chr3	106637264	106637635	-52962148	+	RLTR23	LTR	ERV1	58	429	-1	1
1398	2366	199	16	27	chr3	106646244	106646694	-52953089	+	RMER19C	LTR	ERVK	167	611	0	1
1398	2139	166	11	11	chr3	106646694	106647059	-52952724	-	MTC-int	LTR	MaLR	-783	475	111	1
1398	228	241	146	89	chr3	106654063	106654186	-52945597	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	929	1058	-431	1
1398	1647	118	210	18	chr3	106671955	106672231	-52927552	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1398	701	149	21	56	chr3	106675588	106675730	-52924053	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1104	154	18	1
1398	956	191	85	88	chr3	106675730	106676058	-52923725	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	3	1
1398	518	269	11	101	chr3	106676109	106676287	-52923496	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4828	4989	-10	1
1398	230	308	67	107	chr3	106676289	106676438	-52923345	+	RMER15	LTR	ERVL	19	161	-414	1
1398	330	213	60	40	chr3	106676436	106676536	-52923247	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-38	1925	1844	1
1398	3574	127	42	96	chr3	106677112	106677840	-52921943	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-8	1106	221	1
1398	3574	234	95	93	chr3	106678040	106678409	-52921374	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-742	372	1	1
1398	3324	9	0	6	chr3	106682071	106682419	-52917364	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	2
1398	645	154	62	56	chr3	106683759	106683903	-52915880	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	145	-233	2
1398	1001	178	23	86	chr3	106684682	106684903	-52914880	+	ORR1C2	LTR	MaLR	161	367	-17	2
1398	1069	190	74	17	chr3	106686201	106686291	-52913492	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	446	2
1398	1069	202	51	24	chr3	106686333	106686653	-52913130	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-89	445	35	2
1399	1235	93	0	0	chr3	106701759	106701921	-52897862	+	MT2B2	LTR	ERVL	343	504	-80	2
1399	2766	66	33	0	chr3	106715011	106715346	-52884437	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1399	3456	47	89	6	chr3	106715346	106715838	-52883945	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	533	-1259	2
1399	2321	197	80	75	chr3	106736342	106736930	-52862853	+	RLTR25B	LTR	ERVK	7	597	-431	2
1399	286	192	0	19	chr3	106736903	106736956	-52862827	+	MT2B	LTR	ERVL	202	253	-348	2
1399	312	276	0	75	chr3	106740077	106740171	-52859612	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	154	2
1399	3952	155	155	8	chr3	106740610	106741344	-52858439	+	RMER21B	LTR	ERV1	1	842	0	2
1399	1560	249	62	31	chr3	106750321	106750805	-52848978	-	RMER5	LTR	ERV1	-3	531	33	2
1399	261	286	116	95	chr3	106751425	106751657	-52848126	+	MLT1G1	LTR	MaLR	341	577	-2	3
1399	371	312	53	40	chr3	106753563	106753713	-52846070	+	MTEa	LTR	MaLR	19	170	-209	3
1399	252	242	0	31	chr3	106762049	106762113	-52837670	-	MLT1B	LTR	MaLR	-46	344	283	3
1399	628	327	82	64	chr3	106769743	106770148	-52829635	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	54	3
1399	1275	238	237	20	chr3	106772007	106772458	-52827325	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	27	3
1399	833	265	152	29	chr3	106772617	106772893	-52826890	+	MTEa	LTR	MaLR	67	376	-3	3
1399	554	320	114	28	chr3	106782134	106782564	-52817219	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	1	3
1399	499	369	40	10	chr3	106782855	106783055	-52816728	-	LTR16C	LTR	ERVL	-155	334	129	3
1399	1616	246	59	13	chr3	106783375	106783762	-52816021	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	3
1399	636	279	27	21	chr3	106785553	106785740	-52814043	+	RMER15	LTR	ERVL	345	532	-43	3
1399	876	295	40	8	chr3	106790657	106790910	-52808873	+	RMER15	LTR	ERVL	298	558	-17	3
1399	2169	122	27	33	chr3	106794112	106794443	-52805340	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
1399	731	276	84	67	chr3	106800438	106800536	-52799247	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	106	-253	3
1399	1995	191	27	11	chr3	106800536	106800912	-52798871	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	3
1399	731	276	84	67	chr3	106800912	106801158	-52798625	+	ORR1E	LTR	MaLR	107	359	0	3
1399	471	256	80	0	chr3	106801159	106801284	-52798499	+	MLT1B	LTR	MaLR	42	176	-214	3
1399	283	314	37	19	chr3	106801324	106801431	-52798352	+	MLT1B	LTR	MaLR	253	361	-29	3
1399	273	364	40	40	chr3	106804651	106804800	-52794983	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-214	156	8	3
1399	1003	225	95	4	chr3	106807705	106807937	-52791846	-	MTD	LTR	MaLR	-62	357	105	3
1399	444	197	0	0	chr3	106808161	106808237	-52791546	-	MTD	LTR	MaLR	-299	120	45	3
1399	374	279	17	43	chr3	106820558	106820674	-52779109	+	RMER15	LTR	ERVL	421	533	-42	4
1400	2572	85	17	19	chr3	106849813	106850173	-52749610	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	4
1400	1602	141	226	10	chr3	106860404	106860705	-52739078	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	367	0	4
1400	227	283	0	0	chr3	106870593	106870653	-52729130	+	MLT1A1	LTR	MaLR	66	125	-249	4
1400	340	269	99	16	chr3	106871093	106871214	-52728569	+	MLT1A1	LTR	MaLR	270	400	-8	4
1400	226	317	98	24	chr3	106872680	106872803	-52726980	+	MTEb	LTR	MaLR	6	137	-222	4
1400	375	250	20	20	chr3	106873075	106873177	-52726606	+	MTEb	LTR	MaLR	278	379	0	4
1400	3480	50	2	2	chr3	106878263	106878663	-52721120	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1400	1814	161	66	15	chr3	106880516	106880851	-52718932	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	392	-2	4
1400	2756	185	33	31	chr3	106885408	106885950	-52713833	+	RMER15	LTR	ERVL	31	573	-2	4
1400	1628	147	76	106	chr3	106889656	106890013	-52709770	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	4
1400	663	281	108	25	chr3	106890426	106890762	-52709021	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	16	5
1400	1660	242	39	20	chr3	106925546	106925904	-52673879	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	15	5
1400	2278	182	32	10	chr3	106927412	106927822	-52671961	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1400	2978	233	95	108	chr3	106927822	106929020	-52670763	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	1183	-75	5
1400	1460	254	90	41	chr3	106929008	106929352	-52670431	+	MTD	LTR	MaLR	10	374	-45	5
1400	1460	254	90	41	chr3	106929551	106929596	-52670187	+	MTD	LTR	MaLR	375	418	-1	5
1400	439	307	145	85	chr3	106932080	106932454	-52667329	+	MLT1K	LTR	MaLR	8	405	-190	5
1400	439	307	145	85	chr3	106932511	106932584	-52667199	+	MLT1K	LTR	MaLR	406	482	-113	5
1400	2040	117	48	87	chr3	106937400	106937793	-52661990	-	RMER10B	LTR	ERVL	-20	378	1	5
1400	3394	148	11	4	chr3	106939234	106939785	-52659998	-	MT2B2	LTR	ERVL	-29	555	1	5
1400	269	53	0	0	chr3	106939785	106939823	-52659960	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
1400	323	192	13	40	chr3	106939823	106939899	-52659884	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	5
1400	6554	165	28	4	chr3	106939905	106940979	-52658804	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-139	5622	4523	5
1400	1579	230	145	3	chr3	106943971	106944337	-52655446	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	1	5
1401	292	378	60	20	chr3	106955593	106955793	-52643990	+	LTR16E1	LTR	ERVL	238	445	-93	5
1401	447	355	59	58	chr3	106958572	106958940	-52640843	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	369	-5	5
1401	1837	168	7	150	chr3	106960171	106960605	-52639178	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	372	-6	5
1401	225	240	12	62	chr3	106960983	106961063	-52638720	+	LTR16A1	LTR	ERVL	48	123	-333	5
1401	442	306	83	52	chr3	106964260	106964453	-52635330	+	MLT1L	LTR	MaLR	344	542	-68	5
1401	542	317	56	52	chr3	106967805	106968018	-52631765	+	MLT1D	LTR	MaLR	7	220	-285	5
1401	436	230	150	53	chr3	106968052	106968104	-52631679	+	MLT1D	LTR	MaLR	299	365	-140	5
1401	6228	112	48	10	chr3	106968104	106969027	-52630756	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	6
1401	436	230	150	53	chr3	106969027	106969107	-52630676	+	MLT1D	LTR	MaLR	366	444	-61	5
1401	712	278	9	60	chr3	106969256	106969474	-52630309	-	MTD	LTR	MaLR	-212	207	1	6
1401	483	292	26	0	chr3	106971717	106971830	-52627953	+	MTD	LTR	MaLR	48	163	-256	6
1401	689	223	156	10	chr3	106971842	106972041	-52627742	+	MTD	LTR	MaLR	192	419	0	6
1401	236	284	202	11	chr3	106982180	106982269	-52617514	+	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	28	133	-670	6
1401	1285	176	170	12	chr3	106983177	106983500	-52616283	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	6
1401	544	314	98	72	chr3	106984416	106984955	-52614828	+	MLT2B3	LTR	ERVL	2	554	0	6
1401	297	303	20	54	chr3	107000134	107000235	-52599548	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-123	433	287	1
1401	256	208	21	0	chr3	107001887	107001935	-52597848	-	MLT1K	LTR	MaLR	-4	591	543	5
1401	765	242	141	18	chr3	107002503	107002858	-52596925	-	RMER20B	LTR	ERVK	-41	586	138	8
1401	1978	189	114	3	chr3	107003314	107003691	-52596092	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	9
1401	463	289	100	28	chr3	107007180	107007408	-52592375	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-156	404	137	1
1401	2395	135	26	6	chr3	107008244	107008637	-52591146	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	1
1401	1693	176	158	13	chr3	107009304	107009690	-52590093	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	1
1401	1673	172	33	77	chr3	107009855	107010284	-52589499	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
1401	1626	159	26	187	chr3	107027307	107027762	-52572021	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	384	0	4
1401	633	301	128	13	chr3	107028525	107028751	-52571032	+	ORR1E	LTR	MaLR	108	359	0	4
1401	1303	154	14	5	chr3	107029581	107029802	-52569981	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	81	303	-281	4
1401	1088	274	45	26	chr3	107043251	107043562	-52556221	+	MTEa	LTR	MaLR	1	317	-62	7
1401	1152	266	96	6	chr3	107046477	107046810	-52552973	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	3	7
1401	507	306	34	29	chr3	107047768	107047977	-52551806	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-8	554	345	7
1401	230	302	81	86	chr3	107050932	107051142	-52548641	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-58	332	124	7
1401	1446	245	23	60	chr3	107055058	107055444	-52544339	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	3	9
1401	4287	119	81	17	chr3	107055652	107056359	-52543424	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	752	-4	9
1401	369	333	80	42	chr3	107064862	107065075	-52534708	+	LTR37B	LTR	ERV1	1	221	-247	1
1401	1354	231	60	98	chr3	107065688	107066105	-52533678	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	1
1401	993	260	122	3	chr3	107070787	107071073	-52528710	-	MTEa	LTR	MaLR	-59	320	1	1
1401	1296	184	252	13	chr3	107072031	107072340	-52527443	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	2	1
1401	676	292	117	90	chr3	107074692	107075060	-52524723	-	MLT1B	LTR	MaLR	-12	378	1	1
1401	2011	126	31	64	chr3	107077767	107078191	-52521592	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	1
1401	2042	142	45	45	chr3	107081191	107081589	-52518194	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	1
1402	1398	209	87	12	chr3	107088949	107089293	-52510490	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	5	1
1402	258	236	27	27	chr3	107089374	107089448	-52510335	+	MLT2B1	LTR	ERVL	10	83	-473	1
1402	306	301	143	0	chr3	107089556	107089764	-52510019	+	MLT2B1	LTR	ERVL	319	547	-9	1
1402	531	125	0	0	chr3	107089799	107089879	-52509904	+	MTC	LTR	MaLR	2	81	-340	1
1402	1714	112	84	3	chr3	107090858	107091145	-52508638	+	MTC	LTR	MaLR	68	377	-44	1
1402	925	298	87	3	chr3	107091285	107091571	-52508212	-	MER68	LTR	ERVL	-91	472	163	1
1402	1283	199	195	6	chr3	107095985	107096319	-52503464	+	MTD	LTR	MaLR	12	408	-11	1
1402	2092	111	33	57	chr3	107097366	107097701	-52502082	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1402	946	233	52	6	chr3	107140858	107141168	-52458615	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	198	2
1402	356	296	23	46	chr3	107141419	107141550	-52458233	-	RMER10B	LTR	ERVL	-2	396	269	2
1402	5718	57	42	83	chr3	107149750	107150287	-52449496	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	508	-300	2
1402	5718	57	42	83	chr3	107150470	107150775	-52449008	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	509	808	0	2
1402	686	272	140	35	chr3	107151097	107151469	-52448314	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-90	466	4	2
1402	585	265	84	22	chr3	107152019	107152269	-52447514	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-291	264	36	2
1402	3573	164	92	8	chr3	107152281	107153023	-52446760	-	RLTR40	LTR	ERVK	-13	804	1	2
1402	562	357	75	32	chr3	107153875	107154156	-52445627	-	LTR16A	LTR	ERVL	-9	442	150	2
1402	496	326	14	18	chr3	107158201	107158400	-52441383	+	MTD	LTR	MaLR	2	178	-241	2
1402	271	279	34	23	chr3	107158786	107158874	-52440909	+	MTD	LTR	MaLR	292	380	-39	2
1402	2251	140	117	7	chr3	107163858	107164310	-52435473	+	RLTR28	LTR	ERVL	2	503	-21	3
1402	2400	138	7	70	chr3	107174794	107175206	-52424577	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	3
1402	369	352	50	72	chr3	107176334	107176562	-52423221	+	LTR33	LTR	ERVL	48	267	-264	3
1402	409	300	80	43	chr3	107178787	107179177	-52420606	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	48	3
1402	3161	28	0	0	chr3	107179839	107180193	-52419590	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	354	-3	3
1402	937	264	121	63	chr3	107188162	107188542	-52411241	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	379	0	3
1402	1271	128	226	0	chr3	107188542	107188762	-52411021	-	RLTR28	LTR	ERVL	-253	271	1	3
1402	1128	257	137	0	chr3	107191233	107191540	-52408243	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	71	3
1402	2464	132	51	2	chr3	107191946	107192340	-52407443	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	3
1402	2915	89	33	58	chr3	107192392	107192843	-52406940	+	BGLII_B	LTR	ERVK	2	441	0	3
1402	587	310	68	30	chr3	107197969	107198238	-52401545	+	LTR48B	LTR	ERV1	123	374	-270	3
1402	3122	23	2	138	chr3	107198454	107198905	-52400878	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	3
1402	15861	25	30	40	chr3	107198915	107200878	-52398905	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	1984	-3	3
1402	2929	16	2	205	chr3	107200880	107201367	-52398416	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	3
1402	577	308	75	21	chr3	107201458	107201697	-52398086	+	LTR48B	LTR	ERV1	123	374	-270	3
1402	5007	110	35	10	chr3	107204099	107204818	-52394965	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	3
1402	474	330	35	59	chr3	107213567	107213770	-52386013	+	MLT1J	LTR	MaLR	221	418	-94	3
1403	1237	274	74	52	chr3	107220859	107221328	-52378455	-	RMER5	LTR	ERV1	-2	532	53	4
1403	1237	274	74	52	chr3	107221520	107221551	-52378232	-	RMER5	LTR	ERV1	-482	52	21	4
1403	2473	110	0	0	chr3	107225090	107225417	-52374366	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1403	301	319	44	9	chr3	107225897	107226011	-52373772	-	LTR37B	LTR	ERV1	-350	118	1	4
1403	265	250	0	0	chr3	107228945	107229005	-52370778	+	RMER15	LTR	ERVL	1	60	-515	4
1403	827	242	23	147	chr3	107229043	107229391	-52370392	+	RMER15	LTR	ERVL	15	319	-256	4
1403	3108	84	10	22	chr3	107240125	107240537	-52359246	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1403	478	327	117	53	chr3	107267682	107268103	-52331680	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-64	491	66	4
1403	239	262	78	70	chr3	107268860	107268975	-52330808	+	MLT1H1	LTR	MaLR	129	244	-351	4
1403	348	360	131	40	chr3	107268998	107269250	-52330533	+	MLT1H1	LTR	MaLR	276	550	-5	4
1403	262	327	0	113	chr3	107277526	107277564	-52322219	+	MT2B2	LTR	ERVL	132	155	-429	4
1403	1302	228	167	11	chr3	107291557	107291917	-52307866	+	MTD	LTR	MaLR	4	419	0	4
1403	527	245	31	78	chr3	107292431	107292645	-52307138	+	MLT1A1	LTR	MaLR	221	461	-6	5
1403	445	306	121	43	chr3	107301430	107301686	-52298097	+	ORR1E	LTR	MaLR	84	359	0	5
1403	1091	207	177	27	chr3	107301994	107302322	-52297461	+	MTD	LTR	MaLR	35	411	-8	5
1403	548	237	256	29	chr3	107304096	107304195	-52295588	+	MTEa	LTR	MaLR	1	120	-259	5
1403	548	237	256	29	chr3	107304247	107304456	-52295327	+	MTEa	LTR	MaLR	121	378	-1	5
1403	2662	144	79	14	chr3	107312007	107312501	-52287282	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	2	5
1403	363	210	54	107	chr3	107318009	107318121	-52281662	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	152	5
1403	642	331	110	41	chr3	107325112	107325466	-52274317	+	MLT1G1	LTR	MaLR	5	420	-159	5
1403	305	320	60	38	chr3	107326480	107326613	-52273170	-	ORR1E	LTR	MaLR	-223	136	1	5
1403	645	321	49	52	chr3	107334220	107334585	-52265198	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	7	5
1403	1347	246	45	35	chr3	107334949	107335355	-52264428	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	419	11	5
1403	278	308	83	25	chr3	107336346	107336466	-52263317	-	ORR1E	LTR	MaLR	-214	145	19	5
1403	276	301	182	11	chr3	107341074	107341143	-52258640	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-204	5463	5385	5
1403	2219	144	78	56	chr3	107341143	107341554	-52258229	+	MTC	LTR	MaLR	2	421	0	5
1403	276	301	182	11	chr3	107341554	107341759	-52258024	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-283	5384	5143	5
1403	1730	222	157	24	chr3	107342551	107342890	-52256893	+	MT2B	LTR	ERVL	1	403	-198	5
1403	1730	222	157	24	chr3	107343008	107343171	-52256612	+	MT2B	LTR	ERVL	404	570	-31	5
1403	281	167	0	0	chr3	107343227	107343275	-52256508	+	MT2B	LTR	ERVL	537	584	0	5
1403	371	298	184	31	chr3	107343677	107343926	-52255857	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-63	334	57	5
1403	481	290	69	29	chr3	107343780	107343959	-52255824	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-370	284	43	5
1403	226	282	118	30	chr3	107344676	107344811	-52254972	-	MLT2F	LTR	ERVL	-515	148	2	5
1403	369	319	77	12	chr3	107345659	107345827	-52253956	-	MamGypLTR1b	LTR	Gypsy	-50	732	554	6
1403	318	343	122	17	chr3	107346399	107346580	-52253203	+	MLT1N2	LTR	MaLR	349	548	-14	6
1403	279	303	64	9	chr3	107347841	107347951	-52251832	+	MLT1N2	LTR	MaLR	432	547	-15	6
1404	233	229	45	143	chr3	107348615	107348727	-52251056	+	RLTR30	LTR	ERV1	47	147	-232	6
1404	593	279	85	101	chr3	107350911	107351286	-52248497	+	MLT1F2	LTR	MaLR	25	393	-167	6
1404	271	297	0	86	chr3	107353597	107353678	-52246105	+	MLT1A1	LTR	MaLR	47	120	-288	6
1404	994	263	26	66	chr3	107354246	107354577	-52245206	-	ORR1E	LTR	MaLR	-90	304	2	6
1404	298	250	44	0	chr3	107392113	107392181	-52207602	+	MLT1F1	LTR	MaLR	289	359	-189	6
1404	314	243	62	48	chr3	107392196	107392336	-52207447	+	MLT1F1	LTR	MaLR	425	566	-3	6
1404	1051	240	48	28	chr3	107409788	107410037	-52189746	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	125	6
1404	243	315	14	116	chr3	107412028	107412175	-52187608	+	MT2B2	LTR	ERVL	151	282	-302	6
1404	1427	239	66	30	chr3	107412686	107413052	-52186731	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	6
1404	2787	186	148	56	chr3	107413178	107413929	-52185854	-	RMER13A	LTR	ERVK	-39	821	2	6
1404	234	296	27	40	chr3	107421792	107421866	-52177917	+	LTR78	LTR	ERV1	214	286	-1018	6
1404	259	245	9	67	chr3	107436822	107436927	-52162856	-	MER31-int	LTR	ERV1	-898	4458	4360	7
1404	302	292	24	24	chr3	107437093	107437216	-52162567	-	MER31-int	LTR	ERV1	-941	3995	3873	7
1404	464	245	172	24	chr3	107437670	107437744	-52162039	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3509	1427	1342	7
1404	464	245	172	24	chr3	107437883	107438105	-52161678	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3595	1341	1087	7
1404	398	225	33	8	chr3	107438935	107439056	-52160727	-	MER31-int	LTR	ERV1	-4594	342	219	7
1404	1085	286	68	26	chr3	107439275	107439584	-52160199	-	MTEa	LTR	MaLR	-55	324	3	7
1404	332	352	27	49	chr3	107440351	107440536	-52159247	-	MER31A	LTR	ERV1	-9	476	296	7
1404	1392	231	106	61	chr3	107440669	107441065	-52158718	+	MTD	LTR	MaLR	5	418	-1	7
1404	585	179	129	8	chr3	107448566	107448690	-52151093	-	MT2A	LTR	ERVL	-310	223	85	7
1404	1953	138	21	25	chr3	107448705	107449032	-52150751	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	326	-3	7
1404	596	149	0	11	chr3	107449175	107449270	-52150513	-	MT2A	LTR	ERVL	-439	94	1	7
1404	769	283	78	70	chr3	107449914	107450286	-52149497	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	379	0	7
1404	913	134	7	0	chr3	107451628	107451777	-52148006	-	RMER19A	LTR	ERVK	-587	150	1	7
1404	401	277	30	48	chr3	107451780	107451947	-52147836	-	RNLTR23	LTR	ERVK	0	642	479	7
1404	289	279	152	40	chr3	107452653	107452841	-52146942	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	819	7
1404	234	339	52	119	chr3	107454291	107454425	-52145358	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-20	540	416	7
1404	282	233	44	124	chr3	107454422	107454559	-52145224	-	MER31B	LTR	ERV1	-6	460	335	7
1404	271	267	13	13	chr3	107454551	107454627	-52145156	-	RMER5	LTR	ERV1	-9	525	450	7
1404	3303	103	9	0	chr3	107455315	107455742	-52144041	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-4	432	2	7
1404	1423	224	70	8	chr3	107456452	107456807	-52142976	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	1	7
1404	2550	140	52	7	chr3	107457074	107457477	-52142306	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1404	1470	190	102	33	chr3	107459837	107460201	-52139582	+	MTD	LTR	MaLR	31	419	0	7
1404	264	175	68	44	chr3	107461386	107461474	-52138309	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	377	276	7
1404	463	295	0	30	chr3	107461527	107461660	-52138123	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	21	7
1404	626	238	172	84	chr3	107462518	107462803	-52136980	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1013	7
1404	1784	91	148	3	chr3	107462882	107463192	-52136591	-	RMER12	LTR	ERVK	-553	769	415	7
1404	981	186	0	37	chr3	107463189	107463379	-52136404	-	RMER12	LTR	ERVK	-1139	183	1	7
1404	265	265	52	111	chr3	107463464	107463617	-52136166	+	MT2B	LTR	ERVL	168	311	-290	7
1404	502	240	236	0	chr3	107464399	107464624	-52135159	+	MLT-int	LTR	MaLR	1397	1674	-61	7
1404	475	258	67	0	chr3	107464850	107464970	-52134813	+	MLT1A1	LTR	MaLR	245	372	-36	7
1404	277	339	57	129	chr3	107465478	107465796	-52133987	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	63	7
1405	1105	283	100	52	chr3	107500398	107500898	-52098885	-	LTR85b	LTR	Gypsy?	-12	772	249	1
1405	255	319	0	110	chr3	107502598	107502621	-52097162	+	MT2B2	LTR	ERVL	145	153	-431	3
1405	759	232	270	44	chr3	107502785	107503122	-52096661	+	MTD	LTR	MaLR	5	417	-2	5
1405	1634	146	107	10	chr3	107504032	107504322	-52095461	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	6
1405	2665	181	62	4	chr3	107508596	107509084	-52090699	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	1	1
1405	273	152	0	42	chr3	107510771	107510819	-52088964	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-9	375	330	1
1405	1716	155	73	42	chr3	107510994	107511324	-52088459	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-43	341	2	1
1405	302	325	94	28	chr3	107512386	107512598	-52087185	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	226	-144	2
1405	508	311	104	15	chr3	107513401	107513603	-52086180	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	155	2
1405	359	282	134	43	chr3	107516096	107516425	-52083358	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	3
1405	301	269	15	0	chr3	107518066	107518133	-52081650	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	494	3
1405	471	354	99	53	chr3	107520664	107521189	-52078594	-	MER34A	LTR	ERV1	-20	551	3	4
1405	353	333	114	13	chr3	107521225	107521383	-52078400	+	LTR16D	LTR	ERVL	468	641	-10	4
1405	288	315	70	74	chr3	107522555	107522912	-52076871	-	MTE2a	LTR	MaLR	-7	367	9	4
1405	557	281	54	39	chr3	107522925	107523129	-52076654	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	0	680	474	5
1405	461	305	84	51	chr3	107523869	107524083	-52075700	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-162	462	242	5
1405	1126	170	3	9	chr3	107524429	107524764	-52075019	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	5
1405	230	200	12	70	chr3	107525424	107525510	-52074273	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-558	465	385	6
1405	3180	70	12	0	chr3	107529282	107529695	-52070088	+	BGLII	LTR	ERVK	4	421	0	6
1405	2076	154	41	19	chr3	107530598	107530962	-52068821	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	6
1405	578	281	149	52	chr3	107532448	107532638	-52067145	+	MLT1D	LTR	MaLR	181	373	-132	7
1405	3301	36	5	8	chr3	107532638	107533035	-52066748	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1405	578	281	149	52	chr3	107533035	107533133	-52066650	+	MLT1D	LTR	MaLR	374	497	-8	7
1405	1929	121	69	0	chr3	107538642	107538931	-52060852	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	8
1405	277	283	77	130	chr3	107581282	107581489	-52018294	-	LTR89	LTR	ERVL?	-129	750	555	1
1405	880	270	40	47	chr3	107588816	107589069	-52010714	-	MTE2a	LTR	MaLR	-16	363	113	1
1405	1634	209	85	26	chr3	107589102	107589480	-52010303	+	MTD	LTR	MaLR	12	411	-8	1
1405	353	192	0	4	chr3	107589484	107589548	-52010235	-	MTE2a	LTR	MaLR	-271	148	63	1
1405	582	192	57	16	chr3	107589588	107589710	-52010073	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	250	1
1405	996	214	130	122	chr3	107594846	107595230	-52004553	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	387	-11	1
1405	531	312	92	102	chr3	107597514	107597849	-52001934	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	333	-26	1
1405	2051	192	61	0	chr3	107599729	107600124	-51999659	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1405	235	211	37	134	chr3	107600917	107600999	-51998784	-	MT2B2	LTR	ERVL	-349	235	162	1
1405	302	288	32	97	chr3	107601181	107601335	-51998448	-	MLT1D-int	LTR	MaLR	-110	1277	1134	1
1405	227	255	125	19	chr3	107601466	107601570	-51998213	+	MER72	LTR	ERV1	608	722	0	1
1405	614	306	152	26	chr3	107603531	107603880	-51995903	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	113	1
1405	230	341	49	105	chr3	107603971	107604256	-51995527	+	MLT1A0	LTR	MaLR	36	304	-61	1
1405	1159	202	32	36	chr3	107606866	107607118	-51992665	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	121	1
1405	2604	94	19	6	chr3	107607307	107607670	-51992113	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	1
1406	404	294	152	21	chr3	107612921	107613164	-51986619	+	MLT1C	LTR	MaLR	142	416	-51	2
1406	231	316	25	25	chr3	107613254	107613335	-51986448	+	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	757	837	-2	2
1406	341	292	206	9	chr3	107614051	107614265	-51985518	-	MLT2F	LTR	ERVL	-367	296	41	2
1406	3635	195	57	42	chr3	107622825	107623205	-51976578	-	RLTR40	LTR	ERVK	-6	811	413	2
1406	3635	195	57	42	chr3	107623225	107623637	-51976146	-	RLTR40	LTR	ERVK	-405	412	8	2
1406	267	292	99	109	chr3	107625521	107625713	-51974070	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	168	2
1406	2621	179	17	128	chr3	107637945	107638079	-51961704	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	457	2
1406	2621	179	17	128	chr3	107638258	107638769	-51961014	-	RMER15	LTR	ERVL	-119	456	2	2
1406	558	353	119	73	chr3	107646159	107646654	-51953129	+	MLT1F2	LTR	MaLR	32	549	-11	2
1406	464	363	7	7	chr3	107664069	107664216	-51935567	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1121	1267	-468	2
1406	301	266	174	0	chr3	107664372	107664481	-51935302	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1559	1686	-49	2
1406	227	204	0	0	chr3	107664806	107664850	-51934933	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1678	1721	-14	2
1406	554	330	19	52	chr3	107664868	107665161	-51934622	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	332	-33	2
1406	1350	213	71	57	chr3	107665451	107665805	-51933978	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	61	3
1406	1295	176	9	9	chr3	107667823	107668041	-51931742	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	159	3
1406	4441	155	131	16	chr3	107668282	107669324	-51930459	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-3	1506	34	3
1406	231	323	92	18	chr3	107673385	107673549	-51926234	-	MER87	LTR	ERV1	-69	472	297	3
1406	271	23	182	23	chr3	107674224	107674268	-51925515	+	ORR1A1	LTR	MaLR	291	341	-5	3
1406	2571	140	17	7	chr3	107674870	107675274	-51924509	+	MTC	LTR	MaLR	1	408	-13	3
1406	5277	128	92	35	chr3	107684626	107685235	-51914548	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	315	3
1406	5277	128	92	35	chr3	107685382	107685679	-51914104	-	RMER17B	LTR	ERVK	-644	314	1	3
1406	3775	152	57	36	chr3	107691667	107692674	-51907109	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	1023	1	3
1406	2181	69	4	0	chr3	107697426	107697703	-51902080	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	119	3
1406	323	290	101	25	chr3	107702540	107702671	-51897112	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-145	482	274	3
1406	484	335	56	81	chr3	107702803	107703160	-51896623	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	348	-11	3
1406	281	233	151	0	chr3	107703188	107703261	-51896522	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-476	84	1	3
1406	1691	206	85	56	chr3	107706435	107707064	-51892719	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	553	11	3
1406	2183	141	97	25	chr3	107707769	107708162	-51891621	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1406	2072	223	46	15	chr3	107709047	107709525	-51890258	-	RLTR16	LTR	ERVK	-12	493	1	3
1406	1540	199	137	17	chr3	107716024	107716381	-51883402	+	MTD	LTR	MaLR	2	401	-18	3
1406	467	311	10	45	chr3	107719370	107719569	-51880214	+	MER34-int	LTR	ERV1	760	951	-7256	3
1406	553	313	55	5	chr3	107721950	107722149	-51877634	+	MTC	LTR	MaLR	17	225	-196	3
1406	2935	133	27	96	chr3	107722718	107723301	-51876482	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	8	550	-27	3
1406	483	208	84	2	chr3	107724115	107724265	-51875518	+	RLTR28B	LTR	ERVL	9	178	-346	3
1406	292	305	111	68	chr3	107725922	107726112	-51873671	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	356	3
1406	456	350	62	77	chr3	107729215	107729540	-51870243	-	ORR1E	LTR	MaLR	-13	346	27	3
1406	290	261	49	43	chr3	107739129	107739246	-51860537	+	MLT1J2	LTR	MaLR	257	399	-113	4
1406	3422	47	5	0	chr3	107740001	107740404	-51859379	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	3	4
1407	1428	143	140	159	chr3	107747140	107747505	-51852278	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	17	4
1407	268	294	35	0	chr3	107749718	107749803	-51849980	+	MLT1J2	LTR	MaLR	277	364	-84	4
1407	443	350	43	73	chr3	107750525	107750895	-51848888	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	4
1407	1648	204	71	0	chr3	107757698	107758051	-51841732	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1407	2734	131	16	78	chr3	107758087	107758148	-51841635	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	48	-457	4
1407	2734	131	16	78	chr3	107758322	107758775	-51841008	+	RLTR16	LTR	ERVK	49	483	-22	4
1407	1769	210	84	13	chr3	107758835	107759226	-51840557	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1407	237	257	127	127	chr3	107765327	107765492	-51834291	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-3	559	395	4
1407	654	304	65	4	chr3	107765554	107765785	-51833998	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-252	263	19	4
1407	1922	157	132	11	chr3	107768597	107768952	-51830831	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	4
1407	316	134	884	0	chr3	107774704	107774790	-51824993	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	162	-594	4
1407	3004	50	49	10	chr3	107777963	107778348	-51821435	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1407	282	213	59	85	chr3	107780415	107780438	-51819345	+	MT2B	LTR	ERVL	137	156	-445	4
1407	1887	119	78	18	chr3	107796878	107796996	-51802787	-	BGLII_A	LTR	ERVK	0	445	331	4
1407	2447	120	41	134	chr3	107796996	107797527	-51802256	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	4
1407	1887	119	78	18	chr3	107797527	107797742	-51802041	-	BGLII_A	LTR	ERVK	-115	330	92	4
1407	516	146	62	10	chr3	107797996	107798093	-51801690	-	RLTR17	LTR	ERVK	-590	102	1	4
1407	5697	103	40	25	chr3	107798663	107799551	-51800232	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	4
1407	4293	150	57	32	chr3	107800102	107800975	-51798808	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-11	895	1	4
1407	381	238	54	96	chr3	107801445	107801612	-51798171	+	RMER10A	LTR	ERVL	80	265	-177	4
1407	405	210	88	77	chr3	107801917	107802098	-51797685	+	RLTR23	LTR	ERV1	244	426	-4	4
1407	539	247	70	57	chr3	107802083	107802311	-51797472	+	RMER10A	LTR	ERVL	208	438	-4	4
1407	4329	23	0	0	chr3	107803099	107803581	-51796202	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	4
1407	253	270	0	31	chr3	107804573	107804638	-51795145	+	RLTR25A	LTR	ERVK	510	572	-531	5
1407	3191	12	0	0	chr3	107810100	107810445	-51789338	+	ORR1A0	LTR	MaLR	2	346	0	5
1407	373	302	135	62	chr3	107813707	107814011	-51785772	-	MLT2B2	LTR	ERVL	0	515	190	5
1407	289	314	11	55	chr3	107826543	107826634	-51773149	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-256	109	23	5
1407	371	148	0	0	chr3	107826824	107826878	-51772905	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	362	5
1407	790	166	58	0	chr3	107826874	107827013	-51772770	-	MTC	LTR	MaLR	-274	147	1	5
1407	1204	226	179	20	chr3	107828828	107828940	-51770843	+	MTD	LTR	MaLR	6	128	-291	5
1407	1204	226	179	20	chr3	107828967	107829211	-51770572	+	MTD	LTR	MaLR	129	418	-1	5
1407	2429	79	6	6	chr3	107830487	107830806	-51768977	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
1407	521	302	143	21	chr3	107839977	107840312	-51759471	-	MLT2B1	LTR	ERVL	0	520	145	5
1407	1370	165	42	0	chr3	107848663	107848899	-51750884	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	246	-571	5
1407	267	362	23	15	chr3	107851034	107851166	-51748617	-	MER110-int	LTR	ERV1	-2068	2579	2447	5
1407	3061	48	60	13	chr3	107852812	107853194	-51746589	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1407	4445	62	22	2	chr3	107857663	107858216	-51741567	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	5
1407	247	277	19	63	chr3	107859006	107859164	-51740619	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	604	5
1407	3057	157	20	2	chr3	107859425	107859929	-51739854	+	RMER20A	LTR	ERVK	4	516	0	5
1407	225	196	137	0	chr3	107860347	107860398	-51739385	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	58	-301	5
1407	422	296	122	41	chr3	107860663	107860860	-51738923	+	ORR1E	LTR	MaLR	141	353	-6	5
1407	554	256	35	47	chr3	107861303	107861475	-51738308	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	170	-189	6
1407	916	255	30	108	chr3	107862183	107862517	-51737266	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	63	6
1407	886	269	12	12	chr3	107862536	107862777	-51737006	+	SRV_MM-int	LTR	ERVK	1884	2124	-4043	6
1407	1632	89	128	29	chr3	107862898	107863189	-51736594	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-6003	1403	1076	6
1407	1632	225	63	77	chr3	107863230	107863555	-51736228	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-6331	1075	1060	6
1407	378	213	0	51	chr3	107863557	107863636	-51736147	-	RLTR9F	LTR	ERVK	0	415	341	6
1407	643	118	0	68	chr3	107863614	107863732	-51736051	+	RLTR9D	LTR	ERVK	284	393	-10	6
1407	459	161	7	157	chr3	107869053	107869193	-51730590	+	MT2B	LTR	ERVL	139	257	-344	6
1407	4349	43	101	0	chr3	107869335	107869868	-51729915	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	6
1407	244	250	87	14	chr3	107870564	107870633	-51729150	+	MTEb	LTR	MaLR	289	362	-17	6
1407	261	218	59	82	chr3	107871716	107871801	-51727982	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	427	6
1408	1716	174	77	19	chr3	107930950	107931325	-51668458	-	MTC	LTR	MaLR	-22	399	3	7
1408	424	261	55	55	chr3	107962876	107963095	-51636688	+	RMER12	LTR	ERVK	770	988	-334	7
1408	563	306	56	0	chr3	107975976	107976136	-51623647	+	MLT1J2	LTR	MaLR	6	174	-274	8
1408	256	339	46	57	chr3	107978281	107978456	-51621327	+	LTR85c	LTR	Gypsy?	443	615	-208	8
1408	2198	118	82	45	chr3	107981134	107981185	-51618598	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	349	8
1408	2198	118	82	45	chr3	107981370	107981698	-51618085	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-46	348	1	8
1408	885	259	146	30	chr3	107987614	107987984	-51611799	+	MLT1F	LTR	MaLR	1	413	-135	8
1408	272	191	124	56	chr3	107988851	107988940	-51610843	+	MamGypLTR1b	LTR	Gypsy	649	743	-39	8
1408	226	179	33	82	chr3	107990856	107990917	-51608866	-	MT-int	LTR	MaLR	-431	667	610	8
1408	229	276	13	38	chr3	107995031	107995110	-51604673	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-29	379	303	8
1408	289	314	48	24	chr3	107995299	107995423	-51604360	-	ORR1E	LTR	MaLR	-221	138	12	8
1409	257	240	29	29	chr3	108021517	108021620	-51578163	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	833	935	-5546	2
1409	424	289	45	143	chr3	108036734	108037000	-51562783	-	MLT1K	LTR	MaLR	-39	556	317	5
1409	1909	125	69	61	chr3	108038469	108038498	-51561285	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	30	-348	6
1409	2032	106	93	12	chr3	108038646	108038991	-51560792	+	ORR1B2	LTR	MaLR	13	378	0	6
1409	391	184	56	33	chr3	108039831	108039921	-51559862	+	MTD	LTR	MaLR	13	104	-317	6
1409	672	168	84	0	chr3	108039925	108040056	-51559727	+	MTD	LTR	MaLR	266	407	-12	6
1409	441	261	405	47	chr3	108041208	108041457	-51558326	-	MTEa	LTR	MaLR	-40	339	2	7
1409	3533	47	28	5	chr3	108044899	108045325	-51554458	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	8
1409	7325	35	2	52	chr3	108045327	108046305	-51553478	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2	7579	6651	8
1409	18673	40	0	0	chr3	108046296	108048582	-51551201	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	3525	8
1409	1841	51	0	0	chr3	108048562	108048798	-51550985	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1100	887	652	8
1409	341	89	0	0	chr3	108048801	108048846	-51550937	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-6405	137	93	8
1409	369	23	0	0	chr3	108049019	108049062	-51550721	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	225	8
1409	256	222	0	0	chr3	108049062	108049107	-51550676	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	231	9
1409	1448	50	0	0	chr3	108049107	108049287	-51550496	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7401	180	1	8
1409	3489	54	28	0	chr3	108049287	108049711	-51550072	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	8
1409	422	346	62	70	chr3	108050488	108050715	-51549068	-	LTR16B	LTR	ERVL	-245	235	1	9
1409	279	371	20	20	chr3	108051950	108052096	-51547687	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-1324	4390	4245	9
1409	260	61	0	0	chr3	108052314	108052347	-51547436	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	290	1
1409	1317	261	118	25	chr3	108052339	108052771	-51547012	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-84	472	1	1
1409	592	319	116	32	chr3	108052959	108053234	-51546549	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3573	1423	1127	1
1409	2475	92	6	0	chr3	108053234	108053559	-51546224	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1409	592	319	116	32	chr3	108053559	108053750	-51546033	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3870	1126	918	1
1409	467	106	15	0	chr3	108055683	108055749	-51544034	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	433	1
1409	337	233	139	0	chr3	108055745	108055831	-51543952	-	MLT1B	LTR	MaLR	-292	98	1	1
1409	2157	127	200	6	chr3	108056507	108057238	-51542545	+	RMER19B	LTR	ERVK	3	875	-27	1
1409	517	256	253	25	chr3	108057224	108057503	-51542280	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-35	384	18	1
1409	501	275	29	0	chr3	108066178	108066349	-51533434	+	MTEa	LTR	MaLR	96	271	-108	1
1409	236	255	149	9	chr3	108069110	108069217	-51530566	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	262	1
1409	1726	218	27	27	chr3	108072612	108072980	-51526803	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	1	1
1409	1653	204	81	11	chr3	108074462	108074844	-51524939	+	MTD	LTR	MaLR	3	411	-8	1
1409	1437	109	187	0	chr3	108084420	108084687	-51515096	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	3	1
1409	802	284	80	12	chr3	108103409	108103733	-51496050	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	33	2
1409	278	286	19	24	chr3	108106633	108106760	-51493023	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	465	307	2
1409	754	292	129	59	chr3	108108040	108108429	-51491354	-	MTD	LTR	MaLR	-3	376	3	2
1409	2408	154	67	54	chr3	108114881	108115220	-51484563	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	350	-177	2
1409	2474	84	12	6	chr3	108115220	108115545	-51484238	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1409	2408	154	67	54	chr3	108115545	108115725	-51484058	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	351	527	0	2
1409	1760	112	116	32	chr3	108115748	108116126	-51483657	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
1409	2095	108	6	77	chr3	108119339	108119391	-51480392	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	288	2
1409	2095	108	6	77	chr3	108119579	108119592	-51480191	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-42	287	287	2
1409	2095	108	6	77	chr3	108119791	108120076	-51479707	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-42	287	3	2
1409	2243	108	2	115	chr3	108120799	108121049	-51478734	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	187	2
1409	2243	108	2	115	chr3	108121120	108121331	-51478452	-	RMER17C	LTR	ERVK	-224	186	2	2
1409	877	314	96	66	chr3	108122499	108123184	-51476599	+	MLT-int	LTR	MaLR	67	774	-597	2
1409	241	267	167	0	chr3	108123207	108123297	-51476486	+	MLT-int	LTR	MaLR	676	780	-955	2
1409	286	265	144	19	chr3	108123351	108123455	-51476328	+	MLT-int	LTR	MaLR	1483	1599	-136	2
1409	469	213	26	53	chr3	108123672	108123786	-51475997	+	MTE2a	LTR	MaLR	52	162	-217	2
1409	482	298	17	97	chr3	108123787	108123939	-51475844	+	MLT1A0	LTR	MaLR	75	211	-154	2
1409	482	298	17	97	chr3	108124058	108124143	-51475640	+	MLT1A0	LTR	MaLR	212	293	-72	2
1409	260	287	30	69	chr3	108124823	108124954	-51474829	+	RMER12	LTR	ERVK	714	839	-483	2
1409	242	281	27	135	chr3	108126840	108126951	-51472832	-	MLT1K	LTR	MaLR	-18	577	479	2
1409	1045	211	102	83	chr3	108127702	108128074	-51471709	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	2
176	4639	120	42	20	chr3	108133914	108134728	-51465055	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	906	1	3
1410	825	295	50	74	chr3	108135118	108135481	-51464302	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	3
1410	3456	292	111	40	chr3	108135481	108136878	-51462905	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-53	1527	1	3
1410	300	222	0	60	chr3	108136906	108136973	-51462810	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	378	316	3
1410	2342	121	13	39	chr3	108138237	108138625	-51461158	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	3
1410	840	269	26	52	chr3	108138983	108139328	-51460455	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	8	3
1410	734	259	58	23	chr3	108148031	108148394	-51451389	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	26	3
1410	280	316	53	0	chr3	108154323	108154418	-51445365	-	ORR1E	LTR	MaLR	-248	111	12	3
1410	378	301	23	78	chr3	108155417	108155573	-51444210	-	MER72B	LTR	ERV1	-242	526	229	3
1410	344	309	102	83	chr3	108172501	108172875	-51426908	+	RMER10A	LTR	ERVL	12	392	-50	3
1410	1090	238	84	95	chr3	108180495	108180875	-51418908	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	1	3
1410	279	269	170	14	chr3	108187546	108187693	-51412090	-	RMER17C	LTR	ERVK	-56	354	185	3
1410	240	345	43	0	chr3	108207573	108207689	-51392094	+	ORR1E	LTR	MaLR	45	165	-194	4
1410	520	235	109	18	chr3	108222054	108222219	-51377564	+	ORR1D2	LTR	MaLR	30	209	-161	4
1410	475	221	168	0	chr3	108234031	108234162	-51365621	+	MLT1B	LTR	MaLR	184	336	-54	4
1410	866	239	89	58	chr3	108237677	108238024	-51361759	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	41	4
1410	351	176	101	45	chr3	108239655	108239744	-51360039	+	RLTR25B	LTR	ERVK	416	509	-519	4
1410	296	244	0	43	chr3	108245035	108245129	-51354654	+	MER57-int	LTR	ERV1	7155	7244	-293	4
1410	3390	33	33	7	chr3	108250239	108250664	-51349119	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	4
1411	226	352	70	43	chr3	108268988	108269175	-51330608	+	MER65D	LTR	ERV1	197	388	-85	5
1411	655	232	22	25	chr3	108273597	108273856	-51325927	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	7	5
1411	2540	121	69	25	chr3	108277044	108277478	-51322305	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	5
1411	235	318	49	70	chr3	108280789	108280913	-51318870	-	RMER12	LTR	ERVK	-437	885	765	5
1411	2404	168	106	25	chr3	108282880	108283369	-51316414	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	1	5
1411	1455	188	92	25	chr3	108285538	108285854	-51313929	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	341	-33	5
1411	344	170	0	0	chr3	108285989	108286042	-51313741	+	ORR1D1	LTR	MaLR	330	382	-2	5
1411	1938	93	121	27	chr3	108290274	108290571	-51309212	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	325	-2	6
1411	826	193	286	10	chr3	108290918	108291154	-51308629	+	ORR1D1	LTR	MaLR	9	297	-77	6
1411	2055	135	123	8	chr3	108297182	108297556	-51302227	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	1	6
1411	926	253	115	43	chr3	108298794	108299099	-51300684	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	51	6
1411	372	253	86	57	chr3	108304691	108304919	-51294864	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	667	1114	0	6
1411	543	276	63	6	chr3	108310008	108310183	-51289600	-	MLT1C	LTR	MaLR	-41	426	242	6
1411	453	236	140	13	chr3	108310293	108310443	-51289340	-	MLT1C	LTR	MaLR	-242	225	57	6
1411	2842	61	0	151	chr3	108311325	108311790	-51287993	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	6
1411	284	295	43	43	chr3	108316685	108316802	-51282981	+	MLT1C	LTR	MaLR	46	162	-228	6
1411	389	238	110	130	chr3	108317069	108317315	-51282468	+	MLT1C	LTR	MaLR	197	437	-30	6
1411	230	258	39	205	chr3	108317363	108317408	-51282375	-	MT2B	LTR	ERVL	-305	296	191	6
1411	239	273	36	136	chr3	108318066	108318206	-51281577	+	MT2B	LTR	ERVL	153	278	-323	6
1411	3461	33	2	5	chr3	108320584	108320981	-51278802	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1411	1628	232	103	16	chr3	108325952	108326332	-51273451	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	7
1411	552	304	76	63	chr3	108326382	108326698	-51273085	+	MLT1H	LTR	MaLR	222	541	-8	7
1411	1456	166	40	60	chr3	108349376	108349568	-51250215	+	ORR1D1	LTR	MaLR	30	228	-146	7
1411	1456	166	40	60	chr3	108349685	108349711	-51250072	+	ORR1D1	LTR	MaLR	229	248	-126	7
1411	1456	166	40	60	chr3	108350203	108350330	-51249453	+	ORR1D1	LTR	MaLR	249	373	-1	7
1411	2114	126	49	36	chr3	108350452	108350840	-51248943	+	MTC	LTR	MaLR	21	413	-8	7
1411	2838	36	39	0	chr3	108352828	108353160	-51246623	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	2	7
1411	1172	226	30	4	chr3	108353449	108353715	-51246068	+	MTD	LTR	MaLR	131	403	-16	7
1411	2017	147	82	8	chr3	108354472	108354828	-51244955	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	7
1411	1365	125	125	0	chr3	108355028	108355292	-51244491	-	MTC	LTR	MaLR	-20	401	105	7
1411	464	180	80	9	chr3	108355571	108355683	-51244100	-	MTC	LTR	MaLR	-301	120	1	7
1411	1578	104	147	4	chr3	108367127	108367406	-51232377	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	321	-8	8
1411	1745	169	64	45	chr3	108368897	108369274	-51230509	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	8
1411	642	296	16	24	chr3	108372219	108372472	-51227311	-	RMER15	LTR	ERVL	-35	540	290	8
1411	268	301	0	67	chr3	108386371	108386460	-51213323	-	MLT1K	LTR	MaLR	-61	534	452	8
1411	1446	177	64	118	chr3	108386557	108386948	-51212835	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	8
1411	1242	121	258	12	chr3	108387724	108387976	-51211807	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	314	-15	8
1411	1436	163	4	40	chr3	108390813	108391088	-51208695	-	RMER10B	LTR	ERVL	-133	265	1	9
1411	1995	175	48	24	chr3	108391572	108391874	-51207909	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	312	-72	9
1411	1995	175	48	24	chr3	108392060	108392132	-51207651	+	ORR1C2	LTR	MaLR	313	384	0	9
1411	1671	190	26	52	chr3	108393215	108393435	-51206348	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	160	9
1411	1671	190	26	52	chr3	108393625	108393700	-51206083	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-215	159	91	9
1411	1671	190	26	52	chr3	108393889	108393976	-51205807	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-284	90	1	9
1412	2592	115	2	23	chr3	108406882	108407275	-51192508	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-9	385	1	9
1412	309	164	16	0	chr3	108410888	108410949	-51188834	-	RMER6B	LTR	ERVK	-382	79	18	9
1412	2254	151	42	16	chr3	108414761	108415145	-51184638	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	9
1412	290	278	35	19	chr3	108443334	108443441	-51156342	-	ORR1E	LTR	MaLR	-209	150	24	1
1412	276	243	106	53	chr3	108450614	108450727	-51149056	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-2	407	289	1
1412	365	249	178	24	chr3	108450761	108450859	-51148924	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-173	195	84	1
1412	3339	48	2	0	chr3	108450859	108451254	-51148529	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1412	365	249	178	24	chr3	108451254	108451324	-51148459	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-285	83	1	1
1412	1940	138	31	20	chr3	108453338	108453693	-51146090	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	1
1412	972	271	88	20	chr3	108453959	108454004	-51145779	+	MTE2b	LTR	MaLR	45	102	-277	1
1412	3093	42	42	8	chr3	108454004	108454387	-51145396	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1412	972	271	88	20	chr3	108454387	108454646	-51145137	+	MTE2b	LTR	MaLR	103	370	-9	1
1412	1581	145	24	131	chr3	108459713	108460172	-51139611	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
1412	658	203	20	7	chr3	108460366	108460515	-51139268	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	240	1
1412	247	324	27	18	chr3	108460753	108460863	-51138920	-	RMER15	LTR	ERVL	-43	532	422	1
1412	724	129	0	25	chr3	108465004	108465123	-51134660	+	MTC	LTR	MaLR	1	116	-305	1
1412	1940	83	27	63	chr3	108465998	108466331	-51133452	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	1
1412	232	294	57	32	chr3	108468800	108468923	-51130860	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	24	1
1412	2880	38	98	16	chr3	108469009	108469385	-51130398	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	1
1412	283	312	9	27	chr3	108472324	108472360	-51127423	-	MT2B	LTR	ERVL	-437	164	131	1
1412	3171	59	13	3	chr3	108477961	108478353	-51121430	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1412	238	241	104	21	chr3	108480947	108481091	-51118692	-	RMER10B	LTR	ERVL	-42	356	201	1
1412	2215	156	95	104	chr3	108483376	108483913	-51115870	+	RMER16	LTR	ERVK	1	532	-1	1
1412	2340	203	134	84	chr3	108484059	108484806	-51114977	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	784	-76	1
1412	3297	55	2	0	chr3	108486766	108487165	-51112618	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1412	1804	155	72	0	chr3	108488304	108488639	-51111144	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	1
1412	1576	120	18	18	chr3	108494118	108494390	-51105393	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	272	-203	1
1412	835	102	75	34	chr3	108494556	108494780	-51105003	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	211	475	0	1
1412	250	29	0	0	chr3	108494794	108494829	-51104954	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	16	50	-1937	1
1412	3643	84	19	20	chr3	108494829	108495630	-51104153	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	10	662	-5819	1
1412	2669	79	0	3	chr3	108495630	108495973	-51103810	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	1
1412	6973	39	5	11	chr3	108495966	108496801	-51102982	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5651	6480	-1	1
1412	708	261	111	34	chr3	108510328	108510625	-51089158	+	MTEa	LTR	MaLR	37	356	-23	2
1412	2318	65	55	3	chr3	108520903	108521213	-51078570	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
1413	225	216	0	0	chr3	108527728	108527779	-51072004	+	MTEb	LTR	MaLR	315	365	-14	6
1413	1118	111	0	32	chr3	108528881	108529068	-51070715	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	181	-193	6
1413	758	148	91	24	chr3	108529121	108529325	-51070458	+	ORR1D1	LTR	MaLR	97	356	-18	6
1413	1015	243	29	183	chr3	108529391	108529839	-51069944	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	6
1413	307	93	93	0	chr3	108529848	108529902	-51069881	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	367	309	6
1413	1720	91	147	38	chr3	108530259	108530578	-51069205	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-40	354	1	6
1413	4811	165	72	4	chr3	108531534	108532378	-51067405	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	7
1413	859	289	90	52	chr3	108534813	108535258	-51064525	+	MLT1D	LTR	MaLR	16	477	-28	8
1413	1220	254	85	23	chr3	108535587	108535941	-51063842	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	1	8
1413	2879	155	16	16	chr3	108538734	108539239	-51060544	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	9
1413	1203	225	7	5	chr3	108543481	108543800	-51055983	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	1
1413	1948	217	79	52	chr3	108543804	108544422	-51055361	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	635	-623	1
1413	420	231	25	273	chr3	108544422	108544541	-51055242	+	MTD-int	LTR	MaLR	879	987	-271	1
1413	420	231	25	273	chr3	108544663	108544906	-51054877	+	MTD-int	LTR	MaLR	988	1151	-107	1
1413	367	207	107	4	chr3	108546481	108546593	-51053190	+	MTD-int	LTR	MaLR	1148	1258	0	1
1413	1721	190	18	6	chr3	108546601	108546939	-51052844	+	MTD	LTR	MaLR	9	350	-69	1
1413	1634	126	221	0	chr3	108557439	108557733	-51042050	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	1
1413	257	366	15	22	chr3	108561956	108562090	-51037693	-	LTR33	LTR	ERVL	-350	165	33	1
1413	1072	229	141	42	chr3	108564000	108564333	-51035450	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	367	-3	1
1413	845	165	186	6	chr3	108569397	108569580	-51030203	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	204	1
1413	520	314	168	5	chr3	108576993	108577195	-51022588	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-23	546	312	1
1413	598	275	131	13	chr3	108579662	108579944	-51019839	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	372	43	1
1413	1762	123	31	122	chr3	108586506	108586857	-51012926	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	2
1413	740	248	168	16	chr3	108587519	108587823	-51011960	+	MTEa	LTR	MaLR	28	377	-2	2
1413	1226	205	97	7	chr3	108587823	108588132	-51011651	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1	337	-1243	2
1413	480	250	35	18	chr3	108588245	108588359	-51011424	-	MTEa	LTR	MaLR	-263	116	1	2
1413	813	135	162	0	chr3	108588583	108588731	-51011052	+	MTD	LTR	MaLR	196	367	-52	2
1413	1097	229	87	68	chr3	108588743	108589113	-51010670	-	RLTR14	LTR	ERV1	-5	377	1	2
1413	1034	254	38	85	chr3	108589134	108589452	-51010331	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1275	1577	-3	2
1413	1121	217	94	42	chr3	108589455	108589815	-51009968	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	2
1413	267	174	47	103	chr3	108590158	108590258	-51009525	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	421	290	2
1413	1326	176	69	125	chr3	108590346	108590665	-51009118	-	MT2A	LTR	ERVL	-231	302	2	2
1413	531	326	32	118	chr3	108591843	108592191	-51007592	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	1	2
1413	1161	191	252	124	chr3	108594517	108594994	-51004789	+	MT2B	LTR	ERVL	2	553	-48	2
1413	1161	191	252	124	chr3	108595113	108595167	-51004616	+	MT2B	LTR	ERVL	554	601	0	2
1413	2681	106	20	15	chr3	108595508	108595900	-51003883	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1413	388	297	234	45	chr3	108631464	108631838	-50967945	+	MER21B	LTR	ERV1	21	465	-398	3
1413	3130	68	10	0	chr3	108635529	108635925	-50963858	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
1413	5886	90	3	98	chr3	108635925	108636342	-50963441	-	MTB-int	LTR	MaLR	0	1098	698	3
1413	5886	90	3	98	chr3	108636524	108637192	-50962591	-	MTB-int	LTR	MaLR	-401	697	116	3
1413	535	254	57	11	chr3	108644694	108644869	-50954914	-	RLTR18-int	LTR	ERVK	-130	5231	5049	3
1413	537	298	33	42	chr3	108646185	108646399	-50953384	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-2487	5291	5080	3
1413	1528	351	65	50	chr3	108647187	108647799	-50951984	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-3206	4395	3786	3
1413	2883	81	65	0	chr3	108647799	108648181	-50951602	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	3
1413	1528	351	65	50	chr3	108648181	108648986	-50950797	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-3816	3785	2964	3
1413	2995	80	5	5	chr3	108648986	108649386	-50950397	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
1413	1528	351	65	50	chr3	108649386	108649685	-50950098	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-4638	2963	2651	3
1413	259	334	68	74	chr3	108649827	108650221	-50949562	-	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	-5222	2384	1993	3
1413	3284	65	2	10	chr3	108650854	108651257	-50948526	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1413	1233	229	91	103	chr3	108654999	108655586	-50944197	+	RLTR26	LTR	ERVK	10	614	-28	3
1413	1150	97	40	6	chr3	108655601	108655777	-50944006	+	RLTR23	LTR	ERV1	249	430	0	3
1414	2740	94	34	5	chr3	108662084	108662467	-50937316	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	3
1414	2021	157	53	90	chr3	108664835	108665268	-50934515	+	MTC	LTR	MaLR	1	417	-4	3
1414	400	248	9	18	chr3	108665331	108665442	-50934341	+	MTD	LTR	MaLR	1	110	-309	3
1414	455	250	5	192	chr3	108666974	108667172	-50932611	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	165	-214	3
1414	1219	178	116	30	chr3	108669415	108669716	-50930067	+	ORR1D1	LTR	MaLR	7	333	-41	3
1414	1165	196	106	101	chr3	108669865	108669931	-50929852	+	ORR1D1	LTR	MaLR	338	376	-8	3
1414	1533	142	206	28	chr3	108676202	108676528	-50923255	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1414	856	290	49	78	chr3	108681506	108681854	-50917929	+	MLT1B	LTR	MaLR	53	390	0	4
1414	227	250	46	15	chr3	108687185	108687315	-50912468	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	621	754	-755	4
1414	365	202	37	37	chr3	108690872	108690954	-50908829	+	MT2B	LTR	ERVL	176	257	-344	4
1414	291	245	52	21	chr3	108693236	108693332	-50906451	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	281	4
1414	325	219	65	27	chr3	108694900	108695032	-50904751	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	981	1072	-42	4
1414	760	230	107	24	chr3	108695921	108696126	-50903657	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	184	4
1414	1887	179	64	41	chr3	108696171	108696608	-50903175	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	447	-180	4
1414	1143	123	103	8	chr3	108700054	108700307	-50899476	+	RMER17C	LTR	ERVK	2	278	-132	4
1414	1369	224	56	3	chr3	108700354	108700676	-50899107	-	MTE2b	LTR	MaLR	-40	339	1	4
1414	238	333	29	73	chr3	108700992	108701020	-50898763	+	MT2B	LTR	ERVL	167	296	-305	4
1414	449	168	242	23	chr3	108717191	108717319	-50882464	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	578	423	5
1414	553	256	148	46	chr3	108717316	108717599	-50882184	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-222	312	1	5
1414	944	91	0	40	chr3	108720444	108720593	-50879190	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	143	-356	5
1414	4273	131	65	43	chr3	108720597	108721417	-50878366	-	RMER21B	LTR	ERV1	-4	838	1	5
1414	1759	132	69	63	chr3	108721424	108721771	-50878012	+	RLTR19	LTR	ERVK	151	499	0	5
1414	320	146	0	18	chr3	108721837	108721893	-50877890	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	330	5
1414	1987	225	21	8	chr3	108721897	108722395	-50877388	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-2	1578	1055	5
1414	2161	74	32	0	chr3	108722385	108722694	-50877089	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
1414	1654	251	45	65	chr3	108722694	108723268	-50876515	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-425	945	383	5
1414	1265	224	31	27	chr3	108723605	108723967	-50875816	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-969	401	1	5
1414	1711	132	138	3	chr3	108723972	108724306	-50875477	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-5	379	1	5
1414	311	307	69	44	chr3	108724328	108724488	-50875295	+	RMER15	LTR	ERVL	389	552	-23	5
1414	1444	311	77	62	chr3	108724519	108725225	-50874558	+	RMER15-int	LTR	ERVL	20	735	-4264	5
1414	918	272	45	28	chr3	108725932	108726223	-50873560	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4472	4767	-232	5
1414	231	287	99	0	chr3	108730440	108730541	-50869242	-	MER77	LTR	ERVL	-417	190	80	5
1414	691	322	16	8	chr3	108730581	108730825	-50868958	+	MER68	LTR	ERVL	144	389	-174	5
1414	768	316	79	60	chr3	108730835	108731317	-50868466	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	33	5
1414	282	196	18	0	chr3	108733855	108733911	-50865872	+	RMER15	LTR	ERVL	3	59	-516	5
1414	1845	216	102	18	chr3	108733963	108734464	-50865319	+	RMER15	LTR	ERVL	28	570	-5	5
1414	462	118	0	0	chr3	108736356	108736424	-50863359	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	367	300	5
1414	1714	209	85	27	chr3	108736424	108736872	-50862911	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	138	5
1414	707	150	22	22	chr3	108736911	108737047	-50862736	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-61	333	198	5
1414	246	294	0	0	chr3	108737456	108737524	-50862259	-	MLT1A	LTR	MaLR	-5	369	302	5
1414	3235	28	0	76	chr3	108738572	108738992	-50860791	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	5
1414	16656	27	1	29	chr3	108738992	108740994	-50858789	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1	1986	41	5
1414	3007	28	0	169	chr3	108741006	108741473	-50858310	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	5
1414	840	240	98	68	chr3	108741690	108742016	-50857767	-	MTE2a	LTR	MaLR	-24	355	20	5
1414	341	232	35	138	chr3	108745292	108745437	-50854346	-	MER31B	LTR	ERV1	-333	133	4	5
1414	275	311	49	30	chr3	108746721	108746863	-50852920	-	MER92C	LTR	ERV1	-400	154	10	5
1414	2282	124	43	11	chr3	108769525	108769893	-50829890	-	RLTR14	LTR	ERV1	-2	380	1	6
1414	1180	161	167	19	chr3	108770781	108771092	-50828691	-	MTD	LTR	MaLR	-62	357	1	6
1414	268	235	174	0	chr3	108778808	108778923	-50820860	+	MLT1J	LTR	MaLR	20	154	-358	6
1414	746	268	107	27	chr3	108787020	108787281	-50812502	+	MTEb	LTR	MaLR	91	372	-7	6
1414	363	269	16	112	chr3	108787789	108787977	-50811806	-	MT2B2	LTR	ERVL	-328	256	87	6
1415	384	314	8	0	chr3	108797850	108797971	-50801812	+	MLT1A	LTR	MaLR	253	374	0	7
1415	2414	159	36	16	chr3	108801259	108801752	-50798031	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	51	553	0	7
1415	1047	207	220	12	chr3	108803546	108803883	-50795900	+	MTC	LTR	MaLR	15	421	0	7
1415	225	255	137	39	chr3	108807439	108807541	-50792242	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	152	7
1415	3160	34	42	5	chr3	108810409	108810791	-50788992	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1415	920	159	57	0	chr3	108820306	108820482	-50779301	+	MTC	LTR	MaLR	228	413	-8	7
1415	279	247	22	45	chr3	108826823	108826868	-50772915	-	MER68	LTR	ERVL	0	563	518	7
1415	3105	50	39	5	chr3	108826868	108827251	-50772532	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1415	279	247	22	45	chr3	108827251	108827294	-50772489	-	MER68	LTR	ERVL	-46	517	477	7
1415	434	262	179	18	chr3	108827401	108827619	-50772164	-	MER68	LTR	ERVL	-308	255	3	7
1415	322	301	59	68	chr3	108833945	108834166	-50765617	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-310	221	3	7
1415	250	361	119	27	chr3	108834670	108834855	-50764928	+	MLT1J2	LTR	MaLR	242	443	-5	7
1415	744	232	23	6	chr3	108835388	108835561	-50764222	+	RLTR28B	LTR	ERVL	9	184	-297	7
1415	234	175	45	45	chr3	108835764	108835830	-50763953	+	RLTR28B	LTR	ERVL	435	500	-24	7
1415	674	261	40	107	chr3	108835942	108836330	-50763453	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	1	7
1415	240	318	142	59	chr3	108836519	108836723	-50763060	+	MLT1J1	LTR	MaLR	147	367	-77	7
1415	1797	134	25	128	chr3	108836723	108837090	-50762693	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	7
1415	289	264	103	0	chr3	108837535	108837622	-50762161	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-232	133	38	7
1415	846	287	102	15	chr3	108837644	108837987	-50761796	+	MLT1J1-int	LTR	MaLR	142	514	-873	7
1415	251	292	106	0	chr3	108838059	108838172	-50761611	+	MLT1J1-int	LTR	MaLR	608	732	-655	7
1415	245	339	139	0	chr3	108838197	108838312	-50761471	+	MLT1J1-int	LTR	MaLR	832	962	-425	7
1415	333	378	0	12	chr3	108838581	108838747	-50761036	+	MLT1J1-int	LTR	MaLR	1196	1359	-28	7
1415	1897	159	72	64	chr3	108838747	108839137	-50760646	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	7
1415	317	316	118	15	chr3	108839225	108839360	-50760423	+	MLT1J1	LTR	MaLR	150	298	-146	7
1415	554	122	120	9	chr3	108841188	108841296	-50758487	+	MTC	LTR	MaLR	1	120	-301	7
1415	434	168	19	29	chr3	108842339	108842443	-50757340	+	MTC	LTR	MaLR	108	210	-211	7
1415	1455	222	66	5	chr3	108844969	108845358	-50754425	+	MTD	LTR	MaLR	1	399	-20	8
1415	529	323	84	11	chr3	108853225	108853416	-50746367	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-234	210	6	8
1415	284	342	15	111	chr3	108854127	108854262	-50745521	+	LTR78	LTR	ERV1	272	393	-911	8
1415	435	254	35	69	chr3	108855302	108855446	-50744337	-	MTEa	LTR	MaLR	-235	144	6	8
1415	463	313	115	19	chr3	108857679	108858001	-50741782	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	8
1415	481	263	68	49	chr3	108860098	108860539	-50739244	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-37	322	1	8
1415	372	277	85	30	chr3	108861717	108861881	-50737902	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-36	412	240	8
1415	276	338	170	14	chr3	108864803	108865085	-50734698	+	MLT1C	LTR	MaLR	6	331	-136	8
1415	339	259	73	9	chr3	108865191	108865300	-50734483	+	MLT1C	LTR	MaLR	346	461	-6	8
1415	1114	96	22	27	chr3	108868330	108868513	-50731270	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	211	8
1415	3449	13	18	0	chr3	108870813	108871202	-50728581	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1415	1200	154	23	9	chr3	108872462	108872678	-50727105	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-164	230	12	8
1415	1872	195	84	21	chr3	108888930	108889312	-50710471	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	3	8
1415	413	252	10	10	chr3	108891554	108891658	-50708125	-	MTE2b	LTR	MaLR	-40	339	236	8
1415	536	110	24	0	chr3	108891651	108891733	-50708050	-	RMER6C	LTR	ERVK	-606	84	1	8
1415	384	312	0	44	chr3	108891768	108891882	-50707901	+	MTEa	LTR	MaLR	1	109	-270	8
1415	305	355	16	80	chr3	108891938	108892125	-50707658	+	MT2A	LTR	ERVL	102	276	-257	8
1415	1148	198	44	35	chr3	108892129	108892461	-50707322	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	359	0	8
1415	324	343	43	14	chr3	108892477	108892616	-50707167	+	MT2A	LTR	ERVL	292	434	-99	8
1415	2383	202	37	42	chr3	108892646	108893164	-50706619	-	RLTR17	LTR	ERVK	-78	614	100	8
1415	231	214	135	73	chr3	108893157	108893253	-50706530	+	MT2A	LTR	ERVL	432	533	0	8
1415	2526	195	12	2	chr3	108893886	108894303	-50705480	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	8
1415	1707	130	156	10	chr3	108896031	108896333	-50703450	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	8
1415	1505	200	24	3	chr3	108897741	108898032	-50701751	+	MTD	LTR	MaLR	16	312	-107	9
1415	1228	236	45	98	chr3	108898070	108898470	-50701313	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	9
1415	3786	13	0	2	chr3	108899582	108899979	-50699804	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1415	2898	152	63	15	chr3	108902036	108902578	-50697205	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-9	568	1	9
1415	603	245	148	102	chr3	108908527	108908891	-50690892	-	MLT1B	LTR	MaLR	-9	381	1	9
1415	296	263	0	92	chr3	108910904	108911013	-50688770	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	308	9
1415	281	305	73	48	chr3	108911650	108911718	-50688065	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-279	129	62	9
1415	1101	251	53	103	chr3	108911718	108912117	-50687666	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	9
1415	281	305	73	48	chr3	108912117	108912172	-50687611	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-347	61	3	9
1415	368	311	29	80	chr3	108912958	108913133	-50686650	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1080	500	335	9
1415	2719	52	65	0	chr3	108916418	108916743	-50683040	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	9
1415	1753	184	81	6	chr3	108917264	108917598	-50682185	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	9
1415	7653	159	47	30	chr3	108917602	108919105	-50680678	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	1962	-1	9
1416	549	305	106	66	chr3	108928949	108929251	-50670532	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-164	316	3	9
1416	3219	78	18	0	chr3	108930177	108930577	-50669206	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	9
1416	447	251	46	23	chr3	108931875	108932018	-50667765	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-409	145	1	9
1416	525	155	302	0	chr3	108937028	108937144	-50662639	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-212	162	12	9
1416	258	103	0	0	chr3	108937200	108937239	-50662544	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-345	39	1	9
1416	492	311	126	100	chr3	108938348	108938816	-50660967	+	MER89	LTR	ERV1	2	481	-78	9
1416	651	273	140	60	chr3	108955201	108955688	-50644095	-	RMER13A	LTR	ERVK	-240	620	95	9
1416	1234	265	83	24	chr3	108958067	108958200	-50641583	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	394	1
1416	1234	265	83	24	chr3	108958230	108958517	-50641266	-	RMER5	LTR	ERV1	-141	393	89	1
1416	439	283	51	0	chr3	108958517	108958655	-50641128	-	RMER5	LTR	ERV1	-356	178	34	1
1416	421	293	68	57	chr3	108961152	108961344	-50638439	-	MER77	LTR	ERVL	-11	596	403	1
1416	424	323	82	44	chr3	108961860	108962177	-50637606	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-19	346	18	1
1416	735	319	113	25	chr3	108962428	108962914	-50636869	-	MLT1F	LTR	MaLR	-19	529	1	1
1416	1494	152	132	12	chr3	108965858	108966184	-50633599	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-9	365	1	1
1416	546	254	49	91	chr3	108968122	108968386	-50631397	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	287	1
1416	509	211	89	5	chr3	108971391	108971543	-50628240	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	220	1
1416	1579	163	21	64	chr3	108976904	108977324	-50622459	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	402	-8	1
1416	2391	141	81	13	chr3	108981013	108981472	-50618311	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	490	-38	1
1416	911	264	128	75	chr3	108984036	108984465	-50615318	-	MT2A	LTR	ERVL	-81	452	1	1
1416	2028	113	8	124	chr3	108985677	108986049	-50613734	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1416	2156	120	3	66	chr3	108987111	108987459	-50612324	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-3	326	1	1
1416	1866	229	8	62	chr3	108987699	108988170	-50611613	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	446	-165	1
1416	672	197	14	7	chr3	108988991	108989134	-50610649	+	RMER19C	LTR	ERVK	756	899	-3	1
1416	1841	180	18	59	chr3	108990092	108990482	-50609301	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1416	774	192	187	47	chr3	108995803	108996103	-50603680	-	RLTR15	LTR	ERVK	-15	344	3	1
1416	3041	84	5	2	chr3	108996780	108997173	-50602610	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	1
1416	750	301	69	51	chr3	108997541	108997992	-50601791	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-927	460	2	1
1416	268	403	50	0	chr3	108998193	108998312	-50601471	+	LTR33A_	LTR	ERVL	37	161	-370	1
1416	1226	247	32	99	chr3	109000461	109000876	-50598907	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	421	18	1
1416	1369	236	56	44	chr3	109001400	109001824	-50597959	+	RLTR26	LTR	ERVK	5	466	-176	2
1416	331	326	52	42	chr3	109005135	109005327	-50594456	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	274	6
1416	324	355	121	63	chr3	109005806	109006137	-50593646	-	MLT1J	LTR	MaLR	-162	350	1	7
1416	410	312	26	75	chr3	109007777	109007959	-50591824	-	LTR73	LTR	ERV1	-292	280	109	9
1416	410	312	26	75	chr3	109007979	109008063	-50591720	-	LTR73	LTR	ERV1	-464	108	27	9
1416	1998	213	45	8	chr3	109009871	109010273	-50589510	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	1
1416	333	337	84	24	chr3	109016151	109016259	-50583524	+	MLT2F	LTR	ERVL	2	119	-544	2
1416	1160	318	115	24	chr3	109016379	109016885	-50582898	+	MLT2F	LTR	ERVL	110	661	-2	2
1416	3039	159	71	11	chr3	109017461	109018022	-50581761	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	98	2
1416	870	278	131	16	chr3	109019297	109019611	-50580172	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	4	2
1416	3000	30	36	0	chr3	109020097	109020154	-50579629	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	290	2
1416	3000	30	36	0	chr3	109020191	109020467	-50579316	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-57	289	2	2
1416	837	142	44	7	chr3	109022618	109022753	-50577030	-	RMER19C	LTR	ERVK	-2	609	470	3
1416	1973	191	155	2	chr3	109024182	109024601	-50575182	-	RMER19C	LTR	ERVK	-128	483	1	3
1416	428	344	26	21	chr3	109035207	109035397	-50564386	+	LTR33B	LTR	ERVL	43	233	-270	5
1416	253	311	104	0	chr3	109036057	109036163	-50563620	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	117	-257	5
1416	463	320	64	34	chr3	109036289	109036316	-50563467	+	MLT1B	LTR	MaLR	181	207	-183	5
1416	463	320	64	34	chr3	109036727	109036903	-50562880	+	MLT1B	LTR	MaLR	208	390	0	5
1416	317	352	133	50	chr3	109037790	109038068	-50561715	+	MLT1I	LTR	MaLR	111	411	0	5
1416	633	315	70	42	chr3	109038273	109038631	-50561152	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	2194	2561	-3106	5
1416	249	221	0	56	chr3	109040555	109040627	-50559156	-	MLT1J2	LTR	MaLR	0	444	377	6
1416	522	343	44	10	chr3	109040746	109040949	-50558834	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-233	215	6	6
1416	389	294	210	11	chr3	109043897	109043963	-50555820	-	MLT1D	LTR	MaLR	-8	497	426	6
1416	389	294	210	11	chr3	109044182	109044301	-50555482	-	MLT1D	LTR	MaLR	-80	425	275	6
1416	2158	151	42	26	chr3	109044469	109044849	-50554934	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	7
1416	251	288	70	26	chr3	109049431	109049545	-50550238	-	MLT1L	LTR	MaLR	-210	400	282	7
1417	666	191	51	51	chr3	109052130	109052345	-50547438	+	MTD-int	LTR	MaLR	1028	1242	-16	8
1417	1669	195	113	18	chr3	109052345	109052726	-50547057	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	8
1417	396	293	79	88	chr3	109057702	109057930	-50541853	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	280	8
1417	243	167	0	0	chr3	109057956	109058004	-50541779	-	MLT1D	LTR	MaLR	-304	201	154	8
1417	1908	111	18	57	chr3	109069732	109070067	-50529716	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	9
1417	1521	195	106	9	chr3	109070789	109071130	-50528653	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	9
1417	1563	76	38	0	chr3	109071366	109071603	-50528180	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	166	9
1417	2633	92	42	5	chr3	109071614	109072022	-50527761	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-327	1660	1288	9
1417	3369	49	154	17	chr3	109072026	109072501	-50527282	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1015	5527	4988	9
1417	731	217	26	0	chr3	109072487	109072639	-50527144	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6040	502	347	9
1417	1197	79	277	15	chr3	109072636	109072889	-50526894	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1385	602	302	9
1417	2916	73	29	22	chr3	109072889	109073297	-50526486	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	9
1417	503	364	23	14	chr3	109077654	109077871	-50521912	-	RMER15	LTR	ERVL	-21	554	336	1
1417	3596	18	0	0	chr3	109078356	109078752	-50521031	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1417	9357	33	2	5	chr3	109078752	109079854	-50519929	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1417	3570	20	0	0	chr3	109079854	109080250	-50519533	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1417	354	270	34	136	chr3	109082254	109082430	-50517353	+	LTR33B	LTR	ERVL	31	188	-315	1
1417	446	172	0	5	chr3	109085064	109085150	-50514633	-	MTD	LTR	MaLR	-28	391	270	1
1417	1096	240	97	30	chr3	109086402	109086733	-50513050	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	15	1
1417	4503	153	66	23	chr3	109086887	109087814	-50511969	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-136	967	1	1
1417	275	296	10	30	chr3	109091368	109091469	-50508314	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	308	1
1417	2129	109	45	0	chr3	109091600	109091913	-50507870	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1417	621	340	51	58	chr3	109092554	109092938	-50506845	+	MLT2B1	LTR	ERVL	71	451	-69	1
1417	226	200	0	0	chr3	109093250	109093295	-50506488	+	MLT2B1	LTR	ERVL	519	563	0	1
1417	1990	137	39	183	chr3	109106036	109106528	-50493255	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1417	621	282	135	19	chr3	109114886	109115197	-50484586	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	20	1
1417	1548	120	189	3	chr3	109124424	109124709	-50475074	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-8	338	1	1
1417	893	165	152	4	chr3	109132259	109132490	-50467293	+	RMER4B	LTR	ERVK	26	290	-295	1
1417	760	194	184	44	chr3	109133029	109133317	-50466466	+	RMER4B	LTR	ERVK	322	574	-11	1
1417	2925	92	13	0	chr3	109134647	109135040	-50464743	+	MTB	LTR	MaLR	2	399	-1	2
1417	1453	134	70	88	chr3	109136614	109136941	-50462842	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	361	-33	2
1417	2944	151	30	34	chr3	109136941	109137503	-50462280	-	RLTR20B2	LTR	ERVK	0	560	1	2
1417	1119	253	95	13	chr3	109138472	109138776	-50461007	+	ORR1E	LTR	MaLR	26	354	-5	2
1417	324	336	8	8	chr3	109139046	109139163	-50460620	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	563	447	2
1417	248	114	23	0	chr3	109139581	109139625	-50460158	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-115	445	401	2
1417	317	288	29	9	chr3	109139633	109139738	-50460045	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	457	563	0	2
1417	4327	23	12	0	chr3	109157380	109157867	-50441916	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1417	623	376	53	64	chr3	109166556	109167014	-50432769	+	LTR16E2	LTR	ERVL	12	463	-105	2
1417	623	376	53	64	chr3	109167221	109167325	-50432458	+	LTR16E2	LTR	ERVL	464	568	0	2
1417	603	307	54	89	chr3	109167861	109168197	-50431586	-	ORR1E	LTR	MaLR	-35	324	1	2
1417	429	326	41	72	chr3	109177860	109178055	-50421728	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-72	293	105	2
1418	372	331	110	39	chr3	109183481	109183736	-50416047	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-250	278	6	2
1418	1601	193	63	56	chr3	109200094	109200483	-50399300	+	MTD	LTR	MaLR	3	404	-15	3
1418	3687	23	4	137	chr3	109215660	109216163	-50383620	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	3
1418	548	291	27	50	chr3	109230304	109230525	-50369258	+	RMER15	LTR	ERVL	347	562	-13	3
1418	1554	318	110	16	chr3	109230675	109231386	-50368397	+	RMER15-int	LTR	ERVL	139	916	-4083	3
1418	2447	144	5	29	chr3	109240985	109241393	-50358390	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	10	407	0	3
1418	868	190	146	5	chr3	109256123	109256308	-50343475	-	RLTR17	LTR	ERVK	-1	691	481	4
1418	736	344	66	27	chr3	109258268	109258752	-50341031	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	503	-2	4
1418	1008	211	5	10	chr3	109260078	109260279	-50339504	+	MTD	LTR	MaLR	5	204	-215	4
1418	460	254	40	4	chr3	109265631	109265778	-50334005	+	MTD	LTR	MaLR	228	414	-5	4
1418	1617	179	169	8	chr3	109267244	109267605	-50332178	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
1418	257	301	115	54	chr3	109272352	109272482	-50327301	-	LTR75	LTR	ERVL	-324	238	101	4
1418	288	304	46	97	chr3	109272731	109272906	-50326877	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-337	225	60	4
1418	488	270	33	127	chr3	109276407	109276619	-50323164	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	162	4
1418	355	306	131	50	chr3	109278818	109279100	-50320683	-	ORR1E	LTR	MaLR	-40	319	15	4
1419	677	266	120	111	chr3	109317698	109318130	-50281653	-	MT2B	LTR	ERVL	-2	599	98	4
1419	277	305	163	73	chr3	109333641	109333942	-50265841	-	MLT1J	LTR	MaLR	-73	439	112	5
1419	965	242	80	101	chr3	109339795	109340121	-50259662	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	324	-55	5
1419	983	272	9	19	chr3	109347017	109347331	-50252452	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	5
1419	1958	162	59	23	chr3	109350709	109351063	-50248720	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1419	401	308	28	0	chr3	109351479	109351586	-50248197	+	MER21B	LTR	ERV1	558	667	-196	5
1419	1199	316	114	56	chr3	109351845	109352505	-50247278	-	MER21B	LTR	ERV1	-101	762	65	5
1419	1608	211	35	19	chr3	109354600	109354968	-50244815	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1419	1135	268	111	57	chr3	109360038	109360695	-50239088	+	RMER13A	LTR	ERVK	2	766	-94	5
1419	230	200	186	0	chr3	109375856	109375916	-50223867	-	BGLII_A	LTR	ERVK	-328	117	45	5
1419	444	394	42	54	chr3	109389916	109390249	-50209534	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-98	462	134	5
1419	3502	18	2	0	chr3	109400347	109400742	-50199041	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1419	3236	111	149	32	chr3	109402761	109403299	-50196484	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	5
1419	1903	273	82	75	chr3	109405560	109405705	-50194078	-	MER54B	LTR	ERVL	0	793	664	5
1419	1903	273	82	75	chr3	109405783	109406416	-50193367	-	MER54B	LTR	ERVL	-130	663	9	5
1419	1478	85	20	0	chr3	109415121	109415322	-50184461	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	203	5
1419	2104	99	18	46	chr3	109415323	109415651	-50184132	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	5
1419	389	314	32	16	chr3	109422947	109423070	-50176713	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-240	125	1	5
1419	895	296	82	55	chr3	109435137	109435538	-50164245	+	MTD	LTR	MaLR	6	417	-2	6
1420	1458	109	264	17	chr3	109451182	109451470	-50148313	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	6
1420	856	259	70	25	chr3	109453425	109453667	-50146116	+	MTD	LTR	MaLR	153	405	-14	6
1420	493	292	102	31	chr3	109455162	109455388	-50144395	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	334	6
1420	709	287	75	48	chr3	109468729	109469022	-50130761	-	ORR1E	LTR	MaLR	-9	350	50	6
1420	268	351	60	47	chr3	109482279	109482494	-50117289	-	MLT1J	LTR	MaLR	-8	504	287	6
1420	595	330	292	16	chr3	109491471	109491910	-50107873	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	1	6
1420	336	282	85	58	chr3	109493126	109493314	-50106469	-	MLT1B	LTR	MaLR	-195	195	3	6
1420	442	321	77	24	chr3	109494776	109494945	-50104838	-	MTD	LTR	MaLR	-224	195	18	6
1420	532	328	50	54	chr3	109496199	109496460	-50103323	+	MTEa	LTR	MaLR	4	263	-116	6
1420	395	313	65	42	chr3	109497526	109497715	-50102068	+	LTR33C	LTR	ERVL	431	623	-6	6
1420	591	296	120	31	chr3	109497724	109498073	-50101710	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4081	4460	-1207	6
1420	2252	111	9	3	chr3	109498238	109498563	-50101220	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1420	857	352	12	6	chr3	109498819	109499145	-50100638	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	31	358	-1222	6
1420	681	301	89	92	chr3	109499398	109499735	-50100048	+	ORR1D2	LTR	MaLR	35	370	0	6
1420	351	357	0	16	chr3	109499851	109499979	-50099804	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	560	685	-895	6
1420	306	324	39	19	chr3	109500286	109500390	-50099393	+	MTE-int	LTR	MaLR	713	818	-762	2
1420	1646	80	36	0	chr3	109500455	109500680	-50099103	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	95	3
1420	569	333	83	62	chr3	109500664	109500942	-50098841	+	MTE-int	LTR	MaLR	1100	1396	-184	2
1420	569	333	83	62	chr3	109501119	109501262	-50098521	+	MTE-int	LTR	MaLR	1397	1530	-50	2
1420	320	185	0	0	chr3	109502395	109502449	-50097334	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	54	-325	8
1420	557	326	71	8	chr3	109502624	109502862	-50096921	+	MT2A	LTR	ERVL	281	533	0	9
1420	503	355	111	37	chr3	109502877	109503202	-50096581	+	LTR33C	LTR	ERVL	11	359	-270	1
1420	338	265	10	39	chr3	109503266	109503368	-50096415	+	LTR33C	LTR	ERVL	516	614	-15	1
1420	226	341	95	24	chr3	109504473	109504599	-50095184	-	LTR33	LTR	ERVL	-369	146	12	1
1420	2110	79	119	9	chr3	109518495	109518814	-50080969	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	3
1420	433	288	167	59	chr3	109520449	109520796	-50078987	+	MT2A	LTR	ERVL	132	514	-19	3
1420	660	323	34	115	chr3	109522324	109522468	-50077315	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	285	3
1420	660	323	34	115	chr3	109522509	109522780	-50077003	-	MTD	LTR	MaLR	-135	284	22	3
1420	2073	98	40	0	chr3	109525919	109526215	-50073568	+	MT2B	LTR	ERVL	1	308	-293	4
1420	345	297	95	125	chr3	109529826	109530195	-50069588	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	1	5
1420	226	312	83	53	chr3	109536804	109536936	-50062847	-	MLT1J	LTR	MaLR	-51	461	326	5
1420	349	306	89	96	chr3	109538619	109538890	-50060893	-	RMER20B	LTR	ERVK	-235	392	124	5
1420	1835	176	125	3	chr3	109539133	109539470	-50060313	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	6
1420	5004	155	42	101	chr3	109542051	109543010	-50056773	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	6
1420	1399	229	93	31	chr3	109555227	109555614	-50044169	+	MTD	LTR	MaLR	9	419	0	7
1420	399	330	100	91	chr3	109556049	109556399	-50043384	-	MTEa	LTR	MaLR	-25	354	2	7
1420	1164	278	36	42	chr3	109556619	109556976	-50042807	+	MTEa	LTR	MaLR	25	379	0	8
1420	1992	174	53	3	chr3	109558686	109559061	-50040722	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	8
1420	1323	172	88	13	chr3	109560737	109561012	-50038771	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	8
1420	1001	206	193	63	chr3	109564537	109564868	-50034915	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	8
1420	1418	128	8	28	chr3	109566709	109566958	-50032825	+	BGLII	LTR	ERVK	178	421	0	9
1420	464	260	94	50	chr3	109572609	109572811	-50026972	-	MLT1B	LTR	MaLR	-4	386	176	9
1420	329	307	75	45	chr3	109572839	109573040	-50026743	-	MLT1A	LTR	MaLR	-162	228	22	9
1420	668	309	80	55	chr3	109574375	109574738	-50025045	-	RMER20B	LTR	ERVK	-214	413	42	1
1421	1149	238	90	116	chr3	109578449	109578809	-50020974	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	356	-23	1
1421	2261	96	12	58	chr3	109578809	109579152	-50020631	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1421	1149	238	90	116	chr3	109579152	109579180	-50020603	+	MTE2b	LTR	MaLR	357	379	0	1
1421	229	271	81	48	chr3	109589478	109589602	-50010181	+	LTR33A	LTR	ERVL	387	514	-6	1
1421	235	275	49	12	chr3	109591681	109591762	-50008021	+	MLT1A1	LTR	MaLR	323	406	-2	1
1421	780	182	15	0	chr3	109614148	109614280	-49985503	+	ORR1D1	LTR	MaLR	14	147	-227	1
1421	611	224	5	27	chr3	109614510	109614660	-49985123	+	ORR1D1	LTR	MaLR	231	378	0	1
1421	1495	251	34	9	chr3	109625777	109626127	-49973656	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	1
1421	429	302	67	81	chr3	109626826	109627172	-49972611	+	LTR73	LTR	ERV1	175	515	-57	1
1421	4344	18	0	2	chr3	109666004	109666498	-49933285	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1421	1576	241	71	24	chr3	109677643	109678025	-49921758	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	20	2
1421	1344	241	63	36	chr3	109681625	109681987	-49917796	+	MTEb	LTR	MaLR	3	374	-5	2
1421	327	330	154	47	chr3	109685955	109686361	-49913422	+	MLT1K	LTR	MaLR	115	564	-31	2
1421	2467	240	95	82	chr3	109695066	109696011	-49903772	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	2
1421	867	253	145	27	chr3	109704241	109704538	-49895245	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	73	2
1421	301	203	0	59	chr3	109705287	109705355	-49894428	-	MTD	LTR	MaLR	-345	76	13	2
177	2619	88	3	37	chr3	109706946	109707322	-49892461	-	RLTR8	LTR	ERVK	-2	363	1	2
1422	3358	140	40	45	chr3	109711273	109711900	-49887883	-	RMER6D	LTR	ERVK	-96	624	1	2
1422	1539	151	42	14	chr3	109750411	109750700	-49849083	-	RMER6A	LTR	ERVK	-7	749	453	3
1422	530	276	127	6	chr3	109751213	109751370	-49848413	+	MTEb	LTR	MaLR	204	379	0	3
1422	1996	179	178	55	chr3	109753903	109754464	-49845319	+	RMER6C	LTR	ERVK	61	690	0	3
1422	2122	157	10	26	chr3	109754501	109754887	-49844896	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	380	-14	3
1422	2104	189	37	25	chr3	109760901	109761307	-49838476	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	11	3
1422	2214	148	38	82	chr3	109778660	109779110	-49820673	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	3
1422	2027	230	94	63	chr3	109779992	109780951	-49818832	-	RMER17B	LTR	ERVK	-51	857	1	3
1422	602	210	43	7	chr3	109782196	109782335	-49817448	-	RMER10B	LTR	ERVL	-52	346	203	3
1422	647	316	55	78	chr3	109786285	109786629	-49813154	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	336	-29	3
1422	1599	270	30	7	chr3	109806397	109806800	-49792983	+	MTD	LTR	MaLR	5	416	-3	3
1422	1368	245	58	94	chr3	109817887	109818333	-49781450	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	3
1422	563	209	22	18	chr3	109822100	109822237	-49777546	+	MTD	LTR	MaLR	238	405	-14	3
1422	1113	256	40	67	chr3	109833584	109833956	-49765827	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	18	4
1422	1375	199	81	19	chr3	109835332	109835640	-49764143	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	331	-43	4
1423	1412	205	166	3	chr3	109839961	109840323	-49759460	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1423	1679	170	152	27	chr3	109844460	109844834	-49754949	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1423	3642	152	41	21	chr3	109847656	109848315	-49751468	+	RLTR33	LTR	ERVK	3	674	-4	4
1423	241	349	72	65	chr3	109850741	109850879	-49748904	+	LTR88c	LTR	Genie?	714	852	-10	4
1423	252	326	31	0	chr3	109853655	109853753	-49746030	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	101	-258	4
1423	4929	97	64	0	chr3	109856479	109857171	-49742612	-	RMER19A	LTR	ERVK	-1	736	1	4
1423	249	122	0	0	chr3	109866906	109866947	-49732836	+	ORR1A2	LTR	MaLR	340	380	-14	4
1423	1300	91	16	5	chr3	109869406	109869593	-49730190	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	933	1121	-842	4
1423	2049	143	0	6	chr3	109869592	109869916	-49729867	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1642	1963	0	4
1423	1675	143	11	0	chr3	109869916	109870182	-49729601	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	269	-58	4
1423	480	346	122	39	chr3	109876306	109876520	-49723263	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-6	549	324	4
1423	480	346	122	39	chr3	109876720	109876842	-49722941	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-232	323	185	4
1423	1734	299	99	16	chr3	109878811	109879376	-49720407	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-29	1551	940	4
1423	1209	284	7	3	chr3	109879373	109879673	-49720110	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-1075	505	205	4
1423	619	249	35	30	chr3	109880119	109880317	-49719466	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-1363	217	19	4
1423	583	320	46	57	chr3	109880341	109880707	-49719076	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	4
1423	3472	167	91	5	chr3	109886522	109887185	-49712598	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	4
1423	1052	269	35	54	chr3	109889397	109889712	-49710071	+	MTEa	LTR	MaLR	1	309	-70	4
1423	622	318	69	83	chr3	109892015	109892340	-49707443	+	MLT1C	LTR	MaLR	6	343	-124	4
1423	641	338	121	71	chr3	109892890	109893401	-49706382	+	MLT1C-int	LTR	MaLR	474	1081	-408	4
1423	561	315	168	62	chr3	109894293	109894465	-49705318	+	MLT1C-int	LTR	MaLR	1082	1258	-231	4
1423	327	301	188	65	chr3	109894637	109894779	-49705004	+	MLT1C-int	LTR	MaLR	1213	1381	-28	4
1423	1271	298	32	0	chr3	109897939	109898251	-49701532	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	50	5
1423	243	315	65	58	chr3	109909232	109909370	-49690413	+	RMER12	LTR	ERVK	713	851	-471	5
1423	320	366	46	11	chr3	109917179	109917353	-49682430	+	MLT2C1	LTR	ERVL	1	180	-217	5
1423	230	344	43	58	chr3	109917541	109917680	-49682103	+	MLT2C1	LTR	ERVL	178	314	-83	5
1423	992	259	97	51	chr3	109920854	109921187	-49678596	-	MTD	LTR	MaLR	-43	376	1	5
1423	511	363	39	45	chr3	109949628	109949914	-49649869	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-72	293	10	5
1423	416	388	60	14	chr3	109962881	109963098	-49636685	+	MLT1J	LTR	MaLR	175	401	-111	5
1423	2846	73	36	3	chr3	109965232	109965619	-49634164	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1424	245	339	23	55	chr3	109973595	109973723	-49626060	+	RMER15	LTR	ERVL	438	561	-14	6
1424	311	341	12	0	chr3	109978338	109978420	-49621363	-	LTR16A	LTR	ERVL	-367	84	2	6
1424	3696	154	51	197	chr3	109980613	109981654	-49618129	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	889	-13	6
1424	429	383	22	16	chr3	109981713	109981896	-49617887	+	MLT2F	LTR	ERVL	416	599	-64	6
1424	831	321	108	32	chr3	109982396	109983345	-49616438	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	29	1020	-4647	6
1424	308	330	114	11	chr3	109983594	109983778	-49616005	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3064	3266	-2448	6
1424	286	358	25	49	chr3	109984715	109984918	-49614865	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3376	3573	-2184	6
1424	706	366	51	32	chr3	109985312	109986000	-49613783	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3625	4325	-1342	6
1424	1248	304	31	14	chr3	109989957	109990307	-49609476	+	MTEa	LTR	MaLR	4	359	-20	6
1424	478	318	68	81	chr3	109990923	109991117	-49608666	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	187	-183	6
1424	478	319	78	64	chr3	109991423	109991599	-49608184	+	ORR1D2	LTR	MaLR	188	379	0	6
1424	909	265	141	0	chr3	109992111	109992399	-49607384	+	MTE2b	LTR	MaLR	18	341	-38	6
1424	1510	227	35	24	chr3	109995895	109996265	-49603518	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1424	3053	76	0	5	chr3	110003656	110004054	-49595729	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1424	819	349	49	45	chr3	110008196	110008688	-49591095	-	MLT1D	LTR	MaLR	-9	645	3	9
1424	874	294	50	30	chr3	110019217	110019467	-49580316	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	258	-150	1
1424	2024	168	27	3	chr3	110019467	110019837	-49579946	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	379	0	1
1424	874	294	50	30	chr3	110019837	110019884	-49579899	+	MLT1A1	LTR	MaLR	259	304	-104	1
1424	2068	162	5	24	chr3	110020902	110021276	-49578507	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	2
1424	1826	215	80	10	chr3	110021675	110022089	-49577694	+	MT2A	LTR	ERVL	71	513	-20	2
1424	528	267	22	15	chr3	110022327	110022464	-49577319	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	282	2
1424	3050	68	17	17	chr3	110022464	110022871	-49576912	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
1424	406	314	49	84	chr3	110022924	110023083	-49576700	-	MTD	LTR	MaLR	-149	270	120	2
1424	406	314	49	84	chr3	110023135	110023201	-49576582	-	MTD	LTR	MaLR	-300	119	55	2
1424	310	331	50	29	chr3	110029589	110029729	-49570054	-	MLT1H	LTR	MaLR	-276	273	131	3
1424	2465	167	72	55	chr3	110032427	110032952	-49566831	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	1	4
1424	2868	73	39	3	chr3	110034604	110034990	-49564793	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1424	228	207	10	146	chr3	110036905	110037001	-49562782	+	MER50B	LTR	ERV1	150	232	-465	5
1424	236	267	26	26	chr3	110040191	110040268	-49559515	+	MTEb	LTR	MaLR	272	348	-31	6
1424	1416	223	41	8	chr3	110042668	110043030	-49556753	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	6
1424	914	265	60	57	chr3	110043184	110043520	-49556263	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	337	-47	6
1424	350	109	0	18	chr3	110044120	110044176	-49555607	+	ORR1C2	LTR	MaLR	338	392	-2	6
1424	3220	63	2	0	chr3	110044567	110044966	-49554817	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1424	3295	59	0	19	chr3	110045733	110046148	-49553635	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	7
1424	2324	124	181	71	chr3	110054129	110054505	-49545278	-	MT2B2	LTR	ERVL	-7	577	122	8
1424	2324	124	181	71	chr3	110054653	110054796	-49544987	-	MT2B2	LTR	ERVL	-463	121	1	8
1424	283	170	0	36	chr3	110057128	110057183	-49542600	+	ORR1A1	LTR	MaLR	294	346	0	8
1424	8939	150	64	33	chr3	110057183	110057695	-49542088	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	517	-1446	8
1424	8939	150	64	33	chr3	110057720	110058925	-49540858	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	518	1772	-191	8
1424	1121	129	60	111	chr3	110059952	110060204	-49539579	+	MT2A	LTR	ERVL	1	239	-294	9
1424	438	309	157	42	chr3	110061750	110062063	-49537720	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-190	490	156	9
1424	701	206	33	12	chr3	110062160	110062358	-49537425	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1103	872	9
1424	254	206	17	157	chr3	110068510	110068625	-49531158	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-173	930	832	9
1424	2615	167	44	94	chr3	110069030	110069914	-49529869	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-149	954	141	9
1424	937	183	148	26	chr3	110070351	110070615	-49529168	+	RLTR25B	LTR	ERVK	733	1028	0	9
1424	979	259	67	18	chr3	110071677	110072019	-49527764	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	9
1424	1322	307	36	20	chr3	110072568	110073026	-49526757	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-36	479	14	1
1424	662	256	206	25	chr3	110073042	110073219	-49526564	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-445	5312	5123	1
1424	662	256	206	25	chr3	110074151	110074292	-49525491	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-635	5122	4936	1
1424	529	280	10	37	chr3	110074332	110074515	-49525268	+	MTE2a	LTR	MaLR	44	193	-186	1
1424	2305	142	50	0	chr3	110075981	110076383	-49523400	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	422	0	1
1424	231	315	80	51	chr3	110079098	110079235	-49520548	+	MLT1A0	LTR	MaLR	11	151	-214	1
1424	340	338	76	0	chr3	110081402	110081547	-49518236	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	156	-209	1
1424	1091	248	110	19	chr3	110082336	110082644	-49517139	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	84	1
1424	623	278	7	3	chr3	110083442	110083608	-49516175	-	MTC	LTR	MaLR	-27	380	218	1
1424	231	158	0	0	chr3	110083606	110083644	-49516139	+	MTD	LTR	MaLR	167	204	-217	1
1424	814	267	94	4	chr3	110083650	110083883	-49515900	+	MTD	LTR	MaLR	166	419	0	1
1424	1366	246	99	3	chr3	110099211	110099554	-49500229	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	379	0	1
1425	1103	272	91	21	chr3	110103167	110103498	-49496285	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	6	1
1425	2137	176	53	8	chr3	110104846	110105241	-49494542	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	1
1425	1287	316	58	17	chr3	110106712	110107191	-49492592	+	MLT2B2	LTR	ERVL	4	502	-13	1
1425	1558	254	92	32	chr3	110108749	110109279	-49490504	-	RLTR18	LTR	ERVK	-104	512	31	1
1425	2212	119	0	58	chr3	110113840	110114187	-49485596	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1425	1009	329	55	34	chr3	110114576	110114991	-49484792	+	MER70B	LTR	ERVL	2	425	-153	1
1425	663	326	126	24	chr3	110115259	110115523	-49484260	-	MER73	LTR	ERVL	0	644	348	1
1425	2306	158	54	16	chr3	110115523	110115967	-49483816	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	1
1425	663	326	126	24	chr3	110115967	110116035	-49483748	-	MER73	LTR	ERVL	-297	347	278	1
1425	1052	306	55	30	chr3	110116019	110116380	-49483403	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	1	1
1425	3149	275	89	49	chr3	110116386	110117503	-49482280	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-9	1571	410	1
1425	396	289	15	133	chr3	110119011	110119282	-49480501	-	RMER12	LTR	ERVK	-396	1008	557	1
1425	1457	219	107	37	chr3	110119266	110119845	-49479938	-	RMER12	LTR	ERVK	-596	808	1	1
1425	244	200	55	0	chr3	110121069	110121124	-49478659	+	MLT2B3	LTR	ERVL	7	64	-490	1
1425	1429	171	225	6	chr3	110134070	110134412	-49465371	+	MTC	LTR	MaLR	2	418	-3	2
1425	1374	259	49	17	chr3	110141694	110142044	-49457739	+	MTEa	LTR	MaLR	1	361	-18	2
1425	1163	291	55	15	chr3	110142975	110143310	-49456473	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	367	26	2
1425	385	228	29	10	chr3	110145518	110145635	-49454148	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	247	2
1425	1326	252	25	31	chr3	110160727	110161087	-49438696	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	358	-21	2
1425	2735	131	260	29	chr3	110165121	110165733	-49434050	+	RMER6A	LTR	ERVK	4	756	0	2
1425	474	272	198	59	chr3	110179015	110179443	-49420340	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-19	509	3	2
1425	3466	18	0	8	chr3	110179742	110180141	-49419642	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1425	2022	186	54	17	chr3	110181105	110181511	-49418272	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1425	1135	238	72	11	chr3	110184369	110184717	-49415066	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	370	-4	2
1425	2968	83	5	0	chr3	110184896	110185294	-49414489	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1425	290	393	66	9	chr3	110188065	110188291	-49411492	+	MT2A	LTR	ERVL	222	460	-73	2
1425	373	249	125	49	chr3	110188603	110188795	-49410988	+	MTEb	LTR	MaLR	156	371	-8	2
1425	1027	227	62	124	chr3	110204815	110204893	-49394890	+	MTE2a	LTR	MaLR	2	59	-320	2
1425	1027	227	62	124	chr3	110205087	110205411	-49394372	+	MTE2a	LTR	MaLR	60	379	0	2
1425	693	271	80	0	chr3	110208472	110208671	-49391112	+	MTD	LTR	MaLR	200	414	-5	2
1425	2018	111	3	62	chr3	110217836	110218174	-49381609	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	3
1425	252	291	25	149	chr3	110218287	110218408	-49381375	+	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	62	167	-646	3
1425	2412	184	30	83	chr3	110227569	110228160	-49371623	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	560	0	3
1425	639	181	94	0	chr3	110228301	110228428	-49371355	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	139	-228	3
1426	3983	197	34	58	chr3	110232109	110232943	-49366840	-	RMER19B	LTR	ERVK	-85	817	4	3
1426	653	149	26	0	chr3	110240789	110240903	-49358880	+	RLTR25B	LTR	ERVK	656	772	-256	3
1426	251	208	110	61	chr3	110241098	110241180	-49358603	+	RLTR25B	LTR	ERVK	740	825	-203	3
1426	440	188	220	8	chr3	110241286	110241404	-49358379	+	RLTR25B	LTR	ERVK	961	1103	0	3
1426	2010	191	22	29	chr3	110252566	110252976	-49346807	+	RLTR28	LTR	ERVL	3	409	-115	3
1426	533	224	17	25	chr3	110252972	110253091	-49346692	+	ORR1B2	LTR	MaLR	33	150	-217	3
1426	395	91	0	0	chr3	110253059	110253114	-49346669	+	ORR1B2	LTR	MaLR	273	327	-51	3
1426	779	252	52	13	chr3	110261451	110261680	-49338103	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	238	-1610	3
1426	4236	214	147	30	chr3	110261798	110262816	-49336967	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	246	1382	-426	3
1426	4236	214	147	30	chr3	110262890	110263193	-49336590	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1383	1722	-86	3
1426	3122	66	2	2	chr3	110263759	110264155	-49335628	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1426	7780	78	11	4	chr3	110264155	110265245	-49334538	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
1426	3320	35	5	2	chr3	110265245	110265640	-49334143	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1426	877	191	137	0	chr3	110275978	110276161	-49323622	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	206	3
1426	1002	202	65	15	chr3	110276980	110277181	-49322602	-	MTC	LTR	MaLR	-210	211	1	3
1426	2446	323	70	40	chr3	110277366	110278626	-49321157	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3320	1679	382	3
1426	331	318	87	0	chr3	110279284	110279410	-49320373	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	423	3
1426	455	403	55	29	chr3	110279662	110279974	-49319809	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-240	320	1	3
1426	368	277	114	8	chr3	110280673	110280804	-49318979	+	MLT1C	LTR	MaLR	38	182	-285	3
1426	542	327	18	6	chr3	110280958	110281124	-49318659	+	MLT1C	LTR	MaLR	168	335	-132	3
1426	3560	125	9	92	chr3	110282313	110282954	-49316829	-	MT2B	LTR	ERVL	-8	593	6	3
1426	229	283	61	78	chr3	110283140	110283255	-49316528	-	ORR1E	LTR	MaLR	-246	113	1	3
1426	1081	259	101	6	chr3	110291093	110291438	-49308345	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	379	0	4
1426	850	238	34	5	chr3	110292625	110292832	-49306951	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	363	4
1426	1180	259	50	41	chr3	110294820	110295159	-49304624	-	RMER15	LTR	ERVL	-201	374	33	4
1426	247	312	38	0	chr3	110295323	110295403	-49304380	-	MLT1A	LTR	MaLR	-277	97	15	4
1426	270	220	50	17	chr3	110297038	110297098	-49302685	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	62	-312	4
1426	1047	197	5	28	chr3	110297143	110297357	-49302426	+	ORR1C2	LTR	MaLR	174	382	-2	4
1426	317	317	24	0	chr3	110305088	110305170	-49294613	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	86	-273	4
1426	2222	209	101	47	chr3	110305153	110305729	-49294054	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-763	607	1	4
1426	393	211	35	80	chr3	110305729	110305842	-49293941	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	267	4
1426	384	255	27	36	chr3	110305881	110305991	-49293792	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-265	109	1	4
1426	2438	137	15	45	chr3	110306625	110307092	-49292691	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	4
1426	1405	238	35	6	chr3	110311746	110312059	-49287724	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	58	4
1426	1612	211	47	33	chr3	110322285	110322647	-49277136	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1426	6265	190	83	38	chr3	110322736	110324156	-49275627	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-25	1484	1	4
1426	557	224	116	37	chr3	110324160	110324350	-49275433	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	386	182	4
1426	262	321	17	87	chr3	110326983	110327168	-49272615	+	MLT2C2	LTR	ERVL	392	551	-12	4
1426	422	309	184	13	chr3	110327493	110327726	-49272057	+	MLT1D	LTR	MaLR	88	360	-145	4
1426	308	262	250	23	chr3	110328830	110329002	-49270781	+	RMER15	LTR	ERVL	352	562	-13	4
1426	608	269	42	12	chr3	110355548	110355767	-49244016	+	MTEa	LTR	MaLR	134	376	-3	5
1426	372	338	15	0	chr3	110356324	110356460	-49243323	+	MLT1A0	LTR	MaLR	220	357	-8	5
1426	1042	249	87	22	chr3	110358050	110358325	-49241458	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	127	5
1426	231	349	78	16	chr3	110359734	110359862	-49239921	+	LTR33B	LTR	ERVL	90	225	-278	5
1427	874	335	43	48	chr3	110364203	110364576	-49235207	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	9	5
1427	1455	322	51	30	chr3	110378038	110378608	-49221175	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4159	4740	-259	5
1427	371	286	54	30	chr3	110379252	110379418	-49220365	+	RMER15	LTR	ERVL	276	445	-130	5
1427	297	306	20	10	chr3	110379507	110379606	-49220177	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-295	102	3	5
1427	900	279	93	37	chr3	110388444	110388798	-49210985	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	6	5
1427	2008	87	30	23	chr3	110390387	110390692	-49209091	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	307	-20	5
1427	2267	126	10	32	chr3	110390708	110391157	-49208626	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	21	633	-5848	5
1427	317	337	132	33	chr3	110395237	110395449	-49204334	-	ORR1E	LTR	MaLR	-124	235	3	5
1427	341	258	69	46	chr3	110398900	110399030	-49200753	+	RLTR11B	LTR	ERVK	39	171	-282	5
1427	455	339	58	52	chr3	110407704	110408031	-49191752	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	2	330	-4987	5
1427	286	209	46	11	chr3	110408782	110408869	-49190914	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	827	916	-4401	5
1427	279	320	70	67	chr3	110408909	110409207	-49190576	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	1159	1457	-3606	5
1427	370	306	11	45	chr3	110410077	110410255	-49189528	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	2305	2476	-2587	5
1427	894	262	152	21	chr3	110413350	110413678	-49186105	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	371	-11	5
1427	1577	207	59	19	chr3	110431502	110431877	-49167906	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	390	-4	6
1427	271	349	58	26	chr3	110440632	110440788	-49158995	+	MLT1F2	LTR	MaLR	62	222	-338	6
1427	919	297	65	25	chr3	110440884	110441237	-49158546	+	MLT1F2	LTR	MaLR	192	558	-2	6
1427	266	263	25	50	chr3	110446865	110446945	-49152838	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-4790	527	450	6
1427	315	304	19	19	chr3	110447120	110447224	-49152559	-	RLTR14	LTR	ERV1	-278	104	1	6
1427	551	306	79	73	chr3	110451880	110452222	-49147561	-	MLT1B	LTR	MaLR	-42	348	5	6
1427	280	285	70	76	chr3	110453305	110453476	-49146307	-	MLT1C	LTR	MaLR	-275	192	23	6
1427	736	305	50	43	chr3	110458658	110458939	-49140844	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	97	6
1427	477	369	72	4	chr3	110467714	110467978	-49131805	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-122	286	5	6
1427	324	390	29	46	chr3	110468879	110469118	-49130665	+	MLT1E2	LTR	MaLR	217	451	-176	6
1427	1000	217	184	81	chr3	110490415	110490736	-49109047	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-30	354	1	6
1427	229	224	31	115	chr3	110492950	110493046	-49106737	+	MLT1D	LTR	MaLR	412	499	-6	6
178	776	343	93	38	chr3	110493038	110493879	-49105904	+	MLT1-int	LTR	MaLR	90	1001	-488	6
1428	293	338	55	55	chr3	110494376	110494595	-49105188	+	MLT1-int	LTR	MaLR	1123	1341	-30	6
1428	955	233	235	32	chr3	110500519	110500830	-49098953	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1428	754	309	137	20	chr3	110501491	110501884	-49097899	+	RMER5	LTR	ERV1	87	525	-9	2
1428	1985	103	90	3	chr3	110508493	110508794	-49090989	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1428	1367	245	100	3	chr3	110510510	110510829	-49088954	-	MTD	LTR	MaLR	-68	351	2	1
1428	387	293	77	36	chr3	110526989	110527184	-49072599	+	RMER20B	LTR	ERVK	131	333	-294	4
1428	746	352	31	23	chr3	110529775	110530124	-49069659	+	MLT1A	LTR	MaLR	15	366	-8	4
1428	1372	249	106	77	chr3	110531103	110531765	-49068018	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	10	5
1428	5960	51	60	1	chr3	110539053	110539816	-49059967	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	6
1428	521	151	0	41	chr3	110540416	110540513	-49059270	-	RLTR14	LTR	ERV1	-44	338	246	6
1428	2421	198	107	27	chr3	110542453	110543090	-49056693	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	688	-2	7
1428	1812	192	136	6	chr3	110562197	110562558	-49037225	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	14	9
1428	423	329	77	68	chr3	110578154	110578524	-49021259	+	RMER20B	LTR	ERVK	24	399	-117	1
1428	1006	176	6	6	chr3	110578973	110579156	-49020627	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	345	527	0	1
1428	606	303	60	26	chr3	110587595	110587783	-49012000	+	MTC	LTR	MaLR	5	200	-221	1
1428	330	268	132	66	chr3	110588665	110588854	-49010929	+	MTD	LTR	MaLR	184	389	-30	1
1428	250	296	10	137	chr3	110593014	110593116	-49006667	+	MTB	LTR	MaLR	180	268	-132	1
1428	3457	15	5	0	chr3	110594069	110594462	-49005321	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-1	395	1	1
1428	9004	21	34	1	chr3	110594462	110595525	-49004258	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1428	3466	15	5	0	chr3	110595525	110595919	-49003864	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1428	246	308	110	8	chr3	110597456	110597574	-49002209	+	MLT1A0	LTR	MaLR	192	321	-44	1
1428	2807	58	87	0	chr3	110613834	110614212	-48985571	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	1
1429	405	257	43	11	chr3	110642396	110642559	-48957224	+	MLT2B4	LTR	ERVL	4	171	-349	1
1429	957	292	115	9	chr3	110646034	110646355	-48953428	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	219	1
1429	529	260	73	39	chr3	110647499	110647703	-48952080	-	RMER15	LTR	ERVL	-338	237	27	1
1429	1259	181	159	29	chr3	110649553	110649696	-48950087	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-12	391	224	2
1429	1259	181	159	29	chr3	110650221	110650423	-48949360	-	RLTR9D	LTR	ERVK	-180	223	1	2
1429	3373	141	9	18	chr3	110658332	110658902	-48940881	+	RLTR1D	LTR	ERV1	25	589	-16	2
1429	1529	255	89	25	chr3	110662570	110663041	-48936742	-	RLTR16	LTR	ERVK	-4	501	1	2
1429	1125	193	313	13	chr3	110663108	110663352	-48936431	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	308	-220	2
1429	1125	240	106	20	chr3	110663386	110663580	-48936203	+	RLTR12B	LTR	ERVK	309	527	-1	2
1429	493	184	0	0	chr3	110664016	110664103	-48935680	+	RMER6C	LTR	ERVK	512	598	-92	2
1429	4000	17	53	0	chr3	110664613	110665081	-48934702	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1429	821	253	81	128	chr3	110675741	110676081	-48923702	-	MT2A	LTR	ERVL	-125	476	24	2
1429	2847	170	52	104	chr3	110676730	110677458	-48922325	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	2
1429	2106	190	129	58	chr3	110678311	110678830	-48920953	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-5	556	1	2
1429	3575	97	126	161	chr3	110683382	110684303	-48915480	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	889	0	2
1429	273	350	10	0	chr3	110708050	110708147	-48891636	-	RMER15	LTR	ERVL	-115	460	363	2
1429	5298	92	15	56	chr3	110717693	110718553	-48881230	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	825	-983	3
1429	318	294	45	91	chr3	110718807	110718983	-48880800	+	RMER12	LTR	ERVK	1101	1268	-54	3
1429	240	302	42	0	chr3	110721390	110721486	-48878297	-	RMER12	LTR	ERVK	-510	812	713	3
1429	248	309	49	12	chr3	110728462	110728544	-48871239	+	MLT2B2	LTR	ERVL	3	87	-428	3
1429	399	382	94	80	chr3	110736875	110737438	-48862345	+	MLT1G3	LTR	MaLR	16	586	-9	3
1429	445	222	8	79	chr3	110739579	110739706	-48860077	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-11	517	400	3
1429	1246	206	26	30	chr3	110740550	110740917	-48858866	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-109	419	1	3
1429	2048	207	109	18	chr3	110740970	110741476	-48858307	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-90	8869	8318	3
1429	779	171	21	7	chr3	110741482	110741623	-48858160	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	143	-717	3
1429	2329	182	103	4	chr3	110743169	110743643	-48856140	+	RMER13A	LTR	ERVK	146	666	-194	3
1429	1496	183	114	72	chr3	110743711	110744151	-48855632	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-644	8315	7845	3
1429	1496	199	76	41	chr3	110744449	110744524	-48855259	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1115	7844	7813	3
1429	423	154	20	71	chr3	110745191	110745289	-48854494	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1583	743	651	3
1429	1114	261	35	49	chr3	110752262	110752363	-48847420	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-1	577	492	3
1429	1114	281	61	50	chr3	110752411	110752843	-48846940	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-87	491	12	3
1430	1473	217	93	11	chr3	110756028	110756224	-48843559	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	189	3
1430	1473	217	93	11	chr3	110756268	110756435	-48843348	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-206	188	2	3
1430	245	375	35	53	chr3	110757942	110758111	-48841672	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	168	-337	3
1430	394	363	60	20	chr3	110759480	110759730	-48840053	+	RMER15	LTR	ERVL	316	575	0	3
1430	431	307	93	72	chr3	110763786	110764077	-48835706	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4586	4882	-117	3
1430	318	286	19	39	chr3	110764415	110764596	-48835187	+	RMER15	LTR	ERVL	352	561	-14	3
1430	283	131	0	21	chr3	110771693	110771740	-48828043	-	MTE2a	LTR	MaLR	-333	46	1	3
1430	1060	301	69	20	chr3	110783086	110783476	-48816307	-	MTC	LTR	MaLR	-12	409	1	4
1430	3384	28	2	2	chr3	110794316	110794712	-48805071	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1430	358	287	45	27	chr3	110806343	110806454	-48793329	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	113	-354	4
1430	799	341	24	0	chr3	110806988	110807243	-48792540	+	MLT1C	LTR	MaLR	199	459	-8	4
1430	278	245	126	11	chr3	110809846	110809941	-48789842	+	RMER5	LTR	ERV1	387	492	-42	4
1430	2761	176	32	26	chr3	110822965	110823632	-48776151	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1769	557	1	4
1430	1081	208	150	19	chr3	110823667	110823956	-48775827	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-287	291	9	4
1430	6940	22	0	0	chr3	110823956	110824743	-48775040	+	MERVL-int	LTR	ERVL	3897	4683	-802	4
1430	1506	221	67	11	chr3	110824760	110825089	-48774694	+	MTC	LTR	MaLR	40	385	-36	4
1430	1506	221	67	11	chr3	110825139	110825166	-48774617	+	MTC	LTR	MaLR	386	416	-5	4
1430	870	301	89	11	chr3	110825932	110826291	-48773492	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	31	4
1430	1444	233	94	15	chr3	110832106	110832446	-48767337	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1430	550	228	0	9	chr3	110836323	110836438	-48763345	-	RMER5	LTR	ERV1	-34	500	387	4
1430	1320	224	105	51	chr3	110838753	110838816	-48760967	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	333	4
1430	1320	224	105	51	chr3	110838855	110839163	-48760620	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-62	332	3	4
1430	1223	233	52	17	chr3	110839592	110840025	-48759758	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	6114	6490	-60	4
1430	1841	178	17	9	chr3	110840026	110840371	-48759412	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	348	-11	4
1430	667	267	17	28	chr3	110851525	110851706	-48748077	+	ORR1D1	LTR	MaLR	25	203	-171	4
1430	699	248	15	21	chr3	110851706	110851913	-48747870	+	ORR1D1	LTR	MaLR	156	365	-9	4
1430	1445	234	65	127	chr3	110874834	110875371	-48724412	+	RMER19C	LTR	ERVK	107	610	-1	5
1430	511	173	9	46	chr3	110877292	110877401	-48722382	-	RMER10B	LTR	ERVL	-11	387	283	5
1430	394	388	70	86	chr3	110881515	110881983	-48717800	-	MTE-int	LTR	MaLR	-563	1017	557	5
1430	479	415	56	12	chr3	110882032	110882274	-48717509	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1130	450	193	5
1430	4771	153	54	49	chr3	110882274	110883252	-48716531	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	5
1430	479	415	56	12	chr3	110883252	110883436	-48716347	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1388	192	5	5
1431	306	360	75	18	chr3	110888802	110889028	-48710755	+	MLT2B4	LTR	ERVL	225	463	-93	5
1431	2098	139	43	126	chr3	110895807	110896244	-48703539	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	401	-2	5
1431	2328	103	56	3	chr3	110896671	110897012	-48702771	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	5
1431	311	295	113	65	chr3	110903268	110903453	-48696330	-	RMER2	LTR	ERV1	-66	501	308	5
1431	1332	245	98	26	chr3	110906883	110907272	-48692511	+	MTC	LTR	MaLR	1	417	-4	5
1431	464	356	96	40	chr3	110909086	110909335	-48690448	+	LTR16B2	LTR	ERVL	1	263	-199	5
1431	1028	116	17	6	chr3	110914085	110914299	-48685484	+	MTB	LTR	MaLR	9	229	-178	5
1431	3408	23	2	2	chr3	110915176	110915572	-48684211	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1431	8286	56	36	1	chr3	110915572	110916633	-48683150	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
1431	3329	33	2	2	chr3	110916633	110917029	-48682754	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1431	1466	92	0	0	chr3	110917752	110917947	-48681836	+	MTB	LTR	MaLR	182	376	-24	5
1431	7769	160	41	72	chr3	110935975	110936246	-48663537	-	RLTR21	LTR	ERVK	-9	1563	1301	6
1431	7769	160	41	72	chr3	110936296	110937631	-48662152	-	RLTR21	LTR	ERVK	-272	1300	7	6
1431	393	224	65	29	chr3	110937915	110938019	-48661764	+	RMER17C	LTR	ERVK	96	204	-206	6
1431	393	224	65	29	chr3	110938051	110938116	-48661667	+	RMER17C	LTR	ERVK	205	271	-139	6
1431	2500	205	108	30	chr3	110938338	110938761	-48661022	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	174	6
1431	3308	48	89	0	chr3	110938761	110939197	-48660586	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	6
1431	2500	205	108	30	chr3	110939197	110939336	-48660447	-	RMER19C	LTR	ERVK	-438	173	5	6
1431	288	365	53	45	chr3	110941573	110941705	-48658078	-	RMER10B	LTR	ERVL	-10	388	256	6
1431	5276	198	9	14	chr3	110942124	110942434	-48657349	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	41	347	-5433	6
1431	2799	55	0	3	chr3	110942434	110942781	-48657002	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	6
1431	5276	198	9	14	chr3	110942781	110943454	-48656329	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	348	1019	-4761	6
1431	648	110	0	29	chr3	110943452	110943555	-48656228	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-1764	4016	3917	6
1431	627	223	8	0	chr3	110943558	110943688	-48656095	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	1027	1157	-4623	6
1431	2706	142	535	11	chr3	110943688	110943804	-48655979	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	3913	4090	-1690	6
1431	4927	131	31	65	chr3	110943804	110944738	-48655045	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	6
1431	2706	180	2	20	chr3	110944738	110945227	-48654556	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	4091	4570	-1210	6
1431	510	184	6	60	chr3	110946253	110946421	-48653362	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-65	5715	5557	6
1431	1082	196	51	0	chr3	110946655	110946869	-48652914	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-337	5443	5219	6
1431	3002	186	52	2	chr3	110947634	110948233	-48651550	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-586	5194	4564	6
1431	3124	180	16	46	chr3	110951691	110952321	-48647462	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1431	230	268	0	0	chr3	110957207	110957263	-48642520	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-446	69	14	6
1431	2481	104	23	103	chr3	110961317	110961755	-48638028	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	6
1431	2078	188	152	28	chr3	110965009	110965468	-48634315	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	1	6
1431	429	257	46	84	chr3	110965468	110965626	-48634157	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-75	299	150	6
1431	1559	242	155	18	chr3	110975098	110975587	-48624196	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	556	-12	6
1431	394	321	83	17	chr3	110979909	110980177	-48619606	+	MTEa	LTR	MaLR	64	379	0	6
1431	439	242	196	48	chr3	110986492	110986722	-48613061	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-13	398	135	6
1431	1823	208	16	26	chr3	110986750	110987199	-48612584	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-202	7042	6522	6
1431	2049	324	46	44	chr3	110987327	110989217	-48610566	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1462	5080	3224	6
1431	267	232	48	12	chr3	110989222	110989305	-48610478	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-3611	2556	2471	6
1431	345	222	61	53	chr3	110989611	110989725	-48610058	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1554	433	319	6
1431	489	235	193	53	chr3	110989741	110989984	-48609799	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	135	6
1431	3699	216	37	66	chr3	110990570	110991569	-48608214	+	RLTR25A	LTR	ERVK	8	1019	-9	6
1431	1489	148	41	11	chr3	111001271	111001537	-48598246	-	RLTR10E	LTR	ERVK	-37	274	1	2
1431	2177	219	102	58	chr3	111016429	111016511	-48583272	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	614	3
1431	2177	219	102	58	chr3	111016893	111017469	-48582314	-	RMER6C	LTR	ERVK	-77	613	3	3
1431	463	195	23	11	chr3	111017469	111017556	-48582227	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-306	88	1	3
178	4169	236	65	108	chr3	111017556	111018380	-48581403	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-106	1403	536	3
1432	4169	236	65	108	chr3	111018429	111018579	-48581204	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-974	535	401	3
1432	4169	236	65	108	chr3	111019030	111019145	-48580638	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1109	400	385	3
1432	4169	236	65	108	chr3	111019386	111019760	-48580023	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1125	384	3	3
1432	1817	207	42	26	chr3	111019760	111020138	-48579645	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	11	3
1432	1107	191	175	0	chr3	111023448	111023694	-48576089	-	RMER6D	LTR	ERVK	-431	289	1	4
1432	261	224	26	114	chr3	111023833	111024060	-48575723	+	RMER17D2	LTR	ERVK	320	526	-283	4
1432	2249	157	0	0	chr3	111032948	111033305	-48566478	+	MT2B2	LTR	ERVL	224	580	-4	5
1432	1184	214	191	6	chr3	111036066	111036390	-48563393	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	6
1432	961	296	44	17	chr3	111036396	111036692	-48563091	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	7	310	-1199	6
1432	240	351	54	67	chr3	111036876	111037099	-48562684	+	RMER20B	LTR	ERVK	200	419	-208	6
1432	1722	280	70	46	chr3	111037417	111038020	-48561763	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	382	998	-372	6
1432	884	220	78	0	chr3	111038519	111038710	-48561073	+	ORR1C2	LTR	MaLR	179	384	0	6
1432	612	277	24	30	chr3	111041107	111041271	-48558512	+	RLTR18B	LTR	ERVK	6	168	-344	7
1432	360	260	0	13	chr3	111041265	111041343	-48558440	+	RLTR18B	LTR	ERVK	67	143	-369	7
1432	3119	62	18	0	chr3	111041343	111041732	-48558051	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1432	5134	98	16	5	chr3	111041732	111042559	-48557224	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	3	883	-215	7
1432	765	87	304	0	chr3	111042553	111042691	-48557092	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	217	396	0	8
1432	280	209	15	15	chr3	111043703	111043771	-48556012	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-7	401	334	8
1432	286	214	0	0	chr3	111049721	111049777	-48550006	-	RMER6B	LTR	ERVK	-398	63	8	9
1432	413	173	12	12	chr3	111065104	111065186	-48534597	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-5	362	281	1
1432	1096	239	71	21	chr3	111071580	111071862	-48527921	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-71	296	1	1
1432	1591	191	79	6	chr3	111072695	111073037	-48526746	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	1
1432	2742	223	45	171	chr3	111073375	111074328	-48525455	-	RMER21B	LTR	ERV1	-9	833	1	1
1432	786	230	70	50	chr3	111074476	111074677	-48525106	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	178	1
1432	278	324	9	28	chr3	111074795	111074903	-48524880	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-269	109	4	1
1432	2806	102	18	0	chr3	111082265	111082658	-48517125	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
1432	383	326	126	63	chr3	111097142	111097348	-48502435	-	MER76	LTR	ERVL	-442	249	31	1
1432	3015	76	0	8	chr3	111099602	111100001	-48499782	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1432	372	378	75	6	chr3	111100996	111101169	-48498614	+	LTR78	LTR	ERV1	183	367	-937	1
1432	447	318	35	25	chr3	111103199	111103399	-48496384	+	RMER15	LTR	ERVL	337	538	-37	1
1432	3466	69	25	37	chr3	111106615	111107096	-48492687	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	1
1432	1707	223	56	194	chr3	111111850	111111864	-48487919	-	RMER19C	LTR	ERVK	-29	582	573	1
1432	1707	223	56	194	chr3	111112570	111113229	-48486554	-	RMER19C	LTR	ERVK	-39	572	2	1
1432	499	338	81	51	chr3	111116145	111116479	-48483304	+	MTE2a	LTR	MaLR	31	374	-5	1
1432	315	299	78	89	chr3	111116539	111116915	-48482868	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	951	1236	-727	1
1432	770	284	39	14	chr3	111118136	111118343	-48481440	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	209	1
1432	2234	72	28	21	chr3	111128018	111128343	-48471440	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	1
1432	262	325	15	31	chr3	111130216	111130346	-48469437	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-3964	1703	1576	1
1432	741	361	6	39	chr3	111131330	111131641	-48468142	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-69	301	1	1
1432	2438	228	96	52	chr3	111134935	111135625	-48464158	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	720	0	1
1432	350	320	0	0	chr3	111137374	111137474	-48462309	-	MER34	LTR	ERV1	-320	222	123	1
1432	2474	206	125	23	chr3	111143966	111144616	-48455167	-	RMER6D	LTR	ERVK	-4	716	1	1
1433	226	217	70	28	chr3	111152694	111152765	-48447018	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-9	387	314	2
1433	1234	277	68	12	chr3	111152963	111153299	-48446484	-	MTC	LTR	MaLR	-31	390	36	2
1433	303	318	35	35	chr3	111156587	111156701	-48443082	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-1	364	251	2
1433	260	323	62	10	chr3	111161047	111161144	-48438639	+	MLT2B2	LTR	ERVL	391	492	-70	2
1433	1433	272	39	5	chr3	111165249	111165630	-48434153	-	MTD	LTR	MaLR	-25	394	1	2
1433	2006	244	43	20	chr3	111174359	111174869	-48424914	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	6	527	0	2
1433	492	306	122	48	chr3	111181663	111181934	-48417849	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	283	2
1433	229	312	94	34	chr3	111181947	111182096	-48417687	-	RMER15	LTR	ERVL	-416	159	2	2
1433	515	294	50	22	chr3	111183958	111184139	-48415644	+	MLT1C	LTR	MaLR	282	467	0	2
1433	495	0	0	0	chr3	111187144	111187204	-48412579	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	60	-286	2
1433	392	317	7	7	chr3	111189781	111189924	-48409859	+	ORR1D1	LTR	MaLR	16	158	-216	2
1433	1538	189	88	88	chr3	111194406	111194597	-48405186	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	194	-173	3
1433	1538	189	88	88	chr3	111194777	111194950	-48404833	+	ORR1B2	LTR	MaLR	195	365	-2	3
1433	1725	215	33	37	chr3	111194968	111195453	-48404330	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	34	528	-1435	3
1433	2683	248	75	34	chr3	111195736	111195756	-48404027	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	535	549	-821	3
1433	2683	248	75	34	chr3	111195990	111196071	-48403712	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	550	634	-736	3
1433	3191	192	64	23	chr3	111196200	111196899	-48402884	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	635	1508	-1	3
1433	1686	207	49	26	chr3	111196906	111197253	-48402530	+	ORR1B2	LTR	MaLR	11	365	-2	3
1433	5278	120	73	9	chr3	111204665	111205517	-48394266	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	3
1433	245	316	129	97	chr3	111205905	111206122	-48393661	+	MTD	LTR	MaLR	196	419	0	3
1433	2307	139	40	23	chr3	111209294	111209691	-48390092	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	6	3
1433	626	315	45	33	chr3	111210130	111210465	-48389318	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	678	1016	-7943	3
1433	5697	216	52	33	chr3	111210983	111212466	-48387317	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1624	3134	-5825	3
1433	299	274	107	20	chr3	111212466	111212557	-48387226	-	RMER6C	LTR	ERVK	-300	456	356	3
1433	1055	201	49	60	chr3	111212602	111212875	-48386908	-	RMER6C	LTR	ERVK	-401	355	4	3
1433	645	328	128	18	chr3	111215235	111215570	-48384213	+	MER31A	LTR	ERV1	62	433	-52	3
1433	580	287	86	43	chr3	111225225	111225480	-48374303	+	ORR1E	LTR	MaLR	35	300	-59	3
1433	1633	152	113	24	chr3	111225627	111225963	-48373820	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	3
1433	459	266	8	24	chr3	111231790	111231917	-48367866	+	ORR1E	LTR	MaLR	297	421	0	3
1433	1585	161	141	6	chr3	111235464	111235783	-48364000	-	MTC	LTR	MaLR	-52	369	8	3
1433	629	350	47	33	chr3	111239981	111240282	-48359501	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	70	3
1433	285	262	65	65	chr3	111242602	111242757	-48357026	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1232	1386	-4136	3
1433	784	319	69	4	chr3	111247009	111247270	-48352513	-	MTE2b	LTR	MaLR	-78	301	24	3
1433	383	272	17	142	chr3	111249034	111249210	-48350573	+	RMER5	LTR	ERV1	77	230	-304	4
1433	747	258	72	54	chr3	111255241	111255520	-48344263	+	RMER5	LTR	ERV1	248	531	-3	4
1433	299	363	5	67	chr3	111256311	111256506	-48343277	-	RMER15	LTR	ERVL	-57	518	336	4
1433	1099	258	22	40	chr3	111263678	111264083	-48335700	-	RMER19B	LTR	ERVK	-2	900	220	4
1433	811	268	182	8	chr3	111271140	111271478	-48328305	+	MTD	LTR	MaLR	13	404	-15	4
1433	664	269	66	0	chr3	111278003	111278185	-48321598	+	ORR1C2	LTR	MaLR	191	384	0	4
1433	1053	196	93	9	chr3	111279373	111279589	-48320194	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	93	4
1434	2309	139	29	5	chr3	111281522	111281905	-48317878	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-23	392	1	4
1434	3637	69	19	0	chr3	111283527	111283993	-48315790	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	4
1434	525	138	0	155	chr3	111286689	111286818	-48312965	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-220	109	1	4
1434	684	335	79	58	chr3	111286820	111287200	-48312583	+	MT2A	LTR	ERVL	72	459	-74	4
1434	1267	166	12	4	chr3	111290564	111290806	-48308977	+	RMER6-int	LTR	ERVK	387	630	-2547	4
1434	1510	154	40	46	chr3	111290868	111291194	-48308589	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2579	2902	-275	4
1434	752	175	52	0	chr3	111291218	111291372	-48308411	+	RMER6C	LTR	ERVK	172	333	-357	4
1434	1028	141	78	0	chr3	111291924	111292115	-48307668	+	RMER6C	LTR	ERVK	484	689	-1	4
1434	4635	96	45	28	chr3	111298801	111299540	-48300243	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	4
1434	373	328	98	49	chr3	111299614	111299819	-48299964	-	MER54B	LTR	ERVL	-136	657	443	4
1434	399	368	19	0	chr3	111301705	111301860	-48297923	+	MTEa	LTR	MaLR	17	174	-205	4
1434	284	384	80	46	chr3	111302593	111302855	-48296928	+	LTR16B2	LTR	ERVL	34	304	-158	4
1434	2299	138	44	10	chr3	111305194	111305582	-48294201	+	RLTR9E	LTR	ERVK	9	409	0	4
1434	1746	236	171	8	chr3	111312844	111313370	-48286413	-	RMER6C	LTR	ERVK	-78	612	1	4
1434	398	295	70	65	chr3	111314353	111314567	-48285216	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	215	-341	4
1434	2306	210	69	61	chr3	111314648	111315333	-48284450	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	4
1434	668	285	74	9	chr3	111318202	111318432	-48281351	+	RLTR41	LTR	ERV1	200	444	-2	4
1434	285	333	146	37	chr3	111330156	111330424	-48269359	-	RMER15	LTR	ERVL	-2	573	277	4
1434	355	306	89	71	chr3	111333614	111333783	-48266000	-	RMER2	LTR	ERV1	-62	505	334	5
1434	578	364	34	9	chr3	111336996	111337229	-48262554	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	141	5
1434	382	364	50	20	chr3	111345647	111345849	-48253934	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-127	238	31	5
1434	2233	194	74	90	chr3	111349853	111350554	-48249229	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1434	237	296	212	39	chr3	111353939	111354118	-48245665	+	MTD	LTR	MaLR	210	419	0	5
1434	324	326	48	14	chr3	111370934	111371080	-48228703	-	MLT1D	LTR	MaLR	-354	151	1	5
1434	482	263	0	0	chr3	111373363	111373481	-48226302	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	494	5
1434	1439	165	11	0	chr3	111373488	111373748	-48226035	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	7	315	-246	5
1434	1334	244	77	34	chr3	111375621	111375948	-48223835	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	244	584	0	5
1434	1375	233	73	86	chr3	111375950	111376546	-48223237	-	RMER19C	LTR	ERVK	-115	496	10	5
1434	4243	132	18	17	chr3	111378824	111379646	-48220137	+	RLTR13D2	LTR	ERVK	1	1018	-5	5
1434	2556	103	21	126	chr3	111380177	111380708	-48219075	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
1434	2730	72	37	24	chr3	111380782	111381164	-48218619	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	276	662	-5819	5
1434	2163	83	0	0	chr3	111381164	111381442	-48218341	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	5
1434	5844	51	3	28	chr3	111381441	111382206	-48217577	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6481	0	5
1434	2432	101	14	160	chr3	111382206	111382762	-48217021	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
1434	516	100	0	0	chr3	111392138	111392208	-48207575	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	70	-287	5
1434	707	109	4	33	chr3	111392246	111392383	-48207400	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	204	357	0	5
1434	6609	159	172	22	chr3	111395068	111396517	-48203266	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	296	1961	-2	5
1434	555	123	16	54	chr3	111396509	111396637	-48203146	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	132	-262	5
1434	316	333	72	78	chr3	111398220	111398507	-48201276	-	ORR1E	LTR	MaLR	-14	405	118	5
1434	1829	234	35	49	chr3	111399659	111400171	-48199612	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	505	-215	5
1434	1560	242	77	34	chr3	111400174	111400671	-48199112	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	4	521	-1327	5
1434	3166	11	0	44	chr3	111401103	111401487	-48198296	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	5
1434	47918	19	1	1	chr3	111401487	111406888	-48192895	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	1081	5
1434	971	136	7	7	chr3	111406880	111407028	-48192755	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5297	2383	2236	5
1434	442	66	0	32	chr3	111407017	111407080	-48192703	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5062	1419	1359	5
1434	4706	61	46	16	chr3	111407080	111407716	-48192067	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	8	5
1434	3166	11	0	44	chr3	111407716	111408100	-48191683	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	5
1434	2247	231	123	80	chr3	111408428	111409020	-48190763	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	477	1113	-735	5
1434	2247	231	123	80	chr3	111409118	111409349	-48190434	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1114	1327	-521	5
1434	2247	231	123	80	chr3	111409441	111409534	-48190249	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1328	1434	-414	5
1434	2815	80	26	0	chr3	111409653	111410043	-48189740	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1435	1286	204	128	122	chr3	111415468	111416000	-48183783	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	535	-155	6
1435	2196	230	60	33	chr3	111416218	111416767	-48183016	-	RMER19C	LTR	ERVK	-47	564	1	6
1435	562	235	23	0	chr3	111416767	111416898	-48182885	+	RMER6C	LTR	ERVK	531	664	-26	6
1435	2198	99	139	19	chr3	111417692	111418051	-48181732	+	RLTR9D	LTR	ERVK	2	403	0	6
1435	340	287	33	53	chr3	111420133	111420284	-48179499	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-22	431	284	6
1435	517	304	18	44	chr3	111420358	111420585	-48179198	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-171	282	62	6
1435	273	304	96	35	chr3	111425818	111426016	-48173767	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1266	469	260	6
1435	268	378	23	47	chr3	111433599	111433771	-48166012	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4604	395	228	6
1435	417	328	166	24	chr3	111433922	111434175	-48165608	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	287	6
1435	1371	195	34	20	chr3	111438201	111438494	-48161289	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	165	6
1435	514	182	81	0	chr3	111438473	111438572	-48161211	+	RMER6B	LTR	ERVK	349	455	-6	6
1435	1117	214	94	4	chr3	111438574	111438809	-48160974	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2	257	-8702	6
1435	424	194	21	11	chr3	111438815	111438909	-48160874	+	ORR1B2	LTR	MaLR	271	365	-2	6
1435	321	321	44	39	chr3	111441232	111441436	-48158347	+	RMER10B	LTR	ERVL	194	398	0	6
1435	1790	227	6	3	chr3	111449228	111449594	-48150189	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
1435	584	294	72	53	chr3	111452620	111452924	-48146859	+	MTEb	LTR	MaLR	69	377	-2	6
1435	2081	214	73	33	chr3	111457026	111457602	-48142181	+	RMER6C	LTR	ERVK	91	689	-1	6
1435	500	200	14	126	chr3	111474666	111474707	-48125076	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	131	7
1435	504	75	0	0	chr3	111476965	111477032	-48122751	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	2	68	-297	7
1435	1067	62	0	7	chr3	111477027	111477174	-48122609	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	220	365	0	7
1435	2031	132	23	0	chr3	111480253	111480563	-48119220	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	11	7
1435	722	250	84	77	chr3	111480734	111481148	-48118635	-	RMER2	LTR	ERV1	-51	516	1	7
1435	267	309	109	16	chr3	111513708	111513836	-48085947	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	140	-341	1
1435	803	217	55	6	chr3	111527558	111527739	-48072044	+	RMER12	LTR	ERVK	144	333	-989	3
1435	2959	250	50	23	chr3	111532567	111533009	-48066774	+	RMER12	LTR	ERVK	321	767	-555	3
1435	2959	259	80	40	chr3	111533072	111533600	-48066183	+	RMER12	LTR	ERVK	768	1808	0	3
1436	3764	211	55	14	chr3	111558044	111558827	-48040956	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	815	-93	6
1436	343	194	0	16	chr3	111558943	111559006	-48040777	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	847	6
1436	1501	153	58	68	chr3	111560653	111560948	-48038835	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	27	7
1436	1503	257	77	49	chr3	111581581	111582048	-48017735	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	480	-131	9
1436	839	70	18	0	chr3	111582383	111582497	-48017286	-	RMER17B	LTR	ERVK	-831	127	12	9
1436	1840	78	19	4	chr3	111583914	111584183	-48015600	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-53	304	32	9
1436	390	302	24	8	chr3	111586798	111586929	-48012854	+	MTC	LTR	MaLR	233	406	-15	1
1436	783	312	73	7	chr3	111594882	111595156	-48004627	-	RMER15	LTR	ERVL	-115	460	169	1
1436	1959	128	3	84	chr3	111596922	111597289	-48002494	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1436	26727	9	1	0	chr3	111597289	111600243	-47999540	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3525	1
1436	932	73	24	0	chr3	111600243	111600366	-47999417	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2770	4910	4785	1
1436	1849	111	4	4	chr3	111600363	111600625	-47999158	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5183	2497	2236	1
1436	442	66	0	32	chr3	111600614	111600677	-47999106	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5062	1419	1359	1
1436	5048	38	25	16	chr3	111600677	111601317	-47998466	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	17	1
1436	2320	126	64	55	chr3	111601340	111601587	-47998196	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	221	1
1436	2320	126	64	55	chr3	111601633	111601856	-47997927	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	-255	220	1	1
1436	378	212	162	0	chr3	111604617	111604671	-47995112	-	RMER17C	LTR	ERVK	-136	274	198	1
1436	378	212	162	0	chr3	111604718	111604823	-47994960	-	RMER17C	LTR	ERVK	-213	197	90	1
1436	939	233	9	22	chr3	111621602	111621834	-47977949	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	674	1
1436	1185	192	40	197	chr3	111624533	111624980	-47974803	-	RMER19C	LTR	ERVK	-234	377	1	1
1436	323	332	30	65	chr3	111627658	111627858	-47971925	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	161	1
1436	577	258	45	8	chr3	111627896	111628029	-47971754	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1155	425	288	1
1436	436	0	0	0	chr3	111648204	111648254	-47951529	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	351	1
1436	7497	92	19	5	chr3	111648254	111649337	-47950446	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1436	3076	48	10	8	chr3	111649337	111649732	-47950051	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1436	887	279	57	4	chr3	111653344	111653592	-47946191	+	MTD	LTR	MaLR	14	274	-145	1
1436	3714	189	46	40	chr3	111654139	111654972	-47944811	+	RMER12	LTR	ERVK	1	838	-484	1
1436	545	163	246	22	chr3	111655015	111655153	-47944630	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	161	1
1436	3202	184	48	28	chr3	111655155	111655837	-47943946	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-330	698	3	1
1436	3457	123	209	24	chr3	111656927	111657387	-47942396	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	338	1
1436	3457	123	209	24	chr3	111657449	111657752	-47942031	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-569	337	2	1
1436	2030	196	21	92	chr3	111658131	111658693	-47941090	-	RMER6D	LTR	ERVK	-195	525	4	1
1436	419	220	135	8	chr3	111660094	111660227	-47939556	-	LTR41	LTR	ERVL	0	768	619	2
1436	2594	106	37	5	chr3	111660778	111661186	-47938597	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	2
1436	1195	207	4	36	chr3	111666473	111666718	-47933065	+	RLTR23	LTR	ERV1	193	429	-1	2
1436	298	453	44	9	chr3	111667093	111667318	-47932465	+	LTR33	LTR	ERVL	59	291	-224	2
1437	4305	176	34	32	chr3	111674369	111675214	-47924569	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	847	-256	2
1437	807	204	22	141	chr3	111675402	111675715	-47924068	+	RLTR25A	LTR	ERVK	828	1103	0	2
1437	7058	29	2	4	chr3	111678975	111679798	-47919985	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	2
1437	940	209	9	55	chr3	111687816	111688140	-47911643	+	RMER17C	LTR	ERVK	16	439	-519	2
1437	919	163	58	5	chr3	111694940	111695131	-47904652	-	RLTR21	LTR	ERVK	-538	1034	834	2
1437	2123	147	41	0	chr3	111695375	111695762	-47904021	-	RLTR21	LTR	ERVK	-515	1057	655	2
1437	844	257	78	85	chr3	111696098	111696733	-47903050	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	899	-9	2
1437	1730	202	196	7	chr3	111696948	111697401	-47902382	-	RMER6D	LTR	ERVK	-181	539	1	2
1437	721	242	73	5	chr3	111704049	111704240	-47895543	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	437	-190	2
1437	635	128	82	9	chr3	111704300	111704410	-47895373	-	RMER6D	LTR	ERVK	-597	123	6	2
1437	4368	65	9	2	chr3	111721762	111722318	-47877465	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	3
1437	2972	207	42	30	chr3	111724135	111724846	-47874937	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	720	0	3
1437	3352	35	0	0	chr3	111737229	111737625	-47862158	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1437	264	105	0	0	chr3	111738319	111738357	-47861426	+	MTC	LTR	MaLR	9	46	-375	3
1437	251	284	92	49	chr3	111743376	111743539	-47856244	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-476	1332	1163	3
1437	1142	232	35	72	chr3	111750036	111750423	-47849360	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	180	3
1437	414	222	115	33	chr3	111759740	111759778	-47840005	+	MTD	LTR	MaLR	5	39	-380	3
1437	414	222	115	33	chr3	111759836	111759979	-47839804	+	MTD	LTR	MaLR	40	200	-219	3
1437	669	276	102	67	chr3	111777094	111777408	-47822375	+	MT2B	LTR	ERVL	277	601	0	3
1438	1683	217	86	11	chr3	111805259	111805618	-47794165	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	4
1438	1149	307	68	5	chr3	111819966	111820346	-47779437	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	4
1438	1512	227	45	28	chr3	111821232	111821590	-47778193	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	9	4
1438	501	279	28	14	chr3	111825905	111826047	-47773736	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-2	1026	883	4
1438	430	180	74	184	chr3	111826023	111826186	-47773597	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-253	775	631	4
1438	1186	234	10	94	chr3	111826137	111826529	-47773254	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-971	992	634	4
1438	591	292	22	27	chr3	111826595	111826778	-47773005	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-846	182	1	4
1438	593	244	56	62	chr3	111827443	111827622	-47772161	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	407	4
1438	254	164	36	0	chr3	111827618	111827673	-47772110	-	MT2B2	LTR	ERVL	-544	57	1	4
1438	335	376	70	26	chr3	111828028	111828301	-47771482	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-50	315	31	4
1438	321	332	92	52	chr3	111841486	111841715	-47758068	-	RMER15	LTR	ERVL	-63	512	275	4
1438	1465	266	17	8	chr3	111844148	111844504	-47755279	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	9	4
1438	288	176	28	42	chr3	111852703	111852774	-47747009	-	RNLTR23	LTR	ERVK	0	642	573	4
1438	239	152	0	21	chr3	111855816	111855863	-47743920	-	MTE2a	LTR	MaLR	-331	48	3	4
1438	344	241	0	25	chr3	111860262	111860343	-47739440	-	MTC	LTR	MaLR	-342	79	1	4
1438	283	226	94	38	chr3	111860387	111860493	-47739290	+	RMER15	LTR	ERVL	357	468	-107	4
1438	978	308	60	6	chr3	111863643	111863960	-47735823	+	MTD	LTR	MaLR	72	405	-14	5
1438	300	254	57	9	chr3	111865035	111865138	-47734645	-	MLT1I	LTR	MaLR	-21	427	315	5
1438	4206	150	31	25	chr3	111882845	111883596	-47716187	-	RMER6A	LTR	ERVK	-1	755	1	5
1438	2782	124	65	0	chr3	111885361	111885822	-47713961	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3475	3931	3441	5
1438	1567	204	212	25	chr3	111885838	111886310	-47713473	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-4419	2987	2428	5
1438	3097	178	100	64	chr3	111886309	111887197	-47712586	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3675	1169	250	5
1438	593	281	29	72	chr3	111887830	111888037	-47711746	+	ORR1D2	LTR	MaLR	169	366	-4	5
1438	890	254	171	31	chr3	111888050	111888378	-47711405	+	MTD	LTR	MaLR	46	401	-18	5
1438	4494	155	36	44	chr3	111891185	111892094	-47707689	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	5
1438	1553	153	4	0	chr3	111892112	111892360	-47707423	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-31	5777	5529	5
1438	2910	173	9	6	chr3	111892360	111892896	-47706887	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-419	5389	4852	5
1438	568	176	55	16	chr3	111892947	111893074	-47706709	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	900	1031	-2	5
1438	2558	76	212	10	chr3	111893265	111893666	-47706117	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	5
1438	1391	273	60	112	chr3	111894088	111894658	-47705125	-	RLTR1D	LTR	ERV1	-13	611	72	5
1438	3369	40	51	2	chr3	111894634	111895084	-47704699	-	MT-int	LTR	MaLR	-64	1034	563	5
1438	295	352	113	33	chr3	111897854	111898004	-47701779	-	MER70B	LTR	ERVL	-416	162	1	5
1438	400	222	25	41	chr3	111907169	111907291	-47692492	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	18	137	-270	5
1438	1603	214	44	3	chr3	111909922	111910287	-47689496	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-4	380	1	5
1438	492	308	72	45	chr3	111912255	111912476	-47687307	-	MTE2a	LTR	MaLR	-152	227	1	5
1438	2475	204	101	27	chr3	111913286	111913922	-47685861	+	RMER6C	LTR	ERVK	8	690	0	5
1438	419	274	8	24	chr3	111914687	111914814	-47684969	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	125	-833	5
1438	3326	33	5	0	chr3	111919512	111919904	-47679879	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	5
1438	8702	47	7	5	chr3	111919904	111920999	-47678784	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
1438	3353	23	8	0	chr3	111920999	111921392	-47678391	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1438	419	336	69	50	chr3	111925444	111925704	-47674079	+	RMER15	LTR	ERVL	296	560	-15	5
1438	253	208	19	0	chr3	111925724	111925777	-47674006	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	54	-325	6
1438	1080	339	105	92	chr3	111925792	111926556	-47673227	+	MTE-int	LTR	MaLR	627	1353	-17	6
1438	2432	64	15	0	chr3	111926983	111927309	-47672474	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	55	6
1438	495	260	129	7	chr3	111928031	111928071	-47671712	-	MTD	LTR	MaLR	-56	363	325	6
1438	495	269	113	11	chr3	111928289	111928413	-47671370	-	MTD	LTR	MaLR	-95	324	169	6
1438	253	369	60	7	chr3	111934584	111934734	-47665049	-	MTEb	LTR	MaLR	-221	158	1	6
1438	550	262	118	30	chr3	111934734	111934927	-47664856	-	MTD-int	LTR	MaLR	-63	1517	1351	6
1439	753	284	67	72	chr3	111935577	111935960	-47663823	-	RLTR26	LTR	ERVK	-227	415	2	6
1439	2011	121	76	83	chr3	111936348	111936744	-47663039	+	RLTR9C	LTR	ERVK	1	393	0	6
1439	471	275	74	42	chr3	111936938	111937128	-47662655	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	224	6
1439	323	318	98	13	chr3	111937109	111937262	-47662521	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1384	196	31	6
1439	1143	268	95	24	chr3	111937293	111937671	-47662112	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	6
1439	548	310	62	98	chr3	111939097	111939520	-47660263	-	RLTR26	LTR	ERVK	-191	451	1	6
1439	528	277	14	118	chr3	111941604	111941825	-47657958	-	RMER5	LTR	ERV1	-328	206	9	6
1439	2300	190	38	54	chr3	111941828	111942335	-47657448	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	502	-601	6
1439	2300	190	38	54	chr3	111942367	111942381	-47657402	+	RLTR25A	LTR	ERVK	503	514	-589	6
1439	1855	213	80	31	chr3	111942547	111943108	-47656675	+	RLTR25A	LTR	ERVK	450	967	-136	6
1439	2871	74	5	20	chr3	111943108	111943510	-47656273	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1439	550	286	44	98	chr3	111943510	111943615	-47656168	+	RLTR25A	LTR	ERVK	925	1028	0	6
1439	986	189	168	18	chr3	111946371	111946651	-47653132	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
1439	3393	18	8	0	chr3	111948675	111949068	-47650715	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1439	2000	188	50	8	chr3	111951180	111951581	-47648202	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	3	6
1439	1126	132	44	31	chr3	111952451	111952678	-47647105	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	180	6
1439	332	107	0	18	chr3	111952675	111952732	-47647051	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-353	56	1	6
1439	234	176	18	89	chr3	111953692	111953748	-47646035	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-142	255	204	6
1439	2995	29	0	0	chr3	111954140	111954486	-47645297	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	6
1439	859	121	30	6	chr3	111967668	111967838	-47631945	+	RLTR9C	LTR	ERVK	240	409	0	6
1439	249	268	0	0	chr3	111972953	111973009	-47626774	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-318	56	1	6
1439	675	271	23	53	chr3	111995804	111996104	-47603679	-	RLTR15	LTR	ERVK	-20	339	49	7
1439	242	224	35	0	chr3	111996674	111996732	-47603051	-	RLTR15	LTR	ERVK	-294	65	6	7
1439	339	328	165	15	chr3	112000594	112000866	-47598917	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	313	-52	2
1439	698	279	127	14	chr3	112001098	112001355	-47598428	-	MTD	LTR	MaLR	-23	396	133	3
1439	2376	189	62	8	chr3	112002822	112003292	-47596491	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	495	-365	7
1439	767	291	8	58	chr3	112003299	112003540	-47596243	+	RMER13A	LTR	ERVK	632	860	0	7
1439	521	306	152	31	chr3	112010498	112010788	-47588995	+	MLT1A1	LTR	MaLR	43	367	-41	1
1439	1365	187	15	7	chr3	112010790	112011060	-47588723	-	RMER6D	LTR	ERVK	-2	688	417	1
1439	2271	227	137	16	chr3	112011207	112011812	-47587971	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	678	0	1
1439	1508	167	8	136	chr3	112011813	112012064	-47587719	-	RMER6D	LTR	ERVK	-292	428	220	1
1439	2925	89	37	0	chr3	112012064	112012470	-47587313	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
1439	1508	167	8	136	chr3	112012470	112012586	-47587197	-	RMER6D	LTR	ERVK	-501	219	108	1
1439	1103	267	60	13	chr3	112025071	112025371	-47574412	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-70	327	14	4
1439	993	251	31	124	chr3	112026966	112027289	-47572494	-	RMER15	LTR	ERVL	-282	293	1	4
1439	717	200	64	0	chr3	112034235	112034360	-47565423	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	5
1439	542	318	51	125	chr3	112041061	112041400	-47558383	+	MTEa	LTR	MaLR	1	320	-59	6
1439	542	318	51	125	chr3	112041516	112041585	-47558198	+	MTEa	LTR	MaLR	321	379	0	6
1439	1534	189	162	65	chr3	112042681	112043115	-47556668	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	5	484	-93	6
1439	1534	189	162	65	chr3	112043144	112043173	-47556610	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	485	513	-64	6
1439	3769	169	153	24	chr3	112045547	112046416	-47553367	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	3	983	0	7
1439	1880	211	76	72	chr3	112048232	112048718	-47551065	-	RLTR19	LTR	ERVK	-2	497	10	7
1439	250	302	31	0	chr3	112060224	112060320	-47539463	-	MER57D	LTR	ERV1	0	411	313	9
1439	374	284	58	93	chr3	112060315	112060574	-47539209	-	MER57D	LTR	ERV1	-59	352	67	9
1439	386	381	43	48	chr3	112064746	112065171	-47534612	+	MLT2B2	LTR	ERVL	73	501	-53	1
1440	4410	14	0	0	chr3	112069316	112069809	-47529974	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	1
1440	1661	281	14	30	chr3	112070929	112071355	-47528428	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1440	347	238	90	22	chr3	112083175	112083299	-47516484	-	MTEa	LTR	MaLR	0	419	232	1
1440	433	314	132	14	chr3	112091557	112091770	-47508013	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	133	1
1440	277	376	52	86	chr3	112096218	112096439	-47503344	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	163	1
1440	277	376	52	86	chr3	112096477	112096604	-47503179	-	MTEa	LTR	MaLR	-217	162	35	1
1440	1083	361	184	11	chr3	112106152	112107089	-47492694	+	MTEb-int	LTR	MaLR	482	1580	0	1
1440	453	348	147	58	chr3	112107089	112107437	-47492346	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	1
1440	396	360	0	14	chr3	112112478	112112616	-47487167	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-224	141	6	1
1440	546	197	0	159	chr3	112113509	112113613	-47486170	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	104	-326	1
1440	546	197	0	159	chr3	112113642	112113694	-47486089	+	RLTR23	LTR	ERV1	105	139	-291	1
1440	711	309	81	62	chr3	112113716	112114037	-47485746	+	RLTR23	LTR	ERV1	104	430	0	1
1440	505	211	0	0	chr3	112117126	112117221	-47482562	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	95	-625	1
1440	1765	185	12	27	chr3	112117307	112117645	-47482138	+	RMER6D	LTR	ERVK	384	716	-4	1
1440	1778	173	9	60	chr3	112128933	112129144	-47470639	+	RMER17C	LTR	ERVK	2	193	-217	1
1440	1778	173	9	60	chr3	112129176	112129395	-47470388	+	RMER17C	LTR	ERVK	194	410	0	1
1440	1739	162	13	116	chr3	112133111	112133508	-47466275	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	39	1
1440	2988	23	3	0	chr3	112160810	112161155	-47438628	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1440	407	245	172	55	chr3	112176606	112176814	-47422969	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	234	-219	2
1440	407	245	172	55	chr3	112176992	112177038	-47422745	+	RLTR11B	LTR	ERVK	235	285	-168	2
1440	233	324	2	27	chr3	112179251	112179339	-47420444	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	482	568	0	2
1440	356	353	91	56	chr3	112183191	112183443	-47416340	-	MTEb	LTR	MaLR	-66	313	53	2
1440	1528	287	77	56	chr3	112185465	112186059	-47413724	-	RLTR18	LTR	ERVK	-9	607	1	2
1440	1073	283	79	68	chr3	112189911	112190369	-47409414	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	71	2
1440	300	302	67	26	chr3	112190817	112191002	-47408781	+	RLTR19C	LTR	ERVK	370	714	-1	2
1440	1073	219	38	21	chr3	112191012	112191250	-47408533	-	RMER6C	LTR	ERVK	-448	242	1	2
1441	434	300	38	106	chr3	112201540	112201754	-47398029	-	MTE2a	LTR	MaLR	-76	303	101	3
1441	589	199	5	17	chr3	112201755	112201896	-47397887	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	233	3
1441	1251	262	48	41	chr3	112201908	112202326	-47397457	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-726	644	224	3
1441	357	330	27	16	chr3	112204577	112204762	-47395021	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3174	2540	2354	3
1441	7182	186	27	82	chr3	112213785	112214170	-47385613	-	RLTR21	LTR	ERVK	-8	1564	1190	3
1441	7182	186	27	82	chr3	112214196	112214339	-47385444	-	RLTR21	LTR	ERVK	-383	1189	1082	3
1441	7182	186	27	82	chr3	112214395	112214439	-47385344	-	RLTR21	LTR	ERVK	-491	1081	1055	3
1441	7182	186	27	82	chr3	112214493	112215572	-47384211	-	RLTR21	LTR	ERVK	-518	1054	2	3
1441	260	289	143	86	chr3	112215919	112216059	-47383724	-	ORR1E	LTR	MaLR	-207	152	5	3
1441	461	248	57	0	chr3	112216571	112216676	-47383107	-	MTEa	LTR	MaLR	-15	364	254	3
1441	1554	241	131	19	chr3	112221593	112222094	-47377689	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	64	3
1441	571	271	94	55	chr3	112222724	112223022	-47376761	+	MTD	LTR	MaLR	4	311	-110	3
1441	2254	133	60	5	chr3	112224304	112224690	-47375093	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-2	407	1	3
1441	542	168	293	38	chr3	112234159	112234396	-47365387	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	287	-116	3
1441	5208	129	1	13	chr3	112234396	112235180	-47364603	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	881	1655	-1659	3
1441	21416	177	35	27	chr3	112235416	112240011	-47359772	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1791	7206	-200	3
1441	673	217	262	10	chr3	112240011	112240313	-47359470	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	154	531	-371	3
1441	807	216	185	53	chr3	112240316	112240673	-47359110	+	RLTR9E	LTR	ERVK	6	409	0	3
1441	1771	142	32	59	chr3	112242341	112242679	-47357104	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	3
1441	4219	179	14	27	chr3	112253398	112254296	-47345487	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	716	1532	-431	3
1441	662	279	126	64	chr3	112254296	112254747	-47345036	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	2216	2501	-2562	3
1441	354	336	89	16	chr3	112254841	112255098	-47344685	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4271	4546	-3232	3
1441	914	294	0	15	chr3	112255684	112255943	-47343840	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3532	3786	-1277	3
1441	1933	133	120	45	chr3	112268719	112269161	-47330622	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	3
1441	3414	35	0	0	chr3	112270443	112270839	-47328944	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1441	1467	178	69	27	chr3	112273837	112274344	-47325439	-	RMER6A	LTR	ERVK	-2	754	1	4
1441	522	266	77	7	chr3	112276171	112276326	-47323457	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	206	4
1441	232	273	38	25	chr3	112276400	112276479	-47323304	-	MTE2a	LTR	MaLR	-336	83	4	4
1441	295	200	77	0	chr3	112279180	112279245	-47320538	+	RMER6C	LTR	ERVK	39	108	-582	4
1441	395	191	0	160	chr3	112279247	112279314	-47320469	+	MT2B	LTR	ERVL	209	259	-342	4
1441	1403	153	89	66	chr3	112279413	112279763	-47320020	+	RMER6C	LTR	ERVK	326	683	-7	4
1441	1348	204	73	89	chr3	112280797	112281179	-47318604	+	ORR1B1	LTR	MaLR	19	394	0	4
1441	898	248	25	30	chr3	112283335	112283572	-47316211	+	RMER15	LTR	ERVL	340	575	0	4
1441	820	158	18	54	chr3	112283672	112283839	-47315944	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	161	-363	4
1441	517	210	42	8	chr3	112283820	112283940	-47315843	+	RLTR28	LTR	ERVL	399	522	-2	4
1441	1893	233	37	12	chr3	112284054	112284463	-47315320	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	4
1441	2616	77	21	0	chr3	112285270	112285609	-47314174	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
1441	791	313	102	41	chr3	112291974	112292330	-47307453	-	MTC	LTR	MaLR	-2	377	35	4
1441	698	272	52	39	chr3	112292426	112292659	-47307124	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	144	4
1441	3753	134	3	12	chr3	112307151	112307740	-47292043	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	4
1441	543	349	105	21	chr3	112307935	112308354	-47291429	-	MLT1C	LTR	MaLR	-13	454	1	4
1441	279	205	35	35	chr3	112314756	112314842	-47284941	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	334	4
1441	3149	194	102	146	chr3	112315132	112316193	-47283590	+	RLTR25B	LTR	ERVK	15	1028	0	4
1441	2816	73	281	14	chr3	112318543	112318985	-47280798	+	LTRIS2	LTR	ERV1	5	564	0	4
1441	2060	123	6	52	chr3	112319937	112320280	-47279503	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1441	563	335	110	60	chr3	112322699	112323198	-47276585	+	MT2A	LTR	ERVL	8	531	-2	4
1441	1292	271	88	10	chr3	112323466	112323850	-47275933	+	MTD	LTR	MaLR	5	418	-1	4
1442	1581	232	72	5	chr3	112346503	112346893	-47252890	+	MTC	LTR	MaLR	3	418	-3	4
1442	883	260	89	67	chr3	112350762	112351121	-47248662	+	RMER2	LTR	ERV1	197	563	-4	5
1442	235	340	29	29	chr3	112353063	112353166	-47246617	+	MER21B	LTR	ERV1	20	122	-741	5
1442	240	288	152	32	chr3	112376108	112376266	-47223517	+	LTR48	LTR	ERV1	295	471	-316	5
1442	4812	120	13	65	chr3	112382001	112382848	-47216935	+	RLTR13B4	LTR	ERVK	1	803	0	5
1442	342	221	85	19	chr3	112385278	112385384	-47214399	+	RMER5	LTR	ERV1	72	184	-350	5
1442	2435	105	155	2	chr3	112386976	112387388	-47212395	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
1442	3510	92	19	31	chr3	112387389	112388217	-47211566	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	662	-5819	5
1442	2222	65	0	0	chr3	112388217	112388495	-47211288	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	5
1442	5844	51	5	19	chr3	112388494	112389248	-47210535	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6479	-2	5
1442	2416	98	158	2	chr3	112389250	112389661	-47210122	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
1442	281	321	189	23	chr3	112400461	112400660	-47199123	-	MTEb	LTR	MaLR	-6	373	142	5
1442	1482	226	71	20	chr3	112402450	112402802	-47196981	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	52	5
1442	843	265	60	124	chr3	112410148	112410614	-47189169	-	RMER2	LTR	ERV1	-28	539	104	5
1442	1230	117	0	6	chr3	112411017	112411197	-47188586	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	8	186	-716	5
1442	4091	141	14	91	chr3	112413317	112414131	-47185652	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	147	897	-5	5
1442	362	376	128	36	chr3	112414784	112415035	-47184748	-	MLT1H	LTR	MaLR	-177	372	99	5
1442	895	209	212	20	chr3	112415190	112415483	-47184300	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	349	-35	6
1442	306	243	7	218	chr3	112416367	112416509	-47183274	+	MTD	LTR	MaLR	1	142	-277	6
1442	522	341	64	47	chr3	112416519	112416851	-47182932	+	MT2A	LTR	ERVL	179	516	-17	6
1442	522	341	64	47	chr3	112416890	112416901	-47182882	+	MT2A	LTR	ERVL	517	527	-6	6
1442	3371	184	58	7	chr3	112419085	112419760	-47180023	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	709	-11	6
1442	305	360	75	53	chr3	112420655	112420881	-47178902	-	LTR52	LTR	ERVL	-176	245	15	6
1442	3214	186	78	18	chr3	112422051	112422730	-47177053	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	720	0	6
1442	260	323	186	0	chr3	112422990	112423114	-47176669	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	230	6
1442	295	314	68	54	chr3	112423596	112423744	-47176039	-	MTEa	LTR	MaLR	-229	150	1	6
1442	347	390	77	19	chr3	112424941	112425265	-47174518	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-10	355	13	6
1442	3466	169	75	13	chr3	112425463	112425974	-47173809	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	135	6
1442	5167	149	47	37	chr3	112425974	112426947	-47172836	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	983	1	6
1442	3466	169	75	13	chr3	112426947	112427066	-47172717	-	RLTR33	LTR	ERVK	-544	134	9	6
1442	248	226	0	70	chr3	112436421	112436478	-47163305	-	RLTR15	LTR	ERVK	-3	356	304	6
1442	1639	221	10	0	chr3	112441575	112441883	-47157900	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-83	311	1	6
1443	4321	49	26	5	chr3	112464401	112465009	-47134774	-	MT-int	LTR	MaLR	-118	1140	429	6
1443	235	315	22	33	chr3	112498410	112498502	-47101281	+	MTEa	LTR	MaLR	279	369	-10	7
1443	1277	170	185	0	chr3	112498548	112498824	-47100959	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	3	7
1443	1733	73	4	8	chr3	112500000	112500236	-47099547	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-87	235	1	1
1443	751	185	46	0	chr3	112504103	112504233	-47095550	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	136	-554	6
1443	459	128	109	0	chr3	112504507	112504629	-47095154	-	RMER6D	LTR	ERVK	-356	334	184	8
1443	1021	190	15	0	chr3	112504651	112504851	-47094932	+	RMER6D	LTR	ERVK	145	347	-373	6
1443	595	337	124	30	chr3	112509282	112509652	-47090131	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	1
1443	3481	28	136	0	chr3	112512507	112512941	-47086842	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1443	3972	34	15	8	chr3	112519543	112520022	-47079761	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
1443	529	390	64	47	chr3	112522277	112522638	-47077145	+	MLT1E2	LTR	MaLR	230	596	-31	3
1443	1774	265	68	47	chr3	112527152	112527667	-47072116	-	RMER2	LTR	ERV1	-41	526	1	4
1443	2578	67	0	75	chr3	112528799	112529173	-47070610	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
1443	1228	223	93	27	chr3	112544419	112544751	-47055032	+	MTC	LTR	MaLR	68	421	0	6
1443	398	315	0	0	chr3	112549176	112549284	-47050499	+	MT2A	LTR	ERVL	36	143	-390	6
1443	335	331	76	58	chr3	112549426	112549702	-47050081	+	MT2A	LTR	ERVL	178	458	-75	6
1443	2538	53	28	0	chr3	112549804	112550122	-47049661	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	6
1443	1994	149	22	0	chr3	112557196	112557512	-47042271	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	7
1443	3818	224	90	116	chr3	112557516	112559531	-47040252	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	1	7
1443	1888	162	22	0	chr3	112559531	112559851	-47039932	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1443	558	376	64	18	chr3	112563637	112564132	-47035651	+	MLT1F	LTR	MaLR	3	563	-6	8
1443	271	278	70	30	chr3	112566366	112566466	-47033317	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	276	8
1443	506	368	35	10	chr3	112566477	112566680	-47033103	-	ORR1E	LTR	MaLR	-146	213	6	8
1443	624	163	36	120	chr3	112569288	112569455	-47030328	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	153	-329	9
1443	1346	105	24	28	chr3	112569922	112570247	-47029536	+	RLTR45	LTR	ERVK	107	482	0	9
1443	5897	75	21	12	chr3	112570662	112571463	-47028320	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	9
1444	2994	160	46	13	chr3	112599825	112600293	-46999490	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	480	-98	1
1444	2994	160	46	13	chr3	112600347	112600423	-46999360	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	481	562	-16	1
1444	239	290	132	49	chr3	112604212	112604477	-46995306	+	LTR37A	LTR	ERV1	101	387	-39	1
1444	299	151	19	19	chr3	112604590	112604644	-46995139	+	RMER15	LTR	ERVL	11	64	-511	1
1444	1549	231	185	38	chr3	112606715	112607191	-46992592	+	RMER19B	LTR	ERVK	357	902	0	1
1444	1457	164	75	63	chr3	112607818	112608137	-46991646	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-4	323	1	1
1444	7425	166	81	61	chr3	112608137	112609750	-46990033	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	319	1
1444	371	154	62	25	chr3	112609748	112609828	-46989955	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	234	316	-1647	1
1444	407	200	12	12	chr3	112615617	112615703	-46984080	+	RMER19B	LTR	ERVK	811	896	-6	1
1444	2936	71	2	12	chr3	112616059	112616459	-46983324	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1444	881	289	78	17	chr3	112616841	112617170	-46982613	-	MTD	LTR	MaLR	-45	355	19	1
1444	1639	215	41	55	chr3	112619646	112620010	-46979773	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	1
1444	3577	183	50	5	chr3	112620251	112620911	-46978872	-	RLTR17	LTR	ERVK	-2	690	1	1
1444	254	388	53	15	chr3	112627980	112628111	-46971672	+	RMER15	LTR	ERVL	284	419	-156	1
1444	3160	207	40	4	chr3	112632570	112633265	-46966518	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	1
1444	240	401	51	46	chr3	112648670	112648887	-46950896	+	MLT-int	LTR	MaLR	869	1086	-649	2
1444	441	350	51	18	chr3	112650012	112650296	-46949487	-	MLT1C	LTR	MaLR	-20	447	168	2
1444	1991	223	63	48	chr3	112660624	112660750	-46939033	+	MT2A	LTR	ERVL	1	140	-393	2
1444	1991	223	63	48	chr3	112660780	112660804	-46938979	+	MT2A	LTR	ERVL	141	182	-351	2
1444	1991	223	63	48	chr3	112661561	112661896	-46937887	+	MT2A	LTR	ERVL	183	496	-37	2
1444	1991	223	63	48	chr3	112661962	112661997	-46937786	+	MT2A	LTR	ERVL	497	531	-2	2
1444	3249	43	5	2	chr3	112670254	112670649	-46929134	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1444	4601	64	11	6	chr3	112670649	112671280	-46928503	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	634	-464	2
1444	1777	28	5	0	chr3	112671264	112671478	-46928305	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	177	391	-5	2
1444	309	296	108	38	chr3	112693530	112693688	-46906095	+	MTEb	LTR	MaLR	110	278	-101	2
1444	3107	59	3	3	chr3	112699021	112699413	-46900370	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	5	2
1444	2918	122	31	4	chr3	112700736	112701187	-46898596	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1501	1963	0	2
1444	1999	145	31	0	chr3	112701187	112701504	-46898279	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1444	2669	274	105	25	chr3	112713231	112714077	-46885706	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	5	918	-452	3
1444	1139	184	142	15	chr3	112714110	112714370	-46885413	+	ORR1C2	LTR	MaLR	92	384	0	3
1444	1412	207	64	56	chr3	112715744	112715937	-46883846	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	177	-201	3
1444	1412	207	64	56	chr3	112715983	112716162	-46883621	+	ORR1C1	LTR	MaLR	178	375	-3	3
1444	4436	12	0	0	chr3	112716683	112717176	-46882607	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	3
1444	314	0	0	0	chr3	112717176	112717214	-46882569	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	3
1444	392	167	46	35	chr3	112717214	112717301	-46882482	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	3
180	47244	17	0	0	chr3	112717301	112722661	-46877122	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	3
1445	3710	14	121	0	chr3	112722661	112723101	-46876682	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	3
1445	1112	242	53	48	chr3	112727243	112727660	-46872123	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1445	546	287	107	32	chr3	112735716	112735903	-46863880	+	MTD	LTR	MaLR	1	201	-218	3
1445	646	281	74	23	chr3	112737154	112737369	-46862414	+	MTD	LTR	MaLR	194	419	0	3
1445	2209	209	72	10	chr3	112737961	112738444	-46861339	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-11	516	4	3
1445	534	257	61	52	chr3	112738449	112738716	-46861067	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	2092	3
1445	5148	238	88	78	chr3	112739294	112739847	-46859936	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-241	2085	1521	3
1445	5148	238	88	78	chr3	112739888	112740063	-46859720	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-806	1520	1304	3
1445	5148	238	88	78	chr3	112740222	112741541	-46858242	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1023	1303	15	3
1445	306	229	85	71	chr3	112741892	112742033	-46857750	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2285	6674	6532	3
1445	2470	203	17	27	chr3	112742798	112743319	-46856464	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-11	516	1	3
1445	385	349	102	30	chr3	112753865	112754101	-46845682	+	MLT1C	LTR	MaLR	62	314	-153	3
1445	2459	53	3	48	chr3	112754550	112754887	-46844896	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
1445	2730	96	5	27	chr3	112754887	112755292	-46844491	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	4449	3
1445	632	73	10	0	chr3	112755292	112755388	-46844395	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-225	97	1	3
1445	275	342	98	35	chr3	112758405	112758720	-46841063	+	LTR37B	LTR	ERV1	126	460	-8	3
1445	521	292	56	20	chr3	112761172	112761368	-46838415	-	MTC	LTR	MaLR	-218	203	1	3
1445	247	281	16	0	chr3	112761368	112761432	-46838351	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1194	3
1445	391	287	77	32	chr3	112771192	112771347	-46828436	+	MLT1D	LTR	MaLR	49	210	-295	3
1445	239	276	19	19	chr3	112771423	112771530	-46828253	+	MLT1D	LTR	MaLR	396	502	-3	3
1445	1795	202	47	13	chr3	112774420	112774801	-46824982	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1445	239	224	224	0	chr3	112775268	112775326	-46824457	+	MTE2b	LTR	MaLR	53	123	-256	3
1445	386	301	0	0	chr3	112775505	112775587	-46824196	+	MTE2b	LTR	MaLR	238	319	-60	3
1445	4712	173	62	70	chr3	112775587	112775740	-46824043	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	955	3
1445	4712	173	62	70	chr3	112775913	112776202	-46823581	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-149	954	687	3
1445	2109	127	7	0	chr3	112776517	112776824	-46822959	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	4
1445	4712	173	62	70	chr3	112776868	112776919	-46822864	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-417	686	641	3
1445	4712	173	62	70	chr3	112777188	112777469	-46822314	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-463	640	347	3
1445	4712	173	62	70	chr3	112777541	112777875	-46821908	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-757	346	1	3
1445	365	365	25	12	chr3	112777930	112778091	-46821692	+	MTE-int	LTR	MaLR	2	164	-1416	4
1445	344	325	17	0	chr3	112778107	112778224	-46821559	+	MTE-int	LTR	MaLR	299	417	-1163	4
1445	2394	108	196	0	chr3	112778372	112778817	-46820966	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	532	0	4
1445	6860	53	2	3	chr3	112779345	112780201	-46819582	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	4
1445	1397	177	79	62	chr3	112780336	112780739	-46819044	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	4
1445	1712	337	61	93	chr3	112780807	112781713	-46818070	+	MTE-int	LTR	MaLR	609	1485	-95	4
1445	703	286	129	75	chr3	112784101	112784396	-46815387	+	MTE2b	LTR	MaLR	21	331	-48	4
1445	238	310	128	73	chr3	112792274	112792493	-46807290	+	MLT1B	LTR	MaLR	6	236	-154	4
1445	442	343	65	12	chr3	112792720	112792968	-46806815	-	MLT1B	LTR	MaLR	-35	355	95	4
1445	1231	283	30	22	chr3	112793810	112794175	-46805608	-	MTEb	LTR	MaLR	-11	368	1	4
1445	483	284	24	17	chr3	112797625	112797789	-46801994	+	MLT2B4	LTR	ERVL	66	231	-284	4
1445	1302	230	181	60	chr3	112799327	112800135	-46799648	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	720	0	4
1445	1578	247	54	18	chr3	112813279	112813671	-46786112	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	1	4
1445	309	343	85	7	chr3	112815280	112815421	-46784362	-	MLT1E	LTR	MaLR	-33	620	469	4
1445	1394	201	215	61	chr3	112825628	112826088	-46773695	+	RMER20B	LTR	ERVK	30	560	-67	4
1445	306	231	0	71	chr3	112826151	112826235	-46773548	+	RMER20B	LTR	ERVK	525	602	-25	4
1445	3348	23	21	0	chr3	112831156	112831544	-46768239	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1445	3110	38	3	0	chr3	112831544	112831936	-46767847	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	706	4
1445	4334	59	0	0	chr3	112831936	112832463	-46767320	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-519	4966	4440	4
1445	358	312	0	0	chr3	112835230	112835323	-46764460	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	550	4
1445	1115	306	102	56	chr3	112835395	112835915	-46763868	-	RLTR26	LTR	ERVK	-98	544	1	4
1445	985	195	77	45	chr3	112836890	112837137	-46762646	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-4	1844	1590	4
1445	3642	123	5	17	chr3	112837420	112838009	-46761774	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1043	805	224	4
1445	242	242	45	15	chr3	112838976	112839043	-46760740	+	MLT1A1	LTR	MaLR	71	139	-269	4
1445	328	325	25	59	chr3	112839339	112839521	-46760262	+	MTE2a	LTR	MaLR	91	308	-111	4
1445	234	218	167	0	chr3	112843474	112843552	-46756231	+	MTE2a	LTR	MaLR	275	365	-14	4
1445	2773	51	3	0	chr3	112847831	112848162	-46751621	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	5
1446	2175	125	217	26	chr3	112870729	112871189	-46728594	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-70	584	37	5
1446	228	218	196	56	chr3	112871191	112871298	-46728485	-	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	-532	122	1	5
1446	665	369	66	44	chr3	112880280	112880688	-46719095	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-15	609	193	5
1446	4376	176	154	15	chr3	112886380	112886869	-46712914	+	RLTR25A	LTR	ERVK	12	513	-590	5
1446	4376	176	154	15	chr3	112886900	112887368	-46712415	+	RLTR25A	LTR	ERVK	514	1102	-1	5
1446	951	290	75	40	chr3	112890302	112890663	-46709120	+	MTD	LTR	MaLR	14	365	-14	5
1446	2937	12	0	0	chr3	112893457	112893783	-46706000	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	326	0	5
1446	56904	21	6	0	chr3	112893783	112900542	-46699241	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	1	6801	-20	5
1446	2542	36	3	0	chr3	112900542	112900851	-46698932	+	IAPLTR3	LTR	ERVK	1	310	-16	5
1446	1049	229	61	40	chr3	112911067	112911344	-46688439	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	283	-285	5
1446	324	306	58	58	chr3	112911324	112911398	-46688385	+	RLTR20D	LTR	ERVK	411	479	-99	5
1446	324	286	32	32	chr3	112911472	112911567	-46688216	+	RLTR20D	LTR	ERVK	412	565	-13	5
1446	1230	284	152	30	chr3	112912691	112913166	-46686617	-	RMER13A	LTR	ERVK	-134	726	194	5
1446	2021	129	31	3	chr3	112920913	112921231	-46678552	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1446	9705	157	64	14	chr3	112921231	112922178	-46677605	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1039	-924	5
1446	9705	157	64	14	chr3	112922867	112923786	-46675997	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1040	1963	0	5
1446	2015	149	12	0	chr3	112923786	112924109	-46675674	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1446	1602	181	15	158	chr3	112933809	112934138	-46665645	-	BGLII_A	LTR	ERVK	0	445	194	6
1446	1602	181	15	158	chr3	112934224	112934413	-46665370	-	BGLII_A	LTR	ERVK	-252	193	1	6
1446	310	225	28	14	chr3	112934442	112934514	-46665269	-	MER34A	LTR	ERV1	-498	73	1	6
1446	764	279	5	34	chr3	112936542	112936750	-46663033	+	MTEa	LTR	MaLR	15	216	-163	6
1446	569	305	29	0	chr3	112936812	112936986	-46662797	+	MTEa	LTR	MaLR	201	379	0	6
1446	369	365	39	11	chr3	112937138	112937318	-46662465	-	ORR1E	LTR	MaLR	-149	210	26	6
1446	1942	145	86	47	chr3	112939480	112939864	-46659919	+	RMER16	LTR	ERVK	135	533	0	6
1446	693	219	206	15	chr3	112939864	112939999	-46659784	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-92	1756	1583	6
1446	3714	164	81	11	chr3	112940560	112941312	-46658471	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1043	805	1	6
1446	1172	264	50	32	chr3	112945691	112946070	-46653713	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	148	6
1446	722	225	37	21	chr3	112946596	112946787	-46652996	+	RLTR12A	LTR	ERVK	361	554	-14	6
1446	2098	341	99	37	chr3	112961186	112962417	-46637366	+	MTE-int	LTR	MaLR	194	1501	-79	6
1446	490	347	83	12	chr3	112962524	112962778	-46637005	+	ORR1E	LTR	MaLR	88	359	0	6
1446	1614	121	44	75	chr3	112967887	112968181	-46631602	+	RLTR23	LTR	ERV1	146	430	0	6
1446	424	283	37	56	chr3	112969446	112969607	-46630176	+	MT2A	LTR	ERVL	279	436	-97	6
1446	560	178	0	0	chr3	112980163	112980264	-46619519	+	MTC	LTR	MaLR	1	101	-320	6
1447	3989	101	13	69	chr3	112996659	112997338	-46602445	-	RLTR13B4	LTR	ERVK	-162	641	1	6
1447	702	46	0	0	chr3	112997989	112998076	-46601707	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	87	-395	6
1447	1056	261	0	4	chr3	112998080	112998341	-46601442	-	MuRRS4-int	LTR	ERV1	-2088	2975	2716	6
1447	10658	100	10	9	chr3	112998368	112999994	-46599789	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-4499	3279	1643	6
1447	3489	70	216	11	chr3	113000000	113000589	-46599194	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-3284	1406	726	1
1447	3489	72	61	8	chr3	113000646	113000692	-46599091	-	MuRRS-int	LTR	ERV1	-3965	725	649	1
1447	666	85	75	0	chr3	113000692	113000786	-46598997	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	382	482	0	3
1447	3470	18	5	0	chr3	113003610	113004004	-46595779	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1447	9431	21	4	0	chr3	113004004	113005098	-46594685	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	7
1447	1803	23	5	0	chr3	113005098	113005317	-46594466	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	220	-176	8
1447	3575	67	19	13	chr3	113007438	113007910	-46591873	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1447	2067	124	14	38	chr3	113015251	113015595	-46584188	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	19	1
1447	47885	87	10	6	chr3	113015595	113022499	-46577284	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-8	7505	575	1
1447	641	302	88	45	chr3	113024675	113024915	-46574868	-	RLTR15	LTR	ERVK	-15	344	101	2
1447	641	302	88	45	chr3	113025095	113025184	-46574599	-	RLTR15	LTR	ERVK	-259	100	1	2
1447	2274	127	30	70	chr3	113027918	113028316	-46571467	+	RLTR9A2	LTR	ERVK	1	382	-1	3
1447	2472	99	0	0	chr3	113029646	113029978	-46569805	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	332	0	3
1447	288	274	138	28	chr3	113038436	113038545	-46561238	+	MLT1I	LTR	MaLR	12	132	-279	4
1447	2283	116	17	31	chr3	113039560	113039915	-46559868	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	5	4
1447	18495	93	5	6	chr3	113039919	113042632	-46557151	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	0	7513	4804	4
1447	5812	136	7	38	chr3	113042632	113043713	-46556070	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-6455	1058	12	4
1447	230	122	60	20	chr3	113043716	113043731	-46556052	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	-281	104	87	4
1447	2359	98	14	44	chr3	113043731	113044096	-46555687	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	4
1447	230	122	60	20	chr3	113044096	113044130	-46555653	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	-299	86	53	4
1447	6212	114	48	11	chr3	113047058	113048004	-46551779	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	3	983	0	5
1447	2237	196	51	14	chr3	113048908	113049416	-46550367	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	5
1447	3008	71	8	2	chr3	113051407	113051801	-46547982	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1447	21742	90	1	29	chr3	113062453	113065496	-46534287	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4623	7581	0	6
1447	1816	166	0	7	chr3	113065496	113065806	-46533977	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	308	-3	6
1447	263	294	134	27	chr3	113076040	113076152	-46523631	-	MLT1I	LTR	MaLR	-279	132	9	7
1447	6170	115	48	11	chr3	113079723	113080669	-46519114	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	3	983	0	8
1447	2283	194	51	14	chr3	113081573	113082081	-46517702	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	8
1447	3002	74	8	2	chr3	113084074	113084468	-46515315	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1447	278	307	51	80	chr3	113084979	113085117	-46514666	+	RMER12	LTR	ERVK	713	846	-476	8
1447	21712	90	1	29	chr3	113095065	113098108	-46501675	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4623	7581	0	1
1447	1803	169	0	7	chr3	113098108	113098418	-46501365	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	308	-3	1
1447	263	294	134	27	chr3	113108652	113108764	-46491019	-	MLT1I	LTR	MaLR	-279	132	9	1
1447	6170	115	48	11	chr3	113112335	113113281	-46486502	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	3	983	0	1
1447	2283	194	51	14	chr3	113114185	113114693	-46485090	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	1
1448	3002	74	8	2	chr3	113116686	113117080	-46482703	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1448	21751	90	1	29	chr3	113127668	113130711	-46469072	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4623	7581	0	1
1448	1784	172	0	7	chr3	113130711	113131021	-46468762	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	308	-3	1
1448	263	294	134	27	chr3	113141254	113141366	-46458417	-	MLT1I	LTR	MaLR	-279	132	9	1
1448	6170	115	48	11	chr3	113144937	113145883	-46453900	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	3	983	0	1
1448	2283	194	51	14	chr3	113146787	113147295	-46452488	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	1
1448	3002	74	8	2	chr3	113149286	113149680	-46450103	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1448	21737	90	1	29	chr3	113160274	113163317	-46436466	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	4623	7581	0	1
1448	1784	172	0	7	chr3	113163317	113163627	-46436156	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	308	-3	1
1448	263	294	134	27	chr3	113173859	113173971	-46425812	-	MLT1I	LTR	MaLR	-279	132	9	1
1448	6156	115	48	11	chr3	113177542	113178488	-46421295	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	3	983	0	1
1448	2270	194	51	14	chr3	113179392	113179900	-46419883	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	1
1448	374	304	25	59	chr3	113238432	113238551	-46361232	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	115	-244	1
1448	345	238	0	0	chr3	113242304	113242388	-46357395	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2363	2897	2814	1
1448	308	330	102	0	chr3	113243353	113243471	-46356312	+	MTE2b	LTR	MaLR	9	138	-241	2
1448	504	333	75	16	chr3	113243803	113244056	-46355727	+	MT2A	LTR	ERVL	262	529	-4	2
1449	679	197	30	69	chr3	113248495	113248697	-46351086	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	194	-359	2
1449	1335	228	36	23	chr3	113249285	113249586	-46350197	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	233	537	-16	2
1449	882	304	95	3	chr3	113260089	113260383	-46339400	+	ORR1D2	LTR	MaLR	50	370	0	2
1449	2703	94	2	52	chr3	113268269	113268693	-46331090	+	RLTR9D	LTR	ERVK	1	403	0	2
1449	3969	240	90	76	chr3	113268695	113269080	-46330703	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3	386	-2928	2
1449	5761	176	74	54	chr3	113269133	113271188	-46328595	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	293	3448	-3958	2
1449	4074	147	35	26	chr3	113271443	113272314	-46327469	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	3440	4864	-2380	2
1449	665	386	60	38	chr3	113281870	113282317	-46317466	+	MTE-int	LTR	MaLR	1062	1518	-62	2
1449	293	272	113	83	chr3	113282471	113282738	-46317045	+	MTEa	LTR	MaLR	97	377	-2	2
1449	1526	31	5	15	chr3	113289442	113289639	-46310144	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	206	2
1449	2088	30	107	66	chr3	113289627	113289658	-46310125	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-145	330	300	2
1449	2088	30	107	66	chr3	113289836	113290121	-46309662	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-176	299	1	2
1449	952	229	42	81	chr3	113292669	113293113	-46306670	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	15	2
1449	2314	77	60	27	chr3	113299132	113299467	-46300316	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
1449	860	210	63	40	chr3	113303231	113303454	-46296329	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	230	-137	2
1449	4268	166	56	53	chr3	113303637	113303787	-46295996	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	3	175	-1673	2
1449	4268	166	56	53	chr3	113303838	113304675	-46295108	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	176	993	-855	2
1449	1090	198	61	9	chr3	113304818	113305057	-46294726	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1590	1822	-26	2
1449	246	304	10	115	chr3	113306963	113307067	-46292716	+	ORR1B2	LTR	MaLR	216	308	-51	2
1449	941	255	103	78	chr3	113309437	113309807	-46289976	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	2
1449	943	261	129	7	chr3	113315993	113316302	-46283481	+	ORR1D1	LTR	MaLR	26	372	-2	2
1449	2978	73	5	0	chr3	113329276	113329673	-46270110	-	MTB	LTR	MaLR	-1	399	1	3
1449	975	215	200	105	chr3	113335634	113336118	-46263665	-	MT2A	LTR	ERVL	-3	530	1	3
1449	290	186	90	34	chr3	113336169	113336258	-46263525	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1324	639	546	3
1449	3646	171	110	3	chr3	113336273	113337054	-46262729	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-101	5660	4796	3
1449	968	149	149	21	chr3	113337273	113337491	-46262292	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-130	264	1	3
1449	1612	211	18	13	chr3	113337491	113337876	-46261907	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5139	622	236	3
1449	996	69	8	0	chr3	113337877	113338008	-46261775	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5629	132	1	3
1449	572	258	263	7	chr3	113338010	113338203	-46261580	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	294	3
1449	572	258	263	7	chr3	113338355	113338450	-46261333	-	MT2A	LTR	ERVL	-240	293	170	3
1449	1351	110	11	0	chr3	113338453	113338644	-46261139	-	RMER13B	LTR	ERVK	-453	455	263	3
1449	693	208	32	0	chr3	113338629	113338754	-46261029	-	RMER13B	LTR	ERVK	-777	131	3	3
1449	518	200	19	0	chr3	113338756	113338861	-46260922	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3757	3863	-1898	3
1449	1096	268	88	17	chr3	113338950	113339246	-46260537	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	317	-62	3
1449	3311	46	2	0	chr3	113339708	113340103	-46259680	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1449	1445	108	9	0	chr3	113340771	113340983	-46258800	+	ORR1A1	LTR	MaLR	114	327	0	3
1449	9299	143	112	9	chr3	113340983	113342764	-46257019	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	1963	0	3
1449	2004	158	9	9	chr3	113342764	113343110	-46256673	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	3
1449	956	42	0	0	chr3	113343810	113343929	-46255854	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	119	-374	3
1449	45356	19	1	0	chr3	113343929	113349283	-46250500	+	MERVL-int	LTR	ERVL	10	5371	-114	3
1449	350	125	26	53	chr3	113349283	113349359	-46250424	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	3
1449	302	0	0	0	chr3	113349359	113349397	-46250386	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
1449	3668	20	121	0	chr3	113349397	113349837	-46249946	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1449	4184	159	124	72	chr3	113350248	113351219	-46248564	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	3	3
1449	664	309	48	10	chr3	113355182	113355391	-46244392	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	149	3
1449	2139	114	6	63	chr3	113357440	113357787	-46241996	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1449	2536	165	48	11	chr3	113359300	113359778	-46240005	-	RLTR28	LTR	ERVL	-28	496	1	3
1449	2764	184	43	2	chr3	113361581	113362088	-46237695	-	RMER15	LTR	ERVL	-45	530	3	3
1449	1637	234	38	0	chr3	113363155	113363501	-46236282	-	MTC	LTR	MaLR	-62	359	1	3
1449	414	256	142	68	chr3	113367279	113367484	-46232299	+	RMER2	LTR	ERV1	331	550	-17	3
1449	468	265	109	48	chr3	113368830	113369060	-46230723	-	RLTR16	LTR	ERVK	-261	244	1	3
1449	677	225	102	57	chr3	113369192	113369464	-46230319	+	MT2A	LTR	ERVL	322	601	0	3
1449	2691	209	22	68	chr3	113369468	113370178	-46229605	+	MTC-int	LTR	MaLR	5	799	-459	3
1449	2018	156	3	19	chr3	113370490	113370855	-46228928	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1450	243	234	0	15	chr3	113381149	113381214	-46218569	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-6	554	491	3
1450	733	352	66	52	chr3	113381320	113381743	-46218040	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-6	621	193	3
1450	1998	168	64	41	chr3	113386116	113386506	-46213277	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-1	406	8	3
1450	2990	57	20	23	chr3	113406067	113406464	-46193319	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1450	2579	178	92	85	chr3	113407350	113408033	-46191750	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	1	4
1450	1600	21	0	0	chr3	113419939	113420129	-46179654	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	304	493	0	4
1450	342	381	85	41	chr3	113439768	113440039	-46159744	+	MLT1I	LTR	MaLR	112	394	-17	4
1450	657	221	43	7	chr3	113440981	113441122	-46158661	+	MT2A	LTR	ERVL	1	146	-387	4
1450	616	301	44	55	chr3	113441130	113441401	-46158382	+	MT2A	LTR	ERVL	279	546	-55	4
1450	3423	169	68	61	chr3	113455080	113455800	-46143983	+	RLTR21	LTR	ERVK	7	731	-841	4
1450	2186	189	153	43	chr3	113456265	113456965	-46142818	+	RLTR21	LTR	ERVK	730	1449	-123	4
1450	827	161	20	13	chr3	113458010	113458161	-46141622	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	244	395	-12	4
1450	468	229	72	96	chr3	113461243	113461490	-46138293	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	658	4
1450	1409	232	76	119	chr3	113466269	113466767	-46133016	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-12	894	379	4
1450	1409	198	64	112	chr3	113467273	113467693	-46132090	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-419	390	5	4
1450	2072	141	3	47	chr3	113468735	113469077	-46130706	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-2	327	1	4
1450	705	243	199	106	chr3	113478909	113479042	-46120741	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	177	4
1450	705	243	199	106	chr3	113479129	113479206	-46120577	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-198	176	111	4
1450	705	243	199	106	chr3	113479314	113479432	-46120351	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-264	110	7	4
1450	326	216	56	11	chr3	113480320	113480409	-46119374	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	283	5
1450	321	400	27	23	chr3	113480554	113480774	-46119009	+	RMER15-int	LTR	ERVL	144	364	-4635	5
1450	668	217	65	7	chr3	113480782	113480859	-46118924	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-10	568	492	5
1450	668	217	65	7	chr3	113480903	113480964	-46118819	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-87	491	423	5
1450	1409	187	17	15	chr3	113480955	113481280	-46118503	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-218	316	1	5
1450	1415	318	57	34	chr3	113481290	113481938	-46117845	+	RMER15-int	LTR	ERVL	383	1045	-3954	5
1450	356	241	38	0	chr3	113482301	113482380	-46117403	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1285	1366	-3633	5
1450	1038	222	59	17	chr3	113484258	113484496	-46115287	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	137	5
1450	2130	116	19	3	chr3	113484908	113485228	-46114555	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	327	0	5
1450	1174	176	20	27	chr3	113485296	113485633	-46114150	+	RMER10A	LTR	ERVL	55	429	-13	5
1450	658	242	216	5	chr3	113485968	113486176	-46113607	+	MTD	LTR	MaLR	166	417	-2	5
1450	597	277	137	77	chr3	113487073	113487386	-46112397	+	RLTR28B	LTR	ERVL	139	470	-11	5
1450	1193	155	5	0	chr3	113487423	113487617	-46112166	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	195	-134	5
1450	3821	126	49	189	chr3	113487614	113488581	-46111202	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1133	1963	0	5
1450	1766	155	36	59	chr3	113488581	113488918	-46110865	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1450	325	321	91	45	chr3	113491744	113491920	-46107863	+	MER21B	LTR	ERV1	425	608	-255	5
1450	321	308	85	19	chr3	113495047	113495164	-46104619	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-59	536	406	5
1450	3170	161	21	30	chr3	113497323	113497885	-46101898	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	0	557	1	5
1450	1014	318	43	32	chr3	113500066	113500438	-46099345	-	MTE2b	LTR	MaLR	-23	356	1	1
1450	2245	265	98	77	chr3	113503533	113504416	-46095367	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	1
1450	1695	194	35	77	chr3	113504527	113504912	-46094871	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1450	1027	228	98	77	chr3	113506784	113507019	-46092764	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	228	-146	1
1450	1027	228	98	77	chr3	113507069	113507199	-46092584	+	ORR1D1	LTR	MaLR	229	374	0	1
1451	2096	95	49	3	chr3	113508653	113508958	-46090825	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	2
1451	2308	74	114	6	chr3	113510740	113511092	-46088691	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	2
1451	1809	165	79	0	chr3	113511649	113511989	-46087794	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1451	656	161	388	6	chr3	113519869	113520082	-46079701	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	289	-448	4
1451	290	257	115	35	chr3	113521328	113521441	-46078342	+	MLT1A1	LTR	MaLR	269	390	-18	4
1451	426	297	105	86	chr3	113523861	113524185	-46075598	-	MTEb	LTR	MaLR	-43	336	7	5
1451	1421	368	77	32	chr3	113524194	113524939	-46074844	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-2	1578	801	5
1451	265	334	122	27	chr3	113525199	113525459	-46074324	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-1044	465	216	5
1451	2401	167	10	0	chr3	113531876	113532283	-46067500	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	3	6
1451	374	314	33	0	chr3	113545609	113545730	-46054053	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	130	-235	7
1451	1635	141	8	104	chr3	113548155	113548511	-46051272	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	8
1451	1732	193	75	3	chr3	113548993	113549351	-46050432	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-10	384	1	8
1451	410	315	67	12	chr3	113575678	113575842	-46023941	+	MLT1B	LTR	MaLR	191	363	-27	1
1451	239	247	155	41	chr3	113579211	113579308	-46020475	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-297	111	4	1
1451	1774	251	10	73	chr3	113580271	113580790	-46018993	+	RMER19C	LTR	ERVK	126	611	0	1
1451	769	235	216	25	chr3	113584385	113584560	-46015223	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	169	1
1451	769	235	216	25	chr3	113584684	113584827	-46014956	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-216	168	6	1
1451	1413	202	36	19	chr3	113588402	113588740	-46011043	-	RMER19A	LTR	ERVK	-361	376	1	1
1451	1202	234	88	30	chr3	113589703	113590034	-46009749	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	25	1
1451	477	337	92	24	chr3	113593407	113593744	-46006039	+	MLT1C	LTR	MaLR	63	422	-45	1
1451	272	307	143	0	chr3	113602770	113602910	-45996873	+	RMER20B	LTR	ERVK	180	339	-288	1
1451	4374	59	11	14	chr3	113603753	113604319	-45995464	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	1
1451	2863	193	28	21	chr3	113608052	113608670	-45991113	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-887	622	1	1
1451	1331	223	62	37	chr3	113608670	113609024	-45990759	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	5	1
1451	1307	236	78	46	chr3	113609024	113609353	-45990430	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-18	366	25	1
1451	247	289	94	19	chr3	113609721	113609827	-45989956	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	295	1
1451	570	264	10	73	chr3	113610063	113610255	-45989528	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	240	1
1451	419	292	44	0	chr3	113610388	113610501	-45989282	-	MTD	LTR	MaLR	-51	368	251	1
1451	396	299	0	0	chr3	113610495	113610592	-45989191	+	MTD	LTR	MaLR	227	323	-96	1
1451	381	221	65	28	chr3	113615593	113615700	-45984083	-	RLTR17	LTR	ERVK	-74	618	508	1
1451	1414	222	12	30	chr3	113615698	113616067	-45983716	-	RLTR17	LTR	ERVK	-251	441	106	1
1451	926	259	67	56	chr3	113618915	113619083	-45980700	-	RMER17C	LTR	ERVK	-33	377	219	1
1451	926	259	67	56	chr3	113619154	113619358	-45980425	-	RMER17C	LTR	ERVK	-192	218	1	1
1451	2513	163	129	7	chr3	113619360	113619933	-45979850	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2	3236	2594	1
1451	5429	170	45	61	chr3	113620911	113622347	-45977436	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-644	2594	1278	1
1451	232	365	88	68	chr3	113622347	113622494	-45977289	-	LTR88c	LTR	Genie?	-160	702	553	1
1451	494	285	76	80	chr3	113622673	113622924	-45976859	-	RLTR16	LTR	ERVK	-232	296	32	1
1451	571	170	15	22	chr3	113622938	113623045	-45976738	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-1992	1246	1100	1
1451	1808	243	49	87	chr3	113624820	113625477	-45974306	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-2606	632	1	1
1451	1221	176	11	140	chr3	113625549	113625986	-45973797	-	RMER17C	LTR	ERVK	-29	381	1	1
1451	607	251	335	16	chr3	113626400	113626641	-45973142	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	58	1
1451	873	297	115	6	chr3	113630518	113630857	-45968926	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	1	1
1451	991	244	45	24	chr3	113633135	113633540	-45966243	-	MT2A	LTR	ERVL	-74	459	2	1
1451	1227	270	27	24	chr3	113637728	113637905	-45961878	-	MTEb	LTR	MaLR	-45	334	162	2
1451	1227	270	27	24	chr3	113638268	113638420	-45961363	-	MTEb	LTR	MaLR	-218	161	5	2
181	353	246	138	42	chr3	113639409	113639566	-45960217	-	RMER13A	LTR	ERVK	-389	519	320	2
1452	391	316	39	54	chr3	113639621	113639744	-45960039	-	RMER13A	LTR	ERVK	-659	201	80	2
1452	391	316	39	54	chr3	113640124	113640204	-45959579	-	RMER13A	LTR	ERVK	-781	79	2	2
1452	258	409	47	0	chr3	113643791	113643940	-45955843	-	LTR33	LTR	ERVL	-2	513	358	2
1452	229	305	61	0	chr3	113644116	113644198	-45955585	-	LTR33	LTR	ERVL	-403	112	26	2
1452	313	289	29	82	chr3	113644727	113644826	-45954957	+	MLT2B2	LTR	ERVL	401	499	-63	2
1452	313	289	29	82	chr3	113644942	113645012	-45954771	+	MLT2B2	LTR	ERVL	500	561	-1	2
1452	269	373	196	26	chr3	113650320	113650590	-45949193	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-3	621	306	2
1452	355	250	0	59	chr3	113659058	113659160	-45940623	-	RMER12	LTR	ERVK	-469	853	758	2
1452	6193	48	15	11	chr3	113660721	113660851	-45938932	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	676	2
1452	2830	78	10	5	chr3	113660851	113661237	-45938546	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	2
1452	6193	48	15	11	chr3	113661237	113661911	-45937872	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-133	675	1	2
1452	4097	65	2	2	chr3	113662131	113662643	-45937140	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	2
1452	1823	164	40	65	chr3	113665454	113665851	-45933932	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2670	3056	-2705	2
1452	1024	188	15	30	chr3	113665851	113666054	-45933729	+	MTC	LTR	MaLR	222	421	0	2
1452	414	246	33	16	chr3	113692227	113692311	-45907472	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	190	2
1452	414	246	33	16	chr3	113692380	113692476	-45907307	-	RMER17C	LTR	ERVK	-221	189	93	2
1452	402	320	60	20	chr3	113693119	113693368	-45906415	-	MER57D	LTR	ERV1	0	411	153	2
1452	572	67	100	0	chr3	113698520	113698610	-45901173	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-485	99	1	3
1452	396	386	36	44	chr3	113699986	113700308	-45899475	+	MTE2a	LTR	MaLR	16	365	-14	3
1452	2572	185	65	20	chr3	113704874	113705425	-45894358	+	RMER6C	LTR	ERVK	115	690	0	3
1452	470	180	131	0	chr3	113714424	113714546	-45885237	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	2733	2841	-1	3
1452	2188	132	111	3	chr3	113714546	113714934	-45884849	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	430	-11	3
1452	336	311	128	29	chr3	113716826	113716998	-45882785	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	3	191	-1218	3
1452	2404	189	182	19	chr3	113717078	113717673	-45882110	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	3
1452	239	293	202	0	chr3	113718025	113718124	-45881659	-	MER21B	LTR	ERV1	-316	547	429	3
1452	1412	243	34	18	chr3	113718330	113718715	-45881068	+	MTD	LTR	MaLR	29	419	0	3
1452	1280	235	122	39	chr3	113718909	113719294	-45880489	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	3
1452	2047	221	34	38	chr3	113719850	113720326	-45879457	+	RMER19C	LTR	ERVK	138	611	0	3
1452	1981	157	22	30	chr3	113720451	113720819	-45878964	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	367	0	3
1452	859	142	14	0	chr3	113723045	113723193	-45876590	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	0	332	183	3
1452	10409	54	36	3	chr3	113723193	113724694	-45875089	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-6149	1531	76	3
1452	1019	174	38	6	chr3	113724713	113724935	-45874848	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-149	236	1	3
1452	422	249	45	90	chr3	113746574	113746751	-45853032	-	MT2B	LTR	ERVL	-325	276	108	3
1452	1052	255	93	42	chr3	113759172	113759528	-45840255	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1453	585	295	118	24	chr3	113780685	113781018	-45818765	+	MTD	LTR	MaLR	10	393	-14	4
1453	551	335	142	57	chr3	113784357	113784898	-45814885	-	MTE-int	LTR	MaLR	-41	1539	953	4
1453	290	351	60	26	chr3	113785071	113785188	-45814595	-	MLT-int	LTR	MaLR	-905	830	710	4
1453	662	370	60	3	chr3	113791671	113791988	-45807795	-	MTEa	LTR	MaLR	-17	362	28	4
1453	582	244	32	107	chr3	113806553	113806649	-45793134	-	RMER17C	LTR	ERVK	-34	376	277	4
1453	582	244	32	107	chr3	113806824	113807130	-45792653	-	RMER17C	LTR	ERVK	-134	276	4	4
1453	1463	239	67	26	chr3	113824752	113825143	-45774640	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	5	4
1453	3918	147	40	6	chr3	113825748	113826404	-45773379	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	1	4
1453	1251	268	67	22	chr3	113832390	113832791	-45766992	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1453	272	321	159	78	chr3	113836733	113836990	-45762793	-	MLT1C	LTR	MaLR	-3	464	187	5
1453	1723	160	101	0	chr3	113850924	113850946	-45748837	-	RMER6C	LTR	ERVK	-318	372	348	5
1453	1723	160	101	0	chr3	113850994	113851309	-45748474	-	RMER6C	LTR	ERVK	-343	347	2	5
1453	279	317	91	8	chr3	113862128	113862249	-45737534	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-230	135	5	5
1453	1038	212	100	61	chr3	113865683	113866044	-45733739	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	3	5
1453	982	300	43	37	chr3	113868869	113869243	-45730540	-	MTD	LTR	MaLR	-26	393	18	5
1453	1604	170	48	81	chr3	113891051	113891409	-45708374	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	5
1453	251	277	35	24	chr3	113894901	113894986	-45704797	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-8	400	315	5
1453	2148	197	48	15	chr3	113898467	113898946	-45700837	-	RLTR28	LTR	ERVL	-15	509	15	5
1454	345	350	71	52	chr3	113907385	113907695	-45692088	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	42	5
1454	348	279	23	11	chr3	113910169	113910256	-45689527	-	MLT1C	LTR	MaLR	-82	385	298	5
1454	2628	190	11	17	chr3	113928451	113928981	-45670802	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	6
1454	886	321	55	85	chr3	113929774	113930302	-45669481	-	MT2A	LTR	ERVL	-19	514	3	6
1454	262	301	58	22	chr3	113932295	113932434	-45667349	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	287	6
1454	236	304	75	12	chr3	113945985	113946065	-45653718	+	MLT1E2	LTR	MaLR	374	458	-169	6
1454	3630	111	38	14	chr3	113946077	113946628	-45653155	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	6
1454	3553	207	63	38	chr3	113947450	113948380	-45651403	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	5	6
1454	263	286	78	78	chr3	113959782	113959949	-45639834	+	RMER2	LTR	ERV1	334	500	-67	6
1454	1384	285	20	6	chr3	113960029	113960385	-45639398	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	18	6
1454	916	223	264	8	chr3	113962011	113962412	-45637371	+	RLTR12B	LTR	ERVK	3	506	-22	6
1454	1298	261	85	0	chr3	113974972	113975302	-45624481	+	ORR1D1	LTR	MaLR	17	374	0	6
1454	397	387	146	14	chr3	113985271	113985546	-45614237	+	LTR16A1	LTR	ERVL	146	456	0	6
1454	513	294	68	18	chr3	113986040	113986203	-45613580	+	ORR1E	LTR	MaLR	24	194	-165	6
1454	295	376	128	49	chr3	113986791	113987199	-45612584	-	LTR16A	LTR	ERVL	0	451	12	6
1454	2817	234	16	52	chr3	113987714	113988564	-45611219	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	1919	2738	-104	6
1454	3132	154	27	23	chr3	113988564	113989122	-45610661	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	2	561	0	6
1454	397	381	26	56	chr3	113996617	113996923	-45602860	-	MER21B	LTR	ERV1	-145	718	422	6
1454	958	204	39	211	chr3	113998067	113998575	-45601208	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	428	-2	7
1454	296	328	66	84	chr3	114023335	114023548	-45576235	-	RMER15	LTR	ERVL	-34	541	333	3
1455	388	340	95	51	chr3	114032688	114033079	-45566704	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	1	4
1455	1851	246	126	78	chr3	114034491	114035262	-45564521	+	RLTR40	LTR	ERVK	2	809	-8	5
1455	479	343	61	90	chr3	114043587	114043994	-45555789	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	3	6
1455	609	90	119	8	chr3	114053594	114053728	-45546055	-	RMER17B	LTR	ERVK	-498	460	312	8
1455	2577	152	38	9	chr3	114059527	114059952	-45539831	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	301	9
1455	542	244	95	17	chr3	114061799	114061978	-45537805	+	MTD	LTR	MaLR	227	419	0	9
1455	498	324	52	16	chr3	114063697	114063984	-45535799	-	MER34	LTR	ERV1	-275	296	1	1
1455	328	297	70	76	chr3	114064324	114064481	-45535302	+	RLTR24	LTR	ERV1	6	161	-368	1
1455	298	342	30	9	chr3	114067464	114067612	-45532171	-	MER34A	LTR	ERV1	-7	580	418	1
1455	1133	313	24	34	chr3	114067655	114068050	-45531733	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	395	-24	1
1455	987	306	24	27	chr3	114068071	114068404	-45531379	-	MER34A	LTR	ERV1	-230	341	10	1
1455	2338	193	41	137	chr3	114069373	114070017	-45529766	-	RMER6C	LTR	ERVK	-6	684	111	1
1455	3410	23	2	10	chr3	114070017	114070416	-45529367	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1455	2338	193	41	137	chr3	114070416	114070528	-45529255	-	RMER6C	LTR	ERVK	-580	110	1	1
1455	455	300	21	58	chr3	114072859	114072995	-45526788	-	MLT1B	LTR	MaLR	-206	184	46	1
1455	455	300	21	58	chr3	114073127	114073181	-45526602	-	MLT1B	LTR	MaLR	-345	45	1	1
1455	1316	225	154	9	chr3	114077931	114078249	-45521534	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	364	-14	1
1455	3020	196	22	11	chr3	114078264	114079262	-45520521	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1	1509	0	1
1455	1231	202	194	7	chr3	114079283	114079592	-45520191	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	367	0	1
1455	3100	71	5	0	chr3	114087324	114087718	-45512065	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1455	2746	191	17	38	chr3	114089065	114089259	-45510524	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	388	1
1455	2993	70	19	14	chr3	114089259	114089678	-45510105	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	1
1455	2746	191	17	38	chr3	114089678	114090061	-45509722	-	RMER4B	LTR	ERVK	-198	387	20	1
1455	244	204	0	22	chr3	114104665	114104710	-45495073	-	ORR1E	LTR	MaLR	-315	44	1	1
1455	360	372	65	34	chr3	114106031	114106382	-45493401	+	MLT-int	LTR	MaLR	144	505	-1230	1
1455	248	306	102	37	chr3	114106713	114106774	-45493009	+	MTE2a	LTR	MaLR	223	291	-130	1
1455	410	266	98	17	chr3	114106884	114106948	-45492835	+	MTE2a	LTR	MaLR	247	360	-61	1
1455	410	264	98	16	chr3	114107004	114107064	-45492719	+	MTE2a	LTR	MaLR	320	379	0	1
1455	398	297	42	42	chr3	114114249	114114393	-45485390	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	276	1
1455	1323	249	36	91	chr3	114115071	114115512	-45484271	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	1
1455	2365	172	49	39	chr3	114118867	114119014	-45480769	-	RLTR19	LTR	ERVK	-4	495	334	1
1455	2365	172	49	39	chr3	114119052	114119394	-45480389	-	RLTR19	LTR	ERVK	-166	333	1	1
1455	256	350	21	0	chr3	114122109	114122206	-45477577	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-66	299	201	1
1455	610	279	38	0	chr3	114125870	114126028	-45473755	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-49	316	153	2
1455	2557	49	52	0	chr3	114127598	114127926	-45471857	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	0	345	1	2
1455	2396	108	119	12	chr3	114133440	114133869	-45465914	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
1455	1708	163	0	104	chr3	114143078	114143442	-45456341	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	2
1455	2621	185	75	29	chr3	114146722	114147380	-45452403	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	1	2
1455	555	287	77	18	chr3	114150564	114150784	-45448999	-	RMER20B	LTR	ERVK	-215	412	180	2
1455	2722	307	67	25	chr3	114150971	114151094	-45448689	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-2	6917	6798	2
1455	2722	307	67	25	chr3	114151122	114151998	-45447785	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-122	6797	5878	2
1455	1826	311	14	4	chr3	114152393	114152906	-45446877	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-3455	3464	2947	2
1455	1594	216	146	82	chr3	114152954	114153504	-45446279	-	RMER19B	LTR	ERVK	-2	900	316	2
1456	753	242	76	20	chr3	114165295	114165479	-45434304	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	187	2
1456	753	242	76	20	chr3	114165512	114165525	-45434258	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-198	186	174	2
1456	551	261	40	60	chr3	114165878	114166078	-45433705	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-188	196	1	2
1456	412	356	121	9	chr3	114170021	114170245	-45429538	-	MER92B	LTR	ERV1	-363	273	25	2
1456	386	327	104	21	chr3	114171553	114171816	-45427967	-	MER77	LTR	ERVL	-66	541	218	2
1456	258	368	50	37	chr3	114171884	114172045	-45427738	-	MER77	LTR	ERVL	-441	166	4	2
1456	738	228	19	12	chr3	114174856	114175016	-45424767	+	RMER13B	LTR	ERVK	2	162	-746	2
1456	6332	59	28	18	chr3	114175016	114175862	-45423921	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	2
1456	49020	19	8	4	chr3	114175870	114177665	-45422118	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-10	5798	4010	2
1456	49020	19	8	4	chr3	114177696	114181672	-45418111	-	ETnERV3-int	LTR	ERVK	-1799	4009	4	2
1456	6332	59	28	18	chr3	114181674	114182520	-45417263	-	RLTR13A	LTR	ERVK	0	855	1	2
1456	248	286	0	14	chr3	114182520	114182591	-45417192	+	RLTR26	LTR	ERVK	202	271	-371	2
1456	1705	220	3	18	chr3	114182583	114182921	-45416862	+	RMER13B	LTR	ERVK	181	513	-395	2
1456	1938	168	117	47	chr3	114184521	114185009	-45414774	-	RMER6C	LTR	ERVK	-11	679	158	2
1456	611	174	110	29	chr3	114185266	114185402	-45414381	-	RMER6C	LTR	ERVK	-543	147	1	2
1456	1260	169	132	73	chr3	114189653	114190024	-45409759	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	1	2
1456	336	337	40	40	chr3	114202957	114203225	-45396558	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2280	2542	-2943	3
1456	397	326	66	27	chr3	114205241	114205626	-45394157	+	MLT1-int	LTR	MaLR	4	524	-847	3
1456	2622	163	32	45	chr3	114207017	114207551	-45392232	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	3
1456	513	231	80	80	chr3	114213276	114213612	-45386171	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	3
1456	232	308	26	80	chr3	114214539	114214652	-45385131	+	MLT1F2	LTR	MaLR	50	156	-404	3
1456	500	136	12	0	chr3	114216047	114216113	-45383670	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	320	3
1456	5732	224	64	17	chr3	114216113	114217409	-45382374	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1359	-150	3
1456	5732	224	64	17	chr3	114218649	114218777	-45381006	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1360	1495	-14	3
1456	2066	183	27	13	chr3	114218776	114219152	-45380631	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	385	-9	3
1456	1297	144	38	13	chr3	114219933	114220172	-45379611	-	RMER6C	LTR	ERVK	-372	318	74	3
1456	598	158	0	0	chr3	114223674	114223775	-45376008	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3146	3246	-2891	3
1456	1013	264	23	23	chr3	114225679	114225732	-45374051	-	RMER15	LTR	ERVL	-22	553	501	3
1456	3366	35	2	0	chr3	114225732	114226127	-45373656	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1456	1013	264	23	23	chr3	114226127	114226329	-45373454	-	RMER15	LTR	ERVL	-75	500	298	3
1456	677	271	120	50	chr3	114247917	114248259	-45351524	-	RMER20B	LTR	ERVK	-214	413	48	3
1456	1482	131	7	36	chr3	114250134	114250412	-45349371	+	RMER17A2	LTR	ERVK	7	276	-630	3
1456	280	185	19	0	chr3	114253654	114253708	-45346075	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	474	3
1456	2656	183	29	18	chr3	114258293	114258428	-45341355	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-34	494	362	3
1456	3077	56	10	0	chr3	114258428	114258820	-45340963	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1456	2656	183	29	18	chr3	114258820	114259173	-45340610	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-167	361	1	3
1456	410	330	72	61	chr3	114276951	114277285	-45322498	+	MLT1F2	LTR	MaLR	75	394	-175	4
1456	526	296	37	5	chr3	114278279	114278469	-45321314	-	MER67C	LTR	ERV1	0	711	516	4
1456	318	277	96	64	chr3	114278610	114278720	-45321063	-	RMER17C	LTR	ERVK	-183	227	118	4
1456	318	277	96	64	chr3	114278895	114278919	-45320864	-	RMER17C	LTR	ERVK	-293	117	87	4
1456	318	277	96	64	chr3	114278991	114279074	-45320709	-	RMER17C	LTR	ERVK	-324	86	2	4
1456	367	310	120	23	chr3	114279084	114279259	-45320524	-	MER67C	LTR	ERV1	-229	482	291	4
1456	2359	132	26	21	chr3	114279360	114279778	-45320005	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-2	420	1	4
1456	779	310	27	21	chr3	114280004	114280273	-45319510	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	276	-108	4
1456	257	281	21	43	chr3	114287707	114287800	-45311983	+	MLT1C	LTR	MaLR	318	408	-59	4
1456	1994	103	33	208	chr3	114290774	114291350	-45308433	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	475	1	4
1456	6138	42	3	12	chr3	114291350	114292103	-45307680	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5736	4
1456	2271	54	0	0	chr3	114292102	114292380	-45307403	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	4
1456	3452	69	4	16	chr3	114292380	114292958	-45306825	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	4
1456	234	321	0	0	chr3	114292958	114293011	-45306772	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	223	4
1456	1028	104	25	103	chr3	114293011	114293214	-45306569	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6286	195	9	4
1456	2377	68	15	27	chr3	114293215	114293546	-45306237	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	4
1457	5989	103	60	52	chr3	114295004	114296062	-45303721	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	782	4
1457	5537	79	47	51	chr3	114298854	114299719	-45300064	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-945	863	2	4
1457	1927	121	17	7	chr3	114303866	114304165	-45295618	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-25	302	1	4
1457	1212	270	81	29	chr3	114314432	114314851	-45284932	-	BGLII_B	LTR	ERVK	0	441	1	4
1457	622	262	226	44	chr3	114317905	114318248	-45281535	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	4
1457	321	312	62	8	chr3	114321534	114321663	-45278120	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	424	4
1457	532	274	75	29	chr3	114330947	114331120	-45268663	+	MTD	LTR	MaLR	17	197	-222	4
1457	378	334	216	46	chr3	114338273	114338643	-45261140	+	LTR89	LTR	ERVL?	214	646	-233	4
1457	1012	222	74	99	chr3	114338734	114339128	-45260655	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1457	1525	269	60	10	chr3	114339715	114340113	-45259670	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	4
1457	645	335	116	12	chr3	114340291	114340626	-45259157	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	188	4
1457	401	369	37	54	chr3	114344608	114344967	-45254816	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	1	4
1457	475	238	67	84	chr3	114351439	114351577	-45248206	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-354	455	314	5
1457	475	238	67	84	chr3	114351620	114351779	-45248004	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-496	313	164	5
1457	3815	56	44	12	chr3	114356104	114356607	-45243176	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	5
1457	541	290	134	5	chr3	114366437	114366638	-45233145	+	ORR1E	LTR	MaLR	22	248	-111	5
1457	1520	148	122	10	chr3	114378996	114379290	-45220493	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-5	327	1	5
1457	2346	159	19	5	chr3	114381793	114382215	-45217568	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	428	-381	5
1457	1097	98	109	0	chr3	114384490	114384664	-45215119	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-616	193	1	5
1457	521	213	40	123	chr3	114385115	114385285	-45214498	+	MT2B	LTR	ERVL	91	259	-325	5
1457	1233	175	55	12	chr3	114385579	114385888	-45213895	+	RMER6A	LTR	ERVK	348	690	0	5
1457	3409	164	95	34	chr3	114386493	114387145	-45212638	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	5
1457	3281	36	3	0	chr3	114392363	114392747	-45207036	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	1	385	0	5
1457	366	312	58	77	chr3	114400986	114401194	-45198589	-	LTR33	LTR	ERVL	-20	495	292	5
1457	813	304	107	58	chr3	114410137	114410398	-45189385	+	RLTR26	LTR	ERVK	13	300	-342	5
1457	813	297	116	55	chr3	114410426	114410577	-45189206	+	RLTR26	LTR	ERVK	301	452	-190	5
1458	1413	160	14	130	chr3	114429280	114429633	-45170150	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	11	322	0	5
1458	720	163	21	43	chr3	114439165	114439306	-45160477	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	671	6
1458	569	152	40	0	chr3	114439275	114439374	-45160409	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	706	808	0	6
1458	729	375	65	17	chr3	114444699	114445111	-45154672	+	MER54A	LTR	ERVL	467	898	-3	6
1458	330	361	75	56	chr3	114449973	114450225	-45149558	+	ORR1E	LTR	MaLR	82	338	-21	6
1458	510	320	133	25	chr3	114450681	114450921	-45148862	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	100	6
1458	255	286	64	13	chr3	114451185	114451263	-45148520	+	RMER15	LTR	ERVL	392	473	-102	6
1458	694	254	27	33	chr3	114455137	114455320	-45144463	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-191	183	2	6
1458	3005	224	76	66	chr3	114461166	114462047	-45137736	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	6
1458	1481	167	92	0	chr3	114465421	114465714	-45134069	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	320	-12	6
1458	230	352	72	77	chr3	114469532	114469726	-45130057	-	MLT1C	LTR	MaLR	-24	443	251	6
1458	392	270	24	80	chr3	114474568	114474693	-45125090	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-13	1015	898	6
1458	731	257	60	39	chr3	114474802	114475085	-45124698	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-963	1000	712	6
1458	1168	197	59	63	chr3	114475038	114475292	-45124491	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	35	6
1458	787	214	117	55	chr3	114475105	114475396	-45124387	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1156	807	499	6
1458	2256	219	24	71	chr3	114475323	114475869	-45123914	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-583	520	1	6
1458	665	299	15	24	chr3	114476622	114476828	-45122955	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	171	6
1458	832	224	27	43	chr3	114476881	114477068	-45122715	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-188	186	3	6
1458	377	367	108	36	chr3	114480334	114480712	-45119071	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-108	446	55	6
1458	3126	63	2	2	chr3	114480712	114481108	-45118675	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1458	377	361	110	36	chr3	114481108	114481137	-45118646	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-466	54	16	6
1458	2315	58	78	3	chr3	114481137	114481453	-45118330	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	728	6
1458	3640	74	2	8	chr3	114482159	114482636	-45117147	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-1	474	1	6
1458	1108	208	71	77	chr3	114488092	114488273	-45111510	-	RMER6C	LTR	ERVK	-1	689	509	6
1458	1108	208	71	77	chr3	114488380	114488521	-45111262	-	RMER6C	LTR	ERVK	-182	508	369	6
1458	500	170	49	131	chr3	114488583	114488705	-45111078	-	MT2B	LTR	ERVL	-309	292	181	6
1458	254	79	26	0	chr3	114488715	114488753	-45111030	-	RMER6D	LTR	ERVK	-681	39	1	6
1458	280	349	147	45	chr3	114490875	114491073	-45108710	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1505	230	13	6
1458	2594	222	28	26	chr3	114494524	114495101	-45104682	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	1	7
1458	247	296	132	111	chr3	114495743	114495933	-45103850	+	LTR41	LTR	ERVL	121	314	-454	7
1458	305	336	26	17	chr3	114496285	114496400	-45103383	+	LTR41	LTR	ERVL	532	647	-121	7
1458	2808	185	35	58	chr3	114498880	114499505	-45100278	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	7
1458	653	306	77	5	chr3	114503809	114504016	-45095767	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	149	7
1458	456	314	16	14	chr3	114504535	114504709	-45095074	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-191	187	3	7
1458	506	276	125	51	chr3	114510728	114510984	-45088799	+	LTR73	LTR	ERV1	30	304	-268	2
1458	2144	157	190	51	chr3	114511257	114511863	-45087920	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	2
1458	1188	316	59	11	chr3	114513319	114513780	-45086003	+	RMER5	LTR	ERV1	50	532	-2	3
1458	429	205	119	52	chr3	114515871	114516005	-45083778	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	469	3
1458	2838	178	74	45	chr3	114517134	114517739	-45082044	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	623	-405	4
1458	3621	132	21	70	chr3	114518905	114519694	-45080089	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	4
1458	399	173	35	47	chr3	114532887	114532972	-45066811	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	478	6
1458	4650	113	16	36	chr3	114536061	114536885	-45062898	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	3	6
1458	382	318	87	8	chr3	114546010	114546137	-45053646	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	137	-242	7
1458	241	349	76	49	chr3	114546137	114546194	-45053589	+	MT2A	LTR	ERVL	1	189	-344	7
1458	1469	202	79	21	chr3	114550347	114550727	-45049056	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	0	8959	8558	8
1458	1578	201	119	17	chr3	114550793	114551270	-45048513	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-721	5829	5304	8
1458	430	333	44	17	chr3	114551270	114551450	-45048333	-	RMER4A	LTR	ERVK	-27	439	255	8
1458	710	309	47	76	chr3	114551450	114551595	-45048188	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1416	5134	5000	8
1458	710	271	68	98	chr3	114552124	114552419	-45047364	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1551	4999	4843	8
1458	1317	285	55	1	chr3	114552459	114552972	-45046811	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4419	4540	4028	8
1459	511	211	27	47	chr3	114560217	114560366	-45039417	-	RLTR15	LTR	ERVK	-213	146	1	9
1459	607	198	9	0	chr3	114560449	114560555	-45039228	+	MTD	LTR	MaLR	92	198	-221	9
1459	1731	123	30	240	chr3	114566513	114567114	-45032669	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	9
1459	293	96	77	64	chr3	114567116	114567194	-45032589	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3	81	-1906	9
1459	276	114	0	0	chr3	114567206	114567250	-45032533	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	13	56	-1931	9
1459	463	186	19	38	chr3	114567251	114567357	-45032426	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	20	123	-6358	9
1459	227	267	0	0	chr3	114567357	114567402	-45032381	+	RLTR27	LTR	ERVK	231	275	-34	9
1459	832	97	0	9	chr3	114567402	114567517	-45032266	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	145	258	-7323	9
1459	255	227	0	0	chr3	114567520	114567564	-45032219	+	RLTR27	LTR	ERVK	232	275	-34	9
1459	832	97	0	9	chr3	114567564	114567679	-45032104	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	145	258	-7323	1
1459	227	273	0	0	chr3	114567682	114567726	-45032057	+	RLTR27	LTR	ERVK	232	275	-34	9
1459	237	327	0	0	chr3	114567752	114567807	-45031976	+	RLTR27	LTR	ERVK	221	275	-34	9
1459	3497	63	1	16	chr3	114567807	114568382	-45031401	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	659	-5822	1
1459	2173	72	0	0	chr3	114568385	114568663	-45031120	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	1
1459	6231	32	4	12	chr3	114568662	114569412	-45030371	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6479	-2	1
1459	1701	106	52	260	chr3	114569414	114570014	-45029769	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	1
1459	1803	115	16	32	chr3	114571045	114571359	-45028424	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-132	309	1	1
1459	698	157	102	0	chr3	114571359	114571525	-45028258	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	2144	1
1459	1193	194	80	40	chr3	114576314	114576456	-45023327	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1536	312	154	1
1459	1193	194	80	40	chr3	114576509	114576666	-45023117	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1695	153	1	1
1459	2063	100	65	184	chr3	114577522	114578061	-45021722	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1459	613	257	70	31	chr3	114579830	114580055	-45019728	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1134	1
1459	4550	146	28	26	chr3	114580075	114580118	-45019665	-	RMER12	LTR	ERVK	-468	854	816	1
1459	4550	146	28	26	chr3	114580160	114580221	-45019562	-	RMER12	LTR	ERVK	-507	815	767	1
1459	3403	30	2	2	chr3	114580221	114580617	-45019166	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1459	4550	146	28	26	chr3	114580617	114581343	-45018440	-	RMER12	LTR	ERVK	-556	766	22	1
1459	2808	116	12	9	chr3	114581343	114581768	-45018015	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	426	-1382	1
1459	3623	78	88	70	chr3	114581762	114582407	-45017376	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	556	1212	-636	1
1459	3839	114	35	52	chr3	114583866	114584523	-45015260	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1203	1848	0	1
1459	3277	39	15	0	chr3	114605565	114605955	-44993828	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1459	2607	175	69	28	chr3	114614153	114614589	-44985194	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	3	463	-97	1
1459	2607	175	69	28	chr3	114614629	114614728	-44985055	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	464	559	-1	1
1459	656	321	70	33	chr3	114623094	114623500	-44976283	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-75	481	1	1
1459	1730	179	71	76	chr3	114625115	114625509	-44974274	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	392	-2	1
1459	1280	284	60	6	chr3	114639787	114640181	-44959602	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	2
1459	1185	225	49	85	chr3	114645879	114646267	-44953516	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	2
1459	4408	158	53	14	chr3	114653375	114653666	-44946117	+	RMER17A2	LTR	ERVK	2	297	-609	2
1459	4408	158	53	14	chr3	114653780	114654348	-44945435	+	RMER17A2	LTR	ERVK	298	895	-11	2
1459	241	315	64	9	chr3	114662164	114662273	-44937510	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-216	181	67	2
1459	265	375	108	78	chr3	114673603	114673910	-44925873	+	MLT1G3	LTR	MaLR	16	331	-264	2
1460	4198	168	130	46	chr3	114688703	114689656	-44910127	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	1033	0	2
1460	2030	150	55	28	chr3	114693715	114694113	-44905670	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
1460	452	375	82	8	chr3	114707573	114707818	-44891965	+	RMER15	LTR	ERVL	299	561	-14	3
1460	3031	23	0	0	chr3	114712390	114712736	-44887047	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1460	381	338	70	48	chr3	114713601	114713828	-44885955	-	MLT1D	LTR	MaLR	-268	237	6	3
1460	2869	18	0	0	chr3	114717503	114717831	-44881952	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1297	4188	3861	3
1460	1604	201	86	8	chr3	114719876	114720238	-44879545	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	5	3
1460	1365	177	57	58	chr3	114723262	114723625	-44876158	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1848	1512	3
1460	3699	14	123	0	chr3	114723655	114724094	-44875689	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1460	40491	16	14	0	chr3	114724094	114729381	-44870402	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	3
1460	392	167	46	35	chr3	114729381	114729468	-44870315	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	3
1460	314	0	0	0	chr3	114729468	114729506	-44870277	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
1460	3699	14	123	0	chr3	114729506	114729945	-44869838	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1460	1741	195	87	81	chr3	114729953	114730461	-44869322	-	RMER12	LTR	ERVK	-407	915	405	3
1460	425	357	67	91	chr3	114733773	114734134	-44865649	+	MLT1F2	LTR	MaLR	193	544	-16	3
1460	1065	341	28	3	chr3	114736017	114736379	-44863404	+	MTEa	LTR	MaLR	3	372	-7	3
1460	1440	195	73	4	chr3	114744696	114744969	-44854814	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	76	3
1460	2893	153	122	31	chr3	114770590	114771528	-44828255	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-59	964	4	3
1460	1838	224	39	50	chr3	114774509	114774973	-44824810	+	LTR65	LTR	ERV1	150	608	-61	3
1460	6065	131	18	3	chr3	114789203	114790147	-44809636	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	4
1460	570	268	121	125	chr3	114794130	114794586	-44805197	-	RMER4A	LTR	ERVK	-11	455	2	4
1460	501	289	95	92	chr3	114795889	114796225	-44803558	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	38	4
1460	1025	181	33	93	chr3	114797585	114797919	-44801864	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-8	314	1	4
1460	1366	212	125	64	chr3	114811502	114811926	-44787857	-	RMER16	LTR	ERVK	-83	450	1	4
1460	370	306	166	31	chr3	114812278	114812507	-44787276	-	RLTR40	LTR	ERVK	-243	574	315	4
1460	255	298	60	0	chr3	114812575	114812659	-44787124	-	RLTR40	LTR	ERVK	-710	107	19	4
1461	2269	191	162	20	chr3	114841510	114842113	-44757670	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	2	4
1461	713	287	177	31	chr3	114844330	114844657	-44755126	-	MLT1B	LTR	MaLR	-15	375	1	4
1461	247	290	53	21	chr3	114846950	114847045	-44752738	-	ORR1E	LTR	MaLR	-13	366	269	4
1461	732	312	101	34	chr3	114847045	114847439	-44752344	+	MTD	LTR	MaLR	1	395	-24	4
1461	402	383	38	9	chr3	114847477	114847688	-44752095	-	ORR1E	LTR	MaLR	-127	232	16	4
1461	225	322	206	64	chr3	114859547	114859766	-44740017	-	MLT1K	LTR	MaLR	-334	261	12	4
1461	382	287	0	0	chr3	114863805	114863899	-44735884	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-16	392	299	4
1461	423	291	98	73	chr3	114864657	114864902	-44734881	+	RMER2	LTR	ERV1	290	540	-27	4
1461	233	219	127	6	chr3	114872799	114872887	-44726896	+	MLT1B	LTR	MaLR	268	374	0	5
1461	472	62	0	0	chr3	114876092	114876156	-44723627	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	419	5
1461	235	232	97	96	chr3	114877789	114877941	-44721842	+	RLTR8	LTR	ERVK	228	364	0	5
1461	4867	115	63	62	chr3	114878558	114879159	-44720624	+	RMER16-int	LTR	ERVK	524	1129	-4277	5
1461	2993	81	28	79	chr3	114879159	114879667	-44720116	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	5
1461	4867	115	63	62	chr3	114879667	114879720	-44720063	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1130	1168	-4238	5
1461	4867	115	63	62	chr3	114879890	114880141	-44719642	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1169	1431	-3975	5
1461	857	155	102	51	chr3	114880197	114880374	-44719409	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1327	1512	-3894	5
1461	388	274	130	49	chr3	114880379	114880563	-44719220	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	199	-247	5
1461	759	260	7	99	chr3	114880676	114880970	-44718813	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3279	3545	-3699	5
1461	3885	157	106	90	chr3	114880978	114881903	-44717880	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1715	3533	-2275	5
1461	3885	149	99	90	chr3	114882202	114882349	-44717434	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2546	2674	-2732	5
1461	899	242	50	35	chr3	114882350	114882749	-44717034	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	73	5
1461	9984	109	13	21	chr3	114882779	114884404	-44715379	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2670	4375	-1031	5
1461	2797	32	12	3	chr3	114884404	114884747	-44715036	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	5
1461	9984	101	11	21	chr3	114884747	114884764	-44715019	+	RMER16-int	LTR	ERVK	4376	4396	-1010	5
1461	2460	121	33	8	chr3	114885950	114886349	-44713434	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	5
1461	1557	161	73	0	chr3	114890504	114890790	-44708993	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-12	320	14	5
1461	1401	193	61	20	chr3	114890798	114891141	-44708642	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	6125	5
1461	4296	81	29	0	chr3	114891158	114891737	-44708046	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-342	7338	6743	5
1461	3397	99	0	0	chr3	114891727	114892181	-44707602	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-1367	6214	5761	5
1461	3465	70	0	16	chr3	114892172	114892619	-44707164	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-1939	5642	5203	5
1461	793	96	35	49	chr3	114892874	114893016	-44706767	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4531	5
1461	469	179	18	36	chr3	114893039	114893149	-44706634	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-2380	2464	2357	5
1461	1961	129	114	8	chr3	114893154	114893740	-44706043	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-3135	4271	3569	5
1461	659	202	0	0	chr3	114893768	114893887	-44705896	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4653	2753	2635	5
1461	326	256	0	55	chr3	114893899	114893990	-44705793	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4867	2539	2454	5
1461	321	301	88	0	chr3	114894003	114894116	-44705667	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5077	1060	938	5
1461	1678	213	148	39	chr3	114894121	114894634	-44705149	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4587	819	251	5
1461	1224	131	185	23	chr3	114894746	114895138	-44704645	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-6629	952	407	5
1461	1117	80	18	47	chr3	114895137	114895308	-44704475	-	IAPLTR4_I	LTR	ERVK	-1294	176	11	5
1461	1593	150	73	0	chr3	114895308	114895594	-44704189	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-12	320	14	5
1461	3810	175	35	26	chr3	114902327	114902867	-44696916	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	215	5
1461	3266	46	5	0	chr3	114902942	114903334	-44696449	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	3	396	0	5
1461	3810	175	35	26	chr3	114903527	114903671	-44696112	-	RMER6A	LTR	ERVK	-542	214	56	5
1461	3810	175	35	26	chr3	114903705	114903754	-44696029	-	RMER6A	LTR	ERVK	-701	55	7	5
1461	254	388	48	0	chr3	114905250	114905353	-44694430	+	LTR33C	LTR	ERVL	333	440	-189	5
1461	1685	122	12	0	chr3	114905595	114905842	-44693941	+	ORR1A3	LTR	MaLR	69	318	-8	5
1461	365	318	120	74	chr3	114906232	114906558	-44693225	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-2	652	312	5
1461	1533	226	70	16	chr3	114915519	114915888	-44683895	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	18	5
1461	274	282	30	75	chr3	114917953	114918087	-44681696	+	ORR1D2	LTR	MaLR	242	369	-1	5
1461	6171	68	10	8	chr3	114919142	114919944	-44679839	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	804	-4	5
1461	1012	308	55	50	chr3	114919987	114920349	-44679434	-	MTE2b	LTR	MaLR	-15	364	1	5
1461	2753	76	3	13	chr3	114921702	114922087	-44677696	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-1	474	94	5
1461	297	311	7	138	chr3	114923476	114923614	-44676169	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	258	5
1461	243	246	120	88	chr3	114923760	114923858	-44675925	-	MTEa	LTR	MaLR	-154	220	116	5
1461	1634	142	108	7	chr3	114923858	114924155	-44675628	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1461	243	258	183	63	chr3	114924155	114924221	-44675562	-	MTEa	LTR	MaLR	-254	116	31	5
1461	1771	179	16	74	chr3	114927109	114927476	-44672307	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	49	6
1461	788	304	18	96	chr3	114929772	114929957	-44669826	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	203	6
1461	788	304	18	96	chr3	114930102	114930312	-44669471	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-168	202	1	6
1461	289	297	14	0	chr3	114934807	114934881	-44664902	-	MER54A	LTR	ERVL	-683	218	144	6
1461	480	361	103	66	chr3	114941640	114941829	-44657954	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	171	6
1461	480	361	103	66	chr3	114942008	114942168	-44657615	-	MTEa	LTR	MaLR	-209	170	10	6
1461	2005	170	32	39	chr3	114945564	114945974	-44653809	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	6
1461	877	230	132	115	chr3	114946321	114946710	-44653073	+	MT2A	LTR	ERVL	1	522	-79	6
1461	571	256	0	60	chr3	114946779	114946962	-44652821	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2284	2455	-4951	6
1462	1581	152	19	141	chr3	114950892	114951267	-44648516	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1462	2162	194	7	24	chr3	114952022	114952440	-44647343	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	3	6
1462	280	260	184	16	chr3	114956807	114956932	-44642851	+	RMER5	LTR	ERV1	43	188	-346	6
1462	618	281	67	0	chr3	114959991	114960155	-44639628	-	MTE2b	LTR	MaLR	-204	175	1	6
1462	674	272	69	37	chr3	114960210	114960533	-44639250	-	MTB	LTR	MaLR	-5	414	1	6
1462	349	256	101	124	chr3	114962621	114962799	-44636984	-	MTE2b	LTR	MaLR	-203	176	3	6
1462	3364	33	2	0	chr3	114966814	114967207	-44632576	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	394	-2	6
1462	2511	34	3	50	chr3	114970305	114970643	-44629140	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	6
1462	2330	151	23	0	chr3	114976945	114977330	-44622453	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1462	380	329	84	73	chr3	114980238	114980434	-44619349	-	MER110A	LTR	ERV1	-12	479	274	6
1462	1326	222	86	23	chr3	114980434	114980785	-44618998	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	3	6
1462	380	325	83	80	chr3	114980785	114980994	-44618789	-	MER110A	LTR	ERV1	-183	285	92	6
1462	238	292	42	0	chr3	114981473	114981545	-44618238	+	MTC	LTR	MaLR	347	421	0	6
1462	2535	135	34	47	chr3	114984160	114984627	-44615156	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	7
1462	1392	246	50	56	chr3	114986699	114987182	-44612601	-	RLTR28B	LTR	ERVL	0	481	2	7
1462	237	266	16	0	chr3	114987529	114987590	-44612193	+	MER67A	LTR	ERV1	6	67	-476	7
1462	449	365	112	16	chr3	114987590	114987902	-44611881	+	MER67B	LTR	ERV1	1	342	-319	7
1462	1016	315	39	3	chr3	114988325	114988682	-44611101	+	MER34A1	LTR	ERV1	10	379	-208	7
1462	286	289	41	72	chr3	114995585	114995682	-44604101	-	MLT1B	LTR	MaLR	-25	365	272	7
1462	1963	217	9	186	chr3	114995688	114996430	-44603353	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	7
1462	6024	131	40	60	chr3	114996430	114996811	-44602972	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	0	5780	5252	7
1462	6024	122	40	67	chr3	114997002	114997899	-44601884	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-529	5251	4388	7
1462	2644	184	64	82	chr3	115002381	115003003	-44596780	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	5
1462	1532	193	16	110	chr3	115008500	115008870	-44590913	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-6	364	41	1
1462	263	260	17	152	chr3	115015907	115016025	-44583758	+	MT2B	LTR	ERVL	152	253	-348	2
1462	2604	154	29	40	chr3	115020821	115021267	-44578516	-	RLTR41	LTR	ERV1	-1	445	5	3
1462	3459	238	47	128	chr3	115024071	115024577	-44575206	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-4	1099	675	3
1462	3459	198	60	72	chr3	115024866	115025589	-44574194	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-306	722	1	3
1462	1787	251	25	19	chr3	115025752	115026223	-44573560	+	RMER19C	LTR	ERVK	138	611	0	3
1462	255	365	84	98	chr3	115026223	115026515	-44573268	-	ORR1E	LTR	MaLR	-70	289	3	3
1462	379	280	71	71	chr3	115045037	115045191	-44554592	+	MTE2a	LTR	MaLR	226	379	0	6
1462	1665	230	26	186	chr3	115052143	115052805	-44546978	-	RMER19C	LTR	ERVK	-3	608	53	7
1462	457	309	110	0	chr3	115052937	115053073	-44546710	-	LTR53	LTR	ERVL	-361	158	8	7
1462	349	312	148	52	chr3	115053547	115053777	-44546006	+	MLT1D	LTR	MaLR	5	256	-249	7
1462	316	289	111	0	chr3	115054052	115054187	-44545596	+	MLT1D	LTR	MaLR	356	505	0	7
1462	440	305	113	99	chr3	115060748	115060970	-44538813	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-181	388	164	8
1462	2975	56	0	0	chr3	115063728	115064085	-44535698	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	9
1462	1028	300	45	37	chr3	115069563	115069764	-44530019	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	183	1
1462	1028	300	45	37	chr3	115069810	115069961	-44529822	-	MTEb	LTR	MaLR	-197	182	22	1
1462	658	298	12	12	chr3	115070510	115070683	-44529100	+	RMER15	LTR	ERVL	279	451	-124	1
1462	2147	123	15	6	chr3	115070683	115071017	-44528766	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1462	8214	48	9	7	chr3	115071019	115072093	-44527690	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5403	1
1462	17456	82	43	17	chr3	115072074	115074668	-44525115	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3811	2670	8	1
1462	2147	123	15	6	chr3	115074668	115075002	-44524781	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	1
1462	1365	207	119	3	chr3	115077681	115078016	-44521767	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1462	496	317	18	18	chr3	115079525	115079692	-44520091	-	MLT1H	LTR	MaLR	-275	274	108	1
1463	480	286	87	37	chr3	115084387	115084676	-44515107	-	RMER20B	LTR	ERVK	-32	595	234	1
1463	300	358	24	12	chr3	115085868	115086035	-44513748	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-3208	2459	2291	1
1463	328	340	47	34	chr3	115087139	115087288	-44512495	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-13	549	399	1
1463	518	355	60	57	chr3	115088387	115088719	-44511064	-	MER77	LTR	ERVL	-4	603	271	1
1463	411	319	162	20	chr3	115089366	115089619	-44510164	+	LTR50	LTR	ERVL	35	323	-472	1
1463	828	304	62	72	chr3	115090254	115090661	-44509122	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	419	0	1
1463	1498	192	70	0	chr3	115104554	115104841	-44494942	-	RMER15	LTR	ERVL	-5	570	264	1
1463	323	217	0	0	chr3	115104821	115104881	-44494902	-	RMER15	LTR	ERVL	-512	63	4	1
1463	6014	170	98	43	chr3	115105895	115106960	-44492823	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	1132	-716	1
1463	6014	170	98	43	chr3	115107550	115107883	-44491900	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1133	1476	-372	1
1463	556	159	28	9	chr3	115107879	115107987	-44491796	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1738	1847	-1	1
1463	232	225	26	66	chr3	115112935	115113011	-44486772	+	RMER15	LTR	ERVL	45	117	-458	1
1463	1832	169	66	20	chr3	115113011	115113361	-44486422	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	29	1
1463	602	346	81	0	chr3	115113391	115113651	-44486132	+	RMER15	LTR	ERVL	272	552	-23	1
1463	2148	254	12	19	chr3	115118482	115118995	-44480788	+	RMER5	LTR	ERV1	1	509	-25	1
1463	353	344	118	59	chr3	115121367	115121806	-44477977	+	MLT1C	LTR	MaLR	3	467	0	1
1463	272	246	194	10	chr3	115122102	115122215	-44477568	+	MTE2b	LTR	MaLR	240	373	-6	1
1463	579	336	171	46	chr3	115122499	115122938	-44476845	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	548	55	1
1463	3452	18	5	0	chr3	115130945	115131339	-44468444	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1463	9111	34	4	1	chr3	115131339	115132434	-44467349	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1463	3452	18	5	0	chr3	115132434	115132828	-44466955	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1463	395	36	0	0	chr3	115132828	115132883	-44466900	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1044	1
1463	596	39	39	0	chr3	115132867	115132945	-44466838	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	316	396	0	1
1463	321	354	85	51	chr3	115133876	115134111	-44465672	-	MER34A	LTR	ERV1	-326	245	3	1
1463	1889	109	91	54	chr3	115152274	115152605	-44447178	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	343	-299	1
1463	1157	205	63	14	chr3	115153299	115153522	-44446261	+	RLTR26	LTR	ERVK	312	545	-97	1
1463	832	159	13	7	chr3	115153509	115153661	-44446122	+	RLTR26	LTR	ERVK	490	642	0	1
1463	3672	16	123	0	chr3	115155188	115155627	-44444156	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	1
1463	1112	286	40	122	chr3	115159517	115159859	-44439924	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	60	2
1463	1654	189	25	8	chr3	115159859	115160212	-44439571	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	2
1463	1112	286	40	122	chr3	115160212	115160271	-44439512	-	MTEa	LTR	MaLR	-320	59	1	2
1463	395	378	47	21	chr3	115161153	115161388	-44438395	+	MLT1F	LTR	MaLR	304	544	-4	2
1463	936	189	38	16	chr3	115177125	115177308	-44422475	+	RMER6B	LTR	ERVK	275	461	0	2
1463	643	358	61	15	chr3	115178551	115178812	-44420971	+	MER21B	LTR	ERV1	514	786	-77	2
1463	369	370	68	0	chr3	115179683	115179875	-44419908	+	MLT2B4	LTR	ERVL	4	208	-348	2
1463	397	262	113	0	chr3	115184037	115184178	-44415605	-	MER110	LTR	ERV1	-4	487	331	2
1463	286	352	19	9	chr3	115185092	115185198	-44414585	-	MER110	LTR	ERV1	-170	321	215	2
1463	3438	25	2	0	chr3	115185328	115185723	-44414060	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1463	9091	33	4	1	chr3	115185723	115186816	-44412967	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	3	2
1463	3628	11	136	0	chr3	115186820	115187254	-44412529	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1463	532	283	92	0	chr3	115188677	115188850	-44410933	-	MER110	LTR	ERV1	-282	209	21	2
1463	273	329	0	68	chr3	115188933	115189021	-44410762	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	18	99	-555	2
1463	352	348	16	42	chr3	115189254	115189443	-44410340	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	495	678	-2	2
1463	341	116	0	0	chr3	115191685	115191754	-44408029	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	465	2
1463	1802	229	60	21	chr3	115191948	115192367	-44407416	-	MT2A	LTR	ERVL	-98	435	1	2
1463	284	323	11	59	chr3	115195118	115195333	-44404450	-	LTR41B	LTR	ERVL	-566	202	1	2
1463	3225	43	8	0	chr3	115196129	115196522	-44403261	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1463	619	342	67	37	chr3	115198091	115198495	-44401288	-	MT2A	LTR	ERVL	-117	416	1	2
1463	1236	326	80	18	chr3	115199475	115199978	-44399805	+	MLT1F2	LTR	MaLR	15	548	-12	2
1463	3210	195	39	58	chr3	115207958	115208351	-44391432	+	RMER6D	LTR	ERVK	3	368	-352	2
1463	3210	195	39	58	chr3	115208394	115208720	-44391063	+	RMER6D	LTR	ERVK	369	708	-12	2
1464	240	277	123	25	chr3	115213509	115213631	-44386152	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-417	137	4	3
1464	1831	183	58	13	chr3	115215865	115216241	-44383542	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	3
1464	255	294	56	47	chr3	115217911	115218043	-44381740	-	MTEb	LTR	MaLR	-16	392	276	3
1464	619	314	107	58	chr3	115218296	115218624	-44381159	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	344	-15	3
1464	940	323	92	28	chr3	115219278	115219603	-44380180	-	MTEa	LTR	MaLR	-33	346	1	3
1464	675	222	83	12	chr3	115219869	115220033	-44379750	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	248	3
1464	1024	221	23	5	chr3	115220032	115220250	-44379533	-	MTD	LTR	MaLR	-90	329	108	3
1464	2889	208	160	30	chr3	115220256	115221028	-44378755	+	RMER19B	LTR	ERVK	3	881	-21	3
1464	2889	208	160	30	chr3	115221416	115221430	-44378353	+	RMER19B	LTR	ERVK	882	891	-11	3
1464	419	243	56	37	chr3	115222075	115222182	-44377601	-	MTD	LTR	MaLR	-310	109	1	3
1464	2716	172	15	19	chr3	115223007	115223533	-44376250	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	1	3
1464	2445	219	93	54	chr3	115223923	115224667	-44375116	-	RMER12	LTR	ERVK	-549	773	1	3
1464	659	308	88	48	chr3	115227451	115227782	-44372001	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	344	-15	3
1464	1383	207	157	15	chr3	115236577	115236915	-44362868	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	3
1464	801	328	75	32	chr3	115237372	115237813	-44361970	+	MT2A	LTR	ERVL	5	464	-69	3
1464	2086	157	56	3	chr3	115242316	115242674	-44357109	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	2	3
1464	274	326	84	3	chr3	115251699	115251864	-44347919	-	MER34A	LTR	ERV1	0	571	364	3
1464	491	344	54	5	chr3	115251965	115252187	-44347596	+	MLT1A1	LTR	MaLR	94	326	-82	3
1464	427	271	114	62	chr3	115252171	115252364	-44347419	-	MER34A	LTR	ERV1	-361	210	8	3
1464	234	276	36	125	chr3	115252617	115252729	-44347054	-	MT2B	LTR	ERVL	-347	254	153	3
1464	847	290	99	22	chr3	115253783	115254195	-44345588	-	MLT1B-int	LTR	MaLR	-927	444	1	3
1464	350	354	5	57	chr3	115254238	115254430	-44345353	-	MLT1B	LTR	MaLR	-44	346	165	3
1464	339	216	32	21	chr3	115254355	115254544	-44345239	+	RMER17D	LTR	ERVK	257	447	-442	3
1464	298	358	93	0	chr3	115254488	115254692	-44345091	-	MLT1B	LTR	MaLR	-166	224	2	3
1464	245	311	95	100	chr3	115261195	115261395	-44338388	+	MLT1D	LTR	MaLR	92	290	-215	3
1464	1168	263	72	20	chr3	115263648	115263997	-44335786	+	MTE2b	LTR	MaLR	13	379	0	3
1464	1264	211	110	41	chr3	115269856	115270201	-44329582	+	ORR1D2	LTR	MaLR	2	370	0	4
1464	267	257	40	26	chr3	115273712	115273788	-44325995	+	MLT1A0	LTR	MaLR	276	352	-13	4
1464	2581	196	84	38	chr3	115276158	115276446	-44323337	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	289	4
1464	2581	196	84	38	chr3	115276639	115276906	-44322877	-	RMER20B	LTR	ERVK	-339	288	21	4
1464	438	307	43	24	chr3	115276911	115277118	-44322665	+	MLT1D	LTR	MaLR	4	214	-291	4
1464	282	304	106	14	chr3	115277200	115277315	-44322468	+	MLT1D	LTR	MaLR	387	615	-9	4
1464	327	315	31	8	chr3	115280817	115280945	-44318838	+	MLT1D	LTR	MaLR	343	473	-32	4
1464	1853	159	112	16	chr3	115284356	115284732	-44315051	+	MTC	LTR	MaLR	1	412	-9	4
1464	1537	222	23	50	chr3	115284737	115285136	-44314647	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	388	-870	4
1464	3472	189	71	14	chr3	115286160	115286931	-44312852	+	MTC-int	LTR	MaLR	444	1258	0	4
1464	342	166	9	9	chr3	115286932	115287003	-44312780	+	MTC	LTR	MaLR	2	72	-335	4
1464	1987	158	22	8	chr3	115287515	115287880	-44311903	+	MTC	LTR	MaLR	52	421	0	4
1464	3128	158	8	52	chr3	115288188	115288788	-44310995	+	RMER15	LTR	ERVL	2	575	0	4
1464	235	318	24	0	chr3	115289649	115289734	-44310049	+	LTR40a	LTR	ERVL	31	117	-402	4
1464	267	248	138	37	chr3	115290291	115290400	-44309383	+	LTR40a	LTR	ERVL	387	506	-13	4
1464	259	347	10	0	chr3	115296059	115296157	-44303626	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	102	-277	4
1464	826	223	67	18	chr3	115296159	115296383	-44303400	+	MTE2b	LTR	MaLR	68	302	-77	4
1464	396	289	18	0	chr3	115296392	115296506	-44303277	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-66	342	227	4
1464	250	313	142	32	chr3	115300765	115300920	-44298863	-	MLT1J	LTR	MaLR	-170	342	171	4
1464	250	256	66	58	chr3	115302425	115302562	-44297221	-	ORR1E	LTR	MaLR	-221	138	1	4
1464	671	261	37	93	chr3	115308703	115308973	-44290810	-	MLT1B	LTR	MaLR	-56	334	80	4
1464	2436	185	27	151	chr3	115309315	115310014	-44289769	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1317	1884	-79	4
1464	2020	149	9	88	chr3	115310014	115310433	-44289350	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	4
1464	266	200	47	0	chr3	115314389	115314474	-44285309	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-219	5538	5450	4
1464	1018	315	33	6	chr3	115314478	115314810	-44284973	+	MTEb	LTR	MaLR	2	342	-37	4
1464	2669	343	65	32	chr3	115314867	115316250	-44283533	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-364	5303	3875	4
1464	313	221	52	96	chr3	115317066	115317181	-44282602	+	MER110A	LTR	ERV1	242	351	-117	4
1464	409	326	129	0	chr3	115320957	115321150	-44278633	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-123	285	68	4
1464	755	178	147	11	chr3	115331868	115332156	-44267627	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1464	234	287	58	19	chr3	115332681	115332784	-44266999	-	MER34	LTR	ERV1	-80	462	356	5
1464	869	230	47	30	chr3	115332997	115333293	-44266490	-	RLTR15	LTR	ERVK	-56	303	3	5
1464	1120	239	99	23	chr3	115337094	115337437	-44262346	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	10	5
1464	702	314	96	3	chr3	115339238	115339529	-44260254	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-186	334	17	5
1464	464	326	60	21	chr3	115340140	115340375	-44259408	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	246	-113	5
1464	1130	201	17	13	chr3	115341058	115341295	-44258488	+	RLTR18B	LTR	ERVK	3	240	-272	5
1464	1428	195	56	3	chr3	115341296	115341599	-44258184	+	RLTR18B	LTR	ERVK	188	506	-6	5
1464	3091	23	0	3	chr3	115342100	115342447	-44257336	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	5
1465	1406	221	132	47	chr3	115343614	115344107	-44255676	+	RMER15	LTR	ERVL	1	535	-40	5
1465	658	264	190	12	chr3	115357391	115357633	-44242150	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	273	5
1465	229	217	82	61	chr3	115357627	115357725	-44242058	-	RMER15	LTR	ERVL	-415	160	61	5
1465	364	208	116	54	chr3	115365656	115365768	-44234015	+	LTR29	LTR	ERV1	1	119	-525	5
1465	269	217	131	12	chr3	115366334	115366418	-44233365	+	MER34	LTR	ERV1	384	477	-65	5
1465	380	228	69	0	chr3	115366965	115367066	-44232717	-	MLT1B	LTR	MaLR	-94	296	189	5
1465	346	336	22	30	chr3	115369007	115369142	-44230641	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	134	-285	5
1465	727	283	43	80	chr3	115369336	115369636	-44230147	+	MTE2a	LTR	MaLR	91	379	0	5
1465	1736	236	37	15	chr3	115370083	115370491	-44229292	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	5
1465	3234	60	5	2	chr3	115370677	115371076	-44228707	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1465	1023	250	140	9	chr3	115371659	115371994	-44227789	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	26	6
1465	1467	229	8	71	chr3	115372118	115372498	-44227285	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	20	6
1465	1467	229	8	71	chr3	115373290	115373304	-44226479	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-355	19	6	6
1465	236	286	0	0	chr3	115374268	115374324	-44225459	+	RMER15	LTR	ERVL	403	458	-117	6
1465	236	302	11	23	chr3	115380311	115380399	-44219384	+	MTD	LTR	MaLR	194	280	-139	6
1465	1233	218	127	0	chr3	115381963	115382270	-44217513	-	MTD	LTR	MaLR	-73	346	1	6
1465	458	353	89	10	chr3	115384570	115384773	-44215010	-	LTR16A	LTR	ERVL	-92	359	141	6
1465	3042	26	0	3	chr3	115387032	115387379	-44212404	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	6
1465	639	258	99	27	chr3	115390355	115390578	-44209205	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-128	242	4	6
1465	3359	48	5	0	chr3	115391077	115391475	-44208308	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	6
1465	483	208	148	22	chr3	115394045	115394227	-44205556	+	RMER5	LTR	ERV1	51	255	-279	6
1465	1889	177	98	10	chr3	115420194	115420583	-44179200	-	MT2A	LTR	ERVL	-98	435	13	7
1465	2156	102	9	0	chr3	115424918	115425233	-44174550	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	318	-9	7
1465	318	298	33	0	chr3	115425279	115425398	-44174385	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	243	7
1465	901	262	65	4	chr3	115433085	115433345	-44166438	+	MTEa	LTR	MaLR	104	379	0	7
1465	1316	206	147	6	chr3	115434728	115435083	-44164700	+	MTD	LTR	MaLR	15	404	-15	7
1465	1494	209	70	28	chr3	115436855	115437214	-44162569	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
1465	238	236	41	14	chr3	115438396	115438469	-44161314	-	LTR33	LTR	ERVL	-64	451	377	7
1465	547	335	19	32	chr3	115452543	115452759	-44147024	+	MTE2a	LTR	MaLR	70	282	-97	8
1465	1039	86	0	6	chr3	115452989	115453152	-44146631	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-1	808	647	8
1465	1010	260	52	43	chr3	115453219	115453548	-44146235	+	ORR1D2	LTR	MaLR	37	368	-2	8
1465	261	274	27	0	chr3	115453549	115453622	-44146161	+	MTE2a	LTR	MaLR	284	358	-21	8
1465	2954	98	40	9	chr3	115455055	115455223	-44144560	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-8	467	299	8
1465	2954	98	40	9	chr3	115455282	115455566	-44144217	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-177	298	1	8
1465	1843	157	3	74	chr3	115459729	115460081	-44139702	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	8
1465	375	319	15	0	chr3	115461522	115461657	-44138126	-	LTR16A	LTR	ERVL	-16	435	299	8
1465	1309	189	93	54	chr3	115462571	115462726	-44137057	+	ORR1D1	LTR	MaLR	8	165	-209	8
1465	1309	189	93	54	chr3	115462785	115462982	-44136801	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	374	0	8
1466	784	310	140	23	chr3	115475359	115475831	-44123952	-	MT2A	LTR	ERVL	-6	527	1	8
1466	1433	221	26	63	chr3	115475949	115476330	-44123453	+	MTE2b	LTR	MaLR	10	376	-3	8
1466	290	284	77	54	chr3	115488144	115488274	-44111509	+	MLT1E2	LTR	MaLR	87	219	-408	8
1466	297	353	107	40	chr3	115493724	115494180	-44105603	-	LTR16D	LTR	ERVL	0	651	99	9
1466	536	294	43	51	chr3	115497657	115497935	-44101848	-	ORR1E	LTR	MaLR	-92	278	1	9
1466	1498	105	13	0	chr3	115499771	115500000	-44099783	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	96	9
1466	675	109	33	14	chr3	115500000	115500115	-44099668	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-246	148	1	1
1466	878	273	62	112	chr3	115506298	115506682	-44093101	+	MTE2a	LTR	MaLR	8	372	-7	1
1466	252	304	59	34	chr3	115506951	115507070	-44092713	+	MLT1A0	LTR	MaLR	15	136	-238	1
1466	2399	139	38	10	chr3	115512309	115512708	-44087075	+	MTC	LTR	MaLR	1	410	-11	2
1466	262	302	84	108	chr3	115513214	115513381	-44086402	-	MTEb	LTR	MaLR	-7	372	210	2
1466	325	238	71	100	chr3	115515766	115515906	-44083877	+	MT2B2	LTR	ERVL	125	260	-324	3
1466	332	222	24	12	chr3	115516720	115516802	-44082981	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	297	3
1466	368	320	55	51	chr3	115519395	115519632	-44080151	-	RMER17C	LTR	ERVK	-36	374	137	4
1466	1018	157	361	4	chr3	115530129	115530392	-44069391	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-17	357	1	5
1466	713	248	199	77	chr3	115535282	115535460	-44064323	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	203	-162	7
1466	713	248	199	77	chr3	115535644	115535762	-44064021	+	MLT1A0	LTR	MaLR	204	333	-32	7
1466	478	296	19	115	chr3	115535923	115536132	-44063651	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	23	213	-1522	7
1466	3573	114	44	15	chr3	115536132	115536650	-44063133	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	7
1466	478	296	19	115	chr3	115536650	115536700	-44063083	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	214	257	-1478	7
1466	1305	276	124	45	chr3	115536776	115537302	-44062481	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	216	769	-966	7
1466	2332	78	58	6	chr3	115537617	115537928	-44061855	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1466	389	360	60	30	chr3	115537972	115538207	-44061576	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1321	1562	-173	7
1466	1048	249	88	66	chr3	115538219	115538671	-44061112	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-25	503	42	7
1466	240	77	26	0	chr3	115538725	115538764	-44061019	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1591	1630	-105	7
1466	368	246	176	69	chr3	115540995	115541126	-44058657	-	LTR48	LTR	ERV1	-642	145	1	8
1466	2584	127	61	11	chr3	115542615	115542990	-44056793	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	8
1466	3096	35	3	11	chr3	115543523	115543872	-44055911	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	8
1466	2368	105	45	0	chr3	115543905	115544218	-44055565	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1466	420	217	11	0	chr3	115546629	115546721	-44053062	+	ORR1E	LTR	MaLR	267	359	0	9
1466	1525	175	31	3	chr3	115556844	115557136	-44042647	+	ORR1A3	LTR	MaLR	19	318	-8	1
1466	779	249	69	136	chr3	115561697	115562147	-44037636	+	RLTR23	LTR	ERV1	11	430	0	1
1466	842	193	84	220	chr3	115563290	115563702	-44036081	+	MT2A	LTR	ERVL	20	546	-55	1
1466	3011	105	253	23	chr3	115563751	115563977	-44035806	-	RMER6C	LTR	ERVK	-4	686	339	1
1466	3011	105	253	23	chr3	115564059	115564388	-44035395	-	RMER6C	LTR	ERVK	-352	338	3	1
1466	641	185	86	242	chr3	115564388	115564478	-44035305	+	MT2A	LTR	ERVL	547	598	-3	1
1466	257	312	79	116	chr3	115565261	115565590	-44034193	+	ORR1E	LTR	MaLR	47	367	-12	1
1466	1501	189	100	15	chr3	115569869	115570208	-44029575	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	368	-6	1
1466	3609	18	15	0	chr3	115571432	115571822	-44027961	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1466	465	345	60	52	chr3	115574344	115574692	-44025091	+	MLT1C	LTR	MaLR	84	434	-33	1
1466	2237	94	0	73	chr3	115574778	115575122	-44024661	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	1
1466	330	317	55	99	chr3	115576858	115577131	-44022652	+	ORR1E	LTR	MaLR	97	357	-2	1
1466	322	291	77	144	chr3	115577258	115577543	-44022240	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-5	459	194	1
1466	2035	255	117	42	chr3	115580420	115581004	-44018779	+	MTE-int	LTR	MaLR	920	1548	-32	1
1466	4113	151	15	30	chr3	115581004	115581729	-44018054	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	43	1
1466	2655	101	61	52	chr3	115581735	115582215	-44017568	-	RMER16	LTR	ERVK	-6	527	1	1
1466	328	179	0	0	chr3	115582215	115582263	-44017520	-	RMER6A	LTR	ERVK	-413	48	1	1
1466	683	260	220	43	chr3	115582623	115582663	-44017120	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	359	320	1
1466	976	215	100	14	chr3	115582846	115583110	-44016673	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-40	319	1	1
1466	6458	205	51	25	chr3	115583110	115584445	-44015338	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	1	1
1466	2044	192	19	14	chr3	115584445	115584815	-44014968	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	1
1466	487	246	101	121	chr3	115597571	115597911	-44001872	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	7	1
1467	2903	27	5	62	chr3	115612045	115612434	-43987349	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
1467	7412	90	86	68	chr3	115612434	115613717	-43986066	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	2
1467	29035	21	8	2	chr3	115613716	115616969	-43982814	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3210	6481	0	2
1467	2903	27	5	62	chr3	115616969	115617358	-43982425	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	2
1467	1802	147	92	57	chr3	115626273	115626642	-43973141	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	384	0	2
1467	270	321	99	88	chr3	115636191	115636464	-43963319	+	MTEa	LTR	MaLR	63	338	-41	2
1467	1246	210	29	110	chr3	115659040	115659269	-43940514	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	197	-187	2
1467	1246	210	29	110	chr3	115659334	115659521	-43940262	+	ORR1C2	LTR	MaLR	198	383	-1	2
1467	673	297	156	30	chr3	115661593	115662030	-43937753	+	MLT1F2	LTR	MaLR	3	494	-66	2
1467	466	277	202	16	chr3	115671899	115672141	-43927642	+	MLT1E	LTR	MaLR	60	346	-308	2
1467	727	239	13	6	chr3	115672162	115672318	-43927465	+	MLT1E	LTR	MaLR	429	585	-68	2
1467	277	295	116	84	chr3	115673758	115674102	-43925681	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	5	2
1467	339	267	118	37	chr3	115685227	115685453	-43914330	+	MTD-int	LTR	MaLR	772	915	-343	3
1467	734	74	86	36	chr3	115690860	115691000	-43908783	+	RMER17B	LTR	ERVK	317	463	-495	3
1467	392	281	192	72	chr3	115691299	115691633	-43908150	-	MTE2a	LTR	MaLR	-5	374	1	3
1467	1776	216	80	149	chr3	115700934	115701454	-43898329	+	RMER19C	LTR	ERVK	39	505	-106	3
1467	3210	20	6	0	chr3	115701454	115701798	-43897985	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1467	1776	216	80	149	chr3	115701798	115701893	-43897890	+	RMER19C	LTR	ERVK	506	611	0	3
1467	295	300	78	20	chr3	115702033	115702186	-43897597	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3646	1353	1192	3
1467	828	303	32	32	chr3	115702162	115702500	-43897283	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4243	756	419	3
1467	397	275	64	142	chr3	115702651	115702884	-43896899	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	347	3
1467	336	241	53	9	chr3	115702929	115703042	-43896741	+	MLT1C	LTR	MaLR	191	308	-159	3
1467	777	306	44	53	chr3	115717320	115717641	-43882142	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	1	3
1467	1157	234	82	77	chr3	115721636	115722255	-43877528	-	RMER20B	LTR	ERVK	-21	606	9	3
1467	1420	192	50	137	chr3	115725268	115725685	-43874098	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	3	3
1467	364	298	67	46	chr3	115726202	115726639	-43873144	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-46	313	1	3
1467	1817	128	186	11	chr3	115727551	115727900	-43871883	-	MTC	LTR	MaLR	-11	410	1	3
1468	2311	147	52	75	chr3	115742349	115742826	-43856957	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	1	4
1468	4703	158	32	82	chr3	115750975	115751911	-43847872	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	889	-13	4
1468	556	293	44	65	chr3	115753740	115753988	-43845795	+	MTD	LTR	MaLR	4	246	-173	4
1468	288	299	34	11	chr3	115755154	115755242	-43844541	-	MTEb	LTR	MaLR	-23	356	267	4
1468	1050	234	109	24	chr3	115755402	115755707	-43844076	+	MTD	LTR	MaLR	9	341	-78	4
1468	1034	266	77	30	chr3	115757673	115758010	-43841773	+	MLT1A0	LTR	MaLR	13	365	0	4
1468	354	344	132	53	chr3	115759176	115759403	-43840380	+	LTR88b	LTR	Gypsy?	4	248	-589	4
1468	386	299	126	43	chr3	115760127	115760463	-43839320	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	379	0	4
1468	3303	59	10	2	chr3	115765917	115766310	-43833473	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1468	3499	48	2	0	chr3	115768997	115769392	-43830391	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1468	263	317	83	0	chr3	115770126	115770246	-43829537	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4000	4129	-1538	4
1468	777	233	82	18	chr3	115776162	115776381	-43823402	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1649	1881	-3833	4
1468	768	316	13	13	chr3	115776383	115776620	-43823163	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2029	2265	-3496	4
1468	636	199	70	13	chr3	115777945	115778103	-43821680	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2576	2742	-3015	4
1468	2152	270	109	37	chr3	115778121	115778221	-43821562	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2867	3007	-2754	4
1468	2152	270	109	37	chr3	115778436	115779085	-43820698	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3008	3670	-2091	4
1468	1267	171	53	14	chr3	115779085	115779348	-43820435	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	301	-605	4
1468	271	275	89	55	chr3	115779544	115779690	-43820093	-	RLTR16	LTR	ERVK	-324	181	31	4
1468	801	250	58	33	chr3	115779699	115779939	-43819844	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4003	4248	-1513	4
1468	884	273	35	80	chr3	115790013	115790324	-43809459	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	63	5
1468	1121	297	5	108	chr3	115790521	115790958	-43808825	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	220	5
1468	1279	182	13	95	chr3	115791004	115791308	-43808475	-	RMER19C	LTR	ERVK	-332	279	1	5
1468	1141	257	75	22	chr3	115791598	115791920	-43807863	+	MTEa	LTR	MaLR	5	343	-36	5
1468	743	328	25	51	chr3	115797279	115797594	-43802189	+	MTE2a	LTR	MaLR	56	362	-17	5
1468	1202	304	92	31	chr3	115803066	115803521	-43796262	-	MLT1D	LTR	MaLR	-5	500	18	5
1468	268	347	141	61	chr3	115819621	115819983	-43779800	+	MLT1H	LTR	MaLR	108	498	-51	5
1468	262	295	17	110	chr3	115834320	115834438	-43765345	-	MLT1J	LTR	MaLR	-217	295	189	5
1468	3614	33	2	0	chr3	115838516	115838911	-43760872	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1468	239	163	0	0	chr3	115847357	115847400	-43752383	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	569	6
1468	2193	223	35	100	chr3	115847462	115848084	-43751699	-	RMER19C	LTR	ERVK	-28	583	2	6
1468	693	286	14	48	chr3	115853838	115854047	-43745736	+	MLT2F	LTR	ERVL	370	571	-92	6
1468	1353	240	6	91	chr3	115861434	115861796	-43737987	+	MTE2b	LTR	MaLR	39	369	-10	6
1469	476	252	217	47	chr3	115871353	115871580	-43728203	-	RMER4B	LTR	ERVK	-6	579	343	6
1469	329	246	23	130	chr3	115871624	115871755	-43728028	-	MTE2a	LTR	MaLR	-43	336	220	6
1469	350	252	0	57	chr3	115871755	115871849	-43727934	+	RMER4B	LTR	ERVK	467	556	-29	6
1469	562	294	56	69	chr3	115871907	115872123	-43727660	-	MTE2a	LTR	MaLR	-166	213	1	6
1469	804	288	43	99	chr3	115879338	115879712	-43720071	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	354	-5	6
1469	1231	191	9	4	chr3	115881119	115881345	-43718438	+	ORR1B1	LTR	MaLR	160	386	-8	6
1469	1147	249	30	109	chr3	115888086	115888523	-43711260	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	405	7	6
1469	317	228	129	17	chr3	115891952	115892068	-43707715	+	MLT1I	LTR	MaLR	26	154	-257	6
1469	1350	193	61	132	chr3	115895646	115895863	-43703920	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	198	-186	6
1469	1350	193	61	132	chr3	115896030	115896205	-43703578	+	ORR1C2	LTR	MaLR	199	365	-19	6
1469	380	314	139	56	chr3	115898351	115898689	-43701094	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-8	571	206	6
1469	462	259	104	204	chr3	115901040	115901412	-43698371	+	MTD	LTR	MaLR	6	365	-54	6
1469	462	219	228	0	chr3	115901494	115901543	-43698240	+	MTD	LTR	MaLR	327	403	-16	6
1469	321	312	73	54	chr3	115914616	115914877	-43684906	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-160	288	23	7
1469	599	303	114	22	chr3	115918191	115918464	-43681319	+	MLT1A0	LTR	MaLR	68	365	0	7
1469	2250	104	186	0	chr3	115920390	115920744	-43679039	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	1	420	0	7
1469	2012	164	56	22	chr3	115922837	115923271	-43676512	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1606	1963	0	7
1469	1706	95	10	59	chr3	115923271	115923561	-43676222	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	276	-51	7
1469	408	292	59	48	chr3	115935735	115935922	-43663861	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	2	7
1469	473	270	88	44	chr3	115936550	115936732	-43663051	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	190	-169	7
1469	1705	163	47	64	chr3	115937636	115937997	-43661786	+	ORR1D1	LTR	MaLR	20	374	0	7
1469	977	216	76	11	chr3	115938007	115938286	-43661497	+	ORR1D2	LTR	MaLR	75	374	0	7
1469	2025	113	13	0	chr3	115940726	115941036	-43658747	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	314	-13	7
1469	618	315	146	40	chr3	115943150	115943623	-43656160	+	MT2A	LTR	ERVL	10	532	-1	7
1469	454	169	94	182	chr3	115946947	115947106	-43652677	-	MT2A	LTR	ERVL	-386	147	3	7
1469	627	211	19	76	chr3	115959870	115960080	-43639703	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	246	443	-32	7
1469	343	367	21	26	chr3	115960175	115960368	-43639415	-	LTR31	LTR	ERV1	-256	363	172	7
1469	956	239	186	0	chr3	115963907	115964192	-43635591	-	MTD	LTR	MaLR	-58	361	24	8
1469	500	285	82	51	chr3	115964223	115964478	-43635305	+	ORR1E	LTR	MaLR	92	354	-5	8
1469	1471	178	27	20	chr3	115966700	115966993	-43632790	+	ORR1B2	LTR	MaLR	92	386	-8	8
1469	591	148	0	0	chr3	115967479	115967580	-43632203	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	278	8
1469	339	157	0	0	chr3	115967593	115967644	-43632139	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5572	5622	-139	8
1469	274	162	51	51	chr3	115967644	115967722	-43632061	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	562	639	-1324	8
1469	405	107	0	0	chr3	115967722	115967778	-43632005	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5706	5761	0	8
1469	285	127	91	0	chr3	115967783	115967838	-43631945	+	MT2B	LTR	ERVL	6	65	-536	8
1469	328	233	0	14	chr3	115967838	115967912	-43631871	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2152	2224	-3537	8
1469	362	165	9	23	chr3	115967912	115968005	-43631778	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1444	1508	-1	8
1469	1894	184	24	40	chr3	115968006	115968379	-43631404	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	8
1469	444	286	23	63	chr3	115968537	115968871	-43630912	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	364	-1	8
1469	242	264	113	30	chr3	115971547	115971715	-43628068	+	MER68	LTR	ERVL	279	460	-103	8
1469	1882	224	9	17	chr3	115990219	115990641	-43609142	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	8
1470	1729	190	54	13	chr3	116003700	116004073	-43595710	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	983	1370	0	5
1470	1373	206	77	21	chr3	116004075	116004240	-43595543	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	171	-203	5
1470	1373	206	77	21	chr3	116004329	116004488	-43595295	+	ORR1D1	LTR	MaLR	172	348	-26	5
1470	1373	206	77	21	chr3	116004538	116004550	-43595233	+	ORR1D1	LTR	MaLR	349	359	-15	5
1470	276	318	15	67	chr3	116006061	116006196	-43593587	-	MTEa	LTR	MaLR	-22	357	230	9
1470	704	230	16	136	chr3	116008493	116008814	-43590969	+	ORR1E	LTR	MaLR	36	344	-35	1
1470	271	223	51	41	chr3	116008980	116009078	-43590705	+	MLT1A0	LTR	MaLR	26	124	-241	1
1470	1775	146	123	15	chr3	116016856	116017197	-43582586	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	3
1470	467	297	14	7	chr3	116018905	116019044	-43580739	-	MLT1D	LTR	MaLR	-109	396	257	3
1470	4219	136	83	7	chr3	116037722	116038421	-43561362	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	752	-4	6
1470	1481	201	96	30	chr3	116040236	116040663	-43559120	-	RMER13A	LTR	ERVK	-378	482	28	6
1470	999	286	59	6	chr3	116067666	116068004	-43531779	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	356	-14	1
1470	257	278	20	13	chr3	116074254	116074407	-43525376	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	601	1
1470	338	275	18	27	chr3	116098592	116098704	-43501079	+	MTEa	LTR	MaLR	108	218	-161	1
1470	3020	133	198	25	chr3	116119434	116120065	-43479718	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	740	-16	2
1470	293	271	36	127	chr3	116120745	116120910	-43478873	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	109	2
1470	439	200	73	100	chr3	116123219	116123260	-43476523	+	MT2B	LTR	ERVL	119	155	-446	2
1471	3428	30	5	0	chr3	116132825	116133219	-43466564	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1471	264	333	26	9	chr3	116139868	116140068	-43459715	+	MER72	LTR	ERV1	246	473	-249	2
1471	1039	348	91	40	chr3	116141056	116141763	-43458020	-	MER21B	LTR	ERV1	-104	759	17	2
1471	376	304	98	90	chr3	116142088	116142505	-43457278	-	LTR16C	LTR	ERVL	-4	534	65	2
1471	647	225	141	151	chr3	116143604	116143981	-43455802	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	1	2
1471	1289	244	94	19	chr3	116152294	116152666	-43447117	+	MTD	LTR	MaLR	20	419	0	3
1471	2344	148	23	3	chr3	116155201	116155587	-43444196	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	3
1471	274	218	111	127	chr3	116157047	116157173	-43442610	-	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	-651	188	65	3
1471	778	105	20	0	chr3	116157197	116157350	-43442433	+	RMER17B	LTR	ERVK	308	463	-495	3
1471	2754	115	19	5	chr3	116164247	116164659	-43435124	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	1	3
1471	230	288	18	0	chr3	116165864	116165949	-43433834	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	333	3
1471	1451	153	97	3	chr3	116169221	116169530	-43430253	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	338	-56	3
1471	396	90	45	0	chr3	116171478	116171545	-43428238	+	ORR1B2	LTR	MaLR	296	365	-2	3
1471	289	183	0	16	chr3	116172661	116172722	-43427061	-	RMER6B	LTR	ERVK	-31	430	371	3
1471	473	271	51	36	chr3	116176649	116176727	-43423056	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	323	3
1471	766	255	88	51	chr3	116176918	116177201	-43422582	-	MTD	LTR	MaLR	-74	322	1	3
1471	712	329	35	53	chr3	116182443	116182783	-43417000	+	MLT1F2	LTR	MaLR	223	556	-4	3
1471	668	320	45	21	chr3	116183180	116183532	-43416251	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4810	5234	-480	3
1471	1231	258	41	27	chr3	116184904	116185196	-43414587	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	78	3
1471	2303	163	58	0	chr3	116185196	116185594	-43414189	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1471	1231	258	41	27	chr3	116185594	116185668	-43414115	-	MTEa	LTR	MaLR	-302	77	1	3
1471	1280	222	63	84	chr3	116186680	116187094	-43412689	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	3
1471	1044	146	66	28	chr3	116190956	116191168	-43408615	-	RMER6B	LTR	ERVK	-239	222	3	4
1471	2616	94	32	20	chr3	116204905	116205305	-43394478	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	405	-2	4
1471	380	292	67	67	chr3	116210066	116210290	-43389493	+	MLT1B	LTR	MaLR	10	233	-157	4
1471	4382	119	49	27	chr3	116224124	116224857	-43374926	+	RMER6A	LTR	ERVK	5	753	-3	4
1471	354	306	0	0	chr3	116227455	116227553	-43372230	-	RMER12	LTR	ERVK	-477	845	748	5
1471	3348	45	2	2	chr3	116240734	116241134	-43358649	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1471	328	157	39	39	chr3	116254149	116254241	-43345542	+	MLT1A1	LTR	MaLR	283	396	-12	5
1472	2336	64	0	35	chr3	116263180	116263520	-43336263	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	328	-259	5
1472	1814	72	3	61	chr3	116264459	116264753	-43335030	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	311	587	0	5
1472	914	153	60	171	chr3	116269382	116269846	-43329937	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	370	-8	5
1472	230	235	79	90	chr3	116272440	116272529	-43327254	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	153	6
1472	2733	166	47	20	chr3	116275166	116275720	-43324063	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	7	6
1472	754	226	46	67	chr3	116290408	116290693	-43309090	+	RLTR15	LTR	ERVK	8	286	-73	6
1472	567	191	294	52	chr3	116304737	116305046	-43294737	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	6
1472	3213	74	10	0	chr3	116312115	116312507	-43287276	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1472	1273	175	249	30	chr3	116314863	116314960	-43284823	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	270	7
1472	1273	175	249	30	chr3	116314980	116315183	-43284600	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-98	269	3	7
1472	425	303	121	48	chr3	116318559	116318889	-43280894	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	2	7
1472	343	279	154	47	chr3	116323652	116323866	-43275917	+	MER90	LTR	ERV1	30	266	-309	7
1472	1962	169	80	113	chr3	116325621	116326082	-43273701	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	7
1472	231	240	34	111	chr3	116327059	116327176	-43272607	-	MT2B2	LTR	ERVL	-322	262	155	7
1472	3294	51	15	10	chr3	116328143	116328537	-43271246	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1472	1314	217	109	6	chr3	116339664	116340003	-43259780	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
1472	2091	94	94	0	chr3	116342945	116343243	-43256540	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	7
1472	1284	213	169	6	chr3	116343752	116344083	-43255700	+	MTD	LTR	MaLR	35	419	0	7
1472	653	288	212	43	chr3	116366359	116366755	-43233028	+	MLT1F1	LTR	MaLR	1	463	-106	8
1472	357	219	70	87	chr3	116384815	116384930	-43214853	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	152	8
1472	2071	159	93	21	chr3	116386689	116387074	-43212709	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	8
1472	289	241	34	102	chr3	116387952	116388040	-43211743	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	159	8
1473	3026	60	39	0	chr3	116396231	116396612	-43203171	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	9
1473	1605	183	96	14	chr3	116399182	116399537	-43200246	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	9
1473	607	309	126	39	chr3	116400399	116400685	-43199098	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	55	9
1473	899	188	85	142	chr3	116416747	116417182	-43182601	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	9
1473	1297	173	31	23	chr3	116417641	116417902	-43181881	+	ORR1B1	LTR	MaLR	132	394	0	9
1473	9413	140	52	136	chr3	116417903	116419047	-43180736	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	2	1032	-931	9
1473	9413	140	52	136	chr3	116419193	116420188	-43179595	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1033	1963	0	9
1473	1943	156	6	14	chr3	116420203	116420554	-43179229	+	ORR1B1	LTR	MaLR	47	394	0	9
1473	677	83	83	9	chr3	116421366	116421475	-43178308	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	117	-451	9
1473	250	208	13	89	chr3	116421720	116421799	-43177984	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	178	250	-2592	9
1473	1703	172	35	27	chr3	116421936	116422317	-43177466	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	413	-92	9
1473	741	264	173	42	chr3	116422409	116422501	-43177282	+	RLTR20D	LTR	ERVK	414	504	-1	9
1473	960	160	57	76	chr3	116426979	116427189	-43172594	+	RMER4B	LTR	ERVK	380	585	0	9
1473	908	160	42	15	chr3	116427467	116427630	-43172153	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	193	9
1473	760	106	218	23	chr3	116427720	116427862	-43171921	-	RMER10B	LTR	ERVL	-206	192	14	9
1473	597	204	120	22	chr3	116429830	116430106	-43169677	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	9	311	-4680	1
1473	270	258	155	0	chr3	116430099	116430196	-43169587	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	455	566	-4425	1
1473	249	210	32	0	chr3	116431026	116431088	-43168695	+	ORR1C2	LTR	MaLR	11	74	-310	1
1473	439	234	131	0	chr3	116431140	116431247	-43168536	+	ORR1C2	LTR	MaLR	186	306	-78	1
1473	293	236	118	59	chr3	116433791	116433926	-43165857	+	MER92C	LTR	ERV1	227	369	-185	1
1473	403	283	146	70	chr3	116435103	116435445	-43164338	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	1
1473	3792	51	25	4	chr3	116436694	116437166	-43162617	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1473	3428	22	22	0	chr3	116437476	116437877	-43161906	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	2	1
1473	355	300	111	51	chr3	116438068	116438419	-43161364	+	MER34B-int	LTR	ERV1	2544	2915	-2021	1
1473	464	279	68	71	chr3	116440885	116441375	-43158408	+	MER34B-int	LTR	ERV1	2887	3671	-1685	1
1473	2666	122	29	44	chr3	116463332	116463814	-43135969	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	1
1473	3573	65	20	14	chr3	116463814	116464538	-43135245	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	662	-5819	1
1473	454	66	0	32	chr3	116464538	116464601	-43135182	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1419	-5062	1
1473	1793	130	4	4	chr3	116464590	116464852	-43134931	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2236	2497	-5183	1
1473	953	80	24	0	chr3	116464847	116464972	-43134811	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4783	4910	-2770	1
1473	26940	14	3	0	chr3	116464972	116467919	-43131864	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3525	6481	0	1
1473	2642	124	29	44	chr3	116467919	116468401	-43131382	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	1
1473	2251	72	6	12	chr3	116469480	116469806	-43129977	+	ORR1A2	LTR	MaLR	4	327	0	1
1473	230	261	54	43	chr3	116479681	116479735	-43120048	-	MTD	LTR	MaLR	-4	355	301	1
1473	266	200	33	0	chr3	116479735	116479795	-43119988	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	62	-308	1
1473	354	269	9	19	chr3	116479780	116479886	-43119897	-	MTD	LTR	MaLR	-314	105	1	1
1473	231	276	20	136	chr3	116486569	116486716	-43113067	-	MT2B	LTR	ERVL	-320	281	152	1
1473	316	294	0	19	chr3	116489087	116489191	-43110592	+	MLT1A1	LTR	MaLR	295	396	-12	1
1473	226	293	12	35	chr3	116492330	116492415	-43107368	+	MLT1J	LTR	MaLR	291	373	-139	1
1473	1334	227	44	14	chr3	116511465	116511809	-43087974	+	MTD	LTR	MaLR	46	399	-20	3
1473	679	174	177	35	chr3	116512957	116513160	-43086623	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	298	3
1473	1445	163	63	48	chr3	116513466	116513782	-43086001	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	2	322	0	3
1473	902	258	69	74	chr3	116517402	116517491	-43082292	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	86	-293	4
1473	902	258	69	74	chr3	116517549	116517836	-43081947	+	MTE2a	LTR	MaLR	87	377	-2	4
1473	2670	8	2	239	chr3	116520456	116520937	-43078846	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	4
1473	8051	89	75	30	chr3	116520937	116522186	-43077597	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	4
184	29627	18	1	0	chr3	116522185	116525454	-43074329	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3210	6481	0	4
1474	2670	8	2	239	chr3	116525454	116525935	-43073848	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	4
1474	1410	35	90	5	chr3	116526092	116526292	-43073491	-	MTB	LTR	MaLR	-2	398	182	4
1474	1527	160	97	78	chr3	116532467	116532839	-43066944	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	1	6
1474	1716	240	59	29	chr3	116536802	116537386	-43062397	-	RMER13A	LTR	ERVK	-202	658	15	8
1474	1152	201	40	219	chr3	116537648	116537781	-43062002	-	RLTR40	LTR	ERVK	-341	476	357	8
1474	1152	201	40	219	chr3	116537928	116538109	-43061674	-	RLTR40	LTR	ERVK	-461	356	231	8
1474	1152	201	40	219	chr3	116538308	116538572	-43061211	-	RLTR40	LTR	ERVK	-587	230	1	8
1474	369	330	132	5	chr3	116538584	116538788	-43060995	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	357	128	8
1474	1160	220	99	89	chr3	116540138	116540360	-43059423	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	212	9
1474	1160	220	99	89	chr3	116540529	116540720	-43059063	-	MTD	LTR	MaLR	-208	211	2	9
1474	2045	131	25	12	chr3	116541077	116541402	-43058381	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	329	1	9
1474	976	214	10	5	chr3	116541724	116541931	-43057852	+	RLTR19B	LTR	ERVK	508	715	0	9
1474	3427	209	136	71	chr3	116541931	116543054	-43056729	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-313	1196	1	9
1474	2229	180	13	0	chr3	116543054	116543443	-43056340	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	9
1474	2917	159	98	84	chr3	116544297	116544977	-43054806	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	1
1474	441	244	89	10	chr3	116550262	116550425	-43049358	+	ORR1D1	LTR	MaLR	243	418	-1	1
1474	1228	244	86	67	chr3	116553351	116553781	-43046002	+	MTD-int	LTR	MaLR	616	1053	-205	1
1474	488	216	35	23	chr3	116554130	116554301	-43045482	+	MTD-int	LTR	MaLR	1072	1244	-14	1
1474	1610	166	20	3	chr3	116554299	116554596	-43045187	+	MTD	LTR	MaLR	14	315	-104	1
1474	3501	23	5	0	chr3	116557693	116558087	-43041696	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1474	276	270	77	17	chr3	116558452	116558569	-43041214	+	ORR1E	LTR	MaLR	64	187	-172	1
1474	240	182	0	0	chr3	116558592	116558636	-43041147	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	490	1
1474	2457	147	32	8	chr3	116558696	116559169	-43040614	-	MT2A	LTR	ERVL	-46	487	4	1
1474	280	169	51	90	chr3	116560223	116560301	-43039482	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	189	1
1474	2159	172	17	24	chr3	116568057	116568467	-43031316	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
1474	394	258	29	79	chr3	116568876	116569015	-43030768	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	126	1
1474	590	121	24	1	chr3	116575997	116576103	-43023680	+	MT2B	LTR	ERVL	1	109	-424	1
1474	540	219	24	0	chr3	116576150	116576273	-43023510	+	MT2B	LTR	ERVL	87	212	-321	1
1474	2369	168	163	18	chr3	116576283	116576902	-43022881	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	152	894	-4867	1
1474	6494	130	67	42	chr3	116576908	116577066	-43022717	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1605	1756	-4005	1
1474	6494	137	181	24	chr3	116577247	116578893	-43020890	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1757	3672	-2089	1
1474	6734	135	20	56	chr3	116578951	116579461	-43020322	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3971	4478	-1283	1
1474	6734	135	20	56	chr3	116579607	116580204	-43019579	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4479	5038	-723	1
1474	536	291	140	37	chr3	116590699	116590999	-43008784	-	MER21B	LTR	ERV1	-168	695	365	2
1474	237	308	158	0	chr3	116595070	116595190	-43004593	-	LTR87	LTR	ERVL?	-99	525	387	2
1474	1098	229	142	15	chr3	116595808	116596132	-43003651	-	MTD	LTR	MaLR	-54	365	1	2
1474	381	20	20	0	chr3	116611782	116611833	-42987950	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	326	275	2
1474	2102	68	4	0	chr3	116612529	116612810	-42986973	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-45	282	1	2
1474	1766	190	55	55	chr3	116614160	116614494	-42985289	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	76	2
1474	1766	190	55	55	chr3	116614998	116615081	-42984702	-	MTC	LTR	MaLR	-346	75	1	2
1474	346	151	3	9	chr3	116615982	116616068	-42983715	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	316	2
1474	2242	159	8	3	chr3	116616811	116617176	-42982607	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	2
1474	2002	179	83	40	chr3	116620050	116620579	-42979204	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	552	-9	3
1474	356	179	50	109	chr3	116627352	116627471	-42972312	+	MT2B	LTR	ERVL	153	264	-337	3
1474	358	281	33	58	chr3	116630835	116630956	-42968827	+	MTEa	LTR	MaLR	1	118	-261	3
1474	387	275	80	37	chr3	116631169	116631326	-42968457	+	MTEa	LTR	MaLR	202	377	-2	3
1474	3713	133	45	50	chr3	116641038	116641732	-42958051	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	3
1474	637	276	77	21	chr3	116645920	116646234	-42953549	+	MTD	LTR	MaLR	6	387	-32	3
1474	2315	150	88	0	chr3	116649313	116649700	-42950083	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1474	1713	104	208	23	chr3	116652563	116652693	-42947090	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	282	3
1474	1713	104	208	23	chr3	116652749	116652823	-42946960	-	RMER17C	LTR	ERVK	-129	281	169	3
1474	1713	104	208	23	chr3	116653003	116653143	-42946640	-	RMER17C	LTR	ERVK	-242	168	1	3
1475	2062	163	85	21	chr3	116660902	116661371	-42938412	+	RLTR28	LTR	ERVL	6	504	-20	3
1475	303	283	19	0	chr3	116663499	116663605	-42936178	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	108	-251	3
1475	1677	185	37	48	chr3	116673913	116674287	-42925496	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	5	3
1475	666	334	104	10	chr3	116675508	116675892	-42923891	-	LTR16B	LTR	ERVL	0	463	44	4
1475	505	271	74	116	chr3	116677585	116677948	-42921835	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	10	4
1475	3167	158	92	23	chr3	116680568	116681210	-42918573	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	5	4
1475	284	206	151	11	chr3	116682489	116682582	-42917201	+	MLT1A1	LTR	MaLR	299	404	-4	4
1475	533	273	14	102	chr3	116687453	116687669	-42912114	+	MTD	LTR	MaLR	1	197	-222	4
1475	431	309	0	16	chr3	116687780	116687908	-42911875	+	MTD	LTR	MaLR	280	405	-14	4
1475	3554	170	100	36	chr3	116691766	116692619	-42907164	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	2	4
1475	1102	183	47	0	chr3	116693894	116694107	-42905676	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-91	236	14	4
1475	1122	248	89	25	chr3	116697243	116697617	-42902166	+	MTD	LTR	MaLR	17	403	-16	4
1475	909	279	127	35	chr3	116708117	116708433	-42891350	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	345	-25	4
1475	555	337	136	60	chr3	116708975	116709474	-42890309	-	MLT1F	LTR	MaLR	-9	539	3	4
1475	1023	333	204	29	chr3	116709483	116710597	-42889186	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-7	1482	174	4
1475	696	270	140	101	chr3	116712185	116712543	-42887240	-	MTE2a	LTR	MaLR	-7	372	1	4
1475	513	246	44	44	chr3	116713218	116713401	-42886382	-	MLT2F	LTR	ERVL	-280	383	201	4
1475	3392	31	13	0	chr3	116718890	116719281	-42880502	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1475	396	297	25	37	chr3	116720361	116720522	-42879261	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	224	4
1475	1996	168	36	0	chr3	116726926	116727260	-42872523	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	4
1475	386	310	21	70	chr3	116727376	116727563	-42872220	-	ORR1E	LTR	MaLR	-164	195	18	4
1475	1167	239	185	38	chr3	116731196	116731644	-42868139	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	514	-40	4
1475	855	389	86	19	chr3	116743030	116743615	-42856168	-	MLT2E	LTR	ERVL	-2	626	3	4
1475	1357	209	76	48	chr3	116743775	116744067	-42855716	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	311	-59	4
1475	1357	209	76	48	chr3	116744264	116744327	-42855456	+	ORR1D2	LTR	MaLR	312	370	0	4
1475	1945	189	56	25	chr3	116744887	116745283	-42854500	+	MTD	LTR	MaLR	1	408	-11	5
1475	303	237	165	0	chr3	116745354	116745451	-42854332	+	MTD-int	LTR	MaLR	19	131	-1127	5
1475	445	78	0	15	chr3	116745452	116745517	-42854266	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-63	283	220	5
1475	1219	279	55	11	chr3	116745893	116746256	-42853527	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	5
1475	1013	253	93	99	chr3	116749199	116749703	-42850080	-	RLTR18	LTR	ERVK	-115	501	1	5
1475	948	258	98	36	chr3	116749703	116749939	-42849844	+	ORR1D2	LTR	MaLR	118	370	0	5
1475	1043	297	41	15	chr3	116756230	116756568	-42843215	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	353	-6	5
1475	1255	233	119	27	chr3	116757009	116757344	-42842439	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	5
1475	3688	18	5	0	chr3	116757930	116758324	-42841459	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1475	857	243	270	0	chr3	116760414	116760718	-42839065	+	MTD	LTR	MaLR	20	405	-14	5
1475	233	194	179	0	chr3	116761219	116761286	-42838497	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	84	-290	5
1475	2247	122	3	0	chr3	116767619	116767939	-42831844	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	6	5
1475	798	280	110	13	chr3	116770223	116770523	-42829260	-	RMER15	LTR	ERVL	-27	548	220	5
1475	1232	201	241	12	chr3	116772180	116772494	-42827289	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	16	5
1475	1232	201	241	12	chr3	116772549	116772562	-42827221	-	MTD	LTR	MaLR	-404	15	3	5
1475	311	330	17	17	chr3	116772703	116772823	-42826960	+	MTEa	LTR	MaLR	258	377	-2	5
1475	297	310	115	144	chr3	116774626	116774965	-42824818	+	ORR1E	LTR	MaLR	51	379	0	5
1475	1747	218	19	19	chr3	116778039	116778409	-42821374	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	1	5
1475	396	169	0	38	chr3	116778867	116778947	-42820836	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	77	-740	5
1475	246	248	139	0	chr3	116778946	116779047	-42820736	-	RLTR40	LTR	ERVK	-219	598	484	5
1475	2187	192	86	26	chr3	116779044	116779588	-42820195	+	RLTR40	LTR	ERVK	82	658	-159	5
1475	254	401	21	0	chr3	116779759	116779901	-42819882	-	LTR78	LTR	ERV1	-19	1285	1141	5
1475	1216	263	68	43	chr3	116780498	116780868	-42818915	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	5
1475	588	291	73	103	chr3	116782762	116782840	-42816943	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	83	-276	5
1475	3329	21	21	3	chr3	116782840	116783229	-42816554	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1475	588	291	73	103	chr3	116783229	116783518	-42816265	+	ORR1E	LTR	MaLR	84	357	-2	5
1475	1930	139	84	15	chr3	116783547	116783890	-42815893	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1475	4817	223	65	50	chr3	116783890	116784537	-42815246	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	659	-711	5
184	4817	223	65	50	chr3	116784685	116785386	-42814397	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	660	1369	-1	5
1476	1753	172	49	17	chr3	116785386	116785734	-42814049	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	5
1476	1005	206	126	0	chr3	116789180	116789403	-42810380	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	251	-143	5
1476	333	254	156	39	chr3	116789421	116789601	-42810182	-	RLTR21	LTR	ERVK	-31	1541	1341	5
1476	3787	142	90	28	chr3	116789605	116789990	-42809793	-	RMER12	LTR	ERVK	-517	805	435	5
1476	3787	142	90	28	chr3	116790174	116790546	-42809237	-	RMER12	LTR	ERVK	-888	434	1	5
1476	979	102	0	7	chr3	116790546	116790694	-42809089	+	ORR1B2	LTR	MaLR	221	367	0	5
1476	283	326	89	47	chr3	116792731	116792878	-42806905	+	MLT1I	LTR	MaLR	98	258	-153	5
1476	283	326	89	47	chr3	116793085	116793172	-42806611	+	MLT1I	LTR	MaLR	259	342	-69	5
1476	5506	87	90	33	chr3	116795647	116796500	-42803283	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	5
1476	3165	116	50	20	chr3	116798680	116799226	-42800557	+	RMER2	LTR	ERV1	1	562	-5	6
1476	2871	76	2	15	chr3	116813521	116813746	-42786037	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	220	-187	6
1476	1985	113	12	54	chr3	116813746	116814082	-42785701	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	6
1476	2871	76	2	15	chr3	116814082	116814268	-42785515	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	221	407	0	6
1476	820	317	49	3	chr3	116814476	116814821	-42784962	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	5	6
1476	307	49	0	0	chr3	116815479	116815520	-42784263	+	ORR1A2	LTR	MaLR	286	326	0	6
1476	10997	129	58	16	chr3	116815520	116817404	-42782379	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1963	0	6
1476	856	133	19	26	chr3	116817404	116817558	-42782225	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	153	-174	6
1476	601	290	6	6	chr3	116818123	116818293	-42781490	+	MTD	LTR	MaLR	3	172	-247	6
1476	434	277	142	5	chr3	116818887	116819093	-42780690	+	MTD	LTR	MaLR	177	419	0	6
1476	561	336	52	26	chr3	116821194	116821466	-42778317	+	MLT1B	LTR	MaLR	112	390	0	6
1476	1892	168	111	3	chr3	116823841	116824212	-42775571	+	MTC	LTR	MaLR	1	411	-10	6
1476	1801	231	37	5	chr3	116827023	116827431	-42772352	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1476	2253	127	0	3	chr3	116827434	116827759	-42772024	+	ORR1A3	LTR	MaLR	3	326	0	6
1476	369	214	50	10	chr3	116828363	116828462	-42771321	+	MTE2a	LTR	MaLR	275	377	-2	6
1476	494	247	33	20	chr3	116828566	116828719	-42771064	+	MTD	LTR	MaLR	5	159	-260	6
1476	2300	217	45	55	chr3	116837389	116837990	-42761793	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	22	6
1476	250	338	81	43	chr3	116839512	116839673	-42760110	-	MLT1H	LTR	MaLR	0	549	383	6
1476	1830	111	27	113	chr3	116840561	116840897	-42758886	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-14	313	7	6
1476	236	269	45	0	chr3	116843368	116843435	-42756348	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	72	-307	6
1476	1092	276	47	60	chr3	116851237	116851619	-42748164	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	1	6
1476	2534	133	10	13	chr3	116851696	116852085	-42747698	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-6	388	1	6
1476	2666	211	40	81	chr3	116854948	116855602	-42744181	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	627	0	7
1476	438	48	16	31	chr3	116859560	116859624	-42740159	+	ORR1A2	LTR	MaLR	265	327	0	7
1476	1147	215	197	3	chr3	116859624	116859918	-42739865	+	ORR1D1	LTR	MaLR	24	374	0	7
1476	263	291	106	39	chr3	116860293	116860472	-42739311	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-179	1669	1479	7
1476	598	203	0	83	chr3	116860944	116861100	-42738683	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	143	-410	7
1476	388	248	47	31	chr3	116861765	116861894	-42737889	+	RMER15	LTR	ERVL	1	131	-444	7
1476	763	306	13	17	chr3	116861980	116862219	-42737564	+	RMER15	LTR	ERVL	310	547	-28	7
1476	384	332	57	111	chr3	116862269	116862567	-42737216	+	MamGypLTR1a	LTR	Gypsy	500	781	-3	7
1476	991	257	76	13	chr3	116862792	116863017	-42736766	+	MTD	LTR	MaLR	80	318	-101	7
1476	2627	164	46	9	chr3	116863057	116863518	-42736265	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	76	7
1476	287	213	139	7	chr3	116864803	116864940	-42734843	+	RMER17D2	LTR	ERVK	389	543	-266	7
1476	1109	297	40	26	chr3	116866418	116866770	-42733013	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	7
1476	1440	252	37	29	chr3	116867013	116867364	-42732419	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	7
1476	327	360	52	21	chr3	116867382	116867575	-42732208	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	200	-159	7
1476	1196	267	113	34	chr3	116868087	116868475	-42731308	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1476	2181	164	89	34	chr3	116868522	116868995	-42730788	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	499	0	7
1476	1231	255	182	14	chr3	116869382	116869492	-42730291	+	MTD	LTR	MaLR	1	119	-300	7
1476	1231	255	182	14	chr3	116869571	116869818	-42729965	+	MTD	LTR	MaLR	120	418	-1	7
1476	3735	35	5	0	chr3	116871599	116872033	-42727750	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	7
1476	1653	182	92	6	chr3	116873531	116873879	-42725904	+	MTEa	LTR	MaLR	2	379	0	7
1476	1433	286	109	15	chr3	116880705	116881163	-42718620	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	501	-53	7
1476	839	359	78	34	chr3	116881667	116881931	-42717852	+	MLT-int	LTR	MaLR	1212	1472	-263	7
1476	1602	215	21	37	chr3	116881931	116882308	-42717475	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	371	-3	7
1476	839	359	78	34	chr3	116882308	116882545	-42717238	+	MLT-int	LTR	MaLR	1473	1734	-1	7
1476	782	243	68	16	chr3	116882622	116882814	-42716969	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	178	7
1476	837	280	65	43	chr3	116889820	116890096	-42709687	+	MTEa	LTR	MaLR	98	379	0	7
1476	254	135	50	30	chr3	116893770	116893869	-42705914	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1139	1239	-2060	7
1476	240	255	0	0	chr3	116895577	116895628	-42704155	+	MTC	LTR	MaLR	28	78	-343	7
1476	1774	149	68	39	chr3	116896130	116896466	-42703317	+	MTC	LTR	MaLR	68	413	-8	7
1476	298	235	38	105	chr3	116896997	116897055	-42702728	-	MTEa	LTR	MaLR	0	370	322	7
1476	914	264	53	82	chr3	116897098	116897434	-42702349	-	MTEa	LTR	MaLR	-51	328	1	7
1476	284	299	54	74	chr3	116899433	116899581	-42700202	+	RMER5	LTR	ERV1	15	159	-375	7
1476	488	281	53	92	chr3	116899916	116900143	-42699640	+	RMER5	LTR	ERV1	117	334	-200	7
1476	546	263	85	28	chr3	116900764	116900940	-42698843	+	RLTR18B	LTR	ERVK	84	269	-243	7
1476	1170	278	30	27	chr3	116900916	116901245	-42698538	+	RLTR18B	LTR	ERVK	178	507	-5	7
1476	2009	106	31	22	chr3	116903169	116903488	-42696295	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
1476	15097	16	1	1	chr3	116903488	116905142	-42694641	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1	1655	-1659	7
1476	2734	103	111	12	chr3	116905142	116905574	-42694209	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	7
1476	15097	16	1	1	chr3	116905574	116905592	-42694191	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1656	1672	-1642	7
1476	6109	42	4	20	chr3	116905576	116906332	-42693451	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2	6479	5736	7
1476	2177	69	7	0	chr3	116906331	116906607	-42693176	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-4845	1636	1359	7
1476	3645	58	4	16	chr3	116906607	116907185	-42692598	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	168	7
1476	228	321	0	0	chr3	116907185	116907238	-42692545	-	RLTR27	LTR	ERVK	-34	275	223	7
1476	272	32	0	0	chr3	116907238	116907269	-42692514	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6286	195	165	7
1476	230	327	0	0	chr3	116907269	116907321	-42692462	-	RLTR27	LTR	ERVK	-37	272	221	7
1476	1039	82	26	105	chr3	116907321	116907512	-42692271	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-6288	193	18	7
1476	251	51	0	0	chr3	116907497	116907536	-42692247	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-1932	55	17	7
1476	341	123	82	0	chr3	116907537	116907610	-42692173	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-1906	81	3	7
1476	2650	108	116	12	chr3	116907635	116908065	-42691718	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	7
1476	19055	146	31	21	chr3	116908309	116913171	-42686612	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1658	7202	-204	7
1476	2017	102	31	22	chr3	116913171	116913490	-42686293	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
1477	239	349	153	15	chr3	116919587	116919718	-42680065	+	MLT1A	LTR	MaLR	4	152	-222	7
1477	531	298	11	58	chr3	116919822	116920011	-42679772	+	MLT1A	LTR	MaLR	195	374	0	7
1477	859	342	75	57	chr3	116920264	116920652	-42679131	-	MLT1H	LTR	MaLR	-131	418	24	7
1477	2915	88	33	13	chr3	116925971	116926363	-42673420	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	8
1477	1506	191	130	26	chr3	116933701	116934040	-42665743	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	8
1477	663	317	98	43	chr3	116937879	116938278	-42661505	-	MER68	LTR	ERVL	0	563	143	8
1477	426	147	783	0	chr3	116939044	116939164	-42660619	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	214	-506	8
1477	2352	135	21	85	chr3	116941370	116941887	-42657896	+	RMER6C	LTR	ERVK	204	687	-3	8
1477	4654	80	2	49	chr3	116941996	116942612	-42657171	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	8
1477	376	298	81	74	chr3	116944246	116944590	-42655193	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-259	433	51	8
1477	372	306	26	70	chr3	116949922	116950193	-42649590	-	RMER17C	LTR	ERVK	-68	342	84	8
1477	419	273	74	12	chr3	116952166	116952329	-42647454	-	MER57E1	LTR	ERV1	-195	177	5	8
1477	240	263	216	101	chr3	116953494	116953693	-42646090	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1101	8
1477	5463	117	33	1	chr3	116953885	116954733	-42645050	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-973	875	1	8
1477	826	230	47	7	chr3	116956229	116956462	-42643321	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	243	8
1477	5812	234	88	15	chr3	116956693	116958537	-42641246	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	4937	6915	-4	8
1477	531	326	116	25	chr3	116958700	116959027	-42640756	+	RMER20B	LTR	ERVK	240	596	-31	8
1477	480	245	20	0	chr3	116959031	116959133	-42640650	-	MT2A	LTR	ERVL	-336	197	94	8
1477	537	267	7	30	chr3	116959129	116959264	-42640519	-	MT2A	LTR	ERVL	-401	132	1	8
1477	1127	175	37	112	chr3	116961234	116961582	-42638201	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	8
1477	676	328	58	31	chr3	116963612	116963971	-42635812	-	MER88	LTR	ERVL	-75	389	21	8
1477	478	246	70	64	chr3	116969262	116969449	-42630334	+	MTEa	LTR	MaLR	19	206	-173	8
1477	543	310	120	51	chr3	116983781	116984097	-42615686	+	RMER15	LTR	ERVL	221	558	-17	8
1477	705	310	46	85	chr3	116998270	116998577	-42601206	+	MTE2a	LTR	MaLR	22	316	-63	9
1477	226	331	78	107	chr3	117006042	117006350	-42593433	-	ORR1E	LTR	MaLR	-55	304	6	1
1477	255	248	16	103	chr3	117008578	117008704	-42591079	-	LTR40b	LTR	ERVL	-31	431	317	2
1477	577	294	135	9	chr3	117011624	117011854	-42587929	-	MLT1B	LTR	MaLR	-129	261	3	2
1477	1293	211	78	36	chr3	117018822	117019181	-42580602	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
1478	3076	66	2	12	chr3	117068153	117068553	-42531230	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1478	1961	249	36	226	chr3	117074956	117075305	-42524478	-	RMER12	LTR	ERVK	-10	1312	992	1
1478	1961	249	36	226	chr3	117075514	117076783	-42523000	-	RMER12	LTR	ERVK	-331	991	2	1
1478	1939	127	62	23	chr3	117079878	117080232	-42519551	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	1
1478	3048	17	43	0	chr3	117082086	117082438	-42517345	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
1478	53213	21	16	1	chr3	117082438	117088816	-42510967	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	1
1478	3059	14	43	0	chr3	117088816	117089168	-42510615	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
1478	1219	281	53	31	chr3	117090717	117091168	-42508615	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	59	1
1478	756	336	52	17	chr3	117094261	117094549	-42505234	+	MLT1A0	LTR	MaLR	8	305	-60	1
1478	1665	203	30	30	chr3	117094744	117095110	-42504673	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	370	-4	1
1478	1463	247	39	22	chr3	117098807	117099167	-42500616	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	366	-13	1
1478	537	323	37	21	chr3	117109154	117109311	-42490472	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	160	-205	1
1478	415	303	84	0	chr3	117109569	117109724	-42490059	+	MLT1A0	LTR	MaLR	192	359	-6	1
1478	1080	231	102	0	chr3	117124370	117124625	-42475158	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	295	1
1478	479	232	31	31	chr3	117124653	117124782	-42475001	-	RMER15	LTR	ERVL	-420	155	27	1
1478	1802	232	30	16	chr3	117126404	117126768	-42473015	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	6	1
1478	484	330	112	8	chr3	117127560	117127848	-42471935	+	MLT1F1	LTR	MaLR	211	563	-6	1
1478	299	264	68	97	chr3	117128697	117128873	-42470910	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	171	-188	1
1478	414	240	57	96	chr3	117128885	117129115	-42470668	+	RLTR15	LTR	ERVK	120	340	-19	1
1478	669	276	66	105	chr3	117129186	117129613	-42470170	+	MTC	LTR	MaLR	5	389	-30	1
1478	1048	242	127	32	chr3	117131802	117132140	-42467643	+	MTEa	LTR	MaLR	6	375	-4	1
1478	2922	9	3	0	chr3	117133276	117133617	-42466166	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-54	342	1	2
1478	3551	22	42	2	chr3	117133617	117134066	-42465717	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	632	2
1478	2775	134	87	28	chr3	117137165	117137594	-42462189	+	RLTR20A	LTR	ERVK	4	439	-102	2
1478	2775	134	87	28	chr3	117137644	117137719	-42462064	+	RLTR20A	LTR	ERVK	440	538	-3	2
1478	915	226	36	85	chr3	117140383	117140664	-42459119	+	MT2A	LTR	ERVL	1	267	-266	2
1478	1835	194	8	30	chr3	117154163	117154535	-42445248	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	364	-3	2
1478	245	206	19	148	chr3	117154811	117154919	-42444864	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	205	298	-109	2
1478	571	208	70	37	chr3	117155311	117155481	-42444302	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	170	2
1478	1611	139	97	77	chr3	117156964	117157316	-42442467	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	419	36	2
1478	325	216	0	13	chr3	117159852	117159927	-42439856	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	304	2
1478	3092	53	12	12	chr3	117165680	117166080	-42433703	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
1478	420	263	8	116	chr3	117166117	117166219	-42433564	+	MER57E1	LTR	ERV1	242	329	-43	2
1478	420	263	8	116	chr3	117166365	117166391	-42433392	+	MER57E1	LTR	ERV1	330	356	-16	2
1478	1754	167	128	3	chr3	117170179	117170522	-42429261	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	2
1478	878	299	71	55	chr3	117172640	117173053	-42426730	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	1	2
1478	1828	164	37	3	chr3	117176829	117177153	-42422630	+	ORR1B1	LTR	MaLR	52	386	-8	2
1479	1680	226	40	24	chr3	117181408	117181780	-42418003	+	MTD	LTR	MaLR	30	407	-12	2
1479	647	303	126	66	chr3	117184748	117184928	-42414855	-	MLT1B	LTR	MaLR	-4	386	203	2
1479	647	303	126	66	chr3	117185409	117185592	-42414191	-	MLT1B	LTR	MaLR	-188	202	2	2
1479	1068	270	57	134	chr3	117185778	117186180	-42413603	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	1	2
1479	835	279	108	31	chr3	117186992	117187343	-42412440	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	2	2
1479	226	281	49	66	chr3	117190226	117190348	-42409435	-	LTR45	LTR	ERV1	-36	489	370	2
1479	461	301	24	53	chr3	117192264	117192471	-42407312	-	MLT1D	LTR	MaLR	-62	443	243	2
1479	297	351	5	83	chr3	117195902	117196099	-42403684	-	MLT1D	LTR	MaLR	-323	182	3	2
1479	246	342	62	9	chr3	117199992	117200104	-42399679	-	ORR1E	LTR	MaLR	-241	118	1	3
1479	2377	129	91	7	chr3	117201392	117201799	-42397984	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	441	0	3
1479	1280	273	30	36	chr3	117203225	117203586	-42396197	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	379	7	3
1479	913	262	119	20	chr3	117205976	117206319	-42393464	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	2	3
1479	775	277	130	36	chr3	117206397	117206704	-42393079	+	MTD	LTR	MaLR	30	365	-54	3
1479	3807	167	132	37	chr3	117221259	117222044	-42377739	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	860	0	3
1479	399	123	0	0	chr3	117223705	117223762	-42376021	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	59	-311	3
1479	368	265	48	19	chr3	117223742	117223846	-42375937	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1262	108	2	3
1479	1184	275	16	43	chr3	117223849	117224218	-42375565	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	3
1479	282	232	18	136	chr3	117238855	117238965	-42360818	-	MT2B2	LTR	ERVL	-346	238	142	3
1479	1358	297	24	26	chr3	117246020	117246400	-42353383	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	3
1479	318	234	0	0	chr3	117248726	117248790	-42350993	-	RLTR19C	LTR	ERVK	-410	96	33	3
1479	576	278	113	45	chr3	117253475	117253763	-42346020	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	13	3
1479	2167	220	18	99	chr3	117255694	117256359	-42343424	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	3
1479	362	280	107	86	chr3	117258432	117258666	-42341117	-	MLT1C	LTR	MaLR	-189	278	40	3
1479	3220	168	76	8	chr3	117264781	117265424	-42334359	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	690	0	3
1479	362	323	15	0	chr3	117270656	117270789	-42328994	+	MLT1B	LTR	MaLR	234	368	-22	4
1479	253	244	135	56	chr3	117288332	117288458	-42311325	-	LTR82A	LTR	ERVL	-126	746	611	4
1479	307	235	111	56	chr3	117288659	117288821	-42310962	-	LTR82A	LTR	ERVL	-520	352	182	4
1479	299	262	37	22	chr3	117288848	117288956	-42310827	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	268	4
1479	299	386	102	36	chr3	117308252	117308644	-42291139	-	MLT1L	LTR	MaLR	0	610	193	4
1480	987	197	50	48	chr3	117310365	117310725	-42289058	-	RMER10A	LTR	ERVL	-14	428	1	4
1480	1174	218	19	31	chr3	117314664	117314924	-42284859	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	110	4
1480	1222	155	186	111	chr3	117319871	117320204	-42279579	-	RMER6C	LTR	ERVK	-332	358	1	4
1480	3486	8	0	0	chr3	117329254	117329655	-42270128	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1782	3703	3303	4
1480	244	311	56	0	chr3	117337872	117337962	-42261821	-	MLT1A	LTR	MaLR	-247	127	33	4
1480	474	310	70	43	chr3	117338133	117338389	-42261394	+	MLT1A	LTR	MaLR	112	374	0	5
1480	326	321	116	27	chr3	117340851	117341075	-42258708	-	MLT1G	LTR	MaLR	-9	582	339	5
1480	714	329	80	26	chr3	117342758	117343145	-42256638	+	MTC	LTR	MaLR	8	415	-6	5
1480	282	138	82	49	chr3	117343692	117343753	-42256030	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-521	582	520	5
1480	313	294	43	44	chr3	117346092	117346224	-42253559	-	MLT1D	LTR	MaLR	-363	142	10	5
1480	819	256	65	9	chr3	117350055	117350284	-42249499	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	126	5
1480	2542	168	105	21	chr3	117353251	117353335	-42246448	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	87	-474	5
1480	2542	168	105	21	chr3	117353400	117353831	-42245952	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	88	558	-3	5
1480	1627	169	128	6	chr3	117355137	117355464	-42244319	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1480	1224	217	8	27	chr3	117355782	117356042	-42243741	-	RLTR16	LTR	ERVK	-1	504	250	5
1480	1002	260	141	21	chr3	117357486	117357812	-42241971	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	368	-2	5
1480	1697	214	35	22	chr3	117358887	117358994	-42240789	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	269	5
1480	3520	165	118	61	chr3	117358994	117359850	-42239933	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-1	905	1	5
1480	1697	214	35	22	chr3	117359850	117360109	-42239674	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-106	268	3	5
1480	453	251	62	57	chr3	117367305	117367482	-42232301	-	MER57C2	LTR	ERV1	-256	178	1	5
1480	226	247	13	64	chr3	117370386	117370464	-42229319	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-1086	284	211	5
1480	1073	274	24	48	chr3	117376916	117377253	-42222530	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	51	5
1480	518	158	16	78	chr3	117383123	117383315	-42216468	-	RMER17C	LTR	ERVK	-136	274	95	5
1480	233	311	33	0	chr3	117393958	117394019	-42205764	-	MTE2a	LTR	MaLR	-119	240	178	5
1480	279	346	12	0	chr3	117394891	117394972	-42204811	-	MTE2a	LTR	MaLR	-231	148	67	5
1480	742	205	8	196	chr3	117394970	117395225	-42204558	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	366	572	-798	6
1480	307	197	0	16	chr3	117395223	117395285	-42204498	-	MTE2a	LTR	MaLR	-318	61	1	5
1480	305	295	89	39	chr3	117396668	117396848	-42202935	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-219	189	1	6
1480	3624	165	49	18	chr3	117398885	117399556	-42200227	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	6
1480	1038	272	49	35	chr3	117400270	117400659	-42199124	-	MTE2a	LTR	MaLR	-21	398	13	6
1480	1232	281	37	19	chr3	117401105	117401511	-42198272	-	MTE2b	LTR	MaLR	-15	404	1	6
1480	1219	244	28	28	chr3	117401953	117402305	-42197478	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	27	6
1480	636	320	68	79	chr3	117402383	117402736	-42197047	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	349	-118	6
1480	231	273	130	0	chr3	117402900	117402977	-42196806	+	MLT1C	LTR	MaLR	381	467	0	6
1480	305	386	83	33	chr3	117403123	117403399	-42196384	-	MLT1I	LTR	MaLR	-48	363	74	6
1480	237	324	37	37	chr3	117406955	117407064	-42192719	-	MER34A	LTR	ERV1	-392	179	71	6
1480	1586	255	99	8	chr3	117410958	117411444	-42188339	+	MT2A	LTR	ERVL	4	533	0	6
1480	440	146	35	0	chr3	117411502	117411601	-42188182	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	102	-244	6
1480	1543	236	41	31	chr3	117414983	117415399	-42184384	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	1	6
1480	2721	163	264	86	chr3	117417624	117418390	-42181393	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	6
1480	716	333	158	33	chr3	117420474	117420931	-42178852	+	MT2A	LTR	ERVL	17	530	-3	6
1480	257	319	0	78	chr3	117422469	117422571	-42177212	-	ORR1E	LTR	MaLR	-174	185	92	6
1480	333	304	203	31	chr3	117423072	117423389	-42176394	+	RMER5	LTR	ERV1	148	519	-15	6
1480	350	276	394	114	chr3	117427620	117427892	-42171891	+	MTE2a	LTR	MaLR	2	349	-30	6
1480	2898	148	59	17	chr3	117428493	117429034	-42170749	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1266	582	19	6
1480	1418	244	9	39	chr3	117431381	117431713	-42168070	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	98	6
1480	225	281	0	59	chr3	117439412	117439480	-42160303	+	MLT1J1	LTR	MaLR	49	112	-332	6
1480	393	354	88	56	chr3	117440153	117440494	-42159289	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	354	-5	6
1481	326	125	0	0	chr3	117441373	117441421	-42158362	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	367	320	6
1481	1615	190	86	32	chr3	117441503	117441851	-42157932	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-27	367	1	6
1481	425	266	36	54	chr3	117446009	117446176	-42153607	+	RNLTR23	LTR	ERVK	479	642	0	6
1481	455	315	72	24	chr3	117447495	117447734	-42152049	+	MLT1G1	LTR	MaLR	146	394	-201	6
1481	460	346	125	51	chr3	117447929	117448896	-42150887	+	MLT1G1-int	LTR	MaLR	82	1198	-291	6
1481	460	344	137	59	chr3	117449112	117449384	-42150399	+	MLT1G1-int	LTR	MaLR	1199	1487	-2	6
1481	1083	186	30	47	chr3	117452542	117452879	-42146904	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	978	537	6
1481	262	316	63	49	chr3	117459074	117459217	-42140566	-	MER57A-int	LTR	ERV1	-1579	4608	4464	7
1481	294	347	57	28	chr3	117459379	117459850	-42139933	-	MER57A-int	LTR	ERV1	-2100	4087	3603	7
1481	324	271	78	51	chr3	117463735	117463992	-42135791	+	RMER10A	LTR	ERVL	160	423	-19	7
1481	252	290	52	31	chr3	117464455	117464551	-42135232	+	MTD	LTR	MaLR	318	415	-4	7
1481	1835	197	75	8	chr3	117468957	117469331	-42130452	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	7	7
1481	914	307	69	14	chr3	117469539	117469975	-42129808	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-362	5352	4893	7
1481	295	321	18	9	chr3	117470270	117470380	-42129403	+	MLT1B	LTR	MaLR	203	313	-77	7
1481	387	304	203	82	chr3	117477276	117477666	-42122117	+	MLT1C	LTR	MaLR	3	439	-28	7
1481	2765	48	61	0	chr3	117479223	117479601	-42120182	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-10	401	1	7
1481	1397	293	165	52	chr3	117483587	117484357	-42115426	+	RMER13A	LTR	ERVK	4	860	0	7
1481	3852	176	98	16	chr3	117497399	117498335	-42101448	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	1100	-3	7
1481	232	161	10	156	chr3	117501357	117501453	-42098330	+	RLTR25B	LTR	ERVK	427	508	-520	4
1481	1336	159	142	21	chr3	117504440	117504722	-42095061	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	104	1
1481	240	367	94	30	chr3	117509859	117510061	-42089722	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	216	-143	1
1481	2583	202	68	53	chr3	117513845	117514554	-42085229	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	2
1481	404	200	56	85	chr3	117516129	117516275	-42083508	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	372	-2	2
1481	2999	57	0	20	chr3	117551007	117551403	-42048380	-	MTB	LTR	MaLR	-12	388	1	9
1481	284	316	92	78	chr3	117553560	117553670	-42046113	+	MLT1B	LTR	MaLR	116	225	-165	9
1481	284	316	92	78	chr3	117553850	117554010	-42045773	+	MLT1B	LTR	MaLR	226	390	0	9
1481	243	211	0	0	chr3	117555830	117555887	-42043896	+	MLT1A1	LTR	MaLR	340	396	-12	1
1481	1968	138	25	15	chr3	117562982	117563307	-42036476	+	ORR1A4	LTR	MaLR	2	329	0	1
1481	2245	159	69	63	chr3	117563679	117563896	-42035887	+	RMER20B	LTR	ERVK	108	341	-286	1
1481	2245	159	69	63	chr3	117563939	117564230	-42035553	+	RMER20B	LTR	ERVK	342	619	-8	1
1481	275	229	0	32	chr3	117564572	117564635	-42035148	+	RMER21B	LTR	ERV1	108	168	-674	1
1481	362	226	102	31	chr3	117564669	117564797	-42034986	+	RMER21B	LTR	ERV1	303	439	-403	1
1481	312	352	57	79	chr3	117566566	117566794	-42032989	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-334	261	39	1
1482	428	320	33	82	chr3	117575502	117575866	-42023917	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4156	4568	-1189	1
1482	374	350	16	0	chr3	117576188	117576311	-42023472	-	MLT1I	LTR	MaLR	-279	132	8	1
1482	498	258	113	8	chr3	117578099	117578231	-42021552	+	MLT1A0	LTR	MaLR	207	352	-13	1
1482	555	311	235	15	chr3	117578231	117578704	-42021079	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	2	578	-1157	1
1482	257	461	17	0	chr3	117579571	117579688	-42020095	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1130	1248	-487	1
1482	612	316	113	53	chr3	117579729	117580084	-42019699	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1354	1729	-6	1
1482	295	278	81	27	chr3	117580688	117580799	-42018984	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-44	512	396	1
1482	250	287	533	47	chr3	117581002	117581214	-42018569	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-235	321	7	1
1482	1160	345	81	42	chr3	117581374	117581970	-42017813	+	MER21B	LTR	ERV1	133	751	-112	1
1482	787	273	50	111	chr3	117582451	117582974	-42016809	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-210	5504	5014	1
1482	463	270	51	0	chr3	117583486	117583623	-42016160	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-788	4969	4826	1
1482	353	261	15	22	chr3	117584213	117584350	-42015433	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	3860	3995	-1719	1
1482	1912	140	128	6	chr3	117587321	117587665	-42012118	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	1
1482	284	318	27	27	chr3	117593651	117593761	-42006022	+	MER31-int	LTR	ERV1	426	535	-4401	1
1482	230	235	118	0	chr3	117594345	117594413	-42005370	-	MTEa	LTR	MaLR	-14	365	290	1
1482	544	291	7	15	chr3	117594493	117594629	-42005154	-	MTEa	LTR	MaLR	-241	138	4	1
1482	959	234	0	5	chr3	117602530	117602715	-41997068	+	MTD	LTR	MaLR	1	184	-235	1
1482	860	270	89	28	chr3	117610142	117610466	-41989317	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	188	2
1482	1059	233	105	15	chr3	117617743	117618009	-41981774	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	291	-88	2
1482	241	224	0	0	chr3	117630557	117630606	-41969177	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	422	2
1482	1730	233	22	3	chr3	117636278	117636635	-41963148	-	MTC	LTR	MaLR	-57	364	1	2
1482	1698	265	15	2	chr3	117648556	117648964	-41950819	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	7	2
1482	1444	137	82	57	chr3	117649073	117649352	-41950431	+	MT2B	LTR	ERVL	1	286	-315	2
1482	1069	181	20	12	chr3	117649314	117649565	-41950218	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	720	972	-991	2
1482	4885	150	44	95	chr3	117650768	117651817	-41947966	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	969	1963	0	2
1482	1639	188	27	99	chr3	117651824	117652197	-41947586	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	386	-8	2
1482	509	194	13	21	chr3	117653001	117653238	-41946545	+	RMER17A2	LTR	ERVK	279	513	-393	2
1482	320	284	76	49	chr3	117655003	117655188	-41944595	+	MLT-int	LTR	MaLR	483	672	-1063	2
1482	1088	358	108	72	chr3	117657233	117658123	-41941660	+	MLT-int	LTR	MaLR	802	1723	-12	2
1482	235	170	37	19	chr3	117658215	117658269	-41941514	+	ORR1D2	LTR	MaLR	315	369	-1	2
1482	1297	254	85	20	chr3	117658272	117658767	-41941016	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	2
1482	1159	284	61	101	chr3	117659283	117659760	-41940023	-	RMER15	LTR	ERVL	-90	485	28	2
1482	530	254	92	83	chr3	117684025	117684271	-41915512	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	116	3
1483	268	310	79	72	chr3	117711648	117711787	-41887996	+	MLT1A0	LTR	MaLR	213	352	-13	3
1483	393	330	105	38	chr3	117727270	117727613	-41872170	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	88	453	-934	3
1483	1058	273	26	32	chr3	117728275	117728619	-41871164	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	342	-17	3
1483	420	297	114	53	chr3	117731599	117731862	-41867921	-	MER90	LTR	ERV1	-135	440	162	3
1483	228	277	58	46	chr3	117731970	117732057	-41867726	-	MER90	LTR	ERV1	-421	193	106	3
1483	226	338	0	0	chr3	117735662	117735730	-41864053	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	403	4
1483	425	290	106	53	chr3	117739240	117739582	-41860201	+	RLTR16	LTR	ERVK	32	450	-242	4
1483	889	271	48	72	chr3	117739960	117740250	-41859533	+	MTD	LTR	MaLR	22	306	-94	4
1483	826	284	52	99	chr3	117773817	117774417	-41825366	+	MT2B	LTR	ERVL	1	544	-40	4
1483	2205	166	22	93	chr3	117774616	117775219	-41824564	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	2	4
1483	631	335	33	55	chr3	117776483	117776790	-41822993	+	MLT2B2	LTR	ERVL	13	312	-203	4
1483	2088	156	4	118	chr3	117776893	117777125	-41822658	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	181	4
1483	2088	156	4	118	chr3	117777183	117777409	-41822374	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-227	180	1	4
1483	1184	207	9	0	chr3	117777606	117777819	-41821964	+	MTC	LTR	MaLR	124	338	-83	4
1483	1062	221	149	80	chr3	117780858	117781207	-41818576	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	2	4
1483	1006	261	72	23	chr3	117785548	117785875	-41813908	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	4
1483	393	103	0	0	chr3	117789532	117789590	-41810193	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	309	4
1483	1147	208	88	60	chr3	117793642	117793778	-41806005	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	137	-247	4
1483	1147	221	92	61	chr3	117793949	117794155	-41805628	+	ORR1C2	LTR	MaLR	82	325	-59	4
1483	360	375	90	21	chr3	117794689	117794923	-41804860	-	MLT1J	LTR	MaLR	-156	356	107	4
1483	355	348	99	66	chr3	117795758	117796110	-41803673	+	LTR79	LTR	ERVL	31	394	-133	4
1483	1270	286	28	14	chr3	117815216	117815574	-41784209	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	365	-14	5
1483	932	299	46	76	chr3	117820088	117820182	-41779601	+	MTE2a	LTR	MaLR	17	107	-272	5
1483	932	299	46	76	chr3	117820203	117820477	-41779306	+	MTE2a	LTR	MaLR	108	374	-5	5
1483	5848	148	62	41	chr3	117822758	117823825	-41775958	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	3	1091	-23	5
1483	285	187	239	82	chr3	117823912	117824046	-41775737	-	RMER15	LTR	ERVL	-96	479	325	5
1483	272	267	45	162	chr3	117824054	117824233	-41775550	-	RMER15	LTR	ERVL	-415	160	3	5
1483	1757	245	24	82	chr3	117824436	117824938	-41774845	+	RMER19C	LTR	ERVK	139	611	0	5
1483	3174	56	2	5	chr3	117826320	117826717	-41773066	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1483	521	341	70	32	chr3	117827477	117827819	-41771964	-	MLT1C	LTR	MaLR	-71	396	42	5
1483	7349	48	8	1	chr3	117831085	117831972	-41767811	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	5
1484	566	273	56	46	chr3	117835397	117835845	-41763938	-	RMER17B	LTR	ERVK	-9	899	429	5
1484	295	261	43	0	chr3	117891212	117891304	-41708479	+	RMER15	LTR	ERVL	403	498	-77	6
1484	233	389	19	65	chr3	117891981	117892135	-41707648	-	LTR33B	LTR	ERVL	-321	182	36	6
1484	328	333	62	76	chr3	117892224	117892448	-41707335	+	LTR84a	LTR	ERVL	6	226	-531	6
1484	754	238	130	44	chr3	117897748	117898087	-41701696	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	6
1484	508	299	114	58	chr3	117907058	117907119	-41692664	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	309	6
1484	508	299	114	58	chr3	117907348	117907643	-41692140	-	MTEa	LTR	MaLR	-71	308	4	6
1484	2307	80	39	60	chr3	117916160	117916494	-41683289	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1484	871	243	62	69	chr3	117920365	117920639	-41679144	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	832	6
1484	4006	149	120	33	chr3	117921246	117921328	-41678455	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-218	885	821	6
1484	2873	72	14	30	chr3	117921328	117921756	-41678027	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	6
1484	4006	149	120	33	chr3	117921756	117922487	-41677296	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-283	820	1	6
1484	2345	203	29	19	chr3	117924163	117924685	-41675098	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	6
1484	3771	163	130	55	chr3	117925466	117926305	-41673478	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	6
1484	1170	308	30	15	chr3	117926503	117926839	-41672944	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	19	6
1484	1333	194	151	0	chr3	117929572	117929897	-41669886	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1484	3265	41	8	0	chr3	117930965	117931355	-41668428	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	4	7
1484	1899	181	11	11	chr3	117931868	117932221	-41667562	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	355	-4	7
1484	1094	90	13	0	chr3	117934012	117934168	-41665615	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	265	422	0	7
1484	246	323	31	0	chr3	117934254	117934350	-41665433	+	MTEa	LTR	MaLR	281	379	0	7
1484	227	329	60	13	chr3	117937208	117937359	-41662424	-	RMER12	LTR	ERVK	-476	846	689	7
1484	744	331	71	16	chr3	117951458	117951897	-41647886	+	MER67D	LTR	ERV1	52	514	0	7
1484	1954	90	26	125	chr3	117954432	117954775	-41645008	-	RLTR10E	LTR	ERVK	-2	309	1	7
1484	858	266	50	38	chr3	117956093	117956362	-41643421	-	MTD	LTR	MaLR	-55	364	86	7
1484	952	259	71	117	chr3	117958137	117958505	-41641278	-	MTE2a	LTR	MaLR	-28	351	1	7
1484	362	250	118	53	chr3	117960680	117960832	-41638951	-	ORR1E	LTR	MaLR	-159	200	39	7
1485	6163	57	18	0	chr3	117969661	117969814	-41629969	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	642	7
1485	6163	57	18	0	chr3	117970192	117970832	-41628951	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-167	641	2	7
1485	743	302	39	57	chr3	117970887	117971164	-41628619	+	MTE2a	LTR	MaLR	94	365	-14	7
1485	3329	50	24	0	chr3	117982757	117983180	-41616603	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	433	-42	7
1485	2240	73	10	3	chr3	117983181	117983495	-41616288	+	MT-int	LTR	MaLR	1	316	-782	7
1485	802	69	0	0	chr3	117988102	117988204	-41611579	+	BGLII	LTR	ERVK	1	102	-319	7
1485	468	369	67	8	chr3	117989863	117990101	-41609682	-	MLT1E	LTR	MaLR	0	653	402	8
1485	306	318	0	0	chr3	117990184	117990272	-41609511	-	MLT1E	LTR	MaLR	-431	222	135	8
1485	754	272	52	79	chr3	118038474	118038872	-41560911	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	405	18	5
1485	1153	259	141	6	chr3	118041622	118041956	-41557827	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	6
1485	3036	169	99	84	chr3	118050399	118051099	-41548684	-	RMER6D	LTR	ERVK	-1	719	10	7
1485	369	241	25	130	chr3	118057816	118057978	-41541805	+	MLT1N2	LTR	MaLR	404	548	-14	7
1485	1196	295	39	19	chr3	118081537	118081897	-41517886	+	MTE2b	LTR	MaLR	13	379	0	1
1485	434	376	89	76	chr3	118082620	118083014	-41516769	+	LTR78	LTR	ERV1	9	407	-897	1
1485	1816	249	17	7	chr3	118083783	118084192	-41515591	+	MTD	LTR	MaLR	2	414	-5	1
1485	380	321	22	22	chr3	118084270	118084404	-41515379	+	LTR78	LTR	ERV1	1171	1304	0	1
1485	415	324	0	105	chr3	118085371	118085571	-41514212	+	MTEa	LTR	MaLR	7	185	-194	1
1485	952	310	58	18	chr3	118085926	118086319	-41513464	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	1	1
1485	943	305	68	35	chr3	118087545	118087885	-41511898	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	4	1
1485	608	275	166	24	chr3	118089258	118089590	-41510193	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	1
1486	497	283	47	8	chr3	118098275	118098403	-41501380	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	1
1486	965	229	86	35	chr3	118115503	118115851	-41483932	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	1
1486	240	266	45	102	chr3	118149480	118149568	-41450215	+	MT2B	LTR	ERVL	158	240	-361	1
1486	1605	179	11	110	chr3	118185356	118185802	-41413981	-	RMER17C	LTR	ERVK	-8	402	1	2
1486	2543	176	38	187	chr3	118188115	118189003	-41410780	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	2
1486	1285	235	73	35	chr3	118191397	118191737	-41408046	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	1	2
1486	604	328	47	0	chr3	118192828	118192917	-41406866	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1379	201	106	2
1486	604	328	47	0	chr3	118192969	118193071	-41406712	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1475	105	2	2
1486	892	312	72	25	chr3	118193071	118193433	-41406350	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	2
1486	4272	180	60	23	chr3	118197542	118198412	-41401371	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	2
1486	390	274	161	53	chr3	118198810	118199095	-41400688	+	RMER10A	LTR	ERVL	122	437	-5	2
1486	501	280	42	25	chr3	118201986	118202146	-41397637	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	167	-223	2
1486	392	302	67	155	chr3	118202237	118202418	-41397365	+	MLT1A	LTR	MaLR	168	314	-76	2
1486	455	352	64	0	chr3	118202661	118202925	-41396858	+	MLT1A-int	LTR	MaLR	334	614	-757	2
1486	385	320	60	28	chr3	118203673	118203856	-41395927	+	MLT1A	LTR	MaLR	169	376	-14	2
1486	979	301	73	25	chr3	118218865	118219220	-41380563	-	MTE2a	LTR	MaLR	-7	372	1	2
1486	702	269	52	0	chr3	118220171	118220364	-41379419	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	215	2
1486	687	297	18	49	chr3	118220462	118220685	-41379098	-	MTD	LTR	MaLR	-198	221	6	2
1487	334	306	116	69	chr3	118245722	118245999	-41353784	-	ORR1E	LTR	MaLR	-49	310	21	3
1487	383	413	43	13	chr3	118259738	118259971	-41339812	-	LTR16A	LTR	ERVL	-180	271	32	3
1487	2620	149	144	21	chr3	118283150	118283670	-41316113	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	1	3
1487	2550	158	79	10	chr3	118285132	118285626	-41314157	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	3
1487	724	99	49	7	chr3	118286807	118286950	-41312833	+	RMER17B	LTR	ERVK	312	460	-498	3
1487	897	303	100	35	chr3	118289401	118289880	-41309903	-	MER34A1	LTR	ERV1	-75	512	3	3
1487	935	259	203	7	chr3	118294864	118294881	-41304902	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-13	357	342	4
1487	935	259	203	7	chr3	118294925	118295203	-41304580	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-29	341	4	4
1487	245	220	196	27	chr3	118297043	118297066	-41302717	+	RMER15	LTR	ERVL	332	362	-213	4
1487	245	220	196	27	chr3	118297112	118297200	-41302583	+	RMER15	LTR	ERVL	363	462	-113	4
1487	888	347	25	22	chr3	118301923	118302241	-41297542	+	MLT1A	LTR	MaLR	19	337	-37	4
1487	3378	33	5	0	chr3	118302871	118303265	-41296518	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1487	313	275	92	0	chr3	118314864	118314973	-41284810	-	MLT1B	LTR	MaLR	-10	380	262	4
1487	435	267	50	0	chr3	118315018	118315138	-41284645	-	MLT1B	LTR	MaLR	-262	128	3	4
1487	285	321	49	0	chr3	118324761	118324842	-41274941	-	MT2B	LTR	ERVL	-362	239	155	4
1487	1551	262	52	50	chr3	118328021	118328544	-41271239	+	RMER5	LTR	ERV1	1	524	-10	4
1487	891	304	42	65	chr3	118330315	118330553	-41269230	-	RMER5	LTR	ERV1	-12	522	287	4
1487	891	304	42	65	chr3	118330805	118330949	-41268834	-	RMER5	LTR	ERV1	-248	286	149	4
1487	427	308	82	68	chr3	118331035	118331314	-41268469	-	MER34A	LTR	ERV1	-49	522	240	4
1487	368	254	144	40	chr3	118332043	118332244	-41267539	-	RLTR15	LTR	ERVK	-18	341	120	4
1487	439	223	15	51	chr3	118332290	118332427	-41267356	-	RLTR15	LTR	ERVK	-195	164	33	4
1487	858	247	127	55	chr3	118333162	118333509	-41266274	+	MTD	LTR	MaLR	18	389	-30	4
1487	227	242	73	92	chr3	118335761	118335870	-41263913	-	RMER4A	LTR	ERVK	-54	412	306	4
1487	562	302	43	34	chr3	118339457	118339690	-41260093	+	MT2A	LTR	ERVL	1	235	-298	4
1487	553	321	28	23	chr3	118340372	118340586	-41259197	+	MT2A	LTR	ERVL	245	459	-74	4
1487	228	350	78	24	chr3	118355872	118356039	-41243744	-	MER21B	LTR	ERV1	-345	518	343	5
1488	593	230	80	12	chr3	118371105	118371268	-41228515	+	MTC	LTR	MaLR	248	421	0	5
1488	1234	255	53	17	chr3	118374910	118375265	-41224518	+	MTD	LTR	MaLR	50	417	-2	5
1488	2192	79	0	0	chr3	118384645	118384937	-41214846	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	292	-54	5
1488	245	327	0	84	chr3	118403274	118403381	-41196402	+	MTEa	LTR	MaLR	1	98	-281	5
1488	3067	73	2	2	chr3	118407762	118408162	-41191621	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1488	576	331	76	91	chr3	118423518	118423980	-41175803	-	MLT1H	LTR	MaLR	-14	535	81	6
1488	560	358	124	22	chr3	118454196	118454470	-41145313	-	MER70A	LTR	ERVL	-4	468	167	6
1488	1989	219	12	7	chr3	118474943	118475352	-41124431	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	3	6
1489	386	328	106	113	chr3	118493540	118493621	-41106162	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-64	301	224	7
1489	386	328	106	113	chr3	118493744	118493810	-41105973	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-142	223	153	7
1489	386	328	106	113	chr3	118493919	118494035	-41105748	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-213	152	39	7
1489	304	346	37	55	chr3	118511909	118512181	-41087602	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-2404	2592	2326	1
1489	310	318	53	53	chr3	118512236	118512442	-41087341	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3441	2320	2115	1
1489	647	329	30	17	chr3	118512437	118512672	-41087111	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3011	1985	1748	1
1489	1698	232	92	47	chr3	118515558	118515655	-41084128	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	436	1
1489	1698	232	92	47	chr3	118515691	118516104	-41083679	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-99	435	1	1
1489	424	306	89	58	chr3	118540583	118540774	-41059009	-	MLT1H	LTR	MaLR	-253	296	100	5
1489	4177	110	42	53	chr3	118542866	118543625	-41056158	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	5
1489	2668	189	13	46	chr3	118556534	118557077	-41042706	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-3	525	1	8
1489	293	375	41	70	chr3	118562720	118563035	-41036748	+	MLT1A0	LTR	MaLR	58	363	-2	8
1489	293	222	73	100	chr3	118564057	118564167	-41035616	-	MLT1B	LTR	MaLR	-4	463	357	8
1489	474	287	75	44	chr3	118564504	118564730	-41035053	-	MLT1B	LTR	MaLR	-129	261	29	8
1489	444	293	64	39	chr3	118575950	118576106	-41023677	+	MLT1A0	LTR	MaLR	34	193	-172	1
1489	1108	311	46	34	chr3	118579332	118579912	-41019871	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	75	1
1489	1296	202	86	16	chr3	118583661	118583775	-41016008	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	166	-218	1
1489	1296	190	37	15	chr3	118583846	118584056	-41015727	+	ORR1C2	LTR	MaLR	167	383	-1	1
1489	1612	170	99	34	chr3	118593283	118593666	-41006117	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	1	1
1489	478	310	88	0	chr3	118597586	118597802	-41001981	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-149	248	14	1
1489	2087	121	3	3	chr3	118598474	118598780	-41001003	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-20	307	2	1
1489	1816	236	17	12	chr3	118599448	118599859	-40999924	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	1
1489	1075	259	79	42	chr3	118606057	118606412	-40993371	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	1	1
1489	526	340	98	67	chr3	118609893	118610252	-40989531	+	MTD	LTR	MaLR	6	375	-44	1
1489	266	272	98	0	chr3	118613130	118613222	-40986561	+	MER31A	LTR	ERV1	1	101	-384	1
1489	712	345	18	65	chr3	118613260	118613647	-40986136	-	MER31A	LTR	ERV1	-116	369	1	1
1489	333	228	59	89	chr3	118614566	118614667	-40985116	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	106	-253	1
1490	1273	228	80	17	chr3	118634328	118634680	-40965103	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1490	1477	198	32	37	chr3	118641212	118641538	-40958245	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	349	-35	2
1490	1207	221	106	36	chr3	118641573	118641603	-40958180	+	ORR1D1	LTR	MaLR	350	381	-3	2
1490	512	316	111	11	chr3	118653644	118653833	-40945950	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	198	2
1490	390	354	43	38	chr3	118654059	118654244	-40945539	-	MTD	LTR	MaLR	-216	203	18	2
1490	558	255	95	8	chr3	118654404	118654643	-40945140	-	MTD	LTR	MaLR	-68	351	60	2
1490	1500	17	6	0	chr3	118661487	118661668	-40938115	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	215	396	0	2
1490	2814	23	0	3	chr3	118661668	118662016	-40937767	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	335	-763	2
1490	679	314	67	67	chr3	118697266	118697638	-40902145	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	1	2
1490	1537	323	41	54	chr3	118697646	118698308	-40901475	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-8	1572	920	2
1490	1824	182	35	62	chr3	118698369	118698803	-40900980	-	RMER6C	LTR	ERVK	-266	424	3	2
1490	851	329	71	22	chr3	118708391	118708801	-40890982	-	MLT1H-int	LTR	MaLR	-738	671	242	2
1490	1472	194	67	14	chr3	118723615	118723912	-40875871	+	MTC	LTR	MaLR	109	421	0	3
1490	1080	268	97	19	chr3	118734124	118734496	-40865287	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	3
1490	483	238	10	0	chr3	118740948	118741049	-40858734	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-11	397	296	3
1490	243	258	48	97	chr3	118741498	118741601	-40858182	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-1	407	310	3
1490	964	255	69	57	chr3	118742857	118743220	-40856563	+	MT2A	LTR	ERVL	1	473	-128	3
1490	593	207	52	0	chr3	118743584	118743700	-40856083	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-214	7192	7071	3
1490	325	232	61	68	chr3	118743702	118743817	-40855966	+	MT2A	LTR	ERVL	387	499	-34	3
1490	325	232	61	68	chr3	118743858	118743890	-40855893	+	MT2A	LTR	ERVL	500	533	0	3
1490	4720	205	46	32	chr3	118743910	118745024	-40854759	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	25	1153	-4608	3
1490	2882	209	35	7	chr3	118745080	118745683	-40854100	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1381	2000	-3761	3
1490	764	233	70	62	chr3	118748112	118748395	-40851388	+	ORR1D1	LTR	MaLR	53	374	0	3
1491	570	322	42	64	chr3	118755454	118755766	-40844017	+	MTD	LTR	MaLR	17	321	-98	3
1491	1106	243	96	30	chr3	118756066	118756460	-40843323	-	RMER5	LTR	ERV1	-83	451	32	3
1491	2856	172	112	12	chr3	118758623	118759278	-40840505	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	3
1491	2809	151	93	14	chr3	118762424	118762509	-40837274	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	85	-635	3
1491	3383	30	5	0	chr3	118762509	118762903	-40836880	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1491	2809	153	105	17	chr3	118762903	118763435	-40836348	+	RMER6D	LTR	ERVK	86	690	0	3
1491	914	237	52	76	chr3	118765036	118765419	-40834364	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1491	1175	243	26	121	chr3	118772812	118773201	-40826582	+	MTD	LTR	MaLR	33	384	-35	4
1491	880	263	134	44	chr3	118777648	118778081	-40821702	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	518	-10	4
1491	860	297	45	12	chr3	118779577	118779819	-40819964	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	128	4
1491	798	239	43	20	chr3	118787532	118787827	-40811956	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-4347	4612	4222	4
1491	312	150	0	0	chr3	118787829	118787889	-40811894	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-6178	2781	2722	4
1491	729	163	0	9	chr3	118787942	118788115	-40811668	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-6233	2726	2541	4
1491	1223	259	227	29	chr3	118791291	118791700	-40808083	-	RLTR18	LTR	ERVK	-9	503	14	4
1491	229	315	25	85	chr3	118796906	118797024	-40802759	+	MT2B	LTR	ERVL	130	240	-361	4
1491	277	130	35	252	chr3	118805964	118806190	-40793593	+	RMER17C	LTR	ERVK	99	275	-135	4
1491	2031	198	35	15	chr3	118812979	118813385	-40786398	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	5	4
1491	1264	232	32	32	chr3	118817651	118818025	-40781758	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1491	515	363	100	44	chr3	118821271	118821749	-40778034	-	MLT1H	LTR	MaLR	-6	543	39	4
1491	1807	206	12	35	chr3	118822903	118823306	-40776477	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
1491	1058	218	153	8	chr3	118823690	118824003	-40775780	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	46	4
1491	1831	203	32	6	chr3	118825442	118825784	-40773999	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	351	-16	4
1491	803	241	67	136	chr3	118826895	118827241	-40772542	+	MTE2a	LTR	MaLR	57	378	-1	4
1491	2378	177	78	85	chr3	118827410	118827977	-40771806	-	RMER15	LTR	ERVL	-11	564	2	4
1491	2508	187	21	14	chr3	118830482	118831002	-40768781	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	1	5
1491	2657	80	35	15	chr3	118861478	118861873	-40737910	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	5
1491	1478	259	108	47	chr3	118863082	118863636	-40736147	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	105	5
1491	1283	232	79	64	chr3	118864523	118864893	-40734890	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	417	4	5
1491	635	263	133	145	chr3	118881274	118881785	-40717998	+	RLTR18B	LTR	ERVK	109	613	-3	5
1491	556	258	0	15	chr3	118882040	118882174	-40717609	+	MT2A	LTR	ERVL	1	132	-401	5
186	3150	199	51	13	chr3	118882193	118882882	-40716901	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	250	964	-4797	5
1492	1182	273	17	54	chr3	118887585	118888003	-40711780	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
1492	569	185	116	58	chr3	118906478	118906633	-40693150	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	164	-210	6
1492	259	320	30	76	chr3	118919063	118919195	-40680588	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	240	6
1492	2047	128	24	59	chr3	118926143	118926484	-40673299	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1492	377	383	67	22	chr3	118928207	118928477	-40671306	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	284	-90	6
1492	756	308	35	0	chr3	118931325	118931585	-40668198	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	110	6
1492	706	292	81	103	chr3	118931649	118931997	-40667786	+	MTE2a	LTR	MaLR	40	379	0	6
1492	1020	270	82	11	chr3	118933167	118933519	-40666264	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	379	0	6
1492	2113	12	141	0	chr3	118938180	118938436	-40661347	+	RLTR10B	LTR	ERVK	1	292	0	6
1492	363	278	41	0	chr3	118938436	118938533	-40661250	-	MLT1D	LTR	MaLR	-404	101	1	6
1492	2971	24	93	0	chr3	118946841	118947217	-40652566	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	6
1492	1832	197	27	24	chr3	118947698	118948067	-40651716	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	370	-8	6
1492	768	260	23	12	chr3	118952197	118952368	-40647415	+	MTE2a	LTR	MaLR	207	379	0	6
1492	1170	103	21	11	chr3	118973191	118973377	-40626406	+	MTB	LTR	MaLR	1	188	-208	7
1492	1500	77	0	19	chr3	118974803	118975015	-40624768	+	MTB	LTR	MaLR	193	400	0	7
1492	459	357	135	10	chr3	118990730	118991033	-40608750	+	MLT1A0	LTR	MaLR	25	365	0	7
1492	249	224	12	106	chr3	118991910	118991995	-40607788	+	MT2B	LTR	ERVL	164	240	-361	7
1492	1199	261	127	3	chr3	118994449	118994818	-40604965	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	1	7
1492	1587	181	7	133	chr3	118997976	118998396	-40601387	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	7
1492	331	276	39	94	chr3	118999832	118999960	-40599823	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	465	7
1492	331	191	43	14	chr3	119000002	119000071	-40599712	-	RMER4B	LTR	ERVK	-172	413	343	1
1492	901	212	81	39	chr3	119000181	119000466	-40599317	-	RMER4B	LTR	ERVK	-286	299	3	1
1492	2176	99	9	58	chr3	119001392	119001734	-40598049	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	4
1492	1359	222	7	104	chr3	119006048	119006460	-40593323	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	9
1493	2345	69	119	11	chr3	119015104	119015456	-40584327	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	2
1493	1153	273	33	61	chr3	119020976	119021179	-40578604	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	192	-167	3
1493	1006	223	189	73	chr3	119021179	119021523	-40578260	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1493	1153	273	33	61	chr3	119021523	119021682	-40578101	+	ORR1E	LTR	MaLR	193	354	-5	3
1493	929	161	80	10	chr3	119021905	119022139	-40577644	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	3
1493	445	282	65	7	chr3	119029366	119029522	-40570261	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	211	4
1493	697	286	78	68	chr3	119039788	119040132	-40559651	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	1	5
1493	552	309	128	35	chr3	119040924	119041212	-40558571	+	MLT1A1	LTR	MaLR	8	322	-86	5
1493	2075	179	25	3	chr3	119050275	119050634	-40549149	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
1493	1302	215	111	8	chr3	119053077	119053456	-40546327	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	1	7
1493	1019	269	46	43	chr3	119054351	119054700	-40545083	+	MTEb	LTR	MaLR	3	352	-27	7
1493	3563	220	57	84	chr3	119079576	119080449	-40519334	-	RMER13A	LTR	ERVK	-10	850	1	9
1493	357	208	138	100	chr3	119088543	119088703	-40511080	-	MT2B2	LTR	ERVL	-306	278	113	1
1493	271	281	0	109	chr3	119088705	119088797	-40510986	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-288	82	1	1
1493	919	268	21	127	chr3	119103277	119103701	-40496082	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	1
1493	762	308	58	4	chr3	119106638	119106912	-40492871	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-222	293	5	1
1493	267	363	69	23	chr3	119107686	119107861	-40491922	-	LTR85b	LTR	Gypsy?	-131	653	471	1
1493	282	228	0	37	chr3	119116530	119116612	-40483171	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	408	330	1
1493	366	312	48	48	chr3	119116666	119116831	-40482952	-	MLT1A	LTR	MaLR	-206	168	4	1
1493	821	251	87	24	chr3	119123372	119123580	-40476203	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	222	-157	1
1493	1793	123	40	61	chr3	119123581	119123909	-40475874	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	1
1493	563	281	7	0	chr3	119123910	119124049	-40475734	+	MTE2b	LTR	MaLR	216	355	-24	1
1493	1201	252	96	13	chr3	119128455	119128792	-40470991	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	1	1
1493	770	257	36	63	chr3	119130577	119130830	-40468953	+	MTEa	LTR	MaLR	132	377	-2	1
1493	425	304	0	49	chr3	119132776	119132918	-40466865	+	MTEa	LTR	MaLR	1	135	-244	1
1493	555	292	141	90	chr3	119137305	119137681	-40462102	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	395	-19	1
1493	976	317	16	25	chr3	119137987	119138301	-40461482	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-12	353	43	1
1493	274	253	35	24	chr3	119139618	119139703	-40460080	-	MTEa	LTR	MaLR	-22	357	272	1
1493	1365	249	117	6	chr3	119140781	119141140	-40458643	+	MTD	LTR	MaLR	6	404	-15	1
1493	279	172	14	86	chr3	119141237	119141307	-40458476	-	MLT1K	LTR	MaLR	-7	588	524	1
1493	1399	269	68	15	chr3	119141395	119141791	-40457992	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	1
1493	235	296	47	47	chr3	119141914	119141999	-40457784	+	MLT1D	LTR	MaLR	131	215	-290	1
1493	235	216	66	26	chr3	119142171	119142247	-40457536	+	MLT1D	LTR	MaLR	288	366	-8	1
1493	266	322	77	94	chr3	119142399	119142697	-40457086	+	ORR1E	LTR	MaLR	64	356	-3	1
1493	718	279	100	40	chr3	119143797	119144126	-40455657	+	MLT1A0	LTR	MaLR	12	360	-5	1
1494	977	259	75	126	chr3	119149661	119150059	-40449724	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	378	-1	2
1494	3191	55	12	17	chr3	119156052	119156461	-40443322	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
1494	2979	145	62	27	chr3	119156464	119157185	-40442598	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-3	1095	1	2
1494	549	284	155	21	chr3	119158990	119159274	-40440509	+	MLT1A0	LTR	MaLR	18	339	-26	2
1494	1519	194	50	22	chr3	119160522	119160844	-40438939	+	RLTR25B	LTR	ERVK	106	436	-592	2
1494	1724	186	28	0	chr3	119164491	119164809	-40434974	+	RLTR25B	LTR	ERVK	449	775	-253	2
1494	555	228	47	47	chr3	119165042	119165212	-40434571	+	RLTR25B	LTR	ERVK	859	1028	0	2
1494	266	269	28	73	chr3	119173690	119173979	-40425804	-	RMER17D	LTR	ERVK	-333	556	281	2
1494	587	327	111	66	chr3	119174964	119175341	-40424442	+	MLT1C	LTR	MaLR	57	450	-17	2
1494	425	297	137	27	chr3	119175963	119176245	-40423538	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	342	-37	2
1494	376	332	198	18	chr3	119176600	119176928	-40422855	+	MER110A	LTR	ERV1	81	467	-1	2
1494	1350	259	9	41	chr3	119179085	119179423	-40420360	+	MTD	LTR	MaLR	1	327	-92	2
1494	252	317	0	99	chr3	119182017	119182108	-40417675	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	82	-297	2
1494	654	199	147	0	chr3	119182101	119182237	-40417546	+	MTE2a	LTR	MaLR	224	379	0	2
1494	2253	154	62	17	chr3	119182500	119182902	-40416881	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	2
1494	1163	264	56	67	chr3	119183127	119183485	-40416298	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	4	2
1494	1783	203	26	40	chr3	119190125	119190504	-40409279	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	2
1494	1142	230	222	45	chr3	119190627	119191093	-40408690	+	MT2B	LTR	ERVL	1	549	-52	2
1494	1142	230	222	45	chr3	119191166	119191208	-40408575	+	MT2B	LTR	ERVL	550	598	-3	2
1494	615	272	84	154	chr3	119192711	119192935	-40406848	+	MLT1B	LTR	MaLR	23	212	-178	2
1494	615	272	84	154	chr3	119193137	119193293	-40406490	+	MLT1B	LTR	MaLR	213	376	-14	2
1494	586	330	97	43	chr3	119193872	119194367	-40405416	-	MT2A	LTR	ERVL	-12	542	1	2
1494	504	318	97	55	chr3	119195636	119195926	-40403857	+	RMER15	LTR	ERVL	258	559	-16	2
1494	226	291	43	85	chr3	119200648	119200742	-40399041	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-172	195	106	3
1494	288	263	213	40	chr3	119207825	119208027	-40391756	+	MLT1H2	LTR	MaLR	39	275	-280	3
1494	351	280	73	29	chr3	119209992	119210128	-40389655	+	MLT1H2	LTR	MaLR	348	489	0	3
1494	265	279	76	59	chr3	119215191	119215309	-40384474	-	MER34	LTR	ERV1	-71	471	352	3
1494	321	286	103	35	chr3	119215594	119215739	-40384044	-	LTR48	LTR	ERV1	-632	155	1	3
1494	317	304	33	74	chr3	119220860	119220981	-40378802	+	MTEb	LTR	MaLR	1	116	-263	3
1494	1677	112	16	8	chr3	119221461	119221712	-40378071	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	771	3
1494	3345	118	60	23	chr3	119222434	119223082	-40376701	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	-243	780	1	3
1494	242	218	164	0	chr3	119233554	119233609	-40366174	+	MLT1K	LTR	MaLR	336	399	-196	3
1494	2369	102	196	0	chr3	119236780	119237143	-40362640	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	434	-2	3
1494	915	192	11	6	chr3	119251006	119251184	-40348599	+	ORR1D1	LTR	MaLR	169	347	-27	3
1494	868	234	0	16	chr3	119251197	119251388	-40348395	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-186	188	1	3
1494	292	198	106	47	chr3	119251723	119251808	-40347975	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	420	3
1494	5167	172	45	26	chr3	119257096	119258094	-40341689	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	12	3
1494	257	286	52	35	chr3	119261211	119261327	-40338456	+	MLT1C	LTR	MaLR	313	430	-37	3
1494	233	286	62	125	chr3	119262618	119262778	-40337005	+	LTR81B	LTR	ERV1?	245	394	-999	3
1494	797	331	48	29	chr3	119262909	119263283	-40336500	-	MLT1B	LTR	MaLR	-7	383	3	3
1494	501	287	57	11	chr3	119271874	119272050	-40327733	-	MER57E1	LTR	ERV1	-2	370	187	3
1494	1492	174	151	97	chr3	119272058	119272235	-40327548	-	RMER6D	LTR	ERVK	-272	448	301	4
1494	1492	174	151	97	chr3	119272530	119272777	-40327006	-	RMER6D	LTR	ERVK	-420	300	1	4
1494	421	248	150	0	chr3	119275076	119275209	-40324574	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	423	4
1495	1078	275	63	44	chr3	119276478	119276874	-40322909	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	404	-15	4
1495	488	333	18	0	chr3	119277319	119277487	-40322296	+	MLT1A1	LTR	MaLR	233	403	-5	4
1495	458	314	87	108	chr3	119292742	119293121	-40306662	-	MLT1B	LTR	MaLR	-14	376	6	4
1495	670	284	80	74	chr3	119293354	119293731	-40306052	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	4
1495	973	297	64	38	chr3	119293842	119294185	-40305598	+	MTD	LTR	MaLR	53	404	-15	4
1495	1393	210	123	3	chr3	119295970	119296304	-40303479	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
1495	255	265	0	42	chr3	119297561	119297632	-40302151	+	MLT1D	LTR	MaLR	113	180	-447	4
1495	464	273	204	15	chr3	119297687	119297888	-40301895	+	MLT1D	LTR	MaLR	259	497	-8	4
1495	760	137	158	58	chr3	119298107	119298278	-40301505	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	189	-185	4
1495	1098	230	116	80	chr3	119298281	119298758	-40301025	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	4
1495	673	191	114	24	chr3	119298761	119298927	-40300856	+	ORR1D1	LTR	MaLR	194	374	0	4
1495	516	324	66	4	chr3	119302748	119302974	-40296809	+	MER67C	LTR	ERV1	1	240	-471	4
1495	1190	260	55	81	chr3	119309833	119310050	-40289733	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	184	4
1495	1664	172	11	56	chr3	119310050	119310426	-40289357	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	4
1495	1190	260	55	81	chr3	119310426	119310593	-40289190	-	MTEa	LTR	MaLR	-196	183	1	4
1495	2367	305	113	14	chr3	119310595	119310806	-40288977	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	1342	4
1495	2367	305	113	14	chr3	119310854	119311467	-40288316	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-239	1341	674	4
1495	4397	18	0	0	chr3	119312431	119312924	-40286859	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	4
1495	324	372	27	14	chr3	119313663	119313810	-40285973	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-907	673	525	4
1495	347	264	64	186	chr3	119323900	119324072	-40275711	-	MTE2a	LTR	MaLR	-223	156	6	4
1495	272	303	6	11	chr3	119342652	119342761	-40257022	+	MTEa	LTR	MaLR	272	378	-1	5
1495	1183	265	155	53	chr3	119346030	119346553	-40253230	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	576	-9	5
1495	765	264	62	43	chr3	119356137	119356489	-40243294	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	5
1495	244	258	218	32	chr3	119384695	119384819	-40214964	-	ORR1E	LTR	MaLR	-37	342	196	5
1495	376	261	126	0	chr3	119384832	119384951	-40214832	-	ORR1E	LTR	MaLR	-225	134	1	5
1495	309	295	62	0	chr3	119388161	119388273	-40211510	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	124	-235	5
1495	1518	188	64	26	chr3	119395393	119395730	-40204053	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	5
1495	2002	195	71	10	chr3	119397804	119398197	-40201586	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	5
1495	734	238	143	41	chr3	119405546	119405889	-40193894	+	MTD	LTR	MaLR	1	413	-8	6
1496	367	291	119	0	chr3	119408006	119408140	-40191643	-	RMER20B	LTR	ERVK	-354	273	124	6
1496	279	237	17	0	chr3	119425088	119425147	-40174636	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	64	-315	6
1496	791	343	18	28	chr3	119425363	119425645	-40174138	+	MTE2b	LTR	MaLR	92	370	-9	6
1496	275	295	44	52	chr3	119425708	119425844	-40173939	+	MLT1B	LTR	MaLR	252	386	-4	6
1496	293	128	43	0	chr3	119447360	119447407	-40152376	+	ORR1A1	LTR	MaLR	22	70	-304	6
1496	342	192	81	6	chr3	119447404	119447494	-40152289	+	ORR1A1	LTR	MaLR	267	383	-1	6
1496	835	279	123	36	chr3	119457588	119457922	-40141861	+	MTEb	LTR	MaLR	3	365	-14	6
1496	664	290	137	33	chr3	119467630	119467901	-40131882	+	MER21B	LTR	ERV1	142	440	-423	6
1496	574	270	172	32	chr3	119467926	119468205	-40131578	+	MER21B	LTR	ERV1	525	842	-21	6
1496	1201	207	73	39	chr3	119471521	119471698	-40128085	-	MTC	LTR	MaLR	-125	296	110	6
1496	1201	207	73	39	chr3	119472041	119472149	-40127634	-	MTC	LTR	MaLR	-312	109	1	6
1496	1186	216	131	30	chr3	119478806	119479177	-40120606	+	MTD	LTR	MaLR	1	403	-16	6
1496	1119	254	31	68	chr3	119481118	119481528	-40118255	+	MT2A	LTR	ERVL	1	521	-80	7
1496	1354	176	57	129	chr3	119481528	119481914	-40117869	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	358	-9	7
1496	275	204	9	75	chr3	119481915	119481949	-40117834	+	MT2A	LTR	ERVL	430	464	-69	7
1496	275	204	9	75	chr3	119481977	119482048	-40117735	+	MT2A	LTR	ERVL	465	528	-5	7
1496	1091	239	37	110	chr3	119490017	119490326	-40109457	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	285	-94	7
1496	1456	214	77	11	chr3	119490326	119490675	-40109108	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	7
1496	1091	239	37	110	chr3	119490675	119490774	-40109009	+	MTE2a	LTR	MaLR	286	379	0	7
1496	3005	76	5	5	chr3	119490850	119491246	-40108537	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1496	1252	249	82	9	chr3	119496564	119496892	-40102891	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-10	360	9	7
1496	776	285	71	71	chr3	119501163	119501446	-40098337	+	ORR1E	LTR	MaLR	77	359	0	5
1496	486	178	15	99	chr3	119506420	119506551	-40093232	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	288	407	0	1
1496	629	279	95	43	chr3	119507319	119507645	-40092138	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	343	-16	1
1496	643	273	79	44	chr3	119510525	119510728	-40089055	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	152	2
1496	597	275	148	10	chr3	119510932	119511134	-40088649	+	RMER15	LTR	ERVL	304	533	-42	2
1496	532	319	107	17	chr3	119512086	119512319	-40087464	+	MLT1H	LTR	MaLR	40	293	-256	3
1496	592	343	56	24	chr3	119519921	119520172	-40079611	-	LTR16B	LTR	ERVL	-18	445	187	4
1496	1592	219	36	53	chr3	119522284	119522698	-40077085	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	1	4
1496	309	287	147	71	chr3	119527563	119527689	-40072094	+	MLT1A0	LTR	MaLR	5	145	-220	5
1496	309	287	147	71	chr3	119527722	119527820	-40071963	+	MLT1A0	LTR	MaLR	146	246	-119	5
1496	3265	152	56	26	chr3	119528312	119528880	-40070903	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	1	5
1496	904	190	72	0	chr3	119530881	119531076	-40068707	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	166	5
1496	912	219	28	0	chr3	119531198	119531376	-40068407	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-191	183	1	5
1496	2217	97	13	0	chr3	119532373	119532682	-40067101	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-12	315	3	6
1496	351	320	135	43	chr3	119533257	119533420	-40066363	-	RMER15	LTR	ERVL	-91	484	307	6
1496	1416	193	258	19	chr3	119534002	119534429	-40065354	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	33	6
1496	3874	11	136	0	chr3	119534654	119535088	-40064695	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	6
23	48666	15	1	0	chr3	119535089	119540443	-40059340	+	MERVL-int	LTR	ERVL	2	5360	-125	6
1497	364	191	46	35	chr3	119540443	119540530	-40059253	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	6
1497	322	0	0	0	chr3	119540530	119540568	-40059215	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	6
1497	4598	14	12	0	chr3	119540568	119541055	-40058728	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	6
1497	351	283	30	10	chr3	119544303	119544403	-40055380	-	MTEa	LTR	MaLR	-260	119	18	7
1497	1956	232	63	92	chr3	119544548	119545180	-40054603	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	614	-2	7
1497	1379	212	152	3	chr3	119546776	119547098	-40052685	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	7
1497	1175	200	101	40	chr3	119551561	119551858	-40047925	-	RLTR46	LTR	ERVK	-5	315	1	8
1497	270	238	99	12	chr3	119557018	119557099	-40042684	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-468	88	1	1
1497	370	279	5	103	chr3	119561807	119561991	-40037792	+	MLT2B1	LTR	ERVL	402	567	0	1
1497	2218	114	6	9	chr3	119567956	119568283	-40031500	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	1
1497	236	231	193	9	chr3	119568736	119568845	-40030938	+	RMER15	LTR	ERVL	404	532	-43	1
1497	612	315	143	63	chr3	119574931	119575280	-40024503	+	MTEa	LTR	MaLR	1	377	-2	1
1497	1926	115	45	13	chr3	119575595	119575904	-40023879	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	1
1497	1758	170	64	80	chr3	119576277	119576639	-40023144	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	25	1
1497	1546	131	118	49	chr3	119576639	119576944	-40022839	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
1497	1758	170	64	80	chr3	119576944	119576971	-40022812	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-360	24	1	1
1497	708	352	79	19	chr3	119580990	119581369	-40018414	+	MER57E2	LTR	ERV1	1	402	0	1
1497	269	308	151	16	chr3	119581387	119581691	-40018092	+	MER31-int	LTR	ERV1	775	1119	-3817	1
1497	284	312	45	97	chr3	119582043	119582373	-40017410	+	MER31-int	LTR	ERV1	1747	2059	-3297	1
1497	659	298	96	46	chr3	119583354	119584136	-40015647	+	MER31-int	LTR	ERV1	2463	3283	-1653	1
1497	707	288	124	23	chr3	119584252	119584551	-40015232	+	MER31B	LTR	ERV1	133	461	-5	1
1497	1072	197	281	3	chr3	119588788	119589096	-40010687	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1497	1222	225	216	50	chr3	119590920	119591378	-40008405	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	1	1
1497	276	349	33	27	chr3	119599273	119599423	-40000360	-	LTR77	LTR	ERV1	-34	588	438	1
1497	927	277	17	20	chr3	119599538	119599833	-39999950	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	294	-65	1
1497	339	318	153	34	chr3	119601797	119601973	-39997810	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	197	-162	1
1497	2057	155	25	52	chr3	119602075	119602476	-39997307	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	5	1
1497	226	183	48	48	chr3	119605352	119605415	-39994368	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	374	312	1
1497	2160	129	30	36	chr3	119605450	119605813	-39993970	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-46	361	1	1
1497	1041	257	45	4	chr3	119605840	119606082	-39993701	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-118	252	1	1
1497	1719	143	144	15	chr3	119606120	119606460	-39993323	+	ORR1B1	LTR	MaLR	11	394	0	1
1497	1302	228	48	60	chr3	119610148	119610480	-39989303	+	MTE2a	LTR	MaLR	52	379	0	2
1497	296	310	102	29	chr3	119613342	119613548	-39986235	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	280	500	-27	2
1497	844	307	128	99	chr3	119613977	119614643	-39985140	-	MER21B	LTR	ERV1	-79	784	100	2
1497	296	271	7	79	chr3	119614806	119614958	-39984825	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	268	2
1497	1083	287	60	17	chr3	119617057	119617404	-39982379	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	2	2
1497	760	205	61	38	chr3	119617601	119617820	-39981963	-	MT2A	LTR	ERVL	-4	529	258	2
1497	544	276	47	16	chr3	119619830	119619959	-39979824	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-204	7202	7070	2
1497	237	216	73	64	chr3	119620608	119620717	-39979066	+	LTR85a	LTR	Gypsy?	281	390	-312	2
1497	2122	156	74	3	chr3	119622364	119622717	-39977066	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
1497	297	259	12	47	chr3	119624502	119624587	-39975196	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	82	-277	2
1497	234	235	20	0	chr3	119625061	119625112	-39974671	+	MTE2a	LTR	MaLR	288	339	-40	2
1497	1160	249	47	41	chr3	119630238	119630582	-39969201	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	346	-13	2
1497	1482	232	76	49	chr3	119632503	119632742	-39967041	+	MTD	LTR	MaLR	1	253	-166	2
1497	1482	232	76	49	chr3	119632926	119633094	-39966689	+	MTD	LTR	MaLR	254	419	0	2
1497	3658	109	112	31	chr3	119640594	119641150	-39958633	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	2
1497	352	174	14	28	chr3	119645178	119645249	-39954534	-	MT2A	LTR	ERVL	-402	131	62	2
1497	369	212	0	0	chr3	119645187	119645253	-39954530	-	MTE2b	LTR	MaLR	-256	123	58	2
1497	389	236	53	11	chr3	119645253	119645347	-39954436	-	MTE2b	LTR	MaLR	-281	98	1	2
1497	1562	99	43	72	chr3	119649312	119649616	-39950167	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	117	2
1497	1399	264	52	14	chr3	119656196	119656561	-39943222	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	2
1497	1299	196	108	23	chr3	119667408	119667752	-39932031	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	2	2
1498	628	294	69	18	chr3	119670411	119670629	-39929154	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	333	2
1498	768	316	83	0	chr3	119676159	119676447	-39923336	-	MTE2a	LTR	MaLR	-67	312	1	3
1498	636	232	108	28	chr3	119679780	119680089	-39919694	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	379	1	3
1498	315	266	37	45	chr3	119691591	119691725	-39908058	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4122	1400	1268	3
1498	2376	175	7	2	chr3	119693679	119694098	-39905685	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1498	873	250	107	20	chr3	119695750	119696003	-39903780	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	275	-104	3
1498	346	301	95	27	chr3	119708271	119708418	-39891365	-	MER34A1	LTR	ERV1	0	587	431	3
1498	4132	218	43	66	chr3	119710575	119711498	-39888285	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	3
1498	1925	171	40	3	chr3	119712040	119712386	-39887397	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	3
1498	876	308	60	52	chr3	119713338	119713705	-39886078	+	MTEa	LTR	MaLR	1	370	-9	3
1498	452	256	0	114	chr3	119715588	119715720	-39884063	-	RMER10A	LTR	ERVL	-324	118	2	3
1498	301	306	76	0	chr3	119715754	119715898	-39883885	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-60	3178	3024	3
1498	1129	176	43	0	chr3	119715998	119716186	-39883597	-	RMER10B	LTR	ERVL	-202	196	1	3
1498	255	286	121	97	chr3	119716252	119716376	-39883407	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	127	-378	3
1498	903	258	164	32	chr3	119717680	119717992	-39881791	+	MTEa	LTR	MaLR	1	353	-26	3
1498	1145	304	151	32	chr3	119724396	119725085	-39874698	-	LTR48	LTR	ERV1	-12	775	5	3
1498	677	290	35	165	chr3	119725728	119726153	-39873630	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	3
1498	306	226	35	23	chr3	119726278	119726364	-39873419	+	MER34A1	LTR	ERV1	17	103	-468	3
1498	3231	179	163	61	chr3	119731346	119732169	-39867614	-	RMER19B	LTR	ERVK	-18	884	1	3
1498	6577	82	24	9	chr3	119732544	119733459	-39866324	-	RLTR13B3	LTR	ERVK	0	929	1	3
1498	258	279	68	23	chr3	119734236	119734324	-39865459	+	ORR1D2	LTR	MaLR	279	370	0	3
1498	362	342	66	0	chr3	119734325	119734521	-39865262	+	MER34A1	LTR	ERV1	269	477	-110	3
1498	1877	167	11	86	chr3	119734560	119734945	-39864838	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	3
1498	3660	204	121	37	chr3	119740074	119741091	-39858692	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1102	-1	4
1498	647	285	148	102	chr3	119748270	119748614	-39851169	-	MTD	LTR	MaLR	-5	374	15	4
1498	2328	84	6	24	chr3	119771253	119771594	-39828189	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-72	335	1	4
1498	1193	294	21	40	chr3	119772797	119773173	-39826610	-	MTEb	LTR	MaLR	-10	369	1	4
1498	509	298	46	31	chr3	119774448	119774642	-39825141	-	RMER15	LTR	ERVL	-103	472	276	4
1498	363	368	36	73	chr3	119774867	119775169	-39824614	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-363	291	1	4
1498	497	308	21	53	chr3	119775223	119775478	-39824305	+	MLT1A1	LTR	MaLR	119	406	-2	4
1498	241	241	85	37	chr3	119775698	119775780	-39824003	-	LTR40b	LTR	ERVL	-2	460	375	4
1498	1707	150	79	14	chr3	119781933	119782224	-39817559	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	310	-57	4
1498	1795	164	0	179	chr3	119782222	119782674	-39817109	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	129	499	-1010	4
1498	4294	187	99	14	chr3	119783184	119784207	-39815576	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	457	1505	-4	4
1498	2052	184	5	16	chr3	119784208	119784578	-39815205	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	367	0	4
1498	418	91	0	0	chr3	119788615	119788670	-39811113	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	55	-256	4
1498	2499	109	17	62	chr3	119788707	119789128	-39810655	+	RLTR10C	LTR	ERVK	33	434	-2	4
1498	528	354	71	47	chr3	119789529	119789867	-39809916	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	18	4
1498	1349	226	91	103	chr3	119799049	119799370	-39800413	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	104	4
1498	1349	226	91	103	chr3	119799435	119799532	-39800251	-	MTD	LTR	MaLR	-316	103	6	4
187	1384	229	55	17	chr3	119799720	119800081	-39799702	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	419	1	4
1499	1861	207	62	17	chr3	119800452	119800855	-39798928	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1499	1239	277	51	17	chr3	119804061	119804413	-39795370	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	367	-12	5
1499	272	448	14	24	chr3	119804386	119804594	-39795189	-	LTR16C	LTR	ERVL	-191	298	93	5
1499	1157	291	20	111	chr3	119825605	119826011	-39773772	+	MTE2a	LTR	MaLR	11	379	0	5
1499	235	350	334	28	chr3	119826479	119826767	-39773016	+	MLT1B	LTR	MaLR	4	379	-11	5
1499	3033	213	69	43	chr3	119829971	119830766	-39769017	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	5
1499	808	277	94	85	chr3	119831547	119831878	-39767905	-	MTE2b	LTR	MaLR	-45	334	1	5
1499	992	302	50	50	chr3	119840568	119840931	-39758852	+	MTE2a	LTR	MaLR	49	394	-25	5
1499	712	316	88	88	chr3	119840929	119841304	-39758479	-	MER21B	LTR	ERV1	-214	649	275	5
1499	305	242	78	30	chr3	119842134	119842300	-39757483	-	RLTR21	LTR	ERVK	-317	1255	1082	5
1499	1260	161	55	0	chr3	119847330	119847548	-39752235	+	MTC	LTR	MaLR	1	230	-191	5
1499	723	309	65	90	chr3	119852024	119852380	-39747403	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	187	5
1499	326	272	41	61	chr3	119853848	119853946	-39745837	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	96	-283	5
1499	245	320	13	0	chr3	119853948	119854023	-39745760	+	MTE2b	LTR	MaLR	58	133	-246	5
1499	246	294	87	87	chr3	119859147	119859285	-39740498	-	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	-569	234	97	5
1499	632	269	148	13	chr3	119862255	119862476	-39737307	+	MTD	LTR	MaLR	155	405	-14	5
1499	1392	129	33	0	chr3	119862972	119863212	-39736571	+	BGLII_A	LTR	ERVK	198	445	0	5
1499	375	313	164	56	chr3	119866149	119866491	-39733292	-	RMER20B	LTR	ERVK	-15	612	234	6
1499	252	230	67	13	chr3	119883376	119883451	-39716332	-	MLT1K	LTR	MaLR	0	595	517	6
1499	265	197	79	32	chr3	119886268	119886331	-39713452	+	MT2B	LTR	ERVL	173	238	-363	6
1499	387	350	31	61	chr3	119891836	119892064	-39707719	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-55	409	189	6
1499	468	316	68	45	chr3	119892524	119892746	-39707037	-	ORR1E	LTR	MaLR	-104	255	29	6
1499	405	262	57	63	chr3	119892779	119892938	-39706845	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-296	168	11	6
1499	320	230	14	74	chr3	119899929	119900025	-39699758	-	MLT1F	LTR	MaLR	-43	517	444	6
1499	336	420	31	24	chr3	119900264	119900554	-39699229	-	MLT1F	LTR	MaLR	-133	415	124	6
1499	2034	174	31	100	chr3	119921558	119921808	-39677975	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	212	6
1499	2034	174	31	100	chr3	119921954	119922151	-39677632	-	MTC	LTR	MaLR	-210	211	5	6
1499	1214	244	124	67	chr3	119923751	119924185	-39675598	-	MT2A	LTR	ERVL	-69	464	6	6
1499	954	294	38	63	chr3	119924199	119924595	-39675188	+	MLT1B	LTR	MaLR	5	390	0	6
1499	1166	278	88	44	chr3	119926415	119926799	-39672984	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	5	6
1499	778	290	58	118	chr3	119926902	119927383	-39672400	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-30	498	47	7
1499	1211	306	17	37	chr3	119928961	119929314	-39670469	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	34	7
1499	461	372	78	36	chr3	119929380	119929434	-39670349	+	MLT1A0	LTR	MaLR	118	174	-234	7
1499	2090	183	205	31	chr3	119929434	119929952	-39669831	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	608	-3	7
1499	461	329	35	73	chr3	119929952	119930155	-39669628	+	MLT1A0	LTR	MaLR	158	395	-13	7
1500	1998	125	6	63	chr3	119940768	119941102	-39658681	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	13	7
1500	1803	217	54	18	chr3	119944814	119945204	-39654579	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	7
1500	681	322	101	18	chr3	119945338	119945616	-39654167	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	275	7
1500	1053	307	63	97	chr3	119950314	119950952	-39648831	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	616	0	7
1500	905	352	70	22	chr3	119953738	119954240	-39645543	+	MLT1F2	LTR	MaLR	5	530	-30	7
1500	459	322	144	22	chr3	119955575	119955845	-39643938	+	RMER15	LTR	ERVL	271	573	-2	7
1500	2612	55	12	0	chr3	119956639	119956966	-39642817	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	55	385	0	7
1500	3542	128	61	4	chr3	119959353	119959946	-39639837	-	RMER17B	LTR	ERVK	-376	582	1	7
1500	3423	28	5	0	chr3	119962874	119963268	-39636515	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1500	444	172	7	3	chr3	119973249	119973340	-39626443	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	93	-716	7
1500	3351	106	4	2	chr3	119973340	119973831	-39625952	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-4372	2547	2056	7
1500	777	107	60	15	chr3	119973820	119973953	-39625830	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6563	356	218	7
1500	376	177	10	77	chr3	119973944	119974048	-39625735	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-1631	97	1	7
1500	4143	160	79	40	chr3	119974048	119974978	-39624805	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	7
1500	618	305	48	35	chr3	119977539	119977770	-39622013	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-2	678	445	7
1500	228	272	76	42	chr3	119977850	119977969	-39621814	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-420	260	138	7
1500	636	259	173	25	chr3	119985721	119986005	-39613778	+	MTD	LTR	MaLR	67	416	-3	7
1500	532	292	101	67	chr3	119988172	119988505	-39611278	+	RMER15	LTR	ERVL	28	474	-101	7
1500	410	349	64	93	chr3	119995399	119995851	-39603932	-	MER77	LTR	ERVL	-80	527	89	7
1500	1778	169	12	42	chr3	120000001	120000334	-39599449	+	ORR1D1	LTR	MaLR	50	372	-2	1
1500	1146	286	57	62	chr3	120000519	120000888	-39598895	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	1	3
1500	1242	252	39	56	chr3	120001691	120001780	-39598003	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	92	-267	5
1500	1242	252	39	56	chr3	120002018	120002285	-39597498	+	ORR1E	LTR	MaLR	93	353	-6	5
1500	4370	124	59	17	chr3	120002725	120003441	-39596342	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	748	-8	7
1500	339	254	26	0	chr3	120006945	120007037	-39592746	+	MTEb	LTR	MaLR	281	375	-4	1
1500	621	202	131	12	chr3	120028097	120028257	-39571526	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	227	3
1500	1578	174	46	0	chr3	120028755	120029037	-39570746	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	295	-14	4
1500	352	50	8	0	chr3	120029053	120029106	-39570677	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	163	267	-7314	4
1500	646	243	40	54	chr3	120029112	120029334	-39570449	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	634	852	-1135	4
1500	266	237	0	0	chr3	120029448	120029524	-39570259	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	840	915	-6765	4
1500	6027	306	37	38	chr3	120030055	120034021	-39565762	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1515	5477	-2104	4
1500	648	289	0	0	chr3	120034129	120034333	-39565450	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6491	6694	-887	4
1500	396	325	6	6	chr3	120034455	120034616	-39565167	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6908	7068	-513	4
1500	1431	130	27	30	chr3	120034752	120035014	-39564769	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7321	7581	0	4
1500	1790	169	23	3	chr3	120035014	120035317	-39564466	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	4
1500	540	318	87	15	chr3	120035323	120035518	-39564265	-	MTD	LTR	MaLR	-206	213	5	3
1500	3380	35	2	0	chr3	120036818	120037213	-39562570	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1500	312	246	205	0	chr3	120037507	120037629	-39562154	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	233	4
1500	335	305	11	0	chr3	120037687	120037782	-39562001	-	ORR1E	LTR	MaLR	-262	97	2	4
1500	227	267	56	158	chr3	120049966	120050162	-39549621	-	RLTR43A	LTR	ERVK	0	364	189	7
1500	3242	51	2	2	chr3	120052300	120052696	-39547087	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1501	315	212	24	48	chr3	120070105	120070189	-39529594	-	RLTR14	LTR	ERV1	-3	379	298	9
1501	232	312	104	71	chr3	120080973	120081270	-39518513	-	RMER17C	LTR	ERVK	-38	372	66	1
1501	949	277	80	51	chr3	120082793	120083143	-39516640	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	6	1
1501	342	340	26	65	chr3	120085212	120085366	-39514417	-	MLT1A	LTR	MaLR	-226	148	1	1
1501	2443	173	74	139	chr3	120099063	120099796	-39499987	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	688	-2	1
1501	630	255	122	42	chr3	120113160	120113237	-39486546	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	270	1
1501	630	255	122	42	chr3	120113264	120113522	-39486261	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-101	269	6	1
1501	1486	206	117	26	chr3	120115589	120115906	-39483877	+	MTD	LTR	MaLR	1	350	-69	1
1501	1486	206	117	26	chr3	120115947	120116013	-39483770	+	MTD	LTR	MaLR	351	418	-1	1
1501	1136	314	39	8	chr3	120116478	120116841	-39482942	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	1	1
1501	366	308	0	16	chr3	120122099	120122222	-39477561	+	MTD	LTR	MaLR	43	160	-259	1
1501	629	182	66	0	chr3	120122282	120122403	-39477380	+	MTD	LTR	MaLR	291	419	0	1
1501	281	340	39	10	chr3	120128085	120128189	-39471594	+	MTEa	LTR	MaLR	1	107	-272	1
1501	287	345	73	45	chr3	120128274	120128453	-39471330	+	MT2A	LTR	ERVL	212	395	-138	1
1501	3309	35	2	8	chr3	120131674	120132072	-39467711	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1501	1193	288	33	28	chr3	120138711	120139075	-39460708	-	MTEb	LTR	MaLR	-7	372	7	2
1501	531	307	124	16	chr3	120147858	120148100	-39451683	-	MLT2D	LTR	ERVL	-105	309	42	2
1501	1410	153	97	161	chr3	120149406	120149536	-39450247	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	108	-299	2
1501	1410	153	97	161	chr3	120149682	120149986	-39449797	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	109	407	0	2
1501	1590	191	92	0	chr3	120155134	120155470	-39444313	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1501	952	278	127	11	chr3	120164944	120165278	-39434505	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	365	4	2
1501	2670	141	131	17	chr3	120168309	120168834	-39430949	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	1	2
1501	515	290	164	42	chr3	120170280	120170505	-39429278	+	RMER15	LTR	ERVL	265	531	-44	2
1501	515	290	164	42	chr3	120170548	120170585	-39429198	+	RMER15	LTR	ERVL	532	559	-16	2
1501	2893	52	76	0	chr3	120183170	120183538	-39416245	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1501	904	282	150	12	chr3	120183776	120184096	-39415687	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	364	-15	2
1501	346	194	117	34	chr3	120184111	120184209	-39415574	+	MTD	LTR	MaLR	310	418	-3	2
1501	497	303	79	0	chr3	120185390	120185555	-39414228	-	MTC	LTR	MaLR	-205	216	38	2
1501	497	303	79	0	chr3	120185594	120185606	-39414177	-	MTC	LTR	MaLR	-384	37	26	2
1501	1123	172	197	91	chr3	120185655	120185975	-39413808	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	3
1502	1390	230	41	63	chr3	120203311	120203678	-39396105	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	361	-18	3
1502	828	303	36	33	chr3	120204531	120204771	-39395012	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	243	-136	3
1502	828	303	36	33	chr3	120204851	120204886	-39394897	+	MTE2b	LTR	MaLR	244	276	-103	3
1502	1174	208	61	71	chr3	120204886	120205229	-39394554	-	LTRIS5	LTR	ERV1	0	447	74	3
1502	420	295	9	18	chr3	120205566	120205680	-39394103	+	MTE2b	LTR	MaLR	229	341	-38	3
1502	328	200	0	0	chr3	120205681	120205736	-39394047	+	MT2A	LTR	ERVL	368	422	-111	3
1502	2370	104	150	0	chr3	120206700	120207066	-39392717	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	421	-1	3
1502	804	241	86	33	chr3	120210276	120210699	-39389084	+	MT2B	LTR	ERVL	6	556	-45	3
1502	1500	221	52	12	chr3	120219845	120220188	-39379595	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-17	357	1	3
1502	1045	86	7	0	chr3	120221201	120221340	-39378443	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-49	278	139	3
1502	1356	264	48	3	chr3	120231471	120231801	-39367982	+	MTE2b	LTR	MaLR	28	372	-7	3
1502	2781	131	24	9	chr3	120233159	120233565	-39366218	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	58	3
1502	2781	131	24	9	chr3	120233646	120233693	-39366090	-	RMER6B	LTR	ERVK	-404	57	2	3
1502	2656	155	59	16	chr3	120242072	120242577	-39357206	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	3
1502	1977	207	35	58	chr3	120250502	120250728	-39349055	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	209	4
1502	1977	207	35	58	chr3	120250974	120251172	-39348611	-	MTC	LTR	MaLR	-213	208	1	4
1502	241	174	0	21	chr3	120251983	120252030	-39347753	-	MTC	LTR	MaLR	-138	283	238	4
1502	978	263	75	64	chr3	120252819	120253270	-39346513	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-31	497	42	4
1502	1604	336	110	19	chr3	120255650	120256402	-39343381	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-367	1020	200	4
1502	1306	233	148	33	chr3	120257303	120257662	-39342121	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	400	-7	4
1502	324	241	7	217	chr3	120259079	120259222	-39340561	-	MTE2b	LTR	MaLR	-259	120	8	4
1502	2977	37	50	11	chr3	120264749	120265130	-39334653	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1502	551	325	24	65	chr3	120285432	120285724	-39314059	+	MER34A1	LTR	ERV1	48	327	-260	4
1502	2505	157	27	2	chr3	120285724	120286127	-39313656	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	4
1502	250	229	227	9	chr3	120286612	120286722	-39313061	+	LTR37A	LTR	ERV1	119	252	-174	4
1502	466	315	104	82	chr3	120287464	120287655	-39312128	-	MER31A	LTR	ERV1	-106	379	197	4
1502	466	325	89	85	chr3	120287709	120287878	-39311905	-	MER31A	LTR	ERV1	-253	213	33	4
1502	508	316	129	126	chr3	120294653	120295225	-39304558	+	MER34A1	LTR	ERV1	14	587	0	4
1502	953	254	69	82	chr3	120301218	120301709	-39298074	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	4
1502	726	241	25	0	chr3	120303841	120303999	-39295784	+	MTE2b	LTR	MaLR	20	181	-198	4
1502	3078	83	2	0	chr3	120304597	120304996	-39294787	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1502	532	336	128	21	chr3	120306375	120306703	-39293080	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	3	4
1502	1254	278	65	12	chr3	120306984	120307323	-39292460	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-8	362	6	4
1502	1339	309	151	47	chr3	120307442	120308289	-39291494	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-42	1447	513	4
1502	1312	271	93	12	chr3	120309024	120309368	-39290415	+	MTEb	LTR	MaLR	1	372	-7	4
1502	773	276	72	64	chr3	120309381	120309756	-39290027	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	379	0	4
1502	379	335	143	9	chr3	120310314	120310537	-39289246	-	MLT-int	LTR	MaLR	-173	1562	1310	4
1502	784	307	108	89	chr3	120310766	120311227	-39288556	-	MLT-int	LTR	MaLR	-761	974	505	4
1502	567	296	109	53	chr3	120314491	120314776	-39285007	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1209	526	226	4
1502	359	350	100	12	chr3	120314851	120315052	-39284731	-	MLT1A	LTR	MaLR	-4	370	149	5
1502	1109	296	108	12	chr3	120317385	120317813	-39281970	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-46	474	6	5
1502	1164	265	64	45	chr3	120318314	120318737	-39281046	-	MER110	LTR	ERV1	-8	483	53	5
1502	238	205	0	0	chr3	120320004	120320043	-39279740	-	MTC	LTR	MaLR	0	419	381	5
1502	1211	124	8	84	chr3	120320041	120320278	-39279505	-	MTC	LTR	MaLR	-201	220	2	5
1502	2189	172	5	3	chr3	120320283	120320655	-39279128	-	RLTR14	LTR	ERV1	-9	373	1	5
1503	2443	202	23	33	chr3	120334478	120335000	-39264783	+	RMER5	LTR	ERV1	3	519	-15	5
1503	349	270	120	188	chr3	120335371	120335764	-39264019	+	MTEb	LTR	MaLR	14	379	0	5
1503	350	346	89	28	chr3	120339270	120339484	-39260299	-	MLT1D	LTR	MaLR	-247	258	32	5
1503	369	271	21	0	chr3	120344456	120344552	-39255231	+	MTEb	LTR	MaLR	1	98	-281	5
1503	625	290	26	69	chr3	120344553	120344786	-39254997	+	MTEb	LTR	MaLR	59	281	-98	5
1503	2281	215	40	36	chr3	120344801	120345326	-39254457	-	RMER5	LTR	ERV1	-5	529	3	5
1503	653	287	47	156	chr3	120350360	120350937	-39248846	-	MLT2B2	LTR	ERVL	0	515	2	5
1503	316	329	127	101	chr3	120354970	120355484	-39244299	+	LTR48B	LTR	ERV1	118	644	0	5
1503	585	219	35	23	chr3	120373596	120373737	-39226046	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-1	1027	864	5
1503	305	128	24	249	chr3	120373803	120373936	-39225847	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-240	863	692	5
1503	1127	171	24	2	chr3	120373916	120374192	-39225591	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-997	966	633	5
1503	1241	169	88	72	chr3	120374147	120374396	-39225387	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	35	5
1503	774	190	168	113	chr3	120374217	120374508	-39225275	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1157	806	500	5
1503	2152	191	45	149	chr3	120374432	120375016	-39224767	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-580	523	1	5
1503	436	371	79	47	chr3	120375280	120375622	-39224161	+	MER21B	LTR	ERV1	390	742	-121	5
1503	430	287	101	12	chr3	120377371	120377540	-39222243	-	MLT1A	LTR	MaLR	-4	370	187	5
1503	744	361	84	38	chr3	120392789	120393215	-39206568	+	LTR16B	LTR	ERVL	4	449	-14	6
1503	1256	221	128	18	chr3	120394607	120394863	-39204920	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	296	-78	6
1503	3079	158	88	47	chr3	120394863	120395229	-39204554	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	337	6
1503	3079	158	88	47	chr3	120395305	120395601	-39204182	-	RMER6C	LTR	ERVK	-354	336	1	6
1503	1256	221	128	18	chr3	120395601	120395681	-39204102	+	ORR1D1	LTR	MaLR	297	374	0	6
1503	232	325	117	0	chr3	120398776	120398853	-39200930	+	MLT1A	LTR	MaLR	49	134	-240	6
1503	406	295	104	98	chr3	120402646	120402943	-39196840	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	304	-55	6
1503	301	393	6	41	chr3	120403916	120404086	-39195697	-	MLT1F	LTR	MaLR	-384	164	1	6
1503	435	319	22	0	chr3	120407490	120407628	-39192155	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	408	0	6
1503	953	165	17	12	chr3	120408007	120408215	-39191568	+	ORR1C1	LTR	MaLR	192	394	0	6
1503	829	296	37	47	chr3	120408663	120408961	-39190822	+	MER21B	LTR	ERV1	444	738	-125	6
1503	1417	177	72	65	chr3	120437030	120437420	-39162363	+	MT2A	LTR	ERVL	6	542	-59	7
1503	808	221	35	164	chr3	120437467	120437537	-39162246	+	MT2A	LTR	ERVL	543	601	0	7
1503	349	226	111	49	chr3	120448483	120448627	-39151156	+	MLT1C	LTR	MaLR	3	155	-312	7
1503	2845	78	0	23	chr3	120448817	120449212	-39150571	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-21	386	1	7
1503	614	335	39	109	chr3	120449452	120449810	-39149973	+	MLT1D	LTR	MaLR	77	409	-96	7
1503	1068	256	42	90	chr3	120450077	120450454	-39149329	+	MT2A	LTR	ERVL	3	361	-172	7
1503	1057	279	97	6	chr3	120450907	120451228	-39148555	+	MTD	LTR	MaLR	42	391	-28	7
1503	833	275	253	35	chr3	120452850	120453177	-39146606	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	177	7
1503	833	275	253	35	chr3	120453229	120453360	-39146423	-	RMER15	LTR	ERVL	-399	176	1	7
1504	551	291	56	37	chr3	120461746	120461960	-39137823	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	265	7
1504	1060	311	99	87	chr3	120466488	120467205	-39132578	-	RMER13A	LTR	ERVK	-40	820	95	7
1504	2063	107	94	0	chr3	120474371	120474670	-39125113	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1504	843	296	36	102	chr3	120477026	120477410	-39122373	+	MTE2a	LTR	MaLR	21	379	0	7
1504	1294	79	0	11	chr3	120478957	120479136	-39120647	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	218	7
1504	934	166	111	55	chr3	120479548	120479765	-39120018	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-163	231	3	7
1504	2008	177	59	3	chr3	120482883	120483037	-39116746	+	ORR1C1	LTR	MaLR	2	165	-213	7
1504	2008	177	59	3	chr3	120483132	120483334	-39116449	+	ORR1C1	LTR	MaLR	166	377	-1	7
1504	277	241	31	125	chr3	120485295	120485364	-39114419	+	RMER21B	LTR	ERV1	519	578	-264	7
1504	277	241	31	125	chr3	120485436	120485494	-39114289	+	RMER21B	LTR	ERV1	579	634	-208	7
1504	1244	256	115	77	chr3	120485803	120485985	-39113798	+	RMER5	LTR	ERV1	38	221	-313	7
1504	1824	145	26	81	chr3	120485985	120486331	-39113452	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	7
1504	1244	256	115	77	chr3	120486331	120486498	-39113285	+	RMER5	LTR	ERV1	222	381	-153	7
1504	1244	256	115	77	chr3	120486529	120486647	-39113136	+	RMER5	LTR	ERV1	382	524	-10	7
1504	3874	155	142	7	chr3	120498190	120498947	-39100836	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1028	169	7
1504	517	318	69	35	chr3	120500963	120501165	-39098618	+	MTEb	LTR	MaLR	1	209	-170	2
1504	251	324	43	77	chr3	120501205	120501223	-39098560	+	MTEb	LTR	MaLR	201	216	-163	2
1504	251	324	43	77	chr3	120501306	120501404	-39098379	+	MTEb	LTR	MaLR	217	313	-66	2
1504	819	73	0	9	chr3	120501410	120501520	-39098263	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	109	-289	5
1504	2103	177	13	58	chr3	120501863	120502259	-39097524	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	8
1504	4737	12	0	0	chr3	120503782	120504275	-39095508	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1504	1117	273	36	85	chr3	120505017	120505405	-39094378	+	MTEa	LTR	MaLR	2	370	-9	1
1504	244	300	33	11	chr3	120506771	120506862	-39092921	+	LTR33A	LTR	ERVL	5	97	-423	1
1504	482	350	70	26	chr3	120506895	120507124	-39092659	+	LTR33A	LTR	ERVL	244	482	-38	1
1504	2908	28	61	3	chr3	120509550	120509877	-39089906	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	2
1504	764	189	120	0	chr3	120510079	120510254	-39089529	+	ORR1C2	LTR	MaLR	189	384	0	2
1504	443	281	73	15	chr3	120511952	120512089	-39087694	-	ORR1E	LTR	MaLR	-209	150	6	2
1504	2504	80	9	33	chr3	120517040	120517375	-39082408	-	IAPLTR2b	LTR	ERVK	0	327	1	3
1504	2797	59	40	5	chr3	120520082	120520457	-39079326	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-8	388	1	3
1504	387	308	172	5	chr3	120522483	120522692	-39077091	+	LTR33A	LTR	ERVL	1	244	-551	3
1504	1403	297	130	12	chr3	120523036	120523520	-39076263	+	MLT1F1	LTR	MaLR	1	541	-28	3
1504	1662	132	82	33	chr3	120526550	120526855	-39072928	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	320	0	4
1504	231	315	141	0	chr3	120541242	120541334	-39058449	-	MLT1J1	LTR	MaLR	0	680	576	5
1504	244	250	91	91	chr3	120541447	120541557	-39058226	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-167	460	351	5
1504	542	335	95	38	chr3	120544275	120544539	-39055244	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-157	287	9	5
1504	926	184	83	35	chr3	120546580	120546807	-39052976	+	RMER16	LTR	ERVK	1	320	-213	6
1504	682	136	0	9	chr3	120546807	120546918	-39052865	+	RMER16	LTR	ERVK	424	533	0	6
1504	478	337	157	14	chr3	120549190	120549470	-39050313	+	MLT1I	LTR	MaLR	4	323	-88	6
1504	264	192	0	170	chr3	120549542	120549571	-39050212	+	MT2B	LTR	ERVL	146	223	-378	6
1504	2509	146	9	31	chr3	120558878	120559336	-39040447	-	RMER6B	LTR	ERVK	-11	450	3	7
1504	371	202	54	43	chr3	120559410	120559503	-39040280	-	MLT1B	LTR	MaLR	-294	96	3	8
1504	421	253	0	0	chr3	120565228	120565315	-39034468	+	MTEb	LTR	MaLR	1	87	-292	9
1504	1077	142	102	109	chr3	120565317	120565601	-39034182	+	RMER6B	LTR	ERVK	4	285	-176	9
1504	561	148	99	0	chr3	120566263	120566364	-39033419	+	RMER6B	LTR	ERVK	339	449	-12	9
1504	581	261	121	42	chr3	120566414	120566500	-39033283	+	MTEb	LTR	MaLR	119	200	-179	9
1504	581	261	121	42	chr3	120566545	120566698	-39033085	+	MTEb	LTR	MaLR	201	376	-3	9
1504	1256	236	88	67	chr3	120576987	120577451	-39022332	+	RMER19C	LTR	ERVK	138	611	0	1
1504	566	306	114	28	chr3	120577664	120577919	-39021864	-	MLT-int	LTR	MaLR	-274	1461	1185	1
1504	1553	159	75	154	chr3	120581521	120581988	-39017795	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	1
1504	578	284	53	46	chr3	120582295	120582557	-39017226	+	RLTR18	LTR	ERVK	25	288	-328	1
1504	258	276	148	114	chr3	120582683	120582920	-39016863	+	RLTR18	LTR	ERVK	368	612	-4	1
1505	1916	135	62	45	chr3	120595518	120595716	-39004067	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	200	-210	1
1505	1916	135	62	45	chr3	120595822	120596026	-39003757	+	RMER17C	LTR	ERVK	201	410	0	1
1505	994	192	21	5	chr3	120596630	120596818	-39002965	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	193	1
1505	976	136	15	23	chr3	120597368	120597555	-39002228	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-191	176	1	1
1505	429	216	0	11	chr3	120602965	120603054	-38996729	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-13	395	308	1
1505	3464	30	2	0	chr3	120604483	120604877	-38994906	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	395	-1	1
1505	1731	207	166	19	chr3	120607686	120608163	-38991620	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	356	1
1505	608	332	96	21	chr3	120608202	120608621	-38991162	-	MT2A	LTR	ERVL	-81	452	3	1
1505	2370	134	62	12	chr3	120612202	120612603	-38987180	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1505	308	204	0	0	chr3	120616146	120616200	-38983583	+	MTEa	LTR	MaLR	19	72	-307	1
1505	295	158	17	17	chr3	120616205	120616263	-38983520	+	MTE2b	LTR	MaLR	314	371	-8	1
1505	781	61	0	0	chr3	120616368	120616467	-38983316	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	302	1
1505	3980	153	44	5	chr3	120617218	120617881	-38981902	+	RLTR17	LTR	ERVK	4	692	0	1
1505	2222	168	50	10	chr3	120631355	120631757	-38968026	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	1	2
1505	2624	42	33	0	chr3	120632914	120633246	-38966537	+	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	43	385	0	2
1505	426	261	56	19	chr3	120635004	120635164	-38964619	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	265	2
1505	331	295	70	18	chr3	120648291	120648405	-38951378	+	MTD	LTR	MaLR	1	120	-299	2
1505	1046	226	138	11	chr3	120648933	120649076	-38950707	+	MTE2a	LTR	MaLR	59	200	-179	2
1505	1046	226	138	11	chr3	120649109	120649247	-38950536	+	MTE2a	LTR	MaLR	201	376	-3	2
1505	627	299	131	24	chr3	120656873	120657164	-38942619	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-43	322	1	2
1505	1276	280	65	25	chr3	120657364	120657720	-38942063	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	371	-8	2
1505	285	143	0	0	chr3	120667094	120667136	-38932647	-	MTC	LTR	MaLR	-8	411	370	2
1505	876	181	23	15	chr3	120667125	120667298	-38932485	-	MTC	LTR	MaLR	-157	264	62	2
1505	519	208	9	0	chr3	120667337	120667443	-38932340	-	MTC	LTR	MaLR	-300	107	1	2
1505	237	324	51	59	chr3	120668267	120668385	-38931398	-	MLT1F	LTR	MaLR	-431	117	1	2
1505	401	216	56	56	chr3	120671112	120671220	-38928563	-	RMER15	LTR	ERVL	-43	532	425	2
1505	228	309	14	29	chr3	120671378	120671448	-38928335	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	69	-290	2
1505	297	312	62	27	chr3	120671527	120671639	-38928144	+	ORR1D2	LTR	MaLR	61	176	-194	2
1505	232	235	87	31	chr3	120671841	120671946	-38927837	+	ORR1D2	LTR	MaLR	272	375	-4	2
1505	1958	187	70	18	chr3	120673009	120673407	-38926376	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	2
1505	411	331	28	107	chr3	120677085	120677376	-38922407	-	LTR37B	LTR	ERV1	-86	382	115	2
1505	802	243	137	36	chr3	120678827	120678972	-38920811	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	162	-212	2
1505	802	243	137	36	chr3	120679108	120679209	-38920574	+	ORR1D1	LTR	MaLR	163	274	-100	2
1505	3434	160	28	44	chr3	120679213	120679866	-38919917	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	2
1505	458	157	276	9	chr3	120679866	120679954	-38919829	+	ORR1D1	LTR	MaLR	266	384	0	2
1505	250	306	83	103	chr3	120682071	120682275	-38917508	+	MER34A1	LTR	ERV1	70	269	-318	2
1505	1190	271	39	10	chr3	120682284	120682590	-38917193	-	ORR1E	LTR	MaLR	-33	326	12	2
1505	543	307	82	43	chr3	120682633	120682915	-38916868	+	MER34A1	LTR	ERV1	293	585	-2	2
1505	1125	213	50	69	chr3	120683712	120683989	-38915794	+	MTC	LTR	MaLR	143	414	-7	2
1505	1528	147	55	70	chr3	120689584	120689927	-38909856	+	RMER5	LTR	ERV1	65	402	-132	2
1505	392	231	137	25	chr3	120689938	120690061	-38909722	+	MTEb	LTR	MaLR	229	366	-13	2
1505	2709	143	5	12	chr3	120690806	120691216	-38908567	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
1505	351	159	32	0	chr3	120692733	120692796	-38906987	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	320	2
1505	314	350	51	46	chr3	120698278	120698515	-38901268	+	ORR1E	LTR	MaLR	15	252	-107	3
1505	625	292	0	7	chr3	120702984	120703139	-38896644	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	309	3
1505	661	324	67	48	chr3	120704682	120704996	-38894787	-	MT2A	LTR	ERVL	-213	320	1	3
1505	323	325	0	16	chr3	120714052	120714174	-38885609	+	MLT1B	LTR	MaLR	271	390	0	3
1505	1348	278	45	28	chr3	120715286	120715645	-38884138	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	6	3
1506	2152	100	81	14	chr3	120724001	120724346	-38875437	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	3
1506	1066	227	224	0	chr3	120729773	120730186	-38869597	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	505	-7	3
1506	1728	155	178	62	chr3	120731074	120731474	-38868309	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	3
1506	419	196	8	111	chr3	120731530	120731656	-38868127	+	MT2B	LTR	ERVL	152	264	-337	3
1506	232	254	36	0	chr3	120731787	120731842	-38867941	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-391	57	1	3
1506	505	334	90	46	chr3	120734548	120734873	-38864910	-	LTR33A	LTR	ERVL	-159	372	9	3
1506	1252	121	54	22	chr3	120740519	120740908	-38858875	+	RLTR45	LTR	ERVK	30	482	0	3
1506	233	192	19	0	chr3	120743749	120743801	-38855982	+	ORR1E	LTR	MaLR	88	140	-219	3
1506	272	267	178	0	chr3	120746917	120747007	-38852776	+	LTR85c	LTR	Gypsy?	446	551	-272	3
1506	254	260	28	65	chr3	120749754	120749861	-38849922	-	MLT1K	LTR	MaLR	-65	530	428	3
1506	2180	213	34	20	chr3	120758102	120758600	-38841183	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	4
1506	4390	132	159	78	chr3	120758663	120759309	-38840474	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	2	778	-255	4
1506	4390	132	159	78	chr3	120759390	120759698	-38840085	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	779	1033	0	4
1506	532	302	151	27	chr3	120763714	120764013	-38835770	-	MLT1A	LTR	MaLR	-38	336	1	4
1506	500	233	17	8	chr3	120768790	120768907	-38830876	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-45	571	454	4
1506	648	242	48	6	chr3	120769107	120769273	-38830510	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-331	181	9	4
1506	1122	250	24	68	chr3	120770179	120770593	-38829190	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	404	1	4
1506	828	278	55	75	chr3	120774063	120774439	-38825344	+	MTE2a	LTR	MaLR	20	398	-21	4
1506	1745	151	24	59	chr3	120776764	120777102	-38822681	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
1506	320	355	125	33	chr3	120779505	120779808	-38819975	+	MLT1A0	LTR	MaLR	6	336	-29	4
1506	942	239	36	54	chr3	120781447	120781726	-38818057	+	ORR1E	LTR	MaLR	49	322	-37	4
1506	1034	213	67	88	chr3	120781781	120782157	-38817626	-	RLTR40	LTR	ERVK	-164	653	286	4
1506	699	284	23	83	chr3	120782160	120782529	-38817254	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	350	-178	4
1506	1229	255	60	33	chr3	120793284	120793649	-38806134	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	5	4
1506	8148	105	31	151	chr3	120798256	120798545	-38801238	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1291	4
1506	8148	105	31	151	chr3	120798570	120800062	-38799721	-	RLTR21	LTR	ERVK	-282	1290	5	4
1506	539	280	79	97	chr3	120801600	120801940	-38797843	+	ORR1E	LTR	MaLR	22	355	-4	4
1506	866	179	5	43	chr3	120809176	120809363	-38790420	+	RMER6A	LTR	ERVK	577	756	0	4
1506	1683	176	100	3	chr3	120822385	120822726	-38777057	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	5	5
1506	2266	120	9	0	chr3	120831908	120832232	-38767551	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1506	3666	105	62	27	chr3	120833146	120833694	-38766089	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	5
1506	875	285	54	30	chr3	120835546	120835879	-38763904	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	341	-67	5
1506	286	236	44	4	chr3	120838975	120839105	-38760678	+	MLT1A1	LTR	MaLR	251	387	-21	5
1506	1948	146	91	0	chr3	120839540	120839890	-38759893	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	386	-8	5
1506	426	108	24	24	chr3	120843484	120843569	-38756214	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	125	-269	5
1506	283	247	12	94	chr3	120844109	120844194	-38755589	+	MLT1A1	LTR	MaLR	66	143	-265	5
1506	274	359	0	19	chr3	120844205	120844310	-38755473	+	MLT1A1	LTR	MaLR	263	365	0	5
1506	1085	275	75	51	chr3	120845484	120845994	-38753789	+	MT2A	LTR	ERVL	2	523	-10	5
1507	411	250	250	0	chr3	120848992	120849140	-38750643	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	185	-229	5
1507	279	358	70	83	chr3	120849273	120849514	-38750269	+	MLT2D	LTR	ERVL	165	402	-62	5
1507	287	268	104	52	chr3	120850526	120850699	-38749084	+	ERVL-int	LTR	ERVL	2682	2863	-2804	5
1507	1094	326	50	30	chr3	120851295	120851895	-38747888	+	ERVL-int	LTR	ERVL	3768	4379	-1378	5
1507	357	232	124	9	chr3	120851925	120852038	-38747745	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	406	5
1507	348	321	125	35	chr3	120852124	120852324	-38747459	-	MT2A	LTR	ERVL	-146	387	170	5
1507	335	299	28	18	chr3	120852362	120852471	-38747312	-	MTEa	LTR	MaLR	-269	110	1	5
1507	3379	40	2	0	chr3	120852754	120853149	-38746634	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1507	9549	23	9	0	chr3	120853149	120854237	-38745546	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	5
1507	3586	13	2	0	chr3	120854237	120854632	-38745151	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1507	381	265	110	26	chr3	120854634	120854789	-38744994	+	ERVL-int	LTR	ERVL	4837	5004	-663	5
1507	335	280	47	16	chr3	120854894	120855021	-38744762	-	MTD	LTR	MaLR	-286	133	3	5
1507	704	266	11	11	chr3	120864711	120864897	-38734886	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	188	-171	5
1507	3059	164	189	108	chr3	120864902	120865482	-38734301	+	RMER12	LTR	ERVK	1	674	-648	5
1507	3059	164	189	108	chr3	120865511	120865607	-38734176	+	RMER12	LTR	ERVK	675	675	-647	5
1507	3059	164	189	108	chr3	120865752	120865872	-38733911	+	RMER12	LTR	ERVK	675	806	-516	5
1507	3059	164	189	108	chr3	120865897	120866196	-38733587	+	RMER12	LTR	ERVK	807	1186	-136	5
1507	385	326	111	22	chr3	120867328	120867554	-38732229	+	MER77	LTR	ERVL	330	575	-32	5
1507	3429	180	139	64	chr3	120867552	120867754	-38732029	+	RMER12	LTR	ERVK	111	309	-1013	5
1507	3429	180	139	64	chr3	120867953	120868757	-38731026	+	RMER12	LTR	ERVK	310	1195	-127	5
1507	295	292	21	10	chr3	120869606	120869696	-38730087	+	MLT1D	LTR	MaLR	370	460	-45	5
1507	450	286	168	0	chr3	120879088	120879273	-38720510	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	216	-149	6
1507	2081	145	66	9	chr3	120879277	120879624	-38720159	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1507	2547	74	3	12	chr3	120881912	120882242	-38717541	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1507	2653	151	47	18	chr3	120882247	120882759	-38717024	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	6
1507	330	243	0	122	chr3	120884211	120884237	-38715546	+	MT2B	LTR	ERVL	144	153	-448	6
1507	318	253	62	10	chr3	120885824	120885920	-38713863	+	RMER10A	LTR	ERVL	318	418	-24	6
1507	1984	120	30	51	chr3	120889305	120889639	-38710144	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1507	431	281	75	0	chr3	120891589	120891735	-38708048	-	MLT1D	LTR	MaLR	-7	498	342	6
1507	295	301	10	31	chr3	120892042	120892138	-38707645	-	MLT1D	LTR	MaLR	-411	94	1	6
1507	434	230	35	69	chr3	120892517	120892690	-38707093	+	RNLTR23	LTR	ERVK	464	630	-12	6
1507	1675	184	33	0	chr3	120893295	120893594	-38706189	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	6
1507	673	287	132	48	chr3	120894380	120894669	-38705114	+	MLT1A0	LTR	MaLR	15	327	-38	6
1507	3632	10	2	0	chr3	120899770	120900165	-38699618	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1507	486	151	52	7	chr3	120910428	120910533	-38689250	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-224	103	1	6
1507	298	326	22	22	chr3	120912797	120912932	-38686851	+	LTR80B	LTR	ERVL	449	583	0	6
1507	582	267	199	13	chr3	120918078	120918389	-38681394	-	MLT1C	LTR	MaLR	-79	388	20	6
1507	229	315	64	35	chr3	120921953	120922124	-38677659	+	MLT1H1	LTR	MaLR	37	212	-343	6
1507	284	200	63	53	chr3	120925825	120925920	-38673863	+	RLTR25B	LTR	ERVK	414	509	-519	6
1507	796	259	59	9	chr3	120944891	120945113	-38654670	+	ORR1D2	LTR	MaLR	134	366	-4	7
1507	388	283	81	0	chr3	120945753	120945852	-38653931	+	MTEb	LTR	MaLR	1	107	-272	7
1507	484	256	113	19	chr3	120945842	120946001	-38653782	-	MTE-int	LTR	MaLR	-901	679	506	7
1507	525	266	169	2	chr3	120946015	120946180	-38653603	+	MTEb	LTR	MaLR	161	379	0	7
1507	227	207	65	109	chr3	120951217	120951309	-38648474	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-554	148	61	7
1507	275	319	53	47	chr3	120955205	120955376	-38644407	+	MLT1H	LTR	MaLR	59	230	-319	7
1507	4495	66	8	35	chr3	120955522	120956122	-38643661	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	7
1507	273	267	34	0	chr3	120956481	120956627	-38643156	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	604	754	-755	7
1507	297	331	84	4	chr3	120977262	120977447	-38622336	-	MLT1H	LTR	MaLR	0	624	283	8
1507	546	320	70	44	chr3	120977909	120978180	-38621603	-	MLT1H	LTR	MaLR	-260	289	12	8
1507	1603	123	38	19	chr3	120978582	120978846	-38620937	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	152	8
1507	2172	160	40	0	chr3	120978838	120979188	-38620595	+	MTC	LTR	MaLR	58	421	0	8
1507	502	139	174	0	chr3	120979188	120979272	-38620511	-	MTC	LTR	MaLR	-317	104	1	8
1508	355	311	84	12	chr3	120979538	120979704	-38620079	+	LTR48B	LTR	ERV1	94	271	-373	8
1508	441	155	66	85	chr3	120986628	120986734	-38613049	+	MT2B	LTR	ERVL	154	257	-344	8
1508	1177	163	39	15	chr3	120987315	120987521	-38612262	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	391	8
1508	1304	224	49	43	chr3	120988491	120988859	-38610924	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	8
1508	1174	265	166	0	chr3	120988980	120989305	-38610478	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	8
1508	2783	66	143	139	chr3	120991919	120992429	-38607354	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	8
1508	274	128	0	0	chr3	121002205	121002244	-38597539	-	RMER6C	LTR	ERVK	-37	653	615	6
1508	1325	217	31	108	chr3	121013932	121014376	-38585407	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	3
1508	3566	25	0	0	chr3	121014381	121014777	-38585006	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1508	2258	111	36	3	chr3	121019011	121019346	-38580437	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	3
1508	3720	179	118	67	chr3	121021193	121022040	-38577743	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	4
1508	1585	131	205	40	chr3	121023689	121024040	-38575743	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	4
1508	1626	185	42	44	chr3	121035073	121035481	-38564302	-	RMER17C	LTR	ERVK	-3	407	1	7
1508	1329	147	128	81	chr3	121040295	121040592	-38559191	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	311	-56	8
1508	323	149	0	0	chr3	121040830	121040877	-38558906	+	ORR1B2	LTR	MaLR	313	359	-8	8
1508	455	119	15	0	chr3	121041353	121041420	-38558363	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	312	8
1508	272	266	104	21	chr3	121041718	121041814	-38557969	-	MTE2b	LTR	MaLR	-70	309	206	8
1508	584	296	121	0	chr3	121043230	121043429	-38556354	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-6	359	137	9
1508	250	311	50	50	chr3	121054533	121054672	-38545111	+	ORR1E	LTR	MaLR	62	200	-159	1
1508	744	317	32	43	chr3	121059945	121060222	-38539561	-	MLT1K	LTR	MaLR	-6	589	316	1
1508	865	68	7	45	chr3	121064982	121065137	-38534646	-	RMER17B	LTR	ERVK	-498	460	312	1
1508	378	48	0	48	chr3	121069709	121069772	-38530011	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	535	1
1508	1688	148	62	70	chr3	121069820	121070278	-38529505	-	MT2B	LTR	ERVL	-63	538	1	1
1508	448	289	105	117	chr3	121071399	121071458	-38528325	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-11	613	556	1
1508	1598	157	129	6	chr3	121071458	121071791	-38527992	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1508	448	289	105	117	chr3	121071791	121071836	-38527947	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-69	555	521	1
1508	448	289	105	117	chr3	121071993	121072126	-38527657	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-104	520	378	1
1508	1010	223	55	105	chr3	121072522	121072883	-38526900	+	ORR1D2	LTR	MaLR	6	348	-22	1
1508	230	271	0	54	chr3	121072880	121072954	-38526829	-	LTRIS4	LTR	ERV1	-413	94	25	1
1508	685	306	103	30	chr3	121074757	121075124	-38524659	-	MLT1G	LTR	MaLR	-4	587	194	1
1508	2511	157	29	29	chr3	121090177	121090630	-38509153	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	2
1508	3256	48	2	12	chr3	121095070	121095474	-38504309	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
1508	261	225	153	37	chr3	121095550	121095649	-38504134	+	MLT1A0	LTR	MaLR	217	353	-55	2
1508	364	311	9	28	chr3	121098181	121098287	-38501496	+	MLT1H	LTR	MaLR	59	162	-387	2
1508	245	360	45	65	chr3	121098509	121098800	-38500983	+	MLT1H	LTR	MaLR	153	437	-112	2
1508	1146	29	0	0	chr3	121099442	121099581	-38500202	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	227	2
1508	1553	115	4	22	chr3	121101446	121101677	-38498106	+	MTC	LTR	MaLR	1	227	-194	2
1508	1000	238	134	55	chr3	121104008	121104351	-38495432	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	2
1508	875	324	57	59	chr3	121106117	121106589	-38493194	+	MLT2B3	LTR	ERVL	18	488	-66	2
1508	1185	289	89	32	chr3	121107998	121108502	-38491281	+	MER68	LTR	ERVL	3	535	-28	2
1509	379	318	112	43	chr3	121111377	121111610	-38488173	+	MLT1J	LTR	MaLR	227	475	-37	2
1509	351	289	33	0	chr3	121112618	121112708	-38487075	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-250	115	23	2
1509	1143	261	72	67	chr3	121112713	121113115	-38486668	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-17	1718	1315	2
1509	1250	307	103	41	chr3	121113718	121114347	-38485436	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-1067	668	1	2
1509	226	354	114	30	chr3	121115000	121115166	-38484617	+	RMER4A	LTR	ERVK	8	187	-279	2
1509	363	258	11	11	chr3	121115373	121115467	-38484316	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-206	159	66	2
1509	2328	98	35	3	chr3	121117173	121117490	-38482293	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1509	1995	136	77	34	chr3	121117647	121117998	-38481785	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	2	2
1509	256	273	0	15	chr3	121119511	121119578	-38480205	-	MTEa	LTR	MaLR	-26	353	288	3
1509	444	274	223	63	chr3	121120501	121120801	-38478982	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-17	348	1	3
1509	4361	15	2	0	chr3	121123555	121124036	-38475747	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	3
1509	230	250	32	40	chr3	121141502	121141517	-38458266	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	631	644	-865	3
1509	226	232	37	92	chr3	121145299	121145408	-38454375	+	ORR1D1	LTR	MaLR	31	133	-241	3
1509	1292	188	90	32	chr3	121145937	121146256	-38453527	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-10	374	1	3
1509	900	234	251	0	chr3	121158473	121158772	-38441011	-	MTD	LTR	MaLR	-45	374	1	4
1509	3040	132	34	38	chr3	121175371	121175898	-38423885	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	525	-3	4
1509	962	100	14	0	chr3	121178434	121178574	-38421209	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	312	4
1509	1552	100	5	0	chr3	121178670	121178890	-38420893	+	RLTR11B	LTR	ERVK	228	448	-5	4
1509	2499	92	0	3	chr3	121198007	121198334	-38401449	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
1509	264	281	7	28	chr3	121200398	121200541	-38399242	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	615	4
1509	1623	231	16	18	chr3	121206833	121207210	-38392573	+	MTD	LTR	MaLR	7	419	0	5
1509	491	283	47	31	chr3	121209980	121210230	-38389553	+	MLT1J	LTR	MaLR	39	311	-201	5
1509	677	311	77	91	chr3	121213879	121214243	-38385540	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	5
1509	359	273	88	99	chr3	121219155	121219326	-38380457	+	LTR78	LTR	ERV1	1134	1302	-2	5
1509	2763	135	17	32	chr3	121219894	121220361	-38379422	+	RMER6B	LTR	ERVK	2	461	0	5
1509	2377	90	12	12	chr3	121220848	121221175	-38378608	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1509	358	280	14	108	chr3	121222141	121222289	-38377494	-	ORR1E	LTR	MaLR	-168	191	58	5
1509	338	292	161	26	chr3	121237800	121238073	-38361710	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	59	5
1509	652	312	92	76	chr3	121239961	121240109	-38359674	+	MLT1B	LTR	MaLR	10	150	-240	5
1509	652	312	92	76	chr3	121240298	121240517	-38359266	+	MLT1B	LTR	MaLR	151	383	-7	5
1509	7410	81	27	16	chr3	121241095	121241513	-38358270	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	416	-607	5
1510	7410	81	27	16	chr3	121241691	121242282	-38357501	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	417	1021	-2	5
1510	583	246	191	30	chr3	121254700	121254935	-38344848	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-3182	2532	2260	6
1510	261	333	18	48	chr3	121255204	121255371	-38344412	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-4587	1127	966	6
1510	761	297	70	47	chr3	121255429	121255729	-38344054	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-4738	929	623	6
1510	257	257	241	27	chr3	121258876	121259025	-38340758	+	MTEa	LTR	MaLR	1	197	-182	6
1510	449	286	14	36	chr3	121259130	121259268	-38340515	+	MTEa	LTR	MaLR	238	372	-7	6
1510	1682	129	126	28	chr3	121265375	121265693	-38334090	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	26	6
1510	931	282	118	6	chr3	121265935	121266274	-38333509	+	MTEb	LTR	MaLR	3	379	0	6
1510	1993	132	171	80	chr3	121267105	121267367	-38332416	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	333	-172	6
1510	1993	132	171	80	chr3	121267560	121267758	-38332025	+	RLTR16	LTR	ERVK	334	503	-2	6
1510	296	297	46	103	chr3	121271771	121272034	-38327749	-	RMER17C	LTR	ERVK	-41	369	122	6
1510	1789	180	47	6	chr3	121274927	121275290	-38324493	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	6
1510	3159	64	79	135	chr3	121275737	121276279	-38323504	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
1510	620	368	78	59	chr3	121276289	121276829	-38322954	+	LTR82A	LTR	ERVL	22	571	-301	6
1510	594	310	176	10	chr3	121276894	121277200	-38322583	-	MLT1F	LTR	MaLR	-24	524	168	6
1510	655	299	124	25	chr3	121280631	121280953	-38318830	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	6
1510	2083	136	112	70	chr3	121281485	121281825	-38317958	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	128	6
1510	2083	136	112	70	chr3	121281851	121281938	-38317845	-	RLTR41	LTR	ERV1	-319	127	1	6
1510	426	281	172	54	chr3	121283454	121283791	-38315992	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	9	6
1510	308	263	244	34	chr3	121286335	121286540	-38313243	-	ORR1E	LTR	MaLR	-108	251	4	6
1510	358	295	23	37	chr3	121286613	121286828	-38312955	+	RMER17D	LTR	ERVK	335	546	-343	6
1510	840	264	75	42	chr3	121293667	121293932	-38305851	+	MTEa	LTR	MaLR	1	274	-105	6
1510	507	234	77	13	chr3	121294343	121294492	-38305291	+	MTEa	LTR	MaLR	245	386	-33	6
1510	851	246	35	10	chr3	121295865	121296066	-38303717	+	MTEa	LTR	MaLR	171	376	-3	6
1510	2176	111	9	6	chr3	121297084	121297402	-38302381	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	6
1510	1755	136	47	44	chr3	121304407	121304618	-38295165	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	188	6
1510	1755	136	47	44	chr3	121304641	121304838	-38294945	-	RMER17C	LTR	ERVK	-223	187	1	6
1510	954	295	59	17	chr3	121305586	121305941	-38293842	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	408	0	6
1510	1780	227	14	77	chr3	121309524	121309655	-38290128	+	MTD	LTR	MaLR	6	127	-292	6
1510	2523	108	14	11	chr3	121309655	121310021	-38289762	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1510	1780	227	14	77	chr3	121310021	121310038	-38289745	+	MTD	LTR	MaLR	128	137	-282	6
1510	1780	227	14	77	chr3	121310247	121310537	-38289246	+	MTD	LTR	MaLR	138	417	-2	6
1510	404	343	110	39	chr3	121311997	121312268	-38287515	-	LTR16C	LTR	ERVL	-9	480	188	7
1510	265	315	34	51	chr3	121312281	121312398	-38287385	-	LTR16C	LTR	ERVL	-339	150	36	7
1510	1879	179	155	38	chr3	121317777	121318300	-38281483	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	584	0	7
1510	827	252	102	129	chr3	121318771	121319259	-38280524	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-43	485	11	7
1510	542	227	169	49	chr3	121319645	121319880	-38279903	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-150	247	1	7
1510	3315	142	4	24	chr3	121323235	121323774	-38276009	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	1	7
1510	965	235	34	12	chr3	121323990	121324268	-38275515	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	330	-54	7
1510	690	251	78	32	chr3	121324298	121324310	-38275473	+	ORR1D1	LTR	MaLR	331	343	-41	7
1510	382	131	0	0	chr3	121324301	121324362	-38275421	+	RLTR12B	LTR	ERVK	366	426	-102	7
1510	621	264	198	33	chr3	121325872	121326224	-38273559	-	RLTR16	LTR	ERVK	-257	435	1	7
1510	2149	136	34	6	chr3	121326228	121326582	-38273201	+	ORR1B1	LTR	MaLR	31	394	0	7
1510	895	314	51	10	chr3	121328093	121328386	-38271397	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	104	7
1510	2808	129	34	11	chr3	121330171	121330617	-38269166	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	435	7
1510	1224	192	3	149	chr3	121330616	121330898	-38268885	-	RMER19B	LTR	ERVK	-647	255	15	7
1510	751	274	226	7	chr3	121337398	121337506	-38262277	+	MLT1A1	LTR	MaLR	26	155	-253	7
1510	751	274	226	7	chr3	121337612	121337803	-38261980	+	MLT1A1	LTR	MaLR	156	391	-17	7
1510	1289	244	126	21	chr3	121337804	121338176	-38261607	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	9	7
1510	243	314	47	99	chr3	121345238	121345429	-38254354	-	LTR85a	LTR	Gypsy?	-446	256	76	7
1510	320	288	30	46	chr3	121350703	121350834	-38248949	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	396	-12	7
1510	834	290	114	30	chr3	121362126	121362460	-38237323	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-3	362	1	7
1510	268	284	45	0	chr3	121368813	121368880	-38230903	-	LTR16C	LTR	ERVL	-232	257	188	7
1510	445	348	77	17	chr3	121369286	121369467	-38230316	-	MER110A	LTR	ERV1	-112	356	165	7
1510	1416	237	94	10	chr3	121371358	121371742	-38228041	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	4	8
1511	289	246	15	0	chr3	121373330	121373395	-38226388	+	MLT1A0	LTR	MaLR	23	88	-417	8
1511	504	273	113	0	chr3	121373441	121373591	-38226192	+	MLT1A0	LTR	MaLR	199	365	0	8
1511	1266	250	88	11	chr3	121374007	121374359	-38225424	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	8
1511	2070	199	0	36	chr3	121378696	121379086	-38220697	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	376	-6	8
1511	406	260	134	108	chr3	121381208	121381596	-38218187	+	RMER10A	LTR	ERVL	18	415	-27	8
1511	647	241	165	42	chr3	121385856	121386187	-38213596	-	MLT1K	LTR	MaLR	-9	601	204	8
1511	510	266	102	0	chr3	121386721	121386849	-38212934	-	MLT1B	LTR	MaLR	-41	349	209	8
1511	2440	78	3	6	chr3	121391420	121391742	-38208041	+	ORR1A2	LTR	MaLR	6	326	-1	8
1511	416	308	100	6	chr3	121400251	121400421	-38199362	+	LTR78	LTR	ERV1	992	1177	-127	8
1511	402	308	211	18	chr3	121401588	121401816	-38197967	-	LTR16A	LTR	ERVL	-4	447	176	8
1511	226	340	44	70	chr3	121407910	121407963	-38191820	+	MT2B2	LTR	ERVL	110	158	-426	8
1511	634	279	115	27	chr3	121410304	121410565	-38189218	+	ORR1E	LTR	MaLR	67	350	-9	8
1511	381	296	31	31	chr3	121413118	121413247	-38186536	-	LTR33A	LTR	ERVL	-334	186	58	8
1511	328	212	28	75	chr3	121413408	121413515	-38186268	+	MTEb	LTR	MaLR	278	379	0	8
1511	252	258	14	43	chr3	121420123	121420192	-38179591	+	RMER15	LTR	ERVL	1	67	-508	8
1511	1454	249	19	33	chr3	121420381	121420796	-38178987	+	RMER15	LTR	ERVL	45	574	-1	8
1511	1210	249	24	84	chr3	121421188	121421569	-38178214	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	359	0	8
1511	932	267	52	52	chr3	121422403	121422691	-38177092	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	288	-77	8
1511	299	331	72	36	chr3	121438023	121438161	-38161622	-	MLT1I	LTR	MaLR	-27	384	242	9
1511	860	179	45	34	chr3	121440265	121440444	-38159339	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	181	-193	9
1511	439	278	44	56	chr3	121441165	121441246	-38158537	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	482	9
1511	2447	137	21	38	chr3	121441246	121441672	-38158111	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	9
1511	439	278	44	56	chr3	121441672	121441750	-38158033	-	RMER15	LTR	ERVL	-94	481	403	9
1511	4154	118	68	23	chr3	121443856	121444517	-38155266	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	2	9
1511	256	164	35	35	chr3	121447672	121447729	-38152054	-	MTC	LTR	MaLR	-24	372	316	9
1511	908	204	25	121	chr3	121447729	121448085	-38151698	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	9
1511	6323	106	14	84	chr3	121448099	121449073	-38150710	+	MMETn-int	LTR	ERVK	10	901	-3943	9
1511	4374	8	0	0	chr3	121449073	121449555	-38150228	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	9
1511	6323	106	14	84	chr3	121449555	121449785	-38149998	+	MMETn-int	LTR	ERVK	902	1130	-3714	9
1511	2743	203	78	115	chr3	121449808	121451108	-38148675	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2628	3880	-3526	9
1511	3461	41	87	2	chr3	121451110	121451548	-38148235	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	9
1511	897	110	82	60	chr3	121451549	121451732	-38148051	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	195	-6286	9
1511	248	302	0	0	chr3	121451732	121451785	-38147998	+	RLTR27	LTR	ERVK	223	275	-34	9
1511	878	51	8	0	chr3	121451785	121451902	-38147881	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	285	-6196	9
1511	9994	64	48	33	chr3	121451902	121453370	-38146413	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	211	1700	-4781	9
1511	6074	58	16	13	chr3	121453363	121454190	-38145593	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5651	6479	-2	9
1511	3532	39	77	2	chr3	121454192	121454634	-38145149	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	9
1511	5355	149	19	22	chr3	121454634	121455890	-38143893	+	MMETn-int	LTR	ERVK	2356	3402	-2004	9
1511	6363	135	11	3	chr3	121455996	121456965	-38142818	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6227	7203	-203	9
1511	312	235	338	13	chr3	121456967	121457256	-38142527	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	155	537	-365	9
1511	424	82	25	76	chr3	121457256	121457335	-38142448	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7329	7403	-3	9
1511	962	197	34	129	chr3	121457337	121457693	-38142090	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	9
1511	1592	158	45	134	chr3	121457693	121457975	-38141808	-	MTC	LTR	MaLR	-75	346	98	9
1511	1592	158	45	134	chr3	121458118	121458215	-38141568	-	MTC	LTR	MaLR	-324	97	1	9
1511	310	290	135	16	chr3	121458611	121458737	-38141046	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-453	142	2	9
1511	924	252	100	6	chr3	121470567	121470824	-38128959	+	MTD	LTR	MaLR	111	389	-30	9
1511	280	275	10	21	chr3	121470824	121470920	-38128863	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	94	-1164	9
1511	2781	139	63	48	chr3	121500200	121500720	-38099063	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	1
1511	246	325	44	0	chr3	121500848	121500962	-38098821	-	MTEa	LTR	MaLR	-260	119	1	2
1511	252	263	0	0	chr3	121501418	121501475	-38098308	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	57	-313	3
1511	258	200	0	0	chr3	121501476	121501526	-38098257	+	ORR1D1	LTR	MaLR	322	371	-3	3
1512	228	203	44	122	chr3	121504534	121504549	-38095234	+	MT2B2	LTR	ERVL	159	166	-418	1
1512	497	314	137	33	chr3	121520346	121520490	-38079293	-	LTR65	LTR	ERV1	-205	464	297	4
1512	2417	116	81	23	chr3	121520490	121520887	-38078896	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	4
1512	497	314	137	33	chr3	121520887	121521012	-38078771	-	LTR65	LTR	ERV1	-373	296	168	4
1512	314	324	161	5	chr3	121521201	121521412	-38078371	+	MLT1F1	LTR	MaLR	1	244	-304	4
1512	418	282	39	39	chr3	121521460	121521615	-38078168	+	MLT1F1	LTR	MaLR	398	552	-17	4
1512	1927	136	27	34	chr3	121521765	121522093	-38077690	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	326	-3	4
1512	2550	80	3	9	chr3	121527090	121527420	-38072363	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	2	5
1512	1926	156	134	22	chr3	121528871	121529237	-38070546	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
1512	1544	156	10	274	chr3	121529947	121530458	-38069325	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	6
1512	325	226	35	23	chr3	121531462	121531548	-38068235	-	MTEb	LTR	MaLR	-15	364	278	6
1512	1796	224	57	2	chr3	121533758	121534211	-38065572	+	MT2A	LTR	ERVL	3	480	-53	7
1512	445	282	103	14	chr3	121534445	121534668	-38065115	+	RMER20B	LTR	ERVK	143	385	-242	7
1512	252	175	45	36	chr3	121534782	121534870	-38064913	+	MLT2B1	LTR	ERVL	477	567	0	7
1512	458	359	81	43	chr3	121537249	121537717	-38062066	+	LTR33	LTR	ERVL	30	515	0	7
1512	626	172	59	46	chr3	121538708	121538860	-38060923	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	252	7
1512	353	368	25	5	chr3	121539155	121539357	-38060426	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2699	2904	-2810	8
1512	292	378	24	0	chr3	121539581	121539745	-38060038	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2910	3077	-2590	8
1512	362	265	21	57	chr3	121539795	121539935	-38059848	+	MTD	LTR	MaLR	6	140	-279	8
1512	1333	142	23	5	chr3	121541291	121541511	-38058272	+	MTD	LTR	MaLR	196	419	0	8
1512	1202	228	185	50	chr3	121543555	121543840	-38055943	+	RLTR18	LTR	ERVK	5	276	-340	8
1512	1202	228	185	50	chr3	121543988	121544140	-38055643	+	RLTR18	LTR	ERVK	277	501	-115	8
1512	301	275	0	0	chr3	121544174	121544243	-38055540	+	RLTR18B	LTR	ERVK	397	465	-47	9
1512	237	259	0	0	chr3	121544693	121544747	-38055036	-	MTE2b	LTR	MaLR	-6	373	320	9
1512	376	288	51	19	chr3	121544735	121544891	-38054892	-	MTE2b	LTR	MaLR	-216	163	3	9
1512	332	346	73	48	chr3	121545961	121546274	-38053509	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2425	2745	-2969	9
1512	375	220	121	0	chr3	121546376	121546467	-38053316	-	MTD	LTR	MaLR	-315	104	3	9
1512	560	364	135	23	chr3	121546486	121546885	-38052898	+	LTR16E2	LTR	ERVL	64	507	-61	9
1512	1523	233	57	116	chr3	121552490	121553083	-38046700	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	5	562	-15	1
1512	541	103	0	44	chr3	121558814	121558905	-38040878	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	87	-280	1
1512	872	241	132	0	chr3	121562193	121562413	-38037370	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1151	1399	-4123	1
1512	294	159	28	42	chr3	121562582	121562654	-38037129	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	896	966	-5171	1
1512	579	170	89	92	chr3	121562715	121562911	-38036872	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1556	1791	-3731	1
1512	2675	40	6	44	chr3	121563062	121563402	-38036381	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	1
1512	1394	218	102	140	chr3	121564070	121564987	-38034796	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1870	3019	-3118	1
1512	306	200	0	0	chr3	121565312	121565367	-38034416	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3186	3240	-2897	1
1512	314	250	0	48	chr3	121567223	121567307	-38032476	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2417	2496	-742	1
1512	319	186	14	14	chr3	121567503	121567574	-38032209	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3755	3825	-2312	1
1512	301	171	13	79	chr3	121567605	121567681	-38032102	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	4039	4109	-2028	1
1512	416	224	24	0	chr3	121572099	121572184	-38027599	-	MTEb	LTR	MaLR	-282	97	11	1
1512	334	235	46	132	chr3	121572246	121572398	-38027385	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	119	1
1512	814	251	147	23	chr3	121572682	121572988	-38026795	-	MER21B	LTR	ERV1	-22	841	498	1
1512	342	291	41	49	chr3	121573077	121573200	-38026583	-	MER21B	LTR	ERV1	-498	365	244	1
1512	892	300	93	43	chr3	121573516	121574001	-38025782	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-952	4578	4070	1
1512	266	327	10	0	chr3	121574658	121574759	-38025024	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-5378	152	51	1
1512	907	335	33	23	chr3	121574801	121575198	-38024585	-	LTR40b	LTR	ERVL	0	462	62	1
1512	438	317	48	6	chr3	121578141	121578306	-38021477	-	LTR33	LTR	ERVL	-300	215	44	1
1512	304	251	21	27	chr3	121580619	121580748	-38019035	-	MLT1E3	LTR	MaLR	0	624	431	1
1512	352	250	186	70	chr3	121581315	121581487	-38018296	-	RMER12	LTR	ERVK	-136	1186	995	1
1512	1515	217	59	81	chr3	121581850	121582623	-38017160	-	RMER12	LTR	ERVK	-1101	747	16	1
1512	465	297	142	9	chr3	121599627	121599838	-37999945	-	ORR1E	LTR	MaLR	-114	245	7	2
1512	733	278	70	13	chr3	121604138	121604368	-37995415	+	MTEb	LTR	MaLR	2	244	-135	2
1512	310	340	73	32	chr3	121610074	121610320	-37989463	-	LTR16E2	LTR	ERVL	-97	471	216	2
1512	469	365	74	14	chr3	121622873	121623223	-37976560	+	MLT1A	LTR	MaLR	4	374	0	2
1512	263	349	140	8	chr3	121624043	121624304	-37975479	-	MLT1I	LTR	MaLR	0	411	116	2
1512	308	273	16	106	chr3	121624982	121625105	-37974678	+	MT2B	LTR	ERVL	153	264	-337	2
1512	2346	174	165	16	chr3	121631664	121632161	-37967622	+	RMER15	LTR	ERVL	4	574	-1	2
1513	981	337	47	13	chr3	121636285	121636733	-37963050	-	LTR16B1	LTR	ERVL	0	480	18	2
1513	1003	295	41	14	chr3	121637141	121637433	-37962350	+	MTEa	LTR	MaLR	1	300	-79	2
1513	1885	137	96	25	chr3	121640473	121640826	-37958957	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	3
1513	1666	226	33	47	chr3	121642418	121642535	-37957248	+	MTC	LTR	MaLR	1	118	-303	3
1513	1666	226	33	47	chr3	121642754	121643063	-37956720	+	MTC	LTR	MaLR	119	421	0	3
1513	639	243	34	103	chr3	121644856	121645327	-37954456	+	RMER17C	LTR	ERVK	8	378	-32	3
1513	840	262	89	42	chr3	121648118	121648477	-37951306	-	MLT1B	LTR	MaLR	-10	380	5	3
1513	1098	261	88	27	chr3	121655055	121655386	-37944397	+	MTE2a	LTR	MaLR	29	379	0	3
1513	705	275	65	59	chr3	121661530	121661936	-37937847	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	5	3
1513	336	229	39	85	chr3	121673616	121673745	-37926038	+	MT2B	LTR	ERVL	154	276	-325	3
1513	272	148	151	54	chr3	121675659	121675752	-37924031	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	156	3
1513	4419	111	65	4	chr3	121696971	121697679	-37902104	-	RMER6A	LTR	ERVK	-4	752	2	4
1513	260	270	138	89	chr3	121699343	121699546	-37900237	-	MER74B	LTR	ERVL	-234	388	176	4
1513	1149	257	108	13	chr3	121701585	121701964	-37897819	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	3	4
1513	386	292	35	64	chr3	121702796	121702968	-37896815	-	RMER15	LTR	ERVL	-7	568	402	4
1513	1635	146	210	3	chr3	121721464	121721788	-37877995	+	ORR1B1	LTR	MaLR	2	392	-2	4
1513	2309	207	72	43	chr3	121721788	121722766	-37877017	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	3	976	-987	4
1513	2609	85	155	2	chr3	121731978	121732390	-37867393	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
1513	5657	142	29	9	chr3	121739294	121740178	-37859605	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	5
1513	793	259	24	76	chr3	121743886	121743930	-37855853	+	MLT1A0	LTR	MaLR	3	35	-330	5
1513	793	259	24	76	chr3	121744098	121744303	-37855480	+	MLT1A0	LTR	MaLR	36	239	-126	5
1514	1569	180	55	18	chr3	121766220	121766548	-37833235	+	ORR1C2	LTR	MaLR	40	379	-5	5
1514	2333	169	40	7	chr3	121769189	121769594	-37830189	+	MTC	LTR	MaLR	4	421	0	5
1514	1905	191	36	22	chr3	121769594	121769936	-37829847	+	MTD	LTR	MaLR	73	419	0	5
1514	776	325	57	62	chr3	121771013	121771126	-37828657	-	MLT1D	LTR	MaLR	-9	496	395	5
1514	776	325	57	62	chr3	121771315	121771572	-37828211	-	MLT1D	LTR	MaLR	-111	394	128	5
1514	1774	145	128	12	chr3	121774402	121774745	-37825038	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	10	6
1514	235	346	58	76	chr3	121787295	121787379	-37812404	-	RMER12	LTR	ERVK	-474	848	764	6
1514	235	346	58	76	chr3	121787569	121787656	-37812127	-	RMER12	LTR	ERVK	-559	763	680	6
1514	3813	142	88	20	chr3	121797191	121797895	-37801888	-	RMER6A	LTR	ERVK	-3	753	2	6
1514	241	243	8	164	chr3	121802800	121802928	-37796855	+	RLTR9B	LTR	ERVK	98	205	-232	6
1514	509	256	0	106	chr3	121809114	121809302	-37790481	+	RMER17C	LTR	ERVK	162	329	-81	6
1514	496	221	203	36	chr3	121812969	121813193	-37786590	-	MER57E1	LTR	ERV1	-61	341	5	6
1514	500	296	237	65	chr3	121817301	121817655	-37782128	-	MLT1C	LTR	MaLR	-8	459	45	6
1514	1518	117	0	0	chr3	121826744	121826957	-37772826	+	MTC	LTR	MaLR	1	213	-208	6
1514	1236	79	112	35	chr3	121827687	121827884	-37771899	+	MTC	LTR	MaLR	210	421	0	6
1514	227	277	100	60	chr3	121828277	121828377	-37771406	-	LTR78	LTR	ERV1	-345	959	856	7
1514	3021	69	26	3	chr3	121839166	121839557	-37760226	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1514	2315	208	8	59	chr3	121848577	121849103	-37750680	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	1	7
1514	3440	38	2	2	chr3	121866058	121866456	-37733327	-	MTB	LTR	MaLR	-2	398	1	7
1514	1981	229	173	103	chr3	121867498	121868286	-37731497	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	18	7
1514	1000	207	111	46	chr3	121869924	121870266	-37729517	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	568	216	7
1514	920	209	55	96	chr3	121870323	121870602	-37729181	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-230	298	57	7
1514	1287	161	86	17	chr3	121872077	121872311	-37727472	+	MTC	LTR	MaLR	163	412	-9	7
1514	2132	94	326	0	chr3	121875362	121875733	-37724050	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	2	7
1514	272	326	35	21	chr3	121876171	121876312	-37723471	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-265	143	1	7
1514	909	234	48	85	chr3	121890144	121890615	-37709168	+	RMER2	LTR	ERV1	1	549	-18	7
1514	311	284	105	43	chr3	121891997	121892159	-37707624	+	MER57A-int	LTR	ERV1	2	173	-6014	8
1514	455	143	33	11	chr3	121892896	121892988	-37706795	-	RLTR13B1	LTR	ERVK	0	893	800	8
1514	322	136	15	29	chr3	121892992	121893060	-37706723	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	827	893	0	8
1515	536	279	275	15	chr3	121901484	121901811	-37697972	+	MER57C2	LTR	ERV1	19	430	-4	8
1515	989	249	111	38	chr3	121903884	121904306	-37695477	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	67	8
1515	270	133	94	62	chr3	121906619	121906683	-37693100	-	RLTR42	LTR	ERVK	-22	217	152	8
1515	3150	164	190	21	chr3	121907247	121907952	-37691831	+	RMER19B	LTR	ERVK	79	902	0	8
1515	314	297	0	41	chr3	121908540	121908663	-37691120	-	RMER12	LTR	ERVK	-472	850	733	8
1515	233	297	11	0	chr3	121913373	121913464	-37686319	-	ORR1E	LTR	MaLR	-214	145	54	8
1515	272	224	14	29	chr3	121924926	121924995	-37674788	+	RLTR25A	LTR	ERVK	506	573	-530	8
1515	2413	10	7	0	chr3	121931611	121931909	-37667874	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-96	300	1	8
1515	7783	19	2	11	chr3	121931909	121932911	-37666872	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	106	8
1515	968	8	0	0	chr3	121934187	121934306	-37665477	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-979	119	1	8
1515	1706	32	5	0	chr3	121934306	121934524	-37665259	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	178	8
1515	1542	11	5	0	chr3	121935431	121935621	-37664162	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-205	191	1	8
1515	3281	31	21	0	chr3	121935836	121936015	-37663768	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-4	392	213	8
1515	3281	31	21	0	chr3	121936039	121936243	-37663540	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-184	212	2	8
1515	304	194	75	11	chr3	121938737	121938831	-37660952	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-10	1018	919	8
1515	437	160	47	167	chr3	121938840	121938990	-37660793	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-277	751	620	8
1515	2150	168	23	80	chr3	121939381	121939866	-37659917	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-571	457	1	8
1515	460	204	11	0	chr3	121940271	121940364	-37659419	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-5686	94	1	9
1515	1682	195	120	94	chr3	121940364	121940908	-37658875	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	138	9
1515	344	294	27	20	chr3	121943298	121943444	-37656339	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1118	4404	4258	9
1515	300	209	43	43	chr3	121943973	121944043	-37655740	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-1441	4081	4012	9
1515	2390	158	20	2	chr3	121959162	121959562	-37640221	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	9
1515	592	194	0	0	chr3	121960354	121960457	-37639326	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3619	3721	-2040	9
1515	458	131	333	15	chr3	121960457	121960589	-37639194	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-200	174	1	9
1515	2987	144	8	8	chr3	121961022	121961492	-37638291	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-2397	3364	2895	9
1515	644	210	140	42	chr3	121961527	121961741	-37638042	+	ORR1C2	LTR	MaLR	150	384	0	9
1515	1740	142	88	9	chr3	121973167	121973508	-37626275	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	9
1515	384	268	54	16	chr3	121974370	121974499	-37625284	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	134	-225	9
1515	4314	135	144	34	chr3	121981882	121982847	-37616936	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	33	9
1515	531	138	176	6	chr3	121983408	121983590	-37616193	-	RMER17C	LTR	ERVK	-136	274	62	9
1515	271	214	98	33	chr3	121986046	121986138	-37613645	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	333	9
1515	262	287	78	10	chr3	121989587	121989689	-37610094	+	ORR1E	LTR	MaLR	240	348	-11	1
1515	1881	182	38	5	chr3	121990191	121990561	-37609222	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	1
1515	870	284	62	18	chr3	121997356	121997736	-37602047	-	LTR40c	LTR	ERVL	-23	496	40	1
1515	380	267	267	0	chr3	122002126	122002298	-37597485	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-2	567	350	8
1515	330	254	150	32	chr3	122006979	122007166	-37592617	+	RMER15	LTR	ERVL	366	574	-1	1
1515	267	198	28	142	chr3	122007468	122007574	-37592209	+	MT2B	LTR	ERVL	164	257	-344	2
1515	460	323	50	65	chr3	122009026	122009225	-37590558	+	MER21B	LTR	ERV1	43	238	-625	2
1515	769	284	136	36	chr3	122010045	122010377	-37589406	+	MER21B	LTR	ERV1	420	784	-79	2
1515	244	323	92	89	chr3	122017479	122017795	-37581988	+	ORR1D2	LTR	MaLR	33	349	-21	4
1515	339	392	27	0	chr3	122018516	122018664	-37581119	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-364	231	80	4
1515	627	305	125	32	chr3	122020466	122020747	-37579036	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-269	310	4	5
1516	3680	59	42	0	chr3	122030312	122030768	-37569015	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	7
1516	920	214	117	30	chr3	122034859	122035308	-37564475	-	RMER10B	LTR	ERVL	-5	393	1	8
1516	1635	175	65	209	chr3	122044471	122044963	-37554820	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	9
1516	254	286	63	25	chr3	122048447	122048526	-37551257	-	MTE2a	LTR	MaLR	-18	361	280	1
1516	237	293	64	16	chr3	122048748	122048873	-37550910	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-274	134	4	1
1516	2464	141	24	3	chr3	122049609	122049987	-37549796	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	1
1516	469	286	108	45	chr3	122052317	122052565	-37547218	+	MLT1D	LTR	MaLR	43	314	-153	1
1516	237	226	19	0	chr3	122052773	122052826	-37546957	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	54	-367	1
1516	1971	184	81	3	chr3	122053098	122053479	-37546304	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	1
1516	249	255	0	19	chr3	122053493	122053545	-37546238	+	ORR1D2	LTR	MaLR	48	98	-281	1
1516	279	312	55	101	chr3	122053611	122053903	-37545880	+	ORR1D2	LTR	MaLR	75	363	-11	1
1516	297	370	42	84	chr3	122054510	122054749	-37545034	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-229	333	105	1
1516	1238	251	18	119	chr3	122060038	122060485	-37539298	+	MTD	LTR	MaLR	4	405	-14	1
1516	498	280	93	96	chr3	122060499	122060564	-37539219	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-1	364	307	1
1516	498	280	93	96	chr3	122060677	122060817	-37538966	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-59	306	157	1
1516	498	280	93	96	chr3	122061008	122061133	-37538650	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-209	156	35	1
1516	373	309	245	35	chr3	122061416	122061698	-37538085	+	MLT1F	LTR	MaLR	195	535	-13	1
1516	251	221	0	29	chr3	122066469	122066539	-37533244	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	463	396	1
1516	361	238	46	37	chr3	122066572	122066681	-37533102	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-30	378	269	1
1516	254	344	70	35	chr3	122066888	122067087	-37532696	-	MLT1C	LTR	MaLR	-41	426	221	1
1516	2375	163	11	0	chr3	122070032	122070413	-37529370	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	2	1
1516	1084	148	6	0	chr3	122072177	122072346	-37527437	+	RLTR17	LTR	ERVK	199	368	-324	1
1516	882	316	44	93	chr3	122072352	122072515	-37527268	-	MTD	LTR	MaLR	-30	389	256	1
1516	882	316	44	93	chr3	122072570	122072613	-37527170	-	MTD	LTR	MaLR	-164	255	214	1
1516	882	316	44	93	chr3	122072634	122072834	-37526949	-	MTD	LTR	MaLR	-206	213	2	1
1516	561	307	43	106	chr3	122076397	122076699	-37523084	-	MLT1B	LTR	MaLR	-42	348	66	1
1516	291	190	139	7	chr3	122077295	122077377	-37522406	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	92	-287	1
1516	722	272	45	165	chr3	122083121	122083496	-37516287	+	ORR1E	LTR	MaLR	23	352	-7	1
1516	262	306	112	94	chr3	122083536	122083760	-37516023	+	LTR16C	LTR	ERVL	262	489	0	1
1516	587	342	63	80	chr3	122089049	122089462	-37510321	+	MLT1H	LTR	MaLR	144	549	0	1
1516	1106	304	108	34	chr3	122089572	122090073	-37509710	+	MLT1F	LTR	MaLR	9	546	-2	1
1516	338	242	29	57	chr3	122092827	122092932	-37506851	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	307	1
1516	1783	146	16	102	chr3	122095841	122096464	-37503319	-	RMER17C	LTR	ERVK	-517	441	16	1
1516	546	136	0	19	chr3	122096453	122096558	-37503225	-	RMER17B	LTR	ERVK	-678	280	178	1
1516	1572	168	134	3	chr3	122098813	122099105	-37500678	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	49	2
1516	1110	201	97	41	chr3	122121664	122121994	-37477789	+	MTD	LTR	MaLR	35	379	0	2
1516	251	311	43	79	chr3	122137074	122137125	-37462658	+	MT2B	LTR	ERVL	89	189	-412	2
1516	251	311	43	79	chr3	122137211	122137238	-37462545	+	MT2B	LTR	ERVL	190	246	-355	2
1516	544	280	176	51	chr3	122144365	122144677	-37455106	-	ORR1E	LTR	MaLR	-8	351	1	2
1516	2214	78	40	53	chr3	122147014	122147337	-37452446	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	2
1516	359	310	38	25	chr3	122148224	122148383	-37451400	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-444	180	20	2
1517	336	322	32	32	chr3	122167196	122167321	-37432462	+	MLT1C	LTR	MaLR	6	130	-337	3
1517	1034	286	69	7	chr3	122174606	122174895	-37424888	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	73	3
1517	269	346	152	45	chr3	122176796	122177020	-37422763	-	MLT1K	LTR	MaLR	-174	421	174	3
1517	276	260	91	68	chr3	122205195	122205327	-37394456	-	MLT1J	LTR	MaLR	-121	391	257	3
1517	544	257	148	7	chr3	122222695	122222928	-37376855	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	96	4
1517	287	262	66	7	chr3	122233467	122233563	-37366220	-	ORR1E	LTR	MaLR	-38	341	241	4
1517	919	273	139	57	chr3	122234162	122234624	-37365159	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-12	503	1	4
1517	423	330	184	16	chr3	122237406	122237738	-37362045	+	MLT1F1	LTR	MaLR	1	400	-169	4
1517	1293	201	138	18	chr3	122238137	122238471	-37361312	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1517	1393	169	91	25	chr3	122240389	122240816	-37358967	+	MT2A	LTR	ERVL	3	506	-27	4
1517	1816	150	64	30	chr3	122262866	122263251	-37336532	+	ORR1B1	LTR	MaLR	17	394	0	4
1517	2093	135	9	6	chr3	122264319	122264640	-37335143	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	322	-4	4
1517	357	238	54	54	chr3	122269510	122269621	-37330162	+	MLT1L	LTR	MaLR	220	330	-280	4
1517	601	267	125	103	chr3	122275530	122275898	-37323885	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	2	4
1517	270	284	204	22	chr3	122277544	122277681	-37322102	+	MLT1J2	LTR	MaLR	254	415	-33	4
1517	832	208	27	45	chr3	122278096	122278371	-37321412	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	41	4
1517	229	253	0	142	chr3	122287098	122287204	-37312579	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	151	5
1517	2345	161	9	52	chr3	122288819	122289244	-37310539	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	5
1518	309	234	158	11	chr3	122293331	122293426	-37306357	+	MLT2D	LTR	ERVL	402	510	-50	5
1518	266	318	0	0	chr3	122294056	122294144	-37305639	+	MLT2D	LTR	ERVL	466	553	-2	5
1518	251	256	81	11	chr3	122294345	122294432	-37305351	+	MER57A-int	LTR	ERV1	5800	5892	-295	5
1518	693	306	112	77	chr3	122295685	122296114	-37303669	+	MER21B	LTR	ERV1	13	456	-407	5
1518	1147	245	144	0	chr3	122303375	122303701	-37296082	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	1	5
1518	244	337	134	70	chr3	122305268	122305469	-37294314	+	ORR1E	LTR	MaLR	45	258	-101	5
1518	948	282	139	3	chr3	122306163	122306487	-37293296	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	370	0	5
1518	257	253	93	0	chr3	122309992	122310067	-37289716	+	LTR33	LTR	ERVL	434	515	0	5
1518	492	260	46	13	chr3	122312550	122312702	-37287081	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-214	194	38	5
1518	745	336	47	47	chr3	122314716	122315078	-37284705	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	365	-5	5
1518	291	111	22	0	chr3	122324742	122324787	-37274996	+	MT2A	LTR	ERVL	31	76	-457	5
1518	2162	154	21	3	chr3	122325115	122325454	-37274329	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	2	5
1518	4565	79	21	5	chr3	122325625	122326200	-37273583	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	5
1518	986	220	43	93	chr3	122329034	122329410	-37270373	-	RLTR15	LTR	ERVK	-2	357	1	6
1518	567	199	132	0	chr3	122329642	122329793	-37269990	-	MLT-int	LTR	MaLR	-8	1727	1557	6
1518	359	366	23	11	chr3	122330454	122330631	-37269152	-	MLT-int	LTR	MaLR	-166	1569	1391	6
1518	283	392	95	42	chr3	122330860	122331049	-37268734	-	MLT-int	LTR	MaLR	-352	1383	1185	6
1518	333	245	160	73	chr3	122331053	122331203	-37268580	-	RMER15	LTR	ERVL	-7	568	406	6
1518	1104	314	55	70	chr3	122331488	122332015	-37267768	-	MLT-int	LTR	MaLR	-636	1099	581	6
1518	448	329	0	27	chr3	122332991	122333138	-37266645	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1208	527	385	6
1518	621	287	128	7	chr3	122333640	122333921	-37265862	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1419	316	2	6
1518	2324	125	21	107	chr3	122342932	122342995	-37256788	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	353	6
1518	2324	125	21	107	chr3	122343124	122343490	-37256293	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-42	352	2	6
1518	2038	151	78	25	chr3	122345419	122345778	-37254005	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	6
1518	3006	127	57	52	chr3	122349789	122350312	-37249471	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	526	-1	6
1518	3176	33	190	2	chr3	122357140	122357540	-37242243	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
1518	1176	67	68	68	chr3	122357559	122357751	-37242032	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4	195	-6286	6
1518	231	273	0	0	chr3	122357760	122357804	-37241979	+	RLTR27	LTR	ERVK	232	275	-34	6
1518	239	327	0	0	chr3	122357830	122357885	-37241898	+	RLTR27	LTR	ERVK	221	275	-34	6
1518	3716	74	20	39	chr3	122357885	122358538	-37241245	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	6
1518	2732	61	0	3	chr3	122358538	122358881	-37240902	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1700	-4781	6
1518	6409	56	12	19	chr3	122358874	122359709	-37240074	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5651	6479	-2	6
1518	3190	30	190	2	chr3	122359711	122360111	-37239672	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
1518	785	244	26	26	chr3	122360116	122360347	-37239436	-	RLTR15	LTR	ERVK	-128	231	1	6
1518	240	250	0	0	chr3	122361124	122361172	-37238611	-	MTC	LTR	MaLR	-49	372	325	6
1518	1070	294	72	50	chr3	122361154	122361609	-37238174	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	354	818	-552	6
1518	1630	246	102	34	chr3	122362113	122362613	-37237170	+	RMER5	LTR	ERV1	1	534	0	6
1518	3114	155	124	13	chr3	122366754	122367304	-37232479	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1518	2334	101	82	0	chr3	122368583	122368911	-37230872	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	355	-2	6
1518	905	162	2	16	chr3	122373656	122373822	-37225961	+	MTD	LTR	MaLR	1	149	-251	7
1518	889	234	154	0	chr3	122373984	122374229	-37225554	+	MTD	LTR	MaLR	124	419	0	7
1518	309	206	44	0	chr3	122387130	122387198	-37212585	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	81	-435	7
1518	468	176	37	0	chr3	122387195	122387303	-37212480	+	RMER20A	LTR	ERVK	230	341	-175	7
1518	277	321	51	51	chr3	122391742	122391880	-37207903	-	LTR88b	LTR	Gypsy?	-613	224	87	7
1518	292	261	129	11	chr3	122395078	122395171	-37204612	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-266	182	79	7
1518	3181	68	5	25	chr3	122397238	122397642	-37202141	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1518	1870	168	26	119	chr3	122397667	122397849	-37201934	-	MTD	LTR	MaLR	-38	381	207	7
1518	1870	168	26	119	chr3	122397989	122398018	-37201765	-	MTD	LTR	MaLR	-213	206	206	7
1518	1870	168	26	119	chr3	122398210	122398417	-37201366	-	MTD	LTR	MaLR	-213	206	1	7
1518	814	195	88	0	chr3	122398933	122399092	-37200691	+	ORR1C2	LTR	MaLR	5	177	-207	7
1518	946	178	113	0	chr3	122399271	122399456	-37200327	+	ORR1C2	LTR	MaLR	179	384	0	7
1518	582	259	43	12	chr3	122399456	122399620	-37200163	-	RMER15	LTR	ERVL	-20	555	387	7
1518	2514	173	54	48	chr3	122402286	122402827	-37196956	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-13	564	21	7
1518	1149	219	72	11	chr3	122403110	122403464	-37196319	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	7
1518	431	281	0	0	chr3	122404783	122404897	-37194886	-	MER83B-int	LTR	ERV1	-3907	973	860	7
1518	329	297	86	26	chr3	122406623	122406775	-37193008	+	MLT1A1	LTR	MaLR	248	408	0	7
1518	2077	157	28	62	chr3	122408990	122409377	-37190406	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
1518	2383	106	12	9	chr3	122410280	122410604	-37189179	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	325	-2	7
1518	908	253	117	40	chr3	122413830	122414130	-37185653	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	323	-47	7
1518	381	191	0	0	chr3	122415119	122415182	-37184601	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	312	7
1518	1787	123	45	75	chr3	122416371	122416704	-37183079	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	323	-4	7
1518	498	353	53	87	chr3	122420456	122420869	-37178914	-	MLT1G	LTR	MaLR	-14	577	179	8
1519	2438	152	42	15	chr3	122421345	122421753	-37178030	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	8
1519	247	115	5	9	chr3	122431126	122431184	-37168599	+	MTC	LTR	MaLR	320	403	-18	8
1519	238	381	41	0	chr3	122437266	122437363	-37162420	+	LTR16D	LTR	ERVL	343	443	-208	8
1519	230	349	72	0	chr3	122437567	122437650	-37162133	-	MLT1K	LTR	MaLR	-331	264	176	8
1519	233	162	0	0	chr3	122443425	122443462	-37156321	-	MT2B	LTR	ERVL	-314	287	251	8
1519	2014	197	14	19	chr3	122443878	122444298	-37155485	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	8
1519	1877	142	88	12	chr3	122444738	122445079	-37154704	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	8
1519	353	235	25	0	chr3	122446721	122446802	-37152981	+	RMER15	LTR	ERVL	403	485	-90	8
1519	1465	214	91	9	chr3	122448629	122448968	-37150815	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	372	-2	8
1519	3305	145	18	58	chr3	122448970	122449202	-37150581	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	235	-1135	8
1519	3649	168	23	58	chr3	122449202	122449948	-37149835	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	8
1519	3305	145	18	58	chr3	122449948	122450321	-37149462	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	236	582	-788	8
1519	1126	309	132	7	chr3	122464716	122465163	-37134620	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-6	509	7	8
1519	997	247	132	27	chr3	122465189	122465522	-37134261	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	3	8
1519	516	196	0	38	chr3	122472123	122472229	-37127554	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	320	8
1519	554	328	90	40	chr3	122489646	122490046	-37109737	-	LTR16B2	LTR	ERVL	-4	458	39	9
1519	287	152	0	0	chr3	122494459	122494505	-37105278	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	374	9
1519	770	206	0	53	chr3	122494506	122494587	-37105196	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-214	160	81	9
1519	770	206	0	53	chr3	122494813	122494900	-37104883	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-294	80	1	9
1519	3562	18	2	0	chr3	122509703	122510098	-37089685	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1519	2183	175	45	38	chr3	122513506	122513976	-37085807	+	RLTR12B	LTR	ERVK	47	519	-9	2
1519	1760	199	64	13	chr3	122520227	122520618	-37079165	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	3
1519	242	289	13	0	chr3	122546317	122546393	-37053390	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-609	761	685	6
1519	2289	73	33	60	chr3	122549109	122549445	-37050338	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1519	1703	182	168	87	chr3	122550751	122551202	-37048581	+	MT2A	LTR	ERVL	1	488	-45	7
1519	1703	182	168	87	chr3	122551296	122551336	-37048447	+	MT2A	LTR	ERVL	489	532	-1	7
189	5300	216	43	20	chr3	122551336	122552485	-37047298	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1	1175	-4586	7
1520	3378	164	16	2	chr3	122552687	122553244	-37046539	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2780	3344	-2417	7
1520	1531	145	89	118	chr3	122556384	122556767	-37043016	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-3	375	4	8
1520	1317	193	35	7	chr3	122563670	122563952	-37035831	+	MTD	LTR	MaLR	1	290	-129	9
1520	865	268	138	33	chr3	122570662	122570967	-37028816	+	MTD	LTR	MaLR	2	338	-81	1
1520	718	212	147	0	chr3	122571302	122571486	-37028297	+	MTE2b	LTR	MaLR	169	379	0	1
1520	1303	182	113	51	chr3	122573881	122574217	-37025566	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	357	-17	1
1520	613	251	54	5	chr3	122575043	122575227	-37024556	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	327	1
1520	716	323	37	16	chr3	122576385	122576706	-37023077	+	RMER5	LTR	ERV1	19	346	-188	1
1520	702	134	117	39	chr3	122577730	122577909	-37021874	+	RMER5	LTR	ERV1	331	523	-11	1
1520	472	227	27	9	chr3	122583399	122583510	-37016273	-	MTD	LTR	MaLR	-306	113	1	1
1520	318	324	29	0	chr3	122583510	122583611	-37016172	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-261	104	1	1
1520	262	370	17	0	chr3	122584557	122584676	-37015107	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2290	2410	-3304	1
1520	3283	50	0	8	chr3	122585454	122585853	-37013930	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1520	261	194	43	238	chr3	122586347	122586557	-37013226	-	RMER10A	LTR	ERVL	-14	428	260	1
1520	376	200	58	69	chr3	122586778	122586962	-37012821	-	RMER10A	LTR	ERVL	-218	180	1	1
1520	1147	238	90	68	chr3	122596415	122596619	-37003164	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	253	1
1520	1147	238	90	68	chr3	122596792	122597043	-37002740	-	RMER4A	LTR	ERVK	-214	252	1	1
1520	543	65	187	0	chr3	122605861	122605984	-36993799	-	RMER17B	LTR	ERVK	-498	460	315	1
1520	832	165	197	52	chr3	122610437	122610706	-36989077	+	MTD	LTR	MaLR	111	418	-1	1
1520	3245	39	15	3	chr3	122611513	122611904	-36987879	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1520	700	203	58	0	chr3	122622879	122623017	-36976766	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	146	-232	2
1520	2411	225	29	49	chr3	122623019	122623607	-36976176	+	RLTR18	LTR	ERVK	32	607	-9	2
1520	749	237	50	50	chr3	122623618	122623836	-36975947	+	ORR1C2	LTR	MaLR	167	384	0	2
1520	1399	224	121	62	chr3	122624754	122625225	-36974558	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	499	0	2
1520	1652	192	72	22	chr3	122625481	122625843	-36973940	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	155	2
1520	1119	177	97	172	chr3	122625929	122626394	-36973389	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	2
1520	288	314	0	0	chr3	122628729	122628799	-36970984	+	LTR82A	LTR	ERVL	123	192	-680	2
1520	278	312	167	37	chr3	122628949	122629165	-36970618	+	LTR82A	LTR	ERVL	537	780	-92	2
1520	409	227	139	32	chr3	122629253	122629440	-36970343	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	207	-308	2
1520	4569	144	45	28	chr3	122639412	122640298	-36959485	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	856	-46	2
1520	1206	62	0	6	chr3	122640681	122640843	-36958940	+	RMER19A	LTR	ERVK	575	735	-2	2
1520	626	282	174	5	chr3	122646327	122646534	-36953249	+	MTEa	LTR	MaLR	36	277	-102	2
1520	278	274	11	106	chr3	122646740	122646834	-36952949	+	RLTR33	LTR	ERVK	445	529	-149	2
1520	239	221	208	0	chr3	122647010	122647087	-36952696	+	MTEa	LTR	MaLR	286	378	-1	2
1520	1844	149	99	0	chr3	122649847	122650170	-36949613	+	MTC	LTR	MaLR	1	355	-66	2
1520	712	215	296	34	chr3	122653592	122653886	-36945897	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	371	-3	2
1520	462	174	0	73	chr3	122662273	122662465	-36937318	-	RMER17C	LTR	ERVK	-136	274	97	2
1520	903	200	23	6	chr3	122673484	122673639	-36926144	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	158	-216	2
1520	567	169	22	29	chr3	122673639	122673786	-36925997	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	156	-405	2
1520	1104	207	88	26	chr3	122674004	122674451	-36925332	+	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	40	541	-43	2
1520	643	169	47	23	chr3	122674454	122674623	-36925160	+	ORR1D1	LTR	MaLR	206	374	0	2
1520	665	301	60	40	chr3	122678317	122678566	-36921217	+	MER68	LTR	ERVL	161	414	-149	3
1520	682	352	50	31	chr3	122678934	122679294	-36920489	+	MER54A	LTR	ERVL	57	423	-478	3
1520	1062	296	117	25	chr3	122679305	122679700	-36920083	+	MER54A	LTR	ERVL	461	891	-10	3
1520	258	247	53	27	chr3	122681288	122681363	-36918420	+	MLT1E1	LTR	MaLR	145	221	-406	3
1520	525	348	67	53	chr3	122681400	122681682	-36918101	+	MLT1E1	LTR	MaLR	368	653	-1	3
1520	789	292	156	0	chr3	122682575	122682832	-36916951	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-68	297	1	3
1521	248	326	10	31	chr3	122697179	122697277	-36902506	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	313	3
1521	2085	107	6	59	chr3	122697463	122697802	-36901981	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	3
1521	268	194	0	127	chr3	122698613	122698659	-36901124	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	341	3
1521	2185	226	239	104	chr3	122698659	122700030	-36899753	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	1556	-252	3
1521	1245	257	29	29	chr3	122700658	122700974	-36898809	-	MTE2b	LTR	MaLR	-46	333	18	3
1521	304	265	15	0	chr3	122701204	122701272	-36898511	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	69	-290	3
1521	1163	259	94	12	chr3	122701278	122701618	-36898165	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	368	-11	3
1521	321	336	60	83	chr3	122701631	122701933	-36897850	+	ORR1D2	LTR	MaLR	68	362	-8	3
1521	235	344	10	31	chr3	122702671	122702767	-36897016	+	LTR16B	LTR	ERVL	370	463	0	3
1521	521	276	46	23	chr3	122717991	122718121	-36881662	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7202	-204	3
1521	2218	134	22	17	chr3	122721990	122722347	-36877436	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1521	236	402	26	0	chr3	122739290	122739407	-36860376	-	MLT1J	LTR	MaLR	-274	238	119	3
1521	1871	166	49	33	chr3	122752345	122752713	-36847070	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1521	1663	153	26	98	chr3	122755427	122755804	-36843979	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	35	4
1521	606	254	11	40	chr3	122759817	122759993	-36839790	-	MTD	LTR	MaLR	-231	188	18	4
1521	2122	212	47	103	chr3	122762786	122763291	-36836492	-	RLTR40	LTR	ERVK	-63	754	298	4
1521	2122	212	47	103	chr3	122763338	122763578	-36836205	-	RLTR40	LTR	ERVK	-520	297	53	4
1521	2474	62	6	39	chr3	122771248	122771586	-36828197	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1521	303	193	113	162	chr3	122772335	122772477	-36827306	-	MTEb	LTR	MaLR	-9	370	236	4
1521	245	233	66	11	chr3	122775001	122775092	-36824691	+	MER34	LTR	ERV1	382	477	-65	4
1521	2133	124	215	6	chr3	122777257	122777615	-36822168	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-3	433	1	4
1521	498	238	149	139	chr3	122777715	122778090	-36821693	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	4
1521	1895	100	12	69	chr3	122778127	122778461	-36821322	+	ORR1A2	LTR	MaLR	6	320	-7	4
1521	827	303	94	23	chr3	122778644	122779080	-36820703	+	MER31A	LTR	ERV1	6	472	-13	4
1521	1320	233	70	3	chr3	122788420	122788751	-36811032	+	MTD	LTR	MaLR	49	401	-18	5
1521	2056	158	50	48	chr3	122793638	122794056	-36805727	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1521	717	170	54	7	chr3	122795013	122795161	-36804622	+	MTD	LTR	MaLR	265	419	0	5
1521	3344	35	8	0	chr3	122797669	122798066	-36801717	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1521	1539	178	103	34	chr3	122798197	122798547	-36801236	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1521	1708	211	31	46	chr3	122802600	122803017	-36796766	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	5
1521	1474	209	70	17	chr3	122804706	122805061	-36794722	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1521	2019	172	43	46	chr3	122808137	122808551	-36791232	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	5
1521	348	241	8	97	chr3	122813109	122813233	-36786550	+	MT2B	LTR	ERVL	152	264	-337	5
1522	492	335	97	65	chr3	122825179	122825489	-36774294	+	LTR33	LTR	ERVL	33	352	-163	5
1522	2384	82	28	16	chr3	122827900	122828223	-36771560	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1522	949	286	111	99	chr3	122834778	122835383	-36764400	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	612	-4	5
1522	1257	220	19	36	chr3	122837040	122837347	-36762436	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	302	-226	5
1522	2725	25	71	0	chr3	122847499	122847822	-36751961	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	5
1522	1474	145	14	174	chr3	122847896	122848263	-36751520	+	ORR1C2	LTR	MaLR	39	346	-38	5
1522	597	274	75	43	chr3	122856984	122857239	-36742544	+	MTD	LTR	MaLR	10	272	-147	6
1522	891	257	16	24	chr3	122858916	122859163	-36740620	-	MTD	LTR	MaLR	-161	258	14	6
1522	289	276	91	80	chr3	122860400	122860664	-36739119	+	RMER12	LTR	ERVK	696	962	-360	6
1522	285	286	70	26	chr3	122871522	122871637	-36728146	-	MLT1C	LTR	MaLR	-78	389	270	6
1522	1756	170	62	0	chr3	122872526	122872862	-36726921	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	65	6
1522	242	185	28	84	chr3	122873640	122873711	-36726072	+	ORR1C2	LTR	MaLR	316	382	-2	6
1522	227	269	115	0	chr3	122876480	122876584	-36723199	+	MER74B	LTR	ERVL	73	188	-434	6
1522	557	270	40	6	chr3	122877155	122877330	-36722453	+	MER74B	LTR	ERVL	442	622	0	6
1522	267	272	135	1	chr3	122885093	122885197	-36714586	+	MER74A	LTR	ERVL	248	423	-199	6
1522	245	289	62	62	chr3	122885233	122885285	-36714498	+	MER74A	LTR	ERVL	424	469	-153	6
1522	1170	191	133	16	chr3	122889075	122889383	-36710400	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	344	-30	6
1522	250	150	0	0	chr3	122889535	122889575	-36710208	+	ORR1D1	LTR	MaLR	345	384	0	6
1522	597	217	0	0	chr3	122894491	122894620	-36705163	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	129	-265	6
1522	246	265	71	10	chr3	122895228	122895327	-36704456	-	ORR1E	LTR	MaLR	-254	105	1	6
1522	1315	151	107	4	chr3	122914164	122914416	-36685367	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-89	278	1	6
1522	3794	87	45	109	chr3	122914790	122915573	-36684210	-	RMER17A	LTR	ERVK	-18	733	1	6
1522	2040	105	54	3	chr3	122919414	122919710	-36680073	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	6
1522	1859	131	49	101	chr3	122921630	122922037	-36677746	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	6
1522	1613	128	125	21	chr3	122926134	122926462	-36673321	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	362	-5	7
1522	2172	135	38	21	chr3	122929136	122929508	-36670275	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	7
1522	452	204	220	20	chr3	122930260	122930410	-36669373	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1078	180	1	7
1522	1889	186	29	11	chr3	122934371	122934746	-36665037	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	3	7
1522	623	246	152	59	chr3	122940467	122940756	-36659027	+	ORR1E	LTR	MaLR	36	351	-8	7
1522	555	282	208	19	chr3	122940840	122941142	-36658641	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	7
1522	565	222	35	0	chr3	122941154	122941298	-36658485	-	MLT1B	LTR	MaLR	-235	155	7	7
1522	456	344	61	9	chr3	122941687	122941916	-36657867	+	MamGypLTR1a	LTR	Gypsy	5	245	-539	7
1522	992	251	111	49	chr3	122942196	122942540	-36657243	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	7
1522	3482	38	0	0	chr3	122944530	122944926	-36654857	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
190	9588	26	1	0	chr3	122944926	122946023	-36653760	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	7
1523	3432	38	2	0	chr3	122946023	122946418	-36653365	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1523	2824	76	58	35	chr3	122952468	122952866	-36646917	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	7
1523	788	298	68	78	chr3	122954191	122954573	-36645210	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	378	-1	7
1523	251	319	97	0	chr3	122954652	122954796	-36644987	+	LTR50	LTR	ERVL	1	158	-637	7
1523	2142	158	0	29	chr3	122956382	122956759	-36643024	-	RLTR17	LTR	ERVK	-325	367	2	7
1523	8603	193	51	68	chr3	122956760	122959321	-36640462	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	0	2842	1	7
1523	2573	145	101	8	chr3	122959321	122959816	-36639967	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	152	7
1523	225	308	98	16	chr3	122964071	122964193	-36635590	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	139	-220	7
1523	1278	219	83	88	chr3	122964791	122965010	-36634773	+	RMER4A	LTR	ERVK	21	247	-219	7
1523	1278	219	83	88	chr3	122965197	122965422	-36634361	+	RMER4A	LTR	ERVK	248	463	-3	7
1523	1565	231	30	6	chr3	122965895	122966260	-36633523	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
1523	2910	196	34	25	chr3	122966260	122966905	-36632878	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	651	-719	7
1523	1878	213	46	27	chr3	122967080	122967557	-36632226	+	RMER19C	LTR	ERVK	126	611	0	7
1523	2742	178	130	10	chr3	122967707	122968315	-36631468	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	687	1367	-3	7
1523	1494	208	64	9	chr3	122968320	122968549	-36631234	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	245	-129	7
1523	1494	208	64	9	chr3	122968573	122968673	-36631110	+	ORR1D1	LTR	MaLR	246	348	-26	7
1523	1157	223	102	10	chr3	122969320	122969615	-36630168	+	MTE2b	LTR	MaLR	47	368	-11	7
1523	535	202	0	0	chr3	122976458	122976562	-36623221	+	MTD	LTR	MaLR	13	116	-303	8
1523	314	215	0	44	chr3	122976608	122976676	-36623107	+	MTD	LTR	MaLR	125	189	-230	8
1523	1221	174	14	5	chr3	122977142	122977361	-36622422	+	MTD	LTR	MaLR	192	412	-7	8
1523	1109	111	65	15	chr3	122979043	122979244	-36620539	+	MTC	LTR	MaLR	1	211	-210	8
1523	3195	61	0	17	chr3	122980280	122980683	-36619100	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
1523	1480	111	4	9	chr3	122981180	122981407	-36618376	+	MTC	LTR	MaLR	196	421	0	8
1523	705	224	102	14	chr3	122988421	122988625	-36611158	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	154	8
1523	529	268	53	17	chr3	122990061	122990298	-36609485	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-5	403	112	8
1523	903	174	0	0	chr3	122994362	122994525	-36605258	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	252	8
1523	2741	217	52	27	chr3	122994523	122995266	-36604517	-	MTD-int	LTR	MaLR	-495	763	2	8
1523	1429	190	198	3	chr3	122995267	122995616	-36604167	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	8
1523	238	318	11	11	chr3	122997374	122997463	-36602320	-	MLT1H	LTR	MaLR	-446	103	15	8
1523	249	291	187	0	chr3	122997588	122997720	-36602063	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	159	-200	8
1523	1364	255	14	32	chr3	122997720	122998089	-36601694	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	362	-8	8
1523	1319	218	40	43	chr3	123006170	123006516	-36593267	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	75	8
1523	775	189	5	100	chr3	123010485	123010685	-36589098	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	181	-193	1
1523	654	197	39	26	chr3	123010791	123010947	-36588836	+	ORR1D1	LTR	MaLR	174	331	-53	1
1523	365	267	183	0	chr3	123042833	123042964	-36556819	-	MTEa	LTR	MaLR	-42	337	183	7
1523	504	264	68	51	chr3	123043213	123043389	-36556394	-	MTEa	LTR	MaLR	-200	179	1	7
1523	2424	149	60	0	chr3	123048154	123048551	-36551232	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	8
1523	237	224	111	69	chr3	123052001	123052073	-36547710	-	RLTR40	LTR	ERVK	-52	765	691	9
1523	256	225	93	70	chr3	123057192	123057278	-36542505	-	MLT1B	LTR	MaLR	-295	95	8	9
1523	3610	117	37	7	chr3	123062484	123063029	-36536754	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	1
1524	1164	161	0	0	chr3	123084205	123084391	-36515392	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	186	-160	1
1524	239	276	81	54	chr3	123085023	123085134	-36514649	+	RMER21B	LTR	ERV1	616	729	-113	1
1524	392	320	16	8	chr3	123091624	123091753	-36508030	+	MLT1A1	LTR	MaLR	73	202	-206	1
1524	1486	146	266	7	chr3	123091753	123092043	-36507740	+	MTC	LTR	MaLR	3	367	0	1
1524	1640	160	27	57	chr3	123092043	123092127	-36507656	+	MTC-int	LTR	MaLR	1	88	-1421	1
1524	1640	160	27	57	chr3	123092425	123092445	-36507338	+	MTC-int	LTR	MaLR	89	93	-1416	1
1524	1640	160	27	57	chr3	123092546	123092772	-36507011	+	MTC-int	LTR	MaLR	94	321	-1188	1
1524	824	113	41	56	chr3	123092757	123092954	-36506829	+	MTC-int	LTR	MaLR	1065	1258	0	1
1524	1990	177	81	20	chr3	123092954	123093351	-36506432	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1524	364	237	66	32	chr3	123093352	123093500	-36506283	+	MLT1A1	LTR	MaLR	207	370	-38	1
1524	301	291	68	38	chr3	123096610	123096742	-36503041	+	MLT1B	LTR	MaLR	243	378	-12	1
1524	900	281	42	111	chr3	123097525	123097724	-36502059	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	202	-157	1
1524	2061	131	36	60	chr3	123097724	123098058	-36501725	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
1524	900	281	42	111	chr3	123098058	123098235	-36501548	+	ORR1E	LTR	MaLR	203	351	-8	1
1524	281	233	108	14	chr3	123098248	123098322	-36501461	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	3	83	-1497	1
1524	383	360	18	0	chr3	123098404	123098432	-36501351	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	42	69	-1511	1
1524	383	360	18	0	chr3	123098475	123098597	-36501186	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	70	207	-1373	1
1524	258	292	0	15	chr3	123098621	123098687	-36501096	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	201	265	-1315	1
1524	645	254	0	7	chr3	123098684	123098823	-36500960	-	MTD	LTR	MaLR	-269	150	13	1
1524	735	299	28	18	chr3	123098909	123098952	-36500831	-	MTE-int	LTR	MaLR	-510	1070	1032	1
1524	735	299	28	18	chr3	123099073	123099247	-36500536	-	MTE-int	LTR	MaLR	-549	1031	852	1
1524	502	250	118	0	chr3	123099808	123099960	-36499823	+	MTD	LTR	MaLR	250	419	0	1
1524	345	328	101	0	chr3	123099960	123100045	-36499738	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1150	1246	-334	1
1524	569	270	604	0	chr3	123100091	123100281	-36499502	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1247	1550	-30	1
1524	770	318	44	74	chr3	123100265	123100632	-36499151	+	ORR1D2	LTR	MaLR	8	363	-7	1
1524	350	295	69	40	chr3	123102271	123102444	-36497339	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	183	-176	1
1524	540	250	52	72	chr3	123102442	123102636	-36497147	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1068	190	1	1
1524	1446	226	128	0	chr3	123102650	123103009	-36496774	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	1
1524	301	270	80	0	chr3	123103716	123103816	-36495967	-	MLT1J	LTR	MaLR	-6	506	399	1
1524	1495	184	160	3	chr3	123106723	123107055	-36492728	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-10	384	1	1
1524	721	245	22	88	chr3	123108064	123108292	-36491491	+	MTEa	LTR	MaLR	5	217	-162	1
1524	1711	177	24	13	chr3	123110142	123110440	-36489343	+	ORR1C1	LTR	MaLR	78	378	0	1
1524	1234	161	248	13	chr3	123118255	123118558	-36481225	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1524	783	214	106	3	chr3	123118924	123119122	-36480661	-	MTD	LTR	MaLR	-19	400	201	1
1524	799	230	64	0	chr3	123119301	123119488	-36480295	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	12	1
1524	975	216	50	185	chr3	123119634	123119997	-36479786	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	317	-53	1
1524	1340	199	88	73	chr3	123126390	123126775	-36473008	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	21	2
1524	247	167	37	0	chr3	123129398	123129452	-36470331	+	RMER15	LTR	ERVL	407	462	-113	2
1524	328	323	76	15	chr3	123137996	123138128	-36461655	+	MTE-int	LTR	MaLR	939	1078	-502	2
1524	352	273	66	0	chr3	123138112	123138233	-36461550	+	MTD	LTR	MaLR	276	404	-15	2
1524	635	176	80	7	chr3	123153939	123154076	-36445707	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-49	335	189	2
1524	2778	173	83	44	chr3	123154089	123154467	-36445316	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	325	2
1524	2778	173	83	44	chr3	123155042	123155316	-36444467	-	RMER6C	LTR	ERVK	-366	324	13	2
1524	1131	117	0	0	chr3	123155517	123155688	-36444095	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-213	171	1	2
1524	371	258	162	16	chr3	123158854	123159039	-36440744	-	MLT1C	LTR	MaLR	-246	221	10	2
1524	315	156	62	49	chr3	123160302	123160383	-36439400	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	428	2
1524	1016	251	64	70	chr3	123164653	123164736	-36435047	-	ORR1E	LTR	MaLR	-14	345	259	2
1524	4104	65	16	0	chr3	123164736	123165247	-36434536	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	2
1524	1016	251	64	70	chr3	123165247	123165506	-36434277	-	ORR1E	LTR	MaLR	-101	258	5	2
1524	3408	43	2	0	chr3	123171341	123171736	-36428047	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1524	3058	17	42	3	chr3	123174679	123175032	-36424751	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	2
1524	9579	24	2	6	chr3	123175032	123176118	-36423665	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5400	2
1524	21469	36	38	15	chr3	123176093	123178699	-36421084	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3807	2674	8	2
1524	3058	17	42	3	chr3	123178699	123179052	-36420731	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	2
1524	238	226	109	73	chr3	123187428	123187538	-36412245	-	MLT1B	LTR	MaLR	-125	265	152	2
1524	2827	133	11	20	chr3	123194716	123195170	-36404613	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-1	452	3	3
1524	778	237	52	56	chr3	123199115	123199347	-36400436	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	149	3
1524	276	200	0	0	chr3	123199380	123199430	-36400353	-	MTE2a	LTR	MaLR	-325	54	5	3
1524	1927	164	36	25	chr3	123200987	123201349	-36398434	+	RLTR30	LTR	ERV1	13	378	-1	3
1524	797	80	33	2	chr3	123204773	123204914	-36394869	+	ORR1B1	LTR	MaLR	5	159	-215	3
1524	3328	21	39	0	chr3	123205442	123205823	-36393960	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1525	1235	196	55	76	chr3	123214986	123215458	-36384325	-	MTD	LTR	MaLR	-2	419	1	3
1525	703	271	69	77	chr3	123219306	123219742	-36380041	-	MT2B	LTR	ERVL	-64	537	1	3
1525	946	282	100	44	chr3	123222259	123222600	-36377183	+	MTEa	LTR	MaLR	18	377	-2	3
1525	2364	177	99	24	chr3	123225015	123225422	-36374361	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	439	-102	3
1525	2364	177	99	24	chr3	123225449	123225544	-36374239	+	RLTR20A	LTR	ERVK	440	540	-1	3
1525	349	290	65	0	chr3	123225820	123225944	-36373839	+	MLT2B2	LTR	ERVL	4	135	-380	3
1525	1221	248	109	70	chr3	123226557	123227017	-36372766	-	RMER5	LTR	ERV1	-5	529	52	3
1525	453	256	30	15	chr3	123227627	123227762	-36372021	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	234	3
1525	2117	159	10	60	chr3	123235417	123235831	-36363952	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	393	-14	3
1525	405	226	8	102	chr3	123237600	123237728	-36362055	-	MT2B	LTR	ERVL	-336	265	150	3
1525	2498	132	38	12	chr3	123248981	123249381	-36350402	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	4	3
1525	1330	247	77	6	chr3	123268439	123268765	-36331018	-	MTD	LTR	MaLR	-53	366	18	4
1525	2086	138	135	0	chr3	123277017	123277350	-36322433	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
1525	518	167	244	9	chr3	123278910	123279025	-36320758	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	277	4
1525	2242	154	80	3	chr3	123284051	123284416	-36315367	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	4
1525	1824	198	22	115	chr3	123293263	123293725	-36306058	+	RLTR25B	LTR	ERVK	43	461	-567	4
1525	868	202	158	32	chr3	123298573	123298819	-36300964	+	MTD	LTR	MaLR	107	383	-36	4
1525	310	265	0	176	chr3	123298835	123298954	-36300829	+	MTC-int	LTR	MaLR	11	122	-1458	4
1525	980	284	115	28	chr3	123298960	123299430	-36300353	+	MTC-int	LTR	MaLR	727	1237	-21	4
1525	1601	136	70	202	chr3	123306575	123307016	-36292767	+	RLTR9A2	LTR	ERVK	1	383	0	4
1525	321	310	252	29	chr3	123319579	123319825	-36279958	+	RMER15	LTR	ERVL	275	575	0	5
1525	293	299	75	0	chr3	123323946	123324053	-36275730	+	MER74B	LTR	ERVL	454	568	-54	5
1525	365	253	102	39	chr3	123334869	123335079	-36264704	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	241	-133	5
1525	354	294	114	119	chr3	123337747	123338099	-36261684	+	MTEb	LTR	MaLR	4	353	-26	5
1526	1057	222	190	0	chr3	123342403	123342755	-36257028	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1526	366	315	102	56	chr3	123344686	123344901	-36254882	+	MLT2B4	LTR	ERVL	72	296	-260	5
1526	1476	145	273	12	chr3	123345787	123346128	-36253655	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	5
1526	264	316	167	39	chr3	123346879	123347238	-36252545	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	405	-3	5
1526	749	192	101	34	chr3	123349486	123349664	-36250119	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-184	190	1	5
1526	247	309	134	27	chr3	123351065	123351288	-36248495	+	MLT-int	LTR	MaLR	2	248	-1487	5
1526	402	291	44	76	chr3	123351312	123351561	-36248222	+	MTE-int	LTR	MaLR	260	500	-1080	5
1526	502	316	13	19	chr3	123357736	123357894	-36241889	+	MTE2b	LTR	MaLR	42	198	-181	5
1526	368	221	143	9	chr3	123357897	123358002	-36241781	+	MTC	LTR	MaLR	1	119	-300	5
1526	798	226	11	6	chr3	123358149	123358327	-36241456	+	MTC	LTR	MaLR	114	292	-129	5
1526	476	215	63	49	chr3	123358320	123358462	-36241321	+	RMER15	LTR	ERVL	432	575	0	5
1526	700	318	25	101	chr3	123359475	123359881	-36239902	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	5	5
1526	284	243	0	51	chr3	123361446	123361524	-36238259	+	LTR40b	LTR	ERVL	162	235	-227	5
1526	249	197	118	0	chr3	123361597	123361673	-36238110	+	LTR40b	LTR	ERVL	368	452	-10	5
1526	4730	87	6	106	chr3	123368767	123369601	-36230182	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	5
1526	1420	263	71	8	chr3	123370912	123371306	-36228477	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1526	987	309	44	14	chr3	123371658	123372022	-36227761	+	MTEa	LTR	MaLR	5	379	0	5
1526	1981	145	82	9	chr3	123378705	123379047	-36220736	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1526	2172	200	21	73	chr3	123386610	123387170	-36212613	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	45	5
1526	509	186	109	109	chr3	123399267	123399442	-36200341	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	205	6
1526	2874	176	45	23	chr3	123401683	123402240	-36197543	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	9	6
1526	2131	131	119	14	chr3	123403654	123404081	-36195702	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	219	6
1526	674	247	90	0	chr3	123404066	123404244	-36195539	-	RMER5	LTR	ERV1	-337	197	4	6
1526	324	275	178	20	chr3	123404585	123404737	-36195046	-	ORR1E	LTR	MaLR	-176	183	8	6
1526	316	267	37	28	chr3	123409298	123409406	-36190377	-	RMER5	LTR	ERV1	-7	527	419	6
1526	690	299	93	25	chr3	123409417	123409771	-36190012	-	RMER5	LTR	ERV1	-156	378	1	6
1526	241	308	135	97	chr3	123415195	123415454	-36184329	-	MLT1C	LTR	MaLR	-198	269	1	6
1526	426	318	103	98	chr3	123424675	123425094	-36174689	+	RMER10A	LTR	ERVL	13	433	-9	6
1526	2861	136	91	4	chr3	123426042	123426524	-36173259	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	524	0	6
1526	268	316	32	64	chr3	123426777	123426902	-36172881	+	RMER15	LTR	ERVL	359	479	-96	6
1526	525	266	46	66	chr3	123427588	123427785	-36171998	-	MTEb	LTR	MaLR	-5	374	182	6
1526	1690	176	53	3	chr3	123427826	123428145	-36171638	+	ORR1D1	LTR	MaLR	40	374	0	6
1526	1239	165	29	53	chr3	123439497	123439740	-36160043	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-733	295	59	6
1526	748	238	12	23	chr3	123439776	123439948	-36159835	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-204	170	1	6
1526	268	220	17	0	chr3	123453263	123453322	-36146461	+	MLT1A0	LTR	MaLR	65	124	-241	6
1526	434	264	25	75	chr3	123453337	123453497	-36146286	+	MER77	LTR	ERVL	448	599	-8	6
1526	253	377	157	12	chr3	123453523	123453765	-36146018	-	MLT1J	LTR	MaLR	-235	277	1	6
1526	347	298	40	32	chr3	123466388	123466513	-36133270	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-239	126	1	6
1526	1221	222	129	9	chr3	123467947	123468279	-36131504	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	2	7
1526	260	236	208	69	chr3	123468558	123468717	-36131066	-	MLT1D	LTR	MaLR	-290	215	35	7
1527	225	354	39	29	chr3	123470855	123470957	-36128826	-	LTR16A1	LTR	ERVL	-319	137	35	7
1527	13206	70	12	18	chr3	123473770	123475586	-36124197	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-4	1804	1	7
1527	629	269	215	87	chr3	123479051	123479502	-36120281	-	RMER4B	LTR	ERVK	-18	567	59	7
1527	276	316	77	82	chr3	123484662	123484980	-36114803	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	52	7
1527	1258	281	96	0	chr3	123485882	123486235	-36113548	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	33	7
1527	601	314	72	16	chr3	123489964	123490171	-36109612	+	RMER15	LTR	ERVL	308	527	-48	7
1527	601	314	72	16	chr3	123490212	123490253	-36109530	+	RMER15	LTR	ERVL	528	570	-5	7
1527	336	362	117	46	chr3	123494310	123494617	-36105166	+	MLT2E	LTR	ERVL	1	329	-299	7
1527	1011	276	143	18	chr3	123494733	123495026	-36104757	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	84	7
1527	2970	161	149	2	chr3	123495026	123495625	-36104158	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	4	7
1527	1011	276	143	18	chr3	123495625	123495667	-36104116	-	MTD	LTR	MaLR	-336	83	42	7
1527	260	306	71	40	chr3	123496986	123497112	-36102671	+	RMER20B	LTR	ERVK	234	363	-264	7
1527	272	262	55	55	chr3	123497159	123497268	-36102515	+	RMER20B	LTR	ERVK	478	586	-41	7
1527	1308	280	32	14	chr3	123497819	123498163	-36101620	+	ORR1D2	LTR	MaLR	21	370	0	7
1527	2398	241	35	41	chr3	123498163	123498800	-36100983	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1	633	-737	7
1527	445	215	113	106	chr3	123499849	123500000	-36099783	+	MLT2C2	LTR	ERVL	1	152	-312	7
1527	382	295	139	40	chr3	123500038	123500211	-36099572	+	MLT2D	LTR	ERVL	161	350	-64	1
1527	1980	169	8	34	chr3	123504934	123505319	-36094464	+	RLTR9E	LTR	ERVK	35	409	0	8
1527	657	186	135	109	chr3	123505500	123505693	-36094090	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	495	1
1527	633	249	22	128	chr3	123507274	123507500	-36092283	-	MTD	LTR	MaLR	-217	202	1	1
1527	2732	153	152	8	chr3	123507664	123508196	-36091587	+	RMER19C	LTR	ERVK	3	611	0	1
1527	2142	164	19	0	chr3	123509931	123510302	-36089481	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	1
1527	715	211	217	29	chr3	123511784	123512030	-36087753	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	123	1
1527	1525	155	128	86	chr3	123515224	123515431	-36084352	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	194	2
1527	1525	155	128	86	chr3	123515604	123515778	-36084005	-	RMER10B	LTR	ERVL	-205	193	1	2
1527	545	299	176	5	chr3	123516016	123516238	-36083545	+	MTEa	LTR	MaLR	5	264	-115	2
1527	1263	199	37	4	chr3	123516299	123516541	-36083242	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	250	-124	2
1527	2170	200	130	4	chr3	123516541	123517042	-36082741	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	564	-4	2
1527	776	196	8	0	chr3	123517041	123517174	-36082609	+	ORR1D1	LTR	MaLR	241	374	0	2
1527	414	262	74	0	chr3	123517722	123517844	-36081939	+	MTEa	LTR	MaLR	247	377	-2	2
1527	1380	236	71	88	chr3	123529454	123529735	-36070048	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	113	3
1527	1380	236	71	88	chr3	123529880	123530021	-36069762	-	MTD	LTR	MaLR	-307	112	4	3
1527	506	194	39	46	chr3	123537465	123537595	-36062188	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	271	4
1527	2073	213	78	2	chr3	123544570	123544993	-36054790	+	MT2A	LTR	ERVL	1	455	-78	6
1527	1247	190	25	21	chr3	123548960	123549202	-36050581	+	ORR1C2	LTR	MaLR	87	329	-55	6
1527	733	274	73	64	chr3	123549325	123549733	-36050050	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	519	-37	6
1527	1805	219	24	24	chr3	123549849	123550261	-36049522	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	1	7
1527	1892	182	72	16	chr3	123552274	123552340	-36047443	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	308	7
1527	1892	182	72	16	chr3	123552729	123553034	-36046749	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-87	307	2	7
1527	1163	216	71	41	chr3	123555741	123556108	-36043675	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	1	8
1527	2409	95	6	0	chr3	123557667	123557992	-36041791	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	8
1527	2074	142	78	17	chr3	123558194	123558553	-36041230	+	ORR1B1	LTR	MaLR	14	394	0	8
1527	256	197	12	84	chr3	123559650	123559733	-36040050	-	RMER12	LTR	ERVK	-4	1318	1242	8
1527	804	238	3	161	chr3	123559910	123560221	-36039562	-	RMER12	LTR	ERVK	-85	1237	976	8
1527	4249	156	32	17	chr3	123560215	123560996	-36038787	-	RMER12	LTR	ERVK	-528	794	2	8
1527	370	148	0	0	chr3	123562835	123562889	-36036894	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	703	9
1527	364	272	0	88	chr3	123568790	123568915	-36030868	+	MTE2a	LTR	MaLR	4	117	-262	1
1527	1508	263	38	20	chr3	123569200	123569596	-36030187	+	MTD	LTR	MaLR	15	417	-2	1
1527	651	211	49	69	chr3	123569597	123569801	-36029982	+	MTE2a	LTR	MaLR	152	351	-28	1
1527	1964	299	151	35	chr3	123569877	123570787	-36028996	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	2	1280	-300	1
1527	1964	295	150	30	chr3	123570813	123570881	-36028902	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	1281	1349	-231	1
1527	1964	295	150	30	chr3	123570933	123571106	-36028677	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	1350	1579	-1	1
1527	304	319	14	48	chr3	123571106	123571251	-36028532	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	140	-239	1
1527	3319	25	12	42	chr3	123579647	123580071	-36019712	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	1
1527	467	326	93	32	chr3	123581874	123582121	-36017662	-	RLTR18	LTR	ERVK	-322	294	33	1
1527	1372	233	73	104	chr3	123595192	123595723	-36004060	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	0	563	49	1
1527	772	288	21	46	chr3	123596814	123597098	-36002685	+	RMER15	LTR	ERVL	285	561	-14	1
1527	751	310	60	82	chr3	123597795	123598006	-36001777	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	311	1
1527	3066	66	10	2	chr3	123598006	123598399	-36001384	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	5	1
1527	751	310	60	82	chr3	123598399	123598581	-36001202	-	RMER5	LTR	ERV1	-224	310	136	1
1527	2240	92	38	6	chr3	123598581	123598898	-36000885	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1527	751	310	60	82	chr3	123598898	123598956	-36000827	-	RMER5	LTR	ERV1	-399	135	77	1
1527	705	350	26	37	chr3	123599453	123599726	-36000057	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-34	590	321	1
190	2952	82	12	14	chr3	123600550	123600972	-35998811	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
1528	383	230	27	2	chr3	123600972	123601132	-35998651	-	BGLII	LTR	ERVK	-112	329	175	1
1528	684	138	9	0	chr3	123601992	123602101	-35997682	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	312	1
1528	565	261	62	58	chr3	123604479	123604922	-35994861	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	381	-29	1
1528	1527	221	121	3	chr3	123625043	123625375	-35974408	+	MTD	LTR	MaLR	49	419	0	1
1528	2210	254	79	75	chr3	123641251	123642149	-35957634	-	RMER17B	LTR	ERVK	-56	902	1	1
1528	438	267	143	0	chr3	123675150	123675311	-35924472	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	351	2
1528	227	218	0	18	chr3	123675320	123675376	-35924407	-	RMER19B	LTR	ERVK	-7	895	841	2
1528	878	257	149	49	chr3	123680154	123680424	-35919359	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	128	2
1528	878	257	149	49	chr3	123680481	123680578	-35919205	-	MTD	LTR	MaLR	-292	127	3	2
1528	2093	212	35	14	chr3	123683057	123683573	-35916210	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	2
1528	576	0	97	0	chr3	123692340	123692412	-35907371	+	MTB	LTR	MaLR	322	400	0	2
1528	1599	209	78	17	chr3	123692641	123692987	-35906796	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1528	305	364	39	0	chr3	123693136	123693265	-35906518	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	134	-231	2
1528	302	331	68	0	chr3	123693324	123693457	-35906326	+	MLT1A0	LTR	MaLR	264	405	-3	2
1528	233	348	43	17	chr3	123694347	123694464	-35905319	-	MTD	LTR	MaLR	-299	120	1	2
1528	294	321	9	90	chr3	123697831	123698020	-35901763	-	RMER4B	LTR	ERVK	-280	186	8	2
1528	604	211	0	0	chr3	123701730	123701839	-35897944	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	109	-403	2
1528	797	259	105	25	chr3	123702844	123703121	-35896662	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	116	2
1528	715	296	105	29	chr3	123703739	123704083	-35895700	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	2
1528	495	349	74	28	chr3	123705691	123705974	-35893809	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	357	62	2
1528	1505	238	106	3	chr3	123712085	123712452	-35887331	+	MTC	LTR	MaLR	9	413	-8	3
1528	1893	158	2	158	chr3	123713510	123713953	-35885830	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	374	-4	3
1528	264	355	54	0	chr3	123714818	123715004	-35884779	+	HERV16-int	LTR	ERVL	970	1165	-3831	3
1528	323	177	16	0	chr3	123718867	123718929	-35880854	+	ORR1D2	LTR	MaLR	305	367	-3	3
1528	473	323	37	0	chr3	123719171	123719335	-35880448	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-99	271	102	3
1528	775	262	118	76	chr3	123721160	123721515	-35878268	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	3
1528	366	271	39	5	chr3	123721596	123721699	-35878084	+	MER67A	LTR	ERV1	204	311	-232	3
1528	305	345	43	17	chr3	123724696	123724811	-35874972	+	MTD	LTR	MaLR	1	118	-301	3
1528	542	258	158	133	chr3	123725103	123725344	-35874439	-	MTD	LTR	MaLR	-51	368	122	3
1528	1116	249	69	4	chr3	123726705	123726967	-35872816	+	MTD	LTR	MaLR	130	408	-11	3
1528	560	313	86	48	chr3	123731052	123731425	-35868358	+	RMER5	LTR	ERV1	148	534	0	3
1529	296	285	94	34	chr3	123752437	123752586	-35847197	-	MT2A	LTR	ERVL	-375	158	1	3
1529	921	209	240	58	chr3	123757414	123757739	-35842044	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1529	509	310	74	10	chr3	123758089	123758291	-35841492	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-244	220	6	3
1529	371	196	8	30	chr3	123758766	123758865	-35840918	+	MTD	LTR	MaLR	237	419	0	3
1529	1026	295	119	9	chr3	123762791	123763119	-35836664	+	MTD	LTR	MaLR	56	419	0	3
1529	2641	164	80	12	chr3	123763227	123763714	-35836069	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-7	521	2	3
1529	317	133	0	0	chr3	123773189	123773234	-35826549	+	ORR1B1	LTR	MaLR	340	384	-10	3
1529	553	267	95	29	chr3	123775625	123775868	-35823915	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	259	-100	3
1529	3394	38	0	0	chr3	123775885	123776281	-35823502	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1529	369	82	66	0	chr3	123784285	123784346	-35815437	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5564	5628	-133	4
1529	354	178	13	40	chr3	123784347	123784423	-35815360	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	4
1529	260	81	0	0	chr3	123784423	123784460	-35815323	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5484	-1	4
1529	3007	107	12	43	chr3	123784461	123784951	-35814832	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	4
1529	1371	215	129	3	chr3	123788651	123788977	-35810806	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1529	563	159	0	165	chr3	123789689	123789847	-35809936	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	139	-291	4
1529	603	343	39	45	chr3	123789862	123790195	-35809588	+	RLTR23	LTR	ERV1	100	430	0	4
1529	469	326	126	30	chr3	123793045	123793388	-35806395	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	21	4
1529	1455	251	56	17	chr3	123797438	123797585	-35802198	+	MTD	LTR	MaLR	50	198	-221	4
1529	1455	251	56	17	chr3	123797609	123797817	-35801966	+	MTD	LTR	MaLR	199	419	0	4
1529	701	304	39	25	chr3	123799740	123800101	-35799682	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	370	0	4
1529	294	260	180	0	chr3	123800102	123800202	-35799581	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	3	120	-1460	4
1529	1040	317	14	47	chr3	123803505	123803849	-35795934	+	RMER15	LTR	ERVL	225	557	-18	4
1529	2099	211	5	184	chr3	123804122	123804866	-35794917	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
1529	496	317	84	71	chr3	123816872	123817239	-35782544	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-2	678	307	4
1529	2558	87	81	3	chr3	123820354	123820735	-35779048	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	4
1529	415	241	51	43	chr3	123829828	123829892	-35769891	+	MTC	LTR	MaLR	300	367	-54	4
1529	415	241	51	43	chr3	123830073	123830125	-35769658	+	MTC	LTR	MaLR	368	417	-4	4
1529	491	326	51	4	chr3	123830602	123830866	-35768917	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	408	126	4
1529	989	279	58	29	chr3	123831203	123831480	-35768303	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	285	-85	4
1529	227	325	24	0	chr3	123831519	123831602	-35768181	+	MLT2B4	LTR	ERVL	276	360	-196	4
1529	2567	107	21	8	chr3	123837125	123837512	-35762271	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	392	-17	4
1529	3921	92	19	20	chr3	123837512	123838184	-35761599	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-2310	1388	783	4
1529	1753	134	155	196	chr3	123838317	123839124	-35760659	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-2522	777	114	4
1529	1443	143	52	0	chr3	123839112	123839342	-35760441	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-3057	242	1	4
1529	4068	54	20	2	chr3	123839342	123839845	-35759938	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	4
1529	1599	242	92	3	chr3	123841096	123841465	-35758318	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	4
1529	271	357	22	97	chr3	123844317	123844584	-35755199	+	RLTR18	LTR	ERVK	33	279	-337	5
1529	712	215	3	33	chr3	123855634	123855813	-35743970	+	RLTR18	LTR	ERVK	8	183	-329	5
1529	330	123	69	17	chr3	123855812	123855870	-35743913	+	RLTR18	LTR	ERVK	147	207	-409	5
1529	600	285	115	32	chr3	123855883	123856195	-35743588	-	RLTR15	LTR	ERVK	-21	338	1	5
1529	1832	179	64	71	chr3	123856195	123856547	-35743236	+	RLTR18	LTR	ERVK	205	566	-50	5
1529	1832	179	64	71	chr3	123857042	123857100	-35742683	+	RLTR18	LTR	ERVK	567	612	-4	5
1529	1645	243	35	8	chr3	123857956	123858329	-35741454	+	MTD	LTR	MaLR	34	416	-3	5
1529	287	299	18	41	chr3	123860162	123860333	-35739450	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	588	754	-755	5
1530	688	259	35	57	chr3	123870751	123870980	-35728803	+	RMER15	LTR	ERVL	8	231	-344	5
1530	1533	258	15	0	chr3	123871075	123871409	-35728374	+	RMER15	LTR	ERVL	237	575	0	5
1530	3403	35	2	0	chr3	123872646	123873041	-35726742	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1530	416	324	148	20	chr3	123876740	123877067	-35722716	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	1041	1534	-46	5
1530	1239	149	165	0	chr3	123880723	123880978	-35718805	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	6	302	-1661	5
1530	763	179	47	165	chr3	123896402	123896743	-35703040	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	9	400	-9	5
1530	19089	186	42	27	chr3	123896754	123900469	-35699314	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2	4193	-3213	5
1530	19089	186	42	27	chr3	123900544	123903209	-35696574	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4194	7203	-203	5
1530	502	210	118	7	chr3	123903209	123903353	-35696430	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	153	312	-581	5
1530	333	126	14	50	chr3	123903358	123903438	-35696345	+	ETnERV-int	LTR	ERVK	3118	3181	-133	5
1530	228	233	0	0	chr3	123903438	123903481	-35696302	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	495	537	-365	5
1530	413	120	25	74	chr3	123903482	123903563	-35696220	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7330	7406	0	5
1530	772	191	42	159	chr3	123903570	123903930	-35695853	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	7	409	0	5
1530	337	353	119	23	chr3	123904255	123904516	-35695267	+	MLT1E2	LTR	MaLR	342	627	0	5
1530	1302	290	63	59	chr3	123910830	123911318	-35688465	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	86	5
1530	254	307	0	39	chr3	123911385	123911463	-35688320	-	RMER15	LTR	ERVL	-500	75	1	5
1530	718	261	103	122	chr3	123914747	123915240	-35684543	-	RLTR40	LTR	ERVK	-176	641	158	5
1530	249	264	39	117	chr3	123915821	123915924	-35683859	-	RLTR40	LTR	ERVK	-648	169	75	5
1530	1343	256	82	3	chr3	123915973	123916314	-35683469	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	369	-5	5
1530	278	309	111	60	chr3	123917028	123917262	-35682521	-	MER67C	LTR	ERV1	-333	378	133	5
1530	444	225	89	9	chr3	123918518	123918630	-35681153	-	MTEa	LTR	MaLR	-258	121	1	5
1530	252	278	19	0	chr3	123919304	123919358	-35680425	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	55	-304	6
1530	1623	197	34	42	chr3	123919962	123920384	-35679399	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-6	388	2	6
1530	324	264	86	23	chr3	123921193	123921321	-35678462	-	MTE-int	LTR	MaLR	-2	1578	1443	6
1530	435	374	54	18	chr3	123921479	123921702	-35678081	-	MTE-int	LTR	MaLR	-217	1363	1133	6
1530	736	297	65	56	chr3	123921811	123921899	-35677884	-	MTE-int	LTR	MaLR	-100	1480	1395	6
1530	736	297	65	56	chr3	123922582	123922817	-35676966	-	MTE-int	LTR	MaLR	-186	1394	1156	6
1530	396	360	60	37	chr3	123923066	123923282	-35676501	+	MTE-int	LTR	MaLR	788	1008	-572	6
1530	1042	299	96	6	chr3	123924279	123924592	-35675191	+	MTE2b	LTR	MaLR	39	379	0	6
1530	622	264	39	49	chr3	123924592	123924707	-35675076	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	1	114	-1466	6
1530	622	264	39	49	chr3	123924824	123924911	-35674872	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	115	201	-1379	6
1530	1270	269	71	10	chr3	123926887	123927282	-35672501	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
1530	613	318	49	82	chr3	123940248	123940560	-35659223	+	MTEb	LTR	MaLR	12	318	-61	6
1530	2943	26	9	0	chr3	123940560	123940903	-35658880	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	6
1530	14104	52	6	1	chr3	123940903	123942686	-35657097	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	6
1530	2997	18	9	0	chr3	123942686	123943029	-35656754	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	6
1530	613	318	49	82	chr3	123943029	123943080	-35656703	+	MTEb	LTR	MaLR	319	363	-16	6
1530	302	376	88	88	chr3	123945028	123945392	-35654391	+	MLT1A	LTR	MaLR	5	368	-6	6
1530	341	359	53	32	chr3	123948165	123948355	-35651428	-	RMER15	LTR	ERVL	-46	529	336	6
1530	2606	54	3	0	chr3	123948863	123949199	-35650584	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	-8	337	1	6
1530	2122	235	65	52	chr3	123949242	123949776	-35650007	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	543	-274	6
1530	2122	235	65	52	chr3	123949956	123950062	-35649721	+	RLTR40	LTR	ERVK	544	650	-167	6
1530	4351	18	0	0	chr3	123958763	123959253	-35640530	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	4	493	0	6
1530	255	316	59	42	chr3	123960201	123960320	-35639463	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-406	121	1	6
1530	248	312	31	20	chr3	123963720	123963818	-35635965	+	MER90	LTR	ERV1	5	103	-472	6
1530	1333	125	5	5	chr3	123968090	123968299	-35631484	+	RMER6C	LTR	ERVK	482	690	0	6
1530	822	251	45	32	chr3	123969060	123969373	-35630410	-	RLTR15	LTR	ERVK	-40	319	3	6
1530	338	305	58	35	chr3	123969560	123969733	-35630050	+	MER77	LTR	ERVL	406	582	-25	6
1530	924	305	80	24	chr3	123977060	123977399	-35622384	+	MTEa	LTR	MaLR	1	358	-21	7
1530	597	258	112	5	chr3	123981595	123981782	-35618001	+	MTD	LTR	MaLR	15	221	-198	7
1530	1100	239	152	42	chr3	123993176	123993530	-35606253	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	15	7
1531	800	173	11	57	chr3	123994716	123994961	-35604822	+	MTC	LTR	MaLR	1	212	-209	7
1531	851	177	7	0	chr3	123995490	123995631	-35604152	+	MTC	LTR	MaLR	196	337	-84	7
1531	4079	167	89	41	chr3	123999018	123999878	-35599905	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	7
1531	291	260	57	128	chr3	124001587	124001728	-35598055	+	MLT1F	LTR	MaLR	30	160	-388	4
1531	5685	116	54	11	chr3	124003055	124003970	-35595813	-	RMER17B	LTR	ERVK	-4	954	1	7
1531	610	335	94	40	chr3	124014487	124014838	-35584945	+	MLT1D	LTR	MaLR	120	489	-16	2
1531	466	269	265	14	chr3	124016720	124017003	-35582780	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	2	3
1531	266	356	83	37	chr3	124017627	124017843	-35581940	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	183	3
1531	340	296	77	49	chr3	124021396	124021627	-35578156	+	MLT1G	LTR	MaLR	67	320	-275	4
1531	768	304	131	82	chr3	124034206	124034740	-35565043	+	RMER13A	LTR	ERVK	21	580	-280	5
1531	2527	166	31	12	chr3	124041668	124042185	-35557598	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	6
1531	357	168	39	135	chr3	124047285	124047370	-35552413	+	RMER17C	LTR	ERVK	91	179	-231	7
1531	357	168	39	135	chr3	124047548	124047669	-35552114	+	RMER17C	LTR	ERVK	180	277	-133	7
1531	2092	241	144	33	chr3	124050518	124050612	-35549171	-	RLTR40	LTR	ERVK	-53	764	643	8
1531	2092	241	144	33	chr3	124050651	124051244	-35548539	-	RLTR40	LTR	ERVK	-175	642	1	8
1531	971	302	68	65	chr3	124051606	124051946	-35547837	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	29	8
1531	1459	123	23	83	chr3	124056099	124056364	-35543419	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-8	1840	1592	9
1531	4575	142	61	14	chr3	124056539	124057353	-35542430	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-995	853	1	9
1531	928	299	36	51	chr3	124057354	124057766	-35542017	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	1	9
1531	1123	221	70	108	chr3	124063610	124064081	-35535702	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3511	3963	-2174	1
1531	1526	204	42	21	chr3	124064455	124064791	-35534992	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4039	4381	-1756	1
1531	259	330	0	41	chr3	124066489	124066587	-35533196	+	RNERVK23-int	LTR	ERVK	7409	7502	-715	1
1531	1378	190	41	4	chr3	124069646	124069915	-35529868	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	289	-227	1
1531	842	235	100	127	chr3	124070584	124070788	-35528995	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-45	329	124	1
1531	842	218	110	137	chr3	124070922	124071093	-35528690	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-209	165	5	1
1531	816	285	31	22	chr3	124074919	124075185	-35524598	+	RLTR17	LTR	ERVK	249	619	-73	1
1531	1394	238	63	14	chr3	124078793	124078992	-35520791	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	172	1
1531	1394	238	63	14	chr3	124079073	124079236	-35520547	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-213	171	4	1
1531	563	248	133	25	chr3	124082576	124082770	-35517013	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	153	1
1531	747	247	66	6	chr3	124082790	124082973	-35516810	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	1	194	-1176	1
1531	347	358	36	127	chr3	124094238	124094541	-35505242	+	MTE-int	LTR	MaLR	42	336	-1244	1
1531	347	358	36	127	chr3	124094563	124094618	-35505165	+	MTE-int	LTR	MaLR	337	369	-1211	1
1531	347	358	36	127	chr3	124094800	124094913	-35504870	+	MTE-int	LTR	MaLR	370	471	-1109	1
1531	326	344	21	47	chr3	124096495	124096687	-35503096	+	MTE-int	LTR	MaLR	1338	1524	-56	1
1531	252	352	67	36	chr3	124096716	124096881	-35502902	+	ORR1E	LTR	MaLR	41	210	-149	1
1531	388	378	57	28	chr3	124099086	124099369	-35500414	+	MTE2b	LTR	MaLR	69	359	-20	1
1531	555	365	59	14	chr3	124103204	124103493	-35496290	+	MTE2b	LTR	MaLR	68	369	-10	1
1531	426	311	65	26	chr3	124103520	124103675	-35496108	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	15	175	-1405	1
1531	225	317	139	69	chr3	124105914	124106087	-35493696	+	MTEa	LTR	MaLR	59	243	-136	1
1531	939	296	33	36	chr3	124106387	124106720	-35493063	+	ORR1D2	LTR	MaLR	39	370	0	1
1531	442	308	26	33	chr3	124106750	124106901	-35492882	+	MTD	LTR	MaLR	37	186	-233	1
1531	560	310	60	15	chr3	124107244	124107444	-35492339	+	MTD	LTR	MaLR	197	405	-14	1
1532	291	254	95	40	chr3	124135376	124135524	-35464259	+	MTD-int	LTR	MaLR	1096	1251	-7	2
1532	538	214	0	28	chr3	124135534	124135640	-35464143	+	MTD	LTR	MaLR	18	120	-299	2
1532	252	345	87	47	chr3	124135622	124135771	-35464012	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-172	235	81	2
1532	2044	148	0	3	chr3	124136429	124136741	-35463042	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	2
1532	356	335	122	45	chr3	124140522	124140815	-35458968	+	MTEa	LTR	MaLR	68	379	0	2
1532	1531	216	191	90	chr3	124141639	124142194	-35457589	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
1532	367	58	0	19	chr3	124142937	124142990	-35456793	+	RLTR21	LTR	ERVK	987	1038	-534	2
1532	241	279	77	58	chr3	124145434	124145590	-35454193	-	RMER12	LTR	ERVK	-478	844	686	2
1532	579	100	11	0	chr3	124148280	124148370	-35451413	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	91	-277	2
1532	5823	200	88	45	chr3	124148580	124150096	-35449687	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-267	1581	1	2
1532	389	344	94	17	chr3	124153095	124153382	-35446401	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1243	337	29	2
1532	269	344	66	45	chr3	124175308	124175506	-35424277	-	MLT1E2-int	LTR	MaLR	-638	851	650	2
1532	284	304	85	31	chr3	124175653	124175782	-35424001	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-308	319	184	2
1532	660	251	71	14	chr3	124177141	124177351	-35422432	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	261	2
1532	1726	238	22	66	chr3	124177622	124178076	-35421707	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-326	7080	6647	2
1532	792	255	100	69	chr3	124178089	124178409	-35421374	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-584	6660	6331	2
1532	728	264	90	24	chr3	124179366	124179788	-35419995	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1703	2266	-3495	2
1532	401	279	142	0	chr3	124180800	124180990	-35418793	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2399	2615	-3146	2
1532	1290	266	30	46	chr3	124182503	124182847	-35416936	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	23	2
1532	1750	190	40	32	chr3	124182847	124183222	-35416561	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
1532	1290	266	30	46	chr3	124183222	124183247	-35416536	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-348	22	1	2
1532	230	314	14	54	chr3	124192717	124192791	-35406992	-	LTR81C	LTR	ERV1?	-827	326	256	2
1532	6934	61	9	53	chr3	124193232	124194167	-35405616	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	2
1532	3734	160	78	10	chr3	124197987	124198695	-35401088	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	3
1532	2356	112	3	0	chr3	124216425	124216747	-35383036	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-4	323	1	3
1532	233	310	28	0	chr3	124220190	124220261	-35379522	+	LTR81B	LTR	ERV1?	259	331	-1062	3
1532	719	164	31	62	chr3	124227567	124227729	-35372054	-	RMER6C	LTR	ERVK	-522	168	12	3
1532	862	171	26	47	chr3	124230326	124230516	-35369267	-	RLTR33	LTR	ERVK	-492	186	1	3
1532	262	224	33	71	chr3	124238206	124238389	-35361394	+	RMER17A	LTR	ERVK	292	467	-284	3
1532	441	296	68	104	chr3	124239428	124239843	-35359940	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	103	502	-25	3
1532	1254	219	9	101	chr3	124243272	124243617	-35356166	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	299	3
1532	453	291	72	7	chr3	124246170	124246322	-35353461	+	MTD	LTR	MaLR	258	419	0	3
1532	1098	282	74	64	chr3	124246322	124246822	-35352961	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	505	-753	3
1532	228	206	145	14	chr3	124246822	124246891	-35352892	+	MTE2a	LTR	MaLR	243	320	-59	3
1532	640	329	144	29	chr3	124250674	124250987	-35348796	+	ORR1D2	LTR	MaLR	22	370	0	3
1532	370	272	21	96	chr3	124254628	124254815	-35344968	-	MTE2a	LTR	MaLR	-201	178	6	4
1533	1593	180	63	90	chr3	124256852	124257218	-35342565	+	ORR1B1	LTR	MaLR	39	394	0	4
1533	1460	186	51	126	chr3	124260023	124260108	-35339675	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	346	295	4
1533	1650	174	14	24	chr3	124260256	124260544	-35339239	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-42	285	1	4
1533	486	281	271	22	chr3	124266768	124267045	-35332738	+	ORR1E	LTR	MaLR	25	370	0	4
1533	306	336	17	17	chr3	124267046	124267161	-35332622	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	2	116	-1254	4
1533	555	261	184	20	chr3	124267170	124267420	-35332363	+	ORR1E	LTR	MaLR	64	354	-5	4
1533	515	202	0	11	chr3	124272045	124272140	-35327643	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	94	-273	4
1533	787	126	47	0	chr3	124272150	124272277	-35327506	+	ORR1B1	LTR	MaLR	215	347	-47	4
1533	271	167	21	0	chr3	124272427	124272475	-35327308	+	ORR1B1	LTR	MaLR	312	360	-7	4
1533	607	258	82	143	chr3	124272823	124273066	-35326717	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-3128	3009	2816	4
1533	3353	48	35	12	chr3	124273066	124273492	-35326291	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	4
1533	668	259	81	140	chr3	124273492	124273782	-35326001	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1455	7504	7240	4
1533	3866	174	102	20	chr3	124274551	124275385	-35324398	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	4
1533	361	314	44	28	chr3	124276100	124276280	-35323503	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-42	439	257	4
1533	2163	129	6	6	chr3	124285722	124286049	-35313734	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1533	2020	103	3	23	chr3	124295270	124295577	-35304206	+	ORR1A2	LTR	MaLR	27	327	0	4
1533	321	315	22	65	chr3	124296190	124296329	-35303454	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	135	-224	4
1533	388	338	56	0	chr3	124300714	124300856	-35298927	-	RMER15	LTR	ERVL	-22	553	404	4
1533	3390	35	2	0	chr3	124301292	124301687	-35298096	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1533	1453	233	99	45	chr3	124303182	124303735	-35296048	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	583	-107	4
1533	2158	107	25	9	chr3	124304097	124304419	-35295364	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1533	3048	20	0	0	chr3	124305711	124306057	-35293726	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	4
1533	1381	143	118	67	chr3	124307097	124307300	-35292483	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	208	-202	4
1533	1381	143	118	67	chr3	124307321	124307507	-35292276	+	RMER17C	LTR	ERVK	209	410	0	4
1533	295	345	54	46	chr3	124309766	124310006	-35289777	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	409	650	-30	4
1533	4106	172	102	44	chr3	124312792	124313728	-35286055	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-38	990	1	4
1533	1927	161	14	34	chr3	124315018	124315371	-35284412	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
1533	641	284	103	31	chr3	124316038	124316358	-35283425	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	343	-16	4
1533	1851	278	31	50	chr3	124317879	124318773	-35281010	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	5	768	-1558	5
1533	468	303	45	17	chr3	124318777	124318955	-35280828	+	RMER4A	LTR	ERVK	257	439	-27	5
1533	1356	175	81	51	chr3	124318958	124319446	-35280337	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	7807	8204	-755	5
1533	996	281	132	37	chr3	124324118	124324679	-35275104	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	2	505	-1075	5
1533	754	315	113	65	chr3	124324715	124324841	-35274942	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	506	625	-955	5
1533	402	410	14	9	chr3	124329585	124329804	-35269979	+	MLT1G	LTR	MaLR	10	229	-362	5
1533	274	241	22	98	chr3	124334609	124334834	-35264949	+	RMER17C	LTR	ERVK	69	276	-134	5
1533	1663	206	47	44	chr3	124337001	124337553	-35262230	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	204	5
1533	339	260	31	20	chr3	124338276	124338374	-35261409	-	RMER6C	LTR	ERVK	-500	220	122	5
1533	1732	188	23	8	chr3	124344638	124344992	-35254791	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	5
1533	873	313	46	96	chr3	124346072	124346616	-35253167	-	RMER5	LTR	ERV1	-12	522	6	5
1533	3023	148	109	16	chr3	124347473	124348104	-35251679	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	5
1533	932	283	49	20	chr3	124352898	124353305	-35246478	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1533	227	254	15	15	chr3	124353948	124354016	-35245767	-	MTE2b	LTR	MaLR	-25	354	287	5
1533	939	354	52	21	chr3	124355104	124355569	-35244214	-	LTR16C	LTR	ERVL	-10	479	1	5
1533	1876	180	258	32	chr3	124362637	124363200	-35236583	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1533	703	297	101	15	chr3	124363701	124364015	-35235768	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	418	24	5
1533	383	303	95	18	chr3	124364811	124365033	-35234750	-	MER31-int	LTR	ERV1	-3972	964	726	5
1533	275	345	75	37	chr3	124365812	124365999	-35233784	-	MER67C	LTR	ERV1	-313	398	205	5
1533	3479	28	0	0	chr3	124367599	124367995	-35231788	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1533	340	222	189	0	chr3	124372794	124372884	-35226899	+	ORR1D2	LTR	MaLR	256	362	-8	5
1533	641	253	66	83	chr3	124375340	124375629	-35224154	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2670	2852	2569	6
1533	2965	78	8	0	chr3	124375935	124376330	-35223453	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	3	6
1533	2176	90	26	0	chr3	124378073	124378384	-35221399	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	6
1534	342	175	111	12	chr3	124388279	124388360	-35211423	+	MER67D	LTR	ERV1	50	138	-376	6
1534	2481	91	147	21	chr3	124390392	124390820	-35208963	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	6
1534	1520	254	90	62	chr3	124404009	124404611	-35195172	+	RLTR40	LTR	ERVK	19	670	-147	6
1534	303	243	37	46	chr3	124404642	124404724	-35195059	+	RLTR40	LTR	ERVK	671	754	-63	6
1534	2480	45	45	0	chr3	124428203	124428515	-35171268	-	IAPLTR3	LTR	ERVK	0	326	1	6
1534	1472	196	77	19	chr3	124435482	124435840	-35163943	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	394	6	6
1534	387	271	45	30	chr3	124436426	124436559	-35163224	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-943	4814	4680	6
1534	648	337	75	69	chr3	124436662	124437386	-35162397	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1112	4602	3875	6
1534	279	310	114	23	chr3	124437582	124437757	-35162026	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2083	3674	3484	6
1534	453	290	122	67	chr3	124437842	124438282	-35161501	+	RLTR11B	LTR	ERVK	11	526	-2	7
1534	812	317	106	29	chr3	124438571	124439155	-35160628	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2409	3348	2720	6
1534	485	301	66	10	chr3	124440125	124440323	-35159460	-	MTEb	LTR	MaLR	-12	367	159	7
1534	1132	195	27	77	chr3	124447587	124447887	-35151896	-	RLTR15	LTR	ERVK	-32	327	43	7
1534	2395	97	78	10	chr3	124449978	124450363	-35149420	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	7
1534	542	342	29	95	chr3	124460904	124461250	-35138533	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	57	7
1534	260	228	37	149	chr3	124461677	124461811	-35137972	+	RMER12	LTR	ERVK	743	861	-461	7
1534	577	325	21	129	chr3	124462657	124462943	-35136840	-	MTE2a	LTR	MaLR	-122	257	3	7
1534	3177	187	5	13	chr3	124463270	124463871	-35135912	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	45	640	-1323	7
1534	478	283	43	184	chr3	124463913	124464212	-35135571	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	257	-327	7
1534	4532	196	67	103	chr3	124464097	124465382	-35134401	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	711	1948	-15	7
1534	643	186	121	0	chr3	124465386	124465526	-35134257	+	ORR1A2	LTR	MaLR	98	254	-140	7
1534	650	120	20	0	chr3	124465524	124465624	-35134159	+	ORR1A2	LTR	MaLR	224	325	-2	7
1534	2006	77	28	16	chr3	124466663	124466981	-35132802	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	7
1534	14504	131	22	14	chr3	124466981	124469557	-35130226	+	ETnERV-int	LTR	ERVK	1	2479	-3688	7
1534	434	90	0	0	chr3	124469558	124469625	-35130158	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-255	67	1	7
1534	710	318	13	9	chr3	124479360	124479585	-35120198	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1338	242	17	7
1534	438	321	204	11	chr3	124479802	124480081	-35119702	-	MTEb	LTR	MaLR	-35	344	12	7
1534	929	285	16	8	chr3	124480081	124480325	-35119458	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	174	7
1534	244	347	83	64	chr3	124486914	124487071	-35112712	+	ORR1D2	LTR	MaLR	206	365	-5	8
1534	422	177	39	200	chr3	124491106	124491261	-35108522	+	RLTR23	LTR	ERV1	6	135	-295	8
1534	741	278	73	45	chr3	124491292	124491605	-35108178	+	RLTR23	LTR	ERV1	109	430	0	8
1534	1434	228	57	20	chr3	124502151	124502505	-35097278	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	369	-5	6
1534	366	288	119	15	chr3	124509163	124509364	-35090419	-	MLT-int	LTR	MaLR	-134	1601	1428	1
1534	1145	272	72	18	chr3	124509865	124510198	-35089585	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-19	351	1	1
1534	1774	306	63	11	chr3	124510198	124510757	-35089026	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	783	1
1534	629	269	157	26	chr3	124512801	124513030	-35086753	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	261	-113	2
1535	2904	84	80	22	chr3	124531423	124531872	-35067911	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
1535	3531	92	13	25	chr3	124531874	124532676	-35067107	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	662	-5819	5
1535	939	59	0	0	chr3	124532676	124532795	-35066988	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1477	-5004	5
1535	1837	100	12	0	chr3	124532790	124533041	-35066742	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2244	2497	-5183	5
1535	14175	59	10	3	chr3	124533059	124534849	-35064934	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4678	6479	-2	5
1535	2963	84	82	5	chr3	124534851	124535292	-35064491	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
1535	1878	191	29	8	chr3	124543755	124544141	-35055642	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	6
1535	349	234	36	11	chr3	124549513	124549617	-35050166	-	MTE2a	LTR	MaLR	-15	404	311	6
1535	1769	180	18	12	chr3	124553002	124553333	-35046450	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-5447	333	1	7
1535	2762	189	91	122	chr3	124553333	124553360	-35046423	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	711	7
1535	2762	189	91	122	chr3	124554081	124554486	-35045297	-	RMER19A	LTR	ERVK	-27	710	305	7
1535	2762	189	91	122	chr3	124555186	124555511	-35044272	-	RMER19A	LTR	ERVK	-433	304	5	7
1535	1273	226	0	43	chr3	124568651	124568910	-35030873	+	MTC	LTR	MaLR	1	247	-174	9
1535	2525	193	88	18	chr3	124568910	124569465	-35030318	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	49	9
1535	1746	182	47	72	chr3	124588545	124588989	-35010794	+	RMER17B	LTR	ERVK	2	434	-524	1
1535	2129	113	16	3	chr3	124588977	124589288	-35010495	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-11	346	32	1
1535	5440	94	6	10	chr3	124589298	124590080	-35009703	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	0	7513	6735	1
1535	3425	84	2	2	chr3	124590070	124590524	-35009259	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-1367	6214	5761	1
1535	3005	111	20	16	chr3	124590515	124590953	-35008830	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-1939	5642	5203	1
1535	544	91	47	66	chr3	124591208	124591314	-35008469	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4567	1
1535	424	86	0	0	chr3	124591311	124591369	-35008414	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-3782	3624	3567	1
1535	659	202	0	0	chr3	124591395	124591514	-35008269	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-4653	2753	2635	1
1535	421	223	98	0	chr3	124591630	124591742	-35008041	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5077	1060	938	1
1535	1602	186	107	48	chr3	124591747	124592228	-35007555	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4750	656	251	1
1535	294	165	0	108	chr3	124592340	124592442	-35007341	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-6629	952	862	1
1535	2743	177	82	81	chr3	124592464	124593228	-35006555	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-6748	765	1	1
1535	2459	93	26	3	chr3	124593233	124593579	-35006204	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-3	354	1	1
1535	3106	167	81	28	chr3	124593579	124594233	-35005550	+	RMER17B	LTR	ERVK	270	958	0	1
1535	461	188	0	12	chr3	124607214	124607300	-34992483	+	MT2A	LTR	ERVL	1	85	-448	1
1535	666	332	114	3	chr3	124626293	124626625	-34973158	-	MTEb	LTR	MaLR	-8	371	3	1
1535	1748	207	52	0	chr3	124630437	124630800	-34968983	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	1
1535	663	240	20	7	chr3	124635131	124635282	-34964501	-	RMER5	LTR	ERV1	-31	503	351	1
1535	401	167	0	14	chr3	124635284	124635357	-34964426	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-737	72	1	1
1535	811	230	68	42	chr3	124635370	124635606	-34964177	-	RMER5	LTR	ERV1	-222	312	71	1
1535	1799	192	7	117	chr3	124637499	124637942	-34961841	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
1535	597	299	68	80	chr3	124639565	124639816	-34959967	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-117	253	6	1
1535	256	328	0	49	chr3	124640095	124640217	-34959566	+	MLT1C	LTR	MaLR	352	467	0	1
1535	237	319	87	40	chr3	124642839	124642989	-34956794	+	RLTR21	LTR	ERVK	1085	1241	-331	1
1536	227	261	68	116	chr3	124651144	124651291	-34948492	+	ORR1B1	LTR	MaLR	186	325	-69	2
1536	375	405	69	20	chr3	124665151	124665501	-34934282	-	LTR80A	LTR	ERVL	-109	474	108	2
1536	347	305	42	0	chr3	124666677	124666795	-34932988	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	253	2
1536	785	248	128	32	chr3	124666797	124667184	-34932599	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	124	2
1536	295	298	123	68	chr3	124667374	124667536	-34932247	-	MTEa	LTR	MaLR	-175	184	14	2
1536	520	253	201	11	chr3	124676990	124677174	-34922609	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	684	2
1536	1326	206	10	42	chr3	124677430	124677718	-34922065	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	279	-332	2
1536	1692	229	63	0	chr3	124685874	124686241	-34913542	+	MTC	LTR	MaLR	1	390	-31	2
1536	300	324	120	57	chr3	124687675	124687992	-34911791	+	MLT1B	LTR	MaLR	54	390	0	2
1536	2094	228	70	24	chr3	124691165	124691749	-34908034	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	2
1536	1192	213	212	87	chr3	124692702	124693174	-34906609	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	1	2
1536	3789	195	104	65	chr3	124705374	124706231	-34893552	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	2
1536	1286	199	29	40	chr3	124713269	124713546	-34886237	+	RLTR46	LTR	ERVK	42	315	-5	2
1536	622	209	77	0	chr3	124713731	124713927	-34885856	+	IAPEY3-int	LTR	ERVK	535	745	-6935	2
1536	706	183	12	56	chr3	124714092	124714350	-34885433	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	74	503	-6039	2
1536	1122	97	6	3	chr3	124714350	124714537	-34885246	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	5460	5589	-1992	2
1536	875	94	0	0	chr3	124715164	124715281	-34884502	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	5583	5699	-1882	2
1536	3037	158	5	98	chr3	124715300	124715946	-34883837	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6849	7434	-147	2
1536	2604	58	0	0	chr3	124715948	124716260	-34883523	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1486	1797	-190	2
1536	684	123	0	0	chr3	124716285	124716391	-34883392	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7474	7579	-2	2
1536	1285	178	33	43	chr3	124716402	124716678	-34883105	+	RLTR46	LTR	ERVK	43	315	-5	2
1536	1370	204	43	227	chr3	124717265	124718013	-34881770	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	610	1	2
1536	650	204	7	21	chr3	124728740	124728880	-34870903	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	138	-236	3
1536	878	252	125	57	chr3	124730085	124730526	-34869257	+	RLTR12B	LTR	ERVK	11	481	-47	3
1536	790	212	32	62	chr3	124731746	124732079	-34867704	-	RMER2	LTR	ERV1	-142	425	4	3
1536	601	309	39	0	chr3	124747140	124747318	-34852465	+	MTD	LTR	MaLR	6	190	-229	3
1536	1214	248	120	30	chr3	124753582	124753948	-34845835	+	MTD	LTR	MaLR	18	416	-3	3
1536	349	207	19	124	chr3	124764865	124764970	-34834813	+	MTC	LTR	MaLR	1	94	-327	3
1536	370	374	6	17	chr3	124767586	124767763	-34832020	-	MLT1B	LTR	MaLR	-34	356	182	3
1536	1549	179	28	109	chr3	124769366	124769724	-34830059	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
1537	2809	90	29	17	chr3	124794107	124794524	-34805259	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	422	0	4
1537	1934	168	17	137	chr3	124797091	124797609	-34802174	-	RMER6A	LTR	ERVK	-81	675	220	4
1537	3628	48	35	4	chr3	124806265	124806437	-34793346	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	304	4
1537	3628	48	35	4	chr3	124806478	124806766	-34793017	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-172	303	2	4
1537	316	222	0	0	chr3	124808052	124808115	-34791668	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	297	4
1537	697	319	71	9	chr3	124808263	124808475	-34791308	-	ORR1E	LTR	MaLR	-132	227	3	4
1537	408	399	38	34	chr3	124808572	124808863	-34790920	-	LTR40a	LTR	ERVL	-154	365	74	4
1537	3385	163	94	11	chr3	124809252	124809910	-34789873	+	RMER6D	LTR	ERVK	3	715	-5	4
1537	2685	190	100	16	chr3	124809915	124810526	-34789257	+	RMER6-int	LTR	ERVK	1	662	-2515	4
1537	1028	196	41	98	chr3	124810639	124810980	-34788803	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	409	1	4
1537	5129	163	27	38	chr3	124811620	124812252	-34787531	+	RMER6-int	LTR	ERVK	650	1294	-1883	4
1537	5129	163	27	38	chr3	124812402	124812766	-34787017	+	RMER6-int	LTR	ERVK	1295	1635	-1542	4
1537	441	250	0	29	chr3	124812776	124812879	-34786904	+	RMER6D	LTR	ERVK	621	720	0	4
1537	1448	181	21	25	chr3	124814314	124814598	-34785185	+	RMER20B	LTR	ERVK	13	295	-332	4
1537	933	280	43	43	chr3	124815226	124815528	-34784255	+	RMER20B	LTR	ERVK	282	583	-44	4
1537	3068	63	2	8	chr3	124817596	124817994	-34781789	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1537	1738	152	122	10	chr3	124822847	124823186	-34776597	+	ORR1B1	LTR	MaLR	17	386	-8	4
1537	4598	194	53	7	chr3	124823190	124823469	-34776314	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	286	-1223	4
1537	4598	194	53	7	chr3	124823557	124824284	-34775499	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	287	1052	-457	4
1537	707	109	8	25	chr3	124825491	124825613	-34774170	+	RLTR15	LTR	ERVK	2	121	-238	4
1537	4164	101	36	95	chr3	124825645	124826443	-34773340	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	4
1537	483	301	90	35	chr3	124827473	124827728	-34772055	+	RMER5	LTR	ERV1	68	336	-198	4
1537	1906	166	139	85	chr3	124835909	124836463	-34763320	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	1	584	-70	4
1537	371	227	45	9	chr3	124837410	124837521	-34762262	+	RLTR10A	LTR	ERVK	133	247	-164	4
1537	488	244	145	51	chr3	124837596	124837851	-34761932	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	133	4
1537	253	342	155	19	chr3	124838120	124838267	-34761516	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	296	4
1537	2099	65	236	3	chr3	124838267	124838577	-34761206	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	-3	382	1	4
1537	2954	65	19	2	chr3	124844525	124844939	-34754844	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	4
1537	1551	188	12	61	chr3	124847015	124847361	-34752422	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
1537	1380	207	38	54	chr3	124849499	124849943	-34749840	-	RMER6A	LTR	ERVK	-38	718	355	4
1537	624	177	33	5	chr3	124851781	124851962	-34747821	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	103	4
1537	635	174	11	16	chr3	124852301	124852466	-34747317	-	MTB	LTR	MaLR	-244	163	1	4
1537	725	277	40	156	chr3	124852721	124852935	-34746848	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	183	-196	4
1537	2819	91	71	49	chr3	124852935	124853443	-34746340	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	4
1537	725	277	40	156	chr3	124853443	124853651	-34746132	+	MTE2a	LTR	MaLR	184	379	0	4
1537	1900	266	14	64	chr3	124855978	124856541	-34743242	+	RMER19C	LTR	ERVK	77	611	0	5
1537	303	284	73	10	chr3	124856904	124857000	-34742783	-	MTD	LTR	MaLR	-44	375	274	5
1537	2142	154	20	84	chr3	124857000	124857488	-34742295	-	RMER6B	LTR	ERVK	-4	457	1	5
1537	13562	165	57	57	chr3	124857491	124860100	-34739683	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1195	7764	5051	5
1537	13562	165	57	57	chr3	124860160	124860200	-34739583	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-3909	5050	5010	5
1537	13562	165	57	57	chr3	124860256	124860435	-34739348	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-1195	5009	4820	5
1537	560	217	17	101	chr3	124860435	124860614	-34739169	+	RMER10B	LTR	ERVL	179	342	-56	5
1537	353	184	0	75	chr3	124860704	124860798	-34738985	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4202	4757	4671	5
1537	287	225	62	12	chr3	124860812	124860893	-34738890	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-4262	4697	4613	5
1537	876	214	15	25	chr3	124860890	124861091	-34738692	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2261	2999	2801	5
1537	2435	209	18	107	chr3	124862072	124862247	-34737536	+	RMER15	LTR	ERVL	5	159	-416	5
1537	2435	209	18	107	chr3	124862556	124863007	-34736776	+	RMER15	LTR	ERVL	160	575	0	5
1537	2196	250	48	75	chr3	124864489	124865246	-34734537	+	RLTR40	LTR	ERVK	8	743	-74	5
1537	1038	243	145	39	chr3	124866621	124866959	-34732824	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1537	975	278	66	21	chr3	124869089	124869376	-34730407	+	MTE2b	LTR	MaLR	68	367	-12	5
1537	329	323	134	91	chr3	124869571	124869847	-34729936	+	MTEb	LTR	MaLR	27	314	-65	5
1537	289	287	162	42	chr3	124874475	124874752	-34725031	+	MLT1C	LTR	MaLR	53	465	-2	5
1537	3434	221	130	29	chr3	124884274	124884994	-34714789	+	RMER12	LTR	ERVK	1	767	-555	5
1537	3434	226	130	42	chr3	124885049	124885570	-34714213	+	RMER12	LTR	ERVK	768	1135	-187	5
1537	4125	99	29	89	chr3	124885570	124886369	-34713414	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	5
1537	638	272	117	77	chr3	124901891	124902067	-34697716	+	MTD	LTR	MaLR	2	201	-218	5
1537	638	272	117	77	chr3	124902109	124902334	-34697449	+	MTD	LTR	MaLR	202	419	0	5
1537	2804	177	97	14	chr3	124904914	124905551	-34694232	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1537	799	197	241	72	chr3	124908666	124908931	-34690852	-	RLTR24	LTR	ERV1	-1	528	219	5
1537	277	354	57	24	chr3	124908952	124909198	-34690585	-	RLTR15	LTR	ERVK	-8	351	98	5
1537	238	217	93	19	chr3	124909306	124909414	-34690369	-	RLTR15	LTR	ERVK	-221	138	23	5
1537	1154	140	17	0	chr3	124909424	124909602	-34690181	-	RLTR24	LTR	ERV1	-348	181	1	5
1538	1362	325	99	64	chr3	124921701	124921978	-34677805	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-477	893	592	5
1538	1362	325	99	64	chr3	124922338	124922845	-34676938	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-779	591	81	5
1538	757	258	51	48	chr3	124923009	124923338	-34676445	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	378	1	5
1538	316	351	89	20	chr3	124923429	124923689	-34676094	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-227	293	15	5
1538	273	364	35	88	chr3	124925369	124925595	-34674188	+	LTR68	LTR	ERV1	41	254	-486	6
1538	1391	227	186	105	chr3	124930894	124931297	-34668486	-	RMER6D	LTR	ERVK	-4	716	355	6
1538	1391	227	186	105	chr3	124931370	124931616	-34668167	-	RMER6D	LTR	ERVK	-366	354	14	6
1538	292	368	52	36	chr3	124932351	124932599	-34667184	+	MER67D	LTR	ERV1	235	486	-28	6
1538	3966	113	17	3	chr3	124935161	124935737	-34664046	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	6
1538	1669	197	45	58	chr3	124935813	124936191	-34663592	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	373	-11	6
1538	1402	154	15	4	chr3	124940280	124940540	-34659243	+	BGLII	LTR	ERVK	159	421	0	6
1538	2245	241	47	80	chr3	124940545	124941283	-34658500	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	714	-6	6
1538	3023	69	10	2	chr3	124946156	124946549	-34653234	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1538	5861	138	69	19	chr3	124946551	124947633	-34652150	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	5	1140	-118	6
1538	354	59	20	0	chr3	124948437	124948488	-34651295	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1047	1098	0	6
1538	2830	84	37	0	chr3	124948488	124948870	-34650913	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1538	585	314	170	28	chr3	124951110	124951428	-34648355	-	MTD	LTR	MaLR	-39	380	18	6
1538	336	276	73	153	chr3	124951443	124951893	-34647890	-	RMER10A	LTR	ERVL	-28	414	1	6
1538	2296	211	146	29	chr3	124953860	124954519	-34645264	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	736	-1	6
1538	3786	125	104	31	chr3	124960183	124960934	-34638849	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	4	6
1538	1828	254	22	36	chr3	124961780	124962363	-34637420	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	6
1538	707	247	0	18	chr3	124973667	124973836	-34625947	-	RLTR16	LTR	ERVK	-105	400	235	6
1538	639	211	52	8	chr3	124976610	124976744	-34623039	+	ORR1B1	LTR	MaLR	255	394	0	6
1538	321	265	76	38	chr3	124986577	124986734	-34613049	-	ORR1E	LTR	MaLR	-38	332	170	6
1538	398	279	62	78	chr3	124986927	124987059	-34612724	-	ORR1E	LTR	MaLR	-215	144	16	6
1538	602	314	39	29	chr3	124988144	124988412	-34611371	+	RMER15	LTR	ERVL	253	523	-52	6
1538	540	272	71	6	chr3	124989915	124990085	-34609698	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	181	-193	7
1538	413	327	88	6	chr3	124990368	124990528	-34609255	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-638	732	560	6
1538	468	219	73	32	chr3	124990524	124990647	-34609136	+	ORR1D1	LTR	MaLR	243	370	-4	7
1538	386	147	80	0	chr3	124990651	124990726	-34609057	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	81	-1289	7
1538	884	267	162	16	chr3	125000706	125001026	-34598757	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	53	2
1538	566	243	137	115	chr3	125009268	125009572	-34590211	+	MTC	LTR	MaLR	80	411	-8	2
1538	2290	164	13	3	chr3	125009649	125010039	-34589744	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1538	806	305	48	21	chr3	125014673	125014964	-34584819	-	MTEa	LTR	MaLR	-74	305	7	3
1538	639	296	161	16	chr3	125015213	125015467	-34584316	-	ORR1E	LTR	MaLR	-64	295	5	3
1538	1987	206	50	5	chr3	125021079	125021478	-34578305	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	1	4
1538	693	245	59	86	chr3	125021511	125021766	-34578017	-	MTD	LTR	MaLR	-161	258	11	4
1538	1071	276	85	85	chr3	125021775	125021933	-34577850	-	MTD-int	LTR	MaLR	-4	1254	1088	4
1538	1071	276	85	85	chr3	125022115	125022514	-34577269	-	MTD-int	LTR	MaLR	-171	1087	695	4
1538	734	304	188	8	chr3	125022514	125022769	-34577014	+	MTD	LTR	MaLR	1	301	-118	4
1538	1194	212	70	151	chr3	125022785	125022943	-34576840	-	MTD	LTR	MaLR	-10	409	276	4
1538	1194	212	70	151	chr3	125023256	125023267	-34576516	-	MTD	LTR	MaLR	-144	275	275	4
1538	1194	212	70	151	chr3	125023304	125023578	-34576205	-	MTD	LTR	MaLR	-144	275	1	4
1538	284	345	146	12	chr3	125031789	125032082	-34567701	+	MLT1B	LTR	MaLR	4	383	-84	6
1538	392	284	8	49	chr3	125033779	125033901	-34565882	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	314	6
1539	584	279	88	8	chr3	125049930	125050169	-34549614	+	RMER15	LTR	ERVL	27	284	-291	7
1539	1010	294	63	17	chr3	125050179	125050529	-34549254	+	RMER15	LTR	ERVL	210	575	0	7
1539	1122	200	71	163	chr3	125060752	125061158	-34538625	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	374	0	9
1539	3177	273	113	25	chr3	125061158	125062417	-34537366	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	1370	0	9
1539	1069	268	48	103	chr3	125062417	125062609	-34537174	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	170	-214	9
1539	1069	268	48	103	chr3	125062690	125062896	-34536887	+	ORR1D1	LTR	MaLR	171	377	-7	9
1539	765	341	12	19	chr3	125065708	125066028	-34533755	-	MLT1C	LTR	MaLR	-149	318	1	9
1539	2813	64	0	0	chr3	125083872	125084218	-34515565	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
1539	695	314	121	36	chr3	125085768	125086181	-34513602	+	MT2A	LTR	ERVL	1	448	-85	1
1539	609	189	25	117	chr3	125092483	125092645	-34507138	+	MTD	LTR	MaLR	95	241	-178	1
1539	1977	166	24	16	chr3	125143635	125144008	-34455775	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	3	2
1539	1527	214	107	38	chr3	125145058	125145452	-34454331	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1539	404	232	0	104	chr3	125145847	125145972	-34453811	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	153	2
1539	566	90	90	0	chr3	125150280	125150369	-34449414	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	379	2
1539	473	243	207	33	chr3	125150509	125150722	-34449061	+	RLTR18	LTR	ERVK	366	615	-1	2
1539	2383	193	32	12	chr3	125153680	125154184	-34445599	-	RMER5	LTR	ERV1	-8	526	13	2
1540	872	278	153	32	chr3	125176829	125177175	-34422608	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	2
1540	1055	288	70	35	chr3	125180838	125181241	-34418542	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	2
1540	353	264	65	21	chr3	125191074	125191167	-34408616	-	RMER10A	LTR	ERVL	-28	414	318	2
1540	266	328	69	23	chr3	125191988	125192119	-34407664	+	MLT1B	LTR	MaLR	248	384	-6	2
1540	239	309	70	39	chr3	125199137	125199265	-34400518	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	133	2
1540	275	308	97	53	chr3	125203974	125204026	-34395757	-	LTR80A	LTR	ERVL	-261	322	271	3
1540	3399	45	33	9	chr3	125204026	125204452	-34395331	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	3
1540	275	308	97	53	chr3	125204452	125204646	-34395137	-	LTR80A	LTR	ERVL	-313	270	65	3
1540	512	367	60	16	chr3	125204794	125205110	-34394673	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-1949	3765	3436	3
1540	1116	320	43	10	chr3	125205564	125205981	-34393802	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2795	2919	2489	3
1540	855	323	73	98	chr3	125206133	125206655	-34393128	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	25	3
1540	509	324	117	41	chr3	125206666	125207181	-34392602	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3881	1833	1280	3
1540	962	333	45	51	chr3	125207678	125208384	-34391399	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-5011	703	2	3
1540	318	255	18	64	chr3	125208457	125208566	-34391217	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-180	376	273	3
1540	354	221	116	0	chr3	125208643	125208738	-34391045	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-449	107	2	3
1540	1131	197	128	18	chr3	125209048	125209322	-34390461	+	RMER12	LTR	ERVK	37	340	-982	3
1540	3564	220	50	52	chr3	125209421	125210404	-34389379	+	RMER12	LTR	ERVK	307	1807	-41	3
1540	3221	43	5	5	chr3	125210538	125210934	-34388849	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1540	8683	51	13	0	chr3	125210934	125212018	-34387765	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
1540	3072	36	8	3	chr3	125212018	125212405	-34387378	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	389	-7	3
1540	1533	176	124	17	chr3	125225475	125225822	-34373961	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	24	407	0	3
1540	458	325	38	11	chr3	125227953	125228161	-34371622	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-12	604	291	3
1540	321	240	10	40	chr3	125228165	125228265	-34371518	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	313	3
1540	1427	200	40	117	chr3	125228682	125229084	-34370699	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	16	3
1540	933	293	33	73	chr3	125232631	125232999	-34366784	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	3
1540	269	254	81	73	chr3	125243706	125243829	-34355954	+	ORR1D1	LTR	MaLR	229	352	-22	3
1540	263	368	104	45	chr3	125282368	125282789	-34316994	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-59	501	56	4
1540	518	363	77	6	chr3	125292089	125292438	-34307345	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	4	4
1540	877	278	47	47	chr3	125296497	125296795	-34302988	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	117	4
1540	2525	259	74	66	chr3	125296770	125297674	-34302109	-	MTD-int	LTR	MaLR	-347	911	1	4
1540	239	185	37	0	chr3	125297674	125297728	-34302055	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	364	4
1540	605	208	114	42	chr3	125297929	125298095	-34301688	-	MTD	LTR	MaLR	-47	372	195	4
1540	1539	216	28	3	chr3	125298823	125299148	-34300635	+	MTC	LTR	MaLR	1	333	-88	4
1540	1770	172	35	41	chr3	125299765	125300134	-34299649	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1541	254	274	103	59	chr3	125310988	125311124	-34288659	-	RMER12	LTR	ERVK	-669	653	512	4
1541	262	272	9	104	chr3	125330117	125330232	-34269551	+	MT2B	LTR	ERVL	155	258	-343	4
1541	745	274	149	24	chr3	125331901	125332230	-34267553	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
1541	2390	275	58	48	chr3	125342691	125343574	-34256209	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-520	850	3	4
1541	513	149	193	24	chr3	125343575	125343705	-34256078	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	374	204	4
1541	903	240	84	108	chr3	125347323	125347702	-34252081	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
1541	2147	245	23	37	chr3	125354039	125354551	-34245232	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-7	505	1	5
1541	584	199	19	10	chr3	125355963	125356095	-34243688	+	ORR1D2	LTR	MaLR	253	378	-1	5
1541	246	320	58	10	chr3	125358844	125358948	-34240835	+	MTEb	LTR	MaLR	247	355	-24	5
1541	6320	72	10	0	chr3	125359083	125359883	-34239900	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	5
1541	430	308	38	8	chr3	125360388	125360519	-34239264	+	RLTR41	LTR	ERV1	264	398	-48	5
1541	844	250	136	11	chr3	125361233	125361512	-34238271	+	RMER21B	LTR	ERV1	254	567	-275	5
1541	1255	173	114	68	chr3	125363096	125363195	-34236588	-	RMER17C	LTR	ERVK	-26	384	287	5
1541	1255	173	114	68	chr3	125363224	125363491	-34236292	-	RMER17C	LTR	ERVK	-124	286	1	5
1541	3185	169	61	95	chr3	125372987	125373367	-34226416	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	348	-372	5
1541	3185	169	61	95	chr3	125373404	125373760	-34226023	+	RMER6D	LTR	ERVK	349	712	-8	5
1541	1189	218	167	66	chr3	125383673	125384188	-34215595	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	5
1541	241	290	42	28	chr3	125395111	125395182	-34204601	-	RMER17B	LTR	ERVK	-185	773	702	5
1541	3846	188	93	38	chr3	125405227	125406025	-34193758	+	RMER21B	LTR	ERV1	1	842	0	5
1541	1245	243	105	20	chr3	125409043	125409396	-34190387	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	23	5
1541	406	315	109	55	chr3	125409996	125410271	-34189512	-	RLTR26	LTR	ERVK	-184	458	169	5
1541	910	237	63	5	chr3	125413852	125414043	-34185740	-	MTC	LTR	MaLR	-203	218	17	5
1541	1290	244	72	157	chr3	125418008	125418606	-34181177	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	29	6
1541	1288	241	101	48	chr3	125419085	125419503	-34180280	-	RMER19B	LTR	ERVK	-2	900	461	6
1541	1024	235	35	103	chr3	125419541	125419831	-34179952	-	RMER19B	LTR	ERVK	-332	279	10	6
1541	486	325	103	46	chr3	125419848	125420091	-34179692	-	MLT1G	LTR	MaLR	-56	539	287	6
1541	256	328	146	47	chr3	125420124	125420316	-34179467	-	MLT1G	LTR	MaLR	-381	214	4	6
1541	886	266	142	44	chr3	125424094	125424552	-34175231	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	504	-20	6
1541	1428	208	75	32	chr3	125425389	125425791	-34173992	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1541	919	330	97	34	chr3	125431986	125432462	-34167321	-	LTR53	LTR	ERVL	-11	508	3	6
1542	313	329	168	60	chr3	125436278	125436611	-34163172	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-36	1351	983	6
1542	1556	160	18	11	chr3	125437511	125437789	-34161994	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	280	-87	6
1542	1272	204	48	17	chr3	125441970	125442418	-34157365	+	RMER15	LTR	ERVL	30	553	-22	6
1542	515	236	6	6	chr3	125442437	125442606	-34157177	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1	233	-4766	6
1542	412	189	132	0	chr3	125442835	125442941	-34156842	+	RMER15-int	LTR	ERVL	512	631	-4368	6
1542	3798	274	72	17	chr3	125442923	125444070	-34155713	+	RMER15-int	LTR	ERVL	752	1961	-3038	6
1542	1409	261	135	28	chr3	125444309	125444805	-34154978	+	RMER15	LTR	ERVL	27	575	0	6
1542	316	279	97	16	chr3	125446034	125446158	-34153625	+	RMER15	LTR	ERVL	427	560	-15	6
1542	622	243	132	206	chr3	125453099	125453335	-34146448	+	MTE2b	LTR	MaLR	11	252	-127	6
1542	622	243	132	206	chr3	125453528	125453685	-34146098	+	MTE2b	LTR	MaLR	253	375	-4	6
1542	492	327	13	25	chr3	125453750	125453907	-34145876	+	MTE-int	LTR	MaLR	251	405	-1175	6
1542	1140	323	113	37	chr3	125453958	125454550	-34145233	+	MTE-int	LTR	MaLR	611	1247	-333	6
1542	798	271	163	16	chr3	125454785	125455036	-34144747	+	MTE2a	LTR	MaLR	80	367	-12	6
1542	649	283	53	19	chr3	125457776	125457985	-34141798	+	MTEa	LTR	MaLR	156	371	-8	6
1542	1918	139	95	67	chr3	125458925	125459387	-34140396	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	6
1542	848	119	42	7	chr3	125468511	125468655	-34131128	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	745	893	0	6
1542	354	230	0	13	chr3	125470280	125470355	-34129428	+	MTD	LTR	MaLR	8	81	-338	6
1542	421	282	16	8	chr3	125470334	125470459	-34129324	-	MTD	LTR	MaLR	-293	126	1	6
1542	425	213	26	53	chr3	125470459	125470573	-34129210	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	1148	6
1542	2063	116	29	0	chr3	125478930	125479240	-34120543	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	6
1542	4769	145	73	31	chr3	125481380	125482291	-34117492	-	RMER17B	LTR	ERVK	-8	950	1	6
1542	362	372	37	37	chr3	125487231	125487530	-34112253	-	MLT1B	LTR	MaLR	-21	369	71	6
1542	796	307	81	62	chr3	125492295	125492825	-34106958	-	RMER13A	LTR	ERVK	-337	571	2	6
1542	3457	192	112	64	chr3	125497196	125498045	-34101738	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	890	-12	7
1542	932	274	132	31	chr3	125504006	125504323	-34095460	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	22	5
1542	1467	192	133	9	chr3	125504327	125504719	-34095064	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-39	1541	981	5
1542	515	320	120	34	chr3	125504920	125505211	-34094572	-	MTE-int	LTR	MaLR	-464	1116	801	7
1542	1875	192	44	31	chr3	125509552	125510009	-34089774	-	RMER6A	LTR	ERVK	-12	744	282	1
1542	621	181	31	0	chr3	125510257	125510384	-34089399	-	RMER6A	LTR	ERVK	-442	314	184	1
1542	624	110	359	0	chr3	125511204	125511349	-34088434	-	RMER6A	LTR	ERVK	-523	197	1	1
1542	259	288	95	9	chr3	125517876	125517981	-34081802	+	MLT1C	LTR	MaLR	9	122	-345	2
1542	630	268	137	29	chr3	125528934	125529276	-34070507	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	3
1542	353	321	66	30	chr3	125533481	125533648	-34066135	+	MLT1A0	LTR	MaLR	66	238	-127	4
1542	299	383	48	6	chr3	125537163	125537331	-34062452	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-1201	186	12	5
1542	1685	186	66	64	chr3	125537596	125538080	-34061703	+	RMER6C	LTR	ERVK	119	603	-87	5
1542	1192	211	193	76	chr3	125539696	125540172	-34059611	+	MT2A	LTR	ERVL	1	532	-1	5
1542	257	305	55	104	chr3	125540466	125540649	-34059134	+	MLT1E	LTR	MaLR	131	304	-349	5
1542	351	293	139	33	chr3	125540656	125540836	-34058947	+	MLT1D	LTR	MaLR	132	330	-175	5
1542	347	287	62	54	chr3	125541395	125541524	-34058259	+	MLT1D	LTR	MaLR	343	472	-33	5
1542	696	275	105	117	chr3	125550699	125550804	-34048979	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	104	-326	7
1542	696	275	105	117	chr3	125550826	125551148	-34048635	+	RLTR23	LTR	ERV1	105	430	0	7
1542	1232	250	162	8	chr3	125553620	125553983	-34045800	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	8
1542	279	200	20	0	chr3	125565819	125565869	-34033914	-	RMER15	LTR	ERVL	-13	562	512	1
1543	396	322	55	40	chr3	125573870	125574186	-34025597	+	MTEa	LTR	MaLR	2	379	0	1
1543	1043	182	60	37	chr3	125591664	125591881	-34007902	-	MTC	LTR	MaLR	-57	364	143	1
1543	904	207	32	69	chr3	125598427	125598878	-34000905	+	RMER17C	LTR	ERVK	77	435	-523	1
1543	939	301	18	56	chr3	125600024	125600418	-33999365	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	1
1543	294	272	47	109	chr3	125643298	125643426	-33956357	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	279	1
1543	374	289	48	53	chr3	125653354	125653562	-33946221	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4150	1372	1166	2
1543	374	173	36	24	chr3	125655550	125655633	-33944150	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	336	2
1543	590	276	18	18	chr3	125655634	125655800	-33943983	-	MTD	LTR	MaLR	-253	166	1	2
1543	374	327	23	58	chr3	125657591	125657763	-33942020	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-385	169	4	2
1543	478	167	0	12	chr3	125658530	125658615	-33941168	-	MTC	LTR	MaLR	-337	84	1	2
1543	2753	169	37	16	chr3	125658967	125659391	-33940392	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	441	-83	2
1543	2427	68	68	0	chr3	125659391	125659715	-33940068	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	2
1543	2753	169	37	16	chr3	125659715	125659801	-33939982	+	RLTR28	LTR	ERVL	442	522	-2	2
1543	1314	279	10	13	chr3	125673920	125674229	-33925554	+	MTEb	LTR	MaLR	69	376	-3	2
1543	611	336	134	75	chr3	125680727	125681152	-33918631	+	MER70A	LTR	ERVL	3	452	-20	2
1543	840	361	46	35	chr3	125686429	125686883	-33912900	-	MT2A	LTR	ERVL	-74	459	1	2
1543	4222	287	82	43	chr3	125686885	125687839	-33911944	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	579	2
1543	4222	287	82	43	chr3	125688071	125688635	-33911148	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1002	578	1	2
1543	995	251	67	67	chr3	125688636	125689012	-33910771	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	3	2
1543	718	242	50	20	chr3	125689343	125689545	-33910238	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-301	226	19	2
1543	746	298	100	74	chr3	125691842	125692222	-33907561	-	MER73	LTR	ERVL	0	644	255	2
1544	1392	269	54	8	chr3	125700189	125700575	-33899208	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	2
1544	1042	332	74	37	chr3	125701312	125701910	-33897873	+	MER73	LTR	ERVL	14	633	-11	2
1544	225	302	85	17	chr3	125706762	125706880	-33892903	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-43	765	640	2
1544	246	188	225	45	chr3	125707533	125707622	-33892161	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-1009	105	1	2
1544	262	318	47	0	chr3	125714118	125714203	-33885580	+	MLT1D	LTR	MaLR	3	91	-414	3
1544	1017	297	34	0	chr3	125714331	125714600	-33885183	+	ORR1D2	LTR	MaLR	24	301	-69	3
1544	1692	269	58	61	chr3	125715129	125715866	-33883917	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	735	-82	3
1544	2562	214	119	58	chr3	125718830	125719948	-33879835	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	1103	0	3
1544	2472	183	29	118	chr3	125730185	125730940	-33868843	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	690	0	3
1544	555	222	96	34	chr3	125732611	125732788	-33866995	+	RLTR40	LTR	ERVK	482	669	-148	3
1544	516	152	0	10	chr3	125732760	125732860	-33866923	+	RLTR40	LTR	ERVK	584	682	-135	3
1544	2854	9	0	0	chr3	125733040	125733362	-33866421	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
1544	42300	15	3	3	chr3	125733362	125738206	-33861577	+	MMETn-int	LTR	ERVK	1	4844	0	3
1544	2856	12	0	0	chr3	125738206	125738528	-33861255	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
1544	514	176	10	19	chr3	125738784	125738888	-33860895	+	RLTR40	LTR	ERVK	708	810	-7	3
1544	1130	223	0	9	chr3	125740483	125740696	-33859087	+	MTC	LTR	MaLR	211	421	0	3
1544	853	333	101	16	chr3	125741278	125741705	-33858078	-	MLT1C	LTR	MaLR	-4	463	1	3
1544	237	389	26	0	chr3	125741709	125741822	-33857961	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-204	476	361	3
1544	253	234	16	0	chr3	125741959	125742023	-33857760	+	MLT1C	LTR	MaLR	72	136	-331	3
1544	848	326	26	11	chr3	125742035	125742299	-33857484	+	MLT1C	LTR	MaLR	200	467	0	3
1544	1375	170	163	72	chr3	125743075	125743436	-33856347	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	3
1544	383	333	16	8	chr3	125743438	125743562	-33856221	+	LTR16A1	LTR	ERVL	1	125	-331	3
1544	944	282	4	27	chr3	125744307	125744566	-33855217	+	RLTR18B	LTR	ERVK	259	511	-1	3
1544	383	319	40	103	chr3	125748904	125749205	-33850578	+	MLT1F2	LTR	MaLR	67	348	-212	3
1544	533	271	45	50	chr3	125750921	125751119	-33848664	+	MLT1A0	LTR	MaLR	159	355	-10	3
1544	489	180	82	90	chr3	125752074	125752208	-33847575	-	RMER12	LTR	ERVK	-800	522	390	3
1544	1474	176	69	13	chr3	125752229	125752534	-33847249	-	RMER12	LTR	ERVK	-1000	322	1	3
1544	556	195	78	8	chr3	125752961	125753090	-33846693	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	390	527	0	3
1544	566	311	84	14	chr3	125755073	125755288	-33844495	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-58	350	121	3
1544	325	288	104	61	chr3	125759942	125760105	-33839678	+	MLT1E3	LTR	MaLR	175	344	-280	3
1544	2127	162	8	20	chr3	125762382	125762779	-33837004	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	392	-2	3
1544	527	311	59	46	chr3	125763194	125763554	-33836229	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	9	3
1544	1310	186	137	43	chr3	125780825	125781399	-33818384	+	RMER6C	LTR	ERVK	241	720	0	4
1544	1674	159	9	38	chr3	125783070	125783390	-33816393	+	RLTR28	LTR	ERVL	214	524	0	4
1544	1213	247	93	26	chr3	125783548	125783860	-33815923	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	333	-37	4
1544	1584	161	137	60	chr3	125787731	125788082	-33811701	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
1544	313	293	109	49	chr3	125790836	125791019	-33808764	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	181	4
1544	231	125	118	59	chr3	125791492	125791543	-33808240	-	MLT1A	LTR	MaLR	-410	57	4	4
1544	818	219	81	19	chr3	125792983	125793193	-33806590	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	197	4
1544	237	200	36	18	chr3	125794318	125794374	-33805409	-	MLT1A	LTR	MaLR	-46	328	272	4
1544	1246	231	167	78	chr3	125795826	125796058	-33803725	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1306	4
1544	3732	224	297	71	chr3	125796112	125796575	-33803208	-	RLTR21	LTR	ERVK	-267	1305	756	4
1544	3732	185	89	32	chr3	125796728	125797422	-33802361	-	RLTR21	LTR	ERVK	-817	755	17	4
1544	437	308	7	29	chr3	125803061	125803198	-33796585	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	271	4
1544	337	317	41	8	chr3	125803256	125803377	-33796406	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-281	127	3	4
1544	3994	60	0	23	chr3	125807572	125808087	-33791696	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	503	1	4
1544	490	237	172	10	chr3	125809029	125809221	-33790562	+	RMER5	LTR	ERV1	50	272	-262	4
1544	828	284	50	81	chr3	125818995	125819355	-33780428	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	352	-7	4
1544	332	309	129	8	chr3	125819358	125819482	-33780301	+	MLT1E	LTR	MaLR	464	602	-51	4
1544	275	289	65	22	chr3	125819885	125819977	-33779806	+	MLT1J	LTR	MaLR	61	156	-356	4
1544	356	351	68	45	chr3	125826553	125826918	-33772865	+	MLT1D	LTR	MaLR	50	480	-25	4
1544	3297	24	37	0	chr3	125828529	125828911	-33770872	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1545	2213	108	12	24	chr3	125830296	125830637	-33769146	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	4
1545	20327	47	65	14	chr3	125830637	125833270	-33766513	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	2774	-3707	4
1545	2943	25	0	0	chr3	125833268	125833625	-33766158	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4001	4357	-2124	4
1545	5828	52	12	12	chr3	125833616	125834387	-33765396	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5709	6479	-2	4
1545	2230	108	12	24	chr3	125834389	125834730	-33765053	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	4
1545	19322	49	65	14	chr3	125834730	125837363	-33762420	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	2774	-3707	4
1545	2943	25	0	0	chr3	125837361	125837718	-33762065	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4001	4357	-2124	4
1545	5828	52	12	12	chr3	125837709	125838480	-33761303	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5709	6479	-2	4
1545	2216	105	15	24	chr3	125838482	125838822	-33760961	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	4
1545	2364	225	12	65	chr3	125844282	125844886	-33754897	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	4	4
1545	432	277	93	26	chr3	125854290	125854483	-33745300	-	MER31B	LTR	ERV1	0	466	261	4
1545	952	333	144	25	chr3	125854964	125855450	-33744333	-	MTE-int	LTR	MaLR	-121	1459	916	4
1545	342	337	83	80	chr3	125855841	125856141	-33743642	-	MTE-int	LTR	MaLR	-704	876	576	4
1545	269	263	72	21	chr3	125857459	125857556	-33742227	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	278	4
1545	355	333	22	43	chr3	125858259	125858397	-33741386	-	MTEa	LTR	MaLR	-244	135	1	4
1545	264	308	40	122	chr3	125858432	125858580	-33741203	-	MER31B	LTR	ERV1	-229	237	102	4
1545	3706	16	121	0	chr3	125862163	125862602	-33737181	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	2	493	0	5
1545	45794	15	0	0	chr3	125862602	125867961	-33731822	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	5
1545	390	167	46	35	chr3	125867961	125868048	-33731735	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	5
1545	302	0	0	0	chr3	125868048	125868086	-33731697	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	5
1545	3783	7	121	0	chr3	125868086	125868526	-33731257	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1545	587	308	272	17	chr3	125874330	125874679	-33725104	-	MTE-int	LTR	MaLR	-533	1047	545	5
1545	1458	164	15	0	chr3	125880491	125880820	-33718963	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-1306	274	1	5
1545	2104	35	0	0	chr3	125880820	125881076	-33718707	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1537	5
1545	1631	31	0	0	chr3	125881080	125881275	-33718508	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	299	5
1545	460	260	0	0	chr3	125881273	125881377	-33718406	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-1474	106	3	5
1545	895	279	138	29	chr3	125881376	125881716	-33718067	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	1	5
1545	559	319	91	99	chr3	125888129	125888183	-33711600	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	305	5
1545	559	319	91	99	chr3	125888286	125888603	-33711180	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-66	304	2	5
1545	967	246	52	48	chr3	125888642	125888933	-33710850	-	MTE2a	LTR	MaLR	-56	323	32	5
1545	407	271	50	8	chr3	125896657	125896776	-33703007	-	LTR52	LTR	ERVL	-59	362	239	5
1545	347	286	66	55	chr3	125896802	125896983	-33702800	-	LTR52	LTR	ERVL	-238	183	1	5
1545	244	316	64	87	chr3	125902525	125902680	-33697103	+	MER76	LTR	ERVL	433	583	-108	5
1545	2293	206	83	30	chr3	125902680	125903210	-33696573	+	RMER15	LTR	ERVL	1	558	-17	5
1545	2134	272	48	40	chr3	125903221	125903825	-33695958	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4	612	-4387	5
1545	455	248	9	0	chr3	125903832	125903937	-33695846	+	RMER15-int	LTR	ERVL	758	863	-4136	5
1545	601	218	0	0	chr3	125903933	125904043	-33695740	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1406	1515	-3484	5
1545	1252	250	14	20	chr3	125904664	125904958	-33694825	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1727	2018	-2981	5
1545	1061	235	118	42	chr3	125914741	125915096	-33684687	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	384	0	5
1545	275	265	96	11	chr3	125916361	125916480	-33683303	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-374	141	5	5
1545	381	229	39	59	chr3	125916645	125916798	-33682985	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-180	5534	5385	5
1545	753	268	81	19	chr3	125916847	125917106	-33682677	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2113	3601	3327	5
1545	3019	153	71	35	chr3	125917715	125918484	-33681299	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-252	771	1	5
1545	829	258	66	11	chr3	125922113	125922387	-33677396	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2710	3004	2716	5
1545	2856	44	6	0	chr3	125922713	125923057	-33676726	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1545	302	266	129	14	chr3	125929167	125929364	-33670419	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	169	5
1545	856	217	4	193	chr3	125929441	125929721	-33670062	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	227	-675	5
1545	2467	194	64	13	chr3	125929726	125930255	-33669528	+	RMER19B	LTR	ERVK	340	895	-7	5
1545	271	217	40	68	chr3	125932518	125932592	-33667191	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-516	512	441	5
1545	268	268	128	104	chr3	125949531	125949656	-33650127	+	RMER12	LTR	ERVK	724	851	-471	6
1545	1169	202	21	0	chr3	125952299	125952536	-33647247	-	RLTR40	LTR	ERVK	-572	245	4	6
1545	797	187	111	89	chr3	125953407	125953677	-33646106	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	276	-335	6
1545	295	292	34	50	chr3	125953889	125954008	-33645775	-	MTEb	LTR	MaLR	-6	373	257	6
1545	2987	183	118	16	chr3	125954099	125954728	-33645055	-	RMER13A	LTR	ERVK	-165	695	3	6
1545	352	365	83	6	chr3	125957649	125957817	-33641966	+	MTE-int	LTR	MaLR	476	656	-924	6
1545	1579	298	86	55	chr3	125957833	125958472	-33641311	+	MTE-int	LTR	MaLR	744	1402	-178	6
1545	647	168	296	12	chr3	125958461	125958630	-33641153	+	RLTR42	LTR	ERVK	23	239	0	6
1545	765	190	79	35	chr3	125958644	125958846	-33640937	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	15	225	-5297	6
1545	772	233	5	85	chr3	125959202	125959413	-33640370	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	338	531	-4991	6
1545	352	232	12	0	chr3	125959507	125959589	-33640194	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	539	621	-4901	6
1545	828	210	57	36	chr3	125959587	125959780	-33640003	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	733	929	-4593	6
1546	464	223	94	83	chr3	125964723	125964904	-33634879	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1613	1795	-3727	6
1546	2004	157	75	129	chr3	125965440	125965904	-33633879	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1870	2301	-3221	6
1546	2004	157	75	129	chr3	125965980	125966158	-33633625	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2302	2477	-3045	6
1546	293	262	71	0	chr3	125966198	125966282	-33633501	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2478	2567	-2955	6
1546	13062	161	52	49	chr3	125970477	125972757	-33627026	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2589	4847	-675	6
1546	13062	161	52	49	chr3	125973317	125973960	-33625823	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	4848	5522	0	6
1546	1058	194	47	38	chr3	125973968	125974204	-33625579	+	RLTR42	LTR	ERVK	2	239	0	6
1546	300	246	96	103	chr3	125974240	125974376	-33625407	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1416	1550	-30	6
1546	773	297	57	91	chr3	125974380	125974732	-33625051	+	ORR1E	LTR	MaLR	15	354	-5	6
1546	820	301	82	8	chr3	125974757	125975025	-33624758	+	MLT1A0	LTR	MaLR	78	365	0	6
1546	314	308	128	50	chr3	125975026	125975199	-33624584	+	LTR50	LTR	ERVL	29	221	-574	6
1546	314	308	128	50	chr3	125976150	125976195	-33623588	+	LTR50	LTR	ERVL	222	264	-531	6
1546	377	279	9	9	chr3	125977175	125977280	-33622503	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	5095	5199	-118	6
1546	448	281	31	38	chr3	125977939	125978098	-33621685	+	RLTR14	LTR	ERV1	225	382	0	6
1546	2068	131	99	11	chr3	125983150	125983512	-33616271	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1546	2696	163	69	8	chr3	125989000	125989494	-33610289	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-4	524	1	6
1546	599	357	117	18	chr3	125993092	125993426	-33606357	-	LTR40b	LTR	ERVL	-2	460	94	6
1546	618	329	80	69	chr3	125994624	125995117	-33604666	-	MLT1B	LTR	MaLR	-7	460	3	6
1546	254	301	119	24	chr3	125996630	125996756	-33603027	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	138	-270	6
1546	251	270	66	57	chr3	125996778	125996884	-33602899	+	ORR1E	LTR	MaLR	90	196	-163	6
1546	3930	159	134	18	chr3	125997225	125997992	-33601791	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	856	-4	6
1546	396	255	28	0	chr3	125998019	125998125	-33601658	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-4525	1005	897	6
1546	980	290	64	39	chr3	125998640	125999028	-33600755	-	MLT2D	LTR	ERVL	-11	403	6	6
1546	243	258	97	0	chr3	126002498	126002560	-33597223	-	LTR40a	LTR	ERVL	0	519	452	3
1546	2327	156	49	33	chr3	126007015	126007458	-33592325	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	11	8
1546	1505	127	196	0	chr3	126007458	126007733	-33592050	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	9
1546	2117	198	46	0	chr3	126010530	126010925	-33588858	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	1
1546	3150	271	65	57	chr3	126018528	126019076	-33580707	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	550	-708	2
1546	1828	193	99	0	chr3	126019076	126019459	-33580324	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1546	3150	277	66	63	chr3	126019459	126020028	-33579755	+	MTC-int	LTR	MaLR	544	1098	0	2
1546	1754	220	76	3	chr3	126020059	126020442	-33579341	+	MTD	LTR	MaLR	9	419	0	2
1546	497	246	47	53	chr3	126023320	126023470	-33576313	-	MTEb	LTR	MaLR	-28	351	203	3
1546	728	227	46	55	chr3	126023524	126023743	-33576040	-	MTEb	LTR	MaLR	-162	217	1	3
1546	2257	42	93	10	chr3	126030537	126030850	-33568933	+	ORR1A1	LTR	MaLR	8	346	0	4
1546	2137	148	70	10	chr3	126037441	126037824	-33561959	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	406	-155	4
1546	681	195	5	99	chr3	126037911	126038122	-33561661	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	371	561	0	4
1546	344	368	9	86	chr3	126043503	126043723	-33556060	+	MLT1E1	LTR	MaLR	436	638	-16	5
1546	1709	259	213	0	chr3	126043927	126044397	-33555386	+	RMER15	LTR	ERVL	1	570	-5	5
1546	281	291	93	59	chr3	126048842	126049079	-33550704	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1149	1393	-4129	5
1546	341	279	237	33	chr3	126052051	126052296	-33547487	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-8	709	415	6
1546	4008	159	91	28	chr3	126052842	126053680	-33546103	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	929	0	6
1546	4090	52	79	0	chr3	126053979	126054498	-33545285	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	7
1546	1573	170	231	14	chr3	126057435	126057781	-33542002	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1546	410	351	13	13	chr3	126058532	126058688	-33541095	-	LTR78	LTR	ERV1	-1145	159	4	7
1546	2151	91	3	0	chr3	126059380	126059689	-33540094	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	112	7
1546	1909	160	86	3	chr3	126059797	126060136	-33539647	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	8
1546	249	339	148	66	chr3	126062620	126062952	-33536831	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	8
1546	881	137	74	88	chr3	126064136	126064352	-33535431	+	ORR1C2	LTR	MaLR	172	384	0	8
1546	818	244	35	53	chr3	126074003	126074345	-33525438	-	RLTR15	LTR	ERVK	-13	346	11	1
1546	258	227	26	26	chr3	126084837	126084914	-33514869	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	82	-292	1
1546	326	109	0	0	chr3	126089073	126089119	-33510664	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	341	1
1546	2100	159	3	6	chr3	126089129	126089470	-33510313	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	47	1
1546	1716	190	58	8	chr3	126089607	126089968	-33509815	+	RLTR30	LTR	ERV1	1	379	0	1
1547	3313	68	28	2	chr3	126091558	126091983	-33507800	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	1
1547	4226	100	3	0	chr3	126098576	126099156	-33500627	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	3	1
1547	459	259	61	83	chr3	126107762	126108040	-33491743	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	72	1
1547	411	204	17	50	chr3	126108029	126108148	-33491635	-	RLTR15	LTR	ERVK	-244	115	1	1
1547	264	292	155	26	chr3	126109244	126109476	-33490307	-	LTR37B	LTR	ERV1	-9	459	198	1
1547	394	294	170	59	chr3	126110255	126110526	-33489257	+	RMER15	LTR	ERVL	275	575	0	1
1547	307	340	96	51	chr3	126112294	126112525	-33487258	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-42	366	126	1
1547	1195	287	34	15	chr3	126119741	126120067	-33479716	+	MTE2b	LTR	MaLR	12	343	-36	1
1547	906	294	71	37	chr3	126120433	126120811	-33478972	-	MLT2D	LTR	ERVL	-3	411	21	1
1547	2468	69	0	21	chr3	126133066	126133406	-33466377	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	75	1
1547	1728	189	42	14	chr3	126145935	126146295	-33453488	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	1	1
1547	2908	227	90	60	chr3	126146330	126147197	-33452586	+	RMER13B	LTR	ERVK	5	897	-11	2
1547	1691	174	44	19	chr3	126153687	126154051	-33445732	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	373	-1	2
1547	350	247	11	21	chr3	126157429	126157524	-33442259	-	MTEa	LTR	MaLR	-31	348	255	2
1547	1090	291	58	16	chr3	126157837	126158201	-33441582	+	RMER20A	LTR	ERVK	133	511	-5	2
1547	958	287	73	38	chr3	126158306	126158650	-33441133	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	4	2
1547	410	287	25	27	chr3	126167270	126167425	-33432358	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	228	2
1547	691	138	43	0	chr3	126167438	126167554	-33432229	+	RMER4B	LTR	ERVK	465	585	0	2
1547	1444	176	15	200	chr3	126171233	126171688	-33428095	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	4	2
1547	432	278	70	54	chr3	126180734	126180884	-33418899	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	159	-200	2
1547	1107	199	199	31	chr3	126180884	126181041	-33418742	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	197	-181	2
1547	1107	199	199	31	chr3	126181121	126181285	-33418498	+	ORR1C1	LTR	MaLR	198	377	-1	2
1547	432	278	70	54	chr3	126181285	126181320	-33418463	+	ORR1E	LTR	MaLR	160	191	-168	2
1547	226	277	46	46	chr3	126181458	126181545	-33418238	+	ORR1E	LTR	MaLR	321	407	0	2
1547	2332	324	168	30	chr3	126181548	126182887	-33416896	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	1551	-29	2
1547	1618	183	61	42	chr3	126195196	126195556	-33404227	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	2
1547	386	360	87	37	chr3	126198488	126198788	-33400995	+	MLT1E2	LTR	MaLR	164	478	-149	2
1547	230	228	70	0	chr3	126199328	126199385	-33400398	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-494	62	2	2
1547	1002	187	34	129	chr3	126199749	126200105	-33399678	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	2
1547	319	402	147	25	chr3	126200962	126201358	-33398425	-	LTR16E2	LTR	ERVL	-32	536	93	2
1547	1251	235	165	19	chr3	126205675	126206039	-33393744	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	2
1547	1306	266	75	80	chr3	126206134	126206706	-33393077	+	RMER15	LTR	ERVL	4	572	-3	2
1547	307	175	18	0	chr3	126207036	126207093	-33392690	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	386	329	2
1547	1096	210	71	62	chr3	126207094	126207550	-33392233	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-4	574	1	2
1547	1419	139	153	8	chr3	126207550	126207817	-33391966	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-61	306	1	2
1547	3290	81	11	11	chr3	126212228	126212677	-33387106	-	RLTR44B	LTR	ERVK	0	449	1	3
1547	15452	42	1	4	chr3	126212677	126214619	-33385164	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	0	2812	877	3
1547	344	161	136	0	chr3	126214629	126214710	-33385073	-	RLTR44-int	LTR	ERVK	-2720	92	1	3
1547	3324	88	9	7	chr3	126214710	126215158	-33384625	-	RLTR44B	LTR	ERVK	0	449	1	3
1547	290	324	53	90	chr3	126216862	126217159	-33382624	+	MLT1G3	LTR	MaLR	210	477	-114	3
1547	268	343	7	130	chr3	126217503	126217657	-33382126	-	MLT1I	LTR	MaLR	-256	155	21	3
1547	2114	172	49	10	chr3	126219074	126219479	-33380304	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1547	2032	177	38	23	chr3	126220491	126220884	-33378899	-	RMER20B	LTR	ERVK	-223	404	6	3
1547	226	341	72	39	chr3	126221470	126221567	-33378216	-	RMER17D	LTR	ERVK	-328	561	465	3
1547	226	341	72	39	chr3	126221716	126221798	-33377985	-	RMER17D	LTR	ERVK	-425	464	377	3
193	2108	232	62	87	chr3	126221946	126222801	-33376982	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3457	4290	-1847	3
1548	603	218	52	12	chr3	126224588	126224825	-33374958	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	298	3
1548	942	149	19	0	chr3	126224821	126224982	-33374801	-	RMER4B	LTR	ERVK	-405	180	17	3
1548	1639	146	88	10	chr3	126225589	126225894	-33373889	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
1548	727	216	129	0	chr3	126228585	126228756	-33371027	+	MTD	LTR	MaLR	223	415	-4	3
1548	231	119	0	106	chr3	126233411	126233458	-33366325	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	610	569	3
1548	1635	179	243	26	chr3	126233624	126234003	-33365780	-	RMER19C	LTR	ERVK	-150	461	1	3
1548	387	312	125	14	chr3	126241730	126241938	-33357845	-	MLT1A	LTR	MaLR	-136	238	8	3
1548	2894	86	39	0	chr3	126247305	126247690	-33352093	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
1548	542	314	33	110	chr3	126251565	126251709	-33348074	-	MER34	LTR	ERV1	-6	536	392	3
1548	542	314	33	110	chr3	126251910	126252101	-33347682	-	MER34	LTR	ERV1	-151	391	227	3
1548	368	340	36	32	chr3	126252348	126252567	-33347216	-	MER34	LTR	ERV1	-351	220	1	3
1548	1965	112	3	14	chr3	126254113	126254404	-33345379	+	ORR1A2	LTR	MaLR	32	319	-8	3
1548	2202	146	44	18	chr3	126254581	126254965	-33344818	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1548	608	272	253	27	chr3	126255515	126255738	-33344045	+	MTD	LTR	MaLR	12	302	-117	3
1548	918	211	338	30	chr3	126255738	126256069	-33343714	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	443	-91	3
1548	441	252	88	50	chr3	126256117	126256213	-33343570	+	RLTR20C	LTR	ERVK	444	533	-1	3
1548	633	231	26	45	chr3	126256213	126256358	-33343425	+	MTD	LTR	MaLR	277	417	-2	3
1548	489	291	37	37	chr3	126257271	126257517	-33342266	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1156	1401	-4121	3
1548	374	328	0	8	chr3	126257954	126258080	-33341703	-	RMER15	LTR	ERVL	-57	518	394	3
1548	966	304	53	16	chr3	126258190	126258494	-33341289	+	MTE2b	LTR	MaLR	59	373	-6	3
1548	3196	84	19	9	chr3	126261669	126262102	-33337681	-	RLTR9B	LTR	ERVK	0	437	1	3
1548	356	287	115	82	chr3	126265058	126265240	-33334543	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-205	203	16	3
1548	1640	198	112	3	chr3	126265759	126266098	-33333685	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	378	0	3
1548	1286	217	79	132	chr3	126269764	126270097	-33329686	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	310	-74	3
1548	2960	59	28	3	chr3	126270097	126270486	-33329297	+	MTB	LTR	MaLR	2	400	0	3
1548	1286	217	79	132	chr3	126270486	126270497	-33329286	+	ORR1C2	LTR	MaLR	311	315	-69	3
1548	1286	217	79	132	chr3	126270559	126270616	-33329167	+	ORR1C2	LTR	MaLR	316	383	-1	3
1548	4133	167	118	17	chr3	126271112	126271982	-33327801	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	3
1548	1012	221	24	36	chr3	126274115	126274374	-33325409	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	411	156	3
1548	1573	268	49	27	chr3	126275204	126275614	-33324169	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	3
1548	972	314	100	48	chr3	126277186	126277316	-33322467	+	MT2A	LTR	ERVL	8	137	-396	3
1548	972	314	100	48	chr3	126277431	126277798	-33321985	+	MT2A	LTR	ERVL	138	531	-2	3
1548	501	337	102	68	chr3	126278815	126278962	-33320821	-	MER34A1	LTR	ERV1	-77	510	379	4
1548	501	337	102	68	chr3	126279157	126279391	-33320392	-	MER34A1	LTR	ERV1	-209	378	116	4
1548	767	238	82	159	chr3	126282131	126282596	-33317187	-	RMER10A	LTR	ERVL	-13	429	1	4
1548	2008	232	12	10	chr3	126283402	126283812	-33315971	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	4
1548	260	263	74	0	chr3	126285181	126285276	-33314507	+	MER21B	LTR	ERV1	614	715	-148	4
1548	1368	245	55	57	chr3	126286127	126286547	-33313236	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
1548	272	269	63	56	chr3	126287596	126287620	-33312163	-	MTEa	LTR	MaLR	0	370	349	4
1548	400	214	25	50	chr3	126288080	126288197	-33311586	-	MTEa	LTR	MaLR	-22	348	228	4
1548	272	264	156	8	chr3	126288180	126288302	-33311481	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-349	252	113	4
1548	471	301	23	62	chr3	126288221	126288398	-33311385	-	MTEa	LTR	MaLR	-209	170	1	4
1548	372	285	93	41	chr3	126290620	126290814	-33308969	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-127	317	114	4
1548	734	283	64	131	chr3	126291175	126291626	-33308157	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1548	363	256	0	53	chr3	126293724	126293819	-33305964	+	RLTR18	LTR	ERVK	1	90	-526	4
1548	819	297	87	71	chr3	126293892	126294400	-33305383	+	RLTR18	LTR	ERVK	101	616	0	4
1548	1419	226	96	10	chr3	126294863	126295176	-33304607	-	MTD	LTR	MaLR	-77	342	3	4
1548	1349	279	52	19	chr3	126296092	126296553	-33303230	+	RMER5	LTR	ERV1	51	526	-8	4
1548	266	278	124	59	chr3	126296705	126296858	-33302925	+	MER31B	LTR	ERV1	290	452	-14	4
1548	631	232	70	0	chr3	126317629	126317771	-33282012	+	MTD	LTR	MaLR	2	153	-266	4
1548	2004	98	30	136	chr3	126319468	126319835	-33279948	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-1	328	1	4
1548	1333	240	86	0	chr3	126321956	126322294	-33277489	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	4	4
1548	1471	236	130	3	chr3	126322438	126322808	-33276975	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	4
1548	3290	246	120	69	chr3	126322808	126324005	-33275778	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	1	4
1548	1690	192	105	19	chr3	126324009	126324381	-33275402	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	8	4
1548	965	246	86	76	chr3	126325321	126325740	-33274043	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	8	4
1548	1018	314	60	9	chr3	126331230	126331561	-33268222	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-12	353	6	4
1548	751	282	22	62	chr3	126344494	126344766	-33255017	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	119	5
1548	704	196	54	7	chr3	126352030	126352117	-33247666	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	578	490	5
1548	704	196	54	7	chr3	126352144	126352205	-33247578	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-89	489	424	5
1548	962	202	157	66	chr3	126352203	126352489	-33247294	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-222	312	1	5
1549	406	306	8	24	chr3	126373122	126373249	-33226534	-	MTE2b	LTR	MaLR	-249	130	6	5
1549	3013	55	5	5	chr3	126376115	126376501	-33223282	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	11	5
1549	229	263	87	63	chr3	126376645	126376680	-33223103	+	MT2B	LTR	ERVL	128	256	-345	5
1549	251	250	107	86	chr3	126384458	126384598	-33215185	+	MLT1E	LTR	MaLR	371	513	-140	5
1549	340	310	37	52	chr3	126385109	126385245	-33214538	-	RLTR16	LTR	ERVK	-213	292	159	5
1549	493	269	15	7	chr3	126385295	126385430	-33214353	-	RLTR16	LTR	ERVK	-346	159	24	5
1549	673	318	34	48	chr3	126385446	126385714	-33214069	-	MLT1B	LTR	MaLR	-122	268	5	5
1549	249	247	49	0	chr3	126390017	126390098	-33209685	-	MER67B	LTR	ERV1	-3	658	574	5
1549	359	266	176	79	chr3	126403859	126404177	-33195606	+	MLT1A0	LTR	MaLR	11	359	-6	6
1549	1380	227	100	27	chr3	126407153	126407524	-33192259	+	MTD	LTR	MaLR	22	419	0	6
1549	267	197	29	29	chr3	126414276	126414344	-33185439	+	RLTR19C	LTR	ERVK	30	97	-409	6
1549	1216	240	112	0	chr3	126415788	126416075	-33183708	+	MTD	LTR	MaLR	36	354	-65	6
1549	544	268	77	80	chr3	126419195	126419272	-33180511	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	356	270	6
1549	544	268	77	80	chr3	126419487	126419758	-33180025	-	ORR1E	LTR	MaLR	-90	269	9	6
1549	306	174	56	84	chr3	126419777	126419884	-33179899	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	405	302	6
1549	2103	171	51	15	chr3	126421529	126421912	-33177871	+	MTC	LTR	MaLR	22	421	0	6
1549	338	260	78	0	chr3	126424278	126424355	-33175428	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	534	6
1549	2614	146	75	81	chr3	126424602	126425160	-33174623	-	RLTR18	LTR	ERVK	-61	555	1	6
1549	876	301	136	9	chr3	126426449	126426868	-33172915	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-5	484	13	6
1549	1451	203	156	16	chr3	126430828	126431194	-33168589	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	6
1549	251	308	218	32	chr3	126445622	126445810	-33153973	-	MLT1K	LTR	MaLR	-372	223	1	6
1549	1775	180	15	77	chr3	126446550	126446953	-33152830	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	6
1549	1334	289	48	6	chr3	126451258	126451613	-33148170	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	6
1549	2726	159	84	8	chr3	126465130	126465632	-33134151	+	RLTR20A	LTR	ERVK	1	540	-1	7
1549	276	372	37	50	chr3	126467499	126467717	-33132066	-	MLT1A	LTR	MaLR	-42	332	118	7
1549	2069	169	13	5	chr3	126478734	126479109	-33120674	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	7
193	246	241	21	94	chr3	126484476	126484572	-33115211	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	152	7
1550	599	313	72	57	chr3	126486997	126487346	-33112437	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	12	7
1550	2069	161	8	3	chr3	126489995	126490351	-33109432	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	2	7
1550	445	279	44	18	chr3	126494598	126494711	-33105072	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	116	-263	7
1550	333	231	25	37	chr3	126494811	126494892	-33104891	+	MTE2a	LTR	MaLR	40	119	-260	7
1550	696	304	120	4	chr3	126495373	126495631	-33104152	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	274	7
1550	410	258	8	55	chr3	126495645	126495772	-33104011	-	RMER15	LTR	ERVL	-436	139	19	7
1550	2693	158	26	70	chr3	126524100	126524687	-33075096	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	2
1550	242	220	0	48	chr3	126538596	126538658	-33061125	+	MTEa	LTR	MaLR	273	331	-48	5
1550	1755	197	25	16	chr3	126555094	126555461	-33044322	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	6
1550	1780	188	58	16	chr3	126562103	126562481	-33037302	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	7
1550	4446	134	46	9	chr3	126563086	126563870	-33035913	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	813	-1035	7
1550	225	288	88	56	chr3	126570896	126571021	-33028762	+	RMER12	LTR	ERVK	1133	1261	-61	7
1550	1780	208	13	24	chr3	126571879	126572254	-33027529	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	372	-2	7
1550	1405	271	58	6	chr3	126577246	126577591	-33022192	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	49	9
1550	754	216	5	36	chr3	126580503	126580695	-33019088	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-37	1811	1626	9
1550	389	132	65	11	chr3	126580772	126580864	-33018919	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-830	1018	922	9
1550	752	198	90	6	chr3	126580964	126581142	-33018641	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1113	735	543	9
1550	1290	189	118	7	chr3	126581312	126581616	-33018167	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1293	555	218	9
1550	294	338	25	0	chr3	126583541	126583621	-33016162	-	MTD	LTR	MaLR	-277	82	1	9
1550	1841	136	77	3	chr3	126584161	126584471	-33015312	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	333	-357	1
1550	1888	139	38	171	chr3	126585797	126586293	-33013490	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	1
1550	1554	225	32	17	chr3	126592402	126592699	-33007084	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	302	-82	1
1550	2000	175	11	33	chr3	126592699	126593066	-33006717	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	36	1
1550	484	167	0	12	chr3	126593062	126593147	-33006636	+	ORR1C2	LTR	MaLR	301	384	0	1
1550	2203	175	15	15	chr3	126594439	126594846	-33004937	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	1
1550	2148	249	36	15	chr3	126604037	126604560	-32995223	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	1	1
1551	471	227	117	58	chr3	126615655	126615804	-32983979	+	MLT2B4	LTR	ERVL	327	487	-69	1
1551	471	227	117	58	chr3	126615829	126615885	-32983898	+	MLT2B4	LTR	ERVL	488	544	-12	1
1551	1297	212	125	37	chr3	126616006	126616038	-32983745	+	MTD	LTR	MaLR	10	31	-388	1
1551	1297	212	125	37	chr3	126616264	126616608	-32983175	+	MTD	LTR	MaLR	32	419	0	1
1551	329	241	35	0	chr3	126617580	126617667	-32982116	+	MLT1B	LTR	MaLR	5	94	-296	1
1551	3136	74	7	7	chr3	126619547	126619968	-32979815	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	1
1551	546	253	59	84	chr3	126620190	126620393	-32979390	+	MLT1B	LTR	MaLR	126	323	-67	1
1551	832	211	280	24	chr3	126652396	126652692	-32947091	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	1
1551	343	292	0	45	chr3	126711779	126711890	-32887893	+	MLT1A1	LTR	MaLR	268	373	-35	2
1551	575	271	259	35	chr3	126718943	126719233	-32880550	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	359	0	2
1551	234	306	141	0	chr3	126724150	126724235	-32875548	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	102	-277	2
1551	410	299	110	98	chr3	126725776	126726102	-32873681	+	MTEa	LTR	MaLR	48	377	-2	2
1551	1576	181	88	131	chr3	126742992	126743444	-32856339	-	RMER16	LTR	ERVK	-81	452	20	3
1552	981	145	30	18	chr3	126753075	126753244	-32846539	+	RMER15	LTR	ERVL	1	171	-404	3
1552	1851	163	76	14	chr3	126753656	126754010	-32845773	+	RMER15	LTR	ERVL	200	575	0	3
1552	422	316	68	94	chr3	126763424	126763763	-32836020	-	ORR1E	LTR	MaLR	-17	342	13	3
1552	486	284	84	76	chr3	126763895	126764158	-32835625	+	MLT1D	LTR	MaLR	226	490	-15	3
1552	530	319	188	19	chr3	126768006	126768418	-32831365	+	MLT1F	LTR	MaLR	68	539	-9	3
1552	1952	238	55	136	chr3	126789431	126789839	-32809944	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	349	-468	3
1552	1952	238	55	136	chr3	126790091	126790508	-32809275	+	RLTR40	LTR	ERVK	350	759	-58	3
1552	1832	192	108	80	chr3	126798439	126798937	-32800846	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	512	0	3
1552	1287	230	109	15	chr3	126799800	126800131	-32799652	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-7	367	6	3
1552	1974	230	10	31	chr3	126800673	126801090	-32798693	+	MTD	LTR	MaLR	5	412	-7	3
1552	1503	87	39	0	chr3	126821239	126821445	-32778338	+	MTB	LTR	MaLR	187	400	0	4
1552	641	295	133	51	chr3	126821781	126822159	-32777624	+	MER57C2	LTR	ERV1	7	411	0	4
1552	1037	253	116	3	chr3	126823383	126823712	-32776071	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	370	0	4
1552	4216	19	4	0	chr3	126841530	126842010	-32757773	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	4
1552	2018	171	62	13	chr3	126851203	126851577	-32748206	+	ORR1B1	LTR	MaLR	2	393	-1	4
1552	500	365	75	11	chr3	126872855	126873215	-32726568	-	LTR53	LTR	ERVL	-132	387	5	4
1553	297	329	111	41	chr3	126884501	126884672	-32715111	+	MLT1J	LTR	MaLR	184	366	-146	5
1553	261	339	90	111	chr3	126885568	126885900	-32713883	+	MLT1A1	LTR	MaLR	54	378	-30	5
1553	2059	89	71	62	chr3	126896617	126896940	-32702843	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	5
1553	1248	210	41	7	chr3	126898448	126898741	-32701042	+	MTD	LTR	MaLR	2	304	-115	5
1553	1046	246	94	50	chr3	126905619	126905979	-32693804	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	1	5
1553	1100	278	96	24	chr3	126906301	126906677	-32693106	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	1	5
1553	1035	228	190	26	chr3	126916540	126916851	-32682932	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	5	5
1553	575	253	54	13	chr3	126923929	126924153	-32675630	+	MER90a	LTR	ERV1	87	319	-295	5
1553	319	274	56	156	chr3	126931158	126931467	-32668316	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	83	5
1553	243	339	68	71	chr3	126933484	126933764	-32666019	+	MLT1C	LTR	MaLR	65	343	-124	6
1553	988	256	38	92	chr3	126935351	126935721	-32664062	+	MTEa	LTR	MaLR	27	376	-3	6
1553	403	312	59	60	chr3	126936813	126937175	-32662608	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-23	539	92	6
1553	312	213	107	0	chr3	126937360	126937435	-32662348	+	MLT1A0	LTR	MaLR	272	354	-11	6
1553	432	286	128	55	chr3	126937504	126937778	-32662005	+	ORR1E	LTR	MaLR	61	354	-5	6
1553	1978	118	138	9	chr3	126940443	126940777	-32659006	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-1	377	1	6
1553	310	278	159	72	chr3	126940885	126941318	-32658465	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-8	547	53	6
1553	567	326	26	15	chr3	126941477	126941745	-32658038	+	RMER15	LTR	ERVL	292	562	-13	6
1553	1159	205	144	12	chr3	126953018	126953344	-32646439	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	2	6
1553	1156	203	54	186	chr3	126954678	126954885	-32644898	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	180	-204	6
1553	1156	203	54	186	chr3	126954944	126955178	-32644605	+	ORR1C2	LTR	MaLR	181	384	0	6
1553	1575	125	39	196	chr3	126956982	126957421	-32642362	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-8	370	1	6
1553	822	271	59	127	chr3	126966255	126966797	-32632986	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	6
1553	776	242	158	43	chr3	126968051	126968444	-32631339	-	RMER10A	LTR	ERVL	-4	438	1	6
1553	254	221	13	90	chr3	126969772	126969801	-32629982	+	MER34	LTR	ERV1	1	25	-517	6
1553	254	219	13	89	chr3	126969949	126970021	-32629762	+	MER34	LTR	ERV1	26	92	-450	6
1553	269	318	50	38	chr3	126970178	126970338	-32629445	+	MER34	LTR	ERV1	76	237	-305	6
1553	349	182	0	0	chr3	126972403	126972469	-32627314	-	MTEb	LTR	MaLR	-313	66	1	6
1553	336	299	60	34	chr3	126974565	126974714	-32625069	+	MER34A	LTR	ERV1	49	201	-370	6
1553	316	277	75	0	chr3	126974874	126974968	-32624815	+	MER34A	LTR	ERV1	466	566	-5	6
1553	1148	131	4	88	chr3	126980905	126981131	-32618652	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-122	207	1	6
1553	327	264	19	19	chr3	126984703	126984811	-32614972	+	MLT1A1	LTR	MaLR	301	408	0	7
1553	1038	262	48	38	chr3	126991897	126992294	-32607489	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	134	7
1553	1335	214	50	64	chr3	126992747	126993106	-32606677	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	357	-2	7
1553	228	266	63	0	chr3	126993210	126993289	-32606494	-	RMER5	LTR	ERV1	-403	131	48	7
1553	465	157	164	19	chr3	126999895	126999999	-32599784	+	MTC	LTR	MaLR	1	119	-302	7
1553	1317	179	160	0	chr3	127000311	127000579	-32599204	+	MTC	LTR	MaLR	111	421	0	4
1553	2016	118	28	22	chr3	127001372	127001692	-32598091	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	8
1553	576	295	214	3	chr3	127005121	127005442	-32594341	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	17	1
1554	507	262	151	11	chr3	127016514	127016755	-32583028	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	275	4
1554	228	370	89	39	chr3	127019529	127019709	-32580074	+	MLT1I	LTR	MaLR	108	296	-115	4
1554	3725	18	2	0	chr3	127024207	127024602	-32575181	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1554	311	326	31	0	chr3	127027703	127027801	-32571982	-	MLT1B	LTR	MaLR	-46	344	244	6
1554	439	319	26	36	chr3	127027993	127028185	-32571598	-	MLT1B	LTR	MaLR	-200	190	1	6
1554	637	322	75	49	chr3	127029966	127030315	-32569468	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	359	0	7
1554	541	243	289	7	chr3	127032167	127032472	-32567311	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	18	7
1554	2128	164	33	8	chr3	127034323	127034691	-32565092	+	MTC	LTR	MaLR	45	421	0	8
1554	1883	148	54	54	chr3	127036372	127036721	-32563062	+	ORR1B1	LTR	MaLR	46	394	0	8
1554	1931	138	0	63	chr3	127045121	127045454	-32554329	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	15	1
1554	442	364	57	37	chr3	127045678	127045923	-32553860	+	LTR33	LTR	ERVL	33	282	-233	1
1554	802	218	338	7	chr3	127046624	127046905	-32552878	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1554	4188	138	64	15	chr3	127050037	127050384	-32549399	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	369	-351	1
1554	4188	138	64	15	chr3	127050433	127050771	-32549012	+	RMER6D	LTR	ERVK	370	720	0	1
1554	1117	197	209	65	chr3	127051494	127051867	-32547916	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	1	1
1554	1512	221	92	48	chr3	127054647	127055047	-32544736	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	1
1554	1135	180	0	4	chr3	127055852	127056092	-32543691	-	MTC	LTR	MaLR	-2	417	120	1
1554	447	169	146	0	chr3	127057732	127057821	-32541962	-	MTC	LTR	MaLR	-301	120	19	1
1554	612	148	24	32	chr3	127057825	127057951	-32541832	-	RLTR9C	LTR	ERVK	0	393	269	1
1554	365	220	30	99	chr3	127065259	127065390	-32534393	+	MT2B	LTR	ERVL	157	278	-323	1
1554	306	341	26	92	chr3	127069265	127069400	-32530383	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	548	429	1
1554	306	341	26	92	chr3	127069423	127069516	-32530267	-	MLT1F	LTR	MaLR	-120	428	335	1
1554	1754	164	8	77	chr3	127082411	127082793	-32516990	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	387	-7	1
1554	2825	76	47	3	chr3	127084300	127084683	-32515100	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	1
1554	1556	207	98	5	chr3	127086091	127086460	-32513323	+	MTD	LTR	MaLR	3	405	-14	2
1554	1058	294	31	87	chr3	127089005	127089546	-32510237	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-4	511	1	2
1554	2456	87	12	0	chr3	127092279	127092602	-32507181	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1554	1995	164	73	8	chr3	127093326	127093708	-32506075	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
1554	378	235	25	0	chr3	127097256	127097337	-32502446	+	MLT1D	LTR	MaLR	20	102	-403	2
1554	464	353	55	9	chr3	127097924	127098253	-32501530	+	MT2A	LTR	ERVL	190	533	0	2
1554	225	210	45	75	chr3	127101686	127101753	-32498030	-	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	-175	664	600	2
1554	551	182	46	51	chr3	127102694	127102859	-32496924	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	208	-186	2
1554	410	165	0	24	chr3	127102831	127102915	-32496868	+	ORR1B1	LTR	MaLR	92	236	-158	2
1554	1061	122	17	0	chr3	127103137	127103309	-32496474	+	ORR1A4	LTR	MaLR	147	321	-8	2
1554	319	298	118	20	chr3	127114634	127114829	-32484954	+	MER21B	LTR	ERV1	100	313	-550	2
1554	676	331	54	29	chr3	127115586	127115866	-32483917	+	MER21B	LTR	ERV1	464	750	-113	2
1554	1840	118	146	18	chr3	127117871	127118206	-32481577	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
1554	2452	95	3	3	chr3	127118758	127119085	-32480698	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1554	253	226	81	23	chr3	127120073	127120159	-32479624	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-488	91	1	2
1554	2383	136	38	15	chr3	127121890	127122285	-32477498	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	4	2
1554	288	280	95	34	chr3	127125721	127125869	-32473914	-	MLT1D	LTR	MaLR	-325	180	24	3
1554	2087	134	21	72	chr3	127127426	127127750	-32472033	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	321	-46	3
1554	2087	134	21	72	chr3	127127940	127128002	-32471781	+	ORR1B2	LTR	MaLR	322	367	0	3
1554	519	189	27	7	chr3	127129050	127129199	-32470584	+	RMER17B	LTR	ERVK	309	460	-498	3
1554	691	220	90	28	chr3	127130829	127131007	-32468776	-	MTC	LTR	MaLR	-232	189	1	3
1554	1008	225	148	49	chr3	127133611	127133976	-32465807	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	7	3
1555	847	209	90	138	chr3	127143545	127143901	-32455882	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	339	-45	3
1555	325	80	0	57	chr3	127144097	127144150	-32455633	+	ORR1C2	LTR	MaLR	335	384	0	3
1555	2722	31	0	6	chr3	127147320	127147644	-32452139	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
1555	284	343	22	7	chr3	127152331	127152469	-32447314	+	RMER15	LTR	ERVL	422	561	-14	4
1555	392	290	102	54	chr3	127153972	127154158	-32445625	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-13	554	360	4
1555	244	320	86	102	chr3	127177447	127177760	-32422023	+	MLT1G1	LTR	MaLR	258	565	-14	4
1555	1002	158	14	93	chr3	127181663	127181879	-32417904	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-122	204	6	4
1555	236	273	88	35	chr3	127182198	127182312	-32417471	-	ORR1E	LTR	MaLR	-239	120	1	4
1555	3610	66	28	6	chr3	127183336	127183808	-32415975	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	5
1555	2330	78	18	59	chr3	127194584	127194925	-32404858	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1555	453	332	30	47	chr3	127195587	127195821	-32403962	+	MLT1G1	LTR	MaLR	45	274	-305	5
1555	231	327	37	9	chr3	127196402	127196510	-32403273	+	MLT1G1	LTR	MaLR	459	569	-10	5
1555	572	186	59	0	chr3	127196523	127196641	-32403142	-	MTC-int	LTR	MaLR	-628	630	506	5
1555	500	125	12	0	chr3	127196800	127196880	-32402903	-	MTC	LTR	MaLR	-340	81	1	5
1555	869	231	199	20	chr3	127208202	127208332	-32391451	+	ORR1C2	LTR	MaLR	30	171	-213	5
1555	869	231	199	20	chr3	127208385	127208555	-32391228	+	ORR1C2	LTR	MaLR	172	383	-1	5
1555	298	104	0	0	chr3	127217462	127217510	-32382273	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	486	5
1555	1908	170	35	37	chr3	127218959	127219363	-32380420	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	5	5
1555	404	168	79	144	chr3	127223986	127224012	-32375771	-	MT2B	LTR	ERVL	-457	144	128	6
1555	495	213	0	122	chr3	127231146	127231285	-32368498	-	MT2B	LTR	ERVL	-333	268	147	6
1555	479	189	50	22	chr3	127239141	127239320	-32360463	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	92	6
1555	494	124	22	11	chr3	127251434	127251524	-32348259	+	RLTR28	LTR	ERVL	394	484	-40	6
1555	268	260	87	29	chr3	127255182	127255285	-32344498	-	LTR37A	LTR	ERV1	-272	154	46	7
194	1359	158	82	82	chr3	127270788	127271106	-32328677	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	104	7
1556	659	154	176	16	chr3	127271131	127271256	-32328527	-	MTC	LTR	MaLR	-81	340	196	7
1556	666	239	28	14	chr3	127271385	127271516	-32328267	-	MTC	LTR	MaLR	-211	210	78	7
1556	521	183	0	71	chr3	127271874	127271986	-32327797	-	MTC	LTR	MaLR	-317	104	1	7
1556	6190	158	59	19	chr3	127271986	127272158	-32327625	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1087	7
1556	6190	158	59	19	chr3	127272341	127273332	-32326451	-	MTC-int	LTR	MaLR	-172	1086	49	7
1556	754	170	66	33	chr3	127273325	127273477	-32326306	-	MTC	LTR	MaLR	-264	157	1	7
1556	325	263	8	116	chr3	127279666	127279696	-32320087	-	MT2B	LTR	ERVL	-447	154	139	7
1556	5117	42	17	0	chr3	127279758	127280335	-32319448	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	7
1556	672	242	370	7	chr3	127283061	127283344	-32316439	+	MTD	LTR	MaLR	36	419	0	7
1556	3133	132	131	68	chr3	127291744	127292393	-32307390	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	8
1556	559	274	149	34	chr3	127295239	127295534	-32304249	-	RLTR15	LTR	ERVK	-30	329	1	8
1556	1855	221	60	18	chr3	127299105	127299488	-32300295	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	8	8
1556	1377	211	182	14	chr3	127301788	127302135	-32297648	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	8
1556	350	276	37	73	chr3	127305763	127305920	-32293863	+	LTR40c	LTR	ERVL	113	320	-199	8
1556	1056	152	33	14	chr3	127306846	127307134	-32292649	-	RMER6A	LTR	ERVK	-412	344	6	8
1556	510	291	82	43	chr3	127307541	127307859	-32291924	-	MTEa	LTR	MaLR	-34	345	22	8
1556	1079	185	245	18	chr3	127308591	127308877	-32290906	+	ORR1D2	LTR	MaLR	20	370	0	8
1556	302	232	0	136	chr3	127348654	127348764	-32251019	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	146	9
1556	3271	135	62	21	chr3	127357035	127357353	-32242430	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	241	9
1556	3271	135	62	21	chr3	127357541	127357784	-32241999	-	RMER4B	LTR	ERVK	-345	240	1	9
1556	2135	107	6	74	chr3	127357912	127358265	-32241518	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	9
1556	1828	167	142	28	chr3	127358762	127359186	-32240597	+	RMER16	LTR	ERVK	62	533	0	9
1556	229	243	125	9	chr3	127366176	127366288	-32233495	+	MLT1F1	LTR	MaLR	102	226	-353	9
1556	304	324	39	45	chr3	127366434	127366612	-32233171	+	MLT1F1	LTR	MaLR	312	488	-81	9
1556	415	237	218	34	chr3	127367347	127367526	-32232257	-	RMER15	LTR	ERVL	-17	558	347	9
1556	2971	322	56	65	chr3	127367877	127368552	-32231231	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	150	788	-792	9
1556	2565	138	212	53	chr3	127368552	127369006	-32230777	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	84	9
1556	2565	138	212	53	chr3	127369266	127369338	-32230445	-	RMER19C	LTR	ERVK	-528	83	2	9
1556	2971	231	48	48	chr3	127369338	127369589	-32230194	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	666	908	-462	9
1556	1525	249	11	11	chr3	127369589	127369954	-32229829	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	3	9
1556	2971	240	49	50	chr3	127369954	127370420	-32229363	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	909	1527	-53	9
1556	362	350	65	0	chr3	127370420	127370498	-32229285	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	84	-286	9
1556	362	350	65	0	chr3	127370528	127370635	-32229148	+	ORR1D2	LTR	MaLR	85	197	-173	9
1556	582	279	0	0	chr3	127372865	127373005	-32226778	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	140	-239	9
1556	304	289	92	110	chr3	127373470	127373742	-32226041	-	MLT1I	LTR	MaLR	-31	380	114	9
1556	877	190	5	32	chr3	127378927	127379117	-32220666	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	185	-199	1
1556	562	142	43	17	chr3	127379533	127379648	-32220135	+	ORR1C2	LTR	MaLR	266	383	-1	1
1556	318	282	174	14	chr3	127379648	127379787	-32219996	-	MLT1C	LTR	MaLR	-305	162	1	1
1556	682	136	168	0	chr3	127388460	127388585	-32211198	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	276	1
1556	1336	77	0	0	chr3	127400488	127400671	-32199112	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	183	-144	1
1557	3280	48	10	0	chr3	127402993	127403385	-32196398	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1557	265	342	135	45	chr3	127404557	127404891	-32194892	+	LTR79	LTR	ERVL	71	434	-93	1
1557	947	218	90	45	chr3	127413568	127413921	-32185862	+	MTD	LTR	MaLR	5	401	-18	1
1557	378	267	96	80	chr3	127418881	127419222	-32180561	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	408	0	1
1557	940	260	70	101	chr3	127419550	127419851	-32179932	+	MT2B	LTR	ERVL	3	377	-224	1
1557	1402	163	35	135	chr3	127419851	127420304	-32179479	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	410	0	1
1557	940	244	44	93	chr3	127420304	127420543	-32179240	+	MT2B	LTR	ERVL	378	599	-2	1
1557	2477	167	42	46	chr3	127428394	127428920	-32170863	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	1	1
1557	993	280	91	15	chr3	127456573	127456914	-32142869	-	MTE2a	LTR	MaLR	-10	369	3	1
1557	253	229	0	0	chr3	127457313	127457361	-32142422	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	1481	1528	-4139	1
1557	1184	244	48	10	chr3	127464177	127464467	-32135316	+	MTD	LTR	MaLR	119	419	0	1
1557	2451	68	30	126	chr3	127486547	127486951	-32112832	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	1
1557	2085	144	35	106	chr3	127488450	127488855	-32110928	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	1	1
1557	2578	207	52	16	chr3	127488855	127489488	-32110295	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	0	1509	854	1
1557	662	163	24	0	chr3	127490757	127490880	-32108903	+	RMER6A	LTR	ERVK	631	756	0	1
1557	1231	226	75	11	chr3	127497184	127497533	-32102250	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	3	1
1557	1704	192	96	8	chr3	127501494	127501587	-32098196	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	404	3
1557	1704	192	96	8	chr3	127501640	127501944	-32097839	-	RLTR16	LTR	ERVK	-102	403	74	3
1557	1544	217	34	55	chr3	127502384	127502764	-32097019	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	5
1557	1309	253	83	27	chr3	127505264	127505710	-32094073	-	RMER5	LTR	ERV1	-28	506	36	1
1557	268	267	143	0	chr3	127506399	127506504	-32093279	-	RMER5	LTR	ERV1	-375	159	40	1
1557	1131	289	40	3	chr3	127507468	127507818	-32091965	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	370	-9	1
1557	699	198	407	7	chr3	127508966	127509240	-32090543	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	384	0	1
1557	1627	206	96	18	chr3	127509240	127509680	-32090103	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	474	-896	1
1557	536	199	29	14	chr3	127509682	127509820	-32089963	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	140	-302	1
1557	225	239	53	64	chr3	127523154	127523248	-32076535	+	MT-int	LTR	MaLR	23	115	-983	4
1557	1443	134	197	0	chr3	127523249	127523554	-32076229	+	RMER15	LTR	ERVL	35	399	-176	4
1557	289	170	38	0	chr3	127523555	127523608	-32076175	+	RMER15	LTR	ERVL	521	575	0	4
1557	292	137	20	0	chr3	127527449	127527500	-32072283	+	MTEa	LTR	MaLR	1	52	-327	4
1557	751	288	78	45	chr3	127527544	127527906	-32071877	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	405	28	5
1558	278	190	129	12	chr3	127535544	127535629	-32064154	+	MLT2B1	LTR	ERVL	400	494	-73	5
1558	1215	110	64	56	chr3	127548688	127549084	-32050699	+	RLTR41	LTR	ERV1	2	357	-89	7
1558	2052	165	11	11	chr3	127549095	127549475	-32050308	+	RMER6D	LTR	ERVK	341	720	0	7
1558	2556	98	44	5	chr3	127553992	127554380	-32045403	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	9
1558	2330	83	48	3	chr3	127554724	127555037	-32044746	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	9
1558	1133	190	61	70	chr3	127561733	127562075	-32037708	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	421	25	1
1558	1630	178	54	82	chr3	127562081	127562473	-32037310	+	ORR1C2	LTR	MaLR	4	384	0	1
1558	1985	194	23	5	chr3	127562474	127562863	-32036920	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5227	5622	-139	1
1558	282	213	0	39	chr3	127562870	127562948	-32036835	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	565	639	-1324	1
1558	313	167	0	0	chr3	127562948	127563002	-32036781	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5706	5759	-2	1
1558	1209	195	56	105	chr3	127563004	127563435	-32036348	+	MT2A	LTR	ERVL	1	543	-58	1
1558	1556	163	51	38	chr3	127564833	127565228	-32034555	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	11	1
1558	290	265	69	0	chr3	127567417	127567519	-32032264	+	LTR16A	LTR	ERVL	337	445	-6	1
1558	1264	143	296	19	chr3	127569099	127569420	-32030363	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
1558	229	262	139	23	chr3	127575434	127575520	-32024263	+	LTR50	LTR	ERVL	83	178	-617	1
1558	2176	209	20	159	chr3	127578469	127579179	-32020604	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	1
1558	236	254	16	0	chr3	127586604	127586667	-32013116	+	RLTR19C	LTR	ERVK	34	97	-409	1
1558	285	271	104	37	chr3	127593827	127593961	-32005822	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	236	1
1558	1191	244	98	11	chr3	127602931	127603288	-31996495	+	MTD	LTR	MaLR	18	405	-14	1
1558	1794	203	40	14	chr3	127604962	127605364	-31994419	+	MTD	LTR	MaLR	1	403	-16	1
1558	277	245	192	58	chr3	127606264	127606420	-31993363	+	RLTR15	LTR	ERVK	21	197	-308	1
1558	340	294	78	78	chr3	127611324	127611542	-31988241	+	MLT1A0	LTR	MaLR	9	226	-139	2
1558	285	79	0	0	chr3	127611544	127611582	-31988201	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	38	-682	2
1558	493	189	0	131	chr3	127611593	127611688	-31988095	+	MT2B	LTR	ERVL	181	259	-342	2
1558	1945	114	9	12	chr3	127611815	127612135	-31987648	+	RMER6A	LTR	ERVK	414	732	-24	2
1558	2724	64	0	20	chr3	127618945	127619298	-31980485	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
1558	1482	206	107	12	chr3	127620983	127621321	-31978462	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	2
1558	2452	145	5	10	chr3	127622206	127622590	-31977193	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	382	0	2
1558	300	314	23	39	chr3	127622593	127622722	-31977061	+	LTR41B	LTR	ERVL	432	558	-200	2
1558	896	283	45	25	chr3	127627437	127627723	-31972060	+	MLT1A0	LTR	MaLR	74	365	0	2
1558	875	314	80	22	chr3	127627778	127628279	-31971504	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	4	2
1558	541	173	47	32	chr3	127629383	127629569	-31970214	-	RMER17B	LTR	ERVK	-396	510	301	2
1558	592	267	55	86	chr3	127629797	127630145	-31969638	-	ORR1E	LTR	MaLR	-15	344	8	2
1558	2145	137	41	33	chr3	127632074	127632466	-31967317	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	395	-3	2
1558	756	220	226	114	chr3	127637482	127638000	-31961783	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	576	1	2
1558	3675	184	54	94	chr3	127638000	127638815	-31960968	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	0	8959	8174	2
1558	3675	184	54	94	chr3	127638880	127639021	-31960762	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-786	8173	8043	2
1558	1455	206	49	82	chr3	127639129	127639520	-31960263	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	512	0	2
1558	750	191	31	26	chr3	127639520	127639714	-31960069	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-977	5573	5379	2
1558	482	209	0	0	chr3	127639771	127639862	-31959921	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-3792	1468	1378	2
1558	1733	126	112	3	chr3	127643605	127643908	-31955875	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	3	2
1558	572	322	44	66	chr3	127644022	127644388	-31955395	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-47	548	191	2
1558	286	284	23	108	chr3	127646911	127646943	-31952840	+	MT2B	LTR	ERVL	139	159	-442	2
1558	1116	245	101	3	chr3	127654339	127654556	-31945227	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	145	2
1558	1116	245	101	3	chr3	127654637	127654747	-31945036	-	MTE2b	LTR	MaLR	-235	144	19	2
1558	2057	86	12	60	chr3	127654822	127655157	-31944626	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	2
1558	3012	148	24	63	chr3	127655619	127656208	-31943575	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	10	2
1558	763	316	87	9	chr3	127661813	127662145	-31937638	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	6	2
1558	1748	173	113	5	chr3	127662805	127663194	-31936589	-	RMER20A	LTR	ERVK	-75	441	11	3
194	1462	237	76	0	chr3	127664024	127664404	-31935379	+	MTD	LTR	MaLR	3	411	-8	3
1559	1886	122	151	48	chr3	127668056	127668258	-31931525	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	211	-199	3
1559	1886	122	151	48	chr3	127668352	127668521	-31931262	+	RMER17C	LTR	ERVK	212	410	0	3
1559	4636	136	99	7	chr3	127670020	127670835	-31928948	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	1	3
1559	520	267	42	96	chr3	127671798	127672069	-31927714	-	MTEa	LTR	MaLR	-107	272	1	3
1559	1866	190	54	22	chr3	127677051	127677422	-31922361	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	20	3
1559	529	300	40	119	chr3	127687395	127687747	-31912036	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	31	3
1559	2671	150	96	4	chr3	127687895	127688363	-31911420	+	RLTR11A	LTR	ERVK	18	528	0	3
1559	334	278	10	40	chr3	127688795	127688896	-31910887	+	MTEa	LTR	MaLR	273	370	-9	3
1559	689	237	121	105	chr3	127690368	127690740	-31909043	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	27	3
1559	1242	253	111	33	chr3	127693095	127693484	-31906299	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1559	1352	187	243	13	chr3	127702686	127702814	-31896969	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	136	-238	3
1559	1352	187	243	13	chr3	127702956	127703131	-31896652	+	ORR1D1	LTR	MaLR	137	373	-1	3
1559	426	353	54	63	chr3	127707733	127707954	-31891829	-	MLT1J	LTR	MaLR	-70	442	224	4
1559	246	300	42	62	chr3	127711545	127711641	-31888142	-	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	-21	1047	954	4
1559	307	343	142	33	chr3	127712048	127712259	-31887524	-	MamGypLTR2c	LTR	Gypsy	-522	546	313	4
1559	2849	108	63	26	chr3	127713142	127713315	-31886468	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	168	-1404	4
1559	2849	108	63	26	chr3	127713505	127713788	-31885995	+	RLTR21	LTR	ERVK	169	474	-1098	4
1559	4359	161	40	151	chr3	127715082	127716304	-31883479	+	RLTR21	LTR	ERVK	461	1546	-26	4
1559	623	304	114	81	chr3	127717673	127718144	-31881639	+	MLT1E	LTR	MaLR	22	615	-38	4
1559	1558	230	96	13	chr3	127719755	127720142	-31879641	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1559	3190	85	0	135	chr3	127724231	127724735	-31875048	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
1559	357	264	126	100	chr3	127725220	127725451	-31874332	+	MT2A	LTR	ERVL	297	533	0	4
1559	2341	114	97	0	chr3	127733579	127733920	-31865863	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-4	374	1	4
1559	1114	276	45	3	chr3	127740561	127740848	-31858935	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	300	-59	4
1559	478	358	96	50	chr3	127743427	127743845	-31855938	-	MLT1L	LTR	MaLR	-21	589	153	4
1559	550	271	191	39	chr3	127744864	127745221	-31854562	-	LTR52	LTR	ERVL	-6	415	5	4
1559	2039	175	44	19	chr3	127747692	127748053	-31851730	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	4
1559	1365	299	30	5	chr3	127748485	127748647	-31851136	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	210	4
1559	1365	299	30	5	chr3	127749013	127749217	-31850566	-	MTEb	LTR	MaLR	-170	209	6	4
1559	1218	230	180	6	chr3	127758419	127758760	-31841023	+	MTD	LTR	MaLR	1	401	-18	4
1559	2068	239	154	65	chr3	127758760	127759482	-31840301	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	786	-472	4
1559	262	77	77	0	chr3	127762300	127762339	-31837444	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	345	4
1559	1251	124	34	30	chr3	127762332	127762565	-31837218	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-160	234	1	4
1559	2244	238	44	19	chr3	127766418	127766958	-31832825	+	RMER15	LTR	ERVL	22	575	0	4
1559	327	271	17	50	chr3	127767958	127768030	-31831753	-	RMER17C	LTR	ERVK	-116	294	225	4
1559	824	149	1	66	chr3	127768058	127768248	-31831535	-	RMER17C	LTR	ERVK	-239	171	1	4
1559	978	256	77	6	chr3	127770077	127770400	-31829383	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5369	5714	0	5
1559	305	240	16	23	chr3	127772721	127772849	-31826934	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-755	754	628	5
1559	250	299	26	0	chr3	127773395	127773472	-31826311	-	MLT1F	LTR	MaLR	-434	114	36	5
1559	1371	214	82	32	chr3	127774208	127774550	-31825233	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	5
1559	3506	148	179	22	chr3	127779192	127779362	-31820421	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-2	1101	809	5
1559	3506	194	72	35	chr3	127779396	127780051	-31819732	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-220	808	125	5
1559	3506	194	72	35	chr3	127780108	127780232	-31819551	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-904	124	4	5
1559	260	266	0	0	chr3	127780994	127781058	-31818725	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-7655	1304	1241	5
1559	414	181	0	57	chr3	127781065	127781153	-31818630	+	BGLII	LTR	ERVK	339	421	0	5
1559	2784	180	19	4	chr3	127781277	127781795	-31817988	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	526	-2	5
1559	789	336	94	29	chr3	127787971	127788416	-31811367	-	MER21B	LTR	ERV1	-38	825	352	5
1560	1452	182	80	3	chr3	127802480	127802767	-31797016	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	5
1560	1314	144	375	59	chr3	127806682	127807021	-31792762	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	5
1560	2326	163	10	12	chr3	127813870	127814273	-31785510	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-5	402	1	5
1560	744	146	151	36	chr3	127814273	127814465	-31785318	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1258	1045	5
1560	927	187	59	87	chr3	127815285	127815571	-31784212	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-197	1061	815	5
1560	364	321	9	0	chr3	127815497	127815606	-31784177	+	MLT1C	LTR	MaLR	37	146	-321	5
1560	3381	201	42	86	chr3	127815741	127816743	-31783040	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	958	0	5
1560	386	241	7	189	chr3	127829069	127829212	-31770571	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	117	-262	5
1560	362	327	105	23	chr3	127832337	127832556	-31767227	-	MLT1K	LTR	MaLR	0	595	359	6
1560	568	329	79	58	chr3	127835438	127835767	-31764016	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-3	621	286	6
1560	356	313	7	64	chr3	127835774	127835914	-31763869	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-488	139	8	6
1560	989	142	165	5	chr3	127836406	127836612	-31763171	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	255	-330	6
1560	747	231	157	60	chr3	127836901	127837168	-31762615	+	RMER4B	LTR	ERVK	279	571	-14	6
1560	421	314	34	0	chr3	127857081	127857199	-31742584	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-52	313	192	6
1560	246	318	35	78	chr3	127858323	127858439	-31741344	+	MTEb	LTR	MaLR	90	200	-159	6
1560	262	250	0	0	chr3	127858517	127858573	-31741210	+	MTEb	LTR	MaLR	296	351	-28	6
1560	1599	247	87	3	chr3	127868397	127868775	-31731008	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	3	6
1560	1045	270	86	10	chr3	127871927	127872230	-31727553	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	81	6
1560	1440	242	90	10	chr3	127872335	127872723	-31727060	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
1560	233	295	67	11	chr3	127878438	127878527	-31721256	+	MER72B	LTR	ERV1	124	217	-551	6
1560	407	294	80	104	chr3	127879674	127880001	-31719782	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	321	-38	6
1560	262	331	54	101	chr3	127885523	127885671	-31714112	+	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	69	209	-604	6
1560	1058	302	31	56	chr3	127885909	127886267	-31713516	-	ORR1E	LTR	MaLR	-10	349	1	6
1560	2008	113	174	0	chr3	127905906	127906251	-31693532	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	7
1560	414	278	14	76	chr3	127913661	127913805	-31685978	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	270	7
1560	839	288	57	60	chr3	127919708	127920059	-31679724	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-272	352	3	7
1560	2163	207	27	5	chr3	127921456	127921863	-31677920	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	1	7
1561	2389	204	85	30	chr3	127957243	127957818	-31641965	+	RMER19C	LTR	ERVK	5	611	0	7
1561	3605	16	136	0	chr3	127961993	127962427	-31637356	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	7
1561	275	304	89	85	chr3	127967096	127967366	-31632417	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	98	7
1561	2973	88	0	5	chr3	127967684	127968086	-31631697	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1561	1035	250	112	3	chr3	127968909	127969238	-31630545	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	2	7
1561	225	221	9	152	chr3	127972213	127972325	-31627458	-	MER110A	LTR	ERV1	-332	136	41	8
1561	1090	314	50	3	chr3	127989762	127990104	-31609679	+	MTE2b	LTR	MaLR	22	379	0	8
1561	284	250	14	14	chr3	127993116	127993185	-31606598	-	MTEb	LTR	MaLR	-24	355	287	8
1561	357	332	185	35	chr3	127995227	127995514	-31604269	-	LTR16B	LTR	ERVL	-133	330	1	8
1561	338	326	15	15	chr3	127997908	127998045	-31601738	+	RMER15	LTR	ERVL	426	562	-13	8
1561	1298	236	124	32	chr3	127998389	127998830	-31600953	+	ORR1C2-int	LTR	MaLR	505	1130	-379	8
1561	1807	126	98	16	chr3	127999044	127999359	-31600424	+	ORR1C2	LTR	MaLR	44	384	0	8
1561	253	326	152	34	chr3	128011267	128011445	-31588338	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-8	481	283	1
1561	423	318	49	71	chr3	128037115	128037485	-31562298	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	6	4
1562	524	305	153	7	chr3	128068712	128069012	-31530771	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	190	8
1562	314	327	116	33	chr3	128070004	128070219	-31529564	+	MLT1G3	LTR	MaLR	268	500	-95	8
1562	1699	139	109	33	chr3	128084352	128084656	-31515127	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1562	258	229	260	0	chr3	128086594	128086690	-31513093	+	MLT1A0	LTR	MaLR	8	128	-237	1
1562	489	128	35	0	chr3	128086874	128086960	-31512823	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	89	-237	1
1562	1493	94	44	18	chr3	128088477	128088704	-31511079	+	ORR1A3	LTR	MaLR	94	326	0	1
1562	225	388	48	40	chr3	128094326	128094452	-31505331	-	RMER13A	LTR	ERVK	-37	823	697	1
1562	2312	192	135	10	chr3	128095981	128096471	-31503312	-	RMER15	LTR	ERVL	-22	553	3	1
1562	859	175	126	20	chr3	128096742	128096940	-31502843	+	MTD	LTR	MaLR	79	297	-122	1
1562	1161	244	123	16	chr3	128097744	128098119	-31501664	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	1
1562	2836	79	7	64	chr3	128103310	128103730	-31496053	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1562	1017	249	78	127	chr3	128109030	128109285	-31490498	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	110	1
1562	1017	249	78	127	chr3	128109663	128109794	-31489989	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-261	109	1	1
1562	1202	284	58	14	chr3	128109970	128110316	-31489467	-	MTEa	LTR	MaLR	-18	361	1	1
1562	1436	211	80	11	chr3	128113096	128113446	-31486337	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1562	843	251	46	5	chr3	128113988	128114204	-31485579	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	146	1
1562	2198	91	19	0	chr3	128120537	128120857	-31478926	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	32	1
1562	881	268	41	39	chr3	128120869	128121223	-31478560	-	MTE2b	LTR	MaLR	-21	358	1	1
1562	1300	237	36	86	chr3	128122969	128123462	-31476321	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	460	-277	1
1562	1843	208	87	55	chr3	128124165	128124783	-31475000	-	RMER6C	LTR	ERVK	-14	676	1	1
1562	731	254	141	32	chr3	128126602	128126832	-31472951	+	ORR1D2	LTR	MaLR	41	283	-87	1
1562	731	229	162	18	chr3	128126873	128126943	-31472840	+	ORR1D2	LTR	MaLR	284	369	-1	1
1562	773	238	86	45	chr3	128127403	128127623	-31472160	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	229	-145	1
1562	505	180	32	5	chr3	128128642	128128761	-31471022	+	ORR1D1	LTR	MaLR	271	419	0	1
1562	311	297	42	8	chr3	128136995	128137115	-31462668	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-5	403	244	1
1562	229	139	0	0	chr3	128140944	128140980	-31458803	+	MTC	LTR	MaLR	20	55	-366	1
1562	310	268	99	61	chr3	128157919	128158050	-31441733	+	MLT1C	LTR	MaLR	325	460	-7	2
1562	428	350	63	78	chr3	128165320	128165652	-31434131	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	327	-32	2
1562	1482	262	43	15	chr3	128173134	128173533	-31426250	+	MTD	LTR	MaLR	8	417	-2	2
1562	458	357	81	44	chr3	128181680	128181976	-31417807	-	LTR41	LTR	ERVL	-26	742	436	2
1562	405	339	27	49	chr3	128182183	128182366	-31417417	-	LTR41	LTR	ERVL	-587	181	3	2
1562	516	360	77	16	chr3	128182742	128183053	-31416730	+	MLT1E	LTR	MaLR	7	336	-317	2
1562	556	313	39	9	chr3	128183065	128183294	-31416489	+	MLT1E	LTR	MaLR	399	634	-19	2
1562	2015	145	55	24	chr3	128183485	128183867	-31415916	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1563	1415	210	72	18	chr3	128196155	128196489	-31403294	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-10	364	13	2
1563	232	365	46	97	chr3	128204910	128205147	-31394636	+	LTR78	LTR	ERV1	735	959	-345	2
1563	1692	195	2	68	chr3	128207242	128207671	-31392112	-	RMER17C	LTR	ERVK	-9	401	1	2
1563	3271	35	117	2	chr3	128210918	128211344	-31388439	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
1563	1181	204	144	9	chr3	128225531	128225857	-31373926	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	3
1563	1455	256	39	22	chr3	128245285	128245648	-31354135	+	MTE2a	LTR	MaLR	9	377	-2	3
1563	333	292	213	51	chr3	128256217	128256513	-31343270	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-21	344	1	3
1563	2995	74	8	2	chr3	128257398	128257792	-31341991	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1563	1576	25	0	0	chr3	128269301	128269499	-31330284	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-124	198	1	3
1563	2282	4	19	0	chr3	128269499	128269758	-31330025	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	4581	3
1563	438	309	90	123	chr3	128279171	128279339	-31320444	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	139	-220	3
1563	438	309	90	123	chr3	128279388	128279551	-31320232	+	ORR1E	LTR	MaLR	140	323	-36	3
1563	543	300	77	43	chr3	128296463	128296892	-31302891	+	LTR40a	LTR	ERVL	12	506	-13	4
1563	827	176	14	35	chr3	128297850	128298025	-31301758	+	RMER19C	LTR	ERVK	374	667	-70	4
1564	261	276	107	48	chr3	128329509	128329612	-31270171	-	MT2B	LTR	ERVL	-351	250	142	4
1564	1925	203	71	21	chr3	128333268	128333705	-31266078	+	MT2A	LTR	ERVL	1	459	-74	4
1564	354	325	66	6	chr3	128337412	128337579	-31262204	+	MLT1A1	LTR	MaLR	196	372	-36	4
1564	3925	207	42	68	chr3	128342591	128343554	-31256229	-	MTC-int	LTR	MaLR	-319	939	2	4
1564	1790	184	59	76	chr3	128343557	128343980	-31255803	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	1	4
1564	2496	94	35	195	chr3	128347350	128347930	-31251853	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	487	-402	4
1564	2006	92	28	12	chr3	128349567	128349886	-31249897	+	RMER17A	LTR	ERVK	426	749	-2	4
1564	232	350	129	43	chr3	128353254	128353487	-31246296	+	MLT1H	LTR	MaLR	72	324	-225	5
1564	2867	43	3	0	chr3	128353705	128354050	-31245733	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	5
1564	358	345	117	44	chr3	128354059	128354487	-31245296	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	37	495	-914	5
1564	271	225	35	70	chr3	128354507	128354593	-31245190	-	MER76	LTR	ERVL	-11	680	598	5
1564	508	195	84	23	chr3	128354805	128354936	-31244847	+	MTD	LTR	MaLR	11	149	-270	5
1564	485	244	16	16	chr3	128354930	128355059	-31244724	+	MTD	LTR	MaLR	274	402	-17	5
1564	330	288	58	105	chr3	128355073	128355244	-31244539	-	MER76	LTR	ERVL	-498	193	31	5
1564	707	328	79	16	chr3	128358584	128358900	-31240883	+	MLT1A0	LTR	MaLR	28	363	-2	5
1564	1329	236	85	18	chr3	128361286	128361674	-31238109	+	MTD	LTR	MaLR	5	418	-1	5
1564	329	210	0	0	chr3	128362905	128362967	-31236816	+	MLT1H2	LTR	MaLR	367	428	-61	5
1564	477	211	0	0	chr3	128365834	128365924	-31233859	-	MTC	LTR	MaLR	-331	90	1	5
1564	1643	157	8	138	chr3	128376768	128377137	-31222646	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	321	-5	5
1564	2814	160	37	17	chr3	128385496	128386012	-31213771	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-1	526	1	5
1564	1068	283	73	14	chr3	128388422	128388712	-31211071	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	74	5
1564	1068	283	73	14	chr3	128388746	128388813	-31210970	-	MTEb	LTR	MaLR	-306	73	2	5
1564	1653	226	66	0	chr3	128401128	128401521	-31198262	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	5
1564	415	286	43	90	chr3	128402399	128402587	-31197196	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	196	5
1564	343	221	0	69	chr3	128403274	128403376	-31196407	+	RMER21A	LTR	ERV1	400	494	-453	5
1564	707	271	62	0	chr3	128403336	128403513	-31196270	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1384	196	9	5
1564	841	314	43	125	chr3	128403533	128403822	-31195961	-	MTEa	LTR	MaLR	-18	361	94	5
1564	841	314	43	125	chr3	128403968	128404071	-31195712	-	MTEa	LTR	MaLR	-286	93	1	5
1564	1451	212	18	30	chr3	128406618	128406949	-31192834	+	RLTR11A	LTR	ERVK	202	528	0	5
1564	2771	156	106	47	chr3	128407502	128408080	-31191703	-	RMER20B	LTR	ERVK	-13	614	3	5
1564	401	289	39	15	chr3	128414638	128414768	-31185015	-	MLT1D	LTR	MaLR	-67	438	306	5
1564	453	332	43	34	chr3	128414826	128415036	-31184747	-	MLT1D	LTR	MaLR	-415	212	3	5
1564	276	302	61	20	chr3	128417422	128417520	-31182263	+	MLT1F2	LTR	MaLR	99	200	-360	5
1564	294	331	71	0	chr3	128417671	128417798	-31181985	+	MLT1F2	LTR	MaLR	420	555	-5	5
1564	246	265	29	14	chr3	128427898	128427967	-31171816	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	366	297	5
1564	2163	146	6	6	chr3	128428615	128428953	-31170830	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	5
1564	249	286	153	71	chr3	128429212	128429408	-31170375	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-196	212	1	5
1564	851	251	260	0	chr3	128433536	128433851	-31165932	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	21	6
1564	1472	222	6	48	chr3	128441157	128441469	-31158314	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	115	6
1564	685	178	8	0	chr3	128442859	128442977	-31156806	-	MTC	LTR	MaLR	-302	119	1	6
1565	554	323	78	100	chr3	128461967	128462428	-31137355	+	MLT2B2	LTR	ERVL	14	464	-51	6
1565	299	365	139	5	chr3	128465647	128465834	-31133949	+	MLT1I	LTR	MaLR	106	317	-94	6
1565	1945	171	67	6	chr3	128466378	128466724	-31133059	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1565	1099	187	85	13	chr3	128488819	128489117	-31110666	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-11	348	1	6
1565	334	354	54	42	chr3	128517460	128517720	-31082063	-	MLT1H-int	LTR	MaLR	-898	511	249	2
1565	1629	267	8	28	chr3	128524489	128524889	-31074894	+	MTD	LTR	MaLR	20	411	-8	3
1565	1369	194	139	153	chr3	128533652	128534193	-31065590	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	4
1565	480	359	35	35	chr3	128537458	128537712	-31062071	+	MLT2B2	LTR	ERVL	3	256	-259	4
1565	669	288	71	92	chr3	128540034	128540341	-31059442	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	320	-70	5
1565	669	288	71	92	chr3	128540559	128540633	-31059150	+	MLT1B	LTR	MaLR	321	374	-16	5
1565	246	204	0	0	chr3	128540737	128540786	-31058997	+	RLTR40	LTR	ERVK	5	53	-764	5
1566	259	360	0	35	chr3	128596598	128596713	-31003070	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	111	-263	1
1566	250	206	0	113	chr3	128597116	128597187	-31002596	+	ORR1D1	LTR	MaLR	280	342	-37	1
1566	307	267	32	32	chr3	128597619	128597712	-31002071	+	MTD	LTR	MaLR	6	98	-321	1
1566	1332	265	11	21	chr3	128598108	128598490	-31001293	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	378	-1	1
1566	1140	268	64	3	chr3	128599866	128600211	-30999572	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	370	-4	1
1566	1428	217	44	151	chr3	128611969	128612137	-30987646	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-4	403	273	1
1566	1428	217	44	151	chr3	128613134	128613416	-30986367	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-135	272	1	1
1566	375	291	54	81	chr3	128623863	128624084	-30975699	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	18	232	-1177	1
1566	504	267	116	67	chr3	128624166	128624485	-30975298	+	MLT1B	LTR	MaLR	63	467	0	1
1566	399	359	82	21	chr3	128631990	128632272	-30967511	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	294	592	-88	1
1566	246	264	47	134	chr3	128633076	128633203	-30966580	-	MT2B2	LTR	ERVL	-324	260	145	1
1566	550	311	27	114	chr3	128654336	128654712	-30945071	+	MLT1A	LTR	MaLR	11	398	-10	2
1566	1593	200	45	45	chr3	128674154	128674531	-30925252	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-7	377	1	2
1566	259	174	0	0	chr3	128677823	128677869	-30921914	+	LTR88b	LTR	Gypsy?	14	59	-778	2
1566	226	280	39	39	chr3	128679516	128679594	-30920189	-	MamGypLTR3	LTR	Gypsy	-12	827	750	2
1566	2118	251	93	46	chr3	128680100	128680726	-30919057	+	MTE-int	LTR	MaLR	863	1517	-63	2
1566	745	306	74	74	chr3	128680717	128681056	-30918727	+	ORR1D2	LTR	MaLR	14	352	-18	2
1566	2328	153	45	15	chr3	128681034	128681433	-30918350	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	3	2
1566	453	224	70	189	chr3	128688687	128688712	-30911071	+	MTEa	LTR	MaLR	1	25	-354	2
1566	453	224	70	189	chr3	128689026	128689259	-30910524	+	MTEa	LTR	MaLR	26	228	-151	2
1566	384	293	57	85	chr3	128689077	128689308	-30910475	+	MLT2B5	LTR	ERVL	67	291	-310	2
1566	384	293	57	85	chr3	128689364	128689378	-30910405	+	MLT2B5	LTR	ERVL	292	305	-296	2
1566	277	362	24	48	chr3	128699203	128699371	-30900412	+	MLT1I	LTR	MaLR	77	240	-171	2
1566	228	310	71	12	chr3	128699841	128699926	-30899857	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	269	2
1566	367	370	75	46	chr3	128707603	128707991	-30891792	-	LTR16E2	LTR	ERVL	-13	555	157	2
1566	1455	227	32	15	chr3	128708615	128708939	-30890844	+	MTD	LTR	MaLR	40	400	-19	2
1567	463	269	138	0	chr3	128712838	128712994	-30886789	+	MTEb	LTR	MaLR	1	176	-203	3
1567	849	223	31	26	chr3	128713110	128713303	-30886480	+	MTEb	LTR	MaLR	186	379	0	3
1567	2166	104	22	0	chr3	128719297	128719615	-30880168	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	33	3
1567	3658	33	0	0	chr3	128724557	128724953	-30874830	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1567	1691	108	73	69	chr3	128738287	128738604	-30861179	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	3
1567	2785	157	91	115	chr3	128745912	128746618	-30853165	+	RMER6C	LTR	ERVK	2	690	0	3
1567	1513	231	18	84	chr3	128753685	128753876	-30845907	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	183	-187	3
1567	1513	231	18	84	chr3	128754028	128754219	-30845564	+	ORR1D2	LTR	MaLR	184	358	-12	3
1567	1686	198	96	3	chr3	128754224	128754589	-30845194	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	2	400	-970	3
1567	1374	212	19	56	chr3	128754586	128754663	-30845120	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1059	1131	-239	3
1567	2577	134	62	10	chr3	128754663	128755063	-30844720	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1567	1374	212	19	56	chr3	128755063	128755309	-30844474	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	1132	1370	0	3
1567	1325	199	179	6	chr3	128755309	128755628	-30844155	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	374	0	3
1567	263	203	169	15	chr3	128756216	128756281	-30843502	-	MLT1M	LTR	MaLR	-487	185	111	3
1567	3208	29	0	0	chr3	128759992	128760338	-30839445	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1567	14898	53	10	1	chr3	128760338	128762113	-30837670	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	3
1567	3233	23	0	0	chr3	128762113	128762459	-30837324	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1567	2199	158	38	8	chr3	128776974	128777370	-30822413	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	6	3
1567	2129	108	9	69	chr3	128784369	128784716	-30815067	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
1567	501	356	75	81	chr3	128786025	128786383	-30813400	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	359	0	4
1567	1867	177	78	25	chr3	128787154	128787554	-30812229	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1567	285	237	20	88	chr3	128789907	128790009	-30809774	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	467	373	4
1567	538	272	144	91	chr3	128790210	128790529	-30809254	-	MLT1B	LTR	MaLR	-54	336	1	4
1567	506	223	0	19	chr3	128790745	128790850	-30808933	+	ORR1D2	LTR	MaLR	7	109	-310	4
1567	256	194	45	0	chr3	128793991	128794058	-30805725	+	RMER17C	LTR	ERVK	206	275	-135	4
1567	919	228	92	9	chr3	128794085	128794302	-30805481	+	ORR1D2	LTR	MaLR	136	370	0	4
1567	1409	66	0	0	chr3	128796067	128796240	-30803543	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-249	173	1	4
1567	718	299	69	23	chr3	128798522	128798871	-30800912	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	4
1567	2465	184	29	131	chr3	128800020	128800700	-30799083	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	4
1567	493	228	27	72	chr3	128801855	128802118	-30797665	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	333	4
1567	610	203	145	132	chr3	128802279	128802506	-30797277	-	RMER4B	LTR	ERVK	-339	246	17	4
1567	278	318	81	81	chr3	128808989	128809150	-30790633	+	MTEb	LTR	MaLR	36	196	-163	4
1567	311	221	28	104	chr3	128809380	128809486	-30790297	+	MTEb	LTR	MaLR	282	379	0	4
1567	289	261	0	137	chr3	128811872	128811891	-30787892	+	MT2B	LTR	ERVL	153	157	-444	4
1567	585	288	140	14	chr3	128814831	128815053	-30784730	+	RMER15	LTR	ERVL	292	541	-34	4
1567	709	278	105	73	chr3	128815222	128815549	-30784234	+	MLT1A0	LTR	MaLR	35	365	0	4
1567	491	358	50	28	chr3	128817585	128817867	-30781916	-	MLT1J	LTR	MaLR	-2	510	223	4
1567	278	301	44	97	chr3	128821100	128821214	-30778569	+	MTEb	LTR	MaLR	1	108	-271	4
1567	1011	308	83	36	chr3	128821212	128821708	-30778075	-	MT2A	LTR	ERVL	-11	522	4	4
1567	533	253	130	123	chr3	128821712	128821973	-30777810	+	MTEb	LTR	MaLR	115	377	-2	4
1567	837	269	124	8	chr3	128821991	128822257	-30777526	-	MTD	LTR	MaLR	-19	400	104	4
1567	1994	101	12	51	chr3	128827092	128827427	-30772356	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	4
1567	393	299	78	39	chr3	128837090	128837295	-30762488	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	151	5
1567	416	321	35	14	chr3	128839497	128839639	-30760144	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	145	-234	5
1567	315	203	0	0	chr3	128839626	128839690	-30760093	+	MTE2b	LTR	MaLR	311	374	-5	5
1567	260	295	42	51	chr3	128839871	128839989	-30759794	+	MT2A	LTR	ERVL	1	117	-416	5
1567	769	223	168	21	chr3	128839890	128840128	-30759655	+	MTD	LTR	MaLR	18	290	-129	5
1567	307	311	52	7	chr3	128840218	128840354	-30759429	+	MTD	LTR	MaLR	276	417	-2	5
1568	329	328	80	6	chr3	128849760	128849935	-30749848	-	MER21B	LTR	ERV1	-72	791	604	5
1568	320	317	89	48	chr3	128852929	128853075	-30746708	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-347	184	33	5
1568	332	228	120	33	chr3	128859363	128859513	-30740270	-	RLTR15	LTR	ERVK	-196	163	1	5
1568	438	363	11	0	chr3	128878011	128878193	-30721590	-	MLT1J	LTR	MaLR	-293	219	36	5
1568	3483	33	0	0	chr3	128879983	128880379	-30719404	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1568	2532	139	42	2	chr3	128882378	128882783	-30717000	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
1568	283	288	0	0	chr3	128891174	128891233	-30708550	+	MTE2b	LTR	MaLR	40	98	-281	6
1568	1167	273	56	16	chr3	128891233	128891538	-30708245	+	MTE2b	LTR	MaLR	58	374	-5	6
1568	781	269	177	81	chr3	128934692	128934878	-30664905	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	189	6
1568	2268	204	8	175	chr3	128934878	128935609	-30664174	-	RMER19C	LTR	ERVK	-2	609	1	6
1568	781	269	177	81	chr3	128935609	128935766	-30664017	-	MTE2a	LTR	MaLR	-191	188	1	6
1568	415	272	131	13	chr3	128936125	128936278	-30663505	+	RMER15	LTR	ERVL	402	572	-3	6
1568	230	300	0	16	chr3	128936975	128937036	-30662747	+	RMER15	LTR	ERVL	408	467	-108	6
1568	481	298	42	83	chr3	128948052	128948268	-30651515	+	MLT1F1	LTR	MaLR	110	316	-232	6
1568	421	115	0	0	chr3	128948263	128948324	-30651459	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	61	-523	6
1568	1018	217	42	7	chr3	128948324	128948602	-30651181	+	ORR1B1	LTR	MaLR	96	771	-1192	6
1568	581	324	85	9	chr3	128948604	128948828	-30650955	+	MLT1F1	LTR	MaLR	327	567	-2	6
1568	225	317	61	45	chr3	128948828	128948954	-30650829	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	11	138	-1351	6
1568	799	309	25	46	chr3	128949554	128949638	-30650145	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	310	360	-1129	6
1568	799	305	20	40	chr3	128949696	128949940	-30649843	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	361	607	-882	6
1568	491	313	165	39	chr3	128949975	128950036	-30649747	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	733	799	-690	6
1568	491	305	194	33	chr3	128950113	128950604	-30649179	+	MLT1F1-int	LTR	MaLR	800	1311	-178	6
1568	431	316	57	45	chr3	128950775	128950951	-30648832	+	MLT1F1	LTR	MaLR	17	194	-354	6
1568	1153	277	114	19	chr3	128951033	128951394	-30648389	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	548	154	6
1568	250	290	41	41	chr3	128962551	128962648	-30637135	+	MTEa	LTR	MaLR	273	369	-10	7
1568	796	320	11	35	chr3	128962728	128963010	-30636773	+	MTE-int	LTR	MaLR	72	346	-1234	7
1568	1527	327	150	65	chr3	128963250	128963737	-30636046	+	MTE-int	LTR	MaLR	353	874	-706	7
1568	1527	327	150	65	chr3	128963908	128964524	-30635259	+	MTE-int	LTR	MaLR	875	1550	-30	7
1568	288	298	0	23	chr3	128964690	128964776	-30635007	+	MTEb	LTR	MaLR	279	362	-17	7
1568	4944	94	115	84	chr3	128968531	128969391	-30630392	-	RMER17D	LTR	ERVK	-2	887	1	7
1568	949	282	28	103	chr3	128970338	128970734	-30629049	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	1	7
24	2050	132	50	3	chr3	128974840	128975137	-30624646	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	7
1569	229	294	44	0	chr3	128981083	128981151	-30618632	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	71	-288	7
1569	337	285	57	127	chr3	128981248	128981493	-30618290	+	ORR1E	LTR	MaLR	132	359	0	7
1569	631	287	99	8	chr3	129005986	129006239	-30593544	+	MLT1A	LTR	MaLR	81	356	-18	9
1569	1336	213	146	0	chr3	129026261	129026623	-30573160	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	4
1569	980	181	46	5	chr3	129029575	129029791	-30569992	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	225	-304	5
1569	732	149	39	45	chr3	129029873	129030028	-30569755	+	RLTR24	LTR	ERV1	192	345	-184	5
1569	880	186	119	0	chr3	129030145	129030381	-30569402	-	RMER10B	LTR	ERVL	-133	265	2	5
1569	707	218	99	6	chr3	129030381	129030551	-30569232	+	RLTR24	LTR	ERV1	344	529	0	5
1569	279	269	164	20	chr3	129041758	129041959	-30557824	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	233	-126	7
1569	331	373	43	48	chr3	129042134	129042551	-30557232	+	MLT1D	LTR	MaLR	39	453	-52	7
1569	1445	201	74	76	chr3	129042832	129043225	-30556558	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	7
1569	1857	130	100	70	chr3	129043810	129043987	-30555796	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	175	8
1569	1857	130	100	70	chr3	129044032	129044225	-30555558	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-210	174	1	8
1569	1353	202	183	93	chr3	129044621	129045042	-30554741	+	MT2A	LTR	ERVL	1	459	-74	8
1569	229	156	0	0	chr3	129045167	129045212	-30554571	+	MT2A	LTR	ERVL	489	533	0	8
1569	1969	174	16	62	chr3	129045848	129046233	-30553550	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	8
1569	1072	219	27	0	chr3	129047691	129047915	-30551868	+	ORR1D2	LTR	MaLR	5	234	-136	8
1569	1468	177	58	47	chr3	129049671	129049924	-30549859	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	216	472	-91	9
1569	1468	177	58	47	chr3	129049977	129050067	-30549716	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	473	563	0	9
1569	1465	273	54	14	chr3	129051045	129051546	-30548237	-	RMER5	LTR	ERV1	-1	533	13	9
1569	336	83	0	0	chr3	129052226	129052274	-30547509	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	351	9
1569	1382	161	30	97	chr3	129052512	129052883	-30546900	-	RMER10B	LTR	ERVL	-52	346	1	9
1569	827	142	95	0	chr3	129054901	129055070	-30544713	+	ORR1D1	LTR	MaLR	190	374	0	1
1569	935	159	143	5	chr3	129055074	129055166	-30544617	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	477	1
1569	1904	152	34	11	chr3	129055230	129055622	-30544161	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-92	476	1	1
1569	653	311	86	35	chr3	129055639	129056012	-30543771	+	MT2A	LTR	ERVL	142	533	0	1
1569	260	195	112	26	chr3	129056012	129056038	-30543745	-	RMER17C	LTR	ERVK	-132	278	240	1
1569	260	195	112	26	chr3	129056221	129056283	-30543500	-	RMER17C	LTR	ERVK	-171	239	181	1
1569	6323	61	28	2	chr3	129057239	129058027	-30541756	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	1
1569	1753	189	46	9	chr3	129058027	129058374	-30541409	+	ORR1D1	LTR	MaLR	12	371	-3	1
1569	6453	64	10	10	chr3	129065303	129066111	-30533672	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	1	808	0	1
1569	322	239	0	0	chr3	129067290	129067357	-30532426	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	353	1
1569	2411	231	16	114	chr3	129067354	129068208	-30531575	-	RMER17B	LTR	ERVK	-187	771	1	1
1569	1057	268	81	19	chr3	129068208	129068511	-30531272	-	MTD	LTR	MaLR	-92	327	5	1
1569	2290	141	21	11	chr3	129069706	129070086	-30529697	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
1569	472	169	0	0	chr3	129070685	129070756	-30529027	+	RLTR40	LTR	ERVK	2	72	-745	1
1569	514	109	116	32	chr3	129070740	129070835	-30528948	-	MTC	LTR	MaLR	-318	103	1	1
1569	2250	200	44	86	chr3	129071512	129072108	-30527675	-	RMER20B	LTR	ERVK	-13	614	44	1
1569	249	257	65	39	chr3	129074249	129074326	-30525457	-	ORR1E	LTR	MaLR	-275	84	6	1
1569	475	266	9	27	chr3	129077597	129077709	-30522074	-	ORR1E	LTR	MaLR	-243	116	7	1
1569	247	322	31	118	chr3	129079244	129079473	-30520310	+	MT2B	LTR	ERVL	175	383	-218	1
1569	771	259	176	9	chr3	129079412	129079737	-30520046	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	1
1569	619	141	0	0	chr3	129079752	129079844	-30519939	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	330	1
1569	1968	178	101	0	chr3	129080547	129080912	-30518871	-	MTC	LTR	MaLR	-19	402	1	1
1569	417	293	63	29	chr3	129080954	129081193	-30518590	-	RMER17C	LTR	ERVK	-68	342	96	1
1569	372	232	87	72	chr3	129081272	129081537	-30518246	-	RMER17C	LTR	ERVK	-141	269	1	1
1569	560	274	25	25	chr3	129081537	129081697	-30518086	+	MLT1E2	LTR	MaLR	363	522	-105	1
1569	280	304	11	21	chr3	129083993	129084087	-30515696	+	MLT1J	LTR	MaLR	416	508	-4	1
1569	2291	190	12	7	chr3	129086348	129086767	-30513016	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1569	3630	204	44	90	chr3	129087180	129087830	-30511953	+	RMER13A	LTR	ERVK	2	635	-225	1
1569	2248	86	83	3	chr3	129087830	129088157	-30511626	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	353	-4	1
1569	3630	204	44	90	chr3	129088157	129088406	-30511377	+	RMER13A	LTR	ERVK	636	860	0	1
1569	366	340	112	36	chr3	129089943	129090043	-30509740	-	MT2A	LTR	ERVL	-286	247	149	1
1569	635	229	108	119	chr3	129090043	129090414	-30509369	+	RLTR9A	LTR	ERVK	2	368	0	1
1569	366	340	112	36	chr3	129090414	129090472	-30509311	-	MT2A	LTR	ERVL	-385	148	67	1
1569	2047	119	6	89	chr3	129090472	129090831	-30508952	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1569	366	340	112	36	chr3	129090831	129090894	-30508889	-	MT2A	LTR	ERVL	-467	66	9	1
1569	286	227	13	108	chr3	129094695	129094853	-30504930	+	RMER17C	LTR	ERVK	180	322	-88	1
1569	3688	137	63	26	chr3	129095760	129096560	-30503223	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	1
1569	3385	41	10	0	chr3	129096737	129097129	-30502654	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1569	2383	153	67	8	chr3	129099797	129100199	-30499584	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	426	-55	2
1569	463	223	0	11	chr3	129102922	129103017	-30496766	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	482	2
1569	1332	160	132	18	chr3	129103021	129103301	-30496482	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-16	313	2	2
1569	2008	211	109	17	chr3	129103542	129104020	-30495763	-	RMER15	LTR	ERVL	-53	522	1	2
1570	4336	63	50	30	chr3	129106046	129106621	-30493162	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	2
1570	524	332	146	14	chr3	129107181	129107468	-30492315	+	MLT2D	LTR	ERVL	42	366	-48	2
1570	2589	71	3	0	chr3	129109639	129109965	-30489818	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1570	758	309	21	0	chr3	129110657	129110845	-30488938	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	192	-187	2
1570	464	273	80	29	chr3	129111014	129111158	-30488625	+	MTE2b	LTR	MaLR	163	313	-66	2
1570	448	293	39	86	chr3	129113514	129113794	-30485989	-	MTC-int	LTR	MaLR	-987	271	5	2
1570	473	353	21	5	chr3	129113855	129114043	-30485740	-	MT2A	LTR	ERVL	-135	398	208	2
1570	2385	68	11	69	chr3	129116600	129116947	-30482836	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1570	3441	134	51	39	chr3	129118110	129118701	-30481082	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	4	2
1570	3011	85	0	34	chr3	129125794	129126208	-30473575	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
1570	607	312	26	116	chr3	129126226	129126650	-30473133	+	MLT1C	LTR	MaLR	13	398	-69	2
1570	1900	115	82	3	chr3	129134460	129134765	-30465018	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
1570	1277	272	44	32	chr3	129141322	129141850	-30457933	+	RMER5	LTR	ERV1	1	534	0	2
1570	352	202	13	36	chr3	129141859	129141953	-30457830	-	ORR1E	LTR	MaLR	-28	351	264	2
1570	363	188	45	38	chr3	129142030	129142129	-30457654	-	ORR1E	LTR	MaLR	-277	97	1	2
1570	245	350	20	20	chr3	129142131	129142233	-30457550	-	ORR1E	LTR	MaLR	-214	145	44	2
1570	483	296	86	65	chr3	129142914	129143253	-30456530	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	346	-210	2
1570	458	251	68	21	chr3	129143580	129143771	-30456012	+	RMER15	LTR	ERVL	363	562	-13	2
1570	1586	215	59	8	chr3	129144670	129145026	-30454757	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1570	3523	106	2	40	chr3	129152014	129152594	-30447189	+	RMER2	LTR	ERV1	10	567	0	3
1570	386	299	74	82	chr3	129152719	129152963	-30446820	+	MTEa	LTR	MaLR	107	348	-31	3
1570	262	333	193	12	chr3	129154388	129154637	-30445146	+	MER74A	LTR	ERVL	139	432	-126	3
1570	699	319	45	15	chr3	129155251	129155518	-30444265	+	MTE2b	LTR	MaLR	44	318	-61	3
1570	651	254	22	92	chr3	129155518	129155852	-30443931	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	298	-72	3
1570	3876	54	19	0	chr3	129157903	129158368	-30441415	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	474	-1	3
1570	935	222	24	10	chr3	129158373	129158578	-30441205	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5	212	-5549	3
1570	36797	108	33	2	chr3	129158699	129163758	-30436025	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	413	5629	-132	3
1570	320	119	0	33	chr3	129163758	129163819	-30435964	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	625	-1338	3
1570	543	31	0	0	chr3	129163820	129163885	-30435898	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5421	5485	0	3
1570	3916	49	19	0	chr3	129163885	129164351	-30435432	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	3
1570	2093	142	3	0	chr3	129165881	129166191	-30433592	+	RLTR10E	LTR	ERVK	1	311	0	3
1570	2754	73	10	25	chr3	129167791	129168197	-30431586	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	8	407	0	3
1570	3751	21	19	5	chr3	129170611	129171041	-30428742	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	3
1570	3324	160	29	44	chr3	129171102	129171716	-30428067	-	RLTR1D	LTR	ERV1	0	605	1	3
1570	3126	78	4	36	chr3	129171950	129172428	-30427355	+	RMER16	LTR	ERVK	71	533	0	3
1570	508	266	20	50	chr3	129172792	129172990	-30426793	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	239	3
1570	458	179	111	19	chr3	129173155	129173263	-30426520	-	RLTR23	LTR	ERV1	-305	125	8	3
1570	2415	75	25	0	chr3	129175643	129175961	-30423822	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	3
1570	341	325	61	65	chr3	129176108	129176355	-30423428	-	MLT1F	LTR	MaLR	-99	449	204	3
1570	396	349	6	34	chr3	129177328	129177503	-30422280	-	MT2A	LTR	ERVL	-153	380	211	3
1570	2602	157	37	25	chr3	129177533	129178048	-30421735	+	RLTR17	LTR	ERVK	98	618	-74	3
1570	2687	153	22	24	chr3	129178402	129178585	-30421198	+	RLTR19	LTR	ERVK	5	185	-314	3
1570	2687	153	22	24	chr3	129178616	129178928	-30420855	+	RLTR19	LTR	ERVK	186	499	0	3
1570	1731	149	144	9	chr3	129179550	129179751	-30420032	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	184	3
1570	1731	149	144	9	chr3	129179776	129179920	-30419863	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-211	183	3	3
1570	313	244	54	22	chr3	129182430	129182522	-30417261	+	MER57F	LTR	ERV1	335	429	-7	3
1570	1033	209	257	18	chr3	129183604	129183931	-30415852	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	3
1570	731	245	28	38	chr3	129188015	129188304	-30411479	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	286	-73	3
1570	3377	64	8	106	chr3	129192319	129192544	-30407239	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	286	3
1570	3377	64	8	106	chr3	129192572	129192873	-30406910	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-190	285	1	3
1570	465	325	91	60	chr3	129194123	129194509	-30405274	+	MT2A	LTR	ERVL	2	399	-134	4
1570	1108	299	54	45	chr3	129195912	129196427	-30403356	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	15	4
1570	231	299	63	56	chr3	129197625	129197767	-30402016	-	MER57F	LTR	ERV1	-18	418	276	4
1570	1910	150	79	9	chr3	129199806	129200149	-30399634	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1570	545	221	68	99	chr3	129203795	129203986	-30395797	-	MTD	LTR	MaLR	-234	185	1	4
1570	268	284	80	0	chr3	129204935	129205023	-30394760	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	281	4
1570	1538	260	56	27	chr3	129205722	129206240	-30393543	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	4
1570	250	351	9	0	chr3	129206888	129207002	-30392781	-	RLTR14-int	LTR	ERV1	-3145	2172	2058	4
1570	2377	180	114	62	chr3	129216160	129216740	-30383043	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	610	-1	4
1570	289	221	71	0	chr3	129223875	129223967	-30375816	+	MTEb	LTR	MaLR	256	373	-6	4
1570	229	143	24	0	chr3	129224396	129224438	-30375345	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	328	4
1570	247	244	216	16	chr3	129228975	129229100	-30370683	+	MLT1C	LTR	MaLR	241	390	-77	4
1570	490	259	41	4	chr3	129232343	129232497	-30367286	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-228	166	3	5
1571	697	115	107	0	chr3	129244375	129244497	-30355286	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	175	5
1571	1789	81	4	0	chr3	129244481	129244741	-30355042	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-150	261	1	5
1571	1771	177	247	39	chr3	129246300	129246871	-30352912	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1571	1779	153	126	11	chr3	129254907	129255263	-30344520	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	397	-1	5
1571	1283	192	106	12	chr3	129266835	129267173	-30332610	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	371	2	5
1571	421	264	38	10	chr3	129271177	129271329	-30328454	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	227	5
1571	1083	227	148	18	chr3	129276904	129277241	-30322542	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	19	5
1571	2073	87	14	118	chr3	129277923	129278287	-30321496	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	5
1571	2557	128	5	22	chr3	129280306	129280720	-30319063	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	5
1571	399	287	16	0	chr3	129284133	129284255	-30315528	-	RMER15	LTR	ERVL	-40	535	412	5
1571	1571	176	148	37	chr3	129284609	129285063	-30314720	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	504	-23	5
1571	978	142	45	6	chr3	129293185	129293362	-30306421	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	184	6
1571	425	319	99	20	chr3	129299757	129300010	-30299773	+	MLT1D	LTR	MaLR	150	422	-83	6
1571	606	91	620	6	chr3	129310334	129310489	-30289294	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	118	6
1571	1056	267	142	11	chr3	129321162	129321529	-30278254	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	3	6
1571	625	274	13	13	chr3	129330788	129330947	-30268836	-	ORR1E	LTR	MaLR	-194	165	7	6
1571	2518	170	94	112	chr3	129353336	129354179	-30245604	+	RLTR25B	LTR	ERVK	2	829	-199	6
1571	425	286	103	0	chr3	129354202	129354328	-30245455	-	MTD	LTR	MaLR	-261	158	20	6
1571	612	299	126	23	chr3	129354641	129354942	-30244841	-	MLT1K	LTR	MaLR	-141	454	123	6
1571	1356	141	319	0	chr3	129355428	129355726	-30244057	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	393	-1	6
1571	4294	49	55	13	chr3	129356528	129357069	-30242714	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	6
1571	438	204	32	0	chr3	129357248	129357341	-30242442	+	ORR1B1	LTR	MaLR	113	208	-186	6
1571	575	343	17	21	chr3	129357614	129357852	-30241931	+	MTD	LTR	MaLR	11	247	-172	7
1571	320	266	79	44	chr3	129357935	129358049	-30241734	+	MTD	LTR	MaLR	282	399	-20	7
1571	2578	56	22	12	chr3	129366022	129366346	-30233437	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1571	1706	200	50	8	chr3	129366358	129366716	-30233067	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	374	0	7
1572	1969	102	39	60	chr3	129368560	129368894	-30230889	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1572	3515	82	19	4	chr3	129369000	129369475	-30230308	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	7
1572	4533	62	107	20	chr3	129369475	129370112	-30229671	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1	692	-6552	7
1572	1157	51	0	0	chr3	129370410	129370548	-30229235	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	681	818	-6426	7
1572	273	238	91	45	chr3	129370947	129371035	-30228748	+	MMTV-int	LTR	ERVK	2413	2504	-4749	7
1572	11811	42	16	9	chr3	129371330	129373145	-30226638	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	1322	3212	-4032	7
1572	3952	85	29	39	chr3	129373115	129373728	-30226055	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	3380	3986	-3258	7
1572	8507	38	3	5	chr3	129373721	129374730	-30225053	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	5065	6071	-1173	7
1572	1914	101	13	3	chr3	129374753	129375052	-30224731	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	207	508	-385	7
1572	7919	43	0	3	chr3	129375052	129375967	-30223816	+	RLTR45-int	LTR	ERVK	6333	7244	0	7
1572	3533	82	19	2	chr3	129375967	129376441	-30223342	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	7
1572	406	295	87	10	chr3	129377851	129378046	-30221737	-	LTR33C	LTR	ERVL	0	629	420	7
1572	374	174	0	115	chr3	129389586	129389690	-30210093	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	173	7
1572	522	162	0	17	chr3	129398488	129398596	-30201187	+	MTC	LTR	MaLR	1	101	-295	7
1572	1008	274	56	24	chr3	129401211	129401619	-30198164	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-4	437	18	7
1572	1613	122	62	141	chr3	129419879	129420224	-30179559	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	326	-41	8
1572	1613	122	62	141	chr3	129420416	129420460	-30179323	+	ORR1B2	LTR	MaLR	327	359	-8	8
1572	488	289	137	16	chr3	129443355	129443663	-30156120	-	ORR1E	LTR	MaLR	-35	335	1	8
1572	634	249	38	11	chr3	129447016	129447201	-30152582	+	MTD	LTR	MaLR	6	195	-212	8
1572	2638	173	101	21	chr3	129448626	129448779	-30151004	+	RMER12	LTR	ERVK	1	172	-1232	8
1572	1358	188	81	48	chr3	129448779	129449176	-30150607	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	8
1572	3334	122	33	20	chr3	129449176	129449836	-30149947	+	RMER12	LTR	ERVK	173	765	-557	8
1572	569	234	169	47	chr3	129449821	129449844	-30149939	+	RMER12	LTR	ERVK	958	983	-339	8
1572	569	234	169	47	chr3	129449905	129450159	-30149624	+	RMER12	LTR	ERVK	984	1269	-53	8
1572	359	107	18	0	chr3	129460385	129460441	-30139342	+	RMER16-int	LTR	ERVK	5350	5406	0	8
1572	2181	168	115	42	chr3	129460441	129460880	-30138903	+	RMER16	LTR	ERVK	1	464	-69	8
1572	2181	168	115	42	chr3	129460905	129460962	-30138821	+	RMER16	LTR	ERVK	465	532	-1	8
1572	773	254	47	16	chr3	129460962	129461154	-30138629	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1	198	-5208	8
1572	387	296	19	8	chr3	129461169	129461353	-30138430	+	RMER16-int	LTR	ERVK	194	466	-7751	8
1572	16044	154	18	26	chr3	129461566	129464600	-30135183	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1513	5306	-861	8
1572	8147	109	4	10	chr3	129465079	129466247	-30133536	+	RMER16-int	LTR	ERVK	4137	5297	-109	8
1572	535	138	0	11	chr3	129466324	129466412	-30133371	+	RMER16-int	LTR	ERVK	5318	5404	-2	8
1572	2079	178	128	31	chr3	129466412	129466898	-30132885	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	8
1572	2756	98	30	23	chr3	129471188	129471585	-30128198	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	8
1572	2637	110	94	10	chr3	129475510	129475913	-30123870	+	RLTR9B	LTR	ERVK	1	437	0	8
1572	2983	60	42	3	chr3	129479807	129480192	-30119591	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	8
1572	741	254	72	18	chr3	129488888	129489165	-30110618	-	LTR69	LTR	ERVL	-113	475	184	9
1572	2105	189	58	0	chr3	129489491	129489887	-30109896	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	9
1572	2160	151	47	7	chr3	129494657	129495065	-30104718	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	5	428	-135	9
1572	3170	54	2	8	chr3	129495194	129495589	-30104194	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	4	396	0	9
1572	362	239	11	11	chr3	129495589	129495678	-30104105	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	453	541	-19	9
1572	325	318	40	29	chr3	129496295	129496470	-30103313	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	163	339	-1150	9
1572	928	189	6	0	chr3	129498861	129499030	-30100753	+	ORR1B1	LTR	MaLR	4	173	-221	9
1573	327	305	29	46	chr3	129499329	129499504	-30100279	-	LTR40a	LTR	ERVL	-314	205	34	9
1573	691	302	27	0	chr3	129509831	129510053	-30089730	+	MTE2b	LTR	MaLR	16	243	-136	1
1573	1806	198	117	3	chr3	129512955	129513330	-30086453	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	2
1573	2249	145	62	18	chr3	129519090	129519491	-30080292	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	2	2
1573	412	238	163	26	chr3	129526889	129527079	-30072704	+	ORR1D1	LTR	MaLR	8	223	-151	4
1573	484	262	8	15	chr3	129537158	129537290	-30062493	+	MTD	LTR	MaLR	1	131	-288	5
1573	2460	131	2	31	chr3	129537290	129537709	-30062074	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	179	6
1573	498	298	38	59	chr3	129538011	129538250	-30061533	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4598	4831	-836	6
1573	2442	146	23	5	chr3	129544835	129545222	-30054561	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	6
1573	3191	49	13	8	chr3	129545564	129545958	-30053825	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1573	824	243	182	10	chr3	129546209	129546516	-30053267	+	MTD	LTR	MaLR	51	410	-9	7
1573	707	244	4	114	chr3	129546933	129546978	-30052805	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	329	7
1573	707	244	4	114	chr3	129547143	129547323	-30052460	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-42	328	169	7
1573	2968	60	49	13	chr3	129548327	129548713	-30051070	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1573	252	149	0	0	chr3	129548921	129548968	-30050815	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-367	122	76	8
1573	1021	213	42	27	chr3	129549762	129550023	-30049760	+	RMER15	LTR	ERVL	311	575	0	8
1573	287	354	59	40	chr3	129556116	129556369	-30043414	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	102	1
1573	264	277	79	69	chr3	129556439	129556540	-30043243	-	ORR1E	LTR	MaLR	-271	108	7	1
1573	2098	165	40	5	chr3	129559802	129559993	-30039790	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	189	1
1573	5442	93	61	15	chr3	129560022	129560870	-30038913	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	887	-2	1
1573	2098	165	40	5	chr3	129560870	129561044	-30038739	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-196	188	7	1
1573	1205	249	30	118	chr3	129562644	129563041	-30036742	+	MTE2a	LTR	MaLR	11	372	-7	1
1573	2819	148	140	41	chr3	129563334	129563372	-30036411	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	585	1
1573	2819	148	140	41	chr3	129563558	129564075	-30035708	-	RMER19C	LTR	ERVK	-27	584	1	1
1573	723	237	80	70	chr3	129564522	129564735	-30035048	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	205	1
1573	2045	105	6	112	chr3	129565383	129565440	-30034343	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	287	1
1573	2045	105	6	112	chr3	129565521	129565828	-30033955	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-40	286	1	1
1573	235	401	97	19	chr3	129565975	129566181	-30033602	-	LTR85c	LTR	Gypsy?	-37	786	565	1
1573	255	369	128	19	chr3	129568936	129569248	-30030535	-	LTR83	LTR	ERVL	0	780	435	1
1573	3189	83	6	100	chr3	129569657	129569727	-30030056	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	480	1
1573	3189	83	6	100	chr3	129569870	129570318	-30029465	-	RMER16	LTR	ERVK	-54	479	64	1
1573	1920	126	26	68	chr3	129572092	129572432	-30027351	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	1
1573	616	281	144	38	chr3	129572564	129572856	-30026927	-	MLT1B	LTR	MaLR	-29	361	39	1
1573	2173	58	123	3	chr3	129575341	129575633	-30024150	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1573	377	333	12	90	chr3	129578498	129578742	-30021041	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	335	1
1573	2065	113	128	14	chr3	129578793	129579161	-30020622	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
1573	1173	193	10	88	chr3	129579448	129579743	-30020040	+	RLTR9A	LTR	ERVK	96	367	-1	1
1573	333	169	0	97	chr3	129579890	129579947	-30019836	+	MTE2a	LTR	MaLR	330	379	0	1
1573	436	173	147	52	chr3	129589358	129589474	-30010309	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	127	-281	1
1573	481	291	7	22	chr3	129593939	129594076	-30005707	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-219	146	12	1
1573	338	295	216	17	chr3	129594184	129594360	-30005423	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	350	1
1573	1879	120	6	107	chr3	129594391	129594462	-30005321	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	264	1
1573	3404	50	0	0	chr3	129594462	129594858	-30004925	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1573	1879	120	6	107	chr3	129594858	129595150	-30004633	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-66	263	3	1
1573	1051	287	99	93	chr3	129595381	129596029	-30003754	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3	4996	4345	1
1573	304	302	158	20	chr3	129596089	129596241	-30003542	-	RMER15	LTR	ERVL	-86	489	317	1
1573	1544	179	160	8	chr3	129599602	129599984	-29999799	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	3	1
1573	472	268	85	43	chr3	129601223	129601387	-29998396	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	171	-188	1
1573	338	93	37	0	chr3	129601599	129601653	-29998130	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	312	1
1573	1990	175	14	14	chr3	129601774	129602128	-29997655	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-40	354	1	1
1573	2403	133	59	17	chr3	129605902	129606306	-29993477	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1573	280	179	10	192	chr3	129615593	129615697	-29984086	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1488	2
1573	2089	113	3	12	chr3	129615721	129616051	-29983732	-	RMER12	LTR	ERVK	-995	327	1	2
1573	1709	183	85	30	chr3	129619171	129619570	-29980213	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1573	747	247	78	48	chr3	129625456	129625686	-29974097	+	MTD	LTR	MaLR	23	259	-160	2
1573	1213	179	114	4	chr3	129627164	129627445	-29972338	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	108	2
1573	2442	82	9	0	chr3	129628144	129628463	-29971320	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	323	-4	2
1574	1110	248	125	16	chr3	129630214	129630499	-29969284	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	100	2
1574	1514	211	50	22	chr3	129630499	129630857	-29968926	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	5	2
1574	1110	248	125	16	chr3	129630857	129630940	-29968843	-	MTD	LTR	MaLR	-320	99	7	2
1574	570	199	14	56	chr3	129637726	129637886	-29961897	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	146	-248	2
1574	1233	185	82	13	chr3	129637914	129638090	-29961693	+	ORR1C2	LTR	MaLR	41	251	-133	2
1574	1233	179	81	11	chr3	129638122	129638252	-29961531	+	ORR1C2	LTR	MaLR	252	384	0	2
1574	1388	182	64	11	chr3	129645304	129645587	-29954196	+	ORR1C2	LTR	MaLR	87	384	0	2
1574	234	239	0	0	chr3	129646050	129646096	-29953687	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-2	536	491	2
1574	525	255	52	68	chr3	129649395	129649647	-29950136	-	MLT2F	LTR	ERVL	-11	652	405	2
1574	455	285	87	35	chr3	129649652	129649982	-29949801	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-5	369	1	3
1574	401	325	126	43	chr3	129652363	129652688	-29947095	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	352	-22	3
1574	1021	170	48	0	chr3	129654793	129654999	-29944784	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	199	3
1574	259	279	16	0	chr3	129655094	129655155	-29944628	-	MTD	LTR	MaLR	-255	166	105	3
1574	415	250	9	28	chr3	129655429	129655536	-29944247	-	MTD	LTR	MaLR	-302	119	15	3
1574	873	242	93	77	chr3	129656299	129656612	-29943171	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	318	-41	3
1574	370	277	79	55	chr3	129658596	129658760	-29941023	+	LTR41	LTR	ERVL	22	189	-579	3
1574	1126	129	42	9	chr3	129660183	129660412	-29939371	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	250	-109	3
1574	2327	148	18	101	chr3	129674535	129674873	-29924910	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	113	3
1574	2327	148	18	101	chr3	129675001	129675119	-29924664	-	MTC	LTR	MaLR	-309	112	1	3
1574	1908	158	70	3	chr3	129678943	129679287	-29920496	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	3
1574	1690	140	6	51	chr3	129679659	129679990	-29919793	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	6	3
1574	236	250	26	26	chr3	129682787	129682865	-29916918	-	MTD	LTR	MaLR	-1	420	343	3
1574	548	258	103	42	chr3	129682877	129683140	-29916643	-	MTD	LTR	MaLR	-140	279	1	3
1574	248	325	67	19	chr3	129690382	129690592	-29909191	+	RMER15	LTR	ERVL	356	575	0	3
1574	803	299	113	34	chr3	129722066	129722454	-29877329	+	RMER5	LTR	ERV1	77	495	-39	4
1574	270	190	84	22	chr3	129730450	129730563	-29869220	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-3231	2175	2094	4
1574	493	267	108	16	chr3	129730979	129731173	-29868610	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-2373	2887	2676	4
1574	832	196	71	104	chr3	129737272	129737540	-29862243	-	MLT1B	LTR	MaLR	-131	259	1	4
1574	779	254	142	79	chr3	129738530	129739014	-29860769	-	RMER13A	LTR	ERVK	-82	545	30	4
1574	1985	218	162	67	chr3	129739138	129739840	-29859943	+	RMER12B	LTR	ERVK	427	1195	-209	4
1574	301	204	39	119	chr3	129741494	129741614	-29858169	+	RMER12B	LTR	ERVK	1309	1404	0	4
1574	4469	8	0	0	chr3	129746620	129747102	-29852681	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	4
1574	35217	50	11	22	chr3	129747102	129750789	-29848994	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1	3830	-860	4
1574	35217	49	11	23	chr3	129750981	129751881	-29847902	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	3831	4690	0	4
1574	4495	6	0	0	chr3	129751881	129752363	-29847420	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	4
1574	727	236	154	25	chr3	129755932	129756189	-29843594	+	MLT1D	LTR	MaLR	206	613	-11	4
1574	261	246	61	15	chr3	129756774	129756840	-29842943	-	MLT1D	LTR	MaLR	-158	347	279	4
1574	257	304	98	60	chr3	129757028	129757161	-29842622	-	MLT1D	LTR	MaLR	-72	433	296	4
1574	269	254	301	19	chr3	129760440	129760649	-29839134	-	MER21B	LTR	ERV1	-51	812	545	4
1574	280	287	84	102	chr3	129760988	129761155	-29838628	-	MER21B	LTR	ERV1	-659	204	41	4
1575	2007	140	81	6	chr3	129765173	129765532	-29834251	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	4
1575	778	191	129	16	chr3	129766202	129766388	-29833395	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	207	-653	4
1575	457	330	48	57	chr3	129766402	129766616	-29833167	+	RMER13A	LTR	ERVK	679	887	-21	4
1575	3550	113	74	11	chr3	129766615	129767170	-29832613	-	MT2B	LTR	ERVL	-6	595	6	4
1575	1992	103	6	52	chr3	129774150	129774497	-29825286	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-3	438	108	5
1575	862	120	0	0	chr3	129774736	129774861	-29824922	-	BGLII_A	LTR	ERVK	-320	125	1	5
1575	229	246	0	90	chr3	129776661	129776728	-29823055	-	LTR81B	LTR	ERV1?	-885	508	448	5
1575	291	244	67	34	chr3	129777374	129777463	-29822320	+	RMER5	LTR	ERV1	112	203	-331	5
1575	275	285	41	68	chr3	129788121	129788268	-29811515	+	RMER15	LTR	ERVL	18	160	-415	5
1575	254	358	0	0	chr3	129788362	129788471	-29811312	+	RMER15	LTR	ERVL	424	532	-43	5
1575	638	193	41	0	chr3	129794783	129794928	-29804855	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	151	-208	5
1575	2587	55	3	61	chr3	129796153	129796499	-29803284	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	5
1575	475	315	32	37	chr3	129796615	129796803	-29802980	+	ORR1E	LTR	MaLR	171	357	-2	5
1575	2160	133	3	3	chr3	129798854	129799200	-29800583	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	5
1575	662	291	102	32	chr3	129808770	129809054	-29790729	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	103	6
1575	1753	225	17	31	chr3	129810345	129810767	-29789016	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	4	6
1575	333	291	67	67	chr3	129812502	129812697	-29787086	-	ORR1E	LTR	MaLR	-162	197	3	6
1575	306	349	74	17	chr3	129823332	129823507	-29776276	-	MTE-int	LTR	MaLR	-362	1218	1034	6
1575	274	324	92	49	chr3	129823578	129823905	-29775878	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-75	642	259	6
1575	283	213	16	0	chr3	129823905	129823966	-29775817	-	MTEa	LTR	MaLR	-220	159	98	6
1575	274	324	92	49	chr3	129823966	129824085	-29775698	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-75	258	117	6
1575	930	215	123	11	chr3	129828866	129829143	-29770640	+	RMER13B	LTR	ERVK	525	832	-76	6
1575	2433	98	0	15	chr3	129845250	129845582	-29754201	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1575	520	220	21	28	chr3	129846549	129846694	-29753089	+	RLTR23	LTR	ERV1	287	430	0	6
1575	283	180	121	77	chr3	129847010	129847133	-29752650	-	MTEb	LTR	MaLR	-24	355	240	7
1575	334	345	45	49	chr3	129847668	129847933	-29751850	-	RMER15	LTR	ERVL	-13	562	299	7
1575	1618	161	72	33	chr3	129853936	129854295	-29745488	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-8	560	188	7
1575	1617	167	109	35	chr3	129855095	129855442	-29744341	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	47	7
1575	228	246	35	0	chr3	129856555	129856612	-29743171	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-7	552	494	7
1575	923	259	87	80	chr3	129857156	129857571	-29742212	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-72	443	26	7
1575	785	254	199	39	chr3	129857585	129857946	-29741837	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1575	3552	13	5	0	chr3	129859500	129859894	-29739889	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1575	279	198	41	62	chr3	129860048	129860145	-29739638	-	ORR1E	LTR	MaLR	-235	124	30	7
1575	342	183	17	111	chr3	129866912	129867029	-29732754	+	MLT1A1	LTR	MaLR	301	406	-2	7
1575	372	234	43	16	chr3	129868603	129868720	-29731063	-	MLT1A	LTR	MaLR	-240	125	1	7
1575	1418	128	15	25	chr3	129873337	129873622	-29726161	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	359	-331	7
1575	1263	100	5	0	chr3	129873671	129873861	-29725922	+	RMER6C	LTR	ERVK	500	690	0	7
1575	404	281	35	14	chr3	129873877	129874018	-29725765	+	MLT1A0	LTR	MaLR	61	204	-161	7
1575	614	317	123	43	chr3	129875938	129876413	-29723370	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-358	1131	506	7
1575	879	264	156	21	chr3	129877439	129877772	-29722011	+	MTD	LTR	MaLR	42	419	0	7
1575	419	251	80	3	chr3	129880877	129881043	-29718740	-	MLT1D	LTR	MaLR	-15	612	305	7
1576	631	320	89	47	chr3	129895971	129896374	-29703409	-	LTR37A	LTR	ERV1	-6	420	1	7
1576	296	353	32	6	chr3	129900761	129900918	-29698865	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	161	-247	7
1576	362	164	15	0	chr3	129918518	129918585	-29681198	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	312	8
1576	541	187	0	5	chr3	129923854	129923965	-29675818	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-263	111	5	8
1576	613	319	139	40	chr3	129925906	129926281	-29673502	+	MLT2B1	LTR	ERVL	14	425	-95	8
1576	347	281	91	0	chr3	129926495	129926616	-29673167	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	3501	3632	-2082	8
1576	4955	261	86	84	chr3	129926928	129928633	-29671150	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	3699	5379	-335	8
1576	4955	261	86	84	chr3	129928845	129929128	-29670655	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5380	5691	-23	8
1576	619	272	198	118	chr3	129929132	129929641	-29670142	+	MLT2B4	LTR	ERVL	3	552	-4	8
1576	1282	211	132	26	chr3	129938110	129938456	-29661327	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	8
1576	2761	62	6	0	chr3	129941475	129941800	-29657983	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1576	988	304	14	64	chr3	129949653	129950095	-29649688	+	MTC	LTR	MaLR	2	407	-14	8
1576	955	211	73	136	chr3	129962736	129963119	-29636664	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	8
1576	234	308	33	41	chr3	129963121	129963243	-29636540	+	MLT1F	LTR	MaLR	75	195	-354	8
1576	241	278	112	41	chr3	129963297	129963466	-29636317	+	MLT1F	LTR	MaLR	195	375	-173	8
1576	277	233	115	10	chr3	129964637	129964741	-29635042	+	LTR78	LTR	ERV1	1125	1239	-65	8
1576	527	384	43	18	chr3	129972119	129972514	-29627269	-	MLT1I	LTR	MaLR	0	411	7	8
1576	2287	81	62	3	chr3	129974310	129974619	-29625164	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1576	227	284	64	72	chr3	129979518	129979643	-29620140	-	LTR48B	LTR	ERV1	-519	125	2	9
1576	631	271	70	112	chr3	129980068	129980451	-29619332	-	MLT1B	LTR	MaLR	-10	380	14	9
1576	247	257	55	37	chr3	129984731	129984840	-29614943	-	MLT1B	LTR	MaLR	-41	349	239	9
1576	229	214	43	97	chr3	129994051	129994144	-29605639	-	MLT1C	LTR	MaLR	-313	154	67	9
1576	368	298	139	40	chr3	129994475	129994727	-29605056	-	LTR53	LTR	ERVL	-65	454	178	9
1576	330	248	168	45	chr3	129994967	129995185	-29604598	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	118	9
1576	242	309	10	40	chr3	129996887	129996988	-29602795	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-19	389	292	9
1576	339	230	21	113	chr3	129998080	129998222	-29601561	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-238	136	8	9
1576	1828	181	99	6	chr3	130010165	130010499	-29589284	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-2	365	1	1
1577	279	284	104	44	chr3	130023499	130023689	-29576094	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-96	452	277	2
1577	265	239	31	93	chr3	130024326	130024455	-29575328	+	MT2A	LTR	ERVL	1	121	-412	2
1577	760	231	154	20	chr3	130024349	130024596	-29575187	+	MTD	LTR	MaLR	31	310	-109	3
1577	1001	216	36	18	chr3	130028733	130028955	-29570828	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	386	3
1577	292	224	0	15	chr3	130032579	130032647	-29567136	-	MTC	LTR	MaLR	-354	67	1	4
1577	1983	169	21	0	chr3	130044241	130044566	-29555217	-	MTC	LTR	MaLR	-89	332	1	5
1577	287	212	14	43	chr3	130046574	130046643	-29553140	+	MER57A-int	LTR	ERV1	5798	5864	-323	6
1577	3941	151	68	26	chr3	130046694	130047025	-29552758	-	RMER6D	LTR	ERVK	-4	716	370	6
1577	3941	151	68	26	chr3	130047084	130047439	-29552344	-	RMER6D	LTR	ERVK	-351	369	1	6
1577	413	229	90	165	chr3	130047520	130047708	-29552075	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	203	6
1577	1651	161	82	6	chr3	130083306	130083625	-29516158	-	MTC	LTR	MaLR	-5	416	74	1
1577	526	198	18	0	chr3	130093701	130093812	-29505971	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	113	-257	1
1577	353	202	219	9	chr3	130093823	130093928	-29505855	+	ORR1D2	LTR	MaLR	238	364	-6	1
1577	649	245	315	55	chr3	130096804	130097103	-29502680	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	2	1
1577	1042	171	41	5	chr3	130097322	130097516	-29502267	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	219	1
1577	1141	262	140	3	chr3	130099614	130099935	-29499848	+	MTEa	LTR	MaLR	1	365	-14	1
1577	487	282	50	44	chr3	130100005	130100187	-29499596	-	MTD	LTR	MaLR	-196	183	1	1
1577	1130	112	16	11	chr3	130101449	130101638	-29498145	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	789	1
1577	696	309	52	106	chr3	130102088	130102330	-29497453	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-8	456	243	1
1577	696	309	52	106	chr3	130102468	130102706	-29497077	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-222	242	2	1
1577	981	270	162	10	chr3	130111613	130111916	-29487867	+	MTE2a	LTR	MaLR	19	367	-12	1
1577	842	248	64	11	chr3	130114414	130114661	-29485122	-	MTD	LTR	MaLR	-61	358	39	1
1577	391	177	145	8	chr3	130117064	130117080	-29482703	-	RMER17B	LTR	ERVK	-511	447	432	1
1577	391	177	145	8	chr3	130117149	130117263	-29482520	-	RMER17B	LTR	ERVK	-527	431	299	1
1577	284	393	50	57	chr3	130123226	130123523	-29476260	-	LTR16E2	LTR	ERVL	0	568	274	1
1577	2411	180	69	37	chr3	130125874	130126383	-29473400	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-3	525	1	1
1577	1661	264	49	6	chr3	130140757	130141244	-29458539	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-20	508	1	1
1577	859	259	176	17	chr3	130148117	130148412	-29451371	+	MTEa	LTR	MaLR	38	379	0	1
1578	2573	161	7	2	chr3	130166220	130166637	-29433146	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	2
1578	1868	126	95	0	chr3	130182119	130182444	-29417339	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-22	356	1	2
1578	226	246	152	88	chr3	130182641	130182766	-29417017	+	MLT2F	LTR	ERVL	254	386	-277	2
1578	1468	206	85	30	chr3	130186459	130186825	-29412958	+	MTD	LTR	MaLR	19	404	-15	2
1578	459	261	182	28	chr3	130188532	130188591	-29411192	+	MTEa	LTR	MaLR	170	245	-134	2
1578	459	261	182	28	chr3	130188689	130188809	-29410974	+	MTEa	LTR	MaLR	246	377	-2	2
1578	1908	122	96	24	chr3	130208266	130208329	-29391454	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	296	2
1578	1908	122	96	24	chr3	130208811	130209082	-29390701	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-72	295	2	2
1578	429	140	202	42	chr3	130224442	130224586	-29375197	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	181	-213	2
1578	635	269	80	162	chr3	130228630	130229043	-29370740	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	2
1578	310	264	133	55	chr3	130229043	130229171	-29370612	-	MTE2b-int	LTR	MaLR	-16	1564	1427	2
1578	2000	132	56	51	chr3	130231624	130231998	-29367785	+	RMER5	LTR	ERV1	133	508	-26	2
1578	357	339	172	65	chr3	130247854	130248192	-29351591	-	MER21B	LTR	ERV1	-294	569	196	2
1578	479	338	23	28	chr3	130248555	130248771	-29351012	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-49	511	297	2
1578	271	351	71	77	chr3	130248786	130248968	-29350815	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-320	228	48	2
1578	634	246	138	44	chr3	130251448	130251673	-29348110	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-52	503	258	2
1578	1475	207	89	12	chr3	130255926	130256263	-29343520	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	1	3
1578	276	234	31	15	chr3	130258621	130258686	-29341097	-	ORR1E	LTR	MaLR	-113	266	201	3
1578	901	283	17	8	chr3	130258669	130258908	-29340875	-	ORR1E	LTR	MaLR	-113	246	6	3
1579	2027	126	3	0	chr3	130307668	130307985	-29291798	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	3
1579	523	181	28	9	chr3	130308458	130308564	-29291219	-	MT2A	LTR	ERVL	-425	108	1	3
1579	296	224	142	2	chr3	130308639	130308759	-29291024	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	125	-269	3
1579	1215	221	41	32	chr3	130308749	130309073	-29290710	+	ORR1D1	LTR	MaLR	76	372	-22	3
1579	1468	224	71	23	chr3	130313039	130313391	-29286392	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	1	3
1579	1620	191	93	31	chr3	130314025	130314413	-29285370	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	7	3
1579	260	220	0	0	chr3	130314985	130315044	-29284739	-	MLT1B	LTR	MaLR	-314	76	18	3
1579	354	252	39	10	chr3	130315595	130315699	-29284084	-	MER34A	LTR	ERV1	-6	565	459	3
1579	232	295	119	88	chr3	130315822	130316015	-29283768	-	MER34A	LTR	ERV1	-347	224	26	3
1579	281	292	90	0	chr3	130316879	130316968	-29282815	+	MTEa	LTR	MaLR	254	350	-29	3
1579	845	310	133	14	chr3	130325924	130326353	-29273430	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	23	3
1579	278	298	57	44	chr3	130338655	130338813	-29260970	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-1098	4387	4228	3
1579	686	324	102	76	chr3	130344964	130345819	-29253964	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4036	4912	-755	3
1579	841	294	7	40	chr3	130345843	130346141	-29253642	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1271	1558	-22	3
1579	992	303	52	41	chr3	130346140	130346508	-29253275	+	MTEa	LTR	MaLR	8	379	0	3
1579	328	338	67	7	chr3	130347921	130348070	-29251713	-	MLT1A	LTR	MaLR	-213	161	4	3
1579	276	312	26	43	chr3	130349418	130349585	-29250198	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-6	562	368	3
1579	1377	266	80	11	chr3	130351877	130352341	-29247442	-	MLT1D	LTR	MaLR	-9	496	1	4
1579	1856	186	69	3	chr3	130374790	130375168	-29224615	-	MTC	LTR	MaLR	-17	404	2	4
1579	2826	182	141	75	chr3	130375175	130375359	-29224424	-	MTC-int	LTR	MaLR	-6	1252	1069	4
1579	2826	182	141	75	chr3	130375536	130375592	-29224191	-	MTC-int	LTR	MaLR	-190	1068	1058	4
1579	2826	182	141	75	chr3	130375781	130375882	-29223901	-	MTC-int	LTR	MaLR	-201	1057	944	4
1579	2826	191	140	96	chr3	130375906	130376655	-29223128	-	MTC-int	LTR	MaLR	-315	943	1	4
1579	2506	129	82	3	chr3	130376658	130377047	-29222736	-	MTC	LTR	MaLR	-1	420	1	4
1579	230	250	50	0	chr3	130379359	130379479	-29220304	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-755	754	629	4
1579	414	274	79	87	chr3	130380554	130380928	-29218855	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	4
1579	2860	75	19	17	chr3	130386897	130387307	-29212476	+	RLTR9F	LTR	ERVK	1	411	-4	4
1579	583	262	152	61	chr3	130387512	130387874	-29211909	+	LTR40b	LTR	ERVL	37	431	-31	4
1579	1980	144	3	44	chr3	130390556	130390638	-29209145	+	MTC	LTR	MaLR	1	77	-344	4
1579	1980	158	5	86	chr3	130390936	130391335	-29208448	+	MTC	LTR	MaLR	78	397	-3	4
1579	292	344	112	13	chr3	130393940	130394173	-29205610	-	MLT1G3-int	LTR	MaLR	-1019	390	135	4
1579	409	340	86	65	chr3	130394333	130394832	-29204951	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-21	528	16	4
1579	421	268	128	0	chr3	130396331	130396495	-29203288	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	189	-190	4
1579	464	218	391	0	chr3	130403560	130403826	-29195957	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	4
1579	1643	192	83	18	chr3	130405256	130405643	-29194140	+	MTC	LTR	MaLR	1	412	-9	4
1579	2140	149	19	21	chr3	130409610	130409987	-29189796	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	376	-18	4
1579	349	131	38	56	chr3	130410864	130410956	-29188827	+	ORR1B1	LTR	MaLR	135	286	-108	4
1579	757	329	24	30	chr3	130413044	130413414	-29186369	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4847	5214	-453	5
1580	241	316	70	9	chr3	130426629	130426744	-29173039	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	125	-240	5
1580	664	189	240	18	chr3	130430066	130430370	-29169413	+	MTD	LTR	MaLR	1	412	-7	5
1580	1153	289	80	16	chr3	130437678	130438166	-29161617	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	16	5
1580	1374	242	56	18	chr3	130441758	130441844	-29157939	+	MTD	LTR	MaLR	1	86	-333	5
1580	1374	242	56	18	chr3	130442265	130442372	-29157411	+	MTD	LTR	MaLR	87	198	-221	5
1580	1374	242	56	18	chr3	130442406	130442607	-29157176	+	MTD	LTR	MaLR	199	410	-9	5
1580	721	276	26	22	chr3	130442611	130442841	-29156942	-	MTE2b	LTR	MaLR	-133	246	16	5
1580	578	169	24	41	chr3	130444796	130444919	-29154864	-	RLTR19	LTR	ERVK	-1	498	378	5
1580	3366	136	57	29	chr3	130445993	130446658	-29153125	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	684	-1164	5
1580	3759	135	101	64	chr3	130446902	130447099	-29152684	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1017	1244	-604	5
1580	3759	135	101	64	chr3	130447287	130447614	-29152169	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1245	1562	-286	5
1580	3759	135	101	64	chr3	130447763	130448036	-29151747	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1563	1845	-3	5
1580	861	273	130	0	chr3	130448726	130449026	-29150757	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	340	-39	5
1580	7305	103	12	13	chr3	130452671	130453787	-29145996	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	1	5
1580	618	151	78	23	chr3	130454012	130454141	-29145642	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	136	-238	5
1580	369	319	91	11	chr3	130455435	130455622	-29144161	+	MLT1D	LTR	MaLR	304	505	0	6
1580	2119	198	10	216	chr3	130458659	130459426	-29140357	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	609	-2	6
1580	271	279	35	11	chr3	130471246	130471333	-29128450	+	MTE2b	LTR	MaLR	6	94	-285	6
1580	746	85	68	0	chr3	130471424	130471476	-29128307	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	53	-703	6
1580	746	85	68	0	chr3	130471507	130471572	-29128211	+	RMER6A	LTR	ERVK	54	125	-631	6
1580	1185	131	44	0	chr3	130471568	130471774	-29128009	+	RMER6A	LTR	ERVK	542	756	0	6
1580	756	266	45	5	chr3	130471779	130471979	-29127804	+	MTE2b	LTR	MaLR	172	379	0	6
1580	2559	173	23	143	chr3	130472870	130473564	-29126219	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1580	5062	107	28	1	chr3	130474635	130475353	-29124430	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	6
1580	1596	52	5	0	chr3	130490551	130490762	-29109021	+	MTB	LTR	MaLR	189	400	0	6
1580	549	272	52	6	chr3	130491388	130491562	-29108221	+	MER31B	LTR	ERV1	1	182	-284	6
1580	901	142	177	24	chr3	130492141	130492350	-29107433	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	128	6
1580	1572	163	19	138	chr3	130492350	130492830	-29106953	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	378	0	6
1580	615	207	28	21	chr3	130492830	130492954	-29106829	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-244	126	2	6
1580	238	318	82	0	chr3	130493904	130493989	-29105794	+	MLT1H1	LTR	MaLR	37	128	-427	6
1580	289	269	47	51	chr3	130497436	130497737	-29102046	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-45	314	48	6
1580	2147	151	8	145	chr3	130498260	130498757	-29101026	+	RLTR23	LTR	ERV1	2	430	0	6
1580	2221	88	69	0	chr3	130501043	130501349	-29098434	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1580	1913	140	21	36	chr3	130504947	130505280	-29094503	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	328	-1	1
1580	2011	138	26	12	chr3	130518534	130518878	-29080905	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	19	3
1580	447	234	58	4	chr3	130523553	130523694	-29076089	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-203	345	200	4
1580	229	114	0	0	chr3	130525854	130525889	-29073894	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	350	5
1580	2005	144	118	3	chr3	130525893	130526241	-29073542	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-4	390	3	5
1580	3267	227	78	24	chr3	130526243	130527494	-29072289	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	0	1370	1	5
1580	1964	173	77	3	chr3	130527494	130527859	-29071924	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	5
1580	955	186	32	5	chr3	130527859	130528048	-29071735	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-31	353	160	5
1580	737	172	7	7	chr3	130528232	130528367	-29071416	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-197	187	53	5
1580	408	221	7	122	chr3	130528704	130528731	-29071052	+	MT2B	LTR	ERVL	142	152	-449	5
1580	577	335	83	52	chr3	130537550	130537899	-29061884	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-153	362	3	7
1580	428	320	112	21	chr3	130539604	130539837	-29059946	-	LTR53	LTR	ERVL	-77	442	189	7
1580	3586	15	2	0	chr3	130544139	130544534	-29055249	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	8
1580	2439	78	16	0	chr3	130546740	130547061	-29052722	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	326	-1	8
1581	1291	203	123	6	chr3	130550471	130550789	-29048994	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-19	355	1	9
1581	3155	14	0	0	chr3	130552509	130552855	-29046928	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	9
1581	692	23	0	0	chr3	130552855	130552941	-29046842	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	1707	9
1581	493	35	276	0	chr3	130552938	130553025	-29046758	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-217	258	148	9
1581	2133	98	3	0	chr3	130554557	130554875	-29044908	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	1
1581	677	269	75	32	chr3	130560811	130561106	-29038677	+	MTEa	LTR	MaLR	62	372	-7	1
1581	252	132	0	0	chr3	130563694	130563732	-29036051	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	380	1
1581	1773	137	116	99	chr3	130563732	130563956	-29035827	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	211	1
1581	1773	137	116	99	chr3	130564280	130564459	-29035324	-	MTC	LTR	MaLR	-211	210	3	1
1581	516	254	124	0	chr3	130568694	130568863	-29030920	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	190	1
1581	576	256	78	49	chr3	130569092	130569297	-29030486	-	MTEa	LTR	MaLR	-168	211	1	1
1581	1767	125	30	60	chr3	130575652	130575984	-29023799	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	1
1581	285	268	71	10	chr3	130607906	130608004	-28991779	-	MLT1E	LTR	MaLR	-2	651	548	2
1581	282	218	10	155	chr3	130609973	130610076	-28989707	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	153	2
1581	1090	258	113	20	chr3	130620170	130620514	-28979269	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	4	2
1581	2362	87	123	0	chr3	130621023	130621389	-28978394	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	2
1581	1030	89	94	12	chr3	130621390	130621561	-28978222	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	193	-6288	2
1581	234	327	0	0	chr3	130621561	130621616	-28978167	+	RLTR27	LTR	ERVK	221	275	-34	2
1581	3997	51	2	18	chr3	130621616	130622119	-28977664	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	168	662	-5819	2
1581	2193	83	0	0	chr3	130622119	130622397	-28977386	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1636	-4845	2
1581	6323	43	4	0	chr3	130622396	130623139	-28976644	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5736	6481	0	2
1581	2362	87	123	0	chr3	130623139	130623505	-28976278	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	2
1581	2369	157	13	76	chr3	130637306	130637755	-28962028	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1581	266	210	31	31	chr3	130644528	130644592	-28955191	+	MLT1J1	LTR	MaLR	3	66	-378	2
1581	1140	241	29	38	chr3	130652262	130652607	-28947176	+	RLTR15	LTR	ERVK	2	343	-16	2
1581	1535	221	136	21	chr3	130656278	130656652	-28943131	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	2
1581	1715	234	79	10	chr3	130657266	130657658	-28942125	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
1581	2138	191	108	51	chr3	130657659	130658194	-28941589	+	MTD-int	LTR	MaLR	2	553	-705	2
1581	356	319	81	40	chr3	130658866	130659088	-28940695	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-1116	234	4	2
1581	235	333	78	39	chr3	130670358	130670378	-28929405	+	MLT1F2	LTR	MaLR	29	48	-521	3
1581	251	323	57	33	chr3	130670403	130670606	-28929177	+	MLT1F2	LTR	MaLR	418	552	-8	3
1581	337	224	40	0	chr3	130675035	130675111	-28924672	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	83	-291	3
1581	722	231	17	0	chr3	130675112	130675285	-28924498	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-10	364	189	3
1581	569	142	97	0	chr3	130675284	130675397	-28924386	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1243	1366	-4	3
1581	834	149	552	0	chr3	130675401	130675642	-28924141	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1581	1145	257	68	4	chr3	130676920	130677278	-28922505	+	MTEb	LTR	MaLR	10	379	0	3
1582	1320	253	41	53	chr3	130679051	130679519	-28920264	+	RMER5	LTR	ERV1	68	529	-5	3
1582	261	245	128	16	chr3	130687492	130687662	-28912121	+	MTE2b	LTR	MaLR	185	371	-8	3
1582	237	272	63	16	chr3	130691000	130691127	-28908656	-	RMER15	LTR	ERVL	-96	479	347	3
1582	1276	165	203	29	chr3	130691387	130691736	-28908047	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	3
1582	1166	185	69	8	chr3	130693158	130693403	-28906380	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	260	-114	3
1582	1632	178	97	3	chr3	130707625	130707974	-28891809	-	MTD	LTR	MaLR	-26	393	12	3
1582	399	221	48	0	chr3	130709923	130710017	-28889766	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	101	-277	3
1582	2391	184	59	179	chr3	130710017	130710835	-28888948	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	720	0	3
1582	1259	195	47	25	chr3	130710845	130711063	-28888720	+	ORR1C2	LTR	MaLR	100	326	-58	3
1582	3493	33	2	0	chr3	130711063	130711458	-28888325	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1582	1259	195	47	25	chr3	130711458	130711518	-28888265	+	ORR1C2	LTR	MaLR	327	384	0	3
1582	690	148	0	0	chr3	130714671	130714786	-28884997	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-338	115	1	3
1582	672	282	117	40	chr3	130727990	130728341	-28871442	+	MTEa	LTR	MaLR	2	379	0	4
1582	358	284	8	33	chr3	130728698	130728818	-28870965	+	MT2A	LTR	ERVL	234	350	-183	4
1582	234	192	96	0	chr3	130729005	130729057	-28870726	+	MLT2B1	LTR	ERVL	511	567	0	4
1582	1275	184	43	18	chr3	130729588	130729865	-28869918	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1294	1577	-271	4
1582	470	304	131	32	chr3	130735826	130736139	-28863644	+	MLT1K	LTR	MaLR	121	464	-131	4
1582	1894	111	39	62	chr3	130736711	130737048	-28862735	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	4
1582	579	224	100	13	chr3	130742455	130742684	-28857099	+	MTEa	LTR	MaLR	99	369	-10	4
1582	344	291	76	76	chr3	130748582	130748753	-28851030	-	MLT1H	LTR	MaLR	-10	539	314	4
1582	1212	211	57	7	chr3	130751157	130751457	-28848326	+	ORR1D2	LTR	MaLR	54	368	-2	4
1582	1189	261	74	12	chr3	130752980	130753317	-28846466	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	2	4
1582	1265	225	33	143	chr3	130755975	130756401	-28843382	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	4
1582	363	241	24	0	chr3	130758440	130758523	-28841260	-	MTD	LTR	MaLR	-24	395	311	4
1582	1669	152	10	13	chr3	130760284	130760590	-28839193	+	ORR1B2	LTR	MaLR	63	367	0	4
1582	529	322	29	5	chr3	130764082	130764288	-28835495	+	MLT2C1	LTR	ERVL	1	211	-186	4
1582	1096	212	165	56	chr3	130766568	130766918	-28832865	-	RMER15	LTR	ERVL	-113	462	64	4
1582	1353	229	35	85	chr3	130766918	130767105	-28832678	+	ORR1C2	LTR	MaLR	4	166	-218	4
1582	1353	229	35	85	chr3	130767281	130767494	-28832289	+	ORR1C2	LTR	MaLR	167	384	0	4
1582	1096	212	165	56	chr3	130767494	130767537	-28832246	-	RMER15	LTR	ERVL	-512	63	26	4
1582	1820	211	49	20	chr3	130777193	130777599	-28822184	+	MTD	LTR	MaLR	1	418	-1	5
1582	349	171	90	110	chr3	130779640	130779785	-28819998	-	RLTR15	LTR	ERVK	-1	358	217	5
1582	547	273	34	34	chr3	130780039	130780244	-28819539	-	RLTR15	LTR	ERVK	-154	205	1	5
1582	1066	234	149	6	chr3	130799829	130800152	-28799631	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	369	-1	5
1582	3213	38	30	0	chr3	130801858	130802252	-28797531	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-30	406	1	5
1582	1641	152	94	0	chr3	130803897	130804226	-28795557	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	360	-82	5
1583	769	136	0	15	chr3	130836754	130836888	-28762895	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	132	-278	6
1583	1547	212	80	68	chr3	130861536	130861950	-28737833	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1583	481	271	72	68	chr3	130867976	130868213	-28731570	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	338	6
1583	237	299	90	58	chr3	130868273	130868429	-28731354	-	RMER15	LTR	ERVL	-414	161	1	6
1583	668	195	281	21	chr3	130875179	130875404	-28724379	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	108	6
1583	268	323	204	25	chr3	130878095	130878257	-28721526	+	MLT1E2	LTR	MaLR	220	410	-217	6
1583	246	321	75	9	chr3	130878268	130878375	-28721408	+	MLT1E2	LTR	MaLR	492	605	-49	6
1583	236	325	12	24	chr3	130904609	130904694	-28695089	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-44	364	281	7
1583	1104	224	217	3	chr3	130918413	130918717	-28681066	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	1	7
1583	1403	201	186	17	chr3	130919822	130920177	-28679606	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	7
1583	231	245	104	58	chr3	130931546	130931719	-28668064	+	RMER17C	LTR	ERVK	132	312	-98	7
1583	233	296	76	46	chr3	130937928	130938059	-28661724	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	135	-273	7
1583	283	303	0	76	chr3	130938218	130938336	-28661447	+	MLT1A1	LTR	MaLR	297	405	-3	7
1584	305	296	137	88	chr3	130950523	130950749	-28649034	+	RMER20B	LTR	ERVK	99	335	-292	7
1584	1750	182	61	9	chr3	130950879	130951222	-28648561	+	ORR1B2	LTR	MaLR	7	367	0	8
1584	2473	170	114	73	chr3	130952022	130952612	-28647171	+	RLTR18	LTR	ERVK	3	616	0	8
1584	434	314	17	0	chr3	130954082	130954200	-28645583	+	MER68	LTR	ERVL	2	121	-442	8
1584	508	326	85	24	chr3	130954288	130954536	-28645247	+	MER68	LTR	ERVL	244	506	-57	8
1584	2534	172	30	165	chr3	130956476	130957137	-28642646	+	RMER15	LTR	ERVL	4	575	0	8
1584	986	279	67	0	chr3	130958432	130958686	-28641097	-	MTE2b	LTR	MaLR	-108	271	1	8
1584	1330	244	80	31	chr3	130958730	130958909	-28640874	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-27	343	145	8
1584	1330	244	80	31	chr3	130959134	130959279	-28640504	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-226	144	3	8
1584	263	224	78	144	chr3	130960224	130960391	-28639392	+	RMER15	LTR	ERVL	6	161	-414	8
1584	4204	128	42	53	chr3	130963410	130964169	-28635614	+	RMER6A	LTR	ERVK	6	756	0	8
1584	2208	139	94	41	chr3	130964565	130965001	-28634782	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	459	-2	8
1584	507	354	71	33	chr3	130975518	130975616	-28624167	+	RMER5	LTR	ERV1	152	263	-271	8
1584	507	354	71	33	chr3	130975651	130975920	-28623863	+	RMER5	LTR	ERV1	264	533	-1	8
1584	301	309	21	11	chr3	130976774	130976869	-28622914	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-80	328	233	8
1584	1099	274	35	67	chr3	130976882	130977362	-28622421	+	MT2A	LTR	ERVL	1	465	-68	8
1584	302	264	118	21	chr3	130977613	130977706	-28622077	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-263	102	1	8
1584	2973	33	0	118	chr3	130978277	130978691	-28621092	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	8
1584	2360	67	19	0	chr3	130979127	130979440	-28620343	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	8
1584	3622	93	25	9	chr3	130981735	130982606	-28617177	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	983	1	8
1584	344	162	138	0	chr3	130983156	130983236	-28616547	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-2559	2963	2873	8
1584	257	136	23	0	chr3	130984302	130984346	-28615437	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-9	361	317	8
1584	1142	205	204	33	chr3	130984455	130984661	-28615122	-	MTC	LTR	MaLR	-14	407	141	8
1584	1765	129	66	117	chr3	130984661	130985055	-28614728	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	8
1584	1142	205	204	33	chr3	130985055	130985181	-28614602	-	MTC	LTR	MaLR	-281	140	18	8
1584	381	366	18	12	chr3	130986244	130986410	-28613373	-	MLT1F	LTR	MaLR	-316	232	66	8
1584	286	297	178	8	chr3	130990616	130990745	-28609038	-	LTR48B	LTR	ERV1	-354	290	140	8
1584	3962	198	43	103	chr3	130994880	130995986	-28603797	+	RMER12	LTR	ERVK	1	1040	-282	8
1584	1453	138	142	0	chr3	130996935	130997210	-28602573	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	108	8
1584	731	150	0	0	chr3	130997466	130997577	-28602206	-	MTC	LTR	MaLR	-310	111	1	8
1584	238	279	23	23	chr3	130999082	130999170	-28600613	+	MLT1F1	LTR	MaLR	478	565	-4	8
1584	718	255	121	24	chr3	131000002	131000251	-28599532	+	MLT1D	LTR	MaLR	202	474	-31	1
1584	576	299	64	25	chr3	131002164	131002366	-28597417	-	ORR1E	LTR	MaLR	-145	214	5	2
1584	548	223	18	0	chr3	131005105	131005217	-28594566	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1011	359	246	2
1584	470	245	9	0	chr3	131007527	131007633	-28592150	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1018	352	246	2
1584	714	232	213	79	chr3	131008083	131008411	-28591372	+	MLT1B	LTR	MaLR	16	387	-3	1
1584	3421	154	30	0	chr3	131008545	131009103	-28590680	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	1
1584	336	318	135	52	chr3	131010263	131010611	-28589172	+	RLTR12B	LTR	ERVK	97	473	-55	2
1584	737	261	13	13	chr3	131011332	131011557	-28588226	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-828	6950	6726	2
1584	1144	204	34	22	chr3	131012142	131012418	-28587365	-	RLTR6-int	LTR	ERV1	-7517	261	3	2
1584	553	263	82	57	chr3	131012427	131012701	-28587082	-	LTRIS4	LTR	ERV1	-7	512	235	2
1584	559	317	83	104	chr3	131013533	131014040	-28585743	+	RLTR18B	LTR	ERVK	2	497	-15	2
1584	636	274	78	132	chr3	131016541	131016987	-28582796	+	RLTR23	LTR	ERV1	5	426	-4	3
1584	2215	85	42	0	chr3	131017017	131017323	-28582460	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1584	434	284	37	69	chr3	131017566	131017755	-28582028	-	LTR40b	LTR	ERVL	-84	378	196	3
1584	1592	204	68	6	chr3	131017931	131018271	-28581512	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	10	3
1584	933	176	65	16	chr3	131020207	131020392	-28579391	+	RMER4B	LTR	ERVK	62	255	-330	4
1584	475	183	309	22	chr3	131021342	131021517	-28578266	+	RMER4B	LTR	ERVK	343	568	-17	4
1584	2945	120	7	15	chr3	131029064	131029521	-28570262	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	6
1584	2052	141	21	9	chr3	131031207	131031536	-28568247	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	333	-61	6
1584	1738	169	59	22	chr3	131032042	131032399	-28567384	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	6
1584	423	159	86	86	chr3	131032717	131032834	-28566949	-	MT2B2	LTR	ERVL	-344	240	124	6
1584	2816	73	141	139	chr3	131040751	131041262	-28558521	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	8
1584	1898	147	13	88	chr3	131049241	131049514	-28550269	-	MTC	LTR	MaLR	-62	359	109	9
1584	1898	147	13	88	chr3	131049686	131049800	-28549983	-	MTC	LTR	MaLR	-313	108	1	9
1584	338	305	202	17	chr3	131056269	131056506	-28543277	+	RMER15	LTR	ERVL	295	575	0	1
1584	2303	149	52	12	chr3	131057195	131057597	-28542186	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	1
1584	909	241	160	30	chr3	131059103	131059496	-28540287	-	RMER6B	LTR	ERVK	-15	446	3	1
1584	718	261	180	40	chr3	131070649	131070976	-28528807	+	MTEa	LTR	MaLR	5	377	-2	1
1585	368	312	7	7	chr3	131072554	131072699	-28527084	-	MER68	LTR	ERVL	-2	561	417	1
1585	497	273	75	23	chr3	131072780	131072975	-28526808	-	MER68	LTR	ERVL	-286	277	73	1
1585	1194	206	145	84	chr3	131072975	131073320	-28526463	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	1
1585	497	273	75	23	chr3	131073497	131073514	-28526269	-	MER68	LTR	ERVL	-491	72	54	1
1585	340	192	14	14	chr3	131073679	131073753	-28526030	-	MER68	LTR	ERVL	-478	85	12	1
1585	308	191	313	20	chr3	131076286	131076436	-28523347	+	MTD	LTR	MaLR	7	200	-219	1
1585	268	303	24	139	chr3	131135615	131135699	-28464084	-	MT2B2	LTR	ERVL	-425	159	95	1
1585	275	307	11	11	chr3	131141917	131142006	-28457777	+	MTEb	LTR	MaLR	284	372	-7	1
1585	490	307	109	41	chr3	131143103	131143324	-28456459	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	270	1
1585	2715	58	0	3	chr3	131144408	131144736	-28455047	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1585	247	234	71	126	chr3	131145827	131145862	-28453921	+	MT2B	LTR	ERVL	138	165	-436	1
1585	1767	100	143	0	chr3	131162028	131162307	-28437476	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-10	319	1	2
1585	466	256	51	58	chr3	131163282	131163419	-28436364	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	243	2
1585	2176	147	73	25	chr3	131163541	131163940	-28435843	+	MTC	LTR	MaLR	4	421	0	2
1585	3147	56	5	10	chr3	131165560	131165958	-28433825	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1585	592	290	125	96	chr3	131169058	131169466	-28430317	-	MLT1C	LTR	MaLR	-47	420	1	2
1585	2402	172	30	0	chr3	131172448	131172854	-28426929	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	2
1585	1412	116	4	18	chr3	131175536	131175765	-28424018	+	RLTR17	LTR	ERVK	467	692	0	2
1585	1803	148	81	3	chr3	131176104	131176437	-28423346	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	2
1585	4299	111	98	35	chr3	131178222	131178913	-28420870	-	RMER19A	LTR	ERVK	-2	735	1	2
1585	283	216	15	146	chr3	131181091	131181221	-28418562	+	MT2B	LTR	ERVL	152	264	-337	2
1585	2501	63	38	0	chr3	131188407	131188722	-28411061	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1585	910	131	0	10	chr3	131189132	131189302	-28410481	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-58	320	156	2
1585	4146	117	6	12	chr3	131195577	131196269	-28403514	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	69	3
1585	397	102	0	0	chr3	131196403	131196462	-28403321	-	RMER6A	LTR	ERVK	-402	59	1	3
198	4619	125	21	10	chr3	131202954	131203747	-28396036	+	RMER12	LTR	ERVK	1	802	-520	3
1586	344	252	163	25	chr3	131203750	131203953	-28395830	+	RLTR21	LTR	ERVK	1341	1571	-1	3
1586	275	331	37	55	chr3	131204436	131204599	-28395184	+	RMER15	LTR	ERVL	409	568	-7	3
1586	234	300	33	0	chr3	131205646	131205736	-28394047	+	MTEb	LTR	MaLR	279	371	-8	3
1586	2272	61	39	60	chr3	131205738	131206070	-28393713	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	5	3
1586	2532	80	61	13	chr3	131207206	131207598	-28392185	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	3
1586	3663	62	3	13	chr3	131207635	131208324	-28391459	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	17	662	-5819	3
1586	929	76	0	0	chr3	131208324	131208443	-28391340	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1477	-5004	3
1586	1891	93	0	0	chr3	131208444	131208690	-28391093	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2252	2497	-5183	3
1586	15526	36	3	3	chr3	131208708	131210511	-28389272	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4678	6481	0	3
1586	2521	106	32	22	chr3	131210511	131210918	-28388865	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	3
1586	492	187	140	0	chr3	131210982	131211089	-28388694	+	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	1	122	-210	3
1586	1549	41	3	191	chr3	131211089	131211419	-28388364	+	RLTR10	LTR	ERVK	121	388	-2	3
1586	1895	106	63	0	chr3	131214171	131214473	-28385310	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	3
1586	1745	131	48	0	chr3	131214475	131214765	-28385018	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	12	315	-1648	3
1586	449	86	14	0	chr3	131214756	131214826	-28384957	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-24	303	233	3
1586	2005	96	18	66	chr3	131218771	131219105	-28380678	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	318	-8	3
1586	11644	132	5	84	chr3	131219109	131221241	-28378542	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	1963	0	3
1586	2101	116	28	21	chr3	131221241	131221568	-28378215	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	3
1586	2817	89	40	5	chr3	131222049	131222446	-28377337	-	RLTR9F	LTR	ERVK	-4	411	1	3
1586	3156	65	5	2	chr3	131222977	131223376	-28376407	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1586	2370	8	0	0	chr3	131230276	131230532	-28369251	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1675	1930	-3555	3
1586	441	18	0	0	chr3	131230532	131230587	-28369196	+	MT-int	LTR	MaLR	676	730	-368	3
1586	5812	11	0	0	chr3	131230587	131231232	-28368551	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-3939	1546	902	3
1586	425	258	88	31	chr3	131233617	131233777	-28366006	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	172	-187	3
1586	701	234	119	18	chr3	131238479	131238738	-28361045	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	568	293	3
1586	1166	190	242	6	chr3	131238818	131239152	-28360631	-	MTD	LTR	MaLR	-6	413	1	3
1586	2077	128	13	76	chr3	131240930	131241310	-28358473	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	39	3
1586	226	270	53	26	chr3	131253809	131253885	-28345898	-	MER21B	LTR	ERV1	-505	358	281	4
1586	419	304	88	20	chr3	131253952	131254100	-28345683	-	MER21B	LTR	ERV1	-692	171	14	4
1586	348	351	65	18	chr3	131255255	131255423	-28344360	-	MER21B	LTR	ERV1	-396	467	292	4
1586	539	303	84	35	chr3	131255446	131255648	-28344135	-	MER21B	LTR	ERV1	-647	216	5	4
1586	299	173	10	156	chr3	131266586	131266682	-28333101	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-520	508	427	4
1586	225	260	62	80	chr3	131271379	131271492	-28328291	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1505	1615	-177	4
1586	588	203	130	7	chr3	131272263	131272314	-28327469	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	467	4
1586	588	233	119	14	chr3	131272335	131272494	-28327289	-	MT2A	LTR	ERVL	-53	548	362	4
1586	1546	163	183	0	chr3	131287413	131287763	-28312020	+	MTD	LTR	MaLR	1	414	-5	4
1586	761	252	162	37	chr3	131288565	131288948	-28310835	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	431	-10	4
1586	345	283	156	27	chr3	131290219	131290444	-28309339	-	LTR16A	LTR	ERVL	-192	259	6	4
1586	273	296	69	112	chr3	131292341	131292501	-28307282	-	MER31A	LTR	ERV1	-79	406	254	4
1586	577	237	89	21	chr3	131304560	131304750	-28295033	-	MLT1A	LTR	MaLR	-169	205	3	5
1586	253	302	31	20	chr3	131309760	131309858	-28289925	-	MER34A	LTR	ERV1	-468	103	5	5
1586	896	165	86	91	chr3	131311908	131312128	-28287655	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	203	5
1586	649	169	25	0	chr3	131320607	131320721	-28279062	+	MTC	LTR	MaLR	1	117	-304	5
1586	1128	104	11	16	chr3	131320721	131320906	-28278877	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	176	5
1586	412	97	0	16	chr3	131320911	131320974	-28278809	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-2362	6597	6536	5
1586	1568	227	78	21	chr3	131321288	131321773	-28278010	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	513	-14	5
1586	317	104	0	0	chr3	131321820	131321868	-28277915	+	MTC	LTR	MaLR	112	159	-262	5
1586	899	100	94	56	chr3	131321873	131322053	-28277730	+	RMER6B	LTR	ERVK	275	461	0	5
1586	242	271	61	30	chr3	131325280	131325379	-28274404	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-3	486	385	5
1587	242	309	38	68	chr3	131337222	131337354	-28262429	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-79	477	350	5
1587	272	267	17	0	chr3	131338522	131338582	-28261201	+	MTE2a	LTR	MaLR	9	69	-310	5
1587	2160	204	0	28	chr3	131344169	131344550	-28255233	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	351	5
1587	2160	204	0	28	chr3	131344647	131344698	-28255085	-	RMER6D	LTR	ERVK	-370	350	300	5
1587	1068	167	39	0	chr3	131344694	131344874	-28254909	-	RMER6D	LTR	ERVK	-503	187	1	5
1587	1978	152	19	60	chr3	131351888	131352266	-28247517	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-28	339	1	5
1587	248	375	24	40	chr3	131353805	131353930	-28245853	-	MLT1K	LTR	MaLR	-310	285	163	5
1587	1904	304	25	40	chr3	131357060	131357633	-28242150	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-979	601	38	5
1587	2707	134	61	8	chr3	131357633	131358012	-28241771	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	96	5
1587	2707	134	61	8	chr3	131358044	131358138	-28241645	-	RLTR19	LTR	ERVK	-404	95	2	5
1587	1904	304	25	40	chr3	131358138	131358164	-28241619	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1543	37	11	5
1587	642	276	115	90	chr3	131358172	131358538	-28241245	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	1	5
1587	1845	174	117	5	chr3	131359134	131359509	-28240274	+	MTC	LTR	MaLR	1	417	-4	5
1587	1054	223	36	194	chr3	131360171	131360610	-28239173	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	5
1587	415	374	56	45	chr3	131363090	131363446	-28236337	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-38	370	11	5
1587	1029	324	48	79	chr3	131366813	131367423	-28232360	+	RLTR18	LTR	ERVK	2	592	-24	6
1587	470	314	126	57	chr3	131368952	131369286	-28230497	+	MTEa	LTR	MaLR	6	362	-17	6
1587	479	318	171	0	chr3	131378531	131378748	-28221035	-	MLT1C	LTR	MaLR	-6	461	208	6
1587	1381	227	117	17	chr3	131383148	131383506	-28216277	+	MTD	LTR	MaLR	26	419	0	6
1587	228	260	179	52	chr3	131393568	131393702	-28206081	+	MLT1A	LTR	MaLR	35	185	-189	6
1587	307	259	42	85	chr3	131398734	131398970	-28200813	-	RMER17D	LTR	ERVK	-492	397	172	6
1587	992	154	0	6	chr3	131403907	131404077	-28195706	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	169	-177	6
1587	721	317	4	84	chr3	131404875	131405031	-28194752	+	ORR1E	LTR	MaLR	105	244	-115	6
1587	721	317	4	84	chr3	131405056	131405174	-28194609	+	ORR1E	LTR	MaLR	245	357	-2	6
1587	1054	298	73	45	chr3	131406367	131406487	-28193296	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	116	-249	6
1587	3114	131	90	43	chr3	131406487	131406849	-28192934	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	373	-317	6
1587	3114	131	90	43	chr3	131406921	131407214	-28192569	+	RMER6C	LTR	ERVK	374	690	0	6
1587	1054	298	73	45	chr3	131407214	131407448	-28192335	+	MLT1A0	LTR	MaLR	117	365	0	6
1587	1698	206	82	14	chr3	131412425	131412790	-28186993	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	24	6
1587	1485	224	95	8	chr3	131414727	131415096	-28184687	+	MTD	LTR	MaLR	5	405	-14	6
1587	3782	145	143	86	chr3	131416249	131417096	-28182687	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	895	-7	6
1587	714	281	196	22	chr3	131417303	131417620	-28182163	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	6
1587	313	210	118	82	chr3	131417780	131417915	-28181868	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4155	1367	1228	6
1587	417	379	118	6	chr3	131420880	131421050	-28178733	+	LTR16B	LTR	ERVL	11	199	-264	6
1587	1298	267	49	9	chr3	131421779	131422136	-28177647	+	MTD	LTR	MaLR	44	405	-14	6
1587	2102	245	77	38	chr3	131422140	131422807	-28176976	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	693	-565	6
1587	1528	188	96	8	chr3	131422776	131423151	-28176632	+	MTD-int	LTR	MaLR	851	1258	0	6
1587	1360	271	62	16	chr3	131423151	131423523	-28176260	+	MTD	LTR	MaLR	1	389	-30	6
1587	582	383	102	25	chr3	131423527	131423931	-28175852	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-120	440	6	6
1587	486	305	137	48	chr3	131424162	131424475	-28175308	-	MER57D	LTR	ERV1	-59	352	12	6
1587	243	309	135	26	chr3	131427235	131427391	-28172392	+	MLT1A0	LTR	MaLR	185	357	-8	6
1587	1976	35	93	0	chr3	131437066	131437325	-28162458	-	RLTR10B	LTR	ERVK	0	292	10	7
1587	900	303	28	22	chr3	131437350	131437705	-28162078	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	7
1587	830	273	36	50	chr3	131437963	131438325	-28161458	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	359	0	7
1587	630	264	112	19	chr3	131445361	131445566	-28154217	-	MLT1C	LTR	MaLR	-9	458	235	7
1587	664	212	61	68	chr3	131446825	131447088	-28152695	-	RLTR15	LTR	ERVK	-66	293	33	7
1587	2247	138	33	51	chr3	131450883	131450983	-28148800	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	99	-343	7
1587	2247	138	33	51	chr3	131451388	131451737	-28148046	+	RMER10A	LTR	ERVL	100	441	-1	7
1587	922	332	3	27	chr3	131453785	131454085	-28145698	-	MTE2b	LTR	MaLR	-52	327	35	7
1587	1599	232	82	13	chr3	131456760	131457140	-28142643	+	MTD	LTR	MaLR	1	406	-13	7
1587	280	330	146	36	chr3	131462802	131463022	-28136761	-	MLT1B	LTR	MaLR	-179	310	67	7
1588	367	301	101	71	chr3	131466926	131467094	-28132689	-	MLT1B-int	LTR	MaLR	-788	599	427	7
1588	362	363	79	32	chr3	131467113	131467392	-28132391	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	632	923	-464	7
1588	905	299	53	76	chr3	131467432	131467906	-28131877	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-4779	978	516	7
1588	238	348	59	25	chr3	131469132	131469250	-28130533	+	LTR78	LTR	ERV1	834	955	-349	7
1588	349	322	41	14	chr3	131469924	131470069	-28129714	-	MLT1B	LTR	MaLR	-79	311	163	7
1588	303	255	9	113	chr3	131470273	131470388	-28129395	-	MLT1B	LTR	MaLR	-239	151	49	7
1588	279	300	46	37	chr3	131473994	131474212	-28125571	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-492	414	195	7
1588	359	310	83	47	chr3	131475221	131475414	-28124369	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-1	568	369	7
1588	241	282	28	0	chr3	131475550	131475621	-28124162	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-359	201	129	7
1588	560	368	50	34	chr3	131481076	131481374	-28118409	-	MLT1A	LTR	MaLR	-40	334	32	7
1588	2173	196	60	95	chr3	131485766	131486398	-28113385	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	610	1	7
1588	315	288	76	49	chr3	131496446	131496669	-28103114	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	305	7
1588	268	376	39	28	chr3	131496762	131496940	-28102843	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-383	334	155	8
1588	2028	117	58	0	chr3	131499570	131499878	-28099905	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	8
1588	638	220	75	45	chr3	131501414	131501614	-28098169	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	213	7
1588	871	246	86	43	chr3	131508158	131508582	-28091201	-	RMER20B	LTR	ERVK	-1	626	129	1
1588	242	357	61	18	chr3	131515367	131515481	-28084302	+	MLT1H	LTR	MaLR	1	119	-430	2
1588	229	356	150	53	chr3	131516176	131516422	-28083361	+	ORR1E	LTR	MaLR	90	359	0	3
1588	245	307	0	26	chr3	131518948	131519025	-28080758	-	RMER15	LTR	ERVL	-98	477	403	3
1588	2138	244	69	20	chr3	131520264	131520737	-28079046	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	3	488	-90	3
1588	2138	244	69	20	chr3	131520767	131520842	-28078941	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	489	577	-1	3
1588	1577	251	46	43	chr3	131524968	131525384	-28074399	+	MTD	LTR	MaLR	2	418	-1	4
1588	2357	145	128	130	chr3	131526857	131527427	-28072356	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	585	17	4
1588	562	257	22	0	chr3	131528173	131528309	-28071474	+	MTD	LTR	MaLR	1	139	-280	4
1588	567	234	99	0	chr3	131528308	131528449	-28071334	+	MTD	LTR	MaLR	265	419	0	4
1588	452	229	132	33	chr3	131529222	131529389	-28070394	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	419	246	5
1588	523	295	0	39	chr3	131532873	131533028	-28066755	+	MTE2b	LTR	MaLR	28	176	-203	5
1588	559	341	65	80	chr3	131546397	131546735	-28053048	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	340	-19	6
1588	405	306	80	25	chr3	131547592	131547793	-28051990	-	RMER15	LTR	ERVL	-12	563	352	6
1588	405	250	40	40	chr3	131553220	131553320	-28046463	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	107	-252	7
1588	377	291	3	64	chr3	131553642	131553796	-28045987	+	ORR1E	LTR	MaLR	158	327	-52	7
1588	1086	287	191	26	chr3	131557785	131558283	-28041500	-	MLT2F	LTR	ERVL	-81	582	3	8
1588	432	311	45	11	chr3	131558706	131558885	-28040898	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-3717	1950	1766	8
1588	267	145	46	46	chr3	131560032	131560097	-28039686	-	RLTR42	LTR	ERVK	-28	211	147	9
1588	538	219	16	47	chr3	131560180	131560309	-28039474	-	RLTR42	LTR	ERVK	-113	126	2	9
1588	4125	49	19	0	chr3	131565498	131565964	-28033819	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	1
1588	4564	17	0	0	chr3	131566991	131567473	-28032310	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	1
1588	2210	97	6	59	chr3	131570568	131570908	-28028875	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	6	1
1588	3045	79	20	10	chr3	131579254	131579650	-28020133	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1588	279	342	34	51	chr3	131587551	131587668	-28012115	+	MTC	LTR	MaLR	256	370	-51	1
1588	378	275	74	8	chr3	131587729	131587850	-28011933	+	RMER15	LTR	ERVL	1	129	-446	1
1588	396	304	11	0	chr3	131587886	131587978	-28011805	+	RMER15	LTR	ERVL	276	368	-207	1
1588	609	281	50	30	chr3	131588057	131588259	-28011524	+	RMER15	LTR	ERVL	370	575	0	1
1588	909	138	29	139	chr3	131588622	131589207	-28010576	-	RMER17C	LTR	ERVK	-9	401	3	1
1588	4774	10	0	0	chr3	131591517	131592010	-28007773	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1588	322	0	0	0	chr3	131592010	131592048	-28007735	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	1
1588	368	179	46	35	chr3	131592048	131592135	-28007648	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	1
198	48404	14	6	0	chr3	131592135	131597461	-28002322	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	1
1589	4774	10	0	0	chr3	131597461	131597954	-28001829	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1589	2036	135	9	12	chr3	131622305	131622635	-27977148	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
1589	6300	139	38	88	chr3	131622635	131623948	-27975835	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	0	1963	717	1
1589	445	161	0	230	chr3	131623904	131624017	-27975766	-	MT2B	LTR	ERVL	-309	292	206	1
1589	288	51	0	0	chr3	131624013	131624052	-27975731	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-1470	39	1	1
1589	1798	158	32	0	chr3	131624056	131624367	-27975416	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	1
1589	1345	226	137	30	chr3	131626821	131627186	-27972597	+	MTD	LTR	MaLR	3	406	-13	1
1589	532	343	121	26	chr3	131633697	131634163	-27965620	+	MLT1H	LTR	MaLR	6	540	-9	1
1589	1003	285	0	84	chr3	131635125	131635470	-27964313	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-735	635	321	1
1589	858	296	40	53	chr3	131635643	131635943	-27963840	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1073	297	2	1
1589	857	287	83	39	chr3	131635937	131636274	-27963509	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	356	5	1
1589	319	339	141	46	chr3	131642882	131643237	-27956546	-	MLT1H-int	LTR	MaLR	0	1489	1037	1
1589	1399	192	84	21	chr3	131643981	131644022	-27955761	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-2	365	308	1
1589	1399	192	84	21	chr3	131644459	131644704	-27955079	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-60	307	61	1
1589	2113	110	81	79	chr3	131645490	131645935	-27953848	-	RLTR44E	LTR	ERVK	-5	447	2	1
1589	1808	170	33	69	chr3	131649720	131650112	-27949671	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
1589	298	280	120	1	chr3	131651798	131651909	-27947874	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	248	2
1589	406	310	139	87	chr3	131663042	131663423	-27936360	+	LTR50	LTR	ERVL	16	416	-379	2
1589	502	280	43	70	chr3	131663478	131663708	-27936075	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	336	2
1589	258	312	75	67	chr3	131681090	131681108	-27918675	-	MT2B	LTR	ERVL	-354	247	220	2
1589	258	312	75	67	chr3	131681160	131681224	-27918559	-	MT2B	LTR	ERVL	-354	219	113	2
1589	441	310	42	26	chr3	131688180	131688236	-27911547	-	MT2A	LTR	ERVL	-338	195	1	2
1589	477	294	29	0	chr3	131688236	131688372	-27911411	-	MTEa	LTR	MaLR	-239	140	1	2
1589	3050	165	68	59	chr3	131689160	131689919	-27909864	-	RMER17B	LTR	ERVK	-16	793	1	2
1589	2013	164	8	53	chr3	131691103	131691477	-27908306	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-10	357	1	2
1589	318	310	22	37	chr3	131705165	131705299	-27894484	-	RMER12	LTR	ERVK	-458	864	733	2
1589	1860	180	46	3	chr3	131708379	131708703	-27891080	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	30	2
1589	1969	124	3	86	chr3	131712059	131712421	-27887362	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	332	-5	2
1589	1251	225	108	3	chr3	131712904	131713220	-27886563	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	352	-22	2
1589	1838	169	149	11	chr3	131713220	131713590	-27886193	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1589	1840	194	154	48	chr3	131713784	131714305	-27885478	-	RMER19B	LTR	ERVK	-19	883	308	2
1589	2318	108	6	0	chr3	131715260	131715584	-27884199	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	1	2
1589	258	302	47	16	chr3	131715694	131715822	-27883961	+	MLT1L	LTR	MaLR	352	483	-127	2
1589	357	330	99	99	chr3	131719076	131719429	-27880354	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	353	1	2
1589	3071	192	74	90	chr3	131725396	131726300	-27873483	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	-12	890	1	3
1590	1595	241	44	68	chr3	131730428	131730882	-27868901	+	RMER19C	LTR	ERVK	169	611	0	3
1590	366	310	80	33	chr3	131741630	131741780	-27858003	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	157	-233	3
1590	351	288	83	17	chr3	131741793	131741913	-27857870	+	MLT1B	LTR	MaLR	340	467	0	3
1590	234	357	23	45	chr3	131767082	131767170	-27832613	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-873	477	392	3
1590	607	341	84	15	chr3	131777602	131777876	-27821907	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-332	295	3	3
1590	277	368	87	24	chr3	131778266	131778472	-27821311	+	MLT1C	LTR	MaLR	197	415	-52	3
1590	1858	125	68	62	chr3	131796223	131796548	-27803235	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1590	1152	276	54	16	chr3	131812927	131813240	-27786543	-	MTE2b	LTR	MaLR	-40	339	15	4
1590	806	172	49	31	chr3	131843686	131844008	-27755775	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	418	-24	4
1590	3847	114	161	11	chr3	131845330	131845970	-27753813	-	RMER19A	LTR	ERVK	-1	736	1	4
1590	2301	107	3	58	chr3	131851386	131851732	-27748051	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1591	1319	315	42	8	chr3	131873225	131873731	-27726052	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4167	4689	-310	5
1591	361	242	0	29	chr3	131873751	131873853	-27725930	-	RMER12	LTR	ERVK	-453	869	771	5
1591	2013	196	39	76	chr3	131873939	131874397	-27725386	-	MT2A	LTR	ERVL	-92	441	1	5
1591	575	289	44	40	chr3	131874397	131874624	-27725159	+	RMER15	LTR	ERVL	345	572	-3	5
1591	460	189	13	0	chr3	131874627	131874716	-27725067	+	MTEa	LTR	MaLR	287	376	-3	5
1591	456	356	137	38	chr3	131877017	131877332	-27722451	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	14	5
1591	497	323	76	68	chr3	131882242	131882597	-27717186	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	2	5
1591	533	283	142	28	chr3	131894582	131894829	-27704954	+	RMER15	LTR	ERVL	288	562	-13	5
1591	2171	117	13	3	chr3	131894867	131895185	-27704598	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-6	321	1	5
1591	435	348	133	2	chr3	131900290	131900697	-27699086	-	MLT1C	LTR	MaLR	-8	459	1	5
1591	257	362	68	36	chr3	131900989	131901181	-27698602	+	ORR1E	LTR	MaLR	10	207	-152	5
1591	2284	180	35	8	chr3	131901757	131902155	-27697628	+	MTC	LTR	MaLR	13	421	0	5
1591	250	302	71	20	chr3	131902513	131902611	-27697172	+	RMER12	LTR	ERVK	750	852	-470	5
1591	791	282	122	58	chr3	131903086	131903429	-27696354	-	MTEa	LTR	MaLR	-11	368	4	5
1591	503	295	73	71	chr3	131910312	131910637	-27689146	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	408	68	5
1591	1414	218	146	31	chr3	131917000	131917384	-27682399	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	475	5
1591	293	355	115	16	chr3	131918510	131918693	-27681090	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	190	5
1591	4391	183	34	73	chr3	131920971	131921896	-27677887	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	888	-14	5
1591	543	329	46	36	chr3	131921925	131922228	-27677555	-	RLTR23	LTR	ERV1	-21	409	104	5
1591	336	235	93	12	chr3	131922360	131922446	-27677337	-	RLTR23	LTR	ERV1	-330	100	8	5
1591	1834	232	23	2	chr3	131926067	131926460	-27673323	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	19	6
1591	425	308	73	106	chr3	131929279	131929837	-27669946	+	LTR48	LTR	ERV1	109	785	-2	6
1591	556	313	118	45	chr3	131940640	131940962	-27658821	-	LTR40c	LTR	ERVL	-134	328	1	6
1591	336	354	30	6	chr3	131941506	131941671	-27658112	+	RMER15	LTR	ERVL	402	570	-5	6
1591	261	368	36	22	chr3	131942585	131942623	-27657160	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4330	4466	-1667	6
1591	287	281	31	10	chr3	131942623	131942720	-27657063	+	MER52-int	LTR	ERV1	6301	6399	-692	6
1591	622	328	55	30	chr3	131952746	131952982	-27646801	-	MTEa	LTR	MaLR	-15	364	123	6
1591	2291	293	39	17	chr3	131953073	131953788	-27645995	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	0	1580	850	6
1591	2916	161	85	45	chr3	131953794	131954359	-27645424	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	19	6
1591	2916	161	85	45	chr3	131954379	131954391	-27645392	-	RMER19C	LTR	ERVK	-593	18	11	6
1591	459	153	0	0	chr3	131954392	131954464	-27645319	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-496	72	1	6
1591	264	318	12	12	chr3	131954528	131954614	-27645169	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1493	87	2	6
1591	287	282	43	101	chr3	131954633	131954771	-27645012	-	ORR1E	LTR	MaLR	-15	344	215	6
1591	3067	50	10	0	chr3	131957497	131957881	-27641902	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	6
1591	1265	240	108	8	chr3	131961687	131962057	-27637726	+	MTD	LTR	MaLR	13	419	0	6
1591	1963	142	114	14	chr3	131973432	131973790	-27625993	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	6
1591	921	305	106	0	chr3	131978364	131978705	-27621078	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	1	6
1591	1790	204	41	34	chr3	131979048	131979464	-27620319	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	6
1591	2136	108	3	0	chr3	131982543	131982857	-27616926	+	ORR1A2	LTR	MaLR	10	324	-3	6
1591	333	252	162	19	chr3	131985348	131985453	-27614330	+	MTD	LTR	MaLR	1	120	-299	6
1592	2531	200	78	22	chr3	131990601	131991180	-27608603	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1592	1870	182	42	8	chr3	131993024	131993379	-27606404	+	MTD	LTR	MaLR	45	411	-8	6
1592	277	429	65	5	chr3	131996846	131997031	-27602752	+	MLT1K	LTR	MaLR	344	539	-56	7
1592	332	343	69	25	chr3	131999235	131999438	-27600345	-	MLT1D	LTR	MaLR	-263	242	31	7
1592	277	315	63	57	chr3	131999680	131999855	-27599928	-	MLT2D	LTR	ERVL	-10	550	375	7
1592	365	343	114	17	chr3	132000453	132000690	-27599093	-	MER90a	LTR	ERV1	-174	440	181	3
1592	1396	210	51	66	chr3	132002354	132002580	-27597203	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	152	7
1592	1396	210	51	66	chr3	132002752	132002857	-27596926	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-216	151	41	7
1592	1274	189	29	8	chr3	132004837	132005077	-27594706	+	RMER19C	LTR	ERVK	367	611	0	1
1592	1691	187	57	9	chr3	132030190	132030540	-27569243	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	5
1592	240	230	24	98	chr3	132037501	132037583	-27562200	-	ORR1E	LTR	MaLR	-186	173	98	6
1592	2188	124	9	0	chr3	132037824	132038139	-27561644	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	6
1592	2903	65	47	0	chr3	132040339	132040721	-27559062	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
1592	2356	63	28	21	chr3	132043279	132043604	-27556179	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	7
1592	1571	195	89	0	chr3	132049747	132050096	-27549687	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-4	380	1	8
1592	259	360	67	34	chr3	132058298	132058476	-27541307	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	253	436	-951	1
1592	546	264	28	84	chr3	132058916	132059094	-27540689	-	RLTR9B	LTR	ERVK	0	437	270	1
1592	1001	242	17	55	chr3	132059651	132059944	-27539839	+	MLT1B	LTR	MaLR	93	374	-16	1
1592	235	345	148	47	chr3	132061722	132061884	-27537899	-	MLT1B	LTR	MaLR	-4	361	176	1
1592	273	229	193	27	chr3	132061905	132062060	-27537723	-	MLT1B	LTR	MaLR	-190	175	3	1
1592	562	332	81	44	chr3	132064757	132065236	-27534547	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	497	-30	1
1592	545	314	134	0	chr3	132066970	132067142	-27532641	+	MER21B	LTR	ERV1	138	332	-531	1
1592	855	245	109	72	chr3	132067212	132067333	-27532450	+	ORR1B1	LTR	MaLR	45	151	-243	1
1592	855	232	121	13	chr3	132067386	132067568	-27532215	+	ORR1B1	LTR	MaLR	152	361	-33	1
1592	801	272	70	29	chr3	132068157	132068430	-27531353	+	MLT1C	LTR	MaLR	184	467	0	1
1592	524	295	168	58	chr3	132082987	132083380	-27516403	+	MLT1K	LTR	MaLR	151	586	-9	1
1592	917	129	13	20	chr3	132091971	132092121	-27507662	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1815	1963	0	1
1592	1764	117	17	59	chr3	132092121	132092411	-27507372	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	278	-49	1
1592	311	345	74	0	chr3	132094522	132094670	-27505113	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-210	254	96	1
1592	336	289	77	157	chr3	132096176	132096553	-27503230	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	24	1
1592	710	360	69	33	chr3	132100207	132100598	-27499185	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	4	1
1592	1680	189	42	40	chr3	132110810	132111190	-27488593	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-3	381	1	1
1592	1242	250	69	29	chr3	132116944	132117290	-27482493	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	377	-2	1
1592	3455	20	2	0	chr3	132119609	132120004	-27479779	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1593	950	216	67	165	chr3	132121188	132121424	-27478359	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	153	1
1593	3344	30	5	0	chr3	132121424	132121817	-27477966	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	395	-1	1
1593	950	216	67	165	chr3	132121817	132121985	-27477798	-	MTE2a	LTR	MaLR	-227	152	6	1
1593	1851	159	96	11	chr3	132123462	132123825	-27475958	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	2
1593	579	255	45	7	chr3	132124731	132124878	-27474905	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1087	171	19	2
1593	1288	247	95	21	chr3	132124878	132125245	-27474538	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	21	2
1593	1288	247	95	21	chr3	132125276	132125296	-27474487	-	MTD	LTR	MaLR	-399	20	3	2
1593	397	263	93	0	chr3	132127176	132127329	-27472454	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-25	524	364	2
1593	1430	115	30	229	chr3	132129568	132129975	-27469808	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	4	2
1593	1674	175	58	3	chr3	132131184	132131476	-27468307	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	114	2
1593	273	262	0	87	chr3	132131712	132131804	-27467979	-	MTC	LTR	MaLR	-322	99	16	2
1593	378	304	95	29	chr3	132134115	132134325	-27465458	+	RMER20B	LTR	ERVK	141	364	-263	2
1593	356	238	180	16	chr3	132136939	132137067	-27462716	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-218	149	1	2
1593	1046	260	88	66	chr3	132139851	132140247	-27459536	+	MTD	LTR	MaLR	21	383	-36	2
1593	1818	168	5	79	chr3	132149723	132150164	-27449619	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	410	0	2
1593	333	271	171	8	chr3	132151710	132151833	-27447950	+	RMER15	LTR	ERVL	419	561	-14	2
1593	2196	132	3	0	chr3	132155790	132156116	-27443667	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1593	324	339	106	43	chr3	132160722	132160910	-27438873	-	MLT1J	LTR	MaLR	-31	481	282	2
1593	572	384	112	31	chr3	132161021	132161212	-27438571	+	MLT1E2	LTR	MaLR	1	200	-427	2
1593	572	384	112	31	chr3	132161282	132161453	-27438330	+	MLT1E2	LTR	MaLR	201	388	-239	2
1593	572	384	112	31	chr3	132161490	132161704	-27438079	+	MLT1E2	LTR	MaLR	389	623	-4	2
1593	568	191	36	79	chr3	132171910	132172075	-27427708	+	RMER10B	LTR	ERVL	195	352	-46	3
1593	550	349	76	44	chr3	132176435	132176750	-27423033	-	MLT1B	LTR	MaLR	-65	325	1	3
1593	3391	39	0	130	chr3	132182532	132183033	-27416750	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	3
1593	7477	34	3	22	chr3	132183033	132183987	-27415796	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	6646	3
1593	5652	32	38	3	chr3	132183973	132184960	-27414823	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1771	5810	4790	3
1593	1874	44	0	2	chr3	132184953	132185388	-27414395	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1100	887	652	3
1593	339	67	0	0	chr3	132185391	132185436	-27414347	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6405	137	93	3
1593	402	0	0	0	chr3	132185600	132185646	-27414137	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7314	267	222	3
1593	245	191	0	0	chr3	132185646	132185688	-27414095	-	RLTR27	LTR	ERVK	-37	272	231	3
1593	1451	33	0	0	chr3	132185688	132185868	-27413915	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7401	180	1	3
1593	3729	37	5	0	chr3	132185868	132186302	-27413481	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	3
1593	1146	258	92	14	chr3	132190106	132190401	-27409382	+	ORR1D2	LTR	MaLR	50	367	-3	3
1593	706	251	254	51	chr3	132191957	132192357	-27407426	+	RMER13A	LTR	ERVK	2	482	-378	3
1593	260	275	105	72	chr3	132192433	132192586	-27407197	+	RMER13A	LTR	ERVK	741	898	-10	3
1593	3276	45	22	0	chr3	132206475	132206877	-27392906	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	3
1593	259	237	52	13	chr3	132208431	132208508	-27391275	+	ORR1E	LTR	MaLR	14	93	-266	3
1593	1707	252	45	36	chr3	132211330	132211885	-27387898	-	MER68	LTR	ERVL	-1	562	3	3
1593	472	229	111	104	chr3	132212685	132213127	-27386656	+	RLTR11B	LTR	ERVK	6	568	0	3
1593	236	377	74	51	chr3	132214812	132215027	-27384756	+	MLT1J1	LTR	MaLR	81	300	-144	3
1593	805	229	68	32	chr3	132219498	132219656	-27380127	-	RMER17C	LTR	ERVK	-4	406	246	3
1593	1007	166	31	1	chr3	132219785	132219990	-27379793	-	RMER17C	LTR	ERVK	-165	245	1	3
1593	1934	124	86	29	chr3	132226875	132227065	-27372718	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	214	4
1593	1934	124	86	29	chr3	132227104	132227296	-27372487	-	RMER17C	LTR	ERVK	-197	213	6	4
1593	658	327	56	30	chr3	132233737	132234074	-27365709	+	ORR1E	LTR	MaLR	14	359	0	4
1593	2108	146	6	6	chr3	132234839	132235150	-27364633	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	4
1593	4221	141	19	13	chr3	132235150	132235838	-27363945	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6989	4
1593	1550	89	112	0	chr3	132235835	132236059	-27363724	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5007	4
1593	357	175	0	0	chr3	132236059	132236116	-27363667	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6039	503	447	4
1593	566	306	38	38	chr3	132236133	132236503	-27363280	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-6015	1566	1197	4
1593	3345	72	26	0	chr3	132236544	132236972	-27362811	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-983	1004	566	4
1593	1381	51	6	17	chr3	132237199	132237379	-27362404	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7403	178	1	4
1593	347	254	143	11	chr3	132237750	132237925	-27361858	-	MER34A1	LTR	ERV1	-71	516	319	4
1593	421	282	95	40	chr3	132237985	132238133	-27361650	-	MER34A1	LTR	ERV1	-385	202	47	4
1593	356	293	99	57	chr3	132238438	132238630	-27361153	+	MLT1C	LTR	MaLR	227	426	-41	4
1593	2115	109	68	16	chr3	132245021	132245328	-27354455	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-3	323	1	4
1593	1292	213	86	99	chr3	132245449	132245744	-27354039	+	RLTR41	LTR	ERV1	10	302	-144	4
1593	3357	75	64	4	chr3	132245744	132246199	-27353584	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	4
1593	1292	213	86	99	chr3	132246199	132246346	-27353437	+	RLTR41	LTR	ERV1	303	446	0	4
1594	604	256	0	0	chr3	132252069	132252194	-27347589	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-249	125	1	4
1594	355	336	72	72	chr3	132252541	132252817	-27346966	+	MER21B	LTR	ERV1	270	545	-318	4
1594	744	315	50	43	chr3	132253183	132253505	-27346278	+	MER21B	LTR	ERV1	529	852	-11	4
1594	557	306	78	86	chr3	132255042	132255403	-27344380	+	ORR1D2	LTR	MaLR	10	367	-3	4
1594	3220	79	8	0	chr3	132261264	132261657	-27338126	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1594	1436	167	24	63	chr3	132268801	132269133	-27330650	-	MTC-int	LTR	MaLR	-924	334	16	4
1594	2157	168	96	13	chr3	132269133	132269520	-27330263	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	4
1594	1705	233	79	79	chr3	132269801	132270332	-27329451	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	45	4
1594	272	237	17	0	chr3	132270381	132270440	-27329343	-	RMER15	LTR	ERVL	-515	60	1	4
1594	244	255	159	85	chr3	132277256	132277432	-27322351	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	372	4
1594	873	55	0	0	chr3	132301173	132301283	-27298500	-	MTB	LTR	MaLR	0	396	287	5
1594	2722	45	0	0	chr3	132301283	132301617	-27298166	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	24	5
1594	2208	51	17	3	chr3	132301609	132301904	-27297879	-	MTB	LTR	MaLR	-101	299	1	5
1594	701	318	77	21	chr3	132304962	132305287	-27294496	-	MLT1B	LTR	MaLR	-45	345	3	5
1594	1294	276	54	42	chr3	132311085	132311581	-27288202	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	33	5
1594	497	234	351	2	chr3	132313835	132314045	-27285738	-	MTC	LTR	MaLR	-128	293	13	5
1594	234	273	0	0	chr3	132314057	132314112	-27285671	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1204	5
1594	817	211	320	4	chr3	132314112	132314269	-27285514	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	176	5
1594	817	211	320	4	chr3	132314395	132314484	-27285299	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-199	175	50	5
1594	4401	221	105	29	chr3	132314510	132315782	-27284001	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-2	1368	1	5
1594	1157	206	69	44	chr3	132315796	132316107	-27283676	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	357	1	5
1594	3656	203	146	67	chr3	132316107	132316806	-27282977	-	MTC-int	LTR	MaLR	-49	1209	395	5
1594	3656	203	146	67	chr3	132316846	132316872	-27282911	-	MTC-int	LTR	MaLR	-864	394	394	5
1594	3656	203	146	67	chr3	132317217	132317599	-27282184	-	MTC-int	LTR	MaLR	-864	394	1	5
1594	604	215	202	11	chr3	132317602	132317807	-27281976	-	MTC	LTR	MaLR	-19	402	159	5
1594	358	147	162	0	chr3	132317807	132317875	-27281908	+	MT2A	LTR	ERVL	1	79	-454	5
1594	994	201	59	70	chr3	132318821	132319147	-27280636	+	MT2A	LTR	ERVL	116	601	0	5
1594	790	228	18	5	chr3	132319147	132319306	-27280477	-	MTD	LTR	MaLR	-247	174	18	5
1594	2375	185	33	18	chr3	132319907	132320359	-27279424	+	RMER20B	LTR	ERVK	10	468	-159	5
1594	362	304	103	7	chr3	132321770	132321911	-27277872	-	MTE-int	LTR	MaLR	-42	1538	1384	5
1594	2683	177	37	20	chr3	132321911	132322447	-27277336	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	148	5
1594	264	234	13	4	chr3	132322431	132322501	-27277282	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-356	89	18	5
1594	411	181	4	48	chr3	132322517	132322658	-27277125	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2481	361	282	5
1594	909	302	52	44	chr3	132323022	132323365	-27276418	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1234	346	1	5
1594	2360	104	3	0	chr3	132328223	132328549	-27271234	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1594	751	223	106	5	chr3	132339239	132339428	-27260355	+	MTD	LTR	MaLR	5	212	-207	5
1594	672	189	189	0	chr3	132339649	132339797	-27259986	+	MTD	LTR	MaLR	224	399	-20	5
1594	237	290	39	20	chr3	132341831	132341933	-27257850	+	ORR1E	LTR	MaLR	171	274	-145	5
1594	249	269	15	0	chr3	132341949	132342016	-27257767	+	ORR1E	LTR	MaLR	292	359	0	5
1594	1159	228	93	40	chr3	132344041	132344419	-27255364	+	MT2A	LTR	ERVL	8	537	-64	5
1594	2023	116	0	3	chr3	132351055	132351358	-27248425	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	302	-282	5
1594	563	56	0	0	chr3	132351348	132351420	-27248363	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-255	72	1	5
1594	2269	74	128	8	chr3	132355197	132355563	-27244220	-	BGLII	LTR	ERVK	-11	410	1	5
1594	1103	191	109	5	chr3	132355563	132355931	-27243852	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	0	2326	1921	5
1594	655	277	115	33	chr3	132361577	132361820	-27237963	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	268	-111	6
1594	226	276	0	17	chr3	132361936	132361995	-27237788	-	ORR1E	LTR	MaLR	-267	92	35	6
1594	2606	295	106	65	chr3	132362047	132363167	-27236616	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-159	1421	256	6
1594	719	286	98	4	chr3	132363391	132363626	-27236157	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1317	263	7	6
1594	402	306	61	30	chr3	132363631	132363796	-27235987	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	210	6
1594	3316	170	62	62	chr3	132366335	132366658	-27233125	+	RLTR25A	LTR	ERVK	5	334	-769	6
1594	3316	192	109	58	chr3	132366835	132367401	-27232382	+	RLTR25A	LTR	ERVK	333	1027	-1	6
1595	457	264	15	23	chr3	132383553	132383685	-27216098	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-7	401	271	6
1595	2972	151	19	46	chr3	132385982	132386550	-27213233	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	553	0	6
1595	282	361	142	18	chr3	132391971	132392140	-27207643	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	190	-169	6
1595	632	287	81	99	chr3	132404535	132405077	-27194706	-	RLTR18B	LTR	ERVK	0	616	95	6
1595	418	361	65	78	chr3	132413509	132413818	-27185965	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-215	305	1	6
1595	1595	186	34	25	chr3	132419956	132420282	-27179501	+	MTC	LTR	MaLR	14	342	-79	6
1595	3356	43	2	0	chr3	132420699	132421094	-27178689	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1595	1359	218	63	0	chr3	132425437	132425785	-27173998	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	6
1595	465	338	200	9	chr3	132433027	132433447	-27166336	-	MER76	LTR	ERVL	-6	685	185	7
1595	276	293	129	127	chr3	132439226	132439597	-27160186	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	1	7
1595	808	148	174	0	chr3	132448047	132448202	-27151581	-	MTC	LTR	MaLR	-55	366	185	7
1595	5024	94	45	15	chr3	132451103	132451829	-27147954	-	RMER17A	LTR	ERVK	-3	748	1	7
1595	239	295	0	13	chr3	132454239	132454318	-27145465	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-249	80	3	7
1595	1217	255	26	21	chr3	132457636	132457928	-27141855	-	MTD	LTR	MaLR	-88	291	3	7
1595	291	210	0	16	chr3	132474308	132474371	-27125412	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	317	7
1595	1002	281	56	97	chr3	132474800	132475190	-27124593	+	MTE2b	LTR	MaLR	6	379	0	7
1595	486	145	5	158	chr3	132479446	132479667	-27120116	+	RMER17C	LTR	ERVK	91	277	-133	7
1595	414	184	148	52	chr3	132480401	132480516	-27119267	+	MTE2b	LTR	MaLR	237	362	-17	7
1595	657	251	11	60	chr3	132493304	132493486	-27106297	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-62	303	131	7
1595	482	291	152	37	chr3	132497450	132497746	-27102037	-	MTEb	LTR	MaLR	-49	330	1	8
1595	1300	276	33	3	chr3	132504153	132504513	-27095270	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	371	-8	8
1595	1361	235	52	36	chr3	132510927	132511289	-27088494	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	3	1
1596	306	255	0	102	chr3	132516462	132516580	-27083203	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	152	2
1596	239	290	81	130	chr3	132537054	132537339	-27062444	+	MLT1E1	LTR	MaLR	359	629	-25	3
1596	417	263	43	36	chr3	132556407	132556545	-27043238	-	LTR83	LTR	ERVL	-6	774	636	6
1596	303	301	148	0	chr3	132556831	132557034	-27042749	-	LTR83	LTR	ERVL	-418	362	130	6
1596	227	338	0	24	chr3	132584139	132584221	-27015562	+	MLT1J	LTR	MaLR	101	180	-332	8
1596	2726	149	87	2	chr3	132604238	132604742	-26995041	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	547	-21	1
1596	1505	204	202	23	chr3	132615377	132615858	-26983925	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	1
1596	681	297	75	37	chr3	132616473	132616795	-26982988	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-555	832	499	1
1596	247	337	84	6	chr3	132616808	132616987	-26982796	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-969	418	226	1
1596	413	296	169	4	chr3	132617470	132617718	-26982065	-	LTR87	LTR	ERVL?	-13	611	323	1
1596	446	325	7	7	chr3	132617814	132617969	-26981814	-	LTR87	LTR	ERVL?	-457	167	13	1
1596	2146	161	23	42	chr3	132618228	132618691	-26981092	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	1
1596	1337	256	14	33	chr3	132619824	132620184	-26979599	+	MTE2b	LTR	MaLR	18	370	-9	1
1596	1267	146	43	22	chr3	132624135	132624413	-26975370	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	1
1596	1727	175	55	0	chr3	132629284	132629632	-26970151	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-11	367	1	1
1596	230	255	94	21	chr3	132631506	132631602	-26968181	+	ORR1E	LTR	MaLR	235	337	-22	1
1596	2156	124	35	0	chr3	132632311	132632625	-26967158	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	327	0	1
1596	708	275	178	60	chr3	132633590	132633787	-26965996	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	180	1
1596	708	275	178	60	chr3	132634613	132634763	-26965020	-	MTD	LTR	MaLR	-240	179	18	1
1596	933	180	144	12	chr3	132638894	132639170	-26960613	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	379	9	1
1596	2097	143	128	54	chr3	132640717	132640906	-26958877	+	RMER6C	LTR	ERVK	112	332	-358	1
1596	2097	143	128	54	chr3	132641039	132641388	-26958395	+	RMER6C	LTR	ERVK	333	690	0	1
1596	724	271	87	16	chr3	132641915	132642161	-26957622	+	MTE-int	LTR	MaLR	800	1056	-524	1
1596	260	241	0	0	chr3	132642152	132642206	-26957577	+	MTD	LTR	MaLR	312	365	-54	1
1596	2075	219	166	103	chr3	132642229	132643071	-26956712	+	MTC-int	LTR	MaLR	246	1140	-118	1
1597	1301	179	350	14	chr3	132650049	132650343	-26949440	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	393	-1	1
1597	638	320	79	21	chr3	132659448	132659828	-26939955	-	MER74A	LTR	ERVL	-49	509	108	2
1597	551	311	182	15	chr3	132662581	132663089	-26936694	+	MLT1E2	LTR	MaLR	17	616	-8	2
1597	1071	261	38	38	chr3	132668841	132669159	-26930624	+	ORR1E	LTR	MaLR	40	357	-2	2
1597	2407	145	56	0	chr3	132674738	132675111	-26924672	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	2
1597	1764	148	69	3	chr3	132678296	132678602	-26921181	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	2
1597	1945	22	0	0	chr3	132679650	132679880	-26919903	+	MERVL-int	LTR	ERVL	3463	3692	-1793	2
1597	2137	163	31	45	chr3	132687064	132687482	-26912301	+	MTC	LTR	MaLR	1	412	-9	2
1597	1248	278	270	40	chr3	132687955	132688181	-26911602	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	88	373	-997	2
1597	1248	280	255	40	chr3	132688391	132688981	-26910802	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	374	1028	-342	2
1597	2455	132	65	7	chr3	132693424	132693472	-26906311	-	RLTR16	LTR	ERVK	-43	462	415	2
1597	2455	132	65	7	chr3	132693525	132693910	-26905873	-	RLTR16	LTR	ERVK	-91	414	5	2
1597	658	242	36	3	chr3	132697185	132697350	-26902433	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-50	334	158	2
1597	555	189	111	70	chr3	132697437	132697608	-26902175	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-190	194	17	2
1597	404	228	71	184	chr3	132697600	132697840	-26901943	+	ORR1D2	LTR	MaLR	160	374	0	2
1597	675	281	173	77	chr3	132698040	132698507	-26901276	+	MLT1F2	LTR	MaLR	48	559	-1	2
1597	513	281	101	51	chr3	132707073	132707369	-26892414	+	MLT1B	LTR	MaLR	78	388	-2	2
1597	260	309	84	28	chr3	132744659	132744872	-26854911	-	ORR1E	LTR	MaLR	-110	249	25	3
1597	527	153	102	0	chr3	132745679	132745777	-26854006	+	ORR1D1	LTR	MaLR	2	109	-265	3
1597	5215	205	102	27	chr3	132745751	132747017	-26852766	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	10	1370	0	3
1597	899	231	28	5	chr3	132747021	132747234	-26852549	+	ORR1D1	LTR	MaLR	15	232	-142	3
1597	573	257	118	26	chr3	132766734	132766962	-26832821	-	RMER15	LTR	ERVL	-33	542	294	3
1597	839	241	14	28	chr3	132767843	132768061	-26831722	-	MTD	LTR	MaLR	-202	217	3	3
1597	1130	237	60	34	chr3	132774640	132774990	-26824793	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	3
1598	664	180	166	0	chr3	132784149	132784288	-26815495	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	162	-212	3
1598	3389	56	2	8	chr3	132784298	132784696	-26815087	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1598	612	171	18	0	chr3	132784696	132784807	-26814976	+	ORR1D1	LTR	MaLR	262	374	0	3
1598	3027	14	60	14	chr3	132786626	132786977	-26812806	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1598	56649	20	19	1	chr3	132786977	132793339	-26806444	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	3
1598	3027	14	60	14	chr3	132793339	132793690	-26806093	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1598	432	227	0	0	chr3	132802563	132802638	-26797145	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	79	-300	3
1598	276	336	46	31	chr3	132807276	132807447	-26792336	+	MLT1J	LTR	MaLR	37	183	-329	4
1598	3295	71	10	0	chr3	132810914	132811310	-26788473	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1598	757	271	88	16	chr3	132816280	132816587	-26783196	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	329	-30	4
1598	272	314	9	62	chr3	132847001	132847090	-26752693	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	83	-282	4
1598	1041	253	119	50	chr3	132847090	132847410	-26752373	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	342	-28	4
1598	262	100	25	0	chr3	132847573	132847613	-26752170	+	ORR1D2	LTR	MaLR	324	364	-6	4
1598	625	289	40	77	chr3	132847638	132847885	-26751898	+	MLT1A	LTR	MaLR	113	350	-24	4
1598	3964	155	69	6	chr3	132847909	132848602	-26751181	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	4
1598	295	187	79	13	chr3	132849507	132849583	-26750200	+	MTEa	LTR	MaLR	299	379	0	4
1598	348	282	367	64	chr3	132852861	132853145	-26746638	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-16	392	23	4
1598	2318	117	23	3	chr3	132853284	132853634	-26746149	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	4
1598	3686	34	14	66	chr3	132855293	132855794	-26743989	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
1598	259	319	48	81	chr3	132862372	132862582	-26737201	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	849	4
1598	250	361	49	73	chr3	132863404	132863649	-26736134	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-789	314	76	4
1598	297	336	27	71	chr3	132863667	132863779	-26736004	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-996	107	1	4
1598	2277	119	14	36	chr3	132865227	132865592	-26734191	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	1	357	0	4
1598	230	193	48	56	chr3	132868169	132868295	-26731488	-	RLTR40	LTR	ERVK	-127	690	566	5
1598	406	361	47	47	chr3	132871509	132871762	-26728021	+	LTR83	LTR	ERVL	182	434	-346	5
1598	502	174	13	3	chr3	132878333	132878435	-26721348	-	MTC	LTR	MaLR	-6	415	300	5
1598	417	272	91	18	chr3	132883149	132883314	-26716469	+	RMER20B	LTR	ERVK	180	356	-271	5
1598	262	314	31	47	chr3	132883395	132883522	-26716261	+	RMER20B	LTR	ERVK	483	607	-20	5
1598	930	270	78	16	chr3	132893476	132893785	-26705998	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-11	354	27	5
1598	336	281	70	104	chr3	132901122	132901392	-26698391	+	ORR1E	LTR	MaLR	98	358	-1	5
1598	287	319	61	20	chr3	132902320	132902467	-26697316	+	MLT1I	LTR	MaLR	6	158	-253	5
1599	826	302	80	110	chr3	132908166	132908765	-26691018	+	RLTR18	LTR	ERVK	31	611	-5	5
1599	401	273	127	0	chr3	132911892	132912002	-26687781	+	MTD	LTR	MaLR	1	124	-295	5
1599	1129	272	49	15	chr3	132915789	132916114	-26683669	+	MTD	LTR	MaLR	84	419	0	5
1599	1630	251	31	48	chr3	132916890	132917371	-26682412	+	RMER19C	LTR	ERVK	138	610	-1	5
1599	2483	103	11	0	chr3	132918194	132918554	-26681229	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	364	-30	5
1599	402	298	38	0	chr3	132920004	132920135	-26679648	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-572	917	782	6
1599	243	320	47	37	chr3	132920231	132920338	-26679445	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-906	583	476	6
1599	1681	219	64	5	chr3	132926006	132926382	-26673401	-	MTD	LTR	MaLR	-21	398	1	6
1599	1880	189	51	3	chr3	132937386	132937756	-26662027	+	MTD	LTR	MaLR	26	405	-14	6
1599	1349	231	32	0	chr3	132938941	132939218	-26660565	-	MTE2b	LTR	MaLR	-31	348	63	6
1599	2089	170	15	41	chr3	132952292	132952704	-26647079	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	5	6
1599	361	279	20	83	chr3	132953469	132953658	-26646125	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-37	491	313	6
1599	1608	215	36	188	chr3	132953658	132954378	-26645405	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1599	917	243	13	60	chr3	132954378	132954734	-26645049	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-204	324	1	6
1599	1663	191	5	101	chr3	132954734	132955148	-26644635	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	0	6550	6177	6
1599	11886	224	50	42	chr3	132955151	132959282	-26640501	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-574	5976	307	6
1599	2195	137	42	57	chr3	132960689	132961163	-26638620	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	467	-8	6
1599	4736	50	68	25	chr3	132961164	132961799	-26637984	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1	662	-5819	6
1599	454	66	0	32	chr3	132961799	132961862	-26637921	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1419	-5062	6
1599	1869	111	4	4	chr3	132961851	132962113	-26637670	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2236	2497	-5183	6
1599	953	80	24	0	chr3	132962108	132962233	-26637550	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4783	4910	-2770	6
1599	21092	20	3	2	chr3	132962235	132964592	-26635191	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4123	6481	0	6
1599	2373	145	42	52	chr3	132964592	132965072	-26634711	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
1599	2409	121	57	14	chr3	132965477	132965898	-26633885	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	1	439	-112	6
1599	307	219	31	0	chr3	132965967	132966031	-26633752	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	455	520	-31	6
1599	309	283	45	36	chr3	132970286	132970396	-26629387	-	MTEa	LTR	MaLR	-266	113	3	6
1599	1336	267	78	32	chr3	132970397	132970861	-26628922	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	1094	6
1599	2257	123	100	6	chr3	132971297	132971657	-26628126	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1599	504	234	50	188	chr3	132982450	132982866	-26616917	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
1599	3009	36	3	3	chr3	132995951	132996338	-26603445	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-5	391	5	7
1599	1769	124	9	45	chr3	133006488	133006818	-26592965	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	1
1599	375	259	52	42	chr3	133011752	133011945	-26587838	-	RMER15	LTR	ERVL	-21	554	360	1
1599	350	277	68	47	chr3	133013047	133013195	-26586588	-	RMER13A	LTR	ERVK	-12	848	698	1
1599	548	252	29	47	chr3	133013298	133013507	-26586276	-	RMER13A	LTR	ERVK	-387	521	309	1
1599	1327	190	100	30	chr3	133013507	133013838	-26585945	-	RMER13A	LTR	ERVK	-506	354	1	1
1600	948	210	229	12	chr3	133042978	133043306	-26556477	+	MTD	LTR	MaLR	18	416	-3	6
1600	3157	64	7	10	chr3	133054008	133054416	-26545367	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	7
1600	1448	180	38	22	chr3	133055693	133056011	-26543772	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	16	8
1600	1302	247	32	7	chr3	133057487	133057768	-26542015	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	296	-63	8
1600	2246	161	38	8	chr3	133058664	133058677	-26541106	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	397	8
1600	2246	161	38	8	chr3	133059034	133059415	-26540368	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-11	396	2	8
1600	4453	152	105	13	chr3	133059415	133060253	-26539530	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1258	344	8
1600	1010	144	109	31	chr3	133060265	133060458	-26539325	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-186	208	1	8
1600	2699	34	12	0	chr3	133061564	133061891	-26537892	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	55	9
1600	352	311	72	108	chr3	133061958	133062236	-26537547	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	273	-86	9
1600	981	256	177	3	chr3	133063210	133063532	-26536251	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	2	9
1600	3799	10	2	0	chr3	133064130	133064525	-26535258	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	9
1600	10323	15	0	0	chr3	133064525	133065623	-26534160	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	9
1600	3799	10	2	0	chr3	133065623	133066018	-26533765	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	9
1600	2050	135	6	102	chr3	133068527	133068889	-26530894	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	3	1
1600	302	285	108	48	chr3	133070083	133070249	-26529534	+	MLT2C1	LTR	ERVL	30	205	-192	1
1600	642	314	98	77	chr3	133070105	133070613	-26529170	+	MLT1E2	LTR	MaLR	75	595	-32	1
1600	566	319	65	73	chr3	133072017	133072399	-26527384	-	RLTR26	LTR	ERVK	-167	475	97	1
1600	2260	128	6	9	chr3	133080854	133081184	-26518599	-	RMER13A	LTR	ERVK	-531	329	1	1
1600	5929	116	20	33	chr3	133083695	133084629	-26515154	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	2394	3315	-2465	1
1600	1887	179	29	31	chr3	133084629	133085070	-26514713	+	RMER19B	LTR	ERVK	130	664	-238	1
1600	319	263	23	92	chr3	133089020	133089150	-26510633	-	MT2B	LTR	ERVL	-325	276	156	1
1600	1717	209	19	48	chr3	133089361	133089678	-26510105	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-13	361	55	1
1600	1953	118	16	128	chr3	133089678	133090046	-26509737	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	1
1600	1717	209	19	48	chr3	133090046	133090100	-26509683	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-320	54	1	1
1600	1662	169	19	122	chr3	133091434	133091534	-26508249	-	RMER6B	LTR	ERVK	-85	376	308	1
1600	1662	169	19	122	chr3	133091561	133091879	-26507904	-	RMER6B	LTR	ERVK	-154	307	1	1
1600	2816	34	71	0	chr3	133093452	133093775	-26506008	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
1600	597	256	0	131	chr3	133094438	133094553	-26505230	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	90	-647	1
1600	4526	23	12	0	chr3	133094553	133095040	-26504743	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1600	597	256	0	131	chr3	133095040	133095122	-26504661	+	RMER19B	LTR	ERVK	91	172	-565	1
1600	3555	200	80	11	chr3	133097309	133098018	-26501765	+	RMER19B	LTR	ERVK	131	888	-14	1
1600	6785	55	6	37	chr3	133100926	133101774	-26498009	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	1
1600	242	221	138	128	chr3	133123060	133123091	-26476692	-	MT2B	LTR	ERVL	-449	152	121	2
1600	250	311	0	13	chr3	133123899	133123974	-26475809	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-292	82	9	2
1600	727	203	283	6	chr3	133138929	133139251	-26460532	+	MTD	LTR	MaLR	1	413	-6	2
1600	477	195	33	25	chr3	133140957	133141078	-26458705	-	MTE2b	LTR	MaLR	-242	137	16	2
1600	441	246	36	18	chr3	133167003	133167115	-26432668	-	MTD	LTR	MaLR	-222	197	84	2
1601	422	338	117	80	chr3	133169272	133169761	-26430022	-	MER21B	LTR	ERV1	-151	712	206	2
1601	2617	58	61	0	chr3	133175506	133175832	-26423951	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	3
1601	2309	86	9	58	chr3	133178648	133178992	-26420791	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1601	929	212	201	22	chr3	133181829	133182143	-26417640	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1601	3287	56	2	2	chr3	133209275	133209671	-26390112	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1601	613	268	185	129	chr3	133219179	133219467	-26380316	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	324	-55	4
1601	499	268	185	129	chr3	133219633	133219700	-26380083	+	MTE2b	LTR	MaLR	315	376	-3	4
1601	273	205	62	37	chr3	133220424	133220505	-26379278	+	RLTR25B	LTR	ERVK	427	509	-519	4
1601	619	235	8	46	chr3	133222890	133223153	-26376630	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	253	-157	4
1601	860	274	108	11	chr3	133223371	133223640	-26376143	+	MER21B	LTR	ERV1	450	744	-119	4
1601	570	306	75	22	chr3	133223793	133224060	-26375723	+	MER21-int	LTR	ERV1	14	294	-3897	4
1601	337	258	194	46	chr3	133225491	133225632	-26374151	+	MER4B-int	LTR	ERV1	3304	3465	-3293	4
1601	337	258	194	46	chr3	133225816	133225849	-26373934	+	MER4B-int	LTR	ERV1	3466	3504	-3254	4
1601	728	303	52	52	chr3	133225872	133226335	-26373448	+	RLTR12B	LTR	ERVK	17	479	-49	4
1601	306	308	19	0	chr3	133226364	133226471	-26373312	+	MER4B-int	LTR	ERV1	3693	3801	-2957	4
1601	1761	301	107	7	chr3	133226994	133227814	-26371969	+	MER21-int	LTR	ERV1	2500	3401	-790	4
1601	314	232	24	89	chr3	133227861	133227984	-26371799	+	MER21-int	LTR	ERV1	3481	3595	-596	4
1601	266	297	0	71	chr3	133233431	133233529	-26366254	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-144	226	136	4
1601	438	370	107	33	chr3	133237688	133238174	-26361609	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-2	553	32	4
1601	3264	41	8	2	chr3	133255450	133255844	-26343939	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1601	4700	126	31	16	chr3	133259232	133259547	-26340236	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	331	-425	5
1601	4700	126	31	16	chr3	133259594	133260021	-26339762	+	RMER6A	LTR	ERVK	332	754	-2	5
1601	1305	226	23	111	chr3	133260747	133261180	-26338603	+	RMER19C	LTR	ERVK	217	611	0	5
1601	1869	208	30	21	chr3	133265782	133266328	-26333455	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	21	560	0	5
1601	2379	153	24	7	chr3	133266414	133266823	-26332960	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	6	5
1601	405	271	48	20	chr3	133267616	133267763	-26332020	+	RMER15	LTR	ERVL	423	573	-2	5
1601	2812	49	3	69	chr3	133268772	133269163	-26330620	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	5
1601	363	244	22	11	chr3	133269920	133270011	-26329772	+	MLT1A1	LTR	MaLR	300	391	-17	5
1601	354	328	83	6	chr3	133272017	133272198	-26327585	-	MLT2E	LTR	ERVL	-410	218	24	5
1601	2083	163	65	23	chr3	133273944	133274372	-26325411	+	RMER4A	LTR	ERVK	19	464	-2	5
1601	233	350	134	14	chr3	133281687	133281829	-26317954	+	LTR16B1	LTR	ERVL	320	478	-2	5
1601	2454	183	0	5	chr3	133284926	133285349	-26314434	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1601	1510	230	93	5	chr3	133290366	133290751	-26309032	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1601	7909	44	8	1	chr3	133294712	133295775	-26304008	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	29	1098	0	5
1601	3425	40	2	0	chr3	133295775	133296170	-26303613	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1602	985	275	99	37	chr3	133308774	133309148	-26290635	+	MTD	LTR	MaLR	1	397	-22	6
1602	1991	136	46	92	chr3	133315919	133316117	-26283666	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	177	-217	6
1602	3125	56	10	5	chr3	133316117	133316515	-26283268	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	6
1602	1991	136	46	92	chr3	133316515	133316729	-26283054	+	ORR1B1	LTR	MaLR	178	394	0	6
1602	801	327	73	29	chr3	133323394	133323775	-26276008	+	MT2A	LTR	ERVL	134	531	-2	6
1602	1010	297	59	35	chr3	133324143	133324604	-26275179	-	MER68	LTR	ERVL	-50	513	42	6
1602	438	278	60	56	chr3	133326018	133326269	-26273514	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-47	481	230	6
1602	709	236	63	51	chr3	133326292	133326546	-26273237	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-240	288	32	6
1602	228	305	0	35	chr3	133330246	133330331	-26269452	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-36	372	291	6
1602	301	281	37	52	chr3	133330548	133330683	-26269100	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-232	133	1	6
1602	2249	66	3	51	chr3	133331425	133331760	-26268023	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	6
1602	2317	141	36	11	chr3	133332137	133332495	-26267288	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	6
1602	288	109	0	0	chr3	133333127	133333182	-26266601	+	RMER17C	LTR	ERVK	338	392	-18	6
1602	446	281	191	19	chr3	133336223	133336433	-26263350	-	LTR33B	LTR	ERVL	-172	331	86	6
1602	1512	242	89	14	chr3	133372359	133372728	-26227055	-	MTD	LTR	MaLR	-22	397	1	7
1602	1214	225	101	29	chr3	133373718	133374034	-26225749	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	237	7
1602	501	327	60	38	chr3	133374211	133374513	-26225270	-	RMER20B	LTR	ERVK	-208	419	100	7
1602	428	237	61	20	chr3	133374623	133374722	-26225061	-	RMER15	LTR	ERVL	-446	129	27	7
1602	480	271	150	75	chr3	133375412	133375648	-26224135	+	MLT1A0	LTR	MaLR	110	408	0	7
1602	341	256	77	11	chr3	133377283	133377374	-26222409	+	MTD	LTR	MaLR	1	97	-322	7
1602	690	213	67	28	chr3	133377593	133377772	-26222011	+	MTD	LTR	MaLR	234	419	0	7
1602	227	350	115	34	chr3	133385229	133385377	-26214406	-	MLT2F	LTR	ERVL	-131	532	373	7
1602	274	355	81	0	chr3	133386223	133386347	-26213436	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	400	267	7
1602	304	318	63	77	chr3	133386495	133386638	-26213145	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-215	150	10	7
1602	287	372	31	62	chr3	133401361	133401556	-26198227	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	198	-167	7
1602	1907	204	5	13	chr3	133402576	133402963	-26196820	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	7
1602	516	310	103	17	chr3	133412473	133412647	-26187136	-	MLT1I	LTR	MaLR	-189	222	34	7
1603	1275	297	30	9	chr3	133440022	133440355	-26159428	-	MT2A	LTR	ERVL	-100	433	94	8
1603	290	231	128	0	chr3	133440769	133440847	-26158936	-	MT2A	LTR	ERVL	-445	88	1	8
1603	1817	155	80	17	chr3	133442408	133442757	-26157026	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	371	-13	8
1603	2684	66	0	0	chr3	133443240	133443572	-26156211	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	8
1603	529	324	122	43	chr3	133445358	133445752	-26154031	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	81	8
1603	3055	106	5	7	chr3	133455231	133455667	-26144116	+	RLTR9B	LTR	ERVK	3	437	0	8
1603	332	287	49	72	chr3	133455669	133455932	-26143851	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4	260	-3054	8
1603	9340	150	48	46	chr3	133456054	133457874	-26141909	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	1066	2897	-4509	8
1603	9340	150	48	46	chr3	133458123	133458311	-26141472	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	2898	3078	-4328	8
1603	1687	78	197	91	chr3	133467398	133467707	-26132076	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	342	-4	8
1603	6340	214	79	78	chr3	133469813	133470473	-26129310	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2045	2749	-2657	8
1603	6340	214	79	78	chr3	133470515	133470712	-26129071	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2750	2873	-2533	8
1603	6340	222	66	69	chr3	133470761	133472423	-26127360	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2696	4175	-1231	8
1603	306	132	0	36	chr3	133472635	133472690	-26127093	+	RMER16-int	LTR	ERVK	7331	7383	-23	8
1603	3083	102	7	7	chr3	133472710	133473145	-26126638	+	RLTR9B	LTR	ERVK	1	435	-2	8
1603	268	280	37	74	chr3	133482652	133482760	-26117023	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-443	184	81	8
1603	333	327	99	45	chr3	133497497	133497718	-26102065	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1340	9
1603	354	286	34	40	chr3	133529499	133529674	-26070109	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	525	698	-6858	2
1603	1203	334	70	58	chr3	133530154	133531360	-26068423	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	1051	2417	-5139	2
1603	1387	322	58	33	chr3	133531480	133532746	-26067037	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3533	5308	-2298	2
1603	268	341	33	16	chr3	133532867	133533049	-26066734	+	MMERGLN-int	LTR	ERV1	5363	5547	-2009	2
1603	395	342	19	19	chr3	133533615	133533886	-26065897	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	4663	4933	-130	2
1603	2105	98	182	0	chr3	133533983	133534362	-26065421	+	RLTR47_MM	LTR	ERV1	1	448	-84	2
1603	234	338	54	83	chr3	133545984	133546226	-26053557	+	ORR1D2	LTR	MaLR	88	322	-48	4
1603	408	343	68	24	chr3	133554648	133554854	-26044929	-	LTR16B	LTR	ERVL	-217	246	32	5
1604	267	83	0	0	chr3	133567182	133567218	-26032565	+	ORR1C2	LTR	MaLR	42	77	-307	6
1604	1310	187	174	21	chr3	133567581	133567914	-26031869	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	7
1604	929	307	46	79	chr3	133574718	133575131	-26024652	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	405	18	7
1604	935	260	205	3	chr3	133575763	133576060	-26023723	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-12	358	2	8
1604	4424	133	40	21	chr3	133579318	133580041	-26019742	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	8
1604	245	235	29	29	chr3	133585306	133585376	-26014407	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-21	503	434	9
1604	883	232	201	31	chr3	133585405	133585699	-26014084	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-137	344	1	9
1604	518	275	23	10	chr3	133591702	133591848	-26007935	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	230	1
1604	354	244	47	0	chr3	133592168	133592254	-26007529	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-301	107	18	1
1604	659	365	90	21	chr3	133598207	133598641	-26001142	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-15	465	2	1
1604	419	248	0	110	chr3	133602557	133602578	-25997205	-	MT2B	LTR	ERVL	-349	252	148	1
1604	1989	138	28	3	chr3	133606304	133606623	-25993160	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1604	332	353	53	99	chr3	133606885	133607168	-25992615	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	90	1
1604	1144	356	129	19	chr3	133607288	133607924	-25991859	-	MTE-int	LTR	MaLR	-28	1552	847	1
1604	990	320	110	41	chr3	133607951	133608515	-25991268	-	MTE-int	LTR	MaLR	-963	617	15	1
1604	360	303	35	84	chr3	133618922	133619149	-25980634	+	LTR52	LTR	ERVL	25	240	-181	1
1604	812	286	47	13	chr3	133626059	133626293	-25973490	-	MTE2b	LTR	MaLR	-12	367	126	1
1604	312	186	129	0	chr3	133626790	133626860	-25972923	-	MTE2b	LTR	MaLR	-300	79	1	1
1604	1274	174	183	127	chr3	133627765	133628192	-25971591	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	451	-10	1
1604	531	289	153	19	chr3	133633187	133633531	-25966252	+	LTR84a	LTR	ERVL	8	399	-362	1
1604	248	377	43	43	chr3	133633534	133633695	-25966088	-	LTR16D	LTR	ERVL	-10	641	481	1
1604	1329	199	265	12	chr3	133637462	133637798	-25961985	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1604	593	250	186	38	chr3	133639391	133639628	-25960155	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	1
1604	1728	289	52	44	chr3	133639669	133642193	-25957590	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-202	7042	3208	1
1604	736	285	58	47	chr3	133642194	133642728	-25957055	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-3870	2672	2133	1
1604	265	211	55	55	chr3	133643416	133643526	-25956257	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1559	428	319	1
1604	617	232	183	50	chr3	133643529	133643769	-25956014	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	1
1604	1614	246	79	3	chr3	133649006	133649360	-25950423	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	34	1
1604	400	228	61	30	chr3	133650788	133650919	-25948864	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	138	-221	1
1604	310	147	101	25	chr3	133654096	133654127	-25945656	+	RMER17D	LTR	ERVK	246	285	-604	1
1604	310	147	101	25	chr3	133654307	133654394	-25945389	+	RMER17D	LTR	ERVK	286	373	-516	1
1604	1509	189	28	14	chr3	133654416	133654701	-25945082	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-1220	289	1	1
1604	1390	202	106	73	chr3	133654701	133655059	-25944724	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	9	1
1604	1051	282	66	63	chr3	133656187	133656565	-25943218	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	1
1604	519	318	94	86	chr3	133665785	133666136	-25933647	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	2
1604	830	337	32	51	chr3	133668084	133668456	-25931327	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	2
1604	4441	14	0	0	chr3	133670404	133670897	-25928886	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1604	45330	14	8	0	chr3	133670897	133676217	-25923566	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	2
1604	390	167	46	35	chr3	133676217	133676304	-25923479	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	2
1604	302	0	0	0	chr3	133676304	133676342	-25923441	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	2
1604	4441	14	0	0	chr3	133676342	133676835	-25922948	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	2
1604	308	270	59	34	chr3	133677048	133677167	-25922616	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	258	2
1604	341	298	26	9	chr3	133682673	133682788	-25916995	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	258	2
1604	440	316	0	0	chr3	133685277	133685394	-25914389	+	MLT1B	LTR	MaLR	271	387	-3	2
1604	580	376	65	47	chr3	133685570	133685908	-25913875	+	MLT1E3	LTR	MaLR	270	613	-11	2
1605	240	333	42	75	chr3	133694652	133694772	-25905011	-	ORR1E	LTR	MaLR	-243	116	1	2
1605	284	275	10	99	chr3	133716379	133716480	-25883303	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	92	-282	2
1605	257	299	109	33	chr3	133716559	133716742	-25883041	+	ORR1E	LTR	MaLR	90	286	-88	2
1605	680	283	46	70	chr3	133719027	133719415	-25880368	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	2
1605	399	38	0	0	chr3	133723566	133723619	-25876164	+	RLTR1	LTR	ERV1	1	53	-571	2
1605	1613	141	153	14	chr3	133732320	133732607	-25867176	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1605	356	228	64	93	chr3	133732715	133732855	-25866928	+	MT2B	LTR	ERVL	143	278	-323	2
1605	727	248	156	45	chr3	133733037	133733260	-25866523	+	MTEb	LTR	MaLR	31	278	-101	2
1605	933	259	44	131	chr3	133733260	133733673	-25866110	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	2
1605	354	229	83	0	chr3	133733680	133733776	-25866007	+	MTEb	LTR	MaLR	276	379	0	2
1605	827	289	139	64	chr3	133735591	133735735	-25864048	+	MTD	LTR	MaLR	5	171	-248	2
1605	827	289	139	64	chr3	133736486	133736714	-25863069	+	MTD	LTR	MaLR	172	405	-14	2
1605	263	268	24	12	chr3	133739849	133739932	-25859851	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-11	437	354	2
1605	479	217	29	65	chr3	133743959	133744097	-25855686	+	RMER15	LTR	ERVL	27	159	-416	2
1605	256	273	13	0	chr3	133744096	133744173	-25855610	+	RMER15	LTR	ERVL	462	539	-36	2
1605	2665	39	21	148	chr3	133749606	133750084	-25849699	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	417	-58	2
1605	1573	44	99	22	chr3	133750085	133750317	-25849466	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	226	475	0	2
1605	481	268	24	8	chr3	133755987	133756111	-25843672	-	ORR1E	LTR	MaLR	-233	126	1	2
1605	1014	317	71	3	chr3	133759567	133759877	-25839906	+	MTE2b	LTR	MaLR	12	342	-37	3
1605	1364	310	62	27	chr3	133759883	133760480	-25839303	+	MTE-int	LTR	MaLR	1	618	-962	3
1605	909	271	123	18	chr3	133761069	133761411	-25838372	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	1	3
1605	259	351	148	25	chr3	133762783	133763020	-25836763	+	MLT1K	LTR	MaLR	164	429	-166	3
1605	1404	273	65	66	chr3	133772677	133773234	-25826549	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	20	3
1605	451	259	81	85	chr3	133775709	133775945	-25823838	+	LTR90A	LTR	LTR	131	365	-611	3
1605	609	254	69	47	chr3	133782788	133783065	-25816718	-	RLTR15	LTR	ERVK	-76	283	1	3
1605	1447	89	30	0	chr3	133786359	133786562	-25813221	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	209	-749	3
1605	2143	143	2	84	chr3	133786579	133786968	-25812815	+	RMER17B	LTR	ERVK	566	933	-25	3
1605	2143	143	2	84	chr3	133787352	133787390	-25812393	+	RMER17B	LTR	ERVK	934	958	0	3
1605	626	371	113	26	chr3	133791955	133792484	-25807299	-	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	-199	614	40	3
1605	1169	310	77	46	chr3	133793338	133793835	-25805948	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	512	-8	3
1605	421	360	53	68	chr3	133794240	133794634	-25805149	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	1	3
1605	267	374	18	171	chr3	133799776	133800115	-25799668	+	MLT1N2	LTR	MaLR	255	541	-21	3
1605	824	200	12	6	chr3	133800934	133801095	-25798688	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-1036	334	173	3
1605	4203	246	41	71	chr3	133801201	133803078	-25796705	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	3	1324	-1002	3
1605	2399	223	71	26	chr3	133803080	133803770	-25796013	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	5828	6548	-2	3
1605	2057	135	145	69	chr3	133803772	133804193	-25795590	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	3
1605	426	322	116	29	chr3	133816625	133816900	-25782883	+	ORR1E	LTR	MaLR	41	339	-20	3
1606	1601	213	57	0	chr3	133829165	133829517	-25770266	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	3
1606	2116	162	5	65	chr3	133831558	133831960	-25767823	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1606	231	373	16	170	chr3	133833142	133833336	-25766447	-	LTR33A_	LTR	ERVL	-284	247	84	4
1606	1614	210	66	22	chr3	133835888	133836253	-25763530	+	MTD	LTR	MaLR	12	392	-27	4
1606	527	126	21	21	chr3	133844502	133844599	-25755184	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-257	137	41	4
1606	551	266	87	6	chr3	133847151	133847350	-25752433	+	MLT1G3-int	LTR	MaLR	1194	1485	-4	4
1606	233	339	186	0	chr3	133847373	133847497	-25752286	+	MLT1G3	LTR	MaLR	9	155	-440	4
1606	374	266	71	127	chr3	133847714	133848036	-25751747	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	376	36	4
1606	368	252	108	23	chr3	133848286	133848416	-25751367	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-3	405	265	4
1606	1603	251	59	22	chr3	133850318	133850722	-25749061	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
1606	2482	161	155	29	chr3	133867635	133868248	-25731535	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	4
1606	437	310	115	35	chr3	133882619	133882793	-25716990	-	MLT2B1	LTR	ERVL	0	567	380	4
1606	2224	92	16	0	chr3	133882840	133883154	-25716629	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	4
1606	479	306	96	40	chr3	133883154	133883371	-25716412	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-314	240	1	4
1606	389	344	132	57	chr3	133889161	133889639	-25710144	+	MLT1L	LTR	MaLR	2	515	-95	4
1606	1530	142	187	9	chr3	133943714	133944062	-25655721	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	5
1606	1454	260	62	16	chr3	133946278	133946665	-25653118	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	5
1606	1455	187	24	39	chr3	133953634	133953951	-25645832	+	ORR1C2	LTR	MaLR	56	372	-12	5
1606	4513	117	50	29	chr3	133954440	133954601	-25645182	+	RMER17D2	LTR	ERVK	1	162	-647	5
1606	4513	117	50	29	chr3	133954650	133955280	-25644503	+	RMER17D2	LTR	ERVK	163	808	-1	5
1607	389	331	41	51	chr3	133961641	133961838	-25637945	+	LTR33A_	LTR	ERVL	18	212	-319	5
1607	2357	66	119	11	chr3	133975689	133976041	-25623742	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	5
1607	1429	219	36	13	chr3	133987972	133988277	-25611506	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	108	6
1607	302	276	143	0	chr3	133989076	133989181	-25610602	-	MTD	LTR	MaLR	-299	120	1	6
1607	1597	184	106	0	chr3	133990991	133991322	-25608461	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	1	6
1607	2620	154	79	47	chr3	133995925	133996505	-25603278	-	RMER6A	LTR	ERVK	-49	707	109	6
1607	349	218	66	44	chr3	134002048	134002139	-25597644	+	ORR1E	LTR	MaLR	99	191	-168	6
1607	586	254	44	84	chr3	134002592	134002841	-25596942	+	ORR1D2	LTR	MaLR	132	370	0	7
1607	340	318	84	84	chr3	134004050	134004393	-25595390	+	MLT1A	LTR	MaLR	3	345	-29	1
1607	1903	154	78	6	chr3	134011407	134011741	-25588042	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	359	-8	2
1607	1815	127	32	74	chr3	134016632	134016971	-25582812	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	325	-4	2
1607	1005	180	20	50	chr3	134017745	134017944	-25581839	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	192	3
1607	2793	12	3	0	chr3	134020255	134020576	-25579207	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	3
1607	460	344	47	12	chr3	134020913	134021153	-25578630	+	MLT1F2	LTR	MaLR	305	554	-15	3
1607	650	331	104	35	chr3	134032138	134032454	-25567329	+	LTR16A	LTR	ERVL	6	343	-108	5
1607	566	131	0	0	chr3	134044784	134044868	-25554915	+	MTC	LTR	MaLR	1	84	-337	7
1607	463	213	216	7	chr3	134044853	134044995	-25554788	+	MTC	LTR	MaLR	225	421	0	7
1607	2153	189	40	2	chr3	134045851	134046249	-25553534	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	8
1607	1021	215	36	47	chr3	134049011	134049393	-25550390	+	RMER6A	LTR	ERVK	398	720	0	8
1607	1946	113	9	53	chr3	134049523	134049860	-25549923	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	8
1607	1738	331	61	60	chr3	134053912	134054765	-25545018	+	MTE-int	LTR	MaLR	674	1527	-53	9
1607	347	333	102	54	chr3	134054765	134055060	-25544723	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	309	-50	9
1607	1842	128	10	0	chr3	134059099	134059387	-25540396	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	3	293	-291	1
1607	279	146	0	0	chr3	134059401	134059442	-25540341	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	544	584	0	1
1607	249	160	20	20	chr3	134061491	134061542	-25538241	+	MTE2b	LTR	MaLR	329	379	0	1
1607	2054	184	26	21	chr3	134071906	134072290	-25527493	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	1
1607	954	283	44	41	chr3	134076638	134077051	-25522732	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	414	-27	1
1607	585	316	96	103	chr3	134085495	134086043	-25513740	-	RLTR18	LTR	ERVK	-4	612	72	1
1607	585	316	96	103	chr3	134086063	134086106	-25513677	-	RLTR18	LTR	ERVK	-545	71	25	1
1608	226	393	80	61	chr3	134093195	134093458	-25506325	-	MLT1K	LTR	MaLR	-148	447	180	1
1608	1843	192	30	16	chr3	134109770	134110135	-25489648	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-6	372	3	1
1608	1100	231	107	8	chr3	134121941	134122203	-25477580	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	97	1
1608	240	130	0	80	chr3	134122195	134122245	-25477538	+	ORR1C2	LTR	MaLR	276	321	-57	1
1608	413	84	42	14	chr3	134122386	134122451	-25477332	+	ORR1C2	LTR	MaLR	314	380	-4	1
1608	3070	54	23	0	chr3	134122661	134123048	-25476735	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1608	7464	70	21	72	chr3	134123048	134124205	-25475578	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	1
1608	3226	51	5	0	chr3	134124205	134124599	-25475184	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1608	682	309	75	11	chr3	134124631	134124899	-25474884	+	MLT1A0	LTR	MaLR	79	363	-2	1
1608	244	260	24	94	chr3	134125041	134125126	-25474657	-	MLT1J	LTR	MaLR	-335	177	99	1
1608	2937	40	0	0	chr3	134126097	134126443	-25473340	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	1
1608	666	208	103	7	chr3	134127451	134127596	-25472187	+	MTD	LTR	MaLR	10	168	-253	1
1608	1070	201	24	19	chr3	134128302	134128510	-25471273	+	MTD	LTR	MaLR	196	404	-15	1
1608	3683	145	103	14	chr3	134131578	134132230	-25467553	+	RMER19A	LTR	ERVK	28	737	0	1
1608	2221	183	39	5	chr3	134138832	134139238	-25460545	+	MTC	LTR	MaLR	1	420	-1	2
1608	2967	164	72	21	chr3	134140279	134140889	-25458894	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	641	-49	2
1608	296	278	50	21	chr3	134144289	134144428	-25455355	-	MLT1A	LTR	MaLR	-262	146	1	2
1608	506	330	25	25	chr3	134144650	134144849	-25454934	+	RMER15	LTR	ERVL	279	477	-98	2
1608	470	123	231	13	chr3	134148080	134148153	-25451630	-	RMER17A	LTR	ERVK	-287	464	366	2
1608	470	145	192	23	chr3	134148316	134148435	-25451348	-	RMER17A	LTR	ERVK	-452	454	276	2
1608	853	306	137	28	chr3	134151626	134152013	-25447770	+	MER57D	LTR	ERV1	4	432	-2	2
1608	916	347	47	11	chr3	134156886	134157250	-25442533	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	379	0	2
1608	529	192	14	1	chr3	134157330	134157444	-25442339	+	MTB	LTR	MaLR	249	374	-45	2
1608	3038	71	32	32	chr3	134158435	134158871	-25440912	-	RLTR1B	LTR	ERV1	-76	436	1	2
1608	4006	48	135	51	chr3	134158871	134159484	-25440299	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	0	3299	2635	2
1608	13548	67	40	8	chr3	134159481	134160417	-25439366	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-1190	2109	1165	2
1608	13548	67	40	8	chr3	134160448	134161300	-25438483	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-2135	1164	266	2
1608	725	216	140	31	chr3	134161271	134161500	-25438283	-	MMERGLN-int	LTR	ERV1	-7178	378	125	2
1608	1565	145	7	76	chr3	134161473	134161814	-25437969	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	-3019	280	1	2
1608	1095	114	0	6	chr3	134161814	134161973	-25437810	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	355	2
1608	3418	156	87	6	chr3	134168769	134169094	-25430689	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	352	-338	2
1608	3418	156	87	6	chr3	134169245	134169552	-25430231	+	RMER6C	LTR	ERVK	353	685	-5	2
1608	2466	173	138	63	chr3	134172636	134173365	-25426418	+	RMER6C	LTR	ERVK	8	716	-4	2
1608	3031	71	8	2	chr3	134207772	134208170	-25391613	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1608	2683	151	6	21	chr3	134215245	134215711	-25384072	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	459	-2	2
1609	1256	279	32	12	chr3	134234246	134234590	-25365193	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-1229	351	1	3
1609	1188	258	29	41	chr3	134234590	134234905	-25364878	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	69	3
1609	1610	56	42	0	chr3	134236708	134236921	-25362862	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	106	3
1609	904	155	7	0	chr3	134238688	134238830	-25360953	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-184	143	1	3
1609	526	219	197	0	chr3	134244832	134244969	-25354814	-	MTD	LTR	MaLR	-53	366	203	3
1609	413	294	9	9	chr3	134245400	134245510	-25354273	+	MTE2b	LTR	MaLR	9	118	-261	3
1609	490	262	40	0	chr3	134245684	134245810	-25353973	+	MTE2b	LTR	MaLR	176	306	-73	3
1609	2080	334	81	56	chr3	134245859	134247041	-25352742	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	1	1336	-244	3
1609	2010	178	19	0	chr3	134247041	134247418	-25352365	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1609	1503	294	66	9	chr3	134247418	134247595	-25352188	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	1206	1365	-5	3
1609	1082	280	52	41	chr3	134247595	134247960	-25351823	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	369	-10	3
1609	527	214	65	25	chr3	134254454	134254655	-25345128	-	RMER17C	LTR	ERVK	-136	274	66	3
1609	2652	37	65	0	chr3	134263969	134264294	-25335489	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	346	0	3
1609	1505	195	123	9	chr3	134280329	134280496	-25319287	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	175	-209	3
1609	1505	195	123	9	chr3	134280560	134280734	-25319049	+	ORR1C2	LTR	MaLR	176	380	-4	3
1609	882	332	77	29	chr3	134281057	134281501	-25318282	+	MER31B	LTR	ERV1	1	465	-1	3
1609	286	214	14	28	chr3	134283345	134283417	-25316366	+	MLT1B	LTR	MaLR	28	98	-292	3
1609	1059	321	50	92	chr3	134283445	134283964	-25315819	-	MTE-int	LTR	MaLR	-528	1052	556	3
1609	410	221	66	19	chr3	134286823	134286929	-25312854	-	LTR40b	LTR	ERVL	-8	454	344	3
1609	331	368	99	67	chr3	134287513	134287915	-25311868	-	LTR40a	LTR	ERVL	-104	415	1	3
1609	2910	65	26	5	chr3	134288121	134288509	-25311274	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1609	1085	172	81	121	chr3	134288879	134289186	-25310597	+	MTC-int	LTR	MaLR	639	940	-318	4
1609	1684	186	91	3	chr3	134289190	134289530	-25310253	+	MTC	LTR	MaLR	52	421	0	4
1609	1097	177	26	10	chr3	134301049	134301243	-25298540	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	197	-170	4
1609	6574	103	19	22	chr3	134302504	134303490	-25296293	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	4
1609	251	70	0	122	chr3	134304732	134304760	-25295023	+	MT2B	LTR	ERVL	1	24	-577	4
1609	3717	169	14	35	chr3	134304760	134305496	-25294287	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	1	4
1609	251	70	0	122	chr3	134305496	134305516	-25294267	+	MT2B	LTR	ERVL	25	43	-558	4
1609	572	126	10	21	chr3	134305534	134305631	-25294152	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-4	564	469	4
1609	228	140	77	39	chr3	134305896	134305948	-25293835	+	MT2B	LTR	ERVL	548	601	0	4
1609	493	353	29	53	chr3	134307860	134308141	-25291642	+	MT2A	LTR	ERVL	159	432	-101	4
1609	1578	156	115	48	chr3	134308607	134308938	-25290845	-	RLTR15	LTR	ERVK	-1	358	6	4
1609	2035	178	5	8	chr3	134310231	134310599	-25289184	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1609	2158	148	68	28	chr3	134311116	134311513	-25288270	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	4
1609	1950	170	42	8	chr3	134312399	134312754	-25287029	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1609	3109	44	23	3	chr3	134313273	134313661	-25286122	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1609	1688	132	164	3	chr3	134314647	134314959	-25284824	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	6	4
1609	2227	187	2	20	chr3	134315172	134315575	-25284208	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-11	396	1	4
1609	510	211	104	9	chr3	134322904	134323019	-25276764	+	MTC	LTR	MaLR	9	134	-287	4
1609	243	196	64	147	chr3	134323329	134323485	-25276298	-	RMER6A	LTR	ERVK	-127	629	487	4
1609	2970	44	12	72	chr3	134323874	134324289	-25275494	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	4
1609	1675	186	26	19	chr3	134324725	134325032	-25274751	+	MTC	LTR	MaLR	104	412	-9	4
1609	3023	75	20	12	chr3	134325186	134325590	-25274193	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1609	1532	192	52	0	chr3	134327990	134328281	-25271502	+	MTD	LTR	MaLR	113	418	-1	4
1609	314	264	11	44	chr3	134329157	134329248	-25270535	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-168	240	153	4
1609	1910	210	15	10	chr3	134329264	134329664	-25270119	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-1	406	5	4
1609	604	199	169	34	chr3	134330220	134330397	-25269386	+	MTC	LTR	MaLR	173	373	-48	4
1609	1623	234	80	5	chr3	134330780	134331170	-25268613	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1609	234	181	105	53	chr3	134332962	134333038	-25266745	-	RMER17A	LTR	ERVK	-576	175	96	4
1609	523	258	200	38	chr3	134334420	134334722	-25265061	+	MTE2a	LTR	MaLR	5	386	-14	4
1610	838	287	80	7	chr3	134354351	134354625	-25245158	+	MTD	LTR	MaLR	24	317	-102	5
1610	298	120	0	57	chr3	134354938	134354991	-25244792	+	MTD	LTR	MaLR	329	378	-41	5
1610	357	294	66	9	chr3	134372911	134373052	-25226731	+	MLT1F2	LTR	MaLR	397	557	-3	5
1610	862	155	30	139	chr3	134378455	134378657	-25221126	-	MT2A	LTR	ERVL	-353	180	1	5
1610	1826	185	57	51	chr3	134379505	134380080	-25219703	-	RLTR33	LTR	ERVK	-5	673	2	5
1610	2081	237	36	70	chr3	134380412	134381002	-25218781	+	RLTR18	LTR	ERVK	43	612	-4	5
1610	299	262	12	12	chr3	134390382	134390467	-25209316	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	286	5
1610	280	299	106	46	chr3	134397154	134397305	-25202478	-	RMER15	LTR	ERVL	-120	455	296	5
1610	1187	244	127	25	chr3	134397406	134397532	-25202251	+	MTD	LTR	MaLR	63	200	-219	5
1610	1187	244	127	25	chr3	134397741	134397870	-25201913	+	MTD	LTR	MaLR	201	345	-74	5
1610	1187	244	127	25	chr3	134397890	134397957	-25201826	+	MTD	LTR	MaLR	346	418	-1	5
1610	280	368	25	44	chr3	134400348	134400507	-25199276	-	ORR1E	LTR	MaLR	-125	234	79	5
1610	1457	191	111	23	chr3	134400685	134400807	-25198976	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	224	5
1610	1457	191	111	23	chr3	134400832	134400903	-25198880	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-151	223	159	5
1610	1457	191	111	23	chr3	134400931	134401079	-25198704	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-216	158	3	5
1610	729	243	110	31	chr3	134401175	134401430	-25198353	+	RLTR16	LTR	ERVK	24	298	-207	5
1610	1394	225	94	27	chr3	134402335	134402704	-25197079	+	RMER19B	LTR	ERVK	71	653	-249	5
1610	505	191	86	99	chr3	134402704	134402855	-25196928	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	149	-225	5
1610	2021	185	98	91	chr3	134402870	134403586	-25196197	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	708	-12	5
1610	477	201	73	22	chr3	134403604	134403741	-25196042	+	ORR1D1	LTR	MaLR	154	297	-77	5
1610	1975	254	92	51	chr3	134405244	134405535	-25194248	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	291	-526	5
1610	1975	254	92	51	chr3	134405616	134405793	-25193990	+	RLTR40	LTR	ERVK	292	490	-327	5
1610	1975	254	92	51	chr3	134405846	134405995	-25193788	+	RLTR40	LTR	ERVK	491	652	-165	5
1610	1975	254	92	51	chr3	134406040	134406201	-25193582	+	RLTR40	LTR	ERVK	653	812	-5	5
1610	303	160	25	62	chr3	134408101	134408181	-25191602	+	RLTR25B	LTR	ERVK	426	502	-526	5
1610	1632	212	26	31	chr3	134408523	134408874	-25190909	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	25	5
1610	907	187	0	0	chr3	134408878	134409033	-25190750	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	155	-239	6
1610	1372	180	4	21	chr3	134415252	134415531	-25184252	+	ORR1B1	LTR	MaLR	129	394	0	6
1610	3607	68	12	62	chr3	134415591	134416110	-25183673	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	6
1610	1588	317	55	35	chr3	134418468	134418607	-25181176	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1294	4467	4332	6
1610	1588	317	55	35	chr3	134418754	134419377	-25180406	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-1430	4331	3690	6
1610	1309	335	29	56	chr3	134419351	134419507	-25180276	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-4940	774	645	6
1610	1309	335	29	56	chr3	134419643	134420271	-25179512	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-5070	644	11	6
1610	260	283	87	149	chr3	134420281	134420522	-25179261	-	MLT2B1	LTR	ERVL	0	567	342	6
1610	795	297	135	7	chr3	134420537	134420825	-25178958	-	MTEb	LTR	MaLR	-49	330	6	6
1610	2086	307	62	27	chr3	134420829	134421528	-25178255	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-2	1578	856	6
1610	1204	283	57	15	chr3	134421525	134421859	-25177924	-	MTEb-int	LTR	MaLR	-1215	365	18	6
1610	606	230	44	0	chr3	134421883	134422018	-25177765	-	MTEb	LTR	MaLR	-7	372	232	6
1610	1835	144	101	3	chr3	134424761	134425088	-25174695	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	9	6
1610	3068	176	41	42	chr3	134426291	134426845	-25172938	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	136	6
1610	3068	176	41	42	chr3	134427463	134427597	-25172186	-	RMER6C	LTR	ERVK	-555	135	3	6
1610	370	254	55	48	chr3	134430261	134430453	-25169330	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	143	6
1610	307	265	67	91	chr3	134431100	134431111	-25168672	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-187	142	132	6
1610	494	246	32	84	chr3	134435675	134435830	-25163953	+	MT2B	LTR	ERVL	111	257	-344	6
1610	1453	220	128	128	chr3	134436490	134437038	-25162745	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	27	6
1610	2280	184	76	38	chr3	134438764	134439032	-25160751	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-2	526	273	6
1610	2280	184	76	38	chr3	134439115	134439348	-25160435	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-256	272	6	6
1610	1830	139	56	78	chr3	134439411	134439771	-25160012	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	43	6
1610	261	299	55	44	chr3	134439945	134440036	-25159747	+	RMER12B	LTR	ERVK	1438	1529	-43	6
1610	355	196	0	42	chr3	134440043	134440120	-25159663	+	RMER12B	LTR	ERVK	1341	1404	0	6
1610	6167	55	32	3	chr3	134440218	134441001	-25158782	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-2	806	1	6
1610	942	314	100	48	chr3	134441324	134441903	-25157880	+	RLTR18	LTR	ERVK	6	614	-2	6
1610	1368	246	90	87	chr3	134443920	134444463	-25155320	+	RMER2	LTR	ERV1	1	545	-22	6
1610	1594	232	55	45	chr3	134463523	134463924	-25135859	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	6
1610	1986	140	50	53	chr3	134467213	134467591	-25132192	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	2	6
1610	302	362	6	136	chr3	134469149	134469325	-25130458	-	MTEa	LTR	MaLR	-226	153	1	6
1610	274	250	0	35	chr3	134472533	134472620	-25127163	+	MLT1A1	LTR	MaLR	323	406	-2	6
1610	740	351	38	118	chr3	134473902	134474335	-25125448	+	MLT1-int	LTR	MaLR	898	1293	-78	6
1610	740	351	38	118	chr3	134474524	134474590	-25125193	+	MLT1-int	LTR	MaLR	1294	1357	-14	6
1611	1407	247	26	12	chr3	134489045	134489389	-25110394	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	22	6
1611	1623	278	43	6	chr3	134505516	134506030	-25093753	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	1
1611	344	343	36	0	chr3	134507838	134507975	-25091808	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	535	676	-4	1
1611	2793	27	0	12	chr3	134508718	134509060	-25090723	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	338	-8	2
1611	2887	71	39	3	chr3	134518076	134518458	-25081325	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1611	7380	77	4	88	chr3	134518458	134519268	-25080515	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	387	3
1611	7380	77	4	88	chr3	134519739	134520124	-25079659	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-712	386	3	3
1611	3136	58	2	5	chr3	134520126	134520523	-25079260	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1611	1138	255	36	18	chr3	134521227	134521463	-25078320	-	RMER5	LTR	ERV1	-14	520	280	3
1611	922	137	14	0	chr3	134521463	134521609	-25078174	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	148	-608	3
1611	2207	154	19	6	chr3	134522392	134522757	-25077026	+	RMER6A	LTR	ERVK	387	756	0	3
1611	1144	234	71	24	chr3	134522757	134523020	-25076763	-	RMER5	LTR	ERV1	-254	280	4	4
1611	1712	73	0	0	chr3	134524975	134525194	-25074589	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	182	4
1611	417	144	22	66	chr3	134531561	134531637	-25068146	-	MTB	LTR	MaLR	-198	223	151	4
1611	366	113	16	31	chr3	134531637	134531701	-25068082	+	RMER17A2	LTR	ERVK	2	64	-842	4
1611	1082	187	126	17	chr3	134541360	134541599	-25058184	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	267	-127	5
1611	269	195	76	54	chr3	134541679	134541771	-25058012	+	RLTR25B	LTR	ERVK	409	502	-526	6
1611	1856	114	40	22	chr3	134542093	134542411	-25057372	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	-1	384	60	6
1611	1783	190	67	56	chr3	134551706	134552096	-25047687	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	7
1611	1786	205	105	84	chr3	134555304	134555980	-25043803	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	8
1611	4417	14	0	0	chr3	134564445	134564938	-25034845	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	9
1611	834	290	66	25	chr3	134581110	134581428	-25018355	+	RMER15	LTR	ERVL	211	541	-34	1
1611	261	204	19	0	chr3	134581466	134581520	-25018263	+	RMER15	LTR	ERVL	521	575	0	1
1611	346	318	11	0	chr3	134581521	134581633	-25018150	-	MLT1B-int	LTR	MaLR	-207	1528	1437	1
1611	854	320	77	40	chr3	134582133	134582638	-25017145	-	MLT1B-int	LTR	MaLR	-847	524	1	1
1611	556	314	88	38	chr3	134582648	134582989	-25016794	-	MLT1B	LTR	MaLR	-8	382	25	1
1611	764	279	68	39	chr3	134587481	134587761	-25012022	-	RMER15	LTR	ERVL	-5	570	283	1
1611	567	239	26	0	chr3	134587936	134588049	-25011734	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2	4997	4882	1
1611	980	329	49	14	chr3	134588881	134589229	-25010554	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-1735	3264	2905	1
1611	1450	319	73	17	chr3	134589290	134589932	-25009851	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2200	2799	2122	1
1611	331	220	30	113	chr3	134590074	134590207	-25009576	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3156	1843	1722	1
1611	654	355	82	43	chr3	134590821	134591380	-25008403	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4415	584	4	1
1611	520	285	102	20	chr3	134591383	134591580	-25008203	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	363	1
1611	266	239	40	71	chr3	134591766	134591865	-25007918	-	RMER15	LTR	ERVL	-479	96	1	1
1611	341	368	112	52	chr3	134601923	134602407	-24997376	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-9	553	41	1
1612	1228	287	35	12	chr3	134612598	134612940	-24986843	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	39	1
1612	707	336	20	20	chr3	134612947	134613196	-24986587	+	MTEa	LTR	MaLR	124	372	-7	1
1612	1370	330	56	75	chr3	134613213	134613836	-24985947	+	MTE-int	LTR	MaLR	962	1572	-8	1
1612	704	161	8	0	chr3	134628678	134628796	-24970987	+	ORR1A2	LTR	MaLR	122	240	-87	1
1612	6049	87	45	39	chr3	134628842	134629765	-24970018	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	1
1612	232	313	123	66	chr3	134638724	134638936	-24960847	+	ORR1E	LTR	MaLR	14	237	-122	1
1612	1247	247	13	48	chr3	134639335	134639727	-24960056	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	2	1
1612	578	263	53	36	chr3	134645253	134645478	-24954305	-	MER67C	LTR	ERV1	-347	364	136	1
1612	1557	198	111	14	chr3	134645703	134646062	-24953721	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1612	1303	297	36	31	chr3	134647971	134648392	-24951391	+	MER31A	LTR	ERV1	17	439	-46	1
1612	454	292	104	104	chr3	134650025	134650334	-24949449	+	MLT1A	LTR	MaLR	4	312	-62	1
1612	593	294	44	83	chr3	134650394	134650625	-24949158	+	MLT1D	LTR	MaLR	162	497	-8	1
1612	273	302	57	34	chr3	134650951	134651126	-24948657	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-34	494	316	2
1612	781	272	30	60	chr3	134651211	134651477	-24948306	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-195	258	1	2
1612	1764	228	67	31	chr3	134655975	134656364	-24943419	+	MTD	LTR	MaLR	3	405	-14	2
1612	262	326	72	39	chr3	134659501	134659654	-24940129	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	516	359	2
1612	543	243	24	84	chr3	134659778	134659944	-24939839	-	RMER20B	LTR	ERVK	-471	156	1	2
1612	1512	210	29	37	chr3	134670835	134671186	-24928597	+	MTE2b	LTR	MaLR	32	379	0	2
1612	966	258	64	45	chr3	134671818	134672131	-24927652	-	RMER15	LTR	ERVL	-12	563	245	2
1612	2234	132	11	6	chr3	134681293	134681650	-24918133	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	2
1612	1371	253	62	24	chr3	134681821	134682157	-24917626	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	352	4	2
1612	712	274	24	48	chr3	134684082	134684289	-24915494	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1121	2
1612	450	294	31	51	chr3	134684598	134684774	-24915009	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-126	1196	1040	2
1612	1549	253	50	75	chr3	134686549	134686726	-24913057	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-329	1519	1338	2
1612	1549	253	50	75	chr3	134686761	134686792	-24912991	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-511	1337	1307	2
1612	2296	235	55	98	chr3	134686884	134688012	-24911771	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-542	1306	1	2
1612	743	263	59	52	chr3	134691437	134691564	-24908219	-	RMER13A	LTR	ERVK	-406	454	326	2
1612	743	263	59	52	chr3	134692125	134692286	-24907497	-	RMER13A	LTR	ERVK	-535	325	164	2
1612	1368	157	7	97	chr3	134694522	134694832	-24904951	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	243	2
1612	1393	152	33	84	chr3	134694956	134695229	-24904554	-	RLTR28	LTR	ERVL	-265	259	1	2
1612	754	232	129	53	chr3	134695648	134695877	-24903906	+	RMER15	LTR	ERVL	292	534	-41	2
1612	754	232	129	53	chr3	134695973	134696006	-24903777	+	RMER15	LTR	ERVL	535	574	-1	2
1612	2108	208	211	7	chr3	134698903	134699513	-24900270	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	735	-2	2
1612	553	337	72	42	chr3	134704449	134704808	-24894975	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	1	2
1612	332	297	228	21	chr3	134705003	134705192	-24894591	-	RMER15	LTR	ERVL	-12	563	336	2
1612	1107	298	33	50	chr3	134707996	134708417	-24891366	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	414	-27	2
1612	311	305	189	57	chr3	134708947	134709100	-24890683	+	MLT1A	LTR	MaLR	25	168	-206	2
1612	311	305	189	57	chr3	134709148	134709290	-24890493	+	MLT1A	LTR	MaLR	169	359	-15	2
1612	3191	164	63	23	chr3	134710866	134711527	-24888256	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	3	3
1612	376	259	101	29	chr3	134713092	134713231	-24886552	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	149	-356	3
1612	228	287	95	38	chr3	134713320	134713425	-24886358	+	RLTR17	LTR	ERVK	337	447	-245	3
1612	472	202	0	116	chr3	134719836	134719854	-24879929	+	MT2B	LTR	ERVL	151	153	-448	3
1612	3143	8	3	0	chr3	134719982	134720348	-24879435	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	-126	367	1	3
1612	240	224	95	95	chr3	134720348	134720404	-24879379	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1350	613	558	3
1612	390	167	46	35	chr3	134720386	134720473	-24879310	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	3
1612	1265	188	187	3	chr3	134726333	134726643	-24873140	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-7	367	1	3
1612	1376	204	96	102	chr3	134726792	134727261	-24872522	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	466	0	3
1612	483	350	84	75	chr3	134727860	134728127	-24871656	+	MLT1C	LTR	MaLR	111	388	-79	3
1612	483	350	84	75	chr3	134728352	134728430	-24871353	+	MLT1C	LTR	MaLR	389	459	-8	3
1612	1773	144	111	12	chr3	134731608	134731952	-24867831	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	7	3
1612	510	284	110	42	chr3	134741102	134741293	-24858490	+	MLT2B2	LTR	ERVL	6	209	-306	3
1613	5628	108	62	43	chr3	134742039	134742816	-24856967	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	787	-171	3
1613	5628	108	62	43	chr3	134742850	134743010	-24856773	+	RMER17B	LTR	ERVK	788	955	-3	3
1613	2290	113	23	11	chr3	134745878	134746228	-24853555	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	3
1613	418	125	42	0	chr3	134748588	134748660	-24851123	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	954	3
1613	4532	140	143	2	chr3	134749349	134750180	-24849603	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-57	971	24	3
1613	4224	189	33	89	chr3	134750181	134750923	-24848860	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	162	3
1613	3507	18	2	0	chr3	134750923	134751318	-24848465	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1613	9257	24	11	3	chr3	134751318	134752407	-24847376	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
1613	3479	23	2	0	chr3	134752407	134752802	-24846981	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1613	4224	189	33	89	chr3	134752802	134752968	-24846815	-	RMER13A	LTR	ERVK	-699	161	3	3
1613	4362	43	2	0	chr3	134755812	134756327	-24843456	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	4	519	0	3
1613	1358	273	132	41	chr3	134756340	134756825	-24842958	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	29	3
1613	2598	102	202	23	chr3	134758631	134759071	-24840712	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	3
1613	300	291	0	132	chr3	134764867	134765049	-24834734	+	MLT1J	LTR	MaLR	228	385	-127	3
1613	686	291	79	26	chr3	134765098	134765327	-24834456	+	MTE2a	LTR	MaLR	139	379	0	3
1613	5450	79	42	8	chr3	134768359	134769138	-24830645	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	806	1	3
1613	1768	139	130	0	chr3	134771079	134771417	-24828366	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	384	0	3
1613	418	236	152	37	chr3	134771897	134772045	-24827738	-	MTD	LTR	MaLR	-258	161	1	3
1613	1042	282	63	39	chr3	134779821	134780239	-24819544	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	4
1613	1454	223	40	12	chr3	134781623	134781945	-24817838	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	331	-28	4
1613	455	243	33	59	chr3	134782252	134782438	-24817345	+	MTEa	LTR	MaLR	198	379	0	4
1613	700	294	130	0	chr3	134788058	134788289	-24811494	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	263	-116	4
1613	1323	241	112	11	chr3	134788362	134788727	-24811056	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	4
1613	477	214	68	4	chr3	134788728	134788857	-24810926	+	MTE2b	LTR	MaLR	257	414	-5	4
1613	1890	264	94	11	chr3	134788860	134789404	-24810379	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	2	590	-990	4
1613	2031	283	109	4	chr3	134789662	134790201	-24809582	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	580	1175	-405	4
1613	446	304	43	17	chr3	134790316	134790517	-24809266	+	MLT1D	LTR	MaLR	11	223	-404	4
1613	478	296	150	33	chr3	134790808	134791021	-24808762	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-6	359	122	4
1613	1575	219	66	13	chr3	134791521	134791900	-24807883	+	RMER5	LTR	ERV1	1	399	-135	4
1613	528	204	0	0	chr3	134792109	134792202	-24807581	+	RMER5	LTR	ERV1	437	529	-5	4
1613	1561	266	87	12	chr3	134792634	134792645	-24807138	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	524	4
1613	1561	266	87	12	chr3	134792675	134793158	-24806625	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	4	4
1613	2943	169	38	18	chr3	134794552	134795153	-24804630	-	RMER6A	LTR	ERVK	-5	751	139	4
1613	295	313	170	33	chr3	134795683	134796170	-24803613	+	MT2A	LTR	ERVL	1	512	-42	4
1613	1753	228	80	82	chr3	134797575	134798079	-24801704	+	RMER19C	LTR	ERVK	74	577	-34	4
1613	1753	228	80	82	chr3	134798225	134798259	-24801524	+	RMER19C	LTR	ERVK	578	611	0	4
1613	1576	222	21	35	chr3	134800076	134800450	-24799333	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	1	4
1613	2341	200	57	56	chr3	134803623	134804233	-24795550	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
1613	3643	70	5	88	chr3	134806563	134807129	-24792654	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	0	519	1	4
1613	356	321	187	25	chr3	134807703	134807901	-24791882	+	LTR16B1	LTR	ERVL	42	271	-209	4
1613	1125	291	81	15	chr3	134808015	134808350	-24791433	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	359	0	4
1613	255	333	0	0	chr3	134808350	134808414	-24791369	+	LTR16B1	LTR	ERVL	417	480	0	4
1613	755	239	57	6	chr3	134809465	134809642	-24790141	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	203	4
1613	433	296	77	22	chr3	134810216	134810399	-24789384	-	MLT1B	LTR	MaLR	-194	196	4	4
1613	1294	288	74	28	chr3	134810691	134811162	-24788621	+	RMER5	LTR	ERV1	33	525	-9	4
1613	1827	130	16	118	chr3	134812394	134812760	-24787023	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
1613	252	325	96	16	chr3	134813969	134814094	-24785689	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	138	-221	4
1613	3575	158	32	17	chr3	134814566	134815228	-24784555	+	RMER6C	LTR	ERVK	19	690	0	4
1613	369	289	93	43	chr3	134816516	134816738	-24783045	+	MLT1A	LTR	MaLR	160	390	0	4
1613	1290	231	158	8	chr3	134816820	134817174	-24782609	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	13	4
1613	257	301	41	95	chr3	134819165	134819334	-24780449	+	RMER10A	LTR	ERVL	253	412	-30	4
1613	269	245	143	54	chr3	134826035	134826082	-24773701	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-87	287	226	4
1613	288	245	143	54	chr3	134826244	134826343	-24773440	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-149	225	116	4
1613	619	301	26	17	chr3	134827524	134827754	-24772029	-	MLT2D	LTR	ERVL	-182	232	1	4
1613	5228	94	11	69	chr3	134828416	134829269	-24770514	+	RLTR13B4	LTR	ERVK	1	803	0	4
1613	2159	136	57	6	chr3	134831145	134831499	-24768284	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-20	374	3	4
1613	330	241	58	167	chr3	134831648	134831822	-24767961	+	RMER15	LTR	ERVL	1	155	-420	4
1613	683	313	45	45	chr3	134831874	134832165	-24767618	+	RMER15	LTR	ERVL	283	573	-2	4
1613	291	250	47	0	chr3	134832466	134832530	-24767253	+	MTE2a	LTR	MaLR	20	86	-293	4
1613	450	268	222	0	chr3	134834680	134835000	-24764783	+	ERVL-int	LTR	ERVL	292	682	-5032	5
1613	634	274	90	13	chr3	134835147	134835380	-24764403	+	ERVL-int	LTR	ERVL	2623	2873	-2884	5
1613	2121	230	67	85	chr3	134837914	134838688	-24761095	-	RLTR40	LTR	ERVK	-39	778	19	5
1613	2152	120	272	2	chr3	134844974	134845382	-24754401	-	MT2B2	LTR	ERVL	-43	541	24	5
1613	320	151	0	0	chr3	134845757	134845810	-24753973	-	MT2B2	LTR	ERVL	-548	53	1	5
1613	234	230	22	54	chr3	134845848	134845913	-24753870	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	577	5
1613	4740	66	0	56	chr3	134845913	134846535	-24753248	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	5
1613	234	230	22	54	chr3	134846535	134846561	-24753222	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1387	576	553	5
1613	370	115	216	11	chr3	134846568	134846656	-24753127	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-153	5608	5503	5
1613	2749	132	115	23	chr3	134849802	134850376	-24749407	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	125	5
1613	851	94	54	15	chr3	134850523	134850653	-24749130	-	RMER17A	LTR	ERVK	-616	135	1	5
1613	1450	167	101	4	chr3	134852204	134852481	-24747302	-	RMER12	LTR	ERVK	-1014	308	5	5
1613	4712	14	0	0	chr3	134855960	134856453	-24743330	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1613	2274	76	3	59	chr3	134864851	134865188	-24734595	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-9	318	1	5
1613	256	255	30	50	chr3	134865398	134865497	-24734286	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	278	5
1613	230	327	0	113	chr3	134865756	134865880	-24733903	-	MTEa	LTR	MaLR	-269	110	1	5
1613	4504	146	158	39	chr3	134867501	134867641	-24732142	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1120	5
1613	4504	146	158	39	chr3	134867788	134868646	-24731137	-	MTC-int	LTR	MaLR	-139	1119	141	5
1613	876	164	47	35	chr3	134869202	134869392	-24730391	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1347	233	18	5
1613	603	341	44	47	chr3	134871567	134871908	-24727875	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	348	-11	5
201	3148	57	26	10	chr3	134872966	134873356	-24726427	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1614	1917	129	253	16	chr3	134873824	134874195	-24725588	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	459	-2	5
1614	801	278	82	82	chr3	134876053	134876468	-24723315	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	5
1614	320	279	38	84	chr3	134876663	134876725	-24723058	+	MT2B	LTR	ERVL	110	160	-424	5
1614	399	171	194	8	chr3	134901474	134901598	-24698185	+	MTD	LTR	MaLR	273	419	0	6
1614	602	265	86	23	chr3	134901942	134902162	-24697621	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	145	6
1614	397	258	109	87	chr3	134919881	134920110	-24679673	-	RMER15	LTR	ERVL	-36	539	306	6
1614	1778	106	4	4	chr3	134924796	134925072	-24674711	-	RLTR19	LTR	ERVK	-223	276	1	6
1614	560	158	0	0	chr3	134936586	134936681	-24663102	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	481	6
1614	797	222	123	53	chr3	134937482	134937725	-24662058	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-593	4406	4147	6
1614	502	243	122	26	chr3	134937822	134937978	-24661805	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2611	2388	2218	6
1614	592	212	119	0	chr3	134938337	134938488	-24661295	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3394	1605	1437	6
1614	3700	256	133	33	chr3	134938622	134939607	-24660176	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3512	1487	383	6
1614	3700	256	133	33	chr3	134939740	134939947	-24659836	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4617	382	163	6
1614	2447	146	68	58	chr3	134939947	134940465	-24659318	+	RLTR28	LTR	ERVL	2	524	0	6
1614	3700	256	133	33	chr3	134940465	134940622	-24659161	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-4837	162	1	6
1614	2511	178	24	112	chr3	134941603	134942191	-24657592	-	RMER15	LTR	ERVL	-39	536	1	6
1614	1625	166	155	33	chr3	134946644	134947012	-24652771	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	6
1614	253	171	43	0	chr3	134962460	134962530	-24637253	+	RMER17C	LTR	ERVK	202	274	-136	7
1614	474	276	100	20	chr3	134967753	134967953	-24631830	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-168	240	25	7
1614	2787	134	106	6	chr3	134969123	134969596	-24630187	-	RLTR28	LTR	ERVL	-4	520	1	7
1614	1425	221	95	8	chr3	134971377	134971747	-24628036	-	MTD	LTR	MaLR	-17	402	1	7
1614	1426	207	59	56	chr3	134972843	134973079	-24626704	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	139	7
1614	1426	207	59	56	chr3	134973256	134973392	-24626391	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-236	138	1	7
1614	615	259	58	16	chr3	134975306	134975494	-24624289	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	209	7
1614	2554	163	69	38	chr3	134977197	134977746	-24622037	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-2	566	1	7
1614	1749	201	33	11	chr3	134978455	134978818	-24620965	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	371	-3	7
1614	405	258	99	40	chr3	134996683	134997006	-24602777	-	RMER17C	LTR	ERVK	-68	342	1	7
1614	1736	166	104	22	chr3	135002312	135002768	-24597015	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	480	5
201	2221	183	40	67	chr3	135003909	135004389	-24595394	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-561	467	1	5
1615	3394	45	5	12	chr3	135013380	135013783	-24586000	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1615	3119	148	39	4	chr3	135013988	135014498	-24585285	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	2
1615	3382	219	88	44	chr3	135014499	135015463	-24584320	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-1	2325	1319	2
1615	1290	140	75	15	chr3	135015463	135015728	-24584055	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-80	448	146	3
1615	468	222	8	93	chr3	135026432	135026537	-24573246	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	167	5
1615	468	222	8	93	chr3	135027157	135027180	-24572603	-	MT2B	LTR	ERVL	-435	166	146	5
1615	261	215	88	44	chr3	135028526	135028594	-24571189	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-72	298	228	5
1615	3504	46	5	5	chr3	135031323	135031719	-24568064	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1615	3534	40	5	2	chr3	135031719	135032164	-24567619	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	446	-652	6
1615	739	44	0	0	chr3	135032162	135032253	-24567530	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	306	396	0	6
1615	354	276	18	66	chr3	135038231	135038398	-24561385	-	RMER12	LTR	ERVK	-394	928	770	7
1615	910	272	65	50	chr3	135039133	135039473	-24560310	-	MLT1B	LTR	MaLR	-45	345	1	7
1615	1748	205	58	37	chr3	135041917	135042327	-24557456	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	8
1615	3636	239	86	31	chr3	135042327	135043382	-24556401	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	1113	-145	8
1615	577	212	29	0	chr3	135043671	135043808	-24555975	+	MTD-int	LTR	MaLR	1116	1256	-2	8
1615	386	257	9	51	chr3	135043814	135043935	-24555848	+	MTD	LTR	MaLR	3	116	-305	8
1615	257	234	141	27	chr3	135058382	135058531	-24541252	-	RLTR21	LTR	ERVK	-317	1255	1090	1
1615	1768	168	149	32	chr3	135059058	135059433	-24540350	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1615	240	340	27	40	chr3	135061319	135061469	-24538314	-	RLTR17	LTR	ERVK	-266	426	279	1
1615	408	257	8	34	chr3	135061511	135061628	-24538155	-	RLTR16	LTR	ERVK	-368	137	24	1
1615	1120	216	63	38	chr3	135065627	135065944	-24533839	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-202	325	1	1
1615	2233	119	3	3	chr3	135068925	135069263	-24530520	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	1
1615	299	268	0	35	chr3	135072013	135072098	-24527685	+	MT2B	LTR	ERVL	169	250	-351	1
1615	1024	235	85	96	chr3	135089109	135089542	-24510241	+	MT2A	LTR	ERVL	1	560	-41	1
1615	269	329	116	29	chr3	135092854	135093026	-24506757	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-70	485	299	1
1615	246	359	39	0	chr3	135093089	135093167	-24506616	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-417	178	98	1
1615	336	268	62	23	chr3	135093324	135093454	-24506329	+	MLT1A1	LTR	MaLR	3	137	-271	1
1615	348	241	15	42	chr3	135095351	135095480	-24504303	-	MTE2a	LTR	MaLR	-32	387	266	2
1615	891	320	81	52	chr3	135096813	135097221	-24502562	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-74	441	22	2
1616	250	270	158	38	chr3	135137194	135137352	-24462431	+	LTR41B	LTR	ERVL	576	752	-6	2
1616	875	250	45	157	chr3	135137766	135138227	-24461556	+	RMER20B	LTR	ERVK	207	618	-9	2
1616	249	385	10	0	chr3	135138194	135138290	-24461493	+	RMER20B	LTR	ERVK	504	600	-27	2
1616	1176	155	98	5	chr3	135140293	135140507	-24459276	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	234	-93	2
1616	253	133	41	853	chr3	135140569	135140593	-24459190	+	ORR1A2	LTR	MaLR	277	306	-40	2
1616	253	119	0	23	chr3	135140741	135140773	-24459010	+	ORR1A2	LTR	MaLR	287	318	-8	2
1616	1570	35	40	0	chr3	135140808	135141010	-24458773	+	MTB	LTR	MaLR	187	396	-4	2
1616	375	267	75	15	chr3	135141824	135141957	-24457826	+	MTEb	LTR	MaLR	26	166	-213	2
1616	273	274	172	71	chr3	135142408	135142577	-24457206	+	MTEb	LTR	MaLR	184	369	-10	2
1616	1065	279	91	6	chr3	135143465	135143797	-24455986	+	MTE2b	LTR	MaLR	17	376	-3	2
1616	283	346	92	38	chr3	135143933	135144173	-24455610	-	LTR83	LTR	ERVL	-333	447	195	3
1616	1607	212	44	25	chr3	135144498	135144897	-24454886	-	MTD	LTR	MaLR	-22	397	6	3
1616	1070	203	161	10	chr3	135150668	135150974	-24448809	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	5	3
1616	230	280	15	113	chr3	135151050	135151183	-24448600	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-473	555	436	3
1616	2072	172	73	3	chr3	135153446	135153814	-24445969	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	3
1616	1957	151	33	7	chr3	135155104	135155404	-24444379	-	RLTR10E	LTR	ERVK	-3	308	1	3
1616	20826	86	5	16	chr3	135155404	135157309	-24442474	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7680	5773	3
1616	20826	72	1	15	chr3	135157451	135158615	-24441168	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-1809	5772	4623	3
1616	878	68	36	50	chr3	135159283	135159423	-24440360	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-2911	4670	4533	3
1616	482	217	12	17	chr3	135159440	135159575	-24440208	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-2369	2475	2367	3
1616	1784	153	28	3	chr3	135159576	135159864	-24439919	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-3139	4267	3973	3
1616	463	123	0	14	chr3	135159835	135159909	-24439874	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-2538	2306	2234	3
1616	1557	132	79	4	chr3	135160051	135160318	-24439465	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-3551	3855	3569	3
1616	1191	246	61	24	chr3	135160344	135160639	-24439144	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-4653	2753	2448	3
1616	402	165	78	148	chr3	135160639	135160732	-24439051	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5081	1056	962	3
1616	402	165	78	148	chr3	135160929	135160963	-24438820	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-5176	961	938	3
1616	325	259	41	41	chr3	135160968	135161089	-24438694	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4587	819	699	3
1616	401	280	44	98	chr3	135164650	135164982	-24434801	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	351	55	3
1616	1787	197	39	25	chr3	135166437	135166796	-24432987	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	50	3
1616	420	82	16	0	chr3	135167339	135167400	-24432383	-	MTC	LTR	MaLR	-359	62	1	3
1616	1067	221	8	24	chr3	135167423	135167669	-24432114	-	MTD	LTR	MaLR	-150	269	28	3
1616	1963	200	48	34	chr3	135168978	135169476	-24430307	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	515	-1	3
1616	249	227	45	0	chr3	135172685	135172751	-24427032	+	MTD	LTR	MaLR	3	71	-350	3
1616	651	189	94	41	chr3	135172986	135173157	-24426626	+	MTD	LTR	MaLR	235	414	-5	3
1616	1687	180	27	9	chr3	135177339	135177670	-24422113	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	85	4
1616	542	300	146	16	chr3	135179828	135180136	-24419647	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-172	388	41	4
1616	350	291	22	73	chr3	135180216	135180353	-24419430	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	131	-259	4
1616	2714	79	75	21	chr3	135183567	135183953	-24415830	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1616	265	329	51	28	chr3	135192892	135193143	-24406640	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	467	205	4
1616	275	256	141	33	chr3	135193660	135193781	-24406002	-	MLT1B	LTR	MaLR	-243	147	14	4
1616	639	220	123	10	chr3	135195953	135196160	-24403623	+	ORR1D2	LTR	MaLR	4	234	-136	4
1616	797	220	97	141	chr3	135200407	135200602	-24399181	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	179	4
1616	797	220	97	141	chr3	135200939	135201028	-24398755	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-196	178	115	4
1616	797	220	97	141	chr3	135201076	135201176	-24398607	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-260	114	1	4
1616	235	252	67	67	chr3	135203257	135203376	-24396407	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	145	4
1616	2156	161	34	3	chr3	135206033	135206420	-24393363	-	MTC	LTR	MaLR	-22	399	1	4
1616	4129	179	98	22	chr3	135209329	135210284	-24389499	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	1	4
1616	5018	106	38	7	chr3	135212851	135213688	-24386095	-	RMER17D	LTR	ERVK	-2	887	25	4
1616	2903	85	24	123	chr3	135216808	135217343	-24382440	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	5
1616	868	263	63	87	chr3	135222100	135222195	-24377588	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	317	5
1616	1021	263	63	87	chr3	135222362	135222679	-24377104	-	MTD	LTR	MaLR	-103	316	1	5
1616	359	296	20	0	chr3	135223341	135223439	-24376344	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	100	-279	5
1616	1076	213	38	0	chr3	135223622	135223833	-24375950	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	201	5
1616	941	196	50	11	chr3	135223942	135224123	-24375660	-	MTD	LTR	MaLR	-231	188	1	5
1616	1463	241	46	29	chr3	135228310	135228661	-24371122	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	5
1616	966	281	128	10	chr3	135231611	135231923	-24367860	+	ORR1D2	LTR	MaLR	19	367	-3	5
1616	1180	230	121	62	chr3	135234592	135235078	-24364705	+	RLTR17	LTR	ERVK	82	596	-96	5
1616	1108	228	97	72	chr3	135239075	135239297	-24360486	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	312	5
1616	2222	128	24	27	chr3	135239297	135239708	-24360075	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	5
1616	1108	202	64	68	chr3	135239708	135239886	-24359897	-	RMER16	LTR	ERVK	-222	311	1	5
1616	794	299	165	9	chr3	135245235	135245569	-24354214	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-30	549	164	5
1616	653	243	179	40	chr3	135248564	135248860	-24350923	+	MTD	LTR	MaLR	18	354	-65	5
1616	469	319	30	46	chr3	135249628	135249825	-24349958	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	194	-165	5
1617	456	137	38	54	chr3	135295529	135295714	-24304069	+	RMER17C	LTR	ERVK	90	271	-139	6
1617	862	319	37	22	chr3	135310867	135311274	-24288509	+	MLT1C	LTR	MaLR	55	467	0	6
1617	354	278	45	83	chr3	135327044	135327201	-24272582	+	MLT1D	LTR	MaLR	4	154	-351	6
1617	266	237	281	0	chr3	135327360	135327474	-24272309	+	MLT1D	LTR	MaLR	356	501	-4	6
1617	362	293	46	60	chr3	135330093	135330423	-24269360	+	MLT1C	LTR	MaLR	67	461	-6	6
1617	1855	151	38	6	chr3	135335439	135335785	-24263998	+	ORR1C2	LTR	MaLR	28	384	0	6
1617	256	323	138	26	chr3	135337728	135337960	-24261823	+	MLT1H	LTR	MaLR	108	365	-184	6
1617	497	252	137	78	chr3	135341551	135341844	-24257939	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	56	7
1617	811	253	143	13	chr3	135365174	135365480	-24234303	+	MTEa	LTR	MaLR	3	349	-30	7
1617	415	261	212	5	chr3	135368174	135368363	-24231420	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-321	235	8	7
1617	1470	161	63	18	chr3	135375177	135375462	-24224321	-	MTC	LTR	MaLR	-123	298	1	7
1617	485	265	75	27	chr3	135386775	135386961	-24212822	+	MER31B	LTR	ERV1	262	456	-10	7
1617	1001	260	33	81	chr3	135390720	135391113	-24208670	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	375	-4	7
1617	2022	180	11	11	chr3	135395644	135396010	-24203773	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	367	0	7
1618	4897	45	3	3	chr3	135398090	135398677	-24201106	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	7
1618	360	304	51	15	chr3	135400076	135400213	-24199570	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-7	358	217	7
1618	245	215	335	71	chr3	135406020	135406190	-24193593	+	MLT1J	LTR	MaLR	165	379	-133	7
1618	237	202	137	11	chr3	135407617	135407712	-24192071	-	MLT1B	LTR	MaLR	-132	258	152	8
1618	1950	116	13	78	chr3	135413292	135413666	-24186117	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	390	-4	8
1618	397	342	92	32	chr3	135418363	135418693	-24181090	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	413	-1	8
1618	1214	288	63	30	chr3	135420332	135420826	-24178957	+	RMER5	LTR	ERV1	1	510	-24	8
1618	428	255	39	58	chr3	135421130	135421284	-24178499	+	RLTR14	LTR	ERV1	224	374	-8	8
1618	4660	130	42	44	chr3	135428878	135429769	-24170014	-	RMER17D	LTR	ERVK	0	889	1	8
1618	1947	105	28	19	chr3	135432516	135432835	-24166948	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	8
1618	40633	21	10	5	chr3	135432835	135437801	-24161982	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	1	8
1618	1959	102	28	19	chr3	135437801	135438120	-24161663	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	8
1618	353	196	87	0	chr3	135441257	135441349	-24158434	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	821	920	-1406	8
1618	236	188	105	86	chr3	135441357	135441462	-24158321	+	RMER4A	LTR	ERVK	323	429	-37	8
1618	5993	160	76	12	chr3	135441462	135442674	-24157109	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1037	2326	0	8
1618	2829	126	2	13	chr3	135442674	135443124	-24156659	+	BGLII_A	LTR	ERVK	1	445	0	8
1618	3135	72	12	7	chr3	135445096	135445515	-24154268	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	8
1618	340	263	67	49	chr3	135453680	135453844	-24145939	+	MLT1F	LTR	MaLR	261	427	-121	8
1618	391	307	36	32	chr3	135458065	135458284	-24141499	-	MLT1C	LTR	MaLR	-142	325	106	8
1618	1636	207	11	52	chr3	135458659	135459041	-24140742	+	ORR1D1	LTR	MaLR	9	374	0	8
1618	2010	193	36	24	chr3	135459695	135460109	-24139674	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	8
1618	1805	210	70	35	chr3	135460324	135460732	-24139051	+	RLTR20C	LTR	ERVK	20	442	-92	8
1618	1805	210	70	35	chr3	135460777	135460857	-24138926	+	RLTR20C	LTR	ERVK	443	524	-10	8
1618	259	135	19	0	chr3	135475629	135475671	-24124112	-	MT2A	LTR	ERVL	0	475	433	8
1618	1194	212	162	96	chr3	135475801	135476239	-24123544	-	MT2A	LTR	ERVL	-65	468	2	8
1618	1157	201	183	25	chr3	135476673	135476990	-24122793	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	8
1618	359	289	193	24	chr3	135481769	135482194	-24117589	+	RMER5	LTR	ERV1	20	516	-18	8
1618	1748	141	58	30	chr3	135499667	135499997	-24099786	+	MTC	LTR	MaLR	1	339	-82	9
1618	3242	171	169	108	chr3	135503847	135503978	-24095805	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	898	9
1618	3242	171	169	108	chr3	135504026	135504863	-24094920	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-131	897	1	9
1618	338	238	36	0	chr3	135504864	135504948	-24094835	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-1016	87	1	1
1618	388	268	135	40	chr3	135507694	135507842	-24091941	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-102	413	252	1
1618	270	258	15	0	chr3	135507913	135507979	-24091804	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-376	139	73	1
1618	405	310	157	61	chr3	135508022	135508366	-24091417	-	MER31B	LTR	ERV1	-106	379	3	1
1618	494	237	108	16	chr3	135510719	135511008	-24088775	-	MLT1A	LTR	MaLR	-16	374	1	2
1618	259	330	8	89	chr3	135513701	135513716	-24086067	+	MT2B2	LTR	ERVL	167	274	-310	2
1619	319	315	148	44	chr3	135533856	135534085	-24065698	-	LTR33	LTR	ERVL	-248	267	15	6
1619	350	311	80	20	chr3	135536352	135536552	-24063231	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1534	4133	3922	6
1619	466	297	159	0	chr3	135552074	135552219	-24047564	-	MTD	LTR	MaLR	-53	366	199	8
1619	316	341	39	134	chr3	135553666	135554055	-24045728	-	MLT1J	LTR	MaLR	-127	385	34	8
1619	309	330	0	0	chr3	135554721	135554821	-24044962	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	371	9
1619	360	291	63	52	chr3	135555657	135555831	-24043952	-	LTR41B	LTR	ERVL	-582	176	1	9
1619	3314	130	182	15	chr3	135559552	135560145	-24039638	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	692	0	9
1619	710	271	160	24	chr3	135560725	135561013	-24038770	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-43	327	1	1
1619	1409	213	116	3	chr3	135563681	135564010	-24035773	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	1	1
1619	233	229	16	16	chr3	135575801	135575863	-24023920	-	MER34A	LTR	ERV1	-13	529	468	1
1619	329	247	140	0	chr3	135577297	135577390	-24022393	-	MER34A	LTR	ERV1	-452	119	14	1
1619	841	262	69	37	chr3	135582155	135582401	-24017382	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	117	1
1619	834	184	0	20	chr3	135582477	135582627	-24017156	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	232	1
1619	3066	197	109	106	chr3	135583993	135584361	-24015422	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	441	-517	1
1619	3066	197	109	106	chr3	135584430	135585016	-24014767	+	RMER17B	LTR	ERVK	442	958	0	1
1619	232	328	61	68	chr3	135588278	135588425	-24011358	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-118	241	96	1
1619	302	354	16	8	chr3	135588673	135588801	-24010982	-	MT2A	LTR	ERVL	-72	461	333	1
1619	769	332	78	9	chr3	135592007	135592353	-24007430	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	6	1
1619	1579	195	82	9	chr3	135598429	135598770	-24001013	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	366	1	1
1619	1689	219	34	26	chr3	135598780	135598926	-24000857	+	ORR1D1	LTR	MaLR	21	164	-210	1
1619	3442	47	3	0	chr3	135598926	135599310	-24000473	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	1
1619	1689	219	34	26	chr3	135599310	135599514	-24000269	+	ORR1D1	LTR	MaLR	165	374	0	1
1619	2854	165	43	8	chr3	135599659	135600167	-23999616	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-1	526	1	1
1619	411	294	148	48	chr3	135600181	135600410	-23999373	+	MLT1A	LTR	MaLR	123	374	0	1
1619	1623	313	57	26	chr3	135601666	135602248	-23997535	+	RMER15-int	LTR	ERVL	184	774	-4225	1
1619	1623	313	57	26	chr3	135602269	135602405	-23997378	+	RMER15-int	LTR	ERVL	775	924	-4075	1
1619	261	308	0	0	chr3	135602460	135602525	-23997258	+	RMER15-int	LTR	ERVL	989	1053	-3946	1
1619	1493	318	64	9	chr3	135602794	135603340	-23996443	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1988	2563	-2436	1
1619	850	296	105	16	chr3	135603412	135603908	-23995875	+	RMER15-int	LTR	ERVL	4181	4720	-279	1
1619	1665	224	58	0	chr3	135604302	135604650	-23995133	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	368	-2	1
1619	240	330	102	0	chr3	135604902	135605020	-23994763	+	RMER15	LTR	ERVL	432	561	-14	1
1619	1047	266	104	58	chr3	135605633	135606112	-23993671	-	MLT1D	LTR	MaLR	-2	503	3	1
1619	1365	225	147	17	chr3	135611944	135612305	-23987478	+	MTD	LTR	MaLR	10	417	-2	1
1619	408	229	80	17	chr3	135612307	135612440	-23987343	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	133	-965	1
1619	1292	244	56	91	chr3	135612473	135613060	-23986723	+	MTD-int	LTR	MaLR	76	626	-632	1
1619	1727	153	128	106	chr3	135616487	135616939	-23982844	+	RMER4A	LTR	ERVK	5	466	0	2
1619	774	140	98	0	chr3	135616941	135617084	-23982699	+	RMER4A	LTR	ERVK	308	464	-2	2
1619	285	317	113	66	chr3	135617541	135617963	-23981820	+	LTR33C	LTR	ERVL	7	447	-216	2
1619	248	291	63	0	chr3	135617965	135618044	-23981739	+	MTC	LTR	MaLR	338	421	0	2
1619	289	286	71	0	chr3	135618423	135618507	-23981276	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	734	823	-4844	2
1619	240	125	0	24	chr3	135633863	135633904	-23965879	-	MER66C	LTR	ERV1	-62	493	454	2
1619	325	337	70	103	chr3	135634736	135635123	-23964660	+	LTR81C	LTR	ERV1?	780	1153	0	2
1619	1407	210	88	93	chr3	135635985	135636044	-23963739	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-2	405	340	2
1619	1407	210	88	93	chr3	135636070	135636398	-23963385	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-68	339	20	2
1619	382	351	35	12	chr3	135637694	135637742	-23962041	+	MLT1J	LTR	MaLR	119	169	-343	2
1619	1360	252	75	28	chr3	135637742	135638142	-23961641	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
1619	382	351	35	12	chr3	135638142	135638266	-23961517	+	MLT1J	LTR	MaLR	170	295	-217	2
1619	715	336	24	28	chr3	135639720	135639968	-23959815	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-22	343	97	2
1619	3240	45	2	8	chr3	135642199	135642597	-23957186	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1619	285	300	26	43	chr3	135649430	135649545	-23950238	+	RMER5	LTR	ERV1	115	227	-307	2
1619	1232	248	22	7	chr3	135649755	135650031	-23949752	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	91	2
1619	921	240	106	86	chr3	135650053	135650498	-23949285	-	RMER4B	LTR	ERVK	-27	584	16	2
1619	372	171	156	13	chr3	135650510	135650587	-23949196	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-282	88	1	2
1619	301	189	0	0	chr3	135650589	135650642	-23949141	+	RMER5	LTR	ERV1	430	482	-52	2
1620	553	299	107	10	chr3	135660086	135660282	-23939501	-	ORR1E	LTR	MaLR	-144	215	1	2
1620	4304	304	74	29	chr3	135660282	135661741	-23938042	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-53	1527	3	2
1620	427	174	70	20	chr3	135661742	135661842	-23937941	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	275	2
1620	288	262	74	80	chr3	135661843	135662005	-23937778	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	163	-196	2
1620	1668	174	43	33	chr3	135666608	135666976	-23932807	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	2
1620	2139	220	55	39	chr3	135668532	135669094	-23930689	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	4	2
1620	658	276	96	147	chr3	135674442	135674871	-23924912	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	13	2
1620	1142	262	11	7	chr3	135674930	135675207	-23924576	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-921	4840	4563	2
1620	292	267	0	75	chr3	135675714	135675807	-23923976	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	289	3
1620	304	275	54	199	chr3	135686238	135686424	-23913359	+	MTE2a	LTR	MaLR	207	365	-14	3
1620	636	202	9	168	chr3	135687630	135687844	-23911939	+	MTEb	LTR	MaLR	198	377	-2	3
1620	1919	172	95	15	chr3	135690458	135690848	-23908935	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1620	573	373	39	33	chr3	135701274	135701609	-23898174	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-51	429	93	3
1620	408	342	78	10	chr3	135701711	135701903	-23897880	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-11	354	150	3
1620	854	268	61	85	chr3	135709395	135709758	-23890025	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	1	3
1620	280	308	102	48	chr3	135710301	135710468	-23889315	-	MLT1B	LTR	MaLR	-244	223	48	3
1620	226	242	112	73	chr3	135720786	135720964	-23878819	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-898	591	407	3
1620	632	188	24	48	chr3	135721018	135721186	-23878597	-	RMER10B	LTR	ERVL	-46	352	189	3
1620	246	200	9	87	chr3	135733105	135733220	-23866563	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-539	367	262	3
1620	3212	185	9	18	chr3	135735962	135736535	-23863248	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	568	0	3
1620	725	258	54	129	chr3	135737889	135738299	-23861484	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	3
1620	413	265	141	32	chr3	135742065	135742340	-23857443	+	MTEb	LTR	MaLR	13	379	0	3
1620	311	346	36	65	chr3	135743048	135743187	-23856596	-	ORR1E	LTR	MaLR	-171	188	54	3
1620	3143	287	162	22	chr3	135743238	135744548	-23855235	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-82	1498	6	3
1620	421	304	128	79	chr3	135744555	135744859	-23854924	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	41	3
1620	569	357	121	40	chr3	135780435	135780914	-23818869	+	MLT1G1	LTR	MaLR	37	554	-25	4
1620	2101	135	7	85	chr3	135781187	135781633	-23818150	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	4
1620	347	127	0	0	chr3	135781635	135781690	-23818093	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	57	-1930	4
1620	4171	56	68	23	chr3	135781671	135782289	-23817494	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	17	662	-5819	4
1620	424	38	0	0	chr3	135782289	135782342	-23817441	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1411	-5070	4
1620	1716	123	4	4	chr3	135782341	135782603	-23817180	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2236	2497	-5183	4
1620	886	73	24	0	chr3	135782600	135782723	-23817060	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4785	4910	-2770	4
1620	19962	16	2	2	chr3	135782725	135785085	-23814698	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4123	6481	0	4
1620	2257	132	63	59	chr3	135785085	135785558	-23814225	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	4
1620	1165	275	15	102	chr3	135789491	135789892	-23809891	+	MTEa	LTR	MaLR	1	366	-13	4
1621	242	331	71	49	chr3	135790900	135791084	-23808699	+	MLT1D	LTR	MaLR	176	363	-142	4
1621	3063	66	2	8	chr3	135792359	135792757	-23807026	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1621	1345	199	79	87	chr3	135794376	135794535	-23805248	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	163	-215	4
1621	1345	199	79	87	chr3	135794595	135794814	-23804969	+	ORR1C1	LTR	MaLR	164	375	-3	4
1621	234	255	116	11	chr3	135810206	135810301	-23789482	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	145	249	-162	4
1621	237	281	24	24	chr3	135810401	135810485	-23789298	+	MTE2a	LTR	MaLR	294	377	-2	4
1621	1096	246	56	4	chr3	135816931	135817180	-23782603	+	MTD	LTR	MaLR	13	274	-145	4
1621	1638	201	39	6	chr3	135823435	135823790	-23775993	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1621	1151	244	97	49	chr3	135826016	135826347	-23773436	+	MTD	LTR	MaLR	18	371	-48	4
1621	1151	244	97	49	chr3	135826759	135826797	-23772986	+	MTD	LTR	MaLR	372	405	-14	4
1621	334	297	49	35	chr3	135829025	135829168	-23770615	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	221	4
1621	268	348	62	0	chr3	135829234	135829346	-23770437	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-269	139	21	4
1621	424	308	42	68	chr3	135833132	135833449	-23766334	+	MLT1C	LTR	MaLR	15	369	-98	5
1621	2016	117	12	15	chr3	135836742	135837080	-23762703	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	5
1621	52520	30	9	2	chr3	135837080	135843505	-23756278	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6478	-3	5
1621	2016	117	12	15	chr3	135843509	135843847	-23755936	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	5
1621	237	299	45	0	chr3	135850733	135850800	-23748983	-	MTEa	LTR	MaLR	-235	144	75	5
1621	320	381	29	18	chr3	135860215	135860386	-23739397	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-263	293	121	5
1621	2336	189	10	7	chr3	135863359	135863769	-23736014	+	MTC	LTR	MaLR	3	413	-8	5
1621	242	261	133	18	chr3	135867996	135868109	-23731674	+	LTR73	LTR	ERV1	184	309	-263	5
1621	1989	182	14	53	chr3	135869086	135869522	-23730261	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
1621	694	303	27	102	chr3	135871943	135872277	-23727506	+	MTE2a	LTR	MaLR	69	377	-2	5
1621	2176	210	12	5	chr3	135877919	135878325	-23721458	+	MTC	LTR	MaLR	5	413	-8	5
1621	2582	152	11	2	chr3	135879159	135879593	-23720190	+	BGLII_B	LTR	ERVK	4	441	0	5
1621	1924	185	14	30	chr3	135880661	135881028	-23718755	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	18	5
1621	1873	158	3	6	chr3	135882505	135882817	-23716966	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	5
1621	3089	149	76	69	chr3	135886922	135887605	-23712178	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	690	0	5
1621	743	241	201	37	chr3	135891559	135892016	-23707767	+	RMER4B	LTR	ERVK	47	578	-7	5
1621	1278	208	191	6	chr3	135894375	135894700	-23705083	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	20	5
1621	237	102	286	0	chr3	135898717	135898766	-23701017	+	MTC	LTR	MaLR	1	63	-358	5
1621	292	152	109	89	chr3	135905237	135905338	-23694445	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	162	6
1622	1714	159	3	106	chr3	135925401	135925759	-23674024	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	6
1622	713	242	27	0	chr3	135932932	135933081	-23666702	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	267	6
1622	329	246	75	50	chr3	135933278	135933385	-23666398	-	MTD	LTR	MaLR	-311	110	1	6
1622	4925	139	12	51	chr3	135952170	135953081	-23646702	-	RLTR13A3	LTR	ERVK	0	978	1	6
1622	476	223	76	41	chr3	135955541	135955686	-23644097	-	RMER15	LTR	ERVL	-90	485	336	6
1622	749	299	57	24	chr3	135956490	135956788	-23642995	-	RMER5	LTR	ERV1	-10	524	217	6
1622	506	282	17	0	chr3	135960566	135960683	-23639100	+	RMER10B	LTR	ERVL	270	388	-10	6
1622	325	371	104	12	chr3	135969265	135969505	-23630278	-	MLT1D	LTR	MaLR	-100	405	144	7
1622	238	197	15	76	chr3	135977517	135977583	-23622200	+	MTE2a	LTR	MaLR	269	330	-49	7
1622	805	296	114	23	chr3	135977871	135978214	-23621569	-	MTD	LTR	MaLR	-45	374	1	7
1622	370	313	95	58	chr3	135992841	135993082	-23606701	+	MLT1D	LTR	MaLR	183	432	-73	7
1622	1345	251	138	31	chr3	136000823	136001255	-23598528	-	RLTR40	LTR	ERVK	-55	762	289	1
1622	1345	251	138	31	chr3	136001287	136001433	-23598350	-	RLTR40	LTR	ERVK	-529	288	123	1
1622	1331	227	63	3	chr3	136001452	136001753	-23598030	-	MTC	LTR	MaLR	-102	319	1	3
1622	281	216	53	74	chr3	136001753	136001844	-23597939	-	RLTR40	LTR	ERVK	-693	124	36	1
1622	1310	227	89	11	chr3	136003484	136003854	-23595929	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	18	9
1622	1820	161	22	6	chr3	136006395	136006708	-23593075	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	318	-76	1
1622	285	146	21	0	chr3	136006831	136006879	-23592904	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	319	1
1622	1666	211	79	6	chr3	136006881	136007234	-23592549	+	MTD	LTR	MaLR	41	419	0	1
1622	1375	218	80	17	chr3	136012877	136013227	-23586556	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	2
1622	2437	199	49	15	chr3	136016708	136017284	-23582499	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-65	8894	8395	3
1622	2437	196	57	12	chr3	136017851	136017935	-23581848	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-565	8394	8308	3
1622	1009	251	40	13	chr3	136017935	136018238	-23581545	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-710	5840	5530	3
1622	411	293	35	116	chr3	136020491	136020723	-23579060	-	MTEa	LTR	MaLR	-166	213	1	3
1622	347	286	47	19	chr3	136022281	136022388	-23577395	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-4995	766	657	4
1622	533	256	122	31	chr3	136022392	136022678	-23577105	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5442	319	8	4
1622	1499	284	5	20	chr3	136022775	136023171	-23576612	-	MT2A	LTR	ERVL	-143	390	1	4
1622	989	240	188	34	chr3	136027309	136027482	-23572301	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-1	377	165	5
1622	989	240	188	34	chr3	136027544	136027694	-23572089	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-214	164	5	5
1622	1421	223	179	48	chr3	136037565	136038045	-23561738	-	MT2B	LTR	ERVL	-58	543	1	7
1622	1463	242	42	3	chr3	136038382	136038738	-23561045	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	7
1623	1967	202	31	41	chr3	136060160	136060577	-23539206	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	9
1623	483	390	14	9	chr3	136061738	136061958	-23537825	+	MT2A	LTR	ERVL	242	462	-71	9
1623	2517	218	40	4	chr3	136066716	136067214	-23532569	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	1
1623	1141	306	25	19	chr3	136069655	136069971	-23529812	-	ORR1E	LTR	MaLR	-41	318	1	1
1623	3221	48	5	5	chr3	136074207	136074603	-23525180	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1623	2076	188	47	0	chr3	136082511	136082895	-23516888	+	MTD	LTR	MaLR	18	419	0	1
1623	486	337	142	28	chr3	136085089	136085519	-23514264	+	MLT1F	LTR	MaLR	41	519	-29	1
1623	592	319	70	3	chr3	136097026	136097381	-23502402	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	1
1623	251	295	60	15	chr3	136100258	136100392	-23499391	+	LTR37B	LTR	ERV1	11	150	-318	1
1623	1272	255	80	40	chr3	136103815	136104314	-23495469	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-171	6748	6230	1
1623	304	159	104	96	chr3	136104720	136104845	-23494938	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2184	3953	3828	1
1623	1638	35	7	1	chr3	136106548	136106788	-23492995	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	229	1
1623	1866	171	29	27	chr3	136109292	136109701	-23490082	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	1
1623	679	319	95	25	chr3	136114900	136115382	-23484401	+	MLT2B1	LTR	ERVL	3	518	-2	1
1623	314	343	45	40	chr3	136116525	136116701	-23483082	-	LTR16E2	LTR	ERVL	-1	567	391	1
1623	456	326	148	57	chr3	136118821	136119328	-23480455	+	RLTR18	LTR	ERVK	33	585	-31	1
1623	355	342	26	13	chr3	136122840	136122991	-23476792	-	LTR33	LTR	ERVL	-5	510	358	1
1623	817	286	182	20	chr3	136126481	136126920	-23472863	-	MER89	LTR	ERV1	-37	522	13	1
1623	1749	228	55	53	chr3	136134522	136135057	-23464726	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	615	-27	1
1623	400	227	10	10	chr3	136135580	136135606	-23464177	+	RLTR26	LTR	ERVK	616	641	-1	1
1623	1059	311	20	46	chr3	136143785	136144136	-23455647	+	ORR1D1	LTR	MaLR	17	358	-16	2
1623	417	304	22	62	chr3	136156888	136157067	-23442716	+	MLT1D	LTR	MaLR	61	232	-273	2
1623	1739	249	17	19	chr3	136159014	136159427	-23440356	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	6	2
1623	421	303	105	78	chr3	136164749	136165043	-23434740	+	MER67D	LTR	ERV1	1	302	-212	2
1623	1179	249	40	20	chr3	136167074	136167377	-23432406	+	MTEb	LTR	MaLR	1	309	-70	2
1623	320	331	80	49	chr3	136167614	136167941	-23431842	-	MER110-int	LTR	ERV1	-2144	2503	2167	2
1623	653	210	0	0	chr3	136169301	136169420	-23430363	+	MTEb	LTR	MaLR	301	419	0	2
1623	686	339	80	54	chr3	136169825	136170527	-23429256	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2839	2828	2109	2
1623	501	309	65	6	chr3	136171434	136171603	-23428180	+	LTR33B	LTR	ERVL	325	503	0	2
1624	284	259	145	53	chr3	136186016	136186170	-23413613	+	MTD	LTR	MaLR	18	189	-218	2
1624	651	238	68	26	chr3	136186535	136186725	-23413058	+	MTD	LTR	MaLR	209	406	-13	2
1624	930	381	21	8	chr3	136192386	136192748	-23407035	+	MTE-int	LTR	MaLR	1161	1527	-53	2
1624	529	343	42	112	chr3	136192748	136193132	-23406651	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	2
1624	347	320	139	35	chr3	136196574	136196862	-23402921	+	MLT1A	LTR	MaLR	31	348	-26	2
1624	1201	196	113	83	chr3	136197591	136197964	-23401819	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	2
1624	631	146	239	0	chr3	136199174	136199304	-23400479	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	161	-481	2
1624	235	321	24	12	chr3	136199403	136199485	-23400298	+	RMER13B	LTR	ERVK	817	899	-9	2
1624	2459	62	3	3	chr3	136201054	136201380	-23398403	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	32	2
1624	1126	253	107	3	chr3	136210087	136210404	-23389379	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-20	354	5	3
1624	604	337	58	23	chr3	136212420	136212818	-23386965	-	MLT2D	LTR	ERVL	0	414	3	3
1624	251	338	0	39	chr3	136216840	136216917	-23382866	-	LTR79	LTR	ERVL	-31	496	423	3
1624	273	347	32	91	chr3	136218582	136218801	-23380982	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	916	1121	-266	3
1624	410	305	17	0	chr3	136221834	136221952	-23377831	+	MTD	LTR	MaLR	19	138	-281	3
1624	670	325	72	72	chr3	136221967	136222285	-23377498	+	MTD	LTR	MaLR	86	403	-16	3
1624	293	374	95	39	chr3	136222442	136222748	-23377035	+	MTE-int	LTR	MaLR	178	500	-1080	3
1624	250	269	116	39	chr3	136233623	136233778	-23366005	-	MLT1J	LTR	MaLR	-26	486	320	3
1624	1202	292	76	16	chr3	136238622	136239005	-23360778	+	MTD	LTR	MaLR	13	418	-1	3
1624	1325	255	75	18	chr3	136241088	136241370	-23358413	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	102	3
1624	1325	255	75	18	chr3	136241405	136241506	-23358277	-	MTD	LTR	MaLR	-318	101	1	3
1624	2016	111	52	7	chr3	136248239	136248548	-23351235	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	3
1624	366	276	125	25	chr3	136249715	136249875	-23349908	+	MTEa	LTR	MaLR	204	379	0	3
1624	1481	232	84	35	chr3	136250094	136250369	-23349414	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	124	3
1624	1481	232	84	35	chr3	136250391	136250485	-23349298	-	MTD	LTR	MaLR	-296	123	19	3
1624	261	280	45	27	chr3	136252331	136252441	-23347342	-	MLT1B	LTR	MaLR	-4	386	275	3
1624	577	316	60	67	chr3	136253521	136253915	-23345868	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1077	1473	-107	3
1624	341	258	31	10	chr3	136253950	136254048	-23345735	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	100	-454	3
1624	334	280	39	92	chr3	136254048	136254080	-23345703	+	MTEb	LTR	MaLR	1	123	-256	3
1624	1896	176	70	15	chr3	136256140	136256537	-23343246	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	3
1624	709	214	23	6	chr3	136256559	136256733	-23343050	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1082	3
1624	1708	237	34	80	chr3	136259582	136260118	-23339665	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	511	-17	3
1624	4437	215	34	30	chr3	136263240	136264225	-23335558	-	MTC-int	LTR	MaLR	-270	988	1	3
1624	495	191	0	0	chr3	136264230	136264319	-23335464	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	333	3
1624	327	339	89	21	chr3	136265555	136265745	-23334038	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1965	3702	3500	3
1624	1997	134	0	58	chr3	136269170	136269518	-23330265	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	2	3
1624	474	204	123	18	chr3	136270252	136270422	-23329361	-	MER57A-int	LTR	ERV1	-194	5993	5806	3
1624	821	237	234	37	chr3	136271890	136272240	-23327543	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1624	372	257	38	131	chr3	136275364	136275596	-23324187	+	MTEa	LTR	MaLR	113	352	-27	4
1624	989	322	19	11	chr3	136284802	136285066	-23314717	-	MTEa	LTR	MaLR	-113	266	1	4
1624	582	186	0	0	chr3	136286510	136286607	-23313176	-	MT2A	LTR	ERVL	-74	459	363	4
1624	305	250	79	0	chr3	136289266	136289342	-23310441	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	82	-423	4
1624	357	276	211	26	chr3	136293386	136293613	-23306170	-	LTR40b	LTR	ERVL	0	462	194	4
1624	3428	20	5	2	chr3	136298399	136298794	-23300989	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1624	352	318	123	23	chr3	136306797	136307016	-23292767	-	RMER20B	LTR	ERVK	-242	385	145	4
1624	1259	286	66	20	chr3	136310132	136310524	-23289259	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	1	4
1624	257	326	35	92	chr3	136313743	136313885	-23285898	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-230	140	7	4
1624	939	342	144	77	chr3	136313866	136314382	-23285401	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-28	1552	994	4
1624	939	342	144	77	chr3	136314595	136314844	-23284939	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-587	993	736	4
1625	577	299	70	14	chr3	136315386	136315684	-23284099	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-988	382	68	4
1625	323	197	0	16	chr3	136315923	136315985	-23283798	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1503	77	17	4
1625	249	289	94	19	chr3	136317050	136317156	-23282627	+	LTR16A1	LTR	ERVL	253	366	-90	4
1625	244	354	0	24	chr3	136319077	136319161	-23280622	+	MLT1A1	LTR	MaLR	313	394	-14	4
1625	670	301	30	10	chr3	136321045	136321243	-23278540	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-195	202	1	4
1625	390	346	37	51	chr3	136322943	136323159	-23276624	+	MLT1I	LTR	MaLR	10	222	-189	4
1625	1809	249	14	29	chr3	136328898	136329315	-23270468	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	4
1625	2359	92	3	52	chr3	136329432	136329776	-23270007	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1625	341	333	75	34	chr3	136356604	136356960	-23242823	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	4	5
1625	596	213	78	20	chr3	136358723	136358812	-23240971	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-7	544	459	5
1625	596	213	78	20	chr3	136358872	136358935	-23240848	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-93	458	385	5
1625	917	199	75	68	chr3	136358940	136359220	-23240563	-	RLTR20A1	LTR	ERVK	-252	282	1	5
1625	302	399	19	5	chr3	136360257	136360471	-23239312	+	MLT1J	LTR	MaLR	88	304	-208	5
1625	524	305	94	12	chr3	136360916	136361235	-23238548	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-18	347	3	5
1625	1620	121	52	0	chr3	136363846	136364118	-23235665	+	RLTR15	LTR	ERVK	74	359	0	5
1625	4881	99	14	11	chr3	136389443	136390267	-23209516	-	RLTR13D2	LTR	ERVK	0	1023	2	5
1625	805	302	16	91	chr3	136436452	136436835	-23162948	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-12	358	5	6
1626	731	261	121	71	chr3	136454169	136454507	-23145276	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	357	-2	6
1626	698	283	184	29	chr3	136462808	136463117	-23136666	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	357	1	6
1626	2236	138	145	11	chr3	136464119	136464553	-23135230	+	RMER6D	LTR	ERVK	2	493	-227	6
1626	502	237	70	38	chr3	136468790	136468948	-23130835	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4435	4597	-1117	7
1626	240	329	37	37	chr3	136472452	136472534	-23127249	+	MLT1J	LTR	MaLR	113	194	-318	7
1626	956	276	164	13	chr3	136482333	136482645	-23117138	+	MTEb	LTR	MaLR	1	359	-20	7
1626	2472	197	40	16	chr3	136484693	136485193	-23114590	-	RLTR18B	LTR	ERVK	0	512	1	7
1626	1524	137	130	0	chr3	136486934	136487218	-23112565	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	7
1626	229	293	11	89	chr3	136490810	136490900	-23108883	-	LTR33B	LTR	ERVL	-336	167	85	7
1626	381	267	81	90	chr3	136515455	136515677	-23084106	-	MLT1B	LTR	MaLR	-126	264	45	3
1626	246	291	117	31	chr3	136521536	136521699	-23078084	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-410	618	442	4
1626	1553	171	119	29	chr3	136545985	136546328	-23053455	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	7
1626	613	261	171	36	chr3	136549919	136550253	-23049530	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	7
1627	228	264	66	44	chr3	136583484	136583575	-23016208	-	MTEb	LTR	MaLR	-162	217	125	1
1627	420	320	77	21	chr3	136604958	136605191	-22994592	-	MER110A	LTR	ERV1	-2	466	221	1
1627	780	213	66	17	chr3	136606464	136606645	-22993138	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	190	-169	1
1627	514	269	94	12	chr3	136606755	136606955	-22992828	+	ORR1E	LTR	MaLR	169	370	0	1
1627	339	351	82	19	chr3	136607373	136607640	-22992143	+	MLT1C	LTR	MaLR	131	414	-53	1
1627	287	317	118	80	chr3	136608169	136608594	-22991189	-	LTR40a	LTR	ERVL	-17	502	62	1
1627	3286	31	23	0	chr3	136610132	136610519	-22989264	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1627	1961	111	26	84	chr3	136612256	136612602	-22987181	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
1627	1022	288	63	18	chr3	136612605	136612977	-22986806	+	MTD	LTR	MaLR	1	399	-8	1
1627	1337	248	108	26	chr3	136613225	136613606	-22986177	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	3	1
1627	1688	236	56	8	chr3	136616406	136616798	-22982985	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	1
1627	4867	124	56	12	chr3	136617934	136618753	-22981030	+	RMER17B	LTR	ERVK	1	859	-99	1
1627	8501	21	1	0	chr3	136618753	136619710	-22980073	+	RLTR13A2	LTR	ERVK	1	958	0	1
1627	4867	231	24	40	chr3	136619710	136619762	-22980021	+	RMER17B	LTR	ERVK	860	957	-1	1
1627	381	345	61	28	chr3	136622392	136622604	-22977179	+	MER21B	LTR	ERV1	30	248	-615	1
1627	1482	194	8	99	chr3	136623161	136623516	-22976267	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-4	325	3	1
1627	4941	171	89	93	chr3	136623517	136624953	-22974830	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-191	1772	645	1
1627	1086	174	81	18	chr3	136624994	136625217	-22974566	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-119	275	39	1
1627	798	356	52	16	chr3	136631597	136632037	-22967746	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	1	1
1627	1391	221	117	8	chr3	136649519	136649870	-22949913	+	MTD	LTR	MaLR	18	406	-13	1
1627	474	335	77	30	chr3	136649877	136650046	-22949737	-	MTEa	LTR	MaLR	-202	177	1	1
1627	1437	207	112	30	chr3	136651206	136651545	-22948238	+	ORR1D1	LTR	MaLR	7	373	-1	1
1627	528	296	76	45	chr3	136652755	136653109	-22946674	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	1
1627	786	342	45	47	chr3	136668446	136668826	-22930957	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	2
1627	230	310	128	30	chr3	136669825	136669958	-22929825	-	RMER20B	LTR	ERVK	-481	146	1	2
1627	455	256	8	8	chr3	136670288	136670410	-22929373	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-313	6606	6485	2
1627	486	313	79	52	chr3	136672046	136672413	-22927370	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6453	466	90	2
1627	328	268	192	28	chr3	136672894	136673041	-22926742	-	RMER20B	LTR	ERVK	-355	161	3	2
1627	308	375	49	84	chr3	136676639	136676983	-22922800	+	MLT1B	LTR	MaLR	18	349	-41	2
1627	1043	266	115	34	chr3	136679278	136679664	-22920119	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	1	2
1627	523	300	47	67	chr3	136687451	136687644	-22912139	-	MTEa	LTR	MaLR	-188	191	3	2
1627	1778	217	60	10	chr3	136693163	136693564	-22906219	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1627	1273	195	32	52	chr3	136703955	136704263	-22895520	+	RLTR46	LTR	ERVK	14	315	-5	2
1628	1184	262	74	25	chr3	136708811	136709175	-22890608	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1194	1575	-5	2
1628	1091	317	85	17	chr3	136709181	136709534	-22890249	+	MTEa	LTR	MaLR	1	377	-2	2
1628	446	326	32	37	chr3	136712166	136712354	-22887429	+	MTD	LTR	MaLR	1	187	-232	2
1628	2036	96	123	13	chr3	136712359	136712676	-22887107	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	352	-232	2
1628	4818	132	55	37	chr3	136712940	136713826	-22885957	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	2
1628	2113	133	144	3	chr3	136714454	136714837	-22884946	-	RLTR9B	LTR	ERVK	0	437	1	2
1628	1253	269	68	0	chr3	136718617	136718970	-22880813	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	378	-1	2
1628	5826	165	76	54	chr3	136721959	136722374	-22877409	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	913	2
1628	5826	165	76	54	chr3	136722616	136723485	-22876298	-	RMER12	LTR	ERVK	-430	892	3	2
1628	616	341	97	38	chr3	136729645	136730120	-22869663	+	MER90a	LTR	ERV1	112	614	0	3
1628	310	316	151	43	chr3	136732055	136732194	-22867589	-	ORR1E	LTR	MaLR	-193	166	13	3
1628	1078	208	211	3	chr3	136733774	136734059	-22865724	+	ORR1D1	LTR	MaLR	29	372	-2	3
1628	292	329	92	7	chr3	136739159	136739300	-22860483	-	MLT1C	LTR	MaLR	-280	187	35	3
1628	230	347	114	108	chr3	136743490	136743823	-22855960	+	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	61	395	-408	3
1628	3114	153	21	23	chr3	136748976	136749538	-22850245	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	3
1628	1825	206	58	18	chr3	136752204	136752584	-22847199	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	5	3
1628	319	242	65	32	chr3	136756458	136756612	-22843171	+	RMER17C	LTR	ERVK	112	270	-140	3
1628	342	304	103	103	chr3	136767379	136767698	-22832085	+	MLT2D	LTR	ERVL	73	408	-6	3
1628	1621	222	93	3	chr3	136769660	136770013	-22829770	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	10	3
1628	5328	85	35	9	chr3	136776412	136777174	-22822609	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-26	782	1	3
1628	474	281	15	15	chr3	136780949	136781086	-22818697	+	MTEa	LTR	MaLR	39	175	-204	3
1628	2793	32	0	0	chr3	136781090	136781428	-22818355	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-8	338	1	3
1628	797	251	14	28	chr3	136781428	136781616	-22818167	+	MTEa	LTR	MaLR	171	358	-21	3
1628	797	251	14	28	chr3	136781643	136781665	-22818118	+	MTEa	LTR	MaLR	359	378	-1	3
1628	1400	274	52	39	chr3	136784341	136784725	-22815058	+	MTD	LTR	MaLR	18	406	-13	3
1628	763	259	40	11	chr3	136786590	136786766	-22813017	+	RLTR18B	LTR	ERVK	12	192	-320	3
1628	2727	171	114	34	chr3	136786789	136787378	-22812405	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	636	-54	3
1628	3130	71	2	0	chr3	136799523	136799918	-22799865	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1628	2041	157	61	23	chr3	136801393	136801785	-22797998	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	4
1628	235	256	90	34	chr3	136817131	136817220	-22782563	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-17	348	255	4
1628	336	336	91	75	chr3	136820784	136821170	-22778613	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-2	513	122	4
1628	265	188	0	0	chr3	136822276	136822324	-22777459	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	48	-331	4
1628	589	221	157	6	chr3	136822338	136822497	-22777286	+	MTE2b	LTR	MaLR	197	379	0	4
1628	1230	291	57	11	chr3	136835224	136835595	-22764188	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	4
1629	2352	174	38	0	chr3	136841947	136842344	-22757439	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	2	4
1629	296	309	10	31	chr3	136843671	136843768	-22756015	+	MLT1A	LTR	MaLR	277	371	-3	4
1629	610	338	58	18	chr3	136845893	136846170	-22753613	+	MLT1C	LTR	MaLR	171	458	-9	4
1629	1778	186	15	6	chr3	136850954	136851278	-22748505	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	20	4
1629	758	229	35	60	chr3	136856281	136856579	-22743204	+	RLTR15	LTR	ERVK	36	331	-28	4
1629	758	229	35	60	chr3	136856757	136856774	-22743009	+	RLTR15	LTR	ERVK	332	343	-16	4
1629	3042	137	101	9	chr3	136857090	136857627	-22742156	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	586	-92	4
1629	1947	113	23	73	chr3	136860651	136860995	-22738788	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1629	1216	212	161	8	chr3	136864178	136864531	-22735252	+	MTD	LTR	MaLR	13	419	0	4
1629	3306	325	57	13	chr3	136866455	136867563	-22732220	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-351	1229	73	4
1629	593	342	30	10	chr3	136867563	136867761	-22732022	+	MTE-int	LTR	MaLR	912	1113	-467	4
1629	225	286	84	14	chr3	136867747	136867818	-22731965	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1504	76	1	4
1629	480	317	86	75	chr3	136867818	136868190	-22731593	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	4	4
1629	233	370	108	24	chr3	136872502	136872715	-22727068	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-2	560	330	4
1629	554	321	222	24	chr3	136872895	136873192	-22726591	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	365	0	4
1629	621	349	50	68	chr3	136875407	136875788	-22723995	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	374	0	5
1629	245	340	27	45	chr3	136879620	136879731	-22720052	-	LTR84b	LTR	ERVL	-31	730	622	5
1629	371	239	71	91	chr3	136882817	136882878	-22716905	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	473	5
1629	371	239	71	91	chr3	136882935	136883071	-22716712	-	MT2A	LTR	ERVL	-61	472	340	5
1629	664	229	15	138	chr3	136883346	136883549	-22716234	-	MT2A	LTR	ERVL	-355	178	1	5
1629	1237	276	69	44	chr3	136896105	136896469	-22703314	+	MTEb	LTR	MaLR	7	379	0	5
1629	3618	299	62	75	chr3	136896469	136896907	-22702876	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1	453	-1127	5
1629	3618	299	62	75	chr3	136896952	136897276	-22702507	+	MTEb-int	LTR	MaLR	454	734	-846	5
1629	3618	299	62	75	chr3	136897627	136898166	-22701617	+	MTEb-int	LTR	MaLR	735	1289	-291	5
1629	482	315	13	20	chr3	136898172	136898324	-22701459	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1429	1579	-1	5
1629	853	295	60	73	chr3	136898325	136898709	-22701074	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	5
1629	1276	141	65	84	chr3	136908256	136908519	-22691264	+	RMER6C	LTR	ERVK	433	690	0	5
1629	417	295	34	80	chr3	136913499	136913761	-22686022	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4211	4460	-1254	5
1629	593	303	71	46	chr3	136913787	136914026	-22685757	-	ORR1E	LTR	MaLR	-113	246	2	5
1629	1977	294	115	35	chr3	136914026	136914810	-22684973	-	MTE-int	LTR	MaLR	-52	1528	579	5
1629	1313	224	61	39	chr3	136914875	136915205	-22684578	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	31	5
1629	2955	83	2	8	chr3	136915577	136915979	-22683804	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1629	2201	201	85	214	chr3	136917338	136917546	-22682237	+	RLTR40	LTR	ERVK	1	133	-684	5
1629	2201	201	85	214	chr3	136917693	136918414	-22681369	+	RLTR40	LTR	ERVK	134	810	-7	5
1629	304	179	38	95	chr3	136920829	136920934	-22678849	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	292	5
1629	1376	35	6	0	chr3	136920958	136921130	-22678653	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1774	213	41	5
1629	2867	54	52	0	chr3	136921142	136921511	-22678272	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	5
1629	503	274	78	68	chr3	136921829	136921978	-22677805	+	MLT1B	LTR	MaLR	4	154	-236	5
1629	3358	43	2	0	chr3	136921978	136922373	-22677410	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1629	503	304	73	70	chr3	136922373	136922516	-22677267	+	MLT1B	LTR	MaLR	155	295	-172	5
1629	1012	347	89	55	chr3	136922586	136923488	-22676295	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	5	1042	-329	5
1629	1012	352	91	62	chr3	136923519	136923821	-22675962	+	MLT1B-int	LTR	MaLR	1043	1370	-1	5
1629	710	331	63	46	chr3	136923827	136924178	-22675605	+	MLT1B	LTR	MaLR	6	362	-28	5
1629	276	279	46	37	chr3	136926721	136926829	-22672954	+	LTR40b	LTR	ERVL	352	460	-2	5
1629	355	284	67	52	chr3	136926877	136927119	-22672664	-	MLT1C	LTR	MaLR	-8	497	250	5
1629	2653	243	65	101	chr3	136927489	136928381	-22671402	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	860	0	5
1629	646	325	43	69	chr3	136928662	136928939	-22670844	-	MLT1D	LTR	MaLR	-10	495	226	5
1629	246	291	101	86	chr3	136930349	136930488	-22669295	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	141	-224	5
1629	1826	218	52	10	chr3	136934623	136935008	-22664775	+	MTD	LTR	MaLR	10	410	-9	5
1629	259	347	97	32	chr3	136936974	136937265	-22662518	-	MLT1A	LTR	MaLR	-52	356	1	5
1629	1332	165	132	8	chr3	136939552	136939856	-22659927	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	2	5
1629	474	348	44	69	chr3	136940855	136941292	-22658491	+	MLT2B2	LTR	ERVL	9	513	-2	5
1629	2293	123	15	6	chr3	136944560	136944894	-22654889	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	5
1629	20831	45	42	16	chr3	136944894	136947492	-22652291	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	2674	-3807	5
1629	9040	41	9	5	chr3	136947467	136948542	-22651241	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5400	6479	-2	5
1629	2293	123	15	6	chr3	136948544	136948878	-22650905	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	5
1629	2170	80	132	113	chr3	136950458	136950882	-22648901	-	RLTR44E	LTR	ERVK	-5	447	16	5
1629	4394	123	59	67	chr3	136954203	136954888	-22644895	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	59	6
1629	4394	123	59	67	chr3	136954914	136954988	-22644795	-	RMER6A	LTR	ERVK	-698	58	3	6
1629	444	290	106	21	chr3	136959202	136959512	-22640271	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-17	450	6	6
1629	862	259	124	41	chr3	136959512	136959875	-22639908	-	MLT1A0-int	LTR	MaLR	-6	1729	1337	6
1629	708	349	4	15	chr3	136960208	136960470	-22639313	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	107	6
1629	259	252	217	69	chr3	136963222	136963361	-22636422	+	MLT1A	LTR	MaLR	162	329	-45	6
1629	863	285	72	47	chr3	136963361	136963722	-22636061	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
1629	259	252	217	69	chr3	136963722	136963757	-22636026	+	MLT1A	LTR	MaLR	330	361	-13	6
1629	788	309	112	50	chr3	136966180	136966660	-22633123	-	MT2A	LTR	ERVL	-8	525	16	6
1629	307	315	58	37	chr3	136968846	136969087	-22630696	-	RLTR15	LTR	ERVK	-67	292	47	6
1630	504	350	108	38	chr3	136980692	136981138	-22618645	-	MLT1G1	LTR	MaLR	0	579	103	6
1630	2497	105	135	7	chr3	136988404	136988825	-22610958	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
1630	507	298	96	73	chr3	136990337	136990609	-22609174	-	MTEa	LTR	MaLR	-101	278	1	6
1630	2506	179	103	20	chr3	136991065	136991561	-22608222	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	372	6
1630	982	210	10	0	chr3	136991560	136991755	-22608028	-	RMER13B	LTR	ERVK	-711	197	1	6
1630	1416	168	128	48	chr3	136994736	136994916	-22604867	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	155	6
1630	1416	168	128	48	chr3	136994978	136995134	-22604649	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-213	154	4	6
1630	240	342	71	55	chr3	136996138	136996265	-22603518	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-32	416	288	6
1630	273	280	71	51	chr3	137002577	137002675	-22597108	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-482	621	522	3
1630	552	299	107	65	chr3	137013700	137013961	-22585822	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	148	2
1630	298	309	0	0	chr3	137013965	137014033	-22585750	-	MTD	LTR	MaLR	-238	181	114	2
1630	598	280	149	88	chr3	137017174	137017503	-22582280	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	353	-6	2
1630	2153	75	108	3	chr3	137020729	137021025	-22578758	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1630	350	279	175	99	chr3	137032123	137032151	-22567632	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	537	4
1630	350	279	175	99	chr3	137032211	137032404	-22567379	-	RMER15	LTR	ERVL	-39	536	337	4
1630	267	276	57	49	chr3	137062370	137062492	-22537291	+	MLT1A1	LTR	MaLR	7	129	-279	9
1630	392	293	156	29	chr3	137068636	137068832	-22530951	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-2	565	343	1
1630	249	293	77	32	chr3	137076891	137077046	-22522737	-	LTR16B2	LTR	ERVL	-92	370	209	1
1630	1193	245	104	9	chr3	137088813	137089151	-22510632	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
1630	537	153	93	0	chr3	137092137	137092245	-22507538	-	RMER6C	LTR	ERVK	-566	154	1	1
1630	258	350	40	8	chr3	137096547	137096671	-22503112	-	ORR1E	LTR	MaLR	-223	136	9	1
1631	3366	47	30	12	chr3	137112977	137113405	-22486378	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
1631	1381	55	0	6	chr3	137113405	137113586	-22486197	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	1	180	-7401	1
1631	245	191	0	0	chr3	137113586	137113628	-22486155	+	RLTR27	LTR	ERVK	231	272	-37	1
1631	402	0	0	0	chr3	137113628	137113674	-22486109	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	222	267	-7314	1
1631	299	111	0	0	chr3	137113834	137113879	-22485904	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	93	137	-6405	1
1631	18249	46	0	0	chr3	137113882	137116383	-22483400	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3512	5810	-1771	1
1631	6872	52	0	66	chr3	137116374	137117371	-22482412	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6651	7581	0	1
1631	3496	45	28	9	chr3	137117371	137117799	-22481984	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
1631	315	322	109	45	chr3	137123208	137123378	-22476405	+	MTE2a	LTR	MaLR	40	239	-180	1
1631	557	254	118	32	chr3	137125672	137125859	-22473924	+	MTE2a	LTR	MaLR	172	374	-5	1
1631	991	295	51	11	chr3	137127806	137128162	-22471621	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	1
1631	1327	296	30	17	chr3	137133698	137134059	-22465724	+	MTEb	LTR	MaLR	14	379	0	1
1631	965	282	56	26	chr3	137134059	137134391	-22465392	+	MTEb-int	LTR	MaLR	1	316	-1054	1
1631	261	194	115	77	chr3	137138245	137138323	-22461460	-	MLT1B	LTR	MaLR	-129	261	181	1
1631	363	319	42	42	chr3	137146535	137146848	-22452935	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	45	1
1631	4806	124	102	14	chr3	137160820	137161491	-22438292	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	737	-169	2
1631	4806	124	102	14	chr3	137161536	137161697	-22438086	+	RMER17A2	LTR	ERVK	738	905	-1	2
1631	558	341	46	46	chr3	137176029	137176290	-22423493	+	MLT1K	LTR	MaLR	311	571	-24	2
1631	355	279	20	73	chr3	137176363	137176514	-22423269	-	LTR33	LTR	ERVL	-21	494	352	2
1631	686	325	97	45	chr3	137177015	137177457	-22422326	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2130	3537	3073	2
1631	1170	266	49	47	chr3	137179725	137180138	-22419645	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	2	2
1631	1213	272	155	53	chr3	137186457	137186592	-22413191	+	RLTR20D	LTR	ERVK	51	178	-390	2
1631	1213	272	155	53	chr3	137186648	137186832	-22412951	+	RLTR20D	LTR	ERVK	179	422	-146	2
1631	1213	272	155	53	chr3	137186882	137187031	-22412752	+	RLTR20D	LTR	ERVK	423	568	0	2
1631	428	297	92	20	chr3	137205406	137205602	-22394181	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	168	2
1631	670	302	41	15	chr3	137208409	137208604	-22391179	-	MTE2b	LTR	MaLR	-179	200	1	2
1631	1962	195	111	3	chr3	137209030	137209410	-22390373	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1631	588	256	227	72	chr3	137212306	137212636	-22387147	-	MLT1B	LTR	MaLR	-6	384	4	2
1631	2517	166	28	8	chr3	137221623	137222092	-22377691	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-26	527	50	2
1631	1933	167	88	8	chr3	137230996	137231359	-22368424	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	394	0	2
1632	1921	223	16	29	chr3	137234230	137234609	-22365174	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1632	1634	189	143	14	chr3	137239820	137240190	-22359593	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	1	3
1632	1830	195	57	3	chr3	137245181	137245530	-22354253	+	MTC	LTR	MaLR	53	420	-1	3
1632	763	164	0	0	chr3	137247299	137247416	-22352367	-	RLTR19	LTR	ERVK	0	499	383	3
1632	1451	204	83	51	chr3	137247441	137247813	-22351970	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1632	472	18	0	0	chr3	137250185	137250241	-22349542	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	345	3
1632	781	22	0	0	chr3	137250235	137250327	-22349456	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-304	92	1	3
1632	9909	28	5	0	chr3	137250327	137251420	-22348363	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
1632	472	18	0	0	chr3	137251420	137251476	-22348307	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	400	345	3
1632	781	22	0	0	chr3	137251470	137251562	-22348221	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-304	92	1	3
1632	1046	293	78	65	chr3	137253435	137253459	-22346324	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	513	3
1632	1046	293	78	65	chr3	137253690	137254191	-22345592	-	MT2A	LTR	ERVL	-21	512	1	3
1632	772	260	103	77	chr3	137254412	137254724	-22345059	+	RLTR14	LTR	ERV1	6	325	-57	3
1632	245	270	93	76	chr3	137255363	137255535	-22344248	-	RMER15	LTR	ERVL	-391	184	10	3
1632	1532	214	54	85	chr3	137260475	137260864	-22338919	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	379	0	3
1632	437	322	60	85	chr3	137274437	137274803	-22324980	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	3	3
1632	1167	329	65	17	chr3	137276522	137276940	-22322843	+	MLT2B2	LTR	ERVL	18	455	-60	3
1632	263	282	66	33	chr3	137280707	137280828	-22318955	+	MLT1A1	LTR	MaLR	3	127	-281	3
1632	1015	266	70	23	chr3	137283048	137283348	-22316435	+	ORR1E	LTR	MaLR	28	341	-18	3
1632	4155	21	36	0	chr3	137284184	137284660	-22315123	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1632	662	298	36	12	chr3	137294125	137294376	-22305407	-	MLT1B	LTR	MaLR	-54	336	80	3
1632	442	200	100	39	chr3	137295279	137295409	-22304374	+	RMER13A	LTR	ERVK	311	448	-412	3
1632	3403	46	0	0	chr3	137297353	137297748	-22302035	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	396	0	3
1632	9357	33	4	3	chr3	137297748	137298845	-22300938	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	3
1632	3428	43	0	0	chr3	137298845	137299241	-22300542	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1632	1714	191	40	6	chr3	137299436	137299788	-22299995	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	15	3
1632	573	225	169	23	chr3	137299802	137300090	-22299693	-	MT2A	LTR	ERVL	-181	312	1	3
1632	976	277	61	44	chr3	137301590	137301934	-22297849	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	5	3
1632	3814	32	5	0	chr3	137308752	137309186	-22290597	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	4
1632	1933	114	18	60	chr3	137309601	137309936	-22289847	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	4
1632	1703	175	66	44	chr3	137313261	137313625	-22286158	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	4
1632	381	286	61	143	chr3	137313629	137313825	-22285958	+	MER21B	LTR	ERV1	2	181	-682	4
1632	3110	80	14	17	chr3	137317932	137318354	-22281429	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	4
1632	2522	133	2	112	chr3	137319313	137319822	-22279961	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	4
1632	1458	204	226	46	chr3	137341617	137342121	-22257662	+	RMER19B	LTR	ERVK	308	902	0	4
1632	1807	211	32	3	chr3	137353310	137353685	-22246098	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	4
1632	285	333	58	8	chr3	137353761	137353882	-22245901	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	23	4
1632	1650	155	47	11	chr3	137355594	137355930	-22243853	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	382	-2	4
1632	398	315	109	33	chr3	137357356	137357750	-22242033	+	MuRRS-int	LTR	ERV1	1811	2234	-2456	4
1632	1407	161	149	55	chr3	137361135	137361463	-22238320	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	4
1632	778	97	19	32	chr3	137361585	137361736	-22238047	+	ORR1A2	LTR	MaLR	82	242	-87	4
1632	252	351	0	0	chr3	137361932	137362009	-22237774	+	MER67D	LTR	ERV1	236	312	-202	4
1632	338	276	0	71	chr3	137362017	137362130	-22237653	-	MTE2b	LTR	MaLR	-217	162	58	4
25	1039	281	86	30	chr3	137363101	137363498	-22236285	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
1633	1207	138	151	62	chr3	137365000	137365350	-22234433	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	386	-24	4
1633	1207	138	151	62	chr3	137365401	137365420	-22234363	+	RMER17C	LTR	ERVK	387	403	-7	4
1633	614	269	90	25	chr3	137367087	137367432	-22232351	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	359	-55	4
1633	919	248	150	12	chr3	137367594	137367898	-22231885	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	350	-29	4
1633	919	248	150	12	chr3	137367926	137367948	-22231835	+	MTE2b	LTR	MaLR	351	372	-7	4
1633	1749	270	48	16	chr3	137367957	137368514	-22231269	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	2	576	-1004	4
1633	565	256	122	20	chr3	137368537	137368792	-22230991	-	RLTR15	LTR	ERVK	-78	281	1	4
1633	406	311	103	24	chr3	137368792	137368957	-22230826	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	567	744	-836	4
1633	2269	273	61	32	chr3	137369701	137370243	-22229540	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	787	1359	-221	4
1633	2269	273	61	32	chr3	137370452	137370657	-22229126	+	MTE2b-int	LTR	MaLR	1360	1556	-24	4
1633	614	244	54	44	chr3	137370657	137371141	-22228642	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	376	-34	5
1633	246	218	18	0	chr3	137371215	137371270	-22228513	+	MTEa	LTR	MaLR	44	99	-280	5
1633	874	316	61	0	chr3	137371274	137371568	-22228215	+	MTEa	LTR	MaLR	64	375	-4	5
1633	1840	138	10	15	chr3	137374811	137375170	-22224613	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	394	29	5
1633	471	218	58	164	chr3	137375306	137375618	-22224165	-	RMER17C	LTR	ERVK	-131	279	1	5
1633	462	255	39	22	chr3	137377634	137377792	-22221991	-	MLT1A	LTR	MaLR	-17	488	261	5
1633	266	247	21	21	chr3	137378441	137378536	-22221247	+	RMER10A	LTR	ERVL	318	412	-30	5
1633	1335	284	41	2	chr3	137378970	137379386	-22220397	-	MER31A	LTR	ERV1	-1	484	53	5
1633	226	345	97	41	chr3	137380304	137380449	-22219334	-	MLT1A	LTR	MaLR	-55	310	158	5
1633	1458	181	115	26	chr3	137381203	137381550	-22218233	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	5
1633	708	286	50	4	chr3	137390054	137390293	-22209490	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	250	-255	5
1633	907	260	49	16	chr3	137393386	137393632	-22206151	+	MTD	LTR	MaLR	7	260	-159	5
1633	807	216	28	6	chr3	137393663	137393845	-22205938	+	MTD	LTR	MaLR	234	419	0	5
1633	1591	226	48	8	chr3	137394630	137395067	-22204716	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	65	527	0	5
1633	4256	104	10	0	chr3	137401976	137402553	-22197230	+	MT2B2	LTR	ERVL	2	584	0	5
1633	486	310	84	11	chr3	137402806	137403055	-22196728	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	86	5
1633	2371	60	3	0	chr3	137410198	137410516	-22189267	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	5
1633	1077	225	85	103	chr3	137413424	137413458	-22186325	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	324	5
1633	2086	123	38	6	chr3	137413458	137413777	-22186006	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1633	1077	225	85	103	chr3	137413777	137413943	-22185840	-	MTEa	LTR	MaLR	-56	323	161	5
1633	1077	225	85	103	chr3	137414171	137414344	-22185439	-	MTEa	LTR	MaLR	-219	160	3	5
1633	227	235	132	0	chr3	137417064	137417132	-22182651	+	MER57D	LTR	ERV1	1	77	-334	5
1633	276	252	103	37	chr3	137417378	137417514	-22182269	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	260	5
1633	421	259	46	0	chr3	137417782	137417890	-22181893	-	RMER20B	LTR	ERVK	-514	113	1	5
1633	249	270	16	0	chr3	137419185	137419248	-22180535	-	MLT1J	LTR	MaLR	-396	116	53	5
1633	1675	162	51	87	chr3	137419592	137419984	-22179799	+	RLTR41	LTR	ERV1	62	439	-7	5
1633	1302	146	1	8	chr3	137421806	137422037	-22177746	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	181	5
1633	1149	148	9	32	chr3	137422305	137422521	-22177262	-	MTC	LTR	MaLR	-210	211	1	5
1633	817	253	137	77	chr3	137427877	137427929	-22171854	-	MTD	LTR	MaLR	-22	397	325	6
1633	817	232	171	68	chr3	137428118	137428392	-22171391	-	MTD	LTR	MaLR	-57	362	56	6
1633	1191	212	156	6	chr3	137428637	137428965	-22170818	+	MTEb	LTR	MaLR	3	379	0	6
1633	229	228	112	12	chr3	137429137	137429217	-22170566	-	MLT1H	LTR	MaLR	-1	548	461	6
1633	1226	240	100	61	chr3	137429664	137429905	-22169878	+	RMER4B	LTR	ERVK	35	266	-319	6
1633	1226	241	92	40	chr3	137429963	137430190	-22169593	+	RMER4B	LTR	ERVK	267	561	-24	6
1633	335	299	10	0	chr3	137430552	137430649	-22169134	-	MTE2b	LTR	MaLR	-281	98	1	6
1633	514	337	62	38	chr3	137430777	137431067	-22168716	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-9	356	60	6
1633	557	300	136	35	chr3	137431425	137431909	-22167874	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	6
1633	402	321	126	39	chr3	137433309	137433643	-22166140	+	LTR33C	LTR	ERVL	118	480	-149	6
1633	1374	67	5	0	chr3	137433646	137433840	-22165943	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	195	-212	6
1633	828	221	60	0	chr3	137442335	137442534	-22157249	-	RLTR42	LTR	ERVK	0	239	29	6
1633	718	200	100	0	chr3	137444320	137444480	-22155303	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	204	6
1633	329	267	111	151	chr3	137444887	137445112	-22154671	-	MTE2a	LTR	MaLR	-163	216	1	6
1633	636	296	31	186	chr3	137445320	137445562	-22154221	+	MTEa	LTR	MaLR	2	198	-181	6
1633	636	296	31	186	chr3	137445655	137445857	-22153926	+	MTEa	LTR	MaLR	199	377	-2	6
1633	427	343	67	34	chr3	137446985	137447193	-22152590	+	LTR31	LTR	ERV1	113	327	-292	6
1633	412	71	0	0	chr3	137466398	137466454	-22133329	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	359	304	7
1633	3192	68	2	0	chr3	137466457	137466852	-22132931	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1633	978	207	128	0	chr3	137466854	137467096	-22132687	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-121	273	1	7
1633	1085	216	111	7	chr3	137467745	137468034	-22131749	+	MTD	LTR	MaLR	43	361	-58	7
1633	259	318	168	7	chr3	137470583	137470732	-22129051	+	MLT1F2	LTR	MaLR	266	438	-122	7
1633	2387	161	30	76	chr3	137471029	137471558	-22128225	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-6	506	2	7
1633	2000	151	80	3	chr3	137472050	137472423	-22127360	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	402	-5	7
1633	231	306	96	32	chr3	137472611	137472736	-22127047	+	MTEa	LTR	MaLR	4	136	-223	7
1633	303	242	71	31	chr3	137472887	137472985	-22126798	+	MTEa	LTR	MaLR	278	379	0	7
1633	1619	155	214	24	chr3	137473043	137473374	-22126409	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	7
1633	279	197	106	0	chr3	137473746	137473812	-22125971	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	447	519	-8	7
1633	2167	166	92	13	chr3	137476475	137476865	-22122918	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	7
1633	2234	152	50	27	chr3	137478165	137478604	-22121179	+	RLTR12A	LTR	ERVK	1	449	-119	7
1633	480	125	71	20	chr3	137478604	137478702	-22121081	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	425	7
1633	2060	145	36	29	chr3	137478839	137479259	-22120524	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-104	423	1	7
1633	649	161	8	0	chr3	137479259	137479383	-22120400	+	RLTR12A	LTR	ERVK	444	568	0	7
1633	1160	236	22	22	chr3	137483041	137483318	-22116465	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	278	-112	7
1633	1094	157	156	52	chr3	137489553	137489842	-22109941	-	RMER2	LTR	ERV1	-248	319	1	7
1633	463	219	291	33	chr3	137489852	137490065	-22109718	+	MTD	LTR	MaLR	152	419	0	7
1633	243	256	34	34	chr3	137490357	137490446	-22109337	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	89	-319	7
1633	242	263	116	58	chr3	137490548	137490669	-22109114	+	MLT1A1	LTR	MaLR	269	396	-12	7
1633	1322	234	68	18	chr3	137491769	137492165	-22107618	+	MTD	LTR	MaLR	4	419	0	7
1633	251	266	0	15	chr3	137492973	137493038	-22106745	+	MTEb	LTR	MaLR	294	357	-22	7
1633	240	237	39	88	chr3	137493599	137493701	-22106082	-	MLT1A	LTR	MaLR	-264	110	14	7
1634	364	208	84	9	chr3	137496905	137497012	-22102771	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	305	8
1634	305	342	9	9	chr3	137497310	137497422	-22102361	-	MTD	LTR	MaLR	-240	179	68	8
1634	4297	99	20	24	chr3	137500896	137501592	-22098191	+	RLTR19B	LTR	ERVK	23	715	0	6
1634	1538	181	0	11	chr3	137501592	137501869	-22097914	-	MTC	LTR	MaLR	-38	383	110	7
1634	668	144	17	0	chr3	137504263	137504381	-22095402	-	MTC	LTR	MaLR	-301	120	1	7
1634	1926	186	47	0	chr3	137504383	137504765	-22095018	-	MTC	LTR	MaLR	-21	400	1	1
1634	942	168	5	62	chr3	137505160	137505370	-22094413	-	RLTR14	LTR	ERV1	-137	245	48	1
1634	1722	108	105	0	chr3	137506080	137506366	-22093417	+	ORR1B1	LTR	MaLR	71	386	-8	1
1634	1920	89	11	142	chr3	137507379	137507557	-22092226	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	133	-194	2
1634	1920	89	11	142	chr3	137507689	137507876	-22091907	+	ORR1A2	LTR	MaLR	134	319	-8	2
1634	1105	272	6	56	chr3	137508734	137508863	-22090920	+	MTD	LTR	MaLR	83	205	-214	2
1634	1105	272	6	56	chr3	137509063	137509275	-22090508	+	MTD	LTR	MaLR	206	407	-12	2
1634	258	170	38	0	chr3	137509395	137509448	-22090335	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-24	500	446	2
1634	734	203	178	69	chr3	137509595	137509870	-22089913	-	RLTR28B	LTR	ERVL	-176	305	1	2
1634	684	235	216	61	chr3	137510497	137510821	-22088962	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	6	3
1634	2084	220	20	16	chr3	137510957	137511455	-22088328	-	RLTR16	LTR	ERVK	-5	500	1	3
1634	720	227	0	0	chr3	137512754	137512895	-22086888	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	141	-229	3
1634	875	200	113	9	chr3	137513279	137513491	-22086292	+	ORR1D2	LTR	MaLR	137	370	0	3
1634	2474	95	3	0	chr3	137513673	137513999	-22085784	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1634	307	324	58	22	chr3	137516307	137516446	-22083337	+	MTEa	LTR	MaLR	48	191	-168	5
1634	357	176	12	3	chr3	137516498	137516580	-22083203	+	MTEa	LTR	MaLR	295	379	0	5
1634	1138	256	96	11	chr3	137516652	137517027	-22082756	+	MTD	LTR	MaLR	1	407	-12	5
1634	375	310	57	58	chr3	137517054	137517282	-22082501	+	MLT1A1	LTR	MaLR	87	335	-73	5
1634	1670	185	144	81	chr3	137517944	137518438	-22081345	-	MT2A	LTR	ERVL	-8	525	1	5
1634	320	217	0	0	chr3	137521752	137521821	-22077962	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	302	6
1634	402	270	367	0	chr3	137522062	137522272	-22077511	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-55	315	29	6
1634	1421	229	99	23	chr3	137522282	137522667	-22077116	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	6
1634	1122	167	70	45	chr3	137522693	137522717	-22077066	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	0	1370	1354	6
1634	1919	120	159	39	chr3	137522717	137523126	-22076657	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	4	6
1634	1122	167	70	45	chr3	137523126	137523345	-22076438	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-17	1353	1121	6
1634	829	206	70	11	chr3	137523825	137524011	-22075772	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-247	1123	927	6
1634	586	232	40	23	chr3	137523999	137524191	-22075592	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1382	198	3	6
1634	1101	256	69	29	chr3	137524195	137524541	-22075242	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	8	6
1634	842	172	80	6	chr3	137524650	137524825	-22074958	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	197	7
1634	709	257	29	10	chr3	137524970	137525174	-22074609	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-166	208	1	7
1634	929	200	54	73	chr3	137537137	137537455	-22062328	-	MT2B	LTR	ERVL	-124	477	10	9
1634	3752	58	16	62	chr3	137537635	137538152	-22061631	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	9
1634	1462	153	99	3	chr3	137540403	137540705	-22059078	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	54	1
1634	1087	285	18	18	chr3	137541202	137541538	-22058245	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	44	1
1634	1520	161	48	88	chr3	137551650	137552024	-22047759	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-18	360	2	1
1634	425	257	56	14	chr3	137552072	137552214	-22047569	+	MTD	LTR	MaLR	1	148	-271	1
1634	2083	175	24	7	chr3	137552239	137552648	-22047135	+	MTC	LTR	MaLR	6	421	0	1
1634	490	245	172	15	chr3	137552648	137552851	-22046932	+	MTD	LTR	MaLR	145	379	-40	1
1634	1883	166	67	5	chr3	137553036	137553423	-22046360	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	1
1634	982	239	72	185	chr3	137553423	137553576	-22046207	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	1097	1
1634	982	239	72	185	chr3	137553753	137553778	-22046005	-	MTD-int	LTR	MaLR	-162	1096	1081	1
1634	982	239	72	185	chr3	137553915	137554320	-22045463	-	MTD-int	LTR	MaLR	-178	1080	741	1
1634	249	240	16	32	chr3	137556103	137556228	-22043555	-	MTD-int	LTR	MaLR	-755	754	632	1
1634	353	278	77	67	chr3	137561121	137561398	-22038385	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	378	77	1
1634	1063	198	223	9	chr3	137584279	137584606	-22015177	-	MTD	LTR	MaLR	-22	397	1	2
1634	379	193	24	0	chr3	137590782	137590865	-22008918	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	293	2
1634	4609	158	86	15	chr3	137592681	137593627	-22006156	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	16	2
1634	533	147	109	14	chr3	137593799	137593937	-22005846	+	RLTR30	LTR	ERV1	229	379	0	2
1634	3870	118	128	42	chr3	137596628	137597324	-22002459	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	2
1635	836	308	100	76	chr3	137626295	137626903	-21972880	+	MLT1E3	LTR	MaLR	1	623	-1	2
1635	459	323	108	78	chr3	137629189	137629495	-21970288	+	MLT1B	LTR	MaLR	45	359	-31	2
1635	276	235	0	76	chr3	137634783	137634875	-21964908	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-420	108	24	3
1635	334	242	10	59	chr3	137647666	137647767	-21952016	+	MTEa	LTR	MaLR	1	96	-283	3
1635	3234	48	20	0	chr3	137647826	137648218	-21951565	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	3
1635	404	290	80	64	chr3	137648271	137648474	-21951309	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	198	-167	3
1635	2411	298	65	68	chr3	137648757	137650063	-21949720	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-141	1439	22	3
1635	694	188	0	15	chr3	137650084	137650214	-21949569	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	252	3
1635	2011	144	14	29	chr3	137650639	137651001	-21948782	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	307	-87	3
1635	1083	136	17	11	chr3	137655946	137656124	-21943659	-	RMER10B	LTR	ERVL	-200	198	20	3
1635	1427	211	30	16	chr3	137657705	137658139	-21941644	-	RLTR24	LTR	ERV1	0	529	21	3
1635	8916	135	51	48	chr3	137658139	137658410	-21941373	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1287	3
1635	8916	135	51	48	chr3	137658443	137659739	-21940044	-	RLTR21	LTR	ERVK	-286	1286	1	3
1635	1211	251	138	43	chr3	137660278	137660740	-21939043	-	RMER5	LTR	ERV1	-2	532	27	3
1635	421	269	177	0	chr3	137661426	137661567	-21938216	+	MER34	LTR	ERV1	12	177	-394	3
1635	463	277	135	67	chr3	137662251	137662518	-21937265	+	MER34	LTR	ERV1	186	470	-72	3
1635	405	330	14	83	chr3	137666387	137666648	-21933135	+	MTEb	LTR	MaLR	113	375	-4	3
1635	997	268	55	102	chr3	137672583	137672965	-21926818	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	16	3
1635	2179	269	165	38	chr3	137675257	137676560	-21923223	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-34	1475	1	3
1635	690	203	77	6	chr3	137676560	137676743	-21923040	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	175	3
1635	4407	65	22	48	chr3	137676930	137677533	-21922250	+	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	1	587	0	3
1635	2150	162	10	42	chr3	137681000	137681386	-21918397	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1635	1688	205	220	13	chr3	137681386	137681850	-21917933	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	560	-810	3
1635	462	294	134	5	chr3	137682386	137682639	-21917144	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-108	300	1	3
1635	464	291	315	7	chr3	137682845	137683123	-21916660	+	MTEb	LTR	MaLR	3	366	-13	3
1635	419	340	63	0	chr3	137684888	137685079	-21914704	+	LTR85a	LTR	Gypsy?	500	702	0	3
1635	292	337	10	0	chr3	137685393	137685494	-21914289	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-253	307	206	3
1635	319	352	29	7	chr3	137685518	137685658	-21914125	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-411	149	7	3
1635	227	280	123	33	chr3	137686975	137687041	-21912742	+	MLT1F	LTR	MaLR	362	428	-120	3
1635	2196	176	58	2	chr3	137687041	137687440	-21912343	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1635	227	280	123	33	chr3	137687440	137687457	-21912326	+	MLT1F	LTR	MaLR	429	443	-105	3
1635	3085	52	39	3	chr3	137687457	137687839	-21911944	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1635	227	280	123	33	chr3	137687839	137687876	-21911907	+	MLT1F	LTR	MaLR	444	493	-55	3
1635	1175	245	88	13	chr3	137688529	137688902	-21910881	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	5	3
1635	381	284	112	47	chr3	137693100	137693314	-21906469	+	MLT1B	LTR	MaLR	23	250	-140	4
1635	3364	28	5	15	chr3	137697531	137697931	-21901852	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1635	598	251	40	137	chr3	137699137	137699196	-21900587	-	RMER12	LTR	ERVK	-100	1222	1180	4
1635	2417	81	112	16	chr3	137699196	137699571	-21900212	+	IAPLTR2a	LTR	ERVK	1	411	0	4
1635	598	251	40	137	chr3	137699571	137699760	-21900023	-	RMER12	LTR	ERVK	-143	1179	998	4
1635	225	160	0	57	chr3	137700570	137700623	-21899160	-	RMER12B	LTR	ERVK	-202	1202	1153	4
1635	1354	211	106	89	chr3	137700784	137701583	-21898200	-	RMER12	LTR	ERVK	-1065	783	1	4
1635	357	267	0	43	chr3	137701583	137701660	-21898123	-	MLT1B	LTR	MaLR	-58	332	260	4
1635	2972	50	79	3	chr3	137702301	137702679	-21897104	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	4
1635	830	270	97	57	chr3	137706273	137706442	-21893341	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	230	4
1635	830	270	97	57	chr3	137706462	137706617	-21893166	-	MTD	LTR	MaLR	-190	229	70	4
1635	830	270	97	57	chr3	137707091	137707166	-21892617	-	MTD	LTR	MaLR	-350	69	5	4
1635	1405	231	86	0	chr3	137708637	137708974	-21890809	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	4
1635	321	253	24	37	chr3	137709370	137709452	-21890331	-	ORR1E	LTR	MaLR	-44	335	255	4
1635	406	215	212	15	chr3	137709478	137709615	-21890168	-	ORR1E	LTR	MaLR	-193	166	3	4
1635	1771	161	44	107	chr3	137722381	137722791	-21876992	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1635	294	267	22	104	chr3	137725372	137725506	-21874277	+	MT2B	LTR	ERVL	129	251	-350	4
1635	404	333	0	0	chr3	137744592	137744709	-21855074	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	389	4
1635	1556	199	133	14	chr3	137745246	137745608	-21854175	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	4
1635	749	348	92	28	chr3	137746106	137746582	-21853201	-	MLT1G1	LTR	MaLR	0	591	76	4
1636	513	239	9	0	chr3	137756879	137756992	-21842791	+	MTC-int	LTR	MaLR	1143	1256	-2	4
1636	743	184	78	0	chr3	137756997	137757138	-21842645	+	MTC	LTR	MaLR	4	155	-266	4
1636	1481	150	248	3	chr3	137761386	137761681	-21838102	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1636	279	216	132	105	chr3	137761886	137761916	-21837867	+	MT2B	LTR	ERVL	123	155	-446	5
1636	269	263	38	104	chr3	137776286	137776392	-21823391	+	MT2B2	LTR	ERVL	159	257	-327	5
1636	1828	130	225	6	chr3	137801155	137801510	-21798273	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	433	-3	5
1636	462	207	128	16	chr3	137809684	137809886	-21789897	-	MTD	LTR	MaLR	-5	414	154	5
1636	248	262	44	88	chr3	137811690	137811803	-21787980	+	MT2B2	LTR	ERVL	142	249	-335	5
1636	395	234	153	7	chr3	137815788	137816021	-21783762	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	5
1636	964	262	35	81	chr3	137821256	137821389	-21778394	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	143	-216	5
1636	964	262	35	81	chr3	137821690	137821923	-21777860	+	ORR1E	LTR	MaLR	144	358	-1	5
1636	382	299	23	16	chr3	137822017	137822146	-21777637	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	259	6
1636	785	195	211	26	chr3	137823744	137823976	-21775807	-	RMER20B	LTR	ERVK	-281	346	72	6
1636	381	169	28	14	chr3	137823976	137824048	-21775735	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-80	6839	6767	6
1636	437	278	140	10	chr3	137824445	137824638	-21775145	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-6551	368	151	6
1636	1619	225	35	60	chr3	137824795	137825110	-21774673	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	516	217	6
1636	1619	206	33	48	chr3	137825275	137825496	-21774287	-	RMER20B	LTR	ERVK	-411	216	1	6
1636	1387	182	66	26	chr3	137825626	137826004	-21773779	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	18	6
1636	834	178	76	41	chr3	137826281	137826597	-21773186	+	RMER17C	LTR	ERVK	84	410	0	6
1636	597	92	0	0	chr3	137835836	137835923	-21763860	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-1876	87	1	6
1636	1243	53	47	0	chr3	137835923	137836094	-21763689	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	168	6
1636	1219	227	144	14	chr3	137840300	137840653	-21759130	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	9	407	0	6
1636	412	271	61	77	chr3	137843652	137843848	-21755935	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	210	-211	6
1636	260	195	59	35	chr3	137845075	137845160	-21754623	+	MTE2a	LTR	MaLR	177	263	-116	6
1636	484	233	122	14	chr3	137845160	137845308	-21754475	+	MTE2a	LTR	MaLR	216	379	0	6
1636	307	290	27	68	chr3	137845585	137845733	-21754050	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	16	157	-1213	6
1636	365	276	259	52	chr3	137845978	137846268	-21753515	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	26	6
1636	502	203	81	50	chr3	137847888	137848049	-21751734	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	254	6
1636	510	135	0	22	chr3	137850641	137850732	-21749051	+	MT2A	LTR	ERVL	1	89	-444	6
1636	264	220	0	0	chr3	137850762	137850812	-21748971	+	MT2A	LTR	ERVL	82	131	-402	6
1636	346	191	7	213	chr3	137850806	137850972	-21748811	+	MT2A	LTR	ERVL	348	543	-41	6
1636	288	93	0	0	chr3	137851033	137851076	-21748707	+	MT2A	LTR	ERVL	538	580	-4	6
1636	1375	228	27	103	chr3	137851980	137852425	-21747358	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	6
1636	266	157	0	19	chr3	137852470	137852522	-21747261	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-1209	4505	4455	6
1636	389	283	80	0	chr3	137852532	137852670	-21747113	+	MTD	LTR	MaLR	269	417	-2	6
1636	743	278	42	99	chr3	137853539	137853851	-21745932	+	MLT1A0	LTR	MaLR	69	362	-3	6
1636	1990	151	44	14	chr3	137858018	137858158	-21741625	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	243	6
1636	1990	151	44	14	chr3	137858235	137858456	-21741327	-	RLTR14	LTR	ERV1	-140	242	11	6
1636	1191	184	86	9	chr3	137866824	137867197	-21732586	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	1	488	-90	6
1636	1191	224	46	7	chr3	137867223	137867312	-21732471	+	RLTR20A2	LTR	ERVK	489	577	-1	6
1636	3151	23	2	79	chr3	137868725	137869145	-21730638	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	6
1636	17006	24	7	4	chr3	137869157	137871094	-21728689	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	1984	-3	6
1636	267	53	0	0	chr3	137871096	137871134	-21728649	+	RLTR10	LTR	ERVK	353	390	0	6
1636	3538	151	105	57	chr3	137872508	137873301	-21726482	-	RMER13B	LTR	ERVK	-77	831	1	6
1636	275	284	109	38	chr3	137874456	137874639	-21725144	-	RMER2	LTR	ERV1	-4	563	368	6
1636	3752	129	110	2	chr3	137877126	137877737	-21722046	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	677	-1	6
1636	672	264	139	40	chr3	137882149	137882473	-21717310	-	MLT1B	LTR	MaLR	-5	385	30	6
1636	471	314	14	140	chr3	137887336	137887576	-21712207	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	180	6
204	1837	141	68	28	chr3	137887576	137887970	-21711813	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	6
1637	471	314	14	140	chr3	137887970	137888022	-21711761	-	MLT1B	LTR	MaLR	-211	179	135	6
1637	251	333	49	0	chr3	137888429	137888531	-21711252	-	MLT1B	LTR	MaLR	-268	122	16	6
1637	246	177	61	37	chr3	137907086	137907168	-21692615	+	RMER17C	LTR	ERVK	327	410	0	7
1637	985	195	181	55	chr3	137907168	137907494	-21692289	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	367	-2871	7
1637	553	184	123	34	chr3	137908061	137908207	-21691576	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1513	1671	-1567	7
1637	771	139	155	18	chr3	137908237	137908405	-21691378	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1800	1990	-1248	7
1637	989	143	30	0	chr3	137908408	137908576	-21691207	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2170	2342	-896	7
1637	2404	115	192	25	chr3	137908574	137909179	-21690604	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2533	3238	0	7
1637	1669	184	64	10	chr3	137909179	137909568	-21690215	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	7
1637	824	277	84	36	chr3	137910094	137910427	-21689356	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	349	-16	7
1637	1499	197	92	14	chr3	137918358	137918710	-21681073	+	MTD	LTR	MaLR	12	391	-28	7
1637	1499	197	92	14	chr3	137918740	137918758	-21681025	+	MTD	LTR	MaLR	392	410	-9	7
1637	1840	211	41	39	chr3	137929020	137929588	-21670195	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	8	563	0	7
1637	4688	117	18	1	chr3	137931826	137932493	-21667290	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	1	7
1637	423	294	62	34	chr3	137932940	137933148	-21666635	+	MER34	LTR	ERV1	264	477	-65	7
1637	1927	143	54	31	chr3	137935429	137935819	-21663964	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	9	407	0	7
1637	796	274	94	71	chr3	137936528	137937019	-21662764	+	RMER5	LTR	ERV1	32	533	-1	7
1637	1454	118	56	4	chr3	137937584	137937929	-21661854	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	14	420	0	7
1637	1885	213	39	15	chr3	137955224	137955633	-21644150	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1637	1560	84	4	0	chr3	137960012	137960237	-21639546	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-249	226	1	7
1637	2024	226	11	174	chr3	137961004	137961732	-21638051	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	609	-2	7
1637	250	270	54	33	chr3	137963544	137963636	-21636147	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-559	95	2	7
1637	307	260	121	8	chr3	137963638	137963762	-21636021	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	237	7
1637	1293	165	23	180	chr3	137963879	137964351	-21635432	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	398	0	7
1637	2984	101	45	14	chr3	137967582	137968006	-21631777	+	RLTR9B	LTR	ERVK	1	437	0	7
1637	889	305	107	23	chr3	137968624	137969101	-21630682	+	RMER5	LTR	ERV1	8	524	-10	7
1637	3151	152	52	11	chr3	137969725	137970269	-21629514	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-1	567	2	7
1637	489	282	46	13	chr3	137992746	137992897	-21606886	-	RMER15	LTR	ERVL	-121	454	299	8
1637	499	305	107	59	chr3	138002465	138002754	-21597029	-	MER21B	LTR	ERV1	-111	752	450	1
1637	381	295	29	0	chr3	138002931	138003036	-21596747	-	MER21B	LTR	ERV1	-630	233	126	1
1637	257	318	56	0	chr3	138003237	138003344	-21596439	-	HERVL74-int	LTR	ERVL	-4023	1662	1550	1
1637	401	273	108	69	chr3	138003610	138003859	-21595924	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-23	347	82	1
1637	401	273	108	69	chr3	138003901	138003985	-21595798	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-289	81	1	1
1637	411	205	34	51	chr3	138004023	138004141	-21595642	-	LTR52-int	LTR	ERVL	-3356	200	85	1
1637	336	269	62	0	chr3	138004298	138004428	-21595355	-	LTR52	LTR	ERVL	-46	375	238	1
1637	636	312	131	19	chr3	138004700	138005014	-21594769	+	RMER15	LTR	ERVL	227	575	0	1
1637	472	295	35	35	chr3	138008485	138008646	-21591137	-	MLT1B	LTR	MaLR	-6	384	222	2
1637	472	317	78	1345	chr3	138008739	138008901	-21590882	-	MLT1B	LTR	MaLR	-169	221	3	2
1637	232	242	93	62	chr3	138010545	138010642	-21589141	-	LTR48	LTR	ERV1	-626	161	62	3
1637	1389	239	64	34	chr3	138012050	138012457	-21587326	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1638	1877	155	21	8	chr3	138022648	138023012	-21576771	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1638	405	277	141	52	chr3	138023550	138023763	-21576020	+	MTEa	LTR	MaLR	148	379	0	4
1638	2368	167	63	44	chr3	138023797	138024292	-21575491	-	RLTR16	LTR	ERVK	-1	504	1	4
1638	1057	234	183	45	chr3	138025247	138025838	-21573945	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	1220	1892	-7067	4
1638	3568	20	2	0	chr3	138028081	138028476	-21571307	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1638	2230	105	8	56	chr3	138029278	138029671	-21570112	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	374	-150	5
1638	1242	226	96	3	chr3	138030168	138030531	-21569252	-	RMER20A	LTR	ERVK	-119	397	1	5
1638	598	117	27	9	chr3	138030531	138030643	-21569140	+	RLTR28	LTR	ERVL	411	524	0	5
1638	996	106	25	0	chr3	138031418	138031578	-21568205	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	-193	164	1	5
1638	505	86	0	0	chr3	138031609	138031679	-21568104	+	RMER10B	LTR	ERVL	317	386	-12	6
1638	458	286	126	92	chr3	138031851	138032015	-21567768	+	RLTR18	LTR	ERVK	35	212	-404	6
1638	1976	153	14	6	chr3	138032015	138032371	-21567412	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
1638	458	289	117	100	chr3	138032371	138032772	-21567011	+	RLTR18	LTR	ERVK	183	505	-7	6
1638	385	284	20	0	chr3	138038820	138038922	-21560861	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2871	2974	-2548	7
1638	324	224	45	0	chr3	138039121	138039188	-21560595	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	4012	4081	-1441	7
1638	393	266	27	20	chr3	138039729	138039875	-21559908	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	4258	4404	-1118	7
1638	1406	227	127	30	chr3	138042261	138042693	-21557090	+	RMER19C	LTR	ERVK	138	611	0	7
1638	439	226	11	0	chr3	138042693	138042786	-21556997	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	1	94	-5686	7
1638	2037	172	31	81	chr3	138043189	138043670	-21556113	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	457	-571	7
1638	405	196	10	219	chr3	138044034	138044230	-21555553	+	RLTR25B	LTR	ERVK	597	751	-277	7
1638	284	216	78	10	chr3	138044239	138044342	-21555441	+	RLTR25B	LTR	ERVK	919	1028	0	7
1638	305	318	12	0	chr3	138068958	138069043	-21530740	+	MLT1F2	LTR	MaLR	318	403	-157	9
1638	1653	183	100	6	chr3	138069573	138069924	-21529859	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	9
1638	332	276	32	74	chr3	138071322	138071500	-21528283	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	184	-175	9
1638	3458	23	5	2	chr3	138084429	138084824	-21514959	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1638	2243	187	75	29	chr3	138087607	138088163	-21511620	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	3	584	0	1
1638	2497	127	29	19	chr3	138089096	138089513	-21510270	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1638	276	203	92	54	chr3	138095599	138095729	-21504054	+	RMER15	LTR	ERVL	427	561	-14	1
1638	2613	116	74	37	chr3	138096760	138097218	-21502565	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	1
1638	6975	40	12	0	chr3	138097218	138098035	-21501748	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5655	1
1638	777	121	8	8	chr3	138098033	138098150	-21501633	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5328	2352	2236	1
1638	445	82	0	32	chr3	138098139	138098202	-21501581	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5062	1419	1359	1
1638	5181	44	0	57	chr3	138098202	138098902	-21500881	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5819	662	3	1
1638	1961	95	3	69	chr3	138098904	138099254	-21500529	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-10	327	1	1
1638	2797	60	56	20	chr3	138099902	138099919	-21499864	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	15	-392	1
1638	2797	60	56	20	chr3	138099953	138100328	-21499455	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	16	406	-1	1
1638	1625	83	19	45	chr3	138101027	138101291	-21498492	+	RLTR19	LTR	ERVK	1	257	-242	1
1638	338	165	0	174	chr3	138101523	138101561	-21498222	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	238	1
1638	2460	101	28	3	chr3	138101561	138101719	-21498064	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	204	1
1638	2460	101	28	3	chr3	138101743	138101943	-21497840	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-165	203	2	1
1638	338	165	0	174	chr3	138102022	138102036	-21497747	-	MT2B	LTR	ERVL	-364	237	156	1
1638	307	210	122	12	chr3	138104962	138105044	-21494739	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	91	-293	1
1638	986	141	41	16	chr3	138111043	138111237	-21488546	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	377	1
1638	960	161	122	47	chr3	138111683	138111938	-21487845	-	RMER15	LTR	ERVL	-300	275	2	1
1638	906	244	66	64	chr3	138120882	138121259	-21478524	+	MTEb	LTR	MaLR	2	379	0	1
1638	1917	153	61	22	chr3	138124935	138125297	-21474486	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	378	0	1
1638	310	335	70	15	chr3	138128809	138129009	-21470774	+	MLT1J1	LTR	MaLR	55	265	-179	2
1638	403	254	137	26	chr3	138129646	138129690	-21470093	-	MT2A	LTR	ERVL	-5	528	474	2
1638	403	254	137	26	chr3	138129765	138129851	-21469932	-	MT2A	LTR	ERVL	-60	473	386	2
1638	412	225	186	25	chr3	138130044	138130192	-21469591	-	MT2A	LTR	ERVL	-148	385	160	2
1638	628	272	85	109	chr3	138146460	138146704	-21453079	+	ORR1E	LTR	MaLR	40	277	-82	2
1638	628	272	85	109	chr3	138146894	138146942	-21452841	+	ORR1E	LTR	MaLR	278	325	-34	2
1639	2208	142	76	3	chr3	138155352	138155719	-21444064	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	2
1639	369	191	53	11	chr3	138159366	138159461	-21440322	+	MTC-int	LTR	MaLR	1160	1258	0	2
1639	1999	127	62	3	chr3	138160485	138160793	-21438990	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
1639	1470	195	57	31	chr3	138160936	138161006	-21438777	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	327	2
1639	1470	195	57	31	chr3	138161779	138162062	-21437721	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-68	326	32	2
1639	930	324	33	19	chr3	138164187	138164552	-21435231	-	MLT1B	LTR	MaLR	-20	370	1	2
1639	482	322	49	81	chr3	138165158	138165466	-21434317	-	RLTR26	LTR	ERVK	-176	466	169	2
1639	633	74	156	9	chr3	138167168	138167277	-21432506	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-81	265	141	2
1639	1882	93	53	62	chr3	138174576	138174897	-21424886	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	318	-8	3
1639	418	250	184	18	chr3	138175318	138175331	-21424452	-	MTEa	LTR	MaLR	-178	201	185	3
1639	418	250	184	18	chr3	138175457	138175606	-21424177	-	MTEa	LTR	MaLR	-195	184	13	3
1639	1683	160	67	22	chr3	138178503	138178861	-21420922	+	RLTR30	LTR	ERV1	6	379	0	3
1639	479	320	79	112	chr3	138179869	138179962	-21419821	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	66	-353	3
1639	812	260	82	54	chr3	138180139	138180469	-21419314	+	MTE2a	LTR	MaLR	57	405	-14	3
1639	253	239	29	43	chr3	138182143	138182213	-21417570	+	MER57-int	LTR	ERV1	7155	7223	-314	3
1639	319	285	123	63	chr3	138185401	138185654	-21414129	+	RMER20B	LTR	ERVK	134	399	-228	3
1639	2181	104	3	0	chr3	138203889	138204207	-21395576	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1639	574	189	164	3	chr3	138223855	138224007	-21375776	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-10	368	136	4
1639	1634	188	87	9	chr3	138231992	138232325	-21367458	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	4
1639	1703	168	144	0	chr3	138233523	138233850	-21365933	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1639	2169	103	25	46	chr3	138235225	138235272	-21364511	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	276	4
1639	2169	103	25	46	chr3	138235465	138235742	-21364041	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-51	275	1	4
1639	9179	137	14	143	chr3	138235742	138236730	-21363053	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	0	1792	808	4
1639	9179	137	14	143	chr3	138236924	138237994	-21361789	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-985	807	1	4
1639	1109	129	6	6	chr3	138237994	138238166	-21361617	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	346	175	4
1639	1210	84	0	6	chr3	138238351	138238519	-21361264	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-160	167	1	4
1639	1296	227	71	26	chr3	138241739	138242082	-21357701	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	4	4
1639	607	247	75	125	chr3	138246693	138247068	-21352715	-	RLTR15	LTR	ERVK	-3	356	1	4
1639	307	286	6	157	chr3	138248636	138248802	-21350981	+	MT2B	LTR	ERVL	145	285	-316	4
1639	399	294	237	33	chr3	138250236	138250510	-21349273	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	330	-29	5
1639	539	287	211	13	chr3	138252329	138252632	-21347151	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	3	5
1639	240	329	188	49	chr3	138253300	138253524	-21346259	-	MLT1I	LTR	MaLR	-43	368	114	5
1639	904	264	60	39	chr3	138257728	138258012	-21341771	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	127	5
1639	543	249	25	20	chr3	138259516	138259684	-21340099	-	MER57-int	LTR	ERV1	-232	7305	7157	5
1639	546	69	0	0	chr3	138262586	138262658	-21337125	+	ORR1A4	LTR	MaLR	258	329	0	5
1639	648	333	218	39	chr3	138265414	138265973	-21333810	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-538	951	293	5
1639	290	221	43	14	chr3	138266087	138266156	-21333627	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-56	314	244	5
1639	2298	109	19	3	chr3	138267342	138267664	-21332119	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1639	231	224	137	87	chr3	138268411	138268546	-21331237	+	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	61	194	-609	5
1639	360	275	33	0	chr3	138277272	138277363	-21322420	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	387	294	5
1639	808	298	47	27	chr3	138277575	138277868	-21321915	-	MLT1B	LTR	MaLR	-79	311	13	5
1640	2594	62	9	0	chr3	138281147	138281469	-21318314	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	5
1640	434	157	130	0	chr3	138283190	138283298	-21316485	-	MTC	LTR	MaLR	-287	134	13	5
1640	2650	117	63	28	chr3	138284360	138284782	-21315001	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	432	-102	5
1640	2650	117	63	28	chr3	138284812	138284883	-21314900	+	RLTR20C	LTR	ERVK	433	511	-23	5
1640	1682	206	86	35	chr3	138285168	138285631	-21314152	-	RLTR19C	LTR	ERVK	0	506	20	5
1640	3563	55	20	4	chr3	138287828	138288316	-21311467	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	69	5
1640	333	256	87	97	chr3	138295299	138295491	-21304292	-	MLT1C	LTR	MaLR	-277	190	1	6
1640	299	397	107	0	chr3	138296561	138296785	-21302998	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-28	420	173	6
1640	589	173	14	0	chr3	138296975	138297095	-21302688	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-226	133	3	6
1640	430	179	24	0	chr3	138297104	138297188	-21302595	+	ORR1C1	LTR	MaLR	102	187	-197	6
1640	941	213	40	0	chr3	138297309	138297511	-21302272	+	ORR1C1	LTR	MaLR	166	375	-3	6
1640	232	343	142	23	chr3	138299112	138299330	-21300453	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	251	-108	6
1640	263	366	45	25	chr3	138310029	138310186	-21289597	+	MLT1A0	LTR	MaLR	27	186	-179	6
1640	1911	147	34	76	chr3	138310265	138310647	-21289136	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	366	-12	6
1640	1840	102	3	63	chr3	138313809	138314112	-21285671	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	285	-42	6
1640	329	104	0	0	chr3	138314292	138314340	-21285443	+	ORR1A2	LTR	MaLR	328	375	-9	6
1640	501	276	16	82	chr3	138314334	138314579	-21285204	-	MTEb	LTR	MaLR	-93	286	58	6
1640	452	251	68	34	chr3	138316318	138316495	-21283288	+	RLTR41	LTR	ERV1	264	446	0	6
1640	802	259	49	58	chr3	138318581	138318929	-21280854	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	173	6
1640	2942	105	68	57	chr3	138318964	138319477	-21280306	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	6
1640	256	274	14	0	chr3	138319548	138319621	-21280162	-	RMER5	LTR	ERV1	-421	113	40	6
1640	1240	173	4	21	chr3	138319799	138320041	-21279742	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	297	6
1640	1997	130	47	6	chr3	138320041	138320381	-21279402	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	68	6
1640	397	192	0	0	chr3	138320578	138320651	-21279132	-	MTC	LTR	MaLR	-340	81	9	6
1640	1427	171	14	11	chr3	138320660	138320943	-21278840	-	RMER5	LTR	ERV1	-234	300	17	6
1640	2240	160	47	50	chr3	138321227	138321288	-21278495	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	379	6
1640	2240	160	47	50	chr3	138321480	138321840	-21277943	-	MTC	LTR	MaLR	-43	378	1	6
1640	3140	60	190	2	chr3	138321959	138322396	-21277387	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	6
1640	990	225	123	44	chr3	138323086	138323604	-21276179	-	RMER20B	LTR	ERVK	-36	591	33	6
1640	2254	95	69	0	chr3	138326360	138326665	-21273118	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	327	0	6
1640	1885	216	65	169	chr3	138327350	138328029	-21271754	+	RMER19C	LTR	ERVK	4	611	0	6
1640	231	260	93	28	chr3	138330920	138331027	-21268756	-	LTR48	LTR	ERV1	-178	609	496	6
1640	998	242	87	27	chr3	138332451	138332779	-21267004	+	MTD	LTR	MaLR	41	419	0	6
1640	1338	189	112	27	chr3	138334658	138335099	-21264684	-	RMER4B	LTR	ERVK	-67	518	1	6
1640	3945	189	28	62	chr3	138335102	138336125	-21263658	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-54	8905	8093	6
1640	811	245	320	7	chr3	138336338	138336609	-21263174	-	MurERV4-int	LTR	ERVK	-4820	440	85	6
1640	295	239	95	32	chr3	138336954	138337049	-21262734	+	MLT1B	LTR	MaLR	76	176	-214	6
1640	675	219	176	61	chr3	138338808	138339138	-21260645	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	1	6
1640	3239	100	84	121	chr3	138339635	138340362	-21259421	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	57	7
1640	322	188	16	0	chr3	138342382	138342446	-21257337	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	310	7
1640	722	197	6	6	chr3	138342637	138342795	-21256988	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-55	329	172	7
1640	874	157	67	6	chr3	138342865	138343044	-21256739	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-184	190	1	7
1640	2865	36	7	142	chr3	138346061	138346510	-21253273	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	7
1640	17194	25	3	4	chr3	138346521	138348467	-21251316	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	1984	-3	7
1640	2790	36	7	170	chr3	138348469	138348933	-21250850	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	7
1640	754	199	219	96	chr3	138355119	138355306	-21244477	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	138	7
1640	754	199	219	96	chr3	138355381	138355526	-21244257	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-237	137	1	7
1640	1214	264	48	16	chr3	138357223	138357535	-21242248	-	ORR1E	LTR	MaLR	-35	324	3	7
1640	2168	155	18	48	chr3	138358273	138358707	-21241076	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	7
1640	1983	167	5	48	chr3	138360213	138360585	-21239198	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	4	7
1640	304	264	126	0	chr3	138360804	138360891	-21238892	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	98	-281	7
1640	269	182	17	52	chr3	138360874	138360932	-21238851	+	MTE2b	LTR	MaLR	43	98	-281	7
1640	475	259	87	54	chr3	138361195	138361379	-21238404	+	MTE2b	LTR	MaLR	151	340	-39	7
1640	415	244	16	40	chr3	138361942	138362066	-21237717	-	ORR1E	LTR	MaLR	-162	197	77	7
1640	281	364	65	43	chr3	138363462	138363692	-21236091	+	MLT1G	LTR	MaLR	26	260	-331	7
1640	904	291	12	8	chr3	138369266	138369522	-21230261	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	119	7
1640	3389	35	5	2	chr3	138370780	138371179	-21228604	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	7
1640	445	259	116	10	chr3	138372149	138372351	-21227432	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	680	399	7
1640	296	247	102	51	chr3	138372389	138372487	-21227296	-	MTE2b	LTR	MaLR	-255	104	2	7
1640	386	313	57	15	chr3	138379330	138379543	-21220240	+	MLT1D	LTR	MaLR	20	239	-388	7
1640	274	263	40	10	chr3	138381035	138381135	-21218648	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	304	7
1640	268	269	75	11	chr3	138381262	138381356	-21218427	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-308	100	1	7
1640	564	261	115	14	chr3	138381761	138381979	-21217804	-	MLT1C	LTR	MaLR	-5	462	223	7
1640	373	296	92	6	chr3	138382296	138382459	-21217324	-	MLT1C	LTR	MaLR	-283	184	8	7
1640	345	311	29	58	chr3	138385008	138385213	-21214570	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1190	1388	-4134	7
1640	3420	26	13	0	chr3	138388417	138388808	-21210975	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1640	1895	221	22	10	chr3	138389177	138389589	-21210194	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	7
1640	977	182	11	0	chr3	138391133	138391309	-21208474	+	MTC	LTR	MaLR	6	183	-238	7
1640	1165	108	189	10	chr3	138391426	138391622	-21208161	+	MTC	LTR	MaLR	191	421	0	7
1640	478	282	132	104	chr3	138395415	138395779	-21204004	-	MTD	LTR	MaLR	-5	374	1	8
1640	2592	188	50	22	chr3	138395783	138396328	-21203455	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-8	560	1	8
1640	1390	204	58	88	chr3	138399363	138399794	-21199989	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	8
1640	1765	152	152	19	chr3	138401428	138401796	-21197987	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	8
1640	281	301	67	19	chr3	138409046	138409151	-21190632	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-2	553	444	8
1640	2031	162	94	16	chr3	138409443	138409826	-21189957	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	8
1641	371	254	68	36	chr3	138412786	138412946	-21186837	+	MTEb	LTR	MaLR	199	371	-8	8
1641	274	321	94	0	chr3	138419272	138419378	-21180405	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	356	241	8
1641	238	160	160	0	chr3	138419470	138419520	-21180263	-	ORR1E	LTR	MaLR	-321	58	1	8
1641	595	269	159	29	chr3	138425934	138426210	-21173573	+	LTR40c	LTR	ERVL	83	394	-71	8
1641	1224	287	68	23	chr3	138443707	138444146	-21155637	-	MLT1C	LTR	MaLR	-6	461	3	8
1641	594	316	169	26	chr3	138444786	138445214	-21154569	-	MLT1G	LTR	MaLR	-53	502	11	8
1641	344	274	67	23	chr3	138445317	138445502	-21154281	+	MLT1A1	LTR	MaLR	202	390	-18	8
1641	3195	58	5	10	chr3	138448893	138449291	-21150492	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	8
1641	1263	222	98	48	chr3	138449546	138449924	-21149859	+	MTD	LTR	MaLR	23	419	0	8
1641	259	197	16	16	chr3	138451247	138451309	-21148474	-	MLT1M	LTR	MaLR	-471	201	140	8
1641	2592	73	0	0	chr3	138453138	138453465	-21146318	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1641	833	246	138	6	chr3	138463650	138463985	-21135798	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	9
1641	987	255	173	21	chr3	138481565	138481894	-21117889	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	9
1641	2611	143	76	18	chr3	138489778	138490276	-21109507	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	9
1641	382	64	0	0	chr3	138491547	138491594	-21108189	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	340	9
1641	1845	157	80	3	chr3	138492154	138492481	-21107302	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-41	353	2	9
1641	504	295	100	21	chr3	138506113	138506394	-21093389	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	305	-54	9
1641	387	322	108	65	chr3	138506569	138506848	-21092935	-	MLT1F2	LTR	MaLR	0	560	270	1
1641	256	208	0	0	chr3	138515661	138515714	-21084069	+	MLT1A0	LTR	MaLR	263	315	-50	2
1641	1338	194	141	50	chr3	138529242	138529626	-21070157	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	4
1641	459	341	53	67	chr3	138538540	138538901	-21060882	-	MLT1A	LTR	MaLR	-12	362	7	5
1641	2086	129	60	60	chr3	138540696	138541099	-21058684	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	5	6
1642	298	327	26	0	chr3	138564607	138564720	-21035063	-	ORR1E	LTR	MaLR	-236	123	8	9
1642	405	311	143	44	chr3	138572108	138572380	-21027403	+	MLT1A0	LTR	MaLR	67	365	0	1
1642	237	256	136	87	chr3	138576043	138576227	-21023556	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	194	-180	1
1642	283	284	59	17	chr3	138576243	138576361	-21023422	+	MLT1B	LTR	MaLR	252	374	-16	1
1642	240	238	86	0	chr3	138578342	138578447	-21021336	-	LTR40a	LTR	ERVL	-401	118	5	1
1642	702	216	13	7	chr3	138579910	138580064	-21019719	+	MTD	LTR	MaLR	179	333	-86	1
1642	1818	158	94	14	chr3	138584313	138584665	-21015118	+	MTC	LTR	MaLR	1	380	-41	1
1642	248	372	84	12	chr3	138615714	138615880	-20983903	+	RMER4A	LTR	ERVK	10	187	-279	1
1642	1419	169	223	15	chr3	138616590	138616927	-20982856	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	1
1642	356	267	50	64	chr3	138624242	138624382	-20975401	-	MTEa	LTR	MaLR	-236	143	6	1
1642	1309	225	61	0	chr3	138641372	138641652	-20958131	-	MTD	LTR	MaLR	-122	297	1	1
1642	1047	267	79	38	chr3	138653822	138654165	-20945618	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-13	357	1	2
1642	803	134	0	0	chr3	138654275	138654394	-20945389	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	3120	3238	0	2
1642	1350	161	112	66	chr3	138654397	138654789	-20944994	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	2
1642	1612	216	107	50	chr3	138662235	138662588	-20937195	+	RMER15	LTR	ERVL	1	353	-222	2
1642	1612	216	107	50	chr3	138662628	138662816	-20936967	+	RMER15	LTR	ERVL	354	572	-3	2
1642	400	268	212	18	chr3	138667622	138667839	-20931944	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-286	270	12	2
1642	731	278	87	103	chr3	138668202	138668368	-20931415	+	MTD	LTR	MaLR	2	167	-252	2
1642	731	278	87	103	chr3	138668647	138668905	-20930878	+	MTD	LTR	MaLR	168	419	0	2
1643	2310	76	41	0	chr3	138683846	138684160	-20915623	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1643	392	275	109	71	chr3	138692313	138692497	-20907286	+	MTEa	LTR	MaLR	25	215	-164	2
1643	794	341	54	15	chr3	138694376	138694712	-20905071	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	349	-65	2
1643	657	273	118	37	chr3	138696210	138696480	-20903303	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-78	292	1	2
1643	672	136	0	18	chr3	138700228	138700340	-20899443	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	110	-750	2
1643	1787	173	143	146	chr3	138700334	138700406	-20899377	+	RMER13A	LTR	ERVK	227	297	-563	2
1643	2235	92	136	11	chr3	138700443	138700817	-20898966	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	2
1643	1787	173	143	146	chr3	138700817	138701352	-20898431	+	RMER13A	LTR	ERVK	298	832	-28	2
1643	1010	249	31	21	chr3	138702289	138702576	-20897207	-	MTD	LTR	MaLR	-95	324	1	2
1643	567	259	84	95	chr3	138704865	138705138	-20894645	+	MTEb	LTR	MaLR	1	270	-109	2
1643	249	268	94	31	chr3	138705183	138705310	-20894473	+	MTEb	LTR	MaLR	243	377	-2	2
1643	623	226	64	90	chr3	138710310	138710543	-20889240	-	RMER12	LTR	ERVK	-101	1221	995	2
1643	1940	234	46	60	chr3	138710752	138711550	-20888233	-	RMER12	LTR	ERVK	-1071	777	1	2
1643	267	365	34	46	chr3	138712236	138712411	-20887372	+	MTEa	LTR	MaLR	8	180	-179	2
1643	283	253	101	0	chr3	138712426	138712505	-20887278	+	MTEa	LTR	MaLR	256	342	-37	2
1643	1738	121	75	47	chr3	138720724	138721044	-20878739	-	MTC	LTR	MaLR	-92	329	1	3
1643	500	299	98	0	chr3	138721690	138721854	-20877929	+	MTEb	LTR	MaLR	1	180	-199	3
1643	248	277	47	47	chr3	138721969	138722075	-20877708	+	MTEb	LTR	MaLR	243	348	-31	3
1643	413	228	49	10	chr3	138722630	138722732	-20877051	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	106	-796	3
1643	2832	145	223	13	chr3	138722733	138723411	-20876372	+	RMER19B	LTR	ERVK	56	875	-27	3
1643	475	337	82	45	chr3	138727243	138727597	-20872186	-	MLT1G	LTR	MaLR	0	591	225	3
1643	332	212	113	113	chr3	138731311	138731497	-20868286	+	RMER15	LTR	ERVL	376	561	-14	3
1643	2226	171	110	15	chr3	138732458	138732939	-20866844	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	3
1643	474	256	178	5	chr3	138739581	138739766	-20860017	-	MLT1C	LTR	MaLR	-202	265	49	3
1643	1970	124	83	15	chr3	138741345	138741681	-20858102	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	3
1643	1160	232	70	26	chr3	138742686	138743031	-20856752	-	MTEa	LTR	MaLR	-7	372	13	3
1643	592	269	12	36	chr3	138745516	138745682	-20854101	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-56	352	191	3
1643	705	251	5	30	chr3	138747376	138747577	-20852206	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	310	3
1643	541	262	99	32	chr3	138747591	138747812	-20851971	-	MLT1D	LTR	MaLR	-246	259	24	3
1643	3301	26	39	0	chr3	138751111	138751492	-20848291	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1643	253	278	51	85	chr3	138751873	138751991	-20847792	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-57	432	319	3
1643	2063	156	117	0	chr3	138761568	138761920	-20837863	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	1	3
1643	263	252	160	63	chr3	138762248	138762554	-20837229	-	MTEa	LTR	MaLR	-18	361	14	3
1643	1898	136	19	77	chr3	138764812	138765187	-20834596	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	41	3
1643	2175	161	72	25	chr3	138765556	138765958	-20833825	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1643	1491	209	75	43	chr3	138769888	138770263	-20829520	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	21	3
1643	241	278	124	0	chr3	138771259	138771356	-20828427	+	MLT1J	LTR	MaLR	77	185	-327	3
1643	255	127	0	68	chr3	138773682	138773741	-20826042	-	MTC	LTR	MaLR	-7	412	358	3
1643	228	242	109	73	chr3	138773750	138773915	-20825868	-	RLTR15	LTR	ERVK	-11	348	178	3
1643	274	208	13	13	chr3	138773981	138774059	-20825724	-	RLTR15	LTR	ERVK	-279	80	3	3
1643	1608	156	79	74	chr3	138774059	138774425	-20825358	-	MTC	LTR	MaLR	-53	368	1	3
1643	2058	112	12	30	chr3	138776489	138776770	-20823013	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	282	-45	4
1643	2058	112	12	30	chr3	138777621	138777670	-20822113	+	ORR1A2	LTR	MaLR	283	325	-2	4
1643	491	277	118	98	chr3	138777672	138777931	-20821852	-	MLT1D	LTR	MaLR	-112	393	102	4
1643	491	277	118	98	chr3	138778521	138778548	-20821235	-	MLT1D	LTR	MaLR	-404	101	88	4
1643	2377	172	50	7	chr3	138778548	138778952	-20820831	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1643	491	277	118	98	chr3	138778952	138779012	-20820771	-	MLT1D	LTR	MaLR	-418	87	39	4
1643	3454	41	5	8	chr3	138784660	138785057	-20814726	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1643	609	334	64	61	chr3	138786036	138786145	-20813638	+	MLT1C	LTR	MaLR	53	160	-307	4
1643	609	334	64	61	chr3	138786189	138786487	-20813296	+	MLT1C	LTR	MaLR	161	460	-7	4
1643	3018	49	36	75	chr3	138786587	138787003	-20812780	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1643	302	275	57	24	chr3	138787198	138787321	-20812462	-	RMER20B	LTR	ERVK	-264	363	237	4
1643	1211	283	32	57	chr3	138788744	138788945	-20810838	+	MTEa	LTR	MaLR	18	215	-164	4
1643	3318	74	2	29	chr3	138788945	138789363	-20810420	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1643	1211	283	32	57	chr3	138789363	138789532	-20810251	+	MTEa	LTR	MaLR	216	379	0	4
1643	929	272	69	75	chr3	138798305	138798530	-20801253	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	235	-124	4
1643	2619	127	54	23	chr3	138798530	138798957	-20800826	+	BGLII_B	LTR	ERVK	2	441	0	4
1643	929	272	69	75	chr3	138798957	138799080	-20800703	+	ORR1E	LTR	MaLR	236	350	-9	4
1643	557	154	50	17	chr3	138800565	138800684	-20799099	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	248	4
1643	359	218	101	76	chr3	138800692	138800811	-20798972	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-248	122	1	4
1643	698	303	108	90	chr3	138801453	138802000	-20797783	-	MER89	LTR	ERV1	0	559	3	4
1643	226	348	109	6	chr3	138802318	138802474	-20797309	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	207	4
1643	2274	127	95	5	chr3	138802496	138802875	-20796908	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	4
1643	1223	126	191	12	chr3	138802883	138803124	-20796659	+	MTC-int	LTR	MaLR	16	299	-959	4
1643	230	278	0	0	chr3	138803477	138803531	-20796252	+	MTC-int	LTR	MaLR	295	348	-910	4
1643	4806	166	40	25	chr3	138803565	138804288	-20795495	+	MTC-int	LTR	MaLR	332	1064	-194	4
1643	4806	166	40	25	chr3	138804800	138804979	-20794804	+	MTC-int	LTR	MaLR	1069	1257	-1	4
205	726	278	5	62	chr3	138805060	138805252	-20794531	-	MTEa	LTR	MaLR	-196	183	3	4
1644	384	349	17	11	chr3	138806368	138806545	-20793238	+	MLT1D	LTR	MaLR	310	487	-18	4
1644	252	289	55	47	chr3	138808496	138808623	-20791160	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	281	4
1644	271	346	107	62	chr3	138813056	138813281	-20786502	+	MLT1J	LTR	MaLR	230	464	-48	4
1644	242	335	70	54	chr3	138813598	138813784	-20785999	+	MLT1L	LTR	MaLR	210	398	-212	4
1644	1277	137	26	40	chr3	138814425	138814653	-20785130	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	251	4
1644	1566	126	40	4	chr3	138817933	138818181	-20781602	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	1592	4
1644	4215	119	94	9	chr3	138818337	138819082	-20780701	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1040	808	1	4
1644	1145	275	29	118	chr3	138821209	138821625	-20778158	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	4
1644	4095	53	6	0	chr3	138822072	138822544	-20777239	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	4
1644	620	280	187	31	chr3	138823986	138824307	-20775476	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	373	3	5
1644	1978	219	25	7	chr3	138829491	138829876	-20769907	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	31	5
1644	579	174	37	29	chr3	138830315	138830451	-20769332	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	139	-235	5
1644	1934	111	0	115	chr3	138830465	138830822	-20768961	+	ORR1A4	LTR	MaLR	12	327	-2	5
1644	1046	247	13	34	chr3	138830824	138831063	-20768720	+	ORR1D2	LTR	MaLR	137	370	0	5
1644	832	149	7	28	chr3	138833783	138833928	-20765855	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	393	5
1644	1204	223	15	31	chr3	138833946	138834195	-20765588	-	RMER5	LTR	ERV1	-275	259	14	5
1644	2126	155	6	3	chr3	138834378	138834715	-20765068	-	MTC	LTR	MaLR	-83	338	1	5
1644	610	248	112	92	chr3	138835785	138836280	-20763503	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	568	1	5
1644	236	235	78	161	chr3	138837557	138837800	-20761983	-	RMER10A	LTR	ERVL	-15	427	205	5
1644	3996	61	40	11	chr3	138838003	138838547	-20761236	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	5
1644	2047	185	55	80	chr3	138839187	138839640	-20760143	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	442	-87	5
1644	374	119	60	0	chr3	138839828	138839895	-20759888	+	RLTR24	LTR	ERV1	459	529	0	5
1644	3889	153	69	7	chr3	138840677	138841030	-20758753	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	368	-352	5
1644	3889	153	69	7	chr3	138841061	138841385	-20758398	+	RMER6D	LTR	ERVK	369	720	0	5
1644	386	278	86	99	chr3	138849525	138849920	-20749863	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	390	0	5
1644	433	311	82	64	chr3	138854111	138854341	-20745442	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-30	597	262	5
1644	235	190	29	147	chr3	138854593	138854661	-20745122	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-567	60	1	5
1644	3047	144	72	2	chr3	138861122	138861207	-20738576	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-4	564	479	5
1644	3047	144	72	2	chr3	138861253	138861694	-20738089	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-90	478	2	5
1644	3885	142	41	46	chr3	138861934	138862694	-20737089	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	5
1644	533	29	0	0	chr3	138873382	138873451	-20726332	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	69	-277	5
1644	862	45	54	0	chr3	138873450	138873562	-20726221	+	ORR1A1	LTR	MaLR	229	346	0	5
1644	2204	107	22	0	chr3	138875676	138875994	-20723789	+	ORR1A2	LTR	MaLR	3	327	0	5
1644	5846	200	36	23	chr3	138876280	138877486	-20722297	-	MTC-int	LTR	MaLR	-21	1237	16	5
1644	1540	165	171	30	chr3	138877493	138877855	-20721928	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	5
1644	1769	240	132	70	chr3	138881756	138882694	-20717089	-	RMER12	LTR	ERVK	-192	1212	1	5
1644	269	261	0	0	chr3	138885190	138885259	-20714524	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2330	2398	-3739	5
1644	390	313	65	65	chr3	138885271	138885486	-20714297	+	RLTR12A	LTR	ERVK	14	228	-340	5
1644	439	331	55	7	chr3	138887447	138887593	-20712190	-	RMER13A	LTR	ERVK	-11	849	697	6
1644	237	386	16	25	chr3	138890183	138890305	-20709478	-	LTR88c	LTR	Genie?	-105	757	637	6
1644	1286	249	40	93	chr3	138891860	138892258	-20707525	-	RMER15	LTR	ERVL	-168	407	31	6
1644	306	308	0	28	chr3	138892297	138892404	-20707379	-	RMER15	LTR	ERVL	-471	104	1	6
1644	3151	137	6	26	chr3	138894122	138894654	-20705129	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	521	-3	6
1644	2532	52	64	9	chr3	138908655	138908983	-20690800	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
1644	1432	133	40	0	chr3	138920903	138921128	-20678655	-	RMER6C	LTR	ERVK	-456	234	1	6
1644	258	279	52	43	chr3	138922309	138922398	-20677385	-	LTRIS3	LTR	ERV1	-66	446	357	6
1644	1083	188	129	58	chr3	138922398	138922708	-20677075	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	6
1644	1243	198	55	15	chr3	138922708	138923051	-20676732	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	0	6481	6125	6
1644	1421	127	97	27	chr3	138923068	138923385	-20676398	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-342	7338	6965	6
1644	1260	135	108	0	chr3	138923388	138923610	-20676173	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1290	5252	5007	6
1644	317	175	0	0	chr3	138923610	138923667	-20676116	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6039	503	447	6
1644	583	239	193	9	chr3	138923895	138924123	-20675660	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-5474	663	394	6
1644	666	201	104	0	chr3	138924099	138924253	-20675530	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4903	503	334	6
1644	749	141	7	7	chr3	138924250	138924386	-20675397	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6738	843	708	6
1644	2713	112	7	7	chr3	138924489	138924911	-20674872	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7159	422	1	6
1644	1048	188	126	55	chr3	138924911	138925221	-20674562	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	6
1645	1243	154	5	28	chr3	138939842	138940056	-20659727	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	170	6
1645	399	191	21	73	chr3	138940250	138940346	-20659437	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-191	187	97	6
1645	5359	176	182	9	chr3	138940345	138940924	-20658859	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-98	1411	747	6
1645	3436	28	2	0	chr3	138940924	138941319	-20658464	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1645	9257	23	12	1	chr3	138941319	138942405	-20657378	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
1645	3462	25	2	0	chr3	138942405	138942800	-20656983	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1645	5359	176	182	9	chr3	138942800	138943421	-20656362	-	ORR1C1-int	LTR	MaLR	-763	746	3	6
1645	993	206	18	67	chr3	138943421	138943645	-20656138	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	166	6
1645	486	266	15	15	chr3	138943695	138943825	-20655958	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-188	190	61	6
1645	281	344	93	74	chr3	138950257	138950527	-20649256	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	89	6
1645	1095	193	133	23	chr3	138960402	138960710	-20639073	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	972	1575	-217	6
1645	2944	81	27	2	chr3	138965623	138966034	-20633749	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	6
1645	1293	244	62	27	chr3	138970030	138970435	-20629348	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	7
1645	2174	292	117	46	chr3	138970437	138971346	-20628437	+	MTD-int	LTR	MaLR	2	974	-284	7
1645	290	392	80	15	chr3	138973629	138973953	-20625830	+	LTR40b	LTR	ERVL	70	414	-48	7
1645	350	265	317	24	chr3	138981001	138981283	-20618500	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	365	0	7
1645	1543	155	83	0	chr3	138986494	138986772	-20613011	+	MTC-int	LTR	MaLR	485	785	-473	7
1645	699	175	34	62	chr3	138987269	138987446	-20612337	+	MTC-int	LTR	MaLR	1083	1254	-4	7
1645	648	132	79	0	chr3	138987452	138987566	-20612217	+	MTC	LTR	MaLR	3	125	-296	7
1645	348	191	0	0	chr3	138987563	138987626	-20612157	+	MTD	LTR	MaLR	356	418	-1	7
1645	337	279	208	22	chr3	138992474	138992657	-20607126	-	LTR50	LTR	ERVL	-114	681	465	7
1645	286	233	0	0	chr3	138995491	138995551	-20604232	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-42	366	307	7
1645	225	254	18	0	chr3	139003818	139003873	-20595910	+	RMER15	LTR	ERVL	505	560	-15	4
1645	1251	216	113	25	chr3	139004620	139004810	-20594973	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-28	356	167	6
1645	1251	216	113	25	chr3	139004974	139005110	-20594673	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-218	166	1	6
1645	558	269	13	147	chr3	139015733	139015964	-20583819	+	MTEa	LTR	MaLR	27	226	-153	1
1645	3032	153	98	11	chr3	139018037	139018352	-20581431	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	327	2
1645	3032	153	98	11	chr3	139018372	139018689	-20581094	-	RMER6C	LTR	ERVK	-364	326	3	2
1645	1629	144	37	134	chr3	139018694	139019103	-20580680	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-192	369	1	2
1645	1183	266	82	112	chr3	139022836	139023436	-20576347	-	RMER13A	LTR	ERVK	-278	582	1	3
1645	375	331	50	0	chr3	139042935	139043056	-20556727	-	MLT1C	LTR	MaLR	-8	459	333	4
1645	407	368	84	19	chr3	139043039	139043465	-20556318	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1115	620	167	4
1645	254	262	128	23	chr3	139043637	139043723	-20556060	-	MLT1C	LTR	MaLR	-67	341	247	4
1645	244	364	29	52	chr3	139045667	139045803	-20553980	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1318	262	130	5
1645	3141	176	43	14	chr3	139046956	139047580	-20552203	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	5
1645	2734	202	63	34	chr3	139061300	139062016	-20537767	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	6
1645	640	311	138	36	chr3	139065412	139065691	-20534092	+	MLT1E2	LTR	MaLR	111	429	-198	7
1645	1811	201	127	70	chr3	139065691	139065714	-20534069	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	581	7
1645	1811	201	127	70	chr3	139065815	139066359	-20533424	-	MT2B	LTR	ERVL	-21	580	2	7
1645	640	311	138	36	chr3	139066359	139066412	-20533371	+	MLT1E2	LTR	MaLR	430	477	-150	7
1646	1439	149	18	25	chr3	139069619	139069884	-20529899	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-189	368	108	8
1646	1439	149	18	25	chr3	139069931	139069948	-20529835	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-450	107	88	8
1646	4589	160	54	10	chr3	139071635	139072499	-20527284	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	8
1646	305	221	392	36	chr3	139073441	139073579	-20526204	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-187	197	3	8
1646	1652	220	75	0	chr3	139073629	139074016	-20525767	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	4	9
1646	505	314	36	18	chr3	139076311	139076532	-20523251	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	217	-202	9
1646	443	242	41	174	chr3	139080849	139081044	-20518739	+	MTE2b	LTR	MaLR	211	379	0	9
1646	279	349	99	61	chr3	139083463	139083805	-20515978	+	MTEa	LTR	MaLR	19	373	-6	1
1646	1891	148	59	56	chr3	139087811	139088168	-20511615	+	ORR1B1	LTR	MaLR	37	394	0	1
1646	8982	154	48	77	chr3	139088168	139090187	-20509596	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	1961	-2	1
1646	837	187	33	0	chr3	139090189	139090339	-20509444	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	195	-199	1
1646	483	96	0	0	chr3	139090498	139090571	-20509212	+	ORR1B1	LTR	MaLR	322	394	0	1
1646	3117	42	37	3	chr3	139103428	139103811	-20495972	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1646	324	294	140	66	chr3	139110479	139110655	-20489128	+	MLT1E2	LTR	MaLR	11	188	-439	1
1646	324	309	256	54	chr3	139110736	139111110	-20488673	+	MLT1E2	LTR	MaLR	189	650	-4	1
1646	778	256	53	5	chr3	139111197	139111405	-20488378	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	160	1
1646	1556	234	12	80	chr3	139113922	139114335	-20485448	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	227	1
1646	1277	191	24	87	chr3	139114355	139114653	-20485130	-	RMER19C	LTR	ERVK	-332	279	1	1
1646	248	224	55	66	chr3	139129857	139129948	-20469835	+	RMER21A	LTR	ERV1	797	886	-61	1
1646	518	264	29	0	chr3	139137143	139137283	-20462500	+	LTR41B	LTR	ERVL	8	151	-607	1
1646	3349	33	2	0	chr3	139146402	139146797	-20452986	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1646	236	361	68	4	chr3	139149163	139149334	-20450449	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	467	274	1
1646	1537	258	33	8	chr3	139155267	139155661	-20444122	+	MTD	LTR	MaLR	13	416	-3	1
1646	282	311	33	8	chr3	139160099	139160219	-20439564	-	MER77	LTR	ERVL	0	607	485	2
1646	439	310	115	68	chr3	139168230	139168569	-20431214	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	1	2
1646	274	200	186	0	chr3	139169393	139169463	-20430320	+	RMER5	LTR	ERV1	452	534	0	2
1646	267	283	43	11	chr3	139188965	139189058	-20410725	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-238	127	32	2
1647	232	358	9	44	chr3	139201870	139201984	-20397799	-	MLT1J	LTR	MaLR	-60	452	343	2
1647	1778	209	48	31	chr3	139207249	139207663	-20392120	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1647	2010	113	86	0	chr3	139210355	139210656	-20389127	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1647	4707	173	114	31	chr3	139210656	139211768	-20388015	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1204	-759	2
1647	2062	118	9	58	chr3	139213842	139214185	-20385598	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	2
1647	1241	274	63	11	chr3	139214753	139215103	-20384680	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	3	2
1647	446	320	50	59	chr3	139219326	139219545	-20380238	+	MTEb	LTR	MaLR	1	217	-162	2
1647	602	311	104	26	chr3	139220329	139220676	-20379107	+	RMER20B	LTR	ERVK	216	589	-38	2
1647	3271	44	3	0	chr3	139222984	139223368	-20376415	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	2
1647	20616	47	5	6	chr3	139223368	139226080	-20373703	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	0	7513	4804	2
1647	2490	151	10	19	chr3	139226080	139226759	-20373024	-	IAPEy-int	LTR	ERVK	-6455	1058	1	2
1647	3305	39	3	0	chr3	139226759	139227143	-20372640	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	2
1647	791	270	35	38	chr3	139235646	139235989	-20363794	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	342	-17	2
1647	2775	91	79	2	chr3	139236451	139236894	-20362889	-	RLTR44C	LTR	ERVK	-25	477	1	2
1647	430	150	13	161	chr3	139245276	139245506	-20354277	+	RMER17C	LTR	ERVK	80	275	-135	2
1647	320	340	31	1	chr3	139256228	139256362	-20343421	+	MLT2B1	LTR	ERVL	403	546	-8	3
1647	625	279	145	40	chr3	139257575	139257851	-20341932	+	MTEb	LTR	MaLR	3	307	-72	3
1647	300	317	105	80	chr3	139258028	139258391	-20341392	-	MLT1B	LTR	MaLR	-18	372	1	3
1647	383	259	13	115	chr3	139258654	139258670	-20341113	+	MT2B	LTR	ERVL	154	212	-389	3
1647	383	259	13	115	chr3	139258792	139258811	-20340972	+	MT2B	LTR	ERVL	213	294	-307	3
1647	378	208	50	50	chr3	139258914	139259015	-20340768	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	103	-256	3
1647	225	267	102	55	chr3	139259049	139259176	-20340607	+	ORR1E	LTR	MaLR	238	370	0	3
1647	949	260	154	12	chr3	139259546	139259889	-20339894	+	MTD	LTR	MaLR	13	404	-15	3
1647	454	380	99	59	chr3	139260049	139260386	-20339397	-	LTR40a	LTR	ERVL	-38	481	141	3
1647	454	380	99	59	chr3	139260608	139260695	-20339088	-	LTR40a	LTR	ERVL	-379	140	40	3
1647	254	310	0	0	chr3	139262079	139262150	-20337633	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-37	371	301	3
1647	295	296	107	47	chr3	139262168	139262317	-20337466	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-170	238	81	3
1647	404	275	9	38	chr3	139263337	139263443	-20336340	+	MTEa	LTR	MaLR	5	107	-272	3
1647	411	205	4	176	chr3	139269321	139269560	-20330223	+	MurERV4-int	LTR	ERVK	4822	4979	-281	3
1647	2449	136	30	11	chr3	139269591	139270029	-20329754	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2727	3172	-5	3
1647	3415	175	52	13	chr3	139270033	139270396	-20329387	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	380	-340	3
1647	3415	175	52	13	chr3	139270435	139270761	-20329022	+	RMER6D	LTR	ERVK	381	717	-3	3
1647	2938	160	78	170	chr3	139270802	139271795	-20327988	-	RLTR13D6	LTR	ERVK	0	902	1	3
1647	921	246	179	40	chr3	139277662	139277963	-20321820	+	RMER20B	LTR	ERVK	51	393	-234	3
1647	442	270	29	14	chr3	139283337	139283476	-20316307	+	LTR37A	LTR	ERV1	198	338	-88	3
1647	2515	65	9	0	chr3	139286575	139286899	-20312884	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1647	569	345	69	53	chr3	139290283	139290773	-20309010	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-62	498	1	3
1647	254	182	186	29	chr3	139297782	139297884	-20301899	-	MER34A1	LTR	ERV1	-8	579	462	3
1647	1168	212	40	22	chr3	139306279	139306554	-20293229	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	280	-94	4
1647	1871	106	40	7	chr3	139306989	139307265	-20292518	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	285	-41	4
1647	359	127	0	0	chr3	139307681	139307736	-20292047	+	ORR1A3	LTR	MaLR	272	326	0	4
1647	1420	181	97	76	chr3	139313636	139314006	-20285777	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1647	1605	159	181	0	chr3	139322420	139322740	-20277043	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1647	533	295	212	15	chr3	139325270	139325586	-20274197	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	8	4
1647	1312	329	93	43	chr3	139327544	139328234	-20271549	+	MER21B	LTR	ERV1	42	765	-98	4
1648	301	297	0	73	chr3	139338267	139338376	-20261407	-	RMER12	LTR	ERVK	-476	846	746	4
1648	330	242	91	95	chr3	139342560	139342578	-20257205	+	RLTR21	LTR	ERVK	1013	1027	-545	4
1648	330	242	91	95	chr3	139342763	139343040	-20256743	+	RLTR21	LTR	ERVK	1028	1306	-266	4
1648	2665	141	7	39	chr3	139347289	139347753	-20252030	-	RMER16	LTR	ERVK	-84	449	1	4
1648	9209	110	18	5	chr3	139347753	139349128	-20250655	-	RMER16-int	LTR	ERVK	0	5406	4014	4
1648	558	304	28	39	chr3	139356988	139357272	-20242511	-	RLTR15	LTR	ERVK	-65	294	14	4
1648	842	280	54	19	chr3	139357410	139357731	-20242052	-	MTE2b	LTR	MaLR	-10	369	1	4
1648	555	336	63	19	chr3	139358152	139358489	-20241294	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-12	353	1	4
1648	542	324	39	10	chr3	139375794	139376000	-20223783	+	MLT1C	LTR	MaLR	133	344	-123	5
1648	544	301	88	61	chr3	139385438	139385767	-20214016	-	MLT1C	LTR	MaLR	-129	338	1	5
1648	1981	123	35	3	chr3	139394656	139394966	-20204817	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-7	320	1	5
1648	292	316	123	0	chr3	139398003	139398041	-20201742	-	MLT1B	LTR	MaLR	-12	378	338	5
1648	292	316	123	0	chr3	139398088	139398163	-20201620	-	MLT1B	LTR	MaLR	-53	337	252	5
1648	322	325	61	61	chr3	139405150	139405314	-20194469	-	MLT2D	LTR	ERVL	-62	352	189	5
1648	662	328	114	3	chr3	139405331	139405637	-20194146	+	MLT1A0	LTR	MaLR	26	365	0	5
1648	407	288	53	27	chr3	139405637	139405785	-20193998	-	MLT2D	LTR	ERVL	-260	154	3	5
1648	279	287	31	21	chr3	139412174	139412270	-20187513	-	MER77	LTR	ERVL	-92	515	419	5
1648	2900	140	71	10	chr3	139412305	139412840	-20186943	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	433	983	0	5
1648	430	293	36	24	chr3	139412963	139413150	-20186633	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	378	188	5
1648	1057	327	65	54	chr3	139413731	139414284	-20185499	+	MLT1E2	LTR	MaLR	34	592	-35	5
1648	532	285	78	39	chr3	139414905	139415135	-20184648	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-6	648	410	5
1648	2605	80	68	24	chr3	139419220	139419603	-20180180	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1648	1421	244	90	16	chr3	139425944	139426332	-20173451	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	5
1648	1369	256	86	57	chr3	139427638	139428185	-20171598	-	MTC-int	LTR	MaLR	-23	1235	673	5
1648	263	318	62	16	chr3	139429875	139430003	-20169780	-	LTR48B	LTR	ERV1	-140	647	514	5
1648	446	294	68	0	chr3	139430021	139430184	-20169599	-	LTR48B	LTR	ERV1	-348	296	123	5
1648	1035	283	50	24	chr3	139432023	139432381	-20167402	-	MTD	LTR	MaLR	-4	415	5	5
1648	429	390	72	74	chr3	139433238	139433709	-20166074	-	MER74A	LTR	ERVL	-65	493	24	5
1648	350	294	119	53	chr3	139442109	139442335	-20157448	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-38	522	282	6
1648	337	309	89	93	chr3	139449504	139449761	-20150022	+	MLT1B	LTR	MaLR	93	348	-42	6
1648	302	245	72	111	chr3	139450986	139451193	-20148590	-	RLTR40	LTR	ERVK	-50	767	569	6
1648	448	287	211	16	chr3	139451290	139451574	-20148209	+	MER34	LTR	ERV1	5	344	-198	6
1649	1372	325	22	28	chr3	139460732	139461194	-20138589	+	MT2A	LTR	ERVL	5	463	-70	6
1649	1056	328	169	17	chr3	139465224	139465321	-20134462	+	MER21B	LTR	ERV1	15	113	-750	6
1649	1056	328	169	17	chr3	139465374	139465986	-20133797	+	MER21B	LTR	ERV1	114	831	-32	6
1649	1740	156	57	9	chr3	139466025	139466356	-20133427	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	33	6
1649	262	348	65	38	chr3	139468874	139469059	-20130724	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	190	-169	6
1649	1409	229	132	85	chr3	139469931	139470471	-20129312	+	RMER4B	LTR	ERVK	19	583	-2	6
1649	3386	25	5	8	chr3	139472811	139473208	-20126575	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1649	4710	181	76	30	chr3	139473529	139474307	-20125476	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	820	-208	6
1649	4710	181	76	30	chr3	139474354	139474557	-20125226	+	RLTR25B	LTR	ERVK	821	1028	0	6
1649	4336	4	0	66	chr3	139475501	139476029	-20123754	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	6
1649	347	289	173	19	chr3	139478579	139478787	-20120996	-	ORR1E	LTR	MaLR	-22	337	98	6
1649	632	307	163	24	chr3	139491188	139491612	-20108171	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	23	6
1649	2861	39	129	0	chr3	139497647	139498011	-20101772	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	0	411	1	6
1649	3067	112	19	37	chr3	139512358	139512842	-20086941	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	1	2
1649	502	338	163	7	chr3	139518190	139518491	-20081292	+	MLT1A0	LTR	MaLR	18	365	0	3
1649	273	354	60	55	chr3	139534873	139535046	-20064737	+	MLT1G1	LTR	MaLR	79	247	-302	5
1649	301	378	60	12	chr3	139535190	139535356	-20064427	+	MLT1G1	LTR	MaLR	404	577	-2	5
1649	837	233	234	43	chr3	139538204	139538554	-20061229	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	5
1649	1866	198	100	80	chr3	139538949	139539448	-20060335	-	RMER20B	LTR	ERVK	-118	509	1	5
1649	1983	193	54	17	chr3	139542032	139542438	-20057345	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	6
1649	494	279	134	67	chr3	139543119	139543388	-20056395	-	MLT1B	LTR	MaLR	-72	318	32	6
1649	2412	178	27	69	chr3	139545336	139545928	-20053855	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	6
1649	975	253	59	46	chr3	139551761	139552067	-20047716	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	110	7
1649	661	150	17	17	chr3	139552277	139552392	-20047391	-	MTD	LTR	MaLR	-299	120	6	7
1649	239	288	55	0	chr3	139565360	139565433	-20034350	+	MLT1C	LTR	MaLR	8	84	-383	8
1649	1655	203	70	16	chr3	139565530	139565813	-20033970	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	100	8
1649	4014	58	18	4	chr3	139565813	139566318	-20033465	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	8
1649	1655	203	70	16	chr3	139566318	139566404	-20033379	-	MTD	LTR	MaLR	-320	99	14	8
1649	340	330	65	75	chr3	139566415	139566690	-20033093	-	ORR1E	LTR	MaLR	-87	283	9	8
1649	2579	198	95	23	chr3	139566709	139567414	-20032369	+	RLTR25B	LTR	ERVK	7	762	-266	8
1649	878	186	3	220	chr3	139567834	139567914	-20031869	+	RLTR25B	LTR	ERVK	759	818	-210	8
1649	878	186	3	220	chr3	139568251	139568515	-20031268	+	RLTR25B	LTR	ERVK	819	1028	0	8
1649	267	322	43	17	chr3	139568604	139568721	-20031062	+	MLT1C	LTR	MaLR	340	459	-8	8
1649	272	348	11	52	chr3	139571355	139571568	-20028215	+	RMER4B	LTR	ERVK	8	214	-371	9
1649	1643	167	90	3	chr3	139571893	139572207	-20027576	-	RMER4B	LTR	ERVK	-212	373	43	9
1649	1643	167	90	3	chr3	139572255	139572283	-20027500	-	RMER4B	LTR	ERVK	-543	42	2	9
1649	358	254	137	31	chr3	139574212	139574410	-20025373	-	LTR48B	LTR	ERV1	-419	368	122	1
1649	507	281	96	46	chr3	139579195	139579395	-20020388	-	MTD	LTR	MaLR	-22	397	207	1
1649	4176	126	42	21	chr3	139579660	139580398	-20019385	-	RMER17A	LTR	ERVK	-7	744	6	1
1649	525	313	48	12	chr3	139580441	139580606	-20019177	-	MTD	LTR	MaLR	-231	188	18	1
1649	1065	279	98	6	chr3	139581448	139581784	-20017999	-	MTE2b	LTR	MaLR	-12	367	1	1
1649	254	369	62	62	chr3	139581784	139581962	-20017821	+	MTE2b	LTR	MaLR	188	365	-14	1
1649	742	160	15	8	chr3	139582203	139582335	-20017448	+	MT2A	LTR	ERVL	1	133	-400	1
1649	764	259	19	35	chr3	139582328	139582626	-20017157	+	MT2A	LTR	ERVL	92	542	-59	1
1649	1915	178	101	30	chr3	139582825	139583318	-20016465	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	528	0	1
1649	237	362	78	0	chr3	139584120	139584236	-20015547	+	MLT1G1	LTR	MaLR	13	137	-442	1
1649	264	304	25	0	chr3	139584492	139584571	-20015212	+	MLT1G1	LTR	MaLR	457	537	-42	1
1649	2671	35	9	0	chr3	139587142	139587482	-20012301	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	-41	767	425	1
1649	3401	67	8	180	chr3	139589237	139589855	-20009928	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	1
1649	1197	154	102	82	chr3	139589856	139590301	-20009482	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	2	378	-7178	1
1649	1411	155	118	106	chr3	139590272	139590677	-20009106	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	264	673	-2626	1
206	7673	128	58	46	chr3	139590730	139592815	-20006968	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1557	3299	0	1
1650	2581	46	3	3	chr3	139592815	139593141	-20006642	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	326	-186	1
1650	343	291	83	83	chr3	139593132	139593162	-20006621	+	RLTR1B	LTR	ERV1	359	388	-199	1
1650	1366	96	23	13	chr3	139593280	139593478	-20006305	+	RLTR1B	LTR	ERV1	319	587	0	1
1650	3643	81	87	17	chr3	139594314	139594841	-20004942	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	1
1650	471	399	75	15	chr3	139596057	139596513	-20003270	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-61	499	17	1
1650	291	305	198	19	chr3	139599683	139599840	-19999943	-	RMER15	LTR	ERVL	-90	485	301	1
1650	247	364	7	36	chr3	139606523	139606660	-19993123	+	MER57F	LTR	ERV1	15	147	-289	1
1650	855	273	62	33	chr3	139607508	139607928	-19991855	+	LTR48B	LTR	ERV1	122	747	-40	1
1650	2011	177	60	23	chr3	139608870	139609268	-19990515	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	5	1
1650	1535	157	188	3	chr3	139609626	139609814	-19989969	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	167	1
1650	1535	157	188	3	chr3	139609932	139610062	-19989721	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-212	166	2	1
1650	804	270	139	21	chr3	139615792	139616123	-19983660	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	370	-4	1
1650	353	346	70	95	chr3	139618023	139618307	-19981476	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-27	533	257	1
1650	727	330	89	9	chr3	139622622	139622970	-19976813	+	MLT2B1	LTR	ERVL	5	380	-140	1
1650	841	330	63	73	chr3	139625349	139625765	-19974018	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	405	-14	1
1650	1788	211	40	0	chr3	139628301	139628652	-19971131	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	3	1
1650	528	186	80	0	chr3	139630727	139630840	-19968943	-	MER57A-int	LTR	ERV1	-267	5920	5799	1
1650	548	308	63	13	chr3	139632291	139632528	-19967255	-	MER34A1	LTR	ERV1	-335	252	4	1
1650	465	258	24	50	chr3	139636182	139636337	-19963446	+	ORR1E	LTR	MaLR	211	419	-2	1
1650	1879	311	36	55	chr3	139636337	139637134	-19962649	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	2	783	-587	1
1650	331	0	0	0	chr3	139637542	139637581	-19962202	+	IAPLTR4	LTR	ERVK	1	39	-306	1
1650	3302	73	0	0	chr3	139637582	139637990	-19961793	+	IAPLTR3-int	LTR	ERVK	6394	6801	-20	1
1650	1389	161	126	13	chr3	139637990	139638292	-19961491	+	IAPLTR4	LTR	ERVK	1	465	-10	1
1650	584	348	9	33	chr3	139638318	139638532	-19961251	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	879	1087	-493	1
1650	232	366	52	30	chr3	139640236	139640371	-19959412	+	MLT1L	LTR	MaLR	417	554	-56	1
1650	643	270	45	52	chr3	139640938	139641247	-19958536	+	RLTR15	LTR	ERVK	49	355	-4	1
1650	1926	138	21	56	chr3	139641654	139641992	-19957791	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	1
1650	552	280	7	20	chr3	139644724	139644888	-19954895	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	171	2
1650	1800	213	8	51	chr3	139647256	139647651	-19952132	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	2
1650	243	323	29	86	chr3	139658277	139658416	-19941367	+	MLT1E2	LTR	MaLR	333	463	-164	2
1650	339	319	73	89	chr3	139663782	139664030	-19935753	-	MER21B	LTR	ERV1	-150	713	470	2
1650	2561	108	77	3	chr3	139665195	139665382	-19934401	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	3	218	-204	2
1650	2561	108	77	3	chr3	139665428	139665631	-19934152	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	219	422	0	2
1650	336	332	91	67	chr3	139667062	139667272	-19932511	+	LTR33	LTR	ERVL	248	462	-53	2
1650	373	191	11	35	chr3	139668229	139668316	-19931467	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	295	2
1650	288	313	271	10	chr3	139670576	139670779	-19929004	+	MTEb	LTR	MaLR	6	261	-118	2
1650	553	286	11	48	chr3	139670783	139670970	-19928813	-	MLT1B	LTR	MaLR	-44	346	167	2
1650	334	333	38	57	chr3	139673317	139673527	-19926256	+	MLT1C	LTR	MaLR	262	467	0	2
1650	876	300	30	61	chr3	139674590	139674920	-19924863	+	MTE2b	LTR	MaLR	58	377	-2	2
1650	233	228	17	17	chr3	139682210	139682268	-19917515	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1906	1963	0	2
1650	2025	116	3	83	chr3	139682268	139682617	-19917166	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	321	-8	2
1650	2818	39	0	3	chr3	139682901	139683239	-19916544	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	2
1650	55556	22	15	6	chr3	139683239	139689658	-19910125	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	2
1650	2848	36	0	3	chr3	139689658	139689996	-19909787	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	337	0	2
1650	885	276	193	5	chr3	139690395	139690777	-19909006	-	MT2A	LTR	ERVL	-78	455	2	2
1650	669	321	37	66	chr3	139694304	139694654	-19905129	-	MTEb	LTR	MaLR	-39	340	1	2
1650	887	254	99	4	chr3	139694722	139694955	-19904828	+	MTD	LTR	MaLR	144	398	-21	2
1650	869	298	52	130	chr3	139697188	139697589	-19902194	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	2
1650	1885	165	3	60	chr3	139711595	139711944	-19887839	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
1650	2051	203	39	183	chr3	139715289	139716000	-19883783	-	RMER19C	LTR	ERVK	-2	609	1	2
1651	4079	169	51	63	chr3	139724252	139725220	-19874563	+	RMER17B	LTR	ERVK	2	957	-1	2
1651	443	296	86	11	chr3	139727920	139728094	-19871689	+	MLT2B2	LTR	ERVL	1	187	-328	3
1651	1230	160	0	109	chr3	139730178	139730444	-19869339	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	93	3
1651	500	215	23	83	chr3	139731903	139732035	-19867748	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-241	153	30	3
1651	537	328	77	54	chr3	139732555	139732868	-19866915	+	MLT1B	LTR	MaLR	7	326	-64	3
1651	943	278	172	6	chr3	139749304	139749623	-19850160	+	MTEa	LTR	MaLR	7	378	-1	3
1651	700	293	151	58	chr3	139749779	139750102	-19849681	+	MT2A	LTR	ERVL	208	577	-24	3
1651	2175	366	91	33	chr3	139754137	139755533	-19844250	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	50	1527	-53	3
1651	297	291	129	10	chr3	139755533	139755663	-19844120	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	141	-229	3
1651	1179	194	109	36	chr3	139755713	139756059	-19843724	+	ORR1C2	LTR	MaLR	24	384	0	3
1651	1438	274	99	76	chr3	139757842	139758072	-19841711	+	RMER15	LTR	ERVL	27	230	-345	3
1651	1438	274	99	76	chr3	139758165	139758471	-19841312	+	RMER15	LTR	ERVL	231	575	0	3
1651	761	275	119	8	chr3	139761520	139761773	-19838010	+	RMER15	LTR	ERVL	286	566	-9	3
1651	372	335	39	6	chr3	139768472	139768628	-19831155	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	161	-204	3
1651	494	316	68	148	chr3	139774930	139775330	-19824453	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	370	0	3
1651	841	250	86	45	chr3	139777976	139778028	-19821755	-	MTD	LTR	MaLR	-149	270	221	3
1651	403	280	103	135	chr3	139778028	139778407	-19821376	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	2	3
1651	841	250	86	45	chr3	139778407	139778597	-19821186	-	MTD	LTR	MaLR	-199	220	18	3
1651	2519	69	57	20	chr3	139782973	139783327	-19816456	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1651	8197	83	56	54	chr3	139783327	139784631	-19815152	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	1313	-5168	3
1651	29507	19	1	1	chr3	139784630	139787902	-19811881	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3210	6479	-2	3
1651	2519	69	57	20	chr3	139787904	139788258	-19811525	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1651	3542	154	87	0	chr3	139792804	139793357	-19806426	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	3
1651	278	274	45	61	chr3	139793528	139793660	-19806123	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-47	472	343	3
1651	556	300	77	47	chr3	139794231	139794622	-19805161	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	390	1	3
1651	1991	130	39	0	chr3	139797532	139797839	-19801944	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	3
1651	4920	170	104	11	chr3	139797843	139799133	-19800650	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1	1434	-358	3
1651	2441	133	5	15	chr3	139799621	139800017	-19799766	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1572	1963	0	3
1651	2386	129	3	0	chr3	139800017	139800343	-19799440	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1651	471	151	0	0	chr3	139801331	139801404	-19798379	+	RLTR9C	LTR	ERVK	321	393	0	3
1651	1629	185	71	57	chr3	139801991	139802183	-19797600	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-5	373	178	3
1651	1629	185	71	57	chr3	139802273	139802447	-19797336	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-201	177	4	3
1651	809	326	63	36	chr3	139818647	139818981	-19780802	-	ORR1E	LTR	MaLR	-10	349	7	3
1651	375	320	38	25	chr3	139819155	139819315	-19780468	+	LTR48B	LTR	ERV1	136	297	-347	4
1651	394	262	174	0	chr3	139828569	139828718	-19771065	+	LTR79	LTR	ERVL	350	524	-3	4
1651	402	221	100	58	chr3	139832309	139832429	-19767354	-	RMER10A	LTR	ERVL	-317	125	1	4
1651	2855	115	14	5	chr3	139833169	139833613	-19766170	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	576	1023	0	4
1651	961	236	217	10	chr3	139834089	139834393	-19765390	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	367	-3	4
1651	635	265	59	33	chr3	139836967	139837283	-19762500	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	18	4
1651	307	311	9	9	chr3	139837318	139837425	-19762358	-	MTD-int	LTR	MaLR	-10	1248	1142	4
1651	1701	205	21	49	chr3	139838529	139838918	-19760865	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
1651	436	381	83	40	chr3	139839220	139839676	-19760107	-	RMER5	LTR	ERV1	-13	521	46	4
1651	2327	185	5	2	chr3	139839995	139840407	-19759376	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	4
1651	2733	72	0	0	chr3	139843442	139843788	-19755995	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	4
1651	1711	128	5	19	chr3	139845504	139845802	-19753981	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-104	296	1	4
1651	506	316	38	42	chr3	139847874	139848112	-19751671	+	LTR84a	LTR	ERVL	55	291	-466	4
1651	551	312	37	16	chr3	139848320	139848509	-19751274	+	LTR84a	LTR	ERVL	534	726	-31	4
1652	366	330	70	51	chr3	139856331	139856545	-19743238	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	191	4
1652	392	269	111	0	chr3	139859229	139859337	-19740446	+	MER34A1	LTR	ERV1	6	125	-462	4
1652	644	323	91	50	chr3	139859418	139859435	-19740348	+	MER34A1	LTR	ERV1	151	165	-422	4
1652	644	323	91	50	chr3	139859795	139860195	-19739588	+	MER34A1	LTR	ERV1	166	587	0	4
1652	466	270	30	35	chr3	139865368	139865537	-19734246	-	RMER15	LTR	ERVL	-68	507	340	4
1652	541	149	97	0	chr3	139865768	139865882	-19733901	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-242	125	1	4
1652	355	346	82	33	chr3	139868269	139868310	-19731473	+	MLT2C1	LTR	ERVL	2	144	-253	4
1652	401	291	17	52	chr3	139868310	139868484	-19731299	+	MLT1E3	LTR	MaLR	64	231	-393	4
1652	355	346	82	33	chr3	139868484	139868514	-19731269	+	MLT2C1	LTR	ERVL	145	258	-139	4
1652	317	333	70	51	chr3	139869875	139870033	-19729750	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-192	173	13	4
1652	1841	154	47	15	chr3	139871033	139871376	-19728407	-	RLTR15	LTR	ERVK	-5	354	1	4
1652	957	259	110	29	chr3	139873405	139873751	-19726032	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	4
1652	621	333	57	29	chr3	139876215	139876530	-19723253	+	RMER15	LTR	ERVL	249	572	-3	4
1652	3088	98	49	4	chr3	139881922	139882082	-19717701	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-2	473	306	4
1652	3088	98	49	4	chr3	139882170	139882462	-19717321	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-170	305	1	4
1652	1320	274	42	26	chr3	139889696	139890078	-19709705	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	5
1652	3259	51	2	5	chr3	139898251	139898648	-19701135	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1652	376	303	95	35	chr3	139903039	139903229	-19696554	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-132	233	47	5
1652	3053	158	68	53	chr3	139903472	139903757	-19696026	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	414	5
1652	3053	158	68	53	chr3	139903804	139904198	-19695585	-	RMER6C	LTR	ERVK	-277	413	1	5
1652	1482	265	7	81	chr3	139924573	139925020	-19674763	+	MTD	LTR	MaLR	6	419	0	5
1652	767	322	45	59	chr3	139931254	139931676	-19668107	+	MER34A1	LTR	ERV1	144	559	-28	5
1652	522	225	18	18	chr3	139937227	139937340	-19662443	+	RMER15	LTR	ERVL	28	140	-435	5
1652	941	333	42	88	chr3	139939608	139939695	-19660088	+	RMER15	LTR	ERVL	153	226	-349	5
1652	941	333	42	88	chr3	139939728	139940074	-19659709	+	RMER15	LTR	ERVL	227	566	-9	5
1652	399	335	329	26	chr3	139942293	139942567	-19657216	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	5
1652	442	304	48	7	chr3	139946779	139946925	-19652858	-	MLT1B	LTR	MaLR	-235	155	4	5
1652	1204	281	86	16	chr3	139954524	139954897	-19644886	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	21	5
1652	1805	183	19	83	chr3	139962241	139962723	-19637060	+	RLTR11B	LTR	ERVK	3	453	0	5
1652	2351	157	35	117	chr3	139973394	139973668	-19626115	-	RLTR21	LTR	ERVK	0	1572	1304	6
1652	2351	157	35	117	chr3	139973713	139973802	-19625981	-	RLTR21	LTR	ERVK	-269	1303	1205	6
1652	6431	158	54	48	chr3	139973851	139975207	-19624576	-	RLTR21	LTR	ERVK	-267	1305	1	6
1652	262	298	71	0	chr3	139977945	139978029	-19621754	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-2	652	563	6
1652	247	318	217	19	chr3	139978076	139978233	-19621550	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-194	486	299	6
1652	273	362	0	9	chr3	139978832	139978938	-19620845	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-381	139	35	6
1653	779	310	60	47	chr3	139995502	139995803	-19603980	+	MTE2a	LTR	MaLR	57	361	-18	6
1653	277	242	0	16	chr3	139998196	139998259	-19601524	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	306	6
1653	781	319	38	4	chr3	139999065	139999304	-19600479	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-11	359	113	6
1653	268	257	40	79	chr3	140004064	140004140	-19595643	-	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	-586	227	155	3
1653	1059	119	54	0	chr3	140020482	140020649	-19579134	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	715	2
1653	834	179	25	13	chr3	140020649	140020807	-19578976	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	1	160	-417	2
1653	362	82	0	0	chr3	140020776	140020825	-19578958	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	424	472	-105	2
1653	3345	191	59	16	chr3	140020829	140021519	-19578264	-	RMER19B	LTR	ERVK	-182	720	1	2
1653	649	357	109	19	chr3	140030222	140030533	-19569250	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	349	-10	3
1653	264	309	50	40	chr3	140031502	140031603	-19568180	+	MTEa	LTR	MaLR	274	375	-4	4
1653	1625	197	16	3	chr3	140032667	140032972	-19566811	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	4
1653	1641	169	43	3	chr3	140034620	140034923	-19564860	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-14	315	1	5
1653	243	32	0	0	chr3	140039119	140039150	-19560633	+	RMER19C	LTR	ERVK	581	611	0	6
1653	2741	30	0	45	chr3	140039995	140040348	-19559435	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	6
1653	55334	23	18	3	chr3	140040348	140046727	-19553056	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	8	6
1653	2741	30	0	45	chr3	140046727	140047080	-19552703	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	6
1653	1336	314	36	24	chr3	140064518	140064968	-19534815	+	MT2A	LTR	ERVL	5	459	-74	8
1653	524	107	13	0	chr3	140076599	140076674	-19523109	+	BGLII	LTR	ERVK	1	76	-345	9
1653	920	90	0	0	chr3	140076669	140076791	-19522992	+	BGLII	LTR	ERVK	300	421	0	9
1653	373	350	53	15	chr3	140086498	140086789	-19512994	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-1806	3908	3604	1
1653	3676	130	5	30	chr3	140089700	140089727	-19510056	-	MT2B2	LTR	ERVL	-5	579	553	1
1653	3676	130	5	30	chr3	140089939	140090502	-19509281	-	MT2B2	LTR	ERVL	-32	552	2	1
1653	475	301	54	77	chr3	140093324	140093673	-19506110	-	RLTR15	LTR	ERVK	-18	341	1	1
1653	909	302	144	3	chr3	140101188	140101527	-19498256	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	18	1
1653	657	164	8	45	chr3	140105479	140105613	-19494170	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	-691	2547	2419	1
1653	2934	222	104	123	chr3	140106243	140106851	-19492932	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2461	3676	3235	1
1653	2934	222	104	123	chr3	140106933	140108325	-19491458	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2461	3234	2223	1
1653	1736	252	27	53	chr3	140108446	140108933	-19490850	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	138	1
1653	312	297	65	45	chr3	140109103	140109258	-19490525	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	225	1
1653	407	315	183	9	chr3	140115572	140115796	-19483987	-	RMER15	LTR	ERVL	-14	561	299	1
1654	878	272	37	144	chr3	140118321	140118695	-19481088	-	MTE2a	LTR	MaLR	-37	342	9	1
1654	1492	255	41	9	chr3	140118878	140119218	-19480565	+	MTC	LTR	MaLR	1	351	-70	1
1654	490	298	38	100	chr3	140119234	140119473	-19480310	-	MTD-int	LTR	MaLR	-277	1303	1080	1
1654	627	284	188	110	chr3	140119466	140120031	-19479752	-	MTD-int	LTR	MaLR	-649	609	1	1
1654	603	351	65	22	chr3	140120032	140120423	-19479360	-	MTD	LTR	MaLR	-31	388	3	1
1654	487	398	64	0	chr3	140126051	140126287	-19473496	+	MER54B	LTR	ERVL	503	753	-40	1
1654	381	326	166	35	chr3	140126548	140126837	-19472946	+	MER89	LTR	ERV1	230	556	-3	1
1654	355	188	47	0	chr3	140127736	140127800	-19471983	+	MTC	LTR	MaLR	84	150	-271	1
1654	529	130	0	0	chr3	140129801	140129878	-19469905	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	77	-831	1
1654	1637	173	11	84	chr3	140129877	140130236	-19469547	+	RMER13B	LTR	ERVK	286	618	-290	1
1654	1087	224	111	42	chr3	140130379	140130668	-19469115	+	RMER13B	LTR	ERVK	600	908	0	1
1654	264	336	77	77	chr3	140136634	140136789	-19462994	+	MLT2C1	LTR	ERVL	152	306	-91	1
1654	953	305	76	44	chr3	140143840	140144207	-19455576	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	1
1654	1196	296	79	24	chr3	140145324	140145878	-19453905	-	HERVL74-int	LTR	ERVL	-3817	1868	1284	2
1654	2364	62	66	27	chr3	140146776	140147109	-19452674	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	2
1654	723	221	110	28	chr3	140150256	140150523	-19449260	+	ORR1A4	LTR	MaLR	10	276	-53	2
1654	499	317	18	160	chr3	140172135	140172522	-19427261	-	MER21B	LTR	ERV1	-209	654	323	2
1654	1611	195	96	3	chr3	140182488	140182823	-19416960	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	2
1654	243	325	77	30	chr3	140194942	140195110	-19404673	+	MLT1N2	LTR	MaLR	387	562	0	2
1654	227	333	11	11	chr3	140200769	140200857	-19398926	+	ORR1E	LTR	MaLR	43	130	-229	2
1654	230	308	50	82	chr3	140205595	140205754	-19394029	+	LTR48	LTR	ERV1	6	159	-628	2
1654	1677	210	13	37	chr3	140207097	140207473	-19392310	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1654	1881	269	29	29	chr3	140209942	140210456	-19389327	+	RMER15	LTR	ERVL	44	557	-18	2
1654	327	361	32	0	chr3	140210938	140211093	-19388690	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3643	1353	1194	2
1654	646	369	20	37	chr3	140212261	140212559	-19387224	-	MLT2D	LTR	ERVL	-7	407	115	2
1654	4089	215	95	55	chr3	140212999	140214203	-19385580	+	RLTR21	LTR	ERVK	2	1253	-319	2
1654	361	274	97	46	chr3	140214435	140214630	-19385153	+	RMER12B	LTR	ERVK	1200	1404	0	2
1654	2443	189	70	49	chr3	140215646	140216319	-19383464	-	RMER6C	LTR	ERVK	-3	687	1	2
1654	2221	178	155	45	chr3	140221613	140222231	-19377552	+	RMER6C	LTR	ERVK	5	690	0	2
1654	262	289	139	38	chr3	140225787	140225842	-19373941	+	MER110A	LTR	ERV1	86	153	-315	3
1654	262	289	139	38	chr3	140226238	140226391	-19373392	+	MER110A	LTR	ERV1	154	315	-153	3
1654	891	311	127	9	chr3	140232875	140233206	-19366577	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1654	2216	191	76	15	chr3	140233856	140233948	-19365835	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	480	3
1654	2216	191	76	15	chr3	140234099	140234463	-19365320	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-98	479	93	3
1654	329	338	80	34	chr3	140238858	140239097	-19360686	-	MER110	LTR	ERV1	-194	297	48	3
1655	474	358	69	21	chr3	140255965	140256252	-19343531	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	309	-50	3
1655	3158	175	32	29	chr3	140256580	140257173	-19342610	+	MT2B	LTR	ERVL	7	601	0	3
1655	485	261	39	0	chr3	140257738	140257868	-19341915	+	MLT2C1	LTR	ERVL	1	135	-262	3
1655	494	307	63	18	chr3	140257951	140258173	-19341610	+	MLT1-int	LTR	MaLR	46	277	-1094	3
1655	1364	175	410	17	chr3	140258267	140258519	-19341264	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	342	-348	3
1655	1364	219	223	78	chr3	140258552	140259003	-19340780	+	RMER6C	LTR	ERVK	343	720	0	3
1655	1611	216	183	53	chr3	140260240	140260498	-19339285	+	RMER6C	LTR	ERVK	6	335	-355	3
1655	1611	216	183	53	chr3	140260566	140260913	-19338870	+	RMER6C	LTR	ERVK	336	690	0	3
1655	914	283	142	27	chr3	140273926	140274102	-19325681	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	189	3
1655	914	283	142	27	chr3	140274144	140274305	-19325478	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-196	188	9	3
1655	3923	254	153	21	chr3	140274306	140275512	-19324271	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-5	1365	1	3
1655	1116	273	55	45	chr3	140275512	140275892	-19323891	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
1655	449	306	63	93	chr3	140275983	140276070	-19323713	-	MTEa	LTR	MaLR	-117	262	180	3
1655	449	306	63	93	chr3	140276246	140276428	-19323355	-	MTEa	LTR	MaLR	-200	179	1	3
1655	912	333	58	21	chr3	140281691	140282019	-19317764	-	MTE2b	LTR	MaLR	-37	342	3	3
1655	834	196	53	30	chr3	140288247	140288451	-19311332	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-1	366	154	3
1655	3240	147	67	21	chr3	140289038	140289670	-19310113	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	96	3
1655	534	184	0	55	chr3	140289686	140289795	-19309988	+	RLTR23	LTR	ERV1	2	104	-326	3
1655	237	321	101	25	chr3	140289788	140289986	-19309797	+	RLTR23	LTR	ERV1	71	283	-147	3
1655	1782	209	128	88	chr3	140290502	140290539	-19309244	-	RMER6C	LTR	ERVK	-1	689	659	3
1655	2275	188	104	65	chr3	140290539	140291200	-19308583	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	687	-3	3
1655	1782	209	128	88	chr3	140291200	140291824	-19307959	-	RMER6C	LTR	ERVK	-32	658	1	3
1655	263	250	24	12	chr3	140292086	140292171	-19307612	+	MTE2a	LTR	MaLR	294	379	0	3
1655	650	272	59	22	chr3	140294571	140294793	-19304990	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	188	4
1655	245	337	118	49	chr3	140295652	140295855	-19303928	+	MLT2F	LTR	ERVL	438	654	-9	4
1655	1262	325	69	78	chr3	140299451	140300214	-19299569	-	MTE-int	LTR	MaLR	-28	1552	674	4
1655	525	369	57	31	chr3	140300718	140300857	-19298926	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1081	499	361	4
1655	525	369	57	31	chr3	140301095	140301305	-19298478	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1220	360	141	4
1655	293	337	21	0	chr3	140302554	140302649	-19297134	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1476	104	8	4
1655	1661	181	261	39	chr3	140320235	140320420	-19279363	+	RMER6C	LTR	ERVK	2	241	-449	4
1655	1661	181	261	39	chr3	140320460	140320838	-19278945	+	RMER6C	LTR	ERVK	242	690	0	4
1655	899	245	136	15	chr3	140324804	140325135	-19274648	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	4	4
1655	239	342	26	13	chr3	140332189	140332266	-19267517	+	MLT1L	LTR	MaLR	3	80	-530	4
1655	3486	20	2	0	chr3	140347840	140348235	-19251548	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1655	9122	33	4	1	chr3	140348235	140349330	-19250453	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
1655	3486	20	2	0	chr3	140349330	140349725	-19250058	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1655	3137	193	5	46	chr3	140354150	140354781	-19245002	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	605	-22	4
1655	1119	335	115	26	chr3	140365049	140365928	-19233855	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3016	2698	1742	4
1655	913	226	81	13	chr3	140365935	140366161	-19233622	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-139	245	1	4
1655	2397	200	82	22	chr3	140366162	140366698	-19233085	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1509	942	4
1655	1076	211	126	34	chr3	140366737	140366934	-19232849	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	186	4
1655	1076	211	126	34	chr3	140367085	140367232	-19232551	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-199	185	7	4
1655	1525	184	101	0	chr3	140374697	140375023	-19224760	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	5
1655	1213	250	78	28	chr3	140376794	140377152	-19222631	-	RLTR14	LTR	ERV1	-4	378	3	5
1656	714	329	82	56	chr3	140379137	140379476	-19220307	+	MTD	LTR	MaLR	6	354	-65	5
1656	714	329	82	56	chr3	140379647	140379693	-19220090	+	MTD	LTR	MaLR	355	402	-17	5
1656	1572	226	67	71	chr3	140379808	140379958	-19219825	+	RMER20A	LTR	ERVK	11	147	-369	5
1656	1572	226	67	71	chr3	140379983	140380338	-19219445	+	RMER20A	LTR	ERVK	148	514	-2	5
1656	1108	190	54	118	chr3	140381563	140381934	-19217849	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	5	5
1656	2098	139	9	3	chr3	140383043	140383368	-19216415	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1656	1746	202	87	3	chr3	140388634	140389002	-19210781	+	MTC	LTR	MaLR	10	408	-13	5
1656	545	364	70	49	chr3	140396636	140397122	-19202661	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-130	497	2	5
1656	507	345	42	48	chr3	140399035	140399387	-19200396	-	ORR1E	LTR	MaLR	-10	369	6	5
1656	1679	213	44	14	chr3	140399521	140399883	-19199900	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	47	5
1656	253	354	44	9	chr3	140404024	140404138	-19195645	-	ORR1E	LTR	MaLR	-236	123	6	5
1656	441	310	68	48	chr3	140422686	140422937	-19176846	+	MER89	LTR	ERV1	172	427	-132	5
1656	4430	10	0	12	chr3	140423491	140423990	-19175793	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1656	302	0	0	0	chr3	140423990	140424028	-19175755	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
1656	350	171	71	35	chr3	140424028	140424113	-19175670	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	5
1656	38667	16	14	0	chr3	140424113	140429387	-19170396	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	14	5
1656	4395	10	0	12	chr3	140429400	140429895	-19169888	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	5	5
1656	348	240	73	0	chr3	140442369	140442465	-19157318	+	MLT1A1	LTR	MaLR	304	406	-2	5
1656	1230	228	109	56	chr3	140445696	140446154	-19153629	-	RMER2	LTR	ERV1	-4	563	39	5
1656	241	306	14	0	chr3	140453889	140453961	-19145822	+	ORR1D-int	LTR	MaLR	266	338	-1032	5
1656	241	306	14	0	chr3	140455540	140455612	-19144171	-	ORR1D-int	LTR	MaLR	-1032	338	266	5
1656	2854	163	19	14	chr3	140457958	140458473	-19141310	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-8	520	3	6
1656	4608	179	55	34	chr3	140462103	140463066	-19136717	-	RLTR13C1	LTR	ERVK	0	983	1	6
1656	3173	117	11	63	chr3	140464198	140464738	-19135045	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
1656	998	207	13	48	chr3	140467742	140468029	-19131754	-	RMER19C	LTR	ERVK	-262	349	1	6
1656	871	135	32	50	chr3	140468029	140468247	-19131536	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	0	5780	5567	6
1656	766	261	188	10	chr3	140475517	140475826	-19123957	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	364	-10	6
1656	3081	257	75	52	chr3	140475905	140476864	-19122919	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	43	1023	-347	6
1656	1225	219	97	12	chr3	140477216	140477535	-19122248	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1025	1370	0	6
1656	329	233	174	8	chr3	140477535	140477656	-19122127	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	141	-233	6
1656	469	283	87	0	chr3	140477702	140477840	-19121943	+	ORR1D1	LTR	MaLR	225	374	0	6
1656	3477	159	80	21	chr3	140487154	140487461	-19112322	+	RMER6A	LTR	ERVK	3	322	-434	6
1656	3477	159	80	21	chr3	140487589	140487993	-19111790	+	RMER6A	LTR	ERVK	323	756	0	6
1656	236	98	48	24	chr3	140499686	140499728	-19100055	+	ORR1D2	LTR	MaLR	13	55	-315	6
1656	581	244	167	11	chr3	140501154	140501328	-19098455	+	ORR1D1	LTR	MaLR	174	374	0	1
1656	364	96	0	0	chr3	140503182	140503234	-19096549	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	52	-638	1
1656	621	234	6	99	chr3	140503197	140503340	-19096443	+	MT2B	LTR	ERVL	133	259	-342	1
1656	368	217	207	21	chr3	140503432	140503625	-19096158	+	RMER6A	LTR	ERVK	277	505	-251	1
1656	2950	192	62	7	chr3	140503635	140504211	-19095572	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	608	-84	1
1656	958	65	0	0	chr3	140504206	140504329	-19095454	+	MTB	LTR	MaLR	278	400	0	1
1656	1426	172	37	15	chr3	140507833	140508104	-19091679	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-7	561	285	1
1656	1380	181	18	11	chr3	140508106	140508379	-19091404	+	RLTR15	LTR	ERVK	56	330	-29	1
1657	704	258	51	118	chr3	140512065	140512514	-19087269	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1752	4798	4380	2
1657	1042	291	85	21	chr3	140523578	140523967	-19075816	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	3	4
1657	1241	282	139	72	chr3	140523971	140524985	-19074798	-	MTD-int	LTR	MaLR	-2	1256	29	4
1657	1317	301	20	15	chr3	140525000	140525392	-19074391	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	26	4
1657	225	404	64	21	chr3	140526883	140527070	-19072713	+	MLT1E2	LTR	MaLR	352	546	-81	4
1657	1778	125	78	13	chr3	140542181	140542490	-19057293	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1657	461	336	47	0	chr3	140554882	140555031	-19044752	+	MTD	LTR	MaLR	46	201	-218	8
1657	3167	176	181	31	chr3	140562923	140563696	-19036087	+	RMER19B	LTR	ERVK	2	890	-12	1
1657	800	176	26	13	chr3	140563712	140563867	-19035916	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	1	157	-5623	1
1657	1005	180	110	5	chr3	140563926	140564144	-19035639	+	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	161	401	-5379	1
1657	587	64	0	0	chr3	140564320	140564398	-19035385	+	MTB	LTR	MaLR	323	400	0	1
1657	467	335	119	28	chr3	140567920	140568282	-19031501	-	MLT1C	LTR	MaLR	-9	458	64	1
1657	442	376	26	21	chr3	140568433	140568626	-19031157	+	MER54A	LTR	ERVL	231	424	-477	1
1657	1643	109	39	0	chr3	140569975	140570259	-19029524	+	RLTR10A	LTR	ERVK	117	411	0	1
1657	1322	191	135	0	chr3	140579757	140580045	-19019738	-	RMER6D	LTR	ERVK	0	720	394	1
1657	655	274	230	0	chr3	140580155	140580403	-19019380	-	MTC-int	LTR	MaLR	-266	992	688	1
1657	264	274	192	51	chr3	140580405	140580582	-19019201	+	MTD-int	LTR	MaLR	1035	1236	-22	1
1657	1371	247	84	26	chr3	140580624	140581007	-19018776	+	MTD	LTR	MaLR	3	407	-12	1
1657	3548	177	80	5	chr3	140582424	140583098	-19016685	-	RMER19A	LTR	ERVK	-12	725	1	1
1657	1848	133	17	72	chr3	140584150	140584498	-19015285	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
1657	1719	169	6	71	chr3	140584940	140585290	-19014493	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	1
1657	2769	195	40	94	chr3	140585295	140586018	-19013765	-	RMER12	LTR	ERVK	-638	684	1	1
1657	281	316	118	37	chr3	140599195	140599356	-19000427	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-259	336	163	1
1657	350	335	78	17	chr3	140608786	140608965	-18990818	+	MLT2B4	LTR	ERVL	13	202	-354	1
1657	314	303	79	69	chr3	140608975	140609187	-18990596	+	MLT2B4	LTR	ERVL	317	548	-6	1
1657	246	237	104	73	chr3	140616559	140616723	-18983060	-	LTR48	LTR	ERV1	-42	745	577	1
1657	278	274	25	102	chr3	140616884	140617002	-18982781	-	LTR29	LTR	ERV1	-513	109	1	1
1657	285	262	44	61	chr3	140621266	140621380	-18978403	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	266	1
1657	2757	84	11	0	chr3	140629174	140629545	-18970238	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	375	-21	1
1657	548	279	108	42	chr3	140630299	140630512	-18969271	-	MTE2a	LTR	MaLR	-9	370	144	2
1657	346	386	105	22	chr3	140632602	140632915	-18966868	-	MLT1J	LTR	MaLR	-146	366	28	2
1658	2996	79	5	2	chr3	140641536	140641931	-18957852	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1658	6805	97	26	75	chr3	140641931	140643086	-18956697	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	2
1658	2933	91	2	10	chr3	140643086	140643485	-18956298	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1658	243	343	71	0	chr3	140646620	140646719	-18953064	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-161	204	99	2
1658	270	152	29	57	chr3	140648151	140648221	-18951562	-	MT2B	LTR	ERVL	0	584	517	2
1658	1191	209	66	38	chr3	140648358	140648576	-18951207	-	MT2B	LTR	ERVL	-47	554	340	2
1658	1191	209	66	38	chr3	140648793	140648862	-18950921	-	MT2B	LTR	ERVL	-262	339	259	2
1658	716	192	0	16	chr3	140648849	140648976	-18950807	-	MT2B	LTR	ERVL	-476	125	1	2
1658	3535	188	9	5	chr3	140649018	140649655	-18950128	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	1	2
1658	1217	182	57	240	chr3	140650205	140650675	-18949108	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	2
1658	440	259	98	57	chr3	140653585	140653802	-18945981	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	255	-273	2
1658	408	308	171	51	chr3	140654283	140654506	-18945277	+	RLTR11B	LTR	ERVK	256	510	-18	2
1658	1254	206	246	72	chr3	140658962	140659678	-18940105	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	718	-2	2
1658	581	204	7	42	chr3	140663895	140664038	-18935745	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	233	2
1658	558	256	47	53	chr3	140664444	140664613	-18935170	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-143	227	60	2
1658	1528	229	43	27	chr3	140664612	140664984	-18934799	+	MTD	LTR	MaLR	8	385	-34	2
1658	1990	241	7	85	chr3	140666606	140667159	-18932624	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	510	-2	2
1658	1444	186	18	47	chr3	140668966	140669305	-18930478	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	2
1658	3374	26	134	0	chr3	140677660	140678079	-18921704	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	2
1658	248	312	12	0	chr3	140685898	140685978	-18913805	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	299	2
1658	294	347	53	46	chr3	140686030	140686181	-18913602	-	ORR1E	LTR	MaLR	-168	191	40	2
1658	481	329	50	50	chr3	140689263	140689564	-18910219	-	MT2A	LTR	ERVL	-44	489	189	2
1658	309	340	137	5	chr3	140691111	140691330	-18908453	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-7	508	261	2
1658	337	288	107	27	chr3	140691391	140691541	-18908242	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-348	167	6	2
1658	2203	84	132	11	chr3	140699681	140700029	-18899754	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	3
1658	236	324	51	82	chr3	140700969	140701127	-18898656	-	LTR41B	LTR	ERVL	-605	153	1	3
1658	420	381	99	27	chr3	140702186	140702861	-18896922	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-3198	2469	1746	3
1658	236	365	29	119	chr3	140708282	140708525	-18891258	-	MLT1D	LTR	MaLR	-225	324	104	3
1658	320	276	98	16	chr3	140708942	140709079	-18890704	-	MLT1D	LTR	MaLR	-494	133	1	3
1658	1410	282	80	3	chr3	140709241	140709628	-18890155	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	3
1658	394	369	66	39	chr3	140712106	140712411	-18887372	+	LTR40a	LTR	ERVL	197	509	-10	3
1658	706	147	38	30	chr3	140723093	140723226	-18876557	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1659	1792	0	3
1658	2608	73	18	0	chr3	140723226	140723506	-18876277	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	280	-66	3
1658	2608	73	18	0	chr3	140723536	140723595	-18876188	+	ORR1A1	LTR	MaLR	281	345	-1	3
1658	382	211	67	50	chr3	140736503	140736623	-18863160	+	ORR1D1	LTR	MaLR	253	374	0	3
1658	758	275	123	25	chr3	140746433	140746750	-18853033	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	64	3
1659	372	198	144	59	chr3	140782917	140783035	-18816748	+	MER65D	LTR	ERV1	1	128	-345	4
1659	283	269	196	35	chr3	140784011	140784222	-18815561	+	MLT1A1	LTR	MaLR	48	299	-66	4
1659	383	311	90	0	chr3	140788417	140788594	-18811189	-	LTR48B	LTR	ERV1	-6	638	446	4
1659	3474	145	79	55	chr3	140789435	140789658	-18810125	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-5	1098	883	4
1659	3474	145	79	55	chr3	140789703	140790204	-18809579	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-221	882	357	4
1659	1583	146	12	72	chr3	140798964	140799303	-18800480	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	383	1	4
1659	275	308	36	43	chr3	140799980	140800119	-18799664	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	271	4
1659	581	317	69	9	chr3	140804992	140805222	-18794561	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	136	4
1659	1741	198	176	26	chr3	140805222	140805481	-18794302	+	RMER2	LTR	ERV1	1	295	-272	4
1659	1741	198	176	26	chr3	140805721	140805954	-18793829	+	RMER2	LTR	ERV1	296	567	0	4
1659	533	236	9	0	chr3	140805982	140806092	-18793691	-	MTE2a	LTR	MaLR	-265	114	4	4
1659	2363	68	15	21	chr3	140810757	140811086	-18788697	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	4
1659	54302	28	13	12	chr3	140811087	140817555	-18782228	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	9	6479	-2	4
1659	2374	65	15	21	chr3	140817557	140817886	-18781897	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	4
1659	1347	233	121	8	chr3	140828182	140828537	-18771246	+	MTD	LTR	MaLR	4	398	-21	4
1659	741	268	107	15	chr3	140829371	140829708	-18770075	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	3	4
1659	485	275	188	47	chr3	140854648	140854904	-18744879	-	MER57C2	LTR	ERV1	-18	416	125	5
1659	1070	187	28	28	chr3	140862037	140862252	-18737531	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	199	5
1659	816	222	75	11	chr3	140862848	140863035	-18736748	-	MTC	LTR	MaLR	-222	199	1	5
1659	4764	185	107	28	chr3	140863035	140864201	-18735582	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1	5
1659	1160	208	30	21	chr3	140864201	140864437	-18735346	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	182	5
1659	243	65	0	0	chr3	140864446	140864477	-18735306	-	MTC	LTR	MaLR	-388	31	1	5
1659	459	400	102	19	chr3	140866940	140867371	-18732412	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-85	470	4	5
1659	291	328	47	47	chr3	140868388	140868580	-18731203	-	MER77	LTR	ERVL	-3	604	413	5
1659	355	136	121	0	chr3	140872576	140872642	-18727141	+	MTE2a	LTR	MaLR	17	90	-289	5
1659	3906	97	9	11	chr3	140875851	140876415	-18723368	+	RMER2	LTR	ERV1	1	563	-4	5
1659	1622	183	51	9	chr3	140886305	140886636	-18713147	+	RMER6C	LTR	ERVK	346	690	0	5
1659	232	338	99	80	chr3	140888761	140888912	-18710871	-	LTR79	LTR	ERVL	-353	174	21	5
1659	1115	280	123	9	chr3	140890593	140890977	-18708806	-	MTD	LTR	MaLR	0	421	1	5
1660	348	324	88	21	chr3	140904074	140904266	-18695517	-	MLT1I	LTR	MaLR	-38	373	169	5
1660	1201	199	87	31	chr3	140905023	140905345	-18694438	-	RLTR15	LTR	ERVK	-19	340	1	6
1660	5176	190	55	58	chr3	140911887	140913137	-18686646	+	MTC-int	LTR	MaLR	11	1257	-1	6
1660	1873	191	99	3	chr3	140913137	140913521	-18686262	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1660	500	389	77	43	chr3	140915291	140915705	-18684078	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-166	429	2	6
1660	473	266	152	42	chr3	140919546	140919876	-18679907	+	RMER10A	LTR	ERVL	77	442	0	6
1660	299	349	39	53	chr3	140929939	140929977	-18669806	-	MTE-int	LTR	MaLR	-150	1430	1396	6
1660	299	349	39	53	chr3	140930272	140930435	-18669348	-	MTE-int	LTR	MaLR	-185	1395	1228	6
1660	587	329	49	30	chr3	140930549	140930815	-18668968	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	109	6
1660	3038	68	2	8	chr3	140939020	140939418	-18660365	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1660	650	328	57	34	chr3	140945829	140946126	-18653657	-	MER21B	LTR	ERV1	-130	733	430	6
1660	703	217	83	108	chr3	140947418	140947702	-18652081	-	MT2A	LTR	ERVL	-69	406	2	6
1660	881	309	51	26	chr3	140953546	140953879	-18645904	+	MTD	LTR	MaLR	25	369	-31	6
1660	653	317	98	82	chr3	140953901	140953935	-18645848	+	MTD	LTR	MaLR	370	400	0	6
1660	1157	265	43	87	chr3	140956442	140956838	-18642945	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	370	0	6
1660	1109	236	162	6	chr3	140965754	140966074	-18633709	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	6
1660	3049	158	33	17	chr3	140966145	140966736	-18633047	-	RLTR26	LTR	ERVK	-2	640	1	6
1660	230	364	0	0	chr3	140978585	140978651	-18621132	+	MLT2B2	LTR	ERVL	416	481	-81	6
1660	460	301	92	71	chr3	140978792	140979117	-18620666	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1383	1714	-4000	6
1660	414	315	69	41	chr3	140979931	140979969	-18619814	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1923	1960	-3754	6
1660	414	315	69	41	chr3	140980005	140980211	-18619572	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1961	2173	-3541	6
1660	277	325	102	6	chr3	140980885	140981052	-18618731	+	ERVL-int	LTR	ERVL	4319	4501	-1256	7
1660	1101	291	50	16	chr3	140981408	140981764	-18618019	-	MTE2b	LTR	MaLR	-50	369	1	7
1660	2328	325	80	29	chr3	140981772	140982351	-18617432	-	MTE-int	LTR	MaLR	-9	1571	946	7
1660	2328	325	80	29	chr3	140982400	140982795	-18616988	-	MTE-int	LTR	MaLR	-635	945	547	7
1660	322	367	48	10	chr3	140995362	140995571	-18604212	-	LTR40a	LTR	ERVL	-299	220	4	7
1660	877	265	15	10	chr3	141004076	141004282	-18595501	+	MTC	LTR	MaLR	3	209	-212	6
1660	999	247	13	30	chr3	141004757	141004978	-18594805	+	MTC	LTR	MaLR	204	421	0	6
1660	419	391	69	30	chr3	141005982	141006285	-18593498	+	MLT1A0	LTR	MaLR	49	363	-2	1
1660	395	347	45	69	chr3	141021624	141022021	-18577762	+	LTR78	LTR	ERV1	865	1285	-19	3
1660	300	304	27	100	chr3	141023832	141023982	-18575801	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-486	141	3	3
1660	1937	149	27	73	chr3	141025269	141025681	-18574102	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	1	4
1660	338	330	39	158	chr3	141027117	141027531	-18572252	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	390	0	4
1661	231	379	27	60	chr3	141037471	141037620	-18562163	-	MLT1H	LTR	MaLR	-184	365	222	5
1661	2039	94	52	49	chr3	141038743	141039069	-18560714	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1661	276	332	76	52	chr3	141060148	141060399	-18539384	-	LTR16C	LTR	ERVL	-1	488	232	7
1661	255	341	91	54	chr3	141067426	141067668	-18532115	+	MTEb	LTR	MaLR	1	251	-108	8
1661	277	296	11	22	chr3	141069192	141069282	-18530501	+	MTEb	LTR	MaLR	289	377	-2	8
1661	514	330	207	28	chr3	141075026	141075422	-18524361	+	MLT1F2	LTR	MaLR	90	556	-4	9
1661	674	330	116	48	chr3	141080793	141081226	-18518557	-	MLT2B3	LTR	ERVL	0	554	93	1
1661	2014	135	3	63	chr3	141102370	141102718	-18497065	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1661	1268	271	66	82	chr3	141119777	141119815	-18479968	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-30	497	448	1
1661	1268	271	66	82	chr3	141119877	141120324	-18479459	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-80	447	20	1
1661	1177	256	179	6	chr3	141120884	141121241	-18478542	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1661	258	352	94	45	chr3	141122566	141122810	-18476973	+	MLT1J	LTR	MaLR	236	491	-21	1
1661	285	327	173	75	chr3	141123237	141123544	-18476239	+	MLT1K	LTR	MaLR	72	408	-187	1
1661	358	301	126	99	chr3	141123662	141123794	-18475989	+	MLT1A1	LTR	MaLR	26	157	-251	1
1661	358	301	126	99	chr3	141123828	141124068	-18475715	+	MLT1A1	LTR	MaLR	158	408	0	1
1661	1027	186	39	104	chr3	141133199	141133535	-18466248	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	9	322	0	1
1661	333	326	107	59	chr3	141149429	141149719	-18450064	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	304	-55	1
1661	281	36	70	35	chr3	141150539	141150596	-18449187	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1212	1270	-1056	1
1661	759	227	121	9	chr3	141151440	141151769	-18448014	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	9	1
1661	2345	72	119	11	chr3	141152952	141153304	-18446479	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	1
1661	477	224	26	77	chr3	141156085	141156240	-18443543	+	LTR16A1	LTR	ERVL	4	150	-306	2
1661	259	293	48	8	chr3	141158481	141158605	-18441178	+	MLT1B	LTR	MaLR	238	366	-24	2
1662	1223	228	113	19	chr3	141180198	141180567	-18419216	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	6	2
1662	1401	59	5	5	chr3	141195359	141195547	-18404236	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	0	475	288	2
1662	567	141	18	10	chr3	141195669	141195778	-18404005	-	MT2C_Mm	LTR	ERVL	-228	356	211	2
1662	407	350	102	48	chr3	141198095	141198351	-18401432	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-290	427	159	2
1662	579	320	87	14	chr3	141208259	141208642	-18391141	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-123	446	3	2
1662	633	288	61	75	chr3	141233236	141233557	-18366226	-	MTEa	LTR	MaLR	-48	331	1	2
1662	868	299	26	81	chr3	141258014	141258396	-18341387	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	18	3
1662	1283	289	27	40	chr3	141259777	141260224	-18339559	-	MER31A	LTR	ERV1	-44	441	1	3
1662	704	154	8	0	chr3	141277789	141277906	-18321877	-	RMER4B	LTR	ERVK	-451	134	17	3
1662	507	305	33	41	chr3	141279840	141280110	-18319673	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-1	679	412	3
1662	3832	102	11	12	chr3	141285500	141286068	-18313715	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	1	3
1663	1519	237	48	6	chr3	141297576	141297911	-18301872	-	MTD	LTR	MaLR	-70	349	1	3
1663	3609	128	10	33	chr3	141310552	141311128	-18288655	-	RMER2	LTR	ERV1	-4	563	1	3
1663	324	375	74	60	chr3	141316503	141316855	-18282928	-	LTR31	LTR	ERV1	-25	594	238	3
1663	464	333	68	14	chr3	141317036	141317255	-18282528	-	MER67B	LTR	ERV1	-151	510	280	3
1663	326	320	97	60	chr3	141330488	141330770	-18269013	+	MTEa	LTR	MaLR	54	379	0	4
1663	1840	243	78	49	chr3	141331267	141331835	-18267948	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	1	4
1663	264	303	90	74	chr3	141333497	141333686	-18266097	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-272	192	1	4
1663	424	273	121	0	chr3	141349111	141349243	-18250540	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	218	4
1663	226	282	101	13	chr3	141353805	141353884	-18245899	-	MLT1D	LTR	MaLR	-18	487	402	4
1663	260	312	25	67	chr3	141353969	141354089	-18245694	-	MLT1D	LTR	MaLR	-258	247	133	4
1663	329	128	0	0	chr3	141365838	141365885	-18233898	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	386	340	4
1663	523	108	238	1	chr3	141369987	141370090	-18229693	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-197	149	1	4
1663	2712	18	2	208	chr3	141370656	141371147	-18228636	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	4
1663	431	315	121	51	chr3	141372587	141372958	-18226825	+	RMER20B	LTR	ERVK	4	400	-227	4
1663	1259	279	11	37	chr3	141378792	141379171	-18220612	-	MLT1B	LTR	MaLR	-21	369	1	4
1663	1019	266	40	114	chr3	141399913	141400291	-18199492	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	4	4
1663	1642	166	135	58	chr3	141401170	141401534	-18198249	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	4
1663	3072	58	5	2	chr3	141407955	141408350	-18191433	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1663	4606	120	86	89	chr3	141414615	141415520	-18184263	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	902	-4	5
1663	1681	171	42	28	chr3	141418814	141419175	-18180608	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	1	5
1663	308	326	65	29	chr3	141421833	141421972	-18177811	+	MER34	LTR	ERV1	3	146	-396	5
1663	281	395	54	14	chr3	141422045	141422268	-18177515	+	MER34	LTR	ERV1	311	542	0	5
1664	333	213	53	0	chr3	141444164	141444239	-18155544	-	MTEb	LTR	MaLR	-300	79	1	5
1664	289	367	125	52	chr3	141461674	141462019	-18137764	-	LTR40b	LTR	ERVL	-7	455	86	5
1664	618	367	43	17	chr3	141468061	141468413	-18131370	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	1	5
1664	228	318	45	36	chr3	141473413	141473524	-18126259	+	MLT1E3	LTR	MaLR	213	324	-300	5
1664	232	245	83	93	chr3	141480611	141480719	-18119064	-	RMER13B	LTR	ERVK	-574	334	228	5
1664	3488	18	5	0	chr3	141510087	141510481	-18089302	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1664	1155	211	52	24	chr3	141511671	141511919	-18087864	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	280	1
1664	1997	247	23	92	chr3	141513186	141513842	-18085941	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	2
1664	423	279	25	59	chr3	141514840	141514958	-18084825	+	MTEa	LTR	MaLR	1	114	-265	2
1664	1547	226	59	32	chr3	141518640	141519047	-18080736	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	2
1664	518	271	27	20	chr3	141530852	141530999	-18068784	+	ORR1E	LTR	MaLR	232	379	0	4
1664	3411	297	76	56	chr3	141530999	141532339	-18067444	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	1367	-3	4
1664	644	276	41	12	chr3	141532348	141532517	-18067266	+	ORR1E	LTR	MaLR	9	182	-177	4
1664	331	217	23	46	chr3	141532607	141532694	-18067089	+	ORR1E	LTR	MaLR	295	379	0	4
1664	1381	244	120	14	chr3	141543804	141544170	-18055613	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	1	5
1664	1819	172	91	6	chr3	141546231	141546571	-18053212	-	MTC	LTR	MaLR	-50	371	3	5
1665	334	243	155	14	chr3	141574915	141575057	-18024726	+	MLT2B4	LTR	ERVL	385	546	-10	1
1665	286	317	39	31	chr3	141577456	141577583	-18022200	-	LTR16E2	LTR	ERVL	0	568	441	1
1665	420	353	0	0	chr3	141605879	141606032	-17993751	+	MLT1N2	LTR	MaLR	402	554	-8	1
1665	447	324	126	21	chr3	141659267	141659576	-17940207	+	MLT1G	LTR	MaLR	3	288	-303	2
1665	498	326	110	75	chr3	141659652	141660798	-17938985	+	MLT1G-int	LTR	MaLR	159	1410	-79	2
1665	265	322	61	65	chr3	141661061	141661293	-17938490	+	MLT1G	LTR	MaLR	404	672	-8	2
1665	555	288	88	0	chr3	141661525	141661685	-17938098	+	MTEb	LTR	MaLR	205	378	-1	2
1665	250	328	32	72	chr3	141677797	141677922	-17921861	-	RMER12	LTR	ERVK	-471	851	732	2
1665	406	236	96	91	chr3	141679905	141680124	-17919659	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	220	-170	2
1666	1954	152	7	3	chr3	141702191	141702501	-17897282	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	2
1666	238	207	34	17	chr3	141711059	141711118	-17888665	+	MLT1D	LTR	MaLR	82	141	-326	2
1666	239	306	205	5	chr3	141711173	141711373	-17888410	+	MLT1D	LTR	MaLR	266	505	0	2
1666	267	374	132	41	chr3	141720219	141720584	-17879199	+	MLT1D	LTR	MaLR	41	438	-67	2
1666	546	252	65	41	chr3	141725996	141726166	-17873617	+	MLT1B	LTR	MaLR	217	390	0	2
1666	650	278	44	100	chr3	141731612	141731952	-17867831	-	MLT1H	LTR	MaLR	-111	438	118	2
1666	1126	255	108	58	chr3	141733716	141734115	-17865668	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1666	1666	177	123	29	chr3	141735502	141735885	-17863898	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
1666	654	256	91	24	chr3	141764075	141764283	-17835500	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	338	3
1666	4027	150	20	30	chr3	141765374	141766138	-17833645	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	3
1666	389	323	108	10	chr3	141766934	141767128	-17832655	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	348	3
1666	355	223	15	104	chr3	141768182	141768207	-17831576	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	378	352	3
1666	734	245	31	141	chr3	141768230	141768607	-17831176	-	ORR1E	LTR	MaLR	-28	351	7	3
1666	3288	45	0	2	chr3	141772133	141772530	-17827253	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1666	1689	252	55	57	chr3	141775680	141776447	-17823336	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	731	-177	3
1666	314	288	95	9	chr3	141786664	141786769	-17813014	+	MLT1A1	LTR	MaLR	295	408	0	3
1666	239	276	108	33	chr3	141789882	141790002	-17809781	+	MTEa	LTR	MaLR	251	379	0	3
1666	335	311	208	36	chr3	141790002	141790263	-17809520	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-57	308	1	3
1666	260	250	29	29	chr3	141790617	141790687	-17809096	+	RLTR25A	LTR	ERVK	540	609	-494	3
1666	1160	215	97	28	chr3	141794763	141795155	-17804628	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1666	368	274	52	46	chr3	141797811	141797964	-17801819	+	LTR81B	LTR	ERV1?	61	214	-1179	3
1666	2725	198	43	129	chr3	141808041	141808820	-17790963	-	RMER19B	LTR	ERVK	-238	664	1	3
1666	395	343	81	74	chr3	141810135	141810541	-17789242	+	MLT2B3	LTR	ERVL	1	409	-145	3
1667	3567	159	114	1	chr3	141822350	141823010	-17776773	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	4	4
1667	574	287	209	36	chr3	141837857	141838191	-17761592	-	MTD	LTR	MaLR	-14	407	7	4
1667	3576	20	0	0	chr3	141840059	141840455	-17759328	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1667	574	343	84	4	chr3	141842746	141843021	-17756762	+	LTR33C	LTR	ERVL	23	319	-310	4
1667	295	278	0	53	chr3	141854950	141855064	-17744719	-	MLT1I	LTR	MaLR	-23	388	281	4
1667	450	117	9	211	chr3	141858448	141858556	-17741227	+	RMER17C	LTR	ERVK	93	184	-226	4
1667	450	117	9	211	chr3	141858679	141858790	-17740993	+	RMER17C	LTR	ERVK	185	273	-137	4
1667	2178	81	29	0	chr3	141864544	141864854	-17734929	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	4
1667	784	190	157	5	chr3	141865286	141865471	-17734312	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	207	4
1667	659	246	16	0	chr3	141865471	141865597	-17734186	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7075	7202	-204	4
1667	534	244	0	25	chr3	141865986	141866104	-17733679	-	MTD	LTR	MaLR	-200	219	105	4
1667	283	215	31	0	chr3	141867482	141867547	-17732236	-	MTD	LTR	MaLR	-333	86	20	4
1667	454	346	79	58	chr3	141867635	141868067	-17731716	-	LTR40b	LTR	ERVL	-17	445	5	4
1667	2144	162	53	112	chr3	141873532	141874046	-17725737	+	RMER5	LTR	ERV1	17	506	-28	4
1667	2144	162	53	112	chr3	141874208	141874240	-17725543	+	RMER5	LTR	ERV1	507	534	0	4
1667	1195	256	50	28	chr3	141881388	141881750	-17718033	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	377	-2	5
1667	1974	106	40	0	chr3	141882219	141882522	-17717261	+	ORR1A2	LTR	MaLR	5	319	-8	5
1667	547	276	156	49	chr3	141883607	141883934	-17715849	+	MLT1D	LTR	MaLR	85	446	-59	5
1667	271	250	82	52	chr3	141884622	141884719	-17715064	+	MLT1A	LTR	MaLR	229	328	-46	5
1667	289	28	0	0	chr3	141892550	141892586	-17707197	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-1078	36	1	5
1667	2220	200	32	2	chr3	141893067	141893473	-17706310	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	1	5
1667	495	179	48	57	chr3	141898911	141899035	-17700748	+	LTR41B	LTR	ERVL	2	124	-634	5
1667	269	342	131	5	chr3	141899071	141899262	-17700521	+	LTR41B	LTR	ERVL	220	434	-324	5
1667	420	189	111	117	chr3	141899637	141899774	-17700009	+	LTR41B	LTR	ERVL	620	755	-3	5
1667	2947	76	35	10	chr3	141926800	141927197	-17672586	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	5
1667	885	258	186	69	chr3	141929065	141929528	-17670255	+	MT2A	LTR	ERVL	17	533	0	5
1667	239	296	26	61	chr3	141929624	141929739	-17670044	+	MT2B2	LTR	ERVL	142	252	-332	5
1667	1102	164	309	4	chr3	141930822	141931097	-17668686	+	ORR1B2	LTR	MaLR	9	367	0	5
1667	478	204	27	18	chr3	141933610	141933720	-17666063	+	MTC	LTR	MaLR	1	111	-310	5
1667	2411	64	107	14	chr3	141949734	141950100	-17649683	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1668	3656	157	40	65	chr3	141953092	141954172	-17645611	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	1023	0	5
1668	561	252	107	6	chr3	141956547	141956824	-17642959	+	MTD	LTR	MaLR	50	405	-14	5
1668	423	353	61	24	chr3	141962565	141962777	-17637006	-	LTR16A	LTR	ERVL	-38	413	194	6
1668	1213	217	271	24	chr3	141976777	141977202	-17622581	+	MT2A	LTR	ERVL	2	531	-2	6
1668	735	279	236	3	chr3	141978042	141978330	-17621453	+	MTE2b	LTR	MaLR	20	374	-5	6
1668	228	197	161	62	chr3	141997690	141997715	-17602068	+	MT2A	LTR	ERVL	3	34	-499	6
1668	228	197	161	62	chr3	141997746	141997801	-17601982	+	MT2A	LTR	ERVL	35	91	-442	6
1668	275	133	0	0	chr3	141997809	141997854	-17601929	+	MT2A	LTR	ERVL	489	533	0	6
1668	707	307	89	16	chr3	141998214	141998508	-17601275	+	MTD	LTR	MaLR	23	352	-67	6
1668	298	325	62	61	chr3	141998855	141999048	-17600735	+	MLT1D	LTR	MaLR	76	270	-197	6
1668	262	242	110	0	chr3	142000397	142000488	-17599295	+	MLT1D	LTR	MaLR	400	500	-5	3
1668	1081	199	219	26	chr3	142000929	142001332	-17598451	-	RMER13A	LTR	ERVK	-356	552	3	4
1668	1913	151	55	3	chr3	142011522	142011834	-17587949	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	328	-39	2
1668	1036	205	126	7	chr3	142011865	142012135	-17587648	+	MTD	LTR	MaLR	118	419	0	2
1668	300	343	59	39	chr3	142012519	142012774	-17587009	+	LTR16A1	LTR	ERVL	197	456	0	2
1668	290	313	20	10	chr3	142021759	142021859	-17577924	+	MTEa	LTR	MaLR	277	377	-2	3
1668	244	243	123	41	chr3	142026446	142026519	-17573264	+	MTEb	LTR	MaLR	2	80	-299	4
1668	1064	328	73	36	chr3	142027749	142028160	-17571623	+	MER21B	LTR	ERV1	1	426	-437	4
1668	749	310	76	77	chr3	142028180	142028782	-17571001	+	RLTR18	LTR	ERVK	33	528	-88	4
1668	764	328	76	0	chr3	142028856	142029106	-17570677	+	MER21B	LTR	ERV1	520	788	-75	4
1668	560	351	63	32	chr3	142033219	142033566	-17566217	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	359	0	5
1668	249	215	34	102	chr3	142065161	142065249	-17534534	+	RLTR25B	LTR	ERVK	441	522	-506	1
1668	243	283	95	48	chr3	142075540	142075572	-17524211	+	RMER4A	LTR	ERVK	309	337	-129	1
1668	243	283	95	48	chr3	142075749	142075842	-17523941	+	RMER4A	LTR	ERVK	338	440	-26	1
1669	972	289	22	75	chr3	142096704	142097075	-17502708	+	MTE2b	LTR	MaLR	21	371	-8	1
1669	1099	280	146	2	chr3	142097087	142097499	-17502284	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-54	502	32	1
1669	627	221	101	80	chr3	142108209	142108549	-17491234	+	MT2B	LTR	ERVL	47	524	-77	1
1669	950	149	0	13	chr3	142108593	142108743	-17491040	+	MTC	LTR	MaLR	274	421	0	1
1669	636	343	41	47	chr3	142118729	142119093	-17480690	-	LTR40b	LTR	ERVL	-14	448	87	1
1669	874	256	109	60	chr3	142119529	142119878	-17479905	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	366	-4	1
1669	2996	77	37	13	chr3	142120332	142120791	-17478992	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1033	564	1
1669	3607	86	15	2	chr3	142121295	142121820	-17477963	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	-491	532	1	1
1669	304	234	52	0	chr3	142125646	142125723	-17474060	+	ORR1E	LTR	MaLR	22	102	-257	2
1669	569	350	77	34	chr3	142127573	142127898	-17471885	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	357	19	2
1669	1567	176	168	30	chr3	142137710	142137875	-17461908	+	MTC	LTR	MaLR	1	193	-228	2
1669	1567	176	168	30	chr3	142138527	142138730	-17461053	+	MTC	LTR	MaLR	194	420	-1	2
1669	648	75	11	0	chr3	142140426	142140520	-17459263	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	2	96	-488	2
1669	1199	193	28	74	chr3	142140763	142141125	-17458658	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	160	559	-2	2
1669	1502	140	140	0	chr3	142155244	142155544	-17444239	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	344	-346	2
1669	1836	132	105	31	chr3	142164471	142164654	-17435129	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	214	2
1669	1836	132	105	31	chr3	142164724	142164922	-17434861	-	RMER17C	LTR	ERVK	-197	213	1	2
1669	1107	194	260	71	chr3	142171272	142171749	-17428034	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	2
1669	456	311	124	41	chr3	142172420	142172844	-17426939	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	1289	1688	-6090	2
1669	255	241	103	77	chr3	142173329	142173446	-17426337	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	3181	3300	-4301	2
1669	276	250	0	0	chr3	142173453	142173513	-17426270	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	3504	3563	-4038	2
1669	507	295	41	26	chr3	142173985	142174180	-17425603	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	4350	4547	-3231	2
1669	1182	313	49	26	chr3	142174450	142174996	-17424787	+	MuRRS4-int	LTR	ERV1	3470	3963	-1100	2
1669	865	273	118	106	chr3	142182293	142182842	-17416941	+	RMER2	LTR	ERV1	1	556	-11	2
1669	4800	121	29	68	chr3	142188014	142188955	-17410828	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	864	-38	2
1669	901	199	68	36	chr3	142189358	142189639	-17410144	-	RMER17C	LTR	ERVK	-13	397	108	2
1669	699	225	7	57	chr3	142189611	142189889	-17409894	-	RMER17C	LTR	ERVK	-519	439	16	2
1669	2416	92	0	58	chr3	142191741	142192088	-17407695	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1669	1000	221	65	190	chr3	142196878	142197135	-17402648	-	RLTR30	LTR	ERV1	0	379	175	3
1669	1000	221	65	190	chr3	142197173	142197346	-17402437	-	RLTR30	LTR	ERV1	-205	174	3	3
1669	2729	86	10	2	chr3	142201189	142201585	-17398198	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	399	-8	3
1669	3457	90	4	5	chr3	142203477	142203982	-17395801	-	RLTR1C	LTR	ERV1	0	507	1	3
1670	1652	137	27	82	chr3	142217752	142218219	-17381564	+	RMER17C	LTR	ERVK	19	439	-519	3
1670	556	225	84	56	chr3	142218219	142218398	-17381385	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1	184	-3054	3
1670	1153	196	184	85	chr3	142219469	142219903	-17379880	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	1514	1990	-1248	3
1670	987	154	24	0	chr3	142219917	142220086	-17379697	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2170	2342	-896	3
1670	2187	114	220	16	chr3	142220084	142220656	-17379127	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2533	3221	-17	3
1670	1471	155	122	19	chr3	142224997	142225289	-17374494	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	85	3
1670	1471	166	140	15	chr3	142225351	142225468	-17374315	-	RMER17C	LTR	ERVK	-326	84	13	3
1670	323	307	62	67	chr3	142230963	142231141	-17368642	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-11	613	437	3
1670	1011	280	94	10	chr3	142236285	142236668	-17363115	+	MTE-int	LTR	MaLR	34	448	-1132	3
1670	3368	144	95	2	chr3	142236785	142237364	-17362419	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	4997	5629	-132	3
1670	334	121	14	43	chr3	142237364	142237433	-17362350	+	MTE-int	LTR	MaLR	574	640	-1323	3
1670	273	79	0	0	chr3	142237433	142237471	-17362312	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
1670	3355	114	2	6	chr3	142237476	142237971	-17361812	+	MT2B	LTR	ERVL	7	489	-112	3
1670	435	267	83	69	chr3	142239715	142239932	-17359851	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	348	3
1670	467	193	23	0	chr3	142241049	142241137	-17358646	+	MT2A	LTR	ERVL	338	427	-106	3
1670	1194	265	144	6	chr3	142242003	142242363	-17357420	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	3
1670	376	293	56	24	chr3	142251832	142251958	-17347825	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	130	-235	3
1670	470	170	56	20	chr3	142254397	142254507	-17345276	+	MT2A	LTR	ERVL	324	463	-121	3
1670	2561	53	3	53	chr3	142255212	142255551	-17344232	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	3
1670	1328	254	143	0	chr3	142255750	142256100	-17343683	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	20	3
1670	742	112	14	20	chr3	142261516	142261662	-17338121	+	RMER17B	LTR	ERVK	317	461	-497	3
1670	872	204	56	29	chr3	142262451	142262664	-17337119	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-13	371	149	3
1670	925	186	10	44	chr3	142262791	142262993	-17336790	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-200	184	1	3
1670	842	275	115	37	chr3	142265294	142265750	-17334033	-	RLTR16	LTR	ERVK	-12	493	2	3
1670	4903	137	29	50	chr3	142271891	142272714	-17327069	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	806	1	4
1670	1326	207	132	6	chr3	142272802	142273113	-17326670	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-34	350	1	4
1670	235	250	50	0	chr3	142278621	142278681	-17321102	-	RLTR23	LTR	ERV1	-19	411	349	4
1670	963	285	67	6	chr3	142278763	142279091	-17320692	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	415	762	-1086	4
1670	2491	111	29	0	chr3	142290350	142290729	-17309054	+	RLTR33	LTR	ERVK	1	390	-288	4
1670	1548	247	115	71	chr3	142290741	142291667	-17308116	-	RMER17B	LTR	ERVK	-9	899	1	4
1670	1760	117	73	4	chr3	142291667	142291941	-17307842	+	RLTR33	LTR	ERVK	385	677	-1	4
1670	831	261	152	29	chr3	142292449	142292824	-17306959	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1670	543	307	74	13	chr3	142302487	142302718	-17297065	-	MER89	LTR	ERV1	-2	557	313	4
1670	1357	260	30	0	chr3	142302852	142303217	-17296566	+	MTEa	LTR	MaLR	1	376	-3	4
1670	296	217	0	0	chr3	142303220	142303280	-17296503	+	MTEa-int	LTR	MaLR	1	60	-1520	4
1670	511	148	0	0	chr3	142303876	142303957	-17295826	-	RMER6D	LTR	ERVK	-5	715	635	4
1670	314	211	0	0	chr3	142303954	142304011	-17295772	-	RLTR30	LTR	ERV1	-321	58	2	4
1670	590	250	22	0	chr3	142304750	142304886	-17294897	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	139	-322	4
1670	8435	129	42	49	chr3	142304887	142306550	-17293233	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	3378	5028	-3931	4
1670	7812	150	52	68	chr3	142306614	142307928	-17291855	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	5002	6348	-2611	4
1670	7812	150	52	68	chr3	142308000	142308348	-17291435	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6349	6707	-2252	4
1670	559	172	50	0	chr3	142309028	142309127	-17290656	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6741	6844	-2115	4
1670	2286	207	45	62	chr3	142309355	142309932	-17289851	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	-17	567	1	4
1670	4147	138	60	13	chr3	142309932	142310719	-17289064	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	6939	7762	-1197	4
1670	1000	139	76	0	chr3	142310724	142310896	-17288887	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	185	-276	4
1670	1903	116	6	67	chr3	142310920	142311263	-17288520	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	1	322	0	4
1670	395	291	140	57	chr3	142311637	142311995	-17287788	-	MLT1D	LTR	MaLR	-32	473	49	4
1670	2352	199	47	103	chr3	142313198	142313905	-17285878	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-981	6425	5759	4
1670	1157	296	127	54	chr3	142320681	142321556	-17278227	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-97	1483	1	4
1670	1490	189	64	29	chr3	142328481	142328881	-17270902	-	RLTR1	LTR	ERV1	0	624	135	4
1670	9812	134	96	95	chr3	142328973	142331320	-17268463	-	RLTR1B-int	LTR	ERV1	0	3299	949	4
1670	1677	126	0	12	chr3	142331601	142331859	-17267924	-	MMVL30-int	LTR	ERV1	-2245	1453	1199	4
1670	900	276	116	21	chr3	142334724	142335053	-17264730	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	11	4
1670	465	209	0	35	chr3	142336675	142336789	-17262994	+	RLTR28	LTR	ERVL	389	498	-26	4
1670	7457	132	55	31	chr3	142340319	142341635	-17258148	-	MMETn-int	LTR	ERVK	0	4844	3498	5
1670	5831	143	28	12	chr3	142341655	142343044	-17256739	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-3321	4085	2359	5
208	15073	92	5	44	chr3	142343280	142345248	-17254535	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-2657	2187	271	5
1671	15073	92	5	44	chr3	142345282	142345586	-17254197	-	MMETn-int	LTR	ERVK	-4574	270	2	5
1671	1759	130	18	68	chr3	142345587	142345926	-17253857	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	0	322	1	5
1671	1745	122	23	37	chr3	142349837	142350291	-17249492	+	RLTR1B	LTR	ERV1	135	624	0	5
1671	1252	154	115	128	chr3	142350291	142351067	-17248716	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	1	623	-6933	5
1671	1269	198	26	26	chr3	142351218	142351483	-17248300	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	514	778	-2521	5
1671	11532	83	43	24	chr3	142351634	142353542	-17246241	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	783	3425	-1638	5
1671	4062	55	15	44	chr3	142353540	142354087	-17245696	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	2692	3222	-77	5
1671	688	114	6	57	chr3	142354091	142354240	-17245543	+	RLTR1B-int	LTR	ERV1	3221	3299	0	5
1671	310	149	0	0	chr3	142354304	142354351	-17245432	+	RLTR1B	LTR	ERV1	466	512	0	5
1671	2140	116	3	14	chr3	142354753	142355103	-17244680	-	RLTR9E	LTR	ERVK	-50	359	14	5
1671	236	275	14	14	chr3	142355979	142356049	-17243734	+	MTEb	LTR	MaLR	124	193	-186	5
1671	3748	114	24	5	chr3	142356873	142357427	-17242356	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	1	5
1671	1977	162	18	72	chr3	142357736	142358123	-17241660	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	366	-1	5
1671	312	247	11	23	chr3	142358290	142358377	-17241406	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	294	5
1671	1904	157	69	8	chr3	142359168	142359528	-17240255	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-10	384	3	5
1671	490	272	40	56	chr3	142359800	142360043	-17239740	-	MTE2a	LTR	MaLR	-57	322	83	5
1671	1978	137	41	0	chr3	142360747	142361061	-17238722	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1671	321	214	9	109	chr3	142365877	142365987	-17233796	+	MT2B	LTR	ERVL	152	250	-351	5
1671	4876	179	43	19	chr3	142368122	142369126	-17230657	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	1028	0	5
1671	2834	75	62	124	chr3	142370891	142371405	-17228378	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	5
1671	927	255	112	63	chr3	142374059	142374469	-17225314	-	RMER5	LTR	ERV1	-28	506	77	5
1671	471	272	138	114	chr3	142374609	142374895	-17224888	-	MLT1C	LTR	MaLR	-80	387	82	5
1671	471	272	138	114	chr3	142375094	142375185	-17224598	-	MLT1C	LTR	MaLR	-386	81	1	5
1671	2028	153	68	89	chr3	142375513	142375972	-17223811	+	RLTR44B	LTR	ERVK	1	449	0	5
1671	314	196	0	0	chr3	142375972	142376028	-17223755	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	1	56	-2756	5
1671	5445	63	1	6	chr3	142376041	142376714	-17223069	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	819	1488	-1324	5
1671	4849	56	17	2	chr3	142376985	142377575	-17222208	+	RLTR44-int	LTR	ERVK	2214	2812	0	5
1671	1697	164	72	80	chr3	142377575	142378111	-17221672	+	RLTR44B	LTR	ERVK	1	469	-17	5
1671	472	326	130	8	chr3	142378586	142378944	-17220839	+	MLT2D	LTR	ERVL	19	413	-1	5
1671	340	237	89	77	chr3	142382134	142382303	-17217480	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	944	5
1671	1540	217	79	44	chr3	142384015	142384420	-17215363	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1671	1607	180	52	25	chr3	142387298	142387662	-17212121	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1671	349	282	43	58	chr3	142396609	142396748	-17203035	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-59	306	170	5
1671	231	205	109	98	chr3	142404914	142404931	-17194852	+	MT2B	LTR	ERVL	156	247	-353	6
1671	2581	113	77	8	chr3	142409494	142409885	-17189898	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	6
1671	749	228	18	6	chr3	142410640	142410808	-17188975	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	170	-224	6
1671	654	274	9	8	chr3	142411031	142411218	-17188565	-	MT2A	LTR	ERVL	-71	462	228	6
1671	252	188	0	123	chr3	142413376	142413449	-17186334	+	MT2B	LTR	ERVL	178	241	-360	6
1671	3184	95	27	35	chr3	142418883	142419362	-17180421	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	6
1671	2716	146	34	113	chr3	142421160	142421875	-17177908	+	RMER6A	LTR	ERVK	57	756	0	6
1671	2436	216	19	67	chr3	142426321	142426962	-17172821	-	RMER19C	LTR	ERVK	-1	610	1	6
1671	250	257	28	65	chr3	142427909	142428017	-17171766	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	155	6
1671	4078	36	0	0	chr3	142441450	142441917	-17157866	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-964	4521	4055	6
1671	401	263	30	0	chr3	142442159	142442258	-17157525	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	473	6
1671	402	262	23	54	chr3	142444949	142445078	-17154705	-	RMER10B	LTR	ERVL	-5	393	269	6
1671	891	202	99	65	chr3	142445596	142445961	-17153822	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	6
1671	306	273	76	114	chr3	142448287	142448498	-17151285	-	RLTR14	LTR	ERV1	-26	356	154	6
1671	404	273	274	24	chr3	142450052	142450348	-17149435	-	MER21B	LTR	ERV1	-156	707	338	7
1671	363	336	95	58	chr3	142451681	142451924	-17147859	-	ORR1E	LTR	MaLR	-107	252	1	7
1672	280	333	35	58	chr3	142475938	142476220	-17123563	+	MTEa	LTR	MaLR	80	362	-17	7
1672	292	324	111	66	chr3	142489741	142489939	-17109844	+	MER21B	LTR	ERV1	98	304	-559	7
1672	304	336	48	169	chr3	142522030	142522385	-17077398	+	MLT1H	LTR	MaLR	123	434	-115	3
1672	1815	171	93	6	chr3	142524305	142524658	-17075125	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1672	1835	173	39	14	chr3	142527833	142528190	-17071593	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	366	-8	4
1672	445	198	48	19	chr3	142528636	142528739	-17071044	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	153	5
1672	247	268	18	0	chr3	142549498	142549554	-17050229	-	MLT1I	LTR	MaLR	-116	295	239	9
1672	272	277	72	104	chr3	142551745	142551870	-17047913	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	251	9
1672	681	272	56	35	chr3	142552002	142552234	-17047549	+	MLT1A0	LTR	MaLR	117	353	-12	9
1672	403	277	65	45	chr3	142552793	142552948	-17046835	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	251	9
1672	1707	196	21	26	chr3	142553012	142553352	-17046431	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	76	9
1672	2066	167	55	10	chr3	142553355	142553755	-17046028	+	MTC	LTR	MaLR	3	420	-1	1
1672	493	141	0	13	chr3	142553757	142553836	-17045947	-	MTC	LTR	MaLR	-343	78	1	9
1672	714	213	14	113	chr3	142554758	142554980	-17044803	-	MT2A	LTR	ERVL	-16	517	318	1
1672	330	209	30	0	chr3	142554985	142555052	-17044731	-	MT2A	LTR	ERVL	-361	172	104	1
1672	1176	204	206	9	chr3	142555052	142555373	-17044410	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
1672	662	188	68	0	chr3	142555379	142555512	-17044271	-	MT2A	LTR	ERVL	-391	142	1	1
1672	265	340	90	30	chr3	142555938	142556038	-17043745	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-329	183	78	9
1672	398	329	149	14	chr3	142556233	142556514	-17043269	+	MLT1G3	LTR	MaLR	227	545	-50	1
1672	710	95	9	0	chr3	142558912	142559028	-17040755	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-212	117	1	1
1672	2291	151	42	2	chr3	142566822	142567227	-17032556	+	RMER4A	LTR	ERVK	3	423	-43	1
1672	927	241	12	60	chr3	142577443	142577484	-17022299	-	MTD	LTR	MaLR	-179	240	201	1
1672	927	241	12	60	chr3	142577677	142577887	-17021896	-	MTD	LTR	MaLR	-219	200	1	1
1672	693	276	61	140	chr3	142578259	142578638	-17021145	-	MTE-int	LTR	MaLR	-39	1541	1193	1
1672	1100	224	184	17	chr3	142585655	142586014	-17013769	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	1
1672	1607	236	25	5	chr3	142592800	142593105	-17006678	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	110	1
1672	1607	236	25	5	chr3	142593253	142593344	-17006439	-	MTD	LTR	MaLR	-310	109	16	1
1672	400	234	27	224	chr3	142597623	142597882	-17001901	+	RLTR11B	LTR	ERVK	205	412	-41	1
1672	3409	23	8	0	chr3	142600354	142600744	-16999039	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	2	1
1672	249	329	72	12	chr3	142601090	142601256	-16998527	+	MLT2B4	LTR	ERVL	62	237	-319	1
1672	562	270	126	0	chr3	142601480	142601654	-16998129	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5	200	-5514	1
1672	243	270	32	73	chr3	142602550	142602674	-16997109	+	LTR16D2	LTR	ERVL	454	572	0	1
1673	1944	183	58	14	chr3	142606435	142606740	-16993043	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	333	-252	1
1673	3113	74	5	19	chr3	142606740	142607153	-16992630	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	1
1673	1944	184	40	19	chr3	142607153	142607373	-16992410	+	RMER4B	LTR	ERVK	334	585	0	1
1673	327	200	153	0	chr3	142613272	142613357	-16986426	+	MTD	LTR	MaLR	45	142	-277	2
1673	828	143	111	24	chr3	142613360	142613557	-16986226	+	RMER6C	LTR	ERVK	4	279	-441	2
1673	479	175	173	71	chr3	142613946	142613992	-16985791	+	MTC-int	LTR	MaLR	950	995	-263	2
1673	479	175	173	71	chr3	142614031	142614181	-16985602	+	MTC-int	LTR	MaLR	996	1165	-93	2
1673	687	184	40	25	chr3	142614539	142614720	-16985063	+	MTC-int	LTR	MaLR	1092	1256	-2	2
1673	2207	155	108	3	chr3	142614722	142615103	-16984680	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1673	1609	157	139	11	chr3	142615103	142615471	-16984312	+	MTC-int	LTR	MaLR	3	417	-841	2
1673	1147	219	63	34	chr3	142615575	142615962	-16983821	+	MTC-int	LTR	MaLR	740	1141	-117	2
1673	2252	165	35	12	chr3	142615962	142616368	-16983415	+	MTC	LTR	MaLR	1	415	-6	2
1673	957	278	119	6	chr3	142616876	142617195	-16982588	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	5	2
1673	326	329	141	31	chr3	142620651	142620971	-16978812	-	LTR16A	LTR	ERVL	-2	449	95	2
1673	234	257	58	149	chr3	142621377	142621551	-16978232	-	ORR1E	LTR	MaLR	-125	234	77	2
1673	379	247	23	67	chr3	142621575	142621717	-16978066	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-274	134	1	2
1673	3838	48	5	2	chr3	142631204	142631639	-16968144	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	2
1673	3528	38	5	2	chr3	142645874	142646269	-16953514	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1673	897	242	152	48	chr3	142646999	142647329	-16952454	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	8	2
1673	1141	275	25	82	chr3	142650102	142650502	-16949281	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	377	-2	2
1673	447	350	46	71	chr3	142651064	142651278	-16948505	+	LTR33	LTR	ERVL	46	271	-244	2
1673	353	302	55	36	chr3	142651437	142651602	-16948181	+	LTR33	LTR	ERVL	279	446	-69	2
1673	488	235	132	20	chr3	142657571	142657772	-16942011	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	405	159	2
1673	814	314	136	37	chr3	142665838	142666353	-16933430	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-4	623	58	2
1673	391	237	50	40	chr3	142673642	142673743	-16926040	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	278	3
1673	305	337	85	40	chr3	142687544	142687745	-16912038	-	ORR1E	LTR	MaLR	-149	210	1	3
1673	749	279	72	48	chr3	142696800	142696910	-16902873	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	114	-245	3
1673	749	279	72	48	chr3	142697021	142697244	-16902539	+	RLTR15	LTR	ERVK	115	342	-17	3
1673	837	201	57	74	chr3	142700639	142700753	-16899030	+	RMER17C	LTR	ERVK	120	234	-176	3
1673	837	201	57	74	chr3	142700823	142701004	-16898779	+	RMER17C	LTR	ERVK	235	410	0	3
1673	775	269	102	40	chr3	142704880	142705245	-16894538	+	MLT1B	LTR	MaLR	4	390	0	3
1673	1139	225	221	0	chr3	142708452	142708750	-16891033	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	1	3
1673	266	307	61	9	chr3	142715008	142715123	-16884660	-	MLT1B	LTR	MaLR	-215	175	55	3
1673	1534	158	152	11	chr3	142718473	142719031	-16880752	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	637	-55	3
1673	3626	30	0	0	chr3	142723442	142723838	-16875945	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1673	302	172	0	65	chr3	142727313	142727389	-16872394	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1910	1963	0	3
1673	2004	125	14	116	chr3	142727389	142727752	-16872031	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	3
1673	346	262	112	94	chr3	142728114	142728274	-16871509	+	MTEa	LTR	MaLR	3	165	-214	3
1673	326	320	93	28	chr3	142728274	142728329	-16871454	+	MT2A	LTR	ERVL	3	231	-302	3
1673	315	369	124	15	chr3	142728380	142728581	-16871202	+	MT2A	LTR	ERVL	311	533	0	3
1673	259	350	133	26	chr3	142728686	142728912	-16870871	+	MLT1G1	LTR	MaLR	330	579	0	3
1673	575	323	60	48	chr3	142732148	142732463	-16867320	-	MLT1C	LTR	MaLR	-6	461	143	3
1673	1396	333	33	36	chr3	142732488	142733055	-16866728	+	MLT2B3	LTR	ERVL	6	558	-4	3
1673	340	273	17	76	chr3	142733061	142733180	-16866603	-	MLT1C	LTR	MaLR	-352	115	4	3
1673	665	254	30	60	chr3	142734113	142734314	-16865469	-	MTEb	LTR	MaLR	-18	361	167	3
1673	310	340	42	36	chr3	142734553	142734584	-16865199	-	MT2A	LTR	ERVL	-367	166	12	3
1673	658	193	0	32	chr3	142734584	142734707	-16865076	-	MTEb	LTR	MaLR	-249	130	12	3
1674	4652	177	89	21	chr3	142737839	142738730	-16861053	+	RMER17B	LTR	ERVK	3	953	-5	4
1674	583	244	992	53	chr3	142738748	142738828	-16860955	-	MTE2b	LTR	MaLR	-164	215	191	4
1674	583	252	54	162	chr3	142738943	142739162	-16860621	-	MTE2b	LTR	MaLR	-189	190	2	4
1674	658	257	70	157	chr3	142739894	142740296	-16859487	+	MTEb	LTR	MaLR	11	377	-2	4
1674	314	272	213	60	chr3	142740628	142740961	-16858822	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	384	-24	4
1674	759	240	60	145	chr3	142744536	142744950	-16854833	+	RLTR12B	LTR	ERVK	11	389	-139	4
1674	1382	229	84	99	chr3	142745614	142745997	-16853786	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	379	0	4
1674	283	266	25	131	chr3	142749203	142749363	-16850420	-	MLT1B	LTR	MaLR	-17	373	231	4
1674	557	269	161	137	chr3	142753913	142754373	-16845410	+	LTR86C	LTR	ERVL	45	515	-106	4
1674	1053	280	32	134	chr3	142757739	142758148	-16841635	-	MTE2b	LTR	MaLR	-1	378	12	4
1674	1070	272	68	48	chr3	142759540	142759892	-16839891	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	4
1674	1828	172	45	26	chr3	142768684	142769036	-16830747	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	4
1674	546	309	11	17	chr3	142773869	142774050	-16825733	-	RMER15	LTR	ERVL	-96	479	300	4
1674	463	302	257	4	chr3	142778817	142779066	-16820717	-	MTE2a	LTR	MaLR	-67	312	1	4
1674	1373	224	130	16	chr3	142781319	142781695	-16818088	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1674	610	273	102	25	chr3	142786819	142787089	-16812694	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	221	4
1674	1140	295	52	41	chr3	142787959	142788376	-16811407	+	MTD	LTR	MaLR	1	395	-24	4
1674	1574	124	183	33	chr3	142791560	142791894	-16807889	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	4
1674	1060	363	57	2	chr3	142799031	142799467	-16800316	-	MLT1F	LTR	MaLR	-19	529	70	4
1674	661	267	80	142	chr3	142799546	142799947	-16799836	-	MT2A	LTR	ERVL	-77	456	81	4
1674	225	331	42	112	chr3	142799872	142800015	-16799768	-	MTE2a	LTR	MaLR	-227	152	20	4
1674	238	343	43	82	chr3	142800033	142800175	-16799608	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-197	1212	1077	4
1674	238	343	43	82	chr3	142800241	142800282	-16799501	-	MLT1F-int	LTR	MaLR	-333	1076	1036	4
1674	764	348	78	43	chr3	142802667	142803153	-16796630	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	469	971	-518	4
1674	665	292	38	5	chr3	142809119	142809329	-16790454	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1514	1730	-5	4
1674	953	254	84	22	chr3	142809342	142809616	-16790167	+	MLT1A0	LTR	MaLR	15	305	-60	4
1674	1018	259	86	49	chr3	142814887	142815359	-16784424	+	RMER4B	LTR	ERVK	11	545	-40	5
1674	928	308	133	74	chr3	142818351	142818908	-16780875	+	MLT2B3	LTR	ERVL	123	708	-9	5
1674	834	262	56	103	chr3	142819842	142820182	-16779601	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	293	5
1674	606	246	63	63	chr3	142820327	142820431	-16779352	-	RLTR18	LTR	ERVK	-313	199	98	5
1674	606	246	63	63	chr3	142820574	142820660	-16779123	-	RLTR18	LTR	ERVK	-415	97	9	5
1674	426	317	61	17	chr3	142821617	142821848	-16777935	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1386	1626	-4041	5
1674	479	302	73	22	chr3	142821925	142822256	-16777527	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	1808	2167	-3318	5
1674	1044	113	37	11	chr3	142837513	142837707	-16762076	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	902	589	5
1674	1280	227	37	169	chr3	142837856	142838626	-16761157	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	902	1	5
1674	387	363	52	33	chr3	142839060	142839271	-16760512	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-171	456	242	5
1674	306	200	14	28	chr3	142846430	142846502	-16753281	-	MT2A	LTR	ERVL	-92	441	371	5
1674	878	192	55	70	chr3	142846502	142846725	-16753058	+	MT2B	LTR	ERVL	316	540	-61	5
1674	2215	200	32	38	chr3	142847146	142847607	-16752176	-	RMER15	LTR	ERVL	-34	541	1	5
1674	618	398	49	39	chr3	142849834	142850221	-16749562	-	LTR16A	LTR	ERVL	0	451	61	5
1674	1035	272	130	11	chr3	142857279	142857640	-16742143	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	2	5
1674	611	186	162	14	chr3	142863926	142864004	-16735779	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	578	502	5
1674	1136	229	71	60	chr3	142864051	142864416	-16735367	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-77	501	1	5
1674	228	310	96	17	chr3	142866821	142866936	-16732847	-	LTR90B	LTR	LTR	-509	287	164	5
1675	528	291	0	43	chr3	142869900	142870040	-16729743	-	MTEa	LTR	MaLR	-244	135	2	5
1675	1830	143	3	14	chr3	142870240	142870537	-16729246	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	294	-32	5
1675	390	299	130	62	chr3	142875439	142875731	-16724052	+	MLT2C1	LTR	ERVL	36	347	-50	5
1675	321	281	54	84	chr3	142890117	142890140	-16709643	-	MT2B2	LTR	ERVL	-253	331	170	6
1675	332	222	57	115	chr3	142893537	142893756	-16706027	-	MLT1C	LTR	MaLR	-46	421	152	6
1675	228	319	14	0	chr3	142893831	142893903	-16705880	+	MLT1C	LTR	MaLR	67	139	-328	6
1675	343	375	57	16	chr3	142900401	142900523	-16699260	-	MLT1M	LTR	MaLR	-489	183	57	6
1675	297	323	53	23	chr3	142901758	142901891	-16697892	-	MLT1L	LTR	MaLR	-342	268	132	6
1675	1057	283	31	62	chr3	142908514	142908906	-16690877	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	416	18	6
1675	1667	214	73	0	chr3	142916595	142916922	-16682861	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-14	353	3	6
1675	494	299	96	129	chr3	142926287	142926547	-16673236	+	MER31B	LTR	ERV1	9	260	-225	6
1675	472	294	108	149	chr3	142926734	142926990	-16672793	+	MER31B	LTR	ERV1	261	483	-2	6
1675	686	245	105	28	chr3	142943674	142943964	-16655819	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	350	-9	6
1675	432	234	130	57	chr3	142944678	142944855	-16654928	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	192	-167	6
1675	1213	268	91	25	chr3	142953795	142954159	-16645624	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	18	7
1675	315	340	104	40	chr3	142954983	142955185	-16644598	-	MLT1H	LTR	MaLR	-223	326	112	7
1675	241	143	0	0	chr3	142957008	142957043	-16642740	+	MLT1I	LTR	MaLR	354	388	-23	7
1675	2359	189	133	29	chr3	142963538	142963940	-16635843	+	RMER6C	LTR	ERVK	8	467	-223	7
1675	2359	189	133	29	chr3	142964101	142964313	-16635470	+	RMER6C	LTR	ERVK	468	685	-5	7
1675	1494	220	71	58	chr3	142966359	142966631	-16633152	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	142	7
1675	4622	122	22	39	chr3	142966631	142967447	-16632336	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-3	806	5	7
1675	1494	220	71	58	chr3	142967447	142967585	-16632198	-	MTD	LTR	MaLR	-278	141	2	7
1675	715	283	116	53	chr3	142969718	142970075	-16629708	+	MTD	LTR	MaLR	2	373	-6	7
1675	342	319	126	88	chr3	142971100	142971195	-16628588	-	MLT1B	LTR	MaLR	-8	459	371	7
1675	342	319	126	88	chr3	142971331	142971491	-16628292	-	MLT1B	LTR	MaLR	-97	370	190	7
1675	410	257	75	9	chr3	142971616	142971722	-16628061	-	MLT1B	LTR	MaLR	-237	153	41	7
1675	673	310	40	53	chr3	142988487	142988787	-16610996	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	280	7
1675	236	302	117	33	chr3	142988802	142988922	-16610861	-	RMER15	LTR	ERVL	-445	130	1	7
1675	986	320	137	44	chr3	142998364	142998935	-16600848	-	MLT1E3	LTR	MaLR	0	624	1	7
1676	746	361	73	25	chr3	143008280	143008720	-16591063	-	MT2A	LTR	ERVL	-72	461	1	1
1676	1731	212	43	41	chr3	143028102	143028570	-16571213	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	469	-251	3
1676	1538	171	133	23	chr3	143028563	143028910	-16570873	+	RMER6D	LTR	ERVK	330	714	-6	3
1676	626	201	12	3	chr3	143029601	143029730	-16570053	+	RLTR9B	LTR	ERVK	264	437	0	3
1676	1130	197	108	20	chr3	143032020	143032315	-16567468	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-53	321	1	4
1676	1584	156	69	7	chr3	143034863	143035167	-16564616	-	RMER6C	LTR	ERVK	-2	688	366	4
1676	1520	216	50	37	chr3	143045749	143046128	-16553655	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	5
1676	1317	190	170	6	chr3	143046263	143046417	-16553366	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	210	5
1676	1317	190	170	6	chr3	143046554	143046728	-16553055	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-175	209	2	5
1676	1352	283	16	42	chr3	143048486	143048863	-16550920	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	2	5
1676	1365	205	93	39	chr3	143062314	143062669	-16537114	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
1676	1040	293	20	36	chr3	143087219	143087577	-16512206	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	6	1
1676	1679	226	6	3	chr3	143099734	143100058	-16499725	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-49	325	1	1
1676	2069	184	31	0	chr3	143101818	143102176	-16497607	+	MTC	LTR	MaLR	1	369	-52	1
1676	1611	199	54	56	chr3	143102222	143102638	-16497145	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	417	-2	1
1676	4070	195	161	43	chr3	143102650	143103749	-16496034	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	28	1256	-2	1
1676	1585	229	98	8	chr3	143103751	143104130	-16495653	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	413	-8	1
1676	2599	154	13	34	chr3	143105352	143105823	-16493960	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	1
1676	605	366	140	11	chr3	143106094	143106445	-16493338	+	LTR33B	LTR	ERVL	10	405	-98	1
1676	2068	78	106	101	chr3	143112939	143113296	-16486487	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	1
1676	747	301	46	0	chr3	143123830	143124026	-16475757	-	MTEa	LTR	MaLR	-108	271	67	1
1677	862	252	116	27	chr3	143133532	143133835	-16465948	+	ORR1E	LTR	MaLR	32	377	-2	1
1677	471	339	60	35	chr3	143134967	143135314	-16464469	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	362	-8	1
1677	266	282	35	0	chr3	143139520	143139605	-16460178	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	285	1
1677	3447	81	15	11	chr3	143143302	143143775	-16456008	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1677	2955	61	58	0	chr3	143143874	143144252	-16455531	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1677	752	190	7	4	chr3	143155686	143155852	-16443931	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-210	168	1	1
1677	383	258	32	40	chr3	143162810	143162935	-16436848	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	256	1
1677	1350	265	56	93	chr3	143173200	143173452	-16426331	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	315	2
1677	2314	140	23	18	chr3	143173452	143173844	-16425939	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	2
1677	1350	265	56	93	chr3	143173844	143174131	-16425652	-	RMER5	LTR	ERV1	-220	314	15	2
1677	2459	191	47	35	chr3	143179268	143179805	-16419978	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-13	564	22	2
1677	275	320	115	0	chr3	143184780	143184936	-16414847	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-1	479	306	2
1677	819	339	38	16	chr3	143185253	143185568	-16414215	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-9	356	35	2
1677	432	358	111	60	chr3	143186130	143186582	-16413201	+	LTR16E1	LTR	ERVL	4	478	-60	2
1677	274	321	44	18	chr3	143194701	143194815	-16404968	+	LTR33	LTR	ERVL	378	494	-21	2
1677	346	287	123	8	chr3	143202159	143202289	-16397494	-	RMER15	LTR	ERVL	-59	516	372	2
1677	1798	238	28	20	chr3	143202722	143203064	-16396719	+	MTD	LTR	MaLR	12	363	-56	2
1677	3590	31	28	5	chr3	143203064	143203490	-16396293	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	2
1677	1798	238	28	20	chr3	143203490	143203538	-16396245	+	MTD	LTR	MaLR	364	405	-14	2
1677	1803	194	45	5	chr3	143206839	143207213	-16392570	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	982	1370	0	2
1677	640	263	51	0	chr3	143207213	143207369	-16392414	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	164	-210	2
1677	1105	256	88	47	chr3	143208314	143208634	-16391149	-	MTE2b	LTR	MaLR	-31	348	16	2
1677	1985	146	21	82	chr3	143213025	143213405	-16386378	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	38	2
1677	364	313	53	78	chr3	143217724	143218005	-16381778	-	MLT2D	LTR	ERVL	-90	324	51	2
1677	237	356	0	0	chr3	143218552	143218642	-16381141	-	MLT2D	LTR	ERVL	-464	92	3	2
1677	671	310	55	4	chr3	143220497	143220747	-16379036	-	MTD	LTR	MaLR	-140	239	8	2
1677	225	384	65	52	chr3	143221334	143221625	-16378158	-	MLT1I	LTR	MaLR	0	411	117	2
1677	326	393	87	8	chr3	143221871	143222135	-16377648	+	MLT1I	LTR	MaLR	109	393	-18	2
1677	957	273	15	83	chr3	143255915	143256283	-16343500	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	368	-11	3
1678	2557	102	7	5	chr3	143275868	143276280	-16323503	+	MTB-int	LTR	MaLR	686	1098	0	3
1678	3390	48	5	0	chr3	143276280	143276678	-16323105	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1678	1431	265	33	14	chr3	143282323	143282690	-16317093	-	MTEa	LTR	MaLR	-5	374	1	3
1678	926	180	74	114	chr3	143290475	143290706	-16309077	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	208	-319	3
1678	294	238	26	87	chr3	143290840	143290955	-16308828	-	MLT1C	LTR	MaLR	-26	441	334	3
1678	228	352	88	53	chr3	143298372	143298543	-16301240	-	ORR1E	LTR	MaLR	-111	248	72	3
1678	258	333	30	30	chr3	143298679	143298778	-16301005	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	100	-259	3
1678	404	354	108	0	chr3	143299219	143299377	-16300406	+	MTE2b	LTR	MaLR	91	265	-114	3
1678	842	260	172	54	chr3	143302525	143302879	-16296904	+	MTD	LTR	MaLR	10	405	-14	3
1678	253	286	16	0	chr3	143305741	143305804	-16293979	+	MLT1D	LTR	MaLR	89	152	-353	3
1678	786	226	126	22	chr3	143305825	143306056	-16293727	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	116	3
1678	287	394	38	53	chr3	143306042	143306305	-16293478	+	MLT1D	LTR	MaLR	171	429	-76	3
1678	2179	180	104	35	chr3	143310568	143311114	-16288669	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	1	3
1678	562	337	89	15	chr3	143336675	143336934	-16262849	+	RMER15	LTR	ERVL	296	573	-2	4
1678	238	186	47	0	chr3	143337320	143337363	-16262420	+	MLT1A1	LTR	MaLR	364	408	0	4
1678	1808	157	83	3	chr3	143345722	143346047	-16253736	+	ORR1B2	LTR	MaLR	3	353	-14	4
1678	507	320	93	43	chr3	143346616	143346894	-16252889	+	MLT2B2	LTR	ERVL	224	515	0	4
1678	263	311	87	32	chr3	143354340	143354466	-16245317	+	MLT1E2	LTR	MaLR	527	627	0	4
1678	1091	276	72	43	chr3	143357799	143358153	-16241630	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	419	0	4
1678	1067	248	86	15	chr3	143368592	143368919	-16230864	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	5	4
1678	259	341	0	62	chr3	143371368	143371465	-16228318	+	RMER15	LTR	ERVL	371	461	-114	4
1678	453	185	10	42	chr3	143375408	143375504	-16224279	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-1193	157	65	4
1678	781	284	113	64	chr3	143377519	143377915	-16221868	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	419	0	4
1678	231	279	0	29	chr3	143377951	143378021	-16221762	+	MLT1A1	LTR	MaLR	337	404	-4	4
1678	1744	210	36	29	chr3	143378575	143378991	-16220792	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1678	913	316	36	104	chr3	143378995	143379380	-16220403	-	MTE2a	LTR	MaLR	-10	369	11	4
1678	409	265	34	68	chr3	143387511	143387657	-16212126	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	141	-218	5
1678	529	250	64	59	chr3	143388006	143388193	-16211590	+	ORR1E	LTR	MaLR	169	356	-3	5
1679	260	326	0	10	chr3	143395590	143395686	-16204097	+	MLT1C	LTR	MaLR	333	427	-40	5
1679	458	337	0	14	chr3	143408838	143409049	-16190734	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4173	4380	-1334	5
1679	1965	134	149	0	chr3	143409199	143409542	-16190241	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	5
1679	272	286	0	0	chr3	143409643	143409713	-16190070	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	4676	4745	-969	5
1679	283	304	65	0	chr3	143409840	143409978	-16189805	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5150	5296	-418	5
1679	309	250	80	8	chr3	143410166	143410291	-16189492	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5531	5664	-50	5
1679	330	261	38	92	chr3	143410314	143410445	-16189338	+	MLT1E3	LTR	MaLR	56	179	-445	5
1679	467	279	53	24	chr3	143410349	143410518	-16189265	+	MLT2C1	LTR	ERVL	69	242	-155	5
1679	464	287	132	101	chr3	143429290	143429677	-16170106	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-8	400	2	5
1679	571	349	75	39	chr3	143436677	143437038	-16162745	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	374	0	5
1679	318	382	114	37	chr3	143441442	143441741	-16158042	-	LTR16A	LTR	ERVL	-14	437	116	5
1679	492	279	13	33	chr3	143464893	143465045	-16134738	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	149	-407	6
1679	237	361	73	87	chr3	143465684	143465984	-16133799	-	MLT1J	LTR	MaLR	-7	505	210	6
1679	569	293	100	84	chr3	143467979	143468288	-16131495	-	MTEa	LTR	MaLR	-63	316	3	6
1679	855	182	58	6	chr3	143481586	143481757	-16118026	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	184	-190	6
1679	226	257	53	26	chr3	143481902	143481978	-16117805	+	ORR1D1	LTR	MaLR	166	243	-131	6
1679	249	263	167	50	chr3	143482222	143482342	-16117441	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-82	472	339	6
1679	246	314	149	28	chr3	143483684	143483825	-16115958	-	LTR33	LTR	ERVL	-355	160	3	6
1679	961	261	47	97	chr3	143488057	143488396	-16111387	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	36	6
1679	249	319	120	11	chr3	143495913	143496005	-16103778	+	MLT1A0	LTR	MaLR	24	125	-240	6
1679	229	316	59	59	chr3	143509563	143509664	-16090119	-	RLTR45	LTR	ERVK	-378	104	4	1
1679	1455	152	216	7	chr3	143511901	143512193	-16087590	+	ORR1B2	LTR	MaLR	6	358	-9	1
1680	1069	282	80	36	chr3	143530808	143531220	-16068563	-	MER57F	LTR	ERV1	-1	435	6	3
1680	609	320	120	42	chr3	143532344	143532677	-16067106	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-3	362	4	3
1680	236	276	83	68	chr3	143539770	143539902	-16059881	-	ORR1E	LTR	MaLR	-220	139	6	5
1680	582	261	94	0	chr3	143540880	143541018	-16058765	+	MTE2b	LTR	MaLR	15	165	-214	5
1680	308	229	81	35	chr3	143541068	143541154	-16058629	+	MTE2b	LTR	MaLR	269	358	-21	5
1680	3165	44	10	3	chr3	143545624	143546015	-16053768	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	3	6
1680	660	362	20	111	chr3	143551787	143551928	-16047855	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	233	7
1680	716	272	91	48	chr3	143551928	143552279	-16047504	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	7
1680	660	362	20	111	chr3	143552279	143552541	-16047242	-	MTEa	LTR	MaLR	-147	232	1	7
1680	2612	273	120	45	chr3	143552543	143553399	-16046384	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-2	1578	649	7
1680	2612	273	120	45	chr3	143553589	143553710	-16046073	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-932	648	528	7
1680	843	341	25	44	chr3	143554111	143554473	-16045310	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1022	558	204	7
1680	2721	87	19	22	chr3	143554477	143554887	-16044896	+	BGLII	LTR	ERVK	1	409	-12	7
1680	751	278	26	5	chr3	143554902	143555097	-16044686	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1376	204	6	7
1680	1031	325	34	11	chr3	143555198	143555547	-16044236	-	MTEa	LTR	MaLR	-18	361	5	7
1680	921	274	62	88	chr3	143555718	143556106	-16043677	+	MTEa	LTR	MaLR	2	379	0	7
1680	244	258	54	43	chr3	143556464	143556557	-16043226	-	MLT1A	LTR	MaLR	-1	373	280	7
1680	528	324	105	55	chr3	143560162	143560591	-16039192	-	MLT1D	LTR	MaLR	-15	490	37	8
1680	421	284	30	0	chr3	143567677	143567811	-16031972	+	LTR79	LTR	ERVL	388	525	-2	9
1680	893	279	107	37	chr3	143568119	143568473	-16031310	+	MTEb	LTR	MaLR	1	379	0	9
1680	1067	252	213	17	chr3	143585450	143585802	-16013981	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	1	447	-104	1
1680	1067	252	213	17	chr3	143585873	143585981	-16013802	+	RLTR20A1	LTR	ERVK	448	550	-1	1
1680	1497	220	74	17	chr3	143591955	143592307	-16007476	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	1
1680	3152	148	80	98	chr3	143594198	143594820	-16004963	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
1680	383	290	77	99	chr3	143599308	143599580	-16000203	+	MLT1A0	LTR	MaLR	3	268	-97	1
1680	1655	199	73	39	chr3	143600230	143600585	-15999198	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	1
1680	7001	176	73	29	chr3	143600585	143602030	-15997753	+	ORR1B2-int	LTR	MaLR	1	1509	0	1
1680	856	161	68	0	chr3	143603035	143603196	-15996587	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	222	1
1680	2148	156	73	8	chr3	143604584	143604953	-15994830	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	1	1
1680	1858	175	41	6	chr3	143606342	143606686	-15993097	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-16	358	3	1
1680	229	212	126	23	chr3	143613161	143613248	-15986535	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	410	1
1680	455	276	21	0	chr3	143623798	143623943	-15975840	+	MLT1J2	LTR	MaLR	45	192	-256	1
1680	372	280	82	20	chr3	143654461	143654607	-15945176	-	MLT1H	LTR	MaLR	-394	155	1	2
1681	2844	82	42	8	chr3	143655134	143655517	-15944266	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1681	2017	201	2	36	chr3	143656980	143657397	-15942386	-	MTC	LTR	MaLR	-18	403	1	2
1681	772	284	104	30	chr3	143662452	143662790	-15936993	+	MTEa	LTR	MaLR	3	365	-14	2
1681	1747	219	30	21	chr3	143678219	143678629	-15921154	-	MTD	LTR	MaLR	-33	386	1	2
1681	2510	88	186	0	chr3	143680252	143680617	-15919166	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-3	433	1	2
1681	328	257	99	46	chr3	143681207	143681358	-15918425	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-10	644	486	2
1681	327	267	84	79	chr3	143685161	143685364	-15914419	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-204	204	1	2
1681	329	298	56	8	chr3	143689765	143689890	-15909893	+	ORR1D2	LTR	MaLR	7	137	-233	2
1681	966	271	32	32	chr3	143703226	143703566	-15896217	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	340	-19	2
1681	477	280	70	74	chr3	143709231	143709489	-15890294	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	301	2
1681	347	174	31	148	chr3	143709535	143709663	-15890120	-	RMER15	LTR	ERVL	-461	114	2	2
1681	341	306	94	44	chr3	143709729	143709910	-15889873	-	ORR1E	LTR	MaLR	-166	193	4	2
1681	400	365	56	19	chr3	143716540	143716808	-15882975	+	MLT1I	LTR	MaLR	42	319	-92	2
1681	733	333	102	28	chr3	143719266	143719726	-15880057	+	MLT1H1	LTR	MaLR	54	547	-8	2
1681	427	302	53	29	chr3	143720933	143721122	-15878661	+	MLT1H1	LTR	MaLR	298	549	-6	3
1681	473	316	59	0	chr3	143722673	143722809	-15876974	+	MTEa	LTR	MaLR	3	146	-233	3
1681	2439	139	42	10	chr3	143724300	143724708	-15875075	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1681	271	250	429	0	chr3	143736188	143736363	-15863420	+	MLT1A1	LTR	MaLR	75	374	0	3
1681	3532	28	0	0	chr3	143740202	143740598	-15859185	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1681	1439	233	24	107	chr3	143747483	143747896	-15851887	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	3
1681	583	287	76	16	chr3	143755340	143755524	-15844259	+	MTEb	LTR	MaLR	185	379	0	3
1681	416	283	84	16	chr3	143756009	143756210	-15843573	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-92	278	73	3
1681	467	303	137	77	chr3	143758603	143758939	-15840844	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	359	4	3
1681	850	281	87	48	chr3	143772295	143772545	-15827238	-	MLT2D	LTR	ERVL	-68	346	96	3
1681	850	281	87	48	chr3	143772620	143772702	-15827081	-	MLT2D	LTR	ERVL	-319	95	2	3
1681	857	223	107	28	chr3	143774972	143775299	-15824484	+	MLT1B	LTR	MaLR	12	364	-26	3
1681	2427	171	0	2	chr3	143777671	143778082	-15821701	-	MTC	LTR	MaLR	-11	410	1	3
1681	5252	160	97	22	chr3	143778084	143778274	-15821509	-	MTC-int	LTR	MaLR	-2	1256	1053	3
1681	5252	160	97	22	chr3	143778428	143779398	-15820385	-	MTC-int	LTR	MaLR	-206	1052	10	3
1681	2499	169	29	0	chr3	143779413	143779822	-15819961	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1682	298	378	13	13	chr3	143786199	143786349	-15813434	+	LTR16A	LTR	ERVL	183	332	-119	3
1682	1135	280	14	22	chr3	143788120	143788481	-15811302	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	377	20	3
1682	385	345	99	42	chr3	143791268	143791601	-15808182	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	355	-10	4
1682	2270	143	62	0	chr3	143795153	143795523	-15804260	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	2	4
1682	4393	146	53	112	chr3	143797241	143798310	-15801473	+	RMER21A	LTR	ERV1	5	945	-2	4
1682	374	216	3	22	chr3	143798690	143798792	-15800991	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	103	-226	4
1682	1584	133	39	112	chr3	143798798	143799129	-15800654	+	ORR1B1	LTR	MaLR	80	386	-8	4
1682	1664	176	99	3	chr3	143799513	143799855	-15799928	+	MTEb	LTR	MaLR	5	379	0	4
1682	837	222	330	20	chr3	143810319	143810607	-15789176	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	379	0	4
1682	940	309	10	104	chr3	143812205	143812609	-15787174	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	11	4
1682	296	234	26	0	chr3	143814811	143814888	-15784895	+	MLT1B	LTR	MaLR	303	381	-9	4
1682	227	234	210	80	chr3	143818771	143818947	-15780836	+	LTR50	LTR	ERVL	70	268	-527	4
1682	1283	243	86	6	chr3	143830282	143830621	-15769162	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	4
1682	2026	151	66	17	chr3	143831003	143831353	-15768430	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1682	1797	187	25	27	chr3	143832927	143833295	-15766488	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	4
1682	291	154	0	0	chr3	143833295	143833347	-15766436	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	1458	4
1682	5093	163	54	90	chr3	143833337	143834593	-15765190	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	-298	1211	1	4
1682	1898	140	5	69	chr3	143834597	143834973	-15764810	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	8	4
1682	658	269	37	11	chr3	143834999	143835187	-15764596	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	193	-166	4
1682	826	223	276	3	chr3	143843679	143843990	-15755793	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	12	4
1682	813	244	118	52	chr3	143845340	143845629	-15754154	+	ORR1E	LTR	MaLR	6	313	-46	4
1682	1607	209	156	16	chr3	143875645	143875729	-15724054	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-7	561	479	5
1682	1607	209	156	16	chr3	143875774	143876137	-15723646	-	RLTR20D	LTR	ERVK	-90	478	53	5
1682	667	256	96	39	chr3	143876456	143876794	-15722989	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	248	602	-78	5
1682	265	291	23	11	chr3	143882680	143882767	-15717016	+	MLT1J	LTR	MaLR	40	127	-385	5
1682	234	329	109	74	chr3	143885519	143885886	-15713897	+	MLT1J	LTR	MaLR	178	557	-53	5
1682	723	279	184	10	chr3	143900074	143900379	-15699404	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-7	358	1	5
1682	2244	98	38	0	chr3	143902413	143902728	-15697055	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1682	270	317	145	37	chr3	143908932	143909201	-15690582	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	595	298	5
1682	948	274	78	22	chr3	143910532	143910890	-15688893	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	1	5
1682	820	199	23	6	chr3	143911403	143911580	-15688203	-	MLT1B	LTR	MaLR	-208	182	3	5
1682	484	292	232	23	chr3	143913850	143914242	-15685541	-	MLT1J	LTR	MaLR	-4	508	35	5
1683	2147	131	19	0	chr3	143926426	143926747	-15673036	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1683	289	281	32	43	chr3	143928976	143929069	-15670714	-	MLT1K	LTR	MaLR	-176	419	328	5
1683	789	330	45	8	chr3	143930442	143930794	-15668989	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	5
1683	478	306	59	114	chr3	143932516	143932821	-15666962	+	MLT2D	LTR	ERVL	77	354	-60	5
1683	502	335	126	35	chr3	143946642	143947188	-15652595	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-14	613	2	6
1683	743	265	103	18	chr3	143947686	143947909	-15651874	+	LTR81C	LTR	ERV1?	912	1153	0	6
1683	305	308	117	25	chr3	143948244	143948407	-15651376	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-201	243	66	6
1683	1092	265	52	106	chr3	143950843	143951231	-15648552	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	369	-10	6
1683	246	286	300	17	chr3	143951393	143951731	-15648052	+	MER31A	LTR	ERV1	4	437	-48	6
1683	2216	116	25	0	chr3	143954805	143955123	-15644660	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	326	-1	6
1683	2019	206	34	8	chr3	143955474	143955860	-15643923	+	MTD	LTR	MaLR	12	407	-12	6
1683	2191	140	11	11	chr3	143958335	143958689	-15641094	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	6
1683	264	297	10	99	chr3	143958832	143958933	-15640850	-	MTEa	LTR	MaLR	-287	92	1	6
1683	1819	178	40	40	chr3	143958952	143959327	-15640456	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	10	6
1683	3380	35	5	2	chr3	143964599	143964994	-15634789	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1683	936	282	204	21	chr3	143965574	143965961	-15633822	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	45	6
1683	1348	189	68	37	chr3	143968771	143969136	-15630647	-	MTD	LTR	MaLR	-13	394	1	6
1683	693	342	81	27	chr3	143979324	143979732	-15620051	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-1	554	125	6
1683	693	311	77	80	chr3	143985093	143985443	-15614340	-	MLT1L	LTR	MaLR	-221	389	41	6
1683	486	211	33	50	chr3	143986532	143986652	-15613131	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-326	118	1	6
1683	380	254	109	29	chr3	143987587	143987725	-15612058	-	MLT1C	LTR	MaLR	-51	416	268	7
1683	375	257	55	9	chr3	143987795	143987905	-15611878	-	MLT1C	LTR	MaLR	-291	176	62	7
1683	617	291	173	19	chr3	143988070	143988336	-15611447	+	RMER20B	LTR	ERVK	97	403	-224	7
1683	2131	150	70	21	chr3	143989855	143990229	-15609554	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	7
1683	2548	137	45	0	chr3	144000992	144001393	-15598390	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	1
1683	878	144	24	18	chr3	144001393	144001563	-15598220	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1088	1
1683	3267	201	61	103	chr3	144001709	144001856	-15597927	-	MTC-int	LTR	MaLR	-110	988	887	1
1683	3267	201	61	103	chr3	144002058	144002919	-15596864	-	MTC-int	LTR	MaLR	-212	886	22	1
1683	2224	165	50	0	chr3	144002945	144003344	-15596439	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	1	1
1683	1123	260	23	162	chr3	144007659	144008091	-15591692	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	8	1
1683	249	312	0	15	chr3	144009341	144009406	-15590377	-	MLT1H2	LTR	MaLR	-57	432	369	1
1683	345	170	278	19	chr3	144014103	144014211	-15585572	-	RMER15	LTR	ERVL	-72	503	368	2
1683	516	288	35	18	chr3	144023063	144023233	-15576550	-	MTE2b	LTR	MaLR	-72	307	135	3
1683	285	274	33	77	chr3	144024541	144024632	-15575151	+	MT2B	LTR	ERVL	155	241	-360	3
1683	1230	272	121	19	chr3	144032219	144032691	-15567092	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	520	0	5
1683	1006	337	35	35	chr3	144036760	144037184	-15562599	-	LTR16A	LTR	ERVL	-10	441	18	5
1683	452	175	47	109	chr3	144045687	144045815	-15553968	+	MT2B	LTR	ERVL	145	264	-337	6
1684	1375	171	208	13	chr3	144050409	144050722	-15549061	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	7
1684	1993	94	14	14	chr3	144054598	144054890	-15544893	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-37	292	1	8
1684	2028	157	119	5	chr3	144066960	144067338	-15532445	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1684	1555	170	32	171	chr3	144070636	144071069	-15528714	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	373	-1	1
1684	1240	253	78	15	chr3	144071635	144072012	-15527771	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-9	432	47	1
1684	256	232	0	18	chr3	144072372	144072429	-15527354	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-384	57	2	1
1684	635	107	235	0	chr3	144075473	144075622	-15524161	-	RMER17C	LTR	ERVK	-225	185	2	1
1684	472	367	58	49	chr3	144077776	144078105	-15521678	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	333	-26	1
1684	410	184	8	149	chr3	144078409	144078530	-15521253	-	MT2B	LTR	ERVL	-332	269	166	1
1684	1122	209	88	64	chr3	144079440	144079782	-15520001	-	MTD	LTR	MaLR	-59	360	11	1
1684	1950	148	148	83	chr3	144080733	144081152	-15518631	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	1
1684	353	287	12	133	chr3	144083967	144084140	-15515643	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-438	189	38	1
1684	3543	32	0	132	chr3	144086441	144086943	-15512840	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	1
1684	634	241	94	70	chr3	144101915	144102248	-15497535	+	MTE2a	LTR	MaLR	61	379	0	1
1684	240	367	79	33	chr3	144102972	144103124	-15496659	+	MLT1J	LTR	MaLR	116	274	-238	1
1684	1615	211	56	75	chr3	144103663	144103854	-15495929	+	MTD	LTR	MaLR	1	186	-233	1
1684	1615	211	56	75	chr3	144104024	144104243	-15495540	+	MTD	LTR	MaLR	187	403	-16	1
1684	1452	266	63	96	chr3	144104244	144105301	-15494482	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4042	5310	-470	1
1684	304	290	185	10	chr3	144105301	144105496	-15494287	+	RMER4A	LTR	ERVK	211	439	-27	1
1684	5090	170	54	32	chr3	144105496	144106105	-15493678	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7762	8375	-584	1
1684	3125	168	8	15	chr3	144106105	144106630	-15493153	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-3	525	5	1
1684	5090	170	54	32	chr3	144106630	144107193	-15492590	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8376	8958	-1	1
1684	1010	249	39	50	chr3	144107193	144107531	-15492252	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	334	-25	1
1684	754	330	45	29	chr3	144117243	144117690	-15482093	+	MT2A	LTR	ERVL	3	456	-77	2
1684	663	218	164	0	chr3	144117979	144118199	-15481584	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	164	2
1684	387	214	26	88	chr3	144118353	144118466	-15481317	-	MTD	LTR	MaLR	-315	106	1	2
1684	2551	126	13	5	chr3	144121424	144121815	-15477968	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	2
1684	766	242	201	14	chr3	144128784	144129077	-15470706	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	351	-8	2
1684	3643	80	2	10	chr3	144139153	144139632	-15460151	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	2
1684	3567	18	2	0	chr3	144139997	144140392	-15459391	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1684	283	321	140	35	chr3	144141814	144141985	-15457798	-	LTR41	LTR	ERVL	-577	191	3	2
1684	282	336	59	98	chr3	144142243	144142550	-15457233	+	MTEa	LTR	MaLR	53	347	-32	2
1684	245	226	32	0	chr3	144145482	144145544	-15454239	+	MTE2a	LTR	MaLR	22	85	-285	2
1684	1243	199	35	53	chr3	144145580	144146059	-15453724	-	RMER4B	LTR	ERVK	0	466	17	2
1684	524	227	108	24	chr3	144146063	144146230	-15453553	+	MTE2a	LTR	MaLR	197	377	-2	2
1684	2702	52	2	101	chr3	144150169	144150574	-15449209	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	2
1684	261	175	63	0	chr3	144151762	144151825	-15447958	+	MTC	LTR	MaLR	3	69	-352	2
1684	514	138	20	145	chr3	144151823	144151975	-15447808	+	MTD	LTR	MaLR	277	409	-10	2
1684	1442	196	226	12	chr3	144158799	144159144	-15440639	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
1684	3096	47	37	0	chr3	144166526	144166908	-15432875	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1684	1081	240	54	73	chr3	144170323	144170764	-15429019	+	RMER4A	LTR	ERVK	32	464	-2	2
1684	457	233	188	37	chr3	144170947	144171039	-15428744	+	ORR1C2	LTR	MaLR	57	165	-209	2
1684	502	207	86	17	chr3	144171067	144171246	-15428537	+	ORR1C2	LTR	MaLR	166	379	-5	2
1684	903	227	110	144	chr3	144172496	144172913	-15426870	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	3	2
1684	225	314	45	23	chr3	144178743	144178831	-15420952	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-520	107	18	2
1685	3354	38	5	0	chr3	144188096	144188490	-15411293	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1685	3059	125	26	19	chr3	144191039	144191119	-15408664	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-6	535	452	3
1685	3059	125	26	19	chr3	144191191	144191640	-15408143	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-90	451	4	3
1685	3901	47	19	0	chr3	144198981	144199447	-15400336	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	3
1685	235	283	112	92	chr3	144212954	144213160	-15386623	+	ORR1E	LTR	MaLR	96	305	-54	3
1685	1379	155	25	66	chr3	144222507	144222934	-15376849	+	MT2A	LTR	ERVL	1	490	-43	3
1685	276	134	0	0	chr3	144222975	144223042	-15376741	+	MT2A	LTR	ERVL	467	533	0	3
1685	434	241	37	22	chr3	144223573	144223709	-15376074	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	271	3
1685	425	248	313	4	chr3	144224528	144224771	-15375012	+	MTE2b	LTR	MaLR	58	375	-4	3
1685	496	316	174	17	chr3	144239010	144239303	-15360480	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-8	587	249	3
1685	2035	178	42	113	chr3	144245141	144245691	-15354092	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-1	511	1	3
1685	387	301	100	20	chr3	144248657	144248857	-15350926	-	MTEb	LTR	MaLR	-159	220	5	3
1685	2956	30	185	0	chr3	144250792	144251160	-15348623	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	3
1685	1820	181	65	3	chr3	144251660	144252032	-15347751	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	12	3
1685	2134	155	45	3	chr3	144264647	144264682	-15335101	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	359	4
1685	2982	87	12	71	chr3	144264682	144265163	-15334620	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	453	0	4
1685	2134	155	45	3	chr3	144265163	144265503	-15334280	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-36	358	2	4
1685	808	281	140	52	chr3	144267030	144267436	-15332347	+	MLT2C2	LTR	ERVL	17	458	-6	4
1685	352	313	73	20	chr3	144271880	144272030	-15327753	+	ORR1E	LTR	MaLR	38	195	-164	4
1685	717	208	77	12	chr3	144272225	144272395	-15327388	+	ORR1E	LTR	MaLR	179	359	0	4
1685	490	246	56	39	chr3	144272435	144272613	-15327170	-	MLT1B	LTR	MaLR	-2	388	208	4
1685	446	289	65	32	chr3	144272727	144272881	-15326902	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1230	1388	-4134	4
1685	511	250	121	11	chr3	144273198	144273388	-15326395	-	MLT1B	LTR	MaLR	-179	211	1	4
1685	930	207	199	26	chr3	144273788	144274057	-15325726	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	321	-63	4
1685	930	207	199	26	chr3	144274233	144274275	-15325508	+	ORR1C2	LTR	MaLR	322	366	-18	4
1685	1981	137	19	65	chr3	144275040	144275470	-15324313	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	4
1685	239	273	99	20	chr3	144278164	144278265	-15321518	-	MLT1K	LTR	MaLR	-8	587	479	4
1685	504	330	147	14	chr3	144278657	144279010	-15320773	-	MLT1K	LTR	MaLR	-126	469	70	4
1685	412	272	48	92	chr3	144281159	144281374	-15318409	-	MTD	LTR	MaLR	-207	212	8	4
1685	2224	97	3	6	chr3	144281946	144282279	-15317504	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	332	-5	4
1685	3632	61	5	35	chr3	144282279	144283036	-15316747	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	6	662	-5819	4
1685	953	84	0	0	chr3	144283036	144283155	-15316628	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	1359	1477	-5004	4
1685	1900	90	4	0	chr3	144283156	144283401	-15316382	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	2252	2497	-5183	4
1685	15101	42	5	3	chr3	144283428	144285197	-15314586	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4708	6479	-2	4
1685	2175	115	3	6	chr3	144285199	144285532	-15314251	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	332	-5	4
1685	490	306	49	24	chr3	144285629	144285793	-15313990	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-83	282	115	4
1685	227	200	246	0	chr3	144286007	144286072	-15313711	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-284	81	1	4
1685	2483	127	152	20	chr3	144287776	144288284	-15311499	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	4
1685	2171	161	56	5	chr3	144289716	144290109	-15309674	+	MTC	LTR	MaLR	9	421	0	4
1685	1244	192	20	17	chr3	144290305	144290602	-15309181	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	298	-144	4
1685	805	174	5	32	chr3	144290681	144290871	-15308912	+	RMER10A	LTR	ERVL	258	442	0	4
1685	412	261	105	64	chr3	144291148	144291613	-15308170	+	LTR73	LTR	ERV1	6	535	-37	4
1685	266	333	117	90	chr3	144291889	144292189	-15307594	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	308	-51	4
1685	4056	102	19	36	chr3	144294555	144295194	-15304589	-	RLTR5_Mm	LTR	ERV1	0	628	1	4
1685	1260	247	47	73	chr3	144295374	144295758	-15304025	-	MTD	LTR	MaLR	-34	385	12	4
1685	402	79	16	0	chr3	144297240	144297303	-15302480	-	RLTR40	LTR	ERVK	-594	223	160	4
1685	345	349	141	8	chr3	144299122	144299385	-15300398	-	ORR1E	LTR	MaLR	-59	300	3	4
1685	960	248	139	9	chr3	144299626	144299959	-15299824	+	MTD	LTR	MaLR	45	398	-21	4
1685	401	290	52	62	chr3	144303703	144303993	-15295790	+	RMER10A	LTR	ERVL	12	298	-144	4
1685	270	219	80	27	chr3	144304455	144304530	-15295253	+	RMER10A	LTR	ERVL	346	424	-18	4
1685	338	306	58	0	chr3	144304624	144304745	-15295038	+	LTR16C	LTR	ERVL	358	485	-4	4
1685	259	307	50	0	chr3	144304814	144304915	-15294868	-	LTR37B	LTR	ERV1	0	468	363	4
1685	1056	282	37	24	chr3	144305063	144305437	-15294346	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	4
1685	613	268	23	138	chr3	144307366	144307713	-15292070	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	217	4
1685	2952	146	20	33	chr3	144308245	144308792	-15290991	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	540	-563	5
1685	3083	31	6	0	chr3	144309203	144309558	-15290225	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	1	5
210	3080	83	2	12	chr3	144309869	144310273	-15289510	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1686	1704	115	15	7	chr3	144314391	144314662	-15285121	+	MTC	LTR	MaLR	149	421	0	5
1686	495	316	31	15	chr3	144315686	144315882	-15283901	+	RMER15	LTR	ERVL	363	561	-14	5
1686	2094	143	66	14	chr3	144324346	144324693	-15275090	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-2	365	1	5
1686	957	202	253	67	chr3	144325652	144325749	-15274034	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	434	5
1686	957	202	253	67	chr3	144325799	144326151	-15273632	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-101	433	1	5
1686	2480	177	72	13	chr3	144326675	144327206	-15272577	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	14	5
1686	425	390	39	7	chr3	144331352	144331657	-15268126	+	MLT1I	LTR	MaLR	93	407	-4	5
1686	706	280	159	16	chr3	144331902	144332337	-15267446	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	497	-8	5
1686	281	244	22	55	chr3	144332887	144332978	-15266805	+	MLT1L	LTR	MaLR	120	207	-403	5
1686	643	266	8	59	chr3	144333954	144334190	-15265593	+	RLTR11B	LTR	ERVK	16	239	-214	5
1686	480	241	48	60	chr3	144334361	144334529	-15265254	+	RLTR11B	LTR	ERVK	273	438	-15	5
1686	2593	165	74	18	chr3	144336318	144336818	-15262965	-	RLTR11A	LTR	ERVK	0	528	1	5
1686	246	264	140	9	chr3	144337132	144337239	-15262544	+	MLT1F	LTR	MaLR	392	512	-36	5
1686	2134	145	111	115	chr3	144339702	144340233	-15259550	+	RLTR24	LTR	ERV1	1	529	0	5
1686	2093	131	34	83	chr3	144347255	144347639	-15252144	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	365	-2	5
1686	505	212	65	52	chr3	144361580	144361734	-15238049	+	ORR1E	LTR	MaLR	176	331	-28	5
1686	401	200	160	8	chr3	144370355	144370486	-15229297	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	152	-227	5
1686	302	208	95	38	chr3	144378702	144378807	-15220976	+	MTD	LTR	MaLR	309	419	0	6
1686	1097	266	158	28	chr3	144389185	144389545	-15210238	+	MTD	LTR	MaLR	13	419	0	6
1686	2067	124	14	72	chr3	144394154	144394501	-15205282	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	327	-2	6
1686	1050	111	41	0	chr3	144394503	144394674	-15205109	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	178	-1785	6
1686	4927	108	45	110	chr3	144394672	144395145	-15204638	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1063	1571	-392	6
1686	3434	29	39	0	chr3	144395145	144395526	-15204257	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1686	9848	27	4	2	chr3	144395526	144396622	-15203161	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	6
1686	3461	26	39	0	chr3	144396622	144397003	-15202780	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1686	4927	108	45	110	chr3	144397003	144397491	-15202292	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1572	1961	-2	6
1686	1857	143	61	20	chr3	144397491	144397832	-15201951	+	ORR1A4	LTR	MaLR	38	392	-2	6
1686	2058	217	35	12	chr3	144418914	144419394	-15180389	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	491	-14	6
1686	341	123	17	17	chr3	144425375	144425433	-15174350	+	RLTR17	LTR	ERVK	98	155	-537	6
1686	464	196	44	63	chr3	144425619	144425777	-15174006	+	RLTR43A	LTR	ERVK	210	364	0	6
1686	1584	164	106	32	chr3	144426530	144426870	-15172913	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-4811	595	231	6
1686	1393	210	23	4	chr3	144427284	144427542	-15172241	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	4268	4530	-2876	6
1686	3443	193	19	16	chr3	144427607	144428277	-15171506	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	5122	5793	-1613	6
1686	1069	169	25	15	chr3	144428320	144428518	-15171265	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3791	3990	-1416	6
1686	428	313	111	76	chr3	144429389	144429413	-15170370	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6489	6500	-419	6
1686	447	309	8	0	chr3	144429413	144429539	-15170244	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	4437	4563	-428	6
1686	428	313	111	76	chr3	144429539	144429769	-15170014	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6501	6619	-300	6
1686	1980	205	70	5	chr3	144429775	144430163	-15169620	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6646	7058	-348	6
1686	517	228	51	45	chr3	144430263	144430419	-15169364	+	RLTR43A	LTR	ERVK	208	364	0	6
1686	686	205	8	0	chr3	144430419	144430546	-15169237	+	RLTR17	LTR	ERVK	141	268	-424	6
1686	8444	154	56	79	chr3	144430547	144432221	-15167562	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	1378	3431	-3813	6
1686	8444	147	92	28	chr3	144432250	144433246	-15166537	+	ETnERV3-int	LTR	ERVK	2965	3831	-1977	6
1686	7700	147	92	28	chr3	144433338	144433594	-15166189	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2865	3114	-2292	6
1686	3186	128	127	25	chr3	144440278	144440871	-15158912	+	RMER16-int	LTR	ERVK	3524	4176	-1230	6
1686	405	254	8	54	chr3	144440868	144440997	-15158786	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6086	6208	-1198	6
1686	393	273	168	12	chr3	144441163	144441330	-15158453	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	6233	6425	-981	6
1687	307	131	0	103	chr3	144441532	144441600	-15158183	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7327	7387	-19	6
1687	2200	132	35	58	chr3	144441613	144441990	-15157793	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	368	0	6
1687	3253	67	15	0	chr3	144447217	144447607	-15152176	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	5	6
1687	599	141	0	0	chr3	144448181	144448273	-15151510	+	RMER4B	LTR	ERVK	277	368	-217	6
1687	255	339	21	99	chr3	144448290	144448431	-15151352	-	MLT1J	LTR	MaLR	-173	339	210	6
1687	2195	125	91	16	chr3	144451259	144451557	-15148226	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	318	-91	6
1687	2195	125	91	16	chr3	144451615	144451691	-15148092	+	RLTR9E	LTR	ERVK	319	401	-8	6
1687	3093	38	3	3	chr3	144452115	144452461	-15147322	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	6
1687	693	279	104	18	chr3	144453729	144454073	-15145710	+	MTD	LTR	MaLR	1	407	-14	6
1687	1956	137	14	72	chr3	144461018	144461365	-15138418	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	327	-2	7
1687	1156	76	41	0	chr3	144461367	144461538	-15138245	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	178	-1785	7
1687	5043	120	29	100	chr3	144461536	144462506	-15137277	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1063	1963	0	7
1687	1872	153	65	20	chr3	144462506	144462846	-15136937	+	ORR1A4	LTR	MaLR	38	392	-2	7
1687	2008	226	35	12	chr3	144477623	144478103	-15121680	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	491	-14	7
1687	338	70	137	14	chr3	144483088	144483161	-15116622	+	RMER4A	LTR	ERVK	1	82	-384	7
1687	999	200	33	40	chr3	144489669	144490124	-15109659	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	405	-5	7
1687	1394	157	178	13	chr3	144498993	144499296	-15100487	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	353	-41	7
1687	355	239	13	72	chr3	144503409	144503474	-15096309	+	RMER17C	LTR	ERVK	129	184	-226	6
1687	355	239	13	72	chr3	144503650	144503737	-15096046	+	RMER17C	LTR	ERVK	185	272	-138	6
1687	3086	39	164	0	chr3	144520890	144521298	-15078485	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	2
1687	1032	81	0	0	chr3	144521920	144522056	-15077727	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	286	2
1687	2242	60	0	0	chr3	144522054	144522335	-15077448	-	MT2B2	LTR	ERVL	-303	281	1	3
1687	288	283	75	56	chr3	144528063	144528224	-15071559	+	RNLTR23	LTR	ERVK	478	641	-1	4
1687	1203	225	14	120	chr3	144554048	144554484	-15045299	+	RMER15	LTR	ERVL	1	278	-297	6
1687	1122	150	135	0	chr3	144554569	144554769	-15045014	+	RMER15	LTR	ERVL	311	537	-38	6
1687	1061	262	4	0	chr3	144554821	144555069	-15044714	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1	249	-4750	6
1687	2812	214	78	5	chr3	144555083	144555722	-15044061	+	RMER15-int	LTR	ERVL	797	1482	-3517	6
1687	2727	235	35	25	chr3	144555824	144556229	-15043554	+	RMER15-int	LTR	ERVL	1648	2057	-2942	6
1687	4129	89	23	2	chr3	144556229	144556801	-15042982	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	6
1687	2727	235	35	25	chr3	144556801	144557129	-15042654	+	RMER15-int	LTR	ERVL	2058	2389	-2610	6
1687	359	91	0	0	chr3	144557984	144558039	-15041744	+	RMER15	LTR	ERVL	3	57	-518	6
1687	1752	188	81	24	chr3	144558209	144558579	-15041204	+	MTD	LTR	MaLR	11	401	-18	6
1687	2580	57	27	124	chr3	144558878	144559282	-15040501	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	7
1687	313	261	207	103	chr3	144563855	144564116	-15035667	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	288	-80	7
1687	4585	164	38	28	chr3	144564502	144565638	-15034145	+	RMER16-int	LTR	ERVK	292	2175	-5231	8
1687	346	291	0	9	chr3	144565640	144565751	-15034032	+	ETnERV-int	LTR	ERVK	1067	1176	-2138	8
1687	439	266	33	50	chr3	144565943	144566125	-15033658	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2474	2652	-4754	8
1687	1600	126	22	14	chr3	144566296	144566580	-15033203	+	RMER16-int	LTR	ERVK	1566	1838	-3568	8
1687	9329	129	23	13	chr3	144566584	144568215	-15031568	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2691	4338	-1068	8
1687	428	312	21	63	chr3	144568210	144568497	-15031286	+	RLTR6-int	LTR	ERV1	7387	7661	-117	8
1687	505	230	180	116	chr3	144568856	144569200	-15030583	+	RLTR9A	LTR	ERVK	1	366	-2	8
1688	3835	65	0	0	chr3	144580077	144580552	-15019231	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1688	2564	31	2	259	chr3	144598850	144599375	-15000408	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	1
1688	4128	31	0	0	chr3	144599385	144599895	-14999888	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	550	-1437	1
1688	13196	20	4	4	chr3	144599894	144601475	-14998308	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	404	1984	-3	1
1688	2529	36	2	259	chr3	144601477	144602002	-14997781	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	1
1688	2373	129	27	22	chr3	144604109	144604522	-14995261	-	RLTR9F	LTR	ERVK	0	415	1	1
1688	5554	168	31	34	chr3	144604813	144606660	-14993123	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-977	6429	3500	1
1688	5297	136	29	6	chr3	144608392	144609370	-14990413	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-3911	3495	2496	1
1688	5012	111	69	16	chr3	144609395	144610304	-14989479	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-5321	2085	1129	1
1688	2368	118	23	71	chr3	144610478	144610914	-14988869	+	RLTR9F	LTR	ERVK	1	415	0	1
1688	8792	123	28	18	chr3	144611041	144612434	-14987349	+	RMER16-int	LTR	ERVK	2690	4096	-1310	1
1688	3952	58	21	0	chr3	144621447	144621912	-14977871	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	1
1688	3491	184	47	63	chr3	144625402	144626271	-14973512	+	RLTR13A	LTR	ERVK	1	855	0	1
1688	1831	206	108	59	chr3	144634973	144635438	-14964345	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	494	-90	1
1688	1831	206	108	59	chr3	144635477	144635549	-14964234	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	495	565	-19	1
1688	1831	206	108	59	chr3	144635578	144635596	-14964187	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	566	583	-1	1
1688	229	246	40	80	chr3	144641874	144641949	-14957834	+	LTR16E2	LTR	ERVL	504	568	0	1
1688	3595	129	171	3	chr3	144642176	144642936	-14956847	+	RMER12	LTR	ERVK	1	888	-434	1
1688	384	294	28	92	chr3	144642994	144643115	-14956668	+	RLTR21	LTR	ERVK	1287	1381	-191	1
1688	548	181	9	62	chr3	144643127	144643239	-14956544	+	RMER12	LTR	ERVK	1217	1322	0	1
1688	1671	184	50	84	chr3	144648935	144649441	-14950342	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	526	-6	2
1688	417	284	46	71	chr3	144654516	144654713	-14945070	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	192	-167	2
1688	238	320	18	80	chr3	144661702	144661814	-14937969	+	MTEa	LTR	MaLR	4	108	-271	2
1688	1898	187	112	46	chr3	144665693	144666085	-14933698	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	2
1688	830	235	73	0	chr3	144666871	144667050	-14932733	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	192	-182	2
1688	2281	107	22	0	chr3	144675344	144675663	-14924120	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	2
1688	469	342	108	69	chr3	144675971	144676332	-14923451	+	LTR16A1	LTR	ERVL	72	446	-10	2
1688	3166	69	2	31	chr3	144683573	144683992	-14915791	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	2
1688	5963	146	99	21	chr3	144683992	144685157	-14914626	+	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	2	1258	0	2
1688	821	46	0	0	chr3	144685157	144685266	-14914517	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	109	-298	2
1688	3472	154	1	5	chr3	144685268	144685856	-14913927	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-4748	737	176	2
1688	1427	74	15	0	chr3	144685858	144686061	-14913722	+	MT2B2	LTR	ERVL	379	584	0	2
1688	8246	135	31	68	chr3	144698491	144700124	-14899659	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1572	0	2
1688	330	285	16	8	chr3	144701054	144701178	-14898605	+	SRV_MM-int	LTR	ERVK	3482	3606	-2561	2
1689	8166	136	46	52	chr3	144709553	144710864	-14888919	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1287	-285	2
1689	8166	136	46	52	chr3	144710919	144711188	-14888595	+	RLTR21	LTR	ERVK	1288	1571	-1	2
1689	436	331	145	18	chr3	144712835	144713151	-14886632	+	MER31A	LTR	ERV1	70	425	-60	2
1689	4642	64	17	0	chr3	144716057	144716634	-14883149	-	LTRIS_Mus	LTR	ERV1	0	587	1	2
1689	423	207	0	11	chr3	144717664	144717752	-14882031	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	889	975	-5162	2
1689	1536	190	21	59	chr3	144717892	144718266	-14881517	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	987	1346	-4791	2
1689	4754	172	24	54	chr3	144724882	144725900	-14873883	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2183	3169	-2968	2
1689	2786	154	86	28	chr3	144729044	144729580	-14870203	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	2
1689	3385	76	10	4	chr3	144730430	144730917	-14868866	-	RLTR1C	LTR	ERV1	-13	490	1	2
1689	4162	100	187	29	chr3	144736499	144737263	-14862520	+	RMER17D	LTR	ERVK	1	885	-4	3
1689	1458	248	73	79	chr3	144738853	144739361	-14860422	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	505	-7	3
1689	1686	179	13	3	chr3	144752902	144753210	-14846573	+	RMER12	LTR	ERVK	1	311	-1011	3
1689	262	123	88	0	chr3	144753435	144753492	-14846291	+	RMER12	LTR	ERVK	304	365	-957	3
1689	3353	170	91	1	chr3	144756134	144756341	-14843442	-	RLTR25A	LTR	ERVK	0	1103	846	3
1689	3353	170	91	1	chr3	144756400	144756871	-14842912	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-258	845	364	3
1689	395	146	158	0	chr3	144756877	144756959	-14842824	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-1007	96	2	3
1689	1466	245	39	6	chr3	144762898	144763255	-14836528	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	369	-1	3
1689	302	321	112	82	chr3	144763865	144764170	-14835613	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	56	3
1689	1298	64	16	21	chr3	144771795	144771987	-14827796	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	374	3
1689	3403	3	0	0	chr3	144771987	144772354	-14827429	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1689	27679	28	33	3	chr3	144772354	144775558	-14824225	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	3306	-3175	3
1689	832	11	0	0	chr3	144775548	144775639	-14824144	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	4666	4756	-1725	3
1689	10325	22	3	0	chr3	144775639	144776792	-14822991	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5326	6481	0	3
1689	3403	3	0	0	chr3	144776792	144777159	-14822624	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	3
1689	2436	39	116	0	chr3	144777159	144777495	-14822288	-	LTRIS2	LTR	ERV1	-185	379	5	3
1689	758	310	62	36	chr3	144779922	144780230	-14819553	+	MLT1A0	LTR	MaLR	49	364	-1	3
1689	1441	222	78	171	chr3	144782844	144783463	-14816320	-	MTC-int	LTR	MaLR	-456	802	242	3
1689	847	269	72	109	chr3	144784468	144784844	-14814939	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	16	3
1689	225	275	28	28	chr3	144787125	144787196	-14812587	+	MER67D	LTR	ERV1	188	258	-256	3
1689	255	365	32	70	chr3	144799198	144799354	-14800429	+	RMER12	LTR	ERVK	727	876	-446	3
1689	507	244	36	56	chr3	144801412	144801590	-14798193	-	MTD	LTR	MaLR	-218	201	9	3
1689	447	239	78	11	chr3	144801687	144801852	-14797931	+	LTR40b	LTR	ERVL	255	472	-47	3
1689	2122	177	31	98	chr3	144821836	144822034	-14777749	+	MTC	LTR	MaLR	1	196	-225	4
1689	2122	177	31	98	chr3	144822185	144822437	-14777346	+	MTC	LTR	MaLR	197	421	0	4
1689	659	212	166	16	chr3	144823113	144823300	-14776483	-	RMER15	LTR	ERVL	-53	522	308	4
1689	304	242	43	92	chr3	144823329	144823470	-14776313	-	RMER15	LTR	ERVL	-416	159	26	4
1689	242	158	34	34	chr3	144823484	144823543	-14776240	-	RMER15	LTR	ERVL	-515	60	2	4
1689	352	215	51	0	chr3	144824757	144824836	-14774947	+	MTE-int	LTR	MaLR	1343	1425	-155	4
1689	400	274	95	56	chr3	144825309	144825541	-14774242	+	MLT1B	LTR	MaLR	31	271	-119	4
1689	609	294	211	47	chr3	144833346	144833814	-14765969	+	MLT1F	LTR	MaLR	1	545	-3	4
1690	550	214	18	18	chr3	144834940	144835054	-14764729	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	114	-245	4
1690	944	258	42	87	chr3	144838098	144838408	-14761375	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	352	57	4
1690	2413	81	3	3	chr3	144840162	144840484	-14759299	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	6	4
1690	348	331	40	16	chr3	144843080	144843206	-14756577	-	MLT1A	LTR	MaLR	-245	129	1	4
1690	3604	28	2	10	chr3	144850394	144850793	-14748990	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1690	2598	92	0	6	chr3	144853825	144854154	-14745629	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1690	340	285	190	17	chr3	144854188	144854420	-14745363	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-56	500	229	4
1690	396	211	62	35	chr3	144854525	144854638	-14745145	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-146	5611	5496	4
1690	1424	315	84	25	chr3	144854999	144856365	-14743418	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-656	5058	3584	4
1690	1922	167	17	115	chr3	144859627	144860046	-14739737	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	4
1690	788	231	38	143	chr3	144877694	144877987	-14721796	+	RLTR18B	LTR	ERVK	247	508	-4	4
1690	229	314	41	82	chr3	144881823	144881969	-14717814	+	MLT2B1	LTR	ERVL	106	245	-275	4
1690	230	316	63	0	chr3	144881981	144882076	-14717707	+	MLT2B1	LTR	ERVL	394	494	-73	4
1690	1104	280	37	28	chr3	144882719	144883042	-14716741	-	ORR1E	LTR	MaLR	-33	326	1	5
1690	1554	238	21	98	chr3	144887057	144887590	-14712193	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	426	-185	5
1690	1554	283	41	98	chr3	144887613	144887810	-14711973	+	RMER19C	LTR	ERVK	427	611	0	5
1690	577	339	99	51	chr3	144888891	144889219	-14710564	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	344	-15	5
1690	3597	294	77	37	chr3	144889219	144890632	-14709151	+	ORR1E-int	LTR	MaLR	1	1551	-29	5
1690	365	250	31	125	chr3	144890630	144890758	-14709025	+	ORR1E	LTR	MaLR	16	131	-228	5
1690	375	352	24	24	chr3	144890794	144890960	-14708823	+	ORR1E	LTR	MaLR	206	371	-8	5
1690	1033	307	75	14	chr3	144895042	144895471	-14704312	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	13	5
1690	857	235	191	33	chr3	144896653	144896957	-14702826	-	MTE2a	LTR	MaLR	-27	352	1	5
1690	265	254	68	137	chr3	144907237	144907383	-14692400	-	MTEa	LTR	MaLR	-242	137	2	5
1690	346	321	22	105	chr3	144908252	144908354	-14691429	+	MTEa	LTR	MaLR	1	92	-287	5
1690	346	321	22	105	chr3	144908719	144908797	-14690986	+	MTEa	LTR	MaLR	93	166	-213	5
1690	253	338	44	37	chr3	144911626	144911761	-14688022	-	RMER4A	LTR	ERVK	-303	163	28	5
1690	1081	148	53	94	chr3	144912976	144913318	-14686465	-	RMER17C	LTR	ERVK	-1	409	82	5
1690	784	147	8	0	chr3	144914777	144914906	-14684877	-	RMER17C	LTR	ERVK	-280	130	1	5
1690	2434	82	3	0	chr3	144916479	144916797	-14682986	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	5
1690	565	262	63	94	chr3	144921011	144921234	-14678549	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-129	268	53	5
1690	682	292	124	23	chr3	144922145	144922411	-14677372	-	LTR41B	LTR	ERVL	-5	753	461	5
1690	255	372	9	17	chr3	144922717	144922832	-14676951	-	LTR41B	LTR	ERVL	-626	132	19	5
1690	671	284	199	10	chr3	144928206	144928493	-14671290	+	RMER5	LTR	ERV1	33	373	-161	5
1690	639	231	43	12	chr3	144929337	144929499	-14670284	+	RMER5	LTR	ERV1	366	532	-2	5
1690	235	245	26	155	chr3	144931205	144931321	-14668462	+	LTR78	LTR	ERV1	329	429	-875	5
1690	514	357	119	14	chr3	144932856	144933225	-14666558	-	MLT1C	LTR	MaLR	-2	465	58	5
1690	246	255	94	21	chr3	144939831	144939927	-14659856	+	MTEb	LTR	MaLR	273	375	-4	5
1690	1613	186	54	38	chr3	144945845	144946213	-14653570	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1690	1523	215	90	45	chr3	144950240	144950727	-14649056	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	19	5
1690	949	312	80	3	chr3	144961967	144962317	-14637466	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	6
1691	2393	106	3	0	chr3	144970773	144971095	-14628688	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	5	6
1691	236	163	20	0	chr3	144971833	144971882	-14627901	-	RMER15	LTR	ERVL	-525	50	1	6
1691	456	260	18	2	chr3	144986500	144986623	-14613160	+	MTD	LTR	MaLR	171	293	-128	6
1691	243	278	19	76	chr3	144987353	144987458	-14612325	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-9	399	301	6
1691	387	290	111	51	chr3	144992202	144992518	-14607265	-	ORR1E	LTR	MaLR	-1	358	24	6
1691	303	279	70	54	chr3	144998842	144998971	-14600812	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	278	6
1691	381	254	14	87	chr3	145004785	145004923	-14594860	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-237	128	1	6
1691	923	327	141	25	chr3	145013050	145013533	-14586250	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	548	10	1
1691	2021	175	70	13	chr3	145016649	145017037	-14582746	+	MTC	LTR	MaLR	12	421	0	2
1691	359	313	77	12	chr3	145038916	145039084	-14560699	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-1396	4318	4140	5
1691	588	364	63	14	chr3	145040191	145040604	-14559179	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-2116	2880	2448	6
1691	434	329	86	23	chr3	145043859	145044161	-14555622	-	LTR40b	LTR	ERVL	-23	439	119	6
1691	1318	215	166	113	chr3	145044464	145044899	-14554884	+	MT2A	LTR	ERVL	6	463	-70	6
1691	318	89	18	0	chr3	145046896	145046952	-14552831	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	414	7
1691	900	203	83	91	chr3	145048401	145048655	-14551128	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	125	7
1691	490	239	0	0	chr3	145048692	145048784	-14550999	-	MTEa	LTR	MaLR	-230	149	58	7
1691	380	294	11	0	chr3	145048784	145048876	-14550907	-	MTEa	LTR	MaLR	-286	93	1	7
1691	1002	289	86	20	chr3	145066504	145066900	-14532883	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	113	1
1691	271	187	194	9	chr3	145069005	145069113	-14530670	-	LTR37B	LTR	ERV1	-18	450	323	1
1691	249	305	142	68	chr3	145069720	145069896	-14529887	-	MamGypLTR1b	LTR	Gypsy	-591	191	3	1
1691	232	306	132	26	chr3	145073247	145073351	-14526432	-	LTR48	LTR	ERV1	-517	270	153	1
1691	232	306	132	26	chr3	145073419	145073465	-14526318	-	LTR48	LTR	ERV1	-635	152	105	1
1691	575	338	59	53	chr3	145081476	145081622	-14518161	+	ORR1E	LTR	MaLR	34	177	-182	1
1691	575	320	44	19	chr3	145081691	145081871	-14517912	+	ORR1E	LTR	MaLR	178	416	-3	1
1691	410	344	27	16	chr3	145082134	145082317	-14517466	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-4344	652	468	1
1691	296	355	72	68	chr3	145082757	145083008	-14516775	-	ORR1E	LTR	MaLR	-9	350	99	1
1691	370	297	139	72	chr3	145086437	145086665	-14513118	+	MLT1F1	LTR	MaLR	78	310	-238	1
1691	691	254	181	26	chr3	145090346	145090668	-14509115	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	18	1
1692	12167	101	10	12	chr3	145106166	145108082	-14491701	-	ETnERV2-int	LTR	ERVK	-1184	6222	4558	1
1692	1175	212	136	24	chr3	145117086	145117381	-14482402	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	92	1
1692	754	273	86	61	chr3	145128594	145129003	-14470780	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1692	1274	129	333	17	chr3	145140370	145140718	-14459065	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	2	2
1692	461	276	51	67	chr3	145175697	145176036	-14423747	-	RLTR15	LTR	ERVK	-15	344	45	2
1692	273	247	40	30	chr3	145180483	145180583	-14419200	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	279	2
1692	313	221	186	0	chr3	145180753	145180839	-14418944	-	MTEb	LTR	MaLR	-277	102	1	2
1692	316	341	82	18	chr3	145186508	145186678	-14413105	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-184	181	1	3
1692	450	220	31	92	chr3	145191997	145192023	-14407760	-	MT2B	LTR	ERVL	-446	155	138	3
1692	330	377	29	14	chr3	145192006	145192146	-14407637	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	8	3
1692	893	159	399	72	chr3	145195268	145195505	-14404278	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	349	-45	3
1692	893	159	399	72	chr3	145195656	145195709	-14404074	+	ORR1B1	LTR	MaLR	350	386	-8	3
1692	738	206	29	97	chr3	145195731	145195983	-14403800	+	MTEa	LTR	MaLR	113	371	-8	3
1692	2709	207	6	20	chr3	145203937	145204479	-14395304	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	1	3
1692	2373	52	29	3	chr3	145210198	145210509	-14389274	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1692	714	276	69	22	chr3	145212437	145212742	-14387041	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	6	3
1692	875	299	188	12	chr3	145216401	145216831	-14382952	+	MER21B	LTR	ERV1	278	783	-80	3
1692	1051	212	18	4	chr3	145224594	145224821	-14374962	+	ORR1D2	LTR	MaLR	141	370	0	3
1692	568	235	45	39	chr3	145225909	145226064	-14373719	+	MTE2b	LTR	MaLR	187	342	-37	3
1692	1510	172	33	81	chr3	145226084	145226444	-14373339	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-35	343	1	3
1692	726	249	0	12	chr3	145226454	145226617	-14373166	-	MT2A	LTR	ERVL	-131	402	242	3
1692	3122	169	55	39	chr3	145226624	145226961	-14372822	+	RMER6D	LTR	ERVK	43	375	-345	3
1692	3122	169	55	39	chr3	145226987	145227316	-14372467	+	RMER6D	LTR	ERVK	376	719	-1	3
1693	300	207	0	0	chr3	145227878	145227936	-14371847	-	MT2A	LTR	ERVL	-475	58	1	3
1693	550	156	13	141	chr3	145228928	145229077	-14370706	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-244	130	1	4
1693	2570	52	3	0	chr3	145229855	145230198	-14369585	-	IAPLTR4	LTR	ERVK	-1	344	1	4
1693	3753	65	73	0	chr3	145230271	145230748	-14369035	-	RLTR1B	LTR	ERV1	0	512	1	4
1693	2625	80	3	0	chr3	145231634	145231960	-14367823	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1693	10148	129	64	88	chr3	145231961	145233680	-14366103	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	2	1683	-280	4
1693	10148	129	64	88	chr3	145233791	145234071	-14365712	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	1684	1963	0	4
1693	2509	89	6	0	chr3	145234071	145234396	-14365387	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1693	3890	87	56	7	chr3	145236506	145237063	-14362720	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	584	0	4
1693	467	235	59	0	chr3	145237763	145237882	-14361901	+	RMER15	LTR	ERVL	428	553	-22	4
1693	526	252	33	7	chr3	145238242	145238394	-14361389	-	MLT1B	LTR	MaLR	-234	156	1	4
1693	331	245	36	85	chr3	145249250	145249415	-14350368	-	ORR1E	LTR	MaLR	-150	209	53	4
1693	1785	148	26	67	chr3	145267780	145268121	-14331662	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1693	3117	57	8	5	chr3	145272474	145272863	-14326920	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	4
1693	342	291	26	26	chr3	145279231	145279344	-14320439	+	LTR48B	LTR	ERV1	169	281	-363	4
1693	1897	140	69	43	chr3	145292734	145293084	-14306699	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-19	359	1	5
1693	629	290	77	118	chr3	145298757	145298959	-14300824	+	MLT1H2	LTR	MaLR	29	221	-268	5
1693	629	290	77	118	chr3	145299103	145299341	-14300442	+	MLT1H2	LTR	MaLR	222	451	-38	5
1693	283	217	101	71	chr3	145304142	145304241	-14295542	-	MLT1L	LTR	MaLR	-7	665	516	5
1693	255	304	15	164	chr3	145319339	145319473	-14280310	+	MT2B	LTR	ERVL	152	265	-336	5
1693	1165	267	123	17	chr3	145329453	145329875	-14269908	+	MLT2B4	LTR	ERVL	8	474	-82	5
1693	1423	232	26	69	chr3	145332473	145332862	-14266921	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	5
1693	387	206	20	30	chr3	145332938	145333038	-14266745	-	RLTR15	LTR	ERVK	-209	150	52	5
1693	237	333	0	0	chr3	145342482	145342554	-14257229	-	MLT1H1	LTR	MaLR	-214	341	270	5
1693	301	314	14	69	chr3	145343308	145343452	-14256331	+	MLT1A	LTR	MaLR	27	162	-212	5
1693	280	305	85	8	chr3	145346492	145346621	-14253162	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-20	345	207	6
1693	897	255	21	17	chr3	145351456	145351691	-14248092	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-129	236	1	6
1693	724	255	42	83	chr3	145353150	145353491	-14246292	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	73	6
1694	2085	110	6	6	chr3	145359525	145359854	-14239929	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	6
1694	2811	58	84	16	chr3	145363567	145363938	-14235845	+	MTB	LTR	MaLR	1	396	-4	6
1694	1207	175	85	13	chr3	145364817	145365124	-14234659	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	393	61	6
1694	361	250	39	97	chr3	145365185	145365340	-14234443	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-248	146	1	6
1694	437	263	191	37	chr3	145374043	145374284	-14225499	+	MLT1E2	LTR	MaLR	130	407	-220	6
1694	240	237	13	13	chr3	145374371	145374448	-14225335	+	MLT1E2	LTR	MaLR	551	627	0	6
1694	717	298	66	110	chr3	145377365	145377546	-14222237	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	172	-218	6
1694	717	298	66	110	chr3	145377706	145377932	-14221851	+	MLT1B	LTR	MaLR	173	390	0	6
1694	1118	167	20	22	chr3	145379065	145379403	-14220380	+	RMER17C	LTR	ERVK	179	402	-8	6
1694	400	164	53	3	chr3	145380833	145380920	-14218863	+	MT2B	LTR	ERVL	1	89	-444	6
1694	1094	221	28	38	chr3	145381024	145381315	-14218468	+	MT2B	LTR	ERVL	253	540	-61	6
1694	3187	67	5	7	chr3	145383404	145383826	-14215957	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	6
1694	2460	72	187	146	chr3	145384200	145384692	-14215091	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	512	0	6
1694	985	178	220	36	chr3	145384728	145385032	-14214751	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	489	848	-1994	6
1694	2727	208	100	94	chr3	145385050	145386108	-14213675	+	RMER3D-int	LTR	ERVK	633	1696	-1146	6
1694	3534	191	118	9	chr3	145386075	145387026	-14212757	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	1273	2326	0	6
1694	2616	66	23	5	chr3	145387027	145387422	-14212361	+	BGLII	LTR	ERVK	1	402	-19	6
1694	275	349	112	61	chr3	145394448	145394744	-14205039	+	MLT1A1	LTR	MaLR	22	332	-76	6
1694	294	283	156	16	chr3	145398072	145398285	-14201498	+	MLT1C	LTR	MaLR	8	276	-114	6
1694	400	242	10	81	chr3	145398968	145399067	-14200716	+	MLT1C	LTR	MaLR	376	467	0	6
1694	466	206	75	22	chr3	145403136	145403270	-14196513	+	MTD	LTR	MaLR	265	405	-14	7
1694	2106	130	24	41	chr3	145405116	145405533	-14194250	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	7
1694	308	301	97	97	chr3	145410200	145410395	-14189388	+	MLT1G	LTR	MaLR	64	299	-296	7
1694	873	82	32	3	chr3	145411668	145411848	-14187935	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-35	291	15	7
1694	1968	183	95	106	chr3	145413296	145413835	-14185948	+	RMER16	LTR	ERVK	1	533	0	7
1694	375	326	44	48	chr3	145416005	145416084	-14183699	+	MLT1J1	LTR	MaLR	4	87	-357	7
1694	375	326	44	48	chr3	145417063	145417189	-14182594	+	MLT1J1	LTR	MaLR	88	208	-236	7
1694	2238	103	48	0	chr3	145418667	145418979	-14180804	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1694	941	235	89	110	chr3	145446662	145447044	-14152739	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	374	-5	7
1694	753	243	85	150	chr3	145452423	145452824	-14146959	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	375	-4	7
1694	424	311	21	37	chr3	145460763	145460953	-14138830	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	193	-166	7
1694	287	269	117	51	chr3	145464107	145464244	-14135539	+	LTR48	LTR	ERV1	1	146	-641	7
1694	1371	234	80	22	chr3	145470991	145471114	-14128669	+	MTD	LTR	MaLR	23	144	-275	8
1694	1371	234	80	22	chr3	145471162	145471400	-14128383	+	MTD	LTR	MaLR	145	404	-15	8
1694	242	336	147	21	chr3	145479594	145479737	-14120046	-	MER21B	LTR	ERV1	-296	567	407	8
1694	353	317	31	142	chr3	145479839	145480093	-14119690	-	MER21B	LTR	ERV1	-615	248	23	8
1694	886	218	120	17	chr3	145484968	145485201	-14114582	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	257	-122	8
1694	485	217	57	21	chr3	145485236	145485377	-14114406	+	MTE2b	LTR	MaLR	208	353	-26	8
1695	1669	132	264	6	chr3	145493710	145494044	-14105739	+	MTC	LTR	MaLR	2	421	0	8
1695	229	204	61	0	chr3	145496020	145496069	-14103714	-	MLT1L	LTR	MaLR	-238	372	321	8
1695	2011	146	39	47	chr3	145499030	145499439	-14100344	-	RLTR28	LTR	ERVL	-1	523	118	8
1695	402	344	91	60	chr3	145499662	145499908	-14099875	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-9	645	365	8
1695	300	184	105	0	chr3	145500166	145500242	-14099541	+	MTE2b	LTR	MaLR	294	377	-2	1
1695	480	306	62	51	chr3	145500242	145500514	-14099269	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-355	325	51	2
1695	3097	74	7	10	chr3	145503067	145503475	-14096308	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1695	470	292	68	12	chr3	145504083	145504383	-14095400	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	368	-11	6
1695	1462	102	17	4	chr3	145509132	145509367	-14090416	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	92	1
1695	4651	128	15	13	chr3	145519927	145520682	-14079101	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	3
1695	659	307	84	25	chr3	145525641	145525962	-14073821	+	ORR1E	LTR	MaLR	20	359	0	3
1695	569	221	64	21	chr3	145526468	145526723	-14073060	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-43	327	2	3
1695	2596	103	35	33	chr3	145536085	145536537	-14063246	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	4
1695	846	243	30	34	chr3	145546322	145546590	-14053193	+	MTEb	LTR	MaLR	1	267	-112	6
1695	1277	241	116	29	chr3	145567438	145567819	-14031964	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	6	9
1695	275	173	0	88	chr3	145568909	145568966	-14030817	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	52	-327	9
1695	583	247	18	94	chr3	145569359	145569529	-14030254	-	ORR1E	LTR	MaLR	-169	190	34	1
1695	3695	161	77	168	chr3	145571982	145572975	-14026808	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	1
1695	1753	127	144	35	chr3	145576968	145577337	-14022446	+	RLTR9E	LTR	ERVK	1	409	0	1
1695	1865	238	16	143	chr3	145581215	145581843	-14017940	-	RMER19C	LTR	ERVK	-13	598	51	1
1695	1999	213	65	45	chr3	145582541	145583047	-14016736	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	1
1695	670	304	136	47	chr3	145583047	145583318	-14016465	-	MTE2b	LTR	MaLR	-83	296	1	1
1695	617	107	8	4	chr3	145584188	145584283	-14015500	+	ORR1A4	LTR	MaLR	238	374	0	1
1695	2367	62	61	10	chr3	145597444	145597755	-14002028	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1695	404	254	146	22	chr3	145608959	145608979	-13990804	+	MT2B	LTR	ERVL	179	332	-269	1
1695	375	338	30	17	chr3	145614412	145614595	-13985188	+	ORR1E	LTR	MaLR	11	193	-191	1
1695	422	268	87	107	chr3	145615525	145615872	-13983911	-	RMER10A	LTR	ERVL	-53	389	50	2
1695	259	262	12	24	chr3	145618141	145618223	-13981560	+	MER57E2	LTR	ERV1	3	83	-319	2
1695	250	306	69	92	chr3	145618277	145618450	-13981333	+	MER57E2	LTR	ERV1	189	357	-15	2
1695	1455	222	63	63	chr3	145619713	145620029	-13979754	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	54	2
1695	1455	222	63	63	chr3	145620226	145620260	-13979523	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-321	53	24	2
211	2447	124	108	14	chr3	145620917	145621288	-13978495	-	RMER6B	LTR	ERVK	-4	457	46	2
1696	1972	138	172	76	chr3	145621288	145621695	-13978088	-	RLTR41	LTR	ERV1	0	446	1	2
1696	2447	124	108	14	chr3	145621695	145621741	-13978042	-	RMER6B	LTR	ERVK	-416	45	1	2
1696	540	284	81	17	chr3	145623189	145623361	-13976422	+	MTEa	LTR	MaLR	3	185	-194	2
1696	267	235	14	144	chr3	145623381	145623520	-13976263	-	MT2B	LTR	ERVL	-304	297	177	2
1696	2136	134	24	68	chr3	145624016	145624431	-13975352	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	2	2
1696	1649	134	135	14	chr3	145625544	145625907	-13973876	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	407	-3	2
1696	747	221	49	190	chr3	145631739	145631785	-13967998	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	339	2
1696	747	221	49	190	chr3	145631930	145632252	-13967531	-	MTE2b	LTR	MaLR	-41	338	63	2
1696	356	296	72	31	chr3	145632617	145632773	-13967010	+	MLT1A0	LTR	MaLR	164	356	-34	2
1696	281	235	154	58	chr3	145632800	145632830	-13966953	+	MLT1A0	LTR	MaLR	357	386	-4	2
1696	2604	155	228	26	chr3	145633794	145634365	-13965418	+	RLTR33	LTR	ERVK	8	678	0	2
1696	2218	78	18	55	chr3	145636480	145636757	-13963026	+	ORR1A2	LTR	MaLR	5	285	-42	2
1696	2218	78	18	55	chr3	145636953	145637002	-13962781	+	ORR1A2	LTR	MaLR	286	319	-8	2
1696	912	289	146	8	chr3	145637551	145637890	-13961893	+	MTEa	LTR	MaLR	3	379	0	2
1696	1706	99	19	39	chr3	145640664	145640992	-13958791	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	346	43	2
1696	1601	192	57	147	chr3	145641005	145641771	-13958012	-	RMER17B	LTR	ERVK	-9	899	244	2
1696	863	102	47	0	chr3	145641779	145641907	-13957876	+	ORR1C1	LTR	MaLR	245	378	0	2
1696	2224	118	22	67	chr3	145643347	145643718	-13956065	+	ORR1C1	LTR	MaLR	25	378	0	2
1696	795	267	94	50	chr3	145646206	145646569	-13953214	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	2
1696	2126	109	38	3	chr3	145671140	145671454	-13928329	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	3	3
1696	462	192	44	124	chr3	145676238	145676254	-13923529	+	MT2B	LTR	ERVL	153	157	-444	3
1696	1440	219	105	12	chr3	145687645	145687968	-13911815	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	17	3
1696	2315	145	76	28	chr3	145688096	145688530	-13911253	+	RMER6B	LTR	ERVK	3	457	-4	3
1696	389	216	270	13	chr3	145690528	145690687	-13909096	-	RMER15	LTR	ERVL	-15	560	361	3
1696	1961	173	24	24	chr3	145691468	145691887	-13907896	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	378	0	4
1696	2604	137	66	6	chr3	145692490	145692872	-13906911	+	RLTR16	LTR	ERVK	7	413	-92	4
1696	2604	137	66	6	chr3	145692931	145693019	-13906764	+	RLTR16	LTR	ERVK	414	504	-1	4
1696	470	307	72	43	chr3	145696695	145696930	-13902853	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	242	-263	4
1696	355	305	52	30	chr3	145696981	145697116	-13902667	+	MLT1D	LTR	MaLR	344	481	-24	4
1696	275	273	79	11	chr3	145699279	145699368	-13900415	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-257	191	97	4
1696	727	151	324	8	chr3	145702730	145702984	-13896799	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	333	-41	4
1696	695	292	150	25	chr3	145713106	145713380	-13886403	+	RMER5	LTR	ERV1	218	525	-9	4
1696	1973	208	39	15	chr3	145724134	145724544	-13875239	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	2	4
1696	1123	244	121	45	chr3	145729016	145729346	-13870437	+	MTD	LTR	MaLR	51	405	-14	4
1696	2098	181	36	23	chr3	145730282	145730723	-13869060	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	447	-106	4
1696	684	244	41	32	chr3	145733201	145733413	-13866370	+	MTD	LTR	MaLR	6	202	-217	4
1696	4186	57	16	6	chr3	145745370	145745884	-13853899	+	MURVY-LTR	LTR	ERV1	1	519	0	5
1696	2116	105	3	67	chr3	145746550	145746908	-13852875	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	335	-2	5
1696	24118	8	7	47	chr3	145746930	145749779	-13850004	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	17	2751	-3730	5
26	29646	12	1	0	chr3	145749771	145753004	-13846779	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3244	6481	0	5
1697	2105	103	11	68	chr3	145753004	145753359	-13846424	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	335	-2	5
1697	253	252	8	0	chr3	145753466	145753480	-13846303	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-757	752	633	5
1697	503	300	96	43	chr3	145756791	145757000	-13842783	-	MLT1C	LTR	MaLR	-245	222	3	5
1697	2001	197	50	91	chr3	145758824	145759365	-13840418	+	RLTR11A	LTR	ERVK	10	528	0	5
1697	688	242	0	75	chr3	145761671	145761832	-13837951	+	MTEb	LTR	MaLR	3	151	-228	5
1697	489	290	38	25	chr3	145763041	145763200	-13836583	+	MTEb	LTR	MaLR	219	379	0	5
1697	2735	148	87	32	chr3	145767654	145768151	-13831632	+	RMER16	LTR	ERVK	1	524	-9	5
1697	636	121	0	48	chr3	145768464	145768568	-13831215	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	323	5
1697	800	114	92	0	chr3	145768564	145768695	-13831088	-	MTC	LTR	MaLR	-277	144	2	5
1697	2040	107	23	73	chr3	145768886	145769045	-13830738	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	149	-178	5
1697	2040	107	23	73	chr3	145769269	145769451	-13830332	+	ORR1A2	LTR	MaLR	150	325	-2	5
1697	1199	242	80	58	chr3	145775387	145775751	-13824032	-	MTE2b	LTR	MaLR	-7	372	1	5
1697	1198	234	48	97	chr3	145777401	145777774	-13822009	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	14	5
1697	2223	191	17	15	chr3	145781918	145782327	-13817456	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	1	5
1697	2064	125	43	31	chr3	145789318	145789640	-13810143	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	5
1697	282	232	188	10	chr3	145790376	145790472	-13809311	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	284	5
1697	2263	164	23	3	chr3	145800538	145800923	-13798860	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-1	393	1	6
1697	847	351	154	74	chr3	145805665	145807091	-13792692	+	MLT-int	LTR	MaLR	24	1562	-173	6
1697	292	299	71	10	chr3	145807113	145807211	-13792572	+	MLT-int	LTR	MaLR	1627	1730	-5	6
1697	293	227	11	74	chr3	145807424	145807519	-13792264	+	MLT1A1	LTR	MaLR	320	408	0	6
1697	418	284	0	62	chr3	145808752	145808912	-13790871	-	MLT1A	LTR	MaLR	-4	404	257	6
1697	1164	241	78	3	chr3	145820304	145820587	-13779196	-	MTE2b	LTR	MaLR	-46	333	30	6
1697	1975	163	29	9	chr3	145822248	145822595	-13777188	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	6
1697	2867	57	42	140	chr3	145823842	145824314	-13775469	-	RLTR10C	LTR	ERVK	-10	426	1	6
1697	2156	205	20	11	chr3	145830980	145831434	-13768349	-	RLTR16	LTR	ERVK	-15	490	33	6
1697	273	244	78	96	chr3	145832550	145832683	-13767100	-	LTR48B	LTR	ERV1	-647	140	1	6
1697	521	287	181	44	chr3	145833644	145833898	-13765885	-	MER110A	LTR	ERV1	-34	457	171	6
1697	521	304	86	58	chr3	145834089	145834229	-13765554	-	MER110A	LTR	ERV1	-298	170	25	6
1697	426	269	196	34	chr3	145835991	145836195	-13763588	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	338	6
1697	614	300	100	28	chr3	145839035	145839285	-13760498	+	MTD	LTR	MaLR	5	272	-147	6
1697	912	195	90	16	chr3	145841651	145841839	-13757944	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	169	6
1697	1135	132	2	52	chr3	145843292	145843516	-13756267	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-113	233	20	6
1697	382	169	1	64	chr3	145843521	145843615	-13756168	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-239	107	25	6
1697	236	176	0	73	chr3	145847101	145847156	-13752627	+	MamGypLTR2b	LTR	Gypsy	246	296	-626	6
1697	243	224	21	96	chr3	145847262	145847356	-13752427	+	MT2B2	LTR	ERVL	160	246	-338	6
1697	376	298	111	102	chr3	145848345	145848670	-13751113	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	26	7
1697	891	296	69	72	chr3	145849784	145850159	-13749624	+	MTEb	LTR	MaLR	1	374	-5	7
1697	1401	234	14	126	chr3	145852006	145852427	-13747356	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	1	7
1697	2378	137	29	91	chr3	145853600	145854049	-13745734	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	7
1697	1546	168	79	25	chr3	145855716	145856071	-13743712	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	7
1697	465	278	6	122	chr3	145856605	145856777	-13743006	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	228	7
1697	391	198	276	22	chr3	145856877	145857011	-13742772	-	MTEa	LTR	MaLR	-135	244	77	7
1697	443	221	154	72	chr3	145860138	145860333	-13739450	-	MTEa	LTR	MaLR	-161	218	8	7
1697	226	345	0	66	chr3	145861519	145861640	-13738143	-	MT2B	LTR	ERVL	-341	260	148	7
1697	1730	168	32	92	chr3	145863062	145863496	-13736287	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	1	7
1697	3206	61	5	10	chr3	145873811	145874209	-13725574	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1697	226	252	101	19	chr3	145881047	145881205	-13718578	-	RLTR21	LTR	ERVK	-318	1254	1084	7
1698	358	312	154	15	chr3	145886332	145886527	-13713256	-	ORR1E	LTR	MaLR	-44	315	94	7
1698	847	366	67	25	chr3	145892812	145893338	-13706445	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-642	745	198	7
1698	711	281	21	5	chr3	145911144	145911330	-13688453	-	ORR1E	LTR	MaLR	-168	191	3	8
1698	350	293	114	68	chr3	145912562	145912826	-13686957	-	RMER12	LTR	ERVK	-334	988	713	8
1698	509	281	198	109	chr3	145913252	145913600	-13686183	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	8
1698	232	355	36	18	chr3	145920466	145920578	-13679205	-	LTR28	LTR	ERV1	-103	917	804	8
1698	745	284	79	26	chr3	145921797	145922113	-13677670	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	24	8
1698	629	288	119	21	chr3	145933416	145933743	-13666040	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	8
1698	1092	164	44	19	chr3	145935554	145935759	-13664024	+	MTD	LTR	MaLR	210	419	0	8
1698	294	298	99	65	chr3	145936434	145936755	-13663028	+	MLT1A0	LTR	MaLR	43	408	0	8
1698	952	288	60	18	chr3	145938783	145939143	-13660640	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	18	8
1698	536	213	38	45	chr3	145940527	145940684	-13659099	-	ORR1E	LTR	MaLR	-182	177	22	8
1698	2959	35	3	3	chr3	145952051	145952397	-13647386	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	8
1698	385	208	94	63	chr3	145965082	145965241	-13634542	-	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	-3	319	156	8
1698	229	167	0	0	chr3	145965436	145965478	-13634305	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-326	42	1	8
1698	351	311	67	13	chr3	145966317	145966467	-13633316	+	RMER15	LTR	ERVL	404	561	-14	8
1698	1134	226	132	12	chr3	145968140	145968467	-13631316	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	8
1698	1185	75	6	28	chr3	145971086	145971265	-13628518	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	233	407	0	8
1698	354	329	31	62	chr3	145971423	145971585	-13628198	-	ORR1E	LTR	MaLR	-202	157	1	8
1698	1353	220	54	11	chr3	145972034	145972388	-13627395	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	2	8
1698	311	332	53	43	chr3	145973596	145973804	-13625979	+	LTR78	LTR	ERV1	10	219	-1085	8
1698	239	324	116	80	chr3	145973950	145974312	-13625471	+	LTR78	LTR	ERV1	474	848	-456	8
1698	515	284	116	5	chr3	145974923	145975139	-13624644	+	LTR50	LTR	ERVL	549	788	-7	8
1698	3146	32	45	3	chr3	145977711	145978091	-13621692	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	9
1698	595	282	62	103	chr3	145979159	145979527	-13620256	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	353	-6	9
1698	363	239	131	55	chr3	145980907	145981064	-13618719	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	379	194	9
1698	1224	231	36	58	chr3	145981101	145981621	-13618162	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-67	1303	904	9
1698	258	335	60	66	chr3	145983594	145983776	-13616007	-	ORR1E	LTR	MaLR	-165	194	14	9
1698	1254	244	56	25	chr3	145991716	145992074	-13607709	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	369	-1	9
1698	459	332	63	75	chr3	145992801	145993120	-13606663	+	MLT1J	LTR	MaLR	100	414	-98	9
1698	297	281	110	26	chr3	145994486	145994623	-13605160	+	MLT1A1	LTR	MaLR	216	391	-17	9
1698	852	249	52	35	chr3	145994864	145995093	-13604690	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	233	-126	9
1698	1210	222	107	52	chr3	145995276	145995561	-13604222	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	96	9
1698	1210	222	107	52	chr3	145995681	145995779	-13604004	-	MTD	LTR	MaLR	-324	95	1	9
1698	412	333	185	12	chr3	145995985	145996228	-13603555	+	MLT1D	LTR	MaLR	107	391	-114	9
1698	667	217	148	6	chr3	145996244	145996406	-13603377	+	MTD	LTR	MaLR	4	188	-231	9
1698	358	123	0	0	chr3	145999135	145999192	-13600591	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	263	9
1698	533	283	33	40	chr3	146002382	146002533	-13597250	+	MTE2b	LTR	MaLR	16	165	-214	6
1698	295	221	32	0	chr3	146002633	146002705	-13597078	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	373	290	7
1698	238	346	56	0	chr3	146002696	146002803	-13596980	-	ORR1E	LTR	MaLR	-266	113	1	7
1698	240	193	70	0	chr3	146002804	146002861	-13596922	+	MTEb	LTR	MaLR	316	376	-3	8
1698	234	232	18	77	chr3	146004484	146004652	-13595131	+	RMER17C	LTR	ERVK	62	219	-191	1
1698	477	287	83	70	chr3	146005960	146006298	-13593485	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	19	1
1698	1273	189	80	18	chr3	146009909	146010184	-13589599	+	RMER21B	LTR	ERV1	276	567	-275	2
1698	271	286	28	28	chr3	146010554	146010662	-13589121	-	RMER21B	LTR	ERV1	-647	195	88	2
1698	854	230	138	40	chr3	146013230	146013506	-13586277	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	359	57	2
1699	229	231	14	122	chr3	146014267	146014308	-13585475	+	MT2B2	LTR	ERVL	133	165	-419	2
1699	482	333	152	16	chr3	146016396	146016765	-13583018	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	87	3
1699	2003	151	56	22	chr3	146025995	146026354	-13573429	+	MTC	LTR	MaLR	51	421	0	3
1699	1776	137	8	223	chr3	146029550	146030020	-13569763	+	ORR1C2	LTR	MaLR	16	384	0	4
1699	1234	311	71	18	chr3	146030507	146030959	-13568824	+	MLT2B1	LTR	ERVL	1	476	-44	4
1699	394	103	169	22	chr3	146031090	146031179	-13568604	+	MLT2B1	LTR	ERVL	462	563	0	4
1699	295	346	60	92	chr3	146033508	146033759	-13566024	+	MLT2D	LTR	ERVL	93	335	-79	5
1699	2224	69	3	7	chr3	146035097	146035389	-13564394	+	ORR1A2	LTR	MaLR	29	319	-8	5
1699	246	323	7	127	chr3	146036299	146036334	-13563449	-	MT2B	LTR	ERVL	-336	247	141	5
1699	2566	207	45	8	chr3	146037152	146037667	-13562116	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	1	6
1699	2429	204	63	4	chr3	146041182	146041674	-13558109	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	14	6
1699	3093	66	5	8	chr3	146043531	146043928	-13555855	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1699	273	298	174	6	chr3	146045762	146045934	-13553849	+	MLT1D	LTR	MaLR	280	480	-25	7
1699	373	127	0	0	chr3	146046463	146046518	-13553265	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	272	7
1699	1863	112	32	18	chr3	146048558	146048839	-13550944	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-41	285	1	7
1699	249	265	71	10	chr3	146048855	146048954	-13550829	-	RMER13B	LTR	ERVK	-9	899	795	7
1699	690	225	187	18	chr3	146048932	146049162	-13550621	-	RLTR26	LTR	ERVK	-560	249	1	7
1699	1649	214	39	3	chr3	146051910	146052267	-13547516	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	374	0	8
1699	3736	113	31	46	chr3	146052452	146053062	-13546721	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	8
1699	430	347	90	52	chr3	146053396	146053740	-13546043	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	357	-2	8
1699	300	330	39	104	chr3	146062854	146063084	-13536699	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	215	-144	1
1699	358	282	10	183	chr3	146065460	146065471	-13534312	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-61	1042	1032	1
1699	4714	137	45	59	chr3	146065508	146066379	-13533404	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-72	1031	1	1
1699	3630	184	67	107	chr3	146071610	146072624	-13527159	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	1
1699	686	276	169	14	chr3	146076979	146077269	-13522514	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-7	553	219	1
1699	288	234	52	41	chr3	146078006	146078114	-13521669	+	MTEa	LTR	MaLR	106	214	-165	1
1699	315	297	102	0	chr3	146079514	146079632	-13520151	-	ORR1E	LTR	MaLR	-228	131	2	1
1699	717	269	99	81	chr3	146079836	146080208	-13519575	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	1
1699	1503	199	122	84	chr3	146087549	146088154	-13511629	-	RMER17C-int	LTR	ERVK	0	3238	2611	1
1699	495	170	154	14	chr3	146089593	146089736	-13510047	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	212	1
1699	815	186	21	32	chr3	146089744	146089933	-13509850	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-112	262	76	1
1699	509	312	109	40	chr3	146091884	146092131	-13507652	-	RMER12	LTR	ERVK	-2	1320	1057	1
1699	4124	216	104	39	chr3	146092169	146092526	-13507257	-	RMER12	LTR	ERVK	-131	1191	770	1
1699	4124	216	104	39	chr3	146092555	146093316	-13506467	-	RMER12	LTR	ERVK	-553	769	2	1
1699	1305	218	102	85	chr3	146095018	146095429	-13504354	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	1
1699	1875	153	80	0	chr3	146096388	146096740	-13503043	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	3	1
1699	3568	23	2	0	chr3	146107390	146107785	-13491998	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1699	1128	180	50	0	chr3	146108460	146108660	-13491123	-	RMER15	LTR	ERVL	-1	574	365	1
1699	1194	68	83	22	chr3	146108664	146108844	-13490939	-	MTB	LTR	MaLR	-8	392	202	1
1699	636	302	130	96	chr3	146109832	146110209	-13489574	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	390	0	1
1699	899	239	144	32	chr3	146111971	146112256	-13487527	+	MTE2b	LTR	MaLR	63	379	0	1
1699	1612	157	169	0	chr3	146114427	146114764	-13485019	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
1699	234	286	14	41	chr3	146114786	146114859	-13484924	-	MER57E1	LTR	ERV1	-293	79	9	1
1699	1879	157	155	8	chr3	146115108	146115475	-13484308	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1699	3231	53	0	2	chr3	146123937	146124334	-13475449	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1699	1414	165	130	33	chr3	146133002	146133309	-13466474	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	337	-37	2
1699	267	159	0	0	chr3	146133536	146133580	-13466203	+	ORR1D1	LTR	MaLR	341	384	0	2
1699	413	239	92	0	chr3	146133580	146133689	-13466094	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	119	-1251	2
1699	416	297	57	73	chr3	146133695	146133942	-13465841	+	RLTR18B	LTR	ERVK	25	267	-245	2
1699	711	182	113	104	chr3	146134217	146134438	-13465345	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1148	1370	0	2
1699	1332	219	54	39	chr3	146134438	146134770	-13465013	+	ORR1D1	LTR	MaLR	38	374	0	2
1699	941	241	161	54	chr3	146135212	146135528	-13464255	+	MTEa	LTR	MaLR	30	379	0	2
1699	347	322	62	56	chr3	146136027	146136188	-13463595	-	MT2B	LTR	ERVL	-343	258	97	2
1699	2226	153	142	15	chr3	146137148	146137825	-13461958	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	2
1699	2604	127	26	24	chr3	146142128	146142580	-13457203	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	1	2
1699	498	301	37	59	chr3	146142916	146143103	-13456680	-	MTEa	LTR	MaLR	-196	183	1	2
1699	2631	62	6	0	chr3	146143191	146143513	-13456270	+	ORR1A2	LTR	MaLR	4	327	0	2
1700	556	316	42	64	chr3	146146810	146147074	-13452709	-	ORR1E	LTR	MaLR	-101	258	1	2
1700	298	313	10	29	chr3	146147093	146147195	-13452588	-	ORR1E	LTR	MaLR	-259	100	1	2
1700	583	272	180	74	chr3	146148665	146148882	-13450901	+	RLTR12B	LTR	ERVK	10	271	-257	2
1700	583	272	180	74	chr3	146148962	146149189	-13450594	+	RLTR12B	LTR	ERVK	272	501	-27	2
1700	766	271	94	154	chr3	146157762	146158221	-13441562	+	RLTR11B	LTR	ERVK	41	494	-34	2
1700	810	235	185	6	chr3	146172399	146172712	-13427071	+	ORR1D1	LTR	MaLR	5	373	-1	2
1700	698	244	54	19	chr3	146185634	146185839	-13413944	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	308	3
1700	1278	200	165	25	chr3	146194020	146194384	-13405399	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	3
1700	1640	211	65	51	chr3	146206510	146206924	-13392859	-	RLTR9B2	LTR	ERVK	0	420	1	3
1700	1405	249	23	51	chr3	146209671	146210046	-13389737	+	MTD	LTR	MaLR	1	368	-51	3
1700	1405	249	23	51	chr3	146210243	146210298	-13389485	+	MTD	LTR	MaLR	369	419	0	3
1700	2557	167	62	6	chr3	146210355	146210842	-13388941	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	514	-2	3
1700	601	262	176	18	chr3	146216760	146217090	-13382693	+	MER31A	LTR	ERV1	1	382	-103	3
1700	2499	210	43	38	chr3	146217929	146218100	-13381683	-	RLTR17	LTR	ERVK	-84	608	432	3
1700	3078	66	10	27	chr3	146218100	146218507	-13381276	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1700	2499	210	43	38	chr3	146218507	146218940	-13380843	-	RLTR17	LTR	ERVK	-261	431	1	3
1700	602	220	40	67	chr3	146223976	146224229	-13375554	+	RLTR15	LTR	ERVK	48	293	-66	3
1700	2339	168	26	78	chr3	146224791	146225319	-13374464	-	RLTR16	LTR	ERVK	0	505	5	3
1700	1843	196	45	45	chr3	146241322	146241743	-13358040	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1700	961	198	252	55	chr3	146248572	146248957	-13350826	+	MT2A	LTR	ERVL	4	464	-69	4
1700	1405	213	41	33	chr3	146269349	146269713	-13330070	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	367	-3	4
1700	581	215	113	65	chr3	146274185	146274414	-13325369	-	MTEa	LTR	MaLR	-97	282	43	4
1701	355	313	147	64	chr3	146277563	146277829	-13321954	+	ORR1E	LTR	MaLR	36	323	-47	4
1701	1820	222	97	10	chr3	146278255	146278742	-13321041	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	3	4
1701	283	308	159	6	chr3	146279536	146279693	-13320090	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-236	208	28	4
1701	1619	222	159	39	chr3	146286303	146286700	-13313083	-	RLTR40	LTR	ERVK	-64	753	300	4
1701	1619	222	159	39	chr3	146286735	146286749	-13313034	-	RLTR40	LTR	ERVK	-518	299	280	4
1701	1619	222	159	39	chr3	146286834	146286936	-13312847	-	RLTR40	LTR	ERVK	-538	279	179	4
1701	263	289	13	13	chr3	146295354	146295431	-13304352	-	MTEa	LTR	MaLR	-15	364	288	4
1701	774	283	57	46	chr3	146296415	146296794	-13302989	-	RLTR16	LTR	ERVK	-259	433	1	4
1701	2702	125	48	0	chr3	146299804	146300203	-13299580	+	MTC	LTR	MaLR	4	421	0	4
1701	4164	157	41	87	chr3	146300683	146301628	-13298155	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	4
1701	524	294	124	77	chr3	146301739	146302118	-13297665	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	71	4
1701	292	232	242	53	chr3	146306520	146306652	-13293131	+	MLT1J	LTR	MaLR	199	355	-157	5
1701	429	230	60	0	chr3	146315475	146315592	-13284191	-	MTE2a	LTR	MaLR	-40	339	214	5
1701	589	312	53	49	chr3	146316773	146317019	-13282764	-	MTD	LTR	MaLR	-155	264	18	5
1701	464	266	218	6	chr3	146317037	146317207	-13282576	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-313	207	2	5
1701	293	301	83	97	chr3	146317726	146317954	-13281829	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-519	509	285	5
1701	301	264	70	78	chr3	146318646	146318761	-13281022	-	MTE2a	LTR	MaLR	-202	157	44	5
1701	512	289	64	37	chr3	146321625	146321812	-13277971	-	MLT1A	LTR	MaLR	-180	194	3	5
1701	1345	239	50	19	chr3	146323174	146323533	-13276250	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
1701	1053	251	193	28	chr3	146327913	146328266	-13271517	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	3	5
1701	2156	182	46	22	chr3	146328287	146328400	-13271383	+	MTC	LTR	MaLR	1	129	-292	5
1701	3707	159	66	30	chr3	146328400	146329066	-13270717	+	RLTR17	LTR	ERVK	3	692	0	5
1701	2156	182	46	22	chr3	146329066	146329363	-13270420	+	MTC	LTR	MaLR	130	421	0	5
1701	3813	46	33	0	chr3	146330048	146330508	-13269275	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	5
1701	716	330	186	49	chr3	146333466	146334513	-13265270	+	MTE-int	LTR	MaLR	1	1191	-389	5
1701	803	319	26	23	chr3	146335304	146335609	-13264174	+	MTE-int	LTR	MaLR	1216	1521	-59	5
1701	2558	83	0	0	chr3	146337336	146337663	-13262120	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	5
1701	300	333	45	0	chr3	146351450	146351582	-13248201	+	MTEa	LTR	MaLR	5	142	-237	5
1701	328	291	85	51	chr3	146355311	146355546	-13244237	+	MLT1C	LTR	MaLR	63	305	-162	5
1701	1648	195	120	13	chr3	146355672	146356046	-13243737	+	MTC	LTR	MaLR	6	419	-2	5
1701	435	310	138	52	chr3	146368415	146368834	-13230949	+	MER67B	LTR	ERV1	204	658	-3	6
1701	2668	73	0	0	chr3	146370181	146370508	-13229275	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1701	846	281	128	52	chr3	146371088	146371549	-13228234	-	MLT1D	LTR	MaLR	-9	496	1	6
1701	239	247	12	110	chr3	146378024	146378106	-13221677	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-244	121	48	6
1701	233	173	0	19	chr3	146378513	146378566	-13221217	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	353	6
1701	703	188	0	8	chr3	146378862	146378996	-13220787	-	MTD	LTR	MaLR	-54	365	233	6
1701	710	198	18	48	chr3	146378992	146379157	-13220626	-	MTC-int	LTR	MaLR	-295	963	804	6
1701	1330	185	15	11	chr3	146388029	146388302	-13211481	+	MT2A	LTR	ERVL	1	274	-259	6
1701	318	304	80	0	chr3	146391177	146391289	-13208494	+	MLT1D	LTR	MaLR	384	504	-1	6
1701	261	292	169	0	chr3	146391615	146391704	-13208079	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	287	6
1701	356	304	94	39	chr3	146404266	146404499	-13195284	+	MER68	LTR	ERVL	161	406	-157	6
1701	254	333	33	0	chr3	146404512	146404602	-13195181	+	MER68	LTR	ERVL	463	555	-8	6
1702	2011	80	59	62	chr3	146426137	146426457	-13173326	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	6
1702	1903	112	63	3	chr3	146448146	146448432	-13151351	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-13	313	11	6
1702	11460	114	68	66	chr3	146448442	146450400	-13149383	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	1	6
1702	2486	61	42	0	chr3	146450400	146450713	-13149070	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	2	6
1702	4008	99	26	9	chr3	146450895	146451478	-13148305	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1234	1826	-137	6
1702	231	308	15	0	chr3	146452120	146452185	-13147598	-	MTEa	LTR	MaLR	-291	88	23	7
1702	2535	171	148	99	chr3	146459439	146460022	-13139761	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	7
1702	1034	274	72	35	chr3	146463570	146463974	-13135809	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	7
1702	242	255	46	197	chr3	146464266	146464505	-13135278	+	MTEa	LTR	MaLR	175	377	-2	7
1702	257	339	92	27	chr3	146477170	146477355	-13122428	+	MER34	LTR	ERV1	1	197	-345	7
1702	2372	121	107	0	chr3	146477635	146477991	-13121792	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	7
1702	580	302	133	32	chr3	146482684	146483029	-13116754	+	MLT1D	LTR	MaLR	126	505	0	7
1702	3198	32	0	0	chr3	146484292	146484638	-13115145	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	7
1702	1127	292	39	22	chr3	146487602	146487963	-13111820	-	MTE2a	LTR	MaLR	-10	369	3	7
1702	987	181	6	28	chr3	146488533	146488715	-13111068	-	RMER12	LTR	ERVK	0	1322	1145	7
1702	779	231	125	57	chr3	146488930	146489178	-13110605	-	RMER12	LTR	ERVK	-123	1199	935	7
1702	3996	153	40	17	chr3	146489200	146489953	-13109830	-	RMER12	LTR	ERVK	-552	770	1	7
1702	239	259	131	36	chr3	146492617	146492701	-13107082	+	MLT1A1	LTR	MaLR	243	334	-74	7
1702	2667	164	15	0	chr3	146493705	146494114	-13105669	+	MTC	LTR	MaLR	5	419	-2	7
1702	908	234	82	68	chr3	146496807	146497100	-13102683	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	83	7
1702	1371	196	133	19	chr3	146497032	146497355	-13102428	+	ORR1D1	LTR	MaLR	14	373	-1	7
1702	498	292	30	8	chr3	146497355	146497484	-13102299	-	MTE2b	LTR	MaLR	-247	132	1	7
1702	795	299	35	3	chr3	146498441	146498726	-13101057	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-2967	2790	2497	7
1702	3668	149	160	75	chr3	146498860	146499678	-13100105	+	RMER19B	LTR	ERVK	3	890	-12	7
1702	1895	192	51	8	chr3	146500970	146501363	-13098420	+	MTC	LTR	MaLR	1	410	-11	5
1702	1652	227	48	83	chr3	146502822	146503361	-13096422	-	RLTR20C	LTR	ERVK	-14	520	1	9
1702	262	367	85	20	chr3	146508876	146509029	-13090754	+	MamGypLTR1c	LTR	Gypsy	583	745	-58	1
1702	1512	227	35	20	chr3	146509605	146509951	-13089832	+	MTD	LTR	MaLR	18	368	-51	1
1702	373	354	40	35	chr3	146533721	146533923	-13065860	-	MLT2F	LTR	ERVL	-211	452	250	5
1702	2204	92	27	42	chr3	146534748	146535078	-13064705	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	3	6
1703	1107	264	73	6	chr3	146541310	146541665	-13058118	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	7
1703	4013	47	7	67	chr3	146543395	146543946	-13055837	-	MURVY-LTR	LTR	ERV1	-1	518	1	7
1703	272	341	152	30	chr3	146544416	146544718	-13055065	-	MLT2D	LTR	ERVL	-63	351	13	8
1703	2234	180	24	7	chr3	146546053	146546121	-13053662	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	355	8
1703	2234	180	24	7	chr3	146546147	146546492	-13053291	-	MTC	LTR	MaLR	-67	354	2	8
1703	5329	58	24	18	chr3	146548711	146549511	-13050272	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1043	805	1	8
1703	495	269	14	28	chr3	146553805	146553950	-13045833	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	228	9
1703	433	294	288	9	chr3	146554241	146554560	-13045223	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	1	9
1703	2096	119	6	74	chr3	146558277	146558630	-13041153	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	9
1703	4552	10	0	0	chr3	146574680	146575173	-13024610	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	1
1703	2819	93	255	15	chr3	146592396	146592867	-13006916	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	1	1
1703	252	244	61	109	chr3	146595251	146595398	-13004385	-	RMER12	LTR	ERVK	-483	839	700	1
1703	1718	186	156	143	chr3	146597995	146598598	-13001185	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
1703	391	218	29	29	chr3	146613164	146613268	-12986515	+	ORR1D2	LTR	MaLR	267	370	0	1
1703	939	288	49	82	chr3	146651349	146651739	-12948044	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	379	0	2
1703	1961	147	120	18	chr3	146651975	146652308	-12947475	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1703	893	275	75	66	chr3	146658006	146658368	-12941415	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	6	2
1703	1015	190	25	15	chr3	146662856	146663059	-12936724	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	170	2
1703	522	322	102	19	chr3	146668001	146668314	-12931469	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-8	357	19	2
1704	746	236	168	0	chr3	146672146	146672354	-12927429	+	MTD	LTR	MaLR	44	286	-133	2
1704	907	260	13	91	chr3	146694584	146694957	-12904826	+	MTE2b	LTR	MaLR	36	379	0	2
1704	1546	242	24	26	chr3	146697281	146697701	-12902082	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	2
1704	1186	300	34	0	chr3	146698583	146698933	-12900850	+	MTE2b	LTR	MaLR	18	379	0	2
1704	264	340	100	15	chr3	146703424	146703624	-12896159	+	MER74A	LTR	ERVL	206	422	-136	3
1704	448	286	38	0	chr3	146707642	146707775	-12892008	+	MTEa	LTR	MaLR	1	138	-241	3
1704	347	309	60	36	chr3	146711515	146711531	-12888252	+	MT2A	LTR	ERVL	3	49	-484	3
1704	399	257	88	0	chr3	146711531	146711644	-12888139	+	MTE2a	LTR	MaLR	13	135	-244	3
1704	347	309	60	36	chr3	146711644	146711683	-12888100	+	MT2A	LTR	ERVL	50	174	-359	3
1704	412	289	96	68	chr3	146711834	146712083	-12887700	+	MT2A	LTR	ERVL	144	399	-134	3
1704	896	202	16	0	chr3	146713134	146713317	-12886466	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	194	3
1704	272	232	14	0	chr3	146713320	146713389	-12886394	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	70	-300	3
1704	2081	198	26	114	chr3	146713389	146714010	-12885773	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	46	3
1704	277	348	0	0	chr3	146714007	146714096	-12885687	+	RMER19C	LTR	ERVK	347	435	-176	3
1704	227	174	65	0	chr3	146714072	146714118	-12885665	+	RMER19C	LTR	ERVK	674	722	-180	3
1704	257	139	0	0	chr3	146714102	146714145	-12885638	-	RMER19C	LTR	ERVK	-568	43	1	3
1704	1003	271	40	17	chr3	146714145	146714429	-12885354	+	ORR1E	LTR	MaLR	67	357	-2	3
1704	349	286	51	130	chr3	146714462	146714639	-12885144	-	MTE2a	LTR	MaLR	-212	167	5	3
1704	2225	128	26	26	chr3	146714863	146715249	-12884534	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	1	3
1704	722	275	157	11	chr3	146718773	146719118	-12880665	-	MTD	LTR	MaLR	-4	375	26	3
1704	1577	189	118	3	chr3	146722090	146722429	-12877354	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	3
1704	434	357	12	0	chr3	146723050	146723221	-12876562	+	MLT1F1	LTR	MaLR	20	192	-377	3
1704	298	254	74	58	chr3	146723397	146723518	-12876265	+	MLT1F1	LTR	MaLR	447	569	0	3
1704	293	314	74	34	chr3	146734117	146734265	-12865518	-	MLT1K	LTR	MaLR	-287	308	137	3
1704	393	222	10	72	chr3	146738369	146738466	-12861317	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	541	451	3
1704	1946	102	86	3	chr3	146738960	146739285	-12860498	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-226	352	1	3
1704	577	294	30	40	chr3	146767639	146767841	-12831942	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-314	201	2	4
1704	1035	263	87	6	chr3	146768008	146768352	-12831431	+	MTEa	LTR	MaLR	8	379	0	4
1704	267	352	45	32	chr3	146778629	146778849	-12820934	+	MLT1K	LTR	MaLR	248	470	-125	4
1704	526	205	33	83	chr3	146779898	146780079	-12819704	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-15	438	267	4
1704	833	219	37	57	chr3	146780157	146780435	-12819348	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-176	265	5	4
1704	294	252	39	97	chr3	146781602	146781756	-12818027	-	MT2B	LTR	ERVL	-323	278	134	4
1704	380	308	102	28	chr3	146782574	146782751	-12817032	+	MLT1A	LTR	MaLR	174	363	-11	4
1704	475	244	103	34	chr3	146783216	146783420	-12816363	+	LTR81A	LTR	ERV1?	1131	1348	-2	4
1704	230	241	167	12	chr3	146784017	146784101	-12815682	+	MLT1A	LTR	MaLR	267	363	-11	4
1704	780	258	125	27	chr3	146784279	146784614	-12815169	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	2	4
1704	245	348	113	68	chr3	146796312	146796577	-12803206	+	ORR1E	LTR	MaLR	51	327	-32	4
1704	366	290	55	59	chr3	146796771	146796991	-12802792	-	MLT1B	LTR	MaLR	-125	265	47	4
1705	311	386	81	14	chr3	146809446	146809669	-12790114	+	LTR16A	LTR	ERVL	209	446	-5	4
1705	2145	130	3	18	chr3	146809945	146810274	-12789509	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-1	326	3	4
1705	1089	234	29	99	chr3	146821283	146821657	-12778126	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	1	4
1705	569	224	62	22	chr3	146833715	146833893	-12765890	+	MLT1E2	LTR	MaLR	26	210	-417	4
1705	274	308	77	50	chr3	146833964	146834145	-12765638	+	MLT1E2	LTR	MaLR	317	502	-3	4
1705	234	287	58	0	chr3	146834603	146834690	-12765093	-	MLT1B	LTR	MaLR	-8	382	291	4
1705	1856	191	39	14	chr3	146834673	146835034	-12764749	+	MTC	LTR	MaLR	48	417	-4	4
1705	306	337	17	40	chr3	146835109	146835282	-12764501	-	MLT1B	LTR	MaLR	-221	169	1	4
1705	1449	243	84	13	chr3	146840441	146840820	-12758963	+	MTC	LTR	MaLR	8	413	-8	5
1705	458	328	63	55	chr3	146847198	146847546	-12752237	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	11	5
1705	376	278	31	31	chr3	146847762	146847892	-12751891	-	RMER10B	LTR	ERVL	-75	323	194	5
1705	487	257	63	35	chr3	146847921	146848175	-12751608	-	RMER10B	LTR	ERVL	-133	265	5	5
1705	383	228	97	65	chr3	146856988	146857143	-12742640	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	160	-214	5
1705	530	283	124	39	chr3	146862320	146862651	-12737132	-	MLT2D	LTR	ERVL	-55	359	1	5
1705	2810	103	35	0	chr3	146866277	146866683	-12733100	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	3	5
1705	2801	136	154	64	chr3	146871027	146871656	-12728127	-	RMER6C	LTR	ERVK	-4	686	1	5
1705	990	220	16	31	chr3	146871766	146872024	-12727759	+	MTEb	LTR	MaLR	126	379	0	5
1705	972	262	58	36	chr3	146872900	146873264	-12726519	-	MTE2b	LTR	MaLR	-5	374	3	5
1705	265	250	176	29	chr3	146874981	146875117	-12724666	+	LTR48	LTR	ERV1	4	159	-628	5
1705	483	250	181	0	chr3	146875603	146875763	-12724020	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	231	5
1705	988	262	101	13	chr3	146877775	146878081	-12721702	+	MTEb	LTR	MaLR	7	339	-40	5
1705	1004	311	35	19	chr3	146879992	146880359	-12719424	-	MTE2b	LTR	MaLR	-6	373	1	5
1705	1175	229	76	45	chr3	146881106	146881462	-12718321	-	MTEb	LTR	MaLR	-12	367	1	5
1705	528	307	113	53	chr3	146888607	146889040	-12710743	-	LTR40b	LTR	ERVL	-2	460	2	5
1705	598	301	148	25	chr3	146897821	146898138	-12701645	+	MTEa	LTR	MaLR	18	373	-6	5
1705	253	235	225	42	chr3	146899332	146899452	-12700331	+	LTR48	LTR	ERV1	1	142	-645	5
1705	330	242	95	0	chr3	146902261	146902356	-12697427	-	LTR79	LTR	ERVL	-32	495	392	5
1705	796	266	117	51	chr3	146911305	146911657	-12688126	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	379	0	5
1705	689	300	69	27	chr3	146921764	146922096	-12677687	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-51	346	1	6
1705	336	314	157	0	chr3	146923076	146923248	-12676535	-	MLT1H	LTR	MaLR	-318	231	33	6
1706	857	259	59	0	chr3	146932851	146933071	-12666712	-	MTD	LTR	MaLR	-145	274	42	6
1706	2099	190	55	8	chr3	146934880	146935278	-12664505	+	MTC	LTR	MaLR	5	421	0	6
1706	256	376	7	22	chr3	146935987	146936123	-12663660	-	LTR16A	LTR	ERVL	-92	359	226	6
1706	492	297	45	50	chr3	146937045	146937247	-12662536	+	MLT1A1	LTR	MaLR	31	231	-177	6
1706	1006	295	41	24	chr3	146937394	146937734	-12662049	+	MTE2b	LTR	MaLR	19	364	-15	6
1706	1101	256	14	104	chr3	146942126	146942540	-12657243	+	MTEa	LTR	MaLR	3	379	0	6
1706	517	311	96	32	chr3	146946444	146946859	-12652924	+	MLT1D	LTR	MaLR	45	496	-9	6
1706	451	313	34	0	chr3	146949630	146949777	-12650006	+	MLT1B	LTR	MaLR	238	389	-1	6
1706	683	295	121	32	chr3	146961190	146961537	-12638246	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1195	385	8	6
1706	257	327	47	97	chr3	146962076	146962354	-12637429	-	MT2A	LTR	ERVL	-40	493	230	6
1706	431	298	16	16	chr3	146962546	146962669	-12637114	-	MTEa	LTR	MaLR	-256	123	1	6
1706	697	317	161	45	chr3	146972532	146972955	-12626828	+	MLT1D	LTR	MaLR	2	473	-32	6
1706	742	192	48	36	chr3	146972978	146973154	-12626629	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	173	-186	6
1706	410	298	45	62	chr3	146973343	146973574	-12626209	+	MTE2a	LTR	MaLR	146	379	0	6
1706	347	312	171	37	chr3	146977925	146978141	-12621642	+	LTR50	LTR	ERVL	503	747	-48	6
1706	499	338	158	49	chr3	146980962	146981367	-12618416	+	MLT1E2	LTR	MaLR	51	499	-128	6
1706	257	212	136	0	chr3	146981373	146981439	-12618344	+	MLT1A1	LTR	MaLR	6	80	-328	6
1706	3667	123	14	63	chr3	146981506	146982138	-12617645	+	MT2B	LTR	ERVL	1	601	0	6
1706	611	228	260	43	chr3	146987253	146987581	-12612202	+	MTD	LTR	MaLR	18	378	-1	7
1706	291	338	48	42	chr3	146987729	146987896	-12611887	+	LTR16A	LTR	ERVL	231	398	-53	7
1706	971	276	56	38	chr3	147000049	147000388	-12599395	+	MLT1B	LTR	MaLR	42	386	-4	1
1706	723	286	105	85	chr3	147012460	147012819	-12586964	+	MTE2b	LTR	MaLR	11	366	-13	1
1706	237	167	46	77	chr3	147020892	147020957	-12578826	+	RMER20A	LTR	ERVK	186	248	-268	1
1706	1680	33	34	97	chr3	147026169	147026438	-12573345	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	224	2
1706	914	40	40	19	chr3	147026440	147026615	-12573168	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	-90	385	241	2
1706	2870	34	94	5	chr3	147026615	147026998	-12572785	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	-58	417	1	2
1706	324	313	58	44	chr3	147027214	147027448	-12572335	-	ORR1E	LTR	MaLR	-123	247	11	2
1706	453	366	77	51	chr3	147029890	147030304	-12569479	-	MLT1E2	LTR	MaLR	0	627	203	3
1706	366	285	76	38	chr3	147030784	147030941	-12568842	-	MTEa	LTR	MaLR	-4	375	213	3
1706	527	248	0	37	chr3	147032381	147032515	-12567268	-	LTR90B	LTR	LTR	-6	790	662	3
1706	1067	294	36	83	chr3	147032700	147033086	-12566697	+	MTE2a	LTR	MaLR	12	379	0	3
1706	256	253	100	33	chr3	147044078	147044168	-12555615	+	MTEb	LTR	MaLR	281	376	-3	5
1706	3004	156	122	18	chr3	147053523	147053861	-12545922	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	385	-305	6
1706	3004	156	122	18	chr3	147053947	147054232	-12545551	+	RMER6C	LTR	ERVK	386	689	-1	6
1706	574	344	56	16	chr3	147060445	147060696	-12539087	+	MLT1A0	LTR	MaLR	103	363	-2	7
1707	303	322	139	47	chr3	147072831	147073046	-12526737	-	MLT1C	LTR	MaLR	-12	455	221	8
1707	2489	93	35	8	chr3	147077044	147077413	-12522370	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	380	-16	9
1707	991	291	95	28	chr3	147084689	147085014	-12514769	-	MTEa	LTR	MaLR	-11	368	22	1
1707	353	267	162	8	chr3	147089564	147089681	-12510102	+	MLT1A	LTR	MaLR	240	374	0	1
1707	2294	209	17	158	chr3	147089881	147090592	-12509191	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
1707	1029	254	56	68	chr3	147093517	147093544	-12506239	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	350	1
1707	1029	260	58	70	chr3	147093588	147093917	-12505866	-	MTE2a	LTR	MaLR	-43	376	54	1
1707	1133	266	216	11	chr3	147095121	147095467	-12504316	+	MTD	LTR	MaLR	1	417	-2	1
1707	305	213	0	47	chr3	147096361	147096425	-12503358	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	1	61	-492	1
1707	1174	211	29	157	chr3	147096405	147096788	-12502995	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	174	507	-46	1
1707	228	259	0	45	chr3	147101981	147102070	-12497713	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	324	1
1707	898	301	86	26	chr3	147124262	147124719	-12475064	+	MLT1E2	LTR	MaLR	141	618	-6	1
1707	405	366	30	96	chr3	147125056	147125419	-12474364	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	339	-20	1
1707	1696	164	0	184	chr3	147129639	147130140	-12469643	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	2	1
1707	2202	144	12	65	chr3	147130237	147130653	-12469130	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	1
1707	2219	123	3	0	chr3	147139147	147139473	-12460310	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1707	335	261	126	63	chr3	147144191	147144318	-12455465	+	MLT1A1	LTR	MaLR	43	177	-231	1
1707	247	297	60	51	chr3	147144354	147144471	-12455312	+	MLT1A1	LTR	MaLR	325	442	-25	1
1707	328	127	0	68	chr3	147156594	147156653	-12443130	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-58	326	272	2
1707	792	310	92	37	chr3	147160846	147161225	-12438558	+	MTD	LTR	MaLR	6	405	-14	2
1707	588	341	168	42	chr3	147165716	147166341	-12433442	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-339	1048	346	2
1707	2175	135	278	48	chr3	147172487	147172754	-12427029	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	378	2
1707	2175	135	278	48	chr3	147172806	147173099	-12426684	-	RMER6C	LTR	ERVK	-313	377	1	2
1707	791	259	138	54	chr3	147179925	147180259	-12419524	+	MTE2b	LTR	MaLR	7	368	-11	2
1707	2149	136	15	3	chr3	147191793	147192132	-12407651	+	ORR1B1	LTR	MaLR	52	394	0	2
1708	449	296	64	48	chr3	147199834	147200022	-12399761	-	MTD	LTR	MaLR	-211	208	18	2
1708	296	316	55	101	chr3	147200611	147200829	-12398954	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	208	-297	2
1708	245	323	30	68	chr3	147200916	147201049	-12398734	+	MLT1D	LTR	MaLR	374	501	-4	2
1708	699	242	95	10	chr3	147213626	147213826	-12385957	+	MTD	LTR	MaLR	1	217	-202	2
1708	1637	249	55	10	chr3	147213828	147214246	-12385537	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-90	437	1	2
1708	3522	222	57	52	chr3	147214247	147215399	-12384384	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2	6548	5391	2
1708	592	187	150	7	chr3	147215472	147215612	-12384171	+	MTD	LTR	MaLR	244	403	-16	2
1708	335	326	22	22	chr3	147216515	147216653	-12383130	-	RMER12	LTR	ERVK	-466	856	719	2
1708	4376	20	0	0	chr3	147218860	147219353	-12380430	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1708	302	0	0	0	chr3	147219353	147219391	-12380392	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	2
1708	390	167	46	35	chr3	147219391	147219478	-12380305	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	2
1708	32774	13	6	0	chr3	147219478	147224804	-12374979	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	2
1708	4359	20	0	0	chr3	147224804	147225297	-12374486	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1708	457	233	55	36	chr3	147228524	147228718	-12371065	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	185	2
1708	755	310	123	13	chr3	147228720	147229021	-12370762	-	MTD	LTR	MaLR	-38	381	48	2
1708	952	236	101	50	chr3	147241564	147242011	-12357772	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	578	0	3
1708	1185	289	75	16	chr3	147253541	147253927	-12345856	-	MTD	LTR	MaLR	-10	409	1	3
1708	759	260	97	125	chr3	147255808	147256191	-12343592	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	372	-7	3
1708	728	341	30	68	chr3	147260934	147261362	-12338421	-	LTR40b	LTR	ERVL	-1	461	50	3
1708	956	102	11	3	chr3	147263737	147263941	-12335842	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	346	122	3
1708	1082	185	69	27	chr3	147264015	147264276	-12335507	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-122	272	1	3
1708	598	216	211	23	chr3	147272059	147272234	-12327549	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	172	3
1708	352	145	42	28	chr3	147272638	147272709	-12327074	-	MTE2a	LTR	MaLR	-209	170	99	3
1708	409	378	34	15	chr3	147277216	147277420	-12322363	-	MLT1G1-int	LTR	MaLR	-433	1056	849	3
1708	282	354	88	100	chr3	147277463	147277786	-12321997	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-163	416	98	3
1708	282	354	88	100	chr3	147277892	147277988	-12321795	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-482	97	2	3
1708	3005	89	2	0	chr3	147281660	147282055	-12317728	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1708	785	339	72	59	chr3	147295664	147296190	-12303593	+	MT2A	LTR	ERVL	1	533	0	3
1708	299	343	78	8	chr3	147297758	147297995	-12301788	+	MLT1E	LTR	MaLR	1	302	-351	3
1708	1952	124	3	86	chr3	147298481	147298843	-12300940	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	-5	332	1	4
1708	237	292	62	10	chr3	147304736	147304833	-12294950	+	MTC-int	LTR	MaLR	494	595	-663	4
1708	1947	180	164	109	chr3	147317966	147318620	-12281163	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	4
1709	249	360	85	24	chr3	147331324	147331572	-12268211	-	MER90a	LTR	ERV1	-69	545	283	4
1709	273	320	20	20	chr3	147333749	147333851	-12265932	+	MER21B	LTR	ERV1	207	308	-555	4
1709	369	274	24	0	chr3	147333999	147334083	-12265700	+	MER57E1	LTR	ERV1	1	86	-286	4
1709	3368	181	22	120	chr3	147334186	147335045	-12264738	+	RMER21B	LTR	ERV1	66	840	-2	4
1709	455	326	77	62	chr3	147339106	147339443	-12260340	-	MLT1E1	LTR	MaLR	0	654	313	4
1709	2284	166	32	18	chr3	147350162	147350597	-12249186	+	BGLII_B	LTR	ERVK	1	441	0	4
1709	577	343	65	8	chr3	147351044	147351291	-12248492	+	MLT1C	LTR	MaLR	205	465	-2	4
1709	599	264	98	105	chr3	147352061	147352366	-12247417	+	MTE2a	LTR	MaLR	75	377	-2	4
1709	285	338	129	67	chr3	147354920	147355291	-12244492	+	MER34A	LTR	ERV1	21	414	-157	4
1709	423	304	153	37	chr3	147357210	147357504	-12242279	+	MLT2C1	LTR	ERVL	3	330	-67	4
1709	2860	43	40	3	chr3	147357680	147358032	-12241751	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	4
1709	254	330	170	0	chr3	147369691	147369803	-12229980	-	MTE2b	LTR	MaLR	-248	131	1	5
1709	904	252	3	126	chr3	147381713	147381999	-12217784	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	361	5
1709	250	189	63	45	chr3	147382018	147382129	-12217654	-	MurERV4_19-int	LTR	ERVK	-118	5662	5550	5
1709	559	234	8	0	chr3	147388570	147388698	-12211085	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-69	5461	5333	5
1709	352	227	23	0	chr3	147388724	147388812	-12210971	-	MER68-int	LTR	ERVL	-159	2831	2742	5
1709	264	319	113	46	chr3	147389437	147389588	-12210195	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-1414	4116	3956	5
1709	1146	355	38	15	chr3	147389713	147390237	-12209546	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-1744	3786	3251	5
1709	303	313	30	0	chr3	147391003	147391102	-12208681	-	HERVL40-int	LTR	ERVL	-2721	2809	2708	5
1709	328	270	10	29	chr3	147392554	147392657	-12207126	-	LTR40a	LTR	ERVL	-402	117	17	5
1709	418	352	62	31	chr3	147400910	147401168	-12198615	+	MLT1A1	LTR	MaLR	141	406	-2	5
1709	273	98	0	38	chr3	147402723	147402776	-12197007	-	MT2A	LTR	ERVL	-2	531	481	5
1709	432	348	7	7	chr3	147402823	147402959	-12196824	-	MT2A	LTR	ERVL	-162	371	236	5
1709	505	292	85	35	chr3	147408467	147408666	-12191117	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	166	5
1709	1266	276	22	22	chr3	147441018	147441381	-12158402	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-3	367	5	6
1709	1930	143	3	60	chr3	147446713	147447062	-12152721	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1710	805	337	70	23	chr3	147462801	147463144	-12136639	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	6
1710	434	314	141	62	chr3	147463144	147463419	-12136364	-	ORR1E	LTR	MaLR	-56	323	1	6
1710	287	380	93	22	chr3	147463592	147463775	-12136008	-	LTR16B2	LTR	ERVL	-110	352	157	6
1710	519	307	39	22	chr3	147464137	147464317	-12135466	-	MLT2D	LTR	ERVL	-153	261	79	6
1710	496	309	33	69	chr3	147465207	147465482	-12134301	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	265	-105	6
1710	3569	10	2	0	chr3	147467387	147467782	-12132001	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1710	305	271	115	43	chr3	147467833	147468050	-12131733	-	ORR1E	LTR	MaLR	-100	279	26	6
1710	339	351	46	0	chr3	147476095	147476246	-12123537	+	MLT1D	LTR	MaLR	346	503	-2	6
1710	338	347	46	41	chr3	147481259	147481552	-12118231	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-7	508	219	6
1710	623	297	55	81	chr3	147481635	147481906	-12117877	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-251	264	1	6
1710	267	291	76	5	chr3	147482759	147482887	-12116896	-	MTE2a	LTR	MaLR	-35	344	202	6
1710	325	316	133	35	chr3	147483322	147483525	-12116258	-	MTE-int	LTR	MaLR	-2	1578	1356	6
1710	1053	360	58	25	chr3	147483598	147484148	-12115635	-	MTE-int	LTR	MaLR	-216	1364	797	6
1710	769	343	108	22	chr3	147484202	147484563	-12115220	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-338	1242	851	6
1710	849	266	44	18	chr3	147484573	147484799	-12114984	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1348	232	1	6
1710	600	320	48	98	chr3	147484801	147485179	-12114604	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	6
1710	301	306	149	25	chr3	147485366	147485391	-12114392	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	354	6
1710	301	306	149	25	chr3	147485536	147485671	-12114112	-	MTEa	LTR	MaLR	-26	353	199	6
1710	517	264	33	108	chr3	147485794	147486006	-12113777	-	MTEa	LTR	MaLR	-164	215	20	6
1710	5995	87	136	3	chr3	147489771	147490674	-12109109	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	6
1710	2808	47	94	0	chr3	147490823	147491185	-12108598	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1710	244	298	25	58	chr3	147499350	147499471	-12100312	-	RMER12	LTR	ERVK	-486	836	720	6
1710	836	274	44	95	chr3	147504948	147505263	-12094520	-	MLT1B	LTR	MaLR	-91	299	1	9
1710	1231	284	78	10	chr3	147507626	147508010	-12091773	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	10	1
1710	3097	157	30	7	chr3	147508884	147509425	-12090358	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	1	1
1710	392	412	37	12	chr3	147529468	147529630	-12070153	+	LTR16B	LTR	ERVL	116	281	-182	4
1710	281	348	93	19	chr3	147529881	147530042	-12069741	+	LTR16B	LTR	ERVL	280	452	-11	4
1710	348	319	26	0	chr3	147530509	147530625	-12069158	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	119	-260	4
1710	1180	202	24	24	chr3	147530645	147530894	-12068889	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	249	-80	4
1710	298	305	19	9	chr3	147531874	147531980	-12067803	+	MLT1D	LTR	MaLR	397	503	-2	4
1710	457	272	43	58	chr3	147546897	147547104	-12052679	+	MLT2B2	LTR	ERVL	5	208	-307	6
1710	236	308	46	150	chr3	147547157	147547310	-12052473	+	MLT2B2	LTR	ERVL	379	515	-52	6
1710	382	300	31	62	chr3	147554157	147554285	-12045498	+	MTEa	LTR	MaLR	70	193	-186	7
1710	402	304	58	22	chr3	147554364	147554502	-12045281	+	MTEa	LTR	MaLR	237	379	0	7
1710	3504	135	171	36	chr3	147568653	147569066	-12030717	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	407	9
1710	3504	135	171	36	chr3	147569121	147569431	-12030352	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	-416	406	1	9
1710	243	336	78	73	chr3	147573086	147573295	-12026488	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-265	303	89	1
1710	243	335	72	57	chr3	147573951	147574042	-12025741	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-440	88	5	1
1710	1549	231	76	23	chr3	147578507	147578902	-12020881	-	MTD	LTR	MaLR	-3	416	1	1
1710	589	339	38	36	chr3	147579553	147579910	-12019873	-	MLT1E	LTR	MaLR	-4	649	265	1
1710	1100	279	74	40	chr3	147584368	147584672	-12015111	+	MTEb	LTR	MaLR	17	333	-46	1
1710	1100	279	74	40	chr3	147584765	147584811	-12014972	+	MTEb	LTR	MaLR	334	379	0	1
1710	462	261	114	104	chr3	147585196	147585330	-12014453	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-82	542	397	1
1710	462	261	114	104	chr3	147585935	147586001	-12013782	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-228	396	340	1
1710	227	313	0	78	chr3	147586253	147586343	-12013440	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-540	84	2	1
1711	363	340	142	44	chr3	147592248	147592565	-12007218	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	350	-9	1
1711	2104	177	72	3	chr3	147594916	147595302	-12004481	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	1
1711	968	276	114	30	chr3	147595389	147595722	-12004061	+	MTEb	LTR	MaLR	15	375	-4	1
1711	607	281	239	56	chr3	147598870	147599138	-12000645	+	MTEa	LTR	MaLR	6	322	-57	1
1711	610	211	39	8	chr3	147603929	147604058	-11995725	+	MT2A	LTR	ERVL	1	133	-400	1
1711	366	265	9	29	chr3	147604029	147604134	-11995649	+	MT2A	LTR	ERVL	73	175	-358	1
1711	253	222	0	139	chr3	147604196	147604311	-11995472	+	MT2A	LTR	ERVL	419	517	-16	1
1711	501	243	304	67	chr3	147604606	147604912	-11994871	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	1
1711	555	330	35	5	chr3	147607392	147607593	-11992190	-	MLT-int	LTR	MaLR	-1255	480	274	1
1711	546	220	7	18	chr3	147614842	147614987	-11984796	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	421	256	1
1711	387	149	0	0	chr3	147614987	147615054	-11984729	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5272	5338	-423	1
1711	378	151	13	40	chr3	147615113	147615189	-11984594	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	1
1711	430	100	170	0	chr3	147615191	147615291	-11984492	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-135	5626	5510	1
1711	1066	234	57	33	chr3	147615438	147615770	-11984013	-	RMER17C	LTR	ERVK	-70	340	1	1
1711	354	169	0	0	chr3	147615778	147615849	-11983934	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-275	71	1	1
1711	654	196	7	21	chr3	147617618	147617759	-11982024	-	MT2B	LTR	ERVL	-459	142	4	1
1711	559	215	136	25	chr3	147617850	147618004	-11981779	+	MTE-int	LTR	MaLR	1356	1527	-53	1
1711	542	339	104	56	chr3	147618004	147618342	-11981441	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	1
1711	2454	202	112	11	chr3	147619187	147619707	-11980076	+	RMER15	LTR	ERVL	1	572	-3	1
1711	532	262	215	23	chr3	147623599	147623818	-11975965	+	MLT1A0	LTR	MaLR	34	294	-71	1
1711	941	323	147	51	chr3	147624051	147624703	-11975080	+	MLT-int	LTR	MaLR	172	886	-849	1
1711	334	189	50	50	chr3	147662873	147662973	-11936810	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-4155	1367	1268	2
1711	334	304	52	44	chr3	147665454	147665630	-11934153	+	MLT1A1	LTR	MaLR	159	345	-29	2
1711	308	386	68	90	chr3	147672806	147673250	-11926533	+	LTR16C	LTR	ERVL	4	437	-52	2
1711	1496	219	63	44	chr3	147674372	147674596	-11925187	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	245	-129	2
1711	1496	219	63	44	chr3	147674618	147674760	-11925023	+	ORR1D1	LTR	MaLR	246	373	-1	2
1711	531	195	141	45	chr3	147680253	147680409	-11919374	-	RLTR26	LTR	ERVK	-471	171	1	2
1711	349	302	0	33	chr3	147681515	147681635	-11918148	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	262	2
1711	1478	262	103	5	chr3	147688332	147688712	-11911071	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	2
1711	7838	11	4	0	chr3	147690365	147691184	-11908599	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	2
1711	1600	169	80	13	chr3	147699913	147700224	-11899559	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	332	-62	2
1711	235	179	0	0	chr3	147700351	147700390	-11899393	+	ORR1B1	LTR	MaLR	318	356	-11	2
1711	3601	35	2	0	chr3	147702109	147702504	-11897279	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1711	345	297	104	55	chr3	147709545	147709709	-11890074	+	MLT1D	LTR	MaLR	326	497	-8	2
1712	351	153	4	163	chr3	147731392	147731619	-11868164	+	RMER17C	LTR	ERVK	88	278	-132	3
1712	460	335	78	52	chr3	147735933	147736242	-11863541	-	MTEa	LTR	MaLR	-35	344	28	3
1712	345	339	124	28	chr3	147744465	147744747	-11855036	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-167	313	5	3
1712	410	259	115	24	chr3	147746341	147746495	-11853288	-	MTE2a	LTR	MaLR	-8	371	210	3
1712	558	257	63	111	chr3	147758375	147758764	-11841019	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-11	557	175	3
1712	225	308	148	20	chr3	147767117	147767266	-11832517	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	168	-337	3
1712	1707	237	70	78	chr3	147774361	147774975	-11824808	+	RMER19C	LTR	ERVK	3	611	0	3
1712	1941	155	3	3	chr3	147779920	147780231	-11819552	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	3
1712	4090	122	9	1	chr3	147780231	147780912	-11818871	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	0	7680	6965	3
1712	1325	146	102	0	chr3	147780912	147781138	-11818645	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-1287	5255	5007	3
1712	289	208	0	0	chr3	147781140	147781193	-11818590	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-6043	499	447	3
1712	274	265	0	0	chr3	147781210	147781278	-11818505	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-6015	1566	1499	3
1712	313	291	17	8	chr3	147781339	147781457	-11818326	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-5602	940	822	3
1712	1179	163	152	16	chr3	147781623	147781879	-11817904	-	IAPEY3-int	LTR	ERVK	-4803	603	313	3
1712	604	165	0	0	chr3	147781866	147781987	-11817796	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-6714	867	747	3
1712	2296	103	7	15	chr3	147781987	147782338	-11817445	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-7244	337	10	3
1712	1891	164	3	3	chr3	147782340	147782651	-11817132	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	3
1712	1442	208	73	25	chr3	147783003	147783358	-11816425	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	3
1712	2937	82	17	10	chr3	147785694	147786112	-11813671	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	3
1712	3228	39	21	0	chr3	147793013	147793401	-11806382	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1712	530	269	106	23	chr3	147794181	147794398	-11805385	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	236	-123	4
1712	359	306	24	16	chr3	147806846	147806969	-11792814	-	MT2A	LTR	ERVL	-118	415	292	4
1712	309	295	74	61	chr3	147806992	147807229	-11792554	-	MTEa	LTR	MaLR	-118	261	1	4
1712	376	226	68	68	chr3	147807688	147807821	-11791962	+	RLTR11B	LTR	ERVK	3	135	-318	4
1712	623	248	51	73	chr3	147808091	147808360	-11791423	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-33	495	223	4
1712	635	230	26	184	chr3	147808875	147809184	-11790599	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-8	445	186	4
1712	2212	192	118	75	chr3	147816901	147817487	-11782296	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
1712	579	290	88	26	chr3	147821535	147821843	-11777940	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	327	-32	4
1712	350	259	52	81	chr3	147822697	147822869	-11776914	+	RMER6-int	LTR	ERVK	1284	1450	-1727	4
1712	760	244	74	5	chr3	147823005	147823039	-11776744	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	1286	1319	-7640	4
1712	760	244	74	5	chr3	147823065	147823232	-11776551	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	1320	1500	-7459	4
1712	4425	238	46	67	chr3	147823659	147824110	-11775673	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	1634	2032	-6927	4
1712	4425	238	46	67	chr3	147824257	147825455	-11774328	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	2033	3249	-5710	4
1712	5736	243	113	58	chr3	147825424	147828502	-11771281	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	3513	6521	-29	4
1712	620	299	57	39	chr3	147828521	147828855	-11770928	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	340	-19	4
1712	2436	98	78	10	chr3	147833831	147834214	-11765569	-	IAPLTR2a	LTR	ERVK	-2	409	1	4
1712	597	292	134	26	chr3	147846088	147846320	-11753463	+	MTEa	LTR	MaLR	1	257	-122	4
1712	372	284	60	0	chr3	147846399	147846515	-11753268	+	MTEa	LTR	MaLR	248	370	-9	4
1712	3035	58	8	8	chr3	147847037	147847433	-11752350	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1713	590	350	96	35	chr3	147858772	147859201	-11740582	-	RMER5	LTR	ERV1	-17	517	63	4
1713	283	268	28	102	chr3	147861122	147861230	-11738553	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	158	4
1713	1009	339	77	51	chr3	147864218	147864679	-11735104	+	MLT2B3	LTR	ERVL	5	496	-58	4
1713	1009	339	77	51	chr3	147864710	147864780	-11735003	+	MLT2B3	LTR	ERVL	497	550	-4	4
1713	1257	338	46	44	chr3	147864898	147865465	-11734318	+	MLT1E2	LTR	MaLR	7	574	-53	4
1713	374	291	42	42	chr3	147868190	147868355	-11731428	-	ORR1E	LTR	MaLR	-163	196	32	5
1713	761	285	22	6	chr3	147878293	147878510	-11721273	-	ORR1D2-int	LTR	MaLR	-1560	232	13	5
1713	505	261	63	29	chr3	147878510	147878703	-11721080	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	125	5
1713	896	296	24	92	chr3	147889429	147889808	-11709975	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	355	-4	5
1713	611	224	55	8	chr3	147893364	147893513	-11706270	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	222	5
1713	1029	226	74	126	chr3	147894400	147894437	-11705346	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	33	-351	5
1713	2676	55	0	55	chr3	147894437	147894803	-11704980	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	5
1713	1029	226	74	126	chr3	147894803	147895170	-11704613	+	ORR1C2	LTR	MaLR	34	384	0	5
1713	229	256	105	120	chr3	147897923	147898056	-11701727	+	MTE2a	LTR	MaLR	22	152	-227	5
1713	291	281	115	10	chr3	147898837	147898941	-11700842	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-12	557	443	5
1713	1102	299	42	21	chr3	147909892	147910227	-11689556	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	346	-13	5
1713	1055	308	70	48	chr3	147911466	147912007	-11687776	+	MLT1F1	LTR	MaLR	3	565	-4	5
1713	2422	53	9	6	chr3	147913474	147913799	-11685984	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	32	357	0	5
1713	225	301	130	78	chr3	147914412	147914643	-11685140	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-4	363	121	5
1713	363	330	75	9	chr3	147921346	147921560	-11678223	+	MLT2B1	LTR	ERVL	260	487	-33	5
1713	250	366	92	21	chr3	147922236	147922518	-11677265	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-7	547	246	5
1713	3540	166	48	37	chr3	147924435	147925136	-11674647	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	709	-11	5
1713	2660	72	79	5	chr3	147937470	147937862	-11661921	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	6
1713	475	304	16	62	chr3	147950499	147950692	-11649091	-	ORR1E	LTR	MaLR	-13	346	163	6
1713	691	264	59	43	chr3	147950800	147950986	-11648797	-	ORR1E	LTR	MaLR	-170	189	1	6
1713	242	304	98	0	chr3	147961542	147961634	-11638149	-	ORR1E	LTR	MaLR	-13	346	246	6
1713	345	271	189	18	chr3	147965506	147965675	-11634108	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	170	6
1713	290	312	23	25	chr3	147968149	147968287	-11631496	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-2	406	237	6
1713	971	295	27	89	chr3	147977432	147977804	-11621979	+	MTEb	LTR	MaLR	31	379	0	6
1714	228	183	46	77	chr3	147982035	147982100	-11617683	-	RMER20A	LTR	ERVK	-268	248	186	6
1714	928	252	120	34	chr3	147988219	147988544	-11611239	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	358	-16	6
1714	2100	184	47	10	chr3	147989125	147989531	-11610252	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1714	1050	304	56	10	chr3	147996576	147996878	-11602905	+	MTEa	LTR	MaLR	28	343	-36	6
1714	264	365	80	51	chr3	148000638	148000912	-11598871	+	LTR33A_	LTR	ERVL	248	529	-2	1
1714	1059	327	0	7	chr3	148002533	148002813	-11596970	+	MTE2b	LTR	MaLR	3	280	-99	5
1714	484	201	67	56	chr3	148004705	148004884	-11594899	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	95	9
1714	623	222	20	120	chr3	148010873	148011048	-11588735	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	160	-218	1
1714	623	222	20	120	chr3	148011177	148011201	-11588582	+	ORR1C1	LTR	MaLR	161	180	-198	1
1714	494	206	175	48	chr3	148011284	148011473	-11588310	+	ORR1C1	LTR	MaLR	172	384	0	1
1714	368	339	139	30	chr3	148012095	148012312	-11587471	-	LTR33C	LTR	ERVL	-386	242	1	2
1714	636	361	96	7	chr3	148022999	148023281	-11576502	+	MLT1A0	LTR	MaLR	51	357	-8	4
1714	997	289	83	43	chr3	148033749	148034099	-11565684	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	16	4
1714	330	256	57	139	chr3	148034498	148034810	-11564973	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-10	5704	5427	4
1714	3307	46	4	125	chr3	148034810	148035306	-11564477	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	5
1714	330	256	57	139	chr3	148035306	148035361	-11564422	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-288	5426	5367	4
1714	1051	294	37	37	chr3	148035437	148035744	-11564039	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-323	5434	5127	4
1714	2972	169	5	145	chr3	148035744	148036546	-11563237	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1714	1578	315	122	47	chr3	148036546	148037585	-11562198	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-631	5126	4001	4
1714	1578	318	65	48	chr3	148037745	148038010	-11561773	-	ERVL-int	LTR	ERVL	-1757	4000	3740	4
1714	240	336	35	0	chr3	148038165	148038281	-11561502	+	MLT-int	LTR	MaLR	248	367	-1368	5
1714	451	326	45	45	chr3	148038713	148038915	-11560868	+	MLT1B	LTR	MaLR	189	390	0	5
1714	620	365	120	54	chr3	148041481	148042022	-11557761	+	MTE-int	LTR	MaLR	72	648	-932	6
1714	1770	202	51	18	chr3	148042425	148042818	-11556965	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	2	6
1714	804	225	42	54	chr3	148042818	148043041	-11556742	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1005	253	32	6
1714	2121	154	42	5	chr3	148043041	148043419	-11556364	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	6
1714	804	225	42	54	chr3	148043419	148043435	-11556348	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1227	31	17	6
1714	868	277	42	5	chr3	148046318	148046532	-11553251	+	MTEb	LTR	MaLR	2	223	-156	7
1714	262	284	60	68	chr3	148047658	148047775	-11552008	+	MLT1A1	LTR	MaLR	291	406	-2	7
1714	267	351	18	79	chr3	148055598	148055762	-11544021	+	MLT1E3	LTR	MaLR	72	225	-399	8
1714	239	305	56	38	chr3	148055780	148055940	-11543843	+	MLT2B2	LTR	ERVL	381	543	-19	8
1714	228	211	88	0	chr3	148055989	148056046	-11543737	+	MLT2B2	LTR	ERVL	494	555	-1	8
1714	836	312	87	26	chr3	148057051	148057397	-11542386	+	MTD	LTR	MaLR	38	404	-15	8
1714	3158	57	23	0	chr3	148064571	148064958	-11534825	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	9
1714	1317	202	131	64	chr3	148068872	148069232	-11530551	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	1
1714	338	351	57	105	chr3	148077142	148077476	-11522307	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-126	422	105	1
1714	686	344	183	15	chr3	148077755	148078245	-11521538	-	MLT1F1-int	LTR	MaLR	-161	1328	685	1
1714	1069	313	58	25	chr3	148078805	148079290	-11520493	-	MLT1F1-int	LTR	MaLR	-806	683	183	1
1714	497	346	102	30	chr3	148079445	148079817	-11519966	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-8	561	163	1
1714	421	303	62	26	chr3	148082271	148082464	-11517319	-	RMER5	LTR	ERV1	-6	528	329	1
1714	401	262	62	62	chr3	148083244	148083374	-11516409	-	RMER5	LTR	ERV1	-357	177	48	1
1714	302	290	111	16	chr3	148095118	148095244	-11504539	+	MLT1D	LTR	MaLR	19	156	-349	1
1714	328	274	52	123	chr3	148099668	148099822	-11499961	-	MT2B	LTR	ERVL	-322	279	137	1
1714	255	254	0	17	chr3	148103018	148103078	-11496705	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-318	79	21	1
1714	1907	265	64	13	chr3	148109523	148110119	-11489664	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4013	4638	-1029	1
1715	278	266	33	99	chr3	148119747	148119868	-11479915	-	MT2B	LTR	ERVL	-337	264	152	1
1715	535	168	68	112	chr3	148126591	148126619	-11473164	+	MT2B	LTR	ERVL	136	237	-364	1
1715	535	168	68	112	chr3	148126740	148126752	-11473031	+	MT2B	LTR	ERVL	238	289	-312	1
1715	633	336	64	62	chr3	148129175	148129628	-11470155	-	MT2A	LTR	ERVL	-73	460	7	1
1715	446	290	80	40	chr3	148140147	148140348	-11459435	+	MLT1B	LTR	MaLR	167	375	-15	2
1715	436	360	71	60	chr3	148140748	148141114	-11458669	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	2
1715	306	287	70	75	chr3	148142687	148142932	-11456851	+	MTE2a	LTR	MaLR	106	359	-20	2
1715	996	286	58	21	chr3	148148269	148148598	-11451185	-	MLT2D	LTR	ERVL	-56	358	18	2
1715	715	326	29	44	chr3	148155003	148155314	-11444469	-	MTE2b	LTR	MaLR	-74	305	1	2
1715	285	344	47	23	chr3	148156490	148156618	-11443165	+	MLT1B	LTR	MaLR	6	136	-254	2
1715	241	261	0	0	chr3	148156669	148156715	-11443068	+	MLT1B	LTR	MaLR	343	388	-79	2
1715	386	382	0	0	chr3	148161489	148161612	-11438171	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-69	493	371	2
1715	402	343	21	21	chr3	148161692	148161835	-11437948	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-359	156	14	2
1715	1430	244	108	18	chr3	148162478	148162812	-11436971	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-10	364	1	2
1715	699	323	92	6	chr3	148165565	148165892	-11433891	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	358	-1	2
1715	1712	259	83	26	chr3	148166127	148166623	-11433160	+	RMER19C	LTR	ERVK	88	611	0	2
1715	1117	288	80	20	chr3	148166693	148167044	-11432739	+	MTEa	LTR	MaLR	3	374	-5	2
1715	306	273	125	62	chr3	148167270	148167430	-11432353	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-381	181	12	2
1715	757	115	76	2	chr3	148167866	148168000	-11431783	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	141	-185	2
1715	374	119	0	17	chr3	148167989	148168049	-11431734	+	ORR1A2	LTR	MaLR	260	318	-8	2
1715	282	335	77	84	chr3	148170521	148170830	-11428953	-	MTEa	LTR	MaLR	-55	324	1	2
1715	2321	329	44	25	chr3	148170830	148171754	-11428029	-	MTE-int	LTR	MaLR	-53	1527	586	2
1715	933	311	81	6	chr3	148171757	148172077	-11427706	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1225	355	12	2
1715	542	341	62	68	chr3	148172115	148172423	-11427360	-	ORR1E	LTR	MaLR	-40	319	14	2
1715	494	302	87	94	chr3	148172568	148172867	-11426916	+	MLT1A0	LTR	MaLR	69	365	0	2
1715	2551	155	198	9	chr3	148182385	148182965	-11416818	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	2
1715	2574	56	62	0	chr3	148187449	148187771	-11412012	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	5	2
1715	1056	215	163	15	chr3	148188834	148189160	-11410623	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	2
1715	561	322	66	89	chr3	148189639	148189987	-11409796	+	MTEa	LTR	MaLR	2	341	-38	2
1715	265	191	118	0	chr3	148193820	148193888	-11405895	+	LTR48	LTR	ERV1	90	165	-622	2
1715	1891	134	77	27	chr3	148199024	148199361	-11400422	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	2
1715	387	301	110	0	chr3	148205279	148205442	-11394341	+	MLT1A1	LTR	MaLR	73	253	-155	3
1715	2660	63	2	147	chr3	148205566	148206029	-11393754	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	3
1715	345	329	42	24	chr3	148220304	148220469	-11379314	-	MTEb	LTR	MaLR	-11	368	201	3
1715	1191	266	82	50	chr3	148234159	148234219	-11365564	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	324	3
1715	1978	142	34	9	chr3	148234219	148234540	-11365243	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	3
1715	1191	266	82	50	chr3	148234540	148234843	-11364940	-	MTE2a	LTR	MaLR	-56	323	4	3
1715	482	293	126	31	chr3	148238747	148238969	-11360814	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-168	280	38	3
1716	2212	87	48	0	chr3	148243131	148243443	-11356340	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1716	3414	154	98	22	chr3	148244898	148245541	-11354242	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	1	3
1716	902	217	45	195	chr3	148248626	148248920	-11350863	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-1	1102	866	3
1716	902	217	45	195	chr3	148248983	148249134	-11350649	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-238	865	724	3
1716	317	246	328	0	chr3	148260042	148260185	-11339598	-	MTE2b	LTR	MaLR	-4	375	185	3
1716	6149	183	81	16	chr3	148262413	148262616	-11337167	-	RMER12B	LTR	ERVK	0	1404	1204	3
1716	6149	183	81	16	chr3	148262667	148263781	-11336002	-	RMER12B	LTR	ERVK	-201	1203	2	3
1716	405	336	67	27	chr3	148268307	148268658	-11331125	-	MLT1C	LTR	MaLR	-18	449	36	3
1716	936	345	46	5	chr3	148269483	148269856	-11329927	-	MT2A	LTR	ERVL	-145	388	1	4
1716	289	269	11	8	chr3	148274436	148274525	-11325258	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	92	-327	4
1716	507	335	74	67	chr3	148274589	148274887	-11324896	+	MTE2a	LTR	MaLR	65	364	-15	4
1716	443	249	296	67	chr3	148280194	148280501	-11319282	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	1	4
1716	4510	14	0	0	chr3	148281095	148281588	-11318195	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
1716	3293	48	2	5	chr3	148289443	148289840	-11309943	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1716	9223	31	17	0	chr3	148289840	148290920	-11308863	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	4
1716	3420	38	0	5	chr3	148290920	148291318	-11308465	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1716	361	322	67	50	chr3	148291318	148291558	-11308225	-	MLT2D	LTR	ERVL	-66	348	100	4
1716	281	316	35	0	chr3	148292467	148292581	-11307202	+	MTEa	LTR	MaLR	255	372	-7	4
1716	452	215	0	110	chr3	148301997	148302029	-11297754	+	MT2B	LTR	ERVL	137	153	-448	4
1716	1477	184	29	4	chr3	148302502	148302775	-11297008	-	MTC	LTR	MaLR	-19	402	123	4
1716	244	269	0	0	chr3	148302779	148302831	-11296952	-	MTC	LTR	MaLR	-248	171	120	4
1716	939	166	43	0	chr3	148303097	148303260	-11296523	-	MTC	LTR	MaLR	-250	171	2	4
1716	1857	170	8	57	chr3	148314772	148315158	-11284625	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	367	-11	4
1716	288	200	65	26	chr3	148318796	148318873	-11280910	+	LTR40b	LTR	ERVL	53	132	-330	4
1716	240	283	17	109	chr3	148319281	148319400	-11280383	+	MTEb	LTR	MaLR	115	222	-157	4
1716	289	289	26	9	chr3	148319740	148319855	-11279928	+	LTR40b	LTR	ERVL	344	460	-2	4
1716	3045	78	2	8	chr3	148330402	148330804	-11268979	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1716	425	272	78	78	chr3	148332303	148332534	-11267249	+	RMER15	LTR	ERVL	326	556	-19	5
1716	4133	129	23	0	chr3	148334358	148334962	-11264821	-	RMER19A	LTR	ERVK	-119	618	1	5
1716	806	276	57	1	chr3	148337153	148337393	-11262390	-	MTE2b	LTR	MaLR	-128	251	1	5
1716	873	274	150	55	chr3	148340472	148340839	-11258944	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	18	5
1716	1818	81	120	0	chr3	148341984	148342267	-11257516	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-5	322	6	5
1716	287	274	102	44	chr3	148347809	148348015	-11251768	-	RMER5	LTR	ERV1	-15	519	302	5
1716	608	235	117	29	chr3	148364553	148364759	-11235024	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	196	5
1716	598	264	34	22	chr3	148365789	148365967	-11233816	-	MTD	LTR	MaLR	-227	192	13	5
214	4684	16	2	0	chr3	148373489	148373981	-11225802	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1717	322	0	0	0	chr3	148373981	148374019	-11225764	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
1717	387	167	46	35	chr3	148374019	148374106	-11225677	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	553	5
1717	48347	15	6	0	chr3	148374106	148379432	-11220351	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-125	5360	1	5
1717	4684	16	2	0	chr3	148379432	148379924	-11219859	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	5
1717	335	302	83	54	chr3	148380582	148380750	-11219033	-	MTE2b	LTR	MaLR	-206	173	1	5
1717	617	302	50	80	chr3	148380961	148381299	-11218484	+	MT2A	LTR	ERVL	204	531	-2	5
1717	559	331	151	29	chr3	148384894	148385305	-11214478	-	MLT1D	LTR	MaLR	-44	461	1	5
1717	352	281	77	85	chr3	148385456	148385705	-11214078	+	MLT1E3	LTR	MaLR	385	645	-9	5
1717	290	137	137	0	chr3	148386080	148386146	-11213637	-	MLT1D	LTR	MaLR	-3	502	427	5
1717	442	378	41	25	chr3	148386373	148386617	-11213166	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-58	307	60	5
1717	3128	155	53	87	chr3	148387288	148388002	-11211781	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	5
1717	1271	264	78	33	chr3	148388186	148388585	-11211198	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	1	5
1717	530	212	133	8	chr3	148399702	148399852	-11199931	+	MER74A	LTR	ERVL	40	260	-362	6
1717	237	311	54	22	chr3	148399911	148400003	-11199780	+	MER74A	LTR	ERVL	490	584	-38	6
1717	2964	171	61	2	chr3	148405883	148406421	-11193362	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	3	6
1717	276	249	113	52	chr3	148407354	148407534	-11192249	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-1131	219	33	6
1717	717	286	270	11	chr3	148409252	148409626	-11190157	-	MLT1H	LTR	MaLR	-1	548	78	6
1717	3100	5	0	118	chr3	148413060	148413476	-11186307	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1717	56585	24	17	2	chr3	148413476	148419860	-11179923	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	6481	0	6
1717	3100	5	0	118	chr3	148419860	148420276	-11179507	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	6
1717	401	343	114	50	chr3	148425163	148425522	-11174261	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	382	-85	6
1717	950	265	132	19	chr3	148430380	148430745	-11169038	-	MTC	LTR	MaLR	-15	406	1	6
1717	776	308	99	35	chr3	148432574	148433020	-11166763	-	MLT2B1	LTR	ERVL	0	555	60	6
1717	3083	75	10	2	chr3	148444970	148445374	-11154409	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	6
1717	280	222	0	40	chr3	148445625	148445700	-11154083	-	MLT1B	LTR	MaLR	-17	373	302	6
1717	352	329	55	81	chr3	148445940	148446317	-11153466	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	379	0	6
1717	1510	216	0	132	chr3	148446713	148447139	-11152644	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	1	6
1717	1589	210	21	64	chr3	148453604	148453981	-11145802	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	361	-6	6
1717	1094	239	108	30	chr3	148455509	148455879	-11143904	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	6	6
1717	239	309	30	20	chr3	148460429	148460528	-11139255	+	RMER15	LTR	ERVL	377	476	-99	6
1717	241	331	32	32	chr3	148463995	148464120	-11135663	+	MLT2B4	LTR	ERVL	72	196	-360	6
1717	957	256	87	69	chr3	148466686	148467064	-11132719	+	MTD	LTR	MaLR	20	404	-15	6
1717	230	177	191	16	chr3	148468621	148468684	-11131099	+	MTEb	LTR	MaLR	20	93	-286	7
1717	1494	168	44	54	chr3	148474359	148474767	-11125016	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	404	-6	7
1718	266	217	39	98	chr3	148545611	148545713	-11054070	+	MT2B	LTR	ERVL	163	258	-343	3
1718	3108	19	5	0	chr3	148572582	148572953	-11026830	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	24	8
1718	1473	155	57	11	chr3	148574222	148574502	-11025281	+	ORR1B1	LTR	MaLR	102	394	0	8
1718	359	309	45	153	chr3	148581722	148581944	-11017839	+	MTE2b	LTR	MaLR	152	349	-30	9
1718	300	276	0	117	chr3	148612122	148612233	-10987550	+	MT2B	LTR	ERVL	160	257	-344	1
1719	270	333	56	51	chr3	148668355	148668551	-10931232	+	LTR86A1	LTR	ERVL	18	214	-299	1
1719	1218	179	56	34	chr3	148698423	148698790	-10900993	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	91	508	-53	2
1719	229	191	250	0	chr3	148698804	148698872	-10900911	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	465	549	-8	2
1720	518	297	129	66	chr3	148769579	148769867	-10829916	+	RMER13A	LTR	ERVK	30	337	-523	3
1720	518	297	129	66	chr3	148769915	148770037	-10829746	+	RMER13A	LTR	ERVK	338	466	-394	3
1720	1071	278	51	25	chr3	148773263	148773617	-10826166	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-1	364	2	3
1720	939	258	32	27	chr3	148785815	148786189	-10813594	+	RMER17C	LTR	ERVK	3	378	-32	3
1720	3640	13	0	0	chr3	148786784	148787180	-10812603	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1720	9441	25	4	2	chr3	148787180	148788276	-10811507	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	3
1720	3640	13	0	0	chr3	148788276	148788672	-10811111	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1720	277	303	112	65	chr3	148790305	148790610	-10809173	+	MTE2b	LTR	MaLR	58	379	0	3
1720	1480	168	29	92	chr3	148791882	148792229	-10807554	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	365	-29	4
1720	570	328	32	8	chr3	148793932	148794174	-10805609	+	MLT1A0	LTR	MaLR	112	401	-7	4
1720	492	275	112	76	chr3	148804098	148804401	-10795382	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	316	-43	4
1720	1965	114	115	33	chr3	148805632	148805996	-10793787	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1720	501	265	124	10	chr3	148806294	148806496	-10793287	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-145	225	1	4
1720	842	284	58	39	chr3	148812598	148812893	-10786890	+	MTEa	LTR	MaLR	7	312	-67	4
1720	842	284	58	39	chr3	148813073	148813088	-10786695	+	MTEa	LTR	MaLR	313	323	-56	4
1720	334	152	0	17	chr3	148813136	148813196	-10786587	+	MTEa	LTR	MaLR	314	372	-7	4
1720	546	351	60	54	chr3	148817394	148817692	-10782091	+	MTEa	LTR	MaLR	1	300	-79	4
1720	574	220	65	54	chr3	148819629	148819797	-10779986	+	LTR82A	LTR	ERVL	153	322	-550	4
1720	358	311	94	51	chr3	148820433	148820687	-10779096	+	LTR82A	LTR	ERVL	503	767	-105	4
1720	230	289	0	11	chr3	148837359	148837450	-10762333	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-45	635	546	4
1720	605	260	98	81	chr3	148837952	148838299	-10761484	+	MTEb	LTR	MaLR	8	360	-19	4
1720	3122	56	20	13	chr3	148855216	148855613	-10744170	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	5
1720	612	331	85	73	chr3	148859458	148859976	-10739807	+	MLT1F	LTR	MaLR	15	538	-10	5
1720	1794	153	41	92	chr3	148864318	148864729	-10735054	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-17	390	1	5
1720	4104	142	33	30	chr3	148865106	148865860	-10733923	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	1	5
1720	311	186	105	29	chr3	148882983	148883088	-10716695	+	LTR81A	LTR	ERV1?	195	307	-1043	5
1720	600	252	82	0	chr3	148889700	148889906	-10709877	+	MLT1J	LTR	MaLR	272	494	-18	5
1720	972	295	71	12	chr3	148896844	148897180	-10702603	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	8	5
1721	1916	124	17	20	chr3	148930025	148930379	-10669404	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	53	6
1721	1201	234	16	131	chr3	148938482	148938910	-10660873	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	6
1721	5123	200	50	103	chr3	148941925	148943508	-10656275	+	RLTR21	LTR	ERVK	7	1459	-113	6
1721	1024	300	40	20	chr3	148943722	148944076	-10655707	+	MTE2b	LTR	MaLR	7	367	-12	6
1721	1980	163	202	22	chr3	148950052	148950498	-10649285	+	RLTR24	LTR	ERV1	2	527	-2	6
1721	334	328	104	107	chr3	148973512	148973850	-10625933	-	ORR1E	LTR	MaLR	-22	337	1	7
1721	920	296	48	45	chr3	148974589	148974967	-10624816	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	7
1721	1987	172	53	20	chr3	148982746	148983144	-10616639	-	MTC	LTR	MaLR	-6	415	5	7
1721	655	302	88	69	chr3	148983638	148984090	-10615693	+	MT2A	LTR	ERVL	1	461	-72	7
1721	1880	182	5	67	chr3	148984299	148984687	-10615096	-	MTC	LTR	MaLR	-55	366	3	7
1721	249	225	14	27	chr3	148985308	148985381	-10614402	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	308	7
1721	466	281	42	24	chr3	148985414	148985582	-10614201	-	MTD	LTR	MaLR	-241	178	8	7
1721	1125	249	59	42	chr3	148985602	148985959	-10613824	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-11	363	1	7
1721	522	275	188	12	chr3	148992444	148992768	-10607015	-	RMER5	LTR	ERV1	-11	523	143	7
1721	233	294	123	71	chr3	148998102	148998256	-10601527	-	LTR48	LTR	ERV1	-625	162	1	7
1721	431	298	112	43	chr3	149016266	149016543	-10583240	+	MTEa	LTR	MaLR	74	369	-10	2
1721	1790	184	69	51	chr3	149019354	149019788	-10579995	-	RMER10A	LTR	ERVL	0	442	1	3
1722	257	225	48	36	chr3	149080999	149081082	-10518701	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-73	335	252	1
1722	341	302	61	109	chr3	149081827	149082057	-10517726	-	ORR1E	LTR	MaLR	-122	237	19	1
1722	1768	303	104	59	chr3	149082027	149082944	-10516839	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-21	1559	507	1
1722	232	287	29	38	chr3	149088218	149088323	-10511460	+	MLT1A1	LTR	MaLR	301	404	-4	1
1722	490	354	43	17	chr3	149115356	149115586	-10484197	-	ORR1E	LTR	MaLR	-120	239	4	1
1722	497	305	86	86	chr3	149124182	149124541	-10475242	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	1
1722	1115	234	153	51	chr3	149127578	149127912	-10471871	+	ORR1D2	LTR	MaLR	3	370	0	1
1722	2998	113	0	14	chr3	149127932	149128371	-10471412	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	433	-3	1
1722	389	346	27	30	chr3	149142900	149143162	-10456621	+	HERV16-int	LTR	ERVL	2244	2504	-2492	1
1722	734	274	136	32	chr3	149144428	149144595	-10455188	+	RLTR28B	LTR	ERVL	130	318	-163	1
1722	734	274	136	32	chr3	149144687	149144834	-10454949	+	RLTR28B	LTR	ERVL	319	477	-4	1
1722	703	312	79	25	chr3	149147852	149148180	-10451603	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	368	-2	1
1722	2972	96	5	10	chr3	149153617	149154026	-10445757	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	2
1723	665	280	65	11	chr3	149164984	149165168	-10434615	+	MTD	LTR	MaLR	37	230	-189	2
1723	562	325	0	6	chr3	149166868	149167026	-10432757	-	MTE2b	LTR	MaLR	-219	160	4	2
1723	3391	33	2	2	chr3	149173103	149173499	-10426284	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1723	2014	151	30	58	chr3	149177822	149178216	-10421567	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	1	2
1723	1425	204	82	35	chr3	149179642	149179982	-10419801	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	356	-18	2
1723	329	288	26	43	chr3	149201565	149201681	-10398102	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	253	2
1723	1020	236	79	60	chr3	149210157	149210483	-10389300	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	359	0	2
1723	334	331	65	39	chr3	149215175	149215329	-10384454	+	MLT1F1	LTR	MaLR	27	184	-385	2
1723	1341	201	166	6	chr3	149235773	149236104	-10363679	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	3
1723	517	305	85	58	chr3	149254215	149254473	-10345310	+	MTE2a	LTR	MaLR	28	301	-78	3
1723	3479	25	2	0	chr3	149259292	149259687	-10340096	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1723	555	302	60	0	chr3	149261694	149261834	-10337949	+	MTD	LTR	MaLR	54	202	-217	3
1723	867	294	37	68	chr3	149278440	149278521	-10321262	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	274	4
1723	1879	227	143	14	chr3	149278521	149279030	-10320753	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	4
1723	867	294	37	68	chr3	149279030	149279273	-10320510	-	ORR1E	LTR	MaLR	-86	273	41	4
1723	424	236	0	78	chr3	149283536	149283651	-10316132	-	MT2B	LTR	ERVL	-344	257	152	4
1723	2857	181	43	20	chr3	149284161	149284723	-10315060	+	RMER15	LTR	ERVL	1	575	0	4
1723	946	237	197	22	chr3	149285543	149285858	-10313925	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	370	-4	4
1723	516	346	80	60	chr3	149289782	149290096	-10309687	+	MLT1I	LTR	MaLR	80	399	-12	4
1723	1929	162	137	5	chr3	149290465	149290837	-10308946	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1724	1850	213	17	34	chr3	149292300	149292717	-10307066	+	RLTR16	LTR	ERVK	4	413	-92	4
1724	525	156	0	11	chr3	149292820	149292911	-10306872	+	RLTR16	LTR	ERVK	416	505	0	4
1724	2366	140	40	0	chr3	149296046	149296425	-10303358	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	4
1724	835	273	72	29	chr3	149298484	149298763	-10301020	+	ORR1E	LTR	MaLR	14	304	-55	4
1724	260	255	98	39	chr3	149304528	149304630	-10295153	+	MTEa	LTR	MaLR	267	374	-5	4
1724	904	251	162	48	chr3	149306506	149306840	-10292943	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	4
1724	773	322	49	23	chr3	149308026	149308331	-10291452	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	313	-52	4
1724	406	274	32	70	chr3	149310323	149310480	-10289303	-	MTEb	LTR	MaLR	-226	153	3	4
1724	1009	231	46	122	chr3	149325433	149325843	-10273940	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	4
1724	3574	10	0	0	chr3	149329213	149329609	-10270174	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1724	945	307	60	43	chr3	149329989	149330387	-10269396	+	MTD	LTR	MaLR	1	405	-14	4
1724	718	275	121	9	chr3	149331097	149331321	-10268462	+	ORR1E	LTR	MaLR	102	350	-9	4
1724	2122	250	92	24	chr3	149339122	149339704	-10260079	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	63	4
1724	785	255	31	212	chr3	149340183	149340672	-10259111	+	MTD	LTR	MaLR	10	379	0	5
1724	242	326	0	31	chr3	149349760	149349858	-10249925	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	365	271	5
1724	536	368	82	58	chr3	149350236	149350773	-10249010	-	MTE-int	LTR	MaLR	-539	1041	492	5
1724	645	282	150	48	chr3	149353318	149353758	-10246025	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	189	673	-7	5
1724	524	0	0	0	chr3	149358699	149358759	-10241024	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	-433	60	1	5
1724	302	0	0	0	chr3	149358759	149358797	-10240986	-	MERVL-int	LTR	ERVL	0	5485	5448	5
1724	371	111	26	53	chr3	149358797	149358873	-10240910	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-1323	640	567	5
1724	2584	25	3	0	chr3	149358873	149359193	-10240590	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-114	5371	5051	5
1724	2450	41	2	249	chr3	149370829	149371344	-10228439	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	5
1724	7325	44	7	9	chr3	149371356	149372316	-10227467	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	41	998	-989	5
1724	292	287	31	8	chr3	149372380	149372510	-10227273	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1462	1594	-5987	5
1724	8231	25	0	1	chr3	149372592	149373590	-10226193	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	990	1986	-1	5
1724	2450	41	2	249	chr3	149373590	149374105	-10225678	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	388	-2	5
1724	523	348	81	14	chr3	149378837	149379134	-10220649	-	ORR1E	LTR	MaLR	-8	351	35	5
1724	4670	163	67	12	chr3	149380095	149380950	-10218833	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	5
1724	290	301	132	0	chr3	149381054	149381190	-10218593	+	MLT1C	LTR	MaLR	289	442	-25	5
1724	449	342	73	69	chr3	149387414	149387659	-10212124	+	MLT1H1	LTR	MaLR	67	356	-239	5
1724	572	298	40	56	chr3	149389890	149390142	-10209641	+	MLT1D	LTR	MaLR	21	268	-237	5
1724	236	390	17	8	chr3	149390177	149390296	-10209487	+	MLT1D	LTR	MaLR	348	467	0	5
1724	279	325	157	60	chr3	149391045	149391352	-10208431	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-11	543	3	5
1724	270	312	40	68	chr3	149391352	149391500	-10208283	-	MTEb	LTR	MaLR	-233	146	3	5
1724	290	367	86	31	chr3	149404092	149404348	-10195435	-	LTR16B	LTR	ERVL	0	463	194	5
1724	758	332	36	52	chr3	149413949	149414279	-10185504	-	MTE2b	LTR	MaLR	-54	325	1	6
1724	1499	176	66	27	chr3	149415665	149416101	-10183682	-	RMER6C	LTR	ERVK	-3	687	1	6
1724	1115	294	25	25	chr3	149416157	149416513	-10183270	+	MTEa	LTR	MaLR	20	375	-4	6
1724	1105	263	144	12	chr3	149416819	149417146	-10182637	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	50	6
1724	250	208	18	54	chr3	149417193	149417249	-10182534	+	RLTR25A	LTR	ERVK	522	575	-528	6
1724	2306	203	163	28	chr3	149418132	149418781	-10181002	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	6
1724	792	191	35	9	chr3	149418949	149419127	-10180656	+	RMER19A	LTR	ERVK	580	902	0	6
1725	681	305	44	90	chr3	149432620	149432941	-10166842	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	74	6
1725	229	332	68	78	chr3	149434534	149434753	-10165030	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	217	-191	6
1725	539	257	35	35	chr3	149436412	149436610	-10163173	-	LTR37A	LTR	ERV1	-4	422	225	6
1725	512	246	18	0	chr3	149439453	149439563	-10160220	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	112	-247	6
1725	250	306	78	39	chr3	149444313	149444442	-10155341	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-3	535	402	6
1725	3008	66	10	8	chr3	149452612	149453007	-10146776	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1725	293	382	61	0	chr3	149454585	149454750	-10145033	+	LTR79	LTR	ERVL	13	187	-340	6
1725	714	287	69	7	chr3	149455427	149455718	-10144065	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-1034	337	29	6
1725	294	218	75	75	chr3	149458456	149458550	-10141233	+	RMER15	LTR	ERVL	338	431	-144	6
1725	874	325	43	13	chr3	149462084	149462432	-10137351	+	MLT2D	LTR	ERVL	15	522	-37	6
1725	2907	31	34	6	chr3	149462782	149463137	-10136646	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	6
1725	782	247	11	11	chr3	149475783	149475971	-10123812	+	ORR1D1	LTR	MaLR	187	374	0	6
1725	397	316	19	26	chr3	149475973	149476129	-10123654	-	MLT1B	LTR	MaLR	-235	155	1	6
1725	469	345	92	71	chr3	149476136	149476473	-10123310	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-3	650	306	6
1725	225	290	38	48	chr3	149487209	149487314	-10112469	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-6	402	299	7
1725	2763	114	2	7	chr3	149494101	149494524	-10105259	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	7
1725	1593	166	100	15	chr3	149501603	149501934	-10097849	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	359	-8	3
1725	759	289	127	19	chr3	149511943	149512214	-10087569	-	MTD	LTR	MaLR	-57	362	67	2
1725	3260	177	25	16	chr3	149516238	149516846	-10082937	+	RLTR17	LTR	ERVK	1	613	-79	3
1725	251	326	88	7	chr3	149519248	149519384	-10080399	-	LTR90A	LTR	LTR	-28	948	802	3
1725	415	181	20	60	chr3	149520839	149520939	-10078844	-	MTC	LTR	MaLR	-4	417	322	4
1725	821	192	71	12	chr3	149520932	149521101	-10078682	-	MTC	LTR	MaLR	-242	179	1	4
1725	932	188	46	63	chr3	149521101	149521385	-10078398	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	980	4
1725	4706	210	43	7	chr3	149521551	149522497	-10077286	-	MTC-int	LTR	MaLR	-273	985	6	4
1725	1111	143	84	19	chr3	149522507	149522721	-10077062	-	MTC	LTR	MaLR	-6	415	188	4
1725	446	200	9	95	chr3	149522697	149522813	-10076970	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-752	1211	1106	4
1725	352	155	167	49	chr3	149523832	149523934	-10075849	-	MTC	LTR	MaLR	-301	120	7	4
1725	514	210	20	0	chr3	149523925	149524025	-10075758	+	ORR1D1	LTR	MaLR	273	374	0	4
1725	333	354	38	33	chr3	149524348	149524561	-10075222	+	RMER15	LTR	ERVL	347	560	-15	4
1725	484	314	206	70	chr3	149534730	149535059	-10064724	+	MTEa	LTR	MaLR	5	377	-2	6
1725	2459	68	75	0	chr3	149536805	149537127	-10062656	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	6
1725	249	287	39	29	chr3	149537820	149537924	-10061859	+	MLT2B3	LTR	ERVL	10	114	-440	6
1725	1520	206	78	48	chr3	149540437	149540850	-10058933	+	RLTR28	LTR	ERVL	83	507	-17	7
1725	661	77	2	49	chr3	149543772	149543907	-10055876	+	MT-int	LTR	MaLR	927	1140	-118	7
1725	995	295	55	12	chr3	149545295	149545621	-10054162	-	MLT1E3	LTR	MaLR	0	624	285	8
1726	301	339	179	8	chr3	149554296	149554531	-10045252	-	MER67B	LTR	ERV1	-362	299	25	8
1726	376	309	97	69	chr3	149554585	149554869	-10044914	+	MLT1A1	LTR	MaLR	59	390	-18	9
1726	261	336	69	75	chr3	149566669	149567016	-10032767	+	LTR37B	LTR	ERV1	59	403	-65	1
1726	1422	219	137	3	chr3	149567905	149568089	-10031694	+	MTC	LTR	MaLR	5	201	-220	1
1726	1422	219	137	3	chr3	149568125	149568298	-10031485	+	MTC	LTR	MaLR	202	409	-12	1
1726	244	369	36	23	chr3	149573235	149573454	-10026329	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	1	222	-1165	1
1726	597	323	38	83	chr3	149577092	149577515	-10022268	-	MTE2b	LTR	MaLR	-2	417	2	1
1726	290	350	90	72	chr3	149589547	149589882	-10009901	-	ORR1E	LTR	MaLR	-18	341	1	1
1726	2054	139	9	0	chr3	149590916	149591239	-10008544	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	326	-1	1
1726	515	336	59	60	chr3	149594501	149595106	-10004677	-	MER90	LTR	ERV1	0	614	2	1
1726	742	325	92	44	chr3	149596774	149597112	-10002671	+	MTEa	LTR	MaLR	1	354	-25	1
1726	363	320	0	0	chr3	149603291	149603391	-9996392	+	MLT2B2	LTR	ERVL	3	102	-413	1
1726	459	314	111	11	chr3	149603424	149603695	-9996088	+	MLT1A1	LTR	MaLR	18	315	-93	1
1726	1042	292	82	28	chr3	149604016	149604368	-9995415	+	MTEa	LTR	MaLR	1	371	-8	1
1726	621	252	180	34	chr3	149606303	149606588	-9993195	-	MTEa	LTR	MaLR	-61	358	1	1
1726	827	323	88	27	chr3	149609708	149610004	-9989779	+	MTEa	LTR	MaLR	23	336	-43	1
1726	428	292	66	66	chr3	149621978	149622205	-9977578	-	MER31B	LTR	ERV1	-234	232	6	1
1726	2082	193	43	0	chr3	149626643	149627011	-9972772	-	MTC	LTR	MaLR	-37	384	1	1
1726	1204	238	42	65	chr3	149629905	149630215	-9969568	-	RMER19B	LTR	ERVK	-303	599	297	1
1726	337	293	132	58	chr3	149631330	149631504	-9968279	+	LTR33	LTR	ERVL	309	495	-20	1
1726	253	337	32	0	chr3	149633137	149633232	-9966551	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	2192	2289	-3472	1
1726	1573	201	82	3	chr3	149633496	149633825	-9965958	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	5	1
1726	3321	43	0	0	chr3	149642603	149642997	-9956786	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-2	394	1	1
1726	4663	97	47	12	chr3	149642997	149643689	-9956094	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	379	1
1726	4663	97	47	12	chr3	149643733	149643783	-9956000	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	-720	378	331	1
1726	1624	58	0	30	chr3	149644640	149644871	-9954912	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-172	224	1	1
1726	934	262	122	10	chr3	149645130	149645434	-9954349	-	MTD	LTR	MaLR	-63	356	19	1
1726	1635	240	79	11	chr3	149654699	149655142	-9944641	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	139	2
1726	282	371	151	59	chr3	149672066	149672504	-9927279	-	MLT1F1	LTR	MaLR	-8	561	84	2
1726	379	353	120	48	chr3	149672599	149672708	-9927075	-	MLT1F1-int	LTR	MaLR	-68	1421	1299	2
1726	379	353	120	48	chr3	149672729	149672994	-9926789	-	MLT1F1-int	LTR	MaLR	-191	1298	1020	2
1726	452	359	82	35	chr3	149677170	149677485	-9922298	+	MLT1E3	LTR	MaLR	289	618	-9	2
1726	295	268	35	35	chr3	149679372	149679488	-9920295	-	MLT1B	LTR	MaLR	-88	302	187	2
1727	832	219	304	19	chr3	149696810	149697169	-9902614	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	2
1727	493	340	43	24	chr3	149724594	149724802	-9874981	-	MTEa	LTR	MaLR	-165	214	3	2
1727	1556	84	4	44	chr3	149728616	149728864	-9870919	+	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	1	238	-319	2
1727	1479	162	8	16	chr3	149729448	149729699	-9870084	+	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	223	471	-86	2
1727	414	324	79	93	chr3	149731307	149731520	-9868263	+	MTEa	LTR	MaLR	4	216	-143	2
1727	1439	207	107	9	chr3	149731520	149731704	-9868079	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	173	2
1727	1439	207	107	9	chr3	149731879	149732040	-9867743	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-212	172	5	2
1727	451	272	21	45	chr3	149732040	149732180	-9867603	+	MTEa	LTR	MaLR	217	370	-9	2
1727	625	334	100	41	chr3	149732953	149733415	-9866368	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	17	2
1727	233	328	20	82	chr3	149737588	149737734	-9862049	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	379	243	3
1727	789	240	37	46	chr3	149737871	149738089	-9861694	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-1	373	158	3
1727	243	340	23	140	chr3	149738058	149738229	-9861554	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-139	245	95	3
1727	237	273	18	0	chr3	149749213	149749268	-9850515	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-274	100	45	3
1727	241	322	34	22	chr3	149749374	149749463	-9850320	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-269	90	1	3
1727	1393	208	68	51	chr3	149753327	149753697	-9846086	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	378	0	3
1727	1479	216	90	26	chr3	149755780	149756170	-9843613	+	MTC	LTR	MaLR	1	415	-6	3
1727	275	324	42	10	chr3	149762473	149762646	-9837137	+	MLT1D	LTR	MaLR	57	238	-389	3
1727	383	301	59	41	chr3	149774611	149774781	-9825002	+	MLT1A0	LTR	MaLR	141	313	-52	3
1727	228	312	39	0	chr3	149778556	149778633	-9821150	-	MLT-int	LTR	MaLR	-159	1576	1497	3
1727	762	328	50	0	chr3	149778675	149778916	-9820867	+	MTE2b	LTR	MaLR	61	313	-66	3
1727	779	271	135	12	chr3	149787152	149787485	-9812298	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1727	2157	180	13	23	chr3	149788674	149789072	-9810711	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1727	271	353	73	0	chr3	149789304	149789440	-9810343	+	MTE-int	LTR	MaLR	757	902	-678	3
1727	3042	78	17	116	chr3	149793256	149793791	-9805992	-	RLTR45	LTR	ERVK	0	482	1	3
1727	272	267	64	40	chr3	149803205	149803330	-9796453	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	251	3
1728	1433	166	99	37	chr3	149817122	149817432	-9782351	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-44	334	1	4
1728	227	287	63	84	chr3	149817435	149817530	-9782253	-	RMER10A	LTR	ERVL	-222	220	128	4
1728	2849	189	37	64	chr3	149820240	149820758	-9779025	+	RMER6C	LTR	ERVK	7	511	-179	4
1728	2849	189	37	64	chr3	149820932	149821116	-9778667	+	RMER6C	LTR	ERVK	512	690	0	4
1728	814	48	10	0	chr3	149829699	149829803	-9769980	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	105	-302	4
1728	701	64	11	0	chr3	149829803	149829897	-9769886	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	306	400	0	4
1728	2074	170	230	21	chr3	149829901	149830466	-9769317	-	RMER6C	LTR	ERVK	-7	683	1	4
1728	269	294	99	80	chr3	149833586	149833915	-9765868	+	MTEa	LTR	MaLR	32	377	-2	4
1728	1067	320	189	46	chr3	149833967	149834634	-9765149	+	MTEa-int	LTR	MaLR	37	766	-814	4
1728	459	291	102	40	chr3	149847594	149847869	-9751914	-	MTEb	LTR	MaLR	-14	365	11	4
1728	812	336	115	50	chr3	149850686	149851147	-9748636	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-2	552	62	4
1728	405	336	34	14	chr3	149852614	149852822	-9746961	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	212	-344	4
1728	1859	214	67	8	chr3	149853031	149853421	-9746362	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	4
1728	233	343	115	52	chr3	149854978	149855230	-9744553	+	MLT1G3	LTR	MaLR	121	388	-207	4
1728	735	350	67	33	chr3	149870257	149870635	-9729148	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	19	4
1728	1467	311	62	81	chr3	149870659	149871332	-9728451	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-1	1579	479	4
1728	809	317	45	92	chr3	149871398	149871712	-9728071	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-1193	387	102	4
1728	3635	138	102	111	chr3	149871712	149872623	-9727160	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	903	-3	4
1728	809	317	45	92	chr3	149872623	149872708	-9727075	-	MTE2a-int	LTR	MaLR	-1479	101	7	4
1728	683	321	127	46	chr3	149872711	149873034	-9726749	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	31	4
1728	377	342	82	50	chr3	149873797	149874047	-9725736	-	MLT1C	LTR	MaLR	0	467	206	4
1728	377	342	82	50	chr3	149874083	149874208	-9725575	-	MLT1C	LTR	MaLR	-262	205	80	4
1728	3061	150	36	108	chr3	149878534	149879377	-9720406	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-2	807	26	4
1728	1069	265	87	56	chr3	149879472	149879828	-9719955	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-1	369	3	4
1728	2106	201	151	16	chr3	149897396	149898004	-9701779	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	5
1728	577	287	93	75	chr3	149910080	149910584	-9689199	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	516	0	5
1728	319	343	103	16	chr3	149912883	149913126	-9686657	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-200	264	1	5
1728	954	203	164	44	chr3	149914261	149914626	-9685157	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	5
1728	746	343	72	20	chr3	149916963	149917269	-9682514	+	MTEa	LTR	MaLR	1	322	-57	5
1728	3338	145	33	49	chr3	149921610	149921996	-9677787	+	MT2B	LTR	ERVL	1	382	-219	5
1728	3758	195	79	15	chr3	149921996	149922804	-9676979	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	1	5
1728	3338	145	33	49	chr3	149922804	149923028	-9676755	+	MT2B	LTR	ERVL	383	601	0	5
1728	234	350	29	20	chr3	149923032	149923134	-9676649	-	LTR16A	LTR	ERVL	-346	105	3	5
1728	380	371	51	56	chr3	149924471	149924705	-9675078	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	233	-132	5
1728	546	178	99	25	chr3	149930318	149930439	-9669344	+	ORR1C1	LTR	MaLR	162	291	-87	5
1728	370	207	22	0	chr3	149930417	149930510	-9669273	-	ORR1E	LTR	MaLR	-227	132	36	5
1729	264	325	58	47	chr3	149952047	149952353	-9647430	+	MLT1C	LTR	MaLR	78	390	0	5
1729	278	321	178	15	chr3	149963935	149964146	-9635637	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	121	6
1729	377	288	104	42	chr3	149968229	149968421	-9631362	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	201	6
1729	4498	204	56	46	chr3	149971063	149972155	-9627628	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1103	0	6
1729	2457	178	37	13	chr3	149973443	149973904	-9625879	+	RLTR19	LTR	ERVK	28	499	0	6
1729	1518	199	40	25	chr3	149976460	149976945	-9622838	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	6
1729	535	319	71	73	chr3	149977192	149977490	-9622293	+	MTD	LTR	MaLR	7	292	-115	6
1729	336	340	60	83	chr3	149984937	149985251	-9614532	+	ORR1E	LTR	MaLR	10	316	-43	6
1729	245	362	25	32	chr3	149990261	149990418	-9609365	+	MLT2B1	LTR	ERVL	370	525	-42	6
1729	827	331	32	66	chr3	149996825	149997203	-9602580	-	MTE2a	LTR	MaLR	-1	378	14	6
1729	1170	126	27	0	chr3	149999817	150000000	-9599783	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	188	-287	6
1729	1144	78	0	58	chr3	150000000	150000191	-9599592	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	188	367	0	1
1729	20214	63	21	21	chr3	150000191	150002858	-9596925	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	8	2674	-3807	1
1729	8706	44	9	13	chr3	150002836	150003917	-9595866	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5403	6479	-2	1
1729	2164	127	13	32	chr3	150003919	150004293	-9595490	+	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	1	367	0	1
1729	291	349	68	102	chr3	150011277	150011513	-9588270	+	MLT1E3	LTR	MaLR	358	585	-39	9
1729	234	335	74	49	chr3	150011830	150011993	-9587790	-	LTR40a	LTR	ERVL	-277	242	76	1
1729	4153	128	50	19	chr3	150017532	150018360	-9581423	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	65	1
1729	375	162	29	14	chr3	150018527	150018596	-9581187	-	RMER17B	LTR	ERVK	-888	70	1	1
1729	242	258	48	67	chr3	150019622	150019726	-9580057	+	MamGypLTR1d	LTR	Gypsy	694	795	-18	2
1729	363	361	33	28	chr3	150020296	150020478	-9579305	+	MTEa	LTR	MaLR	5	187	-192	2
1729	1595	260	60	40	chr3	150029851	150030352	-9569431	-	RLTR17	LTR	ERVK	-73	619	109	4
1729	2199	165	56	80	chr3	150034417	150034935	-9564848	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	557	1	4
1729	754	331	53	12	chr3	150037350	150037671	-9562112	+	ORR1E	LTR	MaLR	26	359	0	5
1729	2674	77	20	0	chr3	150045468	150045820	-9553963	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	6
1729	656	188	36	36	chr3	150046494	150046632	-9553151	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	555	6
1729	282	103	0	0	chr3	150053098	150053137	-9546646	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-4	325	287	8
1729	626	146	73	0	chr3	150053118	150053241	-9546542	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	1147	1278	-685	8
1729	263	100	80	0	chr3	150053238	150053288	-9546495	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-275	54	1	8
1729	2616	143	28	155	chr3	150053289	150053894	-9545889	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1	1962	1435	8
1729	1860	150	13	0	chr3	150055078	150055384	-9544399	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-1543	420	111	8
1729	576	161	16	56	chr3	150055364	150055489	-9544294	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-239	155	36	8
1729	307	271	174	39	chr3	150061206	150061436	-9538347	-	RMER20A	LTR	ERVK	-124	392	132	9
1729	390	267	46	26	chr3	150065876	150066062	-9533721	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-358	196	1	1
1729	572	286	23	28	chr3	150068489	150068665	-9531118	+	RLTR28B	LTR	ERVL	17	191	-290	1
1729	527	309	83	80	chr3	150068897	150069185	-9530598	+	RLTR28B	LTR	ERVL	168	456	-25	1
1729	797	309	49	80	chr3	150075057	150075384	-9524399	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	317	-42	1
1729	2589	183	105	14	chr3	150076305	150076865	-9522918	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	1
1730	1527	223	9	35	chr3	150077547	150077887	-9521896	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	89	1
1730	356	190	93	65	chr3	150078218	150078325	-9521458	-	MTD	LTR	MaLR	-301	120	11	1
1730	320	319	46	5	chr3	150080795	150080968	-9518815	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	196	1
1730	459	218	0	0	chr3	150080972	150081073	-9518710	-	RMER19A	LTR	ERVK	-632	105	5	1
1730	267	183	101	61	chr3	150081072	150081156	-9518627	-	MTD	LTR	MaLR	-289	105	16	1
1730	489	339	27	5	chr3	150081567	150081751	-9518032	-	MTD	LTR	MaLR	-229	190	3	1
1730	1097	105	70	0	chr3	150081967	150082139	-9517644	+	RLTR9B	LTR	ERVK	1	184	-253	1
1730	246	364	95	18	chr3	150082143	150082311	-9517472	+	MLT1G3	LTR	MaLR	415	595	0	1
1730	961	335	19	12	chr3	150084129	150084452	-9515331	-	MTE2b	LTR	MaLR	-54	325	1	1
1730	771	286	59	73	chr3	150093663	150094021	-9505762	+	MTEb	LTR	MaLR	27	379	0	1
1730	346	299	104	127	chr3	150104598	150104858	-9494925	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	1452	1705	-30	1
1730	564	308	90	56	chr3	150104888	150105236	-9494547	+	MLT1A0	LTR	MaLR	4	364	-1	1
1730	278	289	26	11	chr3	150105565	150105719	-9494064	-	MLT2B5	LTR	ERVL	-353	167	3	1
1730	564	361	31	11	chr3	150114110	150114466	-9485317	+	MLT1B	LTR	MaLR	28	390	0	1
1730	444	322	35	61	chr3	150120936	150121164	-9478619	-	RMER15	LTR	ERVL	-55	520	299	1
1730	236	304	0	42	chr3	150126463	150126535	-9473248	-	MER21B	LTR	ERV1	-109	754	686	2
1730	357	133	31	4	chr3	150127123	150127192	-9472591	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	62	-332	2
1730	2115	182	13	13	chr3	150127229	150127623	-9472160	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1730	1869	152	57	9	chr3	150131031	150131362	-9468421	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	40	2
1730	2224	111	191	11	chr3	150137465	150137910	-9461873	-	RLTR47_MM	LTR	ERV1	-3	529	5	2
1730	1989	195	126	16	chr3	150141460	150141951	-9457832	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-483	545	1	2
1730	300	262	35	35	chr3	150141951	150142038	-9457745	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-1015	88	2	2
1730	262	276	70	47	chr3	150144930	150145059	-9454724	-	MER34A	LTR	ERV1	-16	555	424	2
1730	375	241	25	107	chr3	150145303	150145424	-9454359	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	111	-797	2
1730	1113	270	61	72	chr3	150146145	150146656	-9453127	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	2
1730	394	245	30	20	chr3	150151319	150151419	-9448364	+	RLTR41	LTR	ERV1	280	380	-66	2
1730	2498	102	97	3	chr3	150153265	150153648	-9446135	+	BGLII	LTR	ERVK	1	419	-2	2
1730	1246	220	302	16	chr3	150156329	150156776	-9443007	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	2
1730	266	335	49	49	chr3	150171746	150171909	-9427874	+	RMER13A	LTR	ERVK	698	860	0	2
1730	250	259	0	0	chr3	150174916	150174974	-9424809	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	60	-660	2
1730	1992	176	8	18	chr3	150174979	150175229	-9424554	+	RMER6-int	LTR	ERVK	251	500	-2677	2
1730	2921	40	0	0	chr3	150175229	150175289	-9424494	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	287	2
1730	2921	40	0	0	chr3	150175316	150175601	-9424182	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-60	286	2	2
1730	7798	168	53	29	chr3	150175601	150177239	-9422544	+	RMER6-int	LTR	ERVK	501	2221	-956	2
1730	529	246	0	80	chr3	150179196	150179333	-9420450	+	RMER6-int	LTR	ERVK	2209	2334	-843	2
1730	2545	187	77	18	chr3	150179441	150179985	-9419798	+	RMER6C	LTR	ERVK	113	688	-2	2
1730	515	292	126	52	chr3	150194869	150195179	-9404604	+	RMER13A	LTR	ERVK	111	443	-417	3
1730	2104	182	98	5	chr3	150195370	150195778	-9404005	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	446	0	3
1731	747	235	94	8	chr3	150211826	150212092	-9387691	+	RMER10B	LTR	ERVL	4	292	-106	3
1731	675	267	40	15	chr3	150212195	150212393	-9387390	+	RMER10B	LTR	ERVL	195	397	-1	3
1731	225	309	101	47	chr3	150213663	150213792	-9385991	-	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	-187	1621	1486	3
1731	327	314	86	21	chr3	150216680	150216820	-9382963	+	MLT1B	LTR	MaLR	188	336	-54	3
1731	663	237	19	57	chr3	150220276	150220480	-9379303	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	193	-217	3
1731	663	243	26	72	chr3	150220577	150220665	-9379118	+	RMER17C	LTR	ERVK	194	254	-156	3
1731	596	222	50	120	chr3	150220717	150221075	-9378708	+	RMER17C	LTR	ERVK	77	409	-1	3
1731	459	234	30	78	chr3	150225665	150225832	-9373951	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-113	298	140	3
1731	307	240	222	60	chr3	150226060	150226325	-9373458	+	MTC	LTR	MaLR	57	419	0	3
1731	249	329	31	50	chr3	150227927	150228087	-9371696	+	LTR29	LTR	ERV1	184	340	-282	3
1731	1643	151	27	8	chr3	150234808	150235127	-9364656	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-25	369	1	3
1731	300	282	47	12	chr3	150236909	150236995	-9362788	+	MLT1A1	LTR	MaLR	25	113	-295	3
1731	568	312	142	19	chr3	150239506	150239774	-9360009	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-95	369	69	3
1731	462	299	124	66	chr3	150240216	150240442	-9359341	-	MTE2a	LTR	MaLR	-140	239	1	3
1731	327	342	34	8	chr3	150240644	150240762	-9359021	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-113	295	175	3
1731	1474	161	142	30	chr3	150251290	150251467	-9348316	-	RMER17C	LTR	ERVK	-3	407	210	3
1731	1474	161	142	30	chr3	150251502	150251690	-9348093	-	RMER17C	LTR	ERVK	-201	209	2	3
1731	1419	188	52	10	chr3	150268957	150269247	-9330536	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-65	302	1	4
1731	292	248	100	77	chr3	150278502	150278672	-9321111	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	174	-272	4
1731	402	159	0	0	chr3	150278726	150278795	-9320988	+	RLTR41	LTR	ERV1	168	236	-210	4
1731	580	170	0	28	chr3	150278793	150278902	-9320881	+	RLTR41	LTR	ERV1	339	444	-2	4
1731	784	244	66	139	chr3	150286342	150286737	-9313046	-	RLTR23	LTR	ERV1	-57	373	8	4
1731	572	227	7	54	chr3	150287588	150287739	-9312044	+	MT2A	LTR	ERVL	1	137	-447	4
1731	1198	257	92	17	chr3	150287794	150288290	-9311493	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-8	552	1	4
1731	774	277	150	7	chr3	150288316	150288603	-9311180	-	MTD	LTR	MaLR	-42	377	50	4
1731	1241	235	40	19	chr3	150291335	150291500	-9308283	-	RMER17C	LTR	ERVK	-29	381	216	4
1731	1241	241	44	26	chr3	150291544	150291790	-9307993	-	RMER17C	LTR	ERVK	-408	401	1	4
1731	2141	194	37	31	chr3	150304431	150304889	-9294894	+	RMER6B	LTR	ERVK	1	461	0	4
1731	1998	175	204	63	chr3	150317038	150317305	-9282478	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	345	-345	4
1731	1998	175	204	63	chr3	150317359	150317694	-9282089	+	RMER6C	LTR	ERVK	346	688	-2	4
1731	1470	169	46	51	chr3	150318197	150318609	-9281174	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	4
1731	981	304	94	20	chr3	150320588	150320930	-9278853	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	2	4
1731	2986	122	10	38	chr3	150323716	150324211	-9275572	-	RMER2	LTR	ERV1	0	567	87	4
1731	296	305	54	180	chr3	150334430	150334818	-9264965	-	MTE2a	LTR	MaLR	-39	340	2	5
1731	267	363	20	7	chr3	150335133	150335280	-9264503	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1184	396	248	5
1731	1159	244	9	0	chr3	150337933	150338162	-9261621	+	MTD	LTR	MaLR	3	233	-186	5
1731	2091	209	27	7	chr3	150338165	150338570	-9261213	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	5
1731	653	277	39	44	chr3	150338570	150338770	-9261013	+	MTD	LTR	MaLR	221	419	0	5
1732	718	269	126	67	chr3	150349010	150349368	-9250415	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
1732	337	326	51	22	chr3	150349989	150350127	-9249656	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	142	-325	5
1732	1614	170	45	69	chr3	150352095	150352430	-9247353	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	329	0	5
1732	1892	176	25	14	chr3	150354086	150354448	-9245335	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	367	0	5
1732	1286	279	51	3	chr3	150356708	150357064	-9242719	+	MTD	LTR	MaLR	6	378	-41	5
1732	284	239	90	0	chr3	150363325	150363392	-9236391	+	MER57-int	LTR	ERV1	7171	7243	-294	5
1732	282	78	25	20	chr3	150365356	150365407	-9234376	-	MTD	LTR	MaLR	0	421	368	5
1732	3139	202	93	8	chr3	150365413	150366077	-9233706	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-196	1062	342	5
1732	2701	143	59	8	chr3	150366077	150366555	-9233228	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	502	-25	5
1732	1571	208	21	12	chr3	150366557	150366893	-9232890	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-917	341	3	5
1732	2081	176	25	15	chr3	150366893	150367296	-9232487	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	5
1732	2731	52	3	9	chr3	150373400	150373748	-9226035	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	5
1732	3371	38	2	0	chr3	150373789	150374184	-9225599	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	5
1732	625	390	58	52	chr3	150378247	150378799	-9220984	+	MTE-int	LTR	MaLR	642	1198	-382	5
1732	625	390	58	52	chr3	150379394	150379576	-9220207	+	MTE-int	LTR	MaLR	1199	1381	-199	5
1732	708	278	82	129	chr3	150380081	150380434	-9219349	-	MT2A	LTR	ERVL	-135	466	1	5
1732	327	409	21	0	chr3	150381392	150381534	-9218249	+	LTR33B	LTR	ERVL	23	167	-336	5
1732	485	299	22	28	chr3	150396753	150396935	-9202848	+	RMER5	LTR	ERV1	351	531	-3	5
1732	361	269	246	0	chr3	150396991	150397158	-9202625	+	MTEa	LTR	MaLR	167	374	-5	5
1732	826	327	95	21	chr3	150410411	150410748	-9189035	+	MTEb	LTR	MaLR	15	376	-3	6
1732	2871	211	150	78	chr3	150412082	150412201	-9187582	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	899	6
1732	2871	211	150	78	chr3	150412403	150412827	-9186956	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-135	893	398	6
1732	2871	211	150	78	chr3	150412873	150413276	-9186507	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-631	397	5	6
1732	241	372	116	36	chr3	150414426	150414702	-9185081	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-150	298	1	6
1732	293	335	66	33	chr3	150418462	150418644	-9181139	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-646	5068	4881	6
1732	299	237	0	17	chr3	150419789	150419849	-9179934	+	MLT1J1	LTR	MaLR	1	59	-385	6
1732	405	275	11	0	chr3	150426372	150426463	-9173320	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-205	169	78	6
1732	344	321	36	0	chr3	150426462	150426574	-9173209	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-1171	199	84	6
1732	507	260	231	6	chr3	150426718	150426900	-9172883	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	371	149	6
1732	894	238	5	16	chr3	150427206	150427398	-9172385	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-184	190	1	6
1732	585	312	72	16	chr3	150429586	150429837	-9169946	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-288	268	4	6
1732	250	299	131	67	chr3	150436851	150437149	-9162634	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	335	-24	6
1732	1928	191	32	3	chr3	150438549	150438926	-9160857	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-4	390	3	6
1732	820	305	93	19	chr3	150450763	150451224	-9148559	+	RMER5	LTR	ERV1	33	527	-7	6
1732	652	327	106	32	chr3	150454203	150454544	-9145239	+	MTEa	LTR	MaLR	1	366	-13	6
1732	1301	244	26	47	chr3	150454548	150454930	-9144853	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	6
1732	7047	33	0	5	chr3	150456970	150457796	-9141987	+	RLTR13B2	LTR	ERVK	1	822	0	6
1732	308	239	15	0	chr3	150466835	150466902	-9132881	+	RLTR18B	LTR	ERVK	20	87	-425	6
1733	1356	275	11	121	chr3	150472652	150473124	-9126659	+	MTC	LTR	MaLR	2	421	0	6
1733	569	206	58	7	chr3	150489498	150489635	-9110148	-	RMER6B	LTR	ERVK	-251	210	67	7
1733	693	161	65	0	chr3	150489637	150489761	-9110022	-	RMER6B	LTR	ERVK	-329	132	1	7
1733	318	300	174	31	chr3	150493977	150494235	-9105548	-	MLT1C-int	LTR	MaLR	-811	560	266	7
1733	247	339	95	18	chr3	150494681	150494849	-9104934	-	MLT1C	LTR	MaLR	-282	185	5	7
1733	287	279	51	26	chr3	150497400	150497528	-9102255	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	229	7
1733	585	260	110	123	chr3	150507663	150507751	-9092032	+	RLTR12B	LTR	ERVK	48	145	-383	1
1733	585	260	110	123	chr3	150507782	150508149	-9091634	+	RLTR12B	LTR	ERVK	146	496	-32	1
1733	1885	174	77	57	chr3	150531348	150531824	-9067959	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	5
1733	4801	126	27	97	chr3	150538343	150539318	-9060465	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	1	5
1733	287	292	62	0	chr3	150541036	150541132	-9058651	+	LTR37B	LTR	ERV1	196	297	-171	6
1733	1522	224	27	41	chr3	150544958	150545326	-9054457	+	ORR1D1	LTR	MaLR	12	374	0	7
1733	926	290	68	45	chr3	150546916	150547270	-9052513	-	MTEb	LTR	MaLR	-16	363	2	7
1733	431	349	156	20	chr3	150553782	150554212	-9045571	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	505	0	9
1733	1610	185	16	23	chr3	150560548	150560852	-9038931	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-27	351	50	9
1733	334	250	129	71	chr3	150561062	150561286	-9038497	-	RMER20B	LTR	ERVK	-207	420	184	1
1733	266	331	101	35	chr3	150562638	150562807	-9036976	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	180	-194	1
1733	2687	190	82	42	chr3	150566605	150567199	-9032584	-	RMER20B	LTR	ERVK	0	627	10	1
1733	2013	214	109	12	chr3	150569898	150570385	-9029398	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	1	1
1733	1222	316	50	12	chr3	150580662	150581062	-9018721	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	3	1
1733	761	310	85	101	chr3	150581780	150582146	-9017637	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	20	1
1733	871	144	29	63	chr3	150585621	150585828	-9013955	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4092	2045	1846	1
1733	828	171	0	7	chr3	150585835	150585976	-9013807	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4499	1638	1499	1
1733	951	224	72	37	chr3	150587728	150588060	-9011723	+	MT2B	LTR	ERVL	1	530	-71	1
1733	311	120	0	39	chr3	150588310	150588362	-9011421	+	MT2B	LTR	ERVL	535	584	0	1
1733	1932	188	20	15	chr3	150588375	150588780	-9011003	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	1
1733	3402	43	30	9	chr3	150589744	150590171	-9009612	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	1
1733	406	231	240	10	chr3	150595169	150595366	-9004417	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	245	1
1733	376	167	28	0	chr3	150595391	150595463	-9004320	-	MT2A	LTR	ERVL	-459	74	1	1
1734	2066	324	81	45	chr3	150608853	150610199	-8989584	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-953	4804	3411	1
1734	2686	272	105	14	chr3	150610755	150611536	-8988247	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-2924	2790	1952	1
1734	2686	272	105	14	chr3	150612321	150612545	-8987238	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-3763	1951	1693	1
1734	324	333	39	134	chr3	150612981	150613112	-8986671	-	MLT2D	LTR	ERVL	-149	265	142	1
1734	324	333	39	134	chr3	150613291	150613443	-8986340	-	MLT2D	LTR	ERVL	-273	141	9	1
1734	308	228	13	0	chr3	150616571	150616650	-8983133	+	MLT1A1	LTR	MaLR	317	396	-12	1
1734	268	376	73	19	chr3	150624218	150624528	-8975255	+	MLT1G1	LTR	MaLR	1	372	-207	2
1734	227	242	16	16	chr3	150636445	150636508	-8963275	+	MTD	LTR	MaLR	18	80	-341	2
1734	432	190	83	33	chr3	150636523	150636643	-8963140	+	MTD	LTR	MaLR	272	397	-22	2
1734	858	311	98	43	chr3	150649342	150649688	-8950095	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	6	2
1734	942	293	77	20	chr3	150650760	150651112	-8948671	+	MTEb	LTR	MaLR	3	374	-5	2
1734	2423	273	71	59	chr3	150653318	150654166	-8945617	-	RMER13A	LTR	ERVK	-2	858	1	2
1734	752	280	115	29	chr3	150657829	150658178	-8941605	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	1	2
1734	1729	187	88	3	chr3	150659822	150660187	-8939596	-	MTC	LTR	MaLR	-25	396	1	2
1734	465	317	88	18	chr3	150671309	150671626	-8928157	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	353	-6	2
1734	343	200	0	0	chr3	150673015	150673080	-8926703	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	58	122	-8837	2
1734	422	110	41	13	chr3	150674500	150674579	-8925204	-	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	-463	1863	1791	2
1734	1760	168	41	56	chr3	150674773	150675165	-8924618	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8572	8957	-2	2
1734	590	277	66	36	chr3	150675167	150675374	-8924409	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	217	-142	2
1734	590	277	66	36	chr3	150675411	150675536	-8924247	+	RLTR15	LTR	ERVK	218	342	-17	2
1734	487	173	9	61	chr3	150682700	150682836	-8916947	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-237	157	1	2
1734	275	342	165	21	chr3	150683237	150683473	-8916310	+	RMER15	LTR	ERVL	300	569	-6	2
1734	318	279	61	35	chr3	150694464	150694579	-8905204	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-235	130	13	3
1734	838	102	34	0	chr3	150698987	150699105	-8900678	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	311	190	3
1734	1898	99	3	3	chr3	150699074	150699358	-8900425	-	RLTR10A	LTR	ERVK	-127	284	1	3
1734	2433	65	75	0	chr3	150705586	150705908	-8893875	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	3
1734	3208	118	63	61	chr3	150706564	150707139	-8892644	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	576	-8	3
1734	420	149	0	0	chr3	150707436	150707503	-8892280	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	624	3
1734	230	0	0	0	chr3	150707503	150707530	-8892253	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	493	467	3
1734	1459	86	5	0	chr3	150707532	150707730	-8892053	-	MT2B2	LTR	ERVL	-368	216	18	3
1734	277	302	88	54	chr3	150712214	150712361	-8887422	-	MLT1J	LTR	MaLR	-346	166	15	3
1734	461	316	82	22	chr3	150718376	150718443	-8881340	-	LTR37A	LTR	ERV1	-27	399	337	3
1734	1833	194	125	42	chr3	150718443	150718964	-8880819	-	RMER2	LTR	ERV1	-3	564	1	3
1734	461	316	82	22	chr3	150718964	150719165	-8880618	-	LTR37A	LTR	ERV1	-90	336	115	3
1734	1642	202	60	19	chr3	150722577	150722946	-8876837	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	3
1734	276	357	103	54	chr3	150728663	150729033	-8870750	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	388	-117	3
1734	479	347	362	42	chr3	150732116	150732403	-8867380	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	1	3
1735	252	308	82	27	chr3	150733493	150733640	-8866143	+	MER34A1	LTR	ERV1	358	512	-75	3
1735	298	247	137	43	chr3	150741276	150741437	-8858346	+	LTR16A1	LTR	ERVL	228	403	-53	3
1735	3350	41	0	130	chr3	150759402	150759903	-8839880	-	RLTR10C	LTR	ERVK	0	436	1	4
1735	234	282	117	32	chr3	150761666	150761820	-8837963	+	MLT1F	LTR	MaLR	347	513	-35	4
1735	3900	275	13	11	chr3	150763989	150764975	-8834808	+	RodERV21-int	LTR	ERV1	1282	2269	-2722	4
1735	536	357	31	2	chr3	150772598	150772851	-8826932	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-251	264	5	4
1735	350	314	181	49	chr3	150782647	150783116	-8816667	+	MLT1E3	LTR	MaLR	6	586	-38	4
1735	274	230	0	63	chr3	150786371	150786450	-8813333	+	MT2B	LTR	ERVL	191	264	-337	4
1735	1177	283	20	28	chr3	150787909	150788265	-8811518	+	ORR1D1	LTR	MaLR	21	373	-1	4
1735	1432	222	66	70	chr3	150788266	150788693	-8811090	+	ORR1D1-int	LTR	MaLR	1	425	-945	4
1735	418	147	27	0	chr3	150788693	150788768	-8811015	+	ORR1D1	LTR	MaLR	298	374	0	4
1735	523	355	93	8	chr3	150791690	150791838	-8807945	+	MTEb	LTR	MaLR	1	161	-218	4
1735	523	303	376	5	chr3	150792059	150792216	-8807567	+	MTEb	LTR	MaLR	162	377	-2	4
1735	226	364	175	0	chr3	150800459	150800602	-8799181	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	94	261	-1126	4
1735	619	183	0	0	chr3	150802645	150802749	-8797034	+	ORR1B2	LTR	MaLR	5	108	-259	4
1735	744	184	163	23	chr3	150803187	150803359	-8796424	+	ORR1B2	LTR	MaLR	163	358	-9	4
1735	2042	212	79	2	chr3	150807702	150808122	-8791661	+	RMER4A	LTR	ERVK	6	457	-9	4
1735	375	225	125	9	chr3	150809900	150810012	-8789771	+	MLT1L	LTR	MaLR	144	268	-342	4
1735	255	214	89	0	chr3	150821315	150821371	-8778412	+	MTEa	LTR	MaLR	4	64	-315	4
1735	613	244	126	53	chr3	150821599	150821789	-8777994	+	MTEa	LTR	MaLR	163	366	-13	4
1735	769	180	49	6	chr3	150826409	150826571	-8773212	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	734	5
1735	260	328	94	23	chr3	150830171	150830299	-8769484	+	MLT1A0	LTR	MaLR	218	354	-11	5
1735	253	303	58	94	chr3	150830806	150830977	-8768806	-	MLT2D	LTR	ERVL	-56	358	194	5
1735	2712	67	0	20	chr3	150852693	150853046	-8746737	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	5
1735	1791	180	65	5	chr3	150853125	150853493	-8746290	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-4	390	1	5
1735	954	293	19	103	chr3	150855080	150855457	-8744326	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	4	5
1735	647	291	98	87	chr3	150861982	150862340	-8737443	-	MTEa	LTR	MaLR	-17	362	1	5
1735	449	275	47	57	chr3	150862540	150862733	-8737050	-	LTR81A	LTR	ERV1?	-984	366	176	5
1736	376	263	7	169	chr3	150864192	150864334	-8735449	+	MTEb	LTR	MaLR	207	325	-54	5
1736	361	222	33	11	chr3	150865027	150865118	-8734665	+	MTEb	LTR	MaLR	287	379	0	5
1736	2946	67	23	10	chr3	150869281	150869672	-8730111	+	MTB	LTR	MaLR	1	396	0	5
1736	7523	61	30	72	chr3	150869672	150870818	-8728965	+	MTB-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
1736	3034	64	26	0	chr3	150870820	150871208	-8728575	+	MTB	LTR	MaLR	3	400	0	5
1736	346	286	0	16	chr3	150871871	150871973	-8727810	-	ORR1E	LTR	MaLR	-267	103	8	5
1736	445	262	172	0	chr3	150873352	150873497	-8726286	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	170	-200	5
1736	569	364	9	135	chr3	150874553	150874896	-8724887	-	MLT1C	LTR	MaLR	-6	384	84	5
1736	1326	265	27	35	chr3	150875841	150876213	-8723570	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	374	0	5
1736	1115	258	65	16	chr3	150876334	150876657	-8723126	+	MTD	LTR	MaLR	81	419	0	5
1736	449	314	150	28	chr3	150876888	150877101	-8722682	-	LTR50	LTR	ERVL	-554	241	3	5
1736	1270	290	59	0	chr3	150877625	150877949	-8721834	-	MTE2b	LTR	MaLR	-36	343	1	5
1736	305	277	104	30	chr3	150879217	150879351	-8720432	-	MLT1A	LTR	MaLR	-125	249	106	5
1736	2580	28	2	263	chr3	150896427	150896955	-8702828	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	6
1736	17162	28	1	1	chr3	150896955	150898940	-8700843	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	1	1984	-3	6
1736	2600	23	2	265	chr3	150898942	150899471	-8700312	+	RLTR10	LTR	ERVK	1	390	0	6
1736	7488	151	17	98	chr3	150907848	150909008	-8690775	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1116	-456	6
1736	7488	151	17	98	chr3	150909029	150909389	-8690394	+	RLTR21	LTR	ERVK	1117	1398	-174	6
1736	1897	227	97	75	chr3	150909384	150910046	-8689737	-	RMER17B	LTR	ERVK	-282	676	1	6
1736	1651	189	12	218	chr3	150910047	150910635	-8689148	+	RMER19C	LTR	ERVK	145	611	0	6
1736	493	367	55	60	chr3	150916181	150916566	-8683217	+	MER77	LTR	ERVL	3	385	-222	6
1736	828	229	9	28	chr3	150919784	150919995	-8679788	-	MTD	LTR	MaLR	-210	209	3	6
1736	1360	223	64	153	chr3	150931693	150932044	-8667739	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-10	558	246	6
1736	1360	172	130	13	chr3	150932228	150932500	-8667283	-	RLTR12A	LTR	ERVK	-262	306	2	6
1736	517	306	24	72	chr3	150943448	150943656	-8656127	+	RMER15	LTR	ERVL	363	560	-15	6
1736	5431	93	67	51	chr3	150949599	150950387	-8649396	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	842	-51	6
1736	5431	93	67	51	chr3	150950593	150950675	-8649108	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	843	893	0	6
1736	382	353	18	74	chr3	150960700	150960917	-8638866	-	MTEa	LTR	MaLR	-172	207	3	6
1736	753	344	83	37	chr3	150966140	150966466	-8633317	-	ORR1E	LTR	MaLR	-18	341	1	7
1736	306	292	54	83	chr3	150973013	150973181	-8626602	-	MLT1L	LTR	MaLR	-305	305	143	7
1736	322	306	66	61	chr3	150974138	150974319	-8625464	-	MLT1E	LTR	MaLR	-25	628	447	7
1736	820	347	31	44	chr3	150981085	150981482	-8618301	+	MTE2a	LTR	MaLR	17	419	0	7
1737	300	326	102	66	chr3	150998521	150998931	-8600852	-	LTR78	LTR	ERV1	-579	725	301	7
1737	1853	155	3	13	chr3	151007609	151007923	-8591860	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	1
1737	3084	68	8	0	chr3	151023505	151023902	-8575881	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1737	3153	155	72	92	chr3	151026139	151026891	-8572892	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	3
1737	354	356	60	71	chr3	151036697	151036963	-8562820	-	MLT1A	LTR	MaLR	-29	345	83	5
1737	276	337	90	71	chr3	151039107	151039318	-8560465	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-193	215	1	6
1737	1000	282	32	30	chr3	151069549	151069918	-8529865	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
1737	517	306	131	54	chr3	151071963	151072260	-8527523	-	MTE2a	LTR	MaLR	-59	320	1	1
1737	227	318	53	26	chr3	151072876	151072989	-8526794	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	116	-258	1
1737	2694	136	2	14	chr3	151079853	151080279	-8519504	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1737	356	345	28	17	chr3	151087767	151087944	-8511839	-	MT2A	LTR	ERVL	-167	366	188	1
1737	322	383	83	21	chr3	151090664	151090904	-8508879	-	MLT1J	LTR	MaLR	-211	301	47	1
1737	3454	136	34	34	chr3	151111570	151112158	-8487625	-	MT2B	LTR	ERVL	-12	589	2	1
1738	3322	45	0	0	chr3	151137647	151138043	-8461740	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1738	681	296	41	71	chr3	151153035	151153301	-8446482	+	RLTR26	LTR	ERVK	168	425	-217	2
1738	3462	25	0	0	chr3	151156168	151156564	-8443219	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1738	9507	13	7	0	chr3	151156564	151157654	-8442129	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
1738	3462	25	0	0	chr3	151157654	151158050	-8441733	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1738	424	300	73	60	chr3	151167225	151167459	-8432324	-	ORR1E	LTR	MaLR	-116	243	7	2
1738	371	262	173	8	chr3	151167958	151168085	-8431698	-	MTD	LTR	MaLR	-43	376	229	2
1738	528	270	82	12	chr3	151168969	151169169	-8430614	-	MTD	LTR	MaLR	-168	253	47	2
1738	1713	194	19	30	chr3	151174061	151174427	-8425356	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	33	2
1738	712	265	197	14	chr3	151178575	151178854	-8420929	+	MTC	LTR	MaLR	38	367	-54	2
1738	2594	157	215	0	chr3	151194733	151195301	-8404482	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	1	2
1738	685	336	126	43	chr3	151197728	151197923	-8401860	-	MLT1E2	LTR	MaLR	0	627	405	2
1738	685	336	126	43	chr3	151198307	151198690	-8401093	-	MLT1E2	LTR	MaLR	-223	404	1	2
1738	284	317	63	31	chr3	151207940	151208067	-8391716	+	MLT1D	LTR	MaLR	351	481	-24	3
1738	243	357	96	37	chr3	151215114	151215332	-8384451	+	MER77	LTR	ERVL	287	517	-90	3
1738	987	308	68	89	chr3	151215695	151216076	-8383707	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-41	373	1	3
1738	996	280	70	13	chr3	151218260	151218560	-8381223	+	MTD	LTR	MaLR	42	358	-61	3
1738	474	324	60	36	chr3	151223261	151223698	-8376085	-	MLT1D	LTR	MaLR	-11	616	3	3
1738	2160	124	9	3	chr3	151234696	151235019	-8364764	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	1	3
1738	393	320	70	124	chr3	151240229	151240297	-8359486	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	292	3
1738	393	320	70	124	chr3	151240561	151240878	-8358905	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-74	291	1	3
1738	1399	264	117	42	chr3	151240930	151241425	-8358358	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-22	532	1	3
1738	293	247	43	33	chr3	151242148	151242240	-8357543	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-35	527	435	3
1738	435	305	69	20	chr3	151242376	151242580	-8357203	-	ORR1E	LTR	MaLR	-126	233	20	3
1738	1136	317	48	50	chr3	151242571	151243013	-8356770	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-127	429	3	3
1738	1987	168	13	52	chr3	151248891	151249274	-8350509	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	368	-10	3
1738	1037	232	48	19	chr3	151249285	151249553	-8350230	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	6	281	-1228	3
1738	2092	223	125	15	chr3	151249712	151250330	-8349453	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	284	969	-540	3
1738	1299	104	54	10	chr3	151250330	151250534	-8349249	+	RLTR11A	LTR	ERVK	1	213	-315	3
1738	633	152	45	0	chr3	151250531	151250643	-8349140	+	ORR1C1	LTR	MaLR	258	374	-4	3
1738	545	312	31	51	chr3	151250825	151251021	-8348762	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	194	-165	3
1738	602	317	68	47	chr3	151251854	151252175	-8347608	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	340	667	-13	3
1738	1609	198	77	35	chr3	151252285	151252661	-8347122	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	392	-6	3
1738	300	200	53	13	chr3	151255073	151255149	-8344634	-	MTE-int	LTR	MaLR	-451	1129	1051	3
1738	241	213	0	0	chr3	151255348	151255395	-8344388	-	MTE-int	LTR	MaLR	-528	1052	1006	3
217	6160	58	4	10	chr3	151256844	151257674	-8342109	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	825	-983	3
1739	1748	107	4	4	chr3	151257886	151258140	-8341643	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1591	1844	-4	3
1739	260	274	114	43	chr3	151260221	151260431	-8339352	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1156	1380	-4142	3
1739	4185	144	63	22	chr3	151260568	151261349	-8338434	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	813	-1035	3
1739	451	348	91	5	chr3	151264108	151264316	-8335467	+	MTD	LTR	MaLR	35	260	-159	3
1739	344	127	0	18	chr3	151264316	151264372	-8335411	-	MERVL-int	LTR	ERVL	-972	4513	4459	3
1739	1157	195	127	46	chr3	151264396	151264703	-8335080	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	0	332	1	3
1739	501	261	57	7	chr3	151264703	151264838	-8334945	+	MTD	LTR	MaLR	266	403	-16	3
1739	2490	147	12	19	chr3	151280489	151280899	-8318884	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	4
1739	2490	192	32	20	chr3	151282097	151282593	-8317190	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	27	4
1739	491	282	25	105	chr3	151282626	151282654	-8317129	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-423	30	4	4
1739	516	282	59	20	chr3	151284062	151284214	-8315569	+	MLT1A	LTR	MaLR	189	346	-28	4
1739	326	311	70	15	chr3	151299429	151299628	-8300155	-	LTR37A	LTR	ERV1	-45	381	172	4
1739	611	277	43	109	chr3	151302665	151303067	-8296716	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-3	418	2	4
1739	279	284	35	35	chr3	151309763	151309876	-8289907	+	RMER15	LTR	ERVL	15	127	-448	4
1739	480	263	204	26	chr3	151309943	151310134	-8289649	+	RMER15	LTR	ERVL	336	560	-15	4
1739	475	305	23	0	chr3	151310141	151310269	-8289514	-	MTE2a	LTR	MaLR	-14	365	235	4
1739	690	244	25	152	chr3	151310663	151310738	-8289045	-	MTE2a	LTR	MaLR	-138	241	192	4
1739	2351	56	56	0	chr3	151310738	151311041	-8288742	+	RLTR46	LTR	ERVK	1	320	0	4
1739	690	244	25	152	chr3	151311041	151311241	-8288542	-	MTE2a	LTR	MaLR	-188	191	1	4
1739	427	341	55	0	chr3	151327541	151327723	-8272060	+	RMER15	LTR	ERVL	371	562	-13	4
1739	576	278	89	75	chr3	151333610	151333824	-8265959	+	MLT2B2	LTR	ERVL	123	339	-176	4
1739	622	269	196	22	chr3	151333854	151334166	-8265617	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-42	366	1	4
1739	572	301	29	56	chr3	151334166	151334429	-8265354	+	MLT2B2	LTR	ERVL	323	551	-4	4
1739	327	330	0	72	chr3	151343451	151343562	-8256221	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-91	317	215	4
1739	603	133	0	0	chr3	151343569	151343659	-8256124	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1060	1149	-814	4
1739	1157	163	0	14	chr3	151343662	151343874	-8255909	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1751	1959	-4	4
1739	1828	134	94	63	chr3	151343878	151344197	-8255586	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	4
1739	361	337	102	71	chr3	151362122	151362486	-8237297	+	MamGypLTR2b	LTR	Gypsy	546	920	-2	4
1739	4237	74	14	0	chr3	151368989	151369544	-8230239	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	563	-21	5
1739	1111	175	49	13	chr3	151376904	151377130	-8222653	-	MTD	LTR	MaLR	-185	234	1	5
1739	532	307	19	152	chr3	151378038	151378307	-8221476	-	ORR1E	LTR	MaLR	-101	258	26	5
1739	290	321	115	52	chr3	151378330	151378599	-8221184	+	MLT2B5	LTR	ERVL	262	547	-8	5
1739	462	192	0	0	chr3	151379817	151379895	-8219888	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	290	5
1739	273	286	0	0	chr3	151380354	151380424	-8219359	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1538	1607	-3915	5
1739	601	204	71	13	chr3	151380737	151380891	-8218892	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1869	2031	-3491	5
1739	269	201	110	82	chr3	151381125	151381271	-8218512	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2726	2875	-3262	5
1739	2221	113	3	0	chr3	151382652	151382970	-8216813	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	319	-8	5
1739	11689	141	49	9	chr3	151382976	151384862	-8214921	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	3	1962	-1	5
1739	1667	100	44	4	chr3	151384886	151385138	-8214645	+	ORR1A2	LTR	MaLR	66	327	0	5
1739	342	264	72	53	chr3	151385738	151385890	-8213893	-	RNLTR23	LTR	ERVK	-10	632	478	5
1739	2643	138	26	3	chr3	151386475	151386860	-8212923	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1740	1905	97	57	4	chr3	151390967	151391246	-8208537	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	294	-15	5
1740	665	254	47	57	chr3	151391880	151392072	-8207711	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	190	-189	5
1740	234	235	146	12	chr3	151392999	151393081	-8206702	+	MLT1H2	LTR	MaLR	392	484	-5	5
1740	3460	59	36	17	chr3	151403619	151404085	-8195698	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	5
1740	1881	183	51	80	chr3	151405259	151405444	-8194339	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	203	-424	5
1740	1881	183	51	80	chr3	151405936	151406201	-8193582	+	RMER20B	LTR	ERVK	204	438	-189	5
1740	310	216	0	51	chr3	151406200	151406278	-8193505	+	RMER20B	LTR	ERVK	540	613	-14	5
1740	669	271	131	14	chr3	151407410	151407655	-8192128	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-95	279	1	5
1740	2203	192	19	10	chr3	151407658	151408074	-8191709	+	MTC	LTR	MaLR	2	421	0	5
1740	812	251	160	50	chr3	151409094	151409413	-8190370	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	354	-5	5
1740	528	297	60	92	chr3	151415220	151415354	-8184429	+	ORR1E	LTR	MaLR	53	168	-191	5
1740	3840	96	15	169	chr3	151415354	151416242	-8183541	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	5
1740	528	297	60	92	chr3	151416242	151416422	-8183361	+	ORR1E	LTR	MaLR	169	357	-2	5
1740	2196	95	13	7	chr3	151417099	151417406	-8182377	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	5
1740	1583	216	144	33	chr3	151418400	151418859	-8180924	+	RLTR17	LTR	ERVK	105	614	-78	5
1740	5417	124	17	54	chr3	151422878	151423815	-8175968	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	902	0	5
1740	2314	124	113	11	chr3	151427423	151427805	-8171978	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1740	285	336	48	76	chr3	151428998	151429249	-8170534	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-147	533	290	5
1740	1855	190	43	40	chr3	151429855	151430250	-8169533	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	2	397	-505	5
1740	2320	138	40	67	chr3	151431904	151432354	-8167429	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	465	902	0	5
1740	2051	108	17	0	chr3	151433610	151433906	-8165877	+	ORR1A2	LTR	MaLR	27	327	0	5
1740	369	242	215	15	chr3	151434239	151434369	-8165414	-	LTR41	LTR	ERVL	-608	160	5	5
1740	463	301	99	0	chr3	151434680	151434894	-8164889	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	257	-108	6
1740	430	300	80	53	chr3	151441543	151441871	-8157912	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	6
1740	260	226	0	36	chr3	151445755	151445810	-8153973	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-317	53	1	6
1740	750	271	84	66	chr3	151446409	151446454	-8153329	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	320	6
1740	3377	81	0	0	chr3	151446454	151446861	-8152922	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
1740	750	269	66	48	chr3	151446861	151447097	-8152686	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-51	319	77	6
1740	622	225	58	20	chr3	151447508	151447680	-8152103	-	ORR1E	LTR	MaLR	-183	184	1	6
1740	1427	185	31	17	chr3	151450042	151450334	-8149449	-	MTD	LTR	MaLR	-123	296	1	6
1740	3261	115	58	28	chr3	151451116	151451808	-8147975	+	RLTR13D4	LTR	ERVK	1	1033	0	6
1740	882	290	88	27	chr3	151454280	151454645	-8145138	+	MLT1B	LTR	MaLR	2	388	-2	6
1740	744	356	18	24	chr3	151456223	151456554	-8143229	-	MLT1A	LTR	MaLR	-45	329	1	6
1740	3677	177	35	20	chr3	151462459	151462838	-8136945	-	RMER6D	LTR	ERVK	-4	716	343	6
1740	3677	177	35	20	chr3	151462922	151463227	-8136556	-	RMER6D	LTR	ERVK	-378	342	22	6
1740	3006	33	30	0	chr3	151468036	151468372	-8131411	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	6
1740	2615	137	44	5	chr3	151470568	151470973	-8128810	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1740	2994	68	100	0	chr3	151471132	151471502	-8128281	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
1740	3058	47	21	3	chr3	151472891	151473279	-8126504	+	MTB	LTR	MaLR	6	400	0	6
1740	231	345	152	41	chr3	151491942	151492232	-8107551	-	LTR16A	LTR	ERVL	-17	434	113	6
1740	460	313	118	45	chr3	151505025	151505339	-8094444	+	MLT1C	LTR	MaLR	87	423	-44	4
1740	352	159	16	0	chr3	151505496	151505559	-8094224	+	MLT1C	LTR	MaLR	404	467	0	6
1740	2441	128	0	3	chr3	151512402	151512730	-8087053	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	1
1740	2134	134	143	17	chr3	151517894	151518244	-8081539	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1741	2570	130	14	0	chr3	151524432	151524793	-8074990	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	1	3
1741	1879	154	46	19	chr3	151529306	151529633	-8070150	-	RMER6A	LTR	ERVK	-39	717	384	3
1741	1879	154	46	19	chr3	151529800	151529843	-8069940	-	RMER6A	LTR	ERVK	-373	383	338	3
1741	509	179	0	86	chr3	151529846	151529962	-8069821	-	RMER6A	LTR	ERVK	-650	106	1	3
1741	1618	234	61	47	chr3	151541782	151542292	-8057491	-	RLTR40	LTR	ERVK	-62	755	239	5
1741	866	227	35	26	chr3	151542377	151542603	-8057180	-	RLTR40	LTR	ERVK	-570	247	20	5
1741	590	340	62	64	chr3	151543144	151543596	-8056187	+	RMER5	LTR	ERV1	81	531	-3	6
1741	1389	271	63	17	chr3	151547681	151548154	-8051629	+	RMER5	LTR	ERV1	40	534	0	7
1741	4592	26	0	0	chr3	151549878	151550371	-8049412	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	7
1741	5820	120	41	6	chr3	151552974	151553885	-8045898	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	16	8
1741	755	268	98	89	chr3	151570719	151571067	-8028716	-	ORR1E	LTR	MaLR	-6	353	3	1
1741	690	312	88	73	chr3	151577651	151578073	-8021710	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-4	575	148	1
1741	5545	163	12	23	chr3	151587327	151588245	-8011538	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	1
1741	3772	195	98	49	chr3	151589155	151590115	-8009668	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	22	1
1741	233	320	107	70	chr3	151591971	151591986	-8007797	-	MLT1C	LTR	MaLR	-92	375	355	1
1741	291	225	59	14	chr3	151591986	151592077	-8007706	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-367	187	92	1
1741	233	320	107	70	chr3	151592077	151592270	-8007513	-	MLT1C	LTR	MaLR	-92	354	66	1
1741	881	220	31	42	chr3	151596949	151597210	-8002573	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	7	264	-1584	1
1741	3595	33	2	0	chr3	151598018	151598413	-8001370	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	1
1741	647	276	146	89	chr3	151606559	151607033	-7992750	+	MLT1D	LTR	MaLR	1	501	-4	1
1741	702	277	130	27	chr3	151607905	151608205	-7991578	+	LTR82A	LTR	ERVL	244	574	-298	1
1741	236	346	80	11	chr3	151608394	151608581	-7991202	+	LTR82A	LTR	ERVL	672	871	-1	1
1741	1911	247	34	28	chr3	151610934	151611405	-7988378	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	138	1
1741	688	316	44	76	chr3	151612343	151612693	-7987090	+	MTEb	LTR	MaLR	6	379	0	1
1741	331	347	30	49	chr3	151612820	151613000	-7986783	+	MLT1D	LTR	MaLR	24	199	-306	1
1741	557	298	71	39	chr3	151613133	151613416	-7986367	+	MLT1D	LTR	MaLR	183	474	-31	1
1741	759	239	87	81	chr3	151621540	151621928	-7977855	-	MTE2a	LTR	MaLR	-20	399	1	1
1741	774	279	35	9	chr3	151630548	151630779	-7969004	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	237	-122	1
1741	240	242	32	0	chr3	151630870	151630932	-7968851	+	ORR1E	LTR	MaLR	316	379	0	1
1741	406	324	100	55	chr3	151633124	151633594	-7966189	-	MLT1D	LTR	MaLR	-24	481	6	1
1741	4281	127	101	5	chr3	151633877	151634549	-7965234	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	1
1741	1112	326	142	39	chr3	151636750	151637392	-7962391	-	MLT2B5	LTR	ERVL	0	717	10	1
1741	1352	202	64	25	chr3	151638760	151639120	-7960663	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1741	248	266	80	37	chr3	151644295	151644452	-7955331	+	RLTR18	LTR	ERVK	79	247	-265	1
1741	1016	174	4	151	chr3	151644451	151644729	-7955054	-	RMER19C	LTR	ERVK	-73	538	302	1
1741	824	235	22	59	chr3	151645140	151645468	-7954315	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	279	-332	1
1741	684	340	5	0	chr3	151645513	151645725	-7954058	+	RMER19C	LTR	ERVK	223	435	-176	1
1741	496	138	11	0	chr3	151645721	151645808	-7953975	+	RMER19B	LTR	ERVK	815	902	0	1
1741	1112	178	9	19	chr3	151646586	151646798	-7952985	+	ORR1B2	LTR	MaLR	158	367	0	1
1741	2120	126	79	11	chr3	151649305	151649674	-7950109	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	1
1742	3421	35	2	2	chr3	151653078	151653474	-7946309	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1742	392	329	84	21	chr3	151653478	151653717	-7946066	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	4306	4559	-1108	1
1742	302	290	88	57	chr3	151653712	151653906	-7945877	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	5427	5626	-41	1
1742	343	227	223	28	chr3	151656426	151656666	-7943117	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	2179	2633	-3128	1
1742	263	316	48	54	chr3	151658346	151658493	-7941290	+	MLT1H2	LTR	MaLR	82	227	-262	2
1742	225	182	0	22	chr3	151663786	151663831	-7935952	+	RLTR13C2	LTR	ERVK	261	304	-504	2
1742	2749	127	137	25	chr3	151664259	151664783	-7935000	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	583	-2	2
1742	328	331	92	41	chr3	151665714	151666029	-7933754	-	MLT1I	LTR	MaLR	-4	407	77	2
1742	2703	97	21	33	chr3	151669070	151669497	-7930286	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	422	0	2
1742	394	360	0	0	chr3	151671084	151671262	-7928521	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	200	377	-6173	2
1742	3493	289	52	37	chr3	151671270	151672538	-7927245	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	938	2224	-6735	2
1742	1321	255	68	12	chr3	151672541	151672866	-7926917	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4076	4418	-2132	2
1742	331	263	54	38	chr3	151672910	151673127	-7926656	+	MYSERV-int	LTR	ERVK	4540	4626	-1924	2
1742	2985	72	9	28	chr3	151673136	151673565	-7926218	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	2
1742	2143	204	88	57	chr3	151673568	151674478	-7925305	+	MYSERV16_I-int	LTR	ERVK	427	2041	-801	2
1742	2469	54	116	11	chr3	151677553	151677906	-7921877	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	2
1742	14057	20	3	5	chr3	151677908	151679487	-7920296	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	409	2
1742	2144	35	4	0	chr3	151679486	151679741	-7920042	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1691	296	41	2
1742	2889	51	40	8	chr3	151679753	151680129	-7919654	-	RLTR10	LTR	ERVK	-2	388	1	2
1742	287	264	83	19	chr3	151683764	151683872	-7915911	-	MTE2b	LTR	MaLR	-14	365	251	2
1742	226	286	75	38	chr3	151684052	151684132	-7915651	-	MTE2b	LTR	MaLR	-271	88	6	2
1742	272	260	60	112	chr3	151684233	151684438	-7915345	+	LTR85a	LTR	Gypsy?	247	530	-254	2
1742	935	280	13	76	chr3	151688767	151689084	-7910699	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	297	-82	2
1742	871	331	64	6	chr3	151689703	151690061	-7909722	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	2
1742	358	315	126	22	chr3	151690408	151690575	-7909208	-	MLT1B	LTR	MaLR	-116	274	86	2
1742	358	315	126	22	chr3	151690787	151690799	-7908984	-	MLT1B	LTR	MaLR	-305	85	74	2
1742	701	110	0	0	chr3	151691227	151691327	-7908456	+	RMER19C	LTR	ERVK	512	611	0	2
1742	569	283	148	25	chr3	151692288	151692647	-7907136	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	1	2
1742	471	266	101	21	chr3	151695864	151696052	-7903731	-	MLT1D	LTR	MaLR	-5	500	298	2
1742	283	271	128	34	chr3	151696102	151696251	-7903532	-	MLT1D	LTR	MaLR	-292	213	51	2
1742	2687	51	0	0	chr3	151698063	151698436	-7901347	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	-1174	618	246	2
1742	1295	258	31	37	chr3	151702988	151703342	-7896441	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	28	2
1742	1761	133	88	67	chr3	151706260	151706647	-7893136	+	RMER10B	LTR	ERVL	4	398	0	2
1742	461	254	7	74	chr3	151706966	151707115	-7892668	+	MLT1A	LTR	MaLR	16	154	-220	2
1742	310	353	78	0	chr3	151711418	151711571	-7888212	-	MLT1E3	LTR	MaLR	-6	618	454	2
1742	548	234	28	7	chr3	151714922	151715064	-7884719	-	RLTR40	LTR	ERVK	-10	807	663	2
1742	1208	158	77	48	chr3	151715106	151715419	-7884364	-	RLTR40	LTR	ERVK	-456	361	40	2
1742	3486	25	5	0	chr3	151715425	151715819	-7883964	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1742	7489	47	18	1	chr3	151715819	151716823	-7882960	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1021	-77	2
1742	1348	214	40	54	chr3	151716837	151717188	-7882595	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	349	-10	2
1742	2314	185	35	42	chr3	151719440	151719983	-7879800	-	RLTR17	LTR	ERVK	-67	625	87	2
1742	514	59	0	0	chr3	151719956	151720024	-7879759	+	ORR1A4	LTR	MaLR	262	329	0	2
1742	3156	49	31	0	chr3	151720409	151720796	-7878987	+	MTB	LTR	MaLR	1	399	-1	2
1742	490	265	51	56	chr3	151729006	151729202	-7870581	-	RLTR26	LTR	ERVK	-225	417	223	3
1742	319	273	61	43	chr3	151729236	151729351	-7870432	-	RMER13A	LTR	ERVK	-730	130	14	3
1742	349	206	9	85	chr3	151731282	151731388	-7868395	+	MLT2B2	LTR	ERVL	463	560	-2	3
1742	2253	87	0	0	chr3	151732501	151732822	-7866961	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-6	321	1	3
1742	417	318	177	63	chr3	151732876	151733333	-7866450	+	LTR33C	LTR	ERVL	49	557	-72	3
1742	1382	189	113	41	chr3	151739095	151739474	-7860309	-	MTD	LTR	MaLR	-11	408	2	3
1742	1777	230	172	46	chr3	151741776	151743235	-7856548	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	1	1806	-42	3
1742	622	267	69	39	chr3	151746824	151747159	-7852624	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	345	-14	3
1742	2532	146	35	0	chr3	151747319	151747723	-7852060	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	4	3
1742	5806	154	55	20	chr3	151747740	151748927	-7850856	-	MTC-int	LTR	MaLR	-28	1230	3	3
1742	2296	177	37	0	chr3	151748927	151749333	-7850450	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	3
1742	1500	139	121	3	chr3	151749774	151750056	-7849727	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	315	-12	3
1742	2306	117	74	0	chr3	151753793	151754160	-7845623	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	3
1742	2105	139	38	0	chr3	151761543	151761887	-7837896	+	MTC	LTR	MaLR	1	357	-64	3
1742	2908	142	49	16	chr3	151763487	151763940	-7835843	+	RLTR20D	LTR	ERVK	1	461	-107	3
1742	2908	142	49	16	chr3	151763986	151764082	-7835701	+	RLTR20D	LTR	ERVK	462	567	-1	3
1742	242	270	9	99	chr3	151764760	151764871	-7834912	+	MLT1K	LTR	MaLR	463	563	-32	3
1742	1658	169	48	56	chr3	151767710	151768087	-7831696	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1742	620	310	104	8	chr3	151769520	151769780	-7830003	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	285	-94	3
1742	843	254	103	8	chr3	151773525	151773787	-7825996	+	MTE2a	LTR	MaLR	93	379	0	3
1742	2042	161	76	56	chr3	151779268	151780004	-7819779	+	RMER6A	LTR	ERVK	57	753	-3	4
1743	275	189	0	0	chr3	151785734	151785787	-7813996	+	ORR1C1	LTR	MaLR	3	55	-329	4
1743	1631	173	63	52	chr3	151785787	151786134	-7813649	+	ORR1C1	LTR	MaLR	28	378	0	4
1743	1863	156	132	0	chr3	151787855	151788189	-7811594	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	4
1743	1809	148	80	71	chr3	151789301	151789665	-7810118	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	4
1743	1280	217	44	4	chr3	151793884	151794157	-7805626	-	MTD	LTR	MaLR	-44	375	92	4
1743	421	198	37	0	chr3	151794351	151794432	-7805351	-	MTD	LTR	MaLR	-317	102	19	4
1743	5868	57	3	19	chr3	151797200	151797981	-7801802	+	RLTR13D1	LTR	ERVK	1	768	-38	4
1743	3528	86	40	59	chr3	151798640	151799185	-7800598	+	MT2B	LTR	ERVL	1	535	-66	4
1743	1861	127	80	0	chr3	151799162	151799461	-7800322	+	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	35	357	0	4
1743	610	130	0	0	chr3	151799461	151799553	-7800230	+	MT2B	LTR	ERVL	493	584	0	4
1743	266	149	28	8	chr3	151802025	151802113	-7797670	+	MT2A	LTR	ERVL	461	551	-4	4
1743	354	129	0	79	chr3	151804145	151804221	-7795562	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	393	324	4
1743	3170	56	13	2	chr3	151809577	151809973	-7789810	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1743	226	318	60	15	chr3	151819693	151819760	-7780023	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	786	855	-532	5
1743	4368	123	35	30	chr3	151825368	151825524	-7774259	-	RMER6A	LTR	ERVK	-7	749	589	5
1743	4368	123	35	30	chr3	151825562	151826150	-7773633	-	RMER6A	LTR	ERVK	-168	588	2	5
1743	940	270	116	115	chr3	151834360	151834971	-7764812	+	RLTR18	LTR	ERVK	5	616	0	5
1743	1863	180	12	3	chr3	151840757	151841086	-7758697	-	MTC	LTR	MaLR	-89	332	1	5
1743	2663	149	67	18	chr3	151842238	151842743	-7757040	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	46	5
1743	2144	173	27	11	chr3	151843131	151843499	-7756284	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	5
1743	478	51	0	0	chr3	151857841	151857900	-7741883	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	59	-348	6
1743	3762	18	2	0	chr3	151858957	151859352	-7740431	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1743	2233	80	22	34	chr3	151860330	151860652	-7739131	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	318	-9	6
1743	397	232	37	134	chr3	151863320	151863484	-7736299	+	MT2B2	LTR	ERVL	117	264	-320	6
1743	2950	103	221	31	chr3	151870613	151871102	-7728681	+	MT2B2	LTR	ERVL	3	584	0	6
1743	1621	169	181	124	chr3	151878915	151879290	-7720493	-	RMER6A	LTR	ERVK	0	756	267	6
1743	1621	167	183	136	chr3	151879738	151879985	-7719798	-	RMER6A	LTR	ERVK	-490	266	1	6
1743	326	147	104	26	chr3	151893545	151893622	-7706161	+	RLTR25B	LTR	ERVK	427	509	-519	6
1744	288	306	72	39	chr3	151924523	151924676	-7675107	-	MTD	LTR	MaLR	-86	333	176	7
1744	615	226	422	12	chr3	151925361	151925600	-7674183	-	MTD	LTR	MaLR	-16	403	67	7
1744	291	310	22	44	chr3	151930594	151930729	-7669054	+	MTE2b	LTR	MaLR	85	216	-163	7
1744	260	295	125	0	chr3	151930862	151930974	-7668809	+	MTE2b	LTR	MaLR	254	379	0	7
1744	315	240	40	32	chr3	151934533	151934658	-7665125	+	MLT1F1	LTR	MaLR	241	366	-203	7
1744	326	233	187	43	chr3	151942207	151942346	-7657437	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-211	163	5	7
1744	1350	232	125	0	chr3	151945147	151945500	-7654283	+	MTD	LTR	MaLR	1	397	-22	7
1744	250	248	138	37	chr3	151959140	151959249	-7640534	+	RMER15	LTR	ERVL	347	466	-109	8
1744	299	206	165	10	chr3	151961286	151961389	-7638394	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-531	572	454	8
1744	1637	192	23	72	chr3	151962989	151963377	-7636406	+	RLTR40	LTR	ERVK	436	804	-13	8
1744	2315	167	15	20	chr3	151963697	151964100	-7635683	-	MTC	LTR	MaLR	-20	401	1	8
1744	699	66	0	0	chr3	151974608	151974699	-7625084	+	ORR1A3	LTR	MaLR	16	106	-221	8
1744	929	67	0	0	chr3	151974696	151974815	-7624968	+	ORR1A3	LTR	MaLR	208	326	0	8
1744	2917	41	6	0	chr3	151981571	151981915	-7617868	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	346	0	9
1744	8021	63	9	69	chr3	151981917	151983085	-7616698	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	9
1744	3248	46	18	3	chr3	151983085	151983475	-7616308	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	9
1744	871	265	95	29	chr3	151983793	151984108	-7615675	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	22	357	-1223	9
1744	260	284	63	0	chr3	151984973	151985068	-7614715	+	MLT1D	LTR	MaLR	374	474	-31	9
1744	6693	18	1	1	chr3	151986103	151986845	-7612938	+	RLTR4_Mm	LTR	ERV1	1	742	0	9
1744	68680	15	6	0	chr3	151986845	151994404	-7605379	+	RLTR4_MM-int	LTR	ERV1	1	7601	0	9
1744	6693	18	1	1	chr3	151994404	151995146	-7604637	+	RLTR4_Mm	LTR	ERV1	1	742	0	9
1744	2704	139	9	9	chr3	151999546	151999980	-7599803	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	434	-474	9
1744	1530	178	18	45	chr3	152000004	152000386	-7599397	+	RMER13B	LTR	ERVK	451	822	-86	1
1744	431	209	0	115	chr3	152003604	152003734	-7596049	+	MT2B	LTR	ERVL	150	264	-337	1
1744	691	241	26	38	chr3	152005204	152005455	-7594328	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	245	-283	2
1744	653	252	189	25	chr3	152005813	152006131	-7593652	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	1	2
1744	295	221	70	96	chr3	152031737	152031852	-7567931	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	152	9
1744	2396	154	102	10	chr3	152038231	152038730	-7561053	-	RMER4B	LTR	ERVK	-8	577	33	1
1744	257	98	48	32	chr3	152038893	152038956	-7560827	-	RMER4B	LTR	ERVK	-519	66	3	1
1745	300	290	82	137	chr3	152047673	152047965	-7551818	+	MLT1B	LTR	MaLR	86	361	-29	1
1745	595	294	204	4	chr3	152049045	152049325	-7550458	-	MTE-int	LTR	MaLR	-437	1143	808	1
1745	1861	114	8	140	chr3	152049641	152050019	-7549764	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-1	328	1	1
1745	1048	136	196	15	chr3	152063043	152063361	-7536422	+	RMER10B	LTR	ERVL	1	376	-22	1
1745	1156	238	86	37	chr3	152064463	152064868	-7534915	+	RMER10A	LTR	ERVL	1	425	-17	1
1745	2295	68	3	43	chr3	152071071	152071423	-7528360	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	338	-8	1
1745	8810	109	233	30	chr3	152071427	152073055	-7526728	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	1	1960	-3	1
1745	2864	49	0	25	chr3	152073055	152073406	-7526377	+	ORR1A1	LTR	MaLR	2	346	0	1
1745	660	265	80	150	chr3	152077140	152077540	-7522243	+	MTE2a	LTR	MaLR	4	375	-4	2
1745	1161	240	93	20	chr3	152078957	152079310	-7520473	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	2
1745	584	208	132	103	chr3	152082048	152082512	-7517271	-	RMER4B	LTR	ERVK	-9	576	12	2
1745	303	185	125	36	chr3	152106538	152106650	-7493133	+	RMER10A	LTR	ERVL	321	442	0	2
1745	492	193	498	4	chr3	152120098	152120347	-7479436	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-8	376	5	2
1745	252	316	69	50	chr3	152136816	152136976	-7462807	+	MLT1G	LTR	MaLR	169	331	-260	2
1745	280	222	51	77	chr3	152143754	152143832	-7455951	-	MTE2b	LTR	MaLR	-151	228	153	2
1745	272	190	51	17	chr3	152143832	152143891	-7455892	+	MTD	LTR	MaLR	1	61	-360	2
1745	412	191	31	82	chr3	152143891	152143988	-7455795	+	MTD	LTR	MaLR	253	344	-75	2
1745	640	252	68	0	chr3	152144035	152144182	-7455601	-	MTE2b	LTR	MaLR	-222	157	1	2
1745	1169	319	107	24	chr3	152154916	152155384	-7444399	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-46	508	2	3
1745	417	305	86	79	chr3	152157291	152157574	-7442209	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	77	3
1745	314	301	136	29	chr3	152157591	152157731	-7442052	-	MTEa	LTR	MaLR	-224	155	1	3
1745	1744	130	2	189	chr3	152159168	152159672	-7440111	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	410	0	3
1745	866	265	73	134	chr3	152167576	152167933	-7431850	+	MTE2a	LTR	MaLR	9	343	-36	3
1745	283	376	20	0	chr3	152169084	152169185	-7430598	+	LTR16A1	LTR	ERVL	244	346	-110	3
1745	488	289	148	29	chr3	152171312	152171643	-7428140	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	1	3
1746	326	289	127	35	chr3	152175197	152175409	-7424374	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-64	333	91	3
1746	280	316	21	0	chr3	152175493	152175588	-7424195	+	RMER15	LTR	ERVL	426	522	-53	3
1746	1943	87	15	12	chr3	152177599	152177899	-7421884	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	317	-104	3
1746	928	300	75	59	chr3	152186967	152187014	-7412769	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	326	3
1746	928	300	75	59	chr3	152187082	152187392	-7412391	-	MTE2b	LTR	MaLR	-54	325	17	3
1746	398	219	83	50	chr3	152189040	152189160	-7410623	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	256	3
1746	772	231	103	96	chr3	152191214	152191526	-7408257	-	MTE2a	LTR	MaLR	-46	333	20	3
1746	4543	10	0	0	chr3	152198748	152199241	-7400542	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1746	48435	15	6	0	chr3	152199241	152204567	-7395216	+	MERVL-int	LTR	ERVL	1	5360	-125	3
1746	370	191	46	35	chr3	152204567	152204654	-7395129	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	553	640	-1323	4
1746	319	0	0	0	chr3	152204654	152204692	-7395091	+	MERVL-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	3
1746	4543	10	0	0	chr3	152204692	152205185	-7394598	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	3
1746	3278	53	2	2	chr3	152213222	152213622	-7386161	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	4
1746	2437	92	3	6	chr3	152216656	152216983	-7382800	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	1	4
1746	295	377	82	35	chr3	152221144	152221403	-7378380	+	MLT1B	LTR	MaLR	20	269	-198	4
1746	295	316	98	49	chr3	152221435	152221564	-7378219	+	MLT1B	LTR	MaLR	256	390	0	4
1746	426	288	52	52	chr3	152222388	152222696	-7377087	+	RLTR18B	LTR	ERVK	13	314	-302	4
1746	1011	276	18	43	chr3	152222741	152223070	-7376713	+	RLTR18B	LTR	ERVK	192	512	0	4
1746	245	193	34	34	chr3	152224086	152224145	-7375638	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-286	79	21	4
1746	491	204	204	0	chr3	152227830	152227982	-7371801	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-45	320	138	4
1746	3197	21	50	0	chr3	152245048	152245425	-7354358	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1746	531	262	168	58	chr3	152245573	152245901	-7353882	+	MTEa	LTR	MaLR	16	379	0	4
1746	1580	186	59	85	chr3	152248452	152248874	-7350909	+	MTD	LTR	MaLR	1	411	-8	4
1746	1168	220	152	39	chr3	152258796	152259074	-7340709	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	324	-50	4
1746	1168	220	152	39	chr3	152259252	152259309	-7340474	+	ORR1D1	LTR	MaLR	325	374	0	4
1746	311	231	71	59	chr3	152265243	152265413	-7334370	+	MER57F	LTR	ERV1	3	174	-262	4
1746	286	283	188	27	chr3	152265470	152265619	-7334164	+	MER57F	LTR	ERV1	257	429	-7	4
1746	922	242	28	24	chr3	152267029	152267283	-7332500	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	255	-115	4
1746	2284	76	3	0	chr3	152267291	152267608	-7332175	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	319	-8	4
1746	406	224	0	12	chr3	152267612	152267698	-7332085	+	ORR1D2	LTR	MaLR	284	368	-2	4
1746	1212	215	34	73	chr3	152269685	152270066	-7329717	-	MTEb	LTR	MaLR	-13	366	1	4
1746	1075	213	94	80	chr3	152270616	152270787	-7328996	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	176	4
1746	1075	213	94	80	chr3	152270966	152271146	-7328637	-	ORR1E	LTR	MaLR	-184	175	1	4
1746	685	228	30	18	chr3	152275724	152275889	-7323894	+	MTD	LTR	MaLR	18	184	-235	5
1746	552	212	191	22	chr3	152276526	152276709	-7323074	+	MTD	LTR	MaLR	206	419	0	5
1746	3375	46	2	0	chr3	152279067	152279462	-7320321	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1746	1803	135	8	117	chr3	152296179	152296548	-7303235	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	5
1746	8950	149	69	124	chr3	152296548	152298626	-7301157	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	1963	0	5
1746	1667	129	74	73	chr3	152298626	152298980	-7300803	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	386	-8	5
1746	338	291	82	31	chr3	152300930	152301125	-7298658	+	LTR33	LTR	ERVL	1	205	-310	5
1747	1860	191	33	11	chr3	152305911	152306277	-7293506	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	5
1747	1234	260	69	11	chr3	152306413	152306615	-7293168	+	MTD	LTR	MaLR	1	208	-211	5
1747	1234	260	69	11	chr3	152306705	152306878	-7292905	+	MTD	LTR	MaLR	209	398	-21	5
1747	437	236	188	169	chr3	152311357	152311729	-7288054	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
1747	270	297	107	17	chr3	152313683	152313861	-7285922	+	MLT1J-int	LTR	MaLR	1064	1257	-130	5
1747	228	322	99	62	chr3	152314661	152314853	-7284930	+	MER21B	LTR	ERV1	40	238	-625	5
1747	363	306	117	33	chr3	152314913	152315153	-7284630	+	MER21B	LTR	ERV1	390	649	-214	5
1747	1751	175	44	52	chr3	152319597	152319982	-7279801	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	382	-2	5
1747	1128	234	75	11	chr3	152323714	152324052	-7275731	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	20	5
1747	749	285	42	13	chr3	152324647	152324885	-7274898	+	MTD	LTR	MaLR	18	262	-157	5
1747	973	270	144	50	chr3	152327099	152327653	-7272130	+	RLTR18	LTR	ERVK	7	612	-4	5
1747	545	291	25	92	chr3	152338157	152338609	-7261174	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	404	-15	6
1747	258	219	48	117	chr3	152352544	152352834	-7246949	+	RMER17D2	LTR	ERVK	221	490	-319	6
1747	1816	192	29	29	chr3	152358446	152358509	-7241274	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-2	376	315	6
1747	1816	192	29	29	chr3	152358536	152358848	-7240935	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-64	314	1	6
1747	1893	230	61	63	chr3	152359275	152359879	-7239904	+	RMER19C	LTR	ERVK	3	605	-6	6
1747	375	285	43	25	chr3	152364948	152365110	-7234673	+	MER34	LTR	ERV1	27	191	-351	6
1747	381	240	120	0	chr3	152365330	152365455	-7234328	+	MTEa	LTR	MaLR	3	142	-237	6
1747	1857	191	84	43	chr3	152365471	152365881	-7233902	+	RLTR20C	LTR	ERVK	1	432	-102	6
1747	1857	191	84	43	chr3	152365954	152366056	-7233727	+	RLTR20C	LTR	ERVK	433	533	-1	6
1747	255	299	174	13	chr3	152366058	152366207	-7233576	+	MTEa	LTR	MaLR	169	341	-38	6
1747	1047	142	45	15	chr3	152366270	152366470	-7233313	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	124	6
1747	451	169	11	63	chr3	152368075	152368170	-7231613	-	ORR1E	LTR	MaLR	-10	349	260	6
1747	1151	217	103	65	chr3	152368169	152368585	-7231198	-	ORR1A4-int	LTR	MaLR	-37	1543	967	6
1747	230	273	85	62	chr3	152368972	152369101	-7230682	+	MTEb	LTR	MaLR	56	187	-172	6
1747	256	167	29	29	chr3	152369250	152369318	-7230465	+	MTEb	LTR	MaLR	312	379	0	6
1747	1828	156	104	25	chr3	152369677	152369853	-7229930	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	193	-191	6
1747	1828	156	104	25	chr3	152369899	152370078	-7229705	+	ORR1C2	LTR	MaLR	194	383	-1	6
1747	465	286	213	16	chr3	152372015	152372339	-7227444	-	MLT1D	LTR	MaLR	-115	390	3	6
1747	803	211	226	23	chr3	152372416	152372717	-7227066	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	4	6
1747	352	304	143	21	chr3	152375112	152375391	-7224392	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	204	6
1747	389	318	44	61	chr3	152381803	152382130	-7217653	-	MLT1A	LTR	MaLR	-28	380	26	6
1747	1132	208	146	23	chr3	152389701	152390050	-7209733	+	MTD	LTR	MaLR	5	396	-23	7
1747	225	212	45	15	chr3	152399125	152399192	-7200591	-	LTR41B	LTR	ERVL	-72	686	618	7
1747	703	279	166	5	chr3	152406206	152406474	-7193309	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1221	359	20	7
1747	7014	108	44	92	chr3	152415311	152416481	-7183302	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	0	1114	1	7
1747	414	259	10	1	chr3	152419541	152419667	-7180116	+	ORR1D2	LTR	MaLR	221	353	-21	7
1747	450	213	151	17	chr3	152431429	152431601	-7168182	+	RMER5	LTR	ERV1	11	205	-329	7
1747	324	267	34	25	chr3	152432972	152433091	-7166692	-	MamGypLTR2b	LTR	Gypsy	-50	872	753	7
1747	231	200	73	0	chr3	152433333	152433388	-7166395	+	MTE2a	LTR	MaLR	34	92	-287	7
1747	248	240	77	39	chr3	152433476	152433580	-7166203	+	MTE2a	LTR	MaLR	265	372	-7	7
1747	995	271	118	18	chr3	152434898	152435337	-7164446	+	RMER5	LTR	ERV1	11	493	-41	7
1748	1233	181	245	10	chr3	152441167	152441473	-7158310	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	7
1748	348	302	112	48	chr3	152441707	152442020	-7157763	-	MLT1E	LTR	MaLR	-65	588	256	7
1748	310	285	164	65	chr3	152455213	152455458	-7144325	+	MLT1H1	LTR	MaLR	20	333	-262	7
1748	1449	84	368	0	chr3	152457482	152457721	-7142062	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	7
1748	283	299	121	102	chr3	152459536	152460106	-7139677	+	LTR41	LTR	ERVL	91	671	-97	7
1748	1864	141	6	42	chr3	152463411	152463744	-7136039	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-8	321	1	7
1748	239	243	42	28	chr3	152464110	152464182	-7135601	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	326	7
1748	2305	138	64	53	chr3	152464440	152464908	-7134875	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	-2	473	1	7
1748	58029	18	7	6	chr3	152464908	152471378	-7128405	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3	7
1748	2305	138	64	53	chr3	152471378	152471846	-7127937	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	-2	473	1	7
1748	1906	106	21	43	chr3	152473876	152474202	-7125581	+	ORR1A4	LTR	MaLR	3	321	-8	7
1748	1745	126	52	3	chr3	152474214	152474290	-7125493	+	ORR1A4	LTR	MaLR	22	96	-233	7
1748	1745	126	52	3	chr3	152474312	152474521	-7125262	+	ORR1A4	LTR	MaLR	97	319	-10	7
1748	796	235	88	13	chr3	152475730	152476018	-7123765	-	ORR1E	LTR	MaLR	-85	299	1	7
1748	302	316	11	0	chr3	152476972	152477067	-7122716	-	RMER15	LTR	ERVL	-40	535	440	8
1748	242	360	53	13	chr3	152477856	152478008	-7121775	-	LTR77	LTR	ERV1	-36	586	429	8
1748	1613	210	58	19	chr3	152485360	152485507	-7114276	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	151	-223	8
1748	1613	210	58	19	chr3	152485556	152485768	-7114015	+	ORR1D1	LTR	MaLR	152	374	0	8
1748	1987	156	93	16	chr3	152486400	152486766	-7113017	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	8
1748	1883	150	81	15	chr3	152487966	152488298	-7111485	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	8
1748	3903	135	21	31	chr3	152488298	152488970	-7110813	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	665	-1298	8
1748	1314	138	63	64	chr3	152489156	152489414	-7110369	+	MT2B	LTR	ERVL	29	287	-314	8
1748	4230	207	103	86	chr3	152489366	152489674	-7110109	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	630	915	-594	8
1748	4324	147	77	77	chr3	152489848	152490855	-7108928	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	875	1963	0	8
1748	1726	141	83	35	chr3	152490862	152491200	-7108583	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	394	0	8
1748	1243	277	13	87	chr3	152500051	152500442	-7099341	+	MTEb	LTR	MaLR	4	365	-14	1
1748	507	276	212	20	chr3	152501768	152502060	-7097723	-	MTEa	LTR	MaLR	-29	350	3	4
1748	360	240	37	37	chr3	152502093	152502201	-7097582	+	MLT1A1	LTR	MaLR	296	403	-5	5
1748	1198	249	111	30	chr3	152511523	152511884	-7087899	+	MTD	LTR	MaLR	1	390	-29	1
1748	302	181	148	153	chr3	152513224	152513407	-7086376	-	ORR1E	LTR	MaLR	-154	205	24	2
1748	457	248	68	47	chr3	152520870	152521018	-7078765	+	MTEb	LTR	MaLR	8	158	-221	3
1748	2065	134	2	95	chr3	152525141	152525329	-7074454	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	178	-232	4
1748	2065	134	2	95	chr3	152525459	152525722	-7074061	+	RMER17C	LTR	ERVK	179	409	-1	4
1748	313	303	31	50	chr3	152529672	152529832	-7069951	+	MLT1G3	LTR	MaLR	208	364	-231	4
1748	227	278	0	164	chr3	152530538	152530654	-7069129	-	MT2B	LTR	ERVL	-360	241	145	4
1748	328	247	37	0	chr3	152534033	152534114	-7065669	+	MLT2B1	LTR	ERVL	63	146	-408	5
1748	377	291	94	8	chr3	152534176	152534304	-7065479	+	MLT2B1	LTR	ERVL	338	476	-91	5
1748	1768	171	98	56	chr3	152536745	152537123	-7062660	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1748	294	275	62	0	chr3	152541324	152541404	-7058379	+	MLT1H2	LTR	MaLR	40	124	-365	6
1748	379	333	19	63	chr3	152550972	152551177	-7048606	+	LTR33	LTR	ERVL	306	501	-14	7
1748	1747	144	33	196	chr3	152553493	152553952	-7045831	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	7
1748	225	293	173	0	chr3	152554082	152554157	-7045626	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	88	-291	7
1748	1372	239	63	3	chr3	152554489	152554774	-7045009	+	MTE2a	LTR	MaLR	77	378	-1	7
1748	1512	144	126	67	chr3	152560089	152560431	-7039352	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	5	9
1748	283	221	25	49	chr3	152560663	152560744	-7039039	+	MLT2B4	LTR	ERVL	5	83	-473	9
1748	375	234	157	62	chr3	152566833	152567043	-7032740	+	MLT1C	LTR	MaLR	6	235	-232	1
1749	323	272	272	74	chr3	152570919	152571135	-7028648	-	MTD	LTR	MaLR	-39	380	123	1
1749	417	308	34	23	chr3	152571877	152572053	-7027730	-	MLT1A	LTR	MaLR	-4	370	193	1
1749	3747	43	5	2	chr3	152577182	152577628	-7022155	+	LTRIS5	LTR	ERV1	1	447	0	1
1749	267	206	0	14	chr3	152582795	152582864	-7016919	-	MLT1C	LTR	MaLR	-353	114	47	1
1749	336	286	17	26	chr3	152587591	152587706	-7012077	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	114	-513	1
1749	365	216	82	54	chr3	152587910	152588057	-7011726	+	RMER20A	LTR	ERVK	366	516	0	1
1749	859	285	106	87	chr3	152588266	152588635	-7011148	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	2	1
1749	319	239	91	35	chr3	152589366	152589509	-7010274	-	ORR1E	LTR	MaLR	-208	151	1	1
1749	1004	124	12	17	chr3	152592891	152593063	-7006720	+	RLTR17	LTR	ERVK	85	255	-437	1
1749	266	315	23	74	chr3	152594516	152594691	-7005092	+	ORR1E	LTR	MaLR	98	263	-96	1
1749	2128	111	3	69	chr3	152595369	152595717	-7004066	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-1	325	1	1
1749	1677	227	109	81	chr3	152596775	152597052	-7002731	+	RLTR40	LTR	ERVK	2	302	-515	1
1749	1677	227	109	81	chr3	152597130	152597595	-7002188	+	RLTR40	LTR	ERVK	303	764	-53	1
1749	471	192	20	10	chr3	152604025	152604125	-6995658	+	MTD	LTR	MaLR	81	181	-238	1
1749	312	179	15	0	chr3	152604122	152604189	-6995594	+	MTD	LTR	MaLR	337	404	-15	1
1749	312	267	186	0	chr3	152607074	152607204	-6992579	+	MLT2B4	LTR	ERVL	3	151	-405	1
1749	312	267	186	0	chr3	152607244	152607285	-6992498	+	MLT2B4	LTR	ERVL	152	205	-351	1
1749	853	257	97	46	chr3	152608273	152608624	-6991159	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	1	1
1749	966	221	106	4	chr3	152608672	152608899	-6990884	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	250	-124	1
1749	337	268	102	39	chr3	152608964	152609092	-6990691	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	136	-223	1
1749	518	299	90	63	chr3	152611744	152612012	-6987771	+	MLT1A0	LTR	MaLR	84	346	-28	1
1749	1063	217	239	18	chr3	152613408	152613751	-6986032	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	1
1749	1021	168	69	25	chr3	152613802	152614004	-6985779	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	169	1
1749	686	284	28	6	chr3	152614198	152614371	-6985412	-	MTE2b	LTR	MaLR	-199	180	4	1
1749	298	330	80	58	chr3	152618239	152618564	-6981219	+	RLTR15	LTR	ERVK	3	334	-25	1
1749	782	174	23	121	chr3	152621958	152622410	-6977373	+	RLTR6_Mm	LTR	ERV1	1	447	0	1
1749	264	256	180	145	chr3	152631353	152631581	-6968202	+	ORR1E	LTR	MaLR	119	354	-5	2
1749	329	241	149	18	chr3	152631780	152631894	-6967889	+	MLT1A1	LTR	MaLR	270	398	-10	2
1749	1166	186	211	14	chr3	152635242	152635592	-6964191	+	MTD	LTR	MaLR	1	419	0	2
1749	612	205	22	50	chr3	152635610	152635790	-6963993	+	MTD-int	LTR	MaLR	31	205	-1053	2
1749	1232	267	33	67	chr3	152650122	152650458	-6949325	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	49	2
1749	945	269	65	54	chr3	152650458	152650811	-6948972	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	1	2
1749	1232	267	33	67	chr3	152650811	152650863	-6948920	-	MTEb	LTR	MaLR	-331	48	2	2
1749	286	319	199	30	chr3	152660504	152660775	-6939008	-	MER74A	LTR	ERVL	-30	528	212	2
1749	373	333	71	38	chr3	152662955	152663167	-6936616	-	RMER12	LTR	ERVK	-334	988	770	2
1749	2961	37	40	3	chr3	152668261	152668613	-6931170	+	RLTR10B2	LTR	ERVK	1	365	0	2
1749	254	306	113	77	chr3	152674015	152674210	-6925573	-	LTR40a	LTR	ERVL	-125	394	193	2
1749	2614	80	0	0	chr3	152675293	152675620	-6924163	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	2
1749	273	337	11	0	chr3	152676510	152676605	-6923178	-	LTR90B	LTR	LTR	-528	268	173	2
1749	1105	245	56	82	chr3	152681763	152682154	-6917629	+	MTD	LTR	MaLR	31	411	-8	2
1749	2813	62	13	3	chr3	152686199	152686590	-6913193	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	6	2
1749	290	232	73	0	chr3	152692736	152692818	-6906965	-	MTEb	LTR	MaLR	-13	366	279	2
1749	668	314	27	11	chr3	152693762	152694023	-6905760	-	RMER15	LTR	ERVL	-105	470	206	2
1749	415	196	423	10	chr3	152694135	152694316	-6905467	-	MTEb	LTR	MaLR	-118	261	5	2
1749	274	322	85	0	chr3	152698550	152698668	-6901115	+	MTE2b	LTR	MaLR	6	133	-246	3
218	493	204	90	14	chr3	152698826	152698970	-6900813	+	MTE2b	LTR	MaLR	225	379	0	3
1750	294	189	135	0	chr3	152700947	152701021	-6898762	+	MER34	LTR	ERV1	18	101	-441	3
1750	1896	90	32	0	chr3	152704059	152704338	-6895445	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	32	3
1750	1536	115	134	10	chr3	152705941	152706231	-6893552	-	RMER13A	LTR	ERVK	-517	343	18	3
1750	424	305	0	0	chr3	152707438	152707556	-6892227	+	MTEa	LTR	MaLR	11	128	-231	3
1750	472	271	34	73	chr3	152707622	152707837	-6891946	+	MTEa	LTR	MaLR	131	365	-14	3
1750	418	288	0	0	chr3	152708118	152708236	-6891547	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-2194	3567	3450	3
1750	561	328	67	24	chr3	152708255	152708583	-6891200	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-2359	2637	2296	3
1750	814	255	160	7	chr3	152708866	152709135	-6890648	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	70	3
1750	286	155	103	0	chr3	152709252	152709310	-6890473	-	MTEb	LTR	MaLR	-315	64	1	3
1750	361	361	24	12	chr3	152709360	152709528	-6890255	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-2948	2048	1879	3
1750	637	325	148	16	chr3	152710082	152710467	-6889316	+	MER21B	LTR	ERV1	368	803	-60	3
1750	585	265	98	47	chr3	152711053	152711370	-6888413	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3854	1142	810	3
1750	432	367	83	7	chr3	152712100	152712377	-6887406	-	LTR16A	LTR	ERVL	-5	446	149	3
1750	353	269	82	18	chr3	152713907	152714017	-6885766	-	MTE2b	LTR	MaLR	-59	320	204	3
1750	1470	196	108	29	chr3	152714437	152714851	-6884932	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	1	3
1750	825	271	92	46	chr3	152715129	152715435	-6884348	+	ORR1D2	LTR	MaLR	51	370	0	3
1750	460	256	8	0	chr3	152715436	152715553	-6884230	+	ORR1D2-int	LTR	MaLR	2	119	-1251	3
1750	911	279	110	9	chr3	152720971	152721307	-6878476	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1750	1424	170	156	9	chr3	152724563	152724745	-6875038	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	154	3
1750	1424	170	156	9	chr3	152724792	152724935	-6874848	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-221	153	2	3
1750	338	222	14	0	chr3	152726792	152726864	-6872919	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	339	3
1750	723	202	48	0	chr3	152726873	152727041	-6872742	-	MTD	LTR	MaLR	-239	180	5	3
1750	581	289	128	14	chr3	152729256	152729467	-6870316	-	MTE2b	LTR	MaLR	-13	366	132	3
1750	1270	195	118	15	chr3	152730858	152731197	-6868586	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1750	3732	144	140	30	chr3	152737430	152738188	-6861595	+	RMER21B	LTR	ERV1	2	842	0	3
1750	485	334	69	51	chr3	152742445	152742795	-6856988	+	ORR1E	LTR	MaLR	4	359	0	3
1750	382	244	134	0	chr3	152742982	152743109	-6856674	+	MLT1C	LTR	MaLR	319	462	-5	3
1750	1372	222	94	6	chr3	152743460	152743800	-6855983	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1750	247	239	62	27	chr3	152745526	152745638	-6854145	-	MT2B2	LTR	ERVL	0	584	469	3
1750	365	327	83	14	chr3	152748905	152749122	-6850661	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	232	-235	3
1750	1330	259	18	24	chr3	152749431	152749811	-6849972	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	379	0	3
1750	512	339	52	13	chr3	152753376	152753609	-6846174	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-80	285	44	3
1750	4180	21	38	0	chr3	152759403	152759878	-6839905	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	3
1750	2872	74	16	23	chr3	152765238	152765626	-6834157	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	1	4
1750	1177	256	114	6	chr3	152765658	152765992	-6833791	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	1	4
1750	266	283	117	29	chr3	152768292	152768463	-6831320	-	LTR89	LTR	ERVL?	-648	231	46	4
1750	270	314	202	16	chr3	152768747	152768999	-6830784	+	MLT1N2	LTR	MaLR	242	540	-22	4
1750	4068	123	91	11	chr3	152769164	152769864	-6829919	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	4
1750	4553	110	54	35	chr3	152775582	152776489	-6823294	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	1	4
1750	475	327	90	24	chr3	152778438	152778726	-6821057	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	307	-58	4
1750	856	281	82	19	chr3	152782401	152782818	-6816965	-	MT2A	LTR	ERVL	-8	525	83	4
1750	276	296	102	36	chr3	152782744	152782881	-6816902	-	MTEa	LTR	MaLR	-209	170	25	4
1750	250	317	71	43	chr3	152783797	152784008	-6815775	-	MLT1K	LTR	MaLR	-111	484	268	4
1750	1032	238	130	18	chr3	152784307	152784645	-6815138	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	3	4
1750	1557	239	22	0	chr3	152785284	152785653	-6814130	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	3	4
1750	549	241	95	0	chr3	152789089	152789247	-6810536	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	177	-182	4
1750	2115	110	51	72	chr3	152789256	152789354	-6810429	+	RLTR23	LTR	ERV1	10	115	-315	4
1750	2115	110	51	72	chr3	152789493	152789824	-6809959	+	RLTR23	LTR	ERV1	116	430	0	4
1750	389	249	20	147	chr3	152789827	152790025	-6809758	+	ORR1E	LTR	MaLR	206	378	-1	4
1750	850	280	4	13	chr3	152792811	152793050	-6806733	-	RMER15	LTR	ERVL	-3	572	336	4
1750	290	271	90	7	chr3	152793064	152793209	-6806574	-	RMER15	LTR	ERVL	-392	183	27	4
1750	467	41	41	0	chr3	152798758	152798831	-6800952	+	MT2B	LTR	ERVL	526	601	0	4
1750	494	339	103	38	chr3	152807704	152808130	-6791653	-	MT2A	LTR	ERVL	-79	454	1	4
1750	3336	46	2	2	chr3	152812393	152812789	-6786994	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1750	1337	164	104	0	chr3	152817109	152817377	-6782406	-	MTD	LTR	MaLR	-106	313	18	4
1750	482	219	16	11	chr3	152817501	152817641	-6782142	+	MTD	LTR	MaLR	90	227	-194	4
1750	1114	249	129	3	chr3	152820256	152820627	-6779156	+	MTD	LTR	MaLR	2	419	0	4
1750	1056	128	128	0	chr3	152825608	152825796	-6773987	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	156	4
1751	903	285	105	9	chr3	152833597	152833930	-6765853	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	365	-14	5
1751	256	277	26	2	chr3	152837978	152838068	-6761715	+	MLT1A	LTR	MaLR	13	103	-262	5
1751	234	312	0	0	chr3	152838107	152838171	-6761612	+	MLT1A	LTR	MaLR	257	320	-45	5
1751	1902	123	11	49	chr3	152838656	152839024	-6760759	-	BGLII_B	LTR	ERVK	-87	354	1	5
1751	279	282	71	33	chr3	152840854	152841037	-6758746	+	RLTR15	LTR	ERVK	154	343	-16	5
1751	3237	56	3	0	chr3	152846156	152846548	-6753235	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	393	-3	5
1751	513	340	108	11	chr3	152851158	152851527	-6748256	+	MLT2D	LTR	ERVL	6	410	-4	5
1751	725	224	255	19	chr3	152853122	152853381	-6746402	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-7	363	44	5
1751	254	346	173	16	chr3	152855124	152855309	-6744474	+	MLT1F2	LTR	MaLR	227	440	-120	5
1751	1315	220	167	3	chr3	152856723	152857083	-6742700	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	5
1751	542	302	136	30	chr3	152862403	152862741	-6737042	+	MTEa	LTR	MaLR	3	376	-3	5
1751	500	255	6	75	chr3	152877938	152878112	-6721671	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	162	-220	5
1751	1838	145	97	14	chr3	152878118	152878488	-6721295	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-6	401	1	5
1751	294	299	117	56	chr3	152878488	152878577	-6721206	+	RLTR14	LTR	ERV1	158	257	-125	5
1751	294	299	117	56	chr3	152878603	152878725	-6721058	+	RLTR14	LTR	ERV1	258	381	-1	5
1751	453	310	129	52	chr3	152878725	152879128	-6720655	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	2	436	-4881	5
1751	453	310	129	52	chr3	152879149	152879170	-6720613	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	437	459	-4858	5
1751	512	179	0	0	chr3	152879811	152879895	-6719888	+	RLTR14-int	LTR	ERV1	833	916	-4401	5
1751	601	326	23	34	chr3	152882398	152882747	-6717036	+	ORR1E	LTR	MaLR	8	352	-7	5
1751	586	279	109	74	chr3	152891870	152892237	-6707546	+	RMER13A	LTR	ERVK	2	381	-479	5
1751	1129	176	197	7	chr3	152894772	152895046	-6704737	+	MTD	LTR	MaLR	92	417	-2	5
1751	264	300	133	69	chr3	152898075	152898308	-6701475	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-2	363	116	6
1751	412	226	52	75	chr3	152900066	152900200	-6699583	+	MTEa	LTR	MaLR	249	379	0	6
1751	227	268	0	40	chr3	152901909	152901983	-6697800	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	338	6
1751	435	275	218	36	chr3	152905890	152906157	-6693626	+	MTEb	LTR	MaLR	55	370	-9	6
1751	489	269	34	113	chr3	152906647	152906857	-6692926	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	181	-189	6
1751	467	285	8	0	chr3	152907037	152907160	-6692623	+	ORR1E	LTR	MaLR	254	377	-2	6
1751	642	209	204	1	chr3	152907768	152907961	-6691822	+	MTD	LTR	MaLR	189	405	-14	6
1751	412	291	294	34	chr3	152916400	152916701	-6683082	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	6
1751	2271	93	15	30	chr3	152918592	152918924	-6680859	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	327	0	6
1751	1188	260	55	35	chr3	152919745	152920179	-6679604	+	RMER5	LTR	ERV1	68	510	-24	6
1751	527	253	281	58	chr3	152925586	152925896	-6673887	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	6
1751	1375	213	226	56	chr3	152931755	152932277	-6667506	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	6
1751	563	234	58	92	chr3	152937190	152937397	-6662386	-	MTE2a	LTR	MaLR	-179	200	1	6
1751	1049	258	99	12	chr3	152943816	152944149	-6655634	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	362	-8	6
1751	287	250	35	23	chr3	152945909	152945995	-6653788	-	MTD	LTR	MaLR	-332	87	1	6
1751	425	261	212	62	chr3	152950683	152950924	-6648859	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	129	6
1751	5195	103	142	14	chr3	152951554	152952402	-6647381	+	RMER17B	LTR	ERVK	3	958	0	6
1751	941	254	181	12	chr3	152960541	152960884	-6638899	+	MTC	LTR	MaLR	3	403	-18	6
1752	269	291	29	19	chr3	152966144	152966249	-6633534	+	MLT1A1	LTR	MaLR	291	396	-12	6
1752	971	297	31	11	chr3	152967744	152968030	-6631753	-	ORR1E	LTR	MaLR	-64	295	4	6
1752	565	225	31	87	chr3	152980051	152980246	-6619537	+	RLTR18	LTR	ERVK	9	192	-424	7
1752	398	312	56	52	chr3	152980401	152980614	-6619169	+	RLTR18	LTR	ERVK	403	616	0	7
1752	817	303	114	6	chr3	152981211	152981536	-6618247	+	MTEa	LTR	MaLR	18	377	-2	7
1752	1224	225	89	24	chr3	152984992	152985329	-6614454	+	MTEb	LTR	MaLR	1	359	-20	7
1752	422	264	157	80	chr3	152993530	152993905	-6605878	+	MTD	LTR	MaLR	1	404	-15	7
1752	2140	158	37	10	chr3	152998740	152999142	-6600641	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	7
1752	475	281	128	0	chr3	153000174	153000338	-6599445	-	MTE2b	LTR	MaLR	-20	359	175	2
1752	266	302	11	11	chr3	153000362	153000449	-6599334	-	MTE2b	LTR	MaLR	-292	87	1	2
1752	295	336	40	40	chr3	153002790	153002939	-6596844	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	149	-210	5
1752	376	376	123	18	chr3	153003793	153004134	-6595649	+	LTR78	LTR	ERV1	8	384	-920	9
1752	1006	267	125	26	chr3	153004192	153004568	-6595215	+	MTD	LTR	MaLR	12	399	-20	1
1752	423	338	151	25	chr3	153004660	153004939	-6594844	+	LTR78	LTR	ERV1	637	950	-354	9
1752	482	286	79	23	chr3	153006242	153006457	-6593326	+	LTR78	LTR	ERV1	1016	1242	-62	9
1752	769	229	63	12	chr3	153011061	153011316	-6588467	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	369	-1	1
1752	701	264	135	8	chr3	153019156	153019400	-6580383	-	ORR1E	LTR	MaLR	-84	275	1	2
1752	2282	98	3	58	chr3	153022814	153023160	-6576623	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	2
1752	292	303	35	64	chr3	153025354	153025495	-6574288	-	LTR33	LTR	ERVL	-373	142	6	3
1752	1980	213	74	98	chr3	153026764	153027772	-6572011	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	3
1752	4343	47	2	8	chr3	153034781	153035296	-6564487	-	LTRIS3	LTR	ERV1	0	512	1	4
1752	1237	232	108	15	chr3	153035342	153035675	-6564108	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-6	364	1	4
1752	1176	260	35	104	chr3	153039783	153040187	-6559596	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	2	5
1752	1667	122	56	26	chr3	153044859	153045128	-6554655	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-99	279	3	6
1752	445	219	133	52	chr3	153052799	153052972	-6546811	+	MTEa	LTR	MaLR	182	368	-11	7
1752	3320	58	0	0	chr3	153053679	153054075	-6545708	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	7
1752	2816	78	65	10	chr3	153054634	153055033	-6544750	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	8
1752	3518	116	34	35	chr3	153056450	153057015	-6542768	+	LTRIS2	LTR	ERV1	1	564	0	8
1752	611	336	85	33	chr3	153057234	153057539	-6542244	-	ORR1E	LTR	MaLR	-11	348	28	8
1752	1050	245	188	6	chr3	153057676	153057724	-6542059	-	MTD	LTR	MaLR	-35	384	329	8
1752	1050	245	188	6	chr3	153057781	153058056	-6541727	-	MTD	LTR	MaLR	-91	328	2	8
1752	1188	243	98	67	chr3	153061685	153061733	-6538050	+	MTE2a	LTR	MaLR	10	57	-322	9
1752	1188	243	98	67	chr3	153061774	153062082	-6537701	+	MTE2a	LTR	MaLR	58	377	-2	9
1752	329	176	189	0	chr3	153077232	153077306	-6522477	-	RMER15	LTR	ERVL	-151	424	337	1
1752	789	254	43	55	chr3	153088302	153088740	-6511043	+	RMER17C	LTR	ERVK	5	410	0	1
1752	283	198	35	58	chr3	153091226	153091312	-6508471	+	MTC	LTR	MaLR	1	84	-337	1
1753	1842	193	82	15	chr3	153095013	153095402	-6504381	+	MTD	LTR	MaLR	5	419	0	1
1753	3483	30	2	0	chr3	153101737	153102132	-6497651	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1753	9553	30	0	0	chr3	153102132	153103230	-6496553	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	1
1753	3493	35	0	0	chr3	153103230	153103626	-6496157	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1753	240	212	206	29	chr3	153104462	153104564	-6495219	-	LTR86A1	LTR	ERVL	-372	141	22	1
1753	2450	168	35	67	chr3	153105856	153106143	-6493640	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-58	519	247	1
1753	2450	168	35	67	chr3	153106168	153106415	-6493368	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-331	246	2	1
1753	616	262	90	45	chr3	153106726	153106970	-6492813	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	352	98	1
1753	260	277	36	97	chr3	153109134	153109382	-6490401	+	RMER17C	LTR	ERVK	130	362	-48	1
1753	533	219	194	0	chr3	153110021	153110176	-6489607	+	RMER15	LTR	ERVL	374	558	-17	1
1753	511	86	172	0	chr3	153114816	153114909	-6484874	-	RMER15	LTR	ERVL	-463	112	4	1
1753	456	71	57	0	chr3	153115303	153115394	-6484389	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	125	-269	1
1753	1092	113	0	6	chr3	153115395	153115564	-6484219	+	RMER10B	LTR	ERVL	3	170	-228	1
1753	631	195	39	32	chr3	153116014	153116168	-6483615	+	RMER10B	LTR	ERVL	244	398	0	1
1753	2163	164	46	62	chr3	153116187	153116608	-6483175	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	418	-87	1
1753	2163	164	46	62	chr3	153116663	153116741	-6483042	+	RLTR16	LTR	ERVK	419	492	-13	1
1753	281	174	101	0	chr3	153116738	153116807	-6482976	+	RLTR16	LTR	ERVK	430	505	0	1
1753	1360	139	28	16	chr3	153116807	153117053	-6482730	+	ORR1A4	LTR	MaLR	81	329	0	1
1753	957	263	65	60	chr3	153120196	153120564	-6479219	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
1753	581	256	141	77	chr3	153120652	153120949	-6478834	+	MTE2b	LTR	MaLR	49	364	-15	1
1753	778	291	42	59	chr3	153122594	153122948	-6476835	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	8	2
1753	447	217	58	8	chr3	153124299	153124420	-6475363	+	MTEb	LTR	MaLR	4	130	-249	2
1753	2839	134	47	11	chr3	153124447	153124975	-6474808	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-14	547	1	2
1753	773	234	64	60	chr3	153124975	153125225	-6474558	+	MTEb	LTR	MaLR	129	379	0	2
1753	926	265	71	32	chr3	153126406	153126745	-6473038	+	MTE2b	LTR	MaLR	20	371	-8	2
1753	1543	122	180	21	chr3	153129886	153130170	-6469613	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	2
1753	1088	204	62	0	chr3	153131263	153131489	-6468294	+	MTD	LTR	MaLR	17	256	-163	2
1753	229	190	155	0	chr3	153131527	153131585	-6468198	+	MTD	LTR	MaLR	355	421	0	2
1753	1229	220	54	76	chr3	153143548	153143917	-6455866	+	MTEa	LTR	MaLR	1	361	-18	2
1753	338	259	35	44	chr3	153149234	153149347	-6450436	-	MLT1D	LTR	MaLR	-144	361	250	2
1753	310	222	12	36	chr3	153149457	153149541	-6450242	-	MLT1D	LTR	MaLR	-543	84	3	2
1753	1415	164	118	9	chr3	153149670	153149805	-6449978	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	157	-210	2
1753	1415	164	118	9	chr3	153149855	153150034	-6449749	+	ORR1B2	LTR	MaLR	158	348	-19	2
1753	1761	144	68	120	chr3	153150990	153151416	-6448367	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	4	2
1753	503	320	23	53	chr3	153158008	153158303	-6441480	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	286	-178	2
1753	818	296	111	23	chr3	153159929	153160271	-6439512	+	MTE2b	LTR	MaLR	8	379	0	2
1753	268	280	11	85	chr3	153167165	153167263	-6432520	-	MTE2a	LTR	MaLR	-210	169	82	2
1753	388	230	23	11	chr3	153167278	153167366	-6432417	-	MTE2a	LTR	MaLR	-288	91	3	2
1753	333	222	20	44	chr3	153168553	153168741	-6431042	-	RMER6B	LTR	ERVK	-1	460	242	2
1753	316	364	24	12	chr3	153168873	153169040	-6430743	+	MTD-int	LTR	MaLR	1090	1258	0	2
1753	824	214	193	32	chr3	153169042	153169322	-6430461	+	MTD	LTR	MaLR	3	327	-92	2
1753	511	216	19	95	chr3	153170019	153170198	-6429585	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	195	2
1753	226	146	0	0	chr3	153179236	153179277	-6420506	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-30	354	314	2
1753	1201	191	164	0	chr3	153179442	153179698	-6420085	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-78	300	3	2
1753	1265	237	110	0	chr3	153184079	153184416	-6415367	+	MTEa	LTR	MaLR	6	379	0	2
1753	834	275	84	28	chr3	153190483	153190839	-6408944	+	MTEa	LTR	MaLR	4	379	0	2
1753	1709	156	111	9	chr3	153191453	153191795	-6407988	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	5	381	-203	2
1753	623	290	77	45	chr3	153192056	153192510	-6407273	+	MER34	LTR	ERV1	2	550	-21	2
1753	812	256	124	34	chr3	153200857	153201180	-6398603	-	MTD	LTR	MaLR	-50	369	18	2
1753	2502	83	3	6	chr3	153205213	153205541	-6394242	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1753	249	307	144	14	chr3	153209392	153209531	-6390252	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-8	801	645	3
1753	246	205	21	144	chr3	153222937	153223034	-6376749	+	MLT1E3	LTR	MaLR	137	221	-403	3
1754	2046	191	93	30	chr3	153223922	153224397	-6375386	+	RLTR16	LTR	ERVK	1	505	0	3
1754	698	301	62	75	chr3	153226834	153227139	-6372644	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	73	3
1754	312	261	214	7	chr3	153227025	153227179	-6372604	-	MT2A	LTR	ERVL	-347	186	1	3
1754	1021	90	3	28	chr3	153228690	153228881	-6370902	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-39	382	199	3
1754	3067	75	5	12	chr3	153230072	153230475	-6369308	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	3
1754	1376	252	47	44	chr3	153233609	153233995	-6365788	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	18	3
1754	4690	106	118	42	chr3	153236524	153237349	-6362434	-	RMER17D	LTR	ERVK	-2	887	1	3
1754	1791	188	67	27	chr3	153239701	153240070	-6359713	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	370	-8	3
1754	5387	199	135	17	chr3	153240069	153241333	-6358450	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	96	1509	0	3
1754	1467	161	211	3	chr3	153241333	153241645	-6358138	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	377	-1	3
1754	915	274	35	109	chr3	153254919	153255287	-6344496	-	MTE2a	LTR	MaLR	-38	341	1	3
1754	451	310	27	44	chr3	153255417	153255705	-6344078	+	MLT1B	LTR	MaLR	113	386	-4	3
1754	2433	101	3	6	chr3	153258694	153259022	-6340761	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1754	350	311	79	32	chr3	153261142	153261394	-6338389	+	RMER5	LTR	ERV1	254	517	-17	3
1754	275	270	44	22	chr3	153261603	153261694	-6338089	-	MLT1H	LTR	MaLR	-50	499	407	3
1754	423	344	42	42	chr3	153262187	153262378	-6337405	+	MTE2b	LTR	MaLR	107	297	-82	3
1754	1646	188	81	17	chr3	153262408	153262754	-6337029	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	368	-10	4
1754	239	272	43	21	chr3	153263922	153264016	-6335767	-	MER89	LTR	ERV1	-99	460	365	4
1754	408	262	98	0	chr3	153264046	153264168	-6335615	-	MER89	LTR	ERV1	-257	302	169	4
1754	1228	249	60	88	chr3	153265253	153265637	-6334146	-	MTD	LTR	MaLR	-1	418	46	4
1754	361	273	54	134	chr3	153277137	153277491	-6322292	+	MLT1B	LTR	MaLR	6	538	-57	4
1754	1433	208	114	40	chr3	153281947	153282297	-6317486	-	MTD	LTR	MaLR	-22	397	22	4
1754	379	261	59	116	chr3	153286063	153286364	-6313419	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-42	1072	662	4
1754	229	167	0	0	chr3	153286967	153287003	-6312780	-	RLTR13D3	LTR	ERVK	-1078	36	1	4
1754	3949	126	64	12	chr3	153291384	153291520	-6308263	+	RMER17B	LTR	ERVK	265	414	-544	4
1754	3949	126	64	12	chr3	153291659	153292182	-6307601	+	RMER17B	LTR	ERVK	415	957	-1	4
1754	312	299	91	67	chr3	153294728	153294893	-6304890	+	ORR1D2	LTR	MaLR	10	178	-192	4
1754	3400	38	5	0	chr3	153301053	153301447	-6298336	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1754	1804	144	58	70	chr3	153303176	153303505	-6296278	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-1	325	1	4
1754	303	216	260	8	chr3	153308196	153308413	-6291370	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	75	4
1754	327	264	34	11	chr3	153308484	153308572	-6291211	-	MTD	LTR	MaLR	-326	93	4	4
1754	761	225	89	35	chr3	153313296	153313494	-6286289	+	MTD	LTR	MaLR	185	418	-1	4
1754	2302	84	51	0	chr3	153317470	153317781	-6282002	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	4
1754	245	233	0	0	chr3	153321399	153321442	-6278341	+	MTEa	LTR	MaLR	36	78	-301	5
1754	720	229	228	8	chr3	153336831	153337099	-6262684	+	MTEa	LTR	MaLR	36	362	-17	5
1754	237	312	0	68	chr3	153339657	153339774	-6260009	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-434	1414	1306	5
1754	2495	134	79	8	chr3	153343001	153343392	-6256391	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	5
1754	1872	158	9	9	chr3	153343677	153343997	-6255786	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	40	5
1754	341	144	42	42	chr3	153344015	153344086	-6255697	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-302	77	1	5
1755	287	289	86	68	chr3	153359506	153359669	-6240114	+	MLT1C	LTR	MaLR	277	442	-25	5
1755	239	368	63	10	chr3	153363895	153364101	-6235682	-	MER34A	LTR	ERV1	-97	490	274	5
1755	334	350	0	25	chr3	153364183	153364303	-6235480	-	MER34A	LTR	ERV1	-434	137	21	5
1755	646	247	44	6	chr3	153365287	153365446	-6234337	-	RMER5	LTR	ERV1	-20	514	350	5
1755	1660	210	60	27	chr3	153369390	153369757	-6230026	+	RLTR14	LTR	ERV1	1	379	-3	5
1755	274	284	24	12	chr3	153369921	153370003	-6229780	+	MTC	LTR	MaLR	42	124	-255	5
1755	484	298	64	91	chr3	153369941	153370363	-6229420	+	MT2A	LTR	ERVL	62	556	0	5
1755	643	188	246	0	chr3	153373609	153373747	-6226036	+	MTC	LTR	MaLR	198	369	-52	5
1755	367	192	0	40	chr3	153379532	153379608	-6220175	+	RMER15	LTR	ERVL	414	486	-89	5
1755	1538	141	130	58	chr3	153380367	153380713	-6219070	+	RMER15	LTR	ERVL	1	371	-204	6
1755	448	282	188	21	chr3	153384756	153384967	-6214816	+	MER34A	LTR	ERV1	158	408	-163	6
1755	1993	204	57	27	chr3	153384967	153385374	-6214409	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	6
1755	1768	147	214	14	chr3	153389476	153389827	-6209956	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	6
1755	414	184	13	13	chr3	153392120	153392188	-6207595	+	MTEa	LTR	MaLR	10	77	-302	6
1755	950	290	36	42	chr3	153392379	153392685	-6207098	+	MTEa	LTR	MaLR	76	379	0	6
1755	1905	216	30	22	chr3	153392889	153393296	-6206487	-	MTD	LTR	MaLR	-9	410	1	6
1755	369	294	65	42	chr3	153403753	153403987	-6195796	-	MLT1H	LTR	MaLR	-304	251	37	6
1755	1836	168	58	19	chr3	153408786	153409150	-6190633	-	RMER5	LTR	ERV1	-8	526	149	6
1755	283	167	74	0	chr3	153409181	153409235	-6190548	-	RMER5	LTR	ERV1	-456	78	21	6
1755	3932	169	8	18	chr3	153409600	153410310	-6189473	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	703	-1145	6
1755	456	267	60	20	chr3	153411418	153411567	-6188216	+	RMER12	LTR	ERVK	1106	1260	-62	6
1755	1090	134	52	11	chr3	153414256	153414430	-6185353	-	RMER19B	LTR	ERVK	-20	882	702	6
1755	1756	175	125	27	chr3	153414419	153414795	-6184988	-	RMER19B	LTR	ERVK	-315	587	175	6
1755	4276	91	108	21	chr3	153414834	153415163	-6184620	-	RMER17A	LTR	ERVK	-15	736	411	6
1755	4276	91	108	21	chr3	153415329	153415452	-6184331	-	RMER17A	LTR	ERVK	-341	410	220	6
1755	3521	15	8	0	chr3	153415452	153415845	-6183938	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1755	4276	91	108	21	chr3	153415845	153416068	-6183715	-	RMER17A	LTR	ERVK	-532	219	2	6
1755	687	269	6	0	chr3	153416068	153416194	-6183589	-	RMER19B	LTR	ERVK	-720	182	56	6
1755	688	186	62	0	chr3	153416172	153416301	-6183482	-	RMER19B	LTR	ERVK	-765	137	1	6
1755	770	264	75	75	chr3	153417038	153417414	-6182369	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	4	6
1755	1458	100	308	0	chr3	153417708	153417958	-6181825	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1755	2672	126	30	51	chr3	153418711	153419203	-6180580	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	6
1755	271	247	129	0	chr3	153419470	153419563	-6180220	-	MLT1L	LTR	MaLR	-3	607	503	6
1755	241	203	174	0	chr3	153419901	153419970	-6179813	-	MLT1L	LTR	MaLR	-526	84	4	6
1755	544	250	169	84	chr3	153420068	153420392	-6179391	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	49	6
1755	3039	65	3	3	chr3	153421721	153422110	-6177673	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	8	396	0	6
1755	324	278	38	38	chr3	153422110	153422241	-6177542	-	ORR1E	LTR	MaLR	-224	135	5	6
1755	1036	271	58	37	chr3	153423660	153423957	-6175826	+	MTEa	LTR	MaLR	3	309	-70	6
1755	3074	115	163	21	chr3	153423957	153424490	-6175293	-	RMER19C	LTR	ERVK	-2	609	1	6
1755	1036	271	58	37	chr3	153424490	153424518	-6175265	+	MTEa	LTR	MaLR	310	335	-44	6
1755	312	295	49	82	chr3	153431197	153431319	-6168464	+	RMER15	LTR	ERVL	45	162	-413	6
1755	843	309	19	15	chr3	153431319	153431588	-6168195	+	RMER15	LTR	ERVL	291	560	-15	6
1755	228	306	85	50	chr3	153433980	153434121	-6165662	-	LTR16D1	LTR	ERVL	-208	467	322	6
1755	244	226	19	0	chr3	153437282	153437335	-6162448	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	326	6
1755	678	313	105	4	chr3	153437333	153437599	-6162184	+	MTE2b	LTR	MaLR	19	311	-68	6
1755	526	280	59	73	chr3	153437608	153437812	-6161971	-	MTEb	LTR	MaLR	-26	353	153	6
1755	266	217	0	0	chr3	153437834	153437880	-6161903	-	MTEb	LTR	MaLR	-332	47	2	6
1755	2237	182	71	44	chr3	153438016	153438351	-6161432	+	RMER20B	LTR	ERVK	91	423	-204	6
1755	3270	89	6	41	chr3	153438351	153438843	-6160940	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	7
1755	2237	182	71	44	chr3	153438843	153439030	-6160753	+	RMER20B	LTR	ERVK	424	627	0	6
1755	1062	275	73	14	chr3	153447099	153447453	-6152330	+	MTE2b	LTR	MaLR	2	376	-3	7
1755	1309	158	97	55	chr3	153459197	153459486	-6140297	+	RLTR20C	LTR	ERVK	4	304	-230	7
1755	621	159	178	22	chr3	153459493	153459553	-6140230	+	RLTR20C	LTR	ERVK	423	489	-89	7
1755	621	159	178	22	chr3	153459612	153459686	-6140097	+	RLTR20C	LTR	ERVK	490	578	0	7
1755	1857	147	141	0	chr3	153470473	153470814	-6128969	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	391	-3	7
1755	396	239	0	0	chr3	153472450	153472539	-6127244	+	MTEb	LTR	MaLR	1	89	-290	7
1755	378	329	65	33	chr3	153476699	153476913	-6122870	-	RMER15	LTR	ERVL	-11	564	344	7
1755	490	276	56	76	chr3	153478516	153478584	-6121199	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	319	7
1755	490	276	56	76	chr3	153479785	153479967	-6119816	-	MTEb	LTR	MaLR	-61	318	134	7
1755	1560	215	45	123	chr3	153481278	153481724	-6118059	-	RMER19B	LTR	ERVK	-491	411	1	7
219	825	350	88	31	chr3	153485275	153485694	-6114089	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-611	969	527	7
1756	403	294	89	121	chr3	153485697	153485945	-6113838	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-1340	240	1	7
1756	463	301	58	93	chr3	153485953	153486158	-6113625	-	MTEa	LTR	MaLR	-12	367	156	7
1756	315	249	67	65	chr3	153489924	153490134	-6109649	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-25	503	232	7
1756	930	256	26	93	chr3	153490168	153490470	-6109313	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-171	282	1	7
1756	2466	155	7	35	chr3	153490608	153490925	-6108858	-	MTC	LTR	MaLR	-2	419	113	7
1756	2466	155	7	35	chr3	153491113	153491222	-6108561	-	MTC	LTR	MaLR	-309	112	5	7
1756	796	252	158	25	chr3	153491476	153491793	-6107990	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	8
1756	1752	123	8	185	chr3	153501841	153502152	-6097631	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	285	-44	4
1756	1752	123	8	185	chr3	153502345	153502433	-6097350	+	ORR1A4	LTR	MaLR	286	329	0	4
1756	1841	132	54	93	chr3	153508449	153508835	-6090948	+	ORR1B1	LTR	MaLR	24	394	0	1
1756	922	212	95	90	chr3	153517261	153517618	-6082165	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	2
1756	308	227	231	6	chr3	153528278	153528451	-6071332	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-343	213	2	4
1756	1021	201	50	17	chr3	153532177	153532415	-6067368	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-108	266	21	5
1756	342	53	20	8	chr3	153538405	153538462	-6061321	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	371	6
1756	1163	199	179	12	chr3	153538507	153538837	-6060946	-	MTD	LTR	MaLR	-34	385	1	6
1756	3489	20	5	2	chr3	153542812	153543207	-6056576	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	7
1756	2353	75	28	21	chr3	153544205	153544530	-6055253	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	7
1756	731	301	54	4	chr3	153550900	153551177	-6048606	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	244	9
1756	1485	145	37	44	chr3	153554840	153555136	-6044647	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	168	1
1756	288	93	0	0	chr3	153555125	153555168	-6044615	+	ORR1A2	LTR	MaLR	276	318	-8	1
1756	10840	117	73	28	chr3	153555173	153557050	-6042733	+	ORR1A2-int	LTR	MaLR	2	1963	0	1
1756	2085	113	3	112	chr3	153557050	153557156	-6042627	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	106	-221	1
1756	2085	113	3	112	chr3	153557303	153557563	-6042220	+	ORR1A2	LTR	MaLR	107	327	0	1
1756	749	269	42	134	chr3	153558942	153559376	-6040407	+	MTD	LTR	MaLR	25	418	-1	1
1756	291	188	85	40	chr3	153562190	153562274	-6037509	+	MLT1C	LTR	MaLR	16	83	-307	1
1756	271	252	137	145	chr3	153562463	153562633	-6037150	+	MLT1C	LTR	MaLR	84	268	-122	1
1756	342	207	156	8	chr3	153563819	153563941	-6035842	+	RMER15	LTR	ERVL	422	561	-14	1
1756	1945	169	83	162	chr3	153565789	153566105	-6033678	+	RMER16	LTR	ERVK	1	259	-274	1
1756	1945	169	83	162	chr3	153566252	153566381	-6033402	+	RMER16	LTR	ERVK	260	401	-132	1
1756	1945	169	83	162	chr3	153566521	153566653	-6033130	+	RMER16	LTR	ERVK	402	532	-1	1
1756	308	167	147	53	chr3	153569608	153569703	-6030080	+	ORR1C2	LTR	MaLR	273	376	-8	1
1756	1133	273	80	54	chr3	153578505	153578592	-6021191	+	MT2A	LTR	ERVL	1	88	-445	1
1756	1133	273	80	54	chr3	153578766	153579193	-6020590	+	MT2A	LTR	ERVL	89	528	-5	1
1756	1729	116	25	118	chr3	153579861	153580224	-6019559	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	1
1756	427	287	111	63	chr3	153580355	153580608	-6019175	+	RLTR9A	LTR	ERVK	104	368	0	1
1756	1460	143	90	35	chr3	153581918	153582230	-6017553	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	1
1756	259	304	49	0	chr3	153583646	153583748	-6016035	+	MLT1A1	LTR	MaLR	302	408	0	1
1756	281	289	67	0	chr3	153584567	153584657	-6015126	-	MTE2b	LTR	MaLR	-9	370	275	1
1756	2974	72	20	15	chr3	153586989	153587387	-6012396	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1756	492	142	18	55	chr3	153594150	153594314	-6005469	-	RMER17C	LTR	ERVK	-137	273	116	2
1756	1386	199	152	26	chr3	153597409	153597576	-6002207	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	170	-214	2
1756	1386	199	152	26	chr3	153597609	153597782	-6002001	+	ORR1C2	LTR	MaLR	171	384	0	2
1756	734	272	106	18	chr3	153608762	153609091	-5990692	+	RMER5	LTR	ERV1	81	438	-96	2
1756	411	217	219	20	chr3	153610264	153610338	-5989445	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	478	2
1756	854	218	234	20	chr3	153610382	153610725	-5989058	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-101	477	3	2
1756	429	107	0	0	chr3	153612931	153612987	-5986796	+	ORR1A4	LTR	MaLR	274	329	0	2
1756	841	243	98	17	chr3	153613619	153613981	-5985802	+	ORR1A4	LTR	MaLR	32	364	-1	2
1756	944	159	6	29	chr3	153613981	153614154	-5985629	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	1	169	-1794	2
1756	1839	224	48	52	chr3	153614154	153614630	-5985153	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	138	2
1756	2331	115	82	5	chr3	153614669	153615045	-5984738	+	ORR1A4-int	LTR	MaLR	164	568	-1395	2
1756	457	122	19	143	chr3	153615043	153615100	-5984683	+	ORR1A4	LTR	MaLR	276	326	-41	2
1756	2263	15	114	0	chr3	153615126	153615388	-5984395	-	RLTR10B	LTR	ERVK	0	292	1	2
1756	457	122	19	143	chr3	153615921	153615967	-5983816	+	ORR1A4	LTR	MaLR	327	366	-1	2
1757	749	325	25	71	chr3	153617579	153617947	-5981836	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	351	-8	2
1757	348	327	19	9	chr3	153620465	153620570	-5979213	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-60	507	402	2
1757	299	276	46	37	chr3	153620604	153620713	-5979070	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-362	194	85	2
1757	336	293	36	130	chr3	153621203	153621450	-5978333	+	RLTR41	LTR	ERV1	161	384	-62	2
1757	614	215	23	58	chr3	153627244	153627411	-5972372	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-16	562	384	2
1757	367	224	47	159	chr3	153627424	153627655	-5972128	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	-261	273	43	2
1757	2227	63	0	103	chr3	153627663	153628014	-5971769	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	-50	315	1	2
1757	1395	157	98	38	chr3	153628572	153628837	-5970946	+	ORR1B2	LTR	MaLR	79	359	-8	2
1757	988	268	29	105	chr3	153629760	153630140	-5969643	-	MTE2a	LTR	MaLR	-17	362	12	2
1757	1620	162	129	18	chr3	153632562	153632902	-5966881	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	378	0	3
1757	1042	216	50	29	chr3	153634126	153634364	-5965419	-	MT2A	LTR	ERVL	-290	243	1	3
1757	1910	80	189	0	chr3	153635231	153635506	-5964277	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1757	898	252	117	14	chr3	153639904	153640186	-5959597	+	ORR1E	LTR	MaLR	44	354	-5	3
1757	353	398	23	51	chr3	153646617	153646834	-5952949	+	MLT1F2	LTR	MaLR	348	558	-2	3
1757	471	254	134	58	chr3	153647525	153647801	-5951982	+	RMER20B	LTR	ERVK	121	417	-210	3
1757	2241	64	48	58	chr3	153648069	153648399	-5951384	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1757	868	279	72	93	chr3	153648923	153649299	-5950484	+	MTE2a	LTR	MaLR	2	369	-10	3
1757	1000	189	139	37	chr3	153651841	153652118	-5947665	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-4	370	63	3
1757	477	191	9	28	chr3	153652313	153652421	-5947362	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-268	106	1	3
1757	2493	109	68	11	chr3	153656573	153656954	-5942829	-	RLTR9D	LTR	ERVK	0	403	1	3
1757	518	270	39	26	chr3	153660037	153660193	-5939590	-	MLT2B1	LTR	ERVL	0	567	410	3
1757	1255	189	189	16	chr3	153661646	153661964	-5937819	+	MTD	LTR	MaLR	43	415	-4	3
1757	1854	224	16	179	chr3	153664248	153664978	-5934805	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	3
1757	1332	238	86	55	chr3	153665813	153666296	-5933487	-	MT2B	LTR	ERVL	0	601	1	3
1757	411	312	76	12	chr3	153676153	153676325	-5923458	+	LTR16C	LTR	ERVL	307	489	0	3
1757	1695	139	82	15	chr3	153678867	153679025	-5920758	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-33	351	189	3
1757	1695	139	82	15	chr3	153679201	153679371	-5920412	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-196	188	1	3
1757	3473	25	5	0	chr3	153681464	153681858	-5917925	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1757	2181	207	27	10	chr3	153684542	153685029	-5914754	-	RMER5	LTR	ERV1	-39	495	1	4
1757	6500	97	97	1	chr3	153693434	153694377	-5905406	-	RLTR13D4	LTR	ERVK	0	1033	1	4
1757	3902	50	58	0	chr3	153694769	153695063	-5904720	+	RLTR1B	LTR	ERV1	1	303	-209	4
1757	3902	50	58	0	chr3	153695085	153695274	-5904509	+	RLTR1B	LTR	ERV1	304	510	-2	4
1757	2718	147	39	89	chr3	153697506	153697677	-5902106	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	402	4
1757	2718	147	39	89	chr3	153697713	153698139	-5901644	-	RMER15	LTR	ERVL	-174	401	10	4
1757	731	245	129	31	chr3	153699157	153699444	-5900339	+	RMER21B	LTR	ERV1	253	567	-275	4
1757	860	282	58	20	chr3	153701569	153701862	-5897921	+	MTE2a	LTR	MaLR	76	379	0	4
1757	3192	98	2	10	chr3	153703139	153703678	-5896105	+	RLTR1D	LTR	ERV1	62	556	-49	4
1757	2656	134	9	19	chr3	153705155	153705580	-5894203	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1757	1826	70	40	25	chr3	153706796	153706874	-5892909	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	250	4
1757	4141	109	114	35	chr3	153706874	153707557	-5892226	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	4
1757	1826	70	40	25	chr3	153707557	153707756	-5892027	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-77	249	45	4
1757	246	197	130	13	chr3	153712329	153712406	-5887377	+	MTE2a	LTR	MaLR	291	376	-3	4
1757	418	327	55	14	chr3	153714408	153714628	-5885155	+	RMER15	LTR	ERVL	347	575	0	4
1757	818	244	81	77	chr3	153718753	153719205	-5880578	-	RMER20B	LTR	ERVK	-25	602	90	4
1757	554	289	66	33	chr3	153730773	153731041	-5868742	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	308	-71	4
1757	3394	35	2	5	chr3	153733003	153733404	-5866379	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	4
1757	497	264	6	44	chr3	153733548	153733730	-5866053	-	MTEb	LTR	MaLR	-6	373	199	4
1757	406	289	65	0	chr3	153733802	153733954	-5865829	-	MTEb	LTR	MaLR	-191	188	5	4
1757	343	270	57	63	chr3	153739314	153739472	-5860311	-	MTEa	LTR	MaLR	-62	317	161	5
1757	2003	174	79	8	chr3	153746721	153747114	-5852669	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	5
1758	347	341	70	6	chr3	153747812	153747983	-5851800	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-262	182	1	5
1758	567	234	68	47	chr3	153748986	153749134	-5850649	-	MTEb	LTR	MaLR	-228	151	1	5
1758	1578	190	91	9	chr3	153758425	153758765	-5841018	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	370	-4	5
1758	939	245	51	63	chr3	153758767	153759102	-5840681	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-39	331	1	5
1758	2693	130	26	30	chr3	153759368	153759829	-5839954	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	1	5
1758	1197	261	26	10	chr3	153769992	153770305	-5829478	+	MTD	LTR	MaLR	1	318	-101	5
1758	394	334	181	22	chr3	153772526	153772841	-5826942	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	5
1758	869	239	46	54	chr3	153781991	153782268	-5817515	-	ORR1E	LTR	MaLR	-78	301	1	5
1758	344	188	17	129	chr3	153785775	153785891	-5813892	+	MT2B	LTR	ERVL	162	264	-337	5
1758	4188	167	130	15	chr3	153786481	153787295	-5812488	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	1	5
1758	3031	160	209	92	chr3	153788946	153789716	-5810067	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	1	5
1758	562	278	210	11	chr3	153789896	153790172	-5809611	+	MTEa	LTR	MaLR	6	336	-43	5
1758	837	255	115	77	chr3	153792007	153792372	-5807411	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	5
1758	872	212	33	33	chr3	153792377	153792587	-5807196	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	210	5
1758	346	219	0	0	chr3	153792609	153792682	-5807101	-	MTD	LTR	MaLR	-346	73	1	5
1758	685	274	30	49	chr3	153809628	153809947	-5789836	+	MTD	LTR	MaLR	1	323	-98	6
1758	399	204	76	59	chr3	153809961	153810095	-5789688	+	MTD	LTR	MaLR	282	405	-14	6
1758	339	296	172	34	chr3	153811784	153812022	-5787761	-	MLT1B	LTR	MaLR	-19	371	85	6
1758	752	294	81	81	chr3	153814553	153815046	-5784737	-	MLT1D	LTR	MaLR	-11	494	2	6
1758	2422	123	5	3	chr3	153816431	153816798	-5782985	-	RLTR17	LTR	ERVK	-324	368	1	6
1758	5745	191	60	67	chr3	153816798	153818327	-5781456	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	0	2842	1324	6
1758	1271	220	19	16	chr3	153818392	153818715	-5781068	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-1504	1338	1015	6
1758	2135	194	76	65	chr3	153818753	153819348	-5780435	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2232	610	10	6
1758	1152	155	133	4	chr3	153819391	153819654	-5780129	-	RLTR17	LTR	ERVK	-82	610	314	6
1758	2670	114	33	12	chr3	153827671	153828070	-5771713	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	407	0	6
1758	507	260	148	105	chr3	153831181	153831533	-5768250	+	MTD	LTR	MaLR	10	376	-3	6
1758	451	268	47	108	chr3	153832769	153832982	-5766801	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-29	379	180	6
1758	272	258	31	50	chr3	153834353	153834512	-5765271	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-755	754	599	6
1758	3528	23	5	0	chr3	153837379	153837773	-5762010	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1758	3717	62	20	16	chr3	153838924	153839418	-5760365	+	LTRIS2	LTR	ERV1	69	564	0	6
1758	447	231	139	22	chr3	153840025	153840162	-5759621	-	MTEb	LTR	MaLR	-226	153	1	6
1758	4338	161	89	62	chr3	153849567	153850529	-5749254	-	RLTR25A	LTR	ERVK	-115	988	1	6
1758	276	278	19	76	chr3	153850573	153850678	-5749105	+	MLT1A1	LTR	MaLR	11	109	-299	6
1758	490	265	60	149	chr3	153850991	153851239	-5748544	-	MTE2a	LTR	MaLR	-153	226	1	6
1758	1954	158	19	36	chr3	153854347	153854761	-5745022	-	RMER17C	LTR	ERVK	-3	407	1	6
1758	480	274	203	61	chr3	153862445	153862756	-5737027	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	5	6
1758	947	218	195	30	chr3	153870107	153870277	-5729506	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-2	368	145	7
1758	947	218	195	30	chr3	153870306	153870437	-5729346	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-226	144	17	7
1758	251	216	46	149	chr3	153875987	153876074	-5723709	+	MT2B	LTR	ERVL	180	257	-344	7
1758	1720	197	125	60	chr3	153876459	153876978	-5722805	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	1	7
219	238	330	33	82	chr3	153878423	153878545	-5721238	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	77	7
1759	913	243	89	140	chr3	153878729	153878891	-5720892	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	152	-227	7
1759	913	243	89	140	chr3	153878914	153879076	-5720707	+	MTE2a	LTR	MaLR	153	334	-45	7
1759	913	243	89	140	chr3	153879268	153879335	-5720448	+	MTE2a	LTR	MaLR	335	377	-2	7
1759	1090	140	52	24	chr3	153879810	153880059	-5719724	+	RMER17A2	LTR	ERVK	214	469	-437	7
1759	2013	171	72	18	chr3	153887570	153887958	-5711825	+	MTC	LTR	MaLR	13	421	0	7
1759	846	263	95	38	chr3	153890911	153891227	-5708556	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	334	-45	7
1759	2956	38	0	11	chr3	153923860	153924210	-5675573	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	8
1759	292	245	62	21	chr3	153926307	153926403	-5673380	-	RLTR24	LTR	ERV1	-80	449	350	8
1759	273	307	0	0	chr3	153926625	153926700	-5673083	-	RLTR24	LTR	ERV1	-454	75	1	8
1759	300	291	156	8	chr3	153927383	153927511	-5672272	-	MLT1A	LTR	MaLR	-225	149	3	8
1759	2371	94	22	0	chr3	153936009	153936329	-5663454	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	8
1759	2682	126	9	12	chr3	153940226	153940645	-5659138	+	MTC	LTR	MaLR	1	418	-3	8
1759	341	163	34	79	chr3	153943397	153943437	-5656346	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	338	8
1759	2038	147	73	6	chr3	153943437	153943780	-5656003	+	ORR1B2	LTR	MaLR	2	367	0	8
1759	515	237	316	51	chr3	153943780	153944078	-5655705	-	MTD	LTR	MaLR	-38	381	1	8
1759	3156	68	5	0	chr3	153945090	153945486	-5654297	+	MTB	LTR	MaLR	1	398	-2	8
1759	1042	260	164	3	chr3	153950768	153951092	-5648691	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	378	-1	8
1759	934	318	77	3	chr3	153952060	153952398	-5647385	-	MTD	LTR	MaLR	-39	380	18	8
1759	232	337	0	0	chr3	153953975	153954058	-5645725	+	LTR79	LTR	ERVL	317	399	-128	8
1759	744	251	61	34	chr3	153959814	153960126	-5639657	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	40	8
1759	1316	238	35	80	chr3	153964081	153964456	-5635327	+	ORR1E	LTR	MaLR	2	359	0	8
1759	676	312	47	31	chr3	153965091	153965349	-5634434	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	104	8
1759	1296	169	37	98	chr3	153978545	153978873	-5620910	+	RMER15	LTR	ERVL	1	308	-267	8
1759	1959	144	72	70	chr3	153978956	153979359	-5620424	+	RMER15	LTR	ERVL	169	572	-3	8
1759	698	130	79	7	chr3	154009439	154009578	-5590205	+	RMER15	LTR	ERVL	6	154	-421	1
219	326	148	198	0	chr3	154009578	154009659	-5590124	+	RMER15-int	LTR	ERVL	26	122	-4877	1
1760	438	190	0	12	chr3	154009983	154010068	-5589715	+	RMER15	LTR	ERVL	3	86	-489	1
1760	372	20	20	0	chr3	154011911	154011960	-5587823	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-5	341	292	2
1760	345	0	0	0	chr3	154011959	154012000	-5587783	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	332	24	0	0	chr3	154011999	154012040	-5587743	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	345	0	0	0	chr3	154012039	154012080	-5587703	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	345	0	0	0	chr3	154012079	154012120	-5587663	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	345	0	0	0	chr3	154012119	154012160	-5587623	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	345	0	0	0	chr3	154012160	154012201	-5587582	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	345	0	0	0	chr3	154012200	154012241	-5587542	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	332	24	0	0	chr3	154012240	154012281	-5587502	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	332	24	0	0	chr3	154012280	154012321	-5587462	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	332	24	0	0	chr3	154012320	154012361	-5587422	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	332	24	0	0	chr3	154012360	154012401	-5587382	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	292	2
1760	323	25	0	0	chr3	154012400	154012440	-5587343	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	293	2
1760	1971	46	0	15	chr3	154012440	154012706	-5587077	-	ORR1A1	LTR	MaLR	-14	332	71	2
1760	3140	17	0	0	chr3	154016346	154016692	-5583091	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	3
1760	4180	203	55	65	chr3	154022227	154023342	-5576441	+	RLTR25A	LTR	ERVK	1	1103	0	4
1760	2248	104	3	74	chr3	154031057	154031409	-5568374	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1760	984	159	270	30	chr3	154031800	154031953	-5567830	-	RMER19B	LTR	ERVK	-232	379	160	6
1760	2162	86	3	151	chr3	154031953	154032004	-5567779	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	286	6
1760	2162	86	3	151	chr3	154032198	154032530	-5567253	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-42	285	1	6
1760	984	145	298	33	chr3	154032530	154032632	-5567151	-	RMER19B	LTR	ERVK	-743	159	1	6
1760	2378	117	106	36	chr3	154033748	154034192	-5565591	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	7
1760	641	248	126	78	chr3	154036533	154036804	-5562979	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	560	277	7
1760	1279	152	267	24	chr3	154055750	154055941	-5543842	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	157	1
1760	1279	152	267	24	chr3	154056055	154056193	-5543590	-	RMER17C	LTR	ERVK	-254	156	1	1
1760	227	326	40	10	chr3	154056424	154056523	-5543260	-	LTR37A	LTR	ERV1	-324	102	1	1
1760	2431	135	89	18	chr3	154059681	154060074	-5539709	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	1
1760	493	239	37	7	chr3	154060805	154060940	-5538843	+	MLT2F	LTR	ERVL	1	139	-524	1
1760	298	270	80	7	chr3	154063433	154063571	-5536212	+	MLT1H-int	LTR	MaLR	384	531	-878	1
1760	237	217	87	0	chr3	154073231	154073300	-5526483	+	MTEa	LTR	MaLR	293	367	-12	1
1760	3103	157	42	50	chr3	154075070	154075714	-5524069	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	639	-3	1
1760	270	253	93	62	chr3	154077487	154077584	-5522199	-	MTEa	LTR	MaLR	-15	364	265	1
1760	398	331	15	0	chr3	154079356	154079486	-5520297	-	MTEa	LTR	MaLR	-162	217	86	1
1760	378	228	0	29	chr3	154084473	154084585	-5515198	-	ORR1E	LTR	MaLR	-253	106	4	1
1760	411	272	305	39	chr3	154091283	154091486	-5508297	-	ORR1E	LTR	MaLR	-4	355	99	1
1760	500	276	22	0	chr3	154091501	154091635	-5508148	-	ORR1E	LTR	MaLR	-222	137	1	1
1760	298	307	58	19	chr3	154092106	154092262	-5507521	-	MLT1B	LTR	MaLR	-16	374	213	1
1760	3264	60	2	0	chr3	154096323	154096722	-5503061	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1760	1427	243	55	8	chr3	154097490	154097872	-5501911	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	5	1
1760	3245	50	7	10	chr3	154098506	154098914	-5500869	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	1
1760	631	196	14	14	chr3	154102450	154102590	-5497193	+	MTD	LTR	MaLR	42	181	-238	2
1760	301	293	179	28	chr3	154108239	154108418	-5491365	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-36	329	124	2
1760	6714	108	72	42	chr3	154111225	154112307	-5487476	+	RLTR13D3	LTR	ERVK	1	1114	0	2
1760	252	200	0	16	chr3	154113762	154113823	-5485960	-	RMER15	LTR	ERVL	-113	462	403	2
1760	1366	139	76	15	chr3	154117863	154118126	-5481657	+	MTC	LTR	MaLR	1	279	-142	2
1760	276	111	0	0	chr3	154118126	154118171	-5481612	+	MTC	LTR	MaLR	235	279	-142	2
1760	267	140	0	0	chr3	154118166	154118216	-5481567	+	MTC	LTR	MaLR	230	279	-142	2
1760	571	236	25	101	chr3	154118211	154118409	-5481374	+	MTC	LTR	MaLR	230	412	-9	2
1760	1040	196	44	119	chr3	154121191	154121509	-5478274	+	MTD	LTR	MaLR	13	306	-113	2
1760	338	304	189	19	chr3	154133667	154133801	-5465982	+	MTE-int	LTR	MaLR	557	692	-888	2
1760	338	304	189	19	chr3	154133832	154134015	-5465768	+	MTE-int	LTR	MaLR	693	927	-653	2
1760	574	279	166	74	chr3	154134033	154134370	-5465413	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	12	2
1760	848	266	246	24	chr3	154134379	154134830	-5464953	+	MTE-int	LTR	MaLR	941	1491	-89	2
27	1429	181	23	46	chr3	154140437	154140776	-5459007	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	419	2
1761	1611	86	16	5	chr3	154140853	154141110	-5458673	-	RMER17A	LTR	ERVK	-333	418	61	2
1761	2326	170	39	2	chr3	154151435	154151841	-5447942	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1761	2676	155	39	52	chr3	154152975	154153067	-5446716	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	3	96	-457	2
1761	2676	155	39	52	chr3	154153094	154153559	-5446224	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	97	552	-1	2
1761	875	279	31	81	chr3	154153608	154153967	-5445816	-	MTE2b	LTR	MaLR	0	379	39	2
1761	4160	105	93	0	chr3	154155615	154156273	-5443510	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	19	2
1761	297	325	68	72	chr3	154156292	154156613	-5443170	-	LTR37B	LTR	ERV1	-138	330	11	2
1761	286	318	104	71	chr3	154157347	154157450	-5442333	+	MTEa	LTR	MaLR	20	129	-290	2
1761	451	302	112	41	chr3	154157654	154157919	-5441864	+	MTEa	LTR	MaLR	75	397	-22	2
1761	1865	185	128	68	chr3	154184049	154184547	-5415236	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	528	0	3
1761	412	163	28	0	chr3	154198659	154198745	-5401038	+	MLT1A	LTR	MaLR	279	400	-8	3
1761	1644	135	106	0	chr3	154200361	154200488	-5399295	+	ORR1C1	LTR	MaLR	23	163	-215	3
1761	1644	135	106	0	chr3	154200547	154200730	-5399053	+	ORR1C1	LTR	MaLR	164	365	-13	3
1761	691	307	91	81	chr3	154207108	154207281	-5392502	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-78	478	286	3
1761	691	307	91	81	chr3	154207717	154208014	-5391769	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-271	285	3	3
1761	1046	264	71	33	chr3	154209152	154209203	-5390580	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	326	3
1761	1046	264	71	33	chr3	154209275	154209588	-5390195	-	MTEb	LTR	MaLR	-54	325	2	3
1761	536	286	55	6	chr3	154222169	154222334	-5377449	+	MLT1A0	LTR	MaLR	41	213	-152	3
1761	691	294	105	15	chr3	154225656	154225922	-5373861	-	MTD	LTR	MaLR	-128	291	2	3
1761	2110	153	201	38	chr3	154237552	154237996	-5361787	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	524	-60	3
1761	2110	153	201	38	chr3	154238059	154238116	-5361667	+	MT2B2	LTR	ERVL	525	583	-1	3
1761	482	328	42	82	chr3	154238533	154238839	-5360944	-	ORR1E	LTR	MaLR	-55	304	11	3
1761	1559	241	94	18	chr3	154238981	154239471	-5360312	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	527	0	4
1761	532	172	141	0	chr3	154241985	154242160	-5357623	+	MTEa	LTR	MaLR	1	261	-118	4
1761	691	277	95	37	chr3	154253686	154254012	-5345771	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	345	-14	4
1761	1995	168	81	14	chr3	154254803	154255172	-5344611	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
1761	294	262	100	59	chr3	154255513	154255683	-5344100	+	MLT1B	LTR	MaLR	69	245	-145	4
1761	3755	138	101	7	chr3	154262322	154263008	-5336775	+	RMER12	LTR	ERVK	1	1169	-235	4
1761	605	204	7	93	chr3	154263088	154263239	-5336544	+	RMER12	LTR	ERVK	1009	1146	-176	4
1761	1230	175	34	26	chr3	154264425	154264700	-5335083	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	0	1848	1590	4
1761	226	304	34	82	chr3	154264775	154264922	-5334861	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-803	1045	906	4
1761	3928	150	48	10	chr3	154265001	154265723	-5334060	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1098	750	1	4
1761	982	169	11	37	chr3	154265723	154265908	-5333875	+	RMER12	LTR	ERVK	1143	1322	0	4
1761	416	214	12	23	chr3	154266419	154266505	-5333278	+	RMER15	LTR	ERVL	356	440	-135	4
1761	1600	164	85	0	chr3	154268521	154268802	-5330981	-	MTC	LTR	MaLR	-116	305	1	4
1761	830	179	75	15	chr3	154268802	154269001	-5330782	-	MTC-int	LTR	MaLR	0	1258	1048	4
1761	2847	158	147	16	chr3	154270649	154271261	-5328522	+	RMER6A	LTR	ERVK	65	756	0	4
1762	1204	266	105	22	chr3	154273383	154273794	-5325989	+	RMER5	LTR	ERV1	79	523	-11	4
1762	1893	153	46	110	chr3	154274762	154275142	-5324641	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	29	4
1762	1893	153	46	110	chr3	154275267	154275296	-5324487	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-356	28	1	4
1762	722	224	95	120	chr3	154275296	154275698	-5324085	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-7	367	1	4
1762	2223	217	106	19	chr3	154286837	154287260	-5312523	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	1	468	-95	4
1762	2223	217	106	19	chr3	154287317	154287411	-5312372	+	RLTR20B1	LTR	ERVK	469	562	-1	4
1762	530	267	81	109	chr3	154288204	154288477	-5311306	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-8	389	109	4
1762	313	293	98	33	chr3	154289025	154289240	-5310543	-	RLTR15	LTR	ERVK	-25	334	106	4
1762	258	235	92	128	chr3	154289248	154289443	-5310340	-	RLTR15	LTR	ERVK	-171	188	1	4
1762	277	167	37	0	chr3	154290801	154290855	-5308928	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	324	4
1762	921	156	105	21	chr3	154290852	154291042	-5308741	+	MTD	LTR	MaLR	200	405	-14	4
1762	359	269	106	0	chr3	154293330	154293434	-5306349	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-6	359	245	4
1762	309	278	108	36	chr3	154293500	154293750	-5306033	-	RMER17C	LTR	ERVK	-60	350	83	4
1762	6965	60	23	2	chr3	154293920	154294795	-5304988	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	893	0	4
1762	1241	172	13	13	chr3	154297748	154297972	-5301811	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	224	-150	4
1762	1369	95	0	0	chr3	154300227	154300417	-5299366	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	197	4
1762	1367	269	72	27	chr3	154300477	154300963	-5298820	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-20	508	1	4
1762	727	184	49	8	chr3	154300963	154301126	-5298657	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-210	160	1	4
1762	272	219	42	11	chr3	154313556	154313745	-5286038	-	RMER17C	LTR	ERVK	-133	277	83	5
1762	543	311	133	81	chr3	154319877	154320222	-5279561	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	369	-1	5
1762	806	301	110	39	chr3	154321427	154321808	-5277975	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	1	5
1762	1576	168	263	6	chr3	154324183	154324518	-5275265	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	5
1762	2272	161	20	40	chr3	154324535	154324937	-5274846	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1762	300	225	8	105	chr3	154325686	154325810	-5273973	+	ORR1E	LTR	MaLR	68	179	-180	5
1762	3004	52	31	15	chr3	154332783	154333175	-5266608	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	3	5
1762	512	286	80	109	chr3	154333363	154333701	-5266082	+	MLT1B	LTR	MaLR	59	386	-4	5
1762	1066	218	147	20	chr3	154333769	154334124	-5265659	-	RMER17B	LTR	ERVK	-5	953	554	5
1762	1580	178	55	14	chr3	154334146	154334493	-5265290	-	RMER17B	LTR	ERVK	-597	361	1	5
1762	563	290	44	64	chr3	154334587	154334885	-5264898	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-36	329	38	5
1762	2144	92	14	28	chr3	154335081	154335438	-5264345	+	RLTR15	LTR	ERVK	8	359	0	5
1762	989	242	39	43	chr3	154336369	154336649	-5263134	-	MTE2b	LTR	MaLR	-67	312	34	5
1762	233	303	39	39	chr3	154339000	154339103	-5260680	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-451	103	1	5
1762	623	263	83	69	chr3	154340531	154340974	-5258809	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-24	504	1	5
1762	796	296	116	13	chr3	154353983	154354301	-5245482	-	MTE2b	LTR	MaLR	-21	358	8	5
1762	348	256	33	104	chr3	154354324	154354571	-5245212	+	MLT-int	LTR	MaLR	180	410	-961	5
1762	431	291	93	59	chr3	154370102	154370456	-5229327	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	5	5
1762	367	370	101	25	chr3	154370526	154370881	-5228902	-	MLT1J	LTR	MaLR	-129	383	2	5
1762	672	326	120	41	chr3	154371571	154372038	-5227745	-	LTR33	LTR	ERVL	0	515	12	5
1762	1703	201	126	11	chr3	154386120	154386598	-5213185	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	1	5
1762	434	319	151	34	chr3	154391859	154392183	-5207600	-	MTEa	LTR	MaLR	-10	369	8	6
1762	734	286	94	12	chr3	154393067	154393386	-5206397	+	ORR1E	LTR	MaLR	10	354	-5	6
1763	301	109	0	0	chr3	154422420	154422466	-5177317	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	329	6
1763	481	275	81	39	chr3	154422466	154422785	-5176998	-	MT2A	LTR	ERVL	0	584	94	6
1763	518	207	17	25	chr3	154422793	154422912	-5176871	-	MT2A	LTR	ERVL	-415	118	1	6
1763	688	208	264	25	chr3	154422912	154423178	-5176605	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-40	334	3	6
1763	1035	235	14	32	chr3	154423180	154423461	-5176322	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	0	1370	1095	6
1763	371	165	18	88	chr3	154423453	154423566	-5176217	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-268	106	2	6
1763	400	121	0	0	chr3	154433614	154433680	-5166103	-	ORR1A3	LTR	MaLR	0	326	261	6
1763	285	236	0	212	chr3	154433742	154433827	-5165956	-	MT2B	LTR	ERVL	-342	259	199	6
1763	2917	129	12	2	chr3	154433825	154434307	-5165476	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-1476	487	1	6
1763	2300	99	9	30	chr3	154434307	154434641	-5165142	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1763	274	280	46	21	chr3	154437681	154437821	-5161962	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-12	396	211	6
1763	512	281	16	0	chr3	154441659	154441787	-5157996	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	249	6
1763	931	259	100	11	chr3	154441819	154442088	-5157695	-	MTEa	LTR	MaLR	-86	293	1	6
1763	876	321	63	42	chr3	154442641	154443164	-5156619	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	1	6
1763	237	331	146	0	chr3	154447731	154447861	-5151922	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-69	498	350	6
1763	351	293	75	37	chr3	154447891	154448079	-5151704	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-325	195	1	6
1763	3305	50	0	8	chr3	154448426	154448825	-5150958	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	6
1763	2391	138	86	0	chr3	154452877	154453262	-5146521	-	MTC	LTR	MaLR	-3	418	1	6
1763	974	232	94	27	chr3	154486014	154486311	-5113472	+	ORR1E	LTR	MaLR	25	341	-18	7
1763	1661	212	38	27	chr3	154490994	154491367	-5108416	-	MTE2a	LTR	MaLR	-2	377	1	7
1763	2234	170	39	15	chr3	154492215	154492626	-5107157	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	7
1763	467	181	154	6	chr3	154492627	154492783	-5107000	-	MTC-int	LTR	MaLR	-1	1257	1079	7
1763	627	168	114	11	chr3	154494304	154494479	-5105304	-	MTC-int	LTR	MaLR	-142	1116	924	7
1763	1030	156	53	65	chr3	154494490	154494737	-5105046	-	MTC	LTR	MaLR	-177	244	1	7
1763	329	326	26	78	chr3	154499842	154499995	-5099788	-	MLT1E	LTR	MaLR	-12	641	497	7
1763	682	325	117	28	chr3	154527534	154527927	-5071856	+	MLT2B2	LTR	ERVL	24	451	-64	3
1764	652	240	304	11	chr3	154544428	154544714	-5055069	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	5
1764	604	283	41	136	chr3	154546400	154546595	-5053188	+	MTD	LTR	MaLR	1	197	-222	5
1764	604	283	41	136	chr3	154546638	154546855	-5052928	+	MTD	LTR	MaLR	198	374	-45	5
1764	1271	223	111	26	chr3	154553565	154553654	-5046129	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	92	-282	6
1764	1509	198	126	0	chr3	154553654	154553988	-5045795	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	376	-2	6
1764	1271	223	111	26	chr3	154553988	154554239	-5045544	+	ORR1D1	LTR	MaLR	93	370	-4	6
1764	392	266	29	86	chr3	154556163	154556303	-5043480	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	379	248	7
1764	443	224	49	17	chr3	154556532	154556653	-5043130	-	ORR1E	LTR	MaLR	-244	126	1	7
1764	330	387	47	23	chr3	154562444	154562788	-5036995	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	352	-18	8
1764	752	306	135	54	chr3	154569039	154569388	-5030395	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	8
1764	680	271	206	41	chr3	154569469	154569785	-5029998	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	3	8
1764	1026	253	119	35	chr3	154575994	154576313	-5023470	-	MTD	LTR	MaLR	-56	363	18	8
1764	743	86	29	112	chr3	154578999	154579169	-5020614	-	RMER17B	LTR	ERVK	-495	463	308	9
1764	640	281	122	69	chr3	154582556	154582851	-5016932	+	ORR1D2	LTR	MaLR	34	378	-1	9
1764	694	277	75	53	chr3	154588844	154589164	-5010619	+	RMER5	LTR	ERV1	208	534	0	1
1764	466	260	81	14	chr3	154596591	154596739	-5003044	-	MTD	LTR	MaLR	-252	167	10	1
1764	4208	143	62	25	chr3	154597647	154598376	-5001407	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	756	0	1
1764	1530	228	54	21	chr3	154607449	154607821	-4991962	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	1
1764	729	317	63	21	chr3	154611357	154611644	-4988139	+	MTD	LTR	MaLR	1	299	-120	1
1764	618	249	76	22	chr3	154611644	154611829	-4987954	-	MTD-int	LTR	MaLR	-1063	195	1	1
1764	268	307	45	0	chr3	154611842	154611930	-4987853	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	314	1
1764	289	272	21	21	chr3	154611932	154612026	-4987757	-	MTC	LTR	MaLR	-315	106	13	1
1764	1202	288	37	11	chr3	154618670	154619046	-4980737	+	RMER5	LTR	ERV1	145	530	-4	1
1764	447	358	116	34	chr3	154620778	154621131	-4978652	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	382	-8	1
1764	652	302	82	61	chr3	154621984	154622312	-4977471	-	MTEb	LTR	MaLR	-39	340	6	1
1764	1042	276	47	58	chr3	154623230	154623611	-4976172	+	MTEa	LTR	MaLR	1	377	-2	1
1764	2355	227	44	91	chr3	154626082	154626717	-4973066	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	605	-6	1
1764	988	325	62	14	chr3	154627052	154627423	-4972360	-	MTD	LTR	MaLR	-30	389	1	1
1764	487	236	39	173	chr3	154632722	154632901	-4966882	-	MTE2a	LTR	MaLR	-216	163	9	1
1764	226	361	141	27	chr3	154642857	154643113	-4956670	+	ORR1D2	LTR	MaLR	21	305	-65	1
1764	332	311	82	33	chr3	154643288	154643471	-4956312	-	MER34A1	LTR	ERV1	-395	192	1	1
1764	2109	211	36	15	chr3	154649038	154649670	-4950113	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	1	1
1764	455	321	62	38	chr3	154650845	154651136	-4948647	+	MER54A	LTR	ERVL	97	394	-507	1
1764	315	289	31	10	chr3	154651148	154651246	-4948537	+	MER54A	LTR	ERVL	631	730	-171	1
1764	1372	121	78	12	chr3	154651439	154651682	-4948101	-	MTC	LTR	MaLR	-162	259	1	1
1764	805	205	12	12	chr3	154651827	154652000	-4947783	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	235	407	0	1
1764	3249	182	68	26	chr3	154656040	154656701	-4943082	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	2	1
1764	2160	123	6	0	chr3	154657291	154657607	-4942176	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	1
1764	808	291	56	15	chr3	154660098	154660367	-4939416	+	MTEb	LTR	MaLR	99	378	-1	1
1764	2055	202	65	10	chr3	154660403	154660802	-4938981	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1765	296	328	40	30	chr3	154672860	154673094	-4926689	+	MLT1G-int	LTR	MaLR	1117	1328	-59	1
1765	702	327	88	0	chr3	154673116	154673367	-4926416	+	MLT1G	LTR	MaLR	3	275	-316	1
1765	532	309	38	92	chr3	154685576	154685890	-4913893	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	297	-93	2
1765	1897	188	147	20	chr3	154688274	154688456	-4911327	+	RMER5	LTR	ERV1	1	206	-328	2
1765	1897	188	147	20	chr3	154688679	154688951	-4910832	+	RMER5	LTR	ERV1	207	513	-21	2
1765	1217	259	138	0	chr3	154694612	154694937	-4904846	-	MTD	LTR	MaLR	-37	382	13	2
1765	1104	236	95	36	chr3	154699412	154699785	-4899998	+	MTE2a	LTR	MaLR	2	379	0	2
1765	384	256	92	8	chr3	154703032	154703162	-4896621	-	RMER5	LTR	ERV1	-179	355	215	2
1765	507	245	64	38	chr3	154703190	154703347	-4896436	-	RMER5	LTR	ERV1	-80	454	294	2
1765	660	276	48	44	chr3	154703475	154703702	-4896081	-	RMER5	LTR	ERV1	-256	278	51	2
1765	1832	215	51	8	chr3	154704552	154704941	-4894842	+	MTD	LTR	MaLR	1	406	-13	2
1765	977	174	384	40	chr3	154706445	154706718	-4893065	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	367	1	2
1765	5957	202	61	35	chr3	154706718	154708120	-4891663	-	ORR1B2-int	LTR	MaLR	0	1509	71	2
1765	2329	133	17	0	chr3	154708156	154708509	-4891274	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-8	359	1	2
1765	1874	204	48	31	chr3	154716105	154716216	-4883567	+	MTC	LTR	MaLR	1	111	-310	2
1765	1874	204	48	31	chr3	154716438	154716740	-4883043	+	MTC	LTR	MaLR	112	421	0	2
1765	999	253	38	72	chr3	154721124	154721295	-4878488	+	MTEa	LTR	MaLR	20	195	-184	2
1765	999	253	38	72	chr3	154721369	154721516	-4878267	+	MTEa	LTR	MaLR	196	327	-52	2
1765	3702	115	155	44	chr3	154724651	154725051	-4874732	-	RMER17D2	LTR	ERVK	0	809	325	2
1765	3702	115	155	44	chr3	154725134	154725461	-4874322	-	RMER17D2	LTR	ERVK	-485	324	1	2
1765	1290	164	101	0	chr3	154729531	154729750	-4870033	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	241	-153	2
1765	2525	237	41	7	chr3	154729757	154730364	-4869419	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1	628	-881	2
1765	430	156	41	72	chr3	154730359	154730456	-4869327	+	MT2B2	LTR	ERVL	155	248	-336	2
1765	1825	199	32	11	chr3	154730443	154730813	-4868970	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	1132	1509	0	2
1765	1896	184	52	90	chr3	154730814	154731214	-4868569	+	ORR1B1	LTR	MaLR	2	386	-8	2
1765	793	84	70	7	chr3	154736562	154736705	-4863078	-	RMER17B	LTR	ERVK	-495	463	312	2
1765	314	349	116	0	chr3	154738018	154738164	-4861619	+	LTR16A	LTR	ERVL	4	166	-285	2
1765	440	278	68	0	chr3	154739331	154739464	-4860319	-	ORR1D2	LTR	MaLR	0	370	229	3
1765	2074	202	120	83	chr3	154740633	154740896	-4858887	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	421	3
1765	2074	202	120	83	chr3	154740938	154741339	-4858444	-	RMER6C	LTR	ERVK	-270	420	1	3
1765	527	167	14	0	chr3	154741385	154741496	-4858287	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	605	3
1765	3697	101	50	55	chr3	154742715	154743333	-4856450	-	RLTR33	LTR	ERVK	-61	617	3	3
1765	1086	194	18	5	chr3	154755057	154755274	-4844509	+	RLTR23	LTR	ERV1	200	419	-11	3
1765	527	240	36	58	chr3	154760162	154760299	-4839484	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	134	-240	3
1765	1902	188	31	11	chr3	154762010	154762360	-4837423	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-10	357	1	3
1765	1105	161	120	21	chr3	154762360	154762601	-4837182	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1509	1245	3
1765	2146	107	3	59	chr3	154762619	154762957	-4836826	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-8	319	1	3
1765	310	339	117	56	chr3	154770160	154770589	-4829194	-	MLT-int	LTR	MaLR	-40	1540	726	3
1765	328	291	50	109	chr3	154770627	154770828	-4828955	+	MT2B2	LTR	ERVL	175	363	-221	3
1765	406	335	66	32	chr3	154773364	154773678	-4826105	-	MER57E1	LTR	ERV1	-4	368	5	3
1765	426	357	130	32	chr3	154775084	154775423	-4824360	-	MER92B	LTR	ERV1	-180	456	85	3
1765	1303	206	143	0	chr3	154775438	154775739	-4824044	+	MTC	LTR	MaLR	3	346	-75	3
1765	226	143	58	58	chr3	154776520	154776572	-4823211	+	RMER15	LTR	ERVL	88	139	-436	3
1765	826	309	112	9	chr3	154776585	154776908	-4822875	+	RMER15	LTR	ERVL	220	575	0	3
1765	375	375	130	20	chr3	154782675	154782974	-4816809	+	MLT1E2	LTR	MaLR	140	471	-156	3
1765	234	393	140	18	chr3	154783783	154784125	-4815658	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-94	386	3	3
1765	326	319	34	17	chr3	154786146	154786264	-4813519	+	MLT1A1	LTR	MaLR	289	408	0	3
1765	548	235	153	48	chr3	154786898	154787126	-4812657	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	324	3
1765	240	204	19	0	chr3	154787294	154787348	-4812435	-	RMER15	LTR	ERVL	-520	55	1	3
1765	723	186	131	8	chr3	154787920	154788202	-4811581	-	RMER17B	LTR	ERVK	-518	440	16	3
1765	2858	189	46	18	chr3	154791422	154791982	-4807801	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	0	577	2	3
1765	227	239	44	140	chr3	154793157	154793293	-4806490	+	LTRIS2	LTR	ERV1	52	174	-390	3
1766	281	281	82	10	chr3	154804256	154804353	-4795430	-	RMER20B	LTR	ERVK	-205	422	319	3
1766	278	297	59	33	chr3	154822496	154822649	-4777134	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-5	523	367	4
1766	524	253	139	29	chr3	154822732	154822950	-4776833	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-315	253	8	4
1766	891	264	72	114	chr3	154826469	154826845	-4772938	+	MTE2a	LTR	MaLR	13	372	-7	4
1766	6479	60	1	21	chr3	154829470	154830309	-4769474	-	RLTR13B2	LTR	ERVK	0	822	1	4
1766	755	333	67	32	chr3	154832089	154832430	-4767353	+	MT2A	LTR	ERVL	181	533	0	4
1766	2036	160	0	22	chr3	154833063	154833421	-4766362	-	RLTR11B	LTR	ERVK	0	453	104	4
1766	241	206	46	31	chr3	154840618	154840683	-4759100	+	MER54B	LTR	ERVL	43	108	-685	4
1766	1827	210	75	71	chr3	154854453	154854999	-4744784	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	611	0	4
1766	1638	216	58	42	chr3	154862454	154862960	-4736823	-	RMER19C	LTR	ERVK	-250	652	138	4
1766	401	296	137	14	chr3	154862994	154863277	-4736506	+	MLT1A0	LTR	MaLR	25	343	-22	4
1766	486	174	54	0	chr3	154865128	154865220	-4734563	+	ORR1C2	LTR	MaLR	282	378	-6	4
1766	552	328	86	73	chr3	154865831	154866226	-4733557	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	6	4
1766	2066	196	115	9	chr3	154867306	154867835	-4731948	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	585	0	4
1766	286	321	42	219	chr3	154872347	154872551	-4727232	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	170	-209	4
1766	286	321	42	219	chr3	154872663	154872745	-4727038	+	MTE2a	LTR	MaLR	171	236	-143	4
1766	229	352	90	27	chr3	154874181	154874292	-4725491	-	ORR1E	LTR	MaLR	-167	192	75	4
1766	944	252	148	133	chr3	154885718	154886622	-4713161	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	2427	3344	-2793	4
1766	1504	212	48	65	chr3	154886718	154887241	-4712542	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	3556	3965	-2172	4
1766	286	219	0	76	chr3	154887284	154887363	-4712420	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4037	4109	-2028	4
1766	660	190	32	84	chr3	154887436	154887591	-4712192	+	RLTR19-int	LTR	ERVK	4128	4274	-1863	4
1766	520	256	44	67	chr3	154888890	154889070	-4710713	-	RMER12	LTR	ERVK	-2	1320	1145	4
1766	3531	243	152	58	chr3	154889423	154889749	-4710034	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-213	1635	1359	4
1766	3531	237	156	51	chr3	154889805	154891005	-4708778	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-490	1358	2	4
1766	291	372	53	35	chr3	154893810	154893980	-4705803	+	MLT1C	LTR	MaLR	292	464	-3	5
1766	1132	199	153	6	chr3	154896797	154897110	-4702673	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	5
1766	1150	257	28	18	chr3	154901619	154901960	-4697823	-	MTD	LTR	MaLR	0	421	79	5
1766	3229	38	8	13	chr3	154905319	154905717	-4694066	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1766	8383	61	10	2	chr3	154905717	154906806	-4692977	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	5
1766	3104	61	8	0	chr3	154906806	154907199	-4692584	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	5
1766	265	368	56	65	chr3	154907431	154907646	-4692137	+	MER74C	LTR	ERVL	39	251	-209	5
1766	303	296	30	22	chr3	154908204	154908313	-4691470	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	405	603	-768	5
1766	299	331	66	26	chr3	154909051	154909203	-4690580	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	866	1023	-466	5
1766	1460	215	47	44	chr3	154912569	154912910	-4686873	+	RMER19B	LTR	ERVK	305	646	-256	5
1766	329	365	42	51	chr3	154912865	154913079	-4686704	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-67	613	402	5
1766	654	238	52	21	chr3	154918805	154918998	-4680785	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-169	209	11	5
1766	913	199	18	6	chr3	154919511	154919678	-4680105	+	ORR1C1	LTR	MaLR	202	370	-8	5
1767	258	164	115	0	chr3	154933943	154934004	-4665779	+	MLT1I	LTR	MaLR	340	407	-4	5
1767	465	325	57	24	chr3	154941716	154941927	-4657856	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	340	5
1767	647	340	44	40	chr3	154945412	154945685	-4654098	-	MTEa	LTR	MaLR	-68	311	38	5
1767	1264	266	96	30	chr3	154949824	154950188	-4649595	+	MTD	LTR	MaLR	1	388	-31	5
1767	632	282	19	0	chr3	154950229	154950385	-4649398	+	MTD-int	LTR	MaLR	1	159	-1099	5
1767	723	283	15	25	chr3	154950367	154950570	-4649213	+	MTD	LTR	MaLR	219	419	0	5
1767	439	330	95	71	chr3	154975954	154976248	-4623535	+	MLT1A0	LTR	MaLR	64	364	-1	6
1767	535	322	68	96	chr3	154978668	154979053	-4620730	+	MTD	LTR	MaLR	28	401	-18	6
1767	2230	158	19	81	chr3	154980703	154981184	-4618599	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	451	-2	6
1767	376	333	47	0	chr3	154988480	154988630	-4611153	+	LTR16C	LTR	ERVL	314	470	-19	6
1767	1648	173	51	3	chr3	154989566	154989880	-4609903	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	6
1767	363	363	24	6	chr3	155000168	155000337	-4599446	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-11	397	226	1
1767	376	290	94	27	chr3	155005430	155005579	-4594204	+	MER34A1	LTR	ERV1	429	587	0	1
1767	267	255	88	39	chr3	155019766	155019868	-4579915	+	MLT1H	LTR	MaLR	70	176	-373	2
1767	397	347	116	42	chr3	155021548	155021909	-4577874	-	LTR16B2	LTR	ERVL	-68	394	7	2
1767	337	353	39	13	chr3	155022309	155022464	-4577319	-	MLT1G	LTR	MaLR	-19	572	414	2
1767	1333	215	9	9	chr3	155025903	155026173	-4573610	+	ORR1C1	LTR	MaLR	1	257	-110	3
1767	1074	265	17	131	chr3	155026323	155026464	-4573319	+	ORR1C1	LTR	MaLR	258	365	-2	3
1767	410	141	39	0	chr3	155026466	155026544	-4573239	+	ORR1C1-int	LTR	MaLR	1	81	-1289	3
1767	276	242	0	15	chr3	155026555	155026622	-4573161	+	ORR1B1	LTR	MaLR	329	394	0	3
1767	1161	239	102	17	chr3	155031705	155032038	-4567745	+	MTD	LTR	MaLR	46	405	-14	4
1767	2179	178	158	32	chr3	155033633	155034127	-4565656	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	347	5
1767	3221	68	0	0	chr3	155034751	155035151	-4564632	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1767	508	232	38	76	chr3	155046347	155046557	-4553226	-	RMER17C	LTR	ERVK	-139	271	70	6
1767	1777	197	20	11	chr3	155048729	155049078	-4550705	+	ORR1B1	LTR	MaLR	35	386	-8	6
1767	246	252	15	146	chr3	155050399	155050529	-4549254	-	MT2B	LTR	ERVL	-338	263	151	7
1768	346	376	108	32	chr3	155074148	155074464	-4525319	+	MLT1E2	LTR	MaLR	101	440	-187	1
1768	611	352	73	94	chr3	155075298	155075540	-4524243	+	MLT1F2	LTR	MaLR	1	251	-309	1
1768	611	352	73	94	chr3	155075579	155075897	-4523886	+	MLT1F2	LTR	MaLR	252	549	-11	1
1768	412	291	189	57	chr3	155077619	155077657	-4522126	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	321	1
1768	412	291	189	57	chr3	155077688	155077966	-4521817	-	ORR1E	LTR	MaLR	-39	320	2	1
1768	2362	168	149	32	chr3	155083319	155083842	-4515941	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	584	0	1
1768	1114	216	54	30	chr3	155084397	155084706	-4515077	+	MTD	LTR	MaLR	95	405	-14	1
1768	652	212	8	0	chr3	155084770	155084888	-4514895	+	ETnERV2-int	LTR	ERVK	7070	7188	-218	1
1768	246	256	31	62	chr3	155089595	155089724	-4510059	+	RMER17A2	LTR	ERVK	249	373	-533	1
1768	821	260	124	56	chr3	155094157	155094512	-4505271	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	1
1768	609	348	147	28	chr3	155098610	155098997	-4500786	+	MER70A	LTR	ERVL	2	434	-38	1
1768	1274	254	85	30	chr3	155103906	155104272	-4495511	+	MTD	LTR	MaLR	13	398	-21	1
1768	304	313	58	50	chr3	155107260	155107381	-4492402	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	374	253	1
1768	336	308	80	84	chr3	155107395	155107608	-4492175	-	ORR1E	LTR	MaLR	-121	238	27	1
1768	265	259	124	44	chr3	155126048	155126161	-4473622	+	MER21B	LTR	ERV1	1	122	-741	1
1768	672	274	131	67	chr3	155126331	155126628	-4473155	-	MTD	LTR	MaLR	-18	401	86	1
1768	233	346	30	15	chr3	155131049	155131181	-4468602	-	LTR80A	LTR	ERVL	-2	581	448	1
1768	700	348	98	18	chr3	155132940	155133005	-4466778	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	350	1
1768	700	348	98	18	chr3	155133065	155133385	-4466398	-	MTC	LTR	MaLR	-72	349	6	1
1768	3923	117	20	43	chr3	155135411	155136064	-4463719	-	RMER17B	LTR	ERVK	0	958	321	1
1768	371	217	0	115	chr3	155140306	155140410	-4459373	+	MT2B	LTR	ERVL	173	264	-337	1
1768	225	270	32	105	chr3	155146341	155146465	-4453318	+	LTR45C	LTR	ERV1	366	480	-59	1
1768	277	450	28	20	chr3	155147396	155147650	-4452133	+	LTR16A	LTR	ERVL	176	431	-20	1
1768	1154	213	89	38	chr3	155150248	155150561	-4449222	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-45	329	1	1
1768	337	304	48	36	chr3	155151261	155151429	-4448354	-	MLT2B2	LTR	ERVL	0	554	384	2
1768	656	289	114	31	chr3	155154755	155155105	-4444678	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	2
1768	1261	271	126	36	chr3	155167860	155168373	-4431410	-	RLTR20A2	LTR	ERVK	0	578	1	2
1768	3986	154	63	98	chr3	155173236	155174108	-4425675	-	RMER21B	LTR	ERV1	0	842	1	2
1768	355	224	23	12	chr3	155187465	155187551	-4412232	-	ORR1B2	LTR	MaLR	0	394	308	2
27	1245	202	81	11	chr3	155189058	155189318	-4410465	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-89	278	1	2
1769	252	314	29	88	chr3	155198509	155198645	-4401138	-	MTEb	LTR	MaLR	-2	377	250	2
1769	936	298	37	6	chr3	155206507	155206855	-4392928	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	2
1769	2354	180	60	6	chr3	155219061	155219542	-4380241	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	507	-17	2
1769	275	360	93	57	chr3	155252116	155252416	-4347367	+	ORR1E	LTR	MaLR	44	354	-5	3
1769	346	323	103	27	chr3	155253001	155253224	-4346559	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	336	3
1769	1339	222	14	0	chr3	155254249	155254524	-4345259	-	MTD	LTR	MaLR	-129	290	12	3
1769	1441	217	43	81	chr3	155277510	155277976	-4321807	+	RMER16	LTR	ERVK	3	533	0	3
1769	518	274	45	37	chr3	155278349	155278595	-4321188	-	RLTR15	LTR	ERVK	-111	248	1	3
1769	4625	217	74	7	chr3	155278596	155279756	-4320027	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-2	6548	5311	3
1769	565	294	5	43	chr3	155279764	155279952	-4319831	-	RMER4A	LTR	ERVK	-35	431	251	3
1769	1467	261	33	43	chr3	155279952	155280412	-4319371	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1424	5126	4672	3
1769	427	286	62	78	chr3	155280823	155281145	-4318638	-	RLTR15	LTR	ERVK	-9	350	34	3
1769	471	207	0	0	chr3	155286164	155286246	-4313537	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	82	-297	3
1769	2365	104	33	24	chr3	155286264	155286672	-4313111	-	RMER16	LTR	ERVK	-31	502	1	3
1769	734	324	37	15	chr3	155286683	155286956	-4312827	+	MTE2b	LTR	MaLR	96	374	-5	3
1769	373	279	40	24	chr3	155297875	155298000	-4301783	-	MTD	LTR	MaLR	-25	394	268	3
1769	2108	165	29	18	chr3	155302776	155303158	-4296625	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	386	-8	3
1769	2164	145	185	77	chr3	155303792	155304413	-4295370	+	RMER6C	LTR	ERVK	3	690	0	3
1769	2688	176	33	8	chr3	155307047	155307561	-4292222	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	1	3
1769	904	235	14	24	chr3	155311291	155311500	-4288283	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	166	4
1769	1356	242	19	131	chr3	155311512	155312078	-4287705	+	RLTR20B2	LTR	ERVK	1	503	-57	4
1769	521	274	0	29	chr3	155312131	155312270	-4287513	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-232	142	8	4
1769	314	311	77	42	chr3	155316185	155316353	-4283430	-	MLT1E1	LTR	MaLR	-439	215	42	4
1769	5168	113	25	30	chr3	155318581	155319393	-4280390	-	RLTR13C2	LTR	ERVK	0	808	1	4
1770	3169	31	39	0	chr3	155320915	155321296	-4278487	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1770	2421	59	68	6	chr3	155329043	155329365	-4270418	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	342	-4	4
1770	561	310	109	26	chr3	155329771	155330036	-4269747	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-83	287	1	4
1770	310	359	98	55	chr3	155331922	155332086	-4267697	-	MT2A	LTR	ERVL	-213	320	1	4
1770	433	319	28	14	chr3	155332086	155332229	-4267554	-	MTEa	LTR	MaLR	-234	145	1	4
1770	2074	179	39	8	chr3	155336475	155336857	-4262926	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	4
1770	1559	220	43	19	chr3	155342164	155342539	-4257244	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	4
1770	1948	152	57	23	chr3	155351447	155351798	-4247985	+	RLTR44A	LTR	ERVK	1	363	-42	4
1770	297	295	54	0	chr3	155359908	155360010	-4239773	+	MLT1A1	LTR	MaLR	5	113	-295	4
1770	266	323	88	31	chr3	155360060	155360220	-4239563	+	MLT1A1	LTR	MaLR	240	408	0	4
1770	722	279	180	10	chr3	155361150	155361450	-4238333	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-5	365	15	4
1770	1699	193	12	21	chr3	155362598	155362937	-4236846	-	RLTR17	LTR	ERVK	-73	619	284	4
1770	276	223	0	105	chr3	155362950	155363055	-4236728	-	RLTR17	LTR	ERVK	-494	198	105	4
1770	252	296	45	0	chr3	155364647	155364735	-4235048	+	MLT2D	LTR	ERVL	56	147	-267	4
1770	1372	189	26	3	chr3	155372397	155372695	-4227088	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1770	2965	236	97	22	chr3	155372781	155373637	-4226146	-	MTC-int	LTR	MaLR	-426	1537	380	4
1770	1632	202	62	11	chr3	155376409	155376780	-4223003	-	MTC-int	LTR	MaLR	-865	393	4	4
1770	1736	240	19	42	chr3	155376781	155377212	-4222571	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	4
1770	1120	239	54	51	chr3	155387831	155388166	-4211617	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	198	5
1770	234	252	262	0	chr3	155395248	155395355	-4204428	-	ORR1E	LTR	MaLR	-224	135	1	5
1770	2043	191	73	69	chr3	155395834	155396385	-4203398	-	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	0	584	32	5
1770	812	138	46	46	chr3	155401828	155401980	-4197803	-	RMER4B	LTR	ERVK	-417	168	17	5
1770	861	320	113	11	chr3	155404410	155404764	-4195019	-	MTD	LTR	MaLR	-29	390	1	5
1770	258	355	67	39	chr3	155404775	155404954	-4194829	-	LTR52	LTR	ERVL	-70	351	168	5
1770	245	224	50	33	chr3	155404998	155405058	-4194725	-	LTR52	LTR	ERVL	-356	65	5	5
1770	3962	65	66	9	chr3	155408585	155409115	-4190668	-	LTRIS2	LTR	ERV1	0	564	5	5
1770	1293	165	32	28	chr3	155409401	155409553	-4190230	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-8	1840	1686	5
1770	1293	165	32	28	chr3	155409692	155409789	-4189994	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-163	1685	1590	5
1770	4720	188	82	50	chr3	155409974	155411154	-4188629	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-630	1218	1	5
1770	2092	100	30	7	chr3	155415035	155415337	-4184446	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	309	0	5
1770	361	66	6	0	chr3	155415362	155415415	-4184368	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	222	267	-7314	5
1770	610	232	72	17	chr3	155415447	155415627	-4184156	+	RLTR10-int	LTR	ERVK	655	844	-1143	5
1770	3318	290	48	47	chr3	155415992	155417813	-4181970	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	3653	5476	-2105	5
1770	304	331	35	18	chr3	155418300	155418469	-4181314	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	6898	7069	-512	5
1770	1394	188	0	22	chr3	155418603	155418870	-4180913	+	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	7321	7581	0	5
1770	2189	96	13	7	chr3	155418870	155419173	-4180610	+	RLTR27	LTR	ERVK	1	305	-4	5
1770	627	228	183	50	chr3	155423321	155423561	-4176222	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	5
1770	647	338	89	55	chr3	155423746	155424084	-4175699	+	MTE-int	LTR	MaLR	2	348	-1232	5
1770	647	338	89	55	chr3	155424261	155424394	-4175389	+	MTE-int	LTR	MaLR	349	489	-1091	5
1770	577	288	79	90	chr3	155426928	155427195	-4172588	+	MTD	LTR	MaLR	154	417	-2	5
1770	978	307	39	39	chr3	155443525	155443881	-4155902	+	MTEb	LTR	MaLR	9	364	-15	5
1770	250	306	154	18	chr3	155445917	155446027	-4153756	+	MLT1A	LTR	MaLR	192	316	-58	5
1771	311	331	46	26	chr3	155458095	155458247	-4141536	-	RMER12	LTR	ERVK	-62	1260	1106	5
1771	1010	314	82	18	chr3	155466996	155467434	-4132349	+	RMER5	LTR	ERV1	67	532	-2	6
1771	944	177	358	9	chr3	155473468	155473686	-4126097	-	RMER6C	LTR	ERVK	-396	294	1	6
1771	3412	165	26	37	chr3	155495590	155496239	-4103544	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	6
1771	296	244	11	22	chr3	155496239	155496331	-4103452	+	RLTR22_Mus	LTR	ERVK	500	590	-1218	6
1771	323	321	45	35	chr3	155496918	155497126	-4102657	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	591	773	-1075	6
1771	718	186	98	61	chr3	155497302	155497526	-4102257	+	RMER12	LTR	ERVK	989	1199	-123	6
1771	1833	253	38	13	chr3	155500486	155500934	-4098849	-	MT2A	LTR	ERVL	-74	459	1	2
1771	1602	153	77	87	chr3	155501123	155501537	-4098246	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	3
1771	286	349	126	17	chr3	155502158	155502333	-4097450	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-1151	220	27	5
1771	1363	226	70	15	chr3	155503141	155503456	-4096327	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-7	360	26	7
1771	1953	164	81	51	chr3	155503456	155503849	-4095934	-	RLTR44A	LTR	ERVK	0	405	1	8
1771	1363	226	70	15	chr3	155503849	155503874	-4095909	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-342	25	1	7
1771	1819	169	0	7	chr3	155517828	155518138	-4081645	-	RLTR10E	LTR	ERVK	-3	308	1	2
1771	382	286	93	64	chr3	155519784	155519956	-4079827	-	MTEb	LTR	MaLR	-196	183	7	3
1771	289	133	0	0	chr3	155521216	155521261	-4078522	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	646	3
1771	403	358	61	53	chr3	155522533	155522908	-4076875	+	MT2A	LTR	ERVL	12	389	-144	3
1771	1302	261	66	65	chr3	155530083	155530624	-4069159	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	66	553	0	5
1771	1727	134	45	60	chr3	155537750	155538084	-4061699	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	329	0	6
1771	525	196	0	67	chr3	155538710	155538830	-4060953	-	ORR1C1	LTR	MaLR	-266	112	1	6
1771	1032	248	122	18	chr3	155538840	155539092	-4060691	+	ORR1C2	LTR	MaLR	21	306	-78	6
1771	1032	248	122	18	chr3	155539112	155539187	-4060596	+	ORR1C2	LTR	MaLR	307	381	-3	6
1771	472	255	148	128	chr3	155540903	155541240	-4058543	+	MTE2a	LTR	MaLR	31	374	-5	6
1771	225	314	18	73	chr3	155544529	155544639	-4055144	+	MLT1E3	LTR	MaLR	216	319	-305	7
1771	1304	220	77	22	chr3	155551894	155552205	-4047578	+	ORR1B2	LTR	MaLR	32	359	-8	8
1771	557	301	113	78	chr3	155554657	155555107	-4044676	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-27	500	35	8
1771	5158	201	30	8	chr3	155555193	155556314	-4043469	-	MYSERV6-int	LTR	ERVK	-46	8913	7768	8
1771	440	286	108	19	chr3	155556334	155556491	-4043292	-	RMER4A	LTR	ERVK	-45	421	251	9
1771	2612	296	58	60	chr3	155556491	155557798	-4041985	-	MYSERV-int	LTR	ERVK	-1424	5126	3823	9
1771	405	269	43	34	chr3	155558939	155559108	-4040675	-	RLTR43A	LTR	ERVK	0	364	214	9
1771	445	258	122	31	chr3	155561669	155562027	-4037756	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	365	-14	9
1771	918	299	52	34	chr3	155565432	155565757	-4034026	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	29	1
1771	328	235	66	141	chr3	155573048	155573261	-4026522	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-2184	3953	3757	1
1771	1517	271	79	96	chr3	155575910	155576665	-4023118	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3215	2307	1570	1
1771	1517	271	79	96	chr3	155576688	155577155	-4022628	-	RLTR42-int	LTR	ERVK	-3953	1569	1105	1
1771	2220	208	98	9	chr3	155578455	155578983	-4020800	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	1	1
1771	317	314	158	46	chr3	155581869	155582109	-4017674	-	MLT1I	LTR	MaLR	-66	345	79	1
1772	1375	114	279	30	chr3	155595309	155595571	-4004212	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1772	724	280	139	42	chr3	155596663	155596950	-4002833	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	25	339	-238	1
1772	297	337	128	21	chr3	155600567	155600849	-3998934	-	RMER20B	LTR	ERVK	-242	385	74	1
1772	1050	272	72	28	chr3	155600875	155600924	-3998859	-	ORR1E	LTR	MaLR	-13	346	299	1
1772	1050	272	72	28	chr3	155601452	155601723	-3998060	-	ORR1E	LTR	MaLR	-61	298	12	1
1772	3264	155	11	14	chr3	155603215	155603770	-3996013	+	RLTR1D	LTR	ERV1	37	589	-16	1
1772	271	250	71	87	chr3	155605163	155605290	-3994493	-	MT2B	LTR	ERVL	-325	276	152	1
1772	1461	163	84	62	chr3	155608612	155608933	-3990850	-	ORR1A4	LTR	MaLR	-1	328	1	1
1772	1981	144	3	18	chr3	155610804	155611136	-3988647	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1772	441	251	5	185	chr3	155612420	155612615	-3987168	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	160	-199	1
1772	470	330	51	55	chr3	155614483	155614756	-3985027	+	MT2A	LTR	ERVL	191	462	-71	1
1772	1899	146	191	11	chr3	155620576	155620943	-3978840	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	433	-3	1
1772	989	236	70	8	chr3	155621107	155621371	-3978412	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1016	306	22	1
1772	720	261	65	56	chr3	155625430	155625779	-3974004	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	411	1	1
1772	360	277	70	63	chr3	155628810	155628968	-3970815	-	RMER15	LTR	ERVL	-416	159	1	1
1772	331	338	25	38	chr3	155630300	155630457	-3969326	+	MLT1A0	LTR	MaLR	208	362	-3	1
1772	521	340	146	81	chr3	155631490	155631874	-3967909	-	MLT2F	LTR	ERVL	-68	595	187	2
1772	351	302	61	23	chr3	155632234	155632366	-3967417	-	ORR1E	LTR	MaLR	-222	137	1	2
1772	1423	311	185	54	chr3	155632366	155633382	-3966401	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-53	1527	356	2
1772	3211	58	2	0	chr3	155633382	155633777	-3966006	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1772	1423	339	199	40	chr3	155633777	155634097	-3965686	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-1225	355	4	2
1772	239	221	33	192	chr3	155634101	155634252	-3965531	-	ORR1E	LTR	MaLR	-7	372	246	2
1772	257	307	28	47	chr3	155644272	155644378	-3955405	+	RMER15	LTR	ERVL	317	420	-155	2
1772	2435	179	63	2	chr3	155646551	155647045	-3952738	-	RLTR28	LTR	ERVL	0	524	1	2
1772	299	250	37	12	chr3	155647346	155647427	-3952356	+	LTR55	LTR	ERV	38	120	-428	2
1772	647	316	119	20	chr3	155647457	155647760	-3952023	+	LTR55	LTR	ERV	212	544	-4	2
1772	2663	157	13	103	chr3	155648526	155649137	-3950646	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-1	556	1	2
1772	1186	271	140	3	chr3	155650606	155650928	-3948855	-	MTD	LTR	MaLR	-36	383	18	2
1772	320	390	51	19	chr3	155664052	155664266	-3935517	-	MLT1I	LTR	MaLR	-120	291	71	2
1772	1616	211	64	57	chr3	155672168	155672574	-3927209	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	13	2
1772	3355	23	13	0	chr3	155677976	155678367	-3921416	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1772	9559	14	1	3	chr3	155678367	155679467	-3920316	+	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	1	1098	0	2
1772	3335	26	13	0	chr3	155679467	155679858	-3919925	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1772	2934	188	10	40	chr3	155682514	155683114	-3916669	+	RMER6D	LTR	ERVK	4	585	-135	2
1772	1919	224	127	79	chr3	155690587	155691168	-3908615	+	RMER19C	LTR	ERVK	3	611	0	2
1772	227	303	30	10	chr3	155700062	155700162	-3899621	+	MLT1A1	LTR	MaLR	291	392	-16	2
1772	3210	45	0	25	chr3	155708628	155709034	-3890749	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1773	227	356	78	69	chr3	155720248	155720465	-3879318	+	ORR1E	LTR	MaLR	19	237	-122	3
1773	826	359	88	52	chr3	155721344	155722004	-3877779	+	MTE-int	LTR	MaLR	842	1525	-55	3
1773	917	251	38	38	chr3	155723135	155723478	-3876305	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	343	-16	3
1773	942	215	31	5	chr3	155723589	155723800	-3875983	+	ORR1C1	LTR	MaLR	149	360	-18	3
1773	1599	230	35	27	chr3	155731444	155731846	-3867937	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	7	3
1773	251	181	56	118	chr3	155734411	155734555	-3865228	-	RMER17D	LTR	ERVK	-375	514	380	3
1773	225	212	56	70	chr3	155751008	155751079	-3848704	+	MTEa	LTR	MaLR	298	367	-12	3
1773	2949	179	52	21	chr3	155756399	155756974	-3842809	+	RLTR17	LTR	ERVK	98	690	-2	3
1773	1576	221	43	74	chr3	155762812	155763232	-3836551	+	MTD	LTR	MaLR	5	411	-8	3
1773	709	265	67	8	chr3	155767414	155767647	-3832136	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	251	-108	3
1773	835	296	107	10	chr3	155768404	155768694	-3831089	+	ORR1D2	LTR	MaLR	53	370	0	3
1773	240	340	83	7	chr3	155777578	155777723	-3822060	-	MLT1A	LTR	MaLR	-26	523	368	3
1773	349	309	37	53	chr3	155778772	155778960	-3820823	-	MLT1A	LTR	MaLR	-16	358	174	3
1773	1462	137	122	0	chr3	155788013	155788291	-3811492	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-69	1440	1129	3
1773	592	302	95	59	chr3	155790169	155790475	-3809308	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	63	3
1773	2070	123	7	0	chr3	155790865	155791174	-3808609	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	311	-16	4
1773	655	235	109	27	chr3	155793463	155793611	-3806172	+	MT2A	LTR	ERVL	1	145	-388	4
1773	655	235	109	27	chr3	155793711	155793746	-3806037	+	MT2A	LTR	ERVL	146	199	-334	4
1773	771	251	165	4	chr3	155794631	155794879	-3804904	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	130	4
1773	2078	56	0	50	chr3	155806688	155806987	-3792796	-	RLTR10B	LTR	ERVK	0	292	9	4
1773	324	48	0	0	chr3	155807009	155807051	-3792732	-	RLTR10B	LTR	ERVK	-250	42	1	4
1773	370	399	60	17	chr3	155807613	155808080	-3791703	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	2531	3017	-2650	4
1773	246	359	43	17	chr3	155808859	155809068	-3790715	+	MLT2B1	LTR	ERVL	52	273	-283	4
1773	1563	285	30	5	chr3	155814157	155814559	-3785224	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	6	4
1773	655	254	239	25	chr3	155814716	155814986	-3784797	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-9	361	34	4
1773	877	286	60	22	chr3	155816180	155816545	-3783238	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	4
1773	324	339	61	39	chr3	155818040	155818221	-3781562	-	LTR16E1	LTR	ERVL	-38	500	316	4
1773	345	319	75	45	chr3	155822310	155822612	-3777171	+	MLT1A	LTR	MaLR	30	353	-21	4
1773	606	270	47	93	chr3	155831208	155831572	-3768211	+	RLTR11B	LTR	ERVK	1	347	-106	4
1773	911	304	77	41	chr3	155833055	155833395	-3766388	-	ORR1E	LTR	MaLR	-5	354	3	4
1773	868	128	28	7	chr3	155837238	155837380	-3762403	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	70	214	-193	4
1773	2937	95	12	0	chr3	155837902	155838303	-3761480	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	2	407	0	4
1773	2100	97	18	30	chr3	155840950	155841279	-3758504	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	325	-2	4
1773	24523	40	22	21	chr3	155841279	155844348	-3755435	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	3	3076	-3405	4
221	6518	58	12	18	chr3	155844334	155845189	-3754594	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	5630	6479	-2	4
1774	2100	97	18	30	chr3	155845191	155845520	-3754263	+	IAPLTR2b	LTR	ERVK	1	325	-2	4
1774	2289	104	148	0	chr3	155854067	155854431	-3745352	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	5	4
1774	1655	205	58	14	chr3	155859292	155859638	-3740145	-	MTC	LTR	MaLR	-60	361	1	4
1774	232	288	14	0	chr3	155860449	155860522	-3739261	-	RMER5	LTR	ERV1	-30	504	431	4
1774	3859	158	159	88	chr3	155862492	155863452	-3736331	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	1	4
1774	247	232	86	136	chr3	155865093	155865313	-3734470	-	MER31A	LTR	ERV1	-76	409	201	4
1774	648	343	32	24	chr3	155867229	155867480	-3732303	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	253	-126	4
1774	255	331	32	95	chr3	155868530	155868720	-3731063	-	ORR1E	LTR	MaLR	-147	212	35	4
1774	543	227	78	0	chr3	155869520	155869648	-3730135	-	RMER15	LTR	ERVL	0	575	438	4
1774	430	312	8	112	chr3	155869643	155869892	-3729891	-	RMER15	LTR	ERVL	-349	226	4	4
1774	769	217	62	62	chr3	155875551	155875762	-3724021	+	ORR1A4	LTR	MaLR	1	211	-118	5
1774	553	304	76	66	chr3	155877115	155877300	-3722483	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	90	275	-6644	5
1774	553	304	76	66	chr3	155877324	155877547	-3722236	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	276	501	-6418	5
1774	374	71	0	51	chr3	155878644	155878703	-3721080	+	ORR1A2	LTR	MaLR	2	57	-270	5
1774	1823	100	17	60	chr3	155879406	155879704	-3720079	+	ORR1A2	LTR	MaLR	43	327	0	5
1774	943	238	122	46	chr3	155879987	155880469	-3719314	+	RMER17C-int	LTR	ERVK	2627	3110	-128	5
1774	295	297	21	32	chr3	155880794	155880888	-3718895	+	RMER20B	LTR	ERVK	1	93	-534	5
1774	312	215	31	0	chr3	155881114	155881179	-3718604	-	RMER20B	LTR	ERVK	-560	67	1	5
1774	439	304	43	43	chr3	155881589	155881890	-3717893	+	MTE2a	LTR	MaLR	7	362	-17	5
1774	1840	234	14	193	chr3	155883320	155884062	-3715721	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	3	5
1774	1957	154	22	0	chr3	155888456	155888775	-3711008	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	5
1774	1209	238	142	6	chr3	155902364	155902702	-3697081	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	5
1774	392	136	0	15	chr3	155902702	155902769	-3697014	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1509	1444	5
1774	313	179	0	0	chr3	155903034	155903090	-3696693	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-59	1311	1256	5
1774	2464	300	103	50	chr3	155903558	155904716	-3695067	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-98	1272	52	5
1774	2464	300	103	50	chr3	155904753	155904803	-3694980	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	-1319	51	2	5
1774	1733	200	46	3	chr3	155904805	155905171	-3694612	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	1	5
1774	1976	235	8	183	chr3	155910980	155911700	-3688083	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	594	-17	5
1774	3215	156	74	24	chr3	155916214	155916929	-3682854	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	5
1774	2545	175	54	10	chr3	155919193	155919690	-3680093	+	RLTR28	LTR	ERVL	1	519	-5	5
1774	382	360	96	29	chr3	155919747	155919956	-3679827	+	LTR16A	LTR	ERVL	1	223	-228	5
1774	3086	3	0	0	chr3	155919987	155920324	-3679459	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	5
1774	9897	15	2	0	chr3	155920324	155921479	-3678304	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	5325	5
1774	31883	25	10	9	chr3	155921479	155925385	-3674398	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2566	3915	8	5
1774	3086	3	0	0	chr3	155925385	155925722	-3674061	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	5
1774	1115	250	218	57	chr3	155931328	155931782	-3668001	+	MT2A	LTR	ERVL	5	531	-2	5
1774	1207	256	46	41	chr3	155932700	155933115	-3666668	+	MTD	LTR	MaLR	3	419	0	5
1774	543	307	125	24	chr3	155934029	155934392	-3665391	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	6	5
1774	372	373	115	62	chr3	155940429	155941097	-3658686	-	MTE-int	LTR	MaLR	-42	1538	828	5
1774	3241	231	8	29	chr3	155941097	155941832	-3657951	+	RMER6D	LTR	ERVK	1	720	0	5
1774	372	373	115	62	chr3	155941832	155941878	-3657905	-	MTE-int	LTR	MaLR	-753	827	786	5
1774	285	271	160	15	chr3	155943147	155943212	-3656571	-	MTEb	LTR	MaLR	-3	376	304	5
1774	428	273	265	9	chr3	155943245	155943466	-3656317	-	MTEb	LTR	MaLR	-76	303	1	5
1774	530	367	35	22	chr3	155954993	155955305	-3644478	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-28	337	22	6
1774	3129	56	183	2	chr3	155969187	155969619	-3630164	-	RLTR1B	LTR	ERV1	-2	510	1	6
1774	468	352	68	37	chr3	155970750	155971074	-3628709	-	MER89	LTR	ERV1	0	559	226	6
1774	2060	35	4	0	chr3	155972531	155972791	-3626992	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1686	301	41	6
1774	2702	26	2	201	chr3	155972801	155973288	-3626495	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	6
1774	15611	22	1	51	chr3	155973290	155975337	-3624446	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-3	1984	41	6
221	2679	28	2	201	chr3	155975347	155975834	-3623949	-	RLTR10	LTR	ERVK	0	390	1	6
1775	2907	68	29	3	chr3	155990150	155990536	-3609247	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1775	338	331	74	17	chr3	155998628	155998803	-3600980	-	LTR50	LTR	ERVL	-538	257	73	6
1775	1958	85	284	0	chr3	156004974	156005291	-3594492	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	8
1775	5008	145	201	13	chr3	156005291	156006349	-3593434	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	0	1258	2	8
1775	2926	98	2	2	chr3	156006349	156006755	-3593028	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	1	8
1775	390	281	55	41	chr3	156010619	156010764	-3589019	+	RMER15	LTR	ERVL	275	421	-154	1
1775	634	302	113	47	chr3	156036786	156037175	-3562608	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	377	-2	4
1775	2656	77	61	0	chr3	156040558	156040936	-3558847	+	BGLII_Mus	LTR	ERVK	1	401	-21	5
1775	3066	99	33	7	chr3	156040956	156041326	-3558457	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-86	471	101	5
1775	3066	99	33	7	chr3	156041371	156041459	-3558324	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-457	100	1	5
1775	276	324	74	69	chr3	156042047	156042236	-3557547	+	MLT1E2	LTR	MaLR	40	229	-398	5
1775	961	240	9	4	chr3	156044395	156044625	-3555158	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	8531	8761	-198	6
1775	721	258	204	14	chr3	156044704	156044983	-3554800	-	MTC	LTR	MaLR	-52	369	38	6
1775	253	264	14	27	chr3	156045802	156045876	-3553907	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	287	6
1775	274	246	15	0	chr3	156046078	156046143	-3553640	+	MTEa	LTR	MaLR	68	133	-246	6
1775	1353	218	86	22	chr3	156046605	156046966	-3552817	+	ORR1C2	LTR	MaLR	1	384	0	7
1775	2235	186	144	41	chr3	156047796	156048289	-3551494	+	RMER19C	LTR	ERVK	1	544	-67	7
1775	1449	250	63	5	chr3	156049092	156049486	-3550297	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	7
1775	1294	250	74	37	chr3	156052486	156052839	-3546944	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-4	366	1	7
1775	1494	120	62	0	chr3	156057660	156057902	-3541881	-	RMER15	LTR	ERVL	-43	532	276	8
1775	587	206	63	0	chr3	156057944	156058070	-3541713	-	RMER15	LTR	ERVL	-440	135	2	8
1775	504	357	22	16	chr3	156058369	156058554	-3541229	+	ORR1E	LTR	MaLR	5	190	-169	8
1775	1297	221	96	12	chr3	156061599	156061942	-3537841	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	372	-2	9
1775	1263	303	73	70	chr3	156067039	156067730	-3532053	-	RMER13A	LTR	ERVK	-30	878	176	1
1775	5720	81	47	7	chr3	156077134	156077986	-3521797	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	1	1023	0	1
1775	295	284	0	105	chr3	156079716	156079803	-3519980	-	ORR1E	LTR	MaLR	-292	78	1	1
1775	452	222	0	0	chr3	156087479	156087578	-3512205	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	101	-273	1
1775	4428	204	44	19	chr3	156088581	156089702	-3510081	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	2335	3483	-5476	1
1775	4062	175	34	2	chr3	156090216	156091052	-3508731	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	3516	4377	-4582	1
1775	1346	277	64	82	chr3	156091035	156091852	-3507931	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	4234	5035	-1515	1
1775	363	329	34	61	chr3	156091897	156092102	-3507681	+	RMER4A	LTR	ERVK	240	557	-28	1
1775	403	160	45	27	chr3	156092103	156092243	-3507540	+	MYSERV6-int	LTR	ERVK	7818	7901	-1058	1
1776	588	177	46	47	chr3	156111439	156111597	-3488186	+	MTD	LTR	MaLR	240	401	-18	1
1776	364	276	147	15	chr3	156114346	156114482	-3485301	+	MTD	LTR	MaLR	15	168	-251	1
1776	1460	201	118	3	chr3	156114941	156115280	-3484503	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	1
1776	698	312	125	36	chr3	156118775	156119104	-3480679	+	MTE2b	LTR	MaLR	11	368	-11	1
1776	361	171	7	0	chr3	156120441	156120509	-3479274	+	ORR1D1	LTR	MaLR	299	374	0	1
1776	1594	214	22	16	chr3	156121173	156121543	-3478240	+	ORR1D1	LTR	MaLR	3	374	0	1
1776	421	342	54	54	chr3	156134822	156134850	-3464933	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	28	-331	1
1776	421	342	54	54	chr3	156135019	156135231	-3464552	+	ORR1E	LTR	MaLR	29	241	-118	1
1776	3158	183	50	13	chr3	156140282	156140901	-3458882	-	RLTR26	LTR	ERVK	0	642	1	1
1776	2383	111	0	22	chr3	156142771	156143117	-3456666	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	6568	6907	-12	2
1776	2383	111	0	22	chr3	156143188	156143199	-3456584	+	MERVK26-int	LTR	ERVK	6908	6917	-2	2
1776	2873	194	71	13	chr3	156143202	156143807	-3455976	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	640	-2	2
1776	541	259	53	47	chr3	156146911	156147081	-3452702	+	MTEa	LTR	MaLR	1	171	-208	2
1776	350	313	205	20	chr3	156147139	156147436	-3452347	+	MTE-int	LTR	MaLR	659	1010	-570	2
1776	296	336	106	34	chr3	156150925	156151090	-3448693	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2048	3619	3444	2
1776	296	336	106	34	chr3	156151121	156151248	-3448535	-	ERVL-E-int	LTR	ERVL	-2224	3443	3306	2
1776	1197	241	124	17	chr3	156159747	156160093	-3439690	-	MTD	LTR	MaLR	-36	383	1	2
1776	315	217	58	0	chr3	156179985	156180054	-3419729	-	MTC	LTR	MaLR	-17	404	332	2
1776	1490	223	84	14	chr3	156181088	156181456	-3418327	-	MTD	LTR	MaLR	-7	412	19	2
1776	3035	146	107	20	chr3	156183038	156183673	-3416110	+	RMER6C	LTR	ERVK	1	690	0	2
1776	2951	71	0	17	chr3	156185144	156185546	-3414237	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	2	2
1776	337	363	74	51	chr3	156186182	156186502	-3413281	+	MLT1A1	LTR	MaLR	28	392	-16	2
1776	437	328	28	44	chr3	156188213	156188395	-3411388	+	MT2A	LTR	ERVL	254	432	-101	2
1776	247	182	109	0	chr3	156194958	156195013	-3404770	+	ORR1A1-int	LTR	MaLR	980	1040	-752	2
1776	2475	160	132	26	chr3	156194980	156195550	-3404233	+	MTC-int	LTR	MaLR	625	1254	-4	2
1776	1868	192	62	10	chr3	156195554	156195954	-3403829	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1776	1940	186	93	7	chr3	156198812	156199231	-3400552	-	RMER19B	LTR	ERVK	-16	886	221	2
1776	1378	170	32	155	chr3	156199220	156199562	-3400221	-	RMER19B	LTR	ERVK	-602	300	1	2
1776	1660	171	91	26	chr3	156199562	156199856	-3399927	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-78	316	1	2
1776	387	114	75	4	chr3	156199964	156200040	-3399743	-	RMER19B	LTR	ERVK	-658	79	1	2
1776	1242	198	80	0	chr3	156203316	156203579	-3396204	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-90	284	1	2
1776	885	302	47	7	chr3	156204957	156205257	-3394526	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-58	312	1	2
1776	816	303	138	39	chr3	156210187	156210651	-3389132	-	MLT2B3	LTR	ERVL	-20	534	25	2
1776	1700	201	34	44	chr3	156212825	156213211	-3386572	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	1	2
1776	3086	58	5	8	chr3	156218366	156218763	-3381020	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	3
1776	1347	244	45	23	chr3	156229711	156230063	-3369720	+	MTD	LTR	MaLR	25	384	-35	3
1776	304	321	50	43	chr3	156230703	156231026	-3368757	+	LTR33A_	LTR	ERVL	141	516	-15	3
1777	2276	146	44	80	chr3	156241436	156241914	-3357869	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	1	3
1777	683	279	196	21	chr3	156254587	156254924	-3344859	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	0	407	12	3
1777	269	294	146	45	chr3	156259261	156259305	-3340478	-	MLT2C1	LTR	ERVL	0	397	351	3
1777	269	294	146	45	chr3	156259349	156259550	-3340233	-	MLT2C1	LTR	ERVL	-47	350	127	3
1777	257	246	118	76	chr3	156261437	156261556	-3338227	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-22	541	418	3
1777	562	249	135	69	chr3	156261566	156261826	-3337957	-	RLTR16	LTR	ERVK	-243	262	24	3
1777	3401	35	2	0	chr3	156265756	156266150	-3333633	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	2	396	0	3
1777	260	294	111	56	chr3	156278043	156278169	-3321614	-	MLT1G3	LTR	MaLR	-2	593	461	3
1777	1515	255	94	3	chr3	156278253	156278626	-3321157	+	MTD	LTR	MaLR	5	411	-8	3
1777	255	344	30	15	chr3	156290778	156290911	-3308872	+	MLT2B2	LTR	ERVL	386	520	-42	3
1777	2271	191	5	32	chr3	156297263	156297338	-3302445	+	MTC	LTR	MaLR	1	75	-346	4
1777	2271	191	5	32	chr3	156297724	156298081	-3301702	+	MTC	LTR	MaLR	76	421	0	4
1777	1490	164	12	0	chr3	156309696	156309952	-3289831	+	MT2B	LTR	ERVL	339	597	-4	4
1777	440	251	76	37	chr3	156314332	156314562	-3285221	+	ORR1E	LTR	MaLR	40	359	-20	4
1777	2746	85	21	5	chr3	156318045	156318434	-3281349	+	MTB	LTR	MaLR	1	395	-5	4
1777	250	184	144	58	chr3	156331807	156331911	-3267872	-	MER110	LTR	ERV1	-66	425	313	4
1777	245	301	91	64	chr3	156344262	156344372	-3255411	+	RMER12	LTR	ERVK	739	851	-471	4
1777	1697	145	101	0	chr3	156356751	156357048	-3242735	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	4
1777	317	360	93	41	chr3	156365502	156365771	-3234012	-	MLT1D	LTR	MaLR	-130	375	93	4
1778	1974	147	53	74	chr3	156370615	156371008	-3228775	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	411	-10	4
1778	3861	151	94	106	chr3	156373284	156374197	-3225586	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	902	0	4
1778	2846	18	0	9	chr3	156382851	156383192	-3216591	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	338	-8	5
1778	282	343	28	35	chr3	156386608	156386753	-3213030	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-8	400	257	5
1778	398	321	58	11	chr3	156387069	156387258	-3212525	-	MER92B	LTR	ERV1	-72	564	367	5
1778	283	314	12	0	chr3	156387305	156387391	-3212392	-	MER92B	LTR	ERV1	-419	217	131	5
1778	393	274	0	10	chr3	156397592	156397688	-3202095	+	MTE2b	LTR	MaLR	4	98	-281	5
1778	350	235	31	63	chr3	156398052	156398207	-3201576	+	MTE2b	LTR	MaLR	139	290	-89	5
1778	416	304	78	1	chr3	156398210	156398353	-3201430	+	MTE2b	LTR	MaLR	215	367	-12	5
1778	614	303	116	46	chr3	156411677	156412006	-3187777	+	MT2A	LTR	ERVL	16	367	-166	5
1778	504	307	138	12	chr3	156419749	156420003	-3179780	-	MLT1F	LTR	MaLR	-261	287	2	5
1778	327	246	41	98	chr3	156420593	156420620	-3179163	-	MT2B	LTR	ERVL	-445	156	137	5
1778	907	201	75	86	chr3	156423310	156423577	-3176206	-	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	-5488	273	10	5
1778	2275	196	87	26	chr3	156424764	156424832	-3174951	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-1	527	464	5
1778	2275	196	87	26	chr3	156424977	156425405	-3174378	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-65	463	1	5
1778	296	292	114	16	chr3	156426218	156426409	-3173374	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-287	241	32	5
1778	5083	114	11	8	chr3	156426993	156427728	-3172055	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	1	5
1778	1555	184	82	57	chr3	156447942	156448374	-3151409	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	1	5
1778	1087	185	119	21	chr3	156458557	156458800	-3140983	-	MT2A	LTR	ERVL	-266	267	1	6
1778	2066	82	110	18	chr3	156462506	156462842	-3136941	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	6
1778	27330	22	1	5	chr3	156462846	156466127	-3133656	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3	6478	3210	6
1778	8485	76	43	9	chr3	156466126	156467389	-3132394	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5168	1313	8	6
1778	2066	82	110	18	chr3	156467389	156467725	-3132058	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	6
1778	4051	138	140	47	chr3	156474205	156474736	-3125047	-	RMER17A2	LTR	ERVK	0	906	341	6
1778	4051	138	140	47	chr3	156474770	156475066	-3124717	-	RMER17A2	LTR	ERVK	-566	340	2	6
1778	1222	179	53	21	chr3	156475516	156475914	-3123869	+	RLTR17	LTR	ERVK	228	686	-6	6
1778	1833	213	103	66	chr3	156487870	156488403	-3111380	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	1	6
1779	238	296	9	36	chr3	156500097	156500209	-3099574	+	RMER12	LTR	ERVK	748	856	-466	1
1779	749	238	85	0	chr3	156501161	156501350	-3098433	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-163	207	3	4
1779	960	264	70	20	chr3	156505121	156505462	-3094321	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	2	1
1779	231	328	0	15	chr3	156525855	156525923	-3073860	-	MTEb	LTR	MaLR	-56	323	257	2
1779	1806	379	79	39	chr3	156526148	156526317	-3073466	-	MTE-int	LTR	MaLR	-2	1578	1419	2
1779	1974	203	55	2	chr3	156526317	156526717	-3073066	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	2
1779	1806	379	79	39	chr3	156526717	156527860	-3071923	-	MTE-int	LTR	MaLR	-162	1418	214	2
1779	408	324	27	13	chr3	156528043	156528189	-3071594	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1363	217	70	2
1779	241	299	8	86	chr3	156528539	156528656	-3071127	-	MTEa	LTR	MaLR	-270	109	2	3
1779	273	286	149	182	chr3	156536032	156536301	-3063482	+	MTE2a	LTR	MaLR	3	262	-117	3
1779	410	281	36	22	chr3	156537595	156537733	-3062050	+	MTE2a	LTR	MaLR	234	373	-6	3
1779	2332	121	100	51	chr3	156541367	156541777	-3058006	-	RLTR23	LTR	ERV1	0	430	1	4
1779	1590	208	35	56	chr3	156541808	156542185	-3057598	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-5	369	1	4
1779	337	332	51	28	chr3	156556670	156556840	-3042943	-	MTEa	LTR	MaLR	-120	259	92	6
1779	358	341	90	42	chr3	156565732	156566020	-3033763	+	MLT1B	LTR	MaLR	11	312	-78	7
1779	293	271	12	12	chr3	156566456	156566541	-3033242	-	MTEa	LTR	MaLR	-268	111	27	7
1779	2836	50	3	0	chr3	156575004	156575347	-3024436	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	344	-2	8
1779	2618	183	60	0	chr3	156580389	156580876	-3018907	+	RMER20A	LTR	ERVK	1	516	0	9
1779	276	322	149	6	chr3	156592622	156592803	-3006980	+	RMER15	LTR	ERVL	353	559	-16	1
1779	512	277	104	32	chr3	156593125	156593376	-3006407	+	MLT1A1	LTR	MaLR	106	406	-2	1
1779	2611	84	50	8	chr3	156593532	156593750	-3006033	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	182	1
1779	2611	84	50	8	chr3	156594000	156594159	-3005624	-	MTB	LTR	MaLR	-222	178	2	1
1779	711	284	39	59	chr3	156598044	156598298	-3001485	-	MTEa	LTR	MaLR	-28	351	103	1
1779	259	279	181	89	chr3	156599514	156599785	-2999998	-	MLT2D	LTR	ERVL	-6	408	113	1
1779	1866	159	19	3	chr3	156603449	156603771	-2996012	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1779	299	322	43	58	chr3	156607146	156607337	-2992446	+	MLT1H	LTR	MaLR	41	233	-346	1
1779	599	364	60	30	chr3	156607798	156607887	-2991896	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-79	436	348	1
1779	1137	259	60	49	chr3	156607887	156608253	-2991530	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	1
1779	599	364	60	30	chr3	156608253	156608528	-2991255	-	MLT2B2	LTR	ERVL	-168	347	61	1
1779	3204	160	93	12	chr3	156611598	156612192	-2987591	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	1
222	1456	339	41	12	chr3	156630833	156631516	-2968267	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-2158	2838	2136	1
1780	273	280	88	0	chr3	156631830	156631955	-2967828	-	HERV16-int	LTR	ERVL	-3235	1761	1626	1
1780	2678	92	22	38	chr3	156634404	156634775	-2965008	-	RLTR8	LTR	ERVK	0	365	1	1
1780	7595	81	23	0	chr3	156634854	156635839	-2963944	-	SRV_MM-int	LTR	ERVK	-8	6159	5152	1
1780	14535	70	55	12	chr3	156635839	156637966	-2961817	-	SRV_MM-int	LTR	ERVK	-3556	2611	396	1
1780	2909	55	0	55	chr3	156637966	156638332	-2961451	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	1
1780	4642	95	44	31	chr3	156638332	156638528	-2961255	-	SRV_MM-int	LTR	ERVK	-5772	395	212	1
1780	4642	95	44	31	chr3	156638700	156638888	-2960895	-	SRV_MM-int	LTR	ERVK	-5956	211	2	1
1780	2594	104	27	38	chr3	156638888	156639257	-2960526	-	RLTR8	LTR	ERVK	0	365	1	1
1780	4366	161	172	52	chr3	156640935	156641802	-2957981	+	RMER12	LTR	ERVK	57	890	-432	1
1780	4366	161	172	52	chr3	156641850	156642108	-2957675	+	RMER12	LTR	ERVK	891	1318	-4	1
1780	1557	231	94	51	chr3	156646377	156646889	-2952894	-	RLTR20C	LTR	ERVK	0	534	1	1
1780	228	336	89	32	chr3	156647375	156647498	-2952285	-	MLT1-int	LTR	MaLR	-51	1320	1191	1
1780	225	336	46	99	chr3	156650670	156650822	-2948961	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	335	478	-4	1
1780	350	246	145	58	chr3	156655374	156655512	-2944271	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-280	164	15	1
1780	1278	251	113	22	chr3	156661404	156661766	-2938017	-	MTD	LTR	MaLR	-20	399	5	1
1780	341	351	59	36	chr3	156662270	156662522	-2937261	-	MLT1G	LTR	MaLR	-296	295	32	1
1780	228	341	45	23	chr3	156663469	156663601	-2936182	-	MLT2F	LTR	ERVL	-402	261	127	1
1780	284	296	83	42	chr3	156666626	156666678	-2933105	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-43	322	271	1
1780	2624	144	49	31	chr3	156666678	156667129	-2932654	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	3	1
1780	280	296	83	42	chr3	156667129	156667196	-2932587	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-95	270	198	1
1780	238	253	91	97	chr3	156677289	156677464	-2922319	+	RLTR21	LTR	ERVK	1080	1253	-319	2
1780	1599	233	76	15	chr3	156682248	156682641	-2917142	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	3	2
1780	1691	190	140	5	chr3	156685638	156686009	-2913774	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	2
1780	991	260	25	131	chr3	156688560	156688958	-2910825	+	MTE2a	LTR	MaLR	6	361	-18	2
1780	295	324	45	9	chr3	156691391	156691503	-2908280	-	RMER15	LTR	ERVL	-16	559	444	2
1780	232	163	40	20	chr3	156692634	156692654	-2907129	+	MT2B2	LTR	ERVL	237	257	-327	2
1780	656	257	55	7	chr3	156701930	156702143	-2897640	-	MLT-int	LTR	MaLR	-45	1690	1491	2
1780	3388	28	5	2	chr3	156715856	156716251	-2883532	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1780	2710	223	105	51	chr3	156717140	156717970	-2881813	+	RMER19B	LTR	ERVK	1	875	-27	2
1780	3091	192	122	101	chr3	156718923	156719781	-2880002	-	RMER19B	LTR	ERVK	-50	852	1	2
1780	358	253	92	61	chr3	156725051	156725215	-2874568	-	MLT1D	LTR	MaLR	-4	501	333	2
1780	2509	132	17	15	chr3	156727260	156727668	-2872115	-	RLTR9E	LTR	ERVK	0	409	1	2
1780	225	231	0	71	chr3	156729863	156729933	-2869850	+	RMER15	LTR	ERVL	403	467	-108	2
1780	236	329	14	0	chr3	156745376	156745446	-2854337	+	MLT1A1	LTR	MaLR	51	121	-287	2
1780	1690	155	80	67	chr3	156755926	156756115	-2843668	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-1	383	191	2
1780	1690	155	80	67	chr3	156756292	156756475	-2843308	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-194	190	7	2
1780	369	297	75	57	chr3	156757428	156757710	-2842073	-	RMER12	LTR	ERVK	-300	1022	736	3
1781	1777	146	41	107	chr3	156767522	156767914	-2831869	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-10	384	19	3
1781	1131	224	168	13	chr3	156784043	156784186	-2815597	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	175	-195	3
1781	1131	224	168	13	chr3	156784398	156784567	-2815216	+	ORR1D2	LTR	MaLR	176	363	-7	3
1781	543	255	91	7	chr3	156786873	156787027	-2812756	+	RMER20B	LTR	ERVK	226	392	-235	3
1781	2364	117	12	9	chr3	156796404	156796732	-2803051	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	1	3
1781	1429	240	50	14	chr3	156800413	156800903	-2798880	+	RMER13B	LTR	ERVK	1	908	0	3
1781	421	294	51	46	chr3	156801648	156801844	-2797939	+	MTEa	LTR	MaLR	181	377	-2	3
1781	237	380	77	21	chr3	156812243	156812477	-2787306	-	LTR86A1	LTR	ERVL	-1	512	266	3
1781	1026	301	31	43	chr3	156813217	156813540	-2786243	-	MLT1F	LTR	MaLR	-229	319	1	3
1781	451	204	134	16	chr3	156814597	156814746	-2785037	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-14	405	179	3
1781	1732	241	44	75	chr3	156837314	156837876	-2761907	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-3	550	1	4
1781	380	299	37	43	chr3	156843832	156843993	-2755790	-	LTR40b	LTR	ERVL	-12	450	291	4
1781	264	275	60	60	chr3	156846980	156847052	-2752731	-	RMER12	LTR	ERVK	-488	834	762	4
1781	264	275	60	60	chr3	156847437	156847480	-2752303	-	RMER12	LTR	ERVK	-561	761	719	4
1781	245	330	32	21	chr3	156849883	156849976	-2749807	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-144	230	137	4
1781	354	298	30	61	chr3	156850022	156850154	-2749629	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-225	140	13	4
1781	280	286	84	14	chr3	156851640	156851782	-2748001	-	MLT1C	LTR	MaLR	-118	349	198	4
1781	2966	38	0	67	chr3	156858718	156859109	-2740674	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	4
1781	585	251	125	28	chr3	156865502	156865792	-2733991	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	9	4
1781	229	268	68	68	chr3	156871498	156871586	-2728197	-	MTEb	LTR	MaLR	-19	360	273	4
1781	820	299	132	11	chr3	156871658	156871939	-2727844	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	315	-64	4
1781	1212	275	39	51	chr3	156884323	156884718	-2715065	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	19	4
1781	360	317	8	16	chr3	156892840	156892965	-2706818	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	627	396	4
1782	721	249	58	0	chr3	156894919	156895092	-2704691	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	183	-191	4
1782	1001	171	20	15	chr3	156895245	156895441	-2704342	+	ORR1D1	LTR	MaLR	178	374	0	4
1782	1048	269	36	8	chr3	156906330	156906581	-2693202	-	MTEa	LTR	MaLR	-117	262	5	4
1782	2084	137	140	14	chr3	156907591	156908013	-2691770	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
1782	2248	182	18	0	chr3	156909434	156909819	-2689964	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-2	392	1	4
1782	3704	25	0	0	chr3	156910527	156910921	-2688862	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	3	4
1782	272	261	0	80	chr3	156912427	156912527	-2687256	-	RMER12	LTR	ERVK	-483	839	748	5
1782	236	337	75	19	chr3	156919537	156919642	-2680141	-	MER68	LTR	ERVL	-4	559	449	5
1782	1864	173	84	41	chr3	156920443	156920811	-2678972	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	5
1782	4602	222	138	31	chr3	156920811	156922048	-2677735	-	ORR1C2-int	LTR	MaLR	0	1370	2	5
1782	816	248	53	82	chr3	156922049	156922458	-2677325	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	5
1782	2057	165	8	55	chr3	156922889	156923274	-2676509	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	5
1782	1929	176	87	8	chr3	156936031	156936387	-2663396	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	1	5
1782	1200	229	43	162	chr3	156949736	156950045	-2649738	-	RMER12B	LTR	ERVK	0	1572	1308	5
1782	1740	176	31	87	chr3	156950096	156950656	-2649127	-	RMER12B	LTR	ERVK	-265	1307	926	5
1782	4082	172	107	6	chr3	156952719	156953567	-2646216	-	RMER12B	LTR	ERVK	-469	935	2	5
1782	554	334	34	62	chr3	156956637	156956927	-2642856	+	MTE2a	LTR	MaLR	18	270	-109	5
1782	1613	283	72	108	chr3	156964781	156965546	-2634237	+	RMER19A	LTR	ERVK	1	737	0	5
1782	1224	270	77	14	chr3	156966303	156966667	-2633116	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	19	5
1782	325	278	158	22	chr3	156969555	156969739	-2630044	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	209	-150	5
1782	461	220	11	0	chr3	156985116	156985207	-2614576	+	MT2B	LTR	ERVL	4	95	-438	5
1782	527	240	195	62	chr3	156985314	156985348	-2614435	+	MT2B	LTR	ERVL	82	110	-423	5
1782	3196	53	5	5	chr3	156985348	156985748	-2614035	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	5
1782	857	250	126	81	chr3	156985748	156986091	-2613692	+	MT2B	LTR	ERVL	111	601	0	5
1782	1146	209	83	113	chr3	156986278	156986640	-2613143	-	RMER21B	LTR	ERV1	0	842	492	5
1782	440	278	199	44	chr3	156988722	156989038	-2610745	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	1	5
1782	248	349	45	9	chr3	156990160	156990270	-2609513	-	MLT1J2	LTR	MaLR	-278	170	57	5
1782	544	290	145	58	chr3	156996362	156996706	-2603077	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	374	-5	6
1782	1241	190	195	6	chr3	157010115	157010428	-2589355	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	3	1
1782	1186	187	19	12	chr3	157011179	157011479	-2588304	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	4	1
1782	310	244	195	27	chr3	157013887	157014072	-2585711	+	MLT1F-int	LTR	MaLR	360	575	-914	1
1782	1474	206	56	70	chr3	157016284	157016420	-2583363	-	RMER6C	LTR	ERVK	0	690	553	2
1782	3286	32	61	5	chr3	157016420	157016795	-2582988	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1782	1474	206	56	70	chr3	157016795	157017086	-2582697	-	RMER6C	LTR	ERVK	-138	552	269	2
1782	260	174	22	0	chr3	157017090	157017136	-2582647	-	RMER6C	LTR	ERVK	-673	47	1	2
1782	1266	192	249	0	chr3	157019114	157019411	-2580372	+	ORR1D1	LTR	MaLR	4	374	0	3
1782	470	250	179	48	chr3	157023354	157023522	-2576261	+	RMER20B	LTR	ERVK	126	315	-312	3
1783	1267	194	168	105	chr3	157025618	157026124	-2573659	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-5	548	11	3
1783	1050	223	199	16	chr3	157041555	157041861	-2557922	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	362	-12	5
1783	2019	125	19	139	chr3	157042448	157042674	-2557109	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	190	-220	6
1783	2019	125	19	139	chr3	157042830	157043069	-2556714	+	RMER17C	LTR	ERVK	191	410	0	6
1783	427	329	167	14	chr3	157044025	157044235	-2555548	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	242	-314	6
1783	2306	124	113	3	chr3	157044665	157045020	-2554763	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	6
1783	1291	231	167	0	chr3	157046854	157047201	-2552582	+	MTC	LTR	MaLR	17	421	0	6
1783	3821	52	34	17	chr3	157048369	157048836	-2550947	+	MT2C_Mm	LTR	ERVL	1	475	0	7
1783	2095	149	50	20	chr3	157051408	157051607	-2548176	+	RMER17C	LTR	ERVK	1	210	-200	7
1783	2095	149	50	20	chr3	157051736	157051934	-2547849	+	RMER17C	LTR	ERVK	211	409	-1	7
1783	328	295	88	75	chr3	157052352	157052579	-2547204	+	RMER15	LTR	ERVL	346	575	0	7
1783	312	267	117	25	chr3	157059630	157059826	-2539957	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	164	8
1783	267	275	11	0	chr3	157061851	157061942	-2537841	+	MLT1A1	LTR	MaLR	315	406	-2	8
1783	2925	78	7	27	chr3	157064464	157064875	-2534908	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	403	-4	9
1783	905	251	155	27	chr3	157064882	157064929	-2534854	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	46	-333	9
1783	2279	227	11	92	chr3	157064929	157065594	-2534189	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	9
1783	905	251	155	27	chr3	157065594	157065882	-2533901	+	MTE2b	LTR	MaLR	47	379	0	9
1783	969	180	23	37	chr3	157068961	157069175	-2530608	+	MTD	LTR	MaLR	1	211	-208	9
1783	853	201	32	18	chr3	157069465	157069647	-2530136	+	MTD	LTR	MaLR	196	381	-38	9
1783	1277	189	200	6	chr3	157069647	157069844	-2529939	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	171	9
1783	1277	189	200	6	chr3	157069909	157070031	-2529752	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-214	170	5	9
1783	853	201	32	18	chr3	157070031	157070066	-2529717	+	MTD	LTR	MaLR	382	416	-3	9
1783	602	291	75	5	chr3	157070688	157070888	-2528895	-	MTE2b	LTR	MaLR	-61	318	105	1
1783	2358	100	127	3	chr3	157086553	157086924	-2512859	+	RLTR9B2	LTR	ERVK	1	417	-3	1
1783	424	359	20	15	chr3	157093231	157093432	-2506351	+	LTR89	LTR	ERVL?	291	492	-387	1
1783	7178	91	3	57	chr3	157094821	157095860	-2503923	+	RLTR13C1	LTR	ERVK	1	983	0	1
1783	498	292	203	7	chr3	157096640	157096950	-2502833	+	MLT1B	LTR	MaLR	4	374	-16	1
1783	229	234	52	21	chr3	157100620	157100716	-2499067	+	MLT2B1	LTR	ERVL	20	118	-438	1
1783	336	284	98	14	chr3	157101212	157101355	-2498428	+	MLT2B1	LTR	ERVL	339	493	-74	1
1783	1625	20	0	14	chr3	157115566	157115773	-2484010	-	IAPEY2_LTR	LTR	ERVK	0	357	154	1
1783	310	138	33	33	chr3	157115779	157115839	-2483944	-	MTC	LTR	MaLR	-351	70	11	1
1783	568	279	11	60	chr3	157117113	157117391	-2482392	+	RMER15	LTR	ERVL	28	383	-192	1
1783	585	270	71	52	chr3	157117393	157117832	-2481951	-	RLTR12B	LTR	ERVK	-14	514	20	1
1783	564	254	46	36	chr3	157117826	157117871	-2481912	+	RMER15	LTR	ERVL	378	422	-153	1
1783	1765	227	55	8	chr3	157117871	157118270	-2481513	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	2	1
1783	564	254	46	36	chr3	157118270	157118420	-2481363	+	RMER15	LTR	ERVL	423	575	0	1
1783	705	258	87	36	chr3	157131402	157131655	-2468128	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	139	1
1783	592	255	49	53	chr3	157131628	157131728	-2468055	-	MTC	LTR	MaLR	-178	243	140	1
1783	2552	162	52	50	chr3	157131728	157132288	-2467495	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	1
1783	592	255	49	53	chr3	157132288	157132431	-2467352	-	MTC	LTR	MaLR	-282	139	1	1
1783	1454	153	24	9	chr3	157132917	157133241	-2466542	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1783	844	232	89	36	chr3	157135984	157136304	-2463479	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	8	1
1783	2241	52	71	0	chr3	157138580	157138889	-2460894	-	IAPEY_LTR	LTR	ERVK	0	385	55	1
1783	254	278	40	134	chr3	157144133	157144357	-2455426	+	MLT1B	LTR	MaLR	129	331	-59	1
1783	367	321	94	70	chr3	157144439	157144717	-2455066	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5407	5682	-32	1
1783	367	321	94	70	chr3	157144776	157144795	-2454988	+	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	5683	5710	-4	1
1783	295	273	70	43	chr3	157144807	157144922	-2454861	+	MLT2B4	LTR	ERVL	1	118	-438	1
1783	388	206	92	42	chr3	157146140	157146282	-2453501	-	ORR1E	LTR	MaLR	-210	149	1	1
1783	1884	136	24	70	chr3	157152209	157152580	-2447203	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	41	1
1784	1051	154	131	0	chr3	157157477	157157691	-2442092	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	242	-152	1
1784	3815	117	8	105	chr3	157158601	157159365	-2440418	+	MTB-int	LTR	MaLR	409	1098	0	1
1784	3192	65	8	2	chr3	157159365	157159763	-2440020	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	1
1784	686	208	160	60	chr3	157160546	157160866	-2438917	-	MTD	LTR	MaLR	-15	404	9	2
1784	329	317	119	88	chr3	157169269	157169587	-2430196	-	MTEa	LTR	MaLR	-49	330	3	2
1784	655	285	147	112	chr3	157170285	157170787	-2428996	-	MLT2B4	LTR	ERVL	0	520	1	2
1784	302	340	85	55	chr3	157171085	157171250	-2428533	+	MLT1K	LTR	MaLR	410	579	-16	2
1784	638	300	122	121	chr3	157171554	157172290	-2427493	-	LTR41B	LTR	ERVL	-2	756	20	2
1784	2789	147	133	55	chr3	157177011	157177537	-2422246	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	2
1784	532	298	177	16	chr3	157178998	157179247	-2420536	-	MLT1A	LTR	MaLR	-85	289	1	2
1784	1578	176	60	156	chr3	157181761	157182179	-2417604	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
1784	299	284	51	142	chr3	157184552	157184806	-2414977	+	RMER2	LTR	ERV1	337	567	0	2
1784	773	348	85	34	chr3	157186880	157187267	-2412516	-	LTR80A	LTR	ERVL	-14	569	163	2
1784	345	306	137	0	chr3	157190735	157190859	-2408924	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	19	159	-521	2
1784	802	296	99	30	chr3	157190945	157191307	-2408476	+	MLT1E1A	LTR	MaLR	286	672	-8	2
1784	668	316	49	107	chr3	157212575	157213007	-2386776	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	1	2
1784	1139	152	200	8	chr3	157213099	157213344	-2386439	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-71	296	5	2
1784	595	238	261	21	chr3	157218569	157218856	-2380927	-	MTE2a	LTR	MaLR	-6	373	18	2
1784	3689	132	91	5	chr3	157219207	157219559	-2380224	-	RLTR33	LTR	ERVK	0	678	275	2
1784	1197	225	296	14	chr3	157219559	157220001	-2379782	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	2
1784	3689	132	91	5	chr3	157220001	157220267	-2379516	-	RLTR33	LTR	ERVK	-404	274	7	2
1784	3195	152	109	6	chr3	157220779	157221471	-2378312	+	RLTR25B	LTR	ERVK	1	835	-268	2
1784	529	256	388	0	chr3	157222711	157222984	-2376799	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	2
1784	977	237	151	32	chr3	157222992	157223105	-2376678	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-8	1572	1452	2
1784	977	237	151	32	chr3	157223822	157224112	-2375671	-	MTEa-int	LTR	MaLR	-134	1446	1115	2
1784	810	277	143	41	chr3	157224183	157224525	-2375258	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	3	2
1784	601	277	68	109	chr3	157225190	157225631	-2374152	+	RLTR23	LTR	ERV1	8	430	0	2
1784	269	230	353	7	chr3	157241499	157241635	-2358148	+	MTEb	LTR	MaLR	1	183	-196	3
1784	492	223	45	23	chr3	157241656	157241789	-2357994	+	MTEb	LTR	MaLR	244	379	0	3
1784	1935	181	38	24	chr3	157248985	157249354	-2350429	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	3
1784	2003	164	5	47	chr3	157258100	157258528	-2341255	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	3
1784	2729	94	18	0	chr3	157259058	157259453	-2340330	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	6	407	0	3
1784	436	232	113	11	chr3	157260740	157260891	-2338892	+	MTD	LTR	MaLR	231	405	-14	3
1784	311	300	54	0	chr3	157262995	157263125	-2336658	-	MLT1A	LTR	MaLR	-2	503	367	3
1784	550	342	68	19	chr3	157264873	157265097	-2334686	-	MLT1A	LTR	MaLR	-49	325	98	3
1784	2400	78	25	0	chr3	157265097	157265416	-2334367	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	3
1784	550	342	68	19	chr3	157265416	157265501	-2334282	-	MLT1A	LTR	MaLR	-277	97	2	3
1784	1336	146	21	16	chr3	157265694	157265939	-2333844	+	MTC	LTR	MaLR	1	242	-179	3
1784	1049	251	22	162	chr3	157266004	157266214	-2333569	+	MTC	LTR	MaLR	232	392	-8	3
1785	792	311	142	19	chr3	157292640	157293050	-2306733	-	MLT1J	LTR	MaLR	-33	479	20	3
1785	362	230	45	11	chr3	157295866	157295954	-2303829	+	ORR1E	LTR	MaLR	10	100	-274	3
1785	321	218	24	60	chr3	157296002	157296085	-2303698	+	ORR1E	LTR	MaLR	21	100	-274	3
1785	498	310	115	74	chr3	157296218	157296556	-2303227	-	ORR1E	LTR	MaLR	-2	357	6	3
1785	1026	299	48	48	chr3	157296603	157296979	-2302804	-	MTEb	LTR	MaLR	-1	378	3	3
1785	476	230	27	38	chr3	157297317	157297449	-2302334	-	MTD	LTR	MaLR	-13	406	263	3
1785	535	307	128	17	chr3	157320234	157320469	-2279314	-	MLT1C	LTR	MaLR	-4	463	203	4
1785	367	269	101	50	chr3	157328696	157328915	-2270868	-	MLT1B	LTR	MaLR	-69	321	92	4
1785	719	194	14	0	chr3	157329681	157329820	-2269963	-	RLTR25B	LTR	ERVK	0	1028	888	4
1785	292	132	136	62	chr3	157330126	157330207	-2269576	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-218	885	799	4
1785	3437	184	38	35	chr3	157341693	157342430	-2257353	-	RLTR25B	LTR	ERVK	-289	739	1	4
1785	1677	175	73	3	chr3	157344346	157344673	-2255110	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-17	350	1	4
1785	560	128	21	0	chr3	157355594	157355688	-2244095	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	96	-278	4
1785	375	320	67	94	chr3	157357551	157357627	-2242156	-	LTR16C	LTR	ERVL	-13	476	403	4
1785	375	320	67	94	chr3	157357818	157357965	-2241818	-	LTR16C	LTR	ERVL	-87	402	259	4
1785	917	241	52	173	chr3	157362418	157362845	-2236938	-	MTEb	LTR	MaLR	-4	375	1	4
1785	3526	15	5	0	chr3	157365338	157365732	-2234051	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1785	9848	11	1	3	chr3	157365732	157366832	-2232951	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
1785	4618	4	0	0	chr3	157366834	157367327	-2232456	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
1785	910	304	67	16	chr3	157368088	157368440	-2231343	-	MTE2b	LTR	MaLR	-11	368	22	4
1785	343	261	116	28	chr3	157374955	157375117	-2224666	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-32	648	470	4
1785	407	308	88	19	chr3	157375138	157375343	-2224440	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-422	258	40	4
1785	2104	126	3	6	chr3	157383327	157383639	-2216144	-	RLTR10E	LTR	ERVK	0	311	1	4
1785	2124	179	31	24	chr3	157385134	157385552	-2214231	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	4
1785	2633	116	7	44	chr3	157387898	157388010	-2211773	+	MT2B2	LTR	ERVL	1	111	-473	4
1785	2800	126	22	42	chr3	157388197	157388537	-2211246	+	MT2B2	LTR	ERVL	112	444	-140	4
1785	4446	14	0	0	chr3	157389179	157389672	-2210111	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	4
1785	1378	168	224	20	chr3	157391460	157391895	-2207888	+	RLTR28B	LTR	ERVL	1	524	0	4
1785	736	228	335	0	chr3	157394827	157395088	-2204695	-	MTE2b	LTR	MaLR	-8	371	22	5
1785	443	283	116	55	chr3	157396689	157396835	-2202948	+	MTEa	LTR	MaLR	209	363	-16	5
1785	6619	50	4	4	chr3	157398065	157398870	-2200913	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	-1	805	1	5
1785	4874	127	12	43	chr3	157404458	157405290	-2194493	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	806	1	5
1785	352	329	158	22	chr3	157410788	157411099	-2188684	+	ORR1E	LTR	MaLR	7	359	0	5
1785	580	285	75	130	chr3	157412109	157412416	-2187367	-	MTE-int	LTR	MaLR	-1107	473	184	5
1785	1163	262	92	0	chr3	157412709	157413003	-2186780	-	MTEa	LTR	MaLR	-9	370	50	5
1786	310	267	99	169	chr3	157420248	157420591	-2179192	-	MER110A	LTR	ERV1	-110	358	40	5
1786	1910	136	28	9	chr3	157421245	157421564	-2178219	-	ORR1A4	LTR	MaLR	0	329	5	5
1786	292	331	44	88	chr3	157423213	157423372	-2176411	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	247	5
1786	2223	157	24	3	chr3	157425224	157425595	-2174188	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-5	379	1	5
1786	663	245	35	85	chr3	157427447	157427648	-2172135	+	ORR1E	LTR	MaLR	167	357	-2	5
1786	1556	145	102	11	chr3	157433305	157433590	-2166193	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	351	-43	5
1786	276	89	0	0	chr3	157435349	157435394	-2164389	+	RMER4B	LTR	ERVK	17	61	-405	5
1786	474	278	80	83	chr3	157435406	157435743	-2164040	-	RLTR15	LTR	ERVK	-21	338	3	5
1786	1278	217	110	26	chr3	157435743	157436190	-2163593	+	RMER4B	LTR	ERVK	56	578	-7	5
1786	232	226	24	184	chr3	157436367	157436415	-2163368	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-114	1273	1238	5
1786	232	226	24	184	chr3	157436489	157436565	-2163218	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-150	1237	1169	5
1786	307	322	148	55	chr3	157441249	157441594	-2158189	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	1	5
1786	725	248	170	122	chr3	157445734	157446087	-2153696	-	MTEa	LTR	MaLR	-8	371	2	5
1786	225	316	0	17	chr3	157448529	157448587	-2151196	+	MLT1H2	LTR	MaLR	64	120	-369	5
1786	448	305	116	62	chr3	157448667	157448891	-2150892	-	ORR1E	LTR	MaLR	-123	236	1	6
1786	556	324	43	39	chr3	157454120	157454206	-2145577	-	RMER15	LTR	ERVL	-18	557	475	6
1786	556	324	43	39	chr3	157454621	157454791	-2144992	-	RMER15	LTR	ERVL	-101	474	300	6
1786	364	346	69	42	chr3	157457449	157457666	-2142117	+	MLT1E	LTR	MaLR	391	613	-40	6
1786	471	291	184	7	chr3	157461515	157461794	-2137989	+	LTR53	LTR	ERVL	2	329	-190	6
1786	232	330	15	152	chr3	157461943	157462147	-2137636	-	MLT1L	LTR	MaLR	-338	272	97	6
1786	430	300	125	23	chr3	157463327	157463583	-2136200	+	MLT1D	LTR	MaLR	33	314	-191	6
1786	463	310	97	21	chr3	157465537	157465802	-2133981	+	MLT1F1	LTR	MaLR	174	485	-84	6
1786	1724	171	88	13	chr3	157465802	157466188	-2133595	+	RLTR9F	LTR	ERVK	1	415	0	6
1786	463	309	104	9	chr3	157466188	157466242	-2133541	+	MLT1F1	LTR	MaLR	486	540	-29	6
1786	3810	15	0	0	chr3	157474063	157474459	-2125324	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	6
1786	736	71	0	0	chr3	157478908	157479006	-2120777	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	3	100	-307	6
1786	3982	90	17	24	chr3	157479302	157479894	-2119889	-	RLTR19-int	LTR	ERVK	-4121	2016	1429	6
1786	2600	95	3	9	chr3	157489180	157489509	-2110274	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	6
1786	422	188	149	18	chr3	157493406	157493520	-2106263	-	RMER12	LTR	ERVK	-5	1317	1189	6
1786	364	257	47	165	chr3	157493506	157493540	-2106243	-	RMER12	LTR	ERVK	-224	1348	1315	6
1786	4503	159	23	87	chr3	157494030	157495126	-2104657	-	RMER12	LTR	ERVK	-258	1314	1	6
1786	231	333	38	68	chr3	157495244	157495376	-2104407	-	MLT1J	LTR	MaLR	-316	196	69	6
1786	281	311	65	43	chr3	157500669	157500807	-2098976	-	MER110	LTR	ERV1	0	491	351	3
1786	4621	125	77	76	chr3	157511453	157511763	-2088020	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	370	-536	2
1786	4621	125	77	76	chr3	157511796	157512378	-2087405	+	RMER17A2	LTR	ERVK	371	893	-13	2
1786	260	140	0	95	chr3	157515598	157515661	-2084122	-	RMER16-int	LTR	ERVK	-2761	2645	2589	3
1786	1328	258	61	64	chr3	157517406	157517783	-2082000	+	MTEa	LTR	MaLR	1	376	-3	3
1786	620	315	38	74	chr3	157524334	157524700	-2075083	-	RLTR26	LTR	ERVK	-212	430	41	5
1786	2248	164	78	14	chr3	157524822	157525192	-2074591	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	5
1786	663	291	117	46	chr3	157527080	157527516	-2072267	+	MER110A	LTR	ERV1	2	468	0	6
1786	1298	166	32	45	chr3	157528235	157528481	-2071302	-	RLTR20B3	LTR	ERVK	-9	568	326	6
1786	267	206	14	87	chr3	157528485	157528554	-2071229	+	RLTR20B3	LTR	ERVK	505	568	-9	6
1786	483	276	76	65	chr3	157535157	157535432	-2064351	+	MLT1A0	LTR	MaLR	10	287	-78	8
1786	593	270	26	42	chr3	157535486	157535679	-2064104	+	MTE2a	LTR	MaLR	177	366	-13	8
1786	1310	130	0	55	chr3	157537519	157537617	-2062166	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-2	325	238	8
1786	1310	130	0	55	chr3	157538289	157538409	-2061374	-	ORR1A2	LTR	MaLR	-90	237	119	8
1786	2453	162	177	2	chr3	157541312	157541764	-2058019	-	MT2A	LTR	ERVL	0	533	3	9
1786	339	314	35	21	chr3	157543191	157543334	-2056449	+	MLT1A1	LTR	MaLR	264	408	0	9
1786	1885	170	64	25	chr3	157544545	157544938	-2054845	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	1	1
1786	1217	222	167	15	chr3	157546778	157547102	-2052681	+	MTEb	LTR	MaLR	7	379	0	1
1787	457	214	88	88	chr3	157551954	157552113	-2047670	+	MLT1A	LTR	MaLR	1	159	-215	1
1787	2345	193	100	134	chr3	157553157	157553525	-2046258	+	RMER12	LTR	ERVK	33	365	-957	1
1787	2345	196	106	137	chr3	157553672	157554189	-2045594	+	RMER12	LTR	ERVK	366	1293	-279	1
1787	557	220	174	165	chr3	157554231	157554304	-2045479	+	RMER12	LTR	ERVK	1294	1314	-258	1
1787	557	220	174	165	chr3	157554351	157554559	-2045224	+	RMER12	LTR	ERVK	1315	1572	0	1
1787	1885	184	77	11	chr3	157555970	157556349	-2043434	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	2	1
1787	1103	244	91	51	chr3	157561377	157561508	-2038275	+	MTD	LTR	MaLR	25	159	-260	1
1787	1103	244	91	51	chr3	157561536	157561776	-2038007	+	MTD	LTR	MaLR	160	411	-8	1
1787	232	269	55	7	chr3	157562765	157562803	-2036980	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	602	646	-863	1
1787	2440	144	37	12	chr3	157563636	157564045	-2035738	+	MTC	LTR	MaLR	1	419	-2	1
1787	1605	244	0	37	chr3	157564956	157565331	-2034452	+	RMER12B	LTR	ERVK	14	374	-1030	1
1787	595	270	205	20	chr3	157565338	157565640	-2034143	+	RMER12B	LTR	ERVK	501	858	-546	1
1787	345	236	55	93	chr3	157565729	157565911	-2033872	+	RMER12	LTR	ERVK	568	742	-580	1
1787	581	214	186	36	chr3	157565970	157566164	-2033619	+	RMER12B	LTR	ERVK	993	1215	-107	1
1787	1982	184	117	21	chr3	157567164	157567538	-2032245	+	RMER5	LTR	ERV1	1	391	-143	1
1787	2548	59	71	0	chr3	157567538	157567861	-2031922	+	ORR1A1	LTR	MaLR	1	346	0	1
1787	1982	184	117	21	chr3	157567861	157567964	-2031819	+	RMER5	LTR	ERV1	392	524	-10	1
1787	2598	152	88	155	chr3	157572009	157572396	-2027387	+	RMER12	LTR	ERVK	1	426	-896	1
1787	2598	152	88	155	chr3	157572501	157572908	-2026875	+	RMER12	LTR	ERVK	427	742	-580	1
1787	850	174	7	262	chr3	157572922	157573326	-2026457	+	RMER12	LTR	ERVK	975	1275	-47	1
1787	468	302	47	0	chr3	157575031	157575203	-2024580	+	MLT1A0	LTR	MaLR	2	181	-184	1
1787	2102	160	68	10	chr3	157575897	157576295	-2023488	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	1	1
1787	1520	160	159	6	chr3	157587306	157587652	-2012131	-	MTC	LTR	MaLR	-21	400	2	2
1787	379	200	8	160	chr3	157592737	157592868	-2006915	+	MT2B	LTR	ERVL	146	256	-345	2
1787	2097	143	59	15	chr3	157594887	157595291	-2004492	-	RLTR9B	LTR	ERVK	-13	424	3	2
1787	915	237	160	62	chr3	157596314	157596426	-2003357	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	2	108	-419	2
1787	915	237	160	62	chr3	157596574	157596848	-2002935	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	109	426	-101	2
1787	523	149	84	0	chr3	157596992	157597099	-2002684	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	412	527	0	2
1787	1744	149	46	3	chr3	157598089	157598413	-2001370	+	RMER4B	LTR	ERVK	247	584	-1	2
1787	454	225	11	11	chr3	157599420	157599510	-2000273	+	RMER20B	LTR	ERVK	10	99	-528	2
1787	966	191	382	11	chr3	157599563	157599997	-1999786	+	RMER20B	LTR	ERVK	10	603	-24	2
1787	2153	131	23	6	chr3	157600120	157600473	-1999310	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	2
1787	3053	94	7	53	chr3	157600913	157601364	-1998419	+	RLTR23	LTR	ERV1	1	430	0	2
1787	767	292	137	21	chr3	157602544	157602586	-1997197	+	RMER5	LTR	ERV1	77	133	-401	2
1787	1703	186	93	14	chr3	157602586	157602951	-1996832	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	1	2
1787	767	292	137	21	chr3	157602951	157603244	-1996539	+	RMER5	LTR	ERV1	134	451	-83	2
1787	2167	130	33	239	chr3	157603316	157603610	-1996173	+	RLTR24	LTR	ERV1	2	184	-345	2
1787	2167	130	33	239	chr3	157603640	157604010	-1995773	+	RLTR24	LTR	ERV1	185	529	0	2
1787	4425	12	0	0	chr3	157604466	157604948	-1994835	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
1787	6459	57	13	24	chr3	157607003	157607607	-1992176	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	1	599	-294	2
1787	6459	57	13	24	chr3	157607860	157608158	-1991625	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	600	893	0	2
1787	3389	25	8	8	chr3	157611460	157611856	-1987927	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1787	1391	117	157	21	chr3	157614504	157614784	-1984999	-	ORR1A3	LTR	MaLR	-8	318	1	2
1787	789	226	22	16	chr3	157626096	157626280	-1973503	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-2993	2006	1822	3
1787	493	231	112	0	chr3	157626331	157626465	-1973318	-	RMER15-int	LTR	ERVL	-3301	1698	1550	3
1787	2652	168	38	21	chr3	157626465	157626945	-1972838	-	RMER15	LTR	ERVL	-79	496	9	3
1787	3024	176	68	59	chr3	157643584	157644493	-1955290	-	RLTR13D1	LTR	ERVK	0	855	1	3
1787	1266	274	25	51	chr3	157645624	157645978	-1953805	-	MTE2a	LTR	MaLR	-30	349	5	3
1787	14077	49	7	2	chr3	157646762	157648545	-1951238	+	ORR1A0-int	LTR	MaLR	1	1792	0	3
1787	1921	22	0	0	chr3	157648545	157648774	-1951009	+	ORR1A0	LTR	MaLR	1	229	-117	3
1787	767	296	90	28	chr3	157655613	157655968	-1943815	-	MLT2C2	LTR	ERVL	-23	441	65	3
1787	284	255	191	25	chr3	157672070	157672227	-1927556	+	MLT2F	LTR	ERVL	288	470	-193	3
1787	621	176	288	45	chr3	157672599	157672965	-1926818	-	RMER4A	LTR	ERVK	-14	452	17	3
1788	1024	272	90	57	chr3	157700438	157700805	-1898978	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	379	0	4
1788	1151	251	84	71	chr3	157700806	157701200	-1898583	+	MTE2a-int	LTR	MaLR	3	401	-1179	4
1788	255	254	32	0	chr3	157701326	157701389	-1898394	+	MTE2a	LTR	MaLR	56	120	-259	4
1788	522	131	317	8	chr3	157701855	157701978	-1897805	-	MTC	LTR	MaLR	0	421	261	4
1788	566	224	93	51	chr3	157702943	157703197	-1896586	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	4
1788	1270	204	180	43	chr3	157718802	157719129	-1880654	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-2	372	1	4
1788	232	274	171	49	chr3	157719342	157719465	-1880318	-	RLTR20A	LTR	ERVK	-344	197	60	4
1788	353	279	54	62	chr3	157755210	157755340	-1844443	+	ORR1E	LTR	MaLR	64	192	-167	5
1788	824	308	164	31	chr3	157769446	157769892	-1829891	-	MLT1D	LTR	MaLR	0	505	1	5
1788	1353	252	38	19	chr3	157772239	157772611	-1827172	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	5
1788	1088	255	109	47	chr3	157774670	157775008	-1824775	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	359	0	5
1788	5516	104	44	1	chr3	157782153	157782905	-1816878	+	RMER12	LTR	ERVK	1	780	-542	5
1788	5516	104	44	1	chr3	157782939	157783026	-1816757	+	RMER12	LTR	ERVK	781	875	-447	5
1789	249	250	11	149	chr3	157814492	157814586	-1785197	+	MT2B2	LTR	ERVL	161	241	-343	5
1789	1358	315	42	24	chr3	157851879	157852335	-1747448	+	MER21B	LTR	ERV1	5	468	-395	6
1789	2674	173	19	78	chr3	157866239	157866779	-1733004	+	RLTR18B	LTR	ERVK	1	508	-4	6
1789	323	331	77	50	chr3	157869241	157869422	-1730361	-	LTR16A	LTR	ERVL	-230	221	36	6
1789	242	254	14	14	chr3	157875188	157875260	-1724523	-	MLT1A1	LTR	MaLR	0	408	337	6
1789	251	349	45	45	chr3	157875461	157875593	-1724190	-	ORR1E	LTR	MaLR	-222	137	6	6
1789	4712	90	24	62	chr3	157881792	157882572	-1717211	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	1	6
1789	1370	229	164	0	chr3	157886017	157886370	-1713413	-	MTD	LTR	MaLR	-8	411	1	6
1789	460	275	42	7	chr3	157886370	157886513	-1713270	-	MTD-int	LTR	MaLR	0	1258	1111	6
1789	3254	226	122	57	chr3	157886782	157887762	-1712021	-	MTD-int	LTR	MaLR	-151	1107	64	6
1789	478	233	29	19	chr3	157887734	157887839	-1711944	-	MTD	LTR	MaLR	-313	106	1	6
1789	497	311	112	72	chr3	157900504	157900809	-1698974	+	MLT1A0	LTR	MaLR	30	346	-19	6
1789	2156	125	44	44	chr3	157900916	157901283	-1698500	+	ORR1B2	LTR	MaLR	1	367	0	6
1789	241	326	99	53	chr3	157931497	157931545	-1668238	+	MLT1B	LTR	MaLR	139	197	-193	7
1789	241	326	99	53	chr3	157931578	157931681	-1668102	+	MLT1B	LTR	MaLR	198	297	-93	7
1790	389	279	35	35	chr3	157948186	157948331	-1651452	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1223	1367	-4155	7
1790	4057	126	134	68	chr3	157955258	157956103	-1643680	+	RLTR13D6	LTR	ERVK	2	902	0	7
1790	268	252	64	7	chr3	157964940	157964972	-1634811	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	607	646	-863	7
1790	1915	208	75	3	chr3	157973954	157974339	-1625444	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	1	7
1790	1325	232	35	76	chr3	157984807	157985473	-1614310	-	RLTR18	LTR	ERVK	-6	506	12	8
1790	7167	154	24	18	chr3	157986137	157987443	-1612340	+	RMER12B	LTR	ERVK	1	1263	-141	8
1790	636	270	101	36	chr3	157987466	157987597	-1612186	+	RMER12B	LTR	ERVK	1264	1404	0	8
1790	389	274	81	25	chr3	158028473	158028634	-1571149	+	MLT1C	LTR	MaLR	1	170	-297	3
1790	264	310	76	19	chr3	158039000	158039158	-1560625	-	LTR55	LTR	ERV	-28	520	354	4
1790	863	251	104	67	chr3	158046673	158047019	-1552764	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	6
1790	12409	87	13	45	chr3	158049485	158051344	-1548439	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	1804	-44	6
1790	12409	87	13	45	chr3	158052095	158052131	-1547652	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1805	1844	-4	6
1790	5489	97	9	7	chr3	158067887	158068697	-1531086	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1	811	-1037	9
1790	293	309	121	73	chr3	158068874	158069080	-1530703	+	RMER12	LTR	ERVK	1101	1316	-6	9
1791	345	353	45	50	chr3	158080167	158080367	-1519416	-	LTR16C	LTR	ERVL	-13	476	278	1
1791	1566	181	165	0	chr3	158082994	158083315	-1516468	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	1
1791	278	308	47	19	chr3	158083557	158083663	-1516120	+	RMER15	LTR	ERVL	277	385	-190	1
1791	254	310	129	0	chr3	158083688	158083804	-1515979	+	RMER15	LTR	ERVL	444	574	-1	1
1791	1527	154	297	19	chr3	158086477	158086800	-1512983	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	1
1791	278	293	173	0	chr3	158089069	158089202	-1510581	+	RMER15	LTR	ERVL	405	560	-15	1
1791	292	368	148	40	chr3	158089699	158090320	-1509463	+	LTR78	LTR	ERV1	469	1156	-148	1
1791	461	323	108	5	chr3	158094124	158094376	-1505407	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	281	-116	1
1791	318	311	104	0	chr3	158094351	158094457	-1505326	+	MLT2D	LTR	ERVL	419	535	-24	1
1791	466	284	169	57	chr3	158095429	158095866	-1503917	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-28	492	7	1
1791	1160	227	83	18	chr3	158100033	158100370	-1499413	-	RLTR10D	LTR	ERVK	0	359	1	1
1791	541	290	131	57	chr3	158103598	158103934	-1495849	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	5	1
1791	302	228	42	42	chr3	158104124	158104220	-1495563	+	MLT1E	LTR	MaLR	191	286	-367	1
1791	259	359	50	58	chr3	158104252	158104497	-1495286	+	MLT1E	LTR	MaLR	328	672	-8	1
1791	2863	56	5	3	chr3	158111670	158112047	-1487736	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	19	1
1791	2769	158	23	19	chr3	158112263	158112787	-1486996	+	RLTR11A2	LTR	ERVK	1	526	-1	1
1791	364	329	115	32	chr3	158116373	158116590	-1483193	+	MLT1A	LTR	MaLR	68	302	-72	1
1791	1860	241	14	48	chr3	158122301	158122719	-1477064	-	MTD	LTR	MaLR	-14	405	2	1
1791	229	313	59	29	chr3	158130097	158130199	-1469584	+	MLT1A	LTR	MaLR	7	111	-263	1
1791	313	309	154	39	chr3	158131414	158131745	-1468038	+	MLT1B	LTR	MaLR	10	382	-8	1
1791	1888	191	47	6	chr3	158134615	158134974	-1464809	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	5	1
1791	2298	165	23	15	chr3	158138569	158138962	-1460821	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-11	396	1	1
1791	928	231	102	0	chr3	158147123	158147339	-1452444	+	MTD	LTR	MaLR	180	417	-2	1
1791	302	313	20	20	chr3	158150005	158150106	-1449677	-	MLT1A	LTR	MaLR	-255	119	19	2
1791	381	250	18	53	chr3	158154500	158154614	-1445169	-	MTEb	LTR	MaLR	0	379	270	2
1791	2806	72	25	5	chr3	158155993	158156385	-1443398	+	MTB	LTR	MaLR	1	400	0	2
1791	330	261	65	36	chr3	158158885	158159024	-1440759	-	MTEa	LTR	MaLR	-6	373	231	2
1791	1083	279	17	103	chr3	158163865	158164272	-1435511	+	MTE2a	LTR	MaLR	8	379	0	2
1791	539	328	117	50	chr3	158169667	158170104	-1429679	+	MLT1A0-int	LTR	MaLR	600	1065	-322	2
1791	581	349	54	43	chr3	158171597	158171873	-1427910	+	MLT1A0	LTR	MaLR	77	355	-10	2
1791	1530	256	42	29	chr3	158172174	158172570	-1427213	-	MTD	LTR	MaLR	-44	375	1	2
1791	1257	217	88	37	chr3	158180130	158180484	-1419299	+	MT2A	LTR	ERVL	27	541	-60	2
1791	1491	115	24	12	chr3	158180465	158180711	-1419072	+	RMER12	LTR	ERVK	467	715	-607	2
1791	251	305	113	31	chr3	158183733	158183892	-1415891	+	MLT1C	LTR	MaLR	65	236	-231	2
1791	407	386	35	35	chr3	158183915	158184170	-1415613	+	MLT1C	LTR	MaLR	213	467	0	2
1791	300	372	71	5	chr3	158185822	158186006	-1413777	+	MLT2D	LTR	ERVL	1	196	-218	2
1791	1383	248	37	12	chr3	158188795	158189118	-1410665	-	MTC	LTR	MaLR	-8	413	83	2
1791	1553	178	4	4	chr3	158191370	158191635	-1408148	-	RMER19A	LTR	ERVK	0	737	473	2
1791	410	204	142	28	chr3	158192177	158192283	-1407500	-	RMER19A	LTR	ERVK	-312	425	308	2
1791	3638	199	56	138	chr3	158192280	158192728	-1407055	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-181	1328	935	2
1791	3638	199	56	138	chr3	158192913	158193600	-1406183	-	ORR1B1-int	LTR	MaLR	-575	934	288	2
1791	324	366	83	25	chr3	158198207	158198448	-1401335	+	ORR1E	LTR	MaLR	85	339	-20	2
1791	3169	61	5	0	chr3	158199929	158200323	-1399460	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	2
1791	2190	143	37	69	chr3	158200777	158201182	-1398601	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	392	-2	2
1791	8209	170	54	86	chr3	158201188	158203253	-1396530	+	ORR1B1-int	LTR	MaLR	3	1905	-58	2
1791	2298	167	13	10	chr3	158203253	158203646	-1396137	+	ORR1B1	LTR	MaLR	1	394	0	2
1792	261	253	92	46	chr3	158208422	158208509	-1391274	-	RLTR41	LTR	ERV1	-343	103	13	2
1792	545	297	108	14	chr3	158209523	158209735	-1390048	+	RMER15	LTR	ERVL	302	533	-42	2
1792	1708	172	121	30	chr3	158210614	158210985	-1388798	-	MTB_Mm	LTR	MaLR	-2	405	1	3
1792	434	191	42	125	chr3	158210988	158211156	-1388627	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-3	1095	942	3
1792	2720	167	19	8	chr3	158211149	158211633	-1388150	-	MTB_Mm-int	LTR	MaLR	-512	746	258	3
1792	236	221	28	42	chr3	158213032	158213103	-1386680	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-335	109	40	3
1792	1143	203	130	138	chr3	158219581	158219753	-1380030	+	ORR1C1	LTR	MaLR	5	145	-233	3
1792	1143	203	130	138	chr3	158220030	158220234	-1379549	+	ORR1C1	LTR	MaLR	146	378	0	3
1792	1210	227	131	11	chr3	158230761	158231135	-1368648	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	3
1792	1559	202	84	77	chr3	158231200	158231618	-1368165	+	MTC	LTR	MaLR	1	421	0	3
1792	861	171	6	6	chr3	158231618	158231777	-1368006	+	MTC-int	LTR	MaLR	3	161	-1097	3
1792	725	207	20	7	chr3	158232624	158232770	-1367013	+	MTC-int	LTR	MaLR	247	394	-864	3
1792	3270	142	68	58	chr3	158233996	158234601	-1365182	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	1	3
1792	3578	179	52	12	chr3	158238143	158238817	-1360966	+	MTC-int	LTR	MaLR	380	1080	-178	3
1792	896	171	32	0	chr3	158239617	158239804	-1359979	+	MTC-int	LTR	MaLR	1066	1258	0	3
1792	1666	180	174	30	chr3	158239804	158240165	-1359618	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	3
1792	1790	213	18	49	chr3	158241016	158241406	-1358377	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-6	378	1	3
1792	328	323	0	21	chr3	158250666	158250761	-1349022	+	MTEa	LTR	MaLR	6	98	-281	3
1792	439	178	0	109	chr3	158251054	158251147	-1348636	+	MTEa	LTR	MaLR	207	290	-89	3
1792	312	296	124	36	chr3	158254179	158254316	-1345467	+	LTR48	LTR	ERV1	1	149	-638	3
1792	1918	61	21	7	chr3	158254767	158255046	-1344737	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	139	3
1792	629	321	142	39	chr3	158267232	158267569	-1332214	-	MER21B	LTR	ERV1	-171	692	321	3
1792	251	347	42	0	chr3	158267776	158267848	-1331935	-	MER21B	LTR	ERV1	-777	86	12	3
1792	651	302	14	47	chr3	158272986	158273198	-1326585	-	ORR1E	LTR	MaLR	-135	224	20	3
1792	235	170	113	0	chr3	158273167	158273220	-1326563	-	ORR1E-int	LTR	MaLR	-25	1767	1709	3
1792	928	270	42	33	chr3	158287827	158288157	-1311626	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1512	336	4	3
1792	2062	106	3	70	chr3	158290876	158291232	-1308551	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	332	-5	3
1792	57480	12	4	7	chr3	158291244	158297712	-1302071	+	IAPEz-int	LTR	ERVK	35	6481	0	3
1792	2073	108	3	70	chr3	158297712	158298071	-1301712	+	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	1	335	-2	3
1792	827	267	21	0	chr3	158304477	158304664	-1295119	+	ORR1E	LTR	MaLR	3	193	-166	3
1792	1406	285	101	11	chr3	158309940	158310405	-1289378	-	RMER20A	LTR	ERVK	0	516	10	4
1792	650	271	63	40	chr3	158310414	158310637	-1289146	-	MERVK26-int	LTR	ERVK	-1	6918	6691	4
1792	1504	139	127	17	chr3	158312089	158312381	-1287402	-	IAPEY3_LTR	LTR	ERVK	-8	324	1	4
1792	764	352	62	0	chr3	158313846	158314153	-1285630	-	MLT1F	LTR	MaLR	0	548	223	4
1792	962	262	88	68	chr3	158314304	158314686	-1285097	-	MTE2a	LTR	MaLR	-13	366	10	4
1792	2122	162	93	119	chr3	158314790	158315359	-1284424	-	RLTR31B_Mm	LTR	ERVK	-2	555	2	4
1792	354	377	31	78	chr3	158330152	158330474	-1269309	+	MTE-int	LTR	MaLR	817	1123	-457	4
1792	268	232	45	34	chr3	158330644	158330733	-1269050	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	290	4
1793	1896	154	120	3	chr3	158346303	158346654	-1253129	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	3	4
1793	229	324	92	101	chr3	158346964	158347290	-1252493	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-57	327	5	4
1793	2129	208	25	10	chr3	158358024	158358431	-1241352	+	MTC	LTR	MaLR	1	413	-8	4
1793	595	149	37	0	chr3	158358434	158358536	-1241247	+	MTC-int	LTR	MaLR	2	107	-1151	4
1793	827	152	92	11	chr3	158358536	158358775	-1241008	+	RMER6A	LTR	ERVK	1	297	-459	4
1793	2550	136	55	21	chr3	158358915	158358934	-1240849	+	RMER6A	LTR	ERVK	262	281	-475	4
1793	2550	136	55	21	chr3	158359669	158359763	-1240020	+	RMER6A	LTR	ERVK	282	376	-380	4
1793	2550	136	55	21	chr3	158359824	158360184	-1239599	+	RMER6A	LTR	ERVK	377	751	-5	4
1793	284	217	17	0	chr3	158360190	158360250	-1239533	+	MTC-int	LTR	MaLR	103	163	-1095	4
1793	683	275	87	126	chr3	158367222	158367291	-1232492	+	MTC-int	LTR	MaLR	150	207	-1051	4
1793	1914	198	37	19	chr3	158367316	158367745	-1232038	+	MTC-int	LTR	MaLR	208	719	-539	4
1793	1582	178	59	73	chr3	158369057	158369415	-1230368	-	ORR1B1	LTR	MaLR	0	394	42	4
1793	1312	317	85	32	chr3	158369521	158370108	-1229675	-	MLT1E1A-int	LTR	MaLR	-214	1275	658	4
1793	346	333	115	75	chr3	158370278	158370402	-1229381	-	MLT1E1A-int	LTR	MaLR	-1100	389	278	4
1793	346	333	115	75	chr3	158370446	158370694	-1229089	-	MLT1E1A-int	LTR	MaLR	-1212	277	2	4
1793	507	328	157	20	chr3	158370695	158370950	-1228833	-	MLT1E1A	LTR	MaLR	-2	678	389	4
1793	1433	227	27	109	chr3	158373978	158374383	-1225400	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	13	4
1793	3298	51	2	0	chr3	158378764	158379159	-1220624	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	4
1793	539	278	58	54	chr3	158382030	158382235	-1217548	+	MTE-int	LTR	MaLR	774	979	-601	4
1793	2756	223	76	24	chr3	158382220	158382891	-1216892	+	RMER13A	LTR	ERVK	14	719	-141	5
1793	399	309	78	11	chr3	158382930	158383126	-1216657	+	MTE-int	LTR	MaLR	1159	1531	-49	4
1793	549	368	117	20	chr3	158385057	158385459	-1214324	-	MLT1H1	LTR	MaLR	0	555	115	5
1793	495	314	90	62	chr3	158388666	158388989	-1210794	+	MLT1A0	LTR	MaLR	17	348	-17	5
1793	270	319	105	11	chr3	158390594	158390689	-1209094	+	MLT1A0	LTR	MaLR	349	452	-139	5
1793	1774	169	45	77	chr3	158391773	158392151	-1207632	-	ORR1B2	LTR	MaLR	-1	366	1	5
1793	2034	116	103	19	chr3	158403901	158404280	-1195503	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	5
1793	3644	29	49	30	chr3	158409518	158409984	-1189799	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	5
1793	283	247	165	25	chr3	158420072	158420151	-1179632	-	RLTR20D	LTR	ERVK	0	568	479	5
1793	285	266	13	184	chr3	158422826	158422978	-1176805	+	RLTR42	LTR	ERVK	1	126	-113	5
1793	3763	232	76	61	chr3	158423139	158423610	-1176173	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	98	628	-4894	5
1793	3763	232	76	61	chr3	158423640	158424044	-1175739	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	629	1027	-4495	5
1793	3763	232	76	61	chr3	158424191	158424729	-1175054	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1028	1534	-3988	5
1793	328	262	55	33	chr3	158425841	158426009	-1173774	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1639	1795	-3727	5
1793	1905	157	103	59	chr3	158426437	158426959	-1172824	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	1926	2470	-3052	5
1793	2335	171	55	17	chr3	158426963	158427425	-1172358	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	2646	3127	-2395	5
1793	2335	171	55	17	chr3	158427488	158427501	-1172282	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3128	3139	-2383	5
1793	1612	176	21	6	chr3	158428058	158428389	-1171394	+	RLTR42-int	LTR	ERVK	3183	3518	-2004	5
1793	824	151	114	22	chr3	158435316	158435587	-1164196	+	MT2B	LTR	ERVL	1	435	-166	5
1793	801	126	258	15	chr3	158438419	158438730	-1161053	-	LTRIS5	LTR	ERV1	0	512	1	5
1793	524	344	138	37	chr3	158439461	158439787	-1159996	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	5
1793	2776	161	165	15	chr3	158440294	158440895	-1158888	-	RLTR17	LTR	ERVK	0	692	2	5
1793	286	335	53	14	chr3	158454872	158455019	-1144764	-	MTE2a	LTR	MaLR	-245	176	31	5
1793	2162	172	69	16	chr3	158458042	158458478	-1141305	-	RMER6B	LTR	ERVK	-2	459	1	5
1794	1335	258	60	58	chr3	158485180	158485333	-1114450	+	RMER5	LTR	ERV1	98	237	-297	6
1794	1335	258	60	58	chr3	158485476	158485737	-1114046	+	RMER5	LTR	ERV1	238	513	-21	6
1794	1207	265	53	50	chr3	158493570	158493928	-1105855	-	ORR1E	LTR	MaLR	0	359	1	6
1794	1345	83	0	15	chr3	158494586	158494781	-1105002	+	MTB	LTR	MaLR	1	192	-204	6
1794	1658	50	14	5	chr3	158495280	158495499	-1104284	+	MTB	LTR	MaLR	180	400	0	6
1794	4911	110	54	6	chr3	158495499	158496453	-1103330	+	MTB-int	LTR	MaLR	1	1098	0	6
1794	2792	85	5	48	chr3	158496453	158496817	-1102966	+	MTB	LTR	MaLR	1	352	-48	6
1794	2792	85	5	48	chr3	158497637	158497690	-1102093	+	MTB	LTR	MaLR	353	400	0	6
1794	959	282	107	89	chr3	158497777	158498124	-1101659	+	MTD	LTR	MaLR	3	395	-24	6
1794	234	296	104	64	chr3	158500000	158500202	-1099581	+	RMER5	LTR	ERV1	162	371	-163	1
1794	286	340	20	10	chr3	158500932	158501033	-1098750	+	RMER5	LTR	ERV1	433	534	0	1
1794	441	270	93	46	chr3	158501940	158501984	-1097799	-	RMER5	LTR	ERV1	-269	265	222	6
1794	3139	64	0	25	chr3	158501984	158502416	-1097367	+	BGLII	LTR	ERVK	1	421	0	7
1794	441	270	93	46	chr3	158502416	158502565	-1097218	-	RMER5	LTR	ERV1	-313	221	63	6
1794	283	329	73	23	chr3	158502716	158502893	-1096890	-	MER57C2	LTR	ERV1	0	434	249	9
1794	319	371	34	25	chr3	158503451	158503570	-1096213	-	LTR33B	LTR	ERVL	-325	178	59	1
1794	253	317	114	36	chr3	158505535	158505702	-1094081	-	MER57E1	LTR	ERV1	-4	368	189	1
1794	230	196	22	0	chr3	158511991	158512037	-1087746	-	LTR84b	LTR	ERVL	-631	130	84	2
1794	404	263	62	114	chr3	158512597	158512790	-1086993	+	MTE2a	LTR	MaLR	1	183	-196	2
1794	642	297	190	21	chr3	158512947	158513332	-1086451	-	RMER4A	LTR	ERVK	0	466	17	2
1794	735	295	28	5	chr3	158513469	158513680	-1086103	+	MTE2a	LTR	MaLR	164	379	0	2
1794	1045	245	95	0	chr3	158513771	158514012	-1085771	+	MTD	LTR	MaLR	1	264	-155	3
1794	321	247	86	43	chr3	158514125	158514218	-1085565	+	MLT2B1	LTR	ERVL	56	152	-262	3
1794	2764	168	95	28	chr3	158515803	158516348	-1083435	-	RMER13A	LTR	ERVK	0	860	279	3
1794	1803	156	20	79	chr3	158516348	158516378	-1083405	-	RLTR9A	LTR	ERVK	0	368	345	3
1794	2954	49	0	16	chr3	158516378	158516749	-1083034	-	RLTR10B2	LTR	ERVK	0	365	1	3
1794	1803	156	20	79	chr3	158516749	158517109	-1082674	-	RLTR9A	LTR	ERVK	-24	344	1	3
1794	1757	145	7	17	chr3	158517109	158517396	-1082387	-	RMER13A	LTR	ERVK	-576	284	1	3
1794	408	305	98	32	chr3	158517599	158517803	-1081980	+	MLT1A0	LTR	MaLR	105	344	-46	3
1794	584	333	68	51	chr3	158517814	158518168	-1081615	+	MLT-int	LTR	MaLR	2	361	-1374	3
1794	1251	282	100	6	chr3	158518139	158518478	-1081305	+	MTEa	LTR	MaLR	9	379	0	3
1794	903	256	48	18	chr3	158518572	158518799	-1080984	+	MTEb	LTR	MaLR	146	379	0	4
1794	228	295	44	33	chr3	158518725	158518816	-1080967	-	MLT1H-int	LTR	MaLR	-1041	368	277	4
1794	1914	222	76	21	chr3	158528550	158528986	-1070797	-	RLTR11A	LTR	ERVK	-68	460	1	4
1794	1029	255	93	4	chr3	158530057	158530325	-1069458	-	MTEb	LTR	MaLR	-9	370	79	4
1794	3958	28	51	0	chr3	158534393	158534862	-1064921	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1794	21384	62	11	0	chr3	158534862	158538322	-1061461	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	1	3608	-2153	5
1794	2856	39	0	3	chr3	158538322	158538660	-1061123	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	5
1794	13783	22	1	4	chr3	158538660	158540319	-1059464	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	4827	5
1794	4233	6	0	0	chr3	158540305	158540791	-1058992	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-2752	3729	3244	5
1794	20593	36	40	14	chr3	158540783	158543456	-1056327	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-3730	2751	8	5
1794	2867	36	0	3	chr3	158543456	158543794	-1055989	-	IAPLTR1a_Mm	LTR	ERVK	0	337	1	5
1794	15188	28	10	0	chr3	158543794	158545646	-1054137	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	3501	5371	-114	5
1794	306	181	26	53	chr3	158545646	158545722	-1054061	+	ORR1A3-int	LTR	MaLR	567	640	-1323	5
1794	302	0	0	0	chr3	158545722	158545760	-1054023	+	MERVL_2A-int	LTR	ERVL	5448	5485	0	5
1794	3949	30	51	0	chr3	158545760	158546229	-1053554	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	493	0	5
1794	555	326	92	30	chr3	158547496	158547799	-1051984	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-70	338	17	6
1794	1470	226	121	46	chr3	158548657	158549070	-1050713	+	RLTR41	LTR	ERV1	1	444	-2	6
1794	1282	299	45	35	chr3	158552912	158553286	-1046497	-	MTEa	LTR	MaLR	-1	378	1	6
1794	799	62	17	17	chr3	158563773	158563888	-1035895	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	115	-281	8
1794	2467	48	3	16	chr3	158565584	158565901	-1033882	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	84	396	0	8
1794	454	296	30	30	chr3	158567500	158567667	-1032116	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-3	450	284	8
1794	458	312	58	67	chr3	158567697	158568027	-1031756	-	RLTR11B	LTR	ERVK	-126	327	1	8
1794	615	187	112	16	chr3	158569782	158569907	-1029876	-	MTD	LTR	MaLR	-2	417	281	8
1794	1009	333	74	41	chr3	158570619	158571202	-1028581	-	RLTR18	LTR	ERVK	-6	610	9	8
1794	232	262	60	102	chr3	158576402	158576568	-1023215	+	LTR82A	LTR	ERVL	635	793	-79	9
1794	649	287	50	77	chr3	158580560	158580938	-1018845	-	RMER5	LTR	ERV1	-49	485	118	1
1794	339	303	88	36	chr3	158581247	158581384	-1018399	-	MTEa	LTR	MaLR	-13	366	223	1
1794	363	284	163	24	chr3	158581624	158581833	-1017950	+	MER67C	LTR	ERV1	3	240	-471	1
1794	258	308	136	8	chr3	158587029	158587147	-1012636	-	MLT1J-int	LTR	MaLR	-981	406	274	1
1795	447	348	60	66	chr3	158608664	158608996	-990787	-	ORR1E	LTR	MaLR	-23	336	7	1
1795	362	346	77	47	chr3	158612289	158612459	-987324	+	MER77	LTR	ERVL	215	389	-218	1
1795	932	203	158	153	chr3	158612549	158612683	-987100	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-8	362	242	1
1795	932	203	158	153	chr3	158612753	158612978	-986805	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-129	241	1	1
1795	1284	197	179	76	chr3	158624807	158625187	-974596	+	RLTR33	LTR	ERVK	175	593	-85	1
1795	5045	215	88	48	chr3	158628684	158629164	-970619	+	RMER12	LTR	ERVK	1	480	-842	1
1795	5045	215	88	48	chr3	158629311	158629550	-970233	+	RMER12	LTR	ERVK	481	767	-555	1
1795	5045	215	88	48	chr3	158629599	158630148	-969635	+	RMER12	LTR	ERVK	768	1320	-2	1
1795	367	316	98	29	chr3	158630813	158630986	-968797	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-4	361	177	1
1795	748	332	153	22	chr3	158632465	158632869	-966914	-	MLT2B1	LTR	ERVL	-63	457	1	1
1795	1021	267	50	79	chr3	158633410	158633830	-965953	+	MTE2b	LTR	MaLR	1	379	0	1
1795	368	271	106	31	chr3	158633978	158634138	-965645	-	ERVL-B4-int	LTR	ERVL	-1801	3913	3742	1
1795	374	280	25	8	chr3	158635072	158635191	-964592	-	RMER5	LTR	ERV1	0	534	414	1
1795	1220	239	136	16	chr3	158635518	158635841	-963942	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	362	-8	1
1795	268	410	54	15	chr3	158636162	158636365	-963418	+	MLT1E1	LTR	MaLR	388	598	-56	1
1795	228	347	31	0	chr3	158636584	158636682	-963101	-	MLT1I	LTR	MaLR	-238	173	73	1
1795	252	291	111	69	chr3	158636750	158636894	-962889	-	MLT1I-int	LTR	MaLR	-25	1384	1235	1
1795	272	348	135	43	chr3	158637105	158637387	-962396	-	MLT1I-int	LTR	MaLR	-609	800	493	1
1795	583	294	74	75	chr3	158639106	158639504	-960279	+	RMER20B	LTR	ERVK	219	602	-25	1
1795	3378	212	83	59	chr3	158659437	158660371	-939412	-	RMER17B	LTR	ERVK	-1	957	1	1
1795	279	336	35	63	chr3	158666398	158666541	-933242	+	MER76	LTR	ERVL	11	149	-542	2
1795	739	277	92	38	chr3	158670563	158670878	-928905	+	MTE-int	LTR	MaLR	1239	1570	-10	2
1795	243	232	183	0	chr3	158674168	158674249	-925534	+	MER31B	LTR	ERV1	34	129	-337	2
1795	237	308	31	62	chr3	158674249	158674346	-925437	+	MLT1A1	LTR	MaLR	1	94	-314	2
1795	315	353	117	27	chr3	158684579	158684879	-914904	-	MLT1A	LTR	MaLR	-47	327	1	2
1795	380	402	85	41	chr3	158685190	158685570	-914213	+	LTR16C	LTR	ERVL	89	538	0	2
1795	1727	212	82	5	chr3	158688040	158688429	-911354	+	MTC	LTR	MaLR	3	421	0	2
1795	4306	8	0	8	chr3	158699897	158700383	-899400	+	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	1	482	0	2
1795	1049	131	11	32	chr3	158705654	158705843	-893940	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	226	2
1795	501	304	83	12	chr3	158707622	158707862	-891921	+	RMER5	LTR	ERV1	278	534	0	2
1795	244	256	11	44	chr3	158708163	158708253	-891530	-	MLT1A1	LTR	MaLR	-4	404	318	2
1795	3518	35	28	9	chr3	158708596	158709024	-890759	+	RLTR10C	LTR	ERVK	1	436	0	2
1795	364	218	57	11	chr3	158712853	158712941	-886842	+	MER34A	LTR	ERV1	8	99	-472	2
1795	255	172	31	15	chr3	158712958	158713023	-886760	+	MER57A-int	LTR	ERV1	1100	1165	-5022	2
1795	262	284	75	33	chr3	158713165	158713285	-886498	+	MER34A	LTR	ERV1	384	508	-79	2
1795	3050	73	13	0	chr3	158713431	158713826	-885957	-	MTB	LTR	MaLR	0	400	1	2
1795	2886	38	6	0	chr3	158722591	158722935	-876848	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	2
1795	409	215	112	97	chr3	158723224	158723358	-876425	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	242	2
1795	644	296	47	55	chr3	158725930	158726184	-873599	-	MTEa	LTR	MaLR	-125	254	3	2
1796	547	262	98	33	chr3	158730457	158730767	-869016	+	ORR1D2	LTR	MaLR	1	370	0	3
1796	860	174	269	45	chr3	158731260	158731422	-868361	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-2	382	171	3
1796	860	174	269	45	chr3	158731467	158731616	-868167	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-214	170	1	3
1796	1812	188	25	58	chr3	158731888	158732290	-867493	+	ORR1B1	LTR	MaLR	3	386	-8	3
1796	1092	196	134	168	chr3	158733158	158733545	-866238	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	374	0	3
1796	298	366	16	31	chr3	158742566	158742693	-857090	+	LTR16A	LTR	ERVL	223	347	-104	3
1796	1068	180	52	79	chr3	158743432	158743789	-855994	+	RLTRETN_Mm	LTR	ERVK	6	409	0	3
1796	1972	243	38	34	chr3	158746513	158746818	-852965	+	RMER5	LTR	ERV1	13	316	-218	3
1796	1911	199	68	13	chr3	158746818	158746868	-852915	+	MTC	LTR	MaLR	1	53	-368	3
1796	1911	199	68	13	chr3	158747014	158747360	-852423	+	MTC	LTR	MaLR	54	418	-3	3
1796	1972	243	38	34	chr3	158747360	158747557	-852226	+	RMER5	LTR	ERV1	317	517	-17	3
1796	286	288	118	8	chr3	158749881	158750000	-849783	+	MLT1E3	LTR	MaLR	5	136	-488	3
1796	266	343	123	27	chr3	158750122	158750341	-849442	+	MLT1E3	LTR	MaLR	306	545	-79	3
1796	598	287	98	105	chr3	158756806	158757164	-842619	-	RLTR18	LTR	ERVK	0	616	123	3
1796	388	265	82	41	chr3	158757159	158757281	-842502	-	RLTR18B	LTR	ERVK	-312	200	74	3
1796	727	348	56	39	chr3	158758787	158759146	-840637	+	MLT1A0	LTR	MaLR	1	365	0	3
1796	2225	226	33	16	chr3	158764492	158765041	-834742	+	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	1	559	-2	3
1796	389	216	35	43	chr3	158778343	158778459	-821324	+	MTEb	LTR	MaLR	265	379	0	3
1796	2015	149	12	3	chr3	158779096	158779420	-820363	+	ORR1A2	LTR	MaLR	1	327	0	3
1796	357	284	226	52	chr3	158783550	158783855	-815928	+	MLT1A1	LTR	MaLR	7	364	-44	3
1796	2853	18	3	0	chr3	158788809	158789146	-810637	-	ORR1A0	LTR	MaLR	-8	338	1	3
1796	426	312	84	27	chr3	158794433	158794710	-805073	+	MLT1A1	LTR	MaLR	39	408	0	3
1796	307	252	163	42	chr3	158795741	158795907	-803876	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	390	205	3
1796	273	272	19	37	chr3	158796736	158796843	-802940	+	MTEb	LTR	MaLR	275	379	0	4
1796	343	283	58	0	chr3	158796852	158796972	-802811	-	MLT-int	LTR	MaLR	-213	1522	1396	4
1796	247	253	66	13	chr3	158797010	158797086	-802697	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-328	80	1	3
1796	454	261	230	24	chr3	158808426	158808738	-791045	+	RMER20B	LTR	ERVK	134	501	-126	4
1796	545	330	124	40	chr3	158809053	158809375	-790408	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-24	350	2	4
1796	1024	244	116	4	chr3	158814351	158814602	-785181	+	MTC	LTR	MaLR	91	369	-52	4
1796	302	27	0	0	chr3	158845950	158845987	-753796	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	400	364	4
1796	5261	64	19	0	chr3	158845987	158846704	-753079	+	MERVL-int	LTR	ERVL	2	732	-4753	4
1796	828	62	26	9	chr3	158846704	158846818	-752965	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-280	116	1	4
1796	6976	91	25	61	chr3	158846818	158847956	-751827	-	MTA_Mm-int	LTR	MaLR	0	1098	1	4
1796	3083	73	2	2	chr3	158847956	158848352	-751431	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	4
1796	371	259	8	41	chr3	158854039	158854160	-745623	+	RLTR14	LTR	ERV1	3	119	-263	4
1796	443	262	104	107	chr3	158854146	158854454	-745329	+	RLTR14	LTR	ERV1	76	382	0	4
1796	1507	254	22	30	chr3	158854454	158854815	-744968	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-16	358	1	4
1796	556	344	73	42	chr3	158855733	158855843	-743940	-	MLT1D	LTR	MaLR	-91	414	309	4
1796	556	344	73	42	chr3	158856032	158856209	-743574	-	MLT1D	LTR	MaLR	-197	308	118	4
224	2981	219	80	16	chr3	158858689	158859368	-740415	-	ORR1D1-int	LTR	MaLR	-648	722	1	4
1797	927	181	229	17	chr3	158859368	158859604	-740179	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	89	4
1797	905	215	79	138	chr3	158859604	158859922	-739861	+	MT2A	LTR	ERVL	1	299	-234	4
1797	3703	22	30	65	chr3	158873557	158874049	-725734	-	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	0	475	1	4
1797	1437	183	46	43	chr3	158874416	158874741	-725042	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-618	1230	905	4
1797	1615	142	15	0	chr3	158874825	158875093	-724690	-	RLTR21	LTR	ERVK	-863	709	438	4
1797	651	226	8	0	chr3	158875086	158875210	-724573	-	RLTR21	LTR	ERVK	-1446	126	2	4
1797	547	171	18	37	chr3	158888158	158888267	-711516	+	RMER12	LTR	ERVK	1216	1322	0	4
1797	227	171	0	0	chr3	158888433	158888468	-711315	-	RMER12	LTR	ERVK	-144	1178	1144	4
1797	599	292	26	122	chr3	158888565	158888869	-710914	-	RMER12	LTR	ERVK	-83	1239	965	4
1797	2746	15	95	6	chr3	158888869	158889206	-710577	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	4
1797	27577	20	1	1	chr3	158889206	158892477	-707306	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	0	6481	3210	4
1797	6231	95	125	73	chr3	158892476	158893718	-706065	-	IAPEz-int	LTR	ERVK	-5168	1313	8	4
1797	2746	15	95	6	chr3	158893718	158894055	-705728	-	IAPLTR1_Mm	LTR	ERVK	0	367	1	4
1797	2374	149	66	123	chr3	158894158	158894594	-705189	-	RMER12	LTR	ERVK	-556	766	378	4
1797	2374	149	66	123	chr3	158895230	158895458	-704325	-	RMER12	LTR	ERVK	-945	377	140	4
1797	293	308	39	148	chr3	158903234	158903463	-696320	-	LTR89	LTR	ERVL?	-655	224	21	4
1797	719	289	58	48	chr3	158904671	158904980	-694803	-	MLT1B	LTR	MaLR	-48	342	31	4
1797	809	395	66	18	chr3	158905014	158905467	-694316	+	MLT1F2	LTR	MaLR	7	481	-79	4
1797	262	270	16	16	chr3	158906675	158906739	-693044	-	MTE2a	LTR	MaLR	-73	346	283	5
1797	327	244	87	121	chr3	158913198	158913347	-686436	-	MTE2a	LTR	MaLR	-235	144	1	5
1797	6937	90	35	12	chr3	158916932	158917932	-681851	-	RLTR13D5	LTR	ERVK	0	1023	1	5
1797	1256	293	18	26	chr3	158920775	158921157	-678626	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	379	1	5
1797	833	244	144	108	chr3	158922926	158923363	-676420	-	RMER4A	LTR	ERVK	-13	453	1	5
1797	706	235	139	25	chr3	158925472	158925673	-674110	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	196	5
1797	838	279	15	0	chr3	158926284	158926485	-673298	-	MTD	LTR	MaLR	-215	204	1	5
1797	3718	126	93	54	chr3	158935514	158936237	-663546	+	RMER17A	LTR	ERVK	1	751	0	5
1797	3594	118	29	5	chr3	158938160	158938714	-661069	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	5
1797	713	253	106	15	chr3	158939489	158939719	-660064	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	246	-124	5
1797	574	257	64	7	chr3	158939857	158939998	-659785	+	ORR1D1	LTR	MaLR	185	333	-51	5
1797	948	329	28	76	chr3	158944101	158944496	-655287	-	MTEa	LTR	MaLR	-3	376	1	5
1797	711	242	12	30	chr3	158945273	158945439	-654344	+	MTC	LTR	MaLR	1	163	-258	5
1797	10769	194	15	3	chr3	158964992	158967670	-632113	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	1159	3868	-2674	5
1797	8012	183	4	3	chr3	158967727	158969228	-630555	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	3886	5387	-1155	5
1797	5293	112	0	14	chr3	158969274	158970076	-629707	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5394	6184	-358	5
1797	397	298	43	53	chr3	158970107	158970429	-629354	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	5632	5950	-531	5
1797	2527	108	0	0	chr3	158970401	158970754	-629029	+	IAP-d-int	LTR	ERVK	6190	6542	0	5
1797	2563	88	53	0	chr3	158970754	158971095	-628688	+	RLTR10D	LTR	ERVK	1	359	0	5
1797	1486	189	104	8	chr3	158971851	158972225	-627558	-	RMER17C	LTR	ERVK	0	410	1	5
1797	900	138	0	14	chr3	158972391	158972531	-627252	+	RMER13A	LTR	ERVK	154	291	-569	5
1797	632	262	18	13	chr3	158972523	158972702	-627081	+	RMER13A	LTR	ERVK	565	779	-81	5
1797	700	267	115	141	chr3	158974741	158974775	-625008	-	MT2A	LTR	ERVL	0	584	529	5
1797	1395	237	150	90	chr3	158974826	158975259	-624524	-	MT2A	LTR	ERVL	-56	528	1	5
1797	1100	298	40	20	chr3	158975354	158975700	-624083	-	MTEa	LTR	MaLR	-2	377	25	5
1797	2534	175	28	43	chr3	158976788	158977320	-622463	+	RLTR12B	LTR	ERVK	1	524	-4	5
1797	607	314	115	62	chr3	158977406	158977746	-622037	-	MLT1A0	LTR	MaLR	0	365	8	5
1797	1226	236	74	69	chr3	158978672	158979036	-620747	+	MTEa	LTR	MaLR	12	377	-2	5
1797	233	364	60	18	chr3	158981851	158982019	-617764	-	MLT1B	LTR	MaLR	-3	387	213	5
1797	364	358	53	26	chr3	158988515	158988667	-611116	-	MLT1J1	LTR	MaLR	-147	297	142	6
1797	424	167	13	12	chr3	158988974	158989051	-610732	-	RLTR20B1	LTR	ERVK	-493	70	1	6
1797	961	146	139	19	chr3	158990113	158990329	-609454	+	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	7	248	-305	6
1798	242	293	55	82	chr3	158999451	158999641	-600142	-	MTC-int	LTR	MaLR	-445	653	494	6
1798	531	280	159	62	chr3	159000273	159000593	-599190	-	ORR1E	LTR	MaLR	-3	356	6	1
1798	324	238	188	16	chr3	159009594	159009722	-590061	-	MTD	LTR	MaLR	0	379	230	7
1798	415	361	10	58	chr3	159009735	159009917	-589866	-	MTD	LTR	MaLR	-206	213	35	7
1798	415	361	10	58	chr3	159010142	159010165	-589618	-	MTD	LTR	MaLR	-385	34	18	7
1798	393	322	44	67	chr3	159010179	159010495	-589288	+	LTR37A	LTR	ERV1	116	424	-2	9
1798	767	169	24	0	chr3	159012413	159012537	-587246	-	RLTR27	LTR	ERVK	-182	127	1	1
1798	1434	153	0	22	chr3	159012537	159012804	-586979	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	0	7581	7321	1
1798	626	335	33	35	chr3	159012946	159013515	-586268	-	MMERVK10C-int	LTR	ERVK	-520	7061	6494	1
1798	758	55	0	0	chr3	159014009	159014119	-585664	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1135	852	743	1
1798	1201	60	43	16	chr3	159014177	159014363	-585420	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-1243	744	554	1
1798	279	174	0	0	chr3	159014359	159014405	-585378	-	RLTR10-int	LTR	ERVK	-7314	267	222	1
1798	1935	135	44	0	chr3	159014439	159014735	-585048	-	RLTR27	LTR	ERVK	0	309	1	1
1798	1250	212	29	32	chr3	159016703	159016886	-582897	-	MTC-int	LTR	MaLR	-437	821	639	1
1798	7256	61	2	1	chr3	159016886	159017777	-582006	+	RLTR13B1	LTR	ERVK	2	893	0	1
1798	1250	224	36	38	chr3	159017777	159017914	-581869	-	MTC-int	LTR	MaLR	-539	719	545	1
1798	3006	155	103	32	chr3	159018024	159018623	-581160	+	RLTR26	LTR	ERVK	1	642	0	1
1798	738	224	23	133	chr3	159018637	159018946	-580837	-	ORR1A3-int	LTR	MaLR	-998	965	691	1
1798	630	239	5	130	chr3	159018776	159018992	-580791	-	MT2B	LTR	ERVL	-332	269	81	2
1798	2694	179	44	14	chr3	159036859	159037410	-562373	+	RMER2	LTR	ERV1	1	567	0	3
1798	324	318	86	70	chr3	159042440	159042656	-557127	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-249	307	102	4
1798	338	246	123	0	chr3	159042871	159042985	-556798	-	MLT2B4	LTR	ERVL	-428	128	1	4
1798	521	293	38	45	chr3	159045791	159045948	-553835	+	ORR1E	LTR	MaLR	41	196	-163	5
1798	363	236	31	170	chr3	159046447	159046641	-553142	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	1575	1741	-107	5
1798	344	342	101	0	chr3	159046640	159046798	-552985	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-12	353	180	5
1798	1908	214	17	43	chr3	159047378	159047434	-552349	+	RMER6D	LTR	ERVK	312	367	-353	5
1798	1908	214	17	43	chr3	159047459	159047818	-551965	+	RMER6D	LTR	ERVK	368	716	-4	5
1798	960	308	142	12	chr3	159054516	159054848	-544935	+	MTE2b	LTR	MaLR	5	379	0	6
1798	1147	272	127	59	chr3	159056145	159056571	-543212	-	MT2A	LTR	ERVL	-3	530	76	6
1798	274	163	41	0	chr3	159056763	159056812	-542971	-	MT2A	LTR	ERVL	-482	51	1	6
1798	573	249	102	23	chr3	159062945	159063122	-536661	+	ORR1E	LTR	MaLR	1	191	-168	7
1798	413	231	33	44	chr3	159063095	159063276	-536507	+	RMER17C	LTR	ERVK	97	275	-135	7
1798	869	263	60	41	chr3	159063364	159063630	-536153	+	ORR1E	LTR	MaLR	84	354	-5	7
1798	242	360	62	50	chr3	159071673	159071834	-527949	-	MLT1G1	LTR	MaLR	-349	230	68	9
1798	1187	281	151	52	chr3	159072109	159072605	-527178	+	MT2B	LTR	ERVL	1	545	-56	9
1798	2383	202	70	16	chr3	159073727	159074230	-525553	-	RMER19C	LTR	ERVK	0	611	82	9
1798	771	231	35	89	chr3	159074691	159075004	-524779	-	RMER6B	LTR	ERVK	0	461	91	9
1798	581	205	38	108	chr3	159075051	159075076	-524707	-	RMER6B	LTR	ERVK	-371	90	67	9
1798	261	268	92	11	chr3	159083899	159083986	-515797	-	MLT1D	LTR	MaLR	-387	118	25	1
1798	3272	36	8	0	chr3	159085029	159085422	-514361	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1798	1173	214	132	44	chr3	159092634	159093179	-506604	-	RMER19B	LTR	ERVK	0	902	1	1
1798	9194	150	74	6	chr3	159094644	159096356	-503427	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-133	1830	2	1
1798	1394	116	303	0	chr3	159096357	159096608	-503175	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	1
1798	1688	238	46	32	chr3	159096609	159097168	-502615	-	RMER12	LTR	ERVK	-1279	569	1	1
1798	1696	195	10	58	chr3	159097435	159097770	-502013	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	1	321	-263	1
1798	1696	195	10	58	chr3	159097919	159097980	-501803	+	RLTR31A_Mm	LTR	ERVK	322	377	-207	1
1798	1441	98	13	6	chr3	159098584	159098924	-500859	+	RMER16	LTR	ERVK	158	533	0	1
1798	533	272	97	67	chr3	159099713	159099778	-500005	-	LTR37A	LTR	ERV1	-42	384	328	1
1798	3049	83	2	7	chr3	159099778	159100201	-499582	-	BGLII	LTR	ERVK	0	421	1	1
1798	533	272	97	67	chr3	159100201	159100434	-499349	-	LTR37A	LTR	ERV1	-99	327	77	1
1798	2718	95	5	64	chr3	159109820	159110257	-489526	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	1	1
1798	3006	133	63	11	chr3	159111454	159111473	-488310	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	0	553	535	1
1798	3006	133	63	11	chr3	159111515	159112021	-487762	-	RLTR31_Mur	LTR	ERVK	-19	534	2	1
1798	756	293	32	38	chr3	159112225	159112572	-487211	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	345	-14	1
1799	654	298	73	25	chr3	159126650	159126977	-472806	-	RLTR15	LTR	ERVK	-16	343	1	1
1799	1502	179	23	46	chr3	159127450	159127755	-472028	+	ORR1B1	LTR	MaLR	41	338	-56	1
1799	370	313	80	86	chr3	159127942	159128413	-471370	+	RLTR12B	LTR	ERVK	26	490	-37	1
1799	2407	105	73	92	chr3	159128494	159128985	-470798	+	RLTR45	LTR	ERVK	1	482	0	1
1799	3266	33	8	10	chr3	159131126	159131523	-468260	+	MTA_Mm	LTR	MaLR	1	396	0	1
1799	947	316	59	53	chr3	159132905	159133563	-466220	+	RMER12B	LTR	ERVK	454	1209	-195	1
1799	1486	180	16	101	chr3	159134440	159134817	-464966	-	RMER16	LTR	ERVK	0	533	189	1
1799	2362	179	11	5	chr3	159140537	159140985	-458798	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	309	759	-1089	1
1799	4387	156	71	71	chr3	159142343	159143301	-456482	+	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	886	1843	-5	1
1799	583	267	37	6	chr3	159144337	159144499	-455284	+	RMER15	LTR	ERVL	407	573	-2	1
1799	647	343	225	52	chr3	159144501	159144964	-454819	+	MLT1F2	LTR	MaLR	5	547	-13	1
1799	609	228	183	50	chr3	159145499	159145739	-454044	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	1
1799	1748	216	12	27	chr3	159145774	159146267	-453516	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-202	7042	6522	1
1799	2104	309	55	46	chr3	159146407	159148287	-451496	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-2050	5531	3472	1
1799	360	255	53	46	chr3	159148346	159148498	-451285	-	IAP-d-int	LTR	ERVK	-4149	2393	2241	1
1799	420	200	54	54	chr3	159148695	159148806	-450977	-	RLTR45-int	LTR	ERVK	-1559	428	318	1
1799	597	229	188	54	chr3	159148822	159149062	-450721	-	RLTR10A	LTR	ERVK	0	411	140	1
1799	1322	161	112	4	chr3	159149146	159149473	-450310	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	-213	348	1	1
1799	232	281	99	106	chr3	159151526	159151568	-448215	-	MER34A1	LTR	ERV1	-416	171	130	1
1799	232	281	99	106	chr3	159151619	159151705	-448078	-	MER34A1	LTR	ERV1	-458	129	43	1
1799	5681	83	10	38	chr3	159151705	159152531	-447252	-	RLTR13B4	LTR	ERVK	0	803	1	1
1799	232	281	99	106	chr3	159152531	159152552	-447231	-	MER34A1	LTR	ERV1	-545	42	22	1
1799	1919	180	15	58	chr3	159153959	159154354	-445429	-	ORR1C1	LTR	MaLR	0	378	1	2
1799	875	265	121	18	chr3	159155169	159155442	-444341	+	RMER15	LTR	ERVL	275	575	0	2
1799	1060	304	83	15	chr3	159155442	159155571	-444212	+	MTEb	LTR	MaLR	33	161	-218	2
1799	1060	304	83	15	chr3	159155656	159155850	-443933	+	MTEb	LTR	MaLR	162	378	-1	2
1799	636	222	0	0	chr3	159157783	159157900	-441883	-	RMER10A	LTR	ERVL	-320	122	6	2
1799	404	152	14	140	chr3	159173407	159173557	-426226	-	RMER17C	LTR	ERVK	-136	274	152	2
1799	4405	6	0	24	chr3	159173557	159174062	-425721	-	MT2_Mm	LTR	ERVL	0	493	1	2
1799	404	152	14	140	chr3	159174062	159174125	-425658	-	RMER17C	LTR	ERVK	-259	151	88	2
1799	3139	49	13	3	chr3	159176652	159177044	-422739	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	0	396	1	2
1799	786	164	0	0	chr3	159180461	159180595	-419188	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	0	527	394	2
1799	1817	163	60	44	chr3	159180697	159181082	-418701	-	RLTR11A2	LTR	ERVK	-136	391	1	2
1799	1993	150	35	3	chr3	159182142	159182490	-417293	-	RLTR15	LTR	ERVK	0	359	1	2
1799	409	380	81	69	chr3	159184127	159184565	-415218	-	MER21B	LTR	ERV1	-138	725	294	2
1799	409	380	81	69	chr3	159184588	159184658	-415125	-	MER21B	LTR	ERV1	-570	293	212	2
1799	288	284	15	0	chr3	159184744	159184811	-414972	-	MER21B	LTR	ERV1	-778	85	18	2
1799	826	268	38	110	chr3	159196874	159197193	-402590	+	RMER15	LTR	ERVL	280	575	0	2
1799	463	212	136	56	chr3	159199248	159199373	-400410	-	RMER3D-int	LTR	ERVK	-2707	135	1	2
1799	2590	192	32	14	chr3	159199373	159200024	-399759	-	RLTR31_Mm	LTR	ERVK	0	561	1	2
1799	1877	214	58	14	chr3	159201874	159202301	-397482	-	RMER13B	LTR	ERVK	0	908	463	2
1799	2765	26	0	101	chr3	159202308	159202693	-397090	-	ORR1A1	LTR	MaLR	0	346	1	2
1799	6341	68	4	30	chr3	159202693	159203601	-396182	-	ORR1A1-int	LTR	MaLR	0	1792	908	2
1799	2734	136	63	0	chr3	159203569	159203996	-395787	-	RMER13B	LTR	ERVK	-454	454	1	2
1799	1540	159	9	137	chr3	159205226	159205569	-394214	+	ORR1B1	LTR	MaLR	96	394	0	2
1799	1997	169	16	43	chr3	159205963	159206334	-393449	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	1	361	-46	2
1799	285	136	72	43	chr3	159206341	159206410	-393373	+	MTB_Mm	LTR	MaLR	337	407	0	2
1799	530	141	30	70	chr3	159208544	159208743	-391040	-	RMER17C	LTR	ERVK	-135	275	85	2
1799	7089	91	25	7	chr3	159211912	159212917	-386866	+	RLTR13D5	LTR	ERVK	1	1023	0	2
1799	389	331	79	16	chr3	159243542	159243732	-356051	+	MLT1D	LTR	MaLR	7	208	-297	3
1799	386	292	65	156	chr3	159247201	159247477	-352306	-	ORR1E	LTR	MaLR	-19	340	90	3
1799	247	284	37	12	chr3	159247537	159247619	-352164	-	ORR1E	LTR	MaLR	-286	88	5	3
1800	2771	24	158	5	chr3	159256519	159256892	-342891	+	MT2_Mm	LTR	ERVL	1	430	-63	3
1800	2002	207	20	22	chr3	159260377	159260777	-339006	-	MTD	LTR	MaLR	-12	407	9	3
1800	240	346	90	36	chr3	159260949	159261060	-338723	-	MLT1N2	LTR	MaLR	-11	551	435	3
1800	649	223	215	11	chr3	159266194	159266373	-333410	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	202	3
1800	774	239	68	21	chr3	159266896	159267088	-332695	-	MTD	LTR	MaLR	-209	210	10	3
1800	4172	25	4	0	chr3	159271411	159271891	-327892	-	LTRIS_Mm	LTR	ERV1	0	482	1	3
1800	249	311	114	91	chr3	159279112	159279331	-320452	-	LTR48	LTR	ERV1	-33	754	531	3
1800	3205	161	9	6	chr3	159281306	159281832	-317951	-	RLTR12B	LTR	ERVK	0	528	1	3
1800	1002	239	0	48	chr3	159293997	159294226	-305557	-	RLTR14	LTR	ERV1	0	382	165	3
1800	1003	249	256	53	chr3	159294231	159294699	-305084	-	RMER2	LTR	ERV1	-4	563	1	3
1800	697	148	26	60	chr3	159294701	159294852	-304931	-	RLTR14	LTR	ERV1	-227	155	10	3
1800	3485	193	92	60	chr3	159296303	159297165	-302618	-	RMER19B	LTR	ERVK	-6	896	8	4
1800	1875	177	54	9	chr3	159310618	159310949	-288834	-	ORR1B1	LTR	MaLR	-8	386	41	4
1800	1898	147	18	62	chr3	159311086	159311427	-288356	+	ORR1A3	LTR	MaLR	1	326	0	4
1800	1557	251	32	16	chr3	159315750	159316123	-283660	-	MTEa	LTR	MaLR	0	379	1	4
1800	236	211	77	0	chr3	159325107	159325159	-274624	+	LTR41	LTR	ERVL	559	614	-154	4
1800	1547	223	40	58	chr3	159325650	159326026	-273757	+	ORR1D1	LTR	MaLR	6	374	0	4
1800	955	339	107	56	chr3	159327222	159327828	-271955	+	MER21B	LTR	ERV1	98	734	-129	4
1800	1282	268	92	57	chr3	159329836	159330483	-269300	+	RMER13A	LTR	ERVK	1	726	-134	4
1800	1658	210	113	8	chr3	159338579	159338958	-260825	-	MTD	LTR	MaLR	0	419	1	4
1800	857	257	244	10	chr3	159340854	159341161	-258622	+	MTEa	LTR	MaLR	1	379	0	4
1800	830	285	64	72	chr3	159341704	159342178	-257605	-	MT2B	LTR	ERVL	-40	561	1	4
1800	2661	98	21	40	chr3	159347496	159347976	-251807	-	RMER17A	LTR	ERVK	0	751	281	4
1800	4076	135	41	107	chr3	159348088	159348771	-251012	+	RMER19A	LTR	ERVK	3	627	-110	4
1800	4076	135	41	107	chr3	159348962	159349065	-250718	+	RMER19A	LTR	ERVK	628	737	0	4
1800	314	333	0	0	chr3	159350984	159351068	-248715	+	MTEa	LTR	MaLR	5	88	-291	4
1800	754	311	0	5	chr3	159351211	159351402	-248381	+	MT2A	LTR	ERVL	264	453	-80	4
1800	279	278	102	0	chr3	159351423	159351531	-248252	+	MLT2B4	LTR	ERVL	432	550	-6	4
1800	329	261	168	48	chr3	159353594	159353935	-245848	-	RMER17B	LTR	ERVK	-529	429	15	4
1800	240	396	90	17	chr3	159368952	159369129	-230654	-	LTR16B1	LTR	ERVL	-160	320	131	4
1800	1020	90	88	28	chr3	159369973	159370155	-229628	+	RMER17C	LTR	ERVK	218	410	0	4
1800	304	194	97	0	chr3	159370883	159370945	-228838	+	RLTR14	LTR	ERV1	315	382	0	4
1800	259	213	211	11	chr3	159371872	159371967	-227816	+	MTEa	LTR	MaLR	262	375	-4	4
1800	8143	154	37	40	chr3	159374087	159375254	-224529	+	RLTR21	LTR	ERVK	1	1188	-384	5
1800	8143	154	37	40	chr3	159375294	159375667	-224116	+	RLTR21	LTR	ERVK	1189	1536	-36	5
1800	3966	169	56	30	chr3	159375667	159376475	-223308	+	RMER12	LTR	ERVK	4	834	-488	5
1800	3966	169	56	30	chr3	159376542	159376560	-223223	+	RMER12	LTR	ERVK	835	851	-471	5
1800	918	294	43	33	chr3	159376557	159376856	-222927	+	RMER12	LTR	ERVK	1021	1322	0	5
1800	272	167	21	0	chr3	159376856	159376899	-222884	+	RLTR21	LTR	ERVK	1529	1572	0	5
1800	2675	25	71	0	chr3	159377210	159377533	-222250	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	5
1800	12002	54	14	1	chr3	159377533	159379120	-220663	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	0	1792	184	5
1801	1426	81	0	0	chr3	159385321	159385518	-214265	-	ORR1A0-int	LTR	MaLR	-1593	199	3	5
1801	3060	20	0	0	chr3	159385519	159385865	-213918	-	ORR1A0	LTR	MaLR	0	346	1	5
1801	306	279	91	49	chr3	159388448	159388591	-211192	+	MER34A	LTR	ERV1	423	571	0	5
1801	1825	155	52	55	chr3	159389634	159390017	-209766	+	ORR1C2	LTR	MaLR	3	384	0	5
1801	1251	217	101	73	chr3	159392691	159392907	-206876	-	RMER17C	LTR	ERVK	-2	408	180	5
1801	1251	217	101	73	chr3	159392993	159393173	-206610	-	RMER17C	LTR	ERVK	-231	179	1	5
1801	295	286	0	21	chr3	159397267	159397369	-202414	-	MLT1A0	LTR	MaLR	-241	124	29	5
1801	289	190	77	132	chr3	159398425	159398516	-201267	-	MT2B	LTR	ERVL	-361	240	155	5
1801	272	336	95	22	chr3	159398987	159399124	-200659	+	MLT1J	LTR	MaLR	31	177	-335	5
1801	639	287	92	53	chr3	159399233	159399590	-200193	-	MLT1A	LTR	MaLR	0	374	4	5
1801	269	299	110	44	chr3	159400696	159400787	-198996	+	MLT1J	LTR	MaLR	190	286	-305	5
1801	420	360	73	26	chr3	159406463	159406654	-193129	+	MLT1J2	LTR	MaLR	5	204	-244	5
1801	1963	179	114	7	chr3	159407095	159407507	-192276	-	RMER19B	LTR	ERVK	-12	890	435	5
1801	459	244	88	58	chr3	159407513	159407718	-192065	+	RLTR15	LTR	ERVK	124	334	-25	5
1801	2418	75	15	12	chr3	159410214	159410540	-189243	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	5
1801	6261	114	14	5	chr3	159410540	159411467	-188316	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	0	1963	1029	5
1801	4656	150	105	25	chr3	159417658	159418632	-181151	-	ORR1A2-int	LTR	MaLR	-922	1041	1	5
1801	2257	88	16	16	chr3	159418632	159418954	-180829	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	6	5
1801	232	384	9	57	chr3	159419159	159419182	-180601	+	MT2B2	LTR	ERVL	142	159	-425	5
1801	7941	35	1	3	chr3	159419313	159420244	-179539	+	RLTR13B3	LTR	ERVK	1	929	0	5
1801	274	321	102	81	chr3	159420493	159420964	-178819	+	ERVL-E-int	LTR	ERVL	3643	4123	-1544	5
1801	931	265	84	55	chr3	159422612	159423047	-176736	+	RMER15	LTR	ERVL	1	535	-40	5
1801	931	256	98	25	chr3	159423083	159423120	-176663	+	RMER15	LTR	ERVL	536	574	-1	5
1801	413	305	88	134	chr3	159424102	159424658	-175125	+	RMER20B	LTR	ERVK	15	599	-28	5
1801	296	182	0	0	chr3	159424975	159425030	-174753	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	320	5
1801	827	221	246	4	chr3	159438490	159438754	-161029	-	ORR1D1	LTR	MaLR	-42	332	5	5
1801	1107	311	27	17	chr3	159439125	159439504	-160279	-	MTE2a	LTR	MaLR	0	419	31	6
1801	1829	151	117	25	chr3	159441155	159441590	-158193	+	IAPLTR2_Mm	LTR	ERVK	1	475	0	6
1801	903	220	32	32	chr3	159441605	159441794	-157989	-	RMER17C	LTR	ERVK	-15	395	193	6
1801	903	220	32	32	chr3	159441974	159442084	-157699	-	RMER17C	LTR	ERVK	-218	192	81	6
1801	756	174	70	29	chr3	159442262	159442488	-157295	-	RMER17C	LTR	ERVK	-175	235	2	6
1801	1949	138	56	3	chr3	159442897	159443238	-156545	+	RLTR15	LTR	ERVK	1	359	0	6
1801	243	308	0	0	chr3	159449315	159449380	-150403	-	MTA_Mm	LTR	MaLR	-69	327	263	6
1801	4256	140	73	52	chr3	159450314	159451201	-148582	+	RMER17A2	LTR	ERVK	1	906	0	6
1801	225	268	66	102	chr3	159458155	159458292	-141491	+	LTR48	LTR	ERV1	1	132	-655	6
1801	238	244	64	43	chr3	159458738	159458832	-140951	+	MER34	LTR	ERV1	375	470	-72	6
1801	247	327	37	18	chr3	159468820	159468929	-130854	+	MLT1F2	LTR	MaLR	450	560	0	6
1801	371	239	87	96	chr3	159482429	159482637	-117146	+	MT2B	LTR	ERVL	59	264	-337	6
1801	548	218	55	49	chr3	159483372	159483428	-116355	-	MTE2a	LTR	MaLR	-3	376	324	6
1801	2182	120	9	3	chr3	159483428	159483753	-116030	-	ORR1A2	LTR	MaLR	0	327	1	6
1801	563	230	60	82	chr3	159483753	159484003	-115780	-	MTE2a	LTR	MaLR	-56	323	3	6
1801	2233	143	17	30	chr3	159484557	159484960	-114823	-	RMER10B	LTR	ERVL	0	398	1	6
1801	750	214	101	6	chr3	159486881	159487060	-112723	+	RMER15	LTR	ERVL	1	196	-379	6
1801	975	168	215	30	chr3	159487055	159487258	-112525	+	RMER15	LTR	ERVL	300	541	-34	6
1801	975	168	215	30	chr3	159487289	159487318	-112465	+	RMER15	LTR	ERVL	542	574	-1	6
1801	461	297	84	100	chr3	159489572	159489707	-110076	-	MLT1B	LTR	MaLR	0	390	258	7
1801	461	297	84	100	chr3	159489911	159490074	-109709	-	MLT1B	LTR	MaLR	-133	257	97	7
1801	231	312	38	89	chr3	159491599	159491757	-108026	+	MLT1B	LTR	MaLR	1	150	-240	7
1801	555	239	31	62	chr3	159491753	159491925	-107858	+	MLT1B	LTR	MaLR	255	467	0	7
1801	1009	209	169	75	chr3	159493293	159493523	-106260	+	RMER4B	LTR	ERVK	1	257	-328	7
1801	1009	209	169	75	chr3	159493632	159493815	-105968	+	RMER4B	LTR	ERVK	258	453	-132	7
1801	990	253	150	9	chr3	159500458	159500529	-99254	+	ORR1D1	LTR	MaLR	1	72	-302	2
1801	990	253	150	9	chr3	159500564	159500819	-98964	+	ORR1D1	LTR	MaLR	73	372	-2	2
1802	1172	262	94	22	chr3	159529909	159530229	-69554	-	MTE2b	LTR	MaLR	-15	364	22	4
1802	741	315	190	15	chr3	159538630	159539036	-60747	-	MLT1F2	LTR	MaLR	-9	551	75	6
1802	477	123	0	0	chr3	159539540	159539613	-60170	-	ORR1C2	LTR	MaLR	0	384	312	6
1802	991	247	80	45	chr3	159539734	159540023	-59760	-	ORR1C2	LTR	MaLR	-60	324	1	6
1802	1343	238	72	7	chr3	159550914	159551218	-48565	-	ORR1D2	LTR	MaLR	-45	325	2	8
1802	878	73	0	0	chr3	159566108	159566232	-33551	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	0	422	299	1
1802	1259	160	31	32	chr3	159568398	159568477	-31306	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-122	300	187	1
1802	1259	131	32	27	chr3	159568623	159568803	-30980	-	BGLII_Mus	LTR	ERVK	-236	186	1	1
1802	2019	170	26	35	chr3	159582408	159582785	-16998	-	ORR1D1	LTR	MaLR	0	374	1	1
1802	271	315	26	18	chr3	159584141	159584254	-15529	-	RMER12	LTR	ERVK	-459	863	750	1
1802	1504	126	58	4	chr3	159589463	159589703	-10080	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-4	1844	1592	1
1802	4224	139	64	11	chr3	159589913	159590677	-9106	-	RLTR22_Mur	LTR	ERVK	-1043	805	1	1